Bilateria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b #22 Chordata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b #22 Vertebrata ANCESTRAL SPECIES 193 ENSGT00950000182926.b #22 ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 Gnathostomata DUPLICATION Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES 470 ENSGT00940000162611 ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000166659 ENSGT00950000182926.b.d #22 ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 220 ENSGT00390000011684 ENSGT00940000161036.B ENSGT00940000157042 ENSGT00530000063711.b ENSGT00390000013726 ENSGT00390000000134.a ENSGT00940000160608 ENSGT00390000013298 ENSGT00510000049872 ENSGT00390000010434.b ENSGT00390000013106 ENSGT00940000166659 ENSGT00950000182926.b.d #22 ENSGT00390000015287 ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 50 ENSGT00940000160581 ENSGT01030000234543.A.b ENSGT00510000048167.b.b ENSGT00940000153322.B ENSGT00390000017284.a.a ENSGT00940000160184 ENSGT00940000160001 ENSGT00940000158095 ENSGT00940000166081 ENSGT00530000063371.C ENSGT00940000164705 ENSGT00940000161460 ENSGT00950000182926.b.d #22 ENSGT00390000015287 ENSGT00940000156168.C ENSGT00950000182950.A ENSGT00940000156931 ENSGT00530000064262 ENSGT00550000074939 ENSGT00940000153203.A.a ENSGT00940000158603 ENSGT00940000157712 ENSGT00940000159747 ENSGT00940000158355 ENSGT00940000164577 ENSGT00530000068573 ENSGT00940000158544 ENSGT00950000183109.c.a.b Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 39 ENSGT00940000158796 ENSGT00390000007726.a.a ENSGT00940000157798 ENSGT00390000002554 ENSGT00390000001546 ENSGT00530000063586.a ENSGT00390000005639.a.b ENSGT00950000183137.a ENSGT00940000162611.b ENSGT00940000162611.a ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00940000157331 ENSGT01100000263518.A.b ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d #22 ENSGT00390000015287 ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00530000063604.A ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 ENSGT00530000063711.b Amniota ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000158796 ENSGT00390000007726.a.a ENSGT00940000157798 ENSGT00390000002554 ENSGT00390000001546 ENSGT00530000063586.a ENSGT00390000005639.a.b ENSGT00950000183137.a ENSGT00940000162611.b ENSGT00940000162611.a ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00940000157331 ENSGT01100000263518.A.b ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d #22 ENSGT00390000015287 ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00530000063604.A ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 ENSGT00530000063711.b Mammalia ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000161044 ENSGT00940000161927 ENSGT00940000154371.b ENSGT00940000153997.b.a.a ENSGT00940000155716 ENSGT00940000158282 ENSGT00940000156111 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155493 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000162611.a ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00940000157331 ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d #22 ENSGT00390000015287 ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00530000063604.A ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 ENSGT01000000220768 Theria ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000156590 ENSGT00940000156981 ENSGT00940000162006 ENSGT00940000155715 ENSGT00940000158584 ENSGT00390000009395 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155493 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000162611.a ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00940000157331 ENSGT00390000007081 ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d #22 ENSGT00390000015287 ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00390000015820 ENSGT00530000063604.A ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 Eutheria DUPLICATION Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.d #22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.d #22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.d #22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.d #22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.d #22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.d #22 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.d #22 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.d #22 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.d #22 Guinea pig MODERN SPECIES 2 ENSCPOG00000037055 C1orf68 (ENSCPOG00000035893) ENSCPOG00000033053 ENSCPOG00000030235 ENSCPOG00000037041 ENSCPOG00000030043 ENSCPOG00000030563 ENSCPOG00000033173 ENSCPOG00000032596 ENSCPOG00000035955 ENSCPOG00000030264 ENSCPOG00000040656 ENSCPOG00000032513 ENSCPOG00000039783 ENSCPOG00000034456 ENSCPOG00000027424 #22 ENSCPOG00000021328 S100A11 (ENSCPOG00000009745) ENSCPOG00000033136 THEM4 (ENSCPOG00000000143) THEM5 (ENSCPOG00000001050) C2CD4D (ENSCPOG00000031360) RORC (ENSCPOG00000023600) LINGO4 (ENSCPOG00000003563) TDRKH (ENSCPOG00000003556) OAZ3 (ENSCPOG00000003550) MRPL9 (ENSCPOG00000021168) CELF3 (ENSCPOG00000003539) SNX27 (ENSCPOG00000007869) TUFT1 (ENSCPOG00000007866) CGN (ENSCPOG00000023121) Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000156981 ENSGT00940000162006 ENSGT00940000155715 ENSGT00940000158584 ENSGT00390000009395 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155493 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000162611.a ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00940000157331 ENSGT00390000007081.b ENSGT00390000007081.a ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d.d #22 ENSGT00390000015287.h ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00530000063604.A ENSGT00390000015820 ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000156981 ENSGT00940000162006 ENSGT00940000155715 ENSGT00940000158584 ENSGT00390000009395 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155493 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000162611.a ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00940000157331 ENSGT00390000007081.b ENSGT00390000007081.a ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d.d #22 ENSGT00390000015287.h ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00530000063604.A ENSGT00390000015820 ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 Muroidea ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000156981 ENSGT00940000162006 ENSGT00940000155715 ENSGT00940000158584 ENSGT00390000009395 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155493 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000162611.a ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00940000157331 ENSGT00390000007081.b ENSGT00390000007081.a ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d.d #22 ENSGT00390000015287.h ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00530000063604.A ENSGT00390000015820 ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 771 Ccnj (ENSNGAG00000023593) Zfp518a (ENSNGAG00000012849) Blnk (ENSNGAG00000017997) Dntt (ENSNGAG00000012677) Opalin (ENSNGAG00000018775) Tll2 (ENSNGAG00000018339) Tm9sf3 (ENSNGAG00000016022) Pik3ap1 (ENSNGAG00000007267) ENSNGAG00000023025 ENSNGAG00000014867 Lcor (ENSNGAG00000015021) Slit1 (ENSNGAG00000020175) Arhgap19 (ENSNGAG00000022828) 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(ENSRNOG00000014940) AABR07006871.1 (ENSRNOG00000053536) Golga7b (ENSRNOG00000015051) Cricetidae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000156981 ENSGT00940000162006 ENSGT00940000155715 ENSGT00940000158584 ENSGT00390000009395 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155493 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000162611.a ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00940000157331 ENSGT00390000007081.b ENSGT00390000007081.a ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d.d #22 ENSGT00390000015287.h ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00390000015820 ENSGT00530000063604.A ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000156981 ENSGT00940000162006 ENSGT00940000155715 ENSGT00940000158584 ENSGT00390000009395 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155493 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000162611.a ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00940000157331 ENSGT00390000007081.b ENSGT00390000007081.a ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d.d #22 ENSGT00390000015287.h ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00390000015820 ENSGT00530000063604.A ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 263 Zfp518a (ENSCGRG00001009777) Blnk (ENSCGRG00001008533) Dntt (ENSCGRG00001003301) Opalin (ENSCGRG00001000224) Tll2 (ENSCGRG00001023733) ENSCGRG00001022183 Pik3ap1 (ENSCGRG00001021098) ENSCGRG00001020516 Lcor (ENSCGRG00001020097) Slit1 (ENSCGRG00001013710) ENSCGRG00001004479 Arhgap19 (ENSCGRG00001008072) ENSCGRG00001004340 Frat2 (ENSCGRG00001007661) Rrp12 (ENSCGRG00001004338) Pgam1 (ENSCGRG00001001591) #22 Exosc1 (ENSCGRG00001000335) Zdhhc16 (ENSCGRG00001024037) Mms19 (ENSCGRG00001022087) Ubtd1 (ENSCGRG00001020134) Ankrd2 (ENSCGRG00001011585) 4933411K16Rik (ENSCGRG00001010620) Hoga1 (ENSCGRG00001010186) Morn4 (ENSCGRG00001008672) Pi4k2a (ENSCGRG00001006184) Avpi1 (ENSCGRG00001003238) Marveld1 (ENSCGRG00001015304) Zfyve27 (ENSCGRG00001001467) Sfrp5 (ENSCGRG00001000510) Golga7b (ENSCGRG00001000198) Crtac1 (ENSCGRG00001023131) Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000156981 ENSGT00940000162006 ENSGT00940000155715 ENSGT00940000158584 ENSGT00390000009395 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155493 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000162611.a ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00940000157331 ENSGT00390000007081.b ENSGT00390000007081.a ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d.d #22 ENSGT00390000015287.h ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00530000063604.A ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 ENSGT00530000063711.b Prairie vole MODERN SPECIES 48 ENSMOCG00000000250 #22 Northern American deer mouse MODERN SPECIES Cc2d2b (ENSPEMG00000020898) Ccnj (ENSPEMG00000030735) Zfp518a (ENSPEMG00000019344) Blnk (ENSPEMG00000019675) Dntt (ENSPEMG00000019606) Opalin (ENSPEMG00000031402) Tll2 (ENSPEMG00000018066) Tm9sf3 (ENSPEMG00000019600) Pik3ap1 (ENSPEMG00000019544) ENSPEMG00000005693 Lcor (ENSPEMG00000018115) Slit1 (ENSPEMG00000002625) Arhgap19 (ENSPEMG00000014758) ENSPEMG00000009720 Rrp12 (ENSPEMG00000008437) Pgam1 (ENSPEMG00000012759) #22 Exosc1 (ENSPEMG00000010710) Zdhhc16 (ENSPEMG00000007675) Mms19 (ENSPEMG00000013174) Ubtd1 (ENSPEMG00000024360) Ankrd2 (ENSPEMG00000013562) Hoga1 (ENSPEMG00000014860) Morn4 (ENSPEMG00000027726) Pi4k2a (ENSPEMG00000016260) Avpi1 (ENSPEMG00000011234) Marveld1 (ENSPEMG00000000505) Zfyve27 (ENSPEMG00000000658) Sfrp5 (ENSPEMG00000018114) Golga7b (ENSPEMG00000019018) Crtac1 (ENSPEMG00000018527) R3hcc1l (ENSPEMG00000009290) Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.d #22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.d #22 Tarsier MODERN SPECIES 1645 ENSTSYG00000026021 #22 MRPL4 (ENSTSYG00000034805) Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.d #22 Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.d #22 Hedgehog MODERN SPECIES 3534 ENSEEUG00000005447 ENSEEUG00000005630 #22 EXOSC1 (ENSEEUG00000005647) ZDHHC16 (ENSEEUG00000005691) MMS19 (ENSEEUG00000005725) Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.d #22 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.d #22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.d #22 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.d #22 Cetacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.d #22 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.d #22 Sperm whale MODERN SPECIES 12 COX15 (ENSPCTG00005015651) ENTPD7 (ENSPCTG00005015609) SLC25A28 (ENSPCTG00005015533) ENSPCTG00005015512 NKX2-3 (ENSPCTG00005015458) GOT1 (ENSPCTG00005015383) CNNM1 (ENSPCTG00005015224) HPSE2 (ENSPCTG00005014453) ENSPCTG00005014329 R3HCC1L (ENSPCTG00005014293) SFRP5 (ENSPCTG00005014239) ZFYVE27 (ENSPCTG00005013655) MARVELD1 (ENSPCTG00005013584) AVPI1 (ENSPCTG00005013541) PI4K2A (ENSPCTG00005013487) ENSPCTG00005013431 #22 PGAM1 (ENSPCTG00005013367) ##22 EXOSC1 (ENSPCTG00005013217) ZDHHC16 (ENSPCTG00005012891) MMS19 (ENSPCTG00005012756) RRP12 (ENSPCTG00005011281) FRAT2 (ENSPCTG00005011203) FRAT1 (ENSPCTG00005011174) ARHGAP19 (ENSPCTG00005011029) LCOR (ENSPCTG00005010896) PIK3AP1 (ENSPCTG00005022480) TM9SF3 (ENSPCTG00005022471) TLL2 (ENSPCTG00005022462) OPALIN (ENSPCTG00005022448) DNTT (ENSPCTG00005022440) BLNK (ENSPCTG00005022431) Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.d #22 Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.d #22 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.d #22 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.d #22 Ursidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.d #22 Giant Panda DUPLICATION Giant Panda DUPLICATION Giant Panda MODERN SPECIES 1963 ENSAMEG00000029767 #22 Giant Panda MODERN SPECIES 1694 ENSAMEG00000028993 #22 Giant Panda DUPLICATION Giant Panda MODERN SPECIES 887 ENSAMEG00000028630 #22 ENSAMEG00000026543 #22 Giant Panda MODERN SPECIES 887 ENSAMEG00000028630 #22 ENSAMEG00000026543 #22 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.d #22 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.d #22 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.d #22 Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 7 ZNF518A (ENSRFEG00010014399) BLNK (ENSRFEG00010014241) DNTT (ENSRFEG00010013880) OPALIN (ENSRFEG00010013702) TLL2 (ENSRFEG00010013346) TM9SF3 (ENSRFEG00010013289) PIK3AP1 (ENSRFEG00010013202) ENSRFEG00010013148 ENSRFEG00010013097 LCOR (ENSRFEG00010013002) SLIT1 (ENSRFEG00010012897) FRAT1 (ENSRFEG00010012872) ARHGAP19 (ENSRFEG00010012522) FRAT2 (ENSRFEG00010012480) RRP12 (ENSRFEG00010012357) ENSRFEG00010012320 #22 EXOSC1 (ENSRFEG00010012162) ZDHHC16 (ENSRFEG00010011834) MMS19 (ENSRFEG00010011787) UBTD1 (ENSRFEG00010011733) ANKRD2 (ENSRFEG00010011484) HOGA1 (ENSRFEG00010011363) MORN4 (ENSRFEG00010011280) PI4K2A (ENSRFEG00010011240) AVPI1 (ENSRFEG00010011224) MARVELD1 (ENSRFEG00010011202) ZFYVE27 (ENSRFEG00010010662) SFRP5 (ENSRFEG00010010565) GOLGA7B (ENSRFEG00010010476) ENSRFEG00010010438 CRTAC1 (ENSRFEG00010010283) Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.d #22 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.d #22 Tenrec DUPLICATION Tenrec MODERN SPECIES 3167 RRP12 (ENSETEG00000002455) ENSETEG00000002467 #22 ENSETEG00000002469 ZDHHC16 (ENSETEG00000002471) MMS19 (ENSETEG00000002473) Tenrec MODERN SPECIES 12698 ENSETEG00000006850 #22 Eutheria DUPLICATION Eutheria ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000156981 ENSGT00940000162006 ENSGT00940000155715 ENSGT00940000158584 ENSGT00390000009395 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155493 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000162611.a ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00940000157331 ENSGT00390000007081.b ENSGT00390000007081.a ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d.c.a ##22 ENSGT00390000015287 ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00390000015820 ENSGT00530000063604.A ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000156981 ENSGT00940000162006 ENSGT00940000155715 ENSGT00940000158584 ENSGT00390000009395 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155493 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000162611.a ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00940000157331 ENSGT00390000007081.b ENSGT00390000007081.a ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d.c.a ##22 ENSGT00390000015287 ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00390000015820 ENSGT00530000063604.A ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000156981 ENSGT00940000162006 ENSGT00940000155715 ENSGT00940000158584 ENSGT00390000009395 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155493 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000162611.a ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00940000157331 ENSGT00390000007081.b ENSGT00390000007081.a ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d.c.a ##22 ENSGT00390000015287 ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00530000063604.A ENSGT00390000015820 ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES 134 ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d.c.a ##22 ENSGT00390000015287 ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 Common shrew MODERN SPECIES 2645 ENSSARG00000000157 PGAM1 (ENSSARG00000000159) ##22 EXOSC1 (ENSSARG00000000162) ENSSARG00000000163 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000156981 ENSGT00940000162006 ENSGT00940000155715 ENSGT00940000158584 ENSGT00390000009395 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155493 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000162611.a ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00940000157331 ENSGT00390000007081.b ENSGT00390000007081.a ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d.c.a ##22 ENSGT00390000015287 ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00530000063604.A ENSGT00390000015820 ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000156981 ENSGT00940000162006 ENSGT00940000155715 ENSGT00940000158584 ENSGT00390000009395 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155493 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000162611.a ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00940000157331 ENSGT00390000007081.b ENSGT00390000007081.a ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d.c.a ##22 ENSGT00390000015287 ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00530000063604.A ENSGT00390000015820 ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 Suina ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000156981 ENSGT00940000162006 ENSGT00940000155715 ENSGT00940000158584 ENSGT00390000009395 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155493 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000162611.b ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00940000157331 ENSGT00390000007081.b ENSGT00390000007081.a ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d.c.a ##22 ENSGT00390000015287 ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00530000063604.A ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 ENSGT00530000063711.b Pig MODERN SPECIES 5 CC2D2B (ENSSSCG00000046471) CCNJ (ENSSSCG00000010502) ZNF518A (ENSSSCG00000010503) BLNK (ENSSSCG00000010504) DNTT (ENSSSCG00000010505) OPALIN (ENSSSCG00000010506) TLL2 (ENSSSCG00000010507) TM9SF3 (ENSSSCG00000010508) PIK3AP1 (ENSSSCG00000010509) LCOR (ENSSSCG00000010513) SLIT1 (ENSSSCG00000010512) ARHGAP19 (ENSSSCG00000037185) FRAT1 (ENSSSCG00000032821) FRAT2 (ENSSSCG00000038904) RRP12 (ENSSSCG00000010514) PGAM1 (ENSSSCG00000010517) ##22 EXOSC1 (ENSSSCG00000010518) ZDHHC16 (ENSSSCG00000010519) MMS19 (ENSSSCG00000010520) UBTD1 (ENSSSCG00000010521) ANKRD2 (ENSSSCG00000010522) HOGA1 (ENSSSCG00000010523) MORN4 (ENSSSCG00000036954) PI4K2A (ENSSSCG00000010525) AVPI1 (ENSSSCG00000036824) MARVELD1 (ENSSSCG00000010527) ZFYVE27 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ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000162611.a ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00940000157331 ENSGT00390000007081.b ENSGT00390000007081.a ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d.c.a ##22 ENSGT00390000015287 ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00530000063604.A ENSGT00390000015820 ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 Cetacea ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000162006 ENSGT00940000155715 ENSGT00940000158584 ENSGT00390000009395 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155493 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000162611.b ENSGT00940000162611.a ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00940000157331 ENSGT00390000007081.b ENSGT00390000007081.a ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d.c.a ##22 ENSGT00390000015287 ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b 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ENSGT00390000015820 ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 Yarkand deer MODERN SPECIES 6 BLNK (ENSCHYG00000015608) DNTT (ENSCHYG00000015940) OPALIN (ENSCHYG00000016188) TLL2 (ENSCHYG00000016501) TM9SF3 (ENSCHYG00000016672) PIK3AP1 (ENSCHYG00000016886) LCOR (ENSCHYG00000017121) SLIT1 (ENSCHYG00000017383) ENSCHYG00000018017 ARHGAP19 (ENSCHYG00000018209) FRAT1 (ENSCHYG00000018557) FRAT2 (ENSCHYG00000018576) ENSCHYG00000018613 ENSCHYG00000018643 RRP12 (ENSCHYG00000018769) PGAM1 (ENSCHYG00000019647) ##22 ENSCHYG00000019703 ZDHHC16 (ENSCHYG00000019968) MMS19 (ENSCHYG00000020307) UBTD1 (ENSCHYG00000020651) ANKRD2 (ENSCHYG00000020741) HOGA1 (ENSCHYG00000021197) MORN4 (ENSCHYG00000021303) PI4K2A (ENSCHYG00000021371) AVPI1 (ENSCHYG00000004424) MARVELD1 (ENSCHYG00000004459) ZFYVE27 (ENSCHYG00000004712) SFRP5 (ENSCHYG00000004868) ENSCHYG00000004880 CRTAC1 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ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 14 DNTT (ENSOARG00020023188) ENSOARG00020023269 OPALIN (ENSOARG00020013479) TLL2 (ENSOARG00020014105) TM9SF3 (ENSOARG00020014308) PIK3AP1 (ENSOARG00020014374) ENSOARG00020014565 ENSOARG00020014604 LCOR (ENSOARG00020014633) SLIT1 (ENSOARG00020014873) ENSOARG00020015779 ARHGAP19 (ENSOARG00020015846) FRAT1 (ENSOARG00020016442) FRAT2 (ENSOARG00020016463) RRP12 (ENSOARG00020016512) PGAM1 (ENSOARG00020017087) ##22 EXOSC1 (ENSOARG00020017150) ZDHHC16 (ENSOARG00020017365) MMS19 (ENSOARG00020017722) UBTD1 (ENSOARG00020018950) ANKRD2 (ENSOARG00020018993) HOGA1 (ENSOARG00020019351) MORN4 (ENSOARG00020019435) PI4K2A (ENSOARG00020019502) AVPI1 (ENSOARG00020019577) MARVELD1 (ENSOARG00020019607) ENSOARG00020019627 ZFYVE27 (ENSOARG00020019673) SFRP5 (ENSOARG00020020728) GOLGA7B (ENSOARG00020020851) CRTAC1 (ENSOARG00020020932) Goat DUPLICATION Goat MODERN SPECIES 18 ZNF518A (ENSCHIG00000014520) BLNK (ENSCHIG00000017513) DNTT (ENSCHIG00000004835) OPALIN (ENSCHIG00000017059) TLL2 (ENSCHIG00000007274) TM9SF3 (ENSCHIG00000012274) ENSCHIG00000013021 PIK3AP1 (ENSCHIG00000020278) LCOR (ENSCHIG00000008908) SLIT1 (ENSCHIG00000011034) ENSCHIG00000014737 ARHGAP19 (ENSCHIG00000009996) FRAT1 (ENSCHIG00000008538) FRAT2 (ENSCHIG00000009856) RRP12 (ENSCHIG00000011876) PGAM1 (ENSCHIG00000023008) ##22 EXOSC1 (ENSCHIG00000015253) ENSCHIG00000024556 MMS19 (ENSCHIG00000015342) UBTD1 (ENSCHIG00000020670) ANKRD2 (ENSCHIG00000011698) C10orf62 (ENSCHIG00000025583) HOGA1 (ENSCHIG00000018410) MORN4 (ENSCHIG00000015248) PI4K2A (ENSCHIG00000019481) AVPI1 (ENSCHIG00000014474) MARVELD1 (ENSCHIG00000019321) ZFYVE27 (ENSCHIG00000015749) SFRP5 (ENSCHIG00000024678) GOLGA7B (ENSCHIG00000020686) CRTAC1 (ENSCHIG00000021520) Goat MODERN SPECIES SLCO2A1 (ENSCHIG00000019191) RYK (ENSCHIG00000023154) AMOTL2 (ENSCHIG00000014704) ANAPC13 (ENSCHIG00000020500) CEP63 (ENSCHIG00000026357) KY (ENSCHIG00000023964) EPHB1 (ENSCHIG00000019310) PPP2R3A 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ENSGT00950000182926.b.d.c.a ##22 ENSGT00390000015287 ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00530000063604.A ENSGT00390000015820 ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 American bison MODERN SPECIES 2808 ENSBBBG00000022157 CCNJ (ENSBBBG00000022128) ZNF518A (ENSBBBG00000022116) BLNK (ENSBBBG00000022102) DNTT (ENSBBBG00000021886) OPALIN (ENSBBBG00000007059) TLL2 (ENSBBBG00000007109) TM9SF3 (ENSBBBG00000021764) PIK3AP1 (ENSBBBG00000021738) ENSBBBG00000021693 LCOR (ENSBBBG00000021665) SLIT1 (ENSBBBG00000005755) ARHGAP19 (ENSBBBG00000021596) ENSBBBG00000005727 RRP12 (ENSBBBG00000021482) PGAM1 (ENSBBBG00000021195) ##22 EXOSC1 (ENSBBBG00000021190) ZDHHC16 (ENSBBBG00000021113) MMS19 (ENSBBBG00000020854) UBTD1 (ENSBBBG00000020612) ANKRD2 (ENSBBBG00000020599) HOGA1 (ENSBBBG00000005549) MORN4 (ENSBBBG00000020533) PI4K2A (ENSBBBG00000020520) AVPI1 (ENSBBBG00000007237) MARVELD1 (ENSBBBG00000005536) ZFYVE27 (ENSBBBG00000020489) SFRP5 (ENSBBBG00000000636) GOLGA7B (ENSBBBG00000000641) CRTAC1 (ENSBBBG00000000665) ENSBBBG00000020378 Bos DUPLICATION Bos DUPLICATION Bos ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.a.c.a ##22 Bos_b ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT01100000263480.a.a.b.b.b.a.a.a.a.a.b.b.a.b.b.a ENSGT00390000005250 ENSGT00940000156639 ENSGT00390000005811 ENSGT00940000158634 ENSGT00530000063335.B.a.b ENSGT00940000156820.a.a ENSGT00390000017892 ENSGT00390000014593 ENSGT00940000156117 ENSGT00550000074816.B ENSGT01100000263511.b.a.b.a.b.a.b.a.a.a.a.a.b.a.a ENSGT00940000160905 ENSGT00940000157366.f ENSGT00940000153636.b ENSGT00950000182926.b.d.c.a.c.a ##22 ENSGT00940000157611 ENSGT00440000033805.h.a ENSGT00390000017130 ENSGT00940000156165 ENSGT00950000183029.A.n.a ENSGT01100000263481.n.a.a.a.b.b.b.a.a.a.b.a.a.b ENSGT01050000244942.b.a.a ENSGT00940000154609 ENSGT00940000155221.l ENSGT00960000191550 ENSGT00940000157708 ENSGT01100000263480.a.a.b.b.b.a.a.a.a.a.a.a.a.b.a.a.b.a ENSGT00940000158164 ENSGT00390000001325 ENSGT00390000005323 Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 27 PIP5K1B (ENSBIXG00005002661) FXN (ENSBIXG00005016495) TJP2 (ENSBIXG00005016444) ENTREP1 (ENSBIXG00005015945) APBA1 (ENSBIXG00005000159) PTAR1 (ENSBIXG00005015792) CFAP95 (ENSBIXG00005015744) MAMDC2 (ENSBIXG00005015686) ENSBIXG00005015663 ENSBIXG00005015611 ENSBIXG00005002258 ENSBIXG00005015415 KLF9 (ENSBIXG00005015399) TRPM3 (ENSBIXG00005015290) CEMIP2 (ENSBIXG00005002091) ENSBIXG00005014723 ##22 ENSBIXG00005014713 ABHD17B (ENSBIXG00005014706) ENSBIXG00005014654 GDA (ENSBIXG00005014619) ENSBIXG00005014554 ZFAND5 (ENSBIXG00005014532) ENSBIXG00005014461 ENSBIXG00005014453 ENSBIXG00005001926 TMC1 (ENSBIXG00005005407) ALDH1A1 (ENSBIXG00005001914) ENSBIXG00005014241 ENSBIXG00005014214 RORB (ENSBIXG00005006505) ENSBIXG00005014163 Bos_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.a.c.a ##22 Domestic yak MODERN SPECIES 26 TMEM252 (ENSBGRG00000002724) PIP5K1B (ENSBGRG00000002519) ENSBGRG00000002457 TJP2 (ENSBGRG00000001216) ENTREP1 (ENSBGRG00000000954) APBA1 (ENSBGRG00000000786) PTAR1 (ENSBGRG00000000713) CFAP95 (ENSBGRG00000000656) MAMDC2 (ENSBGRG00000000561) ENSBGRG00000000527 ENSBGRG00000000522 ENSBGRG00000000389 KLF9 (ENSBGRG00000000307) ENSBGRG00000024088 TRPM3 (ENSBGRG00000023218) ENSBGRG00000023134 ##22 CEMIP2 (ENSBGRG00000022945) ABHD17B (ENSBGRG00000022905) C9orf85 (ENSBGRG00000022827) ENSBGRG00000022780 GDA (ENSBGRG00000022461) ENSBGRG00000022438 ENSBGRG00000022416 ZFAND5 (ENSBGRG00000022368) ENSBGRG00000022352 TMC1 (ENSBGRG00000022319) ENSBGRG00000022195 ENSBGRG00000022028 ENSBGRG00000021968 ENSBGRG00000021937 RORB (ENSBGRG00000021739) Bos ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.a.c.b ##22 Bos_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.a.c.b ##22 Domestic yak MODERN SPECIES 11 ENSBGRG00000008249 ENSBGRG00000008056 ENSBGRG00000007929 ENSBGRG00000007873 CAB39 (ENSBGRG00000007648) ITM2C (ENSBGRG00000007373) SPATA3 (ENSBGRG00000023080) C2orf72 (ENSBGRG00000023040) HTR2B (ENSBGRG00000022997) PSMD1 (ENSBGRG00000022636) ARMC9 (ENSBGRG00000021327) B3GNT7 (ENSBGRG00000021246) ENSBGRG00000021053 NMUR1 (ENSBGRG00000021016) PTMA (ENSBGRG00000020966) ENSBGRG00000020936 ##22 PDE6D (ENSBGRG00000020792) NPPC (ENSBGRG00000020756) COPS7B (ENSBGRG00000020160) DIS3L2 (ENSBGRG00000019933) ENSBGRG00000019258 ENSBGRG00000018978 ENSBGRG00000018889 ENSBGRG00000018743 ECEL1 (ENSBGRG00000018392) PRSS56 (ENSBGRG00000018237) CHRND (ENSBGRG00000018073) CHRNG (ENSBGRG00000017953) ENSBGRG00000017390 ENSBGRG00000017352 PHC2 (ENSBGRG00000017122) Bos ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000162006 ENSGT00940000155715 ENSGT00940000158584 ENSGT00390000009395 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155493 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000162611.b ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00950000183198.c.a.a.a.a.d ENSGT00940000157331 ENSGT00390000007081.b ENSGT00390000007081.a ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d.c.a.d ##22 ENSGT00390000015287 ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00530000063604.A ENSGT00390000015820 ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 Bos_b ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000162006 ENSGT00940000155715 ENSGT00940000158584 ENSGT00390000009395 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155493 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000162611.b ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00950000183198.c.a.a.a.a.d ENSGT00940000157331 ENSGT00390000007081.b ENSGT00390000007081.a ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d.c.a.d ##22 ENSGT00390000015287 ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00530000063604.A ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 ENSGT00530000063711.b Cow MODERN SPECIES 18 DNTT (ENSBTAG00000020427) OPALIN (ENSBTAG00000011740) TLL2 (ENSBTAG00000011743) TM9SF3 (ENSBTAG00000016298) PIK3AP1 (ENSBTAG00000019872) ENSBTAG00000055267 LCOR (ENSBTAG00000046239) SLIT1 (ENSBTAG00000043991) ENSBTAG00000050121 ARHGAP19 (ENSBTAG00000040427) ENSBTAG00000050994 FRAT1 (ENSBTAG00000007956) FRAT2 (ENSBTAG00000046701) RRP12 (ENSBTAG00000002191) ENSBTAG00000050033 PGAM1 (ENSBTAG00000012697) ##22 EXOSC1 (ENSBTAG00000012699) ZDHHC16 (ENSBTAG00000012702) MMS19 (ENSBTAG00000012704) UBTD1 (ENSBTAG00000012719) ANKRD2 (ENSBTAG00000012720) HOGA1 (ENSBTAG00000012721) MORN4 (ENSBTAG00000011137) PI4K2A (ENSBTAG00000002010) AVPI1 (ENSBTAG00000023947) MARVELD1 (ENSBTAG00000013478) ZFYVE27 (ENSBTAG00000018564) SFRP5 (ENSBTAG00000018566) GOLGA7B (ENSBTAG00000008100) CRTAC1 (ENSBTAG00000008102) R3HCC1L (ENSBTAG00000021856) Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 18 TLL2 (ENSBIXG00005002281) TM9SF3 (ENSBIXG00005028883) PIK3AP1 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ENSGT00940000157331 ENSGT00390000007081.b ENSGT00390000007081.a ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d.c.a.d ##22 ENSGT00390000015287 ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00530000063604.A ENSGT00390000015820 ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 Domestic yak MODERN SPECIES 17 CCNJ (ENSBGRG00000025803) ZNF518A (ENSBGRG00000025820) BLNK (ENSBGRG00000025843) DNTT (ENSBGRG00000025937) OPALIN (ENSBGRG00000025982) TLL2 (ENSBGRG00000026019) TM9SF3 (ENSBGRG00000026055) PIK3AP1 (ENSBGRG00000026070) LCOR (ENSBGRG00000026094) ENSBGRG00000026107 SLIT1 (ENSBGRG00000026122) ARHGAP19 (ENSBGRG00000026190) FRAT1 (ENSBGRG00000015960) FRAT2 (ENSBGRG00000015978) RRP12 (ENSBGRG00000016021) PGAM1 (ENSBGRG00000016427) ##22 EXOSC1 (ENSBGRG00000016530) ZDHHC16 (ENSBGRG00000016715) MMS19 (ENSBGRG00000017310) UBTD1 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(ENSPVAG00000003390) GOLGA7B (ENSPVAG00000003391) CRTAC1 (ENSPVAG00000003392) Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000162006 ENSGT00940000155715 ENSGT00940000158584 ENSGT00390000009395 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155493 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000162611.b ENSGT00940000162611.a ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00940000157331 ENSGT00390000007081.b ENSGT00390000007081.a ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d.c.a ##22 ENSGT00390000015287 ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00530000063604.A ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 ENSGT00530000063711.b Microbat MODERN SPECIES 1003 ENSMLUG00000006617 ENSMLUG00000014058 BLNK (ENSMLUG00000004792) ENSMLUG00000028644 ENSMLUG00000025630 DNTT (ENSMLUG00000009288) OPALIN (ENSMLUG00000009306) TLL2 (ENSMLUG00000009321) TM9SF3 (ENSMLUG00000012121) ENSMLUG00000000494 LCOR (ENSMLUG00000015786) SLIT1 (ENSMLUG00000015796) ARHGAP19 (ENSMLUG00000023489) ENSMLUG00000024055 RRP12 (ENSMLUG00000017160) PGAM1 (ENSMLUG00000009117) ##22 EXOSC1 (ENSMLUG00000009228) ZDHHC16 (ENSMLUG00000009246) MMS19 (ENSMLUG00000009260) UBTD1 (ENSMLUG00000009303) ANKRD2 (ENSMLUG00000009324) HOGA1 (ENSMLUG00000009344) MORN4 (ENSMLUG00000009367) PI4K2A (ENSMLUG00000028240) AVPI1 (ENSMLUG00000028157) ZFYVE27 (ENSMLUG00000009377) SFRP5 (ENSMLUG00000025702) GOLGA7B (ENSMLUG00000015977) CRTAC1 (ENSMLUG00000015981) ENSMLUG00000023911 R3HCC1L (ENSMLUG00000000430) Carnivora ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000156981 ENSGT00940000162006 ENSGT00940000155715 ENSGT00940000158584 ENSGT00390000009395 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155493 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000162611.a ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00940000157331 ENSGT00390000007081.b ENSGT00390000007081.a ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d.c.a ##22 ENSGT00390000015287 ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00530000063604.A ENSGT00390000015820 ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 Caniformia ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000156981 ENSGT00940000162006 ENSGT00940000155715 ENSGT00940000158584 ENSGT00390000009395 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155493 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000162611.a ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00940000157331 ENSGT00390000007081.b ENSGT00390000007081.a ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d.c.a ##22 ENSGT00390000015287 ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00530000063604.A ENSGT00390000015820 ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000156981 ENSGT00940000162006 ENSGT00940000155715 ENSGT00940000158584 ENSGT00390000009395 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155493 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000162611.a ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00940000157331 ENSGT00390000007081.b ENSGT00390000007081.a ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d.c.a ##22 ENSGT00390000015287 ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00530000063604.A ENSGT00390000015820 ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 Ursidae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000156590 ENSGT00940000156981 ENSGT00940000162006 ENSGT00940000155715 ENSGT00940000158584 ENSGT00390000009395 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155493 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000162611.a ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00940000157331 ENSGT00390000007081.b ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d.c.a ##22 ENSGT00390000015287 ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00530000063604.A ENSGT00390000015820 ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 Giant Panda MODERN SPECIES 16 CC2D2B (ENSAMEG00000000351) CCNJ (ENSAMEG00000000344) ZNF518A (ENSAMEG00000018804) BLNK (ENSAMEG00000000311) DNTT (ENSAMEG00000000264) OPALIN (ENSAMEG00000025851) TLL2 (ENSAMEG00000000197) TM9SF3 (ENSAMEG00000000195) PIK3AP1 (ENSAMEG00000000188) ENSAMEG00000030117 LCOR (ENSAMEG00000018798) SLIT1 (ENSAMEG00000000150) ARHGAP19 (ENSAMEG00000000146) FRAT1 (ENSAMEG00000024721) RRP12 (ENSAMEG00000000134) PGAM1 (ENSAMEG00000000132) ##22 EXOSC1 (ENSAMEG00000000129) ZDHHC16 (ENSAMEG00000000123) MMS19 (ENSAMEG00000000114) UBTD1 (ENSAMEG00000028810) ANKRD2 (ENSAMEG00000000108) HOGA1 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(ENSUAMG00000009092) PGAM1 (ENSUAMG00000010263) ##22 EXOSC1 (ENSUAMG00000010266) ZDHHC16 (ENSUAMG00000010270) ENSUAMG00000010275 ENSUAMG00000010280 UBTD1 (ENSUAMG00000010282) ANKRD2 (ENSUAMG00000010285) HOGA1 (ENSUAMG00000010287) C10orf62 (ENSUAMG00000010289) MORN4 (ENSUAMG00000010290) PI4K2A (ENSUAMG00000010291) AVPI1 (ENSUAMG00000010293) ZFYVE27 (ENSUAMG00000010295) SFRP5 (ENSUAMG00000010297) Polar bear MODERN SPECIES 92 TCTN3 (ENSUMAG00000021345) ENTPD1 (ENSUMAG00000021352) CC2D2B (ENSUMAG00000021359) CCNJ (ENSUMAG00000021372) ENSUMAG00000021388 DNTT (ENSUMAG00000021390) OPALIN (ENSUMAG00000021392) TLL2 (ENSUMAG00000021398) TM9SF3 (ENSUMAG00000021413) PIK3AP1 (ENSUMAG00000021435) ENSUMAG00000021531 LCOR (ENSUMAG00000021534) SLIT1 (ENSUMAG00000021542) ARHGAP19 (ENSUMAG00000021549) RRP12 (ENSUMAG00000021621) PGAM1 (ENSUMAG00000022000) ##22 EXOSC1 (ENSUMAG00000022002) ZDHHC16 (ENSUMAG00000022010) MMS19 (ENSUMAG00000022094) UBTD1 (ENSUMAG00000022418) ANKRD2 (ENSUMAG00000022422) HOGA1 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ENSGT00940000158584 ENSGT00390000009395 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155493 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000162611.a ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00940000157331 ENSGT00390000007081.b ENSGT00390000007081.a ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d.c.a ##22 ENSGT00390000015287.h ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00390000015820 ENSGT00530000063604.A ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000156981 ENSGT00940000162006 ENSGT00940000155715 ENSGT00940000158584 ENSGT00390000009395 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155493 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000162611.a ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00940000157331 ENSGT00390000007081.b ENSGT00390000007081.a ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d.c.a ##22 ENSGT00390000015287.h 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(ENSOGAG00000001603) ENSOGAG00000025718 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000164312 ENSGT00940000156590 ENSGT00940000156981 ENSGT00940000162006 ENSGT00940000155715 ENSGT00940000158584 ENSGT00390000009395 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155493 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00940000157331 ENSGT00390000007081.b ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d.c.a ##22 ENSGT00390000015287.h ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00390000015820 ENSGT00530000063604.A ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 Mouse lemur MODERN SPECIES 6 TCTN3 (ENSMICG00000015970) ENTPD1 (ENSMICG00000001557) CC2D2B (ENSMICG00000010857) CCNJ (ENSMICG00000037344) BLNK (ENSMICG00000010724) DNTT (ENSMICG00000010732) OPALIN (ENSMICG00000010737) TLL2 (ENSMICG00000044745) TM9SF3 (ENSMICG00000010764) 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EXOSC1 (ENSTSYG00000000760) ZDHHC16 (ENSTSYG00000037429) MMS19 (ENSTSYG00000001157) UBTD1 (ENSTSYG00000033392) ANKRD2 (ENSTSYG00000028913) MORN4 (ENSTSYG00000033396) HOGA1 (ENSTSYG00000009082) AVPI1 (ENSTSYG00000027280) Simiiformes DUPLICATION Simiiformes DUPLICATION Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.a.g.a ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.a.g.a ##22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.a.g.a ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.a.g.a ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.a.g.a ##22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.a.g.a ##22 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.a.g.a ##22 Sooty mangabey MODERN SPECIES 542 DNAJC27 (ENSCATG00000029231) ENSCATG00000028816 ADCY3 (ENSCATG00000006719) CENPO (ENSCATG00000035791) PTRHD1 (ENSCATG00000033690) NCOA1 (ENSCATG00000035964) ITSN2 (ENSCATG00000017804) PFN4 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(ENSCSAG00000003465) SLC36A4 (ENSCSAG00000003469) MTNR1B (ENSCSAG00000003473) ENSCSAG00000003478 ##22 FAT3 (ENSCSAG00000003512) ENSCSAG00000000609 CHORDC1 (ENSCSAG00000003537) NAALAD2 (ENSCSAG00000003546) ENSCSAG00000003550 ENSCSAG00000003560 ENSCSAG00000003564 ENSCSAG00000003569 ENSCSAG00000003571 ENSCSAG00000003574 ENSCSAG00000003576 ENSCSAG00000003583 TRIM77 (ENSCSAG00000003587) FOLH1 (ENSCSAG00000003592) NOX4 (ENSCSAG00000003604) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.a.g.a ##22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.a.g.a ##22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES 46 ENSGT00940000157133 ENSGT00940000156549.a.a ENSGT00390000016702 ENSGT00500000044959 ENSGT00950000183021.b ENSGT00940000155936.b ENSGT00530000064185.b ENSGT00530000064185.a ENSGT00390000017067 ENSGT00940000161217 ENSGT00390000005908 ENSGT00940000153311.a.b.b ENSGT00390000001660 ENSGT00390000005318.b.b.a ENSGT00520000055567.a.b ENSGT00950000182926.b.d.c.a.g.a ##22 ENSGT00550000074694.b ENSGT00940000158824 ENSGT00590000083139 ENSGT00390000009688 ENSGT00940000160140.b ENSGT00390000013092 ENSGT00900000143745 ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b ENSGT00940000157575 ENSGT00940000161171 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000157581 ENSGT00940000155745 ENSGT00390000011905.n.a ENSGT00940000158993 Capuchin MODERN SPECIES 1 ADCY3 (ENSCCAG00000021802) CENPO (ENSCCAG00000026815) PTRHD1 (ENSCCAG00000033856) NCOA1 (ENSCCAG00000023754) ITSN2 (ENSCCAG00000006141) FAM228A (ENSCCAG00000029149) FAM228B (ENSCCAG00000033095) PFN4 (ENSCCAG00000028499) TP53I3 (ENSCCAG00000032310) SF3B6 (ENSCCAG00000036653) FKBP1B (ENSCCAG00000003872) WDCP (ENSCCAG00000035342) MFSD2B (ENSCCAG00000026318) UBXN2A (ENSCCAG00000025921) ENSCCAG00000021209 ENSCCAG00000025817 ##22 ATAD2B (ENSCCAG00000031116) KLHL29 (ENSCCAG00000036850) APOB (ENSCCAG00000021140) LDAH (ENSCCAG00000033829) GDF7 (ENSCCAG00000035529) HS1BP3 (ENSCCAG00000028038) RHOB (ENSCCAG00000018485) PUM2 (ENSCCAG00000037035) SDC1 (ENSCCAG00000031573) ENSCCAG00000019764 LAPTM4A (ENSCCAG00000029231) MATN3 (ENSCCAG00000033118) WDR35 (ENSCCAG00000030486) TTC32 (ENSCCAG00000025284) OSR1 (ENSCCAG00000029161) Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 113 ADCY3 (ENSSBOG00000022082) ENSSBOG00000007440 CENPO (ENSSBOG00000023221) PTRHD1 (ENSSBOG00000031751) NCOA1 (ENSSBOG00000030979) ITSN2 (ENSSBOG00000034128) FAM228B (ENSSBOG00000021849) PFN4 (ENSSBOG00000030872) ENSSBOG00000029308 TP53I3 (ENSSBOG00000036061) SF3B6 (ENSSBOG00000002914) FKBP1B (ENSSBOG00000020385) ENSSBOG00000029165 MFSD2B (ENSSBOG00000022320) UBXN2A (ENSSBOG00000023884) ENSSBOG00000031186 ##22 ATAD2B (ENSSBOG00000032583) KLHL29 (ENSSBOG00000021000) APOB (ENSSBOG00000008834) LDAH (ENSSBOG00000031409) GDF7 (ENSSBOG00000022327) HS1BP3 (ENSSBOG00000023433) ENSSBOG00000032320 RHOB (ENSSBOG00000013056) PUM2 (ENSSBOG00000022007) ENSSBOG00000029288 LAPTM4A (ENSSBOG00000031549) MATN3 (ENSSBOG00000027840) WDR35 (ENSSBOG00000030509) TTC32 (ENSSBOG00000024543) OSR1 (ENSSBOG00000023175) Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.a.g.b ##22 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.a.g.b ##22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.a.g.b ##22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.a.g.b ##22 Capuchin MODERN SPECIES 222 ENSCCAG00000016654 ANAPC1 (ENSCCAG00000024583) MERTK (ENSCCAG00000026739) TMEM87B (ENSCCAG00000031687) FBLN7 (ENSCCAG00000031423) ENSCCAG00000019771 ENSCCAG00000019984 ENSCCAG00000037584 TTL (ENSCCAG00000029632) POLR1B (ENSCCAG00000035252) CHCHD5 (ENSCCAG00000032057) SLC20A1 (ENSCCAG00000030266) CKAP2L (ENSCCAG00000002489) IL1A (ENSCCAG00000035876) IL1B (ENSCCAG00000029540) ENSCCAG00000022621 ##22 IL37 (ENSCCAG00000009572) IL36G (ENSCCAG00000028396) IL36A (ENSCCAG00000021339) ENSCCAG00000025542 IL36RN (ENSCCAG00000028001) IL1F10 (ENSCCAG00000024612) IL1RN (ENSCCAG00000035464) PSD4 (ENSCCAG00000016527) ENSCCAG00000037861 ENSCCAG00000007334 ENSCCAG00000004297 ENSCCAG00000004138 ENSCCAG00000012962 ENSCCAG00000037640 ENSCCAG00000000703 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000156981 ENSGT00940000162006 ENSGT00940000155715 ENSGT00940000158584 ENSGT00390000009395 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155493 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000162611.a ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00940000157331 ENSGT00390000007081.b ENSGT00390000007081.a ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d.c.a.h ##22 ENSGT00390000015287.h ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00390000015820 ENSGT00530000063604.A ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000156981 ENSGT00940000162006 ENSGT00940000155715 ENSGT00940000158584 ENSGT00390000009395 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155493 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000162611.a ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a 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ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00910000147157 Gibbon DUPLICATION Gibbon MODERN SPECIES 18 ENSNLEG00000034181 ADGRB3 (ENSNLEG00000000505) LMBRD1 (ENSNLEG00000000524) ENSNLEG00000034891 COL19A1 (ENSNLEG00000000613) COL9A1 (ENSNLEG00000000726) FAM135A (ENSNLEG00000000844) SDHAF4 (ENSNLEG00000036240) SMAP1 (ENSNLEG00000000922) B3GAT2 (ENSNLEG00000000971) OGFRL1 (ENSNLEG00000029017) ENSNLEG00000031051 RIMS1 (ENSNLEG00000001000) ENSNLEG00000033063 ENSNLEG00000028596 ENSNLEG00000031152 ##22 KCNQ5 (ENSNLEG00000001127) ENSNLEG00000001177 KHDC1L (ENSNLEG00000001179) ENSNLEG00000029407 ENSNLEG00000001183 DPPA5 (ENSNLEG00000001195) KHDC3L (ENSNLEG00000001200) OOEP (ENSNLEG00000001204) DDX43 (ENSNLEG00000001209) CGAS (ENSNLEG00000001281) MTO1 (ENSNLEG00000001308) ENSNLEG00000035164 SLC17A5 (ENSNLEG00000004778) CD109 (ENSNLEG00000004794) COL12A1 (ENSNLEG00000004898) Gibbon MODERN SPECIES 18 ENSNLEG00000036067 ENTPD1 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ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00910000147157 Gorilla DUPLICATION Gorilla MODERN SPECIES 19 ADGRB3 (ENSGGOG00000015587) LMBRD1 (ENSGGOG00000014341) ENSGGOG00000021992 ENSGGOG00000005906 COL9A1 (ENSGGOG00000010221) FAM135A (ENSGGOG00000004791) SDHAF4 (ENSGGOG00000037113) ENSGGOG00000040766 SMAP1 (ENSGGOG00000011243) B3GAT2 (ENSGGOG00000021933) OGFRL1 (ENSGGOG00000010724) RIMS1 (ENSGGOG00000003628) ENSGGOG00000040624 