Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000160770.B.b.a ENSGT00960000186612.B.a.b.a.b.a.b ##8 ENSGT00960000186612.B.a.b.a.b.a.a.a.b #9 ENSGT00960000186612.B.a.b.a.b.a.a.a.a.a.a #8 ENSGT00940000162449 #14 ENSGT00940000163298 #15 ENSGT00940000162748 #17 ENSGT00940000163119 #18 ENSGT00940000162851 #19 ENSGT00950000183066.a.a.a ENSGT01020000230438.B.b.b.b.c.a #20 ENSGT01020000230438.B.b.b.b.c.b #21 ENSGT00390000010337.A #22 ENSGT00390000009010 #23 ENSGT01080000257333.C #24 ENSGT00390000001041 ENSGT01080000257333.A.a.b.a.b.a.a.a ##24 ENSGT01100000263479.D.b ENSGT00940000164072 ENSGT00940000163075 ENSGT01080000257333.A.a.b.a.b.b.a.a ##24 ENSGT01080000257333.A.a.b.b ##24 ENSGT01080000257333.A.a.a #27 ENSGT00660000097488 #28 ENSGT01050000244814.a.a.b.b.b.a.a #29 ENSGT01050000244814.a.a.b.b.a.a #30 ENSGT01050000244814.a.a.b.b.a.b #31 ENSGT00390000009936 #32 Glires ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000160770.B.b.a ENSGT00960000186612.B.a.b.a.b.a.b.j ##8 ENSGT00960000186612.B.a.b.a.b.a.a.a.b #9 ENSGT00960000186612.B.a.b.a.b.a.a.a.a.a.a #8 ENSGT00940000162449 #14 ENSGT00940000163298 #15 ENSGT00940000162748 #17 ENSGT00940000163119 #18 ENSGT00940000162851 #19 ENSGT00950000183066.a.a.a ENSGT00960000186612.B.a.a.d ##8 ENSGT01020000230438.B.b.b.b.c.a #20 ENSGT01020000230438.B.b.b.b.c.b #21 ENSGT00390000010337.A #22 ENSGT00390000009010 #23 ENSGT01080000257333.C #24 ENSGT00390000001041 ENSGT01080000257333.A.a.b.a.b.a.a.a ##24 ENSGT01100000263479.D.b ENSGT00940000164072 ENSGT00940000163075 ENSGT01080000257333.A.a.b.a.b.b.a.a ##24 ENSGT01080000257333.A.a.b.b ##24 ENSGT01080000257333.A.a.a #27 ENSGT00660000097488 #28 ENSGT01050000244814.a.a.b.b.b.a.a #29 ENSGT01050000244814.a.a.b.b.a.a #30 ENSGT01050000244814.a.a.b.b.a.b #31 ENSGT00390000009936 #32 Rodentia ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00950000183066.a.a.a ENSGT00940000163064 ENSGT00940000162898 ENSGT00940000163909 ENSGT00940000162284 ENSGT00940000163218 ENSGT00960000186612.B.a.a.d ##8 ENSGT01020000230438.B.b.b.b.c.a #20 ENSGT01020000230438.B.b.b.b.c.b #21 ENSGT00390000010337.A #22 ENSGT01070000254759 ENSGT01080000257333.A.a.b.a.b.a.b #25 ENSGT01080000257333.A.a.a #27 ENSGT00660000097488 #28 ENSGT01050000244814.a.a.b.b.b.a.a #29 ENSGT01050000244814.a.a.b.b.a.a #30 ENSGT01050000244814.a.a.b.b.a.b #31 ENSGT00390000009936 #32 ENSGT00940000162314 #33 ENSGT00940000160467 #34 ENSGT01080000257333.A.b #35 ENSGT01080000257333.A.a.b.b ##24 ENSGT01080000257333.A.a.b.a.b.b.a.a ##24 ENSGT00940000163075 ENSGT00940000164072 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00960000186612.B.a.b.a.b.a.b.j ##8 ENSGT00960000186612.B.a.b.a.b.a.a.a.b #9 ENSGT00960000186612.B.a.b.a.b.a.a.a.a.a.a #8 ENSGT00940000162449 #14 ENSGT00940000163298 #15 ENSGT00940000162748 #17 ENSGT00940000163119 #18 ENSGT00940000162851 #19 ENSGT00950000183066.a.a.a ENSGT00960000186612.B.a.a.d ##8 ENSGT01020000230438.B.b.b.b.c.a #20 ENSGT01020000230438.B.b.b.b.c.b #21 ENSGT00390000010337.A #22 ENSGT01070000254759 ENSGT01080000257333.A.a.b.a.b.a.b #25 ENSGT01080000257333.A.a.a #27 ENSGT00660000097488 #28 ENSGT01050000244814.a.a.b.b.b.a.a #29 ENSGT01050000244814.a.a.b.b.a.a #30 ENSGT01050000244814.a.a.b.b.a.b #31 ENSGT00390000009936 #32 ENSGT00940000162314 #33 ENSGT00940000160467 #34 ENSGT01080000257333.A.b #35 ENSGT01080000257333.A.a.b.b ##24 ENSGT01080000257333.A.a.b.a.b.b.a.a ##24 ENSGT01100000263479.D.b ENSGT01080000257333.A.a.b.a.b.a.a.a ##24 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00960000186612.B.a.b.a.b.a.a.a.a.a.a.i.b.a ##8 ENSGT00960000186612.B.a.b.a.b.a.a.a.b.f.a.b ##8 