Gnathostomata DUPLICATION Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES 210 ENSGT00390000002628 ENSGT00550000075071 ENSGT00940000157696 ENSGT00390000008825.b.a.a ENSGT00390000009925.a ENSGT00940000164514.a #22 ENSGT00390000015579.a.a.b ENSGT00940000156278 ENSGT00940000154590 ENSGT00940000157809 ENSGT00950000183213.a.a.b ENSGT00530000063694.a ENSGT00390000004566 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 51 ENSGT00390000001488 ENSGT00940000162720.a.b.a ENSGT01030000234862 ENSGT00440000038603 ENSGT00940000155582 ENSGT00730000110975 ENSGT00940000165640 ENSGT00940000163663.B ENSGT00390000004394 ENSGT00940000178019 ENSGT00390000002628 ENSGT00550000075071 ENSGT00940000157696 ENSGT00390000008825.a ENSGT00390000009925.a ENSGT00940000164514.a #22 ENSGT00390000015579.a.a.b ENSGT00940000156278 ENSGT00390000009825 ENSGT00390000015916 ENSGT00940000154590 ENSGT00940000157809 ENSGT00940000155004 ENSGT00950000182803.A.a.b Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 227 ENSGT00390000002628 ENSGT00550000075071 ENSGT00940000157696 ENSGT00390000008825.a ENSGT00390000009925.a ENSGT00940000164514.a #22 ENSGT00940000156278 ENSGT00390000009825 ENSGT00390000015916 ENSGT00940000158623 ENSGT00940000154590 ENSGT00940000157809 ENSGT00940000155004 ENSGT00950000183213.a.a.b ENSGT01020000230627 ENSGT00530000063694.a ENSGT00940000164148.a.b ENSGT00390000004566 Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164514.a #22 Anura ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164514.a #22 Frog MODERN SPECIES 9 ENSXETG00000041576 #7 anks3 (ENSXETG00000010323) #8 ENSXETG00000010322 #9 cluap1 (ENSXETG00000010321) #10 nlrc3 (ENSXETG00000032463) #11 slx4 (ENSXETG00000010319) #12 trap1 (ENSXETG00000033239) #13 crebbp (ENSXETG00000010317) #14 srl (ENSXETG00000045941) #15 tfap4 (ENSXETG00000033922) #16 glis2 (ENSXETG00000036796) #17 pam16 (ENSXETG00000048846) #18 vasn (ENSXETG00000017309) #19 coro7 (ENSXETG00000034093) #20 dnaja3 (ENSXETG00000031809) #21 foxj1.2 (ENSXETG00000024431) #22 naa60 (ENSXETG00000031356) #23 c7orf26 (ENSXETG00000017304) #24 dnase1l2 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VASN (ENSLLEG00000027752) #19 ENSLLEG00000027743 CORO7 (ENSLLEG00000027386) #20 GLIS2 (ENSLLEG00000027340) #17 TFAP4 (ENSLLEG00000027247) #16 ENSLLEG00000027222 SRL (ENSLLEG00000027162) #15 ADCY9 (ENSLLEG00000027073) Leishan spiny toad MODERN SPECIES 1612 ENSLLEG00000027291 #22 Amniota ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164514.a #22 Sauria ANCESTRAL SPECIES 42 ENSGT00940000161859 ENSGT00390000006233.c.a.a ENSGT00940000160198 ENSGT00530000063694.a ENSGT00950000183213.a.a.b ENSGT01020000230627.b ENSGT00390000002827 ENSGT00940000158458 ENSGT01100000263515.a.a ENSGT00390000005678 #26 ENSGT00950000182846.b.r #25 ENSGT00950000182846.b.q #25 ENSGT00390000011370 #24 ENSGT00390000008314 #23 ENSGT00390000016224.j.b ENSGT00940000164514.a #22 ENSGT00390000009925.a ENSGT00390000008825.a ENSGT00940000162979 ENSGT00940000157696 ENSGT00390000017673.a ENSGT00940000160872 ENSGT00940000155280 #21 ENSGT00940000159318 #19 ENSGT00940000156606 #20 ENSGT00390000012037 #18 ENSGT00940000158383 #17 ENSGT00390000015189 #16 ENSGT00940000157834 #15 ENSGT00940000155577 ENSGT00940000155364 #14 Archelosauria ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000161859 ENSGT00390000006233.c.a.a ENSGT00940000160198 ENSGT00530000063694.a ENSGT00950000183213.a.a.b ENSGT01020000230627.b ENSGT00390000002827 ENSGT00940000158458 ENSGT01100000263515.a.a ENSGT00390000005678 #26 ENSGT00950000182846.b.r #25 ENSGT00950000182846.b.q #25 ENSGT00390000011370 #24 ENSGT00390000008314 #23 ENSGT00390000016224.j.b ENSGT00940000164514.a #22 ENSGT00390000009925.a ENSGT00390000008825.a ENSGT00940000162979 ENSGT00940000157696 ENSGT00390000017673.a ENSGT01100000263491.a.b.a.a.a.a.a.b.c.b ENSGT00940000163050.o.b ENSGT00390000014091 #12 ENSGT01020000230401.b.b #13 ENSGT00940000155364 #14 ENSGT00940000155577 ENSGT00940000157834 #15 ENSGT00990000209506 ENSGT00390000015189 #16 ENSGT00940000158383 #17 Cryptodira ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000017359 ENSGT00940000156947 ENSGT00940000161859 ENSGT00390000006233.c.a.a ENSGT00530000063694.a ENSGT00950000183213.a.a.b ENSGT00390000002827 ENSGT00940000158458 ENSGT01100000263515.a.a ENSGT00390000005678 #26 ENSGT00950000182846.b.r #25 ENSGT00950000182846.b.q #25 ENSGT00390000011370 #24 ENSGT00390000008314 #23 ENSGT00390000016224.j.b ENSGT00940000164514.a #22 ENSGT00390000009925.a ENSGT00390000008825.a ENSGT00940000162979 ENSGT00940000157696 ENSGT00390000017673.a ENSGT00940000163050.o.b ENSGT00390000014091 #12 ENSGT01020000230401.b.b #13 ENSGT00940000155364 #14 ENSGT00940000155577 ENSGT00940000157834 #15 ENSGT00990000209506 ENSGT00390000015189 #16 ENSGT00940000158383 #17 ENSGT00390000012037 #18 Testudinoidea ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000156947 ENSGT00940000161859 ENSGT00390000006233.c.a.a ENSGT00940000160198 ENSGT00530000063694.a ENSGT00950000183213.a.a.b ENSGT00390000002827 ENSGT00940000158458 ENSGT01100000263515.a.a ENSGT00390000005678 #26 ENSGT00950000182846.b.r.a #25 ENSGT00950000182846.b.q #25 ENSGT00390000011370 #24 ENSGT00390000008314 #23 ENSGT00390000016224.j.b ENSGT00940000164514.a #22 ENSGT00390000009925.a ENSGT00390000008825.a ENSGT00940000162979 ENSGT00940000157696 ENSGT00390000017673.a ENSGT00390000014091 #12 ENSGT01020000230401.b.b #13 ENSGT00940000155364 #14 ENSGT00940000155577 ENSGT00940000157834 #15 ENSGT00990000209506 ENSGT00390000015189 #16 ENSGT00940000158383 #17 ENSGT00390000012037 #18 ENSGT00940000156606 #20 Emydidae ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000156947 ENSGT00940000161859 ENSGT00390000006233.c.a.a ENSGT00940000160198 ENSGT00530000063694.a ENSGT00950000183213.a.a.b ENSGT00390000002827 ENSGT00940000158458 ENSGT01100000263515.a.a ENSGT00390000005678 #26 ENSGT00950000182846.b.r.a #25 ENSGT00950000182846.b.q #25 ENSGT00390000011370 #24 ENSGT00390000008314 #23 ENSGT00390000016224.j.b ENSGT00940000164514.a #22 ENSGT00390000009925.a ENSGT00390000008825.a ENSGT00940000157696 ENSGT00390000017673.a painted turtle MODERN SPECIES 1065 ECI1 (ENSCPBG00000011704) #26 DNASE1L2 (ENSCPBG00000011706) #25 DNASE1 (ENSCPBG00000011714) #25 INTS15 (ENSCPBG00000011722) #24 NAA60 (ENSCPBG00000011725) #23 NUDT16L1 (ENSCPBG00000011728) ENSCPBG00000011732 #22 MGRN1 (ENSCPBG00000011740) UBALD1 (ENSCPBG00000011759) CDIP1 (ENSCPBG00000011763) HMOX2 (ENSCPBG00000011766) ENSCPBG00000011767 Three-toed box turtle MODERN SPECIES 37 AXIN1 (ENSTMTG00000002708) PDIA2 (ENSTMTG00000002717) ARHGDIG (ENSTMTG00000002735) RGS11 (ENSTMTG00000002775) FAM234A (ENSTMTG00000002800) LUC7L (ENSTMTG00000002807) PERCC1 (ENSTMTG00000002814) CLCN7 (ENSTMTG00000002818) PTX4 (ENSTMTG00000002832) ECI1 (ENSTMTG00000002841) #26 DNASE1L2 (ENSTMTG00000002844) #25 DNASE1 (ENSTMTG00000002851) #25 INTS15 (ENSTMTG00000002854) #24 NAA60 (ENSTMTG00000002857) #23 NUDT16L1 (ENSTMTG00000002867) ENSTMTG00000002873 #22 MGRN1 (ENSTMTG00000002882) UBALD1 (ENSTMTG00000002895) CDIP1 (ENSTMTG00000002902) HMOX2 (ENSTMTG00000002906) Testudinidae ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000156947 ENSGT00940000161859 ENSGT00390000006233.c.a.a ENSGT00940000160198 ENSGT00530000063694.a ENSGT00950000183213.a.a.b ENSGT00390000002827 ENSGT00940000158458 ENSGT01100000263515.a.a ENSGT00390000005678 #26 ENSGT00950000182846.b.r.a #25 ENSGT00950000182846.b.q #25 ENSGT00390000011370 #24 ENSGT00390000008314 #23 ENSGT00390000016224.j.b ENSGT00940000164514.a #22 ENSGT00390000009925.a ENSGT00390000008825.a ENSGT00940000162979 ENSGT00940000157696 ENSGT00390000017673.a ENSGT00390000014091 #12 ENSGT01020000230401.b.b #13 ENSGT00940000155364 #14 ENSGT00940000155577 ENSGT00940000157834 #15 ENSGT00390000015189 #16 ENSGT00940000158383 #17 ENSGT00390000012037 #18 ENSGT00940000156606 #20 ENSGT00940000159318 #19 Goode s thornscrub tortoise MODERN SPECIES 1 AXIN1 (ENSGEVG00005007757) PDIA2 (ENSGEVG00005007638) ARHGDIG (ENSGEVG00005007585) RGS11 (ENSGEVG00005007468) FAM234A (ENSGEVG00005007429) LUC7L (ENSGEVG00005007405) PERCC1 (ENSGEVG00005007388) CLCN7 (ENSGEVG00005007308) PTX4 (ENSGEVG00005007266) ECI1 (ENSGEVG00005007248) #26 DNASE1L2 (ENSGEVG00005007217) #25 DNASE1 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(ENSPSIG00000008425) SRL (ENSPSIG00000008586) #15 TFAP4 (ENSPSIG00000009002) #16 Archosauria ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000161859 ENSGT00390000006233.c.a.a ENSGT00940000160198 ENSGT00530000063694.a ENSGT00950000183213.a.a.b ENSGT01020000230627.b ENSGT00390000002827 ENSGT00940000158458 ENSGT01100000263515.a.a ENSGT00390000005678 #26 ENSGT00950000182846.b.r #25 ENSGT00950000182846.b.q #25 ENSGT00390000011370 #24 ENSGT00390000008314 #23 ENSGT00390000016224.j.b ENSGT00940000164514.a #22 ENSGT00390000009925.a ENSGT00390000008825.a ENSGT00940000157696 ENSGT00390000017673.a ENSGT00940000163050.o.b.b ENSGT00940000163050.o.b.a ENSGT00390000014091 #12 ENSGT01020000230401.b.b #13 ENSGT00940000155364 #14 ENSGT00940000155577 ENSGT00940000157834 #15 ENSGT00990000209506 ENSGT00390000015189 #16 ENSGT00940000158383 #17 ENSGT00390000012037 #18 Australian saltwater crocodile MODERN SPECIES 42 NPRL3 (ENSCPRG00005003465) HBZ (ENSCPRG00005003462) AXIN1 (ENSCPRG00005003352) PDIA2 (ENSCPRG00005003327) 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ENSGT00940000157696 ENSGT00390000017673.a ENSGT00940000160872 ENSGT00940000155280 #21 ENSGT00940000159318 #19 ENSGT00940000156606 #20 ENSGT00390000012037 #18 ENSGT00940000158383 #17 ENSGT00390000015189 #16 ENSGT00940000157834 #15 ENSGT00940000155577 Episquamata ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000155366.a ENSGT00390000009447 ENSGT00390000016020 ENSGT00390000018542.b ENSGT00940000157803.a ENSGT00390000005386 ENSGT01100000263515.a.a ENSGT00940000158458 ENSGT00940000153167.A.b ENSGT00390000005678 #26 ENSGT00950000182846.b.r #25 ENSGT00950000182846.b.q #25 ENSGT00390000011370 #24 ENSGT00390000008314 #23 ENSGT00390000016224.j.b ENSGT00940000164514.a #22 ENSGT00390000009925.a ENSGT00940000157696 ENSGT00390000017673.a ENSGT00940000160872 ENSGT00940000155280 #21 ENSGT00940000156606 #20 ENSGT00940000159318 #19 ENSGT00390000012037 #18 ENSGT00940000158383 #17 ENSGT00390000015189 #16 ENSGT00940000157834 #15 ENSGT00940000155577 ENSGT01050000244814.a.a.a.a ENSGT00390000004566 ENSGT00390000008664 Laterata ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000155366.a ENSGT00390000009447 ENSGT00390000016020 ENSGT00390000018542.b ENSGT00940000157803.a ENSGT00390000005386 ENSGT01100000263515.a.a ENSGT00940000158458 ENSGT00940000153167.A.b ENSGT00390000005678 #26 ENSGT00950000182846.b.r #25 ENSGT00950000182846.b.q #25 ENSGT00390000011370 #24 ENSGT00390000008314 #23 ENSGT00390000016224.j.b ENSGT00940000164514.a #22 ENSGT00390000009925.a ENSGT00940000157696 ENSGT00390000017673.a ENSGT00940000160872 ENSGT00940000155280 #21 ENSGT00940000156606 #20 ENSGT00940000159318 #19 ENSGT00390000012037 #18 ENSGT00940000158383 #17 ENSGT00390000015189 #16 ENSGT00940000157834 #15 ENSGT00940000155577 ENSGT01050000244814.a.a.a.a