Vertebrata	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000163919 #22
Gnathostomata	ANCESTRAL SPECIES	780														ENSGT00940000155477 #25	ENSGT00390000010474 #24	ENSGT00940000163919 #22	ENSGT00940000159932
Euteleostomi	ANCESTRAL SPECIES	526											ENSGT00940000158936 #28	ENSGT00730000111133 #27	ENSGT00940000164321 #26	ENSGT00940000155477 #25	ENSGT00390000010474 #24	ENSGT00940000163919 #22	ENSGT00940000159932
Sarcopterygii	ANCESTRAL SPECIES	183						ENSGT00950000183167.a.b.b.a	ENSGT00650000094724	ENSGT00940000155355	ENSGT00940000159772	ENSGT00940000156808	ENSGT00940000158936 #28	ENSGT00730000111133 #27	ENSGT00940000164321 #26	ENSGT00940000155477 #25	ENSGT00390000010474 #24	ENSGT00940000163919 #22	ENSGT00940000159932	ENSGT00940000158663	ENSGT00950000183082.b.a	ENSGT00940000164214	ENSGT00940000159649	ENSGT00390000002288	ENSGT00940000158941	ENSGT00390000004928	ENSGT00390000014666.a	ENSGT00390000014618.b
Tetrapoda	ANCESTRAL SPECIES	123					ENSGT00940000155860	ENSGT00950000183167.a.b.b.a	ENSGT00650000094724	ENSGT00940000155355	ENSGT00940000159772	ENSGT00940000156808	ENSGT00940000158936 #28	ENSGT00730000111133 #27	ENSGT00940000164321 #26	ENSGT00940000155477 #25	ENSGT00390000010474 #24	ENSGT00940000163919 #22	ENSGT00940000159932	ENSGT00940000158663	ENSGT00950000183082.b.a	ENSGT00940000164214	ENSGT00940000159649	ENSGT00390000002288	ENSGT00940000158941	ENSGT00390000004928	ENSGT00390000014666.a	ENSGT00390000014618.b	ENSGT00950000182815.a.a.b	ENSGT00940000158107	ENSGT00940000159152.d	ENSGT00940000159152.c.b
Anura	ANCESTRAL SPECIES	208						ENSGT00940000155860.j	ENSGT00950000183167.a.b.b.a	ENSGT00940000155355	ENSGT00490000043388.a #12	ENSGT00940000156239.jb.a #13	ENSGT00730000111181 #14	ENSGT00940000160760.a.a #15	ENSGT00940000158064 #16	ENSGT00390000010398.B #17	ENSGT00940000156991.d #18	ENSGT00940000163919 #22	ENSGT00390000010474 #24	ENSGT00940000155477 #25	ENSGT00940000164321 #26	ENSGT00730000111133 #27	ENSGT00940000158936 #28
Frog	MODERN SPECIES	3	ENSXETG00000034109 #7	ENSXETG00000049005 #8	ENSXETG00000038586 #9	ENSXETG00000049226 #10	XB5812267 [provisional] (ENSXETG00000030024) #11	ENSXETG00000015157 #12	adam9 (ENSXETG00000015156) #13	tm2d2 (ENSXETG00000015155) #14	htra4 (ENSXETG00000037557) #15	plekha2 (ENSXETG00000015153) #16	ENSXETG00000035548 #17	ENSXETG00000047461 #18	ENSXETG00000041776 #19	ENSXETG00000033041 #20	nodal3.1 (ENSXETG00000009009) #21	nodal2 (ENSXETG00000036923) #22	nodal1 (ENSXETG00000009008) #23	ash2l (ENSXETG00000009007) #24	star (ENSXETG00000009006) #25	grk5 (ENSXETG00000009005) #26	lsm1 (ENSXETG00000009004) #27	bag4 (ENSXETG00000009003) #28	ENSXETG00000040872 #29	ENSXETG00000049025 #30	ENSXETG00000036311 #31	ENSXETG00000043692 #32	ENSXETG00000045841 #33	ENSXETG00000036792 #34	ENSXETG00000040764 #35	stxbp2 (ENSXETG00000002616) #36	ENSXETG00000037706 #37
Leishan spiny toad	MODERN SPECIES	6	TM2D2 (ENSLLEG00000029134) #14	ADAM9 (ENSLLEG00000029164) #13	ENSLLEG00000029209 #12	ENSLLEG00000029255	DDHD2 (ENSLLEG00000029279)	ENSLLEG00000029326	NSD3 (ENSLLEG00000029373)	ENSLLEG00000014026	LETM2 (ENSLLEG00000014086)	FGFR1 (ENSLLEG00000014330)	ENSLLEG00000015591	ENSLLEG00000015619 ##15	ENSLLEG00000015647 #16	ENSLLEG00000015744 #17	TACC1 (ENSLLEG00000015817) #18	ENSLLEG00000016267 #22	ASH2L (ENSLLEG00000016401) #24	STAR (ENSLLEG00000017335) #25	ENSLLEG00000017507 #26	BAG4 (ENSLLEG00000017662) #28	ENSLLEG00000017808 #27	ENSLLEG00000017935	ENSLLEG00000018136	ENSLLEG00000018253	ENSLLEG00000018321 ##19	NCAPH2 (ENSLLEG00000018366)	SCO2 (ENSLLEG00000018762)	LMF2 (ENSLLEG00000018828)	MIOX (ENSLLEG00000018979)	ENSLLEG00000019191	ENSLLEG00000019227
Amniota	ANCESTRAL SPECIES	33	ENSGT00940000160760.b ##15	ENSGT00940000158064 #16	ENSGT00390000010398.B #17	ENSGT00940000156991 #20	ENSGT00940000155860	ENSGT00950000183167.a.b.b.a	ENSGT00650000094724	ENSGT00940000155355	ENSGT00940000159772	ENSGT00940000156808	ENSGT00940000158936 #28	ENSGT00730000111133 #27	ENSGT00940000164321 #26	ENSGT00940000155477 #25	ENSGT00390000010474 #24	ENSGT00940000163919 #22	ENSGT00940000159932	ENSGT00940000158663	ENSGT00950000183082.b.a	ENSGT00940000164214	ENSGT00940000159649	ENSGT00390000002288	ENSGT00940000158941	ENSGT00390000004928	ENSGT00390000014666.a	ENSGT00390000014618.b	ENSGT00940000161817	ENSGT00950000182815.a.a.b	ENSGT00940000158107	ENSGT00940000159152.d	ENSGT00390000003878
Sauria	ANCESTRAL SPECIES	27	ENSGT00940000158064 #16	ENSGT00390000010398.B #17	ENSGT00940000156991 #20	ENSGT00940000155860.d	ENSGT00950000183167.a.b.b.a	ENSGT00650000094724	ENSGT00940000155355	ENSGT00940000159772	ENSGT00940000156808	ENSGT00980000199378	ENSGT00940000158936 #28	ENSGT00730000111133 #27	ENSGT00940000164321 #26	ENSGT00940000155477 #25	ENSGT00390000010474 #24	ENSGT00940000163919 #22	ENSGT00940000159932	ENSGT01070000253744.b.a.a.a	ENSGT00940000158663	ENSGT00950000183082.b.a	ENSGT00940000164214	ENSGT00940000159649	ENSGT00390000002288	ENSGT00940000158941	ENSGT00390000004928	ENSGT00390000014666.a	ENSGT00390000014618.b	ENSGT00940000161817	ENSGT00950000182815.a.a.b	ENSGT00940000158107	ENSGT00940000159152.d
Archelosauria	ANCESTRAL SPECIES	29	ENSGT00390000010398.B #17	ENSGT00940000156991 #20	ENSGT00940000155860.c.b	ENSGT01030000236496	ENSGT00940000155860.d	ENSGT00950000183167.a.b.b.a	ENSGT00940000155355	ENSGT00940000159772	ENSGT00940000156808	ENSGT00980000199378	ENSGT00940000158936 #28	ENSGT00730000111133 #27	ENSGT00940000164321 #26	ENSGT00940000155477 #25	ENSGT00390000010474 #24	ENSGT00940000163919 #22	ENSGT00940000159932	ENSGT01070000253744.b.a.a.a	ENSGT00940000158663	ENSGT00950000183082.b.a	ENSGT00940000164214	ENSGT00940000159649	ENSGT00390000002288	ENSGT00940000158941	ENSGT00390000004928	ENSGT00390000014666.a	ENSGT00390000014618.b	ENSGT00940000161817	ENSGT00950000182815.a.a.b	ENSGT00940000158107	ENSGT00940000159152.d
Archosauria	ANCESTRAL SPECIES	30	ENSGT00390000010398.B #17	ENSGT00940000156991 #20	ENSGT00940000155860.c.b	ENSGT01030000236496	ENSGT00940000155860.d	ENSGT00950000183167.a.b.b.a	ENSGT00940000155355	ENSGT00940000159772	ENSGT00940000156808	ENSGT00980000199378	ENSGT00940000158936 #28	ENSGT00730000111133 #27	ENSGT00940000164321 #26	ENSGT00940000155477 #25	ENSGT00390000010474 #24	ENSGT00940000163919 #22	ENSGT00940000159932	ENSGT00940000158663	ENSGT00940000164214	ENSGT00940000159649	ENSGT00390000002288	ENSGT00940000158941	ENSGT00390000004928	ENSGT00390000014666.a	ENSGT00390000014618.b	ENSGT00940000161817	ENSGT00950000182815.a.a.b	ENSGT00940000158107	ENSGT00940000159152.d	ENSGT00390000003878	ENSGT00390000012859
Aves	ANCESTRAL SPECIES	30	ENSGT00390000010398.B #17	ENSGT00940000156991 #20	ENSGT00940000155860.c.b	ENSGT01030000236496	ENSGT00940000155860.d	ENSGT00950000183167.a.b.b.a	ENSGT00940000155355	ENSGT00940000159772	ENSGT00940000156808	ENSGT00980000199378	ENSGT00940000158936 #28	ENSGT00730000111133 #27	ENSGT00940000164321 #26	ENSGT00940000155477 #25	ENSGT00390000010474 #24	ENSGT00940000163919 #22	ENSGT00940000159932	ENSGT00940000158663	ENSGT00940000164214	ENSGT00940000159649	ENSGT00390000002288	ENSGT00940000158941	ENSGT00390000004928	ENSGT00390000014666.a	ENSGT00390000014618.b	ENSGT00940000161817	ENSGT00950000182815.a.a.b	ENSGT00940000158107	ENSGT00940000159152.d	ENSGT00390000003878	ENSGT00390000012859
Neognathae	ANCESTRAL SPECIES	33	ENSGT00390000010398.B #17	ENSGT00940000156991 #20	ENSGT00940000155860.c.b	ENSGT01030000236496	ENSGT00940000155860.d	ENSGT00950000183167.a.b.b.a	ENSGT00940000155355	ENSGT00940000159772	ENSGT00940000156808	ENSGT00980000199378	ENSGT00940000158936 #28	ENSGT00730000111133 #27	ENSGT00940000164321 #26	ENSGT00940000155477 #25	ENSGT00390000010474 #24	ENSGT00940000163919 #22	ENSGT00940000159932	ENSGT00940000158663	ENSGT00940000164214	ENSGT00940000159649	ENSGT00390000002288	ENSGT00940000158941	ENSGT00390000004928	ENSGT00390000014666.a	ENSGT00390000014618.b	ENSGT00940000161817	ENSGT00950000182815.a.a.b	ENSGT00940000158107	ENSGT00940000159152.d	ENSGT00390000003878	ENSGT00390000012859
Neognathae_b	ANCESTRAL SPECIES	28	ENSGT00730000111181 #14	ENSGT00940000158064 #16	ENSGT00390000010398.B #17	ENSGT00940000156991 #20	ENSGT00940000155860.d	ENSGT00950000183167.a.b.b.a	ENSGT00940000155355	ENSGT00940000159772	ENSGT00940000156808	ENSGT00980000199378	ENSGT00940000158936 #28	ENSGT00730000111133 #27	ENSGT00940000164321 #26	ENSGT00940000155477 #25	ENSGT00390000010474 #24	ENSGT00940000163919 #22	ENSGT00940000159932	ENSGT00940000158663	ENSGT00940000164214	ENSGT00940000159649	ENSGT00390000002288	ENSGT00940000158941	ENSGT00390000004928	ENSGT00390000014666.a	ENSGT00390000014618.b	ENSGT00940000161817	ENSGT00950000182815.a.a.b	ENSGT00940000158107	ENSGT00940000159152.d	ENSGT00390000003878	ENSGT00390000012859
Passeriformes	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00940000156239 #13	ENSGT00730000111181 #14	ENSGT00940000158064 #16	ENSGT00390000010398.B #17	ENSGT00940000156991 #20	ENSGT00940000155860.d	ENSGT00950000183167.a.b.b.a	ENSGT00940000155355	ENSGT00940000159772	ENSGT00940000156808	ENSGT00980000199378	ENSGT00940000158936 #28	ENSGT00730000111133 #27	ENSGT00940000155477 #25	ENSGT00390000010474 #24	ENSGT00940000163919 #22	ENSGT00940000159932	ENSGT00940000158663	ENSGT00940000159649	ENSGT00390000002288.c	ENSGT00940000158941	ENSGT00390000004928	ENSGT00390000014666.a	ENSGT00390000014618.b	ENSGT00950000182815.a.a.b	ENSGT00940000158107	ENSGT00940000159152.d	ENSGT00390000003878	ENSGT00390000012859	ENSGT00940000159352	ENSGT00940000155068.b
Passeriformes_d	ANCESTRAL SPECIES	30	ENSGT00940000156239.gb #13	ENSGT00730000111181 #14	ENSGT00940000158064 #16	ENSGT00390000010398.B #17	ENSGT00940000156991 #20	ENSGT00940000155860.d	ENSGT00950000183167.a.b.b.a	ENSGT00940000155355	ENSGT00940000159772	ENSGT00940000156808	ENSGT00980000199378	ENSGT00940000158936 #28	ENSGT00730000111133 #27	ENSGT00940000155477 #25	ENSGT00390000010474 #24	ENSGT00940000163919 #22	ENSGT00940000159932	ENSGT00940000158663	ENSGT00940000159649	ENSGT00390000002288.c	ENSGT00940000158941	ENSGT00390000004928	ENSGT00390000014666.a	ENSGT00390000014618.b	ENSGT00950000182815.a.a.b	ENSGT00940000158107	ENSGT00940000159152.d	ENSGT00940000159152.c.b	ENSGT00390000003878	ENSGT00390000012859	ENSGT00940000159352
Passeriformes_g	ANCESTRAL SPECIES	33	ENSGT00940000164380.a	ENSGT00940000161015.a.b.b	ENSGT00940000156239.gb #13	ENSGT00730000111181 #14	ENSGT00940000158064 #16	ENSGT00940000156991 #20	ENSGT00940000155860.d	ENSGT00950000183167.a.b.b.a	ENSGT00940000155355	ENSGT00940000159772	ENSGT00940000156808	ENSGT00940000158936 #28	ENSGT00730000111133 #27	ENSGT00940000155477 #25	ENSGT00390000010474 #24	ENSGT00940000163919 #22	ENSGT00940000159932	ENSGT00940000158663	ENSGT00940000159649	ENSGT00390000002288.c	ENSGT00940000158941	ENSGT00390000004928	ENSGT00390000014666.a	ENSGT00390000014618.b	ENSGT00950000182815.a.a.b	ENSGT00940000158107	ENSGT00940000159152.d	ENSGT00940000159152.c.b	ENSGT00390000003878	ENSGT00390000012859	ENSGT00940000159352
Passeroidea	ANCESTRAL SPECIES	31	ENSGT00940000161015.a.b.b	ENSGT00940000156239.fb #13	ENSGT00940000156239.gb #13	ENSGT00730000111181 #14	ENSGT00940000158064 #16	ENSGT00940000156991 #20	ENSGT00940000155860.d	ENSGT00950000183167.a.b.b.a	ENSGT00940000155355	ENSGT00940000159772	ENSGT00940000156808	ENSGT00940000158936 #28	ENSGT00730000111133 #27	ENSGT00940000155477 #25	ENSGT00390000010474 #24	ENSGT00940000163919 #22	ENSGT00940000159932	ENSGT00940000158663	ENSGT00940000159649	ENSGT00390000002288.c	ENSGT00940000158941	ENSGT00390000004928	ENSGT00390000014666.a	ENSGT00390000014618.b	ENSGT00950000182815.a.a.b	ENSGT00940000158107	ENSGT00940000159152.d	ENSGT00940000159152.c.b	ENSGT00390000003878	ENSGT00390000012859	ENSGT00940000159352
Zebra finch	MODERN SPECIES	15	ENSTGUG00000022296	ADAM32 (ENSTGUG00000005141)	ADAM9 (ENSTGUG00000004989) #13	TM2D2 (ENSTGUG00000005135) #14	PLEKHA2 (ENSTGUG00000005099) #16	TACC1 (ENSTGUG00000005082) #20	FGFR1 (ENSTGUG00000004881)	LETM2 (ENSTGUG00000004862)	NSD3 (ENSTGUG00000004829)	PLPP5 (ENSTGUG00000017310)	DDHD2 (ENSTGUG00000004804)	BAG4 (ENSTGUG00000024841) #28	LSM1 (ENSTGUG00000028102) #27	STAR (ENSTGUG00000004778) #25	ASH2L (ENSTGUG00000004741) #24	ENSTGUG00000022356 #22	EIF4EBP1 (ENSTGUG00000004721)	RAB11FIP1 (ENSTGUG00000004717)	BRF2 (ENSTGUG00000021842)	ADGRA2 (ENSTGUG00000004671)	PLPBP (ENSTGUG00000004658)	ERLIN2 (ENSTGUG00000004644)	ZNF703 (ENSTGUG00000022318)	ENSTGUG00000027409	ENSTGUG00000022985	ENSTGUG00000029065	UNC5D (ENSTGUG00000004556)	DUSP26 (ENSTGUG00000020669)	ENSTGUG00000020405	ENSTGUG00000020415	TTI2 (ENSTGUG00000023218)
Flycatcher	MODERN SPECIES	14	ENSFALG00000024687 #13	TM2D2 (ENSFALG00000006596) #14	PLEKHA2 (ENSFALG00000006597) #16	ENSFALG00000025655 #17	TACC1 (ENSFALG00000024589) #20	FGFR1 (ENSFALG00000006629)	LETM2 (ENSFALG00000006662)	NSD3 (ENSFALG00000006679)	PLPP5 (ENSFALG00000006702)	ENSFALG00000028559	ENSFALG00000006715	ENSFALG00000025292	BAG4 (ENSFALG00000026049) #28	LSM1 (ENSFALG00000026601) #27	STAR (ENSFALG00000006726) #25	ENSFALG00000024925 #22	EIF4EBP1 (ENSFALG00000006751)	ENSFALG00000025488	ADRB3 (ENSFALG00000006756)	ENSFALG00000027467	ENSFALG00000006766	BRF2 (ENSFALG00000006771)	ADGRA2 (ENSFALG00000006741)	PLPBP (ENSFALG00000027360)	ERLIN2 (ENSFALG00000006788)	ENSFALG00000023383	ENSFALG00000023722	ENSFALG00000025103	ENSFALG00000025694	UNC5D (ENSFALG00000006798)	ENSFALG00000025985
Great tit	MODERN SPECIES	14	ADAM32 (ENSPMJG00000017961)	ADAM9 (ENSPMJG00000017960) #13	TM2D2 (ENSPMJG00000017959) #14	PLEKHA2 (ENSPMJG00000017958) #16	TACC1 (ENSPMJG00000017957) #20	ENSPMJG00000017956	FGFR1 (ENSPMJG00000017954)	LETM2 (ENSPMJG00000017953)	NSD3 (ENSPMJG00000017952)	PLPP5 (ENSPMJG00000017951)	DDHD2 (ENSPMJG00000017950)	BAG4 (ENSPMJG00000017948) #28	LSM1 (ENSPMJG00000017949) #27	STAR (ENSPMJG00000017947) #25	ASH2L (ENSPMJG00000017946) #24	ENSPMJG00000017945 #22	EIF4EBP1 (ENSPMJG00000017944)	ADRB3 (ENSPMJG00000017943)	ENSPMJG00000017942	RAB11FIP1 (ENSPMJG00000017941)	ENSPMJG00000017940	ADGRA2 (ENSPMJG00000017904)	PLPBP (ENSPMJG00000017901)	ERLIN2 (ENSPMJG00000017899)	ZNF703 (ENSPMJG00000017898)	ENSPMJG00000017896	ENSPMJG00000017894	UNC5D (ENSPMJG00000017814)	ENSPMJG00000017811	DUSP26 (ENSPMJG00000017808)	ENSPMJG00000017807
Neognathae_c	ANCESTRAL SPECIES	30	ENSGT00940000156239 #13	ENSGT00730000111181 #14	ENSGT00940000158064 #16	ENSGT00940000156991 #20	ENSGT00940000155860.d	ENSGT00950000183167.a.b.b.a	ENSGT00940000155355	ENSGT00940000159772	ENSGT00940000156808	ENSGT00980000199378	ENSGT00940000158936 #28	ENSGT00730000111133 #27	ENSGT00940000164321 #26	ENSGT00940000155477 #25	ENSGT00390000010474 #24	ENSGT00940000163919 #22	ENSGT00940000159932	ENSGT00940000158663	ENSGT00730000114527	ENSGT00940000164214	ENSGT00940000159649	ENSGT00390000002288	ENSGT00940000158941	ENSGT00390000004928	ENSGT00390000014666.a	ENSGT00390000014618.b	ENSGT00940000161817	ENSGT00950000182815.a.a.b	ENSGT00940000158107	ENSGT00940000159152.d	ENSGT00390000003878
Golden eagle	MODERN SPECIES	4	ADAM9 (ENSACCG00020007469) #13	TM2D2 (ENSACCG00020007520) #14	PLEKHA2 (ENSACCG00020007533) #16	TACC1 (ENSACCG00020007550) #20	FGFR1 (ENSACCG00020007576)	LETM2 (ENSACCG00020007596)	NSD3 (ENSACCG00020007624)	PLPP5 (ENSACCG00020007664)	DDHD2 (ENSACCG00020007687)	BAG4 (ENSACCG00020007706) #28	ENSACCG00020007720	LSM1 (ENSACCG00020007728) #27	ENSACCG00020007747 #26	STAR (ENSACCG00020007768) #25	ASH2L (ENSACCG00020007788) #24	ENSACCG00020007816 #22	EIF4EBP1 (ENSACCG00020007829)	ADRB3 (ENSACCG00020007838)	ENSACCG00020007848	ENSACCG00020007859	RAB11FIP1 (ENSACCG00020007868)	BRF2 (ENSACCG00020007880)	ADGRA2 (ENSACCG00020007894)	ENSACCG00020007911	PLPBP (ENSACCG00020007921)	ERLIN2 (ENSACCG00020007937)	ZNF703 (ENSACCG00020005100)	KCNU1 (ENSACCG00020005140)	UNC5D (ENSACCG00020005237)	DUSP26 (ENSACCG00020005301)	RNF122 (ENSACCG00020005328)
Kakapo	MODERN SPECIES	14	ENSSHBG00005009484	ENSSHBG00005009382	ADAM9 (ENSSHBG00005009365) #13	TM2D2 (ENSSHBG00005009353) #14	PLEKHA2 (ENSSHBG00005009335) #16	TACC1 (ENSSHBG00005008407) #20	FGFR1 (ENSSHBG00005008343)	LETM2 (ENSSHBG00005008312)	NSD3 (ENSSHBG00005008224)	PLPP5 (ENSSHBG00005008184)	DDHD2 (ENSSHBG00005008157)	BAG4 (ENSSHBG00005008133) #28	LSM1 (ENSSHBG00005008112) #27	STAR (ENSSHBG00005008092) #25	ASH2L (ENSSHBG00005008073) #24	ENSSHBG00005008059 #22	EIF4EBP1 (ENSSHBG00005008047)	ADRB3 (ENSSHBG00005008036)	ENSSHBG00005008021	ENSSHBG00005008007	RAB11FIP1 (ENSSHBG00005008003)	BRF2 (ENSSHBG00005007987)	ADGRA2 (ENSSHBG00005007949)	PLPBP (ENSSHBG00005007920)	ERLIN2 (ENSSHBG00005007913)	ZNF703 (ENSSHBG00005007902)	UNC5D (ENSSHBG00005007866)	DUSP26 (ENSSHBG00005007834)	RNF122 (ENSSHBG00005007821)	TTI2 (ENSSHBG00005007805)	MAK16 (ENSSHBG00005007784)
Galloanserae	ANCESTRAL SPECIES	32	ENSGT00940000158064 #16	ENSGT00390000010398.B #17	ENSGT00940000156991 #20	ENSGT01030000236496	ENSGT00940000155860.d	ENSGT00950000183167.a.b.b.a	ENSGT00940000155355	ENSGT00940000159772	ENSGT00940000156808	ENSGT00980000199378	ENSGT00940000158936 #28	ENSGT00730000111133 #27	ENSGT00940000164321 #26	ENSGT00940000155477 #25	ENSGT00390000010474 #24	ENSGT00940000163919 #22	ENSGT00940000159932	ENSGT00940000158663	ENSGT00940000164214	ENSGT00940000159649	ENSGT00390000002288	ENSGT00940000158941	ENSGT00390000004928	ENSGT00390000014666.a	ENSGT00390000014618.b	ENSGT00940000161817	ENSGT00950000182815.a.a.b	ENSGT00940000158107	ENSGT00940000159152.d	ENSGT00390000003878	ENSGT00390000012859
Anatidae	ANCESTRAL SPECIES	53						ENSGT00940000155860.d	ENSGT00940000155355	ENSGT00940000159772	ENSGT00940000156808	ENSGT00980000199378	ENSGT00940000158936 #28	ENSGT00730000111133 #27	ENSGT00940000164321 #26	ENSGT00940000155477 #25	ENSGT00390000010474 #24	ENSGT00940000163919 #22	ENSGT00940000159932	ENSGT00940000158663	ENSGT00940000161418	ENSGT00940000161965	ENSGT00940000164214	ENSGT00940000159649	ENSGT00390000002288	ENSGT00940000158941	ENSGT00390000004928	ENSGT00390000014666.a	ENSGT00940000161817	ENSGT00950000182815.a.a.b	ENSGT00940000158107	ENSGT00940000159152.d	ENSGT00390000003878
Pink-footed goose	MODERN SPECIES	203							FGFR1 (ENSABRG00000003171)	NSD3 (ENSABRG00000003063)	PLPP5 (ENSABRG00000003023)	DDHD2 (ENSABRG00000002982)	ENSABRG00000002964	BAG4 (ENSABRG00000002952) #28	LSM1 (ENSABRG00000002937) #27	ENSABRG00000002877 #26	STAR (ENSABRG00000002839) #25	ENSABRG00000002824 #22	ASH2L (ENSABRG00000000535) #24	EIF4EBP1 (ENSABRG00000000446)	ADRB3 (ENSABRG00000000427)	ENSABRG00000000416	ENSABRG00000000397	RAB11FIP1 (ENSABRG00000000382)	ENSABRG00000000364	ADGRA2 (ENSABRG00000000344)	PLPBP (ENSABRG00000000324)	ERLIN2 (ENSABRG00000000274)	KCNU1 (ENSABRG00000000196)	UNC5D (ENSABRG00000015136)	DUSP26 (ENSABRG00000015131)	RNF122 (ENSABRG00000015128)	TTI2 (ENSABRG00000015120)
Duck	MODERN SPECIES	14	SFRP1 (ENSAPLG00000006111)	ZMAT4 (ENSAPLG00000006106)	TCIM (ENSAPLG00000001262)	ENSAPLG00000006102	ENSAPLG00000006066	ENSAPLG00000006063	ADAM9 (ENSAPLG00000005808) #13	TACC1 (ENSAPLG00000014634) #20	FGFR1 (ENSAPLG00000014095)	ENSAPLG00000019197	ENSAPLG00000013728	DDHD2 (ENSAPLG00000014268)	ENSAPLG00000026406 #26	STAR (ENSAPLG00000015079) #25	ASH2L (ENSAPLG00000015588) #24	ENSAPLG00000023258 #22	EIF4EBP1 (ENSAPLG00000015855)	ADRB3 (ENSAPLG00000008630)	ENSAPLG00000008713	RAB11FIP1 (ENSAPLG00000008753)	BRF2 (ENSAPLG00000020942)	ADGRA2 (ENSAPLG00000008397)	PLPBP (ENSAPLG00000015393)	ERLIN2 (ENSAPLG00000014963)	ENSAPLG00000020314	KCNU1 (ENSAPLG00000014841)	UNC5D (ENSAPLG00000013846)	DUSP26 (ENSAPLG00000003050)	RNF122 (ENSAPLG00000003031)	TTI2 (ENSAPLG00000002866)	MAK16 (ENSAPLG00000028345)
Phasianidae	ANCESTRAL SPECIES	31	ENSGT00730000111181 #14	ENSGT00940000158064 #16	ENSGT00390000010398.B #17	ENSGT00940000156991 #20	ENSGT01030000236496	ENSGT00940000155860.d	ENSGT00950000183167.a.b.b.a	ENSGT00940000155355	ENSGT00940000159772	ENSGT00940000156808	ENSGT00980000199378	ENSGT00940000158936 #28	ENSGT00730000111133 #27	ENSGT00940000155477 #25	ENSGT00390000010474 #24	ENSGT00940000163919 #22	ENSGT00940000159932	ENSGT00940000158663	ENSGT00940000164214	ENSGT00940000159649	ENSGT00390000002288	ENSGT00940000158941	ENSGT00390000004928	ENSGT00390000014666.a	ENSGT00390000014618.b	ENSGT00940000161817	ENSGT00950000182815.a.a.b	ENSGT00940000158107	ENSGT00940000159152.d	ENSGT00390000003878	ENSGT00390000012859
Phasianidae_b	ANCESTRAL SPECIES	36	ENSGT00940000161015.a.b.b.a	ENSGT00940000156239 #13	ENSGT00730000111181 #14	ENSGT00940000158064 #16	ENSGT00390000010398.B #17	ENSGT00940000156991 #20	ENSGT00940000155860.d	ENSGT00950000183167.a.b.b.a	ENSGT00940000155355	ENSGT00940000159772	ENSGT00940000156808	ENSGT00940000158936 #28	ENSGT00730000111133 #27	ENSGT00940000155477 #25	ENSGT00390000010474 #24	ENSGT00940000163919 #22	ENSGT00940000159932	ENSGT00940000158663	ENSGT00940000164214	ENSGT00940000159649	ENSGT00390000002288	ENSGT00940000158941	ENSGT00390000004928	ENSGT00390000014666.a	ENSGT00390000014618.b	ENSGT00940000161817	ENSGT00950000182815.a.a.b	ENSGT00940000158107	ENSGT00940000159152.d	ENSGT00390000003878	ENSGT00390000012859
Chicken	MODERN SPECIES	14	ADAM9 (ENSGALG00010017571) #13	TM2D2 (ENSGALG00010017550) #14	PLEKHA2 (ENSGALG00010017526) #16	ENSGALG00010017357 #17	ENSGALG00010017349 #20	ENSGALG00010017323 #20	FGFR1 (ENSGALG00010017332)	LETM2 (ENSGALG00010017852)	WHSC1L1 (ENSGALG00010017843)	PLPP5 (ENSGALG00010017825)	DDHD2 (ENSGALG00010017813)	BAG4 (ENSGALG00010017798) #28	LSM1 (ENSGALG00010017792) #27	STAR (ENSGALG00010017783) #25	ASH2L (ENSGALG00010017774) #24	ENSGALG00010017759 #22	EIF4EBP1 (ENSGALG00010019697)	ADRB3 (ENSGALG00010017438)	ENSGALG00010017426	PRLHRL (ENSGALG00010017417)	RAB11FIP1 (ENSGALG00010017411)	BRF2 (ENSGALG00010017395)	ADGRA2 (ENSGALG00010021026)	PLPBP (ENSGALG00010017388)	ERLIN2 (ENSGALG00010017368)	ZNF703 (ENSGALG00010019418)	ENSGALG00010020757	KCNU1 (ENSGALG00010019743)	UNC5D (ENSGALG00010019540)	DUSP26 (ENSGALG00010017747)	RNF122 (ENSGALG00010021033)
Turkey	MODERN SPECIES	16	ENSMGAG00000002331	ENSMGAG00000016873	ADAM9 (ENSMGAG00000002335) #13	TM2D2 (ENSMGAG00000019276) #14	PLEKHA2 (ENSMGAG00000002802) #16	ENSMGAG00000017921 #20	ENSMGAG00000001963 #20	FGFR1 (ENSMGAG00000002004)	LETM2 (ENSMGAG00000002012)	NSD3 (ENSMGAG00000002028)	PLPP5 (ENSMGAG00000002071)	DDHD2 (ENSMGAG00000002077)	LSM1 (ENSMGAG00000002125) #27	STAR (ENSMGAG00000002130) #25	ASH2L (ENSMGAG00000002148) #24	ENSMGAG00000002207 #22	ENSMGAG00000002216	ADRB3 (ENSMGAG00000002221)	ENSMGAG00000018387	ENSMGAG00000002233	RAB11FIP1 (ENSMGAG00000001841)	BRF2 (ENSMGAG00000001861)	ADGRA2 (ENSMGAG00000001871)	PLPBP (ENSMGAG00000001904)	ERLIN2 (ENSMGAG00000001925)	KCNU1 (ENSMGAG00000001799)	UNC5D (ENSMGAG00000001823)	DUSP26 (ENSMGAG00000001592)	RNF122 (ENSMGAG00000021018)	TTI2 (ENSMGAG00000001612)	MAK16 (ENSMGAG00000001635)
Japanese quail	MODERN SPECIES	14	ADAM9 (ENSCJPG00005015215) #13	TM2D2 (ENSCJPG00005015214) #14	PLEKHA2 (ENSCJPG00005015213) #16	TACC1 (ENSCJPG00005015211) #20	ENSCJPG00005015208	FGFR1 (ENSCJPG00005015206)	LETM2 (ENSCJPG00005015205)	NSD3 (ENSCJPG00005015204)	PLPP5 (ENSCJPG00005015203)	DDHD2 (ENSCJPG00005015202)	ENSCJPG00005015201	BAG4 (ENSCJPG00005015200) #28	LSM1 (ENSCJPG00005015199) #27	STAR (ENSCJPG00005015198) #25	ASH2L (ENSCJPG00005015197) #24	ENSCJPG00005015196 #22	EIF4EBP1 (ENSCJPG00005015195)	ADRB3 (ENSCJPG00005015194)	ENSCJPG00005015193	ENSCJPG00005015192	RAB11FIP1 (ENSCJPG00005015191)	ENSCJPG00005015190	ADGRA2 (ENSCJPG00005015189)	PLPBP (ENSCJPG00005015174)	ENSCJPG00005015171	ERLIN2 (ENSCJPG00005015168)	ZNF703 (ENSCJPG00005015167)	KCNU1 (ENSCJPG00005015158)	UNC5D (ENSCJPG00005015155)	DUSP26 (ENSCJPG00005015152)	RNF122 (ENSCJPG00005015151)
African ostrich	MODERN SPECIES	859									LETM2 (ENSSCUG00000018777)	NSD3 (ENSSCUG00000018783)	PLPP5 (ENSSCUG00000018787)	DDHD2 (ENSSCUG00000018789)	LSM1 (ENSSCUG00000018791) #27	STAR (ENSSCUG00000018792) #25	ASH2L (ENSSCUG00000018801) #24	ENSSCUG00000018817 #22	EIF4EBP1 (ENSSCUG00000018819)	ADRB3 (ENSSCUG00000018821)	ENSSCUG00000018823	ENSSCUG00000018825	ENSSCUG00000018826	BRF2 (ENSSCUG00000018834)	ENSSCUG00000018837	PLPBP (ENSSCUG00000018840)	ERLIN2 (ENSSCUG00000018846)
Australian saltwater crocodile	MODERN SPECIES	51	ADAM9 (ENSCPRG00005001093) #13	TM2D2 (ENSCPRG00005001129) #14	PLEKHA2 (ENSCPRG00005001131) #16	TACC1 (ENSCPRG00005001135) #20	FGFR1 (ENSCPRG00005001153)	ENSCPRG00005001183	NSD3 (ENSCPRG00005001217)	PLPP5 (ENSCPRG00005001370)	DDHD2 (ENSCPRG00005001384)	ENSCPRG00005001463	BAG4 (ENSCPRG00005001476) #28	LSM1 (ENSCPRG00005001504) #27	ENSCPRG00005001522 #26	STAR (ENSCPRG00005001620) #25	ASH2L (ENSCPRG00005001645) #24	ENSCPRG00005001771 #22	EIF4EBP1 (ENSCPRG00005001774)	ENSCPRG00005001777	ENSCPRG00005001782	ADGRA2 (ENSCPRG00005001808)	PLPBP (ENSCPRG00005002179)	NUDT18 (ENSCPRG00005002184)	DMTN (ENSCPRG00005002215)	FGF17 (ENSCPRG00005002380)	NPM2 (ENSCPRG00005002385)	PBDC1 (ENSCPRG00005002392)	XPO7 (ENSCPRG00005002400)	DOK2 (ENSCPRG00005002405)	ENSCPRG00005002409	LZTS1 (ENSCPRG00005002415)	ATP6V1B2 (ENSCPRG00005002451)
Cryptodira	ANCESTRAL SPECIES	30	ENSGT00940000160760.b ##15	ENSGT00940000158064 #16	ENSGT00390000010398.B #17	ENSGT00940000156991 #20	ENSGT01030000236496	ENSGT00940000155860.d	ENSGT00950000183167.a.b.b.a	ENSGT00940000155355	ENSGT00940000159772	ENSGT00940000156808	ENSGT00940000158936 #28	ENSGT00730000111133 #27	ENSGT00940000164321 #26	ENSGT00940000155477 #25	ENSGT00390000010474 #24	ENSGT00940000163919 #22	ENSGT00940000159932	ENSGT01070000253744.b.a.a.a	ENSGT00940000158663	ENSGT00950000183082.b.a	ENSGT00940000164214	ENSGT00940000159649	ENSGT00390000002288	ENSGT00940000158941	ENSGT00390000004928	ENSGT00390000014666.a	ENSGT00390000014618.b	ENSGT00940000161817	ENSGT00950000182815.a.a.b	ENSGT00940000158107	ENSGT00940000159152.d
Chinese turtle	MODERN SPECIES	1928						FGFR1 (ENSPSIG00000006400)	LETM2 (ENSPSIG00000009394)	NSD3 (ENSPSIG00000010362)	PLPP5 (ENSPSIG00000010633)	DDHD2 (ENSPSIG00000011144)	BAG4 (ENSPSIG00000012400) #28	LSM1 (ENSPSIG00000012563) #27	ENSPSIG00000012626 #26	STAR (ENSPSIG00000012823) #25	ASH2L (ENSPSIG00000013417) #24	ENSPSIG00000013969 #22	ENSPSIG00000013981	ADRB3 (ENSPSIG00000014019)	GOT1L1 (ENSPSIG00000014051)	ENSPSIG00000014512	RAB11FIP1 (ENSPSIG00000014732)	BRF2 (ENSPSIG00000014794)
Testudinoidea	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000158064 #16	ENSGT00390000010398.B #17	ENSGT00940000156991 #20	ENSGT01030000236496	ENSGT00940000155860.d	ENSGT00950000183167.a.b.b.a	ENSGT00940000155355	ENSGT00940000159772	ENSGT00940000156808	ENSGT00940000154715.b.k.a	ENSGT00940000158936 #28	ENSGT00730000111133 #27	ENSGT00940000164321 #26	ENSGT00940000155477 #25	ENSGT00390000010474 #24	ENSGT00940000163919 #22	ENSGT00940000159932	ENSGT01070000253744.b.a.a.a	ENSGT00940000158663	ENSGT00950000183082.b.a	ENSGT00940000164214	ENSGT00940000159649	ENSGT00390000002288	ENSGT00940000158941	ENSGT00390000004928	ENSGT00390000014666.a	ENSGT00390000014618.b	ENSGT00940000161817	ENSGT00950000182815.a.a.b	ENSGT00940000158107	ENSGT00940000159152.d
Emydidae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000158064 #16	ENSGT00390000010398.B #17	ENSGT00940000156991 #20	ENSGT01030000236496	ENSGT00940000155860.d	ENSGT00950000183167.a.b.b.a	ENSGT00940000155355	ENSGT00940000159772	ENSGT00940000156808	ENSGT00940000154715.b.k.a	ENSGT00940000158936 #28	ENSGT00730000111133 #27	ENSGT00940000164321 #26	ENSGT00940000155477 #25	ENSGT00390000010474 #24	ENSGT00940000163919 #22	ENSGT00940000159932	ENSGT01070000253744.b.a.a.a	ENSGT00940000158663	ENSGT00950000183082.b.a	ENSGT00940000164214	ENSGT00940000159649	ENSGT00390000002288	ENSGT00940000158941	ENSGT00390000004928	ENSGT00390000014666.a	ENSGT00390000014618.b	ENSGT00940000161817	ENSGT00950000182815.a.a.b	ENSGT00940000158107	ENSGT00940000159152.d
Three-toed box turtle	MODERN SPECIES	20	HTRA4 (ENSTMTG00000001775) ##15	PLEKHA2 (ENSTMTG00000001768) #16	TACC1 (ENSTMTG00000001745) #20	ENSTMTG00000001738	FGFR1 (ENSTMTG00000001727)	ENSTMTG00000001719	NSD3 (ENSTMTG00000001698)	PLPP5 (ENSTMTG00000001690)	DDHD2 (ENSTMTG00000001671)	ENSTMTG00000001660	BAG4 (ENSTMTG00000001649) #28	LSM1 (ENSTMTG00000001636) #27	ENSTMTG00000001607 #26	STAR (ENSTMTG00000001599) #25	ASH2L (ENSTMTG00000001526) #24	ENSTMTG00000001510 #22	EIF4EBP1 (ENSTMTG00000001506)	ENSTMTG00000001481	ADRB3 (ENSTMTG00000001465)	GOT1L1 (ENSTMTG00000001448)	ENSTMTG00000001435	RAB11FIP1 (ENSTMTG00000001426)	BRF2 (ENSTMTG00000001419)	ADGRA2 (ENSTMTG00000001353)	PLPBP (ENSTMTG00000001314)	ERLIN2 (ENSTMTG00000001303)	ZNF703 (ENSTMTG00000001295)	KCNU1 (ENSTMTG00000001247)	UNC5D (ENSTMTG00000001187)	DUSP26 (ENSTMTG00000001154)	RNF122 (ENSTMTG00000001140)
painted turtle	MODERN SPECIES	7	ENSCPBG00000006745	ENSCPBG00000006739	ENSCPBG00000006735	MARCHF6 (ENSCPBG00000006716)	FGFR1 (ENSCPBG00000006675)	LETM2 (ENSCPBG00000006662)	NSD3 (ENSCPBG00000006622)	PLPP5 (ENSCPBG00000006595)	DDHD2 (ENSCPBG00000006582)	ENSCPBG00000006578	BAG4 (ENSCPBG00000006574) #28	LSM1 (ENSCPBG00000006569) #27	ENSCPBG00000006554 #26	STAR (ENSCPBG00000006539) #25	ASH2L (ENSCPBG00000005867) #24	ENSCPBG00000005783 #22	EIF4EBP1 (ENSCPBG00000005778)	ENSCPBG00000005775	ADRB3 (ENSCPBG00000005773)	GOT1L1 (ENSCPBG00000005759)	ENSCPBG00000005747	RAB11FIP1 (ENSCPBG00000005742)	BRF2 (ENSCPBG00000005736)	ADGRA2 (ENSCPBG00000005726)	PLPBP (ENSCPBG00000005714)	ERLIN2 (ENSCPBG00000005704)	ZNF703 (ENSCPBG00000005696)	KCNU1 (ENSCPBG00000005671)	ENSCPBG00000005652	UNC5D (ENSCPBG00000005616)	SLC4A5 (ENSCPBG00000005547)
Testudinidae	ANCESTRAL SPECIES	31	ENSGT00940000160760.b ##15	ENSGT00940000158064 #16	ENSGT00940000156991 #20	ENSGT01030000236496	ENSGT00940000155860.d	ENSGT00950000183167.a.b.b.a	ENSGT00940000155355	ENSGT00940000159772	ENSGT00940000156808	ENSGT00940000154715.b.k.a	ENSGT00940000158936 #28	ENSGT00730000111133 #27	ENSGT00940000164321 #26	ENSGT00940000155477 #25	ENSGT00390000010474 #24	ENSGT00940000163919 #22	ENSGT00940000159932	ENSGT01070000253744.b.a.a.a	ENSGT00940000158663	ENSGT00950000183082.b.a	ENSGT00940000164214	ENSGT00940000159649	ENSGT00390000002288	ENSGT00940000158941	ENSGT00390000004928	ENSGT00390000014666.a	ENSGT00390000014618.b	ENSGT00940000161817	ENSGT00950000182815.a.a.b	ENSGT00940000158107	ENSGT00940000159152.d
