Bilateria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155029 #22 Chordata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155029 #22 Vertebrata ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000161529 #17 ENSGT00940000161230 #15 ENSGT00940000165065 ENSGT00940000158354 #19 ENSGT00940000160027 ENSGT00940000155029 #22 ENSGT00390000004897 Gnathostomata DUPLICATION Gnathostomata DUPLICATION Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155029.c.b #22 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00940000159091 ENSGT00940000154298.a.b ENSGT00390000005121 ENSGT00390000007843 ENSGT00950000183025.a ENSGT00940000161434 ENSGT00940000159029 #12 ENSGT00940000161386 #16 ENSGT00940000161529 #17 ENSGT00940000161230 #15 ENSGT00940000161108 #18 ENSGT00940000158354 #19 ENSGT00940000162072 #20 ENSGT00940000159774 #21 ENSGT00940000155029.c.b #22 ENSGT00940000159503 #23 ENSGT00390000017856.b #25 ENSGT00940000160113 #26 ENSGT00940000154152 #27 ENSGT00950000182892.a.b.a.a #28 ENSGT00390000004405.b #29 ENSGT00390000000713 #30 ENSGT00940000154534.a 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ENSGT00940000162072 #20 ENSGT00940000159774 #21 ENSGT00940000155029.c.b #22 ENSGT00940000159503 #23 ENSGT00390000017856.b #25 ENSGT00940000160113 #26 ENSGT00940000154152.d #27 ENSGT00950000182892.a.b.a.a #28 ENSGT00390000004405.b #29 ENSGT00390000000713 #30 ENSGT00940000154534.a ENSGT00390000011219 #31 ENSGT00640000092844 ENSGT00940000159590 #32 ENSGT00940000161498 #33 ENSGT00390000013474.b.a #34 ENSGT00940000161315 #35 ENSGT00390000000603 #36 Mammalia ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000160427 ENSGT00390000005121 ENSGT00390000007843 ENSGT00940000159091 ENSGT00940000154298.a.b ENSGT00950000183025.a ENSGT00940000161434 ENSGT00940000159029 #12 ENSGT00940000161386 #16 ENSGT00940000161529 #17 ENSGT00940000161230 #15 ENSGT00940000161108 #18 ENSGT00940000158354 #19 ENSGT00940000162072 #20 ENSGT00940000159774 #21 ENSGT00940000155029.c.b #22 ENSGT00940000159503 #23 ENSGT00940000172404 ENSGT00390000017856.b #25 ENSGT00940000160113 #26 ENSGT00940000154152.d #27 ENSGT00950000182892.a.b.a.a #28 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SPECIES 4 ENSGT00940000160427 ENSGT00390000005121 ENSGT00390000007843 ENSGT00940000159091 ENSGT00940000154298.a.b ENSGT00950000183025.a ENSGT00940000161434 ENSGT00940000159029 #12 ENSGT00940000161386 #16 ENSGT00940000161529 #17 ENSGT00940000161230 #15 ENSGT00940000161108 #18 ENSGT00940000158354 #19 ENSGT00940000162072 #20 ENSGT00940000159774 #21 ENSGT00940000155029.c.b #22 ENSGT00940000159503 #23 ENSGT00390000017856.b #25 ENSGT00940000160113 #26 ENSGT00940000154152.d #27 ENSGT00950000182892.a.b.a.a #28 ENSGT00390000004405.b #29 ENSGT00390000000713 #30 ENSGT00940000154534.a ENSGT00390000011219 #31 ENSGT00940000159590 #32 ENSGT00940000161498 #33 ENSGT00390000013474.b.a #34 ENSGT00940000161315 #35 ENSGT00390000000603 #36 ENSGT00940000157439 #37 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000159720 ENSGT01100000264599 ENSGT00940000159091 ENSGT00940000154298.a.b ENSGT00950000183025.a ENSGT00940000161434 ENSGT00940000159029 #12 ENSGT00940000161386 #16 ENSGT00940000161529 #17 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#37 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000007843.u.a ENSGT00940000159091 ENSGT00940000154298.a.b ENSGT00950000183025.a ENSGT00940000161434 ENSGT00940000159029 #12 ENSGT00860000135909 #13 ENSGT00940000165611 ENSGT00940000161386 #16 ENSGT00940000161529 #17 ENSGT00940000161230 #15 ENSGT00940000161108 #18 ENSGT00940000158354 #19 ENSGT00940000162072 #20 ENSGT00940000159774 #21 ENSGT00940000155029.c.b #22 ENSGT00940000159503 #23 ENSGT00390000017856.b #25 ENSGT00940000160113 #26 ENSGT00940000154152.d.b #27 ENSGT00950000182892.a.b.a.a #28 ENSGT00390000004405.b #29 ENSGT00390000000713 #30 ENSGT00940000154534.a ENSGT00390000011219 #31 ENSGT00940000159590 #32 ENSGT00940000161498 #33 ENSGT00390000013474.b.a #34 ENSGT00940000161315 #35 ENSGT00390000000603.b #36 ENSGT00940000157439 #37 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000007843.u.a ENSGT00940000159091 ENSGT00940000154298.a.b ENSGT00950000183025.a ENSGT00940000161434 ENSGT00940000159029 #12 ENSGT00860000135909 #13 ENSGT00940000165611 ENSGT00940000161386 #16 ENSGT00940000161529 #17 ENSGT00940000161230 #15 ENSGT00940000161108 #18 ENSGT00940000158354 #19 ENSGT00940000162072 #20 ENSGT00940000159774 #21 ENSGT00940000155029.c.b #22 ENSGT00940000159503 #23 ENSGT00390000017856.b #25 ENSGT00940000160113 #26 ENSGT00940000154152.d.b #27 ENSGT00950000182892.a.b.a.a #28 ENSGT00390000004405.b #29 ENSGT00390000000713 #30 ENSGT00940000154534.a ENSGT00390000011219 #31 ENSGT00940000159590 #32 ENSGT00940000161498 #33 ENSGT00390000013474.b.a #34 ENSGT00940000161315 #35 ENSGT00390000000603.b #36 ENSGT00940000157439 #37 Vervet Monkey MODERN SPECIES 7 IGF2BP1 (ENSCSAG00000002487) GIP (ENSCSAG00000002491) SNF8 (ENSCSAG00000002494) UBE2Z (ENSCSAG00000002496) ATP5MC1 (ENSCSAG00000002502) CALCOCO2 (ENSCSAG00000002506) TTLL6 (ENSCSAG00000002511) HOXB13 (ENSCSAG00000002517) #12 HOXB9 (ENSCSAG00000002521) #16 HOXB8 (ENSCSAG00000002523) #17 HOXB7 (ENSCSAG00000002524) #15 HOXB6 (ENSCSAG00000002526) #18 HOXB5 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ENSGT00940000162072 #20 ENSGT00940000159774 #21 ENSGT00940000155029.c.b #22 ENSGT00940000159503 #23 ENSGT00390000017856.b #25 ENSGT00940000160113 #26 ENSGT00940000154152.d.b #27 ENSGT00950000182892.a.b.a.a #28 ENSGT00390000004405.b #29 ENSGT00950000185410 ENSGT00390000000713 #30 ENSGT00940000154534.a ENSGT00390000011219 #31 ENSGT00940000159590.h #32 ENSGT00940000161498 #33 ENSGT00390000013474.b.a #34 ENSGT00940000161315 #35 ENSGT00390000000603 #36 Coquerels sifaka MODERN SPECIES 120 IGF2BP1 (ENSPCOG00000006475) GIP (ENSPCOG00000024832) SNF8 (ENSPCOG00000026895) UBE2Z (ENSPCOG00000014816) ENSPCOG00000008741 CALCOCO2 (ENSPCOG00000021998) TTLL6 (ENSPCOG00000021391) HOXB13 (ENSPCOG00000018182) #12 HOXB9 (ENSPCOG00000027130) #16 HOXB8 (ENSPCOG00000024853) #17 HOXB7 (ENSPCOG00000028248) #15 HOXB6 (ENSPCOG00000019931) #18 HOXB5 (ENSPCOG00000015692) #19 HOXB4 (ENSPCOG00000022963) #20 HOXB3 (ENSPCOG00000020113) #21 HOXB2 (ENSPCOG00000017380) #22 HOXB1 (ENSPCOG00000025930) #23 SKAP1 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#37 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000005121 ENSGT00390000007843 ENSGT00990000209473 ENSGT00940000159091 ENSGT00940000159720 ENSGT00950000183025.a ENSGT00940000161434 ENSGT00940000159029 #12 ENSGT00940000161386 #16 ENSGT00940000161529 #17 ENSGT00940000161230 #15 ENSGT00940000161108 #18 ENSGT00940000158354 #19 ENSGT00940000162072 #20 ENSGT00940000159774 #21 ENSGT00940000155029.c.b #22 ENSGT00940000159503 #23 ENSGT00390000017856.b #25 ENSGT00940000160113 #26 ENSGT00940000154152.d.b #27 ENSGT00950000182892.a.b.a.a #28 ENSGT00390000004405.b #29 ENSGT00390000000713 #30 ENSGT00940000154534.a ENSGT00390000011219 #31 ENSGT00940000159590 #32 ENSGT00940000161498 #33 ENSGT00390000013474.b.a #34 ENSGT00940000161315 #35 ENSGT00390000000603 #36 ENSGT00940000157439 #37 Tree shrew MODERN SPECIES 88 HOXB2 (ENSTBEG00000015126) #22 SKAP1 (ENSTBEG00000015048) #25 SNX11 (ENSTBEG00000014960) #26 CBX1 (ENSTBEG00000014931) #27 Glires ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000005121 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ENSGT00940000160427 ENSGT00390000005121 ENSGT00390000007843 ENSGT00940000159091 ENSGT00940000154298.a.b ENSGT00950000183025.a ENSGT00940000161434 ENSGT00940000159029 #12 ENSGT00940000161386 #16 ENSGT00940000161529 #17 ENSGT00940000161230 #15 ENSGT00940000161108 #18 ENSGT00940000158354 #19 ENSGT00940000162072 #20 ENSGT00940000159774 #21 ENSGT00940000155029.c.b #22 ENSGT00940000159503 #23 ENSGT00390000017856.b #25 ENSGT00940000160113 #26 ENSGT00940000154152.d.b #27 ENSGT00950000182892.a.b.a.a #28 ENSGT00390000004405.b #29 ENSGT00390000000713 #30 ENSGT00940000154534.a ENSGT00390000011219 #31 ENSGT00940000159590 #32 ENSGT00940000161498 #33 ENSGT00390000013474.b.a #34 ENSGT00940000161315 #35 ENSGT00390000000603 #36 ENSGT00940000157439 #37 Chacoan peccary MODERN SPECIES 145 IGF2BP1 (ENSCWAG00000022044) GIP (ENSCWAG00000022046) SNF8 (ENSCWAG00000022048) UBE2Z (ENSCWAG00000022050) ATP5MC1 (ENSCWAG00000022052) CALCOCO2 (ENSCWAG00000022056) TTLL6 (ENSCWAG00000022059) HOXB13 (ENSCWAG00000022063) 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#28 ENSGT00950000185410 ENSGT00390000004405.b #29 ENSGT00390000000713 #30 ENSGT00940000154534.a ENSGT00940000159590 #32 ENSGT00940000161498 #33 ENSGT00390000013474.b.a #34 ENSGT00940000161315 #35 ENSGT00390000000603 #36 Arabian camel MODERN SPECIES 7 IGF2BP1 (ENSCDRG00005016778) GIP (ENSCDRG00005016991) ENSCDRG00005017040 ENSCDRG00005017061 UBE2Z (ENSCDRG00005017075) ENSCDRG00005017142 CALCOCO2 (ENSCDRG00005017213) TTLL6 (ENSCDRG00005017585) HOXB13 (ENSCDRG00005017741) #12 HOXB9 (ENSCDRG00005017862) #16 HOXB7 (ENSCDRG00005018007) #15 HOXB6 (ENSCDRG00005018029) #18 HOXB5 (ENSCDRG00005018055) #19 HOXB4 (ENSCDRG00005018079) #20 HOXB3 (ENSCDRG00005018104) #21 HOXB2 (ENSCDRG00005018121) #22 HOXB1 (ENSCDRG00005018147) #23 SKAP1 (ENSCDRG00005018166) #25 SNX11 (ENSCDRG00005018232) #26 CBX1 (ENSCDRG00005018330) ##27 NFE2L1 (ENSCDRG00005018357) #28 ENSCDRG00005018515 COPZ2 (ENSCDRG00005018538) #29 CDK5RAP3 (ENSCDRG00005018564) #30 PRR15L (ENSCDRG00005018636) SP2 (ENSCDRG00005018756) #32 SP6 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ENSGT00940000161108 #18 ENSGT00940000158354 #19 ENSGT00940000162072 #20 ENSGT00940000159774 #21 ENSGT00940000155029.c.b #22 ENSGT00940000159503 #23 ENSGT00390000017856.b #25 ENSGT00940000160113 #26 ENSGT00940000154152.d #27 ENSGT00950000182892.a.b.a.a #28 ENSGT00390000004405.b #29 ENSGT00390000000713 #30 ENSGT00940000154534.a ENSGT00390000011219 #31 ENSGT00640000092844 ENSGT00940000159590 #32 ENSGT00940000161498 #33 ENSGT00390000013474.b.a #34 ENSGT00940000161315 #35 ENSGT00390000000603 #36 Wallaby MODERN SPECIES 12825 HOXB2 (ENSMEUG00000003516) #22 HOXB1 (ENSMEUG00000003514) #23 Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000006679.b.b ENSGT00940000160427 ENSGT00390000007843 ENSGT00940000159091.e ENSGT00940000154298.a.b ENSGT00950000183025.a ENSGT00940000161434 ENSGT00940000159029 #12 ENSGT00940000161386 #16 ENSGT00940000161529 #17 ENSGT00940000161230 #15 ENSGT00940000161108 #18 ENSGT00940000158354 #19 ENSGT00940000162072 #20 ENSGT00940000159774 #21 ENSGT00940000155029.c.b #22 ENSGT00940000159503 #23 ENSGT00390000017856.b #25 ENSGT00940000160113 #26 ENSGT00940000154152.d #27 ENSGT00950000182892.a.b.a.a #28 ENSGT00390000004405.b #29 ENSGT00390000000713 #30 ENSGT00940000154534.a ENSGT00390000011219 #31 ENSGT00640000092844 ENSGT00940000159590 #32 ENSGT00940000161498 #33 ENSGT00390000013474.b.a #34 ENSGT00940000161315 #35 ENSGT00390000000603 #36 koala MODERN SPECIES 67 GNGT2 (ENSPCIG00000013109) B4GALNT2 (ENSPCIG00000003606) IGF2BP1 (ENSPCIG00000013111) SNF8 (ENSPCIG00000013302) ENSPCIG00000013305 ATP5MC1 (ENSPCIG00000013306) CALCOCO2 (ENSPCIG00000010432) TTLL6 (ENSPCIG00000030247) HOXB13 (ENSPCIG00000030249) #12 HOXB9 (ENSPCIG00000030251) #16 HOXB7 (ENSPCIG00000000064) #15 HOXB6 (ENSPCIG00000000076) #18 HOXB5 (ENSPCIG00000031080) #19 HOXB4 (ENSPCIG00000000195) #20 HOXB3 (ENSPCIG00000000217) #21 HOXB2 (ENSPCIG00000000295) #22 HOXB1 (ENSPCIG00000033449) #23 SKAP1 (ENSPCIG00000000339) #25 SNX11 (ENSPCIG00000000612) #26 CBX1 (ENSPCIG00000000630) #27 NFE2L1 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(ENSOANG00000012288) #37 Sauria ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000160427 ENSGT00390000005121 ENSGT00390000007843.cb ENSGT00940000159091 ENSGT00940000154298.a.b ENSGT00950000183025.a ENSGT00940000161434 ENSGT00940000159029 #12 ENSGT00940000161386 #16 ENSGT00940000161529 #17 ENSGT00940000161230 #15 ENSGT00940000161108 #18 ENSGT00940000158354 #19 ENSGT00940000162072 #20 ENSGT00940000159774 #21 ENSGT00940000155029.c.b #22 ENSGT00940000159503 #23 ENSGT00390000017856.b #25 ENSGT00940000160113 #26 ENSGT00940000154152.d #27 ENSGT00950000182892.a.b.a.a #28 ENSGT00390000004405.b #29 ENSGT00390000000713 #30 ENSGT00940000154534.a ENSGT00390000011219 #31 ENSGT00640000092844 ENSGT00940000159590 #32 ENSGT00940000161498 #33 ENSGT00390000013474.b.a #34 ENSGT00940000161315 #35 ENSGT00390000000603 #36 Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000160427 ENSGT00390000005121 ENSGT00390000007843.cb ENSGT00940000159091 ENSGT00940000154298.a.b ENSGT00950000183025.a ENSGT00940000161434 ENSGT00940000159029 #12 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(ENSHHUG00000029715) ##28 copz2 (ENSHHUG00000029680) #29 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 77 ENSGT00940000160548.b ENSGT00990000204190.b ENSGT00940000154957.A.c ENSGT00940000159091.a ENSGT00940000157981.a.b.e ENSGT00940000167564.a ENSGT00940000159029.c #12 ENSGT00940000158266.g.b ENSGT00940000161386.c #16 ENSGT00940000161529.w.a #17 ENSGT00940000161230.d #15 ENSGT00940000161108.e.a #18 ENSGT00940000158354.d.e #19 ENSGT00940000162072.b #20 ENSGT00940000159774.c.a #21 ENSGT00940000155029.c.b.c #22 ENSGT00940000166856.l ENSGT00940000154152.b.a.b #27 ENSGT00950000182892.a.b.a.b.b.d ##28 ENSGT00390000004405.b.c #29 ENSGT00940000154534.b.a.j ENSGT00940000157439.a.c #37 ENSGT00940000153704.B.d.b.a.a ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a.b.e ENSGT00390000006679.b.l ENSGT01100000263525.b.a.l ENSGT00940000156584.e.b.d.a ENSGT00940000158833.a.a.c ENSGT00940000175578.a.a ENSGT00940000175578.a.b.b ENSGT00390000017328.a.a.l Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00940000160548.b ENSGT00990000204190.b 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#12 ENSGT00940000158266.g.b ENSGT00940000161386.c #16 ENSGT00940000161529.w.a #17 ENSGT00940000161230.d #15 ENSGT00940000158354.d.e #19 ENSGT00940000162072.b #20 ENSGT00940000159774.c.a #21 ENSGT00940000155029.c.b.c #22 ENSGT00940000166856.l ENSGT00940000154152.b.a.b #27 ENSGT00950000182892.a.b.a.b.b.d ##28 ENSGT00390000004405.b.d.b.a.b #29 ENSGT00940000154534.b.a.j ENSGT00940000157439.a.c #37 ENSGT00940000153704.B.d.b.a.a ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a.b.e ENSGT00390000006679.b.l ENSGT01100000263525.b.a.l ENSGT00940000156584.e.b.d.a ENSGT00940000158833.a.a.c ENSGT00940000175578.a.a ENSGT00390000017328.a.a.l ENSGT00940000153653.a.a.o Coho salmon MODERN SPECIES 26 nr1d1 (ENSOKIG00005005390) ENSOKIG00005005377 igf2bp1 (ENSOKIG00005003295) ube2z (ENSOKIG00005003129) atp5mc1 (ENSOKIG00005003106) eve1 (ENSOKIG00005003093) ENSOKIG00005003088 hoxb13a (ENSOKIG00005003079) #12 ENSOKIG00005003074 hoxb9a (ENSOKIG00005003066) #16 hoxb8a (ENSOKIG00005003059) #17 hoxb7a (ENSOKIG00005003049) #15 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copz2 (ENSOMYG00000003419) #29 prr15la (ENSOMYG00000041419) ENSOMYG00000077846 ENSOMYG00000041335 ENSOMYG00000041374 #37 nags (ENSOMYG00000041323) ENSOMYG00000041320 ENSOMYG00000048632 col1a1a (ENSOMYG00000041314) ENSOMYG00000041182 csf-3 (ENSOMYG00000041149) ENSOMYG00000041141 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 71 ENSGT00940000160548.a ENSGT00990000204190.a ENSGT00940000154957.A.d ENSGT00940000159091.b ENSGT00940000157981.a.b.f ENSGT00940000167564.b ENSGT00940000159029.d #12 ENSGT00940000163268.e ENSGT00940000161386.d #16 ENSGT00940000161529.w.b #17 ENSGT00940000161230.c #15 ENSGT00940000161108.e.b #18 ENSGT00940000158354.d.f #19 ENSGT00940000162072.a #20 ENSGT00940000159774.c.b #21 ENSGT00940000155029.c.b.d #22 ENSGT00940000166856.k ENSGT00940000154152.b.a.a #27 ENSGT00950000182892.a.b.a.b.b.c ##28 ENSGT00390000004405.b.d.b.a.a #29 ENSGT00940000154534.b.a.i ENSGT00940000157439.a.d #37 ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a.b.f ENSGT00390000005602 ENSGT00390000006679.b.k ENSGT01100000263525.b.a.k ENSGT00940000156584.e.b.d.b ENSGT00940000158833.a.a.d ENSGT00390000017328.a.a.k ENSGT00940000153653.a.a.p ENSGT00940000154360.B.a Coho salmon MODERN SPECIES 1 nr1d1 (ENSOKIG00005009612) ENSOKIG00005009603 igf2bp1 (ENSOKIG00005009099) ube2z (ENSOKIG00005009047) atp5mc1 (ENSOKIG00005009030) eve1 (ENSOKIG00005009021) hoxb13a (ENSOKIG00005009014) #12 ENSOKIG00005009013 hoxb9a (ENSOKIG00005009004) #16 hoxb8a (ENSOKIG00005008994) #17 hoxb7a (ENSOKIG00005008982) #15 hoxb6a (ENSOKIG00005008972) #18 hoxb5a (ENSOKIG00005008959) #19 hoxb4a (ENSOKIG00005008942) #20 hoxb3a (ENSOKIG00005008933) #21 hoxb2a (ENSOKIG00005008923) #22 hoxb1a (ENSOKIG00005008918) cbx1a (ENSOKIG00005008868) #27 nfe2l1a (ENSOKIG00005008857) ##28 copz2 (ENSOKIG00005008689) #29 prr15la (ENSOKIG00005008658) ENSOKIG00005008464 #37 PDK2 (ENSOKIG00005008185) nags (ENSOKIG00005008137) ENSOKIG00005008125 ENSOKIG00005008117 col1a1a (ENSOKIG00005007949) PPP1R9B (ENSOKIG00005007824) ENSOKIG00005007804 psmd3 (ENSOKIG00005007721) ENSOKIG00005007707 Chinook salmon MODERN SPECIES 19 nr1d1 (ENSOTSG00005016330) ENSOTSG00005016329 igf2bp1 (ENSOTSG00005015631) ube2z (ENSOTSG00005015622) atp5mc1 (ENSOTSG00005015620) eve1 (ENSOTSG00005015618) hoxb13a (ENSOTSG00005015615) #12 ENSOTSG00005015589 hoxb9a (ENSOTSG00005015587) #16 hoxb8a (ENSOTSG00005015581) #17 hoxb7a (ENSOTSG00005015578) #15 hoxb6a (ENSOTSG00005015571) #18 hoxb5a (ENSOTSG00005039828) #19 hoxb4a (ENSOTSG00005039826) #20 hoxb3a (ENSOTSG00005039825) #21 hoxb2a (ENSOTSG00005039823) #22 hoxb1a (ENSOTSG00005039822) cbx1a (ENSOTSG00005039820) #27 nfe2l1a (ENSOTSG00005039819) ##28 copz2 (ENSOTSG00005039812) #29 prr15la (ENSOTSG00005039810) ENSOTSG00005039805 #37 pdk2b (ENSOTSG00005038384) nags (ENSOTSG00005038371) ENSOTSG00005038368 ENSOTSG00005038366 col1a1a (ENSOTSG00005038360) PPP1R9B (ENSOTSG00005038348) ENSOTSG00005038347 psmd3 (ENSOTSG00005038327) ENSOTSG00005038324 Salmo ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00390000018292.d.d.b ENSGT00940000160548.a ENSGT00990000204190.a ENSGT00940000154957.A.d ENSGT00940000159091.b ENSGT00940000157981.a.b.f ENSGT00940000167564.b ENSGT00940000159029.d #12 ENSGT00940000158266.g.b ENSGT00940000161386.d #16 ENSGT00940000161529.w.b #17 ENSGT00940000161230.c #15 ENSGT00940000161108.e.b #18 ENSGT00940000162072.a #20 ENSGT00940000159774.c.b #21 ENSGT00940000155029.c.b.d #22 ENSGT00940000166856.k ENSGT00940000154152.b.a.a #27 ENSGT00950000182892.a.b.a.b.b.c ##28 ENSGT00390000004405.b.d.a #29 ENSGT00940000154534.b.a.i ENSGT00940000157439.a.d #37 ENSGT00940000153704.B.d.a ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a.b.f ENSGT00390000005602 ENSGT00390000006679.b.k ENSGT01100000263525.b.a.k ENSGT00940000156584.e.b.d.b ENSGT00940000158833.a.a.d ENSGT00390000017328.a.a.k ENSGT00940000153653.a.a.p River trout MODERN SPECIES nr1d1 (ENSSTUG00000000832) ENSSTUG00000000829 ENSSTUG00000000822 igf2bp1 (ENSSTUG00000000765) ube2z (ENSSTUG00000000705) atp5mc1 (ENSSTUG00000000702) eve1 (ENSSTUG00000000697) hoxb13a 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(ENSHHUG00000011606) #18 hoxb5a (ENSHHUG00000011602) #19 hoxb4a (ENSHHUG00000011590) #20 hoxb3a (ENSHHUG00000011566) #21 hoxb2a (ENSHHUG00000011514) #22 hoxb1a (ENSHHUG00000011502) cbx1a (ENSHHUG00000011492) #27 nfe2l1a (ENSHHUG00000011485) ##28 copz2 (ENSHHUG00000011449) #29 ENSHHUG00000011447 prr15la (ENSHHUG00000011422) ENSHHUG00000011279 #37 TBKBP1 (ENSHHUG00000011258) pdk2b (ENSHHUG00000011222) nags (ENSHHUG00000011200) ENSHHUG00000011194 col1a1a (ENSHHUG00000011137) PPP1R9B (ENSHHUG00000011053) ENSHHUG00000011039 psmd3 (ENSHHUG00000010997) Northern pike MODERN SPECIES 10 msl1a (ENSELUG00000015070) nr1d1 (ENSELUG00000015028) igf2bp1 (ENSELUG00000014974) ube2z (ENSELUG00000014930) atp5mc1 (ENSELUG00000014903) eve1 (ENSELUG00000014847) hoxb13a (ENSELUG00000001314) #12 ENSELUG00000014819 hoxb9a (ENSELUG00000014813) #16 hoxb8a (ENSELUG00000014798) #17 hoxb7 (ENSELUG00000014783) #15 hoxb6a (ENSELUG00000034343) #18 hoxb5a (ENSELUG00000033971) #19 hoxb4a (ENSELUG00000034353) #20 hoxb3a 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ENSGT00390000004405.b #29 ENSGT00940000154534.b.a ENSGT00940000154957.A Cod MODERN SPECIES 11 ENSGMOG00000001726 ENSGMOG00000033297 ube2z (ENSGMOG00000015368) atp5mc1 (ENSGMOG00000015354) ENSGMOG00000015328 eve1 (ENSGMOG00000034875) ENSGMOG00000035317 hoxb13a (ENSGMOG00000015284) #12 hoxb9a (ENSGMOG00000033079) #16 hoxb8a (ENSGMOG00000035281) #17 hoxb7a (ENSGMOG00000024089) #15 ENSGMOG00000027090 HOXB5 (ENSGMOG00000031372) #19 hoxb4a (ENSGMOG00000009880) #20 hoxb3a (ENSGMOG00000024004) #21 hoxb2a (ENSGMOG00000024154) #22 hoxb1a (ENSGMOG00000030229) ENSGMOG00000027442 ENSGMOG00000027289 ENSGMOG00000030519 ENSGMOG00000032198 ENSGMOG00000035523 CBX1 (ENSGMOG00000009322) #27 nfe2l1a (ENSGMOG00000027608) ##28 ENSGMOG00000035621 copz2 (ENSGMOG00000004484) #29 prr15la (ENSGMOG00000028853) ENSGMOG00000019381 ENSGMOG00000034869 ENSGMOG00000025703 eif1 (ENSGMOG00000029255) Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 98 ENSGT00940000153704.B.d ENSGT00940000157439.a #37 ENSGT00940000159091 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SPECIES 56 ENSGT00940000167564 ENSGT00940000159029 #12 ENSGT00940000161386 #16 ENSGT00940000161529 #17 ENSGT00940000161230 #15 ENSGT00940000165065.a.b ENSGT00940000158354.c.b #19 ENSGT00940000162072 #20 ENSGT00940000159774 #21 ENSGT00940000155029.c.b #22 ENSGT00940000166856 ENSGT00940000154152.a.b #27 ENSGT00950000182892.a.b.a.b.b ##28 ENSGT00390000008631.b ENSGT00390000004405.b #29 ENSGT00940000154534.b.a ENSGT00940000154957.A ENSGT00940000164729.a.a.d ENSGT00440000033742.a.b.d ENSGT00390000004832 ENSGT00940000156193 ENSGT00390000018512 ENSGT00940000153536.a.b.b.a.b ENSGT00940000158181.a ENSGT00550000075089 Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 793 ENSHBUG00000013231 eve1 (ENSHBUG00000013255) hoxb13a (ENSHBUG00000013265) #12 hoxb9a (ENSHBUG00000013267) #16 hoxb8a (ENSHBUG00000013281) #17 hoxb7a (ENSHBUG00000013288) #15 ENSHBUG00000013315 HOXB5 (ENSHBUG00000013321) #19 hoxb4a (ENSHBUG00000013332) #20 hoxb3a (ENSHBUG00000013355) #21 hoxb2a (ENSHBUG00000013364) #22 hoxb1a (ENSHBUG00000013373) Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 43 ENSGT00940000167564 ENSGT00940000159029 #12 ENSGT00940000161386 #16 ENSGT00940000161529 #17 ENSGT00940000161230 #15 ENSGT00940000165065.a.b ENSGT00940000158354.c.b #19 ENSGT00940000162072 #20 ENSGT00940000159774 #21 ENSGT00940000155029.c.b #22 ENSGT00940000166856 ENSGT00940000154152.a.b #27 ENSGT00950000182892.a.b.a.b.b ##28 ENSGT00390000008631.b ENSGT00390000004405.b #29 ENSGT00940000154534.b.a ENSGT00940000154957.A ENSGT00940000164729.a.a.d ENSGT00440000033742.a.b.d ENSGT00390000004832 ENSGT00940000156193 ENSGT00390000018512 ENSGT00940000153536.a.b.b.a.b ENSGT00940000158181.a ENSGT00550000075089 P. nyererei MODERN SPECIES 488 hoxb9a (ENSPNYG00000022874) #16 hoxb8a (ENSPNYG00000022869) #17 ENSPNYG00000022864 ENSPNYG00000022859 HOXB5 (ENSPNYG00000022852) #19 hoxb2a (ENSPNYG00000022841) #22 hoxb3a (ENSPNYG00000022832) #21 hoxb1a (ENSPNYG00000022787) CBX1 (ENSPNYG00000022772) #27 nfe2l1a (ENSPNYG00000022769) ##28 praf2 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ENSGT00390000018512 ENSGT00940000153536.a.b.b.a.b ENSGT00940000158181.a ENSGT00550000075089 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1107 ENSMZEG00005023029 ENSMZEG00005023030 ENSMZEG00005023032 ENSMZEG00005023033 ENSMZEG00005023034 ENSMZEG00005023035 eve1 (ENSMZEG00005023036) hoxb13a (ENSMZEG00005023039) #12 hoxb9a (ENSMZEG00005023042) #16 hoxb8a (ENSMZEG00005023045) #17 hoxb7a (ENSMZEG00005023050) #15 ENSMZEG00005023053 HOXB5 (ENSMZEG00005023055) #19 hoxb4a (ENSMZEG00005023060) #20 hoxb3a (ENSMZEG00005023064) #21 hoxb2a (ENSMZEG00005023068) #22 hoxb1a (ENSMZEG00005023072) ENSMZEG00005023088 CBX1 (ENSMZEG00005023093) #27 nfe2l1a (ENSMZEG00005023096) ##28 praf2 (ENSMZEG00005023100) copz2 (ENSMZEG00005023106) #29 prr15la (ENSMZEG00005023123) igf2bp1 (ENSMZEG00005023128) ENSMZEG00005023131 rab11fip4a (ENSMZEG00005023135) coil (ENSMZEG00005023140) scpep1 (ENSMZEG00005023142) engase (ENSMZEG00005023147) CSNK1D (ENSMZEG00005023154) slc16a3b (ENSMZEG00005023159) Eastern happy MODERN SPECIES 16 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ENSGT00940000154957.A ENSGT00940000164729.a.a.d ENSGT00440000033742.a.b.d ENSGT00390000004832 ENSGT00940000156193 ENSGT00390000018512 ENSGT00940000153536.a.b.b.a.b ENSGT00940000158181.a ENSGT00550000075089.i Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000153704.B.d ENSGT00950000183207.b.bb ENSGT01100000263693 ENSGT00940000164903.b ENSGT00940000159091 ENSGT00940000157981.a.b ENSGT00940000167564 ENSGT00400000024810.f ENSGT00940000159029 #12 ENSGT00940000161386 #16 ENSGT00940000161529 #17 ENSGT00940000161230 #15 ENSGT00940000165065.a ENSGT00940000158354.c.b #19 ENSGT00940000162072 #20 ENSGT00940000155029.c.b #22 ENSGT00940000166856 ENSGT00940000154152.a.b #27 ENSGT00950000182892.a.b.a.b.b ##28 ENSGT00390000008631.b ENSGT00390000004405.b #29 ENSGT00940000154534.b.a ENSGT00940000154957.A ENSGT00940000164729.a.a.d ENSGT00440000033742.a.b.d ENSGT00390000004832 ENSGT00940000156193 ENSGT00390000018512 