ENSGT00390000004566 ENSGT00390000008664 Common wall lizard MODERN SPECIES 5 ENSPMRG00000014738 MMD2 (ENSPMRG00000014749) WIPI2 (ENSPMRG00000014768) SLC29A4 (ENSPMRG00000014802) TNRC18 (ENSPMRG00000014823) FBXL18 (ENSPMRG00000014889) ACTB (ENSPMRG00000014896) FSCN1 (ENSPMRG00000014927) RNF216 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NAA60 (ENSSMRG00000003755) #23 NUDT16L1 (ENSSMRG00000003756) ENSSMRG00000003764 #22 MGRN1 (ENSSMRG00000003772) ENSSMRG00000003818 ENSSMRG00000003822 HMOX2 (ENSSMRG00000003827) NMRAL1 (ENSSMRG00000003876) DNAJA3 (ENSSMRG00000003966) #21 ENSSMRG00000004381 CORO7 (ENSSMRG00000004537) #20 ENSSMRG00000006319 VASN (ENSSMRG00000006322) #19 GLIS2 (ENSSMRG00000006324) #17 TFAP4 (ENSSMRG00000006393) #16 SRL (ENSSMRG00000006440) #15 ADCY9 (ENSSMRG00000006446) GSG1L (ENSSMRG00000006468) Toxicofera ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000160271 ENSGT00940000155366.a ENSGT00390000009447 ENSGT00390000016020 ENSGT00390000018542.b ENSGT00940000157803.a ENSGT00390000005386 ENSGT01100000263515.a.a ENSGT00940000158458 ENSGT00940000153167.A.b ENSGT00390000005678 #26 ENSGT00950000182846.b.r #25 ENSGT00950000182846.b.q #25 ENSGT00390000011370 #24 ENSGT00390000008314 #23 ENSGT00940000164514.a #22 ENSGT00390000009925.a ENSGT00940000157696 ENSGT00390000017673.a ENSGT00940000155280 #21 ENSGT00940000159318 #19 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(ENSLACG00000017827) Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT01030000234862 ENSGT00440000038603 ENSGT00940000155582 ENSGT00730000110975 ENSGT00940000164324 ENSGT00940000165873 ENSGT00940000163663.B ENSGT00390000004394 ENSGT00940000173220 ENSGT00950000182979.a.b.b.b.b ENSGT00390000002628 ENSGT00550000075071 ENSGT00940000157696 ENSGT00390000008825.a ENSGT00390000009925.a ENSGT00940000164514.a #22 ENSGT00390000015579.a.a.b ENSGT00940000156278 ENSGT00390000009825 ENSGT00390000015916 ENSGT00940000154590 ENSGT00940000157809 ENSGT00940000155004 ENSGT00950000182803.A.a.b ENSGT01070000253837 ENSGT00940000153759.a.b ENSGT00940000154705.A ENSGT00390000005412 ENSGT00940000155563 ENSGT01050000244891.E ENSGT00390000002361 Neopterygii ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000155582 ENSGT00940000175733 ENSGT00730000110975 ENSGT00940000164324 ENSGT00940000165873 ENSGT00940000163663.B ENSGT00390000004394 ENSGT00940000173220 ENSGT00950000182979.a.b.b.b.b ENSGT00940000163474 ENSGT00390000002628 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ENSGT00940000156201.a.a #32 ENSGT00940000157625.a.b ENSGT01030000235046.a ENSGT00920000149163 ENSGT00940000160577 ENSGT00930000150969.B ENSGT00390000014795 ENSGT00390000001723 Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000161112 ENSGT00390000016475 ENSGT00760000119398 ENSGT00940000155582.q.b ENSGT00440000038603 ENSGT00940000177425 ENSGT00940000162720.a.b.a ENSGT00730000110975 ENSGT00940000163663.B.b ENSGT00940000165873 ENSGT00390000004394 ENSGT00950000182979.a.b.b.b.b.i.b ENSGT00940000163474 ENSGT01100000263632.b ENSGT00390000008825.a ENSGT00940000164514.a #22 ENSGT00940000154590 ENSGT00940000157809.j.a.e.b ENSGT00940000176976 ENSGT00940000163288.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000165638.a.b ENSGT00940000159304 #34 ENSGT00940000156372 #33 ENSGT00940000156201.a.a #32 ENSGT00940000157625.a.b ENSGT00920000149163 ENSGT00940000160577 ENSGT00930000150969.B ENSGT00390000014795 ENSGT00390000001723 ENSGT00940000165237.b.b Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000153861.b.a ENSGT00940000161112 ENSGT00390000016475 ENSGT00760000119398 ENSGT00940000155582.q.b ENSGT00440000038603 ENSGT00940000177425 ENSGT00940000162720.a.b.a ENSGT00730000110975 ENSGT00940000163663.B.b ENSGT00940000165873 ENSGT00390000004394 ENSGT00950000182979.a.b.b.b.b.i.b ENSGT01100000263632.b ENSGT00390000008825.a ENSGT00940000164514.a #22 ENSGT00940000154590 ENSGT00940000176976 ENSGT00940000157809.j.a.e.b ENSGT00940000163288.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000165638.a.b ENSGT00940000159304 #34 ENSGT00940000156372 #33 ENSGT00940000156201.a.a #32 ENSGT00940000157625.a.b ENSGT00920000149163 ENSGT00940000160577 ENSGT00930000150969.B ENSGT00390000014795 ENSGT00390000001723 ENSGT00940000165237.b.b Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 105 ENSGT00940000153861.b.a ENSGT00940000161112 ENSGT00390000016475 ENSGT00760000119398 ENSGT00940000155582.q.b ENSGT00440000038603 ENSGT00940000177425 ENSGT00940000162720.a.b.a ENSGT00730000110975 ENSGT00940000163663.B.b ENSGT00940000165873 ENSGT00390000004394 ENSGT00950000182979.a.b.b.b.b.i.b ENSGT01100000263632.b ENSGT00390000008825.a ENSGT00940000164514.a #22 ENSGT00940000154590 Mangrove rivulus MODERN SPECIES 43 ubald1b (ENSKMAG00000006734) foxj1b (ENSKMAG00000006749) #22 ENSKMAG00000006783 msrb1b (ENSKMAG00000006858) ENSKMAG00000006871 ENSKMAG00000006905 mlst8 (ENSKMAG00000007045) bricd5 (ENSKMAG00000007081) pgp (ENSKMAG00000007095) zdhhc4 (ENSKMAG00000007116) grid2ipb (ENSKMAG00000007141) arhgap17a (ENSKMAG00000007197) #32 lcmt1 (ENSKMAG00000007248) #33 ENSKMAG00000007283 hbae5 (ENSKMAG00000007296) hbbe3 (ENSKMAG00000007361) ENSKMAG00000007795 Turquoise killifish MODERN SPECIES 1621 MAFF (ENSNFUG00015019304) TOMM22 (ENSNFUG00015019305) GSPT2 (ENSNFUG00015019322) rsl1d1 (ENSNFUG00015020154) ENSNFUG00015020159 CR749182.1 (ENSNFUG00015020171) shisa9a (ENSNFUG00015020442) CPPED1 (ENSNFUG00015020445) ENSNFUG00015020449 ERCC4 (ENSNFUG00015020455) ENSNFUG00015020506 MKL2 (ENSNFUG00015020507) ENSNFUG00015020513 UBALD1A (ENSNFUG00015013615) ENSNFUG00015013623 FOXJ1B (ENSNFUG00015013628) #22 ENSNFUG00015013631 HBM (ENSNFUG00015013636) ENSNFUG00015013648 RAB26 (ENSNFUG00015013661) ENSNFUG00015013675 ENSNFUG00015013681 LMF1 (ENSNFUG00015013687) sox8a (ENSNFUG00015013693) ENSNFUG00015013752 cox19 (ENSNFUG00015015298) Nfu_g_1_022970 (ENSNFUG00015015309) ENSNFUG00015015318 sox9a (ENSNFUG00015015338) ENSNFUG00015015514 ENSNFUG00015015517 Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000153861.b.a ENSGT00940000161112 ENSGT00390000016475 ENSGT00760000119398 ENSGT00940000155582.q.b ENSGT00440000038603 ENSGT00940000162720.a.b.a ENSGT00730000110975 ENSGT00940000163663.B.b ENSGT00940000165873 ENSGT00390000004394 ENSGT00950000182979.a.b.b.b.b.i.b ENSGT00940000178019 ENSGT01100000263632.b ENSGT00390000008825.a ENSGT00940000164514.a #22 ENSGT00940000154590 ENSGT00940000176976 ENSGT00940000157809.j.a.e.b ENSGT00940000163288.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000165638.a.b ENSGT00940000159304 #34 ENSGT00940000156372 #33 ENSGT00940000156201.a.a #32 ENSGT00940000157625.a.b ENSGT00920000149163 ENSGT00940000160577 ENSGT00930000150969.B ENSGT00390000014795 ENSGT00390000001723 ENSGT00940000165237.b.b NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000153536.a.a.a.a ENSGT00940000153861.b.a.d ENSGT00940000161112 ENSGT00390000016475 ENSGT00760000119398 ENSGT00940000155582.q.b ENSGT00440000038603 ENSGT00940000168129 ENSGT00940000162720.a.b.a ENSGT00730000110975 ENSGT00940000163663.B.b ENSGT00940000165873 ENSGT00390000004394 ENSGT00950000182979.a.b.b.b.b.i.b ENSGT00390000008825.a ENSGT00940000164514.a #22 ENSGT00940000156278.xb.b ENSGT00940000156278.xb.a ENSGT00940000154590 ENSGT00940000157809.j.a.e.b ENSGT00940000176976 ENSGT00940000163288.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000165638.a.b ENSGT00940000159304 #34 ENSGT00940000156372 #33 ENSGT00940000156201.a.a #32 ENSGT00940000157625.a.b ENSGT00920000149163 ENSGT00940000160577 ENSGT00930000150969.B ENSGT00390000014795 Sheepshead minnow MODERN SPECIES 567 ENSCVAG00000006146 ercc4 (ENSCVAG00000006171) cpped1 (ENSCVAG00000006186) ENSCVAG00000006215 ubald1b (ENSCVAG00000006223) foxj1b (ENSCVAG00000006225) #22 ENSCVAG00000006259 hbae4 (ENSCVAG00000006268) ENSCVAG00000006305 ENSCVAG00000006378 cep131 (ENSCVAG00000006408) ENSCVAG00000006447 ENSCVAG00000006460 ENSCVAG00000006491 CRHR1 (ENSCVAG00000006507) FAM171A2 (ENSCVAG00000006523) grnb (ENSCVAG00000006563) ENSCVAG00000006578 ENSCVAG00000000745 Mummichog MODERN SPECIES 288 tmem184ba (ENSFHEG00000017182) maff (ENSFHEG00000017195) tomm22 (ENSFHEG00000017207) dmc1 (ENSFHEG00000017221) rsl1d1 (ENSFHEG00000017235) ENSFHEG00000017251 ENSFHEG00000017274 SNX29 (ENSFHEG00000017279) shisa9a (ENSFHEG00000017289) cpped1 (ENSFHEG00000017313) ercc4 (ENSFHEG00000017346) ENSFHEG00000017373 ENSFHEG00000017382 ENSFHEG00000017394 ubald1b (ENSFHEG00000017400) foxj1b (ENSFHEG00000017416) #22 ENSFHEG00000017427 ENSFHEG00000017438 hbae4 (ENSFHEG00000017446) hbbe3 (ENSFHEG00000017965) hbae5 (ENSFHEG00000018637) ENSFHEG00000018671 lcmt1 (ENSFHEG00000018726) #33 arhgap17a (ENSFHEG00000018784) #32 grid2ipb (ENSFHEG00000018842) Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000153536.a.a.a.a ENSGT00940000153861.b.a ENSGT00940000161112 ENSGT00390000016475 ENSGT00760000119398 ENSGT00940000155582.q.b ENSGT00440000038603 ENSGT00940000162720.a.b.a ENSGT00730000110975 ENSGT00940000163663.B.b ENSGT00940000165873 ENSGT00390000004394 ENSGT00950000182979.a.b.b.b.b.i.b ENSGT00940000178019 ENSGT00390000008825.a ENSGT00940000164514.a #22 ENSGT00940000154590 ENSGT00940000176976 ENSGT00940000157809.j.a.e.b ENSGT00940000163288.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000165638.a.b ENSGT00940000156372 #33 ENSGT00940000165237.b.b ENSGT00390000001723 ENSGT00390000014795 ENSGT00930000150969.B ENSGT00940000160577 ENSGT00920000149163 ENSGT00940000157625.a.b ENSGT00940000156201.a.a #32 ENSGT00510000047678.a.a.b Poecilia ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000153536.a.a.a.a ENSGT00940000153861.b.a ENSGT00940000161112 ENSGT00390000016475 ENSGT00760000119398 ENSGT00940000155582.q.b ENSGT00440000038603 ENSGT00940000162720.a.b.a ENSGT00730000110975 ENSGT00940000163663.B.b.a ENSGT00940000165873 ENSGT00390000004394 ENSGT00950000182979.a.b.b.b.b.i.b ENSGT00940000178019 ENSGT00390000008825.a ENSGT00940000164514.a #22 ENSGT00940000154590 ENSGT00940000157809.j.a.e.b ENSGT00940000163288.