Vertebrata	DUPLICATION
Vertebrata	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00390000011620.a #22
Gnathostomata	DUPLICATION
Gnathostomata	DUPLICATION
Gnathostomata	ANCESTRAL SPECIES	90						ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00990000204641	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00940000167019	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000163206	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00510000049120	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a	ENSGT01030000234624.b	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT00390000000568
Euteleostomi	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00990000204641	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00940000167019	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000163206.b	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00510000049120	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a	ENSGT01030000234624.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT01100000263524.B.b.b	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.a	ENSGT00950000183111.b.a	ENSGT00940000156618
Sarcopterygii	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00940000167019	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000163206.b	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00510000049120	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a	ENSGT01030000234624.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT01100000263524.B.b.b	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.a	ENSGT00950000183111.b.a	ENSGT00530000063834.e.a
Tetrapoda	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00930000153033	ENSGT00940000167019	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000163206.b	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a	ENSGT01030000234624.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT01100000263524.B.b.b	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.b	ENSGT00950000182909.b.a.a	ENSGT00950000183111.b.a	ENSGT00530000063834.e.a
Amniota	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00930000153033	ENSGT00940000167019	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000163206.b	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a	ENSGT01030000234624.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT01100000263524.B.b.b	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.b	ENSGT00950000182909.b.a.a	ENSGT00950000183111.b.a	ENSGT00530000063834.e.a
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Euarchontoglires	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00400000022086.a	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a.a.b	ENSGT01030000234624.a.a.a	ENSGT01030000234624.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.b
Primates	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00400000022086.a	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a.a.b	ENSGT01030000234624.a.a.a	ENSGT01030000234624.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.b
Strepsirrhini	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00400000022086.a	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354.a #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a.a.b	ENSGT01030000234624.a.a.a	ENSGT01030000234624.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.b
Lemuriformes	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00400000022086.a	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354.a #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a.a.b	ENSGT01030000234624.a.a.a	ENSGT01030000234624.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.b
Lemuriformes_a	ANCESTRAL SPECIES	32	ENSGT00400000022086.a	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354.a #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a.a.b	ENSGT01030000234624.a.a.a	ENSGT01030000234624.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.b
Coquerels sifaka	MODERN SPECIES	236									ENSPCOG00000025488 #15	CABYR (ENSPCOG00000023455) #16	OSBPL1A (ENSPCOG00000026731) #17	IMPACT (ENSPCOG00000015567) #18	ZNF521 (ENSPCOG00000003783) #19	ENSPCOG00000005637 #20	PSMA8 (ENSPCOG00000016573) #21	TAF4B (ENSPCOG00000019250) #22	ENSPCOG00000018213 #23	KCTD1 (ENSPCOG00000028099) #24	AQP4 (ENSPCOG00000026243) #25	CHST9 (ENSPCOG00000026106) #26	CDH2 (ENSPCOG00000014519) #27	ENSPCOG00000014236 #28	ENSPCOG00000007456 #29
Greater bamboo lemur	MODERN SPECIES	161														SS18 (ENSPSMG00000010855) #20	PSMA8 (ENSPSMG00000010897) #21	TAF4B (ENSPSMG00000010953) #22	KCTD1 (ENSPSMG00000010995) #24	AQP4 (ENSPSMG00000011054) #25	CHST9 (ENSPSMG00000011076) #26
Mouse lemur	MODERN SPECIES	10	ASXL3 (ENSMICG00000031715)	CCDC178 (ENSMICG00000004751)	KLHL14 (ENSMICG00000032905)	GAREM1 (ENSMICG00000013177)	MEP1B (ENSMICG00000044828)	ENSMICG00000043457	ENSMICG00000004459	RNF125 (ENSMICG00000044153)	TRAPPC8 (ENSMICG00000001789)	B4GALT6 (ENSMICG00000007307)	TTR (ENSMICG00000013838)	DSG2 (ENSMICG00000013819)	DSG3 (ENSMICG00000033166)	DSG4 (ENSMICG00000007825)	DSG1 (ENSMICG00000007801)	TAF4B (ENSMICG00000007838) #22	KCTD1 (ENSMICG00000002325) #24	ENSMICG00000037615	AQP4 (ENSMICG00000002328) #25	CHST9 (ENSMICG00000042932) #26	ENSMICG00000045056	CDH2 (ENSMICG00000000847) #27	DSC3 (ENSMICG00000004345)	DSC2 (ENSMICG00000004351)	DSC1 (ENSMICG00000007794)	PSMA8 (ENSMICG00000008199) #21	SS18 (ENSMICG00000013326) #20	ZNF521 (ENSMICG00000006267) #19	HRH4 (ENSMICG00000027852)	IMPACT (ENSMICG00000031822) #18	OSBPL1A (ENSMICG00000014621) #17