ENSGT00960000186612.B.a.b.a.b.a.a.a.a.a.a.i.a ##8 ENSGT00960000186612.B.a.b.a.b.a.a.a.b.f.a.a.a ##8 ENSGT00950000183066.a.a.a ENSGT00960000186612.B.a.b.a.b.a.a.a.b.f.b.a #11 ENSGT00960000186612.B.a.b.a.b.a.a.a.a.a.a.j #12 ENSGT00960000186612.B.a.b.a.b.a.a.a.b.f.b.b #13 ENSGT00940000162449 #14 ENSGT00940000163298 #15 ENSGT00940000162748 #17 ENSGT00940000163119 #18 ENSGT00940000162851 #19 ENSGT01020000230438.B.b.b.b.c.a #20 ENSGT01020000230438.B.b.b.b.c.b #21 ENSGT00390000010337.A #22 ENSGT01070000254759 ENSGT01080000257333.A.a.b.a.b.a.b #25 ENSGT01080000257333.A.a.a #27 ENSGT00660000097488 #28 ENSGT01050000244814.a.a.b.b.b.a.a #29 ENSGT01050000244814.a.a.b.b.a.a #30 ENSGT01050000244814.a.a.b.b.a.b #31 ENSGT00390000009936 #32 ENSGT00940000162314 #33 ENSGT00940000160467 #34 ENSGT01080000257333.A.b #35 ENSGT01100000263479.D.b ENSGT01080000257333.A.a.b.a.b.a.a.a ##24 ENSGT00390000001041 ENSGT01020000230389.b.a.b.d.a.b.b Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 8 ENSSVLG00005020378 #7 ENSSVLG00005020268 #8 ENSSVLG00005020215 #9 ENSSVLG00005020196 #10 ENSSVLG00005020154 #11 ENSSVLG00005020106 #12 ENSSVLG00005020038 #13 ZNF350 (ENSSVLG00005019972) #14 ZNF615 (ENSSVLG00005019909) #15 ENSSVLG00005019894 #16 ZNF614 (ENSSVLG00005019839) #17 ZNF432 (ENSSVLG00005019789) #18 ZNF613 (ENSSVLG00005019710) #19 FPR2 (ENSSVLG00005019655) #20 FPR1 (ENSSVLG00005019617) #21 HAS1 (ENSSVLG00005019553) #22 SPACA6 (ENSSVLG00005019454) #23 ENSSVLG00005019040 #24 ENSSVLG00005018929 #25 ENSSVLG00005018861 #26 ENSSVLG00005017959 #27 C19orf84 (ENSSVLG00005017839) #28 LIM2 (ENSSVLG00005017694) #29 NKG7 (ENSSVLG00005017622) #30 CLDND2 (ENSSVLG00005017560) #31 ETFB (ENSSVLG00005017512) #32 VSIG10L (ENSSVLG00005017387) #33 IGLON5 (ENSSVLG00005017281) #34 ENSSVLG00005017148 #35 ENSSVLG00005017083 #36 ENSSVLG00005017028 #37 Marmotini ANCESTRAL SPECIES 111 ENSGT00960000186612.B.a.b.a.b.a.a.a.b.f.a.b.b.b ##8 ENSGT00960000186612.B.a.b.a.b.a.a.a.a.a.a.i.b.a.a ##8 ENSGT00960000186612.B.a.b.a.b.a.a.a.b.f.a.b.a.b ##8 ENSGT00960000186612.B.a.b.a.b.a.a.a.a.a.a.j #12 ENSGT00940000162449 #14 ENSGT00940000163298 #15 ENSGT00940000162748 #17 ENSGT00940000163119 #18 ENSGT00940000162851 #19 ENSGT01020000230438.B.b.b.b.c.a #20 ENSGT01020000230438.B.b.b.b.c.b #21 ENSGT00390000010337.A #22 ENSGT00390000009010 #23 ENSGT01080000257333.C #24 ENSGT00940000164072 ENSGT00940000163075 Alpin marmot MODERN SPECIES 151 ENSMMMG00000022520 ##8 ENSMMMG00000022518 ENSMMMG00000022516 ##8 ENSMMMG00000022515 ##8 ENSMMMG00000022513 ##8 ENSMMMG00000022508 ##8 ENSMMMG00000022505 #12 ENSMMMG00000022502 ##8 ZNF350 (ENSMMMG00000022501) #14 ZNF615 (ENSMMMG00000022499) #15 ZNF614 (ENSMMMG00000022497) #17 ZNF432 (ENSMMMG00000022495) #18 ZNF613 (ENSMMMG00000022493) #19 FPR2 (ENSMMMG00000022490) #20 FPR1 (ENSMMMG00000022489) #21 HAS1 (ENSMMMG00000022487) #22 ENSMMMG00000022480 #24 ENSMMMG00000022470 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 243 ENSGT00940000163298 #15 ENSGT00940000162748 #17 ENSGT00940000163119.a #18 ENSGT00940000162851 #19 ENSGT01020000230438.B.b.b.b.c.a #20 ENSGT01020000230438.B.b.b.b.c.b #21 ENSGT00390000010337.A #22 ENSGT00390000009010 #23 ENSGT01080000257333.C #24 ENSGT00940000164072 ENSGT00940000163075 Squirrel MODERN SPECIES 584 ZNF614 (ENSSTOG00000031591) #17 ZNF432 (ENSSTOG00000031421) #18 ZNF613 (ENSSTOG00000034706) #19 FPR2 (ENSSTOG00000023717) #20 FPR1 (ENSSTOG00000006543) #21 HAS1 (ENSSTOG00000009484) #22 ENSSTOG00000025311 ENSSTOG00000025592 ZNF175 (ENSSTOG00000034517) Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 981 FPR1 (ENSUPAG00010008605) #21 HAS1 (ENSUPAG00010008612) #22 