Vertebrata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000156490 #22 Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000156490 #22 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 643 ENSGT00940000158489 #19 ENSGT00950000183091.B.b #20 ENSGT00390000001787 #21 ENSGT00980000202953 ENSGT00940000156490 #22 Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 46 ENSGT00390000000724.c.a #15 ENSGT00390000001912.f #18 ENSGT00940000158489 #19 ENSGT00950000183091.B.b #20 ENSGT00390000001787 #21 ENSGT00980000202953 ENSGT00940000156490 #22 ENSGT00950000183008.a.a.a.a #26 ENSGT00910000144253 #27 ENSGT00940000154900 #28 ENSGT00940000156134 #29 ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b ENSGT00940000165811 ENSGT00940000159728 ENSGT00940000160725 ENSGT00390000006696 ENSGT00950000182905.b ENSGT00390000003167 ENSGT00940000159884 ENSGT00950000183051.a.b ENSGT00940000156405 ENSGT00940000155384.a Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00530000063255.A ENSGT01000000214440.B ENSGT00640000091492.b ENSGT01100000265274 ENSGT00940000155769 ENSGT00940000157009 ENSGT00950000183066.a.b.a.b 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#20 SPO11 (ENSDNOG00000024599) #21 ENSDNOG00000044690 BMP7 (ENSDNOG00000045446) #22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000157009 ENSGT00940000171528 ENSGT00950000183066.a.b.a.b ENSGT00390000015137 ENSGT00940000154459.A #13 ENSGT00390000000724.c.a #15 ENSGT00390000002234 ENSGT00390000001912.f #18 ENSGT00940000161524 ENSGT00940000158489 #19 ENSGT00950000183091.B.b.b #20 ENSGT00950000183091.B.a.b ##20 ENSGT00950000183091.B.b.a.a #20 ENSGT00390000001787 #21 ENSGT00980000202953 ENSGT00940000156490 #22 ENSGT00950000182848.c.b.a.b #23 ENSGT00390000005057 ENSGT00940000160402 #25 ENSGT00390000010923 #24 ENSGT00950000183008.a.a.a.a #26 ENSGT00910000144253 #27 ENSGT00940000154900 #28 ENSGT00940000156134 #29 ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b ENSGT00940000159728 ENSGT00940000160725 ENSGT00390000006696 ENSGT00950000182905.b ENSGT00390000003167 ENSGT00940000159884 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00640000091492.b ENSGT00940000155769 ENSGT00940000157009 ENSGT00950000183066.a.b.a.b ENSGT00390000015137 ENSGT00940000154459.A #13 ENSGT00390000000724.c.a #15 ENSGT00390000002234 ENSGT00390000001912.f #18 ENSGT00940000161524 ENSGT00940000158489 #19 ENSGT00950000183091.B.b.b #20 ENSGT00950000183091.B.a.b ##20 ENSGT00950000183091.B.b.a.a #20 ENSGT00390000001787 #21 ENSGT00940000156490 #22 ENSGT00950000182848.c.b.a.b #23 ENSGT00390000005057 ENSGT00940000160402 #25 ENSGT00390000010923 #24 ENSGT00950000183008.a.a.a.a #26 ENSGT00910000144253 #27 ENSGT00940000154900 #28 ENSGT00940000156134 #29 ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b ENSGT00940000159728 ENSGT00940000160725 ENSGT00390000006696 ENSGT00950000182905.b ENSGT00390000003167 ENSGT00940000159884 Primates ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00530000063255.A ENSGT01000000214440.B ENSGT00640000091492.b ENSGT00940000155769 ENSGT00940000157009 ENSGT00950000183066.a.b.a.b ENSGT00390000015137 ENSGT00940000154459.A #13 ENSGT00390000000724.c.a #15 ENSGT00390000002234 ENSGT00390000001912.f #18 ENSGT00940000161524 ENSGT00940000158489 #19 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ENSGT00940000154900 #28 ENSGT00940000156134 #29 ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b ENSGT00940000159728 ENSGT00940000160725 ENSGT00390000006696 ENSGT00950000182905.b ENSGT00390000003167 ENSGT00940000159884 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00530000063255.A ENSGT01000000214440.B ENSGT00640000091492.b ENSGT00940000155769 ENSGT00940000157009 ENSGT00950000183066.a.b.a.b ENSGT00390000015137 ENSGT00940000154459.A #13 ENSGT00390000000724.c.a #15 ENSGT00390000002234 ENSGT00390000001912.f #18 ENSGT00940000161524 ENSGT00940000158489 #19 ENSGT00950000183091.B.b.b #20 ENSGT00390000001787 #21 ENSGT00940000156490 #22 ENSGT00950000182848.c.b.a.b #23 ENSGT00390000005057 ENSGT00940000160402 #25 ENSGT00390000010923 #24 ENSGT00950000183008.a.a.a.a #26 ENSGT00910000144253 #27 ENSGT00940000154900 #28 ENSGT00940000156134 #29 ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b ENSGT00940000159728 ENSGT00940000160725 ENSGT00390000006696 ENSGT00950000182905.b ENSGT00390000003167 ENSGT00940000159884 Mouse lemur MODERN SPECIES 9 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#25 RTF2 (ENSSVLG00005001366) #24 CASS4 (ENSSVLG00005001328) #26 CSTF1 (ENSSVLG00005001285) #27 ENSSVLG00005001248 #28 FAM210B (ENSSVLG00005001217) #29 MC3R (ENSSVLG00005001203) ENSSVLG00005001189 ENSSVLG00005001173 CBLN4 (ENSSVLG00005001167) DOK5 (ENSSVLG00005001133) PFDN4 (ENSSVLG00005001111) CYP24A1 (ENSSVLG00005001045) Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT01000000214440.B ENSGT00640000091492.b ENSGT00940000155769 ENSGT00940000157009 ENSGT00950000183066.a.b.a.b ENSGT00390000015137 ENSGT00940000154459.A #13 ENSGT00390000000724.c.a #15 ENSGT00390000002234 ENSGT00390000001912.f #18 ENSGT00940000161524 ENSGT00940000158489 #19 ENSGT00950000183091.B.b.b #20 ENSGT00950000183091.B.a.b ##20 ENSGT00390000001787 #21 ENSGT00940000156490 #22 ENSGT00950000182848.c.b.a.b #23 ENSGT00390000005057 ENSGT00390000010923 #24 ENSGT00940000160402 #25 ENSGT00950000183008.a.a.a.a #26 ENSGT00910000144253 #27 ENSGT00940000154900 #28 ENSGT00940000156134 #29 ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b ENSGT00940000159728 ENSGT00940000160725 ENSGT00390000006696 ENSGT00950000182905.b ENSGT00390000003167 ENSGT00940000159884 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000006634 ENSGT00530000063255.A ENSGT01000000214440.B ENSGT00940000155769 ENSGT00940000157009 ENSGT00950000183066.a.b.a.b ENSGT00390000015137 ENSGT00940000154459.A #13 ENSGT00390000000724.c.a #15 ENSGT00390000002234 ENSGT00390000001912.f #18 ENSGT00940000161524 ENSGT00940000158489 #19 ENSGT00950000183091.B.b.b #20 ENSGT00390000001787 #21 ENSGT00940000156490 #22 ENSGT00950000182848.c.b.a.b #23 ENSGT00390000005057 ENSGT00390000010923 #24 ENSGT00940000160402 #25 ENSGT00950000183008.a.a.a.a #26 ENSGT00910000144253 #27 ENSGT00940000154900 #28 ENSGT00940000156134 #29 ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b ENSGT00940000159728 ENSGT00940000160725 ENSGT00390000006696.ac.a ENSGT00950000182905.b ENSGT00390000003167 ENSGT00940000159884 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00390000006634 ENSGT00530000063255.A ENSGT01000000214440.B ENSGT00940000155769 ENSGT00940000157009 ENSGT00950000183066.a.b.a.b ENSGT00390000015137 ENSGT00940000154459.A #13 ENSGT00390000000724.c.a #15 ENSGT00390000002234 ENSGT00390000001912.f #18 ENSGT00940000161524 ENSGT00940000158489 #19 ENSGT00950000183091.B.b.b #20 ENSGT00390000001787 #21 ENSGT00940000156490 #22 ENSGT00950000182848.c.b.a.b #23 ENSGT00390000005057 ENSGT00390000010923 #24 ENSGT00940000160402 #25 ENSGT00950000183008.a.a.a.a #26 ENSGT00910000144253 #27 ENSGT00940000154900 #28 ENSGT00940000156134 #29 ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b ENSGT00940000159728 ENSGT00940000160725 ENSGT00390000006696.ac.a.b ENSGT00950000182905.b ENSGT00390000003167 ENSGT00940000159884 Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 152 NPEPL1 (ENSCLAG00000007179) STX16 (ENSCLAG00000008863) VAPB (ENSCLAG00000012950) ENSCLAG00000004633 RAB22A (ENSCLAG00000005077) ENSCLAG00000006547 ENSCLAG00000009855 C20orf85 (ENSCLAG00000012263) #13 PMEPA1 (ENSCLAG00000010850) #15 ZBP1 (ENSCLAG00000012154) PCK1 (ENSCLAG00000008119) #18 CTCFL (ENSCLAG00000004596) RBM38 (ENSCLAG00000005906) #19 RAE1 (ENSCLAG00000006500) #20 SPO11 (ENSCLAG00000008712) #21 BMP7 (ENSCLAG00000006692) #22 ENSCLAG00000006921 TFAP2C (ENSCLAG00000008347) #23 ENSCLAG00000005877 RTF2 (ENSCLAG00000005946) #24 GCNT7 (ENSCLAG00000006522) #25 CASS4 (ENSCLAG00000005692) #26 CSTF1 (ENSCLAG00000006676) #27 AURKA (ENSCLAG00000009511) #28 FAM210B (ENSCLAG00000005865) #29 MC3R (ENSCLAG00000017777) CBLN4 (ENSCLAG00000006156) DOK5 (ENSCLAG00000009152) ENSCLAG00000009443 CYP24A1 (ENSCLAG00000006942) BCAS1 (ENSCLAG00000006299) Degu MODERN SPECIES 118 PMEPA1 (ENSODEG00000007664) #15 PCK1 (ENSODEG00000007233) #18 RBM38 (ENSODEG00000007980) #19 ENSODEG00000005687 #20 SPO11 (ENSODEG00000006573) #21 BMP7 (ENSODEG00000005399) #22 ENSODEG00000005762 #23 ENSODEG00000006029 RTF2 (ENSODEG00000005634) #24 GCNT7 (ENSODEG00000006051) #25 CASS4 (ENSODEG00000006198) #26 ENSODEG00000019482 ENSODEG00000007572 #28 FAM210B (ENSODEG00000005961) #29 MC3R (ENSODEG00000019495) ENSODEG00000007202 CBLN4 (ENSODEG00000008098) DOK5 (ENSODEG00000009072) ENSODEG00000005992 CYP24A1 (ENSODEG00000005827) ENSODEG00000006282 Guinea pig MODERN SPECIES 96 PCK1 (ENSCPOG00000006584) #18 ENSCPOG00000006577 RBM38 (ENSCPOG00000012781) #19 RAE1 (ENSCPOG00000008932) #20 SPO11 (ENSCPOG00000011677) #21 BMP7 (ENSCPOG00000035536) #22 TFAP2C (ENSCPOG00000023253) #23 RTF2 (ENSCPOG00000030139) #24 ENSCPOG00000024456 GCNT7 (ENSCPOG00000035093) #25 CASS4 (ENSCPOG00000026525) #26 CSTF1 (ENSCPOG00000004957) #27 ENSCPOG00000006633 #28 FAM210B (ENSCPOG00000006630) #29 MC3R (ENSCPOG00000024876) CBLN4 (ENSCPOG00000011681) ENSCPOG00000010289 DOK5 (ENSCPOG00000012780) ENSCPOG00000032848 CYP24A1 (ENSCPOG00000010077) BCAS1 (ENSCPOG00000009194) Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES 415 ENSGT00950000183091.B.b.b #20 ENSGT00390000001787 #21 ENSGT00940000156490 #22 Pika MODERN SPECIES 5308 RAE1 (ENSOPRG00000000228) #20 SPO11 (ENSOPRG00000000225) #21 BMP7 (ENSOPRG00000000218) #22 Rabbit MODERN SPECIES 1242 ENSOCUG00000025711 #22 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT01000000214440.B ENSGT00640000091492.b ENSGT00940000155769 ENSGT00940000157009 ENSGT00950000183066.a.b.a.b ENSGT00390000015137 ENSGT00940000154459.A #13 ENSGT00390000000724.c.a #15 ENSGT00390000002234 ENSGT00390000001912.f #18 ENSGT00940000161524 ENSGT00940000158489 #19 ENSGT00950000183091.B.b.b #20 ENSGT00390000001787 #21 ENSGT00980000202953 ENSGT00940000156490 #22 ENSGT00950000182848.c.b.a.b #23 ENSGT00390000005057 ENSGT00390000010923 #24 ENSGT00940000160402 #25 ENSGT00950000183008.a.a.a.a #26 ENSGT00910000144253 #27 ENSGT00940000154900 #28 ENSGT00940000156134 #29 ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b ENSGT00940000159728 ENSGT00940000160725 ENSGT00390000006696 ENSGT00950000182905.b ENSGT00390000003167 ENSGT00940000159884 Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000156490 #22 Hedgehog MODERN SPECIES 15180 BMP7 (ENSEEUG00000015290) #22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT01000000214440.B ENSGT00640000091492.b 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14 APCDD1L (ENSECAG00000027891) VAPB (ENSECAG00000013265) RAB22A (ENSECAG00000012914) ENSECAG00000022603 C22H20orf85 (ENSECAG00000033931) #13 ENSECAG00000047328 PMEPA1 (ENSECAG00000018005) #15 ZBP1 (ENSECAG00000017185) PCK1 (ENSECAG00000014037) #18 CTCFL (ENSECAG00000009147) RBM38 (ENSECAG00000007700) #19 ENSECAG00000054153 RAE1 (ENSECAG00000016068) #20 SPO11 (ENSECAG00000012964) #21 ENSECAG00000038425 BMP7 (ENSECAG00000002918) #22 TFAP2C (ENSECAG00000021125) #23 ENSECAG00000021060 GCNT7 (ENSECAG00000016323) #25 RTF2 (ENSECAG00000009943) #24 CASS4 (ENSECAG00000009479) #26 CSTF1 (ENSECAG00000008949) #27 FAM210B (ENSECAG00000023915) #29 AURKA (ENSECAG00000023961) #28 MC3R (ENSECAG00000004637) CBLN4 (ENSECAG00000036307) DOK5 (ENSECAG00000023012) PFDN4 (ENSECAG00000035072) ENSECAG00000053968 CYP24A1 (ENSECAG00000016322) BCAS1 (ENSECAG00000013155) Donkey MODERN SPECIES 6 APCDD1L (ENSEASG00005028820) VAPB (ENSEASG00005023251) RAB22A (ENSEASG00005026275) ENSEASG00005023253 ANKRD60 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MODERN SPECIES 3676 SPO11 (ENSPVAG00000001701) #21 BMP7 (ENSPVAG00000001700) #22 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00530000063255.A ENSGT01000000214440.B ENSGT00640000091492.b ENSGT00940000155769 ENSGT00940000157009 ENSGT00950000183066.a.b.a.b ENSGT00390000015137 ENSGT00940000154459.A #13 ENSGT00390000000724.c.a #15 ENSGT00390000002234 ENSGT00390000001912.f #18 ENSGT00940000161524 ENSGT00940000158489 #19 ENSGT00950000183091.B.b.b #20 ENSGT00390000001787 #21 ENSGT00940000156490 #22 ENSGT00950000182848.c.b.a.b #23 ENSGT00390000005057 ENSGT00390000010923 #24 ENSGT00940000160402 #25 ENSGT00950000183008.a.a.a.a #26 ENSGT00910000144253 #27 ENSGT00940000154900 #28 ENSGT00940000156134 #29 ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b ENSGT00940000159728 ENSGT00940000160725 ENSGT00390000006696 ENSGT00950000182905.b ENSGT00390000003167 ENSGT00940000159884 Suina ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00530000063255.A ENSGT01000000214440.B ENSGT00640000091492.b ENSGT00940000155769 ENSGT00940000157009 ENSGT00950000183066.a.b.a.b ENSGT00390000015137 ENSGT00940000154459.A #13 ENSGT00390000000724.c.a #15 ENSGT00390000002234 ENSGT00390000001912.f #18 ENSGT00940000161524 ENSGT00940000158489 #19 ENSGT00950000183091.B.b.b #20 ENSGT00390000001787 #21 ENSGT00940000156490 #22 ENSGT00950000182848.c.b.a.b #23 ENSGT00390000005057 ENSGT00390000010923 #24 ENSGT00940000160402 #25 ENSGT00950000183008.a.a.a.a #26 ENSGT00910000144253 #27 ENSGT00940000154900 #28 ENSGT00940000156134 #29 ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b ENSGT00940000159728 ENSGT00940000160725 ENSGT00390000006696 ENSGT00950000182905.b ENSGT00390000003167 ENSGT00940000159884 Chacoan peccary MODERN SPECIES 801 NPEPL1 (ENSCWAG00000011185) STX16 (ENSCWAG00000011369) APCDD1L (ENSCWAG00000011751) ENSCWAG00000011835 RAB22A (ENSCWAG00000011920) C20orf85 (ENSCWAG00000012049) #13 PMEPA1 (ENSCWAG00000012098) #15 ZBP1 (ENSCWAG00000012192) PCK1 (ENSCWAG00000012380) #18 CTCFL (ENSCWAG00000012475) RBM38 (ENSCWAG00000013092) #19 RAE1 (ENSCWAG00000013163) #20 SPO11 (ENSCWAG00000013226) #21 BMP7 (ENSCWAG00000013637) #22 TFAP2C (ENSCWAG00000013788) #23 ENSCWAG00000013848 RTF2 (ENSCWAG00000013880) #24 GCNT7 (ENSCWAG00000013939) #25 CASS4 (ENSCWAG00000003694) #26 CSTF1 (ENSCWAG00000003789) #27 AURKA (ENSCWAG00000003823) #28 FAM210B (ENSCWAG00000003878) #29 MC3R (ENSCWAG00000003893) ENSCWAG00000003907 CBLN4 (ENSCWAG00000003931) ENSCWAG00000003959 DOK5 (ENSCWAG00000003971) ENSCWAG00000004002 CYP24A1 (ENSCWAG00000004053) Pig MODERN SPECIES 8 NPEPL1 (ENSSSCG00000007517) STX16 (ENSSSCG00000007516) APCDD1L (ENSSSCG00000007515) VAPB (ENSSSCG00000007514) RAB22A (ENSSSCG00000007513) ENSSSCG00000007512 ANKRD60 (ENSSSCG00000007511) C20orf85 (ENSSSCG00000007510) #13 PMEPA1 (ENSSSCG00000034259) #15 ZBP1 (ENSSSCG00000007508) PCK1 (ENSSSCG00000007507) #18 CTCFL (ENSSSCG00000007505) RBM38 (ENSSSCG00000007504) #19 RAE1 (ENSSSCG00000007503) #20 SPO11 (ENSSSCG00000007502) #21 BMP7 (ENSSSCG00000007501) #22 ENSSSCG00000007500 TFAP2C (ENSSSCG00000007499) #23 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ENSGT00940000159728 ENSGT00940000160725 ENSGT00390000006696 ENSGT00950000182905.b ENSGT00390000003167 ENSGT00940000159884 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00530000063255.A ENSGT01000000214440.B ENSGT00640000091492.b ENSGT00940000155769 ENSGT00940000157009 ENSGT00950000183066.a.b.a.b ENSGT00390000015137 ENSGT00940000154459.A #13 ENSGT00390000000724.c.a #15 ENSGT00390000002234 ENSGT00390000001912.f #18 ENSGT00940000161524 ENSGT00940000158489 #19 ENSGT00950000183091.B.b.b #20 ENSGT00390000001787 #21 ENSGT00940000156490 #22 ENSGT00950000182848.c.b.a.b #23 ENSGT00390000005057 ENSGT00390000010923 #24 ENSGT00940000160402 #25 ENSGT00950000183008.a.a.a.a #26 ENSGT00910000144253 #27 ENSGT00940000154900 #28 ENSGT00940000156134 #29 ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b ENSGT00940000159728 ENSGT00940000160725 ENSGT00390000006696 ENSGT00950000182905.b ENSGT00390000003167 ENSGT00940000159884 Cetacea ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00530000063255.A ENSGT01000000214440.B ENSGT00640000091492.b ENSGT00940000155769 ENSGT00940000157009 ENSGT00950000183066.a.b.a.b ENSGT00390000015137 ENSGT00940000154459.A #13 ENSGT00390000000724.c.a #15 ENSGT00390000002234 ENSGT00390000001912.f #18 ENSGT00940000161524 ENSGT00940000158489 #19 ENSGT00950000183091.B.b.b #20 ENSGT00390000001787 #21 ENSGT00940000156490 #22 ENSGT00950000182848.c.b.a.b #23 ENSGT00390000005057 ENSGT00390000010923 #24 ENSGT00940000160402 #25 ENSGT00950000183008.a.a.a.a #26 ENSGT00910000144253 #27 ENSGT00940000154900 #28 ENSGT00940000156134 #29 ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b ENSGT00940000159728 ENSGT00940000160725 ENSGT00390000006696 ENSGT00950000182905.b ENSGT00390000003167 ENSGT00940000153664.A.a.m.b.b Odontoceti ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00530000063255.A ENSGT01000000214440.B ENSGT00640000091492.b ENSGT00940000155769 ENSGT00940000157009 ENSGT00950000183066.a.b.a.b ENSGT00390000015137 ENSGT00940000154459.A #13 ENSGT00390000000724.c.a #15 ENSGT00390000002234 ENSGT00390000001912.f #18 ENSGT00940000161524 ENSGT00940000158489 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ENSGT00910000144253 #27 ENSGT00940000154900 #28 ENSGT00940000156134 #29 ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b ENSGT00940000159728 ENSGT00940000160725 ENSGT00390000006696 ENSGT00950000182905.b ENSGT00390000003167 ENSGT00940000153664.A.a.m.b.b Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00530000063255.A ENSGT01000000214440.B ENSGT00640000091492.b ENSGT00940000155769 ENSGT00940000157009 ENSGT00950000183066.a.b.a.b ENSGT00390000015137 ENSGT00940000154459.A #13 ENSGT00390000000724.c.a #15 ENSGT00390000002234 ENSGT00390000001912.f #18 ENSGT00940000161524 ENSGT00940000158489 #19 ENSGT00950000183091.B.b.b #20 ENSGT00390000001787 #21 ENSGT00940000156490 #22 ENSGT00950000182848.c.b.a.b #23 ENSGT00390000005057 ENSGT00390000010923 #24 ENSGT00940000160402 #25 ENSGT00950000183008.a.a.a.a #26 ENSGT00910000144253 #27 ENSGT00940000154900 #28 ENSGT00940000156134 #29 ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b ENSGT00940000159728 ENSGT00940000160725 ENSGT00390000006696 ENSGT00950000182905.b ENSGT00390000003167 ENSGT00940000153664.A.a.m.b.b Monodontidae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00530000063255.A ENSGT01000000214440.B ENSGT00640000091492.b ENSGT00940000155769 ENSGT00940000157009 ENSGT00950000183066.a.b.a.b ENSGT00390000015137 ENSGT00940000154459.A #13 ENSGT00390000000724.c.a #15 ENSGT00390000002234 ENSGT00390000001912.f #18 ENSGT00940000161524 ENSGT00940000158489 #19 ENSGT00950000183091.B.b.b #20 ENSGT00390000001787 #21 ENSGT00940000156490 #22 ENSGT00950000182848.c.b.a.b #23 ENSGT00390000005057 ENSGT00390000010923 #24 ENSGT00940000160402 #25 ENSGT00950000183008.a.a.a.a #26 ENSGT00910000144253 #27 ENSGT00940000154900 #28 ENSGT00940000156134 #29 ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b ENSGT00940000159728 ENSGT00940000160725 