Theria	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000160427 #7	ENSGT00390000005121 #8	ENSGT00390000007843 #9	ENSGT00940000159091 #10	ENSGT00940000154298.a.b	ENSGT00950000183025.a #12	ENSGT00940000161434 #13	ENSGT00940000159029 #14	ENSGT00940000161386 #15	ENSGT00940000161529 #16	ENSGT00940000161230 #17	ENSGT00940000161108 #18	ENSGT00940000158354 #19	ENSGT00940000162072 #20	ENSGT00940000159774 #21	ENSGT00940000155029.c.b #22	ENSGT00940000159503 #23	ENSGT00940000172404	ENSGT00390000017856.b #24	ENSGT00940000160113 #25	ENSGT00940000154152.d #26	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00390000000713	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000011219	ENSGT00640000092844	ENSGT00940000159590	ENSGT00940000161498	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161315
Eutheria	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000160427 #7	ENSGT00390000005121 #8	ENSGT00390000007843 #9	ENSGT00940000159091 #10	ENSGT00940000154298.a.b	ENSGT00950000183025.a #12	ENSGT00940000161434 #13	ENSGT00940000159029 #14	ENSGT00940000161386 #15	ENSGT00940000161529 #16	ENSGT00940000161230 #17	ENSGT00940000161108 #18	ENSGT00940000158354 #19	ENSGT00940000162072 #20	ENSGT00940000159774 #21	ENSGT00940000155029.c.b #22	ENSGT00940000159503 #23	ENSGT00390000017856.b #24	ENSGT00940000160113 #25	ENSGT00940000154152.d #26	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00390000000713	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000159590	ENSGT00940000161498	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000157439
Boreoeutheria	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000159720 #11	ENSGT01100000264599	ENSGT00940000159091 #10	ENSGT00940000154298.a.b	ENSGT00950000183025.a #12	ENSGT00940000161434 #13	ENSGT00940000159029 #14	ENSGT00940000161386 #15	ENSGT00940000161529 #16	ENSGT00940000161230 #17	ENSGT00940000161108 #18	ENSGT00940000158354 #19	ENSGT00940000162072 #20	ENSGT00980000199681	ENSGT00940000159774 #21	ENSGT00940000155029.c.b #22	ENSGT00940000159503 #23	ENSGT00390000017856.b #24	ENSGT00940000160113 #25	ENSGT00940000154152.d.b #26	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000185410	ENSGT00390000000713	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000159590	ENSGT00940000161498	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000000603
Euarchontoglires	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT01100000264599	ENSGT00940000159091 #10	ENSGT00940000154298.a.b	ENSGT00940000159720 #11	ENSGT00950000183025.a #12	ENSGT00940000161434 #13	ENSGT00940000159029 #14	ENSGT00940000161386 #15	ENSGT00940000161529 #16	ENSGT00940000161230 #17	ENSGT00940000161108 #18	ENSGT00940000158354 #19	ENSGT00940000162072 #20	ENSGT00980000199681	ENSGT00940000159774 #21	ENSGT00940000155029.c.b #22	ENSGT00940000159503 #23	ENSGT00390000017856.b #24	ENSGT00940000160113 #25	ENSGT00940000154152.d.b #26	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000185410	ENSGT00390000000713	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000159590	ENSGT00940000161498	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000000603
Primates	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00390000007843 #9	ENSGT01100000264599	ENSGT00940000159091 #10	ENSGT00940000154298.a.b	ENSGT00950000183025.a #12	ENSGT00940000161434 #13	ENSGT00940000159029 #14	ENSGT00940000161386 #15	ENSGT00940000161529 #16	ENSGT00940000161230 #17	ENSGT00940000161108 #18	ENSGT00940000158354 #19	ENSGT00940000162072 #20	ENSGT00980000199681	ENSGT00940000159774 #21	ENSGT00940000155029.c.b #22	ENSGT00940000159503 #23	ENSGT00390000017856.b #24	ENSGT00940000160113 #25	ENSGT00940000154152.d.b #26	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000185410	ENSGT00390000000713	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000159590	ENSGT00940000161498	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000000603
Strepsirrhini	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000160427 #7	ENSGT00390000005121 #8	ENSGT00390000007843 #9	ENSGT00940000159091 #10	ENSGT00940000159720 #11	ENSGT00950000183025.a #12	ENSGT00940000161434 #13	ENSGT00940000159029 #14	ENSGT00940000161386 #15	ENSGT00940000161529 #16	ENSGT00940000161230 #17	ENSGT00940000161108 #18	ENSGT00940000158354 #19	ENSGT00940000162072 #20	ENSGT00940000159774 #21	ENSGT00940000155029.c.b #22	ENSGT00940000159503 #23	ENSGT00390000017856.b #24	ENSGT00940000160113 #25	ENSGT00940000154152.d.b #26	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000185410	ENSGT00390000000713	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000159590.h	ENSGT00940000161498	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000000603
Lemuriformes	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000160427 #7	ENSGT00390000005121 #8	ENSGT00390000007843 #9	ENSGT00940000159091 #10	ENSGT00940000159720 #11	ENSGT00950000183025.a #12	ENSGT00940000161434 #13	ENSGT00940000159029 #14	ENSGT00940000161386 #15	ENSGT00940000161529 #16	ENSGT00940000161230 #17	ENSGT00940000161108 #18	ENSGT00940000158354 #19	ENSGT00940000162072 #20	ENSGT00940000159774 #21	ENSGT00940000155029.c.b #22	ENSGT00940000159503 #23	ENSGT00390000017856.b #24	ENSGT00940000160113 #25	ENSGT00940000154152.d.b #26	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000185410	ENSGT00390000000713	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000159590.h	ENSGT00940000161498	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000000603
Lemuriformes_a	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000160427 #7	ENSGT00390000005121 #8	ENSGT00390000007843 #9	ENSGT00940000159091 #10	ENSGT00940000159720 #11	ENSGT00950000183025.a #12	ENSGT00940000161434 #13	ENSGT00940000159029 #14	ENSGT00940000161386 #15	ENSGT00940000161529 #16	ENSGT00940000161230 #17	ENSGT00940000161108 #18	ENSGT00940000158354 #19	ENSGT00940000162072 #20	ENSGT00940000159774 #21	ENSGT00940000155029.c.b #22	ENSGT00940000159503 #23	ENSGT00390000017856.b #24	ENSGT00940000160113 #25	ENSGT00940000154152.d.b #26	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000185410	ENSGT00390000000713	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000159590.h	ENSGT00940000161498	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000000603
Greater bamboo lemur	MODERN SPECIES	168	IGF2BP1 (ENSPSMG00000020445) #7	GIP (ENSPSMG00000020432) #8	SNF8 (ENSPSMG00000020426) #9	UBE2Z (ENSPSMG00000020387) #10	ENSPSMG00000020369 #11	CALCOCO2 (ENSPSMG00000020308) #12	ENSPSMG00000020243 #13	HOXB13 (ENSPSMG00000020237) #14	HOXB9 (ENSPSMG00000020232) #15	HOXB8 (ENSPSMG00000020227) #16	HOXB7 (ENSPSMG00000020218) #17	HOXB6 (ENSPSMG00000020209) #18	HOXB5 (ENSPSMG00000020200) #19	HOXB4 (ENSPSMG00000020187) #20	HOXB3 (ENSPSMG00000020182) #21	HOXB2 (ENSPSMG00000020176) #22	HOXB1 (ENSPSMG00000020167) #23	SKAP1 (ENSPSMG00000020161) #24	SNX11 (ENSPSMG00000020139) #25	CBX1 (ENSPSMG00000020119) #26
Coquerels sifaka	MODERN SPECIES	120	IGF2BP1 (ENSPCOG00000006475) #7	GIP (ENSPCOG00000024832) #8	SNF8 (ENSPCOG00000026895) #9	UBE2Z (ENSPCOG00000014816) #10	ENSPCOG00000008741 #11	CALCOCO2 (ENSPCOG00000021998) #12	TTLL6 (ENSPCOG00000021391) #13	HOXB13 (ENSPCOG00000018182) #14	HOXB9 (ENSPCOG00000027130) #15	HOXB8 (ENSPCOG00000024853) #16	HOXB7 (ENSPCOG00000028248) #17	HOXB6 (ENSPCOG00000019931) #18	HOXB5 (ENSPCOG00000015692) #19	HOXB4 (ENSPCOG00000022963) #20	HOXB3 (ENSPCOG00000020113) #21	HOXB2 (ENSPCOG00000017380) #22	HOXB1 (ENSPCOG00000025930) #23	SKAP1 (ENSPCOG00000022221) #24	SNX11 (ENSPCOG00000011015) #25	ENSPCOG00000010902 #26	NFE2L1 (ENSPCOG00000021740)	COPZ2 (ENSPCOG00000018359)	CDK5RAP3 (ENSPCOG00000016598)	PNPO (ENSPCOG00000017906)	SP2 (ENSPCOG00000017198)	SP6 (ENSPCOG00000008529)	SCRN2 (ENSPCOG00000014438)	LRRC46 (ENSPCOG00000015829)	MRPL10 (ENSPCOG00000025492)	OSBPL7 (ENSPCOG00000019714)	TBX21 (ENSPCOG00000014387)
Mouse lemur	MODERN SPECIES	7	ENSMICG00000013324 #7	GIP (ENSMICG00000013317) #8	SNF8 (ENSMICG00000013305) #9	UBE2Z (ENSMICG00000046102) #10	ENSMICG00000003414 #11	CALCOCO2 (ENSMICG00000015330) #12	TTLL6 (ENSMICG00000007549) #13	HOXB13 (ENSMICG00000007546) #14	HOXB9 (ENSMICG00000038413) #15	HOXB8 (ENSMICG00000045961) #16	HOXB7 (ENSMICG00000007539) #17	HOXB6 (ENSMICG00000042216) #18	HOXB5 (ENSMICG00000047139) #19	HOXB4 (ENSMICG00000043173) #20	HOXB3 (ENSMICG00000007522) #21	HOXB2 (ENSMICG00000038222) #22	HOXB1 (ENSMICG00000048152) #23	SKAP1 (ENSMICG00000047158) #24	ENSMICG00000029923	SNX11 (ENSMICG00000014741) #25	NFE2L1 (ENSMICG00000014716)	ENSMICG00000009510 #26	COPZ2 (ENSMICG00000014097)	CDK5RAP3 (ENSMICG00000014077)	ENSMICG00000014065	SP2 (ENSMICG00000036051)	SP6 (ENSMICG00000047695)	SCRN2 (ENSMICG00000004823)	LRRC46 (ENSMICG00000004816)	MRPL10 (ENSMICG00000048091)	OSBPL7 (ENSMICG00000004799)
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Haplorrhini	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00390000007843 #9	ENSGT01100000264599	ENSGT00940000159091 #10	ENSGT00940000154298.a.b	ENSGT00950000183025.a #12	ENSGT00940000161434 #13	ENSGT00940000159029 #14	ENSGT00940000161386 #15	ENSGT00940000161529 #16	ENSGT00940000161230 #17	ENSGT00940000161108 #18	ENSGT00940000158354 #19	ENSGT00940000162072 #20	ENSGT00980000199681	ENSGT00940000159774 #21	ENSGT00940000155029.c.b #22	ENSGT00940000159503 #23	ENSGT00390000017856.b #24	ENSGT00940000160113 #25	ENSGT00940000154152.d.b #26	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00390000000713	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000159590	ENSGT00940000161498	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000157439
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Catarrhini	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00390000007843.v #9	ENSGT00940000159091 #10	ENSGT00940000154298.a.b	ENSGT00950000183025.a #12	ENSGT00940000161434 #13	ENSGT00940000159029 #14	ENSGT00860000135909	ENSGT00940000165611	ENSGT00940000161386 #15	ENSGT00940000161529 #16	ENSGT00940000161230 #17	ENSGT00940000161108 #18	ENSGT00940000158354 #19	ENSGT00940000162072 #20	ENSGT00940000159774 #21	ENSGT00940000155029.c.b #22	ENSGT00940000159503 #23	ENSGT00390000017856.b #24	ENSGT00940000160113 #25	ENSGT00940000154152.d.b #26	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00390000000713	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000159590	ENSGT00940000161498	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000000603.b	ENSGT00940000157439
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Gorilla	MODERN SPECIES	18	ENSGGOG00000041818 #10	ENSGGOG00000041027	ATP5MC1 (ENSGGOG00000001626)	ENSGGOG00000040493	CALCOCO2 (ENSGGOG00000005537) #12	TTLL6 (ENSGGOG00000001947) #13	HOXB13 (ENSGGOG00000001945) #14	ENSGGOG00000042122	PRAC1 (ENSGGOG00000027105)	ENSGGOG00000036688 #15	HOXB8 (ENSGGOG00000039810) #16	HOXB7 (ENSGGOG00000002637) #17	HOXB6 (ENSGGOG00000002634) #18	HOXB5 (ENSGGOG00000023582) #19	HOXB3 (ENSGGOG00000012838) #21	HOXB2 (ENSGGOG00000009910) #22	HOXB1 (ENSGGOG00000009904) #23	SKAP1 (ENSGGOG00000012624) #24	ENSGGOG00000025896	CBX1 (ENSGGOG00000024063) #26	NFE2L1 (ENSGGOG00000002268)	COPZ2 (ENSGGOG00000002264)	ENSGGOG00000022994	PRR15L (ENSGGOG00000037816)	PNPO (ENSGGOG00000003786)	SP2 (ENSGGOG00000005330)	SP6 (ENSGGOG00000036261)	SCRN2 (ENSGGOG00000004547)	LRRC46 (ENSGGOG00000012667)	MRPL10 (ENSGGOG00000015353)	OSBPL7 (ENSGGOG00000015344)
Orangutan	MODERN SPECIES	8	ENSPPYG00000008911 #9	UBE2Z (ENSPPYG00000032681) #10	ATP5MC1 (ENSPPYG00000008909)	CALCOCO2 (ENSPPYG00000008907) #12	TTLL6 (ENSPPYG00000008906) #13	HOXB13 (ENSPPYG00000008904) #14	ENSPPYG00000036609	PRAC1 (ENSPPYG00000008903)	HOXB9 (ENSPPYG00000008902) #15	HOXB8 (ENSPPYG00000038542) #16	HOXB7 (ENSPPYG00000008901) #17	HOXB6 (ENSPPYG00000008899) #18	HOXB5 (ENSPPYG00000008898) #19	HOXB4 (ENSPPYG00000008897) #20	HOXB3 (ENSPPYG00000008896) #21	HOXB2 (ENSPPYG00000008895) #22	HOXB1 (ENSPPYG00000008894) #23	SKAP1 (ENSPPYG00000008893) #24	SNX11 (ENSPPYG00000008892) #25	ENSPPYG00000008891 ##26	NFE2L1 (ENSPPYG00000036998)	ENSPPYG00000008889	CDK5RAP3 (ENSPPYG00000008888)	PRR15L (ENSPPYG00000008887)	PNPO (ENSPPYG00000040967)	SP2 (ENSPPYG00000008885)	SP6 (ENSPPYG00000008884)	SCRN2 (ENSPPYG00000008883)	LRRC46 (ENSPPYG00000032761)	MRPL10 (ENSPPYG00000008881)	OSBPL7 (ENSPPYG00000008880)
Gibbon	MODERN SPECIES	105	ENSNLEG00000002931	B4GALNT2 (ENSNLEG00000002844)	IGF2BP1 (ENSNLEG00000002786) #7	GIP (ENSNLEG00000002767) #8	SNF8 (ENSNLEG00000002743) #9	ENSNLEG00000002739 #10	ATP5MC1 (ENSNLEG00000002718)	CALCOCO2 (ENSNLEG00000002619) #12	TTLL6 (ENSNLEG00000002601) #13	HOXB13 (ENSNLEG00000002594) #14	ENSNLEG00000036120	ENSNLEG00000029075	HOXB6 (ENSNLEG00000002585) #18	HOXB5 (ENSNLEG00000002574) #19	HOXB4 (ENSNLEG00000002570) #20	HOXB2 (ENSNLEG00000002566) #22	ENSNLEG00000018815 #23	SKAP1 (ENSNLEG00000002519) #24	SNX11 (ENSNLEG00000002479) #25	ENSNLEG00000002435 #26	NFE2L1 (ENSNLEG00000002415)	ENSNLEG00000002409	ENSNLEG00000002109	PRR15L (ENSNLEG00000002102)	PNPO (ENSNLEG00000002062)	ENSNLEG00000002058	SP6 (ENSNLEG00000002050)	SCRN2 (ENSNLEG00000001940)	LRRC46 (ENSNLEG00000001902)	MRPL10 (ENSNLEG00000001803)	OSBPL7 (ENSNLEG00000001657)
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Cercopithecinae	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000007843.u.a #9	ENSGT00940000159091 #10	ENSGT00940000154298.a.b	ENSGT00950000183025.a #12	ENSGT00940000161434 #13	ENSGT00940000159029 #14	ENSGT00860000135909	ENSGT00940000165611	ENSGT00940000161386 #15	ENSGT00940000161529 #16	ENSGT00940000161230 #17	ENSGT00940000161108 #18	ENSGT00940000158354 #19	ENSGT00940000162072 #20	ENSGT00940000159774 #21	ENSGT00940000155029.c.b #22	ENSGT00940000159503 #23	ENSGT00390000017856.b #24	ENSGT00940000160113 #25	ENSGT00940000154152.d.b #26	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00390000000713	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000159590	ENSGT00940000161498	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000000603.b	ENSGT00940000157439
Vervet Monkey	MODERN SPECIES	7	IGF2BP1 (ENSCSAG00000002487) #7	GIP (ENSCSAG00000002491) #8	SNF8 (ENSCSAG00000002494) #9	UBE2Z (ENSCSAG00000002496) #10	ATP5MC1 (ENSCSAG00000002502)	CALCOCO2 (ENSCSAG00000002506) #12	TTLL6 (ENSCSAG00000002511) #13	HOXB13 (ENSCSAG00000002517) #14	HOXB9 (ENSCSAG00000002521) #15	HOXB8 (ENSCSAG00000002523) #16	HOXB7 (ENSCSAG00000002524) #17	HOXB6 (ENSCSAG00000002526) #18	HOXB5 (ENSCSAG00000002529) #19	HOXB4 (ENSCSAG00000002530) #20	HOXB3 (ENSCSAG00000002533) #21	HOXB2 (ENSCSAG00000002536) #22	HOXB1 (ENSCSAG00000002538) #23	ENSCSAG00000019043	SKAP1 (ENSCSAG00000002542) #24	SNX11 (ENSCSAG00000002545) #25	CBX1 (ENSCSAG00000002547) #26	NFE2L1 (ENSCSAG00000002550)	COPZ2 (ENSCSAG00000002558)	CDK5RAP3 (ENSCSAG00000002562)	PRR15L (ENSCSAG00000019042)	PNPO (ENSCSAG00000002565)	SP2 (ENSCSAG00000002567)	SP6 (ENSCSAG00000019041)	SCRN2 (ENSCSAG00000002569)	LRRC46 (ENSCSAG00000002574)	MRPL10 (ENSCSAG00000002576)
Cercopithecinae_a	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000159091 #10	ENSGT00940000154298.a.b	ENSGT00950000183025.a #12	ENSGT00950000183198.c.a.a.b	ENSGT00940000161434 #13	ENSGT00940000159029 #14	ENSGT00860000135909	ENSGT00940000165611	ENSGT00940000161386 #15	ENSGT00940000161529 #16	ENSGT00940000161230 #17	ENSGT00940000161108 #18	ENSGT00940000158354 #19	ENSGT00940000162072 #20	ENSGT00940000159774 #21	ENSGT00940000155029.c.b #22	ENSGT00940000159503 #23	ENSGT00390000017856.b #24	ENSGT00940000160113 #25	ENSGT00940000154152.d.b #26	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00390000000713	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000159590	ENSGT00940000161498	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000000603.b	ENSGT00940000157439
