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ENSGT00390000005033 ENSGT00940000158712 ENSGT00940000158586 ENSGT00390000012377 ENSGT00730000111477 ENSGT00940000158296 ENSGT00390000017718 ENSGT00950000182767.b.b.d ENSGT00730000111160 ENSGT00390000012948.b Cricetidae ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000156502 ENSGT00490000043421 ENSGT00940000158324 ENSGT00940000157135 ENSGT00940000156593 ENSGT00970000194423 ENSGT00390000018516 ENSGT00940000157150 ENSGT00940000157509 ENSGT00390000012435 ENSGT00900000143162 ENSGT00510000048466 ENSGT00390000007341.a ENSGT00390000018085.a.a.a.b.b.b ##27 ENSGT00940000158830 ENSGT00940000154720.b #22 ENSGT00940000155369.A ENSGT00900000143197 ENSGT00390000003897.s.b.a.a.a ENSGT00390000007395 ENSGT00940000156480 ENSGT00940000154514.b ENSGT00390000005033 ENSGT00940000158712 ENSGT00940000158586 ENSGT00390000012377 ENSGT00700000106038.B ENSGT00940000158296 ENSGT00390000017718 ENSGT00950000182767.b.b.d ENSGT00730000111160 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000156502 ENSGT00490000043421 ENSGT00940000158324 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ENSGT00940000156593 ENSGT00970000194423 ENSGT00390000018516 ENSGT00940000157150 ENSGT00940000157509 ENSGT00390000012435 ENSGT00510000048466 ENSGT00900000143162 ENSGT00390000007341.a ENSGT00390000018085.a.a.a.b.b.b ##27 ENSGT00940000158830 ENSGT00940000154720.b #22 ENSGT00940000155369.A ENSGT00900000143197 ENSGT00390000003897.s.b.a.a.a ENSGT00390000007395 ENSGT00940000156480 ENSGT00940000154514.b ENSGT00390000005033 ENSGT00940000158712 ENSGT00940000158586 ENSGT00390000012377 ENSGT00940000158296 ENSGT00390000017718 ENSGT00950000182767.b.b.d ENSGT00730000111160 ENSGT00390000012948.b Golden Hamster MODERN SPECIES 652 Map4k5 (ENSMAUG00000020655) Cdkl1 (ENSMAUG00000020825) Dmac2l (ENSMAUG00000020577) L2hgdh (ENSMAUG00000015336) Sos2 (ENSMAUG00000013147) Vcpkmt (ENSMAUG00000001299) ENSMAUG00000000792 ENSMAUG00000009106 Klhdc2 (ENSMAUG00000012014) Pole2 (ENSMAUG00000001075) Dnaaf2 (ENSMAUG00000014305) ENSMAUG00000007273 Mgat2 (ENSMAUG00000009453) ENSMAUG00000016113 ##27 Lrr1 (ENSMAUG00000009765) ENSMAUG00000000899 #22 Mdga2 (ENSMAUG00000006354) ENSMAUG00000020516 Chinese hamster chok1gshd DUPLICATION Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 229 Pxdn (ENSCGRG00001003434) Tpo (ENSCGRG00001011361) Sntg2 (ENSCGRG00001008435) Tmem18 (ENSCGRG00001009444) Alkal2 (ENSCGRG00001011661) ENSCGRG00001003399 Sh3yl1 (ENSCGRG00001012436) Fam110c (ENSCGRG00001001095) Pla2g10 (ENSCGRG00001006810) Bfar (ENSCGRG00001018222) ENSCGRG00001013064 ENSCGRG00001023948 Parn (ENSCGRG00001012096) Mrtfb (ENSCGRG00001010790) Ercc4 (ENSCGRG00001003669) ENSCGRG00001000990 #22 ENSCGRG00001011152 Shisa9 (ENSCGRG00001023863) Cpped1 (ENSCGRG00001012402) Snx29 (ENSCGRG00001004219) Tnfrsf17 (ENSCGRG00001018459) Gspt1 (ENSCGRG00001009583) Rsl1d1 (ENSCGRG00001014989) Zc3h7a (ENSCGRG00001020639) Txndc11 (ENSCGRG00001016914) Snn (ENSCGRG00001001355) Litaf (ENSCGRG00001018758) Rmi2 (ENSCGRG00001020594) ENSCGRG00001021045 Prm3 (ENSCGRG00001001713) Tnp2 (ENSCGRG00001023391) Chinese hamster chok1gshd DUPLICATION Chinese hamster chok1gshd DUPLICATION Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 317 Fam8a1 (ENSCGRG00001015823) Nup153 (ENSCGRG00001021016) Kif13a (ENSCGRG00001014277) Nhlrc1 (ENSCGRG00001012520) Tpmt (ENSCGRG00001000696) Kdm1b (ENSCGRG00001017531) ENSCGRG00001004976 Rnf144b (ENSCGRG00001009668) Id4 (ENSCGRG00001009628) Zfp169 (ENSCGRG00001010605) Ptpdc1 (ENSCGRG00001017296) Barx1 (ENSCGRG00001020884) Phf2 (ENSCGRG00001019829) Fam120a (ENSCGRG00001009892) ##24 Wnk2 (ENSCGRG00001020589) ENSCGRG00001010167 #22 Ninj1 (ENSCGRG00001011059) Card19 (ENSCGRG00001014208) Susd3 (ENSCGRG00001020631) Fgd3 (ENSCGRG00001016233) Bicd2 (ENSCGRG00001024102) Ippk (ENSCGRG00001000859) Cenpp (ENSCGRG00001017117) Ecm2 (ENSCGRG00001014317) Aspn (ENSCGRG00001018512) Omd (ENSCGRG00001022773) Ogn (ENSCGRG00001017043) ENSCGRG00001016459 ENSCGRG00001017507 Iars (ENSCGRG00001023981) Nutm2 (ENSCGRG00001008000) Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 1 Cnot7 (ENSCGRG00001011174) Zdhhc2 (ENSCGRG00001012910) Micu3 (ENSCGRG00001013964) Fgf20 (ENSCGRG00001017693) ENSCGRG00001012099 Msr1 (ENSCGRG00001004518) ENSCGRG00001005908 ENSCGRG00001008370 Tusc3 (ENSCGRG00001010762) Sgcz (ENSCGRG00001012345) ENSCGRG00001005641 AI429214 (ENSCGRG00001009617) Dlc1 (ENSCGRG00001019041) Trmt9b (ENSCGRG00001019764) Lonrf1 (ENSCGRG00001020250) ENSCGRG00001005461 #22 Prag1 (ENSCGRG00001023518) Cldn23 (ENSCGRG00001006104) Gm19410 (ENSCGRG00001024429) ENSCGRG00001016163 Eri1 (ENSCGRG00001017852) Ppp1r3b (ENSCGRG00001005666) Tnks (ENSCGRG00001020318) Dusp4 (ENSCGRG00001022778) ENSCGRG00001007762 ENSCGRG00001005245 Saraf (ENSCGRG00001024847) Leprotl1 (ENSCGRG00001000543) Mboat4 (ENSCGRG00001015723) Dctn6 (ENSCGRG00001001182) Rbpms (ENSCGRG00001002814) Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 66 Chil6 (ENSCGRG00001019821) ENSCGRG00001000291 Chia1 (ENSCGRG00001018747) ENSCGRG00001023048 Pifo (ENSCGRG00001012700) Ovgp1 (ENSCGRG00001006238) Wdr77 (ENSCGRG00001002232) Atp5pb (ENSCGRG00001013168) I830077J02Rik (ENSCGRG00001009120) Tmigd3 (ENSCGRG00001018286) Adora3 (ENSCGRG00001021966) Rap1a (ENSCGRG00001016141) Inka2 (ENSCGRG00001010315) Ddx20 (ENSCGRG00001014132) Kcnd3 (ENSCGRG00001015791) ENSCGRG00001001537 #22 Cttnbp2nl (ENSCGRG00001022371) ENSCGRG00001004537 Wnt2b (ENSCGRG00001012445) St7l (ENSCGRG00001014565) Capza1 (ENSCGRG00001002836) Mov10 (ENSCGRG00001010914) Rhoc (ENSCGRG00001021156) Ppm1j (ENSCGRG00001010908) Tafa3 (ENSCGRG00001000102) Slc16a1 (ENSCGRG00001016479) Lrig2 (ENSCGRG00001000172) ENSCGRG00001012904 Magi3 (ENSCGRG00001019918) Phtf1 (ENSCGRG00001000594) Rsbn1 (ENSCGRG00001018807) Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 