Theria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000158130 ENSGT00940000157687 ENSGT00940000157026 ENSGT00910000148338 ENSGT00940000158533 ENSGT00940000166800 ENSGT00940000160086 ENSGT00940000163571 ENSGT00940000158454 ENSGT00390000011619 ENSGT00940000158574 ENSGT01030000234570.d.b.a.b.b.b ENSGT00940000162829 ENSGT00940000161932 #19 ENSGT00390000005082 #21 ENSGT00940000161305 #22 ENSGT00940000159380 ENSGT00950000182843.b ENSGT00940000159618 ENSGT00940000160510 ENSGT00950000183080.a.b.a.b.b ENSGT00390000005590 ENSGT00390000010309 ENSGT00940000155815 ENSGT01090000260005.a.a.a.b.a.a.a ENSGT00390000006465 Eutheria ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000157026 ENSGT00910000148338 ENSGT00940000158533 ENSGT00940000160086 ENSGT00940000163571 ENSGT00940000158454 ENSGT00390000011619 ENSGT00940000158574 ENSGT01030000234570.d.b.a.b.b.b ENSGT00940000163134 ENSGT00940000162829.b ENSGT00940000161932 #19 ENSGT00940000162940 ENSGT00940000162593 #20 ENSGT00390000005082 #21 ENSGT00940000161305 #22 ENSGT00530000069333.b 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ENSGT00940000161305 #22 ENSGT00530000069333.b ENSGT00940000159076 #23 ENSGT00940000154960 ENSGT00940000162454 ENSGT00940000156055 ENSGT01020000230359.C.a.a.b ENSGT01020000230359.C.a.b.b ENSGT01020000230359.C.a.b.a ENSGT01020000230359.C.a.a.a.a ENSGT01020000230359.C.a.a.a.b ENSGT01090000260052.a.b ENSGT00940000154044.a.a ENSGT01030000234667.a.b ENSGT01030000234667.a.a.b ENSGT00390000016415 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00730000111701 ENSGT00940000157026 ENSGT00940000160086 ENSGT00940000163571 ENSGT00940000158454 ENSGT00390000011619 ENSGT00940000158574 ENSGT01030000234570.d.b.a.b.b.b ENSGT00940000163134 ENSGT00940000162829.a ENSGT00940000162829.b ENSGT00940000161932 #19 ENSGT00940000162940 ENSGT00940000162593 #20 ENSGT00390000005082 #21 ENSGT00940000161305 #22 ENSGT00530000069333.b ENSGT00940000159076 #23 ENSGT00940000154960 ENSGT00940000156055 ENSGT01020000230359.C.a.a.b ENSGT01020000230359.C.a.b.a ENSGT01020000230359.C.a.a.a.b ENSGT01090000260052.a.b ENSGT00940000154044.a.a 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Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000157026 ENSGT00940000158533 ENSGT00940000160086 ENSGT00940000158454 ENSGT00390000011619 ENSGT00940000158574 ENSGT01030000234570.d.b.a.b.b.b ENSGT00940000163134 ENSGT00940000162829.a ENSGT00940000162829.b.d ENSGT00940000162829.b.c ENSGT00940000161932 #19 ENSGT00940000162940 ENSGT00940000162593 #20 ENSGT00390000005082 #21 ENSGT00940000161305 #22 ENSGT00530000069333.b ENSGT00940000159076 #23 ENSGT00940000154960 ENSGT00960000189448 ENSGT00940000162454 ENSGT00940000156055 ENSGT01020000230359.C.a.a.b ENSGT01020000230359.C.a.b.b ENSGT01020000230359.C.a.b.a ENSGT01020000230359.C.a.a.a.a ENSGT01020000230359.C.a.a.a.b ENSGT01090000260052.a.b ENSGT01030000234667.a.b ENSGT00940000154044.a.a ENSGT01030000234667.a.a.b Squirrel MODERN SPECIES 196 ENSSTOG00000026334 KLHL18 (ENSSTOG00000028599) ENSSTOG00000014845 SETD2 (ENSSTOG00000022116) NBEAL2 (ENSSTOG00000003096) CCDC12 (ENSSTOG00000003085) PTH1R (ENSSTOG00000003066) MYL3 (ENSSTOG00000003058) 