Bovidae	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000154922.b	ENSGT00940000161321 #7	ENSGT00390000000614 #8	ENSGT00940000161082 #9	ENSGT00940000160761 #10	ENSGT00940000161543 #12	ENSGT00390000003256 #11	ENSGT00940000153766.A #13	ENSGT00950000183100.B #14	ENSGT00940000153408.A.d #15	ENSGT00940000157048 #16	ENSGT00940000155636 #17	ENSGT00390000003812 #18	ENSGT00390000018686 #19	ENSGT00390000006493 #21	ENSGT00940000157284 #22	ENSGT00390000001121 #23	ENSGT00940000157084 #24	ENSGT00940000165752 #25	ENSGT00940000158672 #26	ENSGT00490000044373	ENSGT00950000182898.a.a.a.a.b #27	ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b #28	ENSGT00940000157927 #29	ENSGT00940000159120	ENSGT00390000013762.b.a #30	ENSGT00940000159341 #31	ENSGT00940000158246 #32	ENSGT00390000006786 #33	ENSGT00550000074922 #34	ENSGT00390000010738 #35
Caprinae	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000154922.b	ENSGT00940000161321 #7	ENSGT00390000000614 #8	ENSGT00940000161082 #9	ENSGT00940000160761 #10	ENSGT00940000161543 #12	ENSGT00390000003256 #11	ENSGT00940000153766.A #13	ENSGT00950000183100.B #14	ENSGT00940000153408.A.d #15	ENSGT00940000157048 #16	ENSGT00940000155636 #17	ENSGT00390000003812 #18	ENSGT00390000018686 #19	ENSGT00390000006493 #21	ENSGT00940000157284 #22	ENSGT00390000001121 #23	ENSGT00940000157084 #24	ENSGT00940000165752 #25	ENSGT00940000158672 #26	ENSGT00490000044373	ENSGT00950000182898.a.a.a.a.b #27	ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b #28	ENSGT00940000157927 #29	ENSGT00940000159120	ENSGT00390000013762.b.a #30	ENSGT00940000159341 #31	ENSGT00940000158246 #32	ENSGT00390000006786 #33	ENSGT00550000074922 #34	ENSGT00390000010738 #35
Goat	MODERN SPECIES	15	CRIP3 (ENSCHIG00000016523) #7	ZNF318 (ENSCHIG00000003026) #8	ABCC10 (ENSCHIG00000016995) #9	DLK2 (ENSCHIG00000005158) #10	LRRC73 (ENSCHIG00000022549) #11	TJAP1 (ENSCHIG00000021772) #12	YIPF3 (ENSCHIG00000012623) #13	POLR1C (ENSCHIG00000004352) #14	XPO5 (ENSCHIG00000011271) #15	POLH (ENSCHIG00000010328) #16	GTPBP2 (ENSCHIG00000011328) #17	MAD2L1BP (ENSCHIG00000008563) #18	RSPH9 (ENSCHIG00000014085) #19	ENSCHIG00000006683 #20	MRPS18A (ENSCHIG00000013039) #21	VEGFA (ENSCHIG00000009242) #22	MRPL14 (ENSCHIG00000016433) #23	TMEM63B (ENSCHIG00000010295) #24	ENSCHIG00000017964 #25	CAPN11 (ENSCHIG00000010362) #26	SLC29A1 (ENSCHIG00000022410) #27	ENSCHIG00000017807 #28	SLC35B2 (ENSCHIG00000018057) #29	TMEM151B (ENSCHIG00000023296) #30	TCTE1 (ENSCHIG00000011244) #31	AARS2 (ENSCHIG00000018888) #32	SPATS1 (ENSCHIG00000010115) #33	CDC5L (ENSCHIG00000022031) #34	SUPT3H (ENSCHIG00000016615) #35	RUNX2 (ENSCHIG00000016080) #36	CLIC5 (ENSCHIG00000014360) #37