Goode s thornscrub tortoise	MODERN SPECIES	11	ENSGEVG00005001521 ##15	ENSGEVG00005001478 #16	ENSGEVG00005001446 #20	ENSGEVG00005001421	FGFR1 (ENSGEVG00005001397)	LETM2 (ENSGEVG00005001375)	NSD3 (ENSGEVG00005001323)	PLPP5 (ENSGEVG00005001286)	DDHD2 (ENSGEVG00005001239)	ENSGEVG00005001215	BAG4 (ENSGEVG00005001203) #28	LSM1 (ENSGEVG00005001190) #27	ENSGEVG00005001166 #26	STAR (ENSGEVG00005001143) #25	ASH2L (ENSGEVG00005001087) #24	ENSGEVG00005001070 #22	ENSGEVG00005001050	ENSGEVG00005001036	ENSGEVG00005001018	ADRB3 (ENSGEVG00005001001)	GOT1L1 (ENSGEVG00005000956)	ENSGEVG00005000924	RAB11FIP1 (ENSGEVG00005000899)	BRF2 (ENSGEVG00005000872)	ENSGEVG00005000859	PLPBP (ENSGEVG00005000833)	ERLIN2 (ENSGEVG00005000806)	ZNF703 (ENSGEVG00005000791)	KCNU1 (ENSGEVG00005000762)	UNC5D (ENSGEVG00005000704)	DUSP26 (ENSGEVG00005000631)
Abingdon island giant tortoise	DUPLICATION
Abingdon island giant tortoise	MODERN SPECIES	892									PCBD1 (ENSCABG00000015949)	SGPL1 (ENSCABG00000015947)	TBATA (ENSCABG00000015945)	ENSCABG00000015940	ENSCABG00000015935	ADAMTS14 (ENSCABG00000015901)	PALD1 (ENSCABG00000015893)	ENSCABG00000015892 #22	EIF4EBP2 (ENSCABG00000015891)	LRRC20 (ENSCABG00000015889)	ENSCABG00000015888
Abingdon island giant tortoise	MODERN SPECIES	371	TM2D2 (ENSCABG00000014202) #14	HTRA4 (ENSCABG00000014203) ##15	PLEKHA2 (ENSCABG00000014205) #16	TACC1 (ENSCABG00000014230) #20	FGFR1 (ENSCABG00000014235)	ENSCABG00000014260	LETM2 (ENSCABG00000014264)	NSD3 (ENSCABG00000014276)	DDHD2 (ENSCABG00000014674)	PLPP5 (ENSCABG00000014678)	BAG4 (ENSCABG00000014681) #28	LSM1 (ENSCABG00000014684) #27	ENSCABG00000014685 #26	STAR (ENSCABG00000014687) #25	ASH2L (ENSCABG00000014696) #24	ENSCABG00000015351 #22	ENSCABG00000015352	ENSCABG00000015356
Lepidosauria	ANCESTRAL SPECIES	59	ENSGT00940000158064 #16	ENSGT00940000156991 #20	ENSGT00940000155860.d	ENSGT00940000155860.c.a	ENSGT00950000183167.a.b.b.a	ENSGT00650000094724	ENSGT00940000155355	ENSGT00940000159772	ENSGT00940000156808	ENSGT00980000199378	ENSGT00940000158936 #28	ENSGT00730000111133 #27	ENSGT00940000164321 #26	ENSGT00940000155477 #25	ENSGT00390000010474 #24	ENSGT00940000163919 #22	ENSGT00940000159932	ENSGT01070000253744.b.a.a.a	ENSGT00940000158663	ENSGT00950000183082.b.a	ENSGT00940000164214	ENSGT00940000159649	ENSGT00390000002288	ENSGT00940000158941	ENSGT00390000004928	ENSGT00390000014666.a	ENSGT00390000014618.b	ENSGT00940000161817	ENSGT00950000182815.a.a.b	ENSGT00940000158107	ENSGT00940000159152.d
Episquamata	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00390000013415.a.b	ENSGT01030000234527.A.a.b.a.a	ENSGT00940000159105	ENSGT00940000154909	ENSGT00510000049083.a.b	ENSGT00510000049083.a.a	ENSGT00950000185671	ENSGT00940000159772	ENSGT00940000156808	ENSGT00980000199378	ENSGT00940000158936 #28	ENSGT00730000111133 #27	ENSGT00940000164321 #26	ENSGT00940000155477 #25	ENSGT00390000010474 #24	ENSGT00940000163919 #22	ENSGT00940000159932	ENSGT01070000253744.b.a.a.a	ENSGT00940000158663	ENSGT00950000183082.b.a	ENSGT00940000164214	ENSGT00940000159649	ENSGT00390000002288	ENSGT00940000158941	ENSGT00390000004928	ENSGT00390000014666.a	ENSGT00390000014618.b	ENSGT00940000161817	ENSGT00950000182815.a.a.b	ENSGT00940000158107	ENSGT00940000159152.d
Laterata	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00390000013415.a.b	ENSGT01030000234527.A.a.b.a.a	ENSGT00940000159105	ENSGT00940000154909	ENSGT00510000049083.a.b	ENSGT00510000049083.a.a	ENSGT00950000185671	ENSGT00940000159772	ENSGT00940000156808	ENSGT00980000199378	ENSGT00940000158936 #28	ENSGT00730000111133 #27	ENSGT00940000164321 #26	ENSGT00940000155477 #25	ENSGT00390000010474 #24	ENSGT00940000163919 #22	ENSGT00940000159932	ENSGT01070000253744.b.a.a.a	ENSGT00940000158663	ENSGT00950000183082.b.a	ENSGT00940000164214	ENSGT00940000159649	ENSGT00390000002288	ENSGT00940000158941	ENSGT00390000004928	ENSGT00390000014666.a	ENSGT00390000014618.b	ENSGT00940000161817	ENSGT00950000182815.a.a.b	ENSGT00940000158107	ENSGT00940000159152.d
Common wall lizard	MODERN SPECIES	6	ENSPMRG00000014295	ENSPMRG00000014289	LRRTM4 (ENSPMRG00000014281)	ENSPMRG00000014272	ENSPMRG00000014267	ENSPMRG00000014229	ENSPMRG00000014224	PLPP5 (ENSPMRG00000014218)	DDHD2 (ENSPMRG00000014189)	ENSPMRG00000014176	BAG4 (ENSPMRG00000014172) #28	LSM1 (ENSPMRG00000014167) #27	ENSPMRG00000014143 #26	STAR (ENSPMRG00000014126) #25	ASH2L (ENSPMRG00000014115) #24	ENSPMRG00000014105 #22	EIF4EBP1 (ENSPMRG00000018654)	ENSPMRG00000018641	ADRB3 (ENSPMRG00000018633)	GOT1L1 (ENSPMRG00000018613)	ENSPMRG00000018598	ENSPMRG00000018592	ENSPMRG00000018590	ENSPMRG00000018583	ENSPMRG00000018572	ENSPMRG00000018564	RAB11FIP1 (ENSPMRG00000018553)	ENSPMRG00000018543	ENSPMRG00000018538	ENSPMRG00000018533	LZTS1 (ENSPMRG00000018526)
Argentine black and white tegu	MODERN SPECIES	42	CENATAC (ENSSMRG00000021723)	ENSSMRG00000021724	BCL9L (ENSSMRG00000021725)	CXCR5 (ENSSMRG00000021726)	DDX6 (ENSSMRG00000021727)	ENSSMRG00000021728	ENSSMRG00000021729	ENSSMRG00000021730	PLPP5 (ENSSMRG00000021747)	DDHD2 (ENSSMRG00000021748)	BAG4 (ENSSMRG00000021751) #28	LSM1 (ENSSMRG00000021753) #27	ENSSMRG00000021754 #26	STAR (ENSSMRG00000021757) #25	ASH2L (ENSSMRG00000021759) #24	ENSSMRG00000021760 #22	EIF4EBP1 (ENSSMRG00000021761)	ENSSMRG00000021763	ADRB3 (ENSSMRG00000021797)	GOT1L1 (ENSSMRG00000021799)	MYL7 (ENSSMRG00000021804)	GCK (ENSSMRG00000021806)	YKT6 (ENSSMRG00000021811)	CAMK2B (ENSSMRG00000021813)	NUDCD3 (ENSSMRG00000021815)	PGAM2 (ENSSMRG00000021816)	ENSSMRG00000021817	ZMIZ2 (ENSSMRG00000021818)	OGDH (ENSSMRG00000021819)	ENSSMRG00000021820	ENSSMRG00000021821
Toxicofera	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00950000182864.a.b.a	ENSGT00390000013415.a.b	ENSGT01030000234527.A.a.b.a.a	ENSGT00940000159105	ENSGT00940000154909	ENSGT00510000049083.a.b	ENSGT00510000049083.a.a	ENSGT00950000185671	ENSGT00940000159772	ENSGT00940000156808	ENSGT00940000158936 #28	ENSGT00730000111133 #27	ENSGT00940000164321 #26	ENSGT00940000155477 #25	ENSGT00390000010474 #24	ENSGT00940000163919 #22	ENSGT00940000159932	ENSGT01070000253744.b.a.a.a	ENSGT00940000158663	ENSGT00950000183082.b.a	ENSGT00940000164214	ENSGT00940000159649	ENSGT00390000002288	ENSGT00940000158941	ENSGT00390000004928	ENSGT00390000014666.a	ENSGT00390000014618.b	ENSGT00940000161817	ENSGT00950000182815.a.a.b	ENSGT00940000158107	ENSGT00940000159152.d
Elapidae	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00390000013415.a.b	ENSGT01030000234527.A.a.b.a.a	ENSGT00940000159105	ENSGT00940000154909	ENSGT01090000262429	ENSGT00510000049083.a.b	ENSGT00510000049083.a.a	ENSGT00950000185671	ENSGT00940000159772	ENSGT00940000156808	ENSGT00940000158936 #28	ENSGT00730000111133 #27	ENSGT00940000164321 #26	ENSGT00940000155477 #25	ENSGT00390000010474 #24	ENSGT00940000163919 #22	ENSGT00940000159932	ENSGT00940000158663	ENSGT00950000183082.b.a	ENSGT00940000164214	ENSGT00940000159649	ENSGT00390000002288	ENSGT00940000158941	ENSGT00390000004928.b	ENSGT00390000014666.a	ENSGT00390000014618.b	ENSGT00940000161817	ENSGT00950000182815.a.a.b.c	ENSGT00940000158107	ENSGT00940000159152.d	ENSGT00390000003878
Elapidae_a	ANCESTRAL SPECIES	42	ENSGT00390000013415.a.b	ENSGT01030000234527.A.a.b.a.a	ENSGT00940000159105	ENSGT00940000154909	ENSGT01090000262429	ENSGT00510000049083.a.b	ENSGT00510000049083.a.a	ENSGT00950000185671	ENSGT00940000159772	ENSGT00940000156808	ENSGT00940000158936 #28	ENSGT00730000111133 #27	ENSGT00940000164321 #26	ENSGT00940000155477 #25	ENSGT00390000010474 #24	ENSGT00940000163919 #22	ENSGT00940000159932	ENSGT00940000158663	ENSGT00950000183082.b.a	ENSGT00940000164214	ENSGT00940000159649	ENSGT00390000002288	ENSGT00940000158941	ENSGT00390000004928.b	ENSGT00390000014666.a	ENSGT00390000014618.b	ENSGT00940000161817	ENSGT00950000182815.a.a.b.c	ENSGT00940000158107	ENSGT00940000159152.d	ENSGT00390000003878
Acanthophiinae	ANCESTRAL SPECIES	54	ENSGT01030000234527.A.a.b.a.a	ENSGT00940000159105	ENSGT00940000154909	ENSGT01090000262429	ENSGT00510000049083.a.b	ENSGT00510000049083.a.a	ENSGT00950000185671	ENSGT00940000159772.b	ENSGT00940000159772.a	ENSGT00940000156808	ENSGT00940000158936 #28	ENSGT00730000111133 #27	ENSGT00940000164321 #26	ENSGT00940000155477 #25	ENSGT00390000010474 #24	ENSGT00940000163919 #22	ENSGT00940000159932	ENSGT00940000158663	ENSGT00950000183082.b.a	ENSGT00940000164214	ENSGT00940000159649	ENSGT00390000002288	ENSGT00940000158941	ENSGT00390000004928.b	ENSGT00390000014666.a	ENSGT00390000014618.b	ENSGT00940000161817	ENSGT00950000182815.a.a.b.c	ENSGT00940000158107	ENSGT00940000159152.d	ENSGT00390000003878
Mainland tiger snake	MODERN SPECIES	37	DPYSL2 (ENSNSUG00000000209)	ADRA1A (ENSNSUG00000000362)	LRRTM4 (ENSNSUG00000000364)	ENSNSUG00000000366	ENSNSUG00000000367	ENSNSUG00000000368	ENSNSUG00000000370	ENSNSUG00000000376	DDHD2 (ENSNSUG00000000387)	BAG4 (ENSNSUG00000000839) #28	LSM1 (ENSNSUG00000000840) #27	ENSNSUG00000000843 #26	ENSNSUG00000000852	STAR (ENSNSUG00000000853) #25	ASH2L (ENSNSUG00000000871) #24	ENSNSUG00000001230 #22	EIF4EBP1 (ENSNSUG00000001233)	ADRB3 (ENSNSUG00000001234)	GOT1L1 (ENSNSUG00000001236)	ENSNSUG00000001252	ENSNSUG00000001256	BRF2 (ENSNSUG00000001267)	ADGRA2 (ENSNSUG00000001272)	PLPBP (ENSNSUG00000002082)	ERLIN2 (ENSNSUG00000002103)	ZNF703 (ENSNSUG00000002212)	ENSNSUG00000002230	KCNU1 (ENSNSUG00000002231)	UNC5D (ENSNSUG00000002236)	DUSP26 (ENSNSUG00000002247)	RNF122 (ENSNSUG00000002252)
Eastern brown snake	MODERN SPECIES	92					ENSPTXG00000014634	ENSPTXG00000014635	ENSPTXG00000014636	ENSPTXG00000014637	PLPP5 (ENSPTXG00000014638)	DDHD2 (ENSPTXG00000014639)	BAG4 (ENSPTXG00000014641) #28	LSM1 (ENSPTXG00000014642) #27	ENSPTXG00000014643 #26	STAR (ENSPTXG00000014644) #25	ASH2L (ENSPTXG00000014645) #24	ENSPTXG00000014646 #22	EIF4EBP1 (ENSPTXG00000014647)	ENSPTXG00000014648	GOT1L1 (ENSPTXG00000014649)	ENSPTXG00000014650	RAB11FIP1 (ENSPTXG00000014651)	BRF2 (ENSPTXG00000014652)	ADGRA2 (ENSPTXG00000014653)	PLPBP (ENSPTXG00000014658)	ERLIN2 (ENSPTXG00000014660)	ZNF703 (ENSPTXG00000014662)	KCNU1 (ENSPTXG00000014664)	UNC5D (ENSPTXG00000014670)
Blue-lipped sea krait	MODERN SPECIES	6895														STAR (ENSLLTG00000015629) #25	ASH2L (ENSLLTG00000015685) #24	ENSLLTG00000015704 #22
Indian cobra	MODERN SPECIES	7	BNIP3L (ENSNNAG00000003562)	DPYSL2 (ENSNNAG00000003606)	ADRA1A (ENSNNAG00000003650)	LRRTM4 (ENSNNAG00000003671)	ENSNNAG00000003681	ENSNNAG00000003697	ENSNNAG00000003717	PLPP5 (ENSNNAG00000003729)	DDHD2 (ENSNNAG00000003793)	ENSNNAG00000003865 #28	LSM1 (ENSNNAG00000003883) #27	ENSNNAG00000003917 #26	ENSNNAG00000003952	STAR (ENSNNAG00000003969) #25	ASH2L (ENSNNAG00000003990) #24	ENSNNAG00000004040 #22	EIF4EBP1 (ENSNNAG00000004069)	ADRB3 (ENSNNAG00000004083)	GOT1L1 (ENSNNAG00000004109)	ENSNNAG00000004140	RAB11FIP1 (ENSNNAG00000004160)	BRF2 (ENSNNAG00000004177)	ADGRA2 (ENSNNAG00000004212)	PLPBP (ENSNNAG00000004333)	ERLIN2 (ENSNNAG00000004403)	ZNF703 (ENSNNAG00000004463)	ENSNNAG00000004476	ENSNNAG00000004492	ENSNNAG00000004515	ENSNNAG00000004533	ENSNNAG00000004553
tuatara	DUPLICATION
tuatara	MODERN SPECIES	1437														ADAMTS14 (ENSSPUG00000016355)	PALD1 (ENSSPUG00000016322)	ENSSPUG00000016315 #22	EIF4EBP2 (ENSSPUG00000016308)	LRRC20 (ENSSPUG00000016299)
tuatara	MODERN SPECIES	93								ENSSPUG00000014993	ENSSPUG00000014985	ENSSPUG00000014978	BAG4 (ENSSPUG00000014898) #28	LSM1 (ENSSPUG00000014878) #27	ENSSPUG00000014854 #26	STAR (ENSSPUG00000014838) #25	ASH2L (ENSSPUG00000014780) #24	ENSSPUG00000014752 #22	ENSSPUG00000014733
Coelacanth	DUPLICATION
Coelacanth	MODERN SPECIES	319						ENSLACG00000002796	ENSLACG00000009965	ENSLACG00000010526	PCBD1 (ENSLACG00000012079)	SGPL1 (ENSLACG00000012214)	TBATA (ENSLACG00000012888)	ENSLACG00000013094	ENSLACG00000013578 #25	ADAMTS14 (ENSLACG00000013709)	PALD1 (ENSLACG00000015544)	ENSLACG00000016072 #22	EIF4EBP2 (ENSLACG00000016130)	LRRC20 (ENSLACG00000016214)	NPFFR1 (ENSLACG00000016889)	PPA1 (ENSLACG00000016923)	ENSLACG00000017029	TYSND1 (ENSLACG00000017086)	SPOCK2 (ENSLACG00000017152)	ENSLACG00000017358	ASCC1 (ENSLACG00000017431)	ANAPC16 (ENSLACG00000017482)	DDIT4 (ENSLACG00000017521)	DNAJB12 (ENSLACG00000017545)	MICU1 (ENSLACG00000017640)
Coelacanth	MODERN SPECIES	827			FGFR1 (ENSLACG00000013549)	ENSLACG00000013472	ENSLACG00000013446	LETM2 (ENSLACG00000013014)	NSD3 (ENSLACG00000012332)	PLPP5 (ENSLACG00000012160)	DDHD2 (ENSLACG00000011836)	ENSLACG00000011318	BAG4 (ENSLACG00000011098) #28	LSM1 (ENSLACG00000010947) #27	grk5 (ENSLACG00000009832) #26	STAR (ENSLACG00000009236) #25	ASH2L (ENSLACG00000008614) #24	spaw (ENSLACG00000008347) #22	EIF4EBP1 (ENSLACG00000007967)	ENSLACG00000006092	ADRB3 (ENSLACG00000002602)
Actinopterygii	ANCESTRAL SPECIES	722																ENSGT00940000163919 #22	ENSGT00940000159932	ENSGT01070000253744.b.a.a.a
Neopterygii	ANCESTRAL SPECIES	570																ENSGT00940000163919 #22	ENSGT00940000159932	ENSGT01070000253744.b.a.a.a
Osteoglossocephalai	DUPLICATION
Osteoglossocephalai	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000157897	ENSGT00940000160182	ENSGT00940000163293.c.a	ENSGT00940000157648	ENSGT00940000163293.c.b	ENSGT00940000155449	ENSGT00940000155149	ENSGT00390000012759	ENSGT00500000044984	ENSGT00940000153849.a.b	ENSGT00940000153849.a.a.a	ENSGT00390000009670	ENSGT00940000164825	ENSGT01050000244898.b.a	ENSGT00940000159627	ENSGT00940000163919.a #22	ENSGT00940000159932.a	ENSGT00940000168975	ENSGT00940000155760.t.a	ENSGT00950000182859.A.a.a.b	ENSGT00940000156009.A.c	ENSGT00940000164890.b	ENSGT00390000007992	ENSGT00390000001901	ENSGT00950000183185.c.a.a	ENSGT00940000156855.c	ENSGT00940000177369	ENSGT00940000154284.b	ENSGT00940000161655	ENSGT00940000154495.b.b.a	ENSGT00530000063869.B
Clupeocephala	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000155122.a	ENSGT00390000011475	ENSGT00940000173464	ENSGT00730000111142	ENSGT00390000007883	ENSGT00940000153594.c.e.a	ENSGT00940000157897.b	ENSGT00940000160182	ENSGT00940000163293.c.a	ENSGT00390000012759	ENSGT00940000153849.a.a.a	ENSGT00390000009670	ENSGT00940000164825	ENSGT01050000244898.b.a	ENSGT00940000159627	ENSGT00940000163919.a #22	ENSGT00940000159932.a	ENSGT00940000168975	ENSGT00940000155760.t.a	ENSGT00950000182859.A.a.a.b	ENSGT00940000156009.A.c	ENSGT00940000164890.b	ENSGT00390000007992	ENSGT00390000001901	ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.b	ENSGT00940000156855.c	ENSGT00940000177369	ENSGT00940000154284.b	ENSGT00940000161655	ENSGT00940000154495.b.b.a	ENSGT00530000063869.B
Euteleosteomorpha	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00610000087456	ENSGT00940000165952	ENSGT00570000079101.b	ENSGT00950000182881.a.b.a.a.a	ENSGT00940000154642.d	ENSGT00940000161716	ENSGT00390000013711	ENSGT00940000154191.k.a	ENSGT00940000154849.b	ENSGT00940000155991	ENSGT00940000165465	ENSGT00940000157987	ENSGT00390000005772	ENSGT00530000063370.b	ENSGT00940000159627	ENSGT00940000163919.a #22	ENSGT00940000159932.a	ENSGT00940000168975	ENSGT00940000155760.t.a	ENSGT00950000182859.A.a.a.b	ENSGT00940000156009.A.c	ENSGT00940000164890.b	ENSGT00390000007992	ENSGT00390000001901	ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.b	ENSGT00940000156855.c	ENSGT00940000177369	ENSGT00940000154284.b	ENSGT00940000161655	ENSGT00940000154495.b.b.a	ENSGT00530000063869.B
Acanthomorphata	ANCESTRAL SPECIES	48	ENSGT00940000165952	ENSGT00570000079101.b	ENSGT00950000182881.a.b.a.a.a	ENSGT00940000154642.d	ENSGT00940000161542	ENSGT00390000013711	ENSGT00940000168755	ENSGT00940000154191.k.a	ENSGT00940000154849.b	ENSGT00940000155991	ENSGT00940000165465	ENSGT00940000157987	ENSGT00390000005772	ENSGT00530000063370.b	ENSGT00940000159627	ENSGT00940000163919.a #22	ENSGT00940000159932.a	ENSGT00940000168975	ENSGT00940000155760.t.a	ENSGT00950000182859.A.a.a.b	ENSGT00940000156009.A.c	ENSGT00940000164890.b	ENSGT00390000007992	ENSGT00390000001901	ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.b	ENSGT00940000156855.c	ENSGT00940000177369	ENSGT00940000154284.b	ENSGT00940000161655	ENSGT00940000154495.b.b.a	ENSGT00530000063869.B
Euacanthomorphacea	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00610000087456	ENSGT00940000165952	ENSGT00570000079101.b	ENSGT00950000182881.a.b.a.a.a	ENSGT00940000154642.d	ENSGT00940000161716	ENSGT00390000013711	ENSGT00940000154191.k.a	ENSGT00940000154849.b	ENSGT00940000155991	ENSGT00940000165465	ENSGT00940000157987	ENSGT00390000005772	ENSGT00530000063370.b	ENSGT00940000159627	ENSGT00940000163919.a #22	ENSGT00940000159932.a	ENSGT00940000168975	ENSGT00940000155760.t.a	ENSGT00950000182859.A.a.a.b	ENSGT00940000156009.A.c	ENSGT00940000164890.b	ENSGT00390000007992	ENSGT00390000001901	ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.b	ENSGT00940000156855.c	ENSGT00940000177369	ENSGT00940000154284.b	ENSGT00940000161655	ENSGT00940000154495.b.b.a	ENSGT00530000063869.B
Percomorphaceae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00610000087456	ENSGT00940000165952	ENSGT00570000079101.b	ENSGT00950000182881.a.b.a.a.a	ENSGT00940000154642.d	ENSGT00940000161716	ENSGT00390000013711	ENSGT00940000154191.k.a	ENSGT00940000154849.b	ENSGT00940000155991	ENSGT00940000165465	ENSGT00940000157987	ENSGT00390000005772	ENSGT00530000063370.b	ENSGT00940000159627	ENSGT00940000163919.a #22	ENSGT00940000159932.a	ENSGT00940000168975	ENSGT00940000155760.t.a	ENSGT00950000182859.A.a.a.b	ENSGT00940000156009.A.c	ENSGT00940000164890.b	ENSGT00390000007992	ENSGT00390000001901	ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.b	ENSGT00940000156855.c	ENSGT00940000177369	ENSGT00940000154284.b	ENSGT00940000161655	ENSGT00940000154495.b.a.a.a	ENSGT00530000063869.B
Percomorphaceae_B	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00610000087456	ENSGT00940000165952	ENSGT00570000079101.b	ENSGT00950000182881.a.b.a.a.a	ENSGT00940000154642.d	ENSGT00940000161716	ENSGT00390000013711	ENSGT00940000154191.k.a	ENSGT00940000154849.b	ENSGT00940000155991	ENSGT00940000165465	ENSGT00940000157987	ENSGT00390000005772	ENSGT00530000063370.b	ENSGT00940000159627	ENSGT00940000163919.a #22	ENSGT00940000159932.a	ENSGT00940000168975	ENSGT00940000155760.t.a	ENSGT00950000182859.A.a.a.b	ENSGT00940000156009.A.c	ENSGT00940000164890.b	ENSGT00390000007992	ENSGT00390000001901	ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.b	ENSGT00940000156855.c	ENSGT00940000177369	ENSGT00940000154284.b	ENSGT00940000161655	ENSGT00940000154495.b.a.a.a	ENSGT00530000063869.B
Percomorphaceae_C	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00610000087456	ENSGT00940000165952	ENSGT00570000079101.b	ENSGT00950000182881.a.b.a.a.a	ENSGT00940000154642.d	ENSGT00940000161716	ENSGT00390000013711	ENSGT00940000154191.k.a	ENSGT00940000154849.b	ENSGT00940000155991	ENSGT00940000165465	ENSGT00940000157987	ENSGT00390000005772	ENSGT00530000063370.b	ENSGT00940000159627	ENSGT00940000163919.a #22	ENSGT00940000159932.a	ENSGT00940000168975	ENSGT00940000155760.t.a	ENSGT00950000182859.A.a.a.b	ENSGT00940000156009.A.c	ENSGT00940000164890.b	ENSGT00390000007992	ENSGT00390000001901	ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.b	ENSGT00940000156855.c	ENSGT00940000177369	ENSGT00940000154284.b	ENSGT00940000161655	ENSGT00940000154495.b.b.a	ENSGT00530000063869.B
Eupercaria	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00610000087456	ENSGT00940000165952	ENSGT00570000079101.b	ENSGT00950000182881.a.b.a.a.a	ENSGT00940000154642.d	ENSGT00940000161716	ENSGT00390000013711	ENSGT00940000154191.k.a	ENSGT00940000154849.b	ENSGT00940000155991	ENSGT00940000165465	ENSGT00940000157987	ENSGT00390000005772	ENSGT00530000063370.b	ENSGT00940000159627	ENSGT00940000163919.a #22	ENSGT00940000159932.a	ENSGT00940000155760.t.a	ENSGT00950000182859.A.a.a.b	ENSGT00940000156009.A.c	ENSGT00940000164890.b	ENSGT00390000007992	ENSGT00390000001901	ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.b	ENSGT00940000156855.c	ENSGT00940000154284.b	ENSGT00940000161655	ENSGT00940000154495.b.b.a	ENSGT00530000063869.B	ENSGT01050000244898.b.a	ENSGT00940000164825
Tetraodontidae	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00390000017774	ENSGT00940000165952	ENSGT00570000079101.b	ENSGT00950000182881.a.b.a.a.a	ENSGT00940000154642.d	ENSGT00940000161716	ENSGT00390000013711	ENSGT00940000154191.k.a	ENSGT00940000154849.b	ENSGT00940000155991	ENSGT00940000165465	ENSGT00940000157987	ENSGT00390000005772	ENSGT00530000063370.b	ENSGT00940000159627	ENSGT00940000163919.a #22	ENSGT00940000159932.a	ENSGT00940000155760.t.a	ENSGT00950000182859.A.a.a.b	ENSGT00940000156009.A.c	ENSGT00940000164890.b	ENSGT00390000007992	ENSGT00390000001901	ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.b	ENSGT00940000156855.c	ENSGT00940000154284.b	ENSGT00940000154495.b.b.a	ENSGT00530000063869.B	ENSGT01050000244898.b.a	ENSGT00940000164825	ENSGT00390000009670
Fugu	MODERN SPECIES	13	pik3ip1 (ENSTRUG00000013696)	ENSTRUG00000021878	ENSTRUG00000023523	atp6v0a2b (ENSTRUG00000013490)	ENSTRUG00000032865	rhbdd3 (ENSTRUG00000020217)	ewsr1b (ENSTRUG00000021926)	ENSTRUG00000013171	ap1b1 (ENSTRUG00000013017)	ENSTRUG00000024711	rasl10a (ENSTRUG00000029269)	osbp2b (ENSTRUG00000012868)	ccdc117 (ENSTRUG00000019657)	tcn2 (ENSTRUG00000012642)	dguok (ENSTRUG00000012499)	spaw (ENSTRUG00000012437) #22	ENSTRUG00000024442	ANK1 (ENSTRUG00000011938)	ebf2 (ENSTRUG00000011528)	ENSTRUG00000011376	sftpbb (ENSTRUG00000023363)	usp39 (ENSTRUG00000011317)	si:ch211-283h6.4 (ENSTRUG00000011291)	mat2ab (ENSTRUG00000021803)	INPP5J (ENSTRUG00000011059)	selenom (ENSTRUG00000011053)	ENSTRUG00000010473	trafd1 (ENSTRUG00000021902)	mob1a (ENSTRUG00000010297)	mthfd2 (ENSTRUG00000010166)	arl6ip4 (ENSTRUG00000010106)
Tetraodon	MODERN SPECIES	3	limk2 (ENSTNIG00000015862)	pik3ip1 (ENSTNIG00000015861)	ENSTNIG00000015860	TCTN2 (ENSTNIG00000015859)	atp6v0a2b (ENSTNIG00000015858)	DNAH10 (ENSTNIG00000015857)	ENSTNIG00000015856	ENSTNIG00000015855	ewsr1b (ENSTNIG00000015854)	GAS2L1 (ENSTNIG00000015853)	ap1b1 (ENSTNIG00000015852)	rasl10a (ENSTNIG00000015851)	osbp2b (ENSTNIG00000015850)	tcn2 (ENSTNIG00000015849)	dguok (ENSTNIG00000015848)	spaw (ENSTNIG00000015847) #22	ANK1 (ENSTNIG00000015846)	ebf2 (ENSTNIG00000015845)	ENSTNIG00000015844	ENSTNIG00000015843	usp39 (ENSTNIG00000015842)	si:ch211-283h6.4 (ENSTNIG00000015841)	mat2ab (ENSTNIG00000015840)	INPP5J (ENSTNIG00000015839)	selenom (ENSTNIG00000015838)	ENSTNIG00000015837	mob1a (ENSTNIG00000015836)	mthfd2 (ENSTNIG00000015835)	arl6ip4 (ENSTNIG00000015834)	PITPNM2 (ENSTNIG00000015833)	mtrfr (ENSTNIG00000015832)
Eupecaria_A	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00610000087456	ENSGT00940000165952	ENSGT00570000079101.b	ENSGT00950000182881.a.b.a.a.a	ENSGT00940000154642.d	ENSGT00940000161716	ENSGT00390000013711	ENSGT00940000154191.k.a	ENSGT00940000154849.b	ENSGT00940000155991	ENSGT00940000165465	ENSGT00940000157987	ENSGT00390000005772	ENSGT00530000063370.b	ENSGT00940000159627	ENSGT00940000163919.a #22	ENSGT00940000159932.a	ENSGT00940000155760.t.a	ENSGT00950000182859.A.a.a.b	ENSGT00940000156009.A.c	ENSGT00940000164890.b	ENSGT00390000007992	ENSGT00390000001901	ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.b	ENSGT00940000156855.c	ENSGT00940000154284.b	ENSGT00940000161655	ENSGT00530000063869.B	ENSGT01050000244898.b.a	ENSGT00940000164825	ENSGT00390000009670
Eupecaria_B	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00610000087456	ENSGT00940000165952	ENSGT00570000079101.b	ENSGT00950000182881.a.b.a.a.a	ENSGT00940000154642.d	ENSGT00940000161716	ENSGT00390000013711	ENSGT00940000154191.k.a	ENSGT00940000154849.b	ENSGT00940000155991	ENSGT00940000165465	ENSGT00940000157987	ENSGT00390000005772	ENSGT00530000063370.b	ENSGT00940000159627	ENSGT00940000163919.a #22	ENSGT00940000159932.a	ENSGT00940000155760.t.a	ENSGT00950000182859.A.a.a.b	ENSGT00940000156009.A.c	ENSGT00940000164890.b	ENSGT00390000007992	ENSGT00390000001901	ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.b	ENSGT00940000156855.c	ENSGT00940000154284.b	ENSGT00940000161655	ENSGT00530000063869.B	ENSGT01050000244898.b.a	ENSGT00940000164825	ENSGT00390000009670
Perciformes	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00610000087456	ENSGT00940000165952	ENSGT00570000079101.b	ENSGT00950000182881.a.b.a.a.a	ENSGT00940000154642.d	ENSGT00940000161716	ENSGT00390000013711	ENSGT00940000154191.k.a	ENSGT00940000154849.b	ENSGT00940000155991	ENSGT00940000165465	ENSGT00940000157987	ENSGT00390000005772	ENSGT00530000063370.b	ENSGT00940000159627	ENSGT00940000163919.a #22	ENSGT00940000159932.a	ENSGT00940000155760.t.a	ENSGT00950000182859.A.a.a.b	ENSGT00940000156009.A.c	ENSGT00940000164890.b	ENSGT00390000007992	ENSGT00390000001901	ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.b	ENSGT00940000156855.c	ENSGT00940000154284.b	ENSGT00940000161655	ENSGT00530000063869.B	ENSGT01050000244898.b.a	ENSGT00940000164825	ENSGT00390000009670
Perciformes_a	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000017774	ENSGT00940000165952	ENSGT00570000079101.b	ENSGT00950000182881.a.b.a.a.a	ENSGT00940000154642.d	ENSGT00940000161716	ENSGT00390000013711	ENSGT00940000154191.k.a	ENSGT00940000154849.b	ENSGT00940000155991	ENSGT00940000165465	ENSGT00940000157987	ENSGT00390000005772	ENSGT00530000063370.b	ENSGT00940000159627	ENSGT00940000163919.a #22	ENSGT00940000159932.a	ENSGT00940000155760.t.a	ENSGT00950000182859.A.a.a.b	ENSGT00940000156009.A.c	ENSGT00940000164890.b	ENSGT00390000007992	ENSGT00390000001901	ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.b	ENSGT00940000156855.c	ENSGT00940000154284.b	ENSGT00940000161655	ENSGT00940000154495.b.a.a.a	ENSGT00530000063869.B	ENSGT01050000244898.b.a	ENSGT00940000164825
Pike perch	MODERN SPECIES	23	pik3ip1 (ENSSLUG00000001103)	ENSSLUG00000001113	TCTN2 (ENSSLUG00000001158)	atp6v0a2b (ENSSLUG00000001202)	DNAH10 (ENSSLUG00000001270)	ENSSLUG00000001320	ENSSLUG00000001328	ewsr1b (ENSSLUG00000001330)	ENSSLUG00000001336	ap1b1 (ENSSLUG00000001883)	rasl10a (ENSSLUG00000006831)	osbp2b (ENSSLUG00000006855)	ccdc117 (ENSSLUG00000007005)	tcn2 (ENSSLUG00000007022)	dguok (ENSSLUG00000007057)	spaw (ENSSLUG00000007069) #22	ENSSLUG00000007082	ANK1 (ENSSLUG00000007180)	ebf2 (ENSSLUG00000007728)	ENSSLUG00000007778	EPX (ENSSLUG00000007929)	ENSSLUG00000007985	ENSSLUG00000007991	usp39 (ENSSLUG00000008012)	si:ch211-283h6.4 (ENSSLUG00000008133)	mat2ab (ENSSLUG00000008142)	INPP5J (ENSSLUG00000008211)	selenom (ENSSLUG00000008673)	ENSSLUG00000008686	trafd1 (ENSSLUG00000008709)	mob1a (ENSSLUG00000008719)
Channel bull blenny	MODERN SPECIES	23	TCTN2 (ENSCGOG00000007837)	atp6v0a2b (ENSCGOG00000007867)	ENSCGOG00000008829	ENSCGOG00000008833	ENSCGOG00000008843	rhbdd3 (ENSCGOG00000008856)	ewsr1b (ENSCGOG00000008862)	ENSCGOG00000008885	ENSCGOG00000008892	ap1b1 (ENSCGOG00000008937)	rasl10a (ENSCGOG00000009683)	osbp2b (ENSCGOG00000009686)	ccdc117 (ENSCGOG00000009751)	tcn2 (ENSCGOG00000009755)	dguok (ENSCGOG00000009766)	spaw (ENSCGOG00000009777) #22	ENSCGOG00000009821	ANK1 (ENSCGOG00000009984)	ebf2 (ENSCGOG00000015989)	ENSCGOG00000015995	sftpbb (ENSCGOG00000015999)	usp39 (ENSCGOG00000016003)	si:ch211-283h6.4 (ENSCGOG00000016295)	mat2ab (ENSCGOG00000016307)	INPP5J (ENSCGOG00000016704)	selenom (ENSCGOG00000016832)	SMTN (ENSCGOG00000016833)	trafd1 (ENSCGOG00000016854)	mob1a (ENSCGOG00000016865)	mthfd2 (ENSCGOG00000016920)	arl6ip4 (ENSCGOG00000016967)
Cottioidei	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000165952	ENSGT00940000161716	ENSGT00390000013711	ENSGT00570000079101.b	ENSGT00950000182881.a.b.a.a.a	ENSGT00940000154642.d	ENSGT00940000168755	ENSGT00940000154191.k.a	ENSGT00940000154849.b	ENSGT00940000155991	ENSGT00940000165465	ENSGT00940000157987	ENSGT00390000005772	ENSGT00530000063370.b	ENSGT00940000159627	ENSGT00940000163919.a #22	ENSGT00940000159932.a	ENSGT00940000155760.t.a	ENSGT00950000182859.A.a.a.b	ENSGT00940000156009.A.c	ENSGT00940000164890.b	ENSGT00390000007992	ENSGT00390000001901	ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.b	ENSGT00940000156855.c	ENSGT00940000154284.b	ENSGT00940000161655	ENSGT00530000063869.B	ENSGT01050000244898.b.a	ENSGT00940000164825	ENSGT00390000009670
Lumpfish	MODERN SPECIES	24	limk2 (ENSCLMG00005019757)	pik3ip1 (ENSCLMG00005019751)	ENSCLMG00005019749	ENSCLMG00005019744	ENSCLMG00005019743	ENSCLMG00005019741	rhbdd3 (ENSCLMG00005019740)	ewsr1b (ENSCLMG00005019739)	ENSCLMG00005019738	ap1b1 (ENSCLMG00005016862)	rasl10a (ENSCLMG00005016836)	osbp2b (ENSCLMG00005016803)	ccdc117 (ENSCLMG00005016796)	tcn2 (ENSCLMG00005016793)	ENSCLMG00005016792	spaw (ENSCLMG00005016791) #22	ENSCLMG00005016789	ANK1 (ENSCLMG00005009962)	ebf2 (ENSCLMG00005009920)	EPX (ENSCLMG00005009914)	ENSCLMG00005009807	ENSCLMG00005009785	EPX (ENSCLMG00005009771)	ENSCLMG00005009742	ENSCLMG00005009741	sftpbb (ENSCLMG00005009739)	usp39 (ENSCLMG00005009698)	si:ch211-283h6.4 (ENSCLMG00005009690)	mat2ab (ENSCLMG00005009683)	INPP5J (ENSCLMG00005009682)	ENSCLMG00005009681
Stickleback	MODERN SPECIES	12	ENSGACG00000008699	ENSGACG00000008696	ENSGACG00000008693	atp6v0a2b (ENSGACG00000008660)	DNAH10 (ENSGACG00000008633)	ENSGACG00000008631	ENSGACG00000008626	ewsr1b (ENSGACG00000008603)	GAS2L1 (ENSGACG00000008598)	ap1b1 (ENSGACG00000008581)	rasl10a (ENSGACG00000008570)	osbp2b (ENSGACG00000008560)	ccdc117 (ENSGACG00000008555)	tcn2 (ENSGACG00000008530)	dguok (ENSGACG00000008502)	spaw (ENSGACG00000008499) #22	ANK1 (ENSGACG00000008464)	ebf2 (ENSGACG00000008451)	EPX (ENSGACG00000008429)	sftpbb (ENSGACG00000008426)	usp39 (ENSGACG00000008416)	si:ch211-283h6.4 (ENSGACG00000008412)	mat2ab (ENSGACG00000008374)	INPP5J (ENSGACG00000008367)	selenom (ENSGACG00000008365)	ENSGACG00000008350	ENSGACG00000008336	mob1a (ENSGACG00000008308)	mthfd2 (ENSGACG00000008274)	arl6ip4 (ENSGACG00000008271)	PITPNM2 (ENSGACG00000008257)