ENSGT00390000006696 ENSGT00950000182905.b ENSGT00390000003167 ENSGT00940000153664.A.a.m.b.b Narwhal MODERN SPECIES 299 ENSMMNG00015004333 ENSMMNG00015004380 ENSMMNG00015004407 NPEPL1 (ENSMMNG00015004513) APCDD1L (ENSMMNG00015004601) VAPB (ENSMMNG00015004608) RAB22A (ENSMMNG00015004617) 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ENSGT00940000154900 #28 ENSGT00940000156134 #29 ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b.e ENSGT00960000186656.a.a.b ENSGT00960000186656.a.b ENSGT00520000055567.a.a.a ENSGT00940000153311.a.b.a.i.b.a ENSGT00940000161179 ENSGT00520000055634.b Yarkand deer MODERN SPECIES 15 ENSCHYG00000016641 ENSCHYG00000016747 NPEPL1 (ENSCHYG00000016856) STX16 (ENSCHYG00000017190) APCDD1L (ENSCHYG00000017700) VAPB (ENSCHYG00000017763) RAB22A (ENSCHYG00000017863) C20orf85 (ENSCHYG00000018025) #13 PMEPA1 (ENSCHYG00000018099) #15 ENSCHYG00000018137 PCK1 (ENSCHYG00000018190) #18 CTCFL (ENSCHYG00000018291) RBM38 (ENSCHYG00000018538) #19 ENSCHYG00000018647 #20 SPO11 (ENSCHYG00000018785) #21 BMP7 (ENSCHYG00000019388) #22 ENSCHYG00000019890 TFAP2C (ENSCHYG00000019937) #23 ENSCHYG00000020096 RTF2 (ENSCHYG00000020116) #24 GCNT7 (ENSCHYG00000020206) #25 CASS4 (ENSCHYG00000020270) #26 CSTF1 (ENSCHYG00000020443) #27 AURKA (ENSCHYG00000020501) #28 ENSCHYG00000020595 #29 MC3R (ENSCHYG00000020674) ENSCHYG00000020710 SIRPB2 (ENSCHYG00000020774) ENSCHYG00000020847 ENSCHYG00000021051 SDCBP2 (ENSCHYG00000021231) Percora_a ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000006634 ENSGT00530000063255.A ENSGT01000000214440.B ENSGT00640000091492.b ENSGT00940000155769 ENSGT00940000157009 ENSGT00390000015137 ENSGT00940000154459.A #13 ENSGT00390000000724.c.a #15 ENSGT00390000002234 ENSGT00390000001912.f #18 ENSGT00940000161524 ENSGT00940000158489 #19 ENSGT00950000183091.B.b.b #20 ENSGT00390000001787 #21 ENSGT00940000156490 #22 ENSGT00950000182848.c.b.a.b #23 ENSGT00390000005057.g ENSGT00390000010923 #24 ENSGT00940000160402 #25 ENSGT00950000183008.a.a.a.a #26 ENSGT00910000144253 #27 ENSGT00940000154900 #28 ENSGT00940000156134 #29 ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b.e ENSGT00960000186656.a.a.b ENSGT00960000186656.a.b ENSGT00520000055567.a.a.a ENSGT00940000153311.a.b.a.i.b.a ENSGT00940000161179 ENSGT00520000055634.b Siberian musk deer MODERN SPECIES 1193 ENSMMSG00000017849 ENSMMSG00000017768 NPEPL1 (ENSMMSG00000017675) STX16 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ENSGT00390000005057.g ENSGT00390000010923 #24 ENSGT00940000160402 #25 ENSGT00950000183008.a.a.a.a #26 ENSGT00910000144253 #27 ENSGT00940000154900 #28 ENSGT00940000156134.m #29 ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b.e ENSGT00960000186656.a.a.b ENSGT00960000186656.a.b ENSGT00520000055567.a.a.a ENSGT00940000153311.a.b.a.i.b.a.a ENSGT00940000161179 ENSGT00520000055634.b Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 4 ENSOARG00020011802 ENSOARG00020011940 NPEPL1 (ENSOARG00020012021) STX16 (ENSOARG00020012241) APCDD1L (ENSOARG00020012926) VAPB (ENSOARG00020012959) RAB22A (ENSOARG00020013056) C20orf85 (ENSOARG00020013218) #13 PMEPA1 (ENSOARG00020013298) #15 ENSOARG00020013373 PCK1 (ENSOARG00020013457) #18 CTCFL (ENSOARG00020013572) RBM38 (ENSOARG00020014327) #19 RAE1 (ENSOARG00020014456) #20 SPO11 (ENSOARG00020014512) #21 BMP7 (ENSOARG00020014945) #22 TFAP2C (ENSOARG00020015147) #23 ENSOARG00020015232 RTF2 (ENSOARG00020015268) #24 GCNT7 (ENSOARG00020015320) #25 CSTF1 (ENSOARG00020015504) #27 AURKA (ENSOARG00020015608) #28 FAM210B (ENSOARG00020015852) #29 MC3R (ENSOARG00020015898) SIRPB2 (ENSOARG00020015924) NSFL1C (ENSOARG00020015987) ENSOARG00020016172 SDCBP2 (ENSOARG00020016367) RAD21L1 (ENSOARG00020016432) C20orf202 (ENSOARG00020016836) TMEM74B (ENSOARG00020016880) Goat MODERN SPECIES 4 ENSCHIG00000013806 ENSCHIG00000004449 NPEPL1 (ENSCHIG00000020605) STX16 (ENSCHIG00000015266) APCDD1L (ENSCHIG00000008762) VAPB (ENSCHIG00000023510) RAB22A (ENSCHIG00000017305) C20orf85 (ENSCHIG00000013954) #13 PMEPA1 (ENSCHIG00000019681) #15 ENSCHIG00000006747 PCK1 (ENSCHIG00000004184) #18 CTCFL (ENSCHIG00000012079) RBM38 (ENSCHIG00000002609) #19 RAE1 (ENSCHIG00000021396) #20 SPO11 (ENSCHIG00000024033) #21 BMP7 (ENSCHIG00000009982) #22 TFAP2C (ENSCHIG00000016251) #23 ENSCHIG00000011944 RTF2 (ENSCHIG00000016795) #24 GCNT7 (ENSCHIG00000011787) #25 CASS4 (ENSCHIG00000025456) #26 CSTF1 (ENSCHIG00000024686) #27 AURKA (ENSCHIG00000024453) #28 ENSCHIG00000020130 #29 ENSCHIG00000015868 SIRPB2 (ENSCHIG00000020185) NSFL1C (ENSCHIG00000026320) ENSCHIG00000008981 SDCBP2 (ENSCHIG00000026727) SNPH (ENSCHIG00000022086) RAD21L1 (ENSCHIG00000022078) Bovinae ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00390000006634 ENSGT00530000063255.A ENSGT01000000214440.B ENSGT00640000091492.b ENSGT00940000155769 ENSGT00940000157009 ENSGT00390000015137 ENSGT00940000154459.A #13 ENSGT00390000000724.c.a #15 ENSGT00390000002234 ENSGT00390000001912.f #18 ENSGT00940000161524 ENSGT00940000158489 #19 ENSGT00950000183091.B.b.b #20 ENSGT00390000001787 #21 ENSGT00940000156490 #22 ENSGT00950000182848.c.b.a.b #23 ENSGT00390000015224.c.b.a ENSGT00390000005057.g ENSGT00940000160402 #25 ENSGT00390000010923 #24 ENSGT00950000183008.a.a.a.a #26 ENSGT00910000144253 #27 ENSGT00940000154900 #28 ENSGT00940000156134 #29 ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b.e ENSGT00960000186656.a.a.b ENSGT00960000186656.a.b ENSGT00520000055567.a.a.a ENSGT00940000153311.a.b.a.i.b.a.c ENSGT00940000161179 American bison MODERN SPECIES 3089 ENSBBBG00000024413 NPEPL1 (ENSBBBG00000024507) STX16 (ENSBBBG00000009035) APCDD1L (ENSBBBG00000000252) VAPB (ENSBBBG00000024624) RAB22A (ENSBBBG00000006430) ANKRD60 (ENSBBBG00000024644) C20orf85 (ENSBBBG00000000233) #13 PMEPA1 (ENSBBBG00000024661) #15 ENSBBBG00000024674 PCK1 (ENSBBBG00000006468) #18 CTCFL (ENSBBBG00000008049) RBM38 (ENSBBBG00000024899) #19 RAE1 (ENSBBBG00000024949) #20 SPO11 (ENSBBBG00000025046) #21 BMP7 (ENSBBBG00000006644) #22 TFAP2C (ENSBBBG00000007748) #23 ENSBBBG00000025115 ENSBBBG00000025120 GCNT7 (ENSBBBG00000025135) #25 RTF2 (ENSBBBG00000006668) #24 CASS4 (ENSBBBG00000025195) #26 CSTF1 (ENSBBBG00000025215) #27 AURKA (ENSBBBG00000025307) #28 FAM210B (ENSBBBG00000008091) #29 MC3R (ENSBBBG00000025338) SIRPB2 (ENSBBBG00000007856) NSFL1C (ENSBBBG00000025367) ENSBBBG00000025481 SDCBP2 (ENSBBBG00000009625) SNPH (ENSBBBG00000009630) Bos ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00390000006634 ENSGT00530000063255.A ENSGT01000000214440.B ENSGT00640000091492.b ENSGT00940000155769 ENSGT00940000157009 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ENSGT00390000001787 #21 ENSGT00940000156490 #22 ENSGT00950000182848.c.b.a.b #23 ENSGT00390000015224.c.b.a ENSGT00390000005057.g ENSGT00390000010923 #24 ENSGT00940000160402 #25 ENSGT00950000183008.a.a.a.a #26 ENSGT00910000144253 #27 ENSGT00940000154900 #28 ENSGT00940000156134 #29 ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b.e ENSGT00960000186656.a.a.b ENSGT00960000186656.a.b ENSGT00520000055567.a.a.a ENSGT00940000153311.a.b.a.i.a ENSGT00940000161179 Cow MODERN SPECIES 4 NPEPL1 (ENSBTAG00000016724) STX16 (ENSBTAG00000003872) APCDD1L (ENSBTAG00000020397) VAPB (ENSBTAG00000017424) RAB22A (ENSBTAG00000018053) ENSBTAG00000052305 C13H20orf85 (ENSBTAG00000016926) #13 ENSBTAG00000054668 PMEPA1 (ENSBTAG00000054628) #15 ZBP1 (ENSBTAG00000012406) PCK1 (ENSBTAG00000001936) #18 CTCFL (ENSBTAG00000013079) RBM38 (ENSBTAG00000008105) #19 RAE1 (ENSBTAG00000010934) #20 SPO11 (ENSBTAG00000044210) #21 BMP7 (ENSBTAG00000015362) #22 TFAP2C (ENSBTAG00000002065) #23 ENSBTAG00000024608 FAM209A (ENSBTAG00000031462) RTF2 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#27 AURKA (ENSBIXG00005023837) #28 FAM210B (ENSBIXG00005023861) #29 MC3R (ENSBIXG00005023881) SIRPB2 (ENSBIXG00005023892) NSFL1C (ENSBIXG00005023940) ENSBIXG00005023953 SDCBP2 (ENSBIXG00005004119) ENSBIXG00005024112 Bos_a ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000006634 ENSGT00530000063255.A ENSGT01000000214440.B ENSGT00640000091492.b ENSGT00940000155769 ENSGT00940000157009 ENSGT00390000015137 ENSGT00940000154459.A #13 ENSGT00390000000724.c.a #15 ENSGT00390000002234 ENSGT00390000001912.f #18 ENSGT00940000161524 ENSGT00940000158489 #19 ENSGT00950000183091.B.b.b.d #20 ENSGT00390000001787 #21 ENSGT00940000156490 #22 ENSGT00950000182848.c.b.a.b #23 ENSGT00390000015224.c.b.a ENSGT00390000005057.g ENSGT00390000010923 #24 ENSGT00940000160402 #25 ENSGT00950000183008.a.a.a.a #26 ENSGT00910000144253 #27 ENSGT00940000154900 #28 ENSGT00940000156134 #29 ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b.e ENSGT00960000186656.a.a.b ENSGT00960000186656.a.b ENSGT00520000055567.a.a.a ENSGT00940000153311.a.b.a.i.b.a.c ENSGT00940000161179 Wild yak MODERN SPECIES 119 VAPB (ENSBMUG00000017052) RAB22A (ENSBMUG00000017036) ANKRD60 (ENSBMUG00000016999) C20orf85 (ENSBMUG00000016991) #13 PMEPA1 (ENSBMUG00000016982) #15 ZBP1 (ENSBMUG00000016977) PCK1 (ENSBMUG00000016967) #18 CTCFL (ENSBMUG00000016873) RBM38 (ENSBMUG00000016782) #19 ENSBMUG00000016759 #20 SPO11 (ENSBMUG00000016729) #21 BMP7 (ENSBMUG00000016640) #22 TFAP2C (ENSBMUG00000016627) #23 ENSBMUG00000016603 GCNT7 (ENSBMUG00000016592) #25 RTF2 (ENSBMUG00000016577) #24 CASS4 (ENSBMUG00000016558) #26 CSTF1 (ENSBMUG00000016523) #27 AURKA (ENSBMUG00000016455) #28 FAM210B (ENSBMUG00000016427) #29 MC3R (ENSBMUG00000016410) ENSBMUG00000016366 SIRPB2 (ENSBMUG00000016351) NSFL1C (ENSBMUG00000016322) ENSBMUG00000016263 SDCBP2 (ENSBMUG00000016215) Domestic yak MODERN SPECIES 3 ENSBGRG00000025028 ENSBGRG00000025497 NPEPL1 (ENSBGRG00000008119) STX16 (ENSBGRG00000008482) APCDD1L (ENSBGRG00000008754) VAPB (ENSBGRG00000008788) RAB22A (ENSBGRG00000008900) C20orf85 (ENSBGRG00000009150) #13 PMEPA1 (ENSBGRG00000009167) #15 ZBP1 (ENSBGRG00000009247) PCK1 (ENSBGRG00000009353) #18 CTCFL (ENSBGRG00000009589) RBM38 (ENSBGRG00000010003) #19 ENSBGRG00000010143 #20 SPO11 (ENSBGRG00000010307) #21 BMP7 (ENSBGRG00000010612) #22 TFAP2C (ENSBGRG00000010689) #23 ENSBGRG00000010827 ENSBGRG00000010860 RTF2 (ENSBGRG00000010891) #24 GCNT7 (ENSBGRG00000011133) #25 CASS4 (ENSBGRG00000011222) #26 CSTF1 (ENSBGRG00000011331) #27 ENSBGRG00000011378 AURKA (ENSBGRG00000011397) #28 FAM210B (ENSBGRG00000011532) #29 MC3R (ENSBGRG00000011613) SIRPB2 (ENSBGRG00000011673) NSFL1C (ENSBGRG00000011719) ENSBGRG00000012031 SDCBP2 (ENSBGRG00000012247) Camelidae ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT01090000260114 ENSGT00390000006634 ENSGT00530000063255.A ENSGT01000000214440.B ENSGT00640000091492.b ENSGT00940000155769 ENSGT00940000157009 ENSGT00940000154459.A #13 ENSGT00390000000724.c.a #15 ENSGT00390000002234 ENSGT00390000001912.f #18 ENSGT00940000161524 ENSGT00940000158489 #19 ENSGT00950000183091.B.b.b #20 ENSGT00390000001787 #21 ENSGT00940000156490 #22 ENSGT00950000182848.c.b.a.b #23 ENSGT00390000005057 ENSGT00940000160402 #25 ENSGT00390000010923 #24 ENSGT00950000183008.a.a.a.a #26 ENSGT00910000144253 #27 ENSGT00940000154900 #28 ENSGT00940000156134 #29 ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b ENSGT00940000159728 ENSGT00940000160725 ENSGT00390000006696 ENSGT00950000182905.b ENSGT00390000003167 ENSGT00940000159884 Arabian camel MODERN SPECIES 10 GNAS (ENSCDRG00005019285) ENSCDRG00005019259 NPEPL1 (ENSCDRG00005019177) STX16 (ENSCDRG00005018768) APCDD1L (ENSCDRG00005018710) VAPB (ENSCDRG00005018685) RAB22A (ENSCDRG00005018654) C20orf85 (ENSCDRG00005018603) #13 PMEPA1 (ENSCDRG00005018556) #15 ZBP1 (ENSCDRG00005018520) PCK1 (ENSCDRG00005018483) #18 CTCFL (ENSCDRG00005018103) RBM38 (ENSCDRG00005018053) #19 RAE1 (ENSCDRG00005018020) #20 SPO11 (ENSCDRG00005017688) #21 BMP7 (ENSCDRG00005017580) #22 ENSCDRG00005017550 TFAP2C (ENSCDRG00005017528) #23 ENSCDRG00005017508 GCNT7 (ENSCDRG00005017452) #25 RTF2 (ENSCDRG00005017316) #24 CASS4 (ENSCDRG00005017279) #26 CSTF1 (ENSCDRG00005017255) #27 AURKA (ENSCDRG00005017220) #28 FAM210B (ENSCDRG00005017188) #29 MC3R (ENSCDRG00005017174) CBLN4 (ENSCDRG00005017147) DOK5 (ENSCDRG00005017101) PFDN4 (ENSCDRG00005017062) CYP24A1 (ENSCDRG00005016933) BCAS1 (ENSCDRG00005016699) Alpaca MODERN SPECIES 3229 ENSVPAG00000004197 #22 Coelacanth MODERN SPECIES 293 PMEPA1 (ENSLACG00000018056) #15 ENSLACG00000018008 #17 PCK1 (ENSLACG00000017971) #18 RBM38 (ENSLACG00000022659) #19 RAE1 (ENSLACG00000017740) #20 SPO11 (ENSLACG00000017703) #21 BMP7 (ENSLACG00000017567) #22 TFAP2C (ENSLACG00000016799) #23 GCNT7 (ENSLACG00000016587) #25 RTF2 (ENSLACG00000016541) #24 CASS4 (ENSLACG00000016450) #26 CSTF1 (ENSLACG00000016278) #27 ENSLACG00000016233 AURKA (ENSLACG00000016221) #28 FAM210B (ENSLACG00000016160) #29 ENSLACG00000015637 CBLN4 (ENSLACG00000015548) PFDN4 (ENSLACG00000014225) CYP24A1 (ENSLACG00000014028) ZNF217 (ENSLACG00000012453) TSHZ2 (ENSLACG00000011012) ZFP64 (ENSLACG00000004984) Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES 115 ENSGT00390000018558 ENSGT00940000157562 ENSGT00530000063859.b ENSGT00940000161921 ENSGT00940000154543 ENSGT00390000013253 ENSGT00940000159879 ENSGT00950000183053.C ENSGT00940000161664 ENSGT00910000144253 #27 ENSGT00950000183008.a.a.a.a #26 ENSGT00940000158489 #19 ENSGT00950000183091.B.b #20 ENSGT00390000001787 #21 ENSGT00980000202953 ENSGT00940000156490 #22 ENSGT00940000162011 ENSGT00940000163813 ENSGT00390000005939.a.b ENSGT00940000165182 ENSGT00940000161589 ENSGT00940000155218.A ENSGT00940000162118 ENSGT00940000163206.b ENSGT00740000116961 ENSGT00940000157379 ENSGT00940000159853 ENSGT00940000159695 ENSGT00940000156010 ENSGT00390000011620.a.a.b ENSGT00940000158073 Reedfish MODERN SPECIES 1 PIGT (ENSECRG00000008403) phactr3a (ENSECRG00000008393) ppp1r3da (ENSECRG00000008383) ENSECRG00000008378 ENSECRG00000008369 ttll9 (ENSECRG00000008344) ttll9 (ENSECRG00000008291) edn3b (ENSECRG00000008272) ENSECRG00000008263 adtrp1 (ENSECRG00000008251) cstf1 (ENSECRG00000008239) #27 ENSECRG00000008228 #26 rbm38 (ENSECRG00000008219) #19 rae1 (ENSECRG00000008199) #20 SPO11 (ENSECRG00000008161) #21 bmp7a (ENSECRG00000008133) #22 ENSECRG00000008121 irf10 (ENSECRG00000008110) ENSECRG00000008105 ENSECRG00000008094 ENSECRG00000008086 ENSECRG00000008070 ENSECRG00000008052 ENSECRG00000009917 MTG2 (ENSECRG00000009904) SS18L1 (ENSECRG00000009876) PSMA7 (ENSECRG00000009862) lsm14b (ENSECRG00000009847) TAF4 (ENSECRG00000009735) adrm1 (ENSECRG00000009663) osbpl2b (ENSECRG00000009634) Neopterygii DUPLICATION Neopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000156490.a #22 Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000156490.a #22 Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000156490.a #22 Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000156490.a #22 Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000156490.a #22 Northern pike MODERN SPECIES 222 ENSELUG00000025559 #22 Neopterygii DUPLICATION Neopterygii ANCESTRAL SPECIES 49 ENSGT00390000018558 ENSGT00940000157562 ENSGT00530000063859.b ENSGT00940000161921 ENSGT00940000154543 ENSGT00390000013253 ENSGT00940000159879 ENSGT00950000183053.C ENSGT00940000161664 ENSGT00910000144253 #27 ENSGT00950000183008.a.a.a.a #26 ENSGT00940000158489 #19 ENSGT00950000183091.B.b #20 ENSGT00390000001787 #21 ENSGT00980000202953 ENSGT00940000156490.b.a #22 ENSGT00940000163813 ENSGT00390000005939.a.b ENSGT00940000165182 ENSGT00940000161589 ENSGT00940000155218.A ENSGT00940000162118 ENSGT00940000163206.b ENSGT00740000116961 ENSGT00940000157379 ENSGT00940000159853 ENSGT00940000159695 ENSGT00940000156010 ENSGT00390000011620.a.a.b ENSGT00940000158073 ENSGT00940000160902 Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00940000156245.b ENSGT00390000001787 #21 ENSGT00980000202953 ENSGT00940000156490.b.a #22 ENSGT00940000163813 ENSGT00390000005939.a.b.a ENSGT00940000165182 ENSGT00940000161589 ENSGT00940000155218.A.d ENSGT00740000116961 ENSGT00940000157379 ENSGT00940000159853 ENSGT00940000159695 ENSGT00940000156010.db ENSGT00390000011620.a.a.b ENSGT00940000156010.eb ENSGT00940000158073 ENSGT00940000160902.c.a ENSGT00390000018730.A.f Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 180 ENSGT00940000156245.b ENSGT00390000001787 #21 ENSGT00980000202953 ENSGT00940000156490.b.a #22 ENSGT00940000163813 ENSGT00390000005939.a.b.a ENSGT00940000165182.c ENSGT00940000161589 ENSGT00940000155218.A.d ENSGT00740000116961 ENSGT00940000157379 ENSGT00940000159853 ENSGT00940000159695 ENSGT00940000156010.db ENSGT00390000011620.a.a.b.f ENSGT00940000158073.a ENSGT00940000167904 ENSGT00940000160902.c.b ENSGT00390000018730.A.e Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 35 ENSGT00390000015162.d ENSGT00940000158186.g ENSGT00940000162992 ENSGT00940000156911.j ENSGT00940000158666.a.b ENSGT00390000011466 ENSGT00390000012739 ENSGT00440000033468 ENSGT00940000154256.ac ENSGT00940000159490 ENSGT00940000156037.b ENSGT00940000156260.c ENSGT00940000158489.a.a #19 ENSGT00390000001787 #21 ENSGT00980000202953 ENSGT00940000156490.b.a #22 ENSGT00940000163813 ENSGT00390000005939.a.b.a ENSGT00940000165182.c ENSGT00940000161589 ENSGT00940000155218.A.d ENSGT00740000116961 ENSGT00940000157379 ENSGT00940000159853 ENSGT00940000159695 ENSGT00940000156010.db ENSGT00390000011620.a.a.b.f ENSGT00940000158073.a ENSGT00940000167904 ENSGT00940000160902.c.b ENSGT00390000018730.A.e Otophysi ANCESTRAL SPECIES 216 ENSGT00390000008161.a.a.a.b ENSGT00550000075016 ENSGT00940000159233 ENSGT00940000158422.b ENSGT01070000253775.a.d.a.b.b.h.a ENSGT00940000164714 ENSGT00390000014570.b ENSGT00940000164203 ENSGT00940000154256.ac ENSGT00940000159490 ENSGT00940000156037.b ENSGT00940000156260.c ENSGT00940000158489.a.a #19 ENSGT00390000001787 #21 ENSGT00980000202953 ENSGT00940000156490.b.a #22 Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000156777.d ENSGT00940000156637.a ENSGT00940000158040.c ENSGT00940000165428.c.a ENSGT00940000157586.f ENSGT00940000166065.b ENSGT00390000001787 #21 ENSGT00940000156490.b.a #22 ENSGT00940000158489.a.a #19 ENSGT00940000156260.c ENSGT00940000156037.b ENSGT00940000159490 ENSGT00940000154256.ac ENSGT00940000164203 ENSGT00390000014570.b ENSGT00940000164714 ENSGT00940000158422.b ENSGT00940000159233 ENSGT00550000075016 ENSGT00390000008161.a.a.a.b ENSGT00940000159165 ENSGT01020000230412.B.b.b.b.g.a ENSGT00940000158060 Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 41 ENSGT00940000156777.d ENSGT00940000156637.a ENSGT00940000158040.c ENSGT00940000165428.c.a ENSGT00940000157586.f ENSGT00940000166065.b ENSGT00390000001787 #21 ENSGT00940000156490.b.a #22 ENSGT00940000158489.a.a #19 ENSGT00940000156260.c ENSGT00940000156037.b ENSGT00940000159490 ENSGT00940000154256.ac ENSGT00940000164203 ENSGT00390000014570.b ENSGT00940000164714 ENSGT00940000158422.b ENSGT00940000159233 ENSGT00550000075016 ENSGT00390000008161.a.a.a.b ENSGT00940000159165 ENSGT01020000230412.B.b.b.b.g.a ENSGT00940000158060 Characoidei ANCESTRAL SPECIES 258 