Euteleostomi	ANCESTRAL SPECIES	70	ENSGT00940000162916	ENSGT00940000157702	ENSGT00940000162230	ENSGT00390000013040	ENSGT00390000011509	ENSGT00390000008732.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000168178	ENSGT00390000010743.b	ENSGT00910000145076	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000013765	ENSGT00940000156868	ENSGT00390000018089	ENSGT00390000008938	ENSGT00950000182969.A #22	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b	ENSGT00940000156261	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419
Sarcopterygii	ANCESTRAL SPECIES	71								ENSGT00940000159569	ENSGT00390000010743.b	ENSGT00910000145076	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000013765	ENSGT00940000156868	ENSGT00390000018089	ENSGT00390000008938	ENSGT00950000182969.A #22	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b	ENSGT00940000156261	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT01060000248575.C	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936
Tetrapoda	ANCESTRAL SPECIES	58								ENSGT00940000159569	ENSGT00390000010743.b	ENSGT00910000145076	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000013765	ENSGT00940000156868	ENSGT00390000018089	ENSGT00390000008938	ENSGT00950000182969.A #22	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b	ENSGT00940000156261	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT01060000248575.C	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936
Anura	ANCESTRAL SPECIES	127									ENSGT00940000159569	ENSGT00390000010743.b	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000013765	ENSGT00940000156868	ENSGT00390000018089	ENSGT00390000008938	ENSGT00950000182969.A #22	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b	ENSGT00940000156261.a	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00390000016384
Frog	DUPLICATION
Frog	MODERN SPECIES	9	ENSXETG00000036649 #7	ENSXETG00000034875 #8	myo10.2 (ENSXETG00000007165) #9	slc4a3 (ENSXETG00000007160) #10	stk11ip (ENSXETG00000007155) #11	gja7 (ENSXETG00000041851) #12	inha (ENSXETG00000014396) #13	obsl1 (ENSXETG00000014404) #14	TMEM198 (ENSXETG00000043205) #15	XB5760632 [provisional:paox] (ENSXETG00000014418) #16	chpf (ENSXETG00000041884) #17	ENSXETG00000042225 #18	aamp (ENSXETG00000014437) #19	gpbar1 (ENSXETG00000044012) #20	krt8.2 (ENSXETG00000014441) #21	krt18.3 (ENSXETG00000005611) #22	arpc2 (ENSXETG00000027920) #23	cxcr2 (ENSXETG00000048756) #24	tns1 (ENSXETG00000005595) #25	ENSXETG00000048012 #26	igfbp5 (ENSXETG00000044058) #27	igfbp2 (ENSXETG00000033133) #28	ENSXETG00000047629 #29	smarcal1 (ENSXETG00000000465) #30	pecr (ENSXETG00000000470) #31	tmem169 (ENSXETG00000032580) #32	map3k2 (ENSXETG00000000471) #33	bin1 (ENSXETG00000046584) #34	ercc3 (ENSXETG00000033646) #35	ENSXETG00000049050 #36	ENSXETG00000042927 #37
Frog	MODERN SPECIES	8	ENSXETG00000038323	tnfsf15 (ENSXETG00000042774)	ENSXETG00000039224	ENSXETG00000048849	anapc13.1 (ENSXETG00000025461)	ptgs1 (ENSXETG00000016336)	pdcl (ENSXETG00000016335)	ENSXETG00000046420	ENSXETG00000045081	mrrf (ENSXETG00000016327)	ENSXETG00000035538	rbm18 (ENSXETG00000038367)	lhx6 (ENSXETG00000016325)	morn5 (ENSXETG00000016326)	ndufa8 (ENSXETG00000016324)	krt18.2 (ENSXETG00000020532) ##22	zbtb26 (ENSXETG00000042339)	zbtb6 (ENSXETG00000020530)	shroom4 (ENSXETG00000030777)	ENSXETG00000035602	ENSXETG00000046383	CITED1 (ENSXETG00000046523)	hdac8 (ENSXETG00000020527)	XB995740 [provisional] (ENSXETG00000048770)	phka1 (ENSXETG00000018114)	XB940377 (ENSXETG00000045479)	ENSXETG00000041787	ENSXETG00000046837	ENSXETG00000048029	ENSXETG00000049475	ENSXETG00000045370
Leishan spiny toad	MODERN SPECIES	12	ENSLLEG00000010732	PTGS1 (ENSLLEG00000010768)	ENSLLEG00000010935	MRRF (ENSLLEG00000010984)	ENSLLEG00000011055	ENSLLEG00000011120	RBM18 (ENSLLEG00000011151)	LHX6 (ENSLLEG00000011213)	ENSLLEG00000011371	MORN5 (ENSLLEG00000011404)	ENSLLEG00000011593	NDUFA8 (ENSLLEG00000011607)	ENSLLEG00000011693	ENSLLEG00000011705	ENSLLEG00000011717	ENSLLEG00000011741 #22	ENSLLEG00000011807	ZBTB26 (ENSLLEG00000011941)	ZBTB6 (ENSLLEG00000011965)	ENSLLEG00000011983	RABGAP1 (ENSLLEG00000012034)	STRBP (ENSLLEG00000012560)	ENSLLEG00000012676	ENSLLEG00000012686	ENSLLEG00000012716	ENSLLEG00000012741	ENSLLEG00000012760	CRB2 (ENSLLEG00000020099)	ENSLLEG00000020201	ENSLLEG00000020398	ENSLLEG00000020455
Amniota	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182969.A #22
Sauria	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000163074	ENSGT00940000156180	ENSGT00390000001225	ENSGT00950000185166	ENSGT00940000158091	ENSGT00940000160544	ENSGT01040000240451.a.a	ENSGT00940000160799	ENSGT00940000154101.a	ENSGT00940000158887	ENSGT01050000244890.a.b.a	ENSGT00530000065055 #18	ENSGT00940000153648.a #19	ENSGT01030000234555.b #20	ENSGT00940000166665 #21	ENSGT00950000182969.A #22	ENSGT00390000016794.b #23	ENSGT01050000244848.A.a #24	ENSGT00950000186252	ENSGT00940000154044.a.b	ENSGT00940000155400.B #25	ENSGT00940000155890 #27	ENSGT00940000158542 #28	ENSGT00390000016988.a.a.a.a.a.b	ENSGT00390000016988.a.a.a.b.b	ENSGT00940000157608 #30	ENSGT00940000158179 #31	ENSGT00940000153239.A #32	ENSGT00390000015276	ENSGT00940000156882	ENSGT00940000156884 #33
Archelosauria	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00390000005415	ENSGT00940000163074	ENSGT00940000156180	ENSGT00390000001225	ENSGT00940000158091	ENSGT00940000160544	ENSGT01040000240451.a.a	ENSGT00940000160799	ENSGT00940000154101.a	ENSGT00940000158887	ENSGT01050000244890.a.b.a	ENSGT00530000065055 #18	ENSGT00940000153648.a #19	ENSGT01030000234555.b #20	ENSGT00940000166665 #21	ENSGT00950000182969.A #22	ENSGT00390000016794.b #23	ENSGT00940000154044.a.b	ENSGT01050000244848.A.a #24	ENSGT00950000186252	ENSGT00940000155400.B #25	ENSGT00940000155890 #27	ENSGT00940000158542 #28	ENSGT00390000016988.a.a.a.b.b	ENSGT00940000157608 #30	ENSGT00940000158179 #31	ENSGT00940000153239.A #32	ENSGT00390000015276	ENSGT00940000156882	ENSGT00940000156884 #33	ENSGT00390000002204 #35
Cryptodira	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00390000005415	ENSGT00940000163074	ENSGT00940000156180	ENSGT00390000001225	ENSGT00940000158091	ENSGT00940000160544	ENSGT01040000240451.a.a	ENSGT00940000160799	ENSGT00940000154101.a	ENSGT00940000158887	ENSGT01050000244890.a.b.a	ENSGT00530000065055 #18	ENSGT00940000153648.a #19	ENSGT01030000234555.b #20	ENSGT00940000166665 #21	ENSGT00950000182969.A #22	ENSGT00390000016794.b #23	ENSGT01050000244848.A.a #24	ENSGT00950000186252	ENSGT00940000154044.a.b	ENSGT00940000155400.B #25	ENSGT00940000155890 #27	ENSGT00940000158542 #28	ENSGT00390000016988.a.a.a.b.b	ENSGT00940000157608 #30	ENSGT00940000158179 #31	ENSGT00940000153239.A #32	ENSGT00390000015276	ENSGT00940000156882	ENSGT00940000156884 #33	ENSGT00390000002204 #35
Testudinoidea	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00390000005415	ENSGT00940000163074	ENSGT00940000156180	ENSGT00390000001225	ENSGT00940000158091	ENSGT00940000160544	ENSGT01040000240451.a.a	ENSGT00940000160799	ENSGT00940000154101.a	ENSGT00940000158887	ENSGT01050000244890.a.b.a.e	ENSGT00530000065055 #18	ENSGT00940000153648.a #19	ENSGT01030000234555.b #20	ENSGT00940000166665 #21	ENSGT00950000182969.A #22	ENSGT00390000016794.b #23	ENSGT01050000244848.A.a #24	ENSGT00940000154044.a.b	ENSGT00940000155400.B.w #25	ENSGT00940000155890 #27	ENSGT00940000158542 #28	ENSGT00390000016988.a.a.a.b.b	ENSGT00940000157608 #30	ENSGT00940000158179 #31	ENSGT00940000153239.A #32	ENSGT00390000015276	ENSGT00940000156882	ENSGT00940000156884 #33	ENSGT00390000002204 #35	ENSGT00950000182905.a.b
Emydidae	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000005415	ENSGT00940000163074	ENSGT00940000156180	ENSGT00390000001225	ENSGT00940000158091	ENSGT00940000160544	ENSGT01040000240451.a.a	ENSGT00940000160799	ENSGT00940000154101.a	ENSGT00940000158887	ENSGT01050000244890.a.b.a.e	ENSGT00530000065055 #18	ENSGT00940000153648.a #19	ENSGT01030000234555.b #20	ENSGT00940000166665 #21	ENSGT00950000182969.A #22	ENSGT00390000016794.b #23	ENSGT01050000244848.A.a #24	ENSGT00940000154044.a.b	ENSGT00940000155400.B.w #25	ENSGT00940000155890 #27	ENSGT00940000158542 #28	ENSGT00390000016988.a.a.a.b.b	ENSGT00940000157608 #30	ENSGT00940000158179 #31	ENSGT00940000153239.A #32	ENSGT00390000015276	ENSGT00940000156882	ENSGT00940000156884 #33	ENSGT00390000002204 #35	ENSGT00950000182905.a.b
Three-toed box turtle	MODERN SPECIES	25	TTLL4 (ENSTMTG00000002381)	STK36 (ENSTMTG00000002393)	RNF25 (ENSTMTG00000002407)	BCS1L (ENSTMTG00000002414)	ZNF142 (ENSTMTG00000002420)	PLCD4 (ENSTMTG00000002429)	CNOT9 (ENSTMTG00000002465)	USP37 (ENSTMTG00000002474)	ENSTMTG00000002533	VIL1 (ENSTMTG00000002541)	SLC11A1 (ENSTMTG00000002565)	CATIP (ENSTMTG00000002574)	PNKD (ENSTMTG00000002598)	AAMP (ENSTMTG00000002611) #19	ENSTMTG00000000061 #20	ENSTMTG00000000089 #22	ARPC2 (ENSTMTG00000000132) #23	ENSTMTG00000000165 #24	ENSTMTG00000000182	ENSTMTG00000000215 #25	IGFBP5 (ENSTMTG00000000269) #27	IGFBP2 (ENSTMTG00000000287) #28	ENSTMTG00000000302	SMARCAL1 (ENSTMTG00000000320) #30	MARCHF4 (ENSTMTG00000000364) #31	XRCC5 (ENSTMTG00000000396) #32	TMEM169 (ENSTMTG00000000441)	PECR (ENSTMTG00000000451)	MAP3K2 (ENSTMTG00000000471) #33	ERCC3 (ENSTMTG00000000506) #35	CYP27C1 (ENSTMTG00000000553)
painted turtle	MODERN SPECIES	697	BCS1L (ENSCPBG00000013235)	ZNF142 (ENSCPBG00000013238)	PLCD4 (ENSCPBG00000013241)	CNOT9 (ENSCPBG00000013247)	USP37 (ENSCPBG00000013249)	VIL1 (ENSCPBG00000013251)	CTDSP1 (ENSCPBG00000013256)	SLC11A1 (ENSCPBG00000013259)	CATIP (ENSCPBG00000013266)	PNKD (ENSCPBG00000013269)	TMBIM1 (ENSCPBG00000013279)	ENSCPBG00000013281 #18	AAMP (ENSCPBG00000013283) #19	ENSCPBG00000013285 #20	ENSCPBG00000013286 #21	ENSCPBG00000013287 #22	ARPC2 (ENSCPBG00000013289) #23	ENSCPBG00000013291 #24	ENSCPBG00000013294	ENSCPBG00000013300 #25	ENSCPBG00000013348 #25	IGFBP5 (ENSCPBG00000013587) #27	ENSCPBG00000013588 #28	ENSCPBG00000013591	ENSCPBG00000013594	SMARCAL1 (ENSCPBG00000013599) #30	MARCHF4 (ENSCPBG00000013609) #31	XRCC5 (ENSCPBG00000013615) #32	TMEM169 (ENSCPBG00000013623)	PECR (ENSCPBG00000013628)	MAP3K2 (ENSCPBG00000013632) #33
Testudinidae	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00390000005415	ENSGT00940000163074	ENSGT00940000156180	ENSGT00390000001225	ENSGT00940000158091	ENSGT00940000160544	ENSGT01040000240451.a.a	ENSGT00940000160799	ENSGT00940000154101.a	ENSGT00940000158887	ENSGT01050000244890.a.b.a.e	ENSGT00530000065055 #18	ENSGT00940000153648.a #19	ENSGT01030000234555.b #20	ENSGT00940000166665 #21	ENSGT00950000182969.A #22	ENSGT00390000016794.b #23	ENSGT01050000244848.A.a #24	ENSGT00940000154044.a.b	ENSGT00940000155400.B.w #25	ENSGT00940000155890 #27	ENSGT00940000158542 #28	ENSGT00390000016988.a.a.a.b.b	ENSGT00940000157608 #30	ENSGT00940000158179 #31	ENSGT00940000153239.A #32	ENSGT00390000015276	ENSGT00940000156882	ENSGT00940000156884 #33	ENSGT00390000002204 #35	ENSGT00950000182905.a.b
Goode s thornscrub tortoise	MODERN SPECIES	2	BCS1L (ENSGEVG00005019212)	ZNF142 (ENSGEVG00005019203)	PLCD4 (ENSGEVG00005019056)	CNOT9 (ENSGEVG00005019017)	USP37 (ENSGEVG00005018974)	VIL1 (ENSGEVG00005018920)	CTDSP1 (ENSGEVG00005018850)	SLC11A1 (ENSGEVG00005018102)	CATIP (ENSGEVG00005017934)	PNKD (ENSGEVG00005017904)	ENSGEVG00005017881	TMBIM1 (ENSGEVG00005017854)	ENSGEVG00005017838 #18	AAMP (ENSGEVG00005017816) #19	ENSGEVG00005017764 #21	ENSGEVG00005017713 #22	ARPC2 (ENSGEVG00005017680) #23	ENSGEVG00005017657	ENSGEVG00005017649 #24	ENSGEVG00005017615	ENSGEVG00005017576	ENSGEVG00005017528 #25	ENSGEVG00005017383 #25	IGFBP5 (ENSGEVG00005017341) #27	IGFBP2 (ENSGEVG00005017314) #28	ENSGEVG00005017288	SMARCAL1 (ENSGEVG00005017218) #30	MARCHF4 (ENSGEVG00005017175) #31	XRCC5 (ENSGEVG00005017139) #32	TMEM169 (ENSGEVG00005017124)	PECR (ENSGEVG00005017104)
Chinese turtle	MODERN SPECIES	2171								ENSPSIG00000014238	ENSPSIG00000014071	PNKD (ENSPSIG00000013750)	ENSPSIG00000001013	ENSPSIG00000013670	ENSPSIG00000013321	AAMP (ENSPSIG00000013276) #19	ENSPSIG00000012980 #21	ENSPSIG00000012506 #22	ARPC2 (ENSPSIG00000012212) #23	ENSPSIG00000001005 #24
Lepidosauria	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182969.A #22
Episquamata	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000163074	ENSGT00940000156180	ENSGT00390000001225	ENSGT00940000158091	ENSGT00940000160544	ENSGT01040000240451.a.a	ENSGT00940000160799	ENSGT00940000154101.a	ENSGT00940000158887	ENSGT01050000244890.a.b.a.c	ENSGT01050000244890.a.b.a.d	ENSGT00530000065055 #18	ENSGT00940000153648.a #19	ENSGT01030000234555.b #20	ENSGT00940000166665 #21	ENSGT00950000182969.A #22	ENSGT00940000163961.b	ENSGT00390000016794.b #23	ENSGT01050000244848.A.a #24	ENSGT00950000186252	ENSGT00940000155400.B #25	ENSGT00940000155890.k.b #27	ENSGT00940000158542 #28	ENSGT00390000016988.a.a.a.b.b	ENSGT00940000157608 #30	ENSGT00940000158179 #31	ENSGT00940000153239.A #32	ENSGT00390000015276	ENSGT00940000156882	ENSGT00940000156884 #33	ENSGT00390000002204 #35
Toxicofera	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00390000005415	ENSGT00940000163074	ENSGT00940000156180	ENSGT00390000001225	ENSGT00940000158091	ENSGT00940000160544	ENSGT01040000240451.a.a	ENSGT00940000160799	ENSGT00940000154101.a	ENSGT00940000158887	ENSGT01050000244890.a.b.a.c	ENSGT01050000244890.a.b.a.d	ENSGT00940000153648.a #19	ENSGT01030000234555.b #20	ENSGT00940000166665 #21	ENSGT00950000182969.A #22	ENSGT00940000163961.b	ENSGT00390000016794.b #23	ENSGT01050000244848.A.a #24	ENSGT00940000154044.a.b	ENSGT00950000186252	ENSGT00940000155400.B #25	ENSGT00940000155890.k.b #27	ENSGT00940000158542 #28	ENSGT00390000016988.a.a.a.b.b	ENSGT00940000157608 #30	ENSGT00940000158179 #31	ENSGT00940000153239.A #32	ENSGT00390000015276	ENSGT00940000156882	ENSGT00940000156884 #33
Elapidae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000163074	ENSGT00940000156180	ENSGT00390000001225	ENSGT00940000158091	ENSGT00940000160544	ENSGT01040000240451.a.a	ENSGT00940000160799	ENSGT00940000154101.a	ENSGT00940000158887	ENSGT00960000190536	ENSGT01050000244890.a.b.a.c	ENSGT01050000244890.a.b.a.d	ENSGT00940000153648.a #19	ENSGT01030000234555.b #20	ENSGT00940000166665 #21	ENSGT00950000182969.A #22	ENSGT00940000163961.b	ENSGT00390000016794.b #23	ENSGT01050000244848.A.a.c.a #24	ENSGT01050000244848.A.a.d #24	ENSGT00950000186252	ENSGT01050000244848.A.a.c.b #24	ENSGT00940000155400.B #25	ENSGT00940000155890.k.b #27	ENSGT00940000158542 #28	ENSGT00390000016988.a.a.a.b.b	ENSGT00940000157608 #30	ENSGT00940000158179 #31	ENSGT00940000153239.A #32	ENSGT00390000015276	ENSGT00940000156882
Indian cobra	MODERN SPECIES		ZNF142 (ENSNNAG00000015347)	PLCD4 (ENSNNAG00000015326)	CNOT9 (ENSNNAG00000015312)	USP37 (ENSNNAG00000015217)	VIL1 (ENSNNAG00000015190)	CTDSP1 (ENSNNAG00000015173)	SLC11A1 (ENSNNAG00000015159)	CATIP (ENSNNAG00000015139)	PNKD (ENSNNAG00000015068)	ENSNNAG00000015053	TMBIM1 (ENSNNAG00000015027)	ENSNNAG00000015008	AAMP (ENSNNAG00000014988) #19	ENSNNAG00000014976 #20	ENSNNAG00000014960 #21	ENSNNAG00000014932 #22	ARPC2 (ENSNNAG00000014906) #23	ENSNNAG00000014894 #24	ENSNNAG00000014886 #24	ENSNNAG00000014876	TNS1 (ENSNNAG00000014625) #25	ENSNNAG00000014580	IGFBP5 (ENSNNAG00000014564) #27	ENSNNAG00000014542 #27	IGFBP2 (ENSNNAG00000014535) #28	ENSNNAG00000014517	SMARCAL1 (ENSNNAG00000014498) #30	MARCHF4 (ENSNNAG00000014432) #31	XRCC5 (ENSNNAG00000014382) #32	TMEM169 (ENSNNAG00000014361)	PECR (ENSNNAG00000014353)
Elapidae_a	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182969.A #22
Blue-lipped sea krait	MODERN SPECIES	2544																ENSLLTG00000014138 #22	ARPC2 (ENSLLTG00000014132) #23	ENSLLTG00000014129 #24	ENSLLTG00000014125
Lizard	MODERN SPECIES		ENSACAG00000002813	BCS1L (ENSACAG00000002750)	ZNF142 (ENSACAG00000002711)	PLCD4 (ENSACAG00000002589)	CNOT9 (ENSACAG00000002521)	USP37 (ENSACAG00000002348)	VIL1 (ENSACAG00000002214)	CTDSP1 (ENSACAG00000001954)	SLC11A1 (ENSACAG00000001716)	CATIP (ENSACAG00000001693)	ENSACAG00000001617	TMBIM1 (ENSACAG00000001486)	ENSACAG00000001349 #19	ENSACAG00000027443 #20	ENSACAG00000001282 #21	ENSACAG00000001171 #22	ARPC2 (ENSACAG00000001089) #23	ENSACAG00000044804	ENSACAG00000041559 #24	ENSACAG00000035157 #24	ENSACAG00000028385	ENSACAG00000036030	ENSACAG00000000790 #25	ENSACAG00000039319	ENSACAG00000026696	ENSACAG00000037968	ENSACAG00000042531	ENSACAG00000041108	ENSACAG00000025725 #27	ENSACAG00000010477	ENSACAG00000010273
Coelacanth	MODERN SPECIES	1669											MRRF (ENSLACG00000010290)	RBM18 (ENSLACG00000009920)	LHX6 (ENSLACG00000009230)	MORN5 (ENSLACG00000022677)	NDUFA8 (ENSLACG00000008095)	si:ch211-243g18.2 (ENSLACG00000005583) #22	ZBTB6 (ENSLACG00000003026)	ENSLACG00000000406
Actinopterygii	ANCESTRAL SPECIES	70	ENSGT00940000163466	ENSGT00940000164473	ENSGT00940000163579	ENSGT00940000153189.B	ENSGT00950000183190.a.b.b	ENSGT00390000011509	ENSGT00390000008732.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00390000010743.b	ENSGT00910000145076	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000013765	ENSGT00940000156868.g	ENSGT00390000018089	ENSGT00390000008938	ENSGT00950000182969.A #22	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00940000154130.a.b	ENSGT00950000182888.a.b	ENSGT00390000005101	ENSGT01030000234558.D.a	ENSGT00730000111240	ENSGT00390000004247	ENSGT00940000158646	ENSGT00390000009349	ENSGT00940000160710	ENSGT00940000159447
Reedfish	MODERN SPECIES	17	psmd5 (ENSECRG00000012320)	ENSECRG00000012297	zgc:101858 (ENSECRG00000012270)	PPIL3 (ENSECRG00000012237)	ENSECRG00000012050	ENSECRG00000011964	rpl28 (ENSECRG00000011937)	pdcl (ENSECRG00000011923)	PTGS1 (ENSECRG00000011891)	ENSECRG00000011876	mrrf (ENSECRG00000011864)	rbm18 (ENSECRG00000011852)	lhx6a (ENSECRG00000011822)	morn5 (ENSECRG00000011802)	ndufa8 (ENSECRG00000011788)	si:ch211-243g18.2 (ENSECRG00000011765) #22	ENSECRG00000011752	zbtb26 (ENSECRG00000011741)	RC3H2 (ENSECRG00000011691)	RABGAP1 (ENSECRG00000011592)	STRBP (ENSECRG00000011531)	sh2d3cb (ENSECRG00000011472)	tor2a (ENSECRG00000011442)	urm1 (ENSECRG00000011426)	ENSECRG00000011398	ENSECRG00000011360	ptrh1 (ENSECRG00000011332)	slc27a4 (ENSECRG00000011301)	ENSECRG00000011247	ENSECRG00000021099	ENSECRG00000021086
Neopterygii	ANCESTRAL SPECIES	65	ENSGT00940000167622	ENSGT00940000163466	ENSGT00940000164473	ENSGT00940000163579	ENSGT00940000153189.B	ENSGT00950000183190.a.b.b	ENSGT00390000011509	ENSGT00390000008732.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00390000010743.b	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000013765	ENSGT00940000156868.g	ENSGT00390000018089	ENSGT00390000008938	ENSGT00950000182969.A #22	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00940000154130.a.b	ENSGT00950000182888.a.b	ENSGT00390000005101	ENSGT01030000234558.D.a	ENSGT00730000111240	ENSGT00390000004247	ENSGT00940000157589	ENSGT00940000166736	ENSGT00530000063085.B	ENSGT00940000159387
Spotted gar	MODERN SPECIES	660	ENSLOCG00000003261	psmd5 (ENSLOCG00000003231)	col27a1b (ENSLOCG00000003177)	zgc:101858 (ENSLOCG00000003168)	PPIL3 (ENSLOCG00000003154)	ENSLOCG00000003100	ENSLOCG00000003085	rpl28 (ENSLOCG00000003073)	pdcl (ENSLOCG00000003058)	PTGS1 (ENSLOCG00000003036)	mrrf (ENSLOCG00000003021)	rbm18 (ENSLOCG00000003002)	lhx6a (ENSLOCG00000002986)	morn5 (ENSLOCG00000002968)	ndufa8 (ENSLOCG00000002944)	si:ch211-243g18.2 (ENSLOCG00000002921) #22	zbtb26 (ENSLOCG00000002911)	ENSLOCG00000002894	RABGAP1 (ENSLOCG00000002828)	STRBP (ENSLOCG00000002814)	sh2d3cb (ENSLOCG00000002795)	tor2a (ENSLOCG00000002778)	urm1 (ENSLOCG00000002768)	CERCAM (ENSLOCG00000002746)	cfap157 (ENSLOCG00000002725)	sardh (ENSLOCG00000002697)	dbh (ENSLOCG00000002677)	FAM163B (ENSLOCG00000002663)	ADAMTSL2 (ENSLOCG00000002647)	mymk (ENSLOCG00000002633)	ENSLOCG00000002619
Osteoglossocephalai	DUPLICATION
Osteoglossocephalai	DUPLICATION
Osteoglossocephalai	ANCESTRAL SPECIES	501																ENSGT00950000182969.A.a.a #22	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000154130.a.b.f	ENSGT00950000182888.a.b
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Euteleosteomorpha	ANCESTRAL SPECIES	82	ENSGT00940000160711	ENSGT00390000008206	ENSGT00940000154043.A.j.a	ENSGT00940000163579	ENSGT00940000164473	ENSGT00940000162727.a.a	ENSGT00940000156880.c.b	ENSGT00950000182975.a.a.b.k	ENSGT00390000014658	ENSGT00940000157157.b.a.a	ENSGT00940000158199	ENSGT00940000156724	ENSGT00940000167162	ENSGT00390000010743.b.b	ENSGT00940000156868.h	ENSGT00950000182969.A.a.a #22	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000163543.a	ENSGT00940000154687.B.q.b	ENSGT00940000167684	ENSGT00730000111240	ENSGT00940000154130.a.b.f	ENSGT00950000182888.a.b	ENSGT00390000004247	ENSGT00400000024875.c.b	ENSGT00400000024875.c.a.a.a	ENSGT00400000024875.c.a.a.b	ENSGT00940000159387.e	ENSGT00940000159447	ENSGT00940000160710	ENSGT00390000004550
Acanthomorphata	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000154043.A.j.a	ENSGT00940000163579	ENSGT00940000164473	ENSGT00940000162727.a.a	ENSGT00940000155161	ENSGT00940000156880.c.b	ENSGT00940000169810	ENSGT00950000182975.a.a.b.k	ENSGT00390000014658	ENSGT00940000157157.b.a.a	ENSGT00940000158199	ENSGT00940000156724	ENSGT00940000167162	ENSGT00390000010743.b.b	ENSGT00940000156868.h	ENSGT00950000182969.A.a.a #22
Euacanthomorphacea	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000154043.A.j.a	ENSGT00940000163579	ENSGT00940000164473	ENSGT00940000162727.a.a	ENSGT00940000155161	ENSGT00940000156880.c.b	ENSGT00940000169810	ENSGT00950000182975.a.a.b.k	ENSGT00390000014658	ENSGT00940000157157.b.a.a	ENSGT00940000158199	ENSGT00940000156724	ENSGT00940000167162	ENSGT00390000010743.b.b	ENSGT00940000156868.h	ENSGT00950000182969.A.a.a #22	ENSGT00390000013037	ENSGT00940000160867	ENSGT00940000164390	ENSGT00940000167497	ENSGT00940000159487	ENSGT00940000157449.b	ENSGT01030000234535.E.c	ENSGT00940000156423.i	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000153372.A.e.a.b.a	ENSGT00940000157870.a.b	ENSGT00390000014810.b	ENSGT00940000155332.B	ENSGT00940000157905	ENSGT00390000001442
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Percomorphaceae_B	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000154043.A.j.a	ENSGT00940000163579	ENSGT00940000164473	ENSGT00940000162727.a.a	ENSGT00940000156880.c.b	ENSGT00940000169810	ENSGT00950000182975.a.a.b.k	ENSGT00390000014658	ENSGT00940000157157.b.a.a	ENSGT00940000163149.a.b.c.b	ENSGT00940000158199	ENSGT00940000156724	ENSGT00940000167162	ENSGT00390000010743.b.b	ENSGT00940000156868.h	ENSGT00950000182969.A.a.a #22	ENSGT00390000013037	ENSGT00940000160867	ENSGT00940000164390	ENSGT00940000167497	ENSGT00940000159487	ENSGT00940000157449.b	ENSGT01030000234535.E.c	ENSGT00940000156423.i	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000153372.A.e.a.b.a	ENSGT00940000157870.a.b	ENSGT00390000014810.b	ENSGT00940000155332.B	ENSGT00940000157905	ENSGT00390000001442
Percomorphaceae_C	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000154043.A.j.a	ENSGT00940000153189.B	ENSGT00940000164473	ENSGT00940000162727.a.a	ENSGT00940000156880.c.b	ENSGT00940000169810	ENSGT00950000182975.a.a.b.k	ENSGT00390000014658	ENSGT00940000157157.b.a.a	ENSGT00940000163149.a.b.c.b	ENSGT00940000158199	ENSGT00940000156724	ENSGT00940000167162	ENSGT00390000010743.b.b	ENSGT00940000156868.h	ENSGT00950000182969.A.a.a #22	ENSGT00390000013037	ENSGT00940000160867	ENSGT00940000164390	ENSGT00940000167497	ENSGT00940000159487	ENSGT00940000157449.b	ENSGT01030000234535.E.c	ENSGT00940000156423.i	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000178516	ENSGT00940000153372.A.e.a.b.a	ENSGT00940000157870.a.b	ENSGT00390000014810.b	ENSGT00940000155332.B	ENSGT00940000157905
Percomorphaceae_D	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000154043.A.j.a	ENSGT00940000163579.f	ENSGT00940000164473	ENSGT00940000162727.a.a	ENSGT00940000156880.c.b	ENSGT00940000169810	ENSGT00950000182975.a.a.b.k	ENSGT00390000014658	ENSGT00940000157157.b.a.a	ENSGT00940000163149.a.b.c.b	ENSGT00940000158199	ENSGT00940000156724	ENSGT00940000167162	ENSGT00390000010743.b.b	ENSGT00940000156868.h	ENSGT00950000182969.A.a.a #22	ENSGT00390000013037	ENSGT00940000160867	ENSGT00940000164390	ENSGT00940000167497	ENSGT00940000159487	ENSGT00940000157449.b	ENSGT01030000234535.E.c	ENSGT00940000156423.i	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000178516	ENSGT00940000153372.A.e.a.b.a	ENSGT00940000157870.a.b	ENSGT00390000014810.b	ENSGT00940000155332.B	ENSGT00940000157905
Carangaria	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000154043.A.j.a	ENSGT00940000163579.f	ENSGT00940000164473	ENSGT00940000163466	ENSGT00940000167622	ENSGT00940000156880.c.b	ENSGT00950000182975.a.a.b.k	ENSGT00390000014658	ENSGT00940000157157.b.a.a	ENSGT00940000163149.a.b.c.b	ENSGT00940000158199	ENSGT00940000156724	ENSGT00940000167162	ENSGT00390000010743.b.b	ENSGT00940000156868.h	ENSGT00950000182969.A.a.a #22	ENSGT00390000013037	ENSGT00940000160867	ENSGT00940000164390	ENSGT00940000167497	ENSGT00940000159487	ENSGT00940000157449.b	ENSGT01030000234535.E.c.a.b	ENSGT00940000156423.i	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000178516	ENSGT00940000153372.A.e.a.b.a	ENSGT00940000157870.a.b	ENSGT00390000014810.b	ENSGT00940000155332.B	ENSGT00940000157905
Pleuronectoidei	ANCESTRAL SPECIES	34													ENSGT00940000167162	ENSGT00390000010743.b.b	ENSGT00940000156868.h	ENSGT00950000182969.A.a.a #22	ENSGT00390000013037	ENSGT00940000160867	ENSGT00940000164390	ENSGT00940000167497	ENSGT00940000159487	ENSGT00940000157449.b	ENSGT01030000234535.E.c.a.b	ENSGT00940000156423.i	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000178516	ENSGT00940000153372.A.e.a.b.a	ENSGT00940000157870.a.b	ENSGT00390000014810.b	ENSGT00940000155332.B	ENSGT00940000157905
Turbot	MODERN SPECIES	21	ITGA2 (ENSSMAG00000007807)	FST (ENSSMAG00000007849)	NDUFS4 (ENSSMAG00000007862)	arl15a (ENSSMAG00000007879)	SNX18 (ENSSMAG00000007896)	ENSSMAG00000007902	lipg (ENSSMAG00000007932)	ENSSMAG00000007959	ENSSMAG00000007994	mthfd2l (ENSSMAG00000023070)	ENSSMAG00000008038	ENSSMAG00000008061	ENSSMAG00000029263	ENSSMAG00000008073	ENSSMAG00000008093	ENSSMAG00000008121 #22	ENSSMAG00000023340	ENSSMAG00000008134	ugt2b5 (ENSSMAG00000008137)	ENSSMAG00000008149	ENSSMAG00000008171	ENSSMAG00000008195	ENSSMAG00000008215	ENSSMAG00000008238	ENSSMAG00000008267	ENSSMAG00000008285	ENSSMAG00000008290	ENSSMAG00000008325	ENSSMAG00000029669	ENSSMAG00000008364	ENSSMAG00000008382
Tongue sole	MODERN SPECIES	398	ENSCSEG00000019379	dmrt1 (ENSCSEG00000019352)	dmrt3a (ENSCSEG00000019346)	dmrt2a (ENSCSEG00000019331)	SMARCA2 (ENSCSEG00000019311)	adamts3 (ENSCSEG00000019302)	NPFFR2 (ENSCSEG00000019293)	slc4a4a (ENSCSEG00000019255)	rufy3 (ENSCSEG00000019228)	ENSCSEG00000019209	mapk1 (ENSCSEG00000019114)	ENSCSEG00000019092	ENSCSEG00000019086	ENSCSEG00000019076	LHX6 (ENSCSEG00000019057)	krt1-c5 (ENSCSEG00000019044) #22	ENSCSEG00000019025	tal2 (ENSCSEG00000019020)	ENSCSEG00000019019	ENSCSEG00000019012	ENSCSEG00000019007	ENSCSEG00000019003	ENSCSEG00000018988	poli (ENSCSEG00000018977)	RAB27B (ENSCSEG00000018974)	ST8SIA3 (ENSCSEG00000018966)	CCNG2 (ENSCSEG00000018957)	ENSCSEG00000018931	scarb2a (ENSCSEG00000018922)	PPEF2 (ENSCSEG00000018893)	ENSCSEG00000018882