Eupecaria_C	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00390000017774	ENSGT00940000165952	ENSGT00570000079101.b	ENSGT00950000182881.a.b.a.a.a	ENSGT00940000154642.d	ENSGT00940000161716	ENSGT00390000013711	ENSGT00940000154191.k.a	ENSGT00940000154849.b	ENSGT00940000155991	ENSGT00940000165465	ENSGT00940000157987	ENSGT00390000005772	ENSGT00530000063370.b	ENSGT00940000159627	ENSGT00940000163919.a #22	ENSGT00940000159932.a	ENSGT00940000155760.t.a	ENSGT00950000182859.A.a.a.b	ENSGT00940000156009.A.c	ENSGT00940000164890.b	ENSGT00390000007992	ENSGT00390000001901	ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.b	ENSGT00940000156855.c	ENSGT00940000154284.b	ENSGT00940000161655	ENSGT00940000154495.b.a.a.a	ENSGT00530000063869.B	ENSGT01050000244898.b.a	ENSGT00940000164825
Gilthead seabream	MODERN SPECIES	19	limk2 (ENSSAUG00010015382)	pik3ip1 (ENSSAUG00010015361)	ENSSAUG00010015358	ENSSAUG00010015357	atp6v0a2b (ENSSAUG00010009329)	ENSSAUG00010009249	rhbdd3 (ENSSAUG00010009247)	ewsr1b (ENSSAUG00010009245)	ENSSAUG00010009244	ap1b1 (ENSSAUG00010009237)	rasl10a (ENSSAUG00010009234)	osbp2b (ENSSAUG00010009219)	ccdc117 (ENSSAUG00010009216)	tcn2 (ENSSAUG00010009213)	dguok (ENSSAUG00010009210)	spaw (ENSSAUG00010009208) #22	ENSSAUG00010009205	ANK1 (ENSSAUG00010009127)	ebf2 (ENSSAUG00010009055)	ENSSAUG00010008365	ENSSAUG00010008358	usp39 (ENSSAUG00010008348)	si:ch211-283h6.4 (ENSSAUG00010008346)	mat2ab (ENSSAUG00010008281)	INPP5J (ENSSAUG00010008260)	selenom (ENSSAUG00010008256)	ENSSAUG00010008250	trafd1 (ENSSAUG00010008244)	mob1a (ENSSAUG00010008237)	mthfd2 (ENSSAUG00010008234)	arl6ip4 (ENSSAUG00010008232)
Eupercaria_incertae_sedis	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00390000017774	ENSGT00940000165952	ENSGT00570000079101.b	ENSGT00950000182881.a.b.a.a.a	ENSGT00940000154642.d	ENSGT00940000161716	ENSGT00390000013711	ENSGT00940000154191.k.a	ENSGT00940000154849.b	ENSGT00940000155991	ENSGT00940000165465	ENSGT00940000157987	ENSGT00390000005772	ENSGT00530000063370.b	ENSGT00940000159627	ENSGT00940000163919.a #22	ENSGT00940000159932.a	ENSGT00940000155760.t.a	ENSGT00950000182859.A.a.a.b	ENSGT00940000156009.A.c	ENSGT00940000164890.b	ENSGT00390000007992	ENSGT00390000001901	ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.b	ENSGT00940000156855.c	ENSGT00940000154284.b	ENSGT00940000161655	ENSGT00940000154495.b.a.a.a	ENSGT00530000063869.B	ENSGT01050000244898.b.a	ENSGT00940000164825
European seabass	MODERN SPECIES	13	ENSDLAG00005035122	ENSDLAG00005022817	TCTN2 (ENSDLAG00005022842)	ENSDLAG00005022874	DNAH10 (ENSDLAG00005023275)	ENSDLAG00005023395	rhbdd3 (ENSDLAG00005023399)	ewsr1b (ENSDLAG00005023400)	ENSDLAG00005029080	ap1b1 (ENSDLAG00005023469)	rasl10a (ENSDLAG00005024476)	osbp2b (ENSDLAG00005024477)	ENSDLAG00005031037	ENSDLAG00005024480	ENSDLAG00005024487	ENSDLAG00005024507 #22	ENSDLAG00005028009	ENSDLAG00005024539	ENSDLAG00005024785	ENSDLAG00005024839	sftpbb (ENSDLAG00005024943)	ENSDLAG00005024953	si:ch211-283h6.4 (ENSDLAG00005024997)	mat2ab (ENSDLAG00005025002)	INPP5J (ENSDLAG00005025038)	selenom (ENSDLAG00005025123)	SMTN (ENSDLAG00005028720)	ENSDLAG00005001224	mob1a (ENSDLAG00005033706)	mthfd2 (ENSDLAG00005001301)	arl6ip4 (ENSDLAG00005027500)
Large yellow croaker	MODERN SPECIES	2	limk2 (ENSLCRG00005017339)	pik3ip1 (ENSLCRG00005017424)	ENSLCRG00005017427	atp6v0a2b (ENSLCRG00005017450)	ENSLCRG00005019086	rhbdd3 (ENSLCRG00005019087)	ENSLCRG00005019089	ewsr1b (ENSLCRG00005019092)	ENSLCRG00005019095	ap1b1 (ENSLCRG00005019099)	rasl10a (ENSLCRG00005019262)	osbp2b (ENSLCRG00005019263)	ccdc117 (ENSLCRG00005019264)	tcn2 (ENSLCRG00005019265)	dguok (ENSLCRG00005019266)	spaw (ENSLCRG00005019267) #22	ENSLCRG00005019268	ANK1 (ENSLCRG00005019273)	ebf2 (ENSLCRG00005000105)	ENSLCRG00005000248	sftpbb (ENSLCRG00005000537)	usp39 (ENSLCRG00005000540)	si:ch211-283h6.4 (ENSLCRG00005000578)	mat2ab (ENSLCRG00005000579)	ENSLCRG00005000581	ENSLCRG00005000584	trafd1 (ENSLCRG00005000605)	mob1a (ENSLCRG00005000611)	mthfd2 (ENSLCRG00005000624)	arl6ip4 (ENSLCRG00005000633)	PITPNM2 (ENSLCRG00005000718)
Percomorphaceae_D	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000159133	ENSGT00390000017774	ENSGT00940000165952	ENSGT00570000079101.b	ENSGT00950000182881.a.b.a.a.a	ENSGT00940000154642.d	ENSGT00940000168755	ENSGT00940000154191.k.a	ENSGT00940000154849.b	ENSGT00940000155991	ENSGT00940000165465	ENSGT00940000157987	ENSGT00390000005772	ENSGT00530000063370.b	ENSGT00940000159627	ENSGT00940000163919.a #22	ENSGT00940000159932.a	ENSGT00940000168975	ENSGT00940000155760.t.a	ENSGT00950000182859.A.a.a.b	ENSGT00940000156009.A.c	ENSGT00940000164890.b	ENSGT00390000007992	ENSGT00390000001901	ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.b	ENSGT00940000156855.c	ENSGT00940000177369	ENSGT00940000154284.b	ENSGT00940000161655	ENSGT00940000154495.b.b.a	ENSGT00530000063869.B
Carangaria	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000165466	ENSGT00940000159133	ENSGT00390000017774	ENSGT00940000165952	ENSGT00570000079101.b	ENSGT00950000182881.a.b.a.a.a	ENSGT00940000168755	ENSGT00940000154191.k.a	ENSGT00940000154849.b	ENSGT00940000155991	ENSGT00940000165465	ENSGT00940000157987	ENSGT00390000005772	ENSGT00530000063370.b	ENSGT00940000159627	ENSGT00940000163919.a #22	ENSGT00940000159932.a	ENSGT00940000168975	ENSGT00940000155760.t.a	ENSGT00950000182859.A.a.a.b	ENSGT00940000156009.A.c	ENSGT00940000164890.b	ENSGT00390000007992	ENSGT00390000001901	ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.b	ENSGT00940000156855.c	ENSGT00940000177369	ENSGT00940000154284.b	ENSGT00940000161655	ENSGT00940000154495.b.b.a	ENSGT00530000063869.B
Pleuronectoidei	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000159133	ENSGT00390000017774	ENSGT00940000165952	ENSGT00570000079101.b	ENSGT00950000182881.a.b.a.a.a	ENSGT00940000154642.d	ENSGT00940000168755	ENSGT00940000154191.k.a	ENSGT00940000154849.b	ENSGT00940000155991	ENSGT00940000165465	ENSGT00940000157987	ENSGT00390000005772	ENSGT00530000063370.b	ENSGT00940000159627	ENSGT00940000163919.a #22	ENSGT00940000159932.a	ENSGT00940000168975	ENSGT00940000155760.t.a	ENSGT00950000182859.A.a.a.b	ENSGT00940000156009.A.c	ENSGT00940000164890.b	ENSGT00390000007992	ENSGT00390000001901	ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.b	ENSGT00940000156855.c	ENSGT00940000154495.b.b.a	ENSGT00530000063869.B	ENSGT01050000244898.b.a	ENSGT00940000164825	ENSGT00390000009670
Tongue sole	DUPLICATION
Tongue sole	MODERN SPECIES	31									ENSCSEG00000013603	ap1b1 (ENSCSEG00000013466)	rasl10a (ENSCSEG00000013444)	ENSCSEG00000013436	osbp2b (ENSCSEG00000013407)	tcn2 (ENSCSEG00000013399)	ENSCSEG00000013382	ENSCSEG00000013374 #22	dguok (ENSCSEG00000013362)	ENSCSEG00000013360	ENSCSEG00000013357	ANK1 (ENSCSEG00000013307)	ebf2 (ENSCSEG00000013272)	ENSCSEG00000012719
Tongue sole	MODERN SPECIES	397	ENSCSEG00000016122	rorb (ENSCSEG00000016099)	PTCH1 (ENSCSEG00000016042)	ENSCSEG00000016027	ENSCSEG00000016024	ENSCSEG00000016020	ENSCSEG00000016016	atp6v0a2b (ENSCSEG00000015984)	ENSCSEG00000015972	ENSCSEG00000015966	ap1b1 (ENSCSEG00000015590)	rasl10a (ENSCSEG00000015572)	ENSCSEG00000014659	ENSCSEG00000014652	ENSCSEG00000014643	spaw (ENSCSEG00000014635) #22	ENSCSEG00000014602	ENSCSEG00000014589	ANK1 (ENSCSEG00000014527)	ebf2 (ENSCSEG00000014512)	ENSCSEG00000014508	ENSCSEG00000014501	ENSCSEG00000014489	ENSCSEG00000014483	grid2 (ENSCSEG00000014466)	ENSCSEG00000014459	smarcad1a (ENSCSEG00000014419)	ENSCSEG00000014410	ENSCSEG00000014409	smad2 (ENSCSEG00000014228)	ENSCSEG00000014190
Turbot	MODERN SPECIES	21	limk2 (ENSSMAG00000014941)	pik3ip1 (ENSSMAG00000035300)	ENSSMAG00000015021	ENSSMAG00000026057	ENSSMAG00000015116	ENSSMAG00000015195	ENSSMAG00000015394	ENSSMAG00000015440	ewsr1b (ENSSMAG00000015449)	ENSSMAG00000015463	ap1b1 (ENSSMAG00000015486)	rasl10a (ENSSMAG00000036011)	osbp2b (ENSSMAG00000015603)	ENSSMAG00000015710	ENSSMAG00000015729	ENSSMAG00000015754 #22	ENSSMAG00000015759	ENSSMAG00000015797	ENSSMAG00000016051	ENSSMAG00000016108	ENSSMAG00000016145	sftpbb (ENSSMAG00000016234)	ENSSMAG00000016281	si:ch211-283h6.4 (ENSSMAG00000022989)	ENSSMAG00000016324	ENSSMAG00000016360	ENSSMAG00000016422	ENSSMAG00000016533	mob1a (ENSSMAG00000016560)	mthfd2 (ENSSMAG00000016570)	arl6ip4 (ENSSMAG00000016606)
Carangaria_A	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00390000017774	ENSGT00940000165952	ENSGT00570000079101.b	ENSGT00950000182881.a.b.a.a.a	ENSGT00940000154642.d	ENSGT00940000161716	ENSGT00390000013711	ENSGT00940000154191.k.a	ENSGT00940000154849.b	ENSGT00940000155991	ENSGT00940000165465	ENSGT00940000157987	ENSGT00390000005772	ENSGT00530000063370.b	ENSGT00940000159627	ENSGT00940000163919.a #22	ENSGT00940000159932.a	ENSGT00940000155760.t.a	ENSGT00950000182859.A.a.a.b	ENSGT00940000156009.A.c	ENSGT00940000164890.b	ENSGT00390000007992	ENSGT00390000001901	ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.b	ENSGT00940000156855.c	ENSGT00940000177369	ENSGT00940000154284.b	ENSGT00940000161655	ENSGT00940000154495.b.a.a.a	ENSGT00530000063869.B	ENSGT01050000244898.b.a
Seriola	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00390000017774	ENSGT00940000165952	ENSGT00570000079101.b	ENSGT00950000182881.a.b.a.a.a	ENSGT00940000154642.d	ENSGT00940000161716	ENSGT00390000013711	ENSGT00940000154191.k.a	ENSGT00940000154849.b	ENSGT00940000155991	ENSGT00940000165465	ENSGT00940000157987	ENSGT00390000005772	ENSGT00530000063370.b	ENSGT00940000159627	ENSGT00940000163919.a #22
Yellowtail amberjack	MODERN SPECIES	2916	pik3ip1 (ENSSLDG00000024942)	ENSSLDG00000024934	TCTN2 (ENSSLDG00000024914)	atp6v0a2b (ENSSLDG00000024902)	DNAH10 (ENSSLDG00000024861)	ENSSLDG00000024840	rhbdd3 (ENSSLDG00000024849)	ewsr1b (ENSSLDG00000024827)	ENSSLDG00000024818	ap1b1 (ENSSLDG00000024748)	rasl10a (ENSSLDG00000024730)	osbp2b (ENSSLDG00000024716)	ccdc117 (ENSSLDG00000024707)	tcn2 (ENSSLDG00000024702)	dguok (ENSSLDG00000024694)	spaw (ENSSLDG00000024690) #22
Greater amberjack	MODERN SPECIES	6	pik3ip1 (ENSSDUG00000011546)	ENSSDUG00000011502	TCTN2 (ENSSDUG00000011477)	atp6v0a2b (ENSSDUG00000011447)	DNAH10 (ENSSDUG00000011318)	ENSSDUG00000011293	rhbdd3 (ENSSDUG00000011262)	ewsr1b (ENSSDUG00000011226)	ENSSDUG00000011215	ap1b1 (ENSSDUG00000011145)	rasl10a (ENSSDUG00000011130)	osbp2b (ENSSDUG00000011103)	ccdc117 (ENSSDUG00000011083)	tcn2 (ENSSDUG00000011064)	dguok (ENSSDUG00000011049)	spaw (ENSSDUG00000011042) #22
Barramundi perch	MODERN SPECIES	95	limk2 (ENSLCAG00010028245)	pik3ip1 (ENSLCAG00010028246)	ENSLCAG00010028247	TCTN2 (ENSLCAG00010028248)	atp6v0a2b (ENSLCAG00010028249)	DNAH10 (ENSLCAG00010028250)	ENSLCAG00010028251	rhbdd3 (ENSLCAG00010028252)	ewsr1b (ENSLCAG00010028253)	ENSLCAG00010028254	ap1b1 (ENSLCAG00010028255)	osbp2b (ENSLCAG00010028256)	ccdc117 (ENSLCAG00010028257)	tcn2 (ENSLCAG00010028258)	ENSLCAG00010028259	spaw (ENSLCAG00010028260) #22	EIF4EBP1 (ENSLCAG00010028261)	ANK1 (ENSLCAG00010028262)	ebf2 (ENSLCAG00010028264)	ENSLCAG00010028265	sftpbb (ENSLCAG00010028266)	usp39 (ENSLCAG00010028267)	si:ch211-283h6.4 (ENSLCAG00010028268)	mat2ab (ENSLCAG00010028269)	INPP5J (ENSLCAG00010028270)	selenom (ENSLCAG00010028271)	SMTN (ENSLCAG00010028272)	trafd1 (ENSLCAG00010028273)	mob1a (ENSLCAG00010028274)	mthfd2 (ENSLCAG00010028275)	arl6ip4 (ENSLCAG00010028276)
Anabantaria	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000159133	ENSGT00390000017774	ENSGT00940000165952	ENSGT00570000079101.b	ENSGT00950000182881.a.b.a.a.a	ENSGT00940000154642.d	ENSGT00390000013711	ENSGT00940000154191.k.a	ENSGT00940000154849.b	ENSGT00940000155991	ENSGT00940000165465	ENSGT00940000157987	ENSGT00390000005772	ENSGT00530000063370.b	ENSGT00940000159627	ENSGT00940000163919.a #22	ENSGT00940000159932.a	ENSGT00940000155760.t.a	ENSGT00950000182859.A.a.a.b	ENSGT00940000156009.A.c	ENSGT00940000164890.b	ENSGT00390000007992	ENSGT00390000001901	ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.b	ENSGT00940000156855.c	ENSGT00940000154284.b	ENSGT00940000161655	ENSGT00940000154495.b.a.a.a	ENSGT00530000063869.B	ENSGT01050000244898.b.a	ENSGT00940000164825
Anabantoidei	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000159133	ENSGT00390000017774	ENSGT00940000165952	ENSGT00570000079101.b	ENSGT00950000182881.a.b.a.a.a	ENSGT00940000154642.d	ENSGT00390000013711	ENSGT00940000154191.k.a	ENSGT00940000154849.b	ENSGT00940000155991	ENSGT00940000165465	ENSGT00940000157987	ENSGT00390000005772	ENSGT00530000063370.b	ENSGT00940000159627	ENSGT00940000163919.a #22	ENSGT00940000159932.a	ENSGT00940000155760.t.a	ENSGT00950000182859.A.a.a.b	ENSGT00940000156009.A.c	ENSGT00940000164890.b	ENSGT00390000007992	ENSGT00390000001901	ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.b	ENSGT00940000156855.c	ENSGT00940000154284.b	ENSGT00940000161655	ENSGT00940000154495.b.b.a	ENSGT00530000063869.B	ENSGT01050000244898.b.a	ENSGT00940000164825
Climbing perch	MODERN SPECIES	22	limk2 (ENSATEG00000010008)	pik3ip1 (ENSATEG00000010070)	TCTN2 (ENSATEG00000010149)	ENSATEG00000010175	DNAH10 (ENSATEG00000029498)	ENSATEG00000026245	rhbdd3 (ENSATEG00000010654)	ewsr1b (ENSATEG00000010664)	ENSATEG00000010680	ap1b1 (ENSATEG00000010714)	rasl10a (ENSATEG00000010796)	osbp2b (ENSATEG00000010818)	ENSATEG00000010839	ENSATEG00000010863	ENSATEG00000010885	ENSATEG00000010895 #22	ENSATEG00000010916	ENSATEG00000011002	ENSATEG00000011129	ENSATEG00000011186	sftpbb (ENSATEG00000027890)	ENSATEG00000011205	si:ch211-283h6.4 (ENSATEG00000011234)	mat2ab (ENSATEG00000011242)	INPP5J (ENSATEG00000011290)	selenom (ENSATEG00000011331)	SMTN (ENSATEG00000011362)	ENSATEG00000011426	mob1a (ENSATEG00000011438)	mthfd2 (ENSATEG00000011443)	arl6ip4 (ENSATEG00000027706)
Siamese fighting fish	MODERN SPECIES	20	wscd2 (ENSBSLG00000003140)	limk2 (ENSBSLG00000004083)	pik3ip1 (ENSBSLG00000004567)	ENSBSLG00000004570	ENSBSLG00000004574	atp6v0a2b (ENSBSLG00000004674)	ENSBSLG00000006369	rhbdd3 (ENSBSLG00000006469)	ewsr1b (ENSBSLG00000006515)	GAS2L1 (ENSBSLG00000006679)	ap1b1 (ENSBSLG00000006965)	rasl10a (ENSBSLG00000007033)	osbp2b (ENSBSLG00000007051)	ccdc117 (ENSBSLG00000007142)	tcn2 (ENSBSLG00000007151)	spaw (ENSBSLG00000007182) #22	ENSBSLG00000007285	ANK1 (ENSBSLG00000008127)	ebf2 (ENSBSLG00000012704)	ENSBSLG00000012719	ENSBSLG00000012795	ENSBSLG00000012813	ENSBSLG00000012947	ENSBSLG00000012997	ENSBSLG00000013001	sftpbb (ENSBSLG00000013013)	usp39 (ENSBSLG00000013016)	si:ch211-283h6.4 (ENSBSLG00000013558)	mat2ab (ENSBSLG00000013576)	INPP5J (ENSBSLG00000013669)	selenom (ENSBSLG00000013840)
Zig-zag eel	MODERN SPECIES	23	limk2 (ENSMAMG00000016262)	pik3ip1 (ENSMAMG00000016283)	ENSMAMG00000016308	TCTN2 (ENSMAMG00000016337)	ENSMAMG00000016359	DNAH10 (ENSMAMG00000016378)	ENSMAMG00000016493	rhbdd3 (ENSMAMG00000016504)	ewsr1b (ENSMAMG00000016510)	ENSMAMG00000016533	ap1b1 (ENSMAMG00000016557)	osbp2b (ENSMAMG00000016657)	ENSMAMG00000016676	ENSMAMG00000016694	ENSMAMG00000016698	ENSMAMG00000016707 #22	ENSMAMG00000028711	ENSMAMG00000016735	ENSMAMG00000016827	ENSMAMG00000016862	ENSMAMG00000024531	ENSMAMG00000027322	ENSMAMG00000016935	mat2ab (ENSMAMG00000016940)	ENSMAMG00000016963	selenom (ENSMAMG00000025931)	ENSMAMG00000017096	ENSMAMG00000017130	mob1a (ENSMAMG00000017147)	mthfd2 (ENSMAMG00000017168)	arl6ip4 (ENSMAMG00000017190)
Ovalentaria	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00610000087456	ENSGT00940000165952	ENSGT00570000079101.b	ENSGT00950000182881.a.b.a.a.a	ENSGT00940000154642.d	ENSGT00940000161542	ENSGT00390000013711	ENSGT00940000154191.k.a	ENSGT00940000154849.b	ENSGT00940000155991	ENSGT00940000165465	ENSGT00940000157987	ENSGT00390000005772	ENSGT00530000063370.b	ENSGT00940000159627	ENSGT00940000163919.a #22	ENSGT00940000159932.a	ENSGT00940000168975	ENSGT00940000155760.t.a	ENSGT00950000182859.A.a.a.b	ENSGT00940000156009.A.c	ENSGT00940000164890.b	ENSGT00390000007992	ENSGT00390000001901	ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.b	ENSGT00940000156855.c	ENSGT00940000177369	ENSGT00940000154284.b	ENSGT00940000161655	ENSGT00940000154495.b.a.a.a	ENSGT00530000063869.B
Atherinomorphae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00610000087456	ENSGT00940000165952	ENSGT00570000079101.b	ENSGT00950000182881.a.b.a.a.a	ENSGT00940000154642.d	ENSGT00940000161716	ENSGT00390000013711	ENSGT00940000154191.k.a	ENSGT00940000154849.b	ENSGT00940000155991	ENSGT00940000165465	ENSGT00940000157987	ENSGT00390000005772	ENSGT00530000063370.b	ENSGT00940000159627	ENSGT00940000163919.a #22	ENSGT00940000159932.a	ENSGT00940000155760.t.a	ENSGT00950000182859.A.a.a.b	ENSGT00940000156009.A.c	ENSGT00940000164890.b	ENSGT00390000007992	ENSGT00390000001901	ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.b	ENSGT00940000156855.c	ENSGT00940000154284.b	ENSGT00940000161655	ENSGT00940000154495.b.a.a.a	ENSGT00530000063869.B	ENSGT01050000244898.b.a	ENSGT00940000164825
Cyprinodontiformes	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00610000087456	ENSGT00940000165952	ENSGT00570000079101.b	ENSGT00950000182881.a.b.a.a.a	ENSGT00940000154642.d	ENSGT00940000161716	ENSGT00390000013711	ENSGT00940000154191.k.a	ENSGT00940000154849.b	ENSGT00940000155991	ENSGT00940000165465	ENSGT00940000157987	ENSGT00390000005772	ENSGT00530000063370.b	ENSGT00940000159627	ENSGT00940000163919.a #22	ENSGT00940000159932.a	ENSGT00940000155760.t.a	ENSGT00950000182859.A.a.a.b	ENSGT00940000156009.A.c	ENSGT00940000164890.b	ENSGT00390000007992	ENSGT00390000001901	ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.b	ENSGT00940000156855.c	ENSGT00940000154284.b	ENSGT00940000161655	ENSGT00940000154495.b.a.a.a	ENSGT00530000063869.B	ENSGT01050000244898.b.a	ENSGT00940000164825
Aplocheiloidei	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00940000159133	ENSGT00390000017774	ENSGT00940000165952	ENSGT00570000079101.b	ENSGT00950000182881.a.b.a.a.a	ENSGT00940000154642.d	ENSGT00940000161716	ENSGT00390000013711	ENSGT00940000154191.k.a	ENSGT00940000154849.b	ENSGT00940000155991	ENSGT00940000165465	ENSGT00940000157987	ENSGT00530000063370.b	ENSGT00940000159627	ENSGT00940000163919.a #22	ENSGT00940000159932.a	ENSGT00940000155760.t.a	ENSGT00950000182859.A.a.a.b	ENSGT00940000156009.A.c	ENSGT00940000164890.b	ENSGT00390000007992	ENSGT00390000001901	ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.b	ENSGT00940000156855.c	ENSGT00940000154284.b	ENSGT00940000154495.b.a.a.a	ENSGT00530000063869.B	ENSGT01050000244898.b.a	ENSGT00940000164825	ENSGT00390000009670
Turquoise killifish	MODERN SPECIES	1627	cmklr1 (ENSNFUG00015017295)	wscd2 (ENSNFUG00015017301)	LIMK2 (ENSNFUG00015017381)	PIK3IP1 (ENSNFUG00015019346)	ENSNFUG00015019355	ATP6V0A2B (ENSNFUG00015019388)	ENSNFUG00015020928	rhbdd3 (ENSNFUG00015020931)	ewsr1b (ENSNFUG00015020932)	GAS2L1 (ENSNFUG00015020936)	ap1b1 (ENSNFUG00015020983)	rasl10a (ENSNFUG00015022841)	osbp2b (ENSNFUG00015022862)	TCN2L (ENSNFUG00015023018)	dguok (ENSNFUG00015023027)	spaw (ENSNFUG00015023031) #22	EIF4EBP1 (ENSNFUG00015023067)	ANK1 (ENSNFUG00015023113)	ENSNFUG00015023486	ebf2 (ENSNFUG00015023496)	SFTPB (ENSNFUG00015023532)	usp39 (ENSNFUG00015023541)	C5H2ORF68 (ENSNFUG00015023604)	mat2ab (ENSNFUG00015023611)	INPP5J (ENSNFUG00015023621)	selenom (ENSNFUG00015023644)	ENSNFUG00015023645	trafd1 (ENSNFUG00015023653)	OLA.12645 (ENSNFUG00015023666)	mthfd2 (ENSNFUG00015023681)	arl6ip4 (ENSNFUG00015023725)
Mangrove rivulus	MODERN SPECIES	26	limk2 (ENSKMAG00000017094)	pik3ip1 (ENSKMAG00000017152)	ENSKMAG00000017181	TCTN2 (ENSKMAG00000017265)	atp6v0a2b (ENSKMAG00000017289)	DNAH10 (ENSKMAG00000017349)	ENSKMAG00000017541	rhbdd3 (ENSKMAG00000017579)	ewsr1b (ENSKMAG00000017617)	ENSKMAG00000017642	ap1b1 (ENSKMAG00000017663)	rasl10a (ENSKMAG00000017713)	osbp2b (ENSKMAG00000017751)	tcn2 (ENSKMAG00000017882)	dguok (ENSKMAG00000017906)	spaw (ENSKMAG00000017922) #22	ENSKMAG00000017930	ANK1 (ENSKMAG00000017962)	ebf2 (ENSKMAG00000018080)	ENSKMAG00000018131	ENSKMAG00000018162	sftpbb (ENSKMAG00000018229)	usp39 (ENSKMAG00000018200)	si:ch211-283h6.4 (ENSKMAG00000018244)	mat2ab (ENSKMAG00000018262)	INPP5J (ENSKMAG00000018294)	selenom (ENSKMAG00000018317)	ENSKMAG00000018386	trafd1 (ENSKMAG00000018446)	mob1a (ENSKMAG00000018463)	mthfd2 (ENSKMAG00000018489)
Cyprinodontoidei	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000165952	ENSGT00570000079101.b	ENSGT00950000182881.a.b.a.a.a	ENSGT00940000154642.d	ENSGT00940000161716	ENSGT00390000013711	ENSGT00940000154191.k.a	ENSGT00940000154849.b	ENSGT00940000155991.x	ENSGT00940000155991.w.a	ENSGT00940000165465	ENSGT00940000157987	ENSGT00390000005772	ENSGT00530000063370.b	ENSGT00940000159627	ENSGT00940000163919.a #22	ENSGT00940000159932.a	ENSGT00940000155760.t.a	ENSGT00950000182859.A.a.a.b	ENSGT00940000156009.A.c	ENSGT00940000164890.b	ENSGT00390000007992	ENSGT00390000001901	ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.b	ENSGT00940000156855.c	ENSGT00940000154284.b	ENSGT00940000161655	ENSGT00940000154495.b.a.a.a	ENSGT00530000063869.B	ENSGT01050000244898.b.a	ENSGT00940000164825
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Poecilia	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000165952	ENSGT00570000079101.b	ENSGT00950000182881.a.b.a.a.a	ENSGT00940000154642.d	ENSGT00940000161716	ENSGT00390000013711	ENSGT00940000154191.k.a	ENSGT00940000154849.b	ENSGT00940000155991.w.b	ENSGT00940000155991.w.a	ENSGT00940000165465	ENSGT00940000157987	ENSGT00390000005772	ENSGT00530000063370.b	ENSGT00940000159627	ENSGT00940000163919.a #22	ENSGT00940000159932.a	ENSGT00940000155760.t.a	ENSGT00950000182859.A.a.a.b	ENSGT00940000156009.A.c	ENSGT00940000164890.b	ENSGT00390000007992	ENSGT00390000001901	ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.b	ENSGT00940000156855.c	ENSGT00940000154284.b	ENSGT00940000161655	ENSGT00940000154495.b.a.a.a	ENSGT00530000063869.B	ENSGT01050000244898.b.a	ENSGT00940000164825
NAME_6	ANCESTRAL SPECIES	190										ENSGT00940000155991.w.a	ENSGT00940000165465	ENSGT00940000157987	ENSGT00390000005772	ENSGT00530000063370.b	ENSGT00940000159627	ENSGT00940000163919.a #22	ENSGT00940000159932.a	ENSGT00940000155760.t.a	ENSGT00950000182859.A.a.a.b	ENSGT00940000156009.A.c	ENSGT00940000164890.b	ENSGT00390000007992	ENSGT00390000001901	ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.b	ENSGT00940000156855.c	ENSGT00940000154284.b	ENSGT00940000161655	ENSGT00940000154495.b.a.a.a	ENSGT00530000063869.B	ENSGT01050000244898.b.a	ENSGT00940000164825
Sailfin molly	MODERN SPECIES	1077										ap1b1 (ENSPLAG00000017186)	rasl10a (ENSPLAG00000017071)	osbp2b (ENSPLAG00000017050)	ccdc117 (ENSPLAG00000016883)	tcn2 (ENSPLAG00000016877)	dguok (ENSPLAG00000016875)	spaw (ENSPLAG00000016872) #22	EIF4EBP1 (ENSPLAG00000016860)	ank1a (ENSPLAG00000016847)	ANK1 (ENSPLAG00000016824)
Amazon molly	MODERN SPECIES	545										ap1b1 (ENSPFOG00000008291)	rasl10a (ENSPFOG00000008452)	osbp2b (ENSPFOG00000008481)	ccdc117 (ENSPFOG00000008778)	tcn2 (ENSPFOG00000008793)	dguok (ENSPFOG00000008851)	spaw (ENSPFOG00000008931) #22	ENSPFOG00000008954	ank1a (ENSPFOG00000008985)	ebf2 (ENSPFOG00000009617)	ENSPFOG00000010065	sftpbb (ENSPFOG00000010256)	usp39 (ENSPFOG00000010305)	si:ch211-283h6.4 (ENSPFOG00000010409)	mat2ab (ENSPFOG00000010440)	mat2ab (ENSPFOG00000010510)	INPP5J (ENSPFOG00000010595)	selenom (ENSPFOG00000010675)	SMTN (ENSPFOG00000010680)	trafd1 (ENSPFOG00000010803)	mob1a (ENSPFOG00000010833)	mthfd2 (ENSPFOG00000010913)
Guppy	MODERN SPECIES	461	ENSPREG00000022015	TCTN2 (ENSPREG00000021983)	atp6v0a2b (ENSPREG00000021959)	ENSPREG00000021935	ENSPREG00000021918	ENSPREG00000021892	ENSPREG00000021874	rhbdd3 (ENSPREG00000021856)	ewsr1b (ENSPREG00000021835)	ENSPREG00000021825	ap1b1 (ENSPREG00000021769)	rasl10a (ENSPREG00000021747)	osbp2b (ENSPREG00000021738)	tcn2 (ENSPREG00000021726)	dguok (ENSPREG00000021716)	spaw (ENSPREG00000021709) #22	EIF4EBP1 (ENSPREG00000021678)	ANK1 (ENSPREG00000021629)	ebf2 (ENSPREG00000021597)	EPX (ENSPREG00000021577)	sftpbb (ENSPREG00000021554)	usp39 (ENSPREG00000021529)	si:ch211-283h6.4 (ENSPREG00000021512)	mat2ab (ENSPREG00000021500)	INPP5J (ENSPREG00000021447)	selenom (ENSPREG00000021417)	ENSPREG00000021395	trafd1 (ENSPREG00000021376)	mob1a (ENSPREG00000021343)	mthfd2 (ENSPREG00000021326)	arl6ip4 (ENSPREG00000021318)
Platyfish	MODERN SPECIES	3	atp6v0a2b (ENSXMAG00000018056)	ENSXMAG00000023642	ENSXMAG00000027767	ENSXMAG00000029259	ENSXMAG00000029686	ENSXMAG00000026943	rhbdd3 (ENSXMAG00000017943)	ewsr1b (ENSXMAG00000017933)	ENSXMAG00000021971	ap1b1 (ENSXMAG00000017916)	rasl10a (ENSXMAG00000017914)	osbp2b (ENSXMAG00000017911)	ccdc117 (ENSXMAG00000017910)	tcn2 (ENSXMAG00000017900)	dguok (ENSXMAG00000017897)	spaw (ENSXMAG00000017893) #22	ENSXMAG00000017888	ANK1 (ENSXMAG00000017872)	ebf2 (ENSXMAG00000017859)	ENSXMAG00000017815	sftpbb (ENSXMAG00000027554)	usp39 (ENSXMAG00000017793)	si:ch211-283h6.4 (ENSXMAG00000017788)	mat2ab (ENSXMAG00000017778)	ENSXMAG00000017772	selenom (ENSXMAG00000017770)	ENSXMAG00000017754	trafd1 (ENSXMAG00000017752)	mob1a (ENSXMAG00000017741)	mthfd2 (ENSXMAG00000017735)	arl6ip4 (ENSXMAG00000022410)
NAME_4	ANCESTRAL SPECIES	33	ENSGT00940000165952	ENSGT00570000079101.b	ENSGT00950000182881.a.b.a.a.a	ENSGT00940000154642.d	ENSGT00940000161716	ENSGT00390000013711	ENSGT00940000154191.k.a	ENSGT00940000154849.b	ENSGT00940000155991.x	ENSGT00940000155991.w.b	ENSGT00940000165465	ENSGT00940000157987	ENSGT00390000005772	ENSGT00530000063370.b	ENSGT00940000159627	ENSGT00940000163919.a #22	ENSGT00940000159932.a	ENSGT00940000155760.t.a	ENSGT00950000182859.A.a.a.b	ENSGT00940000156009.A.c	ENSGT00940000164890.b	ENSGT00390000007992	ENSGT00390000001901	ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.b	ENSGT00940000156855.c	ENSGT00940000154284.b	ENSGT00940000161655	ENSGT00940000154495.b.a.a.a	ENSGT00530000063869.B	ENSGT01050000244898.b.a	ENSGT00940000164825
Mummichog	MODERN SPECIES	2204	TCTN2 (ENSFHEG00000015912)	atp6v0a2b (ENSFHEG00000015927)	DNAH10 (ENSFHEG00000016198)	ENSFHEG00000016233	rhbdd3 (ENSFHEG00000016271)	ewsr1b (ENSFHEG00000016297)	ENSFHEG00000016305	ENSFHEG00000016322	ap1b1 (ENSFHEG00000016434)	ENSFHEG00000016457	rasl10a (ENSFHEG00000016467)	osbp2b (ENSFHEG00000016509)	ccdc117 (ENSFHEG00000016517)	tcn2 (ENSFHEG00000016550)	dguok (ENSFHEG00000016555)	spaw (ENSFHEG00000016568) #22	EIF4EBP1 (ENSFHEG00000016580)	ANK1 (ENSFHEG00000016678)	ebf2 (ENSFHEG00000000422)	ENSFHEG00000016739	sftpbb (ENSFHEG00000016751)	usp39 (ENSFHEG00000016767)	si:ch211-283h6.4 (ENSFHEG00000016777)	mat2ab (ENSFHEG00000016806)	INPP5J (ENSFHEG00000017114)	selenom (ENSFHEG00000017133)	SMTN (ENSFHEG00000017167)	trafd1 (ENSFHEG00000017178)	mob1a (ENSFHEG00000017214)	mthfd2 (ENSFHEG00000000827)	arl6ip4 (ENSFHEG00000017232)
Sheepshead minnow	MODERN SPECIES	1589												osbp2b (ENSCVAG00000010396)	ccdc117 (ENSCVAG00000010379)	tcn2 (ENSCVAG00000010368)	dguok (ENSCVAG00000000916)	spaw (ENSCVAG00000010323) #22	ENSCVAG00000010306	ank1a (ENSCVAG00000010300)	ENSCVAG00000010293
Oryzias	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000159133	ENSGT00390000017774	ENSGT00940000165952	ENSGT00570000079101.b	ENSGT00950000182881.a.b.a.a.a	ENSGT00940000161716	ENSGT00390000013711	ENSGT00940000154191.k.a	ENSGT00940000154849.b	ENSGT00940000155991	ENSGT00940000165465	ENSGT00940000157987	ENSGT00390000005772	ENSGT00530000063370.b	ENSGT00940000159627	ENSGT00940000163919.a #22	ENSGT00940000159932.a	ENSGT00940000155760.t.a	ENSGT00950000182859.A.a.a.b	ENSGT00940000156009.A.c	ENSGT00940000164890.b	ENSGT00390000007992	ENSGT00390000001901	ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.b	ENSGT00940000156855.c	ENSGT00940000154284.b	ENSGT00940000154495.b.b.a	ENSGT00530000063869.B	ENSGT01050000244898.b.a	ENSGT00940000164825	ENSGT00390000009670
Oryzias_a	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000159434	ENSGT00940000159133	ENSGT00390000017774	ENSGT00940000165952	ENSGT00570000079101.b	ENSGT00950000182881.a.b.a.a.a	ENSGT00390000013711	ENSGT00940000154191.k.a	ENSGT00940000154849.b	ENSGT00940000155991	ENSGT00940000165465	ENSGT00940000157987	ENSGT00390000005772	ENSGT00530000063370.b	ENSGT00940000159627	ENSGT00940000163919.a #22	ENSGT00940000159932.a	ENSGT00940000155760.t.a	ENSGT00950000182859.A.a.a.b	ENSGT00940000156009.A.c.v	ENSGT00940000164890.b	ENSGT00390000007992	ENSGT00390000001901	ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.b	ENSGT00940000156855.c	ENSGT00940000154284.b	ENSGT00940000154495.b.b.a	ENSGT00530000063869.B	ENSGT01050000244898.b.a	ENSGT00940000164825	ENSGT00390000009670
Japanese Medaka HdrR	MODERN SPECIES	23	si:ch211-191d15.2 (ENSORLG00000006911)	sart3 (ENSORLG00000006895)	ficd (ENSORLG00000006873)	cmklr1 (ENSORLG00000006867)	wscd2 (ENSORLG00000006858)	ENSORLG00000006729	rhbdd3 (ENSORLG00000025522)	ewsr1b (ENSORLG00000006712)	ENSORLG00000023658	ap1b1 (ENSORLG00000006687)	rasl10a (ENSORLG00000028722)	osbp2b (ENSORLG00000006598)	ccdc117 (ENSORLG00000026857)	tcn2 (ENSORLG00000006588)	dguok (ENSORLG00000023221)	spaw (ENSORLG00000006553) #22	ENSORLG00000006498	ANK1 (ENSORLG00000006482)	ebf2 (ENSORLG00000006408)	ENSORLG00000029520	ENSORLG00000027810	ENSORLG00000023289	sftpbb (ENSORLG00000022185)	usp39 (ENSORLG00000006325)	si:ch211-283h6.4 (ENSORLG00000006309)	mat2ab (ENSORLG00000006298)	ENSORLG00000006273	selenom (ENSORLG00000006265)	ENSORLG00000028982	trafd1 (ENSORLG00000006256)	mob1a (ENSORLG00000006246)
Chinese medaka	MODERN SPECIES	528	cmklr1 (ENSOSIG00000023806)	wscd2 (ENSOSIG00000023804)	limk2 (ENSOSIG00000023714)	pik3ip1 (ENSOSIG00000023657)	atp6v0a2b (ENSOSIG00000023595)	ENSOSIG00000023545	rhbdd3 (ENSOSIG00000023541)	ewsr1b (ENSOSIG00000023536)	ENSOSIG00000023535	ap1b1 (ENSOSIG00000023171)	rasl10a (ENSOSIG00000023027)	osbp2b (ENSOSIG00000023014)	ccdc117 (ENSOSIG00000022996)	tcn2 (ENSOSIG00000022988)	dguok (ENSOSIG00000022980)	spaw (ENSOSIG00000022970) #22	ENSOSIG00000022966	ANK1 (ENSOSIG00000019576)	ebf2 (ENSOSIG00000019149)	EPX (ENSOSIG00000018941)	usp39 (ENSOSIG00000018886)	si:ch211-283h6.4 (ENSOSIG00000018873)	mat2ab (ENSOSIG00000018872)	INPP5J (ENSOSIG00000018775)	selenom (ENSOSIG00000018764)	ENSOSIG00000018763	trafd1 (ENSOSIG00000018759)	mob1a (ENSOSIG00000018757)	mthfd2 (ENSOSIG00000018742)	arl6ip4 (ENSOSIG00000018738)	PITPNM2 (ENSOSIG00000018642)