ENSGT00940000156777.d ENSGT00940000156637.a ENSGT00940000158040.c ENSGT00940000165428.c.a ENSGT00940000157586.f ENSGT00940000166065.b ENSGT00390000001787 #21 ENSGT00940000156490.b.a #22 ENSGT00940000158489.a.a #19 ENSGT00940000156260.c ENSGT00940000156037.b ENSGT00940000159490 ENSGT00940000154256.ac ENSGT00940000164203 ENSGT00390000014570.b ENSGT00940000164714 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 524 ENSPNAG00000010301 SYT2 (ENSPNAG00000010331) ENSPNAG00000010356 spo11 (ENSPNAG00000001407) #21 bmp7b (ENSPNAG00000010581) #22 rbm38 (ENSPNAG00000010596) #19 mipb (ENSPNAG00000010601) ENSPNAG00000006347 baz2a (ENSPNAG00000010685) ptges3b (ENSPNAG00000010729) ENSPNAG00000010755 p4htma (ENSPNAG00000010788) ENSPNAG00000010832 Mexicana tetra MODERN SPECIES 640 edem2 (ENSAMXG00000031806) ENSAMXG00000001962 ENSAMXG00000041035 ENSAMXG00000038810 ENSAMXG00000037595 ENSAMXG00000043783 ENSAMXG00000039655 spo11 (ENSAMXG00000040654) #21 bmp7b (ENSAMXG00000039982) #22 ENSAMXG00000042608 rbm38 (ENSAMXG00000038120) #19 ENSAMXG00000038895 mipb (ENSAMXG00000034130) ENSAMXG00000001985 baz2a (ENSAMXG00000001995) ptges3b (ENSAMXG00000029980) p4htma (ENSAMXG00000002026) ENSAMXG00000002033 ENSAMXG00000002038 LYZ (ENSAMXG00000030483) ENSAMXG00000030471 ENSAMXG00000032234 ENSAMXG00000042833 ENSAMXG00000037941 Electric eel MODERN SPECIES 988 bmp7b (ENSEEEG00000020701) #22 rbm38 (ENSEEEG00000020698) #19 mipb (ENSEEEG00000020668) ENSEEEG00000020664 baz2a (ENSEEEG00000020663) ptges3b (ENSEEEG00000020661) Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT00550000075016 ENSGT00940000159233 ENSGT00940000158422.b ENSGT01070000253775.a.d.a.b.b.h.a ENSGT01030000234583.a.a.c.b.a.a.a.b.b.a.a.a.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000164714 ENSGT00940000164203 ENSGT00390000014570.b ENSGT00940000154256.ac ENSGT00940000159490 ENSGT00940000156037.b ENSGT00940000156260.c ENSGT00940000158489.a.a #19 ENSGT00390000001787 #21 ENSGT00980000202953 ENSGT00940000156490.b.a #22 ENSGT00940000166065.b ENSGT00940000157586.f ENSGT00940000165428.c.a ENSGT00940000158040.c ENSGT00940000156637.a ENSGT00940000156777.d ENSGT00440000039564.a.a ENSGT01030000234588.a.a.a.b ENSGT00730000112095 ENSGT00940000154709.a.b.a.b ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.d ENSGT00940000155067.b.b ENSGT00940000159939 ENSGT00940000157365 ENSGT00390000010372 Cyprininae DUPLICATION Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 915 ENSGT00940000156490.b.a.a #22 ENSGT00940000166065.b.b ENSGT00940000157586.f.e ENSGT00940000165428.c.a.f ENSGT00940000156637.a.b ENSGT00940000156777.d.b Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 252 ENSGT00390000014570.b.c.a ENSGT00940000154256.ac.b ENSGT00940000159490.d ENSGT00940000156037.b.b ENSGT00940000156260.c ENSGT00940000156245.b.b ENSGT00940000156490.b.a.a #22 ENSGT00940000157586.f.e ENSGT00940000165428.c.a.f ENSGT00940000156637.a.b ENSGT00940000156777.d.b ENSGT00440000039564.a.a ENSGT01030000234588.a.a.a.b.b ENSGT00940000154709.a.b.a.b.a ENSGT00940000156735.d.a ENSGT00390000009166.a.b ENSGT00950000182956.b.b.b.e.a.a.a.b ENSGT00950000182956.b.b.b.e.a.a.b ENSGT00940000158771.h.b ENSGT00940000155067.b.b.b ENSGT00940000159939.f ENSGT00940000157365 Common carp reference MODERN SPECIES 11 ENSCCRG00000065517 SAMD10 (ENSCCRG00000060768) prpf6 (ENSCCRG00000070854) edem2 (ENSCCRG00000081877) ENSCCRG00000004209 trim35-39 (ENSCCRG00000004201) ENSCCRG00000079989 ENSCCRG00000023945 p4htma (ENSCCRG00000016906) ptges3b (ENSCCRG00000033021) baz2a (ENSCCRG00000023984) ENSCCRG00000062859 mipb (ENSCCRG00000060982) ENSCCRG00000062503 ENSCCRG00000068590 bmp7b (ENSCCRG00000058050) #22 ENSCCRG00000061035 ENSCCRG00000075955 ENSCCRG00000045792 NAV1 (ENSCCRG00000080293) csrp1a (ENSCCRG00000074776) phlda3 (ENSCCRG00000065304) ENSCCRG00000073583 tnnt2a (ENSCCRG00000021079) PKP1 (ENSCCRG00000055680) smpd2a (ENSCCRG00000043661) ENSCCRG00000039281 ENSCCRG00000028001 ENSCCRG00000054877 ENSCCRG00000018728 ube2t (ENSCCRG00000015001) Golden-line barbel MODERN SPECIES 1037 prpf6 (ENSSGRG00000054973) ENSSGRG00000054957 ENSSGRG00000054953 ENSSGRG00000054952 baz2a (ENSSGRG00000054950) ENSSGRG00000054948 mipb (ENSSGRG00000054944) ENSSGRG00000054942 bmp7b (ENSSGRG00000054938) #22 Goldfish MODERN SPECIES 2599 ZNF512B (ENSCARG00000054096) ENSCARG00000054085 SAMD10 (ENSCARG00000054073) prpf6 (ENSCARG00000053915) edem2 (ENSCARG00000053580) trim35-39 (ENSCARG00000053553) ENSCARG00000053035 p4htma (ENSCARG00000052988) ptges3b (ENSCARG00000052957) ENSCARG00000052928 ENSCARG00000052918 baz2a (ENSCARG00000052773) ENSCARG00000052725 mipb (ENSCARG00000052705) rbm38 (ENSCARG00000052687) #19 bmp7b (ENSCARG00000052667) #22 ENSCARG00000052658 SYT2 (ENSCARG00000052639) ENSCARG00000052625 ENSCARG00000052565 NAV1 (ENSCARG00000050622) csrp1a (ENSCARG00000050487) phlda3 (ENSCARG00000050464) ENSCARG00000050411 tnnt2a (ENSCARG00000050382) PKP1 (ENSCARG00000050334) smpd2a (ENSCARG00000050220) TEAD3 (ENSCARG00000050026) Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 444 ENSGT01030000234583.a.a.c.b.a.a.a.b.b.a.a.a.a.a.a.a.a.a.b.b ENSGT00940000164714.j ENSGT00390000014570.b.c.a ENSGT00940000154256.ac.b 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ENSGT00940000158273.m.a ENSGT00940000156062.n.c ENSGT00390000003282.B.e.a ENSGT00940000156027.a.e ENSGT00940000153541.A.d ENSGT00940000157262.m.b.a ENSGT00990000211061 ENSGT00940000156490.b.a.c #22 ENSGT00940000163813.k ENSGT00390000005939.a.b.a.a ENSGT00940000161589.q ENSGT00940000155218.A.d ENSGT00740000116961.a ENSGT00940000157379.l.a ENSGT00940000159853.c ENSGT00940000160354.j.b ENSGT00390000011620.a.a.b.f.a ENSGT00940000158073.a.a ENSGT00990000209425 ENSGT00940000160902.c.b.b ENSGT00390000018730.A.e.c ENSGT00940000161930 ENSGT00940000155532.ud.a Atlantic salmon MODERN SPECIES 6 FBLN2 (ENSSSAG00000007361) NUP210 (ENSSSAG00000007421) IQSEC1 (ENSSSAG00000007667) ENSSSAG00000104725 cnbpa (ENSSSAG00000007968) ENSSSAG00000014280 ENSSSAG00000087293 ENSSSAG00000007991 syn2a (ENSSSAG00000008160) ENSSSAG00000089027 slc6a1a (ENSSSAG00000034299) TNNC1 (ENSSSAG00000036263) DUS7 (ENSSSAG00000036380) ENSSSAG00000036866 ENSSSAG00000037152 ENSSSAG00000037663 #22 ENSSSAG00000038413 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(ENSAPOG00000009970) Bicolor damselfish MODERN SPECIES 1695 spo11 (ENSSPAG00000019066) #21 bmp7b (ENSSPAG00000019044) #22 irf10 (ENSSPAG00000018996) ENSSPAG00000018983 ENSSPAG00000018974 ENSSPAG00000018929 ENSSPAG00000018899 MTG2 (ENSSPAG00000018882) ENSSPAG00000018877 lsm14b (ENSSPAG00000018854) ENSSPAG00000018837 TAF4 (ENSSPAG00000018804) Cichlidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183116.b.a.a.b.a.a.b ENSGT00940000156047.b ENSGT00390000009491.d ENSGT00940000156915.f.a ENSGT00530000064244.a ENSGT00940000164112.a ENSGT00950000183041.A.a.b ENSGT00940000156084 ENSGT00940000156062.n ENSGT00390000003282.B.e ENSGT00940000156027.a ENSGT00940000153541.A ENSGT00940000157262.m.b ENSGT00940000156030.j ENSGT00390000001787 #21 ENSGT00940000156490.b.a #22 ENSGT00940000163813 ENSGT00390000005939.a.b.a ENSGT00940000165182.c ENSGT00940000161589 ENSGT00940000155218.A.d ENSGT00940000157379 ENSGT00940000159853 ENSGT00940000156010.db ENSGT00390000011620.a.a.b.f ENSGT00940000158073.a ENSGT00940000160902.c.b ENSGT00390000018730.A.e ENSGT00940000161930 ENSGT00390000002821 ENSGT00940000155532 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00950000183116.b.a.a.b.a.a.b ENSGT00940000156047.b ENSGT00390000009491.d ENSGT00940000156915.f.a ENSGT00530000064244.a ENSGT00940000164112.a ENSGT00950000183041.A.a.b ENSGT00940000156084 ENSGT00940000156062.n ENSGT00390000003282.B.e ENSGT00940000156027.a ENSGT00940000153541.A ENSGT00940000157262.m.b ENSGT00940000156030.j ENSGT00390000001787 #21 ENSGT00940000156490.b.a #22 ENSGT00940000163813 ENSGT00390000005939.a.b.a ENSGT00940000165182.c ENSGT00940000161589 ENSGT00940000155218.A.d ENSGT00940000157379 ENSGT00940000159853 ENSGT00940000156010.db ENSGT00390000011620.a.a.b.f ENSGT00940000158073.a ENSGT00940000160902.c.b ENSGT00390000018730.A.e ENSGT00940000154897.q ENSGT00510000046470.a.a.b ENSGT00950000183021.a.b.c Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00950000183116.b.a.a.b.a.a.b ENSGT00940000156047.b ENSGT00390000009491.d ENSGT00940000156915.f.a ENSGT00530000064244.a ENSGT00940000164112.a ENSGT00950000183041.A.a.b ENSGT00940000156084 ENSGT00940000156062.n ENSGT00390000003282.B.e ENSGT00940000156027.a ENSGT00940000153541.A ENSGT00940000157262.m.b ENSGT00940000156030.j ENSGT00390000001787 #21 ENSGT00940000156490.b.a #22 ENSGT00940000163813 ENSGT00390000005939.a.b.a ENSGT00940000165182.c ENSGT00940000161589 ENSGT00940000155218.A.d ENSGT00940000157379 ENSGT00940000159853 ENSGT00940000156010.db ENSGT00390000011620.a.a.b.f ENSGT00940000158073.a ENSGT00940000160902.c.b ENSGT00390000018730.A.e ENSGT00940000161930 ENSGT00390000002821 ENSGT00940000154897.q Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000156047.b ENSGT00390000009491.d ENSGT00940000182562 ENSGT00940000156915.f.a ENSGT00530000064244.a ENSGT00940000164112.a ENSGT00950000183041.A.a.b ENSGT00940000156084 ENSGT00940000156062.n ENSGT00390000003282.B.e ENSGT00940000156027.a ENSGT00940000153541.A ENSGT00940000157262.m.b ENSGT00940000156030.j ENSGT00390000001787 #21 ENSGT00940000156490.b.a #22 ENSGT00940000163813 ENSGT00390000005939.a.b.a ENSGT00940000165182.c ENSGT00940000161589 