ENSGT00940000153536.a.b.b.a.b ENSGT00940000158181.a ENSGT00550000075089.i Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 105 ENSGT00950000183207.b.bb ENSGT01100000263693 ENSGT00940000164903.b ENSGT00940000159091 ENSGT00940000157981.a.b ENSGT00940000167564 ENSGT00400000024810.f ENSGT00940000159029 #12 ENSGT00940000161386 #16 ENSGT00940000161529 #17 ENSGT00940000161230 #15 ENSGT00940000165065.a ENSGT00940000158354.c.b #19 ENSGT00940000162072.c #20 ENSGT00940000159774 #21 ENSGT00940000155029.c.b #22 ENSGT00940000166856 ENSGT00940000154152.a.b #27 ENSGT00950000182892.a.b.a.b.b ##28 ENSGT00390000008631.b ENSGT00390000004405.b #29 ENSGT00940000154534.b.a ENSGT00940000154957.A ENSGT00940000164729.a.a.d ENSGT00440000033742.a.b.d ENSGT00390000004832 ENSGT00940000156193 ENSGT00390000018512 ENSGT00940000153536.a.b.b.a.b ENSGT00940000158181.a ENSGT00550000075089.i Orange clownfish MODERN SPECIES 5 ENSAPEG00000000721 ENSAPEG00000000707 ENSAPEG00000000688 hoxb4a (ENSAPEG00000000616) #20 atp5mc1 (ENSAPEG00000000609) eve1 (ENSAPEG00000000596) ENSAPEG00000000591 hoxb13a (ENSAPEG00000000571) #12 hoxb9a (ENSAPEG00000000550) #16 hoxb8a (ENSAPEG00000000511) #17 hoxb7a (ENSAPEG00000000503) #15 ENSAPEG00000000480 HOXB5 (ENSAPEG00000000469) #19 hoxb4a (ENSAPEG00000000451) #20 hoxb3a (ENSAPEG00000000442) #21 hoxb2a (ENSAPEG00000000431) #22 hoxb1a (ENSAPEG00000000334) ENSAPEG00000021799 CBX1 (ENSAPEG00000021788) #27 nfe2l1a (ENSAPEG00000021779) ##28 praf2 (ENSAPEG00000021769) copz2 (ENSAPEG00000021752) #29 prr15la (ENSAPEG00000021707) ENSAPEG00000021645 igf2bp1 (ENSAPEG00000021612) ENSAPEG00000021598 rab11fip4a (ENSAPEG00000021574) ENSAPEG00000021555 scpep1 (ENSAPEG00000021527) engase (ENSAPEG00000021483) CSNK1D (ENSAPEG00000021466) Clown anemonefish MODERN SPECIES 820 hoxb13a (ENSAOCG00000013268) #12 hoxb9a (ENSAOCG00000013255) #16 hoxb8a (ENSAOCG00000013237) #17 hoxb7a (ENSAOCG00000013222) #15 ENSAOCG00000013216 HOXB5 (ENSAOCG00000013199) #19 hoxb4a (ENSAOCG00000013144) #20 hoxb3a (ENSAOCG00000013131) #21 hoxb2a (ENSAOCG00000013104) #22 hoxb1a (ENSAOCG00000013070) Spiny chromis MODERN SPECIES 241 ENSAPOG00000001384 ENSAPOG00000001387 kcnc3a (ENSAPOG00000001394) ube2z (ENSAPOG00000001401) atp5mc1 (ENSAPOG00000001410) eve1 (ENSAPOG00000001415) ENSAPOG00000001423 hoxb13a (ENSAPOG00000001427) #12 hoxb9a (ENSAPOG00000001429) #16 hoxb8a (ENSAPOG00000001432) #17 hoxb7a (ENSAPOG00000001435) #15 ENSAPOG00000001438 HOXB5 (ENSAPOG00000001445) #19 hoxb4a (ENSAPOG00000001450) #20 hoxb3a (ENSAPOG00000001467) #21 hoxb2a (ENSAPOG00000001456) #22 hoxb1a (ENSAPOG00000001478) Bicolor damselfish MODERN SPECIES 1081 ube2z (ENSSPAG00000003477) atp5mc1 (ENSSPAG00000003510) eve1 (ENSSPAG00000003522) ENSSPAG00000003539 hoxb13a (ENSSPAG00000003608) #12 hoxb9a (ENSSPAG00000003677) #16 hoxb8a (ENSSPAG00000003685) #17 hoxb7a (ENSSPAG00000003765) #15 ENSSPAG00000003779 HOXB5 (ENSSPAG00000003799) #19 hoxb4a (ENSSPAG00000003843) #20 hoxb3a (ENSSPAG00000003859) #21 hoxb2a (ENSSPAG00000003890) #22 hoxb1a (ENSSPAG00000003907) Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000164625.o.a ENSGT00940000156584.e.b ENSGT00940000177154 ENSGT00950000183207.b ENSGT00940000164903.b ENSGT00940000159091 ENSGT00940000157981.a.b ENSGT00940000167564 ENSGT00940000159029 #12 ENSGT00940000161386 #16 ENSGT00940000161529 #17 ENSGT00940000165065.a ENSGT00940000158354.c.b #19 ENSGT00940000162072 #20 ENSGT00940000159774 #21 ENSGT00940000155029.c.b #22 ENSGT00940000166856 ENSGT00940000154152.a.b #27 ENSGT00950000182892.a.b.a.b.b ##28 ENSGT00390000008631.b ENSGT00390000004405.b #29 ENSGT00940000154957.A ENSGT00940000164729.a.a.d ENSGT00440000033742.a.b.d ENSGT00390000004832 ENSGT00940000156193 ENSGT00390000018512 ENSGT00910000147748 ENSGT00940000153536.a.b.b.a.b ENSGT00940000158181.a ENSGT00550000075089 Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00940000158268.b ENSGT00440000037417.B.a ENSGT00390000014700.b.a.b.b.a ENSGT00390000014595.a.b ENSGT00950000183207.b ENSGT00940000164903.b ENSGT00940000159091 ENSGT00940000167564 ENSGT00940000159029 #12 ENSGT00940000161386 #16 ENSGT00940000161529 #17 ENSGT00940000165065.a ENSGT00940000158354.c.b #19 ENSGT00940000162072 #20 ENSGT00940000159774 #21 ENSGT00940000155029.c.b #22 ENSGT00940000166856 ENSGT00940000154152.a.b #27 ENSGT00950000182892.a.b.a.b.b ##28 ENSGT00390000008631.b ENSGT00390000004405.b #29 ENSGT00940000154957.A ENSGT00940000164729.a.a.d ENSGT00440000033742.a.b.d ENSGT00390000004832 ENSGT00940000156193 ENSGT00390000018512 ENSGT00940000153536.a.b.b.a.b ENSGT00940000158181.a ENSGT00550000075089 ENSGT00940000163009.a Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 180 ENSGT00940000167564 ENSGT00940000159029 #12 ENSGT00940000161386 #16 ENSGT00940000161529 #17 ENSGT00940000165065.a ENSGT00940000158354.c.b #19 ENSGT00940000162072 #20 ENSGT00940000159774 #21 ENSGT00940000155029.c.b #22 ENSGT00940000166856 ENSGT00940000154152.a.b #27 ENSGT00950000182892.a.b.a.b.b ##28 ENSGT00390000008631.b ENSGT00390000004405.b #29 Mangrove rivulus MODERN SPECIES 232 eve1 (ENSKMAG00000020125) hoxb13a (ENSKMAG00000020130) #12 hoxb9a (ENSKMAG00000020136) #16 hoxb8a (ENSKMAG00000020145) #17 ENSKMAG00000020153 HOXB5 (ENSKMAG00000020163) #19 hoxb4a (ENSKMAG00000020174) #20 hoxb3a (ENSKMAG00000020193) #21 hoxb2a (ENSKMAG00000020219) #22 hoxb1a (ENSKMAG00000020236) ENSKMAG00000020252 CBX1 (ENSKMAG00000020265) #27 nfe2l1a (ENSKMAG00000020289) ##28 praf2 (ENSKMAG00000000153) copz2 (ENSKMAG00000000212) #29 Turquoise killifish MODERN SPECIES 1625 cinp (ENSNFUG00015005869) dkc1 (ENSNFUG00015005847) RAB11FIP5A (ENSNFUG00015005839) emx1 (ENSNFUG00015005836) NOTO (ENSNFUG00015005834) GPS1 (ENSNFUG00015005639) ENSNFUG00015005595 ENSNFUG00015005204 #37 AOC2 (ENSNFUG00015005121) kcnc3a (ENSNFUG00015005093) ENSNFUG00015023028 hoxb9a (ENSNFUG00015023026) #16 hoxb8a (ENSNFUG00015023025) #17 HOXB4A (ENSNFUG00015023022) #19 HOXB3A (ENSNFUG00015023020) #21 hoxb2a (ENSNFUG00015023015) #22 hoxb1a (ENSNFUG00015023012) ENSNFUG00015023010 PEX12 (ENSNFUG00015023008) HDAC5 (ENSNFUG00015022977) CYB561 (ENSNFUG00015022964) ENSNFUG00015022872 ENSNFUG00015022855 ENSNFUG00015022851 PRR12 (ENSNFUG00015022844) prrg2 (ENSNFUG00015022839) RRAS (ENSNFUG00015022830) Nfu_g_1_021902 (ENSNFUG00015022824) AP2A1 (ENSNFUG00015022250) prmt1 (ENSNFUG00015021721) PPP1R35 (ENSNFUG00015021706) Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00940000158268.b ENSGT00440000037417.B.a ENSGT00390000014700.b.a.b.b.a ENSGT00390000014595.a.b ENSGT00950000183207.b.ab ENSGT00940000164903.b ENSGT00940000159091 ENSGT00940000167564 ENSGT00940000159029 #12 ENSGT00940000161386 #16 ENSGT00940000161529 #17 ENSGT00940000165065.a ENSGT00940000158354.c.b #19 ENSGT00940000162072 #20 ENSGT00940000159774 #21 ENSGT00940000155029.c.b #22 ENSGT00940000166856 ENSGT00940000154152.a.b #27 ENSGT00950000182892.a.b.a.b.b ##28 ENSGT00390000008631.b ENSGT00390000004405.b #29 ENSGT00940000154957.A ENSGT00940000164729.a.a.d ENSGT00440000033742.a.b.d ENSGT00390000004832 ENSGT00940000156193 ENSGT00390000018512 ENSGT00940000153536.a.b.b.a.b ENSGT00940000158181.a ENSGT00550000075089 ENSGT00940000163009.a Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000160972 ENSGT00940000158268.b ENSGT00440000037417.B.a ENSGT00390000014700.b.a.b.b.a ENSGT00950000183207.b.ab ENSGT00940000164903.b ENSGT00940000159091 ENSGT00940000167564 ENSGT00940000159029 #12 ENSGT00940000161386 #16 ENSGT00940000161529 #17 ENSGT00940000165065.a ENSGT00940000158354.c.b #19 ENSGT00940000162072 #20 ENSGT00940000159774 #21 ENSGT00940000155029.c.b #22 ENSGT00940000166856 ENSGT00940000154152.a.b #27 ENSGT00950000182892.a.b.a.b.b ##28 ENSGT00390000008631.b ENSGT00390000004405.b #29 ENSGT00940000154957.A ENSGT00940000164729.a.a.d ENSGT00440000033742.a.b.d ENSGT00390000004832 ENSGT00940000156193 ENSGT00390000018512 ENSGT00940000153536.a.b.b.a.b ENSGT00940000158181.a ENSGT00550000075089 ENSGT00940000163009.a.g Poecilia ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000160972 ENSGT00940000158268.b ENSGT00440000037417.B.a ENSGT00390000014700.b.a.b.b.a ENSGT00950000183207.b.ab ENSGT00940000164903.b ENSGT00940000159091 ENSGT00940000167564 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ENSXMAG00000005166 ENSXMAG00000005168 NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 298 ENSGT00940000164903.b ENSGT00940000159091 ENSGT00940000167564 ENSGT00940000159029 #12 ENSGT00940000161386.e #16 ENSGT00940000161529 #17 ENSGT00940000165065.a ENSGT00940000158354.c.b #19 ENSGT00940000162072 #20 ENSGT00940000159774 #21 ENSGT00940000155029.c.b #22 ENSGT00940000166856 Mummichog MODERN SPECIES 697 hoxb9a (ENSFHEG00000013492) #16 hoxb8a (ENSFHEG00000013496) #17 ENSFHEG00000013503 HOXB5 (ENSFHEG00000013506) #19 hoxb4a (ENSFHEG00000013512) #20 hoxb3a (ENSFHEG00000013540) #21 hoxb2a (ENSFHEG00000000790) #22 hoxb1a (ENSFHEG00000013582) Sheepshead minnow MODERN SPECIES 526 glyr1 (ENSCVAG00000001116) kcnc3a (ENSCVAG00000001115) ube2z (ENSCVAG00000001114) eve1 (ENSCVAG00000001113) hoxb13a (ENSCVAG00000001112) #12 hoxb9a (ENSCVAG00000001111) #16 hoxb8a (ENSCVAG00000001110) #17 ENSCVAG00000001109 HOXB5 (ENSCVAG00000001108) #19 hoxb4a (ENSCVAG00000001107) #20 hoxb3a (ENSCVAG00000001106) #21 hoxb2a (ENSCVAG00000001105) #22 hoxb1a (ENSCVAG00000001104) Oryzias ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183197.a ENSGT00940000160534 ENSGT00390000016209 ENSGT00940000156584.e.b ENSGT00940000164903.b ENSGT00940000159091 ENSGT00940000157981.a.b ENSGT00940000167564 ENSGT00940000159029 #12 ENSGT00940000161386 #16 ENSGT00940000161529 #17 ENSGT00940000165065.a ENSGT00940000158354.c.b #19 ENSGT00940000162072 #20 ENSGT00940000159774 #21 ENSGT00940000155029.c.b #22 ENSGT00940000166856 ENSGT00940000154152.a.b #27 ENSGT00950000182892.a.b.a.b.b ##28 ENSGT00390000008631.b ENSGT00390000004405.b.f #29 ENSGT00940000154957.A ENSGT00940000164729.a.a.d ENSGT00440000033742.a.b.d ENSGT00390000004832 ENSGT00940000156193 ENSGT00390000018512 ENSGT00910000147748 ENSGT00940000153536.a.b.b.a.b ENSGT00940000158181.a ENSGT00550000075089 Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00950000183197.a ENSGT00940000160534 ENSGT00390000016209 ENSGT00940000156584.e.b ENSGT00940000164903.b ENSGT00940000159091 ENSGT00940000157981.a.b ENSGT00940000167564 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ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a.b ENSGT00940000153704.B.d ENSGT00940000157439.a #37 ENSGT00940000159091 ENSGT00940000157981.a.b ENSGT00940000167564 ENSGT00940000159029 #12 ENSGT00940000161386 #16 ENSGT00940000161529 #17 ENSGT00940000161230 #15 ENSGT00940000161108 #18 ENSGT00940000165065.a ENSGT00940000158354.c.b #19 ENSGT00940000162072 #20 ENSGT00940000159774 #21 ENSGT00940000155029.c.b #22 ENSGT00940000166856 ENSGT01090000261037 ENSGT00940000154152.a.b #27 ENSGT00950000182892.a.b.a.b.b ##28 ENSGT00390000008631.b ENSGT00390000004405.b #29 ENSGT00940000154534.b.a ENSGT00940000154957.A ENSGT00940000164729.a.a.d ENSGT00440000033742.a.b.d ENSGT00390000004832 ENSGT00940000156193 ENSGT00390000018512 ENSGT00910000147748 ENSGT00940000153536.a.b.b.a.b Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 55 ENSGT00940000153704.B.d ENSGT00940000157439.a #37 ENSGT00940000159091 ENSGT00940000157981.a.b ENSGT00940000167564 ENSGT00940000159029 #12 ENSGT00940000161386 #16 ENSGT00940000161529 #17 ENSGT00940000165065.a ENSGT00940000158354.c.b #19 ENSGT00940000162072 #20 ENSGT00940000155029.c.b #22 ENSGT00940000166856 ENSGT00940000154152.a.b #27 ENSGT00950000182892.a.b.a.b.b ##28 ENSGT00390000008631.b ENSGT00390000004405.b #29 ENSGT00940000154534.b.a ENSGT00940000154957.A ENSGT00440000033742.a.b.d ENSGT00390000004832 ENSGT00940000156193 ENSGT00390000018512 ENSGT00940000153536.a.b.b.a.b ENSGT00940000158181.a ENSGT00550000075089 ENSGT00940000163009.a Fugu MODERN SPECIES 17 sox10 (ENSTRUG00000008350) polr2f (ENSTRUG00000021130) ENSTRUG00000020745 ENSTRUG00000008690 #37 ube2z (ENSTRUG00000032441) atp5mc1 (ENSTRUG00000009147) eve1 (ENSTRUG00000009382) hoxb13a (ENSTRUG00000023485) #12 hoxb9a (ENSTRUG00000002255) #16 hoxb8a (ENSTRUG00000028207) #17 ENSTRUG00000033087 ENSTRUG00000001069 HOXB5 (ENSTRUG00000021471) #19 hoxb3a (ENSTRUG00000009707) #21 hoxb4a (ENSTRUG00000021234) #20 hoxb2a (ENSTRUG00000009966) #22 hoxb1a (ENSTRUG00000010036) CBX1 (ENSTRUG00000020253) #27 nfe2l1a 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ENSGT00910000147748 ENSGT00940000153536.a.b.b.a.b Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a.b ENSGT00940000153704.B.d ENSGT00940000157439.a #37 ENSGT00940000159091 ENSGT00940000157981.a.b ENSGT00940000167564 ENSGT00940000159029 #12 ENSGT00940000161386 #16 ENSGT00940000161529 #17 ENSGT00940000161230 #15 ENSGT00940000161108 #18 ENSGT00940000165065.a ENSGT00940000158354.c.b #19 ENSGT00940000162072 #20 ENSGT00940000159774 #21 ENSGT00940000155029.c.b #22 ENSGT00940000166856 ENSGT01090000261037 ENSGT00940000154152.a.b #27 ENSGT00950000182892.a.b.a.b.b ##28 ENSGT00390000008631.b ENSGT00390000004405.b #29 ENSGT00940000154534.b.a ENSGT00940000154957.A ENSGT00940000164729.a.a.d ENSGT00440000033742.a.b.d ENSGT00390000004832 ENSGT00940000156193 ENSGT00390000018512 ENSGT00910000147748 ENSGT00940000153536.a.b.b.a.b Perciformes ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a.b ENSGT00940000153704.B.d ENSGT00940000157439.a #37 ENSGT00940000159091 ENSGT00940000157981.a.b ENSGT00940000167564 ENSGT00940000159029 #12 ENSGT00940000161386 #16 ENSGT00940000161529 #17 ENSGT00940000161230 #15 ENSGT00940000161108 #18 ENSGT00940000165065.a ENSGT00940000158354.c.b #19 ENSGT00940000162072 #20 ENSGT00940000159774 #21 ENSGT00940000155029.c.b #22 ENSGT00940000166856 ENSGT00940000154152.a.b.b.b #27 ENSGT00950000182892.a.b.a.b.b ##28 ENSGT00390000008631.b ENSGT00390000004405.b #29 ENSGT00940000154534.b.a ENSGT00940000154957.A ENSGT00940000164729.a.a.d ENSGT00440000033742.a.b.d ENSGT00390000004832 ENSGT00940000156193 ENSGT00390000018512 ENSGT00940000153536.a.b.b.a.b ENSGT00940000158181.a ENSGT00550000075089 Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000164903.b ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a.b ENSGT00940000153704.B.d ENSGT00940000157439.a #37 ENSGT00940000159091 ENSGT00940000157981.a.b ENSGT00940000167564 ENSGT00940000159029 #12 ENSGT00940000161386 #16 ENSGT00940000161529 #17 ENSGT00940000161230 #15 ENSGT00940000165065.a ENSGT00940000158354.c.b #19 ENSGT00940000162072 #20 ENSGT00940000159774 #21 ENSGT00940000155029.c.b #22 ENSGT00940000166856 ENSGT00940000154152.a.b.b.b #27 ENSGT00950000182892.a.b.a.b.b ##28 ENSGT00390000008631.b ENSGT00390000004405.b #29 ENSGT00940000154534.b.a ENSGT00940000154957.A ENSGT00440000033742.a.b.d ENSGT00390000004832 ENSGT00940000156193 ENSGT00390000018512 ENSGT00940000153536.a.b.b.a.b ENSGT00940000158181.a ENSGT00550000075089 ENSGT01020000230389.a.a.a Pike perch MODERN SPECIES 107 kcnc3a (ENSSLUG00000025735) PDK2 (ENSSLUG00000025753) ENSSLUG00000025772 #37 ENSSLUG00000025782 ube2z (ENSSLUG00000025783) atp5mc1 (ENSSLUG00000025787) eve1 (ENSSLUG00000025790) hoxb13a (ENSSLUG00000025791) #12 hoxb9a (ENSSLUG00000025792) #16 hoxb8a (ENSSLUG00000025797) #17 hoxb7a (ENSSLUG00000025801) #15 ENSSLUG00000025803 HOXB5 (ENSSLUG00000025807) #19 hoxb4a (ENSSLUG00000014165) #20 hoxb3a (ENSSLUG00000014170) #21 hoxb2a (ENSSLUG00000014173) #22 hoxb1a (ENSSLUG00000014182) CBX1 (ENSSLUG00000014227) #27 nfe2l1a (ENSSLUG00000014230) ##28 praf2 (ENSSLUG00000014235) copz2 (ENSSLUG00000014240) #29 prr15la (ENSSLUG00000014255) ENSSLUG00000014263 igf2bp1 (ENSSLUG00000014270) ENSSLUG00000014292 rab11fip4a (ENSSLUG00000014326) coil (ENSSLUG00000014372) scpep1 (ENSSLUG00000014434) engase (ENSSLUG00000014748) csnk1db (ENSSLUG00000014906) slc16a3b (ENSSLUG00000014935) Channel bull blenny MODERN SPECIES 22 kcnc3a (ENSCGOG00000000895) pdk2b (ENSCGOG00000000867) ENSCGOG00000000864 ENSCGOG00000000829 #37 ube2z (ENSCGOG00000000775) atp5mc1 (ENSCGOG00000000767) eve1 (ENSCGOG00000000762) hoxb13a (ENSCGOG00000000761) #12 hoxb9a (ENSCGOG00000000760) #16 hoxb8a (ENSCGOG00000000757) #17 hoxb7a (ENSCGOG00000000755) #15 ENSCGOG00000000754 HOXB5 (ENSCGOG00000000752) #19 hoxb4a (ENSCGOG00000000751) #20 hoxb3a (ENSCGOG00000000749) #21 hoxb2a (ENSCGOG00000000750) #22 hoxb1a (ENSCGOG00000000745) nfe2l1a (ENSCGOG00000000742) ##28 praf2 (ENSCGOG00000000740) copz2 (ENSCGOG00000000733) #29 prr15la (ENSCGOG00000000732) igf2bp1 (ENSCGOG00000000719) rab11fip4a (ENSCGOG00000000701) coil (ENSCGOG00000000688) scpep1 (ENSCGOG00000000661) engase (ENSCGOG00000000633) ENSCGOG00000000521 slc16a3b (ENSCGOG00000000465) dus1l (ENSCGOG00000021611) ENSCGOG00000021607 cln3 (ENSCGOG00000021587) Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000160377 ENSGT00940000153704.B.d ENSGT00940000157439.a #37 ENSGT00940000159091 ENSGT00940000157981.a.b ENSGT00940000167564 ENSGT00940000159029 #12 ENSGT00940000161386 #16 ENSGT00940000161529 #17 ENSGT00940000161230 #15 ENSGT00940000161108 #18 ENSGT00940000165065.a ENSGT00940000158354.c.b #19 ENSGT00940000162072 #20 ENSGT00940000159774 #21 ENSGT00940000155029.c.b #22 ENSGT00940000166856 ENSGT00940000154152.a.b.b.a #27 ENSGT00950000182892.a.b.a.b.b ##28 ENSGT00390000008631.b ENSGT00390000004405.b #29 ENSGT00940000154534.b.a ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a.b ENSGT00940000164903.b ENSGT00950000183098.a.a ENSGT00950000183207.b Stickleback MODERN SPECIES 10 ppp4cb (ENSGACG00000005465) aldh3b1 (ENSGACG00000005487) clpp (ENSGACG00000005502) si:ch211-286b5.5 (ENSGACG00000005522) carm1 (ENSGACG00000005531) ENSGACG00000005568 ENSGACG00000005576 #37 ube2z (ENSGACG00000005589) atp5mc1 (ENSGACG00000005605) hoxb13a (ENSGACG00000005617) #12 ENSGACG00000005622 ENSGACG00000005623 HOXB5 (ENSGACG00000005626) #19 hoxb4a (ENSGACG00000005628) #20 hoxb3a (ENSGACG00000005631) #21 hoxb2a (ENSGACG00000005633) #22 hoxb1a (ENSGACG00000005635) CBX1 (ENSGACG00000005637) #27 nfe2l1a (ENSGACG00000005644) ##28 praf2 (ENSGACG00000005654) copz2 (ENSGACG00000005661) #29 prr15la (ENSGACG00000005720) PDK2 (ENSGACG00000005722) kcnc3a (ENSGACG00000005755) PSME3 (ENSGACG00000005761) aoc2 (ENSGACG00000005784) ENSGACG00000005803 rad23aa (ENSGACG00000005805) traf7 (ENSGACG00000005811) CASKIN1 (ENSGACG00000005822) prpsap2 (ENSGACG00000005830) Lumpfish MODERN SPECIES 23 ppp4cb (ENSCLMG00005005015) aldh3b1 (ENSCLMG00005005012) clpp (ENSCLMG00005005010) si:ch211-286b5.5 (ENSCLMG00005005007) carm1 (ENSCLMG00005004546) ENSCLMG00005004333 #37 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#15 ENSGT00940000165065.a ENSGT00940000158354.c.b #19 ENSGT00940000162072 #20 ENSGT00940000159774 #21 ENSGT00940000155029.c.b #22 ENSGT00940000166856 ENSGT01090000261037 ENSGT00940000154152.a.b #27 ENSGT00950000182892.a.b.a.b.b ##28 ENSGT00390000008631.b ENSGT00390000004405.b #29 ENSGT00940000154534.b.a ENSGT00940000154957.A ENSGT00440000033742.a.b.d ENSGT00390000004832 ENSGT00940000156193 ENSGT00390000018512 ENSGT00910000147748 ENSGT00940000153536.a.b.b.a.b ENSGT00940000158181.a Gilthead seabream MODERN SPECIES 15 ENSSAUG00010003280 ENSSAUG00010003282 ENSSAUG00010003287 ENSSAUG00010003303 #37 ube2z (ENSSAUG00010003377) ATP5G3 (ENSSAUG00010003390) eve1 (ENSSAUG00010003399) hoxb13a (ENSSAUG00010003401) #12 hoxb9a (ENSSAUG00010003409) #16 ENSSAUG00010003410 hoxb8a (ENSSAUG00010003412) #17 ENSSAUG00010003413 HOXB5 (ENSSAUG00010003414) #19 hoxb4a (ENSSAUG00010003417) #20 hoxb3a (ENSSAUG00010003419) #21 hoxb2a (ENSSAUG00010003420) #22 hoxb1a (ENSSAUG00010003422) ENSSAUG00010003433 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Barramundi perch MODERN SPECIES 247 ENSLCAG00010003853 ENSLCAG00010003819 #37 ENSLCAG00010003802 ENSLCAG00010003797 ube2z (ENSLCAG00010003789) atp5mc1 (ENSLCAG00010003778) eve1 (ENSLCAG00010003771) hoxb13a (ENSLCAG00010003768) #12 hoxb9a (ENSLCAG00010003766) #16 hoxb8a (ENSLCAG00010003765) #17 hoxb7a (ENSLCAG00010003762) #15 ENSLCAG00010003761 HOXB5 (ENSLCAG00010003760) #19 hoxb4a (ENSLCAG00010003757) #20 hoxb3a (ENSLCAG00010003753) #21 hoxb2a (ENSLCAG00010003756) #22 hoxb1a (ENSLCAG00010003751) CBX1 (ENSLCAG00010003749) #27 nfe2l1a (ENSLCAG00010003748) ##28 praf2 (ENSLCAG00010003746) copz2 (ENSLCAG00010003729) #29 prr15la (ENSLCAG00010003720) igf2bp1 (ENSLCAG00010003597) rab11fip4a (ENSLCAG00010003575) Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT01100000263693 ENSGT00940000164903.b ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a.b ENSGT00940000153704.B.d ENSGT00940000157439.a #37 ENSGT00940000159091 ENSGT00940000157981.a.b ENSGT00940000167564 ENSGT00940000159029 #12 ENSGT00940000161386 #16 ENSGT00940000161529 #17 ENSGT00940000165065.a ENSGT00940000158354.c.b #19 ENSGT00940000162072 #20 ENSGT00940000159774 #21 ENSGT00940000155029.c.b #22 ENSGT00940000166856 ENSGT00940000154152.a.b #27 ENSGT00950000182892.a.b.a.b.b ##28 ENSGT00390000008631.b ENSGT00390000004405.b #29 ENSGT00940000154534.b.a ENSGT00940000154957.A ENSGT00940000164729.a.a.d ENSGT00440000033742.a.b.d ENSGT00390000004832 ENSGT00940000156193 ENSGT00390000018512 ENSGT00940000153536.a.b.b.a.b ENSGT00940000158181.a ENSGT00550000075089 Tongue sole MODERN SPECIES 8 ENSCSEG00000012821 DLX3 (ENSCSEG00000012819) PSMD11 (ENSCSEG00000012804) rpain (ENSCSEG00000012792) ZNF653 (ENSCSEG00000012787) tspan35 (ENSCSEG00000012782) zgc:158403 (ENSCSEG00000012776) ENSCSEG00000012766 hoxb13a (ENSCSEG00000012749) #12 eve1 (ENSCSEG00000012743) hoxb9a (ENSCSEG00000012735) #16 hoxb8a (ENSCSEG00000012733) #17 ENSCSEG00000012724 hoxb4a (ENSCSEG00000012720) #20 hoxb3a (ENSCSEG00000012710) #21 hoxb2a (ENSCSEG00000012699) #22 hoxb1a 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ENSSMAG00000016421 rab11fip4a (ENSSMAG00000016438) coil (ENSSMAG00000016462) scpep1 (ENSSMAG00000016480) engase (ENSSMAG00000016499) ENSSMAG00000016518 ENSSMAG00000016526 dus1l (ENSSMAG00000016562) ENSSMAG00000016576 Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000160548 ENSGT00990000204190 ENSGT00940000154957.A ENSGT00940000159091 ENSGT00940000157981.a.b ENSGT00940000167564 ENSGT00940000159029 #12 ENSGT00940000163268.e ENSGT00940000161386 #16 ENSGT00940000161529 #17 ENSGT00940000161230 #15 ENSGT00940000161108 #18 ENSGT00940000158354.d #19 ENSGT00940000162072 #20 ENSGT00940000159774 #21 ENSGT00940000155029.c.b #22 ENSGT00940000166856 ENSGT00940000154152.b.a #27 ENSGT00950000182892.a.b.a.b.b ##28 ENSGT00390000004405.b #29 ENSGT00940000154534.b.a ENSGT00940000157439.a #37 ENSGT00940000153704.B.d ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a.b ENSGT00940000155557.jc.a ENSGT00940000156395.f ENSGT00390000015789 ENSGT00950000182969.B.c.a.a.b.a.a.a.a.b.x ENSGT00950000182969.B.c.a.a.b.a.a.a.a.a.a.a 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ENSGT01030000234578.A.b.b ENSGT00940000157367.a.a ENSGT00940000178227.a ENSGT00940000159653.g.a ENSGT00940000153560.b.b.b.g ENSGT01060000248591.a.a.a.b.a ENSGT00940000161265.e.a.a Red-bellied piranha MODERN SPECIES 12 nr1d1 (ENSPNAG00000015887) ENSPNAG00000015829 igf2bp1 (ENSPNAG00000015781) ube2z (ENSPNAG00000015749) ATP5MC1 (ENSPNAG00000015689) eve1 (ENSPNAG00000015546) hoxb13a (ENSPNAG00000015539) #12 ENSPNAG00000015531 hoxb9a (ENSPNAG00000015522) #16 hoxb8a (ENSPNAG00000015517) #17 hoxb7a (ENSPNAG00000015508) #15 hoxb6a (ENSPNAG00000015499) #18 hoxb5a (ENSPNAG00000015488) #19 hoxb4a (ENSPNAG00000015473) #20 hoxb3a (ENSPNAG00000015463) #21 hoxb2a (ENSPNAG00000015444) #22 hoxb1a (ENSPNAG00000015431) cbx1a (ENSPNAG00000015386) #27 nfe2l1a (ENSPNAG00000015355) ##28 copz2 (ENSPNAG00000015344) #29 ENSPNAG00000015260 prr15la (ENSPNAG00000015234) ENSPNAG00000007053 adsl (ENSPNAG00000015193) tmem150b (ENSPNAG00000015100) ENSPNAG00000015029 ENSPNAG00000015012 pvalb6 (ENSPNAG00000014970) ENSPNAG00000014949 CBX6 (ENSPNAG00000014919) ENSPNAG00000014911 Mexicana tetra MODERN SPECIES 143 casc3 (ENSAMXG00000032452) msl1a (ENSAMXG00000015829) nr1d1 (ENSAMXG00000015855) ENSAMXG00000029417 igf2bp1 (ENSAMXG00000015877) ube2z (ENSAMXG00000040778) atp5mc1 (ENSAMXG00000015927) hoxb13a (ENSAMXG00000015950) #12 hoxb9a (ENSAMXG00000029493) #16 hoxb8a (ENSAMXG00000037495) #17 hoxb7a (ENSAMXG00000043718) #15 hoxb6a (ENSAMXG00000029976) #18 hoxb5a (ENSAMXG00000030695) #19 hoxb4a (ENSAMXG00000015999) #20 hoxb3a (ENSAMXG00000041474) #21 hoxb2a (ENSAMXG00000016026) #22 hoxb1a (ENSAMXG00000042720) eve1 (ENSAMXG00000033002) cbx1a (ENSAMXG00000037761) #27 nfe2l1a (ENSAMXG00000030680) ##28 copz2 (ENSAMXG00000042171) #29 prr15la (ENSAMXG00000025774) ENSAMXG00000035669 ENSAMXG00000002620 adsl (ENSAMXG00000041444) tmem150b (ENSAMXG00000040509) ENSAMXG00000041936 ENSAMXG00000044079 pvalb6 (ENSAMXG00000040987) ENSAMXG00000032398 ENSAMXG00000031801 Electric eel MODERN SPECIES 26 ENSEEEG00000004005 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ENSGT00940000166856 ENSGT00940000154152.b.a #27 ENSGT00950000182892.a.b.a.b.b ##28 ENSGT00390000004405.b #29 ENSGT00940000154534.b.a ENSGT00940000157439.a #37 ENSGT00940000153704.B.d ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a.b ENSGT00940000155557.jc.a ENSGT00940000156395.f ENSGT00390000015789 ENSGT00950000182969.B.c.a.a.b.a.a.a.a.b.x ENSGT00950000182969.B.c.a.a.b.a.a.a.a.b.w