Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155029.c.b #22 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00940000159091 #10 ENSGT00940000154298.a.b #11 ENSGT00390000005121 #8 ENSGT00390000007843 #9 ENSGT00950000183025.a #12 ENSGT00940000161434 #13 ENSGT00940000159029 #14 ENSGT00940000161386 #15 ENSGT00940000161529 #16 ENSGT00940000161230 #17 ENSGT00940000161108 #18 ENSGT00940000158354 #19 ENSGT00940000162072 #20 ENSGT00940000159774 #21 ENSGT00940000155029.c.b #22 ENSGT00940000159503 #23 ENSGT00390000017856.b #25 ENSGT00940000160113 #26 ENSGT00940000154152 #27 ENSGT00950000182892.a.b.a.a #28 ENSGT00390000004405.b #29 ENSGT00390000000713 #30 ENSGT00940000154534.a #31 ENSGT00390000011219 #32 ENSGT00940000159590 #33 ENSGT00940000161498 #34 ENSGT00390000013474.b.a #35 ENSGT00940000172406 ENSGT00940000157439 ENSGT00940000166447 Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 94 ENSGT00390000005121 #8 ENSGT00390000007843 #9 ENSGT00940000159091 #10 ENSGT00940000154298.a.b #11 ENSGT00950000183025.a #12 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ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000160427 #7 ENSGT00390000005121 #8 ENSGT00390000007843 #9 ENSGT00940000159091 #10 ENSGT00940000154298.a.b #11 ENSGT00950000183025.a #12 ENSGT00940000161434 #13 ENSGT00940000159029 #14 ENSGT00940000161386 #15 ENSGT00940000161529 #16 ENSGT00940000161230 #17 ENSGT00940000161108 #18 ENSGT00940000158354 #19 ENSGT00940000162072 #20 ENSGT00940000159774 #21 ENSGT00940000155029.c.b #22 ENSGT00940000159503 #23 ENSGT00940000172404 ENSGT00390000017856.b #25 ENSGT00940000160113 #26 ENSGT00940000154152.d #27 ENSGT00950000182892.a.b.a.a #28 ENSGT00390000004405.b #29 ENSGT00390000000713 #30 ENSGT00940000154534.a #31 ENSGT00390000011219 #32 ENSGT00640000092844 ENSGT00940000159590 #33 ENSGT00940000161498 #34 ENSGT00390000013474.b.a #35 ENSGT00940000161315 #36 Eutheria ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000160427 #7 ENSGT00390000005121 #8 ENSGT00390000007843 #9 ENSGT00940000159091 #10 ENSGT00940000154298.a.b #11 ENSGT00950000183025.a #12 ENSGT00940000161434 #13 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#22 Common shrew MODERN SPECIES 5391 HOXB2 (ENSSARG00000008539) #22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000007843 #9 ENSGT00990000209473 ENSGT00940000159091 #10 ENSGT00940000159720 ENSGT00950000183025.a #12 ENSGT00940000161434 #13 ENSGT00940000159029 #14 ENSGT00940000161386 #15 ENSGT00940000161529 #16 ENSGT00940000161230 #17 ENSGT00940000161108 #18 ENSGT00940000158354 #19 ENSGT00940000162072 #20 ENSGT00980000199681 ENSGT00940000159774 #21 ENSGT00940000155029.c.b #22 ENSGT00940000159503 #23 ENSGT00390000017856.b #25 ENSGT00940000160113 #26 ENSGT00940000154152.d.b #27 ENSGT00950000182892.a.b.a.a #28 ENSGT00950000185410 ENSGT00390000004405.b #29 ENSGT00390000000713 #30 ENSGT00940000154534.a #31 ENSGT00390000011219 #32 ENSGT00940000159590 #33 ENSGT00940000161498 #34 ENSGT00390000013474.b.a #35 ENSGT00940000161315 #36 ENSGT00390000000603 #37 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000007843 #9 ENSGT01100000264599 ENSGT00940000159091 #10 ENSGT00940000159720 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OSBPL7 (ENSCDRG00005018943) Alpaca MODERN SPECIES 3027 HOXB2 (ENSVPAG00000010121) #22 SKAP1 (ENSVPAG00000010119) #25 CBX1 (ENSVPAG00000010117) #27 NFE2L1 (ENSVPAG00000010116) #28 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000007843 #9 ENSGT01100000264599 ENSGT00940000159091 #10 ENSGT00940000159720 ENSGT00950000183025.a #12 ENSGT00940000161434 #13 ENSGT00940000159029 #14 ENSGT00940000161386 #15 ENSGT00940000161529 #16 ENSGT00940000161230 #17 ENSGT00940000161108 #18 ENSGT00940000158354 #19 ENSGT00940000162072 #20 ENSGT00980000199681 ENSGT00940000159774 #21 ENSGT00940000155029.c.b #22 ENSGT00940000159503 #23 ENSGT00390000017856.b #25 ENSGT00940000160113 #26 ENSGT00940000154152.d.b #27 ENSGT00950000182892.a.b.a.a #28 ENSGT00390000004405.b #29 ENSGT00950000185410 ENSGT00390000000713 #30 ENSGT00940000154534.a #31 ENSGT00390000011219 #32 ENSGT00940000159590 #33 ENSGT00940000161498 #34 ENSGT00390000013474.b.a #35 ENSGT00940000161315 #36 ENSGT00390000000603 #37 Cetacea ANCESTRAL SPECIES 5 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bear MODERN SPECIES 4290 HOXB3 (ENSUAMG00000008864) #21 HOXB2 (ENSUAMG00000008866) #22 HOXB1 (ENSUAMG00000008868) #23 Giant Panda MODERN SPECIES 4 GIP (ENSAMEG00000005081) #8 SNF8 (ENSAMEG00000005062) #9 UBE2Z (ENSAMEG00000005049) #10 ATP5MC1 (ENSAMEG00000005038) CALCOCO2 (ENSAMEG00000005015) #12 ENSAMEG00000005000 #13 HOXB13 (ENSAMEG00000026873) #14 ENSAMEG00000026258 HOXB9 (ENSAMEG00000024921) #15 ENSAMEG00000004982 #16 HOXB7 (ENSAMEG00000004977) #17 HOXB6 (ENSAMEG00000004971) #18 HOXB5 (ENSAMEG00000004967) #19 HOXB4 (ENSAMEG00000028329) #20 HOXB3 (ENSAMEG00000027375) #21 HOXB2 (ENSAMEG00000030987) #22 HOXB1 (ENSAMEG00000004935) #23 SKAP1 (ENSAMEG00000004919) #25 SNX11 (ENSAMEG00000004898) #26 CBX1 (ENSAMEG00000004890) #27 NFE2L1 (ENSAMEG00000004881) #28 COPZ2 (ENSAMEG00000004850) #29 ENSAMEG00000030152 CDK5RAP3 (ENSAMEG00000004818) #30 PRR15L (ENSAMEG00000025744) #31 PNPO (ENSAMEG00000004786) #32 SP2 (ENSAMEG00000004772) #33 SCRN2 (ENSAMEG00000004751) #35 LRRC46 (ENSAMEG00000004734) 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Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000006679.b.b ENSGT00940000160427 #7 ENSGT00390000007843 #9 ENSGT00940000159091 #10 ENSGT00940000154298.a.b #11 ENSGT00950000183025.a #12 ENSGT00940000161434 #13 ENSGT00940000159029 #14 ENSGT00940000161386 #15 ENSGT00940000161529 #16 ENSGT00940000161230 #17 ENSGT00940000161108 #18 ENSGT00940000158354 #19 ENSGT00940000162072 #20 ENSGT00940000159774 #21 ENSGT00940000155029.c.b #22 ENSGT00940000159503 #23 ENSGT00390000017856.b #25 ENSGT00940000160113 #26 ENSGT00940000154152.d #27 ENSGT00950000182892.a.b.a.a #28 ENSGT00390000004405.b #29 ENSGT00390000000713 #30 ENSGT00940000154534.a #31 ENSGT00390000011219 #32 ENSGT00640000092844 ENSGT00940000159590 #33 ENSGT00940000161498 #34 ENSGT00390000013474.b.a #35 ENSGT00940000161315 #36 ENSGT00390000000603 #37 Wallaby MODERN SPECIES 12825 HOXB2 (ENSMEUG00000003516) #22 HOXB1 (ENSMEUG00000003514) #23 Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000006679.b.b ENSGT00940000160427 #7 ENSGT00390000007843 #9 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ENSGT00940000157411 ENSGT00390000008812.b.b.a Osteoglossiformes DUPLICATION Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 562 ENSGT00940000161108.a #18 ENSGT00940000158354.d #19 ENSGT00940000159774.b.b #21 ENSGT00940000155029.c.b.a #22 Asian bonytongue MODERN SPECIES 23 nsfa (ENSSFOG00015005423) psmd11a (ENSSFOG00015005378) cdk5r1a (ENSSFOG00015005367) RAPGEFL1 (ENSSFOG00015005308) nr1d1 (ENSSFOG00015005263) ENSSFOG00015005236 igf2bp1 (ENSSFOG00015005197) atp5mc1 (ENSSFOG00015005177) ENSSFOG00015005153 hoxb13a (ENSSFOG00015005110) #14 hoxb9a (ENSSFOG00015005102) #15 hoxb8a (ENSSFOG00015005069) #16 hoxb6a (ENSSFOG00015005084) #18 hoxb5a (ENSSFOG00015005053) #19 ENSSFOG00015004928 #21 hoxb2a (ENSSFOG00015030727) #22 cbx1a (ENSSFOG00015029174) #27 copz2 (ENSSFOG00015004826) #29 OSBPL7 (ENSSFOG00015004752) ENSSFOG00015004737 RBFOX3 (ENSSFOG00015004716) engase (ENSSFOG00015004631) ENSSFOG00015027385 ENSSFOG00015029183 PRKAR1A (ENSSFOG00015004495) zgc:86896 (ENSSFOG00015004463) SLC16A6 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hoxb13a (ENSPKIG00000023111) #14 hoxb9a (ENSPKIG00000023117) #15 hoxb8a (ENSPKIG00000000388) #16 hoxb7a (ENSPKIG00000000397) #17 hoxb6a (ENSPKIG00000000403) #18 hoxb5b (ENSPKIG00000000411) #19 hoxb4a (ENSPKIG00000000416) #20 hoxb3a (ENSPKIG00000000431) #21 hoxb2a (ENSPKIG00000000447) #22 hoxb1a (ENSPKIG00000000454) skap1 (ENSPKIG00000000481) #25 NFE2L1 (ENSPKIG00000000547) ##28 copz2 (ENSPKIG00000000610) #29 ENSPKIG00000000651 cdk5rap3 (ENSPKIG00000000684) #30 prr15la (ENSPKIG00000000717) ##31 pnpo (ENSPKIG00000000733) #32 mrpl10 (ENSPKIG00000000749) #37 osbpl7 (ENSPKIG00000000792) tbx21 (ENSPKIG00000000866) ENSPKIG00000000901 PDK2 (ENSPKIG00000000931) ENSPKIG00000000976 MYO1D (ENSPKIG00000000999) Asian bonytongue MODERN SPECIES 13 RAPGEFL1 (ENSSFOG00015002667) casc3 (ENSSFOG00015002645) MSL1 (ENSSFOG00015002607) igf2bp1 (ENSSFOG00015002540) ENSSFOG00015002491 snf8 (ENSSFOG00015002437) #9 ube2z (ENSSFOG00015002387) #10 HOXB13 (ENSSFOG00015002353) #14 hoxb9a (ENSSFOG00015002339) #15 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Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000160144 ENSGT00390000006930 ENSGT00390000018292.d ENSGT00940000160548 ENSGT00990000204190 ENSGT00940000154957.A ENSGT00940000159091 #10 ENSGT00940000157981.a.b ENSGT00940000167564 ENSGT00940000159029 #14 ENSGT00940000163268.e ENSGT00940000161386 #15 ENSGT00940000161529 #16 ENSGT00940000165065.b ENSGT00940000159774 #21 ENSGT00940000155029.c.b #22 ENSGT00940000166856 ENSGT00940000154152.b.a #27 ENSGT00950000182892.a.b.a.b.b ##28 ENSGT00390000004405.b #29 ENSGT00940000154534.b.a ##31 ENSGT00940000157439.a ENSGT00940000153704.B.d ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a.b ENSGT00390000005602 ENSGT00390000006679.b ENSGT01100000263525.b.a ENSGT00940000156584.e.b ENSGT00940000158833.a.a ENSGT00390000017328.a.a ENSGT00940000153653.a.a Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 703 ENSGT00940000167564.a ENSGT00940000159029.c #14 ENSGT00940000158266.g.b ENSGT00940000161386.c #15 ENSGT00940000161529.w.a #16 ENSGT00940000161230.d #17 ENSGT00940000161108.e.a #18 ENSGT00940000158354.d.e #19 ENSGT00940000162072.b #20 ENSGT00940000159774.c.a #21 ENSGT00940000155029.c.b.c #22 ENSGT00940000166856.l Huchen MODERN SPECIES 894 eve1 (ENSHHUG00000029891) hoxb13a (ENSHHUG00000029885) #14 ENSHHUG00000029882 hoxb9a (ENSHHUG00000029874) #15 hoxb8a (ENSHHUG00000029869) #16 hoxb7a (ENSHHUG00000029868) #17 hoxb6a (ENSHHUG00000029857) #18 hoxb4a (ENSHHUG00000029850) #20 hoxb3a (ENSHHUG00000029848) #21 hoxb2a (ENSHHUG00000029798) #22 hoxb1a (ENSHHUG00000029792) cbx1a (ENSHHUG00000029724) #27 nfe2l1a (ENSHHUG00000029715) ##28 copz2 (ENSHHUG00000029680) #29 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 77 ENSGT00940000160548.b ENSGT00990000204190.b ENSGT00940000154957.A.c ENSGT00940000159091.a #10 ENSGT00940000157981.a.b.e ENSGT00940000167564.a ENSGT00940000159029.c #14 ENSGT00940000158266.g.b