Oryzias_b	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000159133	ENSGT00390000017774	ENSGT00940000165952	ENSGT00570000079101.b	ENSGT00950000182881.a.b.a.a.a	ENSGT00940000161716	ENSGT00390000013711	ENSGT00940000154191.k.a	ENSGT00940000154849.b	ENSGT00940000155991	ENSGT00940000165465	ENSGT00940000157987	ENSGT00390000005772	ENSGT00530000063370.b	ENSGT00940000159627	ENSGT00940000163919.a #22	ENSGT00940000159932.a	ENSGT00940000155760.t.a	ENSGT00950000182859.A.a.a.b	ENSGT00940000156009.A.c	ENSGT00940000164890.b	ENSGT00390000007992	ENSGT00390000001901	ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.b	ENSGT00940000156855.c	ENSGT00940000154284.b	ENSGT00940000154495.b.a.a.a	ENSGT00530000063869.B	ENSGT01050000244898.b.a	ENSGT00940000164825	ENSGT00390000009670
Javanese ricefish	MODERN SPECIES	23	cmklr1 (ENSOJAG00000021447)	wscd2 (ENSOJAG00000021391)	limk2 (ENSOJAG00000021229)	pik3ip1 (ENSOJAG00000021208)	ENSOJAG00000021182	atp6v0a2b (ENSOJAG00000020903)	ENSOJAG00000020862	rhbdd3 (ENSOJAG00000020849)	ewsr1b (ENSOJAG00000020835)	ENSOJAG00000020826	ap1b1 (ENSOJAG00000020810)	rasl10a (ENSOJAG00000020797)	osbp2b (ENSOJAG00000020782)	ccdc117 (ENSOJAG00000020777)	dguok (ENSOJAG00000020702)	spaw (ENSOJAG00000020681) #22	ENSOJAG00000020677	ANK1 (ENSOJAG00000017803)	ebf2 (ENSOJAG00000017606)	ENSOJAG00000017366	usp39 (ENSOJAG00000017206)	si:ch211-283h6.4 (ENSOJAG00000017190)	mat2ab (ENSOJAG00000017153)	ENSOJAG00000016638	selenom (ENSOJAG00000016591)	ENSOJAG00000016556	trafd1 (ENSOJAG00000016541)	mob1a (ENSOJAG00000016508)	mthfd2 (ENSOJAG00000016415)	arl6ip4 (ENSOJAG00000016403)	PITPNM2 (ENSOJAG00000016241)
Ovalentaria_B	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00390000017774	ENSGT00940000165952	ENSGT00570000079101.b	ENSGT00950000182881.a.b.a.a.a	ENSGT00940000154642.d	ENSGT00940000161542	ENSGT00390000013711	ENSGT00940000154191.k.a	ENSGT00940000154849.b	ENSGT00940000155991	ENSGT00940000165465	ENSGT00940000157987	ENSGT00390000005772	ENSGT00530000063370.b	ENSGT00940000159627	ENSGT00940000163919.a #22	ENSGT00940000159932.a	ENSGT00940000168975	ENSGT00940000155760.t.a	ENSGT00950000182859.A.a.a.b	ENSGT00940000156009.A.c	ENSGT00940000164890.b	ENSGT00390000007992	ENSGT00390000001901	ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.b	ENSGT00940000156855.c	ENSGT00940000177369	ENSGT00940000154284.b	ENSGT00940000161655	ENSGT00940000154495.b.a.a.a	ENSGT00530000063869.B
Pomacentridae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000165952	ENSGT00570000079101.b	ENSGT00950000182881.a.b.a.a.a	ENSGT00940000154642.d	ENSGT00940000161716	ENSGT00390000013711	ENSGT00940000154191.k.a	ENSGT00940000154849.b	ENSGT00940000155991	ENSGT00940000165465	ENSGT00940000157987	ENSGT00730000112955	ENSGT00390000005772	ENSGT00530000063370.b	ENSGT00940000159627	ENSGT00940000163919.a #22	ENSGT00940000159932.a	ENSGT00940000155760.t.a	ENSGT00950000182859.A.a.a.b	ENSGT00940000156009.A.c	ENSGT00940000164890.b	ENSGT00390000007992	ENSGT00390000001901	ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.b	ENSGT00940000156855.c	ENSGT00940000177369	ENSGT00940000154284.b	ENSGT00940000161655	ENSGT00530000063869.B	ENSGT01050000244898.b.a	ENSGT00940000164825
Pomacentridae_A	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000017774	ENSGT00940000165952	ENSGT00570000079101.b	ENSGT00950000182881.a.b.a.a.a	ENSGT00940000154642.d	ENSGT00940000161716	ENSGT00390000013711	ENSGT00940000154191.k.a	ENSGT00940000154849.b	ENSGT00940000155991	ENSGT00940000165465	ENSGT00940000157987	ENSGT00390000005772	ENSGT00530000063370.b	ENSGT00940000159627	ENSGT00940000163919.a #22	ENSGT00940000159932.a	ENSGT00940000155760.t.a	ENSGT00950000182859.A.a.a.b	ENSGT00940000156009.A.c	ENSGT00940000164890.b	ENSGT00390000007992	ENSGT00390000001901	ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.b	ENSGT00940000156855.c	ENSGT00940000177369	ENSGT00940000154284.b	ENSGT00940000161655	ENSGT00530000063869.B	ENSGT01050000244898.b.a	ENSGT00940000164825
Amphiprion	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000165952	ENSGT00570000079101.b	ENSGT00950000182881.a.b.a.a.a	ENSGT00940000154642.d	ENSGT00940000161716	ENSGT00390000013711	ENSGT00940000164472.a.b.d	ENSGT00940000154191.k.a	ENSGT00940000154849.b	ENSGT00940000155991	ENSGT00940000165465	ENSGT00940000157987	ENSGT00390000005772	ENSGT00530000063370.b	ENSGT00940000159627	ENSGT00940000163919.a #22	ENSGT00940000159932.a	ENSGT00940000155760.t.a	ENSGT00950000182859.A.a.a.b	ENSGT00940000156009.A.c	ENSGT00940000164890.b	ENSGT00390000007992	ENSGT00390000001901	ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.b	ENSGT00940000156855.c	ENSGT00940000177369	ENSGT00940000154284.b	ENSGT00940000161655	ENSGT00530000063869.B	ENSGT01050000244898.b.a	ENSGT00940000164825
Clown anemonefish	MODERN SPECIES	319															dguok (ENSAOCG00000023754)	spaw (ENSAOCG00000023745) #22	ENSAOCG00000023739	ANK1 (ENSAOCG00000023728)	ebf2 (ENSAOCG00000001716)	ENSAOCG00000023662	sftpbb (ENSAOCG00000023565)	usp39 (ENSAOCG00000023553)	si:ch211-283h6.4 (ENSAOCG00000023527)	mat2ab (ENSAOCG00000023509)	ENSAOCG00000023483	ENSAOCG00000023451
Orange clownfish	MODERN SPECIES	19	ENSAPEG00000023902	TCTN2 (ENSAPEG00000023926)	atp6v0a2b (ENSAPEG00000023940)	DNAH10 (ENSAPEG00000023968)	ENSAPEG00000024035	rhbdd3 (ENSAPEG00000024044)	ENSAPEG00000024067	ewsr1b (ENSAPEG00000024145)	ENSAPEG00000024158	ap1b1 (ENSAPEG00000024167)	rasl10a (ENSAPEG00000024233)	osbp2b (ENSAPEG00000024266)	ccdc117 (ENSAPEG00000024333)	tcn2 (ENSAPEG00000024337)	dguok (ENSAPEG00000024342)	spaw (ENSAPEG00000024350) #22	ENSAPEG00000024358	ANK1 (ENSAPEG00000024367)	ebf2 (ENSAPEG00000024396)	ENSAPEG00000024413	sftpbb (ENSAPEG00000024459)	usp39 (ENSAPEG00000024467)	si:ch211-283h6.4 (ENSAPEG00000024480)	mat2ab (ENSAPEG00000024485)	ENSAPEG00000024494	ENSAPEG00000024505	selenom (ENSAPEG00000024508)	ENSAPEG00000024518	trafd1 (ENSAPEG00000024533)	mob1a (ENSAPEG00000024543)	mthfd2 (ENSAPEG00000024550)
Spiny chromis	MODERN SPECIES	3009														ccdc117 (ENSAPOG00000015907)	tcn2 (ENSAPOG00000015916)	spaw (ENSAPOG00000015940) #22	dguok (ENSAPOG00000015947)
Bicolor damselfish	MODERN SPECIES	2636												ENSSPAG00000011335	ccdc117 (ENSSPAG00000011321)	tcn2 (ENSSPAG00000011298)	dguok (ENSSPAG00000011277)	spaw (ENSSPAG00000011253) #22
Cichlidae	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00390000017774	ENSGT00940000165952	ENSGT00570000079101.b	ENSGT00950000182881.a.b.a.a.a	ENSGT00940000154642.d	ENSGT00940000161542	ENSGT00390000013711	ENSGT00940000154191.k.a	ENSGT00940000154849.b	ENSGT00940000155991	ENSGT00940000165465	ENSGT00940000157987	ENSGT00390000005772	ENSGT00530000063370.b	ENSGT00940000159627	ENSGT00940000163919.a #22	ENSGT00940000159932.a	ENSGT00940000168975	ENSGT00940000155760.t.a	ENSGT00950000182859.A.a.a.b	ENSGT00940000156009.A.c	ENSGT00940000164890.b	ENSGT00390000007992	ENSGT00390000001901	ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.b	ENSGT00940000156855.c	ENSGT00940000177369	ENSGT00940000154284.b	ENSGT00940000154495.b.a.a.a	ENSGT00530000063869.B	ENSGT01050000244898.b.a
Pseudocrenilabrinae	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00390000017774	ENSGT00940000165952	ENSGT00570000079101.b	ENSGT00950000182881.a.b.a.a.a	ENSGT00940000154642.d	ENSGT00940000161542	ENSGT00390000013711	ENSGT00940000154191.k.a	ENSGT00940000154849.b	ENSGT00940000155991	ENSGT00940000165465	ENSGT00940000157987	ENSGT00390000005772	ENSGT00530000063370.b	ENSGT00940000159627	ENSGT00940000163919.a #22	ENSGT00940000159932.a	ENSGT00940000168975	ENSGT00940000155760.t.a	ENSGT00950000182859.A.a.a.b	ENSGT00940000156009.A.c	ENSGT00940000164890.b	ENSGT00390000007992	ENSGT00390000001901	ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.b	ENSGT00940000156855.c	ENSGT00940000177369	ENSGT00940000154284.b	ENSGT00940000154495.b.a.a.a	ENSGT00530000063869.B	ENSGT01050000244898.b.a
Pseudocrenilabrinae_A	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00390000017774	ENSGT00940000165952	ENSGT00570000079101.b	ENSGT00950000182881.a.b.a.a.a	ENSGT00940000154642.d	ENSGT00940000161542	ENSGT00390000013711	ENSGT00940000154191.k.a	ENSGT00940000154849.b	ENSGT00940000155991	ENSGT00940000165465	ENSGT00940000157987	ENSGT00390000005772	ENSGT00530000063370.b	ENSGT00940000159627	ENSGT00940000163919.a #22	ENSGT00940000159932.a	ENSGT00940000168975	ENSGT00940000155760.t.a	ENSGT00950000182859.A.a.a.b	ENSGT00940000156009.A.c	ENSGT00940000164890.b	ENSGT00390000007992	ENSGT00390000001901	ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.b	ENSGT00940000156855.c	ENSGT00940000177369	ENSGT00940000154284.b	ENSGT00940000154495.b.a.a.a	ENSGT00530000063869.B	ENSGT01050000244898.b.a
Haplochromini	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000017774	ENSGT00940000165952	ENSGT00570000079101.b	ENSGT00950000182881.a.b.a.a.a	ENSGT00940000154642.d	ENSGT00940000161542	ENSGT00390000013711	ENSGT00940000154191.k.a	ENSGT00940000154849.b	ENSGT00940000155991	ENSGT00940000165465	ENSGT00940000157987.i	ENSGT00390000005772	ENSGT00530000063370.b	ENSGT00940000159627	ENSGT00940000163919.a #22	ENSGT00940000159932.a.a.a	ENSGT00940000168975	ENSGT00940000159932.a.a.b	ENSGT00940000155760.t.a	ENSGT00950000182859.A.a.a.b	ENSGT00940000156009.A.c	ENSGT00940000164890.b	ENSGT00390000007992	ENSGT00390000001901	ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.b	ENSGT00940000156855.c	ENSGT00940000177369	ENSGT00940000154284.b	ENSGT00940000154495.b.a.a.a	ENSGT00530000063869.B
Haplochromini_A	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000017774	ENSGT00940000165952	ENSGT00570000079101.b	ENSGT00950000182881.a.b.a.a.a	ENSGT00940000154642.d	ENSGT00940000161542	ENSGT00390000013711	ENSGT00940000154191.k.a	ENSGT00940000154849.b	ENSGT00940000155991	ENSGT00940000165465	ENSGT00940000157987.i	ENSGT00390000005772	ENSGT00530000063370.b	ENSGT00940000159627	ENSGT00940000163919.a #22	ENSGT00940000159932.a.a.a	ENSGT00940000168975	ENSGT00940000159932.a.a.b	ENSGT00940000155760.t.a	ENSGT00950000182859.A.a.a.b	ENSGT00940000156009.A.c	ENSGT00940000164890.b	ENSGT00390000007992	ENSGT00390000001901	ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.b	ENSGT00940000156855.c	ENSGT00940000154284.b	ENSGT00940000154495.b.a.a.a	ENSGT00530000063869.B	ENSGT01050000244898.b.a
Haplochromini_B	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000017774	ENSGT00940000165952	ENSGT00570000079101.b	ENSGT00950000182881.a.b.a.a.a	ENSGT00940000154642.d	ENSGT00940000161542	ENSGT00390000013711	ENSGT00940000154191.k.a	ENSGT00940000154849.b	ENSGT00940000155991	ENSGT00940000165465	ENSGT00940000157987.i	ENSGT00390000005772	ENSGT00530000063370.b	ENSGT00940000159627	ENSGT00940000163919.a #22	ENSGT00940000159932.a.a.a	ENSGT00940000168975	ENSGT00940000159932.a.a.b	ENSGT00940000155760.t.a	ENSGT00950000182859.A.a.a.b	ENSGT00940000156009.A.c	ENSGT00940000164890.b	ENSGT00390000007992	ENSGT00390000001901	ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.b	ENSGT00940000156855.c	ENSGT00940000154284.b	ENSGT00940000154495.b.a.a.a	ENSGT00530000063869.B	ENSGT01050000244898.b.a
Eastern happy	DUPLICATION
Eastern happy	MODERN SPECIES	3	pik3ip1 (ENSACLG00000025737)	ENSACLG00000025676	TCTN2 (ENSACLG00000025659)	atp6v0a2b (ENSACLG00000025635)	DNAH10 (ENSACLG00000025532)	ENSACLG00000025512	rhbdd3 (ENSACLG00000025489)	ewsr1b (ENSACLG00000025479)	ENSACLG00000025467	ap1b1 (ENSACLG00000025324)	rasl10a (ENSACLG00000025302)	osbp2b (ENSACLG00000025120)	ccdc117 (ENSACLG00000025077)	tcn2 (ENSACLG00000025066)	dguok (ENSACLG00000025037)	spaw (ENSACLG00000025031) #22	ENSACLG00000025025	ENSACLG00000024877	ENSACLG00000024871	ANK1 (ENSACLG00000024750)	ebf2 (ENSACLG00000024690)	EPX (ENSACLG00000024666)	sftpbb (ENSACLG00000024643)	usp39 (ENSACLG00000024626)	si:ch211-283h6.4 (ENSACLG00000024610)	mat2ab (ENSACLG00000024577)	INPP5J (ENSACLG00000024547)	selenom (ENSACLG00000024527)	ENSACLG00000024384	trafd1 (ENSACLG00000024115)	mob1a (ENSACLG00000024107)
Eastern happy	MODERN SPECIES	11	ENSACLG00000016991	ENSACLG00000016981	rnaseh2c (ENSACLG00000016950)	ZBTB3 (ENSACLG00000016934)	trpt1 (ENSACLG00000016893)	fermt3b (ENSACLG00000016852)	FLRT1 (ENSACLG00000016844)	macrod1 (ENSACLG00000016826)	ccdc88b (ENSACLG00000016778)	rom1b (ENSACLG00000016752)	SCYL1 (ENSACLG00000016706)	ENSACLG00000016696	ENSACLG00000016680	INTS5 (ENSACLG00000016656)	dguok (ENSACLG00000016588)	ENSACLG00000016576 #22	ENSACLG00000016553	ENSACLG00000016540	ENSACLG00000016526	INTS5 (ENSACLG00000016466)	GANAB (ENSACLG00000016318)	ENSACLG00000016115	ubxn1 (ENSACLG00000016061)	ehd1a (ENSACLG00000016016)	ENSACLG00000015984	ENSACLG00000015968	ttc9c (ENSACLG00000015943)	ENSACLG00000015902	dpf2l (ENSACLG00000015806)	ENSACLG00000015702	zdhhc24 (ENSACLG00000015687)
Zebra mbuna	MODERN SPECIES	1094	pik3ip1 (ENSMZEG00005017332)	ENSMZEG00005017340	TCTN2 (ENSMZEG00005017348)	atp6v0a2b (ENSMZEG00005017354)	DNAH10 (ENSMZEG00005017374)	EMID1 (ENSMZEG00005017404)	rhbdd3 (ENSMZEG00005017411)	ewsr1b (ENSMZEG00005017417)	ENSMZEG00005017426	ap1b1 (ENSMZEG00005017449)	rasl10a (ENSMZEG00005017480)	osbp2b (ENSMZEG00005017484)	ccdc117 (ENSMZEG00005017489)	tcn2 (ENSMZEG00005017492)	dguok (ENSMZEG00005017502)	spaw (ENSMZEG00005017508) #22	ENSMZEG00005017513	ank1a (ENSMZEG00005000122)	ENSMZEG00005000185	ANK1 (ENSMZEG00005000212)	ebf2 (ENSMZEG00005000407)	ENSMZEG00005000474	sftpbb (ENSMZEG00005000483)	usp39 (ENSMZEG00005000493)	si:ch211-283h6.4 (ENSMZEG00005000502)	mat2ab (ENSMZEG00005000513)	INPP5J (ENSMZEG00005000556)	selenom (ENSMZEG00005000599)	ENSMZEG00005000638	trafd1 (ENSMZEG00005000674)	mob1a (ENSMZEG00005000685)
P. nyererei	MODERN SPECIES	301	limk2 (ENSPNYG00000015560)	pik3ip1 (ENSPNYG00000015540)	ENSPNYG00000015479	ENSPNYG00000015443	atp6v0a2b (ENSPNYG00000015418)	DNAH10 (ENSPNYG00000015288)	rhbdd3 (ENSPNYG00000015271)	ewsr1b (ENSPNYG00000015252)	ENSPNYG00000015234	ap1b1 (ENSPNYG00000015181)	rasl10a (ENSPNYG00000015164)	osbp2b (ENSPNYG00000015141)	ccdc117 (ENSPNYG00000015132)	tcn2 (ENSPNYG00000015100)	dguok (ENSPNYG00000015086)	spaw (ENSPNYG00000015072) #22	ENSPNYG00000015057	ank1a (ENSPNYG00000015041)	ENSPNYG00000015028	ANK1 (ENSPNYG00000014921)	ebf2 (ENSPNYG00000014874)	EPX (ENSPNYG00000014825)	sftpbb (ENSPNYG00000014796)	usp39 (ENSPNYG00000014771)	si:ch211-283h6.4 (ENSPNYG00000014754)	mat2ab (ENSPNYG00000014731)	INPP5J (ENSPNYG00000014708)	selenom (ENSPNYG00000014691)	ENSPNYG00000014671	trafd1 (ENSPNYG00000014646)	mob1a (ENSPNYG00000014622)
Burton s mouthbrooder	MODERN SPECIES	283	pik3ip1 (ENSHBUG00000005382)	ENSHBUG00000005395	TCTN2 (ENSHBUG00000005423)	atp6v0a2b (ENSHBUG00000005437)	DNAH10 (ENSHBUG00000005590)	ENSHBUG00000005632	rhbdd3 (ENSHBUG00000005613)	ewsr1b (ENSHBUG00000005646)	ENSHBUG00000005651	ap1b1 (ENSHBUG00000005689)	rasl10a (ENSHBUG00000005695)	osbp2b (ENSHBUG00000006005)	ccdc117 (ENSHBUG00000006040)	tcn2 (ENSHBUG00000006050)	dguok (ENSHBUG00000006069)	spaw (ENSHBUG00000006084) #22	ENSHBUG00000006107	ANK1 (ENSHBUG00000006749)	ebf2 (ENSHBUG00000006879)	EPX (ENSHBUG00000006922)	ENSHBUG00000006940	sftpbb (ENSHBUG00000006951)	usp39 (ENSHBUG00000006958)	si:ch211-283h6.4 (ENSHBUG00000006968)	mat2ab (ENSHBUG00000006986)	ENSHBUG00000007022	ENSHBUG00000007040	selenom (ENSHBUG00000007053)	ENSHBUG00000007110	trafd1 (ENSHBUG00000007131)	mob1a (ENSHBUG00000007149)
Nile tilapia	MODERN SPECIES	3	ENSONIG00000035899	TCTN2 (ENSONIG00000013395)	atp6v0a2b (ENSONIG00000013387)	DNAH10 (ENSONIG00000013386)	EMID1 (ENSONIG00000013382)	ENSONIG00000034830	ENSONIG00000038334	ewsr1b (ENSONIG00000013378)	ENSONIG00000031046	ap1b1 (ENSONIG00000013367)	rasl10a (ENSONIG00000013366)	osbp2b (ENSONIG00000013361)	ccdc117 (ENSONIG00000030854)	tcn2 (ENSONIG00000013356)	dguok (ENSONIG00000013353)	spaw (ENSONIG00000013352) #22	ENSONIG00000032534	ANK1 (ENSONIG00000013350)	ebf2 (ENSONIG00000013342)	EPX (ENSONIG00000013339)	ENSONIG00000034091	ENSONIG00000041154	usp39 (ENSONIG00000013330)	si:ch211-283h6.4 (ENSONIG00000013329)	mat2ab (ENSONIG00000003555)	ENSONIG00000013324	selenom (ENSONIG00000035340)	ENSONIG00000027517	ENSONIG00000039913	trafd1 (ENSONIG00000013316)	mob1a (ENSONIG00000013313)
Midas cichlid	MODERN SPECIES	355	TCTN2 (ENSACIG00000011169)	atp6v0a2b (ENSACIG00000011128)	ENSACIG00000011060	ENSACIG00000011046	ENSACIG00000011031	ENSACIG00000010924	ENSACIG00000010882	rhbdd3 (ENSACIG00000010864)	ewsr1b (ENSACIG00000010829)	ENSACIG00000010816	ap1b1 (ENSACIG00000010776)	rasl10a (ENSACIG00000010764)	osbp2b (ENSACIG00000010707)	tcn2 (ENSACIG00000010678)	dguok (ENSACIG00000010634)	spaw (ENSACIG00000010618) #22	EIF4EBP1 (ENSACIG00000010565)	ank1a (ENSACIG00000010550)	ENSACIG00000010539	ANK1 (ENSACIG00000010428)	ebf2 (ENSACIG00000010391)	ENSACIG00000010366	ENSACIG00000010354
Tiger tail seahorse	MODERN SPECIES	89	atp6v0a2b (ENSHCOG00000010103)	ENSHCOG00000010409	ENSHCOG00000010480	ENSHCOG00000010508	ENSHCOG00000010523	ENSHCOG00000010538	rhbdd3 (ENSHCOG00000010554)	ewsr1b (ENSHCOG00000010568)	GAS2L1 (ENSHCOG00000010610)	ap1b1 (ENSHCOG00000000717)	rasl10a (ENSHCOG00000010738)	osbp2b (ENSHCOG00000010856)	ccdc117 (ENSHCOG00000010870)	tcn2 (ENSHCOG00000010885)	dguok (ENSHCOG00000010891)	spaw (ENSHCOG00000010909) #22	ENSHCOG00000010913	ank1a (ENSHCOG00000010924)	ENSHCOG00000010936	ANK1 (ENSHCOG00000010970)	ebf2 (ENSHCOG00000011002)	ENSHCOG00000011008	sftpbb (ENSHCOG00000011021)	usp39 (ENSHCOG00000011034)	si:ch211-283h6.4 (ENSHCOG00000011042)	mat2ab (ENSHCOG00000011076)	INPP5J (ENSHCOG00000000342)	selenom (ENSHCOG00000011125)	ENSHCOG00000011145	trafd1 (ENSHCOG00000011162)	mob1a (ENSHCOG00000011169)
Pinecone sodierfish	MODERN SPECIES	23	pik3ip1 (ENSMMDG00005021124)	ENSMMDG00005021129	TCTN2 (ENSMMDG00005021135)	atp6v0a2b (ENSMMDG00005021153)	ENSMMDG00005021468	ENSMMDG00005021470	rhbdd3 (ENSMMDG00005001008)	ewsr1b (ENSMMDG00005001067)	GAS2L1 (ENSMMDG00005001149)	ap1b1 (ENSMMDG00005004197)	rasl10a (ENSMMDG00005013324)	osbp2b (ENSMMDG00005013520)	ccdc117 (ENSMMDG00005014065)	tcn2 (ENSMMDG00005014074)	dguok (ENSMMDG00005014110)	spaw (ENSMMDG00005014169) #22	ENSMMDG00005014235	ank1a (ENSMMDG00005014268)	ANK1 (ENSMMDG00005014687)	ebf2 (ENSMMDG00005016341)	ENSMMDG00005016571	sftpbb (ENSMMDG00005017119)	usp39 (ENSMMDG00005017241)	si:ch211-283h6.4 (ENSMMDG00005017361)	mat2ab (ENSMMDG00005017383)	ENSMMDG00005017446	selenom (ENSMMDG00005017463)	ENSMMDG00005017475	trafd1 (ENSMMDG00005017508)	mob1a (ENSMMDG00005017567)	mthfd2 (ENSMMDG00005017633)
Cod	MODERN SPECIES	19	TCTN2 (ENSGMOG00000029786)	ENSGMOG00000033601	ENSGMOG00000011675	ENSGMOG00000034351	ENSGMOG00000025569	ENSGMOG00000024604	ewsr1b (ENSGMOG00000012263)	ENSGMOG00000028777	ENSGMOG00000027229	ap1b1 (ENSGMOG00000012252)	rasl10a (ENSGMOG00000012248)	osbp2b (ENSGMOG00000012242)	ENSGMOG00000012237	ENSGMOG00000012233	ENSGMOG00000012228	ENSGMOG00000033364 #22	ENSGMOG00000012219	ENSGMOG00000012205	ENSGMOG00000012199	ENSGMOG00000012193	sftpbb (ENSGMOG00000012190)	ENSGMOG00000012185	si:ch211-283h6.4 (ENSGMOG00000017308)	mat2ab (ENSGMOG00000025352)	ENSGMOG00000012173	selenom (ENSGMOG00000025188)	ENSGMOG00000012158	ENSGMOG00000012156	mob1a (ENSGMOG00000003937)	mthfd2 (ENSGMOG00000012153)	arl6ip4 (ENSGMOG00000012151)
Protacanthopterygii	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000159434	ENSGT00940000165466.c	ENSGT00940000159133	ENSGT00390000017774	ENSGT00940000165952	ENSGT00570000079101.b	ENSGT00950000182881.a.b.a.a.a	ENSGT00940000154642.d	ENSGT00940000154849.b	ENSGT00940000155991	ENSGT00940000165465	ENSGT00940000157987	ENSGT00390000005772	ENSGT00530000063370.b	ENSGT00940000159627	ENSGT00940000163919.a #22	ENSGT00940000159932.a	ENSGT00940000168975	ENSGT00940000155760.t.a	ENSGT00950000182859.A.a.a.b	ENSGT00940000156009.A.c	ENSGT00940000164890.b	ENSGT00390000007992	ENSGT00390000001901	ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.b	ENSGT00940000156855.c	ENSGT00940000154284.b	ENSGT00940000154495.b.a.a.a	ENSGT00530000063869.B	ENSGT01050000244898.b.a	ENSGT00940000164825
Salmoninae	DUPLICATION
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000159434.g	ENSGT00940000165466.c.a	ENSGT00940000159133.l	ENSGT00390000017774.d	ENSGT00940000165952	ENSGT00950000182881.a.b.a.a.a.h	ENSGT00940000154642.d	ENSGT00940000161716.fc.b	ENSGT00940000154191.k.a.g	ENSGT00940000154849.b.i	ENSGT00940000155991.z	ENSGT00940000165465.d	ENSGT00940000157987.k	ENSGT00390000005772.l	ENSGT00530000063370.b.d	ENSGT00940000163919.a.e #22	ENSGT00940000159932.a.e	ENSGT00940000168975	ENSGT00940000155760.t.a.e	ENSGT00950000182859.A.a.a.b.u	ENSGT00950000182859.A.a.a.b.v	ENSGT00940000156009.A.c	ENSGT00940000164890.b	ENSGT00390000007992.g	ENSGT00390000001901.a	ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.b.j	ENSGT00940000156855.c.a	ENSGT00940000161655	ENSGT00530000063869.B.l	ENSGT01050000244898.b.a.u	ENSGT00940000164825.h
Huchen	MODERN SPECIES	1670														osbp2b (ENSHHUG00000048863)	tcn2 (ENSHHUG00000048846)	spaw (ENSHHUG00000048843) #22	ENSHHUG00000048823	ANK1 (ENSHHUG00000047770)	ENSHHUG00000047758
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000159434.g	ENSGT00940000165466.c.a	ENSGT00940000159133.l	ENSGT00390000017774.d	ENSGT00940000165952	ENSGT00950000182881.a.b.a.a.a.h	ENSGT00940000154642.d	ENSGT00940000161716.fc.b	ENSGT00940000154191.k.a.g	ENSGT00940000154849.b.i	ENSGT00940000155991.z	ENSGT00940000165465.d	ENSGT00940000157987.k	ENSGT00390000005772.l	ENSGT00530000063370.b.d	ENSGT00940000163919.a.e #22	ENSGT00940000159932.a.e	ENSGT00940000168975	ENSGT00940000155760.t.a.e	ENSGT00950000182859.A.a.a.b.v	ENSGT00940000164890.b	ENSGT00390000007992.g	ENSGT00390000001901.a	ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.b.j	ENSGT00940000156855.c.a	ENSGT00990000210636	ENSGT00940000161655	ENSGT00530000063869.B.l	ENSGT01050000244898.b.a.u	ENSGT00940000164825.h	ENSGT00940000153849.a.a.a.a
Salmo	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000159434.g	ENSGT00940000165466.c.a	ENSGT00940000159133.l	ENSGT00390000017774.d	ENSGT00940000165952	ENSGT00950000182881.a.b.a.a.a.h	ENSGT00940000154642.d	ENSGT00940000161716.fc.b	ENSGT00940000154191.k.a.g	ENSGT00940000154849.b.i	ENSGT00940000155991.z	ENSGT00940000165465.d	ENSGT00940000157987.k	ENSGT00390000005772.l	ENSGT00530000063370.b.d	ENSGT00940000163919.a.e #22	ENSGT00940000159932.a.e	ENSGT00940000168975	ENSGT00940000155760.t.a.e	ENSGT00950000182859.A.a.a.b.v	ENSGT00940000164890.b	ENSGT00390000007992.g	ENSGT00390000001901.a	ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.b.j	ENSGT00940000156855.c.a	ENSGT00990000210636	ENSGT00940000161655	ENSGT00530000063869.B.l	ENSGT01050000244898.b.a.u	ENSGT00940000164825.h	ENSGT00390000009670.i
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	16	p3ip1 (ENSSSAG00000009554)	ENSSSAG00000009577	ENSSSAG00000088920	ENSSSAG00000086554	ENSSSAG00000009798	ENSSSAG00000086395	ENSSSAG00000042424	ENSSSAG00000043752	ENSSSAG00000043782	ENSSSAG00000114096	ap1b1 (ENSSSAG00000043938)	rasl10a (ENSSSAG00000093910)	osbp2b (ENSSSAG00000047180)	ENSSSAG00000047333	tcn2 (ENSSSAG00000047340)	ENSSSAG00000099535 #22	ENSSSAG00000047398	ENSSSAG00000047949	ENSSSAG00000072528	ENSSSAG00000112111	sftpbb (ENSSSAG00000072540)	ENSSSAG00000072571	si:ch211-283h6.4 (ENSSSAG00000078449)	ENSSSAG00000072813	ENSSSAG00000072852	ENSSSAG00000072863	ENSSSAG00000072880	mob1a (ENSSSAG00000085563)	mthfd2 (ENSSSAG00000072915)	arl6ip4 (ENSSSAG00000121888)	ENSSSAG00000113809
River trout	MODERN SPECIES	19	si:ch211-225b11.1 (ENSSTUG00000035799)	limk2 (ENSSTUG00000035895)	pik3ip1 (ENSSTUG00000038586)	ENSSTUG00000038623	atp6v0a2b (ENSSTUG00000038741)	DNAH10 (ENSSTUG00000041111)	ENSSTUG00000043495	EWSR1 (ENSSTUG00000043597)	ENSSTUG00000043624	ENSSTUG00000043641	ap1b1 (ENSSTUG00000043694)	rasl10a (ENSSTUG00000044520)	osbp2b (ENSSTUG00000044554)	ccdc117 (ENSSTUG00000045160)	tcn2 (ENSSTUG00000045173)	spaw (ENSSTUG00000045213) #22	ENSSTUG00000045230	ANK1 (ENSSTUG00000045262)	ENSSTUG00000045804	ENSSTUG00000045812	ebf2 (ENSSTUG00000045822)	sftpbb (ENSSTUG00000045875)	usp39 (ENSSTUG00000045908)	si:ch211-283h6.4 (ENSSTUG00000046165)	MAT2A (ENSSTUG00000046181)	INPP5J (ENSSTUG00000046214)	ENSSTUG00000046314	ENSSTUG00000046323	trafd1 (ENSSTUG00000046414)	mob1a (ENSSTUG00000046433)	mthfd2 (ENSSTUG00000046457)
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000159434.g	ENSGT00940000165466.c.a	ENSGT00940000159133.l	ENSGT00390000017774.d	ENSGT00940000165952	ENSGT00950000182881.a.b.a.a.a.h	ENSGT00940000154642.d	ENSGT00940000161716.fc.b	ENSGT00940000154191.k.a.g	ENSGT00940000154849.b.i	ENSGT00940000155991.z	ENSGT00940000165465.d	ENSGT00940000157987.k	ENSGT00390000005772.l	ENSGT00530000063370.b.d	ENSGT00940000163919.a.e #22	ENSGT00940000159932.a.e	ENSGT00940000168975	ENSGT00940000155760.t.a.e	ENSGT00950000182859.A.a.a.b.v	ENSGT00940000164890.b	ENSGT00390000007992.g	ENSGT00390000001901.a	ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.b.j	ENSGT00940000156855.c.a	ENSGT00990000210636	ENSGT00940000161655	ENSGT00940000154495.b.a.a.a.a	ENSGT00530000063869.B.l	ENSGT01050000244898.b.a.u	ENSGT00940000164825.h
Rainbow trout	MODERN SPECIES	27	si:ch211-225b11.1 (ENSOMYG00000012922)	limk2 (ENSOMYG00000012102)	pik3ip1 (ENSOMYG00000011993)	ENSOMYG00000011939	ENSOMYG00000011467	ENSOMYG00000010653	ENSOMYG00000010245	ENSOMYG00000010211	ENSOMYG00000010174	ap1b1 (ENSOMYG00000009232)	rasl10a (ENSOMYG00000008830)	ENSOMYG00000062703	osbp2b (ENSOMYG00000008766)	ENSOMYG00000008546	ENSOMYG00000008513	ENSOMYG00000008475 #22	4ebp2 (ENSOMYG00000008455)	ENSOMYG00000007762	ENSOMYG00000007222	ENSOMYG00000061983	si:ch211-283h6.4 (ENSOMYG00000007196)	usp39 (ENSOMYG00000006991)	ENSOMYG00000006729	ENSOMYG00000047842	ENSOMYG00000052863	ENSOMYG00000006647	ENSOMYG00000006639	ENSOMYG00000006605	ENSOMYG00000006539	ENSOMYG00000006484	ENSOMYG00000006371
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000159434.g	ENSGT00940000165466.c.a	ENSGT00940000159133.l	ENSGT00390000017774.d	ENSGT00940000165952	ENSGT00950000182881.a.b.a.a.a.h	ENSGT00940000154642.d	ENSGT00940000161716.fc.b	ENSGT00940000154191.k.a.g	ENSGT00940000155755.b	ENSGT00940000155991.z	ENSGT00940000165465.d	ENSGT00940000157987.k	ENSGT00390000005772.l	ENSGT00530000063370.b.d	ENSGT00940000163919.a.e #22	ENSGT00940000159932.a.e	ENSGT00940000168975	ENSGT00940000155760.t.a.e	ENSGT00950000182859.A.a.a.b.v	ENSGT00940000164890.b	ENSGT00390000007992.g	ENSGT00390000001901.a	ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.b.j	ENSGT00940000156855.c.a	ENSGT00990000210636	ENSGT00940000154495.b.a.a.a.a	ENSGT00530000063869.B.l	ENSGT01050000244898.b.a.u	ENSGT00940000164825.h	ENSGT00940000153849.a.a.a.a
Chinook salmon	MODERN SPECIES	28	rasl10a (ENSOTSG00005028410)	si:ch211-225b11.1 (ENSOTSG00005028407)	limk2 (ENSOTSG00005025542)	pik3ip1 (ENSOTSG00005025538)	ENSOTSG00005025535	atp6v0a2b (ENSOTSG00005020507)	DNAH10 (ENSOTSG00005020462)	ENSOTSG00005020454	ENSOTSG00005020451	ENSOTSG00005020446	ap1b1 (ENSOTSG00005020318)	rasl10a (ENSOTSG00005020313)	osbp2b (ENSOTSG00005020312)	ccdc117 (ENSOTSG00005020311)	tcn2 (ENSOTSG00005020310)	spaw (ENSOTSG00005020309) #22	ENSOTSG00005020308	ENSOTSG00005020307	ANK1 (ENSOTSG00005016869)	ebf2 (ENSOTSG00005016849)	TTC28 (ENSOTSG00005016848)	PITPNB (ENSOTSG00005016847)	MN1 (ENSOTSG00005016846)	zgc:153044 (ENSOTSG00005016845)	ENSOTSG00005016843	TCF7L1 (ENSOTSG00005016546)	ube2d4 (ENSOTSG00005016539)	DBNL (ENSOTSG00005016532)	ENSOTSG00005016530	gins4 (ENSOTSG00005016529)	PHYHIP (ENSOTSG00005016528)
Coho salmon	MODERN SPECIES	22	si:ch211-225b11.1 (ENSOKIG00005020171)	limk2 (ENSOKIG00005018679)	pik3ip1 (ENSOKIG00005018601)	ENSOKIG00005018524	ENSOKIG00005017645	ENSOKIG00005017575	DNAH10 (ENSOKIG00005017130)	ENSOKIG00005017064	ENSOKIG00005017039	ENSOKIG00005017027	ap1b1 (ENSOKIG00005016827)	rasl10a (ENSOKIG00005016785)	osbp2b (ENSOKIG00005016727)	ENSOKIG00005016716	ENSOKIG00005016674	spaw (ENSOKIG00005016644) #22	ENSOKIG00005016637	ANK1 (ENSOKIG00005011563)	ENSOKIG00005011170	sftpbb (ENSOKIG00005011156)	USP39 (ENSOKIG00005010790)	si:ch211-283h6.4 (ENSOKIG00005010769)	mat2ab (ENSOKIG00005010743)	INPP5J (ENSOKIG00005010573)	ENSOKIG00005010555	ENSOKIG00005010505	mob1a (ENSOKIG00005010474)	mthfd2 (ENSOKIG00005010457)	PITPNM2 (ENSOKIG00005010291)	ENSOKIG00005010257	RILPL2 (ENSOKIG00005010237)
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	542	ENSGT00940000165466.c.b	ENSGT00940000159133.k	ENSGT00390000017774.c	ENSGT00570000079101.b	ENSGT00950000182881.a.b.a.a.a.g	ENSGT00940000161716.fc.a	ENSGT00390000013711	ENSGT00940000154191.k.a.h	ENSGT00940000154849.b.j	ENSGT00940000155991.y	ENSGT00940000165465.c	ENSGT00940000157987.l	ENSGT00390000005772.k	ENSGT00530000063370.b.c	ENSGT00940000159627	ENSGT00940000163919.a.f #22	ENSGT00940000159932.a.f	ENSGT00940000155760.t.a.f
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	31	ENSGT00940000165466.c.b	ENSGT00940000159133.k	ENSGT00390000017774.c	ENSGT00570000079101.b	ENSGT00950000182881.a.b.a.a.a.g	ENSGT00940000161716.fc.a	ENSGT00390000013711	ENSGT00940000154191.k.a.h	ENSGT00940000154849.b.j	ENSGT00940000155991.y	ENSGT00940000165465.c	ENSGT00940000157987.l	ENSGT00390000005772.k	ENSGT00530000063370.b.c	ENSGT00940000159627	ENSGT00940000163919.a.f #22	ENSGT00940000159932.a.f	ENSGT00940000155760.t.a.f	ENSGT00950000182859.A.a.a.b.u	ENSGT00940000177137	ENSGT00390000007992.h	ENSGT00390000001901.b	ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.b.i	ENSGT00940000156855.c.b	ENSGT00940000154284.b	ENSGT00940000154495.b.b.a.a	ENSGT00530000063869.B.k	ENSGT01050000244898.b.a.v	ENSGT00940000164825.g	ENSGT00390000009670	ENSGT00940000153849.a.a.a.b
