Chordata ANCESTRAL SPECIES 53 ENSGT00940000156823 ENSGT00950000183150 #22 Vertebrata DUPLICATION Vertebrata ANCESTRAL SPECIES 486 ENSGT00940000156823 ENSGT00950000183150.b #22 Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES 447 ENSGT00940000155348.B #14 ENSGT00940000160643 ENSGT00390000005602 #12 ENSGT00390000011938 #11 ENSGT00940000155311.A #20 ENSGT00390000006956 #21 ENSGT00950000183150.b #22 ENSGT00940000160534 #23 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 47 ENSGT00940000165079 ENSGT00940000158951 ENSGT00940000157746 ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a ENSGT00940000160279 ENSGT00940000158833 #19 ENSGT00390000005672.a.a #18 ENSGT00940000156584 #17 ENSGT00940000163871 #15 ENSGT00940000155348.B #14 ENSGT00940000160643 ENSGT00390000005602 #12 ENSGT00390000011938 #11 ENSGT00940000155311.A #20 ENSGT00390000006956 #21 ENSGT00950000183150.b #22 ENSGT00940000160534 #23 Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 86 ENSGT00940000165079 ENSGT00940000158951 ENSGT00940000157746 ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a ENSGT00940000160279 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#10 Frog MODERN SPECIES 1 ENSXETG00000036591 #7 adam11 (ENSXETG00000003388) #8 dbf4b (ENSXETG00000003387) #9 ccdc43 (ENSXETG00000003386) #10 tmem101 (ENSXETG00000003382) #11 nags (ENSXETG00000003384) #12 ENSXETG00000034840 #13 mpp2 (ENSXETG00000003381) #14 ENSXETG00000003380 #15 ENSXETG00000041407 #16 col1a1 (ENSXETG00000003374) #17 rrp1b (ENSXETG00000003373) #18 ppp1r9b (ENSXETG00000003372) #19 XB6050834 [provisional:igfals] (ENSXETG00000041903) #20 lsm12 (ENSXETG00000003371) #21 g6pc3.1 (ENSXETG00000032824) #22 hdac5 (ENSXETG00000003365) #23 asb16 (ENSXETG00000003361) #24 hrob (ENSXETG00000039640) #25 ENSXETG00000040281 #26 tmub2 (ENSXETG00000035153) #27 atxn7l3 (ENSXETG00000027265) #28 ubtf (ENSXETG00000003356) #29 slc4a1 (ENSXETG00000007364) #30 rundc3a (ENSXETG00000007363) #31 ENSXETG00000038864 #32 ENSXETG00000041401 #33 slc35c2 (ENSXETG00000039564) #34 elmo2 (ENSXETG00000007361) #35 snrpb (ENSXETG00000027266) #36 znfx1 (ENSXETG00000007360) #37 Leishan spiny toad MODERN SPECIES 3 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ENSGT00940000160724 ENSGT00940000159523 ENSGT00960000189914 Eutheria ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000155510 ENSGT00940000158142 ENSGT00940000154018.a ENSGT00390000014900.b.b.b ENSGT00940000163612 ENSGT00390000018148 ENSGT00940000157190 ENSGT00940000162429 ENSGT00940000155348.B #14 ENSGT00530000064295 ENSGT00940000160643 ENSGT00390000005602 #12 ENSGT00390000011938 #11 ENSGT00940000155311.A #20 ENSGT00390000006956 #21 ENSGT00950000183150.b #22 ENSGT00940000160534 #23 ENSGT00400000022305 #25 ENSGT00940000160773 #24 ENSGT00390000014069.b #27 ENSGT00940000158253 #28 ENSGT00940000161141 ENSGT00940000157423 #30 ENSGT00940000158922 #31 ENSGT00960000190528 ENSGT00940000156382 ENSGT00470000042293.a.b ENSGT00950000183184.b ENSGT00940000160724 ENSGT00940000159523 ENSGT00960000189914 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000155510 ENSGT00940000158142 ENSGT00940000154018.a ENSGT00390000014900.b.b.b ENSGT00940000163612 ENSGT00390000018148 ENSGT00940000157190 ENSGT00940000162429 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ENSGT00910000147826 ENSGT00940000161141 ENSGT00940000157423 #30 ENSGT00940000158922 #31 ENSGT00940000156382 ENSGT00470000042293.a.b ENSGT00950000183184.b ENSGT00940000160724 Bonobo MODERN SPECIES 8 DHX8 (ENSPPAG00000042508) ETV4 (ENSPPAG00000024983) MEOX1 (ENSPPAG00000038321) ENSPPAG00000036631 SOST (ENSPPAG00000038960) DUSP3 (ENSPPAG00000036872) CFAP97D1 (ENSPPAG00000034446) MPP3 (ENSPPAG00000031569) CD300LG (ENSPPAG00000011895) MPP2 (ENSPPAG00000034198) #14 PPY (ENSPPAG00000036472) PYY (ENSPPAG00000032981) NAGS (ENSPPAG00000019790) #12 TMEM101 (ENSPPAG00000041985) #11 ENSPPAG00000034974 #21 G6PC3 (ENSPPAG00000041035) #22 HDAC5 (ENSPPAG00000031825) #23 HROB (ENSPPAG00000042958) #25 ENSPPAG00000001483 ASB16 (ENSPPAG00000032367) #24 TMUB2 (ENSPPAG00000035514) #27 ENSPPAG00000032123 ATXN7L3 (ENSPPAG00000041050) #28 ENSPPAG00000028996 UBTF (ENSPPAG00000041895) SLC4A1 (ENSPPAG00000038599) #30 RUNDC3A (ENSPPAG00000041417) #31 SLC25A39 (ENSPPAG00000039768) GRN (ENSPPAG00000033379) 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ENSTBEG00000012523 #21 G6PC3 (ENSTBEG00000012538) #22 Glires ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000161341.b ENSGT00940000155510 ENSGT00940000158142 ENSGT00940000154018.a ENSGT00390000014900.b.b.b ENSGT00940000163690 ENSGT00390000018148 ENSGT00940000157190 ENSGT00940000162429 ENSGT00940000155348.B #14 ENSGT00530000064295 ENSGT00940000160643 ENSGT00390000005602 #12 ENSGT00390000011938 #11 ENSGT00390000006956 #21 ENSGT00950000183150.b #22 ENSGT00940000160534 #23 ENSGT00400000022305 #25 ENSGT00940000160773 #24 ENSGT00560000077692 ENSGT00390000014069.b #27 ENSGT01100000263648 ENSGT00940000158253 #28 ENSGT00940000161141 ENSGT00940000157423 #30 ENSGT00940000158922 #31 ENSGT00940000156382 ENSGT00470000042293.a.b ENSGT00950000183184.b ENSGT00940000160724 ENSGT00940000159523 Rodentia ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000161341.b ENSGT00940000155510 ENSGT00940000158142 ENSGT00940000154018.a ENSGT00390000014900.b.b.b ENSGT00940000163690 ENSGT00390000018148 ENSGT00940000157190 ENSGT00940000162429 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ENSGT01100000263648 ENSGT00940000158253 #28 ENSGT00940000161141 ENSGT00940000157423 #30 ENSGT00940000158922 #31 ENSGT00940000156382 ENSGT00470000042293.a.b ENSGT00950000183184.b ENSGT00940000160724 ENSGT00940000159523 ENSGT00940000161812 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000161341.b ENSGT00940000155510 ENSGT00940000158142 ENSGT00940000154018.a ENSGT00390000014900.b.b.b ENSGT00940000163690 ENSGT00390000018148 ENSGT00940000157190 ENSGT00940000162429 ENSGT00940000155348.B #14 ENSGT00530000064295 ENSGT00940000160643 ENSGT00390000005602 #12 ENSGT00390000011938 #11 ENSGT00390000006956 #21 ENSGT00950000183150.b #22 ENSGT00940000160534 #23 ENSGT00400000022305 #25 ENSGT00940000160773 #24 ENSGT00390000014069.b #27 ENSGT01100000263648 ENSGT00940000158253 #28 ENSGT00940000161141 ENSGT00940000157423 #30 ENSGT00940000158922 #31 ENSGT00940000156382 ENSGT00470000042293.a.b ENSGT00950000183184.b ENSGT00940000160724 ENSGT00940000159523 ENSGT00940000161812 Muroidea ANCESTRAL SPECIES 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ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000161341.b ENSGT00940000155510 ENSGT00940000158142 ENSGT00940000154018.a ENSGT00390000014900.b.b.b ENSGT00940000163612 ENSGT00390000018148 ENSGT00940000157190 ENSGT00940000162429 ENSGT00940000155348.B #14 ENSGT00530000064295 ENSGT00940000160643 ENSGT00390000005602 #12 ENSGT00390000011938 #11 ENSGT00390000006956 #21 ENSGT00950000183150.b #22 ENSGT00940000160534 #23 ENSGT00400000022305 #25 ENSGT00560000077692 ENSGT00940000160773 #24 ENSGT00390000014069.b #27 ENSGT01100000263648 ENSGT00940000158253 #28 ENSGT00940000161141 ENSGT00940000157423 #30 ENSGT00940000158922 #31 ENSGT00940000156382 ENSGT00470000042293.a.b ENSGT00950000183184.b ENSGT00940000160724 ENSGT00940000159523 Pig MODERN SPECIES 3 DHX8 (ENSSSCG00000017378) ETV4 (ENSSSCG00000017379) ENSSSCG00000017377 MEOX1 (ENSSSCG00000017376) SOST (ENSSSCG00000039204) DUSP3 (ENSSSCG00000020744) CFAP97D1 (ENSSSCG00000017373) MPP3 (ENSSSCG00000017372) ENSSSCG00000023014 MPP2 (ENSSSCG00000017367) #14 PPY 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#27 ENSGT01100000263648 ENSGT00940000158253 #28 ENSGT00910000147826 ENSGT00940000161141 ENSGT00940000157423 #30 ENSGT00940000158922 #31 ENSGT00940000156382 ENSGT00470000042293.a.b ENSGT00950000183184.b ENSGT00940000160724 Camelidae ANCESTRAL SPECIES 62 ENSGT00940000161341.b ENSGT00940000155510 ENSGT00940000158142 ENSGT00940000154018.a ENSGT00390000014900.b.b.b ENSGT00940000163612 ENSGT00390000018148 ENSGT00940000157190 ENSGT00940000162429 ENSGT00940000155348.B #14 ENSGT00530000064295 ENSGT00940000160643 ENSGT00390000005602 #12 ENSGT00390000011938 #11 ENSGT00390000006956 #21 ENSGT00950000183150.b #22 ENSGT00940000160534 #23 ENSGT00400000022305 #25 ENSGT00940000160773 #24 ENSGT00560000077692 ENSGT00390000014069.b #27 ENSGT01100000263648 ENSGT00940000158253 #28 ENSGT00940000161141 ENSGT00940000157423 #30 ENSGT00940000158922 #31 ENSGT00940000156382 ENSGT00470000042293.a.b ENSGT00950000183184.b ENSGT00940000160724 ENSGT00940000159523 Alpaca MODERN SPECIES 1432 LSM12 (ENSVPAG00000011145) #21 G6PC3 (ENSVPAG00000011146) #22 Arabian camel MODERN SPECIES 7 ARL4D (ENSCDRG00005012487) DHX8 (ENSCDRG00005012511) ETV4 (ENSCDRG00005012629) MEOX1 (ENSCDRG00005012880) SOST (ENSCDRG00005012942) DUSP3 (ENSCDRG00005013017) CFAP97D1 (ENSCDRG00005013063) MPP3 (ENSCDRG00005013136) ENSCDRG00005013287 MPP2 (ENSCDRG00005013377) #14 PPY (ENSCDRG00005013534) PYY (ENSCDRG00005013591) NAGS (ENSCDRG00005013649) #12 TMEM101 (ENSCDRG00005013697) #11 LSM12 (ENSCDRG00005013762) #21 G6PC3 (ENSCDRG00005013821) #22 HDAC5 (ENSCDRG00005013881) #23 HROB (ENSCDRG00005014700) #25 ASB16 (ENSCDRG00005014991) #24 ENSCDRG00005015010 TMUB2 (ENSCDRG00005015028) #27 ENSCDRG00005015114 ATXN7L3 (ENSCDRG00005015133) #28 UBTF (ENSCDRG00005015228) SLC4A1 (ENSCDRG00005015521) #30 RUNDC3A (ENSCDRG00005003384) #31 ENSCDRG00005003521 GRN (ENSCDRG00005003644) FAM171A2 (ENSCDRG00005003750) ITGA2B (ENSCDRG00005003803) GPATCH8 (ENSCDRG00005003876) Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000161341.b ENSGT00940000155510 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ENSGT00940000160773 #24 ENSGT00560000077692 ENSGT00390000014069.b #27 ENSGT01100000263648 ENSGT01000000221239 ENSGT00940000158253 #28 ENSGT00940000161141 ENSGT00940000157423 #30 ENSGT00940000158922 #31 ENSGT00940000156382 ENSGT00470000042293.a.b ENSGT00950000183184.b ENSGT00940000160724 Monodontidae ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000155510 ENSGT00940000158142 ENSGT00940000156866.db.b.a.a.b ENSGT00940000154018.a ENSGT00390000014900.b.b.b ENSGT00940000163612.k ENSGT00390000018148 ENSGT00940000157190 ENSGT00940000162429 ENSGT00940000155348.B #14 ENSGT00530000064295 ENSGT00940000160643 ENSGT00390000005602 #12 ENSGT00390000011938 #11 ENSGT00390000006956 #21 ENSGT00950000183150.b #22 ENSGT00940000160534 #23 ENSGT00400000022305 #25 ENSGT00940000160773 #24 ENSGT00560000077692 ENSGT00390000014069.b #27 ENSGT01100000263648 ENSGT01000000221239 ENSGT00940000158253 #28 ENSGT00940000161141 ENSGT00940000157423 #30 ENSGT00940000158922 #31 ENSGT00940000156382 ENSGT00470000042293.a.b ENSGT00950000183184.b ENSGT00940000160724 Beluga whale MODERN SPECIES 26 DHX8 (ENSDLEG00000016383) ETV4 (ENSDLEG00000016356) ENSDLEG00000016347 MEOX1 (ENSDLEG00000016337) SOST (ENSDLEG00000016330) DUSP3 (ENSDLEG00000016319) CUNH17orf105 (ENSDLEG00000016278) MPP3 (ENSDLEG00000016159) ENSDLEG00000016136 MPP2 (ENSDLEG00000016102) #14 PPY (ENSDLEG00000016086) PYY (ENSDLEG00000016066) NAGS (ENSDLEG00000016043) #12 TMEM101 (ENSDLEG00000016032) #11 LSM12 (ENSDLEG00000016019) #21 G6PC3 (ENSDLEG00000016010) #22 HDAC5 (ENSDLEG00000009250) #23 ENSDLEG00000008279 ASB16 (ENSDLEG00000008257) #24 TMUB2 (ENSDLEG00000008235) #27 ENSDLEG00000008216 ENSDLEG00000008200 ATXN7L3 (ENSDLEG00000008139) #28 UBTF (ENSDLEG00000008074) SLC4A1 (ENSDLEG00000008025) #30 RUNDC3A (ENSDLEG00000007963) #31 SLC25A39 (ENSDLEG00000007915) GRN (ENSDLEG00000007904) FAM171A2 (ENSDLEG00000007900) ITGA2B (ENSDLEG00000007305) ENSDLEG00000007218 Narwhal MODERN SPECIES 316 DHX8 (ENSMMNG00015020621) ETV4 (ENSMMNG00015020665) 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HROB (ENSBMSG00010015577) #25 ASB16 (ENSBMSG00010015714) #24 TMUB2 (ENSBMSG00010015740) #27 ENSBMSG00010015844 ENSBMSG00010015852 ATXN7L3 (ENSBMSG00010015865) #28 ENSBMSG00010015902 UBTF (ENSBMSG00010015923) SLC4A1 (ENSBMSG00010015974) #30 RUNDC3A (ENSBMSG00010016158) #31 SLC25A39 (ENSBMSG00010016337) GRN (ENSBMSG00010016403) FAM171A2 (ENSBMSG00010016465) ITGA2B (ENSBMSG00010016509) Pecora ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000155510 ENSGT00940000158142 ENSGT00940000154018.a ENSGT00390000014900.b.b.b ENSGT00940000163612 ENSGT00390000018148 ENSGT00940000157190 ENSGT00940000162429 ENSGT00940000155348.B #14 ENSGT00530000064295 ENSGT00940000160643 ENSGT00740000117120 ENSGT00390000005602 #12 ENSGT00390000011938 #11 ENSGT00390000006956 #21 ENSGT00950000183150.b #22 ENSGT00940000160534 #23 ENSGT00400000022305 #25 ENSGT00940000160773 #24 ENSGT00560000077692 ENSGT00390000014069.b #27 ENSGT01100000263648 ENSGT00940000158253 #28 ENSGT00940000161141 ENSGT00940000157423 #30 ENSGT00940000158922 #31 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Percora_a ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000155510 ENSGT00940000158142 ENSGT00940000154018.a ENSGT00390000014900.b.b.b ENSGT00940000163612 ENSGT00390000018148 ENSGT00940000157190 ENSGT00940000162429 ENSGT00940000155348.B #14 ENSGT00530000064295 ENSGT00940000160643 ENSGT00740000117120 ENSGT00390000005602 #12 ENSGT00390000011938 #11 ENSGT00390000006956 #21 ENSGT00950000183150.b #22 ENSGT00940000160534 #23 ENSGT00400000022305 #25 ENSGT00940000160773 #24 ENSGT00560000077692 ENSGT00390000014069.b #27 ENSGT01100000263648 ENSGT00940000158253 #28 ENSGT00940000161141 ENSGT00940000157423 #30 ENSGT00940000158922 #31 ENSGT00940000156382 ENSGT00470000042293.a.b ENSGT00950000183184.b ENSGT00940000160724 ENSGT00940000159523 Bovidae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000158142 ENSGT00940000154018.a ENSGT00390000014900.b.b.b ENSGT00940000163612 ENSGT00940000163690 ENSGT00390000018148 ENSGT00940000157190 ENSGT00940000162429 ENSGT00940000155348.B #14 ENSGT00530000064295 ENSGT00940000160643 ENSGT00740000117120 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MODERN SPECIES 10 DHX8 (ENSBTAG00000008339) ETV4 (ENSBTAG00000008333) MEOX1 (ENSBTAG00000015751) SOST (ENSBTAG00000053970) DUSP3 (ENSBTAG00000003966) CFAP97D1 (ENSBTAG00000045732) MPP3 (ENSBTAG00000017536) CD300LG (ENSBTAG00000007434) MPP2 (ENSBTAG00000001279) #14 PPY (ENSBTAG00000002441) PYY (ENSBTAG00000046022) PYY2 (ENSBTAG00000045652) NAGS (ENSBTAG00000016249) #12 TMEM101 (ENSBTAG00000016251) #11 LSM12 (ENSBTAG00000016252) #21 G6PC3 (ENSBTAG00000016253) #22 HDAC5 (ENSBTAG00000016254) #23 HROB (ENSBTAG00000004464) #25 ASB16 (ENSBTAG00000019658) #24 ENSBTAG00000055030 TMUB2 (ENSBTAG00000019660) #27 ATXN7L3 (ENSBTAG00000019662) #28 UBTF (ENSBTAG00000005067) ENSBTAG00000050012 SLC4A1 (ENSBTAG00000001610) #30 RUNDC3A (ENSBTAG00000001615) #31 SLC25A39 (ENSBTAG00000019463) GRN (ENSBTAG00000018823) FAM171A2 (ENSBTAG00000011447) ITGA2B (ENSBTAG00000008165) GPATCH8 (ENSBTAG00000038316) Bos_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000158142 ENSGT00940000154018.a ENSGT00390000014900.b.b.b 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HDAC5 (ENSPVAG00000013712) #23 HROB (ENSPVAG00000013715) #25 ASB16 (ENSPVAG00000013718) #24 ATXN7L3 (ENSPVAG00000013721) #28 UBTF (ENSPVAG00000013724) Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000161341.b ENSGT00940000155510 ENSGT00940000158142 ENSGT00940000154018.a ENSGT00390000014900.b.b.b ENSGT00940000163612 ENSGT00390000018148 ENSGT00940000157190 ENSGT00940000162429 ENSGT00940000155348.B #14 ENSGT00530000064295 ENSGT00940000160643 ENSGT00390000005602 #12 ENSGT00390000011938 #11 ENSGT00390000006956 #21 ENSGT00950000183150.b #22 ENSGT00940000160534 #23 ENSGT00400000022305 #25 ENSGT00940000160773 #24 ENSGT00390000014069.b #27 ENSGT01100000263787 ENSGT00940000158253 #28 ENSGT00940000161141 ENSGT00940000157423 #30 ENSGT00940000158922 #31 ENSGT00940000156382 ENSGT00470000042293.a.b ENSGT00950000183184.b ENSGT00940000160724 ENSGT00940000159523 ENSGT00940000161812 Microbat MODERN SPECIES 1037 ENSMLUG00000000090 ETV4 (ENSMLUG00000000091) MEOX1 (ENSMLUG00000000092) SOST 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Caniformia ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000161341.b ENSGT00940000155510 ENSGT00940000158142 ENSGT00940000154018.a ENSGT00390000014900.b.b.b ENSGT00940000163612 ENSGT00390000018148 ENSGT00940000157190 ENSGT00940000162429 ENSGT00940000155348.B #14 ENSGT00530000064295 ENSGT00940000160643 ENSGT00390000005602 #12 ENSGT00390000011938 #11 ENSGT00390000006956 #21 ENSGT00950000183150.b #22 ENSGT00940000160534 #23 ENSGT00400000022305 #25 ENSGT00940000160773 #24 ENSGT00560000077692 ENSGT00390000014069.b #27 ENSGT01100000263787 ENSGT00940000158253 #28 ENSGT00940000161141 ENSGT00940000157423 #30 ENSGT00940000158922 #31 ENSGT00960000190528 ENSGT00940000156382 ENSGT00470000042293.a.b ENSGT00950000183184.b ENSGT00940000160724 Canidae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000161341.b ENSGT00940000155510 ENSGT00940000158142.l ENSGT00940000154018.a ENSGT00390000014900.b.b.b ENSGT00940000163612 ENSGT00390000018148 ENSGT00940000157190 ENSGT00940000162429 ENSGT00940000155348.B #14 ENSGT00530000064295 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#28 ENSGT00940000161141 ENSGT00940000157423 #30 ENSGT00940000158922 #31 ENSGT00940000156382 ENSGT00470000042293.a.b ENSGT00950000183184.b ENSGT00940000160724 ENSGT00940000159523 Dog MODERN SPECIES 37 DHX8 (ENSCAFG00845010932) ETV4 (ENSCAFG00845010762) MEOX1 (ENSCAFG00845010666) ENSCAFG00845010634 SOST (ENSCAFG00845010604) DUSP3 (ENSCAFG00845010587) CFAP97D1 (ENSCAFG00845010537) MPP3 (ENSCAFG00845010353) CD300LG (ENSCAFG00845010201) MPP2 (ENSCAFG00845009989) #14 PPY (ENSCAFG00845009906) PYY (ENSCAFG00845009862) NAGS (ENSCAFG00845009803) #12 TMEM101 (ENSCAFG00845009766) #11 LSM12 (ENSCAFG00845009725) #21 G6PC3 (ENSCAFG00845009701) #22 HDAC5 (ENSCAFG00845009404) #23 HROB (ENSCAFG00845009214) #25 ENSCAFG00845009181 ASB16 (ENSCAFG00845009148) #24 TMUB2 (ENSCAFG00845009090) #27 ATXN7L3 (ENSCAFG00845009030) #28 UBTF (ENSCAFG00845008774) SLC4A1 (ENSCAFG00845008600) #30 RUNDC3A (ENSCAFG00845008505) #31 SLC25A39 (ENSCAFG00845008385) GRN (ENSCAFG00845008267) FAM171A2 (ENSCAFG00845008184) ITGA2B 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237 ENSVVUG00000017401 DHX8 (ENSVVUG00000017409) ETV4 (ENSVVUG00000017428) MEOX1 (ENSVVUG00000017472) SOST (ENSVVUG00000017483) ENSVVUG00000017486 CFAP97D1 (ENSVVUG00000017491) MPP3 (ENSVVUG00000017506) CD300LG (ENSVVUG00000017537) MPP2 (ENSVVUG00000017546) #14 PPY (ENSVVUG00000017565) PYY (ENSVVUG00000017566) NAGS (ENSVVUG00000017572) #12 TMEM101 (ENSVVUG00000017580) #11 LSM12 (ENSVVUG00000017581) #21 G6PC3 (ENSVVUG00000017585) #22 HDAC5 (ENSVVUG00000017591) #23 HROB (ENSVVUG00000017609) #25 TMUB2 (ENSVVUG00000017618) #27 ENSVVUG00000017621 ATXN7L3 (ENSVVUG00000017632) #28 UBTF (ENSVVUG00000017636) SLC4A1 (ENSVVUG00000017647) #30 RUNDC3A (ENSVVUG00000017662) #31 ENSVVUG00000017685 GRN (ENSVVUG00000017755) FAM171A2 (ENSVVUG00000017759) ITGA2B (ENSVVUG00000017776) GPATCH8 (ENSVVUG00000017996) FZD2 (ENSVVUG00000018007) MEIOC (ENSVVUG00000018011) Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000161341.b ENSGT00940000155510 ENSGT00940000158142 ENSGT00940000154018.a ENSGT00390000014900.b.b.b 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ENSGT00940000161141 ENSGT00940000157423 #30 ENSGT00940000158922 #31 ENSGT00940000156382 ENSGT00940000155494 ENSGT00530000063688.b ENSGT00950000182950.C Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000158951 ENSGT00940000157746 ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a ENSGT00940000160279 ENSGT00940000158833 #19 ENSGT00730000113862 ENSGT00390000005672.a.a #18 ENSGT00940000156584 #17 ENSGT00940000163871 #15 ENSGT00940000155348.B #14 ENSGT00950000185319 ENSGT00940000160643 ENSGT00390000011938 #11 ENSGT00940000155311.A #20 ENSGT00390000006956 #21 ENSGT00950000183150.b #22 ENSGT00940000160534 #23 ENSGT00400000022305 #25 ENSGT00940000160773 #24 ENSGT00390000014069.b #27 ENSGT00940000158253 #28 ENSGT00940000161141 ENSGT00940000157423 #30 ENSGT00940000158922 #31 ENSGT00940000156382 ENSGT00940000155494 ENSGT00530000063688.b ENSGT00950000182950.C ENSGT01030000234570.d.b.a.b.b.a Episquamata ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000155348.B #14 ENSGT00950000185319 ENSGT00940000160643 ENSGT00390000011938 #11 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ENSGT00940000161141 ENSGT00940000157423 #30 ENSGT00940000158922 #31 ENSGT00940000156382 ENSGT00940000155494 ENSGT00530000063688.b ENSGT00950000182950.C ENSGT01030000234570.d.b.a.b.b.a ENSGT00940000164841 ENSGT00940000156559 Passeriformes ANCESTRAL SPECIES 41 ENSGT00940000154376.b ENSGT00940000157900 ENSGT00940000157744 ENSGT00940000163054.a.b ENSGT00940000165079 ENSGT00940000158951 ENSGT00940000157746 ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a ENSGT00940000158833 #19 ENSGT00940000156584 #17 ENSGT00940000163871.d #15 ENSGT00940000155348.B #14 ENSGT00940000160643 ENSGT00390000011938 #11 ENSGT00390000006956 #21 ENSGT00950000183150.b #22 ENSGT00940000160534.t #23 ENSGT00400000022305 #25 ENSGT00940000160773 #24 ENSGT00390000014069.b #27 ENSGT00940000158253 #28 ENSGT00940000161141 ENSGT00940000157423 #30 ENSGT00940000158922 #31 ENSGT00940000156382 ENSGT00940000155494 ENSGT00530000063688.b ENSGT00950000182950.C ENSGT01030000234570.d.b.a.b.b.a ENSGT00940000164841 ENSGT00940000156559 Great tit MODERN SPECIES 324 LSM12 (ENSPMJG00000013450) #21 G6PC3 (ENSPMJG00000013451) #22 ENSPMJG00000013453 #23 ENSPMJG00000013454 #23 HROB (ENSPMJG00000013455) #25 ASB16 (ENSPMJG00000013456) #24 ENSPMJG00000013457 #27 ENSPMJG00000013462 #28 ENSPMJG00000013463 #28 ENSPMJG00000013464 #27 Passeriformes_d ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00950000183070.a.b ENSGT00730000110974 ENSGT00950000182883.a.a ENSGT00940000154376.b ENSGT00940000157900 ENSGT00940000157744 ENSGT00940000158951 ENSGT00940000157746 ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a ENSGT00940000158833 #19 ENSGT00940000163871.d #15 ENSGT00940000155348.B #14 ENSGT00940000160643 ENSGT00390000011938 #11 ENSGT00390000006956 #21 ENSGT00950000183150.b #22 ENSGT00940000160534.t #23 ENSGT00400000022305 #25 ENSGT00940000160773 #24 ENSGT00940000158253 #28 ENSGT00940000161141 ENSGT00940000157423 #30 ENSGT00940000158922 #31 ENSGT00940000156382 ENSGT00940000155494 ENSGT00530000063688.b ENSGT00950000182950.C ENSGT01030000234570.d.b.a.b.b.a ENSGT00940000164841 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ENSGFOG00000005895 #22 ENSGFOG00000005900 #23 Passeroidea ANCESTRAL SPECIES 45 ENSGT00940000160427 ENSGT00940000161380 ENSGT00390000007741.a ENSGT00940000157416 ENSGT00950000183070.a.b ENSGT00730000110974 ENSGT00950000182883.a.a ENSGT00940000154376.b ENSGT00940000157900 ENSGT00940000157744 ENSGT00940000163871.d #15 ENSGT00940000155348.B #14 ENSGT00940000160643 ENSGT00390000011938 #11 ENSGT00390000006956 #21 ENSGT00950000183150.b #22 ENSGT00940000160534.t #23 ENSGT00400000022305 #25 ENSGT00940000160773 #24 ENSGT00940000158253 #28 ENSGT00940000161141 ENSGT00940000157423 #30 ENSGT00940000158922 #31 ENSGT00940000156382 ENSGT00940000155494 ENSGT00530000063688.b ENSGT00950000182950.C ENSGT01030000234570.d.b.a.b.b.a ENSGT00940000164841 ENSGT00940000156559 ENSGT00390000013997 Zebra finch MODERN SPECIES 20 PHOSPHO1 (ENSTGUG00000022673) ZNF652 (ENSTGUG00000003462) PHB1 (ENSTGUG00000003470) NGFR (ENSTGUG00000021536) NXPH3 (ENSTGUG00000020057) SPOP (ENSTGUG00000023775) SLC35B1 (ENSTGUG00000001866) KAT7 (ENSTGUG00000001873) ENSTGUG00000019116 ENSTGUG00000027666 ENSTGUG00000024260 #15 MPP2 (ENSTGUG00000028797) #14 PYY (ENSTGUG00000023157) TMEM101 (ENSTGUG00000028223) #11 LSM12 (ENSTGUG00000026330) #21 G6PC3 (ENSTGUG00000025513) #22 HDAC5 (ENSTGUG00000027937) #23 HROB (ENSTGUG00000027390) #25 ASB16 (ENSTGUG00000019091) #24 ENSTGUG00000023288 ATXN7L3 (ENSTGUG00000026927) #28 SLC4A1 (ENSTGUG00000001885) #30 RUNDC3A (ENSTGUG00000025220) #31 SLC25A39 (ENSTGUG00000001903) UBTF (ENSTGUG00000001880) ENSTGUG00000001908 KANSL1 (ENSTGUG00000001911) CDC27 (ENSTGUG00000001915) ENSTGUG00000001924 ENSTGUG00000025009 CCDC47 (ENSTGUG00000001935) Common canary MODERN SPECIES 405 LSM12 (ENSSCAG00000008976) #21 ENSSCAG00000008978 #22 Neognathae_c ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000157744 ENSGT00940000165079 ENSGT00940000158951 ENSGT00940000157746 ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a ENSGT00940000160279 ENSGT00940000158833 #19 ENSGT00390000005672.a.a #18 ENSGT00940000156584 #17 ENSGT00940000163871.d #15 ENSGT00940000155348.B #14 ENSGT00950000185319 ENSGT00940000160643 ENSGT00390000011938 #11 ENSGT00390000006956 #21 ENSGT00950000183150.b #22 ENSGT00940000160534 #23 ENSGT00400000022305 #25 ENSGT00940000160773 #24 ENSGT00390000014069.b #27 ENSGT00940000158253 #28 ENSGT00940000161141 ENSGT00940000157423 #30 ENSGT00940000158922 #31 ENSGT00940000156382 ENSGT00940000155494 ENSGT00530000063688.b ENSGT00950000182950.C ENSGT01030000234570.d.b.a.b.b.a ENSGT00940000164841 ENSGT00940000156559 Kakapo MODERN SPECIES 12 ENSSHBG00005015857 PPP1R9B (ENSSHBG00005015852) #19 SGCA (ENSSHBG00005015846) #18 COL1A1 (ENSSHBG00005015830) #17 ENSSHBG00005015425 #15 MPP2 (ENSSHBG00005015401) #14 PYY (ENSSHBG00005015397) TMEM101 (ENSSHBG00005015392) #11 LSM12 (ENSSHBG00005015386) #21 G6PC3 (ENSSHBG00005015381) #22 HDAC5 (ENSSHBG00005015149) #23 HROB (ENSSHBG00005015108) #25 ASB16 (ENSSHBG00005015105) #24 ATXN7L3 (ENSSHBG00005015099) #28 UBTF (ENSSHBG00005015095) SLC4A1 (ENSSHBG00005012535) #30 RUNDC3A (ENSSHBG00005012345) #31 SLC25A39 (ENSSHBG00005012294) MAPT (ENSSHBG00005012158) KANSL1 (ENSSHBG00005012007) CDC27 (ENSSHBG00005011976) ENSSHBG00005011956 ENSSHBG00005011928 DDX42 (ENSSHBG00005011912) CCDC47 (ENSSHBG00005000976) Golden eagle MODERN SPECIES 24 FAM117A (ENSACCG00020006125) KAT7 (ENSACCG00020006157) ENSACCG00020006173 DLX3 (ENSACCG00020006186) ITGA3 (ENSACCG00020006218) PDK2 (ENSACCG00020011423) SAMD14 (ENSACCG00020011440) PPP1R9B (ENSACCG00020011480) #19 SGCA (ENSACCG00020011502) #18 ENSACCG00020011586 #15 MPP2 (ENSACCG00020011698) #14 ENSACCG00020011728 PYY (ENSACCG00020011766) TMEM101 (ENSACCG00020011792) #11 LSM12 (ENSACCG00020011812) #21 G6PC3 (ENSACCG00020011848) #22 HDAC5 (ENSACCG00020012220) #23 HROB (ENSACCG00020012573) #25 ASB16 (ENSACCG00020012606) #24 TMUB2 (ENSACCG00020012623) #27 ATXN7L3 (ENSACCG00020012643) #28 UBTF (ENSACCG00020012694) SLC4A1 (ENSACCG00020012822) #30 RUNDC3A (ENSACCG00020012922) #31 SLC25A39 (ENSACCG00020012990) MAPT (ENSACCG00020013118) KANSL1 (ENSACCG00020013218) CDC27 (ENSACCG00020013256) ENSACCG00020013280 ENSACCG00020013301 DDX42 (ENSACCG00020013330) Galloanserae ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000157900 ENSGT00950000183046.a.b ENSGT00940000157744 ENSGT00940000165079 ENSGT00940000158951 ENSGT00940000157746 ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a ENSGT00940000160279 ENSGT00940000158833 #19 ENSGT00390000005672.a.a #18 ENSGT00940000156584 #17 ENSGT00940000163871.d #15 ENSGT00940000155348.B #14 ENSGT00390000011938 #11 ENSGT00390000006956 #21 ENSGT00950000183150.b #22 ENSGT00940000160773 #24 ENSGT00940000158253 #28 ENSGT00940000161141.e ENSGT00940000157423 #30 ENSGT00940000158922 #31 ENSGT00940000156382 ENSGT00940000155494 ENSGT00530000063688.b ENSGT00950000182950.C ENSGT01030000234570.d.b.a.b.b.a ENSGT00940000164841 ENSGT00940000156559 ENSGT00390000013997 ENSGT00940000158827 ENSGT00390000016292 Phasianidae ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00950000183046.a.b ENSGT00940000157744 ENSGT00940000165079 ENSGT00940000158951 ENSGT00940000157746 ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a ENSGT00940000160279 ENSGT00940000158833 #19 ENSGT00390000005672.a.a #18 ENSGT00940000156584 #17 ENSGT00940000163871.d #15 ENSGT00950000185319 ENSGT01070000257226 ENSGT00390000011938 #11 ENSGT00390000006956 #21 ENSGT00950000183150.b #22 ENSGT00940000160773 #24 ENSGT00940000158253 #28 ENSGT00940000161141.f.a ENSGT00940000157423 #30 ENSGT00940000158922 #31 ENSGT00940000156382 ENSGT00940000155494 ENSGT00530000063688.b ENSGT00950000182950.C ENSGT01030000234570.d.b.a.b.b.a ENSGT00940000164841 ENSGT00940000156559 ENSGT00390000013997 ENSGT00940000158827 ENSGT00390000016292 Phasianidae_b ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00950000183046.a.b ENSGT00940000157744 ENSGT00940000165079 ENSGT00940000158951 ENSGT00940000157746 ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a ENSGT00940000160279 ENSGT00940000158833 #19 ENSGT00390000005672.a.a #18 ENSGT00940000156584 #17 ENSGT00940000163871.d #15 ENSGT00950000185319 ENSGT01070000257226 ENSGT00390000011938 #11 ENSGT00390000006956 #21 ENSGT00950000183150.b #22 ENSGT00940000161141.f.a ENSGT00940000157423 #30 ENSGT00940000158922 #31 ENSGT00940000156382 ENSGT00940000155494 ENSGT00530000063688.b ENSGT00950000182950.C ENSGT01030000234570.d.b.a.b.b.a ENSGT00940000164841 ENSGT00940000156559 ENSGT00390000013997 ENSGT00940000158827 ENSGT00390000016292 ENSGT00940000158377.b ENSGT00940000158767 Turkey MODERN SPECIES 887 ENSMGAG00000008407 #22 Chicken MODERN SPECIES 19 KAT7 (ENSGALG00010024189) Dlx4 (ENSGALG00010021149) DLX3 (ENSGALG00010026116) ITGA3 (ENSGALG00010025286) PDK2 (ENSGALG00010025274) SAMD14 (ENSGALG00010025263) PPP1R9B (ENSGALG00010025252) #19 SGCA (ENSGALG00010025247) #18 ENSGALG00010026410 COL1A1 (ENSGALG00010025092) #17 ENSGALG00010025006 #15 PPY (ENSGALG00010024981) ENSGALG00010024972 TMEM101 (ENSGALG00010024968) #11 LSM12 (ENSGALG00010024961) #21 G6PC3 (ENSGALG00010024934) #22 ENSGALG00010024923 UBTF (ENSGALG00010024910) SLC4A1 (ENSGALG00010024885) #30 RUNDC3A (ENSGALG00010024872) #31 SLC25A39 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ENSSPAG00000017378 Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00950000182894.A.b.b ENSGT00950000182696.B.a.a.a ENSGT00940000154768.A.a.g.b ENSGT00940000153771.A ENSGT00940000154768.A.a.h ENSGT00940000158003 ENSGT01100000263520.a.a.a.b.b ENSGT00940000158833.a.b #19 ENSGT00390000005672.a.a #18 ENSGT00940000156584.e.a #17 ENSGT00940000163871.a #15 ENSGT00940000169501 ENSGT00390000011938 #11 ENSGT00940000155311.A.b #20 ENSGT00390000006956.a #21 ENSGT00950000183150.b #22 ENSGT00940000156447.a.a ENSGT00940000178451 ENSGT00440000033966 ENSGT00390000016262 ENSGT00940000159871.b.a.a ENSGT00390000014892 ENSGT00950000182860.a.a.a.ub.b ENSGT00940000160317 ENSGT00940000157186.c ENSGT00390000015375 ENSGT00390000004495 ENSGT00940000154078.a.a.a ENSGT01050000245040 ENSGT00980000198953 ENSGT00950000183002.C.c.b Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00950000182894.A.b.b ENSGT00950000182696.B.a.a.a ENSGT00940000154768.A.a.g.b ENSGT00940000153771.A ENSGT00940000154768.A.a.h ENSGT00940000158003 ENSGT01100000263520.a.a.a.b.b ENSGT00940000158833.a.b #19 ENSGT00390000005672.a.a #18 ENSGT00940000156584.e.a #17 ENSGT00940000163871.a #15 ENSGT00940000169501 ENSGT00390000011938 #11 ENSGT00940000155311.A.b #20 ENSGT00390000006956.a #21 ENSGT00950000183150.b #22 ENSGT00940000156447.a.a ENSGT00940000178451 ENSGT00440000033966 ENSGT00390000016262 ENSGT00940000159871.b.a.a ENSGT00390000014892 ENSGT00950000182860.a.a.a.ub.b ENSGT00940000160317 ENSGT00940000157186.c ENSGT00390000015375 ENSGT00390000004495 ENSGT00940000154078.a.a.a ENSGT00950000183002.C.c.b ENSGT00940000165336.a.a.a ENSGT00940000171531 Nile tilapia MODERN SPECIES 20 TEKT3 (ENSONIG00000007981) PMP22 (ENSONIG00000007977) hs3st3b1b (ENSONIG00000029010) cox10 (ENSONIG00000032031) ENSONIG00000037600 ENSONIG00000007971 ENSONIG00000007967 PPP1R9B (ENSONIG00000007966) #19 ENSONIG00000007963 #18 col1a1b (ENSONIG00000007944) #17 retsatl (ENSONIG00000007943) #15 ENSONIG00000041637 TMEM101 (ENSONIG00000007941) #11 ENSONIG00000007939 #20 lsm12b (ENSONIG00000007933) #21 g6pc3 (ENSONIG00000039829) #22 TANC2 (ENSONIG00000007927) CNTD1 (ENSONIG00000040597) coa3a (ENSONIG00000032871) WNK4 (ENSONIG00000007921) vps25 (ENSONIG00000034604) ENSONIG00000007910 mfsd13a (ENSONIG00000007906) SEMA4G (ENSONIG00000007902) mrpl43 (ENSONIG00000028203) twnk (ENSONIG00000007901) LZTS2 (ENSONIG00000007899) PDZD7 (ENSONIG00000007895) selenou1b (ENSONIG00000007893) ENSONIG00000040080 ENSONIG00000029634 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00950000182894.A.b.b ENSGT00950000182696.B.a.a.a ENSGT00940000154768.A.a.g.b ENSGT00940000153771.A ENSGT00940000154768.A.a.h ENSGT00940000158003 ENSGT01100000263520.a.a.a.b.b ENSGT00940000158833.a.b #19 ENSGT00390000005672.a.a #18 ENSGT00940000156584.e.a #17 ENSGT00940000163871.a #15 ENSGT00940000169501 ENSGT00390000011938 #11 ENSGT00940000155311.A.b #20 ENSGT00390000006956.a #21 ENSGT00950000183150.b #22 ENSGT00940000156447.a.a ENSGT00940000178451 ENSGT00440000033966 ENSGT00390000016262 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ENSGT00940000155311.A.b #20 ENSGT00390000006956.a #21 ENSGT00950000183150.b.a #22 ENSGT00940000156447.a.a ENSGT00940000178451 ENSGT00440000033966 ENSGT00390000016262 ENSGT00940000159871.b.a.a ENSGT00390000014892 ENSGT00950000182860.a.a.a.ub.b ENSGT00940000160317 ENSGT00940000157186.c ENSGT00390000015375 ENSGT00390000004495 ENSGT00940000154078.a.a.a ENSGT00950000183002.C.c.b ENSGT00940000165336.a.a.a ENSGT00940000171531 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1111 TEKT3 (ENSMZEG00005005280) PMP22 (ENSMZEG00005005295) hs3st3b1b (ENSMZEG00005005305) cox10 (ENSMZEG00005005321) ENSMZEG00005005336 ENSMZEG00005005362 ENSMZEG00005005598 PPP1R9B (ENSMZEG00005005608) #19 ENSMZEG00005005635 #18 col1a1b (ENSMZEG00005005660) #17 retsatl (ENSMZEG00005005721) #15 ENSMZEG00005005729 TMEM101 (ENSMZEG00005005738) #11 ENSMZEG00005005746 #20 lsm12b (ENSMZEG00005005754) #21 g6pc3 (ENSMZEG00005005766) #22 TANC2 (ENSMZEG00005005801) ENSMZEG00005005946 CNTD1 (ENSMZEG00005005953) coa3a (ENSMZEG00005005964) WNK4 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Haplochromini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183150.b.b #22 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183150.b.b #22 P. nyererei MODERN SPECIES 65 g6pc3 (ENSPNYG00000024057) #22 Midas cichlid MODERN SPECIES 1140 TEKT3 (ENSACIG00000009053) PMP22 (ENSACIG00000009004) hs3st3b1b (ENSACIG00000008950) cox10 (ENSACIG00000008913) ENSACIG00000008899 ENSACIG00000008787 prdm9 (ENSACIG00000008756) PPP1R9B (ENSACIG00000008730) #19 ENSACIG00000008697 #18 col1a1b (ENSACIG00000008616) #17 retsatl (ENSACIG00000008582) #15 ENSACIG00000008571 TMEM101 (ENSACIG00000008561) #11 ENSACIG00000008548 #20 lsm12b (ENSACIG00000008538) #21 g6pc3 (ENSACIG00000008525) #22 TANC2 (ENSACIG00000008467) CNTD1 (ENSACIG00000008429) coa3a (ENSACIG00000008410) ENSACIG00000008395 vps25 (ENSACIG00000008383) Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00950000182894.A.b.b ENSGT00950000182696.B.a.a.a ENSGT00940000154768.A.a.g.b ENSGT00940000153771.A ENSGT00940000154768.A.a.h ENSGT00940000158003 ENSGT01100000263520.a.a.a.b.b 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#21 g6pc3 (ENSMAMG00000004299) #22 ENSMAMG00000004355 ENSMAMG00000004660 coa3a (ENSMAMG00000004688) ENSMAMG00000004704 mfsd13a (ENSMAMG00000004731) SEMA4G (ENSMAMG00000004769) mrpl43 (ENSMAMG00000004808) twnk (ENSMAMG00000004814) LZTS2 (ENSMAMG00000004847) ENSMAMG00000004882 ENSMAMG00000024514 ENSMAMG00000004943 ENSMAMG00000004996 scn4aa (ENSMAMG00000005014) ENSMAMG00000005087 Carangaria ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00950000182894.A.b.b ENSGT00950000182696.B.a.a.a ENSGT00940000154768.A.a.g.b ENSGT00940000153771.A ENSGT00940000154768.A.a.h ENSGT00940000158003 ENSGT01100000263520.a.a.a.b.b ENSGT00940000158833.a.b #19 ENSGT00390000005672.a.a #18 ENSGT00940000156584.e.a #17 ENSGT00940000163871.a #15 ENSGT01100000263525.b.a ENSGT00390000011938 #11 ENSGT00940000155311.A.b #20 ENSGT00390000006956.a #21 ENSGT00950000183150.b #22 ENSGT00940000156447.a.a ENSGT00440000033966 ENSGT00390000016262 ENSGT00940000159871.b.a.a ENSGT00940000155474.o.a ENSGT00390000014892 ENSGT00950000182860.a.a.a.ub.b 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SPECIES 1 ENSGT00950000182894.A.b.b ENSGT00950000182696.B.a.a.a ENSGT00940000154768.A.a.g.b ENSGT00940000153771.A ENSGT00940000154768.A.a.h ENSGT00940000158003 ENSGT01100000263520.a.a.a.b.b ENSGT00940000158833.a.b #19 ENSGT00390000005672.a.a #18 ENSGT00940000156584.e.a #17 ENSGT00940000163871.a #15 ENSGT01100000263525.b.a ENSGT00390000011938 #11 ENSGT00940000155311.A.b #20 ENSGT00390000006956.a #21 ENSGT00950000183150.b #22 ENSGT00940000156447.a.a ENSGT00440000033966 ENSGT00390000016262 ENSGT00940000159871.b.a.a ENSGT00940000155474.o.a ENSGT00390000014892 ENSGT00950000182860.a.a.a.ub.b ENSGT00950000182860.a.a.a.vb ENSGT00940000160317 ENSGT00940000157186.c ENSGT00390000015375 ENSGT00390000004495 ENSGT00940000154078.a.a.a ENSGT01050000245040 ENSGT00950000183002.C.c.b Greater amberjack MODERN SPECIES 27 TEKT3 (ENSSDUG00000013157) PMP22 (ENSSDUG00000013149) hs3st3b1b (ENSSDUG00000013144) cox10 (ENSSDUG00000013109) ENSSDUG00000013097 ENSSDUG00000013069 ENSSDUG00000013048 PPP1R9B 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Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00950000182894.A.b.b ENSGT00950000182696.B.a.a.a ENSGT00940000154768.A.a.g.b.b ENSGT00940000153771.A ENSGT00940000154768.A.a.h ENSGT00940000158003 ENSGT00940000167583 ENSGT01100000263520.a.a.a.b.b ENSGT00940000158833.a.b #19 ENSGT00390000005672.a.a #18 ENSGT00940000156584.e.a #17 ENSGT00940000163871.a #15 ENSGT01100000263525.b.a ENSGT00390000011938 #11 ENSGT00390000006956.a #21 ENSGT00950000183150.b #22 ENSGT00940000156447.a.a ENSGT00440000033966 ENSGT00390000016262 ENSGT00940000159871.b.a.a ENSGT00390000014892 ENSGT00950000182860.a.a.a.ub.b ENSGT00940000160317 ENSGT00940000157186.c ENSGT00390000015375 ENSGT00390000004495 ENSGT00940000154078.a.a.a ENSGT00980000198953 ENSGT00950000183002.C.c.b ENSGT00940000165336.a.a.a ENSGT00940000177267 Turbot MODERN SPECIES 9 etv4 (ENSSMAG00000008436) meox1 (ENSSMAG00000035663) SOST (ENSSMAG00000008429) ENSSMAG00000008410 arl4d (ENSSMAG00000008394) tmem106a (ENSSMAG00000008371) nbr1a (ENSSMAG00000008345) 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ENSGT00950000182860.a.a.a.vb ENSGT00940000160317 ENSGT00940000157186.c ENSGT00390000015375 ENSGT00390000004495 ENSGT00940000154078.a.a.a ENSGT00980000198953 ENSGT00950000183002.C.c.b Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000161435.a.a ENSGT00950000182894.A.b.b ENSGT00950000182696.B.a.a.a ENSGT00940000154768.A.a.g.b ENSGT00940000153771.A ENSGT00940000154768.A.a.h ENSGT00940000158003 ENSGT00940000167583 ENSGT00940000158833.a.b #19 ENSGT00390000005672.a.a #18 ENSGT00940000156584.e.a #17 ENSGT00940000163871.a #15 ENSGT00940000169501 ENSGT00390000011938 #11 ENSGT00390000006956.a #21 ENSGT00950000183150.b #22 ENSGT00940000156447.a.a ENSGT00440000033966 ENSGT00390000016262 ENSGT00940000159871.b.a.a ENSGT00390000014892 ENSGT00950000182860.a.a.a.ub.b ENSGT00940000160317 ENSGT00940000157186.c ENSGT00390000015375 ENSGT00390000004495 ENSGT00940000154078.a.a.a ENSGT00950000183002.C.c.b ENSGT00980000198953 ENSGT00940000165336.a.a.a ENSGT00940000167352 Fugu MODERN SPECIES ENSTRUG00000031602 TEKT3 (ENSTRUG00000009763) PMP22 (ENSTRUG00000030648) hs3st3b1b (ENSTRUG00000028939) cox10 (ENSTRUG00000009462) ENSTRUG00000009368 ENSTRUG00000009358 ENSTRUG00000009314 PPP1R9B (ENSTRUG00000009156) #19 ENSTRUG00000009053 #18 col1a1b (ENSTRUG00000007520) #17 retsatl (ENSTRUG00000007302) #15 ENSTRUG00000032520 TMEM101 (ENSTRUG00000019702) #11 lsm12b (ENSTRUG00000007121) #21 g6pc3 (ENSTRUG00000031937) #22 TANC2 (ENSTRUG00000006868) CNTD1 (ENSTRUG00000006767) coa3a (ENSTRUG00000027823) WNK4 (ENSTRUG00000023028) vps25 (ENSTRUG00000006428) ARHGAP27 (ENSTRUG00000005700) mfsd13a (ENSTRUG00000005524) SEMA4G (ENSTRUG00000004957) mrpl43 (ENSTRUG00000026364) twnk (ENSTRUG00000004763) LZTS2 (ENSTRUG00000021658) PDZD7 (ENSTRUG00000004457) ENSTRUG00000025435 selenou1b (ENSTRUG00000004431) ENSTRUG00000030171 Tetraodon MODERN SPECIES 13 CDC42EP4 (ENSTNIG00000014450) TEKT3 (ENSTNIG00000014449) PMP22 (ENSTNIG00000014448) hs3st3b1b (ENSTNIG00000014447) cox10 (ENSTNIG00000014446) ENSTNIG00000014445 ENSTNIG00000014444 prdm9 (ENSTNIG00000014443) PPP1R9B (ENSTNIG00000014442) #19 SGCA (ENSTNIG00000014441) #18 col1a1b (ENSTNIG00000014440) #17 retsatl (ENSTNIG00000014439) #15 ENSTNIG00000014438 TMEM101 (ENSTNIG00000014437) #11 lsm12b (ENSTNIG00000014436) #21 g6pc3 (ENSTNIG00000014435) #22 TANC2 (ENSTNIG00000014434) ENSTNIG00000014433 vps25 (ENSTNIG00000014431) ENSTNIG00000014430 mfsd13a (ENSTNIG00000014429) SEMA4G (ENSTNIG00000014428) mrpl43 (ENSTNIG00000014427) twnk (ENSTNIG00000014426) LZTS2 (ENSTNIG00000014425) PDZD7 (ENSTNIG00000014424) selenou1b (ENSTNIG00000014423) scn4aa (ENSTNIG00000014422) ENSTNIG00000014421 ENSTNIG00000000742 ENSTNIG00000001092 Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00950000182894.A.b.b ENSGT00950000182696.B.a.a.a ENSGT00940000154768.A.a.g.b ENSGT00940000153771.A ENSGT00940000154768.A.a.h ENSGT00940000158003 ENSGT01100000263520.a.a.a.b.b ENSGT00940000158833.a.b #19 ENSGT00390000005672.a.a #18 ENSGT00940000156584.e.a #17 ENSGT00940000163871.a #15 ENSGT00940000169501 ENSGT00390000011938 #11 ENSGT00940000155311.A.b #20 ENSGT00390000006956.a #21 ENSGT00950000183150.b #22 ENSGT00940000156447.a.a ENSGT00530000063836.b ENSGT00440000033966 ENSGT00390000016262 ENSGT00940000159871.b.a.a ENSGT00390000014892 ENSGT00950000182860.a.a.a.ub.b ENSGT00950000182860.a.a.a.vb ENSGT00940000160317 ENSGT00940000157186.c ENSGT00390000015375 ENSGT00390000004495 ENSGT00940000154078.a.a.a ENSGT00980000198953 ENSGT00950000183002.C.c.b Ballan wrasse MODERN SPECIES 35 TEKT3 (ENSLBEG00000027767) PMP22 (ENSLBEG00000027780) hs3st3b1b (ENSLBEG00000027788) cox10 (ENSLBEG00000027797) ENSLBEG00000027803 ENSLBEG00000027814 ENSLBEG00000027840 PPP1R9B (ENSLBEG00000027871) #19 SGCA (ENSLBEG00000027888) #18 col1a1b (ENSLBEG00000027905) #17 retsatl (ENSLBEG00000027967) #15 ENSLBEG00000027980 TMEM101 (ENSLBEG00000027986) #11 ENSLBEG00000027995 #20 lsm12b (ENSLBEG00000027999) #21 g6pc3 (ENSLBEG00000028008) #22 TANC2 (ENSLBEG00000028021) CNTD1 (ENSLBEG00000028037) coa3a 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ENSGT00950000182860.a.a.a.vb ENSGT00940000160317 ENSGT00940000157186.c ENSGT00390000015375 ENSGT00390000004495 ENSGT00940000154078.a.a.a ENSGT00980000198953 ENSGT01050000245040 Channel bull blenny MODERN SPECIES 10 PMP22 (ENSCGOG00000014095) hs3st3b1b (ENSCGOG00000014090) cox10 (ENSCGOG00000014088) ENSCGOG00000014074 ENSCGOG00000014047 ENSCGOG00000014042 PPP1R9B (ENSCGOG00000013991) #19 SGCA (ENSCGOG00000013985) #18 col1a1b (ENSCGOG00000009581) #17 retsatl (ENSCGOG00000009324) #15 ENSCGOG00000009314 TMEM101 (ENSCGOG00000009312) #11 ENSCGOG00000009310 #20 ENSCGOG00000009307 #20 lsm12b (ENSCGOG00000009286) #21 g6pc3 (ENSCGOG00000009284) #22 TANC2 (ENSCGOG00000006808) ENSCGOG00000006721 coa3a (ENSCGOG00000006719) WNK4 (ENSCGOG00000006702) ENSCGOG00000006694 mfsd13a (ENSCGOG00000006561) SEMA4G (ENSCGOG00000006539) mrpl43 (ENSCGOG00000006536) twnk (ENSCGOG00000006535) LZTS2 (ENSCGOG00000006507) ENSCGOG00000006502 PDZD7 (ENSCGOG00000006488) selenou1b (ENSCGOG00000006478) ENSCGOG00000006474 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ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000161131.a.b ENSGT00950000182696.B.a.a.b.d.a ENSGT00950000182894.A.b.b ENSGT00940000154768.A.a.g.b.h.a ENSGT00940000153771.A.l ENSGT00940000154768.A.a.h.c ENSGT00940000158003 ENSGT00950000183052.b.c.b.a.f ENSGT00940000158833.a.b.e #19 ENSGT00390000005672.a.a #18 ENSGT00940000156584.e.a.f #17 ENSGT00940000163871.a #15 ENSGT00990000204445.b ENSGT00390000011938 #11 ENSGT00390000006956.a.c #21 ENSGT00950000183150.b #22 ENSGT00940000156447.a.a.a ENSGT00530000063836.b ENSGT00440000033966 ENSGT00390000016262.o ENSGT00940000159871.b.a.a.k.b.b ENSGT00390000014892.b ENSGT00950000182860.a.a.a.ub.b.i ENSGT00910000144305 ENSGT00940000166161 ENSGT00940000158427.i ENSGT00530000063168.b ENSGT00940000159781.a.e ENSGT00940000155172.o ENSGT01030000235370 ENSGT00550000075035.d.a Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000161131.a.b ENSGT00950000182696.B.a.a.b.d.a ENSGT00950000182894.A.b.b ENSGT00940000154768.A.a.g.b.h.a ENSGT00940000153771.A.l ENSGT00940000154768.A.a.h.c ENSGT00940000158003 ENSGT00950000183052.b.c.b.a.f ENSGT00940000158833.a.b.e #19 ENSGT00390000005672.a.a #18 ENSGT00940000156584.e.a.f #17 ENSGT00940000163871.a #15 ENSGT00990000204445.b ENSGT00390000011938 #11 ENSGT00390000006956.a.c #21 ENSGT00950000183150.b #22 ENSGT00940000156447.a.a.a ENSGT00530000063836.b ENSGT00440000033966 ENSGT00390000016262.o ENSGT00940000159871.b.a.a.k.b.b ENSGT00390000014892.b ENSGT00950000182860.a.a.a.ub.b.i ENSGT00910000144305 ENSGT00940000166161 ENSGT00940000158427.i ENSGT00530000063168.b ENSGT00940000159781.a.e ENSGT00940000155172.o ENSGT01030000235370 ENSGT00550000075035.d.a Coho salmon MODERN SPECIES 17 PMP22 (ENSOKIG00005007176) ENSOKIG00005007190 hs3st3b1b (ENSOKIG00005007202) cox10 (ENSOKIG00005007208) ENSOKIG00005007217 ENSOKIG00005007220 ENSOKIG00005007232 ENSOKIG00005007258 PPP1R9B (ENSOKIG00005007276) #19 SGCA (ENSOKIG00005007309) #18 col1a1b (ENSOKIG00005007321) #17 ENSOKIG00005007346 ENSOKIG00005007350 TMEM101 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ENSOMYG00000041063 PSMB1 (ENSOMYG00000041069) Huchen MODERN SPECIES 867 ENSHHUG00000009101 retsatl (ENSHHUG00000009065) #15 ENSHHUG00000009055 TMEM101 (ENSHHUG00000009050) #11 lsm12b (ENSHHUG00000009024) #21 g6pc3 (ENSHHUG00000009014) #22 TANC2 (ENSHHUG00000008702) ENSHHUG00000008680 CNTD1 (ENSHHUG00000008674) coa3a (ENSHHUG00000008670) ENSHHUG00000008650 ENSHHUG00000008635 ENSHHUG00000008632 ENSHHUG00000008631 vps25 (ENSHHUG00000008625) ENSHHUG00000008612 ENSHHUG00000008584 HLTF (ENSHHUG00000008450) ENSHHUG00000008439 Northern pike MODERN SPECIES 4 PMP22 (ENSELUG00000030148) TEKT3 (ENSELUG00000016180) slc6a11a (ENSELUG00000016152) hs3st3b1b (ENSELUG00000016102) cox10 (ENSELUG00000016089) ENSELUG00000016068 ENSELUG00000016039 ENSELUG00000000601 PPP1R9B (ENSELUG00000015912) #19 SGCA (ENSELUG00000015858) #18 col1a1b (ENSELUG00000015762) #17 retsatl (ENSELUG00000015589) #15 gngt2b (ENSELUG00000015568) TMEM101 (ENSELUG00000015554) #11 lsm12b (ENSELUG00000015538) #21 g6pc3 (ENSELUG00000015510) #22 TANC2 (ENSELUG00000015455) CNTD1 (ENSELUG00000015321) coa3a (ENSELUG00000029400) WNK4 (ENSELUG00000015307) vps25 (ENSELUG00000015272) ENSELUG00000015245 ENSELUG00000031579 HLTF (ENSELUG00000015109) ENSELUG00000015059 ppm1g (ENSELUG00000015032) fam120b (ENSELUG00000014975) dld (ENSELUG00000014957) phf10 (ENSELUG00000014927) psmb1 (ENSELUG00000014893) tbp (ENSELUG00000014852) Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 45 ENSGT01090000260005.a.b.a.a ENSGT00940000157539 ENSGT00940000164208 ENSGT00390000017328.a.b ENSGT00390000016438 ENSGT00940000160279.g ENSGT00940000167583 ENSGT00940000158833.a.b #19 ENSGT00390000005672.a.a #18 ENSGT00940000156584.e.a #17 ENSGT00940000163871.a #15 ENSGT01100000263525.b.a.p ENSGT00390000011938 #11 ENSGT00940000155311.A.b #20 ENSGT00390000006956.a #21 ENSGT00950000183150.b #22 ENSGT00940000156447.a.a ENSGT00440000033966 ENSGT00390000016262 ENSGT00940000159871.b.a.a ENSGT00390000014892 ENSGT00950000182860.a.a.a.ub.b ENSGT00940000155111 ENSGT00510000050089.a.b ENSGT00730000111991 ENSGT00940000154363.B ENSGT00940000167352 ENSGT00940000166534 ENSGT01030000234570.d.b.a.b.b.a.b ENSGT00530000063688.b.nb.a Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 236 ENSGT00940000154352.A ENSGT00940000165576.b.b.b ENSGT01090000260005.a.b.a.a ENSGT00940000157539 ENSGT00940000164208 ENSGT00390000017328.a.b ENSGT00390000016438 ENSGT00940000167583 ENSGT00940000158833.a.b #19 ENSGT00390000005672.a.a #18 ENSGT00940000156584.e.a.c #17 ENSGT00940000163871.a #15 ENSGT01100000263525.b.a.p ENSGT00390000011938 #11 ENSGT00390000006956.a #21 ENSGT00950000183150.b #22 ENSGT00940000156447.a.a ENSGT00390000016262 ENSGT00940000159871.b.a.a ENSGT00390000014892 ENSGT00950000182860.a.a.a.ub.b ENSGT00940000155111 ENSGT00940000156584.e.a.d #17 Denticle herring MODERN SPECIES 18 ENSDCDG00000020796 ENSDCDG00000021061 ENSDCDG00000032157 ENSDCDG00000032158 med24 (ENSDCDG00000032180) ENSDCDG00000032218 ENSDCDG00000032221 prdm9 (ENSDCDG00000032225) PPP1R9B (ENSDCDG00000032232) 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ENSGT00950000182987.c.a.a.lb.g.a ENSGT00940000154838.B.i.b.b ENSGT00940000157421.d Golden-line barbel DUPLICATION Golden-line barbel MODERN SPECIES 800 LRRC45 (ENSSGRG00000030007) dcxr (ENSSGRG00000029992) rfng (ENSSGRG00000029985) ENSSGRG00000029984 #18 col1a1b (ENSSGRG00000029961) #17 ENSSGRG00000029960 #15 gngt2b (ENSSGRG00000029959) TMEM101 (ENSSGRG00000029958) #11 ENSSGRG00000029957 #20 lsm12b (ENSSGRG00000029952) #21 g6pc3 (ENSSGRG00000029951) #22 TANC2 (ENSSGRG00000028618) CNTD1 (ENSSGRG00000028592) coa3a (ENSSGRG00000028591) ENSSGRG00000028589 vps25 (ENSSGRG00000028587) pagr1 (ENSSGRG00000028586) ENSSGRG00000028584 TAOK2 (ENSSGRG00000028286) cabp5a (ENSSGRG00000028284) nif3l1 (ENSSGRG00000028283) GDPD3 (ENSSGRG00000028282) tbx6 (ENSSGRG00000028281) zgc:92040 (ENSSGRG00000028280) eif3c (ENSSGRG00000027564) ppp4cb (ENSSGRG00000027007) Golden-line barbel MODERN SPECIES 5214 ENSSGRG00000004383 #22 Common carp reference MODERN SPECIES 44 prkar1ab (ENSCCRG00000006259) 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g6pc3 (ENSDARG00000020371) #22 TANC2 (ENSDARG00000107441) coa3a (ENSDARG00000100585) ENSDARG00000111945 vps25 (ENSDARG00000059079) pagr1 (ENSDARG00000076966) TLCD3B (ENSDARG00000074564) ENSDARG00000063555 ENSDARG00000100620 cabp5a (ENSDARG00000002576) nif3l1 (ENSDARG00000045249) ENSDARG00000006944 tbx6 (ENSDARG00000011785) zgc:92040 (ENSDARG00000021154) eif3c (ENSDARG00000016443) ppp4cb (ENSDARG00000076439) Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 43 ENSGT00940000159914 ENSGT00390000018386 ENSGT00940000165576.a.b ENSGT00940000157539 ENSGT00940000164208 ENSGT00940000153653.a.a.a ENSGT00390000017328 ENSGT00390000016438 ENSGT00940000160279 ENSGT00390000005672.a.a #18 ENSGT00940000156584.e.a #17 ENSGT00940000163871.a #15 ENSGT01100000263525.b.a.j ENSGT00390000011938 #11 ENSGT00390000006956.c #21 ENSGT00950000183150.b #22 ENSGT00940000160534 #23 ENSGT00950000183197.a ENSGT00940000156447.a.b ENSGT00940000156447.a.a ENSGT00440000033966 ENSGT00390000014892 ENSGT00940000159871.b.a.b.b ENSGT00390000016262 ENSGT00950000182860.a.a.a.ub.b ENSGT00940000155111 ENSGT00940000154363.B ENSGT00940000167352 ENSGT01100000264459 ENSGT00940000166534 ENSGT01030000234570.d.b.a.b.b.a.a.b P. kingsleyae MODERN SPECIES 181 dlx4b (ENSPKIG00000021603) ENSPKIG00000021578 kat7b (ENSPKIG00000021511) csf3a (ENSPKIG00000021465) med24 (ENSPKIG00000021411) SAMD14 (ENSPKIG00000021388) ENSPKIG00000021367 ENSPKIG00000021334 PPP1R9B (ENSPKIG00000021274) #19 SGCA (ENSPKIG00000021231) #18 col1a1b (ENSPKIG00000021151) #17 retsatl (ENSPKIG00000021116) #15 gngt2a (ENSPKIG00000021106) TMEM101 (ENSPKIG00000021086) #11 lsm12b (ENSPKIG00000021058) #21 g6pc3 (ENSPKIG00000021038) #22 HDAC5 (ENSPKIG00000020952) #23 cyb561 (ENSPKIG00000020881) ENSPKIG00000020848 Asian bonytongue MODERN SPECIES 18 TMEM101 (ENSSFOG00015032255) #11 lsm12b (ENSSFOG00015028951) #21 g6pc3 (ENSSFOG00015009580) #22 HDAC5 (ENSSFOG00015009531) #23 cyb561 (ENSSFOG00015009517) TANC2 (ENSSFOG00015024414) ENSSFOG00015009455 vps25 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ifnphi2 (ENSLOCG00000013177) rdm1 (ENSLOCG00000013179) gh1 (ENSLOCG00000013185) ENSLOCG00000013192 Reedfish MODERN SPECIES 5 kat7b (ENSECRG00000017085) dlx4b (ENSECRG00000017047) itga3b (ENSECRG00000013495) pdk2b (ENSECRG00000013026) SAMD14 (ENSECRG00000012989) ENSECRG00000012941 ENSECRG00000012907 SGCA (ENSECRG00000012891) #18 col1a1b (ENSECRG00000012828) #17 gngt2a (ENSECRG00000012799) ENSECRG00000012775 TMEM101 (ENSECRG00000012752) #11 nags (ENSECRG00000012734) #12 ENSECRG00000012714 #20 lsm12b (ENSECRG00000012692) #21 g6pc3 (ENSECRG00000012680) #22 HDAC5 (ENSECRG00000012646) #23 tut1 (ENSECRG00000012616) ENSECRG00000012595 ENSECRG00000012577 mpp2a (ENSECRG00000012535) #14 retsatl (ENSECRG00000012503) #15 ENSECRG00000012452 ccdc103 (ENSECRG00000012425) ENSECRG00000012399 cyb561 (ENSECRG00000012372) TANC2 (ENSECRG00000012277) ENSECRG00000012217 ENSECRG00000012196 vps25 (ENSECRG00000012183) WNK4 (ENSECRG00000012151) Elephant shark MODERN SPECIES 1573 znf281b (ENSCMIG00000007416) ENSCMIG00000007423 retsat.2 (ENSCMIG00000007428) ENSCMIG00000007433 hexim1 (ENSCMIG00000007442) ENSCMIG00000007445 ENSCMIG00000007446 ENSCMIG00000007449 ENSCMIG00000007450 mpp2a (ENSCMIG00000007456) #14 ppy (ENSCMIG00000007465) nags (ENSCMIG00000007466) #12 TMEM101 (ENSCMIG00000007468) #11 ENSCMIG00000007469 #20 lsm12b (ENSCMIG00000007471) #21 g6pc3 (ENSCMIG00000007473) #22 HDAC5 (ENSCMIG00000007629) #23 ENSCMIG00000008125 ENSCMIG00000008129 ENSCMIG00000008131 selenow2a (ENSCMIG00000008138) GRB7 (ENSCMIG00000008147) ENSCMIG00000008156 ENSCMIG00000008158 ENSCMIG00000008162 ENSCMIG00000008164 ERBB2 (ENSCMIG00000008177) pgap3 (ENSCMIG00000008226) PNMT (ENSCMIG00000008230) ENSCMIG00000008234 zgc:91968 (ENSCMIG00000008239) Cyclostomata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183150.b #22 Hagfish MODERN SPECIES 1465 ENSEBUG00000017038 arl4ab (ENSEBUG00000005056) ENSEBUG00000016189 ENSEBUG00000001345 ENSEBUG00000011597 ENSEBUG00000014185 ENSEBUG00000014026 ENSEBUG00000004321 #22 ENSEBUG00000006476 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(ENSPMAG00000002488) ##22 Gnathostomata DUPLICATION Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183150.a.a ##22 Elephant shark MODERN SPECIES 2065 ENSCMIG00000008696 ENSCMIG00000008695 ##22 becn1 (ENSCMIG00000008639) CNTD1 (ENSCMIG00000008618) Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 270 ENSGT00950000183098.a ENSGT00950000183207.b ENSGT00950000183150.a.a ##22 ENSGT00960000193113 ENSGT00940000156241 ENSGT00940000163448 ENSGT00390000007311 ENSGT00390000010721.b ENSGT00530000063686.b ENSGT00940000154578.A.c.b ENSGT00940000157579 ENSGT00940000157020 ENSGT00440000034289 ENSGT00970000197525 Actinopterygii DUPLICATION Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES 95 ENSGT00390000012062 ENSGT00940000157190 ENSGT00940000154628.C ENSGT00940000163612 ENSGT00390000014900.b.b.b ENSGT00940000154018.a ENSGT00940000158142 ENSGT00940000155510 ENSGT00940000161341.a.a ENSGT00950000183150.a.a.b ##22 ENSGT00950000183098.a.a ENSGT00950000183207.b ENSGT00950000183150.a.a.a ##22 ENSGT00940000156241 ENSGT00940000163448 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ENSGT00390000000221.B ENSGT00440000033408.b.b ENSGT00940000154775.c.a.a.a ENSGT00940000157509.b ENSGT00940000155111 ENSGT00510000050089.a.b ENSGT00730000111991 ENSGT00940000167352 ENSGT00940000176991 Greater amberjack MODERN SPECIES 27 nsfb (ENSSDUG00000010622) wnt3 (ENSSDUG00000010720) ormdl3 (ENSSDUG00000010734) ENSSDUG00000010747 DHX8 (ENSSDUG00000010774) ENSSDUG00000010822 etv4 (ENSSDUG00000010855) meox1 (ENSSDUG00000010898) SOST (ENSSDUG00000010910) ENSSDUG00000010917 arl4d (ENSSDUG00000010935) tmem106a (ENSSDUG00000010957) nbr1a (ENSSDUG00000010995) psme3 (ENSSDUG00000011048) g6pc1a.1 (ENSSDUG00000011104) ##22 g6pc1a.2 (ENSSDUG00000011228) ##22 ENSSDUG00000011244 ANK3 (ENSSDUG00000011307) MFAP4 (ENSSDUG00000011686) acsl5 (ENSSDUG00000011735) ENSSDUG00000011775 tectb (ENSSDUG00000011824) ENSSDUG00000011834 plxdc1 (ENSSDUG00000011843) LASP1 (ENSSDUG00000011857) ENSSDUG00000011872 plekhm1 (ENSSDUG00000011890) ENSSDUG00000011909 ENSSDUG00000011933 ENSSDUG00000012038 ENSSDUG00000012115 Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 2773 meox1 (ENSSLDG00000005556) SOST (ENSSLDG00000005577) ENSSLDG00000005602 arl4d (ENSSLDG00000005628) tmem106a (ENSSLDG00000005648) nbr1a (ENSSLDG00000005676) psme3 (ENSSLDG00000005747) g6pc1a.1 (ENSSLDG00000005806) ##22 g6pc1a.2 (ENSSLDG00000005823) ##22 ENSSLDG00000005839 ENSSLDG00000005860 ENSSLDG00000005914 MFAP4 (ENSSLDG00000006029) acsl5 (ENSSLDG00000006082) ENSSLDG00000006168 tectb (ENSSLDG00000006278) ENSSLDG00000006299 plxdc1 (ENSSLDG00000006315) LASP1 (ENSSLDG00000006339) ENSSLDG00000006370 plekhm1 (ENSSLDG00000006403) ENSSLDG00000006456 ENSSLDG00000006669 scn4aa (ENSSLDG00000006707) Barramundi perch DUPLICATION Barramundi perch DUPLICATION Barramundi perch MODERN SPECIES 86 ENSLCAG00010027966 ENSLCAG00010027965 DHX8 (ENSLCAG00010027963) ENSLCAG00010027960 etv4 (ENSLCAG00010027957) meox1 (ENSLCAG00010027954) SOST (ENSLCAG00010027953) ENSLCAG00010027952 tmem106a (ENSLCAG00010027950) nbr1a (ENSLCAG00010027948) psme3 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23 ENSGT00530000063301.a.a.c.a ENSGT00530000064085.c ENSGT00940000157854 ENSGT00950000183178.b.b.b ENSGT00940000157917.b ENSGT00940000155510.g.b ENSGT00940000158142 ENSGT00940000154018.a ENSGT00390000014900.b.b.b ENSGT00940000162682.B.a ENSGT00940000161341.a.a ENSGT00940000166248.a ENSGT00390000016335.h ENSGT00950000183098.a.b ENSGT00950000183150.a.a.b ##22 ENSGT00950000183150.a.a.a.c ##22 ENSGT00940000154939.e.a ENSGT00940000154615.i.b ENSGT00940000156651 ENSGT00940000163069 ENSGT00940000159064 ENSGT00390000000221.B ENSGT00440000033408.b.b ENSGT00940000154775.c.a.a.a ENSGT00940000157509.b.b ENSGT00940000157509.b.a ENSGT00940000155111 ENSGT00510000050089.a.b ENSGT00730000111991 ENSGT00940000176991 ENSGT00940000167352 Fugu MODERN SPECIES cdk5r1b (ENSTRUG00000001984) psmd11b (ENSTRUG00000002031) wnt3 (ENSTRUG00000003564) nsfb (ENSTRUG00000002989) ormdl3 (ENSTRUG00000033478) ENSTRUG00000004063 etv4 (ENSTRUG00000004727) meox1 (ENSTRUG00000005193) ENSTRUG00000003867 ENSTRUG00000005294 arl4d 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ENSGT00950000183150.a.a.a.c ##22 ENSGT00950000183052.b.c.b.b.a.a.b.a.b.a ENSGT01100000263491.a.a.d ENSGT00940000154939.e.a ENSGT00940000154615.i.b ENSGT00940000156651 ENSGT00940000163069 ENSGT00940000159064 ENSGT00390000000221.B ENSGT00440000033408.b.b ENSGT00940000154775.c.a.a.a ENSGT00940000157509.b ENSGT00940000155111 ENSGT00510000050089.a.b ENSGT00730000111991 ENSGT00940000176991 Perciformes ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00530000063301.a.a.c.a ENSGT00530000064085.c ENSGT00940000157854 ENSGT00950000183178.b.b.b ENSGT00940000157917.b ENSGT00940000155510 ENSGT00940000158142 ENSGT00940000154018.a ENSGT00390000014900.b.b.b ENSGT00940000163612 ENSGT00940000161341.a.a ENSGT00940000166248.a ENSGT00390000016335.h ENSGT00950000183098.a.b ENSGT00950000183150.a.a.b ##22 ENSGT00950000183150.a.a.a.c ##22 ENSGT01100000263491.a.a.d ENSGT00940000154939.e.a ENSGT00940000156651 ENSGT00940000163069 ENSGT00940000159064 ENSGT00390000000221.B ENSGT00440000033408.b.b ENSGT00940000154775.c.a.a.a ENSGT00940000157509.b ENSGT00940000155111 ENSGT00510000050089.a.b ENSGT00730000111991 ENSGT00940000167352 ENSGT00940000176991 ENSGT00940000171531 Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00530000063301.a.a.c.a ENSGT00530000064085.c ENSGT00940000157854 ENSGT00950000183178.b.b.b ENSGT00940000157917.b ENSGT00940000155510 ENSGT00940000158142 ENSGT00940000154018.a ENSGT00390000014900.b.b.b ENSGT00940000163612 ENSGT00940000161341.a.a ENSGT00940000166248.a ENSGT00390000016335.h ENSGT00950000183098.a.b ENSGT00950000183150.a.a.b ##22 ENSGT00950000183150.a.a.a.c ##22 ENSGT00950000183052.b.c.b.b.a.a.b.a.b.a ENSGT00940000154939.e.a ENSGT00940000156651 ENSGT00940000163069 ENSGT00940000159064 ENSGT00390000000221.B ENSGT00440000033408.b.b ENSGT00940000154775.c.a.a.a ENSGT00940000157509.b ENSGT00940000155111 ENSGT00510000050089.a.b ENSGT00730000111991 ENSGT00940000167352 ENSGT00940000176991 ENSGT00940000171531 Pike perch MODERN SPECIES 3 nsfb (ENSSLUG00000008134) wnt3 (ENSSLUG00000010232) ormdl3 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ENSGT00940000176991 ENSGT00940000167352 Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00530000064085.c ENSGT00940000157854 ENSGT00950000183178.b.b.b ENSGT00940000157917.b ENSGT00940000155510 ENSGT00940000158142 ENSGT00940000154018.a ENSGT00390000014900.b.b.b ENSGT00940000163612 ENSGT00940000162682.B.a ENSGT00940000161341.a.a ENSGT00940000166248.a ENSGT00390000016335.h ENSGT00950000183098.a.b ENSGT00950000183150.a.a.b ##22 ENSGT00950000183150.a.a.a.c ##22 ENSGT00940000154939.e.a ENSGT00940000154615.i.b ENSGT00940000156651 ENSGT00940000163069 ENSGT00940000159064 ENSGT00390000000221.B ENSGT00440000033408.b.b ENSGT00940000154775.c.a.a.a ENSGT00940000157509.b ENSGT00940000155111 ENSGT00510000050089.a.b ENSGT00730000111991 ENSGT00940000176991 ENSGT00940000167352 ENSGT00940000177267 Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00530000064085.c ENSGT00940000157854 ENSGT00950000183178.b.b.b ENSGT00940000157917.b ENSGT00940000155510 ENSGT00940000158142 ENSGT00940000154018.a ENSGT00390000014900.b.b.b 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(ENSNFUG00015023894) ENSNFUG00015023902 ENSNFUG00015023945 ENSNFUG00015023959 ENSNFUG00015023974 scn4aa (ENSNFUG00015023985) ENSNFUG00015024104 OMG (ENSNFUG00015024108) Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00530000064085.c ENSGT00940000157854 ENSGT00950000183178.b.b.b ENSGT00940000157917.b ENSGT00940000155510 ENSGT00940000158142 ENSGT00940000154018.a ENSGT00390000014900.b.b.b ENSGT00940000163612 ENSGT00940000162682.B.a ENSGT00940000161341.a.a ENSGT00940000166248.a ENSGT00390000016335.h ENSGT00950000183098.a.b ENSGT00950000183150.a.a.b ##22 ENSGT00950000183150.a.a.a.c ##22 ENSGT00940000154939.e.a.l ENSGT00940000154615.i.b ENSGT00940000156651 ENSGT00940000163069 ENSGT00940000159064 ENSGT00390000000221.B ENSGT00440000033408.b.b ENSGT00940000154775.c.a.a.a ENSGT00940000157509.b ENSGT00940000155111 ENSGT00510000050089.a.b.i ENSGT00510000050089.a.b.j ENSGT00730000111991 ENSGT00940000176991 ENSGT00940000167352 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00530000064085.c ENSGT00940000157854 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ENSGT00530000064085.c ENSGT00940000157854 ENSGT00950000183178.b.b.b ENSGT00940000157917.b ENSGT00940000155510 ENSGT00940000158142 ENSGT00940000154018.a ENSGT00390000014900.b.b.b ENSGT00940000161341.a.a ENSGT00940000166248.a ENSGT00390000016335.h ENSGT00950000183098.a.b ENSGT00950000183150.a.a.b ##22 ENSGT00950000183150.a.a.a.c ##22 ENSGT00930000151032.B ENSGT00940000157982.a.a ENSGT00940000160739 ENSGT00940000156993.c ENSGT00950000183187.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00940000164472.a.a.b.b.a.a.b.a.a.a.a.b.b ENSGT00940000160084.h ENSGT00940000160175.a ENSGT00390000014794.b.k ENSGT00940000160595.a.b ENSGT00940000161899 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000154939.e.a ENSGT00940000156651 Indian medaka MODERN SPECIES 459 KHDRBS3 (ENSOMEG00000012585) ENSOMEG00000012600 ENSOMEG00000012609 ENSOMEG00000012620 ENSOMEG00000012652 ENSOMEG00000012676 g6pc1a.1 (ENSOMEG00000012694) ##22 g6pc1a.2 (ENSOMEG00000012746) ##22 ENSOMEG00000012862 ENSOMEG00000013082 acbd4 (ENSOMEG00000013138) PLCD3 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Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 52 ENSGT00390000008812.b.b.a ENSGT00530000063301.a.a.c.a ENSGT00530000064085.c ENSGT00940000157854 ENSGT00950000183178.b.b.b ENSGT00940000157917.b ENSGT00940000155510 ENSGT00940000158142 ENSGT00940000154018.a ENSGT00390000014900.b.b.b ENSGT00940000162682.B.a ENSGT00940000166248.a ENSGT00390000016335.h ENSGT00950000183098.a.b ENSGT00950000183150.a.a.b ##22 ENSGT00950000183150.a.a.a.c ##22 ENSGT00930000151032.B ENSGT00940000157982.a.a ENSGT00940000160739 ENSGT00940000156993.c.d.a ENSGT00950000183187.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00940000160084.h ENSGT00940000160175.a ENSGT00940000160595.a.b ENSGT00940000166756.t.b ENSGT00940000154289.B.e.b Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 10 psmd11b (ENSORLG00000012079) nsfb (ENSORLG00000012044) wnt3 (ENSORLG00000012027) ormdl3 (ENSORLG00000027713) ENSORLG00000025859 thra (ENSORLG00000012005) DHX8 (ENSORLG00000011951) etv4 (ENSORLG00000011909) meox1 (ENSORLG00000011858) SOST (ENSORLG00000028572) ENSORLG00000025889 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(ENSOSIG00000016932) PLCD3 (ENSOSIG00000016947) galk1 (ENSOSIG00000017054) llgl2 (ENSOSIG00000017066) Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00530000063301.a.a.c.a ENSGT00530000064085.c ENSGT00940000157854 ENSGT00950000183178.b.b.b ENSGT00940000157917.b ENSGT00940000155510 ENSGT00940000158142 ENSGT00940000154018.a ENSGT00390000014900.b.b.b ENSGT00940000162682.B.a ENSGT00940000161341.a.a ENSGT00940000166248.a ENSGT00390000016335.h ENSGT00950000183098.a.b ENSGT00950000183150.a.a.b ##22 ENSGT00950000183150.a.a.a.c ##22 ENSGT01100000263491.a.a.d ENSGT00940000154939.e.a ENSGT00940000154615.i.b ENSGT00940000156651 ENSGT00940000163069 ENSGT00940000159064 ENSGT00390000000221.B ENSGT00440000033408.b.b ENSGT00940000154775.c.a.a.a ENSGT00940000157509.b ENSGT00940000155111 ENSGT00510000050089.a.b ENSGT00730000111991 ENSGT00940000167352 ENSGT00940000176991 Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00530000063301.a.a.c.a ENSGT00530000064085.c ENSGT00940000157854 ENSGT00950000183178.b.b.b ENSGT00940000157917.b ENSGT00940000155510 ENSGT00940000158142 ENSGT00940000154018.a ENSGT00390000014900.b.b.b ENSGT00940000162682.B.a ENSGT00940000161341.a.a ENSGT00940000166248.a ENSGT00390000016335.h ENSGT00950000183098.a.b ENSGT00950000183150.a.a.b ##22 ENSGT00950000183150.a.a.a.c ##22 ENSGT01100000263491.a.a.d ENSGT00940000154939.e.a ENSGT00940000154615.i.b ENSGT00940000156651 ENSGT00940000163069 ENSGT00940000159064 ENSGT00390000000221.B ENSGT00440000033408.b.b ENSGT00940000154775.c.a.a.a ENSGT00940000157509.b ENSGT00940000155111 ENSGT00510000050089.a.b.a ENSGT00730000111991 ENSGT00940000167352 ENSGT00940000176991 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00530000063301.a.a.c.a ENSGT00530000064085.c ENSGT00940000157854 ENSGT00950000183178.b.b.b ENSGT00940000157917.b ENSGT00940000155510 ENSGT00940000158142 ENSGT00940000154018.a ENSGT00390000014900.b.b.b ENSGT00940000162682.B.a ENSGT00940000161341.a.a ENSGT00940000166248.a ENSGT00390000016335.h ENSGT00950000183098.a.b 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ENSGT00390000000221.B ENSGT00440000033408.b.b ENSGT00940000154775.c.a.a.a ENSGT00940000157509.b ENSGT00940000155111 ENSGT00510000050089.a.b.b.b ENSGT00510000050089.a.b.a.a.a.b ENSGT00510000050089.a.b.a.a.b ENSGT00730000111991 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00530000063301.a.a.c.a ENSGT00530000064085.c ENSGT00940000157854 ENSGT00950000183178.b.b.b ENSGT00940000157917.b ENSGT00940000155510 ENSGT00940000158142 ENSGT00940000154018.a ENSGT00390000014900.b.b.b ENSGT00940000162682.B.a ENSGT00940000161341.a.a ENSGT00940000166248.a ENSGT00390000016335.h ENSGT00950000183098.a.b ENSGT00950000183150.a.a.b ##22 ENSGT00950000183150.a.a.a.c ##22 ENSGT01100000263491.a.a.d ENSGT00940000154939.e.a ENSGT00940000154615.i.b ENSGT00940000156651 ENSGT00940000163069 ENSGT00940000159064 ENSGT00390000000221.B ENSGT00440000033408.b.b ENSGT00940000154775.c.a.a.a ENSGT00940000157509.b ENSGT00940000155111 ENSGT00510000050089.a.b.b.b ENSGT00510000050089.a.b.a.a.a.a ENSGT00510000050089.a.b.a.b.a ENSGT00510000050089.a.b.a.a.a.b Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00530000063301.a.a.c.a ENSGT00530000064085.c ENSGT00940000157854 ENSGT00950000183178.b.b.b ENSGT00940000157917.b ENSGT00940000155510 ENSGT00940000158142 ENSGT00940000154018.a ENSGT00390000014900.b.b.b ENSGT00940000162682.B.a ENSGT00940000161341.a.a ENSGT00940000166248.a ENSGT00390000016335.h ENSGT00950000183098.a.b ENSGT00950000183150.a.a.b ##22 ENSGT00950000183150.a.a.a.c ##22 ENSGT01100000263491.a.a.d ENSGT00940000154939.e.a ENSGT00940000154615.i.b ENSGT00940000156651 ENSGT00940000163069 ENSGT00940000159064 ENSGT00390000000221.B ENSGT00440000033408.b.b ENSGT00940000154775.c.a.a.a ENSGT00940000157509.b ENSGT00940000155111 ENSGT00510000050089.a.b.b.b ENSGT00510000050089.a.b.a.b.b.b ENSGT00510000050089.a.b.a.a.a.a ENSGT00510000050089.a.b.a.b.a P. nyererei MODERN SPECIES 312 psmd11b (ENSPNYG00000001168) nsfb (ENSPNYG00000001221) wnt3 (ENSPNYG00000001306) ormdl3 (ENSPNYG00000001323) ENSPNYG00000001343 DHX8 (ENSPNYG00000001365) etv4 (ENSPNYG00000001425) meox1 (ENSPNYG00000001478) SOST (ENSPNYG00000001488) ENSPNYG00000001494 arl4d (ENSPNYG00000001516) tmem106a (ENSPNYG00000001555) nbr1a (ENSPNYG00000001625) psme3 (ENSPNYG00000001636) g6pc1a.1 (ENSPNYG00000001674) ##22 g6pc1a.2 (ENSPNYG00000001678) ##22 ENSPNYG00000001708 ANK3 (ENSPNYG00000001733) MFAP4 (ENSPNYG00000001822) acsl5 (ENSPNYG00000001855) ENSPNYG00000001917 tectb (ENSPNYG00000001978) ENSPNYG00000002010 plxdc1 (ENSPNYG00000002037) ENSPNYG00000002132 plekhm1 (ENSPNYG00000002171) ENSPNYG00000002188 ENSPNYG00000002295 ENSPNYG00000002315 ENSPNYG00000002340 ENSPNYG00000002516 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00530000064085.c ENSGT00940000157854 ENSGT00950000183178.b.b.b ENSGT00940000157917.b ENSGT00940000155510 ENSGT00940000158142 ENSGT00940000154018.a ENSGT00390000014900.b.b.b ENSGT00940000163612 ENSGT00940000162682.B.a ENSGT00940000161341.a.a ENSGT00940000166248.a ENSGT00390000016335.h ENSGT00950000183098.a.b ENSGT00950000183150.a.a.b ##22 ENSGT00950000183150.a.a.a.c ##22 ENSGT00940000179946 ENSGT00940000154939.e.a ENSGT00940000154615.i.b ENSGT00940000156651 ENSGT00940000163069 ENSGT00940000159064 ENSGT00390000000221.B ENSGT00440000033408.b.b ENSGT00940000154775.c.a.a.a ENSGT00940000157509.b ENSGT00940000155111 ENSGT00510000050089.a.b.b.b ENSGT00510000050089.a.b.b.a.a ENSGT00510000050089.a.b.a.b.b.a.a ENSGT00510000050089.a.b.b.a.b Eastern happy MODERN SPECIES 20 psmd11b (ENSACLG00000024496) nsfb (ENSACLG00000024545) wnt3 (ENSACLG00000024697) ormdl3 (ENSACLG00000024712) ENSACLG00000024723 DHX8 (ENSACLG00000024759) etv4 (ENSACLG00000024826) meox1 (ENSACLG00000024838) SOST (ENSACLG00000024850) ENSACLG00000024978 arl4d (ENSACLG00000024991) tmem106a (ENSACLG00000025007) nbr1a (ENSACLG00000025016) psme3 (ENSACLG00000025057) g6pc1a.1 (ENSACLG00000025091) ##22 g6pc1a.2 (ENSACLG00000025100) ##22 ENSACLG00000025125 ANK3 (ENSACLG00000025143) MFAP4 (ENSACLG00000025253) acsl5 (ENSACLG00000025260) ENSACLG00000025409 tectb (ENSACLG00000025428) ENSACLG00000025441 plxdc1 (ENSACLG00000025445) ENSACLG00000025470 ENSACLG00000025493 plekhm1 (ENSACLG00000025510) ENSACLG00000025546 ENSACLG00000025584 ENSACLG00000025609 ENSACLG00000025627 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1111 psmd11b (ENSMZEG00005007703) nsfb (ENSMZEG00005007665) wnt3 (ENSMZEG00005007648) ormdl3 (ENSMZEG00005007633) ENSMZEG00005007617 DHX8 (ENSMZEG00005007559) etv4 (ENSMZEG00005007459) meox1 (ENSMZEG00005007440) SOST (ENSMZEG00005007434) DUSP3 (ENSMZEG00005007412) arl4d (ENSMZEG00005007392) tmem106a (ENSMZEG00005007383) nbr1a (ENSMZEG00005007368) psme3 (ENSMZEG00005007339) g6pc1a.1 (ENSMZEG00005007323) ##22 g6pc1a.2 (ENSMZEG00005007297) ##22 ENSMZEG00005007286 ANK3 (ENSMZEG00005007233) MFAP4 (ENSMZEG00005007219) acsl5 (ENSMZEG00005007171) ENSMZEG00005007124 tectb (ENSMZEG00005007107) ENSMZEG00005007086 plxdc1 (ENSMZEG00005007068) ENSMZEG00005007041 ENSMZEG00005007025 plekhm1 (ENSMZEG00005007010) ENSMZEG00005006974 ENSMZEG00005006831 ENSMZEG00005006682 ENSMZEG00005006661 Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 274 psmd11b (ENSHBUG00000005413) wnt3 (ENSHBUG00000000764) nsfb (ENSHBUG00000005476) ormdl3 (ENSHBUG00000005502) ENSHBUG00000005555 DHX8 (ENSHBUG00000005644) etv4 (ENSHBUG00000005707) meox1 (ENSHBUG00000005729) SOST (ENSHBUG00000005750) ENSHBUG00000005769 arl4d (ENSHBUG00000005802) tmem106a (ENSHBUG00000005810) nbr1a (ENSHBUG00000005825) psme3 (ENSHBUG00000005878) g6pc1a.1 (ENSHBUG00000005914) ##22 g6pc1a.2 (ENSHBUG00000000147) ##22 ENSHBUG00000005951 ENSHBUG00000005987 ENSHBUG00000006053 MFAP4 (ENSHBUG00000006065) acsl5 (ENSHBUG00000006119) ENSHBUG00000006163 tectb (ENSHBUG00000006171) ENSHBUG00000006180 plxdc1 (ENSHBUG00000006183) ENSHBUG00000006192 ENSHBUG00000006205 plekhm1 (ENSHBUG00000006225) ENSHBUG00000006241 ENSHBUG00000006297 ENSHBUG00000006423 Lyretail cichlid MODERN SPECIES 317 MYO1D (ENSNBRG00000023297) cdk5r1b (ENSNBRG00000023289) psmd11b (ENSNBRG00000023279) nsfb (ENSNBRG00000023269) wnt3 (ENSNBRG00000023262) ormdl3 (ENSNBRG00000023254) ENSNBRG00000023244 DHX8 (ENSNBRG00000023205) etv4 (ENSNBRG00000023116) meox1 (ENSNBRG00000023086) ENSNBRG00000023080 tmem106a (ENSNBRG00000023055) nbr1a (ENSNBRG00000023045) psme3 (ENSNBRG00000023031) g6pc1a.1 (ENSNBRG00000023025) ##22 g6pc1a.2 (ENSNBRG00000023016) ##22 ANK3 (ENSNBRG00000022983) MFAP4 (ENSNBRG00000022967) acsl5 (ENSNBRG00000022946) ENSNBRG00000022922 tectb (ENSNBRG00000022906) ENSNBRG00000022895 plxdc1 (ENSNBRG00000022848) LASP1 (ENSNBRG00000022834) plekhm1 (ENSNBRG00000022819) ENSNBRG00000022811 ENSNBRG00000022803 Nile tilapia MODERN SPECIES 20 psmd11b (ENSONIG00000018238) nsfb (ENSONIG00000018240) wnt3 (ENSONIG00000027851) ormdl3 (ENSONIG00000041840) ENSONIG00000018247 DHX8 (ENSONIG00000018248) etv4 (ENSONIG00000018249) meox1 (ENSONIG00000018256) sost (ENSONIG00000036894) ENSONIG00000018260 arl4d (ENSONIG00000043081) tmem106a (ENSONIG00000018261) nbr1a (ENSONIG00000018263) psme3 (ENSONIG00000018267) g6pc1a.1 (ENSONIG00000018270) ##22 g6pc1a.2 (ENSONIG00000018273) ##22 ANK3 (ENSONIG00000018274) MFAP4 (ENSONIG00000030050) acsl5 (ENSONIG00000018282) ENSONIG00000018285 tectb (ENSONIG00000018289) ENSONIG00000027818 plxdc1 (ENSONIG00000018292) ENSONIG00000018295 ENSONIG00000018297 plekhm1 (ENSONIG00000018298) ENSONIG00000039157 ENSONIG00000042788 ENSONIG00000018301 ENSONIG00000042494 ENSONIG00000031475 Midas cichlid MODERN SPECIES 113 psmd11b (ENSACIG00000013064) nsfb (ENSACIG00000013096) wnt3 (ENSACIG00000013133) ormdl3 (ENSACIG00000013146) ENSACIG00000013155 DHX8 (ENSACIG00000013170) etv4 (ENSACIG00000013230) meox1 (ENSACIG00000013325) SOST (ENSACIG00000013335) ENSACIG00000013348 arl4d (ENSACIG00000013359) tmem106a (ENSACIG00000013382) nbr1a (ENSACIG00000013439) psme3 (ENSACIG00000013533) g6pc1a.1 (ENSACIG00000013554) ##22 g6pc1a.2 (ENSACIG00000013563) ##22 Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 41 ENSGT00390000008812.b.b.a ENSGT00530000063301.a.a.c.a ENSGT00530000064085.c ENSGT00940000157854 ENSGT00950000183178.b.b.b ENSGT00940000157917.b ENSGT00940000155510 ENSGT00940000158142 ENSGT00940000154018.a ENSGT00390000014900.b.b.b ENSGT00940000162682.B.a ENSGT00940000166248.a ENSGT00390000016335.h ENSGT00950000183098.a.b ENSGT00950000183150.a.a.b ##22 ENSGT00950000183150.a.a.a.c ##22 ENSGT00940000154939.e.a ENSGT00940000154615.i.b ENSGT00940000156651 ENSGT00940000163069 ENSGT00940000159064 ENSGT00390000000221.B ENSGT00440000033408.b.b ENSGT00940000154775.c.a.a.a ENSGT00940000157509.b ENSGT00940000155111 ENSGT00940000158710 Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 39 ENSGT00390000008812.b.b.a ENSGT00530000063301.a.a.c.a ENSGT00530000064085.c ENSGT00940000157854 ENSGT00950000183178.b.b.b ENSGT00940000157917.b ENSGT00940000155510 ENSGT00940000158142 ENSGT00940000154018.a ENSGT00390000014900.b.b.b ENSGT00940000162682.B.a ENSGT00940000166248.a ENSGT00390000016335.h ENSGT00950000183098.a.b ENSGT00950000183150.a.a.b ##22 ENSGT00950000183150.a.a.a.c ##22 ENSGT00940000154939.e.a ENSGT00940000154615.i.b ENSGT00940000156651 ENSGT00940000163069 ENSGT00940000159064 ENSGT00390000000221.B ENSGT00440000033408.b.b ENSGT00940000154775.c.a.a.a ENSGT00940000157509.b ENSGT00940000155111 ENSGT00940000158710 ENSGT00390000012745 ENSGT00940000165932 Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 59 ENSGT00390000008812.b.b.a ENSGT00530000063301.a.a.c.a ENSGT00530000064085.c ENSGT00940000157854 ENSGT00950000183178.b.b.b ENSGT00940000157917.b ENSGT00940000155510 ENSGT00940000158142 ENSGT00940000154018.a ENSGT00390000014900.b.b.b ENSGT00940000162682.B.a ENSGT00940000166248.a ENSGT00390000016335.h ENSGT00950000183098.a.b ENSGT00950000183150.a.a.b ##22 ENSGT00950000183150.a.a.a.c ##22 ENSGT00940000154939.e.a ENSGT00940000154615.i.b ENSGT00940000156651 ENSGT00940000163069 ENSGT00940000159064 ENSGT00390000000221.B ENSGT00440000033408.b.b ENSGT00940000154775.c.a.a.a ENSGT00940000157509.b ENSGT00940000155111 ENSGT00940000158710 ENSGT00390000012745.e ENSGT00940000165932 Clown anemonefish MODERN SPECIES 848 SOST (ENSAOCG00000023986) DUSP3 (ENSAOCG00000023997) tmem106a (ENSAOCG00000024033) nbr1a (ENSAOCG00000024050) psme3 (ENSAOCG00000024072) g6pc1a.1 (ENSAOCG00000024083) ##22 g6pc1a.2 (ENSAOCG00000024094) ##22 Orange clownfish MODERN SPECIES 10 nsfb (ENSAPEG00000005478) wnt3 (ENSAPEG00000005543) ormdl3 (ENSAPEG00000005565) ENSAPEG00000005621 DHX8 (ENSAPEG00000005641) ENSAPEG00000005739 etv4 (ENSAPEG00000005761) meox1 (ENSAPEG00000005786) SOST (ENSAPEG00000005879) ENSAPEG00000005889 tmem106a (ENSAPEG00000005942) nbr1a (ENSAPEG00000005951) ENSAPEG00000005969 psme3 (ENSAPEG00000005989) g6pc1a.1 (ENSAPEG00000006009) ##22 g6pc1a.2 (ENSAPEG00000006021) ##22 ANK3 (ENSAPEG00000006088) MFAP4 (ENSAPEG00000006426) acsl5 (ENSAPEG00000006470) ENSAPEG00000006554 tectb (ENSAPEG00000006715) ENSAPEG00000006767 plxdc1 (ENSAPEG00000006782) LASP1 (ENSAPEG00000006799) ENSAPEG00000006830 plekhm1 (ENSAPEG00000006848) ENSAPEG00000006890 GRB7 (ENSAPEG00000006936) nat9 (ENSAPEG00000006995) lrrc59 (ENSAPEG00000007005) TMEM101 (ENSAPEG00000007029) #11 Spiny chromis MODERN SPECIES 361 meox1 (ENSAPOG00000004549) SOST (ENSAPOG00000004532) ENSAPOG00000004518 tmem106a (ENSAPOG00000004454) nbr1a (ENSAPOG00000004436) psme3 (ENSAPOG00000004411) g6pc1a.1 (ENSAPOG00000004366) ##22 ENSAPOG00000004343 g6pc1a.2 (ENSAPOG00000004330) ##22 ANK3 (ENSAPOG00000004281) ENSAPOG00000003923 Bicolor damselfish MODERN SPECIES 1478 ENSSPAG00000015582 g6pc1a.2 (ENSSPAG00000015590) ##22 ENSSPAG00000015610 ENSSPAG00000015628 MFAP4 (ENSSPAG00000015667) Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 10 psmd11b (ENSMMDG00005009924) nsfb (ENSMMDG00005010010) wnt3 (ENSMMDG00005013783) ormdl3 (ENSMMDG00005013793) THRA (ENSMMDG00005013831) DHX8 (ENSMMDG00005016578) etv4 (ENSMMDG00005017257) meox1 (ENSMMDG00005017259) SOST (ENSMMDG00005017264) ENSMMDG00005017266 arl4d (ENSMMDG00005017268) tmem106a (ENSMMDG00005017269) nbr1a (ENSMMDG00005017271) psme3 (ENSMMDG00005017276) g6pc1a.1 (ENSMMDG00005017428) ##22 g6pc1a.2 (ENSMMDG00005017429) ##22 ENSMMDG00005017431 ENSMMDG00005017432 ENSMMDG00005017433 ENSMMDG00005017434 ENSMMDG00005017435 ENSMMDG00005017436 acsl5 (ENSMMDG00005017524) ENSMMDG00005023254 tectb (ENSMMDG00005023261) ENSMMDG00005023264 plxdc1 (ENSMMDG00005023266) LASP1 (ENSMMDG00005023270) ENSMMDG00005023275 plekhm1 (ENSMMDG00005023279) ENSMMDG00005023282 Cod MODERN SPECIES 9 BTBD17 (ENSGMOG00000008758) ENSGMOG00000000035 gprc5c (ENSGMOG00000001115) OXLD1 (ENSGMOG00000024079) pde6gb (ENSGMOG00000036256) nploc4 (ENSGMOG00000001069) ENSGMOG00000027829 cep131 (ENSGMOG00000000884) ENSGMOG00000002221 ENSGMOG00000030416 ENSGMOG00000033508 ENSGMOG00000002147 tmem106a (ENSGMOG00000015974) nbr1a (ENSGMOG00000002718) psme3 (ENSGMOG00000002690) ENSGMOG00000002678 ##22 ENSGMOG00000022865 acsl5 (ENSGMOG00000018683) ENSGMOG00000018652 tectb (ENSGMOG00000018644) ENSGMOG00000027498 ENSGMOG00000015054 ENSGMOG00000028625 rhot2 (ENSGMOG00000001021) h1-0 (ENSGMOG00000030868) zgc:112496 (ENSGMOG00000016864) wdr24 (ENSGMOG00000016843) anks3 (ENSGMOG00000016821) zgc:112185 (ENSGMOG00000016791) ENSGMOG00000028854 ENSGMOG00000029281 Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 100 ENSGT00530000063301.a.a.c.a ENSGT00530000064085.c ENSGT00940000157854 ENSGT00950000183178.b.b.b ENSGT00940000157917.a.a.a ENSGT00940000155510 ENSGT00940000158142 ENSGT00940000154018.a ENSGT00390000014900.b.b.b ENSGT00940000162682.B.a ENSGT00940000161341.a.a ENSGT00940000166248.a ENSGT00390000016335.h ENSGT00950000183098.a.b ENSGT00950000183150.a.a.b ##22 ENSGT00950000183150.a.a.a.c ##22 ENSGT00940000156241 Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 532 ENSGT00530000064085.c.c ENSGT00940000157854.w.a ENSGT00950000183178.b.b.b.c.b ENSGT00940000157917.a.a.a.b ENSGT00940000155510.u.a.a ENSGT00940000155510.u.a.b ENSGT00940000158142.f ENSGT00940000154018.a.a ENSGT00390000014900.b.b.b.a ENSGT00940000162682.B.a.b ENSGT00940000161341.a.a.e ENSGT00940000166248.a.c ENSGT00390000016335.h.h ENSGT00950000183098.a.b.d ENSGT00950000183150.a.a.b.e ##22 ENSGT00950000183150.a.a.a.c.c ##22 ENSGT00940000163448.a ENSGT00940000156292.g.a.c ENSGT00940000157961.A.e Huchen MODERN SPECIES 273 nsfb (ENSHHUG00000024680) wnt3 (ENSHHUG00000024661) ormdl3 (ENSHHUG00000024655) THRA (ENSHHUG00000023258) DHX8 (ENSHHUG00000023175) DHX8 (ENSHHUG00000022506) etv4 (ENSHHUG00000022473) meox1 (ENSHHUG00000022469) SOST (ENSHHUG00000022466) ENSHHUG00000022461 arl4d (ENSHHUG00000022456) tmem106a (ENSHHUG00000022450) nbr1a (ENSHHUG00000022430) psme3 (ENSHHUG00000022263) g6pc1a.1 (ENSHHUG00000022253) ##22 g6pc1a.2 (ENSHHUG00000022249) ##22 ptges3l (ENSHHUG00000022204) FMNL1 (ENSHHUG00000022042) SRCIN1 (ENSHHUG00000021885) Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 45 ENSGT00530000064085.c.c ENSGT00940000157854.w.a ENSGT00950000183178.b.b.b.c.b ENSGT00940000157917.a.a.a.b ENSGT00940000155510.u.a.a ENSGT00940000155510.u.a.b ENSGT00940000158142.f ENSGT00940000154018.a.a ENSGT00390000014900.b.b.b.a ENSGT00940000162682.B.a.b ENSGT00940000161341.a.a.e ENSGT00940000166248.a.c ENSGT00390000016335.h.h ENSGT00950000183098.a.b.d ENSGT00950000183150.a.a.b.e ##22 ENSGT00950000183150.a.a.a.c.c ##22 ENSGT00940000163448.a ENSGT00940000156292.g.a.c ENSGT00940000157961.A.e ENSGT00940000158710 ENSGT00950000183080.a.b.b.a.b.d ENSGT00470000042293.a.b.a.b.c ENSGT00500000044903.b.f.b ENSGT00940000164940.b.g.b ENSGT00940000164940.a.c ENSGT00940000155535.u ENSGT00950000183192.b.f.b ENSGT00730000111029.a.a ENSGT00390000016895 ENSGT00940000155698.B.j ENSGT00940000159920.b.a Salmo ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00530000064085.c.c ENSGT00940000157854.w.a ENSGT00950000183178.b.b.b.c.b ENSGT00940000157917.a.a.a.b ENSGT00940000155510.u.a.a ENSGT00940000155510.u.a.b ENSGT00940000158142.f ENSGT00940000154018.a.a ENSGT00390000014900.b.b.b.a ENSGT00940000162682.B.a.b ENSGT00940000161341.a.a.e ENSGT00940000166248.a.c ENSGT00390000016335.h.h ENSGT00950000183098.a.b.d ENSGT00950000183150.a.a.b.e ##22 ENSGT00950000183150.a.a.a.c.c ##22 ENSGT00990000212728 ENSGT00940000163448.a ENSGT00940000156292.g.a.c ENSGT00940000157961.A.e ENSGT00940000158710 ENSGT00950000183080.a.b.b.a.b.d ENSGT00470000042293.a.b.a.b.c ENSGT00500000044903.b.f.b ENSGT00940000164940.b.g.b ENSGT00940000164940.a.c ENSGT00940000155535.u ENSGT00950000183192.b.f.b ENSGT00730000111029.a.a ENSGT00390000016895 ENSGT00940000155698.B.j Atlantic salmon MODERN SPECIES 20 ENSSSAG00000074396 ormdl3 (ENSSSAG00000098798) ENSSSAG00000107678 ENSSSAG00000093701 DHX8 (ENSSSAG00000075492) etv4 (ENSSSAG00000076063) DHX8 (ENSSSAG00000113538) meox1 (ENSSSAG00000076066) SOST (ENSSSAG00000088726) ENSSSAG00000108015 arl4d (ENSSSAG00000076073) tmem106a (ENSSSAG00000076078) nbr1a (ENSSSAG00000076083) psme3 (ENSSSAG00000076091) ENSSSAG00000097121 ##22 ENSSSAG00000083503 ##22 ENSSSAG00000076155 TEBP (ENSSSAG00000076157) ENSSSAG00000076176 ENSSSAG00000076356 ENSSSAG00000076370 arf1l (ENSSSAG00000117959) grnb (ENSSSAG00000076429) aldh18a1 (ENSSSAG00000076472) crygmx (ENSSSAG00000077442) crygmxl2 (ENSSSAG00000071923) tcf7l2 (ENSSSAG00000077505) vti1a (ENSSSAG00000112588) ENSSSAG00000078768 COX19 (ENSSSAG00000078783) adap1 (ENSSSAG00000078789) River trout MODERN SPECIES 1 nsfb (ENSSTUG00000001411) wnt3 (ENSSTUG00000005517) ormdl3 (ENSSTUG00000005562) THRA (ENSSTUG00000005628) DHX8 (ENSSTUG00000006798) etv4 (ENSSTUG00000007794) meox1 (ENSSTUG00000007839) ENSSTUG00000007847 SOST (ENSSTUG00000007854) ENSSTUG00000007862 arl4d (ENSSTUG00000007873) tmem106a (ENSSTUG00000007891) nbr1a (ENSSTUG00000007897) psme3 (ENSSTUG00000007920) g6pc1a.1 (ENSSTUG00000007950) ##22 g6pc1a.2 (ENSSTUG00000008105) ##22 ENSSTUG00000008122 ptges3l (ENSSTUG00000008135) FMNL1 (ENSSTUG00000008178) ENSSTUG00000009061 GRB7 (ENSSTUG00000009196) ENSSTUG00000009261 grnb (ENSSTUG00000009264) aldh18a1 (ENSSTUG00000009324) crygmx (ENSSTUG00000010575) crygmxl2 (ENSSTUG00000010583) tcf7l2 (ENSSTUG00000010612) vti1a (ENSSTUG00000010938) cox19 (ENSSTUG00000010962) ENSSTUG00000010969 sox8a (ENSSTUG00000011030) Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00930000151045.f.d ENSGT01100000263515.a.b.a.b.a.h.f ENSGT00530000063870.b.d ENSGT01000000220624 ENSGT00390000001390.b.d ENSGT00390000015528.a ENSGT00390000006698 ENSGT00440000033742.a.a.b ENSGT00940000153801.a.d ENSGT00390000014900.b.b.b.b.b.a ENSGT00940000161341.a.a.e ENSGT00940000166248.a.c ENSGT00390000016335.h.h ENSGT00950000183098.a.b.d ENSGT00950000183150.a.a.b.e ##22 ENSGT00950000183150.a.a.a.c.c ##22 ENSGT00940000163448.a ENSGT00940000156292.g.a.c ENSGT00940000157961.A.e ENSGT00940000158710 ENSGT00950000183080.a.b.b.a.b.d ENSGT00470000042293.a.b.a.b.c ENSGT00500000044903.b.f.b ENSGT00940000164940.b.g.b ENSGT00940000164940.a.c ENSGT00940000155535.u ENSGT00950000183192.b.f.b ENSGT00390000016895 ENSGT00940000155698.B.j ENSGT00940000159920.b.a ENSGT00530000063702.b.d Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT01100000263515.a.b.a.b.a.h.f ENSGT00530000063870.b.d ENSGT01000000220624 ENSGT00390000001390.b.d ENSGT00390000015528.a ENSGT00390000006698 ENSGT00440000033742.a.a.b ENSGT00940000153801.a.d ENSGT00390000014900.b.b.b.b.b.a ENSGT00940000161341.a.a.e ENSGT00940000166248.a.c ENSGT00390000016335.h.h ENSGT00950000183098.a.b.d ENSGT00950000183150.a.a.b.e ##22 ENSGT00950000183150.a.a.a.c.c ##22 ENSGT00940000163448.a ENSGT00940000156292.g.a.c ENSGT00940000157961.A.e ENSGT00940000158710 ENSGT01080000257338.C.b.a.a.d.a.a.a.b.a.b.a.a ENSGT00950000183080.a.b.b.a.b.d ENSGT00470000042293.a.b.a.b.c ENSGT00500000044903.b.f.b ENSGT00940000164940.b.g.b ENSGT00940000164940.a.c ENSGT00940000155535.u ENSGT00950000183192.b.f.b ENSGT00390000016895 ENSGT00940000155698.B.j ENSGT00940000159920.b.a Coho salmon MODERN SPECIES 17 tmem204 (ENSOKIG00005009827) metrn (ENSOKIG00005009833) ENSOKIG00005009840 PRR35 (ENSOKIG00005009862) ENSOKIG00005009872 ENSOKIG00005009887 ENSOKIG00005009960 ACLY (ENSOKIG00005010950) ENSOKIG00005011080 arl4d (ENSOKIG00005011109) tmem106a (ENSOKIG00005011125) nbr1a (ENSOKIG00005011143) ENSOKIG00005011169 psme3 (ENSOKIG00005011203) g6pc1a.1 (ENSOKIG00005011815) ##22 G6PC1 (ENSOKIG00005011821) ##22 ptges3l (ENSOKIG00005011849) FMNL1 (ENSOKIG00005011905) SRCIN1 (ENSOKIG00005012022) ENSOKIG00005012167 ENSOKIG00005012174 ENSOKIG00005012179 grnb (ENSOKIG00005012225) aldh18a1 (ENSOKIG00005012428) ENSOKIG00005013815 crygmx (ENSOKIG00005013818) crygmxl2 (ENSOKIG00005013842) tcf7l2 (ENSOKIG00005014136) vti1a (ENSOKIG00005018541) ENSOKIG00005018610 cox19 (ENSOKIG00005018619) Chinook salmon MODERN SPECIES 17 ENSOTSG00005047065 ormdl3 (ENSOTSG00005047066) THRA (ENSOTSG00005047067) DHX8 (ENSOTSG00005047117) etv4 (ENSOTSG00005047383) meox1 (ENSOTSG00005047384) telo2 (ENSOTSG00005047386) ENSOTSG00005047405 ENSOTSG00005047406 SOST (ENSOTSG00005047407) arl4d (ENSOTSG00005047408) tmem106a (ENSOTSG00005047409) nbr1a (ENSOTSG00005047411) psme3 (ENSOTSG00005002663) g6pc1a.1 (ENSOTSG00005004897) ##22 g6pc1a.2 (ENSOTSG00005004899) ##22 ptges3l (ENSOTSG00005004900) FMNL1 (ENSOTSG00005004906) SRCIN1 (ENSOTSG00005004918) GRB7 (ENSOTSG00005004925) ENSOTSG00005004933 ENSOTSG00005004935 grnb (ENSOTSG00005004936) aldh18a1 (ENSOTSG00005004945) crygmx (ENSOTSG00005005538) crygmxl2 (ENSOTSG00005005539) ENSOTSG00005005541 tcf7l2 (ENSOTSG00005005588) vti1a (ENSOTSG00005012796) cox19 (ENSOTSG00005012799) ENSOTSG00005012800 Rainbow trout MODERN SPECIES 12 ENSOMYG00000013491 ENSOMYG00000013484 ENSOMYG00000013480 tmem204 (ENSOMYG00000013475) ENSOMYG00000067717 ENSOMYG00000013425 ENSOMYG00000058398 rab11fip3 (ENSOMYG00000013332) ENSOMYG00000013295 arl4d (ENSOMYG00000013277) tmem106a (ENSOMYG00000013257) ENSOMYG00000013270 nbr1a (ENSOMYG00000013239) psme3 (ENSOMYG00000013045) ENSOMYG00000062125 ##22 ENSOMYG00000012999 ##22 ENSOMYG00000012988 ENSOMYG00000012037 ENSOMYG00000011864 ENSOMYG00000011816 ENSOMYG00000011800 ENSOMYG00000074193 grnb (ENSOMYG00000011786) aldh18a1 (ENSOMYG00000008574) crygmx (ENSOMYG00000006771) crygmxl2 (ENSOMYG00000034528) tcf7l2 (ENSOMYG00000006541) vti1a (ENSOMYG00000005933) ENSOMYG00000005778 ENSOMYG00000005662 sox8a (ENSOMYG00000005426) Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00530000063301.a.a.c.a.f ENSGT00530000064085.c.d ENSGT00940000157854.w.b ENSGT00950000183178.b.b.b.c.a ENSGT00940000157917.a.a.a.a ENSGT00940000155510.u.b ENSGT00940000158142.e ENSGT00940000154018.a.b ENSGT00390000014900.b.b.b.b ENSGT00940000162682.B.a.a ENSGT00940000161341.a.a.f ENSGT00940000166248.a.d ENSGT00390000016335.h.g ENSGT00950000183098.a.b.c ENSGT00950000183150.a.a.b.f ##22 ENSGT00950000183150.a.a.a.c.d ##22 ENSGT00940000156241 ENSGT00940000163448.b ENSGT00940000156292.g.a.d ENSGT00940000157961.A.f ENSGT00950000183080.a.b.b.a.b.c ENSGT00940000156497.b ENSGT00470000042293.a.b.a.b.d Huchen MODERN SPECIES 150 ptprfa (ENSHHUG00000043036) ENSHHUG00000043024 wnt3 (ENSHHUG00000043016) ormdl3 (ENSHHUG00000043012) THRA (ENSHHUG00000042494) DHX8 (ENSHHUG00000042276) etv4 (ENSHHUG00000042254) meox1 (ENSHHUG00000042244) SOST (ENSHHUG00000042239) ENSHHUG00000042233 arl4d (ENSHHUG00000042230) tmem106a (ENSHHUG00000042190) nbr1a (ENSHHUG00000042175) psme3 (ENSHHUG00000041932) g6pc1a.1 (ENSHHUG00000041928) ##22 g6pc1a.2 (ENSHHUG00000041921) ##22 aarsd1 (ENSHHUG00000041837) ptges3l (ENSHHUG00000041823) FMNL1 (ENSHHUG00000041632) SRCIN1 (ENSHHUG00000041602) ENSHHUG00000041572 ENSHHUG00000041558 grnb (ENSHHUG00000041550) Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00530000063301.a.a.c.a.f ENSGT00530000064085.c.d ENSGT00940000157854.w.b ENSGT00950000183178.b.b.b.c.a ENSGT00940000157917.a.a.a.a ENSGT00940000155510.u.b ENSGT00940000158142.e ENSGT00940000154018.a.b ENSGT00390000014900.b.b.b.b.a ENSGT00940000162682.B.a.a ENSGT00940000161341.a.a.f ENSGT00940000166248.a.d ENSGT00390000016335.h.g ENSGT00950000183098.a.b.c ENSGT00950000183150.a.a.b.f ##22 ENSGT00950000183150.a.a.a.c.d ##22 ENSGT00940000156241 ENSGT00940000163448.b ENSGT00940000156292.g.a.d ENSGT00940000157961.A.f ENSGT00950000183080.a.b.b.a.b.c ENSGT00940000156497.b ENSGT00470000042293.a.b.a.b.d ENSGT00500000044903.b.f.a ENSGT00940000164940.b.g.a ENSGT00940000164940.a.d ENSGT00940000155535.v ENSGT00950000183192.b.f.a ENSGT00730000111029.a.b ENSGT00940000155698.B.i ENSGT00940000159920.b.b Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00530000063301.a.a.c.a.f ENSGT00530000064085.c.d ENSGT00940000157854.w.b ENSGT00950000183178.b.b.b.c.a ENSGT00940000157917.a.a.a.a ENSGT00940000155510.u.b ENSGT00940000158142.e ENSGT00940000154018.a.b ENSGT00390000014900.b.b.b.b.a ENSGT00940000162682.B.a.a ENSGT00940000161341.a.a.f ENSGT00940000166248.a.d ENSGT00390000016335.h.g ENSGT00950000183098.a.b.c ENSGT00950000183150.a.a.b.f ##22 ENSGT00950000183150.a.a.a.c.d ##22 ENSGT00940000156241 ENSGT00940000163448.b ENSGT00940000156292.g.a.d ENSGT00940000157961.A.f ENSGT00950000183080.a.b.b.a.b.c ENSGT00940000156497.b ENSGT00470000042293.a.b.a.b.d ENSGT00500000044903.b.f.a ENSGT00940000164940.b.g.a ENSGT00940000164940.a.d ENSGT00940000155535.v ENSGT00950000183192.b.f.a ENSGT00730000111029.a.b ENSGT00940000155698.B.i ENSGT00940000159920.b.b Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00530000063301.a.a.c.a.f ENSGT00530000064085.c.d ENSGT00940000157854.w.b ENSGT00950000183178.b.b.b.c.a ENSGT00940000157917.a.a.a.a ENSGT00940000155510.u.b ENSGT00940000158142.e ENSGT00940000154018.a.b ENSGT00390000014900.b.b.b.b.a ENSGT00940000162682.B.a.a ENSGT00940000161341.a.a.f ENSGT00940000166248.a.d ENSGT00390000016335.h.g ENSGT00950000183098.a.b.c ENSGT00950000183150.a.a.b.f ##22 ENSGT00950000183150.a.a.a.c.d ##22 ENSGT00940000156241 ENSGT00940000163448.b ENSGT00940000156292.g.a.d ENSGT00940000157961.A.f ENSGT00950000183080.a.b.b.a.b.c ENSGT00940000156497.b ENSGT00470000042293.a.b.a.b.d ENSGT00500000044903.b.f.a ENSGT00940000164940.b.g.a ENSGT00940000164940.a.d ENSGT00940000155535.v ENSGT00950000183192.b.e.a ENSGT00940000155698.B.i ENSGT00940000159920.b.b ENSGT00530000063702.b.c Coho salmon MODERN SPECIES 12 wnt3 (ENSOKIG00005008567) ormdl3 (ENSOKIG00005008553) ENSOKIG00005008540 