ENSGT00940000161386.c #15 ENSGT00940000161529.w.a #16 ENSGT00940000161230.d #17 ENSGT00940000161108.e.a #18 ENSGT00940000158354.d.e #19 ENSGT00940000162072.b #20 ENSGT00940000159774.c.a #21 ENSGT00940000155029.c.b.c #22 ENSGT00940000166856.l ENSGT00940000154152.b.a.b #27 ENSGT00950000182892.a.b.a.b.b.d ##28 ENSGT00390000004405.b.c #29 ENSGT00940000154534.b.a.j ##31 ENSGT00940000157439.a.c ENSGT00940000153704.B.d.b.a.a ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a.b.e ENSGT00390000006679.b.l ENSGT01100000263525.b.a.l ENSGT00940000156584.e.b.d.a ENSGT00940000158833.a.a.c ENSGT00940000175578.a.a ENSGT00940000175578.a.b.b ENSGT00390000017328.a.a.l Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00940000160548.b ENSGT00990000204190.b ENSGT00940000154957.A.c ENSGT00940000159091.a #10 ENSGT00940000157981.a.b.e ENSGT00940000167564.a ENSGT00940000159029.c #14 ENSGT00940000158266.g.b ENSGT00940000161386.c #15 ENSGT00940000161529.w.a #16 ENSGT00940000161230.d #17 ENSGT00940000161108.e.a #18 ENSGT00940000158354.d.e #19 ENSGT00940000162072.b #20 ENSGT00940000159774.c.a #21 ENSGT00940000155029.c.b.c #22 ENSGT00940000166856.l ENSGT00940000154152.b.a.b #27 ENSGT00950000182892.a.b.a.b.b.d ##28 ENSGT00390000004405.b.c #29 ENSGT00940000154534.b.a.j ##31 ENSGT00940000157439.a.c ENSGT00940000153704.B.d.b.a.a ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a.b.e ENSGT00390000006679.b.l ENSGT01100000263525.b.a.l ENSGT00940000156584.e.b.d.a ENSGT00940000158833.a.a.c ENSGT00940000175578.a.a ENSGT00390000017328.a.a.l ENSGT00940000153653.a.a.o Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 42 ENSGT00390000018292.d.d.a ENSGT00940000160548.b ENSGT00990000204190.b ENSGT00940000154957.A.c ENSGT00940000159091.a #10 ENSGT00940000157981.a.b.e ENSGT00940000167564.a ENSGT00940000159029.c #14 ENSGT00940000158266.g.b ENSGT00940000161386.c #15 ENSGT00940000161529.w.a #16 ENSGT00940000161230.d #17 ENSGT00940000158354.d.e #19 ENSGT00940000162072.b #20 ENSGT00940000159774.c.a #21 ENSGT00940000155029.c.b.c #22 ENSGT00940000166856.l ENSGT00940000154152.b.a.b #27 ENSGT00950000182892.a.b.a.b.b.d ##28 ENSGT00390000004405.b.d.b.a.b #29 ENSGT00940000154534.b.a.j ##31 ENSGT00940000157439.a.c ENSGT00940000153704.B.d.b.a.a ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a.b.e ENSGT00390000006679.b.l ENSGT01100000263525.b.a.l ENSGT00940000156584.e.b.d.a ENSGT00940000158833.a.a.c ENSGT00940000175578.a.a ENSGT00390000017328.a.a.l ENSGT00940000153653.a.a.o Coho salmon MODERN SPECIES 26 nr1d1 (ENSOKIG00005005390) ENSOKIG00005005377 igf2bp1 (ENSOKIG00005003295) ube2z (ENSOKIG00005003129) #10 atp5mc1 (ENSOKIG00005003106) eve1 (ENSOKIG00005003093) ENSOKIG00005003088 hoxb13a (ENSOKIG00005003079) #14 ENSOKIG00005003074 hoxb9a (ENSOKIG00005003066) #15 hoxb8a (ENSOKIG00005003059) #16 hoxb7a (ENSOKIG00005003049) #17 hoxb5a (ENSOKIG00005003039) #19 hoxb4a (ENSOKIG00005003033) #20 HOXB3 (ENSOKIG00005003027) #21 hoxb2a (ENSOKIG00005003020) #22 hoxb1a (ENSOKIG00005003017) cbx1a (ENSOKIG00005002994) #27 ENSOKIG00005002979 nfe2l1a (ENSOKIG00005002972) ##28 copz2 (ENSOKIG00005002937) #29 prr15la (ENSOKIG00005002918) ##31 ENSOKIG00005002828 pdk2b (ENSOKIG00005002702) ENSOKIG00005002598 ENSOKIG00005002573 col1a1a (ENSOKIG00005002517) PPP1R9B (ENSOKIG00005002344) ENSOKIG00005002309 ENSOKIG00005002298 ENSOKIG00005002224 Chinook salmon MODERN SPECIES 33 casc3 (ENSOTSG00005011832) msl1a (ENSOTSG00005011828) nr1d1 (ENSOTSG00005011824) ENSOTSG00005011821 igf2bp1 (ENSOTSG00005011396) ube2z (ENSOTSG00005011388) #10 atp5mc1 (ENSOTSG00005011385) hoxb13a (ENSOTSG00005011383) #14 eve1 (ENSOTSG00005011380) ENSOTSG00005011376 hoxb9a (ENSOTSG00005011373) #15 hoxb8a (ENSOTSG00005011370) #16 hoxb7a (ENSOTSG00005011367) #17 hoxb5a (ENSOTSG00005011366) #19 hoxb4a (ENSOTSG00005011363) #20 hoxb2a (ENSOTSG00005011362) #22 hoxb1a (ENSOTSG00005011361) cbx1a (ENSOTSG00005011360) #27 nfe2l1a (ENSOTSG00005011359) ##28 copz2 (ENSOTSG00005011352) #29 prr15la (ENSOTSG00005011351) ##31 OSBPL7 (ENSOTSG00005011327) ENSOTSG00005011317 pdk2b (ENSOTSG00005011186) ENSOTSG00005011183 ENSOTSG00005011182 col1a1a (ENSOTSG00005010996) PPP1R9B (ENSOTSG00005010989) ENSOTSG00005010987 psmd3 (ENSOTSG00005010966) ENSOTSG00005010962 Rainbow trout MODERN SPECIES 3 nr1d1 (ENSOMYG00000024434) ENSOMYG00000024411 igf2bp1 (ENSOMYG00000021828) ube2z (ENSOMYG00000021520) #10 atp5mc1 (ENSOMYG00000021454) eve1 (ENSOMYG00000073254) hoxb13a (ENSOMYG00000021419) #14 ENSOMYG00000021407 hoxb9a (ENSOMYG00000021396) #15 hoxb8a (ENSOMYG00000055816) #16 hoxb7a (ENSOMYG00000021367) #17 hoxb6a (ENSOMYG00000021357) #18 hoxb5a (ENSOMYG00000021351) #19 hoxb4a (ENSOMYG00000021348) #20 HOXB3 (ENSOMYG00000021314) #21 hoxb2a (ENSOMYG00000021339) #22 hoxb1a (ENSOMYG00000021300) cbx1a (ENSOMYG00000021278) #27 nfe2l1a (ENSOMYG00000021257) ##28 copz2 (ENSOMYG00000021226) #29 prr15la (ENSOMYG00000021184) ##31 ENSOMYG00000059908 ENSOMYG00000021165 ENSOMYG00000077184 ENSOMYG00000021069 ENSOMYG00000052424 ENSOMYG00000055738 ENSOMYG00000021024 ENSOMYG00000055072 col1a1 (ENSOMYG00000020647) ENSOMYG00000020551 Salmo ANCESTRAL SPECIES 55 ENSGT00940000160548.b ENSGT00990000204190.b ENSGT00940000154957.A.c ENSGT00940000159091.a #10 