Vertebrata DUPLICATION Vertebrata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183185.c.a #22 Gnathostomata DUPLICATION Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES 1542 ENSGT00950000183185.c.a.b #22 ENSGT00610000086460 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 692 ENSGT00940000165336 ENSGT01030000235288 ENSGT00940000169341 ENSGT00950000183185.c.a.b #22 ENSGT00610000086460 Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 566 ENSGT00940000165336 ENSGT01030000235288 ENSGT00940000169341 ENSGT00950000183185.c.a.b #22 ENSGT00610000086460 Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00940000165336 ENSGT01030000235288 ENSGT00940000169341 ENSGT00950000183185.c.a.b #22 ENSGT00610000086460 ENSGT00960000189354 ENSGT00940000155748.a.a ##25 ENSGT00940000160822 ENSGT01050000244968.d ENSGT00940000158499 ENSGT00390000001491.b ENSGT00940000153195.B ENSGT00940000154537 ENSGT00390000016042 ENSGT00600000084626 ENSGT00940000170983 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156008 Amniota ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT01060000248556.A.b ENSGT00940000159449 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Fermt2 (MGP_CAROLIEiJ_G0019153) #33 Ddhd1 (MGP_CAROLIEiJ_G0019154) #34 MGP_CAROLIEiJ_G0019155 #35 Bmp4 (MGP_CAROLIEiJ_G0019156) #36 Cdkn3 (MGP_CAROLIEiJ_G0019157) #37 Mus_B ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000153181.z.g.b.a ENSGT00940000153181.z.g.b.b ENSGT00940000153912.A ENSGT01090000260051.b.a.a.b.b ENSGT00940000156033 ENSGT00940000159143 #7 ENSGT00940000155509 #8 ENSGT00390000015172 #9 ENSGT01050000244940.a.b #10 ENSGT00940000156754.a.b #11 ENSGT00940000159732 #17 ENSGT00940000159235 #18 ENSGT00940000161199 #19 ENSGT00940000162091 #20 ENSGT00940000161631 #21 ENSGT00950000183185.c.a.b #22 ENSGT00940000156653 #23 ENSGT00940000154368.k #24 ENSGT00940000155748.b #25 ENSGT01050000244902.b.c.b ##26 ENSGT01050000244902.b.c.a #26 ENSGT00390000006080 #27 ENSGT00940000153986.a #28 ENSGT00390000007753.b #29 ENSGT01020000230346.A #30 ENSGT00940000154859 #31 ENSGT00390000008666 #32 ENSGT00390000013444.a.a #33 ENSGT00940000156065 #34 ENSGT00860000135823 #35 ENSGT00940000159502 #36 Mus_C ANCESTRAL 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ENSGT00940000155748.b #25 Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 339 SH2D4B (ENSUPAG00010002361) #17 TSPAN14 (ENSUPAG00010002338) #18 PRXL2A (ENSUPAG00010002323) #19 ENSUPAG00010002313 #20 ENSUPAG00010002305 #21 MAT1A (ENSUPAG00010002295) #22 ENSUPAG00010002288 #23 ENSUPAG00010002281 #24 SFTPD (ENSUPAG00010002275) #25 ENSUPAG00010002270 Squirrel MODERN SPECIES 316 ENSSTOG00000022933 #11 SH2D4B (ENSSTOG00000003332) #17 TSPAN14 (ENSSTOG00000012873) #18 PRXL2A (ENSSTOG00000012864) #19 DYDC2 (ENSSTOG00000012860) #20 DYDC1 (ENSSTOG00000012858) #21 MAT1A (ENSSTOG00000007082) #22 ENSSTOG00000030982 #23 ENSSTOG00000022645 #24 SFTPD (ENSSTOG00000020181) #25 Alpin marmot MODERN SPECIES 66 WAPL (ENSMMMG00000011412) GRID1 (ENSMMMG00000011366) CCSER2 (ENSMMMG00000011155) RGR (ENSMMMG00000011130) LRIT1 (ENSMMMG00000011121) LRIT2 (ENSMMMG00000011116) #7 CDHR1 (ENSMMMG00000011089) #8 GPR15LG (ENSMMMG00000011077) #9 GHITM (ENSMMMG00000011060) #10 NRG3 (ENSMMMG00000010985) #11 SH2D4B (ENSMMMG00000010944) #17 TSPAN14 (ENSMMMG00000010918) #18 PRXL2A (ENSMMMG00000010895) #19 ENSMMMG00000010884 #20 DYDC1 (ENSMMMG00000010873) #21 MAT1A (ENSMMMG00000010849) #22 ENSMMMG00000010829 #23 ENSMMMG00000010822 #24 SFTPD (ENSMMMG00000010810) #25 ENSMMMG00000010806 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183185.c.a.b #22 Pika MODERN SPECIES 2177 SH2D4B (ENSOPRG00000003990) #17 TSPAN14 (ENSOPRG00000003969) #18 PRXL2A (ENSOPRG00000003958) #19 DYDC2 (ENSOPRG00000003938) #20 ENSOPRG00000018784 MAT1A (ENSOPRG00000003913) #22 HHEX (ENSOPRG00000003896) Tree shrew MODERN SPECIES 2500 DYDC1 (ENSTBEG00000015714) #21 MAT1A (ENSTBEG00000015565) #22 Primates ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00390000015768 ENSGT00940000155910 ENSGT00940000153912.A ENSGT01090000260051.b.a.a.b.b ENSGT00940000156033 ENSGT00940000159143 #7 ENSGT00940000155509 #8 ENSGT00390000015172 #9 ENSGT01050000244940.a.b #10 ENSGT00940000156754.a.b #11 ENSGT00940000159732 #17 ENSGT00940000159235 #18 ENSGT00940000161199 #19 ENSGT00940000162091 #20 ENSGT00940000161631 #21 ENSGT00950000183185.c.a.b #22 ENSGT00940000156653 #23 ENSGT00940000154368.k #24 ENSGT00940000155748.b #25 ENSGT00390000016042 ENSGT00390000017848 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156008 ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00390000000153.l.b.c.a ENSGT00930000151028 ENSGT00940000155303 ENSGT00940000154935 ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00390000014618.a Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000015768 ENSGT00940000155910 ENSGT00940000153912.A ENSGT01090000260051.b.a.a.b.b ENSGT00940000156033 ENSGT00940000159143 #7 ENSGT00940000155509 #8 ENSGT00390000015172 #9 ENSGT01050000244940.a.b #10 ENSGT00940000156754.a.b #11 ENSGT00940000159732 #17 ENSGT00940000159235 #18 ENSGT00940000161199 #19 ENSGT00940000162091 #20 ENSGT00940000161631 #21 ENSGT00950000183185.c.a.b #22 ENSGT00940000156653 #23 ENSGT00940000154368.k #24 ENSGT00940000155748.b #25 ENSGT00390000016042 ENSGT00390000017848 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156008 ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00390000000153.l.a.cb ENSGT00930000151028 ENSGT00940000155303 ENSGT00940000154935 ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00390000014618.a Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000155590 ENSGT00950000183079.B ENSGT00940000157528 ENSGT00940000157851 ENSGT00390000008798.d ENSGT00940000156635 ENSGT00940000158879 ENSGT00390000015361 ENSGT00530000063727.A ENSGT00390000014549 ENSGT00390000014309 ENSGT00390000013319 ENSGT00940000161044 ENSGT00940000162091 #20 ENSGT00940000161631 #21 ENSGT00950000183185.c.a.b #22 ENSGT00940000156653 #23 ENSGT00940000154368.k #24 ENSGT00940000155748.b #25 ENSGT00390000016042 ENSGT00390000017848 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156008 ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00390000000153.l.a.cb ENSGT00930000151028 ENSGT00940000155303 ENSGT00940000154935 ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00390000014618.a Mouse lemur MODERN SPECIES 6 MICU1 (ENSMICG00000004242) ENSMICG00000046862 MCU (ENSMICG00000007140) OIT3 (ENSMICG00000007147) 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ENSGT00940000161044 ENSGT00940000162091 #20 ENSGT00940000161631 #21 ENSGT00950000183185.c.a.b #22 ENSGT00940000156653 #23 ENSGT00940000154368.k #24 ENSGT00940000155748.b #25 ENSGT00390000016042 ENSGT00390000017848 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156008 ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00390000000153.l.a.cb ENSGT00930000151028 ENSGT00940000155303 ENSGT00940000154935 ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00390000014618.a Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 136 DYDC1 (ENSPSMG00000016025) #21 MAT1A (ENSPSMG00000016009) #22 ENSPSMG00000015968 #23 ENSPSMG00000015956 #24 SFTPD (ENSPSMG00000015948) #25 TMEM254 (ENSPSMG00000015934) PLAC9 (ENSPSMG00000015919) ANXA11 (ENSPSMG00000015896) ENSPSMG00000015841 ZCCHC24 (ENSPSMG00000015828) ENSPSMG00000015824 PPIF (ENSPSMG00000015817) ZMIZ1 (ENSPSMG00000015783) ENSPSMG00000015678 POLR3A (ENSPSMG00000015585) DLG5 (ENSPSMG00000015386) KCNMA1 (ENSPSMG00000011986) Coquerels sifaka MODERN SPECIES 928 MCU (ENSPCOG00000024537) OIT3 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ENSOGAG00000001886 #11 ENSOGAG00000028746 ENSOGAG00000026189 ENSOGAG00000033882 SH2D4B (ENSOGAG00000013668) #17 TSPAN14 (ENSOGAG00000000957) #18 PRXL2A (ENSOGAG00000013638) #19 DYDC2 (ENSOGAG00000004028) #20 DYDC1 (ENSOGAG00000004027) #21 MAT1A (ENSOGAG00000004025) #22 ENSOGAG00000004024 #24 SFTPD (ENSOGAG00000008476) #25 ENSOGAG00000025282 ENSOGAG00000010834 ENSOGAG00000013675 ENSOGAG00000028898 PLAC9 (ENSOGAG00000003029) ANXA11 (ENSOGAG00000003031) ZCCHC24 (ENSOGAG00000001904) PPIF (ENSOGAG00000003114) ZMIZ1 (ENSOGAG00000005655) ENSOGAG00000032884 RPS24 (ENSOGAG00000011005) POLR3A (ENSOGAG00000010995) ENSOGAG00000025837 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000015768 ENSGT00940000155910 ENSGT00940000153912.A ENSGT01090000260051.b.a.a.b.b ENSGT00940000156033 ENSGT00940000159143 #7 ENSGT00940000155509 #8 ENSGT00390000015172 #9 ENSGT01050000244940.a.b #10 ENSGT00940000156754.a.b #11 ENSGT00940000159732 #17 ENSGT00940000159235 #18 ENSGT00940000161199 #19 ENSGT00940000162091 #20 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Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000155910 ENSGT00940000153912.A ENSGT00390000016470.d ENSGT01090000260051.b.a.a.b.b ENSGT00940000156033 ENSGT00940000159143 #7 ENSGT00940000155509 #8 ENSGT00390000015172 #9 ENSGT01050000244940.a.b #10 ENSGT00940000156754.a.b #11 ENSGT00940000159732 #17 ENSGT00940000159235 #18 ENSGT00940000161199 #19 ENSGT00940000162091 #20 ENSGT00940000161631 #21 ENSGT00950000183185.c.a.b #22 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000017848 ENSGT00390000016042 ENSGT00390000015405.t ENSGT00940000155748.b #25 ENSGT00940000154368.k #24 ENSGT00940000156653 #23 ENSGT00390000008264 ENSGT00910000147265 ENSGT00940000156008 ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00390000000153.l.b.c.a ENSGT00930000151028 ENSGT00940000155303 ENSGT00940000154935 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 204 ENSGT00940000159732 #17 ENSGT00940000159235 #18 ENSGT00940000161199 #19 ENSGT00940000162091 #20 ENSGT00940000161631 #21 ENSGT00950000183185.c.a.b #22 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000017848 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ENSGT00390000014618.a Suina ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000015768 ENSGT00940000155910 ENSGT00940000153912.A ENSGT01090000260051.b.a.a.b.b ENSGT00940000156033 ENSGT00940000159143 #7 ENSGT00940000155509 #8 ENSGT00390000015172 #9 ENSGT01050000244940.a.b #10 ENSGT00940000156754.a.b #11 ENSGT00940000159732 #17 ENSGT00940000159235 #18 ENSGT00940000161199 #19 ENSGT00940000162091 #20 ENSGT00940000161631 #21 ENSGT00950000183185.c.a.b #22 ENSGT00940000156653 #23 ENSGT00940000154368.k #24 ENSGT00940000155748.b #25 ENSGT00390000016042 ENSGT00390000017848 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156008 ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b ENSGT00930000151028 ENSGT00940000155303 ENSGT00940000154935 ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00390000014618.a Chacoan peccary MODERN SPECIES 975 GRID1 (ENSCWAG00000015223) CCSER2 (ENSCWAG00000015355) RGR (ENSCWAG00000015482) LRIT1 (ENSCWAG00000015793) LRIT2 (ENSCWAG00000015831) #7 CDHR1 (ENSCWAG00000015860) #8 GPR15LG 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(ENSSSCG00000010341) #18 PRXL2A (ENSSSCG00000010340) #19 DYDC2 (ENSSSCG00000010339) #20 ENSSSCG00000045226 DYDC1 (ENSSSCG00000061214) #21 MAT1A (ENSSSCG00000010337) #22 SFTPA1 (ENSSSCG00000010336) #23 SFTPD (ENSSSCG00000010334) #25 MBL1 (ENSSSCG00000055445) #24 TMEM254 (ENSSSCG00000024300) PLAC9 (ENSSSCG00000010332) ANXA11 (ENSSSCG00000010331) ZCCHC24 (ENSSSCG00000033074) PPIF (ENSSSCG00000010330) ZMIZ1 (ENSSSCG00000010329) ENSSSCG00000039544 POLR3A (ENSSSCG00000010327) DLG5 (ENSSSCG00000026268) ENSSSCG00000048875 KCNMA1 (ENSSSCG00000010325) ENSSSCG00000043656 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000155910 ENSGT00940000153912.A ENSGT01090000260051.b.a.a.b.b ENSGT00940000156033 ENSGT00940000159143 #7 ENSGT00940000155509 #8 ENSGT00390000015172 #9 ENSGT01050000244940.a.b #10 ENSGT00940000156754.a.b #11 ENSGT00940000156754.a.a ##11 ENSGT00940000159732 #17 ENSGT00940000159235 #18 ENSGT00940000161199 #19 ENSGT00940000162091 #20 ENSGT00940000161631 #21 ENSGT00950000183185.c.a.b #22 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ENSGT00940000154935 ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00390000014618.a ENSGT00390000004409 Arabian camel MODERN SPECIES 2 RGR (ENSCDRG00005010360) LRIT1 (ENSCDRG00005010255) LRIT2 (ENSCDRG00005010151) #7 CDHR1 (ENSCDRG00005008037) #8 GPR15LG (ENSCDRG00005007900) #9 GHITM (ENSCDRG00005007844) #10 ENSCDRG00005007837 ENSCDRG00005007794 ENSCDRG00005007739 #11 ENSCDRG00005007698 SH2D4B (ENSCDRG00005007650) #17 ENSCDRG00005007349 #18 ENSCDRG00005007240 #19 ENSCDRG00005007182 #20 DYDC1 (ENSCDRG00005007116) #21 MAT1A (ENSCDRG00005007061) #22 ENSCDRG00005007005 #23 ENSCDRG00005006976 #24 SFTPD (ENSCDRG00005006926) #25 TMEM254 (ENSCDRG00005006878) ENSCDRG00005006822 ANXA11 (ENSCDRG00005006778) ZCCHC24 (ENSCDRG00005006751) PPIF (ENSCDRG00005006732) RPS24 (ENSCDRG00005022258) ENSCDRG00005022257 ENSCDRG00005022255 DLG5 (ENSCDRG00005022253) KCNMA1 (ENSCDRG00005019550) LRMDA (ENSCDRG00005018525) ZNF503 (ENSCDRG00005018488) Alpaca MODERN SPECIES 1120 MAT1A (ENSVPAG00000002966) #22 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000155910 ENSGT00940000153912.A ENSGT01090000260051.b.a.a.b.b ENSGT00940000156033 ENSGT00940000159143 #7 ENSGT00940000155509 #8 ENSGT00390000015172 #9 ENSGT01050000244940.a.b #10 ENSGT00940000156754.a.b #11 ENSGT00940000156754.a.a ##11 ENSGT00940000159732 #17 ENSGT00940000159235 #18 ENSGT00940000161199 #19 ENSGT00940000162091 #20 ENSGT00940000161631 #21 ENSGT00950000183185.c.a.b #22 ENSGT00940000156653 #23 ENSGT00940000154368.k #24 ENSGT00940000155748.b #25 ENSGT00390000016042 ENSGT00390000017848 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156008 ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b ENSGT00930000151028 ENSGT00940000155303 ENSGT00940000154935 ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00390000014618.a Pecora ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000155910 ENSGT00940000153912.A.e.a ENSGT01090000260051.b.a.a.b.b ENSGT00940000156033 ENSGT00940000159143 #7 ENSGT00940000155509 #8 ENSGT00390000015172 #9 ENSGT01050000244940.a.b #10 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#17 TSPAN14 (ENSBBBG00000016354) #18 PRXL2A (ENSBBBG00000016221) #19 DYDC2 (ENSBBBG00000004021) #20 DYDC1 (ENSBBBG00000004016) #21 MAT1A (ENSBBBG00000016161) #22 ENSBBBG00000016144 #23 ENSBBBG00000016126 #24 ENSBBBG00000016117 #25 ENSBBBG00000016103 #25 ENSBBBG00000003996 #25 ENSBBBG00000016073 #25 ENSBBBG00000016044 #25 ENSBBBG00000002568 TMEM254 (ENSBBBG00000016012) PLAC9 (ENSBBBG00000015987) ANXA11 (ENSBBBG00000003980) ZCCHC24 (ENSBBBG00000015927) PPIF (ENSBBBG00000015913) ZMIZ1 (ENSBBBG00000015897) RPS24 (ENSBBBG00000015864) Bos ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00530000064550.B ENSGT00940000155910 ENSGT00940000153912.A.e.a ENSGT01090000260051.b.a.a.b.b ENSGT00940000156033 ENSGT00940000159143 #7 ENSGT00940000155509 #8 ENSGT00390000015172 #9 ENSGT01050000244940.a.b #10 ENSGT00940000156754.a.b #11 ENSGT00940000159732 #17 ENSGT00940000159235 #18 ENSGT00940000161199 #19 ENSGT00940000162091 #20 ENSGT00940000161631 #21 ENSGT00950000183185.c.a.b #22 ENSGT00940000156653 #23 ENSGT00940000154368.k 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ENSGT00390000017848 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156008 ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b ENSGT00930000151028 Cow MODERN SPECIES 20 CCSER2 (ENSBTAG00000017611) RGR (ENSBTAG00000015681) LRIT1 (ENSBTAG00000003442) LRIT2 (ENSBTAG00000023987) #7 CDHR1 (ENSBTAG00000001231) #8 GPR15LG (ENSBTAG00000050197) #9 GHITM (ENSBTAG00000032829) #10 ENSBTAG00000052588 ENSBTAG00000051629 NRG3 (ENSBTAG00000009587) #11 SH2D4B (ENSBTAG00000003910) #17 TSPAN14 (ENSBTAG00000003907) #18 PRXL2A (ENSBTAG00000021416) #19 DYDC2 (ENSBTAG00000032862) #20 DYDC1 (ENSBTAG00000032858) #21 MAT1A (ENSBTAG00000005963) #22 SFTPA1 (ENSBTAG00000023032) #23 MBL1 (ENSBTAG00000054761) #24 SFTPD (ENSBTAG00000046421) #25 ENSBTAG00000048082 #25 CL43 (ENSBTAG00000054756) #25 ENSBTAG00000052810 #25 CL46 (ENSBTAG00000006536) #25 CGN1 (ENSBTAG00000047317) #25 TMEM254 (ENSBTAG00000001656) PLAC9 (ENSBTAG00000020939) ANXA11 (ENSBTAG00000020940) ZCCHC24 (ENSBTAG00000003877) PPIF (ENSBTAG00000016711) ZMIZ1 (ENSBTAG00000019313) RPS24 (ENSBTAG00000013264) Bos_a ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00390000015768 ENSGT00940000155910 ENSGT00940000153912.A.e.a ENSGT01090000260051.b.a.a.b.b ENSGT00940000156033 ENSGT00940000159143 #7 ENSGT00940000155509 #8 ENSGT00390000015172 #9 ENSGT01050000244940.a.b #10 ENSGT00940000156754.a.b #11 ENSGT00940000159732 #17 ENSGT00940000159235 #18 ENSGT00940000161199 #19 ENSGT00940000162091 #20 ENSGT00940000161631 #21 ENSGT00950000183185.c.a.b #22 ENSGT00940000156653 #23 ENSGT00940000154368.k #24 ENSGT00940000155748.b.g #25 ENSGT00940000155748.b.h.a.b.a #25 ENSGT00390000016042 ENSGT00390000017848 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156008 ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b ENSGT00930000151028 ENSGT00940000155303 ENSGT00940000154935 ENSGT00940000153289.a.a.a Wild yak MODERN SPECIES 2369 MAT1A (ENSBMUG00000019068) #22 ENSBMUG00000019031 #23 ENSBMUG00000019009 #24 ENSBMUG00000018989 #25 Domestic yak MODERN 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MODERN SPECIES 273 ENSMPUG00000003501 #11 ENSMPUG00000018426 ENSMPUG00000003508 ##11 ENSMPUG00000018427 SH2D4B (ENSMPUG00000003514) #17 TSPAN14 (ENSMPUG00000003537) #18 PRXL2A (ENSMPUG00000003544) #19 DYDC2 (ENSMPUG00000003553) #20 DYDC1 (ENSMPUG00000003562) #21 MAT1A (ENSMPUG00000003570) #22 ENSMPUG00000003575 #23 ENSMPUG00000003579 #24 SFTPD (ENSMPUG00000003586) #25 ENSMPUG00000003600 TMEM254 (ENSMPUG00000003613) PLAC9 (ENSMPUG00000003622) ANXA11 (ENSMPUG00000003637) ENSMPUG00000003646 ZCCHC24 (ENSMPUG00000003650) PPIF (ENSMPUG00000003652) ZMIZ1 (ENSMPUG00000003659) ENSMPUG00000003772 ENSMPUG00000003778 POLR3A (ENSMPUG00000003790) DLG5 (ENSMPUG00000003812) American mink MODERN SPECIES 11 ZNF641 (ENSNVIG00000002592) NRG3 (ENSNVIG00000002639) #11 SH2D4B (ENSNVIG00000002706) #17 TSPAN14 (ENSNVIG00000002720) #18 PRXL2A (ENSNVIG00000002853) #19 DYDC2 (ENSNVIG00000002926) #20 DYDC1 (ENSNVIG00000002971) #21 MAT1A (ENSNVIG00000003011) #22 ENSNVIG00000003026 #23 ENSNVIG00000003058 #24 SFTPD 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DYDC1 (ENSPVAG00000008955) #21 MAT1A (ENSPVAG00000008954) #22 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000015768 ENSGT00940000155910 ENSGT00940000153912.A ENSGT01090000260051.b.a.a.b.b ENSGT00940000156033 ENSGT00940000159143 #7 ENSGT00940000155509 #8 ENSGT00390000015172 #9 ENSGT01050000244940.a.b #10 ENSGT00940000156754.a.b #11 ENSGT00940000159732 #17 ENSGT00940000159235 #18 ENSGT00940000161199 #19 ENSGT00940000162091 #20 ENSGT00940000161631 #21 ENSGT00950000183185.c.a.b #22 ENSGT00940000156653 #23 ENSGT00940000154368.k #24 ENSGT00940000155748.b #25 ENSGT00390000016042 ENSGT00390000017848 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156008 ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b ENSGT00930000151028 ENSGT00940000155303 ENSGT00940000154935 ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00390000014618.a Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 7 CCSER2 (ENSRFEG00010020289) RGR (ENSRFEG00010020222) LRIT1 (ENSRFEG00010020185) LRIT2 (ENSRFEG00010020160) #7 CDHR1 (ENSRFEG00010020126) 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ENSMLUG00000027676 #25 ENSMLUG00000029822 #24 ENSMLUG00000027766 #25 ENSMLUG00000023584 #25 TMEM254 (ENSMLUG00000007585) PLAC9 (ENSMLUG00000007594) ENSMLUG00000007600 ENSMLUG00000023177 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 164 ENSGT00940000156754.a.b #11 ENSGT00940000159732 #17 ENSGT00940000159235 #18 ENSGT00940000161199 #19 ENSGT00940000162091 #20 ENSGT00940000161631 #21 ENSGT00950000183185.c.a.b #22 ENSGT00940000156653 #23 ENSGT00940000154368.k #24 ENSGT00940000155748.b #25 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES 890 ENSGT00940000162091 #20 ENSGT00940000161631 #21 ENSGT00950000183185.c.a.b #22 ENSGT00940000156653 #23 ENSGT00940000154368.k #24 ENSGT00940000155748.b #25 Sloth MODERN SPECIES 4102 ENSCHOG00000008728 #22 Armadillo MODERN SPECIES 2424 DYDC2 (ENSDNOG00000042509) #20 DYDC1 (ENSDNOG00000016410) #21 MAT1A (ENSDNOG00000003326) #22 ENSDNOG00000004771 #23 ENSDNOG00000036947 #24 SFTPD (ENSDNOG00000005030) #25 ENSDNOG00000034049 ENSDNOG00000037754 ENSDNOG00000039258 ENSDNOG00000038646 ENSDNOG00000037235 ENSDNOG00000033746 ENSDNOG00000031432 ENSDNOG00000038438 ENSDNOG00000041460 ENSDNOG00000031713 ENSDNOG00000041218 ENSDNOG00000046498 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 133 ENSGT00940000154877.C ENSGT01100000263502.B.a.a ENSGT00390000015768 ENSGT00940000155910 ENSGT00940000153912.A ENSGT01090000260051.b.a.a.b.b ENSGT00940000156033 ENSGT00940000155509 #8 ENSGT01050000244940.a.b #10 ENSGT00940000156754.a.b #11 ENSGT00940000159732 #17 ENSGT00940000159235 #18 ENSGT00940000161199 #19 ENSGT00940000162091 #20 ENSGT00940000161631 #21 ENSGT00950000183185.c.a.b #22 ENSGT00940000156653 #23 ENSGT00940000154368.k #24 ENSGT00940000155748.b #25 ENSGT00940000160822 ENSGT01050000244968.d ENSGT00940000158499 ENSGT00940000153195.B Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 136 ENSGT00940000154877.C ENSGT01100000263502.B.a.a ENSGT00390000015768 ENSGT00940000155910 ENSGT00940000153912.A ENSGT01090000260051.b.a.a.b.b ENSGT00940000156033 ENSGT00940000155509 #8 ENSGT01050000244940.a.b #10 ENSGT00940000156754.a.b #11 ENSGT00940000159732 #17 ENSGT00940000159235 #18 ENSGT00940000161199 #19 ENSGT00940000162091 #20 ENSGT00940000161631 #21 ENSGT00950000183185.c.a.b #22 ENSGT00940000156653 #23 ENSGT00940000154368.k #24 ENSGT00940000155748.b #25 ENSGT00940000160822 ENSGT01050000244968.d ENSGT00940000158499 ENSGT00940000153195.B Elephant MODERN SPECIES 491 OPN4 (ENSLAFG00000006004) ENSLAFG00000011624 ENSLAFG00000023317 WAPL (ENSLAFG00000005848) ENSLAFG00000008310 CCSER2 (ENSLAFG00000011324) RGR (ENSLAFG00000014674) LRIT1 (ENSLAFG00000028695) CDHR1 (ENSLAFG00000014034) #8 GHITM (ENSLAFG00000009646) #10 ENSLAFG00000026283 #11 SH2D4B (ENSLAFG00000006817) #17 TSPAN14 (ENSLAFG00000016406) #18 PRXL2A (ENSLAFG00000004468) #19 DYDC1 (ENSLAFG00000018605) #21 MAT1A (ENSLAFG00000005500) #22 ENSLAFG00000002080 #23 SFTPD (ENSLAFG00000002081) #25 ZNF248 (ENSLAFG00000003918) RASGEF1A (ENSLAFG00000017602) CSGALNACT2 (ENSLAFG00000016017) RET (ENSLAFG00000017479) BMS1 (ENSLAFG00000006250) Hyrax MODERN SPECIES 3763 MAT1A (ENSPCAG00000001351) #22 Tenrec MODERN SPECIES 4491 ENSETEG00000016713 #22 Marsupialia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183129.b.b ENSGT00940000154201.a.b ENSGT00390000008107.c.b ENSGT00940000163538 ENSGT00940000156033 ENSGT00940000159143 #7 ENSGT00940000155509 #8 ENSGT01050000244940.a.b #10 ENSGT00940000156754.a.b #11 ENSGT00940000159732 #17 ENSGT00390000014293.b ENSGT00940000159235 #18 ENSGT00940000164872 ENSGT00940000162091 #20 ENSGT00940000161631 #21 ENSGT00950000183185.c.a.b #22 ENSGT00960000189354 ENSGT00940000156653.r #23 ENSGT00940000156653.s #23 ENSGT00940000154368 #24 ENSGT00940000155748.b.a #25 ENSGT00940000155748.b.b.a #25 ENSGT00940000155748.b.b.b #25 ENSGT00940000160822 ENSGT01050000244968.d ENSGT00940000158499 ENSGT00390000001491.b ENSGT00940000153195.B ENSGT00940000154537 ENSGT00390000016042 ENSGT00600000084626 Opossum MODERN SPECIES CELF6 (ENSMODG00000001784) HEXA (ENSMODG00000001771) ENSMODG00000025724 LRIT1 (ENSMODG00000001729) LRIT2 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ENSMGAG00000000989 ENSMGAG00000021831 ENSMGAG00000001006 #22 ENSMGAG00000022176 ENSMGAG00000001032 #23 ENSMGAG00000001038 #23 ENSMGAG00000022331 ENSMGAG00000001047 #24 RASGEF1A (ENSMGAG00000001069) CSGALNACT2 (ENSMGAG00000001117) RET (ENSMGAG00000001124) BMS1 (ENSMGAG00000001170) ENSMGAG00000020801 ENSMGAG00000001360 ENSMGAG00000001306 ENSMGAG00000001327 ENSMGAG00000001343 ENSMGAG00000001413 Neognathae_b ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT01060000248556.A.b ENSGT00940000159449 ENSGT01090000260051.b.a.a.b.b ENSGT00940000156033 ENSGT00940000159143 #7 ENSGT00940000155509 #8 ENSGT01050000244940.a.b #10 ENSGT00940000156754.a.b #11 ENSGT00940000159732 #17 ENSGT00390000014293.b ENSGT00940000159235 #18 ENSGT00940000165336 ENSGT01030000235288 ENSGT00940000153596.A ENSGT00940000167117 ENSGT00950000183185.c.a.b #22 ENSGT00610000086460 ENSGT00960000189354 ENSGT00940000156653 #23 ENSGT00940000154368 #24 ENSGT00940000160822 ENSGT01050000244968.d ENSGT00940000158499 ENSGT00940000153195.B ENSGT00940000154537 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ENSGT00940000156033 ENSGT00940000159143 #7 ENSGT00940000155509 #8 ENSGT01050000244940.a.b #10 ENSGT00940000156754.a.b #11 ENSGT00940000159732 #17 ENSGT00390000014293.b ENSGT00940000159235 #18 ENSGT00940000164872 ENSGT00940000153596.A ENSGT00940000161631 #21 ENSGT00950000183185.c.a.b #22 ENSGT00940000156653.gb.a #23 ENSGT00940000155748.b.m.a.b #25 ENSGT00940000156653.gb.b #23 ENSGT00940000156653.hb #23 ENSGT00940000154368 #24 ENSGT00940000155748.a.b.b.c ##25 ENSGT00940000155748.b.m.a.a #25 Three-toed box turtle MODERN SPECIES 69 CHAT (ENSTMTG00000005649) SLC18A3 (ENSTMTG00000005688) RGR (ENSTMTG00000005697) LRIT1 (ENSTMTG00000005725) LRIT2 (ENSTMTG00000005739) #7 CDHR1 (ENSTMTG00000005755) #8 GHITM (ENSTMTG00000005818) #10 ENSTMTG00000005847 #11 ENSTMTG00000005875 #11 SH2D4B (ENSTMTG00000005893) #17 ENSTMTG00000005940 TSPAN14 (ENSTMTG00000005985) #18 ENSTMTG00000006030 EXOSC3 (ENSTMTG00000006073) DYDC1 (ENSTMTG00000006084) #21 MAT1A (ENSTMTG00000006108) #22 ENSTMTG00000006141 painted turtle MODERN SPECIES 737 SH2D4B (ENSCPBG00000007211) #17 ENSCPBG00000007232 TSPAN14 (ENSCPBG00000007280) #18 ENSCPBG00000007294 EXOSC3 (ENSCPBG00000007299) DYDC1 (ENSCPBG00000007302) #21 MAT1A (ENSCPBG00000007310) #22 ENSCPBG00000007317 #23 ENSCPBG00000007321 ENSCPBG00000007325 #23 ENSCPBG00000007332 #23 MBL2 (ENSCPBG00000007336) #24 ENSCPBG00000007342 ##25 ENSCPBG00000007345 #25 ENSCPBG00000007374 ##25 ENSCPBG00000007378 #25 ENSCPBG00000007387 ##25 ENSCPBG00000007410 ENSCPBG00000007413 WAPL (ENSCPBG00000007425) OPN4 (ENSCPBG00000007440) LDB3 (ENSCPBG00000007467) Chinese turtle MODERN SPECIES 1594 ENSPSIG00000017114 TSPAN14 (ENSPSIG00000017693) #18 ENSPSIG00000005379 EXOSC3 (ENSPSIG00000005839) ENSPSIG00000005911 #21 ENSPSIG00000006309 #21 ENSPSIG00000006670 #22 ENSPSIG00000008724 #23 ENSPSIG00000009077 #23 ENSPSIG00000010989 #24 ENSPSIG00000011765 #25 ENSPSIG00000001744 RASGEF1A (ENSPSIG00000015297) CSGALNACT2 (ENSPSIG00000016845) Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000156033 ENSGT00940000159143 #7 ENSGT00940000155509 #8 ENSGT01050000244940.a.b #10 ENSGT00940000156754.a.b #11 ENSGT00940000156754.a.a ##11 ENSGT00940000159732 #17 ENSGT00390000014293.b ENSGT00940000159235 #18 ENSGT00940000164872 ENSGT00940000165336 ENSGT01030000235288 ENSGT00940000153596.A ENSGT00940000167117 ENSGT00940000161631 #21 ENSGT00950000183185.c.a.b #22 ENSGT00960000189354 ENSGT00940000156653 #23 ENSGT00940000154368 #24 ENSGT00940000155748.a.b.b ##25 ENSGT00940000155748.a.b.a ##25 ENSGT00940000155748.b #25 ENSGT00940000160822 ENSGT01050000244968.d ENSGT00940000158499 ENSGT00960000189939 ENSGT00390000001491.b ENSGT00940000153195.B ENSGT00390000016042 ENSGT00600000084626 ENSGT00940000170983 Episquamata ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000156033 ENSGT00940000159143 #7 ENSGT00940000155509 #8 ENSGT01050000244940.a.b #10 ENSGT00940000156754.a.b #11 ENSGT00940000156754.a.a ##11 ENSGT00940000159732 #17 ENSGT00390000014293.b ENSGT00940000159235 #18 ENSGT00940000164872 ENSGT00940000165336 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(ENSSPUG00000009553) #22 ENSSPUG00000009305 #23 ENSSPUG00000009222 #25 Anura ANCESTRAL SPECIES 47 ENSGT00940000169341 ENSGT00950000183185.c.a.b #22 ENSGT00610000086460 ENSGT00960000189354 ENSGT00940000154368 #24 ENSGT00940000155748.b #25 ENSGT00940000155748.a.a ##25 ENSGT00940000160822 ENSGT01050000244968.d ENSGT00940000158499 ENSGT00390000001491.b ENSGT00940000153195.B ENSGT00940000154537 ENSGT00390000016042 ENSGT00600000084626 ENSGT00940000170983 ENSGT00940000156914 Frog MODERN SPECIES 7 rgr (ENSXETG00000005627) lrit1 (ENSXETG00000033939) lrit2 (ENSXETG00000005631) #7 cdhr1 (ENSXETG00000005632) #8 ghitm (ENSXETG00000005634) #10 ENSXETG00000044895 ENSXETG00000036648 nrg3 (ENSXETG00000005637) #11 ENSXETG00000042886 ENSXETG00000043719 sh2d4b (ENSXETG00000041176) #17 tspan14 (ENSXETG00000003514) #18 ENSXETG00000032747 prxl2a (ENSXETG00000003529) ENSXETG00000046080 mat1a (ENSXETG00000003530) #22 ENSXETG00000048688 ENSXETG00000040943 dydc1 (ENSXETG00000003539) ENSXETG00000044929 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(ENSLOCG00000012693) trim8a (ENSLOCG00000012685) sufu (ENSLOCG00000012672) ACTR1A (ENSLOCG00000012666) mfsd13a (ENSLOCG00000012657) ENSLOCG00000018257 ENSLOCG00000012649 SEMA4G (ENSLOCG00000012636) mrpl43 (ENSLOCG00000012629) twnk (ENSLOCG00000012623) LZTS2 (ENSLOCG00000012615) pdzd7a (ENSLOCG00000012602) sfxn3 (ENSLOCG00000012590) selenou1a (ENSLOCG00000012586) ENSLOCG00000012581 #21 mat1a (ENSLOCG00000012578) #22 ENSLOCG00000012561 sec24c (ENSLOCG00000012547) SYNPO2L (ENSLOCG00000012538) myoz1b (ENSLOCG00000012530) USP54 (ENSLOCG00000012516) ENSLOCG00000012513 opn4a (ENSLOCG00000012496) ldb3a (ENSLOCG00000012484) bmpr1aa (ENSLOCG00000012466) mmrn2a (ENSLOCG00000012455) sncgb (ENSLOCG00000012448) glud1a (ENSLOCG00000012436) shld2 (ENSLOCG00000012430) nfkb2 (ENSLOCG00000012413) PSD (ENSLOCG00000012400) Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 108 ENSGT00940000160317 ENSGT00940000157186.c ENSGT00390000015375 ENSGT00390000004495 ENSGT00940000154078.a.a.a ENSGT00950000183002.C.c.b ENSGT00980000198953 ENSGT00940000157186.d ENSGT00940000154078.a.a.b ENSGT00950000183002.C.c.a ENSGT01030000234641.b.a.b.a.a ENSGT00940000164872 ENSGT00940000165336.a ENSGT01030000235288 ENSGT00940000169341 ENSGT00950000183185.c.a.b #22 ENSGT01030000234578.A.b.a.a.a Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000155737.a.a ENSGT00940000161868 ENSGT00940000157919.b ENSGT00940000160317 ENSGT00940000157186.c ENSGT00390000015375 ENSGT00390000004495 ENSGT00940000154078.a.a.a ENSGT00950000183002.B.b ENSGT00950000183002.C.c.a ENSGT01030000234641.b.a.b.a.a ENSGT00940000164872 ENSGT00940000165336.a ENSGT01030000235288 ENSGT00940000169341 ENSGT00950000183185.c.a.b #22 ENSGT01030000234578.A.b.a.a.a ENSGT01050000244965.a.a ENSGT00940000155061.a.b.k.b ENSGT00940000164992.h ENSGT00390000000854.c.a ENSGT00950000183175.A.d ENSGT00940000156225 ENSGT00940000154877.C ENSGT01100000263502.B.a.a.d.b ENSGT00940000155571.B ENSGT00950000183027.a.b.c.b ENSGT00950000183054.b.c ENSGT00950000182924.A.b.a.a.i ENSGT00940000156481.a.a.a.a ENSGT00390000014331 P. kingsleyae MODERN SPECIES 18 ENSPKIG00000012715 SEMA4G (ENSPKIG00000012691) mrpl43 (ENSPKIG00000012675) twnk (ENSPKIG00000012661) LZTS2 (ENSPKIG00000012642) ENSPKIG00000012602 ENSPKIG00000012584 sfxn3 (ENSPKIG00000012573) ENSPKIG00000012539 ENSPKIG00000012507 ENSPKIG00000012481 SMG9 (ENSPKIG00000012446) ENSPKIG00000012422 ENSPKIG00000012405 ENSPKIG00000012389 