THRA (ENSOKIG00005008207) DHX8 (ENSOKIG00005007738) ENSOKIG00005007695 etv4 (ENSOKIG00005007686) meox1 (ENSOKIG00005007673) SOST (ENSOKIG00005007662) ENSOKIG00005007656 arl4d (ENSOKIG00005007645) tmem106a (ENSOKIG00005007624) nbr1a (ENSOKIG00005007605) psme3 (ENSOKIG00005007470) g6pc1a.1 (ENSOKIG00005007401) ##22 g6pc1a.2 (ENSOKIG00005007383) ##22 aarsd1 (ENSOKIG00005007293) ptges3l (ENSOKIG00005007262) FMNL1 (ENSOKIG00005007173) SRCIN1 (ENSOKIG00005007046) ENSOKIG00005007014 ENSOKIG00005007008 grnb (ENSOKIG00005006999) ENSOKIG00005006991 aldh18a1 (ENSOKIG00005006028) crygmx (ENSOKIG00005037526) tcf7l2 (ENSOKIG00005036906) vti1a (ENSOKIG00005036805) ENSOKIG00005036770 ENSOKIG00005036190 sox8a (ENSOKIG00005036160) Chinook salmon MODERN SPECIES 16 cdk5r1b (ENSOTSG00005043357) psmd11b (ENSOTSG00005043324) nsfb (ENSOTSG00005041578) wnt3 (ENSOTSG00005041563) ormdl3 (ENSOTSG00005041562) THRA (ENSOTSG00005040233) DHX8 (ENSOTSG00005040085) etv4 (ENSOTSG00005040079) meox1 (ENSOTSG00005040076) SOST (ENSOTSG00005040073) arl4d (ENSOTSG00005040072) tmem106a (ENSOTSG00005040070) nbr1a (ENSOTSG00005040069) psme3 (ENSOTSG00005039008) g6pc1a.1 (ENSOTSG00005038981) ##22 g6pc1a.2 (ENSOTSG00005038979) ##22 aarsd1 (ENSOTSG00005038906) ptges3l (ENSOTSG00005038904) FMNL1 (ENSOTSG00005038901) SRCIN1 (ENSOTSG00005038899) ENSOTSG00005038897 ENSOTSG00005038895 grnb (ENSOTSG00005038893) aldh18a1 (ENSOTSG00005038232) crygmx (ENSOTSG00005038222) crygmxl2 (ENSOTSG00005038221) tcf7l2 (ENSOTSG00005037861) vti1a (ENSOTSG00005037857) RNPS1 (ENSOTSG00005037856) ENSOTSG00005037855 ENSOTSG00005037832 Rainbow trout MODERN SPECIES 7 psmd11b (ENSOMYG00000042895) nsfb (ENSOMYG00000042291) wnt3 (ENSOMYG00000042177) ormdl3 (ENSOMYG00000042161) ENSOMYG00000041692 ENSOMYG00000064442 DHX8 (ENSOMYG00000040006) etv4 (ENSOMYG00000039467) meox1 (ENSOMYG00000054849) SOST (ENSOMYG00000075023) ENSOMYG00000039350 arl4d (ENSOMYG00000039302) tmem106a (ENSOMYG00000039279) nbr1a (ENSOMYG00000039260) psme3 (ENSOMYG00000038921) G6PC1 (ENSOMYG00000038810) ##22 AARSD1 (ENSOMYG00000038701) ENSOMYG00000038664 ENSOMYG00000038169 ENSOMYG00000062509 ENSOMYG00000037942 ENSOMYG00000037797 ENSOMYG00000037784 ENSOMYG00000037769 aldh18a1 (ENSOMYG00000034822) crygmx (ENSOMYG00000034544) crygmxl2 (ENSOMYG00000077390) tcf7l2 (ENSOMYG00000033946) ENSOMYG00000068623 vti1a (ENSOMYG00000033851) ENSOMYG00000033822 Salmo ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00530000063301.a.a.c.a.f ENSGT00530000064085.c.d ENSGT00940000157854.w.b ENSGT00950000183178.b.b.b.c.a ENSGT00940000157917.a.a.a.a ENSGT00940000155510.u.b ENSGT00940000158142.e ENSGT00940000154018.a.b ENSGT00390000014900.b.b.b.b.a ENSGT00940000162682.B.a.a ENSGT00940000161341.a.a.f ENSGT00940000166248.a.d ENSGT00390000016335.h.g ENSGT00950000183098.a.b.c ENSGT00950000183150.a.a.b.f ##22 ENSGT00950000183150.a.a.a.c.d ##22 ENSGT00940000156241 ENSGT00940000163448.b ENSGT00940000156292.g.a.d ENSGT00940000157961.A.f ENSGT00950000183080.a.b.b.a.b.c ENSGT00940000156497.b ENSGT00470000042293.a.b.a.b.d ENSGT00500000044903.b.f.a ENSGT00940000164940.b.g.a ENSGT00940000164940.a.d ENSGT00940000155535.v ENSGT00950000183192.b.f.a ENSGT00730000111029.a.b ENSGT00940000155698.B.i ENSGT00940000159920.b.b Atlantic salmon MODERN SPECIES 10 nsfb (ENSSSAG00000077571) wnt3 (ENSSSAG00000077501) ormdl3 (ENSSSAG00000105314) ENSSSAG00000076909 DHX8 (ENSSSAG00000075459) etv4 (ENSSSAG00000075346) meox1 (ENSSSAG00000093864) SOST (ENSSSAG00000086336) ENSSSAG00000075323 ARL4D (ENSSSAG00000116077) tmem106a (ENSSSAG00000075308) ENSSSAG00000092613 psme3 (ENSSSAG00000075257) nbr1a (ENSSSAG00000075301) g6pc1a.1 (ENSSSAG00000094615) ##22 G6PC1 (ENSSSAG00000075243) ##22 aarsd1 (ENSSSAG00000075169) TEBP (ENSSSAG00000075153) ENSSSAG00000101634 ENSSSAG00000072239 ENSSSAG00000072108 ENSSSAG00000076426 ENSSSAG00000072093 grnb (ENSSSAG00000072084) aldh18a1 (ENSSSAG00000071965) crygmx (ENSSSAG00000071930) crygmxl2 (ENSSSAG00000095042) tcf7l2 (ENSSSAG00000066753) vti1a (ENSSSAG00000066569) ENSSSAG00000066551 ENSSSAG00000066310 River trout MODERN SPECIES 11 cdk5r1b (ENSSTUG00000036065) psmd11b (ENSSTUG00000035992) nsfb (ENSSTUG00000035705) wnt3 (ENSSTUG00000035650) ormdl3 (ENSSTUG00000035643) THRA (ENSSTUG00000034118) DHX8 (ENSSTUG00000033181) etv4 (ENSSTUG00000033108) meox1 (ENSSTUG00000033095) SOST (ENSSTUG00000033079) arl4d (ENSSTUG00000033064) tmem106a (ENSSTUG00000033048) nbr1a (ENSSTUG00000033026) psme3 (ENSSTUG00000032585) g6pc1a.1 (ENSSTUG00000032560) ##22 g6pc1a.2 (ENSSTUG00000032524) ##22 aarsd1 (ENSSTUG00000032385) ptges3l (ENSSTUG00000032359) FMNL1 (ENSSTUG00000031650) ENSSTUG00000031436 ENSSTUG00000031411 ENSSTUG00000031379 grnb (ENSSTUG00000031316) aldh18a1 (ENSSTUG00000030686) crygmx (ENSSTUG00000030656) crygmxl2 (ENSSTUG00000030636) tcf7l2 (ENSSTUG00000029934) vti1a (ENSSTUG00000029853) ENSSTUG00000029839 ENSSTUG00000029461 sox8a (ENSSTUG00000029454) Northern pike MODERN SPECIES 4 psmd11b (ENSELUG00000008204) nsfb (ENSELUG00000008162) wnt3 (ENSELUG00000008126) ormdl3 (ENSELUG00000008099) THRA (ENSELUG00000008043) DHX8 (ENSELUG00000007955) etv4 (ENSELUG00000007861) meox1 (ENSELUG00000030379) SOST (ENSELUG00000000284) ENSELUG00000007740 arl4d (ENSELUG00000007727) tmem106a (ENSELUG00000007708) nbr1a (ENSELUG00000007695) psme3 (ENSELUG00000000273) g6pc1a.1 (ENSELUG00000007630) ##22 g6pc1a.2 (ENSELUG00000007558) ##22 aarsd1 (ENSELUG00000007588) ptges3l (ENSELUG00000007536) FMNL1 (ENSELUG00000007411) SRCIN1 (ENSELUG00000007338) GRB7 (ENSELUG00000007234) ENSELUG00000007225 ENSELUG00000007217 grnb (ENSELUG00000007190) aldh18a1 (ENSELUG00000007119) crygmx (ENSELUG00000007083) crygmxl2 (ENSELUG00000007068) tcf7l2 (ENSELUG00000006999) vti1a (ENSELUG00000001440) ENSELUG00000006736 cox19 (ENSELUG00000006716) Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 319 ENSGT00940000153249.a ENSGT00940000157356 ENSGT00390000008540 ENSGT00940000156410.g ENSGT00940000157037.b.b.a ENSGT00940000159911 ENSGT00940000167052 ENSGT00940000163600 ENSGT00940000157746.e ENSGT00940000158951.e ENSGT00940000165079.a ENSGT00650000094974.b ENSGT00940000157744.d ENSGT00940000163448 ENSGT00950000183150.a.a.b ##22 ENSGT00950000183150.a.a.a.c ##22 ENSGT00940000156241 Otophysi ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153249.a ENSGT00940000157356 ENSGT00390000008540 ENSGT00940000156410.g ENSGT00940000157037.b.b.a ENSGT00940000159911 ENSGT00940000167052 ENSGT00940000163600 ENSGT00940000157746.e ENSGT00940000158951.e ENSGT00940000165079.a ENSGT00650000094974.b ENSGT00940000157744.d ENSGT00940000163448 ENSGT00950000183150.a.a.b ##22 ENSGT00950000183150.a.a.a.c ##22 ENSGT00940000156241 ENSGT00390000018409.h ENSGT00940000158306 ENSGT00390000015792 ENSGT00940000158678 ENSGT00940000165723.a ENSGT00940000156675.d ENSGT00940000155309.p ENSGT00940000155109.a.b ENSGT00440000039001 ENSGT00390000013948.b ENSGT00940000156276 ENSGT00390000014563.a.a.b ENSGT00390000014563.a.a.a ENSGT00950000183033.a.a.c.b Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000164645.b ENSGT00940000153249.a ENSGT00940000157356 ENSGT00390000008540 ENSGT00940000156410.g ENSGT00940000159911 ENSGT00940000167052 ENSGT00940000163600 ENSGT00940000157746.e.d ENSGT00940000158951.e ENSGT00940000165079.a ENSGT00650000094974.b ENSGT00940000157744.d ENSGT00940000163448 ENSGT00950000183150.a.a.b ##22 ENSGT00950000183150.a.a.a.c ##22 ENSGT00940000156241 ENSGT00390000018409.h ENSGT00940000158306 ENSGT00390000015792 ENSGT00940000158678 ENSGT00940000165723.a ENSGT00940000156675.d ENSGT00940000155309.p ENSGT00940000155109.a.b ENSGT00440000039001 ENSGT00390000013948.b ENSGT00390000014563.a.a.a ENSGT00950000183033.a.a.c.b ENSGT00940000156416.c ENSGT00390000013594 Channel catfish MODERN SPECIES 4 SLC35G1 (ENSIPUG00000011302) plce1 (ENSIPUG00000011245) noc3l (ENSIPUG00000011208) TBC1D12 (ENSIPUG00000011161) ENSIPUG00000011132 Tnks2 (ENSIPUG00000011046) ENSIPUG00000011036 ENSIPUG00000010977 itga3b (ENSIPUG00000010851) dlx3 (ENSIPUG00000010823) dlx4b (ENSIPUG00000010804) ENSIPUG00000010796 kat7 (ENSIPUG00000010773) ptges3l (ENSIPUG00000010758) g6pc (ENSIPUG00000010733) ##22 g6pc1a.2 (ENSIPUG00000010702) ##22 aarsd1 (ENSIPUG00000010672) sgms1 (ENSIPUG00000010653) ENSIPUG00000010643 IFIT5 (ENSIPUG00000010636) asah2 (ENSIPUG00000010420) a1cf (ENSIPUG00000010367) ENSIPUG00000010348 prkg1 (ENSIPUG00000010199) dkk1 (ENSIPUG00000010173) pcdh15b (ENSIPUG00000008889) ENSIPUG00000008772 ipmk (ENSIPUG00000008753) UBE2D4 (ENSIPUG00000008668) TFAM (ENSIPUG00000008637) zgc:171971 (ENSIPUG00000008608) Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 108 ENSGT00940000164645.b ENSGT00940000153249.a ENSGT00940000157356 ENSGT00390000008540 ENSGT00940000156410.g ENSGT00940000159911 ENSGT00940000167052 ENSGT00940000163600 ENSGT00940000157746.e.d ENSGT00940000158951.e ENSGT00940000165079.a ENSGT00650000094974.b ENSGT00940000157744.d ENSGT00940000163448 ENSGT00950000183150.a.a.b ##22 ENSGT00950000183150.a.a.a.c ##22 ENSGT00940000156241 ENSGT00390000018409.h ENSGT00940000158306 ENSGT00390000015792 ENSGT00940000158678 ENSGT00940000165723.a ENSGT00940000156675.d ENSGT00940000155309.p ENSGT00940000155109.a.b ENSGT00440000039001 ENSGT00390000013948.b ENSGT00390000014563.a.a.a ENSGT00950000183033.a.a.c.b ENSGT00940000156416.c ENSGT00390000013594 Characoidei ANCESTRAL SPECIES 104 ENSGT00940000164645.b ENSGT00940000153249.a ENSGT00940000157356 ENSGT00390000008540 ENSGT00940000156410.g ENSGT00940000159911 ENSGT00940000167052 ENSGT00940000163600 ENSGT00940000157746.e.d ENSGT00940000158951.e ENSGT00940000165079.a ENSGT00650000094974.b ENSGT00940000157744.d ENSGT00940000163448 ENSGT00950000183150.a.a.b ##22 ENSGT00950000183150.a.a.a.c ##22 ENSGT00940000156241 ENSGT00390000018409.h.b ENSGT00940000158306 ENSGT00390000015792 ENSGT00940000158678 ENSGT00940000165723.a ENSGT00940000179608 ENSGT00940000156675.d ENSGT00940000155309.p ENSGT00940000155109.a.b ENSGT00440000039001 ENSGT00390000013948.b ENSGT00390000014563.a.a.a ENSGT00950000183033.a.a.c.b ENSGT00940000156416.c Red-bellied piranha MODERN SPECIES 536 dlx4b (ENSPNAG00000007647) ENSPNAG00000000380 kat7b (ENSPNAG00000000384) ptges3l (ENSPNAG00000007662) g6pc1a.2 (ENSPNAG00000000393) ##22 g6pc1a.1 (ENSPNAG00000007672) ##22 aarsd1 (ENSPNAG00000000407) sgms1b (ENSPNAG00000007691) asah2 (ENSPNAG00000007696) A1CF (ENSPNAG00000007704) PRKG1 (ENSPNAG00000000418) dkk1b (ENSPNAG00000000422) Mexicana tetra MODERN SPECIES 19 SLC35G1 (ENSAMXG00000033646) plce1 (ENSAMXG00000004946) noc3l (ENSAMXG00000004967) TBC1D12 (ENSAMXG00000004972) ENSAMXG00000036689 TNKS2 (ENSAMXG00000004975) ENSAMXG00000041589 ENSAMXG00000004983 itga3b (ENSAMXG00000033569) dlx3b (ENSAMXG00000029370) dlx4b (ENSAMXG00000042142) ENSAMXG00000034848 kat7b (ENSAMXG00000038714) ptges3l (ENSAMXG00000031922) g6pc1a.1 (ENSAMXG00000033979) ##22 g6pc1a.2 (ENSAMXG00000018240) ##22 aarsd1 (ENSAMXG00000031615) sgms1b (ENSAMXG00000031502) asah2 (ENSAMXG00000018196) A1CF (ENSAMXG00000018180) PRKG1 (ENSAMXG00000034003) dkk1b (ENSAMXG00000018166) ENSAMXG00000043620 ENSAMXG00000030918 pcdh15b (ENSAMXG00000018085) ENSAMXG00000037603 ENSAMXG00000035955 ENSAMXG00000032657 ENSAMXG00000039022 ipmkb (ENSAMXG00000031764) ube2d1b (ENSAMXG00000040363) Electric eel MODERN SPECIES 135 FUT9 (ENSEEEG00000003258) CYP51A1 (ENSEEEG00000003257) kat7b (ENSEEEG00000002858) ptges3l (ENSEEEG00000002830) g6pc1a.1 (ENSEEEG00000002716) ##22 g6pc1a.2 (ENSEEEG00000002705) ##22 aarsd1 (ENSEEEG00000002688) sgms1b (ENSEEEG00000002678) asah2 (ENSEEEG00000002581) A1CF (ENSEEEG00000002573) PRKG1 (ENSEEEG00000002442) dkk1b (ENSEEEG00000002427) pcdh15b (ENSEEEG00000001979) ipmkb (ENSEEEG00000001969) ube2d1b (ENSEEEG00000001966) tfam (ENSEEEG00000001963) zgc:171971 (ENSEEEG00000001961) ENSEEEG00000001960 phyhiplb (ENSEEEG00000001955) FAM13C (ENSEEEG00000001947) slc16a9b (ENSEEEG00000001945) Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00940000153249.a ENSGT00940000157356 ENSGT00390000008540 ENSGT00940000156410.g ENSGT00940000157037.b.b.a ENSGT00940000159911 ENSGT00940000167052 ENSGT00940000163600 ENSGT00940000157746.e ENSGT00940000158951.e ENSGT00940000165079.a ENSGT00650000094974.b ENSGT00940000157744.d ENSGT00940000163448 ENSGT00950000183150.a.a.b ##22 ENSGT00950000183150.a.a.a.c ##22 ENSGT00940000156241 ENSGT00390000015792 ENSGT00940000158678 ENSGT00940000165723.a ENSGT00940000156675.d ENSGT00940000155309.p ENSGT00940000155109.a.b ENSGT00440000039001 ENSGT00390000013948.b ENSGT00940000160793 ENSGT00940000155109.a.a ENSGT00940000156276 ENSGT00390000014563.a.a.b ENSGT00390000014794.b.l ENSGT00940000153335.a.b Cyprininae DUPLICATION Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000153249.a.f ENSGT00940000157356.c ENSGT00390000008540 ENSGT00940000156410.g.f ENSGT00940000157037.b.b.a.i ENSGT00940000159911.f ENSGT00940000167052 ENSGT00940000163600.g ENSGT00940000157746.e.a ENSGT00940000158951.e.a ENSGT00940000165079.a.c ENSGT00650000094974.b.b ENSGT00940000157744.d.c ENSGT00940000163448 ENSGT00950000183150.a.a.b.c ##22 ENSGT00950000183150.a.a.a.c.e ##22 Goldfish MODERN SPECIES 3 plce1 (ENSCARG00000029578) noc3l (ENSCARG00000029324) ENSCARG00000027171 ENSCARG00000031596 TNKS2 (ENSCARG00000030628) ENSCARG00000030531 ENSCARG00000028817 itga3b (ENSCARG00000028734) dlx3b (ENSCARG00000028710) dlx4b (ENSCARG00000028703) ENSCARG00000028700 ENSCARG00000028697 kat7b (ENSCARG00000028390) ptges3l (ENSCARG00000028322) g6pc1a.1 (ENSCARG00000028298) ##22 g6pc1a.2 (ENSCARG00000028279) ##22 sgms1b (ENSCARG00000028264) A1CF (ENSCARG00000028246) PRKG1 (ENSCARG00000028170) dkk1b (ENSCARG00000028157) ENSCARG00000028155 pcdh15b (ENSCARG00000027031) ipmkb (ENSCARG00000026884) UBE2D1 (ENSCARG00000026837) tfam (ENSCARG00000026828) zgc:171971 (ENSCARG00000026814) BICC1 (ENSCARG00000026733) phyhiplb (ENSCARG00000026701) ENSCARG00000026670 slc16a9b (ENSCARG00000026662) ccdc6b (ENSCARG00000026609) Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000153249.a.f ENSGT00940000157356.c ENSGT00390000008540 ENSGT00940000156410.g.f ENSGT00940000157037.b.b.a.i ENSGT00940000159911.f ENSGT00940000167052 ENSGT00940000163600.g ENSGT00940000157746.e.a ENSGT00940000158951.e.a ENSGT00940000165079.a.c ENSGT00650000094974.b.b ENSGT00940000157744.d.c ENSGT00940000163448 ENSGT00950000183150.a.a.b.c ##22 ENSGT00950000183150.a.a.a.c.e ##22 Golden-line barbel MODERN SPECIES 3088 ENSSGRG00000001361 ##22 Common carp reference MODERN SPECIES 25 SLC35G1 (ENSCCRG00000068866) plce1 (ENSCCRG00000038867) noc3l (ENSCCRG00000037365) ENSCCRG00000033725 ENSCCRG00000033385 ENSCCRG00000015822 ENSCCRG00000070535 ENSCCRG00000032217 itga3b (ENSCCRG00000039651) dlx3b (ENSCCRG00000003924) dlx4b (ENSCCRG00000066609) ENSCCRG00000072733 kat7b (ENSCCRG00000036476) ptges3l (ENSCCRG00000002170) ENSCCRG00000064700 g6pc1a.2 (ENSCCRG00000081233) ##22 aarsd1 (ENSCCRG00000053368) sgms1b (ENSCCRG00000033007) asah2 (ENSCCRG00000017346) ENSCCRG00000017356 ENSCCRG00000062462 ENSCCRG00000053355 ENSCCRG00000074900 dkk1b (ENSCCRG00000070075) pcdh15b (ENSCCRG00000062792) ENSCCRG00000001657 ENSCCRG00000075114 ENSCCRG00000068969 ipmkb (ENSCCRG00000058848) ube2d1b (ENSCCRG00000023660) tfam (ENSCCRG00000032616) Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000157825.a.a ENSGT00390000017833.d ENSGT00940000164645.b.a ENSGT00940000153249.a.e ENSGT00940000157356.d ENSGT00940000156410.g.e ENSGT00940000157037.b.b.a.j ENSGT00940000159911.e ENSGT00940000163600.h ENSGT00940000157746.e.b ENSGT00940000158951.e.b ENSGT00940000165079.a.d ENSGT00650000094974.b.a ENSGT00940000157744.d.d ENSGT00950000183150.a.a.b.d ##22 ENSGT00950000183150.a.a.a.c.f ##22 ENSGT00940000156241 ENSGT00940000158306.u.b ENSGT00390000015792.x ENSGT00940000158678.k ENSGT00940000158306.u.a ENSGT00390000015792.w ENSGT00940000158678.l ENSGT00940000154704.d.b.d.b.b ENSGT00940000161319 ENSGT00940000165723.a.b ENSGT00940000156675.d.b ENSGT00940000155309.p.b ENSGT00440000039001.b ENSGT00390000013948.b.d ENSGT00940000156276.h.a Goldfish MODERN SPECIES 30 pde6c (ENSCARG00000027159) fra10ac1 (ENSCARG00000027070) lgi1b (ENSCARG00000026945) SLC35G1 (ENSCARG00000026924) plce1 (ENSCARG00000025883) ENSCARG00000025438 ENSCARG00000025397 ENSCARG00000025390 ENSCARG00000025355 itga3b (ENSCARG00000025296) dlx3b (ENSCARG00000025233) dlx4b (ENSCARG00000025218) ENSCARG00000025165 kat7b (ENSCARG00000023431) g6pc1a.1 (ENSCARG00000023314) ##22 g6pc1a.2 (ENSCARG00000023278) ##22 aarsd1 (ENSCARG00000023127) sgms1b (ENSCARG00000023104) asah2 (ENSCARG00000022864) A1CF (ENSCARG00000022824) PRKG1 (ENSCARG00000022793) dkk1b (ENSCARG00000022785) ENSCARG00000022780 pcdh15b (ENSCARG00000022533) ipmkb (ENSCARG00000022490) ENSCARG00000022484 tfam (ENSCARG00000022477) zgc:171971 (ENSCARG00000022471) BICC1 (ENSCARG00000021966) phyhiplb (ENSCARG00000021939) FAM13C (ENSCARG00000021927) Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000157825.a.a ENSGT00390000017833.d ENSGT00940000164645.b.a ENSGT00940000153249.a.e ENSGT00940000157356.d ENSGT00940000156410.g.e ENSGT00940000157037.b.b.a.j ENSGT00940000159911.e ENSGT00940000163600.h ENSGT00940000157746.e.b ENSGT00940000158951.e.b ENSGT00940000165079.a.d ENSGT00650000094974.b.a ENSGT00940000157744.d.d ENSGT00950000183150.a.a.b.d ##22 ENSGT00950000183150.a.a.a.c.f ##22 ENSGT00940000156241 ENSGT00940000158306.u.a ENSGT00390000015792.w ENSGT00940000158678.l ENSGT00940000158306.u.b ENSGT00390000015792.x ENSGT00940000158678.k ENSGT00940000154704.d.b.d.b.b ENSGT00940000161319 ENSGT00940000165723.a.b ENSGT00940000156675.d.b ENSGT00940000155309.p.b ENSGT00940000155109.a.b.b ENSGT00440000039001.b ENSGT00390000013948.b.d Common carp reference MODERN SPECIES 44 plce1 (ENSCCRG00000039636) ENSCCRG00000028425 ENSCCRG00000079411 ENSCCRG00000033395 ENSCCRG00000082904 ENSCCRG00000075036 ENSCCRG00000077586 ENSCCRG00000007722 ENSCCRG00000033437 itga3b (ENSCCRG00000007713) dlx3b (ENSCCRG00000031645) dlx4b (ENSCCRG00000031648) ENSCCRG00000036450 kat7b (ENSCCRG00000002180) g6pc1a.1 (ENSCCRG00000065767) ##22 g6pc1a.2 (ENSCCRG00000037979) ##22 aarsd1 (ENSCCRG00000047672) sgms1b (ENSCCRG00000038187) asah2 (ENSCCRG00000038197) ENSCCRG00000007736 ENSCCRG00000050067 dkk1b (ENSCCRG00000050071) pcdh15b (ENSCCRG00000073582) ipmkb (ENSCCRG00000050608) ube2d1b (ENSCCRG00000049906) tfam (ENSCCRG00000049909) zgc:171971 (ENSCCRG00000032626) ENSCCRG00000070745 BICC1 (ENSCCRG00000015986) phyhiplb (ENSCCRG00000073279) ENSCCRG00000074918 Golden-line barbel MODERN SPECIES 598 fra10ac1 (ENSSGRG00000043370) lgi1b (ENSSGRG00000043369) ENSSGRG00000043367 SLC35G1 (ENSSGRG00000043366) plce1 (ENSSGRG00000043325) ENSSGRG00000042896 ENSSGRG00000042894 ENSSGRG00000042893 ENSSGRG00000042388 itga3b (ENSSGRG00000042378) dlx3b (ENSSGRG00000042377) dlx4b (ENSSGRG00000042376) ENSSGRG00000042375 kat7b (ENSSGRG00000042374) g6pc1a.1 (ENSSGRG00000042340) ##22 g6pc1a.2 (ENSSGRG00000042338) ##22 ENSSGRG00000042337 sgms1b (ENSSGRG00000042336) asah2 (ENSSGRG00000042335) A1CF (ENSSGRG00000042318) ENSSGRG00000041784 DKK1 (ENSSGRG00000041758) Zebrafish MODERN SPECIES 3 SLC35G1 (ENSDARG00000063268) plce1 (ENSDARG00000087921) noc3l (ENSDARG00000002487) ENSDARG00000073771 ENSDARG00000040765 ENSDARG00000063283 ENSDARG00000079166 itga3b (ENSDARG00000012824) dlx3b (ENSDARG00000014626) dlx4b (ENSDARG00000071560) ENSDARG00000112024 ENSDARG00000096645 kat7b (ENSDARG00000031770) ptges3l (ENSDARG00000079462) g6pc1a.1 (ENSDARG00000031616) ##22 g6pc1a.2 (ENSDARG00000013721) ##22 aarsd1 (ENSDARG00000015747) sgms1b (ENSDARG00000029621) asah2 (ENSDARG00000012829) rltgr (ENSDARG00000096533) A1CF (ENSDARG00000002968) PRKG1 (ENSDARG00000031702) dkk1b (ENSDARG00000045219) ENSDARG00000071772 pcdh15b (ENSDARG00000008127) ENSDARG00000096624 ipmkb (ENSDARG00000029291) ube2d1b (ENSDARG00000038576) tfam (ENSDARG00000063145) zgc:171971 (ENSDARG00000042054) BICC1 (ENSDARG00000070497) Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 122 ENSGT00940000153249.a ENSGT00940000157356 ENSGT00390000008540 ENSGT00940000156410.g ENSGT00940000157037.b.b.a ENSGT00940000159911 ENSGT00940000167052 ENSGT00940000163600 ENSGT00940000157746.e ENSGT00940000158951.e ENSGT00940000165079.a ENSGT00650000094974.b ENSGT00940000157744.d ENSGT00940000163448 ENSGT00950000183150.a.a.b ##22 ENSGT00950000183150.a.a.a.c ##22 ENSGT00940000156241 Denticle herring DUPLICATION Denticle herring MODERN SPECIES 11 PHOSPHO1 (ENSDCDG00000001662) ENSDCDG00000001663 ENSDCDG00000001664 ADAM11 (ENSDCDG00000001670) #8 P3H4 (ENSDCDG00000001731) fkbp10b (ENSDCDG00000001733) ENSDCDG00000001738 ENSDCDG00000001753 itga3b (ENSDCDG00000002157) dlx3b (ENSDCDG00000002164) dlx4b (ENSDCDG00000002167) ENSDCDG00000002168 kat7b (ENSDCDG00000002177) ptges3l (ENSDCDG00000002205) g6pc1a.1 (ENSDCDG00000002209) ##22 g6pc1a.2 (ENSDCDG00000002231) ##22 aarsd1 (ENSDCDG00000002244) adkb (ENSDCDG00000002266) KAT6B (ENSDCDG00000002290) ENSDCDG00000002294 DUSP13 (ENSDCDG00000002297) ENSDCDG00000002298 SAMD8 (ENSDCDG00000000134) VDAC2 (ENSDCDG00000000160) COMTD1 (ENSDCDG00000000256) ZNF503 (ENSDCDG00000000297) KCNMA1 (ENSDCDG00000000531) DLG5 (ENSDCDG00000000929) adkb (ENSDCDG00000000964) KAT6B (ENSDCDG00000000970) ENSDCDG00000000978 Denticle herring MODERN SPECIES 256 kat7b (ENSDCDG00000016711) ptges3l (ENSDCDG00000016708) g6pc1a.1 (ENSDCDG00000016325) ##22 g6pc1a.2 (ENSDCDG00000016319) ##22 aarsd1 (ENSDCDG00000016315) Atlantic herring MODERN SPECIES 15 plce1 (ENSCHAG00000017870) noc3l (ENSCHAG00000017878) ENSCHAG00000018201 ENSCHAG00000019984 TNKS2 (ENSCHAG00000020022) ENSCHAG00000020994 ENSCHAG00000021004 ENSCHAG00000021037 itga3b (ENSCHAG00000021380) dlx3b (ENSCHAG00000021429) dlx4b (ENSCHAG00000021459) ENSCHAG00000021524 kat7b (ENSCHAG00000021539) ptges3l (ENSCHAG00000022180) g6pc1a.1 (ENSCHAG00000022186) ##22 g6pc1a.2 (ENSCHAG00000022194) ##22 aarsd1 (ENSCHAG00000022226) WIPI1 (ENSCHAG00000022532) prkar1ab (ENSCHAG00000022558) fam20a (ENSCHAG00000022703) LRRC45 (ENSCHAG00000022888) rac3b (ENSCHAG00000022908) dcxr (ENSCHAG00000022953) rfng (ENSCHAG00000022977) GPS1 (ENSCHAG00000023003) ENSCHAG00000023130 rbp4 (ENSCHAG00000023134) tubgcp2 (ENSCHAG00000023149) ENSCHAG00000023187 exoc6 (ENSCHAG00000023220) CYP26C1 (ENSCHAG00000023737) Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 43 ENSGT00940000157854 ENSGT00950000183178.b.b.b ENSGT00940000157917.a.b ENSGT00940000155510 ENSGT00940000158142 ENSGT00940000154018.a ENSGT00390000014900.b.b.b ENSGT00940000162682.B ENSGT00940000154152.b.b ENSGT00940000161341.a.a ENSGT00940000166248.a ENSGT00390000016335.h ENSGT00950000183098.a.b ENSGT00950000183207.b ENSGT00950000183150.a.a.b ##22 ENSGT00950000183150.a.a.a.c ##22 ENSGT00940000156241 ENSGT00940000163448 ENSGT00940000157744 ENSGT00650000094974 ENSGT00940000165079 ENSGT00940000158951.e ENSGT00940000157746.e ENSGT00940000163600 ENSGT00940000154811.A ENSGT00940000155348.B.d #14 ENSGT00940000160643 ENSGT00940000159914 ENSGT00390000018386 ENSGT00940000165576.a.b ENSGT00940000157539 P. kingsleyae MODERN SPECIES 140 thraa (ENSPKIG00000001202) DHX8 (ENSPKIG00000001290) etv4 (ENSPKIG00000001383) meox1 (ENSPKIG00000001445) SOST (ENSPKIG00000001485) dusp3b (ENSPKIG00000001501) cbx1b (ENSPKIG00000001532) ENSPKIG00000001572 arl4d (ENSPKIG00000001594) tmem106a (ENSPKIG00000001622) ENSPKIG00000001637 nbr1a (ENSPKIG00000001662) psme3 (ENSPKIG00000001731) aoc2 (ENSPKIG00000001770) g6pc1a.1 (ENSPKIG00000001796) ##22 g6pc1a.2 (ENSPKIG00000001818) ##22 aarsd1 (ENSPKIG00000001834) ptges3l (ENSPKIG00000001885) Asian bonytongue MODERN SPECIES 17 ENSSFOG00015031627 ENSSFOG00015028168 ENSSFOG00015032201 dlx3b (ENSSFOG00015030338) dlx4b (ENSSFOG00015009114) ENSSFOG00015009093 kat7b (ENSSFOG00015008976) ptges3l (ENSSFOG00015008932) aarsd1 (ENSSFOG00015008880) g6pc1a.1 (ENSSFOG00015008872) ##22 g6pc1a.2 (ENSSFOG00015027300) ##22 ENSSFOG00015024966 aoc2 (ENSSFOG00015008829) psme3 (ENSSFOG00015026184) nbr1a (ENSSFOG00015008795) tmem106a (ENSSFOG00015008781) arl4d (ENSSFOG00015008747) ENSSFOG00015026663 ENSSFOG00015008693 ap4b1 (ENSSFOG00015008677) SLC16A1 (ENSSFOG00015008659) ENSSFOG00015025644 ENSSFOG00015008625 ENSSFOG00015027788 mov10b.1 (ENSSFOG00015008568) st7l (ENSSFOG00015008506) Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 610 ENSGT00950000183098.a.a ENSGT00950000183207.b ENSGT00950000183150.a.a.a.d ##22 Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000161341.a.b ENSGT00940000166248.b ENSGT00390000016335.g ENSGT00950000183098.a.a ENSGT00950000183207.b ENSGT00950000183150.a.a.a.d ##22 ENSGT00940000157744.c ENSGT00650000094974.a ENSGT00940000165079.b ENSGT00940000158951.f ENSGT01050000245366 ENSGT00940000160643.i ENSGT00940000155348.B.c #14 ENSGT00940000163871.b #15 ENSGT00940000154811.A ENSGT00530000063991.a ENSGT00390000004038 ENSGT01000000215678 ENSGT00950000182860.a.a.a.ub.a ENSGT00510000050089.b ENSGT00940000171795 Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 354 ENSGT00940000161341.a.b ENSGT00940000166248.b ENSGT00390000016335.g ENSGT00950000183098.a.a ENSGT00950000183207.b ENSGT00950000183150.a.a.a.d ##22 ENSGT00940000157744.c ENSGT00650000094974.a Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00950000183197.a ENSGT00940000156447.a.b ENSGT00940000158431.a.a.b.e.a ENSGT00940000159871.b.a.a.l ENSGT01000000215678 ENSGT00950000182860.a.a.a.ub.a ENSGT00390000004690.a.a ENSGT00940000166711 ENSGT00390000003628.a.b ENSGT00940000155223.a.a ENSGT00940000161341.a.b ENSGT00940000166248.b ENSGT00390000016335.g ENSGT00950000183098.a.a ENSGT00950000183207.b ENSGT00950000183150.a.a.a.d ##22 ENSGT00940000157744.c ENSGT00650000094974.a ENSGT00390000005065 ENSGT00940000165414 ENSGT00940000154615.i.b.f ENSGT00940000160234.a.a ENSGT00940000155412.a.a.a ENSGT01000000214708.a.a ENSGT00940000154535.A ENSGT00940000159148.a ENSGT00950000183047.c.a.a ENSGT00970000195776 ENSGT00940000155091.fb ENSGT00530000064158 ENSGT01030000234518.C.a.a Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 565 ENSGT00940000159871.b.a.a.l.a ENSGT01000000215678.a.a.a ENSGT00950000182860.a.a.a.ub.a.c ENSGT00390000004690.a.a ENSGT00940000166711 ENSGT00390000003628.a.b.c.a ENSGT00390000003628.a.b.d ENSGT00940000155223.a.a.c 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Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 137 ENSGT00390000016335.g.b ENSGT00950000183098.a.a.e.b ENSGT00950000183207.b ENSGT00950000183150.a.a.a.d ##22 ENSGT00940000157744.c.d ENSGT00390000005065.i.b ENSGT00940000160234.a.a.b ENSGT00940000155412.a.a.a.a ENSGT00940000154535.A ENSGT00940000159148.a.b ENSGT00950000183047.c.a.a.d ENSGT00940000159005.c.a.a.e.a.a.b ENSGT00940000159005.c.a.a.e.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000155091.fb.a ENSGT00940000159148.a.a ENSGT00950000183047.c.a.a.c ENSGT00940000159005.c.a.a.e.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000155091.fb.b ENSGT00530000064158.c.b Oncorhynchus DUPLICATION Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00940000156447.a.b.db.b ENSGT00940000163148.a.b.b.b.d.b.a.b ENSGT00940000158431.a.a.b.e.a.b ENSGT00940000159871.b.a.a.l.b.b ENSGT01000000215678.a.b ENSGT00950000182860.a.a.a.ub.a.c ENSGT00390000004690.a.a ENSGT00940000166711.e.b ENSGT00390000003628.a.b.c.a ENSGT00940000155223.a.a.c.a ENSGT00940000161341.a.b.j ENSGT00940000166248.b.e ENSGT00390000016335.g.a ENSGT00950000183098.a.a.f ENSGT00950000183207.b.mb ENSGT00950000183150.a.a.a.d.c ##22 ENSGT00940000157744.c.c ENSGT00650000094974.a.c ENSGT00390000005065.i.a ENSGT00390000005065.j ENSGT00940000165414 ENSGT00940000154615.i.b.f.f.a ENSGT00940000160234.a.a.b.a ENSGT00940000155412.a.a.a.a.d ENSGT00940000154535.A ENSGT00940000159148.a.b ENSGT00950000183047.c.a.a.d ENSGT00940000159005.c.a.a.e.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000155091.fb.b ENSGT00530000064158.c.b ENSGT01100000263537.b.a.b.f.b Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 79 ENSGT00940000156447.a.b.db.b ENSGT00940000163148.a.b.b.b.d.b.a.b ENSGT00940000158431.a.a.b.e.a.b ENSGT00940000159871.b.a.a.l.b.b ENSGT01000000215678.a.b ENSGT00950000182860.a.a.a.ub.a.c ENSGT00390000004690.a.a ENSGT00940000166711.e.b ENSGT00390000003628.a.b.c.a ENSGT00940000155223.a.a.c.a ENSGT00940000161341.a.b.j ENSGT00940000166248.b.e ENSGT00390000016335.g.a ENSGT00950000183098.a.a.f ENSGT00950000183207.b.mb ENSGT00950000183150.a.a.a.d.c ##22 ENSGT00940000157744.c.c 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(ENSOMYG00000042778) ENSOMYG00000042768 ENSOMYG00000042761 notch3 (ENSOMYG00000042475) rdh8a (ENSOMYG00000042369) ENSOMYG00000068280 olfm2a (ENSOMYG00000064443) trip10a (ENSOMYG00000042358) ENSOMYG00000042341 ENSOMYG00000042329 ppan (ENSOMYG00000042316) eif3g (ENSOMYG00000042301) dnmt1 (ENSOMYG00000041796) Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 48 ENSGT00950000183197.a.g ENSGT00940000156447.a.b.db.a ENSGT00940000163148.a.b.b.b.d.b.a.a ENSGT00940000158431.a.a.b.e.a.a ENSGT00940000159871.b.a.a.l.b.a ENSGT01000000215678.b ENSGT00950000182860.a.a.a.ub.a.d ENSGT00940000166711.e.a ENSGT00390000003628.a.b.d ENSGT00940000155223.a.a.c.b ENSGT00940000161341.a.b.i ENSGT00940000166248.b.f ENSGT00390000016335.g.b ENSGT00950000183098.a.a.e.b ENSGT00950000183207.b.lb ENSGT00950000183150.a.a.a.d.d ##22 ENSGT00940000157744.c.d ENSGT00650000094974.a.d ENSGT00390000005065.i.b ENSGT00940000154615.i.b.f.f.b ENSGT00940000160234.a.a.b.b ENSGT00940000155412.a.a.a.a.c ENSGT00940000159148.a.a 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ENSGT00950000183197.a.g ENSGT00940000156447.a.b.db.a ENSGT00940000163148.a.b.b.b.d.b.a.a.a ENSGT00940000158431.a.a.b.e.a.a ENSGT00940000159871.b.a.a.l.b.a ENSGT01000000215678.b ENSGT00950000182860.a.a.a.ub.a.d ENSGT00940000166711.e.a ENSGT00390000003628.a.b.d ENSGT00940000155223.a.a.c.b ENSGT00940000161341.a.b.i ENSGT00940000166248.b.f ENSGT00390000016335.g.b ENSGT00950000183098.a.a.e.b ENSGT00950000183207.b.lb ENSGT00950000183150.a.a.a.d.d ##22 ENSGT00940000157744.c.d ENSGT00650000094974.a.d ENSGT00390000005065.i.b ENSGT00940000154615.i.b.f.f.b ENSGT00940000160234.a.a.b.b ENSGT00940000155412.a.a.a.a.c ENSGT00940000154535.A ENSGT00940000159148.a.b ENSGT00950000183047.c.a.a.d ENSGT00940000159005.c.a.a.e.a.a.a.a.a.b ENSGT00950000183047.c.a.a.c.b ENSGT00940000159005.c.a.a.e.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000155091.fb.a ENSGT00530000064158.d ENSGT00530000064158.c.a Coho salmon MODERN SPECIES 26 ENSOKIG00005003336 ENSOKIG00005003327 ENSOKIG00005003321 WNK4 (ENSOKIG00005003309) ENSOKIG00005003302 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ENSGT00940000161341.a.b.g ENSGT00390000016335.g.b ENSGT00950000183098.a.a.e.a.b ENSGT00950000183207.b.jb ENSGT00950000183150.a.a.a.d ##22 ENSGT00940000157744.c.d ENSGT00390000005065.j ENSGT00940000165414.d ENSGT00940000159148.a.a ENSGT00950000183047.c.a.a.c ENSGT00940000160969 ENSGT00530000064158.c.a ENSGT01030000234518.C.a.a ENSGT00510000047802.h.a ENSGT00390000005100.f.b ENSGT00940000154348.c.b.a.a.a.d.a.b ENSGT01050000244887.A.a.a.b.c ENSGT00940000159005.c.a.a.e.a.a.a.a.b.b.b ENSGT00940000159005.c.a.b.c.a ENSGT00390000013443.c.i.b Atlantic salmon MODERN SPECIES 22 cyb561 (ENSSSAG00000083759) ENSSSAG00000009755 ENSSSAG00000086627 ENSSSAG00000081938 ENSSSAG00000091120 ENSSSAG00000009814 ENSSSAG00000009824 ENSSSAG00000049829 ENSSSAG00000117166 ENSSSAG00000010003 ENSSSAG00000010264 ENSSSAG00000115602 ENSSSAG00000049502 PSME3 (ENSSSAG00000010640) ENSSSAG00000010709 G6PC1 (ENSSSAG00000010738) ##22 myst2 (ENSSSAG00000010864) shfl (ENSSSAG00000016147) ENSSSAG00000016216 ENSSSAG00000098726 ENSSSAG00000110502 notch3 (ENSSSAG00000017188) rdh8a (ENSSSAG00000093095) ENSSSAG00000091513 col5a3a (ENSSSAG00000090709) olfm2a (ENSSSAG00000037307) trip10a (ENSSSAG00000014835) p2ry11 (ENSSSAG00000118972) ppan (ENSSSAG00000041926) p2ry11 (ENSSSAG00000116010) eif3g (ENSSSAG00000042802) River trout DUPLICATION River trout MODERN SPECIES 25 ENSSTUG00000025705 WNK4 (ENSSTUG00000025640) ENSSTUG00000025623 ENSSTUG00000025609 ENSSTUG00000025562 rpl23 (ENSSTUG00000025426) ENSSTUG00000025408 smarce1 (ENSSTUG00000025323) CA10 (ENSSTUG00000025067) ENSSTUG00000025045 ARL4D (ENSSTUG00000025017) ENSSTUG00000024999 ENSSTUG00000024944 PSME3 (ENSSTUG00000024841) aoc2 (ENSSTUG00000024810) G6PC1 (ENSSTUG00000024797) ##22 ENSSTUG00000022760 ENSSTUG00000022656 shfl (ENSSTUG00000022646) ENSSTUG00000022613 MFAP4 (ENSSTUG00000022590) notch3 (ENSSTUG00000017994) rdh8a (ENSSTUG00000017789) olfm2a (ENSSTUG00000017771) trip10a (ENSSTUG00000017501) angptl6 (ENSSTUG00000017474) ppan (ENSSTUG00000017288) p2ry11 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ENSELUG00000006622 rpl23 (ENSELUG00000030205) ENSELUG00000006560 smarce1 (ENSELUG00000006546) CA10 (ENSELUG00000006534) ARL4D (ENSELUG00000006503) ENSELUG00000006495 ENSELUG00000006472 PSME3 (ENSELUG00000006404) aoc2 (ENSELUG00000028008) G6PC1 (ENSELUG00000028876) ##22 ENSELUG00000006352 KAT7 (ENSELUG00000006337) ENSELUG00000006315 shfl (ENSELUG00000029233) MFAP4 (ENSELUG00000001383) notch3 (ENSELUG00000006223) rdh8a (ENSELUG00000006157) ENSELUG00000006138 ENSELUG00000024550 olfm2a (ENSELUG00000024523) trip10a (ENSELUG00000024488) ENSELUG00000024268 ENSELUG00000024203 ppan (ENSELUG00000024160) p2ry11 (ENSELUG00000024129) Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183150.a.a.a.d ##22 Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 156 ENSGT00940000165190.B ENSGT00950000183150.a.a.a.d ##22 ENSGT00390000016335.g ENSGT00940000166248.b ENSGT00940000161341.a.b ENSGT00950000183207.b ENSGT00950000183098.a.a ENSGT01100000263693 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 49 ENSGT00940000161529 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ENSGT00950000183098.a.a ENSGT00950000183207.b ENSGT00940000165190.B ENSGT00950000183150.a.a.a.d ##22 ENSGT00390000016335.g ENSGT00940000166248.b ENSGT00940000161341.a.b ENSGT00940000153500.a.b.f ENSGT00940000155148.a.a ENSGT00950000183183.a ENSGT00940000156833.b ENSGT00940000155575.i.b ENSGT00940000157054.c.a ENSGT00940000156505.t ENSGT00390000017136 ENSGT00940000171636 ENSGT00390000007164 ENSGT00940000156435 ENSGT00940000153578.B Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000161230 ENSGT00940000161529 ENSGT00940000161386 ENSGT00940000159029 ENSGT00940000167564 ENSGT00940000157981.a.b ENSGT00940000159091 ENSGT00940000157439.a ENSGT00940000153704.B.d ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a.b ENSGT00940000164903.b ENSGT01100000263693 ENSGT00950000183098.a.a ENSGT00950000183207.b ENSGT00940000165190.B ENSGT00950000183150.a.a.a.d ##22 ENSGT00390000016335.g ENSGT00940000166248.b ENSGT00940000161341.a.b ENSGT00940000153500.a.b.f ENSGT00940000155148.a.a ENSGT00950000183183.a ENSGT00940000156833.b ENSGT00940000155575.i.b ENSGT00940000157054.c.a ENSGT00940000156505.t ENSGT00390000017136 ENSGT00940000171636 ENSGT00390000007164 ENSGT00940000156435 ENSGT00940000153578.B Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00940000160972 ENSGT00940000167194 ENSGT00950000182838.A.a.a ENSGT00940000154700 ENSGT00940000158693.A ENSGT00940000176920 ENSGT00940000160271 ENSGT00950000183205.b.a.b.a.a ENSGT00940000160292 ENSGT00940000153222.a.b.a ENSGT00940000167671 ENSGT01090000260003.a.b.b.a.b ENSGT00950000183098.a.a ENSGT00950000183207.b ENSGT00940000165190.B ENSGT00950000183150.a.a.a.d ##22 ENSGT00390000016335.g ENSGT00940000166248.b ENSGT00940000161341.a.b ENSGT00940000153500.a.b.f ENSGT00940000155148.a.a ENSGT00950000183183.a ENSGT00940000156833.b ENSGT00940000155575.i.b ENSGT00940000157054.c.a ENSGT00940000156505.t ENSGT00390000017136 ENSGT00940000171636 ENSGT00390000007164 ENSGT00940000156435 ENSGT00940000153578.B Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00940000160972 ENSGT00940000167194 ENSGT00950000182838.A.a.a ENSGT00940000154700 ENSGT00940000158693.A ENSGT00940000176920 ENSGT00940000160271 ENSGT00950000183205.b.a.b.a.a ENSGT00940000160292 ENSGT00940000153222.a.b.a ENSGT00940000167671 ENSGT01090000260003.a.b.b.a.b ENSGT00950000183098.a.a ENSGT00950000183207.b ENSGT00940000165190.B ENSGT00950000183150.a.a.a.d ##22 ENSGT00390000016335.g ENSGT00940000166248.b ENSGT00940000161341.a.b ENSGT00940000153500.a.b.f ENSGT00940000155148.a.a ENSGT00950000183183.a ENSGT00940000156833.b ENSGT00940000155575.i.b ENSGT00940000157054.c.a ENSGT00940000156505.t ENSGT00390000017136 ENSGT00940000171636 ENSGT00390000007164 ENSGT00940000156435 ENSGT00940000153578.B Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000161230 ENSGT00940000161529 ENSGT00940000161386 ENSGT00940000159029 ENSGT00940000167564 ENSGT00940000157981.a.b ENSGT00940000159091 ENSGT00940000157439.a ENSGT00940000153704.B.d ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a.b ENSGT00940000164903.b ENSGT01090000260003.a.b.b.a.b ENSGT00950000183098.a.a 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ENSGT00940000157054.c.a ENSGT00940000156505.t ENSGT00390000017136 ENSGT00940000171636 ENSGT00770000120884 ENSGT00390000007164 ENSGT00940000156435 Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000161529 ENSGT00940000161386 ENSGT00940000159029 ENSGT00940000167564 ENSGT00940000157981.a.b ENSGT00940000159091 ENSGT00940000157439.a ENSGT00940000153704.B.d ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a.b ENSGT00940000164903.b ENSGT01100000263693 ENSGT01090000260003.a.b.b.a.b ENSGT00950000183098.a.a ENSGT00950000183207.b ENSGT00940000165190.B ENSGT00950000183150.a.a.a.d ##22 ENSGT00390000016335.g ENSGT00940000166248.b ENSGT00940000161341.a.b ENSGT00940000153500.a.b.f ENSGT00940000155148.a.a ENSGT00950000183183.a ENSGT00940000156833.b ENSGT00940000155575.i.b ENSGT00940000157054.c.a ENSGT00940000156505.t ENSGT00390000017136 ENSGT00940000171636 ENSGT00770000120884 ENSGT00390000007164 ENSGT00940000156435 European seabass MODERN SPECIES 156 ENSDLAG00005033917 ENSDLAG00005033453 ENSDLAG00005028691 ENSDLAG00005035095 ENSDLAG00005003620 ENSDLAG00005003543 ENSDLAG00005003450 ENSDLAG00005003420 ENSDLAG00005003397 ENSDLAG00005033219 ENSDLAG00005003120 ##22 ENSDLAG00005003048 ENSDLAG00005027336 Large yellow croaker MODERN SPECIES 483 hoxb8a (ENSLCRG00005009416) hoxb9a (ENSLCRG00005009434) hoxb13a (ENSLCRG00005009437) eve1 (ENSLCRG00005009438) atp5mc1 (ENSLCRG00005009440) ube2z (ENSLCRG00005009442) ENSLCRG00005009443 ENSLCRG00005009449 ENSLCRG00005009536 pdk2b (ENSLCRG00005009537) kcnc3a (ENSLCRG00005009547) ENSLCRG00005009550 PSME3 (ENSLCRG00005009551) aoc2 (ENSLCRG00005009552) ENSLCRG00005009553 G6PC1 (ENSLCRG00005009554) ##22 ENSLCRG00005009595 ENSLCRG00005009598 ARL4D (ENSLCRG00005009599) rac3a (ENSLCRG00005009601) prkar1aa (ENSLCRG00005009602) zgc:86896 (ENSLCRG00005009617) wipi1 (ENSLCRG00005009626) SLC16A6 (ENSLCRG00005009663) gna13a (ENSLCRG00005009666) rgs9a (ENSLCRG00005000617) COG1 (ENSLCRG00005001168) ENSLCRG00005001173 rogdi (ENSLCRG00005001182) glyr1 (ENSLCRG00005001240) ppl (ENSLCRG00005001263) Perciformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183150.a.a.a.d ##22 Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183150.a.a.a.d ##22 Pike perch MODERN SPECIES 91 gspt1l (ENSSLUG00000019943) ENSSLUG00000020210 ENSSLUG00000020216 RRN3 (ENSSLUG00000020231) ppl (ENSSLUG00000020495) glyr1 (ENSSLUG00000021077) rogdi (ENSSLUG00000021086) ENSSLUG00000021105 COG1 (ENSSLUG00000021108) rgs9a (ENSSLUG00000021131) ENSSLUG00000021149 gna13a (ENSSLUG00000021151) SLC16A6 (ENSSLUG00000021156) wipi1 (ENSSLUG00000021221) zgc:86896 (ENSSLUG00000021697) G6PC1 (ENSSLUG00000021703) ##22 ENSSLUG00000021707 ARL4D (ENSSLUG00000021712) hao1 (ENSSLUG00000021720) smg1 (ENSSLUG00000021789) fbxl16 (ENSSLUG00000022181) ENSSLUG00000022188 ENSSLUG00000022229 ENSSLUG00000022576 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000161230 ENSGT00940000161529 ENSGT00940000161386 ENSGT00940000159029 ENSGT00940000167564 ENSGT00940000157981.a.b ENSGT00940000159091 ENSGT00940000157439.a ENSGT00940000153704.B.d ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a.b ENSGT00940000164903.b ENSGT01100000263693 ENSGT01090000260003.a.b.b.a.b ENSGT00950000183098.a.a ENSGT00950000183207.b ENSGT00950000183150.a.a.a.d ##22 ENSGT00390000016335.g ENSGT00940000166248.b ENSGT00940000161341.a.b ENSGT00940000153500.a.b.f ENSGT00940000155148.a.a ENSGT00950000183183.a ENSGT00940000156833.b ENSGT00940000155575.i.b ENSGT00940000157054.c.a ENSGT00940000156505.t ENSGT00390000017136 ENSGT00940000171636 ENSGT00390000007164 ENSGT00940000156435 ENSGT00940000153578.B Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000165576.a.b ENSGT00950000183145.B.a.b.c ENSGT01030000234785 ENSGT00940000168246 ENSGT00940000160643.i ENSGT00940000155348.B.c #14 ENSGT00940000163871.b #15 ENSGT00940000164286.j.b.a.a.a ENSGT00390000003628.a.b ENSGT00940000166711 ENSGT00390000004690.a.a ENSGT00940000167671 ENSGT01030000234606.a.b.i.a ENSGT00390000018541 ENSGT00390000010157.b ENSGT00950000183150.a.a.a.d ##22 ENSGT00390000016335.g ENSGT00940000166248.b ENSGT00940000161341.a.b Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000165576.a.b ENSGT00950000183145.B.a.b.c ENSGT01030000234785 ENSGT00940000168246 ENSGT00940000160643.i ENSGT00940000155348.B.c #14 ENSGT00940000163871.b #15 ENSGT00940000164286.j.b.a.a.a ENSGT00390000003628.a.b ENSGT00940000166711 ENSGT00390000004690.a.a ENSGT00940000167671 ENSGT01030000234606.a.b.i.a ENSGT00390000018541 ENSGT00390000010157.b ENSGT00950000183150.a.a.a.d ##22 ENSGT00390000016335.g ENSGT00940000166248.b ENSGT00940000161341.a.b ENSGT00950000183207.b ENSGT00950000183098.a.a ENSGT01100000263693 ENSGT00940000164903.b ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a.b ENSGT00940000153704.B.d ENSGT00940000157439.a ENSGT00940000159091 ENSGT00940000157981.a.b ENSGT00940000167564 ENSGT00940000159029 ENSGT00940000161386 Climbing perch MODERN SPECIES 21 ENSATEG00000025452 ENSATEG00000028299 ENSATEG00000010685 ENSATEG00000010638 #14 ENSATEG00000010394 #15 ENSATEG00000010369 ENSATEG00000010285 ENSATEG00000025703 ENSATEG00000010281 ENSATEG00000010264 ENSATEG00000010222 ENSATEG00000010194 ENSATEG00000010181 ENSATEG00000027794 ENSATEG00000010161 ENSATEG00000010121 ##22 ENSATEG00000010101 ENSATEG00000010085 ENSATEG00000010065 ENSATEG00000010051 ENSATEG00000010046 ENSATEG00000010020 ENSATEG00000010012 ENSATEG00000009990 ENSATEG00000009941 ENSATEG00000009928 ENSATEG00000028175 ENSATEG00000009789 ENSATEG00000009778 ube2z (ENSATEG00000009723) atp5mc1 (ENSATEG00000030107) Siamese fighting fish MODERN SPECIES 19 ENSBSLG00000012851 hoxb7a (ENSBSLG00000012850) hoxb8a (ENSBSLG00000012838) hoxb9a (ENSBSLG00000012831) hoxb13a (ENSBSLG00000012830) eve1 (ENSBSLG00000012826) atp5mc1 (ENSBSLG00000012820) ube2z (ENSBSLG00000012809) smarce1 (ENSBSLG00000012800) ENSBSLG00000012797 rpl23 (ENSBSLG00000012789) ENSBSLG00000012785 ENSBSLG00000012784 timm29 (ENSBSLG00000012779) yipf2 (ENSBSLG00000012776) G6PC1 (ENSBSLG00000012754) ##22 ENSBSLG00000012750 ENSBSLG00000012748 ARL4D (ENSBSLG00000012747) aoc2 (ENSBSLG00000012746) ENSBSLG00000012744 kcnc3a (ENSBSLG00000012726) pdk2b (ENSBSLG00000012626) ENSBSLG00000012607 OSBPL7 (ENSBSLG00000012366) zgc:86896 (ENSBSLG00000012323) rogdi (ENSBSLG00000011975) glyr1 (ENSBSLG00000011834) gna13a (ENSBSLG00000011687) rgs9a (ENSBSLG00000011483) COG1 (ENSBSLG00000011433) Carangaria ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000161230 ENSGT00940000161529 ENSGT00940000161386 ENSGT00940000159029 ENSGT00940000167564 ENSGT00940000157981.a.b ENSGT00940000159091 ENSGT00940000157439.a ENSGT00940000153704.B.d ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a.b ENSGT00940000164903.b ENSGT01100000263693 ENSGT01090000260003.a.b.b.a.b ENSGT00950000183098.a.a ENSGT00950000183207.b ENSGT00950000183150.a.a.a.d ##22 ENSGT00390000016335.g ENSGT00940000166248.b ENSGT00940000161341.a.b ENSGT00940000153500.a.b.f ENSGT00940000155148.a.a ENSGT00950000183183.a ENSGT00940000156833.b ENSGT00940000155575.i.b ENSGT00940000157054.c.a ENSGT00940000156505.t ENSGT00390000017136 ENSGT00940000171636 ENSGT00770000120884 ENSGT00390000007164 ENSGT00940000156435 Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 46 ENSGT00940000165065.a ENSGT00940000161230 ENSGT00940000161529 ENSGT00940000161386 ENSGT00940000159029 ENSGT00940000167564 ENSGT00940000157981.a.b ENSGT00940000159091 ENSGT00940000157439.a ENSGT00940000153704.B.d ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a.b ENSGT00940000164903.b ENSGT01090000260003.a.b.b.a.b ENSGT00950000183098.a.a ENSGT00950000183207.b ENSGT00950000183150.a.a.a.d ##22 ENSGT00390000016335.g ENSGT00940000166248.b ENSGT00940000161341.a.b ENSGT00940000153500.a.b.f ENSGT00940000155148.a.a ENSGT00950000183183.a ENSGT00940000156833.b ENSGT00940000155575.i.b ENSGT00940000157054.c.a ENSGT00940000156505.t ENSGT00390000017136 ENSGT00770000120884 ENSGT00390000007164 ENSGT00940000156435 ENSGT00940000153578.B Barramundi perch MODERN SPECIES 24 aoc2 (ENSLCAG00010009030) G6PC1 (ENSLCAG00010009035) ##22 ENSLCAG00010009039 ENSLCAG00010009060 ARL4D (ENSLCAG00010009069) rac3a (ENSLCAG00010009088) prkar1aa (ENSLCAG00010009208) zgc:86896 (ENSLCAG00010009249) wipi1 (ENSLCAG00010009256) SLC16A6 (ENSLCAG00010009263) GNA13 (ENSLCAG00010009270) rgs9a (ENSLCAG00010009293) COG1 (ENSLCAG00010009310) ENSLCAG00010009314 rogdi (ENSLCAG00010009318) glyr1 (ENSLCAG00010009332) ppl (ENSLCAG00010009367) Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 22 ABCC1 (ENSMMDG00005020742) ENSMMDG00005024211 ENSMMDG00005024213 abat (ENSMMDG00005024214) mettl22 (ENSMMDG00005024215) ENSMMDG00005024217 rarab (ENSMMDG00005024233) hspb9 (ENSMMDG00005024320) pyya (ENSMMDG00005024324) mpp2a (ENSMMDG00005024325) #14 ENSMMDG00005024333 #15 smarce1 (ENSMMDG00005024337) ENSMMDG00005024339 rpl23 (ENSMMDG00005024341) ENSMMDG00005024343 G6PC1 (ENSMMDG00005024347) ##22 ENSMMDG00005024356 ARL4D (ENSMMDG00005024358) ENSMMDG00005024359 ENSMMDG00005024360 ENSMMDG00005024361 ENSMMDG00005024363 ENSMMDG00005024364 ENSMMDG00005024366 CA10 (ENSMMDG00005024368) ENSMMDG00005024369 ENSMMDG00005024373 ENSMMDG00005024375 aoc2 (ENSMMDG00005024376) aoc2 (ENSMMDG00005024377) aoc2 (ENSMMDG00005024379) Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 358 ENSGT00940000161341.a.b ENSGT00940000166248.b ENSGT00390000016335.g ENSGT00950000183098.a.a ENSGT00950000183207.b