ENSGT00940000157981.a.b.e ENSGT00940000167564.a ENSGT00940000159029.c #14 ENSGT00940000158266.g.a ENSGT00940000161386.c #15 ENSGT00940000161529.w.a #16 ENSGT00940000161230.d #17 ENSGT00940000161108.e.a #18 ENSGT00940000158354.d.e #19 ENSGT00940000162072.b #20 ENSGT00940000159774.c.a #21 ENSGT00940000155029.c.b.c #22 ENSGT00940000166856.l ENSGT00940000154152.b.a.b #27 ENSGT00950000182892.a.b.a.b.b.d ##28 ENSGT00390000004405.b.c #29 ENSGT00940000154534.b.a.j ##31 ENSGT00940000157439.a.c ENSGT00940000153704.B.d.b.b ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a.b.e ENSGT00390000006679.b.l ENSGT01100000263525.b.a.l ENSGT00940000156584.e.b.d.a ENSGT00940000158833.a.a.c ENSGT00940000175578.a.a ENSGT00940000175578.a.b.b ENSGT00940000153653.a.a.o River trout MODERN SPECIES 25 nr1d1 (ENSSTUG00000044343) ENSSTUG00000044314 igf2bp1 (ENSSTUG00000044083) ube2z (ENSSTUG00000044068) #10 atp5mc1 (ENSSTUG00000044047) eve1 (ENSSTUG00000044042) hoxb13a (ENSSTUG00000044039) #14 ENSSTUG00000044034 hoxb9a (ENSSTUG00000044028) #15 hoxb8a 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nags (ENSELUG00000014289) ENSELUG00000014268 ENSELUG00000014247 col1a1a (ENSELUG00000014218) PPP1R9B (ENSELUG00000014166) ENSELUG00000014127 ENSELUG00000032826 Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 180 ENSGT00940000153704.B.d ENSGT00940000157439.a ENSGT00940000159091 #10 ENSGT00940000157981.a.b ENSGT00940000167564 ENSGT00940000159029 #14 ENSGT00940000163268.e ENSGT00940000161386 #15 ENSGT00940000161529 #16 ENSGT00940000161230 #17 ENSGT00940000161108 #18 ENSGT00940000165065.a ENSGT00940000158354.c.b #19 ENSGT00940000162072 #20 ENSGT00940000159774 #21 ENSGT00940000155029.c.b #22 ENSGT00940000166856 ENSGT01090000261037 ENSGT00940000154152.a.b #27 ENSGT00950000182892.a.b.a.b.b ##28 ENSGT00390000008631.b ENSGT00390000004405.b #29 ENSGT00940000154534.b.a ##31 ENSGT00940000154957.A Cod MODERN SPECIES 11 ENSGMOG00000001726 ENSGMOG00000033297 ube2z (ENSGMOG00000015368) #10 atp5mc1 (ENSGMOG00000015354) ENSGMOG00000015328 eve1 (ENSGMOG00000034875) ENSGMOG00000035317 hoxb13a (ENSGMOG00000015284) #14 hoxb9a (ENSGMOG00000033079) #15 hoxb8a (ENSGMOG00000035281) #16 hoxb7a (ENSGMOG00000024089) #17 ENSGMOG00000027090 HOXB5 (ENSGMOG00000031372) #19 hoxb4a (ENSGMOG00000009880) #20 hoxb3a (ENSGMOG00000024004) #21 hoxb2a (ENSGMOG00000024154) #22 hoxb1a (ENSGMOG00000030229) ENSGMOG00000027442 ENSGMOG00000027289 ENSGMOG00000030519 ENSGMOG00000032198 ENSGMOG00000035523 CBX1 (ENSGMOG00000009322) #27 nfe2l1a (ENSGMOG00000027608) ##28 ENSGMOG00000035621 copz2 (ENSGMOG00000004484) #29 prr15la (ENSGMOG00000028853) ##31 ENSGMOG00000019381 ENSGMOG00000034869 ENSGMOG00000025703 eif1 (ENSGMOG00000029255) Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 98 ENSGT00940000153704.B.d ENSGT00940000157439.a ENSGT00940000159091 #10 ENSGT00940000157981.a.b ENSGT00940000167564 ENSGT00940000159029 #14 ENSGT00940000163268.e ENSGT00940000161386 #15 ENSGT00940000161529 #16 ENSGT00940000161230 #17 ENSGT00940000161108 #18 ENSGT00940000165065.a ENSGT00940000158354.c.b #19 ENSGT00940000162072 #20 ENSGT00940000159774 #21 ENSGT00940000155029.c.b #22 ENSGT00940000166856 ENSGT01090000261037 ENSGT00940000154152.a.b #27 ENSGT00950000182892.a.b.a.b.b ##28 ENSGT00390000008631.b ENSGT00390000004405.b #29 ENSGT00940000154534.b.a ##31 ENSGT00940000154957.A Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 22 ENSMMDG00005000818 ube2z (ENSMMDG00005000811) #10 ENSMMDG00005000806 igf2bp1 (ENSMMDG00005000735) atp5mc1 (ENSMMDG00005000711) eve1 (ENSMMDG00005000701) hoxb13a (ENSMMDG00005000698) #14 ENSMMDG00005000694 hoxb9a (ENSMMDG00005000689) #15 hoxb8a (ENSMMDG00005000684) #16 hoxb7a (ENSMMDG00005000680) #17 ENSMMDG00005000676 HOXB5 (ENSMMDG00005000664) #19 hoxb4a (ENSMMDG00005000657) #20 hoxb3a (ENSMMDG00005000643) #21 hoxb2a (ENSMMDG00005000634) #22 hoxb1a (ENSMMDG00005000621) ENSMMDG00005000614 ENSMMDG00005000609 CBX1 (ENSMMDG00005000606) #27 nfe2l1a (ENSMMDG00005000602) ##28 praf2 (ENSMMDG00005000597) copz2 (ENSMMDG00005000593) #29 prr15la (ENSMMDG00005000591) ##31 ENSMMDG00005000585 ENSMMDG00005000582 ENSMMDG00005000579 ENSMMDG00005000551 ENSMMDG00005000543 ENSMMDG00005000539 ENSMMDG00005000535 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 49 ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a.b ENSGT00940000153704.B.d ENSGT00940000157439.a ENSGT00940000159091 #10 ENSGT00940000157981.a.b ENSGT00940000167564 ENSGT00940000159029 #14 ENSGT00940000161386 #15 ENSGT00940000161529 #16 ENSGT00940000161230 #17 ENSGT00940000161108 #18 ENSGT00940000165065.a ENSGT00940000158354.c.b #19 ENSGT00940000162072 #20 ENSGT00940000159774 #21 ENSGT00940000155029.c.b #22 ENSGT00940000166856 ENSGT01090000261037 ENSGT00940000154152.a.b #27 ENSGT00950000182892.a.b.a.b.b ##28 ENSGT00390000008631.b ENSGT00390000004405.b #29 ENSGT00940000154534.b.a ##31 ENSGT00940000154957.A Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 507 ENSHCOG00000008504 ENSHCOG00000008498 kcnc3a (ENSHCOG00000008490) pdk2b (ENSHCOG00000008469) ENSHCOG00000008443 ENSHCOG00000008433 ube2z (ENSHCOG00000008393) #10 atp5mc1 (ENSHCOG00000008380) hoxb13a (ENSHCOG00000008373) #14 hoxb9a (ENSHCOG00000008300) #15 