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000165466.c.b	ENSGT00940000159133.k	ENSGT00390000017774.c	ENSGT00570000079101.b	ENSGT00950000182881.a.b.a.a.a.g	ENSGT00940000161716.fc.a	ENSGT00390000013711	ENSGT00940000154191.k.a.h	ENSGT00940000154849.b.j	ENSGT00940000155991.y	ENSGT00940000165465.c	ENSGT00940000157987.l	ENSGT00390000005772.k	ENSGT00530000063370.b.c	ENSGT00940000159627	ENSGT00940000163919.a.f #22	ENSGT00940000159932.a.f	ENSGT00940000155760.t.a.f	ENSGT00950000182859.A.a.a.b.u	ENSGT00390000007992.h	ENSGT00390000001901.b	ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.b.i	ENSGT00940000156855.c.b	ENSGT00940000154284.b	ENSGT00940000154495.b.b.a.a	ENSGT00530000063869.B.k	ENSGT01050000244898.b.a.v	ENSGT00940000164825.g	ENSGT00390000009670	ENSGT00940000153849.a.a.a.b	ENSGT00390000012759
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000165466.c.b	ENSGT00940000159133.k	ENSGT00390000017774.c	ENSGT00570000079101.b	ENSGT00950000182881.a.b.a.a.a.g	ENSGT00940000161716.fc.a	ENSGT00390000013711	ENSGT00940000154191.k.a.h	ENSGT00940000154849.b.j	ENSGT00940000155991.y	ENSGT00940000165465.c	ENSGT00940000157987.l	ENSGT00390000005772.k	ENSGT00530000063370.b.c	ENSGT00940000159627	ENSGT00940000163919.a.f #22	ENSGT00940000159932.a.f	ENSGT00940000155760.t.a.f	ENSGT00950000182859.A.a.a.b.u	ENSGT00390000007992.h	ENSGT00390000001901.b	ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.b.i	ENSGT00940000156855.c.b	ENSGT00940000154284.b	ENSGT00940000154495.b.b.a.a	ENSGT00940000154495.b.a.a.a.b	ENSGT00530000063869.B.k	ENSGT01050000244898.b.a.v	ENSGT00940000164825.g	ENSGT00390000009670	ENSGT00940000153849.a.a.a.b
Chinook salmon	MODERN SPECIES	3	dao.2 (ENSOTSG00005027231)	SSH1 (ENSOTSG00005027256)	coro1ca (ENSOTSG00005027258)	selplg (ENSOTSG00005027272)	ENSOTSG00005027274	ENSOTSG00005027275	si:ch211-191d15.2 (ENSOTSG00005027277)	sart3 (ENSOTSG00005027309)	ficd (ENSOTSG00005027766)	ENSOTSG00005027768	cmklr1 (ENSOTSG00005027769)	osbp2b (ENSOTSG00005027770)	ccdc117 (ENSOTSG00005027771)	tcn2 (ENSOTSG00005027773)	dguok (ENSOTSG00005027774)	spaw (ENSOTSG00005027779) #22	ENSOTSG00005027780	ANK1 (ENSOTSG00005027795)	ebf2 (ENSOTSG00005027968)	usp39 (ENSOTSG00005027973)	si:ch211-283h6.4 (ENSOTSG00005027978)	mat2ab (ENSOTSG00005027980)	INPP5J (ENSOTSG00005027983)	selenom (ENSOTSG00005027986)	ENSOTSG00005027987	trafd1 (ENSOTSG00005027988)	mob1a (ENSOTSG00005027990)	mthfd2 (ENSOTSG00005027993)	arl6ip4 (ENSOTSG00005027994)	PITPNM2 (ENSOTSG00005027997)	mtrfr (ENSOTSG00005027998)
Coho salmon	MODERN SPECIES	28	si:ch211-225b11.1 (ENSOKIG00005050520)	limk2 (ENSOKIG00005050553)	pik3ip1 (ENSOKIG00005050679)	ENSOKIG00005050685	atp6v0a2b (ENSOKIG00005050692)	ENSOKIG00005050705	ENSOKIG00005050710	ENSOKIG00005050713	ENSOKIG00005050722	ap1b1 (ENSOKIG00005050804)	rasl10a (ENSOKIG00005050874)	osbp2b (ENSOKIG00005050876)	ccdc117 (ENSOKIG00005050879)	tcn2 (ENSOKIG00005050880)	dguok (ENSOKIG00005050881)	ENSOKIG00005050882 #22	ENSOKIG00005050883	ANK1 (ENSOKIG00005002253)	ebf2 (ENSOKIG00005003662)	usp39 (ENSOKIG00005003695)	si:ch211-283h6.4 (ENSOKIG00005003885)	mat2ab (ENSOKIG00005003893)	INPP5J (ENSOKIG00005003917)	selenom (ENSOKIG00005003928)	ENSOKIG00005003936	trafd1 (ENSOKIG00005003968)	mob1a (ENSOKIG00005003989)	mthfd2 (ENSOKIG00005004018)	arl6ip4 (ENSOKIG00005004041)	PITPNM2 (ENSOKIG00005004095)	mtrfr (ENSOKIG00005004198)
Rainbow trout	MODERN SPECIES	2	ENSOMYG00000027314	ENSOMYG00000026727	ENSOMYG00000064322	ENSOMYG00000059046	ENSOMYG00000026451	rhbdd3 (ENSOMYG00000026439)	ENSOMYG00000026421	ENSOMYG00000026411	ap1b1 (ENSOMYG00000018182)	rasl10a (ENSOMYG00000017985)	ENSOMYG00000051115	osbp2b (ENSOMYG00000017899)	ENSOMYG00000054433	ENSOMYG00000017864	ENSOMYG00000017859	ENSOMYG00000017819 #22	ENSOMYG00000017797	ENSOMYG00000016871	ENSOMYG00000016198	ENSOMYG00000048901	ENSOMYG00000016120	ENSOMYG00000016103	mat2ab (ENSOMYG00000015990)	ENSOMYG00000060185	ENSOMYG00000015968	selenom (ENSOMYG00000015958)	ENSOMYG00000015944	ENSOMYG00000015930	mob1a (ENSOMYG00000015896)	mthfd2 (ENSOMYG00000015879)	arl6ip4 (ENSOMYG00000015866)
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000165466.c.b	ENSGT00940000159133.k	ENSGT00390000017774.c	ENSGT00570000079101.b	ENSGT00950000182881.a.b.a.a.a.g	ENSGT00940000161716.fc.a	ENSGT00940000168755	ENSGT00940000154191.k.a.h	ENSGT00940000154849.b.j	ENSGT00940000155991.y	ENSGT00940000165465.c	ENSGT00940000157987.l	ENSGT00390000005772.k	ENSGT00530000063370.b.c	ENSGT00940000159627	ENSGT00940000163919.a.f #22	ENSGT00940000159932.a.f	ENSGT00940000155760.t.a.f	ENSGT00950000182859.A.a.a.b.u	ENSGT00940000177137	ENSGT00390000007992.h	ENSGT00390000001901.b	ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.b.i	ENSGT00940000156855.c.b	ENSGT00940000154284.b	ENSGT00940000154495.b.b.a.a	ENSGT00940000154495.b.a.a.a.b	ENSGT00530000063869.B.k	ENSGT01050000244898.b.a.v	ENSGT00940000164825.g	ENSGT00390000009670.j
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	12	cmklr1 (ENSSSAG00000098881)	wscd2 (ENSSSAG00000059290)	si:ch211-225b11.1 (ENSSSAG00000105626)	limk2 (ENSSSAG00000056048)	pik3ip1 (ENSSSAG00000104588)	tctn2 (ENSSSAG00000055994)	ENSSSAG00000054796	ENSSSAG00000054756	ENSSSAG00000054745	ENSSSAG00000054753	ENSSSAG00000115278	ap1b1 (ENSSSAG00000045173)	rasl10a (ENSSSAG00000102699)	osbp2b (ENSSSAG00000083409)	ENSSSAG00000078812	ENSSSAG00000078805 #22	ENSSSAG00000078817	ENSSSAG00000078696	ENSSSAG00000078487	ENSSSAG00000078479	ENSSSAG00000078457	ENSSSAG00000119750	ENSSSAG00000078438	ENSSSAG00000113960	ENSSSAG00000084575	ENSSSAG00000078321	ENSSSAG00000096051	mob1a (ENSSSAG00000113921)	mthfd2 (ENSSSAG00000078312)	arl6ip4 (ENSSSAG00000078307)	ENSSSAG00000077962
River trout	MODERN SPECIES	39	pik3ip1 (ENSSTUG00000029191)	ENSSTUG00000029188	ENSSTUG00000029170	atp6v0a2b (ENSSTUG00000028973)	ENSSTUG00000028909	ENSSTUG00000028896	ENSSTUG00000028888	ENSSTUG00000028852	ENSSTUG00000028834	ap1b1 (ENSSTUG00000021717)	rasl10a (ENSSTUG00000021203)	osbp2b (ENSSTUG00000021137)	ccdc117 (ENSSTUG00000021099)	tcn2 (ENSSTUG00000021080)	dguok (ENSSTUG00000021071)	ENSSTUG00000021069 #22	ENSSTUG00000021063	ANK1 (ENSSTUG00000020287)	ebf2 (ENSSTUG00000020075)	usp39 (ENSSTUG00000019726)	si:ch211-283h6.4 (ENSSTUG00000019696)	mat2ab (ENSSTUG00000019611)	INPP5J (ENSSTUG00000019602)	selenom (ENSSTUG00000019597)	ENSSTUG00000019549	trafd1 (ENSSTUG00000019462)	mthfd2 (ENSSTUG00000019389)	arl6ip4 (ENSSTUG00000019351)	PITPNM2 (ENSSTUG00000015984)	mtrfr (ENSSTUG00000015831)	kmt5ab (ENSSTUG00000015790)
Huchen	MODERN SPECIES	568	ENSHHUG00000028213	ENSHHUG00000028220	atp6v0a2b (ENSHHUG00000028237)	ENSHHUG00000028444	rhbdd3 (ENSHHUG00000028452)	ENSHHUG00000028457	GAS2L1 (ENSHHUG00000028468)	ap1b1 (ENSHHUG00000028487)	rasl10a (ENSHHUG00000029911)	ENSHHUG00000029918	osbp2b (ENSHHUG00000029926)	hnrnpr (ENSHHUG00000029934)	ccdc117 (ENSHHUG00000029952)	tcn2 (ENSHHUG00000029954)	dguok (ENSHHUG00000029963)	ENSHHUG00000029966 #22	ENSHHUG00000029970	ANK1 (ENSHHUG00000030006)
Northern pike	MODERN SPECIES	12	limk2 (ENSELUG00000013243)	pik3ip1 (ENSELUG00000013299)	ENSELUG00000013326	ENSELUG00000013371	atp6v0a2b (ENSELUG00000013399)	ENSELUG00000013535	rhbdd3 (ENSELUG00000013543)	ewsr1b (ENSELUG00000013575)	ENSELUG00000013595	ap1b1 (ENSELUG00000000507)	rasl10a (ENSELUG00000024787)	osbp2b (ENSELUG00000013786)	ccdc117 (ENSELUG00000030504)	tcn2 (ENSELUG00000013831)	dguok (ENSELUG00000013881)	spaw (ENSELUG00000013899) #22	EIF4EBP1 (ENSELUG00000013938)	ANK1 (ENSELUG00000001055)	ebf2 (ENSELUG00000014143)	EPX (ENSELUG00000001173)	sftpbb (ENSELUG00000014234)	usp39 (ENSELUG00000014265)	si:ch211-283h6.4 (ENSELUG00000027450)	mat2ab (ENSELUG00000014295)	INPP5J (ENSELUG00000014418)	selenom (ENSELUG00000026520)	ENSELUG00000014606	trafd1 (ENSELUG00000014733)	mob1a (ENSELUG00000014804)	mthfd2 (ENSELUG00000014848)	arl6ip4 (ENSELUG00000014864)
Otomorpha	ANCESTRAL SPECIES	443							ENSGT00940000161655	ENSGT00940000154284.b	ENSGT00940000156855.c	ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.b	ENSGT00390000001901	ENSGT00390000007992	ENSGT00940000156009.A.c	ENSGT00940000155760.u	ENSGT00950000182859.A.a.a.b	ENSGT00940000163919.a #22	ENSGT00940000155760.t.a
Otophysi	ANCESTRAL SPECIES	256					ENSGT00940000156859	ENSGT00490000043385	ENSGT00940000155998	ENSGT00940000161655	ENSGT00940000154284.b	ENSGT00940000177369	ENSGT00940000156855.c	ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.b	ENSGT00390000001901	ENSGT00390000007992	ENSGT00940000164890.b	ENSGT00940000163919.a #22	ENSGT00940000155760.t.a	ENSGT00950000182859.A.a.a.b	ENSGT00940000159627	ENSGT01050000244898.b.a	ENSGT00940000164825	ENSGT00390000009670	ENSGT00940000153849.a.a.a	ENSGT00390000012759	ENSGT00940000163293.c.a	ENSGT00940000160182	ENSGT00940000157897.b	ENSGT00940000153594.c.e.a
Characiphysae	ANCESTRAL SPECIES	129	ENSGT00940000159009	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000158691	ENSGT00390000001803	ENSGT00940000153241.A.cb	ENSGT00490000043385	ENSGT00940000155998	ENSGT00940000161655	ENSGT00940000154284.b	ENSGT00940000177369	ENSGT00940000156855.c	ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.b	ENSGT00390000001901	ENSGT00390000007992	ENSGT00940000164890.b	ENSGT00940000163919.a #22	ENSGT00940000155760.t.a	ENSGT00950000182859.A.a.a.b	ENSGT00940000159627	ENSGT01050000244898.b.a	ENSGT00940000164825	ENSGT00390000009670	ENSGT00940000153849.a.a.a	ENSGT00390000012759	ENSGT00940000163293.c.a	ENSGT00940000160182	ENSGT00940000157897.b	ENSGT00940000153594.c.e.a
Channel catfish	MODERN SPECIES	14	bcl7a (ENSIPUG00000020390)	alkbh2 (ENSIPUG00000020407)	ung (ENSIPUG00000020417)	mlxip (ENSIPUG00000020430)	sra1 (ENSIPUG00000020481)	psat1 (ENSIPUG00000020490)	isca1 (ENSIPUG00000020544)	CCNO (ENSIPUG00000020561)	ENSIPUG00000020568	ENSIPUG00000020584	selenom (ENSIPUG00000020604)	INPP5J (ENSIPUG00000020611)	MAT2A (ENSIPUG00000020619)	c22h2orf68 (ENSIPUG00000020652)	usp39 (ENSIPUG00000020671)	spaw (ENSIPUG00000020679) #22	ank1a (ENSIPUG00000020684)	ebf2 (ENSIPUG00000020735)	dguok (ENSIPUG00000020750)	mob1a (ENSIPUG00000020754)	MTHFD2 (ENSIPUG00000020776)	arl6ip4 (ENSIPUG00000020789)	mtrfr (ENSIPUG00000020793)	rilpl2 (ENSIPUG00000020800)	kmt5ab (ENSIPUG00000020804)	HIP1R (ENSIPUG00000020815)	SDS (ENSIPUG00000020866)	HECTD4 (ENSIPUG00000020876)	ENSIPUG00000020935	ENSIPUG00000020947	SVOP (ENSIPUG00000020994)
Characiphysae_b	ANCESTRAL SPECIES	183								ENSGT00940000161655	ENSGT00940000154284.b	ENSGT00940000177369	ENSGT00940000156855.c	ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.b	ENSGT00390000001901	ENSGT00390000007992	ENSGT00940000164890.b	ENSGT00940000163919.a #22	ENSGT00940000155760.t.a	ENSGT00950000182859.A.a.a.b	ENSGT00940000159627	ENSGT01050000244898.b.a	ENSGT00940000164825	ENSGT00390000009670	ENSGT00940000153849.a.a.a	ENSGT00390000012759	ENSGT00940000163293.c.a	ENSGT00940000160182	ENSGT00940000157897.b	ENSGT00940000153594.c.e.a
Electric eel	MODERN SPECIES	269									ENSEEEG00000004569	selenom (ENSEEEG00000004571)	INPP5J (ENSEEEG00000004572)	mat2ab (ENSEEEG00000004573)	si:ch211-283h6.4 (ENSEEEG00000004574)	usp39 (ENSEEEG00000004583)	sftpbb (ENSEEEG00000004732)	spaw (ENSEEEG00000004736) #22	ank1a (ENSEEEG00000004856)	ebf2 (ENSEEEG00000009793)	dguok (ENSEEEG00000009800)	mob1a (ENSEEEG00000009801)	mthfd2 (ENSEEEG00000009823)	arl6ip4 (ENSEEEG00000009829)	PITPNM2 (ENSEEEG00000009838)	mtrfr (ENSEEEG00000010077)	CDK2AP1 (ENSEEEG00000010078)	kmt5ab (ENSEEEG00000010082)	rilpl2 (ENSEEEG00000010083)	hip1rb (ENSEEEG00000010085)	DENND1A (ENSEEEG00000010110)	NEK6 (ENSEEEG00000010267)	psmb7 (ENSEEEG00000010340)
Characoidei	ANCESTRAL SPECIES	222								ENSGT00940000161655	ENSGT00940000154284.b	ENSGT00940000177369	ENSGT00940000156855.c	ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.b	ENSGT00390000001901	ENSGT00390000007992	ENSGT00940000164890.b	ENSGT00940000163919.a #22	ENSGT00940000155760.t.a	ENSGT00950000182859.A.a.a.b	ENSGT00940000159627	ENSGT01050000244898.b.a	ENSGT00940000164825	ENSGT00390000009670	ENSGT00940000153849.a.a.a	ENSGT00390000012759	ENSGT00940000163293.c.a	ENSGT00940000160182	ENSGT00940000157897.b	ENSGT00940000153594.c.e.a
Mexicana tetra	MODERN SPECIES	124										ENSAMXG00000038733	ENSAMXG00000035124	mat2ab (ENSAMXG00000032698)	ENSAMXG00000038290	usp39 (ENSAMXG00000021157)	sftpbb (ENSAMXG00000021161)	spaw (ENSAMXG00000021167) #22	ENSAMXG00000036948	ank1a (ENSAMXG00000021179)	ebf2 (ENSAMXG00000021198)	ENSAMXG00000036760	dguok (ENSAMXG00000019832)	mob1a (ENSAMXG00000031172)	mthfd2 (ENSAMXG00000009018)
Red-bellied piranha	MODERN SPECIES	271								SMTN (ENSPNAG00000018622)	selenom (ENSPNAG00000018679)	ENSPNAG00000003549	INPP5J (ENSPNAG00000018716)	mat2ab (ENSPNAG00000018750)	si:ch211-283h6.4 (ENSPNAG00000018774)	usp39 (ENSPNAG00000018831)	ENSPNAG00000018845	ENSPNAG00000018858 #22	ank1a (ENSPNAG00000019240)	ebf2 (ENSPNAG00000019339)	dguok (ENSPNAG00000019358)	mob1a (ENSPNAG00000019380)	mthfd2 (ENSPNAG00000019432)	arl6ip4 (ENSPNAG00000019444)	PITPNM2 (ENSPNAG00000019721)	mtrfr (ENSPNAG00000019769)	CDK2AP1 (ENSPNAG00000019785)	kmt5ab (ENSPNAG00000019801)	rilpl2 (ENSPNAG00000019819)	RILPL1 (ENSPNAG00000019828)	hip1rb (ENSPNAG00000020044)	zcchc8 (ENSPNAG00000020069)	vps33a (ENSPNAG00000020114)
Cyprinoidei	ANCESTRAL SPECIES	78	ENSGT00940000154089.b	ENSGT00940000164527.a	ENSGT00390000003209	ENSGT00940000153241.A	ENSGT00940000156859	ENSGT00490000043385	ENSGT00940000155998	ENSGT00940000161655	ENSGT00940000154284.b.gc	ENSGT00940000156855.c	ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.b	ENSGT00390000001901	ENSGT00390000007992	ENSGT00940000164890.b	ENSGT00940000177137	ENSGT00940000163919.a #22	ENSGT00940000155760.t.a.c	ENSGT00950000182879.a.b.a.a.b.b.a.a	ENSGT00940000161002	ENSGT00940000159139.b.a
Cyprininae	DUPLICATION
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Golden-line barbel	MODERN SPECIES	348	ENSSGRG00000037069	vps33a (ENSSGRG00000036957)	aldh2.2 (ENSSGRG00000034983)	mapkapk5 (ENSSGRG00000034907)	zgc:153044 (ENSSGRG00000034906)	tmem116 (ENSSGRG00000034905)	psat1 (ENSSGRG00000034768)	ENSSGRG00000034345	isca1 (ENSSGRG00000034341)	ENSSGRG00000034339	ENSSGRG00000034338	ENSSGRG00000034335	mat2ab (ENSSGRG00000034068)	si:ch211-283h6.4 (ENSSGRG00000034065)	usp39 (ENSSGRG00000033864)	spaw (ENSSGRG00000033852) #22	ank1a (ENSSGRG00000033536)	ENSSGRG00000033527	ENSSGRG00000033526	ganaba (ENSSGRG00000033035)	her7 (ENSSGRG00000033026)	her1 (ENSSGRG00000033024)	mepcea (ENSSGRG00000033023)
Zebrafish	MODERN SPECIES	20	ENSDARG00000017636	spag7 (ENSDARG00000011555)	slc25a11 (ENSDARG00000035741)	KCNAB3 (ENSDARG00000074320)	KIF1C (ENSDARG00000098655)	tnfsf13 (ENSDARG00000091556)	h1m (ENSDARG00000102892)	ephb4a (ENSDARG00000100725)	DLG4 (ENSDARG00000041926)	mepcea (ENSDARG00000059461)	her1 (ENSDARG00000014722)	her7 (ENSDARG00000017917)	C5H2orf68 (ENSDARG00000059459)	usp39 (ENSDARG00000041908)	sftpbb (ENSDARG00000067566)	spaw (ENSDARG00000014309) #22	ank1a (ENSDARG00000059093)	ank1a (ENSDARG00000092143)	ENSDARG00000102513	ganaba (ENSDARG00000076888)	mat2ab (ENSDARG00000037121)	INPP5J (ENSDARG00000093359)	selenom (ENSDARG00000051957)	ENSDARG00000059442	ENSDARG00000099542	isca1 (ENSDARG00000051956)	ENSDARG00000074645	psat1 (ENSDARG00000016733)	tmem116 (ENSDARG00000077155)	zgc:153044 (ENSDARG00000067564)	kiss1rb (ENSDARG00000067563)
Clupeiformes	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000163919.a #22
Atlantic herring	MODERN SPECIES	23	ENSCHAG00000010640	ENSCHAG00000010609	ENSCHAG00000010517	ENSCHAG00000010445	selenom (ENSCHAG00000010416)	ENSCHAG00000010399	ENSCHAG00000010224	mat2ab (ENSCHAG00000009786)	si:ch211-283h6.4 (ENSCHAG00000009765)	usp39 (ENSCHAG00000009596)	ENSCHAG00000009381	ENSCHAG00000008153	ENSCHAG00000007438	ENSCHAG00000007278	ENSCHAG00000007080	spaw (ENSCHAG00000007069) #22	ENSCHAG00000007056	ENSCHAG00000007028	ank1a (ENSCHAG00000001526)	ENSCHAG00000000329	ebf2 (ENSCHAG00000000295)	ENSCHAG00000024733	zgc:136564 (ENSCHAG00000024727)	hnrnpk (ENSCHAG00000024703)	rmi1 (ENSCHAG00000024700)	NTRK2 (ENSCHAG00000024697)	agtpbp1 (ENSCHAG00000024424)	naa35 (ENSCHAG00000024374)	CEP78 (ENSCHAG00000024356)	GNA14 (ENSCHAG00000024349)	vps13a (ENSCHAG00000021136)
Osteoglossiformes	ANCESTRAL SPECIES	82	ENSGT00390000014349	ENSGT00940000167301	ENSGT00940000153594.c.e.a	ENSGT00940000157897	ENSGT00940000160182	ENSGT00940000163293.c.a	ENSGT00940000155449	ENSGT00940000155149	ENSGT00390000012759	ENSGT00500000044984	ENSGT00940000153849.a.a.a	ENSGT00390000009670	ENSGT00940000164825	ENSGT01050000244898.b.a.s	ENSGT00940000159627	ENSGT00940000163919.a #22	ENSGT00940000159932.b.c	ENSGT00940000155760.t.a
P. kingsleyae	MODERN SPECIES	395	denr (ENSPKIG00000001107)	ENSPKIG00000001151	hip1rb (ENSPKIG00000001219)	RILPL1 (ENSPKIG00000001328)	rilpl2 (ENSPKIG00000001387)	kmt5ab (ENSPKIG00000001401)	sbno1 (ENSPKIG00000001441)	CDK2AP1 (ENSPKIG00000001531)	ENSPKIG00000001558	mtrfr (ENSPKIG00000001571)	PITPNM2 (ENSPKIG00000001652)	arl6ip4 (ENSPKIG00000001878)	mthfd2 (ENSPKIG00000001917)	mob1a (ENSPKIG00000001975)	dguok (ENSPKIG00000002079)	spaw (ENSPKIG00000002098) #22	eif4ebp1 (ENSPKIG00000002110)	ank1a (ENSPKIG00000002161)
Asian bonytongue	MODERN SPECIES		denr (ENSSFOG00015018494)	ENSSFOG00015018502	hip1rb (ENSSFOG00015018559)	RILPL1 (ENSSFOG00015018977)	rilpl2 (ENSSFOG00015029690)	kmt5ab (ENSSFOG00015019013)	sbno1 (ENSSFOG00015019025)	CDK2AP1 (ENSSFOG00015019104)	mtrfr (ENSSFOG00015026668)	MPHOSPH9 (ENSSFOG00015019131)	PITPNM2 (ENSSFOG00015019153)	arl6ip4 (ENSSFOG00015030592)	mthfd2 (ENSSFOG00015019212)	mob1a (ENSSFOG00015019239)	dguok (ENSSFOG00015019257)	ENSSFOG00015029722 #22	EIF4EBP1 (ENSSFOG00015027221)	ANK1 (ENSSFOG00015019367)	ccdc22 (ENSSFOG00015019957)	slc38a5b (ENSSFOG00015019972)	wasb (ENSSFOG00015019997)	sema3gb (ENSSFOG00015020068)	tspy (ENSSFOG00015020119)	foxp3a (ENSSFOG00015020151)	gpr173 (ENSSFOG00015020173)	suv39h1b (ENSSFOG00015020184)	wdr13 (ENSSFOG00015020215)	ENSSFOG00015031785	porcnl (ENSSFOG00015000133)	ENSSFOG00015000272	PDZD4 (ENSSFOG00015000289)
Osteoglossocephalai	ANCESTRAL SPECIES	616																ENSGT00940000163919.b #22	ENSGT00940000159932.b	ENSGT00940000155760.t.b
Clupeocephala	ANCESTRAL SPECIES	72				ENSGT00940000157299.d	ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.e	ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.f	ENSGT00940000166638	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000165107.A	ENSGT00390000009130.b.d.b	ENSGT00940000156804.b	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000153725.b.c	ENSGT00950000182909.a.e	ENSGT00940000154484.B.a.a	ENSGT00940000163919.b #22	ENSGT00940000159932.b	ENSGT00940000155760.t.b	ENSGT00730000111146	ENSGT00940000161685.A.a	ENSGT00940000156208.i	ENSGT00950000182926.b.c	ENSGT00940000164254.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000169602	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000167368	ENSGT00390000006044	ENSGT00940000154702.a.b	ENSGT00940000166762	ENSGT00950000183203.c.a
Otomorpha	ANCESTRAL SPECIES	60			ENSGT00520000055591.b	ENSGT00940000157299.d	ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.e	ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.f	ENSGT00940000166638	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000165107.A	ENSGT00390000009130.b.d.b	ENSGT00940000156804.b	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000153725.b.c	ENSGT00950000182909.a.e	ENSGT00940000154484.B.a.a	ENSGT00940000163919.b #22	ENSGT00940000159932.b	ENSGT00940000155760.t.b	ENSGT00730000111146	ENSGT00940000161685.A.a.d	ENSGT00940000156208.i.e	ENSGT00950000182926.b.c	ENSGT00940000164254.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000169602	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000167368	ENSGT00390000006044	ENSGT00940000154702.a.b	ENSGT00940000166762	ENSGT00950000183203.c.a
Clupeiformes	ANCESTRAL SPECIES	16				ENSGT00520000055591.b	ENSGT00940000157299.d	ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.e.g	ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.f	ENSGT00940000166638	ENSGT00940000165107.A	ENSGT00390000009130.b.d.b	ENSGT00940000156804.b	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000153725.b.c	ENSGT00950000182909.a.e	ENSGT00940000154484.B.a.a	ENSGT00940000163919.b #22	ENSGT00940000159932.b	ENSGT00940000155760.t.b	ENSGT00730000111146	ENSGT00940000161685.A.a.d	ENSGT00940000156208.i.e	ENSGT00950000182926.b.c	ENSGT00940000164254.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000169602	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000167368	ENSGT00390000006044	ENSGT00940000154702.a.b	ENSGT00940000166762	ENSGT00950000183203.c.a
Denticle herring	MODERN SPECIES	13	ENSDCDG00000023223	ENSDCDG00000023221	ENSDCDG00000023219	zgc:103482 (ENSDCDG00000023212)	EFNA5 (ENSDCDG00000023205)	ENSDCDG00000023203	GADD45G (ENSDCDG00000023134)	GADD45G (ENSDCDG00000023130)	ENSDCDG00000023127	ghrb (ENSDCDG00000023125)	oxct1b (ENSDCDG00000023105)	c7b (ENSDCDG00000022873)	c6 (ENSDCDG00000022740)	rnf180b (ENSDCDG00000022725)	htr1ab (ENSDCDG00000022724)	ndr1 (ENSDCDG00000022689) #22	eif4ebp1 (ENSDCDG00000022688)	ANK1 (ENSDCDG00000022115)	ftsj1 (ENSDCDG00000022106)	nefma (ENSDCDG00000022102)	NEFL (ENSDCDG00000022084)	NOMO1 (ENSDCDG00000015270)	TMC7 (ENSDCDG00000015016)	ENSDCDG00000015011	LOXL4 (ENSDCDG00000014998)	HNRNPLL (ENSDCDG00000013917)	ENSDCDG00000013835	GEMIN6 (ENSDCDG00000013832)	sos1 (ENSDCDG00000008509)	ENSDCDG00000008411	tpcn3 (ENSDCDG00000006159)
Atlantic herring	MODERN SPECIES	3	ENSCHAG00000019376	ENSCHAG00000019359	ENSCHAG00000019329	ENSCHAG00000019317	dpysl2b (ENSCHAG00000018801)	bnip3lb (ENSCHAG00000018774)	ppp2r2ab (ENSCHAG00000018406)	LRRTM4 (ENSCHAG00000018372)	ENSCHAG00000018355	ENSCHAG00000017417	c7b (ENSCHAG00000015098)	c6 (ENSCHAG00000014259)	rgs7bpb (ENSCHAG00000014219)	rnf180b (ENSCHAG00000014210)	ENSCHAG00000014203	ndr1 (ENSCHAG00000014198) #22	eif4ebp1 (ENSCHAG00000014175)	ENSCHAG00000014170	ANK1 (ENSCHAG00000011691)	ftsj1 (ENSCHAG00000011598)	nefma (ENSCHAG00000011577)	NEFL (ENSCHAG00000011569)	pgam2 (ENSCHAG00000011550)	ENSCHAG00000011489	crkl (ENSCHAG00000011467)	med15 (ENSCHAG00000011210)	si:ch211-222n4.2 (ENSCHAG00000011195)	smpd4 (ENSCHAG00000010719)	TMEM132C (ENSCHAG00000010691)	ENSCHAG00000010683	RIMBP2 (ENSCHAG00000010647)
Otophysi	ANCESTRAL SPECIES	37	ENSGT00390000005102.id.b	ENSGT00670000098179.d.a	ENSGT00520000055591.b	ENSGT00940000157299.d	ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.e	ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.f	ENSGT00940000166638	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000165107.A	ENSGT00390000009130.b.d.b	ENSGT00940000156804.b	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000153725.b.c	ENSGT00950000182909.a.e	ENSGT00940000154484.B.a.a	ENSGT00940000163919.b #22	ENSGT00940000159932.b	ENSGT00940000155760.t.b	ENSGT00730000111146	ENSGT00940000154133.B	ENSGT00940000160033.d	ENSGT00940000175813	ENSGT00570000080851	ENSGT00390000003107.b.i	ENSGT01080000257533	ENSGT00610000087474	ENSGT00940000166868.a	ENSGT00940000164695.b	ENSGT00940000160599	ENSGT00940000156028.t	ENSGT00390000007237.s
Characiphysae	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00390000005102.id.b	ENSGT00670000098179.d.a	ENSGT00520000055591.b	ENSGT00940000157299.d	ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.e	ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.f	ENSGT00940000166638	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000165107.A	ENSGT00390000009130.b.d.b	ENSGT00940000156804.b	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000153725.b.c	ENSGT00950000182909.a.e	ENSGT00940000154484.B.a.a	ENSGT00940000163919.b #22	ENSGT00940000159932.b	ENSGT00940000155760.t.b	ENSGT00730000111146	ENSGT00390000002096	ENSGT00940000165259.a	ENSGT00940000154133.B	ENSGT00940000160033.d	ENSGT00940000175813	ENSGT00390000003107.b.i	ENSGT01080000257533	ENSGT00610000087474	ENSGT00940000166868.a	ENSGT00940000164695.b	ENSGT00940000160599	ENSGT00940000156028.t
Channel catfish	MODERN SPECIES	9	rbp4l (ENSIPUG00000004609)	PDE6B (ENSIPUG00000004687)	hspb9l (ENSIPUG00000004733)	zgc:103482 (ENSIPUG00000004762)	EFNA5 (ENSIPUG00000004774)	GADD45G (ENSIPUG00000004787)	gadd45gb.1 (ENSIPUG00000004791)	ENSIPUG00000004805	ENSIPUG00000004813	ghrb (ENSIPUG00000004825)	c7 (ENSIPUG00000004890)	c6 (ENSIPUG00000004907)	rgs7bpb (ENSIPUG00000004920)	rnf180 (ENSIPUG00000004929)	htr1ab (ENSIPUG00000004938)	ndr1 (ENSIPUG00000004944) #22	eif4ebp1 (ENSIPUG00000004953)	ENSIPUG00000004961	ANK1 (ENSIPUG00000004975)	FTSJ1 (ENSIPUG00000005052)	ENSIPUG00000005137	RICTOR (ENSIPUG00000005150)	lifrb (ENSIPUG00000005236)	ccdc61 (ENSIPUG00000005261)	ENSIPUG00000005300	bhmg1 (ENSIPUG00000005313)	qpctl (ENSIPUG00000005330)	ENSIPUG00000005354	ENSIPUG00000005371	ENSIPUG00000005378	ENSIPUG00000005404
Characiphysae_b	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00390000005102.id.b	ENSGT00670000098179.d.a	ENSGT00520000055591.b	ENSGT00940000157299.d	ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.e	ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.f	ENSGT00940000166638	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000165107.A	ENSGT00390000009130.b.d.b	ENSGT00940000156804.b	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000153725.b.c	ENSGT00950000182909.a.e	ENSGT00940000154484.B.a.a	ENSGT00940000163919.b #22	ENSGT00940000159932.b	ENSGT00940000155760.t.b	ENSGT00730000111146	ENSGT00390000002096	ENSGT00940000165259.a	ENSGT00940000154133.B	ENSGT00940000160033.d	ENSGT00390000003107.b.i	ENSGT01080000257533	ENSGT00610000087474	ENSGT00940000166868.a	ENSGT00940000164695.b	ENSGT00940000160599	ENSGT00940000156028.t	ENSGT00390000007237.s
Characoidei	ANCESTRAL SPECIES	31	ENSGT00940000156471.a	ENSGT00390000005102.id.b	ENSGT00670000098179.d.a	ENSGT00520000055591.b	ENSGT00940000157299.d	ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.f	ENSGT00940000166638	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000165107.A	ENSGT00390000009130.b.d.b	ENSGT00940000156804.b	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000153725.b.c	ENSGT00950000182909.a.e	ENSGT00940000154484.B.a.a	ENSGT00940000163919.b #22	ENSGT00940000159932.b	ENSGT00940000155760.t.b	ENSGT00730000111146	ENSGT00390000002096	ENSGT00940000165259.a	ENSGT00940000154133.B	ENSGT00940000160033.d	ENSGT00390000003107.b.i	ENSGT01080000257533	ENSGT00610000087474	ENSGT00940000166868.a	ENSGT00940000164695.b	ENSGT00940000160599	ENSGT00940000156028.t	ENSGT00390000007237.s
Mexicana tetra	MODERN SPECIES	5	PDE6B (ENSAMXG00000000290)	ENSAMXG00000000297	atp5mea (ENSAMXG00000037129)	hspb9l (ENSAMXG00000025376)	EFNA5 (ENSAMXG00000029244)	gadd45gb.1 (ENSAMXG00000009080)	ENSAMXG00000039927	ENSAMXG00000033771	ghrb (ENSAMXG00000030540)	oxct1b (ENSAMXG00000029696)	c7b (ENSAMXG00000009027)	c6 (ENSAMXG00000009003)	rgs7bpb (ENSAMXG00000031535)	rnf180b (ENSAMXG00000008983)	htr1ab (ENSAMXG00000024875)	ndr1 (ENSAMXG00000034479) #22	eif4ebp1 (ENSAMXG00000033622)	ANK1 (ENSAMXG00000042031)	ftsj1 (ENSAMXG00000037663)	ENSAMXG00000002115	lifrb (ENSAMXG00000032048)	ccdc61 (ENSAMXG00000002319)	ENSAMXG00000041790	ENSAMXG00000027386	ENSAMXG00000035293	ENSAMXG00000039452	ENSAMXG00000026106	si:ch211-191j22.3 (ENSAMXG00000036825)	ENSAMXG00000002478	ppm1nb (ENSAMXG00000039563)	rtn2b (ENSAMXG00000042351)
Red-bellied piranha	MODERN SPECIES	317					EFNA5 (ENSPNAG00000015402)	GADD45G (ENSPNAG00000015407)	gadd45gb.1 (ENSPNAG00000015424)	ENSPNAG00000015438	ghrb (ENSPNAG00000003386)	oxct1b (ENSPNAG00000015544)	c7b (ENSPNAG00000015586)	c6 (ENSPNAG00000004954)	rgs7bpb (ENSPNAG00000015734)	rnf180b (ENSPNAG00000015805)	htr1ab (ENSPNAG00000015841)	ENSPNAG00000015861 #22	eif4ebp1 (ENSPNAG00000015895)	ANK1 (ENSPNAG00000003412)	ftsj1 (ENSPNAG00000016330)	ENSPNAG00000016456	lifrb (ENSPNAG00000016562)	lifrb (ENSPNAG00000016610)	ccdc61 (ENSPNAG00000016698)	ENSPNAG00000016710	ENSPNAG00000016717	QPCTL (ENSPNAG00000016729)	ENSPNAG00000016745	si:ch211-191j22.3 (ENSPNAG00000016767)	ENSPNAG00000016790	ppm1nb (ENSPNAG00000016802)	rtn2b (ENSPNAG00000016860)
Electric eel	MODERN SPECIES	1286												c6 (ENSEEEG00000007260)	rgs7bpb (ENSEEEG00000007424)	rnf180b (ENSEEEG00000007426)	htr1ab (ENSEEEG00000007428)	ndr1 (ENSEEEG00000007430) #22	eif4ebp1 (ENSEEEG00000007450)
Cyprinoidei	ANCESTRAL SPECIES	54	ENSGT00670000098179.d.a	ENSGT01030000234576.D.a.b.b	ENSGT00520000055591.b	ENSGT00940000157299.d	ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.e	ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.f	ENSGT00940000166638	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000165107.A	ENSGT00390000009130.b.d.b	ENSGT00940000156804.b	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000153725.b.c	ENSGT00950000182909.a.e	ENSGT00940000154484.B.a.a	ENSGT00940000163919.b #22	ENSGT00940000159932.b	ENSGT00940000155760.t.b.c	ENSGT00730000111146	ENSGT00940000154133.B	ENSGT00940000160033.d	ENSGT00570000080851	ENSGT00390000003107.b.i	ENSGT01080000257533	ENSGT00610000087474	ENSGT00940000166868.a	ENSGT00940000164695.b	ENSGT00940000160599	ENSGT00940000156028.t	ENSGT00390000007237.s	ENSGT00940000163093.a.a.a.a
Cyprininae	DUPLICATION
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	144	ENSGT00390000005102.id.b.b	ENSGT00670000098179.d.a	ENSGT01030000234576.D.a.b.b	ENSGT00520000055591.b.a	ENSGT00940000157299.d.b	ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.e.e	ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.f.j	ENSGT00940000166638.d	ENSGT00940000165107.A.c	ENSGT00390000009130.b.d.b.b	ENSGT00940000156804.b.a	ENSGT00940000156814.b	ENSGT00940000153725.b.c.a	ENSGT00950000182909.a.e.b	ENSGT00940000154484.B.a.a.s.a	ENSGT00940000163919.b.a #22	ENSGT00940000159932.b.a	ENSGT00940000155760.t.b.c.a	ENSGT00730000111146.c	ENSGT00390000002096.g.a	ENSGT00940000165259.a.e	ENSGT00940000154133.B.h	ENSGT00940000160033.d.b	ENSGT00940000159183.ab	ENSGT00570000080851.d	ENSGT00390000003107.b.i.d	ENSGT01080000257533.b	ENSGT00610000087474.d	ENSGT00940000166868.a.b	ENSGT00940000164695.b.a	ENSGT00940000160599.r