ENSGT00950000183150.a.a.a.d ##22 ENSGT00940000157744.c ENSGT00650000094974.a ENSGT00940000165079.b ENSGT00940000158951.f ENSGT00530000064085.d ENSGT00530000063301.a.a.d ENSGT00390000008812.b.b.b ENSGT00940000157746.f ENSGT00940000155223.a.a ENSGT00390000003628.a.b ENSGT00940000166711 ENSGT00390000004690.a.a Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 213 ENSGT00940000154507.t ENSGT00940000161341.a.b ENSGT00940000166248.b ENSGT00390000016335.g ENSGT00950000183098.a.a.a ENSGT00950000183207.b ENSGT00950000183150.a.a.a.d ##22 ENSGT00940000157744.c ENSGT00650000094974.a ENSGT00940000165079.b ENSGT00940000158951.f ENSGT00940000162682.B.b ENSGT00940000157917.a.a ENSGT00530000064085.d ENSGT00530000063301.a.a.d ENSGT00390000008812.b.b.b ENSGT00940000157746.f ENSGT00940000155223.a.a ENSGT00390000004690.a.a ENSGT00940000166711 ENSGT00390000003628.a.b ENSGT00390000004038 Denticle herring MODERN SPECIES 17 sox10 (ENSDCDG00000026666) polr2f (ENSDCDG00000026668) MICALL1 (ENSDCDG00000026670) ENSDCDG00000026683 ENSDCDG00000027331 ENSDCDG00000027333 rusf1 (ENSDCDG00000027337) ENSDCDG00000027357 cd2bp2 (ENSDCDG00000027360) ENSDCDG00000027361 ARL4D (ENSDCDG00000027363) ENSDCDG00000027364 NBR1 (ENSDCDG00000027365) PSME3 (ENSDCDG00000027368) aoc2 (ENSDCDG00000027370) G6PC1 (ENSDCDG00000027372) ##22 KAT7 (ENSDCDG00000014057) ENSDCDG00000015082 dlx4a (ENSDCDG00000015090) ENSDCDG00000015093 dusp3b (ENSDCDG00000015097) THRA (ENSDCDG00000015154) nsfa (ENSDCDG00000015372) psmd11a (ENSDCDG00000017299) cdk5r1a (ENSDCDG00000018178) ENSDCDG00000018183 CA10 (ENSDCDG00000018204) rpl23 (ENSDCDG00000018328) ENSDCDG00000018333 smarce1 (ENSDCDG00000018337) ccdc103 (ENSDCDG00000018343) Atlantic herring MODERN SPECIES gps1 (ENSCHAG00000010411) rac3a (ENSCHAG00000010289) ENSCHAG00000010222 slc16a3a (ENSCHAG00000010213) engase (ENSCHAG00000010143) scpep1 (ENSCHAG00000009274) coil (ENSCHAG00000009249) rab11fip4a (ENSCHAG00000008893) RTN4R (ENSCHAG00000008872) ENSCHAG00000008861 ARL4D (ENSCHAG00000008844) ENSCHAG00000008827 ENSCHAG00000008794 PSME3 (ENSCHAG00000008598) aoc2 (ENSCHAG00000008581) G6PC1 (ENSCHAG00000008572) ##22 KAT7 (ENSCHAG00000006721) ENSCHAG00000006630 dlx4a (ENSCHAG00000006600) DLX3 (ENSCHAG00000006520) dusp3b (ENSCHAG00000006511) ENSCHAG00000006498 ENSCHAG00000006487 rarab (ENSCHAG00000006222) ENSCHAG00000006209 pyya (ENSCHAG00000006180) mpp2a (ENSCHAG00000004293) #14 ENSCHAG00000004183 #15 abi3a (ENSCHAG00000004138) FAM187A (ENSCHAG00000004112) ccdc103 (ENSCHAG00000004096) Otophysi ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000166711 ENSGT00390000004690.a.a ENSGT00390000004038 ENSGT00530000063991.a ENSGT00940000154811.A ENSGT00940000163871.b #15 ENSGT00940000155348.B.c #14 ENSGT00940000160643.i ENSGT00670000098179.e ENSGT00940000165576.a.b ENSGT00950000183145.A.b.a ENSGT01030000234785 ENSGT00390000016335.g ENSGT00950000183207.b ENSGT00950000183150.a.a.a.d ##22 ENSGT00940000157744.c ENSGT00390000000050 ENSGT00630000091000 ENSGT00520000055626.b ENSGT00390000012483 ENSGT00940000164923.a.b ENSGT00940000159038.a.b ENSGT00940000159805 ENSGT00940000160236 ENSGT00940000162290 ENSGT00940000157290 ENSGT00940000159512 ENSGT00390000001557 ENSGT00940000166574 ENSGT00390000015278 Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 98 ENSGT00390000016335.g ENSGT00950000183207.b ENSGT00950000183150.a.a.a.d ##22 ENSGT00940000157744.c ENSGT00940000161979.B.o ENSGT00390000000050 ENSGT00630000091000 ENSGT00520000055626.b ENSGT00390000012483 ENSGT00940000164923.a.b ENSGT00940000159038.a.b ENSGT00940000159805 ENSGT00940000165591.b ENSGT00940000160271 ENSGT00940000155421.a.b ENSGT00390000000111.b.a.b ENSGT01030000234862 ENSGT00940000155582.q.a Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 113 ENSGT00390000016335.g ENSGT00950000183207.b ENSGT00950000183150.a.a.a.d ##22 ENSGT00940000157744.c 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ENSPNAG00000013679 cd2bp2 (ENSPNAG00000002861) mylpfa (ENSPNAG00000013617) pheta2 (ENSPNAG00000013590) tbc1d10b (ENSPNAG00000002828) ENSPNAG00000013524 ENSPNAG00000013508 ABCC1 (ENSPNAG00000013431) ENSPNAG00000013336 nde1 (ENSPNAG00000002629) Mexicana tetra MODERN SPECIES 457 ENSAMXG00000001226 ENSAMXG00000029305 ENSAMXG00000038322 ENSAMXG00000033397 ENSAMXG00000036003 ENSAMXG00000001259 aoc2 (ENSAMXG00000024339) G6PC1 (ENSAMXG00000031108) ##22 ENSAMXG00000037103 Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000167103 ENSGT00940000160835 ENSGT00940000166711 ENSGT00390000004690.a.a ENSGT00390000004038 ENSGT00530000063991.a ENSGT00940000154811.A ENSGT00940000155348.B.c #14 ENSGT00940000160643.i ENSGT00670000098179.e ENSGT00940000165576.a.b ENSGT00950000183145.A.b.a ENSGT00940000155140.s ENSGT00390000016335.g ENSGT00950000183207.b ENSGT00950000183150.a.a.a.d ##22 ENSGT00940000157744.c ENSGT00940000161979.B.o ENSGT00390000000050 ENSGT00630000091000 ENSGT00520000055626.b ENSGT00390000012483 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carp reference MODERN SPECIES 1 gtpbp1 (ENSCCRG00000023155) ENSCCRG00000024476 rpl23 (ENSCCRG00000073217) abi3a (ENSCCRG00000073201) mpp2a (ENSCCRG00000065115) #14 pyya (ENSCCRG00000073767) hspb9 (ENSCCRG00000007869) rarab (ENSCCRG00000070551) ENSCCRG00000056654 ENSCCRG00000077207 ENSCCRG00000063386 ENSCCRG00000041983 ENSCCRG00000052811 ENSCCRG00000013183 aoc2 (ENSCCRG00000063375) ENSCCRG00000032099 ##22 ENSCCRG00000013229 rusf1 (ENSCCRG00000017991) ENSCCRG00000071035 ENSCCRG00000015331 pheta2 (ENSCCRG00000075166) mylpfa (ENSCCRG00000017709) tbc1d10b (ENSCCRG00000018014) hsd3b7 (ENSCCRG00000017958) ENSCCRG00000054069 fus (ENSCCRG00000065074) rnf25 (ENSCCRG00000018157) ENSCCRG00000071800 thoc6 (ENSCCRG00000018421) srrm2 (ENSCCRG00000067112) ENSCCRG00000052987 Golden-line barbel MODERN SPECIES 48 gtpbp1 (ENSSGRG00000054670) ENSSGRG00000054679 rpl23 (ENSSGRG00000054681) ccdc103 (ENSSGRG00000054693) FAM187A (ENSSGRG00000054694) abi3a (ENSSGRG00000054697) mpp2a (ENSSGRG00000054710) #14 pyya (ENSSGRG00000054787) pyya (ENSSGRG00000054788) hspb9 (ENSSGRG00000054789) rarab (ENSSGRG00000054792) ENSSGRG00000054800 CASP6 (ENSSGRG00000054802) ENSSGRG00000054804 aoc2 (ENSSGRG00000054805) G6PC1 (ENSSGRG00000054808) ##22 KAT7 (ENSSGRG00000054830) ENSSGRG00000054875 cd2bp2 (ENSSGRG00000054876) pheta2 (ENSSGRG00000054877) mylpfa (ENSSGRG00000054878) tbc1d10b (ENSSGRG00000054879) hsd3b7 (ENSSGRG00000054880) ENSSGRG00000054881 ENSSGRG00000054882 fus (ENSSGRG00000054883) ENSSGRG00000054884 rnf25 (ENSSGRG00000054885) ENSSGRG00000054886 thoc6 (ENSSGRG00000054888) ENSSGRG00000054889 Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00530000063991.a ENSGT00940000154811.A.o.b ENSGT00940000155348.B.c.b #14 ENSGT00940000160643.i.a ENSGT00670000098179.e.c ENSGT00940000165576.a.b.m.a ENSGT00940000154811.A.o.a ENSGT00940000155348.B.c.a #14 ENSGT00940000160643.i.b ENSGT00670000098179.e.d ENSGT00940000165576.a.b.m.b.a ENSGT00950000183145.A.a.t ENSGT00940000155140.s.a ENSGT00390000016335.g.d 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ENSGT00940000164923.a.b.a.b ENSGT00940000159038.a.b.b ENSGT00940000159038.a.b.a.b ENSGT00940000159805.f ENSGT00940000160236.c ENSGT00940000162290.`b ENSGT00940000157290.ib ENSGT00940000166391.o.b.a ENSGT00940000159512 ENSGT00390000001557.c Common carp reference MODERN SPECIES 3 ENSCCRG00000056571 sgsm3 (ENSCCRG00000036376) gtpbp1 (ENSCCRG00000072120) ENSCCRG00000070135 rpl23 (ENSCCRG00000072024) abi3a (ENSCCRG00000059284) mpp2a (ENSCCRG00000023127) #14 pyya (ENSCCRG00000023117) hspb9 (ENSCCRG00000077885) rarab (ENSCCRG00000063234) ENSCCRG00000074011 ENSCCRG00000038595 ENSCCRG00000015274 ENSCCRG00000015285 aoc2 (ENSCCRG00000013198) ENSCCRG00000013203 ##22 ENSCCRG00000015203 ENSCCRG00000015295 rusf1 (ENSCCRG00000015305) ENSCCRG00000074582 ENSCCRG00000080330 pheta2 (ENSCCRG00000053574) mylpfa (ENSCCRG00000058291) tbc1d10b (ENSCCRG00000069567) hsd3b7 (ENSCCRG00000018139) ENSCCRG00000057657 fus (ENSCCRG00000043288) ENSCCRG00000063566 kat8 (ENSCCRG00000043309) rnf25 (ENSCCRG00000080225) ENSCCRG00000018412 Golden-line barbel MODERN SPECIES 490 ELFN2 (ENSSGRG00000042346) sgsm3 (ENSSGRG00000041928) gtpbp1 (ENSSGRG00000041800) ENSSGRG00000041799 ccdc103 (ENSSGRG00000041798) ccdc103 (ENSSGRG00000041796) abi3a (ENSSGRG00000041794) mpp2a (ENSSGRG00000041791) #14 pyya (ENSSGRG00000041789) hspb9 (ENSSGRG00000041787) rarab (ENSSGRG00000041778) ENSSGRG00000041773 CASP6 (ENSSGRG00000041772) ENSSGRG00000041771 aoc2 (ENSSGRG00000041770) G6PC1 (ENSSGRG00000041725) ##22 KAT7 (ENSSGRG00000041591) ENSSGRG00000041585 rusf1 (ENSSGRG00000041577) ENSSGRG00000041573 cd2bp2 (ENSSGRG00000041571) pheta2 (ENSSGRG00000041570) mylpfa (ENSSGRG00000041569) tbc1d10b (ENSSGRG00000041564) hsd3b7 (ENSSGRG00000041527) ENSSGRG00000041519 fus (ENSSGRG00000041515) ENSSGRG00000041513 kat8 (ENSSGRG00000041366) rnf25 (ENSSGRG00000041363) ENSSGRG00000041362 Zebrafish MODERN SPECIES 18 rpl23 (ENSDARG00000053457) ccdc103 (ENSDARG00000053455) abi3a (ENSDARG00000060072) ENSDARG00000104213 mpp2a (ENSDARG00000053453) #14 pyya (ENSDARG00000053449) hspb9 (ENSDARG00000078674) rarab (ENSDARG00000034893) ENSDARG00000101017 ENSDARG00000111315 casp6b.2 (ENSDARG00000070368) casp6a (ENSDARG00000093405) casp6b.1 (ENSDARG00000025608) ENSDARG00000078772 aoc2 (ENSDARG00000014646) G6PC1 (ENSDARG00000014967) ##22 kat7a (ENSDARG00000070371) zgc:113090 (ENSDARG00000053260) rusf1 (ENSDARG00000059919) ENSDARG00000098191 ENSDARG00000089232 cd2bp2 (ENSDARG00000027357) pheta2 (ENSDARG00000110325) mylpfa (ENSDARG00000053254) tbc1d10b (ENSDARG00000078604) hsd3b7 (ENSDARG00000036966) ENSDARG00000060030 fus (ENSDARG00000037968) ENSDARG00000027196 kat8 (ENSDARG00000027187) rnf25 (ENSDARG00000027182) Spotted gar MODERN SPECIES 653 slc4a1a (ENSLOCG00000012065) #30 ENSLOCG00000017514 ENSLOCG00000012094 ENSLOCG00000012107 ENSLOCG00000012114 SOST (ENSLOCG00000012122) meox1 (ENSLOCG00000012129) etv4 (ENSLOCG00000012135) DHX8 (ENSLOCG00000012147) arl4d (ENSLOCG00000017515) tmem106a (ENSLOCG00000012162) nbr1a (ENSLOCG00000012171) psme3 (ENSLOCG00000012181) aoc2 (ENSLOCG00000012190) g6pc1a.1 (ENSLOCG00000012196) ##22 g6pc1a.2 (ENSLOCG00000012200) ##22 aarsd1 (ENSLOCG00000012212) RUNDC1 (ENSLOCG00000012232) rpl27 (ENSLOCG00000012239) ifi35 (ENSLOCG00000012246) ENSLOCG00000012256 gpatch8 (ENSLOCG00000012265) gosr2 (ENSLOCG00000012271) wnt9b (ENSLOCG00000012277) ENSLOCG00000012283 GRB7 (ENSLOCG00000012291) SRCIN1 (ENSLOCG00000012303) ccdc103 (ENSLOCG00000012314) ENSLOCG00000012317 FAM187A (ENSLOCG00000012335) cyb561 (ENSLOCG00000012338) Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES 95 ENSGT00940000156832 ENSGT00940000163949 ENSGT00940000156292 ENSGT00940000158599 ENSGT00950000183192.a.b ENSGT00940000159523 ENSGT00940000156497 ENSGT00530000063686.b ENSGT00390000010721.b ENSGT00390000007311 ENSGT00940000163448 ENSGT00940000156241 ENSGT00950000183150.a.a.a ##22 ENSGT00950000183207.b ENSGT00950000183098.a.a ENSGT00950000183150.a.a.b ##22 ENSGT00940000161341.a.a ENSGT00940000155510 ENSGT00940000158142 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ENSGT00390000016335.h ENSGT00940000166248.a ENSGT00940000161341.a.a ENSGT00940000154152.b.b ENSGT00940000162682.B ENSGT00390000014900.b.b.b ENSGT00940000154018.a ENSGT00940000158142 ENSGT00940000155510 ENSGT00940000157917.a.b ENSGT00950000183178.b.b.b ENSGT00940000157854 ENSGT00530000064085.c P. kingsleyae MODERN SPECIES 140 ptges3l (ENSPKIG00000001885) aarsd1 (ENSPKIG00000001834) g6pc1a.2 (ENSPKIG00000001818) ##22 g6pc1a.1 (ENSPKIG00000001796) ##22 aoc2 (ENSPKIG00000001770) psme3 (ENSPKIG00000001731) nbr1a (ENSPKIG00000001662) ENSPKIG00000001637 tmem106a (ENSPKIG00000001622) arl4d (ENSPKIG00000001594) ENSPKIG00000001572 cbx1b (ENSPKIG00000001532) dusp3b (ENSPKIG00000001501) SOST (ENSPKIG00000001485) meox1 (ENSPKIG00000001445) etv4 (ENSPKIG00000001383) DHX8 (ENSPKIG00000001290) thraa (ENSPKIG00000001202) ormdl3 (ENSPKIG00000001166) Asian bonytongue MODERN SPECIES 17 mov10b.1 (ENSSFOG00015008568) ENSSFOG00015027788 ENSSFOG00015008625 ENSSFOG00015025644 SLC16A1 (ENSSFOG00015008659) ap4b1 (ENSSFOG00015008677) ENSSFOG00015008693 ENSSFOG00015026663 arl4d (ENSSFOG00015008747) tmem106a (ENSSFOG00015008781) nbr1a (ENSSFOG00015008795) psme3 (ENSSFOG00015026184) aoc2 (ENSSFOG00015008829) ENSSFOG00015024966 g6pc1a.2 (ENSSFOG00015027300) ##22 g6pc1a.1 (ENSSFOG00015008872) ##22 aarsd1 (ENSSFOG00015008880) ptges3l (ENSSFOG00015008932) kat7b (ENSSFOG00015008976) ENSSFOG00015009093 dlx4b (ENSSFOG00015009114) dlx3b (ENSSFOG00015030338) ENSSFOG00015032201 ENSSFOG00015028168 ENSSFOG00015031627 Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 43 ENSGT01090000260005.a.b.a.a ENSGT00940000165576.b ENSGT00940000154352.A ENSGT00940000159914 ENSGT00940000160643.j ENSGT00940000155348.B.d #14 ENSGT00940000167052 ENSGT00940000163600 ENSGT00940000157746.e ENSGT00940000158951.e ENSGT00940000165079.a ENSGT00940000157744.d ENSGT00940000163448 ENSGT00940000156241 ENSGT00950000183150.a.a.a.c ##22 ENSGT00950000183150.a.a.b ##22 ENSGT00950000183098.a.b ENSGT00390000016335.h ENSGT00940000166248.a ENSGT00940000161341.a.a ENSGT00940000162682.B.a ENSGT00390000014900.b.b.b ENSGT00940000154018.a ENSGT00940000158142 ENSGT00940000155510 ENSGT00940000157917.a.b ENSGT00950000183178.b.b.b ENSGT00940000157854 ENSGT00530000064085.c ENSGT00530000063301.a.a.c.a ENSGT00390000008812.b.b.a Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 319 ENSGT00940000156241 ENSGT00950000183150.a.a.a.c ##22 ENSGT00950000183150.a.a.b ##22 ENSGT00940000163448 ENSGT00940000157744.d ENSGT00650000094974.b ENSGT00940000165079.a ENSGT00940000158951.e ENSGT00940000157746.e ENSGT00940000163600 ENSGT00940000167052 ENSGT00940000159911 ENSGT00940000157037.b.b.a ENSGT00940000156410.g ENSGT00390000008540 ENSGT00940000157356 ENSGT00940000153249.a ENSGT00940000164645.b Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 122 ENSGT00940000156241 ENSGT00950000183150.a.a.a.c ##22 ENSGT00950000183150.a.a.b ##22 ENSGT00940000163448 ENSGT00940000157744.d ENSGT00650000094974.b ENSGT00940000165079.a ENSGT00940000158951.e ENSGT00940000157746.e ENSGT00940000163600 ENSGT00940000167052 ENSGT00940000159911 ENSGT00940000157037.b.b.a ENSGT00940000156410.g ENSGT00390000008540 ENSGT00940000157356 ENSGT00940000153249.a ENSGT00940000164645.b Denticle herring DUPLICATION Denticle herring MODERN SPECIES 256 aarsd1 (ENSDCDG00000016315) g6pc1a.2 (ENSDCDG00000016319) ##22 g6pc1a.1 (ENSDCDG00000016325) ##22 ptges3l (ENSDCDG00000016708) kat7b (ENSDCDG00000016711) Denticle herring MODERN SPECIES 11 KAT6B (ENSDCDG00000000970) adkb (ENSDCDG00000000964) DLG5 (ENSDCDG00000000929) KCNMA1 (ENSDCDG00000000531) ZNF503 (ENSDCDG00000000297) COMTD1 (ENSDCDG00000000256) VDAC2 (ENSDCDG00000000160) SAMD8 (ENSDCDG00000000134) ENSDCDG00000002298 DUSP13 (ENSDCDG00000002297) ENSDCDG00000002294 KAT6B (ENSDCDG00000002290) adkb (ENSDCDG00000002266) aarsd1 (ENSDCDG00000002244) g6pc1a.2 (ENSDCDG00000002231) ##22 g6pc1a.1 (ENSDCDG00000002209) ##22 ptges3l (ENSDCDG00000002205) kat7b (ENSDCDG00000002177) ENSDCDG00000002168 dlx4b (ENSDCDG00000002167) dlx3b (ENSDCDG00000002164) itga3b (ENSDCDG00000002157) ENSDCDG00000001753 ENSDCDG00000001738 fkbp10b (ENSDCDG00000001733) P3H4 (ENSDCDG00000001731) ADAM11 (ENSDCDG00000001670) #8 ENSDCDG00000001664 ENSDCDG00000001663 PHOSPHO1 (ENSDCDG00000001662) ENSDCDG00000001661 Atlantic herring MODERN SPECIES 15 exoc6 (ENSCHAG00000023220) ENSCHAG00000023187 tubgcp2 (ENSCHAG00000023149) rbp4 (ENSCHAG00000023134) ENSCHAG00000023130 GPS1 (ENSCHAG00000023003) rfng (ENSCHAG00000022977) dcxr (ENSCHAG00000022953) rac3b (ENSCHAG00000022908) LRRC45 (ENSCHAG00000022888) fam20a (ENSCHAG00000022703) prkar1ab (ENSCHAG00000022558) WIPI1 (ENSCHAG00000022532) aarsd1 (ENSCHAG00000022226) g6pc1a.2 (ENSCHAG00000022194) ##22 g6pc1a.1 (ENSCHAG00000022186) ##22 ptges3l (ENSCHAG00000022180) kat7b (ENSCHAG00000021539) ENSCHAG00000021524 dlx4b (ENSCHAG00000021459) dlx3b (ENSCHAG00000021429) itga3b (ENSCHAG00000021380) ENSCHAG00000021037 ENSCHAG00000021004 ENSCHAG00000020994 TNKS2 (ENSCHAG00000020022) ENSCHAG00000019984 ENSCHAG00000018201 noc3l (ENSCHAG00000017878) plce1 (ENSCHAG00000017870) SLC35G1 (ENSCHAG00000017863) Otophysi ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000014563.a.a.a ENSGT00390000014563.a.a.b ENSGT00940000156276 ENSGT00390000013948.b ENSGT00440000039001 ENSGT00940000155109.a.b ENSGT00940000155309.p ENSGT00940000156675.d ENSGT00940000165723.a ENSGT00940000158678 ENSGT00390000015792 ENSGT00940000158306 ENSGT00390000018409.h ENSGT00940000156241 ENSGT00950000183150.a.a.a.c ##22 ENSGT00950000183150.a.a.b ##22 ENSGT00940000163448 ENSGT00940000157744.d ENSGT00650000094974.b ENSGT00940000165079.a ENSGT00940000158951.e ENSGT00940000157746.e ENSGT00940000163600 ENSGT00940000167052 ENSGT00940000159911 ENSGT00940000157037.b.b.a ENSGT00940000156410.g ENSGT00390000008540 ENSGT00940000157356 ENSGT00940000153249.a ENSGT00940000164645.b Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000156416.c ENSGT00950000183033.a.a.c.b ENSGT00390000014563.a.a.a ENSGT00390000013948.b ENSGT00440000039001 ENSGT00940000155109.a.b ENSGT00940000155309.p ENSGT00940000156675.d ENSGT00940000165723.a ENSGT00940000158678 ENSGT00390000015792 ENSGT00940000158306 ENSGT00390000018409.h ENSGT00940000156241 ENSGT00950000183150.a.a.a.c ##22 ENSGT00950000183150.a.a.b ##22 ENSGT00940000163448 ENSGT00940000157744.d ENSGT00650000094974.b ENSGT00940000165079.a ENSGT00940000158951.e ENSGT00940000157746.e.d ENSGT00940000163600 ENSGT00940000167052 ENSGT00940000159911 ENSGT00940000156410.g ENSGT00390000008540 ENSGT00940000157356 ENSGT00940000153249.a ENSGT00940000164645.b ENSGT00390000017833 Channel catfish MODERN SPECIES 4 TFAM (ENSIPUG00000008637) UBE2D4 (ENSIPUG00000008668) ipmk (ENSIPUG00000008753) ENSIPUG00000008772 pcdh15b (ENSIPUG00000008889) dkk1 (ENSIPUG00000010173) prkg1 (ENSIPUG00000010199) ENSIPUG00000010348 a1cf (ENSIPUG00000010367) asah2 (ENSIPUG00000010420) IFIT5 (ENSIPUG00000010636) ENSIPUG00000010643 sgms1 (ENSIPUG00000010653) aarsd1 (ENSIPUG00000010672) g6pc1a.2 (ENSIPUG00000010702) ##22 g6pc (ENSIPUG00000010733) ##22 ptges3l (ENSIPUG00000010758) kat7 (ENSIPUG00000010773) ENSIPUG00000010796 dlx4b (ENSIPUG00000010804) dlx3 (ENSIPUG00000010823) itga3b (ENSIPUG00000010851) ENSIPUG00000010977 ENSIPUG00000011036 Tnks2 (ENSIPUG00000011046) ENSIPUG00000011132 TBC1D12 (ENSIPUG00000011161) noc3l (ENSIPUG00000011208) plce1 (ENSIPUG00000011245) SLC35G1 (ENSIPUG00000011302) lgi1b (ENSIPUG00000011310) Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 108 ENSGT00940000156416.c ENSGT00950000183033.a.a.c.b ENSGT00390000014563.a.a.a ENSGT00390000013948.b ENSGT00440000039001 ENSGT00940000155109.a.b ENSGT00940000155309.p ENSGT00940000156675.d ENSGT00940000165723.a ENSGT00940000158678 ENSGT00390000015792 ENSGT00940000158306 ENSGT00390000018409.h ENSGT00940000156241 ENSGT00950000183150.a.a.a.c ##22 ENSGT00950000183150.a.a.b ##22 ENSGT00940000163448 ENSGT00940000157744.d ENSGT00650000094974.b ENSGT00940000165079.a ENSGT00940000158951.e ENSGT00940000157746.e.d ENSGT00940000163600 ENSGT00940000167052 ENSGT00940000159911 ENSGT00940000156410.g ENSGT00390000008540 ENSGT00940000157356 ENSGT00940000153249.a ENSGT00940000164645.b ENSGT00390000017833 Electric eel MODERN SPECIES 135 FAM13C (ENSEEEG00000001947) phyhiplb (ENSEEEG00000001955) ENSEEEG00000001960 zgc:171971 (ENSEEEG00000001961) tfam (ENSEEEG00000001963) ube2d1b (ENSEEEG00000001966) ipmkb (ENSEEEG00000001969) pcdh15b (ENSEEEG00000001979) dkk1b (ENSEEEG00000002427) PRKG1 (ENSEEEG00000002442) A1CF (ENSEEEG00000002573) asah2 (ENSEEEG00000002581) sgms1b (ENSEEEG00000002678) aarsd1 (ENSEEEG00000002688) g6pc1a.2 (ENSEEEG00000002705) ##22 g6pc1a.1 (ENSEEEG00000002716) ##22 ptges3l (ENSEEEG00000002830) kat7b (ENSEEEG00000002858) CYP51A1 (ENSEEEG00000003257) FUT9 (ENSEEEG00000003258) Characoidei ANCESTRAL SPECIES 104 ENSGT00950000183033.a.a.c.b ENSGT00390000014563.a.a.a ENSGT00390000013948.b ENSGT00440000039001 ENSGT00940000155109.a.b ENSGT00940000155309.p ENSGT00940000156675.d ENSGT00940000179608 ENSGT00940000165723.a ENSGT00940000158678 ENSGT00390000015792 ENSGT00940000158306 ENSGT00390000018409.h.b ENSGT00940000156241 ENSGT00950000183150.a.a.a.c ##22 ENSGT00950000183150.a.a.b ##22 ENSGT00940000163448 ENSGT00940000157744.d ENSGT00650000094974.b ENSGT00940000165079.a ENSGT00940000158951.e ENSGT00940000157746.e.d ENSGT00940000163600 ENSGT00940000167052 ENSGT00940000159911 ENSGT00940000156410.g ENSGT00390000008540 ENSGT00940000157356 ENSGT00940000153249.a ENSGT00940000164645.b ENSGT00390000017833 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 536 dkk1b (ENSPNAG00000000422) PRKG1 (ENSPNAG00000000418) A1CF (ENSPNAG00000007704) asah2 (ENSPNAG00000007696) sgms1b (ENSPNAG00000007691) aarsd1 (ENSPNAG00000000407) g6pc1a.1 (ENSPNAG00000007672) ##22 g6pc1a.2 (ENSPNAG00000000393) ##22 ptges3l (ENSPNAG00000007662) kat7b (ENSPNAG00000000384) ENSPNAG00000000380 dlx4b (ENSPNAG00000007647) Mexicana tetra MODERN SPECIES 19 ipmkb (ENSAMXG00000031764) ENSAMXG00000039022 ENSAMXG00000032657 ENSAMXG00000035955 ENSAMXG00000037603 pcdh15b (ENSAMXG00000018085) ENSAMXG00000030918 ENSAMXG00000043620 dkk1b (ENSAMXG00000018166) PRKG1 (ENSAMXG00000034003) A1CF (ENSAMXG00000018180) asah2 (ENSAMXG00000018196) sgms1b (ENSAMXG00000031502) aarsd1 (ENSAMXG00000031615) g6pc1a.2 (ENSAMXG00000018240) ##22 g6pc1a.1 (ENSAMXG00000033979) ##22 ptges3l (ENSAMXG00000031922) kat7b (ENSAMXG00000038714) ENSAMXG00000034848 dlx4b (ENSAMXG00000042142) dlx3b (ENSAMXG00000029370) itga3b (ENSAMXG00000033569) ENSAMXG00000004983 ENSAMXG00000041589 TNKS2 (ENSAMXG00000004975) ENSAMXG00000036689 TBC1D12 (ENSAMXG00000004972) noc3l (ENSAMXG00000004967) plce1 (ENSAMXG00000004946) SLC35G1 (ENSAMXG00000033646) lgi1b (ENSAMXG00000004936) Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00390000014794.b.l ENSGT00390000014563.a.a.b ENSGT00940000156276 ENSGT00940000155109.a.a ENSGT00940000160793 ENSGT00390000013948.b ENSGT00440000039001 ENSGT00940000155109.a.b ENSGT00940000155309.p ENSGT00940000156675.d ENSGT00940000165723.a ENSGT00940000158678 ENSGT00390000015792 ENSGT00940000156241 ENSGT00950000183150.a.a.a.c ##22 ENSGT00950000183150.a.a.b ##22 ENSGT00940000163448 ENSGT00940000157744.d ENSGT00650000094974.b ENSGT00940000165079.a ENSGT00940000158951.e ENSGT00940000157746.e ENSGT00940000163600 ENSGT00940000167052 ENSGT00940000159911 ENSGT00940000157037.b.b.a ENSGT00940000156410.g ENSGT00390000008540 ENSGT00940000157356 ENSGT00940000153249.a ENSGT00940000164645.b Cyprininae DUPLICATION Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00950000183150.a.a.a.c.e ##22 ENSGT00950000183150.a.a.b.c ##22 ENSGT00940000163448 ENSGT00940000157744.d.c ENSGT00650000094974.b.b ENSGT00940000165079.a.c ENSGT00940000158951.e.a ENSGT00940000157746.e.a ENSGT00940000163600.g ENSGT00940000167052 ENSGT00940000159911.f ENSGT00940000157037.b.b.a.i ENSGT00940000156410.g.f ENSGT00390000008540 ENSGT00940000157356.c ENSGT00940000153249.a.f ENSGT00940000164645.b.b Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00950000183150.a.a.a.c.e ##22 ENSGT00950000183150.a.a.b.c ##22 ENSGT00940000163448 ENSGT00940000157744.d.c ENSGT00650000094974.b.b ENSGT00940000165079.a.c ENSGT00940000158951.e.a ENSGT00940000157746.e.a ENSGT00940000163600.g ENSGT00940000167052 ENSGT00940000159911.f ENSGT00940000157037.b.b.a.i ENSGT00940000156410.g.f ENSGT00390000008540 ENSGT00940000157356.c ENSGT00940000153249.a.f ENSGT00940000164645.b.b Golden-line barbel MODERN SPECIES 252 asah2 (ENSSGRG00000035790) sgms1b (ENSSGRG00000035789) aarsd1 (ENSSGRG00000035776) g6pc1a.1 (ENSSGRG00000035772) ##22 ptges3l (ENSSGRG00000035770) kat7b (ENSSGRG00000035391) ENSSGRG00000035377 dlx4b (ENSSGRG00000035375) dlx3b (ENSSGRG00000035374) itga3b (ENSSGRG00000035368) ENSSGRG00000035136 ENSSGRG00000035127 TNKS2 (ENSSGRG00000034701) ENSSGRG00000034699 ENSSGRG00000034615 noc3l (ENSSGRG00000034354) plce1 (ENSSGRG00000034277) SLC35G1 (ENSSGRG00000034273) lgi1b (ENSSGRG00000034239) Goldfish MODERN SPECIES 3 slc16a9b (ENSCARG00000026662) ENSCARG00000026670 phyhiplb (ENSCARG00000026701) BICC1 (ENSCARG00000026733) zgc:171971 (ENSCARG00000026814) tfam (ENSCARG00000026828) UBE2D1 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ENSGT00950000183150.a.a.a.c.f ##22 ENSGT00950000183150.a.a.b.d ##22 ENSGT00940000157744.d.d ENSGT00650000094974.b.a ENSGT00940000165079.a.d ENSGT00940000158951.e.b ENSGT00940000157746.e.b ENSGT00940000163600.h ENSGT00940000159911.e ENSGT00940000157037.b.b.a.j ENSGT00940000156410.g.e ENSGT00940000157356.d ENSGT00940000153249.a.e ENSGT00940000164645.b.a ENSGT00390000017833.d ENSGT00940000157825.a.a ENSGT00510000047107.A.h Goldfish MODERN SPECIES 30 phyhiplb (ENSCARG00000021939) BICC1 (ENSCARG00000021966) zgc:171971 (ENSCARG00000022471) tfam (ENSCARG00000022477) ENSCARG00000022484 ipmkb (ENSCARG00000022490) pcdh15b (ENSCARG00000022533) ENSCARG00000022780 dkk1b (ENSCARG00000022785) PRKG1 (ENSCARG00000022793) A1CF (ENSCARG00000022824) asah2 (ENSCARG00000022864) sgms1b (ENSCARG00000023104) aarsd1 (ENSCARG00000023127) g6pc1a.2 (ENSCARG00000023278) ##22 g6pc1a.1 (ENSCARG00000023314) ##22 kat7b (ENSCARG00000023431) ENSCARG00000025165 dlx4b (ENSCARG00000025218) dlx3b (ENSCARG00000025233) itga3b 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ENSGT00940000157825.a.a ENSGT00510000047107.A.h Common carp reference MODERN SPECIES 44 phyhiplb (ENSCCRG00000073279) BICC1 (ENSCCRG00000015986) ENSCCRG00000070745 zgc:171971 (ENSCCRG00000032626) tfam (ENSCCRG00000049909) ube2d1b (ENSCCRG00000049906) ipmkb (ENSCCRG00000050608) pcdh15b (ENSCCRG00000073582) dkk1b (ENSCCRG00000050071) ENSCCRG00000050067 ENSCCRG00000007736 asah2 (ENSCCRG00000038197) sgms1b (ENSCCRG00000038187) aarsd1 (ENSCCRG00000047672) g6pc1a.2 (ENSCCRG00000037979) ##22 g6pc1a.1 (ENSCCRG00000065767) ##22 kat7b (ENSCCRG00000002180) ENSCCRG00000036450 dlx4b (ENSCCRG00000031648) dlx3b (ENSCCRG00000031645) itga3b (ENSCCRG00000007713) ENSCCRG00000033437 ENSCCRG00000007722 ENSCCRG00000077586 ENSCCRG00000075036 ENSCCRG00000082904 ENSCCRG00000033395 ENSCCRG00000079411 ENSCCRG00000028425 plce1 (ENSCCRG00000039636) lgi1b (ENSCCRG00000064312) Golden-line barbel MODERN SPECIES 598 DKK1 (ENSSGRG00000041758) ENSSGRG00000041784 A1CF (ENSSGRG00000042318) asah2 (ENSSGRG00000042335) 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ENSGT00390000014900.b.b.b.b.a ENSGT00940000154018.a.b ENSGT00940000158142.e ENSGT00940000155510.u.b ENSGT00940000157917.a.a.a.a ENSGT00950000183178.b.b.b.c.a ENSGT00940000157854.w.b ENSGT00530000064085.c.d ENSGT00530000063301.a.a.c.a.f ENSGT00390000008812.b.b.a.a.b Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000155698.B.i ENSGT00730000111029.a.b ENSGT00950000183192.b.f.a ENSGT00940000155535.v ENSGT00940000164940.a.d ENSGT00940000164940.b.g.a ENSGT00500000044903.b.f.a ENSGT00470000042293.a.b.a.b.d ENSGT00940000156497.b ENSGT00950000183080.a.b.b.a.b.c ENSGT00940000157961.A.f ENSGT00940000156292.g.a.d ENSGT00940000163448.b ENSGT00940000156241 ENSGT00950000183150.a.a.a.c.d ##22 ENSGT00950000183150.a.a.b.f ##22 ENSGT00950000183098.a.b.c ENSGT00390000016335.h.g ENSGT00940000166248.a.d ENSGT00940000161341.a.a.f ENSGT00940000162682.B.a.a ENSGT00390000014900.b.b.b.b.a ENSGT00940000154018.a.b ENSGT00940000158142.e ENSGT00940000155510.u.b ENSGT00940000157917.a.a.a.a ENSGT00950000183178.b.b.b.c.a 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ENSGT00950000183178.b.b.b ENSGT00940000157854 ENSGT00530000064085.c ENSGT00530000063301.a.a.c.a ENSGT00390000008812.b.b.a Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000177233 ENSGT00940000177267 ENSGT00940000167352 ENSGT00730000111991 ENSGT00510000050089.a.b ENSGT00940000155111 ENSGT00940000157509.b ENSGT00940000154775.c.a.a.a ENSGT00440000033408.b.b ENSGT00390000000221.B ENSGT00940000159064 ENSGT00940000163069 ENSGT00940000156651 ENSGT00940000154939.e.a ENSGT00950000183150.a.a.a.c ##22 ENSGT00950000183150.a.a.b ##22 ENSGT00950000183098.a.b ENSGT00390000016335.h ENSGT00940000166248.a ENSGT00940000161341.a.a ENSGT00940000162682.B.a ENSGT00390000014900.b.b.b ENSGT00940000154018.a ENSGT00940000158142 ENSGT00940000155510 ENSGT00940000157917.b ENSGT00950000183178.b.b.b ENSGT00940000157854 ENSGT00530000064085.c ENSGT00530000063301.a.a.c.a ENSGT00390000008812.b.b.a Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000176991 ENSGT00730000111991 ENSGT00510000050089.a.b ENSGT00940000155111 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s mouthbrooder MODERN SPECIES 274 ENSHBUG00000006297 ENSHBUG00000006241 plekhm1 (ENSHBUG00000006225) ENSHBUG00000006205 ENSHBUG00000006192 plxdc1 (ENSHBUG00000006183) ENSHBUG00000006180 tectb (ENSHBUG00000006171) ENSHBUG00000006163 acsl5 (ENSHBUG00000006119) MFAP4 (ENSHBUG00000006065) ENSHBUG00000006053 ENSHBUG00000005987 ENSHBUG00000005951 g6pc1a.2 (ENSHBUG00000000147) ##22 g6pc1a.1 (ENSHBUG00000005914) ##22 psme3 (ENSHBUG00000005878) nbr1a (ENSHBUG00000005825) tmem106a (ENSHBUG00000005810) arl4d (ENSHBUG00000005802) ENSHBUG00000005769 SOST (ENSHBUG00000005750) meox1 (ENSHBUG00000005729) etv4 (ENSHBUG00000005707) DHX8 (ENSHBUG00000005644) ENSHBUG00000005555 ormdl3 (ENSHBUG00000005502) nsfb (ENSHBUG00000005476) wnt3 (ENSHBUG00000000764) psmd11b (ENSHBUG00000005413) cdk5r1b (ENSHBUG00000005346) Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00510000050089.a.b.a.a.a.a ENSGT00510000050089.a.b.a.b.b.b ENSGT00510000050089.a.b.b.b ENSGT00940000155111 ENSGT00940000157509.b 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##22 g6pc1a.1 (ENSONIG00000018270) ##22 psme3 (ENSONIG00000018267) nbr1a (ENSONIG00000018263) tmem106a (ENSONIG00000018261) arl4d (ENSONIG00000043081) ENSONIG00000018260 sost (ENSONIG00000036894) meox1 (ENSONIG00000018256) etv4 (ENSONIG00000018249) DHX8 (ENSONIG00000018248) ENSONIG00000018247 ormdl3 (ENSONIG00000041840) wnt3 (ENSONIG00000027851) nsfb (ENSONIG00000018240) psmd11b (ENSONIG00000018238) cdk5r1b (ENSONIG00000018237) Midas cichlid MODERN SPECIES 113 g6pc1a.2 (ENSACIG00000013563) ##22 g6pc1a.1 (ENSACIG00000013554) ##22 psme3 (ENSACIG00000013533) nbr1a (ENSACIG00000013439) tmem106a (ENSACIG00000013382) arl4d (ENSACIG00000013359) ENSACIG00000013348 SOST (ENSACIG00000013335) meox1 (ENSACIG00000013325) etv4 (ENSACIG00000013230) DHX8 (ENSACIG00000013170) ENSACIG00000013155 ormdl3 (ENSACIG00000013146) wnt3 (ENSACIG00000013133) nsfb (ENSACIG00000013096) psmd11b (ENSACIG00000013064) cdk5r1b (ENSACIG00000013056) Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000167352 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ENSGT00940000154939.e.a ENSGT01100000263491.a.a.d ENSGT00950000183052.b.c.b.b.a.a.b.a.b.a ENSGT00950000183150.a.a.a.c ##22 ENSGT00950000183150.a.a.b ##22 ENSGT00950000183098.a.b ENSGT00390000016335.h ENSGT00940000166248.a ENSGT00940000161341.a.a ENSGT00940000162682.B.a ENSGT00940000163612 ENSGT00390000014900.b.b.b ENSGT00940000154018.a ENSGT00940000158142 ENSGT00940000155510 ENSGT00940000157917.b ENSGT00950000183178.b.b.b ENSGT00940000157854 ENSGT00530000064085.c ENSGT00530000063301.a.a.c.a Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000176991 ENSGT00730000111991 ENSGT00510000050089.a.b ENSGT00940000155111 ENSGT00940000157509.b.a ENSGT00940000157509.b.b ENSGT00940000154775.c.a.a.a ENSGT00440000033408.b.b ENSGT00390000000221.B ENSGT00940000159064 ENSGT00940000163069 ENSGT00940000156651 ENSGT00940000154615.i.b ENSGT00940000154939.e.a ENSGT00950000183150.a.a.a.c ##22 ENSGT00950000183150.a.a.b ##22 ENSGT00950000183098.a.b ENSGT00390000016335.h ENSGT00940000166248.a 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psmd11b (ENSTRUG00000002031) cdk5r1b (ENSTRUG00000001984) MYO1D (ENSTRUG00000013296) Tetraodon MODERN SPECIES 13 scn4aa (ENSTNIG00000014422) ENSTNIG00000014421 ENSTNIG00000000742 ENSTNIG00000001092 plekhm1 (ENSTNIG00000014420) ENSTNIG00000000599 ENSTNIG00000014419 ENSTNIG00000014418 plxdc1 (ENSTNIG00000000704) tectb (ENSTNIG00000014417) ENSTNIG00000014416 acsl5 (ENSTNIG00000014415) MFAP4 (ENSTNIG00000001172) ENSTNIG00000014414 g6pc1a.2 (ENSTNIG00000014413) ##22 g6pc1a.1 (ENSTNIG00000014412) ##22 psme3 (ENSTNIG00000014411) nbr1a (ENSTNIG00000014410) tmem106a (ENSTNIG00000014409) ENSTNIG00000014408 SOST (ENSTNIG00000014407) meox1 (ENSTNIG00000014406) etv4 (ENSTNIG00000004134) cdk5r1b (ENSTNIG00000004135) psmd11b (ENSTNIG00000004136) ENSTNIG00000006979 ENSTNIG00000003353 wnt3 (ENSTNIG00000006063) nsfb (ENSTNIG00000006062) psmd11b (ENSTNIG00000006061) MYO1D (ENSTNIG00000019513) Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00730000111991 ENSGT00510000050089.a.b ENSGT00940000155111 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meox1 (ENSLBEG00000011244) etv4 (ENSLBEG00000011272) ENSLBEG00000011490 DHX8 (ENSLBEG00000012048) ENSLBEG00000012113 ormdl3 (ENSLBEG00000012141) wnt3 (ENSLBEG00000012155) nsfb (ENSLBEG00000012216) Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00730000111991 ENSGT00510000050089.a.b ENSGT00940000155111 ENSGT00940000157509.b ENSGT00940000154775.c.a.a.a ENSGT00440000033408.b.b ENSGT00390000000221.B ENSGT00940000159064 ENSGT00940000163069 ENSGT00940000156651 ENSGT00940000154615.i.b ENSGT00940000154939.e.a ENSGT01100000263491.a.a.d ENSGT00950000183052.b.c.b.b.a.a.b.a.b.a ENSGT00950000183150.a.a.a.c ##22 ENSGT00950000183150.a.a.b ##22 ENSGT00950000183098.a.b ENSGT00390000016335.h ENSGT00940000166248.a ENSGT00940000161341.a.a ENSGT00940000162682.B.a ENSGT00940000163612 ENSGT00390000014900.b.b.b ENSGT00940000154018.a ENSGT00940000158142 ENSGT00940000155510 ENSGT00940000157917.b ENSGT00950000183178.b.b.b ENSGT00940000157854 ENSGT00530000064085.c ENSGT00530000063301.a.a.c.a Perciformes ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000176991 ENSGT00940000167352 ENSGT00730000111991 ENSGT00510000050089.a.b ENSGT00940000155111 ENSGT00940000157509.b ENSGT00940000154775.c.a.a.a ENSGT00440000033408.b.b ENSGT00390000000221.B ENSGT00940000159064 ENSGT00940000163069 ENSGT00940000156651 ENSGT00940000154939.e.a ENSGT01100000263491.a.a.d ENSGT00950000183150.a.a.a.c ##22 ENSGT00950000183150.a.a.b ##22 ENSGT00950000183098.a.b ENSGT00390000016335.h ENSGT00940000166248.a ENSGT00940000161341.a.a ENSGT00940000163612 ENSGT00390000014900.b.b.b ENSGT00940000154018.a ENSGT00940000158142 ENSGT00940000155510 ENSGT00940000157917.b ENSGT00950000183178.b.b.b ENSGT00940000157854 ENSGT00530000064085.c ENSGT00530000063301.a.a.c.a ENSGT00390000008812.b.b.a Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000167352 ENSGT00940000176991 ENSGT00730000111991 ENSGT00510000050089.a.b ENSGT00940000155111 ENSGT00940000157509.b ENSGT00940000154775.c.a.a.a ENSGT00440000033408.b.b ENSGT00940000180679 ENSGT00940000159064 ENSGT00940000163069 ENSGT00940000156651 ENSGT00940000154939.e.a ENSGT01100000263491.a.a.d ENSGT00950000183150.a.a.a.c ##22 ENSGT00950000183150.a.a.b ##22 ENSGT00950000183098.a.b ENSGT00390000016335.h ENSGT00940000166248.a ENSGT00940000161341.a.a ENSGT00940000163612 ENSGT00390000014900.b.b.b ENSGT00940000154018.a ENSGT00940000158142 ENSGT00950000183178.b.b.b ENSGT00940000157854 ENSGT00530000064085.c ENSGT00530000063301.a.a.c.a ENSGT00390000008812.b.b.a ENSGT00940000157411 ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a.a Lumpfish MODERN SPECIES 10 ENSCLMG00005012531 ENSCLMG00005012532 ENSCLMG00005012533 ENSCLMG00005012562 plekhm1 (ENSCLMG00005012588) ENSCLMG00005012589 LASP1 (ENSCLMG00005012590) ENSCLMG00005012591 ENSCLMG00005012593 tectb (ENSCLMG00005012595) ENSCLMG00005012596 acsl5 (ENSCLMG00005012597) ANK3 (ENSCLMG00005013956) ENSCLMG00005022608 g6pc1a.2 (ENSCLMG00005022609) ##22 g6pc1a.1 (ENSCLMG00005022610) ##22 psme3 (ENSCLMG00005022614) nbr1a (ENSCLMG00005022618) tmem106a (ENSCLMG00005022623) arl4d 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Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000176991 ENSGT00730000111991 ENSGT00510000050089.a.b ENSGT00940000155111 ENSGT00940000157509.b ENSGT00940000154775.c.a.a.a ENSGT00440000033408.b.b ENSGT00390000000221.B ENSGT00940000159064 ENSGT00940000163069 ENSGT00940000156651 ENSGT00940000154615.i.b ENSGT00940000154939.e.a ENSGT00950000183052.b.c.b.b.a.a.b.a.b.a ENSGT00950000183150.a.a.a.c ##22 ENSGT00950000183150.a.a.b ##22 ENSGT00950000183098.a.b ENSGT00390000016335.h ENSGT00940000166248.a ENSGT00940000161341.a.a ENSGT00940000162682.B.a ENSGT00390000014900.b.b.b ENSGT00940000154018.a ENSGT00940000158142 ENSGT00940000155510 ENSGT00940000157917.b ENSGT00950000183178.b.b.b ENSGT00940000157854 ENSGT00530000064085.c ENSGT00530000063301.a.a.c.a ENSGT00390000008812.b.b.a Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00730000111991 ENSGT00510000050089.a.b.jb ENSGT00510000050089.a.b.kb ENSGT00940000155111 ENSGT00940000157509.b ENSGT00940000154775.c.a.a.a ENSGT00440000033408.b.b ENSGT00390000000221.B 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SOST (ENSECRG00000019377) ENSECRG00000019364 MPP3 (ENSECRG00000019318) ENSECRG00000019276 ENSECRG00000019233 ZNF281 (ENSECRG00000019216) Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 257 ENSGT00440000033966 ENSGT00390000008164 ENSGT00950000183098.a ENSGT00950000183207.b ENSGT00950000183150.a.a ##22 ENSGT00940000156241 ENSGT00940000163448 ENSGT00390000007311 ENSGT00390000010721.b ENSGT00530000063686.b ENSGT00940000154578.A.c.b ENSGT00940000157579 ENSGT00940000157020 ENSGT00440000034289 ENSGT00390000016335 ENSGT00940000161546 Coelacanth MODERN SPECIES 1481 CNTD1 (ENSLACG00000000187) becn1 (ENSLACG00000000994) PSME3 (ENSLACG00000002283) aoc2 (ENSLACG00000003823) aoc2 (ENSLACG00000004727) G6PC1 (ENSLACG00000022601) ##22 AARSD1 (ENSLACG00000006926) RUNDC1 (ENSLACG00000007484) rpl27 (ENSLACG00000007797) ENSLACG00000008000 ENSLACG00000008547 VAT1 (ENSLACG00000008941) RND2 (ENSLACG00000010081) Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00390000006890 ENSGT00940000161349 ENSGT00940000156957 ENSGT00940000159764 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ENSGT00940000157579 ENSGT00940000157020 ENSGT00440000034289 ENSGT00390000016335 ENSGT00940000161546 ENSGT00940000161341.b ENSGT00940000155510 ENSGT00940000158142 ENSGT00940000154018.a Sauria DUPLICATION Sauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183150.a.a.c ##22 Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000156957 ENSGT00940000159764 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.a ENSGT00940000160825 ENSGT00940000156604 ENSGT00950000185523 ENSGT00940000160264 ENSGT00390000014892 ENSGT00940000159871 ENSGT00440000033966 ENSGT00390000008164 ENSGT00950000183098.a ENSGT00950000183207.b.c.a ENSGT00950000183207.b.d ENSGT00950000183150.a.a.d ##22 ENSGT00950000183150.a.a.c ##22 ENSGT00940000156241 ENSGT00940000163448 ENSGT00390000007311 ENSGT00390000010721.a.b ENSGT00530000063686.b ENSGT00940000154578.A.c.b ENSGT00940000157579 ENSGT00940000157020 ENSGT00440000034289 ENSGT00390000016335 ENSGT00940000161546 ENSGT00940000161341.b ENSGT00940000155510 ENSGT00940000158142 ENSGT00940000154018.a Episquamata ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.a ENSGT00940000160825 ENSGT00940000156604 ENSGT00950000185523 ENSGT00940000160264 ENSGT00940000166494 ENSGT00390000014892 ENSGT00940000159871 ENSGT00440000033966 ENSGT00390000008164 ENSGT00950000183098.a ENSGT00950000183207.b.c.a.f ENSGT00950000183207.b.c.a.e ENSGT00950000183207.b.d ENSGT00950000183150.a.a.d ##22 ENSGT00950000183150.a.a.c ##22 ENSGT00940000156241 ENSGT00940000163448 ENSGT00390000007311 ENSGT00390000010721.a.b ENSGT00530000063686.b ENSGT00940000154578.A.c.b ENSGT00940000157579 ENSGT00940000157020 ENSGT00440000034289 ENSGT00390000016335 ENSGT00940000161546 ENSGT00940000161341.b ENSGT00940000159730 ENSGT00550000074820 ENSGT00940000159874 Laterata ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.a ENSGT00940000160825 ENSGT00940000156604 ENSGT00950000185523 ENSGT00940000160264 ENSGT00940000166494 ENSGT00390000014892 ENSGT00940000159871 ENSGT00440000033966 ENSGT00390000008164 ENSGT00950000183098.a ENSGT00950000183207.b.c.a.f 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ENSGT00950000185523 ENSGT00940000160264 ENSGT00940000166494 ENSGT00390000014892 ENSGT00940000159871 ENSGT00440000033966 ENSGT00390000008164 ENSGT00950000183098.a ENSGT00950000183207.b.c.a.f ENSGT00950000183207.b.c.a.e ENSGT00950000183207.b.d ENSGT00950000183150.a.a.d ##22 ENSGT00950000183150.a.a.c ##22 ENSGT00940000156241 ENSGT00940000163448 ENSGT00390000007311 ENSGT00390000010721.a.b ENSGT00530000063686.b ENSGT00940000154578.A.c.b ENSGT00940000157579 ENSGT00940000157020 ENSGT00440000034289 ENSGT00390000016335 ENSGT00940000161546 ENSGT00940000161341.b ENSGT00940000159730 ENSGT00550000074820 Common wall lizard MODERN SPECIES 4 CCR10 (ENSPMRG00000020072) CNTNAP1 (ENSPMRG00000020081) EZH1 (ENSPMRG00000020116) ENSPMRG00000020181 ENSPMRG00000020187 ENSPMRG00000020194 VPS25 (ENSPMRG00000020213) ENSPMRG00000020220 ENSPMRG00000011231 CNTD1 (ENSPMRG00000011237) ENSPMRG00000011248 PSME3 (ENSPMRG00000011261) ENSPMRG00000011269 ENSPMRG00000011274 ENSPMRG00000011278 G6PC1 (ENSPMRG00000011283) ##22 ENSPMRG00000011289 ##22 AARSD1 (ENSPMRG00000011300) PTGES3L (ENSPMRG00000011317) RUNDC1 (ENSPMRG00000011321) RPL27 (ENSPMRG00000011326) IFI35 (ENSPMRG00000011331) ENSPMRG00000011337 RND2 (ENSPMRG00000011341) ENSPMRG00000011351 NBR1 (ENSPMRG00000011365) TMEM106A (ENSPMRG00000011369) ENSPMRG00000011372 ENSPMRG00000011375 ENSPMRG00000011379 ENSPMRG00000011382 Argentine black and white tegu MODERN SPECIES 32 VPS25 (ENSSMRG00000007996) WNK4 (ENSSMRG00000007983) CNTD1 (ENSSMRG00000007974) ENSSMRG00000007969 PSME3 (ENSSMRG00000007965) ENSSMRG00000007963 ENSSMRG00000007959 ENSSMRG00000007958 G6PC1 (ENSSMRG00000007954) ##22 ENSSMRG00000007953 ##22 AARSD1 (ENSSMRG00000007948) PTGES3L (ENSSMRG00000007947) RUNDC1 (ENSSMRG00000007944) RPL27 (ENSSMRG00000007942) IFI35 (ENSSMRG00000007938) ENSSMRG00000007935 VAT1 (ENSSMRG00000007930) RND2 (ENSSMRG00000007908) ENSSMRG00000007896 NBR1 (ENSSMRG00000007877) TMEM106A (ENSSMRG00000007863) ARL4D (ENSSMRG00000007821) PCGF2 (ENSSMRG00000007819) PSMB3 (ENSSMRG00000007818) Toxicofera ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000159764 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.a ENSGT00940000160825 ENSGT00940000156604 ENSGT00950000185523 ENSGT00940000160264 ENSGT00940000166494 ENSGT00390000014892 ENSGT00940000159871 ENSGT00440000033966 ENSGT00390000008164 ENSGT00950000183098.a ENSGT00950000183207.b.c.a.f ENSGT00950000183207.b.c.a.e ENSGT00950000183207.b.d ENSGT00950000183150.a.a.d ##22 ENSGT00950000183150.a.a.c ##22 ENSGT00940000156241 ENSGT00940000163448 ENSGT00390000007311 ENSGT00390000010721.a.b ENSGT00530000063686.b ENSGT00940000157579 ENSGT00940000157020 ENSGT00440000034289 ENSGT00390000016335 ENSGT00940000161546 ENSGT00940000161341.b ENSGT00940000159730 ENSGT00550000074820 ENSGT00940000159874 Elapidae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000156957 ENSGT00940000159764 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.a ENSGT00940000160825 ENSGT00940000156604.i ENSGT00940000156604.j ENSGT00940000160264 ENSGT00390000014892 ENSGT00940000159871 ENSGT00440000033966 ENSGT00390000008164 ENSGT00950000183098.a ENSGT00950000183207.b.c.a.f ENSGT00950000183207.b.c.a.e ENSGT00950000183207.b.d ENSGT00950000183150.a.a.d ##22 ENSGT00950000183150.a.a.c ##22 ENSGT00940000156241 ENSGT00940000163448 ENSGT00390000007311 ENSGT00390000010721.a.b ENSGT00530000063686.b ENSGT00940000157579.h ENSGT00940000157020 ENSGT00990000212482 ENSGT00440000034289 ENSGT00970000197525 ENSGT00390000016335 ENSGT00940000161546 ENSGT00940000161341.b ENSGT00940000159730 Elapidae_a ANCESTRAL SPECIES 100 ENSGT00390000014892 ENSGT00940000159871 ENSGT00440000033966 ENSGT00390000008164 ENSGT00950000183098.a ENSGT00950000183207.b.c.a.f ENSGT00950000183207.b.c.a.e ENSGT00950000183207.b.d ENSGT00950000183150.a.a.d ##22 ENSGT00950000183150.a.a.c ##22 ENSGT00940000156241 ENSGT00940000163448 ENSGT00390000007311 ENSGT00390000010721.a.b ENSGT00530000063686.b ENSGT00940000157579.h ENSGT00940000157020 ENSGT00990000212482 ENSGT00440000034289 ENSGT00970000197525 ENSGT00390000016335 ENSGT00940000161546 ENSGT00940000161341.b ENSGT00940000159730 Acanthophiinae ANCESTRAL SPECIES 90 ENSGT00390000014892 ENSGT00940000159871 ENSGT00440000033966 ENSGT00390000008164 ENSGT00950000183098.a ENSGT00950000183207.b.c.a.f ENSGT00950000183207.b.c.a.e ENSGT00950000183207.b.d ENSGT00950000183150.a.a.d ##22 ENSGT00950000183150.a.a.c ##22 ENSGT00940000156241 ENSGT00940000163448 ENSGT00390000007311 ENSGT00390000010721.a.b ENSGT00530000063686.b ENSGT00940000157579.h ENSGT00940000157020 ENSGT00990000212482 ENSGT00440000034289 ENSGT00970000197525 ENSGT00390000016335 ENSGT00940000161546 ENSGT00940000161341.b ENSGT00940000159730 Mainland tiger snake MODERN SPECIES 361 VPS25 (ENSNSUG00000005924) WNK4 (ENSNSUG00000005925) CNTD1 (ENSNSUG00000005928) ENSNSUG00000005931 PSME3 (ENSNSUG00000005935) ENSNSUG00000006001 ENSNSUG00000006002 ENSNSUG00000006004 G6PC1 (ENSNSUG00000006006) ##22 ENSNSUG00000006007 ##22 AARSD1 (ENSNSUG00000006008) RUNDC1 (ENSNSUG00000006011) RPL27 (ENSNSUG00000006014) ENSNSUG00000006015 Eastern brown snake MODERN SPECIES 149 VPS25 (ENSPTXG00000016649) WNK4 (ENSPTXG00000016652) CNTD1 (ENSPTXG00000016689) ENSPTXG00000016692 PSME3 (ENSPTXG00000016694) ENSPTXG00000016698 ENSPTXG00000016701 ENSPTXG00000016703 G6PC1 (ENSPTXG00000016706) ##22 ENSPTXG00000016709 ##22 AARSD1 (ENSPTXG00000016712) PTGES3L (ENSPTXG00000016717) RUNDC1 (ENSPTXG00000016782) RPL27 (ENSPTXG00000016784) IFI35 (ENSPTXG00000016786) VAT1 (ENSPTXG00000016788) RND2 (ENSPTXG00000016790) ENSPTXG00000016791 ENSPTXG00000016793 ENSPTXG00000016796 NBR1 (ENSPTXG00000016798) TMEM106A (ENSPTXG00000016808) ARL4D (ENSPTXG00000017139) PCGF2 (ENSPTXG00000017142) Blue-lipped sea krait MODERN SPECIES 7497 G6PC1 (ENSLLTG00000009496) ##22 Indian cobra MODERN SPECIES 337 PLEKHH3 (ENSNNAG00000007653) ENSNNAG00000007724 CNTNAP1 (ENSNNAG00000007775) ENSNNAG00000008258 ENSNNAG00000008704 RAMP2 (ENSNNAG00000008735) VPS25 (ENSNNAG00000008755) WNK4 (ENSNNAG00000008782) CNTD1 (ENSNNAG00000008838) ENSNNAG00000008902 PSME3 (ENSNNAG00000008920) ENSNNAG00000008982 ENSNNAG00000009008 