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000165638.a.b ENSGT00940000156372 #33 ENSGT00940000165237.b.b ENSGT00390000001723 ENSGT00390000014795 ENSGT00930000150969.B ENSGT00940000160577 ENSGT00920000149163 ENSGT00940000157625.a.b ENSGT00940000156201.a.a #32 ENSGT00940000159689 ENSGT00940000164352.a NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 453 ENSGT00940000165873 ENSGT00390000004394 ENSGT00950000182979.a.b.b.b.b.i.b ENSGT00940000178019 ENSGT00390000008825.a ENSGT00940000164514.a #22 Sailfin molly MODERN SPECIES 1717 ENSPLAG00000013795 ENSPLAG00000013779 ubald1b (ENSPLAG00000013772) foxj1b (ENSPLAG00000013768) #22 ENSPLAG00000013750 Amazon molly MODERN SPECIES 1026 cpped1 (ENSPFOG00000004295) ercc4 (ENSPFOG00000004300) ENSPFOG00000004404 ercc4 (ENSPFOG00000023739) ubald1b (ENSPFOG00000004566) foxj1b (ENSPFOG00000004597) #22 Guppy MODERN SPECIES 449 csnk1e (ENSPREG00000017059) tmem184ba (ENSPREG00000017044) maff (ENSPREG00000017016) cby1 (ENSPREG00000016996) dmc1 (ENSPREG00000016716) gspt1 (ENSPREG00000016668) rsl1d1 (ENSPREG00000016619) ENSPREG00000016603 ENSPREG00000016592 ENSPREG00000016582 shisa9a (ENSPREG00000016559) ercc4 (ENSPREG00000016530) MRTFB (ENSPREG00000016477) ENSPREG00000016457 ubald1b (ENSPREG00000016448) foxj1b (ENSPREG00000016437) #22 ENSPREG00000016408 hbae4 (ENSPREG00000016396) hbbe3 (ENSPREG00000016388) hbae5 (ENSPREG00000015837) ENSPREG00000015771 lcmt1 (ENSPREG00000015745) #33 ENSPREG00000015733 ENSPREG00000015701 pgp (ENSPREG00000015686) zdhhc4 (ENSPREG00000015676) grid2ipb (ENSPREG00000015659) ENSPREG00000015650 neurl2 (ENSPREG00000015640) ENSPREG00000015592 noxo1b (ENSPREG00000015576) Platyfish MODERN SPECIES 1 csnk1e (ENSXMAG00000016023) tmem184ba (ENSXMAG00000012572) maff 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shisa9a (ENSORLG00000002882) cpped1 (ENSORLG00000002926) ercc4 (ENSORLG00000002948) MRTFB (ENSORLG00000002977) ENSORLG00000024641 ubald1b (ENSORLG00000028679) foxj1b (ENSORLG00000025879) #22 ENSORLG00000002983 ENSORLG00000020174 hbae4 (ENSORLG00000002990) hbbe2 (ENSORLG00000026120) ENSORLG00000003020 ENSORLG00000003046 ENSORLG00000003054 lcmt1 (ENSORLG00000003071) #33 arhgap17a (ENSORLG00000028308) #32 grid2ipb (ENSORLG00000030008) zdhhc4 (ENSORLG00000003085) pgp (ENSORLG00000003089) bricd5 (ENSORLG00000028325) mlst8 (ENSORLG00000003112) ENSORLG00000003120 Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000153536.a.a.a.a ENSGT00940000153861.b.a ENSGT00940000161112 ENSGT00390000016475 ENSGT00760000119398 ENSGT00940000155582.q.b ENSGT00440000038603 ENSGT00940000162720.a.b.a ENSGT00730000110975 ENSGT00940000163663.B.b ENSGT00940000165873 ENSGT00390000004394 ENSGT00950000182979.a.b.b.b.b.i.b ENSGT01100000263632.b ENSGT00390000008825.a ENSGT00940000164514.a #22 ENSGT01000000214725.F 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SPECIES 2177 ubald1b (ENSAOCG00000000682) foxj1b (ENSAOCG00000010884) #22 ENSAOCG00000010864 hbae4 (ENSAOCG00000010824) hbbe3 (ENSAOCG00000010818) ENSAOCG00000010811 hbae5 (ENSAOCG00000010791) ENSAOCG00000010775 aqp8a.1 (ENSAOCG00000010754) #34 lcmt1 (ENSAOCG00000010742) #33 arhgap17a (ENSAOCG00000010702) #32 Orange clownfish MODERN SPECIES 10 ENSAPEG00000003634 tomm22 (ENSAPEG00000003623) dmc1 (ENSAPEG00000003399) gspt1 (ENSAPEG00000003359) rsl1d1 (ENSAPEG00000003334) ENSAPEG00000003316 ENSAPEG00000003304 SNX29 (ENSAPEG00000003272) shisa9a (ENSAPEG00000003215) cpped1 (ENSAPEG00000003168) ercc4 (ENSAPEG00000003113) ENSAPEG00000003101 ENSAPEG00000003060 ENSAPEG00000003032 ubald1b (ENSAPEG00000002998) foxj1b (ENSAPEG00000002988) #22 ENSAPEG00000002884 hbae4 (ENSAPEG00000002862) hbbe3 (ENSAPEG00000002857) ENSAPEG00000002835 hbae5 (ENSAPEG00000002815) ENSAPEG00000002779 aqp8a.1 (ENSAPEG00000002773) #34 lcmt1 (ENSAPEG00000002717) #33 arhgap17a (ENSAPEG00000002629) #32 grid2ipb 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ENSGT00920000149163 ENSGT00940000160577 ENSGT00930000150969.B ENSGT00390000014795 ENSGT00390000001723 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000155133.a.a.b ENSGT00940000153692.B.a ENSGT00950000183015.B.a.a ENSGT00390000016475 ENSGT00760000119398 ENSGT00940000155582.q.b ENSGT00440000038603 ENSGT00940000162720.a.b.a ENSGT00730000110975 ENSGT00940000163663.B.b ENSGT00940000165873 ENSGT00390000004394 ENSGT00950000182979.a.b.b.b.b.i.b ENSGT01100000263632.b ENSGT00390000008825.a ENSGT00940000164514.a #22 ENSGT00940000154590 ENSGT00940000157809.j.a.e.b ENSGT00940000176976 ENSGT00940000163288.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000165638.a.b ENSGT00940000159304 #34 ENSGT00940000156372 #33 ENSGT00940000156201.a.a #32 ENSGT00940000157625.a.b ENSGT00920000149163 ENSGT00940000160577 ENSGT00930000150969.B ENSGT00390000014795 ENSGT00390000001723 ENSGT00940000165237.b.b Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000153692.B.a ENSGT00950000183015.B.a.a ENSGT00390000016475 ENSGT00760000119398 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ENSGT00940000156372 #33 ENSGT00940000156201.a.a #32 ENSGT00940000157625.a.b ENSGT01030000235046.a ENSGT00920000149163 ENSGT00940000160577 ENSGT00930000150969.B ENSGT00390000014795 ENSGT00390000001723 Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000153536.a.a.a.a ENSGT00940000153861.b.a ENSGT00940000161112 ENSGT00390000016475 ENSGT00760000119398 ENSGT00940000155582.q.b ENSGT00440000038603 ENSGT00940000162720.a.b.a ENSGT00730000110975 ENSGT00940000163663.B.b ENSGT00940000165873 ENSGT00390000004394 ENSGT00950000182979.a.b.b.b.b.i.b ENSGT01100000263632.b ENSGT00390000008825.a ENSGT00940000164514.a #22 ENSGT00940000154590 ENSGT00940000163288.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000165638.a.b ENSGT00940000156372 #33 ENSGT00940000156201.a.a #32 ENSGT00940000157625.a.b ENSGT00920000149163 ENSGT00940000160577 ENSGT00930000150969.B ENSGT00390000014795 ENSGT00390000001723 ENSGT00940000165237.b.b ENSGT00510000047678.a.a.b ENSGT00940000159689 ENSGT00940000164352.a Lumpfish MODERN SPECIES 10 ENSCLMG00005001407 csnk1e 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hbae4 (ENSSMAG00000021725) ENSSMAG00000008459 ENSSMAG00000008469 aqp8a.1 (ENSSMAG00000008477) #34 lcmt1 (ENSSMAG00000008498) #33 arhgap17a (ENSSMAG00000008554) #32 grid2ipb (ENSSMAG00000008656) ENSSMAG00000008695 zdhhc4 (ENSSMAG00000008696) pgp (ENSSMAG00000008748) bricd5 (ENSSMAG00000008752) mlst8 (ENSSMAG00000008770) ENSSMAG00000008821 Tongue sole MODERN SPECIES 18 tomm22 (ENSCSEG00000019726) maff (ENSCSEG00000019729) tmem184ba (ENSCSEG00000019733) csnk1e (ENSCSEG00000019742) ENSCSEG00000019747 ENSCSEG00000019764 ENSCSEG00000019772 ENSCSEG00000019775 pdap1a (ENSCSEG00000019786) cby1 (ENSCSEG00000019788) ENSCSEG00000019792 ENSCSEG00000019796 ENSCSEG00000019805 csdc2a (ENSCSEG00000019828) ubald1b (ENSCSEG00000019833) foxj1b (ENSCSEG00000019836) #22 ENSCSEG00000020070 ENSCSEG00000020096 CDR2L (ENSCSEG00000020098) ENSCSEG00000020100 sap30bp (ENSCSEG00000020102) itgb4 (ENSCSEG00000020114) zgc:194990 (ENSCSEG00000020197) ENSCSEG00000020204 h3f3a (ENSCSEG00000020207) unk 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ENSGT00390000008825.a.c.a.a ENSGT00940000164514.a.c.a #22 ENSGT00940000156278.r.b ENSGT00940000154590.e ENSGT01000000215398.b ENSGT00940000157809.j.a.e.b.k ENSGT00940000163288.a.b.b.b.a.a.a.b.b ENSGT00940000165638.a.a.d ENSGT00940000159304.o.b #34 ENSGT00940000165638.b.a.a ENSGT00940000156372.s #33 ENSGT00940000156201.a.a.e #32 ENSGT00940000157625.a.b.f ENSGT00920000149163.i ENSGT00940000160577.a ENSGT00930000150969.B.f ENSGT00390000014795 Chinook salmon MODERN SPECIES 17 ENSOTSG00005045192 maff (ENSOTSG00005045193) tomm22 (ENSOTSG00005045194) dmc1 (ENSOTSG00005045195) gspt1 (ENSOTSG00005045209) ENSOTSG00005045661 ENSOTSG00005045662 SNX29 (ENSOTSG00005045663) shisa9a (ENSOTSG00005045820) cpped1 (ENSOTSG00005045823) ercc4 (ENSOTSG00005045847) MRTFB (ENSOTSG00005045848) ENSOTSG00005045849 ENSOTSG00005045850 UBALD1 (ENSOTSG00005045851) foxj1b (ENSOTSG00005045852) #22 ENSOTSG00005045853 hbae4 (ENSOTSG00005045893) ENSOTSG00005045895 ENSOTSG00005045896 ENSOTSG00005045898 ENSOTSG00005045899 ENSOTSG00005045900 lcmt1 (ENSOTSG00005045901) #33 arhgap17a (ENSOTSG00005045945) #32 grid2ipb (ENSOTSG00005003040) zdhhc4 (ENSOTSG00005003049) pgp (ENSOTSG00005003056) bricd5 (ENSOTSG00005003058) mlst8 (ENSOTSG00005003063) ENSOTSG00005003074 Coho salmon MODERN SPECIES 17 csnk1e (ENSOKIG00005006292) tmem184ba (ENSOKIG00005006343) maff (ENSOKIG00005006375) tomm22 (ENSOKIG00005006384) dmc1 (ENSOKIG00005006425) gspt1 (ENSOKIG00005006595) ENSOKIG00005007120 ENSOKIG00005007134 ENSOKIG00005007143 SNX29 (ENSOKIG00005007189) shisa9a (ENSOKIG00005007313) ercc4 (ENSOKIG00005007341) MRTFB (ENSOKIG00005007433) ENSOKIG00005007466 UBALD1 (ENSOKIG00005007477) foxj1b (ENSOKIG00005007486) #22 ENSOKIG00005007524 hbae4 (ENSOKIG00005008121) ENSOKIG00005008152 ENSOKIG00005008166 ENSOKIG00005008182 ENSOKIG00005008203 aqp8a.1 (ENSOKIG00005008217) #34 lcmt1 (ENSOKIG00005008250) #33 arhgap17a (ENSOKIG00005008532) #32 grid2ipb (ENSOKIG00005009163) zdhhc4 (ENSOKIG00005009292) pgp (ENSOKIG00005009320) bricd5 (ENSOKIG00005009331) mlst8 (ENSOKIG00005009347) ENSOKIG00005009367 Rainbow trout MODERN SPECIES 12 csnk1e (ENSOMYG00000013518) tmem184ba (ENSOMYG00000013544) maff (ENSOMYG00000013559) tomm22 (ENSOMYG00000013563) dmc1 (ENSOMYG00000013595) gspt1 (ENSOMYG00000013872) ENSOMYG00000034014 ENSOMYG00000034028 SNX29 (ENSOMYG00000034067) ENSOMYG00000052785 shisa9a (ENSOMYG00000034255) cpped1 (ENSOMYG00000034264) ercc4 (ENSOMYG00000034286) MRTFB (ENSOMYG00000034323) ENSOMYG00000051089 foxj1b (ENSOMYG00000034349) #22 ENSOMYG00000034369 zgc:163057 (ENSOMYG00000034389) ENSOMYG00000034405 ENSOMYG00000034412 ENSOMYG00000074239 ENSOMYG00000034430 aqp8a.1 (ENSOMYG00000034447) #34 ENSOMYG00000034495 #33 arhgap17a (ENSOMYG00000034604) #32 ENSOMYG00000034750 grid2ipb (ENSOMYG00000034778) zdhhc4 (ENSOMYG00000034821) pgp (ENSOMYG00000034834) bricd5 (ENSOMYG00000057221) mlst8 (ENSOMYG00000034843) Salmo ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000153861.b.a.g ENSGT00940000161112.d ENSGT00390000016475.u ENSGT00760000119398.a ENSGT00940000155582.q.b.f ENSGT00940000177425 ENSGT00940000162720.a.b.a.d ENSGT00940000175733.a ENSGT00730000110975.b ENSGT00940000163663.B.b.d ENSGT00940000165873.d ENSGT00390000004394 ENSGT00950000182979.a.b.b.b.b.i.b.e ENSGT00940000163474 ENSGT00390000008825.a.c.a.a ENSGT00940000164514.a.c.a #22 ENSGT00940000156278.t ENSGT00940000154590.e ENSGT01000000215398.b ENSGT00940000157809.j.a.e.b.k ENSGT00940000163288.a.b.b.b.a.a.a.b.b ENSGT00940000165638.a.a.d ENSGT00940000165638.b.a.a ENSGT00940000156372.s #33 ENSGT00940000156201.a.a.e #32 ENSGT00940000157625.a.b.f ENSGT00920000149163.i ENSGT00940000160577.a ENSGT00930000150969.B.f ENSGT00390000014795 ENSGT00930000150969.B.e Atlantic salmon MODERN SPECIES 20 maff (ENSSSAG00000101656) dmc1 (ENSSSAG00000015763) gspt1 (ENSSSAG00000017241) rsl1d1 (ENSSSAG00000041535) ENSSSAG00000041561 ENSSSAG00000089332 ENSSSAG00000041631 ENSSSAG00000098408 ENSSSAG00000042524 shisa9a (ENSSSAG00000109039) cpped1 (ENSSSAG00000042570) ercc4 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(ENSOKIG00005007198) ENSOKIG00005007181 ENSOKIG00005007133 Chinook salmon MODERN SPECIES ENSOTSG00005023038 ENSOTSG00005023039 ENSOTSG00005023040 csnk1e (ENSOTSG00005024010) tmem184ba (ENSOTSG00005024082) maff (ENSOTSG00005024083) tomm22 (ENSOTSG00005024085) gspt1 (ENSOTSG00005024101) rsl1d1 (ENSOTSG00005027064) SNX29 (ENSOTSG00005027072) shisa9a (ENSOTSG00005027233) cpped1 (ENSOTSG00005027234) ENSOTSG00005027235 ENSOTSG00005027236 UBALD1 (ENSOTSG00005027237) foxj1b (ENSOTSG00005027238) #22 ENSOTSG00005027241 ENSOTSG00005027242 ENSOTSG00005027243 ENSOTSG00005027244 ENSOTSG00005027245 lcmt1 (ENSOTSG00005027246) #33 arhgap17a (ENSOTSG00005027248) #32 grid2ipb (ENSOTSG00005027268) zdhhc4 (ENSOTSG00005027279) ENSOTSG00005027280 pgrmc1 (ENSOTSG00005027281) MEIOB (ENSOTSG00005027282) ENSOTSG00005027283 ENSOTSG00005027284 noxo1b (ENSOTSG00005027285) Huchen MODERN SPECIES 1363 rasd4 (ENSHHUG00000034249) PRPSAP1 (ENSHHUG00000034252) CYGB (ENSHHUG00000034287) FBF1 (ENSHHUG00000034291) SPHK1 (ENSHHUG00000034348) AANAT (ENSHHUG00000034352) ENSHHUG00000034374 