Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 51 ENSGT00390000001488 ENSGT00940000162720.a.b.a ENSGT01030000234862 ENSGT00440000038603 ENSGT00940000155582 ENSGT00730000110975 ENSGT00940000165640 ENSGT00940000163663.B ENSGT00390000004394 ENSGT00940000178019 ENSGT00390000002628 ENSGT00550000075071 ENSGT00940000157696 ENSGT00390000008825.a ENSGT00390000009925.a ENSGT00940000164514.a #22 ENSGT00390000015579.a.a.b ENSGT00940000156278 ENSGT00390000009825 ENSGT00390000015916 ENSGT00940000154590 ENSGT00940000157809 ENSGT00940000155004 ENSGT00950000182803.A.a.b Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 227 ENSGT00390000002628 ENSGT00550000075071 ENSGT00940000157696 ENSGT00390000008825.a ENSGT00390000009925.a ENSGT00940000164514.a #22 ENSGT00940000156278 ENSGT00390000009825 ENSGT00390000015916 ENSGT00940000158623 ENSGT00940000154590 ENSGT00940000157809 ENSGT00940000155004 ENSGT00950000183213.a.a.b ENSGT01020000230627 ENSGT00530000063694.a ENSGT00940000164148.a.b ENSGT00390000004566 Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164514.a #22 Anura ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164514.a #22 Frog MODERN SPECIES 9 ENSXETG00000041576 #7 anks3 (ENSXETG00000010323) #8 ENSXETG00000010322 #9 cluap1 (ENSXETG00000010321) #10 nlrc3 (ENSXETG00000032463) #11 slx4 (ENSXETG00000010319) #12 trap1 (ENSXETG00000033239) #13 crebbp (ENSXETG00000010317) #14 srl (ENSXETG00000045941) #15 tfap4 (ENSXETG00000033922) #16 glis2 (ENSXETG00000036796) #17 pam16 (ENSXETG00000048846) #18 vasn (ENSXETG00000017309) #19 coro7 (ENSXETG00000034093) #20 dnaja3 (ENSXETG00000031809) #21 foxj1.2 (ENSXETG00000024431) #22 naa60 (ENSXETG00000031356) #23 c7orf26 (ENSXETG00000017304) #24 dnase1l2 (ENSXETG00000033707) #25 eci1 (ENSXETG00000017302) #26 ndufab1 (ENSXETG00000024430) #27 ENSXETG00000039275 #28 tnrc6a (ENSXETG00000030437) #29 rbbp6 (ENSXETG00000024429) #30 tex47 (ENSXETG00000030045) #31 arhgap17 (ENSXETG00000017298) #32 lcmt1 (ENSXETG00000027013) #33 aqp8 (ENSXETG00000031281) #34 prkcb (ENSXETG00000017294) #35 cacng3 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ANCESTRAL SPECIES 42 ENSGT00940000161859 ENSGT00390000006233.c.a.a ENSGT00940000160198 ENSGT00530000063694.a ENSGT00950000183213.a.a.b ENSGT01020000230627.b ENSGT00390000002827 ENSGT00940000158458 ENSGT01100000263515.a.a ENSGT00390000005678 #26 ENSGT00950000182846.b.r #25 ENSGT00950000182846.b.q #25 ENSGT00390000011370 #24 ENSGT00390000008314 #23 ENSGT00390000016224.j.b ENSGT00940000164514.a #22 ENSGT00390000009925.a ENSGT00390000008825.a ENSGT00940000162979 ENSGT00940000157696 ENSGT00390000017673.a ENSGT00940000160872 ENSGT00940000155280 #21 ENSGT00940000159318 #19 ENSGT00940000156606 #20 ENSGT00390000012037 #18 ENSGT00940000158383 #17 ENSGT00390000015189 #16 ENSGT00940000157834 #15 ENSGT00940000155577 ENSGT00940000155364 #14 Archelosauria ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000161859 ENSGT00390000006233.c.a.a ENSGT00940000160198 ENSGT00530000063694.a ENSGT00950000183213.a.a.b ENSGT01020000230627.b ENSGT00390000002827 ENSGT00940000158458 ENSGT01100000263515.a.a ENSGT00390000005678 #26 ENSGT00950000182846.b.r #25 ENSGT00950000182846.b.q #25 ENSGT00390000011370 #24 ENSGT00390000008314 #23 ENSGT00390000016224.j.b ENSGT00940000164514.a #22 ENSGT00390000009925.a ENSGT00390000008825.a ENSGT00940000162979 ENSGT00940000157696 ENSGT00390000017673.a ENSGT01100000263491.a.b.a.a.a.a.a.b.c.b ENSGT00940000163050.o.b ENSGT00390000014091 #12 ENSGT01020000230401.b.b #13 ENSGT00940000155364 #14 ENSGT00940000155577 ENSGT00940000157834 #15 ENSGT00990000209506 ENSGT00390000015189 #16 ENSGT00940000158383 #17 Cryptodira ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000017359 ENSGT00940000156947 ENSGT00940000161859 ENSGT00390000006233.c.a.a ENSGT00530000063694.a ENSGT00950000183213.a.a.b ENSGT00390000002827 ENSGT00940000158458 ENSGT01100000263515.a.a ENSGT00390000005678 #26 ENSGT00950000182846.b.r #25 ENSGT00950000182846.b.q #25 ENSGT00390000011370 #24 ENSGT00390000008314 #23 ENSGT00390000016224.j.b ENSGT00940000164514.a #22 ENSGT00390000009925.a ENSGT00390000008825.a ENSGT00940000162979 ENSGT00940000157696 ENSGT00390000017673.a ENSGT00940000163050.o.b ENSGT00390000014091 #12 ENSGT01020000230401.b.b #13 ENSGT00940000155364 #14 ENSGT00940000155577 ENSGT00940000157834 #15 ENSGT00990000209506 ENSGT00390000015189 #16 ENSGT00940000158383 #17 ENSGT00390000012037 #18 Testudinoidea ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000156947 ENSGT00940000161859 ENSGT00390000006233.c.a.a ENSGT00940000160198 ENSGT00530000063694.a ENSGT00950000183213.a.a.b ENSGT00390000002827 ENSGT00940000158458 ENSGT01100000263515.a.a ENSGT00390000005678 #26 ENSGT00950000182846.b.r.a #25 ENSGT00950000182846.b.q #25 ENSGT00390000011370 #24 ENSGT00390000008314 #23 ENSGT00390000016224.j.b ENSGT00940000164514.a #22 ENSGT00390000009925.a ENSGT00390000008825.a ENSGT00940000162979 ENSGT00940000157696 ENSGT00390000017673.a ENSGT00390000014091 #12 ENSGT01020000230401.b.b #13 ENSGT00940000155364 #14 ENSGT00940000155577 ENSGT00940000157834 #15 ENSGT00990000209506 ENSGT00390000015189 #16 ENSGT00940000158383 #17 ENSGT00390000012037 #18 ENSGT00940000156606 #20 Emydidae ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000156947 ENSGT00940000161859 ENSGT00390000006233.c.a.a ENSGT00940000160198 ENSGT00530000063694.a ENSGT00950000183213.a.a.b ENSGT00390000002827 ENSGT00940000158458 ENSGT01100000263515.a.a ENSGT00390000005678 #26 ENSGT00950000182846.b.r.a #25 ENSGT00950000182846.b.q #25 ENSGT00390000011370 #24 ENSGT00390000008314 #23 ENSGT00390000016224.j.b ENSGT00940000164514.a #22 ENSGT00390000009925.a ENSGT00390000008825.a ENSGT00940000157696 ENSGT00390000017673.a painted turtle MODERN SPECIES 1065 ECI1 (ENSCPBG00000011704) #26 DNASE1L2 (ENSCPBG00000011706) #25 DNASE1 (ENSCPBG00000011714) #25 INTS15 (ENSCPBG00000011722) #24 NAA60 (ENSCPBG00000011725) #23 NUDT16L1 (ENSCPBG00000011728) ENSCPBG00000011732 #22 MGRN1 (ENSCPBG00000011740) UBALD1 (ENSCPBG00000011759) CDIP1 (ENSCPBG00000011763) HMOX2 (ENSCPBG00000011766) ENSCPBG00000011767 Three-toed box turtle MODERN SPECIES 37 AXIN1 (ENSTMTG00000002708) PDIA2 (ENSTMTG00000002717) ARHGDIG (ENSTMTG00000002735) RGS11 (ENSTMTG00000002775) FAM234A (ENSTMTG00000002800) LUC7L (ENSTMTG00000002807) PERCC1 (ENSTMTG00000002814) CLCN7 (ENSTMTG00000002818) PTX4 (ENSTMTG00000002832) ECI1 (ENSTMTG00000002841) #26 DNASE1L2 (ENSTMTG00000002844) #25 DNASE1 (ENSTMTG00000002851) #25 INTS15 (ENSTMTG00000002854) #24 NAA60 (ENSTMTG00000002857) #23 NUDT16L1 (ENSTMTG00000002867) ENSTMTG00000002873 #22 MGRN1 (ENSTMTG00000002882) UBALD1 (ENSTMTG00000002895) CDIP1 (ENSTMTG00000002902) HMOX2 (ENSTMTG00000002906) Testudinidae ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000156947 ENSGT00940000161859 ENSGT00390000006233.c.a.a ENSGT00940000160198 ENSGT00530000063694.a ENSGT00950000183213.a.a.b ENSGT00390000002827 ENSGT00940000158458 ENSGT01100000263515.a.a ENSGT00390000005678 #26 ENSGT00950000182846.b.r.a #25 ENSGT00950000182846.b.q #25 ENSGT00390000011370 #24 ENSGT00390000008314 #23 ENSGT00390000016224.j.b ENSGT00940000164514.a #22 ENSGT00390000009925.a ENSGT00390000008825.a ENSGT00940000162979 ENSGT00940000157696 ENSGT00390000017673.a ENSGT00390000014091 #12 ENSGT01020000230401.b.b #13 ENSGT00940000155364 #14 ENSGT00940000155577 ENSGT00940000157834 #15 ENSGT00390000015189 #16 ENSGT00940000158383 #17 ENSGT00390000012037 #18 ENSGT00940000156606 #20 ENSGT00940000159318 #19 Goode s thornscrub tortoise MODERN SPECIES 1 AXIN1 (ENSGEVG00005007757) PDIA2 (ENSGEVG00005007638) ARHGDIG (ENSGEVG00005007585) RGS11 (ENSGEVG00005007468) FAM234A (ENSGEVG00005007429) LUC7L (ENSGEVG00005007405) PERCC1 (ENSGEVG00005007388) CLCN7 (ENSGEVG00005007308) PTX4 (ENSGEVG00005007266) ECI1 (ENSGEVG00005007248) #26 DNASE1L2 (ENSGEVG00005007217) #25 DNASE1 (ENSGEVG00005007183) #25 INTS15 (ENSGEVG00005007165) #24 NAA60 (ENSGEVG00005007137) #23 NUDT16L1 (ENSGEVG00005007111) ENSGEVG00005007087 #22 MGRN1 (ENSGEVG00005007044) UBALD1 (ENSGEVG00005007022) CDIP1 (ENSGEVG00005007006) HMOX2 (ENSGEVG00005006981) ENSGEVG00005006942 ENSGEVG00005006930 SLX4 (ENSGEVG00005006903) #12 TRAP1 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#23 ENSGT00390000016224.j.b ENSGT00940000164514.a #22 ENSGT00390000009925.a ENSGT00940000157696 ENSGT00390000017673.a ENSGT00940000160872 ENSGT00940000155280 #21 ENSGT00940000156606 #20 ENSGT00940000159318 #19 ENSGT00390000012037 #18 ENSGT00940000158383 #17 ENSGT00390000015189 #16 ENSGT00940000157834 #15 ENSGT00940000155577 ENSGT01050000244814.a.a.a.a ENSGT00390000004566 ENSGT00390000008664 Common wall lizard MODERN SPECIES 5 ENSPMRG00000014738 MMD2 (ENSPMRG00000014749) WIPI2 (ENSPMRG00000014768) SLC29A4 (ENSPMRG00000014802) TNRC18 (ENSPMRG00000014823) FBXL18 (ENSPMRG00000014889) ACTB (ENSPMRG00000014896) FSCN1 (ENSPMRG00000014927) RNF216 (ENSPMRG00000014937) ENSPMRG00000014944 SMURF1 (ENSPMRG00000014955) DNASE1 (ENSPMRG00000014979) #25 INTS15 (ENSPMRG00000014988) #24 NAA60 (ENSPMRG00000014997) #23 NUDT16L1 (ENSPMRG00000015005) ENSPMRG00000015017 #22 MGRN1 (ENSPMRG00000015031) ENSPMRG00000015058 CDIP1 (ENSPMRG00000015063) HMOX2 (ENSPMRG00000015069) NMRAL1 (ENSPMRG00000015078) DNAJA3 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ENSGT00930000150969.B ENSGT00390000014795 ENSGT00390000001723 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000161112 ENSGT00390000016475 ENSGT00760000119398 ENSGT00940000155582.q.b ENSGT00440000038603 ENSGT00940000177425 ENSGT00940000162720.a.b.a ENSGT00730000110975 ENSGT00940000163663.B.b ENSGT00940000165873 ENSGT00390000004394 ENSGT00940000173220 ENSGT00950000182979.a.b.b.b.b.i.b ENSGT01100000263632.b ENSGT00390000008825.a ENSGT00940000164514.a #22 ENSGT00940000154590 ENSGT00940000157809.j.a.e.b ENSGT00940000176976 ENSGT00940000163288.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000165638.a.b ENSGT00940000159304 #34 ENSGT00940000156372 #33 ENSGT00940000156201.a.a #32 ENSGT00940000157625.a.b ENSGT01030000235046.a ENSGT00920000149163 ENSGT00940000160577 ENSGT00930000150969.B ENSGT00390000014795 ENSGT00390000001723 Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000161112 ENSGT00390000016475 ENSGT00760000119398 ENSGT00940000155582.q.b ENSGT00440000038603 ENSGT00940000177425 ENSGT00940000162720.a.b.a ENSGT00730000110975 ENSGT00940000163663.B.b ENSGT00940000165873 ENSGT00390000004394 ENSGT00950000182979.a.b.b.b.b.i.b ENSGT00940000163474 ENSGT01100000263632.b ENSGT00390000008825.a ENSGT00940000164514.a #22 ENSGT00940000154590 ENSGT00940000157809.j.a.e.b ENSGT00940000176976 ENSGT00940000163288.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000165638.a.b ENSGT00940000159304 #34 ENSGT00940000156372 #33 ENSGT00940000156201.a.a #32 ENSGT00940000157625.a.b ENSGT00920000149163 ENSGT00940000160577 ENSGT00930000150969.B ENSGT00390000014795 ENSGT00390000001723 ENSGT00940000165237.b.b Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000153861.b.a ENSGT00940000161112 ENSGT00390000016475 ENSGT00760000119398 ENSGT00940000155582.q.b ENSGT00440000038603 ENSGT00940000177425 ENSGT00940000162720.a.b.a ENSGT00730000110975 ENSGT00940000163663.B.b ENSGT00940000165873 ENSGT00390000004394 ENSGT00950000182979.a.b.b.b.b.i.b ENSGT01100000263632.b ENSGT00390000008825.a ENSGT00940000164514.a #22 ENSGT00940000154590 ENSGT00940000176976 ENSGT00940000157809.j.a.e.b ENSGT00940000163288.