Carangaria_A	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00390000008206	ENSGT00940000154043.A.j.a	ENSGT00940000163579.f	ENSGT00940000164473	ENSGT00940000162727.a.a	ENSGT00940000156880.c.b	ENSGT00950000182975.a.a.b.k	ENSGT00390000014658	ENSGT00940000157157.b.a.a	ENSGT00940000163149.a.b.c.b	ENSGT00940000158199	ENSGT00940000156724	ENSGT00940000167162	ENSGT00390000010743.b.b	ENSGT00940000156868.h	ENSGT00950000182969.A.a.a #22	ENSGT00390000013037	ENSGT00940000160867	ENSGT00940000164390	ENSGT00940000167497	ENSGT00940000159487	ENSGT00940000157449.b	ENSGT01030000234535.E.c.a.b	ENSGT00940000156423.i	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000178516	ENSGT00940000153372.A.e.a.b.a	ENSGT00940000157870.a.b	ENSGT00390000014810.b	ENSGT00940000155332.B	ENSGT00940000157905
Seriola	ANCESTRAL SPECIES	40	ENSGT00390000008206	ENSGT00940000154043.A.j.a	ENSGT00940000163579.f	ENSGT00940000164473	ENSGT00940000162727.a.a	ENSGT00940000156880.c.b	ENSGT00950000182975.a.a.b.k	ENSGT00390000014658	ENSGT00940000157157.b.a.a	ENSGT00940000163149.a.b.c.b	ENSGT00940000158199	ENSGT00940000156724	ENSGT00940000167162	ENSGT00390000010743.b.b	ENSGT00940000156868.h	ENSGT00950000182969.A.a.a #22	ENSGT00390000013037	ENSGT00940000160867	ENSGT00940000164390	ENSGT00940000167497	ENSGT00940000159487	ENSGT00940000157449.b	ENSGT01030000234535.E.c.a.b	ENSGT00940000156423.i	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000178516	ENSGT00940000153372.A.e.a.b.a	ENSGT00940000157870.a.b	ENSGT00390000014810.b	ENSGT00940000155332.B	ENSGT00940000157905
Yellowtail amberjack	MODERN SPECIES	2964	hscb (ENSSLDG00000018037)	LRRC8A (ENSSLDG00000018046)	ppil3 (ENSSLDG00000018058)	zgc:101858 (ENSSLDG00000018083)	col27a1b (ENSSLDG00000018113)	ENSSLDG00000018198	KCNT1 (ENSSLDG00000018224)	camsap1b (ENSSLDG00000018278)	ubac1 (ENSSLDG00000018317)	notch1b (ENSSLDG00000018384)	ENSSLDG00000018539	inpp5e (ENSSLDG00000018557)	pmpca (ENSSLDG00000018632)	ENSSLDG00000018678	LHX6 (ENSSLDG00000018703)	krt1-c5 (ENSSLDG00000018727) #22	tal2 (ENSSLDG00000018760)	ugt2b5 (ENSSLDG00000018772)	zgc:152968 (ENSSLDG00000018799)	poli (ENSSLDG00000018830)	RAB27B (ENSSLDG00000018857)
Greater amberjack	MODERN SPECIES	175	ENSSDUG00000022148	ENSSDUG00000022151	ENSSDUG00000022161	ENSSDUG00000022164	KCNT1 (ENSSDUG00000022178)	camsap1b (ENSSDUG00000022239)	ubac1 (ENSSDUG00000022243)	notch1b (ENSSDUG00000022250)	ENSSDUG00000022259	inpp5e (ENSSDUG00000022262)	pmpca (ENSSDUG00000022267)	ENSSDUG00000022274	PTGS1 (ENSSDUG00000022276)	ENSSDUG00000022280	LHX6 (ENSSDUG00000022284)	krt1-c5 (ENSSDUG00000022288) #22	ENSSDUG00000022301	ENSSDUG00000022323	tal2 (ENSSDUG00000022337)	ugt2b5 (ENSSDUG00000022339)	poli (ENSSDUG00000022341)	RAB27B (ENSSDUG00000022347)	ST8SIA3 (ENSSDUG00000022353)	CCNG2 (ENSSDUG00000022362)	ENSSDUG00000022367	ENSSDUG00000022379	scarb2a (ENSSDUG00000022383)	PPEF2 (ENSSDUG00000022399)	ENSSDUG00000022402	ENSSDUG00000022408	hint2 (ENSSDUG00000022415)
Barramundi perch	MODERN SPECIES	9	hscb (ENSLCAG00010016887)	LRRC8A (ENSLCAG00010016891)	ppil3 (ENSLCAG00010016895)	zgc:101858 (ENSLCAG00010016897)	ENSLCAG00010016901	ENSLCAG00010016909	KCNT1 (ENSLCAG00010016933)	ENSLCAG00010017010	ubac1 (ENSLCAG00010017030)	notch1b (ENSLCAG00010017057)	ENSLCAG00010017141	inpp5e (ENSLCAG00010017144)	pmpca (ENSLCAG00010017147)	PTGS1 (ENSLCAG00010017161)	LHX6 (ENSLCAG00010017165)	krt1-c5 (ENSLCAG00010017175) #22	ENSLCAG00010017180	ENSLCAG00010017184	tal2 (ENSLCAG00010017186)	ugt2b5 (ENSLCAG00010017189)	zgc:152968 (ENSLCAG00010017193)	poli (ENSLCAG00010017198)	ENSLCAG00010017204	ST8SIA3 (ENSLCAG00010017205)	CCNG2 (ENSLCAG00010017206)	ENSLCAG00010017211	scarb2a (ENSLCAG00010017220)	PPEF2 (ENSLCAG00010017233)	ENSLCAG00010017243	ENSLCAG00010017269	hint2 (ENSLCAG00010017289)
Anabantaria	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000008206	ENSGT00940000154043.A.j.a	ENSGT00940000153189.B	ENSGT00940000164473	ENSGT00940000162727.a.a	ENSGT00940000156880.c.b	ENSGT00940000169810	ENSGT00950000182975.a.a.b.k	ENSGT00390000014658	ENSGT00940000157157.b.a.a	ENSGT00940000163149.a.b.c.b	ENSGT00940000158199	ENSGT00940000156724	ENSGT00390000010743.b.b	ENSGT00940000156868.h	ENSGT00950000182969.A.a.a #22	ENSGT00390000013037	ENSGT00940000160867	ENSGT00940000164390	ENSGT00940000167497	ENSGT00940000159487	ENSGT00940000157449.b	ENSGT01030000234535.E.c	ENSGT00940000156423.i	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000178516	ENSGT00940000153372.A.e.a.b.a	ENSGT00940000157870.a.b	ENSGT00390000014810.b	ENSGT00940000155332.B	ENSGT00940000157905
Zig-zag eel	MODERN SPECIES	23	ENSMAMG00000005152	ENSMAMG00000005198	ENSMAMG00000005166	ENSMAMG00000005217	ENSMAMG00000005244	KCNT1 (ENSMAMG00000005266)	ENSMAMG00000005391	camsap1b (ENSMAMG00000005419)	UBAC1 (ENSMAMG00000005480)	notch1b (ENSMAMG00000005533)	ENSMAMG00000025385	ENSMAMG00000005627	ENSMAMG00000005634	ENSMAMG00000005662	ENSMAMG00000005696	ENSMAMG00000005720 #22	ENSMAMG00000005877	ENSMAMG00000005897	ENSMAMG00000005920	ENSMAMG00000005933	ENSMAMG00000005953	ENSMAMG00000006381	ENSMAMG00000006417	ENSMAMG00000006423	ENSMAMG00000006445	ENSMAMG00000006485	ENSMAMG00000006505	ENSMAMG00000006516	ENSMAMG00000006530	ENSMAMG00000026002	emb (ENSMAMG00000006553)
Anabantoidei	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000008206	ENSGT00940000154043.A.j.a	ENSGT00940000163579.f	ENSGT00940000164473	ENSGT00940000162727.a.a	ENSGT00940000156880.c.b	ENSGT00940000161826.B	ENSGT00950000182975.a.a.b.k	ENSGT00390000014658	ENSGT00940000157157.b.a.a	ENSGT00940000163149.a.b.c.b	ENSGT00940000158199	ENSGT00940000156724	ENSGT00390000010743.b.b	ENSGT00940000156868.h	ENSGT00950000182969.A.a.a #22	ENSGT00390000013037	ENSGT00940000160867	ENSGT00940000164390	ENSGT00940000167497	ENSGT00940000159487	ENSGT00940000157449.b	ENSGT01030000234535.E.c	ENSGT00940000156423.i	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000178516	ENSGT00940000153372.A.e.a.b.a	ENSGT00940000157870.a.b	ENSGT00390000014810.b	ENSGT00940000155332.B	ENSGT00940000157905
Siamese fighting fish	MODERN SPECIES	20	ENSBSLG00000008284	ENSBSLG00000008262	hs3st1l2 (ENSBSLG00000016514)	h2az2a (ENSBSLG00000016510)	PURB (ENSBSLG00000016507)	ENSBSLG00000016503	ENSBSLG00000016499	CNNM4 (ENSBSLG00000016495)	ubac1 (ENSBSLG00000016470)	notch1b (ENSBSLG00000014799)	ENSBSLG00000014452	inpp5e (ENSBSLG00000014010)	pmpca (ENSBSLG00000013863)	PTGS1 (ENSBSLG00000013422)	LHX6 (ENSBSLG00000013283)	krt1-c5 (ENSBSLG00000013213) #22	ENSBSLG00000013154	tal2 (ENSBSLG00000013115)	ENSBSLG00000013080	ENSBSLG00000013042	ENSBSLG00000012570	ENSBSLG00000012266	ENSBSLG00000012239	ENSBSLG00000011417	ENSBSLG00000011090	zgc:152968 (ENSBSLG00000010880)	poli (ENSBSLG00000010857)	RAB27B (ENSBSLG00000010767)	ST8SIA3 (ENSBSLG00000010732)	CCNG2 (ENSBSLG00000010689)	ENSBSLG00000010677
Climbing perch	MODERN SPECIES	22	ENSATEG00000003487	ENSATEG00000029976	ENSATEG00000003456	col27a1b (ENSATEG00000003177)	ENSATEG00000030043	KCNT1 (ENSATEG00000003080)	ENSATEG00000029647	camsap1b (ENSATEG00000002970)	UBAC1 (ENSATEG00000002922)	notch1b (ENSATEG00000002771)	ENSATEG00000025443	ENSATEG00000028261	ENSATEG00000002702	ENSATEG00000002669	ENSATEG00000002663	ENSATEG00000002658 #22	ENSATEG00000028109	ENSATEG00000002653	ENSATEG00000027957	ENSATEG00000026123	ENSATEG00000026042	ENSATEG00000001922	ENSATEG00000028635	ENSATEG00000028913	ENSATEG00000001813	ENSATEG00000001599	ST8SIA3 (ENSATEG00000030061)	ENSATEG00000001563	ENSATEG00000001552	ENSATEG00000029092	ENSATEG00000001473
Eupercaria	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00390000008206	ENSGT00940000154043.A.j.a	ENSGT00940000153189.B	ENSGT00940000164473	ENSGT00940000162727.a.a	ENSGT00940000156880.c.b	ENSGT00940000169810	ENSGT00950000182975.a.a.b.k	ENSGT00390000014658	ENSGT00940000157157.b.a.a	ENSGT00940000163149.a.b.c.b	ENSGT00940000158199	ENSGT00940000156724	ENSGT00390000010743.b.b	ENSGT00940000156868.h	ENSGT00950000182969.A.a.a #22	ENSGT00390000013037	ENSGT00940000160867	ENSGT00940000164390	ENSGT00940000167497	ENSGT00940000159487	ENSGT00940000157449.b	ENSGT01030000234535.E.c	ENSGT00940000156423.i	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000178516	ENSGT00940000153372.A.e.a.b.a	ENSGT00940000157870.a.b	ENSGT00390000014810.b	ENSGT00940000155332.B	ENSGT00940000157905
Tetraodontidae	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000160711	ENSGT00390000008206	ENSGT00940000154043.A.j.a	ENSGT00940000153189.B	ENSGT00940000164473	ENSGT00940000162727.a.a	ENSGT00940000156880.c.b	ENSGT00950000182975.a.a.b.k	ENSGT00390000014658	ENSGT00940000157157.b.a.a	ENSGT00940000163149.a.b.c.b	ENSGT00940000158199	ENSGT00940000156724.i	ENSGT00390000010743.b.b	ENSGT00940000156868.h	ENSGT00950000182969.A.a.a #22	ENSGT00390000013037	ENSGT00940000160867	ENSGT00940000164390.cb	ENSGT00940000164390.bb	ENSGT00940000167497	ENSGT00940000159487	ENSGT00940000157449.b	ENSGT01030000234535.E.c	ENSGT00940000156423.i	ENSGT00940000175662	ENSGT00940000153372.A.e.a.b.a	ENSGT00940000157870.a.b	ENSGT00390000014810.b	ENSGT00940000155332.B	ENSGT00940000157905
Fugu	MODERN SPECIES	13	hscb (ENSTRUG00000016503)	LRRC8A (ENSTRUG00000016507)	PPIL3 (ENSTRUG00000019978)	ENSTRUG00000029165	zgc:101858 (ENSTRUG00000016514)	col27a1b (ENSTRUG00000031009)	KCNT1 (ENSTRUG00000016571)	camsap1b (ENSTRUG00000016586)	ubac1 (ENSTRUG00000016626)	notch1b (ENSTRUG00000016633)	ENSTRUG00000016658	inpp5e (ENSTRUG00000021076)	pmpca (ENSTRUG00000016669)	PTGS1 (ENSTRUG00000016689)	LHX6 (ENSTRUG00000023259)	krt1-c5 (ENSTRUG00000016703) #22	ENSTRUG00000019865	tal2 (ENSTRUG00000016731)	ENSTRUG00000022623	ENSTRUG00000016732	zgc:152968 (ENSTRUG00000025441)	poli (ENSTRUG00000016759)	RAB27B (ENSTRUG00000016761)	ST8SIA3 (ENSTRUG00000016766)	CCNG2 (ENSTRUG00000016770)	ENSTRUG00000020250	scarb2a (ENSTRUG00000016776)	PPEF2 (ENSTRUG00000016797)	ENSTRUG00000023662	hint2 (ENSTRUG00000023015)	ENSTRUG00000025318
Tetraodon	MODERN SPECIES	3	zgc:112294 (ENSTNIG00000015601)	SCARF2 (ENSTNIG00000015600)	hscb (ENSTNIG00000015599)	LRRC8A (ENSTNIG00000015598)	PPIL3 (ENSTNIG00000015597)	zgc:101858 (ENSTNIG00000015596)	col27a1b (ENSTNIG00000015595)	KCNT1 (ENSTNIG00000015594)	camsap1b (ENSTNIG00000015593)	ubac1 (ENSTNIG00000015592)	notch1b (ENSTNIG00000015591)	ENSTNIG00000015590	PTGS1 (ENSTNIG00000015589)	PTGS1 (ENSTNIG00000001299)	LHX6 (ENSTNIG00000015588)	krt1-c5 (ENSTNIG00000015587) #22	ENSTNIG00000015586	scarb2a (ENSTNIG00000015585)	PPEF2 (ENSTNIG00000015584)	ENSTNIG00000015583	ENSTNIG00000015582	ENSTNIG00000015581	hint2 (ENSTNIG00000015580)	mrps30 (ENSTNIG00000015579)	emb (ENSTNIG00000015578)	MALT1 (ENSTNIG00000015577)	prlrb (ENSTNIG00000001789)	ENSTNIG00000015576	mfsd10 (ENSTNIG00000015575)	coq2 (ENSTNIG00000015574)	gldc (ENSTNIG00000015573)
Eupecaria_A	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00390000008206	ENSGT00940000154043.A.j.a	ENSGT00940000153189.B	ENSGT00940000164473	ENSGT00940000162727.a.a	ENSGT00940000156880.c.b	ENSGT00940000169810	ENSGT00950000182975.a.a.b.k	ENSGT00390000014658	ENSGT00940000157157.b.a.a	ENSGT00940000163149.a.b.c.b	ENSGT00940000158199	ENSGT00940000156724	ENSGT00390000010743.b.b	ENSGT00940000156868.h	ENSGT00950000182969.A.a.a #22	ENSGT00390000013037	ENSGT00940000160867	ENSGT00940000164390	ENSGT00940000167497	ENSGT00940000159487	ENSGT00940000157449.b	ENSGT01030000234535.E.c	ENSGT00940000156423.i	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000178516	ENSGT00940000153372.A.e.a.b.a	ENSGT00940000157870.a.b	ENSGT00390000014810.b	ENSGT00940000155332.B	ENSGT00940000157905
Ballan wrasse	MODERN SPECIES	208				ENSLBEG00000027242	ENSLBEG00000027225	KCNT1 (ENSLBEG00000027041)	camsap1b (ENSLBEG00000026938)	ubac1 (ENSLBEG00000026917)	notch1b (ENSLBEG00000026825)	ENSLBEG00000026774	inpp5e (ENSLBEG00000026755)	pmpca (ENSLBEG00000026738)	ENSLBEG00000026719	ENSLBEG00000026683	LHX6 (ENSLBEG00000026662)	krt1-c5 (ENSLBEG00000026644) #22	tal2 (ENSLBEG00000026627)	ENSLBEG00000026608	ENSLBEG00000026533	zgc:152968 (ENSLBEG00000026485)	poli (ENSLBEG00000026454)	RAB27B (ENSLBEG00000026434)	ST8SIA3 (ENSLBEG00000026418)	CCNG2 (ENSLBEG00000026405)	scarb2a (ENSLBEG00000026365)	PPEF2 (ENSLBEG00000026325)	ENSLBEG00000026295	ENSLBEG00000026266	hint2 (ENSLBEG00000026254)	mrps30 (ENSLBEG00000026237)	emb (ENSLBEG00000026161)
Eupecaria_B	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00390000008206	ENSGT00940000154043.A.j.a	ENSGT00940000153189.B	ENSGT00940000164473	ENSGT00940000162727.a.a	ENSGT00940000156880.c.b	ENSGT00940000169810	ENSGT00950000182975.a.a.b.k	ENSGT00390000014658	ENSGT00940000157157.b.a.a	ENSGT00940000163149.a.b.c.b	ENSGT00940000158199	ENSGT00940000156724	ENSGT00390000010743.b.b	ENSGT00940000156868.h	ENSGT00950000182969.A.a.a #22	ENSGT00390000013037	ENSGT00940000160867	ENSGT00940000164390	ENSGT00940000167497	ENSGT00940000159487	ENSGT00940000157449.b	ENSGT01030000234535.E.c	ENSGT00940000156423.i	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000178516	ENSGT00940000153372.A.e.a.b.a	ENSGT00940000157870.a.b	ENSGT00390000014810.b	ENSGT00940000155332.B	ENSGT00940000157905
Eupecaria_C	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000160711	ENSGT00390000008206	ENSGT00940000154043.A.j.a	ENSGT00940000153189.B	ENSGT00940000164473	ENSGT00940000162727.a.a	ENSGT00940000156880.c.b	ENSGT00950000182975.a.a.b.k	ENSGT00390000014658	ENSGT00940000157157.b.a.a	ENSGT00940000163149.a.b.c.b	ENSGT00940000158199	ENSGT00940000156724	ENSGT00390000010743.b.b	ENSGT00940000156868.h	ENSGT00950000182969.A.a.a #22	ENSGT00390000013037	ENSGT00940000160867	ENSGT00940000164390	ENSGT00940000167497	ENSGT00940000159487	ENSGT00940000157449.b	ENSGT01030000234535.E.c	ENSGT00940000156423.i	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000178516	ENSGT00940000153372.A.e.a.b.a	ENSGT00940000157870.a.b	ENSGT00390000014810.b	ENSGT00940000155332.B	ENSGT00940000157905
Eupercaria_incertae_sedis	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000160711	ENSGT00390000008206	ENSGT00940000154043.A.j.a	ENSGT00940000163579	ENSGT00940000164473	ENSGT00940000162727.a.a	ENSGT00940000156880.c.b	ENSGT00950000182975.a.a.b.k	ENSGT00390000014658	ENSGT00940000157157.b.a.a	ENSGT00940000163149.a.b.c.b	ENSGT00940000158199	ENSGT00940000156724	ENSGT00390000010743.b.b	ENSGT00940000156868.h	ENSGT00950000182969.A.a.a #22	ENSGT00390000013037	ENSGT00940000160867	ENSGT00940000164390	ENSGT00940000167497	ENSGT00940000159487	ENSGT00940000157449.b	ENSGT01030000234535.E.c	ENSGT00940000156423.i	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000178516	ENSGT00940000153372.A.e.a.b.a	ENSGT00940000157870.a.b	ENSGT00390000014810.b	ENSGT00940000155332.B	ENSGT00940000157905
European seabass	MODERN SPECIES	13	hscb (ENSDLAG00005011078)	ENSDLAG00005011070	ENSDLAG00005011049	ENSDLAG00005011038	col27a1b (ENSDLAG00005011004)	ENSDLAG00005010998	KCNT1 (ENSDLAG00005009122)	camsap1b (ENSDLAG00005008463)	UBAC1 (ENSDLAG00005008413)	notch1b (ENSDLAG00005003503)	ENSDLAG00005008748	ENSDLAG00005003029	ENSDLAG00005002269	ENSDLAG00005001648	ENSDLAG00005001472	ENSDLAG00005001412 #22	ENSDLAG00005033717	ENSDLAG00005001396	ENSDLAG00005001380	ENSDLAG00005001388	ENSDLAG00005001358	ENSDLAG00005001346	ENSDLAG00005001325	ENSDLAG00005027334	ENSDLAG00005001283	ENSDLAG00005028959	ENSDLAG00005001253	ENSDLAG00005023243	ENSDLAG00005022737	ENSDLAG00005031276	ENSDLAG00005022718
Large yellow croaker	MODERN SPECIES	2	rtn4r (ENSLCRG00005019766)	ENSLCRG00005019768	hscb (ENSLCRG00005019769)	LRRC8A (ENSLCRG00005019770)	ppil3 (ENSLCRG00005019772)	zgc:101858 (ENSLCRG00005019776)	ENSLCRG00005019778	KCNT1 (ENSLCRG00005019787)	camsap1b (ENSLCRG00005019817)	ubac1 (ENSLCRG00005019848)	notch1b (ENSLCRG00005019890)	inpp5e (ENSLCRG00005021797)	pmpca (ENSLCRG00005021810)	ENSLCRG00005022219	LHX6 (ENSLCRG00005022375)	krt1-c5 (ENSLCRG00005022376) #22	ENSLCRG00005022378	tal2 (ENSLCRG00005022381)	ugt2b5 (ENSLCRG00005022383)	zgc:152968 (ENSLCRG00005022386)	poli (ENSLCRG00005022388)	RAB27B (ENSLCRG00005022392)	ST8SIA3 (ENSLCRG00005022395)	CCNG2 (ENSLCRG00005022396)	ENSLCRG00005022398	ENSLCRG00005022401	ENSLCRG00005022403	scarb2a (ENSLCRG00005022404)	PPEF2 (ENSLCRG00005022405)	ENSLCRG00005022409	ENSLCRG00005022413
Gilthead seabream	MODERN SPECIES	19	hscb (ENSSAUG00010021743)	LRRC8A (ENSSAUG00010021744)	PPIL3 (ENSSAUG00010021745)	zgc:101858 (ENSSAUG00010021747)	col27a1b (ENSSAUG00010021748)	ENSSAUG00010021753	KCNT1 (ENSSAUG00010021801)	camsap1b (ENSSAUG00010022785)	ubac1 (ENSSAUG00010022813)	notch1b (ENSSAUG00010022845)	ENSSAUG00010023592	inpp5e (ENSSAUG00010023598)	pmpca (ENSSAUG00010023609)	ENSSAUG00010023957	LHX6 (ENSSAUG00010024360)	krt1-c5 (ENSSAUG00010024367) #22	tal2 (ENSSAUG00010024369)	ENSSAUG00010004125	ENSSAUG00010004234	ENSSAUG00010004251	zgc:152968 (ENSSAUG00010004309)	poli (ENSSAUG00010004314)	RAB27B (ENSSAUG00010004325)	ST8SIA3 (ENSSAUG00010004329)	CCNG2 (ENSSAUG00010004334)	ENSSAUG00010004348	ENSSAUG00010004365	scarb2a (ENSSAUG00010004392)	PPEF2 (ENSSAUG00010004886)	ENSSAUG00010004897	ENSSAUG00010004904
Perciformes	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00390000008206	ENSGT00940000154043.A.j.a	ENSGT00940000153189.B	ENSGT00940000164473	ENSGT00940000162727.a.a	ENSGT00940000156880.c.b	ENSGT00940000169810	ENSGT00950000182975.a.a.b.k	ENSGT00390000014658	ENSGT00940000157157.b.a.a	ENSGT00940000163149.a.b.c.b	ENSGT00940000158199	ENSGT00940000156724	ENSGT00390000010743.b.b	ENSGT00940000156868.h	ENSGT00950000182969.A.a.a #22	ENSGT00940000160867	ENSGT00940000164390	ENSGT00940000167497	ENSGT00940000159487	ENSGT00940000157449.b	ENSGT01030000234535.E.c	ENSGT00940000156423.i	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000178516	ENSGT00940000153372.A.e.a.b.a	ENSGT00940000157870.a.b	ENSGT00390000014810.b	ENSGT00940000155332.B	ENSGT00940000157905	ENSGT00390000001442
Perciformes_a	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000008206	ENSGT00940000154043.A.j.a	ENSGT00940000163579	ENSGT00940000164473	ENSGT00940000162727.a.a	ENSGT00940000156880.c.b	ENSGT00940000169810	ENSGT00950000182975.a.a.b.k	ENSGT00390000014658	ENSGT00940000157157.b.a.a	ENSGT00940000163149.a.b.c.b	ENSGT00940000158199	ENSGT00940000156724	ENSGT00390000010743.b.b	ENSGT00940000156868.h	ENSGT00950000182969.A.a.a #22	ENSGT00940000160867	ENSGT00940000164390	ENSGT00940000167497	ENSGT00940000159487	ENSGT00940000157449.b	ENSGT01030000234535.E.c	ENSGT00940000156423.i	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000178516	ENSGT00940000153372.A.e.a.b.a	ENSGT00940000157870.a.b	ENSGT00390000014810.b	ENSGT00940000155332.B	ENSGT00940000157905	ENSGT00390000001442
Pike perch	MODERN SPECIES	2	rtn4r (ENSSLUG00000024918)	hscb (ENSSLUG00000000053)	LRRC8A (ENSSLUG00000000055)	ppil3 (ENSSLUG00000000059)	zgc:101858 (ENSSLUG00000000062)	ENSSLUG00000000063	KCNT1 (ENSSLUG00000000330)	camsap1b (ENSSLUG00000001048)	ubac1 (ENSSLUG00000001066)	notch1b (ENSSLUG00000001318)	ENSSLUG00000008022	inpp5e (ENSSLUG00000008052)	pmpca (ENSSLUG00000008145)	PTGS1 (ENSSLUG00000008306)	LHX6 (ENSSLUG00000008315)	krt1-c5 (ENSSLUG00000008320) #22	tal2 (ENSSLUG00000008324)	ENSSLUG00000008331	ENSSLUG00000008335	ENSSLUG00000008360	zgc:152968 (ENSSLUG00000008365)	poli (ENSSLUG00000008381)	RAB27B (ENSSLUG00000008386)	ST8SIA3 (ENSSLUG00000008392)	CCNG2 (ENSSLUG00000008396)	ENSSLUG00000008402	ENSSLUG00000008409	scarb2a (ENSSLUG00000008416)	PPEF2 (ENSSLUG00000008427)	ENSSLUG00000008430	ENSSLUG00000008436
Channel bull blenny	MODERN SPECIES	23	PPIL3 (ENSCGOG00000003941)	ENSCGOG00000003936	zgc:101858 (ENSCGOG00000003874)	ENSCGOG00000003863	ENSCGOG00000018789	KCNT1 (ENSCGOG00000018775)	ENSCGOG00000018771	camsap1b (ENSCGOG00000018725)	ubac1 (ENSCGOG00000018621)	notch1b (ENSCGOG00000016477)	ENSCGOG00000016373	inpp5e (ENSCGOG00000016238)	pmpca (ENSCGOG00000015857)	PTGS1 (ENSCGOG00000013756)	LHX6 (ENSCGOG00000013696)	krt1-c5 (ENSCGOG00000013596) #22	tal2 (ENSCGOG00000013583)	ENSCGOG00000013581	ENSCGOG00000013579	ENSCGOG00000013566	ENSCGOG00000013562	ENSCGOG00000013551	zgc:152968 (ENSCGOG00000013542)	poli (ENSCGOG00000013538)	RAB27B (ENSCGOG00000013537)	ST8SIA3 (ENSCGOG00000013535)	CCNG2 (ENSCGOG00000013532)	ENSCGOG00000013525	ENSCGOG00000013522	scarb2a (ENSCGOG00000013217)	PPEF2 (ENSCGOG00000013185)
Cottioidei	ANCESTRAL SPECIES	34	ENSGT00940000154043.A.j.a	ENSGT00940000153189.B	ENSGT00940000164473	ENSGT00940000162727.a.a	ENSGT00940000155161	ENSGT00940000156880.c.b	ENSGT00940000161826.B	ENSGT00950000182975.a.a.b.k	ENSGT00390000014658	ENSGT00940000157157.b.a.a	ENSGT00940000163149.a.b.c.b	ENSGT00940000158199	ENSGT00940000156724	ENSGT00390000010743.b.b	ENSGT00940000156868.h	ENSGT00950000182969.A.a.a #22	ENSGT00940000160867	ENSGT00940000164390	ENSGT00940000167497	ENSGT00940000159487	ENSGT00940000157449.b	ENSGT01030000234535.E.c	ENSGT00940000156423.i	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000178516	ENSGT00940000153372.A.e.a.b.a	ENSGT00940000157870.a.b	ENSGT00390000014810.b	ENSGT00940000155332.B	ENSGT00940000157905	ENSGT00390000001442
Stickleback	MODERN SPECIES	12	hscb (ENSGACG00000014058)	LRRC8A (ENSGACG00000014056)	PPIL3 (ENSGACG00000014048)	zgc:101858 (ENSGACG00000014039)	col27a1b (ENSGACG00000014007)	ENSGACG00000014003	KCNT1 (ENSGACG00000013992)	camsap1b (ENSGACG00000013987)	ubac1 (ENSGACG00000013983)	notch1b (ENSGACG00000013973)	ENSGACG00000013964	inpp5e (ENSGACG00000013962)	pmpca (ENSGACG00000013937)	PTGS1 (ENSGACG00000013921)	LHX6 (ENSGACG00000013917)	krt1-c5 (ENSGACG00000013907) #22	ENSGACG00000013905	tal2 (ENSGACG00000013904)	ENSGACG00000013898	ENSGACG00000013890	ENSGACG00000013879	ENSGACG00000013874	ENSGACG00000013872	ENSGACG00000013870	poli (ENSGACG00000013865)	RAB27B (ENSGACG00000013851)	ST8SIA3 (ENSGACG00000013843)	CCNG2 (ENSGACG00000013826)	ENSGACG00000013823	scarb2a (ENSGACG00000013819)	PPEF2 (ENSGACG00000013810)
Lumpfish	MODERN SPECIES	24	ENSCLMG00005019675	rtn4r (ENSCLMG00005019674)	hscb (ENSCLMG00005019673)	LRRC8A (ENSCLMG00005019672)	PPIL3 (ENSCLMG00005019670)	zgc:101858 (ENSCLMG00005019668)	ENSCLMG00005019664	ENSCLMG00005019662	KCNT1 (ENSCLMG00005019659)	ENSCLMG00005019658	camsap1b (ENSCLMG00005019637)	ubac1 (ENSCLMG00005019636)	pmpca (ENSCLMG00005019631)	PTGS1 (ENSCLMG00005019492)	LHX6 (ENSCLMG00005019485)	krt1-c5 (ENSCLMG00005019483) #22	ENSCLMG00005019481	ENSCLMG00005019480	camk2b1 (ENSCLMG00005017006)	ENSCLMG00005016920	ENSCLMG00005016917	ENSCLMG00005016916	si:dkey-174n20.1 (ENSCLMG00005016914)	kremen1 (ENSCLMG00005016911)	coq5 (ENSCLMG00005016907)	ZNRF3 (ENSCLMG00005016903)	xbp1 (ENSCLMG00005016893)	ENSCLMG00005016889	hspb8 (ENSCLMG00005016886)	ENSCLMG00005016885	suds3 (ENSCLMG00005016879)
Ovalentaria	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000008206	ENSGT00940000154043.A.j.a	ENSGT00940000163579	ENSGT00940000164473	ENSGT00940000162727.a.a	ENSGT00940000156880.c.b	ENSGT00940000169810	ENSGT00950000182975.a.a.b.k	ENSGT00390000014658	ENSGT00940000157157.b.a.a	ENSGT00940000163149.a.b.c.b	ENSGT00940000158199	ENSGT00940000156724	ENSGT00390000010743.b.b	ENSGT00940000156868.h	ENSGT00950000182969.A.a.a #22	ENSGT00390000013037	ENSGT00940000160867	ENSGT00940000164390	ENSGT00940000167497	ENSGT00940000159487	ENSGT00940000157449.b	ENSGT01030000234535.E.c	ENSGT00940000156423.i	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000153372.A.e.a.b.a	ENSGT00940000157870.a.b	ENSGT00390000014810.b	ENSGT00940000155332.B	ENSGT00940000157905	ENSGT00390000001442
Ovalentaria_B	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00390000008206	ENSGT00940000154043.A.j.a	ENSGT00940000163579	ENSGT00940000164473	ENSGT00940000162727.a.a	ENSGT00940000156880.c.b	ENSGT00940000169810	ENSGT00950000182975.a.a.b.k	ENSGT00390000014658	ENSGT00940000157157.b.a.a	ENSGT00940000163149.a.b.c.b	ENSGT00940000158199	ENSGT00940000156724	ENSGT00390000010743.b.b	ENSGT00940000156868.h	ENSGT00950000182969.A.a.a #22	ENSGT00390000013037	ENSGT00940000160867	ENSGT00940000164390	ENSGT00940000167497	ENSGT00940000159487	ENSGT00940000157449.b	ENSGT01030000234535.E.c	ENSGT00940000156423.i	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000153372.A.e.a.b.a	ENSGT00940000157870.a.b	ENSGT00390000014810.b	ENSGT00940000155332.B	ENSGT00940000157905	ENSGT00390000001442
Pomacentridae	ANCESTRAL SPECIES						ENSGT00940000158973.a.a	ENSGT00950000182924.A.b.b	ENSGT00970000193390.c.a.b.u.a	ENSGT00940000166629	ENSGT00900000140979.a.b	ENSGT00950000183162.a.b.i.a	ENSGT00530000063691.a	ENSGT00950000182943	ENSGT00940000156317.w.b	ENSGT00390000010743.b.b	ENSGT00940000156868.h.f	ENSGT00950000182969.A.a.a #22	ENSGT00390000013037	ENSGT00940000160867	ENSGT00940000164390	ENSGT00940000167497	ENSGT00940000159487	ENSGT00940000157449.b	ENSGT01030000234535.E.c	ENSGT00940000156423.i	ENSGT00550000074816.B	ENSGT00940000178516	ENSGT00940000153372.A.e.a.b.a	ENSGT00940000157870.a.b	ENSGT00390000014810.b	ENSGT00940000155332.B	ENSGT00940000157905
Pomacentridae_A	ANCESTRAL SPECIES	1				ENSGT00940000158973.a.a	ENSGT00940000156481.b	ENSGT00950000182924.A.b.b	ENSGT00970000193390.c.a.b.u.a	ENSGT00940000166629	ENSGT00900000140979.a.b	ENSGT00950000183162.a.b.i.a	ENSGT00530000063691.a	ENSGT00950000182943	ENSGT00940000156317.w.b	ENSGT00390000010743.b.b	ENSGT00940000156868.h.f	ENSGT00950000182969.A.a.a #22	ENSGT00390000013037	ENSGT00940000160867	ENSGT00940000164390	ENSGT00940000167497	ENSGT00940000159487	ENSGT00940000157449.b	ENSGT01030000234535.E.c	ENSGT00940000156423.i	ENSGT00550000074816.B	ENSGT00940000178516	ENSGT00940000153372.A.e.a.b.a	ENSGT00940000157870.a.b	ENSGT00390000014810.b	ENSGT00940000155332.B	ENSGT00940000157905
Amphiprion	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000165623	ENSGT00970000193390.c.a.b.u.a.a.a.a	ENSGT00970000193390.c.a.b.u.a.a.a.b.b	ENSGT00970000193390.c.a.b.u.a.a.a.b.a	ENSGT00950000182924.A.b.b	ENSGT00940000158973.a.a	ENSGT00970000193390.c.a.b.u.a.a.b	ENSGT00940000166629	ENSGT00900000140979.a.b	ENSGT00950000183162.a.b.i.a	ENSGT00530000063691.a	ENSGT00950000182943	ENSGT00940000156317.w.b	ENSGT00390000010743.b.b	ENSGT00940000156868.h.f	ENSGT00950000182969.A.a.a #22	ENSGT00390000013037	ENSGT00940000160867	ENSGT00940000164390.o.a.b	ENSGT00940000164390.p	ENSGT00940000164390.o.a.a	ENSGT00940000167497	ENSGT00940000159487	ENSGT00940000157449.b	ENSGT01030000234535.E.c	ENSGT00940000156423.i	ENSGT00990000203931	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000153372.A.e.a.b.a	ENSGT00940000157870.a.b	ENSGT00390000014810.b
Clown anemonefish	MODERN SPECIES	1931											ENSAOCG00000017679	ENSAOCG00000017689	CNNM4 (ENSAOCG00000017725)	PTGS1 (ENSAOCG00000017781)	LHX6 (ENSAOCG00000017799)	krt1-c5 (ENSAOCG00000017828) #22	ENSAOCG00000017847	tal2 (ENSAOCG00000017862)	ENSAOCG00000017915	ENSAOCG00000002359	ENSAOCG00000018049	poli (ENSAOCG00000018067)	ENSAOCG00000018077	ST8SIA3 (ENSAOCG00000018099)	CCNG2 (ENSAOCG00000018110)	ENSAOCG00000018357	ENSAOCG00000018391	ENSAOCG00000018419	scarb2a (ENSAOCG00000018452)	PPEF2 (ENSAOCG00000018718)	ENSAOCG00000018805