Cercopithecinae_b	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00390000007843.u.a #9	ENSGT00940000159091 #10	ENSGT00940000154298.a.b	ENSGT00950000183025.a #12	ENSGT00950000183198.c.a.a.b	ENSGT00940000161434 #13	ENSGT00940000159029 #14	ENSGT00940000165611	ENSGT00940000161386 #15	ENSGT00940000161529 #16	ENSGT00940000161230 #17	ENSGT00940000161108 #18	ENSGT00940000158354 #19	ENSGT00940000162072 #20	ENSGT00940000159774 #21	ENSGT00940000155029.c.b #22	ENSGT00940000159503 #23	ENSGT00390000017856.b #24	ENSGT00940000160113 #25	ENSGT00940000154152.d.b #26	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00390000000713	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000159590	ENSGT00940000161498	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000000603.b	ENSGT00940000157439
Olive baboon	MODERN SPECIES	8	SNF8 (ENSPANG00000022831) #9	UBE2Z (ENSPANG00000022830) #10	ATP5MC1 (ENSPANG00000022880)	CALCOCO2 (ENSPANG00000022881) #12	ENSPANG00000049214	TTLL6 (ENSPANG00000022885) #13	HOXB13 (ENSPANG00000048407) #14	PRAC1 (ENSPANG00000034268)	HOXB9 (ENSPANG00000022896) #15	HOXB8 (ENSPANG00000022895) #16	HOXB7 (ENSPANG00000041701) #17	HOXB6 (ENSPANG00000022891) #18	HOXB5 (ENSPANG00000022889) #19	HOXB4 (ENSPANG00000022888) #20	ENSPANG00000045928	HOXB2 (ENSPANG00000034765) #22	HOXB1 (ENSPANG00000022886) #23	SKAP1 (ENSPANG00000022897) #24	ENSPANG00000026200	SNX11 (ENSPANG00000022898) #25	CBX1 (ENSPANG00000022906) #26	NFE2L1 (ENSPANG00000022904)	COPZ2 (ENSPANG00000022903)	CDK5RAP3 (ENSPANG00000022902)	PNPO (ENSPANG00000022924)	SP2 (ENSPANG00000022922)	SP6 (ENSPANG00000017158)	SCRN2 (ENSPANG00000022920)	LRRC46 (ENSPANG00000022918)	MRPL10 (ENSPANG00000022926)	OSBPL7 (ENSPANG00000022928)
Cercopithecinae_d	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00390000007843.u.a #9	ENSGT00940000159091 #10	ENSGT00940000154298.a.b	ENSGT00950000183025.a #12	ENSGT00950000183198.c.a.a.b	ENSGT00940000161434 #13	ENSGT00940000159029 #14	ENSGT00940000165611	ENSGT00940000161386 #15	ENSGT00940000161529 #16	ENSGT00940000161230 #17	ENSGT00940000161108 #18	ENSGT00940000158354 #19	ENSGT00940000162072 #20	ENSGT00940000159774 #21	ENSGT00940000155029.c.b #22	ENSGT00940000159503 #23	ENSGT00390000017856.b #24	ENSGT00940000160113 #25	ENSGT00940000154152.d.b #26	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00390000000713	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000159590	ENSGT00940000161498	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000000603.b	ENSGT00940000157439
Drill	MODERN SPECIES	1297	GIP (ENSMLEG00000032963) #8	SNF8 (ENSMLEG00000037501) #9	UBE2Z (ENSMLEG00000043345) #10	ATP5MC1 (ENSMLEG00000026746)	CALCOCO2 (ENSMLEG00000034129) #12	TTLL6 (ENSMLEG00000023683) #13	HOXB13 (ENSMLEG00000043860) #14	PRAC1 (ENSMLEG00000033309)	HOXB9 (ENSMLEG00000030602) #15	HOXB8 (ENSMLEG00000007179) #16	HOXB7 (ENSMLEG00000042331) #17	HOXB6 (ENSMLEG00000029580) #18	HOXB5 (ENSMLEG00000009970) #19	HOXB3 (ENSMLEG00000026268) #21	HOXB4 (ENSMLEG00000029897) #20	HOXB2 (ENSMLEG00000031955) #22	HOXB1 (ENSMLEG00000037557) #23	SKAP1 (ENSMLEG00000029308) #24	SNX11 (ENSMLEG00000039008) #25	CBX1 (ENSMLEG00000038745) #26	NFE2L1 (ENSMLEG00000039330)	COPZ2 (ENSMLEG00000039090)	CDK5RAP3 (ENSMLEG00000033869)	PRR15L (ENSMLEG00000020212)	PNPO (ENSMLEG00000040872)	SP2 (ENSMLEG00000032228)	SP6 (ENSMLEG00000027177)	SCRN2 (ENSMLEG00000041491)	LRRC46 (ENSMLEG00000031583)	MRPL10 (ENSMLEG00000042780)	OSBPL7 (ENSMLEG00000040663)
Sooty mangabey	MODERN SPECIES	564	SNF8 (ENSCATG00000038375) #9	UBE2Z (ENSCATG00000038755) #10	ATP5MC1 (ENSCATG00000030174)	CALCOCO2 (ENSCATG00000007708) #12	ENSCATG00000016293	TTLL6 (ENSCATG00000029768) #13	HOXB13 (ENSCATG00000041758) #14	PRAC1 (ENSCATG00000038550)	HOXB9 (ENSCATG00000002169) #15	HOXB8 (ENSCATG00000025318) #16	HOXB7 (ENSCATG00000042829) #17	HOXB6 (ENSCATG00000043342) #18	HOXB5 (ENSCATG00000027616) #19	HOXB3 (ENSCATG00000031126) #21	HOXB4 (ENSCATG00000040704) #20	HOXB2 (ENSCATG00000035238) #22	HOXB1 (ENSCATG00000035575) #23	SKAP1 (ENSCATG00000044458) #24	ENSCATG00000019817	SNX11 (ENSCATG00000030351) #25	ENSCATG00000034735 ##26	NFE2L1 (ENSCATG00000040775)	COPZ2 (ENSCATG00000042708)	CDK5RAP3 (ENSCATG00000006699)	PRR15L (ENSCATG00000020186)	PNPO (ENSCATG00000039934)	ENSCATG00000003341	SP6 (ENSCATG00000020123)	SCRN2 (ENSCATG00000038846)	LRRC46 (ENSCATG00000031406)	MRPL10 (ENSCATG00000035686)
Macaca	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000159091 #10	ENSGT00940000154298.a.b.e	ENSGT00950000183025.a #12	ENSGT00950000183198.c.a.a.b	ENSGT00940000161434 #13	ENSGT00940000159029 #14	ENSGT00860000135909	ENSGT00940000165611	ENSGT00940000161386 #15	ENSGT00940000161529 #16	ENSGT00940000161230 #17	ENSGT00940000161108 #18	ENSGT00940000158354 #19	ENSGT00940000162072 #20	ENSGT00940000159774 #21	ENSGT00940000155029.c.b #22	ENSGT00940000159503 #23	ENSGT00390000017856.b #24	ENSGT00940000160113 #25	ENSGT00940000154152.d.b #26	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00390000000713	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000159590	ENSGT00940000161498	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000000603.b	ENSGT00940000157439
Macaca_a	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000007843.u.a #9	ENSGT00940000159091 #10	ENSGT00940000154298.a.b.e	ENSGT00950000183025.a #12	ENSGT00950000183198.c.a.a.b	ENSGT00940000161434 #13	ENSGT00940000159029 #14	ENSGT00940000165611	ENSGT00940000161386 #15	ENSGT00940000161529 #16	ENSGT00940000161230 #17	ENSGT00940000161108 #18	ENSGT00940000158354 #19	ENSGT00940000162072 #20	ENSGT00980000199681	ENSGT00940000155029.c.b #22	ENSGT00940000159503 #23	ENSGT00390000017856.b #24	ENSGT00940000160113 #25	ENSGT00940000154152.d.b #26	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00390000000713	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000159590	ENSGT01100000263493.a.b.b.a.a.b.b.a.a.a.a.a.a.a.d.a.b.b	ENSGT00940000161498	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161315	ENSGT00940000157439
Rhesus	MODERN SPECIES	7	GIP (ENSMMUG00000049405) #8	SNF8 (ENSMMUG00000021087) #9	UBE2Z (ENSMMUG00000057164) #10	ATP5MC1 (ENSMMUG00000013395)	ENSMMUG00000016305	TTLL6 (ENSMMUG00000003436) #13	HOXB13 (ENSMMUG00000060879) #14	PRAC1 (ENSMMUG00000053394)	HOXB9 (ENSMMUG00000052505) #15	HOXB8 (ENSMMUG00000020868) #16	HOXB7 (ENSMMUG00000055324) #17	HOXB6 (ENSMMUG00000062283) #18	HOXB5 (ENSMMUG00000051420) #19	ENSMMUG00000045203	HOXB4 (ENSMMUG00000052130) #20	HOXB2 (ENSMMUG00000057001) #22	HOXB1 (ENSMMUG00000022212) #23	SKAP1 (ENSMMUG00000050742) #24	SNX11 (ENSMMUG00000020658) #25	CBX1 (ENSMMUG00000019882) #26	NFE2L1 (ENSMMUG00000021935)	COPZ2 (ENSMMUG00000021934)	CDK5RAP3 (ENSMMUG00000004760)	PRR15L (ENSMMUG00000050551)	PNPO (ENSMMUG00000003325)	SP2 (ENSMMUG00000004765)	ENSMMUG00000053935	SP6 (ENSMMUG00000061952)	MRPL10 (ENSMMUG00000021486)	LRRC46 (ENSMMUG00000061605)	OSBPL7 (ENSMMUG00000019039)
Crab-eating macaque	MODERN SPECIES	7	ENSMFAG00000055147	CALCOCO2 (ENSMFAG00000000840) #12	ENSMFAG00000030534	ENSMFAG00000059251	TTLL6 (ENSMFAG00000035518) #13	HOXB13 (ENSMFAG00000039799) #14	PRAC1 (ENSMFAG00000039547)	ENSMFAG00000047612	HOXB9 (ENSMFAG00000062545) #15	HOXB8 (ENSMFAG00000033418) #16	HOXB7 (ENSMFAG00000039298) #17	HOXB6 (ENSMFAG00000002294) #18	HOXB5 (ENSMFAG00000042418) #19	HOXB4 (ENSMFAG00000041000) #20	ENSMFAG00000062776	HOXB2 (ENSMFAG00000034146) #22	HOXB1 (ENSMFAG00000052359) #23	SKAP1 (ENSMFAG00000038763) #24	ENSMFAG00000048147	ENSMFAG00000047205	SNX11 (ENSMFAG00000001845) #25	CBX1 (ENSMFAG00000036790) #26	NFE2L1 (ENSMFAG00000035583)	COPZ2 (ENSMFAG00000045896)	CDK5RAP3 (ENSMFAG00000046364)	PRR15L (ENSMFAG00000030161)	PNPO (ENSMFAG00000039285)	SP2 (ENSMFAG00000038712)	ENSMFAG00000052999	SP6 (ENSMFAG00000030247)	ENSMFAG00000030335
Pig-tailed macaque	MODERN SPECIES	494	UBE2Z (ENSMNEG00000040572) #10	ENSMNEG00000011359	ENSMNEG00000027016	CALCOCO2 (ENSMNEG00000041410) #12	TTLL6 (ENSMNEG00000035034) #13	HOXB13 (ENSMNEG00000036275) #14	PRAC2 (ENSMNEG00000038796)	PRAC1 (ENSMNEG00000045191)	HOXB9 (ENSMNEG00000045476) #15	HOXB8 (ENSMNEG00000034944) #16	HOXB7 (ENSMNEG00000040001) #17	HOXB6 (ENSMNEG00000042554) #18	HOXB5 (ENSMNEG00000039003) #19	HOXB4 (ENSMNEG00000032435) #20	HOXB3 (ENSMNEG00000032425) #21	HOXB2 (ENSMNEG00000043416) #22	HOXB1 (ENSMNEG00000036848) #23	ENSMNEG00000033446	SKAP1 (ENSMNEG00000015541) #24	SNX11 (ENSMNEG00000034920) #25	CBX1 (ENSMNEG00000039720) #26	NFE2L1 (ENSMNEG00000037921)	COPZ2 (ENSMNEG00000038720)	CDK5RAP3 (ENSMNEG00000029039)	PRR15L (ENSMNEG00000028174)	PNPO (ENSMNEG00000037010)	SP2 (ENSMNEG00000029577)	SP6 (ENSMNEG00000023861)	SCRN2 (ENSMNEG00000031786)	LRRC46 (ENSMNEG00000037035)	MRPL10 (ENSMNEG00000030905)
Rhinopithecus	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00390000007843.u.a #9	ENSGT00940000159091 #10	ENSGT00940000154298.a.b	ENSGT00950000183025.a #12	ENSGT00940000161434 #13	ENSGT00940000159029 #14	ENSGT00860000135909	ENSGT00940000165611	ENSGT00940000161386 #15	ENSGT00940000161529 #16	ENSGT00940000161230 #17	ENSGT00940000161108 #18	ENSGT00940000158354 #19	ENSGT00940000162072 #20	ENSGT00940000159774 #21	ENSGT00940000155029.c.b #22	ENSGT00940000159503 #23	ENSGT00390000017856.b #24	ENSGT00940000160113 #25	ENSGT00940000154152.d.b #26	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00390000000713	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000159590	ENSGT00940000161498	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000000603.b	ENSGT00940000157439
Black snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	1661	SNF8 (ENSRBIG00000038039) #9	UBE2Z (ENSRBIG00000038578) #10	ATP5MC1 (ENSRBIG00000026711)	CALCOCO2 (ENSRBIG00000035235) #12	TTLL6 (ENSRBIG00000035925) #13	HOXB13 (ENSRBIG00000035598) #14	PRAC2 (ENSRBIG00000032698)	PRAC1 (ENSRBIG00000041996)	HOXB9 (ENSRBIG00000035654) #15	HOXB8 (ENSRBIG00000043329) #16	HOXB7 (ENSRBIG00000039896) #17	HOXB6 (ENSRBIG00000029050) #18	HOXB5 (ENSRBIG00000015821) #19	HOXB4 (ENSRBIG00000036141) #20	HOXB3 (ENSRBIG00000036705) #21	HOXB2 (ENSRBIG00000029105) #22	HOXB1 (ENSRBIG00000041849) #23	SKAP1 (ENSRBIG00000042563) #24	SNX11 (ENSRBIG00000030129) #25	ENSRBIG00000027048 #26	NFE2L1 (ENSRBIG00000034817)	COPZ2 (ENSRBIG00000038810)	CDK5RAP3 (ENSRBIG00000039441)	PRR15L (ENSRBIG00000030176)	PNPO (ENSRBIG00000042160)	SP2 (ENSRBIG00000032526)	ENSRBIG00000039530	TXNDC2 (ENSRBIG00000040108)	ENSRBIG00000040735	OCRL (ENSRBIG00000041702)
Golden snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	585	GIP (ENSRROG00000029793) #8	SNF8 (ENSRROG00000041052) #9	UBE2Z (ENSRROG00000038314) #10	ATP5MC1 (ENSRROG00000031127)	CALCOCO2 (ENSRROG00000042598) #12	TTLL6 (ENSRROG00000044208) #13	HOXB13 (ENSRROG00000042147) #14	PRAC2 (ENSRROG00000033208)	PRAC1 (ENSRROG00000039006)	HOXB9 (ENSRROG00000044654) #15	HOXB8 (ENSRROG00000045349) #16	HOXB7 (ENSRROG00000035066) #17	HOXB6 (ENSRROG00000028093) #18	HOXB5 (ENSRROG00000030674) #19	HOXB3 (ENSRROG00000037630) #21	HOXB2 (ENSRROG00000044849) #22	HOXB1 (ENSRROG00000042747) #23	SKAP1 (ENSRROG00000031517) #24	SNX11 (ENSRROG00000029464) #25	CBX1 (ENSRROG00000041227) #26	NFE2L1 (ENSRROG00000044774)	COPZ2 (ENSRROG00000030969)	CDK5RAP3 (ENSRROG00000044651)	PRR15L (ENSRROG00000009484)	PNPO (ENSRROG00000044027)	SP2 (ENSRROG00000037481)	SP6 (ENSRROG00000008983)	SCRN2 (ENSRROG00000037252)	LRRC46 (ENSRROG00000039559)	MRPL10 (ENSRROG00000033938)	OSBPL7 (ENSRROG00000017659)
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Cebidae	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000160427 #7	ENSGT00390000005121 #8	ENSGT00390000007843.u.a #9	ENSGT01100000264599	ENSGT00940000159091 #10	ENSGT00940000154298.a.b	ENSGT00940000161434 #13	ENSGT00940000159029 #14	ENSGT00940000161386 #15	ENSGT00940000161529 #16	ENSGT00940000161230 #17	ENSGT00940000161108 #18	ENSGT00940000158354 #19	ENSGT00940000162072 #20	ENSGT00940000159774 #21	ENSGT00940000155029.c.b #22	ENSGT00940000159503 #23	ENSGT00940000154172.gb.b.b.b	ENSGT00390000017856.b #24	ENSGT00940000160113 #25	ENSGT00940000154152.d.b #26	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00390000000713	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000159590	ENSGT00940000161498	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000000603
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Capuchin	MODERN SPECIES	228						HOXB13 (ENSCCAG00000036871) #14	ENSCCAG00000036164	ENSCCAG00000019672	HOXB7 (ENSCCAG00000023947) #17	HOXB9 (ENSCCAG00000035938) #15	HOXB8 (ENSCCAG00000026051) #16	HOXB6 (ENSCCAG00000022842) #18	HOXB5 (ENSCCAG00000036867) #19	HOXB4 (ENSCCAG00000020311) #20	HOXB3 (ENSCCAG00000013598) #21	HOXB2 (ENSCCAG00000024035) #22	HOXB1 (ENSCCAG00000027667) #23	ENSCCAG00000019181	SKAP1 (ENSCCAG00000035663) #24	SNX11 (ENSCCAG00000030167) #25	CBX1 (ENSCCAG00000025085) #26	NFE2L1 (ENSCCAG00000029090)	COPZ2 (ENSCCAG00000021292)	CDK5RAP3 (ENSCCAG00000038053)	PNPO (ENSCCAG00000029175)	SP2 (ENSCCAG00000038047)	SP6 (ENSCCAG00000020330)	SCRN2 (ENSCCAG00000031435)	LRRC46 (ENSCCAG00000030568)	MRPL10 (ENSCCAG00000023150)	OSBPL7 (ENSCCAG00000034097)
Bolivian squirrel monkey	MODERN SPECIES	86	ENSSBOG00000028176	UBE2Z (ENSSBOG00000036224) #10	ENSSBOG00000028794 #11	CALCOCO2 (ENSSBOG00000035276) #12	TTLL6 (ENSSBOG00000028908) #13	HOXB13 (ENSSBOG00000029964) #14	PRAC2 (ENSSBOG00000032603)	ENSSBOG00000030794	HOXB9 (ENSSBOG00000030218) #15	HOXB8 (ENSSBOG00000034884) #16	HOXB7 (ENSSBOG00000020028) #17	HOXB6 (ENSSBOG00000031900) #18	HOXB5 (ENSSBOG00000018198) #19	HOXB4 (ENSSBOG00000024432) #20	HOXB3 (ENSSBOG00000030844) #21	HOXB2 (ENSSBOG00000025070) #22	HOXB1 (ENSSBOG00000034875) #23	ENSSBOG00000019520	SKAP1 (ENSSBOG00000029434) #24	SNX11 (ENSSBOG00000026967) #25	ENSSBOG00000031880 ##26	NFE2L1 (ENSSBOG00000023867)	COPZ2 (ENSSBOG00000033633)	CDK5RAP3 (ENSSBOG00000033272)	PRR15L (ENSSBOG00000019240)	PNPO (ENSSBOG00000021213)	SP2 (ENSSBOG00000029098)	SP6 (ENSSBOG00000014210)	SCRN2 (ENSSBOG00000027391)	LRRC46 (ENSSBOG00000026980)	MRPL10 (ENSSBOG00000004214)
Marmoset	MODERN SPECIES	17	IGF2BP1 (ENSCJAG00000007258) #7	GIP (ENSCJAG00000007300) #8	SNF8 (ENSCJAG00000007322) #9	UBE2Z (ENSCJAG00000007326) #10	ATP5MC1 (ENSCJAG00000075375)	CALCOCO2 (ENSCJAG00000007375) #12	TTLL6 (ENSCJAG00000007395) #13	HOXB13 (ENSCJAG00000007437) #14	HOXB9 (ENSCJAG00000007442) #15	HOXB8 (ENSCJAG00000045730) #16	HOXB7 (ENSCJAG00000007457) #17	HOXB6 (ENSCJAG00000007467) #18	HOXB5 (ENSCJAG00000007472) #19	HOXB4 (ENSCJAG00000007480) #20	HOXB3 (ENSCJAG00000007487) #21	HOXB2 (ENSCJAG00000007494) #22	HOXB1 (ENSCJAG00000007496) #23	ENSCJAG00000038853	SKAP1 (ENSCJAG00000007504) #24	SNX11 (ENSCJAG00000039549) #25	CBX1 (ENSCJAG00000042052) #26	NFE2L1 (ENSCJAG00000007542)	ENSCJAG00000058197	COPZ2 (ENSCJAG00000007567)	CDK5RAP3 (ENSCJAG00000007669)	PRR15L (ENSCJAG00000044487)	PNPO (ENSCJAG00000007693)	SP2 (ENSCJAG00000007713)	SP6 (ENSCJAG00000043946)	SCRN2 (ENSCJAG00000047705)	LRRC46 (ENSCJAG00000007776)
Mas night monkey	MODERN SPECIES	481	SNF8 (ENSANAG00000032764) #9	UBE2Z (ENSANAG00000029636) #10	ATP5MC1 (ENSANAG00000024881)	ENSANAG00000020581 #12	TTLL6 (ENSANAG00000031133) #13	PRAC2 (ENSANAG00000025557)	HOXB13 (ENSANAG00000023991) #14	ENSANAG00000030331	HOXB9 (ENSANAG00000035156) #15	HOXB8 (ENSANAG00000028346) #16	HOXB7 (ENSANAG00000025513) #17	HOXB6 (ENSANAG00000023964) #18	HOXB5 (ENSANAG00000024299) #19	HOXB4 (ENSANAG00000024005) #20	HOXB3 (ENSANAG00000032072) #21	HOXB2 (ENSANAG00000023626) #22	HOXB1 (ENSANAG00000032306) #23	ENSANAG00000023400	SKAP1 (ENSANAG00000026853) #24	SNX11 (ENSANAG00000022588) #25	ENSANAG00000036853 ##26	NFE2L1 (ENSANAG00000027606)	COPZ2 (ENSANAG00000023309)	CDK5RAP3 (ENSANAG00000021880)	PNPO (ENSANAG00000026080)	SP2 (ENSANAG00000032738)	SP6 (ENSANAG00000019338)	SCRN2 (ENSANAG00000021482)	LRRC46 (ENSANAG00000028496)	MRPL10 (ENSANAG00000022792)	OSBPL7 (ENSANAG00000021406)
Tarsier	MODERN SPECIES	4193										HOXB7 (ENSTSYG00000028173) #17	HOXB6 (ENSTSYG00000031001) #18	HOXB5 (ENSTSYG00000032912) #19	HOXB4 (ENSTSYG00000026874) #20	ENSTSYG00000029322	HOXB3 (ENSTSYG00000035231) #21	HOXB2 (ENSTSYG00000004903) #22	HOXB1 (ENSTSYG00000004656) #23