2 L2hgdh (ENSCGRG00001023345) Sos2 (ENSCGRG00001012314) ENSCGRG00001009974 Vcpkmt (ENSCGRG00001023926) Arf6 (ENSCGRG00001010290) ENSCGRG00001002262 Nemf (ENSCGRG00001017898) Klhdc2 (ENSCGRG00001019467) Klhdc1 (ENSCGRG00001020229) Pole2 (ENSCGRG00001011322) Dnaaf2 (ENSCGRG00001013061) ENSCGRG00001018548 Mgat2 (ENSCGRG00001010693) Rpl36al 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ENSGT00730000111477 ENSGT00940000158296 ENSGT00390000017718 ENSGT00950000182767.b.b.d ENSGT00730000111160 ENSGT00390000012948.b Rat DUPLICATION Rat MODERN SPECIES LOC108349848 (ENSRNOG00000070349) Synm (ENSRNOG00000014030) Ttc23 (ENSRNOG00000013877) Lrrc28 (ENSRNOG00000023274) Mef2a (ENSRNOG00000047756) Lysmd4 (ENSRNOG00000050624) Adamts17 (ENSRNOG00000037080) Cers3 (ENSRNOG00000013823) Lins1 (ENSRNOG00000042776) Asb7 (ENSRNOG00000013795) Aldh1a3 (ENSRNOG00000052070) Lrrk1 (ENSRNOG00000012730) Chsy1 (ENSRNOG00000012698) Selenos (ENSRNOG00000012576) Snrpa1 (ENSRNOG00000011932) ENSRNOG00000070428 #22 Pcsk6 (ENSRNOG00000011526) AABR07004134.1 (ENSRNOG00000056928) Tm2d3 (ENSRNOG00000011290) Tars3 (ENSRNOG00000024460) Tjp1 (ENSRNOG00000011077) AABR07004112.1 (ENSRNOG00000016498) Entrep2 (ENSRNOG00000023496) Apba2 (ENSRNOG00000016358) Mcee (ENSRNOG00000016327) Mphosph10 (ENSRNOG00000016266) Fan1 (ENSRNOG00000023985) Mtmr10 (ENSRNOG00000016090) Trpm1 (ENSRNOG00000015829) ENSRNOG00000064709 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ENSGT00940000158586 ENSGT00390000012377 ENSGT00730000111477 ENSGT00700000106038.B ENSGT00940000158296 ENSGT00390000017718 ENSGT00950000182767.b.b.d ENSGT00730000111160 Ryukyu mouse MODERN SPECIES 3 Dmac2l (MGP_CAROLIEiJ_G0017810) L2hgdh (MGP_CAROLIEiJ_G0017809) Sos2 (MGP_CAROLIEiJ_G0017808) Vcpkmt (MGP_CAROLIEiJ_G0017807) Arf6 (MGP_CAROLIEiJ_G0017806) MGP_CAROLIEiJ_G0017805 Nemf (MGP_CAROLIEiJ_G0017804) Klhdc2 (MGP_CAROLIEiJ_G0017803) Klhdc1 (MGP_CAROLIEiJ_G0017802) Pole2 (MGP_CAROLIEiJ_G0017801) MGP_CAROLIEiJ_G0017800 Dnaaf2 (MGP_CAROLIEiJ_G0017799) Mgat2 (MGP_CAROLIEiJ_G0017798) MGP_CAROLIEiJ_G0017797 ##27 Lrr1 (MGP_CAROLIEiJ_G0017796) Rps29 (MGP_CAROLIEiJ_G0017795) #22 Mdga2 (MGP_CAROLIEiJ_G0017794) Rpl10l (MGP_CAROLIEiJ_G0017793) Mis18bp1 (MGP_CAROLIEiJ_G0017792) Fancm (MGP_CAROLIEiJ_G0017791) Fkbp3 (MGP_CAROLIEiJ_G0017790) Prpf39 (MGP_CAROLIEiJ_G0017789) Togaram1 (MGP_CAROLIEiJ_G0017788) Klhl28 (MGP_CAROLIEiJ_G0017787) Gm527 (MGP_CAROLIEiJ_G0017786) MGP_CAROLIEiJ_G0017785 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(ENSNGAG00000014806) Hecw1 (ENSNGAG00000002566) ENSNGAG00000011632 #22 Ciao2a (ENSNGAG00000011845) Snx1 (ENSNGAG00000008529) Snx22 (ENSNGAG00000009778) Ppib (ENSNGAG00000010794) Csnk1g1 (ENSNGAG00000020698) Pclaf (ENSNGAG00000014228) Trip4 (ENSNGAG00000019566) Zfp609 (ENSNGAG00000013924) ENSNGAG00000015132 Rbpms2 (ENSNGAG00000023569) Pif1 (ENSNGAG00000021720) Plekho2 (ENSNGAG00000021787) ENSNGAG00000003639 