mat1a (ENSPKIG00000012357) #22 zgc:154058 (ENSPKIG00000012318) zgc:92749 (ENSPKIG00000012292) ENSPKIG00000012233 nfkb2 (ENSPKIG00000012183) ENSPKIG00000012160 ENSPKIG00000012133 glud1b (ENSPKIG00000012074) sncgb (ENSPKIG00000011985) bmpr1ab (ENSPKIG00000011886) ldb3b (ENSPKIG00000011805) opn4a (ENSPKIG00000011684) USP54 (ENSPKIG00000011549) myoz1b (ENSPKIG00000011516) SYNPO2L (ENSPKIG00000011504) sec24c (ENSPKIG00000011306) Asian bonytongue MODERN SPECIES 18 cyth1b (ENSSFOG00015003796) USP36 (ENSSFOG00015025331) lgals3bp.1 (ENSSFOG00015025035) TIMP2 (ENSSFOG00015029701) sfxn2 (ENSSFOG00015003684) trim8b (ENSSFOG00015003680) mfsd13a (ENSSFOG00015032875) SEMA4G (ENSSFOG00015003617) mrpl43 (ENSSFOG00015003599) twnk (ENSSFOG00015003556) LZTS2 (ENSSFOG00015025590) pdzd7a (ENSSFOG00015003434) sfxn3 (ENSSFOG00015030404) ENSSFOG00015003363 ENSSFOG00015003358 mat1a (ENSSFOG00015003290) #22 zgc:154058 (ENSSFOG00015024448) ENSSFOG00015029757 ENSSFOG00015029808 ENSSFOG00015027197 ENSSFOG00015004436 zgc:92749 (ENSSFOG00015030277) ENSSFOG00015004390 nfkb2 (ENSSFOG00015004286) ENSSFOG00015033355 glud1b (ENSSFOG00015032044) sncgb (ENSSFOG00015027622) bmpr1ab (ENSSFOG00015004151) ldb3b (ENSSFOG00015004137) OPN4 (ENSSFOG00015004095) USP54 (ENSSFOG00015003996) Clupeocephala DUPLICATION Clupeocephala DUPLICATION Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 59 ENSGT00940000157186.c ENSGT00390000015375 ENSGT00390000004495 ENSGT00940000154078.a.a.a ENSGT00950000183002.C.c.b ENSGT01090000261060 ENSGT00940000157186.d ENSGT00940000154078.a.a.b ENSGT00950000183002.C.c.a ENSGT00980000198953 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ENSGT01030000234641.b.a.b.a.a ENSGT00940000165336.b ENSGT00940000173380 ENSGT00940000164872.a ENSGT00950000183185.c.a.b.a.a #22 ENSGT01030000234578.A.b.a.a.a.a.b ENSGT01100000263516.a.b.b.b.a.a.a.b.b.a.a ENSGT00940000154395.a.a.a.b ENSGT00950000183169.C ENSGT00520000055589.c ENSGT00530000063672.a ENSGT00940000166680 ENSGT01030000234578.A.b.a.b ENSGT00940000166192 ENSGT00940000158935 ENSGT00940000157520 ENSGT00940000156111 ENSGT00940000158282 ENSGT00940000155716 ENSGT00940000153997.b.b Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 511 he1.2 (ENSHCOG00000003565) ENSHCOG00000003570 MARK1 (ENSHCOG00000003592) tppp3 (ENSHCOG00000003606) EFEMP1 (ENSHCOG00000000106) XPO5 (ENSHCOG00000003642) ENSHCOG00000003647 tp53bp2a (ENSHCOG00000003723) SEMA4G (ENSHCOG00000003742) lzts2a (ENSHCOG00000003752) sfxn3 (ENSHCOG00000003775) sfxn3 (ENSHCOG00000003811) ENSHCOG00000003824 ENSHCOG00000003834 ENSHCOG00000003863 mat1a (ENSHCOG00000003901) #22 zgc:154058 (ENSHCOG00000003915) ENSHCOG00000004013 si:ch211-198a12.6 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ENSGT00940000157837.c ENSGT00940000173563 ENSGT00940000153408.A ENSGT00950000185388 ENSGT00940000153463.b.a ENSGT00940000157186.d ENSGT00940000154078.a.a.b ENSGT00950000183002.C.c.a ENSGT00940000177134 ENSGT01030000234641.b.a.b.a.a ENSGT00940000165336.b ENSGT00940000173380 ENSGT00940000164872.b ENSGT00950000183185.c.a.b.a.a #22 ENSGT01030000234578.A.b.a.a.a.a.b ENSGT01100000263516.a.b.b.b.a.a.a.b.b.a.a.k ENSGT00950000183169.C ENSGT00520000055589.c ENSGT00530000063672.a ENSGT00940000166680 ENSGT01030000234578.A.b.a.b ENSGT00940000166192 ENSGT00940000158935 ENSGT00940000157520 ENSGT00940000156111 ENSGT00940000158282 ENSGT00940000155716 ENSGT00940000153997.b.b ENSGT00530000064017.a Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000154741.c ENSGT00510000047961.d ENSGT00940000164645.a ENSGT00940000157560.d.b ENSGT00940000157837.c ENSGT00940000153408.A ENSGT00950000185388 ENSGT00940000153463.b.a ENSGT00940000157186.d ENSGT00940000154078.a.a.b ENSGT00950000183002.C.c.a ENSGT00940000177134 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ENSGT00940000166680 ENSGT01030000234578.A.b.a.b ENSGT00940000166192 ENSGT00940000158935 ENSGT00940000157520 ENSGT00940000156111 ENSGT00940000158282 ENSGT00940000155716 ENSGT00940000153997.b.b ENSGT00530000064017.a Mangrove rivulus MODERN SPECIES 3 ENSKMAG00000003576 cfap36 (ENSKMAG00000003627) ppp4r3b (ENSKMAG00000003648) MYOF (ENSKMAG00000003674) lgi1a (ENSKMAG00000003817) MARK1 (ENSKMAG00000003869) EFEMP1 (ENSKMAG00000003944) ENSKMAG00000003966 XPO5 (ENSKMAG00000004007) tp53bp2a (ENSKMAG00000004076) SEMA4G (ENSKMAG00000004117) lzts2a (ENSKMAG00000004143) pdzd7a (ENSKMAG00000004152) sfxn3 (ENSKMAG00000004212) selenou1a (ENSKMAG00000004253) mat1a (ENSKMAG00000004294) #22 zgc:154058 (ENSKMAG00000004343) ENSKMAG00000004349 si:ch211-198a12.6 (ENSKMAG00000004363) stox1 (ENSKMAG00000004372) ccar1 (ENSKMAG00000004397) zgc:110319 (ENSKMAG00000004521) si:dkey-228d14.5 (ENSKMAG00000004541) eif4e1c (ENSKMAG00000004557) TET1 (ENSKMAG00000004567) slc25a16 (ENSKMAG00000004595) alox5a 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ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000175836 ENSGT00940000157825.b ENSGT00940000164645.a ENSGT00940000157560.d.b ENSGT00940000157837.c ENSGT00940000173563 ENSGT00940000153408.A ENSGT00940000153463.b.a ENSGT00940000157186.d ENSGT00940000154078.a.a.b ENSGT00940000177134 ENSGT00950000183002.C.c.a ENSGT01030000234641.b.a.b.a.a ENSGT00940000173380 ENSGT00940000164872.a ENSGT00950000183185.c.a.b.a.a #22 ENSGT01030000234578.A.b.a.a.a.a.b ENSGT01100000263516.a.b.b.b.a.a.a.b.b.a.a.k ENSGT00950000183169.C ENSGT00520000055589.c ENSGT00530000063672.a ENSGT00940000166680 ENSGT01030000234578.A.b.a.b ENSGT00940000166192 ENSGT00940000158935 ENSGT00940000157520 ENSGT00940000156111 ENSGT00940000158282 ENSGT00940000155716 ENSGT00940000153997.b.b ENSGT00530000064017.a European seabass MODERN SPECIES 1 ENSDLAG00005002765 ENSDLAG00005001029 ENSDLAG00005000930 ENSDLAG00005000614 ENSDLAG00005000508 ENSDLAG00005032825 ENSDLAG00005000445 ENSDLAG00005000395 SEMA4G (ENSDLAG00005000377) lzts2a (ENSDLAG00005000375) 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(ENSOMYG00000020555) #22 ENSOMYG00000073435 zgc:154058 (ENSOMYG00000054275) ENSOMYG00000020494 ENSOMYG00000020460 ENSOMYG00000061066 stox1 (ENSOMYG00000020454) ccar1 (ENSOMYG00000020444) si:dkey-228d14.5 (ENSOMYG00000020436) eif4e1c (ENSOMYG00000020415) ENSOMYG00000056261 ENSOMYG00000020405 ENSOMYG00000040064 slc25a16 (ENSOMYG00000020384) alox5a (ENSOMYG00000020325) marchf8 (ENSOMYG00000020278) Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000160608.e ENSGT00390000000134.a.d.b.a.b.a ENSGT00390000013726.c ENSGT00940000157042.c.a.x ENSGT00940000161036.B.a.c ENSGT00940000164861 ENSGT00390000007125.a.c.b ENSGT00940000159115.d ENSGT00940000157186.d.c ENSGT00940000154078.a.a.b.g ENSGT00950000183002.C.c.a ENSGT01030000234641.b.a.b.a.a.h.a ENSGT00940000165336.b ENSGT00940000173380 ENSGT00940000164872.a ENSGT00950000183185.c.a.b.a.a.a #22 ENSGT01030000234578.A.b.a.a.a.a.b.a.a ENSGT00940000154395.a.a.a.b ENSGT00950000183169.C.i ENSGT00520000055589.c.k ENSGT00530000063672.a.u ENSGT00940000166680.d ENSGT01030000234578.A.b.a.b.a ENSGT00940000166192.a ENSGT00940000158935.g.b ENSGT00940000157520.a ENSGT00940000156111.e ENSGT00940000158282.b ENSGT00940000155716.s ENSGT00940000153997.b.b.c.a ENSGT00940000156914.o.b.d Coho salmon MODERN SPECIES 2 sfrp5 (ENSOKIG00005002138) golga7ba (ENSOKIG00005002166) CRTAC1 (ENSOKIG00005002299) LOXL4 (ENSOKIG00005002470) zgc:123010 (ENSOKIG00005002515) pyroxd2 (ENSOKIG00005002542) ENSOKIG00005002606 SEMA4G (ENSOKIG00005002624) lzts2a (ENSOKIG00005002678) pdzd7a (ENSOKIG00005002692) ENSOKIG00005002716 sfxn3 (ENSOKIG00005002723) ENSOKIG00005002770 ENSOKIG00005002788 ENSOKIG00005002797 mat1a (ENSOKIG00005002839) #22 zgc:154058 (ENSOKIG00005003040) ENSOKIG00005003058 ENSOKIG00005003067 stox1 (ENSOKIG00005003080) ccar1 (ENSOKIG00005003127) si:dkey-228d14.5 (ENSOKIG00005003239) zgc:110319 (ENSOKIG00005003251) eif4e1c (ENSOKIG00005003254) ENSOKIG00005003256 slc25a16 (ENSOKIG00005003259) alox5a (ENSOKIG00005003273) marchf8 (ENSOKIG00005003320) zfand4 (ENSOKIG00005003335) ENSOKIG00005003380 anxa11a (ENSOKIG00005003605) Chinook salmon MODERN SPECIES sfrp5 (ENSOTSG00005034735) golga7ba (ENSOTSG00005034732) CRTAC1 (ENSOTSG00005034724) LOXL4 (ENSOTSG00005034720) zgc:123010 (ENSOTSG00005034718) pyroxd2 (ENSOTSG00005034694) ENSOTSG00005034693 ENSOTSG00005034691 SEMA4G (ENSOTSG00005034586) lzts2a (ENSOTSG00005034581) pdzd7a (ENSOTSG00005034578) sfxn3 (ENSOTSG00005034571) ENSOTSG00005034569 ENSOTSG00005034566 ENSOTSG00005034564 mat1a (ENSOTSG00005034237) #22 zgc:154058 (ENSOTSG00005034226) si:ch211-198a12.6 (ENSOTSG00005034224) stox1 (ENSOTSG00005034222) ccar1 (ENSOTSG00005034184) zgc:110319 (ENSOTSG00005034177) si:dkey-228d14.5 (ENSOTSG00005034176) eif4e1c (ENSOTSG00005034175) ENSOTSG00005034172 slc25a16 (ENSOTSG00005034168) alox5a (ENSOTSG00005033730) marchf8 (ENSOTSG00005033721) zfand4 (ENSOTSG00005033714) ENSOTSG00005033711 anxa11a (ENSOTSG00005033383) dlg5a (ENSOTSG00005033313) Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 170 ENSGT00950000182977.B.b.b.c.a.a.a.a ENSGT00940000157186.d.d ENSGT00940000154078.a.a.b.h ENSGT01030000234641.b.a.b.a.a.g ENSGT00940000164872.b ENSGT00950000183185.c.a.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234578.A.b.a.a.a.a.b.a ENSGT00940000154395.a.a.a.b ENSGT00950000183169.C.j ENSGT00520000055589.c.l ENSGT00530000063672.a.v ENSGT00940000166680.c ENSGT01030000234578.A.b.a.b.b ENSGT00940000166192.b ENSGT00940000158935.g.a ENSGT00940000157520.b ENSGT00940000156111.f ENSGT00940000158282.a ENSGT00940000155716.t ENSGT00940000153997.b.b.c.b ENSGT00940000156914.o.b.c Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000166602.B ENSGT00390000008727.a.a.d ENSGT00940000160608.f ENSGT00390000000134.a.d.b.a.b.b ENSGT00940000157042.c.a.w ENSGT00940000161036.B.a.d ENSGT00390000007125.a.c.a ENSGT01000000216166.A.a ENSGT01000000216166.B ENSGT00950000182977.B.b.b.c.a.a.a.a.c.a.a ENSGT00950000182977.B.b.b.c.a.a.a.a.c.a.b ENSGT00940000157186.d.d ENSGT00940000154078.a.a.b.h ENSGT01030000234641.b.a.b.a.a.g 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ENSGT00940000153997.b.b.c.b ENSGT00940000156914.o.b.c ENSGT00940000155303.l.f Coho salmon MODERN SPECIES 24 ENSOKIG00005043522 ENSOKIG00005043477 ENSOKIG00005043469 ENSOKIG00005043457 ENSOKIG00005043405 ENSOKIG00005043392 ENSOKIG00005043301 ENSOKIG00005043221 ENSOKIG00005043128 SEMA4G (ENSOKIG00005042959) ENSOKIG00005042931 lzts2a (ENSOKIG00005042909) ENSOKIG00005042897 sfxn3 (ENSOKIG00005042841) selenou1a (ENSOKIG00005042808) mat1a (ENSOKIG00005042619) #22 zgc:154058 (ENSOKIG00005042584) ENSOKIG00005042574 si:ch211-198a12.6 (ENSOKIG00005042563) stox1 (ENSOKIG00005042556) ccar1 (ENSOKIG00005042511) zgc:110319 (ENSOKIG00005042474) si:dkey-228d14.5 (ENSOKIG00005042464) eif4e1c (ENSOKIG00005042335) ENSOKIG00005042316 slc25a16 (ENSOKIG00005042132) ENSOKIG00005042116 alox5a (ENSOKIG00005041978) marchf8 (ENSOKIG00005041891) ZFAND4 (ENSOKIG00005041845) ENSOKIG00005041833 Chinook salmon MODERN SPECIES 179 lzts2a (ENSOTSG00005021097) sfxn3 (ENSOTSG00005021069) selenou1a (ENSOTSG00005021066) mat1a (ENSOTSG00005020960) #22 zgc:154058 (ENSOTSG00005020958) si:ch211-198a12.6 (ENSOTSG00005020957) stox1 (ENSOTSG00005020956) Rainbow trout MODERN SPECIES ENSOMYG00000062299 ENSOMYG00000044448 ENSOMYG00000044438 ENSOMYG00000056088 ENSOMYG00000058406 ENSOMYG00000044433 ENSOMYG00000053342 ENSOMYG00000044402 ENSOMYG00000044445 ENSOMYG00000044429 ENSOMYG00000044391 lzts2a (ENSOMYG00000044382) sfxn3 (ENSOMYG00000044368) selenou1a (ENSOMYG00000044360) ENSOMYG00000061168 mat1a (ENSOMYG00000044292) #22 zgc:154058 (ENSOMYG00000044266) ENSOMYG00000044264 stox1 (ENSOMYG00000044262) ccar1 (ENSOMYG00000044243) zgc:110319 (ENSOMYG00000044231) ENSOMYG00000044223 eif4e1c (ENSOMYG00000044217) ENSOMYG00000044210 alox5a (ENSOMYG00000043777) MARCHF8 (ENSOMYG00000051052) ENSOMYG00000077423 ENSOMYG00000069511 ZFAND4 (ENSOMYG00000043690) ENSOMYG00000057914 anxa11a (ENSOMYG00000042976) Salmo ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00390000003939 ENSGT00940000166602.B ENSGT00390000008727.a.a.d.f ENSGT00940000160608.f ENSGT00390000000134.a.d.b.a.b.b ENSGT00940000157042.c.a.w ENSGT00940000161036.B.a.d ENSGT00390000007125.a.c.a ENSGT00950000182977.B.b.b.c.a.a.a.b ENSGT00950000182977.B.b.b.c.a.a.a.a.c.a.a ENSGT00950000182977.B.b.b.c.a.a.a.a.c.a.b ENSGT00940000157186.d.d ENSGT00940000154078.a.a.b.h ENSGT01030000234641.b.a.b.a.a.g ENSGT00940000164872.b ENSGT00950000183185.c.a.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234578.A.b.a.a.a.a.b.a.b ENSGT00950000183169.C.j ENSGT00520000055589.c.l ENSGT00530000063672.a.v ENSGT00940000166680.c ENSGT01030000234578.A.b.a.b.b ENSGT00940000166192.b ENSGT00940000158935.g.a ENSGT00940000156111.f.b ENSGT00940000158282.a ENSGT00940000155716.t ENSGT00940000153997.b.b.c.b.a ENSGT00940000156914.o.b.c ENSGT00940000155303.l.f ENSGT00940000154935.c.a.a.b Atlantic salmon MODERN SPECIES 9 ENSSSAG00000045267 ENSSSAG00000039975 ENSSSAG00000100365 ENSSSAG00000072269 ENSSSAG00000072263 ENSSSAG00000072255 clm7 (ENSSSAG00000072247) ENSSSAG00000117538 ENSSSAG00000072253 ENSSSAG00000072252 ENSSSAG00000072242 ENSSSAG00000120911 ENSSSAG00000000181 LZTS2 (ENSSSAG00000072215) sfxn3 (ENSSSAG00000107744) ENSSSAG00000114295 #22 zgc:154058 (ENSSSAG00000086209) ENSSSAG00000084997 stox1 (ENSSSAG00000070795) ccar1 (ENSSSAG00000070723) zgc:110319 (ENSSSAG00000070714) si:dkey-228d14.5 (ENSSSAG00000122214) eif4e1c (ENSSSAG00000070682) ENSSSAG00000067599 alox5a (ENSSSAG00000067580) marchf8 (ENSSSAG00000068611) ZFAND4 (ENSSSAG00000067562) ENSSSAG00000118353 ENSSSAG00000067557 anxa11a (ENSSSAG00000067234) dlg5a (ENSSSAG00000063726) River trout MODERN SPECIES 35 SLC35F3 (ENSSTUG00000021945) sfrp5 (ENSSTUG00000021994) golga7ba (ENSSTUG00000022006) LOXL4 (ENSSTUG00000022021) zgc:123010 (ENSSTUG00000022076) ENSSTUG00000022112 ENSSTUG00000022118 ENSSTUG00000022136 ENSSTUG00000022175 ENSSTUG00000022209 ENSSTUG00000022219 SEMA4G (ENSSTUG00000022249) lzts2a (ENSSTUG00000022528) sfxn3 (ENSSTUG00000022552) selenou1a (ENSSTUG00000022578) mat1a (ENSSTUG00000022642) #22 zgc:154058 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(ENSELUG00000022252) ENSELUG00000009988 ENSELUG00000022335 mat1a (ENSELUG00000022377) #22 zgc:154058 (ENSELUG00000022409) ENSELUG00000022418 si:ch211-198a12.6 (ENSELUG00000022430) stox1 (ENSELUG00000022439) ccar1 (ENSELUG00000022633) zgc:110319 (ENSELUG00000022693) si:dkey-228d14.5 (ENSELUG00000022728) eif4e1c (ENSELUG00000022791) ENSELUG00000022830 ENSELUG00000028750 slc25a16 (ENSELUG00000001254) alox5a (ENSELUG00000022892) marchf8 (ENSELUG00000022913) ENSELUG00000026905 zfand4 (ENSELUG00000022926) Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00950000183137.a.k ENSGT00390000007726.a.a ENSGT00940000158796 ENSGT00940000157919.a.a ENSGT00390000009747 ENSGT00530000064017.a ENSGT00940000157186.d ENSGT00940000154078.a.a.b ENSGT00950000183002.C.c.a ENSGT00980000198953 ENSGT01030000234641.b.a.b.a.a ENSGT00940000165336.b ENSGT00940000173380 ENSGT00940000164872.a ENSGT00940000164872.b ENSGT00950000183185.c.a.b.a.a #22 ENSGT01030000234578.A.b.a.a.a.a.b ENSGT00940000154395.a.a.a.b ENSGT00950000183169.C ENSGT00520000055589.c ENSGT00530000063672.a ENSGT00940000166680 ENSGT01030000234578.A.b.a.b ENSGT00940000166192 ENSGT00940000158935 ENSGT00940000157520 ENSGT00940000156111 ENSGT00940000153997.b.b ENSGT00940000155716 ENSGT00940000158282 ENSGT00950000182869.e.a.a.q.d Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 284 ENSGT00390000007726.a.a ENSGT00940000158796 ENSGT00940000155737.b ENSGT00940000157919.b ENSGT00390000009747 ENSGT00530000064017.a ENSGT00940000157186.d ENSGT00940000154078.a.a.b ENSGT00950000183002.C.c.a ENSGT00980000198953 ENSGT01030000234641.b.a.b.a.a ENSGT00940000165336.b ENSGT00940000173380 ENSGT00940000164872.a ENSGT00940000164872.b ENSGT00950000183185.c.a.b.a.a #22 ENSGT01030000234578.A.b.a.a.a.a.b ENSGT01100000263516.a.b.b.b.a.a.a.b.b.a.a ENSGT00940000156323.d Denticle herring MODERN SPECIES 11 ATE1 (ENSDCDG00000032749) ENSDCDG00000032738 lrrfip2 (ENSDCDG00000032716) mlh1 (ENSDCDG00000032704) ENSDCDG00000032701 ENSDCDG00000032698 HERC4 (ENSDCDG00000032560) cox5b2 (ENSDCDG00000032540) 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ENSGT01030000234578.A.b.a.a.a.a.b ENSGT01100000263516.a.b.b.b.a.a.a.b.b.a.a ENSGT00990000210241 ENSGT00940000156323.d ENSGT00950000183169.C ENSGT00520000055589.c ENSGT00530000063672.a ENSGT00940000166680 ENSGT01030000234578.A.b.a.b ENSGT00940000166192 ENSGT00940000158935 ENSGT00940000157520 ENSGT00940000156111 ENSGT00940000153997.b.b ENSGT00940000155716 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 425 si:dkey-33c12.4 (ENSPNAG00000018386) ENSPNAG00000018365 zgc:123321 (ENSPNAG00000018310) ENSPNAG00000018288 pomk (ENSPNAG00000018280) wdr32 (ENSPNAG00000018253) CPXM1 (ENSPNAG00000018228) ENSPNAG00000018203 SEMA4G (ENSPNAG00000018162) lzts2a (ENSPNAG00000018144) pdzd7a (ENSPNAG00000018092) ENSPNAG00000017997 sfxn3 (ENSPNAG00000017988) ENSPNAG00000017919 ENSPNAG00000017890 mat1a (ENSPNAG00000017882) #22 zgc:154058 (ENSPNAG00000017842) ENSPNAG00000017812 Mexicana tetra MODERN SPECIES 17 si:dkey-33c12.3 (ENSAMXG00000010889) si:dkey-33c12.4 (ENSAMXG00000010871) zgc:123321 (ENSAMXG00000010838) 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ENSSLDG00000000348 ARHGAP44 (ENSSLDG00000000232) Greater amberjack MODERN SPECIES 27 ENSSDUG00000005613 ENSSDUG00000005625 FMNL1 (ENSSDUG00000005640) ccr10 (ENSSDUG00000005735) SRCIN1 (ENSSDUG00000005747) GRB7 (ENSSDUG00000005770) ENSSDUG00000005984 ENSSDUG00000007780 grnb (ENSSDUG00000007840) FAM171A2 (ENSSDUG00000008062) ENSSDUG00000008071 CRHR1 (ENSSDUG00000008083) KANSL1 (ENSSDUG00000008104) ENSSDUG00000008131 ghrhr2 (ENSSDUG00000008218) ENSSDUG00000008242 #22 ENSSDUG00000008257 zgc:92749 (ENSSDUG00000008267) ENSSDUG00000008278 ENSSDUG00000008314 chuk (ENSSDUG00000008446) ENSSDUG00000008476 tubgcp2 (ENSSDUG00000008508) kctd2 (ENSSDUG00000008540) SLC16A5 (ENSSDUG00000008557) ENSSDUG00000008563 acsf2 (ENSSDUG00000008586) chad (ENSSDUG00000008606) armc7 (ENSSDUG00000008632) ndel1a (ENSSDUG00000008645) ENSSDUG00000008666 Barramundi perch MODERN SPECIES 143 ENSLCAG00010015847 ENSLCAG00010015844 ENSLCAG00010015842 ccr10 (ENSLCAG00010015838) FMNL1 (ENSLCAG00010015674) GRB7 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(ENSSMAG00000009904) ENSSMAG00000009880 ndel1a (ENSSMAG00000009859) ENSSMAG00000035582 Tongue sole MODERN SPECIES 18 INSYN2A (ENSCSEG00000010108) dock1 (ENSCSEG00000010022) foxi1 (ENSCSEG00000010013) CLRN3 (ENSCSEG00000010005) PTPRE (ENSCSEG00000009910) entpd1 (ENSCSEG00000009884) SRCIN1 (ENSCSEG00000009797) GRB7 (ENSCSEG00000009771) ENSCSEG00000009747 grnb (ENSCSEG00000009698) FAM171A2 (ENSCSEG00000009686) CRHR1 (ENSCSEG00000009657) KANSL1 (ENSCSEG00000009618) ENSCSEG00000009557 ghrhr2 (ENSCSEG00000009510) MAT1A (ENSCSEG00000009470) #22 ENSCSEG00000009456 ENSCSEG00000009438 TGFB1I1 (ENSCSEG00000009399) ENSCSEG00000009385 pkmyt1 (ENSCSEG00000009368) ENSCSEG00000009366 ENSCSEG00000009358 mylpfb (ENSCSEG00000009341) pgap3 (ENSCSEG00000009322) erbb2 (ENSCSEG00000009269) ENSCSEG00000009262 ENSCSEG00000009255 KCNH2 (ENSCSEG00000009236) pth3r (ENSCSEG00000009164) RUNDC3A (ENSCSEG00000009144) Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT01030000234575.c.a.a.a.b ENSGT00940000168205 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ENSGT00950000182937.A.a.o ENSGT00940000158585.g.b ENSGT00940000156697 ENSGT00940000158336 ENSGT00940000159666.c ENSGT00940000166090 ENSGT00940000161826.C ENSGT00940000156830.a ENSGT00940000164193 ENSGT00390000000111.a.n ENSGT00390000005565 ENSGT00940000157296.o.a Perciformes ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000165400 ENSGT00940000168205 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.a ENSGT00940000156292.g.a ENSGT00940000157961.A ENSGT00940000158710 ENSGT00950000183080.a.b.b.a.b ENSGT00940000156497.b ENSGT00470000042293.a.b.a.b ENSGT00980000200843 ENSGT00950000183184.b.a ENSGT00940000158410.g.b ENSGT00530000063688.b.nb.a ENSGT00940000155494.j ENSGT00940000166534 ENSGT00950000183185.c.a.b.a.b #22 ENSGT01030000234578.A.b.a.a.a.a.a ENSGT01050000244965.a.a ENSGT00940000155061.a.b.k.b ENSGT00950000182937.A.a.o ENSGT00940000158585.g.b ENSGT00940000156697 ENSGT00940000158336 ENSGT00940000159666.c.d ENSGT00940000166090 ENSGT00940000161826.C ENSGT00940000156830.a ENSGT00940000164193 ENSGT00390000000111.a.n ENSGT00390000005565 ENSGT00940000157296.o.a Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT01030000234592.A.b.b.b.a ENSGT00940000165400 ENSGT00940000168205 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.a ENSGT00940000156292.g.a ENSGT00940000157961.A ENSGT00940000158710 ENSGT00950000183080.a.b.b.a.b ENSGT00940000156497.b ENSGT00470000042293.a.b.a.b ENSGT00980000200843 ENSGT00950000183184.b.a ENSGT00940000158410.g.b ENSGT00530000063688.b.nb.a ENSGT00940000155494.j ENSGT00950000183185.c.a.b.a.b #22 ENSGT01030000234578.A.b.a.a.a.a.a ENSGT01050000244965.a.a ENSGT00940000155061.a.b.k.b ENSGT00950000182937.A.a.o ENSGT00940000158585.g.b ENSGT00940000156697 ENSGT00940000158336 ENSGT00940000159666.c.d ENSGT00940000166090 ENSGT00940000161826.C ENSGT00940000156830.a ENSGT00940000164193 ENSGT00390000000111.a.n ENSGT00390000005565 ENSGT00940000157296.o.a Stickleback MODERN SPECIES 5 ercc4 (ENSGACG00000004432) cpped1 (ENSGACG00000004415) ENSGACG00000004411 ccr10 (ENSGACG00000004402) FMNL1 (ENSGACG00000004388) ENSGACG00000004377 GRB7 (ENSGACG00000004362) ENSGACG00000004358 ENSGACG00000004343 ENSGACG00000004334 grnb (ENSGACG00000004305) FAM171A2 (ENSGACG00000004288) CRHR1 (ENSGACG00000004272) KANSL1 (ENSGACG00000004258) ENSGACG00000004243 MAT1A (ENSGACG00000004225) #22 ENSGACG00000004220 zgc:92749 (ENSGACG00000004214) PSD (ENSGACG00000004207) ENSGACG00000004204 chuk (ENSGACG00000004179) ENSGACG00000004175 tubgcp2 (ENSGACG00000004173) kctd2 (ENSGACG00000004164) SLC16A5 (ENSGACG00000004150) ENSGACG00000004139 chad (ENSGACG00000004134) acsf2 (ENSGACG00000004121) armc7 (ENSGACG00000004117) ndel1a (ENSGACG00000004095) ENSGACG00000004091 Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT01030000234592.A.b.b.b.a ENSGT01030000234575.c.a.a.a.b ENSGT00940000168205 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.a ENSGT00940000156292.g.a ENSGT00940000157961.A ENSGT00940000158710 ENSGT00950000183080.a.b.b.a.b ENSGT00940000156497.b ENSGT00470000042293.a.b.a.b ENSGT00950000183184.b.a ENSGT00940000158410.g.b ENSGT00530000063688.b.nb.a ENSGT00940000155494.j ENSGT00940000166534 ENSGT00950000183185.c.a.b.a.b #22 ENSGT01030000234578.A.b.a.a.a.a.a ENSGT01050000244965.a.a ENSGT00940000155061.a.b.k.b ENSGT00950000182937.A.a.o ENSGT00940000158585.g.b ENSGT00940000156697 ENSGT00940000158336 ENSGT00940000159666.c.d ENSGT00940000166090 ENSGT00940000156830.a ENSGT00940000161826.C ENSGT00940000164193 ENSGT00390000000111.a.n ENSGT00390000005565 ENSGT00940000157296.o.a Channel bull blenny MODERN SPECIES 10 ENSCGOG00000016128 ENSCGOG00000016131 ccr10 (ENSCGOG00000016135) FMNL1 (ENSCGOG00000016150) SRCIN1 (ENSCGOG00000016523) GRB7 (ENSCGOG00000016530) ENSCGOG00000016540 ENSCGOG00000016594 grnb (ENSCGOG00000016598) FAM171A2 (ENSCGOG00000016607) CRHR1 (ENSCGOG00000016622) ENSCGOG00000016663 KANSL1 (ENSCGOG00000016664) ENSCGOG00000016670 ghrhr2 (ENSCGOG00000016694) ENSCGOG00000016722 #22 ENSCGOG00000017528 zgc:92749 (ENSCGOG00000017529) ENSCGOG00000017559 chuk (ENSCGOG00000018218) ENSCGOG00000018862 tubgcp2 (ENSCGOG00000018863) kctd2 (ENSCGOG00000018866) SLC16A5 (ENSCGOG00000018870) acsf2 (ENSCGOG00000018879) chad (ENSCGOG00000019129) armc7 (ENSCGOG00000019136) ndel1a (ENSCGOG00000019138) ARHGAP44 (ENSCGOG00000019161) stx4 (ENSCGOG00000019225) ENSCGOG00000019231 Pike perch MODERN SPECIES 3 exoc7 (ENSSLUG00000019662) ENSSLUG00000019800 ENSSLUG00000019805 ENSSLUG00000019810 ccr10 (ENSSLUG00000019813) FMNL1 (ENSSLUG00000019870) SRCIN1 (ENSSLUG00000020265) ENSSLUG00000020295 GRB7 (ENSSLUG00000020310) ENSSLUG00000020381 grnb (ENSSLUG00000003177) FAM171A2 (ENSSLUG00000003217) CRHR1 (ENSSLUG00000003239) KANSL1 (ENSSLUG00000003306) ENSSLUG00000003352 ENSSLUG00000003488 #22 ENSSLUG00000003844 ENSSLUG00000003849 zgc:92749 (ENSSLUG00000003854) PSD (ENSSLUG00000003861) chuk (ENSSLUG00000003917) ENSSLUG00000003974 tubgcp2 (ENSSLUG00000004021) kctd2 (ENSSLUG00000004071) SLC16A5 (ENSSLUG00000004083) ENSSLUG00000004114 acsf2 (ENSSLUG00000004459) chad (ENSSLUG00000005663) armc7 (ENSSLUG00000005667) ndel1a (ENSSLUG00000005678) ENSSLUG00000005696 Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000165400 ENSGT01030000234575.c.a.a.a.b ENSGT00940000168205 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.a ENSGT00940000156292.g.a ENSGT00940000157961.A ENSGT00940000158710 ENSGT00950000183080.a.b.b.a.b ENSGT00940000156497.b ENSGT00470000042293.a.b.a.b ENSGT00950000183184.b.a ENSGT00940000158410.g.b ENSGT00530000063688.b.nb.a ENSGT00940000155494.j ENSGT00940000166534 ENSGT00950000183185.c.a.b.a.b #22 ENSGT01030000234578.A.b.a.a.a.a.a ENSGT01050000244965.a.a ENSGT00940000155061.a.b.k.b ENSGT00950000182937.A.a.o ENSGT00940000158585.g.b ENSGT00940000156697 ENSGT00940000158336 ENSGT00940000159666.c ENSGT00940000166090 ENSGT00940000161826.C ENSGT00940000156830.a ENSGT00940000164193 ENSGT00390000000111.a.n ENSGT00390000005565 ENSGT00940000157296.o.a Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000165400 ENSGT01030000234575.c.a.a.a.b ENSGT00940000168205 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.a ENSGT00940000156292.g.a ENSGT00940000157961.A ENSGT00940000158710 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ENSLCRG00005017298 ELOVL6 (ENSLCRG00005017296) ENSLCRG00005017293 CHMP6 (ENSLCRG00005017289) BAIAP2 (ENSLCRG00005017285) AATK (ENSLCRG00005017283) ENSLCRG00005017282 ENSLCRG00005017281 ENSLCRG00005017280 ENSLCRG00005017279 ENSLCRG00005017275 cep131 (ENSLCRG00005016540) ENSLCRG00005016527 ENSLCRG00005016525 nploc4 (ENSLCRG00005016208) European seabass MODERN SPECIES 11 ENSDLAG00005031195 ENSDLAG00005026661 ENSDLAG00005028436 ENSDLAG00005010712 ccr10 (ENSDLAG00005010705) ENSDLAG00005006315 ENSDLAG00005006070 ENSDLAG00005005980 ENSDLAG00005029537 ENSDLAG00005005934 grnb (ENSDLAG00005005875) ENSDLAG00005027422 ENSDLAG00005002695 ENSDLAG00005002239 ENSDLAG00005002216 ENSDLAG00005002171 #22 ENSDLAG00005002164 ENSDLAG00005027928 ENSDLAG00005002289 ENSDLAG00005027391 ENSDLAG00005001991 ENSDLAG00005001836 ENSDLAG00005001793 TUBGCP2 (ENSDLAG00005001711) kctd2 (ENSDLAG00005027650) ENSDLAG00005001686 ENSDLAG00005001660 chad (ENSDLAG00005027941) armc7 (ENSDLAG00005001288) acsf2 (ENSDLAG00005001351) ENSDLAG00005001240 Gilthead seabream MODERN SPECIES 12 ENSSAUG00010021150 ENSSAUG00010021152 ENSSAUG00010021154 ccr10 (ENSSAUG00010021155) FMNL1 (ENSSAUG00010021212) SRCIN1 (ENSSAUG00010023262) GRB7 (ENSSAUG00010023281) ENSSAUG00010023284 ENSSAUG00010023286 grnb (ENSSAUG00010023287) FAM171A2 (ENSSAUG00010023288) CRHR1 (ENSSAUG00010023307) KANSL1 (ENSSAUG00010024449) ENSSAUG00010024452 ghrhr2 (ENSSAUG00010024453) ENSSAUG00010024454 #22 ENSSAUG00010024465 zgc:92749 (ENSSAUG00010024466) ENSSAUG00010024473 chuk (ENSSAUG00010025022) ENSSAUG00010025033 tubgcp2 (ENSSAUG00010025037) kctd2 (ENSSAUG00010025042) SLC16A5 (ENSSAUG00010025043) ENSSAUG00010025044 acsf2 (ENSSAUG00010025074) ENSSAUG00010025466 chad (ENSSAUG00010025469) armc7 (ENSSAUG00010025471) ndel1a (ENSSAUG00010016658) ENSSAUG00010016665 Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000164286.j.a.a.a ENSGT01030000234592.A.b.b.b.a ENSGT00940000165400 ENSGT00940000168205 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.a ENSGT00940000156292.g.a 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ENSTNIG00000011850 #22 zgc:92749 (ENSTNIG00000011849) ENSTNIG00000011848 chuk (ENSTNIG00000011847) ADAM8 (ENSTNIG00000011846) tubgcp2 (ENSTNIG00000011845) kctd2 (ENSTNIG00000011844) SLC16A5 (ENSTNIG00000011843) ENSTNIG00000011842 chad (ENSTNIG00000011840) acsf2 (ENSTNIG00000011841) armc7 (ENSTNIG00000011839) ndel1a (ENSTNIG00000011838) ARHGAP44 (ENSTNIG00000010084) stx4 (ENSTNIG00000010085) ENSTNIG00000010086 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000168205 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.a ENSGT00940000156292.g.a ENSGT00940000157961.A ENSGT00940000158710 ENSGT00950000183080.a.b.b.a.b ENSGT00940000156497.b ENSGT00470000042293.a.b.a.b ENSGT00980000200843 ENSGT00470000042293.a.b.b ENSGT00950000183184.b.a ENSGT00940000158410.g.b ENSGT00530000063688.b.nb.a ENSGT00940000155494.j ENSGT00940000166534 ENSGT00950000183185.c.a.b.a.b #22 ENSGT01030000234578.A.b.a.a.a.a.a ENSGT01050000244965.a.a ENSGT00940000155061.a.b.k.b ENSGT00950000182937.A.a.o ENSGT00940000158585.g.b ENSGT00940000156697 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ENSGT00950000183185.c.a.b.a.b #22 ENSGT01030000234578.A.b.a.a.a.a.a ENSGT01050000244965.a.a ENSGT00940000155061.a.b.k.b ENSGT00950000182937.A.a.o ENSGT00940000158585.g.b ENSGT00940000156697 ENSGT00940000158336 ENSGT00940000159666.c ENSGT00940000166090 ENSGT00940000161826.C ENSGT00940000156830.a ENSGT00940000164193 ENSGT00390000000111.a.n ENSGT00390000005565 ENSGT00940000157296.o.a Chinese medaka MODERN SPECIES 216 wdr45b (ENSOSIG00000019160) ENSOSIG00000019188 kdelr2b (ENSOSIG00000019190) mettl9 (ENSOSIG00000019194) ENSOSIG00000019197 CRHR1 (ENSOSIG00000019281) ENSOSIG00000020650 ENSOSIG00000020655 ENSOSIG00000020657 ENSOSIG00000020665 #22 ENSOSIG00000020717 ENSOSIG00000020728 ENSOSIG00000020734 chuk (ENSOSIG00000020753) tubgcp2 (ENSOSIG00000003633) kctd2 (ENSOSIG00000004309) SLC16A5 (ENSOSIG00000004317) ENSOSIG00000004322 acsf2 (ENSOSIG00000004381) chad (ENSOSIG00000006316) armc7 (ENSOSIG00000006319) ndel1a (ENSOSIG00000006323) ENSOSIG00000006408 stx4 (ENSOSIG00000008477) 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(ENSAPEG00000004242) Clown anemonefish MODERN SPECIES 2039 ENSAOCG00000000138 ghrhr2 (ENSAOCG00000004071) ENSAOCG00000004096 #22 ENSAOCG00000004107 zgc:92749 (ENSAOCG00000004117) ENSAOCG00000004134 ENSAOCG00000004141 ENSAOCG00000004150 pvalb6 (ENSAOCG00000004168) ENSAOCG00000004199 Spiny chromis MODERN SPECIES 2882 ghrhr2 (ENSAPOG00000003528) ENSAPOG00000003559 #22 ENSAPOG00000003582 Bicolor damselfish MODERN SPECIES 1132 ENSSPAG00000000327 ghrhr2 (ENSSPAG00000000387) ENSSPAG00000000447 #22 ENSSPAG00000000475 zgc:92749 (ENSSPAG00000000486) ENSSPAG00000000507 ENSSPAG00000000553 chuk (ENSSPAG00000000587) Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000168205 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.a ENSGT00940000156292.g.a ENSGT00940000157961.A ENSGT00940000158710 ENSGT00950000183080.a.b.b.a.b ENSGT00940000156497.b ENSGT00470000042293.a.b.a.b ENSGT00980000201950 ENSGT00470000042293.a.b.b ENSGT00950000183184.b.a ENSGT00940000158410.g.b ENSGT00530000063688.b.nb.a ENSGT00940000155494.j ENSGT00940000166534 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SPECIES 7 ENSGT01030000234592.A.b.b.b.a ENSGT00940000165400 ENSGT00940000168205 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.a ENSGT00940000156292.g.a ENSGT00940000157961.A ENSGT00940000158710 ENSGT00950000183080.a.b.b.a.b ENSGT00940000156497.b ENSGT00470000042293.a.b.a.b