Bushbaby	MODERN SPECIES	127	RIOK3 (ENSOGAG00000014502)	RMC1 (ENSOGAG00000014511)	NPC1 (ENSOGAG00000014516)	ANKRD29 (ENSOGAG00000014521)	LAMA3 (ENSOGAG00000014522)	TTC39C (ENSOGAG00000015961)	ENSOGAG00000015965 #16	OSBPL1A (ENSOGAG00000015970) #17	IMPACT (ENSOGAG00000009485) #18	HRH4 (ENSOGAG00000008382)	ZNF521 (ENSOGAG00000007195) #19	ENSOGAG00000024844	ENSOGAG00000028907	SS18 (ENSOGAG00000003180) #20	PSMA8 (ENSOGAG00000011233) #21	TAF4B (ENSOGAG00000014592) #22	ENSOGAG00000014600 #24	AQP4 (ENSOGAG00000003911) #25	CHST9 (ENSOGAG00000003913) #26	ENSOGAG00000033936	CDH2 (ENSOGAG00000002381) #27	DSC3 (ENSOGAG00000012204)	DSC2 (ENSOGAG00000010189)	DSC1 (ENSOGAG00000010195)	DSG1 (ENSOGAG00000028967)	DSG4 (ENSOGAG00000009937)	DSG3 (ENSOGAG00000008454)	DSG2 (ENSOGAG00000016775)	TTR (ENSOGAG00000016778)	B4GALT6 (ENSOGAG00000016779)	TRAPPC8 (ENSOGAG00000006321)
Haplorrhini	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00400000022086.a	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a.a.b	ENSGT01030000234624.a.a.a	ENSGT01030000234624.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.b
Simiiformes	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT01000000215939	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a.c.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000154281.m.b.a.b.b	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a.a.b	ENSGT01030000234624.a.a.a	ENSGT01030000234624.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT00390000000568
Platyrrhini	DUPLICATION
Platyrrhini	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT01000000215939	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a.c #22	ENSGT00940000156453.a.d #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000154281.m.b.a.b.b	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT00940000154875.l	ENSGT00950000182895.a.a.a.b.f	ENSGT01030000234624.a.a.b	ENSGT01030000234624.a.a.a	ENSGT01030000234624.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b
Cebidae	ANCESTRAL SPECIES	28	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT01000000215939	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a.c #22	ENSGT00940000156453.a.d #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT00940000154875.l	ENSGT00950000182895.a.a.a.b.f	ENSGT01030000234624.a.a.b	ENSGT01030000234624.a.a.a	ENSGT01030000234624.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138
Marmoset	MODERN SPECIES	4	RIOK3 (ENSCJAG00000020556)	RMC1 (ENSCJAG00000020571)	NPC1 (ENSCJAG00000020581)	ANKRD29 (ENSCJAG00000020590)	LAMA3 (ENSCJAG00000020598)	TTC39C (ENSCJAG00000020629)	ENSCJAG00000057247	ENSCJAG00000020641 #16	OSBPL1A (ENSCJAG00000020648) #17	IMPACT (ENSCJAG00000020674) #18	HRH4 (ENSCJAG00000020684)	ENSCJAG00000081714	ENSCJAG00000070295	ZNF521 (ENSCJAG00000020691) #19	SS18 (ENSCJAG00000020695) #20	TAF4B (ENSCJAG00000020711) #22	PSMA8 (ENSCJAG00000020707) #21	ENSCJAG00000076993	ENSCJAG00000072314	KCTD1 (ENSCJAG00000020728) #24	ENSCJAG00000080873	ENSCJAG00000073114	AQP4 (ENSCJAG00000020734) #25	CHST9 (ENSCJAG00000020745) #26	ENSCJAG00000081014	ENSCJAG00000082900	CDH2 (ENSCJAG00000020748) #27	ENSCJAG00000082045	ENSCJAG00000058738	ENSCJAG00000057254	DSC2 (ENSCJAG00000020776)
Cebidae_a	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT01000000215939	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444.i #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a.c #22	ENSGT00940000156453.a.d #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT00940000154875.l	ENSGT01030000234624.a.a.b	ENSGT01030000234624.a.a.a	ENSGT01030000234624.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT00390000000568
Capuchin	MODERN SPECIES	12	RIOK3 (ENSCCAG00000028338)	RMC1 (ENSCCAG00000030450)	NPC1 (ENSCCAG00000035662)	ANKRD29 (ENSCCAG00000037439)	LAMA3 (ENSCCAG00000032219)	ENSCCAG00000030839	TTC39C (ENSCCAG00000025379)	ENSCCAG00000021797 #16	OSBPL1A (ENSCCAG00000032012) #17	IMPACT (ENSCCAG00000036594) #18	HRH4 (ENSCCAG00000032343)	ZNF521 (ENSCCAG00000029899) #19	ENSCCAG00000020450	SS18 (ENSCCAG00000021245) #20	PSMA8 (ENSCCAG00000035292) #21	TAF4B (ENSCCAG00000033480) #22	ENSCCAG00000037563	ENSCCAG00000005936	KCTD1 (ENSCCAG00000033186) #24	ENSCCAG00000018132	AQP4 (ENSCCAG00000021505) #25	ENSCCAG00000018909	CHST9 (ENSCCAG00000020066) #26	CDH2 (ENSCCAG00000021037) #27	ENSCCAG00000035350	ENSCCAG00000037382	ENSCCAG00000021923	ENSCCAG00000028020	ENSCCAG00000031616	DSC3 (ENSCCAG00000037410)	DSC2 (ENSCCAG00000034283)
Bolivian squirrel monkey	MODERN SPECIES	53	TMEM241 (ENSSBOG00000035556)	RIOK3 (ENSSBOG00000034387)	RMC1 (ENSSBOG00000020943)	NPC1 (ENSSBOG00000032420)	ANKRD29 (ENSSBOG00000035888)	LAMA3 (ENSSBOG00000032398)	ENSSBOG00000032927	TTC39C (ENSSBOG00000031876)	ENSSBOG00000019153 #16	OSBPL1A (ENSSBOG00000019319) #17	IMPACT (ENSSBOG00000030096) #18	HRH4 (ENSSBOG00000025937)	ZNF521 (ENSSBOG00000035381) #19	SS18 (ENSSBOG00000032909) #20	PSMA8 (ENSSBOG00000023058) #21	TAF4B (ENSSBOG00000023747) #22	ENSSBOG00000028034	ENSSBOG00000036166 #24	AQP4 (ENSSBOG00000017318) #25	CHST9 (ENSSBOG00000026159) #26	CDH2 (ENSSBOG00000033079) #27	ENSSBOG00000027935	ENSSBOG00000029309	ENSSBOG00000027185	DSC2 (ENSSBOG00000010604)	DSG1 (ENSSBOG00000028425)	DSG3 (ENSSBOG00000026324)	DSG2 (ENSSBOG00000028345)	TTR (ENSSBOG00000031047)	B4GALT6 (ENSSBOG00000034735)	TRAPPC8 (ENSSBOG00000022914)