SPACA6 (ENSUPAG00010008622) #23 ENSUPAG00010008650 #24 ENSUPAG00010008722 ZNF175 (ENSUPAG00010008752) Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000014743 ENSGT00550000075069 ENSGT00390000016605 ENSGT00390000004322.b ENSGT00390000007786.b ENSGT01050000244893.c.b.a ENSGT01050000244961.b ENSGT00940000161219 ENSGT00950000182933.C ENSGT01100000263534.b.k.a.b.b.a.b ENSGT00950000183066.a.a.a.m ENSGT00960000186612.B.a.a.d ##8 ENSGT01020000230438.B.b.b.b.c.a.h #20 ENSGT01020000230438.B.b.b.b.c.a.g #20 ENSGT01020000230438.B.b.b.b.c.b #21 ENSGT00390000010337.A #22 ENSGT00390000009010 #23 ENSGT01080000257333.C #24 ENSGT01080000257333.A.a.a #27 ENSGT00660000097488 #28 ENSGT01050000244814.a.a.b.b.b.a.a #29 ENSGT01050000244814.a.a.b.b.a.a #30 ENSGT01050000244814.a.a.b.b.a.b #31 ENSGT00390000009936 #32 ENSGT00940000162314 #33 ENSGT00940000160467 #34 ENSGT01080000257333.A.a.b.b ##24 ENSGT01080000257333.A.a.b.a.b.b.a.a.b ##24 ENSGT01080000257333.A.a.b.a.b.a.a.a ##24 ENSGT00390000001041 ENSGT01020000230389.b.a.b.d.a.b.b Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00550000075069 ENSGT00390000016605 ENSGT00390000004322.b ENSGT00390000007786.b ENSGT01050000244893.c.b.a ENSGT01050000244961.b ENSGT00940000161219 ENSGT00950000182933.C ENSGT01100000263534.b.k.a.b.b.a.b ENSGT00950000183066.a.a.a.m ENSGT00940000162449 #14 ENSGT00940000163119 #18 ENSGT01020000230438.B.b.b.b.c.a.h #20 ENSGT01020000230438.B.b.b.b.c.a.g #20 ENSGT01020000230438.B.b.b.b.c.b #21 ENSGT00390000010337.A #22 ENSGT00390000009010 #23 ENSGT01080000257333.C #24 ENSGT01080000257333.A.a.a #27 ENSGT01050000244814.a.a.b.b.b.a.a #29 ENSGT01050000244814.a.a.b.b.a.a #30 ENSGT01050000244814.a.a.b.b.a.b #31 ENSGT00390000009936 #32 ENSGT00940000162314 #33 ENSGT00940000160467 #34 ENSGT01080000257333.A.a.b.b ##24 ENSGT01080000257333.A.a.b.a.b.b.a.a.b ##24 ENSGT01080000257333.A.a.b.a.b.a.a.a ##24 ENSGT00390000001041 ENSGT01020000230389.b.a.b.d.a.b.b ENSGT01030000234551.k.d.a.d.a.a Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES 130 ENSGT01100000263534.b.k.a.b.b.a.b ENSGT00950000183066.a.a.a.m ENSGT00940000162449 #14 ENSGT00940000163119 #18 ENSGT01020000230438.B.b.b.b.c.a.h #20 ENSGT01020000230438.B.b.b.b.c.a.g #20 ENSGT01020000230438.B.b.b.b.c.b #21 ENSGT00390000010337.A #22 ENSGT00390000009010 #23 Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 265 ENSCLAG00000002872 ENSCLAG00000001713 ENSCLAG00000001725 ENSCLAG00000001749 ZNF350 (ENSCLAG00000001884) #14 ZNF432 (ENSCLAG00000001933) #18 ENSCLAG00000001986 ENSCLAG00000002005 #20 ENSCLAG00000017493 #20 FPR1 (ENSCLAG00000001964) #21 HAS1 (ENSCLAG00000002507) #22 SPACA6 (ENSCLAG00000002583) #23 ENSCLAG00000002798 ##24 LIM2 (ENSCLAG00000002813) #29 NKG7 (ENSCLAG00000001394) #30 CLDND2 (ENSCLAG00000001487) #31 ETFB (ENSCLAG00000001546) #32 VSIG10L (ENSCLAG00000001572) #33 IGLON5 (ENSCLAG00000001807) #34 ENSCLAG00000001850 ##24 ENSCLAG00000001863 ##24 ENSCLAG00000002681 ##24 ENSCLAG00000002710 #27 KLK13 (ENSCLAG00000001353) KLK14 (ENSCLAG00000001363) KLK12 (ENSCLAG00000001373) Degu MODERN SPECIES 247 ENSODEG00000001568 ENSODEG00000001551 PPP2R1A (ENSODEG00000001538) ENSODEG00000001511 ENSODEG00000001486 HAS1 (ENSODEG00000001436) #22 SPACA6 (ENSODEG00000001402) #23 ENSODEG00000018689 ENSODEG00000001380 ENSODEG00000001349 #27 LIM2 (ENSODEG00000001330) #29 NKG7 (ENSODEG00000001310) #30 CLDND2 (ENSODEG00000001280) #31 ETFB (ENSODEG00000001270) #32 VSIG10L (ENSODEG00000001244) #33 IGLON5 (ENSODEG00000001225) #34 ENSODEG00000001502 ##24 ENSODEG00000001488 ENSODEG00000001475 KLK14 (ENSODEG00000001465) KLK13 (ENSODEG00000001451) Guinea pig MODERN SPECIES 