hoxb8a (ENSHCOG00000008293) #16 ENSHCOG00000008289 HOXB5 (ENSHCOG00000008284) #19 hoxb4a (ENSHCOG00000008282) #20 hoxb3a (ENSHCOG00000008278) #21 hoxb2a (ENSHCOG00000008273) #22 hoxb1a (ENSHCOG00000008252) ENSHCOG00000008185 #27 copz2 (ENSHCOG00000008155) #29 ENSHCOG00000008135 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000164903.b ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a.b ENSGT00940000153704.B.d ENSGT00940000157439.a ENSGT00940000159091 #10 ENSGT00940000157981.a.b ENSGT00940000167564 ENSGT00940000159029 #14 ENSGT00940000161386 #15 ENSGT00940000161529 #16 ENSGT00940000161230 #17 ENSGT00940000165065.a ENSGT00940000158354.c.b #19 ENSGT00940000162072 #20 ENSGT00940000159774 #21 ENSGT00940000155029.c.b #22 ENSGT00940000166856 ENSGT01090000261037 ENSGT00940000154152.a.b #27 ENSGT00950000182892.a.b.a.b.b ##28 ENSGT00390000008631.b ENSGT00390000004405.b #29 ENSGT00940000154534.b.a ##31 ENSGT00940000154957.A ENSGT00940000164729.a.a.d ENSGT00440000033742.a.b.d ENSGT00390000004832 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ENSGT00940000159774 #21 ENSGT00940000155029.c.b #22 ENSGT00940000166856 ENSGT00940000154152.a.b #27 ENSGT00950000182892.a.b.a.b.b ##28 ENSGT00390000008631.b ENSGT00390000004405.b #29 ENSGT00940000154534.b.a ##31 ENSGT00940000154957.A ENSGT00940000164729.a.a.d ENSGT00440000033742.a.b.d ENSGT00390000004832 ENSGT00940000156193 ENSGT00390000018512 ENSGT00940000153536.a.b.b.a.b ENSGT00940000158181.a ENSGT00550000075089 Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 793 ENSHBUG00000013231 eve1 (ENSHBUG00000013255) hoxb13a (ENSHBUG00000013265) #14 hoxb9a (ENSHBUG00000013267) #15 hoxb8a (ENSHBUG00000013281) #16 hoxb7a (ENSHBUG00000013288) #17 ENSHBUG00000013315 HOXB5 (ENSHBUG00000013321) #19 hoxb4a (ENSHBUG00000013332) #20 hoxb3a (ENSHBUG00000013355) #21 hoxb2a (ENSHBUG00000013364) #22 hoxb1a (ENSHBUG00000013373) Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 43 ENSGT00940000167564 ENSGT00940000159029 #14 ENSGT00940000161386 #15 ENSGT00940000161529 #16 ENSGT00940000161230 #17 ENSGT00940000165065.a.b ENSGT00940000158354.c.b #19 ENSGT00940000162072 #20 ENSGT00940000159774 #21 ENSGT00940000155029.c.b #22 ENSGT00940000166856 ENSGT00940000154152.a.b #27 ENSGT00950000182892.a.b.a.b.b ##28 ENSGT00390000008631.b ENSGT00390000004405.b #29 ENSGT00940000154534.b.a ##31 ENSGT00940000154957.A ENSGT00940000164729.a.a.d ENSGT00440000033742.a.b.d ENSGT00390000004832 ENSGT00940000156193 ENSGT00390000018512 ENSGT00940000153536.a.b.b.a.b ENSGT00940000158181.a ENSGT00550000075089 P. nyererei MODERN SPECIES 488 hoxb9a (ENSPNYG00000022874) #15 hoxb8a (ENSPNYG00000022869) #16 ENSPNYG00000022864 ENSPNYG00000022859 HOXB5 (ENSPNYG00000022852) #19 hoxb2a (ENSPNYG00000022841) #22 hoxb3a (ENSPNYG00000022832) #21 hoxb1a (ENSPNYG00000022787) CBX1 (ENSPNYG00000022772) #27 nfe2l1a (ENSPNYG00000022769) ##28 praf2 (ENSPNYG00000022767) copz2 (ENSPNYG00000022748) #29 prr15la (ENSPNYG00000022742) ##31 igf2bp1 (ENSPNYG00000022740) ENSPNYG00000022738 rab11fip4a (ENSPNYG00000022732) coil (ENSPNYG00000022723) scpep1 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AP2A1 (ENSNFUG00015022250) prmt1 (ENSNFUG00015021721) PPP1R35 (ENSNFUG00015021706) Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00940000158268.b ENSGT00440000037417.B.a ENSGT00390000014700.b.a.b.b.a ENSGT00390000014595.a.b ENSGT00950000183207.b.ab ENSGT00940000164903.b ENSGT00940000159091 #10 ENSGT00940000167564 ENSGT00940000159029 #14 ENSGT00940000161386 #15 ENSGT00940000161529 #16 ENSGT00940000165065.a ENSGT00940000158354.c.b #19 ENSGT00940000162072 #20 ENSGT00940000159774 #21 ENSGT00940000155029.c.b #22 ENSGT00940000166856 ENSGT00940000154152.a.b #27 ENSGT00950000182892.a.b.a.b.b ##28 ENSGT00390000008631.b ENSGT00390000004405.b #29 ENSGT00940000154957.A ENSGT00940000164729.a.a.d ENSGT00440000033742.a.b.d ENSGT00390000004832 ENSGT00940000156193 ENSGT00390000018512 ENSGT00940000153536.a.b.b.a.b ENSGT00940000158181.a ENSGT00550000075089 ENSGT00940000163009.a Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000160972 ENSGT00940000158268.b ENSGT00440000037417.B.a ENSGT00390000014700.b.a.b.b.a ENSGT00950000183207.b.ab ENSGT00940000164903.b ENSGT00940000159091 #10 ENSGT00940000167564 ENSGT00940000159029 #14 ENSGT00940000161386 #15 ENSGT00940000161529 #16 ENSGT00940000165065.a ENSGT00940000158354.c.b #19 ENSGT00940000162072 #20 ENSGT00940000159774 #21 ENSGT00940000155029.c.b #22 ENSGT00940000166856 ENSGT00940000154152.a.b #27 ENSGT00950000182892.a.b.a.b.b ##28 ENSGT00390000008631.b ENSGT00390000004405.b #29 ENSGT00940000154957.A ENSGT00940000164729.a.a.d ENSGT00440000033742.a.b.d ENSGT00390000004832 ENSGT00940000156193 ENSGT00390000018512 ENSGT00940000153536.a.b.b.a.b ENSGT00940000158181.a ENSGT00550000075089 ENSGT00940000163009.a.g Poecilia ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000160972 ENSGT00940000158268.b ENSGT00440000037417.B.a ENSGT00390000014700.b.a.b.b.a ENSGT00950000183207.b.ab ENSGT00940000164903.b ENSGT00940000159091 #10 ENSGT00940000167564 ENSGT00940000159029 #14 ENSGT00940000161386 #15 ENSGT00940000161529 #16 ENSGT00940000165065.a ENSGT00940000158354.c.b #19 ENSGT00940000162072 #20 