Mas night monkey	MODERN SPECIES	424															PSMA8 (ENSANAG00000021002) #21	ENSANAG00000031500 #22	ENSANAG00000033025	ENSANAG00000032744 #24	ENSANAG00000023037	AQP4 (ENSANAG00000036347) #25	CHST9 (ENSANAG00000033005) #26	ENSANAG00000021369	CDH2 (ENSANAG00000020532) #27	ENSANAG00000024602	ENSANAG00000034505	ENSANAG00000023813	DSC3 (ENSANAG00000025296)	DSC2 (ENSANAG00000036335)	DSC1 (ENSANAG00000002010)	DSG1 (ENSANAG00000018126)	DSG4 (ENSANAG00000029653)
Platyrrhini	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00390000011620.a.a.a.d #22
Mas night monkey	MODERN SPECIES	902	CBY2 (ENSANAG00000028568)	SIAH3 (ENSANAG00000027513)	ZC3H13 (ENSANAG00000033079)	CPB2 (ENSANAG00000024089)	LCP1 (ENSANAG00000028550)	LRRC63 (ENSANAG00000029208)	RUBCNL (ENSANAG00000025520)	ENSANAG00000021038	LRCH1 (ENSANAG00000032605)	ENSANAG00000033549	HTR2A (ENSANAG00000032310)	ENSANAG00000029501	ENSANAG00000028654	ENSANAG00000025311	NUDT15 (ENSANAG00000023666)	ENSANAG00000027167 #22	ENSANAG00000026714	ITM2B (ENSANAG00000029180)	ENSANAG00000011241	LPAR6 (ENSANAG00000016578)	RB1 (ENSANAG00000022056)	ENSANAG00000031593	RCBTB2 (ENSANAG00000023045)	ENSANAG00000013536	CYSLTR2 (ENSANAG00000024658)	FNDC3A (ENSANAG00000029046)	MLNR (ENSANAG00000037292)	CDADC1 (ENSANAG00000024556)	CAB39L (ENSANAG00000024473)
Catarrhini	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT01000000215939	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a.c.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000154281.m.b.a.b.b	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT00940000154875.l	ENSGT01030000234624.a.a.b	ENSGT01030000234624.a.a.a	ENSGT01030000234624.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138
Hominoidea	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT01000000215939	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a.c.a #24	ENSGT00910000146942	ENSGT00390000011417.k.b	ENSGT00390000002408.c.a.b	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000154281.m.b.a.b.b	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT00940000154875.l	ENSGT01030000234624.a.a.b	ENSGT01030000234624.a.a.a	ENSGT01030000234624.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.a
Hominidae	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00400000022086.a	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a.c.a #24	ENSGT00910000146942	ENSGT00390000011417.k.b	ENSGT00390000002408.c.a.b	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a.a.b	ENSGT01030000234624.a.a.a	ENSGT01030000234624.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b
Homo/Pan/Gorilla group	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00400000022086.a	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a.c.a #24	ENSGT00910000146942	ENSGT00390000011417.k.b	ENSGT00390000002408.c.a.b	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a.a.b	ENSGT01030000234624.a.a.a	ENSGT01030000234624.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b
Gorilla	MODERN SPECIES	9	ENSGGOG00000003409	ENSGGOG00000036734	RMC1 (ENSGGOG00000005106)	NPC1 (ENSGGOG00000005117)	ANKRD29 (ENSGGOG00000005123)	ENSGGOG00000024583	LAMA3 (ENSGGOG00000006722)	TTC39C (ENSGGOG00000003945)	ENSGGOG00000006062 #16	OSBPL1A (ENSGGOG00000006066) #17	ENSGGOG00000042431	HRH4 (ENSGGOG00000005579)	ZNF521 (ENSGGOG00000027325) #19	SS18 (ENSGGOG00000004461) #20	PSMA8 (ENSGGOG00000016377) #21	TAF4B (ENSGGOG00000003977) #22	ENSGGOG00000040020	ENSGGOG00000013560 #24	ENSGGOG00000038362	CIAPIN1 (ENSGGOG00000022607)	ENSGGOG00000023856	AQP4 (ENSGGOG00000010474) #25	CHST9 (ENSGGOG00000025951) #26	CDH2 (ENSGGOG00000012100) #27	DSC3 (ENSGGOG00000003206)	DSC2 (ENSGGOG00000006133)	DSC1 (ENSGGOG00000013528)	DSG1 (ENSGGOG00000000138)	DSG4 (ENSGGOG00000012707)	DSG3 (ENSGGOG00000001155)	DSG2 (ENSGGOG00000008855)
Homo/Pan group	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00400000022086.a	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a.c.a #24	ENSGT00910000146942	ENSGT00390000011417.k.b	ENSGT00390000002408.c.a.b	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a.a.b	ENSGT01030000234624.a.a.a	ENSGT01030000234624.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b
Human	MODERN SPECIES	9	CABLES1 (ENSG00000134508)	TMEM241 (ENSG00000134490)	RIOK3 (ENSG00000101782)	RMC1 (ENSG00000141452)	NPC1 (ENSG00000141458)	ANKRD29 (ENSG00000154065)	LAMA3 (ENSG00000053747)	TTC39C (ENSG00000168234)	CABYR (ENSG00000154040) #16	OSBPL1A (ENSG00000141447) #17	IMPACT (ENSG00000154059) #18	HRH4 (ENSG00000134489)	ZNF521 (ENSG00000198795) #19	SS18 (ENSG00000141380) #20	PSMA8 (ENSG00000154611) #21	TAF4B (ENSG00000141384) #22	KCTD1 (ENSG00000134504) #24	AQP4 (ENSG00000171885) #25	CHST9 (ENSG00000154080) #26	CDH2 (ENSG00000170558) #27	DSC3 (ENSG00000134762)	DSC2 (ENSG00000134755)	DSC1 (ENSG00000134765)	DSG1 (ENSG00000134760)	DSG4 (ENSG00000175065)	DSG3 (ENSG00000134757)	DSG2 (ENSG00000046604)	TTR (ENSG00000118271)	B4GALT6 (ENSG00000118276)	SLC25A52 (ENSG00000141437)	TRAPPC8 (ENSG00000153339)