ENSGT00950000182969.B.c.a.a.b.a.a.a.a.a.a.a ENSGT01090000260030.a.b.b.b Atlantic herring MODERN SPECIES ENSCHAG00000012653 igf2bp1 (ENSCHAG00000012263) ube2z (ENSCHAG00000012169) atp5mc1 (ENSCHAG00000012097) ttll6 (ENSCHAG00000012024) eve1 (ENSCHAG00000012005) hoxb13a (ENSCHAG00000011984) #12 ENSCHAG00000011977 hoxb9a (ENSCHAG00000011972) #16 hoxb8a (ENSCHAG00000011949) #17 hoxb7a (ENSCHAG00000011939) #15 hoxb6a (ENSCHAG00000011924) #18 hoxb5a (ENSCHAG00000011908) #19 hoxb4a (ENSCHAG00000011877) #20 hoxb3a (ENSCHAG00000011846) #21 hoxb2a (ENSCHAG00000011811) #22 hoxb1a (ENSCHAG00000011778) cbx1a (ENSCHAG00000011737) #27 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(ENSDCDG00000023656) ENSDCDG00000023398 #37 TBKBP1 (ENSDCDG00000023381) pdk2b (ENSDCDG00000022777) wipf2b (ENSDCDG00000022755) JUP (ENSDCDG00000020697) eif1 (ENSDCDG00000020640) krt91 (ENSDCDG00000020639) ENSDCDG00000020275 krtt1c19e (ENSDCDG00000019925) si:dkeyp-113d7.1 (ENSDCDG00000019912) Denticle herring MODERN SPECIES 1 plagx (ENSDCDG00000003888) ENSDCDG00000003891 rbms2b (ENSDCDG00000003905) ENSDCDG00000003932 ENSDCDG00000003942 mfsd5 (ENSDCDG00000004049) nr1d4a (ENSDCDG00000004053) rarga (ENSDCDG00000004066) calcoco1a (ENSDCDG00000004166) HOXC13 (ENSDCDG00000004169) hoxc10a (ENSDCDG00000004170) hoxc11a (ENSDCDG00000004171) hoxc9a (ENSDCDG00000004174) hoxc8a (ENSDCDG00000004176) hoxc4a (ENSDCDG00000004178) ENSDCDG00000004182 #22 cbx5 (ENSDCDG00000004185) ENSDCDG00000004186 nfe2 (ENSDCDG00000004189) ##28 znf740b (ENSDCDG00000004192) csad (ENSDCDG00000004195) zgc:174906 (ENSDCDG00000004247) ENSDCDG00000004252 spryd3 (ENSDCDG00000004258) igfbp6b (ENSDCDG00000004262) erbb3b 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ENSGT00940000157883.a.b.e.a ENSGT00680000100059 ENSGT00940000156791 ENSGT00940000157618 ENSGT00950000183140.a.b ENSGT00940000159964 ENSGT00940000155850 ENSGT01100000263532.C.c.b Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000156420 ENSGT00390000003635 ENSGT00940000171365 ENSGT00950000183025.b.a ENSGT00940000155255 ENSGT00940000159854 ENSGT00940000164071 ENSGT00940000158311 ENSGT00940000163268 ENSGT00940000164628 ENSGT00940000161013 ENSGT00940000161585 ENSGT00940000159894 ENSGT00940000158988.a.a ENSGT00940000159522 ENSGT00940000155029.c.a ##22 ENSGT00940000157315 ENSGT00390000017856.a ##25 ENSGT00940000156007 ENSGT00940000153305 ENSGT00940000154431 ENSGT00950000182892.a.b.b ##28 ENSGT00390000003271 ENSGT00390000015236 ENSGT00940000157883.a.b.e.b ENSGT00940000155957 ENSGT00940000155880 ENSGT00940000155348.A ENSGT00940000158500 ENSGT00940000156475 ENSGT00390000007287 Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000161975 ENSGT00940000156420 ENSGT00390000003635 ENSGT00950000183025.b.a 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ENSGT00390000007287 ENSGT00770000120611.B Neognathae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003635 ENSGT00950000183025.b.a ENSGT00940000155255 ENSGT00940000159854 ENSGT00940000164071 ENSGT00940000158311 ENSGT00940000162440 ENSGT00940000161864 ENSGT00940000163268 ENSGT00940000164628 ENSGT00940000161013 ENSGT00940000161585 ENSGT00940000159894 ENSGT00940000158988.a.a ENSGT00940000159522.f ENSGT00940000155029.c.a ##22 ENSGT00940000157315 ENSGT00390000017856.a ##25 ENSGT00940000156007 ENSGT00940000153305.c ENSGT00940000154431 ENSGT00950000182892.a.b.b ##28 ENSGT00390000003271 ENSGT00390000015236 ENSGT00390000009405 ENSGT00940000155957 ENSGT00940000155880 ENSGT00940000158500 ENSGT00940000156475 ENSGT00390000007287 ENSGT00770000120611.B Galloanserae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000161975 ENSGT00940000156420 ENSGT00390000003635 ENSGT00950000183025.b.a ENSGT00940000155255 ENSGT00940000159854 ENSGT00940000164071 ENSGT00940000158311 ENSGT00940000162440 ENSGT00940000161864 ENSGT00940000161013 ENSGT00940000161585 ENSGT00940000159894 ENSGT00940000158988.a.a ENSGT00940000159522.f ENSGT00940000155029.c.a ##22 ENSGT00940000157315 ENSGT00390000017856.a ##25 ENSGT00940000156007 ENSGT00940000153305.c ENSGT00940000154431 ENSGT00390000003271 ENSGT00390000015236 ENSGT00390000009405 ENSGT00940000155957 ENSGT00940000155880 ENSGT00940000158500 ENSGT00940000156475 ENSGT00390000007287 ENSGT00770000120611.B ENSGT00940000153470.a.a.a.b Anatidae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000003635 ENSGT00950000183025.b.a ENSGT00940000155255 ENSGT00940000159854 ENSGT00940000164071 ENSGT00940000158311 ENSGT00940000163268 ENSGT00940000164628 ENSGT00940000162440 ENSGT00940000161864 ENSGT00940000161013 ENSGT00940000161585 ENSGT00940000159894 ENSGT00940000158988.a.a ENSGT00940000159522.f ENSGT00940000155029.c.a ##22 ENSGT00940000157315 ENSGT00390000017856.a ##25 ENSGT00940000156007 ENSGT00940000153305.c ENSGT00940000154431 ENSGT00390000003271 ENSGT00390000015236 ENSGT00390000009405 ENSGT00940000155957 ENSGT00940000155880 ENSGT00940000158500 ENSGT00940000156475 ENSGT00390000007287 ENSGT00770000120611.B ENSGT00940000153470.a.a.a.b Pink-footed goose MODERN SPECIES TRIL (ENSABRG00000009999) CREB5 (ENSABRG00000010020) JAZF1 (ENSABRG00000010106) TAX1BP1 (ENSABRG00000010126) HIBADH (ENSABRG00000010163) EVX1 (ENSABRG00000010188) ENSABRG00000010197 HOXA11 (ENSABRG00000010207) HOXA10 (ENSABRG00000010211) HOXA9 (ENSABRG00000010216) HOXA7 (ENSABRG00000010221) HOXA6 (ENSABRG00000010225) HOXA5 (ENSABRG00000010228) HOXA4 (ENSABRG00000010230) HOXA3 (ENSABRG00000010233) ENSABRG00000010239 ##22 HOXA1 (ENSABRG00000010242) SKAP2 (ENSABRG00000010253) ##25 SNX10 (ENSABRG00000010263) CBX3 (ENSABRG00000010267) HNRNPA2B1 (ENSABRG00000010273) NPVF (ENSABRG00000010288) CYCS (ENSABRG00000010310) OSBPL3 (ENSABRG00000010359) GSDME (ENSABRG00000010392) PALS2 (ENSABRG00000010416) NPY (ENSABRG00000010432) ENSABRG00000010444 ENSABRG00000010455 FAM221A (ENSABRG00000010467) CCDC126 (ENSABRG00000010480) Duck MODERN SPECIES 10 TRIL (ENSAPLG00000027101) CREB5 (ENSAPLG00000004960) JAZF1 (ENSAPLG00000014482) TAX1BP1 (ENSAPLG00000010659) HIBADH (ENSAPLG00000010878) EVX1 (ENSAPLG00000020631) HOXA11 (ENSAPLG00000011282) ENSAPLG00000026443 ENSAPLG00000011292 ENSAPLG00000027301 HOXA7 (ENSAPLG00000011313) HOXA6 (ENSAPLG00000011384) HOXA5 (ENSAPLG00000022394) HOXA4 (ENSAPLG00000011410) HOXA3 (ENSAPLG00000022676) ENSAPLG00000011540 ##22 SKAP2 (ENSAPLG00000020344) ##25 SNX10 (ENSAPLG00000011904) CBX3 (ENSAPLG00000011969) HNRNPA2B1 (ENSAPLG00000012019) NPVF (ENSAPLG00000011937) C7orf31 (ENSAPLG00000012025) CYCS (ENSAPLG00000017045) OSBPL3 (ENSAPLG00000015336) GSDME (ENSAPLG00000014944) PALS2 (ENSAPLG00000014575) NPY (ENSAPLG00000014559) STK31 (ENSAPLG00000014105) FAM221A (ENSAPLG00000013898) CCDC126 (ENSAPLG00000013834) ENSAPLG00000023721 Phasianidae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000161975 ENSGT00940000156420 ENSGT00390000003635 ENSGT00950000183025.b.a ENSGT00940000155255 ENSGT00940000159854 ENSGT00940000164071 ENSGT00940000158311 ENSGT00940000162440 ENSGT00940000164628 ENSGT00940000161013 ENSGT00940000161585 ENSGT00940000159894 ENSGT00940000158988.a.a ENSGT00940000159522.f ENSGT00940000155029.c.a ##22 ENSGT00940000157315 ENSGT00390000017856.a ##25 ENSGT00940000156007 ENSGT00940000153305.c ENSGT00940000154431 ENSGT00390000003271 ENSGT00390000015236 ENSGT00390000009405 ENSGT00940000155957 ENSGT00940000155880 ENSGT00940000158500 ENSGT00940000156475 ENSGT00390000007287 ENSGT00770000120611.B ENSGT00940000153470.a.a.a.b Phasianidae_b ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000161975 ENSGT00940000156420 ENSGT00390000003635 ENSGT00950000183025.b.a ENSGT00940000155255 ENSGT00940000159854 ENSGT00940000164071 ENSGT00940000158311 ENSGT00940000162440 ENSGT00940000164628 ENSGT00940000161013 ENSGT00940000161585 ENSGT00940000159894 ENSGT00940000158988.a.a ENSGT00940000159522.f ENSGT00940000155029.c.a ##22 ENSGT00940000157315 ENSGT00390000017856.a ##25 ENSGT00940000156007 ENSGT00940000153305.c ENSGT00940000154431 ENSGT00390000003271 ENSGT00390000015236 ENSGT00390000009405 ENSGT00940000155957 ENSGT00940000155880 ENSGT00940000158500 ENSGT00940000156475 ENSGT00390000007287 ENSGT00770000120611.B ENSGT00940000153470.a.a.a.b Chicken MODERN SPECIES 11 TRIL (ENSGALG00010001716) CREB5 (ENSGALG00010001711) JAZF1 (ENSGALG00010001458) TAX1BP1 (ENSGALG00010001453) HIBADH (ENSGALG00010001363) EVX1 (ENSGALG00010001589) HOXA13 (ENSGALG00010001321) HOXA11 (ENSGALG00010001848) HOXA10 (ENSGALG00010001844) HOXA9 (ENSGALG00010001840) HOXA7 (ENSGALG00010001826) HOXA6 (ENSGALG00010001819) HOXA5 (ENSGALG00010001813) HOXA4 (ENSGALG00010001808) HOXA3 (ENSGALG00010001801) HOXA2 (ENSGALG00010001790) ##22 HOXA1 (ENSGALG00010001788) SKAP2 (ENSGALG00010001906) ##25 SNX10 (ENSGALG00010001888) CBX3 (ENSGALG00010001861) HNRNPA2B1 (ENSGALG00010001857) NPVF (ENSGALG00010001348) C7orf31 (ENSGALG00010001336) CYCS (ENSGALG00010002409) OSBPL3 (ENSGALG00010002404) DFNA5 (ENSGALG00010002392) PALS2 (ENSGALG00010002385) NPY (ENSGALG00010002375) STK31 (ENSGALG00010002367) FAM221A (ENSGALG00010001420) CCDC126 (ENSGALG00010001414) Japanese quail MODERN SPECIES 11 ENSCJPG00005012552 JAZF1 (ENSCJPG00005012550) TAX1BP1 (ENSCJPG00005012549) HIBADH (ENSCJPG00005012548) EVX1 (ENSCJPG00005012544) ENSCJPG00005012542 ENSCJPG00005012539 HOXA11 (ENSCJPG00005012535) HOXA10 (ENSCJPG00005012534) ENSCJPG00005012532 HOXA7 (ENSCJPG00005012531) HOXA6 (ENSCJPG00005012530) HOXA5 (ENSCJPG00005012529) HOXA4 (ENSCJPG00005012528) HOXA3 (ENSCJPG00005012527) ENSCJPG00005012526 ##22 HOXA1 (ENSCJPG00005012524) SKAP2 (ENSCJPG00005012522) ##25 SNX10 (ENSCJPG00005012520) CBX3 (ENSCJPG00005012519) HNRNPA2B1 (ENSCJPG00005012518) NPVF (ENSCJPG00005012514) C7orf31 (ENSCJPG00005012513) ENSCJPG00005012512 OSBPL3 (ENSCJPG00005012510) GSDME (ENSCJPG00005012509) PALS2 (ENSCJPG00005012508) NPY (ENSCJPG00005012506) STK31 (ENSCJPG00005012504) FAM221A (ENSCJPG00005012503) CCDC126 (ENSCJPG00005012502) Neognathae_b ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000156420 ENSGT00390000003635 ENSGT00950000183025.b.a ENSGT00940000155255 ENSGT00940000159854 ENSGT00940000164071 ENSGT00940000158311 ENSGT00940000162440 ENSGT00940000163268 ENSGT00940000164628 ENSGT00940000161013 ENSGT00940000161585 ENSGT00940000159894 ENSGT00940000158988.a.a ENSGT00940000159522.f ENSGT00940000155029.c.a ##22 ENSGT00940000157315 ENSGT00390000017856.a ##25 ENSGT00940000156007 ENSGT00940000153305.c ENSGT00940000154431 ENSGT00950000182892.a.b.b ##28 ENSGT00390000003271 ENSGT00390000015236 ENSGT00940000157883.a.b.e.b ENSGT00390000009405 ENSGT00940000155957 ENSGT00940000155880 ENSGT00940000158500 ENSGT00940000156475 ENSGT00390000007287 Passeriformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000156420 ENSGT00390000003635 ENSGT00950000183025.b.a ENSGT00940000155255 ENSGT00940000159854 ENSGT00940000164071 ENSGT00940000158311 ENSGT00940000162440 ENSGT00940000163268 ENSGT00940000164628 ENSGT00940000161013 ENSGT00940000161585 ENSGT00940000159894 ENSGT00940000158988.a.a 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SPECIES ENSSHBG00005001318 TRIL (ENSSHBG00005001311) CREB5 (ENSSHBG00005001299) JAZF1 (ENSSHBG00005001291) TAX1BP1 (ENSSHBG00005001265) HIBADH (ENSSHBG00005000011) EVX1 (ENSSHBG00005008278) ENSSHBG00005008269 HOXA11 (ENSSHBG00005008263) HOXA10 (ENSSHBG00005008247) ENSSHBG00005008236 HOXA7 (ENSSHBG00005008228) HOXA5 (ENSSHBG00005008219) HOXA4 (ENSSHBG00005008209) HOXA3 (ENSSHBG00005008202) ENSSHBG00005008197 ##22 HOXA1 (ENSSHBG00005008162) SKAP2 (ENSSHBG00005008089) ##25 SNX10 (ENSSHBG00005008053) CBX3 (ENSSHBG00005008027) HNRNPA2B1 (ENSSHBG00005008006) NFE2L3 (ENSSHBG00005007997) ##28 NPVF (ENSSHBG00005007977) ENSSHBG00005007969 OSBPL3 (ENSSHBG00005006418) GSDME (ENSSHBG00005006258) PALS2 (ENSSHBG00005006231) NPY (ENSSHBG00005006199) STK31 (ENSSHBG00005006119) FAM221A (ENSSHBG00005006100) CCDC126 (ENSSHBG00005006086) African ostrich MODERN SPECIES 661 ENSSCUG00000006886 CREB5 (ENSSCUG00000006888) JAZF1 (ENSSCUG00000006893) TAX1BP1 (ENSSCUG00000006898) HIBADH (ENSSCUG00000006903) EVX1 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ENSGT00940000154431 ENSGT00950000182892.a.b.b ##28 ENSGT00390000003271 ENSGT00390000015236 ENSGT00940000157883.a.b.e.b ENSGT00940000155957 ENSGT00940000155880 ENSGT00940000158500 ENSGT00940000156475 ENSGT00390000007287 ENSGT00770000120611.B Testudinoidea ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000003635 ENSGT00950000183025.b.a ENSGT00940000155255 ENSGT00940000159854 ENSGT00940000164071 ENSGT00940000158311 ENSGT00940000163268 ENSGT00940000161864 ENSGT00940000162440 ENSGT00940000164628 ENSGT00940000161013 ENSGT00940000161585 ENSGT00940000159894 ENSGT00940000158988.a.a ENSGT00940000159522.f ENSGT00940000155029.c.a ##22 ENSGT00940000157315 ENSGT00390000017856.a ##25 ENSGT00940000156007 ENSGT00940000153305.c ENSGT00940000154431 ENSGT00950000182892.a.b.b ##28 ENSGT00390000003271 ENSGT00390000015236 ENSGT00940000157883.a.b.e.b ENSGT00940000155957 ENSGT00940000155880 ENSGT00940000158500 ENSGT00940000156475 ENSGT00390000007287 ENSGT00770000120611.B Emydidae ANCESTRAL SPECIES 40 ENSGT00390000003635 ENSGT00950000183025.b.a ENSGT00940000155255 ENSGT00940000159854 ENSGT00940000164071 ENSGT00940000158311 ENSGT00940000163268 ENSGT00940000161864 ENSGT00940000162440 ENSGT00940000164628 ENSGT00940000161013 ENSGT00940000161585 ENSGT00940000159894 ENSGT00940000158988.a.a ENSGT00940000159522.f ENSGT00940000155029.c.a ##22 Three-toed box turtle MODERN SPECIES 30 ENSTMTG00000003001 JAZF1 (ENSTMTG00000003004) TAX1BP1 (ENSTMTG00000003013) HIBADH (ENSTMTG00000003026) EVX1 (ENSTMTG00000003036) ENSTMTG00000003045 HOXA11 (ENSTMTG00000003050) ENSTMTG00000003062 ENSTMTG00000003069 HOXA9 (ENSTMTG00000003072) HOXA7 (ENSTMTG00000003084) HOXA6 (ENSTMTG00000003094) HOXA5 (ENSTMTG00000003104) HOXA4 (ENSTMTG00000003107) HOXA3 (ENSTMTG00000003112) ENSTMTG00000003122 ##22 HOXA1 (ENSTMTG00000003132) SKAP2 (ENSTMTG00000003145) ##25 SNX10 (ENSTMTG00000003161) CBX3 (ENSTMTG00000003179) HNRNPA2B1 (ENSTMTG00000003199) NFE2L3 (ENSTMTG00000003209) ##28 NPVF (ENSTMTG00000003221) C7orf31 (ENSTMTG00000003235) ENSTMTG00000003246 OSBPL3 (ENSTMTG00000003312) GSDME (ENSTMTG00000004558) PALS2 (ENSTMTG00000004579) ENSTMTG00000004610 NPY (ENSTMTG00000004622) STK31 (ENSTMTG00000004655) painted turtle MODERN SPECIES 7 CREB5 (ENSCPBG00000022518) JAZF1 (ENSCPBG00000022514) TAX1BP1 (ENSCPBG00000022513) HIBADH (ENSCPBG00000022512) EVX1 (ENSCPBG00000022511) ENSCPBG00000022510 HOXA11 (ENSCPBG00000022506) ENSCPBG00000022505 HOXA10 (ENSCPBG00000022503) ENSCPBG00000022501 HOXA7 (ENSCPBG00000022500) HOXA6 (ENSCPBG00000022499) HOXA5 (ENSCPBG00000022498) HOXA4 (ENSCPBG00000022497) HOXA3 (ENSCPBG00000022496) ENSCPBG00000022495 ##22 HOXA1 (ENSCPBG00000022493) SKAP2 (ENSCPBG00000022490) ##25 SNX10 (ENSCPBG00000022488) CBX3 (ENSCPBG00000022487) HNRNPA2B1 (ENSCPBG00000022485) NFE2L3 (ENSCPBG00000022484) ##28 NPVF (ENSCPBG00000022481) C7orf31 (ENSCPBG00000022480) ENSCPBG00000022479 OSBPL3 (ENSCPBG00000022476) GSDME (ENSCPBG00000022474) PALS2 (ENSCPBG00000022473) NPY (ENSCPBG00000022471) STK31 (ENSCPBG00000022469) CCDC126 (ENSCPBG00000022468) Testudinidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155029.c.a ##22 Abingdon island giant tortoise MODERN SPECIES 331 CREB5 (ENSCABG00000019465) ENSCABG00000019502 JAZF1 (ENSCABG00000019505) TAX1BP1 (ENSCABG00000019507) HIBADH (ENSCABG00000019511) EVX1 (ENSCABG00000019516) ENSCABG00000019521 HOXA11 (ENSCABG00000019527) ENSCABG00000019529 ENSCABG00000019531 HOXA7 (ENSCABG00000019533) HOXA6 (ENSCABG00000019534) HOXA5 (ENSCABG00000019535) HOXA4 (ENSCABG00000019537) HOXA3 (ENSCABG00000019539) ENSCABG00000000006 ##22 HOXA1 (ENSCABG00000000045) SKAP2 (ENSCABG00000000106) ##25 SNX10 (ENSCABG00000000122) ENSCABG00000000131 CBX3 (ENSCABG00000000136) HNRNPA2B1 (ENSCABG00000000155) ENSCABG00000000172 NPVF (ENSCABG00000000177) C7orf31 (ENSCABG00000000219) ENSCABG00000000434 OSBPL3 (ENSCABG00000000455) GSDME (ENSCABG00000000465) PALS2 (ENSCABG00000000490) NPY (ENSCABG00000000511) STK31 (ENSCABG00000000534) Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155029.c.a ##22 Episquamata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155029.c.a ##22 Toxicofera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155029.c.a ##22 Elapidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155029.c.a ##22 Elapidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155029.c.a ##22 Acanthophiinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155029.c.a ##22 Mainland tiger snake MODERN SPECIES 55 ENSNSUG00000011815 ENSNSUG00000011816 ENSNSUG00000011817 HIBADH (ENSNSUG00000011818) EVX1 (ENSNSUG00000011819) ENSNSUG00000011820 HOXA11 (ENSNSUG00000011822) ENSNSUG00000011823 ENSNSUG00000011824 ENSNSUG00000011828 ENSNSUG00000011829 HOXA6 (ENSNSUG00000011830) ENSNSUG00000011832 HOXA4 (ENSNSUG00000011833) HOXA3 (ENSNSUG00000011834) ENSNSUG00000011835 ##22 HOXA1 (ENSNSUG00000011837) SKAP2 (ENSNSUG00000011838) ##25 SNX10 (ENSNSUG00000011839) CBX3 (ENSNSUG00000011840) HNRNPA2B1 (ENSNSUG00000011841) ENSNSUG00000011842 ##28 NPVF (ENSNSUG00000011844) ENSNSUG00000011845 CYCS (ENSNSUG00000011846) OSBPL3 (ENSNSUG00000011847) GSDME (ENSNSUG00000011848) PALS2 (ENSNSUG00000011849) Eastern brown snake MODERN SPECIES 250 ENSPTXG00000014286 ##22 ENSPTXG00000014288 ##27 ENSPTXG00000014291 Laterata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155029.c.a ##22 Argentine black and white tegu MODERN SPECIES 5 TRIL (ENSSMRG00000002616) CREB5 (ENSSMRG00000002892) JAZF1 (ENSSMRG00000002932) TAX1BP1 (ENSSMRG00000002937) HIBADH (ENSSMRG00000002954) EVX1 (ENSSMRG00000002969) ENSSMRG00000002987 HOXA11 (ENSSMRG00000003000) HOXA10 (ENSSMRG00000003005) HOXA9 (ENSSMRG00000003009) HOXA7 (ENSSMRG00000003016) HOXA6 (ENSSMRG00000003020) HOXA5 (ENSSMRG00000003023) HOXA4 (ENSSMRG00000003027) HOXA3 (ENSSMRG00000003029) ENSSMRG00000003064 ##22 HOXA1 (ENSSMRG00000003080) SKAP2 (ENSSMRG00000003082) ##25 SNX10 (ENSSMRG00000003170) CBX3 (ENSSMRG00000003213) ENSSMRG00000003215 NPVF (ENSSMRG00000003304) ENSSMRG00000003337 ENSSMRG00000003338 OSBPL3 (ENSSMRG00000003340) GSDME (ENSSMRG00000003361) PALS2 (ENSSMRG00000003371) NPY (ENSSMRG00000003394) STK31 (ENSSMRG00000003403) FAM221A (ENSSMRG00000003430) CCDC126 (ENSSMRG00000003435) Mammalia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155029.c.a ##22 Theria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155029.c.a ##22 Marsupialia ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000161975 ENSGT00940000156420 ENSGT00390000003635 ENSGT00950000183025.b.a ENSGT00940000155255 ENSGT00940000159854 ENSGT00940000162322 ENSGT00940000158311 ENSGT00940000163268 ENSGT00940000161864 ENSGT00940000161013 ENSGT00940000161585 ENSGT00940000159894 ENSGT00940000158988.a.a ENSGT00940000159522 ENSGT00940000155029.c.a ##22 ENSGT00940000162533 ENSGT00940000157315 ENSGT00390000017856.a ##25 ENSGT00940000156007 ENSGT00940000153305.c ENSGT00940000154431.f ENSGT00950000182892.a.b.b ##28 ENSGT00390000003271 ENSGT00390000015236 ENSGT00390000009405 ENSGT00940000155957 ENSGT00940000155880 ENSGT00940000158500 ENSGT00940000156475 ENSGT00390000007287 Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000161975 ENSGT00940000156420 ENSGT00390000003635 ENSGT00950000183025.b.a ENSGT00940000155255 ENSGT00940000159854 ENSGT00940000162322 ENSGT00940000158311 ENSGT00940000163268 ENSGT00940000161864 ENSGT00940000161013 ENSGT00940000161585 ENSGT00940000159894 ENSGT00940000158988.a.a ENSGT00940000159522 ENSGT00940000155029.c.a ##22 ENSGT00940000157315 ENSGT00390000017856.a ##25 ENSGT00940000156007 ENSGT00940000153305.c ENSGT00940000154431.f ENSGT00950000182892.a.b.b ##28 ENSGT00390000003271 ENSGT00390000015236 ENSGT00390000009405 ENSGT00940000155957 ENSGT00940000155880 ENSGT00940000158500.d ENSGT00940000156475 ENSGT00390000007287 ENSGT00770000120611.B Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000161975 ENSGT00940000156420 ENSGT00390000003635 ENSGT00950000183025.b.a ENSGT00940000155255 ENSGT00940000159854 ENSGT00940000162322 ENSGT00940000158311 ENSGT00940000163268 ENSGT00940000161864 ENSGT00940000161013 ENSGT00940000161585 ENSGT00940000159894 ENSGT00940000158988.a.a ENSGT00940000159522 ENSGT00940000155029.c.a ##22 ENSGT00940000157315 ENSGT00390000017856.a ##25 ENSGT00940000156007 ENSGT00940000153305.c ENSGT00940000154431.f ENSGT00950000182892.a.b.b ##28 ENSGT00390000003271 ENSGT00390000015236 ENSGT00390000009405 ENSGT00940000155957 ENSGT00940000155880 ENSGT00940000158500.d ENSGT00940000156475 ENSGT00390000007287 ENSGT00770000120611.B Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000161975 ENSGT00940000156420 ENSGT00390000003635 ENSGT00950000183025.b.a ENSGT00940000155255 ENSGT00940000159854 ENSGT00940000162322 ENSGT00940000158311 ENSGT00940000163268 ENSGT00940000161864 ENSGT00940000161013 ENSGT00940000161585.a ENSGT00940000159894 ENSGT00940000158988.a.a ENSGT00940000159522 ENSGT00940000155029.c.a ##22 ENSGT00940000157315 ENSGT00390000017856.a ##25 ENSGT00940000156007 ENSGT00940000153305.c ENSGT00940000154431.f ENSGT00950000182892.a.b.b ##28 ENSGT00390000003271 ENSGT00390000015236 ENSGT00390000009405.e.b ENSGT00940000155957 ENSGT00940000155880 ENSGT00940000158500.d ENSGT00940000156475 ENSGT00390000007287 ENSGT00770000120611.B Common wonbat DUPLICATION Common wonbat MODERN SPECIES 1036 ENSVURG00010019537 ENSVURG00010019547 ENSVURG00010019555 ENSVURG00010019563 ENSVURG00010019606 ENSVURG00010019653 ENSVURG00010019656 ENSVURG00010019662 HOXA10 (ENSVURG00010019671) ENSVURG00010019686 ENSVURG00010019687 ENSVURG00010019692 ENSVURG00010019698 ENSVURG00010019706 ENSVURG00010019713 ENSVURG00010019721 ##22 ENSVURG00010019727 ENSVURG00010019737 ##25 ENSVURG00010019757 ENSVURG00010019765 ENSVURG00010019785 ENSVURG00010019805 ##28 ENSVURG00010019822 ENSVURG00010019827 ENSVURG00010019836 ENSVURG00010019854 ENSVURG00010019898 ENSVURG00010019917 ENSVURG00010019940 ENSVURG00010019972 ENSVURG00010020074 Common wonbat MODERN SPECIES 1036 ENSVURG00010023105 ENSVURG00010023109 ENSVURG00010000094 ENSVURG00010000109 ENSVURG00010000176 ENSVURG00010000187 ENSVURG00010000199 ENSVURG00010000215 ENSVURG00010000225 ENSVURG00010000241 ENSVURG00010000250 ENSVURG00010000256 ENSVURG00010000263 ENSVURG00010000272 ENSVURG00010000285 ENSVURG00010000296 ##22 ENSVURG00010000303 ENSVURG00010000328 ##25 ENSVURG00010000381 ENSVURG00010000437 ENSVURG00010000471 ENSVURG00010000522 ##28 ENSVURG00010000563 ENSVURG00010000574 ENSVURG00010000608 ENSVURG00010000673 ENSVURG00010000775 ENSVURG00010000860 ENSVURG00010000925 ENSVURG00010001026 ENSVURG00010001662 koala MODERN SPECIES 50 CPVL (ENSPCIG00000008535) CREB5 (ENSPCIG00000005994) JAZF1 (ENSPCIG00000002897) TAX1BP1 (ENSPCIG00000002923) HIBADH (ENSPCIG00000002993) EVX1 (ENSPCIG00000013640) HOXA13 (ENSPCIG00000013657) HOXA11 (ENSPCIG00000013678) ENSPCIG00000033721 HOXA9 (ENSPCIG00000013689) HOXA7 (ENSPCIG00000013692) HOXA6 (ENSPCIG00000037246) HOXA5 (ENSPCIG00000013698) ENSPCIG00000013701 HOXA3 (ENSPCIG00000013705) ENSPCIG00000013706 ##22 HOXA1 (ENSPCIG00000013712) ENSPCIG00000032652 SKAP2 (ENSPCIG00000013715) ##25 SNX10 (ENSPCIG00000013721) ENSPCIG00000013724 HNRNPA2B1 (ENSPCIG00000013729) ENSPCIG00000022663 ENSPCIG00000003201 ENSPCIG00000003196 OSBPL3 (ENSPCIG00000003096) GSDME (ENSPCIG00000023065) ENSPCIG00000023068 ENSPCIG00000023077 STK31 (ENSPCIG00000007874) FAM221A (ENSPCIG00000007910) Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155029.c.a ##22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155029.c.a ##22 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155029.c.a ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155029.c.a ##22 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155029.c.a ##22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155029.c.a ##22 Camelidae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000161975 ENSGT00940000156420 ENSGT00390000003635 ENSGT00950000183025.b.a ENSGT00940000155255.q ENSGT00940000159854 ENSGT00930000152153 ENSGT00940000162322 ENSGT00940000158311 ENSGT00940000162440 ENSGT00940000161864 ENSGT00940000161013 ENSGT00940000161585 ENSGT00940000159894 ENSGT00940000159522 ENSGT00940000155029.c.a ##22 ENSGT00940000157315 ENSGT00390000017856.a ##25 ENSGT00940000156007 ENSGT00940000153305.c.e.b ENSGT00940000154431.f.c.b ENSGT00940000154431.e.b ENSGT00950000182892.a.b.b ##28 ENSGT00390000003271 ENSGT00390000015236 ENSGT00390000009405.b.o.b ENSGT00940000155957 ENSGT00940000155880 ENSGT00940000158500 ENSGT00940000156475 ENSGT00390000007287 Arabian camel MODERN SPECIES 33 TRIL (ENSCDRG00005001580) CREB5 (ENSCDRG00005001440) JAZF1 (ENSCDRG00005001369) TAX1BP1 (ENSCDRG00005001239) HIBADH (ENSCDRG00005001193) ENSCDRG00005001177 ENSCDRG00005001165 HOXA13 (ENSCDRG00005001129) HOXA11 (ENSCDRG00005001112) HOXA10 (ENSCDRG00005001092) HOXA9 (ENSCDRG00005001067) HOXA7 (ENSCDRG00005001043) HOXA6 (ENSCDRG00005001033) HOXA5 (ENSCDRG00005001022) HOXA3 (ENSCDRG00005000976) ENSCDRG00005000963 ##22 HOXA1 (ENSCDRG00005000950) SKAP2 (ENSCDRG00005000915) ##25 SNX10 (ENSCDRG00005000870) CBX3 (ENSCDRG00005000839) HNRNPA2B1 (ENSCDRG00005000755) NFE2L3 (ENSCDRG00005000723) ##28 ENSCDRG00005000704 NPVF (ENSCDRG00005000692) C7orf31 (ENSCDRG00005000664) CYCS (ENSCDRG00005000650) OSBPL3 (ENSCDRG00005000550) GSDME (ENSCDRG00005000498) PALS2 (ENSCDRG00005000457) ENSCDRG00005000443 ENSCDRG00005000392 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155029.c.a ##22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155029.c.a ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155029.c.a ##22 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155029.c.a ##22 Pika MODERN SPECIES 26 EVX1 (ENSOPRG00000010513) HOXA13 (ENSOPRG00000010498) HOXA10 (ENSOPRG00000010473) HOXA9 (ENSOPRG00000010452) HOXA7 (ENSOPRG00000010447) HOXA6 (ENSOPRG00000010431) HOXA5 (ENSOPRG00000010429) ENSOPRG00000010425 ENSOPRG00000010411 HOXA3 (ENSOPRG00000010401) ENSOPRG00000010388 ##22 HOXA1 (ENSOPRG00000010385) Platypus MODERN SPECIES 19 TRIL (ENSOANG00000044975) CREB5 (ENSOANG00000009178) JAZF1 (ENSOANG00000049457) TAX1BP1 (ENSOANG00000009176) HIBADH (ENSOANG00000044957) ENSOANG00000009174 HOXA13 (ENSOANG00000040975) HOXA11 (ENSOANG00000045981) HOXA10 (ENSOANG00000045760) ENSOANG00000046469 HOXA7 (ENSOANG00000046422) HOXA6 (ENSOANG00000009168) HOXA5 (ENSOANG00000009167) ENSOANG00000048692 HOXA3 (ENSOANG00000009165) ENSOANG00000009164 ##22 HOXA1 (ENSOANG00000050092) SKAP2 (ENSOANG00000009162) ##25 SNX10 (ENSOANG00000040490) CBX3 (ENSOANG00000009160) HNRNPA2B1 (ENSOANG00000009159) ENSOANG00000009158 ##28 ENSOANG00000031573 ENSOANG00000036736 OSBPL3 (ENSOANG00000008434) GSDME (ENSOANG00000008431) PALS2 (ENSOANG00000008427) NPY (ENSOANG00000013383) STK31 (ENSOANG00000014200) FAM221A (ENSOANG00000050001) CCDC126 (ENSOANG00000014201) Anura ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000161975 ENSGT00940000156420 ENSGT00390000003635 ENSGT00950000183025.b.a ENSGT00940000155255 ENSGT00940000159854 ENSGT00940000164071 ENSGT00940000158311 ENSGT00940000163268 ENSGT00940000164628 ENSGT00940000161013 ENSGT00940000161585 ENSGT00940000159894 ENSGT00940000158988.a.a ENSGT00940000159522 ENSGT00940000155029.c.a ##22 ENSGT00940000157315 ENSGT00390000017856.a ##25 ENSGT00940000156007 ENSGT00940000153305 ENSGT00940000154431.b ENSGT00950000182892.a.b.b ##28 ENSGT00390000003271 ENSGT00390000015236 ENSGT00940000157883.a.b.e.b ENSGT00940000155957 ENSGT00940000155880 ENSGT00940000158500 ENSGT00940000156475 ENSGT00390000007287 ENSGT00770000120611.B Frog MODERN SPECIES 6 ENSXETG00000046618 ENSXETG00000037596 vill (ENSXETG00000000754) tax1bp1 (ENSXETG00000000752) ENSXETG00000046497 ENSXETG00000042891 hibadh (ENSXETG00000000750) evx1 (ENSXETG00000000736) hoxa13 (ENSXETG00000044962) ENSXETG00000000728 ENSXETG00000000724 hoxa7 (ENSXETG00000000722) hoxa6 (ENSXETG00000036073) hoxa4 (ENSXETG00000027534) hoxa3 (ENSXETG00000000717) hoxa2 (ENSXETG00000000716) ##22 hoxa1 (ENSXETG00000000715) skap2 (ENSXETG00000012181) ##25 ENSXETG00000048932 snx10 (ENSXETG00000012180) cbx3 (ENSXETG00000012175) hnrnpa2b1 (ENSXETG00000012170) atp6v1e1 (ENSXETG00000012174) ##28 NPVF (ENSXETG00000031334) ENSXETG00000012168 c7orf31 (ENSXETG00000039041) cycs (ENSXETG00000027531) ENSXETG00000047025 osbpl3 (ENSXETG00000007406) gsdme (ENSXETG00000007405) ENSXETG00000047346 Leishan spiny toad MODERN SPECIES 8 JAZF1 (ENSLLEG00000009536) ENSLLEG00000009342 HIBADH (ENSLLEG00000009078) EVX1 (ENSLLEG00000009012) ENSLLEG00000008964 ENSLLEG00000008907 HOXA11 (ENSLLEG00000008872) ENSLLEG00000008821 ENSLLEG00000008787 ENSLLEG00000008773 HOXA7 (ENSLLEG00000008742) HOXA6 (ENSLLEG00000008707) HOXA5 (ENSLLEG00000008676) HOXA4 (ENSLLEG00000008646) HOXA3 (ENSLLEG00000008614) ENSLLEG00000008599 ##22 HOXA1 (ENSLLEG00000008580) SKAP2 (ENSLLEG00000008266) ##25 SNX10 (ENSLLEG00000008176) ENSLLEG00000008077 ENSLLEG00000008053 ENSLLEG00000007327 NFE2L3 (ENSLLEG00000007191) ##28 ENSLLEG00000007168 NPVF (ENSLLEG00000007148) C7orf31 (ENSLLEG00000007054) ENSLLEG00000007011 ENSLLEG00000006989 OSBPL3 (ENSLLEG00000006867) GSDME (ENSLLEG00000006817) PALS2 (ENSLLEG00000006683) Coelacanth MODERN SPECIES 372 EVX1 (ENSLACG00000017535) ENSLACG00000017442 hoxa13b (ENSLACG00000017423) HOXA10 (ENSLACG00000017380) hoxa9a (ENSLACG00000017369) HOXA6 (ENSLACG00000017339) HOXA5 (ENSLACG00000017330) HOXA4 (ENSLACG00000017299) HOXA3 (ENSLACG00000017247) hoxa2b (ENSLACG00000017242) ##22 HOXA1 (ENSLACG00000017232) ENSLACG00000017077 ENSLACG00000017044 SKAP2 (ENSLACG00000016050) ##25 ENSLACG00000015520 SNX10 (ENSLACG00000014654) CBX3 (ENSLACG00000014131) HNRNPA2B1 (ENSLACG00000013590) NFE2L3 (ENSLACG00000013393) ##28 ENSLACG00000010967 ENSLACG00000003254 Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT00910000144296 ENSGT00940000156851 ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.b ENSGT00940000156582 ENSGT00940000154298.a.a ENSGT00390000001859 ENSGT00940000161025 ENSGT00940000161457 ENSGT00940000159938 ENSGT00940000161308 ENSGT00940000158266 ENSGT00940000161503 ENSGT00940000157270 ENSGT00940000160027 ENSGT00940000155029.d ##22 ENSGT00940000155029.c.a ##22 ENSGT00940000157315 ENSGT00950000182919.C ENSGT00940000154808.a.a ENSGT00950000182892.a.a.b ##28 ENSGT00940000156112 ENSGT00940000164264 ENSGT00940000157883.a.b.e.a ENSGT00680000100059 ENSGT00940000156791 ENSGT00940000157618 ENSGT00940000158361 ENSGT00390000015818 ENSGT00940000160909 ENSGT00390000005923 ENSGT00940000156472 Neopterygii ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000161013 ENSGT00940000159894 ENSGT00940000164283.b.b ENSGT00940000156458 ENSGT00950000183025.b.b ENSGT00940000161087 ENSGT00940000161307 ENSGT00940000160009 ENSGT00940000160855 ENSGT00940000160866 ENSGT00940000161194 ENSGT00940000159254 ENSGT00940000161023 ENSGT00940000160794 ENSGT00940000159522 ENSGT00940000155029.c.a ##22 ENSGT00940000157315 ENSGT00940000158988.a.a ENSGT00390000017856.a ##25 ENSGT00940000156007 ENSGT00940000153305 ENSGT00950000182892.a.b.b ##28 ENSGT00390000003271 ENSGT00940000165630 ENSGT00390000015236 ENSGT00940000155957 ENSGT00940000155880 ENSGT00940000158500 ENSGT00940000155348.A ENSGT00940000156475 ENSGT00390000007287 Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00940000161975 ENSGT00940000156420.a.b ENSGT00390000003635.g ENSGT00950000183025.b.a.ab ENSGT00940000165581 ENSGT00940000159854 ENSGT00940000164071.b.b ENSGT00940000158311.a ENSGT00940000163268.d.a ENSGT00940000164628 ENSGT00940000161013 ENSGT00940000159894 ENSGT00940000158988.a.a ENSGT00940000159522 ENSGT00940000155029.c.a ##22 ENSGT00940000157315 ENSGT00940000156007.k ENSGT00940000153305 ENSGT00950000182892.a.b.b ##28 ENSGT00390000003271 ENSGT01030000234992 ENSGT00940000155957.b ENSGT00940000155880.f ENSGT00940000155348.A ENSGT00940000156475.f ENSGT00770000120611.B ENSGT00940000153470.a.a.a.b ENSGT00940000157167 ENSGT00940000154957.B ENSGT00950000183188.B Osteoglossiformes DUPLICATION Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000161975 ENSGT00940000156420.a.b ENSGT00390000003635.h.b ENSGT00950000183025.b.a.ab ENSGT00940000155255.eb ENSGT00940000159854 ENSGT00940000164071.b.b ENSGT00940000158311.a ENSGT00940000163268.d.a.e ENSGT00940000161013 ENSGT00940000159894 ENSGT00940000158988.a.a ENSGT00940000155029.c.a.c ##22 ENSGT00940000157315 ENSGT00940000156007.k ENSGT00940000153305 ENSGT00950000182892.a.b.b ##28 ENSGT01030000234992 ENSGT00940000155957.b ENSGT00940000155880.f ENSGT00940000155348.A ENSGT00940000156475.f ENSGT00770000120611.B ENSGT00940000153470.a.a.a.b ENSGT00940000157167 ENSGT00940000154957.B ENSGT00950000183188.B ENSGT00940000160808 P. kingsleyae MODERN SPECIES 161 ENSPKIG00000000065 TRIL (ENSPKIG00000000080) CREB5 (ENSPKIG00000000103) JAZF1 (ENSPKIG00000000128) tax1bp1a (ENSPKIG00000000144) hibadhb (ENSPKIG00000000157) evx1 (ENSPKIG00000000173) hoxa13a (ENSPKIG00000000189) hoxa11a (ENSPKIG00000000203) hoxa10b (ENSPKIG00000000211) hoxa9a (ENSPKIG00000000219) HOXA7 (ENSPKIG00000000233) hoxa5a (ENSPKIG00000000291) hoxa3a (ENSPKIG00000000306) HOXA4 (ENSPKIG00000000314) hoxa2b (ENSPKIG00000000322) ##22 hoxa1a (ENSPKIG00000000337) snx10a (ENSPKIG00000000346) cbx3a (ENSPKIG00000000364) nfe2l3 (ENSPKIG00000000374) ##28 Asian bonytongue MODERN SPECIES 15 ENSSFOG00015013274 TRIL (ENSSFOG00015013322) CREB5 (ENSSFOG00015013343) JAZF1 (ENSSFOG00015021725) tax1bp1a (ENSSFOG00015013406) hibadhb (ENSSFOG00015030994) evx1 (ENSSFOG00015030473) hoxa13a (ENSSFOG00015013482) hoxa11a (ENSSFOG00015013545) hoxa10b (ENSSFOG00015013555) hoxa9a (ENSSFOG00015013564) HOXA7 (ENSSFOG00015031379) hoxa5a (ENSSFOG00015029712) HOXA4 (ENSSFOG00015013621) hoxa3a (ENSSFOG00015013599) hoxa2b (ENSSFOG00015027827) ##22 hoxa1a (ENSSFOG00015013645) snx10a (ENSSFOG00015024663) cbx3a (ENSSFOG00015028486) ENSSFOG00015013727 ENSSFOG00015013760 osbpl3a (ENSSFOG00015013787) GSDME (ENSSFOG00015030956) ENSSFOG00015013869 npy (ENSSFOG00015013942) fam221a (ENSSFOG00015013956) ccdc126 (ENSSFOG00015013990) ENSSFOG00015014036 tra2a (ENSSFOG00015014004) igf2bp3 (ENSSFOG00015027213) GPNMB (ENSSFOG00015014141) Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248.c.a ENSGT00940000157288 ENSGT00940000160267 ENSGT00990000208316 ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h.a ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255.db ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.a.f ENSGT00940000164628 ENSGT00940000155029.c.a.d ##22 ENSGT00390000017856.a ##25 ENSGT00940000156007.l ENSGT00940000166701 ENSGT00940000165630 ENSGT00390000015236 ENSGT00940000155957.a ENSGT00940000155880.e ENSGT00940000156475.e ENSGT00390000007287 ENSGT00390000015035 ENSGT00390000009313 ENSGT00530000063609.b.w ENSGT00940000156439.d ENSGT00940000155660.b.d ENSGT00390000008096.C.c Asian bonytongue MODERN SPECIES 9 COLQ (ENSSFOG00015000185) plekha8 (ENSSFOG00015000156) fkbp14 (ENSSFOG00015028498) ENSSFOG00015000096 CHN2 (ENSSFOG00015021811) cpvl (ENSSFOG00015021768) CREB5 (ENSSFOG00015021739) ENSSFOG00015030257 JAZF1 (ENSSFOG00015026612) tax1bp1b (ENSSFOG00015021686) hibadhb (ENSSFOG00015026866) hoxa13b (ENSSFOG00015029608) hoxa11b (ENSSFOG00015021651) hoxa10b (ENSSFOG00015027620) hoxa9b (ENSSFOG00015021639) hoxa2b (ENSSFOG00015021630) ##22 skap2 (ENSSFOG00015021609) ##25 snx10b (ENSSFOG00015026293) cbx3b (ENSSFOG00015021577) ENSSFOG00015021567 ENSSFOG00015021552 OSBPL3 (ENSSFOG00015021460) gsdmeb (ENSSFOG00015021418) ENSSFOG00015021387 NPY (ENSSFOG00015021370) STK31 (ENSSFOG00015021341) malsu1 (ENSSFOG00015027288) VMO1 (ENSSFOG00015021325) ENSSFOG00015021282 ENSSFOG00015030436 PLCL2 (ENSSFOG00015021254) P. kingsleyae MODERN SPECIES 69 COLQ (ENSPKIG00000008863) plekha8 (ENSPKIG00000008918) fkbp14 (ENSPKIG00000008955) ENSPKIG00000008975 CHN2 (ENSPKIG00000008999) cpvl (ENSPKIG00000009045) CREB5 (ENSPKIG00000009122) JAZF1 (ENSPKIG00000009182) tax1bp1b (ENSPKIG00000009206) hibadhb (ENSPKIG00000009313) hoxa13b (ENSPKIG00000009334) hoxa11b (ENSPKIG00000009343) hoxa10b (ENSPKIG00000009352) hoxa9b (ENSPKIG00000009363) skap2 (ENSPKIG00000009409) ##25 hoxa2b (ENSPKIG00000009468) ##22 snx10b (ENSPKIG00000009486) cbx3b (ENSPKIG00000009516) ENSPKIG00000009559 ENSPKIG00000009627 OSBPL3 (ENSPKIG00000009683) gsdmeb (ENSPKIG00000009804) ENSPKIG00000009856 NPY (ENSPKIG00000009927) STK31 (ENSPKIG00000009950) malsu1 (ENSPKIG00000009997) ENSPKIG00000010013 ENSPKIG00000010052 ENSPKIG00000010105 PLCL2 (ENSPKIG00000010139) ENSPKIG00000010191 Clupeocephala DUPLICATION Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000157858.j ENSGT00940000160267 ENSGT00760000119737 ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.a ENSGT00940000158311.a ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000164628 ENSGT00940000155029.c.a.e ##22 ENSGT00390000017856.a ##25 ENSGT00940000156007.l ENSGT00940000166701 ENSGT00940000165630 ENSGT00390000015236 ENSGT00940000155957.a ENSGT00940000155880.e ENSGT00940000158500 ENSGT00940000156475.e ENSGT00390000007287 ENSGT00390000015035 ENSGT00400000022168.a ENSGT00520000055666.b ENSGT01050000244890.a.a.a.h ENSGT00940000156245.a.a Otomorpha DUPLICATION Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 80 ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248.c.a ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT00760000119737.b ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.a ENSGT00940000164628 ENSGT00940000155029.c.a.e.a ##22 ENSGT00390000017856.a ##25 ENSGT00940000156007.l ENSGT00940000166701 ENSGT00940000165630 ENSGT00390000015236 ENSGT00940000155957.a ENSGT00940000155880.e ENSGT00940000158500 ENSGT00940000156475.e ENSGT00390000007287 ENSGT00390000015035 ENSGT00400000022168.a ENSGT00520000055666.b ENSGT01050000244890.a.a.a.h ENSGT00940000156245.a.a Otophysi ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248.c.a ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT00760000119737.b ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.a ENSGT00940000164628 ENSGT00940000155029.c.a.e.a ##22 ENSGT00390000017856.a ##25 ENSGT00940000156007.l ENSGT00940000166701 ENSGT00940000165630 ENSGT00390000015236 ENSGT00940000155957.a ENSGT00940000155880.e ENSGT00940000158500 ENSGT00940000156475.e ENSGT00390000007287 Characiphysae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248.c.a ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT00760000119737.b ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.a ENSGT00940000164628 ENSGT00940000155029.c.a.e.a ##22 ENSGT00390000017856.a ##25 ENSGT00940000156007.l ENSGT00940000166701 ENSGT00940000165630 ENSGT00390000015236 ENSGT00940000155957.a ENSGT00940000155880.e ENSGT00940000158500 ENSGT00940000156475.e ENSGT00390000007287 ENSGT00390000010652.A.a.a ENSGT00940000160472 ENSGT00940000164559.B ENSGT01050000244841.A.a.a.a ENSGT00940000166061.a Channel catfish MODERN SPECIES colq (ENSIPUG00000002698) plekha8 (ENSIPUG00000002723) FKBP14 (ENSIPUG00000002766) ENSIPUG00000002780 chn2 (ENSIPUG00000002792) CPVL (ENSIPUG00000002845) creb5 (ENSIPUG00000002879) ENSIPUG00000002901 jazf1 (ENSIPUG00000002919) tax1bp1 (ENSIPUG00000002965) hibadh (ENSIPUG00000003016) hoxa13b (ENSIPUG00000003037) hoxa11 (ENSIPUG00000003074) hoxa10 (ENSIPUG00000003081) hoxa9b (ENSIPUG00000003099) hoxa2 (ENSIPUG00000003104) ##22 skap2 (ENSIPUG00000003129) ##25 snx10b (ENSIPUG00000003211) cbx3 (ENSIPUG00000003222) ENSIPUG00000003232 ENSIPUG00000003240 C7orf31 (ENSIPUG00000003249) osbpl3 (ENSIPUG00000003270) dfna5 (ENSIPUG00000003382) ENSIPUG00000003404 ENSIPUG00000003445 ENSIPUG00000003453 Dennd4b (ENSIPUG00000003493) ENSIPUG00000003541 GNRHR (ENSIPUG00000003591) iqgap3 (ENSIPUG00000003615) Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248.c.a ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT00760000119737.b ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.a ENSGT00940000164628 ENSGT00940000155029.c.a.e.a ##22 ENSGT00390000017856.a ##25 ENSGT00940000156007.l ENSGT00940000166701 ENSGT00940000165630 ENSGT00390000015236 ENSGT00940000155957.a ENSGT00940000155880.e ENSGT00940000158500 ENSGT00940000156475.e ENSGT00390000007287 ENSGT00390000010652.A.a.a ENSGT00940000160472 ENSGT00940000164559.B ENSGT01050000244841.A.a.a.a ENSGT00940000166061.a Characoidei ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248.c.a ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT00760000119737.b ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.a ENSGT00940000164628 ENSGT00940000155029.c.a.e.a ##22 ENSGT00390000017856.a ##25 ENSGT00940000156007.l ENSGT00940000166701 ENSGT00940000165630 ENSGT00390000015236 ENSGT00940000155957.a ENSGT00940000155880.e ENSGT00940000158500 ENSGT00940000156475.e ENSGT00390000007287 ENSGT00390000010652.A.a.a ENSGT00940000160472 ENSGT00940000164559.B ENSGT01050000244841.A.a.a.a ENSGT00940000166061.a Red-bellied piranha MODERN SPECIES 409 hacl1 (ENSPNAG00000009314) COLQ (ENSPNAG00000009265) plekha8 (ENSPNAG00000009237) fkbp14 (ENSPNAG00000005979) ENSPNAG00000009181 CHN2 (ENSPNAG00000009158) cpvl (ENSPNAG00000009130) CREB5 (ENSPNAG00000009108) JAZF1 (ENSPNAG00000009089) tax1bp1b (ENSPNAG00000009073) hibadhb (ENSPNAG00000009046) ENSPNAG00000009029 hoxa11b (ENSPNAG00000008993) hoxa10b (ENSPNAG00000008988) hoxa9b (ENSPNAG00000008979) hoxa2b (ENSPNAG00000005010) ##22 skap2 (ENSPNAG00000008959) ##25 snx10b (ENSPNAG00000006507) cbx3b (ENSPNAG00000008930) ENSPNAG00000001247 ENSPNAG00000008888 OSBPL3 (ENSPNAG00000008838) gsdmeb (ENSPNAG00000005128) Electric eel MODERN SPECIES 39 plekha8 (ENSEEEG00000014685) fkbp14 (ENSEEEG00000014686) ENSEEEG00000014687 CHN2 (ENSEEEG00000014689) ENSEEEG00000014690 cpvl (ENSEEEG00000014691) CREB5 (ENSEEEG00000014694) JAZF1 (ENSEEEG00000014697) ENSEEEG00000014702 ENSEEEG00000014703 hibadhb (ENSEEEG00000014704) hoxa13b (ENSEEEG00000014718) hoxa11b (ENSEEEG00000014719) hoxa10b (ENSEEEG00000014720) hoxa9b (ENSEEEG00000014722) hoxa2b (ENSEEEG00000014724) ##22 skap2 (ENSEEEG00000014726) ##25 snx10b (ENSEEEG00000014727) cbx3b (ENSEEEG00000014728) ENSEEEG00000014729 OSBPL3 (ENSEEEG00000014733) gsdmeb (ENSEEEG00000014945) pals2a (ENSEEEG00000014957) ENSEEEG00000015186 ENSEEEG00000015188 ENSEEEG00000015190 DENND4B (ENSEEEG00000015203) ENSEEEG00000015314 ENSEEEG00000015315 iqgap3 (ENSEEEG00000015317) GATAD2B (ENSEEEG00000015321) Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248.c.a ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT00760000119737.b ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.a ENSGT00940000164628 ENSGT00940000155029.c.a.e.a ##22 ENSGT00390000017856.a ##25 ENSGT00940000156007.l ENSGT00940000166701 ENSGT00940000165630 ENSGT00940000155957.a ENSGT00940000155880.e ENSGT00940000158500 ENSGT00940000156475.e ENSGT00390000007287 Cyprininae DUPLICATION Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 106 ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248.c.a.a ENSGT00940000157288.n ENSGT00940000157858.i.b ENSGT00760000119737.b.a.a ENSGT01030000234635.a.b.a.a.a ENSGT00940000159498.a ENSGT00940000156420.a.a.g ENSGT00390000003635.h.c ENSGT00950000183025.b.a.`b.a ENSGT00940000155255.bb ENSGT00940000164071.b.a.a ENSGT00940000158311.b.b ENSGT00940000163268.d.a.a ENSGT00940000164628.s ENSGT00940000155029.c.a.e.a.a ##22 ENSGT00390000017856.a.l ##25 ENSGT00940000156007.l.h ENSGT00940000166701.b ENSGT00940000165630.c ENSGT00940000155957.a.a ENSGT00940000155880.e.c ENSGT00940000158500.g ENSGT00940000159286.a.b.d.a.b 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DUPLICATION Common carp reference MODERN SPECIES 2 ENSCCRG00000019294 ENSCCRG00000030998 ENSCCRG00000018624 plekha8 (ENSCCRG00000066528) fkbp14 (ENSCCRG00000073005) CHN2 (ENSCCRG00000057495) cpvl (ENSCCRG00000008246) CREB5 (ENSCCRG00000054780) JAZF1 (ENSCCRG00000080168) tax1bp1b (ENSCCRG00000056000) hibadhb (ENSCCRG00000012416) hoxa13b (ENSCCRG00000012410) hoxa11b (ENSCCRG00000066087) hoxa10b (ENSCCRG00000007094) hoxa9b (ENSCCRG00000007096) hoxa2b (ENSCCRG00000047655) ##22 skap2 (ENSCCRG00000007100) ##25 snx10b (ENSCCRG00000074325) ENSCCRG00000012400 OSBPL3 (ENSCCRG00000030504) pals2a (ENSCCRG00000081363) NPY (ENSCCRG00000058074) STK31 (ENSCCRG00000028789) ENSCCRG00000028782 ENSCCRG00000062476 ENSCCRG00000058399 ENSCCRG00000006196 rpl18 (ENSCCRG00000021874) ENSCCRG00000022062 ENSCCRG00000022070 tnfrsf1a (ENSCCRG00000055767) Common carp reference MODERN SPECIES 47 hacl1 (ENSCCRG00000018645) COLQ (ENSCCRG00000053136) plekha8 (ENSCCRG00000018609) fkbp14 (ENSCCRG00000073955) 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ENSGT00390000015035 ENSGT00400000022168.a ENSGT00520000055666.b ENSGT00940000156245.a.a ENSGT00940000157508 Denticle herring MODERN SPECIES 15 TMEM14C (ENSDCDG00000000765) DNAH5 (ENSDCDG00000000794) hacl1 (ENSDCDG00000000855) COLQ (ENSDCDG00000000876) plekha8 (ENSDCDG00000000889) fkbp14 (ENSDCDG00000000901) ENSDCDG00000000907 CHN2 (ENSDCDG00000000940) cpvl (ENSDCDG00000001071) CREB5 (ENSDCDG00000001114) JAZF1 (ENSDCDG00000001120) tax1bp1b (ENSDCDG00000001131) hibadhb (ENSDCDG00000001155) hoxa13b (ENSDCDG00000001227) hoxa11b (ENSDCDG00000001236) ENSDCDG00000001250 ##22 skap2 (ENSDCDG00000001259) ##25 snx10b (ENSDCDG00000001291) cbx3b (ENSDCDG00000001306) ENSDCDG00000001310 C7orf31 (ENSDCDG00000001314) OSBPL3 (ENSDCDG00000001362) gsdmeb (ENSDCDG00000001683) pals2a (ENSDCDG00000001691) NPY (ENSDCDG00000001709) ENSDCDG00000001711 malsu1 (ENSDCDG00000001715) smpd5 (ENSDCDG00000001717) rbm24b (ENSDCDG00000001722) ENSDCDG00000001806 ptdss1a (ENSDCDG00000001812) Atlantic herring MODERN SPECIES 2 fkbp14 (ENSCHAG00000013529) ENSCHAG00000013561 CHN2 (ENSCHAG00000013577) cpvl (ENSCHAG00000013681) CREB5 (ENSCHAG00000013853) JAZF1 (ENSCHAG00000013929) JAZF1 (ENSCHAG00000014005) tax1bp1b (ENSCHAG00000014048) ENSCHAG00000014085 HIBADH (ENSCHAG00000014100) hibadhb (ENSCHAG00000014145) hoxa13b (ENSCHAG00000014169) hoxa11b (ENSCHAG00000014172) hoxa10b (ENSCHAG00000014186) hoxa9b (ENSCHAG00000014197) ENSCHAG00000014202 ##22 skap2 (ENSCHAG00000014226) ##25 snx10b (ENSCHAG00000014363) cbx3b (ENSCHAG00000014373) OSBPL3 (ENSCHAG00000014387) gsdmeb (ENSCHAG00000014456) ENSCHAG00000014468 NPY (ENSCHAG00000014504) ENSCHAG00000014509 malsu1 (ENSCHAG00000014521) smpd5 (ENSCHAG00000014528) ENSCHAG00000014537 rbm24b (ENSCHAG00000002344) ENSCHAG00000002991 ENSCHAG00000010746 ENSCHAG00000010758 Otophysi ANCESTRAL SPECIES 77 ENSGT00390000012629 ENSGT00940000164283.b.a ENSGT00940000156458.e.a ENSGT00940000156458.f ENSGT00950000183025.b.b.e.a ENSGT00940000161087.i.a ENSGT00940000161307 ENSGT00940000160009 ENSGT00940000160855 ENSGT00940000160866 ENSGT00940000161194 ENSGT00940000159254.b ENSGT00940000161023.b.b ENSGT00940000160794 ENSGT00940000159522 ENSGT00940000155029.c.a.e.b ##22 ENSGT00940000157315.kc ENSGT00940000157315.jc.b ENSGT00940000158801 ENSGT00940000165646.A ENSGT00950000182892.a.a.a ##28 ENSGT00390000004405.a ##29 ENSGT00940000159609 ENSGT00940000158240 ENSGT00540000073797 ENSGT01000000222029 ENSGT00940000158313.a.b ENSGT00940000158675.a ENSGT00940000160528.b ENSGT00940000156890.a.a.s ENSGT00940000154307.D Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 99 ENSGT00760000119737.a ENSGT00990000205799 ENSGT00940000161975 ENSGT00940000156420.a.b ENSGT00390000003635.g ENSGT00950000183025.b.a.ab ENSGT00940000165581 ENSGT00940000159854 ENSGT00940000164071.b.b ENSGT00940000158311.a ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000166648 ENSGT00940000159894 ENSGT00940000158988.a.a ENSGT00940000159522 ENSGT00940000155029.c.a.e.b ##22 ENSGT00940000157315.kc ENSGT00940000156007.k ENSGT00940000153305 ENSGT00950000182892.a.b.b ##28 ENSGT00390000003271 ENSGT00940000155957.b ENSGT00940000155880.f ENSGT00940000155348.A ENSGT00940000156475.f ENSGT00770000120611.B ENSGT00940000153470.a.a.a.b ENSGT00940000157167 ENSGT00940000154957.B ENSGT00950000183188.B ENSGT00390000004280 Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00760000119737.a ENSGT00990000205799 ENSGT00940000161975 ENSGT00940000156420.a.b ENSGT00390000003635.g ENSGT00950000183025.b.a.ab ENSGT00940000165581 ENSGT00940000159854 ENSGT00940000164071.b.b ENSGT00940000158311.a ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000166648 ENSGT00940000159894 ENSGT00940000158988.a.a ENSGT00940000159522 ENSGT00940000155029.c.a.e.b ##22 ENSGT00940000157315.kc ENSGT00940000156007.k ENSGT00940000153305 ENSGT00950000182892.a.b.b ##28 ENSGT00390000003271 ENSGT00940000155957.b ENSGT00940000155880.f ENSGT00940000155348.A ENSGT00940000156475.f ENSGT00770000120611.B ENSGT00940000153470.a.a.a.b ENSGT00940000157167 ENSGT00940000154957.B ENSGT00950000183188.B ENSGT00390000004280 Characoidei ANCESTRAL SPECIES 62 ENSGT00940000157248.c.b ENSGT00940000160267 ENSGT00990000205799 ENSGT00940000161975 ENSGT00940000156420.a.b ENSGT00390000003635.g ENSGT00950000183025.b.a.ab ENSGT00940000165581 ENSGT00940000159854 ENSGT00940000164071.b.b ENSGT00940000158311.a ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000166648 ENSGT00940000159894 ENSGT00940000158988.a.a ENSGT00940000155029.c.a.e.b ##22 ENSGT00940000157315.kc ENSGT00940000156007.k ENSGT00940000153305 ENSGT00950000182892.a.b.b ##28 ENSGT00390000003271 ENSGT00940000155957.b ENSGT00940000155880.f ENSGT00940000155348.A ENSGT00940000156475.f ENSGT00770000120611.B ENSGT00940000153470.a.a.a.b ENSGT00940000157167 ENSGT00940000154957.B ENSGT00950000183188.B ENSGT00390000004280 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 29 ENSPNAG00000008032 ENSPNAG00000000606 CREB5 (ENSPNAG00000008023) jazf1a (ENSPNAG00000008012) tax1bp1a (ENSPNAG00000000582) hibadha (ENSPNAG00000007995) ENSPNAG00000007989 evx1 (ENSPNAG00000007983) hoxa13a (ENSPNAG00000007974) hoxa11a (ENSPNAG00000000562) ENSPNAG00000007968 ENSPNAG00000000559 HOXA4 (ENSPNAG00000007964) hoxa5a (ENSPNAG00000007959) hoxa3a (ENSPNAG00000000544) ENSPNAG00000007951 ##22 hoxa1a (ENSPNAG00000007947) snx10a (ENSPNAG00000007934) cbx3a (ENSPNAG00000007919) nfe2l3 (ENSPNAG00000007908) ##28 npvf (ENSPNAG00000007901) osbpl3a (ENSPNAG00000007889) ENSPNAG00000000516 ENSPNAG00000000507 npy (ENSPNAG00000000490) fam221a (ENSPNAG00000007821) ccdc126 (ENSPNAG00000000485) tra2a (ENSPNAG00000000482) igf2bp3 (ENSPNAG00000000470) GPNMB (ENSPNAG00000000461) Mexicana tetra MODERN SPECIES 49 ENSAMXG00000043051 CREB5 (ENSAMXG00000039018) jazf1a (ENSAMXG00000043930) ENSAMXG00000039695 tax1bp1a (ENSAMXG00000033050) hibadha (ENSAMXG00000007828) ENSAMXG00000035504 evx1 (ENSAMXG00000031807) hoxa13a (ENSAMXG00000029915) hoxa11a (ENSAMXG00000036161) ENSAMXG00000035583 ENSAMXG00000005199 hoxa5a (ENSAMXG00000037678) hoxa3a (ENSAMXG00000029041) HOXA4 (ENSAMXG00000036478) ENSAMXG00000043544 ##22 hoxa1a (ENSAMXG00000005258) ENSAMXG00000042268 fam221a (ENSAMXG00000005524) ccdc126 (ENSAMXG00000039633) tra2a (ENSAMXG00000005553) ENSAMXG00000036147 igf2bp3 (ENSAMXG00000007453) GPNMB (ENSAMXG00000007393) oxnad1 (ENSAMXG00000007345) RFTN1 (ENSAMXG00000007317) dazl (ENSAMXG00000035291) tbc1d5 (ENSAMXG00000007142) Electric eel MODERN SPECIES 231 ENSEEEG00000001486 ENSEEEG00000001489 TRIL (ENSEEEG00000001491) CREB5 (ENSEEEG00000001492) jazf1a (ENSEEEG00000001495) tax1bp1a (ENSEEEG00000001496) ENSEEEG00000001497 evx1 (ENSEEEG00000001499) hoxa13a (ENSEEEG00000001502) hoxa11a (ENSEEEG00000001503) ENSEEEG00000001505 ENSEEEG00000001506 hoxa5a (ENSEEEG00000001507) HOXA4 (ENSEEEG00000001508) hoxa3a (ENSEEEG00000001510) ENSEEEG00000001512 ##22 hoxa1a (ENSEEEG00000001513) snx10a (ENSEEEG00000001519) cbx3a (ENSEEEG00000001557) nfe2l3 (ENSEEEG00000001593) ##28 npvf (ENSEEEG00000001595) osbpl3a (ENSEEEG00000001599) Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012629 ENSGT00940000164283.b.a ENSGT00940000156458.e.a ENSGT00940000156458.f ENSGT00950000183025.b.b.e.a ENSGT00940000161087.i.a ENSGT00940000161307 ENSGT00940000160009 ENSGT00940000160855 ENSGT00940000160866 ENSGT00940000161194 ENSGT00940000159254.b ENSGT00940000161023.b.b ENSGT00940000160794 ENSGT00940000159522 ENSGT00940000155029.c.a.e.b ##22 ENSGT00940000157315.kc ENSGT00940000157315.jc.b ENSGT00940000158801 ENSGT00940000165646.A.i ENSGT00950000182892.a.a.a ##28 ENSGT00390000004405.a.g ##29 ENSGT00940000159609 ENSGT00940000158240 ENSGT00540000073797 ENSGT00940000158313.a.b ENSGT00940000158675.a ENSGT00940000160528.b ENSGT00940000156890.a.a.s ENSGT00940000154307.D ENSGT00940000160722 Cyprininae DUPLICATION Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 190 ENSGT00390000010145.c.b.p ENSGT00940000160267.a ENSGT00760000119737.a ENSGT00940000161975.c ENSGT00940000156420.a.b.a.b ENSGT00390000003635.g.b ENSGT00950000183025.b.a.ab.f ENSGT00940000165581.g.a.a ENSGT00940000159854.c ENSGT00940000164071.b.b.d ENSGT00940000158311.a.d ENSGT00940000166648.d ENSGT00940000159894.o ENSGT00940000158988.a.a.h ENSGT00940000159522.i.b ENSGT00940000155029.c.a.e.b.a ##22 ENSGT00940000157315.kc.c ENSGT00940000156007.k.a ENSGT00940000153305.i ENSGT00950000182892.a.b.b.l ##28 ENSGT00390000003271.c ENSGT00940000155957.b.d ENSGT00940000155880.f.e ENSGT00940000155348.A.j ENSGT00940000156475.f.d Goldfish MODERN SPECIES 38 osbpl3a (ENSCARG00000032064) ENSCARG00000032558 ENSCARG00000032573 TRIL (ENSCARG00000032590) CREB5 (ENSCARG00000032602) jazf1a (ENSCARG00000032615) tax1bp1a (ENSCARG00000032635) hibadha (ENSCARG00000032652) EVX1 (ENSCARG00000032682) hoxa13a (ENSCARG00000032696) hoxa11a (ENSCARG00000032708) ENSCARG00000032718 hoxa5a (ENSCARG00000032733) HOXA4 (ENSCARG00000032742) hoxa3a (ENSCARG00000032760) ENSCARG00000032770 ##22 hoxa1a (ENSCARG00000032793) snx10a (ENSCARG00000032802) cbx3a (ENSCARG00000032814) nfe2l3 (ENSCARG00000032830) ##28 npvf (ENSCARG00000032846) PTDSS1 (ENSCARG00000032875) STMND1 (ENSCARG00000033057) rbm24a (ENSCARG00000033062) cap2 (ENSCARG00000033170) vps28 (ENSCARG00000036198) ENSCARG00000036207 grinaa (ENSCARG00000036281) ENSCARG00000036288 RPRD1A (ENSCARG00000036295) SLC30A8 (ENSCARG00000036309) Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 191 ENSGT00390000010145.c.b.p ENSGT00940000160267.a ENSGT00760000119737.a ENSGT00940000161975.c ENSGT00940000156420.a.b.a.b ENSGT00390000003635.g.b ENSGT00950000183025.b.a.ab.f ENSGT00940000165581.g.a.a ENSGT00940000159854.c ENSGT00940000164071.b.b.d ENSGT00940000158311.a.d ENSGT00940000166648.d ENSGT00940000159894.o ENSGT00940000158988.a.a.h ENSGT00940000159522.i.b ENSGT00940000155029.c.a.e.b.a ##22 ENSGT00940000157315.kc.c ENSGT00940000156007.k.a ENSGT00940000153305.i ENSGT00950000182892.a.b.b.l ##28 ENSGT00390000003271.c ENSGT00940000155957.b.d Common carp reference MODERN SPECIES 31 smarcc1b (ENSCCRG00000050314) ENSCCRG00000019638 ENSCCRG00000070516 ENSCCRG00000082296 ENSCCRG00000075077 CREB5 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hoxa5a (ENSSGRG00000008976) HOXA4 (ENSSGRG00000008977) ENSSGRG00000008978 hoxa3a (ENSSGRG00000008979) ENSSGRG00000008980 ##22 hoxa1a (ENSSGRG00000008986) snx10a (ENSSGRG00000008990) cbx3a (ENSSGRG00000009001) nfe2l3 (ENSSGRG00000009002) ##28 npvf (ENSSGRG00000009003) ENSSGRG00000009004 osbpl3a (ENSSGRG00000009007) Cyprininae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155029.c.a.e.b.b ##22 Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155029.c.a.e.b.b ##22 Golden-line barbel MODERN SPECIES 2946 ENSSGRG00000004967 ##22 Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 65 ENSGT01000000221212 ENSGT00940000157858.i ENSGT00760000119737 ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00940000171365 ENSGT00940000156420.b ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000164628 ENSGT00940000155029.c.a.e ##22 ENSGT00390000017856.a ##25 ENSGT00940000156007.l ENSGT00940000166701 ENSGT00940000165630 ENSGT00390000015236 ENSGT00940000155957.a ENSGT00940000155880.e ENSGT00940000158500 ENSGT00940000156475.e ENSGT00390000007287 ENSGT00390000015035 ENSGT00400000022168.a ENSGT00520000055666.b ENSGT01050000244890.a.a.a.h ENSGT00940000156245.a.a Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000157248.c.a ENSGT00940000157288 ENSGT01000000221212 ENSGT00940000157858.i ENSGT00760000119737 ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.g.d ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000164628 ENSGT00940000155029.c.a.e ##22 ENSGT00390000017856.a ##25 ENSGT00940000156007.l ENSGT00940000166701 ENSGT00940000165630 ENSGT00390000015236 ENSGT00940000155957.a ENSGT00940000155880.e.f.b ENSGT00940000155880.e.e ENSGT00940000158500 ENSGT00940000156475.e ENSGT00390000007287 ENSGT00390000015035 ENSGT00400000022168.a ENSGT00520000055666.b ENSGT01050000244890.a.a.a.h Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000157248.c.a.c.b ENSGT00940000157288 ENSGT01000000221212 ENSGT00940000157858.i ENSGT00760000119737 ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.g.d ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000164628 ENSGT00940000155029.c.a.e ##22 ENSGT00390000017856.a ##25 ENSGT00940000156007.l ENSGT00940000166701 ENSGT00940000165630 ENSGT00390000015236 ENSGT00940000155957.a.c ENSGT00940000155880.e.f.b.a ENSGT00940000155957.a.d ENSGT00940000155880.e.f.b.b.b ENSGT00940000155880.e.e ENSGT00940000158500 ENSGT00940000156475.e ENSGT00390000007287.`b ENSGT00390000015035 ENSGT00400000022168.a Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 53 ENSGT01000000221212 ENSGT00940000157858.i.j ENSGT00760000119737 ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00940000156420.b ENSGT00390000003368 ENSGT00390000003635.g.d ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000164628 ENSGT00940000155029.c.a.e ##22 ENSGT00390000017856.a ##25 ENSGT00940000156007.l ENSGT00940000166701 ENSGT00940000165630 ENSGT00390000015236 ENSGT00940000155957.a.c ENSGT00940000155880.e.f.b.a ENSGT00940000155880.e.f.b.b.a ENSGT00940000155957.a.d ENSGT00940000155880.e.f.b.b.b ENSGT00940000155880.e.e ENSGT00940000158500 ENSGT00940000156475.e ENSGT00390000007287.`b ENSGT00390000007287.ab Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 50 ENSGT00940000157288 ENSGT01000000221212 ENSGT00940000157858.i.i ENSGT00760000119737 ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a.c ENSGT00390000003368 ENSGT00390000003635.g.d ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b.c ENSGT00940000164628 ENSGT00940000155029.c.a.e ##22 ENSGT00390000017856.a ##25 ENSGT00940000156007.l ENSGT00940000166701 ENSGT00940000165630 ENSGT00390000015236.o.a ENSGT00940000155957.a.c ENSGT00940000155880.e.f.b.a ENSGT00940000155880.e.f.b.b.b ENSGT00940000158500 ENSGT00940000156475.e ENSGT00390000007287.`b ENSGT00390000007287.ab ENSGT00390000015035 ENSGT00400000022168.a ENSGT00520000055666.b.i Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 112 ENSGT00940000157858.i.i ENSGT01000000221212 ENSGT00940000157858.i.j ENSGT00760000119737 ENSGT01030000234635.a.b.a.a.d ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a.c ENSGT00390000003368 ENSGT00390000003635.g.d ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b.c ENSGT00940000164628 ENSGT00940000155029.c.a.e ##22 ENSGT00390000017856.a ##25 ENSGT00940000156007.l ENSGT00940000166701 ENSGT00940000165630 ENSGT00390000015236.o.a ENSGT00940000155957.a.d ENSGT00940000158500 ENSGT00940000156475.e ENSGT00390000007287.`b ENSGT00390000007287.ab ENSGT00390000015035 ENSGT00400000022168.a ENSGT00520000055666.b.i ENSGT01050000244890.a.a.a.h ENSGT00940000156245.a.a Chinook salmon MODERN SPECIES 602 ENSOTSG00005038108 ENSOTSG00005038110 hibadhb (ENSOTSG00005038111) hoxa13b (ENSOTSG00005038134) hoxa11b (ENSOTSG00005038135) ENSOTSG00005038136 hoxa9b (ENSOTSG00005038137) hoxa2b (ENSOTSG00005038139) ##22 Coho salmon MODERN SPECIES 31 ENSOKIG00005050149 ENSOKIG00005050152 CHN2 (ENSOKIG00005050170) cpvl (ENSOKIG00005050225) CREB5 (ENSOKIG00005050277) ENSOKIG00005050281 CREB5 (ENSOKIG00005050290) sycp1 (ENSOKIG00005050301) tax1bp1b (ENSOKIG00005050315) JAZF1 (ENSOKIG00005050330) hibadhb (ENSOKIG00005050338) hoxa13b (ENSOKIG00005050354) hoxa11b (ENSOKIG00005050356) ENSOKIG00005050359 hoxa9b (ENSOKIG00005050361) hoxa2b (ENSOKIG00005050366) ##22 skap2 (ENSOKIG00005050372) ##25 ENSOKIG00005050381 ENSOKIG00005050383 snx10b (ENSOKIG00005050387) cbx3b (ENSOKIG00005050391) ENSOKIG00005050401 C7orf31 (ENSOKIG00005050414) OSBPL3 (ENSOKIG00005050518) ENSOKIG00005050662 ENSOKIG00005050665 gsdmeb (ENSOKIG00005050674) ENSOKIG00005050686 ENSOKIG00005050690 pals2a (ENSOKIG00005050694) NPY (ENSOKIG00005050696) Rainbow trout MODERN SPECIES 11 ENSOMYG00000048461 hacl1 (ENSOMYG00000056364) plekha8 (ENSOMYG00000001004) fkbp14 (ENSOMYG00000000983) ENSOMYG00000001041 CHN2 (ENSOMYG00000067588) cpvl (ENSOMYG00000000789) CREB5 (ENSOMYG00000076901) JAZF1 (ENSOMYG00000053773) tax1bp1b (ENSOMYG00000000420) hibadhb (ENSOMYG00000000413) hoxa13b (ENSOMYG00000029804) hoxa11b (ENSOMYG00000029852) ENSOMYG00000028157 hoxa9b (ENSOMYG00000025017) hoxa2b (ENSOMYG00000029726) ##22 skap2 (ENSOMYG00000029647) ##25 ENSOMYG00000053803 cbx3b (ENSOMYG00000071084) ENSOMYG00000029171 ENSOMYG00000056728 ENSOMYG00000066872 OSBPL3 (ENSOMYG00000049660) ENSOMYG00000002681 gsdmeb (ENSOMYG00000002499) pals2a (ENSOMYG00000051009) NPY (ENSOMYG00000001366) ENSOMYG00000002328 ENSOMYG00000001276 smpd5 (ENSOMYG00000002268) ENSOMYG00000048862 Salmo ANCESTRAL SPECIES 87 ENSGT00940000157858.i.j ENSGT00760000119737 ENSGT00940000157288.s ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a.f ENSGT00940000156420.b ENSGT00390000003368 ENSGT00390000003635.g.d ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255.y.a ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000164628 ENSGT00940000155029.c.a.e ##22 ENSGT00390000017856.a ##25 ENSGT00940000156007.l ENSGT00940000166701 ENSGT00940000165630 ENSGT00390000015236 ENSGT00940000155957.a.c ENSGT00940000155957.a.d ENSGT00940000155880.e.f.b.b.b.b ENSGT00940000155880.e.e ENSGT00940000158500.q.a.a ENSGT00940000156475.e ENSGT00390000007287.`b ENSGT00390000007287.ab ENSGT00390000015035 ENSGT00400000022168.a River trout DUPLICATION River trout MODERN SPECIES 420 hoxa13b (ENSSTUG00000034766) hoxa11b (ENSSTUG00000034756) ENSSTUG00000034750 hoxa9b (ENSSTUG00000034742) hoxa2b (ENSSTUG00000034732) ##22 skap2 (ENSSTUG00000034707) ##25 ENSSTUG00000034696 cbx3b (ENSSTUG00000034690) ENSSTUG00000034643 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ENSSSAG00000015845 Huchen MODERN SPECIES 2633 JAZF1 (ENSHHUG00000021350) tax1bp1b (ENSHHUG00000021359) hibadhb (ENSHHUG00000021398) hoxa13b (ENSHHUG00000021488) hoxa11b (ENSHHUG00000021517) ENSHHUG00000021520 hoxa9b (ENSHHUG00000021524) hoxa2b (ENSHHUG00000021530) ##22 skap2 (ENSHHUG00000021539) ##25 snx10b (ENSHHUG00000021562) cbx3b (ENSHHUG00000021574) Northern pike MODERN SPECIES 19 ANKRD28 (ENSELUG00000007253) hacl1 (ENSELUG00000007356) COLQ (ENSELUG00000007408) plekha8 (ENSELUG00000007445) fkbp14 (ENSELUG00000033081) ENSELUG00000007457 CHN2 (ENSELUG00000000267) cpvl (ENSELUG00000007617) CREB5 (ENSELUG00000007691) jazf1a (ENSELUG00000000282) tax1bp1b (ENSELUG00000007759) hibadhb (ENSELUG00000007803) hoxa13b (ENSELUG00000007825) hoxa11b (ENSELUG00000007833) ENSELUG00000007844 hoxa2b (ENSELUG00000007865) ##22 ENSELUG00000026822 skap2 (ENSELUG00000007940) ##25 snx10 (ENSELUG00000008041) cbx3b (ENSELUG00000008064) ENSELUG00000000294 ENSELUG00000000299 OSBPL3 (ENSELUG00000008198) ENSELUG00000028145 gsdmeb (ENSELUG00000003122) gsdmeb (ENSELUG00000000099) pals2a (ENSELUG00000000093) NPY (ENSELUG00000003034) ENSELUG00000003021 malsu1 (ENSELUG00000003006) smpd5 (ENSELUG00000002998) Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000157248.c.a ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00940000171365 ENSGT00940000156420.b ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000164628 ENSGT00940000155029.c.a.e ##22 ENSGT00390000017856.a ##25 ENSGT00940000156007.l ENSGT00940000166701 ENSGT00940000165630 ENSGT00390000015236 ENSGT00940000155957.a ENSGT00940000155880.e ENSGT00940000158500 ENSGT00940000156475.e ENSGT00390000015035 ENSGT00400000022168.a ENSGT00520000055666.b ENSGT01050000244890.a.a.a.h ENSGT00940000156245.a.a ENSGT00940000157508 Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157248.c.a ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00940000171365 ENSGT00940000156420.b ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000164628 ENSGT00940000155029.c.a.e ##22 ENSGT00390000017856.a ##25 ENSGT00940000156007.l ENSGT00940000166701 ENSGT00940000165630 ENSGT00390000015236 ENSGT00940000155957.a ENSGT00940000155880.e ENSGT00940000158500 ENSGT00940000156475.e ENSGT00390000015035 ENSGT00400000022168.a ENSGT00520000055666.b ENSGT01050000244890.a.a.a.h ENSGT00940000156245.a.a ENSGT00940000157508 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157248.c.a ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00940000171365 ENSGT00940000156420.b ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a 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Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248.c.a ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00940000156420.b ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000164628 ENSGT00940000155029.c.a.e ##22 ENSGT00390000017856.a ##25 ENSGT00940000156007.l ENSGT00940000166701 ENSGT00940000165630 ENSGT00390000015236 ENSGT00940000155957.a ENSGT00940000155880.e ENSGT00940000158500 ENSGT00940000156475.e ENSGT00390000015035 ENSGT00400000022168.a ENSGT00520000055666.b ENSGT01050000244890.a.a.a.h ENSGT00940000156245.a.a ENSGT00940000157508 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00950000182908.C.b ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248.c.a ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h 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(ENSCVAG00000011882) pals2a (ENSCVAG00000011871) NPY (ENSCVAG00000011845) malsu1 (ENSCVAG00000011829) smpd5 (ENSCVAG00000011824) grinab (ENSCVAG00000011815) rbm24b (ENSCVAG00000011805) KIF13A (ENSCVAG00000011787) ENSCVAG00000011607 Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00950000182908.C.b ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248.c.a ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000164628 ENSGT00940000155029.c.a.e ##22 ENSGT00390000017856.a ##25 ENSGT00940000156007.l ENSGT00940000166701 ENSGT00940000165630 ENSGT00940000155957.a ENSGT00940000155880.e ENSGT00940000158500 ENSGT00940000156475.e ENSGT00390000015035 ENSGT00400000022168.a ENSGT00520000055666.b ENSGT01050000244890.a.a.a.h ENSGT00940000156245.a.a ENSGT00940000157508 ENSGT00730000111361 Mangrove rivulus MODERN SPECIES 92 ANKRD28 (ENSKMAG00000015591) hacl1 (ENSKMAG00000015483) COLQ (ENSKMAG00000015426) plekha8 (ENSKMAG00000015362) fkbp14 (ENSKMAG00000015321) CHN2 (ENSKMAG00000015268) cpvl (ENSKMAG00000015213) CREB5 (ENSKMAG00000015158) JAZF1 (ENSKMAG00000015126) tax1bp1b (ENSKMAG00000015099) hibadhb (ENSKMAG00000015068) hoxa13b (ENSKMAG00000015035) hoxa11b (ENSKMAG00000015024) ENSKMAG00000015007 hoxa9b (ENSKMAG00000014986) hoxa2b (ENSKMAG00000014967) ##22 skap2 (ENSKMAG00000014915) ##25 snx10b (ENSKMAG00000014891) cbx3b (ENSKMAG00000014869) ENSKMAG00000014733 OSBPL3 (ENSKMAG00000014680) gsdmeb (ENSKMAG00000014650) pals2a (ENSKMAG00000014598) NPY (ENSKMAG00000014576) malsu1 (ENSKMAG00000014561) smpd5 (ENSKMAG00000014523) ENSKMAG00000014506 grinab (ENSKMAG00000014477) rbm24b (ENSKMAG00000014458) KIF13A (ENSKMAG00000014378) NHLRC1 (ENSKMAG00000014351) Oryzias ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00950000182908.C.b ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248.c.a ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000164628 ENSGT00940000155029.c.a.e ##22 ENSGT00390000017856.a ##25 ENSGT00940000156007.l ENSGT00940000166701 ENSGT00940000165630 ENSGT00390000015236 ENSGT00940000155957.a ENSGT00940000155880.e ENSGT00940000158500 ENSGT00940000156475.e ENSGT00390000015035 ENSGT00400000022168.a ENSGT00520000055666.b ENSGT01050000244890.a.a.a.h ENSGT00940000156245.a.a ENSGT00940000157508 Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00950000182908.C.b ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248.c.a ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000164628 ENSGT00940000155029.c.a.e ##22 ENSGT00390000017856.a ##25 ENSGT00940000156007.l ENSGT00940000166701 ENSGT00940000165630 ENSGT00390000015236 ENSGT00940000155957.a ENSGT00940000155880.e ENSGT00940000158500 ENSGT00940000156475.e ENSGT00390000015035 ENSGT00400000022168.a ENSGT00520000055666.b ENSGT01050000244890.a.a.a.h.g ENSGT00940000156245.a.a ENSGT00940000157508 Indian medaka MODERN SPECIES 5 ANKRD28 (ENSOMEG00000020476) hacl1 (ENSOMEG00000020529) COLQ (ENSOMEG00000020557) plekha8 (ENSOMEG00000020599) fkbp14 (ENSOMEG00000020616) CHN2 (ENSOMEG00000020636) cpvl (ENSOMEG00000020677) CREB5 (ENSOMEG00000020734) JAZF1 (ENSOMEG00000020759) tax1bp1b (ENSOMEG00000020843) hibadhb (ENSOMEG00000020876) hoxa13b (ENSOMEG00000020887) hoxa11b (ENSOMEG00000020907) ENSOMEG00000020917 hoxa9b (ENSOMEG00000020924) hoxa2b (ENSOMEG00000020935) ##22 skap2 (ENSOMEG00000020980) ##25 snx10b (ENSOMEG00000021014) cbx3b (ENSOMEG00000021045) ENSOMEG00000021098 ENSOMEG00000021121 OSBPL3 (ENSOMEG00000021253) gsdmeb (ENSOMEG00000021294) pals2a (ENSOMEG00000021343) NPY (ENSOMEG00000021366) malsu1 (ENSOMEG00000021384) smpd5 (ENSOMEG00000021400) ENSOMEG00000021413 grinab (ENSOMEG00000021436) grinab (ENSOMEG00000021457) grinab (ENSOMEG00000021508) Javanese ricefish MODERN SPECIES 7 ANKRD28 (ENSOJAG00000002474) hacl1 (ENSOJAG00000004335) COLQ (ENSOJAG00000004426) plekha8 (ENSOJAG00000004450) fkbp14 (ENSOJAG00000004525) CHN2 (ENSOJAG00000004542) cpvl (ENSOJAG00000004653) CREB5 (ENSOJAG00000004901) JAZF1 (ENSOJAG00000004919) tax1bp1b (ENSOJAG00000004952) hibadhb (ENSOJAG00000004992) hoxa13b (ENSOJAG00000005031) hoxa11b (ENSOJAG00000005039) ENSOJAG00000005045 hoxa9b (ENSOJAG00000005049) hoxa2b (ENSOJAG00000005061) ##22 skap2 (ENSOJAG00000005085) ##25 snx10b (ENSOJAG00000005107) cbx3b (ENSOJAG00000005112) ENSOJAG00000005128 ENSOJAG00000005152 OSBPL3 (ENSOJAG00000005451) gsdmeb (ENSOJAG00000008946) pals2a (ENSOJAG00000008985) NPY (ENSOJAG00000009530) malsu1 (ENSOJAG00000009536) smpd5 (ENSOJAG00000009545) ENSOJAG00000009553 grinab (ENSOJAG00000009557) rbm24b (ENSOJAG00000009561) KIF13A (ENSOJAG00000009627) Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00950000182908.C.b ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248.c.a ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000164628 ENSGT00940000155029.c.a.e ##22 ENSGT00390000017856.a ##25 ENSGT00940000156007.l ENSGT00940000166701 ENSGT00940000165630 ENSGT00390000015236 ENSGT00940000155957.a ENSGT00940000155880.e ENSGT00940000158500 ENSGT00940000156475.e ENSGT00390000015035 ENSGT00400000022168.a ENSGT00520000055666.b ENSGT01050000244890.a.a.a.h ENSGT00940000156245.a.a ENSGT00940000157508 Chinese medaka MODERN SPECIES 493 ANKRD28 (ENSOSIG00000021208) hacl1 (ENSOSIG00000023206) COLQ (ENSOSIG00000023271) plekha8 (ENSOSIG00000023282) fkbp14 (ENSOSIG00000023284) CHN2 (ENSOSIG00000023311) cpvl (ENSOSIG00000023352) CREB5 (ENSOSIG00000023360) JAZF1 (ENSOSIG00000023362) tax1bp1b (ENSOSIG00000023368) hibadhb (ENSOSIG00000023371) hoxa13b (ENSOSIG00000023372) hoxa11b (ENSOSIG00000023374) ENSOSIG00000003721 hoxa9b (ENSOSIG00000003729) hoxa2b (ENSOSIG00000003738) ##22 skap2 (ENSOSIG00000003769) ##25 snx10b (ENSOSIG00000003931) cbx3b (ENSOSIG00000003938) ENSOSIG00000003945 OSBPL3 (ENSOSIG00000004039) gsdmeb (ENSOSIG00000005215) NPY (ENSOSIG00000005297) malsu1 (ENSOSIG00000005302) smpd5 (ENSOSIG00000005305) grinab (ENSOSIG00000005309) rbm24b (ENSOSIG00000005330) ENSOSIG00000006028 ptdss1a (ENSOSIG00000006032) ENSOSIG00000006102 PLEKHG4B (ENSOSIG00000006105) Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 7 ENSORLG00000007334 hacl1 (ENSORLG00000007343) COLQ (ENSORLG00000007381) plekha8 (ENSORLG00000007400) fkbp14 (ENSORLG00000007415) CHN2 (ENSORLG00000007444) cpvl (ENSORLG00000007488) CREB5 (ENSORLG00000007509) JAZF1 (ENSORLG00000007516) tax1bp1b (ENSORLG00000007562) hibadhb (ENSORLG00000007586) hoxa13b (ENSORLG00000007597) hoxa11b (ENSORLG00000007608) ENSORLG00000007617 hoxa9b (ENSORLG00000007620) hoxa2b (ENSORLG00000007624) ##22 skap2 (ENSORLG00000007660) ##25 snx10b (ENSORLG00000007677) cbx3b (ENSORLG00000007692) ENSORLG00000027931 ENSORLG00000007734 ENSORLG00000025854 OSBPL3 (ENSORLG00000007774) gsdmeb (ENSORLG00000007783) pals2a (ENSORLG00000007872) ENSORLG00000007880 smpd5 (ENSORLG00000007890) ENSORLG00000021836 grinab (ENSORLG00000007899) rbm24b (ENSORLG00000007916) KIF13A (ENSORLG00000007992) Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00950000182908.C.b ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248.c.a ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000164628 ENSGT00940000155029.c.a.e ##22 ENSGT00390000017856.a ##25 ENSGT00940000156007.l ENSGT00940000166701 ENSGT00940000165630 ENSGT00390000015236 ENSGT00940000155957.a ENSGT00940000155880.e ENSGT00940000158500 ENSGT00940000156475.e ENSGT00390000015035 ENSGT00400000022168.a ENSGT00520000055666.b ENSGT01050000244890.a.a.a.h ENSGT00940000156245.a.a ENSGT00940000157508 Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00950000182908.C.b ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248.c.a ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000164628 ENSGT00940000155029.c.a.e ##22 ENSGT00390000017856.a ##25 ENSGT00940000156007.l ENSGT00940000166701 ENSGT00940000165630 ENSGT00390000015236 ENSGT00940000155957.a ENSGT00940000155880.e ENSGT00940000158500 ENSGT00940000156475.e ENSGT00390000015035 ENSGT00400000022168.a ENSGT00520000055666.b ENSGT01050000244890.a.a.a.h ENSGT00940000156245.a.a ENSGT00940000157508 Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00950000182908.C.b ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248.c.a ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000164628 ENSGT00940000155029.c.a.e ##22 ENSGT00390000017856.a ##25 ENSGT00940000156007.l ENSGT00940000166701 ENSGT00940000165630 ENSGT00390000015236 ENSGT00940000155957.a ENSGT00940000155880.e ENSGT00940000158500 ENSGT00940000156475.e ENSGT00400000022168.a ENSGT00520000055666.b ENSGT01050000244890.a.a.a.h ENSGT00940000156245.a.a ENSGT00940000157508 ENSGT00730000111361 Fugu MODERN SPECIES 19 hdac9b (ENSTRUG00000015773) ANKRD28 (ENSTRUG00000015695) hacl1 (ENSTRUG00000015648) COLQ (ENSTRUG00000015630) plekha8 (ENSTRUG00000015600) fkbp14 (ENSTRUG00000015596) CHN2 (ENSTRUG00000015557) 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(ENSTNIG00000000494) ENSTNIG00000001780 hoxa9b (ENSTNIG00000001769) hoxa2b (ENSTNIG00000001768) ##22 skap2 (ENSTNIG00000018427) ##25 snx10b (ENSTNIG00000018426) cbx3b (ENSTNIG00000018425) ENSTNIG00000018424 OSBPL3 (ENSTNIG00000018423) gsdmeb (ENSTNIG00000002463) pals2a (ENSTNIG00000018422) NPY (ENSTNIG00000018421) ENSTNIG00000000117 smpd5 (ENSTNIG00000018420) ENSTNIG00000018419 grinab (ENSTNIG00000018418) rbm24b (ENSTNIG00000018417) KIF13A (ENSTNIG00000018416) ENSTNIG00000001068 Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00950000182908.C.b ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248.c.a ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000164628 ENSGT00940000155029.c.a.e ##22 ENSGT00390000017856.a ##25 ENSGT00940000156007.l ENSGT00940000166701 ENSGT00940000165630 ENSGT00390000015236 ENSGT00940000155957.a ENSGT00940000155880.e ENSGT00940000158500 ENSGT00940000156475.e ENSGT00390000015035 ENSGT00400000022168.a ENSGT00520000055666.b ENSGT01050000244890.a.a.a.h ENSGT00940000156245.a.a ENSGT00940000157508 Ballan wrasse MODERN SPECIES 101 ANKRD28 (ENSLBEG00000008448) hacl1 (ENSLBEG00000008593) COLQ (ENSLBEG00000008704) plekha8 (ENSLBEG00000008747) fkbp14 (ENSLBEG00000008801) CHN2 (ENSLBEG00000008860) cpvl (ENSLBEG00000008956) CREB5 (ENSLBEG00000009016) JAZF1 (ENSLBEG00000009100) tax1bp1b (ENSLBEG00000009134) hibadhb (ENSLBEG00000009177) hoxa13b (ENSLBEG00000009213) hoxa11b (ENSLBEG00000009228) ENSLBEG00000009239 hoxa9b (ENSLBEG00000009261) hoxa2b (ENSLBEG00000009277) ##22 skap2 (ENSLBEG00000009365) ##25 snx10b (ENSLBEG00000009434) cbx3b (ENSLBEG00000009482) ENSLBEG00000009627 ENSLBEG00000009699 ENSLBEG00000009796 ENSLBEG00000009992 ENSLBEG00000010032 ENSLBEG00000010109 hspb6 (ENSLBEG00000010127) proser3 (ENSLBEG00000010147) lin37 (ENSLBEG00000010185) ENSLBEG00000010238 ctrl (ENSLBEG00000010253) hsc70 (ENSLBEG00000010275) Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00950000182908.C.b ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248.c.a ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000164628 ENSGT00940000155029.c.a.e ##22 ENSGT00390000017856.a ##25 ENSGT00940000156007.l ENSGT00940000166701 ENSGT00940000165630 ENSGT00390000015236 ENSGT00940000155957.a ENSGT00940000155880.e ENSGT00940000158500 ENSGT00940000156475.e ENSGT00390000015035 ENSGT00400000022168.a ENSGT00520000055666.b ENSGT01050000244890.a.a.a.h ENSGT00940000156245.a.a ENSGT00940000157508 Perciformes ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00950000182908.C.b ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248.c.a ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000164628 ENSGT00940000155029.c.a.e ##22 ENSGT00390000017856.a ##25 ENSGT00940000156007.l ENSGT00940000166701 ENSGT00940000165630 ENSGT00390000015236 ENSGT00940000155957.a ENSGT00940000155880.e ENSGT00940000158500 ENSGT00940000156475.e ENSGT00390000015035 ENSGT00400000022168.a ENSGT00520000055666.b ENSGT01050000244890.a.a.a.h ENSGT00940000156245.a.a ENSGT00940000157508 Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00950000182908.C.b ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248.c.a ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000164628 ENSGT00940000155029.c.a.e ##22 ENSGT00390000017856.a ##25 ENSGT00940000156007.l ENSGT00940000166701 ENSGT00940000165630 ENSGT00390000015236 ENSGT00940000155957.a ENSGT00940000155880.e ENSGT00940000158500 ENSGT00940000156475.e ENSGT00390000015035 ENSGT00400000022168.a ENSGT00520000055666.b ENSGT01050000244890.a.a.a.h ENSGT00940000156245.a.a ENSGT00940000157508 Pike perch MODERN SPECIES 15 ANKRD28 (ENSSLUG00000001010) hacl1 (ENSSLUG00000001647) COLQ (ENSSLUG00000001725) plekha8 (ENSSLUG00000001749) fkbp14 (ENSSLUG00000001771) CHN2 (ENSSLUG00000001817) cpvl (ENSSLUG00000001939) CREB5 (ENSSLUG00000002018) JAZF1 (ENSSLUG00000002021) tax1bp1b (ENSSLUG00000002026) hibadhb (ENSSLUG00000002035) hoxa13b (ENSSLUG00000002053) hoxa11b (ENSSLUG00000002066) ENSSLUG00000002079 hoxa9b (ENSSLUG00000002087) hoxa2b (ENSSLUG00000002092) ##22 skap2 (ENSSLUG00000002101) ##25 snx10b (ENSSLUG00000002107) cbx3b (ENSSLUG00000002110) ENSSLUG00000002118 ENSSLUG00000002132 OSBPL3 (ENSSLUG00000002358) gsdmeb (ENSSLUG00000005622) pals2a (ENSSLUG00000005650) NPY (ENSSLUG00000005981) malsu1 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(ENSCGOG00000024046) Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00950000182908.C.b ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248.c.a ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000164628 ENSGT00940000155029.c.a.e ##22 ENSGT00390000017856.a ##25 ENSGT00940000156007.l ENSGT00940000166701 ENSGT00940000165630 ENSGT00390000015236 ENSGT00940000155957.a ENSGT00940000155880.e ENSGT00940000158500 ENSGT00940000156475.e ENSGT00390000015035 ENSGT00400000022168.a ENSGT01050000244890.a.a.a.h ENSGT00940000156245.a.a ENSGT00940000157508 ENSGT00730000111361 Lumpfish MODERN SPECIES 7 hdac9b (ENSCLMG00005005026) ANKRD28 (ENSCLMG00005005042) hacl1 (ENSCLMG00005007962) COLQ (ENSCLMG00005008200) plekha8 (ENSCLMG00005008203) fkbp14 (ENSCLMG00005008206) CHN2 (ENSCLMG00005008207) cpvl (ENSCLMG00005008209) 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(ENSGACG00000008297) ENSGACG00000008303 hoxa9b (ENSGACG00000008310) hoxa2b (ENSGACG00000008314) ##22 skap2 (ENSGACG00000008317) ##25 snx10b (ENSGACG00000008327) cbx3b (ENSGACG00000008334) ENSGACG00000008337 OSBPL3 (ENSGACG00000008359) gsdmeb (ENSGACG00000008400) ENSGACG00000008411 pals2a (ENSGACG00000008428) grinab (ENSGACG00000008435) rbm24b (ENSGACG00000008472) KIF13A (ENSGACG00000008481) NHLRC1 (ENSGACG00000008509) ptdss1a (ENSGACG00000008513) PLEKHG4B (ENSGACG00000008538) NKD2 (ENSGACG00000008552) Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00950000182908.C.b ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248.c.a ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000164628 ENSGT00940000155029.c.a.e ##22 ENSGT00390000017856.a ##25 ENSGT00940000156007.l ENSGT00940000166701 ENSGT00940000165630 ENSGT00390000015236 ENSGT00940000155957.a ENSGT00940000155880.e ENSGT00940000158500 ENSGT00940000156475.e ENSGT00390000015035 ENSGT00400000022168.a ENSGT00520000055666.b ENSGT01050000244890.a.a.a.h ENSGT00940000156245.a.a ENSGT00940000157508 Gilthead seabream MODERN SPECIES 8 ANKRD28 (ENSSAUG00010007114) hacl1 (ENSSAUG00010007288) COLQ (ENSSAUG00010007419) plekha8 (ENSSAUG00010007424) fkbp14 (ENSSAUG00010007466) CHN2 (ENSSAUG00010007468) cpvl (ENSSAUG00010007474) CREB5 (ENSSAUG00010007486) JAZF1 (ENSSAUG00010007488) tax1bp1b (ENSSAUG00010007490) hibadhb (ENSSAUG00010007493) hoxa13b (ENSSAUG00010007579) hoxa11b (ENSSAUG00010007580) ENSSAUG00010007581 hoxa9b (ENSSAUG00010007582) hoxa2b (ENSSAUG00010007584) ##22 skap2 (ENSSAUG00010007589) ##25 snx10b (ENSSAUG00010007601) ENSSAUG00010007605 ENSSAUG00010007607 OSBPL3 (ENSSAUG00010007627) gsdmeb (ENSSAUG00010008345) pals2a (ENSSAUG00010008352) NPY (ENSSAUG00010008736) malsu1 (ENSSAUG00010008745) smpd5 (ENSSAUG00010008746) ENSSAUG00010008747 grinab (ENSSAUG00010008748) rbm24b (ENSSAUG00010008749) KIF13A (ENSSAUG00010008827) NHLRC1 (ENSSAUG00010014295) Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00950000182908.C.b ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248.c.a ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000164628 ENSGT00940000155029.c.a.e ##22 ENSGT00390000017856.a ##25 ENSGT00940000156007.l ENSGT00940000166701 ENSGT00940000165630 ENSGT00390000015236 ENSGT00940000155957.a ENSGT00940000155880.e ENSGT00940000158500 ENSGT00940000156475.e ENSGT00390000015035 ENSGT00400000022168.a ENSGT00520000055666.b ENSGT01050000244890.a.a.a.h ENSGT00940000156245.a.a ENSGT00940000157508 Large yellow croaker MODERN SPECIES 484 ANKRD28 (ENSLCRG00005004018) hacl1 (ENSLCRG00005002619) COLQ (ENSLCRG00005002579) plekha8 (ENSLCRG00005002558) fkbp14 (ENSLCRG00005002552) CHN2 (ENSLCRG00005001253) cpvl (ENSLCRG00005000690) CREB5 (ENSLCRG00005000631) JAZF1 (ENSLCRG00005009772) tax1bp1b (ENSLCRG00005009770) hibadhb (ENSLCRG00005009720) hoxa13b (ENSLCRG00005009719) hoxa11b (ENSLCRG00005009718) ENSLCRG00005009717 hoxa9b (ENSLCRG00005009716) hoxa2b (ENSLCRG00005009715) ##22 skap2 (ENSLCRG00005009710) ##25 snx10b (ENSLCRG00005009707) cbx3b (ENSLCRG00005009706) ENSLCRG00005009705 ENSLCRG00005009704 OSBPL3 (ENSLCRG00005009388) gsdmeb (ENSLCRG00005009384) pals2a (ENSLCRG00005009124) NPY (ENSLCRG00005009118) malsu1 (ENSLCRG00005009117) smpd5 (ENSLCRG00005009115) ENSLCRG00005009114 grinab (ENSLCRG00005009112) rbm24b (ENSLCRG00005009111) KIF13A (ENSLCRG00005008814) Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00950000182908.C.b ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248.c.a ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000164628 ENSGT00940000155029.c.a.e ##22 ENSGT00390000017856.a ##25 ENSGT00940000156007.l ENSGT00940000166701 ENSGT00940000165630 ENSGT00390000015236 ENSGT00940000155957.a ENSGT00940000155880.e ENSGT00940000158500 ENSGT00940000156475.e ENSGT00390000015035 ENSGT00400000022168.a ENSGT00520000055666.b ENSGT01050000244890.a.a.a.h ENSGT00940000156245.a.a ENSGT00940000157508 Carangaria ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00950000182908.C.b ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248.c.a ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000164628 ENSGT00940000155029.c.a.e ##22 ENSGT00390000017856.a ##25 ENSGT00940000156007.l ENSGT00940000166701 ENSGT00940000165630 ENSGT00390000015236 ENSGT00940000155957.a ENSGT00940000155880.e ENSGT00940000158500 ENSGT00940000156475.e ENSGT00390000015035 ENSGT00400000022168.a ENSGT00520000055666.b ENSGT01050000244890.a.a.a.h ENSGT00940000156245.a.a ENSGT00940000157508 Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00950000182908.C.b ENSGT00940000156802.q ENSGT00940000157248.c.a ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000164628 ENSGT00940000155029.c.a.e ##22 ENSGT00390000017856.a ##25 ENSGT00940000156007.l ENSGT00940000166701 ENSGT00940000165630 ENSGT00390000015236 ENSGT00940000155957.a ENSGT00940000155880.e ENSGT00940000158500 ENSGT00940000156475.e ENSGT00390000015035 ENSGT00400000022168.a ENSGT00520000055666.b ENSGT01050000244890.a.a.a.h ENSGT00940000156245.a.a ENSGT00940000157508 Seriola ANCESTRAL SPECIES 56 ENSGT00950000182908.C.b ENSGT00940000156802.q ENSGT00940000157248.c.a ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000164628 ENSGT00940000155029.c.a.e ##22 ENSGT00390000017856.a ##25 ENSGT00940000156007.l ENSGT00940000166701 ENSGT00940000165630 ENSGT00940000178953 ENSGT00940000155957.a ENSGT00940000155880.e ENSGT00940000158500 ENSGT00940000156475.e ENSGT00390000015035 ENSGT00400000022168.a ENSGT00520000055666.b ENSGT01050000244890.a.a.a.h ENSGT00940000156245.a.a ENSGT00940000157508 Greater amberjack MODERN SPECIES 250 ANKRD28 (ENSSDUG00000001509) hacl1 (ENSSDUG00000001427) COLQ (ENSSDUG00000001385) plekha8 (ENSSDUG00000001363) fkbp14 (ENSSDUG00000001345) CHN2 (ENSSDUG00000001322) cpvl (ENSSDUG00000001270) CREB5 (ENSSDUG00000001228) JAZF1 (ENSSDUG00000001189) tax1bp1b (ENSSDUG00000001177) hibadhb (ENSSDUG00000001170) hoxa13b (ENSSDUG00000001137) hoxa11b (ENSSDUG00000001124) ENSSDUG00000001112 hoxa9b (ENSSDUG00000001099) hoxa2b (ENSSDUG00000001084) ##22 skap2 (ENSSDUG00000001074) ##25 snx10b (ENSSDUG00000001069) cbx3b (ENSSDUG00000001063) ENSSDUG00000000856 ENSSDUG00000000814 ENSSDUG00000000701 Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 2583 ENSSLDG00000014484 hacl1 (ENSSLDG00000014503) COLQ (ENSSLDG00000014536) plekha8 (ENSSLDG00000014564) fkbp14 (ENSSLDG00000014589) CHN2 (ENSSLDG00000014703) cpvl (ENSSLDG00000014724) CREB5 (ENSSLDG00000014760) JAZF1 (ENSSLDG00000014789) tax1bp1b (ENSSLDG00000014804) hibadhb (ENSSLDG00000014828) hoxa13b (ENSSLDG00000014863) hoxa11b (ENSSLDG00000014872) ENSSLDG00000014879 hoxa9b (ENSSLDG00000014900) hoxa2b (ENSSLDG00000014909) ##22 skap2 (ENSSLDG00000014966) ##25 snx10b (ENSSLDG00000014993) cbx3b (ENSSLDG00000015003) ENSSLDG00000015024 ENSSLDG00000015068 OSBPL3 (ENSSLDG00000015137) gsdmeb (ENSSLDG00000015204) pals2a (ENSSLDG00000015241) NPY (ENSSLDG00000015297) malsu1 (ENSSLDG00000015308) smpd5 (ENSSLDG00000015320) ENSSLDG00000015341 grinab (ENSSLDG00000015358) rbm24b (ENSSLDG00000015378) KIF13A (ENSSLDG00000015412) Barramundi perch MODERN SPECIES 17 ANKRD28 (ENSLCAG00010010440) hacl1 (ENSLCAG00010011623) COLQ (ENSLCAG00010011685) plekha8 (ENSLCAG00010011690) fkbp14 (ENSLCAG00010011697) CHN2 (ENSLCAG00010011703) cpvl (ENSLCAG00010011717) CREB5 (ENSLCAG00010011737) JAZF1 (ENSLCAG00010011748) tax1bp1b (ENSLCAG00010011753) hibadhb (ENSLCAG00010011766) hoxa13b (ENSLCAG00010011777) hoxa11b (ENSLCAG00010011784) ENSLCAG00010011786 hoxa9b (ENSLCAG00010011789) hoxa2b (ENSLCAG00010011791) ##22 skap2 (ENSLCAG00010011794) ##25 snx10b (ENSLCAG00010011798) cbx3b (ENSLCAG00010011802) ENSLCAG00010011810 ENSLCAG00010011822 OSBPL3 (ENSLCAG00010011887) gsdmeb (ENSLCAG00010011962) pals2a (ENSLCAG00010011974) NPY (ENSLCAG00010012003) malsu1 (ENSLCAG00010012008) smpd5 (ENSLCAG00010012017) ENSLCAG00010012021 grinab (ENSLCAG00010012027) rbm24b (ENSLCAG00010012033) KIF13A (ENSLCAG00010012157) Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00950000182908.C.b ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248.c.a ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000164628 ENSGT00940000155029.c.a.e ##22 ENSGT00390000017856.a ##25 ENSGT00940000156007.l ENSGT00940000166701 ENSGT00940000165630 ENSGT00390000015236 ENSGT00940000155957.a ENSGT00940000155880.e ENSGT00940000158500 ENSGT00940000156475.e ENSGT00390000015035 ENSGT00400000022168.a ENSGT01050000244890.a.a.a.h ENSGT00940000156245.a.a ENSGT00940000157508 ENSGT00730000111361 Turbot MODERN SPECIES ANKRD28 (ENSSMAG00000000101) hacl1 (ENSSMAG00000000099) COLQ (ENSSMAG00000000096) plekha8 (ENSSMAG00000000090) fkbp14 (ENSSMAG00000000089) CHN2 (ENSSMAG00000000085) cpvl (ENSSMAG00000000083) CREB5 (ENSSMAG00000000081) JAZF1 (ENSSMAG00000000079) tax1bp1b (ENSSMAG00000000076) hibadhb (ENSSMAG00000000075) hoxa13b (ENSSMAG00000000073) hoxa11b (ENSSMAG00000000072) ENSSMAG00000000071 hoxa9b (ENSSMAG00000000069) hoxa2b (ENSSMAG00000020316) ##22 snx10b (ENSSMAG00000020285) skap2 (ENSSMAG00000020291) ##25 cbx3b (ENSSMAG00000029813) ENSSMAG00000020274 ENSSMAG00000020269 OSBPL3 (ENSSMAG00000020219) gsdmeb (ENSSMAG00000020200) pals2a (ENSSMAG00000020151) NPY (ENSSMAG00000026722) ENSSMAG00000033668 smpd5 (ENSSMAG00000020132) grinab (ENSSMAG00000020122) rbm24b (ENSSMAG00000033434) ENSSMAG00000020055 ENSSMAG00000020049 Tongue sole MODERN SPECIES 4 ANKRD28 (ENSCSEG00000004894) hacl1 (ENSCSEG00000004885) COLQ (ENSCSEG00000004880) plekha8 (ENSCSEG00000004876) fkbp14 (ENSCSEG00000004873) CHN2 (ENSCSEG00000004861) cpvl (ENSCSEG00000004857) CREB5 (ENSCSEG00000004842) JAZF1 (ENSCSEG00000004836) tax1bp1b (ENSCSEG00000004813) hibadhb (ENSCSEG00000004801) hoxa13b (ENSCSEG00000004792) hoxa11b (ENSCSEG00000004788) ENSCSEG00000004785 hoxa9b (ENSCSEG00000004783) hoxa2b (ENSCSEG00000004781) ##22 skap2 (ENSCSEG00000004771) ##25 snx10b (ENSCSEG00000004763) cbx3b (ENSCSEG00000004761) ENSCSEG00000004752 ENSCSEG00000004746 OSBPL3 (ENSCSEG00000004720) steap4 (ENSCSEG00000004702) ENSCSEG00000004691 mindy3 (ENSCSEG00000004684) ITGA8 (ENSCSEG00000004677) ATXN1 (ENSCSEG00000004666) fam8a1b (ENSCSEG00000004661) fabp4b (ENSCSEG00000004659) HEY1 (ENSCSEG00000004656) ENSCSEG00000004626 Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00950000182908.C.b ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248.c.a ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000164628 ENSGT00940000155029.c.a.e ##22 ENSGT00390000017856.a ##25 ENSGT00940000156007.l ENSGT00940000166701 ENSGT00940000165630 ENSGT00390000015236 ENSGT00940000155957.a ENSGT00940000155880.e ENSGT00940000158500 ENSGT00940000156475.e ENSGT00390000015035 ENSGT00400000022168.a ENSGT00520000055666.b ENSGT01050000244890.a.a.a.h ENSGT00940000156245.a.a ENSGT00940000157508 Zig-zag eel MODERN SPECIES 7 ANKRD28 (ENSMAMG00000014112) hacl1 (ENSMAMG00000014027) COLQ (ENSMAMG00000013993) plekha8 (ENSMAMG00000013833) fkbp14 (ENSMAMG00000024896) CHN2 (ENSMAMG00000013775) cpvl (ENSMAMG00000013747) CREB5 (ENSMAMG00000013658) JAZF1 (ENSMAMG00000013626) tax1bp1b (ENSMAMG00000013585) hibadhb (ENSMAMG00000013563) hoxa13b (ENSMAMG00000013489) hoxa11b (ENSMAMG00000013483) ENSMAMG00000013470 hoxa9b (ENSMAMG00000013458) hoxa2b (ENSMAMG00000013414) ##22 skap2 (ENSMAMG00000013360) ##25 snx10b (ENSMAMG00000013344) cbx3b (ENSMAMG00000028713) ENSMAMG00000013143 ENSMAMG00000013119 OSBPL3 (ENSMAMG00000013015) gsdmeb (ENSMAMG00000012973) pals2a (ENSMAMG00000012941) NPY (ENSMAMG00000012919) ENSMAMG00000024695 smpd5 (ENSMAMG00000012885) ENSMAMG00000027454 grinab (ENSMAMG00000012853) rbm24b (ENSMAMG00000012841) ENSMAMG00000012667 Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00950000182908.C.b ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248.c.a ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000164628 ENSGT00940000155029.c.a.e ##22 ENSGT00390000017856.a ##25 ENSGT00940000156007.l ENSGT00940000166701 ENSGT00940000165630 ENSGT00390000015236 ENSGT00940000155957.a ENSGT00940000155880.e ENSGT00940000158500 ENSGT00940000156475.e ENSGT00390000015035 ENSGT00400000022168.a ENSGT00520000055666.b ENSGT01050000244890.a.a.a.h ENSGT00940000156245.a.a ENSGT00940000157508 Climbing perch MODERN SPECIES 7 ANKRD28 (ENSATEG00000006576) hacl1 (ENSATEG00000006565) COLQ (ENSATEG00000025574) plekha8 (ENSATEG00000006488) fkbp14 (ENSATEG00000006455) CHN2 (ENSATEG00000006387) cpvl (ENSATEG00000006320) CREB5 (ENSATEG00000006306) JAZF1 (ENSATEG00000006282) tax1bp1b (ENSATEG00000006270) hibadhb (ENSATEG00000006226) hoxa13b (ENSATEG00000006127) hoxa11b (ENSATEG00000006040) ENSATEG00000006005 hoxa9b (ENSATEG00000005978) hoxa2b (ENSATEG00000005962) ##22 skap2 (ENSATEG00000005895) ##25 snx10b (ENSATEG00000005877) cbx3b (ENSATEG00000005871) ENSATEG00000005781 ENSATEG00000027748 OSBPL3 (ENSATEG00000005642) gsdmeb (ENSATEG00000005633) pals2a (ENSATEG00000005570) NPY (ENSATEG00000005520) ENSATEG00000026729 smpd5 (ENSATEG00000005476) ENSATEG00000005454 grinab (ENSATEG00000005446) rbm24b (ENSATEG00000005396) ENSATEG00000005222 Siamese fighting fish MODERN SPECIES 7 ANKRD28 (ENSBSLG00000023994) hacl1 (ENSBSLG00000023602) COLQ (ENSBSLG00000023554) plekha8 (ENSBSLG00000023540) fkbp14 (ENSBSLG00000023475) CHN2 (ENSBSLG00000023238) cpvl (ENSBSLG00000023204) CREB5 (ENSBSLG00000023199) JAZF1 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(ENSMMDG00005019940) ENSMMDG00005019946 hoxa9b (ENSMMDG00005019947) hoxa2b (ENSMMDG00005019951) ##22 skap2 (ENSMMDG00005019954) ##25 snx10b (ENSMMDG00005019958) cbx3b (ENSMMDG00005019960) ENSMMDG00005019965 ENSMMDG00005019971 OSBPL3 (ENSMMDG00005019983) gsdmeb (ENSMMDG00005019986) pals2a (ENSMMDG00005019994) NPY (ENSMMDG00005020218) malsu1 (ENSMMDG00005020221) smpd5 (ENSMMDG00005020224) ENSMMDG00005020230 GRINA (ENSMMDG00005020237) rbm24b (ENSMMDG00005020289) KIF13A (ENSMMDG00005020301) Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 39 ENSGT00390000012629 ENSGT00940000164283.b.a ENSGT00940000156458.e.a ENSGT00950000183025.b.b.e.a ENSGT00940000161087 ENSGT00940000161307 ENSGT00940000160009 ENSGT00940000163268.e ENSGT00940000160866 ENSGT00940000160855 ENSGT00940000161194 ENSGT00940000159254.b ENSGT00940000161023.a ENSGT00940000160794 ENSGT00940000159522 ENSGT00940000155029.c.a.f ##22 ENSGT00940000157315 ENSGT00940000158801 ENSGT00950000183123 ENSGT00950000182892.a.a.a ##28 ENSGT00390000004405.a ##29 ENSGT00940000159609 ENSGT00940000158240 ENSGT00540000073797 ENSGT01000000222029 ENSGT00940000158313.a.b ENSGT00940000158675.a ENSGT00940000160528.b ENSGT00940000158313.a.a ENSGT00940000158675.b ENSGT00940000160528.a Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00950000183025.b.b.e.a ENSGT00940000161087 ENSGT00940000161307 ENSGT00940000160009 ENSGT00940000160855 ENSGT00940000160866 ENSGT00940000161194 ENSGT00940000159254.a.a ENSGT00940000161023.b.a ENSGT00940000160794 ENSGT00940000168241 ENSGT00940000159254.b ENSGT00940000161023.a ENSGT00940000161023.b.b ENSGT00940000159522 ENSGT00940000155029.c.a.f ##22 ENSGT00940000157315 ENSGT00940000158801 ENSGT00950000183123 ENSGT00950000182892.a.a.a ##28 ENSGT00390000004405.a ##29 ENSGT00940000159609 ENSGT00940000158240 ENSGT00540000073797 ENSGT01000000222029 ENSGT00940000158313.a.b ENSGT00940000158675.a ENSGT00940000160528.b ENSGT00940000160722 ENSGT00940000156890.a.b ENSGT00940000154307.D Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000161087 ENSGT00940000161307 ENSGT00940000160009 ENSGT00940000160855 ENSGT00940000160866 ENSGT00940000161194 ENSGT00940000159254.a.a ENSGT00940000161023.b.a ENSGT00940000160794.d ENSGT00940000160794.c.a ENSGT00940000168241 ENSGT00940000159254.b ENSGT00940000161023.b.b ENSGT00940000160794.c.b ENSGT00940000159522 ENSGT00940000155029.c.a.f ##22 ENSGT00940000157315 ENSGT00940000158801 ENSGT00940000165646.A ENSGT00950000182892.a.a.a ##28 ENSGT00390000004405.a.d ##29 ENSGT00940000159609 ENSGT00540000073797 ENSGT01000000222029 ENSGT00940000158313.a.b ENSGT00940000158675.a ENSGT00940000160528.b ENSGT00940000156890.a.b ENSGT00940000154307.D ENSGT00940000160722 ENSGT00940000158956.c Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 136 ENSGT00940000155957.b.a ENSGT00940000161975.b ENSGT00940000156420.a.b.c.a ENSGT00390000003635.g.c.b ENSGT00950000183025.b.a.ab.d ENSGT00940000165581.c.a ENSGT00940000159854.a ENSGT00940000164071.b.b.a ENSGT00940000158311.a.b ENSGT00940000163268.d.a.c ENSGT00940000166648.b ENSGT00940000161013.h ENSGT00940000159894.n ENSGT00940000158988.a.a.f ENSGT00940000159522.u.b ENSGT00940000155029.c.a.f.a ##22 ENSGT00940000157315.hc.a ENSGT00940000156007.k.d ENSGT00940000153305.l ENSGT00950000182892.a.b.b.m.a ##28 ENSGT00390000003271 Huchen MODERN SPECIES 1721 TRIL (ENSHHUG00000036174) CREB5 (ENSHHUG00000036184) ENSHHUG00000036188 jazf1a (ENSHHUG00000036201) tax1bp1a (ENSHHUG00000036208) hibadha (ENSHHUG00000036216) EVX1 (ENSHHUG00000036232) hoxa13a (ENSHHUG00000036245) hoxa11a (ENSHHUG00000036262) hoxa10b (ENSHHUG00000036267) ENSHHUG00000036272 HOXA7 (ENSHHUG00000036277) hoxa5a (ENSHHUG00000036281) hoxa3a (ENSHHUG00000036288) HOXA4 (ENSHHUG00000036297) ENSHHUG00000036310 ##22 hoxa1a (ENSHHUG00000036347) Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000155957.b.a ENSGT00940000161975.b ENSGT00940000156420.a.b.c.a ENSGT00390000003635.g.c.b ENSGT00950000183025.b.a.ab.d ENSGT00940000165581.c.a ENSGT00940000159854.a ENSGT00940000164071.b.b.a 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ENSGT00940000155029.c.a.f.a ##22 ENSGT00940000157315.hc.a ENSGT00940000156007.k.d ENSGT00940000153305.l ENSGT00950000182892.a.b.b.m.a ##28 ENSGT00390000003271 ENSGT01030000234992.b ENSGT00940000161290.d ENSGT00940000158302.d.b.b ENSGT00940000158302.d.a.k ENSGT00940000160103.i.a ENSGT00940000154383.a.j.b ENSGT00940000154383.a.j.a ENSGT00940000154317.a.a.g.b ENSGT00390000003880.b.a.d ENSGT00950000183052.b.c.a.b.c.a Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000155880.f.b ENSGT00940000155957.b.a ENSGT00940000161975.b ENSGT00940000156420.a.b.c.a ENSGT00390000003635.g.c.b ENSGT00950000183025.b.a.ab.d ENSGT00940000165581.c.a ENSGT00940000159854.a ENSGT00940000164071.b.b.a ENSGT00940000158311.a.b ENSGT00940000163268.d.a.c ENSGT00940000166648.b ENSGT00940000159894.n ENSGT00940000158988.a.a.f ENSGT00940000159522.u.b ENSGT00940000155029.c.a.f.a ##22 ENSGT00940000157315.hc.a ENSGT00940000156007.k.d ENSGT00940000153305.l ENSGT00950000182892.a.b.b.m.a ##28 ENSGT00390000003271 ENSGT01030000234992.b ENSGT00940000161290.d ENSGT00940000158302.d.b.b ENSGT00940000158302.d.a.k ENSGT00940000160103.i.a ENSGT00940000154383.a.j.a ENSGT00940000154317.a.a.g.b ENSGT00390000003880.b.a.d ENSGT00950000183052.b.c.a.b.c.a ENSGT00940000153270.a.r Coho salmon MODERN SPECIES 5 osbpl3a (ENSOKIG00005008676) TRIL (ENSOKIG00005008967) CREB5 (ENSOKIG00005009012) ENSOKIG00005009015 jazf1a (ENSOKIG00005009022) tax1bp1a (ENSOKIG00005009040) ENSOKIG00005009061 EVX1 (ENSOKIG00005009149) hoxa13a (ENSOKIG00005009160) hoxa11a (ENSOKIG00005009170) ENSOKIG00005009180 ENSOKIG00005009193 hoxa5a (ENSOKIG00005009216) HOXA4 (ENSOKIG00005009230) hoxa3a (ENSOKIG00005009246) ENSOKIG00005009258 ##22 hoxa1a (ENSOKIG00005009277) SNX10 (ENSOKIG00005009287) nfe2l3 (ENSOKIG00005009311) ##28 ENSOKIG00005009442 col9a2 (ENSOKIG00005009453) ENSOKIG00005009461 ENSOKIG00005009486 ENSOKIG00005009494 ADGRB2 (ENSOKIG00005009529) ENSOKIG00005009959 ptp4a2b (ENSOKIG00005009965) COL8A2 (ENSOKIG00005009988) trappc3 (ENSOKIG00005010010) ENSOKIG00005010046 gmnn (ENSOKIG00005010054) Rainbow trout MODERN SPECIES 24 CREB5 (ENSOMYG00000006314) ENSOMYG00000073184 ENSOMYG00000006352 tax1bp1a (ENSOMYG00000012725) ENSOMYG00000059680 hibadha (ENSOMYG00000006005) EVX1 (ENSOMYG00000005935) ENSOMYG00000005868 hoxa11a (ENSOMYG00000053299) ENSOMYG00000005816 ENSOMYG00000005794 HOXA7 (ENSOMYG00000060173) hoxa5a (ENSOMYG00000005721) HOXA4 (ENSOMYG00000005706) HOXA3 (ENSOMYG00000067402) ENSOMYG00000005648 ##22 HOXA1 (ENSOMYG00000005629) ENSOMYG00000063825 ENSOMYG00000064397 snx10a (ENSOMYG00000056461) ENSOMYG00000075549 snx10a (ENSOMYG00000005605) ENSOMYG00000057329 CBX3 (ENSOMYG00000066476) nfe2l3 (ENSOMYG00000005546) ##28 ENSOMYG00000058163 ENSOMYG00000005433 ENSOMYG00000012584 ENSOMYG00000077735 ENSOMYG00000056808 ENSOMYG00000049062 Salmo ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000155880.f.b ENSGT00940000155957.b.a ENSGT00940000161975.b ENSGT00940000156420.a.b.c.a ENSGT00390000003635.g.c.b ENSGT00950000183025.b.a.ab.d ENSGT00940000165581.c.a ENSGT00940000159854.a ENSGT00940000164071.b.b.a ENSGT00940000158311.a.b ENSGT00940000163268.d.a.c ENSGT00940000166648.b ENSGT00940000159894.n ENSGT00940000158988.a.a.f ENSGT00940000159522.u.b ENSGT00940000155029.c.a.f.a ##22 ENSGT00940000157315.hc.a ENSGT00940000156007.k.d ENSGT00940000153305.l ENSGT00950000182892.a.b.b.m.a ##28 ENSGT01030000234992.b ENSGT00940000161290.d ENSGT00940000158302.d.b.b ENSGT00940000160103.i.a ENSGT00940000154383.a.i.a ENSGT00940000154317.a.a.g.b ENSGT00390000003880.b.a.d ENSGT00950000182774.a.a.b.a.a ENSGT00940000153270.a.r ENSGT00940000153717.a.a.q ENSGT01000000222038.a River trout MODERN SPECIES 29 