ddx5 (ENSHHUG00000034401) ENSHHUG00000034569 ENSHHUG00000034572 ENSHHUG00000034582 UBALD1 (ENSHHUG00000034585) foxj1b (ENSHHUG00000034590) #22 Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 654 ENSGT00940000154307.B.c.a.a.b ENSGT00940000154741.c.c ENSGT00940000158822.f ENSGT00940000160824.c ENSGT00940000163663.B.a.c ENSGT00950000182979.a.b.b.b.b.i.a.e ENSGT01100000263632 ENSGT00390000002628.t ENSGT00550000075071.t ENSGT00940000157696.o ENSGT00390000008825.a.c.b.b ENSGT00390000009925.a.i ENSGT00940000164514.a.d.a #22 ENSGT00390000015579.a.a.b.g Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 99 ENSGT00550000075088.a.a.f.a ENSGT00730000110939.a.e ENSGT01060000248742.c ENSGT00940000154307.B.c.a.a.b ENSGT00940000154741.c.c ENSGT00940000158822.f ENSGT00940000160824.c ENSGT00940000163663.B.a.c ENSGT00950000182979.a.b.b.b.b.i.a.e ENSGT01100000263632 ENSGT00390000002628.t ENSGT00550000075071.t ENSGT00940000157696.o ENSGT00390000008825.a.c.b.b ENSGT00390000009925.a.i ENSGT00940000164514.a.d.a #22 ENSGT00940000164514.a.d.b.a #22 ENSGT00390000015579.a.a.b.g ENSGT00940000156278 ENSGT00390000009825.e ENSGT00390000015916.o.a.b ENSGT00940000157809.i.b ENSGT00940000163288.a.b.b.a.p ENSGT00940000157809.j.b.gb.a ENSGT00940000157809.j.a.e.a.vb.a.b ENSGT00940000163288.a.b.b.b.a.a.a.a.m.b ENSGT00940000157809.j.a.e.a.vb.a.a.a.a.b.a ENSGT00940000163288.a.b.b.b.a.a.a.a.n.a ENSGT00940000157809.j.a.e.a.vb.a.a.b ENSGT00940000157809.j.a.f ENSGT00940000163288.a.b.b.b.a.a.a.b.a.b.b Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 48 ENSGT00730000110939.a.e ENSGT01060000248742.c ENSGT00940000154307.B.c.a.a.b ENSGT00940000154741.c.c ENSGT00940000158822.f ENSGT00940000160824.c ENSGT00940000163663.B.a.c ENSGT00950000182979.a.b.b.b.b.i.a.e ENSGT01100000263632.c ENSGT00390000002628.s ENSGT00550000075071.s.b ENSGT00940000157696.o ENSGT00390000008825.a.c.b.b ENSGT00390000009925.a.i ENSGT00390000009925.a.j.b ENSGT00940000164514.a.d.a #22 ENSGT00390000015579.a.a.b.g ENSGT00940000156278.r.a.a ENSGT00390000009825.e ENSGT00390000015916.o.a.b ENSGT00940000157809.i.b ENSGT00940000163288.a.b.b.a.p ENSGT00940000157809.j.b.gb.a ENSGT00940000157809.j.a.e.a.vb.a.a.a.b ENSGT00940000163288.a.b.b.b.a.a.a.a.m.a ENSGT00940000157809.j.a.e.a.vb.a.a.b ENSGT00940000157809.j.a.e.a.vb.a.a.a.a.a ENSGT00940000163288.a.b.b.b.a.a.a.a.n.a ENSGT00940000157809.j.a.f ENSGT00940000163288.a.b.b.b.a.a.a.b.a.b.b ENSGT00940000157809.j.a.e.a.vb.b.b Rainbow trout MODERN SPECIES 4 gpr146 (ENSOMYG00000031630) gper1 (ENSOMYG00000031641) ENSOMYG00000031850 ENSOMYG00000032087 ENSOMYG00000032152 ENSOMYG00000056491 shisa9b (ENSOMYG00000032161) ENSOMYG00000065281 ENSOMYG00000032174 ENSOMYG00000032185 snrnp25 (ENSOMYG00000032194) polr3k (ENSOMYG00000032201) cdip1 (ENSOMYG00000032209) ubald1b (ENSOMYG00000064940) mgrn1b (ENSOMYG00000032413) ENSOMYG00000065441 #22 aanat-2 (ENSOMYG00000034236) rhbdf1a (ENSOMYG00000034352) mpg (ENSOMYG00000034828) nprl3 (ENSOMYG00000034908) ENSOMYG00000035352 ENSOMYG00000035454 ENSOMYG00000035506 ENSOMYG00000035512 ENSOMYG00000035520 ENSOMYG00000035525 ENSOMYG00000035530 hbae3 (ENSOMYG00000035531) kank2 (ENSOMYG00000035539) ENSOMYG00000035983 elavl3 (ENSOMYG00000038461) Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 42 ENSGT00730000110939.a.e ENSGT01060000248742.c ENSGT00940000154307.B.c.a.a.b ENSGT00940000154741.c.c ENSGT00940000158822.f ENSGT00940000160824.c ENSGT00940000163663.B.a.c ENSGT00950000182979.a.b.b.b.b.i.a.e ENSGT01100000263632.c ENSGT00390000002628.s ENSGT00550000075071.s.b ENSGT00940000157696.o ENSGT00390000008825.a.c.b.b ENSGT00390000009925.a.i ENSGT00390000009925.a.j.b ENSGT00940000164514.a.d.a #22 ENSGT00390000015579.a.a.b.g ENSGT00940000156278.r.a.a ENSGT00390000009825.e ENSGT00390000015916.o.a.b ENSGT00940000157809.i.b ENSGT00940000163288.a.b.b.a.p ENSGT00940000157809.j.b.gb.a ENSGT00940000157809.j.a.e.a.vb.a.a.a.b ENSGT00940000163288.a.b.b.b.a.a.a.a.m.a ENSGT00940000157809.j.a.e.a.vb.a.a.a.a.a ENSGT00940000163288.a.b.b.b.a.a.a.a.n.a.a ENSGT00940000157809.j.a.f ENSGT00940000163288.a.b.b.b.a.a.a.b.a.b.b.c ENSGT00940000157809.j.a.e.a.vb.b.b ENSGT00940000163288.a.b.b.b.a.a.a.b.a.a.b.b Chinook salmon MODERN SPECIES 2912 mgrn1b (ENSOTSG00005047608) ENSOTSG00005047613 #22 aanat2 (ENSOTSG00005047615) shisa9b (ENSOTSG00005047617) IGFALS (ENSOTSG00005047618) ENSOTSG00005047621 MYOF (ENSOTSG00005047636) gper1 (ENSOTSG00005047654) ube2ia (ENSOTSG00005047655) kctd5a (ENSOTSG00005047656) pdpk1a (ENSOTSG00005047658) ENSOTSG00005047716 il21r.1 (ENSOTSG00005047717) USP31 (ENSOTSG00005047718) ENSOTSG00005047720 hs3st2 (ENSOTSG00005047721) hs3st4 (ENSOTSG00005047722) Coho salmon MODERN SPECIES 1 ube2ia (ENSOKIG00005023157) BAIAP3 (ENSOKIG00005023218) gpr146 (ENSOKIG00005023250) gper1 (ENSOKIG00005023254) MYOF (ENSOKIG00005023425) ENSOKIG00005024442 IGFALS (ENSOKIG00005025057) shisa9b (ENSOKIG00005025062) ENSOKIG00005025074 ENSOKIG00005025096 snrnp25 (ENSOKIG00005025115) polr3k (ENSOKIG00005025142) cdip1 (ENSOKIG00005025193) ubald1b (ENSOKIG00005025204) mgrn1b (ENSOKIG00005025257) ENSOKIG00005025430 #22 aanat2 (ENSOKIG00005025440) rhbdf1a (ENSOKIG00005025519) mpg (ENSOKIG00005026077) nprl3 (ENSOKIG00005026150) hbba2 (ENSOKIG00005026549) ENSOKIG00005026594 ENSOKIG00005026674 ENSOKIG00005026701 ENSOKIG00005026711 HBE1 (ENSOKIG00005026724) ENSOKIG00005026731 ENSOKIG00005026751 ENSOKIG00005026762 HBE1 (ENSOKIG00005026771) hbae3 (ENSOKIG00005026782) Huchen MODERN SPECIES 2359 shisa9b (ENSHHUG00000052167) ENSHHUG00000052166 ENSHHUG00000052163 ENSHHUG00000052162 snrnp25 (ENSHHUG00000052160) polr3k (ENSHHUG00000052154) cdip1 (ENSHHUG00000052153) ubald1b (ENSHHUG00000052151) mgrn1b (ENSHHUG00000051999) ENSHHUG00000051996 #22 rhbdf1a (ENSHHUG00000051981) Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 193 ENSGT00390000008825.a.c.b.a ENSGT00390000009925.a.j ENSGT00940000164514.a.d.b #22 ENSGT00390000015579.a.a.b.h ENSGT00940000156278 ENSGT00390000009825 ENSGT00390000015916.o.a ENSGT00940000157809.i.a.b ENSGT00940000157809.j.b.fb ENSGT00940000163288.a.b.b.a.o ENSGT00940000163288.a.b.b.b.a.a.a.a.m.a ENSGT00940000157809.j.a.e.a.vb.a ENSGT00940000163288.a.b.b.b.a.a.a.a.n ENSGT00940000157809.j.a.f ENSGT00940000163288.a.b.b.b.a.a.a.b.a.b.b ENSGT00940000157809.j.a.e.a.vb.b.b ENSGT00940000163288.a.b.b.b.a.a.a.b.a.a.a ENSGT00940000161012.q.b Salmoninae_a DUPLICATION Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 99 ENSGT00730000110939.a.e ENSGT01060000248742.c ENSGT00940000154307.B.c.a.a.b ENSGT00940000154741.c.c ENSGT00940000158822.f ENSGT00940000160824.c ENSGT00940000163663.B.a.c ENSGT00950000182979.a.b.b.b.b.i.a.e ENSGT01100000263632 ENSGT00390000002628.t ENSGT00550000075071.t ENSGT00940000157696.o ENSGT00390000008825.a.c.b.b ENSGT00390000009925.a.i ENSGT00940000164514.a.d.a #22 ENSGT00940000164514.a.d.b.a #22 ENSGT00390000015579.a.a.b.g ENSGT00940000156278 ENSGT00390000009825.e ENSGT00390000015916.o.a.b ENSGT00940000157809.i.b ENSGT00940000163288.a.b.b.a.p ENSGT00940000157809.j.b.gb.a ENSGT00940000157809.j.a.e.a.vb.a.b ENSGT00940000163288.a.b.b.b.a.a.a.a.m.b ENSGT00940000157809.j.a.e.a.vb.a.a.a.a.b.a ENSGT00940000163288.a.b.b.b.a.a.a.a.n.a ENSGT00940000157809.j.a.e.a.vb.a.a.b ENSGT00940000157809.j.a.f ENSGT00940000163288.a.b.b.b.a.a.a.b.a.b.b ENSGT00940000157809.j.a.e.a.vb.b.b Salmo ANCESTRAL SPECIES 308 ENSGT00940000164514.a.d.b.a #22 ENSGT00390000015579.a.a.b.g ENSGT00940000156278.s.b ENSGT00390000009825.e ENSGT00390000015916.o.a.b River trout MODERN SPECIES BAIAP3 (ENSSTUG00000000295) ENSSTUG00000000303 gpr146 (ENSSTUG00000000305) gper1 (ENSSTUG00000000307) MYOF (ENSSTUG00000000331) ENSSTUG00000000465 IGFALS (ENSSTUG00000000512) ENSSTUG00000000514 shisa9b (ENSSTUG00000000517) ENSSTUG00000000520 snrnp25 (ENSSTUG00000000545) polr3k (ENSSTUG00000000551) cdip1 (ENSSTUG00000000559) ubald1b (ENSSTUG00000000565) mgrn1b (ENSSTUG00000000633) ENSSTUG00000001210 #22 aanat2 (ENSSTUG00000001214) rhbdf1a (ENSSTUG00000001234) mpg 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ENSSSAG00000087487 ENSSSAG00000044836 ENSSSAG00000065398 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164514.a.d.b.a #22 Rainbow trout MODERN SPECIES 3 gpr146 (ENSOMYG00000004833) gper1 (ENSOMYG00000004849) ENSOMYG00000063247 ENSOMYG00000009738 ENSOMYG00000022728 ENSOMYG00000022799 ENSOMYG00000022878 shisa9b (ENSOMYG00000022884) ENSOMYG00000020852 snrnp25 (ENSOMYG00000020817) polr3k (ENSOMYG00000073888) cdip1 (ENSOMYG00000072290) ENSOMYG00000068786 ubald1b (ENSOMYG00000020767) mgrn1b (ENSOMYG00000018566) ENSOMYG00000018456 #22 aanat2 (ENSOMYG00000018439) rhbdf1a (ENSOMYG00000018044) ENSOMYG00000074490 mpg (ENSOMYG00000018016) nprl3 (ENSOMYG00000044457) ENSOMYG00000075215 hbba2 (ENSOMYG00000070982) ENSOMYG00000042940 HBB (ENSOMYG00000044417) ENSOMYG00000063734 ENSOMYG00000038864 ENSOMYG00000044411 ENSOMYG00000044399 ENSOMYG00000044393 ENSOMYG00000044390 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 218 ENSGT00390000008825.a.c.b.a ENSGT00390000009925.a.j ENSGT00940000164514.a.d.b.b #22 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ENSIPUG00000002420 Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000153861.b.a ENSGT00940000161112 ENSGT00390000016475 ENSGT00760000119398 ENSGT00940000155582.q.b ENSGT00440000038603 ENSGT01030000236780 ENSGT00940000175733 ENSGT00730000110975 ENSGT00940000163663.B.b ENSGT00940000165873 ENSGT00390000004394 ENSGT00950000182979.a.b.b.b.b.i.b ENSGT00390000008825.a.b ENSGT00390000009925.a.k.b ENSGT00940000164514.a #22 ENSGT00940000156278.se ENSGT00940000154590 ENSGT00940000157809.j.a.e.b.a ENSGT00940000163288.