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	89	ENSGT00390000005102.id.b.b	ENSGT00670000098179.d.a	ENSGT01030000234576.D.a.b.b	ENSGT00520000055591.b.a	ENSGT00940000157299.d.b	ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.e.e	ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.f.j	ENSGT00940000166638.d	ENSGT00940000165107.A.c	ENSGT00390000009130.b.d.b.b	ENSGT00940000156804.b.a	ENSGT00940000156814.b	ENSGT00940000153725.b.c.a	ENSGT00950000182909.a.e.b	ENSGT00940000154484.B.a.a.s.a	ENSGT00940000163919.b.a #22	ENSGT00940000159932.b.a	ENSGT00940000155760.t.b.c.a	ENSGT00730000111146.c	ENSGT00390000002096.g.a	ENSGT00940000165259.a.e	ENSGT00940000154133.B.h	ENSGT00940000160033.d.b	ENSGT00940000159183.ab	ENSGT00570000080851.d	ENSGT00390000003107.b.i.d	ENSGT01080000257533.b	ENSGT00610000087474.d	ENSGT00940000166868.a.b	ENSGT00940000164695.b.a	ENSGT00940000160599.r
Common carp reference	MODERN SPECIES	38	slc26a1 (ENSCCRG00000057726)	ENSCCRG00000015718	atp5mea (ENSCCRG00000015714)	hspb9l (ENSCCRG00000015713)	ENSCCRG00000070425	zgc:103482 (ENSCCRG00000015705)	ENSCCRG00000081312	ENSCCRG00000005239	gadd45gb.1 (ENSCCRG00000070275)	ENSCCRG00000005229	ghrb (ENSCCRG00000005217)	oxct1b (ENSCCRG00000052819)	c7b (ENSCCRG00000004390)	rgs7bpb (ENSCCRG00000004319)	rnf180b (ENSCCRG00000011085)	ndr1 (ENSCCRG00000004305) #22	ENSCCRG00000037719	ftsj1 (ENSCCRG00000037770)	ENSCCRG00000039416	lifrb (ENSCCRG00000039393)	ccdc61 (ENSCCRG00000039477)	ENSCCRG00000039475	ENSCCRG00000039473	ENSCCRG00000055815	ENSCCRG00000039471	ENSCCRG00000066666	si:ch211-191j22.3 (ENSCCRG00000039469)	ENSCCRG00000039468	ppm1nb (ENSCCRG00000039467)	rtn2b (ENSCCRG00000053026)	nectin3b (ENSCCRG00000039464)
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	144	rbp4l (ENSSGRG00000027713)	PDE6B (ENSSGRG00000026891)	hspb9l (ENSSGRG00000026884)	ENSSGRG00000026882	ENSSGRG00000026881	ENSSGRG00000026878	GADD45G (ENSSGRG00000026877)	gadd45gb.1 (ENSSGRG00000026876)	ENSSGRG00000026875	ghrb (ENSSGRG00000026866)	oxct1b (ENSSGRG00000024966)	c7b (ENSSGRG00000024926)	ENSSGRG00000024919	rnf180b (ENSSGRG00000024917)	htr1ab (ENSSGRG00000024916)	ndr1 (ENSSGRG00000024915) #22	eif4ebp1 (ENSSGRG00000024914)	ENSSGRG00000024912	ENSSGRG00000024911	ENSSGRG00000024907	ftsj1 (ENSSGRG00000024898)	ENSSGRG00000024881	lifrb (ENSSGRG00000024869)	ccdc61 (ENSSGRG00000024866)	ENSSGRG00000024865	QPCTL (ENSSGRG00000024864)	si:ch211-191j22.3 (ENSSGRG00000024863)	ENSSGRG00000024862	ppm1nb (ENSSGRG00000024860)	nectin3b (ENSSGRG00000024858)
Goldfish	MODERN SPECIES	40	PDE6B (ENSCARG00000030340)	atp5mea (ENSCARG00000031186)	hspb9l (ENSCARG00000031193)	ENSCARG00000031200	zgc:103482 (ENSCARG00000031213)	EFNA5 (ENSCARG00000031219)	GADD45G (ENSCARG00000031229)	gadd45gb.1 (ENSCARG00000031239)	ENSCARG00000031251	ghrb (ENSCARG00000031258)	oxct1b (ENSCARG00000031279)	c7b (ENSCARG00000031471)	rgs7bpb (ENSCARG00000033209)	rnf180b (ENSCARG00000033243)	htr1ab (ENSCARG00000033290)	ndr1 (ENSCARG00000033304) #22	eif4ebp1 (ENSCARG00000033335)	ANK1 (ENSCARG00000033533)	ftsj1 (ENSCARG00000035891)	ENSCARG00000036055	lifrb (ENSCARG00000036854)	ENSCARG00000036906	ENSCARG00000036981	ENSCARG00000037000	QPCTL (ENSCARG00000037014)	ENSCARG00000037032	si:ch211-191j22.3 (ENSCARG00000037047)	ENSCARG00000037073	ppm1nb (ENSCARG00000037098)	nectin3b (ENSCARG00000037129)	diablob (ENSCARG00000037185)
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	207				ENSGT00520000055591.b.b	ENSGT00940000157299.d.a	ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.e.f	ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.f.i	ENSGT00940000166638.c	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000165107.A.d	ENSGT00940000156804.b.b	ENSGT00940000156814.a	ENSGT00940000153725.b.c.b	ENSGT00950000182909.a.e.a	ENSGT00940000154484.B.a.a.s.b	ENSGT00940000163919.b.b #22	ENSGT00940000159932.b.b	ENSGT00940000155760.t.b.c.b	ENSGT00730000111146.d	ENSGT00390000002096.g.b	ENSGT00940000165259.a.f	ENSGT00940000154133.B.g	ENSGT00940000160033.d.a	ENSGT00570000080851.c	ENSGT00390000003107.b.i.c	ENSGT01080000257533.a	ENSGT00610000087474.c	ENSGT00940000166868.a.a	ENSGT00940000164695.b.b	ENSGT00940000160599.q	ENSGT00940000156028.t.b
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	33					ENSGT00520000055591.b.b	ENSGT00940000157299.d.a	ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.e.f	ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.f.i	ENSGT00940000166638.c	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000165107.A.d	ENSGT00940000156804.b.b	ENSGT00940000156814.a	ENSGT00950000182909.a.e.a	ENSGT00940000154484.B.a.a.s.b	ENSGT00940000163919.b.b #22	ENSGT00940000159932.b.b	ENSGT00940000155760.t.b.c.b	ENSGT00730000111146.d	ENSGT00390000002096.g.b	ENSGT00940000165259.a.f	ENSGT00940000154133.B.g	ENSGT00940000160033.d.a	ENSGT00940000155944.e.b	ENSGT00570000080851.c	ENSGT00390000003107.b.i.c	ENSGT01080000257533.a	ENSGT00610000087474.c	ENSGT00940000166868.a.a	ENSGT00940000164695.b.b	ENSGT00940000160599.q
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	113	PDE6B (ENSSGRG00000046253)	atp5mea (ENSSGRG00000046795)	hspb9l (ENSSGRG00000046797)	ENSSGRG00000046798	zgc:103482 (ENSSGRG00000046799)	EFNA5 (ENSSGRG00000046800)	GADD45G (ENSSGRG00000046805)	gadd45gb.1 (ENSSGRG00000046820)	ENSSGRG00000046824	ENSSGRG00000046840	ghrb (ENSSGRG00000046841)	c7b (ENSSGRG00000046880)	C6 (ENSSGRG00000047055)	rnf180b (ENSSGRG00000047176)	htr1ab (ENSSGRG00000047178)	ndr1 (ENSSGRG00000047180) #22	eif4ebp1 (ENSSGRG00000047181)	ANK1 (ENSSGRG00000047184)	ENSSGRG00000047192	ENSSGRG00000047193	ftsj1 (ENSSGRG00000047194)	ENSSGRG00000047200	lifrb (ENSSGRG00000047356)	ccdc61 (ENSSGRG00000047359)	ENSSGRG00000047361	ENSSGRG00000047362	ENSSGRG00000047364	QPCTL (ENSSGRG00000047367)	ENSSGRG00000047370	si:ch211-191j22.3 (ENSSGRG00000047372)	ENSSGRG00000047373
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Goldfish	DUPLICATION
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Goldfish	MODERN SPECIES	13	ENSCARG00000009587	ENSCARG00000009579	ENSCARG00000009572	ENSCARG00000009567	ppm1nb (ENSCARG00000009552)	rtn2b (ENSCARG00000009544)	nectin3b (ENSCARG00000009533)	diablob (ENSCARG00000009528)	ENSCARG00000009521	ENSCARG00000009500	b9d2 (ENSCARG00000009490)	ENSCARG00000009477	cbr1l (ENSCARG00000009468)	rnf180b (ENSCARG00000009464)	htr1ab (ENSCARG00000009458)	ndr1 (ENSCARG00000009446) #22	eif4ebp1 (ENSCARG00000009441)	btc (ENSCARG00000009428)	amacr (ENSCARG00000009413)	slc45a2 (ENSCARG00000009404)	rxfp3 (ENSCARG00000009400)	ENSCARG00000009395	rai14 (ENSCARG00000009062)	fgf10a (ENSCARG00000009014)	MFHAS1 (ENSCARG00000008978)	eri1 (ENSCARG00000008969)	ppp1r3b (ENSCARG00000008961)	ENSCARG00000008950	ENSCARG00000008942	oxct1b (ENSCARG00000004743)	C6 (ENSCARG00000004176)
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Euteleosteomorpha	ANCESTRAL SPECIES	154	ENSGT00940000156117.e.b	ENSGT00940000156820.a.b	ENSGT00940000158634.b	ENSGT00940000156639.d	ENSGT00940000157299.d	ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.e	ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.f	ENSGT00940000166638	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000165107.A	ENSGT00940000156804.b	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000153725.b.c	ENSGT00950000182909.a.e	ENSGT00940000154484.B.a.a	ENSGT00940000163919.b #22	ENSGT00940000159932.b	ENSGT00940000155760.t.b	ENSGT00730000111146	ENSGT00940000161685.A.a	ENSGT01100000265222	ENSGT00940000154418.a.b	ENSGT00940000156208.i	ENSGT00950000182926.b.c	ENSGT00940000164254.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000169602	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000167368	ENSGT00390000006044	ENSGT00940000154702.a.b
Acanthomorphata	ANCESTRAL SPECIES	189					ENSGT00940000157299.d	ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.e	ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.f	ENSGT00940000166638	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000165107.A	ENSGT00940000156804.b	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000153725.b.c	ENSGT00950000182909.a.e	ENSGT00940000154484.B.a.a	ENSGT00940000163919.b #22	ENSGT00940000159932.b	ENSGT00940000155760.t.b	ENSGT00940000161685.A.a	ENSGT00940000156208.i	ENSGT00950000182926.b.c	ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b	ENSGT00940000153892.B	ENSGT00940000158699	ENSGT00940000156664.c	ENSGT00940000167368	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000164254.a.b
Euacanthomorphacea	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000156820.a.b	ENSGT00940000158634.b	ENSGT00940000156639.d	ENSGT00940000161979.A.b	ENSGT00940000157299.d	ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.e	ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.f	ENSGT00940000166638	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000165107.A	ENSGT00940000156804.b	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000153725.b.c	ENSGT00950000182909.a.e	ENSGT00940000154484.B.a.a	ENSGT00940000163919.b #22	ENSGT00940000159932.b	ENSGT00940000155760.t.b	ENSGT00940000161685.A.a	ENSGT00940000156208.i	ENSGT00950000182926.b.c	ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b	ENSGT00940000164254.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000167368	ENSGT00940000156664.c	ENSGT00940000158699	ENSGT00940000153892.B	ENSGT00940000173905	ENSGT00940000162805	ENSGT00940000158075
Pinecone sodierfish	MODERN SPECIES	3	MAMDC2 (ENSMMDG00005007062)	ENSMMDG00005006832	tjp2a (ENSMMDG00005006164)	pip5k1ba (ENSMMDG00005006143)	ENSMMDG00005006137	EFNA5 (ENSMMDG00005006136)	GADD45G (ENSMMDG00005006135)	gadd45gb.1 (ENSMMDG00005006133)	ENSMMDG00005006099	ghrb (ENSMMDG00005006094)	c7b (ENSMMDG00005005587)	c6 (ENSMMDG00005004007)	rgs7bpb (ENSMMDG00005003972)	rnf180b (ENSMMDG00005003969)	htr1ab (ENSMMDG00005003967)	ndr1 (ENSMMDG00005003965) #22	eif4ebp1 (ENSMMDG00005003962)	ANK1 (ENSMMDG00005003757)	nefma (ENSMMDG00005003722)	neflb (ENSMMDG00005003706)	pgam2 (ENSMMDG00005003704)	ENSMMDG00005003701	ENSMMDG00005003698	MMP17 (ENSMMDG00005003692)	ENSMMDG00005003690	crkl (ENSMMDG00005003686)	si:ch211-222n4.2 (ENSMMDG00005003681)	ULK1 (ENSMMDG00005003676)	MMP17 (ENSMMDG00005003669)	sfswap (ENSMMDG00005003659)	ENSMMDG00005003646
Percomorphaceae	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000157724.a.b	ENSGT00940000154091.a.a.s.b	ENSGT00940000155816.a	ENSGT00940000156320.d	ENSGT00940000155291.b	ENSGT01100000263544.c.a.a.b	ENSGT00940000155983.a.b	ENSGT00940000168590	ENSGT00940000159066	ENSGT00940000156161.A	ENSGT00390000006975	ENSGT00940000162544.c.a	ENSGT00940000164512.d	ENSGT00940000162544.d	ENSGT00940000178030	ENSGT00940000163919.b #22	ENSGT00940000159932.b	ENSGT00940000155760.t.b	ENSGT00940000161685.A.a	ENSGT00940000156208.i	ENSGT00950000182926.b.c	ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b	ENSGT00940000164254.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000167368	ENSGT00940000156664.c	ENSGT00940000158699	ENSGT00940000153892.B	ENSGT00940000173905	ENSGT00940000162805	ENSGT00940000158075
Tiger tail seahorse	MODERN SPECIES	499			slc26a1 (ENSHCOG00000004672)	paqr3b (ENSHCOG00000004722)	antxr2b (ENSHCOG00000004736)	rasgef1bb (ENSHCOG00000004798)	ENSHCOG00000004820	ENSHCOG00000004845	snx18b (ENSHCOG00000004851)	ENSHCOG00000004868	dusp4 (ENSHCOG00000004893)	ENSHCOG00000004945	cldn23.1 (ENSHCOG00000004952)	ENSHCOG00000004973	ENSHCOG00000004981	ENSHCOG00000004993 #22	eif4ebp1 (ENSHCOG00000004999)	ANK1 (ENSHCOG00000000133)	nefma (ENSHCOG00000005056)	ENSHCOG00000005064	pgam2 (ENSHCOG00000005073)	ENSHCOG00000005076	ENSHCOG00000005082	ENSHCOG00000005102	MMP17 (ENSHCOG00000005121)
Percomorphaceae_B	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000157724.a.b	ENSGT00940000154091.a.a.s.b	ENSGT00940000155816.a	ENSGT00940000156320.d	ENSGT00940000155291.b	ENSGT01100000263544.c.a.a.b	ENSGT00940000155983.a.b	ENSGT00940000168590	ENSGT00940000159066	ENSGT00940000156161.A	ENSGT00390000006975	ENSGT00940000162544.c.a	ENSGT00940000164512.d	ENSGT00940000162544.d	ENSGT00940000178030	ENSGT00940000163919.b #22	ENSGT00940000159932.b	ENSGT00940000155760.t.b	ENSGT00940000161685.A.a	ENSGT00940000156208.i	ENSGT00950000182926.b.c	ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b	ENSGT00940000158699.q.b	ENSGT00940000164254.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000167368	ENSGT00940000156664.c	ENSGT00940000158699.q.a	ENSGT00940000153892.B	ENSGT00940000162805	ENSGT00940000158075
Ovalentaria	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000155816.a	ENSGT00940000156320.d	ENSGT00940000155291.b	ENSGT01100000263544.c.a.a.b	ENSGT00940000155983.a.b	ENSGT00940000168590	ENSGT00940000159066	ENSGT00940000156161.A	ENSGT00390000006975	ENSGT00610000087482	ENSGT00940000162544.c.a	ENSGT00940000164512.d	ENSGT00940000162544.d	ENSGT00940000178030.a	ENSGT00940000178065	ENSGT00940000163919.b #22	ENSGT00940000159932.b	ENSGT00940000155760.t.b	ENSGT00940000161685.A.a	ENSGT00940000156208.i	ENSGT00950000182926.b.c	ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b	ENSGT00940000158699.q.a	ENSGT00940000164254.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000167368	ENSGT00940000156664.c	ENSGT00940000158699.q.b	ENSGT00940000153892.B	ENSGT00940000162805	ENSGT00940000158075
Atherinomorphae	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000154091.a.a.s.b	ENSGT00940000155816.a	ENSGT00940000156320.d	ENSGT00940000155291.b	ENSGT01100000263544.c.a.a.b	ENSGT00940000155983.a.b	ENSGT00940000168590	ENSGT00940000159066	ENSGT00940000156161.A	ENSGT00390000006975	ENSGT00610000087482	ENSGT00940000162544.c.a	ENSGT00940000162544.d	ENSGT00940000178030.a	ENSGT00940000178065	ENSGT00940000163919.b #22	ENSGT00940000159932.b	ENSGT00940000155760.t.b	ENSGT00940000161685.A.a	ENSGT00940000156208.i	ENSGT00950000182926.b.c	ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b	ENSGT00940000158699.q.b.d	ENSGT00940000164254.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000167368	ENSGT00940000156664.c	ENSGT00940000158699.q.b.c	ENSGT00940000153892.B	ENSGT00940000162805	ENSGT00940000158075
Oryzias	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000158994	ENSGT00390000006366.a	ENSGT00940000157724.a.b	ENSGT00940000154091.a.a.s.b	ENSGT00940000155816.a	ENSGT00940000156320.d	ENSGT00940000155291.b	ENSGT01100000263544.c.a.a.b	ENSGT00940000155983.a.b	ENSGT00940000168590	ENSGT00940000159066	ENSGT00940000156161.A	ENSGT00390000006975	ENSGT00940000162544.c.a	ENSGT00940000162544.d	ENSGT00940000163919.b #22	ENSGT00940000159932.b	ENSGT00940000155760.t.b	ENSGT00940000161685.A.a	ENSGT00940000156208.i	ENSGT00950000182926.b.c	ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b	ENSGT00940000158699.q.b.c.a	ENSGT00940000164254.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000167368	ENSGT00940000156664.c	ENSGT00940000158699.q.b.c.b	ENSGT00940000153892.B	ENSGT00940000162805	ENSGT00940000158075
Oryzias_b	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000158994	ENSGT00390000006366.a	ENSGT00940000157724.a.b	ENSGT00940000154091.a.a.s.b	ENSGT00940000155816.a	ENSGT00940000156320.d	ENSGT00940000155291.b	ENSGT01100000263544.c.a.a.b	ENSGT00940000155983.a.b	ENSGT00940000168590	ENSGT00940000159066	ENSGT00940000156161.A	ENSGT00390000006975	ENSGT00940000162544.c.a	ENSGT00940000162544.d	ENSGT00940000163919.b #22	ENSGT00940000159932.b	ENSGT00940000155760.t.b	ENSGT00940000161685.A.a	ENSGT00940000156208.i	ENSGT00950000182926.b.c	ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b	ENSGT00940000158699.q.b.c.a	ENSGT00940000164254.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000167368	ENSGT00940000156664.c	ENSGT00940000158699.q.b.c.b	ENSGT00940000153892.B	ENSGT00940000162805	ENSGT00940000158075
Indian medaka	MODERN SPECIES	30	inip (ENSOMEG00000021200)	snx18b (ENSOMEG00000021218)	ENSOMEG00000021296	rasgef1bb (ENSOMEG00000021364)	antxr2b (ENSOMEG00000021419)	paqr3b (ENSOMEG00000021444)	slc26a1 (ENSOMEG00000021472)	ENSOMEG00000021505	ENSOMEG00000000984	dusp4 (ENSOMEG00000021565)	ENSOMEG00000021619	cldn23.1 (ENSOMEG00000021639)	ENSOMEG00000021669	ENSOMEG00000021690	ENSOMEG00000021710	ENSOMEG00000021722 #22	eif4ebp1 (ENSOMEG00000021742)	ENSOMEG00000021750	ANK1 (ENSOMEG00000021775)	nefma (ENSOMEG00000021807)	pgam2 (ENSOMEG00000021829)	MMP17 (ENSOMEG00000021887)	ENSOMEG00000021910	crkl (ENSOMEG00000021933)	ENSOMEG00000021949	ULK1 (ENSOMEG00000021995)	MMP17 (ENSOMEG00000022028)	sfswap (ENSOMEG00000022065)	trabd2a (ENSOMEG00000022082)	ENSOMEG00000022088	HOOK3 (ENSOMEG00000022217)
Javanese ricefish	MODERN SPECIES	3	ENSOJAG00000008625	SLC46A2 (ENSOJAG00000008664)	snx30 (ENSOJAG00000008681)	inip (ENSOJAG00000008704)	snx18b (ENSOJAG00000008724)	rasgef1bb (ENSOJAG00000008917)	antxr2b (ENSOJAG00000010430)	paqr3b (ENSOJAG00000010452)	slc26a1 (ENSOJAG00000010462)	ENSOJAG00000010480	ENSOJAG00000010493	dusp4 (ENSOJAG00000010517)	ENSOJAG00000010753	cldn23.1 (ENSOJAG00000013055)	ENSOJAG00000013167	ENSOJAG00000013184 #22	ENSOJAG00000013193	ANK1 (ENSOJAG00000013219)	nefma (ENSOJAG00000014598)	neflb (ENSOJAG00000014675)	pgam2 (ENSOJAG00000014687)	ENSOJAG00000014713	MMP17 (ENSOJAG00000014749)	ENSOJAG00000014823	crkl (ENSOJAG00000014832)	MMP17 (ENSOJAG00000014864)	sfswap (ENSOJAG00000014952)	TRABD2A (ENSOJAG00000014991)	HOOK3 (ENSOJAG00000015083)	rnf170 (ENSOJAG00000015515)	gpn3 (ENSOJAG00000015529)
Oryzias_a	ANCESTRAL SPECIES	57	ENSGT00940000161837.c.a	ENSGT00950000183096.a.b	ENSGT00940000158994	ENSGT00390000006366.a	ENSGT00940000157724.a.b	ENSGT00940000154091.a.a.s.b	ENSGT00940000155816.a	ENSGT00940000156320.d	ENSGT00940000155291.b	ENSGT01100000263544.c.a.a.b	ENSGT00940000155983.a.b	ENSGT00940000168590	ENSGT00940000159066	ENSGT00940000156161.A	ENSGT00390000006975	ENSGT00940000163919.b #22	ENSGT00940000159932.b
Japanese Medaka HdrR	MODERN SPECIES	3	snx18b (ENSORLG00000011567)	ENSORLG00000011551	rasgef1bb (ENSORLG00000011516)	ENSORLG00000011465	PAQR3 (ENSORLG00000011427)	slc26a1 (ENSORLG00000011411)	ENSORLG00000011379	ENSORLG00000011372	dusp4 (ENSORLG00000011362)	ENSORLG00000011341	ENSORLG00000022643	cldn23.1 (ENSORLG00000011288)	ENSORLG00000024668	ENSORLG00000011280	ENSORLG00000023124	ENSORLG00000025785 #22	ENSORLG00000028190	ENSORLG00000023779	ENSORLG00000019945	ENSORLG00000026718	ENSORLG00000011244	ENSORLG00000027528	nefma (ENSORLG00000011207)	neflb (ENSORLG00000011182)	pgam2 (ENSORLG00000011149)	ENSORLG00000011130	ENSORLG00000021946	ENSORLG00000011001	ENSORLG00000023408	crkl (ENSORLG00000011093)	ENSORLG00000026074
Chinese medaka	MODERN SPECIES	1333								rasgef1bb (ENSOSIG00000011633)	antxr2b (ENSOSIG00000012652)	paqr3b (ENSOSIG00000012671)	slc26a1 (ENSOSIG00000012674)	ENSOSIG00000012676	ENSOSIG00000012679	ENSOSIG00000012714	cldn23.1 (ENSOSIG00000015086)	ndr1 (ENSOSIG00000015091) #22	eif4ebp1 (ENSOSIG00000015096)
Cyprinodontiformes	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000154091.a.a.s.b	ENSGT00940000155816.a	ENSGT00940000156320.d	ENSGT00940000155291.b	ENSGT01100000263544.c.a.a.b	ENSGT00940000155983.a.b	ENSGT00940000168590	ENSGT00940000159066	ENSGT00940000156161.A	ENSGT00390000006975	ENSGT00610000087482	ENSGT00940000162544.c.a	ENSGT00940000162544.d	ENSGT00940000178030.a	ENSGT00940000178065	ENSGT00940000163919.b #22	ENSGT00940000159932.b	ENSGT00940000155760.t.b	ENSGT00940000161685.A.a	ENSGT00940000156208.i	ENSGT00950000182926.b.c	ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b	ENSGT00940000156024.i.a.f	ENSGT00940000158699.q.b.d	ENSGT00940000164254.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000167368	ENSGT00940000156664.c	ENSGT00940000158699.q.b.c	ENSGT00940000153892.B	ENSGT00940000162805
Aplocheiloidei	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00950000183096.a.b	ENSGT00940000158994	ENSGT00390000006366.a	ENSGT00940000157724.a.b	ENSGT00940000154091.a.a.s.b	ENSGT00940000155816.a	ENSGT00940000156320.d	ENSGT00940000155291.b	ENSGT01100000263544.c.a.a.b	ENSGT00940000155983.a.b	ENSGT00940000159066	ENSGT00940000156161.A	ENSGT00390000006975	ENSGT00940000162544.c.a	ENSGT00940000178030.a	ENSGT00940000163919.b #22	ENSGT00940000159932.b	ENSGT00940000155760.t.b	ENSGT00940000161685.A.a	ENSGT00940000156208.i	ENSGT00950000182926.b.c	ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b	ENSGT00940000156024.i.a.f	ENSGT00940000158699.q.b.d	ENSGT00940000164254.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000167368	ENSGT00940000156664.c	ENSGT00940000158699.q.a	ENSGT00940000153892.B	ENSGT00940000162805
Mangrove rivulus	MODERN SPECIES	16	SLC46A2 (ENSKMAG00000014567)	snx30 (ENSKMAG00000014529)	inip (ENSKMAG00000014510)	snx18b (ENSKMAG00000014496)	ENSKMAG00000014459	rasgef1bb (ENSKMAG00000014414)	antxr2b (ENSKMAG00000014384)	paqr3b (ENSKMAG00000014357)	slc26a1 (ENSKMAG00000014321)	ENSKMAG00000014282	dusp4 (ENSKMAG00000014251)	ENSKMAG00000014133	cldn23.1 (ENSKMAG00000014078)	ENSKMAG00000013925	ENSKMAG00000013883	ndr1 (ENSKMAG00000013866) #22	eif4ebp1 (ENSKMAG00000013857)	ANK1 (ENSKMAG00000013580)	nefma (ENSKMAG00000013463)	neflb (ENSKMAG00000013417)	pgam2 (ENSKMAG00000013402)	ENSKMAG00000013386	ENSKMAG00000013343	MMP17 (ENSKMAG00000013317)	ENSKMAG00000013289	crkl (ENSKMAG00000013269)	ULK1 (ENSKMAG00000013221)	MMP17 (ENSKMAG00000013191)	sfswap (ENSKMAG00000013168)	TRABD2A (ENSKMAG00000013149)	HOOK3 (ENSKMAG00000013042)
Turquoise killifish	MODERN SPECIES	1611	SNX18B (ENSNFUG00015020666)	ENSNFUG00015020667	rasgef1bb (ENSNFUG00015020686)	antxr2b (ENSNFUG00015021407)	PAQR3B (ENSNFUG00015021414)	SLC26A1 (ENSNFUG00015021420)	ENSNFUG00015021423	ENSNFUG00015021425	DUSP4 (ENSNFUG00015021429)	ENSNFUG00015021453	ENSNFUG00015008934	ENSNFUG00015008943	ENSNFUG00015008963	cldn23.1 (ENSNFUG00015008975)	ENSNFUG00015009057	ndr1 (ENSNFUG00015009245) #22	EIF4EBP1 (ENSNFUG00015009271)	ANK1 (ENSNFUG00015009423)	nefma (ENSNFUG00015009773)	neflb (ENSNFUG00015009789)	pgam2 (ENSNFUG00015009807)	ENSNFUG00015009818	MMP17A (ENSNFUG00015009838)	TBX16 (ENSNFUG00015009850)	crkl (ENSNFUG00015009859)	si:ch211-222n4.2 (ENSNFUG00015009865)	ULK1B (ENSNFUG00015009934)	MMP17 (ENSNFUG00015010708)	sfswap (ENSNFUG00015010736)	ENSNFUG00015010767	TRABD2A (ENSNFUG00015010773)
Cyprinodontoidei	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00390000006366.a	ENSGT00940000157724.a.b	ENSGT00940000154091.a.a.s.b	ENSGT00940000155816.a	ENSGT00940000156320.d	ENSGT00940000155291.b	ENSGT01100000263544.c.a.a.b	ENSGT00940000155983.a.b	ENSGT00940000168590	ENSGT00940000159066	ENSGT00940000156161.A	ENSGT00390000006975	ENSGT00610000087482	ENSGT00940000162544.c.a	ENSGT00940000162544.d	ENSGT00940000163919.b #22	ENSGT00940000159932.b	ENSGT00940000155760.t.b	ENSGT00940000161685.A.a	ENSGT00940000156208.i	ENSGT00950000182926.b.c	ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b	ENSGT00940000156024.i.a.f	ENSGT00940000158699.q.b.d	ENSGT00940000164254.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000167368	ENSGT00940000156664.c	ENSGT00940000158699.q.b.c	ENSGT00940000153892.B	ENSGT00940000162805
NAME_4	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000158994	ENSGT00390000006366.a	ENSGT00940000157724.a.b	ENSGT00940000154091.a.a.s.b	ENSGT00940000155816.a	ENSGT00940000156320.d	ENSGT00940000155291.b	ENSGT01100000263544.c.a.a.b	ENSGT00940000155983.a.b	ENSGT00940000168590	ENSGT00940000159066	ENSGT00940000156161.A	ENSGT00390000006975	ENSGT00940000162544.c.a	ENSGT00940000162544.d	ENSGT00940000163919.b #22	ENSGT00940000159932.b	ENSGT00940000155760.t.b	ENSGT00940000161685.A.a	ENSGT00940000156208.i	ENSGT00950000182926.b.c	ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b	ENSGT00940000156024.i.a.f	ENSGT00940000158699.q.b.d	ENSGT00940000164254.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000167368	ENSGT00940000156664.c	ENSGT00940000158699.q.b.c	ENSGT00940000153892.B	ENSGT00940000162805
Sheepshead minnow	MODERN SPECIES	430												ENSCVAG00000000339	cldn23.1 (ENSCVAG00000013009)	ENSCVAG00000012996	ENSCVAG00000012932	ndr1 (ENSCVAG00000012913) #22	eif4ebp1 (ENSCVAG00000012901)	ANK1 (ENSCVAG00000012895)	nefma (ENSCVAG00000012810)	neflb (ENSCVAG00000012802)	pgam2 (ENSCVAG00000012785)	stx2a (ENSCVAG00000012771)	ENSCVAG00000012753	MMP17 (ENSCVAG00000012739)	ENSCVAG00000012690	crkl (ENSCVAG00000012676)	si:ch211-222n4.2 (ENSCVAG00000012655)	ULK1 (ENSCVAG00000012632)	MMP17 (ENSCVAG00000012610)
Mummichog	MODERN SPECIES	2264	snx18b (ENSFHEG00000012784)	ENSFHEG00000012762	rasgef1bb (ENSFHEG00000012689)	antxr2b (ENSFHEG00000012515)	paqr3b (ENSFHEG00000012283)	slc26a1 (ENSFHEG00000012239)	ENSFHEG00000012187	ENSFHEG00000012142	dusp4 (ENSFHEG00000012073)	ENSFHEG00000012036	cldn23.1 (ENSFHEG00000011895)	ENSFHEG00000011883	ENSFHEG00000011812	ENSFHEG00000011786	ENSFHEG00000011766	ENSFHEG00000011753 #22	eif4ebp1 (ENSFHEG00000011737)	ANK1 (ENSFHEG00000011687)	nefma (ENSFHEG00000011564)	neflb (ENSFHEG00000011439)	pgam2 (ENSFHEG00000011366)	ENSFHEG00000011400	ENSFHEG00000011343	MMP17 (ENSFHEG00000011329)	ENSFHEG00000011291	crkl (ENSFHEG00000011272)	si:ch211-222n4.2 (ENSFHEG00000011257)	ULK1 (ENSFHEG00000011250)	MMP17 (ENSFHEG00000011185)	sfswap (ENSFHEG00000011149)	ENSFHEG00000011127
Poeciliinae	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00390000006366.a	ENSGT00940000157724.a.b	ENSGT00940000154091.a.a.s.b	ENSGT00940000155816.a	ENSGT00940000156320.d	ENSGT00940000155291.b	ENSGT01100000263544.c.a.a.b	ENSGT00940000155983.a.b	ENSGT00940000168590	ENSGT00940000159066	ENSGT00940000156161.A	ENSGT00390000006975	ENSGT00610000087482	ENSGT00940000162544.c.a	ENSGT00940000162544.d	ENSGT00940000163919.b #22	ENSGT00940000159932.b	ENSGT00940000155760.t.b	ENSGT00940000161685.A.a	ENSGT00940000156208.i	ENSGT00950000182926.b.c	ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b	ENSGT00940000158699.q.b.d	ENSGT00940000164254.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000156664.c	ENSGT00940000158699.q.b.c	ENSGT00940000153892.B	ENSGT00940000162805	ENSGT00940000158075	ENSGT00390000017123.b
Poecilia	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00390000006366.a	ENSGT00940000157724.a.b	ENSGT00940000154091.a.a.s.b	ENSGT00940000155816.a	ENSGT00940000156320.d	ENSGT00940000155291.b	ENSGT01100000263544.c.a.a.b	ENSGT00940000155983.a.b	ENSGT00940000168590	ENSGT00940000159066	ENSGT00940000156161.A	ENSGT00390000006975	ENSGT00610000087482	ENSGT00940000162544.c.a	ENSGT00940000162544.d	ENSGT00940000163919.b #22	ENSGT00940000159932.b	ENSGT00940000155760.t.b	ENSGT00940000161685.A.a	ENSGT00940000156208.i	ENSGT00950000182926.b.c	ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b	ENSGT00940000158699.q.b.d	ENSGT00940000164254.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000156664.c	ENSGT00940000158699.q.b.c	ENSGT00940000153892.B	ENSGT00940000162805	ENSGT00940000158075	ENSGT00390000017123.b
Guppy	MODERN SPECIES	442	snx30 (ENSPREG00000005480)	inip (ENSPREG00000005504)	snx18b (ENSPREG00000005525)	ENSPREG00000005545	rasgef1bb (ENSPREG00000005609)	antxr2b (ENSPREG00000005651)	paqr3b (ENSPREG00000005732)	slc26a1 (ENSPREG00000005774)	ENSPREG00000005822	ENSPREG00000005848	dusp4 (ENSPREG00000005876)	ENSPREG00000005920	cldn23.1 (ENSPREG00000006047)	ENSPREG00000006089	ENSPREG00000006222	ENSPREG00000006313 #22	eif4ebp1 (ENSPREG00000006324)	ANK1 (ENSPREG00000006344)	nefma (ENSPREG00000006401)	neflb (ENSPREG00000006406)	ENSPREG00000006430	pgam2 (ENSPREG00000006497)	MMP17 (ENSPREG00000006526)	ENSPREG00000006558	crkl (ENSPREG00000006578)	ULK1 (ENSPREG00000006613)	MMP17 (ENSPREG00000006640)	sfswap (ENSPREG00000006692)	TRABD2A (ENSPREG00000006752)	ENSPREG00000006761	HOOK3 (ENSPREG00000006820)
NAME_6	ANCESTRAL SPECIES	130	ENSGT00390000006366.a	ENSGT00940000157724.a.b	ENSGT00940000154091.a.a.s.b	ENSGT00940000155816.a	ENSGT00940000156320.d	ENSGT00940000155291.b	ENSGT01100000263544.c.a.a.b	ENSGT00940000155983.a.b	ENSGT00940000168590	ENSGT00940000159066	ENSGT00940000156161.A	ENSGT00390000006975	ENSGT00610000087482	ENSGT00940000162544.c.a	ENSGT00940000162544.d	ENSGT00940000163919.b #22	ENSGT00940000159932.b	ENSGT00940000155760.t.b	ENSGT00940000161685.A.a	ENSGT00940000156208.i	ENSGT00950000182926.b.c	ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b	ENSGT00940000158699.q.b.d	ENSGT00940000164254.a.b
Sailfin molly	MODERN SPECIES	522										dusp4 (ENSPLAG00000004381)	ENSPLAG00000004341	cldn23.1 (ENSPLAG00000004273)	ENSPLAG00000004260	ENSPLAG00000004243	ENSPLAG00000004217	ENSPLAG00000004204 #22	eif4ebp1 (ENSPLAG00000004199)	ANK1 (ENSPLAG00000004182)	nefma (ENSPLAG00000004120)	ENSPLAG00000004004	pgam2 (ENSPLAG00000003909)	ENSPLAG00000003904
Amazon molly	MODERN SPECIES	396	inip (ENSPFOG00000003562)	snx18b (ENSPFOG00000003569)	ENSPFOG00000003643	rasgef1bb (ENSPFOG00000004093)	antxr2b (ENSPFOG00000004224)	paqr3b (ENSPFOG00000004513)	slc26a1 (ENSPFOG00000004575)	ENSPFOG00000004769	ENSPFOG00000023568	dusp4 (ENSPFOG00000004804)	ENSPFOG00000004982	cldn23.1 (ENSPFOG00000020334)	ENSPFOG00000020335	ENSPFOG00000005920	ENSPFOG00000006003	ndr1 (ENSPFOG00000006036) #22	eif4ebp1 (ENSPFOG00000006081)	ANK1 (ENSPFOG00000006144)	nefma (ENSPFOG00000007247)	neflb (ENSPFOG00000007321)	pgam2 (ENSPFOG00000007353)	pgam2 (ENSPFOG00000007376)	ENSPFOG00000007404	ENSPFOG00000007579