ENSNNAG00000009072 ENSNNAG00000009093 G6PC1 (ENSNNAG00000009117) ##22 ENSNNAG00000009242 ##22 AARSD1 (ENSNNAG00000009316) RUNDC1 (ENSNNAG00000009464) RPL27 (ENSNNAG00000009490) ENSNNAG00000009504 VAT1 (ENSNNAG00000009540) RND2 (ENSNNAG00000009559) ENSNNAG00000009603 ENSNNAG00000009621 NBR1 (ENSNNAG00000009646) TMEM106A (ENSNNAG00000009709) ARL4D (ENSNNAG00000009760) PCGF2 (ENSNNAG00000009772) PSMB3 (ENSNNAG00000009801) PIP4K2B (ENSNNAG00000009843) Lizard MODERN SPECIES 5 PLEKHH3 (ENSACAG00000045328) CCR10 (ENSACAG00000013855) CNTNAP1 (ENSACAG00000013861) EZH1 (ENSACAG00000014235) ENSACAG00000039667 RAMP2 (ENSACAG00000014409) ENSACAG00000029184 VPS25 (ENSACAG00000036831) WNK4 (ENSACAG00000013892) CNTD1 (ENSACAG00000041843) ENSACAG00000013769 ENSACAG00000013688 ENSACAG00000013687 ENSACAG00000041967 ENSACAG00000043366 G6PC1 (ENSACAG00000013598) ##22 ENSACAG00000037552 ##22 AARSD1 (ENSACAG00000013559) PTGES3L (ENSACAG00000042604) RUNDC1 (ENSACAG00000042625) RPL27 (ENSACAG00000013524) IFI35 (ENSACAG00000013511) ENSACAG00000042345 ENSACAG00000040521 VAT1 (ENSACAG00000013472) RND2 (ENSACAG00000013416) BRCA1 (ENSACAG00000013415) NBR1 (ENSACAG00000013331) TMEM106A (ENSACAG00000013303) ARL4D (ENSACAG00000013300) PCGF2 (ENSACAG00000013234) Archelosauria DUPLICATION Archelosauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183150.a.a.d.c ##22 Cryptodira ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183150.a.a.d.c ##22 Testudinoidea DUPLICATION Testudinoidea ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000159764 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.a ENSGT00940000160825.a ENSGT00940000156604 ENSGT00950000185523 ENSGT00940000160264 ENSGT00390000014892 ENSGT00940000159871 ENSGT00390000016262 ENSGT00440000033966 ENSGT00390000008164 ENSGT00950000183098.a ENSGT00950000183207.b.c.a.d ENSGT00950000183207.b.d ENSGT00950000183150.a.a.d.d.a ##22 ENSGT00950000183150.a.a.d.c.a ##22 ENSGT00950000183150.a.a.d.d.b ##22 ENSGT00940000156241 ENSGT00940000163448 ENSGT00390000007311 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DUPLICATION Three-toed box turtle MODERN SPECIES 2768 ENSTMTG00000018866 ##22 Three-toed box turtle MODERN SPECIES 2810 ENSTMTG00000019493 ##22 painted turtle MODERN SPECIES 935 ENSCPBG00000016521 TUBG1 (ENSCPBG00000016518) PLEKHH3 (ENSCPBG00000016513) CCR10 (ENSCPBG00000016511) ENSCPBG00000016508 RAMP2 (ENSCPBG00000016506) VPS25 (ENSCPBG00000016501) WNK4 (ENSCPBG00000016498) COA3 (ENSCPBG00000016496) CNTD1 (ENSCPBG00000016494) ENSCPBG00000016490 PSME3 (ENSCPBG00000016487) ENSCPBG00000016485 ENSCPBG00000016483 ENSCPBG00000016306 ##22 ENSCPBG00000016299 ##22 ENSCPBG00000016296 ##22 AARSD1 (ENSCPBG00000016295) PTGES3L (ENSCPBG00000016294) RUNDC1 (ENSCPBG00000016292) RPL27 (ENSCPBG00000016290) IFI35 (ENSCPBG00000016287) ENSCPBG00000016283 VAT1 (ENSCPBG00000016276) RND2 (ENSCPBG00000016274) BRCA1 (ENSCPBG00000016269) NBR1 (ENSCPBG00000016260) TMEM106A (ENSCPBG00000016256) ARL4D (ENSCPBG00000016255) DHX8 (ENSCPBG00000016252) ETV4 (ENSCPBG00000016249) Testudinidae ANCESTRAL SPECIES 24 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##22 AARSD1 (ENSGEVG00005005159) PTGES3L (ENSGEVG00005005128) RUNDC1 (ENSGEVG00005005090) RPL27 (ENSGEVG00005005063) IFI35 (ENSGEVG00005005036) ENSGEVG00005005015 VAT1 (ENSGEVG00005004981) RND2 (ENSGEVG00005004944) BRCA1 (ENSGEVG00005004875) NBR1 (ENSGEVG00005004827) TMEM106A (ENSGEVG00005004783) ARL4D (ENSGEVG00005004762) DHX8 (ENSGEVG00005004689) ETV4 (ENSGEVG00005004499) Testudinoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183150.a.a.d.c.b ##22 Emydidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183150.a.a.d.c.b ##22 Three-toed box turtle MODERN SPECIES 2811 ENSTMTG00000019500 ##22 ENSTMTG00000019505 ##22 Archelosauria ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000156957 ENSGT00940000159764 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.a ENSGT00940000160825 ENSGT00940000156604 ENSGT00950000185523 ENSGT00940000160264 ENSGT00390000014892 ENSGT00940000159871 ENSGT00390000016262 ENSGT00440000033966 ENSGT00390000008164 ENSGT00950000183098.a ENSGT00950000183207.b.c.a ENSGT00950000183207.b.d ENSGT00950000183150.a.a.d.d ##22 ENSGT00940000156241 ENSGT00940000163448 ENSGT00390000007311 ENSGT00390000010721.a.b ENSGT00530000063686.b ENSGT00940000154578.A.c.b ENSGT00940000157579 ENSGT00940000157020 ENSGT00440000034289 ENSGT00390000016335 ENSGT00940000161546 ENSGT00940000161341.b ENSGT00940000155510 ENSGT00940000158142 ENSGT00940000154018.a Cryptodira DUPLICATION Cryptodira ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000156957 ENSGT00940000159764 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.a ENSGT00940000160825 ENSGT00940000156604 ENSGT00950000185523 ENSGT00940000160264 ENSGT00390000014892 ENSGT00940000159871 ENSGT00390000016262 ENSGT00440000033966 ENSGT00390000008164 ENSGT00950000183098.a ENSGT00950000183207.b.c.a ENSGT00950000183207.b.d ENSGT00950000183150.a.a.d.d.a ##22 ENSGT00950000183150.a.a.d.d.b ##22 ENSGT00940000156241 ENSGT00940000163448 ENSGT00390000007311 ENSGT00390000010721.a.b ENSGT00530000063686.b ENSGT00940000154578.A.c.b ENSGT00940000157579 ENSGT00940000157020 ENSGT00440000034289 ENSGT00390000016335 ENSGT00940000161546 ENSGT00940000161341.b ENSGT00940000155510 ENSGT00940000158142 Testudinoidea ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000156957 ENSGT00940000159764 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.a ENSGT00940000160825.a ENSGT00940000156604 ENSGT00950000185523 ENSGT00940000160264 ENSGT00390000014892 ENSGT00940000159871 ENSGT00390000016262 ENSGT00440000033966 ENSGT00390000008164 ENSGT00950000183098.a ENSGT00950000183207.b.c.a.d ENSGT00950000183207.b.d ENSGT00950000183150.a.a.d.d.a ##22 ENSGT00950000183150.a.a.d.c.a ##22 ENSGT00950000183150.a.a.d.d.b ##22 ENSGT00940000156241 ENSGT00940000163448 ENSGT00390000007311 ENSGT00390000010721.a.b ENSGT00530000063686.b ENSGT00940000154578.A.c.b ENSGT00940000157579 ENSGT00940000157020 ENSGT00440000034289 ENSGT00390000016335 ENSGT00940000161546 ENSGT00940000161341.b ENSGT00940000155510 Emydidae ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000156957 ENSGT00940000159764 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.a ENSGT00940000160825.a ENSGT00940000156604 ENSGT00950000185523 ENSGT00940000160264 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(ENSPSIG00000005804) SOST (ENSPSIG00000006231) ENSPSIG00000006253 Archosauria ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000156957 ENSGT00940000159764 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.a ENSGT00940000160825 ENSGT00940000156604 ENSGT00950000185523 ENSGT00940000160264 ENSGT00390000014892 ENSGT00940000159871 ENSGT00390000016262 ENSGT00440000033966 ENSGT00390000008164 ENSGT00950000183098.a ENSGT00950000183207.b.c.a ENSGT00950000183207.b.d ENSGT00950000183150.a.a.d.d ##22 ENSGT00940000156241 ENSGT00940000163448 ENSGT00390000007311 ENSGT00390000010721.a.b ENSGT00530000063686.b ENSGT00940000154578.A.c.b ENSGT00940000157579 ENSGT00940000157020 ENSGT00440000034289 ENSGT00390000016335 ENSGT00940000161546 ENSGT00940000155510 ENSGT00940000158142 ENSGT00940000154018.a ENSGT00390000014900.b.b.b Australian saltwater crocodile DUPLICATION Australian saltwater crocodile MODERN SPECIES 61 PSMC3IP (ENSCPRG00005007734) ENSCPRG00005007739 TUBG1 (ENSCPRG00005007766) PLEKHH3 (ENSCPRG00005008087) CCR10 (ENSCPRG00005008098) 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(ENSCPRG00005008245) RUNDC1 (ENSCPRG00005008248) RPL27 (ENSCPRG00005008253) IFI35 (ENSCPRG00005008256) ENSCPRG00005008262 VAT1 (ENSCPRG00005008270) RND2 (ENSCPRG00005008296) ENSCPRG00005008315 NBR1 (ENSCPRG00005008332) Aves ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000156957 ENSGT00940000159764 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.a ENSGT00940000160825 ENSGT00940000156604 ENSGT00950000185523 ENSGT00940000160264 ENSGT00390000014892 ENSGT00940000159871 ENSGT00390000016262 ENSGT00440000033966 ENSGT00390000008164 ENSGT00950000183098.a ENSGT00950000183207.b.c.a ENSGT00950000183207.b.d ENSGT00950000183150.a.a.d.d ##22 ENSGT00940000156241 ENSGT00940000163448 ENSGT00390000007311 ENSGT00390000010721.a.b ENSGT00530000063686.b ENSGT00940000154578.A.c.b ENSGT00940000157579 ENSGT00940000157020 ENSGT00440000034289 ENSGT00390000016335 ENSGT00940000161546 ENSGT00940000155510 ENSGT00940000158142 ENSGT00940000154018.a ENSGT00390000014900.b.b.b Neognathae ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000156957 ENSGT00940000159764 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.a ENSGT00940000160825 ENSGT00940000156604 ENSGT00950000185523 ENSGT00940000160264 ENSGT00390000014892 ENSGT00940000159871 ENSGT00390000016262 ENSGT00440000033966 ENSGT00390000008164 ENSGT00950000183098.a ENSGT00950000183207.b.c.a.a.a ENSGT00950000183207.b.d ENSGT00950000183150.a.a.d.d ##22 ENSGT00940000156241 ENSGT00960000193113 ENSGT00940000163448 ENSGT00390000007311 ENSGT00390000010721.a.b ENSGT00530000063686.b ENSGT00940000154578.A.c.b ENSGT00940000157579 ENSGT00940000157020 ENSGT00440000034289 ENSGT00390000016335 ENSGT00940000161546 ENSGT00940000155510 ENSGT00940000158142 ENSGT00940000154018.a Galloanserae ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000167154 ENSGT00940000156957 ENSGT00940000159764 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.a ENSGT00940000160825 ENSGT00940000156604 ENSGT00940000160264 ENSGT00390000014892 ENSGT00940000159871 ENSGT00390000016262 ENSGT00440000033966 ENSGT00390000008164 ENSGT00950000183098.a ENSGT00950000183207.b.c.a.a.a ENSGT00950000183207.b.d ENSGT00950000183150.a.a.d.d ##22 ENSGT00940000156241 ENSGT00940000163448 ENSGT00390000007311 ENSGT00390000010721.a.b ENSGT00530000063686.b ENSGT00940000154578.A.c.b ENSGT00940000157579 ENSGT00940000157020 ENSGT00440000034289 ENSGT00390000016335 ENSGT00940000161546 ENSGT00940000155510 ENSGT00940000158142 ENSGT00940000154018.a ENSGT00390000014900.b.b.b Anatidae ANCESTRAL SPECIES 43 ENSGT00940000167154 ENSGT00940000156957 ENSGT00940000159764 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.a ENSGT00940000160825 ENSGT00940000156604 ENSGT00940000160264 ENSGT00390000014892 ENSGT00940000159871 ENSGT00950000186402 ENSGT00440000033966 ENSGT00390000008164 ENSGT00950000183098.a ENSGT00950000183207.b.c.a.a.b ENSGT00950000183207.b.d ENSGT00950000183150.a.a.d.d ##22 ENSGT00940000156241 ENSGT00940000163448 ENSGT00390000007311 ENSGT00390000010721.a.b ENSGT00940000154578.A.c.b ENSGT00940000157579 ENSGT00940000157020 ENSGT00440000034289 ENSGT00390000016335 ENSGT00940000161546 ENSGT00940000155510 ENSGT00940000158142 ENSGT00940000154018.a ENSGT00390000014900.b.b.b ENSGT00940000163612 Duck MODERN SPECIES 283 G6PC1 (ENSAPLG00000017120) ##22 Pink-footed goose MODERN SPECIES 200 ENSABRG00000012879 TUBG1 (ENSABRG00000012934) PLEKHH3 (ENSABRG00000012943) CCR10 (ENSABRG00000012951) CNTNAP1 (ENSABRG00000012955) EZH1 (ENSABRG00000012958) RAMP2 (ENSABRG00000012970) VPS25 (ENSABRG00000012975) WNK4 (ENSABRG00000012989) ENSABRG00000013016 CNTD1 (ENSABRG00000013032) ENSABRG00000013039 PSME3 (ENSABRG00000013060) ENSABRG00000013066 ENSABRG00000013075 G6PC1 (ENSABRG00000013080) ##22 AARSD1 (ENSABRG00000013088) PTGES3L (ENSABRG00000013094) RUNDC1 (ENSABRG00000013100) RPL27 (ENSABRG00000013103) ENSABRG00000013115 VAT1 (ENSABRG00000013121) RND2 (ENSABRG00000013126) BRCA1 (ENSABRG00000013131) NBR1 (ENSABRG00000013137) TMEM106A (ENSABRG00000013154) DHX8 (ENSABRG00000013185) ETV4 (ENSABRG00000013199) MEOX1 (ENSABRG00000013215) SOST (ENSABRG00000013223) DUSP3 (ENSABRG00000013228) Phasianidae ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000167154 ENSGT00940000156957 ENSGT00940000159764 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.a ENSGT00940000160825 ENSGT00940000156604 ENSGT00390000014892 ENSGT00940000160264 ENSGT00940000159871 ENSGT00390000016262 ENSGT00440000033966 ENSGT00390000008164 ENSGT00950000183098.a ENSGT00950000183207.b.c.a.a.a ENSGT00950000183207.b.d ENSGT00950000183150.a.a.d.d ##22 ENSGT00940000156241 ENSGT00940000163448 ENSGT00390000007311 ENSGT00390000010721.a.b ENSGT00530000063686.b ENSGT00940000154578.A.c.b ENSGT00940000157579 ENSGT00940000157020 ENSGT00440000034289 ENSGT00390000016335 ENSGT00940000155348.B #14 Japanese quail MODERN SPECIES 19 ENSCJPG00005004934 TUBG1 (ENSCJPG00005004950) PLEKHH3 (ENSCJPG00005005308) CCR10 (ENSCJPG00005005317) CNTNAP1 (ENSCJPG00005005320) EZH1 (ENSCJPG00005005323) VPS25 (ENSCJPG00005005339) RAMP2 (ENSCJPG00005005343) WNK4 (ENSCJPG00005005350) ENSCJPG00005005362 CNTD1 (ENSCJPG00005005364) ENSCJPG00005005365 PSME3 (ENSCJPG00005005366) ENSCJPG00005005371 ENSCJPG00005005380 G6PC1 (ENSCJPG00005005382) ##22 AARSD1 (ENSCJPG00005005398) PTGES3L (ENSCJPG00005005413) RUNDC1 (ENSCJPG00005005421) RPL27 (ENSCJPG00005005426) IFI35 (ENSCJPG00005005428) ENSCJPG00005005430 VAT1 (ENSCJPG00005005436) RND2 (ENSCJPG00005005482) BRCA1 (ENSCJPG00005005524) NBR1 (ENSCJPG00005005546) MPP2 (ENSCJPG00005005557) #14 Phasianidae_b ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000157377 ENSGT00390000006890 ENSGT00940000167154 ENSGT00940000156957 ENSGT00940000159764 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.a ENSGT00940000160825 ENSGT00940000156604 ENSGT00940000159871 ENSGT00390000016262 ENSGT00440000033966 ENSGT00390000008164 ENSGT00950000183098.a ENSGT00950000183207.b.c.a.a.a ENSGT00950000183207.b.d ENSGT00950000183150.a.a.d.d ##22 ENSGT00940000156241 ENSGT00940000163448 ENSGT00390000007311 ENSGT00390000010721.a.a ENSGT00530000063686.b ENSGT00940000154578.A.c.b ENSGT00940000157579 ENSGT00940000157020 ENSGT00440000034289 ENSGT00390000016335 ENSGT00940000155348.B #14 Turkey MODERN SPECIES 21 ENSMGAG00000022492 ENSMGAG00000004348 NBR1 (ENSMGAG00000004401) ENSMGAG00000004450 #14 ENSMGAG00000004085 ENSMGAG00000020262 ENSMGAG00000019979 ENSMGAG00000004327 ENSMGAG00000004304 ENSMGAG00000004285 ENSMGAG00000004275 PTGES3L (ENSMGAG00000004245) ENSMGAG00000021589 ENSMGAG00000022525 ENSMGAG00000017036 ENSMGAG00000004239 ##22 ENSMGAG00000020327 ENSMGAG00000017696 PSME3 (ENSMGAG00000004196) ENSMGAG00000017083 ENSMGAG00000004162 ENSMGAG00000021697 RAMP2 (ENSMGAG00000018890) ENSMGAG00000003745 ENSMGAG00000003995 CCR10 (ENSMGAG00000016373) TUBG1 (ENSMGAG00000004052) ENSMGAG00000003941 ENSMGAG00000003897 ENSMGAG00000003898 COASY (ENSMGAG00000016557) Chicken MODERN SPECIES 19 PSMC3IP (ENSGALG00010021329) FAM134C (ENSGALG00010021363) TUBG1 (ENSGALG00010021375) PLEKHH3 (ENSGALG00010021416) CCR10 (ENSGALG00010021440) CNTNAP1 (ENSGALG00010022182) EZH1 (ENSGALG00010022210) RAMP2 (ENSGALG00010022235) WNK4 (ENSGALG00010022251) COA3 (ENSGALG00010022266) CNTD1 (ENSGALG00010022269) BECN1 (ENSGALG00010022276) PSME3 (ENSGALG00010022317) ENSGALG00010026686 AOC3 (ENSGALG00010022333) G6PC1 (ENSGALG00010022348) ##22 AARSD1 (ENSGALG00010022366) PTGES3L (ENSGALG00010022395) RUNDC1 (ENSGALG00010022407) RPL27 (ENSGALG00010022427) IFI35 (ENSGALG00010022439) ENSGALG00010022453 VAT1 (ENSGALG00010022460) RND2 (ENSGALG00010024713) BRCA1 (ENSGALG00010024722) NBR1 (ENSGALG00010024738) MPP2 (ENSGALG00010024752) #14 Neognathae_b ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000156957 ENSGT00940000159764 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.a ENSGT00940000160825 ENSGT00940000156604 ENSGT00950000185523 ENSGT00940000160264 ENSGT00390000014892 ENSGT00940000159871 ENSGT00390000016262 ENSGT00440000033966 ENSGT00390000008164 ENSGT00950000183098.a ENSGT00950000183207.b.c.a.a.a ENSGT00950000183207.b.d ENSGT00950000183150.a.a.d.d ##22 ENSGT00940000156241 ENSGT00960000193113 ENSGT00940000163448 ENSGT00390000007311 ENSGT00390000010721.a.b ENSGT00530000063686.b ENSGT00940000154578.A.c.b ENSGT00940000157579 ENSGT00940000157020 ENSGT00440000034289 ENSGT00390000016335 ENSGT00940000161546 ENSGT00940000155510 ENSGT00940000158142 ENSGT00940000154018.a Passeriformes ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00940000167154 ENSGT00940000156957 ENSGT00940000159764 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.a ENSGT00940000160825 ENSGT00940000156604 ENSGT00940000160264 ENSGT00390000014892 ENSGT00940000159871 ENSGT00390000016262 ENSGT00440000033966 ENSGT00390000008164 ENSGT00950000183098.a ENSGT00950000183207.b.c.a.a.a ENSGT00950000183207.b.d ENSGT00950000183150.a.a.d.d ##22 ENSGT00940000156241 ENSGT00960000193113 ENSGT00940000163448 ENSGT00390000007311 ENSGT00390000010721.a.b ENSGT00530000063686.b ENSGT00940000154578.A.c.b ENSGT00940000157579 ENSGT00940000157020 ENSGT00440000034289 ENSGT00390000016335 ENSGT00940000155510 ENSGT00940000158142 ENSGT00940000154018.a ENSGT00390000014900.b.b.b Passeriformes_d ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00390000006890 ENSGT00940000167154 ENSGT00940000156957 ENSGT00940000159764 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.a ENSGT00940000160825 ENSGT00940000156604 ENSGT00940000160264 ENSGT00390000014892 ENSGT00940000159871 ENSGT00440000033966 ENSGT00390000008164 ENSGT00950000183098.a ENSGT00950000183207.b.c.a.a.a ENSGT00950000183207.b.d ENSGT00950000183150.a.a.d.d ##22 ENSGT00940000156241 ENSGT00960000193113 ENSGT00940000163448 ENSGT00390000007311 ENSGT00390000010721.a.b ENSGT00530000063686.b ENSGT00940000154578.A.c.b ENSGT00940000157579 ENSGT00940000157020 ENSGT00440000034289 ENSGT00390000016335 ENSGT00940000155510 ENSGT00940000158142 ENSGT00940000154018.a ENSGT00390000014900.b.b.b Passeriformes_g ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00390000006890 ENSGT00940000167154 ENSGT00940000156957 ENSGT00940000159764 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.a ENSGT00940000160825 ENSGT00940000156604 ENSGT00940000160264 ENSGT00390000014892 ENSGT00950000186402 ENSGT00440000033966 ENSGT00390000008164 ENSGT00950000183098.a ENSGT00950000183207.b.c.a.a.a ENSGT00950000183207.b.d ENSGT00950000183150.a.a.d.d ##22 ENSGT00940000156241 ENSGT00960000193113 ENSGT00940000163448 ENSGT00390000007311 ENSGT00390000010721.a.b ENSGT00530000063686.b ENSGT00940000154578.A.c.b ENSGT00940000157579 ENSGT00940000157020 ENSGT00440000034289 ENSGT00390000016335 ENSGT00940000155510 ENSGT00940000158142 ENSGT00940000154018.a ENSGT00390000014900.b.b.b Passeroidea ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00390000006890 ENSGT00940000167154 ENSGT00940000156957 ENSGT00940000159764 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.a ENSGT00940000160825 ENSGT00940000156604 ENSGT00940000160264 ENSGT00390000014892 ENSGT00950000186402 ENSGT00440000033966 ENSGT00390000008164 ENSGT00950000183098.a ENSGT00950000183207.b.c.a.a.a ENSGT00950000183207.b.d ENSGT00950000183150.a.a.d.d ##22 ENSGT00940000156241 ENSGT00960000193113 ENSGT00940000163448 ENSGT00390000007311 ENSGT00390000010721.a.b ENSGT00530000063686.b ENSGT00940000154578.A.c.b ENSGT00940000157579 ENSGT00940000157020 ENSGT00440000034289 ENSGT00390000016335 ENSGT00940000155510 ENSGT00940000158142 ENSGT00940000154018.a ENSGT00390000014900.b.b.b Common canary MODERN SPECIES 42 HSD17B1 (ENSSCAG00000006320) MLX (ENSSCAG00000006325) PSMC3IP (ENSSCAG00000006336) ENSSCAG00000006340 TUBG1 (ENSSCAG00000006366) PLEKHH3 (ENSSCAG00000006606) CCR10 (ENSSCAG00000006608) EZH1 (ENSSCAG00000006635) VPS25 (ENSSCAG00000006642) RAMP2 (ENSSCAG00000006645) CNTD1 (ENSSCAG00000006684) ENSSCAG00000006688 PSME3 (ENSSCAG00000006703) ENSSCAG00000006727 ENSSCAG00000006731 G6PC1 (ENSSCAG00000006737) ##22 ENSSCAG00000006739 ENSSCAG00000006742 PTGES3L (ENSSCAG00000006743) RUNDC1 (ENSSCAG00000006747) ENSSCAG00000006750 IFI35 (ENSSCAG00000006757) ENSSCAG00000006762 VAT1 (ENSSCAG00000006764) RND2 (ENSSCAG00000006770) BRCA1 (ENSSCAG00000006782) NBR1 (ENSSCAG00000006793) DHX8 (ENSSCAG00000006818) ETV4 (ENSSCAG00000006830) MEOX1 (ENSSCAG00000006834) SOST (ENSSCAG00000006839) Medium ground finch MODERN SPECIES 259 ATP6V0A1 (ENSGFOG00000004568) NAGLU (ENSGFOG00000004537) COASY (ENSGFOG00000004465) MLX (ENSGFOG00000004430) PSMC3IP (ENSGFOG00000004406) ENSGFOG00000004393 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ENSPMJG00000002012 ENSPMJG00000002015 G6PC1 (ENSPMJG00000002017) ##22 AARSD1 (ENSPMJG00000002104) PTGES3L (ENSPMJG00000002116) RUNDC1 (ENSPMJG00000002128) RPL27 (ENSPMJG00000002138) ENSPMJG00000002146 ENSPMJG00000002155 VAT1 (ENSPMJG00000002170) RND2 (ENSPMJG00000002191) BRCA1 (ENSPMJG00000002201) NBR1 (ENSPMJG00000002262) DHX8 (ENSPMJG00000002357) ETV4 (ENSPMJG00000002400) MEOX1 (ENSPMJG00000002425) SOST (ENSPMJG00000002465) DUSP3 (ENSPMJG00000002466) Neognathae_c ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000159764 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.a ENSGT00940000160825 ENSGT00940000156604 ENSGT00950000185523 ENSGT00940000160264 ENSGT00390000014892 ENSGT00940000159871 ENSGT00390000016262 ENSGT00440000033966 ENSGT00390000008164 ENSGT00950000183098.a ENSGT00950000183207.b.c.a.a.b ENSGT00950000183207.b.c.a.a.a ENSGT00950000183207.b.d ENSGT00950000183150.a.a.d.d ##22 ENSGT00940000156241 ENSGT00940000163448 ENSGT00390000007311 ENSGT00390000010721.a.b ENSGT00530000063686.b ENSGT00940000154578.A.c.b ENSGT00940000157579 ENSGT00940000157020 ENSGT00440000034289 ENSGT00390000016335 ENSGT00940000161546 ENSGT00940000155510 ENSGT00940000158142 ENSGT00940000154018.a ENSGT00390000014900.b.b.b Kakapo MODERN SPECIES 12 ENSSHBG00005013042 TUBG1 (ENSSHBG00005013051) PLEKHH3 (ENSSHBG00005013066) CCR10 (ENSSHBG00005013089) EZH1 (ENSSHBG00005013148) RAMP2 (ENSSHBG00005013361) VPS25 (ENSSHBG00005013380) WNK4 (ENSSHBG00005013395) COA3 (ENSSHBG00005013413) CNTD1 (ENSSHBG00005013497) ENSSHBG00005013517 PSME3 (ENSSHBG00005013541) ENSSHBG00005013554 ENSSHBG00005013561 ENSSHBG00005013582 G6PC1 (ENSSHBG00005013608) ##22 AARSD1 (ENSSHBG00005013629) RUNDC1 (ENSSHBG00005013661) RPL27 (ENSSHBG00005013669) IFI35 (ENSSHBG00005013678) ENSSHBG00005013684 VAT1 (ENSSHBG00005013700) RND2 (ENSSHBG00005013807) BRCA1 (ENSSHBG00005013817) NBR1 (ENSSHBG00005013834) DHX8 (ENSSHBG00005014069) ETV4 (ENSSHBG00005017506) MEOX1 (ENSSHBG00005017511) SOST (ENSSHBG00005017512) ENSSHBG00005017514 ENSSHBG00005017515 Golden eagle MODERN SPECIES 24 PLEKHH3 (ENSACCG00020001396) CCR10 (ENSACCG00020001375) CNTNAP1 (ENSACCG00020001235) EZH1 (ENSACCG00020001100) ENSACCG00020001061 RAMP2 (ENSACCG00020001047) VPS25 (ENSACCG00020001035) WNK4 (ENSACCG00020001019) COA3 (ENSACCG00020000998) CNTD1 (ENSACCG00020000976) ENSACCG00020000960 PSME3 (ENSACCG00020000939) ENSACCG00020000917 ENSACCG00020000901 ENSACCG00020000885 G6PC1 (ENSACCG00020000858) ##22 AARSD1 (ENSACCG00020000826) PTGES3L (ENSACCG00020000795) RUNDC1 (ENSACCG00020000777) RPL27 (ENSACCG00020000755) IFI35 (ENSACCG00020000727) ENSACCG00020000716 VAT1 (ENSACCG00020000656) RND2 (ENSACCG00020000555) BRCA1 (ENSACCG00020000504) NBR1 (ENSACCG00020000437) TMEM106A (ENSACCG00020000391) DHX8 (ENSACCG00020000381) ETV4 (ENSACCG00020000358) MEOX1 (ENSACCG00020004522) SOST (ENSACCG00020004513) Mammalia ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000161349 ENSGT00940000156957 ENSGT00960000187260 ENSGT00940000159764 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.a ENSGT00940000160825 ENSGT00940000156604 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SPECIES 3 ENSGT00940000156957.a ENSGT00940000156957.b ENSGT00940000159764 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.a ENSGT00940000160825 ENSGT00940000156604 ENSGT00940000160264 ENSGT00390000014892 ENSGT00940000159871 ENSGT00390000016262 ENSGT00440000033966 ENSGT00390000008164 ENSGT00950000183098.a ENSGT00950000183207.b.f ENSGT00950000183207.b.e ENSGT00950000183150.a.a ##22 ENSGT00940000156241 ENSGT00390000007311 ENSGT00390000010721.a.b ENSGT00530000063686.b ENSGT00940000157579 ENSGT00940000157020 ENSGT00440000034289 ENSGT00390000016335 ENSGT00940000161546 ENSGT00940000161341.b ENSGT00940000155510 ENSGT00940000158142 ENSGT00940000154018.a ENSGT00390000014900.b.b.b ENSGT00940000163612 Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000156957.a ENSGT00940000156957.b ENSGT00940000159764 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.a ENSGT00940000160825 ENSGT00940000156604 ENSGT00940000160264 ENSGT00390000014892 ENSGT00940000159871 ENSGT00390000016262 ENSGT00440000033966 ENSGT00390000008164 ENSGT00950000183098.a 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ENSGT00940000155510 ENSGT00940000158142 ENSGT00940000154018.a ENSGT00390000014900.b.b.b ENSGT00940000163612 Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00940000156957.a ENSGT00940000156957.b ENSGT00940000159764 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.a ENSGT00940000160825 ENSGT00940000156604 ENSGT00940000160264 ENSGT00390000014892 ENSGT00940000159871 ENSGT00390000016262 ENSGT00440000033966 ENSGT00390000008164 ENSGT00950000183098.a ENSGT00950000183207.b.f ENSGT00950000183207.b.e ENSGT00950000183150.a.a ##22 ENSGT00940000156241 ENSGT00940000155097.b ENSGT00940000163448 ENSGT00390000007311 ENSGT00390000010721.a.b ENSGT00530000063686.b ENSGT00940000157579 ENSGT00940000157020 ENSGT00440000034289.g ENSGT00390000016335 ENSGT00940000161546 ENSGT00940000161341.b ENSGT00940000155510 ENSGT00940000158142 ENSGT00940000154018.a Common wonbat MODERN SPECIES 1034 ENSVURG00010021724 ENSVURG00010021719 PLEKHH3 (ENSVURG00010021715) CCR10 (ENSVURG00010021712) CNTNAP1 (ENSVURG00010021704) EZH1 (ENSVURG00010021689) ENSVURG00010021682 VPS25 (ENSVURG00010021675) WNK4 (ENSVURG00010021662) COA3 (ENSVURG00010021656) CNTD1 (ENSVURG00010021652) ENSVURG00010021647 PSME3 (ENSVURG00010021631) AOC2 (ENSVURG00010021620) AOC3 (ENSVURG00010021616) G6PC1 (ENSVURG00010021612) ##22 AARSD1 (ENSVURG00010021603) ENSVURG00010021598 PTGES3L (ENSVURG00010021594) RUNDC1 (ENSVURG00010021590) RPL27 (ENSVURG00010021581) IFI35 (ENSVURG00010021573) VAT1 (ENSVURG00010021565) RND2 (ENSVURG00010021559) ENSVURG00010021552 ENSVURG00010021541 ENSVURG00010021549 NBR1 (ENSVURG00010021527) TMEM106A (ENSVURG00010021514) ARL4D (ENSVURG00010021503) DHX8 (ENSVURG00010021499) koala MODERN SPECIES 230 MLX (ENSPCIG00000021525) PSMC3IP (ENSPCIG00000021517) RETREG3 (ENSPCIG00000021516) TUBG1 (ENSPCIG00000021514) PLEKHH3 (ENSPCIG00000021512) CCR10 (ENSPCIG00000035818) CNTNAP1 (ENSPCIG00000021508) EZH1 (ENSPCIG00000021506) VPS25 (ENSPCIG00000021502) WNK4 (ENSPCIG00000021500) COA3 (ENSPCIG00000021499) CNTD1 (ENSPCIG00000021498) 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ENSGT01030000234667.a.a.a.a.a ENSGT00940000160825 ENSGT00940000156604 ENSGT00940000160264 ENSGT00390000014892 ENSGT00940000159871 ENSGT00390000016262 ENSGT00440000033966 ENSGT00390000008164.c ENSGT00950000183098.a ENSGT00950000183207.b.f ENSGT00950000183207.b.e ENSGT00950000183150.a.a ##22 ENSGT00940000156241 ENSGT00940000163448 ENSGT00390000007311 ENSGT00390000010721.a.b ENSGT00530000063686.b ENSGT00940000157579 ENSGT00940000157020 ENSGT00440000034289 ENSGT00390000016335 ENSGT00940000161546 ENSGT00850000133618 ENSGT00940000161341.b ENSGT00940000155510 ENSGT00940000158142 ENSGT00940000154018.a Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000162499 ENSGT00940000159764 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.a ENSGT00900000143602 ENSGT00940000160825 ENSGT00940000156604 ENSGT00940000160264 ENSGT00390000014892 ENSGT00940000159871 ENSGT00390000016262 ENSGT00440000033966 ENSGT00390000008164.c ENSGT00950000183098.a ENSGT00950000183207.b.f ENSGT00950000183207.b.e ENSGT00950000183150.a.a ##22 ENSGT00940000156241 ENSGT00940000163448 ENSGT00390000007311 ENSGT00390000010721.a.b ENSGT00530000063686.b ENSGT00940000157579 ENSGT00940000157020 ENSGT00440000034289 ENSGT00390000016335 ENSGT00940000161546 ENSGT00850000133618 ENSGT00940000161341.b ENSGT00940000155510 ENSGT00940000158142 ENSGT00940000154018.a Primates ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000162499 ENSGT00940000159764 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.a ENSGT00900000143602 ENSGT00940000160825 ENSGT00940000156604 ENSGT00940000160264 ENSGT00390000014892 ENSGT00940000159871 ENSGT00390000016262 ENSGT00440000033966 ENSGT00390000008164.c ENSGT00950000183098.a ENSGT00950000183207.b.f ENSGT00950000183207.b.e ENSGT00950000183150.a.a ##22 ENSGT00940000156241 ENSGT00940000163448 ENSGT00390000007311 ENSGT00390000010721.a.b ENSGT00530000063686.b ENSGT00940000157579 ENSGT00940000157020 ENSGT00440000034289 ENSGT00390000016335 ENSGT00940000161546 ENSGT00850000133618 ENSGT00940000161341.b ENSGT00940000155510 ENSGT00940000158142 ENSGT00940000154018.a Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000156957 ENSGT00940000162499 ENSGT00940000159764 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.a ENSGT00940000160825 ENSGT00940000156604 ENSGT00940000160264 ENSGT00390000014892 ENSGT00940000159871 ENSGT00390000016262 ENSGT00440000033966 ENSGT00390000008164.c ENSGT00950000183098.a ENSGT00950000183207.b.f ENSGT00950000183207.b.e ENSGT00950000183150.a.a ##22 ENSGT00940000156241 ENSGT00940000163448 ENSGT00390000007311 ENSGT00390000010721.a.b ENSGT00530000063686.b ENSGT00940000157579 ENSGT00940000157020 ENSGT00440000034289 ENSGT00390000016335 ENSGT00940000161546 ENSGT00850000133618 ENSGT00940000161341.b ENSGT00940000155510 ENSGT00940000158142 ENSGT00940000154018.a Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000162499 ENSGT00940000159764 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.a ENSGT00940000160825 ENSGT00940000156604 ENSGT00940000160264 ENSGT00390000014892 ENSGT00940000159871 ENSGT00390000016262 ENSGT00440000033966 ENSGT00390000008164.c ENSGT00950000183098.a ENSGT00950000183207.b.f ENSGT00950000183207.b.e.c ENSGT00950000183207.b.e.d ENSGT00950000183150.a.a ##22 ENSGT00940000156241 ENSGT00940000163448 ENSGT00390000007311 ENSGT00390000010721.a.b ENSGT00530000063686.b ENSGT00940000157579 ENSGT00940000157020 ENSGT00440000034289 ENSGT00390000016335 ENSGT00940000161546 ENSGT00850000133618 ENSGT00940000161341.b ENSGT00940000155510 ENSGT00940000158142 ENSGT00940000154018.a Mouse lemur MODERN SPECIES 7 TUBG2 (ENSMICG00000044881) PLEKHH3 (ENSMICG00000010298) CCR10 (ENSMICG00000010311) CNTNAP1 (ENSMICG00000010313) EZH1 (ENSMICG00000010327) RAMP2 (ENSMICG00000028500) VPS25 (ENSMICG00000010357) WNK4 (ENSMICG00000010362) COA3 (ENSMICG00000045288) CNTD1 (ENSMICG00000010384) BECN1 (ENSMICG00000010391) PSME3 (ENSMICG00000010398) AOC2 (ENSMICG00000031928) ENSMICG00000027130 ENSMICG00000046526 G6PC1 (ENSMICG00000014178) ##22 AARSD1 (ENSMICG00000014185) PTGES3L (ENSMICG00000044844) RUNDC1 (ENSMICG00000014204) RPL27 (ENSMICG00000014214) IFI35 (ENSMICG00000014224) VAT1 (ENSMICG00000014234) RND2 (ENSMICG00000035270) BRCA1 (ENSMICG00000043973) NBR1 (ENSMICG00000029916) TMEM106A (ENSMICG00000013987) CCDC200 (ENSMICG00000045384) ENSMICG00000046658 ARL4D (ENSMICG00000046097) DHX8 (ENSMICG00000009509) ETV4 (ENSMICG00000009518) Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162499 ENSGT00940000159764 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.a ENSGT00940000160825 ENSGT00940000156604 ENSGT00940000160264 ENSGT00390000014892 ENSGT00940000159871 ENSGT00390000016262 ENSGT00440000033966 ENSGT00390000008164.c ENSGT00950000183098.a ENSGT00950000183207.b.f ENSGT00950000183207.b.e.c ENSGT00950000183207.b.e.d ENSGT00950000183150.a.a ##22 ENSGT00940000156241 ENSGT00940000163448 ENSGT00390000007311 ENSGT00390000010721.a.b ENSGT00530000063686.b ENSGT00940000157579 ENSGT00940000157020 ENSGT00440000034289 ENSGT00390000016335 ENSGT00940000161546 ENSGT00850000133618 Coquerels sifaka MODERN SPECIES 672 TUBG2 (ENSPCOG00000026674) PLEKHH3 (ENSPCOG00000016889) CCR10 (ENSPCOG00000016970) CNTNAP1 (ENSPCOG00000007810) EZH1 (ENSPCOG00000024585) RAMP2 (ENSPCOG00000021480) VPS25 (ENSPCOG00000019464) WNK4 (ENSPCOG00000007130) COA3 (ENSPCOG00000013088) CNTD1 (ENSPCOG00000022551) BECN1 (ENSPCOG00000027315) PSME3 (ENSPCOG00000018396) AOC2 (ENSPCOG00000023288) ENSPCOG00000001852 ENSPCOG00000009608 G6PC1 (ENSPCOG00000027164) ##22 AARSD1 (ENSPCOG00000014853) PTGES3L (ENSPCOG00000013759) RUNDC1 (ENSPCOG00000028668) RPL27 (ENSPCOG00000025683) IFI35 (ENSPCOG00000026451) VAT1 (ENSPCOG00000019576) RND2 (ENSPCOG00000020740) ENSPCOG00000023832 ENSPCOG00000017745 ENSPCOG00000008261 TMEM106A (ENSPCOG00000028320) ENSPCOG00000022550 Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 1007 CCR10 (ENSPSMG00000006986) CNTNAP1 (ENSPSMG00000006973) EZH1 (ENSPSMG00000006803) RAMP2 (ENSPSMG00000006727) VPS25 (ENSPSMG00000006710) WNK4 (ENSPSMG00000006694) COA3 (ENSPSMG00000006655) CNTD1 (ENSPSMG00000006653) BECN1 (ENSPSMG00000006565) PSME3 (ENSPSMG00000006418) AOC2 (ENSPSMG00000006342) ENSPSMG00000006333 ENSPSMG00000006318 G6PC1 (ENSPSMG00000006311) ##22 AARSD1 (ENSPSMG00000006260) RUNDC1 (ENSPSMG00000006210) RPL27 (ENSPSMG00000006202) IFI35 (ENSPSMG00000006197) VAT1 (ENSPSMG00000006194) RND2 (ENSPSMG00000006190) ENSPSMG00000006167 NBR1 (ENSPSMG00000005541) TMEM106A (ENSPSMG00000005332) CCDC200 (ENSPSMG00000005328) Bushbaby MODERN SPECIES 133 TUBG1 (ENSOGAG00000009883) TUBG2 (ENSOGAG00000009878) PLEKHH3 (ENSOGAG00000009889) CCR10 (ENSOGAG00000031984) CNTNAP1 (ENSOGAG00000009895) EZH1 (ENSOGAG00000009904) VPS25 (ENSOGAG00000009911) WNK4 (ENSOGAG00000009916) COA3 (ENSOGAG00000009928) CNTD1 (ENSOGAG00000009929) BECN1 (ENSOGAG00000009933) PSME3 (ENSOGAG00000009420) AOC2 (ENSOGAG00000009425) ENSOGAG00000013065 ENSOGAG00000028463 G6PC1 (ENSOGAG00000009428) ##22 AARSD1 (ENSOGAG00000003934) PTGES3L (ENSOGAG00000032060) RUNDC1 (ENSOGAG00000003938) RPL27 (ENSOGAG00000003940) IFI35 (ENSOGAG00000003942) VAT1 (ENSOGAG00000003946) RND2 (ENSOGAG00000003947) NBR1 (ENSOGAG00000003956) TMEM106A (ENSOGAG00000003960) ARL4D (ENSOGAG00000029839) DHX8 (ENSOGAG00000010418) ETV4 (ENSOGAG00000007666) MEOX1 (ENSOGAG00000007673) SOST (ENSOGAG00000007676) DUSP3 (ENSOGAG00000032737) Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000162499 ENSGT00940000159764 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.a ENSGT00900000143602 ENSGT00940000160825 ENSGT00940000156604 ENSGT00940000160264 ENSGT00390000014892 ENSGT00940000159871 ENSGT00390000016262 ENSGT00440000033966 ENSGT00390000008164.c ENSGT00950000183098.a ENSGT00950000183207.b.f ENSGT00950000183207.b.e ENSGT00950000183150.a.a ##22 ENSGT00940000156241 ENSGT00940000163448 ENSGT00390000007311 ENSGT00390000010721.a.b ENSGT00530000063686.b ENSGT00940000157579 ENSGT00940000157020 ENSGT00440000034289 ENSGT00390000016335 ENSGT00940000161546 ENSGT00850000133618 ENSGT00940000161341.b ENSGT00940000155510 ENSGT00940000158142 ENSGT00940000154018.a Tarsier MODERN SPECIES 6171 TUBG2 (ENSTSYG00000033006) PLEKHH3 (ENSTSYG00000011252) ENSTSYG00000027818 CNTNAP1 (ENSTSYG00000002185) EZH1 (ENSTSYG00000007601) RAMP2 (ENSTSYG00000028404) VPS25 (ENSTSYG00000010015) WNK4 (ENSTSYG00000036715) COA3 (ENSTSYG00000037336) CNTD1 (ENSTSYG00000031966) BECN1 (ENSTSYG00000037105) PSME3 (ENSTSYG00000002969) AOC3 (ENSTSYG00000031390) G6PC (ENSTSYG00000006609) ##22 AARSD1 (ENSTSYG00000034407) Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000159764 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.a ENSGT00900000143602 ENSGT00940000160825 ENSGT00940000156604 ENSGT00940000160264 ENSGT00390000014892 ENSGT00940000159871 ENSGT00390000016262 ENSGT00440000033966 ENSGT00390000008164.c ENSGT00950000183098.a ENSGT00950000183207.b.f ENSGT00950000183207.b.e.a ENSGT00950000183207.b.e.b ENSGT00950000183150.a.a ##22 ENSGT00940000156241 ENSGT00940000163448 ENSGT00390000007311 ENSGT00390000010721.a.b ENSGT00530000063686.b ENSGT00940000157579 ENSGT00940000157020 ENSGT00440000034289 ENSGT00390000016335 ENSGT00940000161546 ENSGT00850000133618 ENSGT00940000161341.b ENSGT00940000155510 ENSGT00940000158142 ENSGT00940000154018.a Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.a ENSGT00900000143602 ENSGT00940000160825 ENSGT00940000156604 ENSGT00390000018423.b.a ENSGT00940000160264 ENSGT00390000014892 ENSGT00940000159871 ENSGT00390000016262 ENSGT00440000033966 ENSGT00390000008164.c ENSGT00950000183098.a ENSGT00950000183207.b.f ENSGT00950000183207.b.e.a ENSGT00950000183207.b.e.b ENSGT00950000183150.a.a ##22 ENSGT00940000156241 ENSGT00940000163448 ENSGT00390000007311 ENSGT00390000010721.a.b ENSGT00530000063686.b ENSGT00940000157579 ENSGT00940000157020 ENSGT00440000034289 ENSGT00390000016335 ENSGT00940000161546 ENSGT00850000133618 ENSGT00940000161341.b ENSGT00390000007084.c.a.d.c.a.b ENSGT00940000155510 ENSGT00940000158142 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.a ENSGT00900000143602 ENSGT00940000160825 ENSGT00940000156604 ENSGT00390000018423.b.a.a.b ENSGT00940000160264 ENSGT00390000014892 ENSGT00940000159871 ENSGT00390000016262 ENSGT00440000033966 ENSGT00390000008164.c ENSGT00950000183098.a ENSGT00950000183207.b.f ENSGT00950000183207.b.e.a ENSGT00950000183207.b.e.b ENSGT00950000183150.a.a ##22 ENSGT00940000156241 ENSGT00940000163448 ENSGT00390000007311 ENSGT00940000166631 ENSGT00390000010721.a.b ENSGT00530000063686.b ENSGT00940000157579 ENSGT00940000157020 ENSGT00440000034289 ENSGT00390000016335 ENSGT00940000161546 ENSGT00850000133618 ENSGT00940000161341.b ENSGT00390000007084.c.a.d.c.a.b.a ENSGT00940000155510 Hominidae ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.a ENSGT00900000143602 ENSGT00940000160825 ENSGT00940000156604 ENSGT00390000018423.b.a.a.b ENSGT00940000160264 ENSGT00390000014892 ENSGT00940000159871 ENSGT00390000016262 ENSGT00440000033966 ENSGT00390000008164.c ENSGT00950000183098.a ENSGT00950000183207.b.f ENSGT00950000183207.b.e.a ENSGT00950000183207.b.e.b ENSGT00950000183150.a.a ##22 ENSGT00940000156241 ENSGT00940000163448 ENSGT00390000007311 ENSGT00390000010721.a.b ENSGT00530000063686.b ENSGT00940000157579 ENSGT00940000157020 ENSGT00440000034289 ENSGT00390000016335 ENSGT00940000161546 ENSGT00850000133618 ENSGT00940000161341.b ENSGT00390000007084.c.a.d.c.a.b.a ENSGT00940000155510 ENSGT00940000158142 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.a ENSGT00900000143602 ENSGT00940000160825 ENSGT00940000156604 ENSGT00390000018423.b.a.a.b ENSGT00940000160264 ENSGT00390000014892 ENSGT00940000159871 ENSGT00390000016262 ENSGT00440000033966 ENSGT00390000008164.c ENSGT00950000183098.a ENSGT00950000183207.b.f ENSGT00950000183207.b.e.a ENSGT00950000183207.b.e.b ENSGT00950000183150.a.a ##22 ENSGT00940000156241 ENSGT00940000163448 ENSGT00390000007311 ENSGT00390000010721.a.b ENSGT00530000063686.b ENSGT00940000157579 ENSGT00940000157020 ENSGT00440000034289 ENSGT00390000016335 ENSGT00940000161546 ENSGT00850000133618 ENSGT00940000161341.b ENSGT00390000007084.c.a.d.c.a.b.a ENSGT00940000155510 ENSGT00940000158142 Gorilla MODERN SPECIES 18 PLEKHH3 (ENSGGOG00000013802) CCR10 (ENSGGOG00000003360) ENSGGOG00000038360 CNTNAP1 (ENSGGOG00000003362) EZH1 (ENSGGOG00000003375) RAMP2 (ENSGGOG00000003437) VPS25 (ENSGGOG00000016041) WNK4 (ENSGGOG00000016049) COA3 (ENSGGOG00000016061) ENSGGOG00000024604 BECN1 (ENSGGOG00000001588) PSME3 (ENSGGOG00000010707) AOC2 (ENSGGOG00000007992) AOC3 (ENSGGOG00000007997) ENSGGOG00000037481 G6PC1 (ENSGGOG00000021956) ##22 ENSGGOG00000006250 RUNDC1 (ENSGGOG00000006273) RPL27 (ENSGGOG00000026039) IFI35 (ENSGGOG00000008874) VAT1 (ENSGGOG00000008878) ENSGGOG00000036493 BRCA1 (ENSGGOG00000009827) NBR1 (ENSGGOG00000023387) TMEM106A (ENSGGOG00000023913) CCDC200 (ENSGGOG00000040466) ENSGGOG00000036475 DHX8 (ENSGGOG00000000143) ETV4 (ENSGGOG00000000144) MEOX1 (ENSGGOG00000003046) SOST (ENSGGOG00000003048) Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.a ENSGT00900000143602 ENSGT00940000160825 ENSGT00940000156604 ENSGT00390000018423.b.a.a.b ENSGT00940000160264 ENSGT00390000014892 ENSGT00940000159871 ENSGT00390000016262 ENSGT00440000033966 ENSGT00390000008164.c ENSGT00950000183098.a ENSGT00950000183207.b.f ENSGT00950000183207.b.e.a ENSGT00950000183207.b.e.b ENSGT00950000183150.a.a ##22 ENSGT00940000156241 ENSGT00940000163448 ENSGT00390000007311 ENSGT00390000010721.a.b ENSGT00530000063686.b ENSGT00940000157579 ENSGT00940000157020 ENSGT00440000034289 ENSGT00390000016335 ENSGT00940000161546 ENSGT00850000133618 ENSGT00940000161341.b ENSGT00390000007084.c.a.d.c.a.b.a ENSGT00940000155510 ENSGT00940000158142 Pan ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.a ENSGT00900000143602 ENSGT00940000160825 ENSGT00940000156604 ENSGT00390000018423.b.a.a.b ENSGT00940000160264 ENSGT00390000014892 ENSGT00940000159871 ENSGT00390000016262 ENSGT00440000033966 ENSGT00390000008164.c ENSGT00950000183098.a ENSGT00950000183207.b.f ENSGT00950000183207.b.e.a ENSGT00950000183207.b.e.b ENSGT00950000183150.a.a ##22 ENSGT00940000156241 ENSGT00390000007311 ENSGT00390000010721.a.b ENSGT00530000063686.b ENSGT00940000157579 ENSGT00940000157020 ENSGT00440000034289 ENSGT00390000016335 ENSGT00940000161546 ENSGT00850000133618 ENSGT00940000161341.b ENSGT00390000007084.c.a.d.c.a.b.a ENSGT00940000155510 ENSGT00940000158142 ENSGT00940000154018.a Chimpanzee MODERN SPECIES 8 PLEKHH3 (ENSPTRG00000009214) CCR10 (ENSPTRG00000009215) CNTNAP1 (ENSPTRG00000009216) EZH1 (ENSPTRG00000009217) ENSPTRG00000044204 RAMP2 (ENSPTRG00000009219) VPS25 (ENSPTRG00000009220) WNK4 (ENSPTRG00000009221) COA3 (ENSPTRG00000009222) CNTD1 (ENSPTRG00000009223) BECN1 (ENSPTRG00000022819) PSME3 (ENSPTRG00000009225) AOC2 (ENSPTRG00000009226) AOC3 (ENSPTRG00000030952) ENSPTRG00000040407 G6PC1 (ENSPTRG00000009229) ##22 ENSPTRG00000009230 RUNDC1 (ENSPTRG00000023434) RPL27 (ENSPTRG00000009232) IFI35 (ENSPTRG00000009233) VAT1 (ENSPTRG00000009234) RND2 (ENSPTRG00000046585) BRCA1 (ENSPTRG00000009236) NBR1 (ENSPTRG00000009241) TMEM106A (ENSPTRG00000009242) CCDC200 (ENSPTRG00000051425) ARL4D (ENSPTRG00000048688) ENSPTRG00000048868 DHX8 (ENSPTRG00000009246) ETV4 (ENSPTRG00000009247) MEOX1 (ENSPTRG00000009248) Bonobo MODERN SPECIES 8 CCR10 (ENSPPAG00000035651) ENSPPAG00000033184 CNTNAP1 (ENSPPAG00000030181) EZH1 (ENSPPAG00000039453) ENSPPAG00000042544 RAMP2 (ENSPPAG00000038060) VPS25 (ENSPPAG00000033993) WNK4 (ENSPPAG00000041116) COA3 (ENSPPAG00000039760) CNTD1 (ENSPPAG00000034086) BECN1 (ENSPPAG00000037995) PSME3 (ENSPPAG00000043945) AOC2 (ENSPPAG00000043842) AOC3 (ENSPPAG00000038632) ENSPPAG00000000911 G6PC1 (ENSPPAG00000030887) ##22 ENSPPAG00000032539 RUNDC1 (ENSPPAG00000021726) RPL27 (ENSPPAG00000027207) IFI35 (ENSPPAG00000029307) VAT1 (ENSPPAG00000041242) RND2 (ENSPPAG00000039785) BRCA1 (ENSPPAG00000030624) NBR1 (ENSPPAG00000030572) TMEM106A (ENSPPAG00000035695) CCDC200 (ENSPPAG00000038733) ARL4D (ENSPPAG00000026240) ENSPPAG00000034842 DHX8 (ENSPPAG00000042508) ETV4 (ENSPPAG00000024983) MEOX1 (ENSPPAG00000038321) Human MODERN SPECIES 8 TUBG1 (ENSG00000131462) TUBG2 (ENSG00000037042) PLEKHH3 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ENSGT00940000161341.b ENSGT00940000155510 ENSGT00940000158142 ENSGT00940000154018.a Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 494 TUBG2 (ENSMNEG00000040353) PLEKHH3 (ENSMNEG00000031058) CCR10 (ENSMNEG00000040961) ENSMNEG00000029871 CNTNAP1 (ENSMNEG00000031126) EZH1 (ENSMNEG00000043174) RAMP2 (ENSMNEG00000033822) VPS25 (ENSMNEG00000035735) WNK4 (ENSMNEG00000045494) ENSMNEG00000043888 CNTD1 (ENSMNEG00000001170) BECN1 (ENSMNEG00000031367) PSME3 (ENSMNEG00000003232) AOC2 (ENSMNEG00000035188) AOC3 (ENSMNEG00000022911) G6PC1 (ENSMNEG00000034909) ##22 AARSD1 (ENSMNEG00000037015) RUNDC1 (ENSMNEG00000020533) RPL27 (ENSMNEG00000031777) IFI35 (ENSMNEG00000035621) VAT1 (ENSMNEG00000034622) RND2 (ENSMNEG00000031652) BRCA1 (ENSMNEG00000034314) NBR1 (ENSMNEG00000042839) TMEM106A (ENSMNEG00000038541) CCDC200 (ENSMNEG00000033834) ENSMNEG00000025927 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000156957 ENSGT00940000162499 ENSGT00940000159764 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.a ENSGT00940000160825 ENSGT00940000156604 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(ENSCSAG00000003347) PSME3 (ENSCSAG00000003352) AOC2 (ENSCSAG00000003354) AOC3 (ENSCSAG00000003361) ENSCSAG00000003367 G6PC1 (ENSCSAG00000003371) ##22 AARSD1 (ENSCSAG00000003373) PTGES3L (ENSCSAG00000003378) RUNDC1 (ENSCSAG00000003380) RPL27 (ENSCSAG00000003383) IFI35 (ENSCSAG00000003386) VAT1 (ENSCSAG00000003390) RND2 (ENSCSAG00000003395) ENSCSAG00000003399 NBR1 (ENSCSAG00000003419) TMEM106A (ENSCSAG00000003433) ARL4D (ENSCSAG00000019024) ENSCSAG00000019023 DHX8 (ENSCSAG00000003443) ETV4 (ENSCSAG00000003449) MEOX1 (ENSCSAG00000003450) Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.a ENSGT00900000143602 ENSGT00940000160825 ENSGT00940000156604 ENSGT00390000018423.b.a ENSGT00940000160264 ENSGT00390000014892 ENSGT00940000159871 ENSGT00390000016262.j ENSGT00440000033966 ENSGT00390000008164.c ENSGT00950000183098.a ENSGT00950000183207.b.f ENSGT00950000183207.b.e.a ENSGT00950000183207.b.e.b ENSGT00950000183150.a.a ##22 ENSGT00940000156241 ENSGT00940000163448 ENSGT00390000007311 ENSGT00390000010721.a.b ENSGT00940000161055 ENSGT00940000153434.a.a ENSGT00390000002374 ENSGT00940000157487 ENSGT00390000008742 ENSGT00940000156437 ENSGT00390000003364 ENSGT00940000158577 ENSGT00940000159488 ENSGT00550000074980.b ENSGT00950000183043.a.b.b.a.b.kb.b Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 744 TUBG2 (ENSRROG00000031570) PLEKHH3 (ENSRROG00000032252) CCR10 (ENSRROG00000033240) CNTNAP1 (ENSRROG00000030589) EZH1 (ENSRROG00000036806) ENSRROG00000028695 RAMP2 (ENSRROG00000044228) VPS25 (ENSRROG00000032886) WNK4 (ENSRROG00000034925) ENSRROG00000032581 CNTD1 (ENSRROG00000039425) BECN1 (ENSRROG00000037620) PSME3 (ENSRROG00000034298) AOC2 (ENSRROG00000023404) AOC3 (ENSRROG00000029395) G6PC1 (ENSRROG00000019715) ##22 AARSD1 (ENSRROG00000030505) RUNDC1 (ENSRROG00000043703) ENSRROG00000033825 IFI35 (ENSRROG00000027068) VAT1 (ENSRROG00000041491) RND2 (ENSRROG00000042041) ENSRROG00000035970 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 225 EZH1 (ENSRBIG00000044059) RAMP2 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ENSGT00940000161546 ENSGT00850000133618 ENSGT00940000155111 ENSGT00950000182860.a.a.a ENSGT00940000156497 ENSGT00390000006879 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000156957 ENSGT00940000162499 ENSGT00940000159764 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.a ENSGT00940000160825 ENSGT00940000156604 ENSGT00940000160264 ENSGT00390000014892 ENSGT00940000159871 ENSGT00390000016262 ENSGT00440000033966 ENSGT00390000008164.c