Euarchontoglires_A	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000005121 #8	ENSGT00390000007843 #9	ENSGT00990000209473	ENSGT00940000159091 #10	ENSGT00940000159720 #11	ENSGT00950000183025.a #12	ENSGT00940000161434 #13	ENSGT00940000159029 #14	ENSGT00940000161386 #15	ENSGT00940000161529 #16	ENSGT00940000161230 #17	ENSGT00940000161108 #18	ENSGT00940000158354 #19	ENSGT00940000162072 #20	ENSGT00940000159774 #21	ENSGT00940000155029.c.b #22	ENSGT00940000159503 #23	ENSGT00390000017856.b #24	ENSGT00940000160113 #25	ENSGT00940000154152.d.b #26	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00390000000713	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000159590	ENSGT00940000161498	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000157439
Tree shrew	MODERN SPECIES	88																HOXB2 (ENSTBEG00000015126) #22	SKAP1 (ENSTBEG00000015048) #24	SNX11 (ENSTBEG00000014960) #25	CBX1 (ENSTBEG00000014931) #26
Glires	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00390000005121 #8	ENSGT00390000007843 #9	ENSGT00990000209473	ENSGT00940000159091 #10	ENSGT00940000159720 #11	ENSGT00950000183025.a #12	ENSGT00940000161434 #13	ENSGT00940000159029 #14	ENSGT00940000161386 #15	ENSGT00940000161529 #16	ENSGT00940000161230 #17	ENSGT00940000161108 #18	ENSGT00940000158354 #19	ENSGT00940000162072 #20	ENSGT00940000159774 #21	ENSGT00940000155029.c.b #22	ENSGT00940000159503 #23	ENSGT00390000017856.b #24	ENSGT00940000160113 #25	ENSGT00940000154152.d.b.dc #26	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00390000000713	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000159590	ENSGT00940000161498	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000157439
Lagomorpha	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT01100000263525.b.a	ENSGT00390000006679.b	ENSGT00940000160427 #7	ENSGT00390000005121 #8	ENSGT00390000007843 #9	ENSGT00940000159091 #10	ENSGT00940000154298.a.b	ENSGT00950000183025.a #12	ENSGT00940000161434 #13	ENSGT00940000159029 #14	ENSGT00940000161386 #15	ENSGT00940000161529 #16	ENSGT00940000161108 #18	ENSGT00940000158354 #19	ENSGT00940000159774 #21	ENSGT00940000155029.c.b #22	ENSGT00940000159503 #23	ENSGT00390000017856.b #24	ENSGT00940000160113 #25	ENSGT00940000154152.d.b.dc #26	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00390000000713	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000159590	ENSGT00940000161498	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000157439
Rabbit	MODERN SPECIES	10	B4GALNT2 (ENSOCUG00000003531)	IGF2BP1 (ENSOCUG00000004411) #7	GIP (ENSOCUG00000004410) #8	SNF8 (ENSOCUG00000009156) #9	UBE2Z (ENSOCUG00000009159) #10	ATP5MC1 (ENSOCUG00000016225)	CALCOCO2 (ENSOCUG00000016209) #12	ENSOCUG00000038154	TTLL6 (ENSOCUG00000006289) #13	HOXB13 (ENSOCUG00000012816) #14	HOXB9 (ENSOCUG00000027316) #15	HOXB8 (ENSOCUG00000029186) #16	HOXB5 (ENSOCUG00000023093) #19	HOXB6 (ENSOCUG00000011560) #18	HOXB3 (ENSOCUG00000023337) #21	HOXB2 (ENSOCUG00000024951) #22	HOXB1 (ENSOCUG00000001720) #23	SKAP1 (ENSOCUG00000001717) #24	SNX11 (ENSOCUG00000002309) #25	CBX1 (ENSOCUG00000008021) #26	NFE2L1 (ENSOCUG00000022298)	COPZ2 (ENSOCUG00000001802)	CDK5RAP3 (ENSOCUG00000012325)	PRR15L (ENSOCUG00000017489)	PNPO (ENSOCUG00000017484)	SP2 (ENSOCUG00000027415)	SP6 (ENSOCUG00000023482)	SCRN2 (ENSOCUG00000009457)	LRRC46 (ENSOCUG00000009453)	MRPL10 (ENSOCUG00000009452)	OSBPL7 (ENSOCUG00000009447)
Pika	MODERN SPECIES	3527												ENSOPRG00000000402	HOXB6 (ENSOPRG00000000399) #18	HOXB5 (ENSOPRG00000000394) #19	HOXB3 (ENSOPRG00000000392) #21	HOXB2 (ENSOPRG00000000389) #22
Rodentia	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000005121 #8	ENSGT00390000007843 #9	ENSGT00990000209473	ENSGT00940000159091 #10	ENSGT00940000159720 #11	ENSGT00950000183025.a #12	ENSGT00940000161434 #13	ENSGT00940000159029 #14	ENSGT00940000161386 #15	ENSGT00940000161529 #16	ENSGT00940000161230 #17	ENSGT00940000161108 #18	ENSGT00940000158354 #19	ENSGT00940000162072 #20	ENSGT00940000159774 #21	ENSGT00940000155029.c.b #22	ENSGT00940000159503 #23	ENSGT00390000017856.b #24	ENSGT00940000160113 #25	ENSGT00940000154152.d.b.dc.b #26	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00390000000713	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000159590	ENSGT00940000161498	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000157439
Rodentia_B	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000160427 #7	ENSGT00390000005121 #8	ENSGT00390000007843 #9	ENSGT00940000159091 #10	ENSGT00940000159720 #11	ENSGT00950000183025.a #12	ENSGT00940000161434 #13	ENSGT00940000159029 #14	ENSGT00940000161386 #15	ENSGT00940000161529 #16	ENSGT00940000161230 #17	ENSGT00940000161108 #18	ENSGT00940000158354 #19	ENSGT00940000162072 #20	ENSGT00940000159774 #21	ENSGT00940000155029.c.b #22	ENSGT00940000159503 #23	ENSGT00390000017856.b #24	ENSGT00940000160113 #25	ENSGT00940000154152.d.b.dc.b #26	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00390000000713	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000159590	ENSGT00940000161498	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000157439
Myomorpha	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000160427 #7	ENSGT00390000005121 #8	ENSGT00390000007843 #9	ENSGT00940000159091 #10	ENSGT00940000159720 #11	ENSGT00950000183025.a #12	ENSGT00940000161434 #13	ENSGT00940000159029 #14	ENSGT00940000161386 #15	ENSGT00940000161529 #16	ENSGT00940000161230 #17	ENSGT00940000161108 #18	ENSGT00940000158354 #19	ENSGT00940000162072 #20	ENSGT00940000159774 #21	ENSGT00940000155029.c.b #22	ENSGT00940000159503 #23	ENSGT00390000017856.b #24	ENSGT00940000160113 #25	ENSGT00940000154152.d.b.dc.b #26	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00390000000713	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000159590	ENSGT00940000161498	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000157439
Muroidea	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000160427 #7	ENSGT00390000005121 #8	ENSGT00390000007843 #9	ENSGT00940000159091 #10	ENSGT00940000159720 #11	ENSGT00950000183025.a #12	ENSGT00940000161434 #13	ENSGT00940000159029 #14	ENSGT00940000161386 #15	ENSGT00940000161529 #16	ENSGT00940000161230 #17	ENSGT00940000161108 #18	ENSGT00940000158354 #19	ENSGT00940000162072 #20	ENSGT00940000159774 #21	ENSGT00940000155029.c.b #22	ENSGT00940000159503 #23	ENSGT00390000017856.b #24	ENSGT00940000160113 #25	ENSGT00940000154152.d.b.dc.b #26	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00390000000713	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000159590	ENSGT00940000161498	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000157439
Muroidea_A	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000160427 #7	ENSGT00390000005121 #8	ENSGT00390000007843 #9	ENSGT00940000159091 #10	ENSGT00940000159720 #11	ENSGT00950000183025.a #12	ENSGT00940000161434 #13	ENSGT00940000159029 #14	ENSGT00940000161386 #15	ENSGT00940000161529 #16	ENSGT00940000161230 #17	ENSGT00940000161108 #18	ENSGT00940000158354 #19	ENSGT00940000162072 #20	ENSGT00940000159774 #21	ENSGT00940000155029.c.b #22	ENSGT00940000159503 #23	ENSGT00390000017856.b #24	ENSGT00940000160113 #25	ENSGT00940000154152.d.b.dc.b #26	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00390000000713	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000159590	ENSGT00940000161498	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000157439
Cricetidae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000005121 #8	ENSGT00390000007843 #9	ENSGT00940000159091 #10	ENSGT00940000159720.`b.a.a #11	ENSGT00940000159720.ab #11	ENSGT00950000183025.a #12	ENSGT00940000161434 #13	ENSGT00940000159029 #14	ENSGT00940000161386 #15	ENSGT00940000161529 #16	ENSGT00940000161230 #17	ENSGT00940000161108 #18	ENSGT00940000158354 #19	ENSGT00940000162072 #20	ENSGT00940000159774 #21	ENSGT00940000155029.c.b #22	ENSGT00940000159503 #23	ENSGT00390000017856.b #24	ENSGT00940000160113 #25	ENSGT00940000154152.d.a.a ##26	ENSGT00940000154152.d.b.dc.b #26	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00390000000713	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000159590	ENSGT00940000161498	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000000603
Cricetidae_B	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000005121 #8	ENSGT00390000007843 #9	ENSGT00940000159091 #10	ENSGT00940000159720.`b.a.a #11	ENSGT00940000159720.ab #11	ENSGT00950000183025.a #12	ENSGT00940000161434 #13	ENSGT00940000159029 #14	ENSGT00940000161386 #15	ENSGT00940000161529 #16	ENSGT00940000161230 #17	ENSGT00940000161108 #18	ENSGT00940000158354 #19	ENSGT00940000162072 #20	ENSGT00940000159774 #21	ENSGT00940000155029.c.b #22	ENSGT00940000159503 #23	ENSGT00390000017856.b #24	ENSGT00940000160113 #25	ENSGT00940000154152.d.b.dc.b #26	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00390000000713	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000159590	ENSGT00940000161498	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000157439
Northern American deer mouse	MODERN SPECIES	21	Gngt2 (ENSPEMG00000027491)	B4galnt2 (ENSPEMG00000020717)	Igf2bp1 (ENSPEMG00000021974) #7	Gip (ENSPEMG00000021184) #8	Snf8 (ENSPEMG00000022229) #9	Ube2z (ENSPEMG00000020953) #10	Atp5g1 (ENSPEMG00000020590) #11	ENSPEMG00000028729 #12	ENSPEMG00000025676 #12	Ttll6 (ENSPEMG00000021918) #13	Hoxb13 (ENSPEMG00000021511) #14	Hoxb9 (ENSPEMG00000027158) #15	Hoxb5 (ENSPEMG00000030101) #19	Hoxb4 (ENSPEMG00000029805) #20	Hoxb3 (ENSPEMG00000028692) #21	Hoxb2 (ENSPEMG00000029510) #22	Hoxb1 (ENSPEMG00000023977) #23	Skap1 (ENSPEMG00000000585) #24	ENSPEMG00000020286	Snx11 (ENSPEMG00000000381) #25	Cbx1 (ENSPEMG00000020976) ##26	Nfe2l1 (ENSPEMG00000010512)	Copz2 (ENSPEMG00000011137)	Cdk5rap3 (ENSPEMG00000020712)	ENSPEMG00000030963	Prr15l (ENSPEMG00000024436)	Pnpo (ENSPEMG00000025094)	Sp2 (ENSPEMG00000017112)	Sp6 (ENSPEMG00000001231)	Scrn2 (ENSPEMG00000020381)	Lrrc46 (ENSPEMG00000020507)
Prairie vole	MODERN SPECIES	114		ENSMOCG00000004266	ENSMOCG00000021226 #8	Snf8 (ENSMOCG00000016684) #9	Ube2z (ENSMOCG00000018241) #10	ENSMOCG00000013163 #11	Ttll6 (ENSMOCG00000021089) #13	Hoxb13 (ENSMOCG00000021389) #14	Hoxb9 (ENSMOCG00000020312) #15	Hoxb8 (ENSMOCG00000018435) #16	Hoxb7 (ENSMOCG00000020820) #17	Hoxb6 (ENSMOCG00000020355) #18	Hoxb5 (ENSMOCG00000014523) #19	Hoxb4 (ENSMOCG00000022964) #20	Hoxb3 (ENSMOCG00000020739) #21	Hoxb2 (ENSMOCG00000014846) #22	Hoxb1 (ENSMOCG00000002452) #23	Skap1 (ENSMOCG00000018431) #24	Snx11 (ENSMOCG00000019303) #25	Cbx1 (ENSMOCG00000001520) #26	Nfe2l1 (ENSMOCG00000016002)	Copz2 (ENSMOCG00000022427)	Cdk5rap3 (ENSMOCG00000019534)	Prr15l (ENSMOCG00000006695)	Pnpo (ENSMOCG00000011655)	Sp2 (ENSMOCG00000020935)	Sp6 (ENSMOCG00000007065)	Scrn2 (ENSMOCG00000019511)	Lrrc46 (ENSMOCG00000016707)	Mrpl10 (ENSMOCG00000019451)	Osbpl7 (ENSMOCG00000021054)
Cricetinae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000005121 #8	ENSGT00390000007843 #9	ENSGT00940000159091 #10	ENSGT00940000159720.`b.a.a #11	ENSGT00940000159720.`b.b #11	ENSGT00950000183025.a #12	ENSGT00940000161434 #13	ENSGT00940000159029 #14	ENSGT00940000161386 #15	ENSGT00940000161529 #16	ENSGT00940000161230 #17	ENSGT00940000161108 #18	ENSGT00940000158354 #19	ENSGT00940000162072 #20	ENSGT00940000159774 #21	ENSGT00940000155029.c.b #22	ENSGT00940000159503 #23	ENSGT00390000017856.b #24	ENSGT00940000160113 #25	ENSGT00940000154152.d.b.dc.a.b #26	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00390000000713	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000159590	ENSGT00940000161498	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000157439
Golden Hamster	MODERN SPECIES	674	Gngt2 (ENSMAUG00000019144)	B4galnt2 (ENSMAUG00000007916)	Gip (ENSMAUG00000009238) #8	Snf8 (ENSMAUG00000001857) #9	Ube2z (ENSMAUG00000007792) #10	ENSMAUG00000021751 #11	Ttll6 (ENSMAUG00000020973) #13	Hoxb13 (ENSMAUG00000008407) #14	Hoxb9 (ENSMAUG00000017720) #15	Hoxb8 (ENSMAUG00000012636) #16	Hoxb7 (ENSMAUG00000021297) #17	Hoxb6 (ENSMAUG00000021423) #18	Hoxb5 (ENSMAUG00000021419) #19	Hoxb4 (ENSMAUG00000009367) #20	Hoxb3 (ENSMAUG00000011251) #21	Hoxb2 (ENSMAUG00000021979) #22	Hoxb1 (ENSMAUG00000013237) #23	Skap1 (ENSMAUG00000022191) #24	Snx11 (ENSMAUG00000021528) #25	ENSMAUG00000003463 #26	Nfe2l1 (ENSMAUG00000020456)	Copz2 (ENSMAUG00000010560)	Cdk5rap3 (ENSMAUG00000007991)	Pnpo (ENSMAUG00000021706)	Sp2 (ENSMAUG00000019269)	Sp6 (ENSMAUG00000009667)	Scrn2 (ENSMAUG00000010014)	Lrrc46 (ENSMAUG00000019416)	Mrpl10 (ENSMAUG00000000820)	Osbpl7 (ENSMAUG00000013876)	Tbx21 (ENSMAUG00000017507)
Chinese hamster chok1gshd	MODERN SPECIES	33	Gip (ENSCGRG00001021533) #8	Snf8 (ENSCGRG00001000737) #9	Ube2z (ENSCGRG00001019150) #10	ENSCGRG00001022606 #11	ENSCGRG00001010560	ENSCGRG00001011435 #12	Ttll6 (ENSCGRG00001018398) #13	Hoxb13 (ENSCGRG00001015060) #14	Hoxb9 (ENSCGRG00001015314) #15	Hoxb8 (ENSCGRG00001020235) #16	Hoxb7 (ENSCGRG00001021590) #17	Hoxb6 (ENSCGRG00001015674) #18	Hoxb5 (ENSCGRG00001016167) #19	Hoxb4 (ENSCGRG00001022431) #20	Hoxb3 (ENSCGRG00001016667) #21	Hoxb2 (ENSCGRG00001017587) #22	Hoxb1 (ENSCGRG00001024619) #23	ENSCGRG00001023355 #24	ENSCGRG00001020759 #24	Snx11 (ENSCGRG00001022221) #25	Cbx1 (ENSCGRG00001014799) ##26	Nfe2l1 (ENSCGRG00001015287)	Copz2 (ENSCGRG00001014767)	Cdk5rap3 (ENSCGRG00001006966)	Prr15l (ENSCGRG00001008926)	Pnpo (ENSCGRG00001018189)	Sp2 (ENSCGRG00001010976)	Sp6 (ENSCGRG00001002797)	Scrn2 (ENSCGRG00001022143)	Lrrc46 (ENSCGRG00001019758)	Mrpl10 (ENSCGRG00001024199)
Murinae	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000160427 #7	ENSGT00390000005121 #8	ENSGT00390000007843 #9	ENSGT00940000159091 #10	ENSGT00940000159720 #11	ENSGT00950000183025.a #12	ENSGT00940000161434 #13	ENSGT00940000159029 #14	ENSGT00940000161386 #15	ENSGT00940000161529 #16	ENSGT00940000161230 #17	ENSGT00940000161108 #18	ENSGT00940000158354 #19	ENSGT00940000162072 #20	ENSGT00940000159774 #21	ENSGT00940000155029.c.b #22	ENSGT00940000159503 #23	ENSGT00390000017856.b #24	ENSGT00940000160113 #25	ENSGT00940000154152.d.b.dc.b #26	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00390000000713	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000159590	ENSGT00940000161498	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000157439
Mus	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000160427 #7	ENSGT00390000005121 #8	ENSGT00390000007843 #9	ENSGT00940000159091 #10	ENSGT00940000159720 #11	ENSGT00950000183025.a #12	ENSGT00940000161434 #13	ENSGT00940000159029 #14	ENSGT00940000161386 #15	ENSGT00940000161529 #16	ENSGT00940000161230 #17	ENSGT00940000161108 #18	ENSGT00940000158354 #19	ENSGT00940000162072 #20	ENSGT00940000159774 #21	ENSGT00940000155029.c.b #22	ENSGT00940000159503 #23	ENSGT00390000017856.b #24	ENSGT00940000160113 #25	ENSGT00940000154152.d.b.dc.b #26	ENSGT00940000153593.c.b.k	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00390000000713	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000159590	ENSGT00940000161498	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000000603
Mus_A	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000160427 #7	ENSGT00390000005121 #8	ENSGT00390000007843 #9	ENSGT00940000159091 #10	ENSGT00940000159720 #11	ENSGT00950000183025.a #12	ENSGT00940000161434 #13	ENSGT00940000159029 #14	ENSGT00940000161386 #15	ENSGT00940000161529 #16	ENSGT00940000161230 #17	ENSGT00940000161108 #18	ENSGT00940000158354 #19	ENSGT00940000162072 #20	ENSGT00940000159774 #21	ENSGT00940000155029.c.b #22	ENSGT00940000159503 #23	ENSGT00390000017856.b #24	ENSGT00940000160113 #25	ENSGT00940000154152.d.b.dc.b #26	ENSGT00940000153593.c.b.k	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00390000000713	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000159590	ENSGT00940000161498	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000000603
Mus_B	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000160427 #7	ENSGT00390000005121 #8	ENSGT00390000007843 #9	ENSGT00940000159091 #10	ENSGT00940000159720 #11	ENSGT00950000183025.a #12	ENSGT00940000161434 #13	ENSGT00940000159029 #14	ENSGT00940000161386 #15	ENSGT00940000161529 #16	ENSGT00940000161230 #17	ENSGT00940000161108 #18	ENSGT00940000158354 #19	ENSGT00940000162072 #20	ENSGT00940000159774 #21	ENSGT00940000155029.c.b #22	ENSGT00940000159503 #23	ENSGT00390000017856.b #24	ENSGT00940000160113 #25	ENSGT00940000154152.d.b.dc.b #26	ENSGT00940000153593.c.b.k	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00390000000713	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000159590	ENSGT00940000161498	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000000603