ENSGT00950000183184.b.a ENSGT00940000158410.g.b ENSGT00530000063688.b.nb.a ENSGT00940000155494.j ENSGT00950000182996.b.b.d.a.a ENSGT00950000183185.c.a.b.a.b #22 ENSGT01030000234578.A.b.a.a.a.a.a ENSGT01050000244965.a.a ENSGT00940000155061.a.b.k.b ENSGT00950000182937.A.a.o ENSGT00940000158585.g.b ENSGT00940000156697 ENSGT00940000158336 ENSGT00940000159666.c ENSGT00940000166090 ENSGT00940000161826.C ENSGT00940000156830.a ENSGT00940000164193 ENSGT00390000000111.a.n ENSGT00390000005565 ENSGT00940000157296.o.a Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000165400.d ENSGT00940000165400.c ENSGT00940000168205 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.a ENSGT00940000156292.g.a ENSGT00940000157961.A ENSGT00940000158710 ENSGT00950000183080.a.b.b.a.b ENSGT00940000156497.b ENSGT00470000042293.a.b.a.b ENSGT00950000183184.b.a ENSGT00940000158410.g.b ENSGT00530000063688.b.nb.a ENSGT00940000155494.j ENSGT00950000182996.b.b.d.a.a ENSGT00950000183185.c.a.b.a.b #22 ENSGT01030000234578.A.b.a.a.a.a.a ENSGT01050000244965.a.a ENSGT00940000155061.a.b.k.b ENSGT00950000182937.A.a.o ENSGT00940000158585.g.b ENSGT00940000156697 ENSGT00940000158336 ENSGT00940000159666.c ENSGT00940000166090 ENSGT00940000161826.C ENSGT00940000156830.a ENSGT00940000164193 ENSGT00390000000111.a.n ENSGT00390000005565 ENSGT00940000157296.o.a Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 274 ENSHBUG00000003432 ENSHBUG00000003437 ENSHBUG00000003450 ENSHBUG00000003463 ccr10 (ENSHBUG00000003468) FMNL1 (ENSHBUG00000000076) SRCIN1 (ENSHBUG00000003567) GRB7 (ENSHBUG00000003637) ENSHBUG00000003654 grnb (ENSHBUG00000003674) FAM171A2 (ENSHBUG00000003681) ENSHBUG00000003724 KANSL1 (ENSHBUG00000003739) ENSHBUG00000003772 ENSHBUG00000003789 ENSHBUG00000000955 #22 ENSHBUG00000003844 zgc:92749 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ENSGT00940000166090 ENSGT00940000156830.a ENSGT00940000161826.C ENSGT00940000164193 ENSGT00390000000111.a.n ENSGT00940000157296.o.a ENSGT01030000234627.a.b.b Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT01030000234592.A.b.b.b.a ENSGT00940000165400.d ENSGT00940000165400.c ENSGT00940000168205 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.a ENSGT00940000156292.g.a ENSGT00940000157961.A ENSGT00940000158710 ENSGT00950000183080.a.b.b.a.b ENSGT00940000156497.b ENSGT00470000042293.a.b.a.b ENSGT00950000183184.b.a ENSGT00940000158410.g.b ENSGT00530000063688.b.nb.a ENSGT00940000155494.j ENSGT00950000183185.c.a.b.a.b #22 ENSGT01030000234578.A.b.a.a.a.a.a ENSGT01050000244965.a.a ENSGT00940000155061.a.b.k.b ENSGT00950000182937.A.a.o ENSGT00940000158585.g.b ENSGT00940000156697 ENSGT00940000158336 ENSGT00940000159666.c ENSGT00940000166090 ENSGT00940000161826.C ENSGT00940000156830.a ENSGT00940000164193 ENSGT00390000000111.a.n ENSGT00940000157296.o.a ENSGT01030000234627.a.b.b Zebra mbuna MODERN SPECIES 1111 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ENSGT00940000156414 ENSGT00950000183001.a.a.d.a.a.a ENSGT00730000114509 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 542 adkb (ENSPNAG00000007481) vclb (ENSPNAG00000029689) ENSPNAG00000029641 ENSPNAG00000029589 ENSPNAG00000004636 trim16 (ENSPNAG00000029494) ENSPNAG00000029475 ENSPNAG00000005401 ENSPNAG00000029178 #22 zgc:86738 (ENSPNAG00000029138) ENSPNAG00000029122 zgc:92749 (ENSPNAG00000029079) uros (ENSPNAG00000029052) ENSPNAG00000028985 mmp21 (ENSPNAG00000028943) Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 196 ENSGT00940000169341 ENSGT00950000183185.c.a.b.a.b #22 ENSGT01030000234578.A.b.a.a.a.a.a ENSGT01050000244965.a.a ENSGT00940000155061.a.b.k.b ENSGT00950000182937.A.a.o.e ENSGT00950000182883.a.a.b ENSGT00940000154268.k.b ENSGT00950000183046.a.b.k ENSGT00940000158922.c ENSGT00940000164841 ENSGT00390000012820 ENSGT00940000157790 ENSGT00390000006939.i.a.f.a ENSGT00940000158232 ENSGT00390000001304 ENSGT00940000159038.a.a Atlantic herring MODERN SPECIES 15 ENSCHAG00000007983 ENSCHAG00000007879 ENSCHAG00000007864 scn4aa (ENSCHAG00000005728) ENSCHAG00000005667 ENSCHAG00000005630 ENSCHAG00000005608 ENSCHAG00000005595 ENSCHAG00000005571 ENSCHAG00000005553 PDZD7 (ENSCHAG00000005535) LZTS2 (ENSCHAG00000005471) twnk (ENSCHAG00000005292) mrpl43 (ENSCHAG00000005246) ENSCHAG00000005234 ENSCHAG00000004020 #22 ENSCHAG00000003975 zgc:92749 (ENSCHAG00000003951) ENSCHAG00000003762 ENSCHAG00000003735 SDK2 (ENSCHAG00000002282) CDC42EP4 (ENSCHAG00000002225) ENSCHAG00000002203 ENSCHAG00000002195 ENSCHAG00000002180 TEKT3 (ENSCHAG00000002165) ENSCHAG00000002154 pmp22b (ENSCHAG00000002134) hs3st3b1b (ENSCHAG00000002118) cox10 (ENSCHAG00000002105) ENSCHAG00000002094 Denticle herring MODERN SPECIES 11 c1qtnf1 (ENSDCDG00000004859) enpp7.2 (ENSDCDG00000004885) NOG (ENSDCDG00000004887) ANKFN1 (ENSDCDG00000004890) selenou1b (ENSDCDG00000004896) ENSDCDG00000004900 ENSDCDG00000004904 ENSDCDG00000004907 ENSDCDG00000004909 ENSDCDG00000004910 ENSDCDG00000004911 ENSDCDG00000004913 ENSDCDG00000004916 ENSDCDG00000004920 ENSDCDG00000004921 ENSDCDG00000004934 #22 ENSDCDG00000005001 zgc:92749 (ENSDCDG00000005004) ENSDCDG00000005036 ENSDCDG00000005506 NXPH3 (ENSDCDG00000005555) ndufa4b (ENSDCDG00000005557) ENSDCDG00000005558 ENSDCDG00000005560 ENSDCDG00000005561 ENSDCDG00000005562 ENSDCDG00000005564 rundc3ab (ENSDCDG00000005567) pth3r (ENSDCDG00000005586) TACO1 (ENSDCDG00000005619) ENSDCDG00000005624 Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183185.c.a.b.b #22 Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183185.c.a.b.b #22 Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183185.c.a.b.b #22 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183185.c.a.b.b #22 Huchen MODERN SPECIES 4533 sfxn3 (ENSHHUG00000038196) selenou1a (ENSHHUG00000038178) ENSHHUG00000038169 #22 Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183185.c.a.b.b #22 Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183185.c.a.b.b #22 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183185.c.a.b.b #22 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183185.c.a.b.b #22 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183185.c.a.b.b #22 Eupercaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183185.c.a.b.b #22 Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183185.c.a.b.b #22 Ballan wrasse MODERN SPECIES 842 ENSLBEG00000018734 KANSL1 (ENSLBEG00000018691) ENSLBEG00000018556 ghrhr2 (ENSLBEG00000018404) ENSLBEG00000018371 #22 Otomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183185.c.a.b.b #22 Otophysi ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183185.c.a.b.b #22 Characiphysae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183185.c.a.b.b #22 Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183185.c.a.b.b #22 Characoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183185.c.a.b.b #22 Mexicana tetra MODERN SPECIES 901 azin1b (ENSAMXG00000042545) ARHGAP44 (ENSAMXG00000019438) ndufb8 (ENSAMXG00000020446) SEC31B (ENSAMXG00000020434) chst3b (ENSAMXG00000029019) zgc:92749 (ENSAMXG00000034182) ENSAMXG00000004211 zgc:86738 (ENSAMXG00000031026) trim16 (ENSAMXG00000042638) FADS6 (ENSAMXG00000004237) ENSAMXG00000004242 #22 Elephant shark MODERN SPECIES 1488 ENSCMIG00000009985 ENSCMIG00000009982 ENSCMIG00000009980 ENSCMIG00000009979 scd (ENSCMIG00000009975) wnt8b (ENSCMIG00000009971) SEC31B (ENSCMIG00000009933) ndufb8 (ENSCMIG00000009905) hif1an (ENSCMIG00000009892) ENSCMIG00000009878 fbxl15 (ENSCMIG00000009873) cuedc2 (ENSCMIG00000009870) ENSCMIG00000009866 chst3a (ENSCMIG00000009861) ghitm (ENSCMIG00000009858) #10 ENSCMIG00000009839 #22 ENSCMIG00000009829 marchf8 (ENSCMIG00000009826) zfand4 (ENSCMIG00000009823) ENSCMIG00000009821 ENSCMIG00000009816 ENSCMIG00000009811 opn4 (ENSCMIG00000009804) ldb3b (ENSCMIG00000009797) ENSCMIG00000009786 bmpr1aa (ENSCMIG00000009756) ENSCMIG00000009745 sncga (ENSCMIG00000009744) glud1a (ENSCMIG00000009718) ENSCMIG00000009704 SYT15 (ENSCMIG00000009702) Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183185.c.a.a ##22 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183185.c.a.a ##22 Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 210 ENSGT00950000183109.c.b ENSGT00940000155596 ENSGT00940000156317 ENSGT00940000161102 ENSGT00940000159885 ENSGT00530000064017.b ENSGT00950000183162.a.b ENSGT00900000140979.a.b ENSGT00940000166629 ENSGT00940000158490 ENSGT00940000165439 ENSGT00940000155715 ENSGT00940000162006 ENSGT00950000183185.c.a.a ##22 ENSGT00390000014909 ENSGT00940000160325.b ENSGT00730000111371 ENSGT00940000160552 ENSGT01030000234578.A.b.a.a.b Coelacanth MODERN SPECIES 465 CNNM3 (ENSLACG00000016309) ENSLACG00000015975 ANKRD39 (ENSLACG00000015682) ENSLACG00000015620 ENSLACG00000014799 ENSLACG00000014625 LMAN2L (ENSLACG00000014419) ARID5A (ENSLACG00000014124) ENSLACG00000013204 ENSLACG00000012999 PURB (ENSLACG00000012910) H2AZ2 (ENSLACG00000012013) ENSLACG00000011385 ENSLACG00000008101 ENSLACG00000006982 MAT2A (ENSLACG00000005249) ##22 GGCX (ENSLACG00000004481) VAMP8 (ENSLACG00000002927) VAMP5 (ENSLACG00000001781) RNF181 (ENSLACG00000000035) Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 61 ENSGT00390000004149 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ENSGT00530000064712 ENSGT00390000017613 ENSGT00390000009488 ENSGT00940000159305 ENSGT00940000162822 ENSGT00950000183185.c.a.a ##22 ENSGT00390000014909 ENSGT00940000160325.b ENSGT00730000111371 ENSGT00940000160552 ENSGT01030000234578.A.b.a.a.b ENSGT00390000001901 ENSGT00390000007992 ENSGT00940000161711 ENSGT00390000002975.b ENSGT00390000002975.a.b ENSGT00390000002975.a.a ENSGT00940000161151 ENSGT00940000157929 ENSGT00920000149138 ENSGT00390000016876 American bison MODERN SPECIES 3338 SUCLG1 (ENSBBBG00000020010) DNAH6 (ENSBBBG00000019994) TMSB10 (ENSBBBG00000019860) ENSBBBG00000019847 TCF7L1 (ENSBBBG00000019828) ENSBBBG00000019799 RETSAT (ENSBBBG00000019791) ELMOD3 (ENSBBBG00000019773) CAPG (ENSBBBG00000005165) ENSBBBG00000019725 MAT2A (ENSBBBG00000019713) ##22 GGCX (ENSBBBG00000019704) VAMP8 (ENSBBBG00000007673) VAMP5 (ENSBBBG00000019660) RNF181 (ENSBBBG00000005186) TMEM150A (ENSBBBG00000019657) USP39 (ENSBBBG00000019591) SFTPB (ENSBBBG00000005209) ENSBBBG00000019476 ENSBBBG00000005222 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(ENSOARG00020002774) TCF7L1 (ENSOARG00020002813) ENSOARG00020002845 GGCX (ENSOARG00020002878) ELMOD3 (ENSOARG00020002916) CAPG (ENSOARG00020002936) SH2D6 (ENSOARG00020002951) MAT2A (ENSOARG00020002979) ##22 ENSOARG00020002994 VAMP5 (ENSOARG00020003011) RNF181 (ENSOARG00020003033) TMEM150A (ENSOARG00020003074) C2orf68 (ENSOARG00020003094) USP39 (ENSOARG00020003123) SFTPB (ENSOARG00020003261) ENSOARG00020003392 ENSOARG00020003492 ATOH8 (ENSOARG00020003526) ST3GAL5 (ENSOARG00020003555) POLR1A (ENSOARG00020003653) PTCD3 (ENSOARG00020000168) IMMT (ENSOARG00020000246) MRPL35 (ENSOARG00020000311) Goat MODERN SPECIES 2 ENSCHIG00000014730 ENSCHIG00000009879 ENSCHIG00000027191 SUCLG1 (ENSCHIG00000020517) ENSCHIG00000025501 ENSCHIG00000017397 KCMF1 (ENSCHIG00000000578) ENSCHIG00000009602 ENSCHIG00000009524 TCF7L1 (ENSCHIG00000010768) ENSCHIG00000019585 RETSAT (ENSCHIG00000007516) ELMOD3 (ENSCHIG00000024857) CAPG (ENSCHIG00000021024) ENSCHIG00000009669 MAT2A (ENSCHIG00000026409) ##22 GGCX 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ENSGT00390000016876 ENSGT00390000002313 ENSGT00390000007547 ENSGT00940000159532 Blue whale MODERN SPECIES 4 ENSBMSG00010020819 LRRTM1 (ENSBMSG00010020793) CTNNA2 (ENSBMSG00010019658) ENSBMSG00010019485 SUCLG1 (ENSBMSG00010019445) DNAH6 (ENSBMSG00010018565) ENSBMSG00010018427 TRABD2A (ENSBMSG00010018310) TMSB10 (ENSBMSG00010018283) KCMF1 (ENSBMSG00010018181) TCF7L1 (ENSBMSG00010018055) RETSAT (ENSBMSG00010018024) ELMOD3 (ENSBMSG00010017999) CAPG (ENSBMSG00010017946) SH2D6 (ENSBMSG00010017841) MAT2A (ENSBMSG00010017771) ##22 GGCX (ENSBMSG00010017708) VAMP8 (ENSBMSG00010017652) VAMP5 (ENSBMSG00010017623) RNF181 (ENSBMSG00010017562) TMEM150A (ENSBMSG00010017376) C2orf68 (ENSBMSG00010017326) USP39 (ENSBMSG00010017135) ENSBMSG00010017087 ENSBMSG00010017048 ATOH8 (ENSBMSG00010017024) ST3GAL5 (ENSBMSG00010016994) ENSBMSG00010016964 ENSBMSG00010016939 POLR1A (ENSBMSG00010016886) PTCD3 (ENSBMSG00010016832) Odontoceti ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT01030000234543.A.a ENSGT00940000154519.d ENSGT01000000219921 ENSGT00550000074828.a.g.a ENSGT00940000156351 ENSGT00940000154761 ENSGT00940000162805 ENSGT00940000163007 ENSGT00510000047171 ENSGT00940000157038 ENSGT00530000064712 ENSGT00390000017613 ENSGT00390000009488 ENSGT00940000159305 ENSGT00940000162822 ENSGT00950000183185.c.a.a ##22 ENSGT00390000014909 ENSGT00940000160325.b ENSGT00730000111371 ENSGT00940000160552 ENSGT01030000234578.A.b.a.a.b ENSGT00390000001901 ENSGT00390000007992 ENSGT00940000161711 ENSGT00940000161151 ENSGT00940000157929 ENSGT00920000149138 ENSGT00390000016876 ENSGT00390000002313 ENSGT00390000007547 ENSGT00940000159532 Sperm whale MODERN SPECIES 549 MAT2A (ENSPCTG00005017128) ##22 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000161705 ENSGT01030000234543.A.a ENSGT00940000154519.d ENSGT01000000219921 ENSGT00940000156351 ENSGT00940000154761 ENSGT00940000162805 ENSGT00940000163007 ENSGT00510000047171 ENSGT00940000157038 ENSGT00530000064712 ENSGT00390000017613 ENSGT00390000009488 ENSGT00940000159305 ENSGT00940000162822 ENSGT00950000183185.c.a.a ##22 ENSGT00390000014909 ENSGT00940000160325.b ENSGT00730000111371 ENSGT00940000160552 ENSGT01030000234578.A.b.a.a.b ENSGT00390000001901 ENSGT00390000007992 ENSGT00940000161711 ENSGT00940000161151 ENSGT00940000157929 ENSGT00920000149138 ENSGT00390000016876 ENSGT00390000002313 ENSGT00390000007547 ENSGT00940000159532 Dolphin MODERN SPECIES 1097 TCF7L1 (ENSTTRG00000008959) RETSAT (ENSTTRG00000008962) ENSTTRG00000008963 CAPG (ENSTTRG00000008964) ENSTTRG00000008965 MAT2A (ENSTTRG00000008966) ##22 GGCX (ENSTTRG00000008967) VAMP8 (ENSTTRG00000008968) VAMP5 (ENSTTRG00000008969) RNF181 (ENSTTRG00000008970) TMEM150A (ENSTTRG00000008971) C2orf68 (ENSTTRG00000008972) USP39 (ENSTTRG00000008973) SFTPB (ENSTTRG00000008974) Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT01030000234543.A.a ENSGT00940000154519.d ENSGT01000000219921 ENSGT00940000156351 ENSGT00940000154761 ENSGT00940000162805 ENSGT00940000165681.d ENSGT00940000163007 ENSGT00510000047171 ENSGT00940000157038 ENSGT00530000064712 ENSGT00390000017613 ENSGT00390000009488 ENSGT00940000159305 ENSGT00940000162822 ENSGT00950000183185.c.a.a ##22 ENSGT00390000014909 ENSGT00940000160325.b ENSGT00730000111371 ENSGT00940000160552 ENSGT01030000234578.A.b.a.a.b ENSGT00390000001901 ENSGT00390000007992 ENSGT00940000161711 ENSGT00940000161151 ENSGT00940000157929 ENSGT00920000149138 ENSGT00390000016876 ENSGT00390000002313 ENSGT00390000007547 ENSGT00940000159532 Monodontidae ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000161705 ENSGT01030000234543.A.a ENSGT00940000154519.d ENSGT01000000219921 ENSGT00940000156351 ENSGT00940000154761 ENSGT00940000165681.d ENSGT00940000163007 ENSGT00510000047171 ENSGT00940000157038 ENSGT00530000064712 ENSGT00390000017613 ENSGT00390000009488 ENSGT00940000159305 ENSGT00940000162822 ENSGT00950000183185.c.a.a ##22 ENSGT00390000014909 ENSGT00940000160325.b ENSGT00730000111371 ENSGT00940000160552 ENSGT01030000234578.A.b.a.a.b ENSGT00390000001901 ENSGT00390000007992 ENSGT00940000161711 ENSGT00940000161151 ENSGT00940000157929 ENSGT00940000165659.a ENSGT00920000149138 ENSGT00390000016876 ENSGT00390000002313 ENSGT00390000007547 Narwhal MODERN SPECIES 305 ENSMMNG00015006629 ENSMMNG00015006585 ENSMMNG00015006568 ENSMMNG00015006559 SUCLG1 (ENSMMNG00015006541) DNAH6 (ENSMMNG00015006430) ENSMMNG00015006372 TMSB10 (ENSMMNG00015006357) KCMF1 (ENSMMNG00015006344) TCF7L1 (ENSMMNG00015006319) ENSMMNG00015006302 RETSAT (ENSMMNG00015006280) ELMOD3 (ENSMMNG00015006250) CAPG (ENSMMNG00015006216) SH2D6 (ENSMMNG00015006178) MAT2A (ENSMMNG00015006153) ##22 GGCX (ENSMMNG00015006106) VAMP8 (ENSMMNG00015006072) VAMP5 (ENSMMNG00015006056) RNF181 (ENSMMNG00015006028) TMEM150A (ENSMMNG00015005993) C2orf68 (ENSMMNG00015005970) USP39 (ENSMMNG00015005861) SFTPB (ENSMMNG00015005711) ATOH8 (ENSMMNG00015005651) ST3GAL5 (ENSMMNG00015005607) ENSMMNG00015005573 POLR1A (ENSMMNG00015005538) PTCD3 (ENSMMNG00015005490) IMMT (ENSMMNG00015005456) MRPL35 (ENSMMNG00015005420) Beluga whale MODERN SPECIES 61 ENSDLEG00000015387 LRRTM1 (ENSDLEG00000015398) CTNNA2 (ENSDLEG00000015448) ENSDLEG00000015731 ENSDLEG00000015822 SUCLG1 (ENSDLEG00000015835) DNAH6 (ENSDLEG00000015865) ENSDLEG00000015940 KCMF1 (ENSDLEG00000015950) TCF7L1 (ENSDLEG00000016012) ENSDLEG00000016031 RETSAT (ENSDLEG00000016040) ELMOD3 (ENSDLEG00000016055) CAPG (ENSDLEG00000016089) ENSDLEG00000016109 MAT2A (ENSDLEG00000016119) ##22 GGCX (ENSDLEG00000016129) VAMP8 (ENSDLEG00000016147) VAMP5 (ENSDLEG00000016153) RNF181 (ENSDLEG00000016163) TMEM150A (ENSDLEG00000016207) CUNH2orf68 (ENSDLEG00000016225) USP39 (ENSDLEG00000016236) ENSDLEG00000016291 ATOH8 (ENSDLEG00000016446) ST3GAL5 (ENSDLEG00000016463) ENSDLEG00000016502 POLR1A (ENSDLEG00000016519) PTCD3 (ENSDLEG00000016579) IMMT (ENSDLEG00000016629) MRPL35 (ENSDLEG00000016654) Vaquita MODERN SPECIES 4 LRRTM1 (ENSPSNG00000018662) ENSPSNG00000007264 ENSPSNG00000007353 SUCLG1 (ENSPSNG00000007400) DNAH6 (ENSPSNG00000007496) TRABD2A (ENSPSNG00000007576) 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##22 GGCX (ENSPTIG00000013923) VAMP8 (ENSPTIG00000014405) VAMP5 (ENSPTIG00000014511) RNF181 (ENSPTIG00000014685) TMEM150A (ENSPTIG00000015089) C2orf68 (ENSPTIG00000015638) USP39 (ENSPTIG00000015767) SFTPB (ENSPTIG00000016782) ST3GAL5 (ENSPTIG00000017771) POLR1A (ENSPTIG00000018783) PTCD3 (ENSPTIG00000019091) IMMT (ENSPTIG00000019189) ENSPTIG00000019867 REEP1 (ENSPTIG00000020564) KDM3A (ENSPTIG00000003722) Cat MODERN SPECIES 2 CTNNA2 (ENSFCAG00000028296) LRRTM1 (ENSFCAG00000022997) ENSFCAG00000039414 ENSFCAG00000031148 SUCLG1 (ENSFCAG00000005140) DNAH6 (ENSFCAG00000000768) TRABD2A (ENSFCAG00000000770) TMSB10 (ENSFCAG00000046545) KCMF1 (ENSFCAG00000044295) TCF7L1 (ENSFCAG00000003376) ENSFCAG00000037179 RETSAT (ENSFCAG00000003377) ELMOD3 (ENSFCAG00000003378) CAPG (ENSFCAG00000003379) SH2D6 (ENSFCAG00000003381) MAT2A (ENSFCAG00000011965) ##22 GGCX (ENSFCAG00000011967) VAMP8 (ENSFCAG00000011968) VAMP5 (ENSFCAG00000024700) RNF181 (ENSFCAG00000011969) TMEM150A (ENSFCAG00000024246) CA3H2orf68 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ENSGT00390000016876 ENSGT00390000002313 ENSGT00390000007547 Equus ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000154447.x ENSGT00940000154447.w ENSGT01030000234543.A.a ENSGT00940000161705 ENSGT00940000156351 ENSGT00940000154761 ENSGT00940000162805 ENSGT00940000165681 ENSGT00510000047171 ENSGT00940000157038 ENSGT00530000064712 ENSGT00390000017613 ENSGT00390000009488 ENSGT00940000159305 ENSGT00940000162822 ENSGT00950000183185.c.a.a ##22 ENSGT00390000014909 ENSGT00940000160325.b ENSGT00730000111371 ENSGT00940000160552 ENSGT01030000234578.A.b.a.a.b ENSGT00390000001901 ENSGT00390000007992 ENSGT00940000161711 ENSGT00390000002975 ENSGT00940000161151 ENSGT00940000157929 ENSGT00920000149138 ENSGT00390000016876 ENSGT00390000002313 ENSGT00390000007547 Horse MODERN SPECIES 6 ENSECAG00000021344 ENSECAG00000052814 ENSECAG00000046045 ENSECAG00000057371 ENSECAG00000059635 DNAH6 (ENSECAG00000011573) ENSECAG00000038584 KCMF1 (ENSECAG00000024834) TRABD2A (ENSECAG00000010499) TCF7L1 (ENSECAG00000022931) 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VAMP8 (ENSEASG00005023642) VAMP5 (ENSEASG00005001487) RNF181 (ENSEASG00005029086) TMEM150A (ENSEASG00005001495) ENSEASG00005033768 USP39 (ENSEASG00005001505) SFTPB (ENSEASG00005001518) ENSEASG00005001603 ATOH8 (ENSEASG00005001607) ST3GAL5 (ENSEASG00005001613) POLR1A (ENSEASG00005001625) PTCD3 (ENSEASG00005001638) IMMT (ENSEASG00005001647) MRPL35 (ENSEASG00005001655) Chiroptera ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000154447 ENSGT00940000161705 ENSGT01030000234543.A.a ENSGT00940000160433.a ENSGT00940000156351 ENSGT00940000154761 ENSGT00940000162805 ENSGT00940000163007 ENSGT00510000047171 ENSGT00940000157038 ENSGT00530000064712 ENSGT00390000017613 ENSGT00390000009488 ENSGT00940000159305 ENSGT00910000146589 ENSGT00950000183185.c.a.a ##22 ENSGT00390000014909 ENSGT00940000160325.b ENSGT00730000111371 ENSGT00940000160552 ENSGT01030000234578.A.b.a.a.b ENSGT00390000001901 ENSGT00390000007992 ENSGT00940000161711 ENSGT00390000002975 ENSGT00940000161151 ENSGT00940000157929 ENSGT00920000149138 ENSGT00390000016876 ENSGT00390000002313 ENSGT00390000007547 Megabat MODERN SPECIES 2127 MAT2A (ENSPVAG00000015346) ##22 GGCX (ENSPVAG00000015347) VAMP8 (ENSPVAG00000015348) VAMP5 (ENSPVAG00000015351) RNF181 (ENSPVAG00000015352) TMEM150A (ENSPVAG00000015354) C2orf68 (ENSPVAG00000015355) USP39 (ENSPVAG00000015356) SFTPB (ENSPVAG00000015359) ENSPVAG00000015360 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000154909 ENSGT00940000154447.u ENSGT00940000161705 ENSGT01030000234543.A.a ENSGT00940000160433.a ENSGT00940000156351 ENSGT00940000154761 ENSGT00940000163007 ENSGT00510000047171 ENSGT00940000157038 ENSGT00530000064712 ENSGT00390000017613 ENSGT00390000009488 ENSGT00940000159305 ENSGT00910000146589 ENSGT00950000183185.c.a.a ##22 ENSGT00390000014909 ENSGT00940000160325.b ENSGT00730000111371 ENSGT00940000160552 ENSGT01030000234578.A.b.a.a.b ENSGT00390000001901 ENSGT00390000007992 ENSGT00940000161711 ENSGT00390000002975 ENSGT00940000161151 ENSGT00940000157929 ENSGT00920000149138 ENSGT00390000016876 ENSGT00390000002313 ENSGT00390000007547 Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 4 ENSRFEG00010014177 LRRTM1 (ENSRFEG00010013989) CTNNA2 (ENSRFEG00010013591) ENSRFEG00010013508 SUCLG1 (ENSRFEG00010013453) DNAH6 (ENSRFEG00010012455) TMSB10 (ENSRFEG00010012256) KCMF1 (ENSRFEG00010012206) ENSRFEG00010012190 TCF7L1 (ENSRFEG00010012140) ENSRFEG00010012085 RETSAT (ENSRFEG00010012053) ELMOD3 (ENSRFEG00010011983) CAPG (ENSRFEG00010011887) ENSRFEG00010011863 MAT2A (ENSRFEG00010011814) ##22 GGCX (ENSRFEG00010011702) VAMP8 (ENSRFEG00010011634) ENSRFEG00010011487 TMEM150A (ENSRFEG00010011398) C2orf68 (ENSRFEG00010011347) USP39 (ENSRFEG00010010822) SFTPB (ENSRFEG00010010754) ENSRFEG00010010730 ATOH8 (ENSRFEG00010010652) ST3GAL5 (ENSRFEG00010010531) POLR1A (ENSRFEG00010010422) PTCD3 (ENSRFEG00010010292) IMMT (ENSRFEG00010009645) MRPL35 (ENSRFEG00010009536) REEP1 (ENSRFEG00010009322) Microbat DUPLICATION Microbat MODERN SPECIES 1706 MAT2A (ENSMLUG00000005348) ##22 GGCX (ENSMLUG00000005356) VAMP8 (ENSMLUG00000005363) VAMP5 (ENSMLUG00000028456) RNF181 (ENSMLUG00000027738) TMEM150A (ENSMLUG00000026810) C2orf68 (ENSMLUG00000005365) USP39 (ENSMLUG00000005367) SFTPB (ENSMLUG00000005372) ENSMLUG00000001579 Microbat MODERN SPECIES 661 ENSMLUG00000028711 ##22 Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES 1030 ENSGT00950000183185.c.a.a ##22 ENSGT00390000014909 Hedgehog MODERN SPECIES 6393 MAT2A (ENSEEUG00000002239) ##22 GGCX (ENSEEUG00000002277) Common shrew MODERN SPECIES 4969 MAT2A (ENSSARG00000013829) ##22 GGCX (ENSSARG00000013846) Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000162393 ENSGT00940000154447 ENSGT01030000234543.A.a ENSGT00940000161705 ENSGT00940000156351 ENSGT00940000154761 ENSGT00940000162805 ENSGT00940000163007 ENSGT00510000047171 ENSGT00940000157038 ENSGT00530000064712 ENSGT00390000017613 ENSGT00390000009488 ENSGT00940000159305 ENSGT00940000162822 ENSGT00950000183185.c.a.a ##22 ENSGT00390000014909 ENSGT00940000160325.b ENSGT00730000111371 ENSGT00940000160552 ENSGT01030000234578.A.b.a.a.b ENSGT00390000001901 ENSGT00390000007992 ENSGT00940000161711 ENSGT00390000002975 ENSGT00940000161151 ENSGT00940000157929 ENSGT00920000149138 ENSGT00390000016876 ENSGT00390000002313 ENSGT00390000007547 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000162393 ENSGT00940000154447 ENSGT01030000234543.A.a ENSGT00940000161705 ENSGT00940000156351 ENSGT00940000154761 ENSGT00940000162805 ENSGT00940000163007 ENSGT00510000047171 ENSGT00940000157038 ENSGT00530000064712 ENSGT00390000017613 ENSGT00390000009488 ENSGT00940000159305 ENSGT00940000162822 ENSGT00950000183185.c.a.a ##22 ENSGT00390000014909 ENSGT00940000160325.b ENSGT00730000111371 ENSGT00940000160552 ENSGT01030000234578.A.b.a.a.b ENSGT00390000001901 ENSGT00390000007992 ENSGT00940000161711 ENSGT00940000161151 ENSGT00940000157929 ENSGT00920000149138 ENSGT00390000016876 ENSGT00390000002313 ENSGT00390000007547 ENSGT00940000159532 Glires ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000162393 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ENSGT00390000014909 ENSGT00940000160325.b ENSGT00730000111371 ENSGT00940000160552 ENSGT01030000234578.A.b.a.a.b ENSGT00390000001901 ENSGT00390000007992 ENSGT00940000161711 ENSGT00940000161151 ENSGT00940000157929 ENSGT00920000149138 ENSGT00390000016876 ENSGT00390000002313 ENSGT00390000007547 ENSGT00940000159532 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000154447.y.a ENSGT00940000162393 ENSGT00940000162300 ENSGT01030000234543.A.a ENSGT00940000161705 ENSGT00940000156351 ENSGT00940000154761 ENSGT00940000163007 ENSGT00510000047171 ENSGT00940000157038 ENSGT00530000064712 ENSGT00390000017613 ENSGT00390000009488 ENSGT00940000159305 ENSGT00940000162822 ENSGT00950000183185.c.a.a ##22 ENSGT00390000014909 ENSGT00940000160325.b ENSGT00730000111371 ENSGT00940000160552 ENSGT01030000234578.A.b.a.a.b ENSGT00390000001901 ENSGT00390000007992 ENSGT00940000161711 ENSGT00940000161151 ENSGT00940000157929 ENSGT00920000149138 ENSGT00390000016876 ENSGT00390000002313 ENSGT00390000007547 ENSGT00940000159532 Kangaroo rat MODERN SPECIES 528 Suclg1 (ENSDORG00000010991) Dnah6 (ENSDORG00000000400) Tmsb10b (ENSDORG00000025129) Kcmf1 (ENSDORG00000029229) Tcf7l1 (ENSDORG00000013753) Retsat (ENSDORG00000009720) Elmod3 (ENSDORG00000009721) Capg (ENSDORG00000009722) Sh2d6 (ENSDORG00000013882) Mat2a (ENSDORG00000011312) ##22 Ggcx (ENSDORG00000006726) Vamp8 (ENSDORG00000010738) Vamp5 (ENSDORG00000027327) ENSDORG00000010740 Tmem150a (ENSDORG00000010742) 0610030E20Rik (ENSDORG00000030143) Usp39 (ENSDORG00000010746) Sftpb (ENSDORG00000010751) Atoh8 (ENSDORG00000028892) St3gal5 (ENSDORG00000008296) Polr1a (ENSDORG00000008298) Ptcd3 (ENSDORG00000008305) ENSDORG00000001073 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00940000162393 ENSGT00940000162300 ENSGT00940000154447.y.a.b ENSGT01030000234543.A.a ENSGT00940000161705 ENSGT00940000156351 ENSGT00940000154761 ENSGT00940000163007 ENSGT00510000047171 ENSGT00940000157038 ENSGT00530000064712 ENSGT00390000017613 ENSGT00390000009488 ENSGT00940000159305 ENSGT00940000162822 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ENSGT00390000017613 ENSGT00390000009488 ENSGT00940000159305 ENSGT00940000162822 ENSGT00950000183185.c.a.a ##22 ENSGT00390000014909 ENSGT00940000160325.b ENSGT00730000111371 ENSGT00940000160552 ENSGT01030000234578.A.b.a.a.b ENSGT00390000001901 ENSGT00390000007992 ENSGT00940000161711 ENSGT00940000161151 ENSGT00940000157929 ENSGT00920000149138 ENSGT00390000016876 ENSGT00390000002313 ENSGT00390000007547 ENSGT00940000159532 Mus ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000154447.y.a.b ENSGT01030000234543.A.a ENSGT00940000161705 ENSGT00390000018097.j ENSGT00940000156351 ENSGT00940000154761 ENSGT00940000165681 ENSGT00940000163007 ENSGT00510000047171 ENSGT00940000157038 ENSGT00530000064712 ENSGT00390000017613 ENSGT00390000009488 ENSGT00940000159305 ENSGT00940000162822 ENSGT00950000183185.c.a.a ##22 ENSGT00390000014909 ENSGT00940000160325.b ENSGT00730000111371 ENSGT00940000160552 ENSGT01030000234578.A.b.a.a.b ENSGT00390000001901 ENSGT00390000007992 ENSGT00940000161711 ENSGT00940000161151 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ENSGT00940000157929 ENSGT00920000149138 ENSGT00390000016876 ENSGT00390000002313 ENSGT00390000007547 ENSGT00940000159532 Steppe mouse MODERN SPECIES 3287 ENSMSIG00000006987 ENSMSIG00000006991 ENSMSIG00000006995 Suclg1 (ENSMSIG00000007008) ENSMSIG00000007054 ENSMSIG00000007062 Dnah6 (ENSMSIG00000007091) Tmsb10b (ENSMSIG00000007285) Kcmf1 (ENSMSIG00000007304) Tcf7l1 (ENSMSIG00000007365) ENSMSIG00000007493 Retsat (ENSMSIG00000007552) Elmod3 (ENSMSIG00000007675) Capg (ENSMSIG00000007704) Sh2d6 (ENSMSIG00000007788) Mat2a (ENSMSIG00000007887) ##22 Ggcx (ENSMSIG00000007972) Vamp8 (ENSMSIG00000008076) ENSMSIG00000008096 ENSMSIG00000008118 Tmem150a (ENSMSIG00000008166) 0610030E20Rik (ENSMSIG00000008200) Usp39 (ENSMSIG00000008226) Sftpb (ENSMSIG00000008238) Atoh8 (ENSMSIG00000008291) St3gal5 (ENSMSIG00000008306) ENSMSIG00000008349 Polr1a (ENSMSIG00000008358) Ptcd3 (ENSMSIG00000008420) Immt (ENSMSIG00000008522) Mrpl35 (ENSMSIG00000009352) spretus MODERN SPECIES 15 Reg3d (MGP_SPRETEiJ_G0029525) 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ENSGT00950000183185.c.a.a.h ##22 Mus_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183185.c.a.a.h ##22 Steppe mouse MODERN SPECIES 1520 ENSMSIG00000021974 ##22 Shrew mouse MODERN SPECIES 11 MGP_PahariEiJ_G0022255 Reg3b (MGP_PahariEiJ_G0022254) Lrrtm1 (MGP_PahariEiJ_G0022253) Ctnna2 (MGP_PahariEiJ_G0022252) Jkampl (MGP_PahariEiJ_G0022251) Suclg1 (MGP_PahariEiJ_G0022250) Dnah6 (MGP_PahariEiJ_G0022249) Tmsb10 (MGP_PahariEiJ_G0022248) Kcmf1 (MGP_PahariEiJ_G0022247) Tcf7l1 (MGP_PahariEiJ_G0022246) MGP_PahariEiJ_G0022245 Retsat (MGP_PahariEiJ_G0022244) Elmod3 (MGP_PahariEiJ_G0022243) Capg (MGP_PahariEiJ_G0022242) Sh2d6 (MGP_PahariEiJ_G0022241) Mat2a (MGP_PahariEiJ_G0022240) ##22 Ggcx (MGP_PahariEiJ_G0022239) Vamp8 (MGP_PahariEiJ_G0022238) Rnf181 (MGP_PahariEiJ_G0022237) Tmem150a (MGP_PahariEiJ_G0022236) 0610030E20Rik (MGP_PahariEiJ_G0022235) Usp39 (MGP_PahariEiJ_G0022234) Sftpb (MGP_PahariEiJ_G0022233) Atoh8 (MGP_PahariEiJ_G0022232) St3gal5 (MGP_PahariEiJ_G0022231) Polr1a (MGP_PahariEiJ_G0022230) Ptcd3 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(ENSMOCG00000007454) Northern American deer mouse MODERN SPECIES 16 ENSPEMG00000029707 ENSPEMG00000024691 ENSPEMG00000029513 Jkampl (ENSPEMG00000024694) Suclg1 (ENSPEMG00000010810) Dnah6 (ENSPEMG00000023939) ENSPEMG00000030958 ENSPEMG00000026592 Kcmf1 (ENSPEMG00000029405) Tcf7l1 (ENSPEMG00000004714) Tgoln1 (ENSPEMG00000007145) Retsat (ENSPEMG00000011191) Elmod3 (ENSPEMG00000010510) Capg (ENSPEMG00000018215) Sh2d6 (ENSPEMG00000016371) Mat2a (ENSPEMG00000015257) ##22 Ggcx (ENSPEMG00000013327) Vamp8 (ENSPEMG00000029313) Vamp5 (ENSPEMG00000027040) ENSPEMG00000010283 Tmem150a (ENSPEMG00000018551) 0610030E20Rik (ENSPEMG00000025650) Usp39 (ENSPEMG00000030030) Sftpb (ENSPEMG00000013792) Atoh8 (ENSPEMG00000014683) St3gal5 (ENSPEMG00000022543) ENSPEMG00000023889 Polr1a (ENSPEMG00000022224) Ptcd3 (ENSPEMG00000024106) Immt (ENSPEMG00000009199) Mrpl35 (ENSPEMG00000021175) Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 1096 ENSNGAG00000009815 Jkampl (ENSNGAG00000013694) ENSNGAG00000023092 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Ggcx (ENSJJAG00000013219) Vamp8 (ENSJJAG00000023575) Vamp5 (ENSJJAG00000021713) ENSJJAG00000012435 Tmem150a (ENSJJAG00000015485) Sftpb (ENSJJAG00000020339) Atoh8 (ENSJJAG00000003684) St3gal5 (ENSJJAG00000012802) Polr1a (ENSJJAG00000013113) ENSJJAG00000012431 Immt (ENSJJAG00000015348) Reep1 (ENSJJAG00000021695) Kdm3a (ENSJJAG00000022464) ENSJJAG00000016934 ENSJJAG00000004517 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000162300 ENSGT00940000162393 ENSGT00940000154447.z ENSGT00940000161705 ENSGT01030000234543.A.a ENSGT00940000156351 ENSGT00940000154761 ENSGT00940000163007 ENSGT00510000047171.n ENSGT00940000157038 ENSGT00530000064712 ENSGT00390000017613 ENSGT00390000009488 ENSGT00940000159305 ENSGT00940000162822 ENSGT00950000183185.c.a.a ##22 ENSGT00390000014909 ENSGT00940000160325.b ENSGT00730000111371 ENSGT00940000160552 ENSGT01030000234578.A.b.a.a.b ENSGT00390000001901 ENSGT00390000007992 ENSGT00940000161711 ENSGT00940000161151 ENSGT00940000157929 ENSGT00920000149138 ENSGT00390000016876 ENSGT00390000002313 ENSGT00390000007547 ENSGT00940000159532 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000154447.z.e.b ENSGT00940000154447.z.e.a ENSGT00940000154447.z.f ENSGT01030000234543.A.a ENSGT00940000161705 ENSGT00940000156351 ENSGT00940000154761 ENSGT00940000163007 ENSGT00510000047171.n ENSGT00940000157038 ENSGT00530000064712 ENSGT00390000017613 ENSGT00390000009488 ENSGT00940000159305 ENSGT00940000162822 ENSGT00950000183185.c.a.a ##22 ENSGT00390000014909 ENSGT00940000160325.b ENSGT00730000111371 ENSGT00940000160552 ENSGT01030000234578.A.b.a.a.b ENSGT00390000001901 ENSGT00390000007992 ENSGT00940000161711 ENSGT00940000161151 ENSGT00940000157929 ENSGT00920000149138 ENSGT00390000016876 ENSGT00390000002313 ENSGT00390000007547 ENSGT00940000159532 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES 35 ENSGT00940000154447.z.e.b ENSGT00940000154447.z.e.a ENSGT00940000154447.z.f ENSGT01030000234543.A.a ENSGT00940000161705 ENSGT00940000156351 ENSGT00940000154761 ENSGT00940000163007 ENSGT00510000047171.n 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ENSCLAG00000005858 LRRTM1 (ENSCLAG00000005364) CTNNA2 (ENSCLAG00000013755) ENSCLAG00000009325 SUCLG1 (ENSCLAG00000008580) DNAH6 (ENSCLAG00000006035) TMSB10 (ENSCLAG00000010365) KCMF1 (ENSCLAG00000009986) TCF7L1 (ENSCLAG00000007414) RETSAT (ENSCLAG00000008939) ELMOD3 (ENSCLAG00000009003) CAPG (ENSCLAG00000004481) ENSCLAG00000006141 MAT2A (ENSCLAG00000007205) ##22 GGCX (ENSCLAG00000005838) VAMP8 (ENSCLAG00000008880) VAMP5 (ENSCLAG00000009915) RNF181 (ENSCLAG00000006082) TMEM150A (ENSCLAG00000005500) C2orf68 (ENSCLAG00000009438) USP39 (ENSCLAG00000006866) SFTPB (ENSCLAG00000006471) ATOH8 (ENSCLAG00000006142) ST3GAL5 (ENSCLAG00000006950) POLR1A (ENSCLAG00000005187) PTCD3 (ENSCLAG00000007992) IMMT (ENSCLAG00000005278) MRPL35 (ENSCLAG00000004489) REEP1 (ENSCLAG00000012499) Naked mole-rat female MODERN SPECIES 23 ENSHGLG00000016889 ENSHGLG00000016878 ENSHGLG00000020983 SUCLG1 (ENSHGLG00000047475) ENSHGLG00000016621 ENSHGLG00000039609 ENSHGLG00000036565 ENSHGLG00000049290 TCF7L1 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ENSGT00730000111371 ENSGT00940000160552 ENSGT01030000234578.A.b.a.a.b ENSGT00390000001901 ENSGT00390000007992 ENSGT00940000161711 ENSGT00940000154129.m.r.b ENSGT00940000161151 ENSGT00940000157929 ENSGT00920000149138 ENSGT00390000016876 ENSGT00390000002313 ENSGT00390000007547 Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 609 IGKC (ENSUPAG00010018047) RPIA (ENSUPAG00010018051) ENSUPAG00010018060 TCF7L1 (ENSUPAG00010018088) ENSUPAG00010018102 RETSAT (ENSUPAG00010018105) ELMOD3 (ENSUPAG00010018158) CAPG (ENSUPAG00010018187) SH2D6 (ENSUPAG00010018214) MAT2A (ENSUPAG00010000075) ##22 GGCX (ENSUPAG00010000144) VAMP8 (ENSUPAG00010000178) ENSUPAG00010000192 TMEM150A (ENSUPAG00010000226) RNF181 (ENSUPAG00010000242) ENSUPAG00010000260 USP39 (ENSUPAG00010000286) SFTPB (ENSUPAG00010000319) ENSUPAG00010000360 Squirrel MODERN SPECIES 312 RPIA (ENSSTOG00000023312) ENSSTOG00000034297 ENSSTOG00000031036 TCF7L1 (ENSSTOG00000021988) ENSSTOG00000020177 RETSAT (ENSSTOG00000026131) ELMOD3 (ENSSTOG00000009420) CAPG 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Gibbon MODERN SPECIES 4 DNAH6 (ENSNLEG00000001321) ENSNLEG00000034028 TRABD2A (ENSNLEG00000001389) KCMF1 (ENSNLEG00000001418) TCF7L1 (ENSNLEG00000001462) ENSNLEG00000028501 ENSNLEG00000032991 ENSNLEG00000035166 TGOLN2 (ENSNLEG00000001482) ENSNLEG00000001496 RETSAT (ENSNLEG00000001497) ENSNLEG00000001571 CAPG (ENSNLEG00000001666) ENSNLEG00000028749 ENSNLEG00000001807 MAT2A (ENSNLEG00000001767) ##22 GGCX (ENSNLEG00000001826) ENSNLEG00000002000 VAMP5 (ENSNLEG00000030799) RNF181 (ENSNLEG00000030284) TMEM150A (ENSNLEG00000032914) C2orf68 (ENSNLEG00000027161) USP39 (ENSNLEG00000002008) SFTPB (ENSNLEG00000002112) ENSNLEG00000027010 ST3GAL5 (ENSNLEG00000002192) POLR1A (ENSNLEG00000002264) PTCD3 (ENSNLEG00000002493) IMMT (ENSNLEG00000002600) MRPL35 (ENSNLEG00000028560) REEP1 (ENSNLEG00000002772) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000156351 ENSGT00940000154761 ENSGT00940000162805 ENSGT00940000163007 ENSGT00510000047171 ENSGT00940000157038 ENSGT00390000017613.q ENSGT00530000064712 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ENSMNEG00000032428 POLR1A (ENSMNEG00000043313) PTCD3 (ENSMNEG00000032067) IMMT (ENSMNEG00000030355) MRPL35 (ENSMNEG00000043851) Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000010799.u.b.a.b.a.b ENSGT00940000156351 ENSGT00940000154761 ENSGT00940000162805 ENSGT00940000163007 ENSGT00510000047171.s.a ENSGT00940000157038 ENSGT00390000017613.q ENSGT00530000064712 ENSGT00390000017613.r ENSGT00390000009488 ENSGT00940000159305 ENSGT00940000162822 ENSGT00910000147328 ENSGT00910000146589 ENSGT00950000183185.c.a.a.s ##22 ENSGT00390000014909 ENSGT00940000160325.b ENSGT00730000111371 ENSGT00940000160552 ENSGT01030000234578.A.b.a.a.b ENSGT00390000001901 ENSGT00390000007992 ENSGT00940000161711 ENSGT00390000002975 ENSGT00940000161151 ENSGT00940000157929 ENSGT00920000149138 ENSGT00390000016876 ENSGT00390000002313 ENSGT00390000007547.g.a Olive baboon MODERN SPECIES 5 ENSPANG00000044148 ENSPANG00000044132 ENSPANG00000044948 SUCLG1 (ENSPANG00000018470) DNAH6 (ENSPANG00000017584) TRABD2A 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ENSGT00390000007547 ENSGT00940000159532 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 119 ENSGT00940000156351 ENSGT00940000154761 ENSGT00940000163007 ENSGT00510000047171 ENSGT00940000157038 ENSGT00530000064712 ENSGT00390000017613 ENSGT00390000009488 ENSGT00940000159305 ENSGT00940000162822 ENSGT00950000183185.c.a.a ##22 ENSGT00390000014909 ENSGT00940000160325.b ENSGT00730000111371 ENSGT00940000160552 ENSGT01030000234578.A.b.a.a.b ENSGT00390000001901 ENSGT00390000007992 ENSGT00940000161711 ENSGT00940000161151 ENSGT00940000157929 ENSGT00920000149138 ENSGT00390000016876 ENSGT00390000002313 ENSGT00390000007547 ENSGT00940000159532 Tenrec DUPLICATION Tenrec DUPLICATION Tenrec MODERN SPECIES 9024 ENSETEG00000006216 ##22 ENSETEG00000006218 Tenrec MODERN SPECIES 14761 ENSETEG00000015680 ##22 Tenrec MODERN SPECIES 1646 ENSETEG00000007634 ##22 ENSETEG00000007629 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 121 ENSGT00940000156351 ENSGT00940000154761 ENSGT00940000163007 ENSGT00510000047171 ENSGT00940000157038 ENSGT00530000064712 ENSGT00390000017613 ENSGT00390000009488 ENSGT00940000159305 ENSGT00940000162822 ENSGT00950000183185.c.a.a ##22 ENSGT00390000014909 ENSGT00940000160325.b ENSGT00730000111371 ENSGT00940000160552 ENSGT01030000234578.A.b.a.a.b ENSGT00390000001901 ENSGT00390000007992 ENSGT00940000161711 ENSGT00940000161151 ENSGT00940000157929 ENSGT00920000149138 ENSGT00390000016876 ENSGT00390000002313 ENSGT00390000007547 ENSGT00940000159532 Elephant MODERN SPECIES 589 ENSLAFG00000031540 SUCLG1 (ENSLAFG00000014517) DNAH6 (ENSLAFG00000009483) TMSB10 (ENSLAFG00000021694) KCMF1 (ENSLAFG00000018643) TCF7L1 (ENSLAFG00000016275) ENSLAFG00000005443 RETSAT (ENSLAFG00000016282) ELMOD3 (ENSLAFG00000016291) CAPG (ENSLAFG00000016295) ENSLAFG00000021536 MAT2A (ENSLAFG00000018042) ##22 GGCX (ENSLAFG00000018045) VAMP8 (ENSLAFG00000001520) VAMP5 (ENSLAFG00000021786) RNF181 (ENSLAFG00000021776) TMEM150A (ENSLAFG00000018054) C2orf68 (ENSLAFG00000023236) USP39 (ENSLAFG00000011741) SFTPB (ENSLAFG00000015010) ATOH8 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(ENSDNOG00000034517) SFTPB (ENSDNOG00000043019) ENSDNOG00000024234 ATOH8 (ENSDNOG00000047321) Sauria ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000161102 ENSGT00940000175342 ENSGT00940000160547 ENSGT00940000159885 ENSGT00530000064017.b ENSGT00390000011010.b ENSGT00940000161587 ENSGT00390000009948.d ENSGT00940000164226 ENSGT00950000183162.a.b ENSGT00900000140979.a.b ENSGT00940000166629 ENSGT00940000158490 ENSGT00940000165439 ENSGT00940000162822 ENSGT00950000183185.c.a.a ##22 ENSGT00390000014909 ENSGT00940000160325.b ENSGT00730000111371 ENSGT00940000160552 ENSGT01030000234578.A.b.a.a.b ENSGT00390000001901 ENSGT00390000007992 ENSGT00940000161711 ENSGT00940000161868 ENSGT00940000161976 ENSGT00950000182943.kb.b.a.b.a ENSGT00950000182943.kb.b.a.b.b ENSGT00940000159012 ENSGT00550000074946 ENSGT00940000159904 Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES 201 ENSGT00940000158490 ENSGT00940000165439 ENSGT00940000162822 ENSGT00950000183185.c.a.a ##22 Episquamata ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000156317.k ENSGT00940000161102 ENSGT00940000175342 ENSGT00940000160547 ENSGT00940000159885 ENSGT00530000064017.b ENSGT00390000011010.b ENSGT00940000161587 ENSGT00390000009948.d ENSGT00940000164226 ENSGT00950000183162.a.b ENSGT00900000140979.a.b ENSGT00940000158490 ENSGT00940000165439 ENSGT00940000162822 ENSGT00950000183185.c.a.a ##22 ENSGT00950000182869.e.b ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000179153 ENSGT00940000158930 ENSGT00940000157991 ENSGT00940000156962 ENSGT00940000155760 ENSGT00940000160545 ENSGT01030000234574.B.c.b.b ENSGT00940000167325 ENSGT00390000003246 ENSGT00390000000134.b ENSGT00940000159875 ENSGT00940000156888 ENSGT00390000003458 Toxicofera ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000014853 ENSGT00390000000483.b ENSGT00940000158750 ENSGT00390000003477 ENSGT00390000012901 ENSGT00940000159350 ENSGT00940000157037.a ENSGT00940000159192 ENSGT00390000009416 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000160449 ENSGT00940000158490 ENSGT00940000165439 ENSGT00950000183185.c.a.a ##22 ENSGT00950000182869.e.b ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000179153 ENSGT00940000158930 ENSGT00940000157991 ENSGT00940000156962 ENSGT00940000155760 ENSGT00940000160545 ENSGT01030000234574.B.c.b.b ENSGT00940000167325 ENSGT00390000003246 ENSGT00390000000134.b ENSGT00940000159875 ENSGT00940000156888 ENSGT00390000003458 Elapidae ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000155596 ENSGT00940000156317.k ENSGT00940000161102 ENSGT00940000175342 ENSGT00940000160547 ENSGT00940000159885 ENSGT00390000011010.b ENSGT00940000161587 ENSGT00390000009948.d ENSGT00940000164226 ENSGT00950000183162.a.b ENSGT00900000140979.a.b ENSGT00940000160449 ENSGT00940000158490 ENSGT00940000165439 ENSGT00950000183185.c.a.a ##22 ENSGT00950000182869.e.b ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000179153 ENSGT00940000158930 ENSGT00940000157991 ENSGT00940000156962 ENSGT00940000155760 ENSGT00940000160545 ENSGT01030000234574.B.c.b.b Elapidae_a ANCESTRAL SPECIES 93 ENSGT00940000155596 ENSGT00940000156317.k ENSGT00940000161102 ENSGT00940000175342 ENSGT00940000160547 ENSGT00940000159885 ENSGT00390000011010.b ENSGT00940000161587 ENSGT00390000009948.d ENSGT00940000164226 ENSGT00950000183162.a.b ENSGT00900000140979.a.b ENSGT00940000160449 ENSGT00940000158490 ENSGT00940000165439 ENSGT00950000183185.c.a.a ##22 ENSGT00950000182869.e.b ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000158930 ENSGT00940000157991 ENSGT00940000156962 ENSGT00940000155760 ENSGT00940000160545 ENSGT01030000234574.B.c.b.b Acanthophiinae ANCESTRAL SPECIES 40 ENSGT00940000155596 ENSGT00940000156317.k ENSGT00940000161102 ENSGT00940000175342 ENSGT00940000160547 ENSGT00940000159885 ENSGT00390000011010.b.dc ENSGT00940000161587 ENSGT00390000009948.d ENSGT00940000164226 ENSGT00950000183162.a.b ENSGT00900000140979.a.b ENSGT00940000160449 ENSGT00940000158490 ENSGT00940000165439 ENSGT00950000183185.c.a.a ##22 ENSGT00950000182869.e.b ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000158930 ENSGT00940000157991.m ENSGT00940000156962 ENSGT00940000155760 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MODERN SPECIES 1157 ENSACAG00000027863 ENSACAG00000013083 ENSACAG00000013065 ENSACAG00000041806 MAT2A (ENSACAG00000044436) ##22 ENSACAG00000012939 IKBKB (ENSACAG00000012776) PLAT (ENSACAG00000012620) AP3M2 (ENSACAG00000012565) KAT6A (ENSACAG00000012392) ANK1 (ENSACAG00000012052) Laterata ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000155596 ENSGT00940000156317.k ENSGT00940000161102 ENSGT00940000160547 ENSGT00940000159885 ENSGT00530000064017.b ENSGT00390000011010.b ENSGT00940000161587 ENSGT00390000009948.d ENSGT00940000164226 ENSGT00950000183162.a.b ENSGT00900000140979.a.b ENSGT00940000158490 ENSGT00940000165439 ENSGT00940000162822 ENSGT00950000183185.c.a.a ##22 ENSGT00950000182869.e.b ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000158930 ENSGT00940000157991 ENSGT00940000156962 ENSGT00940000155760 ENSGT00940000160545 ENSGT01030000234574.B.c.b.b ENSGT00940000167325 ENSGT00390000003246 ENSGT00390000000134.b ENSGT00940000159875 ENSGT00940000156888 ENSGT00390000003458 ENSGT01050000246142 Argentine black and white tegu MODERN SPECIES 127 CNNM3 (ENSSMRG00000019802) ENSSMRG00000019803 ANKRD39 (ENSSMRG00000019804) SEMA4C (ENSSMRG00000019805) ENSSMRG00000019806 COX5B (ENSSMRG00000019808) ACTR1B (ENSSMRG00000019809) ENSSMRG00000019810 ENSSMRG00000019811 PURB (ENSSMRG00000019812) H2AZ2 (ENSSMRG00000019813) ENSSMRG00000019814 POLM (ENSSMRG00000019815) ENSSMRG00000019816 ENSSMRG00000019818 MAT2A (ENSSMRG00000019819) ##22 IKBKB (ENSSMRG00000019820) PLAT (ENSSMRG00000019821) AP3M2 (ENSSMRG00000019822) KAT6A (ENSSMRG00000019823) Common wall lizard MODERN SPECIES 16 ENSPMRG00000010557 ENSPMRG00000010554 ENSPMRG00000010544 ENSPMRG00000010540 IGSF21 (ENSPMRG00000010536) ARHGEF10L (ENSPMRG00000010105) ENSPMRG00000010024 ENSPMRG00000010023 ENSPMRG00000010020 PURB (ENSPMRG00000010017) H2AZ2 (ENSPMRG00000010009) ENSPMRG00000010001 ENSPMRG00000009997 ENSPMRG00000009982 ENSPMRG00000009973 MAT2A (ENSPMRG00000009964) ##22 VDAC3 (ENSPMRG00000009951) ENSPMRG00000009947 ENSPMRG00000009943 IKBKB (ENSPMRG00000009818) 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African ostrich MODERN SPECIES 863 GCK (ENSSCUG00000014547) POLD2 (ENSSCUG00000014545) AEBP1 (ENSSCUG00000014544) CAPG (ENSSCUG00000014541) DBNL (ENSSCUG00000014539) ENSSCUG00000014538 ENSSCUG00000014536 ELMOD3 (ENSSCUG00000014534) GPAT2 (ENSSCUG00000014529) H2AZ2 (ENSSCUG00000014524) MAT2A (ENSSCUG00000014523) ##22 ENSSCUG00000014520 ENSSCUG00000014516 USP39 (ENSSCUG00000014513) Australian saltwater crocodile MODERN SPECIES 51 GPAT4 (ENSCPRG00005000656) NKX6-3 (ENSCPRG00005000634) ANK1 (ENSCPRG00005000592) KAT6A (ENSCPRG00005000585) AP3M2 (ENSCPRG00005000578) PLAT (ENSCPRG00005000562) IKBKB (ENSCPRG00005000500) DKK4 (ENSCPRG00005000482) VDAC3 (ENSCPRG00005000463) POLB (ENSCPRG00005000434) SEMA4C (ENSCPRG00005000404) PURB (ENSCPRG00005000388) H2AZ2 (ENSCPRG00005000382) ENSCPRG00005000376 POLM (ENSCPRG00005000370) MAT2A (ENSCPRG00005000252) ##22 GGCX (ENSCPRG00005000222) VAMP8 (ENSCPRG00005000205) VAMP5 (ENSCPRG00005000186) TMEM150A (ENSCPRG00005000180) ENSCPRG00005000164 C2orf68 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ENSGT00940000161542 ENSGT00390000013711 ENSGT00940000154191.k.a ENSGT00940000154849.b ENSGT00940000155991 ENSGT00940000165465 ENSGT00940000157987 ENSGT00390000005772 ENSGT00530000063370.b ENSGT00530000063869.B ENSGT00940000154495.b.b.a ENSGT00940000161655 ENSGT00940000154284.b ENSGT00940000156855.c ENSGT00950000183185.c.a.a ##22 ENSGT00390000001901 ENSGT00390000007992 ENSGT00940000164890.b ENSGT00940000156009.A.c ENSGT00950000182859.A.a.a.b P. kingsleyae MODERN SPECIES 523 ENSPKIG00000017315 trafd1 (ENSPKIG00000017365) ENSPKIG00000017489 selenom (ENSPKIG00000017624) INPP5J (ENSPKIG00000017651) mat2ab (ENSPKIG00000017674) ##22 si:ch211-283h6.4 (ENSPKIG00000017698) usp39 (ENSPKIG00000017728) sftpbb (ENSPKIG00000017785) ENSPKIG00000017822 ebf2 (ENSPKIG00000017875) Asian bonytongue MODERN SPECIES 10 SRSF9 (ENSSFOG00015002476) DNAH10 (ENSSFOG00015002188) ENSSFOG00015002154 rhbdd3 (ENSSFOG00015002104) ewsr1b (ENSSFOG00015002086) GAS2L1 (ENSSFOG00015027655) ap1b1 (ENSSFOG00015001894) rasl10a 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ENSGT00910000144252.d.b ENSGT00940000166216 ENSGT00940000166787 Otophysi ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000156183 ENSGT00940000156730.b.b ENSGT01050000244968.c.c ENSGT00940000159403 ENSGT00570000079101.a.b ENSGT00390000011937.g.a ENSGT00940000154191.k.b ENSGT00940000157386.b ENSGT01050000244888.b.b.a.b.d ENSGT00390000013929 ENSGT00950000182881.a.b.a.a.b ENSGT00940000166850 ENSGT00730000111291 ENSGT00940000154495.b.b.b ENSGT00940000156855.d ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.a ##22 ENSGT00940000164890.a ENSGT00940000156009.A.d ENSGT00940000154779.a.b.a ENSGT00390000001280.b ENSGT00390000014909 ENSGT00940000156185 ENSGT00390000006707 ENSGT00390000011206.a ENSGT00390000014879.c.a.a.a ENSGT00940000157856 ENSGT00940000153340.B ENSGT00950000182904.a.b.a ENSGT00910000144252.d.b ENSGT00940000166216 ENSGT00940000166787 Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 40 ENSGT00940000156730.b.b ENSGT01050000244968.c.c ENSGT00940000159403 ENSGT00570000079101.a.b ENSGT00390000011937.g.a ENSGT00970000197354 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ENSGT00940000157856 ENSGT00940000153340.B ENSGT00950000182904.a.b.a ENSGT00910000144252.d.b ENSGT00940000166216 ENSGT00940000166787 Mexicana tetra MODERN SPECIES 12 ENSAMXG00000018829 DHX29 (ENSAMXG00000018788) mtrex (ENSAMXG00000018751) hvcn1 (ENSAMXG00000018716) ENSAMXG00000036316 PPTC7 (ENSAMXG00000018699) TBC1D10A (ENSAMXG00000018692) aplnrb (ENSAMXG00000025111) ENSAMXG00000030604 ATP6V0A2 (ENSAMXG00000018672) ewsr1a (ENSAMXG00000018663) ENSAMXG00000018636 slc35e4 (ENSAMXG00000034700) ENSAMXG00000018627 INPP5J (ENSAMXG00000018608) mat2aa (ENSAMXG00000018589) ##22 ENSAMXG00000043655 mpx (ENSAMXG00000018520) mpx (ENSAMXG00000018553) loxa (ENSAMXG00000018503) snx24 (ENSAMXG00000037448) GGCX (ENSAMXG00000018477) gmcl1 (ENSAMXG00000018463) fam136a (ENSAMXG00000043249) pcyox1 (ENSAMXG00000039915) pcyox1 (ENSAMXG00000031156) slc20a1b (ENSAMXG00000019185) STARD7 (ENSAMXG00000041522) ENSAMXG00000038811 ENSAMXG00000043452 ENSAMXG00000042853 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 181 PLPP1 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Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000167013.i ENSGT00390000004965.b ENSGT00940000158782.d.b.g ENSGT00390000016468.b ENSGT00390000016468.a ENSGT00530000064873.a.a ENSGT00390000011937.g.a.d ENSGT00940000157386.b.d ENSGT01050000244888.b.b.a.b.d.c ENSGT00390000013929.g ENSGT00950000182881.a.b.a.a.b.c ENSGT00940000166850.a ENSGT00730000111291.a ENSGT00940000154495.b.b.b.c ENSGT00940000156855.d.b ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.a.c ##22 ENSGT00940000164890.a.a ENSGT00940000156009.A.d.s.a ENSGT00940000154779.a.b.a.g ENSGT00390000001280.b.m ENSGT00390000014909.e ENSGT00940000156185.f ENSGT00390000006707.f ENSGT00390000011206.a.i.a ENSGT00390000014879.c.a.a.a.d ENSGT00940000157856.d ENSGT00940000153340.B.db ENSGT00950000182904.a.b.a.f ENSGT00940000166216 ENSGT00940000162631.e ENSGT00940000158101.f Rainbow trout MODERN SPECIES 26 ENSOMYG00000027775 ENSOMYG00000058231 ENSOMYG00000027762 ENSOMYG00000048106 ENSOMYG00000058199 ENSOMYG00000027715 ENSOMYG00000055792 ENSOMYG00000074789 aplnrb 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ENSGT00940000156009.A.d.s.a ENSGT00940000154779.a.b.a.g ENSGT00390000001280.b.m ENSGT00390000014909.e ENSGT00940000156185.f ENSGT00390000006707.f ENSGT00390000011206.a.i.a ENSGT00390000014879.c.a.a.a.d ENSGT00940000157856.d ENSGT00940000153340.B.db ENSGT00950000182904.a.b.a.f ENSGT00940000166216 ENSGT00940000162631.e ENSGT00940000158101.f Chinook salmon MODERN SPECIES 12 pcna (ENSOTSG00005028438) kcnip3b (ENSOTSG00005028415) ENSOTSG00005028414 ENSOTSG00005028413 prnpb (ENSOTSG00005028412) PPTC7 (ENSOTSG00005028411) TBC1D10A (ENSOTSG00005028408) ENSOTSG00005028404 aplnrb (ENSOTSG00005028403) ENSOTSG00005028400 ENSOTSG00005027853 ENSOTSG00005027756 slc35e4 (ENSOTSG00005027754) ENSOTSG00005027751 INPP5J (ENSOTSG00005027714) mat2aa (ENSOTSG00005027708) ##22 ENSOTSG00005027706 mpx (ENSOTSG00005026447) loxa (ENSOTSG00005026442) snx24 (ENSOTSG00005026441) ENSOTSG00005026437 ENSOTSG00005026433 gmcl1 (ENSOTSG00005026427) fam136a (ENSOTSG00005026426) pcyox1 (ENSOTSG00005026425) slc20a1b 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ENSGT00940000167013.i ENSGT00390000004965.b ENSGT00940000158782.d.b.g ENSGT00390000016468.b ENSGT00530000064873.a.a ENSGT00390000011937.g.a.d ENSGT00940000157386.b.d ENSGT01050000244888.b.b.a.b.d.c ENSGT00940000178234 ENSGT00390000013929.g ENSGT00950000182881.a.b.a.a.b.c ENSGT00940000166850.a ENSGT00730000111291.a ENSGT00940000154495.b.b.b.c ENSGT00940000156855.d.b ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.a.c ##22 ENSGT00940000164890.a.a ENSGT00940000156009.A.d.s.a ENSGT00940000154779.a.b.a.g ENSGT00390000001280.b.m ENSGT00390000014909.f.b ENSGT00940000156185.f ENSGT00390000006707.f ENSGT00390000011206.a.i.a ENSGT00390000014879.c.a.a.a.d ENSGT00940000157856.d ENSGT00940000153340.B.db ENSGT00950000182904.a.b.a.f ENSGT00940000166216 ENSGT00940000162631.e ENSGT00940000158101.f Atlantic salmon MODERN SPECIES trim69 (ENSSSAG00000009437) pcna (ENSSSAG00000009453) ENSSSAG00000058432 ENSSSAG00000114857 ENSSSAG00000010124 ENSSSAG00000108905 ENSSSAG00000111316 ENSSSAG00000116417 aplnrb 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(ENSSTUG00000006674) ##22 ENSSTUG00000006722 mpx (ENSSTUG00000006763) loxa (ENSSTUG00000006986) snx24 (ENSSTUG00000007001) ENSSTUG00000007010 ENSSTUG00000007033 gmcl1 (ENSSTUG00000007080) fam136a (ENSSTUG00000007090) pcyox1 (ENSSTUG00000007099) slc20a1b (ENSSTUG00000007127) STARD7 (ENSSTUG00000007805) drg1 (ENSSTUG00000007933) KCNN2 (ENSSTUG00000007959) ska1 (ENSSTUG00000007972) nt5c2l1 (ENSSTUG00000007997) River trout MODERN SPECIES 3 ENSSTUG00000008730 ENSSTUG00000008692 kcnip3b (ENSSTUG00000008613) ENSSTUG00000008603 prnpb (ENSSTUG00000008601) PPTC7 (ENSSTUG00000008591) TBC1D10A (ENSSTUG00000008566) aplnrb (ENSSTUG00000008552) ENSSTUG00000008545 ENSSTUG00000008101 ewsr1a (ENSSTUG00000008062) ENSSTUG00000008019 slc35e4 (ENSSTUG00000008004) ENSSTUG00000007999 INPP5J (ENSSTUG00000007883) mat2aa (ENSSTUG00000007647) ##22 ENSSTUG00000007618 mpx (ENSSTUG00000007163) loxa (ENSSTUG00000007132) snx24 (ENSSTUG00000007097) GGCX (ENSSTUG00000006556) gmcl1 (ENSSTUG00000006393) fam136a (ENSSTUG00000006364) ENSSTUG00000006352 pcyox1 (ENSSTUG00000006349) slc20a1b (ENSSTUG00000006195) ENSSTUG00000006173 ENSSTUG00000006138 drg1 (ENSSTUG00000006089) KCNN2 (ENSSTUG00000006066) smarcad1b (ENSSTUG00000005593) Huchen MODERN SPECIES 11261 mat2aa (ENSHHUG00000014273) ##22 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 241 ENSGT00940000158782.d.b.h ENSGT00390000016468.a ENSGT00530000064873.a.b ENSGT00390000011937.g.a.c ENSGT00940000157386.b.c ENSGT01050000244888.b.b.a.b.d.d ENSGT00390000013929.h ENSGT00950000182881.a.b.a.a.b.d ENSGT00940000154191.k.b ENSGT00940000166850.b ENSGT00730000111291.b ENSGT00940000154495.b.b.b.d ENSGT00940000156855.d.a ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.a.d ##22 ENSGT00940000164890.a.b ENSGT00940000156009.A.d.s.b ENSGT00940000154779.a.b.a.h ENSGT00390000001280.b.n ENSGT00390000014909.f.a ENSGT00940000156185.e ENSGT00390000006707.e ENSGT00390000011206.a.j ENSGT00390000014879.c.a.a.a.c ENSGT00940000157856.c ENSGT00940000153340.B.eb ENSGT00950000182904.a.b.a.e ENSGT00940000166787 ENSGT00940000162631.f ENSGT00940000158101.e Huchen MODERN SPECIES 71 pcna (ENSHHUG00000034015) kcnip3b (ENSHHUG00000034041) ENSHHUG00000034056 prnpb (ENSHHUG00000034062) ENSHHUG00000034064 PPTC7 (ENSHHUG00000034070) TBC1D10A (ENSHHUG00000034077) aplnrb (ENSHHUG00000034106) ENSHHUG00000034115 ENSHHUG00000034124 ewsr1a (ENSHHUG00000034145) ENSHHUG00000034156 slc35e4 (ENSHHUG00000034177) ENSHHUG00000034181 INPP5J (ENSHHUG00000034188) mat2aa (ENSHHUG00000034226) ##22 ENSHHUG00000034238 mpx (ENSHHUG00000034265) loxa (ENSHHUG00000034377) snx24 (ENSHHUG00000034388) GGCX (ENSHHUG00000034432) ENSHHUG00000034472 ENSHHUG00000034476 fam136a (ENSHHUG00000034487) pcyox1 (ENSHHUG00000034498) slc20a1b (ENSHHUG00000034509) ENSHHUG00000034549 drg1 (ENSHHUG00000034577) KCNN2 (ENSHHUG00000034600) smarcad1b (ENSHHUG00000034610) ENSHHUG00000034634 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000165390.b.c.a ENSGT00990000212312 ENSGT00940000158782.d.b.h ENSGT00390000016468.a 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ENSGT00940000166850.b ENSGT00730000111291.b ENSGT00940000154495.b.b.b.d ENSGT00940000156855.d.a ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.a.d ##22 ENSGT00940000164890.a.b ENSGT00940000156009.A.d.s.b ENSGT00940000154779.a.b.a.h ENSGT00390000014909.f.a ENSGT00940000156185.e ENSGT00390000006707.e ENSGT00390000011206.a.j ENSGT00390000014879.c.a.a.a.c ENSGT00940000157856.c ENSGT00940000153340.B.eb ENSGT00950000182904.a.b.a.e ENSGT00910000144252.d.b ENSGT01060000252579 ENSGT01030000234969 ENSGT00940000166787 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000165390.b.c.a.c ENSGT00990000212312 ENSGT00940000158782.d.b.h ENSGT01000000221771 ENSGT00530000064873.a.b ENSGT00390000011937.g.a.c ENSGT00940000157386.b.c ENSGT01050000244888.b.b.a.b.d.d ENSGT00390000013929.h ENSGT00950000182881.a.b.a.a.b.d ENSGT00940000154191.k.b ENSGT00940000166850.b ENSGT00730000111291.b ENSGT00940000154495.b.b.b.d ENSGT00940000156855.d.a ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.a.d ##22 ENSGT00940000164890.a.b ENSGT00940000156009.A.d.s.b ENSGT00940000154779.a.b.a.h ENSGT00390000014909.f.a ENSGT00940000156185.e ENSGT00390000006707.e ENSGT00390000011206.a.j ENSGT00390000014879.c.a.a.a.c ENSGT00940000157856.c ENSGT00940000153340.B.eb ENSGT00950000182904.a.b.a.e ENSGT00910000144252.d.b ENSGT01030000234969 ENSGT00940000166787 ENSGT00940000162631.f Chinook salmon MODERN SPECIES 26 hrh2b (ENSOTSG00005002923) ENSOTSG00005002795 kcnip3b (ENSOTSG00005038063) ENSOTSG00005038058 prnpb (ENSOTSG00005038057) PPTC7 (ENSOTSG00005038056) TBC1D10A (ENSOTSG00005037960) aplnrb (ENSOTSG00005037958) ENSOTSG00005037957 ENSOTSG00005037228 ewsr1a (ENSOTSG00005037219) ENSOTSG00005037218 slc35e4 (ENSOTSG00005037217) ENSOTSG00005037216 INPP5J (ENSOTSG00005037214) mat2aa (ENSOTSG00005037176) ##22 ENSOTSG00005037175 mpx (ENSOTSG00005037118) loxa (ENSOTSG00005037114) GGCX (ENSOTSG00005037089) gmcl1 (ENSOTSG00005037064) FAM136A (ENSOTSG00005037062) pcyox1 (ENSOTSG00005037060) slc20a1b (ENSOTSG00005036696) ENSOTSG00005036693 drg1 (ENSOTSG00005036692) KCNN2 (ENSOTSG00005036690) smarcad1b (ENSOTSG00005036685) ENSOTSG00005036683 slc2a11l (ENSOTSG00005036682) nt5c2l1 (ENSOTSG00005035366) Coho salmon MODERN SPECIES 21 kcnip1b (ENSOKIG00005050048) ENSOKIG00005050033 ENSOKIG00005050023 ENSOKIG00005050013 ENSOKIG00005050009 ENSOKIG00005050002 PPTC7 (ENSOKIG00005049999) ENSOKIG00005049968 ENSOKIG00005049946 ENSOKIG00005049914 ewsr1a (ENSOKIG00005049886) ENSOKIG00005049881 slc35e4 (ENSOKIG00005049880) ENSOKIG00005049878 ENSOKIG00005049876 mat2aa (ENSOKIG00005049872) ##22 ENSOKIG00005049861 mpx (ENSOKIG00005049844) loxa (ENSOKIG00005049824) GGCX (ENSOKIG00005049801) gmcl1 (ENSOKIG00005049752) fam136a (ENSOKIG00005049742) pcyox1 (ENSOKIG00005049736) slc20a1b (ENSOKIG00005049702) ENSOKIG00005049677 drg1 (ENSOKIG00005049626) KCNN2 (ENSOKIG00005049605) smarcad1b (ENSOKIG00005049544) ENSOKIG00005049500 smarcad1b (ENSOKIG00005049424) ENSOKIG00005049405 Rainbow trout MODERN SPECIES 364 ENSOMYG00000047209 ENSOMYG00000047189 ENSOMYG00000047183 ENSOMYG00000047177 ENSOMYG00000047175 ENSOMYG00000076120 ENSOMYG00000047169 aplnrb (ENSOMYG00000047160) ENSOMYG00000069526 ENSOMYG00000047003 ewsr1a (ENSOMYG00000046894) ENSOMYG00000046878 slc35e4 (ENSOMYG00000046874) ENSOMYG00000046869 ENSOMYG00000046857 mat2aa (ENSOMYG00000046835) ##22 ENSOMYG00000046811 mpx (ENSOMYG00000046785) loxa (ENSOMYG00000064150) ENSOMYG00000046605 gmcl1 (ENSOMYG00000046503) fam136a (ENSOMYG00000046498) pcyox1 (ENSOMYG00000058237) slc20a1b (ENSOMYG00000046445) ENSOMYG00000046432 ENSOMYG00000050731 ENSOMYG00000046414 drg1 (ENSOMYG00000046387) ENSOMYG00000046380 ENSOMYG00000053594 smarcad1b (ENSOMYG00000046354) Salmo ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000158048.d.e ENSGT00990000212312 ENSGT00940000158782.d.b.h ENSGT00390000016468.a ENSGT00530000064873.a.b ENSGT00390000011937.g.a.c ENSGT00940000157386.b.c ENSGT01050000244888.b.b.a.b.d.d ENSGT00390000013929.h ENSGT00950000182881.a.b.a.a.b.d ENSGT00940000154191.k.b ENSGT00940000166850.b ENSGT00730000111291.b ENSGT00940000154495.b.b.b.d ENSGT00940000156855.d.a ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.a.d ##22 ENSGT00940000164890.a.b ENSGT00940000156009.A.d.s.b ENSGT00940000154779.a.b.a.h ENSGT00390000001280.b.n ENSGT00390000014909.f.a ENSGT00940000156185.e ENSGT00390000006707.e ENSGT00390000011206.a.i.b ENSGT00390000014879.c.a.a.a.c ENSGT00940000157856.c ENSGT00940000153340.B.eb ENSGT00950000182904.a.b.a.e ENSGT00910000144252.d.b ENSGT01060000252579 ENSGT01030000234969 Atlantic salmon MODERN SPECIES 2 ENSSSAG00000058765 ENSSSAG00000058634 ENSSSAG00000009482 ENSSSAG00000058413 ENSSSAG00000106012 ENSSSAG00000058265 ENSSSAG00000058243 ENSSSAG00000058238 ENSSSAG00000058222 ENSSSAG00000050674 ewsr1a (ENSSSAG00000050377) ENSSSAG00000118105 slc35e4 (ENSSSAG00000050277) ENSSSAG00000050262 ENSSSAG00000050128 mat2aa (ENSSSAG00000049772) ##22 ENSSSAG00000049747 mpx (ENSSSAG00000048994) ENSSSAG00000083263 ENSSSAG00000092501 loxa (ENSSSAG00000048951) snx24 (ENSSSAG00000091427) ENSSSAG00000048110 gmcl1 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slc2a11l (ENSELUG00000019023) nt5c2l1 (ENSELUG00000018958) Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00940000156575 ENSGT00940000155968.d.a ENSGT00940000156522.c.b ENSGT00940000157176.b ENSGT00940000167013 ENSGT00940000158782.d.b ENSGT00390000016468 ENSGT00530000064873.a ENSGT00940000157386.b ENSGT00390000013929 ENSGT00950000182881.a.b.a.a.b ENSGT00940000166850 ENSGT00730000111291 ENSGT00940000154495.b.b.b ENSGT00940000156855.d ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.a ##22 ENSGT00940000164890.a ENSGT00940000156009.A.d ENSGT00940000154779.a.b.a ENSGT00390000001280.b ENSGT00390000014909 ENSGT00940000156185 ENSGT00390000006707 ENSGT00390000011206.a ENSGT00390000014879.c.a.a.a ENSGT00940000157856 ENSGT00940000153340.B ENSGT00950000182904.a.b.a ENSGT00940000166787 ENSGT00940000162631 ENSGT00940000158101 Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000156522.c.b ENSGT00940000157176.b ENSGT00940000167013 ENSGT00940000158782.d.b