Pan	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00400000022086.a	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a.c.a #24	ENSGT00910000146942	ENSGT00390000011417.k.b	ENSGT00390000002408.c.a.b	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000154281.m.b.a.b.b	ENSGT00910000148296	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a.a.b	ENSGT01030000234624.a.a.a	ENSGT01030000234624.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.a
Bonobo	MODERN SPECIES	9	TMEM241 (ENSPPAG00000029062)	RIOK3 (ENSPPAG00000030258)	RMC1 (ENSPPAG00000033058)	NPC1 (ENSPPAG00000017628)	ANKRD29 (ENSPPAG00000031520)	LAMA3 (ENSPPAG00000014480)	TTC39C (ENSPPAG00000024662)	ENSPPAG00000038669 #16	OSBPL1A (ENSPPAG00000028012) #17	IMPACT (ENSPPAG00000032808) #18	HRH4 (ENSPPAG00000038829)	ENSPPAG00000040491	ZNF521 (ENSPPAG00000032100) #19	SS18 (ENSPPAG00000037543) #20	PSMA8 (ENSPPAG00000027989) #21	TAF4B (ENSPPAG00000033308) #22	ENSPPAG00000034206	ENSPPAG00000036748 #24	ENSPPAG00000028147	ENSPPAG00000029862	ENSPPAG00000030931	AQP4 (ENSPPAG00000031870) #25	CHST9 (ENSPPAG00000030236) #26	ENSPPAG00000032172	ENSPPAG00000023873	CDH2 (ENSPPAG00000037338) #27	DSC3 (ENSPPAG00000041022)	DSC2 (ENSPPAG00000036483)	DSC1 (ENSPPAG00000036726)	DSG1 (ENSPPAG00000041927)	DSG4 (ENSPPAG00000041024)
Chimpanzee	MODERN SPECIES	9	CABLES1 (ENSPTRG00000009916)	TMEM241 (ENSPTRG00000009917)	RIOK3 (ENSPTRG00000009918)	RMC1 (ENSPTRG00000009919)	NPC1 (ENSPTRG00000009920)	ANKRD29 (ENSPTRG00000009921)	LAMA3 (ENSPTRG00000009922)	TTC39C (ENSPTRG00000009923)	CABYR (ENSPTRG00000009925) #16	OSBPL1A (ENSPTRG00000009926) #17	IMPACT (ENSPTRG00000009927) #18	HRH4 (ENSPTRG00000009928)	ZNF521 (ENSPTRG00000022783) #19	SS18 (ENSPTRG00000009931) #20	PSMA8 (ENSPTRG00000009933) #21	TAF4B (ENSPTRG00000009934) #22	ENSPTRG00000052077	KCTD1 (ENSPTRG00000009935) #24	ENSPTRG00000046641	ENSPTRG00000041531	ENSPTRG00000040512	AQP4 (ENSPTRG00000009936) #25	CHST9 (ENSPTRG00000009938) #26	ENSPTRG00000049096	ENSPTRG00000048916	CDH2 (ENSPTRG00000009939) #27	DSC3 (ENSPTRG00000009940)	DSC2 (ENSPTRG00000009941)	DSC1 (ENSPTRG00000009943)	DSG1 (ENSPTRG00000009945)	DSG4 (ENSPTRG00000009946)
Orangutan	MODERN SPECIES	9	RBBP8 (ENSPPYG00000009059)	CABLES1 (ENSPPYG00000009060)	TMEM241 (ENSPPYG00000009061)	RIOK3 (ENSPPYG00000009062)	RMC1 (ENSPPYG00000009063)	NPC1 (ENSPPYG00000009064)	ANKRD29 (ENSPPYG00000009065)	LAMA3 (ENSPPYG00000029871)	TTC39C (ENSPPYG00000009066)	ENSPPYG00000009069 #16	DKFZP469O0726 (ENSPPYG00000009070) #17	ENSPPYG00000009072	ZNF521 (ENSPPYG00000009074) #19	SS18 (ENSPPYG00000009075) #20	PSMA8 (ENSPPYG00000009076) #21	TAF4B (ENSPPYG00000009077) #22	KCTD1 (ENSPPYG00000009078) #24	ENSPPYG00000038429	ENSPPYG00000035338	AQP4 (ENSPPYG00000037974) #25	CHST9 (ENSPPYG00000009080) #26	CDH2 (ENSPPYG00000009082) #27	DSC3 (ENSPPYG00000009083)	DSC2 (ENSPPYG00000009084)	DSC1 (ENSPPYG00000009085)	DSG1 (ENSPPYG00000009086)	DSG4 (ENSPPYG00000009087)	DSG3 (ENSPPYG00000009088)	DSG2 (ENSPPYG00000009089)	TTR (ENSPPYG00000038498)	B4GALT6 (ENSPPYG00000009091)
Gibbon	MODERN SPECIES	19	RMC1 (ENSNLEG00000006736)	NPC1 (ENSNLEG00000006732)	ANKRD29 (ENSNLEG00000006727)	LAMA3 (ENSNLEG00000006636)	ENSNLEG00000029850	TTC39C (ENSNLEG00000006631)	ENSNLEG00000006627 #16	ENSNLEG00000006588 #17	IMPACT (ENSNLEG00000006582) #18	ENSNLEG00000006579	ENSNLEG00000034303	ZNF521 (ENSNLEG00000006568) #19	SS18 (ENSNLEG00000006558) #20	PSMA8 (ENSNLEG00000006555) #21	ENSNLEG00000006553	TAF4B (ENSNLEG00000006545) #22	ENSNLEG00000031533	KCTD1 (ENSNLEG00000006544) #24	ENSNLEG00000028506	AQP4 (ENSNLEG00000006540) #25	CHST9 (ENSNLEG00000006536) #26	ENSNLEG00000028428	CDH2 (ENSNLEG00000006531) #27	ENSNLEG00000030976	DSC3 (ENSNLEG00000006518)	DSC2 (ENSNLEG00000026724)	DSC1 (ENSNLEG00000006503)	DSG1 (ENSNLEG00000006497)	DSG4 (ENSNLEG00000006477)	DSG3 (ENSNLEG00000006471)	DSG2 (ENSNLEG00000006455)
Cercopithecidae	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT01000000215939	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a.c.a #24	ENSGT00910000146942	ENSGT00390000002408.c.a.b	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000154281.m.b.a.b.b	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT00940000154875.l	ENSGT01030000234624.a.a.b	ENSGT01030000234624.a.a.a	ENSGT01030000234624.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.a
Cercopithecinae	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT01000000215939	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00390000017571.k #18	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a.c.a #24	ENSGT00910000146942	ENSGT00390000002408.c.a.b	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000154281.m.b.a.b.b	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT00940000154875.l	ENSGT01030000234624.a.a.b	ENSGT01030000234624.a.a.a	ENSGT01030000234624.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.a
Cercopithecinae_a	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT01000000215939	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00390000017571.k #18	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a.c.a #24	ENSGT00910000146942	ENSGT00390000002408.c.a.b	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000154281.m.b.a.b.b	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT00940000154875.l	ENSGT01030000234624.a.a.b	ENSGT01030000234624.a.a.a	ENSGT01030000234624.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.a