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(ENSODEG00000010780) Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 127 PTPN23 (ENSCLAG00000016371) ENSCLAG00000016267 KLHL18 (ENSCLAG00000016500) KIF9 (ENSCLAG00000014675) ENSCLAG00000014351 SETD2 (ENSCLAG00000014681) ENSCLAG00000014776 NBEAL2 (ENSCLAG00000016378) CCDC12 (ENSCLAG00000016013) PTH1R (ENSCLAG00000014091) MYL3 (ENSCLAG00000016046) ENSCLAG00000015144 ENSCLAG00000015211 #19 ENSCLAG00000015480 #20 TMIE (ENSCLAG00000017029) #21 ENSCLAG00000015530 #22 FAM240A (ENSCLAG00000017079) ENSCLAG00000015624 #23 LRRC2 (ENSCLAG00000016734) ENSCLAG00000016076 LTF (ENSCLAG00000016651) ENSCLAG00000017845 ENSCLAG00000014465 ENSCLAG00000016011 CCR3 (ENSCLAG00000016761) ENSCLAG00000017981 ENSCLAG00000017900 FYCO1 (ENSCLAG00000016349) CXCR6 (ENSCLAG00000018009) CCR9 (ENSCLAG00000016177) LZTFL1 (ENSCLAG00000016619) Guinea pig MODERN SPECIES 7 PTPN23 (ENSCPOG00000024742) ENSCPOG00000033065 KLHL18 (ENSCPOG00000002172) KIF9 (ENSCPOG00000002165) SETD2 (ENSCPOG00000008215) ENSCPOG00000035419 NBEAL2 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ENSGT00390000011619 ENSGT00910000147877 ENSGT00940000158574 ENSGT01030000234570.d.b.a.b.b.b ENSGT00940000163134 ENSGT00940000162829.a ENSGT00940000161932 #19 ENSGT00940000162940 ENSGT00940000162593 #20 ENSGT00390000005082 #21 ENSGT00940000161305 #22 ENSGT00530000069333.b ENSGT00940000159076.u.a #23 ENSGT00940000154960 ENSGT00940000162454 ENSGT00940000156055 ENSGT01020000230359.C.a.a.b ENSGT01020000230359.C.a.b.b ENSGT01020000230359.C.a.b.a ENSGT01020000230359.C.a.a.a.a ENSGT01020000230359.C.a.a.a.b ENSGT01090000260052.a.b ENSGT01030000234667.a.b ENSGT00940000154044.a.a ENSGT01030000234667.a.a.b ENSGT00390000016415 Olive baboon MODERN SPECIES 11 SCAP (ENSPANG00000006873) PTPN23 (ENSPANG00000021916) KLHL18 (ENSPANG00000019810) SETD2 (ENSPANG00000009321) NBEAL2 (ENSPANG00000016986) ENSPANG00000041835 CCDC12 (ENSPANG00000017485) ENSPANG00000013767 MYL3 (ENSPANG00000021040) ENSPANG00000008026 ENSPANG00000042911 ENSPANG00000012872 #19 ENSPANG00000007057 PRSS50 (ENSPANG00000006043) #20 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Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00910000148338 ENSGT00940000158533 ENSGT00940000160086 ENSGT00940000163571 ENSGT00940000158454 ENSGT00390000011619 ENSGT00940000158574 ENSGT01030000234570.d.b.a.b.b.b ENSGT00940000163134 ENSGT00940000162829.a ENSGT00940000162829.b ENSGT00940000161932 #19 ENSGT00940000162940 ENSGT00940000162593 #20 ENSGT00390000005082 #21 ENSGT00940000161305 #22 ENSGT00530000069333.b ENSGT00940000159076 #23 ENSGT00940000154960 ENSGT00940000162454 ENSGT00940000156055 ENSGT01020000230359.C.a.a.b ENSGT01020000230359.C.a.b.b ENSGT01020000230359.C.a.b.a ENSGT01020000230359.C.a.a.a.a ENSGT01020000230359.C.a.a.a.b ENSGT01090000260052.a.b ENSGT01030000234667.a.b ENSGT00940000154044.a.a ENSGT01030000234667.a.a.b ENSGT00390000016415 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000160086 ENSGT00940000163571 ENSGT00940000158454 ENSGT00390000011619 ENSGT00940000158574 ENSGT01030000234570.d.b.a.b.b.b ENSGT00940000163134 ENSGT00940000162829.a ENSGT00940000162829.b.b.a.b 