pals2b (ENSSTUG00000046798) ENSSTUG00000046790 GSDME (ENSSTUG00000046784) osbpl3a (ENSSTUG00000046765) TRIL (ENSSTUG00000046754) CREB5 (ENSSTUG00000046744) jazf1a (ENSSTUG00000046732) tax1bp1a (ENSSTUG00000046720) ENSSTUG00000046667 EVX1 (ENSSTUG00000046662) hoxa13a (ENSSTUG00000046658) hoxa11a (ENSSTUG00000046652) hoxa5a (ENSSTUG00000046646) HOXA4 (ENSSTUG00000046643) hoxa3a (ENSSTUG00000046619) ENSSTUG00000046602 ##22 hoxa1a (ENSSTUG00000046591) snx10a (ENSSTUG00000046585) cbx3a (ENSSTUG00000046557) nfe2l3 (ENSSTUG00000046551) ##28 ENSSTUG00000046547 ENSSTUG00000046517 ENSSTUG00000046508 ENSSTUG00000046503 ENSSTUG00000046500 ptp4a2b (ENSSTUG00000046474) col8a2 (ENSSTUG00000046470) ENSSTUG00000046466 trappc3 (ENSSTUG00000046432) ENSSTUG00000046425 ENSSTUG00000046417 Atlantic salmon MODERN SPECIES 5 osbpl3a (ENSSSAG00000065307) TRIL (ENSSSAG00000106156) CREB5 (ENSSSAG00000065214) jazf1a (ENSSSAG00000065204) ENSSSAG00000103120 tax1bp1a (ENSSSAG00000065188) ENSSSAG00000065080 EVX1 (ENSSSAG00000065073) hoxa13aa (ENSSSAG00000065068) hoxa11aa (ENSSSAG00000065063) ENSSSAG00000118319 hoxa9ab (ENSSSAG00000065038) hoxa5a (ENSSSAG00000065028) hoxa4a (ENSSSAG00000065018) hoxa3a (ENSSSAG00000065011) hoxa2aa (ENSSSAG00000065006) ##22 hoxa1a (ENSSSAG00000082638) snx10a (ENSSSAG00000117399) cbx3 (ENSSSAG00000064790) nfe2l3 (ENSSSAG00000095537) ##28 ENSSSAG00000104433 col9a2 (ENSSSAG00000064768) ENSSSAG00000097270 ENSSSAG00000090253 ENSSSAG00000027483 ENSSSAG00000046244 tp4a2 (ENSSSAG00000046480) ENSSSAG00000101004 trappc3 (ENSSSAG00000046390) ENSSSAG00000092861 ENSSSAG00000046285 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 158 ENSGT00940000165581.c.b ENSGT00940000159854.b ENSGT00940000164071.b.b.b ENSGT00940000158311.a.a ENSGT00940000163268.d.a.d ENSGT00940000166648.a ENSGT00940000161013.g ENSGT00940000159894.m ENSGT00940000158988.a.a.e ENSGT00940000159522.u.a ENSGT00940000155029.c.a.f.b ##22 ENSGT00940000157315.hc.b ENSGT00940000156007.k.c ENSGT00940000153305.k ENSGT00950000182892.a.b.b.m.b ##28 ENSGT01030000234992.a ENSGT00940000157883.a.b.f.wb ENSGT00940000161290.c ENSGT00940000158302.d.b.a ENSGT00940000158302.e ENSGT00940000160103.i.b ENSGT00940000154383.a.i.b ENSGT00940000154317.a.a.g.a ENSGT00390000003880.b.a.c ENSGT00940000153270.a.q ENSGT00530000068834 Huchen MODERN SPECIES 1857 EVX1 (ENSHHUG00000007534) hoxa13a (ENSHHUG00000007550) hoxa11a (ENSHHUG00000007563) hoxa10b (ENSHHUG00000007569) ENSHHUG00000007572 HOXA7 (ENSHHUG00000007578) hoxa3a (ENSHHUG00000007592) HOXA4 (ENSHHUG00000007634) ENSHHUG00000007645 ##22 HOXA1 (ENSHHUG00000007677) Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00940000155957.b.b ENSGT00940000161975.a ENSGT00940000156420.a.b.c.b ENSGT00390000003635.g.c.a ENSGT00950000183025.b.a.ab.c ENSGT00940000165581.c.b ENSGT00940000159854.b ENSGT00940000164071.b.b.b ENSGT00940000158311.a.a ENSGT00940000163268.d.a.d ENSGT00940000166648.a ENSGT00940000161013.g ENSGT00940000159894.m ENSGT00940000158988.a.a.e ENSGT00940000159522.u.a ENSGT00940000155029.c.a.f.b ##22 ENSGT00940000157315.hc.b ENSGT00940000156007.k.c ENSGT00940000153305.k ENSGT00950000182892.a.b.b.m.b ##28 ENSGT01030000234992.a ENSGT00940000157883.a.b.f.wb ENSGT00940000161290.c ENSGT00940000158302.d.b.a ENSGT00940000158302.e ENSGT00940000160103.i.b ENSGT00940000154383.a.i.b ENSGT00940000154317.a.a.g.a ENSGT00390000003880.b.a.c ENSGT00940000153270.a.q ENSGT00530000068834 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00940000156906.j.b ENSGT00940000161975.a ENSGT00940000156420.a.b.c.b ENSGT00390000003635.g.c.a ENSGT00950000183025.b.a.ab.c ENSGT00940000165581.c.b ENSGT00940000159854.b ENSGT00940000164071.b.b.b ENSGT00940000158311.a.a ENSGT00940000163268.d.a.d ENSGT00940000166648.a ENSGT00940000161013.g ENSGT00940000159894.m ENSGT00940000158988.a.a.e ENSGT00940000159522.u.a ENSGT00940000155029.c.a.f.b ##22 ENSGT00940000157315.hc.b ENSGT00940000156007.k.c ENSGT00940000153305.k ENSGT00950000182892.a.b.b.m.b ##28 ENSGT01030000234992.a ENSGT00940000157883.a.b.f.wb ENSGT00940000161290.c ENSGT00940000158302.d.b.a ENSGT00940000158302.e ENSGT00940000160103.i.b ENSGT00940000154383.a.i.b ENSGT00940000154317.a.a.g.a ENSGT00390000003880.b.a.c ENSGT00940000153270.a.q ENSGT00530000068834 Rainbow trout MODERN SPECIES 9 ENSOMYG00000012952 ENSOMYG00000012920 TRIL (ENSOMYG00000012751) CREB5 (ENSOMYG00000012745) jazf1a (ENSOMYG00000012732) tax1bp1a (ENSOMYG00000012797) EVX1 (ENSOMYG00000012716) hoxa13a (ENSOMYG00000012707) hoxa11a (ENSOMYG00000012704) ENSOMYG00000012697 ENSOMYG00000012685 HOXA7 (ENSOMYG00000012674) hoxa5a (ENSOMYG00000012670) HOXA4 (ENSOMYG00000012666) HOXA3 (ENSOMYG00000012659) ENSOMYG00000012652 ##22 ENSOMYG00000054049 snx10a (ENSOMYG00000012638) ENSOMYG00000012624 nfe2l3 (ENSOMYG00000012612) ##28 ENSOMYG00000012602 ENSOMYG00000012598 col9a2 (ENSOMYG00000005383) ENSOMYG00000005326 ENSOMYG00000074617 ENSOMYG00000012420 ENSOMYG00000040750 ptp4a2b (ENSOMYG00000012355) ENSOMYG00000012348 ENSOMYG00000049858 trappc3 (ENSOMYG00000012324) Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00940000155957.b.b ENSGT00940000161975.a ENSGT00940000156420.a.b.c.b ENSGT00390000003635.g.c.a ENSGT00950000183025.b.a.ab.c ENSGT00940000165581.c.b ENSGT00940000159854.b ENSGT00940000164071.b.b.b ENSGT00940000158311.a.a ENSGT00940000163268.d.a.d ENSGT00940000166648.a ENSGT00940000161013.g ENSGT00940000159894.m ENSGT00940000159522.u.a ENSGT00940000158988.a.a.e ENSGT00940000155029.c.a.f.b ##22 ENSGT00940000157315.hc.b ENSGT00940000156007.k.c ENSGT00940000153305.k ENSGT00950000182892.a.b.b.m.b ##28 ENSGT01030000234992.a ENSGT00940000157883.a.b.f.wb ENSGT00940000161290.c ENSGT00940000158302.d.b.a ENSGT00940000160103.i.b ENSGT00940000154383.a.i.b ENSGT00940000154317.a.a.g.a ENSGT00390000003880.b.a.c ENSGT00940000153270.a.q ENSGT00530000068834 ENSGT00940000153717.a.a.r Coho salmon MODERN SPECIES 8 ENSOKIG00005045656 TRIL (ENSOKIG00005045677) CREB5 (ENSOKIG00005045687) jazf1a (ENSOKIG00005045695) tax1bp1a (ENSOKIG00005045707) ENSOKIG00005045717 EVX1 (ENSOKIG00005045730) ENSOKIG00005045738 hoxa11a (ENSOKIG00005045750) ENSOKIG00005045757 ENSOKIG00005045764 HOXA7 (ENSOKIG00005045777) hoxa5a (ENSOKIG00005045791) hoxa3a (ENSOKIG00005045805) HOXA4 (ENSOKIG00005045809) ENSOKIG00005045814 ##22 HOXA1 (ENSOKIG00005045820) snx10a (ENSOKIG00005045843) CBX3 (ENSOKIG00005045853) nfe2l3 (ENSOKIG00005045874) ##28 ENSOKIG00005045878 ENSOKIG00005004272 col9a2 (ENSOKIG00005004293) ENSOKIG00005004328 ENSOKIG00005004363 ADGRB2 (ENSOKIG00005004444) ENSOKIG00005004724 ENSOKIG00005004734 ptp4a2b (ENSOKIG00005004748) col8a2 (ENSOKIG00005004787) trappc3 (ENSOKIG00005004797) Salmo ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000155957.b.b ENSGT00940000161975.a ENSGT00940000156420.a.b.c.b ENSGT00390000003635.g.c.a ENSGT00950000183025.b.a.ab.c ENSGT00940000165581.c.b ENSGT00940000159854.b ENSGT00940000164071.b.b.b ENSGT00940000158311.a.a ENSGT00940000163268.d.a.d ENSGT00940000166648.a ENSGT00940000161013.g ENSGT00940000159894.m ENSGT00940000158988.a.a.e ENSGT00940000159522.u.a ENSGT00940000155029.c.a.f.b ##22 ENSGT00940000157315.hc.b ENSGT00940000156007.k.c ENSGT00940000153305.k ENSGT00950000182892.a.b.b.m.b ##28 ENSGT01030000234992.a ENSGT00940000157883.a.b.f.wb ENSGT00940000161290.c ENSGT00940000158302.d.b.a ENSGT00940000160103.i.b ENSGT00940000154383.a.i.b ENSGT00940000154317.a.a.g.a ENSGT00390000003880.b.a.c ENSGT00940000164868.A.d ENSGT00940000153270.a.q ENSGT00940000153717.a.a.r Atlantic salmon MODERN SPECIES 19 CREB5 (ENSSSAG00000053146) ENSSSAG00000111402 JAZF1 (ENSSSAG00000114494) ENSSSAG00000089230 tax1bp1a (ENSSSAG00000053115) ENSSSAG00000085548 ENSSSAG00000053109 EVX1 (ENSSSAG00000053107) hoxa13 (ENSSSAG00000053102) hoxa11ab (ENSSSAG00000053097) hoxa10ab (ENSSSAG00000053094) ENSSSAG00000095697 hoxa5aa (ENSSSAG00000053069) hoxa4aa (ENSSSAG00000053060) hoxa3ab (ENSSSAG00000053050) hoxa2ab (ENSSSAG00000053040) ##22 HOXA1 (ENSSSAG00000083647) ENSSSAG00000111158 ENSSSAG00000118316 snx10a (ENSSSAG00000114556) CBX3 (ENSSSAG00000052931) nfe2l3 (ENSSSAG00000052910) ##28 ENSSSAG00000052895 ENSSSAG00000111371 ENSSSAG00000103162 ENSSSAG00000106578 ENSSSAG00000116732 ENSSSAG00000114374 tp4a2 (ENSSSAG00000052823) ENSSSAG00000052814 trappc3 (ENSSSAG00000052785) River trout MODERN SPECIES 27 TRIL (ENSSTUG00000019352) CREB5 (ENSSTUG00000019318) jazf1a (ENSSTUG00000019298) ENSSTUG00000019287 tax1bp1a (ENSSTUG00000019255) ENSSTUG00000019249 EVX1 (ENSSTUG00000019239) hoxa13a (ENSSTUG00000019226) hoxa11a (ENSSTUG00000019219) hoxa10b (ENSSTUG00000019212) ENSSTUG00000019197 HOXA7 (ENSSTUG00000019182) hoxa5a (ENSSTUG00000019174) HOXA4 (ENSSTUG00000019162) hoxa3a (ENSSTUG00000019151) ENSSTUG00000019141 ##22 hoxa1a (ENSSTUG00000019096) snx10a (ENSSTUG00000019085) cbx3a (ENSSTUG00000019056) nfe2l3 (ENSSTUG00000019045) ##28 ENSSTUG00000019034 ENSSTUG00000019019 ENSSTUG00000019012 col9a2 (ENSSTUG00000018988) ENSSTUG00000018970 ADGRB2 (ENSSTUG00000018312) ptp4a2b (ENSSTUG00000018246) col8a2 (ENSSTUG00000018231) trappc3 (ENSSTUG00000018222) ENSSTUG00000018213 gmnn (ENSSTUG00000018208) Northern pike MODERN SPECIES 9 osbpl3a (ENSELUG00000000150) TRIL (ENSELUG00000005411) CREB5 (ENSELUG00000005385) jazf1a (ENSELUG00000005364) tax1bp1a (ENSELUG00000005336) hibadha (ENSELUG00000005263) evx1 (ENSELUG00000005188) hoxa13a (ENSELUG00000005145) hoxa11a (ENSELUG00000005123) hoxa10b (ENSELUG00000005073) ENSELUG00000028773 HOXA7 (ENSELUG00000028152) hoxa5a (ENSELUG00000005024) HOXA4 (ENSELUG00000028027) hoxa3a (ENSELUG00000005012) ENSELUG00000004984 ##22 hoxa1a (ENSELUG00000004945) snx10a (ENSELUG00000004919) ENSELUG00000028209 cbx3a (ENSELUG00000004880) nfe2l3 (ENSELUG00000004851) ##28 ENSELUG00000004814 ENSELUG00000004670 ADGRB2 (ENSELUG00000004574) ENSELUG00000033096 ptp4a2b (ENSELUG00000004419) col8a2 (ENSELUG00000030174) trappc3 (ENSELUG00000004334) ENSELUG00000028082 gmnn (ENSELUG00000004309) ENSELUG00000004285 Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 49 ENSGT00940000155957.b ENSGT00940000161975 ENSGT00940000156420.a.b ENSGT00390000003635.g ENSGT00950000183025.b.a.ab ENSGT00940000165581 ENSGT00940000159854 ENSGT00940000164071.b.b ENSGT00940000158311.a ENSGT00940000163268.d.a ENSGT00940000166648 ENSGT00940000161013 ENSGT00940000159894 ENSGT00940000158988.a.a ENSGT00940000159522 ENSGT00940000155029.c.a.f ##22 ENSGT00940000157315 ENSGT00940000156007.k ENSGT00940000153305 ENSGT00950000182892.a.b.b ##28 ENSGT00390000003271 ENSGT01030000234992 ENSGT00940000157248.c.b ENSGT00940000157858.j ENSGT00940000160267 ENSGT00760000119737 ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.C.b ENSGT00940000157121 ENSGT00940000155660.a ENSGT00530000063480.b Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155957.b ENSGT00940000161975 ENSGT00940000155261.b ENSGT00390000003635.g ENSGT00950000183025.b.a.ab ENSGT00940000165581 ENSGT00940000159854 ENSGT00940000164071.b.b ENSGT00940000158311.a ENSGT00940000163268.d.a ENSGT00940000166648 ENSGT00940000161013 ENSGT00940000159894 ENSGT00940000158988.a.a ENSGT00940000159522 ENSGT00940000155029.c.a.f ##22 ENSGT00940000157315 ENSGT00940000156007.k ENSGT00940000153305 ENSGT00950000182892.a.b.b ##28 ENSGT00390000003271 ENSGT01030000234992 ENSGT00940000157248.c.b ENSGT00940000157858.j ENSGT00940000160267 ENSGT00760000119737 ENSGT00940000156869 ENSGT00940000180587 ENSGT00390000008096.C.b ENSGT00940000157121 ENSGT00940000155660.a Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000155957.b ENSGT00940000161975 ENSGT00940000155261.b ENSGT00390000003635.g ENSGT00950000183025.b.a.ab ENSGT00940000165581 ENSGT00940000159854 ENSGT00940000164071.b.b ENSGT00940000158311.a ENSGT00940000163268.d.a ENSGT00940000166648 ENSGT00940000161013 ENSGT00940000159894 ENSGT00940000158988.a.a ENSGT00940000159522 ENSGT00940000155029.c.a.f ##22 ENSGT00940000157315 ENSGT00940000156007.k ENSGT00940000153305 ENSGT00950000182892.a.b.b ##28 ENSGT00390000003271 ENSGT01030000234992 ENSGT00940000157248.c.b ENSGT00940000157858.j ENSGT00940000160267 ENSGT00760000119737 ENSGT00390000004280 ENSGT00530000063609.b.x ENSGT00530000063480.b ENSGT00940000154959 ENSGT00940000155660.a Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000155957.b ENSGT00940000161975 ENSGT00940000155261.b ENSGT00390000003635.g ENSGT00950000183025.b.a.ab ENSGT00940000165581 ENSGT00940000159854 ENSGT00940000164071.b.b ENSGT00940000158311.a 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ENSGT00940000157248.c.b ENSGT00940000157858.j ENSGT00940000160267 ENSGT00760000119737 ENSGT00390000004280 ENSGT00530000063609.b.x ENSGT00530000063480.b ENSGT00940000154959 ENSGT00940000155660.a ENSGT00940000157121 Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000155957.b ENSGT00940000161975 ENSGT00940000155261.b ENSGT00390000003635.g ENSGT00950000183025.b.a.ab ENSGT00940000165581 ENSGT00940000159854 ENSGT00940000164071.b.b ENSGT00940000158311.a ENSGT00940000163268.d.a ENSGT00940000166648 ENSGT00940000161013 ENSGT00940000159894 ENSGT00940000158988.a.a ENSGT00940000159522 ENSGT00940000155029.c.a.f ##22 ENSGT00940000157315 ENSGT00940000156007.k ENSGT00940000153305 ENSGT00950000182892.a.b.b ##28 ENSGT00390000003271 ENSGT00940000157248.c.b ENSGT00940000157858.j ENSGT00940000160267 ENSGT00760000119737 ENSGT00390000004280 ENSGT00530000063609.b.x ENSGT00530000063480.b ENSGT00940000154959 ENSGT00940000155660.a ENSGT00940000157121 Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000155957.b 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(ENSNFUG00015005767) ENSNFUG00015005762 SMARCC1B (ENSNFUG00015005404) CABZ01002626.1 (ENSNFUG00015005337) Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000155957.b ENSGT00940000161975 ENSGT00940000155261.b ENSGT00390000003635.g ENSGT00950000183025.b.a.ab ENSGT00940000165581 ENSGT00940000159854 ENSGT00940000164071.b.b ENSGT00940000158311.a ENSGT00940000163268.d.a ENSGT00940000166648 ENSGT00940000161013 ENSGT00940000159894 ENSGT00940000158988.a.a ENSGT00940000159522 ENSGT00940000155029.c.a.f ##22 ENSGT00940000157315 ENSGT00940000156007.k ENSGT00940000153305 ENSGT00950000182892.a.b.b ##28 ENSGT00390000003271 ENSGT00940000157883.a.b.f.pb.b ENSGT00940000157883.a.b.f.pb.a ENSGT00940000157248.c.b ENSGT00940000162818.c.b.e.a.a ENSGT00940000157858.j ENSGT00940000160267 ENSGT00760000119737 ENSGT00390000004280 ENSGT00530000063609.b.x ENSGT00530000063480.b Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000155957.b ENSGT00940000161975 ENSGT00940000155261.b ENSGT00390000003635.g 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osbpl3a (ENSPLAG00000022345) TRIL (ENSPLAG00000022255) ENSPLAG00000022243 jazf1a (ENSPLAG00000022239) tax1bp1a (ENSPLAG00000022213) hibadha (ENSPLAG00000022107) evx1 (ENSPLAG00000022075) hoxa13a (ENSPLAG00000022061) hoxa11a (ENSPLAG00000022048) ENSPLAG00000022003 ENSPLAG00000021989 HOXA7 (ENSPLAG00000021952) hoxa5a (ENSPLAG00000021936) HOXA4 (ENSPLAG00000021895) hoxa3a (ENSPLAG00000021890) ENSPLAG00000021887 ##22 hoxa1a (ENSPLAG00000021884) snx10a (ENSPLAG00000021857) cbx3a (ENSPLAG00000021841) nfe2l3 (ENSPLAG00000021833) ##28 ENSPLAG00000021827 ENSPLAG00000021808 ENSPLAG00000021801 ENSPLAG00000021790 FKBP14 (ENSPLAG00000021776) ENSPLAG00000021767 ENSPLAG00000021739 oxnad1 (ENSPLAG00000021734) ENSPLAG00000021725 dazl (ENSPLAG00000021715) ENSPLAG00000021687 Guppy MODERN SPECIES 441 ENSPREG00000021480 osbpl3a (ENSPREG00000021509) TRIL (ENSPREG00000021545) ENSPREG00000021553 jazf1a (ENSPREG00000021580) tax1bp1a (ENSPREG00000021617) hibadha (ENSPREG00000021657) evx1 (ENSPREG00000021672) 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ENSGT00940000157858.j ENSGT00940000160267 ENSGT00760000119737 ENSGT00390000004280 ENSGT00530000063609.b.x ENSGT00530000063480.b Mummichog MODERN SPECIES 2329 osbpl3a (ENSFHEG00000013709) TRIL (ENSFHEG00000013715) ENSFHEG00000013720 jazf1a (ENSFHEG00000013733) tax1bp1a (ENSFHEG00000013748) hibadha (ENSFHEG00000013773) evx1 (ENSFHEG00000013781) hoxa13a (ENSFHEG00000013789) hoxa11a (ENSFHEG00000013797) hoxa10b (ENSFHEG00000013805) ENSFHEG00000013809 HOXA7 (ENSFHEG00000013819) hoxa5a (ENSFHEG00000013822) HOXA4 (ENSFHEG00000013828) hoxa3a (ENSFHEG00000013849) ENSFHEG00000013857 ##22 hoxa1a (ENSFHEG00000013905) snx10a (ENSFHEG00000014090) cbx3a (ENSFHEG00000014100) nfe2l3 (ENSFHEG00000014108) ##28 NPVF (ENSFHEG00000014120) ENSFHEG00000014122 ENSFHEG00000014131 COLQ (ENSFHEG00000014155) FKBP14 (ENSFHEG00000014170) ENSFHEG00000014181 ENSFHEG00000014192 oxnad1 (ENSFHEG00000014203) ENSFHEG00000014208 dazl (ENSFHEG00000000634) DNAH3 (ENSFHEG00000014337) Sheepshead minnow MODERN SPECIES 210 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ENSGT00390000003271 ENSGT00940000157248.c.b ENSGT00940000157858.j ENSGT00940000160267 ENSGT00760000119737 ENSGT00390000004280 ENSGT00530000063609.b.x.f ENSGT00530000063480.b ENSGT00940000155660.a ENSGT00940000157121 ENSGT00390000008096.C.b Indian medaka MODERN SPECIES 3 osbpl3a (ENSOMEG00000019036) TRIL (ENSOMEG00000018990) ENSOMEG00000018974 jazf1a (ENSOMEG00000018946) tax1bp1a (ENSOMEG00000018894) hibadha (ENSOMEG00000018845) evx1 (ENSOMEG00000018828) hoxa13a (ENSOMEG00000018800) hoxa11a (ENSOMEG00000018787) hoxa10b (ENSOMEG00000000716) ENSOMEG00000018763 HOXA7 (ENSOMEG00000018749) hoxa5a (ENSOMEG00000018736) hoxa3a (ENSOMEG00000018727) HOXA4 (ENSOMEG00000018715) ENSOMEG00000000777 ##22 hoxa1a (ENSOMEG00000018694) snx10a (ENSOMEG00000018674) cbx3a (ENSOMEG00000018650) nfe2l3 (ENSOMEG00000018610) ##28 ENSOMEG00000018577 ENSOMEG00000018555 FKBP14 (ENSOMEG00000018518) ENSOMEG00000018495 ENSOMEG00000018478 oxnad1 (ENSOMEG00000018467) RFTN1 (ENSOMEG00000018428) dazl (ENSOMEG00000018395) ENSOMEG00000018339 tbc1d5 (ENSOMEG00000018290) satb1a (ENSOMEG00000018126) Javanese ricefish MODERN SPECIES 2 osbpl3a (ENSOJAG00000003244) TRIL (ENSOJAG00000003583) ENSOJAG00000003593 jazf1a (ENSOJAG00000003619) tax1bp1a (ENSOJAG00000003658) hibadha (ENSOJAG00000003690) evx1 (ENSOJAG00000003773) hoxa13a (ENSOJAG00000003786) hoxa11a (ENSOJAG00000003810) hoxa10b (ENSOJAG00000003838) ENSOJAG00000003848 HOXA7 (ENSOJAG00000003886) hoxa5a (ENSOJAG00000003979) HOXA4 (ENSOJAG00000004001) hoxa3a (ENSOJAG00000004029) ENSOJAG00000004052 ##22 hoxa1a (ENSOJAG00000004073) snx10a (ENSOJAG00000004089) cbx3a (ENSOJAG00000004172) nfe2l3 (ENSOJAG00000004247) ##28 ENSOJAG00000004264 ENSOJAG00000004275 FKBP14 (ENSOJAG00000004301) ENSOJAG00000004313 oxnad1 (ENSOJAG00000004338) ENSOJAG00000004347 ENSOJAG00000004362 dazl (ENSOJAG00000004441) ENSOJAG00000004895 tbc1d5 (ENSOJAG00000005575) ENSOJAG00000006651 Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00940000155957.b ENSGT00940000161975 ENSGT00940000155261.b 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ENSGT00940000157858.j ENSGT00940000160267 ENSGT00760000119737 ENSGT00390000004280 ENSGT00530000063609.b.x ENSGT00530000063480.b ENSGT00940000154959.w ENSGT00940000154959.x.b ENSGT00940000155660.a Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000155957.b ENSGT00940000161975 ENSGT00940000155261.b ENSGT00390000003635.g ENSGT00950000183025.b.a.ab ENSGT00940000165581 ENSGT00940000159854 ENSGT00940000164071.b.b ENSGT00940000158311.a ENSGT00940000163268.d.a ENSGT00940000166648 ENSGT00940000161013 ENSGT00940000159894 ENSGT00940000158988.a.a ENSGT00940000159522 ENSGT00940000155029.c.a.f ##22 ENSGT00940000157315 ENSGT00940000156007.k ENSGT00940000153305 ENSGT00950000182892.a.b.b ##28 ENSGT00390000003271 ENSGT00960000188241 ENSGT00940000157248.c.b ENSGT00940000157858.j ENSGT00940000160267 ENSGT00760000119737 ENSGT00390000004280 ENSGT00530000063609.b.x ENSGT00530000063480.b ENSGT00940000154959.w ENSGT00940000155660.a Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000155957.b ENSGT00940000161975 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ENSMZEG00005009496 ENSMZEG00005009477 Eastern happy MODERN SPECIES 13 osbpl3a (ENSACLG00000001532) TRIL (ENSACLG00000001487) ENSACLG00000001476 jazf1a (ENSACLG00000001447) tax1bp1a (ENSACLG00000001428) hibadha (ENSACLG00000001395) evx1 (ENSACLG00000001390) hoxa13a (ENSACLG00000001370) hoxa11a (ENSACLG00000001279) hoxa10b (ENSACLG00000001266) ENSACLG00000001248 HOXA7 (ENSACLG00000001195) hoxa5a (ENSACLG00000001190) HOXA4 (ENSACLG00000001184) hoxa3a (ENSACLG00000001177) ENSACLG00000001166 ##22 hoxa1a (ENSACLG00000001107) SNX10 (ENSACLG00000000984) cbx3a (ENSACLG00000000964) snx10a (ENSACLG00000000942) cbx3a (ENSACLG00000000888) nfe2l3 (ENSACLG00000000873) ##28 ENSACLG00000000868 ENSACLG00000000794 COLQ (ENSACLG00000000784) FKBP14 (ENSACLG00000000687) ENSACLG00000000637 ENSACLG00000000633 oxnad1 (ENSACLG00000000611) ENSACLG00000000599 dazl (ENSACLG00000000529) Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 367 osbpl3a (ENSHBUG00000016525) TRIL (ENSHBUG00000016567) ENSHBUG00000000487 jazf1a 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(ENSACIG00000002201) snx10a (ENSACIG00000002122) cbx3a (ENSACIG00000002111) nfe2l3 (ENSACIG00000002095) ##28 ENSACIG00000002071 ENSACIG00000002046 FKBP14 (ENSACIG00000002030) ENSACIG00000001998 ENSACIG00000001986 oxnad1 (ENSACIG00000001969) ENSACIG00000001960 dazl (ENSACIG00000001931) DNAH3 (ENSACIG00000001775) ENSACIG00000001735 tbc1d5 (ENSACIG00000001681) Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000155957.b ENSGT00940000161975 ENSGT00940000155261.b ENSGT00390000003635.g ENSGT00950000183025.b.a.ab ENSGT00940000165581 ENSGT00940000159854 ENSGT00940000164071.b.b ENSGT00940000158311.a ENSGT00940000163268.d.a ENSGT00940000166648 ENSGT00940000161013 ENSGT00940000159894 ENSGT00940000158988.a.a ENSGT00940000159522 ENSGT00940000155029.c.a.f ##22 ENSGT00940000157315 ENSGT00940000156007.k ENSGT00940000153305 ENSGT00950000182892.a.b.b ##28 ENSGT01030000234992 ENSGT00940000157248.c.b ENSGT00940000157858.j ENSGT00940000160267 ENSGT00760000119737 ENSGT00390000004280 ENSGT00530000063609.b.x ENSGT00530000063480.b ENSGT00940000154959 ENSGT00940000155660.a ENSGT00940000157121 Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000155957.b ENSGT00940000161975 ENSGT00940000155261.b ENSGT00390000003635.g ENSGT00950000183025.b.a.ab ENSGT00940000165581 ENSGT00940000159854 ENSGT00940000164071.b.b ENSGT00940000158311.a ENSGT00940000163268.d.a ENSGT00940000166648 ENSGT00940000161013 ENSGT00940000159894 ENSGT00940000158988.a.a ENSGT00940000159522 ENSGT00940000155029.c.a.f ##22 ENSGT00940000157315 ENSGT00940000156007.k ENSGT00940000153305 ENSGT00950000182892.a.b.b ##28 ENSGT01030000234992 ENSGT00940000157248.c.b ENSGT00940000157858.j ENSGT00940000160267 ENSGT00760000119737 ENSGT00390000004280 ENSGT00530000063609.b.x ENSGT00530000063480.b ENSGT00940000154959 ENSGT00940000155660.a ENSGT00940000157121 Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000155957.b ENSGT00940000161975 ENSGT00940000155261.b ENSGT00390000003635.g ENSGT00950000183025.b.a.ab ENSGT00940000165581 ENSGT00940000159854 ENSGT00940000164071.b.b ENSGT00940000158311.a ENSGT00940000163268.d.a ENSGT00940000166648 ENSGT00940000161013 ENSGT00940000159894 ENSGT00940000158988.a.a ENSGT00940000159522 ENSGT00940000155029.c.a.f ##22 ENSGT00940000157315 ENSGT00940000156007.k ENSGT00940000153305 ENSGT00950000182892.a.b.b ##28 ENSGT01030000234992 ENSGT00940000157248.c.b ENSGT00940000157858.j ENSGT00940000160267 ENSGT00760000119737 ENSGT00390000004280 ENSGT00530000063609.b.x ENSGT00530000063480.b ENSGT00940000154959 ENSGT00940000155660.a ENSGT00940000157121 Orange clownfish MODERN SPECIES 8 TRIL (ENSAPEG00000019911) ENSAPEG00000019901 ENSAPEG00000019890 jazf1a (ENSAPEG00000019873) tax1bp1a (ENSAPEG00000019804) hibadha (ENSAPEG00000019757) evx1 (ENSAPEG00000019743) hoxa13a (ENSAPEG00000019685) hoxa11a (ENSAPEG00000019676) hoxa10b (ENSAPEG00000019646) ENSAPEG00000019634 HOXA7 (ENSAPEG00000019614) hoxa5a (ENSAPEG00000019578) HOXA4 (ENSAPEG00000019567) hoxa3a (ENSAPEG00000019555) ENSAPEG00000019539 ##22 hoxa1a (ENSAPEG00000019509) snx10a (ENSAPEG00000019361) cbx3a (ENSAPEG00000019335) nfe2l3 (ENSAPEG00000019329) ##28 ENSAPEG00000019310 ENSAPEG00000019301 COLQ (ENSAPEG00000019258) FKBP14 (ENSAPEG00000019236) ENSAPEG00000019216 ENSAPEG00000019182 oxnad1 (ENSAPEG00000019163) ENSAPEG00000019149 ENSAPEG00000019138 dazl (ENSAPEG00000019114) ENSAPEG00000019059 Clown anemonefish MODERN SPECIES 1052 osbpl3a (ENSAOCG00000021114) TRIL (ENSAOCG00000021002) ENSAOCG00000020977 jazf1a (ENSAOCG00000002494) tax1bp1a (ENSAOCG00000020906) hibadha (ENSAOCG00000020824) hoxa10b (ENSAOCG00000001942) evx1 (ENSAOCG00000020769) hoxa13a (ENSAOCG00000020728) hoxa11a (ENSAOCG00000020636) ENSAOCG00000020575 HOXA7 (ENSAOCG00000020541) hoxa5a (ENSAOCG00000020522) HOXA4 (ENSAOCG00000020516) hoxa3a (ENSAOCG00000020502) ENSAOCG00000020489 ##22 hoxa1a (ENSAOCG00000020470) Spiny chromis MODERN SPECIES 10 osbpl3a (ENSAPOG00000020643) TRIL (ENSAPOG00000020703) ENSAPOG00000020725 JAZF1 (ENSAPOG00000020760) tax1bp1a (ENSAPOG00000020841) hibadha (ENSAPOG00000020887) evx1 (ENSAPOG00000000596) hoxa13a (ENSAPOG00000021038) hoxa11a (ENSAPOG00000021108) hoxa10b (ENSAPOG00000021132) ENSAPOG00000021169 HOXA7 (ENSAPOG00000021207) hoxa5a (ENSAPOG00000021214) HOXA4 (ENSAPOG00000021221) hoxa3a (ENSAPOG00000021239) ENSAPOG00000021248 ##22 hoxa1a (ENSAPOG00000021294) Bicolor damselfish MODERN SPECIES 1727 tax1bp1a (ENSSPAG00000023369) hibadha (ENSSPAG00000000072) evx1 (ENSSPAG00000000089) hoxa13a (ENSSPAG00000000108) hoxa11a (ENSSPAG00000000114) hoxa10b (ENSSPAG00000000124) ENSSPAG00000000136 HOXA7 (ENSSPAG00000000170) hoxa5a (ENSSPAG00000000186) HOXA4 (ENSSPAG00000000194) hoxa3a (ENSSPAG00000000203) ENSSPAG00000000207 ##22 hoxa1a (ENSSPAG00000000269) Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000155957.b ENSGT00940000161975 ENSGT00940000155261.b ENSGT00390000003635.g ENSGT00950000183025.b.a.ab ENSGT00940000165581 ENSGT00940000159854 ENSGT00940000164071.b.b ENSGT00940000158311.a ENSGT00940000163268.d.a ENSGT00940000166648 ENSGT00940000161013 ENSGT00940000159894 ENSGT00940000158988.a.a ENSGT00940000159522 ENSGT00940000155029.c.a.f ##22 ENSGT00940000157315 ENSGT00940000156007.k ENSGT00940000153305 ENSGT00950000182892.a.b.b ##28 ENSGT00390000003271 ENSGT00940000157248.c.b ENSGT00940000157858.j ENSGT00940000160267 ENSGT00760000119737 ENSGT00390000004280 ENSGT00530000063609.b.x ENSGT00530000063480.b ENSGT00940000154959 ENSGT00940000155660.a ENSGT00940000157121 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000155957.b ENSGT00940000161975 ENSGT00940000155261.b ENSGT00390000003635.g ENSGT00950000183025.b.a.ab ENSGT00940000165581 ENSGT00940000159854 ENSGT00940000164071.b.b ENSGT00940000158311.a ENSGT00940000163268.d.a ENSGT00940000166648 ENSGT00940000161013 ENSGT00940000159894 ENSGT00940000158988.a.a ENSGT00940000159522 ENSGT00940000155029.c.a.f ##22 ENSGT00940000157315 ENSGT00940000156007.k ENSGT00940000153305 ENSGT00950000182892.a.b.b ##28 ENSGT00390000003271 ENSGT00940000157248.c.b ENSGT00940000157858.j ENSGT00940000160267 ENSGT00760000119737 ENSGT00390000004280 ENSGT00530000063609.b.x ENSGT00530000063480.b ENSGT00940000154959 ENSGT00940000155660.a ENSGT00940000157121 Carangaria ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000155957.b ENSGT00940000161975 ENSGT00940000155261.b ENSGT00390000003635.g ENSGT00950000183025.b.a.ab ENSGT00940000165581 ENSGT00940000159854 ENSGT00940000164071.b.b ENSGT00940000158311.a ENSGT00940000163268.d.a ENSGT00940000166648 ENSGT00940000161013 ENSGT00940000159894 ENSGT00940000158988.a.a ENSGT00940000159522 ENSGT00940000155029.c.a.f ##22 ENSGT00940000157315 ENSGT00940000156007.k ENSGT00940000153305 ENSGT00950000182892.a.b.b ##28 ENSGT01030000234992 ENSGT00940000157248.c.b ENSGT00940000157858.j ENSGT00940000160267 ENSGT00760000119737 ENSGT00390000004280 ENSGT00530000063609.b.x ENSGT00530000063480.b ENSGT00940000154959 ENSGT00940000155660.a ENSGT00940000157121 Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000155957.b ENSGT00940000161975 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(ENSSLDG00000005261) ENSSLDG00000005024 Barramundi perch MODERN SPECIES 3 TRIL (ENSLCAG00010016586) ENSLCAG00010016589 jazf1a (ENSLCAG00010016593) tax1bp1a (ENSLCAG00010016597) ENSLCAG00010016602 hibadha (ENSLCAG00010016611) evx1 (ENSLCAG00010016651) hoxa13a (ENSLCAG00010016654) hoxa11a (ENSLCAG00010016655) hoxa10b (ENSLCAG00010016658) ENSLCAG00010016661 HOXA7 (ENSLCAG00010016662) hoxa5a (ENSLCAG00010016664) HOXA4 (ENSLCAG00010016671) hoxa3a (ENSLCAG00010016667) ENSLCAG00010016673 ##22 hoxa1a (ENSLCAG00010016677) snx10a (ENSLCAG00010016683) cbx3a (ENSLCAG00010016686) nfe2l3 (ENSLCAG00010016699) ##28 ENSLCAG00010016700 ENSLCAG00010016702 COLQ (ENSLCAG00010016703) FKBP14 (ENSLCAG00010016709) ENSLCAG00010016711 ENSLCAG00010016719 oxnad1 (ENSLCAG00010016722) ENSLCAG00010016725 dazl (ENSLCAG00010016730) DNAH3 (ENSLCAG00010016780) ENSLCAG00010016925 Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000155957.b ENSGT00940000161975 ENSGT00940000155261.b ENSGT00390000003635.g 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ENSSMAG00000014822 ENSSMAG00000014800 ENSSMAG00000014788 ENSSMAG00000014778 ENSSMAG00000014767 oxnad1 (ENSSMAG00000014752) ENSSMAG00000014721 dazl (ENSSMAG00000014694) ENSSMAG00000036740 Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000155957.b ENSGT00940000161975 ENSGT00940000155261.b ENSGT00390000003635.g ENSGT00950000183025.b.a.ab ENSGT00940000165581 ENSGT00940000159854 ENSGT00940000164071.b.b ENSGT00940000158311.a ENSGT00940000163268.d.a ENSGT00940000166648 ENSGT00940000161013 ENSGT00940000159894 ENSGT00940000158988.a.a ENSGT00940000159522 ENSGT00940000155029.c.a.f ##22 ENSGT00940000157315 ENSGT00940000156007.k ENSGT00940000153305 ENSGT00950000182892.a.b.b ##28 ENSGT00390000003271 ENSGT00940000157248.c.b ENSGT00940000157858.j ENSGT00940000160267 ENSGT00760000119737 ENSGT00390000004280 ENSGT00530000063609.b.x ENSGT00530000063480.b ENSGT00940000154959 ENSGT00940000155660.a ENSGT00940000157121 Zig-zag eel MODERN SPECIES 2 TRIL (ENSMAMG00000007728) ENSMAMG00000007742 JAZF1 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ENSGT00940000158988.a.a ENSGT00940000159522 ENSGT00940000155029.c.a.f ##22 ENSGT00940000157315 ENSGT00940000156007.k ENSGT00940000153305 ENSGT00950000182892.a.b.b ##28 ENSGT00390000003271 ENSGT00940000157248.c.b ENSGT00940000157858.j ENSGT00940000160267 ENSGT00760000119737 ENSGT00390000004280 ENSGT00530000063609.b.x ENSGT00530000063480.b ENSGT00940000154959 ENSGT00940000155660.a ENSGT00940000157121 Climbing perch MODERN SPECIES 2 ENSATEG00000002213 ENSATEG00000002124 TRIL (ENSATEG00000029886) ENSATEG00000002087 JAZF1 (ENSATEG00000002071) tax1bp1a (ENSATEG00000002002) hibadha (ENSATEG00000001998) evx1 (ENSATEG00000001945) ENSATEG00000026862 hoxa11a (ENSATEG00000001926) ENSATEG00000001918 ENSATEG00000001859 hoxa5a (ENSATEG00000001828) HOXA4 (ENSATEG00000028592) HOXA3 (ENSATEG00000001808) ENSATEG00000001763 ##22 HOXA1 (ENSATEG00000001717) snx10a (ENSATEG00000001661) CBX3 (ENSATEG00000001629) nfe2l3 (ENSATEG00000001620) ##28 ENSATEG00000001574 ENSATEG00000001525 ENSATEG00000001514 ENSATEG00000001464 ENSATEG00000001434 oxnad1 (ENSATEG00000001424) ENSATEG00000001396 ENSATEG00000001386 dazl (ENSATEG00000001349) ENSATEG00000027399 ENSATEG00000001204 Siamese fighting fish MODERN SPECIES 2 nup42 (ENSBSLG00000009916) ENSBSLG00000009937 osbpl3a (ENSBSLG00000009971) TRIL (ENSBSLG00000010166) jazf1a (ENSBSLG00000010180) tax1bp1a (ENSBSLG00000010674) hibadha (ENSBSLG00000010856) ENSBSLG00000011586 evx1 (ENSBSLG00000011641) hoxa13a (ENSBSLG00000011697) hoxa11a (ENSBSLG00000011737) HOXA7 (ENSBSLG00000011758) hoxa5a (ENSBSLG00000011797) HOXA4 (ENSBSLG00000011815) hoxa3a (ENSBSLG00000011839) ENSBSLG00000011861 ##22 hoxa1a (ENSBSLG00000011877) snx10a (ENSBSLG00000011898) cbx3a (ENSBSLG00000011919) nfe2l3 (ENSBSLG00000012036) ##28 ENSBSLG00000012060 ENSBSLG00000012090 FKBP14 (ENSBSLG00000012125) ENSBSLG00000012133 ENSBSLG00000012157 oxnad1 (ENSBSLG00000012170) ENSBSLG00000012189 dazl (ENSBSLG00000012205) DNAH3 (ENSBSLG00000012261) ENSBSLG00000012668 tbc1d5 (ENSBSLG00000012727) Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000155957.b ENSGT00940000161975 ENSGT00940000155261.b ENSGT00390000003635.g ENSGT00950000183025.b.a.ab ENSGT00940000165581 ENSGT00940000159854 ENSGT00940000164071.b.b ENSGT00940000158311.a ENSGT00940000163268.d.a ENSGT00940000166648 ENSGT00940000161013 ENSGT00940000159894 ENSGT00940000158988.a.a ENSGT00940000159522 ENSGT00940000155029.c.a.f ##22 ENSGT00940000157315 ENSGT00940000156007.k ENSGT00940000153305 ENSGT00950000182892.a.b.b ##28 ENSGT00390000003271 ENSGT00940000157248.c.b ENSGT00940000157858.j ENSGT00940000160267 ENSGT00760000119737 ENSGT00390000004280 ENSGT00530000063609.b.x ENSGT00530000063480.b ENSGT00940000154959 ENSGT00940000155660.a ENSGT00940000157121 Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000155880.f ENSGT00940000155957.b ENSGT00940000156906.j.b ENSGT00940000155261.b ENSGT00390000003635.g ENSGT00950000183025.b.a.ab ENSGT00940000165581 ENSGT00940000159854 ENSGT00940000164071.b.b ENSGT00940000158311.a ENSGT00940000163268.d.a ENSGT00940000166648 ENSGT00940000159894 ENSGT00940000158988.a.a ENSGT00940000159522 ENSGT00940000155029.c.a.f ##22 ENSGT00940000157315 ENSGT00940000156007.k ENSGT00940000153305 ENSGT00950000182892.a.b.b ##28 ENSGT00390000003271 ENSGT00940000157248.c.b ENSGT00940000157858.j ENSGT00940000160267 ENSGT00760000119737 ENSGT00390000004280 ENSGT00530000063609.b.x ENSGT00530000063480.b ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00940000154383.a Tetraodon MODERN SPECIES 15 ENSTNIG00000000830 osbpl3a (ENSTNIG00000009202) ENSTNIG00000000262 ENSTNIG00000009203 jazf1a (ENSTNIG00000009204) tax1bp1a (ENSTNIG00000009205) hibadha (ENSTNIG00000009206) evx1 (ENSTNIG00000000875) hoxa13a (ENSTNIG00000009207) hoxa11a (ENSTNIG00000001767) hoxa10b (ENSTNIG00000001766) ENSTNIG00000001582 hoxa5a (ENSTNIG00000001756) HOXA4 (ENSTNIG00000001755) hoxa3a (ENSTNIG00000001754) ENSTNIG00000001753 ##22 hoxa1a (ENSTNIG00000000977) snx10a (ENSTNIG00000009208) cbx3a (ENSTNIG00000001200) nfe2l3 (ENSTNIG00000009209) ##28 ENSTNIG00000009210 FKBP14 (ENSTNIG00000009211) oxnad1 (ENSTNIG00000009212) ENSTNIG00000009213 dazl (ENSTNIG00000001115) trappc3 (ENSTNIG00000009214) col8a2 (ENSTNIG00000009215) ptp4a2b (ENSTNIG00000001611) ENSTNIG00000001705 ENSTNIG00000009216 ENSTNIG00000000175 Fugu MODERN SPECIES 3 osbpl3a (ENSTRUG00000018171) ENSTRUG00000018191 ENSTRUG00000027270 ENSTRUG00000031997 Jazf1a (ENSTRUG00000028050) tax1bp1a (ENSTRUG00000027936) hibadha (ENSTRUG00000023488) Evx1 (ENSTRUG00000020143) hoxa13a (ENSTRUG00000016010) hoxa11a (ENSTRUG00000020015) hoxa10b (ENSTRUG00000015981) ENSTRUG00000015974 hoxa5a (ENSTRUG00000018252) hoxa3a (ENSTRUG00000022811) HOXA4 (ENSTRUG00000023173) ENSTRUG00000015941 ##22 hoxa1a (ENSTRUG00000015937) snx10a (ENSTRUG00000015910) cbx3a (ENSTRUG00000015895) nfe2l3 (ENSTRUG00000015857) ##28 rfrp (ENSTRUG00000015852) ENSTRUG00000024909 ENSTRUG00000015831 FKBP14 (ENSTRUG00000021578) ENSTRUG00000015805 ENSTRUG00000020614 oxnad1 (ENSTRUG00000015784) dazl (ENSTRUG00000015745) trappc3 (ENSTRUG00000015734) col8a2 (ENSTRUG00000024438) ptp4a2b (ENSTRUG00000015716) Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000155957.b ENSGT00940000161975 ENSGT00940000155261.b ENSGT00390000003635.g ENSGT00950000183025.b.a.ab ENSGT00940000165581 ENSGT00940000159854 ENSGT00940000164071.b.b ENSGT00940000158311.a ENSGT00940000163268.d.a ENSGT00940000166648 ENSGT00940000161013 ENSGT00940000159894 ENSGT00940000158988.a.a ENSGT00940000159522 ENSGT00940000155029.c.a.f ##22 ENSGT00940000157315 ENSGT00940000156007.k ENSGT00940000153305 ENSGT00950000182892.a.b.b ##28 ENSGT00390000003271 ENSGT00940000157248.c.b ENSGT00940000157858.j ENSGT00940000160267 ENSGT00760000119737 ENSGT00390000004280 ENSGT00530000063609.b.x ENSGT00530000063480.b ENSGT00940000154959 ENSGT00940000155660.a ENSGT00940000157121 Ballan wrasse MODERN SPECIES 172 osbpl3a (ENSLBEG00000002210) TRIL (ENSLBEG00000002179) ENSLBEG00000002154 jazf1a (ENSLBEG00000002120) tax1bp1a (ENSLBEG00000002045) hibadha (ENSLBEG00000002000) evx1 (ENSLBEG00000001985) hoxa13a (ENSLBEG00000001862) hoxa11a (ENSLBEG00000001844) hoxa10b (ENSLBEG00000001831) ENSLBEG00000001814 HOXA7 (ENSLBEG00000001798) hoxa5a (ENSLBEG00000001723) HOXA4 (ENSLBEG00000001673) hoxa3a (ENSLBEG00000001651) ENSLBEG00000001637 ##22 hoxa1a (ENSLBEG00000001584) Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000155957.b ENSGT00940000161975 ENSGT00940000155261.b ENSGT00390000003635.g ENSGT00950000183025.b.a.ab ENSGT00940000165581 ENSGT00940000159854 ENSGT00940000164071.b.b ENSGT00940000158311.a ENSGT00940000163268.d.a ENSGT00940000166648 ENSGT00940000161013 ENSGT00940000159894 ENSGT00940000158988.a.a ENSGT00940000159522 ENSGT00940000155029.c.a.f ##22 ENSGT00940000157315 ENSGT00940000156007.k ENSGT00940000153305 ENSGT00950000182892.a.b.b ##28 ENSGT00390000003271 ENSGT00940000157248.c.b ENSGT00940000157858.j ENSGT00940000160267 ENSGT00760000119737 ENSGT00390000004280 ENSGT00530000063609.b.x ENSGT00530000063480.b ENSGT00940000154959 ENSGT00940000155660.a ENSGT00940000157121 Perciformes ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000155957.b ENSGT00940000161975 ENSGT00940000155261.b ENSGT00390000003635.g ENSGT00950000183025.b.a.ab ENSGT00940000165581 ENSGT00940000159854 ENSGT00940000164071.b.b ENSGT00940000158311.a ENSGT00940000163268.d.a ENSGT00940000166648 ENSGT00940000161013 ENSGT00940000159894 ENSGT00940000158988.a.a ENSGT00940000159522 ENSGT00940000155029.c.a.f ##22 ENSGT00940000157315 ENSGT00940000156007.k ENSGT00940000153305 ENSGT00950000182892.a.b.b ##28 ENSGT01030000234992 ENSGT00940000157248.c.b ENSGT00940000157858.j ENSGT00940000160267 ENSGT00760000119737 ENSGT00390000004280 ENSGT00530000063609.b.x ENSGT00530000063480.b ENSGT00940000154959 ENSGT00940000155660.a ENSGT00940000157121 Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000155957.b ENSGT00940000161975 ENSGT00940000155261.b ENSGT00390000003635.g ENSGT00950000183025.b.a.ab ENSGT00940000165581 ENSGT00940000159854 ENSGT00940000164071.b.b ENSGT00940000158311.a ENSGT00940000163268.d.a ENSGT00940000166648 ENSGT00940000161013 ENSGT00940000159894 ENSGT00940000158988.a.a ENSGT00940000159522 ENSGT00940000155029.c.a.f ##22 ENSGT00940000157315 ENSGT00940000156007.k ENSGT00940000153305 ENSGT00950000182892.a.b.b ##28 ENSGT01030000234992 ENSGT00940000157248.c.b ENSGT00940000157858.j ENSGT00940000160267 ENSGT00760000119737 ENSGT00390000004280 ENSGT00530000063609.b.x ENSGT00530000063480.b ENSGT00940000154959 ENSGT00940000155660.a ENSGT00940000157121 Pike perch MODERN SPECIES 41 osbpl3a (ENSSLUG00000009717) TRIL (ENSSLUG00000010971) ENSSLUG00000010975 jazf1a (ENSSLUG00000010981) tax1bp1a (ENSSLUG00000011017) hibadha (ENSSLUG00000011037) evx1 (ENSSLUG00000011184) hoxa13a (ENSSLUG00000011191) hoxa11a (ENSSLUG00000011196) ENSSLUG00000011201 ENSSLUG00000011207 HOXA7 (ENSSLUG00000011211) hoxa5a (ENSSLUG00000011216) HOXA4 (ENSSLUG00000011218) hoxa3a (ENSSLUG00000011219) ENSSLUG00000011223 ##22 hoxa1a (ENSSLUG00000011224) snx10a (ENSSLUG00000011232) cbx3a (ENSSLUG00000011259) nfe2l3 (ENSSLUG00000011266) ##28 ENSSLUG00000011269 ENSSLUG00000011273 COLQ (ENSSLUG00000011276) FKBP14 (ENSSLUG00000011283) ENSSLUG00000011287 ENSSLUG00000011290 oxnad1 (ENSSLUG00000011292) ENSSLUG00000011298 dazl (ENSSLUG00000011304) DNAH3 (ENSSLUG00000011601) ENSSLUG00000014304 Channel bull blenny MODERN SPECIES 2 osbpl3a (ENSCGOG00000001403) TRIL (ENSCGOG00000002306) ENSCGOG00000002307 jazf1a (ENSCGOG00000002320) tax1bp1a (ENSCGOG00000002329) hibadha (ENSCGOG00000002339) evx1 (ENSCGOG00000002366) hoxa13a (ENSCGOG00000002368) hoxa11a (ENSCGOG00000002371) hoxa10b (ENSCGOG00000002380) ENSCGOG00000002392 HOXA7 (ENSCGOG00000002396) hoxa5a (ENSCGOG00000002402) HOXA4 (ENSCGOG00000002403) hoxa3a (ENSCGOG00000002407) ENSCGOG00000002408 ##22 hoxa1a (ENSCGOG00000002411) snx10a (ENSCGOG00000002413) cbx3a (ENSCGOG00000002431) nfe2l3 (ENSCGOG00000002472) ##28 ENSCGOG00000002473 ENSCGOG00000002478 COLQ (ENSCGOG00000002481) FKBP14 (ENSCGOG00000002494) ENSCGOG00000002489 ENSCGOG00000002497 oxnad1 (ENSCGOG00000002500) ENSCGOG00000002501 ENSCGOG00000002503 dazl (ENSCGOG00000002506) ENSCGOG00000002511 Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000155957.b ENSGT00940000161975 ENSGT00940000155261.b ENSGT00390000003635.g ENSGT00950000183025.b.a.ab ENSGT00940000165581 ENSGT00940000159854 ENSGT00940000164071.b.b ENSGT00940000158311.a ENSGT00940000163268.d.a ENSGT00940000166648 ENSGT00940000161013 ENSGT00940000159894 ENSGT00940000158988.a.a ENSGT00940000159522 ENSGT00940000155029.c.a.f ##22 ENSGT00940000157315 ENSGT00940000156007.k ENSGT00940000153305 ENSGT00950000182892.a.b.b ##28 ENSGT00390000003271 ENSGT00940000157248.c.b ENSGT00940000157858.j ENSGT00940000160267 ENSGT00760000119737 ENSGT00390000004280 ENSGT00530000063609.b.x ENSGT00530000063480.b ENSGT00940000154959 ENSGT00940000155660.a ENSGT00940000157121 Stickleback MODERN SPECIES 9 osbpl3a (ENSGACG00000007208) TRIL (ENSGACG00000007203) ENSGACG00000007196 jazf1a (ENSGACG00000007192) tax1bp1a (ENSGACG00000007180) hibadha (ENSGACG00000007155) evx1 (ENSGACG00000007148) hoxa13a (ENSGACG00000007134) hoxa11a (ENSGACG00000007132) hoxa10b (ENSGACG00000007128) ENSGACG00000007123 HOXA7 (ENSGACG00000007112) hoxa5a (ENSGACG00000007108) HOXA4 (ENSGACG00000007100) hoxa3a (ENSGACG00000007094) ENSGACG00000007090 ##22 hoxa1a (ENSGACG00000007085) snx10a (ENSGACG00000007074) cbx3a (ENSGACG00000007069) nfe2l3 (ENSGACG00000007066) ##28 cycsb (ENSGACG00000007058) ENSGACG00000007049 FKBP14 (ENSGACG00000007031) ENSGACG00000007025 ENSGACG00000007024 oxnad1 (ENSGACG00000007010) ENSGACG00000007006 dazl (ENSGACG00000007001) ENSGACG00000006993 ENSGACG00000006988 tbc1d5 (ENSGACG00000006967) Lumpfish MODERN SPECIES 2 ENSCLMG00005020357 osbpl3a (ENSCLMG00005020227) TRIL (ENSCLMG00005020211) ENSCLMG00005020208 jazf1a (ENSCLMG00005020199) tax1bp1a (ENSCLMG00005020195) hibadha (ENSCLMG00005020131) evx1 (ENSCLMG00005020130) hoxa13a (ENSCLMG00005020129) hoxa11a (ENSCLMG00005020127) ENSCLMG00005020123 ENSCLMG00005020119 hoxa5a (ENSCLMG00005020117) HOXA4 (ENSCLMG00005020116) hoxa3a (ENSCLMG00005020115) ENSCLMG00005020113 ##22 hoxa1a (ENSCLMG00005020112) snx10a (ENSCLMG00005020105) cbx3a (ENSCLMG00005020104) nfe2l3 (ENSCLMG00005020103) ##28 ENSCLMG00005020102 ENSCLMG00005020101 ENSCLMG00005020100 FKBP14 (ENSCLMG00005020097) ENSCLMG00005020096 ENSCLMG00005020092 oxnad1 (ENSCLMG00005020091) ENSCLMG00005020090 dazl (ENSCLMG00005020089) ENSCLMG00005020085 ENSCLMG00005020080 Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000155957.b ENSGT00940000161975 ENSGT00940000155261.b ENSGT00390000003635.g ENSGT00950000183025.b.a.ab ENSGT00940000165581 ENSGT00940000159854 ENSGT00940000164071.b.b ENSGT00940000158311.a ENSGT00940000163268.d.a ENSGT00940000166648 ENSGT00940000161013 ENSGT00940000159894 ENSGT00940000158988.a.a ENSGT00940000159522 ENSGT00940000155029.c.a.f ##22 ENSGT00940000157315 ENSGT00940000156007.k ENSGT00940000153305 ENSGT00950000182892.a.b.b ##28 ENSGT00390000003271 ENSGT00940000157248.c.b ENSGT00940000157858.j ENSGT00940000160267 ENSGT00760000119737 ENSGT00390000004280 ENSGT00530000063609.b.x ENSGT00530000063480.b ENSGT00940000154959 ENSGT00940000155660.a ENSGT00940000157121 Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000155957.b ENSGT00940000161975 ENSGT00940000155261.b ENSGT00390000003635.g ENSGT00950000183025.b.a.ab ENSGT00940000165581 ENSGT00940000159854 ENSGT00940000164071.b.b ENSGT00940000158311.a ENSGT00940000163268.d.a ENSGT00940000166648 ENSGT00940000161013 ENSGT00940000159894 ENSGT00940000158988.a.a ENSGT00940000159522 ENSGT00940000155029.c.a.f ##22 ENSGT00940000157315 ENSGT00940000156007.k ENSGT00940000153305 ENSGT00950000182892.a.b.b ##28 ENSGT00390000003271 ENSGT00940000157248.c.b ENSGT00940000157858.j ENSGT00940000160267 ENSGT00760000119737 ENSGT00390000004280 ENSGT00530000063609.b.x ENSGT00530000063480.b ENSGT00940000154959 ENSGT00940000155660.a ENSGT00940000157121 Large yellow croaker MODERN SPECIES 484 osbpl3a (ENSLCRG00005008414) TRIL (ENSLCRG00005008796) ENSLCRG00005008798 jazf1a (ENSLCRG00005008799) tax1bp1a (ENSLCRG00005008801) hibadha (ENSLCRG00005008807) evx1 (ENSLCRG00005008873) hoxa13a (ENSLCRG00005008874) hoxa11a (ENSLCRG00005008876) ENSLCRG00005008877 ENSLCRG00005008882 HOXA7 (ENSLCRG00005008884) hoxa5a (ENSLCRG00005008888) HOXA4 (ENSLCRG00005008891) hoxa3a (ENSLCRG00005008893) ENSLCRG00005008895 ##22 hoxa1a (ENSLCRG00005008896) snx10a (ENSLCRG00005008897) cbx3a (ENSLCRG00005008899) nfe2l3 (ENSLCRG00005008904) ##28 ENSLCRG00005008906 ENSLCRG00005008907 COLQ (ENSLCRG00005008908) FKBP14 (ENSLCRG00005008910) ENSLCRG00005008912 ENSLCRG00005008913 oxnad1 (ENSLCRG00005008916) ENSLCRG00005008917 dazl (ENSLCRG00005008918) DNAH3 (ENSLCRG00005008939) ENSLCRG00005011199 Gilthead seabream MODERN SPECIES 17 osbpl3a (ENSSAUG00010023135) TRIL (ENSSAUG00010023131) ENSSAUG00010023129 jazf1a (ENSSAUG00010023128) tax1bp1a (ENSSAUG00010023127) hibadha (ENSSAUG00010023125) evx1 (ENSSAUG00010023124) hoxa13a (ENSSAUG00010023123) hoxa11a (ENSSAUG00010023122) hoxa10b (ENSSAUG00010023121) ENSSAUG00010023119 HOXA7 (ENSSAUG00010023118) hoxa5a (ENSSAUG00010023117) HOXA4 (ENSSAUG00010023116) hoxa3a (ENSSAUG00010023115) ENSSAUG00010023114 ##22 hoxa1a (ENSSAUG00010023113) snx10a (ENSSAUG00010023111) cbx3a (ENSSAUG00010023110) nfe2l3 (ENSSAUG00010023109) ##28 ENSSAUG00010023108 ENSSAUG00010023107 ENSSAUG00010023106 FKBP14 (ENSSAUG00010023105) ENSSAUG00010023104 ENSSAUG00010023103 oxnad1 (ENSSAUG00010023102) ENSSAUG00010023101 dazl (ENSSAUG00010023098) DNAH3 (ENSSAUG00010023021) ENSSAUG00010022956 Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 99 osbpl3a (ENSHCOG00000016386) TRIL (ENSHCOG00000016402) ENSHCOG00000016476 ENSHCOG00000016502 jazf1a (ENSHCOG00000016517) tax1bp1a (ENSHCOG00000016543) hibadha (ENSHCOG00000016567) evx1 (ENSHCOG00000016584) hoxa13a (ENSHCOG00000016646) hoxa11a (ENSHCOG00000016652) hoxa10b (ENSHCOG00000016663) ENSHCOG00000016667 hoxa5a (ENSHCOG00000000757) HOXA4 (ENSHCOG00000016701) hoxa3a (ENSHCOG00000016709) ENSHCOG00000016712 ##22 hoxa1a (ENSHCOG00000016729) Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 2 osbpl3a (ENSMMDG00005001447) TRIL (ENSMMDG00005001342) ENSMMDG00005001324 jazf1a (ENSMMDG00005001312) tax1bp1a (ENSMMDG00005001294) hibadha (ENSMMDG00005001180) evx1 (ENSMMDG00005001159) hoxa13a (ENSMMDG00005001155) hoxa11a (ENSMMDG00005023116) ENSMMDG00005023114 ENSMMDG00005023112 HOXA7 (ENSMMDG00005023109) hoxa5a (ENSMMDG00005023106) HOXA4 (ENSMMDG00005023105) hoxa3a (ENSMMDG00005023103) ENSMMDG00005023102 ##22 hoxa1a (ENSMMDG00005023101) snx10a (ENSMMDG00005023096) cbx3a (ENSMMDG00005023091) nfe2l3 (ENSMMDG00005023087) ##28 ENSMMDG00005023084 ENSMMDG00005023083 ENSMMDG00005023076 FKBP14 (ENSMMDG00005023075) ENSMMDG00005023073 ENSMMDG00005023071 ENSMMDG00005023069 ENSMMDG00005023066 satb1a (ENSMMDG00005023062) tbc1d5 (ENSMMDG00005022004) ENSMMDG00005021849 Cod MODERN SPECIES 14 ENSGMOG00000035459 ENSGMOG00000014090 TRIL (ENSGMOG00000026639) 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ENSECRG00000021680 hoxa9a (ENSECRG00000021687) hoxa5a (ENSECRG00000021709) HOXA4 (ENSECRG00000021734) hoxa3a (ENSECRG00000021756) hoxa2b (ENSECRG00000021769) ##22 hoxa1a (ENSECRG00000021786) skap2 (ENSECRG00000021805) ##25 snx10b (ENSECRG00000021839) CBX3 (ENSECRG00000021859) cbx3a (ENSECRG00000021891) ENSECRG00000021926 ##28 ENSECRG00000021933 ##28 ENSECRG00000021937 C7orf31 (ENSECRG00000021970) osbpl3a (ENSECRG00000022016) GSDME (ENSECRG00000022034) pals2a (ENSECRG00000022043) ENSECRG00000022070 npy (ENSECRG00000022082) fam221a (ENSECRG00000022092) Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000160027 ENSGT00940000155029.d ##22 ENSGT00940000159522 ENSGT00940000155029.c.a ##22 ENSGT00940000157315 ENSGT00950000182919.C ENSGT00940000154808.a.a ENSGT00950000182892.a.a.b ##28 ENSGT00940000156112 ENSGT00940000164264 ENSGT00940000157883.a.b.e.a ENSGT00680000100059 ENSGT00940000156791 ENSGT00940000157618 ENSGT00950000183140.a.b ENSGT00940000159964 ENSGT00940000155850 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000004153 ENSGT00910000144296 ENSGT00940000156851 ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.b ENSGT00940000156582 ENSGT00940000154298.a.a ENSGT00390000001859 ENSGT00940000161025 ENSGT00940000161457 ENSGT00940000159938 ENSGT00940000161308 ENSGT00940000158266 ENSGT00940000161503 ENSGT00940000157270 ENSGT00940000160027 ENSGT00940000155029.d ##22 ENSGT00940000155029.c.a ##22 ENSGT00940000157315 ENSGT00950000182919.C ENSGT00940000154808.a.a ENSGT00940000153147 ENSGT00950000182892.a.a.b ##28 ENSGT00940000156112 ENSGT00940000164264 ENSGT00940000157883.a.b.e.a ENSGT00680000100059 ENSGT00940000156791 ENSGT00940000157618 ENSGT00950000183140.a.b ENSGT00940000159964 ENSGT00940000155850 Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000004153 ENSGT00910000144296 ENSGT00940000156851 ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.b ENSGT00940000156582 ENSGT00940000154298.a.a ENSGT00390000001859 ENSGT00940000161025 ENSGT00940000161457 ENSGT00940000159938 ENSGT00940000161308 ENSGT00940000158266 ENSGT00940000161503 ENSGT00940000157270 ENSGT00940000160027 ENSGT00940000155029.d ##22 ENSGT00940000155029.c.a ##22 ENSGT00940000157315 ENSGT00950000182919.C ENSGT00940000154808.a.a ENSGT00950000182892.a.a.b ##28 ENSGT00940000156112 ENSGT00940000164264 ENSGT00940000157883.a.b.e.a ENSGT00680000100059 ENSGT00940000156791 ENSGT00940000157618 ENSGT00940000158361 ENSGT00390000015818 ENSGT00940000160909 ENSGT00390000005923 Neopterygii ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000004153 ENSGT00910000144296 ENSGT00940000156851 ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.b ENSGT00940000156582 ENSGT00940000157981.a.a.b ENSGT00390000001859 ENSGT00940000161025 ENSGT00940000161457 ENSGT00940000159938 ENSGT00940000161308 ENSGT00940000158266 ENSGT00940000161503 ENSGT00940000157270 ENSGT00940000160027 ENSGT00940000155029.d ##22 ENSGT00950000182919.C ENSGT00940000154808.a.a ENSGT00950000182892.a.a.b ##28 ENSGT00940000156112 ENSGT00940000164264 ENSGT00940000157883.a.b.e.a ENSGT00680000100059 ENSGT00940000156791 ENSGT00940000157618 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