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000165638.b ENSGT00940000165638.a.a ENSGT00940000159304 #34 ENSGT00940000156372 #33 ENSGT00940000156201.a.a #32 ENSGT00940000157625.a.b.c ENSGT01030000235046 ENSGT00920000149163 ENSGT00940000160577 ENSGT00930000150969.B ENSGT00390000014795 Characoidei ANCESTRAL SPECIES 50 ENSGT00950000182979.a.b.b.b.b.i.b ENSGT00390000008825.a.b ENSGT00390000009925.a.k.b ENSGT00940000164514.a #22 ENSGT00940000156278.se ENSGT00940000154590 ENSGT00940000157809.j.a.e.b.a 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ENSGT00390000001723.g ENSGT00510000047678.a.a.b.c ENSGT00940000159689.d Goldfish MODERN SPECIES 30 klhl11 (ENSCARG00000020359) fkbp10b (ENSCARG00000020028) ENSCARG00000019988 ADAM11 (ENSCARG00000019462) GPT (ENSCARG00000016982) foxh1 (ENSCARG00000016884) ENSCARG00000016879 oplah (ENSCARG00000016822) ENSCARG00000016800 stat5b (ENSCARG00000016692) cpped1 (ENSCARG00000016669) ENSCARG00000016649 ENSCARG00000016628 ENSCARG00000016605 mgrn1a (ENSCARG00000016538) foxj1b (ENSCARG00000016512) #22 ENSCARG00000015704 ENSCARG00000015674 hbae4 (ENSCARG00000015671) ENSCARG00000015665 hbbe2 (ENSCARG00000015663) hbae5 (ENSCARG00000015662) aqp8a.2 (ENSCARG00000015657) aqp8a.1 (ENSCARG00000015649) #34 lcmt1 (ENSCARG00000015619) #33 arhgap17a (ENSCARG00000015512) #32 grid2ipb (ENSCARG00000015468) zdhhc4 (ENSCARG00000015458) pgp (ENSCARG00000015456) mlst8 (ENSCARG00000015448) neurl2 (ENSCARG00000015443) Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00940000153861.b.a.b ENSGT00940000161112.b ENSGT00390000016475.x 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ENSGT00390000004394.i ENSGT00950000182979.a.b.b.b.b.i.b.b ENSGT00940000163474 ENSGT00390000008825.b.b.d.a ENSGT00390000009925.a.k.b.b ENSGT00940000164514.a.f #22 ENSGT00940000156278.pe.a ENSGT00940000154590.d ENSGT00940000157809.j.a.e.b.a.b ENSGT00940000157809.j.a.e.b.b.a.a ENSGT00940000157809.j.a.e.b.a.a.a ENSGT00940000163288.a.b.b.b.a.b.b ENSGT00940000165638.b ENSGT00940000159304.e #34 ENSGT00940000156372.p #33 ENSGT00940000156201.a.a.a #32 ENSGT00940000157625.a.b.a ENSGT00920000149163.e ENSGT00940000160577.f ENSGT00930000150969.B.b ENSGT00390000014795.g.a Common carp reference MODERN SPECIES 25 tmem184ba (ENSCCRG00000070789) dmc1 (ENSCCRG00000075552) gspt1 (ENSCCRG00000017371) rsl1d1 (ENSCCRG00000017375) ENSCCRG00000017328 ENSCCRG00000017532 ENSCCRG00000017535 SNX29 (ENSCCRG00000027039) shisa9a (ENSCCRG00000017582) ENSCCRG00000069544 ercc4 (ENSCCRG00000017588) MRTFB (ENSCCRG00000055428) ENSCCRG00000023470 ENSCCRG00000058219 mgrn1a (ENSCCRG00000017601) foxj1b (ENSCCRG00000017776) #22 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(ENSSFOG00015004752) Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 153 ENSGT00940000157800 ENSGT00940000163587.a.b.a.c.a ENSGT00530000066520 ENSGT00940000158326 ENSGT00940000158883.a ENSGT00950000182849.B.c.b.a ENSGT00940000158256.h ENSGT00940000160433 ENSGT01100000263687 ENSGT00940000156867 ENSGT00510000048008 ENSGT00940000154883.e.b ENSGT00390000012918.c ENSGT00940000161294 ENSGT00390000008825.b.b ENSGT00940000164514.b ##22 ENSGT00390000004214 ENSGT00940000163471.a ENSGT00390000001244 ENSGT00940000156964.B Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157800 ENSGT00940000163587.a.b.a.c.a ENSGT00530000066520 ENSGT00940000158326 ENSGT00940000158883.a ENSGT00950000182849.B.c.b.a ENSGT00940000158256.h ENSGT00940000160433 ENSGT01100000263687 ENSGT00940000156867 ENSGT00510000048008 ENSGT00940000154883.e.b ENSGT00390000012918.c ENSGT00940000161294 ENSGT00390000008825.b.b ENSGT00940000164514.b ##22 ENSGT00390000004214 ENSGT00940000163471.a ENSGT00390000001244 ENSGT00940000156964.B 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Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000015229 ENSGT00390000007119 ENSGT00390000005976.b ENSGT00940000157795.g.b ENSGT00950000183191.a.a.f ENSGT00940000154813.e.a.b ENSGT00940000161215 ENSGT00940000158256.h ENSGT00940000160433 ENSGT00940000156867 ENSGT00510000048008 ENSGT00940000154883.e.b ENSGT00390000012918.c ENSGT00940000161294 ENSGT00390000008825.b.b ENSGT00940000164514.b ##22 ENSGT00390000004214 ENSGT00940000163471.a ENSGT00390000001244 ENSGT00940000156964.B ENSGT00940000159924.c.b ENSGT00940000159339.sb.b.b ENSGT00940000158816.c ENSGT00390000006009.a.a.a.c.b ENSGT00940000156843 ENSGT00940000154322.A.b.a ENSGT00940000157428 ENSGT00940000156555.i.b ENSGT00940000155709.j ENSGT00940000177272 ENSGT00940000162720.b.a.a.b Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 22 sh2b1 (ENSMMDG00005004143) ENSMMDG00005004139 ENSMMDG00005004134 HSPA2 (ENSMMDG00005004128) ENSMMDG00005004124 ENSMMDG00005004120 ENSMMDG00005004114 CASKIN2 (ENSMMDG00005004106) ST6GALNAC2 (ENSMMDG00005004087) 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sh2b1 (ENSLCRG00005005709) atxn2l (ENSLCRG00005005710) European seabass MODERN SPECIES 21 ENSDLAG00005031866 ENSDLAG00005033855 ENSDLAG00005033405 ENSDLAG00005032310 ENSDLAG00005032757 ENSDLAG00005031265 ENSDLAG00005026598 ENSDLAG00005026772 ENSDLAG00005003650 ENSDLAG00005012845 ENSDLAG00005017338 ENSDLAG00005031148 ENSDLAG00005022353 ENSDLAG00005022343 ENSDLAG00005027913 ENSDLAG00005034394 ##22 ENSDLAG00005031599 ENSDLAG00005022317 ENSDLAG00005022247 ENSDLAG00005023614 ENSDLAG00005003976 ENSDLAG00005027463 ENSDLAG00005028757 ENSDLAG00005027692 ENSDLAG00005022206 RBFOX3 (ENSDLAG00005022194) ENSDLAG00005022192 cbx2 (ENSDLAG00005035002) NOG (ENSDLAG00005022186) pctp (ENSDLAG00005022183) TMEM100 (ENSDLAG00005027024) Gilthead seabream MODERN SPECIES 15 anapc2 (ENSSAUG00010021029) ENSSAUG00010021277 srrm2 (ENSSAUG00010021280) arl6ip1 (ENSSAUG00010021284) fus (ENSSAUG00010021289) GBGT1 (ENSSAUG00010021292) ENSSAUG00010021294 zgc:100868 (ENSSAUG00010021296) zgc:100868 (ENSSAUG00010021309) zgc:100868 (ENSSAUG00010021312) ENSSAUG00010021313 eif1 (ENSSAUG00010021314) srsf2b (ENSSAUG00010021315) mfsd11 (ENSSAUG00010021318) ubald2 (ENSSAUG00010021329) ENSSAUG00010012602 ##22 amdhd2 (ENSSAUG00010012610) CAPN15 (ENSSAUG00010012619) ENSSAUG00010012624 ENSSAUG00010012627 ENSSAUG00010012630 ENSSAUG00010012632 HSPA2 (ENSSAUG00010012636) ENSSAUG00010012638 ENSSAUG00010012640 JMJD8 (ENSSAUG00010012642) ENSSAUG00010012646 ENSSAUG00010012654 dcp2 (ENSSAUG00010012773) cdipt (ENSSAUG00010012774) MAZ (ENSSAUG00010012775) Perciformes ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000159512 ENSGT00390000001557 ENSGT00390000016127 ENSGT00940000166574 ENSGT00940000167070 ENSGT00940000154937 ENSGT00940000157290 ENSGT00940000163009.b.a.a.b.b ENSGT01030000235138 ENSGT00940000163852.c.b ENSGT00390000015789 ENSGT01100000263483.E.a.d ENSGT00940000154883.e.b ENSGT00390000012918.c ENSGT00390000008825.b.b ENSGT00940000164514.b ##22 ENSGT00390000012605 ENSGT00940000158312.f ENSGT00930000151045.e ENSGT00990000204060 ENSGT00390000015438 ENSGT00940000163852.c.a.b.a.a.f ENSGT00940000154813.e.a.b ENSGT00940000159991.A.a ENSGT00940000154169.A.h ENSGT00940000158525.u ENSGT00940000165613 ENSGT01010000222313.A.b.b.a.a.a ENSGT00950000183191.a.a.f ENSGT00940000157795.g.b ENSGT00390000005976.b Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000157381.d ENSGT00940000159512 ENSGT00390000001557 ENSGT00390000016127 ENSGT00940000166574 ENSGT00940000167070 ENSGT00940000154937 ENSGT00940000157290 ENSGT00940000163009.b.a.a.b.b ENSGT01030000235138 ENSGT00390000015789 ENSGT01100000263483.E.a.d ENSGT00940000154883.e.b ENSGT00390000012918.c ENSGT00390000008825.b.b ENSGT00940000164514.b ##22 ENSGT00390000012605 ENSGT00940000158312.f ENSGT00930000151045.e ENSGT00980000200578 ENSGT00390000015438 ENSGT00940000163852.c.a.b.a.a.f ENSGT00940000154813.e.a.b ENSGT00940000159991.A.a ENSGT00940000154169.A.h ENSGT00940000158525.u ENSGT00940000165613 ENSGT01010000222313.A.b.b.a.a.a ENSGT00950000183191.a.a.f ENSGT00940000157795.g.b ENSGT00390000005976.b Lumpfish MODERN SPECIES 23 GRIN2C (ENSCLMG00005002157) ENSCLMG00005002148 kat8 (ENSCLMG00005002137) rnf25 (ENSCLMG00005002112) anapc2 (ENSCLMG00005002105) ENSCLMG00005002103 ENSCLMG00005002099 arl6ip1 (ENSCLMG00005002096) zgc:100868 (ENSCLMG00005002095) ENSCLMG00005002094 eif1 (ENSCLMG00005002092) ENSCLMG00005002090 srsf2b (ENSCLMG00005002089) mfsd11 (ENSCLMG00005002070) ubald2 (ENSCLMG00005002060) ENSCLMG00005002050 ##22 amdhd2 (ENSCLMG00005001983) CAPN15 (ENSCLMG00005001458) STUB1 (ENSCLMG00005001325) ENSCLMG00005001297 ENSCLMG00005001277 hsp70.1 (ENSCLMG00005001276) ENSCLMG00005001251 cdipt (ENSCLMG00005001249) ENSCLMG00005001248 nlk1 (ENSCLMG00005001245) TLCD3B (ENSCLMG00005001239) sh2b1 (ENSCLMG00005001236) atxn2l (ENSCLMG00005001230) spns1 (ENSCLMG00005001173) ENSCLMG00005001225 Stickleback MODERN SPECIES 10 rnf25 (ENSGACG00000014927) anapc2 (ENSGACG00000014924) ENSGACG00000014915 ENSGACG00000014914 ENSGACG00000014910 arl6ip1 (ENSGACG00000014908) fus (ENSGACG00000014903) zgc:100868 (ENSGACG00000014893) ENSGACG00000014891 ENSGACG00000014890 eif1 (ENSGACG00000014885) srsf2b (ENSGACG00000014884) mfsd11 (ENSGACG00000014882) ENSGACG00000014881 ubald2 (ENSGACG00000014880) ENSGACG00000014879 ##22 amdhd2 (ENSGACG00000014872) JMJD8 (ENSGACG00000014866) ENSGACG00000014865 ENSGACG00000014861 cdipt (ENSGACG00000014844) ENSGACG00000014840 nlk1 (ENSGACG00000014837) TLCD3B (ENSGACG00000014836) SCN4A (ENSGACG00000014830) ENSGACG00000014829 cdc27 (ENSGACG00000014822) ENSGACG00000014820 GBGT1 (ENSGACG00000014813) ENSGACG00000014806 rdm1 (ENSGACG00000014802) Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT01100000263505.b.b.a.b.a.a.a.a ENSGT00940000163496.a ENSGT00940000157381.d ENSGT00940000159512 ENSGT00390000001557 ENSGT00390000016127 ENSGT00940000166574 ENSGT00940000167070 ENSGT00940000154937 ENSGT01100000263483.E.a.d ENSGT00390000015789 ENSGT00940000163009.b.a.a.b.b ENSGT00940000154883.e.b ENSGT00390000012918.c ENSGT00390000008825.b.b ENSGT00940000164514.b ##22 ENSGT00390000012605 Pike perch MODERN SPECIES 35 ENSSLUG00000006739 srrm2 (ENSSLUG00000006721) arl6ip1 (ENSSLUG00000006708) ENSSLUG00000006699 ENSSLUG00000006345 ENSSLUG00000006308 eif1 (ENSSLUG00000006303) srsf2b (ENSSLUG00000006296) mfsd11 (ENSSLUG00000006270) fus (ENSSLUG00000006229) ENSSLUG00000006213 ENSSLUG00000006204 ENSSLUG00000006196 ENSSLUG00000006159 ubald2 (ENSSLUG00000006149) ENSSLUG00000006147 ##22 amdhd2 (ENSSLUG00000006127) ENSSLUG00000006114 ENSSLUG00000006105 zgc:158403 (ENSSLUG00000004664) GADD45GIP1 (ENSSLUG00000004605) ENSSLUG00000004599 nfixb (ENSSLUG00000004549) rad23aa (ENSSLUG00000004523) gng13b (ENSSLUG00000004520) traf7 (ENSSLUG00000002610) CASKIN1 (ENSSLUG00000002493) #37 ENSSLUG00000002487 #37 prpsap2 (ENSSLUG00000002295) PPP1R9B (ENSSLUG00000002269) carhsp1 (ENSSLUG00000002258) Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000016127 ENSGT00940000166574 ENSGT00940000167070 ENSGT00940000154937 ENSGT00940000157290 ENSGT00940000163009.b.a.a.b.b ENSGT00940000163009.b.b ENSGT00940000177501 ENSGT00940000163852.c.b ENSGT01030000235138 ENSGT00390000015789 ENSGT00940000154883.e.b ENSGT00390000012918.c ENSGT00940000161294.f ENSGT00390000008825.b.b ENSGT00940000164514.b ##22 ENSGT00390000012605 ENSGT00940000158312.f ENSGT00930000151045.e ENSGT00390000015438 ENSGT00940000163852.c.a.b.a.a ENSGT00940000163160.b.a.b ENSGT00940000154813.e.a.b ENSGT00940000159991.A.a ENSGT00940000154169.A.h ENSGT00940000158525.u ENSGT00940000165613 ENSGT01010000222313.A.b.b.a.a.a ENSGT00950000183191.a.a.f ENSGT00940000157795.g.b ENSGT00390000005976.b Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000159512 ENSGT00390000001557 ENSGT00390000016127 ENSGT00940000166574 ENSGT00940000167070 ENSGT00940000154937 ENSGT00940000157290 ENSGT00940000163009.b.a.a.b.b ENSGT00940000163852.c.b ENSGT00390000015789 ENSGT00940000154883.e.b ENSGT00390000012918.c ENSGT00940000161294.f ENSGT00390000008825.b.b ENSGT00940000156895 ENSGT00940000164514.b ##22 ENSGT00390000012605 ENSGT00940000158312.f ENSGT00990000204060 ENSGT00930000151045.e ENSGT00390000015438 ENSGT00940000163852.c.a.b.a.a ENSGT00940000163160.b.a.b ENSGT00940000161215.h ENSGT00940000159991.A.a ENSGT00940000154169.A.h ENSGT00940000158525.u ENSGT00940000165613 ENSGT01010000222313.A.b.b.a.a.a ENSGT00940000154813.e.a.b ENSGT00950000183191.a.a.f Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 136 ENSGT00940000159512 ENSGT00390000001557 ENSGT00390000016127 ENSGT00940000166574.h ENSGT00940000167070 ENSGT00940000154937 ENSGT00940000157290 ENSGT00940000163009.b.a.a.b.b ENSGT00940000163009.b.b ENSGT00940000154883.e.b ENSGT00390000015789 ENSGT01030000235138 ENSGT00390000012918.c ENSGT00390000008825.b.b ENSGT00940000164514.b ##22 ENSGT00390000012605 ENSGT00940000158312.f