ENSGT00950000183098.a.r ENSGT00950000183207.b.f ENSGT00950000183207.b.e ENSGT00950000183150.a.a ##22 ENSGT00940000156241.c ENSGT00940000163448 ENSGT00390000007311 ENSGT00390000010721.a.b ENSGT00530000063686.b ENSGT00940000157579 ENSGT00940000157020 ENSGT00440000034289 ENSGT00390000016335 ENSGT00940000161546 ENSGT00850000133618 ENSGT00940000155111 ENSGT00950000182860.a.a.a ENSGT00940000156497 ENSGT00390000006879 Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 33 ENSCGRG00001012361 Tubg2 (ENSCGRG00001018359) Plekhh3 (ENSCGRG00001016828) Ccr10 (ENSCGRG00001000112) Cntnap1 (ENSCGRG00001023354) 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spretus MODERN SPECIES 2 MGP_SPRETEiJ_G0018042 MGP_SPRETEiJ_G0018043 Plekhh3 (MGP_SPRETEiJ_G0018044) Cntnap1 (MGP_SPRETEiJ_G0018045) Ccr10 (MGP_SPRETEiJ_G0018046) Ezh1 (MGP_SPRETEiJ_G0018047) Ramp2 (MGP_SPRETEiJ_G0018048) Vps25 (MGP_SPRETEiJ_G0018049) Wnk4 (MGP_SPRETEiJ_G0018050) Coa3 (MGP_SPRETEiJ_G0018051) Cntd1 (MGP_SPRETEiJ_G0018052) Becn1 (MGP_SPRETEiJ_G0018053) Psme3 (MGP_SPRETEiJ_G0018054) Aoc2 (MGP_SPRETEiJ_G0018055) Aoc3 (MGP_SPRETEiJ_G0018056) G6pc (MGP_SPRETEiJ_G0018057) ##22 MGP_SPRETEiJ_G0018058 Aarsd1 (MGP_SPRETEiJ_G0018059) Ptges3l (MGP_SPRETEiJ_G0018060) Rundc1 (MGP_SPRETEiJ_G0018061) Rpl27 (MGP_SPRETEiJ_G0018062) Ifi35 (MGP_SPRETEiJ_G0018063) Vat1 (MGP_SPRETEiJ_G0018064) Rnd2 (MGP_SPRETEiJ_G0018065) Brca1 (MGP_SPRETEiJ_G0018066) Nbr1 (MGP_SPRETEiJ_G0018067) MGP_SPRETEiJ_G0018068 Rdm1 (MGP_SPRETEiJ_G0018069) Arl4d (MGP_SPRETEiJ_G0018070) Dhx8 (MGP_SPRETEiJ_G0018071) Etv4 (MGP_SPRETEiJ_G0018072) Ryukyu mouse MODERN SPECIES 2 Tubg1 (MGP_CAROLIEiJ_G0017199) Tubg2 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SPECIES 10 RETREG3 (ENSOCUG00000015226) TUBG1 (ENSOCUG00000015260) PLEKHH3 (ENSOCUG00000021704) CCR10 (ENSOCUG00000023791) CNTNAP1 (ENSOCUG00000007327) EZH1 (ENSOCUG00000006045) RAMP2 (ENSOCUG00000023670) VPS25 (ENSOCUG00000034593) WNK4 (ENSOCUG00000015928) COA3 (ENSOCUG00000015948) CNTD1 (ENSOCUG00000037401) ENSOCUG00000015964 PSME3 (ENSOCUG00000015986) AOC2 (ENSOCUG00000015997) AOC3 (ENSOCUG00000033151) G6PC1 (ENSOCUG00000016018) ##22 AARSD1 (ENSOCUG00000009259) PTGES3L (ENSOCUG00000029390) RUNDC1 (ENSOCUG00000009268) ENSOCUG00000003872 ENSOCUG00000003874 BRCA1 (ENSOCUG00000003883) RND2 (ENSOCUG00000009277) NBR1 (ENSOCUG00000025171) TMEM106A (ENSOCUG00000022876) ARL4D (ENSOCUG00000004788) DHX8 (ENSOCUG00000008014) ETV4 (ENSOCUG00000008031) MEOX1 (ENSOCUG00000002945) SOST (ENSOCUG00000002947) ENSOCUG00000016062 Pika MODERN SPECIES 2345 ENSOPRG00000012471 TUBG2 (ENSOPRG00000012479) PLEKHH3 (ENSOPRG00000012493) CCR10 (ENSOPRG00000012509) CNTNAP1 (ENSOPRG00000012512) EZH1 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ENSGT00940000162499 ENSGT00940000159764 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.a ENSGT00940000160825 ENSGT00940000156604 ENSGT00390000006359 ENSGT00940000160264 ENSGT00390000014892 ENSGT00940000159871 ENSGT00390000016262 ENSGT00440000033966 ENSGT00390000008164.c ENSGT00950000183098.a ENSGT00950000183207.b.f ENSGT00950000183207.b.e ENSGT00950000183150.a.a ##22 ENSGT00940000156241 ENSGT00940000163448 ENSGT00390000007311 ENSGT00390000010721.a.b ENSGT00530000063686.b ENSGT00940000157579 ENSGT00940000157020 ENSGT00440000034289 ENSGT00390000016335 ENSGT00940000161546 ENSGT00850000133618 ENSGT00940000161341.b ENSGT00940000155510 ENSGT00940000158142 ENSGT00940000154018.a Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000162499 ENSGT00940000159764 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.a ENSGT00940000160825 ENSGT00940000156604 ENSGT00390000006359 ENSGT00940000160264 ENSGT00390000014892 ENSGT00940000159871 ENSGT00390000016262 ENSGT00440000033966 ENSGT00390000008164.c ENSGT00950000183098.a ENSGT00950000183207.b.f 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ENSGT00940000158142 ENSGT00940000154018.a ENSGT00390000014900.b.b.b Chacoan peccary MODERN SPECIES 941 RETREG3 (ENSCWAG00000015230) TUBG2 (ENSCWAG00000015300) PLEKHH3 (ENSCWAG00000015523) CCR10 (ENSCWAG00000015705) CNTNAP1 (ENSCWAG00000015742) EZH1 (ENSCWAG00000015888) RAMP2 (ENSCWAG00000015988) VPS25 (ENSCWAG00000016052) WNK4 (ENSCWAG00000016080) ENSCWAG00000016212 CNTD1 (ENSCWAG00000016243) BECN1 (ENSCWAG00000016315) PSME3 (ENSCWAG00000016389) AOC2 (ENSCWAG00000016709) ENSCWAG00000016746 G6PC1 (ENSCWAG00000016784) ##22 AARSD1 (ENSCWAG00000016868) PTGES3L (ENSCWAG00000016940) RUNDC1 (ENSCWAG00000016981) RPL27 (ENSCWAG00000017014) ENSCWAG00000017042 IFI35 (ENSCWAG00000017061) VAT1 (ENSCWAG00000017113) RND2 (ENSCWAG00000017139) BRCA1 (ENSCWAG00000017235) NBR1 (ENSCWAG00000019138) TMEM106A (ENSCWAG00000019408) ARL4D (ENSCWAG00000019482) DHX8 (ENSCWAG00000019520) ETV4 (ENSCWAG00000019564) MEOX1 (ENSCWAG00000019759) Pig MODERN SPECIES 3 TUBG2 (ENSSSCG00000059397) PLEKHH3 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ENSTTRG00000011744 Sperm whale MODERN SPECIES 5 EZH1 (ENSPCTG00005010030) HSD17B1 (ENSPCTG00005010292) COASY (ENSPCTG00005010374) MLX (ENSPCTG00005010554) PSMC3IP (ENSPCTG00005010711) RETREG3 (ENSPCTG00005010862) TUBG1 (ENSPCTG00005010947) ENSPCTG00005011075 COA3 (ENSPCTG00005011150) CNTD1 (ENSPCTG00005011189) BECN1 (ENSPCTG00005011315) PSME3 (ENSPCTG00005011427) AOC2 (ENSPCTG00005011473) ENSPCTG00005011580 ENSPCTG00005011608 G6PC (ENSPCTG00005011690) ##22 ENSPCTG00005011820 AARSD1 (ENSPCTG00005011875) PTGES3L (ENSPCTG00005011935) ENSPCTG00005012012 ENSPCTG00005012041 ENSPCTG00005012077 ETV4 (ENSPCTG00005012140) DHX8 (ENSPCTG00005012269) MEOX1 (ENSPCTG00005012305) SOST (ENSPCTG00005012378) DUSP3 (ENSPCTG00005012416) CFAP97D1 (ENSPCTG00005012455) MPP3 (ENSPCTG00005012528) ENSPCTG00005012730 PPY (ENSPCTG00005012817) Blue whale MODERN SPECIES 12 TUBG2 (ENSBMSG00010019913) PLEKHH3 (ENSBMSG00010019937) CCR10 (ENSBMSG00010020019) CNTNAP1 (ENSBMSG00010020039) EZH1 (ENSBMSG00010020069) RAMP2 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ENSGT00940000161341.b ENSGT00940000155510 ENSGT00940000158142 ENSGT00940000154018.a ENSGT00390000014900.b.b.b Bovidae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.a ENSGT00940000160825 ENSGT00940000156604 ENSGT00940000160264 ENSGT00390000014892 ENSGT00940000159871 ENSGT00390000016262 ENSGT00440000033966 ENSGT00390000008164.c.b ENSGT00950000183098.a ENSGT00950000183207.b.f ENSGT00950000183207.b.e.q.a.a.a ENSGT00950000183207.b.e.q.a.a.b ENSGT00950000183207.b.e.q.a.b ENSGT00950000183207.b.e.q.b ENSGT00950000183150.a.a ##22 ENSGT00940000156241 ENSGT00940000163448 ENSGT00390000007311 ENSGT00390000010721.a.b ENSGT00530000063686.b ENSGT00940000157579 ENSGT00940000157020 ENSGT00440000034289 ENSGT00390000016335 ENSGT00940000161546 ENSGT00940000161341.b ENSGT00940000155510 ENSGT00940000158142 ENSGT00940000154018.a ENSGT00390000014900.b.b.b Caprinae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.a ENSGT00940000160825 ENSGT00940000156604 ENSGT00940000160264 ENSGT00390000014892 ENSGT00940000159871 ENSGT00390000016262.e ENSGT00440000033966 ENSGT00390000008164.c.b ENSGT00950000183098.a ENSGT00950000183207.b.f ENSGT00950000183207.b.e.q.a.a.a ENSGT00950000183207.b.e.q.a.a.b ENSGT00950000183207.b.e.q.a.b ENSGT00950000183207.b.e.q.b ENSGT00950000183150.a.a ##22 ENSGT00940000156241 ENSGT00940000163448 ENSGT00390000007311 ENSGT00390000010721.a.b ENSGT00530000063686.b ENSGT00940000157579 ENSGT00940000157020 ENSGT00440000034289 ENSGT00390000016335 ENSGT00940000161546 ENSGT00940000161341.b ENSGT00940000155510 ENSGT00940000158142 ENSGT00940000154018.a ENSGT00390000014900.b.b.b Goat MODERN SPECIES 10 CNTNAP1 (ENSCHIG00000021718) EZH1 (ENSCHIG00000021460) RAMP2 (ENSCHIG00000009603) VPS25 (ENSCHIG00000015624) WNK4 (ENSCHIG00000020630) ENSCHIG00000017406 CNTD1 (ENSCHIG00000027036) ENSCHIG00000021542 PSME3 (ENSCHIG00000007996) AOC2 (ENSCHIG00000013407) ENSCHIG00000006644 ENSCHIG00000022166 ENSCHIG00000014982 ENSCHIG00000018075 ENSCHIG00000024750 G6PC1 (ENSCHIG00000017441) ##22 AARSD1 (ENSCHIG00000006766) PTGES3L (ENSCHIG00000013108) RUNDC1 (ENSCHIG00000024583) RPL27 (ENSCHIG00000019558) IFI35 (ENSCHIG00000021984) VAT1 (ENSCHIG00000013460) RND2 (ENSCHIG00000018383) BRCA1 (ENSCHIG00000026740) NBR1 (ENSCHIG00000023358) TMEM106A (ENSCHIG00000000726) ARL4D (ENSCHIG00000005944) DHX8 (ENSCHIG00000009291) ETV4 (ENSCHIG00000023037) MEOX1 (ENSCHIG00000015761) SOST (ENSCHIG00000019903) Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 2 PLEKHH3 (ENSOARG00020023384) CCR10 (ENSOARG00020023357) CNTNAP1 (ENSOARG00020023130) EZH1 (ENSOARG00020023003) RAMP2 (ENSOARG00020022922) VPS25 (ENSOARG00020022861) WNK4 (ENSOARG00020022783) ENSOARG00020022706 CNTD1 (ENSOARG00020022636) BECN1 (ENSOARG00020022575) PSME3 (ENSOARG00020022334) AOC2 (ENSOARG00020022287) ENSOARG00020022200 ENSOARG00020021890 ENSOARG00020021709 G6PC1 (ENSOARG00020021610) ##22 AARSD1 (ENSOARG00020021551) PTGES3L (ENSOARG00020021506) RUNDC1 (ENSOARG00020021471) ENSOARG00020021436 IFI35 (ENSOARG00020021421) VAT1 (ENSOARG00020021403) RND2 (ENSOARG00020021316) BRCA1 (ENSOARG00020021029) NBR1 (ENSOARG00020020810) TMEM106A (ENSOARG00020020662) ARL4D (ENSOARG00020020415) DHX8 (ENSOARG00020020274) ETV4 (ENSOARG00020019959) MEOX1 (ENSOARG00020019877) SOST (ENSOARG00020019837) Bovinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234667.a.a.a.a.a ENSGT00940000160825 ENSGT00940000156604 ENSGT00940000160264 ENSGT00390000014892 ENSGT00940000159871 ENSGT00390000016262 ENSGT00440000033966 ENSGT00390000008164.c.b ENSGT00950000183098.a ENSGT00950000183207.b.f ENSGT00950000183207.b.e.q.a.a.a ENSGT00950000183207.b.e.q.a.a.b ENSGT00950000183207.b.e.q.a.b ENSGT00950000183207.b.e.q.b ENSGT00950000183150.a.a ##22 ENSGT00940000156241 ENSGT00940000163448 ENSGT00390000007311 ENSGT00390000010721.a.b ENSGT00530000063686.b ENSGT00940000157579 ENSGT00940000157020 ENSGT00440000034289 ENSGT00390000016335 ENSGT00940000161546 ENSGT00940000161341.b ENSGT00940000155510 ENSGT00940000158142 ENSGT00940000154018.a ENSGT00390000014900.b.b.b Bos ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.a ENSGT00940000160825 ENSGT00940000156604 ENSGT00940000160264 ENSGT00390000014892 ENSGT00940000159871.c ENSGT00940000159871.d ENSGT00390000016262 ENSGT00440000033966 ENSGT00390000008164.c.b ENSGT00950000183098.a ENSGT00950000183207.b.f ENSGT00950000183207.b.e.q.a.a.a ENSGT00950000183207.b.e.q.a.b ENSGT00950000183207.b.e.q.b ENSGT00950000183150.a.a ##22 ENSGT00940000156241 ENSGT00940000163448 ENSGT00390000007311 ENSGT00390000010721.a.b ENSGT00530000063686.b ENSGT00940000157579 ENSGT00940000157020 ENSGT00440000034289 ENSGT00390000016335 ENSGT00940000161546 ENSGT00940000161341.b ENSGT00940000155510 ENSGT00940000158142 ENSGT00940000154018.a ENSGT00390000014900.b.b.b Bos_b ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000159764 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.a ENSGT00940000160825 ENSGT00940000156604 ENSGT00940000160264 ENSGT00390000014892 ENSGT00940000159871.c ENSGT00390000016262 ENSGT00440000033966 ENSGT00390000008164.c.b ENSGT00950000183098.a 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ENSGT00940000158142 ENSGT00940000154018.a Carnivora ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000156957 ENSGT00940000162499 ENSGT00940000159764 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.a ENSGT00940000160825 ENSGT00940000156604 ENSGT00940000160264 ENSGT00390000014892 ENSGT00940000159871 ENSGT00390000016262 ENSGT00440000033966 ENSGT00390000008164.c ENSGT00950000183098.a ENSGT00950000183207.b.f ENSGT00950000183207.b.e ENSGT00950000183150.a.a ##22 ENSGT00940000156241 ENSGT00940000163448 ENSGT00390000007311 ENSGT00390000010721.a.b ENSGT00530000063686.b ENSGT00940000157579 ENSGT00940000157020 ENSGT00440000034289 ENSGT00390000016335 ENSGT00940000161546 ENSGT00850000133618 ENSGT00940000161341.b ENSGT00940000155510 ENSGT00940000158142 ENSGT00940000154018.a Caniformia ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000156957 ENSGT00940000162499 ENSGT00940000159764 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.a ENSGT00940000160825 ENSGT00940000156604 ENSGT00940000160264 ENSGT00390000014892 ENSGT00940000159871 ENSGT00390000016262 ENSGT00440000033966 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MODERN SPECIES 336 RETREG3 (ENSMPUG00000010199) TUBG2 (ENSMPUG00000010190) PLEKHH3 (ENSMPUG00000010185) CCR10 (ENSMPUG00000010177) CNTNAP1 (ENSMPUG00000010160) EZH1 (ENSMPUG00000010144) RAMP2 (ENSMPUG00000010135) VPS25 (ENSMPUG00000010128) WNK4 (ENSMPUG00000010121) COA3 (ENSMPUG00000010114) BECN1 (ENSMPUG00000010100) PSME3 (ENSMPUG00000010027) AOC2 (ENSMPUG00000010017) ENSMPUG00000009988 ENSMPUG00000009975 G6PC1 (ENSMPUG00000009965) ##22 AARSD1 (ENSMPUG00000009956) RUNDC1 (ENSMPUG00000009940) RPL27 (ENSMPUG00000009913) IFI35 (ENSMPUG00000009886) VAT1 (ENSMPUG00000009833) RND2 (ENSMPUG00000009814) ENSMPUG00000009796 NBR1 (ENSMPUG00000009782) TMEM106A (ENSMPUG00000009731) ARL4D (ENSMPUG00000019051) DHX8 (ENSMPUG00000009717) ETV4 (ENSMPUG00000009691) MEOX1 (ENSMPUG00000009670) SOST (ENSMPUG00000009665) ENSMPUG00000009658 American mink MODERN SPECIES 354 TUBG1 (ENSNVIG00000013082) TUBG2 (ENSNVIG00000013103) PLEKHH3 (ENSNVIG00000013123) CCR10 (ENSNVIG00000013159) CNTNAP1 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ENSGT00940000157579 ENSGT00940000157020 ENSGT00440000034289 ENSGT00390000016335 ENSGT00940000161546 leopard MODERN SPECIES 177 TUBG2 (ENSPPRG00000000291) PLEKHH3 (ENSPPRG00000000939) CCR10 (ENSPPRG00000001107) CNTNAP1 (ENSPPRG00000003989) EZH1 (ENSPPRG00000006279) RAMP2 (ENSPPRG00000006488) VPS25 (ENSPPRG00000006995) WNK4 (ENSPPRG00000007524) COA3 (ENSPPRG00000007814) CNTD1 (ENSPPRG00000008099) BECN1 (ENSPPRG00000008498) PSME3 (ENSPPRG00000009714) AOC2 (ENSPPRG00000010462) ENSPPRG00000011276 ENSPPRG00000012507 G6PC1 (ENSPPRG00000013602) ##22 AARSD1 (ENSPPRG00000013962) PTGES3L (ENSPPRG00000014424) RUNDC1 (ENSPPRG00000014541) RPL27 (ENSPPRG00000015684) IFI35 (ENSPPRG00000017438) VAT1 (ENSPPRG00000019000) RND2 (ENSPPRG00000019905) ENSPPRG00000023630 NBR1 (ENSPPRG00000000240) TMEM106A (ENSPPRG00000001037) lion MODERN SPECIES 124 G6PC1 (ENSPLOG00000010088) ##22 AARSD1 (ENSPLOG00000010128) PTGES3L (ENSPLOG00000010186) RUNDC1 (ENSPLOG00000010227) RPL27 (ENSPLOG00000010254) IFI35 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Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000162499 ENSGT00940000159764 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.a ENSGT00940000160825 ENSGT00940000156604 ENSGT00390000006359 ENSGT00940000160264 ENSGT00390000014892 ENSGT00940000159871 ENSGT00390000016262 ENSGT00440000033966 ENSGT00390000008164.c ENSGT00950000183098.a ENSGT00950000183207.b.f ENSGT00950000183207.b.e ENSGT00950000183150.a.a ##22 ENSGT00940000156241 ENSGT00940000163448 ENSGT00390000007311 ENSGT00390000010721.a.b ENSGT00530000063686.b ENSGT00940000157579 ENSGT00940000157020 ENSGT00440000034289 ENSGT00390000016335 ENSGT00940000161546 ENSGT00850000133618 ENSGT00940000161341.b ENSGT00940000155510 ENSGT00940000158142 ENSGT00940000154018.a Equus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162499 ENSGT00940000159764 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.a ENSGT00940000160825 ENSGT00940000156604 ENSGT00940000160264 ENSGT00390000014892 ENSGT00940000159871 ENSGT00390000016262 ENSGT00440000033966 ENSGT00390000008164.c ENSGT00950000183098.a ENSGT00950000183207.b.f 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(ENSEASG00005030335) BRCA1 (ENSEASG00005010077) NBR1 (ENSEASG00005010082) TMEM106A (ENSEASG00005010088) CCDC200 (ENSEASG00005027773) ARL4D (ENSEASG00005032170) DHX8 (ENSEASG00005010097) ETV4 (ENSEASG00005010106) MEOX1 (ENSEASG00005010118) Chiroptera ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000162499 ENSGT00940000159764 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.a ENSGT00940000160825 ENSGT00940000156604 ENSGT00390000006359 ENSGT00940000160264 ENSGT00390000014892 ENSGT00940000159871 ENSGT00390000016262 ENSGT00440000033966 ENSGT00390000008164.c ENSGT00950000183098.a ENSGT00950000183207.b.f ENSGT00950000183207.b.e ENSGT00950000183150.a.a ##22 ENSGT00940000156241 ENSGT00940000163448 ENSGT00390000007311 ENSGT00940000166631 ENSGT00390000010721.a.b ENSGT00530000063686.b ENSGT00940000157579 ENSGT00940000157020 ENSGT00440000034289 ENSGT00390000016335 ENSGT00940000161546 ENSGT00850000133618 ENSGT00940000161341.b ENSGT00940000155510 ENSGT00940000158142 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000156957 ENSGT00940000162499 ENSGT00940000159764 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.a ENSGT00940000160825 ENSGT00940000156604 ENSGT00940000160264 ENSGT00390000014892 ENSGT00940000159871 ENSGT00390000016262 ENSGT00440000033966 ENSGT00390000008164.c ENSGT00950000183098.a ENSGT00950000183207.b.f ENSGT00950000183207.b.e ENSGT00950000183150.a.a ##22 ENSGT00940000156241 ENSGT00940000163448 ENSGT00390000007311 ENSGT00390000010721.a.b ENSGT00530000063686.b ENSGT00940000157579 ENSGT00940000157020 ENSGT00440000034289 ENSGT00390000016335 ENSGT00940000161546 ENSGT00850000133618 ENSGT00940000161341.b ENSGT00940000155510 ENSGT00940000158142 ENSGT00940000154018.a Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 13 RETREG3 (ENSRFEG00010008876) TUBG1 (ENSRFEG00010009005) PLEKHH3 (ENSRFEG00010009248) CCR10 (ENSRFEG00010009309) CNTNAP1 (ENSRFEG00010009359) EZH1 (ENSRFEG00010009456) RAMP2 (ENSRFEG00010009607) ENSRFEG00010009695 WNK4 (ENSRFEG00010009730) COA3 (ENSRFEG00010009767) CNTD1 (ENSRFEG00010009799) BECN1 (ENSRFEG00010009915) PSME3 (ENSRFEG00010010112) AOC2 (ENSRFEG00010010759) AOC3 (ENSRFEG00010010898) G6PC1 (ENSRFEG00010010983) ##22 AARSD1 (ENSRFEG00010011044) RUNDC1 (ENSRFEG00010011136) RPL27 (ENSRFEG00010011209) IFI35 (ENSRFEG00010011258) VAT1 (ENSRFEG00010011324) RND2 (ENSRFEG00010011550) BRCA1 (ENSRFEG00010011676) NBR1 (ENSRFEG00010013426) TMEM106A (ENSRFEG00010013861) CCDC200 (ENSRFEG00010013967) ENSRFEG00010014072 DHX8 (ENSRFEG00010014130) ETV4 (ENSRFEG00010014233) MEOX1 (ENSRFEG00010014385) SOST (ENSRFEG00010014460) Microbat MODERN SPECIES 1037 RETREG3 (ENSMLUG00000001002) TUBG1 (ENSMLUG00000016694) TUBG2 (ENSMLUG00000007817) PLEKHH3 (ENSMLUG00000007840) CCR10 (ENSMLUG00000024590) CNTNAP1 (ENSMLUG00000004037) EZH1 (ENSMLUG00000004048) RAMP2 (ENSMLUG00000024598) COA3 (ENSMLUG00000004072) WNK4 (ENSMLUG00000004064) BECN1 (ENSMLUG00000004077) PSME3 (ENSMLUG00000004084) AOC2 (ENSMLUG00000004091) ENSMLUG00000004099 ENSMLUG00000004104 G6PC1 (ENSMLUG00000004107) ##22 AARSD1 (ENSMLUG00000024369) PTGES3L (ENSMLUG00000023954) RUNDC1 (ENSMLUG00000004114) RPL27 (ENSMLUG00000004119) IFI35 (ENSMLUG00000004122) VAT1 (ENSMLUG00000030460) RND2 (ENSMLUG00000004129) BRCA1 (ENSMLUG00000004135) NBR1 (ENSMLUG00000012487) TMEM106A (ENSMLUG00000012505) ENSMLUG00000025790 ARL4D (ENSMLUG00000014197) ENSMLUG00000000090 ETV4 (ENSMLUG00000000091) MEOX1 (ENSMLUG00000000092) Megabat MODERN SPECIES 2759 CCR10 (ENSPVAG00000008788) CNTNAP1 (ENSPVAG00000008789) EZH1 (ENSPVAG00000008794) ENSPVAG00000008796 RAMP2 (ENSPVAG00000008800) VPS25 (ENSPVAG00000008801) WNK4 (ENSPVAG00000008802) COA3 (ENSPVAG00000008803) CNTD1 (ENSPVAG00000008804) BECN1 (ENSPVAG00000008805) PSME3 (ENSPVAG00000008806) AOC2 (ENSPVAG00000008807) AOC3 (ENSPVAG00000008808) G6PC1 (ENSPVAG00000008809) ##22 AARSD1 (ENSPVAG00000008812) ENSPVAG00000008816 RPL27 (ENSPVAG00000008817) IFI35 (ENSPVAG00000008820) VAT1 (ENSPVAG00000008821) RND2 (ENSPVAG00000008823) BRCA1 (ENSPVAG00000008824) Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183150.a.a ##22 Common shrew MODERN SPECIES 11774 ENSSARG00000008932 ##22 Hedgehog MODERN SPECIES 11166 ENSEEUG00000002528 ##22 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000156957 ENSGT00940000162499 ENSGT00940000159764 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.a ENSGT00940000160825 ENSGT00940000156604 ENSGT00940000160264 ENSGT00390000014892 ENSGT00940000159871 ENSGT00390000016262 ENSGT00440000033966 ENSGT00390000008164.c ENSGT00950000183098.a ENSGT00950000183207.b.f ENSGT00950000183207.b.e ENSGT00950000183150.a.a ##22 ENSGT00940000156241 ENSGT00390000007311 ENSGT00390000010721.a.b ENSGT00530000063686.b ENSGT00940000157579 ENSGT00940000157020 ENSGT00440000034289 ENSGT00390000016335 ENSGT00940000161546 ENSGT00940000161341.b ENSGT00940000155510 ENSGT00940000158142 ENSGT00940000154018.a ENSGT00390000014900.b.b.b ENSGT00940000163690 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000156957 ENSGT00940000162499 ENSGT00940000159764 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.a ENSGT00940000160825 ENSGT00940000156604 ENSGT00940000160264 ENSGT00390000014892 ENSGT00940000159871 ENSGT00390000016262 ENSGT00440000033966 ENSGT00390000008164.c ENSGT00950000183098.a ENSGT00950000183207.b.f ENSGT00950000183207.b.e ENSGT00950000183150.a.a ##22 ENSGT00940000156241 ENSGT00390000007311 ENSGT00390000010721.a.b ENSGT00530000063686.b ENSGT00940000157579 ENSGT00940000157020 ENSGT00440000034289 ENSGT00390000016335 ENSGT00940000161546.f ENSGT00940000161341.b ENSGT00940000155510 ENSGT00940000158142 ENSGT00940000154018.a ENSGT00390000014900.b.b.b ENSGT00940000163690 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000156957 ENSGT00940000162499 ENSGT00940000159764 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.a ENSGT00940000160825 ENSGT00940000156604 ENSGT00940000160264 ENSGT00390000014892 ENSGT00940000159871 ENSGT00390000016262 ENSGT00440000033966 ENSGT00390000008164.c ENSGT00950000183098.a ENSGT00950000183207.b.f ENSGT00950000183207.b.e ENSGT00950000183150.a.a ##22 ENSGT00940000156241 ENSGT00390000007311 ENSGT00390000010721.a.b ENSGT00530000063686.b ENSGT00940000157579 ENSGT00940000157020 ENSGT00440000034289 ENSGT00390000016335 ENSGT00940000161546.f ENSGT00940000161341.b ENSGT00940000155510 ENSGT00940000158142 ENSGT00940000154018.a ENSGT00390000014900.b.b.b ENSGT00940000163690 Elephant MODERN SPECIES 310 MLX (ENSLAFG00000000328) PSMC3IP (ENSLAFG00000000331) RETREG3 (ENSLAFG00000000334) TUBG2 (ENSLAFG00000000335) ENSLAFG00000008207 CCR10 (ENSLAFG00000031245) CNTNAP1 (ENSLAFG00000010414) EZH1 (ENSLAFG00000010425) RAMP2 (ENSLAFG00000025820) VPS25 (ENSLAFG00000003967) COA3 (ENSLAFG00000013431) CNTD1 (ENSLAFG00000013433) BECN1 (ENSLAFG00000013438) PSME3 (ENSLAFG00000013446) AOC3 (ENSLAFG00000013755) G6PC1 (ENSLAFG00000014207) ##22 AARSD1 (ENSLAFG00000003022) RUNDC1 (ENSLAFG00000014211) RPL27 (ENSLAFG00000014220) IFI35 (ENSLAFG00000029429) VAT1 (ENSLAFG00000014527) RND2 (ENSLAFG00000015512) BRCA1 (ENSLAFG00000021784) NBR1 (ENSLAFG00000001608) ENSLAFG00000001611 ARL4D (ENSLAFG00000002606) DHX8 (ENSLAFG00000022159) ETV4 (ENSLAFG00000014615) MEOX1 (ENSLAFG00000003050) SOST (ENSLAFG00000029742) ENSLAFG00000016354 Hyrax MODERN SPECIES 9865 ENSPCAG00000004518 ##22 Tenrec MODERN SPECIES 2754 PSME3 (ENSETEG00000018739) ENSETEG00000018745 G6PC1 (ENSETEG00000018749) ##22 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183150.a.a ##22 Sloth MODERN SPECIES 2452 G6PC1 (ENSCHOG00000008162) ##22 Anura DUPLICATION Anura DUPLICATION Anura ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000006890 ENSGT00940000161349 ENSGT00940000156957 ENSGT00940000159764 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.a ENSGT00940000160825 ENSGT00940000156604 ENSGT00940000160264 ENSGT00390000014892 ENSGT00940000159871 ENSGT00390000016262 ENSGT00440000033966 ENSGT00390000008164 ENSGT00950000183098.a ENSGT00950000183207.b.a ENSGT00950000183150.a.a.g.a ##22 ENSGT00950000183150.a.a.g.b ##22 ENSGT00940000156241 Frog MODERN SPECIES 1 ENSXETG00000047091 RAMP2 (ENSXETG00000048585) ENSXETG00000047056 vps25 (ENSXETG00000024599) ENSXETG00000046699 ENSXETG00000045490 ENSXETG00000012615 ENSXETG00000044875 ccdc56 (ENSXETG00000024597) cntd1 (ENSXETG00000041227) ENSXETG00000047141 becn1 (ENSXETG00000012613) elac2 (ENSXETG00000012596) psme3 (ENSXETG00000040776) aoc2 (ENSXETG00000036549) g6pc1.1 (ENSXETG00000012583) ##22 g6pc1.2 (ENSXETG00000013641) ##22 g6pc1.3 (ENSXETG00000024588) ##22 aarsd1 (ENSXETG00000013644) rpl27 (ENSXETG00000013647) ptges3l (ENSXETG00000048831) ENSXETG00000047319 ENSXETG00000048988 ENSXETG00000043444 tmc6 (ENSXETG00000013651) ENSXETG00000048984 ENSXETG00000037886 ENSXETG00000037797 ENSXETG00000046228 cyth2 (ENSXETG00000024577) ENSXETG00000042749 Leishan spiny toad MODERN SPECIES 3 MLX (ENSLLEG00000019449) ENSLLEG00000019378 ENSLLEG00000019356 ENSLLEG00000019318 ##16 HSD17B1 (ENSLLEG00000019269) ENSLLEG00000019252 NAGLU (ENSLLEG00000018857) ENSLLEG00000018688 ENSLLEG00000018626 ENSLLEG00000018604 ENSLLEG00000018583 ENSLLEG00000018558 ENSLLEG00000018461 ENSLLEG00000018410 ENSLLEG00000018383 G6PC1 (ENSLLEG00000018323) ##22 Anura ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000161349 ENSGT00940000156957 ENSGT00940000159764 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.a ENSGT00940000160825 ENSGT00940000156604 ENSGT00940000160264 ENSGT00390000014892 ENSGT00940000159871 ENSGT00390000016262 ENSGT00440000033966 ENSGT00390000008164 ENSGT00950000183098.a ENSGT00950000183207.b.a ENSGT00950000183150.a.a.g.a ##22 ENSGT00950000183150.a.a.g.b ##22 ENSGT00940000156241 Frog MODERN SPECIES 1 ENSXETG00000047056 vps25 (ENSXETG00000024599) ENSXETG00000046699 ENSXETG00000045490 ENSXETG00000012615 ENSXETG00000044875 ccdc56 (ENSXETG00000024597) cntd1 (ENSXETG00000041227) ENSXETG00000047141 becn1 (ENSXETG00000012613) elac2 (ENSXETG00000012596) psme3 (ENSXETG00000040776) aoc2 (ENSXETG00000036549) g6pc1.1 (ENSXETG00000012583) ##22 g6pc1.2 (ENSXETG00000013641) ##22 g6pc1.3 (ENSXETG00000024588) ##22 aarsd1 (ENSXETG00000013644) rpl27 (ENSXETG00000013647) ptges3l (ENSXETG00000048831) ENSXETG00000047319 ENSXETG00000048988 ENSXETG00000043444 tmc6 (ENSXETG00000013651) ENSXETG00000048984 ENSXETG00000037886 ENSXETG00000037797 ENSXETG00000046228 cyth2 (ENSXETG00000024577) ENSXETG00000042749 ENSXETG00000049412 ##16 ENSXETG00000036585 Anura ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183150.a.a.h ##22 Frog MODERN SPECIES 1 RAMP2 (ENSXETG00000048585) ENSXETG00000047056 vps25 (ENSXETG00000024599) ENSXETG00000046699 ENSXETG00000045490 ENSXETG00000012615 ENSXETG00000044875 ccdc56 (ENSXETG00000024597) cntd1 (ENSXETG00000041227) ENSXETG00000047141 becn1 (ENSXETG00000012613) elac2 (ENSXETG00000012596) psme3 (ENSXETG00000040776) aoc2 (ENSXETG00000036549) g6pc1.1 (ENSXETG00000012583) ##22 g6pc1.2 (ENSXETG00000013641) ##22 g6pc1.3 (ENSXETG00000024588) ##22 aarsd1 (ENSXETG00000013644) rpl27 (ENSXETG00000013647) ptges3l (ENSXETG00000048831) ENSXETG00000047319 ENSXETG00000048988 ENSXETG00000043444 tmc6 (ENSXETG00000013651) ENSXETG00000048984 ENSXETG00000037886 ENSXETG00000037797 ENSXETG00000046228 cyth2 (ENSXETG00000024577) ENSXETG00000042749 ENSXETG00000049412 ##16 Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES 105 ENSGT00530000063608.B ENSGT00940000163423.C ENSGT01030000235214 ENSGT01090000260228 ENSGT00390000005979.b ENSGT00940000156609 ENSGT00950000183072.b.b ENSGT00530000063779.A ENSGT00940000156219 ENSGT00940000154621.a.a ENSGT01030000234515.a.a.b ENSGT00510000048120 ENSGT00390000002220 ENSGT00950000183150.a.b ##22 ENSGT00940000157564 ENSGT00940000158665 ENSGT00940000164857 ENSGT00940000157232 ENSGT00940000165617 ENSGT00550000074800 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00530000063608.B ENSGT00940000157782 ENSGT01030000235134 ENSGT01090000260228 ENSGT00390000005979.b ENSGT00940000156609 ENSGT00950000183072.b.b ENSGT00530000063779.A ENSGT00940000167474 ENSGT00940000156219 ENSGT00930000151775 ENSGT00940000154621.a.a ENSGT01030000234515.a.a.b ENSGT00510000048120 ENSGT00390000002220 ENSGT00950000183150.a.b ##22 ENSGT00940000157564 ENSGT00940000158665 ENSGT00940000164857 ENSGT00940000157232 ENSGT00940000165617 ENSGT00550000074800 ENSGT00940000163195.B ENSGT01090000260278 ENSGT00390000002753 ENSGT00940000158859 ENSGT01030000234607.B ENSGT00940000157954 ENSGT00940000165303 ENSGT00390000007741.b ENSGT00940000155863 Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00530000063779.A ENSGT00940000167474 ENSGT00940000156219 ENSGT00930000151775 ENSGT00940000154621.a.a ENSGT01030000234515.a.a.b ENSGT00510000048120 ENSGT00390000002220 ENSGT00950000183150.a.b ##22 ENSGT00940000157564 ENSGT00940000158665 ENSGT00940000164857 ENSGT00940000157232 ENSGT00940000165617 ENSGT00550000074800 ENSGT00940000163195.B ENSGT01090000260278 ENSGT00390000002753 ENSGT00940000158859 ENSGT01030000234607.B ENSGT00940000157954 ENSGT00940000165303 ENSGT00390000007741.b ENSGT00940000155863 Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00530000063608.B ENSGT00940000157782 ENSGT00940000163423.C.d ENSGT00950000183072.b.b ENSGT00940000156609 ENSGT00390000005979.b ENSGT01090000260228 ENSGT00530000063779.A ENSGT00940000167474 ENSGT00940000156219 ENSGT00930000151775 ENSGT00940000154621.a.a ENSGT01030000234515.a.a.b ENSGT00510000048120 ENSGT00390000002220 ENSGT00950000183150.a.b ##22 ENSGT00940000157564 ENSGT00940000158665 ENSGT00940000164857 ENSGT00940000157232 ENSGT00940000163195.B ENSGT01090000260278 ENSGT00390000002753 ENSGT00940000158859 ENSGT01030000234607.B ENSGT00940000157954 ENSGT00940000165303 ENSGT00390000007741.b ENSGT00940000159106 ENSGT00830000128380 ENSGT00390000000227 Amniota ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000157130 ENSGT00530000063779.A ENSGT00940000167474 ENSGT01030000235134 ENSGT00940000154224 ENSGT00950000183072.b.b ENSGT00940000156609 ENSGT00390000005979.b ENSGT01090000260228 ENSGT00940000156219 ENSGT00930000151775 ENSGT00940000154621.a.a ENSGT01030000234515.a.a.b ENSGT00510000048120 ENSGT00390000002220 ENSGT00950000183150.a.b ##22 ENSGT00940000157564 ENSGT00940000158665 ENSGT00940000164857 ENSGT00940000157232 ENSGT00940000163195.B ENSGT00390000002753 ENSGT00940000158859 ENSGT01030000234607.B ENSGT00940000157954 ENSGT00390000007741.b ENSGT00940000159106 ENSGT00830000128380 ENSGT00390000000227 ENSGT00950000183075.a.b ENSGT00940000176165 Sauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183072.b.b ENSGT00940000156609 ENSGT00390000005979.b ENSGT00940000154224.d ENSGT01090000260228 ENSGT00940000157130 ENSGT00530000063779.A ENSGT00940000167474 ENSGT00940000156219 ENSGT00930000151775 ENSGT00940000154621.a.a ENSGT00940000169926 ENSGT01030000234515.a.a.b ENSGT00510000048120 ENSGT00390000002220 ENSGT00950000183150.a.b ##22 ENSGT00940000157564 ENSGT00940000158665 ENSGT00940000164857 ENSGT00940000157232 ENSGT00940000163195.B ENSGT00940000153769.D ENSGT00390000002753 ENSGT00940000158859 ENSGT01030000234607.B ENSGT00940000157954 ENSGT00940000167377 ENSGT00390000007741.b ENSGT00940000159106 ENSGT00830000128380 ENSGT00390000000227 Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000157782 ENSGT01090000260228 ENSGT00940000157130 ENSGT00940000154224.d ENSGT00950000183072.b.b ENSGT00940000156609 ENSGT00390000005979.b ENSGT00530000063779.A ENSGT00940000167474 ENSGT00940000156219 ENSGT00930000151775 ENSGT00940000154621.a.a ENSGT01030000234515.a.a.b ENSGT00510000048120 ENSGT00390000002220 ENSGT00950000183150.a.b ##22 ENSGT00940000157564 ENSGT00940000158665 ENSGT00940000164857 ENSGT00940000157232 ENSGT00940000163195.B ENSGT00940000153769.D ENSGT00390000002753 ENSGT00940000158859 ENSGT01030000234607.B ENSGT00940000157954 ENSGT00940000167377 ENSGT00390000007741.b ENSGT00940000159106 ENSGT00830000128380 ENSGT00390000000227 Episquamata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157782 ENSGT01090000260228.d.b ENSGT00940000157130 ENSGT00940000154224.d ENSGT00950000183072.b.b ENSGT00940000156609 ENSGT00390000005979.b ENSGT01090000260228.d.a ENSGT00530000063779.A ENSGT00940000167474 ENSGT00940000156219 ENSGT00940000154621.a.a ENSGT01030000234515.a.a.b ENSGT00510000048120 ENSGT00390000002220 ENSGT00950000183150.a.b ##22 ENSGT00940000157564 ENSGT00940000158665 ENSGT00940000164857 ENSGT00940000157232 ENSGT00940000163195.B ENSGT00940000153769.D ENSGT00390000002753 ENSGT00940000158859 ENSGT01030000234607.B ENSGT00940000157954 ENSGT00940000167377 ENSGT00390000007741.b ENSGT00940000159106 ENSGT00830000128380 ENSGT00390000000227 Laterata ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000157782 ENSGT01090000260228.d.a ENSGT00940000157130 ENSGT00940000154224.d ENSGT00950000183072.b.b ENSGT00940000156609 ENSGT00390000005979.b ENSGT01090000260228.d.b ENSGT00530000063779.A ENSGT00940000167474 ENSGT00940000156219 ENSGT00940000154621.a.a ENSGT01030000234515.a.a.b ENSGT00510000048120 ENSGT00390000002220 ENSGT00950000183150.a.b ##22 ENSGT00940000157564 ENSGT00940000158665 ENSGT00940000164857 ENSGT00940000157232 ENSGT00940000163195.B ENSGT00390000002753 ENSGT00940000158859 ENSGT01030000234607.B ENSGT00940000157954 Common wall lizard MODERN SPECIES SCN3A (ENSPMRG00000011815) ENSPMRG00000012593 CSRNP3 (ENSPMRG00000014917) GALNT3 (ENSPMRG00000014922) TTC21B (ENSPMRG00000014932) ENSPMRG00000015021 ENSPMRG00000015372 ENSPMRG00000015705 XIRP2 (ENSPMRG00000015712) ENSPMRG00000015727 B3GALT1 (ENSPMRG00000015734) STK39 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ENSGT00940000157954 ENSGT00960000189603 ENSGT00940000167377 ENSGT00390000007741.b ENSGT00940000159106 ENSGT00830000128380 Duck MODERN SPECIES 25 SLC38A11 (ENSAPLG00000016061) SCN3A (ENSAPLG00000012021) ENSAPLG00000019932 ENSAPLG00000014616 ENSAPLG00000027201 CSRNP3 (ENSAPLG00000014467) GALNT3 (ENSAPLG00000013748) TTC21B (ENSAPLG00000012826) ENSAPLG00000015499 ENSAPLG00000011920 ENSAPLG00000029779 B3GALT1 (ENSAPLG00000000770) STK39 (ENSAPLG00000011513) CERS6 (ENSAPLG00000011316) SPC25 (ENSAPLG00000011090) G6PC2 (ENSAPLG00000010817) ##22 ABCB11 (ENSAPLG00000009811) DHRS9 (ENSAPLG00000009615) LRP2 (ENSAPLG00000007540) ENSAPLG00000025028 ENSAPLG00000028581 KLHL41 (ENSAPLG00000007022) FASTKD1 (ENSAPLG00000006739) PPIG (ENSAPLG00000006370) ENSAPLG00000020418 ENSAPLG00000006323 KLHL23 (ENSAPLG00000006271) SSB (ENSAPLG00000006109) METTL5 (ENSAPLG00000005961) UBR3 (ENSAPLG00000005734) MYO3B (ENSAPLG00000005409) Pink-footed goose MODERN SPECIES 20 SCN3A (ENSABRG00000022061) ENSABRG00000022671 ENSABRG00000022844 CSRNP3 (ENSABRG00000023028) GALNT3 (ENSABRG00000023029) TTC21B (ENSABRG00000023030) ENSABRG00000023047 ENSABRG00000023148 ENSABRG00000023151 ENSABRG00000023152 ENSABRG00000023158 B3GALT1 (ENSABRG00000023161) STK39 (ENSABRG00000023162) CERS6 (ENSABRG00000023164) SPC25 (ENSABRG00000023165) G6PC2 (ENSABRG00000023166) ##22 ABCB11 (ENSABRG00000023167) DHRS9 (ENSABRG00000023168) LRP2 (ENSABRG00000023169) ENSABRG00000023170 ENSABRG00000023171 BBS5 (ENSABRG00000023172) KLHL41 (ENSABRG00000023173) FASTKD1 (ENSABRG00000023174) PPIG (ENSABRG00000023175) ENSABRG00000023176 PHOSPHO2 (ENSABRG00000023177) KLHL23 (ENSABRG00000023178) SSB (ENSABRG00000023179) METTL5 (ENSABRG00000023180) UBR3 (ENSABRG00000023181) Neognathae_b ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00530000063608.B ENSGT00940000157782 ENSGT00940000157130 ENSGT01030000235134.c.a ENSGT00940000154224.c ENSGT00950000183072.b.b ENSGT00940000156609 ENSGT00390000005979.b ENSGT00940000154224.d ENSGT01030000235134.c.b ENSGT00940000167474 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ENSGT00960000189603 ENSGT00940000167377 ENSGT00390000007741.b ENSGT00940000159106 ENSGT00830000128380 ENSGT00390000000227 ENSGT00950000183075.a.b Great tit MODERN SPECIES 27 SLC38A11 (ENSPMJG00000019634) SCN3A (ENSPMJG00000019132) ENSPMJG00000019131 ENSPMJG00000019121 CSRNP3 (ENSPMJG00000019120) GALNT3 (ENSPMJG00000019119) TTC21B (ENSPMJG00000019118) ENSPMJG00000019117 ENSPMJG00000019116 ENSPMJG00000019115 ENSPMJG00000019113 B3GALT1 (ENSPMJG00000019111) STK39 (ENSPMJG00000019110) CERS6 (ENSPMJG00000019109) SPC25 (ENSPMJG00000019108) G6PC2 (ENSPMJG00000019107) ##22 ABCB11 (ENSPMJG00000019106) ENSPMJG00000019105 LRP2 (ENSPMJG00000018810) ENSPMJG00000018802 BBS5 (ENSPMJG00000018751) KLHL41 (ENSPMJG00000018750) PPIG (ENSPMJG00000018743) ENSPMJG00000018742 PHOSPHO2 (ENSPMJG00000018741) KLHL23 (ENSPMJG00000018740) SSB (ENSPMJG00000018739) METTL5 (ENSPMJG00000018738) UBR3 (ENSPMJG00000018681) MYO3B (ENSPMJG00000018680) SP5 (ENSPMJG00000018679) Passeriformes_d ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000158609 ENSGT00530000063608.B ENSGT00940000157782 ENSGT00940000157130.b ENSGT00940000154224.c ENSGT00950000183072.b.b ENSGT00940000156609 ENSGT00390000005979.b ENSGT01090000260192.a.a.a ENSGT00940000154224.d ENSGT00940000167474 ENSGT00940000156219 ENSGT00940000154621.a.a ENSGT01030000234515.a.a.b ENSGT00390000002220 ENSGT00950000183150.a.b ##22 ENSGT00940000157564 ENSGT00940000164857 ENSGT00940000157232 ENSGT00940000163195.B ENSGT00390000002753 ENSGT00940000158859 ENSGT01030000234607.B ENSGT00940000157954 ENSGT00960000189603 ENSGT00940000167377 ENSGT00390000007741.b ENSGT00940000159106 ENSGT00830000128380 ENSGT00390000000227 ENSGT00950000183075.a.b Flycatcher MODERN SPECIES 26 SCN3A (ENSFALG00000008338) ENSFALG00000024019 ENSFALG00000008380 CSRNP3 (ENSFALG00000008389) GALNT3 (ENSFALG00000008392) TTC21B (ENSFALG00000008398) ENSFALG00000025921 ENSFALG00000008409 ENSFALG00000024181 ENSFALG00000000733 ENSFALG00000025299 ENSFALG00000023334 STK39 (ENSFALG00000000750) CERS6 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ENSGT00940000157954 ENSGT00960000189603 ENSGT00940000167377 ENSGT00390000007741.b ENSGT00940000159106 ENSGT00830000128380 ENSGT00390000000227 ENSGT00950000183075.a.b Medium ground finch MODERN SPECIES 1 SCN3A (ENSGFOG00000002600) ENSGFOG00000002810 ENSGFOG00000002835 ENSGFOG00000002841 CSRNP3 (ENSGFOG00000002854) GALNT3 (ENSGFOG00000002891) TTC21B (ENSGFOG00000002953) ENSGFOG00000003052 ENSGFOG00000003543 ENSGFOG00000003610 ENSGFOG00000004171 B3GALT1 (ENSGFOG00000004179) STK39 (ENSGFOG00000004195) CERS6 (ENSGFOG00000004296) SPC25 (ENSGFOG00000004319) G6PC2 (ENSGFOG00000004325) ##22 ABCB11 (ENSGFOG00000004339) ENSGFOG00000004453 LRP2 (ENSGFOG00000004623) ENSGFOG00000005552 BBS5 (ENSGFOG00000005578) KLHL41 (ENSGFOG00000005590) FASTKD1 (ENSGFOG00000005595) PPIG (ENSGFOG00000005608) ENSGFOG00000005627 PHOSPHO2 (ENSGFOG00000005636) KLHL23 (ENSGFOG00000005640) SSB (ENSGFOG00000005646) METTL5 (ENSGFOG00000005656) UBR3 (ENSGFOG00000005674) MYO3B (ENSGFOG00000005762) Passeroidea ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00530000063608.B ENSGT00940000157782 ENSGT00940000154224.c ENSGT01090000260192.a.a.a.b ENSGT00950000183072.b.b ENSGT00940000156609 ENSGT00390000005979.b ENSGT01090000260192.a.a.a.a ENSGT00940000154224.d ENSGT00940000157130.b ENSGT00940000167474 ENSGT00940000156219 ENSGT00940000154621.a.a ENSGT01030000234515.a.a.b ENSGT00390000002220 ENSGT00950000183150.a.b ##22 ENSGT00940000157564 ENSGT00940000164857 ENSGT00940000157232 ENSGT00940000163195.B ENSGT00390000002753 ENSGT00940000158859 ENSGT01030000234607.B ENSGT00940000157954 ENSGT00960000189603 ENSGT00940000167377 ENSGT00390000007741.b ENSGT00940000159106 ENSGT00830000128380 ENSGT00390000000227 ENSGT00950000183075.a.b Common canary MODERN SPECIES 8 ENSSCAG00000015299 ENSSCAG00000015347 CSRNP3 (ENSSCAG00000015357) GALNT3 (ENSSCAG00000015364) TTC21B (ENSSCAG00000015369) ENSSCAG00000015405 ENSSCAG00000015499 ENSSCAG00000015501 ENSSCAG00000015503 ENSSCAG00000015516 ENSSCAG00000015585 B3GALT1 (ENSSCAG00000015593) STK39 (ENSSCAG00000015596) CERS6 (ENSSCAG00000015610) SPC25 (ENSSCAG00000015615) G6PC2 (ENSSCAG00000015617) ##22 ABCB11 (ENSSCAG00000015622) ENSSCAG00000015625 LRP2 (ENSSCAG00000015630) BBS5 (ENSSCAG00000015658) KLHL41 (ENSSCAG00000015662) FASTKD1 (ENSSCAG00000015665) PPIG (ENSSCAG00000015671) ENSSCAG00000015692 ENSSCAG00000015695 PHOSPHO2 (ENSSCAG00000015699) KLHL23 (ENSSCAG00000015702) SSB (ENSSCAG00000015704) METTL5 (ENSSCAG00000015707) UBR3 (ENSSCAG00000015743) MYO3B (ENSSCAG00000015846) Zebra finch MODERN SPECIES 29 ENSTGUG00000006979 COBLL1 (ENSTGUG00000007022) SCN3A (ENSTGUG00000007034) ENSTGUG00000007152 ENSTGUG00000022108 CSRNP3 (ENSTGUG00000007262) GALNT3 (ENSTGUG00000007273) TTC21B (ENSTGUG00000007307) ENSTGUG00000007356 ENSTGUG00000007470 ENSTGUG00000027001 B3GALT1 (ENSTGUG00000019956) STK39 (ENSTGUG00000007554) CERS6 (ENSTGUG00000025815) SPC25 (ENSTGUG00000007605) G6PC2 (ENSTGUG00000007608) ##22 ABCB11 (ENSTGUG00000007617) ENSTGUG00000007656 LRP2 (ENSTGUG00000007663) ENSTGUG00000027661 BBS5 (ENSTGUG00000007830) KLHL41 (ENSTGUG00000007856) FASTKD1 (ENSTGUG00000007867) PPIG (ENSTGUG00000007875) SSB (ENSTGUG00000007942) PHOSPHO2 (ENSTGUG00000022051) ENSTGUG00000007922 KLHL23 (ENSTGUG00000007937) METTL5 (ENSTGUG00000007994) UBR3 (ENSTGUG00000008012) MYO3B (ENSTGUG00000008038) Neognathae_c ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00530000063608.B ENSGT00940000157782 ENSGT00940000157130 ENSGT01030000235134.c.a ENSGT00940000154224.c ENSGT00950000183072.b.b ENSGT00940000156609 ENSGT00390000005979.b ENSGT00940000154224.d ENSGT01030000235134.c.b ENSGT00940000167474 ENSGT00940000156219 ENSGT00940000154621.a.a ENSGT01030000234515.a.a.b ENSGT00390000002220 ENSGT00950000183150.a.b ##22 ENSGT00940000157564 ENSGT00940000158665 ENSGT00940000164857 ENSGT00940000157232 ENSGT00940000163195.B ENSGT00940000153769.D ENSGT00390000002753 ENSGT00940000158859 ENSGT01030000234607.B ENSGT00940000157954 ENSGT00960000189603 ENSGT00940000167377 ENSGT00390000007741.b ENSGT00940000159106.z ENSGT00830000128380 Golden eagle MODERN SPECIES 22 SLC38A11 (ENSACCG00020010535) SCN3A (ENSACCG00020010441) ENSACCG00020010312 ENSACCG00020010293 CSRNP3 (ENSACCG00020010266) GALNT3 (ENSACCG00020010226) TTC21B (ENSACCG00020010044) ENSACCG00020009841 ENSACCG00020009828 ENSACCG00020009810 ENSACCG00020009765 B3GALT1 (ENSACCG00020009756) STK39 (ENSACCG00020009735) CERS6 (ENSACCG00020009711) SPC25 (ENSACCG00020009688) G6PC2 (ENSACCG00020009665) ##22 ABCB11 (ENSACCG00020009621) DHRS9 (ENSACCG00020009578) ENSACCG00020009546 ENSACCG00020009531 ENSACCG00020009518 ENSACCG00020009497 ENSACCG00020009473 ENSACCG00020009460 ENSACCG00020009448 KLHL41 (ENSACCG00020009429) FASTKD1 (ENSACCG00020009338) PPIG (ENSACCG00020009324) ENSACCG00020009301 PHOSPHO2 (ENSACCG00020009284) KLHL23 (ENSACCG00020009277) Kakapo MODERN SPECIES 22 ENSSHBG00005020220 ENSSHBG00005020212 ENSSHBG00005020197 CSRNP3 (ENSSHBG00005020187) GALNT3 (ENSSHBG00005020184) TTC21B (ENSSHBG00005020179) ENSSHBG00005020175 ENSSHBG00005020029 ENSSHBG00005019993 ENSSHBG00005004557 ENSSHBG00005002984 B3GALT1 (ENSSHBG00005002942) STK39 (ENSSHBG00005002872) CERS6 (ENSSHBG00005002842) SPC25 (ENSSHBG00005000352) G6PC2 (ENSSHBG00005000348) ##22 ABCB11 (ENSSHBG00005000329) ENSSHBG00005000313 ENSSHBG00005000310 LRP2 (ENSSHBG00005000265) ENSSHBG00005004934 ENSSHBG00005004924 BBS5 (ENSSHBG00005004912) KLHL41 (ENSSHBG00005004906) FASTKD1 (ENSSHBG00005004900) PPIG (ENSSHBG00005004894) ENSSHBG00005004885 ENSSHBG00005004877 PHOSPHO2 (ENSSHBG00005004873) ENSSHBG00005004869 ENSSHBG00005004864 African ostrich MODERN SPECIES 123 ENSSCUG00000000915 ENSSCUG00000000913 B3GALT1 (ENSSCUG00000000910) STK39 (ENSSCUG00000000885) CERS6 (ENSSCUG00000000864) SPC25 (ENSSCUG00000000861) G6PC2 (ENSSCUG00000000859) ##22 DHRS9 (ENSSCUG00000000858) ABCB11 (ENSSCUG00000000850) ENSSCUG00000000845 LRP2 (ENSSCUG00000000830) ENSSCUG00000000790 KLHL41 (ENSSCUG00000000787) FASTKD1 (ENSSCUG00000000785) PPIG (ENSSCUG00000000782) ENSSCUG00000000781 PHOSPHO2 (ENSSCUG00000000777) KLHL23 (ENSSCUG00000000775) SSB (ENSSCUG00000000773) METTL5 (ENSSCUG00000000771) UBR3 (ENSSCUG00000000762) ENSSCUG00000000757 Australian saltwater crocodile MODERN SPECIES 66 SLC38A11 (ENSCPRG00005018501) SCN3A (ENSCPRG00005018418) ENSCPRG00005016653 CSRNP3 (ENSCPRG00005016080) GALNT3 (ENSCPRG00005016076) TTC21B (ENSCPRG00005016071) ENSCPRG00005015999 ENSCPRG00005015892 ENSCPRG00005015870 ENSCPRG00005015866 ENSCPRG00005015862 B3GALT1 (ENSCPRG00005015857) STK39 (ENSCPRG00005015835) CERS6 (ENSCPRG00005015825) SPC25 (ENSCPRG00005015820) G6PC2 (ENSCPRG00005015814) ##22 ABCB11 (ENSCPRG00005015801) DHRS9 (ENSCPRG00005015788) ENSCPRG00005015786 LRP2 (ENSCPRG00005015717) ENSCPRG00005015690 BBS5 (ENSCPRG00005015679) ENSCPRG00005015675 ENSCPRG00005015673 PPIG (ENSCPRG00005015671) ENSCPRG00005015670 PHOSPHO2 (ENSCPRG00005015666) KLHL23 (ENSCPRG00005015661) SSB (ENSCPRG00005015654) METTL5 (ENSCPRG00005015652) UBR3 (ENSCPRG00005015405) Cryptodira ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000157782 ENSGT00950000183072.b.b ENSGT00940000156609 ENSGT00390000005979.b ENSGT00940000154224.d ENSGT01090000260228 ENSGT00940000157130 ENSGT00530000063779.A.c ENSGT00530000063779.A.d ENSGT00940000167474 ENSGT00940000156219 ENSGT00940000154621.a.a ENSGT00940000169926 ENSGT01030000234515.a.a.b ENSGT00390000002220 ENSGT00950000183150.a.b ##22 ENSGT00940000157564 ENSGT00940000158665 ENSGT00940000164857 ENSGT00940000157232 ENSGT01090000260278 ENSGT00390000002753 ENSGT00940000158859 ENSGT01030000234607.B ENSGT00940000157954 ENSGT00940000167377 ENSGT00390000007741.b ENSGT00940000159106 ENSGT00830000128380 ENSGT00390000000227 ENSGT00950000183075.a.b Testudinoidea ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000157782 ENSGT01090000260228.e ENSGT01090000260228.f ENSGT00950000183072.b.b ENSGT00940000156609 ENSGT00390000005979.b ENSGT00940000154224.d ENSGT00940000157130 ENSGT00530000063779.A.c ENSGT00530000063779.A.d ENSGT00940000167474 ENSGT00940000156219 ENSGT00940000154621.a.a.b ENSGT01030000234515.a.a.b ENSGT00390000002220 ENSGT00950000183150.a.b ##22 ENSGT00940000157564 ENSGT00940000158665 ENSGT00940000164857 ENSGT00940000157232 ENSGT01090000260278 ENSGT00390000002753 ENSGT00940000158859 ENSGT01030000234607.B ENSGT00940000157954 ENSGT00940000167377 ENSGT00390000007741.b ENSGT00940000159106.ab.a ENSGT00830000128380 ENSGT00390000000227 ENSGT00950000183075.a.b Emydidae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000158609.z ENSGT00530000063608.B ENSGT00940000157782 ENSGT00940000157130 ENSGT00940000154224.d ENSGT01090000260228.f ENSGT00950000183072.b.b ENSGT00940000156609 ENSGT00390000005979.b ENSGT00530000063779.A.c ENSGT00940000167474 ENSGT00940000156219 ENSGT00940000154621.a.a.b ENSGT01030000234515.a.a.b ENSGT00390000002220 ENSGT00950000183150.a.b ##22 ENSGT00940000157564 ENSGT00940000158665 ENSGT00940000164857 ENSGT00940000157232 ENSGT01090000260278 ENSGT00390000002753 ENSGT00940000158859 ENSGT01030000234607.B ENSGT00940000157954 