Orange clownfish	MODERN SPECIES	19	kremen1 (ENSAPEG00000011341)	si:dkey-174n20.1 (ENSAPEG00000011386)	ENSAPEG00000011403	ENSAPEG00000011416	ENSAPEG00000011422	ENSAPEG00000011433	camk2b1 (ENSAPEG00000011512)	ENSAPEG00000011592	hs3st1l2 (ENSAPEG00000011595)	h2az2b (ENSAPEG00000011609)	purbb (ENSAPEG00000011640)	il1b (ENSAPEG00000011655)	CNNM4 (ENSAPEG00000011674)	PTGS1 (ENSAPEG00000011702)	LHX6 (ENSAPEG00000011769)	krt1-c5 (ENSAPEG00000011821) #22	tal2 (ENSAPEG00000011840)	ENSAPEG00000011860	ENSAPEG00000012138	ENSAPEG00000012381	zgc:152968 (ENSAPEG00000012559)	poli (ENSAPEG00000012596)	ENSAPEG00000012612	ST8SIA3 (ENSAPEG00000012621)	CCNG2 (ENSAPEG00000012633)	ENSAPEG00000012649	ENSAPEG00000012683	ENSAPEG00000012704	scarb2a (ENSAPEG00000012720)	PPEF2 (ENSAPEG00000012747)	ENSAPEG00000012764
Spiny chromis	MODERN SPECIES	2267																krt1-c5 (ENSAPOG00000023497) #22	tal2 (ENSAPOG00000023514)	ENSAPOG00000023539	ENSAPOG00000023561	ENSAPOG00000023577
Bicolor damselfish	MODERN SPECIES	804							camk2b1 (ENSSPAG00000011599)	hs3st1l2 (ENSSPAG00000011580)	purbb (ENSSPAG00000011577)	h2az2b (ENSSPAG00000011557)	ENSSPAG00000011540	ENSSPAG00000011528	CNNM4 (ENSSPAG00000011494)	PTGS1 (ENSSPAG00000011460)	LHX6 (ENSSPAG00000011411)	krt1-c5 (ENSSPAG00000011383) #22	tal2 (ENSSPAG00000011373)
Cichlidae	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000160711	ENSGT00390000008206	ENSGT00940000154043.A.j.a	ENSGT00940000163579	ENSGT00940000164473	ENSGT00940000162727.a.a	ENSGT00940000156880.c.b	ENSGT00950000182975.a.a.b.k	ENSGT00390000014658	ENSGT00940000157157.b.a.a	ENSGT00940000163149.a.b.c.b	ENSGT00940000158199	ENSGT00940000156724	ENSGT00390000010743.b.b	ENSGT00940000156868.h	ENSGT00950000182969.A.a.a #22	ENSGT00390000013037	ENSGT00940000160867	ENSGT00940000164390	ENSGT00940000167497	ENSGT00940000159487	ENSGT00940000157449.b	ENSGT01030000234535.E.c	ENSGT00940000156423.i	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000153372.A.e.a.b.a	ENSGT00940000157870.a.b	ENSGT00390000014810.b	ENSGT00940000155332.B	ENSGT00940000157905	ENSGT00390000001442
Pseudocrenilabrinae	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000160711	ENSGT00390000008206	ENSGT00940000154043.A.j.a	ENSGT00940000163579	ENSGT00940000164473	ENSGT00940000162727.a.a	ENSGT00940000156880.c.b	ENSGT00950000182975.a.a.b.k	ENSGT00390000014658	ENSGT00940000157157.b.a.a	ENSGT00940000163149.a.b.c.b	ENSGT00940000158199	ENSGT00940000156724	ENSGT00390000010743.b.b	ENSGT00940000156868.h	ENSGT00950000182969.A.a.a #22	ENSGT00390000013037	ENSGT00940000160867	ENSGT00940000164390.t.b	ENSGT00940000164390.s	ENSGT00940000164390.t.a.a.a	ENSGT00940000164390.t.a.a.b	ENSGT00940000167497	ENSGT00940000159487	ENSGT00940000157449.b	ENSGT01030000234535.E.c	ENSGT00940000156423.i	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000153372.A.e.a.b.a	ENSGT00940000157870.a.b	ENSGT00390000014810.b
Pseudocrenilabrinae_A	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000160711	ENSGT00390000008206	ENSGT00940000154043.A.j.a	ENSGT00940000163579	ENSGT00940000164473	ENSGT00940000162727.a.a	ENSGT00940000156880.c.b	ENSGT00950000182975.a.a.b.k	ENSGT00390000014658	ENSGT00940000157157.b.a.a	ENSGT00940000163149.a.b.c.b	ENSGT00940000158199	ENSGT00940000156724	ENSGT00390000010743.b.b	ENSGT00940000156868.h	ENSGT00950000182969.A.a.a #22	ENSGT00390000013037	ENSGT00940000160867	ENSGT00940000164390.t.b.b	ENSGT00940000164390.t.b.a	ENSGT00940000164390.s	ENSGT00940000164390.t.a.a.a	ENSGT00940000164390.t.a.a.b	ENSGT00940000167497	ENSGT00940000159487	ENSGT00940000157449.b	ENSGT01030000234535.E.c	ENSGT00940000156423.i	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000153372.A.e.a.b.a	ENSGT00940000157870.a.b
Haplochromini	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000160711	ENSGT00390000008206	ENSGT00940000154043.A.j.a	ENSGT00940000163579	ENSGT00940000164473	ENSGT00940000162727.a.a	ENSGT00940000156880.c.b	ENSGT00950000182975.a.a.b.k	ENSGT00390000014658	ENSGT00940000157157.b.a.a	ENSGT00940000163149.a.b.c.b	ENSGT00940000158199	ENSGT00940000156724	ENSGT00390000010743.b.b	ENSGT00940000156868.h	ENSGT00950000182969.A.a.a #22	ENSGT00390000013037	ENSGT00940000160867	ENSGT00940000164390.t.b.b	ENSGT00940000164390.t.b.a	ENSGT00940000164390.s	ENSGT00940000164390.t.a.a.a	ENSGT00940000164390.t.a.a.b	ENSGT00940000167497	ENSGT00940000159487	ENSGT00940000157449.b	ENSGT01030000234535.E.c	ENSGT00940000156423.i	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000153372.A.e.a.b.a	ENSGT00940000157870.a.b
Burton s mouthbrooder	MODERN SPECIES	369	rtn4r (ENSHBUG00000011315)	hscb (ENSHBUG00000011323)	LRRC8A (ENSHBUG00000011336)	PPIL3 (ENSHBUG00000011352)	zgc:101858 (ENSHBUG00000011364)	col27a1b (ENSHBUG00000011422)	KCNT1 (ENSHBUG00000011883)	ENSHBUG00000011929	ubac1 (ENSHBUG00000011953)	notch1b (ENSHBUG00000012147)	inpp5e (ENSHBUG00000012186)	pmpca (ENSHBUG00000000338)	ENSHBUG00000012232	ENSHBUG00000012265	LHX6 (ENSHBUG00000012289)	krt1-c5 (ENSHBUG00000012333) #22	ENSHBUG00000012345	tal2 (ENSHBUG00000012361)	ENSHBUG00000012562
Haplochromini_A	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000160711	ENSGT00390000008206	ENSGT00940000154043.A.j.a	ENSGT00940000163579	ENSGT00940000164473	ENSGT00940000162727.a.a	ENSGT00940000156880.c.b	ENSGT00950000182975.a.a.b.k	ENSGT00390000014658	ENSGT00940000157157.b.a.a	ENSGT00940000163149.a.b.c.b	ENSGT00940000158199	ENSGT00940000156724	ENSGT00390000010743.b.b	ENSGT00940000156868.h	ENSGT00950000182969.A.a.a #22	ENSGT00390000013037	ENSGT00940000160867	ENSGT00940000164390.t.b.b	ENSGT00940000164390.t.b.a	ENSGT00940000164390.s	ENSGT00940000164390.t.a.a.b.d	ENSGT00940000164390.t.a.a.a	ENSGT00940000164390.t.a.a.b.c.a	ENSGT00940000167497	ENSGT00940000159487	ENSGT00940000157449.b	ENSGT01030000234535.E.c	ENSGT00940000156423.i	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000153372.A.e.a.b.a
P. nyererei	MODERN SPECIES	422	rtn4r (ENSPNYG00000008729)	hscb (ENSPNYG00000008769)	LRRC8A (ENSPNYG00000008799)	ppil3 (ENSPNYG00000008814)	zgc:101858 (ENSPNYG00000008830)	col27a1b (ENSPNYG00000008867)	KCNT1 (ENSPNYG00000008991)	camsap1b (ENSPNYG00000009056)	ubac1 (ENSPNYG00000009108)	notch1b (ENSPNYG00000009162)	ENSPNYG00000009273	inpp5e (ENSPNYG00000009294)	pmpca (ENSPNYG00000009398)	ENSPNYG00000009452	LHX6 (ENSPNYG00000009481)	krt1-c5 (ENSPNYG00000009501) #22	tal2 (ENSPNYG00000009522)	ENSPNYG00000009536	ENSPNYG00000009548	ENSPNYG00000009566
Haplochromini_B	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000160711	ENSGT00390000008206	ENSGT00940000154043.A.j.a	ENSGT00940000163579	ENSGT00940000164473	ENSGT00940000162727.a.a	ENSGT00940000156880.c.b	ENSGT00950000182975.a.a.b.k	ENSGT00390000014658	ENSGT00940000157157.b.a.a	ENSGT00940000163149.a.b.c.b	ENSGT00940000158199	ENSGT00940000156724	ENSGT00390000010743.b.b	ENSGT00940000156868.h	ENSGT00950000182969.A.a.a #22	ENSGT00390000013037	ENSGT00940000160867	ENSGT00940000164390.t.b.b	ENSGT00940000164390.t.b.a	ENSGT00940000164390.s	ENSGT00940000164390.t.a.a.b.d	ENSGT00940000164390.t.a.a.a	ENSGT00940000164390.t.a.a.b.c.a	ENSGT00940000167497	ENSGT00940000159487	ENSGT00940000157449.b	ENSGT01030000234535.E.c	ENSGT00940000156423.i	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000153372.A.e.a.b.a
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Zebra mbuna	MODERN SPECIES	1094	rtn4r (ENSMZEG00005014340)	hscb (ENSMZEG00005014312)	LRRC8A (ENSMZEG00005014303)	ppil3 (ENSMZEG00005014286)	zgc:101858 (ENSMZEG00005014271)	ENSMZEG00005014263	KCNT1 (ENSMZEG00005014200)	camsap1b (ENSMZEG00005014145)	ubac1 (ENSMZEG00005014097)	notch1b (ENSMZEG00005014036)	ENSMZEG00005014014	inpp5e (ENSMZEG00005014004)	pmpca (ENSMZEG00005013988)	ENSMZEG00005013973	LHX6 (ENSMZEG00005013958)	krt1-c5 (ENSMZEG00005013944) #22	tal2 (ENSMZEG00005013939)	ENSMZEG00005013933	ENSMZEG00005013901	ENSMZEG00005013892	ENSMZEG00005013885	ENSMZEG00005013864	ENSMZEG00005013783	poli (ENSMZEG00005013776)	RAB27B (ENSMZEG00005013765)	ST8SIA3 (ENSMZEG00005013756)	CCNG2 (ENSMZEG00005013748)	scarb2a (ENSMZEG00005013738)	PPEF2 (ENSMZEG00005013720)	ENSMZEG00005013709	ENSMZEG00005013698
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Nile tilapia	MODERN SPECIES	3	LRRC8A (ENSONIG00000010645)	ppil3 (ENSONIG00000029007)	zgc:101858 (ENSONIG00000010651)	ENSONIG00000030277	KCNT1 (ENSONIG00000010675)	camsap1b (ENSONIG00000010678)	ubac1 (ENSONIG00000010682)	notch1b (ENSONIG00000010684)	ENSONIG00000042348	inpp5e (ENSONIG00000010704)	pmpca (ENSONIG00000010708)	ENSONIG00000034473	ENSONIG00000034296	ENSONIG00000010712	LHX6 (ENSONIG00000010719)	krt1-c5 (ENSONIG00000010725) #22	ENSONIG00000026196	tal2 (ENSONIG00000021296)	ENSONIG00000038601	ENSONIG00000035645	ENSONIG00000027852	ENSONIG00000010731	ENSONIG00000020570	ENSONIG00000036603	ENSONIG00000016897	poli (ENSONIG00000016901)	RAB27B (ENSONIG00000016904)	ST8SIA3 (ENSONIG00000016905)	CCNG2 (ENSONIG00000016907)	ENSONIG00000016909	scarb2a (ENSONIG00000016910)
Midas cichlid	MODERN SPECIES	8							KCNT1 (ENSACIG00000001589)	camsap1b (ENSACIG00000001695)	ubac1 (ENSACIG00000001737)	notch1b (ENSACIG00000001768)	ENSACIG00000002065	inpp5e (ENSACIG00000002077)	pmpca (ENSACIG00000002109)	ENSACIG00000002134	LHX6 (ENSACIG00000002159)	krt1-c5 (ENSACIG00000002179) #22	tal2 (ENSACIG00000002194)	ENSACIG00000002200	ENSACIG00000002219	zgc:152968 (ENSACIG00000002527)	poli (ENSACIG00000002566)	RAB27B (ENSACIG00000002606)	ST8SIA3 (ENSACIG00000002619)	CCNG2 (ENSACIG00000002636)	scarb2a (ENSACIG00000002691)	PPEF2 (ENSACIG00000002721)	ENSACIG00000002815
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Turquoise killifish	MODERN SPECIES	1620										ENSNFUG00015016981	ENSNFUG00015017394	ENSNFUG00015017398	ENSNFUG00015017409	ENSNFUG00015017414	tal2 (ENSNFUG00015017417)	krt1-c5 (ENSNFUG00015017420) #22	LHX6 (ENSNFUG00015017436)	PTGS1 (ENSNFUG00015017519)	pmpca (ENSNFUG00015017936)	INPP5E (ENSNFUG00015018019)	ENSNFUG00015018025	notch1b (ENSNFUG00015018057)	UBAC1 (ENSNFUG00015018848)	camsap1b (ENSNFUG00015018973)	KCNT1 (ENSNFUG00015019121)	ENSNFUG00015021566	Nfu_g_1_017025 (ENSNFUG00015021570)	PPIL3 (ENSNFUG00015021573)	LRRC8A (ENSNFUG00015021578)	HSCB (ENSNFUG00015021580)	RTN4R (ENSNFUG00015021586)
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Mummichog	MODERN SPECIES	2405	ENSFHEG00000004006	PPEF2 (ENSFHEG00000003973)	scarb2a (ENSFHEG00000003768)	ENSFHEG00000000658	CCNG2 (ENSFHEG00000000099)	ST8SIA3 (ENSFHEG00000003717)	ENSFHEG00000003681	poli (ENSFHEG00000003656)	ENSFHEG00000003641	ENSFHEG00000003607	ENSFHEG00000003604	ENSFHEG00000003592	ENSFHEG00000003576	tal2 (ENSFHEG00000003463)	ENSFHEG00000003453	krt1-c5 (ENSFHEG00000003429) #22	LHX6 (ENSFHEG00000003390)	ENSFHEG00000000097	pmpca (ENSFHEG00000003312)	inpp5e (ENSFHEG00000003289)	notch1b (ENSFHEG00000000739)	ubac1 (ENSFHEG00000003227)	camsap1b (ENSFHEG00000003214)	KCNT1 (ENSFHEG00000003149)
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Oryzias_b	ANCESTRAL SPECIES	92							ENSGT00940000156880.c.b	ENSGT00950000182975.a.a.b.k	ENSGT00390000014658	ENSGT00940000157157.b.a.a	ENSGT00940000163149.a.b.c.b	ENSGT00940000158199	ENSGT00940000156724	ENSGT00390000010743.b.b	ENSGT00940000156868.h	ENSGT00950000182969.A.a.a #22	ENSGT00390000013037	ENSGT00940000160867	ENSGT00940000164390	ENSGT00940000167497	ENSGT00940000159487	ENSGT00940000157449.b	ENSGT01030000234535.E.c	ENSGT00940000156423.i	ENSGT00940000175662	ENSGT00940000153372.A.e.a.b.a	ENSGT00940000157870.a.b	ENSGT00940000158431.a.a.a.a.a.b.a.a	ENSGT00390000014810.b	ENSGT00490000043356.b	ENSGT00940000154851.B.a
Indian medaka	MODERN SPECIES	11	ENSOMEG00000010225	dmrt1 (ENSOMEG00000010203)	ENSOMEG00000010188	dmrt2a (ENSOMEG00000010181)	ENSOMEG00000010150	KCNT1 (ENSOMEG00000009946)	ENSOMEG00000009383	camsap1b (ENSOMEG00000009336)	ubac1 (ENSOMEG00000009259)	notch1b (ENSOMEG00000009226)	ENSOMEG00000009173	inpp5e (ENSOMEG00000009153)	pmpca (ENSOMEG00000009124)	PTGS1 (ENSOMEG00000009088)	ENSOMEG00000009017	krt1-c5 (ENSOMEG00000008996) #22	tal2 (ENSOMEG00000008957)	ugt2b5 (ENSOMEG00000008921)	ENSOMEG00000008840	emb (ENSOMEG00000008769)	ENSOMEG00000008700	prlrb (ENSOMEG00000008632)	ENSOMEG00000008613	ENSOMEG00000008595	ENSOMEG00000008572	ENSOMEG00000008551
Javanese ricefish	MODERN SPECIES	23	ENSOJAG00000007889	tncb (ENSOJAG00000004606)	ENSOJAG00000003981	srp19 (ENSOJAG00000003972)	ENSOJAG00000003936	ENSOJAG00000003921	ENSOJAG00000003858	ENSOJAG00000003833	ENSOJAG00000003796	ENSOJAG00000003767	camsap1b (ENSOJAG00000003465)	ubac1 (ENSOJAG00000003406)	inpp5e (ENSOJAG00000002863)	PTGS1 (ENSOJAG00000002196)	LHX6 (ENSOJAG00000001953)	krt1-c5 (ENSOJAG00000001936) #22	ENSOJAG00000001912	tal2 (ENSOJAG00000001890)	ugt2b5 (ENSOJAG00000001871)	ENSOJAG00000001853	RAB27B (ENSOJAG00000001841)	ST8SIA3 (ENSOJAG00000001828)	ENSOJAG00000001820	ENSOJAG00000001799	scarb2a (ENSOJAG00000001690)	PPEF2 (ENSOJAG00000001625)	ENSOJAG00000001613	ENSOJAG00000001604	ENSOJAG00000001581	prlrb (ENSOJAG00000001557)	ENSOJAG00000001536
Oryzias_a	ANCESTRAL SPECIES	67	ENSGT00390000008206	ENSGT00940000154043.A.j.a	ENSGT00940000153189.B	ENSGT00940000164473	ENSGT00940000162448	ENSGT00940000155199.p	ENSGT00940000156880.c.b	ENSGT00950000182975.a.a.b.k	ENSGT00390000014658	ENSGT00940000157157.b.a.a	ENSGT00940000163149.a.b.c.b	ENSGT00940000158199	ENSGT00940000156724	ENSGT00390000010743.b.b	ENSGT00940000156868.h	ENSGT00950000182969.A.a.a #22	ENSGT00390000013037	ENSGT00940000160867	ENSGT00940000164390	ENSGT00940000167497	ENSGT01030000237845	ENSGT00940000159487	ENSGT00940000157449.b	ENSGT01030000234535.E.c	ENSGT00940000156423.i	ENSGT00940000153372.A.e.a.b.a	ENSGT00940000157870.a.b	ENSGT00390000014810.b	ENSGT00490000043356.b	ENSGT00940000154851.B.a	ENSGT00390000018044.b.a
Japanese Medaka HdrR	MODERN SPECIES	23	PPIL3 (ENSORLG00000000798)	zgc:101858 (ENSORLG00000000791)	ENSORLG00000028519	ENSORLG00000000741	ENSORLG00000014468	ENSORLG00000024131	KCNT1 (ENSORLG00000000733)	camsap1b (ENSORLG00000000683)	ubac1 (ENSORLG00000000672)	notch1b (ENSORLG00000000636)	ENSORLG00000000560	pmpca (ENSORLG00000000547)	inpp5e (ENSORLG00000000555)	ENSORLG00000000509	LHX6 (ENSORLG00000000498)	krt1-c5 (ENSORLG00000000488) #22	ENSORLG00000030010	tal2 (ENSORLG00000000466)	ugt2b5 (ENSORLG00000000460)	ENSORLG00000024525	ENSORLG00000024554	ENSORLG00000000417	siat8c2 (ENSORLG00000000401)	ENSORLG00000000384	scarb2a (ENSORLG00000000372)	ENSORLG00000000353	ENSORLG00000000346	ENSORLG00000027430	ENSORLG00000000343	prlrb (ENSORLG00000000338)	ENSORLG00000000330
Chinese medaka	MODERN SPECIES	650												inpp5e (ENSOSIG00000000920)	pmpca (ENSOSIG00000000933)	PTGS1 (ENSOSIG00000000959)	LHX6 (ENSOSIG00000001012)	krt1-c5 (ENSOSIG00000001013) #22	ENSOSIG00000001016	tal2 (ENSOSIG00000001018)	RAB27B (ENSOSIG00000001019)	ST8SIA3 (ENSOSIG00000001025)	scarb2a (ENSOSIG00000001076)	PPEF2 (ENSOSIG00000001086)	ENSOSIG00000001107	ENSOSIG00000001112	ENSOSIG00000001117
Tiger tail seahorse	MODERN SPECIES	343	HCAR1 (ENSHCOG00000019729)	hip1rb (ENSHCOG00000019797)	RILPL1 (ENSHCOG00000019808)	rilpl2 (ENSHCOG00000000533)	ENSHCOG00000019829	mtrfr (ENSHCOG00000019848)	ENSHCOG00000020052	ENSHCOG00000020090	mthfd2 (ENSHCOG00000020109)	ubac1 (ENSHCOG00000020151)	notch1b (ENSHCOG00000020166)	inpp5e (ENSHCOG00000020188)	pmpca (ENSHCOG00000020242)	PTGS1 (ENSHCOG00000020268)	LHX6 (ENSHCOG00000020310)	krt1-c5 (ENSHCOG00000020324) #22	tal2 (ENSHCOG00000020327)	ugt2b5 (ENSHCOG00000020332)	ENSHCOG00000000547	poli (ENSHCOG00000020397)	RAB27B (ENSHCOG00000020409)	ST8SIA3 (ENSHCOG00000020423)	ENSHCOG00000020430	scarb2a (ENSHCOG00000020526)	dnm1b (ENSHCOG00000020586)	gsnb (ENSHCOG00000020595)	ENSHCOG00000020623	ENSHCOG00000020652	ENSHCOG00000020677	FIBCD1 (ENSHCOG00000020693)	ENSHCOG00000020695
Pinecone sodierfish	MODERN SPECIES	23	rtn4r (ENSMMDG00005014094)	hscb (ENSMMDG00005014091)	LRRC8A (ENSMMDG00005014088)	ppil3 (ENSMMDG00005014086)	zgc:101858 (ENSMMDG00005014084)	ENSMMDG00005014083	KCNT1 (ENSMMDG00005014051)	camsap1b (ENSMMDG00005013645)	ubac1 (ENSMMDG00005013622)	notch1b (ENSMMDG00005013617)	ENSMMDG00005013595	inpp5e (ENSMMDG00005013310)	pmpca (ENSMMDG00005013093)	PTGS1 (ENSMMDG00005010284)	LHX6 (ENSMMDG00005010241)	krt1-c5 (ENSMMDG00005010235) #22	tal2 (ENSMMDG00005010232)	ugt2b5 (ENSMMDG00005009130)	ENSMMDG00005009105	poli (ENSMMDG00005009098)	RAB27B (ENSMMDG00005009096)	ST8SIA3 (ENSMMDG00005009092)	CCNG2 (ENSMMDG00005009087)	ENSMMDG00005009080	scarb2a (ENSMMDG00005009069)	PPEF2 (ENSMMDG00005009063)	ENSMMDG00005009058	ENSMMDG00005009015	hint2 (ENSMMDG00005009007)	mrps30 (ENSMMDG00005009004)	emb (ENSMMDG00005009000)
Protacanthopterygii	ANCESTRAL SPECIES	172	ENSGT00390000012665	ENSGT01080000257442	ENSGT00940000166440	ENSGT00940000164772	ENSGT00940000159652	ENSGT00940000156002.a.b	ENSGT00940000155275.c.b.b	ENSGT00940000155422.bb	ENSGT00940000159838	ENSGT00940000157157.b.a.a	ENSGT00940000158199	ENSGT00940000156724	ENSGT00940000167162	ENSGT00390000010743.b.b	ENSGT00940000156868.h	ENSGT00950000182969.A.a.a #22	ENSGT00940000165787.a.b	ENSGT00940000157920.a
Salmoninae	DUPLICATION
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	122											ENSGT00940000158199.k	ENSGT00940000156724.l	ENSGT00940000156511.b.kb.a.a	ENSGT00390000010743.b.b.c	ENSGT00940000156868.h.c	ENSGT00950000182969.A.a.a.a #22	ENSGT00940000165787.a.b.db	ENSGT00940000157920.a.c	ENSGT00940000163543.a.d	ENSGT00940000154687.B.q.b.a.b	ENSGT00730000111240	ENSGT00950000182888.a.b	ENSGT00390000004247.l.a	ENSGT00400000024875.c.b	ENSGT00400000024875.c.a.b.b	ENSGT00940000159387.e.f	ENSGT00940000159447.n	ENSGT00940000160710.h	ENSGT00390000004550	ENSGT00940000158795.i	ENSGT00940000174697
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00390000012665.i	ENSGT01080000257442.c.a	ENSGT01080000257442.d	ENSGT00940000159652.j	ENSGT00940000156002.a.b.lb.a	ENSGT00940000155275.c.b.b.f	ENSGT00940000166112.h	ENSGT00940000155422.bb.a	ENSGT00940000159838	ENSGT00940000157157.b.a.a.f	ENSGT00940000158199.k	ENSGT00940000156724.l	ENSGT00940000156511.b.kb.a.a	ENSGT00390000010743.b.b.c	ENSGT00940000156868.h.c	ENSGT00950000182969.A.a.a.a #22	ENSGT00940000165787.a.b.db	ENSGT00940000157920.a.c	ENSGT00940000163543.a.d	ENSGT00940000154687.B.q.b.a.b	ENSGT00730000111240	ENSGT00950000182888.a.b	ENSGT00390000004247.l.a	ENSGT00400000024875.c.b	ENSGT00400000024875.c.a.b.b	ENSGT00940000159387.e.f	ENSGT00940000159447.n	ENSGT00940000160710.h	ENSGT00390000004550	ENSGT00940000158795.i	ENSGT00940000174697
Salmo	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT01100000263537.b.a.b.e.b	ENSGT01080000257442.d	ENSGT00940000159652.j	ENSGT00940000156002.a.b.lb.a	ENSGT00940000155275.c.b.b.f	ENSGT00940000166112.h	ENSGT00940000155422.bb.a	ENSGT00940000159838	ENSGT00940000157157.b.a.a.f	ENSGT01100000264406.a	ENSGT00940000158199.k	ENSGT00940000156724.l	ENSGT00940000156511.b.kb.a.a	ENSGT00390000010743.b.b.c	ENSGT00940000156868.h.c	ENSGT00950000182969.A.a.a.a #22	ENSGT00940000165787.a.b.db.c	ENSGT00940000157920.a.c	ENSGT00940000163543.a.d	ENSGT00940000154687.B.q.b.a.b	ENSGT00730000111240	ENSGT00950000182888.a.b	ENSGT00390000004247.l.a	ENSGT00400000024875.c.b	ENSGT00400000024875.c.a.b.b	ENSGT00940000159387.e.f	ENSGT00940000159447.n	ENSGT00940000160710.h	ENSGT00390000004550	ENSGT00940000158795.i	ENSGT00940000174697
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Atlantic salmon	MODERN SPECIES	16	nelfb (ENSSSAG00000074069)	ENSSSAG00000116526	ARRDC1 (ENSSSAG00000072523)	ehmt1a (ENSSSAG00000074046)	cacna1ba (ENSSSAG00000072846)	ENSSSAG00000092968	man1b1b (ENSSSAG00000052998)	dpp7 (ENSSSAG00000120719)	ENSSSAG00000053490	ENSSSAG00000110942	inpp5e (ENSSSAG00000065150)	pmpca (ENSSSAG00000007720)	ENSSSAG00000066986	ENSSSAG00000067020	ENSSSAG00000067466	krt1-c5 (ENSSSAG00000067470) #22	ENSSSAG00000067473	zbtb26 (ENSSSAG00000086063)	ENSSSAG00000067480	ENSSSAG00000067497	cfap157 (ENSSSAG00000067531)	ENSSSAG00000106847	ptrh1 (ENSSSAG00000067542)	ENSSSAG00000067546	ENSSSAG00000122187	FAM163B (ENSSSAG00000108350)	ENSSSAG00000117977	ENSSSAG00000067560	mymk (ENSSSAG00000067591)	ENSSSAG00000067596	slc2a8 (ENSSSAG00000067601)
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000167390.d	ENSGT01100000263542.B.b.a.b.f	ENSGT00390000012665.i	ENSGT01080000257442.c.a	ENSGT01080000257442.d	ENSGT00940000159652.j	ENSGT00940000156002.a.b.lb.a	ENSGT00940000155275.c.b.b.f	ENSGT00940000155422.bb.a	ENSGT00940000159838	ENSGT00940000157157.b.a.a.f	ENSGT00940000158199.k	ENSGT00940000156724.l	ENSGT00390000010743.b.b.c	ENSGT00940000156868.h.c	ENSGT00950000182969.A.a.a.a #22	ENSGT00940000165787.a.b.db.a.b	ENSGT00940000165787.a.b.db.a.a	ENSGT00940000157920.a.c	ENSGT00940000163543.a.d	ENSGT00940000154687.B.q.b.a.b	ENSGT00730000111240	ENSGT00950000182888.a.b	ENSGT00390000004247.l.a	ENSGT00400000024875.c.b.a	ENSGT00400000024875.c.a.b.b	ENSGT00940000159387.e.f	ENSGT00940000159447.n	ENSGT00940000160710.h	ENSGT00390000004550	ENSGT00940000158795.i
Rainbow trout	MODERN SPECIES	27	ENSOMYG00000045551	ENSOMYG00000045493	ENSOMYG00000045472	p2ry2 (ENSOMYG00000045470)	ARRDC1 (ENSOMYG00000045458)	ehmt1a (ENSOMYG00000043578)	cacna1ba (ENSOMYG00000018918)	man1b1b (ENSOMYG00000017764)	dpp7 (ENSOMYG00000017676)	ENSOMYG00000013769	inpp5e (ENSOMYG00000013328)	pmpca (ENSOMYG00000012088)	ENSOMYG00000068825	ENSOMYG00000009125	ENSOMYG00000008013	krt1-c5 (ENSOMYG00000008001) #22	ENSOMYG00000048704	ENSOMYG00000007975	ENSOMYG00000007966	zbtb26 (ENSOMYG00000007950)	ENSOMYG00000007941	ENSOMYG00000007651	cfap157 (ENSOMYG00000007071)	ENSOMYG00000006904	ptrh1 (ENSOMYG00000006957)	ENSOMYG00000006932	FAM163B (ENSOMYG00000064671)	ENSOMYG00000006823	mymk (ENSOMYG00000062248)	ENSOMYG00000006664	slc2a8 (ENSOMYG00000006574)
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT01100000263542.B.b.a.b.f	ENSGT00390000012665.i	ENSGT01080000257442.c.a	ENSGT01080000257442.d	ENSGT00940000159652.j	ENSGT00940000156002.a.b.lb.a	ENSGT00940000155275.c.b.b.f	ENSGT00940000166112.h	ENSGT00940000155422.bb.a	ENSGT00940000159838	ENSGT00940000157157.b.a.a.f	ENSGT00940000158199.k	ENSGT00940000156724.l	ENSGT00390000010743.b.b.c	ENSGT00940000156868.h.c	ENSGT00950000182969.A.a.a.a #22	ENSGT00940000165787.a.b.db.a.b	ENSGT00940000165787.a.b.db.a.a	ENSGT00940000157920.a.c	ENSGT00940000163543.a.d	ENSGT00940000154687.B.q.b.a.b	ENSGT00730000111240	ENSGT00950000182888.a.b	ENSGT00390000004247.l.a	ENSGT00400000024875.c.b.a	ENSGT00400000024875.c.a.b.b	ENSGT00940000159387.e.f	ENSGT00940000159447.n	ENSGT00940000160710.h	ENSGT00390000004550	ENSGT00940000158795.i
Coho salmon	MODERN SPECIES	22	ENSOKIG00005033387	ENSOKIG00005033383	ARRDC1 (ENSOKIG00005033365)	ENSOKIG00005033359	ehmt1a (ENSOKIG00005028420)	cacna1ba (ENSOKIG00005003648)	ENSOKIG00005002302	ENSOKIG00005002293	man1b1b (ENSOKIG00005002275)	dpp7 (ENSOKIG00005002064)	NOTCH1 (ENSOKIG00005000726)	inpp5e (ENSOKIG00005000060)	pmpca (ENSOKIG00005024063)	PTGS1 (ENSOKIG00005022764)	LHX6 (ENSOKIG00005022577)	krt1-c5 (ENSOKIG00005022530) #22	ENSOKIG00005022516	ENSOKIG00005022512	zbtb26 (ENSOKIG00005022508)	GPR21 (ENSOKIG00005022494)	ENSOKIG00005022446	cfap157 (ENSOKIG00005022420)	tor2a (ENSOKIG00005022411)	ptrh1 (ENSOKIG00005022401)	ENSOKIG00005022394	ENSOKIG00005022351	FAM163B (ENSOKIG00005022342)	ADAMTSL2 (ENSOKIG00005022204)	mymk (ENSOKIG00005022167)	ENSOKIG00005022141	slc2a8 (ENSOKIG00005022062)
Chinook salmon	MODERN SPECIES	41	ENTPD2 (ENSOTSG00005046509)	nelfb (ENSOTSG00005046514)	ENSOTSG00005046519	ENSOTSG00005046520	ARRDC1 (ENSOTSG00005046521)	ehmt1a (ENSOTSG00005046527)	cacna1ba (ENSOTSG00005047430)	ENSOTSG00005047980	man1b1b (ENSOTSG00005047984)	dpp7 (ENSOTSG00005047986)	notch1b (ENSOTSG00005047988)	inpp5e (ENSOTSG00005047995)	pmpca (ENSOTSG00005047996)	PTGS1 (ENSOTSG00005047998)	LHX6 (ENSOTSG00005047999)	krt1-c5 (ENSOTSG00005048000) #22	ENSOTSG00005036448	zbtb26 (ENSOTSG00005036451)	GPR21 (ENSOTSG00005036510)	ENSOTSG00005036513	cfap157 (ENSOTSG00005036591)	tor2a (ENSOTSG00005036592)	ptrh1 (ENSOTSG00005036594)	ENSOTSG00005036595	FAM163B (ENSOTSG00005036597)	ADAMTSL2 (ENSOTSG00005036598)	mymk (ENSOTSG00005036606)	ENSOTSG00005036609	slc2a8 (ENSOTSG00005036611)	lcn15 (ENSOTSG00005036634)	jak2b (ENSOTSG00005036647)
Huchen	MODERN SPECIES	151											inpp5e (ENSHHUG00000045045)	pmpca (ENSHHUG00000045089)	ENSHHUG00000045201	PTGS1 (ENSHHUG00000045209)	LHX6 (ENSHHUG00000045545)	krt1-c5 (ENSHHUG00000045549) #22	ENSHHUG00000045561	zbtb26 (ENSHHUG00000045562)	GPR21 (ENSHHUG00000045567)	cfap157 (ENSHHUG00000045570)	tor2a (ENSHHUG00000045581)	ptrh1 (ENSHHUG00000045594)	ENSHHUG00000045597	ENSHHUG00000045600	FAM163B (ENSHHUG00000045607)	ADAMTSL2 (ENSHHUG00000045609)	mymk (ENSHHUG00000045628)	ENSHHUG00000045638	slc2a8 (ENSHHUG00000045646)	lcn15 (ENSHHUG00000045657)	jak2b (ENSHHUG00000045676)
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Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000164907.b.a.c	ENSGT00940000155151.a.a.a.d	ENSGT00530000064286.c.a	ENSGT00940000167390.c	ENSGT01100000263542.B.b.a.b.e	ENSGT00390000012665.j	ENSGT01080000257442.c.b	ENSGT00940000166440	ENSGT00940000155275.c.b.b.e	ENSGT00940000155422.bb.b	ENSGT00940000157157.b.a.a.e	ENSGT00940000158199.l	ENSGT00940000156724.k	ENSGT00390000010743.b.b.d	ENSGT00940000156868.h.d	ENSGT00950000182969.A.a.a.b #22	ENSGT00940000165787.a.b.eb	ENSGT00940000157920.a.d	ENSGT00940000163543.a.c	ENSGT00940000154687.B.q.b.a.a	ENSGT00940000154130.a.b.f	ENSGT00390000004247.l.b	ENSGT00400000024875.c.b.b	ENSGT00400000024875.c.a.b.a	ENSGT00940000159387.e.e	ENSGT00940000159447.m	ENSGT00940000160710.g	ENSGT00940000158795.j	ENSGT00390000017970.d.b	ENSGT01030000234564.a.a.b.b	ENSGT00940000153771.B.w
Chinook salmon	MODERN SPECIES	3	ENSOTSG00005044033	ccn1l2 (ENSOTSG00005044034)	FKBP15 (ENSOTSG00005044042)	fgf17 (ENSOTSG00005044537)	ENTPD2 (ENSOTSG00005044538)	nelfb (ENSOTSG00005044540)	arrdc1a (ENSOTSG00005045057)	cacna1ba (ENSOTSG00005045082)	man1b1b (ENSOTSG00005046690)	notch1b (ENSOTSG00005009635)	inpp5e (ENSOTSG00005009781)	pmpca (ENSOTSG00005009796)	ENSOTSG00005010937	PTGS1 (ENSOTSG00005010939)	LHX6 (ENSOTSG00005010952)	krt1-c5 (ENSOTSG00005010954) #22	ENSOTSG00005010957	zbtb26 (ENSOTSG00005010963)	GPR21 (ENSOTSG00005010964)	ENSOTSG00005010965	sh2d3cb (ENSOTSG00005010967)	ptrh1 (ENSOTSG00005010969)	ENSOTSG00005010970	ENSOTSG00005010971	FAM163B (ENSOTSG00005010972)	ADAMTSL2 (ENSOTSG00005010977)	mymk (ENSOTSG00005010983)	slc2a8 (ENSOTSG00005010984)	gldc (ENSOTSG00005010988)	mboat4 (ENSOTSG00005011163)	coq2 (ENSOTSG00005011165)
Coho salmon	MODERN SPECIES	28	ENSOKIG00005045969	ENSOKIG00005045974	FKBP15 (ENSOKIG00005046028)	fgf17 (ENSOKIG00005046602)	ENTPD2 (ENSOKIG00005046613)	nelfb (ENSOKIG00005046649)	ENSOKIG00005046731	arrdc1a (ENSOKIG00005046737)	cacna1ba (ENSOKIG00005047148)	MAN1B1 (ENSOKIG00005049871)	notch1b (ENSOKIG00005049913)	inpp5e (ENSOKIG00005050049)	pmpca (ENSOKIG00005050081)	PTGS1 (ENSOKIG00005050217)	LHX6 (ENSOKIG00005050386)	krt1-c5 (ENSOKIG00005050397) #22	ENSOKIG00005050409	zbtb26 (ENSOKIG00005050413)	GPR21 (ENSOKIG00005050417)	ENSOKIG00005050430	sh2d3cb (ENSOKIG00005050447)	ENSOKIG00005050457	ENSOKIG00005050460	FAM163B (ENSOKIG00005050461)	ADAMTSL2 (ENSOKIG00005050467)	mymk (ENSOKIG00005050477)	slc2a8 (ENSOKIG00005050482)	gldc (ENSOKIG00005050497)	mboat4 (ENSOKIG00005050535)	coq2 (ENSOKIG00005050538)	ENSOKIG00005050541