KCNQ5 (ENSGGOG00000011406) ENSGGOG00000038380 ENSGGOG00000038734 ##22 ENSGGOG00000043309 KHDC1L (ENSGGOG00000025471) ENSGGOG00000006894 ENSGGOG00000038983 ENSGGOG00000041551 DPPA5 (ENSGGOG00000012001) KHDC3L (ENSGGOG00000007778) OOEP (ENSGGOG00000016832) DDX43 (ENSGGOG00000016092) CGAS (ENSGGOG00000010774) ENSGGOG00000038471 ENSGGOG00000041490 ENSGGOG00000025675 SLC17A5 (ENSGGOG00000002667) CD109 (ENSGGOG00000004082) Gorilla MODERN SPECIES 3 CEP83 (ENSGGOG00000026256) ENSGGOG00000028247 ENSGGOG00000036546 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(ENSPTRG00000005317) CCDC38 (ENSPTRG00000005318) AMDHD1 (ENSPTRG00000005319) HAL (ENSPTRG00000005320) LTA4H (ENSPTRG00000005321) ELK3 (ENSPTRG00000005322) CDK17 (ENSPTRG00000005323) ENSPTRG00000046831 CFAP54 (ENSPTRG00000005326) NEDD1 (ENSPTRG00000005329) ENSPTRG00000039568 TMPO (ENSPTRG00000005331) SLC25A3 (ENSPTRG00000005333) ENSPTRG00000005334 APAF1 (ENSPTRG00000005335) Chimpanzee MODERN SPECIES 1 CCNJ (ENSPTRG00000002790) ZNF518A (ENSPTRG00000043182) BLNK (ENSPTRG00000002792) DNTT (ENSPTRG00000002793) OPALIN (ENSPTRG00000022887) TLL2 (ENSPTRG00000002795) TM9SF3 (ENSPTRG00000002797) PIK3AP1 (ENSPTRG00000002798) LCOR (ENSPTRG00000002801) ENSPTRG00000052704 SLIT1 (ENSPTRG00000033956) ARHGAP19 (ENSPTRG00000047078) FRAT1 (ENSPTRG00000051237) FRAT2 (ENSPTRG00000002805) RRP12 (ENSPTRG00000002806) PGAM1 (ENSPTRG00000002807) ##22 EXOSC1 (ENSPTRG00000002808) ZDHHC16 (ENSPTRG00000002809) MMS19 (ENSPTRG00000002810) UBTD1 (ENSPTRG00000002811) ANKRD2 (ENSPTRG00000002812) PI4K2A 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(ENSPPAG00000026527) CD109 (ENSPPAG00000029267) ENSPPAG00000043602 COL12A1 (ENSPPAG00000044050) Bonobo MODERN SPECIES 1 TCTN3 (ENSPPAG00000043730) ENTPD1 (ENSPPAG00000033911) ENSPPAG00000038503 CCNJ (ENSPPAG00000039585) BLNK (ENSPPAG00000040349) DNTT (ENSPPAG00000040802) ENSPPAG00000041321 TLL2 (ENSPPAG00000040475) TM9SF3 (ENSPPAG00000042084) PIK3AP1 (ENSPPAG00000042299) ENSPPAG00000001131 LCOR (ENSPPAG00000024948) SLIT1 (ENSPPAG00000023312) ARHGAP19 (ENSPPAG00000027208) RRP12 (ENSPPAG00000043885) PGAM1 (ENSPPAG00000028548) ##22 EXOSC1 (ENSPPAG00000039842) ZDHHC16 (ENSPPAG00000030292) MMS19 (ENSPPAG00000044031) UBTD1 (ENSPPAG00000041666) ANKRD2 (ENSPPAG00000034743) ENSPPAG00000025810 ENSPPAG00000030161 AVPI1 (ENSPPAG00000033222) ZFYVE27 (ENSPPAG00000029291) SFRP5 (ENSPPAG00000031585) GOLGA7B (ENSPPAG00000040315) CRTAC1 (ENSPPAG00000042754) ENSPPAG00000031192 R3HCC1L (ENSPPAG00000039950) LOXL4 (ENSPPAG00000030338) Bonobo MODERN SPECIES 18 ENSPPAG00000030177 ADAMTS12 (ENSPPAG00000037028) RXFP3 (ENSPPAG00000012921) SLC45A2 (ENSPPAG00000006580) AMACR (ENSPPAG00000043217) RAI14 (ENSPPAG00000039153) ENSPPAG00000033122 RAD1 (ENSPPAG00000028406) BRIX1 (ENSPPAG00000038183) DNAJC21 (ENSPPAG00000042627) AGXT2 (ENSPPAG00000035314) PRLR (ENSPPAG00000043899) ENSPPAG00000037233 IL7R (ENSPPAG00000039723) CAPSL (ENSPPAG00000019420) ENSPPAG00000004829 ##22 ENSPPAG00000040298 ENSPPAG00000039004 ENSPPAG00000031288 LMBRD2 (ENSPPAG00000029193) SKP2 (ENSPPAG00000026467) ENSPPAG00000036531 RANBP3L (ENSPPAG00000031849) SLC1A3 (ENSPPAG00000032856) NIPBL (ENSPPAG00000038200) ENSPPAG00000039740 ENSPPAG00000032480 CPLANE1 (ENSPPAG00000036782) NUP155 (ENSPPAG00000043867) ENSPPAG00000000687 ENSPPAG00000030132 Cercopithecidae DUPLICATION Cercopithecidae DUPLICATION Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.a.h.l.a ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.a.h.l.a ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000154368.l ENSGT00940000156675 ENSGT00390000017639 ENSGT00940000155309.f ENSGT00940000154445.e.a ENSGT00940000155109.b ENSGT00440000039001 ENSGT00940000156276 ENSGT00940000155426.t ENSGT00390000014563.a.b ENSGT00950000183033.a.a.d ENSGT00940000154185.l.a.b ENSGT00940000156416 ENSGT01030000235256 ENSGT00390000013594 ENSGT00950000182926.b.d.c.a.h.l.a ##22 ENSGT00940000154939 ENSGT00940000153335.a.b.y.a ENSGT00940000159995 ENSGT00390000014794.b ENSGT00390000004181 ENSGT00940000161078 ENSGT00940000157470 ENSGT00530000063713.a ENSGT00510000055172 ENSGT00390000014082.b ENSGT00940000158394 ENSGT00390000000984.t.a ENSGT00940000158210 ENSGT00950000182810.B.a.x.b.b ENSGT00940000158794 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00910000147615 ENSGT00940000154368.l ENSGT00940000156675 ENSGT00390000017639 ENSGT00940000155309.f ENSGT00940000154445.e.a ENSGT00940000155109.b ENSGT00440000039001 ENSGT00940000156276 ENSGT00390000014563.a.b ENSGT00950000183033.a.a.d ENSGT00940000154185.l.a.b ENSGT00940000156416 ENSGT01030000235256 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ENSGT00390000014082.b ENSGT00940000158394 ENSGT00390000000984.t.b ENSGT00940000165721 ENSGT00940000158210 ENSGT00950000182810.B.a.x.b.b Sooty mangabey MODERN SPECIES 595 PCDH15 (ENSCATG00000044325) ZWINT (ENSCATG00000044437) ENSCATG00000022893 IPMK (ENSCATG00000026842) CISD1 (ENSCATG00000030948) UBE2D1 (ENSCATG00000006141) TFAM (ENSCATG00000027920) BICC1 (ENSCATG00000016603) ENSCATG00000030400 PHYHIPL (ENSCATG00000037368) FAM13C (ENSCATG00000032373) ENSCATG00000034993 SLC16A9 (ENSCATG00000013976) CCDC6 (ENSCATG00000033448) ENSCATG00000045201 ##22 ANK3 (ENSCATG00000039015) ENSCATG00000038329 RHOBTB1 (ENSCATG00000042026) TMEM26 (ENSCATG00000043914) CABCOCO1 (ENSCATG00000014612) ARID5B (ENSCATG00000035614) RTKN2 (ENSCATG00000043432) ZNF365 (ENSCATG00000030610) ENSCATG00000036398 ADO (ENSCATG00000016498) EGR2 (ENSCATG00000036150) ENSCATG00000033855 ENSCATG00000030709 ENSCATG00000033326 JMJD1C (ENSCATG00000040124) Macaca ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000154368.l ENSGT00940000156675 ENSGT00390000017639 ENSGT00940000155309.f ENSGT00940000154445.e.a ENSGT00940000155109.b ENSGT00440000039001 ENSGT00940000156276 ENSGT00940000155426.t ENSGT00390000014563.a.b ENSGT00950000183033.a.a.d ENSGT00940000154185.l.a.b ENSGT00940000156416 ENSGT01030000235256 ENSGT00390000013594 ENSGT00950000182926.b.d.c.a.h.l.a ##22 ENSGT00940000154939 ENSGT00940000153335.a.b.y.a ENSGT00940000159995 ENSGT00390000014794.b ENSGT00390000004181 ENSGT00940000161078 ENSGT00940000157470 ENSGT00530000063713.a ENSGT00510000055172 ENSGT00390000014082.b ENSGT00940000158394 ENSGT00390000000984.t.a ENSGT00940000158210 ENSGT00950000182810.B.a.x.b.b ENSGT00940000158794 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 353 IPMK (ENSMNEG00000033112) CISD1 (ENSMNEG00000039390) UBE2D1 (ENSMNEG00000040023) TFAM (ENSMNEG00000030206) BICC1 (ENSMNEG00000009601) ENSMNEG00000030319 PHYHIPL (ENSMNEG00000035222) FAM13C (ENSMNEG00000044679) ENSMNEG00000031580 SLC16A9 (ENSMNEG00000029664) MRLN (ENSMNEG00000014934) CCDC6 (ENSMNEG00000030697) ENSMNEG00000029490 ##22 ENSMNEG00000044750 ANK3 (ENSMNEG00000034594) CDK1 (ENSMNEG00000043947) RHOBTB1 (ENSMNEG00000042613) TMEM26 (ENSMNEG00000038130) CABCOCO1 (ENSMNEG00000031430) ARID5B (ENSMNEG00000041462) RTKN2 (ENSMNEG00000044923) ZNF365 (ENSMNEG00000030489) ENSMNEG00000033048 ADO (ENSMNEG00000028166) EGR2 (ENSMNEG00000042085) NRBF2 (ENSMNEG00000025366) ENSMNEG00000043648 ENSMNEG00000029188 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.a.h.l.b ##22 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.a.h.l.b ##22 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 3294 ENSRBIG00000037169 ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.a.h.l.b ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.a.h.l.b ##22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.a.h.l.b ##22 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.a.h.l.b ##22 Sooty mangabey MODERN SPECIES 406 PLXNC1 (ENSCATG00000044596) CEP83 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ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 ENSGT00530000063711.b ENSGT00940000157042 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 78 ZNF518A (ENSRBIG00000029224) BLNK (ENSRBIG00000044422) DNTT (ENSRBIG00000044322) OPALIN (ENSRBIG00000036919) TLL2 (ENSRBIG00000030223) TM9SF3 (ENSRBIG00000010642) PIK3AP1 (ENSRBIG00000037363) LCOR (ENSRBIG00000000077) SLIT1 (ENSRBIG00000040022) ARHGAP19 (ENSRBIG00000036845) FRAT1 (ENSRBIG00000042677) RRP12 (ENSRBIG00000021296) PGAM1 (ENSRBIG00000026513) ##22 EXOSC1 (ENSRBIG00000035618) ZDHHC16 (ENSRBIG00000027779) MMS19 (ENSRBIG00000036026) UBTD1 (ENSRBIG00000044391) ANKRD2 (ENSRBIG00000039282) PI4K2A (ENSRBIG00000037559) MORN4 (ENSRBIG00000017424) AVPI1 (ENSRBIG00000028956) ZFYVE27 (ENSRBIG00000031505) SFRP5 (ENSRBIG00000033947) GOLGA7B (ENSRBIG00000035613) CRTAC1 (ENSRBIG00000032795) R3HCC1L (ENSRBIG00000031918) LOXL4 (ENSRBIG00000029695) PYROXD2 (ENSRBIG00000029292) Golden snub-nosed monkey DUPLICATION Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2749 ENSRROG00000026745 CCNJ (ENSRROG00000001051) ZNF518A (ENSRROG00000022511) BLNK (ENSRROG00000030371) DNTT (ENSRROG00000043651) OPALIN (ENSRROG00000036213) TLL2 (ENSRROG00000011825) TM9SF3 (ENSRROG00000038774) PIK3AP1 (ENSRROG00000033166) LCOR (ENSRROG00000041759) SLIT1 (ENSRROG00000042977) ARHGAP19 (ENSRROG00000033746) FRAT1 (ENSRROG00000028813) FRAT2 (ENSRROG00000004277) RRP12 (ENSRROG00000032482) PGAM1 (ENSRROG00000039757) ##22 EXOSC1 (ENSRROG00000032589) ZDHHC16 (ENSRROG00000028529) MMS19 (ENSRROG00000039896) UBTD1 (ENSRROG00000041721) ANKRD2 (ENSRROG00000036593) MORN4 (ENSRROG00000044980) PI4K2A (ENSRROG00000040937) AVPI1 (ENSRROG00000042798) MARVELD1 (ENSRROG00000032671) ZFYVE27 (ENSRROG00000036164) SFRP5 (ENSRROG00000030455) GOLGA7B (ENSRROG00000029385) CRTAC1 (ENSRROG00000044890) R3HCC1L (ENSRROG00000029245) LOXL4 (ENSRROG00000023283) Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 3070 ENSRROG00000044897 ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 15 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SPECIES 12 ORC6 (ENSMFAG00000005502) VPS35 (ENSMFAG00000049538) SHCBP1 (ENSMFAG00000036653) ENSMFAG00000065442 ENSMFAG00000005730 ENSMFAG00000049007 ENSMFAG00000052873 ENSMFAG00000001393 ENSMFAG00000041373 ENSMFAG00000064182 ENSMFAG00000034226 ENSMFAG00000051119 ENSMFAG00000058077 ZNF267 (ENSMFAG00000024474) ENSMFAG00000055709 ENSMFAG00000050567 ##22 ENSMFAG00000047326 ENSMFAG00000045574 AHSP (ENSMFAG00000044875) RUSF1 (ENSMFAG00000032375) SLC5A2 (ENSMFAG00000002366) TGFB1I1 (ENSMFAG00000041546) ARMC5 (ENSMFAG00000043898) COX6A2 (ENSMFAG00000042019) ITGAX (ENSMFAG00000032646) ITGAM (ENSMFAG00000031182) PYDC1 (ENSMFAG00000030032) TRIM72 (ENSMFAG00000035762) PYCARD (ENSMFAG00000033296) FUS (ENSMFAG00000031794) ENSMFAG00000063406 Crab-eating macaque MODERN SPECIES ENSMFAG00000060456 BRINP3 (ENSMFAG00000045708) SKP1 (ENSMFAG00000052365) RGS18 (ENSMFAG00000059808) RGS21 (ENSMFAG00000060899) RGS1 (ENSMFAG00000036716) RGS13 (ENSMFAG00000033037) RGS2 (ENSMFAG00000033433) UCHL5 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SPECIES 14 ENSGT01100000263542.C ENSGT00940000164312 ENSGT00940000156590 ENSGT00940000156981 ENSGT00940000162006 ENSGT00940000155715 ENSGT00940000158584 ENSGT00390000009395 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155493 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00940000157331 ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d.c.a.h ##22 ENSGT00390000015287.h ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00530000063604.A ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 ENSGT00530000063711.b Mas night monkey MODERN SPECIES 658 ENSANAG00000037354 ZNF518A (ENSANAG00000037819) BLNK (ENSANAG00000027173) DNTT (ENSANAG00000037070) OPALIN (ENSANAG00000038093) TLL2 (ENSANAG00000037945) TM9SF3 (ENSANAG00000028656) PIK3AP1 (ENSANAG00000008972) ENSANAG00000033782 LCOR (ENSANAG00000033126) ENSANAG00000037982 SLIT1 (ENSANAG00000033563) ENSANAG00000021580 ARHGAP19 (ENSANAG00000003403) RRP12 (ENSANAG00000037485) PGAM1 (ENSANAG00000023598) ##22 EXOSC1 (ENSANAG00000034669) ZDHHC16 (ENSANAG00000032609) MMS19 (ENSANAG00000023237) UBTD1 (ENSANAG00000035205) ANKRD2 (ENSANAG00000038359) PI4K2A (ENSANAG00000019727) MORN4 (ENSANAG00000023217) AVPI1 (ENSANAG00000029881) MARVELD1 (ENSANAG00000031120) ZFYVE27 (ENSANAG00000038112) SFRP5 (ENSANAG00000020345) GOLGA7B (ENSANAG00000026383) CRTAC1 (ENSANAG00000035892) R3HCC1L (ENSANAG00000035504) LOXL4 (ENSANAG00000028977) Cebidae ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00570000079101.a.a ENSGT01100000263542.C ENSGT00940000156590 ENSGT00940000156981 ENSGT00940000162006 ENSGT00940000155715 ENSGT00940000158584 ENSGT00390000009395 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155493 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00940000157331 ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d.c.a.h ##22 ENSGT00390000015287.h ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 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MODERN SPECIES 90 BICDL1 (ENSSBOG00000020926) CIT (ENSSBOG00000033965) ENSSBOG00000024739 PRKAB1 (ENSSBOG00000030942) TMEM233 (ENSSBOG00000023158) CCDC60 (ENSSBOG00000027014) HSPB8 (ENSSBOG00000022568) SRRM4 (ENSSBOG00000035310) ENSSBOG00000036079 SUDS3 (ENSSBOG00000034907) TAOK3 (ENSSBOG00000032744) PEBP1 (ENSSBOG00000025736) VSIG10 (ENSSBOG00000036249) WSB2 (ENSSBOG00000025618) RFC5 (ENSSBOG00000030812) ENSSBOG00000026256 ##22 KSR2 (ENSSBOG00000033625) NOS1 (ENSSBOG00000009305) FBXO21 (ENSSBOG00000030663) TESC (ENSSBOG00000027843) FBXW8 (ENSSBOG00000026849) RNFT2 (ENSSBOG00000027445) SPRING1 (ENSSBOG00000027268) MED13L (ENSSBOG00000029205) TBX3 (ENSSBOG00000029505) TBX5 (ENSSBOG00000025834) ENSSBOG00000021434 LHX5 (ENSSBOG00000029868) SDSL (ENSSBOG00000033491) SDS (ENSSBOG00000029121) PLBD2 (ENSSBOG00000013245) Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 47 TCTN3 (ENSSBOG00000033268) ENTPD1 (ENSSBOG00000020994) CC2D2B (ENSSBOG00000034706) CCNJ (ENSSBOG00000014297) BLNK 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ENSCPOG00000034213 TLL2 (ENSCPOG00000000539) TM9SF3 (ENSCPOG00000002320) PIK3AP1 (ENSCPOG00000012888) ENSCPOG00000005739 LCOR (ENSCPOG00000035033) SLIT1 (ENSCPOG00000005743) ARHGAP19 (ENSCPOG00000021474) FRAT2 (ENSCPOG00000000139) RRP12 (ENSCPOG00000004215) PGAM1 (ENSCPOG00000034665) ##22 EXOSC1 (ENSCPOG00000001173) ZDHHC16 (ENSCPOG00000006710) MMS19 (ENSCPOG00000006715) UBTD1 (ENSCPOG00000033582) ANKRD2 (ENSCPOG00000035324) HOGA1 (ENSCPOG00000004555) C10orf62 (ENSCPOG00000033899) MORN4 (ENSCPOG00000031641) PI4K2A (ENSCPOG00000004558) AVPI1 (ENSCPOG00000024508) MARVELD1 (ENSCPOG00000024434) ENSCPOG00000013283 SFRP5 (ENSCPOG00000021880) GOLGA7B (ENSCPOG00000031966) CRTAC1 (ENSCPOG00000007832) Sciuridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.a.i.a ##22 Marmotini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.a.i.a ##22 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.a.i.a ##22 Squirrel MODERN SPECIES 236 CC2D2B (ENSSTOG00000005628) CCNJ (ENSSTOG00000005634) ZNF518A (ENSSTOG00000021018) BLNK (ENSSTOG00000012711) DNTT (ENSSTOG00000012729) OPALIN (ENSSTOG00000012748) TLL2 (ENSSTOG00000002746) TM9SF3 (ENSSTOG00000002762) PIK3AP1 (ENSSTOG00000002786) LCOR (ENSSTOG00000010811) SLIT1 (ENSSTOG00000010816) ARHGAP19 (ENSSTOG00000019537) FRAT1 (ENSSTOG00000009543) FRAT2 (ENSSTOG00000023988) RRP12 (ENSSTOG00000006515) PGAM1 (ENSSTOG00000025955) ##22 EXOSC1 (ENSSTOG00000006615) ZDHHC16 (ENSSTOG00000006627) MMS19 (ENSSTOG00000006641) UBTD1 (ENSSTOG00000006700) ANKRD2 (ENSSTOG00000006701) ENSSTOG00000020441 HOGA1 (ENSSTOG00000011929) MORN4 (ENSSTOG00000026926) PI4K2A (ENSSTOG00000006737) AVPI1 (ENSSTOG00000029293) MARVELD1 (ENSSTOG00000006756) ZFYVE27 (ENSSTOG00000012103) SFRP5 (ENSSTOG00000012113) GOLGA7B (ENSSTOG00000012116) CRTAC1 (ENSSTOG00000012122) Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.a.i.b ##22 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.a.i.b ##22 Marmotini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.a.i.b ##22 Alpin marmot MODERN SPECIES 39 ENSMMMG00000021357 ZNF518A (ENSMMMG00000021365) BLNK (ENSMMMG00000021371) DNTT (ENSMMMG00000021389) OPALIN (ENSMMMG00000021401) TLL2 (ENSMMMG00000021409) ENSMMMG00000021418 PIK3AP1 (ENSMMMG00000021426) ENSMMMG00000021445 ENSMMMG00000021452 LCOR (ENSMMMG00000021462) SLIT1 (ENSMMMG00000021470) ARHGAP19 (ENSMMMG00000021533) FRAT2 (ENSMMMG00000021560) RRP12 (ENSMMMG00000021563) PGAM1 (ENSMMMG00000021588) ##22 EXOSC1 (ENSMMMG00000021593) ZDHHC16 (ENSMMMG00000021606) MMS19 (ENSMMMG00000021617) UBTD1 (ENSMMMG00000021672) ANKRD2 (ENSMMMG00000021677) HOGA1 (ENSMMMG00000021688) C10orf62 (ENSMMMG00000021691) ENSMMMG00000021693 PI4K2A (ENSMMMG00000021697) AVPI1 (ENSMMMG00000021725) ZFYVE27 (ENSMMMG00000021729) SFRP5 (ENSMMMG00000021743) GOLGA7B (ENSMMMG00000021751) CRTAC1 (ENSMMMG00000021757) R3HCC1L (ENSMMMG00000021780) Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.a.i.b ##22 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 20 NECTIN4 (ENSHGLG00000010781) ARHGAP30 (ENSHGLG00000006495) USF1 (ENSHGLG00000012402) TSTD1 (ENSHGLG00000035841) ENSHGLG00000038623 ENSHGLG00000015520 ENSHGLG00000048048 ENSHGLG00000049342 CD244 (ENSHGLG00000016536) ENSHGLG00000046741 CD48 (ENSHGLG00000016645) SLAMF1 (ENSHGLG00000013870) ENSHGLG00000036722 CD84 (ENSHGLG00000018167) ENSHGLG00000040731 ENSHGLG00000044874 ##22 VANGL2 (ENSHGLG00000015020) NHLH1 (ENSHGLG00000020397) NCSTN (ENSHGLG00000007191) COPA (ENSHGLG00000011307) PEX19 (ENSHGLG00000006365) DCAF8 (ENSHGLG00000009593) PEA15 (ENSHGLG00000049375) CASQ1 (ENSHGLG00000036911) ATP1A4 (ENSHGLG00000018340) ATP1A2 (ENSHGLG00000015210) IGSF8 (ENSHGLG00000017599) KCNJ9 (ENSHGLG00000015357) KCNJ10 (ENSHGLG00000035959) PIGM (ENSHGLG00000020908) SLAMF9 (ENSHGLG00000014754) Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000156981 ENSGT00940000162006 ENSGT00940000155715 ENSGT00940000158584 ENSGT00390000009395 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155493 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000162611.a ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00940000157331 ENSGT00390000007081.b ENSGT00390000007081.a ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d.c.a.j ##22 ENSGT00390000015287.h ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00530000063604.A ENSGT00390000015820 ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000156981 ENSGT00940000162006 ENSGT00940000155715 ENSGT00940000158584 ENSGT00390000009395 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155493 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000162611.a ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00940000157331 ENSGT00390000007081.b ENSGT00390000007081.a ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d.c.a.j ##22 ENSGT00390000015287.h ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00530000063604.A ENSGT00390000015820 ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 Marmotini ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000156981 ENSGT00940000162006 ENSGT00940000155715 ENSGT00940000158584 ENSGT00390000009395 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155493 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000162611.a ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00940000157331 ENSGT00390000007081.b ENSGT00390000007081.a ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d.c.a.j ##22 ENSGT00390000015287.h.g.a ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00530000063604.A ENSGT00390000015820 ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 97 ENSGT00940000156590 ENSGT00940000156981 ENSGT00940000162006 ENSGT00940000155715 ENSGT00940000158584 ENSGT00390000009395 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(ENSUPAG00010014455) ##22 ENSUPAG00010014471 ZDHHC16 (ENSUPAG00010014509) MMS19 (ENSUPAG00010014546) UBTD1 (ENSUPAG00010014630) ANKRD2 (ENSUPAG00010014650) HOGA1 (ENSUPAG00010014672) ENSUPAG00010014696 MORN4 (ENSUPAG00010014704) PI4K2A (ENSUPAG00010014721) AVPI1 (ENSUPAG00010014745) MARVELD1 (ENSUPAG00010014753) ZFYVE27 (ENSUPAG00010014758) SFRP5 (ENSUPAG00010014793) GOLGA7B (ENSUPAG00010014804) CRTAC1 (ENSUPAG00010014843) Eurasian red squirrel DUPLICATION Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 13 BLNK (ENSSVLG00005021548) DNTT (ENSSVLG00005021305) OPALIN (ENSSVLG00005021033) TLL2 (ENSSVLG00005020186) TM9SF3 (ENSSVLG00005019967) PIK3AP1 (ENSSVLG00005019678) ENSSVLG00005019543 ENSSVLG00005019472 LCOR (ENSSVLG00005019384) SLIT1 (ENSSVLG00005018555) ENSSVLG00005018513 ARHGAP19 (ENSSVLG00005018106) FRAT1 (ENSSVLG00005018038) ENSSVLG00005018017 RRP12 (ENSSVLG00005017893) PGAM1 (ENSSVLG00005017816) ##22 EXOSC1 (ENSSVLG00005017650) ZDHHC16 (ENSSVLG00005017379) MMS19 (ENSSVLG00005017214) ANKRD2 (ENSSVLG00005016694) C10orf62 (ENSSVLG00005016610) HOGA1 (ENSSVLG00005016513) MORN4 (ENSSVLG00005016417) PI4K2A (ENSSVLG00005016376) AVPI1 (ENSSVLG00005016336) MARVELD1 (ENSSVLG00005016317) ZFYVE27 (ENSSVLG00005015995) SFRP5 (ENSSVLG00005015909) GOLGA7B (ENSSVLG00005015799) CRTAC1 (ENSSVLG00005015382) R3HCC1L (ENSSVLG00005015247) Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 14 ABCC9 (ENSSVLG00005022831) CMAS (ENSSVLG00005010853) ENSSVLG00005010892 ST8SIA1 (ENSSVLG00005010944) C2CD5 (ENSSVLG00005011062) ETNK1 (ENSSVLG00005011233) ENSSVLG00005011366 SOX5 (ENSSVLG00005011483) BCAT1 (ENSSVLG00005012012) ENSSVLG00005012187 DNAI7 (ENSSVLG00005012568) ETFRF1 (ENSSVLG00005013055) KRAS (ENSSVLG00005013177) LMNTD1 (ENSSVLG00005013266) RASSF8 (ENSSVLG00005013368) ENSSVLG00005013521 ##22 BHLHE41 (ENSSVLG00005013568) SSPN (ENSSVLG00005013638) ITPR2 (ENSSVLG00005014004) INTS13 (ENSSVLG00005014650) FGFR1OP2 (ENSSVLG00005014699) ENSSVLG00005014788 TM7SF3 (ENSSVLG00005014809) MED21 (ENSSVLG00005014838) STK38L (ENSSVLG00005014875) BMAL2 (ENSSVLG00005015014) SMCO2 (ENSSVLG00005015897) ENSSVLG00005016025 ENSSVLG00005016042 PPFIBP1 (ENSSVLG00005016094) REP15 (ENSSVLG00005016211) Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.a.j ##22 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 18 LRRC74A (ENSHGLG00000013955) ANGEL1 (ENSHGLG00000019080) VASH1 (ENSHGLG00000014181) ENSHGLG00000009813 ESRRB (ENSHGLG00000007373) GPATCH2L (ENSHGLG00000011249) IFT43 (ENSHGLG00000006159) TGFB3 (ENSHGLG00000041469) ENSHGLG00000009260 ERG28 (ENSHGLG00000035965) FLVCR2 (ENSHGLG00000012149) BATF (ENSHGLG00000009995) ENSHGLG00000032847 ENSHGLG00000034007 JDP2 (ENSHGLG00000046590) ENSHGLG00000012043 ##22 Fos (ENSHGLG00000009642) TMED10 (ENSHGLG00000009862) ENSHGLG00000011281 ZC2HC1C (ENSHGLG00000012165) ENSHGLG00000014222 ENSHGLG00000040406 MLH3 (ENSHGLG00000015005) EIF2B2 (ENSHGLG00000016520) ENSHGLG00000050804 ENSHGLG00000018678 ENSHGLG00000013243 RPS6KL1 (ENSHGLG00000013483) DLST (ENSHGLG00000009814) PROX2 (ENSHGLG00000011710) ENSHGLG00000046547 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000156590 ENSGT00940000156981 ENSGT00940000162006 ENSGT00940000155715 ENSGT00940000158584 ENSGT00390000009395 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155493 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000162611.a ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00940000157331 ENSGT00390000007081.a ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d.c.a.j ##22 ENSGT00390000015287.h ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00530000063604.A ENSGT00390000015820 ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000156590 ENSGT00940000156981 ENSGT00940000162006 ENSGT00940000155715 ENSGT00940000158584 ENSGT00390000009395 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155493 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000162611.a ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00940000157331 ENSGT00390000007081.a ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d.c.a.j ##22 ENSGT00390000015287.h ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00530000063604.A ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 ENSGT00530000063711.b Long-tailed chinchilla DUPLICATION Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 214 ENTPD1 (ENSCLAG00000002693) CC2D2B (ENSCLAG00000002936) CCNJ (ENSCLAG00000003191) ENSCLAG00000004870 ZNF518A (ENSCLAG00000017653) BLNK (ENSCLAG00000005498) DNTT (ENSCLAG00000006186) OPALIN (ENSCLAG00000006654) TLL2 (ENSCLAG00000007122) TM9SF3 (ENSCLAG00000002078) PIK3AP1 (ENSCLAG00000002443) LCOR (ENSCLAG00000008402) SLIT1 (ENSCLAG00000009153) ARHGAP19 (ENSCLAG00000002574) RRP12 (ENSCLAG00000003753) ENSCLAG00000002369 ##22 EXOSC1 (ENSCLAG00000002463) ZDHHC16 (ENSCLAG00000002570) MMS19 (ENSCLAG00000002928) UBTD1 (ENSCLAG00000002195) ANKRD2 (ENSCLAG00000002245) HOGA1 (ENSCLAG00000002513) MORN4 (ENSCLAG00000001852) PI4K2A (ENSCLAG00000001867) AVPI1 (ENSCLAG00000001993) MARVELD1 (ENSCLAG00000002008) ZFYVE27 (ENSCLAG00000002084) SFRP5 (ENSCLAG00000002118) GOLGA7B (ENSCLAG00000002560) CRTAC1 (ENSCLAG00000002601) R3HCC1L (ENSCLAG00000002695) Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 169 NME7 (ENSCLAG00000007842) ATP1B1 (ENSCLAG00000009477) DPT (ENSCLAG00000005439) ENSCLAG00000005901 TBX19 (ENSCLAG00000006520) SFT2D2 (ENSCLAG00000007183) ENSCLAG00000004496 GPR161 (ENSCLAG00000005310) DCAF6 (ENSCLAG00000005742) ENSCLAG00000004770 ADCY10 (ENSCLAG00000005189) RCSD1 (ENSCLAG00000004726) CREG1 (ENSCLAG00000005740) CD247 (ENSCLAG00000005425) POU2F1 (ENSCLAG00000005927) ENSCLAG00000005067 ##22 STYXL2 (ENSCLAG00000006188) ENSCLAG00000017324 MAEL (ENSCLAG00000006862) ILDR2 (ENSCLAG00000008045) ENSCLAG00000008737 TADA1 (ENSCLAG00000009819) POGK (ENSCLAG00000004943) ENSCLAG00000008264 FAM78B (ENSCLAG00000009778) UCK2 (ENSCLAG00000010692) ENSCLAG00000004400 TMCO1 (ENSCLAG00000004923) ENSCLAG00000006096 MGST3 (ENSCLAG00000007690) LRRC52 (ENSCLAG00000006632) Degu DUPLICATION Degu DUPLICATION Degu MODERN SPECIES 296 ENSODEG00000000552 ENSODEG00000000567 ENSODEG00000000580 ENSODEG00000000592 ENSODEG00000018618 ENSODEG00000000602 ##22 ENSODEG00000018667 ENSODEG00000001156 ENSODEG00000018765 ENSODEG00000001186 ENSODEG00000001196 ENSODEG00000001234 ENSODEG00000001248 ENSODEG00000001317 ENSODEG00000018656 ENSODEG00000001352 ENSODEG00000018550 Degu MODERN SPECIES 261 ENSODEG00000014860 ENSODEG00000019926 ARL5B (ENSODEG00000013924) NSUN6 (ENSODEG00000010093) ENSODEG00000011487 ##22 CACNB2 (ENSODEG00000009971) SLC39A12 (ENSODEG00000010075) MRC1 (ENSODEG00000010406) TMEM236 (ENSODEG00000013808) ENSODEG00000010216 HACD1 (ENSODEG00000012161) ST8SIA6 (ENSODEG00000010495) ENSODEG00000011037 ENSODEG00000009896 ENSODEG00000009660 CUBN (ENSODEG00000010405) RSU1 (ENSODEG00000009946) C1QL3 (ENSODEG00000010477) PTER (ENSODEG00000010317) ENSODEG00000010031 Degu MODERN SPECIES 157 ENSODEG00000007553 ENSODEG00000006646 ENSODEG00000007386 ENSODEG00000008496 ENSODEG00000007187 CFAP126 (ENSODEG00000006839) SDHC (ENSODEG00000008215) MPZ (ENSODEG00000008395) PCP4L1 (ENSODEG00000008404) NR1I3 (ENSODEG00000008562) TOMM40L (ENSODEG00000006761) APOA2 (ENSODEG00000007021) FCER1G (ENSODEG00000007489) NDUFS2 (ENSODEG00000007813) ADAMTS4 (ENSODEG00000011124) ENSODEG00000008124 ##22 B4GALT3 (ENSODEG00000008462) PPOX (ENSODEG00000007017) USP21 (ENSODEG00000010632) UFC1 (ENSODEG00000008078) DEDD (ENSODEG00000008446) NIT1 (ENSODEG00000008755) PFDN2 (ENSODEG00000007888) ENSODEG00000007376 KLHDC9 (ENSODEG00000008140) NECTIN4 (ENSODEG00000009227) ENSODEG00000012487 ENSODEG00000012848 TSTD1 (ENSODEG00000010923) ENSODEG00000008881 F11R (ENSODEG00000007564) Degu MODERN SPECIES 51 DNAH5 (ENSODEG00000015643) ENSODEG00000015511 CEP55 (ENSODEG00000015163) FFAR4 (ENSODEG00000016129) RBP4 (ENSODEG00000015640) PDE6C (ENSODEG00000015159) FRA10AC1 (ENSODEG00000016002) ENSODEG00000014890 LGI1 (ENSODEG00000015911) ENSODEG00000015909 SLC35G1 (ENSODEG00000016132) ENSODEG00000015694 ##22 PLCE1 (ENSODEG00000016086) NOC3L (ENSODEG00000015822) ENSODEG00000015684 ENSODEG00000015179 HELLS (ENSODEG00000015916) CYP2C18 (ENSODEG00000015439) ENSODEG00000020373 ENSODEG00000015492 ENSODEG00000015808 ENSODEG00000015364 SORBS1 (ENSODEG00000015885) ENSODEG00000015731 ALDH18A1 (ENSODEG00000015796) TCTN3 (ENSODEG00000015591) ENTPD1 (ENSODEG00000017035) Degu MODERN SPECIES 356 SLC6A9 (ENSODEG00000001483) CCDC24 (ENSODEG00000001255) B4GALT2 (ENSODEG00000002805) ATP6V0B (ENSODEG00000002795) DPH2 (ENSODEG00000002604) IPO13 (ENSODEG00000002581) ARTN (ENSODEG00000002533) ST3GAL3 (ENSODEG00000002472) ENSODEG00000002231 ##22 KDM4A (ENSODEG00000002177) PTPRF (ENSODEG00000003593) HYI (ENSODEG00000003277) SZT2 (ENSODEG00000002541) MED8 (ENSODEG00000002395) ELOVL1 (ENSODEG00000002280) CDC20 (ENSODEG00000002247) MPL (ENSODEG00000002358) TIE1 (ENSODEG00000002098) C1orf210 (ENSODEG00000002000) TMEM125 (ENSODEG00000018817) CFAP57 (ENSODEG00000001921) EBNA1BP2 (ENSODEG00000001868) ENSODEG00000018750 ENSODEG00000001842 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.a ##22 Kangaroo rat MODERN SPECIES 355 Cc2d2b (ENSDORG00000028246) Ccnj (ENSDORG00000008265) Zfp518a (ENSDORG00000025759) Blnk (ENSDORG00000008045) Dntt (ENSDORG00000008047) Opalin (ENSDORG00000008050) Tll2 (ENSDORG00000008052) Tm9sf3 (ENSDORG00000008053) Pik3ap1 (ENSDORG00000003681) ENSDORG00000029222 ENSDORG00000026699 Slit1 (ENSDORG00000015380) Arhgap19 (ENSDORG00000012582) ENSDORG00000030156 Rrp12 (ENSDORG00000009199) Pgam1 (ENSDORG00000027733) ##22 Exosc1 (ENSDORG00000016528) Zdhhc16 (ENSDORG00000016530) Mms19 (ENSDORG00000016531) Ubtd1 (ENSDORG00000029750) Ankrd2 (ENSDORG00000016536) Hoga1 (ENSDORG00000016537) Morn4 (ENSDORG00000016540) Pi4k2a (ENSDORG00000002269) Avpi1 (ENSDORG00000028399) Marveld1 (ENSDORG00000002279) Zfyve27 (ENSDORG00000008178) Sfrp5 (ENSDORG00000008180) Golga7b (ENSDORG00000015475) Crtac1 (ENSDORG00000015477) ENSDORG00000024055 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.a ##22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.a ##22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.a ##22 Cricetidae DUPLICATION Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.a.k ##22 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.a.k ##22 Prairie vole MODERN SPECIES 82 Lmntd1 (ENSMOCG00000008486) Kras (ENSMOCG00000011313) Etfrf1 (ENSMOCG00000000926) Casc1 (ENSMOCG00000010336) Irag2 (ENSMOCG00000001897) Bcat1 (ENSMOCG00000018342) Sox5 (ENSMOCG00000003982) Etnk1 (ENSMOCG00000015568) C2cd5 (ENSMOCG00000005597) St8sia1 (ENSMOCG00000020160) Sult6b2 (ENSMOCG00000001915) Cmas (ENSMOCG00000021041) Abcc9 (ENSMOCG00000018016) Kcnj8 (ENSMOCG00000000081) Ldhb (ENSMOCG00000001380) ENSMOCG00000016666 ##22 Gys2 (ENSMOCG00000000198) Spx (ENSMOCG00000006172) Golt1b (ENSMOCG00000019088) Recql (ENSMOCG00000007093) Pyroxd1 (ENSMOCG00000002670) Iapp (ENSMOCG00000012346) ENSMOCG00000020797 ENSMOCG00000012882 ENSMOCG00000015685 ENSMOCG00000003164 Slco1b2 (ENSMOCG00000009708) Slco1c1 (ENSMOCG00000014209) Pde3a (ENSMOCG00000005904) ENSMOCG00000007837 Aebp2 (ENSMOCG00000005729) Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.a.k ##22 Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 1 ENSCGRG00001002366 ENSCGRG00001000944 Cox7c (ENSCGRG00001016442) ENSCGRG00001007486 Rasa1 (ENSCGRG00001024641) Ccnh (ENSCGRG00001024363) Tmem161b (ENSCGRG00001023931) Mef2c (ENSCGRG00001006934) ENSCGRG00001007435 ENSCGRG00001003095 Cetn3 (ENSCGRG00001000920) Mblac2 (ENSCGRG00001018393) ENSCGRG00001004958 Lysmd3 (ENSCGRG00001004064) ENSCGRG00001017247 ENSCGRG00001020880 ##22 ENSCGRG00001024885 Arrdc3 (ENSCGRG00001024801) ENSCGRG00001024656 Nr2f1 (ENSCGRG00001020383) Pou5f2 (ENSCGRG00001019940) Fam172a (ENSCGRG00001019984) ENSCGRG00001010369 2210408I21Rik (ENSCGRG00001009297) Slf1 (ENSCGRG00001007173) Mctp1 (ENSCGRG00001011214) ENSCGRG00001007825 Fam81b (ENSCGRG00001005643) Skic3 (ENSCGRG00001016182) Arsk (ENSCGRG00001019637) ENSCGRG00001010656 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.a.l ##22 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.a.l ##22 Prairie vole MODERN SPECIES 12 Abce1 (ENSMOCG00000013213) Otud4 (ENSMOCG00000012639) Smad1 (ENSMOCG00000002828) Mmaa (ENSMOCG00000000542) 1700011L22Rik (ENSMOCG00000010556) Zfp827 (ENSMOCG00000020399) ENSMOCG00000002657 Lsm6 (ENSMOCG00000020049) Slc10a7 (ENSMOCG00000007838) ENSMOCG00000017327 Pou4f2 (ENSMOCG00000014811) Ttc29 (ENSMOCG00000010925) ENSMOCG00000018841 ENSMOCG00000010337 Ednra (ENSMOCG00000017745) ENSMOCG00000016788 ##22 Rasd2 (ENSMOCG00000014090) Hmox1 (ENSMOCG00000005130) Tom1 (ENSMOCG00000010687) Hmgxb4 (ENSMOCG00000005178) Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.a.l ##22 Golden Hamster MODERN SPECIES 634 Srfbp1 (ENSMAUG00000009431) Lox (ENSMAUG00000008060) 1700034E13Rik (ENSMAUG00000007545) Gykl1 (ENSMAUG00000005428) ENSMAUG00000004463 Snx2 (ENSMAUG00000018379) Dpep3 (ENSMAUG00000017410) ENSMAUG00000017250 Snx24 (ENSMAUG00000017166) Ppic (ENSMAUG00000016808) Prdm6 (ENSMAUG00000016287) Cep120 (ENSMAUG00000016424) Csnk1g3 (ENSMAUG00000015117) Zfp608 (ENSMAUG00000014536) ENSMAUG00000013888 ENSMAUG00000014738 ##22 Gramd3 (ENSMAUG00000012430) Aldh7a1 (ENSMAUG00000001614) Phax (ENSMAUG00000014638) Tex43 (ENSMAUG00000013359) Lmnb1 (ENSMAUG00000010471) Marchf3 (ENSMAUG00000012056) C330018D20Rik (ENSMAUG00000011803) Megf10 (ENSMAUG00000004517) Prrc1 (ENSMAUG00000011136) Ctxn3 (ENSMAUG00000010112) Ccdc192 (ENSMAUG00000011938) Slc12a2 (ENSMAUG00000009760) Fbn2 (ENSMAUG00000009747) Slc27a6 (ENSMAUG00000019470) Isoc1 (ENSMAUG00000017533) Lesser Egyptian jerboa DUPLICATION Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 64 Ccar1 (ENSJJAG00000024055) Tet1 (ENSJJAG00000023109) Slc25a16 (ENSJJAG00000019315) Dna2 (ENSJJAG00000021501) ENSJJAG00000022466 ENSJJAG00000022736 ENSJJAG00000018983 Atoh7 (ENSJJAG00000014782) Mypn (ENSJJAG00000007229) Herc4 (ENSJJAG00000016624) Sirt1 (ENSJJAG00000021678) ENSJJAG00000011610 Lrrtm3 (ENSJJAG00000017094) Ctnna3 (ENSJJAG00000018409) Reep3 (ENSJJAG00000017116) ENSJJAG00000004728 ##22 Jmjd1c (ENSJJAG00000023295) Nrbf2 (ENSJJAG00000000936) ENSJJAG00000021676 Zfp365 (ENSJJAG00000019674) Rtkn2 (ENSJJAG00000019121) Arid5b (ENSJJAG00000001974) Cabcoco1 (ENSJJAG00000023473) Tmem26 (ENSJJAG00000010064) ENSJJAG00000018107 ENSJJAG00000018248 ENSJJAG00000015480 ENSJJAG00000017885 ENSJJAG00000016045 Ccdc6 (ENSJJAG00000000385) Slc16a9 (ENSJJAG00000014368) Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 179 Aldh18a1 (ENSJJAG00000015332) Tctn3 (ENSJJAG00000014982) Entpd1 (ENSJJAG00000014493) Cc2d2b (ENSJJAG00000009099) ENSJJAG00000022402 Blnk (ENSJJAG00000017943) Dntt (ENSJJAG00000022684) Tll2 (ENSJJAG00000007261) Tm9sf3 (ENSJJAG00000000058) Pik3ap1 (ENSJJAG00000012258) ENSJJAG00000010901 ENSJJAG00000006963 Slit1 (ENSJJAG00000021868) Arhgap19 (ENSJJAG00000012736) Rrp12 (ENSJJAG00000000110) ENSJJAG00000015130 ##22 Exosc1 (ENSJJAG00000013311) Zdhhc16 (ENSJJAG00000011384) Mms19 (ENSJJAG00000016216) Ubtd1 (ENSJJAG00000013950) Ankrd2 (ENSJJAG00000013600) Hoga1 (ENSJJAG00000013267) Morn4 (ENSJJAG00000013030) Pi4k2a (ENSJJAG00000021991) Avpi1 (ENSJJAG00000021703) Marveld1 (ENSJJAG00000012601) Zfyve27 (ENSJJAG00000005638) Sfrp5 (ENSJJAG00000022836) Golga7b (ENSJJAG00000021511) Crtac1 (ENSJJAG00000020645) ENSJJAG00000020251 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000156981 ENSGT00940000162006 ENSGT00940000155715 ENSGT00940000158584 ENSGT00390000009395 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155493 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000162611.a ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00940000157331 ENSGT00390000007081.b ENSGT00390000007081.a ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d.c.a ##22 ENSGT00390000015287 ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00530000063604.A ENSGT00390000015820 ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000156981 ENSGT00940000162006 ENSGT00940000155715 ENSGT00940000158584 ENSGT00390000009395 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155493 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00940000165139.a ENSGT00940000157331 ENSGT00390000007081.b ENSGT00390000007081.a ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d.c.a ##22 ENSGT00390000015287 ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00530000063604.A ENSGT00390000015820 ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 Sloth MODERN SPECIES 5913 PGAM1 (ENSCHOG00000006467) ##22 EXOSC1 (ENSCHOG00000006477) ZDHHC16 (ENSCHOG00000006491) Armadillo DUPLICATION Armadillo MODERN SPECIES 1646 BCOR (ENSDNOG00000038847) ENSDNOG00000025629 ##22 Armadillo DUPLICATION Armadillo MODERN SPECIES 1432 BLNK (ENSDNOG00000003737) DNTT (ENSDNOG00000003744) OPALIN (ENSDNOG00000033233) TLL2 (ENSDNOG00000003754) TM9SF3 (ENSDNOG00000035398) PIK3AP1 (ENSDNOG00000011360) LCOR (ENSDNOG00000024156) ENSDNOG00000032782 ENSDNOG00000018004 SLIT1 (ENSDNOG00000015506) ENSDNOG00000047969 ARHGAP19 (ENSDNOG00000034625) FRAT1 (ENSDNOG00000038953) ENSDNOG00000034994 RRP12 (ENSDNOG00000005120) ENSDNOG00000006685 ##22 EXOSC1 (ENSDNOG00000007983) ZDHHC16 (ENSDNOG00000006690) MMS19 (ENSDNOG00000006707) UBTD1 (ENSDNOG00000049344) ANKRD2 (ENSDNOG00000001240) HOGA1 (ENSDNOG00000001243) C10orf62 (ENSDNOG00000036266) MORN4 (ENSDNOG00000032778) PI4K2A (ENSDNOG00000017724) AVPI1 (ENSDNOG00000044043) MARVELD1 (ENSDNOG00000008327) ZFYVE27 (ENSDNOG00000019918) SFRP5 (ENSDNOG00000032287) GOLGA7B (ENSDNOG00000033712) CRTAC1 (ENSDNOG00000007658) Armadillo MODERN SPECIES 355 STPG4 (ENSDNOG00000039454) TTC7A (ENSDNOG00000045960) MCFD2 (ENSDNOG00000032663) SOCS5 (ENSDNOG00000020011) CRIPT (ENSDNOG00000035515) PIGF (ENSDNOG00000041519) RHOQ (ENSDNOG00000047538) ATP6V1E2 (ENSDNOG00000007277) TMEM247 (ENSDNOG00000042102) EPAS1 (ENSDNOG00000005938) PRKCE (ENSDNOG00000048651) ENSDNOG00000038824 SRBD1 (ENSDNOG00000018686) SIX2 (ENSDNOG00000018725) CAMKMT (ENSDNOG00000044307) ENSDNOG00000000193 ##22 ENSDNOG00000012230 PREPL (ENSDNOG00000025378) ENSDNOG00000046304 SLC3A1 (ENSDNOG00000031447) ENSDNOG00000034472 PPM1B (ENSDNOG00000009468) ENSDNOG00000012594 ABCG8 (ENSDNOG00000049689) ABCG5 (ENSDNOG00000012558) C1GALT1C1L (ENSDNOG00000032389) PLEKHH2 (ENSDNOG00000012497) THADA (ENSDNOG00000012440) ZFP36L2 (ENSDNOG00000043725) Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b ##22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b ##22 Euarchontoglires DUPLICATION Euarchontoglires DUPLICATION Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.a ##22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.a ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.a ##22 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00940000157331 ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.a ##22 ENSGT00390000007081.b ENSGT00390000007081.a ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d.c.a ##22 ENSGT00390000015287.h ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00530000063604.A ENSGT00390000015820 ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049709 ENSGT00390000013298 Rabbit MODERN SPECIES 9 SORBS1 (ENSOCUG00000013647) ALDH18A1 (ENSOCUG00000005956) TCTN3 (ENSOCUG00000005964) ENSOCUG00000024251 ENTPD1 (ENSOCUG00000012677) CC2D2B (ENSOCUG00000011118) CCNJ (ENSOCUG00000011114) ZNF518A (ENSOCUG00000015638) BLNK (ENSOCUG00000002864) DNTT (ENSOCUG00000002871) OPALIN (ENSOCUG00000002880) TLL2 (ENSOCUG00000002883) LCOR (ENSOCUG00000029435) SLIT1 (ENSOCUG00000003676) ARHGAP19 (ENSOCUG00000021497) ENSOCUG00000005679 ##22 FRAT1 (ENSOCUG00000005650) RRP12 (ENSOCUG00000005662) ENSOCUG00000011898 ZDHHC16 (ENSOCUG00000000595) MMS19 (ENSOCUG00000007776) UBTD1 (ENSOCUG00000007789) ANKRD2 (ENSOCUG00000007793) HOGA1 (ENSOCUG00000007799) MORN4 (ENSOCUG00000007810) PI4K2A (ENSOCUG00000007814) AVPI1 (ENSOCUG00000007821) MARVELD1 (ENSOCUG00000025329) ZFYVE27 (ENSOCUG00000001352) SFRP5 (ENSOCUG00000021137) GOLGA7B (ENSOCUG00000017860) Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.a ##22 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.a ##22 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.a ##22 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.a ##22 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.a ##22 Degu MODERN SPECIES 66 UBE2E3 (ENSODEG00000012934) ITGA4 (ENSODEG00000011915) ENSODEG00000012379 CERKL (ENSODEG00000012012) NEUROD1 (ENSODEG00000019934) ITPRID2 (ENSODEG00000011169) PPP1R1C (ENSODEG00000012042) PDE1A (ENSODEG00000011693) DNAJC10 (ENSODEG00000011257) FRZB (ENSODEG00000011697) NCKAP1 (ENSODEG00000012291) DUSP19 (ENSODEG00000012741) ENSODEG00000011202 ENSODEG00000011356 ENSODEG00000010656 ##22 ZNF804A (ENSODEG00000011236) FSIP2 (ENSODEG00000011670) ENSODEG00000011277 ZC3H15 (ENSODEG00000010533) ITGAV (ENSODEG00000013327) ENSODEG00000019974 FAM171B (ENSODEG00000011840) ZSWIM2 (ENSODEG00000010673) CALCRL (ENSODEG00000014219) GULP1 (ENSODEG00000010757) COL3A1 (ENSODEG00000010707) COL5A2 (ENSODEG00000010110) ENSODEG00000019830 ENSODEG00000009648 ENSODEG00000019783 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.a ##22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.a ##22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.a ##22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.a ##22 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.a ##22 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.a ##22 Prairie vole DUPLICATION Prairie vole MODERN SPECIES 86 Lrrn4 (ENSMOCG00000011080) Crls1 (ENSMOCG00000006111) Mcm8 (ENSMOCG00000015893) Trmt6 (ENSMOCG00000022320) Chgb (ENSMOCG00000001424) Shld1 (ENSMOCG00000005816) Gpcpd1 (ENSMOCG00000013354) Prokr2 (ENSMOCG00000012413) Cds2 (ENSMOCG00000015701) Pcna (ENSMOCG00000019613) Tmem230 (ENSMOCG00000019540) Slc23a2 (ENSMOCG00000021732) Rassf2 (ENSMOCG00000000426) Prnd (ENSMOCG00000022573) Prnp (ENSMOCG00000003173) ENSMOCG00000021022 ##22 Adra1d (ENSMOCG00000006284) Smox (ENSMOCG00000011648) Rnf24 (ENSMOCG00000008073) Pank2 (ENSMOCG00000015823) Mavs (ENSMOCG00000022480) Ap5s1 (ENSMOCG00000007406) Cdc25b (ENSMOCG00000000383) Cenpb (ENSMOCG00000006748) Spef1 (ENSMOCG00000016870) 1700037H04Rik (ENSMOCG00000002686) Hspa12b (ENSMOCG00000020638) Siglec1 (ENSMOCG00000013504) Adam33 (ENSMOCG00000022885) Gfra4 (ENSMOCG00000020802) Atrn (ENSMOCG00000000501) Prairie vole MODERN SPECIES 80 ENSMOCG00000001406 Gpr52 (ENSMOCG00000007360) Rabgap1l (ENSMOCG00000007533) ENSMOCG00000009195 Rc3h1 (ENSMOCG00000016587) ENSMOCG00000014126 Serpinc1 (ENSMOCG00000019599) Zbtb37 (ENSMOCG00000005828) Dars2 (ENSMOCG00000020112) Cenpl (ENSMOCG00000015725) ENSMOCG00000005640 Ankrd45 (ENSMOCG00000021366) ENSMOCG00000011324 Tnfsf4 (ENSMOCG00000016434) Tnfsf18 (ENSMOCG00000021434) ENSMOCG00000022063 ##22 Fasl (ENSMOCG00000002112) Suco (ENSMOCG00000005241) 4930558K02Rik (ENSMOCG00000000623) Pigc (ENSMOCG00000003546) Dnm3 (ENSMOCG00000020210) ENSMOCG00000008821 ENSMOCG00000008075 Mettl13 (ENSMOCG00000011261) Vamp4 (ENSMOCG00000015230) Myoc (ENSMOCG00000011618) Myocos (ENSMOCG00000013431) ENSMOCG00000021278 ENSMOCG00000012732 ENSMOCG00000013255 Fmo4 (ENSMOCG00000018998) Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.a ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.a ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.a ##22 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.a ##22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.a ##22 Marmoset MODERN SPECIES 21 PLEKHG6 (ENSCJAG00000000666) CD9 (ENSCJAG00000000659) VWF (ENSCJAG00000000613) ANO2 (ENSCJAG00000000606) NTF3 (ENSCJAG00000000605) KCNA5 (ENSCJAG00000068399) KCNA1 (ENSCJAG00000068371) KCNA6 (ENSCJAG00000061475) ENSCJAG00000075610 ENSCJAG00000001647 ENSCJAG00000001628 FGF6 (ENSCJAG00000001613) FGF23 (ENSCJAG00000069632) TIGAR (ENSCJAG00000040111) CCND2 (ENSCJAG00000001593) ENSCJAG00000001586 ##22 ENSCJAG00000021822 PARP11 (ENSCJAG00000001570) ENSCJAG00000082222 CRACR2A (ENSCJAG00000018917) ENSCJAG00000063173 PRMT8 (ENSCJAG00000018891) ENSCJAG00000018882 TEAD4 (ENSCJAG00000018796) ENSCJAG00000085073 FOXM1 (ENSCJAG00000018781) RHNO1 (ENSCJAG00000018790) TEX52 (ENSCJAG00000018779) NRIP2 (ENSCJAG00000083523) ITFG2 (ENSCJAG00000018765) FKBP4 (ENSCJAG00000018746) Mas night monkey DUPLICATION Mas night monkey MODERN SPECIES 1050 VIPR2 (ENSANAG00000024103) DYNC2I1 (ENSANAG00000030447) ESYT2 (ENSANAG00000019778) NCAPG2 (ENSANAG00000029627) ENSANAG00000026104 ENSANAG00000026862 ENSANAG00000029187 UBE3C (ENSANAG00000030081) MNX1 (ENSANAG00000031648) ENSANAG00000020425 ENSANAG00000021639 LMBR1 (ENSANAG00000026160) ENSANAG00000025885 ##22 RNF32 (ENSANAG00000035219) ENSANAG00000030048 RBM33 (ENSANAG00000032494) ENSANAG00000024223 EN2 (ENSANAG00000034609) INSIG1 (ENSANAG00000026708) HTR5A (ENSANAG00000027051) PAXIP1 (ENSANAG00000030136) DPP6 (ENSANAG00000023529) Mas night monkey MODERN SPECIES 349 PEX16 (ENSANAG00000024741) LARGE2 (ENSANAG00000024552) PHF21A (ENSANAG00000033662) ENSANAG00000034457 CREB3L1 (ENSANAG00000023783) DGKZ (ENSANAG00000023123) ENSANAG00000030861 CHRM4 (ENSANAG00000007361) AMBRA1 (ENSANAG00000037577) HARBI1 (ENSANAG00000038532) ATG13 (ENSANAG00000036615) ARHGAP1 (ENSANAG00000038289) ZNF408 (ENSANAG00000036294) F2 (ENSANAG00000036904) CKAP5 (ENSANAG00000031236) ENSANAG00000038320 ##22 LRP4 (ENSANAG00000038492) CSTPP1 (ENSANAG00000037882) ENSANAG00000026796 ARFGAP2 (ENSANAG00000031850) PACSIN3 (ENSANAG00000030038) DDB2 (ENSANAG00000036510) ACP2 (ENSANAG00000032696) NR1H3 (ENSANAG00000037990) MADD (ENSANAG00000024603) MYBPC3 (ENSANAG00000023289) SPI1 (ENSANAG00000029485) SLC39A13 (ENSANAG00000027448) ENSANAG00000037076 RAPSN (ENSANAG00000022248) CELF1 (ENSANAG00000031770) Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00440000033232.c ENSGT00390000008983.a ENSGT00940000155071.E ENSGT00940000158384 ENSGT00940000154861.c ENSGT00940000157717 ENSGT01030000234648.a.a.d ENSGT00910000147697 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00910000147055 ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.a ##22 ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00910000147469 ENSGT00940000159659 ENSGT00940000157794 ENSGT00640000091554 ENSGT00940000156378.b ENSGT00390000008947 ENSGT00390000016233 ENSGT00940000154857 ENSGT00940000161059 ENSGT00390000018596.A.a.a ENSGT00390000005596 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00440000033232.c ENSGT00390000008983.a ENSGT00940000155071.E ENSGT00940000158384 ENSGT00940000154861.c ENSGT00940000157717 