Rambouillet Sheep	MODERN SPECIES	12	CRIP3 (ENSOARG00020021515) #7	ZNF318 (ENSOARG00020021662) #8	ABCC10 (ENSOARG00020021781) #9	DLK2 (ENSOARG00020021941) #10	TJAP1 (ENSOARG00020021973) #12	LRRC73 (ENSOARG00020022144) #11	YIPF3 (ENSOARG00020022197) #13	POLR1C (ENSOARG00020022290) #14	XPO5 (ENSOARG00020022433) #15	POLH (ENSOARG00020022497) #16	GTPBP2 (ENSOARG00020022529) #17	MAD2L1BP (ENSOARG00020022622) #18	RSPH9 (ENSOARG00020022645) #19	MRPS18A (ENSOARG00020022680) #21	ENSOARG00020022732 ##20	VEGFA (ENSOARG00020022857) #22	MRPL14 (ENSOARG00020024309) #23	TMEM63B (ENSOARG00020024328) #24	CAPN11 (ENSOARG00020024352) #26	MYMX (ENSOARG00020024406)	SLC29A1 (ENSOARG00020024417) #27	HSP90AB1 (ENSOARG00020024426) #28	SLC35B2 (ENSOARG00020024444) #29	NFKBIE (ENSOARG00020024469)	TMEM151B (ENSOARG00020024483) #30	TCTE1 (ENSOARG00020024516) #31	AARS2 (ENSOARG00020024543) #32	CDC5L (ENSOARG00020024617) #34	SUPT3H (ENSOARG00020024651) #35	RUNX2 (ENSOARG00020024751) #36	CLIC5 (ENSOARG00020011684) #37
Bovinae	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000154922.b	ENSGT00940000161321 #7	ENSGT00390000000614 #8	ENSGT00940000161082 #9	ENSGT00940000160761 #10	ENSGT00940000161543 #12	ENSGT00390000003256 #11	ENSGT00940000153766.A #13	ENSGT00950000183100.B #14	ENSGT00940000153408.A.d #15	ENSGT00940000157048 #16	ENSGT00940000155636 #17	ENSGT00390000003812 #18	ENSGT00390000018686 #19	ENSGT00390000006493 #21	ENSGT00940000157284 #22	ENSGT00390000001121 #23	ENSGT00940000157084 #24	ENSGT00940000165752 #25	ENSGT00940000158672 #26	ENSGT00490000044373	ENSGT00950000182898.a.a.a.a.b #27	ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b #28	ENSGT00940000157927 #29	ENSGT00940000159120	ENSGT00390000013762.b.a #30	ENSGT00940000159341 #31	ENSGT00940000158246 #32	ENSGT00390000006786 #33	ENSGT00550000074922 #34	ENSGT00390000010738 #35
Bos	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000154922.b	ENSGT00940000161321 #7	ENSGT00390000000614 #8	ENSGT00940000161082 #9	ENSGT00940000160761 #10	ENSGT00940000161543 #12	ENSGT00390000003256 #11	ENSGT00940000153766.A #13	ENSGT00950000183100.B #14	ENSGT00940000153408.A.d #15	ENSGT00940000157048 #16	ENSGT00940000155636 #17	ENSGT00390000003812 #18	ENSGT00390000018686 #19	ENSGT00390000006493 #21	ENSGT00940000157284 #22	ENSGT00390000001121 #23	ENSGT00940000157084 #24	ENSGT00940000165752 #25	ENSGT00940000158672 #26	ENSGT00490000044373	ENSGT00950000182898.a.a.a.a.b #27	ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b #28	ENSGT00940000157927 #29	ENSGT00940000159120	ENSGT00390000013762.b.a #30	ENSGT00940000159341 #31	ENSGT00940000158246 #32	ENSGT00390000006786 #33	ENSGT00550000074922 #34	ENSGT00390000010738 #35
Bos_a	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000154922.b	ENSGT00940000161321 #7	ENSGT00390000000614 #8	ENSGT00940000161082 #9	ENSGT00940000160761 #10	ENSGT00940000161543 #12	ENSGT00390000003256 #11	ENSGT00940000153766.A #13	ENSGT00950000183100.B #14	ENSGT00940000153408.A.d #15	ENSGT00940000157048 #16	ENSGT00940000155636 #17	ENSGT00390000003812 #18	ENSGT00390000018686 #19	ENSGT00390000006493 #21	ENSGT00940000157284 #22	ENSGT00390000001121 #23	ENSGT00940000157084 #24	ENSGT00940000165752 #25	ENSGT00940000158672 #26	ENSGT00490000044373	ENSGT00950000182898.a.a.a.a.b #27	ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b #28	ENSGT00940000157927 #29	ENSGT00940000159120	ENSGT00390000013762.b.a #30	ENSGT00940000159341 #31	ENSGT00940000158246 #32	ENSGT00390000006786 #33	ENSGT00550000074922 #34	ENSGT00390000010738 #35