Ankdd1a (ENSNGAG00000009321) ENSNGAG00000021527 Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 684 L2hgdh (ENSNGAG00000015201) Sos2 (ENSNGAG00000020145) Vcpkmt (ENSNGAG00000010479) ENSNGAG00000001008 Arf6 (ENSNGAG00000021182) ENSNGAG00000020523 ENSNGAG00000021321 Klhdc2 (ENSNGAG00000002689) Klhdc1 (ENSNGAG00000019790) Pole2 (ENSNGAG00000018619) Dnaaf2 (ENSNGAG00000019379) ENSNGAG00000011083 Mgat2 (ENSNGAG00000012185) ENSNGAG00000021930 ##27 Lrr1 (ENSNGAG00000006447) ENSNGAG00000013159 #22 Mdga2 (ENSNGAG00000000533) ENSNGAG00000018918 Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 43 Copb1 (ENSJJAG00000013738) Rras2 (ENSJJAG00000023091) Spon1 (ENSJJAG00000021081) Far1 (ENSJJAG00000023677) Pth (ENSJJAG00000020801) ENSJJAG00000021998 Arntl (ENSJJAG00000018760) Rassf10 (ENSJJAG00000013526) Tead1 (ENSJJAG00000020173) Parva (ENSJJAG00000013058) ENSJJAG00000022447 Mical2 (ENSJJAG00000021294) Dkk3 (ENSJJAG00000013289) Usp47 (ENSJJAG00000022599) Galnt18 (ENSJJAG00000021987) ENSJJAG00000011627 #22 ENSJJAG00000011119 ENSJJAG00000021142 ENSJJAG00000006637 Ctr9 (ENSJJAG00000003972) Irag1 (ENSJJAG00000013023) Lyve1 (ENSJJAG00000018545) ENSJJAG00000014778 ENSJJAG00000000841 Ampd3 (ENSJJAG00000010237) Adm (ENSJJAG00000024387) ENSJJAG00000020513 ENSJJAG00000015333 ENSJJAG00000013130 ENSJJAG00000008080 Swap70 (ENSJJAG00000020532) Kangaroo rat DUPLICATION Kangaroo rat MODERN SPECIES 320 Epsti1 (ENSDORG00000004992) Fam216b (ENSDORG00000007655) Tnfsf11 (ENSDORG00000026136) Dgkh (ENSDORG00000005024) Vwa8 (ENSDORG00000011298) Rgcc (ENSDORG00000015195) Naa16 (ENSDORG00000012584) Mtrf1 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ENSDORG00000023215 Crygc (ENSDORG00000023173) Crygd (ENSDORG00000003876) ENSDORG00000027705 Plekhm3 (ENSDORG00000029697) ENSDORG00000023690 Fzd5 (ENSDORG00000027490) Ccnyl1 (ENSDORG00000009933) Mettl21a (ENSDORG00000012543) Creb1 (ENSDORG00000012535) Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000158072 ENSGT00940000159132.a ENSGT00940000156502 ENSGT00490000043421 ENSGT00940000158324 ENSGT00940000157135 ENSGT00940000156593 ENSGT00390000018516 ENSGT00940000157150 ENSGT00940000157509 ENSGT00390000012435 ENSGT00510000048466 ENSGT00390000007341.a ENSGT00390000018085.a.a.a.b.b.b ##27 ENSGT00940000158830 ENSGT00940000154720.b #22 ENSGT00940000168019 ENSGT00940000161931 ENSGT00940000155369.A ENSGT00390000003897.s.b.a.a.a ENSGT00390000007395 ENSGT00940000156480 ENSGT00940000154514.b ENSGT00390000005033 ENSGT00940000158712 ENSGT00940000158586 ENSGT00390000012377 ENSGT00730000111477 ENSGT00940000158296 ENSGT00390000017718 ENSGT00950000182767.b.b.d Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES 15 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ENSHGLG00000010009 MGAT2 (ENSHGLG00000020857) ENSHGLG00000035140 ##27 ENSHGLG00000013547 RPS29 (ENSHGLG00000033323) #22 ENSHGLG00000047775 ENSHGLG00000038797 ENSHGLG00000033780 