ENSGT00390000016468 ENSGT00530000064873.a ENSGT00390000011937.g.a 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ENSMMDG00005004440 mpx (ENSMMDG00005004421) loxa (ENSMMDG00005004400) snx24 (ENSMMDG00005023666) GGCX (ENSMMDG00005023662) gmcl1 (ENSMMDG00005023660) fam136a (ENSMMDG00005023659) cdc37l1 (ENSMMDG00005023657) ak3 (ENSMMDG00005023654) rcl1 (ENSMMDG00005023650) anxa3b (ENSMMDG00005023626) ENSMMDG00005023610 npdc1a (ENSMMDG00005023601) pou5f3 (ENSMMDG00005023598) fut7 (ENSMMDG00005023597) Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00390000013711 ENSGT00940000154191.k.a ENSGT00940000154849.b ENSGT00940000155991 ENSGT00940000165465 ENSGT00940000157987 ENSGT00730000112955 ENSGT00390000005772 ENSGT00530000063370.b ENSGT00530000063869.B ENSGT00940000154495.b.b.a ENSGT00940000161655 ENSGT00940000154284.b ENSGT00940000177369 ENSGT00940000156855.c ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.b ##22 ENSGT00390000001901 ENSGT00390000007992 ENSGT00940000164890.b ENSGT00940000156009.A.c ENSGT00950000182859.A.a.a.b ENSGT00940000155760.t.a ENSGT00940000168975 ENSGT00940000159932.a ENSGT00940000163919.a ENSGT00940000159627 ENSGT01050000244898.b.a ENSGT00940000164825 ENSGT00390000009670 ENSGT00940000153849.a.a.a ENSGT00390000012759 Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 443 ENSGT00940000161655 ENSGT00940000154284.b ENSGT00940000156855.c ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.b ##22 ENSGT00390000001901 ENSGT00390000007992 ENSGT00940000156009.A.c ENSGT00940000155760.u ENSGT00950000182859.A.a.a.b ENSGT00940000163919.a ENSGT00940000155760.t.a Otophysi ANCESTRAL SPECIES 256 ENSGT00940000156859 ENSGT00490000043385 ENSGT00940000155998 ENSGT00940000161655 ENSGT00940000154284.b ENSGT00940000177369 ENSGT00940000156855.c ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.b ##22 ENSGT00390000001901 ENSGT00390000007992 ENSGT00940000164890.b ENSGT00940000163919.a ENSGT00940000155760.t.a ENSGT00950000182859.A.a.a.b ENSGT00940000159627 ENSGT01050000244898.b.a ENSGT00940000164825 ENSGT00390000009670 ENSGT00940000153849.a.a.a ENSGT00390000012759 ENSGT00940000163293.c.a ENSGT00940000160182 ENSGT00940000157897.b Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 129 ENSGT00940000154540.b ENSGT00390000004147 ENSGT00390000013370 ENSGT00390000002172.B ENSGT00940000159009 ENSGT00390000003405 ENSGT00940000158691 ENSGT00390000001803 ENSGT00940000153241.A.cb ENSGT00490000043385 ENSGT00940000155998 ENSGT00940000161655 ENSGT00940000154284.b ENSGT00940000177369 ENSGT00940000156855.c ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.b ##22 ENSGT00390000001901 ENSGT00390000007992 ENSGT00940000164890.b ENSGT00940000163919.a ENSGT00940000155760.t.a ENSGT00950000182859.A.a.a.b ENSGT00940000159627 ENSGT01050000244898.b.a ENSGT00940000164825 ENSGT00390000009670 ENSGT00940000153849.a.a.a ENSGT00390000012759 ENSGT00940000163293.c.a ENSGT00940000160182 ENSGT00940000157897.b Channel catfish MODERN SPECIES 14 ENSIPUG00000020340 Psmd9 (ENSIPUG00000020349) wdr66 (ENSIPUG00000020374) bcl7a (ENSIPUG00000020390) alkbh2 (ENSIPUG00000020407) ung (ENSIPUG00000020417) mlxip (ENSIPUG00000020430) sra1 (ENSIPUG00000020481) psat1 (ENSIPUG00000020490) isca1 (ENSIPUG00000020544) CCNO (ENSIPUG00000020561) ENSIPUG00000020568 ENSIPUG00000020584 selenom (ENSIPUG00000020604) INPP5J (ENSIPUG00000020611) MAT2A (ENSIPUG00000020619) ##22 c22h2orf68 (ENSIPUG00000020652) usp39 (ENSIPUG00000020671) spaw (ENSIPUG00000020679) ank1a (ENSIPUG00000020684) ebf2 (ENSIPUG00000020735) dguok (ENSIPUG00000020750) mob1a (ENSIPUG00000020754) MTHFD2 (ENSIPUG00000020776) arl6ip4 (ENSIPUG00000020789) mtrfr (ENSIPUG00000020793) rilpl2 (ENSIPUG00000020800) kmt5ab (ENSIPUG00000020804) HIP1R (ENSIPUG00000020815) SDS (ENSIPUG00000020866) HECTD4 (ENSIPUG00000020876) Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 183 ENSGT00940000161655 ENSGT00940000154284.b ENSGT00940000177369 ENSGT00940000156855.c ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.b ##22 ENSGT00390000001901 ENSGT00390000007992 ENSGT00940000164890.b ENSGT00940000163919.a ENSGT00940000155760.t.a ENSGT00950000182859.A.a.a.b ENSGT00940000159627 ENSGT01050000244898.b.a ENSGT00940000164825 ENSGT00390000009670 ENSGT00940000153849.a.a.a ENSGT00390000012759 ENSGT00940000163293.c.a ENSGT00940000160182 ENSGT00940000157897.b Characoidei ANCESTRAL SPECIES 222 ENSGT00940000161655 ENSGT00940000154284.b ENSGT00940000177369 ENSGT00940000156855.c ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.b ##22 ENSGT00390000001901 ENSGT00390000007992 ENSGT00940000164890.b ENSGT00940000163919.a ENSGT00940000155760.t.a ENSGT00950000182859.A.a.a.b ENSGT00940000159627 ENSGT01050000244898.b.a ENSGT00940000164825 ENSGT00390000009670 ENSGT00940000153849.a.a.a ENSGT00390000012759 ENSGT00940000163293.c.a ENSGT00940000160182 ENSGT00940000157897.b Red-bellied piranha MODERN SPECIES 271 SMTN (ENSPNAG00000018622) selenom (ENSPNAG00000018679) ENSPNAG00000003549 INPP5J (ENSPNAG00000018716) mat2ab (ENSPNAG00000018750) ##22 si:ch211-283h6.4 (ENSPNAG00000018774) usp39 (ENSPNAG00000018831) ENSPNAG00000018845 ENSPNAG00000018858 ank1a (ENSPNAG00000019240) ebf2 (ENSPNAG00000019339) dguok (ENSPNAG00000019358) mob1a (ENSPNAG00000019380) mthfd2 (ENSPNAG00000019432) arl6ip4 (ENSPNAG00000019444) PITPNM2 (ENSPNAG00000019721) mtrfr (ENSPNAG00000019769) CDK2AP1 (ENSPNAG00000019785) kmt5ab (ENSPNAG00000019801) rilpl2 (ENSPNAG00000019819) Mexicana tetra MODERN SPECIES 124 ENSAMXG00000038733 ENSAMXG00000035124 mat2ab (ENSAMXG00000032698) ##22 ENSAMXG00000038290 usp39 (ENSAMXG00000021157) sftpbb (ENSAMXG00000021161) spaw (ENSAMXG00000021167) ENSAMXG00000036948 ank1a (ENSAMXG00000021179) ebf2 (ENSAMXG00000021198) ENSAMXG00000036760 dguok (ENSAMXG00000019832) mob1a (ENSAMXG00000031172) mthfd2 (ENSAMXG00000009018) Electric eel MODERN SPECIES 269 ENSEEEG00000004569 selenom (ENSEEEG00000004571) INPP5J (ENSEEEG00000004572) mat2ab (ENSEEEG00000004573) ##22 si:ch211-283h6.4 (ENSEEEG00000004574) usp39 (ENSEEEG00000004583) sftpbb (ENSEEEG00000004732) spaw (ENSEEEG00000004736) ank1a (ENSEEEG00000004856) ebf2 (ENSEEEG00000009793) dguok (ENSEEEG00000009800) mob1a (ENSEEEG00000009801) mthfd2 (ENSEEEG00000009823) arl6ip4 (ENSEEEG00000009829) PITPNM2 (ENSEEEG00000009838) mtrfr (ENSEEEG00000010077) CDK2AP1 (ENSEEEG00000010078) kmt5ab (ENSEEEG00000010082) rilpl2 (ENSEEEG00000010083) Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 78 ENSGT00390000013143 ENSGT00960000189785 ENSGT00550000074853 ENSGT00940000155165 ENSGT00940000156240 ENSGT00940000154089.b ENSGT00940000164527.a ENSGT00390000003209 ENSGT00940000153241.A ENSGT00940000156859 ENSGT00490000043385 ENSGT00940000155998 ENSGT00940000161655 ENSGT00940000154284.b.gc ENSGT00940000156855.c ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.b ##22 ENSGT00390000001901 ENSGT00390000007992 ENSGT00940000164890.b ENSGT00940000177137 ENSGT00940000163919.a ENSGT00940000155760.t.a.c ENSGT00950000182879.a.b.a.a.b.b.a.a ENSGT00940000161002 ENSGT00940000159139.b.a Cyprininae DUPLICATION Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 60 ENSGT00960000189785 ENSGT00550000074853.b ENSGT00940000155165.h ENSGT00940000156240 ENSGT00940000154089.b ENSGT00940000164527.a ENSGT00390000003209.b ENSGT00940000153241.A.ab ENSGT00940000156859.cb ENSGT00490000043385.sc ENSGT00940000155998.e ENSGT00940000161655 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ENSGT00940000163919.a ENSGT00940000159627 ENSGT00530000063370.b ENSGT00390000005772 ENSGT00940000157987 ENSGT00940000165465 ENSGT00940000155991 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00990000203619.A.b.b.b.b.a.a.h ENSGT00940000153594.c.e.a ENSGT00940000157897.b ENSGT00940000160182 ENSGT00940000163293.c.a ENSGT00390000012759 ENSGT00940000153849.a.a.a ENSGT00390000009670 ENSGT00940000164825 ENSGT01050000244898.b.a ENSGT00530000063869.B ENSGT00940000154495.b.a.a.a ENSGT00940000154284.b ENSGT00940000177369 ENSGT00940000156855.c ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.b ##22 ENSGT00390000001901 ENSGT00390000007992 ENSGT00940000164890.b ENSGT00940000156009.A.c ENSGT00950000182859.A.a.a.b ENSGT00940000155760.t.a ENSGT00940000159932.a.a.b ENSGT00940000168975 ENSGT00940000159932.a.a.a ENSGT00940000163919.a ENSGT00940000159627 ENSGT00530000063370.b ENSGT00390000005772 ENSGT00940000157987.i ENSGT00940000165465 Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 283 KNTC1 (ENSHBUG00000007770) HCAR1 (ENSHBUG00000007379) hip1rb (ENSHBUG00000007357) RILPL1 (ENSHBUG00000007292) rilpl2 (ENSHBUG00000000177) mtrfr (ENSHBUG00000007273) PITPNM2 (ENSHBUG00000007246) arl6ip4 (ENSHBUG00000007166) mthfd2 (ENSHBUG00000007159) mob1a (ENSHBUG00000007149) trafd1 (ENSHBUG00000007131) ENSHBUG00000007110 selenom (ENSHBUG00000007053) ENSHBUG00000007040 ENSHBUG00000007022 mat2ab (ENSHBUG00000006986) ##22 si:ch211-283h6.4 (ENSHBUG00000006968) usp39 (ENSHBUG00000006958) sftpbb (ENSHBUG00000006951) ENSHBUG00000006940 EPX (ENSHBUG00000006922) ebf2 (ENSHBUG00000006879) ANK1 (ENSHBUG00000006749) ENSHBUG00000006107 spaw (ENSHBUG00000006084) dguok (ENSHBUG00000006069) tcn2 (ENSHBUG00000006050) ccdc117 (ENSHBUG00000006040) osbp2b (ENSHBUG00000006005) rasl10a (ENSHBUG00000005695) ap1b1 (ENSHBUG00000005689) Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000007883 ENSGT00990000203619.A.b.b.b.b.a.a.h ENSGT00940000153594.c.e.a ENSGT00940000157897.b ENSGT00940000160182 ENSGT00940000163293.c.a ENSGT00390000012759 ENSGT00940000153849.a.a.a 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ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00990000203619.A.b.b.b.b.a.a.h ENSGT00940000153594.c.e.a ENSGT00940000157897.b ENSGT00940000160182 ENSGT00940000163293.c.a ENSGT00390000012759 ENSGT00940000153849.a.a.a ENSGT00390000009670 ENSGT00940000164825 ENSGT01050000244898.b.a ENSGT00530000063869.B ENSGT00940000154495.b.a.a.a ENSGT00940000161655 ENSGT00940000154284.b ENSGT00940000156855.c ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.b ##22 ENSGT00390000001901 ENSGT00390000007992 ENSGT00940000164890.b ENSGT00940000156009.A.c ENSGT00950000182859.A.a.a.b ENSGT00940000155760.t.a ENSGT00940000159932.a ENSGT00940000163919.a ENSGT00940000159627 ENSGT00530000063370.b ENSGT00390000005772 ENSGT00940000157987 ENSGT00940000165465 ENSGT00940000155991.w.a ENSGT00940000155991.x Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00990000203619.A.b.b.b.b.a.a.h ENSGT00940000153594.c.e.a ENSGT00940000157897.b ENSGT00940000160182 ENSGT00940000163293.c.a ENSGT00390000012759 ENSGT00940000153849.a.a.a ENSGT00390000009670 ENSGT00940000164825 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Guppy MODERN SPECIES 461 KNTC1 (ENSPREG00000021130) ENSPREG00000021184 hip1rb (ENSPREG00000021201) RILPL1 (ENSPREG00000021228) rilpl2 (ENSPREG00000021239) kmt5ab (ENSPREG00000021252) mtrfr (ENSPREG00000021268) PITPNM2 (ENSPREG00000021286) arl6ip4 (ENSPREG00000021318) mthfd2 (ENSPREG00000021326) mob1a (ENSPREG00000021343) trafd1 (ENSPREG00000021376) ENSPREG00000021395 selenom (ENSPREG00000021417) INPP5J (ENSPREG00000021447) mat2ab (ENSPREG00000021500) ##22 si:ch211-283h6.4 (ENSPREG00000021512) usp39 (ENSPREG00000021529) sftpbb (ENSPREG00000021554) EPX (ENSPREG00000021577) ebf2 (ENSPREG00000021597) ANK1 (ENSPREG00000021629) EIF4EBP1 (ENSPREG00000021678) spaw (ENSPREG00000021709) dguok (ENSPREG00000021716) tcn2 (ENSPREG00000021726) osbp2b (ENSPREG00000021738) rasl10a (ENSPREG00000021747) ap1b1 (ENSPREG00000021769) ENSPREG00000021825 ewsr1b (ENSPREG00000021835) Platyfish MODERN SPECIES 3 si:ch211-110p13.9 (ENSXMAG00000026704) KNTC1 (ENSXMAG00000017627) HCAR1 (ENSXMAG00000020330) hip1rb 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ENSGT00990000203619.A.b.b.b.b.a.a ENSGT00940000153594.c.e.a ENSGT00940000157897.b ENSGT00940000160182 ENSGT00940000163293.c.a ENSGT00390000012759 ENSGT00940000153849.a.a.a ENSGT00390000009670 ENSGT00940000164825 ENSGT01050000244898.b.a ENSGT00530000063869.B ENSGT00940000154495.b.b.a ENSGT00940000156855.c ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.b ##22 ENSGT00390000001901 ENSGT00390000007992 ENSGT00940000164890.b ENSGT00940000156009.A.c ENSGT00950000182859.A.a.a.b ENSGT00940000155760.t.a ENSGT00940000168975 ENSGT00940000159932.a ENSGT00940000163919.a ENSGT00940000159627 ENSGT00530000063370.b ENSGT00390000005772 ENSGT00940000157987 ENSGT00940000165465 ENSGT00940000155991 Turbot MODERN SPECIES 21 KNTC1 (ENSSMAG00000017012) ENSSMAG00000016981 ENSSMAG00000024887 HIP1R (ENSSMAG00000016843) ENSSMAG00000016822 rilpl2 (ENSSMAG00000016819) kmt5ab (ENSSMAG00000016787) mtrfr (ENSSMAG00000033634) ENSSMAG00000016662 arl6ip4 (ENSSMAG00000016606) mthfd2 (ENSSMAG00000016570) mob1a (ENSSMAG00000016560) 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ENSLCAG00010028254 ewsr1b (ENSLCAG00010028253) Seriola ANCESTRAL SPECIES 35 ENSGT00940000153594.c.e.a ENSGT00940000157897.b ENSGT00940000160182 ENSGT00940000163293.c.a ENSGT00390000012759 ENSGT00940000153849.a.a.a ENSGT00390000009670 ENSGT00940000164825 ENSGT01050000244898.b.a ENSGT00530000063869.B ENSGT00940000154495.b.a.a.a ENSGT00940000154495.b.b.a ENSGT00940000154284.b ENSGT00940000177369 ENSGT00940000156855.c ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.b ##22 ENSGT00390000001901 ENSGT00390000007992 ENSGT00940000164890.b ENSGT00940000156009.A.c.l ENSGT00940000156009.A.c.k ENSGT00950000182859.A.a.a.b ENSGT00940000155760.t.a ENSGT00940000159932.a Greater amberjack MODERN SPECIES 98 HCAR1 (ENSSDUG00000020608) hip1rb (ENSSDUG00000020454) RILPL1 (ENSSDUG00000020423) rilpl2 (ENSSDUG00000020415) kmt5ab (ENSSDUG00000020406) mtrfr (ENSSDUG00000020401) PITPNM2 (ENSSDUG00000020278) arl6ip4 (ENSSDUG00000020259) mthfd2 (ENSSDUG00000020221) mob1a (ENSSDUG00000020206) trafd1 (ENSSDUG00000020193) ENSSDUG00000020068 selenom (ENSSDUG00000020048) ENSSDUG00000020041 ENSSDUG00000020027 mat2ab (ENSSDUG00000020008) ##22 si:ch211-283h6.4 (ENSSDUG00000019998) usp39 (ENSSDUG00000019931) sftpbb (ENSSDUG00000019891) ENSSDUG00000019856 ENSSDUG00000019782 ENSSDUG00000019767 EPX (ENSSDUG00000017578) ebf2 (ENSSDUG00000017394) ANK1 (ENSSDUG00000017309) ENSSDUG00000017281 Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 2853 KNTC1 (ENSSLDG00000017822) HCAR1 (ENSSLDG00000017799) hip1rb (ENSSLDG00000017722) RILPL1 (ENSSLDG00000017695) rilpl2 (ENSSLDG00000017674) kmt5ab (ENSSLDG00000017652) mtrfr (ENSSLDG00000017638) PITPNM2 (ENSSLDG00000017588) arl6ip4 (ENSSLDG00000017507) mthfd2 (ENSSLDG00000017340) mob1a (ENSSLDG00000017235) trafd1 (ENSSLDG00000017208) ENSSLDG00000017156 selenom (ENSSLDG00000017101) INPP5J (ENSSLDG00000017063) mat2ab (ENSSLDG00000017044) ##22 si:ch211-283h6.4 (ENSSLDG00000017029) usp39 (ENSSLDG00000016937) ENSSLDG00000016877 ENSSLDG00000016860 EPX (ENSSLDG00000016838) ebf2 (ENSSLDG00000016812) ANK1 (ENSSLDG00000016701) ENSSLDG00000016596 Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00990000203619.A.b.b.b.b.a.a ENSGT00940000153594.c.e.a ENSGT00940000157897.b ENSGT00940000160182 ENSGT00940000163293.c.a ENSGT00390000012759 ENSGT00940000153849.a.a.a ENSGT00390000009670 ENSGT00940000164825 ENSGT01050000244898.b.a ENSGT00530000063869.B ENSGT00940000154495.b.a.a.a ENSGT00940000161655 ENSGT00940000154284.b ENSGT00940000156855.c ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.b ##22 ENSGT00390000001901 ENSGT00390000007992 ENSGT00940000164890.b ENSGT00940000156009.A.c ENSGT00950000182859.A.a.a.b ENSGT00940000155760.t.a ENSGT00940000159932.a ENSGT00940000163919.a ENSGT00940000159627 ENSGT00530000063370.b ENSGT00390000005772 ENSGT00940000157987 ENSGT00940000165465 ENSGT00940000155991 ENSGT00940000154849.b Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00990000203619.A.b.b.b.b.a.a ENSGT00940000153594.c.e.a ENSGT00940000157897.b ENSGT00940000160182 ENSGT00940000163293.c.a ENSGT00390000012759 ENSGT00940000153849.a.a.a ENSGT00390000009670 ENSGT00940000164825 ENSGT01050000244898.b.a ENSGT00530000063869.B ENSGT00940000154495.b.b.a ENSGT00940000161655 ENSGT00940000154284.b ENSGT00940000156855.c ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.b ##22 ENSGT00390000001901 ENSGT00390000007992 ENSGT00940000164890.b ENSGT00940000156009.A.c ENSGT00950000182859.A.a.a.b ENSGT00940000155760.t.a ENSGT00940000159932.a ENSGT00940000163919.a ENSGT00940000159627 ENSGT00530000063370.b ENSGT00390000005772 ENSGT00940000157987 ENSGT00940000165465 ENSGT00940000155991 ENSGT00940000154849.b Climbing perch MODERN SPECIES 22 ENSATEG00000011839 ENSATEG00000011819 HIP1R (ENSATEG00000011717) ENSATEG00000011706 rilpl2 (ENSATEG00000011688) kmt5ab (ENSATEG00000011675) mtrfr (ENSATEG00000011661) ENSATEG00000011506 arl6ip4 (ENSATEG00000027706) mthfd2 (ENSATEG00000011443) mob1a (ENSATEG00000011438) ENSATEG00000011426 SMTN (ENSATEG00000011362) selenom (ENSATEG00000011331) INPP5J (ENSATEG00000011290) mat2ab (ENSATEG00000011242) ##22 si:ch211-283h6.4 (ENSATEG00000011234) ENSATEG00000011205 sftpbb (ENSATEG00000027890) ENSATEG00000011186 ENSATEG00000011129 ENSATEG00000011002 ENSATEG00000010916 ENSATEG00000010895 ENSATEG00000010885 ENSATEG00000010863 ENSATEG00000010839 osbp2b (ENSATEG00000010818) rasl10a (ENSATEG00000010796) ap1b1 (ENSATEG00000010714) ENSATEG00000010680 Siamese fighting fish MODERN SPECIES 20 ENSBSLG00000016136 ENSBSLG00000016129 hip1rb (ENSBSLG00000014586) RILPL1 (ENSBSLG00000014532) kmt5ab (ENSBSLG00000014502) mtrfr (ENSBSLG00000014494) PITPNM2 (ENSBSLG00000014016) arl6ip4 (ENSBSLG00000013998) ENSBSLG00000013986 mthfd2 (ENSBSLG00000013949) mob1a (ENSBSLG00000013917) trafd1 (ENSBSLG00000013897) ENSBSLG00000013849 selenom (ENSBSLG00000013840) INPP5J (ENSBSLG00000013669) mat2ab (ENSBSLG00000013576) ##22 si:ch211-283h6.4 (ENSBSLG00000013558) usp39 (ENSBSLG00000013016) sftpbb (ENSBSLG00000013013) ENSBSLG00000013001 ENSBSLG00000012997 ENSBSLG00000012947 ENSBSLG00000012813 ENSBSLG00000012795 ENSBSLG00000012719 ebf2 (ENSBSLG00000012704) ANK1 (ENSBSLG00000008127) ENSBSLG00000007285 spaw (ENSBSLG00000007182) tcn2 (ENSBSLG00000007151) ccdc117 (ENSBSLG00000007142) Zig-zag eel MODERN SPECIES 23 ENSMAMG00000017494 ENSMAMG00000017480 ENSMAMG00000017417 ENSMAMG00000017398 rilpl2 (ENSMAMG00000017377) kmt5ab (ENSMAMG00000017368) C12orf65 (ENSMAMG00000024345) ENSMAMG00000017220 arl6ip4 (ENSMAMG00000017190) mthfd2 (ENSMAMG00000017168) mob1a (ENSMAMG00000017147) ENSMAMG00000017130 ENSMAMG00000017096 selenom (ENSMAMG00000025931) ENSMAMG00000016963 mat2ab (ENSMAMG00000016940) ##22 ENSMAMG00000016935 ENSMAMG00000027322 ENSMAMG00000024531 ENSMAMG00000016862 ENSMAMG00000016827 ENSMAMG00000016735 ENSMAMG00000028711 ENSMAMG00000016707 ENSMAMG00000016698 ENSMAMG00000016694 ENSMAMG00000016676 osbp2b (ENSMAMG00000016657) ap1b1 (ENSMAMG00000016557) ENSMAMG00000016533 ewsr1b (ENSMAMG00000016510) Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00990000203619.A.b.b.b.b.a.a ENSGT00940000153594.c.e.a 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ENSGT00940000154191.k.a.g Salmo ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155122.a.d ENSGT00390000011475.i ENSGT00730000111142.o ENSGT00940000153594.c.e.a.f ENSGT00940000160182.l ENSGT00940000163293.c.a.d ENSGT00940000155149.kc ENSGT00940000153849.a.a.a.a ENSGT00390000009670.i ENSGT00940000164825.h ENSGT01050000244898.b.a.u ENSGT00530000063869.B.l ENSGT00940000161655 ENSGT00990000210636 ENSGT00940000156855.c.a ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.b.j ##22 ENSGT00390000001901.a ENSGT00390000007992.g ENSGT00940000164890.b ENSGT00950000182859.A.a.a.b.v ENSGT00940000155760.t.a.e ENSGT00940000168975 ENSGT00940000159932.a.e ENSGT00940000163919.a.e ENSGT00530000063370.b.d ENSGT00390000005772.l ENSGT00940000157987.k ENSGT00940000165465.d ENSGT00940000155991.z ENSGT00940000154849.b.i ENSGT00940000154191.k.a.g River trout MODERN SPECIES 19 mlxip (ENSSTUG00000049011) CLIP1 (ENSSTUG00000048953) zcchc8 (ENSSTUG00000048938) rsrc2 (ENSSTUG00000048933) hip1rb (ENSSTUG00000047044) rilpl2 (ENSSTUG00000046925) ENSSTUG00000046906 ENSSTUG00000046896 PITPNM2 (ENSSTUG00000046564) mthfd2 (ENSSTUG00000046457) mob1a (ENSSTUG00000046433) trafd1 (ENSSTUG00000046414) ENSSTUG00000046323 ENSSTUG00000046314 INPP5J (ENSSTUG00000046214) MAT2A (ENSSTUG00000046181) ##22 si:ch211-283h6.4 (ENSSTUG00000046165) usp39 (ENSSTUG00000045908) sftpbb (ENSSTUG00000045875) ebf2 (ENSSTUG00000045822) ENSSTUG00000045812 ENSSTUG00000045804 ANK1 (ENSSTUG00000045262) ENSSTUG00000045230 spaw (ENSSTUG00000045213) tcn2 (ENSSTUG00000045173) ccdc117 (ENSSTUG00000045160) osbp2b (ENSSTUG00000044554) rasl10a (ENSSTUG00000044520) ap1b1 (ENSSTUG00000043694) ENSSTUG00000043641 Atlantic salmon MODERN SPECIES 16 ENSSSAG00000075467 ENSSSAG00000075156 rilpl2 (ENSSSAG00000097122) kmt5ab (ENSSSAG00000075132) ENSSSAG00000075109 ENSSSAG00000075113 ENSSSAG00000073063 ENSSSAG00000085766 ENSSSAG00000113809 arl6ip4 (ENSSSAG00000121888) mthfd2 (ENSSSAG00000072915) mob1a (ENSSSAG00000085563) ENSSSAG00000072880 ENSSSAG00000072863 ENSSSAG00000072852 ENSSSAG00000072813 ##22 si:ch211-283h6.4 (ENSSSAG00000078449) ENSSSAG00000072571 sftpbb (ENSSSAG00000072540) ENSSSAG00000112111 ENSSSAG00000072528 ENSSSAG00000047949 ENSSSAG00000047398 ENSSSAG00000099535 tcn2 (ENSSSAG00000047340) ENSSSAG00000047333 osbp2b (ENSSSAG00000047180) rasl10a (ENSSSAG00000093910) ap1b1 (ENSSSAG00000043938) ENSSSAG00000114096 ENSSSAG00000043782 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155122.a.d ENSGT00390000011475.i ENSGT00730000111142.o ENSGT00940000153594.c.e.a.f ENSGT00940000160182.l ENSGT00940000163293.c.a.d ENSGT00940000155149.kc ENSGT00940000153849.a.a.a.a ENSGT00940000164825.h ENSGT01050000244898.b.a.u ENSGT00530000063869.B.l ENSGT00940000154495.b.a.a.a.a ENSGT00940000161655 ENSGT00990000210636 ENSGT00940000156855.c.a ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.b.j ##22 ENSGT00390000001901.a ENSGT00390000007992.g ENSGT00940000164890.b ENSGT00950000182859.A.a.a.b.v ENSGT00940000155760.t.a.e ENSGT00940000168975 ENSGT00940000159932.a.e ENSGT00940000163919.a.e 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tcn2 (ENSELUG00000013831) ccdc117 (ENSELUG00000030504) osbp2b (ENSELUG00000013786) rasl10a (ENSELUG00000024787) ap1b1 (ENSELUG00000000507) ENSELUG00000013595 Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.b ##22 Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.b ##22 Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.b ##22 Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.b ##22 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000156522.c.b ENSGT00940000157176.b ENSGT00940000167013 ENSGT00940000158782.d.b ENSGT00390000016468 ENSGT00530000064873.a ENSGT00390000011937.g.a ENSGT00940000157386.b ENSGT01050000244888.b.b.a.b.d ENSGT00390000013929 ENSGT00950000182881.a.b.a.a.b ENSGT00940000166850 ENSGT00730000111291 ENSGT00940000154495.b.b.b ENSGT00940000156855.d ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.b ##22 ENSGT00940000164890.a ENSGT00940000156009.A.d ENSGT00940000154779.a.b.a ENSGT00390000001280.b ENSGT00390000014909 ENSGT00940000156185 ENSGT00390000006707 ENSGT00390000011206.a ENSGT00390000014879.c.a.a.a ENSGT00940000157856 ENSGT00940000153340.B ENSGT00950000182904.a.b.a ENSGT00940000166787 ENSGT00940000162631 ENSGT00940000158101 Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 320 bmp1b (ENSHCOG00000010653) trim69 (ENSHCOG00000010609) kcnip3b (ENSHCOG00000010587) ENSHCOG00000010565 kcnip3b (ENSHCOG00000010539) ENSHCOG00000010518 prnpb (ENSHCOG00000010509) PPTC7 (ENSHCOG00000000327) TBC1D10A (ENSHCOG00000010477) aplnrb (ENSHCOG00000010448) ENSHCOG00000010422 ATP6V0A2 (ENSHCOG00000010328) slc35e4 (ENSHCOG00000009515) ENSHCOG00000009508 ENSHCOG00000009490 MAT2A (ENSHCOG00000009453) ##22 mpx (ENSHCOG00000009437) loxa (ENSHCOG00000009407) Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000156522.c.b ENSGT00940000157176.b ENSGT00940000167013 ENSGT00940000158782.d.b ENSGT00390000016468 ENSGT00530000064873.a ENSGT00390000011937.g.a ENSGT00940000157386.b ENSGT01050000244888.b.b.a.b.d ENSGT00390000013929 ENSGT00950000182881.a.b.a.a.b ENSGT00940000166850 ENSGT00730000111291 ENSGT00940000154495.b.b.b ENSGT00940000156855.d ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.b ##22 ENSGT00940000164890.a ENSGT00940000156009.A.d ENSGT00940000154779.a.b.a ENSGT00390000001280.b ENSGT00390000014909 ENSGT00940000156185 ENSGT00390000006707 ENSGT00390000011206.a ENSGT00390000014879.c.a.a.a ENSGT00690000103805 ENSGT00940000157856 ENSGT00940000153340.B ENSGT00950000182904.a.b.a ENSGT00940000166787 ENSGT00940000162631 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000156522.c.b ENSGT00940000157176.b ENSGT00940000167013 ENSGT00940000158782.d.b ENSGT00390000016468 ENSGT00530000064873.a ENSGT00390000011937.g.a ENSGT00940000157386.b ENSGT01050000244888.b.b.a.b.d ENSGT00390000013929 ENSGT00950000182881.a.b.a.a.b ENSGT00940000166850 ENSGT00730000111291 ENSGT00940000154495.b.b.b ENSGT00940000156855.d ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.b ##22 ENSGT00940000164890.a ENSGT00940000156009.A.d ENSGT00940000154779.a.b.a ENSGT00390000001280.b ENSGT00390000014909 ENSGT00940000156185 ENSGT00390000006707 ENSGT00390000011206.a ENSGT00390000014879.c.a.a.a ENSGT00690000103805 ENSGT00940000157856 ENSGT00940000153340.B ENSGT00950000182904.a.b.a ENSGT00940000166787 ENSGT00940000162631 Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000156522.c.b ENSGT00940000157176.b ENSGT00940000167013 ENSGT00940000158782.d.b ENSGT00390000016468 ENSGT00530000064873.a ENSGT00390000011937.g.a ENSGT00940000157386.b ENSGT01050000244888.b.b.a.b.d ENSGT00390000013929 ENSGT00950000182881.a.b.a.a.b ENSGT00940000166850 ENSGT00730000111291 ENSGT00940000154495.b.b.b ENSGT00940000156855.d ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.b ##22 ENSGT00940000164890.a ENSGT00940000156009.A.d ENSGT00940000154779.a.b.a ENSGT00390000001280.b ENSGT00390000014909 ENSGT00940000156185 ENSGT00390000006707 ENSGT00390000011206.a ENSGT00400000025098 ENSGT00390000014879.c.a.a.a ENSGT00690000103805 ENSGT00940000157856 ENSGT00940000153340.B ENSGT00950000182904.a.b.a ENSGT00940000166787 Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000156522.c.b ENSGT00940000157176.b ENSGT00940000167013 ENSGT00940000158782.d.b ENSGT00390000016468 ENSGT00530000064873.a ENSGT00390000011937.g.a ENSGT00940000157386.b ENSGT01050000244888.b.b.a.b.d ENSGT00390000013929 ENSGT00950000182881.a.b.a.a.b ENSGT00940000166850 ENSGT00730000111291 ENSGT00940000154495.b.b.b ENSGT00940000156855.d ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.b ##22 ENSGT00940000164890.a ENSGT00940000156009.A.d ENSGT00940000154779.a.b.a ENSGT00390000001280.b ENSGT00390000014909 ENSGT00940000156185 ENSGT00390000006707 ENSGT00390000011206.a ENSGT00400000025098 ENSGT00390000014879.c.a.a.a ENSGT00690000103805 ENSGT00940000157856 ENSGT00940000153340.B ENSGT00950000182904.a.b.a ENSGT00940000166787 Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000156522.c.b ENSGT00940000157176.b ENSGT00940000167013 ENSGT00940000158782.d.b ENSGT00390000016468 ENSGT00530000064873.a ENSGT00390000011937.g.a ENSGT00940000157386.b ENSGT01050000244888.b.b.a.b.d ENSGT00390000013929 ENSGT00950000182881.a.b.a.a.b ENSGT00940000166850 ENSGT00730000111291 ENSGT00940000154495.b.b.b ENSGT00940000156855.d ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.b ##22 ENSGT00940000164890.a ENSGT00940000156009.A.d ENSGT00940000154779.a.b.a ENSGT00390000001280.b ENSGT00390000014909 ENSGT00940000156185 ENSGT00390000006707 ENSGT00390000011206.a ENSGT00400000025098 ENSGT00390000014879.c.a.a.a ENSGT00690000103805 ENSGT00940000157856 ENSGT00940000153340.B ENSGT00950000182904.a.b.a ENSGT00940000166787 Perciformes ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000156522.c.b ENSGT00940000157176.b ENSGT00940000167013 ENSGT00940000158782.d.b ENSGT00390000016468 ENSGT00530000064873.a ENSGT00390000011937.g.a ENSGT00940000157386.b ENSGT01050000244888.b.b.a.b.d ENSGT00390000013929 ENSGT00950000182881.a.b.a.a.b ENSGT00940000166850 ENSGT00730000111291 ENSGT00940000154495.b.b.b ENSGT00940000156855.d ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.b ##22 ENSGT00940000164890.a ENSGT00940000156009.A.d ENSGT00940000154779.a.b.a ENSGT00390000001280.b 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MODERN SPECIES 48 ANTXR1 (ENSSLUG00000015261) bmp1b (ENSSLUG00000015676) trim69 (ENSSLUG00000020634) kcnip3b (ENSSLUG00000020637) ENSSLUG00000020640 prnpb (ENSSLUG00000020644) PPTC7 (ENSSLUG00000020653) TBC1D10A (ENSSLUG00000020664) aplnrb (ENSSLUG00000020734) ENSSLUG00000020737 ENSSLUG00000020752 ENSSLUG00000020803 slc35e4 (ENSSLUG00000020833) ENSSLUG00000020835 ENSSLUG00000020841 MAT2A (ENSSLUG00000020867) ##22 ENSSLUG00000020996 mpx (ENSSLUG00000021032) loxa (ENSSLUG00000021459) snx24 (ENSSLUG00000021463) GGCX (ENSSLUG00000021499) gmcl1 (ENSSLUG00000021988) fam136a (ENSSLUG00000022197) pcyox1 (ENSSLUG00000022204) slc20a1b (ENSSLUG00000022225) STARD7 (ENSSLUG00000022327) drg1 (ENSSLUG00000022341) KCNN2 (ENSSLUG00000022419) nt5c2l1 (ENSSLUG00000022546) ENSSLUG00000023388 sppl3 (ENSSLUG00000023400) Channel bull blenny MODERN SPECIES 3 AAK1 (ENSCGOG00000001516) ANTXR1 (ENSCGOG00000001523) bmp1b (ENSCGOG00000001562) trim69 (ENSCGOG00000002477) kcnip3b (ENSCGOG00000002507) 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ENSGT00940000156855.d ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.b ##22 ENSGT00940000164890.a ENSGT00940000156009.A.d ENSGT00940000154779.a.b.a ENSGT00390000001280.b ENSGT00390000014909 ENSGT00940000156185 ENSGT00390000006707 ENSGT00390000011206.a ENSGT00400000025098 ENSGT00390000014879.c.a.a.a ENSGT00690000103805 ENSGT00940000157856 ENSGT00940000153340.B ENSGT00950000182904.a.b.a ENSGT00940000162631 Lumpfish MODERN SPECIES 3 AAK1 (ENSCLMG00005016824) ANTXR1 (ENSCLMG00005016834) bmp1b (ENSCLMG00005017155) trim69 (ENSCLMG00005017170) ENSCLMG00005017171 ENSCLMG00005017172 PPTC7 (ENSCLMG00005017173) TBC1D10A (ENSCLMG00005017181) aplnrb (ENSCLMG00005017465) ENSCLMG00005017466 ENSCLMG00005017469 ENSCLMG00005017899 slc35e4 (ENSCLMG00005017900) ENSCLMG00005017902 INPP5J (ENSCLMG00005017903) MAT2A (ENSCLMG00005017915) ##22 ENSCLMG00005017937 mpx (ENSCLMG00005017951) loxa (ENSCLMG00005017966) snx24 (ENSCLMG00005017967) GGCX (ENSCLMG00005017972) gmcl1 (ENSCLMG00005018038) fam136a (ENSCLMG00005018315) pcyox1 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(ENSGACG00000017239) nt5c2l1 (ENSGACG00000017246) Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000156522.c.b ENSGT00940000157176.b ENSGT00940000167013 ENSGT00940000158782.d.b ENSGT00390000016468 ENSGT00530000064873.a ENSGT00390000011937.g.a ENSGT00940000157386.b ENSGT01050000244888.b.b.a.b.d ENSGT00390000013929 ENSGT00950000182881.a.b.a.a.b ENSGT00940000166850 ENSGT00730000111291 ENSGT00940000154495.b.b.b ENSGT00940000156855.d ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.b ##22 ENSGT00940000164890.a ENSGT00940000156009.A.d ENSGT00940000154779.a.b.a ENSGT00390000001280.b ENSGT00390000014909 ENSGT00940000156185 ENSGT00390000006707 ENSGT00390000011206.a ENSGT00390000014879.c.a.a.a ENSGT00940000157856 ENSGT00940000153340.B