ENSGT01030000234648.a.a.d ENSGT00910000147697 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00910000147055 ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.a ##22 ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00910000147469 ENSGT00940000159659 ENSGT00940000157794 ENSGT00640000091554 ENSGT00940000156378.b ENSGT00390000008947 ENSGT00390000016233 ENSGT00940000154857 ENSGT00940000161059 ENSGT00390000018596.A.a.a ENSGT00390000005596 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000014001.b ENSGT00440000033232.c ENSGT00390000008983.a ENSGT00940000155071.E ENSGT00940000158384 ENSGT00940000154861.c ENSGT00940000157717 ENSGT01030000234648.a.a.d ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00910000147055 ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.a ##22 ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00940000159659 ENSGT00940000157794 ENSGT00640000091554 ENSGT00940000156378.b ENSGT00390000008947 ENSGT00390000016233 ENSGT00940000154857 ENSGT00940000161059 ENSGT00390000018596.A.a.a ENSGT00390000005596 ENSGT00940000161421 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000014001.b ENSGT00440000033232.c ENSGT00390000008983.a ENSGT00940000155071.E ENSGT00940000158384 ENSGT00940000154861.c ENSGT00940000157717 ENSGT01030000234648.a.a.d ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00910000147055 ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.a ##22 ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00910000148533 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00940000159659 ENSGT00940000157794 ENSGT00640000091554 ENSGT00940000156378.b ENSGT00390000008947 ENSGT00390000016233 ENSGT00940000154857 ENSGT00940000161059 ENSGT00390000018596.A.a.a ENSGT00390000005596 Macaca ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000014001.b ENSGT00440000033232.c.f ENSGT00390000008983.a ENSGT00940000155071.E ENSGT00940000158384 ENSGT00940000154861.c ENSGT00940000157717 ENSGT01030000234648.a.a.d ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00910000147055 ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.a ##22 ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00910000148533 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00940000159659 ENSGT00940000157794 ENSGT00640000091554 ENSGT00940000156378.b ENSGT00390000008947 ENSGT00390000016233 ENSGT00940000154857 ENSGT00940000161059 ENSGT00390000018596.A.a.a ENSGT00390000005596 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 546 SETMAR (ENSMNEG00000045183) SUMF1 (ENSMNEG00000003566) ITPR1 (ENSMNEG00000034253) BHLHE40 (ENSMNEG00000038264) ARL8B (ENSMNEG00000029717) EDEM1 (ENSMNEG00000034041) ENSMNEG00000021998 GRM7 (ENSMNEG00000031784) LMCD1 (ENSMNEG00000039664) SSUH2 (ENSMNEG00000032764) CAV3 (ENSMNEG00000045110) OXTR (ENSMNEG00000037475) ENSMNEG00000027815 RAD18 (ENSMNEG00000013464) SRGAP3 (ENSMNEG00000028942) ENSMNEG00000032308 ##22 THUMPD3 (ENSMNEG00000030529) SETD5 (ENSMNEG00000045236) ENSMNEG00000026054 LHFPL4 (ENSMNEG00000032394) MTMR14 (ENSMNEG00000036145) CPNE9 (ENSMNEG00000032338) BRPF1 (ENSMNEG00000028158) OGG1 (ENSMNEG00000037925) CAMK1 (ENSMNEG00000036021) TADA3 (ENSMNEG00000034551) ENSMNEG00000045138 TTLL3 (ENSMNEG00000041644) RPUSD3 (ENSMNEG00000040308) CIDEC (ENSMNEG00000033573) JAGN1 (ENSMNEG00000030195) Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00440000033232.c ENSGT00390000008983.a ENSGT00940000155071.E ENSGT00940000158384 ENSGT00940000154861.c ENSGT00940000157717 ENSGT01030000234648.a.a.d ENSGT00910000147697 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00910000147055 ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.a ##22 ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00910000147469 ENSGT00940000159659 ENSGT00940000157794 ENSGT00640000091554 ENSGT00940000156378.b ENSGT00390000008947 ENSGT00390000016233 ENSGT00940000154857 ENSGT00940000161059 ENSGT00390000018596.A.a.a ENSGT00390000005596 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.a ##22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.a ##22 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.a ##22 Pan ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000156905 ENSGT00950000182899.B.a ENSGT00940000154927 ENSGT00530000063627.a ENSGT00940000157453 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TADA3 (ENSNLEG00000004174) ARPC4 (ENSNLEG00000004196) ENSNLEG00000026984 RPUSD3 (ENSNLEG00000004214) CIDEC (ENSNLEG00000004221) JAGN1 (ENSNLEG00000004230) Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.b ##22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.b ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.b ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.b ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.b ##22 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.b ##22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.b ##22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000161027 ENSGT00940000153370.a.a ENSGT00390000013169 ENSGT00940000160285 ENSGT00930000151054 ENSGT00410000028887 ENSGT00940000165817 ENSGT00530000063721.B ENSGT00940000161002 ENSGT00940000162651 ENSGT00940000155070.k.b ENSGT00940000161776 ENSGT00390000016784 ENSGT00940000162438 ENSGT00940000159147 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ENSGT01030000234598.b.b ENSGT00940000160988 ENSGT00940000160125 ENSGT00940000157941 Pan ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000161992 ENSGT00940000161027 ENSGT00940000153370.a.a ENSGT00390000013169 ENSGT00940000160285 ENSGT00930000151054 ENSGT00410000028887 ENSGT00530000063721.B.i ENSGT00940000161002 ENSGT00940000162651 ENSGT00940000155070.k.b ENSGT00940000161776 ENSGT00390000016784 ENSGT00940000162438 ENSGT00940000159147 ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.b ##22 ENSGT00940000154524.a ENSGT00940000154276.hb.a.f ENSGT00940000157743 ENSGT00390000017253 ENSGT00390000007479.y.a.n.a ENSGT00390000017147 ENSGT00390000000417.a.a.b.a.a.b ENSGT00390000001738 ENSGT00530000064783 ENSGT00390000009753 ENSGT00390000010028 ENSGT01030000234598.b.b ENSGT00940000160988 ENSGT00940000160125 ENSGT00940000157941 Chimpanzee MODERN SPECIES 2 KCNK7 (ENSPTRG00000003885) EHBP1L1 (ENSPTRG00000003883) FAM89B (ENSPTRG00000003882) ZNRD2 (ENSPTRG00000003881) LTBP3 (ENSPTRG00000003880) SCYL1 (ENSPTRG00000003879) ENSPTRG00000049826 ENSPTRG00000044235 SLC25A45 (ENSPTRG00000003874) TIGD3 (ENSPTRG00000003873) DPF2 (ENSPTRG00000003872) CDC42EP2 (ENSPTRG00000051376) POLA2 (ENSPTRG00000003870) ENSPTRG00000052347 CAPN1 (ENSPTRG00000003869) ENSPTRG00000044015 ##22 SPDYC (ENSPTRG00000028537) ENSPTRG00000048485 SYVN1 (ENSPTRG00000003868) MRPL49 (ENSPTRG00000003867) FAU (ENSPTRG00000003866) ZNHIT2 (ENSPTRG00000003865) TM7SF2 (ENSPTRG00000003864) VPS51 (ENSPTRG00000003863) TMEM262 (ENSPTRG00000050805) ZFPL1 (ENSPTRG00000003861) CDCA5 (ENSPTRG00000003860) NAALADL1 (ENSPTRG00000003859) SAC3D1 (ENSPTRG00000003858) SNX15 (ENSPTRG00000003857) ARL2 (ENSPTRG00000034478) Bonobo MODERN SPECIES 2 KCNK7 (ENSPPAG00000040175) EHBP1L1 (ENSPPAG00000022447) ENSPPAG00000023660 ZNRD2 (ENSPPAG00000035017) LTBP3 (ENSPPAG00000036458) SCYL1 (ENSPPAG00000029818) ENSPPAG00000022234 ENSPPAG00000036161 SLC25A45 (ENSPPAG00000035170) TIGD3 (ENSPPAG00000001675) DPF2 (ENSPPAG00000043218) CDC42EP2 (ENSPPAG00000017994) POLA2 (ENSPPAG00000038067) ENSPPAG00000030242 CAPN1 (ENSPPAG00000027661) ENSPPAG00000036656 ##22 SPDYC (ENSPPAG00000039970) ENSPPAG00000025565 SYVN1 (ENSPPAG00000024469) MRPL49 (ENSPPAG00000037118) FAU (ENSPPAG00000040318) ZNHIT2 (ENSPPAG00000024364) TM7SF2 (ENSPPAG00000030405) VPS51 (ENSPPAG00000026847) TMEM262 (ENSPPAG00000041718) ZFPL1 (ENSPPAG00000019581) CDCA5 (ENSPPAG00000027263) NAALADL1 (ENSPPAG00000043800) ENSPPAG00000041034 SNX15 (ENSPPAG00000036705) ARL2 (ENSPPAG00000041696) Gorilla MODERN SPECIES 2 KCNK7 (ENSGGOG00000011766) EHBP1L1 (ENSGGOG00000011754) FAM89B (ENSGGOG00000011751) ZNRD2 (ENSGGOG00000011746) LTBP3 (ENSGGOG00000000714) SCYL1 (ENSGGOG00000000712) ENSGGOG00000025059 FRMD8 (ENSGGOG00000014773) SLC25A45 (ENSGGOG00000014767) TIGD3 (ENSGGOG00000014762) DPF2 (ENSGGOG00000026412) CDC42EP2 (ENSGGOG00000038944) POLA2 (ENSGGOG00000003056) ENSGGOG00000007767 CAPN1 (ENSGGOG00000007754) ENSGGOG00000022894 ##22 SPDYC (ENSGGOG00000004263) ENSGGOG00000024036 SYVN1 (ENSGGOG00000002718) MRPL49 (ENSGGOG00000024514) FAU (ENSGGOG00000002714) ZNHIT2 (ENSGGOG00000002712) TM7SF2 (ENSGGOG00000002708) VPS51 (ENSGGOG00000002704) TMEM262 (ENSGGOG00000041966) ZFPL1 (ENSGGOG00000002697) CDCA5 (ENSGGOG00000026067) NAALADL1 (ENSGGOG00000002695) SAC3D1 (ENSGGOG00000024890) SNX15 (ENSGGOG00000010421) ARL2 (ENSGGOG00000005254) Platyrrhini DUPLICATION Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000154245.B ENSGT00900000143503 ENSGT00940000154713.B ENSGT00390000018121 ENSGT00940000156728 ENSGT00940000157103 ENSGT00940000157059 ENSGT00940000156074 ENSGT00940000160022 ENSGT00940000160857 ENSGT00940000155951.b ENSGT00390000017860.b ENSGT00950000182808.a.a.b.b ENSGT00390000012305.a ENSGT00610000086058.a ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.b.a ##22 ENSGT00530000063690.a.b.a.a ENSGT00530000063690.a.b.a.b.c ENSGT00510000048509 ENSGT00940000156935 ENSGT00390000014817 ENSGT00390000008110 ENSGT00390000013532 ENSGT00940000153284.b ENSGT00870000136875 ENSGT00940000158643 ENSGT00390000011192 ENSGT01080000257472 ENSGT00940000158757 ENSGT00940000154326.a.a.h.a.a ENSGT00390000003601.b Mas night monkey MODERN SPECIES 469 GABRB1 (ENSANAG00000026324) ENSANAG00000025231 COMMD8 (ENSANAG00000019583) ATP10D (ENSANAG00000026040) ENSANAG00000020160 CORIN (ENSANAG00000024072) NFXL1 (ENSANAG00000021407) CNGA1 (ENSANAG00000026609) NIPAL1 (ENSANAG00000022393) TXK (ENSANAG00000031213) TEC (ENSANAG00000035862) SLAIN2 (ENSANAG00000020742) SLC10A4 (ENSANAG00000029030) ZAR1 (ENSANAG00000035179) FRYL (ENSANAG00000030260) ENSANAG00000027091 ##22 OCIAD1 (ENSANAG00000037176) OCIAD2 (ENSANAG00000033240) CWH43 (ENSANAG00000036936) DCUN1D4 (ENSANAG00000006089) LRRC66 (ENSANAG00000027871) SGCB (ENSANAG00000037522) SPATA18 (ENSANAG00000024358) USP46 (ENSANAG00000037399) RASL11B (ENSANAG00000030414) ENSANAG00000036362 ENSANAG00000027223 SCFD2 (ENSANAG00000037492) ENSANAG00000032461 LNX1 (ENSANAG00000028251) ENSANAG00000037095 Cebidae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000154245.B ENSGT00900000143503 ENSGT00940000154713.B ENSGT00390000018121 ENSGT00940000156728 ENSGT00940000157103 ENSGT00940000157059 ENSGT00940000156074 ENSGT00940000160022 ENSGT00940000160857 ENSGT00940000155951.b ENSGT00390000017860.b ENSGT00950000182808.a.a.b.b ENSGT00390000012305.a ENSGT00610000086058.a ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.b.a ##22 ENSGT00530000063690.a.b.a.a ENSGT00530000063690.a.b.a.b.c ENSGT00510000048509 ENSGT00940000156935 ENSGT00390000014817 ENSGT00390000008110 ENSGT00390000013532 ENSGT00940000153284.b ENSGT00870000136875 ENSGT00940000158643 ENSGT00390000011192 ENSGT01080000257472 ENSGT00940000158757 ENSGT00940000154326.a.a.h.a.a ENSGT00390000003601.b Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES 63 ENSGT00940000159024 ENSGT00940000154245.B ENSGT00900000143503 ENSGT00390000018121 ENSGT00940000156728 ENSGT00940000157103 ENSGT00940000157059 ENSGT00940000156074 ENSGT00940000160022 ENSGT00940000160857 ENSGT00940000155951.b ENSGT00390000017860.b ENSGT00950000182808.a.a.b.b ENSGT00390000012305.a ENSGT00610000086058.a ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.b.a ##22 ENSGT00530000063690.a.b.a.a ENSGT00530000063690.a.b.a.b.c ENSGT00510000048509 ENSGT00940000156935 ENSGT00390000014817 ENSGT00390000008110 ENSGT00390000013532 ENSGT00940000153284.b.g ENSGT00940000158643 ENSGT00390000011192 ENSGT01080000257472 ENSGT00940000158757 ENSGT00940000154326.a.a.h.a.a ENSGT00390000003601.b ENSGT00940000156043 Capuchin MODERN SPECIES 124 GABRB1 (ENSCCAG00000031056) ENSCCAG00000021015 COMMD8 (ENSCCAG00000037718) ATP10D (ENSCCAG00000032623) CORIN (ENSCCAG00000036055) NFXL1 (ENSCCAG00000035844) CNGA1 (ENSCCAG00000027342) NIPAL1 (ENSCCAG00000032859) TXK (ENSCCAG00000017733) TEC (ENSCCAG00000034761) ENSCCAG00000021799 SLAIN2 (ENSCCAG00000008869) SLC10A4 (ENSCCAG00000037459) ENSCCAG00000034311 FRYL (ENSCCAG00000034554) ENSCCAG00000037817 ##22 OCIAD1 (ENSCCAG00000025450) OCIAD2 (ENSCCAG00000031065) CWH43 (ENSCCAG00000020925) DCUN1D4 (ENSCCAG00000016912) LRRC66 (ENSCCAG00000037453) SGCB (ENSCCAG00000012614) SPATA18 (ENSCCAG00000020113) ENSCCAG00000030356 ENSCCAG00000032234 RASL11B (ENSCCAG00000037560) ENSCCAG00000031404 ENSCCAG00000030526 ENSCCAG00000023197 SCFD2 (ENSCCAG00000031373) FIP1L1 (ENSCCAG00000021687) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.b.b ##22 Mas night monkey MODERN SPECIES 896 BRWD3 (ENSANAG00000008738) ENSANAG00000026677 ENSANAG00000020981 TBX22 (ENSANAG00000021162) ENSANAG00000029835 ITM2A (ENSANAG00000036156) GPR174 (ENSANAG00000019966) P2RY10 (ENSANAG00000020031) LPAR4 (ENSANAG00000020241) ENSANAG00000035162 ENSANAG00000024359 ENSANAG00000033757 TAF9B (ENSANAG00000036258) PGK1 (ENSANAG00000024705) ATP7A (ENSANAG00000023455) ENSANAG00000022195 ##22 COX7B (ENSANAG00000022390) MAGT1 (ENSANAG00000030919) ATRX (ENSANAG00000032142) ENSANAG00000027335 FGF16 (ENSANAG00000037272) MAGEE1 (ENSANAG00000037886) PBDC1 (ENSANAG00000018001) ZDHHC15 (ENSANAG00000023886) UPRT (ENSANAG00000030692) ABCB7 (ENSANAG00000031764) NEXMIF (ENSANAG00000024438) RLIM (ENSANAG00000021696) SLC16A2 (ENSANAG00000031908) Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.b ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.b ##22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.b ##22 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.b ##22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.b ##22 Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 88 ENSJJAG00000014774 Lrrc2 (ENSJJAG00000012595) ENSJJAG00000023493 Als2cl (ENSJJAG00000017612) Prss46 (ENSJJAG00000021613) Prss45 (ENSJJAG00000019524) ENSJJAG00000014988 ENSJJAG00000012384 Myl3 (ENSJJAG00000021882) Pth1r (ENSJJAG00000020640) Ccdc12 (ENSJJAG00000014918) Nbeal2 (ENSJJAG00000018112) Nradd (ENSJJAG00000008456) ENSJJAG00000000233 Setd2 (ENSJJAG00000022758) ENSJJAG00000014043 ##22 Kif9 (ENSJJAG00000004798) Klhl18 (ENSJJAG00000022221) Ngp (ENSJJAG00000019896) Ptpn23 (ENSJJAG00000023111) ENSJJAG00000012176 ENSJJAG00000011308 ENSJJAG00000018014 Cspg5 (ENSJJAG00000011976) ENSJJAG00000022882 ENSJJAG00000009892 ENSJJAG00000023311 ENSJJAG00000010648 ENSJJAG00000013858 Cdc25a (ENSJJAG00000005624) Camp (ENSJJAG00000020763) Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b ##22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b ##22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b ##22 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b ##22 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b ##22 Marmotini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b ##22 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b ##22 Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 293 TRMT10C (ENSUPAG00010020476) ENSUPAG00010020479 ZBTB11 (ENSUPAG00010020492) RPL24 (ENSUPAG00010020498) CEP97 (ENSUPAG00010020505) NXPE3 (ENSUPAG00010020518) NFKBIZ (ENSUPAG00010020526) ENSUPAG00010020562 ##22 ZPLD1 (ENSUPAG00010020567) Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b ##22 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 23 FNDC9 (ENSHGLG00000035156) CYFIP2 (ENSHGLG00000013823) ITK (ENSHGLG00000018493) GARIN3 (ENSHGLG00000016204) ENSHGLG00000021195 ENSHGLG00000014147 ENSHGLG00000046979 ENSHGLG00000017927 ENSHGLG00000042356 ENSHGLG00000041626 SGCD (ENSHGLG00000014518) ENSHGLG00000043124 MRPL22 (ENSHGLG00000018496) GEMIN5 (ENSHGLG00000013629) CNOT8 (ENSHGLG00000039848) ENSHGLG00000044881 ##22 ENSHGLG00000047467 ENSHGLG00000050510 LARP1 (ENSHGLG00000006267) HAND1 (ENSHGLG00000008657) SAP30L (ENSHGLG00000040967) GALNT10 (ENSHGLG00000011151) MFAP3 (ENSHGLG00000012228) FAM114A2 (ENSHGLG00000005817) GRIA1 (ENSHGLG00000008564) ENSHGLG00000049292 ENSHGLG00000040393 NMUR2 (ENSHGLG00000016664) ENSHGLG00000046430 GLRA1 (ENSHGLG00000016730) G3BP1 (ENSHGLG00000014921) Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b ##22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b ##22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b ##22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b ##22 Cricetidae DUPLICATION Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.a ##22 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.a ##22 Golden Hamster MODERN SPECIES 617 Cc2d2b (ENSMAUG00000020785) Ccnj (ENSMAUG00000021828) Zfp518a (ENSMAUG00000021731) Blnk (ENSMAUG00000021912) Dntt (ENSMAUG00000020553) Opalin (ENSMAUG00000019374) Tll2 (ENSMAUG00000003237) Tm9sf3 (ENSMAUG00000020867) Pik3ap1 (ENSMAUG00000021883) ENSMAUG00000021613 Lcor (ENSMAUG00000019331) Slit1 (ENSMAUG00000002133) Arhgap19 (ENSMAUG00000020627) ENSMAUG00000018859 Rrp12 (ENSMAUG00000020743) ENSMAUG00000021727 ##22 ENSMAUG00000020462 Zdhhc16 (ENSMAUG00000020857) Mms19 (ENSMAUG00000021095) Ubtd1 (ENSMAUG00000019537) Ankrd2 (ENSMAUG00000018303) 4933411K16Rik (ENSMAUG00000017996) Hoga1 (ENSMAUG00000021216) Morn4 (ENSMAUG00000019301) Pi4k2a (ENSMAUG00000018850) Avpi1 (ENSMAUG00000020844) Marveld1 (ENSMAUG00000020397) Zfyve27 (ENSMAUG00000020339) Sfrp5 (ENSMAUG00000019322) Golga7b (ENSMAUG00000019120) Crtac1 (ENSMAUG00000019399) Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.a ##22 Prairie vole MODERN SPECIES 16 Zfp518a (ENSMOCG00000007078) Blnk (ENSMOCG00000015343) Dntt (ENSMOCG00000018899) Opalin (ENSMOCG00000009465) Tll2 (ENSMOCG00000014816) Tm9sf3 (ENSMOCG00000017499) Pik3ap1 (ENSMOCG00000019863) ENSMOCG00000016297 Lcor (ENSMOCG00000022456) Slit1 (ENSMOCG00000010266) Arhgap19 (ENSMOCG00000011553) ENSMOCG00000021597 ENSMOCG00000001977 Frat2 (ENSMOCG00000001178) Rrp12 (ENSMOCG00000006753) ENSMOCG00000003968 ##22 ENSMOCG00000006004 Zdhhc16 (ENSMOCG00000010918) ENSMOCG00000015241 Ubtd1 (ENSMOCG00000004869) Ankrd2 (ENSMOCG00000005548) Hoga1 (ENSMOCG00000008769) Morn4 (ENSMOCG00000011013) Pi4k2a (ENSMOCG00000012623) Avpi1 (ENSMOCG00000012593) Marveld1 (ENSMOCG00000013119) Zfyve27 (ENSMOCG00000014672) Sfrp5 (ENSMOCG00000017190) Golga7b (ENSMOCG00000018394) Crtac1 (ENSMOCG00000021947) ENSMOCG00000019358 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.b ##22 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.b ##22 Golden Hamster MODERN SPECIES 730 Myo1f (ENSMAUG00000002414) Adamts10 (ENSMAUG00000012826) Actl9 (ENSMAUG00000004280) ENSMAUG00000017033 ENSMAUG00000012218 ENSMAUG00000017172 Pot1b (ENSMAUG00000020767) Adgre4 (ENSMAUG00000008688) ENSMAUG00000007845 Adgre1 (ENSMAUG00000000651) Vav1 (ENSMAUG00000021145) Trip10 (ENSMAUG00000005828) ENSMAUG00000020000 C3 (ENSMAUG00000013599) Tnfsf14 (ENSMAUG00000020967) ENSMAUG00000015229 ##22 Cd70 (ENSMAUG00000019101) ENSMAUG00000021205 Tubb4a (ENSMAUG00000017901) Dennd1c (ENSMAUG00000006409) Crb3 (ENSMAUG00000019988) ENSMAUG00000000871 Slc25a41 (ENSMAUG00000014724) Khsrp (ENSMAUG00000018966) Gm17949 (ENSMAUG00000018260) ENSMAUG00000015346 Pspn (ENSMAUG00000019121) Alkbh7 (ENSMAUG00000000800) Clpp (ENSMAUG00000021469) Acer1 (ENSMAUG00000012781) Mllt1 (ENSMAUG00000011374) Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 81 ENSJJAG00000013742 ENSJJAG00000007203 Ephb6 (ENSJJAG00000015598) Trpv6 (ENSJJAG00000010273) Trpv5 (ENSJJAG00000020226) Tas2r144 (ENSJJAG00000017432) ENSJJAG00000012066 Tmem139 (ENSJJAG00000014062) Casp2 (ENSJJAG00000008256) Zyx (ENSJJAG00000016066) Epha1 (ENSJJAG00000021813) ENSJJAG00000010770 Tcaf1 (ENSJJAG00000020805) Or6b1 (ENSJJAG00000016325) Nobox (ENSJJAG00000017542) ENSJJAG00000002419 ##22 ENSJJAG00000005242 ENSJJAG00000024312 ENSJJAG00000003559 Ezh2 (ENSJJAG00000014722) Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b ##22 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b ##22 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b ##22 Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b ##22 Coquerels sifaka MODERN SPECIES 743 PRRG3 (ENSPCOG00000023165) VMA21 (ENSPCOG00000028336) GPR50 (ENSPCOG00000027251) ENSPCOG00000014562 ##22 ENSPCOG00000023929 CD99L2 (ENSPCOG00000015996) MTMR1 (ENSPCOG00000019778) MTM1 (ENSPCOG00000017319) MAMLD1 (ENSPCOG00000019557) ENSPCOG00000025016 TMEM185A (ENSPCOG00000020150) ENSPCOG00000017118 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b ##22 Tarsier MODERN SPECIES 4870 CDK12 (ENSTSYG00000009800) MED1 (ENSTSYG00000029543) ENSTSYG00000036215 ##22 Simiiformes DUPLICATION Simiiformes DUPLICATION Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.c.a ##22 Catarrhini DUPLICATION Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.c.a.a ##22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.c.a.a ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.c.a.a ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.c.a.a ##22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.c.a.a ##22 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.c.a.a ##22 Drill MODERN SPECIES 226 ENTPD1 (ENSMLEG00000032678) ENSMLEG00000031797 CC2D2B (ENSMLEG00000041340) CCNJ (ENSMLEG00000021833) ZNF518A (ENSMLEG00000020642) BLNK (ENSMLEG00000037312) DNTT (ENSMLEG00000041343) OPALIN (ENSMLEG00000028586) TLL2 (ENSMLEG00000042598) TM9SF3 (ENSMLEG00000032756) PIK3AP1 (ENSMLEG00000036975) LCOR (ENSMLEG00000017762) SLIT1 (ENSMLEG00000039609) ARHGAP19 (ENSMLEG00000037965) RRP12 (ENSMLEG00000041317) ENSMLEG00000040909 ##22 EXOSC1 (ENSMLEG00000027643) ZDHHC16 (ENSMLEG00000044387) MMS19 (ENSMLEG00000043890) UBTD1 (ENSMLEG00000039442) ANKRD2 (ENSMLEG00000032656) PI4K2A (ENSMLEG00000032830) MORN4 (ENSMLEG00000031488) AVPI1 (ENSMLEG00000031158) ZFYVE27 (ENSMLEG00000032971) GOLGA7B (ENSMLEG00000025571) CRTAC1 (ENSMLEG00000018903) R3HCC1L (ENSMLEG00000044088) LOXL4 (ENSMLEG00000039866) PYROXD2 (ENSMLEG00000027593) HPS1 (ENSMLEG00000035442) Olive baboon MODERN SPECIES 7 MAFB (ENSPANG00000016615) TOP1 (ENSPANG00000025552) PLCG1 (ENSPANG00000023857) ZHX3 (ENSPANG00000023855) LPIN3 (ENSPANG00000010914) EMILIN3 (ENSPANG00000020628) CHD6 (ENSPANG00000025554) ENSPANG00000037008 PTPRT (ENSPANG00000010915) ENSPANG00000041815 SRSF6 (ENSPANG00000035224) L3MBTL1 (ENSPANG00000026135) SGK2 (ENSPANG00000003908) IFT52 (ENSPANG00000021782) MYBL2 (ENSPANG00000023992) ENSPANG00000010304 ##22 TOX2 (ENSPANG00000023990) JPH2 (ENSPANG00000023989) OSER1 (ENSPANG00000022564) GDAP1L1 (ENSPANG00000022715) FITM2 (ENSPANG00000022713) R3HDML (ENSPANG00000030933) HNF4A (ENSPANG00000026281) TTPAL (ENSPANG00000026279) SERINC3 (ENSPANG00000024778) PKIG (ENSPANG00000022565) ADA (ENSPANG00000023202) CCN5 (ENSPANG00000021786) KCNK15 (ENSPANG00000024499) RIMS4 (ENSPANG00000000384) YWHAB (ENSPANG00000004093) Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.c.a.a ##22 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1850 ENSRBIG00000010479 ENSRBIG00000034597 TNFAIP3 (ENSRBIG00000034026) ENSRBIG00000025427 ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000158773 ENSGT00940000160583 ENSGT00910000146870 ENSGT00940000156205 ENSGT00940000170417 ENSGT00940000157771 ENSGT01020000230401.b.a.m.a ENSGT00530000063847.a ENSGT00940000159268 ENSGT00390000015368.a.b ENSGT00940000156682 ENSGT00510000048902.b ENSGT00940000160523 ENSGT00910000146810 ENSGT00530000063727.A.j ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.c.a.b ##22 ENSGT00940000157540.A ENSGT00940000156291 ENSGT00950000183112.a ENSGT00940000155888 ENSGT00940000157160.e ENSGT00730000111392 ENSGT00910000147013 ENSGT01030000234535.F.a ENSGT00940000153052.c.b.b.a.b ENSGT01080000257410.A.f ENSGT00950000182940.b.a.a ENSGT00940000156876.k.b ENSGT00940000163116 ENSGT00950000183076.a.b.b.a.a ENSGT00390000010652.C Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 185 ENSGT00530000063727.A.j ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.c.a.b ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 175 ENSGT00530000063727.A.j ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.c.a.b ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 174 ENSGT00530000063727.A.j ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.c.a.b ##22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 192 ENSGT00530000063727.A.j ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.c.a.b ##22 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 60 ENSGT00910000147385 ENSGT00910000146870 ENSGT00940000156205 ENSGT00910000148191 ENSGT00940000157771 ENSGT01020000230401.b.a.m.a ENSGT00530000063847.a ENSGT00940000159268 ENSGT00390000015368.a.b ENSGT00940000156682 ENSGT00510000048902.b ENSGT00390000011698.c.a.c.a.i ENSGT00940000160523 ENSGT00910000146810 ENSGT00530000063727.A.j ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.c.a.b ##22 ENSGT00940000157540.A ENSGT00950000182891.a.a.b.a.b.b.a.b ENSGT00940000156291 ENSGT00860000135750 ENSGT00950000183112.a ENSGT00940000155888 ENSGT00730000111392 ENSGT00910000147013 ENSGT01030000234535.F.a ENSGT01080000257410.A.f ENSGT00950000182940.b.a.a ENSGT00940000156876.k.b ENSGT00940000163116 ENSGT00950000183076.a.b.b.a.a ENSGT00390000010652.C Sooty mangabey MODERN SPECIES 215 LYSMD4 (ENSCATG00000045215) ENSCATG00000041680 MEF2A (ENSCATG00000013642) ENSCATG00000022742 LRRC28 (ENSCATG00000040008) ENSCATG00000013868 TTC23 (ENSCATG00000030495) SYNM (ENSCATG00000025065) PGPEP1L (ENSCATG00000028080) IGF1R (ENSCATG00000027553) ENSCATG00000036401 ENSCATG00000037029 ARRDC4 (ENSCATG00000042268) ENSCATG00000039546 ENSCATG00000030455 ENSCATG00000038786 ##22 NR2F2 (ENSCATG00000031188) ENSCATG00000018962 MCTP2 (ENSCATG00000040946) ENSCATG00000044758 RGMA (ENSCATG00000031113) CHD2 (ENSCATG00000031069) FAM174B (ENSCATG00000037463) ST8SIA2 (ENSCATG00000035756) ENSCATG00000037617 SLCO3A1 (ENSCATG00000037751) SV2B (ENSCATG00000040402) Drill MODERN SPECIES 1648 ENSMLEG00000022570 ENSMLEG00000026190 MEF2A (ENSMLEG00000040969) ENSMLEG00000043137 LRRC28 (ENSMLEG00000028357) ENSMLEG00000029728 TTC23 (ENSMLEG00000042651) SYNM (ENSMLEG00000027302) PGPEP1L (ENSMLEG00000039938) IGF1R (ENSMLEG00000036236) ENSMLEG00000043699 ENSMLEG00000018383 ARRDC4 (ENSMLEG00000026370) ENSMLEG00000033372 ENSMLEG00000037058 ENSMLEG00000027490 ##22 NR2F2 (ENSMLEG00000039345) ENSMLEG00000022024 MCTP2 (ENSMLEG00000035947) ENSMLEG00000040680 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.c.a.b ##22 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 557 ENSMNEG00000036969 ENSMNEG00000031350 LYSMD4 (ENSMNEG00000040707) ENSMNEG00000031780 MEF2A (ENSMNEG00000030025) ENSMNEG00000019113 ENSMNEG00000032848 LRRC28 (ENSMNEG00000037760) TTC23 (ENSMNEG00000029743) SYNM (ENSMNEG00000033330) PGPEP1L (ENSMNEG00000021363) IGF1R (ENSMNEG00000038485) ENSMNEG00000022749 ARRDC4 (ENSMNEG00000038340) ENSMNEG00000037257 ENSMNEG00000040826 ##22 NR2F2 (ENSMNEG00000035712) ENSMNEG00000043107 MCTP2 (ENSMNEG00000035810) ENSMNEG00000031378 RGMA (ENSMNEG00000034257) CHD2 (ENSMNEG00000036875) ENSMNEG00000037638 FAM174B (ENSMNEG00000045033) ENSMNEG00000039640 ST8SIA2 (ENSMNEG00000035925) SLCO3A1 (ENSMNEG00000034162) SV2B (ENSMNEG00000040435) Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 1039 ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.c.a.b ##22 ENSGT00940000157540.A.j Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 320 ENSRBIG00000039629 ENSRBIG00000007021 ENSRBIG00000032734 ##22 ENSRBIG00000029319 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT01030000234515.a.b.a.b ENSGT00940000158773 ENSGT00940000160583 ENSGT00910000146870 ENSGT00940000156205 ENSGT00940000170417 ENSGT00940000157771 ENSGT00530000063847.a ENSGT00940000159268 ENSGT00390000015368.a.b ENSGT00940000156682 ENSGT00510000048902.b ENSGT00940000160523 ENSGT00910000146810 ENSGT00530000063727.A.j ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.c.a.b ##22 ENSGT00940000157540.A ENSGT00940000161069.f ENSGT00390000017267.i.b ENSGT00860000135750 ENSGT00940000156291 ENSGT00950000183112.a ENSGT00940000155888 ENSGT00940000157160.e ENSGT00730000111392 ENSGT00910000147013 ENSGT01030000234535.F.a ENSGT00940000153052.c.b.b.a.b ENSGT01080000257410.A.f ENSGT00950000182940.b.a.a ENSGT00940000156813 Hominidae ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT01030000234515.a.b.a.b ENSGT00940000158773 ENSGT00940000160583 ENSGT00910000146870 ENSGT00940000156205 ENSGT00940000170417 ENSGT00940000157771 ENSGT00530000063847.a ENSGT00940000159268 ENSGT00390000015368.a.b ENSGT00940000156682 ENSGT00510000048902.b ENSGT00940000160523 ENSGT00390000010718 ENSGT00530000063727.A.j ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.c.a.b ##22 ENSGT00940000157540.A ENSGT00390000017267.i.b ENSGT00860000135750 ENSGT00940000156291 ENSGT00950000183112.a ENSGT00940000155888 ENSGT00730000111392 ENSGT00910000147013 ENSGT01030000234535.F.a ENSGT00940000153052.c.b.b.a.b ENSGT01080000257410.A.f ENSGT00950000182940.b.a.a ENSGT00940000156813 ENSGT00390000009453 ENSGT00940000162149 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00940000158773 ENSGT00910000147385 ENSGT00940000160583 ENSGT00910000146870 ENSGT00940000156205 ENSGT00940000170417 ENSGT00940000157771 ENSGT00530000063847.a ENSGT00940000159268 ENSGT00390000015368.a.b ENSGT00940000156682 ENSGT00510000048902.b ENSGT00940000160523 ENSGT00390000010718 ENSGT00530000063727.A.j ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.c.a.b ##22 ENSGT00940000157540.A ENSGT00390000017267.i.b ENSGT00860000135750 ENSGT00940000156291 ENSGT00950000183112.a ENSGT00940000155888 ENSGT00730000111392 ENSGT00910000147013 ENSGT01030000234535.F.a ENSGT00940000153052.c.b.b.a.b ENSGT01080000257410.A.f ENSGT00950000182940.b.a.a ENSGT00940000156813 ENSGT00390000009453 ENSGT00940000162149 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT01030000234515.a.b.a.b ENSGT00940000158773 ENSGT00910000147385 ENSGT00940000160583 ENSGT00940000156205 ENSGT00940000170417 ENSGT00940000157771 ENSGT00530000063847.a ENSGT00940000159268 ENSGT00390000015368.a.b ENSGT00940000156682 ENSGT00510000048902.b ENSGT00940000160523 ENSGT00390000010718 ENSGT00530000063727.A.j ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.c.a.b ##22 ENSGT00940000157540.A ENSGT00390000017267.i.b ENSGT00860000135750 ENSGT00940000156291 ENSGT00950000183112.a ENSGT00940000155888 ENSGT00730000111392 ENSGT00910000147013 ENSGT01030000234535.F.a ENSGT00940000153052.c.b.b.a.b ENSGT01080000257410.A.f ENSGT00950000182940.b.a.a ENSGT00940000156813 ENSGT00390000009453 ENSGT00940000162149 Pan ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT01030000234515.a.b.a.b ENSGT00940000158773 ENSGT00910000147385 ENSGT00940000160583 ENSGT00940000156205 ENSGT00940000170417 ENSGT00940000157771 ENSGT00530000063847.a ENSGT00940000159268 ENSGT00390000015368.a.b ENSGT00940000156682 ENSGT00510000048902.b ENSGT00940000160523 ENSGT00390000010718 ENSGT00530000063727.A.j ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.c.a.b ##22 ENSGT00940000157540.A ENSGT00390000017267.i.b ENSGT00860000135750 ENSGT00940000156291 ENSGT00950000183112.a ENSGT00940000155888 ENSGT00940000157160.e ENSGT00730000111392 ENSGT00910000147013 ENSGT01030000234535.F.a ENSGT00940000153052.c.b.b.a.b ENSGT01080000257410.A.f ENSGT00950000182940.b.a.a ENSGT00940000156813 ENSGT00390000009453 Chimpanzee MODERN SPECIES 6 CERS3 (ENSPTRG00000007502) ADAMTS17 (ENSPTRG00000007500) ENSPTRG00000047954 LYSMD4 (ENSPTRG00000007497) MEF2A (ENSPTRG00000007496) ENSPTRG00000046616 LRRC28 (ENSPTRG00000007495) TTC23 (ENSPTRG00000007494) SYNM (ENSPTRG00000007493) ENSPTRG00000007492 IGF1R (ENSPTRG00000007489) FAM169B (ENSPTRG00000042426) ARRDC4 (ENSPTRG00000007487) SPATA8 (ENSPTRG00000007486) ENSPTRG00000045669 ENSPTRG00000044433 ##22 NR2F2 (ENSPTRG00000044693) ENSPTRG00000052493 ENSPTRG00000043984 MCTP2 (ENSPTRG00000007482) RGMA (ENSPTRG00000007480) CHD2 (ENSPTRG00000007478) ENSPTRG00000044489 ENSPTRG00000042874 FAM174B (ENSPTRG00000007475) ENSPTRG00000047348 ST8SIA2 (ENSPTRG00000049717) ENSPTRG00000052368 SLCO3A1 (ENSPTRG00000007471) SV2B (ENSPTRG00000007469) VPS33B (ENSPTRG00000007468) Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.c.b ##22 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.c.b ##22 Mas night monkey MODERN SPECIES 321 GRM7 (ENSANAG00000036825) LMCD1 (ENSANAG00000034565) SSUH2 (ENSANAG00000038074) ENSANAG00000025958 CAV3 (ENSANAG00000027621) OXTR (ENSANAG00000031655) RAD18 (ENSANAG00000033360) ENSANAG00000037778 SRGAP3 (ENSANAG00000034431) ENSANAG00000024293 ##22 THUMPD3 (ENSANAG00000002365) SETD5 (ENSANAG00000005767) LHFPL4 (ENSANAG00000032953) MTMR14 (ENSANAG00000033686) CPNE9 (ENSANAG00000034969) BRPF1 (ENSANAG00000019372) OGG1 (ENSANAG00000037964) CAMK1 (ENSANAG00000027843) TADA3 (ENSANAG00000031129) ENSANAG00000037313 TTLL3 (ENSANAG00000025962) ENSANAG00000029371 ENSANAG00000030547 ENSANAG00000031570 SLC6A1 (ENSANAG00000028300) Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.c.b ##22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.c.b ##22 Capuchin MODERN SPECIES 219 ATP6V1FNB (ENSCCAG00000033294) ENSCCAG00000034897 FLNC (ENSCCAG00000022550) CCDC136 (ENSCCAG00000034758) OPN1SW (ENSCCAG00000037669) CALU (ENSCCAG00000037513) FAM71F1 (ENSCCAG00000032023) FAM71F2 (ENSCCAG00000028902) IMPDH (ENSCCAG00000020872) PRRT4 (ENSCCAG00000024784) RBM28 (ENSCCAG00000035105) ENSCCAG00000022053 LEP (ENSCCAG00000032161) ENSCCAG00000025380 LRRC4 (ENSCCAG00000002650) ENSCCAG00000014968 ##22 SND1 (ENSCCAG00000036847) PAX4 (ENSCCAG00000005730) FSCN3 (ENSCCAG00000026519) ENSCCAG00000027943 GCC1 (ENSCCAG00000022144) ZNF800 (ENSCCAG00000021078) GRM8 (ENSCCAG00000020804) Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.c.b ##22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.c.b ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.c.b ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 243 ENSGT00550000074994.p ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.c.b ##22 Macaca ANCESTRAL SPECIES 181 ENSGT00550000074994.p ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.c.b ##22 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 190 ENSMNEG00000042479 ENSMNEG00000042773 VWC2 (ENSMNEG00000035702) ZPBP (ENSMNEG00000008202) SPATA48 (ENSMNEG00000040240) IKZF1 (ENSMNEG00000033465) ENSMNEG00000028866 DDC (ENSMNEG00000000178) GRB10 (ENSMNEG00000039855) ENSMNEG00000042806 COBL (ENSMNEG00000044240) ENSMNEG00000013900 ENSMNEG00000042241 ENSMNEG00000037561 ENSMNEG00000019174 ENSMNEG00000034131 ##22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 250 ENSGT00550000074994.p ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.c.b ##22 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 354 ENSGT00550000074994.p ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.c.b ##22 Drill MODERN SPECIES 1237 ENSMLEG00000040898 ##22 Sooty mangabey MODERN SPECIES 133 SUN3 (ENSCATG00000036420) C7orf57 (ENSCATG00000028895) UPP1 (ENSCATG00000040025) ABCA13 (ENSCATG00000034377) CDC14C (ENSCATG00000032252) ENSCATG00000044759 VWC2 (ENSCATG00000009270) ZPBP (ENSCATG00000036172) SPATA48 (ENSCATG00000036782) IKZF1 (ENSCATG00000041205) DDC (ENSCATG00000013954) GRB10 (ENSCATG00000026832) COBL (ENSCATG00000031936) ENSCATG00000031533 ENSCATG00000035640 ENSCATG00000033364 ##22 VSTM2A (ENSCATG00000018326) ENSCATG00000017520 SEC61G (ENSCATG00000036780) ENSCATG00000029935 EGFR (ENSCATG00000039642) LANCL2 (ENSCATG00000038535) VOPP1 (ENSCATG00000014863) Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.c.b ##22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.c.b ##22 Orangutan MODERN SPECIES 2 KCNK7 (ENSPPYG00000003059) EHBP1L1 (ENSPPYG00000003060) FAM89B (ENSPPYG00000003061) ZNRD2 (ENSPPYG00000003062) LTBP3 (ENSPPYG00000003063) SCYL1 (ENSPPYG00000003064) ENSPPYG00000030176 ENSPPYG00000003066 FRMD8 (ENSPPYG00000031154) SLC25A45 (ENSPPYG00000003067) TIGD3 (ENSPPYG00000003068) DPF2 (ENSPPYG00000003069) CDC42EP2 (ENSPPYG00000032097) POLA2 (ENSPPYG00000003071) CAPN1 (ENSPPYG00000003073) ENSPPYG00000041044 ##22 SPDYC (ENSPPYG00000003074) ENSPPYG00000032178 SYVN1 (ENSPPYG00000003075) MRPL49 (ENSPPYG00000037407) FAU (ENSPPYG00000038797) ZNHIT2 (ENSPPYG00000003078) TM7SF2 (ENSPPYG00000003079) VPS51 (ENSPPYG00000003080) TMEM262 (ENSPPYG00000040202) ZFPL1 (ENSPPYG00000003082) ENSPPYG00000003083 NAALADL1 (ENSPPYG00000003084) SAC3D1 (ENSPPYG00000003085) ENSPPYG00000003086 ARL2 (ENSPPYG00000038004) Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.d ##22 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.d ##22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.d ##22 Marmoset MODERN SPECIES 3 ENSCJAG00000041013 ##22 POLR3K (ENSCJAG00000011568) SNRNP25 (ENSCJAG00000080317) MPG (ENSCJAG00000011582) NPRL3 (ENSCJAG00000011598) HBZ (ENSCJAG00000043819) HBM (ENSCJAG00000011639) ENSCJAG00000011647 HBQ1 (ENSCJAG00000011671) LUC7L (ENSCJAG00000011674) FAM234A (ENSCJAG00000037284) RGS11 (ENSCJAG00000011745) ARHGDIG (ENSCJAG00000061079) AXIN1 (ENSCJAG00000011809) MRPL28 (ENSCJAG00000083388) PGAP6 (ENSCJAG00000011857) Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.d ##22 Capuchin MODERN SPECIES 58 C11orf94 (ENSCCAG00000021208) PEX16 (ENSCCAG00000030937) LARGE2 (ENSCCAG00000022292) PHF21A (ENSCCAG00000031643) ENSCCAG00000032167 CREB3L1 (ENSCCAG00000036096) DGKZ (ENSCCAG00000027153) ENSCCAG00000030225 CHRM4 (ENSCCAG00000016622) AMBRA1 (ENSCCAG00000036631) HARBI1 (ENSCCAG00000033538) ATG13 (ENSCCAG00000033415) ARHGAP1 (ENSCCAG00000005865) ZNF408 (ENSCCAG00000029472) F2 (ENSCCAG00000028699) PGAM4 (ENSCCAG00000037081) ##22 CKAP5 (ENSCCAG00000029859) ENSCCAG00000033202 LRP4 (ENSCCAG00000034888) C11orf49 (ENSCCAG00000028967) ENSCCAG00000036464 PACSIN3 (ENSCCAG00000031265) DDB2 (ENSCCAG00000031012) ACP2 (ENSCCAG00000022333) NR1H3 (ENSCCAG00000024854) MADD (ENSCCAG00000036617) MYBPC3 (ENSCCAG00000036859) SPI1 (ENSCCAG00000022473) SLC39A13 (ENSCCAG00000034535) PSMC3 (ENSCCAG00000025080) RAPSN (ENSCCAG00000022014) Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 42 FREY1 (ENSSBOG00000032977) PEX16 (ENSSBOG00000001635) LARGE2 (ENSSBOG00000024444) PHF21A (ENSSBOG00000026213) CREB3L1 (ENSSBOG00000026826) DGKZ (ENSSBOG00000028666) ENSSBOG00000025813 CHRM4 (ENSSBOG00000015294) AMBRA1 (ENSSBOG00000021917) HARBI1 (ENSSBOG00000025915) ATG13 (ENSSBOG00000009657) ARHGAP1 (ENSSBOG00000032970) ZNF408 (ENSSBOG00000033023) F2 (ENSSBOG00000020779) CKAP5 (ENSSBOG00000031735) ENSSBOG00000028063 ##22 ENSSBOG00000032726 LRP4 (ENSSBOG00000032261) CSTPP1 (ENSSBOG00000033686) ENSSBOG00000031368 PACSIN3 (ENSSBOG00000033696) DDB2 (ENSSBOG00000030867) ACP2 (ENSSBOG00000033600) NR1H3 (ENSSBOG00000027982) MADD (ENSSBOG00000021915) MYBPC3 (ENSSBOG00000030340) SPI1 (ENSSBOG00000022091) SLC39A13 (ENSSBOG00000010603) ENSSBOG00000006227 RAPSN (ENSSBOG00000022262) CELF1 (ENSSBOG00000021912) Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.d ##22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.d ##22 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 984 ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.d ##22 ENSGT00940000154939 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1200 ENSRROG00000008761 SLC16A9 (ENSRROG00000033335) MRLN (ENSRROG00000005710) ENSRROG00000039976 CCDC6 (ENSRROG00000035795) ENSRROG00000030358 ##22 ANK3 (ENSRROG00000007163) ENSRROG00000041085 CDK1 (ENSRROG00000043415) RHOBTB1 (ENSRROG00000038093) Black snub-nosed monkey DUPLICATION Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 534 SATB1 (ENSRBIG00000042854) ENSRBIG00000036838 ENSRBIG00000037606 TBC1D5 (ENSRBIG00000034049) PLCL2 (ENSRBIG00000043534) ENSRBIG00000015911 ENSRBIG00000034010 ENSRBIG00000009846 ##22 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1778 ENSRBIG00000038020 ##22 ENSRBIG00000043508 ANK3 (ENSRBIG00000029117) CDK1 (ENSRBIG00000044302) RHOBTB1 (ENSRBIG00000019190) TMEM26 (ENSRBIG00000034827) CABCOCO1 (ENSRBIG00000034467) ARID5B (ENSRBIG00000033016) RTKN2 (ENSRBIG00000036892) Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.d ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.d ##22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.d ##22 Olive baboon MODERN SPECIES 6 ARHGEF7 (ENSPANG00000019938) ANKRD10 (ENSPANG00000035969) ING1 (ENSPANG00000015880) CARS2 (ENSPANG00000017574) NAXD (ENSPANG00000000957) RAB20 (ENSPANG00000044058) COL4A2 (ENSPANG00000012522) COL4A1 (ENSPANG00000004421) IRS2 (ENSPANG00000029692) MYO16 (ENSPANG00000012679) ENSPANG00000019731 LIG4 (ENSPANG00000007562) ENSPANG00000045788 ENSPANG00000046676 NALF1 (ENSPANG00000009295) ENSPANG00000011850 ##22 ENSPANG00000044135 ENSPANG00000050745 ENSPANG00000037981 ARGLU1 (ENSPANG00000049597) EFNB2 (ENSPANG00000004281) ENSPANG00000007600 ENSPANG00000048625 ENSPANG00000041499 ENSPANG00000042101 ENSPANG00000046932 ENSPANG00000038142 SLC10A2 (ENSPANG00000049257) METTL21EP (ENSPANG00000008110) ENSPANG00000007563 POGLUT2 (ENSPANG00000018248) Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.d ##22 Drill MODERN SPECIES 1591 ENSMLEG00000015628 ##22 ARGLU1 (ENSMLEG00000005466) EFNB2 (ENSMLEG00000036784) Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.d ##22 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.d ##22 Crab-eating macaque MODERN SPECIES 1 PLCG1 (ENSMFAG00000000283) ZHX3 (ENSMFAG00000038640) ENSMFAG00000047948 LPIN3 (ENSMFAG00000038975) EMILIN3 (ENSMFAG00000045816) CHD6 (ENSMFAG00000032830) PTPRT (ENSMFAG00000002480) ENSMFAG00000030794 ENSMFAG00000032571 SRSF6 (ENSMFAG00000036925) L3MBTL1 (ENSMFAG00000032249) SGK2 (ENSMFAG00000032486) IFT52 (ENSMFAG00000044608) MYBL2 (ENSMFAG00000032458) ENSMFAG00000062509 ENSMFAG00000026943 ##22 TOX2 (ENSMFAG00000036799) JPH2 (ENSMFAG00000002372) OSER1 (ENSMFAG00000000578) GDAP1L1 (ENSMFAG00000031122) ENSMFAG00000057869 FITM2 (ENSMFAG00000044491) R3HDML (ENSMFAG00000038530) HNF4A (ENSMFAG00000035660) ENSMFAG00000053985 TTPAL (ENSMFAG00000036596) SERINC3 (ENSMFAG00000045198) PKIG (ENSMFAG00000003009) ENSMFAG00000042071 CCN5 (ENSMFAG00000036685) RIMS4 (ENSMFAG00000052597) Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 550 CC2D2B (ENSMNEG00000042350) CCNJ (ENSMNEG00000034961) ZNF518A (ENSMNEG00000028261) BLNK (ENSMNEG00000031238) DNTT (ENSMNEG00000043593) OPALIN (ENSMNEG00000036553) TLL2 (ENSMNEG00000000061) TM9SF3 (ENSMNEG00000040908) PIK3AP1 (ENSMNEG00000033410) LCOR (ENSMNEG00000030522) SLIT1 (ENSMNEG00000030571) ARHGAP19 (ENSMNEG00000042296) FRAT1 (ENSMNEG00000029910) FRAT2 (ENSMNEG00000006562) RRP12 (ENSMNEG00000036759) ENSMNEG00000028115 ##22 EXOSC1 (ENSMNEG00000029816) ZDHHC16 (ENSMNEG00000027994) MMS19 (ENSMNEG00000044701) UBTD1 (ENSMNEG00000039022) ANKRD2 (ENSMNEG00000039814) MORN4 (ENSMNEG00000035432) PI4K2A (ENSMNEG00000020019) AVPI1 (ENSMNEG00000032294) MARVELD1 (ENSMNEG00000009162) ZFYVE27 (ENSMNEG00000039230) SFRP5 (ENSMNEG00000043178) GOLGA7B (ENSMNEG00000033947) ENSMNEG00000001433 CRTAC1 (ENSMNEG00000035544) R3HCC1L (ENSMNEG00000037890) Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.d ##22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.d ##22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.d ##22 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.d ##22 Human MODERN SPECIES 1827 RPS6KA6 (ENSG00000072133) CYLC1 (ENSG00000183035) POU3F4 (ENSG00000196767) SH3BGRL (ENSG00000131171) HMGN5 (ENSG00000198157) BRWD3 (ENSG00000165288) TENT5D (ENSG00000174016) TBX22 (ENSG00000122145) ITM2A (ENSG00000078596) GPR174 (ENSG00000147138) P2RY10 (ENSG00000078589) LPAR4 (ENSG00000147145) RTL3 (ENSG00000179300) CYSLTR1 (ENSG00000173198) TAF9B (ENSG00000187325) PGAM4 (ENSG00000226784) ##22 PGK1 (ENSG00000102144) ATP7A (ENSG00000165240) COX7B (ENSG00000131174) MAGT1 (ENSG00000102158) ATRX (ENSG00000085224) FGF16 (ENSG00000196468) MAGEE1 (ENSG00000198934) PBDC1 (ENSG00000102390) MAGEE2 (ENSG00000186675) ZDHHC15 (ENSG00000102383) UPRT (ENSG00000094841) ABCB7 (ENSG00000131269) NEXMIF (ENSG00000050030) RLIM (ENSG00000131263) SLC16A2 (ENSG00000147100) Gorilla MODERN SPECIES 22 ENSGGOG00000039378 ZBTB5 (ENSGGOG00000043647) GRHPR (ENSGGOG00000003710) ZCCHC7 (ENSGGOG00000034973) PAX5 (ENSGGOG00000003633) MELK (ENSGGOG00000014746) RNF38 (ENSGGOG00000016336) GNE (ENSGGOG00000013160) CLTA (ENSGGOG00000013155) CCIN (ENSGGOG00000027920) GLIPR2 (ENSGGOG00000003324) RECK (ENSGGOG00000003313) ENSGGOG00000024545 ENSGGOG00000024475 ENSGGOG00000024643 ENSGGOG00000024966 ##22 SPAAR (ENSGGOG00000039944) HRCT1 (ENSGGOG00000036981) ENSGGOG00000043128 OR13J1 (ENSGGOG00000028587) ENSGGOG00000007705 FAM221B (ENSGGOG00000011270) HINT2 (ENSGGOG00000011265) SPAG8 (ENSGGOG00000011256) NPR2 (ENSGGOG00000011241) RGP1 (ENSGGOG00000007370) MSMP (ENSGGOG00000007374) GBA2 (ENSGGOG00000007356) CREB3 (ENSGGOG00000007353) ENSGGOG00000007440 CD72 (ENSGGOG00000017153) Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b ##22 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b ##22 Suina ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b ##22 Chacoan peccary MODERN SPECIES 955 CCNJ (ENSCWAG00000017468) BLNK (ENSCWAG00000016542) DNTT (ENSCWAG00000016338) OPALIN (ENSCWAG00000015720) TLL2 (ENSCWAG00000015533) TM9SF3 (ENSCWAG00000015473) PIK3AP1 (ENSCWAG00000015321) ENSCWAG00000015271 LCOR (ENSCWAG00000015211) SLIT1 (ENSCWAG00000014663) ARHGAP19 (ENSCWAG00000014322) FRAT1 (ENSCWAG00000014264) FRAT2 (ENSCWAG00000014245) RRP12 (ENSCWAG00000014123) ENSCWAG00000014086 PGAM4 (ENSCWAG00000014065) ##22 EXOSC1 (ENSCWAG00000013946) ENSCWAG00000013760 MMS19 (ENSCWAG00000013469) UBTD1 (ENSCWAG00000013405) ANKRD2 (ENSCWAG00000013015) HOGA1 (ENSCWAG00000012895) MORN4 (ENSCWAG00000012823) PI4K2A (ENSCWAG00000012772) AVPI1 (ENSCWAG00000012736) MARVELD1 (ENSCWAG00000012717) ZFYVE27 (ENSCWAG00000012082) SFRP5 (ENSCWAG00000011979) GOLGA7B (ENSCWAG00000011885) CRTAC1 (ENSCWAG00000020281) R3HCC1L (ENSCWAG00000020239) Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b ##22 Camelidae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT01100000263542.C ENSGT00940000156590 ENSGT00940000156981 ENSGT00940000162006 ENSGT00940000155715 ENSGT00940000158584 ENSGT00390000009395 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155493 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00940000157331 