Rainbow trout	MODERN SPECIES	2	entpd2a.1 (ENSOMYG00000038734)	nelfb (ENSOMYG00000038706)	ENSOMYG00000038658	ENSOMYG00000038647	arrdc1a (ENSOMYG00000038634)	cacna1ba (ENSOMYG00000011876)	man1b1b (ENSOMYG00000009283)	ENSOMYG00000008306	ENSOMYG00000056878	inpp5e (ENSOMYG00000007023)	ENSOMYG00000048519	pmpca (ENSOMYG00000006347)	ENSOMYG00000049576	ENSOMYG00000004690	ENSOMYG00000003601	krt1-c5 (ENSOMYG00000003512) #22	ENSOMYG00000003458	ENSOMYG00000072137	zbtb26 (ENSOMYG00000003405)	ENSOMYG00000003363	ENSOMYG00000003330	ENSOMYG00000003273	ENSOMYG00000003185	ENSOMYG00000031748	FAM163B (ENSOMYG00000031733)	ENSOMYG00000031637	mymk (ENSOMYG00000031725)	slc2a8 (ENSOMYG00000031508)	ENSOMYG00000048673	ENSOMYG00000031308	ENSOMYG00000031091
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	58	ENSGT00940000155151.a.a.a.d	ENSGT00530000064286.c.a	ENSGT00940000167390.c	ENSGT01100000263542.B.b.a.b.e	ENSGT00390000012665.j	ENSGT01100000263537.b.a.b.e.a	ENSGT00940000166440	ENSGT00940000156002.a.b.lb.b	ENSGT00940000155275.c.b.b.e	ENSGT00940000155422.bb.b	ENSGT00940000157157.b.a.a.e	ENSGT00940000158199.l	ENSGT00940000156724.k	ENSGT00390000010743.b.b.d	ENSGT00940000156868.h.d	ENSGT00950000182969.A.a.a.b #22	ENSGT00940000165787.a.b.eb	ENSGT00940000157920.a.d	ENSGT00940000163543.a.c	ENSGT00940000154687.B.q.b.a.a	ENSGT00940000154130.a.b.f	ENSGT00390000004247.l.b	ENSGT00400000024875.c.a.b.a	ENSGT00940000159387.e.e	ENSGT00940000159447.m	ENSGT00940000160710.g	ENSGT00940000158795.j	ENSGT00390000017970.d.b	ENSGT01030000234564.a.a.b.b.f	ENSGT00940000153771.B.w	ENSGT00940000156411.od.b.b
River trout	MODERN SPECIES	39	ccn1l2 (ENSSTUG00000021631)	FKBP15 (ENSSTUG00000021489)	fgf17 (ENSSTUG00000021462)	ENTPD2 (ENSSTUG00000021428)	nelfb (ENSSTUG00000021155)	ENSSTUG00000021145	arrdc1a (ENSSTUG00000021140)	ehmt1a (ENSSTUG00000021036)	cacna1ba (ENSSTUG00000018726)	man1b1b (ENSSTUG00000018604)	notch1b (ENSSTUG00000012059)	inpp5e (ENSSTUG00000011860)	pmpca (ENSSTUG00000010933)	PTGS1 (ENSSTUG00000009525)	LHX6 (ENSSTUG00000009495)	krt1-c5 (ENSSTUG00000009475) #22	ENSSTUG00000009470	zbtb26 (ENSSTUG00000009462)	GPR21 (ENSSTUG00000009453)	ENSSTUG00000009387	sh2d3cb (ENSSTUG00000009336)	ptrh1 (ENSSTUG00000009327)	ENSSTUG00000009314	FAM163B (ENSSTUG00000009302)	ADAMTSL2 (ENSSTUG00000009188)	mymk (ENSSTUG00000009158)	slc2a8 (ENSSTUG00000009111)	gldc (ENSSTUG00000008212)	mboat4 (ENSSTUG00000008108)	coq2 (ENSSTUG00000008104)	ENSSTUG00000008069
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	12	ENSSSAG00000074256	ENSSSAG00000098312	ENSSSAG00000118121	nelfb (ENSSSAG00000072439)	ENSSSAG00000106615	arrdc1a (ENSSSAG00000074053)	ENSSSAG00000098478	cacna1ba (ENSSSAG00000009555)	ENSSSAG00000008225	ENSSSAG00000007822	inpp5e (ENSSSAG00000007762)	pmpca (ENSSSAG00000065319)	ENSSSAG00000094072	pgh1 (ENSSSAG00000006478)	ENSSSAG00000086923	krt1-c5 (ENSSSAG00000006317) #22	ENSSSAG00000083046	ENSSSAG00000006310	zbtb26 (ENSSSAG00000090802)	ENSSSAG00000006286	ENSSSAG00000083515	ENSSSAG00000006250	ENSSSAG00000006182	ENSSSAG00000080160	ENSSSAG00000080158	FAM163B (ENSSSAG00000080156)	ENSSSAG00000080139	mymk (ENSSSAG00000080130)	ENSSSAG00000080126	ENSSSAG00000080122	ENSSSAG00000079812
Northern pike	MODERN SPECIES	12	ENSELUG00000002048	ccn1l2 (ENSELUG00000002050)	ENSELUG00000002078	fgf17 (ENSELUG00000002082)	nelfb (ENSELUG00000002087)	ENSELUG00000002099	ENSELUG00000002101	cacna1ba (ENSELUG00000002116)	man1b1b (ENSELUG00000002128)	dpp7 (ENSELUG00000002133)	notch1b (ENSELUG00000002143)	inpp5e (ENSELUG00000002148)	pmpca (ENSELUG00000002154)	ENSELUG00000002162	LHX6 (ENSELUG00000002165)	krt1-c5 (ENSELUG00000002169) #22	ENSELUG00000032479	ENSELUG00000030271	ENSELUG00000030443	ENSELUG00000033055	zbtb26 (ENSELUG00000002173)	GPR21 (ENSELUG00000002175)	ENSELUG00000001098	ELOVL7 (ENSELUG00000001485)	ercc8 (ENSELUG00000002194)	ndufaf2 (ENSELUG00000031461)	smim15 (ENSELUG00000001541)	ZSWIM6 (ENSELUG00000002207)	pgm5 (ENSELUG00000002214)	foxd5 (ENSELUG00000002216)	cbwd (ENSELUG00000002220)
Otomorpha	ANCESTRAL SPECIES	158	ENSGT00390000004550	ENSGT00940000160710	ENSGT00940000159447	ENSGT00940000159387.e	ENSGT00400000024875.c.a.b	ENSGT00400000024875.c.b	ENSGT00940000154687.B.q.b	ENSGT00730000111240	ENSGT00940000154130.a.b.f	ENSGT00950000182888.a.b	ENSGT00390000004247	ENSGT00940000158199	ENSGT00940000156724	ENSGT00390000010743.b.a	ENSGT00940000156868.h	ENSGT00950000182969.A.a.a #22	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000164473	ENSGT00940000163579	ENSGT00940000154043.A.j.a	ENSGT00390000000560	ENSGT00940000160404	ENSGT00940000160570	ENSGT00940000153246.b	ENSGT00940000158049
Otophysi	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00390000004550	ENSGT00940000160710	ENSGT00940000159447	ENSGT00940000159387.e	ENSGT00400000024875.c.a.b	ENSGT00400000024875.c.b	ENSGT00940000154687.B.q.b	ENSGT00730000111240	ENSGT00940000154130.a.b.f	ENSGT00950000182888.a.b	ENSGT00390000004247	ENSGT00940000158199	ENSGT00940000156724	ENSGT00390000010743.b.a	ENSGT00940000156868.h	ENSGT00950000182969.A.a.a #22	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000164473	ENSGT00940000163579	ENSGT00940000154043.A.j.a	ENSGT00390000005869.b	ENSGT00940000164519.d	ENSGT00940000159244.a	ENSGT00940000159734	ENSGT00940000154416.C.c.a.a.b	ENSGT00940000181328	ENSGT00940000155214.k.b	ENSGT00440000039084.a.a	ENSGT00530000064123.h	ENSGT00940000156744.p	ENSGT00940000161616.c
Characiphysae	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000154742.b	ENSGT00940000155305.a	ENSGT00940000155123.a	ENSGT00940000158982	ENSGT00390000018619	ENSGT00390000016407	ENSGT00390000004985.a	ENSGT00660000097118	ENSGT00940000156031.e	ENSGT00940000158953	ENSGT00940000165983	ENSGT00530000063907.c	ENSGT00940000157876.d	ENSGT00390000010743.b.a	ENSGT00940000156868.h	ENSGT00950000182969.A.a.a #22	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000164473	ENSGT00940000163579	ENSGT00940000154043.A.j.a	ENSGT00390000005869.b	ENSGT00940000156959.A.c.b	ENSGT00940000154143.c.a	ENSGT00940000153385.b.b	ENSGT00390000008519	ENSGT00940000157147.d	ENSGT00390000018059.a.a	ENSGT00500000044895	ENSGT00940000159244.a	ENSGT00940000159734	ENSGT00940000154416.C.c.a.a.b
Channel catfish	MODERN SPECIES	14	ENSIPUG00000018397	hmgcr (ENSIPUG00000018368)	cert1a (ENSIPUG00000018340)	arsk (ENSIPUG00000018314)	nol6 (ENSIPUG00000018266)	SKIC3 (ENSIPUG00000018203)	ENSIPUG00000018190	mctp1 (ENSIPUG00000018094)	slf1 (ENSIPUG00000018030)	ENSIPUG00000017995	ENSIPUG00000017986	fam172a (ENSIPUG00000017948)	nr2f1a (ENSIPUG00000017934)	ENSIPUG00000017926	ptgs1 (ENSIPUG00000017887)	krt1-c5 (ENSIPUG00000017851) #22	ENSIPUG00000017838	zbtb26 (ENSIPUG00000017831)	zgc:101858 (ENSIPUG00000017810)	Ppil3 (ENSIPUG00000017773)	Lrrc8a (ENSIPUG00000017760)	lix1 (ENSIPUG00000017729)	olfm1 (ENSIPUG00000017707)	rxrab (ENSIPUG00000017652)	ENSIPUG00000017642	ENSIPUG00000017617	edf1 (ENSIPUG00000017576)	ppapdc3 (ENSIPUG00000017565)	FAM78A (ENSIPUG00000017547)	ENSIPUG00000017476	ENSIPUG00000017457
Characiphysae_b	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000154742.b	ENSGT00940000155305.a	ENSGT00940000155123.a	ENSGT00940000158982	ENSGT00390000018619	ENSGT00390000016407	ENSGT00390000004985.a	ENSGT00660000097118	ENSGT00940000156031.e	ENSGT00940000158953	ENSGT00940000165983	ENSGT00530000063907.c	ENSGT00940000157876.d	ENSGT00390000010743.b.a	ENSGT00940000156868.h	ENSGT00950000182969.A.a.a #22	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000164473	ENSGT00940000163579	ENSGT00940000154043.A.j.a	ENSGT00390000005869.b	ENSGT00940000156959.A.c.b	ENSGT00940000154143.c.a	ENSGT00940000153385.b.b	ENSGT00980000198604	ENSGT00390000008519	ENSGT00940000157147.d	ENSGT00390000018059.a.a	ENSGT00500000044895	ENSGT00940000159244.a	ENSGT00940000159734
Characoidei	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000159721.g	ENSGT00940000154742.b	ENSGT00940000155305.a	ENSGT00940000155123.a	ENSGT00940000158982	ENSGT00390000018619	ENSGT00390000016407	ENSGT00390000004985.a	ENSGT00940000156031.e	ENSGT00940000158953	ENSGT00940000165983	ENSGT00530000063907.c	ENSGT00940000157876.d	ENSGT00390000010743.b.a	ENSGT00940000156868.h	ENSGT00950000182969.A.a.a #22	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000164473	ENSGT00940000163579	ENSGT00940000154043.A.j.a	ENSGT00390000005869.b	ENSGT00940000156959.A.c.b	ENSGT00940000154143.c.a	ENSGT00940000153385.b.b	ENSGT00980000198604	ENSGT00390000008519	ENSGT00940000157147.d	ENSGT00390000018059.a.a	ENSGT00500000044895	ENSGT00940000159244.a	ENSGT00940000159734
Mexicana tetra	MODERN SPECIES	26	ENSAMXG00000030426	hmgcra (ENSAMXG00000007971)	cert1a (ENSAMXG00000007931)	arsk (ENSAMXG00000007903)	nol6 (ENSAMXG00000007881)	SKIC3 (ENSAMXG00000007850)	ENSAMXG00000035443	MCTP1 (ENSAMXG00000007805)	ENSAMXG00000035646	ENSAMXG00000007786	fam172a (ENSAMXG00000007782)	nr2f1a (ENSAMXG00000007779)	ENSAMXG00000007776	ptgs1 (ENSAMXG00000007774)	ENSAMXG00000007769	krt1-c5 (ENSAMXG00000007764) #22	zbtb26 (ENSAMXG00000034454)	ppil3 (ENSAMXG00000007761)	LRRC8A (ENSAMXG00000007760)	zgc:101858 (ENSAMXG00000035229)	lix1 (ENSAMXG00000007757)	olfm1a (ENSAMXG00000029681)	rxrab (ENSAMXG00000007750)	ENSAMXG00000007741	ENSAMXG00000007739	ENSAMXG00000040048	edf1 (ENSAMXG00000007737)	plpp7a (ENSAMXG00000030606)	fam78aa (ENSAMXG00000038971)	ENSAMXG00000007720	ENSAMXG00000007711
Red-bellied piranha	MODERN SPECIES	17	gcnt4a (ENSPNAG00000004329)	ankrd31 (ENSPNAG00000004792)	hmgcra (ENSPNAG00000028218)	cert1a (ENSPNAG00000028148)	arsk (ENSPNAG00000006490)	nol6 (ENSPNAG00000028102)	SKIC3 (ENSPNAG00000006378)	ENSPNAG00000006063	MCTP1 (ENSPNAG00000027085)	ENSPNAG00000004118	ENSPNAG00000026743	fam172a (ENSPNAG00000026657)	nr2f1a (ENSPNAG00000026577)	ptgs1 (ENSPNAG00000005508)	LHX6 (ENSPNAG00000026432)	krt1-c5 (ENSPNAG00000025840) #22	zbtb26 (ENSPNAG00000025830)	zgc:101858 (ENSPNAG00000003966)	ppil3 (ENSPNAG00000025814)	LRRC8A (ENSPNAG00000025808)	STX7 (ENSPNAG00000025803)	lix1 (ENSPNAG00000005472)	olfm1a (ENSPNAG00000025754)	rxrab (ENSPNAG00000005154)	ENSPNAG00000025678	ENSPNAG00000025626	ENSPNAG00000025519	edf1 (ENSPNAG00000003925)	plpp7a (ENSPNAG00000006659)	fam78aa (ENSPNAG00000025468)	ENSPNAG00000025439
Electric eel	MODERN SPECIES	541														ptgs1 (ENSEEEG00000000418)	ENSEEEG00000000288	krt1-c5 (ENSEEEG00000000274) #22	zbtb26 (ENSEEEG00000000226)	zgc:101858 (ENSEEEG00000000213)	PPIL3 (ENSEEEG00000000172)	LRRC8A (ENSEEEG00000000145)
Cyprinoidei	ANCESTRAL SPECIES	43	ENSGT00940000160710	ENSGT00940000159447	ENSGT00940000159387.e	ENSGT00940000157157.b.a.a	ENSGT00950000182975.a.a.b.k	ENSGT00940000156880.c.b	ENSGT00940000162727.a.a	ENSGT00730000111240	ENSGT00940000154130.a.b.f	ENSGT00950000182888.a.b	ENSGT00390000004247	ENSGT00940000158199	ENSGT00940000156724	ENSGT00390000010743.b.a	ENSGT00940000156868.h	ENSGT00950000182969.A.a.a #22	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000164473	ENSGT00940000163579	ENSGT00940000154043.A.j.a	ENSGT00390000005869.b	ENSGT00940000164519.d	ENSGT00940000159244.a
Cyprininae	DUPLICATION
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000160710.d	ENSGT00940000159447.k	ENSGT00940000159387.e.g	ENSGT00940000157157.b.a.a.a	ENSGT00950000182975.a.a.b.k.i	ENSGT00940000156880.c.b.b	ENSGT00530000064485.cb	ENSGT00940000158302.d.a	ENSGT00730000111240.j	ENSGT00940000154130.a.b.f.d	ENSGT00950000182888.a.b.h	ENSGT00390000004247	ENSGT00940000158199.n	ENSGT00940000156724.d	ENSGT00390000010743.b.a.d	ENSGT00950000182969.A.a.a.c #22	ENSGT00940000157920.a.h	ENSGT00940000164473.g	ENSGT00940000154043.A.j.a.h	ENSGT00390000005869.b.c	ENSGT00940000156959.A.c.b.a	ENSGT00940000159789.q.b	ENSGT00940000154143.c.a	ENSGT00940000153385.b.b.a	ENSGT00390000008519.ac.b	ENSGT00940000157147.d.b	ENSGT00390000018059.a.a.a.a	ENSGT00500000044895.e	ENSGT00940000159734.h	ENSGT00940000154667.a.x.a	ENSGT00940000155917.cb.b
Goldfish	MODERN SPECIES	23	FAM163B (ENSCARG00000036498)	notch1b (ENSCARG00000036847)	camsap1b (ENSCARG00000043184)	ENSCARG00000043527	KCNT1 (ENSCARG00000043579)	ENSCARG00000043710	ENSCARG00000043755	cfap157 (ENSCARG00000043892)	sh2d3cb (ENSCARG00000043923)	tor2a (ENSCARG00000043991)	ptrh1 (ENSCARG00000044011)	inpp5e (ENSCARG00000044047)	pmpca (ENSCARG00000044126)	ptgs1 (ENSCARG00000044239)	ENSCARG00000046492	krt1-c5 (ENSCARG00000046531) #22	zbtb26 (ENSCARG00000046557)	zgc:101858 (ENSCARG00000046585)	ENSCARG00000046691	lix1 (ENSCARG00000046708)	olfm1a (ENSCARG00000046728)	rxrab (ENSCARG00000005823)	ENSCARG00000006260	ENSCARG00000006451	edf1 (ENSCARG00000006631)	plpp7a (ENSCARG00000006680)	fam78aa (ENSCARG00000006689)	ENSCARG00000006699	QSOX2 (ENSCARG00000006712)	ENSCARG00000006862	ak5l (ENSCARG00000006871)
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000159447.k	ENSGT00940000159387.e.g	ENSGT00940000157157.b.a.a.a	ENSGT00950000182975.a.a.b.k.i	ENSGT00940000156880.c.b.b	ENSGT00940000155199.e.b	ENSGT00530000064485.cb	ENSGT00940000158302.d.a	ENSGT00730000111240.j	ENSGT00940000154130.a.b.f.d	ENSGT00950000182888.a.b.h	ENSGT00390000004247	ENSGT00940000158199.n	ENSGT00940000156724.d	ENSGT00390000010743.b.a.d	ENSGT00950000182969.A.a.a.c #22	ENSGT00940000157920.a.h	ENSGT00940000164473.g	ENSGT00940000154043.A.j.a.h	ENSGT00390000005869.b.c	ENSGT00940000156959.A.c.b.a	ENSGT00940000159789.q.b	ENSGT00940000154143.c.a	ENSGT00940000153385.b.b.a	ENSGT00390000008519.ac.b	ENSGT00940000157147.d.b	ENSGT00390000018059.a.a.a.a	ENSGT00500000044895.e	ENSGT00940000159734.h	ENSGT00940000154667.a.x.a	ENSGT00940000155917.cb.b
Common carp reference	MODERN SPECIES	15	FAM163B (ENSCCRG00000028786)	notch1b (ENSCCRG00000048100)	camsap1b (ENSCCRG00000048553)	ENSCCRG00000048608	ENSCCRG00000076707	ENSCCRG00000055170	cfap157 (ENSCCRG00000039547)	sh2d3cb (ENSCCRG00000039541)	tor2a (ENSCCRG00000076886)	ptrh1 (ENSCCRG00000066590)	inpp5e (ENSCCRG00000037910)	pmpca (ENSCCRG00000029418)	ENSCCRG00000060409	ENSCCRG00000068756	ptgs1 (ENSCCRG00000029174)	krt1-c5 (ENSCCRG00000042925) #22	zbtb26 (ENSCCRG00000080338)	zgc:101858 (ENSCCRG00000074879)	ENSCCRG00000001143	lix1 (ENSCCRG00000063150)	olfm1a (ENSCCRG00000012569)	rxrab (ENSCCRG00000071227)	ENSCCRG00000041126	ENSCCRG00000036933	edf1 (ENSCCRG00000036947)	plpp7a (ENSCCRG00000000673)	fam78aa (ENSCCRG00000066899)	ENSCCRG00000057801	ENSCCRG00000081251	ENSCCRG00000076454	ak5l (ENSCCRG00000032721)
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	453			notch1b (ENSSGRG00000053707)	camsap1b (ENSSGRG00000053743)	ENSSGRG00000053748	KCNT1 (ENSSGRG00000053752)	ENSSGRG00000053759	ENSSGRG00000053766	cfap157 (ENSSGRG00000053767)	sh2d3cb (ENSSGRG00000053768)	tor2a (ENSSGRG00000053771)	ptrh1 (ENSSGRG00000053773)	inpp5e (ENSSGRG00000053774)	pmpca (ENSSGRG00000053792)	ptgs1 (ENSSGRG00000053795)	krt1-c5 (ENSSGRG00000053796) #22	zbtb26 (ENSSGRG00000053797)	zgc:101858 (ENSSGRG00000053798)	ppil3 (ENSSGRG00000053799)	ENSSGRG00000053802	lix1 (ENSSGRG00000053803)	olfm1a (ENSSGRG00000053804)	rxrab (ENSSGRG00000053806)	ENSSGRG00000053807	edf1 (ENSSGRG00000053867)	plpp7a (ENSSGRG00000053870)	fam78aa (ENSSGRG00000053871)	ENSSGRG00000053872	QSOX2 (ENSSGRG00000053875)
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	183	ENSGT00940000160710.c	ENSGT00940000159447.l	ENSGT00940000159387.e.h	ENSGT00940000157157.b.a.a.b	ENSGT00950000182975.a.a.b.k.j	ENSGT00940000156880.c.b.a	ENSGT00940000162727.a.a	ENSGT00730000111240.i	ENSGT00940000154130.a.b.f.c	ENSGT00950000182888.a.b.g	ENSGT00940000158199.m	ENSGT00940000156724.c	ENSGT00940000156511.b.nb	ENSGT00390000010743.b.a.c	ENSGT00940000156868.h	ENSGT00950000182969.A.a.a.d #22	ENSGT00940000157920.a.g	ENSGT00940000164473.h	ENSGT00940000163579	ENSGT00940000154043.A.j.a.g	ENSGT00390000005869.b.d	ENSGT00940000156959.A.c.b.b	ENSGT00940000159789.q.a	ENSGT00940000153385.b.b.b	ENSGT00390000008519.ac.a	ENSGT00940000157147.d.a	ENSGT00390000018059.a.a.a.b	ENSGT00940000164519.d	ENSGT00940000159244.a	ENSGT00940000159734.g.b	ENSGT00940000159734.g.a
Goldfish	MODERN SPECIES	44	slc2a8 (ENSCARG00000042096)	ENSCARG00000042213	mymk (ENSCARG00000042224)	FAM163B (ENSCARG00000042268)	notch1b (ENSCARG00000042660)	camsap1b (ENSCARG00000050080)	KCNT1 (ENSCARG00000050577)	col27a1b (ENSCARG00000051323)	cfap157 (ENSCARG00000051517)	sh2d3cb (ENSCARG00000051550)	tor2a (ENSCARG00000051640)	inpp5e (ENSCARG00000051674)	pmpca (ENSCARG00000051779)	ENSCARG00000053096	ptgs1 (ENSCARG00000053126)	krt1-c5 (ENSCARG00000054061) #22	zbtb26 (ENSCARG00000054137)	ppil3 (ENSCARG00000054152)	LRRC8A (ENSCARG00000054192)	lix1 (ENSCARG00000054201)	olfm1a (ENSCARG00000054216)	ENSCARG00000054258	ENSCARG00000054305	rxrab (ENSCARG00000054336)	ENSCARG00000054567	edf1 (ENSCARG00000054664)	plpp7a (ENSCARG00000054680)	fam78aa (ENSCARG00000012893)	QSOX2 (ENSCARG00000012902)	ENSCARG00000013017	ak5l (ENSCARG00000013023)
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	75	ENSGT00940000160710.c	ENSGT00940000159447.l	ENSGT00940000159387.e.h	ENSGT00940000157157.b.a.a.b	ENSGT00950000182975.a.a.b.k.j	ENSGT00940000156880.c.b.a	ENSGT00940000162727.a.a	ENSGT00730000111240.i	ENSGT00940000154130.a.b.f.c	ENSGT00950000182888.a.b.g	ENSGT00940000158199.m	ENSGT00940000156724.c	ENSGT00940000156511.b.nb	ENSGT00390000010743.b.a.c	ENSGT00940000156868.h	ENSGT00950000182969.A.a.a.d #22	ENSGT00940000157920.a.g	ENSGT00940000164473.h	ENSGT00940000163579	ENSGT00940000154043.A.j.a.g	ENSGT00390000005869.b.d	ENSGT00940000156959.A.c.b.b	ENSGT00940000159789.q.a	ENSGT00940000153385.b.b.b	ENSGT00390000008519.ac.a	ENSGT00940000157147.d.a	ENSGT00390000018059.a.a.a.b	ENSGT00940000164519.d	ENSGT00940000159244.a.i	ENSGT00940000159734.g.a	ENSGT00940000154667.a.x.b
Common carp reference	MODERN SPECIES	7	ENSCCRG00000040491	ENSCCRG00000061329	ENSCCRG00000069117	ENSCCRG00000065726	col27a1b (ENSCCRG00000054958)	cfap157 (ENSCCRG00000008803)	sh2d3cb (ENSCCRG00000029992)	tor2a (ENSCCRG00000029989)	ENSCCRG00000055839	inpp5e (ENSCCRG00000029962)	pmpca (ENSCCRG00000037883)	ENSCCRG00000073124	ptgs1 (ENSCCRG00000065272)	ENSCCRG00000042349	ENSCCRG00000082697	krt1-c5 (ENSCCRG00000001156) #22	zbtb26 (ENSCCRG00000013354)	zgc:101858 (ENSCCRG00000068545)	ppil3 (ENSCCRG00000082790)	ENSCCRG00000013342	lix1 (ENSCCRG00000063910)	olfm1a (ENSCCRG00000027322)	rxrab (ENSCCRG00000027314)	ENSCCRG00000003296	edf1 (ENSCCRG00000026176)	plpp7a (ENSCCRG00000056473)	fam78aa (ENSCCRG00000076571)	ENSCCRG00000000689	ENSCCRG00000030933	ENSCCRG00000032723	ak5l (ENSCCRG00000013667)
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	94				camsap1b (ENSSGRG00000026120)	ENSSGRG00000026156	ENSSGRG00000026158	ENSSGRG00000026159	ENSSGRG00000026162	cfap157 (ENSSGRG00000026164)	sh2d3cb (ENSSGRG00000026166)	tor2a (ENSSGRG00000026168)	ENSSGRG00000026169	inpp5e (ENSSGRG00000026170)	pmpca (ENSSGRG00000026182)	ptgs1 (ENSSGRG00000026513)	krt1-c5 (ENSSGRG00000027990) #22	zbtb26 (ENSSGRG00000027992)	ppil3 (ENSSGRG00000027993)	ENSSGRG00000028003	lix1 (ENSSGRG00000028005)	olfm1a (ENSSGRG00000028006)	rxrab (ENSSGRG00000028010)	ENSSGRG00000028019	ENSSGRG00000028020	edf1 (ENSSGRG00000028048)	plpp7a (ENSSGRG00000028052)	ENSSGRG00000028054	ENSSGRG00000028056	QSOX2 (ENSSGRG00000028065)	ENSSGRG00000028164	ak5l (ENSSGRG00000028166)
Zebrafish	MODERN SPECIES	20	notch1b (ENSDARG00000052094)	camsap1b (ENSDARG00000035122)	KCNT1 (ENSDARG00000104868)	col27a1b (ENSDARG00000099930)	cfap157 (ENSDARG00000099042)	sh2d3cb (ENSDARG00000104555)	tor2a (ENSDARG00000100559)	ptrh1 (ENSDARG00000098206)	inpp5e (ENSDARG00000103926)	pmpca (ENSDARG00000102607)	anxa1b (ENSDARG00000100095)	anxa1c (ENSDARG00000104359)	anxa1d (ENSDARG00000098481)	ptgs1 (ENSDARG00000052148)	LHX6 (ENSDARG00000052165)	krt1-c5 (ENSDARG00000026979) #22	zbtb26 (ENSDARG00000028949)	zgc:101858 (ENSDARG00000035129)	ppil3 (ENSDARG00000033370)	LRRC8A (ENSDARG00000052155)	lix1 (ENSDARG00000052154)	olfm1a (ENSDARG00000018270)	rxrab (ENSDARG00000035127)	brd3b (ENSDARG00000100129)	ENSDARG00000105544	edf1 (ENSDARG00000009950)	plpp7a (ENSDARG00000103712)	fam78aa (ENSDARG00000101217)	ENSDARG00000112370	QSOX2 (ENSDARG00000077174)	ENSDARG00000092517
Clupeiformes	ANCESTRAL SPECIES	444															ENSGT00940000156868.h	ENSGT00950000182969.A.a.a #22	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000164473	ENSGT00940000163579	ENSGT00940000154043.A.j.a	ENSGT00390000000560	ENSGT00940000160404	ENSGT00940000160570	ENSGT00940000153246.b
Denticle herring	MODERN SPECIES		ENSDCDG00000002830	ENSDCDG00000002823	ndufaf2 (ENSDCDG00000002820)	smim15 (ENSDCDG00000002816)	ENSDCDG00000002814	ENSDCDG00000002812	zbtb26 (ENSDCDG00000002809)	zgc:101858 (ENSDCDG00000002805)	ppil3 (ENSDCDG00000002803)	ENSDCDG00000002801	ENSDCDG00000002798	ENSDCDG00000002794	ndufaf2 (ENSDCDG00000002791)	smim15 (ENSDCDG00000002789)	ENSDCDG00000002785	krt1-c5 (ENSDCDG00000002778) #22	ENSDCDG00000002772	zbtb26 (ENSDCDG00000002769)	zgc:101858 (ENSDCDG00000002764)	ppil3 (ENSDCDG00000002759)	LRRC8A (ENSDCDG00000002758)	entr1 (ENSDCDG00000002754)	snapc4 (ENSDCDG00000002747)	CARD9 (ENSDCDG00000002727)	ENSDCDG00000002724	ENSDCDG00000002723	ENSDCDG00000002721	ENSDCDG00000002715	ENSDCDG00000002713	HECTD4 (ENSDCDG00000002644)	SDS (ENSDCDG00000002616)
Osteoglossiformes	ANCESTRAL SPECIES	117	ENSGT00940000156820.a.a	ENSGT00530000063335.B.a.b	ENSGT00940000158634.a	ENSGT00390000005811	ENSGT00940000156639	ENSGT00940000157654	ENSGT00940000158126	ENSGT00640000091523	ENSGT00940000154110.a	ENSGT00390000014658	ENSGT00940000157157.b.a.a	ENSGT00940000156724	ENSGT00390000010743.b.a.b	ENSGT00940000156868.h	ENSGT00390000008938	ENSGT00950000182969.A.a.a #22	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B.q.b.c	ENSGT00940000154130.a.b.f	ENSGT00950000182888.a.b	ENSGT00730000111240	ENSGT00390000004247	ENSGT00400000024875.c.b	ENSGT00400000024875.c.a	ENSGT00940000159387.e
Asian bonytongue	DUPLICATION
Asian bonytongue	MODERN SPECIES		ddx18 (ENSSFOG00015029658)	ccdc93 (ENSSFOG00015024988)	INSIG2 (ENSSFOG00015028296)	ENSSFOG00015028367	ENSSFOG00015006650	ENSSFOG00015029379	ENSSFOG00015006638	ENSSFOG00015030581	LRRC24 (ENSSFOG00015006665)	THEM6 (ENSSFOG00015006698)	THEM6 (ENSSFOG00015031535)	EEF1D (ENSSFOG00015006740)	ARHGAP39 (ENSSFOG00015006826)	LHX6 (ENSSFOG00015006864)	ndufa8 (ENSSFOG00015006890)	krt1-c5 (ENSSFOG00015006903) #22	zbtb26 (ENSSFOG00015006928)	GPR21 (ENSSFOG00015006937)	ENSSFOG00015006972	sh2d3cb (ENSSFOG00015007015)	tor2a (ENSSFOG00015027795)	cfap157 (ENSSFOG00015007039)	ptrh1 (ENSSFOG00015007053)	ENSSFOG00015007079	ENSSFOG00015007097	FAM163B (ENSSFOG00015025811)	ADAMTSL2 (ENSSFOG00015007117)	mymk (ENSSFOG00015007195)	slc2a8 (ENSSFOG00015007238)	ptgdsa (ENSSFOG00015007285)	nrarpb (ENSSFOG00015032220)
Asian bonytongue	MODERN SPECIES	9	ENSSFOG00015012103	ENSSFOG00015012019	RSPO2 (ENSSFOG00015011936)	eif3ea (ENSSFOG00015030883)	emc2 (ENSSFOG00015011902)	TMEM74 (ENSSFOG00015031673)	TRHR (ENSSFOG00015009715)	eny2 (ENSSFOG00015011825)	EBAG9 (ENSSFOG00015011777)	SYBU (ENSSFOG00015025869)	gdf6a (ENSSFOG00015011764)	ENSSFOG00015011769	ENSSFOG00015032624	ENSSFOG00015029166	plekhf2 (ENSSFOG00015011740)	krt1-c5 (ENSSFOG00015005843) #22	NDUFAF6 (ENSSFOG00015011699)	nagpa (ENSSFOG00015011685)	tp53inp1 (ENSSFOG00015031909)	ccne2 (ENSSFOG00015011596)	ENSSFOG00015011480	gbp (ENSSFOG00015024517)	KCNV1 (ENSSFOG00015011459)	dek (ENSSFOG00015011439)	aldh5a1 (ENSSFOG00015011388)	KIAA0319 (ENSSFOG00015011360)	ENSSFOG00015011322	CALB1 (ENSSFOG00015011258)	decr1 (ENSSFOG00015011212)	ENSSFOG00015031573	ENSSFOG00015027273
P. kingsleyae	MODERN SPECIES	458					pgm5 (ENSPKIG00000015206)	cbwd (ENSPKIG00000015095)	ENSPKIG00000015006	ubac1 (ENSPKIG00000014942)	notch1b (ENSPKIG00000014821)	pmpca (ENSPKIG00000014739)	rpl28 (ENSPKIG00000014698)	ENSPKIG00000014646	PTGS1 (ENSPKIG00000014608)	LHX6 (ENSPKIG00000014555)	ndufa8 (ENSPKIG00000014521)	krt1-c5 (ENSPKIG00000014498) #22	zbtb26 (ENSPKIG00000014483)
Osteoglossocephalai	ANCESTRAL SPECIES	138	ENSGT00940000156880.c.a	ENSGT00950000182975.a.a.b	ENSGT00940000157157.b.a.b	ENSGT00940000159324	ENSGT00940000158199	ENSGT00390000011509	ENSGT00390000008732.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00390000010743.b.a	ENSGT00390000005084	ENSGT00940000177220	ENSGT00390000013765	ENSGT00940000156868.g	ENSGT00390000018089	ENSGT00390000008938	ENSGT00950000182969.A.a.b #22	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B.q.b	ENSGT00940000167684	ENSGT00940000154687.B.q.a	ENSGT00940000154130.a.b.e	ENSGT00390000005101	ENSGT01030000234558.D.a	ENSGT00940000157589	ENSGT00940000166736	ENSGT00530000063085.B	ENSGT00940000159387.f	ENSGT00730000111240	ENSGT00390000004247
Clupeocephala	ANCESTRAL SPECIES	8				ENSGT00940000157724.a.b	ENSGT00940000154091.a.a.s.b	ENSGT00940000155816.a	ENSGT00940000156320.d	ENSGT00940000155291.b	ENSGT00940000159174.e	ENSGT00390000005084	ENSGT00940000177220	ENSGT00390000013765	ENSGT00940000156868.g	ENSGT00390000018089	ENSGT00390000008938	ENSGT00950000182969.A.a.b #22	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543.b	ENSGT00940000154687.B.q.a	ENSGT00940000154130.a.b.e	ENSGT00390000005101	ENSGT01030000234558.D.a	ENSGT00940000157589	ENSGT00940000166736	ENSGT00530000063085.B	ENSGT00940000159387.f	ENSGT00390000009349	ENSGT00940000158646	ENSGT01100000263580	ENSGT00940000160109
Otomorpha	ANCESTRAL SPECIES	28	ENSGT00530000066485	ENSGT00940000157072.a	ENSGT00940000156244.a.b	ENSGT00940000157724.a.b	ENSGT00940000154091.a.a.s.b	ENSGT00940000155816.a	ENSGT00940000156320.d	ENSGT00940000155291.b	ENSGT00940000159174.e	ENSGT00940000177220	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000013765	ENSGT00940000156868.g	ENSGT00390000018089	ENSGT00390000008938	ENSGT00950000182969.A.a.b #22	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543.b	ENSGT00940000154687.B.q.a	ENSGT00940000154130.a.b.e	ENSGT00390000005101	ENSGT01030000234558.D.a	ENSGT00940000157589	ENSGT00530000063085.B	ENSGT00940000159387.f	ENSGT00390000009349	ENSGT00940000158646	ENSGT01100000263580	ENSGT00940000160109	ENSGT00940000161928
Otophysi	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00530000066485	ENSGT00940000157072.a	ENSGT00940000156244.a.b	ENSGT00940000157724.a.b	ENSGT00940000154091.a.a.s.b	ENSGT00940000155816.a	ENSGT00940000156320.d	ENSGT00940000155291.b	ENSGT00940000159174.e	ENSGT00940000177220	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000013765	ENSGT00940000156868.g	ENSGT00390000018089	ENSGT00390000008938	ENSGT00950000182969.A.a.b #22	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543.b	ENSGT00940000154687.B.q.a	ENSGT00940000154130.a.b.e	ENSGT00390000005101	ENSGT01030000234558.D.a	ENSGT00940000157589	ENSGT00530000063085.B	ENSGT00940000159387.f	ENSGT00390000009349	ENSGT00940000158646	ENSGT01100000263580	ENSGT00940000160109	ENSGT00940000161928