ENSGT00950000182904.a.b.a.h ENSGT00940000166787 ENSGT00940000162631 ENSGT00940000158101 Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000156522.c.b ENSGT00940000157176.b ENSGT00940000167013 ENSGT00940000158782.d.b ENSGT00390000016468 ENSGT00530000064873.a ENSGT00390000011937.g.a ENSGT00940000157386.b ENSGT01050000244888.b.b.a.b.d ENSGT00390000013929 ENSGT00950000182881.a.b.a.a.b ENSGT00940000166850 ENSGT00730000111291 ENSGT00940000154495.b.b.b ENSGT00940000156855.d ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.b ##22 ENSGT00940000164890.a ENSGT00940000156009.A.d ENSGT00940000154779.a.b.a ENSGT00390000001280.b ENSGT00390000014909 ENSGT00940000156185 ENSGT00390000006707 ENSGT00390000011206.a ENSGT00390000014879.c.a.a.a ENSGT00940000157856 ENSGT00940000153340.B ENSGT00950000182904.a.b.a.h ENSGT00940000166787 ENSGT00940000162631 ENSGT00940000158101 European seabass MODERN SPECIES 9 ANTXR1 (ENSDLAG00005007493) bmp1b (ENSDLAG00005007875) trim69 (ENSDLAG00005012489) ENSDLAG00005012502 ENSDLAG00005012748 ENSDLAG00005027590 ENSDLAG00005012792 ENSDLAG00005030250 ENSDLAG00005033973 ENSDLAG00005013085 ENSDLAG00005013132 ENSDLAG00005014390 slc35e4 (ENSDLAG00005014454) ENSDLAG00005014458 ENSDLAG00005014467 ENSDLAG00005014548 ##22 ENSDLAG00005014974 mpx (ENSDLAG00005014999) loxa 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sppl3 (ENSSAUG00010024252) Ballan wrasse MODERN SPECIES 28 ANTXR1 (ENSLBEG00000021061) bmp1b (ENSLBEG00000021159) trim69 (ENSLBEG00000021237) kcnip3b (ENSLBEG00000021370) ENSLBEG00000021592 prnpb (ENSLBEG00000021655) PPTC7 (ENSLBEG00000021664) TBC1D10A (ENSLBEG00000021729) aplnrb (ENSLBEG00000021765) ENSLBEG00000021799 ENSLBEG00000021828 ENSLBEG00000022048 slc35e4 (ENSLBEG00000022285) ENSLBEG00000022300 INPP5J (ENSLBEG00000022361) MAT2A (ENSLBEG00000022533) ##22 mpx (ENSLBEG00000022571) ENSLBEG00000022597 loxa (ENSLBEG00000022610) snx24 (ENSLBEG00000022636) GGCX (ENSLBEG00000022695) gmcl1 (ENSLBEG00000022754) fam136a (ENSLBEG00000022812) pcyox1 (ENSLBEG00000022828) slc20a1b (ENSLBEG00000022851) STARD7 (ENSLBEG00000022885) drg1 (ENSLBEG00000022934) KCNN2 (ENSLBEG00000022963) slc2a11l (ENSLBEG00000023000) nt5c2l1 (ENSLBEG00000023049) sppl3 (ENSLBEG00000023149) Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000155968.d.a ENSGT00940000156522.c.b ENSGT00940000157176.b ENSGT00940000167013 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ENSGT00950000182904.a.b.a ENSGT00940000166787 ENSGT00940000162631 ENSGT00940000158101 Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000156522.c.b ENSGT00940000157176.b ENSGT00940000167013 ENSGT00940000158782.d.b ENSGT00390000016468 ENSGT00530000064873.a ENSGT00390000011937.g.a ENSGT00940000157386.b ENSGT01050000244888.b.b.a.b.d ENSGT00390000013929 ENSGT00950000182881.a.b.a.a.b ENSGT00940000166850 ENSGT00730000111291 ENSGT00940000154495.b.b.b ENSGT00940000156855.d ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.b ##22 ENSGT00940000164890.a ENSGT00940000156009.A.d ENSGT00940000154779.a.b.a ENSGT00390000001280.b ENSGT00390000014909 ENSGT00940000156185 ENSGT00390000006707 ENSGT00390000011206.a ENSGT00390000014879.c.a.a.a ENSGT00940000157856 ENSGT00940000153340.B ENSGT00950000182904.a.b.a ENSGT00940000166787 ENSGT00940000162631 ENSGT00940000158101 Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000156522.c.b ENSGT00940000157176.b ENSGT00940000167013 ENSGT00940000158782.d.b ENSGT00390000016468 ENSGT00530000064873.a ENSGT00390000011937.g.a ENSGT00940000157386.b ENSGT01050000244888.b.b.a.b.d ENSGT00390000013929 ENSGT00950000182881.a.b.a.a.b ENSGT00940000166850 ENSGT00730000111291 ENSGT00940000154495.b.b.b ENSGT00940000156855.d ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.b ##22 ENSGT00940000164890.a ENSGT00940000156009.A.d ENSGT00940000154779.a.b.a ENSGT00390000001280.b ENSGT00390000014909 ENSGT00940000156185 ENSGT00390000006707 ENSGT00390000011206.a ENSGT00390000014879.c.a.a.a ENSGT00940000157856 ENSGT00940000153340.B ENSGT00950000182904.a.b.a ENSGT00940000166787 ENSGT00940000162631 ENSGT00940000158101 Climbing perch MODERN SPECIES 13 ANTXR1 (ENSATEG00000016282) bmp1b (ENSATEG00000016438) trim69 (ENSATEG00000016483) ENSATEG00000016522 ENSATEG00000016547 ENSATEG00000026233 ENSATEG00000016578 ENSATEG00000016610 aplnrb (ENSATEG00000016645) ENSATEG00000016667 ENSATEG00000016677 ENSATEG00000016761 slc35e4 (ENSATEG00000029805) ENSATEG00000016996 ENSATEG00000017009 ENSATEG00000017051 ##22 ENSATEG00000028313 mpx (ENSATEG00000017086) loxa (ENSATEG00000017109) snx24 (ENSATEG00000029765) ENSATEG00000017194 gmcl1 (ENSATEG00000017256) fam136a (ENSATEG00000029151) pcyox1 (ENSATEG00000017322) slc20a1b (ENSATEG00000017331) ENSATEG00000017373 drg1 (ENSATEG00000017417) ENSATEG00000017485 slc2a11l (ENSATEG00000017525) nt5c2l1 (ENSATEG00000017577) sppl3 (ENSATEG00000017660) Siamese fighting fish MODERN SPECIES 3 AAK1 (ENSBSLG00000020254) ANTXR1 (ENSBSLG00000020159) trim69 (ENSBSLG00000019873) kcnip3b (ENSBSLG00000019736) ENSBSLG00000019734 prnpb (ENSBSLG00000019731) PPTC7 (ENSBSLG00000019729) TBC1D10A (ENSBSLG00000019719) aplnrb (ENSBSLG00000019713) ENSBSLG00000019706 ENSBSLG00000018984 ENSBSLG00000018843 slc35e4 (ENSBSLG00000018824) ENSBSLG00000018801 INPP5J (ENSBSLG00000018718) MAT2A (ENSBSLG00000018657) ##22 mpx (ENSBSLG00000018347) loxa (ENSBSLG00000018299) snx24 (ENSBSLG00000018269) GGCX (ENSBSLG00000017978) gmcl1 (ENSBSLG00000017842) fam136a (ENSBSLG00000017813) pcyox1 (ENSBSLG00000017799) slc20a1b 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ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000156522.c.b ENSGT00940000157176.b ENSGT00940000167013 ENSGT00940000158782.d.b ENSGT00390000016468 ENSGT00530000064873.a ENSGT00390000011937.g.a ENSGT00940000157386.b ENSGT01050000244888.b.b.a.b.d ENSGT00390000013929 ENSGT00950000182881.a.b.a.a.b ENSGT00940000166850 ENSGT00730000111291 ENSGT00940000154495.b.b.b ENSGT00940000156855.d ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.b ##22 ENSGT00940000164890.a ENSGT00940000156009.A.d ENSGT00940000154779.a.b.a ENSGT00390000001280.b ENSGT00390000014909 ENSGT00940000156185 ENSGT00390000006707 ENSGT00390000011206.a ENSGT00390000014879.c.a.a.a ENSGT00940000157856 ENSGT00940000153340.B ENSGT00950000182904.a.b.a ENSGT00940000166787 ENSGT00940000162631 ENSGT00940000158101 Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000156522.c.b ENSGT00940000157176.b ENSGT00940000167013 ENSGT00940000158782.d.b ENSGT00390000016468 ENSGT00530000064873.a ENSGT00390000011937.g.a ENSGT00940000157386.b ENSGT01050000244888.b.b.a.b.d ENSGT00390000013929 ENSGT00950000182881.a.b.a.a.b ENSGT00940000166850 ENSGT00730000111291 ENSGT00940000154495.b.b.b ENSGT00940000156855.d ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.b ##22 ENSGT00940000164890.a ENSGT00940000156009.A.d ENSGT00940000154779.a.b.a ENSGT00390000001280.b ENSGT00390000014909 ENSGT00940000156185 ENSGT00390000006707 ENSGT00390000011206.a ENSGT00390000014879.c.a.a.a ENSGT00940000157856 ENSGT00940000153340.B ENSGT00950000182904.a.b.a ENSGT00940000166787 ENSGT00940000162631 ENSGT00940000158101 Barramundi perch MODERN SPECIES 218 bmp1b (ENSLCAG00010005567) trim69 (ENSLCAG00010005506) kcnip3b (ENSLCAG00010005496) ENSLCAG00010005491 prnpb (ENSLCAG00010005490) PPTC7 (ENSLCAG00010005479) TBC1D10A (ENSLCAG00010005474) aplnrb (ENSLCAG00010005472) ENSLCAG00010005469 ENSLCAG00010005467 ENSLCAG00010004962 ENSLCAG00010004760 slc35e4 (ENSLCAG00010004745) ENSLCAG00010004742 INPP5J (ENSLCAG00010004738) MAT2A (ENSLCAG00010004730) ##22 ENSLCAG00010004725 mpx (ENSLCAG00010004717) loxa (ENSLCAG00010004714) snx24 (ENSLCAG00010004711) GGCX (ENSLCAG00010004692) gmcl1 (ENSLCAG00010004684) Seriola ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000156522.c.b ENSGT00940000157176.b ENSGT00940000167013 ENSGT00940000158782.d.b ENSGT00390000016468 ENSGT00530000064873.a ENSGT00390000011937.g.a ENSGT00940000157386.b ENSGT01050000244888.b.b.a.b.d ENSGT00390000013929 ENSGT00950000182881.a.b.a.a.b ENSGT00940000166850 ENSGT00730000111291 ENSGT00940000154495.b.b.b ENSGT00940000156855.d ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.b ##22 ENSGT00940000177137 ENSGT00940000156009.A.d ENSGT00940000154779.a.b.a ENSGT00390000001280.b ENSGT00390000014909 ENSGT00940000156185 ENSGT00390000006707 ENSGT00390000011206.a ENSGT00390000014879.c.a.a.a ENSGT00940000157856 ENSGT00940000153340.B ENSGT00950000182904.a.b.a ENSGT00940000166787 ENSGT00940000162631 ENSGT00940000158101 Greater amberjack MODERN SPECIES 138 ANTXR1 (ENSSDUG00000017651) bmp1b (ENSSDUG00000017600) trim69 (ENSSDUG00000017568) kcnip3b (ENSSDUG00000017538) ENSSDUG00000017528 prnpb (ENSSDUG00000017523) PPTC7 (ENSSDUG00000017509) TBC1D10A (ENSSDUG00000017488) aplnrb (ENSSDUG00000017477) ENSSDUG00000017463 ENSSDUG00000017409 ENSSDUG00000017266 slc35e4 (ENSSDUG00000017242) ENSSDUG00000017226 INPP5J (ENSSDUG00000017189) MAT2A (ENSSDUG00000017156) ##22 mpx (ENSSDUG00000017130) loxa (ENSSDUG00000017113) snx24 (ENSSDUG00000017103) GGCX (ENSSDUG00000017057) gmcl1 (ENSSDUG00000017005) fam136a (ENSSDUG00000016998) pcyox1 (ENSSDUG00000016983) slc20a1b (ENSSDUG00000016944) STARD7 (ENSSDUG00000016892) drg1 (ENSSDUG00000016834) KCNN2 (ENSSDUG00000016805) slc2a11l (ENSSDUG00000016767) nt5c2l1 (ENSSDUG00000016751) GNAZ (ENSSDUG00000016730) sppl3 (ENSSDUG00000016643) Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 2737 ANTXR1 (ENSSLDG00000016013) bmp1b (ENSSLDG00000016052) trim69 (ENSSLDG00000016080) kcnip3b (ENSSLDG00000016101) ENSSLDG00000016120 prnpb (ENSSLDG00000016127) PPTC7 (ENSSLDG00000016137) TBC1D10A (ENSSLDG00000016162) aplnrb (ENSSLDG00000016185) ENSSLDG00000016215 ENSSLDG00000016266 ENSSLDG00000016391 slc35e4 (ENSSLDG00000016611) ENSSLDG00000016623 INPP5J (ENSSLDG00000016645) MAT2A (ENSSLDG00000016684) ##22 ENSSLDG00000016706 mpx (ENSSLDG00000016725) Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000156522.c.b ENSGT00940000157176.b ENSGT00940000167013 ENSGT00940000158782.d.b ENSGT00390000016468 ENSGT00530000064873.a ENSGT00390000011937.g.a ENSGT00940000157386.b ENSGT01050000244888.b.b.a.b.d ENSGT00390000013929 ENSGT00950000182881.a.b.a.a.b ENSGT00940000166850 ENSGT00730000111291 ENSGT00940000154495.b.b.b.f ENSGT00940000156855.d ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.b ##22 ENSGT00940000156009.A.d ENSGT00940000154779.a.b.a ENSGT00390000001280.b ENSGT00390000014909 ENSGT00940000156185 ENSGT00390000006707 ENSGT00390000011206.a ENSGT00390000014879.c.a.a.a ENSGT00940000157856 ENSGT00940000153340.B ENSGT00950000182904.a.b.a ENSGT00940000166787 ENSGT00940000162631 ENSGT00940000158101 ENSGT00940000160353 Turbot MODERN SPECIES 7 ANTXR1 (ENSSMAG00000000923) bmp1b (ENSSMAG00000000838) trim69 (ENSSMAG00000000814) ENSSMAG00000032911 ENSSMAG00000000765 ENSSMAG00000020518 ENSSMAG00000020516 ENSSMAG00000020512 aplnrb (ENSSMAG00000035529) ENSSMAG00000020507 ENSSMAG00000020490 ENSSMAG00000020462 slc35e4 (ENSSMAG00000020459) ENSSMAG00000020458 ENSSMAG00000020448 ENSSMAG00000020436 ##22 mpx (ENSSMAG00000020424) loxa (ENSSMAG00000020416) snx24 (ENSSMAG00000020379) ENSSMAG00000020385 gmcl1 (ENSSMAG00000020368) fam136a (ENSSMAG00000020365) pcyox1 (ENSSMAG00000020363) slc20a1b (ENSSMAG00000020358) ENSSMAG00000031185 drg1 (ENSSMAG00000020355) ENSSMAG00000020347 slc2a11l (ENSSMAG00000020344) nt5c2l1 (ENSSMAG00000020335) sppl3 (ENSSMAG00000020304) ENSSMAG00000020299 Tongue sole MODERN SPECIES 5 AAK1 (ENSCSEG00000001577) ANTXR1 (ENSCSEG00000001586) bmp1b (ENSCSEG00000001620) trim69 (ENSCSEG00000001662) prnpb (ENSCSEG00000001666) kcnip3b (ENSCSEG00000001671) PPTC7 (ENSCSEG00000001681) TBC1D10A (ENSCSEG00000001686) aplnrb (ENSCSEG00000001695) ENSCSEG00000001701 ENSCSEG00000001709 ENSCSEG00000001730 slc35e4 (ENSCSEG00000001734) ENSCSEG00000001737 INPP5J (ENSCSEG00000001743) MAT2A (ENSCSEG00000001757) ##22 mpx (ENSCSEG00000001760) loxa (ENSCSEG00000001764) snx24 (ENSCSEG00000001768) GGCX (ENSCSEG00000001781) gmcl1 (ENSCSEG00000001798) fam136a (ENSCSEG00000001808) pcyox1 (ENSCSEG00000001815) Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000156522.c.b ENSGT00940000157176.b ENSGT00940000167013 ENSGT00940000158782.d.b ENSGT00390000016468 ENSGT00530000064873.a ENSGT00390000011937.g.a ENSGT00940000157386.b ENSGT01050000244888.b.b.a.b.d ENSGT00390000013929 ENSGT00950000182881.a.b.a.a.b ENSGT00940000166850 ENSGT00730000111291 ENSGT00940000154495.b.b.b ENSGT00940000156855.d ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.b ##22 ENSGT00940000164890.a ENSGT00940000156009.A.d ENSGT00940000154779.a.b.a ENSGT00390000001280.b ENSGT00390000014909 ENSGT00940000156185 ENSGT00390000006707 ENSGT00390000011206.a ENSGT00390000014879.c.a.a.a ENSGT00690000103805 ENSGT00940000157856 ENSGT00940000153340.B ENSGT00950000182904.a.b.a ENSGT00940000166787 ENSGT00940000162631 Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000156522.c.b ENSGT00940000157176.b ENSGT00940000167013 ENSGT00940000158782.d.b ENSGT00390000016468 ENSGT00530000064873.a ENSGT00390000011937.g.a ENSGT00940000157386.b ENSGT01050000244888.b.b.a.b.d ENSGT00390000013929 ENSGT00950000182881.a.b.a.a.b ENSGT00940000166850 ENSGT00730000111291 ENSGT00940000154495.b.b.b ENSGT00940000156855.d ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.b ##22 ENSGT00940000177137 ENSGT00940000156009.A.d ENSGT00940000154779.a.b.a ENSGT00390000001280.b ENSGT00390000014909 ENSGT00940000156185 ENSGT00390000006707 ENSGT00390000011206.a ENSGT00390000014879.c.a.a.a ENSGT00940000157856 ENSGT00940000153340.B ENSGT00950000182904.a.b.a ENSGT00940000166787 ENSGT00940000162631 ENSGT00940000158101 Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000156522.c.b ENSGT00940000157176.b ENSGT00940000167013 ENSGT00940000158782.d.b ENSGT00390000016468 ENSGT00530000064873.a ENSGT00390000011937.g.a ENSGT00940000157386.b ENSGT01050000244888.b.b.a.b.d ENSGT00390000013929 ENSGT00950000182881.a.b.a.a.b ENSGT00940000166850 ENSGT00730000111291 ENSGT00940000154495.b.b.b ENSGT00940000156855.d ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.b ##22 ENSGT00940000177137 ENSGT00940000156009.A.d ENSGT00940000154779.a.b.a ENSGT00390000001280.b ENSGT00390000014909 ENSGT00940000156185 ENSGT00390000006707 ENSGT00390000011206.a ENSGT00390000014879.c.a.a.a ENSGT00940000157856 ENSGT00940000153340.B ENSGT00950000182904.a.b.a ENSGT00940000166787 ENSGT00940000162631 ENSGT00940000158101 Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000156522.c.b ENSGT00940000157176.b ENSGT00940000167013 ENSGT00940000158782.d.b ENSGT00390000016468 ENSGT00530000064873.a ENSGT00390000011937.g.a ENSGT00940000157386.b ENSGT01050000244888.b.b.a.b.d ENSGT00390000013929 ENSGT00950000182881.a.b.a.a.b ENSGT00940000166850 ENSGT00730000111291 ENSGT00940000154495.b.b.b ENSGT00940000156855.d 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ENSGT00940000157856 ENSGT00940000153340.B ENSGT00950000182904.a.b.a ENSGT00940000166787 ENSGT00940000162631 ENSGT00940000158101 Clown anemonefish MODERN SPECIES 1097 kcnip3b (ENSAOCG00000005829) ENSAOCG00000005809 prnpb (ENSAOCG00000005799) PPTC7 (ENSAOCG00000005783) TBC1D10A (ENSAOCG00000000271) aplnrb (ENSAOCG00000005736) ENSAOCG00000005726 ENSAOCG00000005710 ENSAOCG00000000263 ENSAOCG00000005631 slc35e4 (ENSAOCG00000005498) ENSAOCG00000005481 INPP5J (ENSAOCG00000005452) MAT2A (ENSAOCG00000005368) ##22 ENSAOCG00000005353 mpx (ENSAOCG00000002300) Orange clownfish MODERN SPECIES 7 trim69 (ENSAPEG00000009920) kcnip3b (ENSAPEG00000009858) ENSAPEG00000009847 prnpb (ENSAPEG00000009834) PPTC7 (ENSAPEG00000009809) TBC1D10A (ENSAPEG00000009769) aplnrb (ENSAPEG00000009735) ENSAPEG00000009717 ENSAPEG00000009700 ENSAPEG00000009688 ENSAPEG00000009540 slc35e4 (ENSAPEG00000009509) ENSAPEG00000009500 ENSAPEG00000009488 ENSAPEG00000009397 MAT2A (ENSAPEG00000009353) ##22 ENSAPEG00000009326 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ENSGT00940000156522.c.b ENSGT00940000157176.b ENSGT00940000167013 ENSGT00940000158782.d.b ENSGT00390000016468 ENSGT00530000064873.a ENSGT00390000011937.g.a ENSGT00940000157386.b ENSGT01050000244888.b.b.a.b.d ENSGT00390000013929 ENSGT00950000182881.a.b.a.a.b ENSGT00940000166850 ENSGT00730000111291 ENSGT00940000154495.b.b.b ENSGT00940000156855.d ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.b ##22 ENSGT00940000156009.A.d ENSGT00940000154779.a.b.a ENSGT00390000001280.b ENSGT00390000014909 ENSGT00940000156185 ENSGT00390000006707 ENSGT00390000011206.a ENSGT00390000014879.c.a.a.a ENSGT00940000157856 ENSGT00940000153340.B ENSGT00950000182904.a.b.a ENSGT00940000166787 ENSGT00940000162631 ENSGT00940000158101 ENSGT00940000160353 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000156522.c.b ENSGT00940000157176.b ENSGT00940000167013 ENSGT00940000158782.d.b ENSGT00390000016468 ENSGT00530000064873.a ENSGT00390000011937.g.a ENSGT00940000157386.b ENSGT01050000244888.b.b.a.b.d ENSGT00390000013929 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ENSGT00940000177369 ENSGT00940000156855.d ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.b ##22 ENSGT00940000164890.a ENSGT00940000156009.A.d ENSGT00940000154779.a.b.a ENSGT00390000001280.b ENSGT00390000014909 ENSGT00940000156185 ENSGT00390000006707 ENSGT00390000011206.a ENSGT00390000014879.c.a.a.a ENSGT00690000103805 ENSGT00940000157856 ENSGT00940000153340.B ENSGT00950000182904.a.b.a ENSGT00940000166787 ENSGT00940000162631 Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000155968.d.a ENSGT00940000156522.c.b ENSGT00940000157176.b ENSGT00940000167013 ENSGT00940000158782.d.b ENSGT00530000064873.a ENSGT00390000011937.g.a ENSGT00940000157386.b ENSGT01050000244888.b.b.a.b.d ENSGT00390000013929 ENSGT00950000182881.a.b.a.a.b ENSGT00940000166850 ENSGT00730000111291 ENSGT00940000154495.b.b.b ENSGT00940000156855.d ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.b ##22 ENSGT00940000156009.A.d ENSGT00940000154779.a.b.a ENSGT00390000001280.b ENSGT00390000014909 ENSGT00940000156185 ENSGT00390000006707 ENSGT00390000011206.a 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(ENSKMAG00000010036) GNAZ (ENSKMAG00000010081) Turquoise killifish MODERN SPECIES 1611 prnpb (ENSNFUG00015018493) PPTC7B (ENSNFUG00015018489) AP2S1 (ENSNFUG00015018486) TBC1D10A (ENSNFUG00015018476) ENSNFUG00015018472 APLNRB (ENSNFUG00015018469) ENSNFUG00015018458 ENSNFUG00015018386 ENSNFUG00015018378 ENSNFUG00015018376 ENSNFUG00015018371 ENSNFUG00015018349 SLC35E4 (ENSNFUG00015018345) ENSNFUG00015018343 ENSNFUG00015018339 MAT2A (ENSNFUG00015018305) ##22 ENSNFUG00015018296 OLA.17191 (ENSNFUG00015016623) loxa (ENSNFUG00015016563) snx24 (ENSNFUG00015016555) GGCX (ENSNFUG00015016432) GMCL1 (ENSNFUG00015015360) FAM136A (ENSNFUG00015015281) PCYOX1 (ENSNFUG00015015268) SLC20A1B (ENSNFUG00015015000) STARD7 (ENSNFUG00015014877) DRG1 (ENSNFUG00015014427) KCNN2 (ENSNFUG00015014355) slc2a11l (ENSNFUG00015014296) NT5C2L1 (ENSNFUG00015013998) SPPL3 (ENSNFUG00015013975) Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000157176.b ENSGT00940000167013 ENSGT00940000158782.d.b ENSGT00390000016468 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ENSGT00390000014879.c.a.a.a ENSGT00690000103805 ENSGT00940000157856 ENSGT00940000153340.B ENSGT00950000182904.a.b.a ENSGT00940000166787 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000156522.c.b ENSGT00940000157176.b ENSGT00940000167013 ENSGT00940000158782.d.b ENSGT00390000016468 ENSGT00530000064873.a ENSGT00390000011937.g.a ENSGT00940000157386.b ENSGT01050000244888.b.b.a.b.d ENSGT00390000013929 ENSGT00950000182881.a.b.a.a.b ENSGT00940000166850 ENSGT00730000111291 ENSGT00940000154495.b.b.b ENSGT00940000156855.d ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.b ##22 ENSGT00940000164890.a ENSGT00940000156009.A.d.k ENSGT00940000156009.A.d.l ENSGT00940000154779.a.b.a ENSGT00390000001280.b ENSGT00390000014909 ENSGT00940000156185 ENSGT00390000006707 ENSGT00390000011206.a ENSGT00390000014879.c.a.a.a ENSGT00690000103805 ENSGT00940000157856 ENSGT00940000153340.B ENSGT00950000182904.a.b.a ENSGT00940000166787 Amazon molly MODERN SPECIES 258 AAK1 (ENSPFOG00000019752) ANTXR1 (ENSPFOG00000019751) bmp1b (ENSPFOG00000019750) 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ENSGT00940000153340.B ENSGT00950000182904.a.b.a ENSGT00940000166787 Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000155968.d.a ENSGT00940000156522.c.b ENSGT00940000157176.b ENSGT00940000167013 ENSGT00940000158782.d.b ENSGT00530000064873.a ENSGT00390000011937.g.a ENSGT00940000157386.b ENSGT01050000244888.b.b.a.b.d ENSGT00390000013929 ENSGT00950000182881.a.b.a.a.b ENSGT00940000166850 ENSGT00730000111291 ENSGT00940000154495.b.b.b ENSGT00940000156855.d ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.b ##22 ENSGT00940000177137 ENSGT00940000156009.A.d.m ENSGT00940000156009.A.d.n ENSGT00940000154779.a.b.a ENSGT00390000001280.b ENSGT00390000014909 ENSGT00940000156185 ENSGT00390000006707 ENSGT00390000011206.a ENSGT00390000014879.c.a.a.a ENSGT00940000157856 ENSGT00940000153340.B ENSGT00950000182904.a.b.a ENSGT00940000166787 ENSGT00940000162631 Indian medaka MODERN SPECIES 30 AAK1 (ENSOMEG00000002051) ANTXR1 (ENSOMEG00000002034) bmp1b (ENSOMEG00000002007) trim69 (ENSOMEG00000001991) kcnip3b (ENSOMEG00000001973) prnpb (ENSOMEG00000001953) PPTC7 (ENSOMEG00000001946) TBC1D10A (ENSOMEG00000001929) aplnrb (ENSOMEG00000001920) ENSOMEG00000001911 ATP6V0A2 (ENSOMEG00000001901) ENSOMEG00000001878 slc35e4 (ENSOMEG00000001856) ENSOMEG00000001849 ENSOMEG00000001846 MAT2A (ENSOMEG00000001837) ##22 ENSOMEG00000001831 mpx (ENSOMEG00000001821) ENSOMEG00000001810 mpx (ENSOMEG00000001803) loxa (ENSOMEG00000001789) snx24 (ENSOMEG00000001775) GGCX (ENSOMEG00000001781) gmcl1 (ENSOMEG00000001766) fam136a (ENSOMEG00000001755) pcyox1 (ENSOMEG00000001751) slc20a1b (ENSOMEG00000001738) STARD7 (ENSOMEG00000001725) drg1 (ENSOMEG00000001715) KCNN2 (ENSOMEG00000001707) slc2a11l (ENSOMEG00000001702) Javanese ricefish MODERN SPECIES 3 prlhr2b (ENSOJAG00000017778) anxa4 (ENSOJAG00000017458) AAK1 (ENSOJAG00000017432) ANTXR1 (ENSOJAG00000017112) trim69 (ENSOJAG00000014564) kcnip3b (ENSOJAG00000014416) prnpb (ENSOJAG00000014403) PPTC7 (ENSOJAG00000014390) TBC1D10A (ENSOJAG00000014265) aplnrb (ENSOJAG00000014231) ENSOJAG00000014213 ENSOJAG00000013646 ENSOJAG00000013259 slc35e4 (ENSOJAG00000013216) ENSOJAG00000013207 MAT2A (ENSOJAG00000013116) ##22 ENSOJAG00000013089 mpx (ENSOJAG00000012856) mpx (ENSOJAG00000012378) loxa (ENSOJAG00000012340) snx24 (ENSOJAG00000012322) gmcl1 (ENSOJAG00000011996) fam136a (ENSOJAG00000011964) pcyox1 (ENSOJAG00000011937) ENSOJAG00000011903 slc20a1b (ENSOJAG00000011615) STARD7 (ENSOJAG00000011487) drg1 (ENSOJAG00000011283) KCNN2 (ENSOJAG00000011050) slc2a11l (ENSOJAG00000010984) nt5c2l1 (ENSOJAG00000009616) Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000155968.d.a ENSGT00940000156522.c.b ENSGT00940000157176.b ENSGT00940000167013 ENSGT00940000158782.d.b ENSGT00530000064873.a ENSGT00390000011937.g.a ENSGT00940000157386.b ENSGT01050000244888.b.b.a.b.d ENSGT00390000013929 ENSGT00950000182881.a.b.a.a.b ENSGT00940000166850 ENSGT00730000111291 ENSGT00940000154495.b.b.b ENSGT00940000156855.d ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.b ##22 ENSGT00940000156009.A.d.m ENSGT00940000164890.a ENSGT00940000156009.A.d.n ENSGT00940000154779.a.b.a ENSGT00390000001280.b ENSGT00390000014909 ENSGT00940000156185 ENSGT00390000006707 ENSGT00390000011206.a ENSGT00390000014879.c.a.a.a ENSGT00940000157856 ENSGT00940000153340.B ENSGT00950000182904.a.b.a ENSGT00940000166787 ENSGT00940000162631 Chinese medaka MODERN SPECIES 199 ENSOSIG00000014181 PPTC7 (ENSOSIG00000014189) TBC1D10A (ENSOSIG00000014190) aplnrb (ENSOSIG00000014193) ENSOSIG00000014197 ATP6V0A2 (ENSOSIG00000014217) ENSOSIG00000014493 ENSOSIG00000014631 ENSOSIG00000014632 INPP5J (ENSOSIG00000014634) MAT2A (ENSOSIG00000014638) ##22 ENSOSIG00000014639 mpx (ENSOSIG00000014675) loxa (ENSOSIG00000015201) snx24 (ENSOSIG00000015203) GGCX (ENSOSIG00000015210) gmcl1 (ENSOSIG00000015219) fam136a (ENSOSIG00000015259) pcyox1 (ENSOSIG00000015260) slc20a1b (ENSOSIG00000015262) STARD7 (ENSOSIG00000015263) drg1 (ENSOSIG00000015265) KCNN2 (ENSOSIG00000015335) slc2a11l (ENSOSIG00000015347) nt5c2l1 (ENSOSIG00000015351) sppl3 (ENSOSIG00000015793) Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 3 bmp1b (ENSORLG00000008971) trim69 (ENSORLG00000009000) ENSORLG00000027236 ENSORLG00000029850 kcnip3b (ENSORLG00000009025) prnpb (ENSORLG00000009036) ENSORLG00000009060 ENSORLG00000028596 aplnrb (ENSORLG00000009085) ENSORLG00000009103 ENSORLG00000009170 ENSORLG00000009198 slc35e4 (ENSORLG00000027665) ENSORLG00000030547 ENSORLG00000009212 ENSORLG00000009236 ##22 mpx (ENSORLG00000009349) mpx (ENSORLG00000009297) loxa (ENSORLG00000009368) snx24 (ENSORLG00000009378) GGCX (ENSORLG00000009417) gmcl1 (ENSORLG00000009447) fam136a (ENSORLG00000009454) pcyox1 (ENSORLG00000009465) slc20a1b (ENSORLG00000009527) STARD7 (ENSORLG00000009554) drg1 (ENSORLG00000009578) KCNN2 (ENSORLG00000009605) slc2a11l (ENSORLG00000009619) nt5c2l1 (ENSORLG00000009627) sppl3 (ENSORLG00000009658) Otomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.b ##22 Otophysi ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.b ##22 Characiphysae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.b ##22 Channel catfish MODERN SPECIES 7 gmcl1 (ENSIPUG00000022914) ggcx (ENSIPUG00000022932) SNX24 (ENSIPUG00000022955) loxa (ENSIPUG00000022970) mpx (ENSIPUG00000022985) pptc7 (ENSIPUG00000023050) ENSIPUG00000023056 TBC1D10A (ENSIPUG00000024156) aplnrb (ENSIPUG00000024158) ENSIPUG00000024160 ENSIPUG00000024165 ewsr1a (ENSIPUG00000024176) slc35e4 (ENSIPUG00000024177) ENSIPUG00000024178 INPP5J (ENSIPUG00000024179) MAT2A (ENSIPUG00000024182) ##22 tctn1 (ENSIPUG00000024322) hvcn1 (ENSIPUG00000024329) csgalnact1 (ENSIPUG00000024332) plpp1 (ENSIPUG00000024346) skiv2l2 (ENSIPUG00000024348) dhx29 (ENSIPUG00000024354) ENSIPUG00000024365 pstpip2 (ENSIPUG00000024366) SUB1 (ENSIPUG00000024367) pmaip1 (ENSIPUG00000024368) itga1 (ENSIPUG00000024369) isl1b (ENSIPUG00000024427) GOLPH3 (ENSIPUG00000024434) GFRA2 (ENSIPUG00000024438) ENSIPUG00000024441 Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183185.c.a.a.cb ##22 Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183185.c.a.a.cb ##22 Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183185.c.a.a.cb ##22 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183185.c.a.a.cb ##22 Huchen DUPLICATION Huchen MODERN SPECIES 2678 folr (ENSHHUG00000042036) anapc15 (ENSHHUG00000042035) tomt (ENSHHUG00000041998) ENSHHUG00000041995 lamtor1 (ENSHHUG00000041980) lrrc51 (ENSHHUG00000041976) wu:fb44b02 (ENSHHUG00000041927) chordc1a (ENSHHUG00000041912) tyr (ENSHHUG00000041833) ENSHHUG00000041832 ENSHHUG00000041830 ##22 Huchen MODERN SPECIES 862 mpx (ENSHHUG00000003114) ENSHHUG00000003362 ##22 ENSHHUG00000003390 mpx (ENSHHUG00000003406) loxa (ENSHHUG00000003502) snx24 (ENSHHUG00000003524) ENSHHUG00000003625 ENSHHUG00000003644 gmcl1 (ENSHHUG00000003660) fam136a (ENSHHUG00000003685) pcyox1 (ENSHHUG00000003718) slc20a1b (ENSHHUG00000003732) STARD7 (ENSHHUG00000003815) drg1 (ENSHHUG00000003854) KCNN2 (ENSHHUG00000004077) ENSHHUG00000004247 ska1 (ENSHHUG00000004258) Elephant shark MODERN SPECIES 1671 ENSCMIG00000010556 dusp2 (ENSCMIG00000010553) ENSCMIG00000010552 stard7 (ENSCMIG00000010550) OGDH (ENSCMIG00000010470) ENSCMIG00000010460 ENSCMIG00000010459 ENSCMIG00000010458 tmem150aa (ENSCMIG00000010454) rnf181 (ENSCMIG00000010453) ENSCMIG00000010450 vamp8 (ENSCMIG00000010449) GGCX (ENSCMIG00000010446) usp39 (ENSCMIG00000010426) si:ch211-283h6.4 (ENSCMIG00000010415) mat2ab (ENSCMIG00000010351) ##22 ENSCMIG00000010326 ENSCMIG00000010321 ENSCMIG00000010320 ENSCMIG00000010318 ENSCMIG00000010309 kcnip3b (ENSCMIG00000010301) ENSCMIG00000010281 ENSCMIG00000010225 ykt6 (ENSCMIG00000010212) NPC1L1 (ENSCMIG00000010165) ddx56 (ENSCMIG00000010148) ENSCMIG00000010136 tmed4 (ENSCMIG00000010131) ENSCMIG00000010126 slc20a1b (ENSCMIG00000010122) Cyclostomata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183185.c.a #22 Hagfish MODERN SPECIES 1144 ENSEBUG00000010943 ENSEBUG00000014817 ENSEBUG00000015882 ENSEBUG00000009788 ENSEBUG00000002937 mat2ab (ENSEBUG00000003353) #22 ENSEBUG00000002313 ENSEBUG00000004296 ENSEBUG00000010133 WTAP (ENSEBUG00000000698) ENSEBUG00000006532 ENSEBUG00000003804 ENSEBUG00000003686 Vertebrata ANCESTRAL SPECIES 1151 ENSGT00950000183185.c.b ##22 ENSGT00950000183041.C Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183185.c.b ##22 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183185.c.b ##22 Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a ENSGT00940000160196 ENSGT00940000154827 ENSGT00940000156423 ENSGT00940000153771.B ENSGT00940000157329 ENSGT00940000153510.b ENSGT00940000155881 ENSGT00390000003175.a.b ENSGT00940000162090 ENSGT01030000234578.A.a ENSGT00440000039914 ENSGT00940000154426 ENSGT00940000158010 ENSGT00940000160325.a ENSGT00950000183185.c.b ##22 ENSGT00390000018326 ENSGT00550000074618.a.b ENSGT00390000006260 ENSGT00950000183162.b ENSGT00940000159168 ENSGT00940000157326 ENSGT00940000160287 ENSGT00940000156591 ENSGT00940000157357.f ENSGT00390000005646 ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155603.A.b.d ENSGT00940000155603.A.b.c ENSGT00940000159608 ENSGT00950000182908.A Neopterygii ANCESTRAL 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ENSGT00940000157897.a ENSGT00970000193629.b ENSGT00390000011669 ENSGT00940000153594.c.e.b ENSGT00940000167301 ENSGT00940000155122.b ENSGT00990000203619.A.b.b.b.b.a.b ENSGT00390000014349 Poecilia ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000159721.h ENSGT00940000166328 ENSGT00390000014845 ENSGT00940000158562 ENSGT00940000158733 ENSGT00940000155967 ENSGT00940000156571 ENSGT00940000157329 ENSGT00940000153510.b ENSGT00940000155881 ENSGT00390000003175.a.b ENSGT01030000234578.A.a ENSGT00440000039914 ENSGT00940000158010 ENSGT00940000160325.a ENSGT00950000183185.c.b ##22 ENSGT00940000155496.a.b ENSGT00940000155570.t ENSGT00940000153849.a.a.b ENSGT00500000044984 ENSGT00940000155149 ENSGT00940000155449 ENSGT00940000163293.c.b ENSGT00940000157897.a ENSGT00970000193629.b ENSGT00390000011669 ENSGT00940000153594.c.e.b ENSGT00940000167301 ENSGT00940000155122.b ENSGT00990000203619.A.b.b.b.b.a.b ENSGT00390000014349 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 172 ENSGT00390000014845 ENSGT00940000158562 ENSGT00940000158733 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trim23 (ENSORLG00000002016) ppwd1 (ENSORLG00000002002) ENSORLG00000030025 cwc27 (ENSORLG00000001991) ADAMTS6 (ENSORLG00000001971) ENSORLG00000025212 plac8.1 (ENSORLG00000024268) cops4 (ENSORLG00000001924) lin54 (ENSORLG00000001906) sec31a (ENSORLG00000001874) TMEM150C (ENSORLG00000030448) ENOPH1 (ENSORLG00000001846) hnrnpd (ENSORLG00000001833) si:ch73-234b20.5 (ENSORLG00000029060) mat2al (ENSORLG00000001777) ##22 ENSORLG00000001735 ENSORLG00000001697 PITPNM2 (ENSORLG00000001638) MPHOSPH9 (ENSORLG00000029246) CDK2AP1 (ENSORLG00000029235) sbno1 (ENSORLG00000001593) kmt5aa (ENSORLG00000001558) RILPL1 (ENSORLG00000001553) ENSORLG00000021982 ENSORLG00000001544 