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000165638.a.b ENSGT00940000159304 #34 ENSGT00940000156372 #33 ENSGT00940000156201.a.a #32 ENSGT00940000157625.a.b ENSGT00920000149163 ENSGT00940000160577 ENSGT00930000150969.B ENSGT00390000014795 ENSGT00390000001723 ENSGT00940000165237.b.b Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 105 ENSGT00940000153861.b.a ENSGT00940000161112 ENSGT00390000016475 ENSGT00760000119398 ENSGT00940000155582.q.b ENSGT00440000038603 ENSGT00940000177425 ENSGT00940000162720.a.b.a ENSGT00730000110975 ENSGT00940000163663.B.b ENSGT00940000165873 ENSGT00390000004394 ENSGT00950000182979.a.b.b.b.b.i.b ENSGT01100000263632.b ENSGT00390000008825.a ENSGT00940000164514.a #22 ENSGT00940000154590 Mangrove rivulus MODERN SPECIES 43 ubald1b (ENSKMAG00000006734) foxj1b (ENSKMAG00000006749) #22 ENSKMAG00000006783 msrb1b (ENSKMAG00000006858) ENSKMAG00000006871 ENSKMAG00000006905 mlst8 (ENSKMAG00000007045) bricd5 (ENSKMAG00000007081) pgp (ENSKMAG00000007095) zdhhc4 (ENSKMAG00000007116) grid2ipb (ENSKMAG00000007141) arhgap17a (ENSKMAG00000007197) #32 lcmt1 (ENSKMAG00000007248) #33 ENSKMAG00000007283 hbae5 (ENSKMAG00000007296) hbbe3 (ENSKMAG00000007361) ENSKMAG00000007795 Turquoise killifish MODERN SPECIES 1621 MAFF (ENSNFUG00015019304) TOMM22 (ENSNFUG00015019305) GSPT2 (ENSNFUG00015019322) rsl1d1 (ENSNFUG00015020154) ENSNFUG00015020159 CR749182.1 (ENSNFUG00015020171) shisa9a (ENSNFUG00015020442) CPPED1 (ENSNFUG00015020445) ENSNFUG00015020449 ERCC4 (ENSNFUG00015020455) ENSNFUG00015020506 MKL2 (ENSNFUG00015020507) ENSNFUG00015020513 UBALD1A (ENSNFUG00015013615) ENSNFUG00015013623 FOXJ1B (ENSNFUG00015013628) #22 ENSNFUG00015013631 HBM (ENSNFUG00015013636) ENSNFUG00015013648 RAB26 (ENSNFUG00015013661) ENSNFUG00015013675 ENSNFUG00015013681 LMF1 (ENSNFUG00015013687) sox8a (ENSNFUG00015013693) ENSNFUG00015013752 cox19 (ENSNFUG00015015298) Nfu_g_1_022970 (ENSNFUG00015015309) ENSNFUG00015015318 sox9a (ENSNFUG00015015338) ENSNFUG00015015514 ENSNFUG00015015517 Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000153861.b.a ENSGT00940000161112 ENSGT00390000016475 ENSGT00760000119398 ENSGT00940000155582.q.b ENSGT00440000038603 ENSGT00940000162720.a.b.a ENSGT00730000110975 ENSGT00940000163663.B.b ENSGT00940000165873 ENSGT00390000004394 ENSGT00950000182979.a.b.b.b.b.i.b ENSGT00940000178019 ENSGT01100000263632.b ENSGT00390000008825.a ENSGT00940000164514.a #22 ENSGT00940000154590 ENSGT00940000176976 ENSGT00940000157809.j.a.e.b ENSGT00940000163288.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000165638.a.b ENSGT00940000159304 #34 ENSGT00940000156372 #33 ENSGT00940000156201.a.a #32 ENSGT00940000157625.a.b ENSGT00920000149163 ENSGT00940000160577 ENSGT00930000150969.B ENSGT00390000014795 ENSGT00390000001723 ENSGT00940000165237.b.b NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000153536.a.a.a.a ENSGT00940000153861.b.a.d ENSGT00940000161112 ENSGT00390000016475 ENSGT00760000119398 ENSGT00940000155582.q.b ENSGT00440000038603 ENSGT00940000168129 ENSGT00940000162720.a.b.a ENSGT00730000110975 ENSGT00940000163663.B.b ENSGT00940000165873 ENSGT00390000004394 ENSGT00950000182979.a.b.b.b.b.i.b ENSGT00390000008825.a ENSGT00940000164514.a #22 ENSGT00940000156278.xb.b ENSGT00940000156278.xb.a ENSGT00940000154590 ENSGT00940000157809.j.a.e.b ENSGT00940000176976 ENSGT00940000163288.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000165638.a.b ENSGT00940000159304 #34 ENSGT00940000156372 #33 ENSGT00940000156201.a.a #32 ENSGT00940000157625.a.b ENSGT00920000149163 ENSGT00940000160577 ENSGT00930000150969.B ENSGT00390000014795 Sheepshead minnow MODERN SPECIES 567 ENSCVAG00000006146 ercc4 (ENSCVAG00000006171) cpped1 (ENSCVAG00000006186) ENSCVAG00000006215 ubald1b (ENSCVAG00000006223) foxj1b (ENSCVAG00000006225) #22 ENSCVAG00000006259 hbae4 (ENSCVAG00000006268) ENSCVAG00000006305 ENSCVAG00000006378 cep131 (ENSCVAG00000006408) ENSCVAG00000006447 ENSCVAG00000006460 ENSCVAG00000006491 CRHR1 (ENSCVAG00000006507) FAM171A2 (ENSCVAG00000006523) grnb (ENSCVAG00000006563) ENSCVAG00000006578 ENSCVAG00000000745 Mummichog MODERN SPECIES 288 tmem184ba (ENSFHEG00000017182) maff (ENSFHEG00000017195) tomm22 (ENSFHEG00000017207) dmc1 (ENSFHEG00000017221) rsl1d1 (ENSFHEG00000017235) ENSFHEG00000017251 ENSFHEG00000017274 SNX29 (ENSFHEG00000017279) shisa9a (ENSFHEG00000017289) cpped1 (ENSFHEG00000017313) ercc4 (ENSFHEG00000017346) ENSFHEG00000017373 ENSFHEG00000017382 ENSFHEG00000017394 ubald1b (ENSFHEG00000017400) foxj1b (ENSFHEG00000017416) #22 ENSFHEG00000017427 ENSFHEG00000017438 hbae4 (ENSFHEG00000017446) hbbe3 (ENSFHEG00000017965) hbae5 (ENSFHEG00000018637) ENSFHEG00000018671 lcmt1 (ENSFHEG00000018726) #33 arhgap17a (ENSFHEG00000018784) #32 grid2ipb (ENSFHEG00000018842) Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000153536.a.a.a.a ENSGT00940000153861.b.a ENSGT00940000161112 ENSGT00390000016475 ENSGT00760000119398 ENSGT00940000155582.q.b ENSGT00440000038603 ENSGT00940000162720.a.b.a ENSGT00730000110975 ENSGT00940000163663.B.b ENSGT00940000165873 ENSGT00390000004394 ENSGT00950000182979.a.b.b.b.b.i.b ENSGT00940000178019 ENSGT00390000008825.a ENSGT00940000164514.a #22 ENSGT00940000154590 ENSGT00940000176976 ENSGT00940000157809.j.a.e.b ENSGT00940000163288.