Platyfish	MODERN SPECIES	22	snx30 (ENSXMAG00000026436)	inip (ENSXMAG00000002259)	snx18b (ENSXMAG00000002261)	ENSXMAG00000002267	rasgef1bb (ENSXMAG00000002271)	antxr2b (ENSXMAG00000002277)	paqr3b (ENSXMAG00000002288)	slc26a1 (ENSXMAG00000002291)	ENSXMAG00000002301	ENSXMAG00000022408	dusp4 (ENSXMAG00000021873)	ENSXMAG00000002312	cldn23.1 (ENSXMAG00000020077)	ENSXMAG00000002338	ENSXMAG00000023414	ENSXMAG00000027715 #22	eif4ebp1 (ENSXMAG00000025049)	ANK1 (ENSXMAG00000002364)	nefma (ENSXMAG00000025159)	neflb (ENSXMAG00000002416)	pgam2 (ENSXMAG00000021805)	ENSXMAG00000026112	MMP17 (ENSXMAG00000002441)	ENSXMAG00000027166	crkl (ENSXMAG00000026069)	ENSXMAG00000029005	ULK1 (ENSXMAG00000002466)	MMP17 (ENSXMAG00000023131)	sfswap (ENSXMAG00000009020)	TRABD2A (ENSXMAG00000009059)	HOOK3 (ENSXMAG00000009065)
Ovalentaria_B	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000157724.a.b	ENSGT00940000154091.a.a.s.b	ENSGT00940000155816.a	ENSGT00940000156320.d	ENSGT00940000155291.b	ENSGT01100000263544.c.a.a.b	ENSGT00940000155983.a.b	ENSGT00940000168590	ENSGT00940000159066	ENSGT00940000156161.A	ENSGT00390000006975	ENSGT00610000087482	ENSGT00940000162544.c.a	ENSGT00940000162544.d	ENSGT00940000178065	ENSGT00940000163919.b #22	ENSGT00940000159932.b	ENSGT00940000155760.t.b	ENSGT00940000161685.A.a	ENSGT00940000156208.i	ENSGT00950000182926.b.c	ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b	ENSGT00940000158699.q.b	ENSGT00940000164254.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000167368	ENSGT00940000156664.c	ENSGT00940000158699.q.a	ENSGT00940000153892.B	ENSGT00940000173905	ENSGT00940000162805
Pomacentridae	ANCESTRAL SPECIES	44	ENSGT00390000006366.a	ENSGT00940000157724.a.b	ENSGT00940000154091.a.a.s.b	ENSGT00940000155816.a	ENSGT00940000156320.d	ENSGT00940000155291.b	ENSGT01100000263544.c.a.a.b	ENSGT00940000155983.a.b	ENSGT00940000168590	ENSGT00940000159066	ENSGT00940000156161.A	ENSGT00390000006975	ENSGT00940000162544.c.a	ENSGT00940000178030.b	ENSGT00940000178065	ENSGT00940000163919.b #22	ENSGT00940000159932.b	ENSGT00940000155760.t.b	ENSGT00940000161685.A.a	ENSGT00940000156208.i	ENSGT00950000182926.b.c	ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b	ENSGT00940000158699.q.b.a	ENSGT00940000164254.a.b
Pomacentridae_A	ANCESTRAL SPECIES	86	ENSGT00940000158994	ENSGT00390000006366.a	ENSGT00940000157724.a.b	ENSGT00940000154091.a.a.s.b	ENSGT00940000155816.a	ENSGT00940000156320.d	ENSGT00940000155291.b	ENSGT01100000263544.c.a.a.b	ENSGT00940000155983.a.b	ENSGT00940000168590	ENSGT00940000159066	ENSGT00940000156161.A	ENSGT00390000006975	ENSGT00940000162544.c.a	ENSGT00940000178030.b	ENSGT00940000163919.b #22	ENSGT00940000159932.b	ENSGT00940000155760.t.b	ENSGT00940000161685.A.a	ENSGT00940000156208.i	ENSGT00950000182926.b.c	ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b	ENSGT00940000158699.q.b.a	ENSGT00940000164254.a.b
Amphiprion	ANCESTRAL SPECIES	127	ENSGT00940000158994	ENSGT00390000006366.a	ENSGT00940000157724.a.b	ENSGT00940000154091.a.a.s.b	ENSGT00940000155816.a	ENSGT00940000156320.d	ENSGT00940000155291.b	ENSGT01100000263544.c.a.a.b	ENSGT00940000155983.a.b	ENSGT00940000168590	ENSGT00940000159066	ENSGT00940000156161.A	ENSGT00390000006975	ENSGT00940000162544.c.a	ENSGT00940000178030.b	ENSGT00940000163919.b #22	ENSGT00940000159932.b	ENSGT00940000155760.t.b	ENSGT00940000161685.A.a	ENSGT00940000156208.i	ENSGT00950000182926.b.c	ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b	ENSGT00940000158699.q.b.a	ENSGT00940000164254.a.b
Clown anemonefish	MODERN SPECIES	607													cldn23.1 (ENSAOCG00000017929)	ENSAOCG00000018001	ENSAOCG00000018014	ENSAOCG00000018021 #22	eif4ebp1 (ENSAOCG00000001279)	ANK1 (ENSAOCG00000018157)	nefma (ENSAOCG00000001297)	neflb (ENSAOCG00000018195)	pgam2 (ENSAOCG00000018211)	STX2 (ENSAOCG00000018220)
Orange clownfish	MODERN SPECIES	7	snx30 (ENSAPEG00000003107)	inip (ENSAPEG00000003088)	snx18b (ENSAPEG00000003006)	ENSAPEG00000002992	rasgef1bb (ENSAPEG00000002968)	ENSAPEG00000002881	paqr3b (ENSAPEG00000002831)	slc26a1 (ENSAPEG00000002819)	ENSAPEG00000002757	ENSAPEG00000002720	ENSAPEG00000002695	dusp4 (ENSAPEG00000002683)	ENSAPEG00000002584	cldn23.1 (ENSAPEG00000002542)	ENSAPEG00000002120	ENSAPEG00000002083 #22	eif4ebp1 (ENSAPEG00000002059)	ANK1 (ENSAPEG00000001924)	nefma (ENSAPEG00000001916)	neflb (ENSAPEG00000001897)	pgam2 (ENSAPEG00000001880)	ENSAPEG00000001870	MMP17 (ENSAPEG00000001832)	ENSAPEG00000001739
Spiny chromis	MODERN SPECIES	519										ENSAPOG00000020110	ENSAPOG00000020073	dusp4 (ENSAPOG00000020056)	ENSAPOG00000020020	cldn23.1 (ENSAPOG00000019889)	ENSAPOG00000019865	ENSAPOG00000019755 #22	eif4ebp1 (ENSAPOG00000019728)	ANK1 (ENSAPOG00000019707)
Bicolor damselfish	MODERN SPECIES	504										ENSSPAG00000001035	cldn23.1 (ENSSPAG00000001151)	ENSSPAG00000001164	ENSSPAG00000001182	ENSSPAG00000001198	ENSSPAG00000001219	ENSSPAG00000001241 #22	eif4ebp1 (ENSSPAG00000001256)	ANK1 (ENSSPAG00000001274)	ENSSPAG00000001391	nefma (ENSSPAG00000001418)	neflb (ENSSPAG00000001497)	pgam2 (ENSSPAG00000001517)	ENSSPAG00000001534	MMP17 (ENSSPAG00000001562)	ENSSPAG00000001605
Cichlidae	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000157724.a.b	ENSGT00940000154091.a.a.s.b	ENSGT00940000155816.a	ENSGT00940000156320.d	ENSGT00940000155291.b	ENSGT01100000263544.c.a.a.b	ENSGT00940000155983.a.b	ENSGT00940000168590	ENSGT00940000159066	ENSGT00940000156161.A	ENSGT00390000006975	ENSGT00610000087482	ENSGT00940000162544.c.a	ENSGT00940000162544.d	ENSGT00940000178065	ENSGT00940000163919.b #22	ENSGT00940000159932.b	ENSGT00940000155760.t.b	ENSGT00940000161685.A.a	ENSGT00940000156208.i	ENSGT00950000182926.b.c	ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b	ENSGT00940000158699.q.b	ENSGT00940000164254.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000167368	ENSGT00940000156664.c	ENSGT00940000158699.q.a	ENSGT00940000153892.B	ENSGT00940000173905	ENSGT00940000162805
Pseudocrenilabrinae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000157724.a.b	ENSGT00940000154091.a.a.s.b	ENSGT00940000155816.a	ENSGT00940000156320.d	ENSGT00940000155291.b	ENSGT01100000263544.c.a.a.b	ENSGT00940000155983.a.b	ENSGT00940000168590	ENSGT00940000159066	ENSGT00940000156161.A	ENSGT00390000006975	ENSGT00610000087482	ENSGT00940000162544.c.a	ENSGT00940000164512.d	ENSGT00940000178065	ENSGT00940000163919.b #22	ENSGT00940000159932.b	ENSGT00940000155760.t.b	ENSGT00940000161685.A.a	ENSGT00940000156208.i	ENSGT00950000182926.b.c	ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b	ENSGT00940000158699.q.b	ENSGT00940000154396.a	ENSGT00940000155640.b	ENSGT00940000157920.b	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543.b	ENSGT00940000154687.B.q.a	ENSGT00940000154130.a.b.e
Pseudocrenilabrinae_A	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000154091.a.a.s.b	ENSGT00940000155816.a	ENSGT00940000156320.d	ENSGT00940000155291.b	ENSGT01100000263544.c.a.a.b	ENSGT00940000155983.a.b	ENSGT00940000168590	ENSGT00940000159066	ENSGT00940000156161.A	ENSGT00390000006975	ENSGT00610000087482	ENSGT00940000162544.c.a	ENSGT00940000164512.d	ENSGT00940000178723	ENSGT00940000178065	ENSGT00940000163919.b #22	ENSGT00940000159932.b	ENSGT00940000155760.t.b	ENSGT00940000161685.A.a	ENSGT00940000156208.i	ENSGT00950000182926.b.c	ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b	ENSGT00940000158699.q.b	ENSGT00940000154396.a	ENSGT00940000155640.b	ENSGT00940000157920.b	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543.b	ENSGT00940000154687.B.q.a	ENSGT00940000154130.a.b.e
Haplochromini	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000154091.a.a.s.b	ENSGT00940000155816.a	ENSGT00940000156320.d	ENSGT00940000155291.b	ENSGT01100000263544.c.a.a.b	ENSGT00940000155983.a.b	ENSGT00940000168590	ENSGT00940000159066	ENSGT00940000156161.A	ENSGT00390000006975	ENSGT00610000087482	ENSGT00940000162544.c.a	ENSGT00940000164512.d	ENSGT00940000178723	ENSGT00940000178065	ENSGT00940000163919.b #22	ENSGT00940000159932.b	ENSGT00940000155760.t.b	ENSGT00940000161685.A.a	ENSGT00940000156208.i	ENSGT00950000182926.b.c	ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b	ENSGT00940000158699.q.b	ENSGT00940000154396.a	ENSGT00940000155640.b	ENSGT00940000157920.b	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543.b	ENSGT00940000154687.B.q.a	ENSGT00940000154130.a.b.e
Haplochromini_A	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00390000013183.d.a.b	ENSGT00940000157724.a.b	ENSGT00940000154091.a.a.s.b	ENSGT00940000155816.a	ENSGT00940000156320.d	ENSGT00940000155291.b	ENSGT01100000263544.c.a.a.b	ENSGT00940000155983.a.b	ENSGT00940000168590	ENSGT00940000159066	ENSGT00940000156161.A	ENSGT00390000006975	ENSGT00940000162544.c.a	ENSGT00940000178723	ENSGT00940000181550	ENSGT00940000163919.b #22	ENSGT00940000159932.b	ENSGT00940000155760.t.b	ENSGT00940000161685.A.a	ENSGT00940000156208.i	ENSGT00950000182926.b.c	ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b	ENSGT00940000158699.q.b	ENSGT00940000154396.a	ENSGT00940000155640.b	ENSGT00940000157920.b	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543.b	ENSGT00940000154687.B.q.a	ENSGT00940000154130.a.b.e
P. nyererei	MODERN SPECIES	327	snx18b (ENSPNYG00000010729)	ENSPNYG00000010793	rasgef1bb (ENSPNYG00000010843)	antxr2b (ENSPNYG00000010906)	paqr3b (ENSPNYG00000011056)	slc26a1 (ENSPNYG00000011102)	ENSPNYG00000011233	ENSPNYG00000011253	dusp4 (ENSPNYG00000011292)	ENSPNYG00000011308	cldn23.1 (ENSPNYG00000011364)	ENSPNYG00000011415	ENSPNYG00000011584	ENSPNYG00000011596	ENSPNYG00000011617	ENSPNYG00000011630 #22	eif4ebp1 (ENSPNYG00000011640)	ANK1 (ENSPNYG00000011659)	ENSPNYG00000011726	nefma (ENSPNYG00000011781)	neflb (ENSPNYG00000011855)	pgam2 (ENSPNYG00000011876)	ENSPNYG00000011898	ENSPNYG00000011911	MMP17 (ENSPNYG00000011926)	rln1 (ENSPNYG00000011951)	jak2a (ENSPNYG00000011975)	ENSPNYG00000012034	RC3H2 (ENSPNYG00000012063)	RABGAP1 (ENSPNYG00000012166)	GPR21 (ENSPNYG00000012294)
Haplochromini_B	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000013183.d.a.b	ENSGT00940000157724.a.b	ENSGT00940000154091.a.a.s.b	ENSGT00940000155816.a	ENSGT00940000156320.d	ENSGT00940000155291.b	ENSGT01100000263544.c.a.a.b	ENSGT00940000155983.a.b	ENSGT00940000168590	ENSGT00940000159066	ENSGT00940000156161.A	ENSGT00390000006975	ENSGT00940000162544.c.a	ENSGT00940000164512.d	ENSGT00940000178065	ENSGT00940000163919.b #22	ENSGT00940000159932.b	ENSGT00940000155760.t.b	ENSGT00940000161685.A.a	ENSGT00940000156208.i	ENSGT00950000182926.b.c	ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b	ENSGT00940000158699.q.b	ENSGT00940000154396.a	ENSGT00940000155640.b	ENSGT00940000157920.b	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543.b	ENSGT00940000154687.B.q.a	ENSGT00940000154130.a.b.e
Zebra mbuna	MODERN SPECIES	1110	ENSMZEG00005016628	snx18b (ENSMZEG00005016632)	ENSMZEG00005016645	rasgef1bb (ENSMZEG00005016666)	antxr2b (ENSMZEG00005016675)	paqr3b (ENSMZEG00005016683)	slc26a1 (ENSMZEG00005016692)	ENSMZEG00005016707	ENSMZEG00005016712	dusp4 (ENSMZEG00005016720)	ENSMZEG00005016736	cldn23.1 (ENSMZEG00005016795)	ENSMZEG00005016839	ENSMZEG00005016872	ENSMZEG00005016874	ENSMZEG00005016886 #22	eif4ebp1 (ENSMZEG00005016890)	ANK1 (ENSMZEG00005016895)	nefma (ENSMZEG00005016914)	neflb (ENSMZEG00005016919)	pgam2 (ENSMZEG00005016923)	ENSMZEG00005016933	ENSMZEG00005016937	MMP17 (ENSMZEG00005016954)	ENSMZEG00005016978	jak2a (ENSMZEG00005016984)	ENSMZEG00005017007	ENSMZEG00005017012	RC3H2 (ENSMZEG00005017019)	RABGAP1 (ENSMZEG00005017064)	GPR21 (ENSMZEG00005017141)
Eastern happy	MODERN SPECIES	19	snx18b (ENSACLG00000024685)	ENSACLG00000024520	rasgef1bb (ENSACLG00000024446)	ENSACLG00000024434	antxr2b (ENSACLG00000024375)	paqr3b (ENSACLG00000024363)	slc26a1 (ENSACLG00000024164)	ENSACLG00000024154	ENSACLG00000024141	dusp4 (ENSACLG00000024134)	ENSACLG00000024068	cldn23.1 (ENSACLG00000023958)	ENSACLG00000023692	ENSACLG00000023660	ENSACLG00000023648	ndr1 (ENSACLG00000023643) #22	eif4ebp1 (ENSACLG00000023638)	ANK1 (ENSACLG00000023453)	nefma (ENSACLG00000023422)	neflb (ENSACLG00000023415)	pgam2 (ENSACLG00000023406)	ENSACLG00000023400	ENSACLG00000023355	ENSACLG00000023350	ENSACLG00000023342	MMP17 (ENSACLG00000023299)	rln1 (ENSACLG00000023223)	jak2a (ENSACLG00000023172)	ENSACLG00000023156	RC3H2 (ENSACLG00000023136)	GPR21 (ENSACLG00000023129)
Burton s mouthbrooder	MODERN SPECIES	405	ENSHBUG00000022718	snx18b (ENSHBUG00000022759)	ENSHBUG00000022962	rasgef1bb (ENSHBUG00000022982)	antxr2b (ENSHBUG00000023003)	paqr3b (ENSHBUG00000023053)	slc26a1 (ENSHBUG00000023105)	ENSHBUG00000023145	ENSHBUG00000023166	dusp4 (ENSHBUG00000023178)	ENSHBUG00000023389	cldn23.1 (ENSHBUG00000023433)	ENSHBUG00000023458	ENSHBUG00000023476	ENSHBUG00000023489	ndr1 (ENSHBUG00000000716) #22	eif4ebp1 (ENSHBUG00000023513)	ANK1 (ENSHBUG00000023656)	nefma (ENSHBUG00000023788)	neflb (ENSHBUG00000023803)	pgam2 (ENSHBUG00000023816)	ENSHBUG00000023822	MMP17 (ENSHBUG00000003869)	rln1 (ENSHBUG00000003877)	jak2a (ENSHBUG00000003937)	ENSHBUG00000003956	RC3H2 (ENSHBUG00000003976)	GPR21 (ENSHBUG00000003995)	RABGAP1 (ENSHBUG00000004280)	STRBP (ENSHBUG00000004384)
Lyretail cichlid	MODERN SPECIES	328	inip (ENSNBRG00000010323)	snx18b (ENSNBRG00000010311)	ENSNBRG00000010251	rasgef1bb (ENSNBRG00000010210)	antxr2b (ENSNBRG00000010166)	paqr3b (ENSNBRG00000010143)	slc26a1 (ENSNBRG00000010013)	ENSNBRG00000009976	ENSNBRG00000009941	dusp4 (ENSNBRG00000009930)	ENSNBRG00000009869	ENSNBRG00000009850	cldn23.1 (ENSNBRG00000009840)	ENSNBRG00000009700	ENSNBRG00000009654	ENSNBRG00000009644 #22	eif4ebp1 (ENSNBRG00000009633)	ANK1 (ENSNBRG00000009558)	nefma (ENSNBRG00000009534)	neflb (ENSNBRG00000009521)	pgam2 (ENSNBRG00000009501)	ENSNBRG00000009486	ENSNBRG00000009476	MMP17 (ENSNBRG00000009451)	rln1 (ENSNBRG00000009431)	jak2a (ENSNBRG00000009344)	ENSNBRG00000009318	RC3H2 (ENSNBRG00000009276)	GPR21 (ENSNBRG00000009242)	RABGAP1 (ENSNBRG00000009158)	STRBP (ENSNBRG00000009092)
Nile tilapia	MODERN SPECIES	19	palm2akap2 (ENSONIG00000004088)	slc46a2 (ENSONIG00000004086)	snx30 (ENSONIG00000004082)	inip (ENSONIG00000029172)	ENSONIG00000035349	snx18b (ENSONIG00000004080)	ENSONIG00000004075	rasgef1bb (ENSONIG00000004068)	antxr2b (ENSONIG00000004061)	paqr3b (ENSONIG00000030068)	slc26a1 (ENSONIG00000004047)	dusp4 (ENSONIG00000041169)	ENSONIG00000004019	cldn23.1 (ENSONIG00000020635)	ENSONIG00000004014	ndr1 (ENSONIG00000004012) #22	eif4ebp1 (ENSONIG00000035373)	ANK1 (ENSONIG00000003990)	nefma (ENSONIG00000003986)	neflb (ENSONIG00000003981)	pgam2 (ENSONIG00000003979)	STX2 (ENSONIG00000043217)	ENSONIG00000032869	ENSONIG00000040512	ENSONIG00000032559	MMP17 (ENSONIG00000003963)	ENSONIG00000003962	jak2a (ENSONIG00000003957)	ENSONIG00000031422	RC3H2 (ENSONIG00000003945)	RABGAP1 (ENSONIG00000003929)
Midas cichlid	MODERN SPECIES	110											ENSACIG00000008519	ENSACIG00000008534	cldn23.1 (ENSACIG00000008551)	ENSACIG00000008568	ENSACIG00000008659	ENSACIG00000008674 #22	eif4ebp1 (ENSACIG00000008686)	ANK1 (ENSACIG00000008764)	ENSACIG00000008836	nefma (ENSACIG00000008855)	neflb (ENSACIG00000008909)	pgam2 (ENSACIG00000008930)	ENSACIG00000009069	MMP17 (ENSACIG00000009078)	ENSACIG00000009104	crkl (ENSACIG00000009121)	si:ch211-222n4.2 (ENSACIG00000009131)	ULK1 (ENSACIG00000009165)	MMP17 (ENSACIG00000009215)	ENSACIG00000009240
Percomorphaceae_C	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00390000013183.d.a.b	ENSGT00940000157724.a.b	ENSGT00940000154091.a.a.s.b	ENSGT00940000155816.a	ENSGT00940000156320.d	ENSGT00940000155291.b	ENSGT01100000263544.c.a.a.b	ENSGT00940000155983.a.b	ENSGT00940000168590	ENSGT00940000159066	ENSGT00940000156161.A	ENSGT00390000006975	ENSGT00940000162544.c.a	ENSGT00940000164512.d	ENSGT00940000162544.d	ENSGT00940000163919.b #22	ENSGT00940000159932.b	ENSGT00940000155760.t.b	ENSGT00940000161685.A.a	ENSGT00940000156208.i	ENSGT00950000182926.b.c	ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b	ENSGT00940000158699.q.b	ENSGT00940000164254.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000167368	ENSGT00940000156664.c	ENSGT00940000158699.q.a	ENSGT00940000153892.B	ENSGT00940000162805	ENSGT00940000158075
Eupercaria	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00390000013183.d.a.b	ENSGT00940000157724.a.b	ENSGT00940000154091.a.a.s.b	ENSGT00940000155816.a	ENSGT00940000156320.d	ENSGT00940000155291.b	ENSGT01100000263544.c.a.a.b	ENSGT00940000155983.a.b	ENSGT00940000168590	ENSGT00940000159066	ENSGT00940000156161.A	ENSGT00390000006975	ENSGT00940000162544.c.a	ENSGT00940000178030	ENSGT00940000162544.d	ENSGT00940000163919.b #22	ENSGT00940000159932.b	ENSGT00940000155760.t.b	ENSGT00940000161685.A.a	ENSGT00940000156208.i	ENSGT00950000182926.b.c	ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b	ENSGT00940000164254.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000167368	ENSGT00940000156664.c	ENSGT00940000158699.q.a	ENSGT00940000153892.B	ENSGT00940000162805	ENSGT00940000158075	ENSGT00390000017123.b
Tetraodontidae	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00950000183096.a.b	ENSGT00940000158994	ENSGT00390000006366.a	ENSGT00940000157724.a.b	ENSGT00940000154091.a.a.t	ENSGT00940000155816.a	ENSGT00940000156320.d	ENSGT00940000155291.b	ENSGT01100000263544.c.a.a.b	ENSGT00940000155983.a.b	ENSGT00940000168590	ENSGT00940000159066	ENSGT00940000156161.A	ENSGT00390000006975	ENSGT00940000162544.c.a	ENSGT00940000163919.b #22	ENSGT00940000159932.b	ENSGT00440000038604.i	ENSGT00940000165709	ENSGT00940000167205	ENSGT00530000063749.c.b	ENSGT00390000014471	ENSGT00390000008196	ENSGT00940000155803.l	ENSGT00940000153212	ENSGT00520000055626.a	ENSGT00390000013484	ENSGT00510000050587	ENSGT00940000176948	ENSGT00940000154997	ENSGT00390000008457
Fugu	MODERN SPECIES	18	ENSTRUG00000026503	palm2akap2 (ENSTRUG00000006899)	SLC46A2 (ENSTRUG00000006727)	snx30 (ENSTRUG00000006587)	inip (ENSTRUG00000023960)	snx18b (ENSTRUG00000023691)	rasgef1bb (ENSTRUG00000005484)	paqr3b (ENSTRUG00000004286)	slc26a1 (ENSTRUG00000022331)	ENSTRUG00000003018	ENSTRUG00000023865	dusp4 (ENSTRUG00000011369)	ENSTRUG00000010911	cldn23.1 (ENSTRUG00000010901)	ENSTRUG00000030476	ndr1 (ENSTRUG00000032378) #22	eif4ebp1 (ENSTRUG00000020480)	npdc1a (ENSTRUG00000024228)	pou5f3 (ENSTRUG00000010727)	fut7 (ENSTRUG00000010723)	apc (ENSTRUG00000010546)	fktn (ENSTRUG00000010423)	ufc1 (ENSTRUG00000029986)	ythdc1 (ENSTRUG00000010142)	ENSTRUG00000009845	ENSTRUG00000020043	pisd (ENSTRUG00000009670)	rnf224 (ENSTRUG00000024290)	ENSTRUG00000021391	FER (ENSTRUG00000009120)	cdc26 (ENSTRUG00000022304)
Tetraodon	MODERN SPECIES	19	snx18b (ENSTNIG00000013223)	ENSTNIG00000013224	rasgef1bb (ENSTNIG00000013225)	antxr2b (ENSTNIG00000013226)	paqr3b (ENSTNIG00000013227)	slc26a1 (ENSTNIG00000013228)	ENSTNIG00000013229	ENSTNIG00000013230	dusp4 (ENSTNIG00000013231)	ENSTNIG00000013232	cldn23.1 (ENSTNIG00000013233)	ENSTNIG00000013234	ENSTNIG00000001722	ENSTNIG00000013235	ENSTNIG00000013236	ndr1 (ENSTNIG00000013237) #22	ENSTNIG00000013238	npdc1a (ENSTNIG00000001556)	pou5f3 (ENSTNIG00000013239)	fut7 (ENSTNIG00000013240)	apc (ENSTNIG00000013241)	fktn (ENSTNIG00000013242)	ufc1 (ENSTNIG00000001144)	ugt2a6 (ENSTNIG00000013244)	ythdc1 (ENSTNIG00000013243)	ENSTNIG00000013245	pisd (ENSTNIG00000013246)	rnf224 (ENSTNIG00000013247)	FER (ENSTNIG00000013248)	cdc26 (ENSTNIG00000013249)	prpf4 (ENSTNIG00000013250)
Eupecaria_A	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00390000013183.d.a.b	ENSGT00940000157724.a.b	ENSGT00940000154091.a.a.s.b	ENSGT00940000155816.a	ENSGT00940000156320.d	ENSGT00940000155291.b	ENSGT01100000263544.c.a.a.b	ENSGT00940000155983.a.b	ENSGT00940000168590	ENSGT00940000159066	ENSGT00940000156161.A	ENSGT00390000006975	ENSGT00940000162544.c.a	ENSGT00940000178030	ENSGT00940000162544.d	ENSGT00940000163919.b #22	ENSGT00940000159932.b	ENSGT00940000155760.t.b	ENSGT00940000161685.A.a	ENSGT00940000156208.i	ENSGT00950000182926.b.c	ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b	ENSGT00940000158699.q.a.i.a	ENSGT00940000164254.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000167368	ENSGT00940000156664.c	ENSGT00940000158699.q.a.j	ENSGT00940000153892.B	ENSGT00940000162805	ENSGT00940000158075
Ballan wrasse	MODERN SPECIES	676												ENSLBEG00000011348	ENSLBEG00000011373	cldn23.1 (ENSLBEG00000011419)	ENSLBEG00000011476	ENSLBEG00000011558 #22	eif4ebp1 (ENSLBEG00000011576)	ANK1 (ENSLBEG00000011682)
Eupecaria_B	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00390000013183.d.a.b	ENSGT00940000157724.a.b	ENSGT00940000154091.a.a.s.b	ENSGT00940000155816.a	ENSGT00940000156320.d	ENSGT00940000155291.b	ENSGT01100000263544.c.a.a.b	ENSGT00940000155983.a.b	ENSGT00940000168590	ENSGT00940000159066	ENSGT00940000156161.A	ENSGT00390000006975	ENSGT00940000162544.c.a	ENSGT00940000178030	ENSGT00940000162544.d	ENSGT00940000163919.b #22	ENSGT00940000159932.b	ENSGT00940000155760.t.b	ENSGT00940000161685.A.a	ENSGT00940000156208.i	ENSGT00950000182926.b.c	ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b	ENSGT00940000158699.q.a.i.a	ENSGT00940000164254.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000167368	ENSGT00940000156664.c	ENSGT00940000158699.q.a.j	ENSGT00940000153892.B	ENSGT00940000162805	ENSGT00940000158075
Eupecaria_C	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000158994	ENSGT00390000006366.a	ENSGT00390000013183.d.a.b	ENSGT00940000157724.a.b	ENSGT00940000154091.a.a.s.b	ENSGT00940000155816.a	ENSGT00940000156320.d	ENSGT00940000155291.b	ENSGT01100000263544.c.a.a.b	ENSGT00940000155983.a.b	ENSGT00940000168590	ENSGT00940000159066	ENSGT00940000156161.A	ENSGT00390000006975	ENSGT00940000162544.c.a	ENSGT00940000163919.b #22	ENSGT00940000159932.b	ENSGT00940000155760.t.b	ENSGT00940000161685.A.a	ENSGT00940000156208.i	ENSGT00950000182926.b.c	ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b	ENSGT00940000158699.q.a.i.a	ENSGT00940000164254.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000167368	ENSGT00940000156664.c	ENSGT00940000158699.q.a.j	ENSGT00940000153892.B	ENSGT00940000162805	ENSGT00940000158075
Gilthead seabream	MODERN SPECIES	3	inip (ENSSAUG00010014456)	ENSSAUG00010014458	snx18b (ENSSAUG00010014459)	ENSSAUG00010014465	ENSSAUG00010014471	rasgef1bb (ENSSAUG00010014513)	antxr2b (ENSSAUG00010016352)	paqr3b (ENSSAUG00010016364)	slc26a1 (ENSSAUG00010016365)	ENSSAUG00010016368	ENSSAUG00010016369	dusp4 (ENSSAUG00010016370)	ENSSAUG00010016440	cldn23.1 (ENSSAUG00010019162)	ENSSAUG00010019169	ENSSAUG00010019172 #22	eif4ebp1 (ENSSAUG00010019173)	ANK1 (ENSSAUG00010019186)	nefma (ENSSAUG00010019254)	neflb (ENSSAUG00010019256)	pgam2 (ENSSAUG00010019257)	ENSSAUG00010019258	MMP17 (ENSSAUG00010019260)	crkl (ENSSAUG00010019265)	si:ch211-222n4.2 (ENSSAUG00010019266)	ULK1 (ENSSAUG00010019274)	MMP17 (ENSSAUG00010019909)	sfswap (ENSSAUG00010019918)	TRABD2A (ENSSAUG00010019922)	HOOK3 (ENSSAUG00010019932)	rnf170 (ENSSAUG00010020081)
Eupercaria_incertae_sedis	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000158994	ENSGT00390000006366.a	ENSGT00390000013183.d.a.b	ENSGT00940000157724.a.b	ENSGT00940000154091.a.a.s.b	ENSGT00940000155816.a	ENSGT00940000156320.d	ENSGT00940000155291.b	ENSGT01100000263544.c.a.a.b	ENSGT00940000155983.a.b	ENSGT00940000168590	ENSGT00940000159066	ENSGT00940000156161.A	ENSGT00390000006975	ENSGT00940000162544.c.a	ENSGT00940000163919.b #22	ENSGT00940000159932.b	ENSGT00940000155760.t.b	ENSGT00940000161685.A.a	ENSGT00940000156208.i	ENSGT00950000182926.b.c	ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b	ENSGT00940000164254.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000167368	ENSGT00940000156664.c	ENSGT00940000158699.q.a.j	ENSGT00940000153892.B	ENSGT00940000162805	ENSGT00940000158075	ENSGT00390000017123.b
Large yellow croaker	MODERN SPECIES	3	snx30 (ENSLCRG00005023626)	inip (ENSLCRG00005023624)	ENSLCRG00005023623	snx18b (ENSLCRG00005023622)	ENSLCRG00005023621	rasgef1bb (ENSLCRG00005023618)	antxr2b (ENSLCRG00005023616)	paqr3b (ENSLCRG00005023615)	slc26a1 (ENSLCRG00005023613)	ENSLCRG00005023612	ENSLCRG00005023611	dusp4 (ENSLCRG00005023610)	ENSLCRG00005023417	cldn23.1 (ENSLCRG00005023406)	ENSLCRG00005023405	ndr1 (ENSLCRG00005023403) #22	eif4ebp1 (ENSLCRG00005023402)	ANK1 (ENSLCRG00005023388)	nefma (ENSLCRG00005023386)	neflb (ENSLCRG00005023385)	pgam2 (ENSLCRG00005023383)	stx2a (ENSLCRG00005023381)
European seabass	MODERN SPECIES	9	SLC46A2 (ENSDLAG00005012643)	snx30 (ENSDLAG00005033001)	INIP (ENSDLAG00005034143)	ENSDLAG00005012590	snx18b (ENSDLAG00005012573)	ENSDLAG00005012556	rasgef1bb (ENSDLAG00005011529)	ENSDLAG00005011485	ENSDLAG00005032465	ENSDLAG00005011466	ENSDLAG00005011448	ENSDLAG00005009802	ENSDLAG00005031297	ENSDLAG00005009681	ENSDLAG00005027687	ndr1 (ENSDLAG00005031812) #22	ENSDLAG00005026462	ENSDLAG00005009265	ENSDLAG00005009244	ENSDLAG00005009241	ENSDLAG00005033489	ENSDLAG00005028312	ENSDLAG00005009209	ENSDLAG00005009189	ENSDLAG00005034631	ULK1 (ENSDLAG00005009082)	ENSDLAG00005009053	sfswap (ENSDLAG00005008996)	ENSDLAG00005008981	ENSDLAG00005008738	ENSDLAG00005008708
Perciformes	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000158994	ENSGT00390000006366.a	ENSGT00390000013183.d.a.b	ENSGT00940000157724.a.b	ENSGT00940000154091.a.a.s.b	ENSGT00940000155816.a	ENSGT00940000156320.d	ENSGT00940000155291.b	ENSGT01100000263544.c.a.a.b	ENSGT00940000155983.a.b	ENSGT00940000168590	ENSGT00940000159066	ENSGT00940000156161.A	ENSGT00390000006975	ENSGT00940000162544.c.a	ENSGT00940000163919.b #22	ENSGT00940000159932.b	ENSGT00940000155760.t.b	ENSGT00940000161685.A.a	ENSGT00940000156208.i	ENSGT00950000182926.b.c	ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b	ENSGT00940000164254.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000167368	ENSGT00940000156664.c	ENSGT00940000158699.q.a.j	ENSGT00940000153892.B	ENSGT00940000162805	ENSGT00940000158075	ENSGT00390000017123.b
Cottioidei	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00390000006366.a	ENSGT00390000013183.d.a.b	ENSGT00940000157724.a.b	ENSGT00940000154091.a.a.s.b	ENSGT00940000155816.a	ENSGT00940000156320.d	ENSGT00940000155291.b	ENSGT01100000263544.c.a.a.b	ENSGT00940000155983.a.b	ENSGT00940000168590	ENSGT00940000159066	ENSGT00940000156161.A	ENSGT00390000006975	ENSGT00610000087482	ENSGT00940000162544.d	ENSGT00940000163919.b #22	ENSGT00940000159932.b	ENSGT00940000155760.t.b	ENSGT00940000161685.A.a	ENSGT00940000156208.i	ENSGT00950000182926.b.c	ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b	ENSGT00940000164254.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000167368	ENSGT00940000156664.c	ENSGT00940000158699.q.a.j	ENSGT00940000153892.B	ENSGT00940000162805	ENSGT00940000158075	ENSGT00390000017123.b
Lumpfish	MODERN SPECIES	3	ENSCLMG00005005462	ENSCLMG00005005459	EFNA5 (ENSCLMG00005005440)	GADD45G (ENSCLMG00005005098)	gadd45gb.1 (ENSCLMG00005005083)	ENSCLMG00005005041	pip5k1ba (ENSCLMG00005005037)	tjp2a (ENSCLMG00005004443)	ENSCLMG00005004278	MAMDC2 (ENSCLMG00005021595)	slc30a5 (ENSCLMG00005021579)	ANXA1 (ENSCLMG00005021578)	ENSCLMG00005021577	TMC2 (ENSCLMG00005021576)	ENSCLMG00005021574	ENSCLMG00005021573 #22	eif4ebp1 (ENSCLMG00005021572)	ANK1 (ENSCLMG00005021571)	nefma (ENSCLMG00005021547)	neflb (ENSCLMG00005021541)	pgam2 (ENSCLMG00005021539)	ENSCLMG00005021538	MMP17 (ENSCLMG00005021537)	ENSCLMG00005021535	crkl (ENSCLMG00005021534)	si:ch211-222n4.2 (ENSCLMG00005021533)	ULK1 (ENSCLMG00005021531)	ENSCLMG00005021529	MMP17 (ENSCLMG00005021528)	sfswap (ENSCLMG00005021527)	TRABD2A (ENSCLMG00005021526)
Stickleback	MODERN SPECIES	13	snx30 (ENSGACG00000017783)	snx18b (ENSGACG00000017780)	ENSGACG00000017776	rasgef1bb (ENSGACG00000017774)	antxr2b (ENSGACG00000017757)	paqr3b (ENSGACG00000017750)	slc26a1 (ENSGACG00000017745)	ENSGACG00000017742	dusp4 (ENSGACG00000017739)	ENSGACG00000017729	cldn23.1 (ENSGACG00000017727)	ENSGACG00000017725	ENSGACG00000017722	ENSGACG00000017721	ENSGACG00000017714	ndr1 (ENSGACG00000017712) #22	ENSGACG00000017711	ENSGACG00000017709	ANK1 (ENSGACG00000017699)	nefma (ENSGACG00000017695)	neflb (ENSGACG00000017687)	pgam2 (ENSGACG00000017684)	ENSGACG00000017680	MMP17 (ENSGACG00000017673)	crkl (ENSGACG00000017670)	ENSGACG00000017668	ULK1 (ENSGACG00000017660)	MMP17 (ENSGACG00000017659)	sfswap (ENSGACG00000017647)	HOOK3 (ENSGACG00000017640)	rnf170 (ENSGACG00000017624)
Perciformes_a	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000158994	ENSGT00390000006366.a	ENSGT00390000013183.d.a.b	ENSGT00940000157724.a.b	ENSGT00940000154091.a.a.s.b	ENSGT00940000155816.a	ENSGT00940000156320.d	ENSGT00940000155291.b	ENSGT01100000263544.c.a.a.b	ENSGT00940000155983.a.b	ENSGT00940000168590	ENSGT00940000159066	ENSGT00940000156161.A	ENSGT00390000006975	ENSGT00940000162544.c.a	ENSGT00940000163919.b #22	ENSGT00940000159932.b	ENSGT00940000155760.t.b	ENSGT00940000161685.A.a	ENSGT00940000156208.i	ENSGT00950000182926.b.c	ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b	ENSGT00940000164254.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000167368	ENSGT00940000156664.c	ENSGT00940000158699.q.a.j	ENSGT00940000153892.B	ENSGT00940000162805	ENSGT00940000158075	ENSGT00390000017123.b
Channel bull blenny	MODERN SPECIES	3	snx18b (ENSCGOG00000011138)	ENSCGOG00000011140	rasgef1bb (ENSCGOG00000011155)	antxr2b (ENSCGOG00000011618)	paqr3b (ENSCGOG00000011755)	slc26a1 (ENSCGOG00000011761)	ENSCGOG00000011845	ENSCGOG00000011846	dusp4 (ENSCGOG00000011850)	ENSCGOG00000011930	cldn23.1 (ENSCGOG00000014323)	ENSCGOG00000014325	ENSCGOG00000014329	ENSCGOG00000014333	ENSCGOG00000014335	ENSCGOG00000014336 #22	eif4ebp1 (ENSCGOG00000014340)	ANK1 (ENSCGOG00000014403)	nefma (ENSCGOG00000015241)	neflb (ENSCGOG00000015243)	pgam2 (ENSCGOG00000015244)	ENSCGOG00000015246	ENSCGOG00000015248	MMP17 (ENSCGOG00000015249)	ENSCGOG00000015250	crkl (ENSCGOG00000015252)	si:ch211-222n4.2 (ENSCGOG00000015255)	ULK1 (ENSCGOG00000015261)	MMP17 (ENSCGOG00000015532)	sfswap (ENSCGOG00000015556)	TRABD2A (ENSCGOG00000015571)