ENSGT00940000167377 ENSGT00390000007741.b 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ENSGT00940000158859 ENSGT01030000234607.B ENSGT00940000157954 ENSGT00730000111149 ENSGT00390000007741.b ENSGT00940000159106 ENSGT00830000128380.a.a ENSGT00390000000227 ENSGT00950000183075.a.b ENSGT00940000159309 ENSGT00940000160673.j Opossum MODERN SPECIES 3 TTC21B (ENSMODG00000006501) SCN1A (ENSMODG00000006537) ENSMODG00000006587 ENSMODG00000028392 ENSMODG00000047999 ENSMODG00000048739 ENSMODG00000027390 XIRP2 (ENSMODG00000007546) B3GALT1 (ENSMODG00000024805) STK39 (ENSMODG00000007566) ENSMODG00000041773 ENSMODG00000024803 CERS6 (ENSMODG00000007694) NOSTRIN (ENSMODG00000007742) SPC25 (ENSMODG00000007753) ENSMODG00000045927 ##22 ABCB11 (ENSMODG00000007818) DHRS9 (ENSMODG00000007888) LRP2 (ENSMODG00000007996) KLHL41 (ENSMODG00000008022) FASTKD1 (ENSMODG00000008073) PPIG (ENSMODG00000008110) CFAP210 (ENSMODG00000008147) PHOSPHO2 (ENSMODG00000024787) KLHL23 (ENSMODG00000008183) METTL5 (ENSMODG00000008236) ENSMODG00000008227 UBR3 (ENSMODG00000008265) MYO3B (ENSMODG00000008396) SP5 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ENSGT00940000154224.a ENSGT00950000183072.b.b ENSGT00940000156609 ENSGT00390000005979.b ENSGT00940000154224.b ENSGT00940000161368 ENSGT00940000162042 ENSGT00530000063779.A ENSGT00940000156219 ENSGT00940000154621.a.a ENSGT01030000234515.a.a.b ENSGT00510000048120 ENSGT00390000002220 ENSGT00950000183150.a.b ##22 ENSGT00940000157564 ENSGT00940000158665 ENSGT00940000157232 ENSGT00390000002753 ENSGT00940000158859 ENSGT01030000234607.B ENSGT00940000157954 ENSGT00730000111149 ENSGT00390000007741.b ENSGT00940000159106 ENSGT00830000128380.r ENSGT00390000000227.h ENSGT00950000183075.a.b ENSGT00940000159309 ENSGT00940000160673 Mouse lemur MODERN SPECIES 30 ENSMICG00000002843 CSRNP3 (ENSMICG00000015267) GALNT3 (ENSMICG00000015295) TTC21B (ENSMICG00000015487) ENSMICG00000031358 SCN1A (ENSMICG00000004920) SCN9A (ENSMICG00000004943) SCN7A (ENSMICG00000014439) XIRP2 (ENSMICG00000033404) B3GALT1 (ENSMICG00000042176) STK39 (ENSMICG00000012416) ENSMICG00000034404 CERS6 (ENSMICG00000044307) NOSTRIN (ENSMICG00000017323) SPC25 (ENSMICG00000017327) G6PC2 (ENSMICG00000017329) ##22 ABCB11 (ENSMICG00000017332) ENSMICG00000048155 ENSMICG00000017336 ENSMICG00000004735 DHRS9 (ENSMICG00000017337) LRP2 (ENSMICG00000017339) BBS5 (ENSMICG00000029865) KLHL41 (ENSMICG00000044368) FASTKD1 (ENSMICG00000030856) ENSMICG00000037163 PPIG (ENSMICG00000013133) CFAP210 (ENSMICG00000026950) KLHL23 (ENSMICG00000004335) ENSMICG00000028252 METTL5 (ENSMICG00000008584) Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES 69 ENSGT00530000063779.A ENSGT00940000156219 ENSGT00940000154621.a.a ENSGT01030000234515.a.a.b ENSGT00510000048120 ENSGT00390000002220 ENSGT00950000183150.a.b ##22 ENSGT00940000157564 ENSGT00940000158665 ENSGT00940000157232 ENSGT00390000002753 ENSGT00940000158859 ENSGT01030000234607.B ENSGT00940000157954 ENSGT00730000111149 ENSGT00390000007741.b ENSGT00940000159106 ENSGT00830000128380.r ENSGT00390000000227.h ENSGT00950000183075.a.b ENSGT00940000159309 ENSGT00940000160673 Coquerels sifaka MODERN SPECIES 478 XIRP2 (ENSPCOG00000011918) ENSPCOG00000013338 B3GALT1 (ENSPCOG00000011545) STK39 (ENSPCOG00000028579) CERS6 (ENSPCOG00000019829) NOSTRIN (ENSPCOG00000021408) SPC25 (ENSPCOG00000009341) G6PC2 (ENSPCOG00000021912) ##22 ABCB11 (ENSPCOG00000022330) DHRS9 (ENSPCOG00000020628) LRP2 (ENSPCOG00000008020) BBS5 (ENSPCOG00000027299) KLHL41 (ENSPCOG00000018624) FASTKD1 (ENSPCOG00000024955) PPIG (ENSPCOG00000016588) CFAP210 (ENSPCOG00000006861) KLHL23 (ENSPCOG00000028044) SSB (ENSPCOG00000023189) METTL5 (ENSPCOG00000011627) UBR3 (ENSPCOG00000027735) MYO3B (ENSPCOG00000024102) SP5 (ENSPCOG00000020629) ENSPCOG00000006630 Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 243 B3GALT1 (ENSPSMG00000022378) STK39 (ENSPSMG00000022408) ENSPSMG00000022430 CERS6 (ENSPSMG00000022480) NOSTRIN (ENSPSMG00000022547) SPC25 (ENSPSMG00000022576) G6PC2 (ENSPSMG00000022600) ##22 ABCB11 (ENSPSMG00000022657) DHRS9 (ENSPSMG00000022676) LRP2 (ENSPSMG00000022759) BBS5 (ENSPSMG00000022789) KLHL41 (ENSPSMG00000022798) FASTKD1 (ENSPSMG00000022810) PPIG (ENSPSMG00000022849) CFAP210 (ENSPSMG00000022888) PHOSPHO2 (ENSPSMG00000022897) KLHL23 (ENSPSMG00000022902) ENSPSMG00000022906 ENSPSMG00000022931 METTL5 (ENSPSMG00000022976) UBR3 (ENSPSMG00000023009) MYO3B (ENSPSMG00000023092) Bushbaby MODERN SPECIES 205 SCN3A (ENSOGAG00000002160) SCN2A (ENSOGAG00000002162) CSRNP3 (ENSOGAG00000025814) GALNT3 (ENSOGAG00000009656) TTC21B (ENSOGAG00000016385) SCN1A (ENSOGAG00000016402) SCN9A (ENSOGAG00000013021) SCN7A (ENSOGAG00000015002) ENSOGAG00000034586 XIRP2 (ENSOGAG00000026609) B3GALT1 (ENSOGAG00000007886) STK39 (ENSOGAG00000007887) CERS6 (ENSOGAG00000007893) NOSTRIN (ENSOGAG00000007895) SPC25 (ENSOGAG00000007897) G6PC2 (ENSOGAG00000007899) ##22 ABCB11 (ENSOGAG00000007900) DHRS9 (ENSOGAG00000007903) LRP2 (ENSOGAG00000007904) Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000154224.a ENSGT00950000183072.b.b ENSGT00940000156609 ENSGT00390000005979.b ENSGT00940000154224.b ENSGT00940000161368 ENSGT00940000162042 ENSGT00530000063779.A ENSGT00940000156219 ENSGT00900000143463 ENSGT00940000154621.a.a ENSGT01030000234515.a.a.b ENSGT00910000147933 ENSGT00510000048120 ENSGT00390000002220 ENSGT00950000183150.a.b ##22 ENSGT00940000157564 ENSGT00940000158665 ENSGT00940000157232 ENSGT00390000002753 ENSGT00940000158859 ENSGT01030000234607.B ENSGT00940000157954 ENSGT00730000111149 ENSGT00390000007741.b ENSGT00940000159106 ENSGT00830000128380.q.b ENSGT00390000000227.h ENSGT00950000183075.a.b ENSGT00940000159309 ENSGT00940000160673 Tarsier MODERN SPECIES 7049 CERS6 (ENSTSYG00000003214) NOSTRIN (ENSTSYG00000013119) ENSTSYG00000036208 SPC25 (ENSTSYG00000008593) G6PC2 (ENSTSYG00000008603) ##22 ABCB11 (ENSTSYG00000008998) DHRS9 (ENSTSYG00000004865) Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000154224.a ENSGT00950000183072.b.b ENSGT00940000156609 ENSGT00390000005979.b ENSGT00940000154224.b ENSGT00940000161368 ENSGT00940000162042 ENSGT00530000063779.A ENSGT00940000156219 ENSGT00900000143463 ENSGT00940000154621.a.a ENSGT01030000234515.a.a.b ENSGT00910000147933 ENSGT00510000048120 ENSGT00390000002220 ENSGT00950000183150.a.b ##22 ENSGT00940000157564 ENSGT00940000158665 ENSGT00940000157232 ENSGT00390000002753 ENSGT00940000158859 ENSGT01030000234607.B ENSGT00940000157954 ENSGT00730000111149 ENSGT00390000007741.b ENSGT00940000159106 ENSGT00830000128380.q.b ENSGT00390000000227.h ENSGT00950000183075.a.b ENSGT00940000159309 ENSGT00940000160673 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000157130 ENSGT00940000154224.a ENSGT00950000183072.b.b ENSGT00940000156609 ENSGT00390000005979.b ENSGT00940000154224.b ENSGT00940000161368 ENSGT00940000162042 ENSGT00530000063779.A ENSGT00940000156219 ENSGT00940000154621.a.a ENSGT01030000234515.a.a.b ENSGT00910000147933 ENSGT00510000048120 ENSGT00390000002220 ENSGT00950000183150.a.b ##22 ENSGT00940000157564 ENSGT00940000158665 ENSGT00940000157232 ENSGT00390000002753 ENSGT00940000158859 ENSGT01030000234607.B ENSGT00940000157954 ENSGT00730000111149 ENSGT00390000007741.b ENSGT00940000159106 ENSGT00830000128380.q.b ENSGT00390000000227.h ENSGT00950000183075.a.b ENSGT00940000159309 ENSGT00940000160673 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00950000183072.b.b ENSGT00940000156609 ENSGT00390000005979.b ENSGT00960000186726 ENSGT00940000154224.b ENSGT00940000161368 ENSGT00940000162042 ENSGT00530000063779.A ENSGT00950000182767.b.b.d.hb.b.a.d.b ENSGT00940000156219 ENSGT00910000146878 ENSGT00940000154621.a.a ENSGT01030000234515.a.a.b ENSGT00510000048120 ENSGT00390000002220 ENSGT00950000183150.a.b ##22 ENSGT00940000157564 ENSGT00940000158665 ENSGT00940000157232 ENSGT00390000002753 ENSGT00940000158859 ENSGT01030000234607.B ENSGT00940000157954 ENSGT00730000111149 ENSGT00390000007741.b ENSGT00940000159106 ENSGT00830000128380.q.b ENSGT00390000000227.h ENSGT00950000183075.a.b ENSGT00940000159309 ENSGT00950000183120.e.b.a.a.a.n Hominidae ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00950000183072.b.b ENSGT00940000156609 ENSGT00390000005979.b ENSGT00960000186726 ENSGT00940000154224.b 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ENSGT00730000111149 ENSGT00390000007741.b ENSGT00940000159106 ENSGT00830000128380.q.b ENSGT00390000000227.h ENSGT00950000183075.a.b ENSGT00940000159309 ENSGT00940000160673 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00950000183072.b.b ENSGT00940000156609 ENSGT00390000005979.b ENSGT00940000154224.b ENSGT00940000161368 ENSGT00940000162042 ENSGT00530000063779.A ENSGT00940000156219 ENSGT00900000143463 ENSGT00910000146878 ENSGT00940000154621.a.a ENSGT01030000234515.a.a.b ENSGT00910000147933 ENSGT00510000048120 ENSGT00390000002220 ENSGT00950000183150.a.b ##22 ENSGT00940000157564 ENSGT00940000158665 ENSGT00940000157232 ENSGT00390000002753 ENSGT00940000158859 ENSGT01030000234607.B ENSGT00940000157954 ENSGT00730000111149 ENSGT00390000007741.b ENSGT00940000159106 ENSGT00830000128380.q.b ENSGT00390000000227.h ENSGT00950000183075.a.b ENSGT00940000159309 ENSGT00940000160673 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00950000183072.b.b ENSGT00940000156609 ENSGT00390000005979.b ENSGT00940000154224.b ENSGT00940000161368 ENSGT00940000162042 ENSGT00530000063779.A ENSGT00940000156219 ENSGT00900000143463 ENSGT00910000146878 ENSGT00940000154621.a.a ENSGT01030000234515.a.a.b ENSGT00910000147933 ENSGT00510000048120 ENSGT00390000002220 ENSGT00950000183150.a.b ##22 ENSGT00940000157564 ENSGT00940000158665 ENSGT00940000157232 ENSGT00390000002753 ENSGT00940000158859 ENSGT01030000234607.B ENSGT00940000157954 ENSGT00730000111149 ENSGT00390000007741.b ENSGT00940000159106 ENSGT00830000128380.q.b ENSGT00390000000227.h ENSGT00950000183075.a.b ENSGT00940000159309 ENSGT00940000160673 Olive baboon MODERN SPECIES 1 SCN1A (ENSPANG00000000722) ENSPANG00000043786 SCN9A (ENSPANG00000005059) ENSPANG00000046321 ENSPANG00000039382 SCN7A (ENSPANG00000013338) XIRP2 (ENSPANG00000001118) ENSPANG00000045547 ENSPANG00000038339 B3GALT1 (ENSPANG00000013219) STK39 (ENSPANG00000001119) CERS6 (ENSPANG00000008522) ENSPANG00000011886 NOSTRIN (ENSPANG00000018065) SPC25 (ENSPANG00000021924) G6PC2 (ENSPANG00000035838) ##22 ABCB11 (ENSPANG00000011791) DHRS9 (ENSPANG00000008570) ENSPANG00000050557 LRP2 (ENSPANG00000007656) KLHL41 (ENSPANG00000014471) FASTKD1 (ENSPANG00000011789) PPIG (ENSPANG00000020996) CFAP210 (ENSPANG00000011788) PHOSPHO2 (ENSPANG00000002467) KLHL23 (ENSPANG00000034453) SSB (ENSPANG00000007440) METTL5 (ENSPANG00000005422) UBR3 (ENSPANG00000005674) MYO3B (ENSPANG00000005421) ENSPANG00000048998 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000156609 ENSGT00390000005979.b ENSGT00940000154224.b ENSGT00940000161368 ENSGT00940000153525.g.b.b.b ENSGT00940000162042 ENSGT00530000063779.A ENSGT00940000156219 ENSGT00900000143463 ENSGT00910000146878 ENSGT00940000154621.a.a ENSGT01030000234515.a.a.b ENSGT00910000147933 ENSGT00510000048120 ENSGT00390000002220 ENSGT00950000183150.a.b ##22 ENSGT00940000157564 ENSGT00940000158665 ENSGT00940000157232 ENSGT00390000002753 ENSGT00940000158859 ENSGT01030000234607.B ENSGT00940000157954 ENSGT00730000111149 ENSGT00390000007741.b ENSGT00940000159106 ENSGT00830000128380.q.b ENSGT00390000000227.h ENSGT00950000183075.a.b ENSGT00940000159309 ENSGT00940000160673 Drill MODERN SPECIES 972 XIRP2 (ENSMLEG00000025456) B3GALT1 (ENSMLEG00000017074) ENSMLEG00000015701 ENSMLEG00000032532 STK39 (ENSMLEG00000033606) CERS6 (ENSMLEG00000041943) ENSMLEG00000024316 NOSTRIN (ENSMLEG00000031387) SPC25 (ENSMLEG00000038353) G6PC2 (ENSMLEG00000043124) ##22 ABCB11 (ENSMLEG00000043405) DHRS9 (ENSMLEG00000044415) LRP2 (ENSMLEG00000029408) BBS5 (ENSMLEG00000035859) KLHL41 (ENSMLEG00000043097) FASTKD1 (ENSMLEG00000023795) PPIG (ENSMLEG00000042390) ENSMLEG00000013800 CFAP210 (ENSMLEG00000042831) PHOSPHO2 (ENSMLEG00000022305) KLHL23 (ENSMLEG00000037653) ENSMLEG00000007711 SSB (ENSMLEG00000035717) ENSMLEG00000030018 ENSMLEG00000002706 Macaca ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00950000183072.b.b ENSGT00940000156609 ENSGT00390000005979.b ENSGT00940000154224.b ENSGT00940000161368 ENSGT00940000162042 ENSGT00530000063779.A ENSGT00940000156219 ENSGT00900000143463 ENSGT00910000146878 ENSGT00940000154621.a.a ENSGT01030000234515.a.a.b ENSGT00910000147933 ENSGT00510000048120 ENSGT00390000002220 ENSGT00950000183150.a.b ##22 ENSGT00940000157564 ENSGT00940000158665 ENSGT00940000157232 ENSGT00390000002753 ENSGT00940000158859 ENSGT01030000234607.B ENSGT00940000157954 ENSGT00730000111149 ENSGT00390000007741.b ENSGT00940000159106 ENSGT00830000128380.q.b ENSGT00390000000227.g.a.c ENSGT00950000183075.a.b ENSGT00940000159309 ENSGT00940000160673 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000157782 ENSGT00940000157130 ENSGT00940000154224.a ENSGT00950000183072.b.b ENSGT00940000156609 ENSGT00390000005979.b ENSGT00940000154224.b ENSGT00940000161368 ENSGT00940000162042 ENSGT00530000063779.A ENSGT00940000156219 ENSGT00940000154621.a.a ENSGT01030000234515.a.a.b ENSGT00510000048120 ENSGT00390000002220 ENSGT00950000183150.a.b ##22 ENSGT00940000157564 ENSGT00940000158665 ENSGT00940000157232 ENSGT00390000002753 ENSGT00940000158859 ENSGT01030000234607.B ENSGT00940000157954 ENSGT00730000111149 ENSGT00390000007741.b ENSGT00940000159106 ENSGT00390000000227.g.a.c ENSGT00950000183075.a.b ENSGT00940000159309 ENSGT00940000160673 ENSGT00390000017846 Crab-eating macaque MODERN SPECIES 3 SLC38A11 (ENSMFAG00000003277) SCN3A (ENSMFAG00000045084) SCN2A (ENSMFAG00000033946) CSRNP3 (ENSMFAG00000036441) GALNT3 (ENSMFAG00000045217) TTC21B (ENSMFAG00000044970) SCN1A (ENSMFAG00000031169) SCN9A (ENSMFAG00000034634) SCN7A (ENSMFAG00000012357) XIRP2 (ENSMFAG00000000943) B3GALT1 (ENSMFAG00000008871) STK39 (ENSMFAG00000031858) CERS6 (ENSMFAG00000046177) NOSTRIN (ENSMFAG00000031990) SPC25 (ENSMFAG00000035541) G6PC2 (ENSMFAG00000002062) ##22 ABCB11 (ENSMFAG00000037604) DHRS9 (ENSMFAG00000034505) LRP2 (ENSMFAG00000045364) BBS5 (ENSMFAG00000040347) ENSMFAG00000012041 MYO3B (ENSMFAG00000002186) ENSMFAG00000053753 ERICH2 (ENSMFAG00000045253) ENSMFAG00000047967 GAD1 (ENSMFAG00000045590) GORASP2 (ENSMFAG00000045440) TLK1 (ENSMFAG00000040555) ENSMFAG00000056665 ENSMFAG00000052717 METTL8 (ENSMFAG00000032752) Rhesus MODERN SPECIES 3 SCN2A (ENSMMUG00000002712) CSRNP3 (ENSMMUG00000008393) GALNT3 (ENSMMUG00000019177) TTC21B (ENSMMUG00000008400) SCN1A (ENSMMUG00000008407) SCN9A (ENSMMUG00000018510) ENSMMUG00000031412 XIRP2 (ENSMMUG00000013251) ENSMMUG00000053565 ENSMMUG00000063463 B3GALT1 (ENSMMUG00000021775) STK39 (ENSMMUG00000006215) CERS6 (ENSMMUG00000043509) NOSTRIN (ENSMMUG00000019968) SPC25 (ENSMMUG00000053972) G6PC2 (ENSMMUG00000013830) ##22 ABCB11 (ENSMMUG00000013832) DHRS9 (ENSMMUG00000013835) LRP2 (ENSMMUG00000017143) KLHL41 (ENSMMUG00000020510) FASTKD1 (ENSMMUG00000020511) PPIG (ENSMMUG00000020512) CFAP210 (ENSMMUG00000031398) PHOSPHO2 (ENSMMUG00000048893) KLHL23 (ENSMMUG00000023051) METTL5 (ENSMMUG00000023054) UBR3 (ENSMMUG00000023062) ENSMMUG00000062944 MYO3B (ENSMMUG00000016256) SP5 (ENSMMUG00000002690) ERICH2 (ENSMMUG00000031393) Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 585 CSRNP3 (ENSMNEG00000036036) GALNT3 (ENSMNEG00000028896) TTC21B (ENSMNEG00000028156) SCN1A (ENSMNEG00000038343) SCN9A (ENSMNEG00000031766) XIRP2 (ENSMNEG00000034926) ENSMNEG00000027340 B3GALT1 (ENSMNEG00000000617) ENSMNEG00000025671 ENSMNEG00000030143 STK39 (ENSMNEG00000009661) CERS6 (ENSMNEG00000041990) ENSMNEG00000020427 NOSTRIN (ENSMNEG00000044898) SPC25 (ENSMNEG00000030967) G6PC2 (ENSMNEG00000033139) ##22 ABCB11 (ENSMNEG00000034147) DHRS9 (ENSMNEG00000039893) LRP2 (ENSMNEG00000016273) BBS5 (ENSMNEG00000034580) KLHL41 (ENSMNEG00000039276) FASTKD1 (ENSMNEG00000043635) PPIG (ENSMNEG00000044068) CFAP210 (ENSMNEG00000032114) PHOSPHO2 (ENSMNEG00000020447) KLHL23 (ENSMNEG00000035092) SSB (ENSMNEG00000028321) METTL5 (ENSMNEG00000037870) UBR3 (ENSMNEG00000040174) MYO3B (ENSMNEG00000036500) SP5 (ENSMNEG00000038850) Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 68 ENSGT00950000183072.b.b ENSGT00940000156609 ENSGT00390000005979.b ENSGT00940000154224.b ENSGT00940000161368 ENSGT00940000162042 ENSGT00530000063779.A ENSGT00940000156219 ENSGT00900000143463 ENSGT00910000146878 ENSGT00940000154621.a.a ENSGT01030000234515.a.a.b ENSGT00510000048120 ENSGT00390000002220 ENSGT00950000183150.a.b ##22 ENSGT00940000157564 ENSGT00940000158665 ENSGT00940000157232 ENSGT00390000002753 ENSGT00940000158859 ENSGT01030000234607.B ENSGT00940000157954 ENSGT00730000111149 ENSGT00390000007741.b ENSGT00940000159106 ENSGT00830000128380.r ENSGT00390000000227.h ENSGT00950000183075.a.b ENSGT00940000159309 ENSGT00940000160673 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2920 B3GALT1 (ENSRROG00000002319) ENSRROG00000028534 ENSRROG00000040977 STK39 (ENSRROG00000028699) CERS6 (ENSRROG00000043931) NOSTRIN (ENSRROG00000036473) SPC25 (ENSRROG00000033928) G6PC2 (ENSRROG00000035221) ##22 ABCB11 (ENSRROG00000034656) DHRS9 (ENSRROG00000037518) LRP2 (ENSRROG00000035813) BBS5 (ENSRROG00000009204) FASTKD1 (ENSRROG00000045404) KLHL41 (ENSRROG00000030676) PPIG (ENSRROG00000034250) CFAP210 (ENSRROG00000028316) PHOSPHO2 (ENSRROG00000002864) KLHL23 (ENSRROG00000031144) ENSRROG00000030084 SSB (ENSRROG00000040346) ENSRROG00000044489 ENSRROG00000040576 ENSRROG00000018018 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1693 NOSTRIN (ENSRBIG00000043560) SPC25 (ENSRBIG00000036298) G6PC2 (ENSRBIG00000028907) ##22 ABCB11 (ENSRBIG00000040452) DHRS9 (ENSRBIG00000043394) LRP2 (ENSRBIG00000029285) BBS5 (ENSRBIG00000028832) KLHL41 (ENSRBIG00000006984) FASTKD1 (ENSRBIG00000028416) PPIG (ENSRBIG00000028208) CFAP210 (ENSRBIG00000032337) PHOSPHO2 (ENSRBIG00000003770) KLHL23 (ENSRBIG00000040010) ENSRBIG00000041972 ENSRBIG00000030838 UBR3 (ENSRBIG00000029096) ENSRBIG00000015046 MYO3B (ENSRBIG00000001283) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000157782 ENSGT00940000157130 ENSGT00940000154224.a ENSGT00950000183072.b.b ENSGT00940000156609 ENSGT00390000005979.b ENSGT00940000154224.b ENSGT00940000161368 ENSGT00940000162042 ENSGT00530000063779.A ENSGT00940000156219 ENSGT00940000154621.a.a ENSGT01030000234515.a.a.b ENSGT00510000048120 ENSGT00390000002220 ENSGT00950000183150.a.b ##22 ENSGT00940000157564 ENSGT00940000158665 ENSGT00940000157232 ENSGT00390000002753 ENSGT00940000158859 ENSGT01030000234607.B ENSGT00940000157954 ENSGT00730000111149 ENSGT00390000007741.b ENSGT00940000159106 ENSGT00830000128380.q.a ENSGT00390000000227.h ENSGT00950000183075.a.b ENSGT00940000159309 ENSGT00940000160673 Cebidae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000157782 ENSGT00940000157130 ENSGT00940000154224.a ENSGT00950000183072.b.b ENSGT00940000156609 ENSGT00390000005979.b ENSGT00940000154224.b ENSGT00940000161368 ENSGT00940000162042 ENSGT00530000063779.A ENSGT00940000156219 ENSGT00940000154621.a.a ENSGT01030000234515.a.a.b ENSGT00510000048120 ENSGT00390000002220 ENSGT00950000183150.a.b ##22 ENSGT00940000157564 ENSGT00940000158665 ENSGT00940000157232 ENSGT00390000002753 ENSGT00940000158859 ENSGT01030000234607.B ENSGT00940000157954 ENSGT00730000111149 ENSGT00390000007741.b ENSGT00940000159106 ENSGT00830000128380.q.a ENSGT00390000000227.h ENSGT00950000183075.a.b ENSGT00940000159309 ENSGT00940000160673 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000157782 ENSGT00940000157130 ENSGT00940000154224.a ENSGT00950000183072.b.b ENSGT00940000156609 ENSGT00390000005979.b ENSGT00940000154224.b ENSGT00940000161368 ENSGT00940000162042 ENSGT00530000063779.A ENSGT00940000156219 ENSGT00940000154621.a.a ENSGT01030000234515.a.a.b ENSGT00510000048120 ENSGT00390000002220 ENSGT00950000183150.a.b ##22 ENSGT00940000157564 ENSGT00940000158665 ENSGT00940000153773.a.b.b.s ENSGT00940000157232 ENSGT00390000002753 ENSGT00940000158859 ENSGT01030000234607.B ENSGT00940000157954 ENSGT00730000111149 ENSGT00390000007741.b ENSGT00940000159106 ENSGT00830000128380.q.a ENSGT00390000000227.h ENSGT00950000183075.a.b ENSGT00940000159309 Capuchin MODERN SPECIES 756 CERS6 (ENSCCAG00000022966) NOSTRIN (ENSCCAG00000020213) G6PC2 (ENSCCAG00000026877) ##22 SPC25 (ENSCCAG00000021691) ABCB11 (ENSCCAG00000021459) Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 46 SCN3A (ENSSBOG00000035894) SCN2A (ENSSBOG00000026760) CSRNP3 (ENSSBOG00000030284) GALNT3 (ENSSBOG00000018468) TTC21B (ENSSBOG00000035824) SCN1A (ENSSBOG00000031948) SCN9A (ENSSBOG00000015324) SCN7A (ENSSBOG00000035538) XIRP2 (ENSSBOG00000033204) B3GALT1 (ENSSBOG00000019649) STK39 (ENSSBOG00000024160) ENSSBOG00000019049 CERS6 (ENSSBOG00000027020) NOSTRIN (ENSSBOG00000025020) SPC25 (ENSSBOG00000027130) G6PC2 (ENSSBOG00000025087) ##22 ABCB11 (ENSSBOG00000021598) DHRS9 (ENSSBOG00000034610) ENSSBOG00000025499 LRP2 (ENSSBOG00000032083) ENSSBOG00000026248 BBS5 (ENSSBOG00000031567) KLHL41 (ENSSBOG00000034556) FASTKD1 (ENSSBOG00000023109) PPIG (ENSSBOG00000035503) CFAP210 (ENSSBOG00000034513) PHOSPHO2 (ENSSBOG00000019196) ENSSBOG00000022335 KLHL23 (ENSSBOG00000034226) ENSSBOG00000027204 ENSSBOG00000018367 Mas night monkey MODERN SPECIES 628 SCN3A (ENSANAG00000004012) SCN2A (ENSANAG00000021599) CSRNP3 (ENSANAG00000030848) GALNT3 (ENSANAG00000034280) TTC21B (ENSANAG00000027520) SCN1A (ENSANAG00000029435) SCN9A (ENSANAG00000026511) ENSANAG00000027438 SCN7A (ENSANAG00000023904) XIRP2 (ENSANAG00000037086) B3GALT1 (ENSANAG00000019866) STK39 (ENSANAG00000031467) CERS6 (ENSANAG00000029649) NOSTRIN (ENSANAG00000038398) SPC25 (ENSANAG00000017892) G6PC2 (ENSANAG00000021102) ##22 ABCB11 (ENSANAG00000023549) DHRS9 (ENSANAG00000030381) ENSANAG00000020998 ENSANAG00000029891 ENSANAG00000028652 PCMTD2 (ENSANAG00000025729) MYT1 (ENSANAG00000028892) OPRL1 (ENSANAG00000023538) LKAAEAR1 (ENSANAG00000023064) RGS19 (ENSANAG00000024379) TCEA2 (ENSANAG00000023470) SOX18 (ENSANAG00000036560) C20orf204 (ENSANAG00000029364) PRPF6 (ENSANAG00000012661) SAMD10 (ENSANAG00000023181) Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000154224.a ENSGT00950000183072.b.b ENSGT00940000156609 ENSGT00390000005979.b ENSGT00940000154224.b ENSGT00960000186726 ENSGT00940000161368 ENSGT00940000162042 ENSGT00530000064954 ENSGT00530000063779.A ENSGT00940000156219 ENSGT00940000154621.a.a ENSGT01030000234515.a.a.b ENSGT00510000048120 ENSGT00390000002220 ENSGT00950000183150.a.b ##22 ENSGT00940000157564 ENSGT00940000158665 ENSGT00940000157232 ENSGT00390000002753 ENSGT00940000158859 ENSGT01030000234607.B ENSGT00940000157954 ENSGT00730000111149 ENSGT00390000007741.b ENSGT00940000159106 ENSGT00830000128380 ENSGT00390000000227.h ENSGT00950000183075.a.b ENSGT00940000159309 ENSGT00940000160673 Tree shrew MODERN SPECIES 4758 CERS6 (ENSTBEG00000010137) NOSTRIN (ENSTBEG00000011356) ENSTBEG00000012511 SPC25 (ENSTBEG00000012559) G6PC2 (ENSTBEG00000012635) ##22 ABCB11 (ENSTBEG00000012695) Glires ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000154224.a ENSGT00950000183072.b.b ENSGT00940000156609 ENSGT00390000005979.b ENSGT00940000154224.b ENSGT00960000186726 ENSGT00940000161368 ENSGT00940000162042 ENSGT00530000064954 ENSGT00530000063779.A ENSGT00940000156219 ENSGT00940000154621.a.a ENSGT01030000234515.a.a.b ENSGT00510000048120 ENSGT00390000002220 ENSGT00950000183150.a.b ##22 ENSGT00940000157564 ENSGT00940000158665 ENSGT00940000157232 ENSGT00390000002753 ENSGT00940000158859 ENSGT01030000234607.B ENSGT00940000157954 ENSGT00730000111149 ENSGT00390000007741.b ENSGT00940000159106 ENSGT00830000128380 ENSGT00390000000227.h ENSGT00950000183075.a.b ENSGT00940000159309 ENSGT00940000160673 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000157130 ENSGT00940000154224.a ENSGT00950000183072.b.b ENSGT00940000156609 ENSGT00390000005979.b ENSGT00940000154224.b ENSGT00960000186726 ENSGT00940000161368 ENSGT00940000162042 ENSGT00530000063779.A ENSGT00940000156219 ENSGT00940000154621.a.a ENSGT01030000234515.a.a.b ENSGT00510000048120 ENSGT00390000002220 ENSGT00950000183150.a.b ##22 ENSGT00940000157564 ENSGT00940000158665 ENSGT00940000157232 ENSGT00390000002753 ENSGT00940000158859 ENSGT01030000234607.B ENSGT00940000157954 ENSGT00730000111149 ENSGT00940000159106 ENSGT00830000128380 ENSGT00390000000227.h ENSGT00950000183075.a.b ENSGT00940000159309 ENSGT00390000017846 ENSGT00940000155526 Rabbit MODERN SPECIES 18 TTC21B (ENSOCUG00000010620) ENSOCUG00000037223 SCN1A (ENSOCUG00000007266) ENSOCUG00000034812 SCN9A (ENSOCUG00000005623) ENSOCUG00000035153 SCN7A (ENSOCUG00000017729) ENSOCUG00000031892 XIRP2 (ENSOCUG00000017551) ENSOCUG00000012435 B3GALT1 (ENSOCUG00000001623) STK39 (ENSOCUG00000017874) CERS6 (ENSOCUG00000005722) NOSTRIN (ENSOCUG00000005730) ENSOCUG00000001366 G6PC2 (ENSOCUG00000001370) ##22 ABCB11 (ENSOCUG00000001372) DHRS9 (ENSOCUG00000005666) ENSOCUG00000011007 ENSOCUG00000031211 BBS5 (ENSOCUG00000034384) KLHL41 (ENSOCUG00000012980) FASTKD1 (ENSOCUG00000002198) PPIG (ENSOCUG00000011084) CFAP210 (ENSOCUG00000012003) KLHL23 (ENSOCUG00000010394) SSB (ENSOCUG00000010396) METTL5 (ENSOCUG00000010405) UBR3 (ENSOCUG00000006646) MYO3B (ENSOCUG00000010266) ENSOCUG00000004647 Pika MODERN SPECIES 4484 STK39 (ENSOPRG00000013194) CERS6 (ENSOPRG00000013220) NOSTRIN (ENSOPRG00000013241) SPC25 (ENSOPRG00000013274) G6PC2 (ENSOPRG00000013286) ##22 ABCB11 (ENSOPRG00000013311) Rodentia ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000154224.a ENSGT00950000183072.b.b ENSGT00940000156609 ENSGT00390000005979.b ENSGT00940000154224.b ENSGT00960000186726 ENSGT00940000161368 ENSGT00940000162042 ENSGT00530000064954 ENSGT00530000063779.A ENSGT00940000156219 ENSGT00940000154621.a.a ENSGT01030000234515.a.a.b ENSGT00510000048120 ENSGT00390000002220 ENSGT00950000183150.a.b ##22 ENSGT00940000157564 ENSGT00940000158665 ENSGT00940000157232 ENSGT00390000002753 ENSGT00940000158859 ENSGT01030000234607.B ENSGT00940000157954 ENSGT00730000111149 ENSGT00390000007741.b ENSGT00940000159106 ENSGT00830000128380 ENSGT00390000000227.h ENSGT00950000183075.a.b ENSGT00940000159309 ENSGT00940000160673 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000154224.a ENSGT00950000183072.b.b ENSGT00940000156609 ENSGT00390000005979.b ENSGT00940000154224.b ENSGT00960000186726 ENSGT00940000161368 ENSGT00940000162042 ENSGT00530000064954 ENSGT00530000063779.A ENSGT00940000156219 ENSGT00940000154621.a.a ENSGT01030000234515.a.a.b ENSGT00510000048120 ENSGT00390000002220 ENSGT00950000183150.a.b ##22 ENSGT00940000157564 ENSGT00940000158665 ENSGT00940000157232 ENSGT00390000002753 ENSGT00940000158859 ENSGT01030000234607.B ENSGT00940000157954 ENSGT00730000111149 ENSGT00390000007741.b ENSGT00940000159106 ENSGT00830000128380 ENSGT00390000000227.h ENSGT00950000183075.a.b ENSGT00940000159309 ENSGT00940000160673 Kangaroo rat DUPLICATION Kangaroo rat MODERN SPECIES 324 Scn3a (ENSDORG00000006416) ENSDORG00000026906 ENSDORG00000024148 Csrnp3 (ENSDORG00000003313) Galnt3 (ENSDORG00000003316) Ttc21b (ENSDORG00000003317) Scn1a (ENSDORG00000003321) Scn9a (ENSDORG00000014776) Scn7a (ENSDORG00000005720) Xirp2 (ENSDORG00000008838) B3galt1 (ENSDORG00000007446) Stk39 (ENSDORG00000015053) Cers6 (ENSDORG00000004633) Nostrin (ENSDORG00000005391) Spc25 (ENSDORG00000005398) ENSDORG00000005399 ##22 Abcb11 (ENSDORG00000002034) Dhrs9 (ENSDORG00000003025) Lrp2 (ENSDORG00000010845) ENSDORG00000028100 Bbs5 (ENSDORG00000029914) Klhl41 (ENSDORG00000026440) Fastkd1 (ENSDORG00000023855) Ppig (ENSDORG00000015561) Ccdc173 (ENSDORG00000015564) Phospho2 (ENSDORG00000010182) Klhl23 (ENSDORG00000011744) Ssb (ENSDORG00000005543) ENSDORG00000026009 Ubr3 (ENSDORG00000004131) Myo3b (ENSDORG00000012603) Kangaroo rat MODERN SPECIES 60 ENSDORG00000024378 ##22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000154224.a ENSGT00950000183072.b.b ENSGT00940000156609 ENSGT00390000005979.b ENSGT00940000154224.b ENSGT00960000186726 ENSGT00940000161368 ENSGT00940000162042 ENSGT00530000064954 ENSGT00530000063779.A ENSGT00940000156219 ENSGT00940000154621.a.a ENSGT01030000234515.a.a.b ENSGT00510000048120 ENSGT00390000002220 ENSGT00950000183150.a.b ##22 ENSGT00940000157564 ENSGT00940000158665 ENSGT00940000157232 ENSGT00390000002753 ENSGT00940000158859 ENSGT01030000234607.B ENSGT00940000157954 ENSGT00730000111149 ENSGT00390000007741.b ENSGT00940000159106 ENSGT00830000128380 ENSGT00390000000227.h ENSGT00950000183075.a.b ENSGT00940000159309 ENSGT00940000160673 Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 46 Csrnp3 (ENSJJAG00000019404) ENSJJAG00000011709 Galnt3 (ENSJJAG00000015309) Ttc21b (ENSJJAG00000023932) Scn1a (ENSJJAG00000022951) Scn9a (ENSJJAG00000023830) Scn7a (ENSJJAG00000024222) ENSJJAG00000020873 ENSJJAG00000018588 Xirp2 (ENSJJAG00000018741) B3galt1 (ENSJJAG00000001769) Stk39 (ENSJJAG00000023293) Cers6 (ENSJJAG00000020286) Nostrin (ENSJJAG00000023261) ENSJJAG00000020523 G6pc2 (ENSJJAG00000021781) ##22 Abcb11 (ENSJJAG00000024409) Dhrs9 (ENSJJAG00000005285) Lrp2 (ENSJJAG00000014991) ENSJJAG00000024082 Klhl41 (ENSJJAG00000021985) Fastkd1 (ENSJJAG00000023087) ENSJJAG00000024410 Ppig (ENSJJAG00000018139) Ccdc173 (ENSJJAG00000019851) Phospho2 (ENSJJAG00000001330) Klhl23 (ENSJJAG00000021449) ENSJJAG00000023158 ENSJJAG00000018646 Ubr3 (ENSJJAG00000024138) Myo3b (ENSJJAG00000020504) Muroidea ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00940000154224.a ENSGT00950000183072.b.b ENSGT00940000156609 ENSGT00390000005979.b ENSGT00940000154224.b ENSGT00960000186726 ENSGT00940000161368 ENSGT00940000162042 ENSGT00530000064954 ENSGT00530000063779.A ENSGT00940000156219 ENSGT00940000154621.a.a ENSGT01030000234515.a.a.b ENSGT00510000048120 ENSGT00390000002220 ENSGT00950000183150.a.b ##22 ENSGT00940000157564 ENSGT00940000158665 ENSGT00940000157232 ENSGT00390000002753 ENSGT00940000158859 ENSGT01030000234607.B ENSGT00940000157954 ENSGT00730000111149 ENSGT00390000007741.b ENSGT00940000159106 ENSGT00830000128380 ENSGT00390000000227.h ENSGT00950000183075.a.b ENSGT00940000159309 ENSGT00940000160673 Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 1011 ENSNGAG00000000663 Cers6 (ENSNGAG00000000371) Nostrin (ENSNGAG00000020161) Spc25 (ENSNGAG00000019235) G6pc2 (ENSNGAG00000018312) ##22 Abcb11 (ENSNGAG00000014534) Dhrs9 (ENSNGAG00000011696) Lrp2 (ENSNGAG00000011151) ENSNGAG00000015265 Bbs5 (ENSNGAG00000014871) Klhl41 (ENSNGAG00000014053) Fastkd1 (ENSNGAG00000013543) Ppig (ENSNGAG00000012335) Ccdc173 (ENSNGAG00000011382) Phospho2 (ENSNGAG00000010570) Klhl23 (ENSNGAG00000013310) ENSNGAG00000012920 ENSNGAG00000012423 Ubr3 (ENSNGAG00000013182) Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000154224.a ENSGT00950000183072.b.b ENSGT00940000156609 ENSGT00390000005979.b ENSGT00940000154224.b ENSGT00960000186726 ENSGT00940000161368 ENSGT00940000162042 ENSGT00530000064954 ENSGT00530000063779.A ENSGT00940000156219 ENSGT00940000154621.a.a ENSGT01030000234515.a.a.b ENSGT00510000048120 ENSGT00390000002220 ENSGT00950000183150.a.b ##22 ENSGT00940000157564 ENSGT00940000158665 ENSGT00940000157232 ENSGT00390000002753 ENSGT00940000158859 ENSGT01030000234607.B ENSGT00940000157954 ENSGT00730000111149 ENSGT00390000007741.b ENSGT00940000159106 ENSGT00830000128380 ENSGT00390000000227.h ENSGT00950000183075.a.b ENSGT00940000159309 ENSGT00940000160673 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT01030000235134 ENSGT00940000154224.a ENSGT00950000183072.b.b ENSGT00940000156609 ENSGT00390000005979.b ENSGT00940000154224.b ENSGT00940000161368 ENSGT00940000162042 ENSGT00530000064954 ENSGT00530000063779.A ENSGT00940000156219 ENSGT00940000154621.a.a ENSGT01030000234515.a.a.b ENSGT00510000048120 ENSGT00390000002220 ENSGT00950000183150.a.b ##22 ENSGT00940000157564 ENSGT00940000158665 ENSGT00940000157232 ENSGT00390000002753 ENSGT00940000158859 ENSGT01030000234607.B ENSGT00940000157954 ENSGT00730000111149 ENSGT00390000007741.b ENSGT00940000159106 ENSGT00830000128380 ENSGT00390000000227.h ENSGT00950000183075.a.b ENSGT00940000159309 ENSGT00940000160673 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000154224.a ENSGT00950000183072.b.b ENSGT00940000156609 ENSGT00390000005979.b ENSGT00940000154224.b ENSGT00940000161368 ENSGT00940000162042 ENSGT00530000063779.A ENSGT00940000156219 ENSGT00940000154621.a.a ENSGT00860000135934 ENSGT00940000153661.b.b ENSGT01030000234515.a.a.b ENSGT00510000048120 ENSGT00390000002220 ENSGT00950000183150.a.b ##22 ENSGT00940000157564 ENSGT00940000158665 ENSGT00940000157232 ENSGT00390000002753 ENSGT00940000158859 ENSGT01030000234607.B ENSGT00940000157954 ENSGT00730000111149 ENSGT00390000007741.b ENSGT00940000159106 ENSGT00830000128380 ENSGT00390000000227.h ENSGT00950000183075.a.b ENSGT00940000159309 ENSGT00940000160673 Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 188 Csrnp3 (ENSCGRG00001016696) Galnt3 (ENSCGRG00001014642) Ttc21b (ENSCGRG00001000626) Scn1a (ENSCGRG00001000717) Scn9a (ENSCGRG00001017498) Scn7a (ENSCGRG00001018559) ENSCGRG00001012755 ENSCGRG00001014032 Xirp2 (ENSCGRG00001013342) B3galt1 (ENSCGRG00001006856) Stk39 (ENSCGRG00001016830) ENSCGRG00001015938 Cers6 (ENSCGRG00001024870) Nostrin (ENSCGRG00001022017) Spc25 (ENSCGRG00001017739) G6pc2 (ENSCGRG00001013926) ##22 Abcb11 (ENSCGRG00001022102) Dhrs9 (ENSCGRG00001016780) Lrp2 (ENSCGRG00001015380) Bbs5 (ENSCGRG00001015834) Klhl41 (ENSCGRG00001024522) Fastkd1 (ENSCGRG00001022041) Ppig (ENSCGRG00001019618) Ccdc173 (ENSCGRG00001021032) Phospho2 (ENSCGRG00001006372) Klhl23 (ENSCGRG00001020651) Ssb (ENSCGRG00001024831) Mettl5 (ENSCGRG00001024537) Ubr3 (ENSCGRG00001014413) Myo3b (ENSCGRG00001013565) Sp5 (ENSCGRG00001010611) Golden Hamster MODERN SPECIES 618 Galnt3 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ENSGT00530000063779.A ENSGT00940000156219 ENSGT00940000154621.a.a ENSGT01030000234515.a.a.b ENSGT00510000048120 ENSGT00390000002220 ENSGT00950000183150.a.b ##22 ENSGT00940000157564 ENSGT00940000158665 ENSGT00940000157232 ENSGT00390000002753 ENSGT00940000158859 ENSGT01030000234607.B ENSGT00940000157954 ENSGT00730000111149 ENSGT00390000007741.b ENSGT00940000159106 ENSGT00830000128380 ENSGT00390000000227.h ENSGT00950000183075.a.b ENSGT00940000159309 ENSGT00940000160673 Northern American deer mouse MODERN SPECIES 17 Scn2a (ENSPEMG00000002426) Csrnp3 (ENSPEMG00000009261) Galnt3 (ENSPEMG00000002197) Ttc21b (ENSPEMG00000012829) Scn1a (ENSPEMG00000019046) Scn9a (ENSPEMG00000010302) Scn7a (ENSPEMG00000019127) ENSPEMG00000026787 Xirp2 (ENSPEMG00000012379) B3galt1 (ENSPEMG00000025791) Stk39 (ENSPEMG00000021458) ENSPEMG00000030695 Cers6 (ENSPEMG00000021075) Nostrin (ENSPEMG00000010901) Spc25 (ENSPEMG00000022334) G6pc2 (ENSPEMG00000000190) ##22 Abcb11 (ENSPEMG00000014679) Dhrs9 (ENSPEMG00000020846) 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ENSGT00940000159309 ENSGT00940000160673 Rat MODERN SPECIES 13 Galnt3 (ENSRNOG00000005727) Ttc21b (ENSRNOG00000005868) Scn1a (ENSRNOG00000053122) LOC108350387 (ENSRNOG00000066633) Scn9a (ENSRNOG00000006639) Scn7a (ENSRNOG00000029342) RGD1560831 (ENSRNOG00000007605) Xirp2 (ENSRNOG00000034258) B3galt1 (ENSRNOG00000007625) Stk39 (ENSRNOG00000024808) LOC685184 (ENSRNOG00000062489) Eif5-ps1 (ENSRNOG00000065729) Cers6 (ENSRNOG00000024595) Nostrin (ENSRNOG00000006611) Spc25 (ENSRNOG00000006731) AABR07052465.1 (ENSRNOG00000050620) ##22 Abcb11 (ENSRNOG00000050860) Dhrs9 (ENSRNOG00000065735) Lrp2 (ENSRNOG00000056184) Bbs5 (ENSRNOG00000007127) Klhl41 (ENSRNOG00000007461) Fastkd1 (ENSRNOG00000024335) Ppig (ENSRNOG00000007673) Cfap210 (ENSRNOG00000052954) Phospho2 (ENSRNOG00000007979) Klhl23 (ENSRNOG00000007981) Ssb (ENSRNOG00000007998) Mettl5 (ENSRNOG00000008469) Ubr3 (ENSRNOG00000008616) Myo3b (ENSRNOG00000030022) Sp5 (ENSRNOG00000054086) Mus ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00950000183072.b.b ENSGT00940000156609 ENSGT00390000005979.b ENSGT00940000154224.b ENSGT00940000161368 ENSGT00940000162042 ENSGT00530000064954 ENSGT00530000063779.A ENSGT00940000156219 ENSGT00940000154621.a.a ENSGT00860000135934 ENSGT00940000153661.b.b ENSGT01030000234515.a.a.b ENSGT00510000048120 ENSGT00390000002220 ENSGT00950000183150.a.b ##22 ENSGT00940000157564 ENSGT00940000158665 ENSGT00940000157232 ENSGT00390000002753 ENSGT00940000158859 ENSGT01030000234607.B ENSGT00940000157954 ENSGT00730000111149 ENSGT00390000007741.b ENSGT00940000159106 ENSGT00830000128380 ENSGT00390000000227.h ENSGT00950000183075.a.b ENSGT00940000159309 ENSGT00940000160673 Mus_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154224.a ENSGT00950000183072.b.b ENSGT00940000156609 ENSGT00390000005979.b ENSGT00940000154224.b ENSGT00940000161368 ENSGT00940000162042 ENSGT00530000064954 ENSGT00530000063779.A ENSGT00940000156219 ENSGT00940000154621.a.a ENSGT00940000153661.a.b.a.b.b ENSGT01030000234515.a.a.b ENSGT00510000048120 ENSGT00390000002220 ENSGT00950000183150.a.b ##22 ENSGT00940000157564 ENSGT00940000158665 ENSGT00940000157232 ENSGT00390000002753 ENSGT00940000158859 ENSGT01030000234607.B ENSGT00940000157954.c ENSGT00730000111149 ENSGT00390000007741.b ENSGT00940000159106 ENSGT00830000128380 ENSGT00390000000227.h ENSGT00950000183075.a.b ENSGT00940000159309 ENSGT00940000160673 Mus_B ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00950000183072.b.b ENSGT00940000156609 ENSGT00390000005979.b ENSGT00940000154224.b ENSGT00940000161368 ENSGT00940000162042 ENSGT00530000064954 ENSGT00530000063779.A ENSGT00940000156219 ENSGT00940000154621.a.a ENSGT00860000135934 ENSGT00940000153661.b.b ENSGT01030000234515.a.a.b ENSGT00510000048120 ENSGT00390000002220 ENSGT00950000183150.a.b ##22 ENSGT00940000157564 ENSGT00940000158665 ENSGT00940000157232 ENSGT00390000002753 ENSGT00940000158859 ENSGT01030000234607.B ENSGT00940000157954.c ENSGT00730000111149 ENSGT00390000007741.b ENSGT00940000159106 ENSGT00830000128380 ENSGT00390000000227.h ENSGT00950000183075.a.b ENSGT00940000159309 ENSGT00940000160673 Mus_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183072.b.b ENSGT00940000156609 ENSGT00390000005979.b ENSGT00940000154224.b ENSGT00940000161368 ENSGT00940000162042 ENSGT00530000064954 ENSGT00530000063779.A ENSGT00940000156219 ENSGT00940000154621.a.a ENSGT00860000135934 ENSGT00940000153661.b.b ENSGT01030000234515.a.a.b ENSGT00510000048120 ENSGT00390000002220 ENSGT00950000183150.a.b ##22 ENSGT00940000157564 ENSGT00940000158665 ENSGT00940000157232 ENSGT00390000002753 ENSGT00940000158859 ENSGT01030000234607.B ENSGT00940000157954.c ENSGT00730000111149 ENSGT00390000007741.b ENSGT00940000159106 ENSGT00830000128380 ENSGT00390000000227.h ENSGT00950000183075.a.b ENSGT00940000159309 ENSGT00940000160673 spretus MODERN SPECIES 11 Csrnp3 (MGP_SPRETEiJ_G0024525) Galnt3 (MGP_SPRETEiJ_G0024526) Ttc21b (MGP_SPRETEiJ_G0024527) Scn1a (MGP_SPRETEiJ_G0024528) Scn9a (MGP_SPRETEiJ_G0024529) Scn7a (MGP_SPRETEiJ_G0024530) MGP_SPRETEiJ_G0024531 Xirp2 (MGP_SPRETEiJ_G0024532) B3galt1 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Ttc21b (ENSMUSG00000034848) Scn1a (ENSMUSG00000064329) Scn9a (ENSMUSG00000075316) Scn7a (ENSMUSG00000034810) Xirp2 (ENSMUSG00000027022) B3galt1 (ENSMUSG00000034780) Stk39 (ENSMUSG00000027030) 4933409G03Rik (ENSMUSG00000053896) 4932414N04Rik (ENSMUSG00000079324) Cers6 (ENSMUSG00000027035) Nostrin (ENSMUSG00000034738) Spc25 (ENSMUSG00000005233) G6pc2 (ENSMUSG00000005232) ##22 Abcb11 (ENSMUSG00000027048) Dhrs9 (ENSMUSG00000027068) Lrp2 (ENSMUSG00000027070) Bbs5 (ENSMUSG00000063145) Klhl41 (ENSMUSG00000075307) Fastkd1 (ENSMUSG00000027086) Ppig (ENSMUSG00000042133) Ccdc173 (ENSMUSG00000070883) Phospho2 (ENSMUSG00000027088) Klhl23 (ENSMUSG00000042155) Ssb (ENSMUSG00000068882) Mettl5 (ENSMUSG00000051730) Ubr3 (ENSMUSG00000044308) Myo3b (ENSMUSG00000042064) Sp5 (ENSMUSG00000075304) Ryukyu mouse MODERN SPECIES 11 Csrnp3 (MGP_CAROLIEiJ_G0023603) Galnt3 (MGP_CAROLIEiJ_G0023604) Ttc21b (MGP_CAROLIEiJ_G0023605) Scn1a (MGP_CAROLIEiJ_G0023606) Scn9a (MGP_CAROLIEiJ_G0023607) Scn7a 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MGP_PahariEiJ_G0025060 Xirp2 (MGP_PahariEiJ_G0025061) B3galt1 (MGP_PahariEiJ_G0025062) Stk39 (MGP_PahariEiJ_G0025063) MGP_PahariEiJ_G0025064 4933409G03Rik (MGP_PahariEiJ_G0025065) 4932414N04Rik (MGP_PahariEiJ_G0025066) Cers6 (MGP_PahariEiJ_G0025067) Nostrin (MGP_PahariEiJ_G0025068) Spc25 (MGP_PahariEiJ_G0025069) G6pc2 (MGP_PahariEiJ_G0025070) ##22 Abcb11 (MGP_PahariEiJ_G0025071) Dhrs9 (MGP_PahariEiJ_G0025072) Lrp2 (MGP_PahariEiJ_G0025073) Bbs5 (MGP_PahariEiJ_G0025074) Klhl41 (MGP_PahariEiJ_G0025075) Fastkd1 (MGP_PahariEiJ_G0025076) Ppig (MGP_PahariEiJ_G0025077) Ccdc173 (MGP_PahariEiJ_G0025078) Phospho2 (MGP_PahariEiJ_G0025079) Klhl23 (MGP_PahariEiJ_G0025080) MGP_PahariEiJ_G0025081 Mettl5 (MGP_PahariEiJ_G0025082) MGP_PahariEiJ_G0025083 Myo3b (MGP_PahariEiJ_G0025084) Sp5 (MGP_PahariEiJ_G0025085) Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000154224.a ENSGT00950000183072.b.b ENSGT00940000156609 ENSGT00390000005979.b ENSGT00940000154224.b ENSGT00940000161368 ENSGT00960000186726 ENSGT00940000162042 ENSGT00530000064954 ENSGT00530000063779.A ENSGT00940000156219 ENSGT00940000154621.a.a ENSGT01030000234515.a.a.b ENSGT00510000048120 ENSGT00390000002220 ENSGT00950000183150.a.b ##22 ENSGT00940000157564 ENSGT00940000158665 ENSGT00940000157232 ENSGT00390000002753 ENSGT00940000158859 ENSGT01030000234607.B ENSGT00940000157954 ENSGT00730000111149 ENSGT00390000007741.b ENSGT00940000159106 ENSGT00830000128380 ENSGT00390000000227.h ENSGT00950000183075.a.b ENSGT00940000159309 ENSGT00940000160673 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000157130 ENSGT00940000154224.a ENSGT00950000183072.b.b ENSGT00940000156609 ENSGT00390000005979.b ENSGT00940000154224.b ENSGT00940000161368 ENSGT00960000186726 ENSGT00940000162042 ENSGT00530000063779.A ENSGT00940000156219 ENSGT00940000154621.a.a ENSGT01030000234515.a.a.b ENSGT00510000048120 ENSGT00390000002220 ENSGT00950000183150.a.b ##22 ENSGT00940000157564 ENSGT00940000158665 ENSGT00940000157232 ENSGT00390000002753 ENSGT00940000158859 ENSGT01030000234607.B ENSGT00940000157954 ENSGT00730000111149 ENSGT00390000007741.b ENSGT00940000159106 ENSGT00830000128380 ENSGT00390000000227.h ENSGT00950000183075.a.b ENSGT00940000159309 ENSGT00940000160673 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000157782 ENSGT00940000157130 ENSGT00940000154224.a ENSGT00950000183072.b.b ENSGT00940000156609 ENSGT00390000005979.b ENSGT00940000154224.b ENSGT00940000161368 ENSGT00940000162042 ENSGT00530000063779.A ENSGT00940000156219 ENSGT00940000154621.a.a ENSGT01030000234515.a.a.b ENSGT00510000048120 ENSGT00390000002220 ENSGT00950000183150.a.b ##22 ENSGT00940000157564 ENSGT00940000158665 ENSGT00940000157232 ENSGT00390000002753 ENSGT00940000158859 ENSGT01030000234607.B ENSGT00940000157954 ENSGT00730000111149 ENSGT00390000007741.b ENSGT00940000159106 ENSGT00830000128380 ENSGT00390000000227.h ENSGT00950000183075.a.b ENSGT00940000159309 ENSGT00940000160673 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000157782 ENSGT00940000157130 ENSGT00940000154224.a ENSGT00950000183072.b.b ENSGT00940000156609 ENSGT00390000005979.b ENSGT00940000154224.b ENSGT00940000161368 ENSGT00940000162042 ENSGT00530000063779.A ENSGT00940000156219 ENSGT00940000154621.a.a ENSGT01030000234515.a.a.b ENSGT00510000048120 ENSGT00390000002220 ENSGT00950000183150.a.b ##22 ENSGT00940000157564 ENSGT00940000158665 ENSGT00940000157232 ENSGT00390000002753 ENSGT00940000158859 ENSGT01030000234607.B ENSGT00940000157954 ENSGT00730000111149 ENSGT00390000007741.b ENSGT00940000159106 ENSGT00830000128380 ENSGT00390000000227.h ENSGT00950000183075.a.b ENSGT00940000159309 ENSGT00940000160673 Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 156 SLC38A11 (ENSCLAG00000002390) SCN3A (ENSCLAG00000005437) SCN2A (ENSCLAG00000003780) CSRNP3 (ENSCLAG00000003503) GALNT3 (ENSCLAG00000003904) TTC21B (ENSCLAG00000002585) SCN1A (ENSCLAG00000003667) SCN9A (ENSCLAG00000003743) SCN7A (ENSCLAG00000003279) XIRP2 (ENSCLAG00000002839) B3GALT1 (ENSCLAG00000002732) STK39 (ENSCLAG00000002655) CERS6 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(ENSODEG00000011580) ENSODEG00000010185 METTL5 (ENSODEG00000010402) ENSODEG00000019791 Guinea pig MODERN SPECIES 3 SLC38A11 (ENSCPOG00000012437) SCN3A (ENSCPOG00000004367) SCN2A (ENSCPOG00000002692) CSRNP3 (ENSCPOG00000031306) GALNT3 (ENSCPOG00000000034) TTC21B (ENSCPOG00000030764) SCN1A (ENSCPOG00000002666) SCN9A (ENSCPOG00000013017) SCN7A (ENSCPOG00000014210) XIRP2 (ENSCPOG00000013625) B3GALT1 (ENSCPOG00000037694) STK39 (ENSCPOG00000013574) CERS6 (ENSCPOG00000006353) NOSTRIN (ENSCPOG00000005917) SPC25 (ENSCPOG00000005926) G6PC2 (ENSCPOG00000020713) ##22 ABCB11 (ENSCPOG00000005935) DHRS9 (ENSCPOG00000005946) ENSCPOG00000036279 BBS5 (ENSCPOG00000004965) KLHL41 (ENSCPOG00000004968) FASTKD1 (ENSCPOG00000004972) PPIG (ENSCPOG00000033985) CFAP210 (ENSCPOG00000015613) PHOSPHO2 (ENSCPOG00000026577) KLHL23 (ENSCPOG00000007544) SSB (ENSCPOG00000003338) METTL5 (ENSCPOG00000038464) UBR3 (ENSCPOG00000005284) MYO3B (ENSCPOG00000039650) SP5 (ENSCPOG00000031622) Naked mole-rat female MODERN SPECIES 22 SCN1A (ENSHGLG00000008308) ENSHGLG00000038458 SCN9A (ENSHGLG00000006689) SCN7A (ENSHGLG00000008262) XIRP2 (ENSHGLG00000010607) B3GALT1 (ENSHGLG00000046287) ENSHGLG00000003999 STK39 (ENSHGLG00000004279) ENSHGLG00000006827 ENSHGLG00000050746 CERS6 (ENSHGLG00000046937) ENSHGLG00000049025 NOSTRIN (ENSHGLG00000004291) SPC25 (ENSHGLG00000004724) ENSHGLG00000011331 G6PC2 (ENSHGLG00000006936) ##22 ABCB11 (ENSHGLG00000003788) DHRS9 (ENSHGLG00000007470) LRP2 (ENSHGLG00000006508) KLHL41 (ENSHGLG00000007203) FASTKD1 (ENSHGLG00000008510) PPIG (ENSHGLG00000010757) CFAP210 (ENSHGLG00000012662) PHOSPHO2 (ENSHGLG00000048235) KLHL23 (ENSHGLG00000017566) SSB (ENSHGLG00000017580) METTL5 (ENSHGLG00000016062) UBR3 (ENSHGLG00000016142) MYO3B (ENSHGLG00000009793) SP5 (ENSHGLG00000044879) ENSHGLG00000032720 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000157130 ENSGT00940000154224.a ENSGT00950000183072.b.b ENSGT00940000156609 ENSGT00390000005979.b ENSGT00940000154224.b ENSGT00940000161368 ENSGT00940000162042 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ENSGT00940000157954 ENSGT00730000111149 ENSGT00390000007741.b ENSGT00940000159106 ENSGT00830000128380 ENSGT00390000000227.h ENSGT00950000183075.a.b ENSGT00940000159309 