ENSGT00940000155218.A.d ENSGT00940000157379 ENSGT00940000159853 ENSGT00940000156010.db ENSGT00390000011620.a.a.b.f ENSGT00940000158073.a ENSGT00940000160902.c.b ENSGT00390000018730.A.e ENSGT00940000161930 ENSGT00390000002821 ENSGT00940000155532 Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 1249 spo11 (ENSHBUG00000007679) #21 bmp7b (ENSHBUG00000007625) #22 irf10 (ENSHBUG00000007607) ENSHBUG00000007567 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000156047.b ENSGT00390000009491.d ENSGT00940000182562 ENSGT00940000156915.f.a ENSGT00530000064244.a ENSGT00940000164112.a ENSGT00950000183041.A.a.b ENSGT00940000156084 ENSGT00940000156062.n ENSGT00390000003282.B.e ENSGT00940000156027.a ENSGT00940000153541.A ENSGT00940000157262.m.b ENSGT00940000156030.j ENSGT00390000001787 #21 ENSGT00940000156490.b.a #22 ENSGT00940000163813 ENSGT00390000005939.a.b.a ENSGT00940000165182.c 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(ENSTNIG00000012615) #21 bmp7b (ENSTNIG00000012614) #22 irf10 (ENSTNIG00000012613) ENSTNIG00000000162 ENSTNIG00000012612 MTG2 (ENSTNIG00000012611) SS18L1 (ENSTNIG00000012610) lsm14b (ENSTNIG00000012609) TAF4 (ENSTNIG00000012608) CDH4 (ENSTNIG00000012607) kcnk15 (ENSTNIG00000012606) ogfr (ENSTNIG00000012605) col9a3 (ENSTNIG00000012604) ENSTNIG00000000421 prkcbp1l (ENSTNIG00000012603) zgc:113278 (ENSTNIG00000012602) NCOA3 (ENSTNIG00000012601) Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00950000183116.b.a.a.b.a.a.b ENSGT00940000156047.b ENSGT00390000009491.d ENSGT00940000156915.f.a ENSGT00530000064244.a ENSGT00940000164112.a ENSGT00950000183041.A.a.b ENSGT00940000156084 ENSGT00940000156062.n ENSGT00390000003282.B.e ENSGT00940000156027.a ENSGT00940000153541.A ENSGT00940000157262.m.b ENSGT00940000156030.j ENSGT00390000001787 #21 ENSGT00940000156490.b.a #22 ENSGT00940000163813 ENSGT00390000005939.a.b.a ENSGT00940000165182.c ENSGT00940000161589 ENSGT00940000155218.A.d ENSGT00940000157379 ENSGT00940000159853 ENSGT00940000156010.db ENSGT00390000011620.a.a.b.f ENSGT00940000158073.a ENSGT00940000160902.c.b ENSGT00390000018730.A.e ENSGT00940000161930 ENSGT00390000002821 ENSGT00940000155532 Ballan wrasse MODERN SPECIES 26 zgc:171857 (ENSLBEG00000006494) WNT7A (ENSLBEG00000006524) FBLN2 (ENSLBEG00000006569) NUP210 (ENSLBEG00000006661) IQSEC1 (ENSLBEG00000007008) zgc:77375 (ENSLBEG00000007066) ENSLBEG00000007132 raf1a (ENSLBEG00000007171) syn2a (ENSLBEG00000007331) VGLL4 (ENSLBEG00000007400) slc6a1a (ENSLBEG00000007443) ENSLBEG00000007505 DUSP7 (ENSLBEG00000007544) ENSLBEG00000007571 spo11 (ENSLBEG00000007627) #21 bmp7b (ENSLBEG00000007667) #22 irf10 (ENSLBEG00000007684) ENSLBEG00000007715 ENSLBEG00000007734 ENSLBEG00000007774 ENSLBEG00000007883 MTG2 (ENSLBEG00000007918) ENSLBEG00000007935 lsm14b (ENSLBEG00000007951) ENSLBEG00000007971 TAF4 (ENSLBEG00000007994) nr2c2 (ENSLBEG00000008028) ENSLBEG00000008057 wdr46 (ENSLBEG00000008068) ENSLBEG00000008109 ENSLBEG00000008156 Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00950000183116.b.a.a.b.a.a.b ENSGT00940000156047.b ENSGT00390000009491.d ENSGT00940000156915.f.a ENSGT00530000064244.a ENSGT00940000164112.a ENSGT00950000183041.A.a.b ENSGT00940000156084 ENSGT00940000156062.n ENSGT00390000003282.B.e ENSGT00940000156027.a ENSGT00940000153541.A ENSGT00940000157262.m.b ENSGT00940000156030.j ENSGT00390000001787 #21 ENSGT00940000156490.b.a #22 ENSGT00940000163813 ENSGT00390000005939.a.b.a ENSGT00940000165182.c ENSGT00940000161589 ENSGT00940000155218.A.d ENSGT00940000157379 ENSGT00940000159853 ENSGT00940000156010.db ENSGT00390000011620.a.a.b.f ENSGT00940000158073.a ENSGT00940000160902.c.b ENSGT00390000018730.A.e ENSGT00940000161930 ENSGT00390000002821 ENSGT00940000155532 Perciformes ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00950000183116.b.a.a.b.a.a.b ENSGT00940000156047.b ENSGT00390000009491.d ENSGT00940000156915.f.a ENSGT00530000064244.a ENSGT00940000164112.a ENSGT00950000183041.A.a.b ENSGT00940000156084 ENSGT00940000156062.n ENSGT00390000003282.B.e ENSGT00940000156027.a ENSGT00940000153541.A ENSGT00940000157262.m.b ENSGT00940000156030.j ENSGT00390000001787 #21 ENSGT00940000156490.b.a #22 ENSGT00940000163813 ENSGT00390000005939.a.b.a ENSGT00940000165182.c ENSGT00940000161589 ENSGT00940000155218.A.d ENSGT00940000157379 ENSGT00940000159853 ENSGT00940000156010.db ENSGT00390000011620.a.a.b.f ENSGT00940000158073.a ENSGT00940000160902.c.b ENSGT00390000018730.A.e ENSGT00940000161930 ENSGT00390000002821 ENSGT00940000155532 Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000163520.A.a.a.a.a.a.a.h ENSGT00940000156047.b ENSGT00390000009491.d ENSGT00940000156915.f.a ENSGT00530000064244.a ENSGT00940000164112.a ENSGT00950000183041.A.a.b ENSGT00940000156084 ENSGT00940000156062.n ENSGT00390000003282.B.e ENSGT00940000156027.a ENSGT00940000153541.A ENSGT00940000157262.m.b ENSGT00940000156030.j ENSGT00390000001787 #21 ENSGT00940000156490.b.a #22 ENSGT00940000163813 ENSGT00390000005939.a.b.a ENSGT00940000165182.c ENSGT00940000161589 ENSGT00940000155218.A.d ENSGT00940000157379 ENSGT00940000159853 ENSGT00940000156010.db ENSGT00390000011620.a.a.b.f ENSGT00940000158073.a ENSGT00940000160902.c.b ENSGT00390000018730.A.e ENSGT00940000161930 ENSGT00940000154897.q ENSGT00510000046470.a.a.b Stickleback MODERN SPECIES 512 rbm38 (ENSGACG00000015224) #19 ENSGACG00000015221 zgc:113278 (ENSGACG00000015220) prkcbp1l (ENSGACG00000015209) ENSGACG00000015205 col9a3 (ENSGACG00000015178) ogfr (ENSGACG00000015176) kcnk15 (ENSGACG00000015173) VGLL4 (ENSGACG00000015170) slc6a1a (ENSGACG00000015157) ENSGACG00000015155 ENSGACG00000015148 DUSP7 (ENSGACG00000015141) ENSGACG00000015138 spo11 (ENSGACG00000015129) #21 bmp7b (ENSGACG00000015125) #22 irf10 (ENSGACG00000015123) ENSGACG00000015121 ENSGACG00000015119 ENSGACG00000015114 ENSGACG00000015110 MTG2 (ENSGACG00000015104) SS18L1 (ENSGACG00000015102) lsm14b (ENSGACG00000015099) TAF4 (ENSGACG00000015092) CDH4 (ENSGACG00000015086) Lumpfish MODERN SPECIES 22 ENSCLMG00005018978 ENSCLMG00005018977 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ENSCHAG00000026219 ENSCHAG00000026223 ENSCHAG00000026226 ENSCHAG00000026231 acad9 (ENSCHAG00000026242) IQSEC1 (ENSCHAG00000026309) hdac11 (ENSCHAG00000026731) FBLN2 (ENSCHAG00000026752) wnt7aa (ENSCHAG00000026868) ENSCHAG00000026871 Otophysi ANCESTRAL SPECIES 211 ENSGT00940000154554.a.e ENSGT00940000154554.a.f ENSGT00940000156315.e.b ENSGT00390000009630 ENSGT00390000003017.c.a ENSGT00940000158320 ENSGT00940000159273 ENSGT00390000018321 ENSGT00940000157448 ENSGT00940000156378.a.a ENSGT00390000014429.a ENSGT00390000011228.b.a.e.a ENSGT00510000047967 ENSGT00940000155048.d.a.k ENSGT00550000074884 ENSGT00940000156490.b.b #22 ENSGT00390000005939.a.b.b ENSGT00940000165182.d ENSGT00940000155218.A.c ENSGT00390000011620.a.a.b.e ENSGT00940000158073.b ENSGT00940000160902.c.a ENSGT00390000018730.A.f ENSGT00940000155532 ENSGT00940000154897.r ENSGT00950000183021.a.b.d ENSGT00940000161109 ENSGT00940000156478 Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00940000154554.a.e ENSGT00940000154554.a.f.a 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ENSGT00940000158436 ENSGT00940000155241.d Mexicana tetra MODERN SPECIES 14 rpn1 (ENSAMXG00000017141) PBRM1 (ENSAMXG00000017325) gnl3 (ENSAMXG00000020880) glt8d1 (ENSAMXG00000042559) spcs1 (ENSAMXG00000017538) nek4 (ENSAMXG00000031938) CAMK1 (ENSAMXG00000017559) zgc:194209 (ENSAMXG00000043132) ENSAMXG00000042647 ccdc3b (ENSAMXG00000030925) ENSAMXG00000042063 ENSAMXG00000037249 fhit (ENSAMXG00000016351) ptprga (ENSAMXG00000016372) cse1l (ENSAMXG00000016416) bmp7a (ENSAMXG00000037549) #22 ENSAMXG00000041468 ENSAMXG00000043601 ENSAMXG00000016453 cdh4 (ENSAMXG00000016470) ENSAMXG00000030049 ENSAMXG00000029646 dido1 (ENSAMXG00000006865) ZMYND8 (ENSAMXG00000006882) NCOA3 (ENSAMXG00000006902) id1 (ENSAMXG00000030460) PFKFB2 (ENSAMXG00000032440) phtf1 (ENSAMXG00000006946) cishb (ENSAMXG00000041177) twf2b (ENSAMXG00000006961) rpusd4 (ENSAMXG00000031479) Red-bellied piranha MODERN SPECIES 6 ENSPNAG00000002680 gata2a (ENSPNAG00000013264) rpn1 (ENSPNAG00000002645) PBRM1 (ENSPNAG00000013202) gnl3 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Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00390000013132.b.a ENSGT00390000003721.d.a.g.a ENSGT00940000156310.p ENSGT01050000244841.A.b.b.b.a ENSGT00390000018596.A.a.a ENSGT01000000215056 ENSGT00940000158931 ENSGT00940000154857.yb.b ENSGT00940000158489.a.b #19 ENSGT00950000183091.B.b.c #20 ENSGT00940000156490.b.b #22 ENSGT00390000005939.a.b.b ENSGT00940000165182.d ENSGT00940000156010.eb ENSGT00390000011620.a.a.b.e ENSGT00940000158073.b ENSGT00940000177296 ENSGT00940000160902.c.a ENSGT00390000018730.A.f ENSGT00940000155532 ENSGT00940000154897.q ENSGT00510000046470.a.a.b ENSGT00950000183021.a.b.c ENSGT00940000154897.r ENSGT00950000183021.a.b.d ENSGT00940000161109 Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 103 ENSGT00390000003721.d.a.g.a.a ENSGT00940000156310.p.d ENSGT01050000244841.A.b.b.b.a.e ENSGT00390000018596.A.a.a.h ENSGT01000000215056.a ENSGT00940000158931.k ENSGT00940000154857.yb.b ENSGT00940000158489.a.b.a #19 ENSGT00950000183091.B.b.c #20 ENSGT00940000156490.b.b.c 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ENSOMYG00000044786 ENSOMYG00000007315 ENSOMYG00000008594 ID1C (ENSOMYG00000008617) sulf2a (ENSOMYG00000008664) arhgap46a (ENSOMYG00000008693) Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000016233.e.a.a.a