Mouse	MODERN SPECIES	2	Igf2bp1 (ENSMUSG00000013415) #7	Gip (ENSMUSG00000014351) #8	Snf8 (ENSMUSG00000006058) #9	Ube2z (ENSMUSG00000014349) #10	Atp5g1 (ENSMUSG00000006057) #11	Calcoco2 (ENSMUSG00000006056) #12	Ttll6 (ENSMUSG00000038756) #13	Hoxb13 (ENSMUSG00000049604) #14	Hoxb9 (ENSMUSG00000020875) #15	Hoxb8 (ENSMUSG00000056648) #16	Hoxb7 (ENSMUSG00000038721) #17	Hoxb6 (ENSMUSG00000000690) #18	Hoxb5 (ENSMUSG00000038700) #19	Hoxb4 (ENSMUSG00000038692) #20	Hoxb3 (ENSMUSG00000048763) #21	Hoxb2 (ENSMUSG00000075588) #22	Hoxb1 (ENSMUSG00000018973) #23	Skap1 (ENSMUSG00000057058) #24	Snx11 (ENSMUSG00000020876) #25	Cbx1 (ENSMUSG00000018666) #26	Nfe2l1 (ENSMUSG00000038615)	Copz2 (ENSMUSG00000018672)	Cdk5rap3 (ENSMUSG00000018669)	Prr15l (ENSMUSG00000047040)	Pnpo (ENSMUSG00000018659)	Sp2 (ENSMUSG00000018678)	Sp6 (ENSMUSG00000038560)	Scrn2 (ENSMUSG00000020877)	Lrrc46 (ENSMUSG00000020878)	Mrpl10 (ENSMUSG00000001445)	Osbpl7 (ENSMUSG00000038534)
Mus_C	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000160427 #7	ENSGT00390000005121 #8	ENSGT00390000007843 #9	ENSGT00940000159091 #10	ENSGT00940000159720 #11	ENSGT00950000183025.a #12	ENSGT00940000161434 #13	ENSGT00940000159029 #14	ENSGT00940000161386 #15	ENSGT00940000161529 #16	ENSGT00940000161230 #17	ENSGT00940000161108 #18	ENSGT00940000158354 #19	ENSGT00940000162072 #20	ENSGT00940000159774 #21	ENSGT00940000155029.c.b #22	ENSGT00940000159503 #23	ENSGT00390000017856.b #24	ENSGT00940000160113 #25	ENSGT00940000154152.d.b.dc.b #26	ENSGT00940000153593.c.b.k	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00390000000713	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000159590	ENSGT00940000161498	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000000603
Steppe mouse	MODERN SPECIES	3291	Gip (ENSMSIG00000019162) #8	Snf8 (ENSMSIG00000019072) #9	Ube2z (ENSMSIG00000019038) #10	Atp5g1 (ENSMSIG00000018986) #11	ENSMSIG00000018956 #12	Ttll6 (ENSMSIG00000018881) #13	Hoxb13 (ENSMSIG00000018865) #14	Hoxb9 (ENSMSIG00000018823) #15	Hoxb8 (ENSMSIG00000018807) #16	Hoxb7 (ENSMSIG00000018805) #17	Hoxb6 (ENSMSIG00000018795) #18	Hoxb5 (ENSMSIG00000018787) #19	Hoxb4 (ENSMSIG00000018777) #20	ENSMSIG00000018776	Hoxb3 (ENSMSIG00000018771) #21	Hoxb2 (ENSMSIG00000018769) #22	Hoxb1 (ENSMSIG00000018752) #23	Skap1 (ENSMSIG00000018601) #24	Snx11 (ENSMSIG00000018546) #25	ENSMSIG00000018520	Cbx1 (ENSMSIG00000018447) #26	Nfe2l1 (ENSMSIG00000018374)	Copz2 (ENSMSIG00000018337)	Cdk5rap3 (ENSMSIG00000018309)	ENSMSIG00000018270	ENSMSIG00000018267	Sp2 (ENSMSIG00000018237)	Sp6 (ENSMSIG00000018223)	Scrn2 (ENSMSIG00000018202)	Lrrc46 (ENSMSIG00000018171)	Mrpl10 (ENSMSIG00000018160)
spretus	MODERN SPECIES	2	Igf2bp1 (MGP_SPRETEiJ_G0017862) #7	Gip (MGP_SPRETEiJ_G0017863) #8	Snf8 (MGP_SPRETEiJ_G0017864) #9	Ube2z (MGP_SPRETEiJ_G0017865) #10	Atp5g1 (MGP_SPRETEiJ_G0017866) #11	MGP_SPRETEiJ_G0017867 #12	Ttll6 (MGP_SPRETEiJ_G0017868) #13	Hoxb13 (MGP_SPRETEiJ_G0017869) #14	Hoxb9 (MGP_SPRETEiJ_G0017870) #15	Hoxb8 (MGP_SPRETEiJ_G0017871) #16	Hoxb7 (MGP_SPRETEiJ_G0017872) #17	Hoxb6 (MGP_SPRETEiJ_G0017873) #18	Hoxb5 (MGP_SPRETEiJ_G0017874) #19	Hoxb4 (MGP_SPRETEiJ_G0017875) #20	Hoxb3 (MGP_SPRETEiJ_G0017876) #21	Hoxb2 (MGP_SPRETEiJ_G0017877) #22	Hoxb1 (MGP_SPRETEiJ_G0017878) #23	MGP_SPRETEiJ_G0017879 #24	Snx11 (MGP_SPRETEiJ_G0017880) #25	Cbx1 (MGP_SPRETEiJ_G0017881) #26	MGP_SPRETEiJ_G0017882	Nfe2l1 (MGP_SPRETEiJ_G0017883)	Copz2 (MGP_SPRETEiJ_G0017884)	Cdk5rap3 (MGP_SPRETEiJ_G0017885)	Prr15l (MGP_SPRETEiJ_G0017886)	Pnpo (MGP_SPRETEiJ_G0017887)	Sp2 (MGP_SPRETEiJ_G0017888)	Sp6 (MGP_SPRETEiJ_G0017889)	Scrn2 (MGP_SPRETEiJ_G0017890)	Lrrc46 (MGP_SPRETEiJ_G0017891)	Mrpl10 (MGP_SPRETEiJ_G0017892)
Ryukyu mouse	MODERN SPECIES	2	Igf2bp1 (MGP_CAROLIEiJ_G0017016) #7	Gip (MGP_CAROLIEiJ_G0017017) #8	Snf8 (MGP_CAROLIEiJ_G0017018) #9	MGP_CAROLIEiJ_G0017019 #10	MGP_CAROLIEiJ_G0017020 #11	MGP_CAROLIEiJ_G0017021 #12	Ttll6 (MGP_CAROLIEiJ_G0017022) #13	Hoxb13 (MGP_CAROLIEiJ_G0017023) #14	Hoxb9 (MGP_CAROLIEiJ_G0017024) #15	Hoxb8 (MGP_CAROLIEiJ_G0017025) #16	Hoxb7 (MGP_CAROLIEiJ_G0017026) #17	Hoxb6 (MGP_CAROLIEiJ_G0017027) #18	Hoxb5 (MGP_CAROLIEiJ_G0017028) #19	Hoxb4 (MGP_CAROLIEiJ_G0017029) #20	Hoxb3 (MGP_CAROLIEiJ_G0017030) #21	Hoxb2 (MGP_CAROLIEiJ_G0017031) #22	Hoxb1 (MGP_CAROLIEiJ_G0017032) #23	Skap1 (MGP_CAROLIEiJ_G0017033) #24	Snx11 (MGP_CAROLIEiJ_G0017034) #25	Cbx1 (MGP_CAROLIEiJ_G0017035) #26	MGP_CAROLIEiJ_G0017036	Nfe2l1 (MGP_CAROLIEiJ_G0017037)	Copz2 (MGP_CAROLIEiJ_G0017038)	Cdk5rap3 (MGP_CAROLIEiJ_G0017039)	Prr15l (MGP_CAROLIEiJ_G0017040)	Pnpo (MGP_CAROLIEiJ_G0017041)	Sp2 (MGP_CAROLIEiJ_G0017042)	Sp6 (MGP_CAROLIEiJ_G0017043)	MGP_CAROLIEiJ_G0017044	Lrrc46 (MGP_CAROLIEiJ_G0017045)	Mrpl10 (MGP_CAROLIEiJ_G0017046)
Shrew mouse	MODERN SPECIES	5	MGP_PahariEiJ_G0018146 #7	Gip (MGP_PahariEiJ_G0018147) #8	Snf8 (MGP_PahariEiJ_G0018148) #9	Ube2z (MGP_PahariEiJ_G0018149) #10	Atp5g1 (MGP_PahariEiJ_G0018150) #11	MGP_PahariEiJ_G0018151 #12	Ttll6 (MGP_PahariEiJ_G0018152) #13	Hoxb13 (MGP_PahariEiJ_G0018153) #14	Hoxb9 (MGP_PahariEiJ_G0018154) #15	Hoxb8 (MGP_PahariEiJ_G0018155) #16	Hoxb7 (MGP_PahariEiJ_G0018156) #17	Hoxb6 (MGP_PahariEiJ_G0018157) #18	Hoxb5 (MGP_PahariEiJ_G0018158) #19	Hoxb4 (MGP_PahariEiJ_G0018159) #20	Hoxb3 (MGP_PahariEiJ_G0018160) #21	Hoxb2 (MGP_PahariEiJ_G0018161) #22	Hoxb1 (MGP_PahariEiJ_G0018162) #23	Skap1 (MGP_PahariEiJ_G0018163) #24	Snx11 (MGP_PahariEiJ_G0018164) #25	Cbx1 (MGP_PahariEiJ_G0018165) #26	MGP_PahariEiJ_G0018166	Nfe2l1 (MGP_PahariEiJ_G0018167)	Copz2 (MGP_PahariEiJ_G0018168)	Cdk5rap3 (MGP_PahariEiJ_G0018169)	Prr15l (MGP_PahariEiJ_G0018170)	Pnpo (MGP_PahariEiJ_G0018171)	Sp2 (MGP_PahariEiJ_G0018172)	Sp6 (MGP_PahariEiJ_G0018173)	Scrn2 (MGP_PahariEiJ_G0018174)	Lrrc46 (MGP_PahariEiJ_G0018175)	Mrpl10 (MGP_PahariEiJ_G0018176)
Rat	MODERN SPECIES	1	B4galnt2 (ENSRNOG00000067203)	Igf2bp1 (ENSRNOG00000006122) #7	Gip (ENSRNOG00000006306) #8	Snf8 (ENSRNOG00000006500) #9	Ube2z (ENSRNOG00000006868) #10	ENSRNOG00000066153 #12	Ttll6 (ENSRNOG00000004939) #13	Hoxb13 (ENSRNOG00000007491) #14	Hoxb9 (ENSRNOG00000007573) #15	Hoxb8 (ENSRNOG00000007585) #16	Hoxb7 (ENSRNOG00000007611) #17	Hoxb6 (ENSRNOG00000007823) #18	Hoxb5 (ENSRNOG00000008010) #19	Hoxb4 (ENSRNOG00000008191) #20	Hoxb3 (ENSRNOG00000008313) #21	Hoxb2 (ENSRNOG00000008365) #22	Hoxb1 (ENSRNOG00000008506) #23	Skap1 (ENSRNOG00000023881) #24	Snx11 (ENSRNOG00000008642) #25	Cbx1 (ENSRNOG00000008689) #26	Nfe2l1 (ENSRNOG00000008830)	Copz2 (ENSRNOG00000009225)	Cdk5rap3 (ENSRNOG00000048747)	Prr15l (ENSRNOG00000049162)	Pnpo (ENSRNOG00000046493)	Sp2 (ENSRNOG00000010492)	Sp6 (ENSRNOG00000023551)	Scrn2 (ENSRNOG00000010214)	Lrrc46 (ENSRNOG00000009902)	Mrpl10 (ENSRNOG00000009567)	Osbpl7 (ENSRNOG00000009473)
Upper Galilee mountains blind mole rat	MODERN SPECIES	1028	Igf2bp1 (ENSNGAG00000015679) #7	Gip (ENSNGAG00000020354) #8	Snf8 (ENSNGAG00000001366) #9	Ube2z (ENSNGAG00000024296) #10	ENSNGAG00000024212 #11	ENSNGAG00000023585 #12	Ttll6 (ENSNGAG00000011763) #13	Hoxb13 (ENSNGAG00000011053) #14	Hoxb9 (ENSNGAG00000010851) #15	Hoxb8 (ENSNGAG00000010647) #16	Hoxb7 (ENSNGAG00000010205) #17	Hoxb6 (ENSNGAG00000000973) #18	Hoxb5 (ENSNGAG00000023238) #19	Hoxb4 (ENSNGAG00000021768) #20	Hoxb3 (ENSNGAG00000020227) #21	Hoxb2 (ENSNGAG00000019089) #22	Hoxb1 (ENSNGAG00000018593) #23	Skap1 (ENSNGAG00000012571) #24	Snx11 (ENSNGAG00000010446) #25	Cbx1 (ENSNGAG00000006760) #26	Nfe2l1 (ENSNGAG00000000736)	Copz2 (ENSNGAG00000023713)	ENSNGAG00000000747	ENSNGAG00000022529	Prr15l (ENSNGAG00000021432)	Pnpo (ENSNGAG00000020016)	Sp2 (ENSNGAG00000017612)	Sp6 (ENSNGAG00000015868)	Scrn2 (ENSNGAG00000023806)	Lrrc46 (ENSNGAG00000022557)	Mrpl10 (ENSNGAG00000022195)
Lesser Egyptian jerboa	MODERN SPECIES	56	B4galnt2 (ENSJJAG00000006322)	Igf2bp1 (ENSJJAG00000002687) #7	Gip (ENSJJAG00000010688) #8	Snf8 (ENSJJAG00000006012) #9	ENSJJAG00000003530 #10	ENSJJAG00000010301 #11	Ttll6 (ENSJJAG00000010253) #13	Hoxb13 (ENSJJAG00000010401) #14	Hoxb9 (ENSJJAG00000009821) #15	Hoxb8 (ENSJJAG00000002398) #16	Hoxb7 (ENSJJAG00000001284) #17	Hoxb6 (ENSJJAG00000000997) #18	Hoxb5 (ENSJJAG00000000763) #19	Hoxb4 (ENSJJAG00000002642) #20	Hoxb3 (ENSJJAG00000007804) #21	Hoxb2 (ENSJJAG00000009465) #22	Hoxb1 (ENSJJAG00000001073) #23	Skap1 (ENSJJAG00000003458) #24	ENSJJAG00000005754 #25	ENSJJAG00000007753 #26	Nfe2l1 (ENSJJAG00000006432)	Copz2 (ENSJJAG00000001025)	ENSJJAG00000002511	Prr15l (ENSJJAG00000006478)	Pnpo (ENSJJAG00000023608)	Sp2 (ENSJJAG00000003061)	Sp6 (ENSJJAG00000006452)	Scrn2 (ENSJJAG00000023635)	Lrrc46 (ENSJJAG00000010412)	Mrpl10 (ENSJJAG00000004046)	Osbpl7 (ENSJJAG00000004477)
Kangaroo rat	MODERN SPECIES	326	Gngt2 (ENSDORG00000023588)	Igf2bp1 (ENSDORG00000014371) #7	Snf8 (ENSDORG00000009262) #9	Ube2z (ENSDORG00000009258) #10	ENSDORG00000008511	ENSDORG00000028385	ENSDORG00000024585 #12	Hoxb13 (ENSDORG00000008369) #14	Hoxb9 (ENSDORG00000027423) #15	Hoxb8 (ENSDORG00000007906) #16	Hoxb7 (ENSDORG00000007905) #17	Hoxb6 (ENSDORG00000023877) #18	Hoxb5 (ENSDORG00000007900) #19	Hoxb4 (ENSDORG00000007899) #20	Hoxb3 (ENSDORG00000007898) #21	Hoxb2 (ENSDORG00000007897) #22	Hoxb1 (ENSDORG00000007896) #23	Snx11 (ENSDORG00000029078) #25	Cbx1 (ENSDORG00000026399) #26	Nfe2l1 (ENSDORG00000000715)	Copz2 (ENSDORG00000013441)	Prr15l (ENSDORG00000027427)	Pnpo (ENSDORG00000014110)	Sp2 (ENSDORG00000014109)	Sp6 (ENSDORG00000026201)	Scrn2 (ENSDORG00000002361)	Osbpl7 (ENSDORG00000002354)	Tbx21 (ENSDORG00000013302)	Npepps (ENSDORG00000009627)	Socs7 (ENSDORG00000028979)	ENSDORG00000007713
Rodentia_A	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00390000005121 #8	ENSGT00390000007843 #9	ENSGT00990000209473	ENSGT00940000159091 #10	ENSGT00940000154298.a.b	ENSGT00950000183025.a #12	ENSGT00940000161434 #13	ENSGT00940000159029 #14	ENSGT00940000161386 #15	ENSGT00940000161529 #16	ENSGT00940000161230 #17	ENSGT00940000161108 #18	ENSGT00940000158354 #19	ENSGT00940000162072 #20	ENSGT00940000159774 #21	ENSGT00940000155029.c.b #22	ENSGT00940000159503 #23	ENSGT00390000017856.b #24	ENSGT00940000160113 #25	ENSGT00940000154152.d.b.dc.b #26	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00390000000713	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000159590	ENSGT00940000161498	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000157439
Hystricomorpha	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000160427 #7	ENSGT00390000005121 #8	ENSGT00390000007843 #9	ENSGT00940000159091 #10	ENSGT00940000154298.a.b	ENSGT00950000183025.a #12	ENSGT00940000161434 #13	ENSGT00940000159029 #14	ENSGT00940000161386 #15	ENSGT00940000161529 #16	ENSGT00940000161230 #17	ENSGT00940000161108 #18	ENSGT00940000158354 #19	ENSGT00940000162072 #20	ENSGT00940000159774 #21	ENSGT00940000155029.c.b #22	ENSGT00940000159503 #23	ENSGT00390000017856.b #24	ENSGT00940000160113 #25	ENSGT00940000154152.d.b.dc.b #26	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00390000000713	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000159590	ENSGT00940000161498	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000157439
Naked mole-rat female	MODERN SPECIES	12	ENSHGLG00000010703 #8	SNF8 (ENSHGLG00000011519) #9	UBE2Z (ENSHGLG00000016280) #10	ATP5MC1 (ENSHGLG00000035460)	CALCOCO2 (ENSHGLG00000012114) #12	TTLL6 (ENSHGLG00000019187) #13	HOXB13 (ENSHGLG00000014634) #14	ENSHGLG00000048296	HOXB9 (ENSHGLG00000014731) #15	HOXB8 (ENSHGLG00000038380) #16	HOXB7 (ENSHGLG00000045318) #17	HOXB6 (ENSHGLG00000012400) #18	HOXB5 (ENSHGLG00000039265) #19	HOXB4 (ENSHGLG00000034075) #20	HOXB3 (ENSHGLG00000010686) #21	HOXB2 (ENSHGLG00000010090) #22	HOXB1 (ENSHGLG00000009781) #23	SKAP1 (ENSHGLG00000014563) #24	SNX11 (ENSHGLG00000016837) #25	CBX1 (ENSHGLG00000013574) #26	NFE2L1 (ENSHGLG00000012592)	COPZ2 (ENSHGLG00000018543)	CDK5RAP3 (ENSHGLG00000019464)	PRR15L (ENSHGLG00000014696)	PNPO (ENSHGLG00000013159)	SP2 (ENSHGLG00000009902)	SP6 (ENSHGLG00000021113)	SCRN2 (ENSHGLG00000041375)	LRRC46 (ENSHGLG00000035931)	MRPL10 (ENSHGLG00000048399)	OSBPL7 (ENSHGLG00000012525)
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Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000160427 #7	ENSGT00390000005121 #8	ENSGT00390000007843 #9	ENSGT00940000159091 #10	ENSGT00940000154298.a.b	ENSGT00950000183025.a #12	ENSGT00940000161434 #13	ENSGT00940000159029 #14	ENSGT00940000161386 #15	ENSGT00940000161529 #16	ENSGT00940000161230 #17	ENSGT00940000161108 #18	ENSGT00940000158354 #19	ENSGT00940000162072 #20	ENSGT00940000159774 #21	ENSGT00940000155029.c.b #22	ENSGT00940000159503 #23	ENSGT00390000017856.b #24	ENSGT00940000160113 #25	ENSGT00940000154152.d.b.dc.b #26	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00390000000713	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000159590	ENSGT00940000161498	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000157439
Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	158	B4GALNT2 (ENSCLAG00000016224)	IGF2BP1 (ENSCLAG00000015853) #7	ENSCLAG00000014301 #8	SNF8 (ENSCLAG00000013387) #9	UBE2Z (ENSCLAG00000016068) #10	ATP5MC1 (ENSCLAG00000015723)	CALCOCO2 (ENSCLAG00000015881) #12	TTLL6 (ENSCLAG00000013529) #13	HOXB13 (ENSCLAG00000014855) #14	ENSCLAG00000015198 #15	HOXB7 (ENSCLAG00000014906) #17	HOXB6 (ENSCLAG00000015524) #18	HOXB5 (ENSCLAG00000014374) #19	HOXB4 (ENSCLAG00000014725) #20	HOXB3 (ENSCLAG00000015322) #21	HOXB2 (ENSCLAG00000015271) #22	HOXB1 (ENSCLAG00000013047) #23	SKAP1 (ENSCLAG00000015423) #24	SNX11 (ENSCLAG00000015837) #25	CBX1 (ENSCLAG00000013587) #26	NFE2L1 (ENSCLAG00000014836)	COPZ2 (ENSCLAG00000013544)	CDK5RAP3 (ENSCLAG00000012292)	PRR15L (ENSCLAG00000017903)	PNPO (ENSCLAG00000013871)	SP2 (ENSCLAG00000014115)	SP6 (ENSCLAG00000016276)	LRRC46 (ENSCLAG00000016713)	SCRN2 (ENSCLAG00000013965)	MRPL10 (ENSCLAG00000015400)	OSBPL7 (ENSCLAG00000014839)
Degu	MODERN SPECIES	97	B4GALNT2 (ENSODEG00000018456)	ENSODEG00000016991 #7	ENSODEG00000017109	GIP (ENSODEG00000017003) #8	ENSODEG00000017032 #9	UBE2Z (ENSODEG00000017306) #10	ATP5MC1 (ENSODEG00000017366)	TTLL6 (ENSODEG00000017145) #13	HOXB13 (ENSODEG00000017199) #14	HOXB9 (ENSODEG00000017293) #15	HOXB8 (ENSODEG00000017119) #16	HOXB6 (ENSODEG00000016988) #18	HOXB5 (ENSODEG00000017253) #19	HOXB4 (ENSODEG00000017038) #20	HOXB3 (ENSODEG00000017116) #21	HOXB2 (ENSODEG00000017153) #22	HOXB1 (ENSODEG00000017050) #23	SKAP1 (ENSODEG00000017533) #24	SNX11 (ENSODEG00000017458) #25	CBX1 (ENSODEG00000017272) #26	NFE2L1 (ENSODEG00000017348)	ENSODEG00000020421	COPZ2 (ENSODEG00000017565)	ENSODEG00000017229	PNPO (ENSODEG00000017424)	SP2 (ENSODEG00000017126)	SP6 (ENSODEG00000017625)	SCRN2 (ENSODEG00000017395)	LRRC46 (ENSODEG00000017367)	MRPL10 (ENSODEG00000017536)	OSBPL7 (ENSODEG00000017364)
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Squirrel	MODERN SPECIES	90	GIP (ENSSTOG00000004043) #8	SNF8 (ENSSTOG00000004023) #9	UBE2Z (ENSSTOG00000000796) #10	ATP5MC1 (ENSSTOG00000013404)	ENSSTOG00000013395 #12	TTLL6 (ENSSTOG00000006016) #13	ENSSTOG00000025444	HOXB13 (ENSSTOG00000014942) #14	HOXB9 (ENSSTOG00000009741) #15	HOXB8 (ENSSTOG00000028337) #16	HOXB7 (ENSSTOG00000025657) #17	HOXB6 (ENSSTOG00000020303) #18	HOXB5 (ENSSTOG00000009740) #19	HOXB4 (ENSSTOG00000009734) #20	HOXB3 (ENSSTOG00000025093) #21	HOXB2 (ENSSTOG00000023586) #22	HOXB1 (ENSSTOG00000028630) #23	SKAP1 (ENSSTOG00000013692) #24	SNX11 (ENSSTOG00000013684) #25	CBX1 (ENSSTOG00000023986) #26	NFE2L1 (ENSSTOG00000013664)	ENSSTOG00000027550	CDK5RAP3 (ENSSTOG00000006244)	PRR15L (ENSSTOG00000006235)	PNPO (ENSSTOG00000006221)	SP2 (ENSSTOG00000015926)	SP6 (ENSSTOG00000001607)	SCRN2 (ENSSTOG00000027108)	LRRC46 (ENSSTOG00000002068)	MRPL10 (ENSSTOG00000024617)	OSBPL7 (ENSSTOG00000001636)