70 MYADM (ENSCPOG00000036678) ENSCPOG00000001212 ENSCPOG00000025434 ENSCPOG00000037775 ENSCPOG00000032992 ENSCPOG00000033886 ENSCPOG00000033450 ENSCPOG00000038003 ENSCPOG00000031294 ENSCPOG00000008583 ZNF350 (ENSCPOG00000037560) #14 ZNF432 (ENSCPOG00000037172) #18 ENSCPOG00000039638 #20 ENSCPOG00000039634 #20 ENSCPOG00000039351 #20 HAS1 (ENSCPOG00000022257) #22 SPACA6 (ENSCPOG00000040279) #23 ENSCPOG00000039552 #24 ENSCPOG00000033422 ENSCPOG00000026684 ##24 ENSCPOG00000005525 #27 LIM2 (ENSCPOG00000021206) #29 NKG7 (ENSCPOG00000007150) #30 ENSCPOG00000000322 ETFB (ENSCPOG00000030309) #32 VSIG10L (ENSCPOG00000002074) #33 IGLON5 (ENSCPOG00000022606) #34 ENSCPOG00000003480 ##24 ENSCPOG00000038458 ##24 ENSCPOG00000023339 ##24 ENSCPOG00000036731 ##24 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 21 ENSHGLG00000042875 ENSHGLG00000035949 ENSHGLG00000035507 ENSHGLG00000043735 ENSHGLG00000016742 ENSHGLG00000036517 #8 ENSHGLG00000035101 #8 ENSHGLG00000018576 #8 ZNF350 (ENSHGLG00000045910) #14 ENSHGLG00000015217 #19 ENSHGLG00000044506 ##8 ENSHGLG00000021346 #20 ENSHGLG00000043778 #20 ENSHGLG00000043401 #20 FPR1 (ENSHGLG00000020105) #21 HAS1 (ENSHGLG00000004680) #22 SPACA6 (ENSHGLG00000005223) #23 ENSHGLG00000048593 #24 ENSHGLG00000044171 #24 ENSHGLG00000013667 ENSHGLG00000017485 ##24 ENSHGLG00000006266 ##24 C19orf84 (ENSHGLG00000007012) #28 LIM2 (ENSHGLG00000007982) #29 NKG7 (ENSHGLG00000047075) #30 ENSHGLG00000040775 ETFB (ENSHGLG00000004666) #32 IGLON5 (ENSHGLG00000016424) #34 ENSHGLG00000035514 ##24 ENSHGLG00000018406 ##24 ENSHGLG00000033500 ##24 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT01100000263478.a.a ENSGT01100000263478.a.b ENSGT00390000007786.b ENSGT01050000244893.c.b.a ENSGT01050000244961.b ENSGT00940000161219 ENSGT00950000182933.C ENSGT00940000160873 ENSGT00940000161142 ENSGT01020000230438.B.b.b.b.d ##20 ENSGT00950000183066.a.a.a ENSGT00960000186612.B.a.b.a.b.a.a.a.a.a.a #8 ENSGT00960000186612.B.a.b.a.b.a.a.a.b #9 ENSGT01020000230438.B.b.b.b.c.a #20 ENSGT01020000230438.B.b.b.b.c.b #21 ENSGT00390000010337.A #22 ENSGT00390000009010 #23 Kangaroo rat MODERN SPECIES 424 Tfpt (ENSDORG00000008023) Ndufa3 (ENSDORG00000008024) Oscar (ENSDORG00000006720) Cacng6 (ENSDORG00000010542) Cacng8 (ENSDORG00000028300) Cacng7 (ENSDORG00000023681) Prkcg (ENSDORG00000003929) Nlrp12 (ENSDORG00000014614) AU018091 (ENSDORG00000029371) ENSDORG00000014476 ENSDORG00000026193 ENSDORG00000023378 ENSDORG00000025030 ENSDORG00000004520 ##20 ENSDORG00000025116 ##20 Has1 (ENSDORG00000012527) #22 ENSDORG00000012529 #23 ENSDORG00000024541 Iglon5 (ENSDORG00000004286) #34 Vsig10l (ENSDORG00000004289) #33 Etfb (ENSDORG00000004290) #32 Nkg7 (ENSDORG00000004292) #30 Lim2 (ENSDORG00000004293) #29 Klk14 (ENSDORG00000000700) Klk13 (ENSDORG00000000698) Klk12 (ENSDORG00000028520) Klk11 (ENSDORG00000001774) Klk10 (ENSDORG00000029095) Klk9 (ENSDORG00000001788) Klk8 (ENSDORG00000001790) Klk7 (ENSDORG00000001791) Myomorpha ANCESTRAL SPECIES 44 ENSGT01100000263562.b.a.a.c.b ENSGT01100000263478.a.a ENSGT01100000263478.a.b ENSGT00390000007786.b ENSGT01050000244893.c.b.a ENSGT01050000244961.b ENSGT00940000161219 ENSGT00950000182933.C ENSGT00940000160873 ENSGT00940000161142 ENSGT00950000183066.a.a.a ENSGT00960000186612.B.a.b.a.b.a.a.a.a.a.a #8 ENSGT00960000186612.B.a.b.a.b.a.a.a.b #9 ENSGT01020000230438.B.b.b.b.c.a #20 ENSGT01020000230438.B.b.b.b.c.b #21 ENSGT00390000010337.A #22 ENSGT00390000009010 #23 Muroidea ANCESTRAL SPECIES 49 ENSGT01100000263478.a.b ENSGT00390000007786.b ENSGT01050000244893.c.b.a ENSGT01050000244961.b ENSGT00940000161219 ENSGT00950000182933.C