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000165638.a.b ENSGT00940000156372 #33 ENSGT00940000165237.b.b ENSGT00390000001723 ENSGT00390000014795 ENSGT00930000150969.B ENSGT00940000160577 ENSGT00920000149163 ENSGT00940000157625.a.b ENSGT00940000156201.a.a #32 ENSGT00510000047678.a.a.b Poecilia ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000153536.a.a.a.a ENSGT00940000153861.b.a ENSGT00940000161112 ENSGT00390000016475 ENSGT00760000119398 ENSGT00940000155582.q.b ENSGT00440000038603 ENSGT00940000162720.a.b.a ENSGT00730000110975 ENSGT00940000163663.B.b.a ENSGT00940000165873 ENSGT00390000004394 ENSGT00950000182979.a.b.b.b.b.i.b ENSGT00940000178019 ENSGT00390000008825.a ENSGT00940000164514.a #22 ENSGT00940000154590 ENSGT00940000157809.j.a.e.b ENSGT00940000163288.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000165638.a.b ENSGT00940000156372 #33 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ENSGT00950000182979.a.b.b.b.b.i.b ENSGT00390000008825.a ENSGT00940000164514.a #22 ENSGT00940000154590 ENSGT00940000157809.j.a.e.b ENSGT00940000163288.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000165638.a.b ENSGT00940000159304 #34 ENSGT00940000156372 #33 ENSGT00940000165566.a ENSGT00390000007041 ENSGT00940000158558.b ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00940000162951 ENSGT00900000141125 ENSGT00390000013574 ENSGT00940000153514.a.b ENSGT00390000004691 Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 2780 ubald1b (ENSSLDG00000019645) foxj1b (ENSSLDG00000019635) #22 ENSSLDG00000019574 hbae4 (ENSSLDG00000019533) hbbe3 (ENSSLDG00000019517) hbae5 (ENSSLDG00000019509) ENSSLDG00000019496 aqp8a.1 (ENSSLDG00000019450) #34 lcmt1 (ENSSLDG00000019394) #33 rasd1 (ENSSLDG00000019388) PEMT (ENSSLDG00000019376) RAB26 (ENSSLDG00000019351) wbp2 (ENSSLDG00000019336) ENSSLDG00000019319 mrpl38 (ENSSLDG00000019306) FDXR (ENSSLDG00000019288) narf (ENSSLDG00000019246) Greater amberjack MODERN SPECIES 27 csnk1e (ENSSDUG00000008258) tmem184ba 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ENSGT00390000014795 ENSGT00390000001723 Turbot MODERN SPECIES 9 tmem184ba (ENSSMAG00000007554) maff (ENSSMAG00000007569) tomm22 (ENSSMAG00000022972) dmc1 (ENSSMAG00000007594) gspt1 (ENSSMAG00000007886) rsl1d1 (ENSSMAG00000007957) ENSSMAG00000007986 SNX29 (ENSSMAG00000007999) shisa9a (ENSSMAG00000008053) cpped1 (ENSSMAG00000008063) ENSSMAG00000022831 ercc4 (ENSSMAG00000008092) MRTFB (ENSSMAG00000008135) ENSSMAG00000008161 ENSSMAG00000023967 foxj1b (ENSSMAG00000008197) #22 ENSSMAG00000008257 hbae5 (ENSSMAG00000008444) hbae4 (ENSSMAG00000021725) ENSSMAG00000008459 ENSSMAG00000008469 aqp8a.1 (ENSSMAG00000008477) #34 lcmt1 (ENSSMAG00000008498) #33 arhgap17a (ENSSMAG00000008554) #32 grid2ipb (ENSSMAG00000008656) ENSSMAG00000008695 zdhhc4 (ENSSMAG00000008696) pgp (ENSSMAG00000008748) bricd5 (ENSSMAG00000008752) mlst8 (ENSSMAG00000008770) ENSSMAG00000008821 Tongue sole MODERN SPECIES 18 tomm22 (ENSCSEG00000019726) maff (ENSCSEG00000019729) tmem184ba (ENSCSEG00000019733) csnk1e 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ENSGT00940000163288.a.b.b.b.a.a.a.b.a ENSGT00940000157809.j.a.e.a.vb.b ENSGT00940000163288.a.b.b.b.a.a.a.a ENSGT00940000157809.j.a.e.a.wb ENSGT00940000161012 Northern pike DUPLICATION Northern pike MODERN SPECIES 4 tomm22 (ENSELUG00000019345) dmc1 (ENSELUG00000019339) gspt1 (ENSELUG00000019323) ENSELUG00000019267 ENSELUG00000019258 rsl1d1 (ENSELUG00000019243) ENSELUG00000019208 ENSELUG00000000819 SNX29 (ENSELUG00000019189) shisa9a (ENSELUG00000019170) cpped1 (ENSELUG00000019151) ercc4 (ENSELUG00000019115) MRTFB (ENSELUG00000019087) ENSELUG00000019069 UBALD1 (ENSELUG00000032018) foxj1b (ENSELUG00000019053) #22 ENSELUG00000019035 hbae4 (ENSELUG00000019002) aqp8a.1 (ENSELUG00000018983) #34 arhgap17a (ENSELUG00000018904) #32 grid2ipb (ENSELUG00000018823) zdhhc4 (ENSELUG00000018782) pgp (ENSELUG00000018770) bricd5 (ENSELUG00000025950) mlst8 (ENSELUG00000000801) MEIOB (ENSELUG00000018701) ENSELUG00000018675 msrb1b (ENSELUG00000018663) neurl2 (ENSELUG00000018631) ENSELUG00000018620 RNF151 (ENSELUG00000018574) Northern pike MODERN SPECIES 10 kctd5a (ENSELUG00000021097) BAIAP3 (ENSELUG00000021231) GPR146 (ENSELUG00000021247) gper1 (ENSELUG00000021252) MYOF (ENSELUG00000021344) UNKL (ENSELUG00000021446) IGFALS (ENSELUG00000029108) shisa9b (ENSELUG00000021492) MRTFB (ENSELUG00000021530) ENSELUG00000021559 snrnp25 (ENSELUG00000026630) polr3k (ENSELUG00000021625) cdip1 (ENSELUG00000021658) ubald1b (ENSELUG00000021672) mgrn1b (ENSELUG00000032017) ENSELUG00000021693 #22 AANAT2 (ENSELUG00000021739) rhbdf1a (ENSELUG00000021768) mpg (ENSELUG00000021802) nprl3 (ENSELUG00000021934) hbb (ENSELUG00000027383) HBE1 (ENSELUG00000022098) ENSELUG00000022197 HBE1 (ENSELUG00000031432) hbb (ENSELUG00000022039) HBA4 (ENSELUG00000023994) ENSELUG00000022233 ENSELUG00000000959 ENSELUG00000000955 ENSELUG00000009422 ENSELUG00000022278 Salmoninae DUPLICATION Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 147 ENSGT00440000038603 ENSGT00940000177425 ENSGT00940000162720.a.b.a ENSGT00730000110975.b 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SPECIES 17 ENSOTSG00005045192 maff (ENSOTSG00005045193) tomm22 (ENSOTSG00005045194) dmc1 (ENSOTSG00005045195) gspt1 (ENSOTSG00005045209) ENSOTSG00005045661 ENSOTSG00005045662 SNX29 (ENSOTSG00005045663) shisa9a (ENSOTSG00005045820) cpped1 (ENSOTSG00005045823) ercc4 (ENSOTSG00005045847) MRTFB (ENSOTSG00005045848) ENSOTSG00005045849 ENSOTSG00005045850 UBALD1 (ENSOTSG00005045851) foxj1b (ENSOTSG00005045852) #22 