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	46	IGF2BP1 (ENSUPAG00010006100) #7	GIP (ENSUPAG00010006136) #8	SNF8 (ENSUPAG00010006148) #9	UBE2Z (ENSUPAG00010006178) #10	ENSUPAG00010006195 #11	CALCOCO2 (ENSUPAG00010006243) #12	TTLL6 (ENSUPAG00010006267) #13	HOXB13 (ENSUPAG00010006301) #14	HOXB9 (ENSUPAG00010006305) #15	HOXB8 (ENSUPAG00010006310) #16	HOXB7 (ENSUPAG00010006312) #17	HOXB6 (ENSUPAG00010006317) #18	HOXB5 (ENSUPAG00010006320) #19	HOXB4 (ENSUPAG00010006325) #20	HOXB3 (ENSUPAG00010006328) #21	HOXB2 (ENSUPAG00010006336) #22	HOXB1 (ENSUPAG00010006340) #23	SKAP1 (ENSUPAG00010006345) #24	SNX11 (ENSUPAG00010006370) #25	CBX1 (ENSUPAG00010006381) #26	NFE2L1 (ENSUPAG00010006396)	COPZ2 (ENSUPAG00010006455)	CDK5RAP3 (ENSUPAG00010006466)	PRR15L (ENSUPAG00010006473)	PNPO (ENSUPAG00010006483)	SP2 (ENSUPAG00010006507)	SP6 (ENSUPAG00010006522)	SCRN2 (ENSUPAG00010006526)	LRRC46 (ENSUPAG00010006533)	MRPL10 (ENSUPAG00010006539)	OSBPL7 (ENSUPAG00010006545)
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	12	GIP (ENSSVLG00005020522) #8	SNF8 (ENSSVLG00005020472) #9	ENSSVLG00005020450	UBE2Z (ENSSVLG00005020428) #10	ATP5MC1 (ENSSVLG00005020344)	CALCOCO2 (ENSSVLG00005020296) #12	TTLL6 (ENSSVLG00005020005) #13	HOXB13 (ENSSVLG00005019820) #14	HOXB9 (ENSSVLG00005019725) #15	HOXB8 (ENSSVLG00005019675) #16	HOXB7 (ENSSVLG00005019618) #17	HOXB6 (ENSSVLG00005019586) #18	HOXB5 (ENSSVLG00005019546) #19	HOXB4 (ENSSVLG00005019455) #20	HOXB3 (ENSSVLG00005019421) #21	HOXB2 (ENSSVLG00005019378) #22	HOXB1 (ENSSVLG00005019304) #23	SKAP1 (ENSSVLG00005019232) #24	SNX11 (ENSSVLG00005019122) #25	CBX1 (ENSSVLG00005019034) #26	NFE2L1 (ENSSVLG00005018798)	COPZ2 (ENSSVLG00005018641)	CDK5RAP3 (ENSSVLG00005018459)	PRR15L (ENSSVLG00005018399)	PNPO (ENSSVLG00005018295)	ENSSVLG00005018218	SP6 (ENSSVLG00005018194)	SCRN2 (ENSSVLG00005018077)	LRRC46 (ENSSVLG00005018036)	MRPL10 (ENSSVLG00005017985)	OSBPL7 (ENSSVLG00005017757)
Laurasiatheria	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT01100000264599	ENSGT00940000159091 #10	ENSGT00940000154298.a.b	ENSGT00940000159720 #11	ENSGT00950000183025.a #12	ENSGT00940000161434 #13	ENSGT00940000159029 #14	ENSGT00940000161386 #15	ENSGT00940000161529 #16	ENSGT00940000161230 #17	ENSGT00940000161108 #18	ENSGT00940000158354 #19	ENSGT00940000162072 #20	ENSGT00980000199681	ENSGT00940000159774 #21	ENSGT00940000155029.c.b #22	ENSGT00940000159503 #23	ENSGT00390000017856.b #24	ENSGT00940000160113 #25	ENSGT00940000154152.d.b #26	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000185410	ENSGT00390000000713	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000159590	ENSGT00940000161498	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000000603
Eulipotyphla	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000155029.c.b #22
Common shrew	MODERN SPECIES	5391																HOXB2 (ENSSARG00000008539) #22
Laurasiatheria_a	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000007843 #9	ENSGT00990000209473	ENSGT00940000159091 #10	ENSGT00940000159720 #11	ENSGT00950000183025.a #12	ENSGT00940000161434 #13	ENSGT00940000159029 #14	ENSGT00940000161386 #15	ENSGT00940000161529 #16	ENSGT00940000161230 #17	ENSGT00940000161108 #18	ENSGT00940000158354 #19	ENSGT00940000162072 #20	ENSGT00980000199681	ENSGT00940000159774 #21	ENSGT00940000155029.c.b #22	ENSGT00940000159503 #23	ENSGT00390000017856.b #24	ENSGT00940000160113 #25	ENSGT00940000154152.d.b #26	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00950000185410	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00390000000713	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000159590	ENSGT00940000161498	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000000603
Artiodactyla	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000007843 #9	ENSGT01100000264599	ENSGT00940000159091 #10	ENSGT00940000159720 #11	ENSGT00950000183025.a #12	ENSGT00940000161434 #13	ENSGT00940000159029 #14	ENSGT00940000161386 #15	ENSGT00940000161529 #16	ENSGT00940000161230 #17	ENSGT00940000161108 #18	ENSGT00940000158354 #19	ENSGT00940000162072 #20	ENSGT00980000199681	ENSGT00940000159774 #21	ENSGT00940000155029.c.b #22	ENSGT00940000159503 #23	ENSGT00390000017856.b #24	ENSGT00940000160113 #25	ENSGT00940000154152.d.b #26	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00950000185410	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00390000000713	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000159590	ENSGT00940000161498	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000000603
Suina	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000160427 #7	ENSGT00390000005121 #8	ENSGT00390000007843 #9	ENSGT00940000159091 #10	ENSGT00940000154298.a.b	ENSGT00950000183025.a #12	ENSGT00940000161434 #13	ENSGT00940000159029 #14	ENSGT00940000161386 #15	ENSGT00940000161529 #16	ENSGT00940000161230 #17	ENSGT00940000161108 #18	ENSGT00940000158354 #19	ENSGT00940000162072 #20	ENSGT00940000159774 #21	ENSGT00940000155029.c.b #22	ENSGT00940000159503 #23	ENSGT00390000017856.b #24	ENSGT00940000160113 #25	ENSGT00940000154152.d.b #26	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00390000000713	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000159590	ENSGT00940000161498	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000157439
Chacoan peccary	MODERN SPECIES	145	IGF2BP1 (ENSCWAG00000022044) #7	GIP (ENSCWAG00000022046) #8	SNF8 (ENSCWAG00000022048) #9	UBE2Z (ENSCWAG00000022050) #10	ATP5MC1 (ENSCWAG00000022052)	CALCOCO2 (ENSCWAG00000022056) #12	TTLL6 (ENSCWAG00000022059) #13	HOXB13 (ENSCWAG00000022063) #14	HOXB9 (ENSCWAG00000022065) #15	HOXB8 (ENSCWAG00000022066) #16	HOXB7 (ENSCWAG00000022067) #17	HOXB6 (ENSCWAG00000022069) #18	HOXB5 (ENSCWAG00000022071) #19	HOXB4 (ENSCWAG00000022074) #20	HOXB3 (ENSCWAG00000022077) #21	HOXB2 (ENSCWAG00000022078) #22	HOXB1 (ENSCWAG00000022080) #23	SKAP1 (ENSCWAG00000000046) #24	SNX11 (ENSCWAG00000000070) #25	CBX1 (ENSCWAG00000000121) #26	NFE2L1 (ENSCWAG00000000185)	COPZ2 (ENSCWAG00000000341)	CDK5RAP3 (ENSCWAG00000000377)	PRR15L (ENSCWAG00000000410)	PNPO (ENSCWAG00000000427)	SP2 (ENSCWAG00000000474)	SP6 (ENSCWAG00000000502)	SCRN2 (ENSCWAG00000000520)	LRRC46 (ENSCWAG00000000570)	MRPL10 (ENSCWAG00000000589)	OSBPL7 (ENSCWAG00000000623)
Pig	MODERN SPECIES	3	IGF2BP1 (ENSSSCG00000023128) #7	GIP (ENSSSCG00000026330) #8	SNF8 (ENSSSCG00000021461) #9	UBE2Z (ENSSSCG00000025638) #10	ATP5MC1 (ENSSSCG00000017544)	CALCOCO2 (ENSSSCG00000017543) #12	TTLL6 (ENSSSCG00000017542) #13	HOXB13 (ENSSSCG00000017541) #14	HOXB9 (ENSSSCG00000061856) #15	HOXB8 (ENSSSCG00000017537) #16	HOXB7 (ENSSSCG00000017538) #17	HOXB6 (ENSSSCG00000017539) #18	HOXB5 (ENSSSCG00000017540) #19	HOXB4 (ENSSSCG00000017535) #20	HOXB3 (ENSSSCG00000017534) #21	HOXB2 (ENSSSCG00000017533) #22	HOXB1 (ENSSSCG00000017532) #23	SKAP1 (ENSSSCG00000017527) #24	SNX11 (ENSSSCG00000017528) #25	CBX1 (ENSSSCG00000017529) #26	NFE2L1 (ENSSSCG00000017525)	COPZ2 (ENSSSCG00000017526)	CDK5RAP3 (ENSSSCG00000017524)	PRR15L (ENSSSCG00000054179)	PNPO (ENSSSCG00000032782)	SP2 (ENSSSCG00000017516)	SP6 (ENSSSCG00000017522)	SCRN2 (ENSSSCG00000017521)	LRRC46 (ENSSSCG00000017520)	MRPL10 (ENSSSCG00000017519)	OSBPL7 (ENSSSCG00000017518)
Artiodactyla_a	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00390000007843 #9	ENSGT01100000264599	ENSGT00940000159091 #10	ENSGT00940000159720 #11	ENSGT00950000183025.a #12	ENSGT00940000161434 #13	ENSGT00940000159029 #14	ENSGT00940000161386 #15	ENSGT00940000161529 #16	ENSGT00940000161230 #17	ENSGT00940000161108 #18	ENSGT00940000158354 #19	ENSGT00940000162072 #20	ENSGT00980000199681	ENSGT00940000159774 #21	ENSGT00940000155029.c.b #22	ENSGT00940000159503 #23	ENSGT00390000017856.b #24	ENSGT00940000160113 #25	ENSGT00940000154152.d.b #26	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00950000185410	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00390000000713	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000159590	ENSGT00940000161498	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000000603
Camelidae	ANCESTRAL SPECIES	60	ENSGT00390000005121 #8	ENSGT00390000007843 #9	ENSGT00990000209473	ENSGT00940000159091 #10	ENSGT00940000154298.a.b	ENSGT00940000159720 #11	ENSGT00950000183025.a #12	ENSGT00940000161434 #13	ENSGT00940000159029 #14	ENSGT00940000161386 #15	ENSGT00940000161230 #17	ENSGT00940000161108 #18	ENSGT00940000158354 #19	ENSGT00940000162072 #20	ENSGT00940000159774 #21	ENSGT00940000155029.c.b #22	ENSGT00940000159503 #23	ENSGT00390000017856.b #24	ENSGT00940000160113 #25	ENSGT00940000154152.d.a.a ##26	ENSGT00940000154152.d.b #26	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00950000185410	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00390000000713	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00940000159590	ENSGT00940000161498	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000000603
Arabian camel	MODERN SPECIES	7	IGF2BP1 (ENSCDRG00005016778) #7	GIP (ENSCDRG00005016991) #8	ENSCDRG00005017040 #9	ENSCDRG00005017061	UBE2Z (ENSCDRG00005017075) #10	ENSCDRG00005017142 #11	CALCOCO2 (ENSCDRG00005017213) #12	TTLL6 (ENSCDRG00005017585) #13	HOXB13 (ENSCDRG00005017741) #14	HOXB9 (ENSCDRG00005017862) #15	HOXB7 (ENSCDRG00005018007) #17	HOXB6 (ENSCDRG00005018029) #18	HOXB5 (ENSCDRG00005018055) #19	HOXB4 (ENSCDRG00005018079) #20	HOXB3 (ENSCDRG00005018104) #21	HOXB2 (ENSCDRG00005018121) #22	HOXB1 (ENSCDRG00005018147) #23	SKAP1 (ENSCDRG00005018166) #24	SNX11 (ENSCDRG00005018232) #25	CBX1 (ENSCDRG00005018330) ##26	NFE2L1 (ENSCDRG00005018357)	ENSCDRG00005018515	COPZ2 (ENSCDRG00005018538)	CDK5RAP3 (ENSCDRG00005018564)	PRR15L (ENSCDRG00005018636)	SP2 (ENSCDRG00005018756)	SP6 (ENSCDRG00005018791)	SCRN2 (ENSCDRG00005018805)	LRRC46 (ENSCDRG00005018865)	MRPL10 (ENSCDRG00005018906)	OSBPL7 (ENSCDRG00005018943)
Alpaca	MODERN SPECIES	3027																HOXB2 (ENSVPAG00000010121) #22	SKAP1 (ENSVPAG00000010119) #24	CBX1 (ENSVPAG00000010117) #26	NFE2L1 (ENSVPAG00000010116)
Artiodactyla_b	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00390000007843 #9	ENSGT01100000264599	ENSGT00940000159091 #10	ENSGT00940000159720 #11	ENSGT00950000183025.a #12	ENSGT00940000161434 #13	ENSGT00940000159029 #14	ENSGT00940000161386 #15	ENSGT00940000161529 #16	ENSGT00940000161230 #17	ENSGT00940000161108 #18	ENSGT00940000158354 #19	ENSGT00940000162072 #20	ENSGT00980000199681	ENSGT00940000159774 #21	ENSGT00940000155029.c.b #22	ENSGT00940000159503 #23	ENSGT00390000017856.b #24	ENSGT00940000160113 #25	ENSGT00940000154152.d.b #26	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000185410	ENSGT00390000000713	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000159590	ENSGT00940000161498	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000000603
Cetacea	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000160427 #7	ENSGT00390000005121 #8	ENSGT00390000007843 #9	ENSGT00940000159091 #10	ENSGT00940000159720.g #11	ENSGT00950000183025.a #12	ENSGT00940000161434 #13	ENSGT00940000159029 #14	ENSGT00940000161386 #15	ENSGT00940000161529 #16	ENSGT00940000161230 #17	ENSGT00940000161108 #18	ENSGT00940000158354 #19	ENSGT00940000162072 #20	ENSGT00940000159774 #21	ENSGT00940000155029.c.b #22	ENSGT00940000159503 #23	ENSGT00390000017856.b #24	ENSGT00940000160113 #25	ENSGT00940000154152.d.b #26	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00390000000713	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000159590	ENSGT00940000161498	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000157439
Odontoceti	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000160427 #7	ENSGT00390000005121 #8	ENSGT00390000007843 #9	ENSGT00940000159091 #10	ENSGT00940000159720.g #11	ENSGT00950000183025.a #12	ENSGT00940000161434 #13	ENSGT00940000159029 #14	ENSGT00940000161386 #15	ENSGT00940000161529 #16	ENSGT00940000161230 #17	ENSGT00940000161108 #18	ENSGT00940000158354 #19	ENSGT00940000162072 #20	ENSGT00940000159774 #21	ENSGT00940000155029.c.b #22	ENSGT00940000159503 #23	ENSGT00390000017856.b #24	ENSGT00940000160113 #25	ENSGT00940000154152.d.b #26	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00390000000713	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000159590	ENSGT00940000161498	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000157439
Odontoceti_a	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000160427 #7	ENSGT00390000005121 #8	ENSGT00390000007843 #9	ENSGT00940000159091 #10	ENSGT00940000159720.g #11	ENSGT00950000183025.a #12	ENSGT00940000161434 #13	ENSGT00940000159029 #14	ENSGT00940000161386 #15	ENSGT00940000161529 #16	ENSGT00940000161230 #17	ENSGT00940000161108 #18	ENSGT00940000158354 #19	ENSGT00940000162072 #20	ENSGT00940000159774 #21	ENSGT00940000155029.c.b #22	ENSGT00940000159503 #23	ENSGT00390000017856.b #24	ENSGT00940000160113 #25	ENSGT00940000154152.d.b #26	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00390000000713	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000159590	ENSGT00940000161498	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000157439
Dolphin	MODERN SPECIES	4465									HOXB9 (ENSTTRG00000012262) #15	HOXB8 (ENSTTRG00000012260) #16	ENSTTRG00000012257	HOXB6 (ENSTTRG00000012252) #18	HOXB5 (ENSTTRG00000012251) #19	HOXB4 (ENSTTRG00000012249) #20	HOXB3 (ENSTTRG00000012246) #21	HOXB2 (ENSTTRG00000012244) #22	HOXB1 (ENSTTRG00000012240) #23
Odontoceti_b	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000160427 #7	ENSGT00390000005121 #8	ENSGT00390000007843 #9	ENSGT00940000159091 #10	ENSGT00940000159720.g #11	ENSGT00950000183025.a #12	ENSGT00940000161434 #13	ENSGT00940000159029 #14	ENSGT00940000161386 #15	ENSGT00940000161529 #16	ENSGT00940000161230 #17	ENSGT00940000161108 #18	ENSGT00940000158354 #19	ENSGT00940000162072 #20	ENSGT00940000159774 #21	ENSGT00940000155029.c.b #22	ENSGT00940000159503 #23	ENSGT00390000017856.b #24	ENSGT00940000160113 #25	ENSGT00940000154152.d.b #26	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00390000000713	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000159590	ENSGT00940000161498	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000157439
Monodontidae	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000160427 #7	ENSGT00390000005121 #8	ENSGT00390000007843 #9	ENSGT00940000159091 #10	ENSGT00940000159720.g #11	ENSGT00950000183025.a #12	ENSGT00940000161434 #13	ENSGT00940000159029 #14	ENSGT00940000161386 #15	ENSGT00940000161529 #16	ENSGT00940000161230 #17	ENSGT00940000161108 #18	ENSGT00940000158354 #19	ENSGT00940000162072 #20	ENSGT00940000159774 #21	ENSGT00940000155029.c.b #22	ENSGT00940000159503 #23	ENSGT00390000017856.b #24	ENSGT00940000160113 #25	ENSGT00940000154152.d.b #26	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00390000000713	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000159590	ENSGT00940000161498	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000157439
Beluga whale	MODERN SPECIES	26	IGF2BP1 (ENSDLEG00000004887) #7	GIP (ENSDLEG00000004882) #8	SNF8 (ENSDLEG00000004876) #9	UBE2Z (ENSDLEG00000004871) #10	ATP5G1 (ENSDLEG00000004867) #11	CALCOCO2 (ENSDLEG00000004861) #12	TTLL6 (ENSDLEG00000004850) #13	HOXB13 (ENSDLEG00000004844) #14	HOXB9 (ENSDLEG00000004838) #15	HOXB8 (ENSDLEG00000004837) #16	HOXB7 (ENSDLEG00000004834) #17	HOXB6 (ENSDLEG00000004829) #18	HOXB5 (ENSDLEG00000004826) #19	HOXB4 (ENSDLEG00000004820) #20	HOXB3 (ENSDLEG00000004817) #21	HOXB2 (ENSDLEG00000004813) #22	HOXB1 (ENSDLEG00000004807) #23	SKAP1 (ENSDLEG00000004779) #24	SNX11 (ENSDLEG00000004765) #25	CBX1 (ENSDLEG00000004754) ##26	NFE2L1 (ENSDLEG00000004744)	ENSDLEG00000004734	COPZ2 (ENSDLEG00000004721)	CDK5RAP3 (ENSDLEG00000004709)	PRR15L (ENSDLEG00000004704)	PNPO (ENSDLEG00000004701)	SP2 (ENSDLEG00000004697)	SP6 (ENSDLEG00000004694)	SCRN2 (ENSDLEG00000004688)	ENSDLEG00000004684	MRPL10 (ENSDLEG00000004678)