ENSGT00940000160873 ENSGT00940000161142 ENSGT00940000162609 ENSGT00960000186612.B.a.b.a.b.a.a.a.b.d.b.a #9 ENSGT00950000183066.a.a.a ENSGT00960000186612.B.a.b.a.b.a.a.a.a.a.a #8 ENSGT00960000186612.B.a.b.a.b.a.a.a.b.d.a #9 ENSGT01020000230438.B.b.b.b.c.a #20 ENSGT01020000230438.B.b.b.b.c.b #21 ENSGT00390000010337.A #22 ENSGT00390000009010 #23 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES 52 ENSGT01020000230438.B.b.b.b.c.a.i #20 ENSGT01020000230438.B.b.b.b.c.b #21 ENSGT00390000010337.A #22 ENSGT00390000009010 #23 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES 57 ENSGT01020000230438.B.b.b.b.c.a.i #20 ENSGT01020000230438.B.b.b.b.c.b #21 ENSGT00390000010337.A #22 ENSGT00390000009010 #23 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES 66 ENSGT01020000230438.B.b.b.b.c.a.j #20 ENSGT00950000183069.b.b.a.a.e.a.a.a.b ENSGT00950000183069.b.b.a.a.e.a.a.a.a ENSGT00960000186612.B.a.b.a.b.a.a.a.a.a.a.g.a.a.a.b #8 ENSGT00960000186612.B.a.b.a.b.a.a.a.a.a.a.g.a.a.a.a.a #8 ENSGT00950000183066.a.a.a.q ENSGT00960000186612.B.a.b.a.b.a.a.a.b.d.a.a.a.a #9 ENSGT00940000162609 ENSGT01020000230438.B.b.b.b.c.a.i #20 ENSGT01020000230438.B.b.b.b.c.b #21 ENSGT00390000010337.A #22 ENSGT00390000009010 #23 Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 337 ENSCGRG00001021845 ENSCGRG00001022726 ENSCGRG00001023028 #8 Vmn1r224 (ENSCGRG00001015084) #8 ENSCGRG00001000225 ENSCGRG00001015071 #9 ENSCGRG00001001153 ENSCGRG00001001868 #9 Zfp160 (ENSCGRG00001002576) ENSCGRG00001015019 #8 Vmn1r230 (ENSCGRG00001003729) #8 ENSCGRG00001015016 #8 ENSCGRG00001014990 #20 ENSCGRG00001015259 #20 Fpr1 (ENSCGRG00001014935) #21 Has1 (ENSCGRG00001006095) #22 Spaca6 (ENSCGRG00001008495) #23 ENSCGRG00001002297 Golden Hamster MODERN SPECIES 850 ENSMAUG00000005974 ENSMAUG00000005183 ENSMAUG00000005143 ENSMAUG00000004844 Zfp760 (ENSMAUG00000004700) ENSMAUG00000004540 ENSMAUG00000015712 #20 Fpr1 (ENSMAUG00000004238) #21 Has1 (ENSMAUG00000007037) #22 Spaca6 (ENSMAUG00000003906) #23 ENSMAUG00000000740 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES 94 ENSGT01020000230438.B.b.b.b.c.a.i #20 ENSGT01020000230438.B.b.b.b.c.b #21 ENSGT00390000010337.A #22 ENSGT00390000009010 #23 Northern American deer mouse MODERN SPECIES ENSPEMG00000026516 ENSPEMG00000027074 ENSPEMG00000021527 ENSPEMG00000030297 #8 ENSPEMG00000029266 #15 ENSPEMG00000025984 #8 ENSPEMG00000028462 #8 ENSPEMG00000029249 ENSPEMG00000027496 ENSPEMG00000029777 ENSPEMG00000027001 ENSPEMG00000007966 #20 ENSPEMG00000027315 ENSPEMG00000011102 #20 Fpr1 (ENSPEMG00000006964) #21 Has1 (ENSPEMG00000012368) #22 Spaca6 (ENSPEMG00000011711) #23 ENSPEMG00000025277 Crx (ENSPEMG00000029855) ENSPEMG00000025120 ENSPEMG00000011553 ENSPEMG00000029263 ENSPEMG00000029695 ENSPEMG00000027450 ENSPEMG00000027011 ENSPEMG00000025012 ENSPEMG00000028588 Lair1 (ENSPEMG00000022687) Ttyh1 (ENSPEMG00000023145) Leng8 (ENSPEMG00000021439) ENSPEMG00000024883 Prairie vole MODERN SPECIES 245 ENSMOCG00000022754 #20 Fpr1 (ENSMOCG00000022663) #21 Has1 (ENSMOCG00000001231) #22 Spaca6 (ENSMOCG00000000438) #23 Murinae ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00940000162609 ENSGT00960000186612.B.a.b.a.b.a.a.a.b.d.a.a.a.a #9 ENSGT00950000183066.a.a.a ENSGT00960000186612.B.a.b.a.b.a.a.a.a.a.a.g.a.a.a.b.a.b.a.a #8 ENSGT00960000186612.B.a.b.a.b.a.a.a.a.a.a.g.a.a.a.a.b #8 ENSGT00960000186612.B.a.b.a.b.a.a.a.a.a.a.g.a.a.b #8 ENSGT00960000186612.B.a.b.a.b.a.a.a.a.a.a.g.a.a.a.b.a.a #8 ENSGT00960000186612.B.a.b.a.b.a.a.a.a.a.a.g.a.a.a.b.a.b.b #8 ENSGT01020000230438.B.b.b.b.c.a.j.b #20 ENSGT00950000183069.b.b.a.a.e.a.a.a.c.a.b ENSGT01020000230438.B.b.b.b.c.a.j.a.b #20 ENSGT00950000183069.b.b.a.a.e.a.a.a.c.b ENSGT01020000230438.B.b.b.b.c.a.j.a.a #20 ENSGT01020000230438.B.b.b.b.c.a.i #20 ENSGT01020000230438.B.b.b.b.c.b #21 ENSGT00390000010337.A #22 ENSGT00390000009010 #23 ENSGT00940000157902 ENSGT00390000005869.b ENSGT00390000003255 ENSGT00950000183112.b.a.b ENSGT00940000156579 ENSGT00940000158211 ENSGT00940000156603 ENSGT00940000157474 ENSGT00550000075035 ENSGT00530000063168.b ENSGT00940000159781 ENSGT00390000001024 ENSGT00940000160069 ENSGT00940000155172 Mus ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00960000186612.B.a.b.a.b.a.a.a.a.a.a.g.a.a.a.b.a.b.a.b #8 ENSGT00960000186612.B.a.b.a.b.a.a.a.a.a.a.g.a.a.a.b.a.a #8 ENSGT00960000186612.B.a.b.a.b.a.a.a.a.a.a.g.a.a.a.b.a.b.b #8 ENSGT01020000230438.B.b.b.b.c.a.j.b #20 ENSGT00950000183069.b.b.a.a.e.a.a.a.c.a.a.a.a.b ENSGT00960000186612.B.a.b.a.b.a.a.a.a.a.a.g.a.a.a.a.a #8 ENSGT00950000183069.b.b.a.a.e.a.a.a.c.b.b ENSGT00950000183069.b.b.a.a.e.a.a.a.c.a.b ENSGT01020000230438.B.b.b.b.c.a.j.a.b #20 ENSGT00950000183069.b.b.a.a.e.a.a.a.c.b.a.a.a ENSGT00950000183069.b.b.a.a.e.a.a.a.c.b.a.b ENSGT01020000230438.B.b.b.b.c.a.j.a.a #20 ENSGT01020000230438.B.b.b.b.c.a.i.b #20 ENSGT01020000230438.B.b.b.b.c.a.i.a #20 ENSGT01020000230438.B.b.b.b.c.b #21 ENSGT00390000010337.A #22 ENSGT00390000009010 #23 ENSGT00940000157902 ENSGT00390000005869.b ENSGT00390000003255 ENSGT00950000183112.b.a.b ENSGT00940000156579 ENSGT00940000158211 ENSGT00940000156603 ENSGT00940000157474 ENSGT00550000075035 ENSGT00530000063168.b ENSGT00940000159781 ENSGT00390000001024 ENSGT00940000160069 ENSGT00940000155172 Mus_A ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT01020000230438.B.b.b.b.c.a.j.b #20 ENSGT00950000183069.b.b.a.a.e.a.a.a.c.a.a.a.a.b ENSGT00960000186612.B.a.b.a.b.a.a.a.a.a.a.g.a.a.a.b.b #8 ENSGT00950000183069.b.b.a.a.e.a.a.a.c.a.a.a.b ENSGT00960000186612.B.a.b.a.b.a.a.a.a.a.a.g.a.a.a.a.a #8 ENSGT00950000183069.b.b.a.a.e.a.a.a.c.b.b ENSGT00950000183069.b.b.a.a.e.a.a.a.c.a.b ENSGT01020000230438.B.b.b.b.c.a.j.a.b.a #20 ENSGT01020000230438.B.b.b.b.c.a.j.a.b.b #20 ENSGT00950000183069.b.b.a.a.e.a.a.a.c.b.a.a.a ENSGT00950000183069.b.b.a.a.e.a.a.a.c.b.a.b ENSGT01020000230438.B.b.b.b.c.a.j.a.a #20 ENSGT01020000230438.B.b.b.b.c.a.i.b #20 ENSGT01020000230438.B.b.b.b.c.a.i.a #20 ENSGT01020000230438.B.b.b.b.c.b #21 ENSGT00390000010337.A #22 ENSGT00390000009010 #23 ENSGT00940000157902 ENSGT00390000005869.b ENSGT00390000003255 ENSGT00950000183112.b.a.b ENSGT00940000156579 ENSGT00940000158211 ENSGT00940000156603 ENSGT00940000157474 ENSGT00550000075035 ENSGT00530000063168.b ENSGT00940000159781 ENSGT00390000001024 ENSGT00940000160069 ENSGT00940000155172 Mus_B ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00950000183069.b.b.a.a.e.a.a.a.c.a.a.a.b ENSGT00960000186612.B.a.b.a.b.a.a.a.a.a.a.g.a.a.a.b.b #8 ENSGT00950000183069.b.b.a.a.e.a.a.a.c.a.a.a.a.a ENSGT00960000186612.B.a.b.a.b.a.a.a.a.a.a.g.a.a.a.a.a #8 ENSGT00950000183069.b.b.a.a.e.a.a.a.c.b.b ENSGT00950000183069.b.b.a.a.e.a.a.a.c.a.a.b ENSGT00950000183069.b.b.a.a.e.a.a.a.c.a.b ENSGT01020000230438.B.b.b.b.c.a.j.a.b.a #20 ENSGT01020000230438.B.b.b.b.c.a.j.a.b.b #20 ENSGT00950000183069.b.b.a.a.e.a.a.a.c.b.a.a.a.b ENSGT00950000183069.b.b.a.a.e.a.a.a.c.b.a.b.b.b ENSGT01020000230438.B.b.b.b.c.a.j.a.a #20 ENSGT01020000230438.B.b.b.b.c.a.i.b #20 ENSGT01020000230438.B.b.b.b.c.a.i.a #20 ENSGT01020000230438.B.b.b.b.c.b #21 ENSGT00390000010337.A #22 ENSGT00390000009010 #23 ENSGT00950000183069.b.b.a.a.e.a.a.b.b ENSGT00940000157902 ENSGT00390000005869.b ENSGT00390000003255 ENSGT00950000183112.b.a.b ENSGT00940000156579 ENSGT00940000158211 