Characiphysae	ANCESTRAL SPECIES	40	ENSGT00530000066485	ENSGT00940000157072.a	ENSGT00940000156244.a.b	ENSGT00940000157724.a.b	ENSGT00940000154091.a.a.s.b	ENSGT00940000155816.a	ENSGT00940000156320.d	ENSGT00940000155291.b	ENSGT00940000159174.e	ENSGT00390000005084	ENSGT00940000177220	ENSGT00390000013765	ENSGT00940000156868.g	ENSGT00390000018089	ENSGT00390000008938	ENSGT00950000182969.A.a.b #22	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000163543.b	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B.q.a	ENSGT00940000154130.a.b.e	ENSGT00390000005101	ENSGT01030000234558.D.a	ENSGT00940000157589	ENSGT00530000063085.B	ENSGT00940000159387.f	ENSGT00390000009349	ENSGT00940000158646	ENSGT01100000263580	ENSGT00940000160109	ENSGT00940000161928.d
Channel catfish	MODERN SPECIES	7	ARL15 (ENSIPUG00000021784)	snx18b (ENSIPUG00000021778)	ENSIPUG00000021772	rasgef1bb (ENSIPUG00000021733)	Antxr1 (ENSIPUG00000021704)	paqr3b (ENSIPUG00000021677)	anxa3b (ENSIPUG00000021602)	anxa3b (ENSIPUG00000021576)	ENSIPUG00000021560	ENSIPUG00000021550	mrrf (ENSIPUG00000021524)	rbm18 (ENSIPUG00000021512)	lhx6 (ENSIPUG00000021490)	morn5 (ENSIPUG00000021487)	ndufa8 (ENSIPUG00000021483)	si:ch211-243g18.2 (ENSIPUG00000021469) #22	ENSIPUG00000021433	GPR21 (ENSIPUG00000021429)	RABGAP1 (ENSIPUG00000021311)	strbp (ENSIPUG00000021251)	SH2D3C (ENSIPUG00000020632)	urm1 (ENSIPUG00000020621)	cercam (ENSIPUG00000020562)	sardh (ENSIPUG00000020519)	dbh (ENSIPUG00000020489)	fam163b (ENSIPUG00000020478)	swi5 (ENSIPUG00000020474)	slc27a4 (ENSIPUG00000020449)	ptgdsa (ENSIPUG00000020408)	AMBP (ENSIPUG00000020385)	nrarp (ENSIPUG00000020378)
Characiphysae_b	ANCESTRAL SPECIES	36	ENSGT00530000066485	ENSGT00940000157072.a	ENSGT00940000156244.a.b	ENSGT00940000157724.a.b	ENSGT00940000154091.a.a.s.b	ENSGT00940000155816.a	ENSGT00940000156320.d	ENSGT00940000155291.b	ENSGT00940000159174.e	ENSGT00390000005084	ENSGT00940000177220	ENSGT00390000013765	ENSGT00940000156868.g	ENSGT00390000018089	ENSGT00390000008938	ENSGT00950000182969.A.a.b #22	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543.b	ENSGT00940000154687.B.q.a	ENSGT00940000154130.a.b.e	ENSGT00390000005101	ENSGT01030000234558.D.a	ENSGT00940000157589	ENSGT00530000063085.B	ENSGT00940000159387.f	ENSGT00390000009349	ENSGT00940000158646	ENSGT01100000263580	ENSGT00940000160109	ENSGT00940000161928.d
Electric eel	MODERN SPECIES	7	MOCS2 (ENSEEEG00000011737)	ENSEEEG00000011736	fstb (ENSEEEG00000011733)	ARL15 (ENSEEEG00000011729)	snx18b (ENSEEEG00000011725)	ENSEEEG00000011722	rasgef1bb (ENSEEEG00000011712)	antxr2b (ENSEEEG00000011699)	paqr3b (ENSEEEG00000011697)	anxa3b (ENSEEEG00000011695)	mrrf (ENSEEEG00000011693)	rbm18 (ENSEEEG00000011692)	lhx6a (ENSEEEG00000011687)	morn5 (ENSEEEG00000011685)	ndufa8 (ENSEEEG00000011679)	si:ch211-243g18.2 (ENSEEEG00000011678) #22	pip5k1ba (ENSEEEG00000011654)	tjp2a (ENSEEEG00000011653)	ENSEEEG00000011652	MAMDC2 (ENSEEEG00000011651)	smc5 (ENSEEEG00000011620)	zfand5b (ENSEEEG00000011608)	erbin (ENSEEEG00000011369)	sgtb (ENSEEEG00000011322)	trappc13 (ENSEEEG00000011279)	trim23 (ENSEEEG00000011212)	ppwd1 (ENSEEEG00000011211)	ADAMTS6 (ENSEEEG00000011210)	cwc27 (ENSEEEG00000011208)	srek1ip1 (ENSEEEG00000011206)	plac8.1 (ENSEEEG00000011203)
Characoidei	ANCESTRAL SPECIES	29	ENSGT00530000066485	ENSGT00940000157072.a	ENSGT00940000156244.a.b	ENSGT00940000157724.a.b	ENSGT00940000154091.a.a.s.b.a	ENSGT00940000155816.a	ENSGT00940000156320.d	ENSGT00940000155291.b	ENSGT00940000159174.e	ENSGT00390000005084	ENSGT00940000177220	ENSGT00390000013765	ENSGT00940000156868.g	ENSGT00390000018089	ENSGT00390000008938	ENSGT00950000182969.A.a.b #22	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543.b	ENSGT00940000154687.B.q.a	ENSGT00940000154130.a.b.e	ENSGT00390000005101	ENSGT01030000234558.D.a	ENSGT00940000157589	ENSGT00530000063085.B	ENSGT00940000159387.f	ENSGT00390000009349	ENSGT00940000158646	ENSGT01100000263580	ENSGT00940000160109	ENSGT00940000161928.d
Red-bellied piranha	MODERN SPECIES	137	ARL15 (ENSPNAG00000017858)	snx18b (ENSPNAG00000017844)	ENSPNAG00000017836	ENSPNAG00000017826	rasgef1bb (ENSPNAG00000017817)	ENSPNAG00000017790	antxr2b (ENSPNAG00000017778)	paqr3b (ENSPNAG00000017763)	anxa3b (ENSPNAG00000017721)	mrrf (ENSPNAG00000017686)	ENSPNAG00000017682	rbm18 (ENSPNAG00000017660)	lhx6a (ENSPNAG00000017642)	morn5 (ENSPNAG00000017585)	ndufa8 (ENSPNAG00000017563)	si:ch211-243g18.2 (ENSPNAG00000017541) #22	ENSPNAG00000017502	RABGAP1 (ENSPNAG00000017429)	GPR21 (ENSPNAG00000003472)	STRBP (ENSPNAG00000003471)	SH2D3C (ENSPNAG00000017213)	urm1 (ENSPNAG00000017145)	CERCAM (ENSPNAG00000017084)	sardh (ENSPNAG00000017076)	dbh (ENSPNAG00000017010)	FAM163B (ENSPNAG00000016959)	swi5 (ENSPNAG00000016943)	slc27a4 (ENSPNAG00000016932)	ptgdsa (ENSPNAG00000016858)	ambp (ENSPNAG00000016836)	nrarpa (ENSPNAG00000016775)
Mexicana tetra	MODERN SPECIES	12	ENSAMXG00000006632	ARL15 (ENSAMXG00000013546)	snx18b (ENSAMXG00000013566)	ENSAMXG00000013582	rasgef1bb (ENSAMXG00000035578)	ENSAMXG00000043854	antxr2b (ENSAMXG00000013635)	paqr3b (ENSAMXG00000013650)	anxa3b (ENSAMXG00000035775)	mrrf (ENSAMXG00000013693)	ENSAMXG00000037504	rbm18 (ENSAMXG00000035574)	lhx6a (ENSAMXG00000034290)	morn5 (ENSAMXG00000035315)	ndufa8 (ENSAMXG00000032633)	si:ch211-243g18.2 (ENSAMXG00000006794) #22	ENSAMXG00000006778	GPR21 (ENSAMXG00000037145)	RABGAP1 (ENSAMXG00000006727)	STRBP (ENSAMXG00000043016)	SH2D3C (ENSAMXG00000006672)	ENSAMXG00000039049	urm1 (ENSAMXG00000042562)	CERCAM (ENSAMXG00000006650)	sardh (ENSAMXG00000006616)	ENSAMXG00000025065	dbh (ENSAMXG00000006576)	FAM163B (ENSAMXG00000036123)	swi5 (ENSAMXG00000006560)	slc27a4 (ENSAMXG00000006543)	ptgdsa (ENSAMXG00000043533)
Cyprinoidei	ANCESTRAL SPECIES	70	ENSGT00530000066485	ENSGT00940000157072.a	ENSGT00940000156244.a.b	ENSGT00940000157724.a.b	ENSGT00940000154091.a.a.s.b	ENSGT00940000155816.a	ENSGT00940000156320.d	ENSGT00940000155291.b.a	ENSGT00940000159174.e	ENSGT00940000177220	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000013765	ENSGT00940000156868.g	ENSGT00390000018089	ENSGT00390000008938	ENSGT00950000182969.A.a.b #22	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000157216.k.b	ENSGT00940000163543.b	ENSGT00940000157216.k.a	ENSGT00940000154687.B.q.a	ENSGT00940000154130.a.b.e	ENSGT00390000005101	ENSGT01030000234558.D.a	ENSGT00940000157589	ENSGT00530000063085.B	ENSGT00940000159387.f	ENSGT00390000009349.a	ENSGT00940000158646	ENSGT01100000263580	ENSGT00940000160109
Cyprininae	DUPLICATION
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182969.A.a.b.a #22
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182969.A.a.b.a #22
Golden-line barbel	DUPLICATION
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	233	fstb (ENSSGRG00000009803)	ARL15 (ENSSGRG00000009802)	snx18b (ENSSGRG00000009800)	ENSSGRG00000009799	rasgef1bb (ENSSGRG00000009278)	ENSSGRG00000009260	antxr2b (ENSSGRG00000009217)	paqr3b (ENSSGRG00000009211)	anxa3b (ENSSGRG00000009189)	ENSSGRG00000009185	mrrf (ENSSGRG00000009184)	ENSSGRG00000009183	lhx6a (ENSSGRG00000009182)	morn5 (ENSSGRG00000009181)	ndufa8 (ENSSGRG00000009180)	si:ch211-243g18.2 (ENSSGRG00000009167) #22	ENSSGRG00000009162	RABGAP1 (ENSSGRG00000007877)	STRBP (ENSSGRG00000007853)	SH2D3C (ENSSGRG00000007852)	urm1 (ENSSGRG00000007851)	CERCAM (ENSSGRG00000006744)	sardh (ENSSGRG00000006732)	dbh (ENSSGRG00000006729)	FAM163B (ENSSGRG00000006728)	swi5 (ENSSGRG00000006727)	slc27a4 (ENSSGRG00000006007)	ptgdsa (ENSSGRG00000005981)
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	203	ENSSGRG00000010611	fstb (ENSSGRG00000010613)	ARL15 (ENSSGRG00000010622)	snx18b (ENSSGRG00000010623)	ENSSGRG00000010624	rasgef1bb (ENSSGRG00000010625)	ENSSGRG00000011231	antxr2b (ENSSGRG00000011233)	paqr3b (ENSSGRG00000011240)	anxa3b (ENSSGRG00000011254)	mrrf (ENSSGRG00000011357)	rbm18 (ENSSGRG00000011358)	lhx6a (ENSSGRG00000011359)	morn5 (ENSSGRG00000011360)	ndufa8 (ENSSGRG00000011361)	si:ch211-243g18.2 (ENSSGRG00000011363) #22	ENSSGRG00000011364	RABGAP1 (ENSSGRG00000011367)	GPR21 (ENSSGRG00000011571)	STRBP (ENSSGRG00000011572)	ENSSGRG00000011574	ENSSGRG00000011575	urm1 (ENSSGRG00000011576)	CERCAM (ENSSGRG00000011579)	sardh (ENSSGRG00000012104)	dbh (ENSSGRG00000012220)	FAM163B (ENSSGRG00000012223)	swi5 (ENSSGRG00000012225)	slc27a4 (ENSSGRG00000012227)	ambp (ENSSGRG00000012282)	nrarpa (ENSSGRG00000012283)
Cyprininae	DUPLICATION
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	100	ENSGT00940000156244.a.b.a	ENSGT00940000157724.a.b.e.a	ENSGT00940000154091.a.a.s.b.c	ENSGT00940000155816.a.a	ENSGT00890000139463.b.b.b.o.a	ENSGT00940000156320.d.b	ENSGT00940000155291.b.a	ENSGT00940000159174.e.c	ENSGT00940000177220	ENSGT00390000005084.b	ENSGT00390000013765.k.a	ENSGT00940000156868.g.a	ENSGT00390000018089.e	ENSGT00940000172900	ENSGT00390000008938.d	ENSGT00950000182969.A.a.b.b.a #22	ENSGT00940000157685.k	ENSGT00940000157216.l
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	189		ENSGT00940000156244.a.b.a	ENSGT00940000157724.a.b.e.a	ENSGT00940000154091.a.a.s.b.c	ENSGT00940000155816.a.a	ENSGT00890000139463.b.b.b.o.a	ENSGT00940000156320.d.b	ENSGT00940000155291.b.a	ENSGT00940000159174.e.c	ENSGT00940000177220	ENSGT00390000005084.b	ENSGT00390000013765.k.a	ENSGT00940000156868.g.a	ENSGT00390000018089.e	ENSGT00390000008938.d	ENSGT00950000182969.A.a.b.b.a #22	ENSGT00940000157685.k	ENSGT00940000157216.k.a.a	ENSGT00940000154687.B.q.a.e	ENSGT00940000154130.a.b.e.j	ENSGT00390000005101.a	ENSGT01030000234558.D.a.a	ENSGT00940000157589.a	ENSGT00530000063085.B.f	ENSGT00940000159387.f.b	ENSGT00390000009349.a.b	ENSGT00940000158646.b	ENSGT01100000263580.mb.a.a	ENSGT00940000160109.b	ENSGT00390000006843.c	ENSGT00390000013443.d.a
Common carp reference	MODERN SPECIES	24	MOCS2 (ENSCCRG00000007250)	fstb (ENSCCRG00000007244)	ARL15 (ENSCCRG00000031650)	snx18b (ENSCCRG00000078391)	ENSCCRG00000025511	rasgef1bb (ENSCCRG00000025409)	ENSCCRG00000076501	antxr2b (ENSCCRG00000025327)	paqr3b (ENSCCRG00000036762)	anxa3b (ENSCCRG00000047750)	rbm18 (ENSCCRG00000053603)	mrrf (ENSCCRG00000070375)	morn5 (ENSCCRG00000064990)	lhx6a (ENSCCRG00000016275)	ndufa8 (ENSCCRG00000050757)	si:ch211-243g18.2 (ENSCCRG00000050750) #22	ENSCCRG00000078059	ENSCCRG00000050691	ENSCCRG00000002405	ENSCCRG00000015963	urm1 (ENSCCRG00000034842)	ENSCCRG00000015955	sardh (ENSCCRG00000011071)	dbh (ENSCCRG00000011055)	FAM163B (ENSCCRG00000060257)	ENSCCRG00000068012	slc27a4 (ENSCCRG00000068930)	ptgdsa (ENSCCRG00000040812)	ambp (ENSCCRG00000009879)	ENSCCRG00000009805	cdc37l1 (ENSCCRG00000009870)
Goldfish	MODERN SPECIES	1	ndufa8 (ENSCARG00000019646)	morn5 (ENSCARG00000019660)	lhx6a (ENSCARG00000019675)	rbm18 (ENSCARG00000019693)	mrrf (ENSCARG00000019699)	anxa3b (ENSCARG00000019724)	paqr3b (ENSCARG00000019903)	antxr2b (ENSCARG00000019926)	ENSCARG00000020221	rasgef1bb (ENSCARG00000020248)	ENSCARG00000020454	snx18b (ENSCARG00000020460)	ARL15 (ENSCARG00000020467)	ENSCARG00000020479	ndufa8 (ENSCARG00000020484)	si:ch211-243g18.2 (ENSCARG00000020512) #22	ENSCARG00000020524	RABGAP1 (ENSCARG00000020595)	GNAZ (ENSCARG00000001740)	rab36 (ENSCARG00000001745)	DEPDC5 (ENSCARG00000001994)	ywhah (ENSCARG00000004776)	slc5a1 (ENSCARG00000004816)	slc5a1 (ENSCARG00000005191)	RNF208 (ENSCARG00000005254)	fam166b (ENSCARG00000005258)	ENSCARG00000005262	ENSCARG00000005295	UNC13B (ENSCARG00000005673)	stoml2 (ENSCARG00000005817)	pcyox1 (ENSCARG00000005876)
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	153	ENSGT00940000157072.a.b	ENSGT00940000156244.a.b.b	ENSGT00940000157724.a.b.e.b	ENSGT00940000157724.a.b.f	ENSGT00940000154091.a.a.s.b.d	ENSGT00940000155816.a.b	ENSGT00890000139463.b.b.b.o.b	ENSGT00940000156320.d.a	ENSGT00940000155291.b.b	ENSGT00940000159174.e.d	ENSGT00390000005084.a	ENSGT00390000013765.k.b	ENSGT00940000156868.g.b	ENSGT00390000018089.f	ENSGT00390000008938.c	ENSGT00950000182969.A.a.b.b.b #22	ENSGT00940000157685.l	ENSGT00940000157216.k.b	ENSGT00940000163543.b	ENSGT00940000157216.k.a.b	ENSGT00940000154687.B.q.a.f	ENSGT00940000154130.a.b.e.i	ENSGT00390000005101.b	ENSGT01030000234558.D.a.b	ENSGT00940000157589.b	ENSGT00530000063085.B.e	ENSGT00940000159387.f.a	ENSGT00390000009349.a.a	ENSGT00940000158646.a	ENSGT01100000263580.mb.a.b	ENSGT00940000160109.a
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	51	ENSGT00940000157072.a.b	ENSGT00940000156244.a.b.b	ENSGT00940000157724.a.b.e.b	ENSGT00940000157724.a.b.f	ENSGT00940000154091.a.a.s.b.d	ENSGT00940000155816.a.b	ENSGT00890000139463.b.b.b.o.b	ENSGT00940000156320.d.a	ENSGT00940000155291.b.b	ENSGT00940000159174.e.d	ENSGT00390000005084.a	ENSGT00390000013765.k.b	ENSGT00940000156868.g.b	ENSGT00390000018089.f	ENSGT00390000008938.c	ENSGT00950000182969.A.a.b.b.b #22	ENSGT00940000157685.l	ENSGT00940000157216.k.b	ENSGT00940000163543.b	ENSGT00940000157216.k.a.b	ENSGT00940000154687.B.q.a.f	ENSGT00940000154130.a.b.e.i	ENSGT00390000005101.b	ENSGT01030000234558.D.a.b	ENSGT00940000157589.b	ENSGT00530000063085.B.e	ENSGT00940000159387.f.a	ENSGT00390000009349.a.a	ENSGT00940000158646.a	ENSGT01100000263580.mb.a.b	ENSGT00940000160109.a
Common carp reference	MODERN SPECIES	32	ITGA2 (ENSCCRG00000028652)	ITGA2 (ENSCCRG00000007253)	MOCS2 (ENSCCRG00000072415)	fstb (ENSCCRG00000012070)	ARL15 (ENSCCRG00000025524)	snx18b (ENSCCRG00000070870)	rasgef1bb (ENSCCRG00000035322)	antxr2b (ENSCCRG00000035873)	PAQR3 (ENSCCRG00000025307)	anxa3b (ENSCCRG00000024744)	mrrf (ENSCCRG00000081674)	rbm18 (ENSCCRG00000035070)	lhx6a (ENSCCRG00000050759)	morn5 (ENSCCRG00000050758)	ndufa8 (ENSCCRG00000016898)	si:ch211-243g18.2 (ENSCCRG00000059036) #22	ENSCCRG00000050744	ENSCCRG00000079785	ENSCCRG00000002230	ENSCCRG00000034854	urm1 (ENSCCRG00000015958)	ENSCCRG00000034798	sardh (ENSCCRG00000034793)	dbh (ENSCCRG00000052624)	FAM163B (ENSCCRG00000052622)	slc27a4 (ENSCCRG00000028723)	ptgdsa (ENSCCRG00000070426)	ambp (ENSCCRG00000040818)	nrarpa (ENSCCRG00000074114)	ENSCCRG00000074778	ENSCCRG00000055117
Goldfish	MODERN SPECIES	28	ITGA2 (ENSCARG00000028260)	ENSCARG00000028237	ITGA2 (ENSCARG00000027965)	fstb (ENSCARG00000027948)	ARL15 (ENSCARG00000027928)	snx18b (ENSCARG00000027915)	rasgef1bb (ENSCARG00000027816)	antxr2b (ENSCARG00000025230)	PAQR3 (ENSCARG00000025031)	ENSCARG00000025020	mrrf (ENSCARG00000025014)	rbm18 (ENSCARG00000025001)	lhx6a (ENSCARG00000024961)	morn5 (ENSCARG00000024945)	ndufa8 (ENSCARG00000024925)	si:ch211-243g18.2 (ENSCARG00000024907) #22	ENSCARG00000024862	GPR21 (ENSCARG00000024842)	RABGAP1 (ENSCARG00000024440)	STRBP (ENSCARG00000024150)	SH2D3C (ENSCARG00000024087)	urm1 (ENSCARG00000024063)	CERCAM (ENSCARG00000023968)	ENSCARG00000023962	FAM163B (ENSCARG00000023959)	dbh (ENSCARG00000023937)	swi5 (ENSCARG00000023934)	slc27a4 (ENSCARG00000021856)	ptgdsa (ENSCARG00000021756)	ambp (ENSCARG00000021719)	nrarpa (ENSCARG00000021710)
Zebrafish	MODERN SPECIES	1	fstb (ENSDARG00000057992)	ARL15 (ENSDARG00000057995)	snx18b (ENSDARG00000044246)	ENSDARG00000075600	rasgef1bb (ENSDARG00000044251)	ENSDARG00000092269	antxr2b (ENSDARG00000063011)	paqr3b (ENSDARG00000044253)	anxa3b (ENSDARG00000044254)	ENSDARG00000093531	mrrf (ENSDARG00000034174)	rbm18 (ENSDARG00000044255)	lhx6a (ENSDARG00000006896)	morn5 (ENSDARG00000033610)	ndufa8 (ENSDARG00000058041)	si:ch211-243g18.2 (ENSDARG00000044261) #22	ENSDARG00000063050	RABGAP1 (ENSDARG00000098967)	STRBP (ENSDARG00000021455)	SH2D3C (ENSDARG00000028099)	urm1 (ENSDARG00000091198)	CERCAM (ENSDARG00000079049)	sardh (ENSDARG00000058102)	dbh (ENSDARG00000069446)	FAM163B (ENSDARG00000073914)	swi5 (ENSDARG00000078492)	slc27a4 (ENSDARG00000017047)	ptgdsa (ENSDARG00000069439)	ambp (ENSDARG00000004296)	nrarpa (ENSDARG00000091419)	ENSDARG00000063140
Clupeiformes	ANCESTRAL SPECIES	204	ENSGT00530000066485	ENSGT00940000157072.a	ENSGT00940000156244.a.b	ENSGT00940000157724.a.b	ENSGT00940000154091.a.a.s.b	ENSGT00940000155816.a	ENSGT00940000156320.d	ENSGT00940000155291.b	ENSGT00940000159174.e	ENSGT00940000177220	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000013765	ENSGT00940000156868.g	ENSGT00390000018089	ENSGT00390000008938	ENSGT00950000182969.A.a.b #22
Denticle herring	MODERN SPECIES	13	ENSDCDG00000030146	fstb (ENSDCDG00000030145)	ARL15 (ENSDCDG00000030142)	snx18b (ENSDCDG00000030137)	ENSDCDG00000030132	rasgef1bb (ENSDCDG00000030082)	antxr2b (ENSDCDG00000030072)	paqr3b (ENSDCDG00000030066)	anxa3b (ENSDCDG00000029887)	ENSDCDG00000029864	mrrf (ENSDCDG00000029862)	rbm18 (ENSDCDG00000029860)	lhx6a (ENSDCDG00000029857)	morn5 (ENSDCDG00000029855)	ndufa8 (ENSDCDG00000029853)	si:ch211-243g18.2 (ENSDCDG00000029848) #22	hnrnpd (ENSDCDG00000029845)	si:ch73-234b20.5 (ENSDCDG00000029843)	mat2al (ENSDCDG00000029764)	ubxn8 (ENSDCDG00000029755)	ppp2cb (ENSDCDG00000029752)	ENSDCDG00000029749	PURG (ENSDCDG00000029747)	WRN (ENSDCDG00000029742)	nrg1 (ENSDCDG00000029736)	fut10 (ENSDCDG00000029733)	ENSDCDG00000028200	ENSDCDG00000028172	slc38a9 (ENSDCDG00000028127)	ddx4 (ENSDCDG00000028102)	ENSDCDG00000028086
Euteleosteomorpha	ANCESTRAL SPECIES	27				ENSGT00940000157724.a.b	ENSGT00940000154091.a.a.s.b	ENSGT00940000155816.a	ENSGT00940000156320.d	ENSGT00940000155291.b	ENSGT00940000159174.e	ENSGT00390000005084	ENSGT00940000177220	ENSGT00390000013765	ENSGT00940000156868.g	ENSGT00390000018089	ENSGT00390000008938	ENSGT00950000182969.A.a.b #22	ENSGT00940000157920.b	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543.b	ENSGT00940000154687.B.q.a	ENSGT00940000154130.a.b.e	ENSGT00390000005101	ENSGT01030000234558.D.a	ENSGT00940000157589	ENSGT00940000166736	ENSGT00530000063085.B	ENSGT00940000159387.f	ENSGT00390000009349	ENSGT00940000158646	ENSGT01100000263580
Acanthomorphata	ANCESTRAL SPECIES	33	ENSGT00940000154687.B.q.a	ENSGT00940000163543.b	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000157920.b	ENSGT00940000155640.b	ENSGT00940000154396.a	ENSGT00390000000375	ENSGT00940000161373	ENSGT00390000005084	ENSGT00940000177220	ENSGT00390000013765	ENSGT00940000156868.g	ENSGT00390000018089	ENSGT00390000008938	ENSGT00950000182969.A.a.b #22	ENSGT00510000047107.B.c	ENSGT00940000156471.a	ENSGT00390000005102	ENSGT00530000063460.A.b	ENSGT00940000173711	ENSGT00940000166240	ENSGT00390000004624.a.a	ENSGT00940000158907.c	ENSGT00940000157400	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT01000000214704	ENSGT00900000141033.b.a	ENSGT00940000154822.b	ENSGT00680000100126	ENSGT00940000155844
Euacanthomorphacea	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000154687.B.q.a	ENSGT00940000163543.b	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000157920.b	ENSGT00940000155640.b	ENSGT00940000154396.a	ENSGT00390000000375	ENSGT00940000161373	ENSGT00390000005084	ENSGT00940000177220	ENSGT00390000013765	ENSGT00940000156868.g	ENSGT00390000018089	ENSGT00390000008938	ENSGT00950000182969.A.a.b #22	ENSGT00510000047107.B.c	ENSGT00940000156471.a	ENSGT00390000005102	ENSGT00530000063460.A.b	ENSGT00940000173711	ENSGT00940000166240	ENSGT00390000004624.a.a	ENSGT00940000158907.c	ENSGT00940000157400	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT01000000214704	ENSGT00900000141033.b.a	ENSGT00940000154822.b	ENSGT00680000100126	ENSGT00940000155844
Pinecone sodierfish	MODERN SPECIES	3	sppl3 (ENSMMDG00005021746)	GNAZ (ENSMMDG00005021767)	slc5a1 (ENSMMDG00005021772)	RNF208 (ENSMMDG00005021778)	fam166b (ENSMMDG00005021779)	ENSMMDG00005021780	ENSMMDG00005021782	SCARB2 (ENSMMDG00005021790)	rai14 (ENSMMDG00005021978)	mrrf (ENSMMDG00005022044)	ENSMMDG00005022047	rbm18 (ENSMMDG00005022052)	lhx6a (ENSMMDG00005022057)	morn5 (ENSMMDG00005022065)	ndufa8 (ENSMMDG00005022072)	si:ch211-243g18.2 (ENSMMDG00005022079) #22	rbp4l (ENSMMDG00005022080)	PDE6B (ENSMMDG00005022082)	atp5mea (ENSMMDG00005022088)	ENSMMDG00005022089	ENSMMDG00005022092	nnt (ENSMMDG00005022133)	fgf10a (ENSMMDG00005022910)	MAP1B (ENSMMDG00005022923)	ptcd2 (ENSMMDG00005022925)	CACFD1 (ENSMMDG00005022929)	garnl3 (ENSMMDG00005022950)	ptges (ENSMMDG00005023143)	usp20 (ENSMMDG00005023168)	RPL7A (ENSMMDG00005023578)	ENSMMDG00005023585
Percomorphaceae	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000154687.B.q.a	ENSGT00940000163543.b	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000157920.b	ENSGT00940000155640.b	ENSGT00940000154396.a	ENSGT00390000000375	ENSGT00940000161373	ENSGT00390000005084	ENSGT00940000177220	ENSGT00390000013765	ENSGT00940000156868.g	ENSGT00390000018089	ENSGT00390000008938	ENSGT00950000182969.A.a.b #22	ENSGT00510000047107.B.c	ENSGT00940000156471.a	ENSGT00390000005102	ENSGT00530000063460.A.b	ENSGT00940000173711	ENSGT00940000166240	ENSGT00390000004624.a.a	ENSGT00940000158907.c	ENSGT00940000157400	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT01000000214704	ENSGT00900000141033.b.a	ENSGT00940000154822.b	ENSGT00680000100126	ENSGT00940000155844
Tiger tail seahorse	MODERN SPECIES	199	SH2D3C (ENSHCOG00000002884)	STRBP (ENSHCOG00000002930)	GPR21 (ENSHCOG00000000085)	RABGAP1 (ENSHCOG00000002980)	RC3H2 (ENSHCOG00000003006)	jak2a (ENSHCOG00000003063)	ENSHCOG00000003073	plgrkt (ENSHCOG00000003081)	ENSHCOG00000003090	ENSHCOG00000003104	mrrf (ENSHCOG00000003122)	rbm18 (ENSHCOG00000003148)	lhx6a (ENSHCOG00000003159)	morn5 (ENSHCOG00000003172)	ndufa8 (ENSHCOG00000003188)	si:ch211-243g18.2 (ENSHCOG00000003199) #22	rbp4l (ENSHCOG00000003205)	PDE6B (ENSHCOG00000003238)	atp5mea (ENSHCOG00000003255)	ENSHCOG00000003276	ENSHCOG00000003292	nnt (ENSHCOG00000003341)	fgf10a (ENSHCOG00000003348)	rai14 (ENSHCOG00000003361)	SCARB2 (ENSHCOG00000003374)	ENSHCOG00000003379	ENSHCOG00000003385	ENSHCOG00000003401	RNF208 (ENSHCOG00000003412)	slc5a1 (ENSHCOG00000003444)	GNAZ (ENSHCOG00000003455)
Percomorphaceae_B	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000154687.B.q.a	ENSGT00940000163543.b	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000157920.b	ENSGT00940000155640.b	ENSGT00940000154396.a	ENSGT00390000000375	ENSGT00940000161373	ENSGT00940000177220	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000013765	ENSGT00940000156868.g	ENSGT00390000018089	ENSGT00390000008938	ENSGT00950000182969.A.a.b #22	ENSGT00510000047107.B.c	ENSGT00940000156471.a	ENSGT00390000005102	ENSGT00530000063460.A.b	ENSGT00940000173711	ENSGT00940000166240	ENSGT00390000004624.a.a	ENSGT00940000158907.c	ENSGT00940000157400	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT01000000214704	ENSGT00940000171384	ENSGT00900000141033.b.a	ENSGT00940000154822.b	ENSGT00680000100126
Ovalentaria	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000154687.B.q.a	ENSGT00940000163543.b	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000157920.b	ENSGT00940000155640.b	ENSGT00940000154396.a	ENSGT00390000000375	ENSGT00940000161373	ENSGT00940000177220	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000013765	ENSGT00940000156868.g	ENSGT00390000018089	ENSGT00390000008938	ENSGT00950000182969.A.a.b #22	ENSGT00510000047107.B.c	ENSGT00940000156471.a	ENSGT00390000005102	ENSGT00530000063460.A.b	ENSGT00940000173711	ENSGT00940000166240	ENSGT00390000004624.a.a	ENSGT00940000158907.c	ENSGT00940000157400	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT01000000214704	ENSGT00940000171384	ENSGT00900000141033.b.a	ENSGT00940000166013	ENSGT00680000100126
Atherinomorphae	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000154687.B.q.a	ENSGT00940000163543.b	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000157920.b	ENSGT00940000155640.b	ENSGT00940000154396.a	ENSGT00390000000375	ENSGT00940000161373	ENSGT00940000177220	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000013765	ENSGT00940000156868.g	ENSGT00390000018089	ENSGT00390000008938	ENSGT00950000182969.A.a.b #22	ENSGT00510000047107.B.c	ENSGT00940000156471.a	ENSGT00390000005102	ENSGT00530000063460.A.b	ENSGT00940000166240	ENSGT00390000004624.a.a	ENSGT00940000158907.c	ENSGT00940000157400	ENSGT00960000187050	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT01000000214704	ENSGT00940000171384	ENSGT00900000141033.b.a	ENSGT00940000166013	ENSGT00680000100126
Cyprinodontiformes	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000154687.B.q.a	ENSGT00940000163543.b	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000157920.b	ENSGT00940000155640.b	ENSGT00940000154396.a	ENSGT00390000000375	ENSGT00940000161373	ENSGT00940000177220	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000013765	ENSGT00940000156868.g	ENSGT00390000018089	ENSGT00390000008938	ENSGT00950000182969.A.a.b #22	ENSGT00510000047107.B.c	ENSGT00940000156471.a	ENSGT00390000005102	ENSGT00530000063460.A.b	ENSGT00940000166240	ENSGT00390000004624.a.a	ENSGT00940000158907.c	ENSGT00940000157400	ENSGT00960000187050	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT01000000214704	ENSGT00940000171384	ENSGT00900000141033.b.a	ENSGT00940000166013	ENSGT00680000100126
Aplocheiloidei	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000154130.a.b.e	ENSGT00940000154687.B.q.a	ENSGT00940000163543.b	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000157920.b	ENSGT00940000155640.b	ENSGT00940000154396.a	ENSGT00390000000375	ENSGT00940000161373	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000013765	ENSGT00940000156868.g	ENSGT00390000018089	ENSGT00390000008938	ENSGT00950000182969.A.a.b #22	ENSGT00510000047107.B.c	ENSGT00940000156471.a	ENSGT00390000005102	ENSGT00530000063460.A.b	ENSGT00940000166240	ENSGT00390000004624.a.a	ENSGT00940000158907.c	ENSGT00940000157400	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT01000000214704	ENSGT00940000171384	ENSGT00900000141033.b.a	ENSGT00680000100126	ENSGT00940000155844	ENSGT00940000160353
Mangrove rivulus	MODERN SPECIES	16	SH2D3C (ENSKMAG00000011360)	STRBP (ENSKMAG00000011192)	GPR21 (ENSKMAG00000011148)	RABGAP1 (ENSKMAG00000011024)	ENSKMAG00000010936	ENSKMAG00000010912	jak2a (ENSKMAG00000010807)	ENSKMAG00000010772	plgrkt (ENSKMAG00000010745)	ENSKMAG00000010718	mrrf (ENSKMAG00000010695)	rbm18 (ENSKMAG00000010679)	lhx6a (ENSKMAG00000010657)	morn5 (ENSKMAG00000010642)	ndufa8 (ENSKMAG00000010616)	si:ch211-243g18.2 (ENSKMAG00000010576) #22	rbp4l (ENSKMAG00000010541)	PDE6B (ENSKMAG00000010467)	ENSKMAG00000010444	ENSKMAG00000010437	ENSKMAG00000010420	ENSKMAG00000010388	nnt (ENSKMAG00000010311)	fgf10a (ENSKMAG00000010292)	rai14 (ENSKMAG00000010241)	ENSKMAG00000010217	ENSKMAG00000010207	ENSKMAG00000010196	RNF208 (ENSKMAG00000010180)	slc5a1 (ENSKMAG00000010111)	GNAZ (ENSKMAG00000010081)
Turquoise killifish	MODERN SPECIES	1611	RABGAP1 (ENSNFUG00015024865)	ENSNFUG00015024931	RC3H2 (ENSNFUG00015024934)	ENSNFUG00015024936	jak2a (ENSNFUG00015025014)	RLN1 (ENSNFUG00015025178)	ENSNFUG00015025180	ENSNFUG00015025181	ENSNFUG00015025182	ENSNFUG00015025183	mrrf (ENSNFUG00015025184)	rbm18 (ENSNFUG00015025185)	LHX6 (ENSNFUG00015025187)	morn5 (ENSNFUG00015025188)	NDUFA8 (ENSNFUG00015025189)	si:ch211-243g18.2 (ENSNFUG00015025193) #22	Nfu_g_1_006592 (ENSNFUG00015025196)	PDE6B (ENSNFUG00015009126)	atp5mea (ENSNFUG00015010172)	ENSNFUG00015010189	CCDC80L2 (ENSNFUG00015010207)	nnt (ENSNFUG00015010350)	ENSNFUG00015011981	fgf10a (ENSNFUG00015011985)	RAI14 (ENSNFUG00015011997)	SCARB2 (ENSNFUG00015012026)	ENSNFUG00015012045	ENSNFUG00015012057	ENSNFUG00015012059	RNF208 (ENSNFUG00015012062)	slc5a1 (ENSNFUG00015012193)