ENSGT00390000007081.b ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d.c.b ##22 ENSGT00390000015287 ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00390000015820 ENSGT00530000063604.A ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 Alpaca MODERN SPECIES 4085 ENSVPAG00000004947 ##22 Arabian camel MODERN SPECIES 2 ENSCDRG00005010552 CCNJ (ENSCDRG00005010456) ZNF518A (ENSCDRG00005010426) BLNK (ENSCDRG00005010120) DNTT (ENSCDRG00005009911) OPALIN (ENSCDRG00005009332) TLL2 (ENSCDRG00005009257) TM9SF3 (ENSCDRG00005008940) PIK3AP1 (ENSCDRG00005008820) ENSCDRG00005008738 LCOR (ENSCDRG00005008609) SLIT1 (ENSCDRG00005008525) ARHGAP19 (ENSCDRG00005008432) FRAT1 (ENSCDRG00005008405) RRP12 (ENSCDRG00005008039) PGAM4 (ENSCDRG00005007987) ##22 EXOSC1 (ENSCDRG00005007159) ZDHHC16 (ENSCDRG00005006637) MMS19 (ENSCDRG00005006081) UBTD1 (ENSCDRG00005006007) ANKRD2 (ENSCDRG00005005898) C10orf62 (ENSCDRG00005005880) HOGA1 (ENSCDRG00005005801) MORN4 (ENSCDRG00005005757) PI4K2A (ENSCDRG00005005722) AVPI1 (ENSCDRG00005005710) MARVELD1 (ENSCDRG00005005688) ZFYVE27 (ENSCDRG00005005050) SFRP5 (ENSCDRG00005004990) GOLGA7B (ENSCDRG00005004929) CRTAC1 (ENSCDRG00005004684) Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b ##22 Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b ##22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b ##22 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b ##22 Bovinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b ##22 Bos ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b ##22 Bos_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b ##22 Cow MODERN SPECIES 27 TMEM252 (ENSBTAG00000011874) PIP5K1B (ENSBTAG00000009917) FXN (ENSBTAG00000001306) TJP2 (ENSBTAG00000011770) ENTREP1 (ENSBTAG00000011173) APBA1 (ENSBTAG00000008877) PTAR1 (ENSBTAG00000005826) CFAP95 (ENSBTAG00000033396) MAMDC2 (ENSBTAG00000017369) SMC5 (ENSBTAG00000018437) ENSBTAG00000052999 KLF9 (ENSBTAG00000016229) TRPM3 (ENSBTAG00000007778) TRPM3 (ENSBTAG00000050253) CEMIP2 (ENSBTAG00000005090) ENSBTAG00000054590 ##22 ABHD17B (ENSBTAG00000006816) C8H9orf85 (ENSBTAG00000006831) GDA (ENSBTAG00000011545) ZFAND5 (ENSBTAG00000009417) ENSBTAG00000054894 TMC1 (ENSBTAG00000018778) ENSBTAG00000052698 ALDH1A1 (ENSBTAG00000008103) ANXA1 (ENSBTAG00000015978) ENSBTAG00000053207 RORB (ENSBTAG00000021699) TRPM6 (ENSBTAG00000033076) ENSBTAG00000051504 C8H9orf40 (ENSBTAG00000013231) CARNMT1 (ENSBTAG00000008204) Bos_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b ##22 Wild yak MODERN SPECIES 2435 ENSBMUG00000018296 ##22 Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b ##22 Rambouillet Sheep DUPLICATION Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 4 ENSOARG00020025351 ENSOARG00020025359 SNRPB2 (ENSOARG00020025367) OTOR (ENSOARG00020025370) NANP (ENSOARG00020025376) ENSOARG00020003187 ENSOARG00020003227 ENSOARG00020003271 FBH1 (ENSOARG00020003456) ENSOARG00020003590 IL2RA (ENSOARG00020003621) RBM17 (ENSOARG00020003664) PFKFB3 (ENSOARG00020003727) PRKCQ (ENSOARG00020003986) SFMBT2 (ENSOARG00020004270) ENSOARG00020004315 ##22 ITIH5 (ENSOARG00020004363) ENSOARG00020004546 ITIH2 (ENSOARG00020004566) KIN (ENSOARG00020004659) ATP5F1C (ENSOARG00020004769) TAF3 (ENSOARG00020004833) GATA3 (ENSOARG00020004895) CELF2 (ENSOARG00020005064) USP6NL (ENSOARG00020005525) ECHDC3 (ENSOARG00020005746) ENSOARG00020005780 UPF2 (ENSOARG00020005801) DHTKD1 (ENSOARG00020005895) SEC61A2 (ENSOARG00020006097) NUDT5 (ENSOARG00020007141) Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 13 JAM3 (ENSOARG00020009874) IGSF9B (ENSOARG00020010264) SPATA19 (ENSOARG00020010923) OPCML (ENSOARG00020011005) ENSOARG00020011324 ENSOARG00020011407 TMEM45B (ENSOARG00020011458) NFRKB (ENSOARG00020011602) PRDM10 (ENSOARG00020011870) APLP2 (ENSOARG00020012094) ENSOARG00020012954 ST14 (ENSOARG00020013007) ZBTB44 (ENSOARG00020013898) ADAMTS15 (ENSOARG00020014165) SNX19 (ENSOARG00020014289) ENSOARG00020014561 ##22 MS4A8 (ENSOARG00020014608) ENSOARG00020014643 MS4A15 (ENSOARG00020014705) CCDC86 (ENSOARG00020015152) PTGDR2 (ENSOARG00020015206) PRPF19 (ENSOARG00020015225) TMEM109 (ENSOARG00020015313) TMEM132A (ENSOARG00020015357) SLC15A3 (ENSOARG00020015451) ENSOARG00020015709 VPS37C (ENSOARG00020015860) ENSOARG00020015937 ENSOARG00020016043 ENSOARG00020016221 ENSOARG00020016320 Cetacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b ##22 Blue whale MODERN SPECIES 7 CCNJ (ENSBMSG00010017383) ZNF518A (ENSBMSG00010017358) BLNK (ENSBMSG00010016850) DNTT (ENSBMSG00010016661) OPALIN (ENSBMSG00010016051) TLL2 (ENSBMSG00010015946) TM9SF3 (ENSBMSG00010015811) PIK3AP1 (ENSBMSG00010015684) ENSBMSG00010015636 LCOR (ENSBMSG00010015588) SLIT1 (ENSBMSG00010015125) ARHGAP19 (ENSBMSG00010014875) FRAT1 (ENSBMSG00010014808) FRAT2 (ENSBMSG00010014789) RRP12 (ENSBMSG00010014708) PGAM4 (ENSBMSG00010014630) ##22 EXOSC1 (ENSBMSG00010014544) ZDHHC16 (ENSBMSG00010014246) MMS19 (ENSBMSG00010014036) UBTD1 (ENSBMSG00010021584) ANKRD2 (ENSBMSG00010021528) HOGA1 (ENSBMSG00010021510) ENSBMSG00010021499 PI4K2A (ENSBMSG00010021477) AVPI1 (ENSBMSG00010021470) MARVELD1 (ENSBMSG00010021463) SFRP5 (ENSBMSG00010021454) ENSBMSG00010021433 ZFYVE27 (ENSBMSG00010021315) CRTAC1 (ENSBMSG00010021195) R3HCC1L (ENSBMSG00010021112) Odontoceti ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b ##22 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b ##22 Dolphin MODERN SPECIES 2524 ENSTTRG00000009856 LCOR (ENSTTRG00000009862) SLIT1 (ENSTTRG00000009865) ARHGAP19 (ENSTTRG00000009873) FRAT1 (ENSTTRG00000009877) RRP12 (ENSTTRG00000009878) ENSTTRG00000009885 ##22 EXOSC1 (ENSTTRG00000009887) ZDHHC16 (ENSTTRG00000009890) MMS19 (ENSTTRG00000009892) UBTD1 (ENSTTRG00000009894) ANKRD2 (ENSTTRG00000009895) HOGA1 (ENSTTRG00000009896) C10orf62 (ENSTTRG00000009897) MORN4 (ENSTTRG00000009898) PI4K2A (ENSTTRG00000009899) ENSTTRG00000009900 MARVELD1 (ENSTTRG00000009901) ZFYVE27 (ENSTTRG00000009902) SFRP5 (ENSTTRG00000009903) GOLGA7B (ENSTTRG00000009904) CRTAC1 (ENSTTRG00000009905) Sperm whale DUPLICATION Sperm whale MODERN SPECIES 1034 ENSPCTG00005015606 ##22 Sperm whale MODERN SPECIES SERPINI2 (ENSPCTG00005000778) PDCD10 (ENSPCTG00005000801) SERPINI1 (ENSPCTG00005000818) GOLIM4 (ENSPCTG00005000852) ENSPCTG00005000924 MECOM (ENSPCTG00005000999) ACTRT3 (ENSPCTG00005001252) MYNN (ENSPCTG00005001270) LRRC34 (ENSPCTG00005001296) LRRIQ4 (ENSPCTG00005001334) LRRC31 (ENSPCTG00005001353) SAMD7 (ENSPCTG00005001374) SEC62 (ENSPCTG00005001393) GPR160 (ENSPCTG00005001412) PHC3 (ENSPCTG00005001443) ENSPCTG00005001517 ##22 PRKCI (ENSPCTG00005001542) SKIL (ENSPCTG00005001599) CLDN11 (ENSPCTG00005001618) SLC7A14 (ENSPCTG00005001634) ENSPCTG00005001650 RPL22L1 (ENSPCTG00005001662) EIF5A2 (ENSPCTG00005001682) SLC2A2 (ENSPCTG00005001701) TNIK (ENSPCTG00005001786) PLD1 (ENSPCTG00005001936) TMEM212 (ENSPCTG00005002038) FNDC3B (ENSPCTG00005002082) GHSR (ENSPCTG00005002161) TNFSF10 (ENSPCTG00005002181) NCEH1 (ENSPCTG00005002205) Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b ##22 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000164312 ENSGT00940000156590 ENSGT00940000156981 ENSGT00940000155715 ENSGT00940000158584 ENSGT00390000009395 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155493 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000162611.a ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00940000157331 ENSGT00390000007081.a ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d.c.b ##22 ENSGT00390000015287 ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00530000063604.A ENSGT00390000015820 ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 ENSGT00530000063711.b Tenrec MODERN SPECIES 11626 ENSETEG00000008034 ##22 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT01100000263542.C ENSGT00940000156590 ENSGT00940000156981 ENSGT00940000155715 ENSGT00940000158584 ENSGT00390000009395 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155493 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000162611.a ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00940000157331 ENSGT00390000007081.a ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d.c.b ##22 ENSGT00390000015287 ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00530000063604.A ENSGT00390000015820 ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 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Zebra finch MODERN SPECIES 28 DPCD (ENSTGUG00000009967) FBXW4 (ENSTGUG00000009903) FGF8 (ENSTGUG00000009956) NPM3 (ENSTGUG00000009948) OGA (ENSTGUG00000009938) KCNIP2 (ENSTGUG00000009911) ARMH3 (ENSTGUG00000009880) HPS6 (ENSTGUG00000009875) ENSTGUG00000009862 LDB1 (ENSTGUG00000009855) PPRC1 (ENSTGUG00000009839) LCOR (ENSTGUG00000009834) SLIT1 (ENSTGUG00000009734) ARHGAP19 (ENSTGUG00000009730) RRP12 (ENSTGUG00000009711) ENSTGUG00000021202 #22 EXOSC1 (ENSTGUG00000009692) ZDHHC16 (ENSTGUG00000009668) MMS19 (ENSTGUG00000009642) UBTD1 (ENSTGUG00000009637) ANKRD2 (ENSTGUG00000022547) HOGA1 (ENSTGUG00000009624) MORN4 (ENSTGUG00000009616) PI4K2A (ENSTGUG00000009606) AVPI1 (ENSTGUG00000025747) ZFYVE27 (ENSTGUG00000009586) SFRP5 (ENSTGUG00000023601) GOLGA7B (ENSTGUG00000026467) CRTAC1 (ENSTGUG00000009582) R3HCC1L (ENSTGUG00000009574) LOXL4 (ENSTGUG00000009546) Common canary MODERN SPECIES 7 DPCD (ENSSCAG00000016547) FBXW4 (ENSSCAG00000016551) FGF8 (ENSSCAG00000016555) NPM3 (ENSSCAG00000016557) OGA (ENSSCAG00000016559) KCNIP2 (ENSSCAG00000016561) ARMH3 (ENSSCAG00000016565) HPS6 (ENSSCAG00000016571) LDB1 (ENSSCAG00000016573) ENSSCAG00000016575 ENSSCAG00000016579 ENSSCAG00000016580 SLIT1 (ENSSCAG00000016584) ARHGAP19 (ENSSCAG00000016588) RRP12 (ENSSCAG00000016597) ENSSCAG00000016605 #22 EXOSC1 (ENSSCAG00000016610) ZDHHC16 (ENSSCAG00000016614) UBTD1 (ENSSCAG00000016648) ANKRD2 (ENSSCAG00000016650) HOGA1 (ENSSCAG00000016653) MORN4 (ENSSCAG00000016656) ZFYVE27 (ENSSCAG00000016659) SFRP5 (ENSSCAG00000016665) GOLGA7B (ENSSCAG00000016669) CRTAC1 (ENSSCAG00000016674) ENSSCAG00000016682 LOXL4 (ENSSCAG00000016687) PYROXD2 (ENSSCAG00000016694) HPS1 (ENSSCAG00000016709) HPSE2 (ENSSCAG00000016715) Galloanserae ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000005029 ENSGT00940000159518 ENSGT00940000158796 ENSGT00390000007726.a.a ENSGT00940000157798 ENSGT00390000002554 ENSGT00390000001546 ENSGT00530000063586.a ENSGT00390000005639.a.b ENSGT00950000183137.a ENSGT00940000162611.a ENSGT00940000154965.A 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ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 ENSGT00530000063711.b ENSGT00940000157042 ENSGT00390000011684 Pink-footed goose MODERN SPECIES 11 DPCD (ENSABRG00000007691) FBXW4 (ENSABRG00000007699) FGF8 (ENSABRG00000007708) NPM3 (ENSABRG00000007714) OGA (ENSABRG00000007745) KCNIP2 (ENSABRG00000007767) ARMH3 (ENSABRG00000007775) ENSABRG00000007812 LDB1 (ENSABRG00000007841) PPRC1 (ENSABRG00000007859) LCOR (ENSABRG00000007875) SLIT1 (ENSABRG00000007893) ENSABRG00000007944 ARHGAP19 (ENSABRG00000007950) RRP12 (ENSABRG00000007978) ENSABRG00000007994 #22 EXOSC1 (ENSABRG00000008001) ZDHHC16 (ENSABRG00000008020) MMS19 (ENSABRG00000008035) UBTD1 (ENSABRG00000008082) ANKRD2 (ENSABRG00000008091) HOGA1 (ENSABRG00000008109) PI4K2A (ENSABRG00000008151) MARVELD1 (ENSABRG00000008311) ZFYVE27 (ENSABRG00000008327) SFRP5 (ENSABRG00000008364) GOLGA7B (ENSABRG00000008376) CRTAC1 (ENSABRG00000008392) R3HCC1L (ENSABRG00000008410) LOXL4 (ENSABRG00000008428) PYROXD2 (ENSABRG00000008449) Duck MODERN SPECIES 165 ENSAPLG00000016572 #22 Phasianidae ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000005029 ENSGT00940000159518 ENSGT00940000158796 ENSGT00390000007726.a.a ENSGT00940000157798 ENSGT00390000002554 ENSGT00390000001546 ENSGT00530000063586.a ENSGT00390000005639.a.b ENSGT00950000183137.a ENSGT00940000162611.a ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00940000157331 ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d #22 ENSGT00390000015287 ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00530000063604.A ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 ENSGT00530000063711.b Japanese quail MODERN SPECIES 24 DPCD (ENSCJPG00005019857) FBXW4 (ENSCJPG00005019856) FGF8 (ENSCJPG00005019855) NPM3 (ENSCJPG00005019854) OGA (ENSCJPG00005019752) KCNIP2 (ENSCJPG00005019751) ARMH3 (ENSCJPG00005019742) HPS6 (ENSCJPG00005019741) LDB1 (ENSCJPG00005019740) ENSCJPG00005019739 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ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000159518 ENSGT00940000158796 ENSGT00390000007726.a.a ENSGT00940000157798 ENSGT00390000002554 ENSGT00390000001546 ENSGT00530000063586.a ENSGT00390000005639.a.b ENSGT00950000183137.a ENSGT00940000162611.b ENSGT00940000162611.a ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00940000157331 ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d #22 ENSGT00390000015287 ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00530000063604.A ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 ENSGT00530000063711.b tuatara MODERN SPECIES 1056 FBXW4 (ENSSPUG00000011804) FGF8 (ENSSPUG00000011861) NPM3 (ENSSPUG00000011875) OGA (ENSSPUG00000011899) KCNIP2 (ENSSPUG00000011942) ARMH3 (ENSSPUG00000011969) ENSSPUG00000012022 LDB1 (ENSSPUG00000012060) ENSSPUG00000012068 ENSSPUG00000012079 ENSSPUG00000012101 ENSSPUG00000012129 SLIT1 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Blue-lipped sea krait MODERN SPECIES 5121 ARHGAP19 (ENSLLTG00000010055) RRP12 (ENSLLTG00000010103) ENSLLTG00000010187 #22 EXOSC1 (ENSLLTG00000010201) ZDHHC16 (ENSLLTG00000010230) MMS19 (ENSLLTG00000010289) UBTD1 (ENSLLTG00000010462) ANKRD2 (ENSLLTG00000010491) HOGA1 (ENSLLTG00000011116) MORN4 (ENSLLTG00000011130) PI4K2A (ENSLLTG00000011149) AVPI1 (ENSLLTG00000011164) MARVELD1 (ENSLLTG00000011178) ZFYVE27 (ENSLLTG00000011202) SFRP5 (ENSLLTG00000011244) GOLGA7B (ENSLLTG00000011263) Lizard MODERN SPECIES 1408 ARHGAP19 (ENSACAG00000002351) RRP12 (ENSACAG00000002175) ENSACAG00000002126 #22 EXOSC1 (ENSACAG00000002101) ZDHHC16 (ENSACAG00000001999) ENSACAG00000038894 MMS19 (ENSACAG00000001981) Anura ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000158796 ENSGT00390000007726.a.a ENSGT00940000157798 ENSGT00390000002554 ENSGT00390000001546 ENSGT00530000063586.a ENSGT00390000005639.a.b ENSGT00950000183137.a ENSGT00940000162611.a ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00940000157331 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DUPLICATION Osteoglossocephalai DUPLICATION Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000166659 ENSGT00950000182926.b.d.a.a.a.a #22 ENSGT00390000015287 ENSGT00940000155032.k ENSGT00390000000464 ENSGT00940000155032.l ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000157727.x.a ENSGT00390000014726.c.b ENSGT00390000014726.c.a ENSGT00940000159802 ENSGT00940000157214 ENSGT00940000161964 ENSGT00940000155133.a.a.b ENSGT00940000153692.B.a ENSGT00950000183015.B.a.a Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 268 ENSGT00940000168493 ENSGT00940000165889 ENSGT00390000015298 ENSGT00390000004874.a.a ENSGT00940000157556.a.a.b ENSGT00940000165452.a ENSGT00940000157049.a ENSGT00940000164861 ENSGT00940000157042.c.a ENSGT00390000013726.c ENSGT00940000160608.c ENSGT00940000165757.a.a ENSGT00510000049375.a ENSGT00970000193827.a ENSGT00390000010434.b.b ENSGT00950000182926.b.d.a.a.a.a #22 ENSGT00390000015287 ENSGT00940000155032.k ENSGT00390000013106 ENSGT00940000156522.d ENSGT00890000139463.b.b.a Asian 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ENSEEEG00000006374 ENSEEEG00000006372 tekt4 (ENSEEEG00000006370) Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.a.a.a.a.j #22 Electric eel DUPLICATION Electric eel MODERN SPECIES 1 ENSEEEG00000001691 LRRC18 (ENSEEEG00000001694) ARHGAP22 (ENSEEEG00000001699) mapk8a (ENSEEEG00000001743) ENSEEEG00000001952 ENSEEEG00000001953 ENSEEEG00000001954 GDF10 (ENSEEEG00000001956) prdm8 (ENSEEEG00000001968) ENSEEEG00000001970 rrp12 (ENSEEEG00000001993) ENSEEEG00000002997 zdhhc16a (ENSEEEG00000003000) mettl18 (ENSEEEG00000003005) ENSEEEG00000003008 #22 ENSEEEG00000003014 #22 marveld1 (ENSEEEG00000003037) ENSEEEG00000003040 zgc:171482 (ENSEEEG00000003042) sfrp5 (ENSEEEG00000003044) GOLGA7B (ENSEEEG00000003050) CRTAC1 (ENSEEEG00000003086) LOXL4 (ENSEEEG00000003102) ENSEEEG00000003295 pyroxd2 (ENSEEEG00000003301) slc25a28 (ENSEEEG00000003354) nkx3.3 (ENSEEEG00000003355) nkx2.3 (ENSEEEG00000003356) got1 (ENSEEEG00000003358) CNNM1 (ENSEEEG00000003359) HPSE2 (ENSEEEG00000003368) Electric eel MODERN SPECIES 1 CNNM1 (ENSEEEG00000003359) got1 (ENSEEEG00000003358) nkx2.3 (ENSEEEG00000003356) nkx3.3 (ENSEEEG00000003355) slc25a28 (ENSEEEG00000003354) pyroxd2 (ENSEEEG00000003301) ENSEEEG00000003295 LOXL4 (ENSEEEG00000003102) CRTAC1 (ENSEEEG00000003086) GOLGA7B (ENSEEEG00000003050) sfrp5 (ENSEEEG00000003044) zgc:171482 (ENSEEEG00000003042) ENSEEEG00000003040 marveld1 (ENSEEEG00000003037) ENSEEEG00000003014 #22 ENSEEEG00000003008 #22 mettl18 (ENSEEEG00000003005) zdhhc16a (ENSEEEG00000003000) ENSEEEG00000002997 rrp12 (ENSEEEG00000001993) ENSEEEG00000001970 prdm8 (ENSEEEG00000001968) GDF10 (ENSEEEG00000001956) ENSEEEG00000001954 ENSEEEG00000001953 ENSEEEG00000001952 mapk8a (ENSEEEG00000001743) ARHGAP22 (ENSEEEG00000001699) LRRC18 (ENSEEEG00000001694) ENSEEEG00000001691 vstm4a (ENSEEEG00000001690) Channel catfish MODERN SPECIES 18 ENSIPUG00000008625 aftph (ENSIPUG00000008613) grpb (ENSIPUG00000008575) ENSIPUG00000008563 VPS54 (ENSIPUG00000008415) c26h19orf53 (ENSIPUG00000008390) 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ENSSTUG00000005774 ENSSTUG00000005788 River trout MODERN SPECIES 316 cdc25d (ENSSTUG00000043215) pgam1b (ENSSTUG00000043197) #22 exosc1 (ENSSTUG00000043065) ENSSTUG00000043055 gprc5bb (ENSSTUG00000043049) ENSSTUG00000043024 tekt4 (ENSSTUG00000042941) Atlantic salmon MODERN SPECIES 11 sgsh (ENSSSAG00000000859) slc26a11 (ENSSSAG00000000912) ENSSSAG00000000906 ENSSSAG00000113515 ENSSSAG00000107846 ENSSSAG00000118177 ENSSSAG00000008427 LOXL4 (ENSSSAG00000108329) ENSSSAG00000001117 crtac1a (ENSSSAG00000001123) golga7ba (ENSSSAG00000091893) zfyve27 (ENSSSAG00000097461) ENSSSAG00000082312 pi4k2a (ENSSSAG00000001068) cdc25d (ENSSSAG00000001080) pgam1b (ENSSSAG00000008206) #22 exosc1 (ENSSSAG00000008190) gprc5bb (ENSSSAG00000008177) si:ch211-202h22.9 (ENSSSAG00000000527) ENSSSAG00000008172 tekt4 (ENSSSAG00000000501) ENSSSAG00000001140 ENSSSAG00000120600 ENSSSAG00000120755 ENSSSAG00000001103 ENSSSAG00000004566 NTHL1 (ENSSSAG00000000591) ENSSSAG00000086587 ENSSSAG00000110868 ENSSSAG00000042177 ENSSSAG00000106981 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 68 ENSGT00940000164753.b ENSGT00940000158204.d.c.a.a ENSGT00390000013080.k.c ENSGT01070000253775.b.k.a ENSGT01100000263495.A.a.a ENSGT00950000182774.a.a.a ENSGT00940000156038.a.a.d.b.b.b.b ENSGT00940000157042.c.b ENSGT00530000063711.b ENSGT00390000013726.d ENSGT00390000000134.a.d.a.b ENSGT00390000013298.g ENSGT01030000234958 ENSGT00390000010434.b.c.b ENSGT00940000166659 ENSGT00950000182926.b.d.a.a.a.a #22 ENSGT00390000015287.b.c.b ENSGT00390000015287.b.c.a ENSGT00500000044955 ENSGT00950000182961.b.c ENSGT00940000167543 ENSGT00940000155366.b.a.b.e ENSGT00940000165523.a ENSGT00950000183139.C.i.b.a.a ENSGT00510000047513.h ENSGT00940000162996.u.b.b.a ENSGT00950000182849.B.c.a.a.d ENSGT00940000156708.a.a ENSGT00940000154396.b.a.a.b ENSGT01050000244879.a.b.f ENSGT00390000011987.g Rainbow trout DUPLICATION Rainbow trout MODERN SPECIES 8 sgsh (ENSOMYG00000032489) slc26a11 (ENSOMYG00000032295) ENSOMYG00000050426 ENSOMYG00000048613 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ENSOTSG00005000164 gprc5bb (ENSOTSG00005000162) ENSOTSG00005000158 ENSOTSG00005000153 ENSOTSG00005000149 ENSOTSG00005000102 ENSOTSG00005000073 ENSOTSG00005000072 Huchen DUPLICATION Huchen MODERN SPECIES 4587 ENSHHUG00000041809 pi4k2a (ENSHHUG00000041806) ENSHHUG00000041802 pgam1b (ENSHHUG00000041788) #22 exosc1 (ENSHHUG00000041781) ENSHHUG00000041776 Huchen MODERN SPECIES 6404 pi4k2a (ENSHHUG00000025445) pgam1b (ENSHHUG00000025431) #22 cdc25d (ENSHHUG00000025399) exosc1 (ENSHHUG00000025397) ENSHHUG00000025396 ENSHHUG00000025394 si:ch211-202h22.8 (ENSHHUG00000025382) Northern pike MODERN SPECIES 8 SIRT7 (ENSELUG00000018223) pcyt2 (ENSELUG00000018189) gnav1 (ENSELUG00000018135) sgsh (ENSELUG00000000729) slc26a11 (ENSELUG00000001524) ENSELUG00000017837 LOXL4 (ENSELUG00000017718) crtac1a (ENSELUG00000017651) ENSELUG00000028633 golga7ba (ENSELUG00000033388) zfyve27 (ENSELUG00000017599) zgc:171482 (ENSELUG00000017517) ENSELUG00000000683 pi4k2a (ENSELUG00000017465) cdc25d (ENSELUG00000000659) pgam1b (ENSELUG00000017389) #22 exosc1 (ENSELUG00000017369) ENSELUG00000030465 gprc5bb (ENSELUG00000017298) ENSELUG00000024737 litaf (ENSELUG00000017282) ENSELUG00000017248 ENSELUG00000028858 ENSELUG00000028826 ENSELUG00000017204 tekt4 (ENSELUG00000017199) ENSELUG00000017164 ENSELUG00000017103 TSC2 (ENSELUG00000016788) NTHL1 (ENSELUG00000016661) ENSELUG00000016602 Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 39 ENSGT00940000154394.b.a.a.b.a.b ENSGT00940000165036.b ENSGT00940000156783.k ENSGT00940000164791.a.b ENSGT01100000263541.a.a.a.b.a.b.a ENSGT01100000263541.a.a.a.a ENSGT00940000157042.c.b ENSGT00530000063711.b ENSGT00390000013726.d ENSGT00390000000134.a.c ENSGT00390000013298 ENSGT00940000165757.d ENSGT01030000234958 ENSGT00390000010434.b ENSGT00950000182926.b.d.a.b #22 ENSGT00950000182926.b.d.a.a.a.a #22 ENSGT00390000015287.b ENSGT00500000044955 ENSGT00950000182961.b.c ENSGT01030000234810 ENSGT00940000155366.b.a.b ENSGT00940000167543 ENSGT00940000176048 ENSGT00950000182894.B ENSGT00940000165523.a ENSGT00940000167012 ENSGT00950000183139.C ENSGT00510000047513 ENSGT00950000182849.B.c.a.a ENSGT00940000156708.a.a ENSGT00940000154396.b.a.a.b Cod MODERN SPECIES 16 ENSGMOG00000031412 ENSGMOG00000014521 ENSGMOG00000027671 ENSGMOG00000032150 ENSGMOG00000001172 ENSGMOG00000001182 ENSGMOG00000023697 b3gntl1 (ENSGMOG00000013255) ENSGMOG00000013267 LOXL4 (ENSGMOG00000018502) ENSGMOG00000008903 crtac1a (ENSGMOG00000008938) golga7ba (ENSGMOG00000009859) zfyve27 (ENSGMOG00000008965) pi4k2a (ENSGMOG00000008978) pgam1b (ENSGMOG00000009189) #22 exosc1 (ENSGMOG00000008993) ENSGMOG00000026064 gprc5bb (ENSGMOG00000031761) ENSGMOG00000035352 ENSGMOG00000014567 ENSGMOG00000012895 ENSGMOG00000028747 ENSGMOG00000018001 ENSGMOG00000018036 ENSGMOG00000018062 ENSGMOG00000018083 tpcn3 (ENSGMOG00000034442) pgap4 (ENSGMOG00000033614) ENSGMOG00000014247 slc8a1a (ENSGMOG00000032115) Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.a.a.a.a #22 Pinecone sodierfish MODERN SPECIES ENSMMDG00005015022 ENSMMDG00005015024 ENSMMDG00005015028 ENSMMDG00005015031 ENSMMDG00005015034 b3gntl1 (ENSMMDG00005015041) METRNL (ENSMMDG00005015051) ENSMMDG00005015054 ENSMMDG00005015057 LOXL4 (ENSMMDG00005015059) crtac1a (ENSMMDG00005015070) golga7ba (ENSMMDG00005015099) zfyve27 (ENSMMDG00005015119) zgc:171482 (ENSMMDG00005015125) pi4k2a (ENSMMDG00005015133) pgam1b (ENSMMDG00005015171) #22 exosc1 (ENSMMDG00005015172) ENSMMDG00005015174 gprc5bb (ENSMMDG00005015179) si:ch211-202h22.9 (ENSMMDG00005015185) tekt4 (ENSMMDG00005015265) ENSMMDG00005015270 ENSMMDG00005015280 TSC2 (ENSMMDG00005015317) NTHL1 (ENSMMDG00005016888) NHERF2 (ENSMMDG00005016890) TNPO2 (ENSMMDG00005016900) rln3b (ENSMMDG00005016933) RFX1 (ENSMMDG00005016937) DCAF15 (ENSMMDG00005017280) khsrp (ENSMMDG00005017285) Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.a.a.a.b #22 Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.a.a.a.b #22 Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 55 ENSGT01100000263540.B.c 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ENSGT00940000160608 ENSGT00940000165757.d ENSGT00510000049375 ENSGT00950000182926.b.d.a.a.a.b #22 ENSGT00390000000464 ENSGT00940000155032.k ENSGT00390000013106 ENSGT00940000157727.x.b ENSGT00890000139463.b.b.a ENSGT00940000157214.e ENSGT00940000160066 ENSGT00940000177496 ENSGT00940000161964.g.a ENSGT00940000155133.a.a.a ENSGT00940000153692.B.b ENSGT00940000172400 ENSGT00940000156026.e ENSGT00940000155684 ENSGT00390000008566.a Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00390000015298 ENSGT00390000004874.a.a ENSGT00940000157525.b ENSGT00950000183082.b.b.a.a ENSGT00940000157556.a.b ENSGT00940000165452.a ENSGT00940000157049 ENSGT00940000164861 ENSGT00940000161036.B.a ENSGT00940000157042.c.a ENSGT00390000013726.c ENSGT00390000000134.a.e ENSGT00940000160608 ENSGT00940000165757.d ENSGT00510000049375 ENSGT00950000182926.b.d.a.a.a.b #22 ENSGT00390000000464 ENSGT00940000155032.k ENSGT00390000013106 ENSGT00940000157727.x.b ENSGT00890000139463.b.b.a ENSGT00940000157214.e ENSGT00940000160066 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ENSGT00940000153692.B.b.d ENSGT00950000183015.B.a.a.e.a ENSGT00940000172400 ENSGT00940000156026.e.b Goldfish MODERN SPECIES 4 sobpa (ENSCARG00000003793) pdss2 (ENSCARG00000003768) bend3 (ENSCARG00000003759) mtres1 (ENSCARG00000003758) prkcha (ENSCARG00000003746) slc38a6 (ENSCARG00000003730) trmt5 (ENSCARG00000003715) mnat1 (ENSCARG00000003688) six4a (ENSCARG00000003672) six1a (ENSCARG00000003663) ENSCARG00000003658 six6a (ENSCARG00000003653) ppm1aa (ENSCARG00000003645) dhrs7 (ENSCARG00000003638) ENSCARG00000003583 pgam1a (ENSCARG00000003554) #22 mettl18 (ENSCARG00000003550) zdhhc16a (ENSCARG00000003534) rrp12 (ENSCARG00000002371) ENSCARG00000002131 prdm8 (ENSCARG00000002109) GDF10 (ENSCARG00000002096) ENSCARG00000002080 ENSCARG00000002061 ENSCARG00000001963 mapk8a (ENSCARG00000019349) ARHGAP22 (ENSCARG00000019094) ENSCARG00000019071 LRRC18 (ENSCARG00000019068) WDFY4 (ENSCARG00000018997) vstm4a (ENSCARG00000018981) Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 107 ENSGT00940000159420.d ENSGT00530000063876.a.b ENSGT00940000156774.jb.b ENSGT00940000158220.o.a ENSGT00940000156982.d ENSGT00940000153304.B.c ENSGT00390000002319.g.b ENSGT00940000165916.f.a ENSGT00940000160091.f.a.a ENSGT00940000154832.db.b.c ENSGT00940000155226.c ENSGT00940000156899.u.b ENSGT00940000158583.n ENSGT00940000182267 ENSGT00940000155077.v.d ENSGT00950000182926.b.d.a.a.a.b.b #22 ENSGT00390000000464.k ENSGT00940000155032.k.c ENSGT00940000158630.h.d.b.a ENSGT00390000013106.i ENSGT00940000157727.x.b.b ENSGT00890000139463.b.b.a.a ENSGT00940000157214.e.a ENSGT00940000160066.bb.a ENSGT00940000153692.B.b.d ENSGT00950000183015.B.a.a.e.a ENSGT00940000156026.e.b ENSGT00940000155684.ud ENSGT00390000008566.a.a ENSGT00940000159008.b ENSGT00940000158057.a.a Common carp reference MODERN SPECIES 18 ENSCCRG00000027246 SERTAD4 (ENSCCRG00000072297) hif1aa (ENSCCRG00000011557) prkcha (ENSCCRG00000011302) slc38a6 (ENSCCRG00000011294) trmt5 (ENSCCRG00000030686) mnat1 (ENSCCRG00000076890) six4a (ENSCCRG00000028520) 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(ENSDARG00000095378) ENSDARG00000075459 ENSDARG00000106245 mapk8a (ENSDARG00000031888) ENSDARG00000112690 ARHGAP22 (ENSDARG00000021255) ENSDARG00000075225 LRRC18 (ENSDARG00000078790) ENSDARG00000077009 Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 146 ENSGT00940000162476 ENSGT00940000177979 ENSGT00940000157556.a.b ENSGT00940000165452.a ENSGT00940000157049 ENSGT00940000164861 ENSGT00940000161036.B.a ENSGT00940000157042.c.a ENSGT00390000013726.c ENSGT00390000000134.a.e ENSGT00940000160608 ENSGT00940000165757.c.b.b ENSGT00510000049375 ENSGT00390000010434.b.p ENSGT00950000182926.b.d.a.a.a.a #22 ENSGT00950000182926.b.d.a.a.a.b #22 ENSGT00390000000464 ENSGT00940000155032.k ENSGT00940000158630.g.b ENSGT00390000013106 ENSGT00940000157727.x.b ENSGT00890000139463.b.b.a ENSGT00940000157214.f.b ENSGT00940000160066 ENSGT00940000153692.B.b ENSGT00950000183015.B.a.b ENSGT00940000165944 ENSGT00940000155684 ENSGT00390000008566.a ENSGT00730000111333.a ENSGT00940000159008 Denticle herring DUPLICATION Denticle herring MODERN SPECIES 11 got1 (ENSDCDG00000017514) ENSDCDG00000017511 nkx3.3 (ENSDCDG00000017510) slc25a28 (ENSDCDG00000017509) ENSDCDG00000017503 ENSDCDG00000017497 pyroxd2 (ENSDCDG00000017052) zgc:123010 (ENSDCDG00000017041) LOXL4 (ENSDCDG00000016723) CRTAC1 (ENSDCDG00000016710) GOLGA7B (ENSDCDG00000016703) sfrp5 (ENSDCDG00000016702) zgc:171482 (ENSDCDG00000016698) ENSDCDG00000016695 marveld1 (ENSDCDG00000016694) pgam1a (ENSDCDG00000016692) #22 mettl18 (ENSDCDG00000016688) zdhhc16a (ENSDCDG00000016684) ubtd1a (ENSDCDG00000016682) rrp12 (ENSDCDG00000016653) ENSDCDG00000016641 ENSDCDG00000016640 ENSDCDG00000016631 paox (ENSDCDG00000016628) chst3b (ENSDCDG00000016625) pax2b (ENSDCDG00000016621) fbxl15 (ENSDCDG00000016614) gpx9 (ENSDCDG00000016607) ndufb8 (ENSDCDG00000016604) SEC31B (ENSDCDG00000016304) scd (ENSDCDG00000016293) Denticle herring MODERN SPECIES 299 marveld1 (ENSDCDG00000029311) pgam1a (ENSDCDG00000029309) #22 mettl18 (ENSDCDG00000029307) zdhhc16a (ENSDCDG00000029262) ubtd1a 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ENSGT00950000183169.C ENSGT01100000263516.a.b.b.b.a.a.a.b.b.a.a.k ENSGT01030000234578.A.b.a.a.a.a.b Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00390000004874.a.a ENSGT00940000157525.b ENSGT00950000183082.b.b.a.a ENSGT00940000157556.a.b ENSGT00940000165452.a ENSGT00940000157049.c ENSGT00940000164861 ENSGT00940000161036.B.a ENSGT00940000157042.c.a ENSGT00390000013726.c ENSGT00390000000134.a.d ENSGT00940000160608 ENSGT00940000165757.d ENSGT00730000112219 ENSGT00510000049375 ENSGT00950000182926.b.d.a.a.b #22 ENSGT00530000064017.a ENSGT00940000153997.b.b ENSGT00940000155716 ENSGT00940000158282 ENSGT00940000156111 ENSGT00940000157520 ENSGT00940000158935 ENSGT00940000166192 ENSGT01030000234578.A.b.a.b ENSGT00940000166680 ENSGT00530000063672.a ENSGT00520000055589.c ENSGT00950000183169.C ENSGT01100000263516.a.b.b.b.a.a.a.b.b.a.a.k ENSGT01030000234578.A.b.a.a.a.a.b Oryzias ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT01100000265163 ENSGT00950000183082.b.b.a.a ENSGT00940000157556.a.b ENSGT00940000165452.a ENSGT00940000157049.c ENSGT00940000164861 ENSGT00940000161036.B.a ENSGT00940000157042.c.a ENSGT00390000013726.c ENSGT00390000000134.a.d ENSGT00940000160608 ENSGT00940000165757.d ENSGT00730000112219 ENSGT00970000193827 ENSGT00510000049375 ENSGT00950000182926.b.d.a.a.b #22 ENSGT00530000064017.a ENSGT00940000153997.b.b ENSGT00940000155716 ENSGT00940000158282 ENSGT00940000156111 ENSGT00940000157520 ENSGT00940000158935 ENSGT00940000166192 ENSGT01030000234578.A.b.a.b ENSGT00940000166680 ENSGT00530000063672.a ENSGT00520000055589.c ENSGT00950000183169.C ENSGT01100000263516.a.b.b.b.a.a.a.b.b.a.a.k ENSGT01030000234578.A.b.a.a.a.a.b Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000157525.b ENSGT01100000265163 ENSGT00950000183082.b.b.a.a ENSGT00940000157556.a.b ENSGT00940000165452.a ENSGT00940000157049.c ENSGT00940000164861 ENSGT00940000161036.B.a ENSGT00940000157042.c.a ENSGT00390000013726.c ENSGT00390000000134.a.d ENSGT00940000160608 ENSGT00940000165757.d ENSGT00970000193827 ENSGT00510000049375 ENSGT00950000182926.b.d.a.a.b #22 ENSGT00530000064017.a ENSGT00940000153997.b.b ENSGT00940000155716 ENSGT00940000158282 ENSGT00940000156111 ENSGT00940000157520 ENSGT00940000158935 ENSGT00940000166192 ENSGT01030000234578.A.b.a.b ENSGT00940000166680 ENSGT00530000063672.a ENSGT00520000055589.c ENSGT00950000183169.C ENSGT01100000263516.a.b.b.b.a.a.a.b.b.a.a.k ENSGT01030000234578.A.b.a.a.a.a.b Indian medaka MODERN SPECIES 27 HPSE2 (ENSOMEG00000003198) CNNM1 (ENSOMEG00000003230) got1 (ENSOMEG00000003293) nkx2.3 (ENSOMEG00000003316) nkx3.3 (ENSOMEG00000003321) slc25a28 (ENSOMEG00000003332) pyroxd2 (ENSOMEG00000003379) zgc:123010 (ENSOMEG00000003408) LOXL4 (ENSOMEG00000003421) CRTAC1 (ENSOMEG00000003461) golga7ba (ENSOMEG00000003486) sfrp5 (ENSOMEG00000003509) zgc:171482 (ENSOMEG00000003526) ENSOMEG00000003536 marveld1 (ENSOMEG00000003543) pgam1a (ENSOMEG00000003552) #22 ENSOMEG00000003591 ENSOMEG00000003742 zfand4 (ENSOMEG00000003785) marchf8 (ENSOMEG00000003833) alox5a (ENSOMEG00000003860) slc25a16 (ENSOMEG00000003877) TET1 (ENSOMEG00000003894) eif4e1c (ENSOMEG00000003911) si:dkey-228d14.5 (ENSOMEG00000003916) zgc:110319 (ENSOMEG00000003938) ccar1 (ENSOMEG00000003998) stox1 (ENSOMEG00000004013) si:ch211-198a12.6 (ENSOMEG00000004023) ENSOMEG00000004030 zgc:154058 (ENSOMEG00000004041) Javanese ricefish MODERN SPECIES 6 CNNM1 (ENSOJAG00000013995) ENSOJAG00000013960 got1 (ENSOJAG00000013930) nkx2.3 (ENSOJAG00000013921) nkx3.3 (ENSOJAG00000013915) slc25a28 (ENSOJAG00000013902) pyroxd2 (ENSOJAG00000013451) zgc:123010 (ENSOJAG00000013423) LOXL4 (ENSOJAG00000013309) CRTAC1 (ENSOJAG00000013109) golga7ba (ENSOJAG00000013072) sfrp5 (ENSOJAG00000013058) zgc:171482 (ENSOJAG00000013050) ENSOJAG00000013022 marveld1 (ENSOJAG00000013004) pgam1a (ENSOJAG00000012978) #22 ENSOJAG00000012965 ENSOJAG00000012919 zfand4 (ENSOJAG00000012892) marchf8 (ENSOJAG00000012830) ENSOJAG00000012795 alox5a (ENSOJAG00000012713) slc25a16 (ENSOJAG00000012616) TET1 (ENSOJAG00000012552) eif4e1c (ENSOJAG00000012509) si:dkey-228d14.5 (ENSOJAG00000012495) zgc:110319 (ENSOJAG00000012476) ccar1 (ENSOJAG00000011851) stox1 (ENSOJAG00000011811) si:ch211-198a12.6 (ENSOJAG00000011802) ENSOJAG00000011794 Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000157525.b ENSGT01100000265163 ENSGT00950000183082.b.b.a.a ENSGT00940000157556.a.b ENSGT00940000165452.a ENSGT00940000157049.c ENSGT00940000164861 ENSGT00940000161036.B.a ENSGT00940000157042.c.a ENSGT00390000013726.c ENSGT00390000000134.a.d ENSGT00940000160608 ENSGT00940000165757.d ENSGT00730000112219 ENSGT00510000049375 ENSGT00950000182926.b.d.a.a.b #22 ENSGT00530000064017.a ENSGT00940000153997.b.b ENSGT00940000155716 ENSGT00940000158282 ENSGT00940000156111 ENSGT00940000157520 ENSGT00940000158935 ENSGT00940000166192 ENSGT01030000234578.A.b.a.b ENSGT00940000166680 ENSGT00530000063672.a ENSGT00520000055589.c ENSGT00950000183169.C ENSGT01030000234578.A.b.a.a.a.a.b ENSGT00950000183185.c.a.b.a.a Chinese medaka MODERN SPECIES 557 ENSOSIG00000007278 got1 (ENSOSIG00000007277) nkx2.3 (ENSOSIG00000007275) nkx3.3 (ENSOSIG00000007274) slc25a28 (ENSOSIG00000007272) pyroxd2 (ENSOSIG00000007194) zgc:123010 (ENSOSIG00000007189) LOXL4 (ENSOSIG00000006771) CRTAC1 (ENSOSIG00000005087) golga7ba (ENSOSIG00000005065) sfrp5 (ENSOSIG00000005063) zgc:171482 (ENSOSIG00000005061) ENSOSIG00000005060 ENSOSIG00000005059 marveld1 (ENSOSIG00000005057) pgam1a (ENSOSIG00000005056) #22 ENSOSIG00000005055 ENSOSIG00000005053 zfand4 (ENSOSIG00000005048) marchf8 (ENSOSIG00000005042) alox5a (ENSOSIG00000003843) slc25a16 (ENSOSIG00000003791) ENSOSIG00000003776 eif4e1c (ENSOSIG00000003757) si:dkey-228d14.5 (ENSOSIG00000023351) ccar1 (ENSOSIG00000023348) stox1 (ENSOSIG00000023341) ENSOSIG00000023333 zgc:154058 (ENSOSIG00000023328) mat1a (ENSOSIG00000023325) selenou1a (ENSOSIG00000023320) Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 6 ENSORLG00000021808 got1 (ENSORLG00000007741) nkx2.3 (ENSORLG00000007722) nkx3.3 (ENSORLG00000007716) slc25a28 (ENSORLG00000007710) pyroxd2 (ENSORLG00000007699) zgc:123010 (ENSORLG00000007675) ENSORLG00000007662 ENSORLG00000025258 CRTAC1 (ENSORLG00000007646) GOLGA7B (ENSORLG00000023120) sfrp5 (ENSORLG00000007621) zgc:171482 (ENSORLG00000007607) ENSORLG00000007598 marveld1 (ENSORLG00000027726) pgam1a (ENSORLG00000007592) #22 ENSORLG00000026750 ENSORLG00000007565 zfand4 (ENSORLG00000007496) marchf8 (ENSORLG00000007479) alox5a (ENSORLG00000007461) slc25a16 (ENSORLG00000026181) TET1 (ENSORLG00000026069) eif4e1c (ENSORLG00000019400) si:dkey-228d14.5 (ENSORLG00000019392) zgc:110319 (ENSORLG00000029904) ccar1 (ENSORLG00000007436) stox1 (ENSORLG00000026324) si:ch211-198a12.6 (ENSORLG00000007397) zgc:154058 (ENSORLG00000007393) mat1a (ENSORLG00000007386) Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00390000004874.a.a ENSGT00940000157525.b ENSGT00950000183082.b.b.a.a ENSGT00940000157556.a.b ENSGT00940000165452.a ENSGT00940000157049.c ENSGT00940000164861 ENSGT00940000161036.B.a ENSGT00940000157042.c.a ENSGT00390000013726.c ENSGT00390000000134.a.d ENSGT00940000160608 ENSGT00940000165757.d ENSGT00730000112219 ENSGT00510000049375 ENSGT00950000182926.b.d.a.a.b #22 ENSGT00530000064017.a ENSGT00940000153997.b.b ENSGT00940000155716 ENSGT00940000158282 ENSGT00940000156111 ENSGT00940000157520 ENSGT00940000158935 ENSGT00940000166192 ENSGT01030000234578.A.b.a.b ENSGT00940000166680 ENSGT00530000063672.a ENSGT00520000055589.c ENSGT00950000183169.C ENSGT01100000263516.a.b.b.b.a.a.a.b.b.a.a.k ENSGT01030000234578.A.b.a.a.a.a.b Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 43 ENSGT00390000004874.a.a ENSGT00940000157525.b ENSGT00950000183082.b.b.a.a ENSGT00940000157556.a.b ENSGT00940000165452.a ENSGT00940000157049.c ENSGT00940000164861 ENSGT00940000161036.B.a ENSGT00940000157042.c.a ENSGT00390000013726.c ENSGT00390000000134.a.d ENSGT00940000160608 ENSGT00940000165757.d ENSGT00730000112219 ENSGT00510000049375 ENSGT00950000182926.b.d.a.a.b #22 ENSGT00530000064017.a ENSGT00940000153997.b.b ENSGT00940000155716 ENSGT00940000158282 ENSGT00940000156111 ENSGT00940000157520 ENSGT00940000158935 ENSGT00940000166192 ENSGT01030000234578.A.b.a.b ENSGT00940000166680 ENSGT00530000063672.a ENSGT00520000055589.c ENSGT00950000183169.C ENSGT00940000154395.a.a.a.b.b ENSGT01030000234578.A.b.a.a.a.a.b Mangrove rivulus MODERN SPECIES 3 zgc:171482 (ENSKMAG00000005077) ENSKMAG00000005062 marveld1 (ENSKMAG00000005056) pgam1a (ENSKMAG00000005032) #22 ENSKMAG00000005005 ENSKMAG00000004942 zfand4 (ENSKMAG00000004916) marchf8 (ENSKMAG00000004883) alox5a (ENSKMAG00000004642) slc25a16 (ENSKMAG00000004595) TET1 (ENSKMAG00000004567) eif4e1c (ENSKMAG00000004557) si:dkey-228d14.5 (ENSKMAG00000004541) zgc:110319 (ENSKMAG00000004521) ccar1 (ENSKMAG00000004397) stox1 (ENSKMAG00000004372) si:ch211-198a12.6 (ENSKMAG00000004363) ENSKMAG00000004349 zgc:154058 (ENSKMAG00000004343) Turquoise killifish MODERN SPECIES 1612 got1 (ENSNFUG00015018375) nkx2.3 (ENSNFUG00015018403) nkx3.3 (ENSNFUG00015018405) SLC25A28 (ENSNFUG00015018407) pyroxd2 (ENSNFUG00015018415) TTC31 (ENSNFUG00015018453) LOXL4 (ENSNFUG00015018470) ENSNFUG00015018502 CRTAC1 (ENSNFUG00015018504) GOLGA7BB (ENSNFUG00015018520) SFRP5 (ENSNFUG00015018523) zgc:171482 (ENSNFUG00015018528) ENSNFUG00015018529 ENSNFUG00015018533 MARVELD1 (ENSNFUG00015018535) PGAM1B (ENSNFUG00015018538) #22 FAM178A (ENSNFUG00015018546) ENSNFUG00015018559 ZFAND4 (ENSNFUG00015018581) MARCH8 (ENSNFUG00015018583) alox5a (ENSNFUG00015018618) ENSNFUG00015002938 SLC25A16 (ENSNFUG00015002944) ENSNFUG00015002954 eif4e1c (ENSNFUG00015002958) ENSNFUG00015002961 Nfu_g_1_014361 (ENSNFUG00015002966) ccar1 (ENSNFUG00015002979) ENSNFUG00015003002 si:ch211-198a12.6 (ENSNFUG00015003006) STOX1 (ENSNFUG00015003009) Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00390000004874.a.a ENSGT00940000157525.b ENSGT00950000183082.b.b.a.a ENSGT00940000157556.a.b ENSGT00940000165452.a ENSGT00940000157049.c ENSGT00940000164861 ENSGT00940000161036.B.a ENSGT00940000157042.c.a ENSGT00390000013726.c ENSGT00390000000134.a.d 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MODERN SPECIES 1828 ENSHHUG00000021281 marveld1 (ENSHHUG00000021289) pi4k2a (ENSHHUG00000021295) ENSHHUG00000021335 #22 ENSHHUG00000021420 slc25a28 (ENSHHUG00000021446) dnajc27 (ENSHHUG00000021468) Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 235 ENSGT00510000049375.h ENSGT00730000112219 ENSGT00390000010434.b.d.a ENSGT00950000182926.b.d.a.a.b.g #22 ENSGT00530000064017.a.e ENSGT00940000157049.c.a ENSGT00940000165452.a.g ENSGT00940000157556.a.b.e ENSGT00950000183082.b.b.a.a.d.a ENSGT00940000157525.b.c ENSGT00390000004874.a.a.tb ENSGT00390000015298 ENSGT00940000163723.A.f.a ENSGT00510000049375.g ENSGT00390000010434.b.d.b ENSGT00950000182926.b.d.a.a.b.h #22 ENSGT00530000064017.a.f ENSGT00940000157049.c.b.b ENSGT00940000165452.a.h ENSGT00940000157556.a.b.f ENSGT00950000183082.b.b.a.a.d.b ENSGT00940000157525.b.d ENSGT00390000004874.a.a.ub ENSGT00940000165889 ENSGT00940000153956.b ENSGT00730000111173.g ENSGT00940000162611.a.a.b.b ENSGT00940000154965.A.a ENSGT00940000157322.b.a.e.b ENSGT00940000162611.a.a.b.a 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parp12a (ENSCVAG00000016405) ENSCVAG00000016394 parp12a (ENSCVAG00000016385) Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 115 ENSGT00940000165021.b ENSGT00640000091565 ENSGT00940000158217.a.b ENSGT00390000006933 ENSGT00390000001390.a.a.b ENSGT00970000193486 ENSGT00940000176048 ENSGT00950000182894.B ENSGT00940000157042.c.b ENSGT00390000013726.d ENSGT00390000000134.a.c ENSGT00390000013298 ENSGT01100000263491.a.b.b.c.a.b ENSGT01030000234958 ENSGT00390000010434.b ENSGT00950000182926.b.d.a.b #22 ENSGT00390000015287.b ENSGT00500000044955 ENSGT00950000182961.b.c ENSGT00940000155366.b.a.b Turquoise killifish MODERN SPECIES 1611 ENSNFUG00015013100 ENSNFUG00015013096 CRTAC1A (ENSNFUG00015013043) golga7ba (ENSNFUG00015013023) ZFYVE27 (ENSNFUG00015012998) ENSNFUG00015012990 Nfu_g_1_000275 (ENSNFUG00015012986) ENSNFUG00015012981 HIST1H2BD (ENSNFUG00015012978) ENSNFUG00015012975 ENSNFUG00015012972 ENSNFUG00015012968 pi4k2a (ENSNFUG00015012951) PGAM1A (ENSNFUG00015012935) #22 exosc1 (ENSNFUG00015012920) 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ENSGT00940000157042.c.b ENSGT00530000063711.b ENSGT00390000013726.d ENSGT00390000000134.a.c ENSGT00390000013298 ENSGT01100000263491.a.b.b.c.a.b ENSGT01080000257510 ENSGT01030000234958 ENSGT00390000010434.b ENSGT00950000182926.b.d.a.b #22 ENSGT00390000015287.b ENSGT00500000044955 ENSGT00950000182961.b.c ENSGT00940000155366.b.a.b.m ENSGT00940000167543 ENSGT00940000155366.b.a.b.n ENSGT00940000165523.a ENSGT00940000167012 ENSGT00950000183139.C ENSGT00510000047513 ENSGT00950000182849.B.c.a.a ENSGT00940000156708.a.a ENSGT00940000154396.b.a.a.b ENSGT01050000244879.a.b.f ENSGT00390000011987 Midas cichlid MODERN SPECIES 266 ENSACIG00000018654 ENSACIG00000018673 ENSACIG00000018691 ENSACIG00000018703 tekt4 (ENSACIG00000018734) ENSACIG00000018753 ENSACIG00000018772 LOXL4 (ENSACIG00000018798) ENSACIG00000018819 crtac1a (ENSACIG00000018831) golga7ba (ENSACIG00000018848) zfyve27 (ENSACIG00000018866) ENSACIG00000018920 ENSACIG00000018927 pi4k2a (ENSACIG00000018930) ENSACIG00000018943 #22 exosc1 (ENSACIG00000018956) ENSACIG00000018969 gprc5bb (ENSACIG00000018977) si:ch211-202h22.8 (ENSACIG00000018989) Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000006933 ENSGT00390000001390.a.a.b ENSGT00940000175309.a ENSGT01010000226470 ENSGT00950000182894.B ENSGT00940000178088 ENSGT00940000157042.c.b ENSGT00530000063711.b ENSGT00390000013726.d ENSGT00390000000134.a.c ENSGT00390000013298 ENSGT01100000263491.a.b.b.c.a.b ENSGT01080000257510 ENSGT01030000234958 ENSGT00390000010434.b ENSGT00950000182926.b.d.a.b #22 ENSGT00390000015287.b ENSGT00500000044955 ENSGT00950000182961.b.c ENSGT00940000155366.b.a.b.m ENSGT00940000167543 ENSGT00940000155366.b.a.b.n ENSGT00940000165523.a ENSGT00940000167012 ENSGT00950000183139.C ENSGT00510000047513 ENSGT00950000182849.B.c.a.a ENSGT00940000156708.a.a ENSGT00940000154396.b.a.a.b ENSGT01050000244879.a.b.f ENSGT00390000011987 Nile tilapia MODERN SPECIES 18 ENSONIG00000030004 ENSONIG00000037706 ENSONIG00000016550 ENSONIG00000036463 ENSONIG00000041354 tekt4 (ENSONIG00000017668) ENSONIG00000032442 LOXL4 (ENSONIG00000017669) ENSONIG00000027510 crtac1a (ENSONIG00000017670) golga7ba (ENSONIG00000017672) zfyve27 (ENSONIG00000017673) ENSONIG00000028978 ENSONIG00000040860 pi4k2a (ENSONIG00000017677) pgam1 (ENSONIG00000031535) #22 exosc1 (ENSONIG00000017683) ENSONIG00000030221 gprc5bb (ENSONIG00000017688) ENSONIG00000036837 ENSONIG00000035434 ENSONIG00000028111 ENSONIG00000035666 si:ch211-202h22.8 (ENSONIG00000017691) ENSONIG00000017693 ENSONIG00000017694 TSC2 (ENSONIG00000017699) NTHL1 (ENSONIG00000017701) ENSONIG00000040853 ENSONIG00000016413 ASF1B (ENSONIG00000039569) Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000158217.a.b ENSGT00390000006933 ENSGT00390000001390.a.a.b ENSGT00970000193466.a.a.b.a.a ENSGT01010000226470 ENSGT00950000182894.B ENSGT00940000178088 ENSGT00940000157042.c.b ENSGT00530000063711.b ENSGT00390000013726.d ENSGT00390000000134.a.c ENSGT00390000013298 ENSGT01100000263491.a.b.b.c.a.b ENSGT01080000257510 ENSGT00390000010434.b ENSGT00950000182926.b.d.a.b #22 ENSGT00390000015287.b ENSGT00500000044955 ENSGT00950000182961.b.c ENSGT00940000155366.b.a.b.m ENSGT00940000167543 ENSGT00940000165523.a ENSGT00940000167012 ENSGT00950000183139.C ENSGT00510000047513 ENSGT00950000182849.B.c.a.a ENSGT00940000156708.a.a ENSGT00940000154396.b.a.a.b ENSGT01050000244879.a.b.f ENSGT00390000011987 ENSGT00940000156051.c.b Lyretail cichlid MODERN SPECIES 308 ENSNBRG00000024100 ENSNBRG00000024093 tekt4 (ENSNBRG00000024082) ENSNBRG00000024079 ENSNBRG00000024075 LOXL4 (ENSNBRG00000024068) ENSNBRG00000024064 crtac1a (ENSNBRG00000024060) golga7ba (ENSNBRG00000024056) zfyve27 (ENSNBRG00000024042) ENSNBRG00000024034 ENSNBRG00000024031 ENSNBRG00000024028 pi4k2a (ENSNBRG00000024021) ENSNBRG00000024018 #22 ENSNBRG00000024011 #22 exosc1 (ENSNBRG00000024007) ENSNBRG00000024005 gprc5bb (ENSNBRG00000024001) ENSNBRG00000023995 ENSNBRG00000023992 ENSNBRG00000023974 TSC2 (ENSNBRG00000023922) NTHL1 (ENSNBRG00000023880) 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ENSGT00950000183015.B.a.b ENSGT00940000165944 Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 213 ENSGT00940000165452.a ENSGT00940000157049 ENSGT00940000164861 ENSGT00940000161036.B ENSGT00940000157042.c.a ENSGT00390000013726.c ENSGT00390000000134.a ENSGT00940000160608 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000165757 ENSGT00510000049375 ENSGT00970000193827 ENSGT00730000112219 ENSGT00510000049872 ENSGT00390000010434.b ENSGT00950000182926.b.d.b #22 ENSGT00390000013106 ENSGT00940000157727.x.b ENSGT00890000139463.b.b.a Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.b #22 Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.b #22 Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.b #22 Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.b #22 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.b #22 Tiger tail seahorse