Narwhal	MODERN SPECIES	316	IGF2BP1 (ENSMMNG00015022053) #7	GIP (ENSMMNG00015022055) #8	ENSMMNG00015022056 #9	UBE2Z (ENSMMNG00015022057) #10	ENSMMNG00015022058 #11	CALCOCO2 (ENSMMNG00015022060) #12	TTLL6 (ENSMMNG00015015987) #13	HOXB13 (ENSMMNG00015016080) #14	HOXB9 (ENSMMNG00015016160) #15	HOXB8 (ENSMMNG00015016175) #16	HOXB7 (ENSMMNG00015016197) #17	HOXB6 (ENSMMNG00015016215) #18	HOXB5 (ENSMMNG00015016235) #19	HOXB4 (ENSMMNG00015016252) #20	HOXB3 (ENSMMNG00015016287) #21	HOXB2 (ENSMMNG00015016324) #22	HOXB1 (ENSMMNG00015016356) #23	SKAP1 (ENSMMNG00015016386) #24	SNX11 (ENSMMNG00015016452) #25	CBX1 (ENSMMNG00015016582) #26	NFE2L1 (ENSMMNG00015016634)	COPZ2 (ENSMMNG00015016743)	CDK5RAP3 (ENSMMNG00015016820)	PRR15L (ENSMMNG00015016868)	PNPO (ENSMMNG00015016895)	SP2 (ENSMMNG00015016948)	SP6 (ENSMMNG00015016969)	SCRN2 (ENSMMNG00015016985)	LRRC46 (ENSMMNG00015017038)	MRPL10 (ENSMMNG00015017084)	OSBPL7 (ENSMMNG00015017115)
Vaquita	MODERN SPECIES	12	IGF2BP1 (ENSPSNG00000016168) #7	GIP (ENSPSNG00000016483) #8	SNF8 (ENSPSNG00000016533) #9	UBE2Z (ENSPSNG00000016576) #10	ENSPSNG00000016635 #11	CALCOCO2 (ENSPSNG00000016749) #12	TTLL6 (ENSPSNG00000017015) #13	HOXB13 (ENSPSNG00000017233) #14	HOXB9 (ENSPSNG00000017398) #15	HOXB8 (ENSPSNG00000017436) #16	HOXB7 (ENSPSNG00000017482) #17	HOXB6 (ENSPSNG00000017525) #18	HOXB5 (ENSPSNG00000017559) #19	HOXB4 (ENSPSNG00000017604) #20	HOXB3 (ENSPSNG00000017636) #21	HOXB2 (ENSPSNG00000017708) #22	HOXB1 (ENSPSNG00000017728) #23	SKAP1 (ENSPSNG00000017760) #24	SNX11 (ENSPSNG00000017889) #25	ENSPSNG00000017984 #26	NFE2L1 (ENSPSNG00000018052)	COPZ2 (ENSPSNG00000018262)	CDK5RAP3 (ENSPSNG00000018321)	PRR15L (ENSPSNG00000018399)	PNPO (ENSPSNG00000018423)	SP2 (ENSPSNG00000018528)	SP6 (ENSPSNG00000018568)	SCRN2 (ENSPSNG00000018588)	LRRC46 (ENSPSNG00000018676)	ENSPSNG00000018757	OSBPL7 (ENSPSNG00000018799)
Sperm whale	MODERN SPECIES	5	IGF2BP1 (ENSPCTG00005004404) #7	GIP (ENSPCTG00005004443) #8	ENSPCTG00005004464	SNF8 (ENSPCTG00005004481) #9	ATP5MC1 (ENSPCTG00005004516) #10	CALCOCO2 (ENSPCTG00005004611) #12	TTLL6 (ENSPCTG00005004739) #13	HOXB13 (ENSPCTG00005004788) #14	HOXB9 (ENSPCTG00005004847) #15	HOXB8 (ENSPCTG00005004864) #16	HOXB7 (ENSPCTG00005004882) #17	HOXB6 (ENSPCTG00005004887) #18	HOXB5 (ENSPCTG00005004905) #19	HOXB4 (ENSPCTG00005004920) #20	HOXB3 (ENSPCTG00005004930) #21	HOXB2 (ENSPCTG00005004951) #22	HOXB1 (ENSPCTG00005004966) #23	SKAP1 (ENSPCTG00005004985) #24	CBX1 (ENSPCTG00005005034) #26	ENSPCTG00005005083	TBX21 (ENSPCTG00005005105)	TBKBP1 (ENSPCTG00005005144)	KPNB1 (ENSPCTG00005005195)	NPEPPS (ENSPCTG00005005245)	GPR179 (ENSPCTG00005005545)	SOCS7 (ENSPCTG00005005634)	ARHGAP23 (ENSPCTG00005005753)	SRCIN1 (ENSPCTG00005005823)	ENSPCTG00005006189	PSMB3 (ENSPCTG00005006224)	PIP4K2B (ENSPCTG00005006258)
Blue whale	MODERN SPECIES	12	GIP (ENSBMSG00010017026) #8	SNF8 (ENSBMSG00010017067) #9	UBE2Z (ENSBMSG00010017102) #10	ATP5MC1 (ENSBMSG00010017142)	ENSBMSG00010017179	CALCOCO2 (ENSBMSG00010017255) #12	TTLL6 (ENSBMSG00010017444) #13	HOXB13 (ENSBMSG00010017547) #14	HOXB9 (ENSBMSG00010017655) #15	HOXB8 (ENSBMSG00010017685) #16	HOXB7 (ENSBMSG00010017724) #17	HOXB6 (ENSBMSG00010017746) #18	HOXB5 (ENSBMSG00010017772) #19	HOXB4 (ENSBMSG00010017814) #20	HOXB3 (ENSBMSG00010017838) #21	HOXB2 (ENSBMSG00010017860) #22	HOXB1 (ENSBMSG00010017892) #23	SKAP1 (ENSBMSG00010017921) #24	SNX11 (ENSBMSG00010018006) #25	CBX1 (ENSBMSG00010018099) #26	NFE2L1 (ENSBMSG00010018163)	COPZ2 (ENSBMSG00010018306)	CDK5RAP3 (ENSBMSG00010018481)	PRR15L (ENSBMSG00010018513)	PNPO (ENSBMSG00010018544)	SP2 (ENSBMSG00010018607)	SP6 (ENSBMSG00010018628)	ENSBMSG00010018650	ENSBMSG00010018673	ENSBMSG00010018688	ENSBMSG00010018708
Pecora	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000007843 #9	ENSGT01100000264599	ENSGT00940000159091 #10	ENSGT00940000159720 #11	ENSGT00950000183025.a #12	ENSGT00940000161434 #13	ENSGT00940000159029 #14	ENSGT00940000161386 #15	ENSGT00940000161529 #16	ENSGT00940000161230 #17	ENSGT00940000161108 #18	ENSGT00940000158354 #19	ENSGT00940000162072 #20	ENSGT00980000199681	ENSGT00940000159774 #21	ENSGT00940000155029.c.b #22	ENSGT00940000159503 #23	ENSGT00390000017856.b #24	ENSGT00940000160113 #25	ENSGT00940000154152.d.b #26	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000185410	ENSGT00390000000713	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000159590	ENSGT00940000161498	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000000603
Yarkand deer	MODERN SPECIES	28	GIP (ENSCHYG00000004425) #8	SNF8 (ENSCHYG00000004443) #9	UBE2Z (ENSCHYG00000004456) #10	ENSCHYG00000004476 #11	ENSCHYG00000004493	ENSCHYG00000004521 #12	TTLL6 (ENSCHYG00000004571) #13	HOXB13 (ENSCHYG00000004599) #14	HOXB9 (ENSCHYG00000004623) #15	HOXB8 (ENSCHYG00000004637) #16	HOXB7 (ENSCHYG00000004645) #17	HOXB6 (ENSCHYG00000004651) #18	HOXB5 (ENSCHYG00000004658) #19	HOXB4 (ENSCHYG00000004668) #20	HOXB3 (ENSCHYG00000004670) #21	HOXB2 (ENSCHYG00000004674) #22	HOXB1 (ENSCHYG00000004684) #23	SKAP1 (ENSCHYG00000004692) #24	ENSCHYG00000004720	SNX11 (ENSCHYG00000004737) #25	CBX1 (ENSCHYG00000004750) #26	NFE2L1 (ENSCHYG00000004781)	COPZ2 (ENSCHYG00000004829)	ENSCHYG00000004851	CDK5RAP3 (ENSCHYG00000000101)	PRR15L (ENSCHYG00000000125)	PNPO (ENSCHYG00000000157)	SP2 (ENSCHYG00000000198)	SP6 (ENSCHYG00000000221)	SCRN2 (ENSCHYG00000000227)	LRRC46 (ENSCHYG00000000251)
Percora_a	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000007843 #9	ENSGT01100000264599	ENSGT00940000159091 #10	ENSGT00940000159720 #11	ENSGT00950000183025.a #12	ENSGT00940000161434 #13	ENSGT00940000159029 #14	ENSGT00940000161386 #15	ENSGT00940000161529 #16	ENSGT00940000161230 #17	ENSGT00940000161108 #18	ENSGT00940000158354 #19	ENSGT00940000162072 #20	ENSGT00980000199681	ENSGT00940000159774 #21	ENSGT00940000155029.c.b #22	ENSGT00940000159503 #23	ENSGT00390000017856.b #24	ENSGT00940000160113 #25	ENSGT00940000154152.d.b #26	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00390000000713	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000159590	ENSGT00940000161498	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000157439
Siberian musk deer	MODERN SPECIES	1210	GIP (ENSMMSG00000024503) #8	ENSMMSG00000024504 #9	UBE2Z (ENSMMSG00000024505) #10	ATP5MC1 (ENSMMSG00000024506)	CALCOCO2 (ENSMMSG00000024509) #12	TTLL6 (ENSMMSG00000024514) #13	HOXB13 (ENSMMSG00000024516) #14	HOXB9 (ENSMMSG00000024520) #15	HOXB8 (ENSMMSG00000024522) #16	HOXB7 (ENSMMSG00000024523) #17	HOXB6 (ENSMMSG00000024525) #18	HOXB5 (ENSMMSG00000024526) #19	HOXB4 (ENSMMSG00000024528) #20	ENSMMSG00000024530	HOXB3 (ENSMMSG00000024531) #21	HOXB2 (ENSMMSG00000024532) #22	HOXB1 (ENSMMSG00000024533) #23	ENSMMSG00000024535	SKAP1 (ENSMMSG00000024536) #24	SNX11 (ENSMMSG00000024538) #25	CBX1 (ENSMMSG00000024540) #26	NFE2L1 (ENSMMSG00000024541)	COPZ2 (ENSMMSG00000024546)	CDK5RAP3 (ENSMMSG00000024548)	PRR15L (ENSMMSG00000024549)	PNPO (ENSMMSG00000024550)	SP2 (ENSMMSG00000024551)	SP6 (ENSMMSG00000018224)	SCRN2 (ENSMMSG00000018238)	LRRC46 (ENSMMSG00000018351)	MRPL10 (ENSMMSG00000018396)
Bovidae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000005121 #8	ENSGT00390000007843 #9	ENSGT01100000264599	ENSGT00940000159091 #10	ENSGT00940000159720 #11	ENSGT00950000183025.a #12	ENSGT00940000161434 #13	ENSGT00940000159029 #14	ENSGT00940000161386 #15	ENSGT00940000161529 #16	ENSGT00940000161230 #17	ENSGT00940000161108 #18	ENSGT00940000158354 #19	ENSGT00940000162072 #20	ENSGT00940000159774 #21	ENSGT00940000155029.c.b #22	ENSGT00940000159503 #23	ENSGT00390000017856.b #24	ENSGT00940000160113 #25	ENSGT00940000154152.d.b #26	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00390000000713	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000159590	ENSGT00940000161498	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000157439
Caprinae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000005121 #8	ENSGT00390000007843.g.a #9	ENSGT01100000264599	ENSGT00940000159091 #10	ENSGT00940000159720 #11	ENSGT00950000183025.a #12	ENSGT00940000161434 #13	ENSGT00940000159029 #14	ENSGT00940000161386 #15	ENSGT00940000161529 #16	ENSGT00940000161230 #17	ENSGT00940000161108 #18	ENSGT00940000158354 #19	ENSGT00940000162072 #20	ENSGT00940000159774 #21	ENSGT00940000155029.c.b #22	ENSGT00940000159503 #23	ENSGT00940000154688.b.j	ENSGT00390000017856.b #24	ENSGT00940000160113 #25	ENSGT00940000154152.d.b #26	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00390000000713	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000159590	ENSGT00940000161498	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000000603
Rambouillet Sheep	MODERN SPECIES	2	IGF2BP1 (ENSOARG00020022766) #7	GIP (ENSOARG00020022695) #8	UBE2Z (ENSOARG00020022664) #10	ATP5MC1 (ENSOARG00020022590) #11	CALCOCO2 (ENSOARG00020022295) #12	ENSOARG00020022258 #13	SNF8 (ENSOARG00020022227) #9	HOXB13 (ENSOARG00020022195) #14	HOXB9 (ENSOARG00020022138) #15	HOXB8 (ENSOARG00020022064) #16	HOXB7 (ENSOARG00020022042) #17	HOXB6 (ENSOARG00020022021) #18	HOXB5 (ENSOARG00020022004) #19	HOXB4 (ENSOARG00020021954) #20	HOXB3 (ENSOARG00020021943) #21	HOXB2 (ENSOARG00020021907) #22	HOXB1 (ENSOARG00020021886) #23	SKAP1 (ENSOARG00020021817) #24	SNX11 (ENSOARG00020021783) #25	CBX1 (ENSOARG00020021741) #26	NFE2L1 (ENSOARG00020021460)	COPZ2 (ENSOARG00020021377)	CDK5RAP3 (ENSOARG00020021339)	PRR15L (ENSOARG00020021319)	PNPO (ENSOARG00020021017)	SP2 (ENSOARG00020020972)	SP6 (ENSOARG00020020944)	SCRN2 (ENSOARG00020020770)	LRRC46 (ENSOARG00020020663)	MRPL10 (ENSOARG00020020614)	OSBPL7 (ENSOARG00020020494)
Goat	MODERN SPECIES	10	GIP (ENSCHIG00000010936) #8	SNF8 (ENSCHIG00000014794) #9	ENSCHIG00000020962	UBE2Z (ENSCHIG00000003883) #10	ENSCHIG00000016881 #11	CALCOCO2 (ENSCHIG00000025313) #12	TTLL6 (ENSCHIG00000022654) #13	HOXB13 (ENSCHIG00000026703) #14	HOXB9 (ENSCHIG00000022791) #15	HOXB8 (ENSCHIG00000015504) #16	HOXB7 (ENSCHIG00000017532) #17	HOXB6 (ENSCHIG00000008881) #18	HOXB5 (ENSCHIG00000023147) #19	HOXB4 (ENSCHIG00000025323) #20	HOXB3 (ENSCHIG00000013978) #21	HOXB2 (ENSCHIG00000025836) #22	HOXB1 (ENSCHIG00000017872) #23	ENSCHIG00000010180	ENSCHIG00000015920 #24	ENSCHIG00000026878 #24	SNX11 (ENSCHIG00000017547) #25	CBX1 (ENSCHIG00000010985) #26	NFE2L1 (ENSCHIG00000015427)	COPZ2 (ENSCHIG00000026544)	CDK5RAP3 (ENSCHIG00000025420)	PRR15L (ENSCHIG00000008261)	PNPO (ENSCHIG00000004606)	SP2 (ENSCHIG00000018648)	SP6 (ENSCHIG00000009897)	SCRN2 (ENSCHIG00000026802)	LRRC46 (ENSCHIG00000015497)
Bovinae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000160427 #7	ENSGT00390000005121 #8	ENSGT00390000007843 #9	ENSGT00940000159091 #10	ENSGT00940000159720 #11	ENSGT00950000183025.a #12	ENSGT00940000161434 #13	ENSGT00940000159029 #14	ENSGT00940000161386 #15	ENSGT00940000161529 #16	ENSGT00940000161230 #17	ENSGT00940000161108 #18	ENSGT00940000158354 #19	ENSGT00940000162072 #20	ENSGT00940000159774 #21	ENSGT00940000155029.c.b #22	ENSGT00940000159503 #23	ENSGT00390000017856.b #24	ENSGT00940000160113 #25	ENSGT00940000154152.d.b #26	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00390000000713	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000159590	ENSGT00940000161498	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000157439
American bison	MODERN SPECIES	3101	B4GALNT2 (ENSBBBG00000021305)	IGF2BP1 (ENSBBBG00000021334) #7	GIP (ENSBBBG00000021349) #8	SNF8 (ENSBBBG00000021356) #9	UBE2Z (ENSBBBG00000021371) #10	ATP5MC1 (ENSBBBG00000021377)	CALCOCO2 (ENSBBBG00000005726) #12	TTLL6 (ENSBBBG00000021540) #13	HOXB13 (ENSBBBG00000021546) #14	HOXB9 (ENSBBBG00000021558) #15	HOXB7 (ENSBBBG00000021565) #17	HOXB6 (ENSBBBG00000021567) #18	HOXB5 (ENSBBBG00000021577) #19	HOXB4 (ENSBBBG00000021585) #20	HOXB3 (ENSBBBG00000005740) #21	HOXB2 (ENSBBBG00000021598) #22	HOXB1 (ENSBBBG00000021601) #23	SKAP1 (ENSBBBG00000021634) #24	SNX11 (ENSBBBG00000021652) #25	ENSBBBG00000021675 ##26	NFE2L1 (ENSBBBG00000021740)	COPZ2 (ENSBBBG00000021782)	CDK5RAP3 (ENSBBBG00000021808)	PRR15L (ENSBBBG00000021809)	PNPO (ENSBBBG00000021862)	SP2 (ENSBBBG00000021914)	SP6 (ENSBBBG00000021924)	SCRN2 (ENSBBBG00000021958)	LRRC46 (ENSBBBG00000021972)	MRPL10 (ENSBBBG00000021983)	OSBPL7 (ENSBBBG00000022056)
Bos	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000160427 #7	ENSGT00390000005121 #8	ENSGT00390000007843 #9	ENSGT00940000159091 #10	ENSGT00940000159720 #11	ENSGT00950000183025.a #12	ENSGT00940000161434 #13	ENSGT00940000159029 #14	ENSGT00940000161386 #15	ENSGT00940000161529 #16	ENSGT00940000161230 #17	ENSGT00940000161108 #18	ENSGT00940000158354 #19	ENSGT00940000162072 #20	ENSGT00940000159774 #21	ENSGT00940000155029.c.b #22	ENSGT00940000159503 #23	ENSGT00940000154688.b.k.a	ENSGT00390000017856.b #24	ENSGT00940000160113 #25	ENSGT00940000154152.d.b.i #26	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00390000000713	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000159590.e.b	ENSGT00940000161498	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000000603
Bos_b	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000160427 #7	ENSGT00390000005121 #8	ENSGT00390000007843 #9	ENSGT00940000159091 #10	ENSGT00940000159720 #11	ENSGT00950000183025.a #12	ENSGT00940000161434 #13	ENSGT00940000159029 #14	ENSGT00940000161386 #15	ENSGT00940000161529 #16	ENSGT00940000161230 #17	ENSGT00940000161108 #18	ENSGT00940000158354 #19	ENSGT00940000162072 #20	ENSGT00940000159774 #21	ENSGT00940000155029.c.b #22	ENSGT00940000159503 #23	ENSGT00940000154688.b.k.a	ENSGT00390000017856.b #24	ENSGT00940000160113 #25	ENSGT00940000154152.d.b.i #26	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00390000000713	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000159590.e.b	ENSGT00940000161498	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000000603
Cow	MODERN SPECIES	10	IGF2BP1 (ENSBTAG00000011736) #7	GIP (ENSBTAG00000005045) #8	SNF8 (ENSBTAG00000018803) #9	UBE2Z (ENSBTAG00000018802) #10	ATP5MC1 (ENSBTAG00000018339) #11	CALCOCO2 (ENSBTAG00000007935) #12	TTLL6 (ENSBTAG00000009332) #13	HOXB13 (ENSBTAG00000014663) #14	HOXB9 (ENSBTAG00000054623) #15	HOXB8 (ENSBTAG00000054162) #16	HOXB7 (ENSBTAG00000005546) #17	HOXB6 (ENSBTAG00000050006) #18	HOXB5 (ENSBTAG00000045835) #19	HOXB4 (ENSBTAG00000039599) #20	HOXB3 (ENSBTAG00000021427) #21	HOXB2 (ENSBTAG00000009979) #22	HOXB1 (ENSBTAG00000007603) #23	SKAP1 (ENSBTAG00000000641) #24	SNX11 (ENSBTAG00000020321) #25	CBX1 (ENSBTAG00000002949) #26	NFE2L1 (ENSBTAG00000013653)	COPZ2 (ENSBTAG00000039954)	CDK5RAP3 (ENSBTAG00000014202)	PRR15L (ENSBTAG00000012249)	PNPO (ENSBTAG00000012259)	SP2 (ENSBTAG00000013740)	SP6 (ENSBTAG00000001825)	SCRN2 (ENSBTAG00000001828)	LRRC46 (ENSBTAG00000001830)	MRPL10 (ENSBTAG00000001832)	OSBPL7 (ENSBTAG00000013523)
Hybrid Bos Indicus	MODERN SPECIES	10	IGF2BP1 (ENSBIXG00005007917) #7	GIP (ENSBIXG00005007892) #8	SNF8 (ENSBIXG00005007866) #9	UBE2Z (ENSBIXG00005029277) #10	ENSBIXG00005029305 #11	CALCOCO2 (ENSBIXG00005029366) #12	ENSBIXG00005029447 #13	HOXB13 (ENSBIXG00005029474) #14	HOXB9 (ENSBIXG00005029519) #15	HOXB8 (ENSBIXG00005029530) #16	HOXB7 (ENSBIXG00005029546) #17	HOXB6 (ENSBIXG00005029554) #18	HOXB5 (ENSBIXG00005029559) #19	HOXB4 (ENSBIXG00005029577) #20	HOXB3 (ENSBIXG00005029591) #21	HOXB2 (ENSBIXG00005029607) #22	HOXB1 (ENSBIXG00005029618) #23	ENSBIXG00005029636	SKAP1 (ENSBIXG00005029657) #24	SNX11 (ENSBIXG00005029679) #25	CBX1 (ENSBIXG00005029691) #26	NFE2L1 (ENSBIXG00005029748)	COPZ2 (ENSBIXG00005029862)	CDK5RAP3 (ENSBIXG00005029886)	PRR15L (ENSBIXG00005029905)	PNPO (ENSBIXG00005029918)	ENSBIXG00005029934	SP6 (ENSBIXG00005029948)	SCRN2 (ENSBIXG00005029976)	LRRC46 (ENSBIXG00005030008)	MRPL10 (ENSBIXG00005030023)
Bos_a	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000160427 #7	ENSGT00390000005121 #8	ENSGT00390000007843 #9	ENSGT00940000159091 #10	ENSGT00940000159720 #11	ENSGT00950000183025.a #12	ENSGT00940000161434 #13	ENSGT00940000159029 #14	ENSGT00940000161386 #15	ENSGT00940000161529 #16	ENSGT00940000161230 #17	ENSGT00940000161108 #18	ENSGT00940000158354 #19	ENSGT00940000162072 #20	ENSGT00940000159774 #21	ENSGT00940000155029.c.b #22	ENSGT00940000159503 #23	ENSGT00940000154688.b.k.a	ENSGT00390000017856.b #24	ENSGT00940000160113 #25	ENSGT00940000154152.d.b.i #26	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00390000000713	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000159590.e.b	ENSGT00940000161498	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000000603