Macaca	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00400000022086.a	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00390000017571.k #18	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a.c.a #24	ENSGT00910000146942	ENSGT00390000002408.c.a.b	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a.a.b	ENSGT01030000234624.a.a.a	ENSGT01030000234624.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138
Macaca_a	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00390000017571.k #18	ENSGT00940000162118	ENSGT01090000260213.a.b.a	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00940000164709.a.b.b.a.b.b.a.a.b.a.a.a.b.b.a.b	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a.c.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a.a.b	ENSGT01030000234624.a.a.a	ENSGT01030000234624.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT00940000155622.e.b.b	ENSGT00390000000568
Rhesus	MODERN SPECIES	9	ANKRD29 (ENSMMUG00000020328)	NPC1 (ENSMMUG00000021484)	LAMA3 (ENSMMUG00000004321)	TTC39C (ENSMMUG00000004343)	CABYR (ENSMMUG00000004346) #16	OSBPL1A (ENSMMUG00000004350) #17	ENSMMUG00000060481	IMPACT (ENSMMUG00000004664) #18	HRH4 (ENSMMUG00000015065)	ENSMMUG00000063433	ZNF521 (ENSMMUG00000008600) #19	ENSMMUG00000057585	SS18 (ENSMMUG00000018059) #20	PSMA8 (ENSMMUG00000018066) #21	ENSMMUG00000050048	TAF4B (ENSMMUG00000016190) #22	KCTD1 (ENSMMUG00000004595) #24	AQP4 (ENSMMUG00000014934) #25	ENSMMUG00000063880	ENSMMUG00000050507	CHST9 (ENSMMUG00000011801) #26	ENSMMUG00000039405	CDH2 (ENSMMUG00000015178) #27	DSC3 (ENSMMUG00000007668)	DSC2 (ENSMMUG00000011687)	DSC1 (ENSMMUG00000011690)	DSG1 (ENSMMUG00000022703)	DSG4 (ENSMMUG00000022704)	DSG3 (ENSMMUG00000021094)	DSG2 (ENSMMUG00000021095)	TTR (ENSMMUG00000052277)
Crab-eating macaque	MODERN SPECIES	9	ANKRD29 (ENSMFAG00000032971)	LAMA3 (ENSMFAG00000045256)	TTC39C (ENSMFAG00000023934)	ENSMFAG00000007440 #16	ENSMFAG00000047510	OSBPL1A (ENSMFAG00000003468) #17	ENSMFAG00000052772 #18	ENSMFAG00000057815	ENSMFAG00000060888	HRH4 (ENSMFAG00000050624)	ENSMFAG00000048831	ZNF521 (ENSMFAG00000044636) #19	SS18 (ENSMFAG00000035986) #20	PSMA8 (ENSMFAG00000011562) #21	ENSMFAG00000050615	TAF4B (ENSMFAG00000031932) #22	ENSMFAG00000036987 #24	ENSMFAG00000050383	ENSMFAG00000052328	AQP4 (ENSMFAG00000041146) #25	ENSMFAG00000056073	CHST9 (ENSMFAG00000037917) #26	CDH2 (ENSMFAG00000004661) #27	ENSMFAG00000033666	DSC2 (ENSMFAG00000045076)	DSC1 (ENSMFAG00000035735)	ENSMFAG00000059757	DSG1 (ENSMFAG00000033359)	DSG4 (ENSMFAG00000031939)	DSG3 (ENSMFAG00000031707)	DSG2 (ENSMFAG00000014923)
Pig-tailed macaque	MODERN SPECIES	88	CABLES1 (ENSMNEG00000028707)	TMEM241 (ENSMNEG00000002543)	RIOK3 (ENSMNEG00000041106)	RMC1 (ENSMNEG00000040499)	NPC1 (ENSMNEG00000000903)	ANKRD29 (ENSMNEG00000042612)	LAMA3 (ENSMNEG00000038755)	TTC39C (ENSMNEG00000021471)	ENSMNEG00000034958 #16	OSBPL1A (ENSMNEG00000043616) #17	ENSMNEG00000045101 #18	HRH4 (ENSMNEG00000038364)	ZNF521 (ENSMNEG00000024580) #19	SS18 (ENSMNEG00000035248) #20	PSMA8 (ENSMNEG00000029712) #21	TAF4B (ENSMNEG00000030401) #22	KCTD1 (ENSMNEG00000031582) #24	ENSMNEG00000034649	ENSMNEG00000031060	AQP4 (ENSMNEG00000029824) #25	CHST9 (ENSMNEG00000028230) #26	CDH2 (ENSMNEG00000043364) #27
Cercopithecinae_b	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT01000000215939	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00390000017571.k #18	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a.c.a #24	ENSGT00910000146942	ENSGT00390000002408.c.a.b	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000154281.m.b.a.b.b	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT00940000154875.l	ENSGT01030000234624.a.a.b	ENSGT01030000234624.a.a.a	ENSGT01030000234624.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.a
Olive baboon	MODERN SPECIES	10	CABLES1 (ENSPANG00000009181)	TMEM241 (ENSPANG00000023661)	RIOK3 (ENSPANG00000011485)	RMC1 (ENSPANG00000016020)	NPC1 (ENSPANG00000010539)	ANKRD29 (ENSPANG00000005578)	LAMA3 (ENSPANG00000006011)	TTC39C (ENSPANG00000022865)	ENSPANG00000007685 #16	OSBPL1A (ENSPANG00000006624) #17	IMPACT (ENSPANG00000008356) #18	HRH4 (ENSPANG00000012665)	ZNF521 (ENSPANG00000024017) #19	SS18 (ENSPANG00000008559) #20	PSMA8 (ENSPANG00000015004) #21	TAF4B (ENSPANG00000008355) #22	KCTD1 (ENSPANG00000024016) #24	CHST9 (ENSPANG00000020899) #26	ENSPANG00000039105	CDH2 (ENSPANG00000017231) #27	ENSPANG00000049833	DSC2 (ENSPANG00000009805)	DSC1 (ENSPANG00000009488)	DSG1 (ENSPANG00000016945)	DSG4 (ENSPANG00000005935)	DSG3 (ENSPANG00000010061)	DSG2 (ENSPANG00000016509)	TTR (ENSPANG00000043902)	B4GALT6 (ENSPANG00000009803)	SLC25A52 (ENSPANG00000047262)	TRAPPC8 (ENSPANG00000007683)
Cercopithecinae_d	ANCESTRAL SPECIES	40	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT01000000215939	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00390000017571.k #18	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a.c.a #24	ENSGT00910000146942	ENSGT00390000002408.c.a.b	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000154281.m.b.a.b.b	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT00940000154875.l	ENSGT01030000234624.a.a.b	ENSGT01030000234624.a.a.a	ENSGT01030000234624.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.a