ENSHGLG00000017089 ENSHGLG00000036645 ENSHGLG00000016763 ENSHGLG00000032093 ENSHGLG00000048747 ENSHGLG00000048597 ENSHGLG00000040429 ENSHGLG00000019549 ENSHGLG00000000611 ENSHGLG00000016363 FANCM (ENSHGLG00000013787) ENSHGLG00000012727 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000158072 ENSGT00940000159132.a ENSGT00940000156502 ENSGT00490000043421 ENSGT00940000158324 ENSGT00940000157135 ENSGT00940000156593 ENSGT00390000018516 ENSGT00940000157150 ENSGT00940000157509 ENSGT00390000012435 ENSGT00510000048466 ENSGT00390000007341.a ENSGT00390000018085.a.a.a.b.b.b ##27 ENSGT00940000158830 ENSGT00940000154720.b #22 ENSGT00940000161931 ENSGT00940000155369.A ENSGT00390000003897.s.b.a.a.a ENSGT00390000007395 ENSGT00940000156480 ENSGT00940000154514.b ENSGT00390000005033 ENSGT00940000158712 ENSGT00940000158586 ENSGT00390000012377 ENSGT00940000164190 ENSGT00940000158296 ENSGT00390000017718 ENSGT00950000182767.b.b.d ENSGT00730000111160 Guinea pig MODERN SPECIES 23 MAP4K5 (ENSCPOG00000014479) CDKL1 (ENSCPOG00000034915) DMAC2L (ENSCPOG00000014471) L2HGDH (ENSCPOG00000010700) SOS2 (ENSCPOG00000010690) VCPKMT (ENSCPOG00000011127) ARF6 (ENSCPOG00000008137) NEMF (ENSCPOG00000011839) KLHDC2 (ENSCPOG00000011835) KLHDC1 (ENSCPOG00000038390) POLE2 (ENSCPOG00000004304) DNAAF2 (ENSCPOG00000009147) MGAT2 (ENSCPOG00000009139) ENSCPOG00000037100 ##27 LRR1 (ENSCPOG00000032561) RPS29 (ENSCPOG00000032637) #22 MDGA2 (ENSCPOG00000001953) RPL10L (ENSCPOG00000015183) MIS18BP1 (ENSCPOG00000001453) FANCM (ENSCPOG00000001446) FKBP3 (ENSCPOG00000031983) PRPF39 (ENSCPOG00000001443) TOGARAM1 (ENSCPOG00000015482) KLHL28 (ENSCPOG00000011148) C14orf28 (ENSCPOG00000030521) KIF4B (ENSCPOG00000033325) LRFN5 (ENSCPOG00000005325) ENSCPOG00000035115 ENSCPOG00000007732 ENSCPOG00000030116 PNN (ENSCPOG00000030068) Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154720.b #22 Degu DUPLICATION Degu MODERN SPECIES 84 ENSODEG00000006288 ENSODEG00000019205 ENSODEG00000009554 ENSODEG00000009106 ENSODEG00000006477 PDE12 (ENSODEG00000006268) ENSODEG00000006837 DENND6A (ENSODEG00000005908) ENSODEG00000019341 ENSODEG00000006496 SLMAP (ENSODEG00000005798) FLNB (ENSODEG00000008526) ENSODEG00000006739 DNASE1L3 (ENSODEG00000006359) BTD (ENSODEG00000006036) ENSODEG00000019220 #22 ENSODEG00000019255 ENSODEG00000008690 ENSODEG00000019376 ANKRD28 (ENSODEG00000007156) GALNT15 (ENSODEG00000005854) ENSODEG00000005288 OXNAD1 (ENSODEG00000005968) RFTN1 (ENSODEG00000005477) ENSODEG00000019190 ENSODEG00000006167 ENSODEG00000019240 PLCL2 (ENSODEG00000005955) TBC1D5 (ENSODEG00000006516) SATB1 (ENSODEG00000006082) KCNH8 (ENSODEG00000005720) Degu MODERN SPECIES 311 ENSODEG00000000166 ENSODEG00000018519 #22 ENSODEG00000000147 Degu MODERN SPECIES 172 ENSODEG00000019135 ENSODEG00000005507 NFASC (ENSODEG00000006271) CNTN2 (ENSODEG00000005095) RBBP5 (ENSODEG00000005136) DSTYK (ENSODEG00000007490) TMCC2 (ENSODEG00000005555) NUAK2 (ENSODEG00000006060) KLHDC8A (ENSODEG00000006709) ENSODEG00000005112 CDK18 (ENSODEG00000005608) MFSD4A (ENSODEG00000005247) ELK4 (ENSODEG00000006084) ENSODEG00000019457 #22 SLC45A3 (ENSODEG00000007692) ENSODEG00000005090 RAB29 (ENSODEG00000006357) SLC41A1 (ENSODEG00000006495) PM20D1 (ENSODEG00000005792) SLC26A9 (ENSODEG00000005539) RAB7B (ENSODEG00000005589) CTSE (ENSODEG00000005548) AVPR1B (ENSODEG00000006394) ENSODEG00000005913 ENSODEG00000007417 IKBKE (ENSODEG00000005963) RASSF5 (ENSODEG00000007254) EIF2D (ENSODEG00000005533) DYRK3 (ENSODEG00000005989) Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000156502 ENSGT00490000043421 ENSGT00940000158324 ENSGT00940000157135 ENSGT00940000156593 ENSGT00390000018516 ENSGT00940000157150 ENSGT00940000157509 ENSGT00390000012435 ENSGT00510000048466 ENSGT00390000007341.a ENSGT00940000161656 ENSGT00390000018085.a.a.a.b.a ##27 ENSGT00390000018085.a.a.a.a ##27 ENSGT00940000158830 ENSGT00940000154720.b #22 ENSGT00940000161931 ENSGT00940000155369.A ENSGT00390000003897.s.b.a.a.a ENSGT00390000007395 ENSGT00940000156480 ENSGT00940000154514.b ENSGT00390000005033 ENSGT00940000158712 ENSGT00940000158586 ENSGT00390000012377 ENSGT00730000111477 ENSGT00940000158296 ENSGT00390000017718 ENSGT00950000182767.b.b.d.t ENSGT00730000111160.j Eurasian red squirrel DUPLICATION Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 11 CDKL1 (ENSSVLG00005008203) DMAC2L (ENSSVLG00005008238) L2HGDH (ENSSVLG00005008301) SOS2 (ENSSVLG00005008363) VCPKMT (ENSSVLG00005008401) ARF6 (ENSSVLG00005008433) NEMF (ENSSVLG00005008455) KLHDC2 (ENSSVLG00005008503) KLHDC1 (ENSSVLG00005008548) ENSSVLG00005008574 POLE2 (ENSSVLG00005008639) DNAAF2 (ENSSVLG00005008952) MGAT2 (ENSSVLG00005008964) RPL36AL (ENSSVLG00005008979) LRR1 (ENSSVLG00005008998) ENSSVLG00005009087 #22 ENSSVLG00005009142 ENSSVLG00005009176 MDGA2 (ENSSVLG00005009198) ENSSVLG00005009425 RPL10L (ENSSVLG00005009435) ENSSVLG00005009496 ENSSVLG00005009546 MIS18BP1 (ENSSVLG00005009570) FANCM (ENSSVLG00005009709) FKBP3 (ENSSVLG00005010096) ENSSVLG00005010123 TOGARAM1 (ENSSVLG00005010233) ENSSVLG00005010384 KLHL28 (ENSSVLG00005010413) C14orf28 (ENSSVLG00005010455) Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 18 ENSSVLG00005009691 ENSSVLG00005009661 ENSSVLG00005009520 ADH7 (ENSSVLG00005009430) C4orf17 (ENSSVLG00005009347) TRMT10A (ENSSVLG00005009297) MTTP (ENSSVLG00005009151) C4orf54 (ENSSVLG00005009113) ENSSVLG00005009094 DAPP1 (ENSSVLG00005008968) ENSSVLG00005008864 DNAJB14 (ENSSVLG00005008827) ENSSVLG00005008769 DDIT4L (ENSSVLG00005008748) EMCN (ENSSVLG00005008557) ENSSVLG00005008499 #22 PPP3CA (ENSSVLG00005008404) ENSSVLG00005008348 ENSSVLG00005008327 BANK1 (ENSSVLG00005008002) SLC39A8 (ENSSVLG00005007869) ENSSVLG00005007842 ENSSVLG00005007814 NFKB1 (ENSSVLG00005007655) MANBA (ENSSVLG00005007586) ENSSVLG00005007472 CISD2 (ENSSVLG00005007409) SLC9B1 (ENSSVLG00005007310) SLC9B2 (ENSSVLG00005007129) BDH2 (ENSSVLG00005007067) CENPE (ENSSVLG00005006634) Marmotini ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000158072 ENSGT00940000159132.a ENSGT00940000156502 ENSGT00490000043421 ENSGT00940000158324 ENSGT00940000157135 ENSGT00940000156593 ENSGT00390000018516 ENSGT00940000157150 ENSGT00940000157509 ENSGT00390000012435 ENSGT00510000048466 ENSGT00390000007341.a ENSGT00390000018085.a.a.a.a ##27 ENSGT00940000158830 ENSGT00940000154720.b #22 ENSGT00940000161931 ENSGT00940000155369.A ENSGT00390000003897.s.b.a.a.a ENSGT00390000007395 ENSGT00940000156480 ENSGT00940000154514.b ENSGT00390000005033 ENSGT00940000158712 ENSGT00940000158586 ENSGT00390000012377 ENSGT00940000158296 ENSGT00390000017718 ENSGT00950000182767.b.b.d.t ENSGT00730000111160.j ENSGT00390000012948.b Alpin marmot DUPLICATION Alpin marmot MODERN SPECIES RGS19 (ENSMMMG00000000211) TCEA2 (ENSMMMG00000000252) C20orf204 (ENSMMMG00000000267) PRPF6 (ENSMMMG00000000333) ENSMMMG00000000797 SAMD10 (ENSMMMG00000000802) ZNF512B (ENSMMMG00000000818) UCKL1 (ENSMMMG00000000881) DNAJC5 (ENSMMMG00000000914) TPD52L2 (ENSMMMG00000000947) ABHD16B (ENSMMMG00000001062) ZBTB46 (ENSMMMG00000001077) SLC2A4RG (ENSMMMG00000001105) ENSMMMG00000001114 ZGPAT (ENSMMMG00000001152) ENSMMMG00000001208 #22 ARFRP1 (ENSMMMG00000001220) RTEL1 (ENSMMMG00000001278) STMN3 (ENSMMMG00000001758) GMEB2 (ENSMMMG00000001787) ENSMMMG00000001804 HELZ2 (ENSMMMG00000001816) FNDC11 (ENSMMMG00000001907) SRMS (ENSMMMG00000001913) PTK6 (ENSMMMG00000001940) PPDPF (ENSMMMG00000001957) EEF1A2 (ENSMMMG00000001969) KCNQ2 (ENSMMMG00000002019) CHRNA4 (ENSMMMG00000002798) COL20A1 (ENSMMMG00000002849) ARFGAP1 (ENSMMMG00000003181) Alpin marmot MODERN SPECIES 1 MAP4K5 (ENSMMMG00000001735) CDKL1 (ENSMMMG00000001936) DMAC2L (ENSMMMG00000001954) L2HGDH (ENSMMMG00000001966) SOS2 (ENSMMMG00000002005) VCPKMT (ENSMMMG00000002166) ARF6 (ENSMMMG00000002177) NEMF (ENSMMMG00000002268) KLHDC2 (ENSMMMG00000002856) KLHDC1 (ENSMMMG00000002951) POLE2 (ENSMMMG00000002980) DNAAF2 (ENSMMMG00000003007) MGAT2 (ENSMMMG00000003019) ENSMMMG00000003026 ##27 LRR1 (ENSMMMG00000003031) ENSMMMG00000003048 #22 ENSMMMG00000003059 ENSMMMG00000003083 ENSMMMG00000003100 RPL10L (ENSMMMG00000003144) ENSMMMG00000003154 ENSMMMG00000003166 ENSMMMG00000003184 ENSMMMG00000003194 FKBP3 (ENSMMMG00000003203) PRPF39 (ENSMMMG00000003250) TOGARAM1 (ENSMMMG00000003305) ENSMMMG00000003419 KLHL28 (ENSMMMG00000003427) C14orf28 (ENSMMMG00000003444) LRFN5 (ENSMMMG00000003466) Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000159132.a ENSGT00940000156502 ENSGT00490000043421 ENSGT00940000158324 ENSGT00940000157135 ENSGT00940000156593 ENSGT00390000018516 ENSGT00940000157150 ENSGT00940000157509 ENSGT00390000012435 ENSGT00510000048466 ENSGT00390000007341.a ENSGT00940000161656 ENSGT00390000018085.a.a.a.b.a ##27 ENSGT00940000158830 ENSGT00940000154720.b #22 ENSGT00940000161931 