Wild yak	MODERN SPECIES	319	IGF2BP1 (ENSBMUG00000000549) #7	GIP (ENSBMUG00000000594) #8	SNF8 (ENSBMUG00000000607) #9	UBE2Z (ENSBMUG00000000624) #10	ENSBMUG00000000644 #11	CALCOCO2 (ENSBMUG00000000720) #12	ENSBMUG00000000753 #13	HOXB13 (ENSBMUG00000000770) #14	HOXB9 (ENSBMUG00000000804) #15	HOXB8 (ENSBMUG00000000824) #16	HOXB7 (ENSBMUG00000000832) #17	HOXB6 (ENSBMUG00000000839) #18	HOXB5 (ENSBMUG00000000849) #19	HOXB4 (ENSBMUG00000000867) #20	HOXB3 (ENSBMUG00000000876) #21	HOXB2 (ENSBMUG00000000885) #22	HOXB1 (ENSBMUG00000000891) #23	ENSBMUG00000000901	SKAP1 (ENSBMUG00000000925) #24	SNX11 (ENSBMUG00000000953) #25	CBX1 (ENSBMUG00000000974) #26	NFE2L1 (ENSBMUG00000001054)	COPZ2 (ENSBMUG00000001081)	CDK5RAP3 (ENSBMUG00000001110)	ENSBMUG00000001125	PNPO (ENSBMUG00000001160)	SP2 (ENSBMUG00000001179)
Domestic yak	MODERN SPECIES	10	B4GALNT2 (ENSBGRG00000022672)	IGF2BP1 (ENSBGRG00000022442) #7	GIP (ENSBGRG00000022397) #8	SNF8 (ENSBGRG00000022296) #9	UBE2Z (ENSBGRG00000022223) #10	ENSBGRG00000022156 #11	CALCOCO2 (ENSBGRG00000021810) #12	TTLL6 (ENSBGRG00000021744) #13	HOXB13 (ENSBGRG00000021718) #14	HOXB9 (ENSBGRG00000021683) #15	HOXB8 (ENSBGRG00000021618) #16	HOXB6 (ENSBGRG00000021579) #18	HOXB5 (ENSBGRG00000021555) #19	HOXB4 (ENSBGRG00000021501) #20	HOXB3 (ENSBGRG00000021464) #21	HOXB2 (ENSBGRG00000021425) #22	HOXB1 (ENSBGRG00000021404) #23	SKAP1 (ENSBGRG00000021202) #24	SNX11 (ENSBGRG00000021141) #25	CBX1 (ENSBGRG00000021062) #26	NFE2L1 (ENSBGRG00000020783)	COPZ2 (ENSBGRG00000020574)	CDK5RAP3 (ENSBGRG00000020283)	ENSBGRG00000020194	PNPO (ENSBGRG00000019898)	ENSBGRG00000019774	SP6 (ENSBGRG00000019744)	SCRN2 (ENSBGRG00000019672)	LRRC46 (ENSBGRG00000019490)	MRPL10 (ENSBGRG00000019422)	OSBPL7 (ENSBGRG00000019260)
Laurasiatheria_b	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000007843 #9	ENSGT00990000209473	ENSGT00940000159091 #10	ENSGT00940000159720 #11	ENSGT00950000183025.a #12	ENSGT00940000161434 #13	ENSGT00940000159029 #14	ENSGT00940000161386 #15	ENSGT00940000161529 #16	ENSGT00940000161230 #17	ENSGT00940000161108 #18	ENSGT00940000158354 #19	ENSGT00940000162072 #20	ENSGT00980000199681	ENSGT00940000159774 #21	ENSGT00940000155029.c.b #22	ENSGT00940000159503 #23	ENSGT00390000017856.b #24	ENSGT00940000160113 #25	ENSGT00940000154152.d.b #26	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00950000185410	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00390000000713	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000159590	ENSGT00940000161498	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000000603
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Caniformia	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00390000005121 #8	ENSGT00390000007843 #9	ENSGT00990000209473	ENSGT00940000159091 #10	ENSGT00940000159720 #11	ENSGT00950000183025.a #12	ENSGT00940000161434 #13	ENSGT00940000159029 #14	ENSGT00940000161386 #15	ENSGT00940000161529 #16	ENSGT00940000161230 #17	ENSGT00940000161108 #18	ENSGT00940000158354 #19	ENSGT00940000162072 #20	ENSGT00940000159774 #21	ENSGT00940000155029.c.b #22	ENSGT00940000159503 #23	ENSGT00390000017856.b #24	ENSGT00940000160113 #25	ENSGT00940000154152.d.b #26	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00950000185410	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00390000000713	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000159590	ENSGT00940000161498	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000000603
Canidae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000160427 #7	ENSGT00390000005121 #8	ENSGT00390000007843 #9	ENSGT00940000159091 #10	ENSGT00940000159720.c #11	ENSGT00950000183025.a #12	ENSGT00940000161434 #13	ENSGT00940000159029 #14	ENSGT00940000161386 #15	ENSGT00940000161529 #16	ENSGT00940000161230 #17	ENSGT00940000161108 #18	ENSGT00940000158354 #19	ENSGT00940000162072 #20	ENSGT00940000159774 #21	ENSGT00940000155029.c.b #22	ENSGT00940000159503 #23	ENSGT00390000017856.b #24	ENSGT00940000160113 #25	ENSGT00940000154152.d.b #26	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00390000000713	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000159590	ENSGT00940000161498	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000157439
Canis_lupus	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000160427 #7	ENSGT00390000005121 #8	ENSGT00390000007843 #9	ENSGT00940000159091 #10	ENSGT00940000159720.c #11	ENSGT00950000183025.a #12	ENSGT00940000161434 #13	ENSGT00940000159029 #14	ENSGT00940000161386 #15	ENSGT00940000161529 #16	ENSGT00940000161230 #17	ENSGT00940000161108 #18	ENSGT00940000158354 #19	ENSGT00940000162072 #20	ENSGT00940000159774 #21	ENSGT00940000155029.c.b #22	ENSGT00940000159503 #23	ENSGT00390000017856.b #24	ENSGT00940000160113 #25	ENSGT00940000154152.d.b #26	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00390000000713	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000159590	ENSGT00940000161498	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000157439
Dog	MODERN SPECIES	37	IGF2BP1 (ENSCAFG00845010596) #7	GIP (ENSCAFG00845010532) #8	SNF8 (ENSCAFG00845010455) #9	UBE2Z (ENSCAFG00845010395) #10	ATP5MC1 (ENSCAFG00845010336) #11	CALCOCO2 (ENSCAFG00845010119) #12	TTLL6 (ENSCAFG00845010017) #13	HOXB13 (ENSCAFG00845009992) #14	HOXB9 (ENSCAFG00845009956) #15	HOXB8 (ENSCAFG00845009931) #16	HOXB7 (ENSCAFG00845009899) #17	HOXB6 (ENSCAFG00845009871) #18	HOXB5 (ENSCAFG00845009832) #19	HOXB4 (ENSCAFG00845017264) #20	HOXB3 (ENSCAFG00845017188) #21	HOXB2 (ENSCAFG00845017142) #22	HOXB1 (ENSCAFG00845017096) #23	SKAP1 (ENSCAFG00845016959) #24	SNX11 (ENSCAFG00845016720) #25	CBX1 (ENSCAFG00845016596) #26	NFE2L1 (ENSCAFG00845016388)	COPZ2 (ENSCAFG00845016156)	CDK5RAP3 (ENSCAFG00845016051)	ENSCAFG00845016000	PRR15L (ENSCAFG00845015978)	PNPO (ENSCAFG00845015876)	SP2 (ENSCAFG00845015786)	SP6 (ENSCAFG00845015746)	SCRN2 (ENSCAFG00845015686)	LRRC46 (ENSCAFG00845015603)	MRPL10 (ENSCAFG00845015539)
Dingo	MODERN SPECIES	150	IGF2BP1 (ENSCAFG00020023369) #7	GIP (ENSCAFG00020023360) #8	SNF8 (ENSCAFG00020023354) #9	UBE2Z (ENSCAFG00020023351) #10	ENSCAFG00020023349 #11	CALCOCO2 (ENSCAFG00020023334) #12	TTLL6 (ENSCAFG00020023324) #13	HOXB13 (ENSCAFG00020023319) #14	HOXB9 (ENSCAFG00020023312) #15	HOXB8 (ENSCAFG00020023306) #16	ENSCAFG00020023303 #17	HOXB6 (ENSCAFG00020023302) #18	HOXB5 (ENSCAFG00020023301) #19	HOXB4 (ENSCAFG00020023297) #20	HOXB3 (ENSCAFG00020023294) #21	HOXB2 (ENSCAFG00020023293) #22	HOXB1 (ENSCAFG00020023290) #23	SKAP1 (ENSCAFG00020023287) #24	SNX11 (ENSCAFG00020023282) #25	CBX1 (ENSCAFG00020023275) #26	NFE2L1 (ENSCAFG00020023270)	COPZ2 (ENSCAFG00020023263)	CDK5RAP3 (ENSCAFG00020023258)	PRR15L (ENSCAFG00020023256)	PNPO (ENSCAFG00020023249)	SP2 (ENSCAFG00020023246)	SP6 (ENSCAFG00020023243)	SCRN2 (ENSCAFG00020023238)	LRRC46 (ENSCAFG00020023236)	MRPL10 (ENSCAFG00020023232)	OSBPL7 (ENSCAFG00020023225)
Red fox	MODERN SPECIES	20	IGF2BP1 (ENSVVUG00000003451) #7	GIP (ENSVVUG00000003440) #8	SNF8 (ENSVVUG00000003434) #9	UBE2Z (ENSVVUG00000003424) #10	ATP5MC1 (ENSVVUG00000003411) #11	CALCOCO2 (ENSVVUG00000003399) #12	TTLL6 (ENSVVUG00000003393) #13	HOXB13 (ENSVVUG00000003382) #14	HOXB9 (ENSVVUG00000003367) #15	HOXB8 (ENSVVUG00000003366) #16	HOXB7 (ENSVVUG00000003360) #17	HOXB6 (ENSVVUG00000003359) #18	HOXB5 (ENSVVUG00000003354) #19	ENSVVUG00000003340 #20	HOXB3 (ENSVVUG00000003329) #21	HOXB2 (ENSVVUG00000003328) #22	HOXB1 (ENSVVUG00000003325) #23	SKAP1 (ENSVVUG00000003297) #24	SNX11 (ENSVVUG00000003276) #25	ENSVVUG00000003272 #26	NFE2L1 (ENSVVUG00000003262)	COPZ2 (ENSVVUG00000003249)	CDK5RAP3 (ENSVVUG00000003227)	PRR15L (ENSVVUG00000003218)	PNPO (ENSVVUG00000003178)	SP2 (ENSVVUG00000003171)	SP6 (ENSVVUG00000003167)	SCRN2 (ENSVVUG00000003154)	LRRC46 (ENSVVUG00000003146)	MRPL10 (ENSVVUG00000003141)	ENSVVUG00000003127
Caniformia_b	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00390000005121 #8	ENSGT00390000007843 #9	ENSGT00990000209473	ENSGT00940000159091 #10	ENSGT00940000159720 #11	ENSGT00950000183025.a #12	ENSGT00940000161434 #13	ENSGT00940000159029 #14	ENSGT00940000161386 #15	ENSGT00940000161529 #16	ENSGT00940000161230 #17	ENSGT00940000161108 #18	ENSGT00940000158354 #19	ENSGT00940000162072 #20	ENSGT00940000159774 #21	ENSGT00940000155029.c.b #22	ENSGT00940000159503 #23	ENSGT00390000017856.b #24	ENSGT00940000160113 #25	ENSGT00940000154152.d.b #26	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00950000185410	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00390000000713	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000159590	ENSGT00940000161498	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000000603
Mustelinae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000005121 #8	ENSGT00390000007843 #9	ENSGT00990000209473	ENSGT00940000159091 #10	ENSGT00940000159720 #11	ENSGT00950000183025.a #12	ENSGT00940000161434 #13	ENSGT00940000159029 #14	ENSGT00940000161386 #15	ENSGT00940000161529 #16	ENSGT00940000161230 #17	ENSGT00940000161108 #18	ENSGT00940000158354 #19	ENSGT00940000162072 #20	ENSGT00940000159774 #21	ENSGT00940000155029.c.b #22	ENSGT00940000159503 #23	ENSGT00390000017856.b #24	ENSGT00940000160113 #25	ENSGT00940000154152.d.b #26	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00950000185410	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00390000000713	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000159590	ENSGT00940000161498	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000000603
American mink	MODERN SPECIES	92	GIP (ENSNVIG00000006361) #8	ENSNVIG00000006352 #9	ENSNVIG00000006339	UBE2Z (ENSNVIG00000006316) #10	ENSNVIG00000006295 #11	CALCOCO2 (ENSNVIG00000006167) #12	TTLL6 (ENSNVIG00000006132) #13	HOXB13 (ENSNVIG00000006117) #14	HOXB9 (ENSNVIG00000006082) #15	HOXB8 (ENSNVIG00000006066) #16	HOXB7 (ENSNVIG00000006060) #17	HOXB6 (ENSNVIG00000006053) #18	HOXB5 (ENSNVIG00000006049) #19	HOXB4 (ENSNVIG00000006040) #20	HOXB3 (ENSNVIG00000006032) #21	HOXB2 (ENSNVIG00000006024) #22	HOXB1 (ENSNVIG00000006017) #23	ENSNVIG00000006009	SKAP1 (ENSNVIG00000005974) #24	SNX11 (ENSNVIG00000005959) #25	CBX1 (ENSNVIG00000005946) #26	NFE2L1 (ENSNVIG00000005857)	ENSNVIG00000005842	COPZ2 (ENSNVIG00000005837)	CDK5RAP3 (ENSNVIG00000005742)	PR15L (ENSNVIG00000005731)	PNPO (ENSNVIG00000005692)	SP2 (ENSNVIG00000005673)	SP6 (ENSNVIG00000005667)	SCRN2 (ENSNVIG00000005641)	LRRC46 (ENSNVIG00000005619)
Ferret	MODERN SPECIES	270	B4GALNT2 (ENSMPUG00000015373)	IGF2BP1 (ENSMPUG00000015358) #7	GIP (ENSMPUG00000015357) #8	SNF8 (ENSMPUG00000015356) #9	UBE2Z (ENSMPUG00000015342) #10	ENSMPUG00000015341 #11	CALCOCO2 (ENSMPUG00000015338) #12	TTLL6 (ENSMPUG00000015335) #13	HOXB13 (ENSMPUG00000015332) #14	HOXB9 (ENSMPUG00000015330) #15	HOXB8 (ENSMPUG00000015329) #16	HOXB7 (ENSMPUG00000015328) #17	HOXB6 (ENSMPUG00000015322) #18	HOXB5 (ENSMPUG00000015316) #19	HOXB4 (ENSMPUG00000015310) #20	HOXB2 (ENSMPUG00000015309) #22	HOXB1 (ENSMPUG00000015307) #23	SKAP1 (ENSMPUG00000015305) #24	SNX11 (ENSMPUG00000015303) #25	CBX1 (ENSMPUG00000015302) ##26	NFE2L1 (ENSMPUG00000015301)	COPZ2 (ENSMPUG00000015292)	CDK5RAP3 (ENSMPUG00000015291)	PRR15L (ENSMPUG00000020087)	PNPO (ENSMPUG00000015290)	SP2 (ENSMPUG00000015289)	SP6 (ENSMPUG00000020086)	SCRN2 (ENSMPUG00000015288)	LRRC46 (ENSMPUG00000015287)	MRPL10 (ENSMPUG00000015278)	OSBPL7 (ENSMPUG00000015276)
Ursidae	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000160427 #7	ENSGT00390000005121 #8	ENSGT00390000007843 #9	ENSGT00940000159091 #10	ENSGT00940000159720 #11	ENSGT00950000183025.a #12	ENSGT00940000161434 #13	ENSGT00940000159029 #14	ENSGT00940000161386 #15	ENSGT00940000161529 #16	ENSGT00940000161230 #17	ENSGT00940000161108 #18	ENSGT00940000158354 #19	ENSGT00940000162072 #20	ENSGT00940000159774 #21	ENSGT00940000155029.c.b #22	ENSGT00940000159503 #23	ENSGT00390000017856.b #24	ENSGT00940000160113 #25	ENSGT00940000154152.d.b #26	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00950000185410	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00390000000713	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000159590	ENSGT00940000161498	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000000603
Ursus	ANCESTRAL SPECIES	67	ENSGT00940000160427 #7	ENSGT00390000005121 #8	ENSGT00390000007843 #9	ENSGT00940000159091 #10	ENSGT00940000159720 #11	ENSGT00950000183025.a #12	ENSGT00940000161434 #13	ENSGT00940000159029 #14	ENSGT00940000161386 #15	ENSGT00940000161529 #16	ENSGT00940000161230 #17	ENSGT00940000161108 #18	ENSGT00940000158354 #19	ENSGT00940000162072 #20	ENSGT00940000159774 #21	ENSGT00940000155029.c.b #22	ENSGT00940000159503 #23	ENSGT00390000017856.b #24	ENSGT00940000160113 #25	ENSGT00940000154152.d.b #26	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00950000185410	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00390000000713	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000159590	ENSGT00940000161498	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000000603
American black bear	MODERN SPECIES	4290															HOXB3 (ENSUAMG00000008864) #21	HOXB2 (ENSUAMG00000008866) #22	HOXB1 (ENSUAMG00000008868) #23
Giant Panda	MODERN SPECIES	4	GIP (ENSAMEG00000005081) #8	SNF8 (ENSAMEG00000005062) #9	UBE2Z (ENSAMEG00000005049) #10	ATP5MC1 (ENSAMEG00000005038) #11	CALCOCO2 (ENSAMEG00000005015) #12	ENSAMEG00000005000 #13	HOXB13 (ENSAMEG00000026873) #14	ENSAMEG00000026258	HOXB9 (ENSAMEG00000024921) #15	ENSAMEG00000004982 #16	HOXB7 (ENSAMEG00000004977) #17	HOXB6 (ENSAMEG00000004971) #18	HOXB5 (ENSAMEG00000004967) #19	HOXB4 (ENSAMEG00000028329) #20	HOXB3 (ENSAMEG00000027375) #21	HOXB2 (ENSAMEG00000030987) #22	HOXB1 (ENSAMEG00000004935) #23	SKAP1 (ENSAMEG00000004919) #24	SNX11 (ENSAMEG00000004898) #25	CBX1 (ENSAMEG00000004890) #26	NFE2L1 (ENSAMEG00000004881)	COPZ2 (ENSAMEG00000004850)	ENSAMEG00000030152	CDK5RAP3 (ENSAMEG00000004818)	PRR15L (ENSAMEG00000025744)	PNPO (ENSAMEG00000004786)	SP2 (ENSAMEG00000004772)	SCRN2 (ENSAMEG00000004751)	LRRC46 (ENSAMEG00000004734)	MRPL10 (ENSAMEG00000004722)	OSBPL7 (ENSAMEG00000004670)
Felidae	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000160427 #7	ENSGT00390000005121 #8	ENSGT00390000007843 #9	ENSGT00940000159091 #10	ENSGT00940000159720.f.a #11	ENSGT00950000183025.a #12	ENSGT00940000161434 #13	ENSGT00940000159029 #14	ENSGT00940000161386 #15	ENSGT00940000161529 #16	ENSGT00940000161230 #17	ENSGT00940000161108 #18	ENSGT00940000158354 #19	ENSGT00940000162072 #20	ENSGT00940000159774 #21	ENSGT00940000155029.c.b #22	ENSGT00940000159503 #23	ENSGT00390000013771.p	ENSGT00390000017856.b #24	ENSGT00940000160113 #25	ENSGT00940000154152.d.b #26	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00950000185410	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00390000000713	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000159590	ENSGT00940000161498	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161315
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Cat	MODERN SPECIES	245	IGF2BP1 (ENSFCAG00000002454) #7	GIP (ENSFCAG00000008946) #8	SNF8 (ENSFCAG00000008944) #9	UBE2Z (ENSFCAG00000045462) #10	ENSFCAG00000002344 #11	CALCOCO2 (ENSFCAG00000010622) #12	TTLL6 (ENSFCAG00000010617) #13	HOXB13 (ENSFCAG00000002120) #14	HOXB9 (ENSFCAG00000035234) #15	HOXB8 (ENSFCAG00000036979) #16	HOXB7 (ENSFCAG00000002118) #17	HOXB6 (ENSFCAG00000034768) #18	HOXB5 (ENSFCAG00000039068) #19	HOXB4 (ENSFCAG00000051422) #20	HOXB3 (ENSFCAG00000006408) #21	HOXB2 (ENSFCAG00000045039) #22	HOXB1 (ENSFCAG00000028151) #23	ENSFCAG00000034133	SKAP1 (ENSFCAG00000004784) #24	SNX11 (ENSFCAG00000009371) #25	CBX1 (ENSFCAG00000006056) ##26	NFE2L1 (ENSFCAG00000009369)	COPZ2 (ENSFCAG00000034233)	CDK5RAP3 (ENSFCAG00000009367)	PRR15L (ENSFCAG00000009366)	PNPO (ENSFCAG00000001300)	SP2 (ENSFCAG00000009365)	SP6 (ENSFCAG00000009363)	SCRN2 (ENSFCAG00000009362)	LRRC46 (ENSFCAG00000045119)	MRPL10 (ENSFCAG00000009360)