Pike perch	MODERN SPECIES	145	inip (ENSSLUG00000003324)	ENSSLUG00000003338	snx18b (ENSSLUG00000003349)	ENSSLUG00000003404	ENSSLUG00000003479	rasgef1bb (ENSSLUG00000003530)	antxr2b (ENSSLUG00000003857)	paqr3b (ENSSLUG00000003885)	slc26a1 (ENSSLUG00000003906)	ENSSLUG00000004031	ENSSLUG00000004036	dusp4 (ENSSLUG00000004043)	ENSSLUG00000004193	cldn23.1 (ENSSLUG00000006666)	ENSSLUG00000006690	ENSSLUG00000006728 #22	eif4ebp1 (ENSSLUG00000006736)	ANK1 (ENSSLUG00000006887)	nefma (ENSSLUG00000009688)	neflb (ENSSLUG00000009691)	pgam2 (ENSSLUG00000009693)	stx2a (ENSSLUG00000009697)	ENSSLUG00000009701	MMP17 (ENSSLUG00000009705)	ENSSLUG00000009710	crkl (ENSSLUG00000009712)	si:ch211-222n4.2 (ENSSLUG00000009714)	ULK1 (ENSSLUG00000009718)	MMP17 (ENSSLUG00000009735)	ENSSLUG00000009757	sfswap (ENSSLUG00000009762)
Percomorphaceae_D	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00390000013183.d.a.b	ENSGT00940000157724.a.b	ENSGT00940000154091.a.a.s.b	ENSGT00940000155816.a	ENSGT00940000156320.d	ENSGT00940000155291.b	ENSGT01100000263544.c.a.a.b	ENSGT00940000155983.a.b	ENSGT00940000168590	ENSGT00940000159066	ENSGT00940000156161.A	ENSGT00390000006975	ENSGT00940000162544.c.a	ENSGT00940000164512.d	ENSGT00940000162544.d	ENSGT00940000163919.b #22	ENSGT00940000159932.b	ENSGT00940000155760.t.b	ENSGT00940000161685.A.a	ENSGT00940000156208.i	ENSGT00950000182926.b.c	ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b	ENSGT00940000158699.q.b	ENSGT00940000164254.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000167368	ENSGT00940000156664.c	ENSGT00940000158699.q.a	ENSGT00940000153892.B	ENSGT00940000162805	ENSGT00940000158075
Carangaria	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00390000013183.d.a.b	ENSGT00940000157724.a.b	ENSGT00940000154091.a.a.s.b	ENSGT00940000155816.a	ENSGT00940000156320.d	ENSGT00940000155291.b	ENSGT01100000263544.c.a.a.b	ENSGT00940000155983.a.b	ENSGT00940000168590	ENSGT00940000159066	ENSGT00940000156161.A	ENSGT00390000006975	ENSGT00940000162544.c.a	ENSGT00940000164512.d	ENSGT00940000162544.d	ENSGT00940000163919.b #22	ENSGT00940000159932.b	ENSGT00940000155760.t.b	ENSGT00940000161685.A.a	ENSGT00940000156208.i	ENSGT00950000182926.b.c	ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b	ENSGT00940000158699.q.b	ENSGT00940000164254.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000167368	ENSGT00940000156664.c	ENSGT00940000158699.q.a	ENSGT00940000153892.B	ENSGT00940000162805	ENSGT00940000158075
Pleuronectoidei	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00950000183096.a.b	ENSGT00940000158994	ENSGT00390000006366.a	ENSGT00940000157724.a.b	ENSGT00940000154091.a.a.s.b	ENSGT00940000155816.a	ENSGT00940000156320.d	ENSGT00940000155291.b	ENSGT01100000263544.c.a.a.b	ENSGT00940000155983.a.b	ENSGT00940000168590	ENSGT00940000159066	ENSGT00940000156161.A	ENSGT00390000006975	ENSGT00940000162544.c.a	ENSGT00940000163919.b #22	ENSGT00940000159932.b	ENSGT00940000155760.t.b	ENSGT00940000161685.A.a	ENSGT00940000156208.i	ENSGT00950000182926.b.c	ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b	ENSGT00940000164254.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000167368	ENSGT00940000156664.c	ENSGT00940000158699.q.a	ENSGT00940000153892.B	ENSGT00940000162805	ENSGT00940000158075	ENSGT00390000017123.b
Tongue sole	MODERN SPECIES	5	ENSCSEG00000005088	ENSCSEG00000005090	CLDN10 (ENSCSEG00000005094)	ENSCSEG00000005097	CHRM4 (ENSCSEG00000005105)	mdka (ENSCSEG00000005113)	ENSCSEG00000005118	VAV2 (ENSCSEG00000005120)	ENSCSEG00000005127	wdr5 (ENSCSEG00000005130)	rxraa (ENSCSEG00000005139)	LRRTM4 (ENSCSEG00000005148)	ENSCSEG00000005154	cldn23.1 (ENSCSEG00000005168)	ENSCSEG00000005171	ENSCSEG00000005180 #22	eif4ebp1 (ENSCSEG00000005182)	ENSCSEG00000005185	ANK1 (ENSCSEG00000005188)	nefma (ENSCSEG00000005201)	neflb (ENSCSEG00000005207)	ENSCSEG00000005204	pgam2 (ENSCSEG00000005208)	MMP17 (ENSCSEG00000005210)	ENSCSEG00000005220	dnpep (ENSCSEG00000005230)	desmb (ENSCSEG00000005241)	tmem198b (ENSCSEG00000005251)	ENSCSEG00000005254	arl13b (ENSCSEG00000005258)	cckbra (ENSCSEG00000005266)
Turbot	MODERN SPECIES	7	palm2akap2 (ENSSMAG00000025348)	SLC46A2 (ENSSMAG00000017714)	snx30 (ENSSMAG00000017724)	INIP (ENSSMAG00000017739)	snx18b (ENSSMAG00000017753)	ENSSMAG00000017766	rasgef1bb (ENSSMAG00000017793)	ENSSMAG00000017837	ENSSMAG00000017883	ENSSMAG00000017915	ENSSMAG00000017948	ENSSMAG00000017997	ENSSMAG00000018022	ENSSMAG00000018031	ENSSMAG00000018153	ENSSMAG00000018402 #22	ENSSMAG00000022068	ENSSMAG00000018418	ENSSMAG00000018452	ENSSMAG00000018466	ENSSMAG00000031091	ENSSMAG00000018474	ENSSMAG00000018572	ENSSMAG00000018593	ENSSMAG00000018600	ENSSMAG00000018610	ULK1 (ENSSMAG00000018627)	ENSSMAG00000018696	sfswap (ENSSMAG00000018718)	ENSSMAG00000018744	ENSSMAG00000018754
Carangaria_A	ANCESTRAL SPECIES	34	ENSGT00390000013183.d.a.b	ENSGT00940000157724.a.b	ENSGT00940000154091.a.a.s.b	ENSGT00940000155816.a	ENSGT00940000156320.d	ENSGT00940000155291.b	ENSGT01100000263544.c.a.a.b	ENSGT00940000155983.a.b	ENSGT00940000168590	ENSGT00940000159066	ENSGT00940000156161.A	ENSGT00390000006975	ENSGT00940000162544.c.a	ENSGT00940000164512.d	ENSGT00940000162544.d	ENSGT00940000163919.b #22	ENSGT00940000159932.b	ENSGT00940000155760.t.b	ENSGT00940000161685.A.a	ENSGT01100000265222	ENSGT00940000156208.i	ENSGT00950000182926.b.c	ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b	ENSGT00940000158699.q.b
Barramundi perch	MODERN SPECIES	174	ENSLCAG00010000174	snx18b (ENSLCAG00010000181)	rasgef1bb (ENSLCAG00010000266)	antxr2b (ENSLCAG00010000326)	paqr3b (ENSLCAG00010000352)	slc26a1 (ENSLCAG00010000363)	ENSLCAG00010000378	ENSLCAG00010000391	dusp4 (ENSLCAG00010000398)	ENSLCAG00010000812	cldn23.1 (ENSLCAG00010001336)	ENSLCAG00010001345	ENSLCAG00010001357	ENSLCAG00010001362	ENSLCAG00010001366	ndr1 (ENSLCAG00010001372) #22	eif4ebp1 (ENSLCAG00010001377)	ANK1 (ENSLCAG00010001728)	nefma (ENSLCAG00010003114)	ENSLCAG00010003116	neflb (ENSLCAG00010003118)	pgam2 (ENSLCAG00010003120)	stx2a (ENSLCAG00010003127)	MMP17 (ENSLCAG00010003136)
Seriola	ANCESTRAL SPECIES	167												ENSGT00940000156161.A	ENSGT00390000006975	ENSGT00940000162544.c.a	ENSGT00940000178065	ENSGT00940000163919.b #22	ENSGT00940000159932.b	ENSGT00940000155760.t.b	ENSGT00940000161685.A.a	ENSGT00940000156208.i	ENSGT00950000182926.b.c	ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b	ENSGT00940000158699.q.a.f
Yellowtail amberjack	MODERN SPECIES	2595												ENSSLDG00000018496	cldn23.1 (ENSSLDG00000018546)	ENSSLDG00000018562	eif4ebp1 (ENSSLDG00000018599)	ENSSLDG00000018612 #22	ANK1 (ENSSLDG00000018658)	nefma (ENSSLDG00000018896)
Greater amberjack	MODERN SPECIES	278												ENSSDUG00000020636	cldn23.1 (ENSSDUG00000020667)	ENSSDUG00000020680	ENSSDUG00000020714	ndr1 (ENSSDUG00000020729) #22	eif4ebp1 (ENSSDUG00000020734)	ENSSDUG00000020742	ANK1 (ENSSDUG00000020758)	nefma (ENSSDUG00000020811)	ENSSDUG00000020835	pgam2 (ENSSDUG00000020942)	ENSSDUG00000020951	MMP17 (ENSSDUG00000020958)
Anabantaria	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00950000183096.a.b	ENSGT00940000158994	ENSGT00390000006366.a	ENSGT00940000157724.a.b	ENSGT00940000154091.a.a.s.b	ENSGT00940000155816.a	ENSGT00940000156320.d	ENSGT00940000155291.b	ENSGT01100000263544.c.a.a.b	ENSGT00940000155983.a.b	ENSGT00940000159066	ENSGT00940000156161.A	ENSGT00390000006975	ENSGT00940000162544.c.a	ENSGT00940000181550	ENSGT00940000163919.b #22	ENSGT00940000159932.b	ENSGT00940000155760.t.b	ENSGT00940000161685.A.a	ENSGT00940000156208.i	ENSGT00950000182926.b.c	ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b	ENSGT00940000158699.q.b	ENSGT00940000164254.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000167368	ENSGT00940000156664.c	ENSGT00940000158699.q.a	ENSGT00940000153892.B	ENSGT00940000162805	ENSGT00940000158075
Zig-zag eel	MODERN SPECIES	3	SLC46A2 (ENSMAMG00000005756)	snx30 (ENSMAMG00000005759)	INIP (ENSMAMG00000028703)	snx18b (ENSMAMG00000005798)	ENSMAMG00000005808	rasgef1bb (ENSMAMG00000005869)	ENSMAMG00000005889	ENSMAMG00000005968	ENSMAMG00000024834	ENSMAMG00000006023	ENSMAMG00000006038	ENSMAMG00000006069	ENSMAMG00000006199	ENSMAMG00000006223	ENSMAMG00000026839	ENSMAMG00000006351 #22	ENSMAMG00000006358	ENSMAMG00000006368	ENSMAMG00000006388	ENSMAMG00000006452	ENSMAMG00000006458	ENSMAMG00000027866	ENSMAMG00000028496	ENSMAMG00000006507	ENSMAMG00000006543	ENSMAMG00000025233	ENSMAMG00000006569	ULK1 (ENSMAMG00000006585)	ENSMAMG00000006609	sfswap (ENSMAMG00000006631)	ENSMAMG00000006645
Anabantoidei	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00950000183096.a.b	ENSGT00940000158994	ENSGT00390000006366.a	ENSGT00940000157724.a.b	ENSGT00940000154091.a.a.s.b	ENSGT00940000155816.a	ENSGT00940000156320.d	ENSGT00940000155291.b	ENSGT01100000263544.c.a.a.b	ENSGT00940000155983.a.b	ENSGT00940000159066	ENSGT00940000156161.A	ENSGT00390000006975	ENSGT00940000162544.c.a	ENSGT00940000181550	ENSGT00940000163919.b #22	ENSGT00940000159932.b	ENSGT00940000155760.t.b	ENSGT00940000161685.A.a	ENSGT00940000156208.i	ENSGT00950000182926.b.c	ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b	ENSGT00940000158699.q.b	ENSGT00940000164254.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000167368	ENSGT00940000156664.c	ENSGT00940000158699.q.a	ENSGT00940000153892.B	ENSGT00940000162805	ENSGT00940000158075
Siamese fighting fish	MODERN SPECIES	3	SLC46A2 (ENSBSLG00000016995)	snx30 (ENSBSLG00000017034)	snx18b (ENSBSLG00000017185)	rasgef1bb (ENSBSLG00000017238)	antxr2b (ENSBSLG00000017631)	paqr3b (ENSBSLG00000017670)	slc26a1 (ENSBSLG00000017692)	ENSBSLG00000017717	dusp4 (ENSBSLG00000017732)	ENSBSLG00000017806	cldn23.1 (ENSBSLG00000018724)	ENSBSLG00000018846	ENSBSLG00000018862	ENSBSLG00000018881	ENSBSLG00000018907	ndr1 (ENSBSLG00000018933) #22	eif4ebp1 (ENSBSLG00000018981)	ANK1 (ENSBSLG00000019028)	nefma (ENSBSLG00000019378)	neflb (ENSBSLG00000019382)	pgam2 (ENSBSLG00000019384)	stx2a (ENSBSLG00000019389)	MMP17 (ENSBSLG00000019441)	ENSBSLG00000019497	crkl (ENSBSLG00000019518)	si:ch211-222n4.2 (ENSBSLG00000019522)	ULK1 (ENSBSLG00000019561)	ENSBSLG00000019904	sfswap (ENSBSLG00000019922)	TRABD2A (ENSBSLG00000019963)	HOOK3 (ENSBSLG00000019985)
Climbing perch	MODERN SPECIES	13	SLC46A2 (ENSATEG00000000093)	snx30 (ENSATEG00000000086)	INIP (ENSATEG00000027741)	snx18b (ENSATEG00000000071)	ENSATEG00000000032	rasgef1bb (ENSATEG00000021833)	ENSATEG00000021812	ENSATEG00000021790	ENSATEG00000021714	ENSATEG00000021700	ENSATEG00000025333	ENSATEG00000021596	ENSATEG00000021577	ENSATEG00000021511	ENSATEG00000021486	ENSATEG00000021483 #22	ENSATEG00000028413	ENSATEG00000021333	ENSATEG00000021287	ENSATEG00000021261	ENSATEG00000021248	ENSATEG00000021235	ENSATEG00000021212	ENSATEG00000021187	ENSATEG00000021179	ENSATEG00000021175	ULK1 (ENSATEG00000021132)	ENSATEG00000021097	sfswap (ENSATEG00000021053)	ENSATEG00000021041	ENSATEG00000020975
Cod	MODERN SPECIES	17	ENSGMOG00000010144	ENSGMOG00000010122	ENSGMOG00000025430	ENSGMOG00000010084	pip5k1ba (ENSGMOG00000010074)	ENSGMOG00000028966	ENSGMOG00000031529	gadd45gb.1 (ENSGMOG00000036667)	ENSGMOG00000010042	ENSGMOG00000026351	ghrb (ENSGMOG00000010024)	c7b (ENSGMOG00000010005)	c6 (ENSGMOG00000009978)	rnf180b (ENSGMOG00000009952)	ENSGMOG00000009945	ndr1 (ENSGMOG00000028107) #22	eif4ebp1 (ENSGMOG00000016807)	ENSGMOG00000016731	ENSGMOG00000016567	ENSGMOG00000025072	ENSGMOG00000035872	ENSGMOG00000001120	ENSGMOG00000009196	ENSGMOG00000009205	ENSGMOG00000011000	mpx (ENSGMOG00000006436)	ENSGMOG00000026981	ENSGMOG00000010250	ENSGMOG00000029931	slc35e4 (ENSGMOG00000028981)	ENSGMOG00000010225
Protacanthopterygii	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00990000203931	ENSGT00550000074816.B	ENSGT00940000156117.e.b	ENSGT00940000156820.a.b	ENSGT00940000158634.b	ENSGT00940000156639.d	ENSGT00940000166638	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000165107.A	ENSGT00940000156804.b	ENSGT00940000156814	ENSGT01010000222287.B.b.b.b	ENSGT00940000153725.b.c	ENSGT00950000182909.a.e	ENSGT00940000154484.B.a.a	ENSGT00940000163919.b #22	ENSGT00940000159932.b	ENSGT00940000155760.t.b	ENSGT00730000111146.e	ENSGT00940000154418.a.b	ENSGT00940000156208.i	ENSGT00950000182926.b.c	ENSGT00730000111146.f	ENSGT00940000161685.A.a	ENSGT01100000265222	ENSGT00940000164254.a.b	ENSGT00820000127055.b.e.b	ENSGT00940000169602	ENSGT00820000127055.b.e.a	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000167368
Salmoninae	DUPLICATION
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	79	ENSGT00940000156820.a.b.o	ENSGT00940000158634.b.i	ENSGT00940000156639.d.k	ENSGT00940000167469.c.b	ENSGT00520000055591.b.c.a	ENSGT00940000157299.d.c	ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.e.c	ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.f.c	ENSGT00940000166638.b.b	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000165107.A.b	ENSGT00940000156804.b	ENSGT00940000153725.b.c	ENSGT00950000182909.a.e	ENSGT00940000154484.B.a.a	ENSGT00940000163919.b.c #22	ENSGT00940000155760.t.b.e
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000156820.a.b.o	ENSGT00940000158634.b.i	ENSGT00940000156639.d.k	ENSGT00940000167469.c.b	ENSGT00520000055591.b.c.a	ENSGT00940000157299.d.c	ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.e.c	ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.f.c	ENSGT00940000166638.b.b	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000165107.A.b	ENSGT00940000156804.b	ENSGT00940000153725.b.c	ENSGT00950000182909.a.e	ENSGT00940000154484.B.a.a	ENSGT00940000163919.b.c #22	ENSGT00940000155760.t.b.e	ENSGT00730000111146.e	ENSGT00940000161685.A.a.b	ENSGT00940000156208.i.c	ENSGT00950000182926.b.c.j.a	ENSGT00940000164254.a.b.b	ENSGT00820000127055.b.e.b	ENSGT01000000220289	ENSGT00730000111140.ic	ENSGT00940000167368	ENSGT00390000006044.m.b	ENSGT00940000154702.a.b.c	ENSGT00940000166762.a.a	ENSGT00390000017498.c	ENSGT00950000183203.c.a.d
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000156117.e.b	ENSGT00940000156820.a.b.o	ENSGT00940000158634.b.i	ENSGT00940000156639.d.k	ENSGT00520000055591.b.c.a	ENSGT00940000157299.d.c	ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.e.c	ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.f.c	ENSGT00940000166638.b.b	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000165107.A.b.a	ENSGT00940000156804.b	ENSGT00940000153725.b.c	ENSGT00950000182909.a.e	ENSGT00940000154484.B.a.a	ENSGT00940000163919.b.c #22	ENSGT00940000155760.t.b.e	ENSGT00730000111146.e	ENSGT00940000161685.A.a.b	ENSGT00940000156208.i.c	ENSGT00950000182926.b.c.j.a	ENSGT00940000164254.a.b.b	ENSGT00820000127055.b.e.b	ENSGT01000000220289	ENSGT00730000111140.ic	ENSGT00940000167368	ENSGT00390000006044.m.b	ENSGT00940000154702.a.b.c	ENSGT00940000166762.a.a	ENSGT00390000017498.c	ENSGT00950000183203.c.a.d
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000156820.a.b.o	ENSGT00940000158634.b.i	ENSGT00940000156639.d.k	ENSGT01100000263505.b.b.a.b.a.a.a.b.b.b.b.b.a	ENSGT00520000055591.b.c.a	ENSGT00940000157299.d.c	ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.e.c	ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.f.c	ENSGT00940000166638.b.b	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000165107.A.b.a	ENSGT00940000156804.b	ENSGT00940000153725.b.c	ENSGT00950000182909.a.e	ENSGT00940000154484.B.a.a	ENSGT00940000163919.b.c #22	ENSGT00940000155760.t.b.e	ENSGT00730000111146.e	ENSGT00940000161685.A.a.b	ENSGT00940000156208.i.c	ENSGT00950000182926.b.c.j.a	ENSGT00940000164254.a.b.b	ENSGT00820000127055.b.e.b	ENSGT01000000220289	ENSGT00730000111140.ic	ENSGT00940000167368	ENSGT00390000006044.m.b	ENSGT00940000154702.a.b.c	ENSGT00940000166762.a.a	ENSGT00390000017498.c	ENSGT00950000183203.c.a.d
Coho salmon	MODERN SPECIES	15	ENSOKIG00005010936	ENSOKIG00005010943	ENSOKIG00005010949	ENSOKIG00005010966	zgc:103482 (ENSOKIG00005010977)	EFNA5 (ENSOKIG00005011006)	GADD45G (ENSOKIG00005011014)	gadd45gb.1 (ENSOKIG00005011016)	ENSOKIG00005011027	ENSOKIG00005011035	ghrb (ENSOKIG00005011052)	c7b (ENSOKIG00005011183)	rgs7bpb (ENSOKIG00005012351)	rnf180b (ENSOKIG00005012363)	htr1ab (ENSOKIG00005012371)	ENSOKIG00005012377 #22	ANK1 (ENSOKIG00005012537)	ftsj1 (ENSOKIG00005015471)	ENSOKIG00005015502	NEFL (ENSOKIG00005015557)	PGAM2 (ENSOKIG00005015568)	ENSOKIG00005015573	crkl (ENSOKIG00005015581)	ENSOKIG00005015592	med15 (ENSOKIG00005015618)	si:ch211-222n4.2 (ENSOKIG00005015793)	smpd4 (ENSOKIG00005015846)	TMEM132C (ENSOKIG00005015952)	ENSOKIG00005015965	ENSOKIG00005015975	ENSOKIG00005016041
Chinook salmon	MODERN SPECIES	12	ENSOTSG00005009506	tjp2a (ENSOTSG00005007559)	ENSOTSG00005007549	ENSOTSG00005007545	zgc:103482 (ENSOTSG00005007543)	EFNA5 (ENSOTSG00005007541)	GADD45G (ENSOTSG00005007539)	gadd45gb.1 (ENSOTSG00005007537)	ENSOTSG00005007535	ENSOTSG00005007533	ghrb (ENSOTSG00005007531)	c7b (ENSOTSG00005007485)	rgs7bpb (ENSOTSG00005007483)	rnf180b (ENSOTSG00005007481)	htr1ab (ENSOTSG00005007477)	ENSOTSG00005007476 #22	ANK1 (ENSOTSG00005002114)	ftsj1 (ENSOTSG00005002050)	nefma (ENSOTSG00005002034)	NEFL (ENSOTSG00005001789)	pgam2 (ENSOTSG00005046774)	ENSOTSG00005046773	crkl (ENSOTSG00005046772)	ENSOTSG00005046771	med15 (ENSOTSG00005046770)	si:ch211-222n4.2 (ENSOTSG00005046769)	smpd4 (ENSOTSG00005046749)	TMEM132C (ENSOTSG00005046744)	ENSOTSG00005046743	ENSOTSG00005046742	RIMBP2 (ENSOTSG00005046737)
Rainbow trout	MODERN SPECIES	26	tjp2a (ENSOMYG00000034926)	ENSOMYG00000034582	ENSOMYG00000050792	ENSOMYG00000054636	zo6 (ENSOMYG00000067115)	zgc:103482 (ENSOMYG00000034562)	ENSOMYG00000034526	ENSOMYG00000034523	gadd45gb.1 (ENSOMYG00000034440)	ENSOMYG00000034483	ghr1 (ENSOMYG00000034417)	c7b (ENSOMYG00000032326)	rgs7bpb (ENSOMYG00000032081)	rnf180b (ENSOMYG00000032072)	htr1ab (ENSOMYG00000032055)	ndr1 (ENSOMYG00000032048) #22	ENSOMYG00000064670	ENSOMYG00000030029	ftsj1 (ENSOMYG00000028976)	ENSOMYG00000069784	ENSOMYG00000028862	ENSOMYG00000060145	ENSOMYG00000028808	ENSOMYG00000028792	ENSOMYG00000028760	crkl (ENSOMYG00000028728)	ENSOMYG00000028721	ENSOMYG00000028679	si:ch211-222n4.2 (ENSOMYG00000028622)	ENSOMYG00000048056	smpd4 (ENSOMYG00000028516)
Salmo	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000158634.b.i	ENSGT00940000156639.d.k	ENSGT00940000167469.c.b	ENSGT00520000055591.b.c.a	ENSGT00940000157299.d.c	ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.e.c	ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.f.c	ENSGT00940000166638.a	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000165107.A.b	ENSGT00990000213146	ENSGT00940000156804.b	ENSGT00940000153725.b.c	ENSGT00950000182909.a.e	ENSGT00940000154484.B.a.a	ENSGT00940000163919.b.c #22	ENSGT00940000159932.b	ENSGT00940000155760.t.b.e	ENSGT00730000111146.e	ENSGT00940000161685.A.a.b	ENSGT00940000156208.i.c	ENSGT00950000182926.b.c.j.a	ENSGT00940000164254.a.b.b	ENSGT00820000127055.b.e.b	ENSGT01000000220289	ENSGT00730000111140.ic	ENSGT00940000167368	ENSGT00390000006044.m.b	ENSGT00940000154702.a.b.c	ENSGT00940000166762.a.a	ENSGT00390000017498.c
River trout	MODERN SPECIES	15	pip5k1ba (ENSSTUG00000016507)	ENSSTUG00000016580	ENSSTUG00000016584	zgc:103482 (ENSSTUG00000016587)	EFNA5 (ENSSTUG00000016602)	GADD45G (ENSSTUG00000016609)	gadd45gb.1 (ENSSTUG00000016615)	ENSSTUG00000016631	ENSSTUG00000016642	ghrb (ENSSTUG00000016658)	ENSSTUG00000016685	c7b (ENSSTUG00000016707)	rgs7bpb (ENSSTUG00000016907)	rnf180b (ENSSTUG00000016963)	htr1ab (ENSSTUG00000016972)	ENSSTUG00000016975 #22	eif4ebp1 (ENSSTUG00000016984)	ANK1 (ENSSTUG00000017006)	ftsj1 (ENSSTUG00000032190)	nefma (ENSSTUG00000032250)	NEFL (ENSSTUG00000032264)	pgam2 (ENSSTUG00000032273)	ENSSTUG00000032296	crkl (ENSSTUG00000032315)	ENSSTUG00000032327	med15 (ENSSTUG00000032361)	si:ch211-222n4.2 (ENSSTUG00000032477)	smpd4 (ENSSTUG00000032515)	TMEM132C (ENSSTUG00000032659)	ENSSTUG00000032932	RIMBP2 (ENSSTUG00000032975)
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	84	ENSGT01050000244942.b.a.b.e.b	ENSGT00940000164966.b.a.c	ENSGT00550000074816.B.f	ENSGT00940000156820.a.b.n	ENSGT00940000158634.b.j	ENSGT00940000156639.d.l	ENSGT00520000055591.b.c.b	ENSGT00940000157299.d.d	ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.e.d	ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.f.d	ENSGT00940000166638.b.a	ENSGT00940000165107.A.a	ENSGT00390000009130.b.d.b	ENSGT00940000156814	ENSGT01010000222287.B.b.b.b	ENSGT00940000163919.b.d #22	ENSGT00940000159932.b	ENSGT00940000155760.t.b.f	ENSGT00730000111146.f	ENSGT00940000161685.A.a.a	ENSGT00940000156208.i.d	ENSGT00950000182926.b.c.i	ENSGT00940000164254.a.b.a	ENSGT00820000127055.b.e.a	ENSGT00730000111140.hc	ENSGT00390000006044.m.a	ENSGT00940000154702.a.b.d	ENSGT00940000166762.b	ENSGT00950000183203.c.a.c	ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b	ENSGT00940000153892.B.d
Huchen	MODERN SPECIES	591	ENSHHUG00000032538	smc5 (ENSHHUG00000032525)	ENSHHUG00000032519	tjp2a (ENSHHUG00000032496)	ENSHHUG00000032417	zgc:103482 (ENSHHUG00000032408)	EFNA5 (ENSHHUG00000032407)	GADD45G (ENSHHUG00000032404)	gadd45gb.1 (ENSHHUG00000032402)	ENSHHUG00000032401	ghrb (ENSHHUG00000032389)	oxct1b (ENSHHUG00000032269)	c6 (ENSHHUG00000032101)	rgs7bpb (ENSHHUG00000032098)	ENSHHUG00000032089	ndr1 (ENSHHUG00000032088) #22	ENSHHUG00000032083	ENSHHUG00000032079	ENSHHUG00000032076	ENSHHUG00000032073	ENSHHUG00000032064	ftsj1 (ENSHHUG00000032060)	nefma (ENSHHUG00000032056)	neflb (ENSHHUG00000032053)	pgam2 (ENSHHUG00000032048)	ENSHHUG00000032033
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT01050000244942.b.a.b.e.b	ENSGT00940000164966.b.a.c	ENSGT00550000074816.B.f	ENSGT00940000156820.a.b.n	ENSGT00940000158634.b.j	ENSGT00940000156639.d.l	ENSGT00520000055591.b.c.b	ENSGT00940000157299.d.d	ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.e.d	ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.f.d	ENSGT00940000166638.b.a	ENSGT00940000165107.A.a	ENSGT00390000009130.b.d.b	ENSGT00940000156814	ENSGT01010000222287.B.b.b.b	ENSGT00940000163919.b.d #22	ENSGT00940000159932.b	ENSGT00940000155760.t.b.f	ENSGT00730000111146.f	ENSGT00940000161685.A.a.a	ENSGT00940000156208.i.d	ENSGT00950000182926.b.c.i	ENSGT00940000164254.a.b.a	ENSGT00820000127055.b.e.a	ENSGT00730000111140.hc	ENSGT00390000006044.m.a	ENSGT00940000154702.a.b.d	ENSGT00940000166762.b	ENSGT00950000183203.c.a.c	ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b	ENSGT00940000153892.B.d
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT01050000244942.b.a.b.e.b	ENSGT00940000164966.b.a.c	ENSGT00550000074816.B.f	ENSGT00940000156820.a.b.n	ENSGT00940000158634.b.j	ENSGT00940000156639.d.l	ENSGT00520000055591.b.c.b	ENSGT00940000157299.d.d	ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.e.d	ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.f.d	ENSGT00940000166638.b.a	ENSGT00940000165107.A.a	ENSGT00390000009130.b.d.b	ENSGT00940000156814	ENSGT01010000222287.B.b.b.b	ENSGT00940000163919.b.d #22	ENSGT00940000159932.b	ENSGT00940000155760.t.b.f	ENSGT00730000111146.f	ENSGT00940000161685.A.a.a	ENSGT00940000156208.i.d	ENSGT00950000182926.b.c.i	ENSGT00940000164254.a.b.a	ENSGT00820000127055.b.e.a	ENSGT00730000111140.hc	ENSGT00390000006044.m.a	ENSGT00940000154702.a.b.d	ENSGT00940000166762.b	ENSGT00950000183203.c.a.c	ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b	ENSGT00940000153892.B.d
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT01050000244942.b.a.b.e.b	ENSGT00940000164966.b.a.c	ENSGT00550000074816.B.f	ENSGT00940000156820.a.b.n	ENSGT00940000158634.b.j	ENSGT00940000156639.d.l	ENSGT00520000055591.b.c.b	ENSGT00940000157299.d.d	ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.e.d	ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.f.d	ENSGT00940000166638.b.a	ENSGT00940000165107.A.a	ENSGT00390000009130.b.d.b	ENSGT00940000156814	ENSGT01010000222287.B.b.b.b	ENSGT00940000163919.b.d #22	ENSGT00940000159932.b	ENSGT00940000155760.t.b.f	ENSGT00730000111146.f	ENSGT00940000161685.A.a.a	ENSGT00940000156208.i.d	ENSGT00950000182926.b.c.i	ENSGT00940000164254.a.b.a	ENSGT00820000127055.b.e.a	ENSGT00730000111140.hc	ENSGT00390000006044.m.a	ENSGT00940000154702.a.b.d	ENSGT00940000166762.b	ENSGT00950000183203.c.a.c	ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b	ENSGT00940000153892.B.d
Coho salmon	MODERN SPECIES	21	ENSOKIG00005022574	ENSOKIG00005022497	ENSOKIG00005051005	tjp2a (ENSOKIG00005051004)	ENSOKIG00005051003	zgc:103482 (ENSOKIG00005051001)	ENSOKIG00005051000	EFNA5 (ENSOKIG00005050999)	GADD45G (ENSOKIG00005050998)	gadd45gb.1 (ENSOKIG00005050997)	ENSOKIG00005050996	ghrb (ENSOKIG00005050995)	oxct1b (ENSOKIG00005050994)	c6 (ENSOKIG00005050993)	ENSOKIG00005050992	ndr1 (ENSOKIG00005050991) #22	ENSOKIG00005050990	ANK1 (ENSOKIG00005050989)	ftsj1 (ENSOKIG00005050986)	nefma (ENSOKIG00005050985)	neflb (ENSOKIG00005050984)	pgam2 (ENSOKIG00005050983)	ENSOKIG00005050981	crkl (ENSOKIG00005050980)	med15 (ENSOKIG00005050979)	smpd4 (ENSOKIG00005050974)	TMEM132C (ENSOKIG00005050969)	ENSOKIG00005050966	RIMBP2 (ENSOKIG00005050961)	stx2a (ENSOKIG00005050960)	ENSOKIG00005050958
Chinook salmon	MODERN SPECIES	26	TMC2 (ENSOTSG00005013101)	zfand5b (ENSOTSG00005013098)	smc5 (ENSOTSG00005012896)	ENSOTSG00005012894	tjp2a (ENSOTSG00005012743)	ENSOTSG00005012736	zgc:103482 (ENSOTSG00005012735)	EFNA5 (ENSOTSG00005012734)	GADD45G (ENSOTSG00005012733)	gadd45gb.1 (ENSOTSG00005012732)	ENSOTSG00005012731	ghrb (ENSOTSG00005012466)	oxct1b (ENSOTSG00005009955)	c6 (ENSOTSG00005007733)	ENSOTSG00005007707	ndr1 (ENSOTSG00005007705) #22	eif4ebp1 (ENSOTSG00005007704)	ANK1 (ENSOTSG00005004812)	ftsj1 (ENSOTSG00005004765)	nefma (ENSOTSG00005004759)	neflb (ENSOTSG00005004757)	pgam2 (ENSOTSG00005004755)	ENSOTSG00005004753	crkl (ENSOTSG00005004751)	med15 (ENSOTSG00005004747)	smpd4 (ENSOTSG00005003636)	TMEM132C (ENSOTSG00005003605)	ENSOTSG00005003604	RIMBP2 (ENSOTSG00005003465)	stx2a (ENSOTSG00005003459)	sfswap (ENSOTSG00005003457)
Rainbow trout	MODERN SPECIES	364	ENSOMYG00000047640	ENSOMYG00000047634	ENSOMYG00000047630	ENSOMYG00000047627	tjp2a (ENSOMYG00000047617)	ENSOMYG00000047604	zgc:103482 (ENSOMYG00000047602)	ENSOMYG00000047601	ENSOMYG00000047599	gadd45gb.1 (ENSOMYG00000047598)	ENSOMYG00000047596	ghr (ENSOMYG00000047593)	oxct1b (ENSOMYG00000047505)	c6 (ENSOMYG00000047226)	ENSOMYG00000047161	ndr1 (ENSOMYG00000047159) #22	eif4ebp1 (ENSOMYG00000047155)	ENSOMYG00000047104	ftsj1 (ENSOMYG00000063167)	ENSOMYG00000047020	ENSOMYG00000047018	ENSOMYG00000066692	ENSOMYG00000047008	crkl (ENSOMYG00000047006)	med15 (ENSOMYG00000046989)	smpd4 (ENSOMYG00000046961)	ENSOMYG00000069894	ENSOMYG00000059079	ENSOMYG00000046945	ENSOMYG00000046943	ENSOMYG00000046938
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000155221.gb	ENSGT01050000244942.b.a.b.e.b	ENSGT00940000164966.b.a.c	ENSGT00550000074816.B.f	ENSGT00940000156820.a.b.n	ENSGT00940000158634.b.j	ENSGT00520000055591.b.c.b	ENSGT00940000157299.d.d	ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.e.d	ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.f.d	ENSGT00940000166638.b.a	ENSGT00940000165107.A.a	ENSGT00390000009130.b.d.b	ENSGT00940000156814	ENSGT01010000222287.B.b.b.b	ENSGT00940000163919.b.d #22	ENSGT00940000155760.t.b.f	ENSGT00730000111146.f	ENSGT00940000161685.A.a.a	ENSGT00940000156208.i.d	ENSGT00950000182926.b.c.i	ENSGT00940000164254.a.b.a	ENSGT00820000127055.b.e.a	ENSGT00730000111140.hc	ENSGT00390000006044.m.a	ENSGT00940000154702.a.b.d	ENSGT00940000166762.b	ENSGT00950000183203.c.a.c	ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b	ENSGT00940000153892.B.d	ENSGT00940000158699.i
River trout	MODERN SPECIES	3	smc5 (ENSSTUG00000036410)	ENSSTUG00000036079	tjp2a (ENSSTUG00000031734)	zgc:103482 (ENSSTUG00000031528)	ENSSTUG00000031447	EFNA5 (ENSSTUG00000031423)	ENSSTUG00000031415	GADD45G (ENSSTUG00000031406)	gadd45gb.1 (ENSSTUG00000031398)	ENSSTUG00000031390	ghrb (ENSSTUG00000031364)	oxct1b (ENSSTUG00000027739)	c6 (ENSSTUG00000026741)	ENSSTUG00000026708	ENSSTUG00000026699	ndr1 (ENSSTUG00000026694) #22	ANK1 (ENSSTUG00000025834)	nefma (ENSSTUG00000025801)	neflb (ENSSTUG00000025796)	pgam2 (ENSSTUG00000025783)	ENSSTUG00000025720	crkl (ENSSTUG00000025694)	med15 (ENSSTUG00000025664)	smpd4 (ENSSTUG00000025178)	ENSSTUG00000025140	TMEM132C (ENSSTUG00000025106)	ENSSTUG00000025084	RIMBP2 (ENSSTUG00000024960)	stx2a (ENSSTUG00000024934)	ENSSTUG00000024930	ENSSTUG00000024925
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	2	ENSSSAG00000081640	smc5 (ENSSSAG00000081637)	ENSSSAG00000081636	tjp2a (ENSSSAG00000081595)	ENSSSAG00000081538	ENSSSAG00000088854	ENSSSAG00000082974	ENSSSAG00000081529	gadd45gb.1 (ENSSSAG00000102182)	ENSSSAG00000081527	ghrb (ENSSSAG00000081526)	oxct1b (ENSSSAG00000106911)	c6 (ENSSSAG00000081483)	r7bpb (ENSSSAG00000097983)	ENSSSAG00000081477	ndr1 (ENSSSAG00000081476) #22	ENSSSAG00000081470	ftsj1 (ENSSSAG00000081466)	nfm (ENSSSAG00000081465)	ENSSSAG00000081463	ENSSSAG00000081461	ENSSSAG00000113868	crkl (ENSSSAG00000081459)	med15 (ENSSSAG00000081458)	smpd4 (ENSSSAG00000081417)	ENSSSAG00000081413	ENSSSAG00000081411	ENSSSAG00000081391	ENSSSAG00000081379	ENSSSAG00000107178	sfswap (ENSSSAG00000081373)
Northern pike	MODERN SPECIES	13	MAMDC2 (ENSELUG00000012261)	ENSELUG00000012214	tjp2a (ENSELUG00000012138)	pip5k1ba (ENSELUG00000011993)	zgc:103482 (ENSELUG00000011872)	EFNA5 (ENSELUG00000034260)	GADD45G (ENSELUG00000011831)	gadd45gb.1 (ENSELUG00000011823)	ENSELUG00000011802	ENSELUG00000028900	ghrb (ENSELUG00000011769)	c7b (ENSELUG00000011733)	c6 (ENSELUG00000011662)	rnf180b (ENSELUG00000011598)	ENSELUG00000011574	ndr1 (ENSELUG00000011567) #22	ANK1 (ENSELUG00000011547)	ftsj1 (ENSELUG00000011483)	NEFM (ENSELUG00000011468)	neflb (ENSELUG00000011459)	pgam2 (ENSELUG00000011434)	ENSELUG00000011420	crkl (ENSELUG00000011394)	med15 (ENSELUG00000011355)	si:ch211-222n4.2 (ENSELUG00000011289)	smpd4 (ENSELUG00000011271)	TMEM132C (ENSELUG00000011190)	ENSELUG00000011149	ENSELUG00000011126	RIMBP2 (ENSELUG00000011063)	ENSELUG00000011011
Spotted gar	DUPLICATION
Spotted gar	DUPLICATION
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Hagfish	DUPLICATION
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