ENSGT00940000159774 #21 ENSGT00940000155029.c.b #22 ENSGT00940000166856 ENSGT00940000154152.a.b #27 ENSGT00950000182892.a.b.a.b.b ##28 ENSGT00390000008631.b ENSGT00390000004405.b #29 ENSGT00940000154957.A ENSGT00940000164729.a.a.d ENSGT00440000033742.a.b.d ENSGT00390000004832 ENSGT00940000156193 ENSGT00390000018512 ENSGT00940000153536.a.b.b.a.b ENSGT00940000158181.a ENSGT00550000075089 ENSGT00940000163009.a.g NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 456 ENSGT00940000165065.a ENSGT00940000158354.c.b #19 ENSGT00940000162072 #20 ENSGT00940000159774 #21 ENSGT00940000155029.c.b #22 ENSGT00940000166856 Sailfin molly MODERN SPECIES 794 ENSPLAG00000016792 HOXB5 (ENSPLAG00000016784) #19 hoxb4a (ENSPLAG00000016769) #20 hoxb3a (ENSPLAG00000016765) #21 hoxb2a (ENSPLAG00000016752) #22 hoxb1a (ENSPLAG00000016712) Amazon molly MODERN SPECIES 702 ENSPFOG00000001315 ripor1 (ENSPFOG00000001483) ctcf (ENSPFOG00000001733) ENSPFOG00000024294 ENSPFOG00000023634 ENSPFOG00000001956 HOXB5 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ENSPREG00000007308 ENSPREG00000007321 Platyfish MODERN SPECIES 7 rras (ENSXMAG00000025428) prrg2 (ENSXMAG00000002785) PRR12 (ENSXMAG00000027073) ENSXMAG00000021756 aoc2 (ENSXMAG00000002813) kcnc3a (ENSXMAG00000002823) ube2z (ENSXMAG00000002829) #10 eve1 (ENSXMAG00000002833) hoxb13a (ENSXMAG00000002835) #14 hoxb9a (ENSXMAG00000002838) #15 hoxb8a (ENSXMAG00000027358) #16 ENSXMAG00000002841 HOXB5 (ENSXMAG00000023952) #19 hoxb4a (ENSXMAG00000023849) #20 hoxb3a (ENSXMAG00000022738) #21 hoxb2a (ENSXMAG00000030079) #22 hoxb1a (ENSXMAG00000013632) CBX1 (ENSXMAG00000003552) #27 nfe2l1a (ENSXMAG00000003544) ##28 praf2 (ENSXMAG00000027862) copz2 (ENSXMAG00000003541) #29 igf2bp1 (ENSXMAG00000003513) rab11fip4a (ENSXMAG00000003503) ENSXMAG00000026861 scpep1 (ENSXMAG00000003463) engase (ENSXMAG00000003449) csnk1db (ENSXMAG00000003430) slc16a3b (ENSXMAG00000023181) dus1l (ENSXMAG00000005147) ENSXMAG00000005166 ENSXMAG00000005168 NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 298 ENSGT00940000164903.b ENSGT00940000159091 #10 ENSGT00940000167564 ENSGT00940000159029 #14 ENSGT00940000161386.e #15 ENSGT00940000161529 #16 ENSGT00940000165065.a ENSGT00940000158354.c.b #19 ENSGT00940000162072 #20 ENSGT00940000159774 #21 ENSGT00940000155029.c.b #22 ENSGT00940000166856 Mummichog MODERN SPECIES 697 hoxb9a (ENSFHEG00000013492) #15 hoxb8a (ENSFHEG00000013496) #16 ENSFHEG00000013503 HOXB5 (ENSFHEG00000013506) #19 hoxb4a (ENSFHEG00000013512) #20 hoxb3a (ENSFHEG00000013540) #21 hoxb2a (ENSFHEG00000000790) #22 hoxb1a (ENSFHEG00000013582) Sheepshead minnow MODERN SPECIES 526 glyr1 (ENSCVAG00000001116) kcnc3a (ENSCVAG00000001115) ube2z (ENSCVAG00000001114) #10 eve1 (ENSCVAG00000001113) hoxb13a (ENSCVAG00000001112) #14 hoxb9a (ENSCVAG00000001111) #15 hoxb8a (ENSCVAG00000001110) #16 ENSCVAG00000001109 HOXB5 (ENSCVAG00000001108) #19 hoxb4a (ENSCVAG00000001107) #20 hoxb3a (ENSCVAG00000001106) #21 hoxb2a (ENSCVAG00000001105) #22 hoxb1a (ENSCVAG00000001104) Oryzias ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183197.a ENSGT00940000160534 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ENSORLG00000027484 AP2A1 (ENSORLG00000017087) ABCC1 (ENSORLG00000017141) ENSORLG00000023603 ENSORLG00000029325 ENSORLG00000023681 orla-uha (ENSORLG00000017153) Chinese medaka MODERN SPECIES 387 cyb561 (ENSOSIG00000005247) ENSOSIG00000005246 HDAC5 (ENSOSIG00000005244) pex12 (ENSOSIG00000005241) col1a1a (ENSOSIG00000005123) kcnc3a (ENSOSIG00000005100) ube2z (ENSOSIG00000005094) #10 atp5mc1 (ENSOSIG00000004884) eve1 (ENSOSIG00000004873) hoxb13a (ENSOSIG00000004871) #14 hoxb9a (ENSOSIG00000004864) #15 hoxb8a (ENSOSIG00000004862) #16 hoxb4a (ENSOSIG00000004858) #20 hoxb2a (ENSOSIG00000004856) #22 hoxb3a (ENSOSIG00000004853) #21 hoxb1a (ENSOSIG00000004850) ENSOSIG00000004848 Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES 43 ENSGT00940000160534 ENSGT00390000016209 ENSGT00940000174909 ENSGT00940000156584.e.b ENSGT00940000164903.b ENSGT00940000159091 #10 ENSGT00940000157981.a.b ENSGT00940000167564 ENSGT00940000159029 #14 ENSGT00940000161386 #15 ENSGT00940000161529 #16 ENSGT00940000165065.a ENSGT00940000158354.c.b #19 ENSGT00940000162072 #20 ENSGT00940000159774 #21 ENSGT00940000155029.c.b #22 ENSGT00940000166856 ENSGT00940000154152.a.b #27 ENSGT00950000182892.a.b.a.b.b ##28 ENSGT00390000008631.b.c ENSGT00390000004405.b.f #29 ENSGT00940000154957.A ENSGT00940000164729.a.a.d ENSGT00440000033742.a.b.d ENSGT00390000004832 ENSGT00940000156193 ENSGT00390000018512 ENSGT00910000147748 ENSGT00940000153536.a.b.b.a.b ENSGT00940000158181.a ENSGT00550000075089 Indian medaka MODERN SPECIES 9 thraa (ENSOMEG00000011291) ENSOMEG00000011319 TANC2 (ENSOMEG00000011411) cyb561 (ENSOMEG00000011454) HDAC5 (ENSOMEG00000011665) pex12 (ENSOMEG00000011719) ENSOMEG00000011759 eve1 (ENSOMEG00000011771) hoxb13a (ENSOMEG00000011777) #14 hoxb9a (ENSOMEG00000011785) #15 hoxb8a (ENSOMEG00000011855) #16 ENSOMEG00000011874 HOXB5 (ENSOMEG00000011882) #19 hoxb4a (ENSOMEG00000011889) #20 hoxb3a (ENSOMEG00000012003) #21 hoxb2a (ENSOMEG00000011894) #22 hoxb1a (ENSOMEG00000012109) CBX1 (ENSOMEG00000012142) #27 ENSOMEG00000012155 ##28 praf2 (ENSOMEG00000012171) copz2 (ENSOMEG00000000304) #29 igf2bp1 (ENSOMEG00000012285) ENSOMEG00000012319 rab11fip4a (ENSOMEG00000012355) ENSOMEG00000012365 scpep1 (ENSOMEG00000012417) engase (ENSOMEG00000000315) ENSOMEG00000012463 csnk1db (ENSOMEG00000012505) slc16a3b (ENSOMEG00000012546) dus1l (ENSOMEG00000012607) Javanese ricefish DUPLICATION Javanese ricefish MODERN SPECIES 22 ENSOJAG00000014535 HDAC5 (ENSOJAG00000014523) pex12 (ENSOJAG00000014515) ENSOJAG00000014499 kcnc3a (ENSOJAG00000007326) ube2z (ENSOJAG00000007274) #10 atp5mc1 (ENSOJAG00000007185) eve1 (ENSOJAG00000007159) hoxb13a (ENSOJAG00000007146) #14 hoxb9a (ENSOJAG00000007135) #15 hoxb8a (ENSOJAG00000007082) #16 ENSOJAG00000007068 hoxb4a (ENSOJAG00000007045) #20 HOXB5 (ENSOJAG00000007030) #19 hoxb3a (ENSOJAG00000007007) #21 hoxb2a (ENSOJAG00000007019) #22 hoxb1a (ENSOJAG00000006853) ENSOJAG00000006838 #27 praf2 (ENSOJAG00000006831) copz2 (ENSOJAG00000006786) #29 igf2bp1 (ENSOJAG00000006407) rab11fip4a 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SPECIES ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a.b ENSGT00940000153704.B.d ENSGT00940000157439.a ENSGT00940000159091 #10 ENSGT00940000157981.a.b ENSGT00940000167564 ENSGT00940000159029 #14 ENSGT00940000161386 #15 ENSGT00940000161529 #16 ENSGT00940000161230 #17 ENSGT00940000161108 #18 ENSGT00940000165065.a ENSGT00940000158354.c.b #19 ENSGT00940000162072 #20 ENSGT00940000159774 #21 ENSGT00940000155029.c.b #22 ENSGT00940000166856 ENSGT01090000261037 ENSGT00940000154152.a.b #27 ENSGT00950000182892.a.b.a.b.b ##28 ENSGT00390000008631.b ENSGT00390000004405.b #29 ENSGT00940000154534.b.a ##31 ENSGT00940000154957.A ENSGT00940000164729.a.a.d ENSGT00440000033742.a.b.d ENSGT00390000004832 ENSGT00940000156193 ENSGT00390000018512 ENSGT00910000147748 ENSGT00940000153536.a.b.b.a.b Perciformes ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a.b ENSGT00940000153704.B.d ENSGT00940000157439.a ENSGT00940000159091 #10 ENSGT00940000157981.a.b ENSGT00940000167564 ENSGT00940000159029 #14 ENSGT00940000161386 #15 ENSGT00940000161529 #16 ENSGT00940000161230 #17 ENSGT00940000161108 #18 ENSGT00940000165065.a ENSGT00940000158354.c.b #19 ENSGT00940000162072 #20 ENSGT00940000159774 #21 ENSGT00940000155029.c.b #22 ENSGT00940000166856 ENSGT00940000154152.a.b.b.b #27 ENSGT00950000182892.a.b.a.b.b ##28 ENSGT00390000008631.b ENSGT00390000004405.b #29 ENSGT00940000154534.b.a ##31 ENSGT00940000154957.A ENSGT00940000164729.a.a.d ENSGT00440000033742.a.b.d ENSGT00390000004832 ENSGT00940000156193 ENSGT00390000018512 ENSGT00940000153536.a.b.b.a.b ENSGT00940000158181.a ENSGT00550000075089 Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000164903.b ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a.b ENSGT00940000153704.B.d ENSGT00940000157439.a ENSGT00940000159091 #10 ENSGT00940000157981.a.b ENSGT00940000167564 ENSGT00940000159029 #14 ENSGT00940000161386 #15 ENSGT00940000161529 #16 ENSGT00940000161230 #17 ENSGT00940000165065.a ENSGT00940000158354.c.b #19 ENSGT00940000162072 #20 ENSGT00940000159774 #21 ENSGT00940000155029.c.b #22 ENSGT00940000166856 ENSGT00940000154152.a.b.b.b #27 ENSGT00950000182892.a.b.a.b.b ##28 ENSGT00390000008631.b ENSGT00390000004405.b #29 ENSGT00940000154534.b.a ##31 ENSGT00940000154957.A ENSGT00440000033742.a.b.d ENSGT00390000004832 ENSGT00940000156193 ENSGT00390000018512 ENSGT00940000153536.a.b.b.a.b ENSGT00940000158181.a ENSGT00550000075089 ENSGT01020000230389.a.a.a Pike perch MODERN SPECIES 107 kcnc3a (ENSSLUG00000025735) PDK2 (ENSSLUG00000025753) ENSSLUG00000025772 ENSSLUG00000025782 ube2z (ENSSLUG00000025783) #10 atp5mc1 (ENSSLUG00000025787) eve1 (ENSSLUG00000025790) hoxb13a (ENSSLUG00000025791) #14 hoxb9a (ENSSLUG00000025792) #15 hoxb8a (ENSSLUG00000025797) #16 hoxb7a (ENSSLUG00000025801) #17 ENSSLUG00000025803 HOXB5 (ENSSLUG00000025807) #19 hoxb4a (ENSSLUG00000014165) #20 hoxb3a (ENSSLUG00000014170) #21 hoxb2a (ENSSLUG00000014173) #22 hoxb1a (ENSSLUG00000014182) CBX1 (ENSSLUG00000014227) #27 nfe2l1a (ENSSLUG00000014230) ##28 praf2 (ENSSLUG00000014235) copz2 (ENSSLUG00000014240) 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ENSSAUG00010003433 ENSSAUG00010003436 ENSSAUG00010003437 ENSSAUG00010003441 ENSSAUG00010003443 CBX1 (ENSSAUG00010003449) #27 nfe2l1a (ENSSAUG00010003455) ##28 praf2 (ENSSAUG00010003458) copz2 (ENSSAUG00010003464) #29 prr15la (ENSSAUG00010003469) ##31 igf2bp1 (ENSSAUG00010003494) ENSSAUG00010003727 rab11fip4a (ENSSAUG00010003756) aldh3b1 (ENSSAUG00010004557) Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000164903.b ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a.b ENSGT00940000153704.B.d ENSGT00940000157439.a ENSGT00940000159091 #10 ENSGT00940000157981.a.b ENSGT00940000167564 ENSGT00940000159029 #14 ENSGT00940000161386 #15 ENSGT00940000161529 #16 ENSGT00940000161230 #17 ENSGT00940000165065.a ENSGT00940000158354.c.b #19 ENSGT00940000162072 #20 ENSGT00940000159774 #21 ENSGT00940000155029.c.b #22 ENSGT00940000166856 ENSGT01090000261037 ENSGT00940000154152.a.b #27 ENSGT00950000182892.a.b.a.b.b ##28 ENSGT00390000008631.b ENSGT00390000004405.b #29 ENSGT00940000154534.b.a ##31 ENSGT00940000154957.A ENSGT00440000033742.a.b.d ENSGT00390000004832 ENSGT00940000156193 