ENSGT00930000151045.e ENSGT00390000015438 ENSGT00940000163160.b.a.b ENSGT00940000161215.h ENSGT01010000222313.A.b.b.a.a.a ENSGT00940000163852.c.a.b.a.a ENSGT00940000154813.e.a.b ENSGT00950000183191.a.a.f ENSGT00940000157795.g.b Bicolor damselfish MODERN SPECIES 938 rnf25 (ENSSPAG00000006218) anapc2 (ENSSPAG00000006238) ENSSPAG00000006302 srrm2 (ENSSPAG00000006319) arl6ip1 (ENSSPAG00000006344) fus (ENSSPAG00000006364) zgc:100868 (ENSSPAG00000006400) ENSSPAG00000006422 ENSSPAG00000006453 ENSSPAG00000006466 ENSSPAG00000006483 eif1 (ENSSPAG00000006492) ENSSPAG00000006505 mfsd11 (ENSSPAG00000006525) ubald2 (ENSSPAG00000006578) ENSSPAG00000006585 ##22 amdhd2 (ENSSPAG00000006601) CAPN15 (ENSSPAG00000006662) STUB1 (ENSSPAG00000006692) JMJD8 (ENSSPAG00000006717) ENSSPAG00000006732 ENSSPAG00000006741 ENSSPAG00000006751 cdipt (ENSSPAG00000006807) Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000164818.c.b ENSGT00940000159512 ENSGT00390000001557 ENSGT00390000016127 ENSGT00940000166574.h ENSGT00940000167070 ENSGT00940000154937 ENSGT00940000157290 ENSGT00940000163009.b.a.a.b.b.bb.b ENSGT00940000163009.b.a.a.b.b.bb.a ENSGT00940000154883.e.b ENSGT00390000015789 ENSGT00390000012918.c ENSGT00390000008825.b.b ENSGT00940000156895 ENSGT00940000164514.b ##22 ENSGT00390000012605 ENSGT00940000158312.f ENSGT00930000151045.e ENSGT00390000015438 ENSGT00940000163852.c.a.b.a.a ENSGT00940000154813.e.a.b ENSGT00940000159991.A.a ENSGT00940000154169.A.h ENSGT00940000158525.u ENSGT00940000165613 ENSGT01010000222313.A.b.b.a.a.a ENSGT00950000183191.a.a.f ENSGT00940000157795.g.b ENSGT00940000157381.d ENSGT00940000164445 Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000164818.c.b ENSGT00940000159512 ENSGT00390000001557 ENSGT00390000016127 ENSGT00940000166574.h ENSGT00940000167070 ENSGT00940000154937 ENSGT00940000157290 ENSGT00940000163009.b.a.a.b.b.bb.b ENSGT00940000163009.b.a.a.b.b.bb.a ENSGT00940000154883.e.b ENSGT00390000015789 ENSGT00390000012918.c ENSGT00390000008825.b.b ENSGT00940000156895 ENSGT00940000164514.b ##22 ENSGT00390000012605 ENSGT00940000158312.f ENSGT00930000151045.e ENSGT00390000015438 ENSGT00940000163852.c.a.b.a.a ENSGT00940000154813.e.a.b ENSGT00940000159991.A.a ENSGT00940000154169.A.h ENSGT00940000158525.u ENSGT00940000165613 ENSGT01010000222313.A.b.b.a.a.a ENSGT00950000183191.a.a.f ENSGT00940000157795.g.b ENSGT00940000157381.d ENSGT00940000164445.u.a Clown anemonefish MODERN SPECIES 221 ENSAOCG00000011067 ##22 amdhd2 (ENSAOCG00000011042) CAPN15 (ENSAOCG00000000694) STUB1 (ENSAOCG00000010990) JMJD8 (ENSAOCG00000010968) ENSAOCG00000010951 HSPA2 (ENSAOCG00000010923) ENSAOCG00000010909 Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000159512 ENSGT00390000001557 ENSGT00390000016127 ENSGT00940000166574 ENSGT00940000167070 ENSGT00940000154937 ENSGT00940000157290 ENSGT00940000163009.b.a.a.b.b ENSGT00940000163852.c.b ENSGT00390000015789 ENSGT00940000154883.e.b ENSGT00390000012918.c ENSGT00940000161294.f ENSGT00390000008825.b.b ENSGT00940000156895 ENSGT00940000164514.b ##22 ENSGT00390000012605 ENSGT00940000158312.f ENSGT00990000204060 ENSGT00930000151045.e ENSGT00390000015438 ENSGT00940000163852.c.a.b.a.a ENSGT00940000163160.b.a.b ENSGT00940000161215.h ENSGT00940000159991.A.a ENSGT00940000154169.A.h ENSGT00940000158525.u ENSGT00940000165613 ENSGT01010000222313.A.b.b.a.a.a ENSGT00940000154813.e.a.b ENSGT00950000183191.a.a.f Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000016127 ENSGT00940000166574 ENSGT00940000167070 ENSGT00940000154937 ENSGT00940000157290 ENSGT00940000163009.b.a.a.b.b.`b.b ENSGT00940000163852.c.b ENSGT00940000163009.b.a.a.b.b.`b.a ENSGT00940000163009.b.b ENSGT00390000015789 ENSGT00940000154883.e.b ENSGT00390000012918.c ENSGT00940000161294.f ENSGT00390000008825.b.b ENSGT00940000156895 ENSGT00940000164514.b ##22 ENSGT00390000012605 ENSGT00940000158312.f ENSGT00990000204060 ENSGT00930000151045.e ENSGT00390000015438 ENSGT00940000163852.c.a.b.a.a ENSGT00940000154813.e.a.b ENSGT00940000159991.A.a ENSGT00940000154169.A.h ENSGT00940000158525.u ENSGT00940000165613 ENSGT01010000222313.A.b.b.a.a.a ENSGT00950000183191.a.a.f ENSGT00940000157795.g.b ENSGT00390000005976.b Nile tilapia MODERN SPECIES 16 ENSONIG00000009435 ENSONIG00000034919 ENSONIG00000029378 ENSONIG00000037911 ENSONIG00000034728 nfasca (ENSONIG00000008728) ENSONIG00000031528 ENSONIG00000035728 ENSONIG00000039019 ENSONIG00000032426 eif1b (ENSONIG00000038092) srsf2b (ENSONIG00000009428) mfsd11 (ENSONIG00000009424) ENSONIG00000009423 ubald2 (ENSONIG00000041837) ENSONIG00000038706 ##22 amdhd2 (ENSONIG00000035651) CAPN15 (ENSONIG00000009415) STUB1 (ENSONIG00000009413) ENSONIG00000040304 JMJD8 (ENSONIG00000030339) prss60.1 (ENSONIG00000039763) ENSONIG00000038306 ENSONIG00000009407 cdipt (ENSONIG00000009405) ENSONIG00000009401 nlk1 (ENSONIG00000009396) TLCD3B (ENSONIG00000029841) hsp70.2 (ENSONIG00000037051) sh2b1 (ENSONIG00000009394) atxn2l (ENSONIG00000009388) Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000157290 ENSGT00940000154937 ENSGT00940000167070 ENSGT00940000166574 ENSGT00390000016127 ENSGT00390000001557 ENSGT00940000159512 ENSGT00940000177501 ENSGT00940000163852.c.b ENSGT01030000235138 ENSGT00390000015789 ENSGT00940000154883.e.b ENSGT00390000012918.c ENSGT00940000167057 ENSGT00390000008825.b.b ENSGT00940000164514.b ##22 ENSGT00390000012605 ENSGT00940000158312.f ENSGT00940000163160.b.a.b.b.b ENSGT00390000015438 ENSGT00940000163852.c.a.b.a.a ENSGT00940000163160.b.a.b.b.a ENSGT00940000154813.e.a.b ENSGT00940000159991.A.a ENSGT00940000154169.A.h ENSGT00940000158525.u ENSGT00940000165613 ENSGT01010000222313.A.b.b.a.a.a ENSGT00950000183191.a.a.f ENSGT00390000005976.b ENSGT00960000186816 Oryzias ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016127 ENSGT00390000001557 ENSGT00940000159512 ENSGT00390000014712.a.g.b ENSGT00940000163852.c.b.i.a.b ENSGT00940000163009.b.a.a.b.b.r.a.a ENSGT00940000177501 ENSGT00940000163852.c.b.i.b ENSGT00940000163009.b.a.a.b.b.r.b ENSGT01030000235138 ENSGT00390000015789 ENSGT00940000154883.e.b ENSGT00390000012918.c ENSGT00940000167057 ENSGT00390000008825.b.b ENSGT00940000164514.b ##22 ENSGT00390000012605 ENSGT00940000164626.b.a.a.b ENSGT00940000162543 ENSGT00940000156268.a.a ENSGT00940000166074.A 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ENSGT00940000159512 ENSGT00940000163852.c.b.g ENSGT00940000163009.b.a.a.b.b.s.b.c ENSGT00940000163160.b.a.a.k ENSGT00940000163009.b.a.a.b.b.s.b.d ENSGT01030000235138 ENSGT00390000015789 ENSGT00390000012918.c ENSGT00940000167057 ENSGT00390000008825.b.b ENSGT00940000164514.b ##22 ENSGT00390000012605 ENSGT00390000015438 Amazon molly MODERN SPECIES 940 kat8 (ENSPFOG00000019613) zgc:100868 (ENSPFOG00000019614) ENSPFOG00000023441 zgc:100868 (ENSPFOG00000021734) ENSPFOG00000022472 eif1 (ENSPFOG00000019615) mfsd11 (ENSPFOG00000019616) ENSPFOG00000022121 ENSPFOG00000019617 ENSPFOG00000023876 ENSPFOG00000019618 ##22 amdhd2 (ENSPFOG00000019619) JMJD8 (ENSPFOG00000019620) Sailfin molly MODERN SPECIES 2902 UBALD2 (ENSPLAG00000021742) ENSPLAG00000021732 ##22 amdhd2 (ENSPLAG00000021720) JMJD8 (ENSPLAG00000021694) Guppy MODERN SPECIES 460 STAC2 (ENSPREG00000010833) FBXL20 (ENSPREG00000010866) CDK12 (ENSPREG00000010918) NEUROD2 (ENSPREG00000010959) ppp1r1b (ENSPREG00000010982) stard3 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rivulus MODERN SPECIES 1389 ENSKMAG00000015300 ##22 Cod MODERN SPECIES 11 ENSGMOG00000027482 ENSGMOG00000035467 ENSGMOG00000020504 ENSGMOG00000011236 ENSGMOG00000020073 ENSGMOG00000020289 ENSGMOG00000028083 ENSGMOG00000023710 ST6GALNAC2 (ENSGMOG00000022408) ENSGMOG00000033570 jmjd6 (ENSGMOG00000007652) mettl23 (ENSGMOG00000007648) srsf2b (ENSGMOG00000007642) mfsd11 (ENSGMOG00000007632) ubald2 (ENSGMOG00000033120) ENSGMOG00000027630 ##22 ENSGMOG00000013158 ENSGMOG00000004612 ENSGMOG00000008574 ENSGMOG00000028327 ENSGMOG00000024535 ENSGMOG00000027156 ENSGMOG00000037090 ENSGMOG00000008250 ENSGMOG00000023509 ENSGMOG00000008248 ENSGMOG00000008239 ENSGMOG00000007518 ENSGMOG00000035035 ENSGMOG00000008236 rasd2a (ENSGMOG00000024152) Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00990000205960 ENSGT00940000157800 ENSGT00940000163587.a.b.a.c.a ENSGT00940000158326 ENSGT00940000158883.a ENSGT00950000182849.B.c.b.a ENSGT00940000158256.h ENSGT00940000160433 ENSGT01100000263687 ENSGT00940000156867 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ENSGT00390000004214.a.b ENSGT00390000001244 ENSGT00940000156964.B.g.b ENSGT00940000159924.c.b.b ENSGT00940000159339.sb.b.a.a ENSGT00940000158816.c ENSGT00390000006009.a.a.a.c.b ENSGT00940000156843 ENSGT00940000154322.A.b.a.b.b ENSGT00940000157428.k.b ENSGT00940000156555.i.b ENSGT00940000155709.j ENSGT00940000162720.b.a.a.b.a.a Huchen DUPLICATION Huchen MODERN SPECIES 2099 ENSHHUG00000019889 ##22 tsen54 (ENSHHUG00000019890) ENSHHUG00000019899 TMEM104 (ENSHHUG00000019904) GRIN2C (ENSHHUG00000019926) Huchen MODERN SPECIES 316 RECQL5 (ENSHHUG00000034697) ENSHHUG00000034694 npm2a (ENSHHUG00000034691) xylt2 (ENSHHUG00000034602) ENSHHUG00000034593 NHERF1 (ENSHHUG00000034588) CASKIN2 (ENSHHUG00000034540) ST6GALNAC2 (ENSHHUG00000034532) ENSHHUG00000034531 jmjd6 (ENSHHUG00000034497) mettl23 (ENSHHUG00000034488) srsf2b (ENSHHUG00000034475) mfsd11 (ENSHHUG00000034426) ENSHHUG00000034415 ubald2 (ENSHHUG00000034411) ENSHHUG00000034402 ##22 tsen54 (ENSHHUG00000034375) TMEM104 (ENSHHUG00000034350) GRIN2C (ENSHHUG00000034273) Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00940000160433 ENSGT01100000263687.d ENSGT00940000156867.j ENSGT01100000263687.c ENSGT00940000156867.i ENSGT00510000048008 ENSGT00940000154883.e.b.b ENSGT00390000012918.c.g ENSGT00940000161294.c.b ENSGT00390000008825.b.b.f.b ENSGT00940000164514.b.d ##22 ENSGT00390000004214.a.a.a.a ENSGT00940000163471.a.e ENSGT00940000161294.c.a ENSGT00390000008825.b.b.f.a ENSGT00940000164514.b.c.a ##22 ENSGT00390000004214.a.b ENSGT00390000001244 ENSGT00940000156964.B.g.b ENSGT00940000159924.c.b.b ENSGT00940000159339.sb.b.a.b ENSGT00940000159339.sb.b.a.a ENSGT00940000158816.c ENSGT00390000006009.a.a.a.c.b ENSGT00940000156843.c.b ENSGT00940000154322.A.b.a.b.a ENSGT00940000157428.k.a ENSGT00940000156555.i.b ENSGT00940000155709.j ENSGT00940000162720.b.a.a.b.a.b ENSGT00990000210470.a.a Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00390000008825.b.b.f.a.c.b ENSGT00940000156895 ENSGT00390000008825.b.b.f.a.d ENSGT00940000164514.b.c.b ##22 ENSGT00390000004214.a.a.b ENSGT00390000001244.k.b ENSGT00940000156964.B.g.b ENSGT00940000158816.c.c ENSGT00390000006009.a.a.a.c.b.c ENSGT00940000156843.c.a ENSGT01000000218087 ENSGT00940000154883.e.b.b ENSGT00390000012918.c.g.d ENSGT00940000161294.c.a ENSGT00390000008825.b.b.f.a.c.a ENSGT00940000164514.b.c.a ##22 ENSGT00390000004214.a.b ENSGT00390000001244.k.a ENSGT00940000156964.B.g.a ENSGT00940000159924.c.b.b ENSGT00940000159339.sb.b.a.b ENSGT00940000159339.sb.b.a.a ENSGT00940000158816.c.d ENSGT00390000006009.a.a.a.c.b.d ENSGT00940000156843.c.b ENSGT00940000154322.A.b.a.b.a ENSGT00940000157428.k.a ENSGT00940000156555.i.b.g ENSGT00940000155709.j.e ENSGT00940000162720.b.a.a.b.a.b