Cyprinodontoidei	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000154687.B.q.a	ENSGT00940000163543.b	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000157920.b	ENSGT00940000155640.b	ENSGT00940000154396.a	ENSGT00390000000375	ENSGT00940000161373	ENSGT00940000177220	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000013765	ENSGT00940000156868.g	ENSGT00390000018089	ENSGT00390000008938	ENSGT00950000182969.A.a.b #22	ENSGT00510000047107.B.c	ENSGT00940000156471.a	ENSGT00390000005102	ENSGT00530000063460.A.b	ENSGT00940000166240	ENSGT00390000004624.a.a	ENSGT00940000158907.c	ENSGT00940000157400	ENSGT00960000187050	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT01000000214704	ENSGT00940000171384	ENSGT00900000141033.b.a	ENSGT00940000166013	ENSGT00680000100126
NAME_4	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000154687.B.q.a	ENSGT00940000163543.b	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000157920.b	ENSGT00940000155640.b	ENSGT00940000154396.a	ENSGT00390000000375	ENSGT00940000161373	ENSGT00940000177220	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000013765	ENSGT00940000156868.g	ENSGT00390000018089	ENSGT00390000008938	ENSGT00950000182969.A.a.b #22	ENSGT00510000047107.B.c	ENSGT00940000156471.a	ENSGT00390000005102	ENSGT00530000063460.A.b	ENSGT00940000166240	ENSGT00390000004624.a.a	ENSGT00940000158907.c	ENSGT00940000157400	ENSGT00960000187050	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT01000000214704	ENSGT00900000141033.b.a	ENSGT00680000100126	ENSGT00940000155844.c	ENSGT00940000155844.d.b
Mummichog	MODERN SPECIES	2365																si:ch211-243g18.2 (ENSFHEG00000021937) #22	rbp4l (ENSFHEG00000021953)	PDE6B (ENSFHEG00000022023)	atp5mea (ENSFHEG00000022049)	ENSFHEG00000022076	ENSFHEG00000022093	nnt (ENSFHEG00000022181)	fgf10a (ENSFHEG00000022199)	rai14 (ENSFHEG00000022228)	SCARB2 (ENSFHEG00000022240)	ENSFHEG00000022267	ENSFHEG00000022278	RNF208 (ENSFHEG00000022295)	slc5a1 (ENSFHEG00000022368)	slc5a1 (ENSFHEG00000022416)	GNAZ (ENSFHEG00000022430)
Sheepshead minnow	MODERN SPECIES	339	STRBP (ENSCVAG00000011985)	GPR21 (ENSCVAG00000012010)	RABGAP1 (ENSCVAG00000012167)	ENSCVAG00000012202	ENSCVAG00000012217	jak2a (ENSCVAG00000012367)	ENSCVAG00000012225	plgrkt (ENSCVAG00000012390)	ENSCVAG00000012397	ENSCVAG00000012417	mrrf (ENSCVAG00000012428)	rbm18 (ENSCVAG00000012436)	lhx6a (ENSCVAG00000012474)	morn5 (ENSCVAG00000012492)	ndufa8 (ENSCVAG00000012512)	si:ch211-243g18.2 (ENSCVAG00000012536) #22	rbp4l (ENSCVAG00000012551)
Poeciliinae	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000154687.B.q.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543.b	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000157920.b	ENSGT00940000155640.b	ENSGT00940000154396.a	ENSGT00390000000375	ENSGT00940000161373	ENSGT00940000177220	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000013765	ENSGT00940000156868.g	ENSGT00390000018089	ENSGT00390000008938	ENSGT00950000182969.A.a.b #22	ENSGT00510000047107.B.c	ENSGT00940000156471.a	ENSGT00390000005102	ENSGT00530000063460.A.b	ENSGT00940000166240	ENSGT00390000004624.a.a	ENSGT00940000158907.c	ENSGT00940000157400	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT01000000214704	ENSGT00940000171384	ENSGT00900000141033.b.a	ENSGT00940000166013	ENSGT00680000100126	ENSGT00940000155844.c
Poecilia	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000154687.B.q.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543.b	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000157920.b	ENSGT00940000155640.b	ENSGT00940000154396.a	ENSGT00390000000375	ENSGT00940000161373	ENSGT00940000177220	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000013765	ENSGT00940000156868.g	ENSGT00390000018089	ENSGT00390000008938	ENSGT00950000182969.A.a.b #22	ENSGT00510000047107.B.c	ENSGT00940000156471.a	ENSGT00390000005102	ENSGT00530000063460.A.b	ENSGT00940000166240	ENSGT00390000004624.a.a	ENSGT00940000158907.c	ENSGT00940000157400	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT01000000214704	ENSGT00940000171384	ENSGT00900000141033.b.a	ENSGT00940000166013	ENSGT00680000100126	ENSGT00940000155844.c.a.a
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Amazon molly	MODERN SPECIES	258	SH2D3C (ENSPFOG00000019695)	STRBP (ENSPFOG00000019696)	RABGAP1 (ENSPFOG00000019697)	GPR21 (ENSPFOG00000019698)	ENSPFOG00000019699	ENSPFOG00000019700	jak2a (ENSPFOG00000019701)	ENSPFOG00000019702	plgrkt (ENSPFOG00000019703)	ENSPFOG00000019704	mrrf (ENSPFOG00000019705)	rbm18 (ENSPFOG00000019706)	lhx6a (ENSPFOG00000019707)	morn5 (ENSPFOG00000019708)	ndufa8 (ENSPFOG00000019709)	si:ch211-243g18.2 (ENSPFOG00000021672) #22	rbp4l (ENSPFOG00000019710)	PDE6B (ENSPFOG00000019711)	ENSPFOG00000019713	ENSPFOG00000019714	nnt (ENSPFOG00000019715)	fgf10a (ENSPFOG00000019716)	rai14 (ENSPFOG00000019717)	ENSPFOG00000019718	ENSPFOG00000023372	ENSPFOG00000022106	RNF208 (ENSPFOG00000019946)	slc5a1 (ENSPFOG00000019719)	slc5a1 (ENSPFOG00000022361)	slc5a1 (ENSPFOG00000019720)	GNAZ (ENSPFOG00000019721)
Sailfin molly	MODERN SPECIES	190			ENSPLAG00000000118	ENSPLAG00000005819	RC3H2 (ENSPLAG00000005799)	ENSPLAG00000005721	jak2a (ENSPLAG00000005705)	ENSPLAG00000005645	plgrkt (ENSPLAG00000000756)	ENSPLAG00000005606	mrrf (ENSPLAG00000005592)	rbm18 (ENSPLAG00000005571)	lhx6a (ENSPLAG00000005560)	morn5 (ENSPLAG00000005545)	ndufa8 (ENSPLAG00000005524)	si:ch211-243g18.2 (ENSPLAG00000005498) #22	rbp4l (ENSPLAG00000005472)	PDE6B (ENSPLAG00000005419)	atp5mea (ENSPLAG00000005372)	ENSPLAG00000005360	ENSPLAG00000000099	nnt (ENSPLAG00000005329)	fgf10a (ENSPLAG00000005267)
Guppy	MODERN SPECIES	442	RABGAP1 (ENSPREG00000008819)	GPR21 (ENSPREG00000008933)	ENSPREG00000008947	RC3H2 (ENSPREG00000008979)	ENSPREG00000009012	jak2a (ENSPREG00000009040)	rln1 (ENSPREG00000009095)	plgrkt (ENSPREG00000009087)	ENSPREG00000009109	ENSPREG00000009120	mrrf (ENSPREG00000009134)	rbm18 (ENSPREG00000009157)	lhx6a (ENSPREG00000009198)	morn5 (ENSPREG00000009221)	ndufa8 (ENSPREG00000009243)	si:ch211-243g18.2 (ENSPREG00000009265) #22	rbp4l (ENSPREG00000009283)	PDE6B (ENSPREG00000009300)	atp5mea (ENSPREG00000009362)	ENSPREG00000009378	ENSPREG00000009450	nnt (ENSPREG00000009508)	fgf10a (ENSPREG00000009587)	rai14 (ENSPREG00000009607)	ENSPREG00000009635	ENSPREG00000009644	ENSPREG00000009652	ENSPREG00000009660	ENSPREG00000009672	RNF208 (ENSPREG00000009678)	slc5a1 (ENSPREG00000009698)
Platyfish	MODERN SPECIES	22	ENSXMAG00000021536	ENSXMAG00000026567	ENSXMAG00000019949	PHF24 (ENSXMAG00000026879)	ENSXMAG00000024102	ENSXMAG00000003457	jak2a (ENSXMAG00000003465)	ENSXMAG00000025293	plgrkt (ENSXMAG00000003524)	ENSXMAG00000003530	mrrf (ENSXMAG00000023463)	rbm18 (ENSXMAG00000003538)	lhx6a (ENSXMAG00000003545)	morn5 (ENSXMAG00000029911)	ndufa8 (ENSXMAG00000003556)	si:ch211-243g18.2 (ENSXMAG00000003560) #22	rbp4l (ENSXMAG00000003574)	PDE6B (ENSXMAG00000003582)	atp5mea (ENSXMAG00000003626)	ENSXMAG00000003627	ENSXMAG00000024281	nnt (ENSXMAG00000003631)	fgf10a (ENSXMAG00000023995)	rai14 (ENSXMAG00000003662)	SCARB2 (ENSXMAG00000003673)	ENSXMAG00000028448	ENSXMAG00000003690	ENSXMAG00000003692	RNF208 (ENSXMAG00000022652)	slc5a1 (ENSXMAG00000003695)	slc5a1 (ENSXMAG00000025904)
Oryzias	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000154130.a.b.e	ENSGT00940000154687.B.q.a	ENSGT00940000163543.b	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000157920.b	ENSGT00940000155640.b	ENSGT00940000154396.a	ENSGT00390000000375	ENSGT00940000161373	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000013765	ENSGT00940000156868.g	ENSGT00390000018089	ENSGT00390000008938	ENSGT00950000182969.A.a.b #22	ENSGT00510000047107.B.c	ENSGT00940000156471.a	ENSGT00390000005102	ENSGT00530000063460.A.b	ENSGT00940000166240	ENSGT00390000004624.a.a	ENSGT00940000158907.c	ENSGT00940000157400	ENSGT00960000187050	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT01000000214704	ENSGT00900000141033.b.a	ENSGT00940000166013	ENSGT00680000100126	ENSGT00940000155844.e
Oryzias_b	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000154130.a.b.e	ENSGT00940000154687.B.q.a	ENSGT00940000163543.b	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000157920.b	ENSGT00940000154396.a	ENSGT00940000155640.b	ENSGT00390000000375	ENSGT00940000161373	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000013765	ENSGT00940000156868.g	ENSGT00390000018089	ENSGT00390000008938	ENSGT00950000182969.A.a.b #22	ENSGT00510000047107.B.c	ENSGT00940000156471.a	ENSGT00390000005102	ENSGT00530000063460.A.b	ENSGT00940000166240	ENSGT00390000004624.a.a	ENSGT00940000158907.c	ENSGT00940000157400	ENSGT00960000187050	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT01000000214704	ENSGT00900000141033.b.a	ENSGT00940000166013	ENSGT00680000100126	ENSGT00940000155844.e
Javanese ricefish	MODERN SPECIES	3	SH2D3C (ENSOJAG00000021935)	STRBP (ENSOJAG00000022044)	RABGAP1 (ENSOJAG00000022105)	GPR21 (ENSOJAG00000022340)	RC3H2 (ENSOJAG00000022355)	jak2a (ENSOJAG00000022479)	ENSOJAG00000023089	ENSOJAG00000023092	plgrkt (ENSOJAG00000023098)	ENSOJAG00000023102	mrrf (ENSOJAG00000023109)	rbm18 (ENSOJAG00000001653)	lhx6a (ENSOJAG00000001671)	morn5 (ENSOJAG00000001713)	ndufa8 (ENSOJAG00000001750)	si:ch211-243g18.2 (ENSOJAG00000001774) #22	rbp4l (ENSOJAG00000001788)	PDE6B (ENSOJAG00000001880)	atp5mea (ENSOJAG00000002176)	ENSOJAG00000002185	ENSOJAG00000002207	nnt (ENSOJAG00000002554)	fgf10a (ENSOJAG00000003571)	rai14 (ENSOJAG00000003589)	ENSOJAG00000003638	ENSOJAG00000003733	ENSOJAG00000003746	ENSOJAG00000003768	RNF208 (ENSOJAG00000003779)	slc5a1 (ENSOJAG00000004399)	GNAZ (ENSOJAG00000009136)
Indian medaka	MODERN SPECIES	30	SH2D3C (ENSOMEG00000023311)	GPR21 (ENSOMEG00000023327)	STRBP (ENSOMEG00000023400)	RABGAP1 (ENSOMEG00000023491)	RC3H2 (ENSOMEG00000023540)	ENSOMEG00000023570	rln1 (ENSOMEG00000023578)	jak2a (ENSOMEG00000023623)	plgrkt (ENSOMEG00000001473)	ENSOMEG00000001480	mrrf (ENSOMEG00000001486)	rbm18 (ENSOMEG00000001492)	lhx6a (ENSOMEG00000001499)	morn5 (ENSOMEG00000001503)	ndufa8 (ENSOMEG00000001509)	si:ch211-243g18.2 (ENSOMEG00000001522) #22	rbp4l (ENSOMEG00000001529)	PDE6B (ENSOMEG00000001559)	atp5mea (ENSOMEG00000001536)	ENSOMEG00000001584	ENSOMEG00000001597	nnt (ENSOMEG00000001608)	fgf10a (ENSOMEG00000001612)	rai14 (ENSOMEG00000001617)	ENSOMEG00000001621	ENSOMEG00000001624	ENSOMEG00000001630	ENSOMEG00000001633	RNF208 (ENSOMEG00000001637)	slc5a1 (ENSOMEG00000001640)	slc5a1 (ENSOMEG00000001665)
Oryzias_a	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000154130.a.b.e	ENSGT00940000154687.B.q.a	ENSGT00940000163543.b	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000157920.b	ENSGT00940000155640.b	ENSGT00940000154396.a	ENSGT00390000000375	ENSGT00940000161373	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000013765	ENSGT00940000156868.g	ENSGT00390000018089	ENSGT00390000008938	ENSGT00950000182969.A.a.b #22	ENSGT00510000047107.B.c	ENSGT00940000156471.a	ENSGT00390000005102	ENSGT00530000063460.A.b	ENSGT00940000166240	ENSGT00390000004624.a.a	ENSGT00940000158907.c	ENSGT00940000157400	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT01000000214704	ENSGT00900000141033.b.a	ENSGT00680000100126	ENSGT00940000155844.e	ENSGT00940000155844.f	ENSGT00940000160353
Japanese Medaka HdrR	MODERN SPECIES	3	RABGAP1 (ENSORLG00000010095)	ENSORLG00000010018	ENSORLG00000019255	ENSORLG00000024849	rln1 (ENSORLG00000023074)	jak2a (ENSORLG00000010002)	plgrkt (ENSORLG00000022984)	ENSORLG00000025440	mrrf (ENSORLG00000009966)	rbm18 (ENSORLG00000009962)	lhx6a (ENSORLG00000009953)	ENSORLG00000030169	ENSORLG00000029716	morn5 (ENSORLG00000009943)	ndufa8 (ENSORLG00000009940)	si:ch211-243g18.2 (ENSORLG00000009927) #22	rbp4l (ENSORLG00000009897)	ENSORLG00000009868	atp5mea (ENSORLG00000026970)	ENSORLG00000025096	ENSORLG00000009805	nnt (ENSORLG00000028727)	fgf10a (ENSORLG00000027985)	rai14 (ENSORLG00000009761)	SCARB2 (ENSORLG00000009744)	ENSORLG00000030498	ENSORLG00000026279	RNF208 (ENSORLG00000025306)	slc5a1 (ENSORLG00000009712)	slc5a1 (ENSORLG00000009679)	GNAZ (ENSORLG00000024304)
Chinese medaka	MODERN SPECIES	2251																si:ch211-243g18.2 (ENSOSIG00000012785) #22
Ovalentaria_B	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000154687.B.q.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543.b	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000157920.b	ENSGT00940000155640.b	ENSGT00940000154396.a	ENSGT00390000000375	ENSGT00940000161373	ENSGT00940000177220	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000013765	ENSGT00940000156868.g	ENSGT00390000018089	ENSGT00390000008938	ENSGT00950000182969.A.a.b #22	ENSGT00510000047107.B.c	ENSGT00940000156471.a	ENSGT00390000005102	ENSGT00530000063460.A.b	ENSGT00940000173711	ENSGT00940000166240	ENSGT00390000004624.a.a	ENSGT00940000158907.c	ENSGT00940000157400	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT01000000214704	ENSGT00940000171384	ENSGT00900000141033.b.a	ENSGT00940000154822.b	ENSGT00940000166013
Cichlidae	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000154687.B.q.a	ENSGT00940000163543.b	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000157920.b	ENSGT00940000155640.b	ENSGT00940000154396.a	ENSGT00390000000375	ENSGT00940000161373	ENSGT00940000177220	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000013765	ENSGT00940000156868.g	ENSGT00390000018089	ENSGT00390000008938	ENSGT00950000182969.A.a.b #22	ENSGT00510000047107.B.c	ENSGT00940000156471.a	ENSGT00390000005102	ENSGT00530000063460.A.b	ENSGT00940000166240	ENSGT00390000004624.a.a	ENSGT00940000158907.c	ENSGT00940000157400	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT01000000214704	ENSGT00940000171384	ENSGT00900000141033.b.a	ENSGT00680000100126	ENSGT00940000155844	ENSGT00940000160353
Pseudocrenilabrinae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000162805	ENSGT00940000153892.B	ENSGT00940000158699.q.a	ENSGT00940000156664.c	ENSGT00940000167368	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000164254.a.b	ENSGT00390000000375	ENSGT00940000161373	ENSGT00940000177220	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000013765	ENSGT00940000156868.g	ENSGT00390000018089	ENSGT00390000008938	ENSGT00950000182969.A.a.b #22	ENSGT00510000047107.B.c	ENSGT00940000156471.a	ENSGT00390000005102	ENSGT00530000063460.A.b	ENSGT00940000166240	ENSGT00390000004624.a.a	ENSGT00940000158907.c	ENSGT00940000157400	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT01000000214704	ENSGT00940000171384	ENSGT00900000141033.b.a	ENSGT00680000100126	ENSGT00940000155844.g	ENSGT00940000155844.h.b
Pseudocrenilabrinae_A	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000162805	ENSGT00940000153892.B	ENSGT00940000158699.q.a	ENSGT00940000156664.c	ENSGT00940000167368	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000164254.a.b	ENSGT00390000000375	ENSGT00940000161373	ENSGT00940000177220	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000013765	ENSGT00940000156868.g	ENSGT00390000018089	ENSGT00390000008938	ENSGT00950000182969.A.a.b #22	ENSGT00510000047107.B.c	ENSGT00940000156471.a	ENSGT00390000005102	ENSGT00530000063460.A.b	ENSGT00940000166240	ENSGT00390000004624.a.a	ENSGT00940000158907.c	ENSGT00940000157400	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT01000000214704	ENSGT00940000171384	ENSGT00900000141033.b.a	ENSGT00680000100126	ENSGT00940000155844.g	ENSGT00940000155844.h.a
Haplochromini	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000162805	ENSGT00940000153892.B	ENSGT00940000158699.q.a	ENSGT00940000156664.c	ENSGT00940000167368	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000164254.a.b	ENSGT00390000000375	ENSGT00940000161373	ENSGT00940000177220	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000013765	ENSGT00940000156868.g	ENSGT00390000018089	ENSGT00390000008938	ENSGT00950000182969.A.a.b #22	ENSGT00510000047107.B.c	ENSGT00940000156471.a	ENSGT00390000005102	ENSGT00530000063460.A.b	ENSGT00940000166240	ENSGT00390000004624.a.a	ENSGT00940000158907.c	ENSGT00940000157400	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT01000000214704	ENSGT00900000141033.b.a	ENSGT00680000100126	ENSGT00940000155844.g	ENSGT00940000155844.h.b	ENSGT00940000160353
Haplochromini_A	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000162805	ENSGT00940000153892.B	ENSGT00940000158699.q.a	ENSGT00940000156664.c	ENSGT00940000167368	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000164254.a.b	ENSGT00390000000375	ENSGT00940000161373	ENSGT00940000177220	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000013765	ENSGT00940000156868.g	ENSGT00390000018089	ENSGT00390000008938	ENSGT00950000182969.A.a.b #22	ENSGT00510000047107.B.c	ENSGT00940000156471.a	ENSGT00390000005102	ENSGT00530000063460.A.b	ENSGT00940000166240	ENSGT00390000004624.a.a	ENSGT00940000158907.c	ENSGT00940000157400	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT01000000214704	ENSGT00900000141033.b.a	ENSGT00680000100126	ENSGT00940000155844.g	ENSGT00940000155844.h.a	ENSGT00940000155844.h.b
P. nyererei	MODERN SPECIES	358	HOOK3 (ENSPNYG00000012742)	TRABD2A (ENSPNYG00000012689)	sfswap (ENSPNYG00000012660)	MMP17 (ENSPNYG00000012621)	ULK1 (ENSPNYG00000012585)	si:ch211-222n4.2 (ENSPNYG00000012551)	crkl (ENSPNYG00000012531)	plgrkt (ENSPNYG00000012511)	ENSPNYG00000012489	ENSPNYG00000012472	mrrf (ENSPNYG00000012453)	rbm18 (ENSPNYG00000012421)	lhx6a (ENSPNYG00000012377)	morn5 (ENSPNYG00000012351)	ndufa8 (ENSPNYG00000012324)	si:ch211-243g18.2 (ENSPNYG00000012293) #22	rbp4l (ENSPNYG00000012221)	PDE6B (ENSPNYG00000012148)	atp5mea (ENSPNYG00000012118)	ENSPNYG00000012086	ENSPNYG00000012065	nnt (ENSPNYG00000011982)	fgf10a (ENSPNYG00000011927)	rai14 (ENSPNYG00000011871)	SCARB2 (ENSPNYG00000011757)	ENSPNYG00000011701	ENSPNYG00000011688	RNF208 (ENSPNYG00000011672)	slc5a1 (ENSPNYG00000011648)	slc5a1 (ENSPNYG00000011616)	slc5a1 (ENSPNYG00000011573)
Haplochromini_B	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000162805	ENSGT00940000153892.B	ENSGT00940000158699.q.a	ENSGT00940000156664.c	ENSGT00940000167368	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000164254.a.b	ENSGT00390000000375	ENSGT00940000161373	ENSGT00390000005084	ENSGT00940000177220	ENSGT00390000013765	ENSGT00940000156868.g	ENSGT00390000018089	ENSGT00390000008938	ENSGT00950000182969.A.a.b #22	ENSGT00510000047107.B.c	ENSGT00940000156471.a	ENSGT00390000005102	ENSGT00530000063460.A.b	ENSGT00940000166240	ENSGT00390000004624.a.a	ENSGT00940000158907.c	ENSGT00940000157400	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT01000000214704	ENSGT00900000141033.b.a	ENSGT00680000100126	ENSGT00940000155844.g	ENSGT00940000155844.h.a	ENSGT00940000155844.h.b
Eastern happy	MODERN SPECIES	19	sfswap (ENSACLG00000020159)	MMP17 (ENSACLG00000020149)	ENSACLG00000020106	ULK1 (ENSACLG00000020055)	si:ch211-222n4.2 (ENSACLG00000020031)	crkl (ENSACLG00000020019)	ENSACLG00000019999	plgrkt (ENSACLG00000019947)	ENSACLG00000019922	mrrf (ENSACLG00000019898)	rbm18 (ENSACLG00000019848)	lhx6a (ENSACLG00000019817)	morn5 (ENSACLG00000019763)	ENSACLG00000019761	ndufa8 (ENSACLG00000019730)	si:ch211-243g18.2 (ENSACLG00000019698) #22	rbp4l (ENSACLG00000019682)	PDE6B (ENSACLG00000019586)	atp5mea (ENSACLG00000019652)	ENSACLG00000019555	ENSACLG00000019527	nnt (ENSACLG00000019458)	fgf10a (ENSACLG00000019449)	rai14 (ENSACLG00000019325)	SCARB2 (ENSACLG00000019289)	ENSACLG00000019269	ENSACLG00000019227	RNF208 (ENSACLG00000019214)	slc5a1 (ENSACLG00000019177)	slc5a1 (ENSACLG00000019145)	slc5a1 (ENSACLG00000019123)
Zebra mbuna	MODERN SPECIES	1110	ENSMZEG00005017848	MMP17 (ENSMZEG00005017861)	ULK1 (ENSMZEG00005017870)	si:ch211-222n4.2 (ENSMZEG00005017880)	crkl (ENSMZEG00005017885)	ENSMZEG00005017889	plgrkt (ENSMZEG00005017897)	plgrkt (ENSMZEG00005017901)	ENSMZEG00005017907	mrrf (ENSMZEG00005017909)	ENSMZEG00005017914	rbm18 (ENSMZEG00005017921)	lhx6a (ENSMZEG00005017925)	morn5 (ENSMZEG00005017928)	ndufa8 (ENSMZEG00005017941)	si:ch211-243g18.2 (ENSMZEG00005017949) #22	rbp4l (ENSMZEG00005017957)	PDE6B (ENSMZEG00005017966)	ENSMZEG00005017986	ENSMZEG00005017988	ENSMZEG00005017992	ENSMZEG00005017995	nnt (ENSMZEG00005017999)	fgf10a (ENSMZEG00005018005)	rai14 (ENSMZEG00005018010)	SCARB2 (ENSMZEG00005018020)	ENSMZEG00005018022	ENSMZEG00005018027	RNF208 (ENSMZEG00005018030)	slc5a1 (ENSMZEG00005018037)	slc5a1 (ENSMZEG00005018047)
Burton s mouthbrooder	MODERN SPECIES	592									ENSHBUG00000015046	ENSHBUG00000015068	mrrf (ENSHBUG00000015190)	rbm18 (ENSHBUG00000015237)	lhx6a (ENSHBUG00000015291)	morn5 (ENSHBUG00000015331)	ndufa8 (ENSHBUG00000015355)	si:ch211-243g18.2 (ENSHBUG00000015388) #22	rbp4l (ENSHBUG00000015417)	PDE6B (ENSHBUG00000015549)	atp5mea (ENSHBUG00000015578)	ENSHBUG00000015604	ENSHBUG00000015620	nnt (ENSHBUG00000015702)	fgf10a (ENSHBUG00000015713)	rai14 (ENSHBUG00000015729)	SCARB2 (ENSHBUG00000015825)	ENSHBUG00000015843	ENSHBUG00000015860	ENSHBUG00000015868	RNF208 (ENSHBUG00000015879)	slc5a1 (ENSHBUG00000015965)	GNAZ (ENSHBUG00000015983)
Lyretail cichlid	MODERN SPECIES	304	sfswap (ENSNBRG00000020857)	ENSNBRG00000020868	ENSNBRG00000020880	ULK1 (ENSNBRG00000020898)	si:ch211-222n4.2 (ENSNBRG00000021010)	crkl (ENSNBRG00000021022)	ENSNBRG00000021038	plgrkt (ENSNBRG00000021057)	ENSNBRG00000021079	mrrf (ENSNBRG00000021100)	rbm18 (ENSNBRG00000021128)	lhx6a (ENSNBRG00000021164)	morn5 (ENSNBRG00000021236)	ENSNBRG00000021248	ndufa8 (ENSNBRG00000021260)	si:ch211-243g18.2 (ENSNBRG00000021274) #22	rbp4l (ENSNBRG00000021297)	PDE6B (ENSNBRG00000021327)	atp5mea (ENSNBRG00000021395)	ENSNBRG00000021411	ENSNBRG00000000230	nnt (ENSNBRG00000000237)	fgf10a (ENSNBRG00000000279)	rai14 (ENSNBRG00000000288)	ENSNBRG00000000351	ENSNBRG00000000377	ENSNBRG00000000410	ENSNBRG00000000414	RNF208 (ENSNBRG00000000436)	slc5a1 (ENSNBRG00000000453)	slc5a1 (ENSNBRG00000000513)
Nile tilapia	MODERN SPECIES	19	HOOK3 (ENSONIG00000003763)	TRABD2A (ENSONIG00000003762)	sfswap (ENSONIG00000003757)	MMP17 (ENSONIG00000028766)	ULK1 (ENSONIG00000003736)	si:ch211-222n4.2 (ENSONIG00000031619)	crkl (ENSONIG00000003734)	ENSONIG00000003732	plgrkt (ENSONIG00000003731)	ENSONIG00000003728	mrrf (ENSONIG00000003726)	rbm18 (ENSONIG00000003723)	lhx6 (ENSONIG00000003722)	morn5 (ENSONIG00000035610)	ndufa8 (ENSONIG00000003717)	si:ch211-243g18.2 (ENSONIG00000003709) #22	rbp4l (ENSONIG00000003705)	PDE6B (ENSONIG00000003687)	atp5mea (ENSONIG00000003686)	ENSONIG00000003685	ENSONIG00000027980	nnt (ENSONIG00000003670)	fgf10a (ENSONIG00000003669)	rai14 (ENSONIG00000003664)	SCARB2 (ENSONIG00000003649)	ENSONIG00000032766	ENSONIG00000038756	ENSONIG00000027918	RNF208 (ENSONIG00000039316)	slc5a1 (ENSONIG00000003632)	GNAZ (ENSONIG00000003631)
Midas cichlid	MODERN SPECIES	1039	SH2D3C (ENSACIG00000005325)	STRBP (ENSACIG00000005296)	GPR21 (ENSACIG00000005282)	RABGAP1 (ENSACIG00000005233)	RC3H2 (ENSACIG00000005206)	ENSACIG00000005197	jak2a (ENSACIG00000005134)	ENSACIG00000005119	plgrkt (ENSACIG00000005101)	ENSACIG00000005077	mrrf (ENSACIG00000005017)	rbm18 (ENSACIG00000005001)	lhx6a (ENSACIG00000004983)	morn5 (ENSACIG00000004971)	ndufa8 (ENSACIG00000004963)	si:ch211-243g18.2 (ENSACIG00000004945) #22	rbp4l (ENSACIG00000004936)	PDE6B (ENSACIG00000004888)	atp5mea (ENSACIG00000004870)	ENSACIG00000004833	ENSACIG00000004826	nnt (ENSACIG00000004780)
Pomacentridae	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000154687.B.q.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543.b	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000157920.b	ENSGT00940000155640.b	ENSGT00940000154396.a	ENSGT00390000000375	ENSGT00940000161373	ENSGT00390000005084	ENSGT00940000177220	ENSGT00390000013765	ENSGT00940000156868.g	ENSGT00390000018089	ENSGT00390000008938	ENSGT00950000182969.A.a.b #22	ENSGT00510000047107.B.c	ENSGT00940000156471.a	ENSGT00390000005102	ENSGT00530000063460.A.b	ENSGT00940000173711	ENSGT00940000166240	ENSGT00390000004624.a.a	ENSGT00940000158907.c	ENSGT00940000157400	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT01000000214704	ENSGT00900000141033.b.a	ENSGT00940000154822.b	ENSGT00940000166013	ENSGT00680000100126
Pomacentridae_A	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000154687.B.q.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543.b	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000157920.b	ENSGT00940000155640.b	ENSGT00940000154396.a	ENSGT00390000000375	ENSGT00940000161373	ENSGT00390000005084	ENSGT00940000177220	ENSGT00390000013765	ENSGT00940000156868.g	ENSGT00390000018089	ENSGT00390000008938	ENSGT00950000182969.A.a.b #22	ENSGT00510000047107.B.c	ENSGT00940000156471.a	ENSGT00390000005102	ENSGT00530000063460.A.b	ENSGT00940000173711	ENSGT00940000166240	ENSGT00390000004624.a.a	ENSGT00940000158907.c	ENSGT00940000157400	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT01000000214704	ENSGT00900000141033.b.a	ENSGT00940000154822.b	ENSGT00940000166013	ENSGT00680000100126
Amphiprion	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000154687.B.q.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543.b	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000157920.b	ENSGT00940000155640.b	ENSGT00940000154396.a	ENSGT00390000000375	ENSGT00940000161373	ENSGT00390000005084	ENSGT00940000177220	ENSGT00390000013765	ENSGT00940000156868.g	ENSGT00390000018089	ENSGT00390000008938	ENSGT00950000182969.A.a.b #22	ENSGT00510000047107.B.c	ENSGT00940000156471.a	ENSGT00390000005102	ENSGT00530000063460.A.b	ENSGT00940000173711	ENSGT00940000166240	ENSGT00390000004624.a.a	ENSGT00940000158907.c	ENSGT00940000157400	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT01000000214704	ENSGT00900000141033.b.a	ENSGT00940000154822.b	ENSGT00940000166013	ENSGT00680000100126
Clown anemonefish	MODERN SPECIES	92																si:ch211-243g18.2 (ENSAOCG00000012117) #22	rbp4l (ENSAOCG00000012131)	PDE6B (ENSAOCG00000012207)	atp5mea (ENSAOCG00000012227)	ENSAOCG00000012264	ENSAOCG00000012294	nnt (ENSAOCG00000012387)
Orange clownfish	MODERN SPECIES	7	RABGAP1 (ENSAPEG00000007575)	GPR21 (ENSAPEG00000007738)	ENSAPEG00000007757	ENSAPEG00000007788	jak2a (ENSAPEG00000007819)	ENSAPEG00000007896	plgrkt (ENSAPEG00000007905)	ENSAPEG00000007916	mrrf (ENSAPEG00000007934)	ENSAPEG00000007948	rbm18 (ENSAPEG00000007972)	lhx6a (ENSAPEG00000007998)	morn5 (ENSAPEG00000008034)	ndufa8 (ENSAPEG00000008066)	ENSAPEG00000008094	si:ch211-243g18.2 (ENSAPEG00000008108) #22	rbp4l (ENSAPEG00000008138)	PDE6B (ENSAPEG00000008147)	atp5mea (ENSAPEG00000008221)	ENSAPEG00000008241	ENSAPEG00000008255	ENSAPEG00000008269	nnt (ENSAPEG00000008287)	fgf10a (ENSAPEG00000008395)	rai14 (ENSAPEG00000008414)	ENSAPEG00000008430	SCARB2 (ENSAPEG00000008445)	ENSAPEG00000008456	ENSAPEG00000008473	ENSAPEG00000008488	RNF208 (ENSAPEG00000008513)
Spiny chromis	MODERN SPECIES	684													lhx6a (ENSAPOG00000004734)	morn5 (ENSAPOG00000004715)	ndufa8 (ENSAPOG00000004691)	si:ch211-243g18.2 (ENSAPOG00000004679) #22	rbp4l (ENSAPOG00000004653)	PDE6B (ENSAPOG00000004640)	atp5mea (ENSAPOG00000004595)	ENSAPOG00000004573	ENSAPOG00000004555	ENSAPOG00000004546	nnt (ENSAPOG00000004530)	fgf10a (ENSAPOG00000004462)