DUPLICATION Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 406 SFR1 (ENSHCOG00000011490) itprip (ENSHCOG00000011493) GSTO1 (ENSHCOG00000011503) ENSHCOG00000011521 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golga7ba (ENSNBRG00000024056) zfyve27 (ENSNBRG00000024042) ENSNBRG00000024034 ENSNBRG00000024031 ENSNBRG00000024028 pi4k2a (ENSNBRG00000024021) ENSNBRG00000024018 #22 ENSNBRG00000024011 #22 exosc1 (ENSNBRG00000024007) ENSNBRG00000024005 gprc5bb (ENSNBRG00000024001) ENSNBRG00000023995 ENSNBRG00000023992 ENSNBRG00000023974 TSC2 (ENSNBRG00000023922) NTHL1 (ENSNBRG00000023880) ENSNBRG00000023866 TNPO2 (ENSNBRG00000023849) rln3b (ENSNBRG00000023834) RFX1 (ENSNBRG00000023821) DCAF15 (ENSNBRG00000023810) khsrp (ENSNBRG00000023797) Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.b #22 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 172 ENSGT01070000253775.b.k ENSGT01100000263495.A.a.a ENSGT00940000156038.a.a.d.b.b.b.b ENSGT00940000156038.a.a.d.b.b.b.a.a.a.b ENSGT00940000157042.c.b ENSGT00530000063711.b ENSGT00390000013726.d ENSGT00390000000134.a.d.a ENSGT00390000013298 ENSGT00940000165757.d.n ENSGT01030000234958 ENSGT00390000010434.b.c.b ENSGT00940000166659 ENSGT00950000182926.b.d.a.a.a.a #22 ENSGT00390000015287.a.a ENSGT00950000182926.b.d.b #22 ENSGT00390000015287.b ENSGT00500000044955 ENSGT00950000182961.b.c ENSGT00940000167543 ENSGT00940000155366.b.a.b ENSGT00950000182894.B.i.a.b ENSGT00940000165523.a ENSGT00940000167012.d ENSGT00950000183139.C.i.b.a ENSGT00510000047513.h ENSGT00950000182849.B.c.a.a.c ENSGT00950000182849.B.c.a.a.d ENSGT00940000156708.a.a ENSGT00940000154396.b.a.a.b ENSGT01050000244879.a.b.f Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.b #22 Salmo ANCESTRAL SPECIES 177 ENSGT00940000165757.d.m.a ENSGT01030000234958 ENSGT00390000010434.b.c.b ENSGT00940000166659.d ENSGT00950000182926.b.d.b #22 ENSGT00390000015287.b.e ENSGT00500000044955 ENSGT00950000182961.b.c ENSGT00940000155366.b.a.b.g ENSGT00950000182894.B.i.a.b ENSGT00940000165523.a ENSGT00940000167012.d ENSGT00950000183139.C.i.a.b ENSGT00940000167543 ENSGT00940000155366.b.a.b.h ENSGT00950000182894.B.i.b ENSGT00940000176048 ENSGT01090000260920.a Atlantic salmon MODERN SPECIES 3 ENSSSAG00000008452 ENSSSAG00000121010 ENSSSAG00000000931 LOXL4 (ENSSSAG00000000950) ENSSSAG00000103780 ENSSSAG00000097164 crtac1a (ENSSSAG00000000986) golga7ba (ENSSSAG00000001015) zfyve27 (ENSSSAG00000110795) ENSSSAG00000103473 ENSSSAG00000001055 ENSSSAG00000120539 ENSSSAG00000008247 pi4k2a (ENSSSAG00000008236) cdc25d (ENSSSAG00000008227) ENSSSAG00000099687 #22 exosc1 (ENSSSAG00000093562) ENSSSAG00000108874 gprc5bb (ENSSSAG00000038426) si:ch211-202h22.9 (ENSSSAG00000008178) ENSSSAG00000000516 ENSSSAG00000101938 ENSSSAG00000062557 tekt4 (ENSSSAG00000101639) ENSSSAG00000117368 tekt4 (ENSSSAG00000103017) ENSSSAG00000004221 ENSSSAG00000106567 ENSSSAG00000096854 NTHL1 (ENSSSAG00000097563) ENSSSAG00000083657 Otomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.b #22 Otophysi ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.b #22 Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.b #22 Cyprininae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.b #22 Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.b #22 Golden-line barbel MODERN SPECIES 4752 ENSSGRG00000004630 #22 Elephant shark MODERN SPECIES 1631 NHLRC2 (ENSCMIG00000010877) adrb1 (ENSCMIG00000010889) CCDC186 (ENSCMIG00000010895) ENSCMIG00000010902 ENSCMIG00000010904 VWA2 (ENSCMIG00000010908) AFAP1L2 (ENSCMIG00000010918) ubtd1b (ENSCMIG00000010921) mms19 (ENSCMIG00000010937) zdhhc16a (ENSCMIG00000010996) exosc1 (ENSCMIG00000011000) ENSCMIG00000011007 ENSCMIG00000011008 ENSCMIG00000011009 ENSCMIG00000011010 pgam1a (ENSCMIG00000011015) #22 hps1 (ENSCMIG00000011025) ENSCMIG00000011035 cox15 (ENSCMIG00000011044) cutc (ENSCMIG00000011058) ENSCMIG00000011106 ENSCMIG00000011182 cpn1 (ENSCMIG00000011192) KCNIP2 (ENSCMIG00000011199) lbx1b (ENSCMIG00000011205) HPS6 (ENSCMIG00000011210) ENSCMIG00000011217 ldb1a (ENSCMIG00000011249) Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES 1741 ENSGT00940000161605 ENSGT00950000182926.b.c ##22 Elephant shark DUPLICATION Elephant shark MODERN SPECIES 1671 TCIRG1 (ENSCMIG00000010563) ENSCMIG00000010559 stambpa (ENSCMIG00000010558) ENSCMIG00000010556 dusp2 (ENSCMIG00000010553) ENSCMIG00000010552 ##22 stard7 (ENSCMIG00000010550) OGDH (ENSCMIG00000010470) ENSCMIG00000010460 ENSCMIG00000010459 ENSCMIG00000010458 tmem150aa (ENSCMIG00000010454) rnf181 (ENSCMIG00000010453) ENSCMIG00000010450 vamp8 (ENSCMIG00000010449) GGCX (ENSCMIG00000010446) usp39 (ENSCMIG00000010426) si:ch211-283h6.4 (ENSCMIG00000010415) mat2ab (ENSCMIG00000010351) ENSCMIG00000010326 ENSCMIG00000010321 Elephant shark MODERN SPECIES 1703 ENSCMIG00000013719 ENSCMIG00000013717 ENSCMIG00000013711 ENSCMIG00000013709 ENSCMIG00000013705 ENSCMIG00000013704 si:dkey-33c12.3 (ENSCMIG00000013703) ENSCMIG00000013697 hspa12b (ENSCMIG00000013691) tex261 (ENSCMIG00000013685) ENSCMIG00000013680 ENSCMIG00000013672 vax2 (ENSCMIG00000013668) ENSCMIG00000013663 cct7 (ENSCMIG00000013624) ENSCMIG00000013605 ##22 ENSCMIG00000013603 smyd5 (ENSCMIG00000013534) noto (ENSCMIG00000013510) emx1 (ENSCMIG00000013509) sfxn5b (ENSCMIG00000013500) ENSCMIG00000013492 ENSCMIG00000013488 ENSCMIG00000013487 SPR (ENSCMIG00000013482) Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 325 ENSGT00530000063255.C ENSGT00940000160571 ENSGT00520000055570.A.b ENSGT00940000161915 ENSGT00940000154856.A.a ENSGT00940000161605 ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000164699 ENSGT00530000064712 ENSGT00940000157038 ENSGT00940000160915 ENSGT00940000156732 Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES 504 ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000156185 ENSGT00940000160058 ENSGT00390000006707 ENSGT00510000046985 ENSGT00390000011206.a Neopterygii ANCESTRAL SPECIES 97 ENSGT00390000003706.a.a ENSGT00940000165064 ENSGT00390000008694.b.b ENSGT00940000159105 ENSGT01030000234527.A.a.b.a.a ENSGT00390000013415.a.b ENSGT00950000182864.a.b.b.a.a ENSGT00940000154909.a ENSGT00940000154909.b ENSGT00940000166792 ENSGT00940000165076.b ENSGT00730000111146 ENSGT00940000157734 ENSGT00940000161685.A.a ENSGT00940000156208 ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000156185 ENSGT00940000160058 ENSGT00390000006707 ENSGT00510000046985 ENSGT00390000011206.a Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 194 ENSGT00950000182864.a.b.b.a.a ENSGT00390000013415.a.b.jb ENSGT00390000013415.a.b.ib ENSGT01030000234527.A.a.b.a.a ENSGT00940000159105 ENSGT00390000008694.b.b ENSGT00940000165064.a ENSGT01030000234522.C.d.b ENSGT00940000154909.a.b ENSGT00940000154909.b.a ENSGT00940000166792 ENSGT00940000165076.b ENSGT00730000111146 ENSGT00940000161685.A.a ENSGT00940000156208.i ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00390000008529 ENSGT00940000164254 ENSGT00820000127055.b ENSGT00730000111140 ENSGT00940000167368 ENSGT00390000006044 ENSGT00940000154702.a.b Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 72 ENSGT00940000166638 ENSGT00390000010075 ENSGT00940000165107.A ENSGT00390000009130.b.d.b ENSGT00940000156804.b ENSGT00940000156814 ENSGT00940000153725.b.c ENSGT00950000182909.a.e ENSGT00940000154484.B.a.a ENSGT00940000163919.b ENSGT00940000159932.b ENSGT00940000155760.t.b ENSGT00730000111146 ENSGT00940000161685.A.a ENSGT00940000156208.i ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000164254.a.b ENSGT00820000127055.b ENSGT00940000169602 ENSGT00730000111140 ENSGT00940000167368 ENSGT00390000006044 ENSGT00940000154702.a.b ENSGT00940000166762 ENSGT00950000183203.c.a ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b ENSGT00940000173905 ENSGT00940000153892.B ENSGT00940000158699 ENSGT00940000156664.c ENSGT00950000183160.B Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 154 ENSGT00390000010075 ENSGT00940000165107.A ENSGT00940000156804.b ENSGT00940000156814 ENSGT00940000153725.b.c ENSGT00950000182909.a.e ENSGT00940000154484.B.a.a ENSGT00940000163919.b ENSGT00940000159932.b ENSGT00940000155760.t.b ENSGT00730000111146 ENSGT00940000161685.A.a ENSGT01100000265222 ENSGT00940000154418.a.b ENSGT00940000156208.i ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000164254.a.b ENSGT00820000127055.b ENSGT00940000169602 ENSGT00730000111140 ENSGT00940000167368 ENSGT00390000006044 ENSGT00940000154702.a.b ENSGT00940000166762 ENSGT00950000183203.c.a ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b ENSGT00940000153892.B ENSGT00940000158699 ENSGT00940000156664.c Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 189 ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.e ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.f ENSGT00940000166638 ENSGT00390000010075 ENSGT00940000165107.A ENSGT00940000156804.b ENSGT00940000156814 ENSGT00940000153725.b.c ENSGT00950000182909.a.e ENSGT00940000154484.B.a.a ENSGT00940000163919.b ENSGT00940000159932.b ENSGT00940000155760.t.b ENSGT00940000161685.A.a ENSGT00940000156208.i ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b ENSGT00940000153892.B ENSGT00940000158699 ENSGT00940000156664.c ENSGT00940000167368 ENSGT00820000127055.b ENSGT00940000164254.a.b Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.e ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.f ENSGT00940000166638 ENSGT00390000010075 ENSGT00940000165107.A ENSGT00940000156804.b ENSGT00940000156814 ENSGT00940000153725.b.c ENSGT00950000182909.a.e ENSGT00940000154484.B.a.a ENSGT00940000163919.b ENSGT00940000159932.b ENSGT00940000155760.t.b ENSGT00940000161685.A.a ENSGT00940000156208.i ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b ENSGT00940000164254.a.b ENSGT00820000127055.b ENSGT00940000167368 ENSGT00940000156664.c ENSGT00940000158699 ENSGT00940000153892.B ENSGT00940000173905 ENSGT00940000162805 ENSGT00940000158075 ENSGT00390000017123.b ENSGT00950000183172.A ENSGT00390000018018 ENSGT00940000165298.a.a ENSGT00940000154702.a.b Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 3 EFNA5 (ENSMMDG00005006136) GADD45G (ENSMMDG00005006135) gadd45gb.1 (ENSMMDG00005006133) ENSMMDG00005006099 ghrb (ENSMMDG00005006094) c7b (ENSMMDG00005005587) c6 (ENSMMDG00005004007) rgs7bpb (ENSMMDG00005003972) rnf180b (ENSMMDG00005003969) htr1ab (ENSMMDG00005003967) ndr1 (ENSMMDG00005003965) eif4ebp1 (ENSMMDG00005003962) ANK1 (ENSMMDG00005003757) nefma (ENSMMDG00005003722) neflb (ENSMMDG00005003706) pgam2 (ENSMMDG00005003704) ##22 ENSMMDG00005003701 ENSMMDG00005003698 MMP17 (ENSMMDG00005003692) ENSMMDG00005003690 crkl (ENSMMDG00005003686) si:ch211-222n4.2 (ENSMMDG00005003681) ULK1 (ENSMMDG00005003676) MMP17 (ENSMMDG00005003669) sfswap (ENSMMDG00005003659) ENSMMDG00005003646 ENSMMDG00005003640 TRABD2A (ENSMMDG00005003636) HOOK3 (ENSMMDG00005001350) rnf170 (ENSMMDG00005001186) gpn3 (ENSMMDG00005001169) Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT01100000263544.c.a.a.b ENSGT00940000155983.a.b ENSGT00940000168590 ENSGT00940000159066 ENSGT00940000156161.A ENSGT00390000006975 ENSGT00940000162544.c.a ENSGT00940000164512.d ENSGT00940000162544.d ENSGT00940000178030 ENSGT00940000163919.b ENSGT00940000159932.b ENSGT00940000155760.t.b ENSGT00940000161685.A.a ENSGT00940000156208.i ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b ENSGT00940000164254.a.b ENSGT00820000127055.b ENSGT00940000167368 ENSGT00940000156664.c ENSGT00940000158699 ENSGT00940000153892.B ENSGT00940000173905 ENSGT00940000162805 ENSGT00940000158075 ENSGT00390000017123.b ENSGT00950000183172.A ENSGT00390000018018 ENSGT00940000165298.a.a ENSGT00940000154702.a.b Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 499 rasgef1bb (ENSHCOG00000004798) ENSHCOG00000004820 ENSHCOG00000004845 snx18b (ENSHCOG00000004851) ENSHCOG00000004868 dusp4 (ENSHCOG00000004893) ENSHCOG00000004945 cldn23.1 (ENSHCOG00000004952) ENSHCOG00000004973 ENSHCOG00000004981 ENSHCOG00000004993 eif4ebp1 (ENSHCOG00000004999) ANK1 (ENSHCOG00000000133) nefma (ENSHCOG00000005056) ENSHCOG00000005064 pgam2 (ENSHCOG00000005073) ##22 ENSHCOG00000005076 ENSHCOG00000005082 ENSHCOG00000005102 MMP17 (ENSHCOG00000005121) Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT01100000263544.c.a.a.b ENSGT00940000155983.a.b ENSGT00940000168590 ENSGT00940000159066 ENSGT00940000156161.A ENSGT00390000006975 ENSGT00940000162544.c.a ENSGT00940000164512.d ENSGT00940000162544.d ENSGT00940000178030 ENSGT00940000163919.b ENSGT00940000159932.b ENSGT00940000155760.t.b ENSGT00940000161685.A.a ENSGT00940000156208.i ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b ENSGT00940000158699.q.b ENSGT00940000164254.a.b ENSGT00820000127055.b ENSGT00940000167368 ENSGT00940000156664.c ENSGT00940000158699.q.a ENSGT00940000153892.B ENSGT00940000162805 ENSGT00940000158075 ENSGT00390000017123.b ENSGT00950000183172.A ENSGT00390000018018 ENSGT00940000165298.a.a ENSGT00940000154702.a.b Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000168590 ENSGT00940000159066 ENSGT00940000156161.A ENSGT00390000006975 ENSGT00610000087482 ENSGT00940000162544.c.a ENSGT00940000164512.d ENSGT00940000162544.d ENSGT00940000178030.a ENSGT00940000178065 ENSGT00940000163919.b ENSGT00940000159932.b ENSGT00940000155760.t.b ENSGT00940000161685.A.a ENSGT00940000156208.i ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b ENSGT00940000158699.q.a ENSGT00940000164254.a.b ENSGT00820000127055.b ENSGT00940000167368 ENSGT00940000156664.c ENSGT00940000158699.q.b ENSGT00940000153892.B ENSGT00940000162805 ENSGT00940000158075 ENSGT00390000017123.b ENSGT00950000183172.A ENSGT00390000018018 ENSGT00940000165298.a.a ENSGT00940000154702.a.b Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000155983.a.b ENSGT00940000168590 ENSGT00940000159066 ENSGT00940000156161.A ENSGT00390000006975 ENSGT00610000087482 ENSGT00940000162544.c.a ENSGT00940000162544.d ENSGT00940000178030.a ENSGT00940000178065 ENSGT00940000163919.b ENSGT00940000159932.b ENSGT00940000155760.t.b ENSGT00940000161685.A.a ENSGT00940000156208.i ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b ENSGT00940000158699.q.b.d ENSGT00940000164254.a.b ENSGT00820000127055.b ENSGT00940000167368 ENSGT00940000156664.c ENSGT00940000158699.q.b.c ENSGT00940000153892.B ENSGT00940000162805 ENSGT00940000158075 ENSGT00390000017123.b ENSGT00950000183172.A ENSGT00390000018018 ENSGT00940000154702.a.b ENSGT00940000166762 Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000155983.a.b ENSGT00940000168590 ENSGT00940000159066 ENSGT00940000156161.A ENSGT00390000006975 ENSGT00610000087482 ENSGT00940000162544.c.a ENSGT00940000162544.d ENSGT00940000178030.a ENSGT00940000178065 ENSGT00940000163919.b ENSGT00940000159932.b ENSGT00940000155760.t.b ENSGT00940000161685.A.a ENSGT00940000156208.i ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b ENSGT00940000156024.i.a.f ENSGT00940000158699.q.b.d ENSGT00940000164254.a.b ENSGT00820000127055.b ENSGT00940000167368 ENSGT00940000156664.c ENSGT00940000158699.q.b.c ENSGT00940000153892.B ENSGT00940000162805 ENSGT00940000158075 ENSGT00390000017123.b ENSGT00950000183172.A ENSGT00390000018018 ENSGT00940000154702.a.b Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000155816.a ENSGT00940000156320.d ENSGT00940000155291.b ENSGT01100000263544.c.a.a.b ENSGT00940000155983.a.b ENSGT00940000159066 ENSGT00940000156161.A ENSGT00390000006975 ENSGT00940000162544.c.a ENSGT00940000178030.a ENSGT00940000163919.b ENSGT00940000159932.b ENSGT00940000155760.t.b ENSGT00940000161685.A.a ENSGT00940000156208.i ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b ENSGT00940000156024.i.a.f ENSGT00940000158699.q.b.d ENSGT00940000164254.a.b ENSGT00820000127055.b ENSGT00940000167368 ENSGT00940000156664.c ENSGT00940000158699.q.a ENSGT00940000153892.B ENSGT00940000162805 ENSGT00940000158075 ENSGT00390000017123.b ENSGT00950000183172.A ENSGT00390000018018 ENSGT00940000154702.a.b Mangrove rivulus MODERN SPECIES 16 rasgef1bb (ENSKMAG00000014414) antxr2b (ENSKMAG00000014384) paqr3b (ENSKMAG00000014357) slc26a1 (ENSKMAG00000014321) ENSKMAG00000014282 dusp4 (ENSKMAG00000014251) ENSKMAG00000014133 cldn23.1 (ENSKMAG00000014078) ENSKMAG00000013925 ENSKMAG00000013883 ndr1 (ENSKMAG00000013866) eif4ebp1 (ENSKMAG00000013857) ANK1 (ENSKMAG00000013580) nefma (ENSKMAG00000013463) neflb (ENSKMAG00000013417) pgam2 (ENSKMAG00000013402) ##22 ENSKMAG00000013386 ENSKMAG00000013343 MMP17 (ENSKMAG00000013317) ENSKMAG00000013289 crkl (ENSKMAG00000013269) ULK1 (ENSKMAG00000013221) MMP17 (ENSKMAG00000013191) sfswap (ENSKMAG00000013168) TRABD2A (ENSKMAG00000013149) HOOK3 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SPECIES 16 ENSGT00940000155291.b ENSGT01100000263544.c.a.a.b ENSGT00940000155983.a.b ENSGT00940000168590 ENSGT00940000159066 ENSGT00940000156161.A ENSGT00390000006975 ENSGT00610000087482 ENSGT00940000162544.c.a ENSGT00940000162544.d ENSGT00940000163919.b ENSGT00940000159932.b ENSGT00940000155760.t.b ENSGT00940000161685.A.a ENSGT00940000156208.i ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b ENSGT00940000156024.i.a.f ENSGT00940000158699.q.b.d ENSGT00940000164254.a.b ENSGT00820000127055.b ENSGT00940000167368 ENSGT00940000156664.c ENSGT00940000158699.q.b.c ENSGT00940000153892.B ENSGT00940000162805 ENSGT00940000158075 ENSGT00390000017123.b ENSGT00950000183172.A ENSGT00390000018018 ENSGT00940000154702.a.b Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000155291.b ENSGT01100000263544.c.a.a.b ENSGT00940000155983.a.b ENSGT00940000168590 ENSGT00940000159066 ENSGT00940000156161.A ENSGT00390000006975 ENSGT00610000087482 ENSGT00940000162544.c.a ENSGT00940000162544.d ENSGT00940000163919.b 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ENSGT00940000158699.q.b.c ENSGT00940000153892.B ENSGT00940000162805 ENSGT00940000158075 ENSGT00390000017123.b ENSGT00950000183172.A ENSGT00390000018018 ENSGT00940000154702.a.b ENSGT00940000166762 ENSGT00950000183203.c.a Guppy MODERN SPECIES 442 paqr3b (ENSPREG00000005732) slc26a1 (ENSPREG00000005774) ENSPREG00000005822 ENSPREG00000005848 dusp4 (ENSPREG00000005876) ENSPREG00000005920 cldn23.1 (ENSPREG00000006047) ENSPREG00000006089 ENSPREG00000006222 ENSPREG00000006313 eif4ebp1 (ENSPREG00000006324) ANK1 (ENSPREG00000006344) nefma (ENSPREG00000006401) neflb (ENSPREG00000006406) ENSPREG00000006430 pgam2 (ENSPREG00000006497) ##22 MMP17 (ENSPREG00000006526) ENSPREG00000006558 crkl (ENSPREG00000006578) ULK1 (ENSPREG00000006613) MMP17 (ENSPREG00000006640) sfswap (ENSPREG00000006692) TRABD2A (ENSPREG00000006752) ENSPREG00000006761 HOOK3 (ENSPREG00000006820) rnf170 (ENSPREG00000006963) gpn3 (ENSPREG00000006986) arpc3 (ENSPREG00000007014) TMEM132C (ENSPREG00000007031) ENSPREG00000007087 RIMBP2 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ENSPFOG00000007579 Amazon molly MODERN SPECIES 396 slc26a1 (ENSPFOG00000004575) ENSPFOG00000004769 ENSPFOG00000023568 dusp4 (ENSPFOG00000004804) ENSPFOG00000004982 cldn23.1 (ENSPFOG00000020334) ENSPFOG00000020335 ENSPFOG00000005920 ENSPFOG00000006003 ndr1 (ENSPFOG00000006036) eif4ebp1 (ENSPFOG00000006081) ANK1 (ENSPFOG00000006144) nefma (ENSPFOG00000007247) neflb (ENSPFOG00000007321) pgam2 (ENSPFOG00000007353) ##22 pgam2 (ENSPFOG00000007376) ##22 ENSPFOG00000007404 ENSPFOG00000007579 Sailfin molly DUPLICATION Sailfin molly MODERN SPECIES 522 dusp4 (ENSPLAG00000004381) ENSPLAG00000004341 cldn23.1 (ENSPLAG00000004273) ENSPLAG00000004260 ENSPLAG00000004243 ENSPLAG00000004217 ENSPLAG00000004204 eif4ebp1 (ENSPLAG00000004199) ANK1 (ENSPLAG00000004182) nefma (ENSPLAG00000004120) ENSPLAG00000004004 pgam2 (ENSPLAG00000003909) ##22 ENSPLAG00000003904 Sailfin molly MODERN SPECIES 1067 pgam2 (ENSPLAG00000019725) ##22 ENSPLAG00000019706 MMP17 (ENSPLAG00000019695) ENSPLAG00000019656 Platyfish MODERN SPECIES 22 antxr2b (ENSXMAG00000002277) paqr3b (ENSXMAG00000002288) slc26a1 (ENSXMAG00000002291) ENSXMAG00000002301 ENSXMAG00000022408 dusp4 (ENSXMAG00000021873) ENSXMAG00000002312 cldn23.1 (ENSXMAG00000020077) ENSXMAG00000002338 ENSXMAG00000023414 ENSXMAG00000027715 eif4ebp1 (ENSXMAG00000025049) ANK1 (ENSXMAG00000002364) nefma (ENSXMAG00000025159) neflb (ENSXMAG00000002416) pgam2 (ENSXMAG00000021805) ##22 ENSXMAG00000026112 MMP17 (ENSXMAG00000002441) ENSXMAG00000027166 crkl (ENSXMAG00000026069) ENSXMAG00000029005 ULK1 (ENSXMAG00000002466) MMP17 (ENSXMAG00000023131) sfswap (ENSXMAG00000009020) TRABD2A (ENSXMAG00000009059) HOOK3 (ENSXMAG00000009065) rnf170 (ENSXMAG00000009097) gpn3 (ENSXMAG00000009108) ENSXMAG00000024599 arpc3 (ENSXMAG00000027458) ENSXMAG00000019766 NAME_4 ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000156320.d ENSGT00940000155291.b ENSGT01100000263544.c.a.a.b ENSGT00940000155983.a.b ENSGT00940000168590 ENSGT00940000159066 ENSGT00940000156161.A ENSGT00390000006975 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(ENSCVAG00000012632) MMP17 (ENSCVAG00000012610) Mummichog MODERN SPECIES 2264 slc26a1 (ENSFHEG00000012239) ENSFHEG00000012187 ENSFHEG00000012142 dusp4 (ENSFHEG00000012073) ENSFHEG00000012036 cldn23.1 (ENSFHEG00000011895) ENSFHEG00000011883 ENSFHEG00000011812 ENSFHEG00000011786 ENSFHEG00000011766 ENSFHEG00000011753 eif4ebp1 (ENSFHEG00000011737) ANK1 (ENSFHEG00000011687) nefma (ENSFHEG00000011564) neflb (ENSFHEG00000011439) pgam2 (ENSFHEG00000011366) ##22 ENSFHEG00000011400 ENSFHEG00000011343 MMP17 (ENSFHEG00000011329) ENSFHEG00000011291 crkl (ENSFHEG00000011272) si:ch211-222n4.2 (ENSFHEG00000011257) ULK1 (ENSFHEG00000011250) MMP17 (ENSFHEG00000011185) sfswap (ENSFHEG00000011149) ENSFHEG00000011127 TRABD2A (ENSFHEG00000011113) HOOK3 (ENSFHEG00000011102) Oryzias ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000156320.d ENSGT00940000155291.b ENSGT01100000263544.c.a.a.b ENSGT00940000155983.a.b ENSGT00940000168590 ENSGT00940000159066 ENSGT00940000156161.A ENSGT00390000006975 ENSGT00940000162544.c.a 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ENSGT00820000127055.b ENSGT00940000167368 ENSGT00940000156664.c ENSGT00940000158699.q.b.c.b ENSGT00940000153892.B ENSGT00940000162805 ENSGT00940000158075 ENSGT00390000017123.b ENSGT00950000183172.A ENSGT00390000018018 ENSGT00940000154702.a.b ENSGT00940000166762 Javanese ricefish MODERN SPECIES 3 rasgef1bb (ENSOJAG00000008917) antxr2b (ENSOJAG00000010430) paqr3b (ENSOJAG00000010452) slc26a1 (ENSOJAG00000010462) ENSOJAG00000010480 ENSOJAG00000010493 dusp4 (ENSOJAG00000010517) ENSOJAG00000010753 cldn23.1 (ENSOJAG00000013055) ENSOJAG00000013167 ENSOJAG00000013184 ENSOJAG00000013193 ANK1 (ENSOJAG00000013219) nefma (ENSOJAG00000014598) neflb (ENSOJAG00000014675) pgam2 (ENSOJAG00000014687) ##22 ENSOJAG00000014713 MMP17 (ENSOJAG00000014749) ENSOJAG00000014823 crkl (ENSOJAG00000014832) MMP17 (ENSOJAG00000014864) sfswap (ENSOJAG00000014952) TRABD2A (ENSOJAG00000014991) HOOK3 (ENSOJAG00000015083) rnf170 (ENSOJAG00000015515) gpn3 (ENSOJAG00000015529) arpc3 (ENSOJAG00000015547) ENSOJAG00000015578 TMEM132C (ENSOJAG00000015619) ENSOJAG00000015827 RIMBP2 (ENSOJAG00000015873) Indian medaka MODERN SPECIES 30 paqr3b (ENSOMEG00000021444) slc26a1 (ENSOMEG00000021472) ENSOMEG00000021505 ENSOMEG00000000984 dusp4 (ENSOMEG00000021565) ENSOMEG00000021619 cldn23.1 (ENSOMEG00000021639) ENSOMEG00000021669 ENSOMEG00000021690 ENSOMEG00000021710 ENSOMEG00000021722 eif4ebp1 (ENSOMEG00000021742) ENSOMEG00000021750 ANK1 (ENSOMEG00000021775) nefma (ENSOMEG00000021807) pgam2 (ENSOMEG00000021829) ##22 MMP17 (ENSOMEG00000021887) ENSOMEG00000021910 crkl (ENSOMEG00000021933) ENSOMEG00000021949 ULK1 (ENSOMEG00000021995) MMP17 (ENSOMEG00000022028) sfswap (ENSOMEG00000022065) trabd2a (ENSOMEG00000022082) ENSOMEG00000022088 HOOK3 (ENSOMEG00000022217) rnf170 (ENSOMEG00000022333) gpn3 (ENSOMEG00000022391) arpc3 (ENSOMEG00000022426) TMEM132C (ENSOMEG00000022451) ENSOMEG00000022470 Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000155760.t.b ENSGT00940000161685.A.a ENSGT00940000156208.i ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b ENSGT00940000158699.q.b.c.a ENSGT00940000164254.a.b ENSGT00820000127055.b ENSGT00940000156664.c ENSGT00940000158699.q.a ENSGT00940000153892.B ENSGT00940000158075 ENSGT00940000156024.i.a.f ENSGT00390000017123.b ENSGT00950000183172.A ENSGT00390000018018 ENSGT00940000154702.a.b ENSGT00940000166762 ENSGT00950000183203.c.a Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 3 ENSORLG00000011341 ENSORLG00000022643 cldn23.1 (ENSORLG00000011288) ENSORLG00000024668 ENSORLG00000011280 ENSORLG00000023124 ENSORLG00000025785 ENSORLG00000028190 ENSORLG00000023779 ENSORLG00000019945 ENSORLG00000026718 ENSORLG00000011244 ENSORLG00000027528 nefma (ENSORLG00000011207) neflb (ENSORLG00000011182) pgam2 (ENSORLG00000011149) ##22 ENSORLG00000011130 ENSORLG00000021946 ENSORLG00000011001 ENSORLG00000023408 crkl (ENSORLG00000011093) ENSORLG00000026074 ULK1 (ENSORLG00000011071) ENSORLG00000028766 sfswap (ENSORLG00000010983) trabd2a (ENSORLG00000026885) HOOK3 (ENSORLG00000010949) ENSORLG00000028328 ENSORLG00000023540 rnf170 (ENSORLG00000010897) gpn3 (ENSORLG00000010884) Chinese medaka MODERN SPECIES 1147 ANK1 (ENSOSIG00000021364) nefma (ENSOSIG00000022894) neflb (ENSOSIG00000022898) pgam2 (ENSOSIG00000022906) ##22 stx2a (ENSOSIG00000022910) Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT01100000263544.c.a.a.b ENSGT00940000155983.a.b ENSGT00940000168590 ENSGT00940000159066 ENSGT00940000156161.A ENSGT00390000006975 ENSGT00610000087482 ENSGT00940000162544.c.a ENSGT00940000162544.d ENSGT00940000178065 ENSGT00940000163919.b ENSGT00940000159932.b ENSGT00940000155760.t.b ENSGT00940000161685.A.a ENSGT00940000156208.i ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b ENSGT00940000158699.q.b ENSGT00940000164254.a.b ENSGT00820000127055.b ENSGT00940000167368 ENSGT00940000156664.c ENSGT00940000158699.q.a ENSGT00940000153892.B ENSGT00940000173905 ENSGT00940000162805 ENSGT00940000158075 ENSGT00390000017123.b ENSGT00950000183172.A ENSGT00390000018018 ENSGT00940000165298.a.a Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 44 ENSGT00940000155291.b ENSGT01100000263544.c.a.a.b ENSGT00940000155983.a.b ENSGT00940000168590 ENSGT00940000159066 ENSGT00940000156161.A ENSGT00390000006975 ENSGT00940000162544.c.a ENSGT00940000178030.b ENSGT00940000178065 ENSGT00940000163919.b ENSGT00940000159932.b ENSGT00940000155760.t.b ENSGT00940000161685.A.a ENSGT00940000156208.i ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b ENSGT00940000158699.q.b.a ENSGT00940000164254.a.b Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 86 ENSGT00940000156320.d ENSGT00940000155291.b ENSGT01100000263544.c.a.a.b ENSGT00940000155983.a.b ENSGT00940000168590 ENSGT00940000159066 ENSGT00940000156161.A ENSGT00390000006975 ENSGT00940000162544.c.a ENSGT00940000178030.b ENSGT00940000163919.b ENSGT00940000159932.b ENSGT00940000155760.t.b ENSGT00940000161685.A.a ENSGT00940000156208.i ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b ENSGT00940000158699.q.b.a ENSGT00940000164254.a.b Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 127 ENSGT00940000156320.d ENSGT00940000155291.b ENSGT01100000263544.c.a.a.b ENSGT00940000155983.a.b ENSGT00940000168590 ENSGT00940000159066 ENSGT00940000156161.A ENSGT00390000006975 ENSGT00940000162544.c.a ENSGT00940000178030.b ENSGT00940000163919.b ENSGT00940000159932.b ENSGT00940000155760.t.b ENSGT00940000161685.A.a ENSGT00940000156208.i ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b ENSGT00940000158699.q.b.a ENSGT00940000164254.a.b Clown anemonefish MODERN SPECIES 607 cldn23.1 (ENSAOCG00000017929) ENSAOCG00000018001 ENSAOCG00000018014 ENSAOCG00000018021 eif4ebp1 (ENSAOCG00000001279) ANK1 (ENSAOCG00000018157) nefma (ENSAOCG00000001297) neflb (ENSAOCG00000018195) pgam2 (ENSAOCG00000018211) ##22 STX2 (ENSAOCG00000018220) Orange clownfish MODERN SPECIES 7 ENSAPEG00000002881 paqr3b (ENSAPEG00000002831) slc26a1 (ENSAPEG00000002819) ENSAPEG00000002757 ENSAPEG00000002720 ENSAPEG00000002695 dusp4 (ENSAPEG00000002683) ENSAPEG00000002584 cldn23.1 (ENSAPEG00000002542) ENSAPEG00000002120 ENSAPEG00000002083 eif4ebp1 (ENSAPEG00000002059) ANK1 (ENSAPEG00000001924) nefma (ENSAPEG00000001916) neflb (ENSAPEG00000001897) pgam2 (ENSAPEG00000001880) ##22 ENSAPEG00000001870 MMP17 (ENSAPEG00000001832) ENSAPEG00000001739 Spiny chromis MODERN SPECIES 606 snap25a (ENSAPOG00000017456) sccpdhb (ENSAPOG00000017439) cnstb (ENSAPOG00000017427) ENSAPOG00000017413 hnrnpub (ENSAPOG00000017400) lft1 (ENSAPOG00000017349) ENSAPOG00000000468 nefma (ENSAPOG00000017321) neflb (ENSAPOG00000017313) pgam2 (ENSAPOG00000017307) ##22 ENSAPOG00000017287 Bicolor damselfish MODERN SPECIES 504 ENSSPAG00000001035 cldn23.1 (ENSSPAG00000001151) ENSSPAG00000001164 ENSSPAG00000001182 ENSSPAG00000001198 ENSSPAG00000001219 ENSSPAG00000001241 eif4ebp1 (ENSSPAG00000001256) ANK1 (ENSSPAG00000001274) ENSSPAG00000001391 nefma (ENSSPAG00000001418) neflb (ENSSPAG00000001497) pgam2 (ENSSPAG00000001517) ##22 ENSSPAG00000001534 MMP17 (ENSSPAG00000001562) ENSSPAG00000001605 Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 10 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ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b ENSGT00940000158699.q.b ENSGT00940000154396.a ENSGT00940000155640.b ENSGT00940000157920.b ENSGT00940000157685 ENSGT00940000157216 ENSGT00940000163543.b ENSGT00940000154687.B.q.a ENSGT00940000154130.a.b.e ENSGT00390000005101 ENSGT01030000234558.D.a ENSGT00940000157589 ENSGT00530000063085.B ENSGT00940000159387.f P. nyererei MODERN SPECIES 327 ENSPNYG00000011233 ENSPNYG00000011253 dusp4 (ENSPNYG00000011292) ENSPNYG00000011308 cldn23.1 (ENSPNYG00000011364) ENSPNYG00000011415 ENSPNYG00000011584 ENSPNYG00000011596 ENSPNYG00000011617 ENSPNYG00000011630 eif4ebp1 (ENSPNYG00000011640) ANK1 (ENSPNYG00000011659) ENSPNYG00000011726 nefma (ENSPNYG00000011781) neflb (ENSPNYG00000011855) pgam2 (ENSPNYG00000011876) ##22 ENSPNYG00000011898 ENSPNYG00000011911 MMP17 (ENSPNYG00000011926) rln1 (ENSPNYG00000011951) jak2a (ENSPNYG00000011975) ENSPNYG00000012034 RC3H2 (ENSPNYG00000012063) RABGAP1 (ENSPNYG00000012166) GPR21 (ENSPNYG00000012294) STRBP (ENSPNYG00000012317) SH2D3C (ENSPNYG00000012381) ENSPNYG00000012429 urm1 (ENSPNYG00000012446) CERCAM (ENSPNYG00000012488) sardh (ENSPNYG00000012545) Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000155291.b ENSGT01100000263544.c.a.a.b ENSGT00940000155983.a.b ENSGT00940000168590 ENSGT00940000159066 ENSGT00940000156161.A ENSGT00390000006975 ENSGT00940000162544.c.a ENSGT00940000164512.d ENSGT00940000178065 ENSGT00940000163919.b ENSGT00940000159932.b ENSGT00940000155760.t.b ENSGT00940000161685.A.a ENSGT00940000156208.i ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b ENSGT00940000158699.q.b ENSGT00940000154396.a ENSGT00940000155640.b ENSGT00940000157920.b ENSGT00940000157685 ENSGT00940000157216 ENSGT00940000163543.b ENSGT00940000154687.B.q.a ENSGT00940000154130.a.b.e ENSGT00390000005101 ENSGT01030000234558.D.a ENSGT00940000157589 ENSGT00530000063085.B ENSGT00940000159387.f Zebra mbuna MODERN SPECIES 1110 paqr3b (ENSMZEG00005016683) slc26a1 (ENSMZEG00005016692) ENSMZEG00005016707 ENSMZEG00005016712 dusp4 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nefma (ENSACLG00000023422) neflb (ENSACLG00000023415) pgam2 (ENSACLG00000023406) ##22 ENSACLG00000023400 ENSACLG00000023355 ENSACLG00000023350 ENSACLG00000023342 MMP17 (ENSACLG00000023299) rln1 (ENSACLG00000023223) jak2a (ENSACLG00000023172) ENSACLG00000023156 RC3H2 (ENSACLG00000023136) GPR21 (ENSACLG00000023129) RABGAP1 (ENSACLG00000022769) STRBP (ENSACLG00000022623) ENSACLG00000022603 SH2D3C (ENSACLG00000022506) urm1 (ENSACLG00000022484) Lyretail cichlid MODERN SPECIES 328 paqr3b (ENSNBRG00000010143) slc26a1 (ENSNBRG00000010013) ENSNBRG00000009976 ENSNBRG00000009941 dusp4 (ENSNBRG00000009930) ENSNBRG00000009869 ENSNBRG00000009850 cldn23.1 (ENSNBRG00000009840) ENSNBRG00000009700 ENSNBRG00000009654 ENSNBRG00000009644 eif4ebp1 (ENSNBRG00000009633) ANK1 (ENSNBRG00000009558) nefma (ENSNBRG00000009534) neflb (ENSNBRG00000009521) pgam2 (ENSNBRG00000009501) ##22 ENSNBRG00000009486 ENSNBRG00000009476 MMP17 (ENSNBRG00000009451) rln1 (ENSNBRG00000009431) jak2a (ENSNBRG00000009344) ENSNBRG00000009318 RC3H2 (ENSNBRG00000009276) GPR21 (ENSNBRG00000009242) RABGAP1 (ENSNBRG00000009158) STRBP (ENSNBRG00000009092) SH2D3C (ENSNBRG00000009032) urm1 (ENSNBRG00000009012) CERCAM (ENSNBRG00000008921) Nile tilapia MODERN SPECIES 19 snx18b (ENSONIG00000004080) ENSONIG00000004075 rasgef1bb (ENSONIG00000004068) antxr2b (ENSONIG00000004061) paqr3b (ENSONIG00000030068) slc26a1 (ENSONIG00000004047) dusp4 (ENSONIG00000041169) ENSONIG00000004019 cldn23.1 (ENSONIG00000020635) ENSONIG00000004014 ndr1 (ENSONIG00000004012) eif4ebp1 (ENSONIG00000035373) ANK1 (ENSONIG00000003990) nefma (ENSONIG00000003986) neflb (ENSONIG00000003981) pgam2 (ENSONIG00000003979) ##22 STX2 (ENSONIG00000043217) ENSONIG00000032869 ENSONIG00000040512 ENSONIG00000032559 MMP17 (ENSONIG00000003963) ENSONIG00000003962 jak2a (ENSONIG00000003957) ENSONIG00000031422 RC3H2 (ENSONIG00000003945) RABGAP1 (ENSONIG00000003929) STRBP (ENSONIG00000003920) SH2D3C (ENSONIG00000003912) urm1 (ENSONIG00000003910) CERCAM (ENSONIG00000003905) sardh (ENSONIG00000003900) Midas cichlid MODERN SPECIES 110 ENSACIG00000008519 ENSACIG00000008534 cldn23.1 (ENSACIG00000008551) ENSACIG00000008568 ENSACIG00000008659 ENSACIG00000008674 eif4ebp1 (ENSACIG00000008686) ANK1 (ENSACIG00000008764) ENSACIG00000008836 nefma (ENSACIG00000008855) neflb (ENSACIG00000008909) pgam2 (ENSACIG00000008930) ##22 ENSACIG00000009069 MMP17 (ENSACIG00000009078) ENSACIG00000009104 crkl (ENSACIG00000009121) si:ch211-222n4.2 (ENSACIG00000009131) ULK1 (ENSACIG00000009165) MMP17 (ENSACIG00000009215) ENSACIG00000009240 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000155291.b ENSGT01100000263544.c.a.a.b ENSGT00940000155983.a.b ENSGT00940000168590 ENSGT00940000159066 ENSGT00940000156161.A ENSGT00390000006975 ENSGT00940000162544.c.a ENSGT00940000164512.d ENSGT00940000162544.d ENSGT00940000163919.b ENSGT00940000159932.b ENSGT00940000155760.t.b ENSGT00940000161685.A.a ENSGT00940000156208.i ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b ENSGT00940000158699.q.b ENSGT00940000164254.a.b ENSGT00820000127055.b ENSGT00940000167368 ENSGT00940000156664.c ENSGT00940000158699.q.a ENSGT00940000153892.B ENSGT00940000162805 ENSGT00940000158075 ENSGT00390000017123.b ENSGT00950000183172.A ENSGT00390000018018 ENSGT00940000165298.a.a ENSGT00940000154702.a.b Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000155291.b ENSGT01100000263544.c.a.a.b ENSGT00940000155983.a.b ENSGT00940000168590 ENSGT00940000159066 ENSGT00940000156161.A ENSGT00390000006975 ENSGT00940000162544.c.a ENSGT00940000178030 ENSGT00940000162544.d ENSGT00940000163919.b ENSGT00940000159932.b ENSGT00940000155760.t.b ENSGT00940000161685.A.a ENSGT00940000156208.i ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b ENSGT00940000164254.a.b ENSGT00820000127055.b ENSGT00940000167368 ENSGT00940000156664.c ENSGT00940000158699.q.a ENSGT00940000153892.B ENSGT00940000162805 ENSGT00940000158075 ENSGT00390000017123.b ENSGT00950000183172.A ENSGT00390000018018 ENSGT00940000165298.a.a ENSGT00940000154702.a.b ENSGT00940000166762 Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 205 ENSGT00940000161685.A.a ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b ENSGT00820000127055.b ENSGT00940000156664.c ENSGT00940000153892.B Fugu MODERN SPECIES 18 ENSTRUG00000028280 ENSTRUG00000024441 ENSTRUG00000030365 galt (ENSTRUG00000016445) sigmar1 (ENSTRUG00000024592) ier3ip1 (ENSTRUG00000001826) skor2 (ENSTRUG00000027386) ENSTRUG00000031343 ENSTRUG00000028660 ENSTRUG00000015690 ENSTRUG00000027956 ENSTRUG00000032728 ENSTRUG00000000842 clic3 (ENSTRUG00000000860) nefma (ENSTRUG00000001267) pgam2 (ENSTRUG00000009333) ##22 ENSTRUG00000009162 MMP17 (ENSTRUG00000028124) crkl (ENSTRUG00000003912) ULK1 (ENSTRUG00000030331) sfswap (ENSTRUG00000028452) pus1 (ENSTRUG00000002198) noc4l (ENSTRUG00000002312) ENSTRUG00000026745 RIMBP2 (ENSTRUG00000028382) ENSTRUG00000028582 ENSTRUG00000031605 TMEM132C (ENSTRUG00000030774) ENSTRUG00000032674 ube2g1b (ENSTRUG00000000955) arpc3 (ENSTRUG00000000904) Tetraodon MODERN SPECIES 26 cldn10a (ENSTNIG00000006119) ENSTNIG00000006120 chia.1 (ENSTNIG00000000017) chia.3 (ENSTNIG00000006123) cntn2 (ENSTNIG00000006124) nfasca (ENSTNIG00000006125) sacm1la (ENSTNIG00000006128) trnau1apa (ENSTNIG00000006129) tspan12 (ENSTNIG00000006146) tspan12 (ENSTNIG00000000260) ENSTNIG00000006147 ENSTNIG00000000192 FLNC (ENSTNIG00000006148) ENSTNIG00000006149 nefma (ENSTNIG00000006150) pgam2 (ENSTNIG00000006151) ##22 ENSTNIG00000000082 MMP17 (ENSTNIG00000006152) crkl (ENSTNIG00000006153) ULK1 (ENSTNIG00000006154) MMP17 (ENSTNIG00000006155) ENSTNIG00000006156 TAAR1 (ENSTNIG00000001471) TAAR1 (ENSTNIG00000000218) TAAR1 (ENSTNIG00000005193) TAAR1 (ENSTNIG00000001226) ENSTNIG00000006197 ENSTNIG00000006198 ENSTNIG00000006199 galcb (ENSTNIG00000006200) ENSTNIG00000006209 Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000155291.b ENSGT01100000263544.c.a.a.b ENSGT00940000155983.a.b ENSGT00940000168590 ENSGT00940000159066 ENSGT00940000156161.A ENSGT00390000006975 ENSGT00940000162544.c.a ENSGT00940000178030 ENSGT00940000162544.d ENSGT00940000163919.b ENSGT00940000159932.b ENSGT00940000155760.t.b ENSGT00940000161685.A.a ENSGT00940000156208.i ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b ENSGT00940000158699.q.a.i.a ENSGT00940000164254.a.b ENSGT00820000127055.b ENSGT00940000167368 ENSGT00940000156664.c ENSGT00940000158699.q.a.j ENSGT00940000153892.B ENSGT00940000162805 ENSGT00940000158075 ENSGT00390000017123.b ENSGT00950000183172.A ENSGT00390000018018 ENSGT00940000165298.a.a ENSGT00940000154702.a.b Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse MODERN SPECIES 216 pgam2 (ENSLBEG00000009884) ##22 ENSLBEG00000009862 MMP17 (ENSLBEG00000009906) ENSLBEG00000009947 crkl (ENSLBEG00000009981) si:ch211-222n4.2 (ENSLBEG00000010013) ULK1 (ENSLBEG00000010033) MMP17 (ENSLBEG00000010094) sfswap (ENSLBEG00000010239) TRABD2A (ENSLBEG00000010270) HOOK3 (ENSLBEG00000010367) rnf170 (ENSLBEG00000010554) gpn3 (ENSLBEG00000010593) arpc3 (ENSLBEG00000010653) ube2g1b (ENSLBEG00000010678) Ballan wrasse MODERN SPECIES 1018 nefma (ENSLBEG00000006701) neflb (ENSLBEG00000006718) pgam2 (ENSLBEG00000006783) ##22 ENSLBEG00000006764 Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000155291.b ENSGT01100000263544.c.a.a.b ENSGT00940000155983.a.b ENSGT00940000168590 ENSGT00940000159066 ENSGT00940000156161.A ENSGT00390000006975 ENSGT00940000162544.c.a ENSGT00940000178030 ENSGT00940000162544.d ENSGT00940000163919.b ENSGT00940000159932.b ENSGT00940000155760.t.b ENSGT00940000161685.A.a ENSGT00940000156208.i ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b ENSGT00940000158699.q.a.i.a ENSGT00940000164254.a.b ENSGT00820000127055.b ENSGT00940000167368 ENSGT00940000156664.c ENSGT00940000158699.q.a.j ENSGT00940000153892.B ENSGT00940000162805 ENSGT00940000158075 ENSGT00390000017123.b ENSGT00950000183172.A ENSGT00390000018018 ENSGT00940000165298.a.a ENSGT00940000154702.a.b Perciformes ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000155816.a ENSGT00940000156320.d ENSGT00940000155291.b ENSGT01100000263544.c.a.a.b ENSGT00940000155983.a.b ENSGT00940000168590 ENSGT00940000159066 ENSGT00940000156161.A ENSGT00390000006975 ENSGT00940000162544.c.a ENSGT00940000163919.b ENSGT00940000159932.b ENSGT00940000155760.t.b ENSGT00940000161685.A.a ENSGT00940000156208.i ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b ENSGT00940000164254.a.b ENSGT00820000127055.b ENSGT00940000167368 ENSGT00940000156664.c ENSGT00940000158699.q.a.j ENSGT00940000153892.B ENSGT00940000162805 ENSGT00940000158075 ENSGT00390000017123.b ENSGT00950000183172.A ENSGT00390000018018 ENSGT00940000165298.a.a ENSGT00940000154702.a.b ENSGT00940000166762 Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000156320.d ENSGT00940000155291.b ENSGT01100000263544.c.a.a.b ENSGT00940000155983.a.b ENSGT00940000168590 ENSGT00940000159066 ENSGT00940000156161.A ENSGT00390000006975 ENSGT00610000087482 ENSGT00940000162544.d ENSGT00940000163919.b ENSGT00940000159932.b ENSGT00940000155760.t.b ENSGT00940000161685.A.a ENSGT00940000156208.i ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b ENSGT00940000164254.a.b ENSGT00820000127055.b ENSGT00940000167368 ENSGT00940000156664.c ENSGT00940000158699.q.a.j ENSGT00940000153892.B ENSGT00940000162805 ENSGT00940000158075 ENSGT00390000017123.b ENSGT00950000183172.A ENSGT00390000018018 ENSGT00940000165298.a.a ENSGT00940000154702.a.b ENSGT00940000166762 Lumpfish MODERN SPECIES 3 ENSCLMG00005005041 pip5k1ba (ENSCLMG00005005037) tjp2a (ENSCLMG00005004443) ENSCLMG00005004278 MAMDC2 (ENSCLMG00005021595) slc30a5 (ENSCLMG00005021579) ANXA1 (ENSCLMG00005021578) ENSCLMG00005021577 TMC2 (ENSCLMG00005021576) ENSCLMG00005021574 ENSCLMG00005021573 eif4ebp1 (ENSCLMG00005021572) ANK1 (ENSCLMG00005021571) nefma (ENSCLMG00005021547) neflb (ENSCLMG00005021541) pgam2 (ENSCLMG00005021539) ##22 ENSCLMG00005021538 MMP17 (ENSCLMG00005021537) ENSCLMG00005021535 crkl (ENSCLMG00005021534) si:ch211-222n4.2 (ENSCLMG00005021533) ULK1 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(ENSGACG00000017598) ENSGACG00000017593 RIMBP2 (ENSGACG00000017586) Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000155816.a ENSGT00940000156320.d ENSGT00940000155291.b ENSGT01100000263544.c.a.a.b ENSGT00940000155983.a.b ENSGT00940000168590 ENSGT00940000159066 ENSGT00940000156161.A ENSGT00390000006975 ENSGT00940000162544.c.a ENSGT00940000163919.b ENSGT00940000159932.b ENSGT00940000155760.t.b ENSGT00940000161685.A.a ENSGT00940000156208.i ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b ENSGT00940000164254.a.b ENSGT00820000127055.b ENSGT00940000167368 ENSGT00940000156664.c ENSGT00940000158699.q.a.j ENSGT00940000153892.B ENSGT00940000162805 ENSGT00940000158075 ENSGT00390000017123.b ENSGT00950000183172.A ENSGT00390000018018 ENSGT00940000165298.a.a ENSGT00940000154702.a.b ENSGT00940000166762 Pike perch MODERN SPECIES 145 rasgef1bb (ENSSLUG00000003530) antxr2b (ENSSLUG00000003857) paqr3b (ENSSLUG00000003885) slc26a1 (ENSSLUG00000003906) ENSSLUG00000004031 ENSSLUG00000004036 dusp4 (ENSSLUG00000004043) ENSSLUG00000004193 cldn23.1 (ENSSLUG00000006666) ENSSLUG00000006690 ENSSLUG00000006728 eif4ebp1 (ENSSLUG00000006736) ANK1 (ENSSLUG00000006887) nefma (ENSSLUG00000009688) neflb (ENSSLUG00000009691) pgam2 (ENSSLUG00000009693) ##22 stx2a (ENSSLUG00000009697) ENSSLUG00000009701 MMP17 (ENSSLUG00000009705) ENSSLUG00000009710 crkl (ENSSLUG00000009712) si:ch211-222n4.2 (ENSSLUG00000009714) ULK1 (ENSSLUG00000009718) MMP17 (ENSSLUG00000009735) ENSSLUG00000009757 sfswap (ENSSLUG00000009762) Channel bull blenny MODERN SPECIES 3 slc26a1 (ENSCGOG00000011761) ENSCGOG00000011845 ENSCGOG00000011846 dusp4 (ENSCGOG00000011850) ENSCGOG00000011930 cldn23.1 (ENSCGOG00000014323) ENSCGOG00000014325 ENSCGOG00000014329 ENSCGOG00000014333 ENSCGOG00000014335 ENSCGOG00000014336 eif4ebp1 (ENSCGOG00000014340) ANK1 (ENSCGOG00000014403) nefma (ENSCGOG00000015241) neflb (ENSCGOG00000015243) pgam2 (ENSCGOG00000015244) ##22 ENSCGOG00000015246 ENSCGOG00000015248 MMP17 (ENSCGOG00000015249) ENSCGOG00000015250 crkl (ENSCGOG00000015252) si:ch211-222n4.2 (ENSCGOG00000015255) ULK1 (ENSCGOG00000015261) MMP17 (ENSCGOG00000015532) sfswap (ENSCGOG00000015556) TRABD2A (ENSCGOG00000015571) HOOK3 (ENSCGOG00000015589) rnf170 (ENSCGOG00000016331) gpn3 (ENSCGOG00000016337) arpc3 (ENSCGOG00000016368) ube2g1b (ENSCGOG00000016397) Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000155816.a ENSGT00940000156320.d ENSGT00940000155291.b ENSGT01100000263544.c.a.a.b ENSGT00940000155983.a.b ENSGT00940000168590 ENSGT00940000159066 ENSGT00940000156161.A ENSGT00390000006975 ENSGT00940000162544.c.a ENSGT00940000163919.b ENSGT00940000159932.b ENSGT00940000155760.t.b ENSGT00940000161685.A.a ENSGT00940000156208.i ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b ENSGT00940000158699.q.a.i.a ENSGT00940000164254.a.b ENSGT00820000127055.b ENSGT00940000167368 ENSGT00940000156664.c ENSGT00940000158699.q.a.j ENSGT00940000153892.B ENSGT00940000162805 ENSGT00940000158075 ENSGT00390000017123.b ENSGT00950000183172.A ENSGT00390000018018 ENSGT00940000165298.a.a ENSGT00940000154702.a.b Gilthead seabream MODERN SPECIES 3 rasgef1bb (ENSSAUG00010014513) antxr2b (ENSSAUG00010016352) paqr3b (ENSSAUG00010016364) slc26a1 (ENSSAUG00010016365) ENSSAUG00010016368 ENSSAUG00010016369 dusp4 (ENSSAUG00010016370) ENSSAUG00010016440 cldn23.1 (ENSSAUG00010019162) ENSSAUG00010019169 ENSSAUG00010019172 eif4ebp1 (ENSSAUG00010019173) ANK1 (ENSSAUG00010019186) nefma (ENSSAUG00010019254) neflb (ENSSAUG00010019256) pgam2 (ENSSAUG00010019257) ##22 ENSSAUG00010019258 MMP17 (ENSSAUG00010019260) crkl (ENSSAUG00010019265) si:ch211-222n4.2 (ENSSAUG00010019266) ULK1 (ENSSAUG00010019274) MMP17 (ENSSAUG00010019909) sfswap (ENSSAUG00010019918) TRABD2A (ENSSAUG00010019922) HOOK3 (ENSSAUG00010019932) rnf170 (ENSSAUG00010020081) gpn3 (ENSSAUG00010020092) arpc3 (ENSSAUG00010020099) ube2g1b (ENSSAUG00010020110) TMEM132C (ENSSAUG00010001346) ENSSAUG00010001378 Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000155816.a ENSGT00940000156320.d ENSGT00940000155291.b ENSGT01100000263544.c.a.a.b ENSGT00940000155983.a.b ENSGT00940000168590 ENSGT00940000159066 ENSGT00940000156161.A ENSGT00390000006975 ENSGT00940000162544.c.a ENSGT00940000163919.b ENSGT00940000159932.b ENSGT00940000155760.t.b ENSGT00940000161685.A.a ENSGT00940000156208.i ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b ENSGT00940000164254.a.b ENSGT00820000127055.b ENSGT00940000167368 ENSGT00940000156664.c ENSGT00940000158699.q.a.j ENSGT00940000153892.B ENSGT00940000162805 ENSGT00940000158075 ENSGT00390000017123.b ENSGT00950000183172.A ENSGT00390000018018 ENSGT00940000165298.a.a ENSGT00940000154702.a.b ENSGT00940000166762 European seabass MODERN SPECIES 9 ENSDLAG00005012556 rasgef1bb (ENSDLAG00005011529) ENSDLAG00005011485 ENSDLAG00005032465 ENSDLAG00005011466 ENSDLAG00005011448 ENSDLAG00005009802 ENSDLAG00005031297 ENSDLAG00005009681 ENSDLAG00005027687 ndr1 (ENSDLAG00005031812) ENSDLAG00005026462 ENSDLAG00005009265 ENSDLAG00005009244 