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Chiroptera	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000005121 #8	ENSGT00390000007843 #9	ENSGT00940000159091 #10	ENSGT00940000159720.b #11	ENSGT00950000183025.a #12	ENSGT00940000161434 #13	ENSGT00940000159029 #14	ENSGT00940000161386 #15	ENSGT00940000161529 #16	ENSGT00940000161230 #17	ENSGT00940000161108 #18	ENSGT00940000158354 #19	ENSGT00940000162072 #20	ENSGT00980000199681	ENSGT00940000159774 #21	ENSGT00940000155029.c.b #22	ENSGT00940000159503 #23	ENSGT00390000017856.b #24	ENSGT00940000160113 #25	ENSGT00940000154152.d.b #26	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00390000000713	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000159590	ENSGT00940000161498	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000157439
Microchiroptera	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000005121 #8	ENSGT00390000007843 #9	ENSGT00940000159091 #10	ENSGT00940000159720.b #11	ENSGT00950000183025.a #12	ENSGT00940000161434 #13	ENSGT00940000159029 #14	ENSGT00940000161386 #15	ENSGT00940000161529 #16	ENSGT00940000161230 #17	ENSGT00940000161108 #18	ENSGT00940000158354 #19	ENSGT00940000162072 #20	ENSGT00980000199681	ENSGT00940000159774 #21	ENSGT00940000155029.c.b #22	ENSGT00940000159503 #23	ENSGT00390000017856.b #24	ENSGT00940000160113 #25	ENSGT00940000154152.d.b #26	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00390000000713	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000159590	ENSGT00940000161498	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000157439
Greater horseshoe bat	MODERN SPECIES	13	SNF8 (ENSRFEG00010021745) #9	UBE2Z (ENSRFEG00010021755) #10	ENSRFEG00010021766 #11	CALCOCO2 (ENSRFEG00010021784) #12	ENSRFEG00010021798	TTLL6 (ENSRFEG00010021801) #13	HOXB13 (ENSRFEG00010021808) #14	HOXB9 (ENSRFEG00010021814) #15	HOXB8 (ENSRFEG00010021818) #16	HOXB7 (ENSRFEG00010021823) #17	HOXB6 (ENSRFEG00010021831) #18	HOXB5 (ENSRFEG00010021836) #19	HOXB4 (ENSRFEG00010021844) #20	ENSRFEG00010021849	HOXB3 (ENSRFEG00010021853) #21	HOXB2 (ENSRFEG00010021859) #22	HOXB1 (ENSRFEG00010021864) #23	SKAP1 (ENSRFEG00010021866) #24	SNX11 (ENSRFEG00010021879) #25	CBX1 (ENSRFEG00010021893) #26	NFE2L1 (ENSRFEG00010021900)	COPZ2 (ENSRFEG00010021918)	CDK5RAP3 (ENSRFEG00010021928)	PRR15L (ENSRFEG00010021936)	PNPO (ENSRFEG00010021942)	SP2 (ENSRFEG00010021950)	SP6 (ENSRFEG00010021957)	SCRN2 (ENSRFEG00010021961)	LRRC46 (ENSRFEG00010008197)	MRPL10 (ENSRFEG00010008230)	OSBPL7 (ENSRFEG00010008272)
Microbat	MODERN SPECIES	2739																ENSMLUG00000008433 #22
Megabat	MODERN SPECIES	334							HOXB13 (ENSPVAG00000015531) #14	ENSPVAG00000015530	HOXB8 (ENSPVAG00000015529) #16	HOXB7 (ENSPVAG00000015528) #17	ENSPVAG00000015526	HOXB6 (ENSPVAG00000015525) #18	HOXB5 (ENSPVAG00000015524) #19	HOXB4 (ENSPVAG00000015523) #20	HOXB3 (ENSPVAG00000015522) #21	ENSPVAG00000015521 #22	HOXB1 (ENSPVAG00000015520) #23	SKAP1 (ENSPVAG00000015519) #24	SNX11 (ENSPVAG00000015518) #25
Equus	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000160427 #7	ENSGT00390000005121 #8	ENSGT00390000007843 #9	ENSGT00940000159091 #10	ENSGT00940000159720.b #11	ENSGT00950000183025.a #12	ENSGT00940000161434 #13	ENSGT00940000159029 #14	ENSGT00940000161386 #15	ENSGT00940000161529 #16	ENSGT00940000161230 #17	ENSGT00940000161108 #18	ENSGT00940000158354 #19	ENSGT00940000162072 #20	ENSGT00940000159774 #21	ENSGT00940000155029.c.b #22	ENSGT00940000159503 #23	ENSGT00390000017856.b #24	ENSGT00940000160113 #25	ENSGT00940000154152.d.b #26	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00390000000713	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000159590	ENSGT00940000161498	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000157439
Donkey	MODERN SPECIES	4	SNF8 (ENSEASG00005000402) #9	ENSEASG00005030756	UBE2Z (ENSEASG00005000404) #10	ENSEASG00005032484 #11	ENSEASG00005026420 #12	CALCOCO2 (ENSEASG00005000430) #12	ENSEASG00005037375 #13	ENSEASG00005000438 #13	HOXB13 (ENSEASG00005025083) #14	HOXB9 (ENSEASG00005000527) #15	HOXB8 (ENSEASG00005024978) #16	HOXB7 (ENSEASG00005000556) #17	HOXB5 (ENSEASG00005000563) #19	HOXB6 (ENSEASG00005000560) #18	HOXB3 (ENSEASG00005000581) #21	HOXB2 (ENSEASG00005000585) #22	HOXB1 (ENSEASG00005000594) #23	SKAP1 (ENSEASG00005000601) #24	SNX11 (ENSEASG00005000605) #25	CBX1 (ENSEASG00005000607) #26	NFE2L1 (ENSEASG00005000634)	COPZ2 (ENSEASG00005000641)	CDK5RAP3 (ENSEASG00005000658)	PRR15L (ENSEASG00005000660)	PNPO (ENSEASG00005028794)	SP2 (ENSEASG00005000667)	SP6 (ENSEASG00005036407)	SCRN2 (ENSEASG00005000671)	LRRC46 (ENSEASG00005000676)	MRPL10 (ENSEASG00005027403)	OSBPL7 (ENSEASG00005000733)
Horse	MODERN SPECIES	2	IGF2BP1 (ENSECAG00000009723) #7	GIP (ENSECAG00000008172) #8	ENSECAG00000046431	SNF8 (ENSECAG00000022092) #9	UBE2Z (ENSECAG00000021160) #10	ATP5MC1 (ENSECAG00000019908) #11	CALCOCO2 (ENSECAG00000015498) #12	ENSECAG00000059603 #13	TTLL6 (ENSECAG00000014417) #13	HOXB13 (ENSECAG00000013619) #14	HOXB9 (ENSECAG00000036001) #15	HOXB8 (ENSECAG00000034473) #17	HOXB5 (ENSECAG00000012439) #19	HOXB4 (ENSECAG00000028576) #20	HOXB3 (ENSECAG00000002707) #21	HOXB2 (ENSECAG00000012423) #22	HOXB1 (ENSECAG00000011628) #23	SKAP1 (ENSECAG00000010544) #24	SNX11 (ENSECAG00000008117) #25	CBX1 (ENSECAG00000008048) #26	NFE2L1 (ENSECAG00000007777)	COPZ2 (ENSECAG00000024471)	CDK5RAP3 (ENSECAG00000018688)	PRR15L (ENSECAG00000002658)	PNPO (ENSECAG00000014995)	SP2 (ENSECAG00000012859)	SP6 (ENSECAG00000012853)	SCRN2 (ENSECAG00000009826)	LRRC46 (ENSECAG00000007543)	OSBPL7 (ENSECAG00000019067)	TBX21 (ENSECAG00000018160)
Atlantogenata	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000160427 #7	ENSGT00390000005121 #8	ENSGT00390000007843 #9	ENSGT00940000159091 #10	ENSGT00940000154298.a.b	ENSGT00950000183025.a #12	ENSGT00940000161434 #13	ENSGT00940000159029 #14	ENSGT00940000161386 #15	ENSGT00940000161529 #16	ENSGT00940000161230 #17	ENSGT00940000161108 #18	ENSGT00940000158354 #19	ENSGT00940000162072 #20	ENSGT00940000159774 #21	ENSGT00940000155029.c.b #22	ENSGT00940000159503 #23	ENSGT00390000017856.b #24	ENSGT00940000160113 #25	ENSGT00940000154152.d #26	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00390000000713	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000159590	ENSGT00940000161498	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000157439
Afrotheria	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000160427 #7	ENSGT00390000005121 #8	ENSGT00390000007843 #9	ENSGT00940000159091 #10	ENSGT00940000154298.a.b	ENSGT00950000183025.a #12	ENSGT00940000161434 #13	ENSGT00940000159029 #14	ENSGT00940000161386 #15	ENSGT00940000161529 #16	ENSGT00940000161230 #17	ENSGT00940000161108 #18	ENSGT00940000158354 #19	ENSGT00940000162072 #20	ENSGT00940000159774 #21	ENSGT00940000155029.c.b #22	ENSGT00940000159503 #23	ENSGT00390000017856.b #24	ENSGT00940000160113 #25	ENSGT00940000154152.d #26	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00390000000713	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000159590	ENSGT00940000161498	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000157439
Afrotheria_a	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000160427 #7	ENSGT00390000005121 #8	ENSGT00390000007843 #9	ENSGT00940000159091 #10	ENSGT00940000154298.a.b	ENSGT00950000183025.a #12	ENSGT00940000161434 #13	ENSGT00940000159029 #14	ENSGT00940000161386 #15	ENSGT00940000161529 #16	ENSGT00940000161230 #17	ENSGT00940000161108 #18	ENSGT00940000158354 #19	ENSGT00940000162072 #20	ENSGT00940000159774 #21	ENSGT00940000155029.c.b #22	ENSGT00940000159503 #23	ENSGT00390000017856.b #24	ENSGT00940000160113 #25	ENSGT00940000154152.d #26	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00390000000713	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000159590	ENSGT00940000161498	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000157439
Elephant	MODERN SPECIES	310	UBE2Z (ENSLAFG00000006606) #10	ATP5MC1 (ENSLAFG00000004537)	CALCOCO2 (ENSLAFG00000016693) #12	ENSLAFG00000027009	TTLL6 (ENSLAFG00000003368) #13	ENSLAFG00000026602	HOXB13 (ENSLAFG00000011262) #14	HOXB9 (ENSLAFG00000013600) #15	HOXB8 (ENSLAFG00000030682) #16	HOXB7 (ENSLAFG00000030637) #17	HOXB6 (ENSLAFG00000013593) #18	HOXB5 (ENSLAFG00000013590) #19	HOXB4 (ENSLAFG00000013588) #20	HOXB3 (ENSLAFG00000030335) #21	ENSLAFG00000030505	HOXB2 (ENSLAFG00000030161) #22	ENSLAFG00000031610 #23	SKAP1 (ENSLAFG00000018530) #24	SNX11 (ENSLAFG00000018529) #25	CBX1 (ENSLAFG00000018526) #26	NFE2L1 (ENSLAFG00000018523)	ENSLAFG00000015209	ENSLAFG00000030284	CDK5RAP3 (ENSLAFG00000000339)	PRR15L (ENSLAFG00000015553)	PNPO (ENSLAFG00000015550)	SP2 (ENSLAFG00000021817)	SP6 (ENSLAFG00000010701)	SCRN2 (ENSLAFG00000025964)	LRRC46 (ENSLAFG00000006826)	MRPL10 (ENSLAFG00000028127)
Hyrax	MODERN SPECIES	9097															HOXB3 (ENSPCAG00000007683) #21	HOXB2 (ENSPCAG00000007667) #22
Xenarthra	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000155029.c.b #22
Armadillo	MODERN SPECIES	231																ENSDNOG00000047374 #22
Marsupialia	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000160427 #7	ENSGT00390000005121 #8	ENSGT00390000007843 #9	ENSGT00940000159091 #10	ENSGT00940000154298.a.b	ENSGT00950000183025.a #12	ENSGT00940000161434 #13	ENSGT00940000159029 #14	ENSGT00940000161386 #15	ENSGT00940000161529 #16	ENSGT00940000161230 #17	ENSGT00940000161108 #18	ENSGT00940000158354 #19	ENSGT00940000162072 #20	ENSGT00940000159774 #21	ENSGT00940000155029.c.b #22	ENSGT00940000159503 #23	ENSGT00390000017856.b #24	ENSGT00940000160113 #25	ENSGT00940000154152.d #26	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00390000000713	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000011219	ENSGT00640000092844	ENSGT00940000159590	ENSGT00940000161498	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000000603
Marsupialia_b	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000160427 #7	ENSGT00390000005121 #8	ENSGT00390000007843 #9	ENSGT00940000159091 #10	ENSGT00940000154298.a.b	ENSGT00950000183025.a #12	ENSGT00940000161434 #13	ENSGT00940000159029 #14	ENSGT00940000161386 #15	ENSGT00940000161529 #16	ENSGT00940000161230 #17	ENSGT00940000161108 #18	ENSGT00940000158354 #19	ENSGT00940000162072 #20	ENSGT00940000159774 #21	ENSGT00940000155029.c.b #22	ENSGT00940000159503 #23	ENSGT00390000017856.b #24	ENSGT00940000160113 #25	ENSGT00940000154152.d #26	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00390000000713	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000011219	ENSGT00640000092844	ENSGT00940000159590	ENSGT00940000161498	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000000603
Diprotodontia	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00390000006679.b.b	ENSGT00940000160427 #7	ENSGT00390000007843 #9	ENSGT00940000159091 #10	ENSGT00940000154298.a.b	ENSGT00950000183025.a #12	ENSGT00940000161434 #13	ENSGT00940000159029 #14	ENSGT00940000161386 #15	ENSGT00940000161529 #16	ENSGT00940000161230 #17	ENSGT00940000161108 #18	ENSGT00940000158354 #19	ENSGT00940000162072 #20	ENSGT00940000159774 #21	ENSGT00940000155029.c.b #22	ENSGT00940000159503 #23	ENSGT00390000017856.b #24	ENSGT00940000160113 #25	ENSGT00940000154152.d #26	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00390000000713	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000011219	ENSGT00640000092844	ENSGT00940000159590	ENSGT00940000161498	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000000603
Wallaby	MODERN SPECIES	12825																HOXB2 (ENSMEUG00000003516) #22	HOXB1 (ENSMEUG00000003514) #23
Diprotodontia_a	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00390000006679.b.b	ENSGT00940000160427 #7	ENSGT00390000007843 #9	ENSGT00940000159091.e #10	ENSGT00940000154298.a.b	ENSGT00950000183025.a #12	ENSGT00940000161434 #13	ENSGT00940000159029 #14	ENSGT00940000161386 #15	ENSGT00940000161529 #16	ENSGT00940000161230 #17	ENSGT00940000161108 #18	ENSGT00940000158354 #19	ENSGT00940000162072 #20	ENSGT00940000159774 #21	ENSGT00940000155029.c.b #22	ENSGT00940000159503 #23	ENSGT00390000017856.b #24	ENSGT00940000160113 #25	ENSGT00940000154152.d #26	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00390000000713	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000011219	ENSGT00640000092844	ENSGT00940000159590	ENSGT00940000161498	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000000603
koala	MODERN SPECIES	67	GNGT2 (ENSPCIG00000013109)	B4GALNT2 (ENSPCIG00000003606)	IGF2BP1 (ENSPCIG00000013111) #7	SNF8 (ENSPCIG00000013302) #9	ENSPCIG00000013305 #10	ATP5MC1 (ENSPCIG00000013306)	CALCOCO2 (ENSPCIG00000010432) #12	TTLL6 (ENSPCIG00000030247) #13	HOXB13 (ENSPCIG00000030249) #14	HOXB9 (ENSPCIG00000030251) #15	HOXB7 (ENSPCIG00000000064) #17	HOXB6 (ENSPCIG00000000076) #18	HOXB5 (ENSPCIG00000031080) #19	HOXB4 (ENSPCIG00000000195) #20	HOXB3 (ENSPCIG00000000217) #21	HOXB2 (ENSPCIG00000000295) #22	HOXB1 (ENSPCIG00000033449) #23	SKAP1 (ENSPCIG00000000339) #24	SNX11 (ENSPCIG00000000612) #25	CBX1 (ENSPCIG00000000630) #26	NFE2L1 (ENSPCIG00000000720)	COPZ2 (ENSPCIG00000000757)	CDK5RAP3 (ENSPCIG00000000798)	PRR15L (ENSPCIG00000000814)	PNPO (ENSPCIG00000000828)	ENSPCIG00000000834	SP2 (ENSPCIG00000000843)	SP6 (ENSPCIG00000000873)	SCRN2 (ENSPCIG00000000883)	LRRC46 (ENSPCIG00000000900)	MRPL10 (ENSPCIG00000031062)
Common wonbat	MODERN SPECIES	1037	ABI3 (ENSVURG00010007788)	GNGT2 (ENSVURG00010007781)	B4GALNT2 (ENSVURG00010007761)	IGF2BP1 (ENSVURG00010007702) #7	SNF8 (ENSVURG00010007691) #9	ENSVURG00010007663 #10	CALCOCO2 (ENSVURG00010007642) #12	HOXB13 (ENSVURG00010007629) #14	HOXB9 (ENSVURG00010007619) #15	HOXB8 (ENSVURG00010007609) #16	HOXB7 (ENSVURG00010007606) #17	HOXB6 (ENSVURG00010007602) #18	HOXB5 (ENSVURG00010007599) #19	HOXB4 (ENSVURG00010007589) #20	HOXB3 (ENSVURG00010007587) #21	HOXB2 (ENSVURG00010007579) #22	HOXB1 (ENSVURG00010007572) #23	SKAP1 (ENSVURG00010007559) #24	SNX11 (ENSVURG00010007541) #25	CBX1 (ENSVURG00010007537) #26	NFE2L1 (ENSVURG00010007465)	COPZ2 (ENSVURG00010007430)	CDK5RAP3 (ENSVURG00010007403)	PRR15L (ENSVURG00010007394)	PNPO (ENSVURG00010007376)	ENSVURG00010007365	SP2 (ENSVURG00010007347)	SP6 (ENSVURG00010007336)	SCRN2 (ENSVURG00010007326)	LRRC46 (ENSVURG00010007320)	MRPL10 (ENSVURG00010007313)
Tasmanian devil	MODERN SPECIES	3	ENSSHAG00000014937	ENSSHAG00000014639	IGF2BP1 (ENSSHAG00000014259) #7	ENSSHAG00000014119 #8	SNF8 (ENSSHAG00000013985) #9	UBE2Z (ENSSHAG00000020994) #10	ATP5MC1 (ENSSHAG00000013859)	CALCOCO2 (ENSSHAG00000022264) #12	TTLL6 (ENSSHAG00000013396) #13	HOXB13 (ENSSHAG00000013189) #14	HOXB9 (ENSSHAG00000012684) #15	HOXB8 (ENSSHAG00000023021) #16	HOXB7 (ENSSHAG00000022783) #17	HOXB5 (ENSSHAG00000024100) #19	HOXB3 (ENSSHAG00000031207) #21	HOXB2 (ENSSHAG00000012232) #22	HOXB1 (ENSSHAG00000012150) #23	ENSSHAG00000029678	SNX11 (ENSSHAG00000029423) #25	CBX1 (ENSSHAG00000023789) #26	NFE2L1 (ENSSHAG00000026195)	COPZ2 (ENSSHAG00000023675)	CDK5RAP3 (ENSSHAG00000006548)	PRR15L (ENSSHAG00000025985)	PNPO (ENSSHAG00000023730)	ENSSHAG00000005930	SP2 (ENSSHAG00000005633)	SP6 (ENSSHAG00000030597)	SCRN2 (ENSSHAG00000003868)	LRRC46 (ENSSHAG00000003740)	MRPL10 (ENSSHAG00000030224)
Opossum	MODERN SPECIES	1	IGF2BP1 (ENSMODG00000012268) #7	ENSMODG00000028269 #8	SNF8 (ENSMODG00000012276) #9	UBE2Z (ENSMODG00000046619) #10	ENSMODG00000012296 #11	ENSMODG00000029509 #12	ENSMODG00000012306 #12	ENSMODG00000025670 #13	HOXB13 (ENSMODG00000012310) #14	HOXB9 (ENSMODG00000012329) #15	HOXB7 (ENSMODG00000044053) #17	HOXB6 (ENSMODG00000012334) #18	HOXB5 (ENSMODG00000012338) #19	HOXB4 (ENSMODG00000042083) #20	HOXB3 (ENSMODG00000012344) #21	HOXB2 (ENSMODG00000012347) #22	HOXB1 (ENSMODG00000046816) #23	SKAP1 (ENSMODG00000012360) #24	SNX11 (ENSMODG00000051179) #25	CBX1 (ENSMODG00000012368) #26	NFE2L1 (ENSMODG00000012375)	COPZ2 (ENSMODG00000012424)	CDK5RAP3 (ENSMODG00000012439)	PRR15L (ENSMODG00000024090)	PNPO (ENSMODG00000012446)	ENSMODG00000050066	SP2 (ENSMODG00000012452)	SP6 (ENSMODG00000012454)	SCRN2 (ENSMODG00000012467)	LRRC46 (ENSMODG00000012473)	MRPL10 (ENSMODG00000038269)