Wild yak	MODERN SPECIES	1156	SLC22A7 (ENSBMUG00000012334)	CRIP3 (ENSBMUG00000012319) #7	ZNF318 (ENSBMUG00000012273) #8	ABCC10 (ENSBMUG00000012259) #9	DLK2 (ENSBMUG00000012238) #10	TJAP1 (ENSBMUG00000012199) #12	LRRC73 (ENSBMUG00000012153) #11	YIPF3 (ENSBMUG00000012145) #13	POLR1C (ENSBMUG00000012129) #14	XPO5 (ENSBMUG00000012108) #15	POLH (ENSBMUG00000012084) #16	GTPBP2 (ENSBMUG00000012068) #17	MAD2L1BP (ENSBMUG00000012054) #18	RSPH9 (ENSBMUG00000012049) #19	MRPS18A (ENSBMUG00000012027) #21	ENSBMUG00000011996 #22	MRPL14 (ENSBMUG00000011949) #23	TMEM63B (ENSBMUG00000011927) #24	ENSBMUG00000011908 #25	CAPN11 (ENSBMUG00000011894) #26	MYMX (ENSBMUG00000011878)	SLC29A1 (ENSBMUG00000011739) #27	ENSBMUG00000011676 #28	SLC35B2 (ENSBMUG00000011640) #29	NFKBIE (ENSBMUG00000011601)	TCTE1 (ENSBMUG00000011580) #31	TMEM151B (ENSBMUG00000011556) #30	AARS2 (ENSBMUG00000011497) #32	SPATS1 (ENSBMUG00000011457) #33	CDC5L (ENSBMUG00000011426) #34	SUPT3H (ENSBMUG00000011389) #35
Domestic yak	MODERN SPECIES	16	SLC22A7 (ENSBGRG00000014004)	CRIP3 (ENSBGRG00000013743) #7	ZNF318 (ENSBGRG00000013542) #8	ABCC10 (ENSBGRG00000012998) #9	DLK2 (ENSBGRG00000012938) #10	TJAP1 (ENSBGRG00000012682) #12	LRRC73 (ENSBGRG00000012584) #11	YIPF3 (ENSBGRG00000012257) #13	POLR1C (ENSBGRG00000011968) #14	XPO5 (ENSBGRG00000011470) #15	POLH (ENSBGRG00000011380) #16	GTPBP2 (ENSBGRG00000011005) #17	MAD2L1BP (ENSBGRG00000010868) #18	RSPH9 (ENSBGRG00000010763) #19	ENSBGRG00000010432 #21	VEGFA (ENSBGRG00000010227) #22	ENSBGRG00000009813 #23	ENSBGRG00000009756 #25	TMEM63B (ENSBGRG00000008917) #24	ENSBGRG00000008841	MYMX (ENSBGRG00000008830)	SLC29A1 (ENSBGRG00000007719) #27	SLC35B2 (ENSBGRG00000007502) #29	NFKBIE (ENSBGRG00000007378)	ENSBGRG00000007091 #28	TCTE1 (ENSBGRG00000007036) #31	TMEM151B (ENSBGRG00000006948) #30	AARS2 (ENSBGRG00000025693) #32	SPATS1 (ENSBGRG00000025671) #33	CDC5L (ENSBGRG00000025587) #34	SUPT3H (ENSBGRG00000025521) #35
Bos_b	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000154922.b	ENSGT00940000161321 #7	ENSGT00390000000614 #8	ENSGT00940000161082 #9	ENSGT00940000160761 #10	ENSGT00940000161543 #12	ENSGT00390000003256 #11	ENSGT00940000153766.A #13	ENSGT00950000183100.B #14	ENSGT00940000153408.A.d #15	ENSGT00940000157048 #16	ENSGT00940000155636 #17	ENSGT00390000003812 #18	ENSGT00390000018686 #19	ENSGT00390000006493 #21	ENSGT00940000157284 #22	ENSGT00390000001121 #23	ENSGT00940000157084 #24	ENSGT00940000165752 #25	ENSGT00940000158672 #26	ENSGT00490000044373	ENSGT00950000182898.a.a.a.a.b #27	ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b #28	ENSGT00940000157927 #29	ENSGT00940000159120	ENSGT00390000013762.b.a #30	ENSGT00940000159341 #31	ENSGT00940000158246 #32	ENSGT00390000006786 #33	ENSGT00550000074922 #34	ENSGT00390000010738 #35