ENSDLAG00005009241 ENSDLAG00005033489 ##22 ENSDLAG00005028312 ENSDLAG00005009209 ENSDLAG00005009189 ENSDLAG00005034631 ULK1 (ENSDLAG00005009082) ENSDLAG00005009053 sfswap (ENSDLAG00005008996) ENSDLAG00005008981 ENSDLAG00005008738 ENSDLAG00005008708 ENSDLAG00005008721 ube2g1b (ENSDLAG00005008612) ENSDLAG00005008625 ENSDLAG00005008595 ENSDLAG00005008589 Large yellow croaker MODERN SPECIES 3 rasgef1bb (ENSLCRG00005023618) antxr2b (ENSLCRG00005023616) paqr3b (ENSLCRG00005023615) slc26a1 (ENSLCRG00005023613) ENSLCRG00005023612 ENSLCRG00005023611 dusp4 (ENSLCRG00005023610) ENSLCRG00005023417 cldn23.1 (ENSLCRG00005023406) ENSLCRG00005023405 ndr1 (ENSLCRG00005023403) eif4ebp1 (ENSLCRG00005023402) ANK1 (ENSLCRG00005023388) nefma (ENSLCRG00005023386) neflb (ENSLCRG00005023385) pgam2 (ENSLCRG00005023383) ##22 stx2a (ENSLCRG00005023381) Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000155291.b ENSGT01100000263544.c.a.a.b ENSGT00940000155983.a.b 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ENSGT00940000156208.i ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b ENSGT00940000158699.q.b ENSGT00940000164254.a.b ENSGT00820000127055.b ENSGT00940000167368 ENSGT00940000156664.c ENSGT00940000158699.q.a ENSGT00940000153892.B ENSGT00940000162805 ENSGT00940000158075 ENSGT00390000017123.b ENSGT00950000183172.A ENSGT00390000018018 ENSGT00940000165298.a.a ENSGT00940000154702.a.b Zig-zag eel MODERN SPECIES 3 ENSMAMG00000005889 ENSMAMG00000005968 ENSMAMG00000024834 ENSMAMG00000006023 ENSMAMG00000006038 ENSMAMG00000006069 ENSMAMG00000006199 ENSMAMG00000006223 ENSMAMG00000026839 ENSMAMG00000006351 ENSMAMG00000006358 ENSMAMG00000006368 ENSMAMG00000006388 ENSMAMG00000006452 ENSMAMG00000006458 ENSMAMG00000027866 ##22 ENSMAMG00000028496 ENSMAMG00000006507 ENSMAMG00000006543 ENSMAMG00000025233 ENSMAMG00000006569 ULK1 (ENSMAMG00000006585) ENSMAMG00000006609 sfswap (ENSMAMG00000006631) ENSMAMG00000006645 ENSMAMG00000006670 ENSMAMG00000006821 gpn3 (ENSMAMG00000006837) ENSMAMG00000028367 ube2g1b (ENSMAMG00000006875) ENSMAMG00000006898 Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000155816.a ENSGT00940000156320.d ENSGT00940000155291.b ENSGT01100000263544.c.a.a.b ENSGT00940000155983.a.b ENSGT00940000159066 ENSGT00940000156161.A ENSGT00390000006975 ENSGT00940000162544.c.a ENSGT00940000181550 ENSGT00940000163919.b ENSGT00940000159932.b ENSGT00940000155760.t.b ENSGT00940000161685.A.a ENSGT00940000156208.i ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b ENSGT00940000158699.q.b ENSGT00940000164254.a.b ENSGT00820000127055.b ENSGT00940000167368 ENSGT00940000156664.c ENSGT00940000158699.q.a ENSGT00940000153892.B ENSGT00940000162805 ENSGT00940000158075 ENSGT00390000017123.b ENSGT00950000183172.A ENSGT00390000018018 ENSGT00940000165298.a.a ENSGT00940000154702.a.b Siamese fighting fish MODERN SPECIES 3 paqr3b (ENSBSLG00000017670) slc26a1 (ENSBSLG00000017692) ENSBSLG00000017717 dusp4 (ENSBSLG00000017732) ENSBSLG00000017806 cldn23.1 (ENSBSLG00000018724) ENSBSLG00000018846 ENSBSLG00000018862 ENSBSLG00000018881 ENSBSLG00000018907 ndr1 (ENSBSLG00000018933) eif4ebp1 (ENSBSLG00000018981) ANK1 (ENSBSLG00000019028) nefma (ENSBSLG00000019378) neflb (ENSBSLG00000019382) pgam2 (ENSBSLG00000019384) ##22 stx2a (ENSBSLG00000019389) MMP17 (ENSBSLG00000019441) ENSBSLG00000019497 crkl (ENSBSLG00000019518) si:ch211-222n4.2 (ENSBSLG00000019522) ULK1 (ENSBSLG00000019561) ENSBSLG00000019904 sfswap (ENSBSLG00000019922) TRABD2A (ENSBSLG00000019963) HOOK3 (ENSBSLG00000019985) rnf170 (ENSBSLG00000020182) gpn3 (ENSBSLG00000020193) arpc3 (ENSBSLG00000020198) ube2g1b (ENSBSLG00000020210) TMEM132C (ENSBSLG00000021010) Climbing perch MODERN SPECIES 13 rasgef1bb (ENSATEG00000021833) ENSATEG00000021812 ENSATEG00000021790 ENSATEG00000021714 ENSATEG00000021700 ENSATEG00000025333 ENSATEG00000021596 ENSATEG00000021577 ENSATEG00000021511 ENSATEG00000021486 ENSATEG00000021483 ENSATEG00000028413 ENSATEG00000021333 ENSATEG00000021287 ENSATEG00000021261 ENSATEG00000021248 ##22 ENSATEG00000021235 ENSATEG00000021212 ENSATEG00000021187 ENSATEG00000021179 ENSATEG00000021175 ULK1 (ENSATEG00000021132) ENSATEG00000021097 sfswap (ENSATEG00000021053) ENSATEG00000021041 ENSATEG00000020975 ENSATEG00000030102 ENSATEG00000020940 gpn3 (ENSATEG00000020912) ENSATEG00000028858 ube2g1b (ENSATEG00000020900) Carangaria ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000155291.b ENSGT01100000263544.c.a.a.b ENSGT00940000155983.a.b ENSGT00940000168590 ENSGT00940000159066 ENSGT00940000156161.A ENSGT00390000006975 ENSGT00940000162544.c.a ENSGT00940000164512.d ENSGT00940000162544.d ENSGT00940000163919.b ENSGT00940000159932.b ENSGT00940000155760.t.b ENSGT00940000161685.A.a ENSGT00940000156208.i ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b ENSGT00940000158699.q.b ENSGT00940000164254.a.b ENSGT00820000127055.b ENSGT00940000167368 ENSGT00940000156664.c ENSGT00940000158699.q.a ENSGT00940000153892.B ENSGT00940000162805 ENSGT00940000158075 ENSGT00390000017123.b ENSGT00950000183172.A ENSGT00390000018018 ENSGT00940000165298.a.a ENSGT00940000154702.a.b Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000155816.a ENSGT00940000156320.d ENSGT00940000155291.b ENSGT01100000263544.c.a.a.b ENSGT00940000155983.a.b ENSGT00940000168590 ENSGT00940000159066 ENSGT00940000156161.A ENSGT00390000006975 ENSGT00940000162544.c.a ENSGT00940000163919.b ENSGT00940000159932.b ENSGT00940000155760.t.b ENSGT00940000161685.A.a ENSGT00940000156208.i ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b ENSGT00940000164254.a.b ENSGT00820000127055.b ENSGT00940000167368 ENSGT00940000156664.c ENSGT00940000158699.q.a ENSGT00940000153892.B ENSGT00940000162805 ENSGT00940000158075 ENSGT00390000017123.b ENSGT00950000183172.A ENSGT00390000018018 ENSGT00940000165298.a.a ENSGT00940000154702.a.b ENSGT00940000166762 Tongue sole MODERN SPECIES 5 VAV2 (ENSCSEG00000005120) ENSCSEG00000005127 wdr5 (ENSCSEG00000005130) rxraa (ENSCSEG00000005139) LRRTM4 (ENSCSEG00000005148) ENSCSEG00000005154 cldn23.1 (ENSCSEG00000005168) ENSCSEG00000005171 ENSCSEG00000005180 eif4ebp1 (ENSCSEG00000005182) ENSCSEG00000005185 ANK1 (ENSCSEG00000005188) nefma (ENSCSEG00000005201) neflb (ENSCSEG00000005207) ENSCSEG00000005204 pgam2 (ENSCSEG00000005208) ##22 MMP17 (ENSCSEG00000005210) ENSCSEG00000005220 dnpep (ENSCSEG00000005230) desmb (ENSCSEG00000005241) tmem198b (ENSCSEG00000005251) ENSCSEG00000005254 arl13b (ENSCSEG00000005258) cckbra (ENSCSEG00000005266) cpo (ENSCSEG00000005269) nudt15 (ENSCSEG00000005276) gemin8 (ENSCSEG00000005280) ENSCSEG00000005285 rab9a (ENSCSEG00000005287) TCEANC (ENSCSEG00000005288) ENSCSEG00000005301 Turbot MODERN SPECIES 7 ENSSMAG00000017766 rasgef1bb (ENSSMAG00000017793) ENSSMAG00000017837 ENSSMAG00000017883 ENSSMAG00000017915 ENSSMAG00000017948 ENSSMAG00000017997 ENSSMAG00000018022 ENSSMAG00000018031 ENSSMAG00000018153 ENSSMAG00000018402 ENSSMAG00000022068 ENSSMAG00000018418 ENSSMAG00000018452 ENSSMAG00000018466 ENSSMAG00000031091 ##22 ENSSMAG00000018474 ENSSMAG00000018572 ENSSMAG00000018593 ENSSMAG00000018600 ENSSMAG00000018610 ULK1 (ENSSMAG00000018627) ENSSMAG00000018696 sfswap (ENSSMAG00000018718) ENSSMAG00000018744 ENSSMAG00000018754 ENSSMAG00000018842 gpn3 (ENSSMAG00000018848) ENSSMAG00000018899 ube2g1b (ENSSMAG00000018912) ENSSMAG00000018921 Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT01100000263544.c.a.a.b ENSGT00940000155983.a.b ENSGT00940000168590 ENSGT00940000159066 ENSGT00940000156161.A ENSGT00390000006975 ENSGT00940000162544.c.a ENSGT00940000164512.d ENSGT00940000162544.d ENSGT00940000163919.b ENSGT00940000159932.b ENSGT00940000155760.t.b ENSGT00940000161685.A.a ENSGT01100000265222 ENSGT00940000156208.i ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b ENSGT00940000158699.q.b Seriola ANCESTRAL SPECIES 167 ENSGT00940000156161.A ENSGT00390000006975 ENSGT00940000162544.c.a ENSGT00940000178065 ENSGT00940000163919.b ENSGT00940000159932.b ENSGT00940000155760.t.b ENSGT00940000161685.A.a ENSGT00940000156208.i ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b ENSGT00940000158699.q.a.f Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 1897 NEFL (ENSSLDG00000011520) pgam2 (ENSSLDG00000011481) ##22 ENSSLDG00000011465 MMP17 (ENSSLDG00000011420) Greater amberjack MODERN SPECIES 278 ENSSDUG00000020636 cldn23.1 (ENSSDUG00000020667) ENSSDUG00000020680 ENSSDUG00000020714 ndr1 (ENSSDUG00000020729) eif4ebp1 (ENSSDUG00000020734) ENSSDUG00000020742 ANK1 (ENSSDUG00000020758) nefma (ENSSDUG00000020811) ENSSDUG00000020835 pgam2 (ENSSDUG00000020942) ##22 ENSSDUG00000020951 MMP17 (ENSSDUG00000020958) Barramundi perch MODERN SPECIES 174 ENSLCAG00010000378 ENSLCAG00010000391 dusp4 (ENSLCAG00010000398) ENSLCAG00010000812 cldn23.1 (ENSLCAG00010001336) ENSLCAG00010001345 ENSLCAG00010001357 ENSLCAG00010001362 ENSLCAG00010001366 ndr1 (ENSLCAG00010001372) eif4ebp1 (ENSLCAG00010001377) ANK1 (ENSLCAG00010001728) nefma (ENSLCAG00010003114) ENSLCAG00010003116 neflb (ENSLCAG00010003118) pgam2 (ENSLCAG00010003120) ##22 stx2a (ENSLCAG00010003127) MMP17 (ENSLCAG00010003136) Cod MODERN SPECIES 17 ENSGMOG00000031529 gadd45gb.1 (ENSGMOG00000036667) ENSGMOG00000010042 ENSGMOG00000026351 ghrb (ENSGMOG00000010024) c7b (ENSGMOG00000010005) c6 (ENSGMOG00000009978) rnf180b (ENSGMOG00000009952) ENSGMOG00000009945 ndr1 (ENSGMOG00000028107) eif4ebp1 (ENSGMOG00000016807) ENSGMOG00000016731 ENSGMOG00000016567 ENSGMOG00000025072 ENSGMOG00000035872 ENSGMOG00000001120 ##22 ENSGMOG00000009196 ENSGMOG00000009205 ENSGMOG00000011000 mpx (ENSGMOG00000006436) ENSGMOG00000026981 ENSGMOG00000010250 ENSGMOG00000029931 slc35e4 (ENSGMOG00000028981) ENSGMOG00000010225 ENSGMOG00000010198 ENSGMOG00000033911 ENSGMOG00000016003 ENSGMOG00000010170 ENSGMOG00000010125 trim69 (ENSGMOG00000010110) Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000166638 ENSGT00390000010075 ENSGT00940000165107.A ENSGT00940000156804.b ENSGT00940000156814 ENSGT01010000222287.B.b.b.b ENSGT00940000153725.b.c ENSGT00950000182909.a.e ENSGT00940000154484.B.a.a ENSGT00940000163919.b 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ENSGT00820000127055.b.e.a ENSGT00730000111140.hc ENSGT00390000006044.m.a ENSGT00940000154702.a.b.d ENSGT00940000166762.b ENSGT00950000183203.c.a.c ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b ENSGT00940000153892.B.d ENSGT00940000158699.i ENSGT00940000156664.c.d ENSGT00940000165298.a.a.d ENSGT00390000018018.i ENSGT00950000183172.A.d ENSGT00390000012669.dc Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00520000055591.b.c.b ENSGT00940000157299.d.d ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.e.d ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.f.d ENSGT00940000166638.b.a ENSGT00940000165107.A.a ENSGT00390000009130.b.d.b ENSGT00940000156814 ENSGT01010000222287.B.b.b.b ENSGT00940000163919.b.d ENSGT00940000159932.b ENSGT00940000155760.t.b.f ENSGT00730000111146.f ENSGT00940000161685.A.a.a ENSGT00940000156208.i.d ENSGT00950000182926.b.c.i ##22 ENSGT00940000164254.a.b.a ENSGT00820000127055.b.e.a ENSGT00730000111140.hc ENSGT00390000006044.m.a ENSGT00940000154702.a.b.d ENSGT00940000166762.b ENSGT00950000183203.c.a.c ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b ENSGT00940000153892.B.d ENSGT00940000158699.i ENSGT00940000156664.c.d ENSGT00940000165298.a.a.d ENSGT00390000018018.i ENSGT00950000183172.A.d ENSGT00390000012669.dc Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00520000055591.b.c.b ENSGT00940000157299.d.d ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.e.d ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.f.d ENSGT00940000166638.b.a ENSGT00940000165107.A.a ENSGT00390000009130.b.d.b ENSGT00940000156814 ENSGT01010000222287.B.b.b.b ENSGT00940000163919.b.d ENSGT00940000159932.b ENSGT00940000155760.t.b.f ENSGT00730000111146.f ENSGT00940000161685.A.a.a ENSGT00940000156208.i.d ENSGT00950000182926.b.c.i ##22 ENSGT00940000164254.a.b.a ENSGT00820000127055.b.e.a ENSGT00730000111140.hc ENSGT00390000006044.m.a ENSGT00940000154702.a.b.d ENSGT00940000166762.b ENSGT00950000183203.c.a.c ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b ENSGT00940000153892.B.d ENSGT00940000158699.i ENSGT00940000156664.c.d ENSGT00940000165298.a.a.d ENSGT00390000018018.i ENSGT00950000183172.A.d ENSGT00390000012669.dc Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00520000055591.b.c.b ENSGT00940000157299.d.d ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.e.d ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.f.d ENSGT00940000166638.b.a ENSGT00940000165107.A.a ENSGT00390000009130.b.d.b ENSGT00940000156814 ENSGT01010000222287.B.b.b.b ENSGT00940000163919.b.d ENSGT00940000159932.b ENSGT00940000155760.t.b.f ENSGT00730000111146.f ENSGT00940000161685.A.a.a ENSGT00940000156208.i.d ENSGT00950000182926.b.c.i ##22 ENSGT00940000164254.a.b.a ENSGT00820000127055.b.e.a ENSGT00730000111140.hc ENSGT00390000006044.m.a ENSGT00940000154702.a.b.d ENSGT00940000166762.b ENSGT00950000183203.c.a.c ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b ENSGT00940000153892.B.d ENSGT00940000158699.i ENSGT00940000156664.c.d ENSGT00940000165298.a.a.d ENSGT00390000018018.i ENSGT00950000183172.A.d ENSGT00390000012669.dc Chinook salmon MODERN SPECIES 26 zgc:103482 (ENSOTSG00005012735) EFNA5 (ENSOTSG00005012734) GADD45G (ENSOTSG00005012733) gadd45gb.1 (ENSOTSG00005012732) ENSOTSG00005012731 ghrb 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ENSOMYG00000047104 ftsj1 (ENSOMYG00000063167) ENSOMYG00000047020 ENSOMYG00000047018 ENSOMYG00000066692 ##22 ENSOMYG00000047008 crkl (ENSOMYG00000047006) med15 (ENSOMYG00000046989) smpd4 (ENSOMYG00000046961) ENSOMYG00000069894 ENSOMYG00000059079 ENSOMYG00000046945 ENSOMYG00000046943 ENSOMYG00000046938 ENSOMYG00000046932 ENSOMYG00000071063 sfswap (ENSOMYG00000046928) ENSOMYG00000046924 ULK1 (ENSOMYG00000046852) ube2g1b (ENSOMYG00000046779) Salmo ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000158634.b.j ENSGT00520000055591.b.c.b ENSGT00940000157299.d.d ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.e.d ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.f.d ENSGT00940000166638.b.a ENSGT00940000165107.A.a ENSGT00390000009130.b.d.b ENSGT00940000156814 ENSGT01010000222287.B.b.b.b ENSGT00940000163919.b.d ENSGT00940000155760.t.b.f ENSGT00730000111146.f ENSGT00940000161685.A.a.a ENSGT00940000156208.i.d ENSGT00950000182926.b.c.i ##22 ENSGT00940000164254.a.b.a ENSGT00820000127055.b.e.a ENSGT00730000111140.hc ENSGT00390000006044.m.a ENSGT00940000154702.a.b.d ENSGT00940000166762.b ENSGT00950000183203.c.a.c ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b ENSGT00940000153892.B.d ENSGT00940000158699.i ENSGT00940000156664.c.d ENSGT00940000165298.a.a.d ENSGT00390000018018.i ENSGT00950000183172.A.d ENSGT00390000012669.dc River trout MODERN SPECIES 3 ENSSTUG00000031447 EFNA5 (ENSSTUG00000031423) ENSSTUG00000031415 GADD45G (ENSSTUG00000031406) gadd45gb.1 (ENSSTUG00000031398) ENSSTUG00000031390 ghrb (ENSSTUG00000031364) oxct1b (ENSSTUG00000027739) c6 (ENSSTUG00000026741) ENSSTUG00000026708 ENSSTUG00000026699 ndr1 (ENSSTUG00000026694) ANK1 (ENSSTUG00000025834) nefma (ENSSTUG00000025801) neflb (ENSSTUG00000025796) pgam2 (ENSSTUG00000025783) ##22 ENSSTUG00000025720 crkl (ENSSTUG00000025694) med15 (ENSSTUG00000025664) smpd4 (ENSSTUG00000025178) ENSSTUG00000025140 TMEM132C (ENSSTUG00000025106) ENSSTUG00000025084 RIMBP2 (ENSSTUG00000024960) stx2a (ENSSTUG00000024934) ENSSTUG00000024930 ENSSTUG00000024925 sfswap (ENSSTUG00000024884) MMP17 (ENSSTUG00000024750) ULK1 (ENSSTUG00000024667) ube2g1b (ENSSTUG00000024625) Atlantic salmon MODERN SPECIES 2 ENSSSAG00000088854 ENSSSAG00000082974 ENSSSAG00000081529 gadd45gb.1 (ENSSSAG00000102182) ENSSSAG00000081527 ghrb (ENSSSAG00000081526) oxct1b (ENSSSAG00000106911) c6 (ENSSSAG00000081483) r7bpb (ENSSSAG00000097983) ENSSSAG00000081477 ndr1 (ENSSSAG00000081476) ENSSSAG00000081470 ftsj1 (ENSSSAG00000081466) nfm (ENSSSAG00000081465) ENSSSAG00000081463 ENSSSAG00000081461 ##22 ENSSSAG00000113868 crkl (ENSSSAG00000081459) med15 (ENSSSAG00000081458) smpd4 (ENSSSAG00000081417) ENSSSAG00000081413 ENSSSAG00000081411 ENSSSAG00000081391 ENSSSAG00000081379 ENSSSAG00000107178 sfswap (ENSSSAG00000081373) ENSSSAG00000106842 ULK1 (ENSSSAG00000081347) ube2g1 (ENSSSAG00000081338) arpc3 (ENSSSAG00000081334) gpn3 (ENSSSAG00000081331) Huchen MODERN SPECIES 591 ENSHHUG00000032401 ghrb (ENSHHUG00000032389) oxct1b (ENSHHUG00000032269) c6 (ENSHHUG00000032101) rgs7bpb (ENSHHUG00000032098) ENSHHUG00000032089 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ENSGT00940000154966.bb ENSGT00390000014879.c.a.a.b.h ENSGT00390000003282.A.g ENSGT00940000165688.e Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000157299.d.c ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.e.c ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.f.c ENSGT00940000166638.b.b ENSGT00390000010075 ENSGT00940000165107.A.b ENSGT00940000156804.b ENSGT00940000153725.b.c ENSGT00950000182909.a.e ENSGT00940000154484.B.a.a ENSGT00940000163919.b.c ENSGT00940000155760.t.b.e ENSGT00730000111146.e ENSGT00940000161685.A.a.b ENSGT00940000156208.i.c ENSGT00950000182926.b.c.j.a ##22 ENSGT00940000164254.a.b.b ENSGT00820000127055.b.e.b ENSGT01000000220289 ENSGT00730000111140.ic ENSGT00940000167368 ENSGT00390000006044.m.b ENSGT00940000154702.a.b.c ENSGT00940000166762.a.a ENSGT00390000017498.c ENSGT00950000183203.c.a.d ENSGT00940000153892.B.c ENSGT00940000158699.j ENSGT00940000156664.c.c ENSGT00940000165298.a.a.c ENSGT00390000018018.j Salmo ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.f.c ENSGT00940000166638.a ENSGT00390000010075 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ENSSSAG00000115014 ENSSSAG00000071665 ENSSSAG00000071667 ##22 ENSSSAG00000071670 crkl (ENSSSAG00000071673) MED15 (ENSSSAG00000104209) si:ch211-222n4.2 (ENSSSAG00000071716) smpd4 (ENSSSAG00000071727) ENSSSAG00000102589 ENSSSAG00000071776 ENSSSAG00000071781 ENSSSAG00000112984 sfswap (ENSSSAG00000110276) ENSSSAG00000081366 ULK1 (ENSSSAG00000000318) ub2g1 (ENSSSAG00000120549) arpc3 (ENSSSAG00000030191) gpn3 (ENSSSAG00000097446) Atlantic salmon MODERN SPECIES gadd45gb.1 (ENSSSAG00000070322) ENSSSAG00000098302 ghrb (ENSSSAG00000070335) ENSSSAG00000070863 ENSSSAG00000070413 rnf180b (ENSSSAG00000099351) htr1ab (ENSSSAG00000070900) ENSSSAG00000070948 ftsj1 (ENSSSAG00000082019) ENSSSAG00000111499 ENSSSAG00000071661 ENSSSAG00000093362 ENSSSAG00000092291 ENSSSAG00000085621 ENSSSAG00000089786 ENSSSAG00000083510 ##22 ENSSSAG00000116846 crkl (ENSSSAG00000089033) med15 (ENSSSAG00000071684) si:ch211-222n4.2 (ENSSSAG00000097476) smpd4 (ENSSSAG00000118362) ENSSSAG00000081911 ENSSSAG00000082402 ENSSSAG00000104306 sfswap (ENSSSAG00000000140) ENSSSAG00000108414 mmp17 (ENSSSAG00000000176) ULK1 (ENSSSAG00000096036) ub2g1 (ENSSSAG00000000483) arpc3 (ENSSSAG00000000509) gpn3 (ENSSSAG00000000532) Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000157299.d.c ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.e.c ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.f.c ENSGT00940000166638.b.b ENSGT00390000010075 ENSGT00940000165107.A.b.a ENSGT00940000156804.b ENSGT00940000153725.b.c ENSGT00950000182909.a.e ENSGT00940000154484.B.a.a ENSGT00940000163919.b.c ENSGT00940000155760.t.b.e ENSGT00730000111146.e ENSGT00940000161685.A.a.b ENSGT00940000156208.i.c ENSGT00950000182926.b.c.j.a ##22 ENSGT00940000164254.a.b.b ENSGT00820000127055.b.e.b ENSGT01000000220289 ENSGT00730000111140.ic ENSGT00940000167368 ENSGT00390000006044.m.b ENSGT00940000154702.a.b.c ENSGT00940000166762.a.a ENSGT00390000017498.c ENSGT00950000183203.c.a.d ENSGT00940000153892.B.c ENSGT00940000158699.j ENSGT00940000156664.c.c ENSGT00940000165298.a.a.c ENSGT00390000018018.j Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000157299.d.c ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.e.c ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.f.c ENSGT00940000166638.b.b ENSGT00390000010075 ENSGT00940000165107.A.b.a ENSGT00940000156804.b ENSGT00940000153725.b.c ENSGT00950000182909.a.e ENSGT00940000154484.B.a.a ENSGT00940000163919.b.c ENSGT00940000155760.t.b.e ENSGT00730000111146.e ENSGT00940000161685.A.a.b ENSGT00940000156208.i.c ENSGT00950000182926.b.c.j.a ##22 ENSGT00940000164254.a.b.b ENSGT00820000127055.b.e.b ENSGT01000000220289 ENSGT00730000111140.ic ENSGT00940000167368 ENSGT00390000006044.m.b ENSGT00940000154702.a.b.c ENSGT00940000166762.a.a ENSGT00390000017498.c ENSGT00950000183203.c.a.d ENSGT00940000153892.B.c ENSGT00940000158699.j ENSGT00940000156664.c.c ENSGT00940000165298.a.a.c ENSGT00390000018018.j Coho salmon MODERN SPECIES 15 EFNA5 (ENSOKIG00005011006) GADD45G (ENSOKIG00005011014) gadd45gb.1 (ENSOKIG00005011016) ENSOKIG00005011027 ENSOKIG00005011035 ghrb (ENSOKIG00005011052) c7b (ENSOKIG00005011183) rgs7bpb (ENSOKIG00005012351) rnf180b (ENSOKIG00005012363) htr1ab (ENSOKIG00005012371) ENSOKIG00005012377 ANK1 (ENSOKIG00005012537) ftsj1 (ENSOKIG00005015471) ENSOKIG00005015502 NEFL (ENSOKIG00005015557) PGAM2 (ENSOKIG00005015568) ##22 ENSOKIG00005015573 crkl (ENSOKIG00005015581) ENSOKIG00005015592 med15 (ENSOKIG00005015618) si:ch211-222n4.2 (ENSOKIG00005015793) smpd4 (ENSOKIG00005015846) TMEM132C (ENSOKIG00005015952) ENSOKIG00005015965 ENSOKIG00005015975 ENSOKIG00005016041 sfswap (ENSOKIG00005016180) MMP17 (ENSOKIG00005016245) ULK1 (ENSOKIG00005016726) ube2g1b (ENSOKIG00005016950) arpc3 (ENSOKIG00005017031) Chinook salmon MODERN SPECIES 12 EFNA5 (ENSOTSG00005007541) GADD45G (ENSOTSG00005007539) gadd45gb.1 (ENSOTSG00005007537) ENSOTSG00005007535 ENSOTSG00005007533 ghrb (ENSOTSG00005007531) c7b (ENSOTSG00005007485) rgs7bpb (ENSOTSG00005007483) rnf180b (ENSOTSG00005007481) htr1ab (ENSOTSG00005007477) ENSOTSG00005007476 ANK1 (ENSOTSG00005002114) ftsj1 (ENSOTSG00005002050) nefma (ENSOTSG00005002034) NEFL (ENSOTSG00005001789) pgam2 (ENSOTSG00005046774) ##22 ENSOTSG00005046773 crkl (ENSOTSG00005046772) ENSOTSG00005046771 med15 (ENSOTSG00005046770) si:ch211-222n4.2 (ENSOTSG00005046769) smpd4 (ENSOTSG00005046749) TMEM132C (ENSOTSG00005046744) ENSOTSG00005046743 ENSOTSG00005046742 RIMBP2 (ENSOTSG00005046737) sfswap (ENSOTSG00005046734) MMP17 (ENSOTSG00005046716) ULK1 (ENSOTSG00005046700) ube2g1b (ENSOTSG00005046699) arpc3 (ENSOTSG00005046698) Rainbow trout MODERN SPECIES 26 gadd45gb.1 (ENSOMYG00000034440) ENSOMYG00000034483 ghr1 (ENSOMYG00000034417) c7b (ENSOMYG00000032326) rgs7bpb (ENSOMYG00000032081) rnf180b (ENSOMYG00000032072) htr1ab (ENSOMYG00000032055) ndr1 (ENSOMYG00000032048) ENSOMYG00000064670 ENSOMYG00000030029 ftsj1 (ENSOMYG00000028976) ENSOMYG00000069784 ENSOMYG00000028862 ENSOMYG00000060145 ENSOMYG00000028808 ENSOMYG00000028792 ##22 ENSOMYG00000028760 crkl (ENSOMYG00000028728) ENSOMYG00000028721 ENSOMYG00000028679 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Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.c.j.b ##22 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.c.j.b ##22 Coho salmon MODERN SPECIES 21 ENSOKIG00005051000 EFNA5 (ENSOKIG00005050999) GADD45G (ENSOKIG00005050998) gadd45gb.1 (ENSOKIG00005050997) ENSOKIG00005050996 ghrb (ENSOKIG00005050995) oxct1b (ENSOKIG00005050994) c6 (ENSOKIG00005050993) ENSOKIG00005050992 ndr1 (ENSOKIG00005050991) ENSOKIG00005050990 ANK1 (ENSOKIG00005050989) ftsj1 (ENSOKIG00005050986) nefma (ENSOKIG00005050985) neflb (ENSOKIG00005050984) pgam2 (ENSOKIG00005050983) ##22 ENSOKIG00005050981 crkl (ENSOKIG00005050980) med15 (ENSOKIG00005050979) smpd4 (ENSOKIG00005050974) TMEM132C (ENSOKIG00005050969) ENSOKIG00005050966 RIMBP2 (ENSOKIG00005050961) stx2a (ENSOKIG00005050960) ENSOKIG00005050958 ENSOKIG00005050957 sfswap (ENSOKIG00005050956) MMP17 (ENSOKIG00005050955) ENSOKIG00005050953 ULK1 (ENSOKIG00005050950) ube2g1b (ENSOKIG00005050949) Salmo ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.c.j.b ##22 River trout MODERN SPECIES 15 gadd45gb.1 (ENSSTUG00000016615) ENSSTUG00000016631 ENSSTUG00000016642 ghrb (ENSSTUG00000016658) ENSSTUG00000016685 c7b (ENSSTUG00000016707) rgs7bpb (ENSSTUG00000016907) rnf180b (ENSSTUG00000016963) htr1ab (ENSSTUG00000016972) ENSSTUG00000016975 eif4ebp1 (ENSSTUG00000016984) ANK1 (ENSSTUG00000017006) ftsj1 (ENSSTUG00000032190) nefma (ENSSTUG00000032250) NEFL (ENSSTUG00000032264) pgam2 (ENSSTUG00000032273) ##22 ENSSTUG00000032296 crkl (ENSSTUG00000032315) ENSSTUG00000032327 med15 (ENSSTUG00000032361) si:ch211-222n4.2 (ENSSTUG00000032477) smpd4 (ENSSTUG00000032515) TMEM132C (ENSSTUG00000032659) ENSSTUG00000032932 RIMBP2 (ENSSTUG00000032975) sfswap (ENSSTUG00000033081) MMP17 (ENSSTUG00000033116) ULK1 (ENSSTUG00000033237) ube2g1b (ENSSTUG00000034774) arpc3 (ENSSTUG00000034830) gpn3 (ENSSTUG00000034799) Northern pike MODERN SPECIES 13 EFNA5 (ENSELUG00000034260) GADD45G (ENSELUG00000011831) gadd45gb.1 (ENSELUG00000011823) ENSELUG00000011802 ENSELUG00000028900 ghrb (ENSELUG00000011769) c7b (ENSELUG00000011733) c6 (ENSELUG00000011662) rnf180b (ENSELUG00000011598) ENSELUG00000011574 ndr1 (ENSELUG00000011567) ANK1 (ENSELUG00000011547) ftsj1 (ENSELUG00000011483) NEFM (ENSELUG00000011468) neflb (ENSELUG00000011459) pgam2 (ENSELUG00000011434) ##22 ENSELUG00000011420 crkl (ENSELUG00000011394) med15 (ENSELUG00000011355) si:ch211-222n4.2 (ENSELUG00000011289) smpd4 (ENSELUG00000011271) TMEM132C (ENSELUG00000011190) ENSELUG00000011149 ENSELUG00000011126 RIMBP2 (ENSELUG00000011063) ENSELUG00000011011 sfswap (ENSELUG00000010942) MMP17 (ENSELUG00000010862) ULK1 (ENSELUG00000010787) ube2g1b (ENSELUG00000010679) arpc3 (ENSELUG00000010620) Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 60 ENSGT00940000166638 ENSGT00390000010075 ENSGT00940000165107.A ENSGT00390000009130.b.d.b ENSGT00940000156804.b ENSGT00940000156814 ENSGT00940000153725.b.c ENSGT00950000182909.a.e ENSGT00940000154484.B.a.a ENSGT00940000163919.b ENSGT00940000159932.b ENSGT00940000155760.t.b ENSGT00730000111146 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ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000161886 ENSGT01030000234534.B.a.a.a.b ENSGT00950000182914.a.b ENSGT00940000157215 ENSGT00940000160508 ENSGT00940000163023 ENSGT00390000004874.a.b ENSGT00940000157350 ENSGT00940000165965 ENSGT00530000063424.b ENSGT01030000234574.B.c.b.a.a.a ENSGT00940000160897 ENSGT00950000183010.a.a.b ENSGT00940000161685.A.a.d ENSGT00940000156208.i.e ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000164254.a.b ENSGT00820000127055.b ENSGT00730000111140 ENSGT00940000167368 ENSGT00390000006044 ENSGT00390000003581 ENSGT00940000154702.a.b ENSGT00940000166762 ENSGT00950000183203.c.a ENSGT00530000063497.a.a ENSGT00940000181939 ENSGT00940000156662.d ENSGT00940000158483 ENSGT00940000153877.a.a.b ENSGT00940000153592.B.b.a.b Channel catfish MODERN SPECIES 9 gzmk (ENSIPUG00000004016) rxfp3 (ENSIPUG00000004003) slc45a2 (ENSIPUG00000003993) AMACR (ENSIPUG00000003980) btc (ENSIPUG00000003972) myl5 (ENSIPUG00000003872) hpse (ENSIPUG00000003847) helq 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ENSGT00940000156208.i.e ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000164254.a.b ENSGT00820000127055.b ENSGT00730000111140 ENSGT00940000167368 ENSGT00390000006044 ENSGT00390000003581 ENSGT00940000154702.a.b ENSGT00940000166762 ENSGT00950000183203.c.a ENSGT00530000063497.a.a ENSGT00940000181939 ENSGT00940000156662.d ENSGT00940000158483 ENSGT00940000153877.a.a.b ENSGT00940000153592.B.b.a.b Characoidei ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000161886 ENSGT01030000234534.B.a.a.a.b ENSGT00950000182914.a.b ENSGT00940000157215 ENSGT00940000160508 ENSGT00940000163023 ENSGT00390000004874.a.b ENSGT00940000157350 ENSGT00940000165965 ENSGT00530000063424.b ENSGT01030000234574.B.c.b.a.a.a ENSGT00940000160897 ENSGT00950000183010.a.a.b ENSGT00940000161685.A.a.d ENSGT00940000156208.i.e ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000164254.a.b ENSGT00820000127055.b ENSGT00730000111140 ENSGT00940000167368 ENSGT00390000006044 ENSGT00390000003581 ENSGT00940000154702.a.b ENSGT00940000166762 ENSGT00950000183203.c.a ENSGT00530000063497.a.a ENSGT00940000181939 ENSGT00940000156662.d ENSGT00940000158483 ENSGT00940000153877.a.a.b ENSGT00940000153592.B.b.a.b Mexicana tetra MODERN SPECIES 66 ENSAMXG00000034072 rxfp3 (ENSAMXG00000025441) slc45a2 (ENSAMXG00000011270) amacr (ENSAMXG00000029907) btc (ENSAMXG00000037033) MYL5 (ENSAMXG00000034506) hpse (ENSAMXG00000032004) HELQ (ENSAMXG00000012252) mrps18c (ENSAMXG00000012238) ENSAMXG00000029786 abraxas1 (ENSAMXG00000038713) gpat3 (ENSAMXG00000012191) nkx6.1 (ENSAMXG00000001095) rpl17 (ENSAMXG00000001082) nefma (ENSAMXG00000040032) pgam2 (ENSAMXG00000030317) ##22 ENSAMXG00000001033 neflb (ENSAMXG00000001050) crkl (ENSAMXG00000041556) ENSAMXG00000037233 med15 (ENSAMXG00000040274) si:ch211-222n4.2 (ENSAMXG00000031218) smpd4 (ENSAMXG00000031407) ENSAMXG00000026016 ENSAMXG00000031497 TMEM132C (ENSAMXG00000002738) ENSAMXG00000038695 ENSAMXG00000031686 ENSAMXG00000031269 RIMBP2 (ENSAMXG00000002674) rnf145b (ENSAMXG00000030834) Red-bellied piranha MODERN SPECIES 7 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ENSGT00940000156664.c ENSGT00950000183160.B ENSGT00390000016776 Denticle herring MODERN SPECIES 13 sfswap (ENSDCDG00000027899) MMP17 (ENSDCDG00000027898) ULK1 (ENSDCDG00000027342) pus1 (ENSDCDG00000027334) noc4l (ENSDCDG00000027327) vps29 (ENSDCDG00000027301) gpn3 (ENSDCDG00000027296) arpc3 (ENSDCDG00000027293) ENSDCDG00000027289 ATP2A1 (ENSDCDG00000026929) BCR (ENSDCDG00000023774) SPECC1L (ENSDCDG00000023391) ADORA2A (ENSDCDG00000023384) snrpd3l (ENSDCDG00000023379) ENSDCDG00000023376 pgam2 (ENSDCDG00000023371) ##22 ENSDCDG00000023361 crkl (ENSDCDG00000023353) ENSDCDG00000023350 med15 (ENSDCDG00000023345) si:ch211-222n4.2 (ENSDCDG00000023341) smpd4 (ENSDCDG00000023292) TMEM132C (ENSDCDG00000023286) ENSDCDG00000023285 ENSDCDG00000023282 RIMBP2 (ENSDCDG00000023250) stx2a (ENSDCDG00000023238) ENSDCDG00000023232 ENSDCDG00000023227 ENSDCDG00000023225 ENSDCDG00000023223 Atlantic herring MODERN SPECIES 3 LRRTM4 (ENSCHAG00000018372) ENSCHAG00000018355 ENSCHAG00000017417 c7b 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ENSGT00730000111146 ENSGT00940000161685.A.a ENSGT00940000156208.i.b ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00820000127055.b.a.a ENSGT00730000111140 ENSGT00940000167368 ENSGT00390000006044 ENSGT00940000154702.a.b ENSGT00950000183200.A.a.b.b ENSGT00950000183203.c.a.f ENSGT00940000153892.B ENSGT00940000158699.d P. kingsleyae MODERN SPECIES 439 ENSPKIG00000019440 LRRTM4 (ENSPKIG00000019427) ENSPKIG00000019405 ENSPKIG00000019377 ftsj1 (ENSPKIG00000019318) nefma (ENSPKIG00000019288) NEFL (ENSPKIG00000019266) pgam2 (ENSPKIG00000019244) ##22 ENSPKIG00000019214 ENSPKIG00000019194 ENSPKIG00000019164 crkl (ENSPKIG00000019123) ENSPKIG00000019016 smpd4 (ENSPKIG00000018865) Asian bonytongue MODERN SPECIES 21 ENSSFOG00015005872 ENSSFOG00015005896 tmem230b (ENSSFOG00015026560) ADRA1A (ENSSFOG00015005994) DPYSL2 (ENSSFOG00015006019) bnip3lb (ENSSFOG00015006084) ppp2r2ab (ENSSFOG00015029148) LRRTM4 (ENSSFOG00015006160) LRRTM4 (ENSSFOG00015006167) ENSSFOG00015006182 ENSSFOG00015006222 ftsj1 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ENSECRG00000000219 ENSECRG00000000220 ENSECRG00000000221 mrps24 (ENSECRG00000000222) nudcd3 (ENSECRG00000000223) Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.c ##22 Coelacanth MODERN SPECIES 244 SNRPG (ENSLACG00000017900) PCYOX1 (ENSLACG00000017877) TIA1 (ENSLACG00000017828) C2orf42 (ENSLACG00000017805) ENSLACG00000017769 zgc:65851 (ENSLACG00000017637) MXD1 (ENSLACG00000017438) SNRNP27 (ENSLACG00000017387) ADD2 (ENSLACG00000017281) ENSLACG00000017151 HK2 (ENSLACG00000016947) ENSLACG00000016676 ENSLACG00000016571 ZMIZ2 (ENSLACG00000015641) ENSLACG00000015459 PGAM2 (ENSLACG00000015180) ##22 ENSLACG00000014763 NUDCD3 (ENSLACG00000014354) CAMK2B (ENSLACG00000012089) MRPS24 (ENSLACG00000011763) ENSLACG00000011344 SLC20A1 (ENSLACG00000010827) NT5DC4 (ENSLACG00000009174) ENSLACG00000008987 ENSLACG00000006615 PAX8 (ENSLACG00000003762) Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 61 ENSGT00940000157038 ENSGT00940000160915 ENSGT00940000156732 ENSGT00390000009488 ENSGT00940000158323 ENSGT00390000006780 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ENSLLEG00000005004 ENSLLEG00000004966 Frog MODERN SPECIES 3 dbnl (ENSXETG00000019013) elmod3 (ENSXETG00000019012) aebp1 (ENSXETG00000032698) kcnk5 (ENSXETG00000019007) spata18a (ENSXETG00000019005) myl7 (ENSXETG00000019004) gck (ENSXETG00000019003) ykt6 (ENSXETG00000019002) npc1l1 (ENSXETG00000019001) ddx56 (ENSXETG00000019000) tmed4 (ENSXETG00000018999) ogdh (ENSXETG00000018997) zmiz2 (ENSXETG00000018991) ppia (ENSXETG00000018981) ENSXETG00000036135 pgam2 (ENSXETG00000018980) ##22 ENSXETG00000039060 nudcd3 (ENSXETG00000018972) camk2b (ENSXETG00000018971) mrps24 (ENSXETG00000018967) slc20a1 (ENSXETG00000018957) nt5dc4 (ENSXETG00000018955) ckap2l (ENSXETG00000041090) ENSXETG00000041755 ENSXETG00000041287 il1b (ENSXETG00000001276) psd4 (ENSXETG00000001273) pax8 (ENSXETG00000001272) sftpb (ENSXETG00000032549) usp39 (ENSXETG00000001269) c2orf68 (ENSXETG00000025802) Amniota ANCESTRAL SPECIES 100 ENSGT00940000159904 ENSGT00550000074946 ENSGT00940000159012 ENSGT00950000183125.b.a.a 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ENSGT00390000009488 Archelosauria ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00940000161976 ENSGT00950000182943.kb.b.a.b.a ENSGT00950000182943.kb.b.a.b.b ENSGT00940000159012 ENSGT00550000074946 ENSGT00940000159904 ENSGT00390000011179 ENSGT00390000014879.c.a ENSGT00940000162631 ENSGT00530000063691.a ENSGT00950000182943.jb ENSGT00950000182943.kb.a ENSGT00950000183125.b.a.a ENSGT01030000234539.b.b.a ENSGT00950000183087.B ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000166166 ENSGT00940000158444 ENSGT00940000158973.b ENSGT00390000015164 ENSGT00950000182787.E.d.e.b ENSGT00940000161682 ENSGT00610000087417 ENSGT00390000006780 ENSGT00940000158323 ENSGT00940000159305 ENSGT00940000156732 ENSGT00940000157038 ENSGT00530000064712 ENSGT00940000164699 ENSGT00390000017613 Cryptodira ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00950000182943.kb.b.a.b.a ENSGT00950000182943.kb.b.a.b.b ENSGT00940000159012 ENSGT00550000074946 ENSGT00940000159904 ENSGT00390000011179 ENSGT00390000014879.c.a ENSGT00940000162631 ENSGT00530000063691.a ENSGT00950000182943.jb ENSGT00950000182943.kb.a ENSGT00950000182943.kb.b.a.a.a ENSGT00950000183125.b.a.a ENSGT01030000234539.b.b.a ENSGT00950000183087.B ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000166166 ENSGT00940000158444 ENSGT00940000158973.b ENSGT00390000015164 ENSGT00950000182787.E.d.e.b ENSGT00940000161682 ENSGT00610000087417 ENSGT00390000006780 ENSGT00940000158323 ENSGT00940000159305 ENSGT00940000156732 ENSGT00940000157038 ENSGT00530000064712 ENSGT00390000009488 ENSGT00940000161915 Testudinoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000159012 ENSGT00550000074946 ENSGT00940000159904 ENSGT00390000011179 ENSGT00390000014879.c.a ENSGT00940000162631 ENSGT00530000063691.a ENSGT00950000182943.jb ENSGT00950000182943.kb.a ENSGT00950000182943.kb.b.a.a.b ENSGT01000000217133 ENSGT00950000182943.kb.b.a.a.a ENSGT00950000183125.b.a.a ENSGT01030000234539.b.b.a ENSGT00950000183087.B ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000166166 ENSGT00940000154187.a.a Emydidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000159012 ENSGT00550000074946 ENSGT00940000159904 ENSGT00390000011179 ENSGT00390000014879.c.a ENSGT00940000162631 ENSGT00530000063691.a ENSGT00950000182943.jb ENSGT00950000182943.kb.a ENSGT00950000182943.kb.b.a.a.b ENSGT01000000217133 ENSGT00950000182943.kb.b.a.a.a ENSGT00950000183125.b.a.a ENSGT01030000234539.b.b.a ENSGT00950000183087.B ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000166166 ENSGT00940000154187.a.a Three-toed box turtle DUPLICATION Three-toed box turtle DUPLICATION Three-toed box turtle DUPLICATION Three-toed box turtle MODERN SPECIES 2676 ENSTMTG00000012616 ##22 Three-toed box turtle MODERN SPECIES 2688 ENSTMTG00000012754 ##22 Three-toed box turtle DUPLICATION Three-toed box turtle MODERN SPECIES 2687 ENSTMTG00000012743 ##22 Three-toed box turtle MODERN SPECIES 2675 ENSTMTG00000012600 ##22 Three-toed box turtle DUPLICATION Three-toed box turtle MODERN SPECIES 2677 ENSTMTG00000012635 ##22 Three-toed box turtle MODERN SPECIES 2689 ENSTMTG00000012765 ##22 painted turtle MODERN SPECIES 703 TRIQK (ENSCPBG00000003013) ENSCPBG00000002997 RUNX1T1 (ENSCPBG00000002973) SLC26A7 (ENSCPBG00000002908) ENSCPBG00000002878 OTUD6B (ENSCPBG00000002864) PIP4P2 (ENSCPBG00000002850) C8orf88 (ENSCPBG00000002825) NECAB1 (ENSCPBG00000002796) TMEM64 (ENSCPBG00000002776) CDH10 (ENSCPBG00000002731) ENSCPBG00000002716 OGDH (ENSCPBG00000002653) ZMIZ2 (ENSCPBG00000002557) ENSCPBG00000002513 PGAM2 (ENSCPBG00000002504) ##22 ENSCPBG00000002499 Testudinidae ANCESTRAL SPECIES 55 ENSGT00950000182943.kb.b.a.b.b ENSGT00940000159012 ENSGT00550000074946 ENSGT00940000159904 ENSGT00390000011179 ENSGT00390000014879.c.a ENSGT00940000162631 ENSGT00530000063691.a ENSGT00950000182943.kb.a ENSGT00950000182943.kb.b.a.a.b ENSGT01000000217133 ENSGT00950000182943.kb.b.a.a.a ENSGT00950000183125.b.a.a ENSGT01030000234539.b.b.a ENSGT00950000183087.B ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000166166 ENSGT00940000154187.a.a Abingdon island giant tortoise MODERN SPECIES 367 OGDH (ENSCABG00000011759) ZMIZ2 (ENSCABG00000011764) ENSCABG00000011772 PGAM2 (ENSCABG00000011796) ##22 ENSCABG00000011811 Goode s thornscrub tortoise MODERN SPECIES 11 IL36RN (ENSGEVG00005001146) ENSGEVG00005001125 TMED4 (ENSGEVG00005001113) DDX56 (ENSGEVG00005001091) NPC1L1 (ENSGEVG00005001011) MRPS24 (ENSGEVG00005000963) SLC20A1 (ENSGEVG00005000937) NT5DC4 (ENSGEVG00005000883) CKAP2L (ENSGEVG00005000846) ENSGEVG00005000819 ENSGEVG00005000805 ENSGEVG00005000795 OGDH (ENSGEVG00005000746) ZMIZ2 (ENSGEVG00005000698) ENSGEVG00005000684 PGAM2 (ENSGEVG00005000671) ##22 ENSGEVG00005000661 CDH10 (ENSGEVG00005000637) ENSGEVG00005000595 ENSGEVG00005000582 ENSGEVG00005000572 ENSGEVG00005000556 CDH12 (ENSGEVG00005000540) CDH18 (ENSGEVG00005000511) BASP1 (ENSGEVG00005000485) MYO10 (ENSGEVG00005000330) RETREG1 (ENSGEVG00005000289) ZNF622 (ENSGEVG00005000274) MARCHF11 (ENSGEVG00005000252) FBXL7 (ENSGEVG00005000212) ANKH (ENSGEVG00005000152) Archosauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.c ##22 Australian saltwater crocodile MODERN SPECIES 51 ENSCPRG00005016213 ENSCPRG00005016272 ENSCPRG00005016278 AAK1 (ENSCPRG00005016287) ENSCPRG00005016291 GFPT1 (ENSCPRG00005016297) ANTXR1 (ENSCPRG00005016303) GKN1 (ENSCPRG00005016314) GKN2 (ENSCPRG00005016328) PGAM2 (ENSCPRG00005016337) ##22 BMP10 (ENSCPRG00005016340) ARHGAP25 (ENSCPRG00005016346) CDS2 (ENSCPRG00005016351) PCNA (ENSCPRG00005016357) TMEM230 (ENSCPRG00005016358) SLC23A2 (ENSCPRG00005016364) RASSF2 (ENSCPRG00005016383) PRNP (ENSCPRG00005016388) LRRTM4 (ENSCPRG00005016394) ENSCPRG00005016401 TIA1 (ENSCPRG00005016407) C2orf42 (ENSCPRG00005016412) ENSCPRG00005016416 MXD1 (ENSCPRG00005016437) SNRNP27 (ENSCPRG00005016441) Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00950000182943.kb.b.a.b.a ENSGT00950000182943.kb.b.a.b.b ENSGT00940000159012 ENSGT00550000074946 ENSGT00940000159904 ENSGT00390000011179 ENSGT00390000014879.c.a ENSGT00940000162631 ENSGT00530000063691.a ENSGT00950000182943.jb ENSGT00950000182943.kb.a ENSGT00950000182943.kb.b.a.a ENSGT00950000183125.b.a.a ENSGT01030000234539.b.b.a ENSGT00950000183087.B ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000166166 ENSGT00940000158444 ENSGT00940000158973.b ENSGT00390000015164 ENSGT00950000182787.E.d.e.b ENSGT00940000161682 ENSGT00390000006780 ENSGT00940000158323 ENSGT00940000159305 ENSGT00940000156732 ENSGT00940000157038 ENSGT00530000064712 ENSGT00940000164699 ENSGT00390000017613 ENSGT00390000009488 tuatara MODERN SPECIES 704 PSD4 (ENSSPUG00000000840) ENSSPUG00000000834 ENSSPUG00000000825 IL36RN (ENSSPUG00000000818) ENSSPUG00000000811 TMED4 (ENSSPUG00000000791) DDX56 (ENSSPUG00000000784) NPC1L1 (ENSSPUG00000000641) MRPS24 (ENSSPUG00000000628) SLC20A1 (ENSSPUG00000000609) NT5DC4 (ENSSPUG00000000379) CKAP2L (ENSSPUG00000000352) ENSSPUG00000000345 OGDH (ENSSPUG00000000282) ENSSPUG00000000087 ENSSPUG00000000014 ##22 NUDCD3 (ENSSPUG00000018880) CAMK2B (ENSSPUG00000018871) YKT6 (ENSSPUG00000018864) GCK (ENSSPUG00000018858) MYL7 (ENSSPUG00000018849) POLD2 (ENSSPUG00000018846) CAPG (ENSSPUG00000018830) Episquamata ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000014666.a ENSGT00390000014618.b ENSGT00940000161817 ENSGT00950000182815.a.a.b ENSGT00940000158107 ENSGT00940000159152.d ENSGT00390000003878 ENSGT00390000012859 ENSGT00940000159352 ENSGT00940000155068.b ENSGT00940000154078.a.b ENSGT00950000182943.kb.b.a.a.d ENSGT00950000183125.b.a.a ENSGT01030000234539.b.b.a ENSGT00950000183087.B ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000166166 ENSGT00940000158444 ENSGT00940000158973.b ENSGT00390000015164 ENSGT00950000182787.E.d.e.b ENSGT00940000161682 ENSGT00390000006780 ENSGT00940000158323 ENSGT00940000159305 ENSGT00940000156732 ENSGT00940000157038 ENSGT00530000064712 ENSGT00940000164699 ENSGT00390000017613.v ENSGT00390000017613.u Laterata ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000014666.a ENSGT00390000014618.b ENSGT00940000161817 ENSGT00950000182815.a.a.b ENSGT00940000158107 ENSGT00940000159152.d ENSGT00390000003878 ENSGT00390000012859 ENSGT00940000159352 ENSGT00940000155068.b ENSGT00940000154078.a.b ENSGT00950000182943.kb.b.a.a.d ENSGT00950000183125.b.a.a ENSGT01030000234539.b.b.a ENSGT00950000183087.B ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000166166 ENSGT00940000158444 ENSGT00940000158973.b ENSGT00390000015164 ENSGT00950000182787.E.d.e.b ENSGT00940000161682 ENSGT00390000006780 ENSGT00940000158323 ENSGT00940000159305 ENSGT00940000156732 ENSGT00940000157038 ENSGT00530000064712 ENSGT00940000164699 ENSGT00390000017613.v ENSGT00390000017613.u Common wall lizard MODERN SPECIES 6 UNC5D (ENSPMRG00000018363) KCNU1 (ENSPMRG00000018335) ENSPMRG00000018326 ZNF703 (ENSPMRG00000018320) ERLIN2 (ENSPMRG00000018305) PLPBP (ENSPMRG00000018295) ADGRA2 (ENSPMRG00000018224) ENSPMRG00000018203 ENSPMRG00000018193 OGDH (ENSPMRG00000018166) ENSPMRG00000018154 ENSPMRG00000018134 ENSPMRG00000018126 ZMIZ2 (ENSPMRG00000018113) ENSPMRG00000018099 PGAM2 (ENSPMRG00000018089) ##22 ENSPMRG00000018085 NUDCD3 (ENSPMRG00000018077) ENSPMRG00000018072 CAMK2B (ENSPMRG00000017756) YKT6 (ENSPMRG00000017605) GCK (ENSPMRG00000017579) MYL7 (ENSPMRG00000017569) POLD2 (ENSPMRG00000017556) AEBP1 (ENSPMRG00000017538) CAPG (ENSPMRG00000017524) ENSPMRG00000017517 ENSPMRG00000017512 DBNL (ENSPMRG00000017499) TCF7L1 (ENSPMRG00000017473) ENSPMRG00000017459 Argentine black and white tegu MODERN SPECIES 42 SCN2B (ENSSMRG00000021883) SCN4B (ENSSMRG00000021882) TMPRSS4 (ENSSMRG00000021863) ENSSMRG00000021862 TMPRSS13 (ENSSMRG00000021861) FXYD6 (ENSSMRG00000021860) ENSSMRG00000021859 DSCAML1 (ENSSMRG00000021825) CEP164 (ENSSMRG00000021823) ENSSMRG00000021822 ENSSMRG00000021821 ENSSMRG00000021820 OGDH (ENSSMRG00000021819) ZMIZ2 (ENSSMRG00000021818) ENSSMRG00000021817 PGAM2 (ENSSMRG00000021816) ##22 NUDCD3 (ENSSMRG00000021815) CAMK2B (ENSSMRG00000021813) YKT6 (ENSSMRG00000021811) GCK (ENSSMRG00000021806) MYL7 (ENSSMRG00000021804) GOT1L1 (ENSSMRG00000021799) ADRB3 (ENSSMRG00000021797) ENSSMRG00000021763 EIF4EBP1 (ENSSMRG00000021761) ENSSMRG00000021760 ASH2L (ENSSMRG00000021759) STAR (ENSSMRG00000021757) ENSSMRG00000021754 LSM1 (ENSSMRG00000021753) BAG4 (ENSSMRG00000021751) Toxicofera ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00390000014666.a ENSGT00390000014618.b ENSGT00940000161817 ENSGT00950000182815.a.a.b ENSGT00940000158107 ENSGT00940000159152.d ENSGT00390000003878 ENSGT00390000012859 ENSGT00940000159352 ENSGT00940000155068.b ENSGT00940000154078.a.b ENSGT00950000182943.kb.b.a.a.d.a.b ENSGT00950000182943.kb.b.a.a.d.a.a ENSGT00950000183125.b.a.a ENSGT01030000234539.b.b.a ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000166166 ENSGT00940000158444 ENSGT00940000158973.b ENSGT00390000015164 ENSGT00950000182787.E.d.e.b ENSGT00940000161682 ENSGT00390000006780 ENSGT00940000158323 ENSGT00940000159305 ENSGT00940000156732 ENSGT00940000157038 ENSGT00530000064712 ENSGT00940000164699 ENSGT00390000017613.v ENSGT00390000017613.u Lizard DUPLICATION Lizard MODERN SPECIES 3 NHLRC1 (ENSACAG00000003390) KIF13A (ENSACAG00000003398) ENSACAG00000039776 SIRT5 (ENSACAG00000003538) ENSACAG00000003604 MCUR1 (ENSACAG00000003648) ENSACAG00000003668 CD83 (ENSACAG00000036337) JARID2 (ENSACAG00000003669) DTNBP1 (ENSACAG00000003762) MYLIP (ENSACAG00000003816) GMPR (ENSACAG00000003844) ATXN1 (ENSACAG00000003919) ENSACAG00000042775 ENSACAG00000040272 ENSACAG00000036935 ##22 ENSACAG00000044296 RBM24 (ENSACAG00000003962) CAP2 (ENSACAG00000003976) FAM8A1 (ENSACAG00000038018) NUP153 (ENSACAG00000004118) ENSACAG00000004205 ENSACAG00000004251 ENSACAG00000041173 GFOD1 (ENSACAG00000043438) ENSACAG00000004331 PHACTR1 (ENSACAG00000004337) ENSACAG00000031093 MYO10 (ENSACAG00000000351) RETREG1 (ENSACAG00000000324) ENSACAG00000036779 Lizard MODERN SPECIES 852 MAK16 (ENSACAG00000000888) ENSACAG00000000930 ENSACAG00000037047 ENSACAG00000001266 ENSACAG00000001472 ENSACAG00000045225 ENSACAG00000001497 ENSACAG00000040862 ENSACAG00000035425 ENSACAG00000038670 ENSACAG00000001501 ENSACAG00000044106 ENSACAG00000001508 ENSACAG00000043480 ENSACAG00000001877 ENSACAG00000002010 ##22 ENSACAG00000039141 NUDCD3 (ENSACAG00000002043) PPIA (ENSACAG00000036521) CAMK2B (ENSACAG00000012012) YKT6 (ENSACAG00000011947) GCK (ENSACAG00000011822) MYL7 (ENSACAG00000043660) ENSACAG00000043719 POLD2 (ENSACAG00000011710) AEBP1 (ENSACAG00000022067) ENSACAG00000011605 ENSACAG00000022415 ENSACAG00000011504 ENSACAG00000011398 ENSACAG00000043703 Elapidae ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000014666.a ENSGT00390000014618.b ENSGT00940000161817 ENSGT00950000182815.a.a.b.c ENSGT00940000158107 ENSGT00940000159152.d ENSGT00390000003878 ENSGT00390000012859 ENSGT00940000159352 ENSGT00940000155068.b ENSGT00940000154078.a.b