Sooty mangabey	MODERN SPECIES	190														ENSCATG00000040236 #20	PSMA8 (ENSCATG00000039661) #21	TAF4B (ENSCATG00000033025) #22	ENSCATG00000032708	KCTD1 (ENSCATG00000033898) #24	ENSCATG00000037357	AQP4 (ENSCATG00000043318) #25	ENSCATG00000042047	CHST9 (ENSCATG00000038090) #26	ENSCATG00000041408	CDH2 (ENSCATG00000023265) #27	ENSCATG00000032024	DSC3 (ENSCATG00000023525)	DSC2 (ENSCATG00000030635)	DSC1 (ENSCATG00000039095)	DSG1 (ENSCATG00000035435)	DSG4 (ENSCATG00000034220)	DSG3 (ENSCATG00000027372)
Drill	MODERN SPECIES	970	TMEM241 (ENSMLEG00000038124)	RIOK3 (ENSMLEG00000028187)	RMC1 (ENSMLEG00000036227)	NPC1 (ENSMLEG00000042669)	ANKRD29 (ENSMLEG00000038382)	LAMA3 (ENSMLEG00000038499)	ENSMLEG00000033765	TTC39C (ENSMLEG00000030204)	ENSMLEG00000040361 #16	OSBPL1A (ENSMLEG00000043765) #17	IMPACT (ENSMLEG00000033219) #18	HRH4 (ENSMLEG00000030717)	ZNF521 (ENSMLEG00000042856) #19	SS18 (ENSMLEG00000043814) #20	PSMA8 (ENSMLEG00000042180) #21	TAF4B (ENSMLEG00000030427) #22	ENSMLEG00000032605	ENSMLEG00000033054 #24	ENSMLEG00000034783	AQP4 (ENSMLEG00000041854) #25
Vervet Monkey	MODERN SPECIES	9	CABLES1 (ENSCSAG00000017675)	TMEM241 (ENSCSAG00000017679)	RIOK3 (ENSCSAG00000017680)	RMC1 (ENSCSAG00000017683)	NPC1 (ENSCSAG00000017694)	ANKRD29 (ENSCSAG00000017699)	LAMA3 (ENSCSAG00000017763)	TTC39C (ENSCSAG00000017784)	CABYR (ENSCSAG00000017786) #16	OSBPL1A (ENSCSAG00000017790) #17	IMPACT (ENSCSAG00000017798) #18	HRH4 (ENSCSAG00000017801)	ZNF521 (ENSCSAG00000017805) #19	SS18 (ENSCSAG00000017808) #20	PSMA8 (ENSCSAG00000017812) #21	TAF4B (ENSCSAG00000017814) #22	KCTD1 (ENSCSAG00000017816) #24	AQP4 (ENSCSAG00000017817) #25	CHST9 (ENSCSAG00000017818) #26	CDH2 (ENSCSAG00000017819) #27	ENSCSAG00000018574	ENSCSAG00000018573	ENSCSAG00000018572	DSC3 (ENSCSAG00000017820)	DSC2 (ENSCSAG00000017822)	DSC1 (ENSCSAG00000017834)	DSG1 (ENSCSAG00000017839)	DSG4 (ENSCSAG00000017847)	DSG3 (ENSCSAG00000017854)	DSG2 (ENSCSAG00000017859)	TTR (ENSCSAG00000017862)
Rhinopithecus	ANCESTRAL SPECIES	537														ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a.c.a #24	ENSGT00910000146942	ENSGT00390000002408.c.a.b	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000154281.m.b.a.b.b
Black snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	2055														SS18 (ENSRBIG00000042147) #20	PSMA8 (ENSRBIG00000010432) #21	TAF4B (ENSRBIG00000029558) #22	ENSRBIG00000027224	ENSRBIG00000038661 #24	ENSRBIG00000030904	AQP4 (ENSRBIG00000028190) #25	CHST9 (ENSRBIG00000012098) #26
Golden snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	2237														SS18 (ENSRROG00000043063) #20	PSMA8 (ENSRROG00000014601) #21	TAF4B (ENSRROG00000030187) #22	ENSRROG00000030521	ENSRROG00000025474 #24	ENSRROG00000034652	AQP4 (ENSRROG00000040234) #25	CHST9 (ENSRROG00000035490) #26	ENSRROG00000014836
Tarsier	MODERN SPECIES	5852													ENSTSYG00000009189	SS18 (ENSTSYG00000011577) #20	PSMA8 (ENSTSYG00000006548) #21	TAF4B (ENSTSYG00000009936) #22	ENSTSYG00000012694 #24
Euarchontoglires_A	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00400000022086.a	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00910000146942	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a.a.b	ENSGT01030000234624.a.a.a	ENSGT01030000234624.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT00390000000568
Glires	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00400000022086.a	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00910000146942	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a.a.b	ENSGT01030000234624.a.a.a	ENSGT01030000234624.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT00390000000568
Rodentia	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00400000022086.a	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a.a.b	ENSGT01030000234624.a.a.a	ENSGT01030000234624.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.b
Rodentia_B	ANCESTRAL SPECIES	27	ENSGT00400000022086.a	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a.a.b	ENSGT01030000234624.a.a.a	ENSGT01030000234624.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.b
Kangaroo rat	MODERN SPECIES	344	Riok3 (ENSDORG00000011663)	Rmc1 (ENSDORG00000009591)	Npc1 (ENSDORG00000009593)	Ankrd29 (ENSDORG00000009596)	ENSDORG00000025608	ENSDORG00000007343	Ttc39c (ENSDORG00000016739)	ENSDORG00000028513 #16	ENSDORG00000028811 #17	ENSDORG00000028033 #17	Impact (ENSDORG00000008055) #18	Hrh4 (ENSDORG00000008057)	Zfp521 (ENSDORG00000013718) #19	Ss18 (ENSDORG00000009314) #20	Psma8 (ENSDORG00000009316) #21	Taf4b (ENSDORG00000014517) #22	Kctd1 (ENSDORG00000006020) #24	Aqp4 (ENSDORG00000008152) #25	Chst9 (ENSDORG00000007818) #26	Cdh2 (ENSDORG00000003504) #27	Dsc3 (ENSDORG00000009594)	Dsc2 (ENSDORG00000009592)	Dsc1 (ENSDORG00000009590)	ENSDORG00000012113	Dsg4 (ENSDORG00000012128)	Dsg3 (ENSDORG00000016511)	ENSDORG00000026582	Ttr (ENSDORG00000012678)	B4galt6 (ENSDORG00000029583)	Trappc8 (ENSDORG00000002918)	Rnf125 (ENSDORG00000024503)