ENSGT00950000182835.c.d.c.a.c ENSGT00940000154089.a.c.h ENSGT00940000154791 ENSGT00940000166464.d ENSGT00390000013132.b.a.d ENSGT00390000003721.d.a.g.a.a ENSGT00940000156310.p.d ENSGT01050000244841.A.b.b.b.a.e ENSGT00390000018596.A.a.a.h ENSGT01000000215056.a ENSGT00940000158931.k ENSGT00940000154857.yb.b ENSGT00940000158489.a.b.a #19 ENSGT00950000183091.B.b.c #20 ENSGT00940000156490.b.b.c #22 ENSGT00390000005939.a.b.b.d ENSGT00940000165182.d.c ENSGT00390000011620.a.a.b.e ENSGT00940000158073.b.g ENSGT00940000160902.c.a.b ENSGT00390000018730.A.f.p.a ENSGT00940000155532.vd.a.b.a ENSGT00940000154897.r.d ENSGT00950000183021.a.b.d.d ENSGT00940000161109.n.b ENSGT00940000166926.d ENSGT00940000164502.a.b.d ENSGT00940000156477.d.a.j ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b.a.b ENSGT00940000160331.f.b 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Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000018439 ENSGT00390000008947.a ENSGT00390000016233.e.a.a.b ENSGT00950000182835.c.d.c.a.d ENSGT00940000154089.a.c.g ENSGT00940000166464.c ENSGT00390000013132.b.a.c ENSGT00390000003721.d.a.g.a.b ENSGT00940000156310.p.c ENSGT01050000244841.A.b.b.b.a.f ENSGT00390000018596.A.a.a.g ENSGT01000000215056.b ENSGT00940000158931.l ENSGT00940000158489.a.a.d #19 ENSGT00940000158489.a.b.b #19 ENSGT00940000156490.b.b.d #22 ENSGT00390000005939.a.b.b.c ENSGT00940000165182.d.d ENSGT00940000156010.eb ENSGT00940000158073.b.h ENSGT00940000160902.c.a.a ENSGT00940000155532.vd.b ENSGT00390000018730.A.f.o ENSGT00940000154897.r.c ENSGT00950000183021.a.b.d.c ENSGT00940000161109.n.a ENSGT00940000166926.c ENSGT00940000164502.a.b.c ENSGT00940000156477.d.a.i ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b.b ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b.a.a Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000155864.a.b.c ENSGT00390000018439 ENSGT00390000008947.a ENSGT00390000016233.e.a.a.b 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ENSSTUG00000030219 ndrg3a (ENSSTUG00000030326) ENSSTUG00000033367 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000018439 ENSGT00390000008947.a ENSGT00390000016233.e.a.a.b ENSGT00950000182835.c.d.c.a.d ENSGT00940000154089.a.c.g ENSGT00940000166464.c ENSGT00390000013132.b.a.c ENSGT00390000003721.d.a.g.a.b ENSGT00940000156310.p.c ENSGT01050000244841.A.b.b.b.a.f ENSGT00390000018596.A.a.a.g ENSGT01000000215056.b ENSGT00940000158931.l ENSGT00940000156245.b ENSGT00940000158489.a.b.b #19 ENSGT00940000156490.b.b.d #22 ENSGT00390000005939.a.b.b.c ENSGT00940000165182.d.d ENSGT00940000156010.eb ENSGT00940000158073.b.h ENSGT00940000160902.c.a.a ENSGT00940000155532.vd.b ENSGT00390000018730.A.f.o ENSGT00940000154897.r.c ENSGT00950000183021.a.b.d.c ENSGT00940000161109.n.a ENSGT00940000166926.c ENSGT00940000164502.a.b.c ENSGT00940000156477.d.a.i ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b.b.b ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b.a.a Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000018439 ENSGT00390000008947.a ENSGT00390000016233.e.a.a.b ENSGT00950000182835.c.d.c.a.d ENSGT00940000154089.a.c.g ENSGT00940000166464.c ENSGT00390000013132.b.a.c ENSGT00390000003721.d.a.g.a.b ENSGT00940000156310.p.c ENSGT01050000244841.A.b.b.b.a.f ENSGT00390000018596.A.a.a.g ENSGT01000000215056.b ENSGT00940000158931.l ENSGT00940000156245.b ENSGT00940000158489.a.b.b #19 ENSGT00940000156490.b.b.d #22 ENSGT00940000165182.d.d ENSGT00940000156010.eb ENSGT00940000158073.b.h ENSGT00940000160902.c.a.a ENSGT00940000155532.vd.b ENSGT00390000018730.A.f.o ENSGT00940000154897.r.c ENSGT00950000183021.a.b.d.c ENSGT00940000161109.n.a ENSGT00940000166926.c ENSGT00940000164502.a.b.c ENSGT00940000156477.d.a.i ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b.a.a ENSGT00940000160331.f.a ENSGT00390000018330.f.a Coho salmon MODERN SPECIES 25 rab7a (ENSOKIG00005017511) hmces (ENSOKIG00005017466) tada3l (ENSOKIG00005017451) ARPC4 (ENSOKIG00005017430) pfkfb4a (ENSOKIG00005013806) mapkapk3 (ENSOKIG00005013363) ENSOKIG00005013310 chchd4a (ENSOKIG00005013290) 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sulf2a (ENSOMYG00000029277) Huchen MODERN SPECIES 335 ENSHHUG00000036913 cidec (ENSHHUG00000036902) uqcrc1 (ENSHHUG00000036883) ENSHHUG00000036880 ENSHHUG00000036868 #19 ENSHHUG00000036864 bmp7a (ENSHHUG00000036856) #22 ENSHHUG00000036854 ENSHHUG00000036853 LSM14B (ENSHHUG00000036841) cdh4 (ENSHHUG00000035538) ENSHHUG00000035509 ENSHHUG00000035501 ENSHHUG00000035495 ENSHHUG00000035488 ZMYND8 (ENSHHUG00000034217) NCOA3 (ENSHHUG00000034193) id1 (ENSHHUG00000034172) Northern pike MODERN SPECIES 16 arpc4 (ENSELUG00000006470) pfkfb4a (ENSELUG00000006392) mapkapk3 (ENSELUG00000006341) DNAH1 (ENSELUG00000006295) ENSELUG00000006181 chchd4a (ENSELUG00000006166) SEC61A1 (ENSELUG00000006142) ip6k2a (ENSELUG00000006086) ENSELUG00000025158 ENSELUG00000006029 cidec (ENSELUG00000006000) ENSELUG00000005948 uqcrc1 (ENSELUG00000005895) RBM38 (ENSELUG00000005849) #19 rae1 (ENSELUG00000005833) #20 bmp7a (ENSELUG00000005817) #22 ENSELUG00000005806 ENSELUG00000005799 LSM14B (ENSELUG00000005780) TAF4 (ENSELUG00000005741) cdh4 (ENSELUG00000005693) KCNK15 (ENSELUG00000000159) ENSELUG00000031326 ENSELUG00000005607 ENSELUG00000033279 ZMYND8 (ENSELUG00000005483) ENSELUG00000005397 id1 (ENSELUG00000005365) sulf2a (ENSELUG00000005287) arhgap46a (ENSELUG00000005147) ENSELUG00000005071 Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 42 ENSGT00940000158489.a.b #19 ENSGT00950000183091.B.b #20 ENSGT00940000156490.b.b #22 ENSGT00390000005939.a.b.b ENSGT00940000165182.d ENSGT00940000155218.A.c ENSGT00940000156010.eb ENSGT00390000011620.a.a.b.e ENSGT00940000158073.b ENSGT00940000177296 ENSGT00940000160902.c.a ENSGT00390000018730.A.f ENSGT00940000154897.r ENSGT00950000183021.a.b.d ENSGT00940000161109 ENSGT00940000166926 ENSGT00940000164502.a.b ENSGT00940000156477.d.a Cod MODERN SPECIES 4 ENSGMOG00000024791 mustn1b (ENSGMOG00000019317) stimate (ENSGMOG00000019310) SFMBT1 (ENSGMOG00000019301) ENSGMOG00000019294 ENSGMOG00000036049 ENSGMOG00000019276 ENSGMOG00000019270 ENSGMOG00000010010 ENSGMOG00000027022 ENSGMOG00000034646 ENSGMOG00000009988 ENSGMOG00000029494 RBM38 (ENSGMOG00000029207) #19 RAE1 (ENSGMOG00000016670) #20 bmp7a (ENSGMOG00000016691) #22 ENSGMOG00000036693 ENSGMOG00000032653 ENSGMOG00000016727 LSM14B (ENSGMOG00000017115) ENSGMOG00000017138 CDH4 (ENSGMOG00000017191) ENSGMOG00000025076 ogfr2 (ENSGMOG00000017268) ENSGMOG00000022276 ENSGMOG00000027426 ENSGMOG00000022915 ENSGMOG00000017376 ENSGMOG00000017433 id1 (ENSGMOG00000037179) sulf2a (ENSGMOG00000017504) Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000018596.A.a.a ENSGT01050000244841.A.b.b.b.a ENSGT00940000156310.p ENSGT00390000003721.d.a.g.a ENSGT00390000013132.b.a ENSGT00940000166464 ENSGT00940000174829 ENSGT00940000154791 ENSGT00940000154089.a.c ENSGT00950000182835.c.d.c.a ENSGT00390000016233.e.a ENSGT00390000008947 ENSGT00940000156245.b ENSGT00940000158489.a.b #19 ENSGT00950000183091.B.b #20 ENSGT00940000156490.b.b #22 ENSGT00390000005939.a.b.b ENSGT00940000165182.d ENSGT00940000155218.A.c ENSGT00940000156010.eb 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arhgap46a (ENSMMDG00005004002) PHF20 (ENSMMDG00005004009) Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000169986 ENSGT00390000018596.A.a.a ENSGT01050000244841.A.b.b.b.a ENSGT00940000156310.p ENSGT00390000003721.d.a.g.a ENSGT00390000013132.b.a ENSGT00940000166464 ENSGT00940000174829 ENSGT00940000154791 ENSGT00940000154089.a.c ENSGT00950000182835.c.d.c.a ENSGT00390000016233.e.a ENSGT00390000008947 ENSGT00940000158489.a.b #19 ENSGT00950000183091.B.b #20 ENSGT00940000156490.b.b #22 ENSGT00390000005939.a.b.b ENSGT00940000165182.d ENSGT00940000155218.A.c ENSGT00940000156010.eb ENSGT00390000011620.a.a.b.e ENSGT00940000158073.b ENSGT00940000177296 ENSGT00940000160902.c.a ENSGT00390000018730.A.f ENSGT00940000154897.r ENSGT00950000183021.a.b.d ENSGT00940000161109 ENSGT00940000166926 ENSGT00940000164502.a.b ENSGT00940000156477.d.a Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 510 ENSHCOG00000005676 ZMYND8 (ENSHCOG00000005670) ARPC4 (ENSHCOG00000005642) tada3l (ENSHCOG00000005625) RBM38 (ENSHCOG00000005622) #19 rae1 (ENSHCOG00000005616) #20 BMP7 (ENSHCOG00000005555) #22 ENSHCOG00000004876 LSM14B (ENSHCOG00000004867) ENSHCOG00000004862 ENSHCOG00000004847 cdh4 (ENSHCOG00000004825) ENSHCOG00000004773 slc25a26 (ENSHCOG00000004718) ENSHCOG00000004706 LRIG1 (ENSHCOG00000004691) kbtbd8 (ENSHCOG00000004650) ENSHCOG00000004623 suclg2 (ENSHCOG00000004615) ENSHCOG00000004607 tafa4b (ENSHCOG00000004598) EOGT (ENSHCOG00000004579) Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000169986 ENSGT00390000018596.A.a.a ENSGT01050000244841.A.b.b.b.a ENSGT00940000156310.p ENSGT00390000003721.d.a.g.a ENSGT00390000013132.b.a ENSGT00940000166464 ENSGT00940000174829 ENSGT00940000154791 ENSGT00940000154089.a.c ENSGT00950000182835.c.d.c.a ENSGT00390000016233.e.a ENSGT00390000008947 ENSGT00940000158489.a.b #19 ENSGT00950000183091.B.b #20 ENSGT00940000156490.b.b #22 ENSGT00390000005939.a.b.b ENSGT00940000165182.d ENSGT00940000155218.A.c ENSGT00940000156010.eb ENSGT00390000011620.a.a.b.e ENSGT00940000158073.b ENSGT00940000177296 ENSGT00940000160902.c.a ENSGT00390000018730.A.f ENSGT00940000154897.r ENSGT00950000183021.a.b.d ENSGT00940000161109 ENSGT00940000166926 ENSGT00940000164502.a.b