ENSGT00950000182943.kb.b.a.a.d.a.b ENSGT00950000182943.kb.b.a.a.d.a.a.a ENSGT00950000183125.b.a.a ENSGT01030000234539.b.b.a ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000166166 ENSGT00940000158444 ENSGT00940000158973.b ENSGT00390000015164 ENSGT00950000182787.E.d.e.b ENSGT00940000161682 ENSGT00390000006780 ENSGT00940000158323 ENSGT00940000159305 ENSGT00940000156732 ENSGT00940000157038.g ENSGT00530000064712 ENSGT00940000164699 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ENSGT00950000182943.kb.b.a.b.b.b ENSGT00950000182943.kb.b.a.b.b.a koala MODERN SPECIES 146 TEPP (ENSPCIG00000007125) ENSPCIG00000007118 KIFC3 (ENSPCIG00000007108) KATNB1 (ENSPCIG00000007102) DRC7 (ENSPCIG00000008593) ENSPCIG00000032443 ADGRG3 (ENSPCIG00000016187) ADGRG1 (ENSPCIG00000016189) ENSPCIG00000022759 ENSPCIG00000001328 ENSPCIG00000008413 ENSPCIG00000012984 ENSPCIG00000012982 ENSPCIG00000032656 POLM (ENSPCIG00000002853) PGAM2 (ENSPCIG00000002837) ##22 ENSPCIG00000002818 ENSPCIG00000019204 URGCP (ENSPCIG00000019203) MRPS24 (ENSPCIG00000019201) SLC20A1 (ENSPCIG00000000596) NT5DC4 (ENSPCIG00000000629) ENSPCIG00000036262 ENSPCIG00000019173 ENSPCIG00000013144 ENSPCIG00000035147 ENSPCIG00000005687 ENSPCIG00000033104 ENSPCIG00000019853 IL36RN (ENSPCIG00000031417) IL1F10 (ENSPCIG00000032584) Common wonbat MODERN SPECIES 990 ENSVURG00010008676 POLM (ENSVURG00010008682) PGAM2 (ENSVURG00010008688) ##22 DBNL (ENSVURG00010008693) ENSVURG00010008706 URGCP (ENSVURG00010008718) MRPS24 (ENSVURG00010008733) SLC20A1 (ENSVURG00010008738) NT5DC4 (ENSVURG00010008747) ENSVURG00010008765 ENSVURG00010008784 ENSVURG00010008793 Wallaby MODERN SPECIES 7071 ENSMEUG00000012922 PGAM2 (ENSMEUG00000012920) ##22 Tasmanian devil MODERN SPECIES 1 USB1 (ENSSHAG00000024120) ZNF319 (ENSSHAG00000031600) TEPP (ENSSHAG00000007313) ENSSHAG00000024794 KIFC3 (ENSSHAG00000031697) KATNB1 (ENSSHAG00000022649) DRC7 (ENSSHAG00000006675) ENSSHAG00000006225 ENSSHAG00000005146 ENSSHAG00000003822 ENSSHAG00000029230 ENSSHAG00000001828 ENSSHAG00000001442 ENSSHAG00000024438 ENSSHAG00000002674 PGAM2 (ENSSHAG00000003170) ##22 DBNL (ENSSHAG00000003404) UBE2D4 (ENSSHAG00000024831) ENSSHAG00000005460 ENSSHAG00000020918 ENSSHAG00000031402 NT5DC4 (ENSSHAG00000007640) ENSSHAG00000024240 ENSSHAG00000007933 ENSSHAG00000008360 ENSSHAG00000008907 ENSSHAG00000027329 ENSSHAG00000010472 ENSSHAG00000010571 IL1F10 (ENSSHAG00000024364) ENSSHAG00000028511 Eutheria ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00950000183087.A.a.b.a ENSGT00950000183087.B ENSGT01030000234539.b.b.a ENSGT00950000183125.b.a.a ENSGT00940000159012 ENSGT00550000074946 ENSGT00940000159904 ENSGT00940000158444 ENSGT00940000158973.b ENSGT00390000015164 ENSGT00950000182787.E.d.e.b ENSGT00940000161682 ENSGT00390000006780 ENSGT00940000158323 ENSGT00940000158490 ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000156732 ENSGT00940000160915 ENSGT00940000154390.A.j ENSGT00390000011179 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00950000183087.A.a.b.b ENSGT00950000183087.B ENSGT01030000234539.b.b.a ENSGT00950000183125.b.a.a ENSGT00940000159012 ENSGT00550000074946 ENSGT00940000159904 ENSGT00940000158444 ENSGT00940000158973.b ENSGT00390000015164 ENSGT00950000182787.E.d.e.b ENSGT00940000161682 ENSGT00390000006780 ENSGT00940000158323 ENSGT00940000158490 ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000156732 ENSGT00940000160915 ENSGT00940000154390.A.j ENSGT00390000011179 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00950000183087.A.a.b.b ENSGT00950000183087.B ENSGT01030000234539.b.b.a ENSGT00950000183125.b.a.a ENSGT00940000159012 ENSGT00550000074946 ENSGT00940000159904 ENSGT00940000158444 ENSGT00940000158973.b ENSGT00390000015164 ENSGT00950000182787.E.d.e.b ENSGT00940000161682 ENSGT00390000006780 ENSGT00940000158323 ENSGT00940000158490 ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000156732 ENSGT00940000160915 ENSGT00940000154390.A.j ENSGT00390000011179 Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES 1715 ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000156732 Hedgehog MODERN SPECIES 3350 PGAM2 (ENSEEUG00000003746) ##22 DBNL (ENSEEUG00000003696) Common shrew DUPLICATION Common shrew MODERN SPECIES 7657 PGAM2 (ENSSARG00000011298) ##22 Common shrew MODERN SPECIES 11677 ENSSARG00000006705 ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00900000140979.a.b ENSGT00950000183087.A.a.a.a.b.b ENSGT01030000234539.b.b.a ENSGT00950000183125.b.a.a ENSGT00940000159012 ENSGT00550000074946 ENSGT00940000159904 ENSGT00940000158444 ENSGT00940000158973.b ENSGT00390000015164 ENSGT00950000182787.E.d.e.b ENSGT00940000161682 ENSGT00390000006780 ENSGT00940000158323 ENSGT00940000158490 ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000156732 ENSGT00940000160915 ENSGT00940000154390.A.j ENSGT00390000011179 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000157781 ENSGT00940000161703 ENSGT00720000108792.A ENSGT00520000055647.a ENSGT00940000162844 ENSGT00940000156782.c ENSGT00940000161552 ENSGT00940000156004 ENSGT00940000155909 ENSGT00530000063608.A ENSGT00940000160556 ENSGT00390000001319 ENSGT00940000155450 ENSGT00530000063186.b.a ENSGT00390000015821 ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000156732 ENSGT00940000160915 ENSGT00940000154390.A.j ENSGT00390000011179 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000157781 ENSGT00940000161703 ENSGT00720000108792.A ENSGT00520000055647.a ENSGT00940000162844 ENSGT00940000156782.c ENSGT00940000161552 ENSGT00940000156004 ENSGT00940000155909 ENSGT00530000063608.A ENSGT00940000160556 ENSGT00390000001319 ENSGT00940000155450 ENSGT00530000063186.b.a ENSGT00390000015821 ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000156732 ENSGT00940000160915 ENSGT00940000154390.A.j ENSGT00390000011179 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000157781 ENSGT00940000161703 ENSGT00720000108792.A ENSGT00520000055647.a ENSGT00940000162844 ENSGT00940000156782.c ENSGT00940000161552 ENSGT00940000156004 ENSGT00940000155909 ENSGT00530000063608.A ENSGT00940000160556 ENSGT00390000001319.nb.a ENSGT00940000155450 ENSGT00530000063186.b.a ENSGT00390000015821 ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000156732 ENSGT00940000160915 ENSGT00940000154390.A.j ENSGT00390000011179 Cetacea ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000157781 ENSGT00720000108792.A ENSGT00520000055647.a ENSGT00940000162844 ENSGT00940000156782.c ENSGT00940000161552 ENSGT00940000156004 ENSGT00940000155909.j ENSGT00530000063608.A ENSGT00390000017589.d ENSGT00940000160556 ENSGT00390000001319.nb.a ENSGT00940000155450 ENSGT00530000063186.b.a ENSGT00390000015821 ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000156732 ENSGT00940000160915 ENSGT00940000154390.A.j ENSGT00390000011179 ENSGT00940000156328.b ENSGT00940000158092 ENSGT00940000157394 ENSGT00490000044045 ENSGT00940000154872.C ENSGT00940000161026 ENSGT00730000111762 ENSGT01030000234607.A.a.b.a ENSGT00940000161501 ENSGT00390000016168.a ENSGT00940000158053 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00720000108792.A ENSGT00520000055647.a ENSGT00940000162844 ENSGT00940000156782.c ENSGT00940000161552 ENSGT00940000156004 ENSGT00940000155909.j ENSGT00530000063608.A ENSGT00390000015714.x ENSGT00390000017589.d ENSGT00940000160556 ENSGT00390000001319.nb.a ENSGT00940000155450 ENSGT00530000063186.b.a ENSGT00390000015821.g.b ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000156732 ENSGT00940000160915 ENSGT00940000154390.A.j ENSGT00390000011179 ENSGT00940000156328.b ENSGT00940000158092 ENSGT00940000157394 ENSGT00490000044045 ENSGT00940000154872.C ENSGT00940000161026 ENSGT00730000111762 ENSGT01030000234607.A.a.b.a ENSGT00940000161501 ENSGT00390000016168.a ENSGT00940000158053 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00720000108792.A ENSGT00520000055647.a ENSGT00940000162844 ENSGT00940000156782.c ENSGT00940000161552 ENSGT00940000156004 ENSGT00940000155909.j ENSGT00530000063608.A ENSGT00390000015714.x ENSGT00390000017589.d ENSGT00940000160556 ENSGT00390000001319.nb.a ENSGT00940000155450 ENSGT00530000063186.b.a ENSGT00390000015821.g.b ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000156732 ENSGT00940000160915 ENSGT00940000154390.A.j ENSGT00390000011179 ENSGT00940000156328.b ENSGT00940000158092 ENSGT00940000157394 ENSGT00490000044045 ENSGT00940000154872.C ENSGT00940000161026 ENSGT00730000111762 ENSGT01030000234607.A.a.b.a ENSGT00940000161501 ENSGT00390000016168.a ENSGT00940000158053 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00720000108792.A ENSGT00520000055647.a ENSGT00940000162844 ENSGT00940000156782.c ENSGT00940000161552 ENSGT00940000156004 ENSGT00940000155909.j ENSGT00530000063608.A ENSGT00390000015714.x ENSGT00390000017589.d ENSGT00940000160556 ENSGT00390000001319.nb.a ENSGT00940000155450 ENSGT00530000063186.b.a ENSGT00390000015821.g.b ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000156732 ENSGT00940000154390.A.j ENSGT00390000011179 ENSGT00940000156328.b ENSGT00940000158092 ENSGT00940000157394 ENSGT00490000044045 ENSGT00940000154872.C ENSGT00940000161026 ENSGT00730000111762 ENSGT01030000234607.A.a.b.a ENSGT00940000161501 ENSGT00390000016168.a ENSGT00940000158053 ENSGT00950000183162.a.b Monodontidae ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000157781 ENSGT00720000108792.A ENSGT00520000055647.a ENSGT00940000162844 ENSGT00940000156782.c ENSGT00940000161552 ENSGT00940000156004 ENSGT00940000155909.j ENSGT00530000063608.A ENSGT00390000017589.d ENSGT00940000160556 ENSGT00390000001319.nb.a ENSGT00940000155450 ENSGT00530000063186.b.a ENSGT00390000015821.g.b ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000156732 ENSGT00940000154390.A.j ENSGT00390000011179 ENSGT00940000156328.b ENSGT00940000158092 ENSGT00940000157394 ENSGT00490000044045 ENSGT00940000154872.C ENSGT00940000161026 ENSGT00730000111762 ENSGT01030000234607.A.a.b.a ENSGT00940000161501 ENSGT00390000016168.a ENSGT00940000158053 ENSGT00950000183162.a.b Narwhal MODERN SPECIES 306 VWC2 (ENSMMNG00015009001) ZPBP (ENSMMNG00015009014) SPATA48 (ENSMMNG00015009027) IKZF1 (ENSMMNG00015009060) FIGNL1 (ENSMMNG00015009090) DDC (ENSMMNG00015009141) ENSMMNG00015009222 COBL (ENSMMNG00015009269) ENSMMNG00015009341 ENSMMNG00015009346 VSTM2A (ENSMMNG00015010168) ENSMMNG00015010184 EGFR (ENSMMNG00015010237) LANCL2 (ENSMMNG00015010287) VOPP1 (ENSMMNG00015010340) PGAM2 (ENSMMNG00015010428) ##22 DBNL (ENSMMNG00015010470) URGCP (ENSMMNG00015010531) ENSMMNG00015010539 TNS3 (ENSMMNG00015010584) IGFBP3 (ENSMMNG00015010669) IGFBP1 (ENSMMNG00015010699) CCDC201 (ENSMMNG00015010720) ADCY1 (ENSMMNG00015010742) RAMP3 (ENSMMNG00015010800) ENSMMNG00015010824 TBRG4 (ENSMMNG00015010846) ENSMMNG00015010885 ENSMMNG00015010898 CCM2 (ENSMMNG00015010954) MYO1G (ENSMMNG00015011062) Beluga whale MODERN SPECIES 17 VWC2 (ENSDLEG00000007130) ZPBP (ENSDLEG00000007123) ENSDLEG00000007117 IKZF1 (ENSDLEG00000007094) FIGNL1 (ENSDLEG00000007088) DDC (ENSDLEG00000007076) ENSDLEG00000007069 COBL (ENSDLEG00000007036) ENSDLEG00000007019 ENSDLEG00000007010 VSTM2A (ENSDLEG00000007004) ENSDLEG00000006999 EGFR (ENSDLEG00000004590) LANCL2 (ENSDLEG00000004118) VOPP1 (ENSDLEG00000004105) PGAM2 (ENSDLEG00000004099) ##22 DBNL (ENSDLEG00000004073) ENSDLEG00000004063 URGCP (ENSDLEG00000004057) MRPS24 (ENSDLEG00000004051) TNS3 (ENSDLEG00000003402) IGFBP3 (ENSDLEG00000003238) IGFBP1 (ENSDLEG00000005245) ADCY1 (ENSDLEG00000005087) RAMP3 (ENSDLEG00000005050) ENSDLEG00000005039 TBRG4 (ENSDLEG00000005026) ENSDLEG00000005015 ENSDLEG00000005007 CCM2 (ENSDLEG00000004996) MYO1G (ENSDLEG00000004931) Vaquita MODERN SPECIES 20 VWC2 (ENSPSNG00000012383) ZPBP (ENSPSNG00000012291) SPATA48 (ENSPSNG00000012190) IKZF1 (ENSPSNG00000011675) FIGNL1 (ENSPSNG00000011531) DDC (ENSPSNG00000010797) ENSPSNG00000010618 COBL 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ENSGT00940000157045 ENSGT00940000161037 ENSGT00390000001319.nb.b ENSGT00940000155450 ENSGT00530000063186.b.a ENSGT00390000015821 ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000156732 ENSGT00940000160915 ENSGT00940000154390.A.j ENSGT00390000011179 Caprinae ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000155488 ENSGT00940000158391 ENSGT00940000157527 ENSGT00940000157131.b ENSGT00560000077278.b ENSGT00940000153704.A ENSGT00390000018696 ENSGT00940000158728 ENSGT00940000157045 ENSGT00940000161037 ENSGT00390000001319.nb.b ENSGT00390000001319.nb.a ENSGT00940000155450 ENSGT00530000063186.b.a ENSGT00390000015821 ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000156732 ENSGT00940000160915 ENSGT00940000154390.A.j ENSGT00390000011179 Goat MODERN SPECIES 14 STT3B (ENSCHIG00000013391) ENSCHIG00000020290 GADL1 (ENSCHIG00000015633) TGFBR2 (ENSCHIG00000011473) RBMS3 (ENSCHIG00000009144) ENSCHIG00000022736 AZI2 (ENSCHIG00000017018) CMC1 (ENSCHIG00000009271) EOMES (ENSCHIG00000024745) SLC4A7 (ENSCHIG00000015677) NEK10 (ENSCHIG00000003691) SEC61G (ENSCHIG00000015002) EGFR (ENSCHIG00000020547) LANCL2 (ENSCHIG00000016442) VOPP1 (ENSCHIG00000012490) PGAM2 (ENSCHIG00000005138) ##22 DBNL (ENSCHIG00000015882) ENSCHIG00000024005 URGCP (ENSCHIG00000015397) MRPS24 (ENSCHIG00000022276) ENSCHIG00000024528 Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 10 OSBPL10 (ENSOARG00020024245) ENSOARG00020024192 GADL1 (ENSOARG00020024116) TGFBR2 (ENSOARG00020024064) RBMS3 (ENSOARG00020023909) AZI2 (ENSOARG00020023862) CMC1 (ENSOARG00020023823) EOMES (ENSOARG00020023776) SLC4A7 (ENSOARG00020018025) NEK10 (ENSOARG00020017393) ENSOARG00020017329 ENSOARG00020017266 EGFR (ENSOARG00020016388) LANCL2 (ENSOARG00020016230) VOPP1 (ENSOARG00020015646) PGAM2 (ENSOARG00020015624) ##22 DBNL (ENSOARG00020015082) ENSOARG00020014847 URGCP (ENSOARG00020014532) Bovinae ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000157880 ENSGT00940000155488 ENSGT00940000158391 ENSGT00940000157527 ENSGT00940000157131.b ENSGT00560000077278.b ENSGT00940000153704.A ENSGT00390000018696 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ENSGT00940000155450 ENSGT00530000063186.b.a ENSGT00390000015821 ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000156732 ENSGT00940000160915 ENSGT00940000154390.A.j ENSGT00390000011179.o.b Cow MODERN SPECIES 14 OSBPL10 (ENSBTAG00000009194) STT3B (ENSBTAG00000007438) GADL1 (ENSBTAG00000007131) TGFBR2 (ENSBTAG00000019832) RBMS3 (ENSBTAG00000044062) ZCWPW2 (ENSBTAG00000022751) AZI2 (ENSBTAG00000004117) CMC1 (ENSBTAG00000035286) EOMES (ENSBTAG00000016920) SLC4A7 (ENSBTAG00000018227) NEK10 (ENSBTAG00000000220) SEC61G (ENSBTAG00000014971) EGFR (ENSBTAG00000011628) LANCL2 (ENSBTAG00000018026) VOPP1 (ENSBTAG00000012073) PGAM2 (ENSBTAG00000014547) ##22 DBNL (ENSBTAG00000017547) UBE2D4 (ENSBTAG00000003997) URGCP (ENSBTAG00000009453) MRPS24 (ENSBTAG00000007398) ENSBTAG00000049586 ENSBTAG00000053760 Bos_a ANCESTRAL SPECIES 140 ENSGT00530000063186.b.a ENSGT00390000015821 ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000156732 ENSGT00940000160915 Wild yak MODERN SPECIES 1647 LANCL2 (ENSBMUG00000022864) VOPP1 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PGAM2 (ENSCHYG00000027118) ##22 ENSCHYG00000027116 UBE2D4 (ENSCHYG00000027114) URGCP (ENSCHYG00000027111) NEK10 (ENSCHYG00000027107) SLC4A7 (ENSCHYG00000027098) EOMES (ENSCHYG00000027096) ENSCHYG00000027093 AZI2 (ENSCHYG00000027091) ZCWPW2 (ENSCHYG00000027089) RBMS3 (ENSCHYG00000027074) TGFBR2 (ENSCHYG00000027066) GADL1 (ENSCHYG00000027050) STT3B (ENSCHYG00000027034) OSBPL10 (ENSCHYG00000027022) ENSCHYG00000027011 Camelidae ANCESTRAL SPECIES 98 ENSGT00940000157781 ENSGT00940000161703 ENSGT00720000108792.A ENSGT00520000055647.a ENSGT00940000162844 ENSGT00940000156782.c ENSGT00940000161552 ENSGT00940000156004 ENSGT00940000155909 ENSGT00530000063608.A ENSGT00940000160556 ENSGT00390000001319 ENSGT00940000155450 ENSGT00530000063186.b.a ENSGT00390000015821 ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000156732 ENSGT00940000154390.A.j ENSGT00390000011179 Arabian camel MODERN SPECIES 29 VWC2 (ENSCDRG00005014668) ZPBP (ENSCDRG00005014690) SPATA48 (ENSCDRG00005014809) ENSCDRG00005014861 FIGNL1 (ENSCDRG00005014893) DDC (ENSCDRG00005014922) GRB10 (ENSCDRG00005015047) ENSCDRG00005015409 ENSCDRG00005015439 VSTM2A (ENSCDRG00005015527) SEC61G (ENSCDRG00005015629) EGFR (ENSCDRG00005015677) ENSCDRG00005015894 LANCL2 (ENSCDRG00005015911) VOPP1 (ENSCDRG00005015947) PGAM2 (ENSCDRG00005016246) ##22 DBNL (ENSCDRG00005016326) URGCP (ENSCDRG00005016741) MRPS24 (ENSCDRG00005016830) ENSCDRG00005016856 Suina ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00390000003271 ENSGT00390000015236 ENSGT00390000009405.b.q.a ENSGT00940000155957 ENSGT00940000155880 ENSGT00940000158500 ENSGT00940000156475 ENSGT00390000007287 ENSGT00770000120611.B ENSGT00940000157781 ENSGT00390000014376 ENSGT00940000161393 ENSGT00390000000706 ENSGT00530000063186.b.a ENSGT00390000015821 ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000156732 ENSGT00940000160915 ENSGT00940000154390.A.j ENSGT00390000011179 ENSGT00940000156328.b ENSGT00940000158092 ENSGT00940000157394 ENSGT00490000044045 ENSGT00940000154872.C ENSGT00940000161026 ENSGT00730000111762 ENSGT01030000234607.A.a.b.a ENSGT00940000161501 ENSGT00390000016168.a ENSGT00940000158053 Chacoan peccary MODERN SPECIES 77 C7orf31 (ENSCWAG00000000512) ENSCWAG00000000536 OSBPL3 (ENSCWAG00000000578) ENSCWAG00000000638 GSDME (ENSCWAG00000000655) PALS2 (ENSCWAG00000000694) NPY (ENSCWAG00000000744) STK31 (ENSCWAG00000000802) FAM221A (ENSCWAG00000001136) UPP1 (ENSCWAG00000001201) C7orf57 (ENSCWAG00000001234) SUN3 (ENSCWAG00000001274) HUS1 (ENSCWAG00000001301) LANCL2 (ENSCWAG00000001326) VOPP1 (ENSCWAG00000001344) PGAM2 (ENSCWAG00000001358) ##22 DBNL (ENSCWAG00000001408) UBE2D4 (ENSCWAG00000001519) URGCP (ENSCWAG00000001532) MRPS24 (ENSCWAG00000001544) TNS3 (ENSCWAG00000001571) ENSCWAG00000001620 IGFBP3 (ENSCWAG00000001631) IGFBP1 (ENSCWAG00000001668) ADCY1 (ENSCWAG00000001712) RAMP3 (ENSCWAG00000001748) ENSCWAG00000001760 TBRG4 (ENSCWAG00000001776) ENSCWAG00000001862 CCM2 (ENSCWAG00000001911) MYO1G (ENSCWAG00000002051) Pig MODERN SPECIES 9 CYCS (ENSSSCG00000016714) OSBPL3 (ENSSSCG00000016715) GSDME (ENSSSCG00000016716) PALS2 (ENSSSCG00000016717) NPY (ENSSSCG00000016718) ENSSSCG00000037148 ENSSSCG00000016719 ENSSSCG00000056164 FAM221A (ENSSSCG00000038792) UPP1 (ENSSSCG00000030388) C7orf57 (ENSSSCG00000033266) SUN3 (ENSSSCG00000022557) HUS1 (ENSSSCG00000028523) LANCL2 (ENSSSCG00000023801) VOPP1 (ENSSSCG00000032734) PGAM2 (ENSSSCG00000016720) ##22 DBNL (ENSSSCG00000016721) UBE2D4 (ENSSSCG00000016722) URGCP (ENSSSCG00000040519) MRPS24 (ENSSSCG00000016724) TNS3 (ENSSSCG00000016725) IGFBP3 (ENSSSCG00000058216) IGFBP1 (ENSSSCG00000016728) ENSSSCG00000050056 ADCY1 (ENSSSCG00000016726) ENSSSCG00000062187 RAMP3 (ENSSSCG00000031144) ENSSSCG00000016731 TBRG4 (ENSSSCG00000016732) ENSSSCG00000016733 CCM2 (ENSSSCG00000016734) Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00900000140979.a.b ENSGT00950000183087.A.a.a.a.b.b ENSGT01030000234539.b.b.a ENSGT00950000183125.b.a.a ENSGT00940000159012 ENSGT00550000074946 ENSGT00940000159904 ENSGT00940000158444 ENSGT00940000158973.b ENSGT00390000015164 ENSGT00950000182787.E.d.e.b ENSGT00940000161682 ENSGT00390000006780 ENSGT00940000158323 ENSGT00940000158490 ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000156732 ENSGT00940000160915 ENSGT00940000154390.A.j ENSGT00390000011179 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00900000140979.a.b ENSGT00950000183087.A.a.a.a.b.b ENSGT01030000234539.b.b.a ENSGT00950000183125.b.a.a ENSGT00940000159012 ENSGT00550000074946 ENSGT00940000159904 ENSGT00940000158444 ENSGT00940000158973.b ENSGT00390000015164 ENSGT00950000182787.E.d.e.b ENSGT00940000161682 ENSGT00390000006780 ENSGT00940000158323 ENSGT00940000158490 ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000156732 ENSGT00940000160915 ENSGT00940000154390.A.j ENSGT00390000011179 ENSGT00390000011072 ENSGT00440000033985 ENSGT00940000154014.a ENSGT00940000158294 ENSGT00390000014996 ENSGT00550000074870.b ENSGT00390000014722 ENSGT00940000155925 ENSGT00940000157116 ENSGT00940000157866 ENSGT00390000002582 Equus ANCESTRAL SPECIES 57 ENSGT00900000140979.a.b ENSGT00950000183087.A.a.a.a.b.b ENSGT01030000234539.b.b.a ENSGT00950000183125.b.a.a ENSGT00940000159012 ENSGT00550000074946 ENSGT00940000159904 ENSGT00940000158444 ENSGT00940000158973.b ENSGT00390000015164 ENSGT00950000182787.E.d.e.b ENSGT00940000161682 ENSGT00390000006780 ENSGT00940000158323 ENSGT00940000158490 ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000156732 ENSGT00940000160915 ENSGT00940000154390.A.j ENSGT00390000011179 ENSGT00390000011072 ENSGT00440000033985 ENSGT00940000154014.a ENSGT00940000158294 ENSGT00390000014996.u ENSGT00550000074870.b ENSGT00390000014722 ENSGT00940000155925 ENSGT00940000157116 ENSGT00940000157866 ENSGT00390000002582 Donkey MODERN SPECIES H2AZ2 (ENSEASG00005025915) ENSEASG00005017822 ZMIZ2 (ENSEASG00005017817) OGDH (ENSEASG00005017801) ENSEASG00005035492 DDX56 (ENSEASG00005017795) NPC1L1 (ENSEASG00005017780) NUDCD3 (ENSEASG00005017767) CAMK2B (ENSEASG00005017762) YKT6 (ENSEASG00005017757) GCK (ENSEASG00005017749) MYL7 (ENSEASG00005017744) POLD2 (ENSEASG00005017741) AEBP1 (ENSEASG00005017728) POLM (ENSEASG00005017723) PGAM2 (ENSEASG00005017720) ##22 DBNL (ENSEASG00005017717) UBE2D4 (ENSEASG00005017715) URGCP (ENSEASG00005017713) MRPS24 (ENSEASG00005030446) BLVRA (ENSEASG00005017707) COA1 (ENSEASG00005029281) STK17A (ENSEASG00005017699) HECW1 (ENSEASG00005017685) ENSEASG00005027314 PSMA2 (ENSEASG00005017678) C7orf25 (ENSEASG00005017675) GLI3 (ENSEASG00005017667) INHBA (ENSEASG00005029952) SUGCT (ENSEASG00005017649) MPLKIP (ENSEASG00005017642) Horse MODERN SPECIES 25 ZMIZ2 (ENSECAG00000024843) OGDH (ENSECAG00000023953) TMED4 (ENSECAG00000016918) DDX56 (ENSECAG00000019897) ENSECAG00000032300 NPC1L1 (ENSECAG00000023982) ENSECAG00000055483 NUDCD3 (ENSECAG00000022535) CAMK2B (ENSECAG00000017000) YKT6 (ENSECAG00000010316) GCK (ENSECAG00000022171) MYL7 (ENSECAG00000018912) POLD2 (ENSECAG00000018009) AEBP1 (ENSECAG00000019884) POLM (ENSECAG00000013117) PGAM2 (ENSECAG00000046525) ##22 DBNL (ENSECAG00000012048) UBE2D4 (ENSECAG00000019978) URGCP (ENSECAG00000017344) MRPS24 (ENSECAG00000014621) ENSECAG00000009786 BLVRA (ENSECAG00000011650) COA1 (ENSECAG00000011136) STK17A (ENSECAG00000006915) HECW1 (ENSECAG00000010537) PSMA2 (ENSECAG00000020597) ENSECAG00000009052 C4H7orf25 (ENSECAG00000002284) GLI3 (ENSECAG00000009281) INHBA (ENSECAG00000022448) SUGCT (ENSECAG00000020946) Chiroptera ANCESTRAL SPECIES 67 ENSGT00900000140979.a.b ENSGT00950000183087.A.a.b.b ENSGT01030000234539.b.b.a ENSGT00950000183125.b.a.a ENSGT00940000159012 ENSGT00550000074946 ENSGT00940000159904 ENSGT00940000158444 ENSGT00940000158973.b ENSGT00390000015164 ENSGT00950000182787.E.d.e.b ENSGT00940000161682 ENSGT00390000006780 ENSGT00940000158323 ENSGT00940000158490 ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000156732 ENSGT00940000160915 ENSGT00940000154390.A.j ENSGT00390000011179 Megabat MODERN SPECIES 6580 CAMK2B (ENSPVAG00000008082) YKT6 (ENSPVAG00000008081) GCK (ENSPVAG00000008079) MYL7 (ENSPVAG00000008077) POLD2 (ENSPVAG00000008075) AEBP1 (ENSPVAG00000008074) POLM (ENSPVAG00000008070) PGAM2 (ENSPVAG00000008069) ##22 DBNL (ENSPVAG00000008067) Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 59 ENSGT00900000140979.a.b ENSGT00950000183087.A.a.b.a ENSGT01030000234539.b.b.a ENSGT00950000183125.b.a.a ENSGT00940000159012 ENSGT00550000074946 ENSGT00940000159904 ENSGT00940000158444 ENSGT00940000158973.b ENSGT00390000015164 ENSGT00950000182787.E.d.e.b ENSGT00940000161682 ENSGT00390000006780 ENSGT00940000158323 ENSGT00940000158490 ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000156732 ENSGT00940000160915 ENSGT00940000154390.A.j ENSGT00390000011179 Microbat MODERN SPECIES 1823 ENSMLUG00000005479 GCK (ENSMLUG00000012016) MYL7 (ENSMLUG00000012005) POLD2 (ENSMLUG00000011994) AEBP1 (ENSMLUG00000011971) POLM (ENSMLUG00000011953) PGAM2 (ENSMLUG00000011943) ##22 DBNL (ENSMLUG00000011929) UBE2D4 (ENSMLUG00000011919) URGCP (ENSMLUG00000005131) MRPS24 (ENSMLUG00000005121) Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 12 H2AZ2 (ENSRFEG00010021273) ENSRFEG00010021241 ZMIZ2 (ENSRFEG00010021151) OGDH (ENSRFEG00010021036) ENSRFEG00010020979 DDX56 (ENSRFEG00010020937) NPC1L1 (ENSRFEG00010020867) NUDCD3 (ENSRFEG00010020831) CAMK2B (ENSRFEG00010020714) YKT6 (ENSRFEG00010020632) GCK (ENSRFEG00010020533) MYL7 (ENSRFEG00010020461) POLD2 (ENSRFEG00010020433) AEBP1 (ENSRFEG00010020403) POLM (ENSRFEG00010020319) PGAM2 (ENSRFEG00010020304) ##22 DBNL (ENSRFEG00010020128) URGCP (ENSRFEG00010020016) MRPS24 (ENSRFEG00010019993) Carnivora ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00900000140979.a.b ENSGT00950000183087.A.a.a.a.b.b ENSGT01030000234539.b.b.a ENSGT00950000183125.b.a.a ENSGT00940000159012 ENSGT00550000074946 ENSGT00940000159904 ENSGT00940000158444 ENSGT00940000158973.b ENSGT00390000015164 ENSGT00950000182787.E.d.e.b ENSGT00940000161682 ENSGT00390000006780 ENSGT00940000158323 ENSGT00940000158490 ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000156732 ENSGT00940000154390.A.j ENSGT00390000011179 Felidae ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00900000140979.a.b ENSGT00950000183087.A.a.a.a.b.b ENSGT01030000234539.b.b.a ENSGT00950000183125.b.a.a ENSGT00940000159012 ENSGT00550000074946 ENSGT00940000159904 ENSGT00940000158444 ENSGT00940000158973.b ENSGT00390000015164 ENSGT00950000182787.E.d.e.b ENSGT00940000161682 ENSGT00390000006780 ENSGT00940000158323 ENSGT00940000158490 ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000156732 ENSGT00940000154390.A.j ENSGT00390000011179 Panthera ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00900000140979.a.b ENSGT00950000183087.A.a.a.a.b.b ENSGT01030000234539.b.b.a ENSGT00950000183125.b.a.a ENSGT00940000159012 ENSGT00550000074946 ENSGT00940000159904 ENSGT00940000158444 ENSGT00940000158973.b ENSGT00390000015164 ENSGT00950000182787.E.d.e.b ENSGT00940000161682 ENSGT00390000006780 ENSGT00940000158323 ENSGT00940000158490 ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000156732 ENSGT00940000154390.A.j ENSGT00390000011179 ENSGT00940000160913 ENSGT00940000156977 ENSGT00940000153110.A ENSGT00940000162216 ENSGT00390000015136 ENSGT00940000161154 ENSGT00390000004778 ENSGT00940000159178 ENSGT00390000000903.b ENSGT01050000244850.A.b ENSGT00390000016807 ENSGT01050000244824.F Panthera_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00900000140979.a.b ENSGT00950000183087.A.a.a.a.b.b ENSGT01030000234539.b.b.a ENSGT00950000183125.b.a.a ENSGT00940000159012 ENSGT00550000074946 ENSGT00940000159904 ENSGT00940000158444 ENSGT00940000158973.b ENSGT00390000015164 ENSGT00950000182787.E.d.e.b ENSGT00940000161682 ENSGT00390000006780 ENSGT00940000158323 ENSGT00940000158490 ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000156732 ENSGT00940000154390.A.j ENSGT00390000011179 ENSGT00940000160913 ENSGT00940000156977 ENSGT00940000153110.A ENSGT00940000162216 ENSGT00390000015136 ENSGT00940000161154 ENSGT00390000004778 ENSGT00940000159178 ENSGT00390000000903.b ENSGT01050000244850.A.b ENSGT00390000016807 ENSGT01050000244824.F leopard MODERN SPECIES 20 H2AZ2 (ENSPPRG00000000061) ENSPPRG00000001180 ZMIZ2 (ENSPPRG00000006857) OGDH (ENSPPRG00000011132) TMED4 (ENSPPRG00000013278) DDX56 (ENSPPRG00000014594) NPC1L1 (ENSPPRG00000024119) NUDCD3 (ENSPPRG00000023951) CAMK2B (ENSPPRG00000023528) YKT6 (ENSPPRG00000022701) GCK (ENSPPRG00000001844) MYL7 (ENSPPRG00000002309) POLD2 (ENSPPRG00000006721) AEBP1 (ENSPPRG00000007601) POLM (ENSPPRG00000009385) PGAM2 (ENSPPRG00000009633) ##22 DBNL (ENSPPRG00000016242) URGCP (ENSPPRG00000019392) MRPS24 (ENSPPRG00000019882) lion MODERN SPECIES 2 H2AZ2 (ENSPLOG00000007660) ENSPLOG00000007614 ZMIZ2 (ENSPLOG00000007381) OGDH (ENSPLOG00000007164) TMED4 (ENSPLOG00000007034) DDX56 (ENSPLOG00000006977) NPC1L1 (ENSPLOG00000006816) NUDCD3 (ENSPLOG00000006720) CAMK2B (ENSPLOG00000005761) YKT6 (ENSPLOG00000005393) GCK (ENSPLOG00000005357) MYL7 (ENSPLOG00000005336) POLD2 (ENSPLOG00000005310) AEBP1 (ENSPLOG00000005280) POLM (ENSPLOG00000005263) PGAM2 (ENSPLOG00000005255) ##22 DBNL (ENSPLOG00000005208) URGCP (ENSPLOG00000005169) MRPS24 (ENSPLOG00000005156) ALDH1L1 (ENSPLOG00000004392) KLF15 (ENSPLOG00000004355) CFAP100 (ENSPLOG00000004337) ZXDC (ENSPLOG00000004315) UROC1 (ENSPLOG00000004294) CHST13 (ENSPLOG00000004278) C3orf22 (ENSPLOG00000004263) TXNRD3 (ENSPLOG00000004215) CHCHD6 (ENSPLOG00000004177) PLXNA1 (ENSPLOG00000004165) TPRA1 (ENSPLOG00000004134) MCM2 (ENSPLOG00000004115) Tiger MODERN SPECIES 24 CCM2 (ENSPTIG00000016795) MYO1G (ENSPTIG00000020405) H2AZ2 (ENSPTIG00000020941) ENSPTIG00000021058 OGDH (ENSPTIG00000011836) TMED4 (ENSPTIG00000019158) DDX56 (ENSPTIG00000019500) ENSPTIG00000020252 NUDCD3 (ENSPTIG00000020534) CAMK2B (ENSPTIG00000003495) YKT6 (ENSPTIG00000012852) GCK (ENSPTIG00000013711) MYL7 (ENSPTIG00000016950) POLD2 (ENSPTIG00000018542) POLM (ENSPTIG00000020448) PGAM2 (ENSPTIG00000020599) ##22 DBNL (ENSPTIG00000021038) URGCP (ENSPTIG00000003252) MRPS24 (ENSPTIG00000005496) Cat MODERN SPECIES 1 PURB (ENSFCAG00000039247) H2AZ2 (ENSFCAG00000010271) PPIA (ENSFCAG00000009159) ZMIZ2 (ENSFCAG00000010268) OGDH (ENSFCAG00000010264) TMED4 (ENSFCAG00000010263) NPC1L1 (ENSFCAG00000010256) NUDCD3 (ENSFCAG00000010253) CAMK2B (ENSFCAG00000019129) YKT6 (ENSFCAG00000014362) GCK (ENSFCAG00000014361) MYL7 (ENSFCAG00000014360) POLD2 (ENSFCAG00000014359) AEBP1 (ENSFCAG00000014358) POLM (ENSFCAG00000029004) PGAM2 (ENSFCAG00000023275) ##22 DBNL (ENSFCAG00000014355) URGCP (ENSFCAG00000031416) MRPS24 (ENSFCAG00000027947) ENSFCAG00000001776 KLF15 (ENSFCAG00000015732) CFAP100 (ENSFCAG00000015734) ZXDC (ENSFCAG00000015744) UROC1 (ENSFCAG00000015746) CHST13 (ENSFCAG00000032669) ENSFCAG00000049526 TXNRD3 (ENSFCAG00000000974) PLXNA1 (ENSFCAG00000000976) MCM2 (ENSFCAG00000013550) TPRA1 (ENSFCAG00000028259) ABTB1 (ENSFCAG00000013553) Caniformia ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00900000140979.b ENSGT00950000183087.A.a.a.a.b.b ENSGT01030000234539.b.b.a ENSGT00950000183125.b.a.a ENSGT00940000159012 ENSGT00550000074946 ENSGT00940000159904 ENSGT00940000158444 ENSGT00940000158973.b ENSGT00390000015164 ENSGT00950000182787.E.d.e.b ENSGT00940000161682 ENSGT00390000006780 ENSGT00940000158323 ENSGT00940000158490 ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000156732 ENSGT00940000154390.A.j ENSGT00390000011179 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00900000140979.b ENSGT00950000183087.A.a.a.a.b.b ENSGT01030000234539.b.b.a ENSGT00950000183125.b.a.a ENSGT00940000159012 ENSGT00550000074946 ENSGT00940000159904 ENSGT00940000158444 ENSGT00940000158973.b ENSGT00390000015164 ENSGT00950000182787.E.d.e.b ENSGT00940000161682 ENSGT00390000006780 ENSGT00940000158323 ENSGT00940000158490 ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000156732 ENSGT00940000154390.A.j ENSGT00390000011179.y Ursidae ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00900000140979.b ENSGT00950000183087.A.a.a.a.b.b ENSGT01030000234539.b.b.a ENSGT00950000183125.b.a.a ENSGT00940000159012.x ENSGT00550000074946 ENSGT00940000159904 ENSGT00940000158444 ENSGT00940000158973.b ENSGT00390000015164 ENSGT00950000182787.E.d.e.b ENSGT00940000161682 ENSGT00390000006780 ENSGT00940000158323 ENSGT00940000158490 ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000156732 ENSGT00940000154390.A.j ENSGT00390000011179.y.b ENSGT00390000011179.y.a ENSGT00390000011072 ENSGT00440000033985 ENSGT00940000154014.a ENSGT00940000158294 ENSGT00390000014996 ENSGT00550000074870.b.eb ENSGT00390000014722 ENSGT00940000155925 ENSGT00940000157116 ENSGT00940000157866 ENSGT00390000002582 Ursus ANCESTRAL SPECIES 47 ENSGT00900000140979.b ENSGT00950000183087.A.a.a.a.b.b ENSGT01030000234539.b.b.a ENSGT00950000183125.b.a.a ENSGT00940000159012.x ENSGT00550000074946 ENSGT00940000159904 ENSGT00940000158444 ENSGT00940000158973.b ENSGT00390000015164 ENSGT00950000182787.E.d.e.b ENSGT00940000161682 ENSGT00390000006780 ENSGT00940000158323 ENSGT00940000158490 ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000156732 ENSGT00940000154390.A.j ENSGT00390000011179.y.b ENSGT00390000011179.y.a ENSGT00390000011072 ENSGT00440000033985 ENSGT00940000154014.a ENSGT00940000158294 ENSGT00390000014996 ENSGT00550000074870.b.eb ENSGT00390000014722 ENSGT00940000155925 ENSGT00940000157116 ENSGT00940000157866 ENSGT00390000002582 American black bear MODERN SPECIES 322 CAMK2B (ENSUAMG00000005274) YKT6 (ENSUAMG00000004717) GCK (ENSUAMG00000004714) MYL7 (ENSUAMG00000004709) POLD2 (ENSUAMG00000004707) AEBP1 (ENSUAMG00000004703) ENSUAMG00000004700 ENSUAMG00000004699 PGAM2 (ENSUAMG00000004693) ##22 DBNL (ENSUAMG00000004505) URGCP (ENSUAMG00000004490) ENSUAMG00000004487 Polar bear MODERN SPECIES 254 TBRG4 (ENSUMAG00000009532) ENSUMAG00000009538 MYO1G (ENSUMAG00000009562) H2AZ2 (ENSUMAG00000009609) ENSUMAG00000009616 OGDH (ENSUMAG00000009648) TMED4 (ENSUMAG00000009661) DDX56 (ENSUMAG00000009666) NPC1L1 (ENSUMAG00000009683) ENSUMAG00000009696 ENSUMAG00000009707 ENSUMAG00000009711 YKT6 (ENSUMAG00000009731) MYL7 (ENSUMAG00000009737) ENSUMAG00000009769 PGAM2 (ENSUMAG00000009777) ##22 ENSUMAG00000009798 ENSUMAG00000009803 ENSUMAG00000009809 BLVRA (ENSUMAG00000009818) COA1 (ENSUMAG00000009824) STK17A (ENSUMAG00000009828) ENSUMAG00000009834 ENSUMAG00000009845 MRPL32 (ENSUMAG00000009855) PSMA2 (ENSUMAG00000009859) C7orf25 (ENSUMAG00000009863) ENSUMAG00000009879 INHBA (ENSUMAG00000009886) SUGCT (ENSUMAG00000009910) MPLKIP (ENSUMAG00000009927) Giant Panda MODERN SPECIES PURB (ENSAMEG00000030637) ENSAMEG00000017799 ENSAMEG00000017784 ZMIZ2 (ENSAMEG00000017768) OGDH (ENSAMEG00000017730) TMED4 (ENSAMEG00000017721) DDX56 (ENSAMEG00000017711) NPC1L1 (ENSAMEG00000017673) NUDCD3 (ENSAMEG00000017668) CAMK2B (ENSAMEG00000017625) YKT6 (ENSAMEG00000017618) GCK (ENSAMEG00000017601) MYL7 (ENSAMEG00000017578) POLD2 (ENSAMEG00000017560) POLM (ENSAMEG00000017526) ENSAMEG00000017522 ##22 ENSAMEG00000017502 ENSAMEG00000028932 ENSAMEG00000024440 EIF2A (ENSAMEG00000010505) SELENOT (ENSAMEG00000008718) ERICH6 (ENSAMEG00000008727) SIAH2 (ENSAMEG00000008730) MINDY4B (ENSAMEG00000008742) CLRN1 (ENSAMEG00000008747) GPR171 (ENSAMEG00000019039) P2RY14 (ENSAMEG00000019052) GPR87 (ENSAMEG00000008852) P2RY13 (ENSAMEG00000019079) P2RY12 (ENSAMEG00000019091) ENSAMEG00000008749 Mustelinae ANCESTRAL SPECIES 85 ENSGT00900000140979.a.b ENSGT00950000183087.A.b.b ENSGT01030000234539.b.b.a ENSGT00950000183125.b.a.a ENSGT00940000159012 ENSGT00550000074946 ENSGT00940000159904 ENSGT00940000158444 ENSGT00940000158973.b ENSGT00390000015164 ENSGT00950000182787.E.d.e.b ENSGT00940000161682 ENSGT00390000006780 ENSGT00940000158323 ENSGT00940000158490 ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000156732 ENSGT00940000154390.A.j ENSGT00390000011179.y ENSGT00910000144359 ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.a Ferret MODERN SPECIES 165 OGDH (ENSMPUG00000018194) TMED4 (ENSMPUG00000018195) DDX56 (ENSMPUG00000018196) NPC1L1 (ENSMPUG00000018197) NUDCD3 (ENSMPUG00000018198) CAMK2B (ENSMPUG00000018199) ENSMPUG00000018391 ENSMPUG00000018200 GCK (ENSMPUG00000018201) MYL7 (ENSMPUG00000018202) ENSMPUG00000018203 AEBP1 (ENSMPUG00000018204) ENSMPUG00000018205 POLM (ENSMPUG00000018206) ENSMPUG00000018392 PGAM2 (ENSMPUG00000018207) ##22 DBNL (ENSMPUG00000018208) URGCP (ENSMPUG00000018209) ENSMPUG00000018210 OR2I1P (ENSMPUG00000018393) ENSMPUG00000018211 ENSMPUG00000018212 ENSMPUG00000018213 ENSMPUG00000018214 ENSMPUG00000018215 ENSMPUG00000018216 ENSMPUG00000018217 ENSMPUG00000018218 ENSMPUG00000018219 ENSMPUG00000018220 ENSMPUG00000018221 American mink MODERN SPECIES 245 ENSNVIG00000021873 ZMIZ2 (ENSNVIG00000021773) OGDH (ENSNVIG00000021703) TMED4 (ENSNVIG00000021686) DDX56 (ENSNVIG00000021632) ENSNVIG00000021611 ENSNVIG00000021585 NUDCD3 (ENSNVIG00000021579) CAMK2B (ENSNVIG00000021221) YKT6 (ENSNVIG00000021168) GCK (ENSNVIG00000021119) MYL7 (ENSNVIG00000021107) POLD2 (ENSNVIG00000021087) AEBP1 (ENSNVIG00000021021) POLM (ENSNVIG00000021016) PGAM2 (ENSNVIG00000021011) ##22 DBNL (ENSNVIG00000020945) URGCP (ENSNVIG00000020932) ENSNVIG00000020926 UBD (ENSNVIG00000020921) OR2I1P (ENSNVIG00000020908) Canidae ANCESTRAL SPECIES 69 ENSGT00900000140979.a.a.ab ENSGT00950000183087.A.a.a.b.p.b ENSGT01030000234539.b.b.a ENSGT00950000183125.b.a.a ENSGT00940000159012 ENSGT00550000074946 ENSGT00940000159904 ENSGT00940000158444 ENSGT00940000158973.b ENSGT00390000015164 ENSGT00950000182787.E.d.e.b ENSGT00940000161682 ENSGT00390000006780 ENSGT00940000158323 ENSGT00940000158490 ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000156732 ENSGT00940000154390.A.j ENSGT00390000011179 Red fox MODERN SPECIES 274 ENSVVUG00000011986 ENSVVUG00000011981 ZMIZ2 (ENSVVUG00000011961) OGDH (ENSVVUG00000011930) TMED4 (ENSVVUG00000011912) DDX56 (ENSVVUG00000011905) NPC1L1 (ENSVVUG00000011887) NUDCD3 (ENSVVUG00000011881) CAMK2B (ENSVVUG00000008671) YKT6 (ENSVVUG00000008511) GCK (ENSVVUG00000008505) MYL7 (ENSVVUG00000008494) POLD2 (ENSVVUG00000008484) AEBP1 (ENSVVUG00000008470) POLM (ENSVVUG00000008318) PGAM2 (ENSVVUG00000008295) ##22 DBNL (ENSVVUG00000008287) URGCP (ENSVVUG00000008277) ENSVVUG00000008273 ENSVVUG00000008267 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 52 ENSGT00900000140979.a.a.ab ENSGT00950000183087.A.a.a.a.b.b ENSGT01030000234539.b.b.a ENSGT00950000183125.b.a.a ENSGT00940000159012 ENSGT00550000074946 ENSGT00940000159904 ENSGT00940000158444 ENSGT00940000158973.b ENSGT00390000015164 ENSGT00950000182787.E.d.e.b ENSGT00940000161682 ENSGT00390000006780 ENSGT00940000158323 ENSGT00940000158490 ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000156732 ENSGT00940000154390.A.j ENSGT00390000011179 ENSGT00390000010128.p.a.b.b Dingo MODERN SPECIES 319 ENSCAFG00020019735 ENSCAFG00020019732 ZMIZ2 (ENSCAFG00020019721) OGDH (ENSCAFG00020019711) TMED4 (ENSCAFG00020019707) DDX56 (ENSCAFG00020019695) NPC1L1 (ENSCAFG00020019646) NUDCD3 (ENSCAFG00020019639) CAMK2B (ENSCAFG00020016629) YKT6 (ENSCAFG00020016566) GCK (ENSCAFG00020016524) MYL7 (ENSCAFG00020016519) POLD2 (ENSCAFG00020016514) AEBP1 (ENSCAFG00020016512) POLM (ENSCAFG00020016508) PGAM2 (ENSCAFG00020016505) ##22 DBNL (ENSCAFG00020016499) URGCP (ENSCAFG00020016495) MRPS24 (ENSCAFG00020016492) ENSCAFG00020016487 Dog MODERN SPECIES 7 H2AFV (ENSCAFG00845011363) RPL37 (ENSCAFG00845011502) PPIA (ENSCAFG00845011538) ZMIZ2 (ENSCAFG00845011634) OGDH (ENSCAFG00845012087) TMED4 (ENSCAFG00845012302) NPC1L1 (ENSCAFG00845012489) NUDCD3 (ENSCAFG00845012602) CAMK2B (ENSCAFG00845012770) YKT6 (ENSCAFG00845013042) GCK (ENSCAFG00845013118) MYL7 (ENSCAFG00845005721) POLD2 (ENSCAFG00845005836) AEBP1 (ENSCAFG00845005991) POLM (ENSCAFG00845006272) PGAM2 (ENSCAFG00845006374) ##22 DBNL (ENSCAFG00845006509) URGCP (ENSCAFG00845006768) ENSCAFG00845006854 ENSCAFG00845006945 ENSCAFG00845007156 ENSCAFG00845007400 ENSCAFG00845007653 ENSCAFG00845007944 ZNF425 (ENSCAFG00845007981) ZNF398 (ENSCAFG00845008073) ZNF282 (ENSCAFG00845008180) ZNF783 (ENSCAFG00845008245) ZNF777 (ENSCAFG00845008339) ZNF746 (ENSCAFG00845008380) KRBA1 (ENSCAFG00845008456) Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00900000140979.a.b ENSGT00950000183087.A.a.b.b.g ENSGT01030000234539.b.b.a ENSGT00950000183125.b.a.a ENSGT00940000159012 ENSGT00550000074946 ENSGT00940000159904 ENSGT00940000158444 ENSGT00940000158973.b ENSGT00390000015164 ENSGT00950000182787.E.d.e.b ENSGT00940000161682 ENSGT00390000006780 ENSGT00940000158323 ENSGT00940000158490 ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000156732 ENSGT00940000160915 ENSGT00940000154390.A.j ENSGT00390000011179 ENSGT00390000011072 ENSGT00440000033985 ENSGT00940000154014.a ENSGT00900000143452 ENSGT00940000158294 ENSGT00390000014996 ENSGT00550000074870.b ENSGT00390000014722 ENSGT00960000190657 ENSGT00940000155925 ENSGT00940000157116 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00900000140979.a.b ENSGT00950000183087.A.a.b.b.g ENSGT01030000234539.b.b.a ENSGT00950000183125.b.a.a ENSGT00940000159012 ENSGT00550000074946 ENSGT00940000159904 ENSGT00940000158444 ENSGT00940000158973.b ENSGT00390000015164 ENSGT00950000182787.E.d.e.b ENSGT00940000161682 ENSGT00390000006780 ENSGT00940000158323 ENSGT00940000158490 ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000156732 ENSGT00940000160915 ENSGT00940000154390.A.j ENSGT00390000011179 ENSGT00390000011072 ENSGT00440000033985 ENSGT00940000154014.a ENSGT00940000158294 ENSGT00390000014996 ENSGT00550000074870.b ENSGT00390000014722 ENSGT00940000155925 ENSGT00940000157116 ENSGT00940000157866 ENSGT00390000002582 Tree shrew MODERN SPECIES 4923 MYL7 (ENSTBEG00000006959) AEBP1 (ENSTBEG00000005763) ENSTBEG00000005043 PGAM2 (ENSTBEG00000004587) ##22 DBNL (ENSTBEG00000004139) UBE2D4 (ENSTBEG00000003691) Glires ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00900000140979.a.b ENSGT00950000183087.A.a.b.b.g ENSGT01030000234539.b.b.a ENSGT00950000183125.b.a.a ENSGT00940000159012 ENSGT00550000074946 ENSGT00940000159904 ENSGT00940000158444 ENSGT00940000158973.b ENSGT00390000015164 ENSGT00950000182787.E.d.e.b ENSGT00940000161682 ENSGT00390000006780 ENSGT00940000158323 ENSGT00940000158490 ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000156732 ENSGT00940000160915 ENSGT00940000154390.A.j ENSGT00390000011179 ENSGT00390000011072 ENSGT00440000033985 ENSGT00940000154014.a ENSGT00940000158294 ENSGT00390000014996 ENSGT00550000074870.b ENSGT00390000014722 ENSGT00940000155925 ENSGT00940000157116 ENSGT00940000157866 ENSGT00390000002582 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES 146 ENSGT00390000016168.a ENSGT00940000158053 ENSGT00900000140979.a.b ENSGT00950000183087.A.a.a.b ENSGT01030000234539.b.b.a ENSGT00950000183125.b.a.a ENSGT00940000159012 ENSGT00550000074946 ENSGT00940000159904 ENSGT00940000158444 ENSGT00940000158973.b ENSGT00390000015164 ENSGT00390000006780 ENSGT00940000158323 ENSGT00940000158490 ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000156732 ENSGT00940000154390.A.j ENSGT00390000011179 Rabbit MODERN SPECIES 1 ENSOCUG00000008133 ENSOCUG00000016662 ZMIZ2 (ENSOCUG00000022046) OGDH (ENSOCUG00000002419) TMED4 (ENSOCUG00000003964) DDX56 (ENSOCUG00000022918) NPC1L1 (ENSOCUG00000023032) ENSOCUG00000023828 ENSOCUG00000021803 ENSOCUG00000002981 ENSOCUG00000001018 ENSOCUG00000036640 AEBP1 (ENSOCUG00000014914) POLD2 (ENSOCUG00000014942) POLM (ENSOCUG00000022428) PGAM2 (ENSOCUG00000027853) ##22 ENSOCUG00000027855 ENSOCUG00000031138 ENSOCUG00000010530 ENSOCUG00000021755 ENSOCUG00000033651 SEMA3A (ENSOCUG00000011919) SEMA3D (ENSOCUG00000012016) GRM3 (ENSOCUG00000007359) ELAPOR2 (ENSOCUG00000007364) DMTF1 (ENSOCUG00000009179) TMEM243 (ENSOCUG00000009187) CROT (ENSOCUG00000010544) ABCB1 (ENSOCUG00000014981) ENSOCUG00000036400 SLC25A40 (ENSOCUG00000015008) Rodentia ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00950000183087.A.a.b.b.g ENSGT01030000234539.b.b.a ENSGT00950000183125.b.a.a ENSGT00940000159012 ENSGT00550000074946 ENSGT00940000159904 ENSGT00860000135606 ENSGT00940000158444 ENSGT00940000158973.b ENSGT00390000015164 ENSGT00950000182787.E.d.e.b ENSGT00940000161682 ENSGT00390000006780 ENSGT00940000158323 ENSGT00940000158490 ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000156732 ENSGT00940000160915 ENSGT00940000154390.A.j ENSGT00390000011179 ENSGT00390000011072 ENSGT00440000033985 ENSGT00940000154014.a ENSGT00940000158294 ENSGT00390000014996 ENSGT00550000074870.b ENSGT00390000014722 ENSGT00940000155925 ENSGT00940000157116 ENSGT00940000157866 ENSGT00390000002582 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00950000183087.A.a.b.a ENSGT01030000234539.b.b.a ENSGT00950000183125.b.a.a ENSGT00940000159012 ENSGT00550000074946 ENSGT00940000159904 ENSGT00860000135606 ENSGT00940000158444 ENSGT00940000158973.b ENSGT00390000015164 ENSGT00950000182787.E.d.e.b ENSGT00940000161682 ENSGT00390000006780 ENSGT00940000158323 ENSGT00940000158490 ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000156732 ENSGT00940000160915 ENSGT00940000154390.A.j ENSGT00390000011179 ENSGT00390000011072 ENSGT00440000033985 ENSGT00940000154014.a ENSGT00940000158294 ENSGT00390000014996 ENSGT00550000074870.b ENSGT00390000014722 ENSGT00940000155925 ENSGT00940000157116 ENSGT00940000157866 ENSGT00390000002582 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00950000183087.A.a.b.a ENSGT01030000234539.b.b.a ENSGT00950000183125.b.a.a ENSGT00940000159012.s ENSGT00550000074946 ENSGT00940000159904 ENSGT00860000135606 ENSGT00940000158444 ENSGT00940000158973.b ENSGT00390000015164 ENSGT00950000182787.E.d.e.b ENSGT00940000161682 ENSGT00390000006780 ENSGT00940000158323 ENSGT00940000158490 ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000156732 ENSGT00940000160915 ENSGT00940000154390.A.j ENSGT00390000011179 ENSGT00390000011072 ENSGT00440000033985 ENSGT00940000154014.a ENSGT00940000158294 ENSGT00390000014996 ENSGT00550000074870.b ENSGT00390000014722 ENSGT00940000155925 ENSGT00940000157116 ENSGT00940000157866 ENSGT00390000002582 Marmotini ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00950000183087.B ENSGT01030000234539.b.b.a ENSGT00950000183125.b.a.a ENSGT00940000159012.s ENSGT00550000074946 ENSGT00940000159904 ENSGT00860000135606 ENSGT00940000158444 ENSGT00940000158973.b ENSGT00390000015164 ENSGT00950000182787.E.d.e.b ENSGT00940000161682 ENSGT00390000006780 ENSGT00940000158323 ENSGT00940000158490 ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000156732 ENSGT00940000160915 ENSGT00940000154390.A.j ENSGT00390000011179 ENSGT00940000153505.a.a.c.a ENSGT00390000011072 ENSGT00960000189879 ENSGT00940000154014.a ENSGT00940000158294 ENSGT00390000014996 ENSGT00550000074870.b ENSGT00390000014722 ENSGT00940000155925 ENSGT00940000157116 ENSGT00940000157866 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00950000183087.A.a.b.a ENSGT01030000234539.b.b.a ENSGT00950000183125.b.a.a ENSGT00940000159012.s ENSGT00550000074946 ENSGT00940000159904 ENSGT00860000135606 ENSGT00940000158444 ENSGT00940000158973.b ENSGT00390000015164 ENSGT00950000182787.E.d.e.b