Myomorpha	ANCESTRAL SPECIES	45	ENSGT00400000022086.a	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a.a.b	ENSGT01030000234624.a.a.a	ENSGT01030000234624.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.b
Muroidea	ANCESTRAL SPECIES	46	ENSGT00400000022086.a	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a.a.b	ENSGT01030000234624.a.a.a	ENSGT01030000234624.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.b
Muroidea_A	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00400000022086.a	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a.a.b	ENSGT01030000234624.a.a.a	ENSGT01030000234624.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.b
Cricetidae	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00400000022086.a	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a.a.b	ENSGT01030000234624.a.a.a	ENSGT01030000234624.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.b
Cricetinae	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00400000022086.a	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a.a.b	ENSGT01030000234624.a.a.a	ENSGT01030000234624.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.b
Chinese hamster chok1gshd	MODERN SPECIES	92	Tmem241 (ENSCGRG00001015184)	Riok3 (ENSCGRG00001013249)	Rmc1 (ENSCGRG00001014209)	Npc1 (ENSCGRG00001018684)	Ankrd29 (ENSCGRG00001014314)	Lama3 (ENSCGRG00001008813)	Ttc39c (ENSCGRG00001022129)	Cabyr (ENSCGRG00001010088) #16	Osbpl1a (ENSCGRG00001000881) #17	ENSCGRG00001008388	Impact (ENSCGRG00001014462) #18	Hrh4 (ENSCGRG00001020367)	Zfp521 (ENSCGRG00001024510) #19	Ss18 (ENSCGRG00001023153) #20	Psma8 (ENSCGRG00001022616) #21	Taf4b (ENSCGRG00001003694) #22	ENSCGRG00001021440	Kctd1 (ENSCGRG00001007208) #24	Aqp4 (ENSCGRG00001023202) #25	Chst9 (ENSCGRG00001013825) #26	Cdh2 (ENSCGRG00001015862) #27	ENSCGRG00001019027	ENSCGRG00001020686	ENSCGRG00001000131	Dsc3 (ENSCGRG00001018804)	Dsc2 (ENSCGRG00001024514)	Dsc1 (ENSCGRG00001018340)	ENSCGRG00001018683	Dsg4 (ENSCGRG00001015415)	Dsg3 (ENSCGRG00001017357)	Ttr (ENSCGRG00001021304)
Golden Hamster	MODERN SPECIES	619	Cables1 (ENSMAUG00000021209)	ENSMAUG00000014369	Riok3 (ENSMAUG00000020527)	Rmc1 (ENSMAUG00000002841)	Npc1 (ENSMAUG00000011294)	Ankrd29 (ENSMAUG00000001273)	Lama3 (ENSMAUG00000014571)	Ttc39c (ENSMAUG00000001012)	Cabyr (ENSMAUG00000009212) #16	Osbpl1a (ENSMAUG00000012839) #17	Impact (ENSMAUG00000018528) #18	Hrh4 (ENSMAUG00000002034)	Zfp521 (ENSMAUG00000018583) #19	Ss18 (ENSMAUG00000019395) #20	Psma8 (ENSMAUG00000017223) #21	Taf4b (ENSMAUG00000000960) #22	Kctd1 (ENSMAUG00000012159) #24	Aqp4 (ENSMAUG00000017449) #25	Chst9 (ENSMAUG00000012710) #26	Cdh2 (ENSMAUG00000014636) #27	Dsc3 (ENSMAUG00000013762)	Dsc2 (ENSMAUG00000010434)	Dsc1 (ENSMAUG00000000925)	ENSMAUG00000021176	Dsg4 (ENSMAUG00000010495)	Dsg3 (ENSMAUG00000011710)	Dsg2 (ENSMAUG00000018653)	Ttr (ENSMAUG00000011770)	B4galt6 (ENSMAUG00000016396)	Trappc8 (ENSMAUG00000016177)	ENSMAUG00000009622
Cricetidae_B	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00400000022086.a	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT00950000182895.a.a.a.b.f	ENSGT01030000234624.a.a.b	ENSGT01030000234624.a.a.a	ENSGT01030000234624.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT00390000000568
Northern American deer mouse	MODERN SPECIES	10	Tmem241 (ENSPEMG00000017338)	Riok3 (ENSPEMG00000023794)	Rmc1 (ENSPEMG00000022078)	Npc1 (ENSPEMG00000023382)	Ankrd29 (ENSPEMG00000003235)	ENSPEMG00000030013	ENSPEMG00000016767	Ttc39c (ENSPEMG00000007592)	ENSPEMG00000025747 #16	Osbpl1a (ENSPEMG00000014841) #17	Impact (ENSPEMG00000029969) #18	Hrh4 (ENSPEMG00000014230)	Zfp521 (ENSPEMG00000001995) #19	Ss18 (ENSPEMG00000014583) #20	Psma8 (ENSPEMG00000008949) #21	Taf4b (ENSPEMG00000019174) #22	ENSPEMG00000018321 #24	Aqp4 (ENSPEMG00000029003) #25	Chst9 (ENSPEMG00000006948) #26	Cdh2 (ENSPEMG00000018458) #27	ENSPEMG00000030174	Dsc3 (ENSPEMG00000023539)	ENSPEMG00000026147	Dsc1 (ENSPEMG00000023922)	ENSPEMG00000009841	Dsg4 (ENSPEMG00000016266)	ENSPEMG00000023683	Dsg2 (ENSPEMG00000011444)	Ttr (ENSPEMG00000024235)	B4galt6 (ENSPEMG00000011754)	Trappc8 (ENSPEMG00000010916)
Prairie vole	MODERN SPECIES	5	Npc1 (ENSMOCG00000014032)	Ankrd29 (ENSMOCG00000015884)	Lama3 (ENSMOCG00000020402)	Ttc39c (ENSMOCG00000019093)	Cabyr (ENSMOCG00000017399) #16	ENSMOCG00000019839 #17	ENSMOCG00000022203 #17	Impact (ENSMOCG00000009264) #18	Hrh4 (ENSMOCG00000016549)	ENSMOCG00000009042	Zfp521 (ENSMOCG00000021972) #19	ENSMOCG00000000611	ENSMOCG00000000904	Ss18 (ENSMOCG00000008443) #20	Psma8 (ENSMOCG00000016308) #21	Taf4b (ENSMOCG00000000743) #22	Kctd1 (ENSMOCG00000003075) #24	ENSMOCG00000012425	Aqp4 (ENSMOCG00000017811) #25	Chst9 (ENSMOCG00000016675) #26	Dsc3 (ENSMOCG00000012014)	Dsc2 (ENSMOCG00000014974)	Dsc1 (ENSMOCG00000005177)	ENSMOCG00000020919	Dsg4 (ENSMOCG00000016289)	Dsg3 (ENSMOCG00000018195)	Dsg2 (ENSMOCG00000015887)	Ttr (ENSMOCG00000002400)	B4galt6 (ENSMOCG00000012621)	Trappc8 (ENSMOCG00000020417)	Rnf125 (ENSMOCG00000022723)
Murinae	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00400000022086.a	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a.a.b	ENSGT01030000234624.a.a.a	ENSGT01030000234624.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.b
Mus	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00400000022086.a	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a.a.b	ENSGT01030000234624.a.a.a	ENSGT01030000234624.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.b