ENSGT00940000156477.d.a Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000169986 ENSGT00390000018596.A.a.a ENSGT01050000244841.A.b.b.b.a ENSGT00940000156310.p ENSGT00390000003721.d.a.g.a ENSGT00390000013132.b.a ENSGT00940000166464 ENSGT00940000174829 ENSGT00940000154791 ENSGT00940000154089.a.c ENSGT00950000182835.c.d.c.a ENSGT00390000016233.e.a ENSGT00390000008947 ENSGT00940000158489.a.b #19 ENSGT00950000183091.B.b #20 ENSGT00940000156490.b.b #22 ENSGT00390000005939.a.b.b ENSGT00940000165182.d ENSGT00940000155218.A.c ENSGT00940000156010.eb ENSGT00390000011620.a.a.b.e ENSGT00940000158073.b ENSGT00940000177296 ENSGT00940000160902.c.a ENSGT00390000018730.A.f ENSGT00940000154897.r ENSGT00950000183021.a.b.d ENSGT00940000161109 ENSGT00940000166926 ENSGT00940000164502.a.b ENSGT00940000156477.d.a Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000169986 ENSGT00390000018596.A.a.a ENSGT01050000244841.A.b.b.b.a ENSGT00940000156310.p ENSGT00390000003721.d.a.g.a ENSGT00390000013132.b.a ENSGT00940000166464 ENSGT00940000174829 ENSGT00940000154791 ENSGT00940000154089.a.c ENSGT00950000182835.c.d.c.a ENSGT00390000016233.e.a ENSGT00390000008947 ENSGT00940000158489.a.b #19 ENSGT00950000183091.B.b #20 ENSGT00940000156490.b.b #22 ENSGT00940000165182.d ENSGT00940000155218.A.c ENSGT00940000156010.eb ENSGT00390000011620.a.a.b.e ENSGT00940000158073.b ENSGT00940000177296 ENSGT00940000160902.c.a ENSGT00390000018730.A.f ENSGT00940000154897.r ENSGT00950000183021.a.b.d ENSGT00940000161109 ENSGT00940000166926 ENSGT00940000164502.a.b ENSGT00940000156477.d.a ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00940000166196 ENSGT00940000166313.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT00940000164411 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000158405 ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00940000154089.a.c ENSGT00950000182835.c.d.c.a ENSGT00390000016233.e.a ENSGT00390000008947 ENSGT00940000158489.a.b #19 ENSGT00950000183091.B.b #20 ENSGT00940000156490.b.b #22 ENSGT00940000165182.d ENSGT00940000155218.A.c ENSGT00940000156010.eb ENSGT00390000011620.a.a.b.e ENSGT00940000158073.b ENSGT00940000177296 ENSGT00940000160902.c.a ENSGT00390000018730.A.f ENSGT00940000154897.r ENSGT00950000183021.a.b.d ENSGT00940000161109 ENSGT00940000166926 ENSGT00940000164502.a.b ENSGT00940000156477.d.a ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000166196 ENSGT00940000166313.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT00940000164411 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000158405 ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00940000154089.a.c ENSGT00950000182835.c.d.c.a ENSGT00390000016233.e.a ENSGT00390000008947 ENSGT00940000158489.a.b #19 ENSGT00950000183091.B.b #20 ENSGT00940000156490.b.b #22 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ENSGT00940000161109 ENSGT00940000166926 ENSGT00940000164502.a.b ENSGT00940000156477.d.a ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b ENSGT00940000160331 Orange clownfish MODERN SPECIES 20 si:dkey-13a21.4 (ENSAPEG00000023338) gata1a (ENSAPEG00000023372) BCL2L1 (ENSAPEG00000023385) adnpa (ENSAPEG00000023391) ENSAPEG00000023397 MAFB (ENSAPEG00000023407) fam83d (ENSAPEG00000023418) ENSAPEG00000023431 top1a (ENSAPEG00000023452) MAPKAPK3 (ENSAPEG00000023504) pfkfb4a (ENSAPEG00000023519) arpc4 (ENSAPEG00000023544) tada3l (ENSAPEG00000023555) RBM38 (ENSAPEG00000023581) #19 rae1 (ENSAPEG00000023589) #20 bmp7a (ENSAPEG00000023610) #22 ENSAPEG00000023619 ENSAPEG00000023624 LSM14B (ENSAPEG00000023633) ENSAPEG00000023671 cdh4 (ENSAPEG00000023708) ENSAPEG00000023796 ogfr2 (ENSAPEG00000023804) ENSAPEG00000023815 ZMYND8 (ENSAPEG00000023865) NCOA3 (ENSAPEG00000024040) id1 (ENSAPEG00000024079) sulf2a (ENSAPEG00000024100) arhgap46a (ENSAPEG00000024124) PHF20 (ENSAPEG00000024148) ndrg3a (ENSAPEG00000024175) Clown anemonefish MODERN SPECIES 1068 RBM38 (ENSAOCG00000012559) #19 rae1 (ENSAOCG00000012519) #20 bmp7a (ENSAOCG00000012469) #22 ENSAOCG00000012441 ENSAOCG00000012394 LSM14B (ENSAOCG00000012380) ENSAOCG00000012362 Spiny chromis MODERN SPECIES 2429 bmp7a (ENSAPOG00000001722) #22 ENSAPOG00000001734 ENSAPOG00000001769 ENSAPOG00000001780 ENSAPOG00000001831 Bicolor damselfish MODERN SPECIES 1122 si:dkey-13a21.4 (ENSSPAG00000021279) gata1a (ENSSPAG00000021259) BCL2L1 (ENSSPAG00000021255) adnpa (ENSSPAG00000021247) ENSSPAG00000021221 MAFB (ENSSPAG00000021215) fam83d (ENSSPAG00000021210) ENSSPAG00000021203 top1a (ENSSPAG00000021140) ENSSPAG00000021102 PFKFB4 (ENSSPAG00000021065) ARPC4 (ENSSPAG00000021038) tada3l (ENSSPAG00000021006) RBM38 (ENSSPAG00000020989) #19 rae1 (ENSSPAG00000020972) #20 bmp7a (ENSSPAG00000020958) #22 ENSSPAG00000020949 ENSSPAG00000020915 ENSSPAG00000020887 Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000169986 ENSGT00390000018596.A.a.a ENSGT01050000244841.A.b.b.b.a 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(ENSONIG00000020316) ENSONIG00000032490 ENSONIG00000029288 ENSONIG00000038101 ENSONIG00000020315 ZMYND8 (ENSONIG00000020314) NCOA3 (ENSONIG00000020313) id1 (ENSONIG00000040265) sulf2a (ENSONIG00000020311) arhgap46a (ENSONIG00000020310) PHF20 (ENSONIG00000020309) Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000169986 ENSGT00390000018596.A.a.a ENSGT01050000244841.A.b.b.b.a ENSGT00940000156310.p ENSGT00390000003721.d.a.g.a ENSGT00390000013132.b.a ENSGT00940000166464 ENSGT00940000174829 ENSGT00940000154791 ENSGT00940000154089.a.c ENSGT00950000182835.c.d.c.a ENSGT00390000016233.e.a ENSGT00390000008947 ENSGT00940000158489.a.b #19 ENSGT00950000183091.B.b #20 ENSGT00940000156490.b.b #22 ENSGT00940000165182.d ENSGT00940000155218.A.c ENSGT00940000156010.eb ENSGT00390000011620.a.a.b.e ENSGT00940000158073.b ENSGT00940000177296 ENSGT00940000160902.c.a ENSGT00390000018730.A.f ENSGT00940000155532 ENSGT00940000154897.r ENSGT00950000183021.a.b.d ENSGT00940000161109 ENSGT00940000166926 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DUPLICATION Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000156490.b.b.e #22 Poecilia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000156490.b.b.e #22 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000156490.b.b.e #22 Sailfin molly MODERN SPECIES 3926 BMP7 (ENSPLAG00000018898) #22 irf10 (ENSPLAG00000018876) Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000169986 ENSGT00390000018596.A.a.a ENSGT01050000244841.A.b.b.b.a ENSGT00940000156310.p ENSGT00390000003721.d.a.g.a ENSGT00390000013132.b.a ENSGT00940000166464 ENSGT00940000174829 ENSGT00940000154791 ENSGT00940000154089.a.c ENSGT00950000182835.c.d.c.a ENSGT00390000016233.e.a ENSGT00390000008947 ENSGT00940000158489.a.b #19 ENSGT00950000183091.B.b #20 ENSGT00940000156490.b.b.f #22 ENSGT00390000005939.a.b.b ENSGT00940000165182.d ENSGT00940000155218.A.c ENSGT00940000156010.eb ENSGT00390000011620.a.a.b.e ENSGT00940000158073.b ENSGT00940000177296 ENSGT00940000154664.h.n.c.c ENSGT00940000160902.c.a ENSGT00390000018730.A.f ENSGT00940000154897.r ENSGT00950000183021.a.b.d 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ENSGT00940000154897.r ENSGT00950000183021.a.b.d ENSGT00940000161109 ENSGT00940000166926 ENSGT00940000164502.a.b ENSGT00940000156477.d.a Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000169986 ENSGT00390000018596.A.a.a ENSGT01050000244841.A.b.b.b.a ENSGT00940000156310.p ENSGT00390000003721.d.a.g.a ENSGT00390000013132.b.a ENSGT00940000166464 ENSGT00940000174829 ENSGT00940000154791 ENSGT00940000154089.a.c ENSGT00950000182835.c.d.c.a ENSGT00390000016233.e.a ENSGT00390000008947 ENSGT00940000158489.a.b #19 ENSGT00950000183091.B.b #20 ENSGT00940000156490.b.b #22 ENSGT00390000005939.a.b.b ENSGT00940000165182.d ENSGT00940000155218.A.c ENSGT00940000156010.eb ENSGT00390000011620.a.a.b.e ENSGT00940000158073.b ENSGT00940000160902.c.a ENSGT00390000018730.A.f ENSGT00940000154897.r ENSGT00950000183021.a.b.d ENSGT00940000161109 ENSGT00940000166926 ENSGT00940000164502.a.b ENSGT00940000156477.d.a ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b Seriola ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000169986 ENSGT00390000018596.A.a.a 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ENSATEG00000016287 id1 (ENSATEG00000027640) sulf2a (ENSATEG00000016107) arhgap46a (ENSATEG00000016027) ENSATEG00000015958 Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000154468.tb.b.a.b ENSGT00940000156368.a ENSGT00940000155740 ENSGT00940000162210 ENSGT00940000160586 ENSGT00940000165482 ENSGT00940000166842 ENSGT00390000011067.C ENSGT01050000244841.A.b.b.b.a.a ENSGT00390000018596.A.a.a ENSGT01030000235510 ENSGT00940000158931.f ENSGT00940000158489.a.a #19 ENSGT00940000158489.b #19 ENSGT00950000183091.B.b #20 ENSGT00940000156490.b.b #22 ENSGT00390000005939.a.b.b ENSGT00940000163813.g ENSGT00940000165182.b ENSGT00940000159853.a.a ENSGT00940000156010.eb ENSGT00390000011620.a.a.b ENSGT00940000158073.c.a ENSGT00940000160902.c.a ENSGT00390000018730.A.f ENSGT00390000002821 ENSGT00940000181232 ENSGT00940000154897.s ENSGT00950000183021.a.b.e ENSGT00940000156478.d ENSGT00940000161109 P. kingsleyae MODERN SPECIES 322 rem1 (ENSPKIG00000017079) rbm39b (ENSPKIG00000017145) si:ch211-15p9.2 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#20 rbm24a (ENSCMIG00000015448) Cyclostomata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000156490 #22 Lamprey MODERN SPECIES 2386 ENSPMAG00000000166 ENSPMAG00000000167 #22