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LZTFL1 (ENSBMSG00010019520) Pecora ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000160086 ENSGT00940000163571 ENSGT00940000158454 ENSGT00390000011619 ENSGT00940000158574 ENSGT01030000234570.d.b.a.b.b.b ENSGT00940000163134 ENSGT00940000162829.a ENSGT00940000162829.b.b.a.b ENSGT00940000162829.b.b.a.a ENSGT00940000162829.b.a ENSGT00940000161932 #19 ENSGT00940000162940 ENSGT00940000162593 #20 ENSGT00390000005082 #21 ENSGT00940000161305 #22 ENSGT00530000069333.b ENSGT00940000159076 #23 ENSGT00940000154960 ENSGT00940000162454 ENSGT00940000156055 ENSGT01020000230359.C.a.a.b ENSGT01020000230359.C.a.b.b ENSGT01020000230359.C.a.b.a ENSGT01020000230359.C.a.a.a.a ENSGT01020000230359.C.a.a.a.b.h ENSGT01020000230359.C.a.a.a.b.g ENSGT01090000260052.a.b ENSGT00940000154044.a.a ENSGT01030000234667.a.b ENSGT01030000234667.a.a.b Percora_a ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000160086 ENSGT00940000163571 ENSGT00940000158454 ENSGT00390000011619 ENSGT00940000158574 ENSGT01030000234570.d.b.a.b.b.b ENSGT00940000163134 ENSGT00940000162829.a ENSGT00940000162829.b.b.a.b ENSGT00940000162829.b.b.a.a ENSGT00940000162829.b.a ENSGT00940000161932 #19 ENSGT00940000162940 ENSGT00940000162593 #20 ENSGT00390000005082 #21 ENSGT00940000161305 #22 ENSGT00530000069333.b ENSGT00940000159076 #23 ENSGT00940000154960 ENSGT00940000162454 ENSGT00940000156055 ENSGT01020000230359.C.a.a.b ENSGT01020000230359.C.a.b.b ENSGT01020000230359.C.a.b.a ENSGT01020000230359.C.a.a.a.a ENSGT01020000230359.C.a.a.a.b.h ENSGT01020000230359.C.a.a.a.b.g ENSGT01090000260052.a.b ENSGT01030000234667.a.b ENSGT00940000154044.a.a ENSGT01030000234667.a.a.b Bovidae ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000160086 ENSGT00940000163571 ENSGT00940000158454 ENSGT00390000011619 ENSGT00940000158574 ENSGT01030000234570.d.b.a.b.b.b ENSGT00940000163134 ENSGT00940000162829.a ENSGT00940000162829.b.b.a.b ENSGT00940000162829.b.b.a.a ENSGT00940000162829.b.a ENSGT00940000161932 #19 ENSGT00940000162940 ENSGT00940000162593 #20 ENSGT00390000005082 #21 ENSGT00940000161305 #22 ENSGT00530000069333.b ENSGT00940000159076 #23 ENSGT00940000154960 ENSGT00940000162454 ENSGT00940000156055 ENSGT01020000230359.C.a.a.b ENSGT01020000230359.C.a.b.b ENSGT01020000230359.C.a.b.a ENSGT01020000230359.C.a.a.a.a ENSGT01020000230359.C.a.a.a.b.h ENSGT01020000230359.C.a.a.a.b.g ENSGT01090000260052.a.b ENSGT00940000154044.a.a ENSGT01030000234667.a.b ENSGT01030000234667.a.a.b Bovinae ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000160086 ENSGT00940000163571 ENSGT00940000158454 ENSGT00390000011619 ENSGT00940000158574 ENSGT01030000234570.d.b.a.b.b.b ENSGT00940000163134 ENSGT00940000162829.a ENSGT00940000162829.b.b.a.b ENSGT00940000162829.b.b.a.a ENSGT00940000162829.b.a ENSGT00940000161932 #19 ENSGT00940000162940 ENSGT00940000162593 #20 ENSGT00390000005082 #21 ENSGT00940000161305 #22 ENSGT00530000069333.b ENSGT00940000159076.e #23 ENSGT00940000154960 ENSGT00940000162454 ENSGT00940000156055 ENSGT01020000230359.C.a.a.b ENSGT01020000230359.C.a.b.b ENSGT01020000230359.C.a.b.a 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