ENSGT00390000018512 ENSGT00940000153536.a.b.b.a.b ENSGT00940000158181.a ENSGT00550000075089 European seabass MODERN SPECIES 21 ENSDLAG00005015851 ENSDLAG00005024545 ENSDLAG00005033674 ENSDLAG00005024552 ENSDLAG00005024569 ube2z (ENSDLAG00005024583) #10 atp5mc1 (ENSDLAG00005033252) eve1 (ENSDLAG00005032886) hoxb13a (ENSDLAG00005029232) #14 hoxb8a (ENSDLAG00005031830) #16 hoxb7a (ENSDLAG00005030569) #17 hoxb3a (ENSDLAG00005024643) #21 ENSDLAG00005029789 HOXB5 (ENSDLAG00005024633) #19 hoxb4a (ENSDLAG00005024639) #20 hoxb2a (ENSDLAG00005027794) #22 hoxb1a (ENSDLAG00005024658) ENSDLAG00005024662 ENSDLAG00005033551 CBX1 (ENSDLAG00005030727) #27 nfe2l1a (ENSDLAG00005024673) ##28 copz2 (ENSDLAG00005024679) #29 ENSDLAG00005031095 ENSDLAG00005033002 ENSDLAG00005032726 ##31 ENSDLAG00005024705 ENSDLAG00005025081 ENSDLAG00005025089 scpep1 (ENSDLAG00005025129) coil (ENSDLAG00005025126) ENSDLAG00005025223 Large yellow croaker MODERN SPECIES 483 pdk2b (ENSLCRG00005009537) ENSLCRG00005009536 ENSLCRG00005009449 ENSLCRG00005009443 ube2z (ENSLCRG00005009442) #10 atp5mc1 (ENSLCRG00005009440) eve1 (ENSLCRG00005009438) hoxb13a (ENSLCRG00005009437) #14 hoxb9a (ENSLCRG00005009434) #15 hoxb8a (ENSLCRG00005009416) #16 hoxb7a (ENSLCRG00005009413) #17 ENSLCRG00005009412 HOXB5 (ENSLCRG00005009410) #19 hoxb4a (ENSLCRG00005009408) #20 hoxb3a (ENSLCRG00005009406) #21 hoxb2a (ENSLCRG00005009404) #22 hoxb1a (ENSLCRG00005009402) ENSLCRG00005009400 CBX1 (ENSLCRG00005009397) #27 nfe2l1a (ENSLCRG00005009396) ##28 praf2 (ENSLCRG00005009395) copz2 (ENSLCRG00005009391) #29 prr15la (ENSLCRG00005009387) ##31 ENSLCRG00005009385 igf2bp1 (ENSLCRG00005006089) ENSLCRG00005006069 rab11fip4a (ENSLCRG00005006046) coil (ENSLCRG00005006040) ENSLCRG00005006039 scpep1 (ENSLCRG00005006029) engase (ENSLCRG00005006022) Ballan wrasse MODERN SPECIES 405 hoxb3a (ENSLBEG00000022332) #21 hoxb2a (ENSLBEG00000022320) #22 hoxb1a (ENSLBEG00000022250) 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25 ENSGT00940000164903.b ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a.b ENSGT00940000153704.B.d ENSGT00940000157439.a ENSGT00940000159091 #10 ENSGT00940000157981.a.b ENSGT00940000167564 ENSGT00940000159029 #14 ENSGT00940000161386 #15 ENSGT00940000161529 #16 ENSGT00940000161230 #17 ENSGT00940000165065.a ENSGT00940000158354.c.b #19 ENSGT00940000162072 #20 ENSGT00940000159774 #21 ENSGT00940000155029.c.b #22 ENSGT00940000166856 ENSGT00940000154152.a.b #27 ENSGT00950000182892.a.b.a.b.b ##28 ENSGT00390000008631.b ENSGT00390000004405.b #29 ENSGT00940000154534.b.a ##31 ENSGT00940000154957.A ENSGT00440000033742.a.b.d ENSGT00390000004832 ENSGT00940000156193 ENSGT00390000018512 ENSGT00940000153536.a.b.b.a.b ENSGT00940000158181.a ENSGT00550000075089 ENSGT01020000230389.a.a.a Climbing perch MODERN SPECIES 21 ENSATEG00000009928 ENSATEG00000028175 ENSATEG00000009789 ENSATEG00000009778 ube2z (ENSATEG00000009723) #10 atp5mc1 (ENSATEG00000030107) eve1 (ENSATEG00000009682) hoxb13a (ENSATEG00000009662) #14 hoxb9a 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15 ENSGT00940000159091 #10 ENSGT00940000157981.a.b ENSGT00940000167564 ENSGT00940000159029 #14 ENSGT00940000161386 #15 ENSGT00940000161529 #16 ENSGT00940000161230 #17 ENSGT00940000165065.a ENSGT00940000158354.c.b #19 ENSGT00940000162072 #20 ENSGT00940000159774 #21 ENSGT00940000155029.c.b #22 ENSGT00940000166856 ENSGT00940000154152.a.b #27 ENSGT00950000182892.a.b.a.b.b ##28 ENSGT00390000008631.b ENSGT00390000004405.b #29 ENSGT00940000154534.b.a ##31 ENSGT00940000154957.A ENSGT00940000164729.a.a.d ENSGT00440000033742.a.b.d ENSGT00390000004832 ENSGT00940000156193 ENSGT00390000018512 ENSGT00940000153536.a.b.b.a.b ENSGT00940000158181.a ENSGT00550000075089 Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 3120 ube2z (ENSSLDG00000012333) #10 atp5mc1 (ENSSLDG00000012315) eve1 (ENSSLDG00000012289) hoxb13a (ENSSLDG00000012270) #14 hoxb9a (ENSSLDG00000012259) #15 hoxb8a (ENSSLDG00000012246) #16 hoxb7a (ENSSLDG00000012232) #17 ENSSLDG00000012217 HOXB5 (ENSSLDG00000012209) #19 hoxb4a (ENSSLDG00000012189) #20 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(ENSEEEG00000003814) ENSEEEG00000003812 dnal4a (ENSEEEG00000003810) Channel catfish MODERN SPECIES 11 msl1l1 (ENSIPUG00000002657) nr1d1 (ENSIPUG00000002625) ENSIPUG00000002610 igf2bp1 (ENSIPUG00000002561) ube2z (ENSIPUG00000002542) #10 ATP5G2 (ENSIPUG00000002509) eve1 (ENSIPUG00000002492) hoxb13a (ENSIPUG00000002487) #14 hoxb9 (ENSIPUG00000002484) #15 hoxb8a (ENSIPUG00000002469) #16 hoxb7-a (ENSIPUG00000002446) #17 hoxb6a (ENSIPUG00000002440) #18 hoxb5a (ENSIPUG00000002437) #19 hoxb4 (ENSIPUG00000002433) #20 hoxb3a (ENSIPUG00000002427) #21 hoxb2 (ENSIPUG00000002425) #22 hoxb1a (ENSIPUG00000002421) cbx1a (ENSIPUG00000002405) #27 nfe2l1a (ENSIPUG00000002401) ##28 COPZ1 (ENSIPUG00000002355) #29 prr15la (ENSIPUG00000002338) ##31 ENSIPUG00000002327 ADSL (ENSIPUG00000002270) tmem150b (ENSIPUG00000002228) PDGFB (ENSIPUG00000002192) ENSIPUG00000002159 pvalb7 (ENSIPUG00000002145) ENSIPUG00000002119 ENSIPUG00000002113 ENSIPUG00000002107 dnal4a (ENSIPUG00000002099) Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 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