Bicolor damselfish	MODERN SPECIES	890	RABGAP1 (ENSSPAG00000005088)	GPR21 (ENSSPAG00000005222)	ENSSPAG00000005233	ENSSPAG00000005254	jak2a (ENSSPAG00000005276)	ENSSPAG00000005352	plgrkt (ENSSPAG00000005355)	ENSSPAG00000005367	mrrf (ENSSPAG00000005380)	rbm18 (ENSSPAG00000005394)	lhx6a (ENSSPAG00000005407)	lhx6a (ENSSPAG00000005428)	ENSSPAG00000005442	morn5 (ENSSPAG00000005455)	ndufa8 (ENSSPAG00000005474)	si:ch211-243g18.2 (ENSSPAG00000005484) #22
Percomorphaceae_C	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000154687.B.q.a	ENSGT00940000163543.b	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000157920.b	ENSGT00940000155640.b	ENSGT00940000154396.a	ENSGT00390000000375	ENSGT00940000161373	ENSGT00940000177220	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000013765	ENSGT00940000156868.g	ENSGT00390000018089	ENSGT00390000008938	ENSGT00950000182969.A.a.b #22	ENSGT00510000047107.B.c	ENSGT00940000156471.a	ENSGT00390000005102	ENSGT00530000063460.A.b	ENSGT00940000173711	ENSGT00940000166240	ENSGT00390000004624.a.a	ENSGT00940000158907.c	ENSGT00940000157400	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT01000000214704	ENSGT00940000171384	ENSGT00900000141033.b.a	ENSGT00940000154822.b	ENSGT00680000100126
Eupercaria	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000154687.B.q.a	ENSGT00940000163543.b	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000157920.b	ENSGT00940000155640.b	ENSGT00940000154396.a	ENSGT00390000000375	ENSGT00940000161373	ENSGT00940000177220	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000013765	ENSGT00940000156868.g	ENSGT00390000018089	ENSGT00390000008938	ENSGT00950000182969.A.a.b #22	ENSGT00510000047107.B.c	ENSGT00940000156471.a	ENSGT00390000005102	ENSGT00530000063460.A.b	ENSGT00940000166240	ENSGT00390000004624.a.a	ENSGT00940000158907.c	ENSGT00940000157400	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT01000000214704	ENSGT00940000171384	ENSGT00900000141033.b.a	ENSGT00940000154822.b	ENSGT00680000100126	ENSGT00940000155844
Tetraodontidae	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT01030000234558.D.a	ENSGT00390000005101	ENSGT00940000154130.a.b.e	ENSGT00940000154687.B.q.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543.b	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000155640.b	ENSGT00940000154396.a	ENSGT00390000000375	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000013765	ENSGT00940000156868.g	ENSGT00390000018089	ENSGT00390000008938	ENSGT00950000182969.A.a.b #22	ENSGT00510000047107.B.c	ENSGT00940000156471.a	ENSGT00390000005102	ENSGT00530000063460.A.b	ENSGT00940000166240	ENSGT00390000004624.a.a	ENSGT00940000158907.c	ENSGT00940000157400	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT01000000214704	ENSGT00940000179166	ENSGT00680000100126	ENSGT00940000155844	ENSGT00940000160353	ENSGT00940000158101
Tetraodon	DUPLICATION
Tetraodon	MODERN SPECIES	19	urm1 (ENSTNIG00000013204)	SH2D3C (ENSTNIG00000013203)	ENSTNIG00000004947	RABGAP1 (ENSTNIG00000004941)	GPR21 (ENSTNIG00000004940)	RC3H2 (ENSTNIG00000004942)	jak2a (ENSTNIG00000004943)	rln1 (ENSTNIG00000000319)	plgrkt (ENSTNIG00000004944)	ENSTNIG00000004945	mrrf (ENSTNIG00000004946)	rbm18 (ENSTNIG00000009141)	lhx6a (ENSTNIG00000009140)	morn5 (ENSTNIG00000009139)	ndufa8 (ENSTNIG00000009138)	si:ch211-243g18.2 (ENSTNIG00000009137) #22	rbp4l (ENSTNIG00000009136)	PDE6B (ENSTNIG00000009135)	atp5mea (ENSTNIG00000009134)	ENSTNIG00000009133	ENSTNIG00000009132	nnt (ENSTNIG00000009131)	fgf10a (ENSTNIG00000009130)	rai14 (ENSTNIG00000009129)	ENSTNIG00000000705	ENSTNIG00000009128	slc5a1 (ENSTNIG00000009127)	GNAZ (ENSTNIG00000009126)	sppl3 (ENSTNIG00000009125)	nt5c2l1 (ENSTNIG00000009124)	slc2a11l (ENSTNIG00000009123)
Tetraodon	MODERN SPECIES	26	stx1b (ENSTNIG00000002341)	ENSTNIG00000002342	ENSTNIG00000002345	kin (ENSTNIG00000002346)	mrpl28 (ENSTNIG00000002347)	ENSTNIG00000002349	pthlha (ENSTNIG00000000580)	ENSTNIG00000002440	ENSTNIG00000002352	tspan13a (ENSTNIG00000002353)	ENSTNIG00000002354	ENSTNIG00000002356	ENSTNIG00000002357	ENSTNIG00000002359	ENSTNIG00000002360	ENSTNIG00000002362 #22	ENSTNIG00000002363	rgma (ENSTNIG00000001545)	ENSTNIG00000002365	n4bp1 (ENSTNIG00000002366)	siah1 (ENSTNIG00000002367)	ENSTNIG00000002368	ENSTNIG00000002374	ENSTNIG00000002375	ENSTNIG00000002376	ENSTNIG00000002377	ENSTNIG00000002378	ENSTNIG00000002379	ENSTNIG00000002380	glt8d2 (ENSTNIG00000003326)	ENSTNIG00000002382
Fugu	MODERN SPECIES	18	CERCAM (ENSTRUG00000008540)	urm1 (ENSTRUG00000008530)	SH2D3C (ENSTRUG00000008304)	STRBP (ENSTRUG00000003062)	ENSTRUG00000031096	GPR21 (ENSTRUG00000026912)	RABGAP1 (ENSTRUG00000003120)	ENSTRUG00000003364	rln (ENSTRUG00000005640)	plgrkt (ENSTRUG00000025063)	mrrf (ENSTRUG00000005792)	rbm18 (ENSTRUG00000005812)	lhx6a (ENSTRUG00000024435)	morn5 (ENSTRUG00000027583)	ndufa8 (ENSTRUG00000000871)	si:ch211-243g18.2 (ENSTRUG00000005926) #22	rbp4l (ENSTRUG00000006802)	atp5mea (ENSTRUG00000019731)	ENSTRUG00000024843	ENSTRUG00000032838	nnt (ENSTRUG00000007087)	fgf10a (ENSTRUG00000023059)	rai14 (ENSTRUG00000007760)	ENSTRUG00000007954	ENSTRUG00000023741	ENSTRUG00000030988	RNF208 (ENSTRUG00000008021)	slc5a1 (ENSTRUG00000008039)	sppl3 (ENSTRUG00000003509)	slc2a11l (ENSTRUG00000026665)	KCNN2 (ENSTRUG00000009421)
Eupecaria_A	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000154687.B.q.a	ENSGT00940000163543.b	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000157920.b	ENSGT00940000155640.b	ENSGT00940000154396.a	ENSGT00390000000375	ENSGT00940000161373	ENSGT00940000177220	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000013765	ENSGT00940000156868.g	ENSGT00390000018089	ENSGT00390000008938	ENSGT00950000182969.A.a.b #22	ENSGT00510000047107.B.c	ENSGT00940000156471.a	ENSGT00390000005102	ENSGT00530000063460.A.b	ENSGT00940000166240	ENSGT00390000004624.a.a	ENSGT00940000158907.c	ENSGT00940000157400	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT01000000214704	ENSGT00940000171384	ENSGT00900000141033.b.a	ENSGT00940000154822.b	ENSGT00680000100126	ENSGT00940000155844
Ballan wrasse	MODERN SPECIES	28					ENSLBEG00000024130	jak2a (ENSLBEG00000024071)	ENSLBEG00000024041	plgrkt (ENSLBEG00000024027)	ENSLBEG00000023990	mrrf (ENSLBEG00000023948)	ENSLBEG00000023924	rbm18 (ENSLBEG00000023896)	lhx6a (ENSLBEG00000023861)	morn5 (ENSLBEG00000023834)	ndufa8 (ENSLBEG00000023815)	si:ch211-243g18.2 (ENSLBEG00000023778) #22	rbp4l (ENSLBEG00000023763)	PDE6B (ENSLBEG00000023708)	atp5mea (ENSLBEG00000023682)	ENSLBEG00000023639	ENSLBEG00000023603	nnt (ENSLBEG00000023549)	fgf10a (ENSLBEG00000023527)	rai14 (ENSLBEG00000023438)	SCARB2 (ENSLBEG00000023397)	ENSLBEG00000023376	ENSLBEG00000023360	ENSLBEG00000023341	RNF208 (ENSLBEG00000023328)	slc5a1 (ENSLBEG00000023251)	GNAZ (ENSLBEG00000023199)
Eupecaria_B	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000154687.B.q.a	ENSGT00940000163543.b	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000157920.b	ENSGT00940000155640.b	ENSGT00940000154396.a	ENSGT00390000000375	ENSGT00940000161373	ENSGT00940000177220	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000013765	ENSGT00940000156868.g	ENSGT00390000018089	ENSGT00390000008938	ENSGT00950000182969.A.a.b #22	ENSGT00510000047107.B.c	ENSGT00940000156471.a	ENSGT00390000005102	ENSGT00530000063460.A.b	ENSGT00940000166240	ENSGT00390000004624.a.a	ENSGT00940000158907.c	ENSGT00940000157400	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT01000000214704	ENSGT00940000171384	ENSGT00900000141033.b.a	ENSGT00940000154822.b	ENSGT00680000100126	ENSGT00940000155844
Perciformes	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000154687.B.q.a	ENSGT00940000163543.b	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000157920.b	ENSGT00940000155640.b	ENSGT00940000154396.a	ENSGT00390000000375	ENSGT00940000161373	ENSGT00940000177220	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000013765	ENSGT00940000156868.g	ENSGT00390000018089	ENSGT00390000008938	ENSGT00950000182969.A.a.b #22	ENSGT00510000047107.B.c	ENSGT00940000156471.a	ENSGT00390000005102	ENSGT00530000063460.A.b	ENSGT00940000166240	ENSGT00390000004624.a.a	ENSGT00940000158907.c	ENSGT00940000157400	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT01000000214704	ENSGT00900000141033.b.a	ENSGT00940000154822.b	ENSGT00680000100126	ENSGT00940000155844	ENSGT00940000160353
Cottioidei	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000154687.B.q.a	ENSGT00940000163543.b	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000157920.b	ENSGT00940000155640.b	ENSGT00940000154396.a	ENSGT00390000000375	ENSGT00940000161373	ENSGT00940000177220	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000013765	ENSGT00940000156868.g	ENSGT00390000018089	ENSGT00390000008938	ENSGT00950000182969.A.a.b #22	ENSGT00510000047107.B.c	ENSGT00940000156471.a	ENSGT00390000005102	ENSGT00530000063460.A.b	ENSGT00940000166240	ENSGT00390000004624.a.a	ENSGT00940000158907.c	ENSGT00940000157400	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT01000000214704	ENSGT00940000179166	ENSGT00940000154822.b	ENSGT00680000100126	ENSGT00940000155844	ENSGT00940000160353
Lumpfish	MODERN SPECIES	3	STRBP (ENSCLMG00005016104)	GPR21 (ENSCLMG00005016098)	RABGAP1 (ENSCLMG00005013055)	RC3H2 (ENSCLMG00005012939)	ENSCLMG00005012933	jak2a (ENSCLMG00005009023)	ENSCLMG00005009004	plgrkt (ENSCLMG00005009003)	ENSCLMG00005009002	ENSCLMG00005009001	mrrf (ENSCLMG00005009000)	rbm18 (ENSCLMG00005008999)	lhx6a (ENSCLMG00005008997)	morn5 (ENSCLMG00005008993)	ndufa8 (ENSCLMG00005008989)	si:ch211-243g18.2 (ENSCLMG00005008988) #22	rbp4l (ENSCLMG00005008987)	PDE6B (ENSCLMG00005008981)	atp5mea (ENSCLMG00005008978)	ENSCLMG00005008977	nnt (ENSCLMG00005006198)	fgf10a (ENSCLMG00005006180)	rai14 (ENSCLMG00005006048)	ENSCLMG00005006042	ENSCLMG00005006040	ENSCLMG00005006039	fam166b (ENSCLMG00005006038)	RNF208 (ENSCLMG00005006037)	slc5a1 (ENSCLMG00005006027)	GNAZ (ENSCLMG00005006025)	sppl3 (ENSCLMG00005006024)
Stickleback	MODERN SPECIES	13	STRBP (ENSGACG00000017377)	GPR21 (ENSGACG00000017376)	RABGAP1 (ENSGACG00000017370)	RC3H2 (ENSGACG00000017369)	ENSGACG00000017368	jak2a (ENSGACG00000017365)	ENSGACG00000017364	plgrkt (ENSGACG00000017363)	ENSGACG00000017360	ENSGACG00000017359	mrrf (ENSGACG00000017355)	rbm18 (ENSGACG00000017348)	lhx6a (ENSGACG00000017345)	morn5 (ENSGACG00000017344)	ndufa8 (ENSGACG00000017341)	si:ch211-243g18.2 (ENSGACG00000017340) #22	rbp4l (ENSGACG00000017329)	PDE6B (ENSGACG00000017311)	ENSGACG00000017305	ENSGACG00000017303	ENSGACG00000017301	nnt (ENSGACG00000017293)	fgf10a (ENSGACG00000017290)	rai14 (ENSGACG00000017285)	SCARB2 (ENSGACG00000017281)	ENSGACG00000017278	RNF208 (ENSGACG00000017276)	slc5a1 (ENSGACG00000017262)	slc5a1 (ENSGACG00000017252)	GNAZ (ENSGACG00000017251)	sppl3 (ENSGACG00000017249)
Perciformes_a	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000154687.B.q.a	ENSGT00940000163543.b	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000157920.b	ENSGT00940000155640.b	ENSGT00940000154396.a	ENSGT00390000000375	ENSGT00940000161373	ENSGT00940000177220	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000013765	ENSGT00940000156868.g	ENSGT00390000018089	ENSGT00390000008938	ENSGT00950000182969.A.a.b #22	ENSGT00510000047107.B.c	ENSGT00940000156471.a	ENSGT00390000005102	ENSGT00530000063460.A.b	ENSGT00940000173711	ENSGT00390000004624.a.a	ENSGT00940000158907.c	ENSGT00940000157400	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT01000000214704	ENSGT00900000141033.b.a	ENSGT00940000154822.b	ENSGT00680000100126	ENSGT00940000155844	ENSGT00940000160353
Pike perch	MODERN SPECIES	48	STRBP (ENSSLUG00000025087)	GPR21 (ENSSLUG00000025074)	RABGAP1 (ENSSLUG00000025044)	RC3H2 (ENSSLUG00000025020)	ENSSLUG00000025012	jak2a (ENSSLUG00000024718)	rln1 (ENSSLUG00000024626)	plgrkt (ENSSLUG00000024623)	ENSSLUG00000024620	ENSSLUG00000024617	mrrf (ENSSLUG00000024612)	rbm18 (ENSSLUG00000024609)	lhx6a (ENSSLUG00000024604)	morn5 (ENSSLUG00000024602)	ndufa8 (ENSSLUG00000024596)	si:ch211-243g18.2 (ENSSLUG00000024589) #22	rbp4l (ENSSLUG00000024581)	PDE6B (ENSSLUG00000024571)	atp5mea (ENSSLUG00000024564)	ENSSLUG00000024558	ENSSLUG00000024553	nnt (ENSSLUG00000024186)	fgf10a (ENSSLUG00000024132)	rai14 (ENSSLUG00000024127)	SCARB2 (ENSSLUG00000024080)	ENSSLUG00000024056	ENSSLUG00000024053	ENSSLUG00000024042	RNF208 (ENSSLUG00000024034)	slc5a1 (ENSSLUG00000023497)	GNAZ (ENSSLUG00000023419)
Channel bull blenny	MODERN SPECIES	3	STRBP (ENSCGOG00000006130)	RABGAP1 (ENSCGOG00000006824)	GPR21 (ENSCGOG00000008798)	RC3H2 (ENSCGOG00000008812)	ENSCGOG00000009040	jak2a (ENSCGOG00000009110)	rln1 (ENSCGOG00000011700)	plgrkt (ENSCGOG00000011704)	ENSCGOG00000011711	mrrf (ENSCGOG00000011719)	ENSCGOG00000011722	rbm18 (ENSCGOG00000011724)	lhx6a (ENSCGOG00000011731)	morn5 (ENSCGOG00000011736)	ndufa8 (ENSCGOG00000011745)	si:ch211-243g18.2 (ENSCGOG00000011767) #22	rbp4l (ENSCGOG00000011776)	PDE6B (ENSCGOG00000011901)	ENSCGOG00000016356	ENSCGOG00000016362	nnt (ENSCGOG00000016393)	fgf10a (ENSCGOG00000017689)	rai14 (ENSCGOG00000017690)	ENSCGOG00000017695	ENSCGOG00000017829	ENSCGOG00000017833	fam166b (ENSCGOG00000017835)	ENSCGOG00000017837	RNF208 (ENSCGOG00000017838)	slc5a1 (ENSCGOG00000017841)	GNAZ (ENSCGOG00000017870)
Eupecaria_C	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000154687.B.q.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543.b	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000157920.b	ENSGT00940000155640.b	ENSGT00940000154396.a	ENSGT00390000000375	ENSGT00940000161373	ENSGT00940000177220	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000013765	ENSGT00940000156868.g	ENSGT00390000018089	ENSGT00390000008938	ENSGT00950000182969.A.a.b #22	ENSGT00510000047107.B.c	ENSGT00940000156471.a	ENSGT00390000005102	ENSGT00530000063460.A.b	ENSGT00940000166240	ENSGT00390000004624.a.a	ENSGT00940000158907.c	ENSGT00940000157400	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT01000000214704	ENSGT00940000171384	ENSGT00900000141033.b.a	ENSGT00940000154822.b	ENSGT00680000100126	ENSGT00940000155844
Eupercaria_incertae_sedis	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000154130.a.b.e	ENSGT00940000154687.B.q.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000157920.b	ENSGT00940000155640.b	ENSGT00940000154396.a	ENSGT00390000000375	ENSGT00940000161373	ENSGT00940000177220	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000013765	ENSGT00940000156868.g	ENSGT00390000018089	ENSGT00390000008938	ENSGT00950000182969.A.a.b #22	ENSGT00510000047107.B.c	ENSGT00940000156471.a	ENSGT00390000005102	ENSGT00530000063460.A.b	ENSGT00940000166240	ENSGT00390000004624.a.a	ENSGT00940000158907.c	ENSGT00940000157400	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT01000000214704	ENSGT00900000141033.b.a	ENSGT00940000179166	ENSGT00940000154822.b	ENSGT00680000100126	ENSGT00940000155844
European seabass	MODERN SPECIES	9	urm1 (ENSDLAG00005024484)	ENSDLAG00005024298	ENSDLAG00005024359	ENSDLAG00005024000	ENSDLAG00005023963	ENSDLAG00005023949	ENSDLAG00005022633	ENSDLAG00005033055	ENSDLAG00005035124	ENSDLAG00005022515	mrrf (ENSDLAG00005028988)	rbm18 (ENSDLAG00005022505)	lhx6a (ENSDLAG00005022500)	morn5 (ENSDLAG00005022499)	ndufa8 (ENSDLAG00005022483)	si:ch211-243g18.2 (ENSDLAG00005022473) #22	ENSDLAG00005033368	ENSDLAG00005020933	ENSDLAG00005027856	ENSDLAG00005020864	nnt (ENSDLAG00005019517)	fgf10a (ENSDLAG00005033192)	ENSDLAG00005019436	ENSDLAG00005028767	rai14 (ENSDLAG00005019457)	ENSDLAG00005019421	ENSDLAG00005033863	ENSDLAG00005018325	ENSDLAG00005018357	sppl3 (ENSDLAG00005018242)	nt5c2l1 (ENSDLAG00005016629)
Large yellow croaker	MODERN SPECIES	4	CERCAM (ENSLCRG00005009424)	urm1 (ENSLCRG00005009748)	ENSLCRG00005009778	STRBP (ENSLCRG00005011009)	RABGAP1 (ENSLCRG00005011428)	ENSLCRG00005012111	ENSLCRG00005012113	jak2a (ENSLCRG00005012127)	rln1 (ENSLCRG00005012250)	plgrkt (ENSLCRG00005012253)	ENSLCRG00005012255	morn5 (ENSLCRG00005012256)	rbm18 (ENSLCRG00005012263)	lhx6a (ENSLCRG00005012268)	ndufa8 (ENSLCRG00005012273)	si:ch211-243g18.2 (ENSLCRG00005012281) #22	rbp4l (ENSLCRG00005012286)	PDE6B (ENSLCRG00005012298)	atp5mea (ENSLCRG00005012770)	ENSLCRG00005012772	ENSLCRG00005012773	nnt (ENSLCRG00005012777)	fgf10a (ENSLCRG00005012876)	rai14 (ENSLCRG00005012880)	SCARB2 (ENSLCRG00005012889)	ENSLCRG00005013652	ENSLCRG00005013653	ENSLCRG00005013654	fam166b (ENSLCRG00005013655)	RNF208 (ENSLCRG00005013656)	slc5a1 (ENSLCRG00005013663)
Gilthead seabream	MODERN SPECIES	3	STRBP (ENSSAUG00010018478)	RABGAP1 (ENSSAUG00010018892)	GPR21 (ENSSAUG00010019417)	ENSSAUG00010019420	ENSSAUG00010019431	jak2a (ENSSAUG00010019520)	rln1 (ENSSAUG00010022388)	plgrkt (ENSSAUG00010022389)	ENSSAUG00010022392	mrrf (ENSSAUG00010022394)	ENSSAUG00010022395	rbm18 (ENSSAUG00010022397)	lhx6a (ENSSAUG00010022398)	morn5 (ENSSAUG00010022399)	NDUFA8 (ENSSAUG00010022401)	si:ch211-243g18.2 (ENSSAUG00010022403) #22	rbp4l (ENSSAUG00010022404)	PDE6B (ENSSAUG00010022428)	atp5mea (ENSSAUG00010022955)	ENSSAUG00010022957	ENSSAUG00010022959	nnt (ENSSAUG00010022969)	fgf10a (ENSSAUG00010023445)	ENSSAUG00010023447	rai14 (ENSSAUG00010023450)	SCARB2 (ENSSAUG00010023455)	ENSSAUG00010023469	ENSSAUG00010023470	ENSSAUG00010023471	fam166b (ENSSAUG00010023473)	RNF208 (ENSSAUG00010023476)
Percomorphaceae_D	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000154687.B.q.a	ENSGT00940000163543.b	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000157920.b	ENSGT00940000155640.b	ENSGT00940000154396.a	ENSGT00390000000375	ENSGT00940000161373	ENSGT00940000177220	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000013765	ENSGT00940000156868.g	ENSGT00390000018089	ENSGT00390000008938	ENSGT00950000182969.A.a.b #22	ENSGT00510000047107.B.c	ENSGT00940000156471.a	ENSGT00390000005102	ENSGT00530000063460.A.b	ENSGT00940000173711	ENSGT00940000166240	ENSGT00390000004624.a.a	ENSGT00940000158907.c	ENSGT00940000157400	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT01000000214704	ENSGT00940000171384	ENSGT00900000141033.b.a	ENSGT00940000154822.b	ENSGT00680000100126
Anabantaria	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000154687.B.q.a	ENSGT00940000163543.b	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000157920.b	ENSGT00940000155640.b	ENSGT00940000154396.a	ENSGT00390000000375	ENSGT00940000161373	ENSGT00390000005084	ENSGT00940000177220	ENSGT00390000013765	ENSGT00940000156868.g	ENSGT00390000018089	ENSGT00390000008938	ENSGT00950000182969.A.a.b #22	ENSGT00510000047107.B.c	ENSGT00940000156471.a	ENSGT00390000005102	ENSGT00530000063460.A.b	ENSGT00940000166240	ENSGT00390000004624.a.a	ENSGT00940000158907.c	ENSGT00940000157400	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT01000000214704	ENSGT00940000171384	ENSGT00900000141033.b.a	ENSGT00940000154822.b	ENSGT00680000100126	ENSGT00940000155844
Zig-zag eel	MODERN SPECIES	3	ENSMAMG00000008774	ENSMAMG00000009032	GPR21 (ENSMAMG00000009103)	ENSMAMG00000009119	ENSMAMG00000009138	jak2a (ENSMAMG00000009157)	ENSMAMG00000009187	plgrkt (ENSMAMG00000009197)	ENSMAMG00000028096	mrrf (ENSMAMG00000024391)	ENSMAMG00000009221	rbm18 (ENSMAMG00000009239)	lhx6a (ENSMAMG00000009266)	morn5 (ENSMAMG00000009286)	ndufa8 (ENSMAMG00000009309)	si:ch211-243g18.2 (ENSMAMG00000009330) #22	rbp4l (ENSMAMG00000009365)	ENSMAMG00000009435	atp5mea (ENSMAMG00000009506)	ENSMAMG00000009522	nnt (ENSMAMG00000009580)	fgf10a (ENSMAMG00000009611)	rai14 (ENSMAMG00000009619)	ENSMAMG00000009658	ENSMAMG00000009670	ENSMAMG00000009691	fam166b (ENSMAMG00000009700)	ENSMAMG00000009715	slc5a1 (ENSMAMG00000009728)	ENSMAMG00000009740	sppl3 (ENSMAMG00000009758)
Anabantoidei	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000154687.B.q.a	ENSGT00940000163543.b	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000157920.b	ENSGT00940000155640.b	ENSGT00940000154396.a	ENSGT00390000000375	ENSGT00940000161373	ENSGT00940000177220	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000013765	ENSGT00940000156868.g	ENSGT00390000018089	ENSGT00390000008938	ENSGT00950000182969.A.a.b #22	ENSGT00510000047107.B.c	ENSGT00940000156471.a	ENSGT00390000005102	ENSGT00530000063460.A.b	ENSGT00940000166240	ENSGT00390000004624.a.a	ENSGT00940000158907.c	ENSGT00940000157400	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT01000000214704	ENSGT00940000171384	ENSGT00900000141033.b.a	ENSGT00940000154822.b	ENSGT00680000100126	ENSGT00940000155844
Siamese fighting fish	MODERN SPECIES	3	SH2D3C (ENSBSLG00000010756)	STRBP (ENSBSLG00000011673)	RABGAP1 (ENSBSLG00000011987)	ENSBSLG00000012536	ENSBSLG00000012563	jak2a (ENSBSLG00000012598)	ENSBSLG00000012778	plgrkt (ENSBSLG00000012783)	ENSBSLG00000013070	mrrf (ENSBSLG00000013109)	ENSBSLG00000013156	rbm18 (ENSBSLG00000013190)	lhx6a (ENSBSLG00000013244)	morn5 (ENSBSLG00000013311)	ndufa8 (ENSBSLG00000013363)	si:ch211-243g18.2 (ENSBSLG00000013392) #22	rbp4l (ENSBSLG00000013410)	atp5mea (ENSBSLG00000013677)	ENSBSLG00000013689	ENSBSLG00000013722	ENSBSLG00000013731	nnt (ENSBSLG00000014137)	fgf10a (ENSBSLG00000014642)	rai14 (ENSBSLG00000014682)	SCARB2 (ENSBSLG00000014777)	ENSBSLG00000015105	ENSBSLG00000015108	fam166b (ENSBSLG00000015110)	RNF208 (ENSBSLG00000015114)	ENSBSLG00000015118	slc5a1 (ENSBSLG00000015126)
Climbing perch	MODERN SPECIES	13	STRBP (ENSATEG00000019558)	ENSATEG00000019543	RABGAP1 (ENSATEG00000019451)	ENSATEG00000019414	ENSATEG00000019384	jak2a (ENSATEG00000019327)	ENSATEG00000019304	plgrkt (ENSATEG00000029320)	ENSATEG00000019264	ENSATEG00000019235	mrrf (ENSATEG00000019203)	rbm18 (ENSATEG00000019164)	lhx6a (ENSATEG00000019137)	morn5 (ENSATEG00000019121)	ndufa8 (ENSATEG00000019115)	si:ch211-243g18.2 (ENSATEG00000019087) #22	rbp4l (ENSATEG00000019002)	ENSATEG00000018934	atp5mea (ENSATEG00000018887)	ENSATEG00000018842	ENSATEG00000018815	nnt (ENSATEG00000018771)	fgf10a (ENSATEG00000029507)	rai14 (ENSATEG00000018638)	ENSATEG00000018610	ENSATEG00000018603	ENSATEG00000026512	ENSATEG00000018593	fam166b (ENSATEG00000026052)	ENSATEG00000027097	slc5a1 (ENSATEG00000017774)
Carangaria	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000154687.B.q.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543.b	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000157920.b	ENSGT00940000155640.b	ENSGT00940000154396.a	ENSGT00390000000375	ENSGT00940000161373	ENSGT00940000177220	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000013765	ENSGT00940000156868.g	ENSGT00390000018089	ENSGT00390000008938	ENSGT00950000182969.A.a.b #22	ENSGT00510000047107.B.c	ENSGT00940000156471.a	ENSGT00390000005102	ENSGT00530000063460.A.b	ENSGT00940000173711	ENSGT00940000166240	ENSGT00390000004624.a.a	ENSGT00940000158907.c	ENSGT00940000157400	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT01000000214704	ENSGT00900000141033.b.a	ENSGT00940000154822.b	ENSGT00680000100126	ENSGT00940000155844
Carangaria_A	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000154130.a.b.e	ENSGT00940000154687.B.q.a	ENSGT00940000163543.b	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000157920.b	ENSGT00940000155640.b	ENSGT00940000154396.a	ENSGT00390000000375	ENSGT00940000161373	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000013765	ENSGT00940000156868.g	ENSGT00390000018089	ENSGT00390000008938	ENSGT00950000182969.A.a.b #22	ENSGT00510000047107.B.c	ENSGT00940000156471.a	ENSGT00390000005102	ENSGT00530000063460.A.b	ENSGT00940000173711	ENSGT00940000166240	ENSGT00390000004624.a.a	ENSGT00940000158907.c	ENSGT00940000157400	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT01000000214704	ENSGT00900000141033.b.a	ENSGT00940000154822.b	ENSGT00680000100126	ENSGT00940000155844
Seriola	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000154130.a.b.e	ENSGT00940000154687.B.q.a	ENSGT00940000163543.b	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000157920.b	ENSGT00940000155640.b	ENSGT00940000154396.a	ENSGT00390000000375	ENSGT00940000161373	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000013765	ENSGT00940000156868.g	ENSGT00390000018089	ENSGT00390000008938	ENSGT00950000182969.A.a.b #22	ENSGT00510000047107.B.c	ENSGT00940000156471.a	ENSGT00390000005102	ENSGT00530000063460.A.b	ENSGT00940000173711	ENSGT00940000166240	ENSGT00390000004624.a.a	ENSGT00940000158907.c	ENSGT00940000157400	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT01000000214704	ENSGT00900000141033.b.a	ENSGT00940000154822.b	ENSGT00680000100126	ENSGT00940000155844
Greater amberjack	MODERN SPECIES	138			RABGAP1 (ENSSDUG00000015893)	GPR21 (ENSSDUG00000016014)	ENSSDUG00000016022	ENSSDUG00000016049	jak2a (ENSSDUG00000016063)	ENSSDUG00000016134	plgrkt (ENSSDUG00000016153)	ENSSDUG00000016168	mrrf (ENSSDUG00000016181)	rbm18 (ENSSDUG00000016203)	lhx6a (ENSSDUG00000016217)	morn5 (ENSSDUG00000016237)	ndufa8 (ENSSDUG00000016251)	si:ch211-243g18.2 (ENSSDUG00000016265) #22	rbp4l (ENSSDUG00000016277)	PDE6B (ENSSDUG00000016292)	ENSSDUG00000016359	ENSSDUG00000016375	ENSSDUG00000016395	ENSSDUG00000016404	nnt (ENSSDUG00000016421)	fgf10a (ENSSDUG00000016482)	rai14 (ENSSDUG00000016515)	ENSSDUG00000016554	ENSSDUG00000016572	ENSSDUG00000016580	fam166b (ENSSDUG00000016589)	RNF208 (ENSSDUG00000016600)	slc5a1 (ENSSDUG00000016608)
Yellowtail amberjack	MODERN SPECIES	2438		STRBP (ENSSLDG00000015865)	RABGAP1 (ENSSLDG00000015951)	GPR21 (ENSSLDG00000016048)	RC3H2 (ENSSLDG00000016070)	ENSSLDG00000016126	jak2a (ENSSLDG00000016144)	ENSSLDG00000016238	plgrkt (ENSSLDG00000016244)	ENSSLDG00000016271	mrrf (ENSSLDG00000016309)	rbm18 (ENSSLDG00000016329)	lhx6a (ENSSLDG00000016353)	morn5 (ENSSLDG00000016365)	ndufa8 (ENSSLDG00000016378)	si:ch211-243g18.2 (ENSSLDG00000016390) #22	rbp4l (ENSSLDG00000016422)	PDE6B (ENSSLDG00000016467)	atp5mea (ENSSLDG00000016564)	ENSSLDG00000016582	ENSSLDG00000016616	nnt (ENSSLDG00000016646)	fgf10a (ENSSLDG00000016717)	rai14 (ENSSLDG00000016738)	ENSSLDG00000016786	ENSSLDG00000016807	ENSSLDG00000016820	ENSSLDG00000016842
Barramundi perch	MODERN SPECIES	121	urm1 (ENSLCAG00010003790)	SH2D3C (ENSLCAG00010003745)	STRBP (ENSLCAG00010003638)	RABGAP1 (ENSLCAG00010003497)	ENSLCAG00010003434	ENSLCAG00010003423	jak2a (ENSLCAG00010003367)	rln1 (ENSLCAG00010003346)	plgrkt (ENSLCAG00010003345)	ENSLCAG00010003343	mrrf (ENSLCAG00010003341)	rbm18 (ENSLCAG00010003338)	lhx6a (ENSLCAG00010003333)	morn5 (ENSLCAG00010003327)	ndufa8 (ENSLCAG00010003322)	si:ch211-243g18.2 (ENSLCAG00010003316) #22	rbp4l (ENSLCAG00010003311)	PDE6B (ENSLCAG00010003229)	atp5mea (ENSLCAG00010003200)	ENSLCAG00010003193	ENSLCAG00010003185	nnt (ENSLCAG00010002654)	fgf10a (ENSLCAG00010002578)	rai14 (ENSLCAG00010002569)	ENSLCAG00010002564	ENSLCAG00010002557	ENSLCAG00010002554	fam166b (ENSLCAG00010002551)	RNF208 (ENSLCAG00010002549)	slc5a1 (ENSLCAG00010002397)	GNAZ (ENSLCAG00010002376)
Pleuronectoidei	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000154687.B.q.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543.b	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000157920.b	ENSGT00940000155640.b	ENSGT00940000154396.a	ENSGT00390000000375	ENSGT00940000161373	ENSGT00940000177220	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000013765	ENSGT00940000156868.g	ENSGT00390000018089	ENSGT00390000008938	ENSGT00950000182969.A.a.b #22	ENSGT00510000047107.B.c	ENSGT00940000156471.a	ENSGT00390000005102	ENSGT00530000063460.A.b	ENSGT00940000173711	ENSGT00390000004624.a.a	ENSGT00940000158907.c	ENSGT00940000157400	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT01000000214704	ENSGT00900000141033.b.a	ENSGT00940000154822.b	ENSGT00680000100126	ENSGT00940000155844	ENSGT00940000160353