Hybrid Bos Indicus	MODERN SPECIES	15	SLC22A7 (ENSBIXG00005000127)	CRIP3 (ENSBIXG00005008099) #7	ZNF318 (ENSBIXG00005008030) #8	ABCC10 (ENSBIXG00005007997) #9	DLK2 (ENSBIXG00005007975) #10	TJAP1 (ENSBIXG00005007955) #12	LRRC73 (ENSBIXG00005007915) #11	YIPF3 (ENSBIXG00005007907) #13	POLR1C (ENSBIXG00005007888) #14	XPO5 (ENSBIXG00005000022) #15	POLH (ENSBIXG00005029268) #16	GTPBP2 (ENSBIXG00005029285) #17	MAD2L1BP (ENSBIXG00005029309) #18	RSPH9 (ENSBIXG00005029313) #19	MRPS18A (ENSBIXG00005029321) #21	VEGFA (ENSBIXG00005029350) #22	ENSBIXG00005029198 #23	TMEM63B (ENSBIXG00005029176) #24	ENSBIXG00005001907 #25	MYMX (ENSBIXG00005029092)	SLC29A1 (ENSBIXG00005029077) #27	ENSBIXG00005005101 #28	SLC35B2 (ENSBIXG00005028950) #29	TMEM151B (ENSBIXG00005005053) #30	TCTE1 (ENSBIXG00005028882) #31	AARS2 (ENSBIXG00005002270) #32	SPATS1 (ENSBIXG00005005004) #33	CDC5L (ENSBIXG00005028783) #34	SUPT3H (ENSBIXG00005002363) #35	RUNX2 (ENSBIXG00005028546) #36	CLIC5 (ENSBIXG00005004883) #37
Cow	MODERN SPECIES	15	SLC22A7 (ENSBTAG00000006350)	CRIP3 (ENSBTAG00000006357) #7	ZNF318 (ENSBTAG00000010217) #8	ABCC10 (ENSBTAG00000005842) #9	DLK2 (ENSBTAG00000005850) #10	TJAP1 (ENSBTAG00000011189) #12	LRRC73 (ENSBTAG00000025554) #11	YIPF3 (ENSBTAG00000018967) #13	POLR1C (ENSBTAG00000018969) #14	XPO5 (ENSBTAG00000018970) #15	POLH (ENSBTAG00000006015) #16	GTPBP2 (ENSBTAG00000006016) #17	MAD2L1BP (ENSBTAG00000009548) #18	RSPH9 (ENSBTAG00000009549) #19	MRPS18A (ENSBTAG00000025571) #21	VEGFA (ENSBTAG00000005339) #22	ENSBTAG00000050249	TMEM63B (ENSBTAG00000032680) #24	CAPN11 (ENSBTAG00000021066) #26	ENSBTAG00000050117 #25	ENSBTAG00000053551 #26	MYMX (ENSBTAG00000049369)	SLC29A1 (ENSBTAG00000015131) #27	HSP90AB1 (ENSBTAG00000000778) #28	SLC35B2 (ENSBTAG00000008076) #29	NFKBIE (ENSBTAG00000013705)	TMEM151B (ENSBTAG00000050799) #30	ENSBTAG00000050049 #31	AARS2 (ENSBTAG00000013722) #32	SPATS1 (ENSBTAG00000053813) #33	CDC5L (ENSBTAG00000020012) #34
American bison	MODERN SPECIES	3345	SLC22A7 (ENSBBBG00000018739)	CRIP3 (ENSBBBG00000004705) #7	ZNF318 (ENSBBBG00000004718) #8	ABCC10 (ENSBBBG00000018811) #9	DLK2 (ENSBBBG00000018845) #10	ENSBBBG00000018854	LRRC73 (ENSBBBG00000018869) #11	YIPF3 (ENSBBBG00000004770) #13	POLR1C (ENSBBBG00000018932) #14	XPO5 (ENSBBBG00000018959) #15	POLH (ENSBBBG00000004824) #16	GTPBP2 (ENSBBBG00000004840) #17	MAD2L1BP (ENSBBBG00000004843) #18	RSPH9 (ENSBBBG00000004846) #19	MRPS18A (ENSBBBG00000019022) #21	VEGFA (ENSBBBG00000004895) #22	MRPL14 (ENSBBBG00000019131) #23	TMEM63B (ENSBBBG00000019165) #24	ENSBBBG00000019176 #25	CAPN11 (ENSBBBG00000004944) #26	MYMX (ENSBBBG00000019201)	SLC29A1 (ENSBBBG00000019250) #27	ENSBBBG00000009167 #28	SLC35B2 (ENSBBBG00000005002) #29	NFKBIE (ENSBBBG00000005007)	TMEM151B (ENSBBBG00000019315) #30	TCTE1 (ENSBBBG00000005019) #31	AARS2 (ENSBBBG00000005050) #32	SPATS1 (ENSBBBG00000019339) #33	CDC5L (ENSBBBG00000008519) #34	SUPT3H (ENSBBBG00000019372) #35