ENSGT00940000160673 Alpin marmot MODERN SPECIES 5 SCN3A (ENSMMMG00000023103) SCN2A (ENSMMMG00000023120) CSRNP3 (ENSMMMG00000023157) GALNT3 (ENSMMMG00000023162) TTC21B (ENSMMMG00000023166) SCN1A (ENSMMMG00000023199) SCN9A (ENSMMMG00000023238) SCN7A (ENSMMMG00000023276) ENSMMMG00000023290 XIRP2 (ENSMMMG00000023302) B3GALT1 (ENSMMMG00000023336) STK39 (ENSMMMG00000023347) CERS6 (ENSMMMG00000023452) NOSTRIN (ENSMMMG00000023455) SPC25 (ENSMMMG00000023459) G6PC2 (ENSMMMG00000023464) ##22 ABCB11 (ENSMMMG00000023466) DHRS9 (ENSMMMG00000023477) LRP2 (ENSMMMG00000023480) BBS5 (ENSMMMG00000023488) KLHL41 (ENSMMMG00000023505) FASTKD1 (ENSMMMG00000023508) PPIG (ENSMMMG00000023511) CFAP210 (ENSMMMG00000023522) PHOSPHO2 (ENSMMMG00000023527) KLHL23 (ENSMMMG00000023528) SSB (ENSMMMG00000023530) METTL5 (ENSMMMG00000023538) UBR3 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(ENSSTOG00000005970) SCN7A (ENSSTOG00000011072) XIRP2 (ENSSTOG00000020530) B3GALT1 (ENSSTOG00000014885) STK39 (ENSSTOG00000013680) CERS6 (ENSSTOG00000007384) NOSTRIN (ENSSTOG00000007406) SPC25 (ENSSTOG00000007433) G6PC2 (ENSSTOG00000007441) ##22 ABCB11 (ENSSTOG00000007463) DHRS9 (ENSSTOG00000009896) LRP2 (ENSSTOG00000009904) ENSSTOG00000019847 ARRDC3 (ENSSTOG00000020450) ENSSTOG00000031315 ENSSTOG00000034589 LYSMD3 (ENSSTOG00000008678) ENSSTOG00000008664 MBLAC2 (ENSSTOG00000023398) CETN3 (ENSSTOG00000012271) MEF2C (ENSSTOG00000001883) ENSSTOG00000011141 CCNH (ENSSTOG00000000659) RASA1 (ENSSTOG00000000649) Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 69 ENSUPAG00010009247 B3GALT1 (ENSUPAG00010009257) STK39 (ENSUPAG00010009262) CERS6 (ENSUPAG00010009291) NOSTRIN (ENSUPAG00010009336) SPC25 (ENSUPAG00010009355) G6PC2 (ENSUPAG00010009373) ##22 ABCB11 (ENSUPAG00010009397) DHRS9 (ENSUPAG00010009511) ENSUPAG00010009516 ENSUPAG00010009561 KLHL41 (ENSUPAG00010009602) FASTKD1 (ENSUPAG00010009622) PPIG 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(ENSSVLG00005023680) UBR3 (ENSSVLG00005023774) MYO3B (ENSSVLG00005024087) SP5 (ENSSVLG00005024348) Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000156609 ENSGT00390000005979.b ENSGT00940000154224.b ENSGT00960000186726 ENSGT00940000161368 ENSGT00940000162042 ENSGT00530000064954 ENSGT00530000063779.A ENSGT00940000156219 ENSGT00900000143463 ENSGT00940000154621.a.a ENSGT01030000234515.a.a.b ENSGT00910000147933 ENSGT00510000048120 ENSGT00390000002220 ENSGT00950000183150.a.b ##22 ENSGT00940000157564 ENSGT00940000158665 ENSGT00940000157232 ENSGT00390000002753 ENSGT00940000158859 ENSGT01030000234607.B ENSGT00940000157954 ENSGT00730000111149 ENSGT00390000007741.b ENSGT00940000159106 ENSGT00830000128380 ENSGT00390000000227 ENSGT00950000183075.a.b ENSGT00940000176165 ENSGT00940000159309 Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES 57 ENSGT01030000234515.a.a.b ENSGT00510000048120 ENSGT00390000002220 ENSGT00950000183150.a.b ##22 ENSGT00940000157564 ENSGT00940000158665 ENSGT00940000157232 Common shrew MODERN SPECIES 3663 G6PC2 (ENSSARG00000001402) ##22 ABCB11 (ENSSARG00000001408) Hedgehog MODERN SPECIES 5525 NOSTRIN (ENSEEUG00000008436) SPC25 (ENSEEUG00000008725) ENSEEUG00000008827 ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00950000183072.b.b ENSGT00940000156609 ENSGT00390000005979.b ENSGT00940000154224.b ENSGT00940000161368 ENSGT00940000162042 ENSGT00530000064954 ENSGT00530000063779.A ENSGT00940000156219 ENSGT00900000143463 ENSGT00940000154621.a.a ENSGT01030000234515.a.a.b ENSGT00910000147933 ENSGT00510000048120 ENSGT00390000002220 ENSGT00950000183150.a.b ##22 ENSGT00940000157564 ENSGT00940000158665 ENSGT00940000157232 ENSGT00390000002753 ENSGT00940000158859 ENSGT01030000234607.B ENSGT00940000157954 ENSGT00730000111149 ENSGT00390000007741.b ENSGT00940000159106 ENSGT00830000128380 ENSGT00390000000227 ENSGT00950000183075.a.b ENSGT00940000176165 ENSGT00940000159309 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00950000183072.b.b ENSGT00940000156609 ENSGT00390000005979.b ENSGT00940000154224.b ENSGT00960000186726 ENSGT00940000161368 ENSGT00940000162042 ENSGT00530000064954 ENSGT00530000063779.A ENSGT00940000156219 ENSGT00900000143463 ENSGT00940000154621.a.a ENSGT01030000234515.a.a.b ENSGT00510000048120 ENSGT00390000002220 ENSGT00950000183150.a.b ##22 ENSGT00940000157564 ENSGT00940000158665 ENSGT00940000157232 ENSGT00390000002753 ENSGT00940000158859 ENSGT01030000234607.B ENSGT00940000157954 ENSGT00730000111149 ENSGT00390000007741.b ENSGT00940000159106 ENSGT00830000128380 ENSGT00390000000227 ENSGT00950000183075.a.b ENSGT00940000176165 ENSGT00940000159309 Carnivora ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000154224.a ENSGT00950000183072.b.b ENSGT00940000156609 ENSGT00390000005979.b ENSGT00940000154224.b ENSGT00940000161368 ENSGT00940000162042 ENSGT00530000064954 ENSGT00530000063779.A ENSGT00940000156219 ENSGT00900000143463 ENSGT00940000154621.a.a ENSGT01030000234515.a.a.b ENSGT00510000048120 ENSGT00390000002220 ENSGT00950000183150.a.b ##22 ENSGT00940000157564 ENSGT00940000158665 ENSGT00940000157232 ENSGT00390000002753 ENSGT00940000158859 ENSGT01030000234607.B ENSGT00940000157954 ENSGT00730000111149 ENSGT00390000007741.b ENSGT00940000159106 ENSGT00830000128380 ENSGT00390000000227 ENSGT00950000183075.a.b ENSGT00940000176165 ENSGT00940000159309 Caniformia ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00960000186726 ENSGT00950000183072.b.b ENSGT00940000156609 ENSGT00390000005979.b ENSGT00940000154224.b ENSGT00940000161368 ENSGT00940000162042 ENSGT00530000064954 ENSGT00530000063779.A ENSGT00940000156219 ENSGT00900000143463 ENSGT00940000154621.a.a ENSGT01030000234515.a.a.b ENSGT00510000048120 ENSGT00390000002220 ENSGT00950000183150.a.b ##22 ENSGT00940000157564 ENSGT00940000158665 ENSGT00940000157232 ENSGT00390000002753 ENSGT00940000158859 ENSGT01030000234607.B ENSGT00940000157954 ENSGT00730000111149 ENSGT00390000007741.b ENSGT00940000159106 ENSGT00830000128380 ENSGT00390000000227 ENSGT00950000183075.a.b ENSGT00940000176165 ENSGT00940000159309 Canidae ANCESTRAL SPECIES 45 ENSGT00940000157130 ENSGT00940000154224.a ENSGT00960000186726 ENSGT00950000183072.b.b ENSGT00940000156609 ENSGT00390000005979.b ENSGT00940000154224.b ENSGT00940000161368 ENSGT00940000162042 ENSGT00530000063779.A ENSGT00940000156219 ENSGT00940000154621.a.a ENSGT01030000234515.a.a.b ENSGT00510000048120 ENSGT00390000002220 ENSGT00950000183150.a.b ##22 ENSGT00940000157564 ENSGT00940000158665 ENSGT00940000157232 ENSGT00390000002753 ENSGT00940000158859 ENSGT01030000234607.B ENSGT00940000157954 ENSGT00730000111149 ENSGT00390000007741.b ENSGT00940000159106 ENSGT00830000128380 ENSGT00390000000227 ENSGT00950000183075.a.b ENSGT00940000159309 ENSGT00940000160673 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 39 ENSGT00940000157130 ENSGT00940000154224.a ENSGT00960000186726 ENSGT00950000183072.b.b ENSGT00940000156609 ENSGT00390000005979.b ENSGT00940000154224.b ENSGT00940000161368 ENSGT00940000162042 ENSGT00530000063779.A ENSGT00940000156219 ENSGT00940000154621.a.a ENSGT01030000234515.a.a.b ENSGT00510000048120 ENSGT00390000002220 ENSGT00950000183150.a.b ##22 ENSGT00940000157564 ENSGT00940000158665 ENSGT00940000157232 ENSGT00390000016333.q ENSGT00390000002753 ENSGT00940000158859 ENSGT01030000234607.B ENSGT00940000157954 ENSGT00730000111149 ENSGT00390000007741.b ENSGT00940000159106 ENSGT00830000128380 ENSGT00390000000227 ENSGT00950000183075.a.b ENSGT00940000159309 Dingo MODERN SPECIES 339 ENSCAFG00020000659 TTC21B (ENSCAFG00020000674) ENSCAFG00020000687 ENSCAFG00020000829 ENSCAFG00020001266 SCN9A (ENSCAFG00020001333) SCN7A (ENSCAFG00020001913) XIRP2 (ENSCAFG00020001970) B3GALT1 (ENSCAFG00020002091) ENSCAFG00020002108 ENSCAFG00020002266 CERS6 (ENSCAFG00020002306) NOSTRIN (ENSCAFG00020002311) SPC25 (ENSCAFG00020002326) G6PC2 (ENSCAFG00020002328) ##22 ABCB11 (ENSCAFG00020002351) ENSCAFG00020002434 DHRS9 (ENSCAFG00020002437) LRP2 (ENSCAFG00020002453) ENSCAFG00020002802 BBS5 (ENSCAFG00020002805) KLHL41 (ENSCAFG00020002823) FASTKD1 (ENSCAFG00020002841) PPIG (ENSCAFG00020002848) 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MODERN SPECIES 15 SCN2A (ENSVVUG00000017010) CSRNP3 (ENSVVUG00000017006) GALNT3 (ENSVVUG00000016983) TTC21B (ENSVVUG00000016961) ENSVVUG00000016952 SCN1A (ENSVVUG00000016933) SCN9A (ENSVVUG00000016916) SCN7A (ENSVVUG00000016900) ENSVVUG00000016892 ENSVVUG00000016812 B3GALT1 (ENSVVUG00000016791) STK39 (ENSVVUG00000016764) CERS6 (ENSVVUG00000016728) NOSTRIN (ENSVVUG00000016717) SPC25 (ENSVVUG00000016713) G6PC2 (ENSVVUG00000016709) ##22 ABCB11 (ENSVVUG00000016706) DHRS9 (ENSVVUG00000016699) LRP2 (ENSVVUG00000016655) BBS5 (ENSVVUG00000016633) FASTKD1 (ENSVVUG00000016627) PPIG (ENSVVUG00000016610) CCDC173 (ENSVVUG00000016602) ENSVVUG00000016595 KLHL23 (ENSVVUG00000016586) SSB (ENSVVUG00000016573) METTL5 (ENSVVUG00000016567) UBR3 (ENSVVUG00000016563) MYO3B (ENSVVUG00000015905) ENSVVUG00000015834 ERICH2 (ENSVVUG00000015798) Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00950000183072.b.b ENSGT00940000156609 ENSGT00390000005979.b ENSGT00960000186726 ENSGT00940000154224.b ENSGT00940000161368 ENSGT00940000162042 ENSGT00530000064954 ENSGT00530000063779.A ENSGT00940000156219 ENSGT00900000143463 ENSGT00940000154621.a.a ENSGT01030000234515.a.a.b ENSGT00510000048120 ENSGT00390000002220 ENSGT00950000183150.a.b ##22 ENSGT00940000157564 ENSGT00940000158665 ENSGT00940000157232 ENSGT00960000190149 ENSGT00390000002753 ENSGT00940000158859 ENSGT01030000234607.B ENSGT00940000157954 ENSGT00730000111149 ENSGT00390000007741.b ENSGT00940000159106 ENSGT00830000128380 ENSGT00390000000227 ENSGT00950000183075.a.b ENSGT00940000176165 Ursidae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000154224.a ENSGT00950000183072.b.b ENSGT00940000156609 ENSGT00390000005979.b ENSGT00960000186726 ENSGT00940000154224.b ENSGT00940000161368 ENSGT00940000162042 ENSGT00530000064954 ENSGT00530000063779.A ENSGT00940000156219 ENSGT00940000154621.a.a ENSGT01030000234515.a.a.b ENSGT00510000048120 ENSGT00390000002220 ENSGT00950000183150.a.b ##22 ENSGT00940000157564 ENSGT00940000158665 ENSGT00940000157232 ENSGT00960000190149 ENSGT00390000002753 ENSGT00940000158859 ENSGT01030000234607.B ENSGT00940000157954 ENSGT00730000111149 ENSGT00390000007741.b ENSGT00940000159106 ENSGT00830000128380 ENSGT00390000000227 ENSGT00950000183075.a.b ENSGT00940000159309 Ursus ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000154224.a ENSGT00950000183072.b.b ENSGT00940000156609 ENSGT00390000005979.b ENSGT00960000186726 ENSGT00940000154224.b ENSGT00940000161368 ENSGT00940000162042 ENSGT00530000064954 ENSGT00530000063779.A ENSGT00940000156219 ENSGT00940000154621.a.a ENSGT01030000234515.a.a.b ENSGT00510000048120 ENSGT00390000002220 ENSGT00950000183150.a.b ##22 ENSGT00940000157564 ENSGT00940000158665 ENSGT00940000157232 ENSGT00960000190149 ENSGT00390000002753 ENSGT00940000158859 ENSGT01030000234607.B ENSGT00940000157954 ENSGT00730000111149 ENSGT00390000007741.b ENSGT00940000159106 ENSGT00830000128380 ENSGT00390000000227 ENSGT00950000183075.a.b ENSGT00940000159309 American black bear DUPLICATION American black bear DUPLICATION American black bear MODERN SPECIES 820 ENSUAMG00000019275 ##22 ABCB11 (ENSUAMG00000019274) DHRS9 (ENSUAMG00000019273) LRP2 (ENSUAMG00000019021) ENSUAMG00000019001 ENSUAMG00000019000 ENSUAMG00000018998 KLHL41 (ENSUAMG00000018997) FASTKD1 (ENSUAMG00000018993) ENSUAMG00000018990 ENSUAMG00000018987 ENSUAMG00000018986 American black bear MODERN SPECIES 8675 ENSUAMG00000003272 ##22 American black bear MODERN SPECIES 8597 ENSUAMG00000002658 ##22 Polar bear MODERN SPECIES 142 CSRNP3 (ENSUMAG00000012956) GALNT3 (ENSUMAG00000012964) TTC21B (ENSUMAG00000012992) ENSUMAG00000013018 ENSUMAG00000013020 ENSUMAG00000013050 SCN9A (ENSUMAG00000013160) SCN7A (ENSUMAG00000013410) ENSUMAG00000013477 XIRP2 (ENSUMAG00000013497) B3GALT1 (ENSUMAG00000013562) STK39 (ENSUMAG00000013582) CERS6 (ENSUMAG00000013593) NOSTRIN (ENSUMAG00000013615) SPC25 (ENSUMAG00000013621) G6PC2 (ENSUMAG00000013624) ##22 ABCB11 (ENSUMAG00000013635) DHRS9 (ENSUMAG00000013694) ENSUMAG00000013704 ENSUMAG00000013713 ENSUMAG00000013746 BBS5 (ENSUMAG00000013778) KLHL41 (ENSUMAG00000013791) FASTKD1 (ENSUMAG00000013794) PPIG (ENSUMAG00000013799) CFAP210 (ENSUMAG00000013893) KLHL23 (ENSUMAG00000013904) SSB (ENSUMAG00000013907) METTL5 (ENSUMAG00000013916) UBR3 (ENSUMAG00000013956) MYO3B (ENSUMAG00000014257) Giant Panda MODERN SPECIES 11 SLC38A11 (ENSAMEG00000018027) SCN3A (ENSAMEG00000002310) SCN2A (ENSAMEG00000002426) CSRNP3 (ENSAMEG00000002546) GALNT3 (ENSAMEG00000002550) TTC21B (ENSAMEG00000015663) SCN1A (ENSAMEG00000015558) SCN9A (ENSAMEG00000015522) SCN7A (ENSAMEG00000001312) XIRP2 (ENSAMEG00000001296) B3GALT1 (ENSAMEG00000018570) STK39 (ENSAMEG00000010927) CERS6 (ENSAMEG00000010903) NOSTRIN (ENSAMEG00000010880) SPC25 (ENSAMEG00000010875) G6PC2 (ENSAMEG00000010863) ##22 ABCB11 (ENSAMEG00000010784) DHRS9 (ENSAMEG00000010770) ENSAMEG00000010654 ENSAMEG00000031108 BBS5 (ENSAMEG00000010645) KLHL41 (ENSAMEG00000010622) FASTKD1 (ENSAMEG00000010599) PPIG (ENSAMEG00000010574) CFAP210 (ENSAMEG00000010564) KLHL23 (ENSAMEG00000010557) SSB (ENSAMEG00000010507) METTL5 (ENSAMEG00000010504) UBR3 (ENSAMEG00000010475) MYO3B (ENSAMEG00000010422) SP5 (ENSAMEG00000029346) Mustelinae ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000157130 ENSGT00940000154224.a ENSGT00950000183072.b.b ENSGT00940000156609 ENSGT00390000005979.b ENSGT00940000154224.b ENSGT00940000161368 ENSGT00940000162042 ENSGT00530000063779.A ENSGT00940000156219 ENSGT00900000143463 ENSGT00940000154621.a.a ENSGT01030000234515.a.a.b ENSGT00510000048120 ENSGT00390000002220 ENSGT00950000183150.a.b ##22 ENSGT00940000157564 ENSGT00940000158665 ENSGT00940000157232 ENSGT00960000190149 ENSGT00390000002753 ENSGT00940000158859 ENSGT01030000234607.B ENSGT00940000157954 ENSGT00730000111149 ENSGT00390000007741.b ENSGT00940000159106 ENSGT00830000128380 ENSGT00390000000227 ENSGT00950000183075.a.b ENSGT00940000176165 American mink MODERN SPECIES 106 SCN9A (ENSNVIG00000004287) ENSNVIG00000004698 SCN7A (ENSNVIG00000004718) ENSNVIG00000004768 XIRP2 (ENSNVIG00000004825) B3GT1 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ENSGT00510000048120 ENSGT00390000002220 ENSGT00950000183150.a.b ##22 ENSGT00940000157564 ENSGT00940000158665 ENSGT00940000157232 ENSGT00390000002753 ENSGT00940000158859 ENSGT01030000234607.B ENSGT00940000157954 ENSGT00730000111149 ENSGT00390000007741.b ENSGT00940000159106 ENSGT00830000128380 ENSGT00390000000227 ENSGT00950000183075.a.b ENSGT00940000159309 ENSGT00940000160673 lion MODERN SPECIES 8 SCN2A (ENSPLOG00000010658) CSRNP3 (ENSPLOG00000010387) GALNT3 (ENSPLOG00000010336) TTC21B (ENSPLOG00000010285) SCN1A (ENSPLOG00000009351) ENSPLOG00000009085 ENSPLOG00000008924 SCN7A (ENSPLOG00000008516) XIRP2 (ENSPLOG00000008175) B3GALT1 (ENSPLOG00000008125) ENSPLOG00000008104 STK39 (ENSPLOG00000007992) CERS6 (ENSPLOG00000007790) NOSTRIN (ENSPLOG00000007722) SPC25 (ENSPLOG00000007688) G6PC2 (ENSPLOG00000007623) ##22 ABCB11 (ENSPLOG00000007524) DHRS9 (ENSPLOG00000022717) LRP2 (ENSPLOG00000022711) ENSPLOG00000022708 ENSPLOG00000022706 BBS5 (ENSPLOG00000022701) KLHL41 (ENSPLOG00000022698) FASTKD1 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METTL5 (ENSPPRG00000006367) UBR3 (ENSPPRG00000005856) Cat MODERN SPECIES 239 ENSFCAG00000044163 CSRNP3 (ENSFCAG00000010380) GALNT3 (ENSFCAG00000027241) TTC21B (ENSFCAG00000007863) SCN1A (ENSFCAG00000030973) SCN9A (ENSFCAG00000000647) SCN7A (ENSFCAG00000011354) XIRP2 (ENSFCAG00000024481) B3GALT1 (ENSFCAG00000002170) ENSFCAG00000044586 STK39 (ENSFCAG00000011272) CERS6 (ENSFCAG00000042308) NOSTRIN (ENSFCAG00000010646) ABCB11 (ENSFCAG00000006114) SPC25 (ENSFCAG00000010648) G6PC2 (ENSFCAG00000006113) ##22 DHRS9 (ENSFCAG00000034902) LRP2 (ENSFCAG00000006116) ENSFCAG00000032860 ENSFCAG00000047335 BBS5 (ENSFCAG00000039610) KLHL41 (ENSFCAG00000010291) FASTKD1 (ENSFCAG00000030802) ENSFCAG00000049950 PPIG (ENSFCAG00000043864) CFAP210 (ENSFCAG00000025828) PHOSPHO2 (ENSFCAG00000025908) KLHL23 (ENSFCAG00000011599) METTL5 (ENSFCAG00000023880) SSB (ENSFCAG00000011601) UBR3 (ENSFCAG00000031648) Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000154224.a ENSGT00950000183072.b.b ENSGT00940000156609 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SPECIES 942 ENSMLUG00000023095 SCN2A (ENSMLUG00000004750) CSRNP3 (ENSMLUG00000004777) GALNT3 (ENSMLUG00000004782) TTC21B (ENSMLUG00000004790) SCN1A (ENSMLUG00000009631) SCN9A (ENSMLUG00000009695) SCN7A (ENSMLUG00000009778) ENSMLUG00000029827 XIRP2 (ENSMLUG00000000873) B3GALT1 (ENSMLUG00000013733) STK39 (ENSMLUG00000013105) CERS6 (ENSMLUG00000013118) NOSTRIN (ENSMLUG00000013124) SPC25 (ENSMLUG00000013138) G6PC2 (ENSMLUG00000028970) ##22 ENSMLUG00000013144 DHRS9 (ENSMLUG00000009548) LRP2 (ENSMLUG00000009562) ENSMLUG00000024075 BBS5 (ENSMLUG00000003551) KLHL41 (ENSMLUG00000003558) FASTKD1 (ENSMLUG00000003567) PPIG (ENSMLUG00000030696) CFAP210 (ENSMLUG00000013114) PHOSPHO2 (ENSMLUG00000023795) KLHL23 (ENSMLUG00000022808) SSB (ENSMLUG00000016316) METTL5 (ENSMLUG00000028748) UBR3 (ENSMLUG00000012909) MYO3B (ENSMLUG00000009957) Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 26 SCN3A (ENSRFEG00010004586) SCN2A (ENSRFEG00010004518) CSRNP3 (ENSRFEG00010004479) GALNT3 (ENSRFEG00010004451) TTC21B 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ENSGT00940000154224.b ENSGT00940000161368 ENSGT00940000162042 ENSGT00530000063779.A ENSGT00940000156219 ENSGT00940000154621.a.a ENSGT01030000234515.a.a.b ENSGT00510000048120 ENSGT00390000002220 ENSGT00950000183150.a.b ##22 ENSGT00940000157564 ENSGT00940000158665 ENSGT00940000157232 ENSGT00390000002753 ENSGT00940000158859 ENSGT01030000234607.B ENSGT00940000157954 ENSGT00730000111149 ENSGT00390000007741.b ENSGT00940000159106 ENSGT00830000128380 ENSGT00390000000227 ENSGT00950000183075.a.b ENSGT00940000159309 ENSGT00940000160673 Donkey MODERN SPECIES 24 SLC38A11 (ENSEASG00005022950) SCN3A (ENSEASG00005022947) SCN2A (ENSEASG00005022945) CSRNP3 (ENSEASG00005022944) GALNT3 (ENSEASG00005022941) TTC21B (ENSEASG00005022931) SCN1A (ENSEASG00005022921) SCN9A (ENSEASG00005022916) SCN7A (ENSEASG00005022905) XIRP2 (ENSEASG00005022893) B3GALT1 (ENSEASG00005036225) STK39 (ENSEASG00005022885) CERS6 (ENSEASG00005022882) NOSTRIN (ENSEASG00005022877) SPC25 (ENSEASG00005022875) G6PC2 (ENSEASG00005022872) ##22 ABCB11 (ENSEASG00005022866) DHRS9 (ENSEASG00005022861) LRP2 (ENSEASG00005022851) BBS5 (ENSEASG00005022847) ENSEASG00005032038 KLHL41 (ENSEASG00005022846) FASTKD1 (ENSEASG00005022845) PPIG (ENSEASG00005022843) CFAP210 (ENSEASG00005022841) PHOSPHO2 (ENSEASG00005022840) KLHL23 (ENSEASG00005022838) SSB (ENSEASG00005022835) METTL5 (ENSEASG00005022833) UBR3 (ENSEASG00005022772) MYO3B (ENSEASG00005022728) Horse MODERN SPECIES 9 CSRNP3 (ENSECAG00000002782) GALNT3 (ENSECAG00000007974) TTC21B (ENSECAG00000019898) SCN1A (ENSECAG00000015359) SCN9A (ENSECAG00000022007) SCN7A (ENSECAG00000014625) ENSECAG00000055719 ENSECAG00000053041 XIRP2 (ENSECAG00000002596) B3GALT1 (ENSECAG00000002755) ENSECAG00000056809 STK39 (ENSECAG00000014475) CERS6 (ENSECAG00000019549) NOSTRIN (ENSECAG00000020088) SPC25 (ENSECAG00000024519) G6PC2 (ENSECAG00000010214) ##22 ABCB11 (ENSECAG00000015291) LRP2 (ENSECAG00000000435) DHRS9 (ENSECAG00000023566) BBS5 (ENSECAG00000007520) KLHL41 (ENSECAG00000015659) ENSECAG00000045606 FASTKD1 (ENSECAG00000020558) PPIG (ENSECAG00000018538) CFAP210 (ENSECAG00000016815) PHOSPHO2 (ENSECAG00000031680) KLHL23 (ENSECAG00000018323) SSB (ENSECAG00000018495) METTL5 (ENSECAG00000004756) UBR3 (ENSECAG00000006675) MYO3B (ENSECAG00000000293) Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00950000183072.b.b ENSGT00940000156609 ENSGT00390000005979.b ENSGT00940000154224.b ENSGT00940000161368 ENSGT00940000162042 ENSGT00530000064954 ENSGT00530000063779.A ENSGT00940000156219 ENSGT00900000143463 ENSGT00940000154621.a.a ENSGT01030000234515.a.a.b ENSGT00910000147933 ENSGT00510000048120 ENSGT00390000002220 ENSGT00950000183150.a.b ##22 ENSGT00940000157564 ENSGT00940000158665 ENSGT00940000157232 ENSGT00390000002753 ENSGT00940000158859 ENSGT01030000234607.B ENSGT00940000157954 ENSGT00730000111149 ENSGT00390000007741.b ENSGT00940000159106 ENSGT00830000128380 ENSGT00390000000227 ENSGT00950000183075.a.b ENSGT00940000159309 ENSGT00940000160673 Suina ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000154224.a ENSGT00950000183072.b.b ENSGT00940000156609 ENSGT00390000005979.b ENSGT00940000154224.b ENSGT00960000186726 ENSGT00940000161368 ENSGT00940000162042 ENSGT00530000063779.A ENSGT00940000156219 ENSGT00900000143463 ENSGT00940000154621.a.a ENSGT01030000234515.a.a.b ENSGT00510000048120 ENSGT00390000002220 ENSGT00950000183150.a.b ##22 ENSGT00940000157564 ENSGT00940000158665 ENSGT00940000157232 ENSGT00390000002753 ENSGT00940000158859 ENSGT01030000234607.B ENSGT00940000157954 ENSGT00730000111149 ENSGT00390000007741.b ENSGT00940000159106 ENSGT00830000128380 ENSGT00390000000227 ENSGT00950000183075.a.b ENSGT01070000257234 ENSGT00940000159309 Chacoan peccary MODERN SPECIES 88 SCN2A (ENSCWAG00000002890) CSRNP3 (ENSCWAG00000003057) GALNT3 (ENSCWAG00000003082) TTC21B (ENSCWAG00000003132) SCN1A (ENSCWAG00000003259) SCN9A (ENSCWAG00000004273) SCN7A (ENSCWAG00000005546) XIRP2 (ENSCWAG00000006027) ENSCWAG00000006263 B3GALT1 (ENSCWAG00000006279) ENSCWAG00000006291 STK39 (ENSCWAG00000006303) CERS6 (ENSCWAG00000006386) NOSTRIN (ENSCWAG00000006529) SPC25 (ENSCWAG00000006568) G6PC2 (ENSCWAG00000006621) ##22 ABCB11 (ENSCWAG00000006701) DHRS9 (ENSCWAG00000006851) LRP2 (ENSCWAG00000006936) BBS5 (ENSCWAG00000007259) KLHL41 (ENSCWAG00000007307) FASTKD1 (ENSCWAG00000007352) PPIG (ENSCWAG00000007392) CFAP210 (ENSCWAG00000007449) PHOSPHO2 (ENSCWAG00000007499) KLHL23 (ENSCWAG00000007513) SSB (ENSCWAG00000007539) METTL5 (ENSCWAG00000007575) UBR3 (ENSCWAG00000007648) ENSCWAG00000007684 MYO3B (ENSCWAG00000007745) Pig MODERN SPECIES 6 GALNT3 (ENSSSCG00000015907) TTC21B (ENSSSCG00000015908) SCN1A (ENSSSCG00000024204) ENSSSCG00000059899 SCN9A (ENSSSCG00000015913) SCN7A (ENSSSCG00000015914) ENSSSCG00000061960 XIRP2 (ENSSSCG00000015917) ENSSSCG00000048880 B3GALT1 (ENSSSCG00000034351) ENSSSCG00000036153 STK39 (ENSSSCG00000022496) CERS6 (ENSSSCG00000032715) NOSTRIN (ENSSSCG00000015923) SPC25 (ENSSSCG00000015924) G6PC2 (ENSSSCG00000015925) ##22 ABCB11 (ENSSSCG00000015926) DHRS9 (ENSSSCG00000015930) LRP2 (ENSSSCG00000040746) BBS5 (ENSSSCG00000015931) KLHL41 (ENSSSCG00000057938) FASTKD1 (ENSSSCG00000015933) PPIG (ENSSSCG00000031123) CFAP210 (ENSSSCG00000015935) PHOSPHO2 (ENSSSCG00000015936) KLHL23 (ENSSSCG00000015937) SSB (ENSSSCG00000015938) METTL5 (ENSSSCG00000028458) UBR3 (ENSSSCG00000015940) ENSSSCG00000057710 MYO3B (ENSSSCG00000032177) Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00950000183072.b.b ENSGT00940000156609 ENSGT00390000005979.b ENSGT00940000154224.b ENSGT00940000161368 ENSGT00940000162042 ENSGT00530000064954 ENSGT00530000063779.A ENSGT00940000156219 ENSGT00900000143463 ENSGT00940000154621.a.a ENSGT01030000234515.a.a.b ENSGT00910000147933 ENSGT00510000048120 ENSGT00390000002220 ENSGT00950000183150.a.b ##22 ENSGT00940000157564 ENSGT00940000158665 ENSGT00940000157232 ENSGT00390000002753 ENSGT00940000158859 ENSGT01030000234607.B ENSGT00940000157954 ENSGT00730000111149 ENSGT00390000007741.b ENSGT00940000159106 ENSGT00830000128380 ENSGT00390000000227 ENSGT00950000183075.a.b ENSGT00940000159309 ENSGT00940000160673 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00950000183072.b.b ENSGT00940000156609 ENSGT00390000005979.b ENSGT00940000154224.b ENSGT00940000161368 ENSGT00940000162042 ENSGT00530000064954 ENSGT00530000063779.A ENSGT00940000156219 ENSGT00900000143463 ENSGT00940000154621.a.a ENSGT01030000234515.a.a.b ENSGT00910000147933 ENSGT00510000048120 ENSGT00390000002220 ENSGT00950000183150.a.b ##22 ENSGT00940000157564 ENSGT00940000158665 ENSGT00940000157232 ENSGT00390000002753 ENSGT00940000158859 ENSGT01030000234607.B ENSGT00940000157954 ENSGT00730000111149 ENSGT00390000007741.b ENSGT00940000159106 ENSGT00830000128380 ENSGT00390000000227 ENSGT00950000183075.a.b ENSGT00940000159309 ENSGT00940000160673 Cetacea ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000154224.a ENSGT00390000005569.x.a.b.b.a.a ENSGT00950000183072.b.b ENSGT00940000156609 ENSGT00390000005979.b ENSGT00940000154224.b ENSGT00940000161368 ENSGT00940000162042 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ENSGT01030000234607.B ENSGT00940000157954 ENSGT00730000111149 ENSGT00390000007741.b ENSGT00940000159106 ENSGT00830000128380 ENSGT00390000000227.i.a ENSGT00390000000227.j ENSGT00950000183075.a.b ENSGT00990000204543.a Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000157130 ENSGT00940000154224.a ENSGT00950000183072.b.b ENSGT00940000156609 ENSGT00390000005979.b ENSGT00940000154224.b ENSGT00940000161368 ENSGT00940000162042 ENSGT00530000063779.A ENSGT00940000156219 ENSGT00900000143463 ENSGT00940000154621.a.a ENSGT01030000234515.a.a.b ENSGT00510000048120 ENSGT00390000002220.a ENSGT00950000183150.a.b ##22 ENSGT00940000157564 ENSGT00940000158665 ENSGT00940000157232 ENSGT00390000002753 ENSGT00940000158859 ENSGT01030000234607.B ENSGT00940000157954 ENSGT00730000111149 ENSGT00390000007741.b ENSGT00940000159106 ENSGT00830000128380 ENSGT00390000000227.i.a ENSGT00390000000227.j ENSGT00950000183075.a.b ENSGT00940000159309 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000154224.a ENSGT00950000183072.b.b 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ENSGT00940000161368 ENSGT00940000162042 ENSGT00530000063779.A ENSGT00940000156219 ENSGT00940000154621.a.a ENSGT01030000234515.a.a.b ENSGT00910000147933 ENSGT00510000048120 ENSGT00390000002220 ENSGT00950000183150.a.b ##22 ENSGT00940000157564 ENSGT00940000158665 ENSGT00940000157232 ENSGT00390000002753 ENSGT00940000158859 ENSGT01030000234607.B ENSGT00940000157954 ENSGT00730000111149 ENSGT00390000007741.b ENSGT00940000159106 ENSGT00830000128380.g ENSGT00390000000227 ENSGT00950000183075.a.b ENSGT00940000159309 ENSGT00940000160673 Goat MODERN SPECIES 11 SLC38A11 (ENSCHIG00000014139) SCN3A (ENSCHIG00000016974) SCN2A (ENSCHIG00000023553) CSRNP3 (ENSCHIG00000023391) GALNT3 (ENSCHIG00000024307) TTC21B (ENSCHIG00000027050) SCN1A (ENSCHIG00000024980) SCN9A (ENSCHIG00000020127) SCN7A (ENSCHIG00000018164) XIRP2 (ENSCHIG00000008742) B3GALT1 (ENSCHIG00000015105) STK39 (ENSCHIG00000019194) CERS6 (ENSCHIG00000026191) NOSTRIN (ENSCHIG00000012500) SPC25 (ENSCHIG00000020759) G6PC2 (ENSCHIG00000013225) ##22 ABCB11 (ENSCHIG00000021030) DHRS9 (ENSCHIG00000017969) LRP2 (ENSCHIG00000018974) BBS5 (ENSCHIG00000020516) KLHL41 (ENSCHIG00000021751) FASTKD1 (ENSCHIG00000016701) PPIG (ENSCHIG00000013589) ENSCHIG00000011012 CFAP210 (ENSCHIG00000013234) PHOSPHO2 (ENSCHIG00000003204) KLHL23 (ENSCHIG00000007109) ENSCHIG00000022624 METTL5 (ENSCHIG00000013448) UBR3 (ENSCHIG00000013985) ENSCHIG00000006320 Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 11 SCN2A (ENSOARG00020007222) CSRNP3 (ENSOARG00020007133) GALNT3 (ENSOARG00020006946) TTC21B (ENSOARG00020006665) ENSOARG00020006593 ENSOARG00020010370 XIRP2 (ENSOARG00020006458) ENSOARG00020006155 B3GALT1 (ENSOARG00020006117) ENSOARG00020006107 STK39 (ENSOARG00020006051) CERS6 (ENSOARG00020005930) ENSOARG00020005900 NOSTRIN (ENSOARG00020005730) SPC25 (ENSOARG00020005693) G6PC2 (ENSOARG00020005639) ##22 ABCB11 (ENSOARG00020005538) DHRS9 (ENSOARG00020005485) LRP2 (ENSOARG00020004893) BBS5 (ENSOARG00020004764) KLHL41 (ENSOARG00020004721) FASTKD1 (ENSOARG00020004650) PPIG (ENSOARG00020004571) CFAP210 (ENSOARG00020004520) PHOSPHO2 (ENSOARG00020004502) KLHL23 (ENSOARG00020004486) SSB (ENSOARG00020004443) METTL5 (ENSOARG00020004372) ENSOARG00020004353 UBR3 (ENSOARG00020004036) MYO3B (ENSOARG00020003534) Bovinae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000157130 ENSGT00940000154224.a ENSGT00950000183072.b.b ENSGT00940000156609 ENSGT00390000005979.b ENSGT00940000154224.b ENSGT00940000161368 ENSGT00940000162042 ENSGT00530000064954 ENSGT00530000063779.A ENSGT00940000156219 ENSGT00940000154621.a.a ENSGT01030000234515.a.a.b ENSGT00510000048120 ENSGT00390000002220 ENSGT00950000183150.a.b ##22 ENSGT00940000157564 ENSGT00940000158665 ENSGT00940000157232 ENSGT00390000002753 ENSGT00940000158859 ENSGT01030000234607.B ENSGT00940000157954 ENSGT00730000111149 ENSGT00390000007741.b ENSGT00940000159106 ENSGT00830000128380 ENSGT00390000000227 ENSGT00950000183075.a.b ENSGT00940000159309 ENSGT00940000160673 Bos ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00950000183072.b.b ENSGT00940000156609 ENSGT00390000005979.b ENSGT00940000154224.b.g ENSGT00960000186726 ENSGT00940000154224.b.h ENSGT00940000161368 ENSGT00940000162042 ENSGT00530000064954 ENSGT00530000063779.A ENSGT00940000156219 ENSGT00940000154621.a.a ENSGT01030000234515.a.a.b ENSGT00510000048120 ENSGT00390000002220 ENSGT00950000183150.a.b ##22 ENSGT00940000157564 ENSGT00940000158665 ENSGT00940000157232 ENSGT00390000002753 ENSGT00940000158859 ENSGT01030000234607.B ENSGT00940000157954 ENSGT00730000111149 ENSGT00390000007741.b ENSGT00940000159106 ENSGT00830000128380 ENSGT00390000000227 ENSGT00950000183075.a.b ENSGT00940000159309 ENSGT00940000160673 Bos_a ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00960000186726 ENSGT00940000154224.a ENSGT00950000183072.b.b ENSGT00940000156609 ENSGT00390000005979.b ENSGT00940000154224.b.g ENSGT00940000154224.b.h ENSGT00940000161368 ENSGT00940000162042 ENSGT00530000063779.A ENSGT00940000156219 ENSGT00940000154621.a.a ENSGT01030000234515.a.a.b ENSGT00510000048120 ENSGT00390000002220 ENSGT00950000183150.a.b ##22 ENSGT00940000157564 ENSGT00940000158665 ENSGT00940000157232 ENSGT00390000002753 ENSGT00940000158859 ENSGT01030000234607.B ENSGT00940000157954 ENSGT00730000111149 ENSGT00390000007741.b ENSGT00940000159106 ENSGT00830000128380 ENSGT00390000000227 ENSGT00950000183075.a.b ENSGT00940000159309 ENSGT00940000160673 Wild yak MODERN SPECIES 97 NOSTRIN (ENSBMUG00000003630) SPC25 (ENSBMUG00000003555) G6PC2 (ENSBMUG00000003523) ##22 ABCB11 (ENSBMUG00000003482) DHRS9 (ENSBMUG00000003423) LRP2 (ENSBMUG00000003383) BBS5 (ENSBMUG00000003222) KLHL41 (ENSBMUG00000003173) ENSBMUG00000003157 FASTKD1 (ENSBMUG00000003141) PPIG (ENSBMUG00000003113) CFAP210 (ENSBMUG00000003016) PHOSPHO2 (ENSBMUG00000002996) KLHL23 (ENSBMUG00000002983) SSB (ENSBMUG00000002942) METTL5 (ENSBMUG00000002926) UBR3 (ENSBMUG00000002858) MYO3B (ENSBMUG00000002766) Domestic yak MODERN SPECIES 11 SCN2A (ENSBGRG00000020107) CSRNP3 (ENSBGRG00000021834) GALNT3 (ENSBGRG00000021944) TTC21B (ENSBGRG00000022141) SCN1A (ENSBGRG00000022402) SCN9A (ENSBGRG00000022714) ENSBGRG00000022976 SCN7A (ENSBGRG00000023014) XIRP2 (ENSBGRG00000023219) B3GALT1 (ENSBGRG00000023526) STK39 (ENSBGRG00000023567) ENSBGRG00000004580 CERS6 (ENSBGRG00000004600) NOSTRIN (ENSBGRG00000004710) SPC25 (ENSBGRG00000005253) G6PC2 (ENSBGRG00000005364) ##22 ABCB11 (ENSBGRG00000005443) DHRS9 (ENSBGRG00000005591) LRP2 (ENSBGRG00000005655) BBS5 (ENSBGRG00000006370) KLHL41 (ENSBGRG00000006517) FASTKD1 (ENSBGRG00000006547) ENSBGRG00000006596 PPIG (ENSBGRG00000006620) CFAP210 (ENSBGRG00000006676) PHOSPHO2 (ENSBGRG00000006691) KLHL23 (ENSBGRG00000006712) SSB (ENSBGRG00000006739) METTL5 (ENSBGRG00000006819) UBR3 (ENSBGRG00000006942) MYO3B (ENSBGRG00000007081) Bos_b ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00950000183072.b.b ENSGT00940000156609 ENSGT00390000005979.b ENSGT00940000154224.b.g ENSGT00960000186726 ENSGT00940000161368 ENSGT00940000162042 ENSGT00530000064954 ENSGT00530000063779.A ENSGT00940000156219 ENSGT00900000143463 ENSGT00940000154621.a.a ENSGT01030000234515.a.a.b ENSGT00510000048120 ENSGT00390000002220 ENSGT00950000183150.a.b ##22 ENSGT00940000157564 ENSGT00940000158665 ENSGT00940000157232 ENSGT00390000002753 ENSGT00940000158859 ENSGT00390000018316.b.a.k.b.b.a.a ENSGT01030000234607.B ENSGT00940000157954 ENSGT00730000111149 ENSGT00390000007741.b ENSGT00940000159106 ENSGT00830000128380 ENSGT00390000000227 ENSGT00950000183075.a.b ENSGT00940000159309 Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 11 GALNT3 (ENSBIXG00005023797) ENSBIXG00005006479 TTC21B (ENSBIXG00005023900) SCN1A (ENSBIXG00005024090) ENSBIXG00005024149 SCN9A (ENSBIXG00005024345) XIRP2 (ENSBIXG00005024694) ENSBIXG00005007239 B3GALT1 (ENSBIXG00005024811) ENSBIXG00005024834 STK39 (ENSBIXG00005024984) ENSBIXG00005025055 CERS6 (ENSBIXG00005004274) NOSTRIN (ENSBIXG00005025313) SPC25 (ENSBIXG00005025356) G6PC2 (ENSBIXG00005025397) ##22 ABCB11 (ENSBIXG00005007398) DHRS9 (ENSBIXG00005004341) LRP2 (ENSBIXG00005025558) BBS5 (ENSBIXG00005006074) KLHL41 (ENSBIXG00005025650) ENSBIXG00005025664 ENSBIXG00005025693 PPIG (ENSBIXG00005025779) CFAP210 (ENSBIXG00005025842) PHOSPHO2 (ENSBIXG00005025907) KLHL23 (ENSBIXG00005004425) SSB (ENSBIXG00005005783) METTL5 (ENSBIXG00005026139) ENSBIXG00005026147 UBR3 (ENSBIXG00005026176) Cow MODERN SPECIES 11 CSRNP3 (ENSBTAG00000039091) GALNT3 (ENSBTAG00000013957) TTC21B (ENSBTAG00000016512) SCN1A (ENSBTAG00000018520) SCN9A (ENSBTAG00000002425) ENSBTAG00000026882 SCN7A (ENSBTAG00000019137) ENSBTAG00000046347 XIRP2 (ENSBTAG00000017743) ENSBTAG00000052016 STK39 (ENSBTAG00000017162) ENSBTAG00000053930 CERS6 (ENSBTAG00000044179) NOSTRIN (ENSBTAG00000010362) SPC25 (ENSBTAG00000010048) G6PC2 (ENSBTAG00000004241) ##22 ABCB11 (ENSBTAG00000026885) DHRS9 (ENSBTAG00000004557) LRP2 (ENSBTAG00000004555) BBS5 (ENSBTAG00000010736) KLHL41 (ENSBTAG00000010741) ENSBTAG00000046878 FASTKD1 (ENSBTAG00000010743) PPIG (ENSBTAG00000027789) CFAP210 (ENSBTAG00000001090) PHOSPHO2 (ENSBTAG00000001092) KLHL23 (ENSBTAG00000001093) SSB (ENSBTAG00000008716) METTL5 (ENSBTAG00000026008) UBR3 (ENSBTAG00000020296) MYO3B (ENSBTAG00000003626) American bison MODERN SPECIES 3312 SCN3A (ENSBBBG00000016080) SCN2A (ENSBBBG00000016486) CSRNP3 (ENSBBBG00000016537) GALNT3 (ENSBBBG00000004083) TTC21B (ENSBBBG00000004091) SCN1A (ENSBBBG00000007263) SCN9A (ENSBBBG00000017678) ENSBBBG00000017710 SCN7A (ENSBBBG00000004390) XIRP2 (ENSBBBG00000017898) B3GALT1 (ENSBBBG00000017907) STK39 (ENSBBBG00000004407) CERS6 (ENSBBBG00000017967) NOSTRIN (ENSBBBG00000018047) SPC25 (ENSBBBG00000018070) G6PC2 (ENSBBBG00000018083) ##22 ABCB11 (ENSBBBG00000018144) Siberian musk deer MODERN SPECIES 346 SCN2A (ENSMMSG00000023010) CSRNP3 (ENSMMSG00000022981) GALNT3 (ENSMMSG00000022964) TTC21B (ENSMMSG00000022918) SCN1A (ENSMMSG00000021114) SCN9A (ENSMMSG00000019213) SCN7A (ENSMMSG00000018383) ENSMMSG00000018334 XIRP2 (ENSMMSG00000018137) B3GALT1 (ENSMMSG00000018113) ENSMMSG00000018095 STK39 (ENSMMSG00000017972) CERS6 (ENSMMSG00000017903) NOSTRIN (ENSMMSG00000017750) SPC25 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ENSGT00940000156609 ENSGT00950000183072.b.b ENSGT00530000063779.A ENSGT00940000167474 ENSGT00940000156219 ENSGT00930000151775 ENSGT00940000154621.a.a ENSGT01030000234515.a.a.b ENSGT00510000048120 ENSGT00390000002220 ENSGT00950000183150.a.b ##22 ENSGT00940000157564 ENSGT00940000158665 ENSGT00940000164857 ENSGT00940000157232 ENSGT00940000165617 ENSGT00550000074800.a.a.a ENSGT00550000074800.a.b ENSGT00940000163195.B ENSGT01090000260278 ENSGT00390000002753 ENSGT00940000158859 ENSGT01030000234607.B ENSGT00940000157954 ENSGT00940000165303 ENSGT00390000007741.b Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00530000063608.B.b ENSGT00940000163423.C ENSGT00390000005979.b ENSGT00940000156609 ENSGT00950000183072.b.b ENSGT00530000063779.A.e.a ENSGT00940000158313.b ENSGT00530000063779.A.e.b ENSGT00940000167474 ENSGT00940000156219 ENSGT00930000151775 ENSGT00940000154621.a.a ENSGT01030000234515.a.a.b ENSGT00510000048120 ENSGT00390000002220 ENSGT00950000183150.a.b ##22 ENSGT00940000157564 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ENSGT00940000157232 ENSGT00940000165617 ENSGT00550000074800.a.a.a ENSGT00940000163195.B.b ENSGT01090000260278 ENSGT00390000002753 ENSGT00940000158859.e ENSGT01030000234607.B ENSGT00940000157954 ENSGT00940000165303 ENSGT00940000155863 ENSGT00390000000417.a.b Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT01010000229232 ENSGT00530000063608.B.a ENSGT00940000157782 ENSGT00940000163423.C.g.a ENSGT00940000177046 ENSGT00390000005979.b ENSGT00940000156609 ENSGT00950000183072.b.b.a ENSGT00530000063779.A.e.a.b ENSGT00940000167474 ENSGT00940000156219.e.a ENSGT00940000154621.a.a ENSGT01030000234515.a.a.b ENSGT00510000048120 ENSGT00390000002220 ENSGT00950000183150.a.b ##22 ENSGT00940000166545 ENSGT00940000158665.c ENSGT00940000164857 ENSGT00940000157232 ENSGT00940000165617 ENSGT00550000074800.a.a.a ENSGT00940000163195.B.b ENSGT01090000260278 ENSGT00390000002753 ENSGT00940000158859.e ENSGT01030000234607.B ENSGT00940000157954 ENSGT00940000165303 ENSGT00940000155863 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 17 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ENSGT00940000163423.C.g.a ENSGT00940000177046 ENSGT00390000005979.b ENSGT00940000156609 ENSGT00950000183072.b.b.a ENSGT00530000063779.A.e.a.b ENSGT00940000156219.e.a ENSGT00940000154621.a.a ENSGT01030000234515.a.a.b ENSGT00510000048120 ENSGT00390000002220 ENSGT00950000183150.a.b ##22 ENSGT00940000166545 ENSGT00940000158665.c.e ENSGT00940000164857 ENSGT00940000157232 ENSGT00940000165617 ENSGT00550000074800.a.a.a ENSGT00940000163195.B.b ENSGT00390000002753 ENSGT00940000158859.e ENSGT01030000234607.B ENSGT00940000157954 ENSGT00940000165303 ENSGT00940000155863 ENSGT00940000159106 ENSGT00830000128380 Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000157526.a ENSGT00940000158609 ENSGT00530000063608.B.a ENSGT00940000157782 ENSGT00940000163423.C.g.a ENSGT00940000177046 ENSGT00390000005979.b ENSGT00940000156609 ENSGT00950000183072.b.b.a ENSGT00530000063779.A.e.a.b ENSGT00940000156219.e.a ENSGT00940000154621.a.a ENSGT01030000234515.a.a.b ENSGT00510000048120 ENSGT00390000002220 ENSGT00950000183150.a.b ##22 ENSGT00940000166545.h ENSGT00940000166545.g ENSGT00940000158665.c.e.b ENSGT00940000158665.c.e.a ENSGT00940000164857 ENSGT00940000157232 ENSGT00940000165617 ENSGT00550000074800.a.a.a ENSGT00940000163195.B.b ENSGT00390000002753 ENSGT00940000158859.e ENSGT01030000234607.B ENSGT00940000157954 ENSGT00940000165303 ENSGT00940000155863 Clown anemonefish MODERN SPECIES 1325 TBC1D4 (ENSAOCG00000016818) klf12b (ENSAOCG00000016698) KLF5 (ENSAOCG00000016669) dachd (ENSAOCG00000016609) GPR18 (ENSAOCG00000001126) si:ch211-184m13.4 (ENSAOCG00000016396) clybl (ENSAOCG00000001995) zic5 (ENSAOCG00000002544) zic2a (ENSAOCG00000016327) XIRP2 (ENSAOCG00000016305) B3GALT1 (ENSAOCG00000016240) STK39 (ENSAOCG00000016227) CERS6 (ENSAOCG00000016181) nostrin (ENSAOCG00000016157) spc25 (ENSAOCG00000016048) G6PC2 (ENSAOCG00000016036) ##22 ENSAOCG00000016009 ENSAOCG00000015979 dhrs9 (ENSAOCG00000015873) dhrs9 (ENSAOCG00000015846) ENSAOCG00000015836 ENSAOCG00000015821 Orange clownfish MODERN SPECIES 3 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13 ENSGT00940000157526.a ENSGT00940000158609 ENSGT00530000063608.B.a ENSGT00940000157782 ENSGT00940000177046 ENSGT00940000163423.C.g.a ENSGT00390000005979.b ENSGT00940000156609 ENSGT00950000183072.b.b.a ENSGT00530000063779.A.e.a.b ENSGT00940000156219.e.a ENSGT00940000154621.a.a ENSGT01030000234515.a.a.b ENSGT00510000048120 ENSGT00390000002220 ENSGT00950000183150.a.b ##22 ENSGT00940000166545 ENSGT00940000158665.c ENSGT00940000164857 ENSGT00940000157232 ENSGT00940000165617 ENSGT00940000163195.B.b ENSGT00390000002753 ENSGT00940000158859.e ENSGT01030000234607.B ENSGT00940000157954 ENSGT00940000165303 ENSGT00940000155863 ENSGT00940000159106 ENSGT00830000128380 ENSGT00390000000227 Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000157526.a ENSGT00940000158609 ENSGT00530000063608.B.a ENSGT00940000157782 ENSGT00940000177046 ENSGT00940000163423.C.g.a ENSGT00390000005979.b ENSGT00940000156609 ENSGT00950000183072.b.b.a ENSGT00530000063779.A.e.a.b ENSGT00940000156219.e.a ENSGT00940000154621.a.a 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ENSGT01030000234607.B ENSGT00940000157954 ENSGT00940000165303 ENSGT00940000155863 ENSGT00940000159106 ENSGT00830000128380 ENSGT00390000000227 Mangrove rivulus MODERN SPECIES 78 ENSKMAG00000014393 fign (ENSKMAG00000014407) GRB14 (ENSKMAG00000014432) COBLL1 (ENSKMAG00000014466) slc38a11 (ENSKMAG00000014498) scn1laa (ENSKMAG00000014530) ttc21b (ENSKMAG00000014601) GALNT3 (ENSKMAG00000014671) CSRNP3 (ENSKMAG00000014697) XIRP2 (ENSKMAG00000014731) B3GALT1 (ENSKMAG00000014808) STK39 (ENSKMAG00000014844) CERS6 (ENSKMAG00000014916) nostrin (ENSKMAG00000014957) spc25 (ENSKMAG00000014987) G6PC2 (ENSKMAG00000015054) ##22 ENSKMAG00000015194 dhrs9 (ENSKMAG00000015338) rdh1 (ENSKMAG00000015400) rdh1 (ENSKMAG00000015434) lrp2a (ENSKMAG00000015498) zgc:172182 (ENSKMAG00000015671) col28a2a (ENSKMAG00000015699) bbs5 (ENSKMAG00000015738) klhl41a (ENSKMAG00000015754) fastkd1 (ENSKMAG00000015786) PPIG (ENSKMAG00000015824) ENSKMAG00000015860 phgdh (ENSKMAG00000015915) KLHL23 (ENSKMAG00000015941) ITGA6 (ENSKMAG00000015960) Turquoise killifish MODERN SPECIES 1623 GRB14 (ENSNFUG00015019849) ENSNFUG00015019838 ENSNFUG00015019834 slc38a11 (ENSNFUG00015019717) scn1laa (ENSNFUG00015014392) ttc21b (ENSNFUG00015025102) GALNT3 (ENSNFUG00015025059) CSRNP3 (ENSNFUG00015025053) ENSNFUG00015025051 ENSNFUG00015025049 B3GALT1 (ENSNFUG00015025048) STK39 (ENSNFUG00015025041) CERS6 (ENSNFUG00015025036) nostrin (ENSNFUG00015025030) spc25 (ENSNFUG00015025027) G6PC2 (ENSNFUG00015025008) ##22 dhrs9 (ENSNFUG00015024916) rdh1 (ENSNFUG00015024879) ENSNFUG00015024868 lrp2a (ENSNFUG00015024831) ENSNFUG00015024792 col28a2a (ENSNFUG00015024789) BBS5 (ENSNFUG00015024779) klhl41a (ENSNFUG00015024771) PPIG (ENSNFUG00015024766) ENSNFUG00015024763 phgdh (ENSNFUG00015024740) KLHL23 (ENSNFUG00015024730) ssb (ENSNFUG00015024701) METTL5 (ENSNFUG00015024693) UBR3 (ENSNFUG00015024544) Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000157526.a ENSGT00940000158609 ENSGT00530000063608.B.a ENSGT00940000157782 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GRB14 (ENSSTUG00000050876) ENSSTUG00000050891 slc38a11 (ENSSTUG00000050893) scn1laa (ENSSTUG00000050918) ENSSTUG00000050973 ENSSTUG00000050975 GALNT3 (ENSSTUG00000050976) CSRNP3 (ENSSTUG00000050978) ENSSTUG00000050979 B3GALT1 (ENSSTUG00000050980) STK39 (ENSSTUG00000050985) ENSSTUG00000051029 CERS6 (ENSSTUG00000051030) G6PC2 (ENSSTUG00000051034) ##22 dhrs9 (ENSSTUG00000051037) lrp2a (ENSSTUG00000051047) col28a2a (ENSSTUG00000028249) bbs5 (ENSSTUG00000028340) klhl41a (ENSSTUG00000028405) PPIG (ENSSTUG00000028411) ENSSTUG00000028451 phgdh (ENSSTUG00000028475) ENSSTUG00000028555 ssb (ENSSTUG00000028567) ubr3 (ENSSTUG00000028886) MYO3B (ENSSTUG00000030010) sp5a (ENSSTUG00000030253) GAD1 (ENSSTUG00000030337) GORASP2 (ENSSTUG00000033920) Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 39 ENSGT00940000157526.a ENSGT00940000158609 ENSGT00530000063608.B.a ENSGT00940000157782 ENSGT00940000163423.C.g.a ENSGT00390000005979.b ENSGT00940000156609 ENSGT00950000183072.b.b.a ENSGT00530000063779.A.e.a ENSGT00940000156219.f ENSGT00930000151775 ENSGT00940000154621.a.a ENSGT01030000234515.a.a.b ENSGT00510000048120 ENSGT00390000002220 ENSGT00950000183150.a.b ##22 ENSGT00940000166545 ENSGT00940000158665.c ENSGT00940000164857 ENSGT00940000157232 ENSGT00940000165617 ENSGT00940000163195.B.b ENSGT00390000002753 ENSGT00940000158859.e ENSGT01030000234607.B ENSGT00940000165303 Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00940000155518.m ENSGT00940000157526.a ENSGT00940000158609 ENSGT00530000063608.B.a ENSGT00940000157782 ENSGT00940000163423.C.g.a ENSGT00390000005979.b ENSGT00940000156609 ENSGT00950000183072.b.b.a ENSGT00530000063779.A.e.a ENSGT00940000156219.f ENSGT00940000154621.a.a ENSGT01030000234515.a.a.b.j ENSGT00510000048120 ENSGT00390000002220 ENSGT00950000183150.a.b ##22 ENSGT00940000166545 ENSGT00940000158665.c ENSGT00940000164857 ENSGT00940000157232 ENSGT00940000165617 ENSGT00940000163195.B.b ENSGT00950000182899.B.a.j ENSGT00940000154927.c.b ENSGT00940000157453.s ENSGT00940000154652.p ENSGT00940000156596.d 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ENSGT00940000158609.b ENSGT00530000063608.B.a ENSGT00940000177046 ENSGT00940000163423.C.e ENSGT00940000156609.h ENSGT00950000183072.b.b.d ENSGT00530000063779.A.f ENSGT00530000063779.A.e.a ENSGT00940000167474 ENSGT00940000156219 ENSGT00940000154621.a.a ENSGT01030000234515.a.a.b ENSGT00510000048120 ENSGT00390000002220 ENSGT00950000183150.a.b ##22 ENSGT00940000157564 ENSGT00940000166545 ENSGT00940000158665.e ENSGT00940000164857.b ENSGT00940000157232 Asian bonytongue MODERN SPECIES 3 gca (ENSSFOG00015027865) KCNH7 (ENSSFOG00015022675) fign (ENSSFOG00015022667) GRB14 (ENSSFOG00015022659) ENSSFOG00015032594 slc38a11 (ENSSFOG00015022634) ENSSFOG00015022604 ttc21b (ENSSFOG00015022570) GALNT3 (ENSSFOG00015022553) CSRNP3 (ENSSFOG00015022536) XIRP2 (ENSSFOG00015022507) B3GALT1 (ENSSFOG00015032057) ENSSFOG00015022495 nostrin (ENSSFOG00015022464) spc25 (ENSSFOG00015030443) G6PC2 (ENSSFOG00015032991) ##22 ABCB11 (ENSSFOG00015022375) ENSSFOG00015022343 dhrs9 (ENSSFOG00015022335) rdh1 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(ENSLOCG00000007973) KLHL23 (ENSLOCG00000007956) ssb (ENSLOCG00000007933) Reedfish MODERN SPECIES 16 fign (ENSECRG00000005933) GRB14 (ENSECRG00000010880) COBLL1 (ENSECRG00000010869) slc38a11 (ENSECRG00000010863) ENSECRG00000010861 scn1lab (ENSECRG00000010853) ttc21b (ENSECRG00000010841) ENSECRG00000010834 CSRNP3 (ENSECRG00000010829) ENSECRG00000010819 ENSECRG00000010814 STK39 (ENSECRG00000010794) CERS6 (ENSECRG00000010768) nostrin (ENSECRG00000010755) spc25 (ENSECRG00000010742) G6PC2 (ENSECRG00000010736) ##22 ABCB11 (ENSECRG00000010716) ENSECRG00000010647 dhrs9 (ENSECRG00000010585) dhrs9 (ENSECRG00000010351) ENSECRG00000010252 ENSECRG00000010238 bbs5 (ENSECRG00000010217) klhl41b (ENSECRG00000010205) fastkd1 (ENSECRG00000010188) ppig (ENSECRG00000010172) ENSECRG00000010154 phospho2 (ENSECRG00000010139) phgdh (ENSECRG00000010117) KLHL23 (ENSECRG00000010104) ssb (ENSECRG00000010084) Elephant shark MODERN SPECIES 1499 fign (ENSCMIG00000008106) ENSCMIG00000008118 ENSCMIG00000008157 scn1lab 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