ENSOTSG00005045853 hbae4 (ENSOTSG00005045893) ENSOTSG00005045895 ENSOTSG00005045896 ENSOTSG00005045898 ENSOTSG00005045899 ENSOTSG00005045900 lcmt1 (ENSOTSG00005045901) #33 arhgap17a (ENSOTSG00005045945) #32 grid2ipb (ENSOTSG00005003040) zdhhc4 (ENSOTSG00005003049) pgp (ENSOTSG00005003056) bricd5 (ENSOTSG00005003058) mlst8 (ENSOTSG00005003063) ENSOTSG00005003074 Coho salmon MODERN SPECIES 17 csnk1e (ENSOKIG00005006292) tmem184ba (ENSOKIG00005006343) maff (ENSOKIG00005006375) tomm22 (ENSOKIG00005006384) dmc1 (ENSOKIG00005006425) gspt1 (ENSOKIG00005006595) ENSOKIG00005007120 ENSOKIG00005007134 ENSOKIG00005007143 SNX29 (ENSOKIG00005007189) shisa9a (ENSOKIG00005007313) ercc4 (ENSOKIG00005007341) MRTFB (ENSOKIG00005007433) ENSOKIG00005007466 UBALD1 (ENSOKIG00005007477) foxj1b (ENSOKIG00005007486) #22 ENSOKIG00005007524 hbae4 (ENSOKIG00005008121) ENSOKIG00005008152 ENSOKIG00005008166 ENSOKIG00005008182 ENSOKIG00005008203 aqp8a.1 (ENSOKIG00005008217) #34 lcmt1 (ENSOKIG00005008250) #33 arhgap17a (ENSOKIG00005008532) #32 grid2ipb (ENSOKIG00005009163) zdhhc4 (ENSOKIG00005009292) pgp (ENSOKIG00005009320) bricd5 (ENSOKIG00005009331) mlst8 (ENSOKIG00005009347) ENSOKIG00005009367 Rainbow trout MODERN SPECIES 12 csnk1e (ENSOMYG00000013518) tmem184ba (ENSOMYG00000013544) maff (ENSOMYG00000013559) tomm22 (ENSOMYG00000013563) dmc1 (ENSOMYG00000013595) gspt1 (ENSOMYG00000013872) ENSOMYG00000034014 ENSOMYG00000034028 SNX29 (ENSOMYG00000034067) ENSOMYG00000052785 shisa9a (ENSOMYG00000034255) cpped1 (ENSOMYG00000034264) ercc4 (ENSOMYG00000034286) MRTFB (ENSOMYG00000034323) 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mlst8 (ENSSSAG00000048447) River trout MODERN SPECIES 1 maff (ENSSTUG00000036365) tomm22 (ENSSTUG00000036373) dmc1 (ENSSTUG00000036396) ENSSTUG00000036460 gspt1 (ENSSTUG00000036515) ENSSTUG00000038053 ENSSTUG00000038059 ENSSTUG00000038068 SNX29 (ENSSTUG00000038109) shisa9a (ENSSTUG00000038971) ENSSTUG00000038973 ercc4 (ENSSTUG00000038989) MRTFB (ENSSTUG00000039256) ENSSTUG00000039345 UBALD1 (ENSSTUG00000039355) foxj1b (ENSSTUG00000039360) #22 ENSSTUG00000039385 ENSSTUG00000039676 ENSSTUG00000039715 ENSSTUG00000039726 ENSSTUG00000039731 ENSSTUG00000039747 lcmt1 (ENSSTUG00000039753) #33 arhgap17a (ENSSTUG00000039890) #32 grid2ipb (ENSSTUG00000042706) zdhhc4 (ENSSTUG00000042794) pgp (ENSSTUG00000000733) mlst8 (ENSSTUG00000000921) ENSSTUG00000001133 ENSSTUG00000001136 msrb1b (ENSSTUG00000001139) Huchen MODERN SPECIES 2042 ercc4 (ENSHHUG00000032192) ENSHHUG00000032177 ENSHHUG00000032168 ENSHHUG00000032166 ENSHHUG00000032163 ENSHHUG00000032149 ENSHHUG00000032145 ENSHHUG00000032136 foxj1b (ENSHHUG00000032126) #22 ENSHHUG00000031992 hbae4 (ENSHHUG00000031960) ENSHHUG00000031955 ENSHHUG00000031927 ENSHHUG00000031831 ENSHHUG00000031823 ENSHHUG00000031817 ENSHHUG00000031813 ENSHHUG00000031811 ENSHHUG00000031805 lcmt1 (ENSHHUG00000031794) #33 arhgap17a (ENSHHUG00000031608) #32 ENSHHUG00000031604 ENSHHUG00000031601 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 1158 ENSGT00950000182979.a.b.b.b.b.i.b.f ENSGT00940000178019 ENSGT00390000008825.a.c.a.b ENSGT00940000164514.a.c.b #22 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000153861.b.a.h ENSGT00940000161112.c ENSGT00390000016475.v ENSGT00760000119398.b ENSGT00940000155582.q.b.e ENSGT00440000038603 ENSGT00940000177425 ENSGT00940000162720.a.b.a ENSGT01030000234583.a.a.c.a.b.a.b.b ENSGT00940000175733 ENSGT00730000110975.a ENSGT00940000163663.B.b.c.a ENSGT00940000165873.c ENSGT00950000182979.a.b.b.b.b.i.b.f ENSGT00390000008825.a.c.a.b ENSGT00940000164514.a.c.b #22 ENSGT00940000154590.f ENSGT00940000157809.j.a.e.b.l ENSGT01000000215398.a 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ENSSSAG00000004853 ENSSSAG00000122216 ENSSSAG00000107705 foxj1b (ENSSSAG00000105536) #22 rhbl4 (ENSSSAG00000004938) ENSSSAG00000100077 ENSSSAG00000005171 aqp8aa1 (ENSSSAG00000005186) #34 ENSSSAG00000117726 #33 ENSSSAG00000095092 arhgap17a (ENSSSAG00000005208) #32 ENSSSAG00000107128 #31 grid2ipb (ENSSSAG00000005353) ENSSSAG00000005384 ENSSSAG00000005390 bricd5 (ENSSSAG00000005398) ENSSSAG00000102775 meiob (ENSSSAG00000005413) ENSSSAG00000000122 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000160068.a.b.d ENSGT01010000226722 ENSGT00940000155813.i.b.f.a ENSGT00940000153536.a.a.a.a.e ENSGT00940000153861.b.a.h ENSGT00940000161112.c ENSGT00390000016475.v ENSGT00760000119398.b ENSGT00940000155582.q.b.e ENSGT00440000038603 ENSGT00730000110975.a ENSGT00940000163663.B.b.c.a ENSGT00940000165873.c ENSGT00950000182979.a.b.b.b.b.i.b.f ENSGT00390000008825.a.c.a.b ENSGT00940000164514.a.c.b #22 ENSGT00940000156278.q ENSGT00940000154590.f ENSGT00940000157809.j.a.e.b.l ENSGT01000000215398.a ENSGT00940000165638.b.a.b ENSGT00940000159304.o.b #34 ENSGT00940000156372.t #33 ENSGT00940000156201.a.a.f #32 ENSGT00940000157625.a.b.e ENSGT01000000222128 ENSGT00940000160619.l.a.b ENSGT00390000001723 ENSGT00940000165237.b.b.d ENSGT00940000164352.a.g ENSGT00940000158812.j.a.p Rainbow trout MODERN SPECIES 15 ENSOMYG00000045838 ENSOMYG00000071602 csnk1e (ENSOMYG00000045866) tmem184ba (ENSOMYG00000045878) maff (ENSOMYG00000066190) tomm22 (ENSOMYG00000045886) dmc1 (ENSOMYG00000045893) gspt1 (ENSOMYG00000045903) rsl1d1 (ENSOMYG00000045927) ENSOMYG00000051497 ENSOMYG00000045953 shisa9a (ENSOMYG00000045999) cpped1 (ENSOMYG00000046004) ENSOMYG00000046012 ENSOMYG00000046018 foxj1b (ENSOMYG00000046020) #22 ENSOMYG00000064377 ENSOMYG00000046025 ENSOMYG00000043102 ENSOMYG00000073651 ENSOMYG00000070166 ENSOMYG00000055147 hbae4 (ENSOMYG00000021449) ENSOMYG00000021459 ENSOMYG00000070015 ENSOMYG00000049967 ENSOMYG00000021512 #32 ENSOMYG00000021531 ENSOMYG00000056707 ENSOMYG00000021543 ENSOMYG00000021550 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000158369.f ENSGT00940000160068.a.b.d ENSGT01010000226722 ENSGT00940000155813.i.b.f.a ENSGT00940000153536.a.a.a.a.e ENSGT00940000153861.b.a.h ENSGT00940000161112.c ENSGT00390000016475.v ENSGT00940000155582.q.b.e ENSGT00440000038603 ENSGT00730000110975.a ENSGT00940000163663.B.b.c.a ENSGT00940000165873.c ENSGT00950000182979.a.b.b.b.b.i.b.f ENSGT00390000008825.a.c.a.b ENSGT00940000164514.a.c.b #22 ENSGT00940000156278.q ENSGT01000000215398.a ENSGT00940000157809.j.a.e.b.l ENSGT00940000165638.b.a.b ENSGT00940000156372.t #33 ENSGT00940000156201.a.a.f #32 ENSGT00940000157625.a.b.e ENSGT01000000222128 ENSGT00960000193203 ENSGT00940000160619.l.a.b ENSGT00390000001723 ENSGT00940000165237.b.b.d ENSGT00940000164352.a.g ENSGT00940000153432.A.a.o.b ENSGT00550000074902.o Coho salmon MODERN SPECIES 2 csnk1e (ENSOKIG00005011762) tmem184ba (ENSOKIG00005011745) maff (ENSOKIG00005011731) tomm22 (ENSOKIG00005011723) gspt1 (ENSOKIG00005010827) 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(ENSOTSG00005027237) foxj1b (ENSOTSG00005027238) #22 ENSOTSG00005027241 ENSOTSG00005027242 ENSOTSG00005027243 ENSOTSG00005027244 ENSOTSG00005027245 lcmt1 (ENSOTSG00005027246) #33 arhgap17a (ENSOTSG00005027248) #32 grid2ipb (ENSOTSG00005027268) zdhhc4 (ENSOTSG00005027279) ENSOTSG00005027280 pgrmc1 (ENSOTSG00005027281) MEIOB (ENSOTSG00005027282) ENSOTSG00005027283 ENSOTSG00005027284 noxo1b (ENSOTSG00005027285) Huchen MODERN SPECIES 1363 rasd4 (ENSHHUG00000034249) PRPSAP1 (ENSHHUG00000034252) CYGB (ENSHHUG00000034287) FBF1 (ENSHHUG00000034291) SPHK1 (ENSHHUG00000034348) AANAT (ENSHHUG00000034352) ENSHHUG00000034374 ddx5 (ENSHHUG00000034401) ENSHHUG00000034569 ENSHHUG00000034572 ENSHHUG00000034582 UBALD1 (ENSHHUG00000034585) foxj1b (ENSHHUG00000034590) #22 Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 654 ENSGT00940000154307.B.c.a.a.b ENSGT00940000154741.c.c ENSGT00940000158822.f ENSGT00940000160824.c ENSGT00940000163663.B.a.c ENSGT00950000182979.a.b.b.b.b.i.a.e ENSGT01100000263632 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ENSGT00940000157809.j.a.e.a.vb.a.a.b ENSGT00940000157809.j.a.f ENSGT00940000163288.a.b.b.b.a.a.a.b.a.b.b Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 48 ENSGT00730000110939.a.e ENSGT01060000248742.c ENSGT00940000154307.B.c.a.a.b ENSGT00940000154741.c.c ENSGT00940000158822.f ENSGT00940000160824.c ENSGT00940000163663.B.a.c ENSGT00950000182979.a.b.b.b.b.i.a.e ENSGT01100000263632.c ENSGT00390000002628.s ENSGT00550000075071.s.b ENSGT00940000157696.o ENSGT00390000008825.a.c.b.b ENSGT00390000009925.a.i ENSGT00390000009925.a.j.b ENSGT00940000164514.a.d.a #22 ENSGT00390000015579.a.a.b.g ENSGT00940000156278.r.a.a ENSGT00390000009825.e ENSGT00390000015916.o.a.b ENSGT00940000157809.i.b ENSGT00940000163288.a.b.b.a.p ENSGT00940000157809.j.b.gb.a ENSGT00940000157809.j.a.e.a.vb.a.a.a.b ENSGT00940000163288.a.b.b.b.a.a.a.a.m.a ENSGT00940000157809.j.a.e.a.vb.a.a.b ENSGT00940000157809.j.a.e.a.vb.a.a.a.a.a ENSGT00940000163288.a.b.b.b.a.a.a.a.n.a ENSGT00940000157809.j.a.f ENSGT00940000163288.a.b.b.b.a.a.a.b.a.b.b ENSGT00940000157809.j.a.e.a.vb.b.b Rainbow trout MODERN SPECIES 4 gpr146 (ENSOMYG00000031630) gper1 (ENSOMYG00000031641) ENSOMYG00000031850 ENSOMYG00000032087 ENSOMYG00000032152 ENSOMYG00000056491 shisa9b (ENSOMYG00000032161) ENSOMYG00000065281 ENSOMYG00000032174 ENSOMYG00000032185 snrnp25 (ENSOMYG00000032194) polr3k (ENSOMYG00000032201) cdip1 (ENSOMYG00000032209) ubald1b (ENSOMYG00000064940) mgrn1b (ENSOMYG00000032413) ENSOMYG00000065441 #22 aanat-2 (ENSOMYG00000034236) rhbdf1a (ENSOMYG00000034352) mpg (ENSOMYG00000034828) nprl3 (ENSOMYG00000034908) ENSOMYG00000035352 ENSOMYG00000035454 ENSOMYG00000035506 ENSOMYG00000035512 ENSOMYG00000035520 ENSOMYG00000035525 ENSOMYG00000035530 hbae3 (ENSOMYG00000035531) kank2 (ENSOMYG00000035539) ENSOMYG00000035983 elavl3 (ENSOMYG00000038461) Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 42 ENSGT00730000110939.a.e ENSGT01060000248742.c ENSGT00940000154307.B.c.a.a.b ENSGT00940000154741.c.c ENSGT00940000158822.f ENSGT00940000160824.c ENSGT00940000163663.B.a.c ENSGT00950000182979.a.b.b.b.b.i.a.e ENSGT01100000263632.c ENSGT00390000002628.s ENSGT00550000075071.s.b ENSGT00940000157696.o ENSGT00390000008825.a.c.b.b ENSGT00390000009925.a.i ENSGT00390000009925.a.j.b ENSGT00940000164514.a.d.a #22 ENSGT00390000015579.a.a.b.g ENSGT00940000156278.r.a.a ENSGT00390000009825.e ENSGT00390000015916.o.a.b ENSGT00940000157809.i.b ENSGT00940000163288.a.b.b.a.p ENSGT00940000157809.j.b.gb.a ENSGT00940000157809.j.a.e.a.vb.a.a.a.b ENSGT00940000163288.a.b.b.b.a.a.a.a.m.a ENSGT00940000157809.j.a.e.a.vb.a.a.a.a.a ENSGT00940000163288.a.b.b.b.a.a.a.a.n.a.a ENSGT00940000157809.j.a.f ENSGT00940000163288.a.b.b.b.a.a.a.b.a.b.b.c ENSGT00940000157809.j.a.e.a.vb.b.b ENSGT00940000163288.a.b.b.b.a.a.a.b.a.a.b.b Chinook salmon MODERN SPECIES 2912 mgrn1b (ENSOTSG00005047608) ENSOTSG00005047613 #22 aanat2 (ENSOTSG00005047615) shisa9b (ENSOTSG00005047617) IGFALS (ENSOTSG00005047618) ENSOTSG00005047621 MYOF (ENSOTSG00005047636) gper1 (ENSOTSG00005047654) ube2ia (ENSOTSG00005047655) kctd5a (ENSOTSG00005047656) pdpk1a (ENSOTSG00005047658) ENSOTSG00005047716 il21r.1 (ENSOTSG00005047717) USP31 (ENSOTSG00005047718) ENSOTSG00005047720 hs3st2 (ENSOTSG00005047721) hs3st4 (ENSOTSG00005047722) Coho salmon MODERN SPECIES 