ENSGT00940000156603 ENSGT00940000157474 ENSGT00550000075035 ENSGT00530000063168.b ENSGT00940000159781 ENSGT00390000001024 ENSGT00940000160069 Mus_C ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00390000007046.b.a.b.g.b ENSGT00960000186612.B.a.b.a.b.a.a.a.a.a.a.g.a.a.a.b.b #8 ENSGT00950000183069.b.b.a.a.e.a.a.a.c.a.a.a.b ENSGT00960000186612.B.a.b.a.b.a.a.a.a.a.a.g.a.a.a.a.a #8 ENSGT00950000183069.b.b.a.a.e.a.a.a.c.b.b ENSGT00950000183069.b.b.a.a.e.a.a.a.c.a.a.b ENSGT00950000183069.b.b.a.a.e.a.a.a.c.a.b ENSGT01020000230438.B.b.b.b.c.a.j.a.b.a #20 ENSGT01020000230438.B.b.b.b.c.a.j.a.b.b #20 ENSGT00950000183069.b.b.a.a.e.a.a.a.c.b.a.a.a.b ENSGT00950000183069.b.b.a.a.e.a.a.a.c.b.a.b.b.b ENSGT01020000230438.B.b.b.b.c.a.j.a.a #20 ENSGT01020000230438.B.b.b.b.c.a.i.b #20 ENSGT01020000230438.B.b.b.b.c.a.i.a #20 ENSGT01020000230438.B.b.b.b.c.b #21 ENSGT00390000010337.A #22 ENSGT00390000009010 #23 ENSGT00950000183069.b.b.a.a.e.a.a.b.b ENSGT00940000157902 ENSGT00390000005869.b ENSGT00950000183112.b.a.b ENSGT00940000156579 ENSGT00940000158211 ENSGT00940000156603 ENSGT00940000157474 ENSGT00550000075035 ENSGT00530000063168.b ENSGT00940000159781 ENSGT00390000001024 ENSGT00940000160069 ENSGT00940000155172 Steppe mouse MODERN SPECIES 2633 Vmn2r97 (ENSMSIG00000029673) ENSMSIG00000029671 Vmn2r95 (ENSMSIG00000029647) Vmn2r93 (ENSMSIG00000029636) Vmn2r94 (ENSMSIG00000029626) Vmn2r124 (ENSMSIG00000029620) Fpr-rs4 (ENSMSIG00000029613) #20 Fpr3 (ENSMSIG00000029609) #20 ENSMSIG00000029603 ENSMSIG00000029598 Fpr1 (ENSMSIG00000029597) #21 Has1 (ENSMSIG00000029591) #22 Spaca6 (ENSMSIG00000029585) #23 spretus MODERN SPECIES 8 Vmn1r226 (MGP_SPRETEiJ_G0022021) #8 Fpr-rs3 (MGP_SPRETEiJ_G0022020) #20 MGP_SPRETEiJ_G0022019 Vmn1r225 (MGP_SPRETEiJ_G0022018) #8 MGP_SPRETEiJ_G0022017 Vmn1r224 (MGP_SPRETEiJ_G0022016) #8 Vmn2r107 (MGP_SPRETEiJ_G0022015) Vmn2r105 (MGP_SPRETEiJ_G0022014) MGP_SPRETEiJ_G0022013 #20 MGP_SPRETEiJ_G0022012 #20 Vmn2r93 (MGP_SPRETEiJ_G0022011) Fpr-rs4 (MGP_SPRETEiJ_G0022010) #20 Fpr3 (MGP_SPRETEiJ_G0022009) #20 Fpr2 (MGP_SPRETEiJ_G0022008) #20 Fpr1 (MGP_SPRETEiJ_G0022007) #21 Has1 (MGP_SPRETEiJ_G0022006) #22 Spaca6 (MGP_SPRETEiJ_G0022005) #23 Vmn2r90 (MGP_SPRETEiJ_G0022004) Lnpep (MGP_SPRETEiJ_G0022003) Lix1 (MGP_SPRETEiJ_G0022002) Rgmb (MGP_SPRETEiJ_G0022001) Prdm9 (MGP_SPRETEiJ_G0021999) Pdcd2 (MGP_SPRETEiJ_G0021998) Tbp (MGP_SPRETEiJ_G0021997) Psmb1 (MGP_SPRETEiJ_G0021996) Fam120b (MGP_SPRETEiJ_G0021995) Dll1 (MGP_SPRETEiJ_G0021994) MGP_SPRETEiJ_G0021993 MGP_SPRETEiJ_G0021992 MGP_SPRETEiJ_G0021991 Phf10 (MGP_SPRETEiJ_G0021990) Mouse MODERN SPECIES 8 Vmn2r99 (ENSMUSG00000090304) Vmn2r127 (ENSMUSG00000093533) Vmn2r98 (ENSMUSG00000096717) Vmn2r97 (ENSMUSG00000091491) Vmn2r96 (ENSMUSG00000091679) Vmn2r95 (ENSMUSG00000091631) Vmn2r93 (ENSMUSG00000079698) Vmn2r94 (ENSMUSG00000090417) Vmn2r92 (ENSMUSG00000091350) Vmn2r91 (ENSMUSG00000091206) Vmn2r124 (ENSMUSG00000094396) Fpr-rs4 (ENSMUSG00000048062) #20 Fpr3 (ENSMUSG00000079700) #20 Fpr2 (ENSMUSG00000052270) #20 Fpr1 (ENSMUSG00000045551) #21 Has1 (ENSMUSG00000003665) #22 Spaca6 (ENSMUSG00000080316) #23 Vmn2r90 (ENSMUSG00000092120) Lnpep (ENSMUSG00000023845) Lix1 (ENSMUSG00000047786) Riok2 (ENSMUSG00000116564) Zfp97 (ENSMUSG00000095990) Zfp960 (ENSMUSG00000096696) Rgmb (ENSMUSG00000048027) Chd1 (ENSMUSG00000023852) Prdm9 (ENSMUSG00000051977) Pdcd2 (ENSMUSG00000014771) Tbp (ENSMUSG00000014767) Psmb1 (ENSMUSG00000014769) Fam120b (ENSMUSG00000014763) Dll1 (ENSMUSG00000014773) Ryukyu mouse MODERN SPECIES 8 Vmn1r230 (MGP_CAROLIEiJ_G0021120) #8 Vmn1r229 (MGP_CAROLIEiJ_G0021119) #8 Vmn1r228 (MGP_CAROLIEiJ_G0021118) #8 