ENSGT00940000161682 ENSGT00390000006780 ENSGT00940000158323 ENSGT00940000158490 ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000156732 ENSGT00940000160915 ENSGT00940000154390.A.j ENSGT00390000011179 ENSGT00940000153505.a.a.c.a ENSGT00390000011072 ENSGT00960000189879 ENSGT00940000154014.a ENSGT00940000158294 ENSGT00390000014996 ENSGT00550000074870.b ENSGT00390000014722 ENSGT00940000155925 ENSGT00940000157116 ENSGT00940000157866 Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 214 ENSUPAG00010022046 ENSUPAG00010022045 ZMIZ2 (ENSUPAG00010022033) OGDH (ENSUPAG00010021984) TMED4 (ENSUPAG00010021975) DDX56 (ENSUPAG00010021974) NPC1L1 (ENSUPAG00010021963) NUDCD3 (ENSUPAG00010021958) CAMK2B (ENSUPAG00010021102) YKT6 (ENSUPAG00010021076) GCK (ENSUPAG00010021047) MYL7 (ENSUPAG00010021036) POLD2 (ENSUPAG00010021026) AEBP1 (ENSUPAG00010020977) POLM (ENSUPAG00010020954) PGAM2 (ENSUPAG00010020948) ##22 DBNL (ENSUPAG00010020898) Squirrel MODERN SPECIES 78 ENSSTOG00000010215 ZMIZ2 (ENSSTOG00000010197) OGDH (ENSSTOG00000000469) TMED4 (ENSSTOG00000014658) DDX56 (ENSSTOG00000000464) NPC1L1 (ENSSTOG00000020879) ENSSTOG00000031145 NUDCD3 (ENSSTOG00000000456) CAMK2B (ENSSTOG00000000450) YKT6 (ENSSTOG00000000448) GCK (ENSSTOG00000002740) MYL7 (ENSSTOG00000002725) POLD2 (ENSSTOG00000002713) AEBP1 (ENSSTOG00000002677) POLM (ENSSTOG00000002662) PGAM2 (ENSSTOG00000008573) ##22 DBNL (ENSSTOG00000002644) UBE2D4 (ENSSTOG00000002630) URGCP (ENSSTOG00000010637) MRPS24 (ENSSTOG00000032907) BLVRA (ENSSTOG00000021499) STK17A (ENSSTOG00000026139) HECW1 (ENSSTOG00000016043) MRPL32 (ENSSTOG00000013340) PSMA2 (ENSSTOG00000013334) C7orf25 (ENSSTOG00000027844) GLI3 (ENSSTOG00000020844) ENSSTOG00000034121 SUGCT (ENSSTOG00000011998) MPLKIP (ENSSTOG00000026468) CDK13 (ENSSTOG00000022568) Alpin marmot MODERN SPECIES 26 ENSMMMG00000014677 ENSMMMG00000014669 ZMIZ2 (ENSMMMG00000014533) OGDH (ENSMMMG00000014266) ENSMMMG00000014248 DDX56 (ENSMMMG00000014226) NPC1L1 (ENSMMMG00000014118) NUDCD3 (ENSMMMG00000014107) CAMK2B (ENSMMMG00000012507) YKT6 (ENSMMMG00000012487) GCK (ENSMMMG00000012459) MYL7 (ENSMMMG00000012448) POLD2 (ENSMMMG00000012436) ENSMMMG00000012394 POLM (ENSMMMG00000012375) PGAM2 (ENSMMMG00000012371) ##22 DBNL (ENSMMMG00000012313) ENSMMMG00000012291 URGCP (ENSMMMG00000012282) MRPS24 (ENSMMMG00000012279) ENSMMMG00000012270 BLVRA (ENSMMMG00000012252) ENSMMMG00000012217 STK17A (ENSMMMG00000012208) ENSMMMG00000012200 HECW1 (ENSMMMG00000012160) ENSMMMG00000012152 MRPL32 (ENSMMMG00000012145) PSMA2 (ENSMMMG00000012134) C7orf25 (ENSMMMG00000012127) ENSMMMG00000012115 Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 17 ENSSVLG00005009853 ZMIZ2 (ENSSVLG00005009754) ENSSVLG00005009696 OGDH (ENSSVLG00005009410) ENSSVLG00005009279 DDX56 (ENSSVLG00005009218) NPC1L1 (ENSSVLG00005008888) NUDCD3 (ENSSVLG00005008781) CAMK2B (ENSSVLG00005007607) ENSSVLG00005007143 GCK (ENSSVLG00005006971) MYL7 (ENSSVLG00005006900) POLD2 (ENSSVLG00005006846) AEBP1 (ENSSVLG00005006770) POLM (ENSSVLG00005006728) PGAM2 (ENSSVLG00005006699) ##22 DBNL (ENSSVLG00005006493) UBE2D4 (ENSSVLG00005006358) ENSSVLG00005006336 URGCP (ENSSVLG00005006226) MRPS24 (ENSSVLG00005006180) ENSSVLG00005006086 BLVRA (ENSSVLG00005006049) COA1 (ENSSVLG00005006028) STK17A (ENSSVLG00005005990) HECW1 (ENSSVLG00005005468) ENSSVLG00005005320 MRPL32 (ENSSVLG00005005303) PSMA2 (ENSSVLG00005005237) C7orf25 (ENSSVLG00005005209) GLI3 (ENSSVLG00005005178) Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00900000140979.a.b.vb ENSGT00950000183087.A.a.b.a ENSGT01030000234539.b.b.a ENSGT00950000183125.b.a.a ENSGT00940000159012 ENSGT00550000074946 ENSGT00940000159904 ENSGT00940000158444 ENSGT00940000158973.b ENSGT00390000015164 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ENSHGLG00000041438 ENSHGLG00000038583 ENSHGLG00000036018 ENSHGLG00000041022 ENSHGLG00000033643 ENSHGLG00000048189 ENSHGLG00000016304 ENSHGLG00000009551 NIPSNAP2 (ENSHGLG00000005574) PSPH (ENSHGLG00000010095) ENSHGLG00000009645 PHKG1 (ENSHGLG00000018933) Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00900000140979.a.b.vb ENSGT00950000183087.A.a.b.a ENSGT01030000234539.b.b.a ENSGT00950000183125.b.a.a ENSGT00940000159012 ENSGT00550000074946 ENSGT00940000159904 ENSGT00940000158444 ENSGT00940000158973.b ENSGT00390000015164 ENSGT00950000182787.E.d.e.b ENSGT00940000161682 ENSGT00390000006780 ENSGT00940000158323 ENSGT00940000158490 ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000156732 ENSGT00940000160915 ENSGT00940000154390.A.j ENSGT00390000011179 ENSGT00940000161752 ENSGT00950000182890.A.a.b.b.b ENSGT00530000064130 ENSGT00950000183018.a.d ENSGT00390000003115 ENSGT00940000154631 ENSGT00940000162897 ENSGT00390000008983.b ENSGT00940000158139 ENSGT00440000038159 ENSGT00530000064242.b Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT00900000140979.a.b.vb ENSGT00950000183087.A.a.b.a ENSGT01030000234539.b.b.a ENSGT00950000183125.b.a.a ENSGT00940000159012 ENSGT00550000074946 ENSGT00940000159904 ENSGT00940000158444 ENSGT00940000158973.b ENSGT00390000015164 ENSGT00950000182787.E.d.e.b ENSGT00940000161682 ENSGT00390000006780 ENSGT00940000158323 ENSGT00940000158490 ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000156732 ENSGT00940000160915 ENSGT00940000154390.A.j ENSGT00390000011179 ENSGT00940000161752 ENSGT00950000182890.A.a.b.b.b ENSGT00530000064130 ENSGT00950000183018.a.d ENSGT00390000003115 ENSGT00940000154631 ENSGT00390000008983.b ENSGT00940000158139 ENSGT00440000038159 ENSGT00530000064242.b ENSGT00940000157044.f Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 163 ENSCLAG00000007031 ENSCLAG00000006301 ZMIZ2 (ENSCLAG00000006368) OGDH (ENSCLAG00000016487) TMED4 (ENSCLAG00000011255) DDX56 (ENSCLAG00000007666) NPC1L1 (ENSCLAG00000008529) NUDCD3 (ENSCLAG00000010110) CAMK2B (ENSCLAG00000006106) YKT6 (ENSCLAG00000014974) GCK (ENSCLAG00000004771) MYL7 (ENSCLAG00000009648) POLD2 (ENSCLAG00000005092) AEBP1 (ENSCLAG00000005509) POLM (ENSCLAG00000007360) PGAM2 (ENSCLAG00000004577) ##22 DBNL (ENSCLAG00000005058) UBE2D4 (ENSCLAG00000005618) URGCP (ENSCLAG00000006286) MRPS24 (ENSCLAG00000004732) ENSCLAG00000004813 SEPTIN14 (ENSCLAG00000005493) ZNF713 (ENSCLAG00000007534) MRPS17 (ENSCLAG00000007650) NIPSNAP2 (ENSCLAG00000008451) PSPH (ENSCLAG00000008790) CCT6A (ENSCLAG00000004434) ENSCLAG00000005667 PHKG1 (ENSCLAG00000005270) CHCHD2 (ENSCLAG00000005594) NUPR2 (ENSCLAG00000005756) Degu MODERN SPECIES 76 ENSODEG00000013307 ENSODEG00000014266 ZMIZ2 (ENSODEG00000013173) OGDH (ENSODEG00000013491) TMED4 (ENSODEG00000013873) DDX56 (ENSODEG00000014807) NPC1L1 (ENSODEG00000014236) NUDCD3 (ENSODEG00000014835) CAMK2B (ENSODEG00000014782) ENSODEG00000014119 GCK (ENSODEG00000014198) MYL7 (ENSODEG00000014034) POLD2 (ENSODEG00000014406) AEBP1 (ENSODEG00000015327) POLM (ENSODEG00000015087) PGAM2 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NIPSNAP2 (ENSCPOG00000004556) PSPH (ENSCPOG00000039209) CCT6A (ENSCPOG00000006992) SUMF2 (ENSCPOG00000006993) PHKG1 (ENSCPOG00000000387) CHCHD2 (ENSCPOG00000012413) NUPR2 (ENSCPOG00000036999) VKORC1L1 (ENSCPOG00000040223) GUSB (ENSCPOG00000004691) Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES 40 ENSGT00950000183087.A.a.b.b.g ENSGT01030000234539.b.b.a ENSGT00950000183125.b.a.a ENSGT00940000159012 ENSGT00550000074946 ENSGT00940000159904 ENSGT00860000135606 ENSGT00940000158444 ENSGT00940000158973.b ENSGT00390000015164 ENSGT00950000182787.E.d.e.b ENSGT00940000161682 ENSGT00390000006780 ENSGT00940000158323 ENSGT00940000158490 ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000156732 ENSGT00940000160915 ENSGT00940000154390.A.j ENSGT00390000011179 Kangaroo rat MODERN SPECIES 479 Myo1g (ENSDORG00000008897) ENSDORG00000000793 Zmiz2 (ENSDORG00000003702) Ogdh (ENSDORG00000014528) Tmed4 (ENSDORG00000025102) ENSDORG00000026173 Npc1l1 (ENSDORG00000004156) Nudcd3 (ENSDORG00000024793) Camk2b (ENSDORG00000016394) Ykt6 (ENSDORG00000016393) Gck (ENSDORG00000016392) Myl7 (ENSDORG00000016391) Pold2 (ENSDORG00000005386) Aebp1 (ENSDORG00000005385) Polm (ENSDORG00000006893) Pgam2 (ENSDORG00000024532) ##22 Dbnl (ENSDORG00000006890) Urgcp (ENSDORG00000009971) Mrps24 (ENSDORG00000028469) Myomorpha ANCESTRAL SPECIES 50 ENSGT00950000183087.A.a.b.b.g ENSGT01030000234539.b.b.a ENSGT00950000183125.b.a.a ENSGT00940000159012 ENSGT00550000074946 ENSGT00940000159904 ENSGT00860000135606 ENSGT00940000158444 ENSGT00940000158973.b ENSGT00390000015164 ENSGT00950000182787.E.d.e.b ENSGT00940000161682 ENSGT00390000006780 ENSGT00940000158323 ENSGT00940000158490 ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000156732 ENSGT00940000160915 ENSGT00940000154390.A.j ENSGT00390000011179 Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 49 ENSJJAG00000012094 ENSJJAG00000015423 Zmiz2 (ENSJJAG00000023115) Ogdh (ENSJJAG00000007589) Tmed4 (ENSJJAG00000005100) Ddx56 (ENSJJAG00000014269) Npc1l1 (ENSJJAG00000019937) Nudcd3 (ENSJJAG00000024120) Camk2b (ENSJJAG00000012313) ENSJJAG00000024358 Gck (ENSJJAG00000020695) Myl7 (ENSJJAG00000023280) Pold2 (ENSJJAG00000013260) Aebp1 (ENSJJAG00000006815) Polm (ENSJJAG00000005659) Pgam2 (ENSJJAG00000006198) ##22 Dbnl (ENSJJAG00000019824) ENSJJAG00000013146 ENSJJAG00000016812 Mrps24 (ENSJJAG00000011276) Smg1 (ENSJJAG00000018008) ENSJJAG00000017362 ENSJJAG00000021154 Bmper (ENSJJAG00000009850) Bbs9 (ENSJJAG00000003244) Phtf2 (ENSJJAG00000007015) ENSJJAG00000012291 Rsbn1l (ENSJJAG00000017941) Ptpn12 (ENSJJAG00000023092) ENSJJAG00000004035 ENSJJAG00000009895 Muroidea ANCESTRAL SPECIES 39 ENSGT00950000183087.A.a.b.b.g ENSGT01030000234539.b.b.a ENSGT00950000183125.b.a.a ENSGT00940000159012 ENSGT00550000074946 ENSGT00940000159904 ENSGT00860000135606 ENSGT00940000158444 ENSGT00940000158973.b ENSGT00390000015164 ENSGT00950000182787.E.d.e.b ENSGT00940000161682 ENSGT00390000006780 ENSGT00940000158323 ENSGT00940000158490 ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000156732 ENSGT00940000160915 ENSGT00940000154390.A.j ENSGT00390000011179 ENSGT00940000153661.a.b.a.a.a.b ENSGT00390000005772 ENSGT00390000017751 ENSGT00940000154006.a ENSGT00940000158390 ENSGT00940000161542 ENSGT00390000013711 ENSGT00940000154191.i.b ENSGT00940000154849.b ENSGT00940000162366 ENSGT00940000155991 Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 869 ENSNGAG00000018529 Zmiz2 (ENSNGAG00000021083) Ogdh (ENSNGAG00000022300) ENSNGAG00000013628 Tmed4 (ENSNGAG00000014114) Ddx56 (ENSNGAG00000018785) Npc1l1 (ENSNGAG00000023026) Nudcd3 (ENSNGAG00000001892) Camk2b (ENSNGAG00000024309) Ykt6 (ENSNGAG00000021621) Gck (ENSNGAG00000022694) Myl7 (ENSNGAG00000010256) Pold2 (ENSNGAG00000023318) Aebp1 (ENSNGAG00000021547) Polm (ENSNGAG00000024068) Pgam2 (ENSNGAG00000022542) ##22 Dbnl (ENSNGAG00000001208) ENSNGAG00000021393 Urgcp (ENSNGAG00000020683) Mrps24 (ENSNGAG00000021383) ENSNGAG00000015149 Ccdc117 (ENSNGAG00000012546) ENSNGAG00000016645 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00950000183087.A.a.b.b.g.m.a.a 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Ppia (ENSRNOG00000027864) Zmiz2 (ENSRNOG00000025923) Ogdh (ENSRNOG00000005130) Tmed4 (ENSRNOG00000005016) Ddx56 (ENSRNOG00000004670) Npc1l1 (ENSRNOG00000049955) Nudcd3 (ENSRNOG00000056148) Camk2b (ENSRNOG00000052080) Ykt6 (ENSRNOG00000014785) Gck (ENSRNOG00000061527) Myl7 (ENSRNOG00000014409) Pold2 (ENSRNOG00000014098) Aebp1 (ENSRNOG00000013720) Polm (ENSRNOG00000013647) Pgam2 (ENSRNOG00000013532) ##22 Dbnl (ENSRNOG00000012378) Urgcp (ENSRNOG00000012184) Mrps24 (ENSRNOG00000011979) ENSRNOG00000069799 AC136588.2 (ENSRNOG00000030988) Ankrd36 (ENSRNOG00000056767) Ccdc117 (ENSRNOG00000010706) Xbp1 (ENSRNOG00000010298) Znrf3 (ENSRNOG00000067305) Kremen1 (ENSRNOG00000051487) Emid1 (ENSRNOG00000033575) Rhbdd3 (ENSRNOG00000027032) Ewsr1 (ENSRNOG00000009437) Rasl10a (ENSRNOG00000008951) Gas2l1 (ENSRNOG00000009040) Cricetidae ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00950000183087.A.a.b.b.g.m.a.a.a.b ENSGT01030000234539.b.b.a ENSGT00950000183125.b.a.a ENSGT00940000159012 ENSGT00550000074946 ENSGT00940000159904 ENSGT00860000135606 ENSGT00940000158444 ENSGT00940000158973.b ENSGT00390000015164 ENSGT00950000182787.E.d.e.b ENSGT00940000161682 ENSGT00390000006780 ENSGT00940000158323 ENSGT00940000158490 ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000156732 ENSGT00940000160915 ENSGT00940000154390.A.j ENSGT00390000011179 ENSGT00940000153661.a.b.a.a.a.b ENSGT00390000005772 ENSGT00390000017751 ENSGT00940000154006.a ENSGT00940000158390 ENSGT00940000161542 ENSGT00390000013711 ENSGT00940000154191.i.b ENSGT00940000154849.b ENSGT00940000162366 ENSGT00940000155991 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00950000183087.A.a.b.b.g.m.a.a.a.b ENSGT01030000234539.b.b.a ENSGT00950000183125.b.a.a ENSGT00940000159012 ENSGT00550000074946 ENSGT00940000159904 ENSGT00860000135606 ENSGT00940000158444 ENSGT00940000158973.b ENSGT00390000015164 ENSGT00950000182787.E.d.e.b ENSGT00940000161682 ENSGT00390000006780 ENSGT00940000158323 ENSGT00940000158490 ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000156732 ENSGT00940000160915 ENSGT00940000154390.A.j ENSGT00390000011179 ENSGT00940000153661.a.b.a.a.a.b Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 121 PPIA (ENSCGRG00001013904) Zmiz2 (ENSCGRG00001000371) Ogdh (ENSCGRG00001018679) Tmed4 (ENSCGRG00001020468) Ddx56 (ENSCGRG00001019019) Npc1l1 (ENSCGRG00001005429) ENSCGRG00001023520 Nudcd3 (ENSCGRG00001022901) Camk2b (ENSCGRG00001022679) Ykt6 (ENSCGRG00001017336) Gck (ENSCGRG00001009989) Myl7 (ENSCGRG00001016475) Pold2 (ENSCGRG00001012036) Aebp1 (ENSCGRG00001018686) Polm (ENSCGRG00001014159) Pgam2 (ENSCGRG00001023475) ##22 Dbnl (ENSCGRG00001011369) ENSCGRG00001015643 Urgcp (ENSCGRG00001010492) Mrps24 (ENSCGRG00001009085) ENSCGRG00001004440 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00950000183087.A.a.b.b.g.m.a.a.a.a.b ENSGT01030000234539.b.b.a ENSGT00950000183125.b.a.a ENSGT00940000159012 ENSGT00550000074946 ENSGT00940000159904 ENSGT00860000135606 ENSGT00940000158444 ENSGT00940000158973.b ENSGT00390000015164 ENSGT00950000182787.E.d.e.b ENSGT00940000161682 ENSGT00390000006780 ENSGT00940000158323 ENSGT00940000158490 ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000156732 ENSGT00940000160915 ENSGT00940000154390.A.j ENSGT00390000011179 ENSGT00940000153661.a.b.a.a.a.b ENSGT00390000005772 ENSGT00390000017751 ENSGT00940000154006.a ENSGT00940000158390 ENSGT00940000161542 ENSGT00390000013711 ENSGT00940000154191.i.b ENSGT00940000154849.b ENSGT00940000162366 ENSGT00940000155991 Northern American deer mouse MODERN SPECIES 1 Purb (ENSPEMG00000014786) H2az2 (ENSPEMG00000013226) Zmiz2 (ENSPEMG00000010648) Ogdh (ENSPEMG00000001741) ENSPEMG00000030252 Tmed4 (ENSPEMG00000004413) Ddx56 (ENSPEMG00000018351) Npc1l1 (ENSPEMG00000014976) Nudcd3 (ENSPEMG00000014178) Camk2b (ENSPEMG00000000806) Ykt6 (ENSPEMG00000012487) Gck (ENSPEMG00000001040) Myl7 (ENSPEMG00000003767) Pold2 (ENSPEMG00000016023) Polm (ENSPEMG00000013953) Pgam2 (ENSPEMG00000016914) ##22 Dbnl (ENSPEMG00000002008) ENSPEMG00000010442 Urgcp (ENSPEMG00000018952) Mrps24 (ENSPEMG00000012062) ENSPEMG00000028247 ENSPEMG00000017379 ENSPEMG00000024821 ENSPEMG00000029702 Znrf3 (ENSPEMG00000005713) Kremen1 (ENSPEMG00000013999) Emid1 (ENSPEMG00000005971) Rhbdd3 (ENSPEMG00000006444) Ewsr1 (ENSPEMG00000018724) Gas2l1 (ENSPEMG00000014176) Rasl10a (ENSPEMG00000000799) Prairie vole MODERN SPECIES 89 ENSMOCG00000019036 Zmiz2 (ENSMOCG00000004069) Ogdh (ENSMOCG00000015048) Tmed4 (ENSMOCG00000018994) Ddx56 (ENSMOCG00000016782) Npc1l1 (ENSMOCG00000022891) ENSMOCG00000010822 Nudcd3 (ENSMOCG00000008685) Camk2b (ENSMOCG00000003054) Ykt6 (ENSMOCG00000015485) Gck (ENSMOCG00000007909) Myl7 (ENSMOCG00000001155) Pold2 (ENSMOCG00000020553) Aebp1 (ENSMOCG00000015924) Polm (ENSMOCG00000017650) Pgam2 (ENSMOCG00000017141) ##22 Dbnl (ENSMOCG00000010776) ENSMOCG00000007622 ENSMOCG00000019147 Mrps24 (ENSMOCG00000009358) ENSMOCG00000001805 Ccdc117 (ENSMOCG00000017474) ENSMOCG00000016607 Znrf3 (ENSMOCG00000007694) Kremen1 (ENSMOCG00000006589) Emid1 (ENSMOCG00000007842) Rhbdd3 (ENSMOCG00000020377) Ewsr1 (ENSMOCG00000013671) Rasl10a (ENSMOCG00000019931) Gas2l1 (ENSMOCG00000013252) Ap1b1 (ENSMOCG00000020166) Primates ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00900000140979.a.b ENSGT00950000183087.A.a.b.b.g ENSGT01030000234539.b.b.a ENSGT00950000183125.b.a.a ENSGT00940000159012 ENSGT00550000074946 ENSGT00940000159904 ENSGT00940000158444 ENSGT00940000158973.b ENSGT00390000015164 ENSGT00950000182787.E.d.e.b ENSGT00940000161682 ENSGT00390000006780 ENSGT00940000158323 ENSGT00940000158490 ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000156732 ENSGT00940000160915 ENSGT00940000154390.A.j ENSGT00390000011179 ENSGT00390000011072 ENSGT00440000033985 ENSGT00940000154014.a ENSGT00900000143452 ENSGT00940000158294 ENSGT00390000014996 ENSGT00550000074870.b ENSGT00390000014722 ENSGT00960000190657 ENSGT00940000155925 ENSGT00940000157116 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00900000140979.a.b ENSGT00950000183087.A.a.b.b.g ENSGT01030000234539.b.b.a ENSGT00950000183125.b.a.a ENSGT00940000159012 ENSGT00550000074946 ENSGT00940000159904 ENSGT00940000158444 ENSGT00940000158973.b ENSGT00390000015164 ENSGT00950000182787.E.d.e.b ENSGT00940000161682 ENSGT00390000006780 ENSGT00940000158323 ENSGT00940000158490 ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000156732 ENSGT00940000160915 ENSGT00940000154390.A.j ENSGT00390000011179 ENSGT00390000011072 ENSGT00440000033985 ENSGT00940000154014.a ENSGT00900000143452 ENSGT00940000158294 ENSGT00390000014996 ENSGT00550000074870.b.nc ENSGT00390000014722 ENSGT00960000190657 ENSGT00940000155925 ENSGT00940000157116 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00900000140979.a.b ENSGT00950000183087.A.a.b.b.g ENSGT01030000234539.b.b.a ENSGT00950000183125.b.a.a ENSGT00940000159012 ENSGT00550000074946 ENSGT00940000159904 ENSGT00940000158444 ENSGT00940000158973.b ENSGT00390000015164.k ENSGT00950000182787.E.d.e.b ENSGT00940000161682 ENSGT00390000006780 ENSGT00940000158323 ENSGT00940000158490 ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000156732 ENSGT00910000147095 ENSGT00940000160915 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ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00900000140979.a.b ENSGT00950000183087.A.a.b.b.g.e.b.b.b ENSGT01030000234539.b.b.a ENSGT00950000183125.b.a.a ENSGT00940000159012 ENSGT00550000074946.e ENSGT00940000159904 ENSGT00940000158444 ENSGT00940000158973.b ENSGT00390000015164.k ENSGT00950000182787.E.d.e.b ENSGT00940000161682 ENSGT00390000006780 ENSGT00940000158323 ENSGT00940000158490 ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000156732 ENSGT00940000160915.e.a ENSGT00940000160915.f ENSGT00940000154390.A.j ENSGT00390000011179 ENSGT00390000011072 ENSGT00440000033985 ENSGT00940000154014.a ENSGT00900000143452 ENSGT00940000158294 ENSGT00390000014996.y ENSGT00550000074870.b.nc ENSGT00390000014722 ENSGT00550000074878.`b.b ENSGT00940000155925 Hominidae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00900000140979.a.b ENSGT00950000183087.A.a.b.b.g.e.b.b.b ENSGT01030000234539.b.b.a ENSGT00950000183125.b.a.a ENSGT00940000159012 ENSGT00550000074946.e ENSGT00940000159904 ENSGT00940000158444 ENSGT00940000158973.b ENSGT00390000015164.k 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ENSGT00390000015164.k ENSGT00950000182787.E.d.e.b ENSGT00940000161682 ENSGT00390000006780 ENSGT00940000158323 ENSGT00940000158490 ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000156732 ENSGT01040000241441 ENSGT00940000155142.i.b ENSGT00940000157852 ENSGT00390000002582 ENSGT00940000157866 ENSGT00940000157116 ENSGT00940000155925 ENSGT00550000074878.`b.b ENSGT00390000014722 ENSGT00550000074870.b.nc ENSGT00390000014996.y ENSGT00940000158294 ENSGT00900000143452 ENSGT00940000154014.a Chimpanzee DUPLICATION Chimpanzee MODERN SPECIES 20 NPC1L1 (ENSPTRG00000019146) ENSPTRG00000052427 NUDCD3 (ENSPTRG00000019144) CAMK2B (ENSPTRG00000051317) YKT6 (ENSPTRG00000019141) GCK (ENSPTRG00000019140) MYL7 (ENSPTRG00000019139) POLD2 (ENSPTRG00000019138) AEBP1 (ENSPTRG00000019137) POLM (ENSPTRG00000048404) ENSPTRG00000043134 ##22 DBNL (ENSPTRG00000019134) POLD2 (ENSPTRG00000046411) ENSPTRG00000052352 POLM (ENSPTRG00000019136) ENSPTRG00000051032 ##22 ENSPTRG00000047759 ENSPTRG00000050290 ENSPTRG00000028448 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ENSPTRG00000050507 ENSPTRG00000034205 CDK13 (ENSPTRG00000019112) Bonobo MODERN SPECIES 20 PPIA (ENSPPAG00000040793) ZMIZ2 (ENSPPAG00000036211) OGDH (ENSPPAG00000040167) TMED4 (ENSPPAG00000034880) DDX56 (ENSPPAG00000029147) NPC1L1 (ENSPPAG00000029235) ENSPPAG00000034668 NUDCD3 (ENSPPAG00000024525) CAMK2B (ENSPPAG00000033180) YKT6 (ENSPPAG00000019726) GCK (ENSPPAG00000030131) MYL7 (ENSPPAG00000038855) POLD2 (ENSPPAG00000029927) AEBP1 (ENSPPAG00000004827) POLM (ENSPPAG00000037663) PGAM2 (ENSPPAG00000033065) ##22 DBNL (ENSPPAG00000031811) ENSPPAG00000036366 RALA (ENSPPAG00000003692) CDK13 (ENSPPAG00000041831) MPLKIP (ENSPPAG00000037056) SUGCT (ENSPPAG00000042639) INHBA (ENSPPAG00000036866) GLI3 (ENSPPAG00000043020) ENSPPAG00000022173 ENSPPAG00000036468 C7orf25 (ENSPPAG00000040042) PSMA2 (ENSPPAG00000036019) MRPL32 (ENSPPAG00000039260) HECW1 (ENSPPAG00000030847) ENSPPAG00000004221 Human MODERN SPECIES 19 H2AZ2 (ENSG00000105968) PPIA (ENSG00000196262) ZMIZ2 (ENSG00000122515) OGDH 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(ENSPPYG00000033846) POLD2 (ENSPPYG00000017597) AEBP1 (ENSPPYG00000030504) ENSPPYG00000017598 PGAM2 (ENSPPYG00000017599) ##22 DBNL (ENSPPYG00000017600) ENSPPYG00000038796 URGCP (ENSPPYG00000017603) MRPS24 (ENSPPYG00000017604) BLVRA (ENSPPYG00000017605) COA1 (ENSPPYG00000017606) STK17A (ENSPPYG00000017607) HECW1 (ENSPPYG00000017608) MRPL32 (ENSPPYG00000017611) PSMA2 (ENSPPYG00000030380) C7orf25 (ENSPPYG00000034147) GLI3 (ENSPPYG00000017613) INHBA (ENSPPYG00000038204) SUGCT (ENSPPYG00000017615) MPLKIP (ENSPPYG00000017617) Gibbon MODERN SPECIES 7 H2AZ2 (ENSNLEG00000004039) PPIA (ENSNLEG00000004024) ZMIZ2 (ENSNLEG00000028725) OGDH (ENSNLEG00000003931) ENSNLEG00000029010 DDX56 (ENSNLEG00000003816) NPC1L1 (ENSNLEG00000003753) NUDCD3 (ENSNLEG00000003732) CAMK2B (ENSNLEG00000003715) YKT6 (ENSNLEG00000003689) GCK (ENSNLEG00000028208) MYL7 (ENSNLEG00000003674) POLD2 (ENSNLEG00000003570) ENSNLEG00000003564 ENSNLEG00000003555 PGAM2 (ENSNLEG00000003550) ##22 DBNL (ENSNLEG00000003395) UBE2D4 (ENSNLEG00000003364) URGCP (ENSNLEG00000003351) ENSNLEG00000026683 MRPS24 (ENSNLEG00000033007) BLVRA (ENSNLEG00000003333) COA1 (ENSNLEG00000003316) STK17A (ENSNLEG00000003304) ENSNLEG00000035608 HECW1 (ENSNLEG00000003209) MRPL32 (ENSNLEG00000027404) PSMA2 (ENSNLEG00000003177) ENSNLEG00000027384 C7orf25 (ENSNLEG00000003174) GLI3 (ENSNLEG00000003160) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00900000140979.a.b ENSGT00950000183087.A.a.b.b.g.e.b.b.b ENSGT01030000234539.b.b.a ENSGT00950000183125.b.a.a ENSGT00940000159012 ENSGT00550000074946 ENSGT00940000159904 ENSGT00940000158444 ENSGT00940000158973.b ENSGT00390000015164.k ENSGT00950000182787.E.d.e.b ENSGT00940000161682 ENSGT00390000006780 ENSGT00940000158323 ENSGT00940000158490 ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000156732 ENSGT00940000160915.e.a ENSGT00910000147095 ENSGT00940000160915.f ENSGT00940000154390.A.j ENSGT00390000011179 ENSGT00390000011072 ENSGT00440000033985 ENSGT00940000154014.a ENSGT00900000143452 ENSGT00940000158294 ENSGT00390000014996.y ENSGT00550000074870.b.nc ENSGT00390000014722 ENSGT00550000074878.`b.b Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00900000140979.a.b ENSGT00950000183087.A.a.b.b.g.e.b.b.b ENSGT01030000234539.b.b.a ENSGT00950000183125.b.a.a ENSGT00940000159012 ENSGT00550000074946 ENSGT00940000159904 ENSGT00940000158444 ENSGT00940000158973.b ENSGT00390000015164.k ENSGT00950000182787.E.d.e.b ENSGT00940000161682 ENSGT00390000006780 ENSGT00940000158323 ENSGT00940000158490 ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000156732 ENSGT00940000160915.e.a ENSGT00910000147095 ENSGT00940000160915.f ENSGT00940000154390.A.j ENSGT00390000011179 ENSGT00390000011072 ENSGT00440000033985 ENSGT00940000154014.a ENSGT00900000143452 ENSGT00940000158294 ENSGT00390000014996.y ENSGT00550000074870.b.nc ENSGT00390000014722 ENSGT00550000074878.`b.b Vervet Monkey MODERN SPECIES 13 H2AZ2 (ENSCSAG00000015697) PPIA (ENSCSAG00000015690) ZMIZ2 (ENSCSAG00000015673) OGDH (ENSCSAG00000015662) TMED4 (ENSCSAG00000015650) DDX56 (ENSCSAG00000015636) NPC1L1 (ENSCSAG00000015627) NUDCD3 (ENSCSAG00000015602) CAMK2B (ENSCSAG00000015599) YKT6 (ENSCSAG00000015593) GCK (ENSCSAG00000015587) MYL7 (ENSCSAG00000015580) POLD2 (ENSCSAG00000015565) AEBP1 (ENSCSAG00000015516) POLM (ENSCSAG00000015486) PGAM2 (ENSCSAG00000015481) ##22 DBNL (ENSCSAG00000015475) UBE2D4 (ENSCSAG00000015467) URGCP (ENSCSAG00000015454) MRPS24 (ENSCSAG00000015447) BLVRA (ENSCSAG00000015441) COA1 (ENSCSAG00000015432) STK17A (ENSCSAG00000015428) HECW1 (ENSCSAG00000015421) ENSCSAG00000015403 PSMA2 (ENSCSAG00000015394) C7orf25 (ENSCSAG00000015390) ENSCSAG00000015385 ENSCSAG00000019599 GLI3 (ENSCSAG00000015361) INHBA (ENSCSAG00000015294) Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00900000140979.a.b ENSGT00950000183087.A.a.b.b.g.e.b.b.b ENSGT01030000234539.b.b.a ENSGT00950000183125.b.a.a ENSGT00940000159012 ENSGT00550000074946 ENSGT00940000159904 ENSGT00940000158444 ENSGT00940000158973.b ENSGT00390000015164.k ENSGT00950000182787.E.d.e.b ENSGT00940000161682 ENSGT00390000006780 ENSGT00940000158323 ENSGT00940000158490 ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000156732 ENSGT00940000160915.e.a ENSGT00910000147095 ENSGT00940000160915.f ENSGT00940000154390.A.j ENSGT00390000011179 ENSGT00390000011072 ENSGT00440000033985 ENSGT00940000154014.a ENSGT00900000143452 ENSGT00940000158294 ENSGT00390000014996.y ENSGT00550000074870.b.nc ENSGT00390000014722 ENSGT00550000074878.`b.b Macaca ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00900000140979.a.b ENSGT00950000183087.A.a.b.b.g.e.b.b.b ENSGT01030000234539.b.b.a ENSGT00950000183125.b.a.a ENSGT00940000159012 ENSGT00550000074946 ENSGT00940000159904 ENSGT00940000158444 ENSGT00940000158973.b ENSGT00390000015164.k ENSGT00950000182787.E.d.e.b ENSGT00940000161682 ENSGT00390000006780 ENSGT00940000158323 ENSGT00940000158490 ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000156732 ENSGT00940000160915.e.a ENSGT00910000147095 ENSGT00940000160915.f ENSGT00940000154390.A.j ENSGT00390000011179 ENSGT00390000011072 ENSGT00440000033985 ENSGT00940000154014.a ENSGT00900000143452 ENSGT00940000158294 ENSGT00940000163323.c.a ENSGT00390000014996.y ENSGT00550000074870.b.nc ENSGT00390000014722 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 212 H2AZ2 (ENSMNEG00000034878) ENSMNEG00000031080 ZMIZ2 (ENSMNEG00000029115) OGDH (ENSMNEG00000037375) TMED4 (ENSMNEG00000043518) DDX56 (ENSMNEG00000028492) NPC1L1 (ENSMNEG00000042016) NUDCD3 (ENSMNEG00000032656) CAMK2B (ENSMNEG00000038861) YKT6 (ENSMNEG00000036461) GCK (ENSMNEG00000036780) MYL7 (ENSMNEG00000029278) POLD2 (ENSMNEG00000032635) ENSMNEG00000042467 POLM (ENSMNEG00000032354) PGAM2 (ENSMNEG00000034644) ##22 DBNL (ENSMNEG00000043760) ENSMNEG00000038254 UBE2D4 (ENSMNEG00000038205) URGCP (ENSMNEG00000005790) MRPS24 (ENSMNEG00000044096) BLVRA (ENSMNEG00000036114) COA1 (ENSMNEG00000035017) STK17A (ENSMNEG00000040471) ENSMNEG00000037947 ENSMNEG00000033977 HECW1 (ENSMNEG00000028314) MRPL32 (ENSMNEG00000042550) PSMA2 (ENSMNEG00000043089) C7orf25 (ENSMNEG00000038920) ENSMNEG00000034098 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00900000140979.a.b ENSGT00950000183087.A.a.b.b.g.e.b.b.b.b.b ENSGT01030000234539.b.b.a ENSGT00950000183125.b.a.a ENSGT00940000159012 ENSGT00550000074946 ENSGT00940000159904 ENSGT00940000158444 ENSGT00940000158973.b ENSGT00390000015164.k ENSGT00950000182787.E.d.e.b ENSGT00940000161682 ENSGT00390000006780 ENSGT00940000158323 ENSGT00940000158490 ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000156732 ENSGT00940000160915.e.a ENSGT00940000154390.A.j ENSGT00390000011179 ENSGT00390000011072 ENSGT00440000033985 ENSGT00940000154014.a ENSGT00940000158294 ENSGT00940000163323.c.a ENSGT00390000014996.y ENSGT00550000074870.b.nc ENSGT00390000014722 ENSGT00960000190657 ENSGT00940000155925 ENSGT00940000157116 Crab-eating macaque MODERN SPECIES 13 H2AZ2 (ENSMFAG00000040562) ENSMFAG00000058017 ZMIZ2 (ENSMFAG00000003941) OGDH (ENSMFAG00000042097) TMED4 (ENSMFAG00000035764) DDX56 (ENSMFAG00000041001) NPC1L1 (ENSMFAG00000043097) NUDCD3 (ENSMFAG00000037323) ENSMFAG00000003145 YKT6 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ENSGT00900000140979.a.b ENSGT00950000183087.A.a.b.b.g.e.b.b.a.a.a.b ENSGT01030000234539.b.b.a ENSGT00950000183125.b.a.a ENSGT00940000159012 ENSGT00550000074946 ENSGT00940000159904 ENSGT00940000158444 ENSGT00940000158973.b ENSGT00390000015164.k ENSGT00950000182787.E.d.e.b ENSGT00390000006780 ENSGT00940000158323 ENSGT00940000158490 ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000156732 ENSGT00940000160915.e.a ENSGT00940000154390.A.j ENSGT00390000011179 ENSGT00390000011072 ENSGT00440000033985 ENSGT00940000154014.a ENSGT00900000143452 ENSGT00940000158294 ENSGT00390000014996.y ENSGT00550000074870.b.nc ENSGT00390000014722 ENSGT00550000074878.`b.b ENSGT00940000155925 ENSGT00940000157116 Sooty mangabey MODERN SPECIES 252 PURB (ENSCATG00000021124) H2AZ2 (ENSCATG00000001553) ENSCATG00000035746 ZMIZ2 (ENSCATG00000036431) OGDH (ENSCATG00000043101) TMED4 (ENSCATG00000036933) DDX56 (ENSCATG00000039389) NPC1L1 (ENSCATG00000034769) NUDCD3 (ENSCATG00000033255) CAMK2B (ENSCATG00000033919) YKT6 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(ENSRROG00000000118) H2AZ2 (ENSRROG00000036393) PPIA (ENSRROG00000015742) ZMIZ2 (ENSRROG00000033224) OGDH (ENSRROG00000031910) TMED4 (ENSRROG00000041322) DDX56 (ENSRROG00000044428) NPC1L1 (ENSRROG00000040884) NUDCD3 (ENSRROG00000014276) CAMK2B (ENSRROG00000040951) YKT6 (ENSRROG00000044282) GCK (ENSRROG00000035669) POLD2 (ENSRROG00000044307) AEBP1 (ENSRROG00000041649) POLM (ENSRROG00000032525) PGAM2 (ENSRROG00000039506) ##22 DBNL (ENSRROG00000040794) ENSRROG00000012365 ENSRROG00000033214 URGCP (ENSRROG00000022418) MRPS24 (ENSRROG00000043231) Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1199 YKT6 (ENSRBIG00000037437) GCK (ENSRBIG00000034645) MYL7 (ENSRBIG00000041967) POLD2 (ENSRBIG00000036987) AEBP1 (ENSRBIG00000037140) POLM (ENSRBIG00000042241) PGAM2 (ENSRBIG00000034848) ##22 DBNL (ENSRBIG00000034629) ENSRBIG00000009757 ENSRBIG00000040351 URGCP (ENSRBIG00000032716) BLVRA (ENSRBIG00000029337) COA1 (ENSRBIG00000023583) STK17A (ENSRBIG00000033570) HECW1 (ENSRBIG00000042909) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00900000140979.a.b ENSGT00950000183087.A.a.b.a.h.c.b.a.b ENSGT01030000234539.b.b.a ENSGT00950000183125.b.a.a ENSGT00940000159012 ENSGT00550000074946 ENSGT00940000159904 ENSGT00940000158444 ENSGT00940000158973.b ENSGT00390000015164.k ENSGT00950000182787.E.d.e.b ENSGT00940000161682 ENSGT00390000006780 ENSGT00940000158323 ENSGT00940000158490 ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000156732 ENSGT00910000147095 ENSGT00940000160915 ENSGT00940000154390.A.j ENSGT00390000011179.m ENSGT00390000011072 ENSGT00440000033985 ENSGT00940000154014.a ENSGT00900000143452 ENSGT00940000158294 ENSGT00530000063426.b.b.b ENSGT00390000014996 ENSGT00550000074870.b.nc ENSGT00390000014722.c ENSGT00940000155925 Cebidae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00900000140979.a.b ENSGT00950000183087.A.a.b.a.h.c.b.a.b ENSGT01030000234539.b.b.a ENSGT00950000183125.b.a.a ENSGT00940000159012 ENSGT00550000074946 ENSGT00940000159904 ENSGT00940000158444 ENSGT00940000158973.b ENSGT00390000015164.k ENSGT00950000182787.E.d.e.b 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ENSGT00900000143452 ENSGT00940000158294 ENSGT00910000144211.n.b ENSGT00390000014996 ENSGT00550000074870.b.nc ENSGT00390000014722.c ENSGT00940000155925 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 82 ENSSBOG00000035081 ZMIZ2 (ENSSBOG00000032470) OGDH (ENSSBOG00000032539) TMED4 (ENSSBOG00000032356) DDX56 (ENSSBOG00000034339) ENSSBOG00000027505 NPC1L1 (ENSSBOG00000031878) NUDCD3 (ENSSBOG00000030729) CAMK2B (ENSSBOG00000031179) YKT6 (ENSSBOG00000012145) GCK (ENSSBOG00000000143) MYL7 (ENSSBOG00000021992) POLD2 (ENSSBOG00000033855) AEBP1 (ENSSBOG00000023002) POLM (ENSSBOG00000026333) PGAM2 (ENSSBOG00000031111) ##22 DBNL (ENSSBOG00000027972) UBE2D4 (ENSSBOG00000034793) URGCP (ENSSBOG00000020021) ENSSBOG00000028274 BLVRA (ENSSBOG00000030897) COA1 (ENSSBOG00000023098) STK17A (ENSSBOG00000022665) HECW1 (ENSSBOG00000022224) ENSSBOG00000031237 ENSSBOG00000023091 MRPL32 (ENSSBOG00000029277) PSMA2 (ENSSBOG00000019977) ENSSBOG00000033820 GLI3 (ENSSBOG00000020504) INHBA (ENSSBOG00000021061) Capuchin MODERN SPECIES 546 NUDCD3 (ENSCCAG00000031094) CAMK2B (ENSCCAG00000029763) YKT6 (ENSCCAG00000026854) GCK (ENSCCAG00000027953) MYL7 (ENSCCAG00000034593) POLD2 (ENSCCAG00000023591) AEBP1 (ENSCCAG00000027385) POLM (ENSCCAG00000034931) PGAM2 (ENSCCAG00000020406) ##22 DBNL (ENSCCAG00000024783) ENSCCAG00000029289 UBE2D4 (ENSCCAG00000024405) URGCP (ENSCCAG00000033948) MRPS24 (ENSCCAG00000023789) BLVRA (ENSCCAG00000028614) COA1 (ENSCCAG00000030094) STK17A (ENSCCAG00000036249) ENSCCAG00000003717 HECW1 (ENSCCAG00000036579) Marmoset MODERN SPECIES 20 H2AZ2 (ENSCJAG00000011953) ENSCJAG00000011969 ZMIZ2 (ENSCJAG00000011984) OGDH (ENSCJAG00000012021) TMED4 (ENSCJAG00000012217) DDX56 (ENSCJAG00000012233) NPC1L1 (ENSCJAG00000012318) NUDCD3 (ENSCJAG00000008208) CAMK2B (ENSCJAG00000008079) ENSCJAG00000040988 GCK (ENSCJAG00000008025) MYL7 (ENSCJAG00000008015) POLD2 (ENSCJAG00000007954) AEBP1 (ENSCJAG00000007936) ENSCJAG00000007934 PGAM2 (ENSCJAG00000007923) ##22 ENSCJAG00000007899 URGCP (ENSCJAG00000007849) ENSCJAG00000007842 BLVRA (ENSCJAG00000007829) COA1 (ENSCJAG00000007826) STK17A (ENSCJAG00000007799) ENSCJAG00000078337 HECW1 (ENSCJAG00000007768) ENSCJAG00000082260 ENSCJAG00000062733 MRPL32 (ENSCJAG00000007749) PSMA2 (ENSCJAG00000039517) C7orf25 (ENSCJAG00000007729) GLI3 (ENSCJAG00000007690) INHBA (ENSCJAG00000007682) Mas night monkey MODERN SPECIES 867 NUDCD3 (ENSANAG00000029361) CAMK2B (ENSANAG00000030017) YKT6 (ENSANAG00000015863) GCK (ENSANAG00000028532) MYL7 (ENSANAG00000023612) POLD2 (ENSANAG00000027652) AEBP1 (ENSANAG00000024351) POLM (ENSANAG00000025140) PGAM2 (ENSANAG00000020857) ##22 DBNL (ENSANAG00000027306) UBE2D4 (ENSANAG00000029203) URGCP (ENSANAG00000014118) ENSANAG00000027880 Tarsier MODERN SPECIES 4231 NUDCD3 (ENSTSYG00000008598) CAMK2B (ENSTSYG00000012581) YKT6 (ENSTSYG00000005835) GCK (ENSTSYG00000007022) MYL7 (ENSTSYG00000011012) POLD2 (ENSTSYG00000011007) AEBP1 (ENSTSYG00000031939) POLM (ENSTSYG00000010327) PGAM2 (ENSTSYG00000006825) ##22 DBNL (ENSTSYG00000009066) UBE2D4 (ENSTSYG00000027924) URGCP (ENSTSYG00000026474) BLVRA (ENSTSYG00000030197) Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00900000140979.a.b ENSGT00950000183087.A.a.b.b.g ENSGT01030000234539.b.b.a ENSGT00950000183125.b.a.a ENSGT00940000159012 ENSGT00550000074946 ENSGT00940000159904 ENSGT00940000158444 ENSGT00940000158973.b ENSGT00390000015164 ENSGT00950000182787.E.d.e.b ENSGT00940000161682 ENSGT00390000006780 ENSGT00940000158323 ENSGT00940000158490 ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000156732 ENSGT00940000160915 ENSGT00940000154390.A.j ENSGT00390000011179 ENSGT00390000011072 ENSGT00440000033985 ENSGT00940000154014.a ENSGT00940000158294.a ENSGT00900000143452 ENSGT00940000158294.b ENSGT00390000014996 ENSGT00550000074870.b ENSGT00390000014722 ENSGT00960000190657 ENSGT00940000155925 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00900000140979.a.b ENSGT00950000183087.A.a.b.b.g ENSGT01030000234539.b.b.a ENSGT00950000183125.b.a.a ENSGT00940000159012 ENSGT00550000074946 ENSGT00940000159904 ENSGT00940000158444 ENSGT00940000158973.b ENSGT00390000015164 ENSGT00950000182787.E.d.e.b ENSGT00940000161682 ENSGT00390000006780 ENSGT00940000158323 ENSGT00940000158490 ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000156732 ENSGT00940000160915 ENSGT00940000154390.A.j ENSGT00390000011179 ENSGT00390000011072 ENSGT00440000033985 ENSGT00940000154014.a ENSGT00940000158294.a ENSGT00900000143452 ENSGT00940000158294.b ENSGT00390000014996 ENSGT00550000074870.b ENSGT00390000014722 ENSGT00960000190657 ENSGT00940000155925 Mouse lemur MODERN SPECIES 2 H2AZ2 (ENSMICG00000008792) ENSMICG00000027555 ZMIZ2 (ENSMICG00000003918) OGDH (ENSMICG00000015987) TMED4 (ENSMICG00000005557) DDX56 (ENSMICG00000005550) NPC1L1 (ENSMICG00000005536) NUDCD3 (ENSMICG00000003284) CAMK2B (ENSMICG00000004015) YKT6 (ENSMICG00000004010) GCK (ENSMICG00000013503) MYL7 (ENSMICG00000004005) ENSMICG00000013459 AEBP1 (ENSMICG00000013400) POLM (ENSMICG00000013358) PGAM2 (ENSMICG00000013345) ##22 DBNL (ENSMICG00000013311) ENSMICG00000013289 URGCP (ENSMICG00000030783) MRPS24 (ENSMICG00000043303) BLVRA (ENSMICG00000007284) COA1 (ENSMICG00000013834) STK17A (ENSMICG00000047496) ENSMICG00000047051 HECW1 (ENSMICG00000001053) ENSMICG00000045915 PSMA2 (ENSMICG00000017286) C7orf25 (ENSMICG00000017285) GLI3 (ENSMICG00000010785) INHBA (ENSMICG00000033429) YAE1 (ENSMICG00000042079) Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES 94 ENSGT00900000140979.a.b ENSGT00950000183087.A.a.b.a.h ENSGT01030000234539.b.b.a ENSGT00950000183125.b.a.a ENSGT00940000159012 ENSGT00550000074946 ENSGT00940000159904 ENSGT00940000158444 ENSGT00940000158973.b ENSGT00390000015164 ENSGT00950000182787.E.d.e.b ENSGT00940000161682 ENSGT00390000006780 ENSGT00940000158323 ENSGT00940000158490 ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000156732 ENSGT00940000160915 ENSGT00940000154390.A.j ENSGT00390000011179 ENSGT00390000011072 ENSGT00440000033985 ENSGT00940000154014.a ENSGT00940000158294.b ENSGT00390000014996 ENSGT00550000074870.b ENSGT00390000014722 ENSGT00960000190657 ENSGT00940000155925 ENSGT00940000157116 ENSGT00940000157866 Coquerels sifaka MODERN SPECIES 361 H2AZ2 (ENSPCOG00000018252) ENSPCOG00000028123 ZMIZ2 (ENSPCOG00000025600) OGDH (ENSPCOG00000025741) ENSPCOG00000017663 DDX56 (ENSPCOG00000024864) NPC1L1 (ENSPCOG00000027497) NUDCD3 (ENSPCOG00000013041) CAMK2B (ENSPCOG00000014854) YKT6 (ENSPCOG00000016771) GCK (ENSPCOG00000021845) MYL7 (ENSPCOG00000027788) POLD2 (ENSPCOG00000023991) AEBP1 (ENSPCOG00000014510) POLM (ENSPCOG00000013792) PGAM2 (ENSPCOG00000015813) ##22 DBNL (ENSPCOG00000025819) ENSPCOG00000028067 URGCP (ENSPCOG00000026370) MRPS24 (ENSPCOG00000015625) BLVRA (ENSPCOG00000028055) COA1 (ENSPCOG00000013220) STK17A (ENSPCOG00000023716) HECW1 (ENSPCOG00000012498) MRPL32 (ENSPCOG00000020168) PSMA2 (ENSPCOG00000025748) C7orf25 (ENSPCOG00000021972) Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 241 ENSPSMG00000021440 ZMIZ2 (ENSPSMG00000021326) OGDH (ENSPSMG00000020942) TMED4 (ENSPSMG00000020530) DDX56 (ENSPSMG00000020497) NPC1L1 (ENSPSMG00000020447) NUDCD3 (ENSPSMG00000020362) CAMK2B (ENSPSMG00000018309) YKT6 (ENSPSMG00000016728) GCK (ENSPSMG00000016706) MYL7 (ENSPSMG00000016635) POLD2 (ENSPSMG00000016620) AEBP1 (ENSPSMG00000016602) POLM (ENSPSMG00000016557) ENSPSMG00000016529 PGAM2 (ENSPSMG00000016519) ##22 DBNL (ENSPSMG00000016466) UBE2D4 (ENSPSMG00000016250) URGCP (ENSPSMG00000016242) ENSPSMG00000016188 BLVRA (ENSPSMG00000016166) COA1 (ENSPSMG00000016121) ENSPSMG00000016103 STK17A (ENSPSMG00000016095) ENSPSMG00000016059 Bushbaby MODERN SPECIES 234 ENSOGAG00000027997 ZMIZ2 (ENSOGAG00000001208) OGDH (ENSOGAG00000002776) TMED4 (ENSOGAG00000009985) DDX56 (ENSOGAG00000009981) NPC1L1 (ENSOGAG00000030638) ENSOGAG00000031987 NUDCD3 (ENSOGAG00000009560) CAMK2B (ENSOGAG00000025215) YKT6 (ENSOGAG00000006454) GCK (ENSOGAG00000013533) MYL7 (ENSOGAG00000013527) POLD2 (ENSOGAG00000006720) AEBP1 (ENSOGAG00000007419) POLM (ENSOGAG00000006715) PGAM2 (ENSOGAG00000006713) ##22 DBNL (ENSOGAG00000006706) UBE2D4 (ENSOGAG00000004018) URGCP (ENSOGAG00000001595) MRPS24 (ENSOGAG00000001593) BLVRA (ENSOGAG00000001591) COA1 (ENSOGAG00000006944) STK17A (ENSOGAG00000033031) HECW1 (ENSOGAG00000013436) MRPL32 (ENSOGAG00000016806) PSMA2 (ENSOGAG00000016805) C7orf25 (ENSOGAG00000016804) GLI3 (ENSOGAG00000012651) INHBA (ENSOGAG00000003846) ENSOGAG00000025676 MPLKIP (ENSOGAG00000014138) Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00900000140979.a.b ENSGT00950000183087.A.a.b.a ENSGT01030000234539.b.b.a ENSGT00950000183125.b.a.a ENSGT00940000159012 ENSGT00550000074946 ENSGT00940000159904 ENSGT00940000158444 ENSGT00940000158973.b ENSGT00390000015164 ENSGT00950000182787.E.d.e.b ENSGT00940000161682 ENSGT00390000006780 ENSGT00940000158323 ENSGT00940000158490 ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000156732 ENSGT00940000154390.A.j ENSGT00390000011179 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES 771 ENSGT00950000182787.E.d.e.b ENSGT00940000161682 ENSGT00390000006780 ENSGT00940000158323 ENSGT00940000158490 ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000156732 Armadillo MODERN SPECIES 1849 GCK (ENSDNOG00000015156) MYL7 (ENSDNOG00000032380) POLD2 (ENSDNOG00000044199) AEBP1 (ENSDNOG00000048568) POLM (ENSDNOG00000005765) PGAM2 (ENSDNOG00000024480) ##22 DBNL (ENSDNOG00000024838) Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 148 ENSGT00900000140979.a.b ENSGT00950000183087.A.a.b.a ENSGT01030000234539.b.b.a ENSGT00950000183125.b.a.a ENSGT00940000159012 ENSGT00550000074946 ENSGT00940000159904 ENSGT00940000158444 ENSGT00940000158973.b ENSGT00390000015164 ENSGT00950000182787.E.d.e.b ENSGT00940000161682 ENSGT00390000006780 ENSGT00940000158323 ENSGT00940000158490 ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000156732 ENSGT00940000154390.A.j ENSGT00390000011179 Tenrec MODERN SPECIES 3228 PGAM2 (ENSETEG00000002564) ##22 DBNL (ENSETEG00000002558) Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 152 ENSGT00900000140979.a.b ENSGT00950000183087.A.a.b.a ENSGT01030000234539.b.b.a ENSGT00950000183125.b.a.a ENSGT00940000159012 ENSGT00550000074946 ENSGT00940000159904 ENSGT00940000158444 ENSGT00940000158973.b ENSGT00390000015164 ENSGT00950000182787.E.d.e.b ENSGT00940000161682 ENSGT00390000006780 ENSGT00940000158323 ENSGT00940000158490 ENSGT00950000182926.b.c ##22 ENSGT00940000156732 ENSGT00940000154390.A.j ENSGT00390000011179 Hyrax MODERN SPECIES 2631 PGAM2 (ENSPCAG00000002181) ##22 DBNL (ENSPCAG00000002123) Elephant MODERN SPECIES 491 H2AZ2 (ENSLAFG00000006180) ENSLAFG00000011345 ZMIZ2 (ENSLAFG00000010282) OGDH (ENSLAFG00000013723) TMED4 (ENSLAFG00000018216) DDX56 (ENSLAFG00000018206) NPC1L1 (ENSLAFG00000018200) NUDCD3 (ENSLAFG00000012250) CAMK2B (ENSLAFG00000012840) YKT6 (ENSLAFG00000012838) GCK (ENSLAFG00000020833) MYL7 (ENSLAFG00000022961) POLD2 (ENSLAFG00000022905) AEBP1 (ENSLAFG00000014436) POLM (ENSLAFG00000010390) PGAM2 (ENSLAFG00000026429) ##22 DBNL (ENSLAFG00000004682) URGCP (ENSLAFG00000031339) MRPS24 (ENSLAFG00000011905) GPRIN2 (ENSLAFG00000016467) ENSLAFG00000016206 SHLD2 (ENSLAFG00000022147) ENSLAFG00000012059 ENSLAFG00000011199 SNCG (ENSLAFG00000032751) MMRN2 (ENSLAFG00000012825) BMPR1A (ENSLAFG00000005832) LDB3 (ENSLAFG00000006009) OPN4 (ENSLAFG00000006004) ENSLAFG00000011624 ENSLAFG00000023317 Cyclostomata ANCESTRAL SPECIES 189 ENSGT00950000182926.b #22 ENSGT00940000155032.a ENSGT00510000047420 Lamprey MODERN SPECIES 546 pgam2 (ENSPMAG00000008358) #22 zdhhc16a (ENSPMAG00000008343) ENSPMAG00000008336 TRPV6 (ENSPMAG00000008331) pxylp1 (ENSPMAG00000008325) sinhcafl (ENSPMAG00000008320) psmd13 (ENSPMAG00000008290) rpl10a (ENSPMAG00000008233) ENSPMAG00000008214 ENSPMAG00000008211 Hagfish MODERN SPECIES 20 ENSEBUG00000007326 pgam2 (ENSEBUG00000010813) #22 ENSEBUG00000008252 smyd5 (ENSEBUG00000001585) ubtd2 (ENSEBUG00000003243) ndufa10 (ENSEBUG00000014980) ENSEBUG00000004358 tnksb (ENSEBUG00000014360) ENSEBUG00000007528 ENSEBUG00000014012 ENSEBUG00000007890 ENSEBUG00000014147 ENSEBUG00000000684 Ciona ANCESTRAL SPECIES 99 ENSGT00940000167355 ENSGT00950000182926.b #22 ENSGT00940000153528.b ENSGT00390000018651 ENSGT00530000063681 ENSGT00940000170345 Ciona savignyi MODERN SPECIES 30 ENSCSAVG00000001946 ENSCSAVG00000001945 ENSCSAVG00000001942 ENSCSAVG00000001889 ENSCSAVG00000001888 ENSCSAVG00000001885 ENSCSAVG00000001882 ENSCSAVG00000001880 ENSCSAVG00000001878 ENSCSAVG00000001874 ENSCSAVG00000001870 ENSCSAVG00000001869 ENSCSAVG00000001859 ENSCSAVG00000001855 ENSCSAVG00000001849 ENSCSAVG00000001846 #22 ENSCSAVG00000001839 ENSCSAVG00000001836 ENSCSAVG00000001827 ENSCSAVG00000001824 ENSCSAVG00000001822 ENSCSAVG00000001820 ENSCSAVG00000001814 ENSCSAVG00000001808 ENSCSAVG00000001803 ENSCSAVG00000001799 ENSCSAVG00000001798 ENSCSAVG00000001760 ENSCSAVG00000001755 ENSCSAVG00000001752 ENSCSAVG00000001745 Ciona intestinalis MODERN SPECIES 9 zf(c2h2)-24 (ENSCING00000012142) ENSCING00000008138 ENSCING00000012143 ENSCING00000008136 ENSCING00000008132 ENSCING00000012145 ENSCING00000022244 ENSCING00000008131 ENSCING00000022941 ENSCING00000019344 ENSCING00000012146 ENSCING00000021962 ENSCING00000012148 ENSCING00000018201 ENSCING00000009910 ENSCING00000008129 #22 ENSCING00000022453 ENSCING00000023230 ENSCING00000023088 ENSCING00000012150 ENSCING00000024672 ENSCING00000012152 ENSCING00000018715 ENSCING00000019237 ENSCING00000009908 ENSCING00000008124 ENSCING00000023006 gp130-like (ENSCING00000008123) ENSCING00000021870 ENSCING00000018972 ENSCING00000012153 Ecdysozoa ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b #22 Fruitfly DUPLICATION Fruitfly MODERN SPECIES 19 CG11843 (FBgn0039630) Sirt7 (FBgn0039631) Cul5 (FBgn0039632) Bicra (FBgn0039633) alpha-Man-Ib (FBgn0039634) Pdhb (FBgn0039635) Atg14 (FBgn0039636) yem (FBgn0005596) Ctl2 (FBgn0039637) dgt6 (FBgn0039638) Vha100-1 (FBgn0028671) Alg13 (FBgn0039639) superdeath (FBgn0039640) CG14511 (FBgn0039641) CG11882 (FBgn0039642) Pglym78 (FBgn0014869) #22 eIF2D (FBgn0041588) Slbp (FBgn0041186) Rpn2 (FBgn0028692) rdog (FBgn0039644) CG11898 (FBgn0039645) jus (FBgn0039647) CG14515 (FBgn0039648) CG11899 (FBgn0014427) Mesh1 (FBgn0039650) Cyt-c1L 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