1 ube2ia (ENSOKIG00005023157) BAIAP3 (ENSOKIG00005023218) gpr146 (ENSOKIG00005023250) gper1 (ENSOKIG00005023254) MYOF (ENSOKIG00005023425) ENSOKIG00005024442 IGFALS (ENSOKIG00005025057) shisa9b (ENSOKIG00005025062) ENSOKIG00005025074 ENSOKIG00005025096 snrnp25 (ENSOKIG00005025115) polr3k (ENSOKIG00005025142) cdip1 (ENSOKIG00005025193) ubald1b (ENSOKIG00005025204) mgrn1b (ENSOKIG00005025257) ENSOKIG00005025430 #22 aanat2 (ENSOKIG00005025440) rhbdf1a (ENSOKIG00005025519) mpg (ENSOKIG00005026077) nprl3 (ENSOKIG00005026150) hbba2 (ENSOKIG00005026549) ENSOKIG00005026594 ENSOKIG00005026674 ENSOKIG00005026701 ENSOKIG00005026711 HBE1 (ENSOKIG00005026724) ENSOKIG00005026731 ENSOKIG00005026751 ENSOKIG00005026762 HBE1 (ENSOKIG00005026771) hbae3 (ENSOKIG00005026782) Huchen MODERN SPECIES 2359 shisa9b (ENSHHUG00000052167) ENSHHUG00000052166 ENSHHUG00000052163 ENSHHUG00000052162 snrnp25 (ENSHHUG00000052160) polr3k (ENSHHUG00000052154) cdip1 (ENSHHUG00000052153) ubald1b (ENSHHUG00000052151) mgrn1b (ENSHHUG00000051999) ENSHHUG00000051996 #22 rhbdf1a (ENSHHUG00000051981) Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 193 ENSGT00390000008825.a.c.b.a ENSGT00390000009925.a.j ENSGT00940000164514.a.d.b #22 ENSGT00390000015579.a.a.b.h ENSGT00940000156278 ENSGT00390000009825 ENSGT00390000015916.o.a ENSGT00940000157809.i.a.b ENSGT00940000157809.j.b.fb ENSGT00940000163288.a.b.b.a.o ENSGT00940000163288.a.b.b.b.a.a.a.a.m.a ENSGT00940000157809.j.a.e.a.vb.a ENSGT00940000163288.a.b.b.b.a.a.a.a.n ENSGT00940000157809.j.a.f ENSGT00940000163288.a.b.b.b.a.a.a.b.a.b.b ENSGT00940000157809.j.a.e.a.vb.b.b ENSGT00940000163288.a.b.b.b.a.a.a.b.a.a.a ENSGT00940000161012.q.b Salmoninae_a DUPLICATION Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 99 ENSGT00730000110939.a.e ENSGT01060000248742.c ENSGT00940000154307.B.c.a.a.b ENSGT00940000154741.c.c ENSGT00940000158822.f ENSGT00940000160824.c ENSGT00940000163663.B.a.c ENSGT00950000182979.a.b.b.b.b.i.a.e ENSGT01100000263632 ENSGT00390000002628.t ENSGT00550000075071.t ENSGT00940000157696.o ENSGT00390000008825.a.c.b.b ENSGT00390000009925.a.i ENSGT00940000164514.a.d.a #22 ENSGT00940000164514.a.d.b.a #22 ENSGT00390000015579.a.a.b.g ENSGT00940000156278 ENSGT00390000009825.e ENSGT00390000015916.o.a.b ENSGT00940000157809.i.b ENSGT00940000163288.a.b.b.a.p ENSGT00940000157809.j.b.gb.a ENSGT00940000157809.j.a.e.a.vb.a.b ENSGT00940000163288.a.b.b.b.a.a.a.a.m.b ENSGT00940000157809.j.a.e.a.vb.a.a.a.a.b.a ENSGT00940000163288.a.b.b.b.a.a.a.a.n.a ENSGT00940000157809.j.a.e.a.vb.a.a.b ENSGT00940000157809.j.a.f ENSGT00940000163288.a.b.b.b.a.a.a.b.a.b.b ENSGT00940000157809.j.a.e.a.vb.b.b Salmo ANCESTRAL SPECIES 308 ENSGT00940000164514.a.d.b.a #22 ENSGT00390000015579.a.a.b.g ENSGT00940000156278.s.b ENSGT00390000009825.e ENSGT00390000015916.o.a.b River trout MODERN SPECIES BAIAP3 (ENSSTUG00000000295) ENSSTUG00000000303 gpr146 (ENSSTUG00000000305) gper1 (ENSSTUG00000000307) MYOF (ENSSTUG00000000331) ENSSTUG00000000465 IGFALS (ENSSTUG00000000512) ENSSTUG00000000514 shisa9b (ENSSTUG00000000517) ENSSTUG00000000520 snrnp25 (ENSSTUG00000000545) polr3k (ENSSTUG00000000551) cdip1 (ENSSTUG00000000559) ubald1b (ENSSTUG00000000565) mgrn1b (ENSSTUG00000000633) ENSSTUG00000001210 #22 aanat2 (ENSSTUG00000001214) rhbdf1a (ENSSTUG00000001234) mpg (ENSSTUG00000001309) nprl3 (ENSSTUG00000001358) ENSSTUG00000001634 hbba2 (ENSSTUG00000001645) ENSSTUG00000001675 HBE1 (ENSSTUG00000001703) HBE1 (ENSSTUG00000001719) ENSSTUG00000001727 HBE1 (ENSSTUG00000001741) ENSSTUG00000001750 ENSSTUG00000001774 ENSSTUG00000001782 hbae3 (ENSSTUG00000001788) Atlantic salmon MODERN SPECIES 25 ENSSSAG00000055541 UBC9B (ENSSSAG00000055512) ENSSSAG00000082220 gpr146 (ENSSSAG00000096111) gper1 (ENSSSAG00000098367) ENSSSAG00000046935 ENSSSAG00000046204 ENSSSAG00000117969 shisa9b (ENSSSAG00000046166) ENSSSAG00000046151 cp033 (ENSSSAG00000046131) polr3k (ENSSSAG00000046113) cdip1 (ENSSSAG00000099369) f100a (ENSSSAG00000046095) mgrn1b (ENSSSAG00000046020) ENSSSAG00000121236 #22 aanat2 (ENSSSAG00000085086) rhbdf1a (ENSSSAG00000092858) mpg (ENSSSAG00000045948) nprl3 (ENSSSAG00000045099) ENSSSAG00000087439 ENSSSAG00000106288 ENSSSAG00000065229 ENSSSAG00000086616 HBB (ENSSSAG00000045065) ENSSSAG00000102409 HBA4 (ENSSSAG00000017138) ENSSSAG00000119552 ENSSSAG00000087487 ENSSSAG00000044836 ENSSSAG00000065398 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164514.a.d.b.a #22 Rainbow trout MODERN SPECIES 3 gpr146 (ENSOMYG00000004833) gper1 (ENSOMYG00000004849) ENSOMYG00000063247 ENSOMYG00000009738 ENSOMYG00000022728 ENSOMYG00000022799 ENSOMYG00000022878 shisa9b (ENSOMYG00000022884) ENSOMYG00000020852 snrnp25 (ENSOMYG00000020817) polr3k (ENSOMYG00000073888) cdip1 (ENSOMYG00000072290) ENSOMYG00000068786 ubald1b (ENSOMYG00000020767) mgrn1b (ENSOMYG00000018566) 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ENSGT00390000009925.a.i ENSGT00940000164514.a.d.b.b #22 ENSGT00390000015579.a.a.b.h ENSGT00940000156278.s.a ENSGT00390000009825.f ENSGT00390000015916.o.a.a ENSGT00940000157809.i.a.b ENSGT00940000157809.j.b.fb.c ENSGT00940000163288.a.b.b.a.o ENSGT00940000157809.j.b.fb.d ENSGT00940000163288.a.b.b.b.b.h.a.a ENSGT00940000157809.j.a.e.a.vb.a.a.a.a.b.a ENSGT00940000163288.a.b.b.b.a.a.a.a.m.b ENSGT00940000163288.a.b.b.b.a.a.a.a.n.b ENSGT00940000157809.j.a.f ENSGT00940000163288.a.b.b.b.a.a.a.b.a.b.b ENSGT00940000161012.q.b Atlantic salmon MODERN SPECIES 22 ENSSSAG00000091048 kctd5a (ENSSSAG00000099179) UBC9B (ENSSSAG00000041047) ENSSSAG00000091900 gpr146 (ENSSSAG00000097402) gper1 (ENSSSAG00000114707) ENSSSAG00000041494 ENSSSAG00000059518 ENSSSAG00000114797 shisa9b (ENSSSAG00000118252) ENSSSAG00000061058 ENSSSAG00000086275 polr3k (ENSSSAG00000061173) ubald1b (ENSSSAG00000061233) mgrn1b (ENSSSAG00000061316) ENSSSAG00000063759 #22 aanat2 (ENSSSAG00000045980) rhbdf1a (ENSSSAG00000063779) mpg 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kank2 (ENSSTUG00000013455) hbae3 (ENSSTUG00000013496) DOCK6 (ENSSTUG00000013593) elavl3 (ENSSTUG00000015497) Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00550000075088.a.a.f.b ENSGT00730000110939.a.f ENSGT01060000248742.d ENSGT00940000154307.B.c.a.a.a ENSGT00940000154741.c.d ENSGT00940000158822.e ENSGT00940000160824.d ENSGT00940000163663.B.a.d ENSGT00950000182979.a.b.b.b.b.i.a.f ENSGT01100000263632.d ENSGT00390000002628.t ENSGT00550000075071.s.a ENSGT00940000157696.p ENSGT00390000008825.a.c.b.a ENSGT00390000009925.a.j.a ENSGT00940000164514.a.d.b.b #22 ENSGT00390000015579.a.a.b.h ENSGT00940000156278.r.a.b ENSGT00390000009825.f ENSGT00390000015916.o.a.a ENSGT00940000157809.j.a.e.a.vb.a.a.a.a.b.a ENSGT00990000206851.b ENSGT00940000157809.i.a.b ENSGT00940000163288.a.b.b.b.b.g Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 58 ENSGT00550000075088.a.a.f.b ENSGT00730000110939.a.f ENSGT01060000248742.d ENSGT00940000154307.B.c.a.a.a ENSGT00940000154741.c.d ENSGT00940000158822.e ENSGT00940000160824.d ENSGT00940000163663.B.a.d ENSGT00950000182979.a.b.b.b.b.i.a.f ENSGT01100000263632.d ENSGT00390000002628.t ENSGT00550000075071.s.a ENSGT00940000157696.p ENSGT00390000008825.a.c.b.a ENSGT00390000009925.a.j.a ENSGT00940000164514.a.d.b.b #22 ENSGT00390000015579.a.a.b.h ENSGT00940000156278.r.a.b ENSGT00390000009825.f ENSGT00390000015916.o.a.a ENSGT00940000163288.a.b.b.a.o ENSGT00940000157809.j.b.fb ENSGT00940000157809.i.a.b ENSGT00940000163288.a.b.b.b.b.g Chinook salmon MODERN SPECIES 33 mgp (ENSOTSG00005047826) ENSOTSG00005047825 ENSOTSG00005047824 ENSOTSG00005047823 ddx47 (ENSOTSG00005047822) MYH10 (ENSOTSG00005038983) rad23aa (ENSOTSG00005038594) ENSOTSG00005038593 MRTFB (ENSOTSG00005038592) ENSOTSG00005038590 snrnp25 (ENSOTSG00005038586) polr3k (ENSOTSG00005038585) cdip1 (ENSOTSG00005038584) ubald1b (ENSOTSG00005038583) mgrn1b (ENSOTSG00005038580) ENSOTSG00005038568 #22 aanat2 (ENSOTSG00005038567) rhbdf1a (ENSOTSG00005038508) mpg (ENSOTSG00005038505) nprl3 (ENSOTSG00005038093) 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ENSGT00440000038603 ENSGT01030000236780 ENSGT00940000175733 ENSGT00730000110975 ENSGT00940000163663.B.b ENSGT00940000165873 ENSGT00390000004394 ENSGT00950000182979.a.b.b.b.b.i.b ENSGT00390000008825.a.b ENSGT00390000009925.a.k.b ENSGT00940000164514.a #22 ENSGT00940000156278.se ENSGT00940000154590 ENSGT00940000157809.j.a.e.b.a ENSGT00940000163288.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000165638.b ENSGT00940000158476.b ENSGT00390000001390.a.b ENSGT00940000165638.a.a ENSGT00940000159304 #34 ENSGT00940000156372 #33 ENSGT00940000156201.a.a #32 ENSGT00940000157625.a.b.c ENSGT01030000235046 ENSGT00920000149163 ENSGT00940000160577 Channel catfish MODERN SPECIES 4 Mafk (ENSIPUG00000001579) tomm22 (ENSIPUG00000001590) dmc1 (ENSIPUG00000001598) Gspt1 (ENSIPUG00000001655) rsl1d1 (ENSIPUG00000001677) ENSIPUG00000001685 tnfrsf17 (ENSIPUG00000001693) snx29 (ENSIPUG00000001708) shisa9 (ENSIPUG00000001767) cpped1 (ENSIPUG00000001771) ercc4 (ENSIPUG00000001779) mkl2 (ENSIPUG00000001798) ENSIPUG00000001839 ubald1a 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arhgap17a (ENSCARG00000010081) #32 grid2ipb (ENSCARG00000010421) pgp (ENSCARG00000010577) bricd5 (ENSCARG00000010585) MEIOB (ENSCARG00000010601) msrb1b (ENSCARG00000010651) neurl2 (ENSCARG00000010661) Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000161112.a ENSGT00390000016475.w ENSGT00760000119398.d ENSGT00940000155582.q.b.b ENSGT00440000038603.v ENSGT01030000236780.b ENSGT00940000175733.d ENSGT00730000110975.j ENSGT00940000163663.B.b.e ENSGT00940000165873.a.b ENSGT00390000004394.i ENSGT00950000182979.a.b.b.b.b.i.b.b ENSGT00940000163474 ENSGT00390000008825.b.b.d.a ENSGT00390000009925.a.k.b.b ENSGT00940000164514.a.f #22 ENSGT00940000156278.pe.a ENSGT00940000154590.d ENSGT00940000157809.j.a.e.b.a.b ENSGT00940000157809.j.a.e.b.b.a.a ENSGT00940000157809.j.a.e.b.a.a.a ENSGT00940000163288.a.b.b.b.a.b.b ENSGT00940000165638.b ENSGT00940000159304.e #34 ENSGT00940000156372.p #33 ENSGT00940000156201.a.a.a #32 ENSGT00940000157625.a.b.a ENSGT00920000149163.e ENSGT00940000160577.f ENSGT00930000150969.B.b ENSGT00390000014795.g.a Common carp reference MODERN SPECIES 25 tmem184ba (ENSCCRG00000070789) dmc1 (ENSCCRG00000075552) gspt1 (ENSCCRG00000017371) rsl1d1 (ENSCCRG00000017375) ENSCCRG00000017328 ENSCCRG00000017532 ENSCCRG00000017535 SNX29 (ENSCCRG00000027039) shisa9a (ENSCCRG00000017582) ENSCCRG00000069544 ercc4 (ENSCCRG00000017588) MRTFB (ENSCCRG00000055428) ENSCCRG00000023470 ENSCCRG00000058219 mgrn1a (ENSCCRG00000017601) foxj1b (ENSCCRG00000017776) #22 ENSCCRG00000047557 hbae4 (ENSCCRG00000048220) hbae4 (ENSCCRG00000076628) hbbe3 (ENSCCRG00000026395) hbbe2 (ENSCCRG00000048225) hbae5 (ENSCCRG00000048228) aqp8a.2 (ENSCCRG00000054783) aqp8a.1 (ENSCCRG00000022389) #34 lcmt1 (ENSCCRG00000022341) #33 arhgap17a (ENSCCRG00000015365) #32 grid2ipb (ENSCCRG00000019630) zdhhc4 (ENSCCRG00000076926) pgp (ENSCCRG00000081685) bricd5 (ENSCCRG00000056246) mlst8 (ENSCCRG00000019540) Golden-line barbel MODERN SPECIES 56 maff (ENSSGRG00000000695) tomm22 (ENSSGRG00000000696) GSPT2 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