ENSGT00990000210470.a.b Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 55 ENSGT00940000154322.A.b.a.b.b ENSGT00940000157428.k.b ENSGT00940000156555.i.b.h ENSGT00940000155709.j.f ENSGT00940000162720.b.a.a.b.b ENSGT00990000210470.b ENSGT00940000162720.b.a.a.b.a.a ENSGT00940000156854.t.l ENSGT00730000111191.i 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ENSOMYG00000072230 RBFOX3 (ENSOMYG00000007062) ENSOMYG00000061077 ENSOMYG00000032417 ENSOMYG00000007166 cbx2 (ENSOMYG00000055225) NOG (ENSOMYG00000007238) pctp (ENSOMYG00000007308) TMEM100 (ENSOMYG00000007348) mmd (ENSOMYG00000007407) Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 1755 ENSGT00940000164514.b.c.b ##22 ENSGT00390000004214.a.a.b Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 690 ENSGT00940000164514.b.c.b ##22 ENSGT00390000004214.a.a.b Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00940000161850.g.b ENSGT00390000018868.B.a.g ENSGT00390000006233.c.b.y.p.b ENSGT00390000018570.b.b.e ENSGT01000000220600 ENSGT00990000205960.b ENSGT01100000263687.c ENSGT00940000156867.i.b ENSGT00940000178143 ENSGT00940000154883.e.b.a ENSGT00390000012918.c.g.c ENSGT00940000161294.c.b ENSGT00390000008825.b.b.f.a.c.b ENSGT00940000156895 ENSGT00390000008825.b.b.f.a.d ENSGT00940000164514.b.c.b ##22 ENSGT00390000004214.a.a.b ENSGT00390000001244.k.b ENSGT00940000156964.B.g.b ENSGT00940000158816.c.c ENSGT00390000006009.a.a.a.c.b.c ENSGT00940000156843.c.a ENSGT01000000218087 ENSGT00940000154883.e.b.b ENSGT00390000012918.c.g.d ENSGT00940000161294.c.a ENSGT00390000008825.b.b.f.a.c.a ENSGT00940000164514.b.c.a ##22 ENSGT00390000004214.a.b ENSGT00390000001244.k.a ENSGT00940000156964.B.g.a Rainbow trout MODERN SPECIES 3 ENSOMYG00000064809 ENSOMYG00000032942 ENSOMYG00000032968 ENSOMYG00000033050 ENSOMYG00000033164 ENSOMYG00000033176 ENSOMYG00000033193 ENSOMYG00000033228 jmjd6 (ENSOMYG00000033240) ENSOMYG00000003179 srsf2b (ENSOMYG00000003208) mfsd11 (ENSOMYG00000003387) ubald2 (ENSOMYG00000077364) ENSOMYG00000056008 ENSOMYG00000051265 ENSOMYG00000070298 ##22 tsen54 (ENSOMYG00000003674) ENSOMYG00000003727 ENSOMYG00000004038 ENSOMYG00000053780 RBFOX3 (ENSOMYG00000004285) ENSOMYG00000005042 cbx2 (ENSOMYG00000005102) NOG (ENSOMYG00000052448) ppct (ENSOMYG00000005246) TMEM100 (ENSOMYG00000005312) mmd (ENSOMYG00000005389) HLF (ENSOMYG00000005447) ENSOMYG00000005588 ENSOMYG00000005631 ENSOMYG00000005642 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 691 ENSGT00390000008825.b.b.f.a.d ENSGT00940000164514.b.c.b ##22 Chinook salmon MODERN SPECIES 33 MCHR1 (ENSOTSG00005040660) GRB2 (ENSOTSG00005040663) ENSOTSG00005040677 kpna2 (ENSOTSG00005040684) smurf2 (ENSOTSG00005040717) ddx5 (ENSOTSG00005040745) AANAT (ENSOTSG00005040747) SPHK1 (ENSOTSG00005040750) ENSOTSG00005040753 PRPSAP1 (ENSOTSG00005040759) rasd4 (ENSOTSG00005040832) MGAT5B (ENSOTSG00005040833) ENSOTSG00005040866 nptx1l (ENSOTSG00005041043) ubald2 (ENSOTSG00005041044) ENSOTSG00005041045 ##22 tsen54 (ENSOTSG00005041046) ENSOTSG00005041047 ENSOTSG00005041048 PPFIA3 (ENSOTSG00005041049) ENSOTSG00005041050 ENSOTSG00005041051 ENSOTSG00005041052 hsd17b14 (ENSOTSG00005041053) bcat2 (ENSOTSG00005041091) ifi35 (ENSOTSG00005041161) rpl27 (ENSOTSG00005041164) ENSOTSG00005041165 slc25a39 (ENSOTSG00005041172) rpl3 (ENSOTSG00005041174) ENSOTSG00005041200 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 1713 ENSGT00390000008825.b.b.f.b ENSGT00940000164514.b.d ##22 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00940000163587.a.b.a.c.a ENSGT00940000158326.e ENSGT00940000158883.a.b ENSGT00950000182849.B.c.b.a.b ENSGT00940000158256.h.c.a ENSGT00940000160433 ENSGT01100000263687.d ENSGT00940000156867.j ENSGT01100000263687.c ENSGT00940000156867.i ENSGT00510000048008 ENSGT00940000154883.e.b.b ENSGT00390000012918.c.g ENSGT00940000161294.c.b ENSGT00390000008825.b.b.f.b ENSGT00940000164514.b.d ##22 ENSGT00390000004214.a.a.a.a ENSGT00940000163471.a.e ENSGT00940000161294.c.a ENSGT00390000008825.b.b.f.a ENSGT00940000164514.b.c.a ##22 ENSGT00390000004214.a.b ENSGT00390000001244 ENSGT00940000156964.B.g.b ENSGT00940000159924.c.b.b ENSGT00940000159339.sb.b.a.b ENSGT00940000159339.sb.b.a.a ENSGT00940000158816.c ENSGT00390000006009.a.a.a.c.b ENSGT00940000156843.c.b ENSGT00940000154322.A.b.a.b.a Salmo ANCESTRAL SPECIES 145 ENSGT00940000158883.a.b.a ENSGT00950000182849.B.c.b.a.b.b ENSGT00940000158256.h.c.a ENSGT00940000160433.l ENSGT01100000263687.c ENSGT00940000156867.i ENSGT00510000048008 ENSGT00940000154883.e.b.a ENSGT00390000012918.c.g.e ENSGT00940000161294.c.a ENSGT00390000008825.b.b.f.a ENSGT00940000156895 ENSGT00390000004214.a.a.a.b ENSGT00940000161294.c.b ENSGT00390000008825.b.b.f.b ENSGT00940000164514.b.d ##22 ENSGT00390000004214.a.a.a.a ENSGT00940000163471.a.e ENSGT00390000004214.a.b ENSGT00390000001244 ENSGT00940000156964.B.g.b ENSGT00940000159924.c.b.a ENSGT00940000159339.sb.b.a.b Atlantic salmon MODERN SPECIES 25 cdr2l (ENSSSAG00000001377) ENSSSAG00000003526 ENSSSAG00000002726 ENSSSAG00000002723 ENSSSAG00000001495 ENSSSAG00000002819 ENSSSAG00000002730 ENSSSAG00000001357 ENSSSAG00000118328 st6galnac2 (ENSSSAG00000000896) jmjd6 (ENSSSAG00000117818) SFRS2 (ENSSSAG00000117310) mfsd11 (ENSSSAG00000002351) ENSSSAG00000000999 ubald2 (ENSSSAG00000001002) ENSSSAG00000001004 ##22 tsen54 (ENSSSAG00000002642) tsen54 (ENSSSAG00000073399) ENSSSAG00000092018 ENSSSAG00000085058 ENSSSAG00000046777 ENSSSAG00000083037 ENSSSAG00000084642 ENSSSAG00000002317 cbx2 (ENSSSAG00000002307) nog1 (ENSSSAG00000095989) ENSSSAG00000001544 ppct (ENSSSAG00000002292) TMEM100 (ENSSSAG00000122166) mmd (ENSSSAG00000002237) HLF (ENSSSAG00000002175) River trout MODERN SPECIES ENSSTUG00000018042 ENSSTUG00000018046 ENSSTUG00000018060 xylt2 (ENSSTUG00000018084) ENSSTUG00000018266 NHERF1 (ENSSTUG00000018321) CASKIN2 (ENSSTUG00000018327) ST6GALNAC2 (ENSSTUG00000018476) ENSSTUG00000018491 jmjd6 (ENSSTUG00000018494) mettl23 (ENSSTUG00000014180) srsf2b (ENSSTUG00000014182) mfsd11 (ENSSTUG00000014193) ENSSTUG00000014360 ubald2 (ENSSTUG00000014382) ENSSTUG00000014389 ##22 tsen54 (ENSSTUG00000014397) ENSSTUG00000014411 TMEM104 (ENSSTUG00000014419) GRIN2C (ENSSTUG00000014450) RBFOX3 (ENSSTUG00000014561) ENPP7 (ENSSTUG00000014751) cbx2 (ENSSTUG00000014756) NOG (ENSSTUG00000014762) pctp (ENSSTUG00000014765) TMEM100 (ENSSTUG00000014786) mmd (ENSSTUG00000014795) hlfa (ENSSTUG00000014973) FOXK2 (ENSSTUG00000014997) ENSSTUG00000015076 ENSSTUG00000015086 Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 185 ENSGT00940000157800 ENSGT00940000163587.a.b.a.c.a ENSGT00530000066520 ENSGT00940000158326 ENSGT00940000158883.a ENSGT00950000182849.B.c.b.a ENSGT00940000158256.h ENSGT00940000160433 ENSGT01100000263687 ENSGT00940000156867 ENSGT00510000048008 ENSGT00940000154883.e.b ENSGT00390000012918.c ENSGT00940000161294 ENSGT00390000008825.b.b ENSGT00940000164514.b ##22 ENSGT00390000004214 ENSGT00940000163471.a ENSGT00390000001244 ENSGT00940000156964.B ENSGT01050000244879.a.b.e ENSGT00940000154396.b.a.a.a ENSGT00940000155603.B ENSGT00940000156708.a.b ENSGT00390000006806 ENSGT01100000263497.E.a.a ENSGT00390000008063 ENSGT00950000182849.B.c.a.b.a.b Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 142 ENSGT00390000018570.b.b ENSGT00940000157800 ENSGT00940000163587.a.b.a.c.a ENSGT00940000158326 ENSGT00940000158883.a ENSGT00950000182849.B.c.b.a ENSGT00940000158256.h ENSGT00940000160433 ENSGT01100000263687 ENSGT00940000156867 ENSGT00510000048008 ENSGT00940000154883.e.b ENSGT00940000154883.e.a.f ENSGT00390000012918.c ENSGT00390000008825.b.b ENSGT00940000164514.b ##22 ENSGT00390000004214 ENSGT00940000163471.a ENSGT00390000001244 ENSGT00940000156964.B ENSGT01050000244879.a.b.e ENSGT00940000154396.b.a.a.a ENSGT00940000155603.B ENSGT00940000156708.a.b ENSGT00390000006806 ENSGT01100000263497.E.a.a ENSGT00390000008063 ENSGT00950000182849.B.c.a.b.b ENSGT00950000182933.B.a.b.b ENSGT00950000182933.B.a.b.a.j ENSGT00940000165523.b Atlantic herring MODERN SPECIES 15 cdr2l (ENSCHAG00000003693) ENSCHAG00000003867 ENSCHAG00000003897 ENSCHAG00000003905 ENSCHAG00000003919 xylt2 (ENSCHAG00000003946) ENSCHAG00000004078 ST6GALNAC2 (ENSCHAG00000004133) ENSCHAG00000004201 jmjd6 (ENSCHAG00000004221) mettl23 (ENSCHAG00000004331) srsf2b (ENSCHAG00000004357) mfsd11 (ENSCHAG00000004367) mfsd11 (ENSCHAG00000004495) ubald2 (ENSCHAG00000004529) ENSCHAG00000004607 ##22 ENSCHAG00000004870 ENSCHAG00000004896 ENSCHAG00000004908 ENSCHAG00000004926 ENSCHAG00000004936 ENSCHAG00000004978 ENSCHAG00000004996 ENSCHAG00000005030 ENSCHAG00000005058 ENSCHAG00000005110 ENSCHAG00000005342 ENSCHAG00000005370 ENSCHAG00000005375 ENSCHAG00000005395 ENSCHAG00000005423 Denticle herring MODERN SPECIES 17 ARHGDIA (ENSDCDG00000011044) cdr2l (ENSDCDG00000011051) RECQL5 (ENSDCDG00000011074) ENSDCDG00000011099 xylt2 (ENSDCDG00000011116) ENSDCDG00000011141 NHERF1 (ENSDCDG00000011616) CASKIN2 (ENSDCDG00000011649) ST6GALNAC2 (ENSDCDG00000011679) ENSDCDG00000011685 jmjd6 (ENSDCDG00000011698) mettl23 (ENSDCDG00000011721) ENSDCDG00000011722 mfsd11 (ENSDCDG00000011727) ubald2 (ENSDCDG00000011734) ENSDCDG00000011737 ##22 tsen54 (ENSDCDG00000011744) ENSDCDG00000011778 TMEM104 (ENSDCDG00000011813) GRIN2C (ENSDCDG00000011930) rfx1a (ENSDCDG00000014180) rln3a (ENSDCDG00000015355) ENSDCDG00000015356 ENSDCDG00000015362 ENSDCDG00000015378 ENSDCDG00000015379 dhps (ENSDCDG00000015387) NHERF2 (ENSDCDG00000015641) ENSDCDG00000015647 ENSDCDG00000015648 sstr5 (ENSDCDG00000015653) Otophysi ANCESTRAL SPECIES 89 ENSGT00940000163587.a.b.a.c.a ENSGT00530000066520 ENSGT00940000158326 ENSGT00940000158883.a ENSGT00950000182849.B.c.b.a ENSGT00940000158256.h ENSGT00940000160433 ENSGT01100000263687 ENSGT00940000156867 ENSGT00510000048008 ENSGT00940000154883.e.b ENSGT00390000012918.c ENSGT00940000161294 ENSGT00390000008825.b.b ENSGT00940000156895 ENSGT00940000164514.b ##22 ENSGT00390000004214 ENSGT00940000163471.a ENSGT00950000183044.a.a.a.a.b ENSGT00940000175118 ENSGT00940000157746.f ENSGT00390000008812.b.b.b ENSGT00530000063301.a.a.d ENSGT00530000064085.d ENSGT00940000157917.a.a ENSGT00940000162682.B.b ENSGT00940000165079.b ENSGT00650000094974.a ENSGT00940000159384 ENSGT01060000249533 ENSGT00390000013965 Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 202 ENSGT00950000182849.B.c.b.a ENSGT00940000158256.h ENSGT00940000160433 ENSGT01100000263687 ENSGT00940000156867 ENSGT00510000048008 ENSGT00940000154883.f ENSGT00390000012918.c ENSGT00940000161294 ENSGT00390000008825.b.b ENSGT00940000164514.b ##22 ENSGT00390000004214 Channel catfish DUPLICATION Channel catfish DUPLICATION Channel catfish DUPLICATION Channel catfish MODERN SPECIES 11 carm1 (ENSIPUG00000000942) yipf2 (ENSIPUG00000000909) c2h19orf52 (ENSIPUG00000000894) slc25a23b (ENSIPUG00000000880) znf207a (ENSIPUG00000000865) ENSIPUG00000000853 TNRC6C (ENSIPUG00000000818) septin9a (ENSIPUG00000000769) tac4 (ENSIPUG00000000748) prkar1b (ENSIPUG00000000724) HEATR2 (ENSIPUG00000000696) zgc:77748 (ENSIPUG00000000689) mettl23 (ENSIPUG00000000688) MFSD11 (ENSIPUG00000000657) ENSIPUG00000000645 foxj1-a (ENSIPUG00000000641) ##22 ENSIPUG00000000633 ##22 ENSIPUG00000000627 ENSIPUG00000000612 ##22 ENSIPUG00000000601 tsen54 (ENSIPUG00000000590) MYADML2 (ENSIPUG00000000586) CA10 (ENSIPUG00000000565) ENSIPUG00000000549 cdk5r1a (ENSIPUG00000000540) NSF (ENSIPUG00000000474) stx18 (ENSIPUG00000000463) msx1a (ENSIPUG00000000460) cytl1 (ENSIPUG00000000458) stk32b (ENSIPUG00000000449) gpc2 (ENSIPUG00000000445) Channel catfish MODERN SPECIES 11 stag3 (ENSIPUG00000000431) gpc2 (ENSIPUG00000000445) stk32b (ENSIPUG00000000449) cytl1 (ENSIPUG00000000458) msx1a (ENSIPUG00000000460) stx18 (ENSIPUG00000000463) NSF (ENSIPUG00000000474) cdk5r1a (ENSIPUG00000000540) ENSIPUG00000000549 CA10 (ENSIPUG00000000565) MYADML2 (ENSIPUG00000000586) tsen54 (ENSIPUG00000000590) ENSIPUG00000000601 ENSIPUG00000000612 ##22 ENSIPUG00000000627 ENSIPUG00000000633 ##22 foxj1-a (ENSIPUG00000000641) ##22 ENSIPUG00000000645 MFSD11 (ENSIPUG00000000657) mettl23 (ENSIPUG00000000688) zgc:77748 (ENSIPUG00000000689) HEATR2 (ENSIPUG00000000696) prkar1b (ENSIPUG00000000724) tac4 (ENSIPUG00000000748) septin9a (ENSIPUG00000000769) TNRC6C (ENSIPUG00000000818) ENSIPUG00000000853 znf207a (ENSIPUG00000000865) slc25a23b (ENSIPUG00000000880) c2h19orf52 (ENSIPUG00000000894) yipf2 (ENSIPUG00000000909) Channel catfish MODERN SPECIES 11 slc25a23b (ENSIPUG00000000880) znf207a (ENSIPUG00000000865) ENSIPUG00000000853 TNRC6C (ENSIPUG00000000818) septin9a (ENSIPUG00000000769) tac4 (ENSIPUG00000000748) prkar1b (ENSIPUG00000000724) HEATR2 (ENSIPUG00000000696) zgc:77748 (ENSIPUG00000000689) mettl23 (ENSIPUG00000000688) MFSD11 (ENSIPUG00000000657) ENSIPUG00000000645 foxj1-a (ENSIPUG00000000641) ##22 ENSIPUG00000000633 ##22 ENSIPUG00000000627 ENSIPUG00000000612 ##22 ENSIPUG00000000601 tsen54 (ENSIPUG00000000590) MYADML2 (ENSIPUG00000000586) CA10 (ENSIPUG00000000565) ENSIPUG00000000549 cdk5r1a (ENSIPUG00000000540) NSF (ENSIPUG00000000474) stx18 (ENSIPUG00000000463) msx1a (ENSIPUG00000000460) cytl1 (ENSIPUG00000000458) stk32b (ENSIPUG00000000449) gpc2 (ENSIPUG00000000445) stag3 (ENSIPUG00000000431) mcm7 (ENSIPUG00000000421) ENSIPUG00000000419 Channel catfish MODERN SPECIES cnfn (ENSIPUG00000006326) cxcr3.2 (ENSIPUG00000006343) cxcr3.3 (ENSIPUG00000006350) cxcr3 (ENSIPUG00000006358) cd4-1 (ENSIPUG00000006367) cd4-2.2 (ENSIPUG00000006445) usp5 (ENSIPUG00000006508) p3h3 (ENSIPUG00000006593) gnb3a (ENSIPUG00000006616) cdca3 (ENSIPUG00000006662) pex5 (ENSIPUG00000006679) clstn3 (ENSIPUG00000006856) LPCAT3 (ENSIPUG00000006923) tpi1b (ENSIPUG00000006988) leng8 (ENSIPUG00000007047) ENSIPUG00000007070 ##22 gabarapl1 (ENSIPUG00000007078) si:dkey-26c10.5 (ENSIPUG00000007105) ENSIPUG00000007130 ENSIPUG00000007153 Trpv6 (ENSIPUG00000007196) ENSIPUG00000007232 ENSIPUG00000007253 cox6b2 (ENSIPUG00000007268) ENSIPUG00000007284 Rasip1 (ENSIPUG00000007296) il11 (ENSIPUG00000007353) znf628 (ENSIPUG00000007361) nat14 (ENSIPUG00000007369) aicda (ENSIPUG00000007380) Necap1 (ENSIPUG00000007461) Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00950000182849.B.c.b.a ENSGT00940000158256.h ENSGT00940000160433 ENSGT01100000263687 ENSGT00940000156867 ENSGT00510000048008 ENSGT00940000154883.f ENSGT00390000012918.c ENSGT00940000161294.b ENSGT00390000008825.b.b ENSGT00940000164514.b ##22 ENSGT00390000004214 ENSGT00940000163471.a ENSGT00950000183044.a.a.a.a.b ENSGT00950000182933.A.a.a ENSGT00390000015892.b ENSGT00390000002725 ENSGT01050000244894.b.b.d.b ENSGT00950000182935.B.a.d ENSGT00390000012872.a ENSGT00950000182933.B.a.b.a.i ENSGT00950000182933.B.a.b.a.j ENSGT00940000165523.b ENSGT00940000155366.b.a.a.x ENSGT00940000159473 ENSGT00940000154505.A.d Electric eel MODERN SPECIES 131 TFAP4 (ENSEEEG00000021539) #16 srl (ENSEEEG00000021541) #15 ADCY9 (ENSEEEG00000021543) CREBBP (ENSEEEG00000021603) #14 trap1 (ENSEEEG00000022243) #13 ENSEEEG00000022310 CASKIN2 (ENSEEEG00000022313) ST6GALNAC2 (ENSEEEG00000022315) ENSEEEG00000022316 jmjd6 (ENSEEEG00000022317) mettl23 (ENSEEEG00000022320) ENSEEEG00000022321 mfsd11 (ENSEEEG00000022325) ENSEEEG00000022329 ubald2 (ENSEEEG00000022332) ENSEEEG00000022334 ##22 tsen54 (ENSEEEG00000022336) ENSEEEG00000022339 pycr1a (ENSEEEG00000022344) MYADML2 (ENSEEEG00000022375) notum1a (ENSEEEG00000022376) Characoidei ANCESTRAL SPECIES 185 ENSGT00950000182849.B.c.b.a ENSGT00940000158256.h ENSGT00940000160433 ENSGT01100000263687 ENSGT00940000156867 ENSGT00510000048008 ENSGT00390000012918.c ENSGT00940000161294.b ENSGT00390000008825.b.b ENSGT00940000156895 ENSGT00940000164514.b ##22 ENSGT00390000004214 ENSGT00940000163471.a ENSGT00950000183044.a.a.a.a.b ENSGT00950000182933.A.a.a ENSGT00390000015892.b ENSGT00390000002725 ENSGT01050000244894.b.b.d.b ENSGT00950000182935.B.a.d ENSGT00390000012872.a ENSGT00950000182933.B.a.b.a.i ENSGT00950000182933.B.a.b.a.j ENSGT00940000165523.b ENSGT00940000155366.b.a.a.x ENSGT00940000159473 ENSGT00940000154505.A.d Mexicana tetra MODERN SPECIES 60 pdgfab (ENSAMXG00000031610) ccdc137 (ENSAMXG00000020780) GPRC5C (ENSAMXG00000043370) BTBD17 (ENSAMXG00000006695) KCNJ2 (ENSAMXG00000025749) ENSAMXG00000027431 ENSAMXG00000029179 NHERF1 (ENSAMXG00000006681) CASKIN2 (ENSAMXG00000031258) ST6GALNAC2 (ENSAMXG00000041660) ENSAMXG00000040323 jmjd6 (ENSAMXG00000006635) mettl23 (ENSAMXG00000039658) mfsd11 (ENSAMXG00000006597) ENSAMXG00000030207 ENSAMXG00000032494 ##22 tsen54 (ENSAMXG00000006546) ENSAMXG00000039186 MYADML2 (ENSAMXG00000025748) notum1a (ENSAMXG00000006517) ENSAMXG00000041012 cenpx (ENSAMXG00000034305) ENSAMXG00000020593 SYNGR2 (ENSAMXG00000032863) cant1a (ENSAMXG00000031352) Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164514.b ##22 Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 56 ENSGT00390000012918.c.e ENSGT00940000164514.b ##22 ENSGT00940000163471.a.a.a ENSGT00390000017548.a.j ENSGT00940000165478 ENSGT00390000006425.m ENSGT00940000160720.b.b.h ENSGT00940000156686.p.b ENSGT00390000007786.a.b.b ENSGT01050000244893.c.b.b.b.b ##36 ENSGT00390000015826.b ENSGT00940000163861.a.a.a ENSGT00940000163861.a.b ENSGT00940000163144.a.b.p.b.a ENSGT00940000167161.g.a ENSGT00940000158475.f ENSGT00510000047886.a.b.a Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT01060000248591.a.a.b.a.a.a ENSGT01070000253837.d.b ENSGT00940000159603.a.b ENSGT00940000161850.r.b.a ENSGT00390000006233.c.b.y.a ENSGT00390000018570.b.b.k ENSGT00940000163587.a.b.a.c.a.l ENSGT00940000158326.d ENSGT00940000158883.a.e ENSGT00950000182849.B.c.b.a.c ENSGT00940000158256.h.a ENSGT00940000156867.e ENSGT00940000170233 ENSGT00390000012918.c.e ENSGT00940000164514.b ##22 ENSGT00940000163471.a.a.a ENSGT00390000017548.a.j ENSGT00940000165478 ENSGT00390000006425.m ENSGT00940000160720.b.b.h ENSGT00940000156686.p.b ENSGT00390000007786.a.b.b ENSGT01050000244893.c.b.b.b.b ##36 ENSGT00390000015826.b ENSGT00940000163861.a.a.a ENSGT00940000163861.a.b ENSGT00940000163144.a.b.p.b.b ENSGT00940000167161.h ENSGT00940000167161.g.a ENSGT00940000158475.f Golden-line barbel MODERN SPECIES 1030 xylt2 (ENSSGRG00000038285) ENSSGRG00000038803 NHERF1 (ENSSGRG00000038807) CASKIN2 (ENSSGRG00000038808) jmjd6 (ENSSGRG00000038814) ENSSGRG00000038815 mfsd11 (ENSSGRG00000038816) ENSSGRG00000038820 ##22 anks4b (ENSSGRG00000038821) ENSSGRG00000038823 PITPNC1 (ENSSGRG00000038824) helz (ENSSGRG00000038847) CACNG1 (ENSSGRG00000038852) cacng4b (ENSSGRG00000038854) ##36 aimp2 (ENSSGRG00000038856) pvalb8 (ENSSGRG00000038870) pvalb4 (ENSSGRG00000038877) pvalb1 (ENSSGRG00000038887) lmtk2 (ENSSGRG00000038889) bri3 (ENSSGRG00000038945) baiap2l1b (ENSSGRG00000038946) Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164514.b ##22 Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164514.b ##22 Amniota ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164514.b ##22 Sauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164514.b ##22 Archelosauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164514.b ##22 Archosauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164514.b ##22 Aves ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164514.b ##22 Neognathae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164514.b ##22 Neognathae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164514.b ##22 Passeriformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164514.b ##22 Passeriformes_d ANCESTRAL SPECIES 82 ENSGT00940000164514.b ##22 ENSGT00950000183167.a.b.b.b ENSGT00940000155330 ENSGT00390000016293 ENSGT00940000161297 ENSGT00390000017840 Flycatcher MODERN SPECIES 66 ENSFALG00000023261 ##22 ENSFALG00000007546 Passeriformes_g ANCESTRAL SPECIES 93 ENSGT00940000164514.b ##22 ENSGT00950000183167.a.b.b.b ENSGT00940000155330 ENSGT00390000016293 ENSGT00940000161297 ENSGT00390000017840 Passeroidea ANCESTRAL SPECIES 100 ENSGT00940000164514.b ##22 ENSGT00950000183167.a.b.b.b ENSGT00940000155330 ENSGT00390000016293 ENSGT00940000161297 ENSGT00390000017840 Zebra finch MODERN SPECIES 22 ENSTGUG00000023580 ENSTGUG00000025361 ENSTGUG00000023245 ENSTGUG00000025252 ENSTGUG00000022398 ENSTGUG00000026256 ENSTGUG00000024950 ENSTGUG00000021908 ENSTGUG00000026926 ENSTGUG00000016992 ENSTGUG00000029425 ENSTGUG00000022410 RAB5B (ENSTGUG00000021392) ENSTGUG00000021777 ENSTGUG00000003763 ENSTGUG00000027969 ##22 ENSTGUG00000022194 ENSTGUG00000020797 ENSTGUG00000026380 ENSTGUG00000020185 METTL1 (ENSTGUG00000027215) ENSTGUG00000022032 ENSTGUG00000025573 ENSTGUG00000025200 ENSTGUG00000023154 ENSTGUG00000029707 ENSTGUG00000029408 RPS26 (ENSTGUG00000019146) ENSTGUG00000023193 ENSTGUG00000023594 ENSTGUG00000020400 Mammalia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164514.b ##22 Theria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164514.b ##22 Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164514.b ##22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164514.b ##22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164514.b ##22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164514.b ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164514.b ##22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164514.b ##22 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164514.b ##22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164514.b ##22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164514.b ##22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164514.b ##22 Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164514.b ##22 Rat MODERN SPECIES 18 ENSRNOG00000070532 AABR07038881.1 (ENSRNOG00000038181) Lipc (ENSRNOG00000060338) Adam10 (ENSRNOG00000054257) AABR07070609.1 (ENSRNOG00000061240) Mindy2 (ENSRNOG00000061337) Sltm (ENSRNOG00000054446) Rnf111 (ENSRNOG00000060750) Ccnb2 (ENSRNOG00000063216) ENSRNOG00000071086 Myo1e (ENSRNOG00000061928) Fam81a (ENSRNOG00000057501) Gcnt3 (ENSRNOG00000059540) LOC103695118 (ENSRNOG00000056701) Bnip2 (ENSRNOG00000056024) Foxb1 (ENSRNOG00000068150) ##22 Anxa2 (ENSRNOG00000010362) Ice2 (ENSRNOG00000010160) Rora (ENSRNOG00000027145) Vps13c (ENSRNOG00000030213) C2cd4a (ENSRNOG00000034236) C2cd4b (ENSRNOG00000065921) Tln2 (ENSRNOG00000018373) Tpm1 (ENSRNOG00000018184) Lactb (ENSRNOG00000018081) Rps27l (ENSRNOG00000050473) Rab8b (ENSRNOG00000018009) Aph1b (ENSRNOG00000027295) LOC120094192 (ENSRNOG00000067077) LOC691658 (ENSRNOG00000063302) Car12 (ENSRNOG00000017766)