ENSGT00940000155369.A ENSGT00390000003897.s.b.a.a.a ENSGT00390000007395 ENSGT00940000156480 ENSGT00940000154514.b ENSGT00390000005033 ENSGT00940000158712 ENSGT00940000158586 ENSGT00390000012377 Arctic ground squirrel DUPLICATION Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 345 SHCBP1 (ENSUPAG00010006909) ENSUPAG00010006814 VPS35 (ENSUPAG00010006777) ORC6 (ENSUPAG00010006762) MYLK3 (ENSUPAG00010006742) C16orf87 (ENSUPAG00010006726) ENSUPAG00010006721 GPT2 (ENSUPAG00010006694) ENSUPAG00010006682 ENSUPAG00010006680 #22 NETO2 (ENSUPAG00010006651) ITFG1 (ENSUPAG00010006623) PHKB (ENSUPAG00010006450) ABCC12 (ENSUPAG00010006392) ENSUPAG00010006386 ABCC11 (ENSUPAG00010006358) ENSUPAG00010006356 Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 84 MAP4K5 (ENSUPAG00010007764) CDKL1 (ENSUPAG00010007853) DMAC2L (ENSUPAG00010007867) L2HGDH (ENSUPAG00010007904) SOS2 (ENSUPAG00010007931) VCPKMT (ENSUPAG00010008108) ARF6 (ENSUPAG00010008117) NEMF (ENSUPAG00010008130) KLHDC2 (ENSUPAG00010008179) KLHDC1 (ENSUPAG00010008181) POLE2 (ENSUPAG00010008225) DNAAF2 (ENSUPAG00010008249) ENSUPAG00010008252 ENSUPAG00010008255 ##27 LRR1 (ENSUPAG00010008259) ENSUPAG00010008281 #22 ENSUPAG00010008297 MDGA2 (ENSUPAG00010008313) RPL10L (ENSUPAG00010008397) Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154720.b #22 Rabbit DUPLICATION Rabbit MODERN SPECIES 8 CDKL1 (ENSOCUG00000023744) DMAC2L (ENSOCUG00000003348) L2HGDH (ENSOCUG00000011422) SOS2 (ENSOCUG00000006052) VCPKMT (ENSOCUG00000006049) ARF6 (ENSOCUG00000001692) NEMF (ENSOCUG00000017384) KLHDC2 (ENSOCUG00000017378) KLHDC1 (ENSOCUG00000017367) ENSOCUG00000031174 POLE2 (ENSOCUG00000015480) ENSOCUG00000015466 MGAT2 (ENSOCUG00000015463) ENSOCUG00000027946 ##27 LRR1 (ENSOCUG00000000121) ENSOCUG00000027423 #22 ENSOCUG00000033024 MDGA2 (ENSOCUG00000017002) RPL10L (ENSOCUG00000015485) ENSOCUG00000012678 ENSOCUG00000021198 ENSOCUG00000027427 ENSOCUG00000035475 ENSOCUG00000007451 MIS18BP1 (ENSOCUG00000007550) FANCM (ENSOCUG00000007539) ENSOCUG00000007535 PRPF39 (ENSOCUG00000007531) TOGARAM1 (ENSOCUG00000006378) KLHL28 (ENSOCUG00000006372) ENSOCUG00000008733 Rabbit MODERN SPECIES 14 ENSOCUG00000039638 ENSOCUG00000037614 TMEM74 (ENSOCUG00000000175) EMC2 (ENSOCUG00000002461) ENSOCUG00000027337 EIF3E (ENSOCUG00000008050) RSPO2 (ENSOCUG00000000779) ANGPT1 (ENSOCUG00000003722) ENSOCUG00000023959 ABRA (ENSOCUG00000006570) OXR1 (ENSOCUG00000000462) ZFPM2 (ENSOCUG00000005930) LRP12 (ENSOCUG00000002245) DPYS (ENSOCUG00000011148) ENSOCUG00000004398 ENSOCUG00000025731 #22 ENSOCUG00000033506 RIMS2 (ENSOCUG00000011775) SLC25A32 (ENSOCUG00000009191) DCAF13 (ENSOCUG00000009197) FZD6 (ENSOCUG00000009180) ENSOCUG00000021507 ENSOCUG00000013717 ATP6V1C1 (ENSOCUG00000017814) AZIN1 (ENSOCUG00000015196) KLF10 (ENSOCUG00000016141) ODF1 (ENSOCUG00000017222) ENSOCUG00000030455 UBR5 (ENSOCUG00000008549) RRM2B (ENSOCUG00000008545) NCALD (ENSOCUG00000009431)