Turbot	MODERN SPECIES	7	ENSSMAG00000019931	ENSSMAG00000019946	ENSSMAG00000019967	ENSSMAG00000020048	ENSSMAG00000020069	jak2a (ENSSMAG00000020074)	ENSSMAG00000020098	plgrkt (ENSSMAG00000020103)	ENSSMAG00000020121	ENSSMAG00000020134	mrrf (ENSSMAG00000020126)	rbm18 (ENSSMAG00000020138)	lhx6a (ENSSMAG00000020142)	morn5 (ENSSMAG00000020156)	ndufa8 (ENSSMAG00000035909)	si:ch211-243g18.2 (ENSSMAG00000020163) #22	rbp4l (ENSSMAG00000020171)	ENSSMAG00000020179	atp5mea (ENSSMAG00000020210)	ENSSMAG00000020216	ENSSMAG00000029611	nnt (ENSSMAG00000020244)	fgf10a (ENSSMAG00000020257)	rai14 (ENSSMAG00000020262)	ENSSMAG00000020273	ENSSMAG00000029639	ENSSMAG00000020283	ENSSMAG00000020288	ENSSMAG00000020290	ENSSMAG00000020292	ENSSMAG00000020299
Tongue sole	MODERN SPECIES	5	drg1 (ENSCSEG00000017259)	KCNN2 (ENSCSEG00000017286)	slc2a11l (ENSCSEG00000017305)	RABGAP1 (ENSCSEG00000017356)	ENSCSEG00000017448	GPR21 (ENSCSEG00000017452)	ENSCSEG00000017460	jak2a (ENSCSEG00000017489)	ENSCSEG00000017552	ENSCSEG00000017557	mrrf (ENSCSEG00000017565)	rbm18 (ENSCSEG00000017587)	lhx6a (ENSCSEG00000017597)	morn5 (ENSCSEG00000017608)	ndufa8 (ENSCSEG00000017614)	si:ch211-243g18.2 (ENSCSEG00000017629) #22	rbp4l (ENSCSEG00000017648)	PDE6B (ENSCSEG00000017653)	ENSCSEG00000017669	ENSCSEG00000017672	nnt (ENSCSEG00000017705)	ENSCSEG00000017731	fgf10a (ENSCSEG00000017732)	GFRA2 (ENSCSEG00000017738)	xpo7 (ENSCSEG00000017746)	pbdc1 (ENSCSEG00000017787)	dmtn (ENSCSEG00000017799)	ATP6V1B2 (ENSCSEG00000017810)	dusp11 (ENSCSEG00000017836)	ENSCSEG00000017847	ENSCSEG00000017856
Cod	MODERN SPECIES	17	ENSGMOG00000006257	urm1 (ENSGMOG00000006245)	ENSGMOG00000006010	ENSGMOG00000004870	ENSGMOG00000016738	ENSGMOG00000016709	ENSGMOG00000016684	jak2a (ENSGMOG00000016634)	ENSGMOG00000037246	ENSGMOG00000000122	plgrkt (ENSGMOG00000016622)	mrrf (ENSGMOG00000016602)	lhx6a (ENSGMOG00000016580)	morn5 (ENSGMOG00000016571)	ndufa8 (ENSGMOG00000016559)	si:ch211-243g18.2 (ENSGMOG00000016548) #22	ENSGMOG00000036082	ENSGMOG00000016506	ENSGMOG00000027914	ENSGMOG00000024295	ENSGMOG00000025799	ENSGMOG00000036730	ENSGMOG00000028443	ENSGMOG00000015564	nnt (ENSGMOG00000016424)	fgf10a (ENSGMOG00000028286)	rai14 (ENSGMOG00000016362)	ENSGMOG00000016349	ENSGMOG00000033371	ENSGMOG00000030612	fam166b (ENSGMOG00000016231)
Protacanthopterygii	ANCESTRAL SPECIES	36	ENSGT00940000157072.a	ENSGT00940000156244.a.b	ENSGT00940000157724.a.b	ENSGT00940000154091.a.a.s.b	ENSGT00940000155816.a	ENSGT00940000156320.d	ENSGT00940000155291.b.c	ENSGT00940000155291.b.d	ENSGT00940000159174.e	ENSGT00390000005084.d	ENSGT00940000177220	ENSGT00390000013765	ENSGT00940000156868.g.g	ENSGT00390000018089	ENSGT00390000008938	ENSGT00950000182969.A.a.b #22	ENSGT00940000157920.b	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543.b	ENSGT00940000154687.B.q.a	ENSGT00940000154130.a.b.e	ENSGT00390000005101	ENSGT01030000234558.D.a	ENSGT00940000157589	ENSGT00530000063085.B	ENSGT00940000159387.f	ENSGT00390000009349	ENSGT00940000158646	ENSGT01100000263580	ENSGT00940000160109
Salmoninae	DUPLICATION
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	346					ENSGT00940000156244.a.b.c.b	ENSGT00940000157724.a.b.c	ENSGT00940000155816.a.c	ENSGT00890000139463.b.b.b.e.a	ENSGT00940000156320.d.c	ENSGT00940000155291.b.c	ENSGT00390000005084.d.b	ENSGT00390000013765.m	ENSGT00940000156868.g.g.b	ENSGT00390000018089.d	ENSGT00390000008938.b	ENSGT00950000182969.A.a.b.e #22	ENSGT00940000157685.i.a	ENSGT00940000157216.j.a	ENSGT00940000154687.B.q.a.a	ENSGT00940000154130.a.b.e.e	ENSGT00390000005101	ENSGT01030000234558.D.a.e	ENSGT00940000157589	ENSGT00530000063085.B.d	ENSGT00940000159387.f.c	ENSGT00390000009349	ENSGT00940000158646.e	ENSGT01100000263580	ENSGT00940000160109.c	ENSGT00940000161928	ENSGT00390000006843
Huchen	MODERN SPECIES	1107					ARL15 (ENSHHUG00000036070)	snx18b (ENSHHUG00000036068)	rasgef1bb (ENSHHUG00000036051)	ENSHHUG00000036047	antxr2b (ENSHHUG00000036016)	paqr3b (ENSHHUG00000036009)	mrrf (ENSHHUG00000035996)	rbm18 (ENSHHUG00000035987)	lhx6a (ENSHHUG00000035976)	morn5 (ENSHHUG00000035970)	ndufa8 (ENSHHUG00000035950)	si:ch211-243g18.2 (ENSHHUG00000035925) #22	ENSHHUG00000035896	RABGAP1 (ENSHHUG00000035867)	STRBP (ENSHHUG00000035766)	ENSHHUG00000035728
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00940000156303.c.a	ENSGT00510000047669.u	ENSGT00530000066485	ENSGT00940000157072.a.c	ENSGT00940000156244.a.b.c.b	ENSGT00940000157724.a.b.c	ENSGT00940000155816.a.c	ENSGT00890000139463.b.b.b.e.a	ENSGT00940000156320.d.c	ENSGT00940000155291.b.c	ENSGT00390000005084.d.b	ENSGT00390000013765.m	ENSGT00940000156868.g.g.b	ENSGT00390000018089.d	ENSGT00390000008938.b	ENSGT00950000182969.A.a.b.e #22	ENSGT00940000157685.i.a	ENSGT00940000163543.b.d	ENSGT00940000157216.j.a	ENSGT00940000154687.B.q.a.a	ENSGT00940000154130.a.b.e.e	ENSGT00390000005101	ENSGT01030000234558.D.a.e	ENSGT00940000157589	ENSGT00530000063085.B.d	ENSGT00940000159387.f.c	ENSGT00390000009349	ENSGT00940000158646.e	ENSGT01100000263580	ENSGT00940000160109.c	ENSGT00940000161928
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	54	ENSGT00940000157646.j	ENSGT00940000156303.c.a	ENSGT00510000047669.u	ENSGT00940000157072.a.c	ENSGT00940000156244.a.b.c.b	ENSGT00940000157724.a.b.c	ENSGT00940000155816.a.c	ENSGT00890000139463.b.b.b.e.a	ENSGT00940000156320.d.c	ENSGT00940000155291.b.c	ENSGT00990000210845	ENSGT01030000239635	ENSGT00940000156868.g.g.b	ENSGT00390000018089.d	ENSGT00390000008938.b	ENSGT00950000182969.A.a.b.e #22	ENSGT00940000157685.i.a	ENSGT00940000163543.b.d	ENSGT00940000157216.j.a	ENSGT00940000154687.B.q.a.a	ENSGT00940000154130.a.b.e.e	ENSGT00390000005101	ENSGT01030000234558.D.a.e	ENSGT00940000157589	ENSGT00530000063085.B.d	ENSGT00940000159387.f.c	ENSGT00390000009349	ENSGT00940000158646.e	ENSGT01100000263580	ENSGT00940000160109.c	ENSGT00940000161928
River trout	MODERN SPECIES	15	ITGA1 (ENSSTUG00000013762)	ITGA2 (ENSSTUG00000013466)	MOCS2 (ENSSTUG00000013427)	fstb (ENSSTUG00000013412)	snx18b (ENSSTUG00000013405)	ARL15 (ENSSTUG00000013376)	rasgef1bb (ENSSTUG00000013177)	ENSSTUG00000013162	antxr2b (ENSSTUG00000012796)	paqr3b (ENSSTUG00000012746)	ENSSTUG00000012712	ENSSTUG00000012673	lhx6a (ENSSTUG00000012650)	morn5 (ENSSTUG00000012639)	ndufa8 (ENSSTUG00000012616)	si:ch211-243g18.2 (ENSSTUG00000012577) #22	ENSSTUG00000012538	GPR21 (ENSSTUG00000012517)	RABGAP1 (ENSSTUG00000011170)	STRBP (ENSSTUG00000010669)	SH2D3C (ENSSTUG00000009924)	urm1 (ENSSTUG00000009908)	CERCAM (ENSSTUG00000009844)	sardh (ENSSTUG00000007829)	ENSSTUG00000007743	dbh (ENSSTUG00000007726)	FAM163B (ENSSTUG00000007720)	ENSSTUG00000007705	slc27a4 (ENSSTUG00000005957)	ptgdsa (ENSSTUG00000005895)	ambp (ENSSTUG00000005783)
Atlantic salmon	MODERN SPECIES		ITGA1 (ENSSSAG00000040699)	ITGA2 (ENSSSAG00000037674)	MOCS2 (ENSSSAG00000037149)	fstb (ENSSSAG00000036732)	ARL15 (ENSSSAG00000091874)	snx18b (ENSSSAG00000036373)	rasgef1bb (ENSSSAG00000034358)	ENSSSAG00000102221	antxr2b (ENSSSAG00000050730)	ENSSSAG00000108094	ENSSSAG00000050633	ENSSSAG00000050624	lhx6a (ENSSSAG00000050181)	morn5 (ENSSSAG00000122247)	ndufa8 (ENSSSAG00000050131)	si:ch211-243g18.2 (ENSSSAG00000050082) #22	ENSSSAG00000049926	GPR21 (ENSSSAG00000096388)	rabgap1 (ENSSSAG00000042610)	ENSSSAG00000041236	ENSSSAG00000040878	urm1 (ENSSSAG00000117928)	sardh (ENSSSAG00000012085)	dbh (ENSSSAG00000011014)	FAM163B (ENSSSAG00000095907)	swi5 (ENSSSAG00000010881)	slc27a4 (ENSSSAG00000010194)	ptgdsa (ENSSSAG00000010165)	AMBP (ENSSSAG00000010137)	nrarpa (ENSSSAG00000119476)	ENSSSAG00000098617
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00510000047669.u	ENSGT00530000066485	ENSGT00940000157072.a.c	ENSGT00940000156244.a.b.c.b	ENSGT00940000157724.a.b.c	ENSGT00940000155816.a.c	ENSGT00890000139463.b.b.b.e.a	ENSGT00940000156320.d.c	ENSGT00970000196788.J.a.b	ENSGT00940000155291.b.c	ENSGT00390000005084.d.b	ENSGT00390000013765.m	ENSGT00940000156868.g.g.b	ENSGT00390000018089.d	ENSGT00390000008938.b	ENSGT00950000182969.A.a.b.e #22	ENSGT00940000157685.i.a	ENSGT00940000157216.j.a	ENSGT00940000163543.b.d	ENSGT00940000154687.B.q.a.a	ENSGT00940000154130.a.b.e.e	ENSGT00390000005101	ENSGT01030000234558.D.a.e	ENSGT00940000157589	ENSGT00940000166736	ENSGT00530000063085.B.d	ENSGT00940000159387.f.c	ENSGT00390000009349	ENSGT00940000158646.e	ENSGT01100000263580	ENSGT00940000160109.c
Rainbow trout	MODERN SPECIES	26	ENSOMYG00000024464	fstb (ENSOMYG00000024477)	ARL15 (ENSOMYG00000024501)	ENSOMYG00000048692	snx18b (ENSOMYG00000024549)	ENSOMYG00000024661	ENSOMYG00000025032	ENSOMYG00000025184	ENSOMYG00000025383	paqr3b (ENSOMYG00000074682)	mrrf (ENSOMYG00000025426)	rbm18 (ENSOMYG00000025520)	lhx6a (ENSOMYG00000025550)	morn5 (ENSOMYG00000025563)	ndufa8 (ENSOMYG00000025572)	si:ch211-243g18.2 (ENSOMYG00000025606) #22	ENSOMYG00000025659	ENSOMYG00000026096	ENSOMYG00000027391	ENSOMYG00000029065	urm1 (ENSOMYG00000029135)	ENSOMYG00000029176	sardh (ENSOMYG00000029679)	ENSOMYG00000070800	ENSOMYG00000067702	ENSOMYG00000056815	ENSOMYG00000030856	ENSOMYG00000030858	slc27a4 (ENSOMYG00000030841)	ptgdsa (ENSOMYG00000030891)	ambp (ENSOMYG00000030902)
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	73	ENSGT00510000047669.u	ENSGT00530000066485	ENSGT00940000157072.a.c	ENSGT00940000156244.a.b.c.b	ENSGT00940000157724.a.b.c	ENSGT00940000155816.a.c	ENSGT00890000139463.b.b.b.e.a	ENSGT00940000156320.d.c	ENSGT00970000196788.J.a.b	ENSGT00940000155291.b.c	ENSGT00990000210845	ENSGT00390000013765.m	ENSGT00940000156868.g.g.b	ENSGT00390000018089.d	ENSGT00390000008938.b	ENSGT00950000182969.A.a.b.e #22	ENSGT00940000157685.i.a	ENSGT00940000163543.b.d	ENSGT00940000157216.j.a	ENSGT00940000154687.B.q.a.a	ENSGT00940000154130.a.b.e.e	ENSGT00390000005101	ENSGT01030000234558.D.a.e	ENSGT00940000157589	ENSGT00940000166736	ENSGT00530000063085.B.d	ENSGT00940000159387.f.c	ENSGT00390000009349	ENSGT00940000158646.e	ENSGT01100000263580	ENSGT00940000160109.c
Chinook salmon	MODERN SPECIES	12	ENSOTSG00005047650	acad9 (ENSOTSG00005017731)	barx1 (ENSOTSG00005017736)	ARL15 (ENSOTSG00005017738)	fstb (ENSOTSG00005017740)	snx18b (ENSOTSG00005017741)	rasgef1bb (ENSOTSG00005017749)	ENSOTSG00005017826	antxr2b (ENSOTSG00005017834)	ENSOTSG00005017856	ENSOTSG00005017857	ENSOTSG00005017900	rbm18 (ENSOTSG00005017904)	ENSOTSG00005017909	ndufa8 (ENSOTSG00005017913)	si:ch211-243g18.2 (ENSOTSG00005017915) #22	ENSOTSG00005017918	ENSOTSG00005017926	ENSOTSG00005018002	ENSOTSG00005023342	catip (ENSOTSG00005023345)	rpl28 (ENSOTSG00005023347)	pdcl (ENSOTSG00005023349)	pdxp (ENSOTSG00005023351)	SETD9 (ENSOTSG00005023353)	ENSOTSG00005023359	mier3a (ENSOTSG00005023365)	camsap1a (ENSOTSG00005023818)	notch1a (ENSOTSG00005023839)	ENSOTSG00005028639	ENSOTSG00005028640
Coho salmon	MODERN SPECIES	15	MOCS2 (ENSOKIG00005032445)	ENSOKIG00005032464	fstb (ENSOKIG00005032476)	ARL15 (ENSOKIG00005032486)	snx18b (ENSOKIG00005032490)	rasgef1bb (ENSOKIG00005032503)	ENSOKIG00005032582	antxr2b (ENSOKIG00005032602)	ENSOKIG00005032775	paqr3b (ENSOKIG00005032831)	ENSOKIG00005032952	rbm18 (ENSOKIG00005032989)	lhx6a (ENSOKIG00005033014)	morn5 (ENSOKIG00005033042)	ndufa8 (ENSOKIG00005033061)	si:ch211-243g18.2 (ENSOKIG00005033092) #22	RABGAP1 (ENSOKIG00005033193)	GPR21 (ENSOKIG00005034016)	ENSOKIG00005034026	STRBP (ENSOKIG00005034043)	SH2D3C (ENSOKIG00005034181)	urm1 (ENSOKIG00005034274)	CERCAM (ENSOKIG00005034298)	sardh (ENSOKIG00005034459)	FAM163B (ENSOKIG00005037047)	swi5 (ENSOKIG00005037057)	slc27a4 (ENSOKIG00005037165)	ptgdsa (ENSOKIG00005039272)	ambp (ENSOKIG00005039290)	nrarpa (ENSOKIG00005039340)	cdc37l1 (ENSOKIG00005039354)
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	52	ENSGT00940000157072.a.d	ENSGT00940000156244.a.b.d	ENSGT00940000157724.a.b.d	ENSGT00940000154091.a.a.s.b	ENSGT00940000155816.a.d	ENSGT00890000139463.b.b.b.e.b	ENSGT00940000156320.d.d	ENSGT00940000155291.b.d	ENSGT00940000159174.e	ENSGT00390000005084.d.a	ENSGT00940000177220	ENSGT00390000013765.n	ENSGT00940000156868.g.g.a	ENSGT00390000018089.c	ENSGT00390000008938.a	ENSGT00950000182969.A.a.b.f #22	ENSGT00940000157920.b	ENSGT00940000157685.i.b	ENSGT00940000163543.b	ENSGT00940000157216.j.b	ENSGT00940000154687.B.q.a.b	ENSGT00940000154130.a.b.e.f	ENSGT01030000234558.D.a.f	ENSGT00530000063085.B.c	ENSGT00940000159387.f.d	ENSGT00990000204868	ENSGT00940000158646.f	ENSGT00940000160109.d
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	57	ENSGT00940000157072.a.d	ENSGT00940000156244.a.b.d	ENSGT00940000157724.a.b.d	ENSGT00940000154091.a.a.s.b	ENSGT00940000155816.a.d	ENSGT00890000139463.b.b.b.e.b	ENSGT00940000156320.d.d	ENSGT00940000155291.b.d	ENSGT00940000159174.e	ENSGT00390000005084.d.a	ENSGT00940000177220	ENSGT00390000013765.n	ENSGT00940000156868.g.g.a	ENSGT00390000018089.c	ENSGT00390000008938.a	ENSGT00950000182969.A.a.b.f #22	ENSGT00940000157920.b	ENSGT00940000157685.i.b	ENSGT00940000163543.b.c	ENSGT00940000157216.j.b	ENSGT00940000154687.B.q.a.b	ENSGT00940000154130.a.b.e.f	ENSGT01030000234558.D.a.f	ENSGT00530000063085.B.c	ENSGT00940000159387.f.d	ENSGT00990000204868.b	ENSGT00940000158646.f	ENSGT00940000160109.d	ENSGT00390000006843	ENSGT00390000013443.d.d	ENSGT00940000155120.b
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000156244.a.b.c.a.b	ENSGT00940000156244.a.b.d	ENSGT00940000157724.a.b.d	ENSGT00940000154091.a.a.s.b	ENSGT00940000155816.a.d	ENSGT00890000139463.b.b.b.e.b	ENSGT00940000156320.d.d	ENSGT00940000155291.b.d	ENSGT00940000159174.e	ENSGT00390000005084.d.a	ENSGT00940000177220	ENSGT00390000013765.n	ENSGT00940000156868.g.g.a	ENSGT00390000018089.c	ENSGT00390000008938.a	ENSGT00950000182969.A.a.b.f #22	ENSGT00940000157920.b	ENSGT00940000157685.i.b	ENSGT00940000157216.j.b	ENSGT00940000163543.b.c	ENSGT00940000154687.B.q.a.b	ENSGT00940000154130.a.b.e.f	ENSGT01040000241697.a	ENSGT01030000234558.D.a.f	ENSGT00530000063085.B.c	ENSGT00940000159387.f.d	ENSGT00990000204868.b	ENSGT00940000158646.f	ENSGT00940000160109.d	ENSGT00390000006843	ENSGT00390000013443.d.d
River trout	MODERN SPECIES	6	ARL15 (ENSSTUG00000007051)	fstb (ENSSTUG00000007075)	snx18b (ENSSTUG00000007079)	ENSSTUG00000007083	rasgef1bb (ENSSTUG00000007121)	antxr2b (ENSSTUG00000007327)	paqr3b (ENSSTUG00000007392)	anxa3b (ENSSTUG00000007442)	mrrf (ENSSTUG00000007526)	ENSSTUG00000007544	rbm18 (ENSSTUG00000007552)	lhx6a (ENSSTUG00000007572)	morn5 (ENSSTUG00000007580)	ndufa8 (ENSSTUG00000007591)	ENSSTUG00000007600	si:ch211-243g18.2 (ENSSTUG00000007603) #22	ENSSTUG00000007633	ENSSTUG00000007649	RABGAP1 (ENSSTUG00000007696)	GPR21 (ENSSTUG00000008797)	ENSSTUG00000008810	ENSSTUG00000008827	ENSSTUG00000008834	STRBP (ENSSTUG00000008853)	SH2D3C (ENSSTUG00000009073)	ENSSTUG00000009184	ENSSTUG00000009193	ENSSTUG00000009204	ENSSTUG00000009224	dbh (ENSSTUG00000009236)	FAM163B (ENSSTUG00000009284)
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	4	ENSSSAG00000114287	snx18b (ENSSSAG00000116713)	ENSSSAG00000015572	rasgef1bb (ENSSSAG00000015626)	ENSSSAG00000015716	antxr2b (ENSSSAG00000015771)	ENSSSAG00000096776	paqr3b (ENSSSAG00000021835)	anxa3b (ENSSSAG00000022802)	mrrf (ENSSSAG00000026140)	rbm18 (ENSSSAG00000026491)	lhx6a (ENSSSAG00000027654)	ENSSSAG00000108955	morn5 (ENSSSAG00000101025)	ndufa8 (ENSSSAG00000028652)	si:ch211-243g18.2 (ENSSSAG00000028869) #22	ENSSSAG00000029317	ENSSSAG00000029476	ENSSSAG00000097631	ENSSSAG00000030121	strbp (ENSSSAG00000031285)	ENSSSAG00000120884	ENSSSAG00000093773	ENSSSAG00000032306	ENSSSAG00000075290	ENSSSAG00000113260	ENSSSAG00000033888	dbh (ENSSSAG00000041010)	ENSSSAG00000093843	ENSSSAG00000093188	slc27a4 (ENSSSAG00000041801)
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	47	ENSGT01020000232179	ENSGT00940000157072.a.d	ENSGT00940000156244.a.b.d	ENSGT00940000157724.a.b.d	ENSGT00940000154091.a.a.s.b	ENSGT00940000155816.a.d	ENSGT00890000139463.b.b.b.e.b	ENSGT00940000156320.d.d	ENSGT00940000155291.b.d	ENSGT00940000159174.e	ENSGT00390000005084.d.a	ENSGT00390000013765.n	ENSGT00940000156868.g.g.a	ENSGT00390000018089.c	ENSGT00390000008938.a	ENSGT00950000182969.A.a.b.f #22	ENSGT00940000157920.b	ENSGT00940000157685.i.b	ENSGT00940000163543.b.c	ENSGT00940000157216.j.b	ENSGT00940000154687.B.q.a.b	ENSGT00940000154130.a.b.e.f	ENSGT01030000234558.D.a.f	ENSGT00530000063085.B.c	ENSGT00940000159387.f.d	ENSGT00990000204868.b	ENSGT00940000158646.f	ENSGT00940000160109.d	ENSGT00390000006843	ENSGT00390000013443.d.d	ENSGT00940000155120.b
Rainbow trout	MODERN SPECIES	3	ARL15 (ENSOMYG00000019394)	snx18b (ENSOMYG00000019369)	ENSOMYG00000035108	ENSOMYG00000019352	rasgef1bb (ENSOMYG00000019338)	antxr2b (ENSOMYG00000019094)	paqr3b (ENSOMYG00000019024)	anxa3b (ENSOMYG00000018975)	ENSOMYG00000056904	ENSOMYG00000059574	mrrf (ENSOMYG00000018946)	rbm18 (ENSOMYG00000066240)	lhx6a (ENSOMYG00000018939)	morn5 (ENSOMYG00000018933)	ndufa8 (ENSOMYG00000018920)	si:ch211-243g18.2 (ENSOMYG00000018900) #22	ENSOMYG00000018887	ENSOMYG00000056234	GPR21 (ENSOMYG00000072697)	ENSOMYG00000018766	ENSOMYG00000053349	ENSOMYG00000018656	ENSOMYG00000062697	ENSOMYG00000064817	ENSOMYG00000060692	ENSOMYG00000018585	ENSOMYG00000066648	ENSOMYG00000018296	dbh (ENSOMYG00000018264)	ENSOMYG00000068284	ENSOMYG00000058972
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	48	ENSGT01020000232179	ENSGT00940000157072.a.d	ENSGT00940000156244.a.b.d	ENSGT00940000157724.a.b.d	ENSGT00940000154091.a.a.s.b	ENSGT00940000155816.a.d	ENSGT00890000139463.b.b.b.e.b	ENSGT00940000156320.d.d	ENSGT00940000155291.b.d	ENSGT00940000159174.e	ENSGT00390000005084.d.a	ENSGT00390000013765.n	ENSGT00940000156868.g.g.a	ENSGT00390000018089.c	ENSGT00390000008938.a	ENSGT00950000182969.A.a.b.f #22	ENSGT00940000157920.b	ENSGT00940000157685.i.b	ENSGT00940000163543.b.c	ENSGT00940000157216.j.b	ENSGT00940000154687.B.q.a.b	ENSGT00940000154130.a.b.e.f	ENSGT00940000174776	ENSGT01040000241697.a	ENSGT01030000234558.D.a.f	ENSGT00530000063085.B.c	ENSGT00940000159387.f.d	ENSGT00990000204868.b	ENSGT00940000158646.f	ENSGT00940000160109.d	ENSGT00390000006843
Coho salmon	MODERN SPECIES	26	fstb (ENSOKIG00005000420)	ARL15 (ENSOKIG00005000414)	snx18b (ENSOKIG00005000405)	ENSOKIG00005000368	rasgef1bb (ENSOKIG00005000313)	antxr2b (ENSOKIG00005000246)	paqr3b (ENSOKIG00005000183)	anxa3b (ENSOKIG00005000161)	ENSOKIG00005000152	mrrf (ENSOKIG00005000123)	ENSOKIG00005000096	rbm18 (ENSOKIG00005000083)	lhx6a (ENSOKIG00005000066)	morn5 (ENSOKIG00005000040)	ndufa8 (ENSOKIG00005000024)	si:ch211-243g18.2 (ENSOKIG00005043851) #22	ENSOKIG00005043826	ENSOKIG00005043792	GPR21 (ENSOKIG00005043779)	RABGAP1 (ENSOKIG00005042193)	STRBP (ENSOKIG00005041432)	SH2D3C (ENSOKIG00005041361)	ENSOKIG00005041326	ENSOKIG00005041293	CERCAM (ENSOKIG00005041060)	dbh (ENSOKIG00005041036)	FAM163B (ENSOKIG00005041033)	slc27a4 (ENSOKIG00005040735)	ambp (ENSOKIG00005040634)	ENSOKIG00005040595	ENSOKIG00005040586
Chinook salmon	MODERN SPECIES	33	ENSOTSG00005032970	tdgf1 (ENSOTSG00005032948)	ENSOTSG00005032945	ENSOTSG00005032943	ENSOTSG00005032939	nxnl2 (ENSOTSG00005032938)	CSGALNACT1 (ENSOTSG00005032937)	STRBP (ENSOTSG00005032932)	paqr3b (ENSOTSG00005032923)	anxa3b (ENSOTSG00005032920)	mrrf (ENSOTSG00005032916)	rbm18 (ENSOTSG00005032913)	lhx6a (ENSOTSG00005032911)	morn5 (ENSOTSG00005032907)	ENSOTSG00005032904	si:ch211-243g18.2 (ENSOTSG00005032886) #22	ENSOTSG00005032867	ENSOTSG00005032865	RABGAP1 (ENSOTSG00005032755)	CERCAM (ENSOTSG00005032749)	dbh (ENSOTSG00005032748)	FAM163B (ENSOTSG00005032747)	ENSOTSG00005032745	slc27a4 (ENSOTSG00005030646)	ENSOTSG00005030630	ambp (ENSOTSG00005030601)	ENSOTSG00005030592	cdc37l1 (ENSOTSG00005030589)	ak3 (ENSOTSG00005030585)	jak2a (ENSOTSG00005027989)	ENSOTSG00005027963
Huchen	MODERN SPECIES	2050																si:ch211-243g18.2 (ENSHHUG00000000439) #22	ENSHHUG00000000459	ENSHHUG00000000483	ENSHHUG00000000534	ENSHHUG00000000543	RABGAP1 (ENSHHUG00000000547)
Northern pike	MODERN SPECIES	13	fstb (ENSELUG00000005475)	ARL15 (ENSELUG00000005500)	snx18b (ENSELUG00000005515)	ENSELUG00000005537	rasgef1bb (ENSELUG00000001592)	ENSELUG00000000154	antxr2b (ENSELUG00000005614)	paqr3b (ENSELUG00000005678)	anxa3 (ENSELUG00000005818)	ENSELUG00000029989	mrrf (ENSELUG00000005852)	rbm18 (ENSELUG00000005876)	lhx6a (ENSELUG00000005915)	morn5 (ENSELUG00000005932)	ndufa8 (ENSELUG00000005962)	si:ch211-243g18.2 (ENSELUG00000006006) #22	ENSELUG00000006044	RC3H2 (ENSELUG00000006105)	RABGAP1 (ENSELUG00000000201)	GPR21 (ENSELUG00000006135)	STRBP (ENSELUG00000006540)	SH2D3C (ENSELUG00000006660)	ENSELUG00000006578	ENSELUG00000027794	ENSELUG00000005511	urm1 (ENSELUG00000006757)	CERCAM (ENSELUG00000006806)	sardh (ENSELUG00000006912)	dbh (ENSELUG00000006960)	FAM163B (ENSELUG00000028986)	ENSELUG00000030044
Osteoglossiformes	ANCESTRAL SPECIES	65	ENSGT00940000162230	ENSGT00940000156880.c.b	ENSGT00950000182975.a.a.b	ENSGT00940000157157.b.a.b	ENSGT00940000159324	ENSGT00940000158199	ENSGT00390000011509	ENSGT00390000008732.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00390000010743.b.a.a	ENSGT00390000005084	ENSGT00940000177220	ENSGT00390000013765	ENSGT00940000156868.g	ENSGT00390000018089	ENSGT00950000182969.A.a.b #22	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B.q.a	ENSGT00940000154130.a.b.e	ENSGT00390000005101	ENSGT01030000234558.D.a	ENSGT00940000157589	ENSGT00530000063085.B	ENSGT00940000159387.f	ENSGT00940000159447	ENSGT00940000160710	ENSGT00940000158795.m	ENSGT00940000155640.a	ENSGT00940000161373.cb	ENSGT00390000002955.f
Asian bonytongue	MODERN SPECIES	21	B3GALT9 (ENSSFOG00015001800)	KCNT1 (ENSSFOG00015001645)	camsap1b (ENSSFOG00015001555)	notch1a (ENSSFOG00015001412)	ENSSFOG00015001350	inpp5e (ENSSFOG00015001342)	ENSSFOG00015001322	rpl28 (ENSSFOG00015025883)	pdcl (ENSSFOG00015001272)	ptgs1 (ENSSFOG00015001194)	mrrf (ENSSFOG00015001131)	ENSSFOG00015001145	rbm18 (ENSSFOG00015032292)	lhx6a (ENSSFOG00015001064)	morn5 (ENSSFOG00015001034)	si:ch211-243g18.2 (ENSSFOG00015001007) #22	RC3H2 (ENSSFOG00015000964)	RABGAP1 (ENSSFOG00015000857)	ENSSFOG00015000779	SH2D3C (ENSSFOG00015000702)	urm1 (ENSSFOG00015000673)	CERCAM (ENSSFOG00015000611)	sardh (ENSSFOG00015000505)	dbh (ENSSFOG00015000449)	FAM163B (ENSSFOG00015000438)	ADAMTSL2 (ENSSFOG00015000229)	swi5 (ENSSFOG00015000214)	slc27a4 (ENSSFOG00015000115)	lcn15 (ENSSFOG00015024244)	ENSSFOG00015023097	nrarpa (ENSSFOG00015025355)
P. kingsleyae	MODERN SPECIES	88	ENSPKIG00000004253	B3GALT9 (ENSPKIG00000004266)	KCNT1 (ENSPKIG00000004391)	camsap1b (ENSPKIG00000004720)	notch1a (ENSPKIG00000004878)	ENSPKIG00000005095	inpp5e (ENSPKIG00000005282)	ENSPKIG00000005307	pdcl (ENSPKIG00000005321)	ptgs1 (ENSPKIG00000005344)	ENSPKIG00000005365	mrrf (ENSPKIG00000005396)	rbm18 (ENSPKIG00000005430)	lhx6a (ENSPKIG00000005455)	morn5 (ENSPKIG00000005500)	si:ch211-243g18.2 (ENSPKIG00000005528) #22
Osteoglossocephalai	ANCESTRAL SPECIES	981																ENSGT00950000182969.A.b #22	ENSGT00390000016794.c.b #23
Clupeocephala	ANCESTRAL SPECIES	863																ENSGT00950000182969.A.b #22	ENSGT00390000016794.c.b #23
Otomorpha	ANCESTRAL SPECIES	155	ENSGT00940000162795.c.b	ENSGT00940000153981.A	ENSGT00940000159196	ENSGT01060000248589.C.g.b	ENSGT00940000155600.a.a	ENSGT00940000155375.p	ENSGT00940000154443.g	ENSGT00940000154517.nb	ENSGT00940000166518	ENSGT00940000162831	ENSGT00940000157440.m.b	ENSGT00940000153648.a #19	ENSGT01030000234555.b.f #20	ENSGT00940000161090.A	ENSGT00940000163961.b.j	ENSGT00950000182969.A.b #22	ENSGT00390000016794.c.b #23	ENSGT01050000244848.A.b.b ##24	ENSGT00940000155400.A ##25	ENSGT00940000155890.a.b #27	ENSGT00940000158542.a #28	ENSGT00940000158471 #11	ENSGT01090000260005.a.a.a.b.a.b.a #12	ENSGT00390000005935 #13	ENSGT00940000177589	ENSGT00940000163418.D	ENSGT00940000156702.a.b.b ##14	ENSGT00940000158212.B	ENSGT00950000183022.b	ENSGT00940000162768.B.b	ENSGT00940000154360.A.b.b
Otophysi	ANCESTRAL SPECIES	49	ENSGT00940000153981.A	ENSGT00940000159196	ENSGT00940000159395.d	ENSGT01060000248589.C.g.b	ENSGT00940000155600.a.a	ENSGT00940000155375.p	ENSGT00940000154443.g	ENSGT00940000154517.nb	ENSGT00940000166518	ENSGT00940000162831	ENSGT00940000157440.m.b	ENSGT00940000153648.a #19	ENSGT01030000234555.b.f #20	ENSGT00940000161090.A	ENSGT00940000163961.b.j	ENSGT00950000182969.A.b #22	ENSGT00390000016794.c.b #23	ENSGT01050000244848.A.b.b ##24	ENSGT00940000155400.A ##25	ENSGT00940000155890.a.b #27	ENSGT00940000158542.a #28	ENSGT00940000158471 #11	ENSGT01090000260005.a.a.a.b.a.b.a #12	ENSGT00390000005935 #13	ENSGT00940000177589	ENSGT00940000163418.D	ENSGT00940000156702.a.b.b ##14	ENSGT00940000158212.B	ENSGT00950000183022.b	ENSGT00940000162768.B.b	ENSGT00940000154360.A.b.b
Characiphysae	ANCESTRAL SPECIES	34			ENSGT00940000159395.d	ENSGT01060000248589.C.g.b	ENSGT00940000155600.a.a	ENSGT00940000155375.p	ENSGT00940000154443.g	ENSGT00940000154517.nb	ENSGT00940000166518	ENSGT00940000162831	ENSGT00940000157440.m.b	ENSGT00940000153648.a #19	ENSGT01030000234555.b.f #20	ENSGT00940000161090.A	ENSGT00940000163961.b.j	ENSGT00950000182969.A.b #22	ENSGT00390000016794.c.b #23	ENSGT01050000244848.A.b.b ##24	ENSGT00940000155400.A ##25	ENSGT00940000155890.a.b #27	ENSGT00940000158542.a #28	ENSGT00940000158471 #11	ENSGT01090000260005.a.a.a.b.a.b.a #12	ENSGT00390000005935 #13	ENSGT00940000177589	ENSGT00940000163418.D	ENSGT00940000156702.a.b.b ##14	ENSGT00940000165423.a.b	ENSGT00950000183022.b	ENSGT00940000162768.B.b	ENSGT00940000154360.A.b.b
Characiphysae_b	ANCESTRAL SPECIES	50	ENSGT00390000013956	ENSGT00390000017860.a.b.f	ENSGT00940000159395.d	ENSGT01060000248589.C.g.b	ENSGT00940000155600.a.a	ENSGT00940000155375.p	ENSGT00940000154443.g	ENSGT00940000154517.nb	ENSGT00940000166518	ENSGT00940000162831	ENSGT00940000157440.m.b	ENSGT00940000153648.a #19	ENSGT01030000234555.b.f #20	ENSGT00940000161090.A	ENSGT00940000163961.b.j	ENSGT00950000182969.A.b #22	ENSGT00390000016794.c.b #23	ENSGT01050000244848.A.b.b ##24	ENSGT00940000155400.A ##25	ENSGT00940000155890.a.b #27	ENSGT00940000158542.a #28	ENSGT00940000158471 #11	ENSGT01090000260005.a.a.a.b.a.b.a #12	ENSGT00390000005935 #13	ENSGT00940000177589	ENSGT00940000163418.D	ENSGT00940000156702.a.b.b ##14	ENSGT00940000158212.B	ENSGT00950000183022.b	ENSGT00940000162768.B.b	ENSGT00940000154360.A.b.b
Electric eel	MODERN SPECIES	355										twist2 (ENSEEEG00000023217)	ENSEEEG00000023222	ENSEEEG00000023226	aamp (ENSEEEG00000023229) #19	ENSEEEG00000023231 #20	ENSEEEG00000023232	ENSEEEG00000023234 #22	ARPC2 (ENSEEEG00000023237) #23	ENSEEEG00000023239 ##24	ENSEEEG00000023240	ENSEEEG00000023241 ##25	ENSEEEG00000023243 ##25	igfbp5a (ENSEEEG00000023247) #27	igfbp2a (ENSEEEG00000023248) #28	stk11ip (ENSEEEG00000023249) #11	gjc4a.1 (ENSEEEG00000023252) #12	inha (ENSEEEG00000023253) #13	spega (ENSEEEG00000023254)	ENSEEEG00000023255	ENSEEEG00000023258	ENSEEEG00000023260 ##14	ENSEEEG00000023261