ENSORLG00000029471 denr (ENSORLG00000001495) ENSORLG00000024996 ENSORLG00000001483 ENSORLG00000028535 Chinese medaka MODERN SPECIES 1198 CERT1 (ENSOSIG00000023449) hmgcrb (ENSOSIG00000023419) GCNT4 (ENSOSIG00000023414) lhx5 (ENSOSIG00000023408) mzt2b (ENSOSIG00000023402) trim23 (ENSOSIG00000023398) ppwd1 (ENSOSIG00000023394) ENSOSIG00000023392 cwc27 (ENSOSIG00000023391) ADAMTS6 (ENSOSIG00000023375) cops4 (ENSOSIG00000023364) ENSOSIG00000023361 TMEM150C (ENSOSIG00000023356) enoph1 (ENSOSIG00000023355) hnrnpd (ENSOSIG00000023353) mat2al (ENSOSIG00000023327) ##22 ZSWIM6 (ENSOSIG00000023256) Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183185.c.b.b ##22 Chinese medaka DUPLICATION Chinese medaka MODERN SPECIES 1669 ENSOSIG00000012085 ##22 Chinese medaka MODERN SPECIES 1780 mat2al (ENSOSIG00000012327) ##22 Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000159721.h ENSGT00940000166328 ENSGT00390000014845 ENSGT00940000158562 ENSGT00940000158733 ENSGT00940000155967 ENSGT00940000156571 ENSGT00940000157329 ENSGT00940000153510.b ENSGT00940000155881 ENSGT00390000003175.a.b ENSGT01030000234578.A.a ENSGT00440000039914 ENSGT00940000158010 ENSGT00940000160325.a ENSGT00950000183185.c.b ##22 ENSGT00940000155496.a.b ENSGT00940000155570.t ENSGT00940000153849.a.a.b ENSGT00500000044984 ENSGT00940000155149 ENSGT00940000155449 ENSGT00940000163293.c.b ENSGT00940000157897.a ENSGT00940000153594.c.e.b ENSGT00940000167301 ENSGT00390000014349 ENSGT00990000203619.A.b.b.b.b.a.b ENSGT00940000155122.b ENSGT01030000234539.b.b.a.i ENSGT01100000266316 Javanese ricefish MODERN SPECIES 3 GCNT4 (ENSOJAG00000007303) lhx5 (ENSOJAG00000007311) mzt2b (ENSOJAG00000007325) trim23 (ENSOJAG00000007342) ppwd1 (ENSOJAG00000007397) cwc27 (ENSOJAG00000007407) ADAMTS6 (ENSOJAG00000007539) plac8.1 (ENSOJAG00000008053) cops4 (ENSOJAG00000008081) lin54 (ENSOJAG00000008114) sec31a (ENSOJAG00000008250) TMEM150C (ENSOJAG00000008930) ENOPH1 (ENSOJAG00000008954) hnrnpd (ENSOJAG00000008964) si:ch73-234b20.5 (ENSOJAG00000008982) mat2al (ENSOJAG00000009024) ##22 ZSWIM6 (ENSOJAG00000009483) ENSOJAG00000010311 ENSOJAG00000010435 ENSOJAG00000010455 kmt5aa (ENSOJAG00000012131) RILPL1 (ENSOJAG00000012157) ccdc62 (ENSOJAG00000012362) ccdc62 (ENSOJAG00000012384) denr (ENSOJAG00000012408) ENSOJAG00000012527 ENSOJAG00000012547 ZMIZ2 (ENSOJAG00000012581) ENSOJAG00000012799 ENSOJAG00000012915 DUSP26 (ENSOJAG00000012931) Indian medaka MODERN SPECIES 30 lhx5 (ENSOMEG00000017880) mzt2b (ENSOMEG00000017910) trim23 (ENSOMEG00000017937) ppwd1 (ENSOMEG00000017997) ENSOMEG00000018032 cwc27 (ENSOMEG00000018078) ADAMTS6 (ENSOMEG00000018187) ENSOMEG00000018208 cops4 (ENSOMEG00000000468) lin54 (ENSOMEG00000018289) sec31a (ENSOMEG00000018435) TMEM150C (ENSOMEG00000018506) enoph1 (ENSOMEG00000018534) hnrnpd (ENSOMEG00000018558) si:ch73-234b20.5 (ENSOMEG00000018572) mat2al (ENSOMEG00000018599) ##22 ZSWIM6 (ENSOMEG00000018660) ENSOMEG00000018764 PITPNM2 (ENSOMEG00000019058) MPHOSPH9 (ENSOMEG00000019226) CDK2AP1 (ENSOMEG00000019254) sbno1 (ENSOMEG00000019313) kmt5aa (ENSOMEG00000019347) RILPL1 (ENSOMEG00000019394) HIP1R (ENSOMEG00000021109) ccdc62 (ENSOMEG00000021753) denr (ENSOMEG00000021836) ENSOMEG00000021864 ENSOMEG00000021873 ENSOMEG00000021883 ZMIZ2 (ENSOMEG00000021971) Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000159721.h ENSGT00940000166328 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happy DUPLICATION Eastern happy MODERN SPECIES 19 mzt2b (ENSACLG00000025764) trim23 (ENSACLG00000025724) ppwd1 (ENSACLG00000025671) cwc27 (ENSACLG00000025628) ENSACLG00000025619 ENSACLG00000025574 ADAMTS6 (ENSACLG00000025480) plac8.1 (ENSACLG00000025459) cops4 (ENSACLG00000025422) lin54 (ENSACLG00000025384) sec31a (ENSACLG00000025274) TMEM150C (ENSACLG00000025250) enoph1 (ENSACLG00000025238) hnrnpd (ENSACLG00000025213) si:ch73-234b20.5 (ENSACLG00000025231) mat2al (ENSACLG00000025185) ##22 ZSWIM6 (ENSACLG00000025144) KIF2A (ENSACLG00000025094) PITPNM2 (ENSACLG00000024946) ENSACLG00000024944 CDK2AP1 (ENSACLG00000024940) sbno1 (ENSACLG00000024913) kmt5aa (ENSACLG00000024907) RILPL1 (ENSACLG00000024901) HIP1R (ENSACLG00000024813) ccdc62 (ENSACLG00000024796) denr (ENSACLG00000024786) ENSACLG00000024783 ENSACLG00000024770 ENSACLG00000024762 bcl7a (ENSACLG00000024751) Eastern happy MODERN SPECIES 142 enoph1 (ENSACLG00000026506) hnrnpd (ENSACLG00000026497) si:ch73-234b20.5 (ENSACLG00000026493) mat2al (ENSACLG00000026471) ##22 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1110 GCNT4 (ENSMZEG00005007116) lhx5 (ENSMZEG00005007128) mzt2b (ENSMZEG00005007140) trim23 (ENSMZEG00005007146) ppwd1 (ENSMZEG00005007195) cwc27 (ENSMZEG00005007217) ADAMTS6 (ENSMZEG00005007248) plac8.1 (ENSMZEG00005007305) cops4 (ENSMZEG00005007315) lin54 (ENSMZEG00005007345) sec31a (ENSMZEG00005007385) TMEM150C (ENSMZEG00005007525) enoph1 (ENSMZEG00005007539) hnrnpd (ENSMZEG00005007558) si:ch73-234b20.5 (ENSMZEG00005007567) mat2al (ENSMZEG00005007580) ##22 ZSWIM6 (ENSMZEG00005007609) KIF2A (ENSMZEG00005007647) PITPNM2 (ENSMZEG00005007677) MPHOSPH9 (ENSMZEG00005007706) CDK2AP1 (ENSMZEG00005007739) sbno1 (ENSMZEG00005007769) kmt5aa (ENSMZEG00005007800) RILPL1 (ENSMZEG00005007818) HIP1R (ENSMZEG00005007870) ccdc62 (ENSMZEG00005007962) denr (ENSMZEG00005007982) ENSMZEG00005007993 ENSMZEG00005008002 ENSMZEG00005008017 bcl7a (ENSMZEG00005008022) P. nyererei MODERN SPECIES 297 ENSPNYG00000005572 GCNT4 (ENSPNYG00000005563) lhx5 (ENSPNYG00000005549) mzt2b (ENSPNYG00000005538) trim23 (ENSPNYG00000005520) ppwd1 (ENSPNYG00000005473) cwc27 (ENSPNYG00000005384) ADAMTS6 (ENSPNYG00000005317) cops4 (ENSPNYG00000005262) lin54 (ENSPNYG00000005193) sec31a (ENSPNYG00000004982) TMEM150C (ENSPNYG00000004914) enoph1 (ENSPNYG00000004899) hnrnpd (ENSPNYG00000004884) si:ch73-234b20.5 (ENSPNYG00000004865) mat2al (ENSPNYG00000004824) ##22 ZSWIM6 (ENSPNYG00000004769) KIF2A (ENSPNYG00000004708) PITPNM2 (ENSPNYG00000004501) MPHOSPH9 (ENSPNYG00000004444) CDK2AP1 (ENSPNYG00000004423) sbno1 (ENSPNYG00000004291) kmt5aa (ENSPNYG00000004269) RILPL1 (ENSPNYG00000004220) HIP1R (ENSPNYG00000003944) ENSPNYG00000003883 denr (ENSPNYG00000003833) ENSPNYG00000003810 ENSPNYG00000003789 ENSPNYG00000003773 bcl7a (ENSPNYG00000003757) Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 1009 cops4 (ENSHBUG00000012142) lin54 (ENSHBUG00000012118) sec31a (ENSHBUG00000012044) TMEM150C (ENSHBUG00000011859) enoph1 (ENSHBUG00000011827) hnrnpd (ENSHBUG00000011794) si:ch73-234b20.5 (ENSHBUG00000011783) mat2al (ENSHBUG00000011776) ##22 ZSWIM6 (ENSHBUG00000011756) Lyretail cichlid MODERN SPECIES 419 GCNT4 (ENSNBRG00000020005) lhx5 (ENSNBRG00000019994) mzt2b (ENSNBRG00000019985) trim23 (ENSNBRG00000019976) ppwd1 (ENSNBRG00000019956) cwc27 (ENSNBRG00000019906) ADAMTS6 (ENSNBRG00000019825) plac8.1 (ENSNBRG00000019785) cops4 (ENSNBRG00000019754) lin54 (ENSNBRG00000019683) sec31a (ENSNBRG00000019633) TMEM150C (ENSNBRG00000019597) enoph1 (ENSNBRG00000019572) hnrnpd (ENSNBRG00000019548) si:ch73-234b20.5 (ENSNBRG00000019537) mat2al (ENSNBRG00000019485) ##22 ZSWIM6 (ENSNBRG00000019399) KIF2A (ENSNBRG00000019346) PITPNM2 (ENSNBRG00000019267) CDK2AP1 (ENSNBRG00000019255) sbno1 (ENSNBRG00000019189) kmt5aa (ENSNBRG00000019148) RILPL1 (ENSNBRG00000019084) HIP1R (ENSNBRG00000019017) ccdc62 (ENSNBRG00000018935) denr (ENSNBRG00000018898) ENSNBRG00000018875 ENSNBRG00000018855 ENSNBRG00000018840 bcl7a (ENSNBRG00000018831) eif2b1 (ENSNBRG00000018808) Nile tilapia MODERN SPECIES 19 GCNT4 (ENSONIG00000015429) lhx5 (ENSONIG00000015427) mzt2b (ENSONIG00000015425) trim23 (ENSONIG00000015424) ppwd1 (ENSONIG00000015422) cwc27 (ENSONIG00000015415) ADAMTS6 (ENSONIG00000015412) plac8.1 (ENSONIG00000015410) cops4 (ENSONIG00000015405) lin54 (ENSONIG00000015402) sec31a (ENSONIG00000015395) TMEM150C (ENSONIG00000036344) enoph1 (ENSONIG00000015392) hnrnpd (ENSONIG00000015390) si:ch73-234b20.5 (ENSONIG00000015389) mat2al (ENSONIG00000015385) ##22 ZSWIM6 (ENSONIG00000015381) KIF2A (ENSONIG00000015376) PITPNM2 (ENSONIG00000015369) MPHOSPH9 (ENSONIG00000015368) CDK2AP1 (ENSONIG00000042866) sbno1 (ENSONIG00000015348) kmt5aa (ENSONIG00000032617) RILPL1 (ENSONIG00000015346) ENSONIG00000015326 ccdc62 (ENSONIG00000015323) denr (ENSONIG00000015319) ENSONIG00000021001 ENSONIG00000031937 ENSONIG00000037058 bcl7a (ENSONIG00000015318) Midas cichlid MODERN SPECIES 633 sec31a (ENSACIG00000008405) TMEM150C (ENSACIG00000008388) enoph1 (ENSACIG00000008366) hnrnpd (ENSACIG00000008353) si:ch73-234b20.5 (ENSACIG00000008334) mat2al (ENSACIG00000008315) ##22 ZSWIM6 (ENSACIG00000008279) KIF2A (ENSACIG00000008231) PITPNM2 (ENSACIG00000008178) ENSACIG00000008166 CDK2AP1 (ENSACIG00000008153) sbno1 (ENSACIG00000008088) kmt5aa (ENSACIG00000008046) RILPL1 (ENSACIG00000008024) HIP1R (ENSACIG00000007758) ccdc62 (ENSACIG00000007719) denr (ENSACIG00000007705) ENSACIG00000007697 ENSACIG00000007676 ENSACIG00000007663 bcl7a (ENSACIG00000007635) Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000159721.h ENSGT00940000166328 ENSGT00390000014845 ENSGT00940000158562 ENSGT00940000158733 ENSGT00940000155967 ENSGT00940000156571 ENSGT00940000157329 ENSGT00940000153510.b ENSGT00940000155881 ENSGT00390000003175.a.b ENSGT01030000234578.A.a ENSGT00440000039914 ENSGT00940000158010 ENSGT00940000160325.a ENSGT00950000183185.c.b ##22 ENSGT00940000155496.a.b ENSGT00940000155570.t ENSGT00940000153849.a.a.b ENSGT00940000153849.a.b ENSGT00500000044984 ENSGT00940000155149 ENSGT00940000155449 ENSGT00940000163293.c.b ENSGT00940000157897.a ENSGT00940000153594.c.e.b ENSGT00940000167301 ENSGT00390000014349 ENSGT00990000203619.A.b.b.b.b.a.b Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000159721.h ENSGT00940000166328 ENSGT00390000014845 ENSGT00940000158562 ENSGT00940000158733 ENSGT00940000155967 ENSGT00940000156571 ENSGT00940000157329 ENSGT00940000153510.b ENSGT00940000155881 ENSGT00390000003175.a.b ENSGT01030000234578.A.a ENSGT00440000039914 ENSGT00940000158010 ENSGT00940000160325.a ENSGT00950000183185.c.b ##22 ENSGT00940000155496.a.b ENSGT00940000155570.t ENSGT00940000153849.a.a.b ENSGT00500000044984 ENSGT00940000155149 ENSGT00940000155449 ENSGT00940000163293.c.b ENSGT00940000157897.a ENSGT00940000153594.c.e.b ENSGT00940000167301 ENSGT00390000014349 ENSGT00990000203619.A.b.b.b.b.a.b Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000159721.h ENSGT00940000166328 ENSGT00390000014845 ENSGT00940000158562 ENSGT00940000158733 ENSGT00940000155967 ENSGT00940000156571 ENSGT00940000157329 ENSGT00940000153510.b ENSGT00940000155881 ENSGT00390000003175.a.b ENSGT01030000234578.A.a ENSGT00440000039914 ENSGT00940000158010 ENSGT00940000160325.a ENSGT00950000183185.c.b ##22 ENSGT00940000155496.a.b ENSGT00940000155570.t ENSGT00940000153849.a.a.b ENSGT00500000044984 ENSGT00940000155149 ENSGT00940000155449 ENSGT00940000163293.c.b ENSGT00940000157897.a Clown anemonefish MODERN SPECIES 615 enoph1 (ENSAOCG00000014154) hnrnpd (ENSAOCG00000014191) si:ch73-234b20.5 (ENSAOCG00000014216) mat2al (ENSAOCG00000014248) ##22 ZSWIM6 (ENSAOCG00000014289) KIF2A (ENSAOCG00000014410) ENSAOCG00000000951 ENSAOCG00000014539 ENSAOCG00000014590 ENSAOCG00000014605 PITPNM2 (ENSAOCG00000000970) MPHOSPH9 (ENSAOCG00000014755) CDK2AP1 (ENSAOCG00000014778) sbno1 (ENSAOCG00000014859) ENSAOCG00000001015 kmt5aa (ENSAOCG00000001020) RILPL1 (ENSAOCG00000014917) ENSAOCG00000001037 Orange clownfish MODERN SPECIES 7 ENSAPEG00000004780 mzt2b (ENSAPEG00000004797) trim23 (ENSAPEG00000004822) ppwd1 (ENSAPEG00000004859) cwc27 (ENSAPEG00000004904) ADAMTS6 (ENSAPEG00000004933) plac8.1 (ENSAPEG00000005010) cops4 (ENSAPEG00000005079) lin54 (ENSAPEG00000005149) ENSAPEG00000005226 sec31a (ENSAPEG00000005330) TMEM150C (ENSAPEG00000005480) enoph1 (ENSAPEG00000005547) hnrnpd (ENSAPEG00000005603) si:ch73-234b20.5 (ENSAPEG00000005615) mat2al (ENSAPEG00000005632) ##22 ZSWIM6 (ENSAPEG00000005669) ENSAPEG00000005741 KIF2A (ENSAPEG00000005760) PITPNM2 (ENSAPEG00000005833) ENSAPEG00000005915 ENSAPEG00000005926 ENSAPEG00000005956 MPHOSPH9 (ENSAPEG00000006011) CDK2AP1 (ENSAPEG00000006040) sbno1 (ENSAPEG00000006069) kmt5aa (ENSAPEG00000006170) RILPL1 (ENSAPEG00000006199) ENSAPEG00000006237 ENSAPEG00000006245 ENSAPEG00000006282 Spiny chromis MODERN SPECIES 324 trim23 (ENSAPOG00000005524) ppwd1 (ENSAPOG00000005578) cwc27 (ENSAPOG00000005662) ADAMTS6 (ENSAPOG00000005762) PLAC8 (ENSAPOG00000005787) ENSAPOG00000005800 ENSAPOG00000000144 PLAC8 (ENSAPOG00000005824) cops4 (ENSAPOG00000000150) lin54 (ENSAPOG00000005944) sec31a (ENSAPOG00000006099) TMEM150C (ENSAPOG00000006128) enoph1 (ENSAPOG00000006157) hnrnpd (ENSAPOG00000006184) si:ch73-234b20.5 (ENSAPOG00000000172) mat2al (ENSAPOG00000006244) ##22 ZSWIM6 (ENSAPOG00000006311) Bicolor damselfish MODERN SPECIES 1797 ADAMTS6 (ENSSPAG00000021321) plac8.1 (ENSSPAG00000021299) cops4 (ENSSPAG00000021261) lin54 (ENSSPAG00000021218) sec31a (ENSSPAG00000021076) TMEM150C (ENSSPAG00000021046) enoph1 (ENSSPAG00000021031) hnrnpd (ENSSPAG00000021014) si:ch73-234b20.5 (ENSSPAG00000021001) mat2al (ENSSPAG00000020980) ##22 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000159721.h ENSGT00940000166328 ENSGT00390000014845 ENSGT00940000158562 ENSGT00940000158733 ENSGT00940000155967 ENSGT00940000156571 ENSGT00940000157329 ENSGT00940000153510.b ENSGT00940000155881 ENSGT00390000003175.a.b ENSGT01030000234578.A.a ENSGT00440000039914 ENSGT00940000158010 ENSGT00940000160325.a ENSGT00950000183185.c.b ##22 ENSGT00940000154486.b.a.a.b.e.a.a.b ENSGT00940000155496.a.b ENSGT00940000155570.t ENSGT00940000153849.a.a.b ENSGT00500000044984 ENSGT00940000178081 ENSGT00940000155149 ENSGT00940000155449 ENSGT00940000163293.c.b ENSGT00940000157897.a ENSGT00940000153594.c.e.b ENSGT00940000167301 ENSGT00390000014349 ENSGT00990000203619.A.b.b.b.b.a.b ENSGT00940000155122.b Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000159721.h ENSGT00940000166328 ENSGT00390000014845 ENSGT00940000158562 ENSGT00940000158733 ENSGT00940000155967 ENSGT00940000156571 ENSGT00940000157329 ENSGT00940000153510.b ENSGT00940000155881 ENSGT00390000003175.a.b ENSGT01030000234578.A.a ENSGT00440000039914 ENSGT00940000158010 ENSGT00940000160325.a ENSGT00950000183185.c.b ##22 ENSGT00940000154486.b.a.a.b.e.a.a.b ENSGT00940000155496.a.b ENSGT00940000155570.t ENSGT00940000153849.a.a.b ENSGT00500000044984 ENSGT00940000155149 ENSGT00940000155449 ENSGT00940000163293.c.b ENSGT00940000157897.a ENSGT00940000153594.c.e.b ENSGT00940000167301 ENSGT00390000014349 ENSGT00990000203619.A.b.b.b.b.a.b ENSGT00940000155122.b ENSGT00390000002172.B Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000155305.b.b ENSGT00940000159721.h ENSGT00940000166328 ENSGT00390000014845 ENSGT00940000158562 ENSGT00940000158733 ENSGT00940000155967 ENSGT00940000156571 ENSGT00940000157329 ENSGT00940000153510.b ENSGT00940000155881 ENSGT00390000003175.a.b ENSGT00440000039914 ENSGT00940000158010 ENSGT00940000160325.a ENSGT00950000183185.c.b ##22 ENSGT00940000154486.b.a.a.b.e.a.a.b ENSGT00940000155496.a.b ENSGT00940000155570.t ENSGT00940000153849.a.a.b ENSGT00500000044984 ENSGT00940000155149 ENSGT00940000155449 ENSGT00940000163293.c.b ENSGT00940000157897.a ENSGT00940000153594.c.e.b ENSGT00940000167301 ENSGT00390000014349 ENSGT00990000203619.A.b.b.b.b.a.b ENSGT00940000155122.b ENSGT00390000002172.B Tetraodon MODERN SPECIES 19 CERT1 (ENSTNIG00000013486) hmgcrb (ENSTNIG00000013487) GCNT4 (ENSTNIG00000013488) lhx5 (ENSTNIG00000013489) trim23 (ENSTNIG00000013490) ppwd1 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(ENSTRUG00000018428) sec31a (ENSTRUG00000018434) enoph1 (ENSTRUG00000018448) hnrnpd (ENSTRUG00000018450) si:ch73-234b20.5 (ENSTRUG00000023648) mat2al (ENSTRUG00000018457) ##22 ENSTRUG00000018462 ZSWIM6 (ENSTRUG00000018464) ENSTRUG00000018472 MPHOSPH9 (ENSTRUG00000018487) CDK2AP1 (ENSTRUG00000025872) sbno1 (ENSTRUG00000018490) kmt5aa (ENSTRUG00000018497) RILPL1 (ENSTRUG00000018499) ccdc62 (ENSTRUG00000022161) denr (ENSTRUG00000020621) ENSTRUG00000018511 ENSTRUG00000024096 eif2b1 (ENSTRUG00000018520) ddx55 (ENSTRUG00000018525) ENSTRUG00000018535 Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000159721.h ENSGT00940000166328 ENSGT00390000014845 ENSGT00940000158562 ENSGT00940000158733 ENSGT00940000155967 ENSGT00940000156571 ENSGT00940000157329 ENSGT00940000153510.b ENSGT00940000155881 ENSGT00390000003175.a.b ENSGT01030000234578.A.a ENSGT00440000039914 ENSGT00940000158010 ENSGT00940000160325.a ENSGT00950000183185.c.b ##22 ENSGT00940000154486.b.a.a.b.e.a.a.b ENSGT00940000155496.a.b ENSGT00940000155570.t ENSGT00940000153849.a.a.b ENSGT00500000044984 ENSGT00940000155149 ENSGT00940000155449 ENSGT00940000163293.c.b ENSGT00940000157897.a ENSGT00940000153594.c.e.b ENSGT00940000167301 ENSGT00390000014349 ENSGT00990000203619.A.b.b.b.b.a.b ENSGT00940000155122.b ENSGT00390000002172.B Ballan wrasse MODERN SPECIES 314 GCNT4 (ENSLBEG00000028000) lhx5 (ENSLBEG00000027984) mzt2b (ENSLBEG00000027972) trim23 (ENSLBEG00000027953) ppwd1 (ENSLBEG00000027922) cwc27 (ENSLBEG00000027896) ADAMTS6 (ENSLBEG00000027841) plac8.1 (ENSLBEG00000027815) cops4 (ENSLBEG00000027798) lin54 (ENSLBEG00000027727) sec31a (ENSLBEG00000027609) TMEM150C (ENSLBEG00000027546) enoph1 (ENSLBEG00000027536) hnrnpd (ENSLBEG00000027508) si:ch73-234b20.5 (ENSLBEG00000027485) mat2al (ENSLBEG00000027469) ##22 ahr2 (ENSLBEG00000027450) ZNF462 (ENSLBEG00000027432) TMEM38B (ENSLBEG00000027414) Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000159721.h ENSGT00940000166328 ENSGT00390000014845 ENSGT00940000158562 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ENSGT00940000154486.b.a.a.b.e.a.a.b ENSGT00940000155496.a.b ENSGT00940000155570.t ENSGT00940000153849.a.a.b ENSGT00500000044984 ENSGT00940000155149 ENSGT00940000155449 ENSGT00940000163293.c.b ENSGT00940000157897.a ENSGT00940000153594.c.e.b ENSGT00940000167301 ENSGT00390000014349 ENSGT00990000203619.A.b.b.b.b.a.b ENSGT00940000155122.b ENSGT00390000002172.B Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000159721.h ENSGT00940000166328 ENSGT00390000014845 ENSGT00940000158562 ENSGT00940000158733 ENSGT00940000155967 ENSGT00940000156571 ENSGT00940000157329 ENSGT00940000153510.b ENSGT00940000155881 ENSGT00390000003175.a.b ENSGT01030000234578.A.a ENSGT00440000039914 ENSGT00940000158010 ENSGT00940000160325.a ENSGT00950000183185.c.b ##22 ENSGT00940000154486.b.a.a.b.e.a.a.b ENSGT00940000155496.a.b ENSGT00940000155570.t ENSGT00940000153849.a.a.b ENSGT00500000044984 ENSGT00940000155149 ENSGT00940000155449 ENSGT00940000163293.c.b ENSGT00940000157897.a ENSGT00940000153594.c.e.b ENSGT00390000014349 ENSGT00990000203619.A.b.b.b.b.a.b ENSGT00390000002172.B ENSGT00550000074853 ENSGT00550000074969 European seabass MODERN SPECIES 9 ENSDLAG00005012197 ENSDLAG00005012230 ENSDLAG00005030358 kmt5aa (ENSDLAG00005032838) SBNO1 (ENSDLAG00005012458) CDK2AP1 (ENSDLAG00005031361) MPHOSPH9 (ENSDLAG00005015522) PITPNM2 (ENSDLAG00005015579) ENSDLAG00005018427 ENSDLAG00005019991 ENSDLAG00005020362 TMEM150C (ENSDLAG00005020425) enoph1 (ENSDLAG00005020433) hnrnpd (ENSDLAG00005020442) si:ch73-234b20.5 (ENSDLAG00005034912) mat2al (ENSDLAG00005020467) ##22 SEC31A (ENSDLAG00005020508) lin54 (ENSDLAG00005020845) COPS4 (ENSDLAG00005020910) plac8.1 (ENSDLAG00005020949) ENSDLAG00005020960 ENSDLAG00005021155 ENSDLAG00005021185 ENSDLAG00005013686 mzt2b (ENSDLAG00005031291) ENSDLAG00005028991 GCNT4 (ENSDLAG00005027499) hmgcrb (ENSDLAG00005021232) CERT1 (ENSDLAG00005021764) SV2C (ENSDLAG00005022048) F2RL2 (ENSDLAG00005022059) Large yellow croaker MODERN SPECIES 4 nudcd3 (ENSLCRG00005005433) 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ADAMTS6 (ENSSAUG00010016797) plac8.1 (ENSSAUG00010016792) cops4 (ENSSAUG00010016783) lin54 (ENSSAUG00010016779) sec31a (ENSSAUG00010016623) TMEM150C (ENSSAUG00010016588) enoph1 (ENSSAUG00010016585) hnrnpd (ENSSAUG00010016583) si:ch73-234b20.5 (ENSSAUG00010016579) mat2al (ENSSAUG00010016252) ##22 ahr2 (ENSSAUG00010016242) ENSSAUG00010016237 ENSSAUG00010016236 ENSSAUG00010016235 ENSSAUG00010016234 ZSWIM6 (ENSSAUG00010014895) ENSSAUG00010014873 ENSSAUG00010014871 KIF2A (ENSSAUG00010011847) ENSSAUG00010011814 ENSSAUG00010011813 ENSSAUG00010011811 ENSSAUG00010011810 ENSSAUG00010011809 ENSSAUG00010011806 Perciformes ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000159721.h ENSGT00940000166328 ENSGT00390000014845 ENSGT00940000158562 ENSGT00940000158733 ENSGT00940000155967 ENSGT00940000156571 ENSGT00940000157329 ENSGT00940000153510.b ENSGT00940000155881 ENSGT00390000003175.a.b ENSGT01030000234578.A.a ENSGT00440000039914 ENSGT00940000158010 ENSGT00940000160325.a ENSGT00950000183185.c.b ##22 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ENSGT00390000014349 ENSGT00990000203619.A.b.b.b.b.a.b ENSGT00940000155122.b ENSGT00390000002172.B Pike perch MODERN SPECIES 165 ENSSLUG00000004436 ENSSLUG00000004433 PLAC8 (ENSSLUG00000004426) ENSSLUG00000004419 ENSSLUG00000004397 PLAC8 (ENSSLUG00000004384) cops4 (ENSSLUG00000004332) lin54 (ENSSLUG00000004104) sec31a (ENSSLUG00000003678) TMEM150C (ENSSLUG00000003552) enoph1 (ENSSLUG00000003542) hnrnpd (ENSSLUG00000003534) si:ch73-234b20.5 (ENSSLUG00000003528) mat2al (ENSSLUG00000003453) ##22 ahr2 (ENSSLUG00000002968) ENSSLUG00000024223 ZSWIM6 (ENSSLUG00000024177) KIF2A (ENSSLUG00000023853) PITPNM2 (ENSSLUG00000022540) ENSSLUG00000022413 MPHOSPH9 (ENSSLUG00000022407) CDK2AP1 (ENSSLUG00000022395) sbno1 (ENSSLUG00000018463) kmt5aa (ENSSLUG00000018350) RILPL1 (ENSSLUG00000018336) HIP1R (ENSSLUG00000018303) ENSSLUG00000018287 ENSSLUG00000018282 denr (ENSSLUG00000018274) Channel bull blenny MODERN SPECIES 3 GCNT4 (ENSCGOG00000016250) lhx5 (ENSCGOG00000016241) mzt2b (ENSCGOG00000016240) trim23 (ENSCGOG00000016037) ppwd1 (ENSCGOG00000015933) cwc27 (ENSCGOG00000015627) ADAMTS6 (ENSCGOG00000015595) plac8.1 (ENSCGOG00000015587) cops4 (ENSCGOG00000015563) lin54 (ENSCGOG00000015485) sec31a (ENSCGOG00000011628) TMEM150C (ENSCGOG00000011547) enoph1 (ENSCGOG00000011542) si:ch73-234b20.5 (ENSCGOG00000011539) hnrnpd (ENSCGOG00000011480) mat2al (ENSCGOG00000010821) ##22 ahr2 (ENSCGOG00000010813) ZSWIM6 (ENSCGOG00000010592) KIF2A (ENSCGOG00000007698) PITPNM2 (ENSCGOG00000007514) MPHOSPH9 (ENSCGOG00000007509) CDK2AP1 (ENSCGOG00000007500) sbno1 (ENSCGOG00000005666) kmt5aa (ENSCGOG00000005633) RILPL1 (ENSCGOG00000005624) HIP1R (ENSCGOG00000004261) ccdc62 (ENSCGOG00000004191) denr (ENSCGOG00000004119) ENSCGOG00000004105 ENSCGOG00000004094 bcl7a (ENSCGOG00000004076) Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00940000155305.b.b ENSGT00940000159721.h ENSGT00940000166328 ENSGT00390000014845 ENSGT00940000158562 ENSGT00940000158733 ENSGT00940000155967 ENSGT00940000156571 ENSGT00940000157329 ENSGT00940000153510.b ENSGT00940000155881 ENSGT00390000003175.a.b ENSGT00440000039914 ENSGT00940000158010 ENSGT00940000160325.a ENSGT00950000183185.c.b ##22 ENSGT00940000154486.b.a.a.b.e.a.a.b ENSGT00940000155496.a.b ENSGT00940000155570.t ENSGT00940000153849.a.a.b ENSGT00500000044984 ENSGT00940000155149 ENSGT00940000155449 ENSGT00940000163293.c.b ENSGT00940000157897.a ENSGT00940000153594.c.e.b ENSGT00940000167301 ENSGT00390000014349 ENSGT00990000203619.A.b.b.b.b.a.b ENSGT00940000155122.b ENSGT00390000002172.B Lumpfish MODERN SPECIES 3 hmgcrb (ENSCLMG00005018721) GCNT4 (ENSCLMG00005018715) lhx5 (ENSCLMG00005018712) mzt2b (ENSCLMG00005018711) trim23 (ENSCLMG00005018578) ppwd1 (ENSCLMG00005018502) cwc27 (ENSCLMG00005018500) ADAMTS6 (ENSCLMG00005018496) plac8.1 (ENSCLMG00005018495) cops4 (ENSCLMG00005018470) lin54 (ENSCLMG00005018332) sec31a (ENSCLMG00005018147) enoph1 (ENSCLMG00005018139) hnrnpd (ENSCLMG00005018137) si:ch73-234b20.5 (ENSCLMG00005018135) mat2al (ENSCLMG00005018126) ##22 ENSCLMG00005018124 ZSWIM6 (ENSCLMG00005017606) ENSCLMG00005017602 PITPNM2 (ENSCLMG00005017599) ENSCLMG00005017596 CDK2AP1 (ENSCLMG00005017595) sbno1 (ENSCLMG00005014368) kmt5aa (ENSCLMG00005014338) kyat1 (ENSCLMG00005014337) surf6 (ENSCLMG00005014336) surf1 (ENSCLMG00005014335) ENSCLMG00005014326 RPL7A (ENSCLMG00005014319) usp20 (ENSCLMG00005014215) ptges (ENSCLMG00005014209) Stickleback MODERN SPECIES 13 SV2C (ENSGACG00000015751) CERT1 (ENSGACG00000015744) hmgcrb (ENSGACG00000015741) GCNT4 (ENSGACG00000015737) mzt2b (ENSGACG00000015736) trim23 (ENSGACG00000015730) ppwd1 (ENSGACG00000015717) cwc27 (ENSGACG00000015712) ADAMTS6 (ENSGACG00000015707) plac8.1 (ENSGACG00000015705) cops4 (ENSGACG00000015697) lin54 (ENSGACG00000015693) sec31a (ENSGACG00000015685) enoph1 (ENSGACG00000015673) hnrnpd (ENSGACG00000015669) mat2al (ENSGACG00000015651) ##22 ENSGACG00000015650 ENSGACG00000015649 ZSWIM6 (ENSGACG00000015647) ENSGACG00000015644 PITPNM2 (ENSGACG00000015641) ENSGACG00000015639 CDK2AP1 (ENSGACG00000015636) sbno1 (ENSGACG00000015633) kmt5aa (ENSGACG00000015630) RILPL1 (ENSGACG00000015627) ENSGACG00000015624 ccdc62 (ENSGACG00000015623) denr (ENSGACG00000015614) ENSGACG00000015612 ENSGACG00000015608 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000159721.h ENSGT00940000166328 ENSGT00390000014845 ENSGT00940000158562 ENSGT00940000158733 ENSGT00940000155967 ENSGT00940000156571 ENSGT00940000157329 ENSGT00940000153510.b ENSGT00940000155881 ENSGT00390000003175.a.b ENSGT01030000234578.A.a ENSGT00440000039914 ENSGT00940000158010 ENSGT00940000160325.a ENSGT00950000183185.c.b ##22 ENSGT00940000154486.b.a.a.b.e.a.a.b ENSGT00940000155496.a.b ENSGT00940000155570.t ENSGT00940000153849.a.a.b ENSGT00500000044984 ENSGT00940000178081 ENSGT00940000155149 ENSGT00940000155449 ENSGT00940000163293.c.b ENSGT00940000157897.a ENSGT00940000153594.c.e.b ENSGT00940000167301 ENSGT00390000014349 ENSGT00990000203619.A.b.b.b.b.a.b ENSGT00940000155122.b Carangaria ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000159721.h ENSGT00940000166328 ENSGT00390000014845 ENSGT00940000158562 ENSGT00940000158733 ENSGT00940000155967 ENSGT00940000156571 ENSGT00940000157329 ENSGT00940000153510.b ENSGT00940000155881 ENSGT00390000003175.a.b ENSGT01030000234578.A.a ENSGT00440000039914 ENSGT00940000158010 ENSGT00940000160325.a ENSGT00950000183185.c.b ##22 ENSGT00940000154486.b.a.a.b.e.a.a.b ENSGT00940000155496.a.b ENSGT00940000155570.t ENSGT00940000153849.a.a.b ENSGT00500000044984 ENSGT00940000155149 ENSGT00940000155449 ENSGT00940000163293.c.b ENSGT00940000157897.a ENSGT00940000153594.c.e.b ENSGT00940000167301 ENSGT00390000014349 ENSGT00990000203619.A.b.b.b.b.a.b ENSGT00940000155122.b ENSGT00390000002172.B Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000159721.h ENSGT00940000166328 ENSGT00390000014845 ENSGT00940000158562 ENSGT00940000158733 ENSGT00940000155967 ENSGT00940000156571 ENSGT00940000157329 ENSGT00940000153510.b ENSGT00940000155881 ENSGT00390000003175.a.b ENSGT01030000234578.A.a ENSGT00440000039914 ENSGT00940000158010 ENSGT00940000160325.a ENSGT00950000183185.c.b ##22 ENSGT00940000154486.b.a.a.b.e.a.a.b ENSGT00940000155496.a.b ENSGT00940000155570.t ENSGT00940000153849.a.a.b ENSGT00500000044984 ENSGT00940000155149 ENSGT00940000155449 ENSGT00940000163293.c.b ENSGT00940000157897.a ENSGT00940000153594.c.e.b ENSGT00940000167301 ENSGT00390000014349 ENSGT00990000203619.A.b.b.b.b.a.b ENSGT00940000155122.b ENSGT00390000002172.B Barramundi perch DUPLICATION Barramundi perch MODERN SPECIES 619 PLAC8 (ENSLCAG00010007877) cops4 (ENSLCAG00010007894) lin54 (ENSLCAG00010007953) sec31a (ENSLCAG00010008043) TMEM150C (ENSLCAG00010008081) enoph1 (ENSLCAG00010008091) hnrnpd (ENSLCAG00010008100) si:ch73-234b20.5 (ENSLCAG00010008113) mat2al (ENSLCAG00010008118) ##22 ENSLCAG00010008129 Barramundi perch MODERN SPECIES 767 mat2al (ENSLCAG00010002966) ##22 ahr2 (ENSLCAG00010002968) Seriola ANCESTRAL SPECIES 53 ENSGT00940000158010 ENSGT00940000160325.a ENSGT00950000183185.c.b ##22 ENSGT00940000154486.b.a.a.b.e.a.a.b ENSGT00940000155496.a.b ENSGT00940000155553.e.a ENSGT00940000156399 ENSGT00730000110872.a.tb ENSGT00940000159526 ENSGT00950000183171.A.b.a.a ENSGT00940000158321 ENSGT00390000015280 ENSGT00950000183197.b.a.b ENSGT00940000165531.b.b ENSGT00950000182815.a.a.b.g ENSGT00940000157242.a.b ENSGT00940000163584.a ENSGT00940000158491.b Greater amberjack MODERN SPECIES 261 hnrnpd (ENSSDUG00000010792) si:ch73-234b20.5 (ENSSDUG00000010784) mat2al (ENSSDUG00000010753) ##22 ahr2 (ENSSDUG00000010731) ZSWIM6 (ENSSDUG00000010650) pik3r1 (ENSSDUG00000010574) MAST4 (ENSSDUG00000010544) ENSSDUG00000010433 ENSSDUG00000010414 ENSSDUG00000010395 erbin (ENSSDUG00000010319) nln (ENSSDUG00000010276) sgtb (ENSSDUG00000010248) sgtb (ENSSDUG00000010220) trappc13 (ENSSDUG00000010162) CYB561A3 (ENSSDUG00000010122) tnfrsfa (ENSSDUG00000010104) unc5da (ENSSDUG00000009979) Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 3042 COL5A1 (ENSSLDG00000015379) olfm1a (ENSSLDG00000015461) mrps2 (ENSSLDG00000015489) mob1bb (ENSSLDG00000015512) dck (ENSSLDG00000015520) SLC4A4 (ENSSLDG00000015570) NPFFR2 (ENSSLDG00000015760) ENSSLDG00000015787 ENSSLDG00000015805 fbp1b (ENSSLDG00000015834) gas1b (ENSSLDG00000015854) c9 (ENSSLDG00000015864) dab2 (ENSSLDG00000015916) hnrnpd (ENSSLDG00000015962) si:ch73-234b20.5 (ENSSLDG00000015994) mat2al (ENSSLDG00000016008) ##22 ahr2 (ENSSLDG00000016033) ZSWIM6 (ENSSLDG00000016063) pik3r1 (ENSSLDG00000016135) ENSSLDG00000016213 ENSSLDG00000016285 erbin (ENSSLDG00000016321) nln (ENSSLDG00000016400) sgtb (ENSSLDG00000016416) trappc13 (ENSSLDG00000016461) ENSSLDG00000016520 tnfrsfa (ENSSLDG00000016532) Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000159721.h ENSGT00940000166328 ENSGT00390000014845 ENSGT00940000158562 ENSGT00940000158733 ENSGT00940000155967 ENSGT00940000156571 ENSGT00940000157329 ENSGT00940000153510.b ENSGT00940000155881 ENSGT00390000003175.a.b ENSGT01030000234578.A.a ENSGT00440000039914 ENSGT00940000158010 ENSGT00940000160325.a ENSGT00950000183185.c.b ##22 ENSGT00940000154486.b.a.a.b.e.a.a.b ENSGT00940000155496.a.b ENSGT00940000155570.t ENSGT00940000153849.a.a.b ENSGT00500000044984 ENSGT00940000178081 ENSGT00940000155149 ENSGT00940000155449 ENSGT00940000166544.a ENSGT00940000156102.r ENSGT00940000159267 ENSGT00940000157995 ENSGT00940000157492.a ENSGT00940000155411.d ENSGT00940000156031.f Zig-zag eel MODERN SPECIES 3 GCNT4 (ENSMAMG00000004514) ENSMAMG00000004519 mzt2b (ENSMAMG00000004537) ENSMAMG00000004557 ENSMAMG00000004609 ENSMAMG00000004661 ENSMAMG00000004760 plac8.1 (ENSMAMG00000004799) COPS4 (ENSMAMG00000004815) lin54 (ENSMAMG00000004854) sec31a (ENSMAMG00000004874) TMEM150C (ENSMAMG00000004946) ENOPH1 (ENSMAMG00000027525) hnrnpd (ENSMAMG00000004971) si:ch73-234b20.5 (ENSMAMG00000005144) mat2al (ENSMAMG00000005162) ##22 ENSMAMG00000005201 ENSMAMG00000005237 ENSMAMG00000005289 PITPNM2 (ENSMAMG00000005324) MPHOSPH9 (ENSMAMG00000005376) CDK2AP1 (ENSMAMG00000005443) SBNO1 (ENSMAMG00000005473) ENSMAMG00000027057 ENSMAMG00000024362 ENSMAMG00000028067 ENSMAMG00000025349 xrcc4 (ENSMAMG00000024660) vcanb (ENSMAMG00000005922) ENSMAMG00000005950 ENSMAMG00000027148 Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00390000014845 ENSGT00940000158562 ENSGT00940000158733 ENSGT00940000155967 ENSGT00940000156571 ENSGT00940000157329 ENSGT00940000153510.b ENSGT00940000155881 ENSGT00390000003175.a.b ENSGT01030000234578.A.a.f ENSGT01030000234578.A.a.e.b ENSGT00440000039914 ENSGT01030000234578.A.a.e.a.a ENSGT00940000158010 ENSGT00940000160325.a ENSGT00950000183185.c.b ##22 ENSGT00940000154486.b.a.a.b.e.a.a.b ENSGT00940000155496.a.b ENSGT00940000155570.t ENSGT00940000153849.a.a.b ENSGT00500000044984 ENSGT00940000178081 ENSGT00940000155149 ENSGT00940000155449 ENSGT00940000166544.a ENSGT00940000156102.r ENSGT00940000159267 ENSGT00940000157995 ENSGT00940000157492.a ENSGT00940000155411.d ENSGT00940000156031.f Climbing perch MODERN SPECIES 3 ENSATEG00000007557 ENSATEG00000007479 plac8.1 (ENSATEG00000026599) COPS4 (ENSATEG00000007411) lin54 (ENSATEG00000007360) TMEM150C (ENSATEG00000007347) TMEM150C (ENSATEG00000026625) SEC31A (ENSATEG00000007271) TMEM150C (ENSATEG00000007266) TMEM150C (ENSATEG00000026913) TMEM150C (ENSATEG00000007228) ENSATEG00000007131 ENSATEG00000007235 hnrnpd (ENSATEG00000007097) ENSATEG00000027999 mat2al (ENSATEG00000007046) ##22 ENSATEG00000007036 ENSATEG00000006972 ENSATEG00000006887 PITPNM2 (ENSATEG00000006764) MPHOSPH9 (ENSATEG00000006746) CDK2AP1 (ENSATEG00000006721) SBNO1 (ENSATEG00000006667) xrcc4 (ENSATEG00000026220) vcanb (ENSATEG00000006644) ENSATEG00000006578 ENSATEG00000006557 ENSATEG00000006512 ENSATEG00000006498 ENSATEG00000006369 ENSATEG00000006356 Siamese fighting fish MODERN SPECIES 3 ENSBSLG00000012883 stc1l (ENSBSLG00000012885) kctd9b (ENSBSLG00000012961) marchf5l (ENSBSLG00000012982) actr1b (ENSBSLG00000013000) npy8ar (ENSBSLG00000013019) ddx56 (ENSBSLG00000013161) aebp1a (ENSBSLG00000002257) pnx (ENSBSLG00000002310) ash2l (ENSBSLG00000002405) grk5 (ENSBSLG00000002568) scarb1 (ENSBSLG00000002660) ENSBSLG00000002755 ENSBSLG00000002770 ENSBSLG00000002800 ENSBSLG00000002804 ##22 ENSBSLG00000002824 ENSBSLG00000002831 ENSBSLG00000002856 hmgcs1 (ENSBSLG00000002871) YTHDC2 (ENSBSLG00000003867) ENSBSLG00000004178 TSHR (ENSBSLG00000004193) pomk (ENSBSLG00000004210) PAM (ENSBSLG00000004235) ENSBSLG00000004741 macir (ENSBSLG00000004788) skp2 (ENSBSLG00000004815) nadk2 (ENSBSLG00000004864) slc1a3b (ENSBSLG00000004994) SPR (ENSBSLG00000005403) Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 3 trim23 (ENSMMDG00005003417) ppwd1 (ENSMMDG00005003414) cwc27 (ENSMMDG00005003407) ADAMTS6 (ENSMMDG00005003397) plac8.1 (ENSMMDG00005003391) ENSMMDG00005003389 cops4 (ENSMMDG00005003373) lin54 (ENSMMDG00005003009) ENSMMDG00005002976 sec31a (ENSMMDG00005002969) SCD5 (ENSMMDG00005002022) TMEM150C (ENSMMDG00005001980) enoph1 (ENSMMDG00005001964) hnrnpd (ENSMMDG00005001961) si:ch73-234b20.5 (ENSMMDG00005001958) mat2al (ENSMMDG00005001793) ##22 ENSMMDG00005001326 ZSWIM6 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ENSGT00940000153594.c.e.b ENSGT00940000167301 Northern pike MODERN SPECIES 13 mzt2b (ENSELUG00000003568) trim23 (ENSELUG00000003542) ppwd1 (ENSELUG00000003516) srek1ip1 (ENSELUG00000003495) cwc27 (ENSELUG00000003475) ADAMTS6 (ENSELUG00000003445) plac8.1 (ENSELUG00000003418) ENSELUG00000003402 cops4 (ENSELUG00000003391) lin54 (ENSELUG00000003370) sec31a (ENSELUG00000003329) TMEM150C (ENSELUG00000003276) hnrnpdl (ENSELUG00000003241) enoph1 (ENSELUG00000003255) vamp8 (ENSELUG00000003187) mat2al (ENSELUG00000003216) ##22 ENSELUG00000029949 ZSWIM6 (ENSELUG00000003169) KIF2A (ENSELUG00000003141) ENSELUG00000003108 PITPNM2 (ENSELUG00000003067) ENSELUG00000033325 ENSELUG00000002967 CDK2AP1 (ENSELUG00000002934) sbno1 (ENSELUG00000002886) kmt5aa (ENSELUG00000002825) snrnp35 (ENSELUG00000000071) ENSELUG00000029706 RILPL1 (ENSELUG00000002813) HIP1R (ENSELUG00000002768) ENSELUG00000002709 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 179 ENSGT00940000158562.i ENSGT00940000169093 ENSGT00510000047710 ENSGT00940000155967.e ENSGT00940000156571.ab.b ENSGT00940000157329.i ENSGT00940000153510.b.m ENSGT00940000155881.i ENSGT00390000003175.a.b.j ENSGT00940000162090.c ENSGT01030000234578.A.a.j ENSGT00440000039914.