Vmn1r226 (MGP_CAROLIEiJ_G0021117) #8 MGP_CAROLIEiJ_G0021116 Vmn1r225 (MGP_CAROLIEiJ_G0021115) #8 MGP_CAROLIEiJ_G0021114 Vmn1r224 (MGP_CAROLIEiJ_G0021113) #8 Vmn2r107 (MGP_CAROLIEiJ_G0021112) Vmn2r105 (MGP_CAROLIEiJ_G0021111) Fpr-rs6 (MGP_CAROLIEiJ_G0021110) #20 MGP_CAROLIEiJ_G0021109 #20 Fpr3 (MGP_CAROLIEiJ_G0021108) #20 Fpr2 (MGP_CAROLIEiJ_G0021107) #20 Fpr1 (MGP_CAROLIEiJ_G0021106) #21 Has1 (MGP_CAROLIEiJ_G0021105) #22 Spaca6 (MGP_CAROLIEiJ_G0021104) #23 Lnpep (MGP_CAROLIEiJ_G0021103) Lix1 (MGP_CAROLIEiJ_G0021102) MGP_CAROLIEiJ_G0021101 Rgmb (MGP_CAROLIEiJ_G0021100) Chd1 (MGP_CAROLIEiJ_G0021099) MGP_CAROLIEiJ_G0021098 Pdcd2 (MGP_CAROLIEiJ_G0021097) Tbp (MGP_CAROLIEiJ_G0021096) Psmb1 (MGP_CAROLIEiJ_G0021095) Fam120b (MGP_CAROLIEiJ_G0021094) Dll1 (MGP_CAROLIEiJ_G0021093) MGP_CAROLIEiJ_G0021092 MGP_CAROLIEiJ_G0021091 MGP_CAROLIEiJ_G0021090 Shrew mouse MODERN SPECIES 13 Fpr-rs3 (MGP_PahariEiJ_G0023434) #20 MGP_PahariEiJ_G0023433 MGP_PahariEiJ_G0023432 Vmn2r108 (MGP_PahariEiJ_G0023431) MGP_PahariEiJ_G0023430 #8 Vmn1r224 (MGP_PahariEiJ_G0023429) #8 MGP_PahariEiJ_G0023428 Vmn2r105 (MGP_PahariEiJ_G0023427) MGP_PahariEiJ_G0023426 #20 MGP_PahariEiJ_G0023425 #20 Vmn2r94 (MGP_PahariEiJ_G0023424) Fpr-rs4 (MGP_PahariEiJ_G0023423) #20 Fpr3 (MGP_PahariEiJ_G0023422) #20 Fpr2 (MGP_PahariEiJ_G0023421) #20 Fpr1 (MGP_PahariEiJ_G0023420) #21 Has1 (MGP_PahariEiJ_G0023419) #22 Spaca6 (MGP_PahariEiJ_G0023418) #23 Lnpep (MGP_PahariEiJ_G0023417) Lix1 (MGP_PahariEiJ_G0023416) Rgmb (MGP_PahariEiJ_G0023415) Chd1 (MGP_PahariEiJ_G0023414) MGP_PahariEiJ_G0023413 Pdcd2 (MGP_PahariEiJ_G0023412) Tbp (MGP_PahariEiJ_G0023411) Psmb1 (MGP_PahariEiJ_G0023410) Fam120b (MGP_PahariEiJ_G0023409) Dll1 (MGP_PahariEiJ_G0023408) MGP_PahariEiJ_G0023407 MGP_PahariEiJ_G0023406 MGP_PahariEiJ_G0023405 Phf10 (MGP_PahariEiJ_G0023404) Rat MODERN SPECIES Vom1r10 (ENSRNOG00000070198) #8 Vom1r7 (ENSRNOG00000068940) #8 Vom1r6 (ENSRNOG00000065978) #8 Fpr2l1 (ENSRNOG00000045732) #20 Vom2r8 (ENSRNOG00000017648) Vom1r5 (ENSRNOG00000068871) #8 Vom2r11 (ENSRNOG00000065448) Vom1r3 (ENSRNOG00000065836) #8 Vom1r2 (ENSRNOG00000066554) #8 Fpr2l2 (ENSRNOG00000043056) #20 Vom2r10 (ENSRNOG00000011191) Fpr2l3 (ENSRNOG00000048014) #20 Fpr3 (ENSRNOG00000031331) #20 Fpr2 (ENSRNOG00000042605) #20 Fpr1 (ENSRNOG00000011174) #21 Has1 (ENSRNOG00000010994) #22 Spaca6 (ENSRNOG00000039076) #23 ENSRNOG00000062758 LOC102552823 (ENSRNOG00000064244) ENSRNOG00000064980 Lnpep (ENSRNOG00000055229) Lix1 (ENSRNOG00000012988) Riok2 (ENSRNOG00000012692) Rgmb (ENSRNOG00000064721) Chd1 (ENSRNOG00000014434) Prdm9 (ENSRNOG00000021493) Pdcd2 (ENSRNOG00000001490) Tbp (ENSRNOG00000001489) Psmb1 (ENSRNOG00000001488) Fam120b (ENSRNOG00000058790) Dll1 (ENSRNOG00000059984) Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 1660 ENSNGAG00000017908 ENSNGAG00000000624 #20 Fpr1 (ENSNGAG00000016345) #21 Has1 (ENSNGAG00000017916) #22 ENSNGAG00000017017 ENSNGAG00000016559 Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 211 Cacng6 (ENSJJAG00000019691) Cacng8 (ENSJJAG00000000193) Cacng7 (ENSJJAG00000003894) Prkcg (ENSJJAG00000008261) Nlrp12 (ENSJJAG00000016425) ENSJJAG00000017506 ENSJJAG00000017820 ENSJJAG00000010003 Zfp160 (ENSJJAG00000010857) ENSJJAG00000012999 ENSJJAG00000011012 Ppp2r1a (ENSJJAG00000019716) ENSJJAG00000022194 #8 ENSJJAG00000022713 #8 ENSJJAG00000001122 Has1 (ENSJJAG00000003947) #22 Spaca6 (ENSJJAG00000021754) #23 ENSJJAG00000022004 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000010337.A #22 Pika MODERN SPECIES 5520 ENSOPRG00000009489 #22 Tree shrew MODERN SPECIES 4371 ENSTBEG00000005921 #21 HAS1 (ENSTBEG00000004868) #22