`b ENSGT00940000154426.g ENSGT00940000158010 ENSGT00940000160325.a ENSGT00950000183185.c.b ##22 ENSGT00940000154486.b.a.a.b.e.a.a.b.a ENSGT00940000155496.a.a.f.a.b ENSGT00940000155570.t.e.b ENSGT00940000153849.a.a.b.d ENSGT00500000044984.q ENSGT00940000155149.jc.a.b ENSGT00940000178081 ENSGT00940000155149.jc.b.a ENSGT00940000155449.v ENSGT00940000163293.c.b.d ENSGT00940000157648 ENSGT00940000157897.a.h ENSGT00390000014349.a ENSGT00990000203619.A.b.b.b.b.a.b.j ENSGT00940000155122.b.bc.b Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000158562.i ENSGT00940000169093 ENSGT00510000047710 ENSGT00940000155967.e ENSGT00940000156571.ab.b ENSGT00940000157329.i ENSGT00940000153510.b.m ENSGT00940000155881.i ENSGT00390000003175.a.b.j ENSGT00940000162090.c ENSGT01030000234578.A.a.j 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ENSGT00940000153849.a.a.b.d ENSGT00500000044984.q ENSGT00940000155149.jc.b.a ENSGT00940000155449.v ENSGT00940000163293.c.b.d ENSGT00940000157648 ENSGT00940000157897.a.h ENSGT00390000014349.a ENSGT00990000203619.A.b.b.b.b.a.b.j ENSGT00940000155122.b.bc.b ENSGT00390000002172.B.a.b ENSGT00550000074853.d River trout MODERN SPECIES 6 ppwd1 (ENSSTUG00000027969) srek1ip1 (ENSSTUG00000027934) ADAMTS6 (ENSSTUG00000027558) PLAC8 (ENSSTUG00000027544) ENSSTUG00000027532 cops4 (ENSSTUG00000027438) lin54 (ENSSTUG00000027395) sec31a (ENSSTUG00000026000) SCD5 (ENSSTUG00000024905) TMEM150C (ENSSTUG00000024873) hnrnpdl (ENSSTUG00000024856) enoph1 (ENSSTUG00000024842) hnrnpd (ENSSTUG00000024774) si:ch73-234b20.5 (ENSSTUG00000024765) ENSSTUG00000024755 mat2al (ENSSTUG00000024727) ##22 ENSSTUG00000024714 ZSWIM6 (ENSSTUG00000024436) ENSSTUG00000023954 PITPNM2 (ENSSTUG00000021826) MPHOSPH9 (ENSSTUG00000021718) CDK2AP1 (ENSSTUG00000021697) sbno1 (ENSSTUG00000016677) kmt5aa (ENSSTUG00000016545) snrnp35 (ENSSTUG00000016535) RILPL1 (ENSSTUG00000016483) denr (ENSSTUG00000016464) ENSSTUG00000016461 ENSSTUG00000016454 ENSSTUG00000016440 EIF2B1 (ENSSTUG00000016163) Atlantic salmon MODERN SPECIES 4 ENSSSAG00000073899 ENSSSAG00000091630 ENSSSAG00000073544 ENSSSAG00000073515 ENSSSAG00000073507 ENSSSAG00000073447 PLAC8 (ENSSSAG00000073431) cops4 (ENSSSAG00000073417) lin54 (ENSSSAG00000073397) SEC31A (ENSSSAG00000056097) SCD5 (ENSSSAG00000087236) HNRDL (ENSSSAG00000055698) enoph1 (ENSSSAG00000120380) hnrnpd (ENSSSAG00000055684) si:ch73-234b20.5 (ENSSSAG00000118448) mat2al (ENSSSAG00000055621) ##22 ENSSSAG00000055531 ENSSSAG00000099788 ENSSSAG00000078890 PITPNM2 (ENSSSAG00000053461) MPHOSPH9 (ENSSSAG00000041658) cdka1 (ENSSSAG00000041550) sbno1 (ENSSSAG00000041895) kmt5aa (ENSSSAG00000006163) snrnp35 (ENSSSAG00000006055) rilpl1 (ENSSSAG00000041761) denr (ENSSSAG00000005986) ENSSSAG00000005975 ENSSSAG00000114897 EIF2B1 (ENSSSAG00000005551) ddx55 (ENSSSAG00000005403) Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT01100000263865.a ENSGT00940000155770.b.b ENSGT00510000047710 ENSGT00940000155967.e ENSGT00940000156571.ab.b ENSGT00940000157329.i ENSGT00940000153510.b.m ENSGT00940000155881.i ENSGT00390000003175.a.b.j ENSGT00940000162090.c ENSGT01030000234578.A.a.j ENSGT00440000039914.`b ENSGT00940000154426.g ENSGT00940000158010 ENSGT00940000160325.a ENSGT00950000183185.c.b ##22 ENSGT00940000154486.b.a.a.b.e.a.a.b.a ENSGT00940000155496.a.a.f.a.b ENSGT00940000155570.t.e.b ENSGT00940000153849.a.a.b.d ENSGT00500000044984.q ENSGT00940000155149.jc.a.b ENSGT00940000178081 ENSGT00940000155149.jc.b.a ENSGT00940000155449.v ENSGT00940000163293.c.b.d ENSGT00940000157648 ENSGT00940000157897.a.h ENSGT00390000014349.a ENSGT00990000203619.A.b.b.b.b.a.b.j ENSGT00940000155122.b.bc.b Rainbow trout MODERN SPECIES 3 ENSOMYG00000003339 ENSOMYG00000003481 ENSOMYG00000003582 ENSOMYG00000057000 ENSOMYG00000004017 ENSOMYG00000004127 ENSOMYG00000004148 ENSOMYG00000076729 ENSOMYG00000004369 ENSOMYG00000063982 TMEM150C (ENSOMYG00000004540) enoph1 (ENSOMYG00000004563) hnrnpdl (ENSOMYG00000004595) hnrnpd (ENSOMYG00000004637) si:ch73-234b20.5 (ENSOMYG00000004681) mat2al (ENSOMYG00000004742) ##22 ENSOMYG00000004817 ENSOMYG00000005453 ENSOMYG00000006607 PITPNM2 (ENSOMYG00000007835) ENSOMYG00000008135 CDK2AP1 (ENSOMYG00000008164) sbno1 (ENSOMYG00000010222) kmt5aa (ENSOMYG00000017571) snrnp35 (ENSOMYG00000017584) RILPL1 (ENSOMYG00000017616) denr (ENSOMYG00000017655) ENSOMYG00000017681 ENSOMYG00000001221 ENSOMYG00000017684 ENSOMYG00000017701 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00510000048902.a.f.d ENSGT00940000166328.c ENSGT00940000158562.i ENSGT00510000047710 ENSGT00940000155967.e ENSGT00940000156571.ab.b ENSGT00940000157329.i ENSGT00940000153510.b.m ENSGT00940000155881.i ENSGT00390000003175.a.b.j ENSGT00940000162090.c ENSGT01030000234578.A.a.j ENSGT00440000039914.`b ENSGT00940000158010 ENSGT00940000160325.a ENSGT00950000183185.c.b ##22 ENSGT00940000154486.b.a.a.b.e.a.a.b.a ENSGT00940000155496.a.a.f.a.b ENSGT00940000155570.t.e.b ENSGT00940000153849.a.a.b.d ENSGT00500000044984.q ENSGT00940000178081 ENSGT00940000155149.jc.b.a ENSGT00940000155449.v ENSGT00940000163293.c.b.d ENSGT00940000157648 ENSGT00940000157897.a.h ENSGT00390000014349.a ENSGT00990000203619.A.b.b.b.b.a.b.j ENSGT00940000155122.b.bc.b ENSGT00390000002172.B.a.b Chinook salmon MODERN SPECIES 33 mzt2b (ENSOTSG00005042179) trim23 (ENSOTSG00005042181) ppwd1 (ENSOTSG00005030464) srek1ip1 (ENSOTSG00005042182) ADAMTS6 (ENSOTSG00005030466) ENSOTSG00005030467 ENSOTSG00005030468 cops4 (ENSOTSG00005030475) lin54 (ENSOTSG00005030493) SCD5 (ENSOTSG00005030498) TMEM150C (ENSOTSG00005030501) enoph1 (ENSOTSG00005030509) hnrnpdl (ENSOTSG00005030513) hnrnpd (ENSOTSG00005030515) si:ch73-234b20.5 (ENSOTSG00005030520) mat2al (ENSOTSG00005030521) ##22 ENSOTSG00005030523 ZSWIM6 (ENSOTSG00005030524) KIF2A (ENSOTSG00005030532) PITPNM2 (ENSOTSG00005036061) ENSOTSG00005036110 CDK2AP1 (ENSOTSG00005036111) sbno1 (ENSOTSG00005036204) kmt5aa (ENSOTSG00005042592) snrnp35 (ENSOTSG00005042593) RILPL1 (ENSOTSG00005042596) denr (ENSOTSG00005042597) ENSOTSG00005042600 ENSOTSG00005042602 ENSOTSG00005042606 EIF2B1 (ENSOTSG00005042607) Coho salmon MODERN SPECIES 26 ppwd1 (ENSOKIG00005009851) ENSOKIG00005009883 ENSOKIG00005009891 ADAMTS6 (ENSOKIG00005009945) ENSOKIG00005010311 ENSOKIG00005010319 ENSOKIG00005010330 lin54 (ENSOKIG00005010393) ENSOKIG00005010499 SCD5 (ENSOKIG00005010503) TMEM150C (ENSOKIG00005010512) enoph1 (ENSOKIG00005010523) hnrnpdl (ENSOKIG00005010540) hnrnpd (ENSOKIG00005010566) si:ch73-234b20.5 (ENSOKIG00005010578) mat2al (ENSOKIG00005010586) ##22 ENSOKIG00005010595 ENSOKIG00005010600 ZSWIM6 (ENSOKIG00005010627) ENSOKIG00005010703 ENSOKIG00005010736 ENSOKIG00005011054 PITPNM2 (ENSOKIG00005011135) MPHOSPH9 (ENSOKIG00005000125) ENSOKIG00005000148 CDK2AP1 (ENSOKIG00005000166) sbno1 (ENSOKIG00005000709) kmt5aa (ENSOKIG00005001559) snrnp35 (ENSOKIG00005001566) RILPL1 (ENSOKIG00005001582) denr (ENSOKIG00005001616) Huchen DUPLICATION Huchen MODERN SPECIES 1851 ADAMTS6 (ENSHHUG00000005065) ENSHHUG00000005052 cops4 (ENSHHUG00000005019) lin54 (ENSHHUG00000004946) ENSHHUG00000004943 ENSHHUG00000004935 SCD5 (ENSHHUG00000004719) hnrnpdl (ENSHHUG00000004566) enoph1 (ENSHHUG00000004532) hnrnpd (ENSHHUG00000004501) si:ch73-234b20.5 (ENSHHUG00000004494) mat2al (ENSHHUG00000004273) ##22 ENSHHUG00000004199 Huchen MODERN SPECIES 2132 PPTC7 (ENSHHUG00000001888) TBC1D10A (ENSHHUG00000001853) ENSHHUG00000001784 ENSHHUG00000001731 ENSHHUG00000001543 slc35e4 (ENSHHUG00000001535) ENSHHUG00000001525 INPP5J (ENSHHUG00000001502) ENSHHUG00000001493 ##22 Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 84 ENSGT00390000003175.a.b ENSGT00940000162090 ENSGT01030000234578.A.a ENSGT00440000039914 ENSGT00940000154426 ENSGT00940000158010 ENSGT00940000160325.a ENSGT00950000183185.c.b ##22 ENSGT00390000018326 ENSGT00550000074618.a.b ENSGT00390000006260 ENSGT00950000183162.b ENSGT00940000159168 ENSGT00940000157326 ENSGT00940000160287 ENSGT00940000156591 ENSGT00940000157357.f ENSGT00390000005646 ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155603.A.b.d ENSGT00940000155603.A.a.a.a ENSGT00950000182908.A ENSGT00940000159154 Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000158010 ENSGT00940000160325.a ENSGT00950000183185.c.b ##22 ENSGT00390000018326 ENSGT00550000074618.a.b ENSGT00390000006260 ENSGT00950000183162.b ENSGT00940000159168 ENSGT00940000157326 ENSGT00940000160287 ENSGT00940000156591 ENSGT00940000157357.f ENSGT00390000005646 ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155603.A.b.d ENSGT00940000155603.A.a.a.a ENSGT00950000182908.A ENSGT00940000159154 Denticle herring MODERN SPECIES 13 snx18b (ENSDCDG00000030137) ENSDCDG00000030132 rasgef1bb (ENSDCDG00000030082) antxr2b (ENSDCDG00000030072) paqr3b (ENSDCDG00000030066) anxa3b (ENSDCDG00000029887) ENSDCDG00000029864 mrrf (ENSDCDG00000029862) rbm18 (ENSDCDG00000029860) lhx6a (ENSDCDG00000029857) morn5 (ENSDCDG00000029855) ndufa8 (ENSDCDG00000029853) si:ch211-243g18.2 (ENSDCDG00000029848) hnrnpd (ENSDCDG00000029845) si:ch73-234b20.5 (ENSDCDG00000029843) mat2al (ENSDCDG00000029764) ##22 ubxn8 (ENSDCDG00000029755) ppp2cb (ENSDCDG00000029752) ENSDCDG00000029749 PURG (ENSDCDG00000029747) WRN (ENSDCDG00000029742) nrg1 (ENSDCDG00000029736) fut10 (ENSDCDG00000029733) ENSDCDG00000028200 ENSDCDG00000028172 slc38a9 (ENSDCDG00000028127) ddx4 (ENSDCDG00000028102) ENSDCDG00000028086 il6st (ENSDCDG00000028074) ANKRD55 (ENSDCDG00000028065) MAP3K1 (ENSDCDG00000028034) Otophysi ANCESTRAL SPECIES 378 ENSGT00390000003175.a.b ENSGT00940000162090 ENSGT01030000234578.A.a ENSGT00440000039914 ENSGT00940000154426 ENSGT00940000158010 ENSGT00940000160325.a ENSGT00950000183185.c.b ##22 Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 40 ENSGT00940000158226 ENSGT01050000244941.A ENSGT00940000163892.C.a.b ENSGT00940000158571 ENSGT00940000158875 ENSGT00940000161837.c.a ENSGT00950000183096.a.b ENSGT00940000158994 ENSGT00390000003175.a.b ENSGT00940000162090 ENSGT01030000234578.A.a ENSGT00440000039914 ENSGT00940000154426 ENSGT00940000158010 ENSGT00940000160325.a ENSGT00950000183185.c.b ##22 Channel catfish MODERN SPECIES 7 Lpar1 (ENSIPUG00000024901) epha5 (ENSIPUG00000024902) GRIN3A (ENSIPUG00000024907) lppr1 (ENSIPUG00000024909) ENSIPUG00000024914 ENSIPUG00000024917 SLC46A2 (ENSIPUG00000024922) snx30 (ENSIPUG00000024925) sec31a (ENSIPUG00000024931) scd5 (ENSIPUG00000024944) Tmem150c (ENSIPUG00000024946) enoph1 (ENSIPUG00000024949) hnrnpdl (ENSIPUG00000024951) hnrnpd (ENSIPUG00000024954) VAMP8 (ENSIPUG00000024956) mat2al (ENSIPUG00000024958) ##22 lyrm7 (ENSIPUG00000024959) cdc42se2 (ENSIPUG00000024960) sptlc1 (ENSIPUG00000024961) ror2 (ENSIPUG00000024965) ENSIPUG00000024967 nfil3 (ENSIPUG00000024968) auh (ENSIPUG00000024969) syk (ENSIPUG00000024970) Diras2 (ENSIPUG00000024977) ENSIPUG00000024978 lysc (ENSIPUG00000024982) macir (ENSIPUG00000024986) ppip5k2 (ENSIPUG00000001177) pam (ENSIPUG00000001295) St8sia4 (ENSIPUG00000001344) Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00940000158226 ENSGT01050000244941.A ENSGT00940000163892.C.a.b ENSGT00940000158571 ENSGT00940000158875 ENSGT00940000161837.c.a ENSGT00950000183096.a.b ENSGT00940000158994 ENSGT00390000003175.a.b ENSGT00940000162090 ENSGT01030000234578.A.a ENSGT00440000039914 ENSGT00940000154426 ENSGT00940000158010 ENSGT00940000160325.a ENSGT00950000183185.c.b ##22 Characoidei ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00940000158226 ENSGT01050000244941.A ENSGT00940000163892.C.a.b ENSGT00940000158571 ENSGT00940000158875 ENSGT00940000161837.c.a ENSGT00950000183096.a.b ENSGT00940000158994 ENSGT00390000003175.a.b ENSGT00940000162090 ENSGT01030000234578.A.a ENSGT00440000039914 ENSGT00940000154426 ENSGT00940000158010 ENSGT00940000160325.a ENSGT00950000183185.c.b ##22 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 368 ENSPNAG00000016737 ENSPNAG00000016722 GRIN3A (ENSPNAG00000016687) PLPPR1 (ENSPNAG00000005876) ENSPNAG00000016606 SLC46A2 (ENSPNAG00000016555) SLC46A2 (ENSPNAG00000007114) snx30 (ENSPNAG00000016540) sec31a (ENSPNAG00000016528) SCD5 (ENSPNAG00000016482) TMEM150C (ENSPNAG00000016455) enoph1 (ENSPNAG00000016397) hnrnpdl (ENSPNAG00000016380) hnrnpd (ENSPNAG00000016368) si:ch73-234b20.5 (ENSPNAG00000016334) mat2al (ENSPNAG00000016323) ##22 ENSPNAG00000016253 Mexicana tetra MODERN SPECIES 12 lpar1 (ENSAMXG00000040288) ENSAMXG00000021204 GRIN3A (ENSAMXG00000021254) PLPPR1 (ENSAMXG00000021269) ENSAMXG00000033093 ENSAMXG00000043048 SLC46A2 (ENSAMXG00000021281) snx30 (ENSAMXG00000032117) sec31a (ENSAMXG00000001550) SCD5 (ENSAMXG00000036335) TMEM150C (ENSAMXG00000001521) enoph1 (ENSAMXG00000035397) hnrnpdl (ENSAMXG00000001495) hnrnpd (ENSAMXG00000001477) si:ch73-234b20.5 (ENSAMXG00000001464) mat2al (ENSAMXG00000001449) ##22 ENSAMXG00000038469 tpm2 (ENSAMXG00000010165) tln1 (ENSAMXG00000010531) hmgcs1 (ENSAMXG00000039120) MAP3K1 (ENSAMXG00000010510) ENSAMXG00000030022 ANKRD55 (ENSAMXG00000010411) il6st (ENSAMXG00000040431) ENSAMXG00000010329 ddx4 (ENSAMXG00000010288) slc38a9 (ENSAMXG00000010243) SH2D4A (ENSAMXG00000034670) ENSAMXG00000042855 ENSAMXG00000031392 ENSAMXG00000010171 Electric eel MODERN SPECIES 152 lpar1 (ENSEEEG00000002572) ENSEEEG00000002576 GRIN3A (ENSEEEG00000002578) PLPPR1 (ENSEEEG00000002579) ENSEEEG00000002583 palm2akap2 (ENSEEEG00000002585) SLC46A2 (ENSEEEG00000002586) snx30 (ENSEEEG00000002590) sec31a (ENSEEEG00000002729) SCD5 (ENSEEEG00000002848) TMEM150C (ENSEEEG00000003036) enoph1 (ENSEEEG00000003039) hnrnpdl (ENSEEEG00000003047) hnrnpd (ENSEEEG00000003071) si:ch73-234b20.5 (ENSEEEG00000003077) mat2al (ENSEEEG00000003078) ##22 zcchc9 (ENSEEEG00000003082) wdr45 (ENSEEEG00000003110) ENSEEEG00000003575 stc1l (ENSEEEG00000003578) Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 84 ENSGT00940000159053 ENSGT00940000157484 ENSGT00940000160540 ENSGT00940000175401 ENSGT00940000153947.A ENSGT00550000074872 ENSGT00940000158245.ec.b ENSGT00990000203922.f.b ENSGT00390000003175.a.b ENSGT00940000164013.b ENSGT01030000234578.A.a ENSGT00440000039914 ENSGT00940000154426 ENSGT00940000158010.g.a ENSGT00940000160325.a ENSGT00950000183185.c.b ##22 ENSGT00390000017923 ENSGT00940000158994 ENSGT00950000183096.a.b ENSGT00940000161837.c.a.d ENSGT00940000161837.c.a.c.a ENSGT00940000158875 ENSGT00940000158571 ENSGT00940000163892.C.a.b ENSGT01050000244941.A ENSGT00940000158226 ENSGT00940000159886 ENSGT00390000009872 ENSGT00390000003050 ENSGT00940000165521.a ENSGT00940000158864.k.a Zebrafish MODERN SPECIES 1 auh (ENSDARG00000042975) nfil3 (ENSDARG00000042977) ENSDARG00000097088 ROR2 (ENSDARG00000076227) sptlc1 (ENSDARG00000042995) cdc42se2 (ENSDARG00000094577) ENSDARG00000093630 zgc:113274 (ENSDARG00000059235) sec31a (ENSDARG00000021082) ENSDARG00000091531 TMEM150C (ENSDARG00000069590) enoph1 (ENSDARG00000026198) hnrnpdl (ENSDARG00000003429) hnrnpd (ENSDARG00000059246) si:ch73-234b20.5 (ENSDARG00000086996) mat2al (ENSDARG00000063665) ##22 lyrm7 (ENSDARG00000079815) snx30 (ENSDARG00000069601) SLC46A2 (ENSDARG00000075229) palm2akap2 (ENSDARG00000069608) ENSDARG00000099005 PLK2 (ENSDARG00000090752) ENSDARG00000010729 ENSDARG00000075802 PLPPR1 (ENSDARG00000100642) MN1 (ENSDARG00000076529) pitpnb (ENSDARG00000036005) TTC28 (ENSDARG00000114920) pla2g3 (ENSDARG00000008948) ENSDARG00000063436 ptpn11a (ENSDARG00000020334) Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 186 ENSGT00940000160540 ENSGT00940000175401 ENSGT00940000153947.A ENSGT00550000074872 ENSGT00940000158245.ec.a ENSGT00990000203922.f.b ENSGT00390000003175.a.b.b ENSGT00940000164013.b ENSGT01030000234578.A.a.c ENSGT00440000039914.y.a ENSGT00940000154426 ENSGT00940000158010.h ENSGT00440000039914.z ENSGT00940000158010.g.a ENSGT00940000160325.a ENSGT00950000183185.c.b ##22 ENSGT00390000017923.a ENSGT00940000158994.e ENSGT00950000183096.a.b.q.a ENSGT00940000161837.c.a.c.a ENSGT00940000158875.h ENSGT00940000158571.g.b ENSGT00940000163892.C.a.b.d ENSGT01050000244941.A.k ENSGT00940000158226.j.b ENSGT00940000159886.c ENSGT00390000009872.b ENSGT00940000165521.a.b ENSGT00940000158864.k.a.a.b Goldfish MODERN SPECIES 28 DIRAS2 (ENSCARG00000070449) syk (ENSCARG00000070451) nfil3 (ENSCARG00000070452) ENSCARG00000070453 ROR2 (ENSCARG00000070454) sptlc1 (ENSCARG00000070455) cdc42se2 (ENSCARG00000070469) sec31a (ENSCARG00000070475) ENSCARG00000070476 ENSCARG00000070477 TMEM150C (ENSCARG00000070478) enoph1 (ENSCARG00000070479) hnrnpdl (ENSCARG00000015682) hnrnpd (ENSCARG00000015685) si:ch73-234b20.5 (ENSCARG00000015693) mat2al (ENSCARG00000015700) ##22 lyrm7 (ENSCARG00000015721) snx30 (ENSCARG00000015726) ENSCARG00000015734 SLC46A2 (ENSCARG00000015736) ENSCARG00000015743 ENSCARG00000015761 ENSCARG00000015767 PLPPR1 (ENSCARG00000015772) GRIN3A (ENSCARG00000015782) ENSCARG00000015844 ENSCARG00000017638 ENSCARG00000017645 lpar1 (ENSCARG00000017648) MUSK (ENSCARG00000017704) rassf6 (ENSCARG00000018156) Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 500 ENSGT00390000003175.a.b.a ENSGT00940000160325.a.d ENSGT00950000183185.c.b ##22 ENSGT00390000017923.a ENSGT00940000158994.e ENSGT00950000183096.a.b.q.a ENSGT00940000161837.c.a.d ENSGT00940000161837.c.a.c.a.a ENSGT00940000158875.h ENSGT00940000158571.g.b ENSGT00940000163892.C.a.b.d ENSGT01050000244941.A.k ENSGT00940000158226.j.b ENSGT00940000159886.c ENSGT00390000009872.b Common carp reference MODERN SPECIES 32 syk (ENSCCRG00000053057) auh (ENSCCRG00000058814) nfil3 (ENSCCRG00000069614) ENSCCRG00000000251 ROR2 (ENSCCRG00000058752) sptlc1 (ENSCCRG00000073416) sec31a (ENSCCRG00000009144) ENSCCRG00000055716 ENSCCRG00000073332 ENSCCRG00000017621 TMEM150C (ENSCCRG00000017620) hnrnpdl (ENSCCRG00000063006) enoph1 (ENSCCRG00000068587) hnrnpd (ENSCCRG00000017619) si:ch73-234b20.5 (ENSCCRG00000056330) mat2al (ENSCCRG00000054689) ##22 lyrm7 (ENSCCRG00000039588) ENSCCRG00000071509 ENSCCRG00000062587 ENSCCRG00000072233 ENSCCRG00000061276 snx30 (ENSCCRG00000039590) ENSCCRG00000067885 palm2akap2 (ENSCCRG00000039612) ENSCCRG00000009705 ENSCCRG00000017751 ENSCCRG00000026732 ENSCCRG00000009925 ENSCCRG00000068638 ENSCCRG00000059997 ENSCCRG00000014009 Golden-line barbel DUPLICATION Golden-line barbel MODERN SPECIES 2001 ENSSGRG00000018919 ENSSGRG00000018920 enoph1 (ENSSGRG00000018921) hnrnpdl (ENSSGRG00000018929) hnrnpd (ENSSGRG00000018931) si:ch73-234b20.5 (ENSSGRG00000018954) mat2al (ENSSGRG00000018955) ##22 ENSSGRG00000018992 ##22 lyrm7 (ENSSGRG00000018997) Golden-line barbel MODERN SPECIES 2001 ENSSGRG00000018919 ENSSGRG00000018920 enoph1 (ENSSGRG00000018921) hnrnpdl (ENSSGRG00000018929) hnrnpd (ENSSGRG00000018931) si:ch73-234b20.5 (ENSSGRG00000018954) mat2al (ENSSGRG00000018955) ##22 ENSSGRG00000018992 ##22 lyrm7 (ENSSGRG00000018997) Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 39 ENSGT00940000158562 ENSGT00940000158733 ENSGT00510000047710 ENSGT00940000155967 ENSGT00940000156571 ENSGT00940000157329 ENSGT00940000153510.b ENSGT00940000155881 ENSGT00390000003175.a.b ENSGT00940000162090 ENSGT01030000234578.A.a ENSGT00440000039914 ENSGT00940000154426 ENSGT00940000158010 ENSGT00940000160325.a ENSGT00950000183185.c.b ##22 ENSGT00390000018326 ENSGT00550000074618.a.b.a ENSGT00390000006260 ENSGT00950000183162.b ENSGT00940000159168 ENSGT00940000157326 ENSGT00940000160287 ENSGT00940000156591 ENSGT00940000157357.f ENSGT00390000005646 ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155603.A.b.d ENSGT00940000159608 ENSGT00950000182908.A ENSGT00940000159154 Asian bonytongue MODERN SPECIES 21 trim23 (ENSSFOG00015005305) ppwd1 (ENSSFOG00015005347) srek1ip1 (ENSSFOG00015025571) cwc27 (ENSSFOG00015005406) ADAMTS6 (ENSSFOG00015005415) plac8.1 (ENSSFOG00015005492) cops4 (ENSSFOG00015005542) lin54 (ENSSFOG00015005629) sec31a (ENSSFOG00015005688) SCD5 (ENSSFOG00015030208) TMEM150C (ENSSFOG00015005842) enoph1 (ENSSFOG00015005874) hnrnpdl (ENSSFOG00015005893) hnrnpd (ENSSFOG00015005913) si:ch73-234b20.5 (ENSSFOG00015005945) mat2al (ENSSFOG00015005969) ##22 ubxn8 (ENSSFOG00015005997) ppp2cb (ENSSFOG00015032663) ENSSFOG00015006034 PURG (ENSSFOG00015033307) WRN (ENSSFOG00015006123) nrg1 (ENSSFOG00015006282) fut10 (ENSSFOG00015006346) ENSSFOG00015006370 ENSSFOG00015006403 slc38a9 (ENSSFOG00015006467) ddx4 (ENSSFOG00015006531) ENSSFOG00015006549 IL6ST (ENSSFOG00015006588) ANKRD55 (ENSSFOG00015006619) MAP3K1 (ENSSFOG00015006667) P. kingsleyae MODERN SPECIES 115 trim23 (ENSPKIG00000025543) ppwd1 (ENSPKIG00000025542) srek1ip1 (ENSPKIG00000025540) cwc27 (ENSPKIG00000025538) ADAMTS6 (ENSPKIG00000025536) plac8.1 (ENSPKIG00000025534) cops4 (ENSPKIG00000025533) lin54 (ENSPKIG00000025530) sec31a (ENSPKIG00000025523) SCD5 (ENSPKIG00000025520) TMEM150C (ENSPKIG00000025519) enoph1 (ENSPKIG00000025516) hnrnpdl (ENSPKIG00000025514) hnrnpd (ENSPKIG00000025512) si:ch73-234b20.5 (ENSPKIG00000025511) mat2al (ENSPKIG00000025509) ##22 ubxn8 (ENSPKIG00000025508) ppp2cb (ENSPKIG00000025506) ENSPKIG00000025503 PURG (ENSPKIG00000025501) WRN (ENSPKIG00000025497) nrg1 (ENSPKIG00000025481) fut10 (ENSPKIG00000025470) ENSPKIG00000025464 ENSPKIG00000025458 ENSPKIG00000025456 slc38a9 (ENSPKIG00000025454) Spotted gar MODERN SPECIES 658 ppwd1 (ENSLOCG00000010598) ADAMTS6 (ENSLOCG00000010611) cwc27 (ENSLOCG00000010631) srek1ip1 (ENSLOCG00000010643) SHISAL2B (ENSLOCG00000010652) plac8.1 (ENSLOCG00000010660) cops4 (ENSLOCG00000010665) lin54 (ENSLOCG00000010680) sec31a (ENSLOCG00000010692) SCD5 (ENSLOCG00000010712) TMEM150C (ENSLOCG00000010721) enoph1 (ENSLOCG00000010725) hnrnpdl (ENSLOCG00000010736) hnrnpd (ENSLOCG00000010743) si:ch73-234b20.5 (ENSLOCG00000010753) mat2al (ENSLOCG00000010761) ##22 ubxn8 (ENSLOCG00000010771) ppp2cb (ENSLOCG00000010776) ENSLOCG00000010784 PURG (ENSLOCG00000017542) WRN (ENSLOCG00000010792) ENSLOCG00000010808 nrg1 (ENSLOCG00000010824) fut10 (ENSLOCG00000010836) ENSLOCG00000010844 SH2D4A (ENSLOCG00000010857) slc38a9 (ENSLOCG00000010879) ddx4 (ENSLOCG00000010887) ENSLOCG00000010902 ENSLOCG00000010916 IL6ST (ENSLOCG00000010925) Reedfish MODERN SPECIES 15 plac8.1 (ENSECRG00000006613) coq2 (ENSECRG00000006619) ccng2 (ENSECRG00000006638) ccni (ENSECRG00000006646) SEPTIN11 (ENSECRG00000006667) ENSECRG00000006698 SHROOM3 (ENSECRG00000006719) ENSECRG00000006735 unc45b (ENSECRG00000007444) pgm5 (ENSECRG00000007463) TMEM150C (ENSECRG00000007477) enoph1 (ENSECRG00000007490) hnrnpdl (ENSECRG00000007520) hnrnpd (ENSECRG00000007542) si:ch73-234b20.5 (ENSECRG00000007552) mat2al (ENSECRG00000007559) ##22 ubxn8 (ENSECRG00000007565) ppp2cb (ENSECRG00000007578) PURG (ENSECRG00000007588) WRN (ENSECRG00000007612) nrg1 (ENSECRG00000007677) fut10 (ENSECRG00000007688) PSD3 (ENSECRG00000007698) ENSECRG00000007708 ENSECRG00000007717 slc38a9 (ENSECRG00000007731) ddx4 (ENSECRG00000007753) ENSECRG00000007804 atp5mc3a (ENSECRG00000007829) ENSECRG00000007843 IL6ST (ENSECRG00000007862) Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183185.c.b ##22 Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183185.c.b ##22 Amniota ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183185.c.b ##22 Sauria ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000162268 ENSGT00940000157347 ENSGT00390000017246 ENSGT00940000175611 ENSGT00950000182938.b.b.b.a ENSGT00940000158395 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ENSGT00940000154617.A ENSGT00940000158062 ENSGT00940000156892 ENSGT00990000211137 ENSGT00940000159383 ENSGT00940000165922 ENSGT00390000017123.b ENSGT00940000158075 ENSGT00510000047171 ENSGT00550000074935 ENSGT00940000160287 Archosauria ANCESTRAL SPECIES 35 ENSGT00390000015494 ENSGT01100000263544.c.a.a.b ENSGT00510000047107.B ENSGT00940000156471.a ENSGT00390000005102 ENSGT00940000163023 ENSGT00390000015667 ENSGT00950000183185.c.b ##22 ENSGT00940000159527 ENSGT00910000144269 ENSGT00940000162805 ENSGT00940000154761 ENSGT00940000154617.A ENSGT00940000158062 ENSGT00940000156892 ENSGT00990000211137 ENSGT00940000159383 ENSGT00940000165922 ENSGT00390000017123.b ENSGT00940000158075 ENSGT00510000047171 ENSGT00550000074935 ENSGT00940000160287 Aves ANCESTRAL SPECIES 43 ENSGT00550000074935 ENSGT00510000047171.u ENSGT00940000158075 ENSGT00390000017123.b ENSGT00940000165922 ENSGT00940000159383 ENSGT00990000211137 ENSGT00940000156892 ENSGT00940000158062 ENSGT00390000015494 ENSGT01100000263544.c.a.a.b ENSGT00510000047107.B ENSGT00940000156471.a ENSGT00390000005102 ENSGT00390000015667 ENSGT00950000183185.c.b ##22 ENSGT00940000159527 ENSGT00910000144269 ENSGT00940000162805 ENSGT00940000154617.A Neognathae ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00550000074935 ENSGT00510000047171.u ENSGT00940000158075 ENSGT00390000017123.b ENSGT00940000165922 ENSGT00940000159383 ENSGT00990000211137 ENSGT00940000156892 ENSGT00940000158062 ENSGT00390000015494 ENSGT01100000263544.c.a.a.b ENSGT00510000047107.B ENSGT00940000156471.a ENSGT00390000005102 ENSGT00390000015667 ENSGT00950000183185.c.b ##22 ENSGT00940000159527 ENSGT00910000144269 ENSGT00940000162805 ENSGT00940000154617.A ENSGT01030000234625.C ENSGT00940000158395 ENSGT00950000182938.b.b.b.a ENSGT00390000017246 ENSGT00940000157347 ENSGT00390000011081 ENSGT00940000161010 ENSGT00940000156228.k ENSGT00940000161591 ENSGT00940000157902 ENSGT00390000005869.b Galloanserae ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00550000074935 ENSGT00510000047171.u ENSGT00940000158075 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ENSGT00910000144269 ENSGT00940000162805 ENSGT00940000154617.A ENSGT01030000234625.C ENSGT00940000158395 ENSGT00950000182938.b.b.b.a ENSGT00390000017246 ENSGT00940000157347 ENSGT00390000011081 ENSGT00940000161010 ENSGT00940000156228.k ENSGT00940000161591 ENSGT00940000157902 ENSGT00390000005869.b Pink-footed goose MODERN SPECIES 93 FUT10 (ENSABRG00000009913) FNTA (ENSABRG00000009920) ENSABRG00000009930 HOOK3 (ENSABRG00000009951) RNF170 (ENSABRG00000009978) ENSABRG00000010009 THAP1 (ENSABRG00000010016) CHRNB3 (ENSABRG00000010022) CHRNA6 (ENSABRG00000010028) IDUA (ENSABRG00000010040) SLC26A1 (ENSABRG00000010083) ENSABRG00000010237 PDE6B (ENSABRG00000010417) ATP5ME (ENSABRG00000012363) TMEM175 (ENSABRG00000012403) ENSABRG00000012428 ##22 GAK (ENSABRG00000012452) PIGG (ENSABRG00000012483) TRABD2A (ENSABRG00000012537) ENSABRG00000012551 ENSABRG00000012590 SLC49A3 (ENSABRG00000012643) ENSABRG00000012650 ENSABRG00000012687 Duck MODERN SPECIES 4281 FNTA (ENSAPLG00000013651) ENSAPLG00000003106 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ENSGT00390000011081 ENSGT00940000161010 ENSGT00940000156228.k ENSGT00940000161591 ENSGT00940000157902 ENSGT00390000005869.b Chicken MODERN SPECIES 131 ENSGALG00010012032 HOOK3 (ENSGALG00010012011) RNF170 (ENSGALG00010011971) ENSGALG00010011954 THAP1 (ENSGALG00010011947) ENSGALG00010011872 CHRNB3 (ENSGALG00010012425) CHRNA6 (ENSGALG00010013675) ENSGALG00010013639 SLC26A1 (ENSGALG00010013587) IDUA (ENSGALG00010013546) RBP4 (ENSGALG00010013515) PDE6B (ENSGALG00010013455) ATP5I (ENSGALG00010013446) TMEM175 (ENSGALG00010013431) MAT2A (ENSGALG00010013338) ##22 GAK (ENSGALG00010013313) ENSGALG00010012400 ENSGALG00010012395 ENSGALG00010012389 ENSGALG00010012383 ENSGALG00010012375 ENSGALG00010012365 ENSGALG00010012359 PIGG (ENSGALG00010012353) TMEM271 (ENSGALG00010014359) TRABD2A (ENSGALG00010012308) ENSGALG00010012284 ENSGALG00010012278 ENSGALG00010012270 ENSGALG00010012261 Japanese quail MODERN SPECIES 699 FUT10 (ENSCJPG00005012371) FNTA (ENSCJPG00005012370) KCMF1 (ENSCJPG00005012369) HOOK3 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