Mus_A	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00950000183087.A.a.a.b	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a.a.b	ENSGT01030000234624.a.a.a	ENSGT01030000234624.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.b.d	ENSGT01030000234624.b.a.b.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.b
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spretus	MODERN SPECIES	9	Tmem241 (MGP_SPRETEiJ_G0022915)	Riok3 (MGP_SPRETEiJ_G0022916)	Rmc1 (MGP_SPRETEiJ_G0022917)	Npc1 (MGP_SPRETEiJ_G0022918)	Ankrd29 (MGP_SPRETEiJ_G0022919)	Lama3 (MGP_SPRETEiJ_G0022920)	Ttc39c (MGP_SPRETEiJ_G0022921)	Cabyr (MGP_SPRETEiJ_G0022922) #16	Osbpl1a (MGP_SPRETEiJ_G0022923) #17	Impact (MGP_SPRETEiJ_G0022924) #18	Hrh4 (MGP_SPRETEiJ_G0022925)	Zfp521 (MGP_SPRETEiJ_G0022926) #19	MGP_SPRETEiJ_G0022927	Ss18 (MGP_SPRETEiJ_G0022928) #20	Psma8 (MGP_SPRETEiJ_G0022929) #21	Taf4b (MGP_SPRETEiJ_G0022930) #22	Kctd1 (MGP_SPRETEiJ_G0022931) #24	Aqp4 (MGP_SPRETEiJ_G0022932) #25	Chst9 (MGP_SPRETEiJ_G0022933) #26	Cdh2 (MGP_SPRETEiJ_G0022934) #27	Dsc3 (MGP_SPRETEiJ_G0022935)	Dsc2 (MGP_SPRETEiJ_G0022936)	Dsc1 (MGP_SPRETEiJ_G0022937)	Dsg4 (MGP_SPRETEiJ_G0022938)	MGP_SPRETEiJ_G0022939	Dsg2 (MGP_SPRETEiJ_G0022940)	Ttr (MGP_SPRETEiJ_G0022941)	B4galt6 (MGP_SPRETEiJ_G0022942)	Trappc8 (MGP_SPRETEiJ_G0022943)	Rnf125 (MGP_SPRETEiJ_G0022944)	Rnf138 (MGP_SPRETEiJ_G0022945)
Steppe mouse	MODERN SPECIES	3229					ENSMSIG00000007290	Ttc39c (ENSMSIG00000007224)	Cabyr (ENSMSIG00000007159) #16	Osbpl1a (ENSMSIG00000006873) #17	Impact (ENSMSIG00000006812) #18	ENSMSIG00000006798	Hrh4 (ENSMSIG00000006789)	Zfp521 (ENSMSIG00000006761) #19	ENSMSIG00000006731	Ss18 (ENSMSIG00000006510) #20	Psma8 (ENSMSIG00000006470) #21	Taf4b (ENSMSIG00000006310) #22	Kctd1 (ENSMSIG00000006254) #24
Mouse	MODERN SPECIES	9	Cables1 (ENSMUSG00000040957)	Tmem241 (ENSMUSG00000049411)	Riok3 (ENSMUSG00000024404)	Rmc1 (ENSMUSG00000024410)	Npc1 (ENSMUSG00000024413)	Ankrd29 (ENSMUSG00000057766)	Lama3 (ENSMUSG00000024421)	Ttc39c (ENSMUSG00000024424)	Cabyr (ENSMUSG00000024430) #16	Osbpl1a (ENSMUSG00000044252) #17	Impact (ENSMUSG00000024423) #18	Hrh4 (ENSMUSG00000037346)	Zfp521 (ENSMUSG00000024420) #19	Ss18 (ENSMUSG00000037013) #20	Psma8 (ENSMUSG00000036743) #21	Taf4b (ENSMUSG00000054321) #22	Kctd1 (ENSMUSG00000036225) #24	Aqp4 (ENSMUSG00000024411) #25	Chst9 (ENSMUSG00000047161) #26	Cdh2 (ENSMUSG00000024304) #27	Dsc3 (ENSMUSG00000059898)	Dsc2 (ENSMUSG00000024331)	Dsc1 (ENSMUSG00000044322)	Dsg1c (ENSMUSG00000034774)	Dsg1a (ENSMUSG00000069441)	Dsg1b (ENSMUSG00000061928)	Dsg4 (ENSMUSG00000001804)	Dsg3 (ENSMUSG00000056632)	Dsg2 (ENSMUSG00000044393)	Ttr (ENSMUSG00000061808)	B4galt6 (ENSMUSG00000056124)
Ryukyu mouse	MODERN SPECIES	9	Riok3 (MGP_CAROLIEiJ_G0022001)	Rmc1 (MGP_CAROLIEiJ_G0022002)	Npc1 (MGP_CAROLIEiJ_G0022003)	Ankrd29 (MGP_CAROLIEiJ_G0022004)	Lama3 (MGP_CAROLIEiJ_G0022005)	MGP_CAROLIEiJ_G0022006	Ttc39c (MGP_CAROLIEiJ_G0022007)	Cabyr (MGP_CAROLIEiJ_G0022008) #16	Osbpl1a (MGP_CAROLIEiJ_G0022009) #17	Impact (MGP_CAROLIEiJ_G0022010) #18	Hrh4 (MGP_CAROLIEiJ_G0022011)	Zfp521 (MGP_CAROLIEiJ_G0022012) #19	MGP_CAROLIEiJ_G0022013	Ss18 (MGP_CAROLIEiJ_G0022014) #20	Psma8 (MGP_CAROLIEiJ_G0022015) #21	Taf4b (MGP_CAROLIEiJ_G0022016) #22	Kctd1 (MGP_CAROLIEiJ_G0022017) #24	Aqp4 (MGP_CAROLIEiJ_G0022018) #25	Chst9 (MGP_CAROLIEiJ_G0022019) #26	Cdh2 (MGP_CAROLIEiJ_G0022020) #27	Dsc3 (MGP_CAROLIEiJ_G0022021)	Dsc2 (MGP_CAROLIEiJ_G0022022)	Dsc1 (MGP_CAROLIEiJ_G0022023)	MGP_CAROLIEiJ_G0022024	MGP_CAROLIEiJ_G0022025	MGP_CAROLIEiJ_G0022026	Dsg4 (MGP_CAROLIEiJ_G0022027)	MGP_CAROLIEiJ_G0022028	Dsg2 (MGP_CAROLIEiJ_G0022029)	Ttr (MGP_CAROLIEiJ_G0022030)	B4galt6 (MGP_CAROLIEiJ_G0022031)
Shrew mouse	MODERN SPECIES	6	Cables1 (MGP_PahariEiJ_G0018737)	Tmem241 (MGP_PahariEiJ_G0018738)	Riok3 (MGP_PahariEiJ_G0018739)	Rmc1 (MGP_PahariEiJ_G0018740)	Npc1 (MGP_PahariEiJ_G0018741)	Ankrd29 (MGP_PahariEiJ_G0018742)	Lama3 (MGP_PahariEiJ_G0018743)	Ttc39c (MGP_PahariEiJ_G0018744)	Cabyr (MGP_PahariEiJ_G0018745) #16	Osbpl1a (MGP_PahariEiJ_G0018746) #17	Impact (MGP_PahariEiJ_G0018747) #18	Hrh4 (MGP_PahariEiJ_G0018748)	Zfp521 (MGP_PahariEiJ_G0018749) #19	Ss18 (MGP_PahariEiJ_G0018750) #20	Psma8 (MGP_PahariEiJ_G0018751) #21	Taf4b (MGP_PahariEiJ_G0018752) #22	Kctd1 (MGP_PahariEiJ_G0018753) #24	Aqp4 (MGP_PahariEiJ_G0018754) #25	Chst9 (MGP_PahariEiJ_G0018755) #26	MGP_PahariEiJ_G0018756	Cdh2 (MGP_PahariEiJ_G0018757) #27	Dsc3 (MGP_PahariEiJ_G0018758)	Dsc2 (MGP_PahariEiJ_G0018759)	Dsc1 (MGP_PahariEiJ_G0018760)	Dsg4 (MGP_PahariEiJ_G0018761)	Dsg3 (MGP_PahariEiJ_G0018762)	Dsg2 (MGP_PahariEiJ_G0018763)	Ttr (MGP_PahariEiJ_G0018764)	B4galt6 (MGP_PahariEiJ_G0018765)	Trappc8 (MGP_PahariEiJ_G0018766)	Rnf125 (MGP_PahariEiJ_G0018767)
Rat	MODERN SPECIES	9	Tmem241 (ENSRNOG00000023412)	Riok3 (ENSRNOG00000023376)	Rmc1 (ENSRNOG00000012597)	Npc1 (ENSRNOG00000012016)	Ankrd29 (ENSRNOG00000046744)	Lama3 (ENSRNOG00000011300)	Ttc39c (ENSRNOG00000050949)	Cabyr (ENSRNOG00000047436) #16	Osbpl1a (ENSRNOG00000054058) #17	Impact (ENSRNOG00000045844) #18	Hrh4 (ENSRNOG00000016887)	LOC108349606 (ENSRNOG00000031244)	Zfp521 (ENSRNOG00000016874) #19	Ss18 (ENSRNOG00000016800) #20	Psma8 (ENSRNOG00000030363) #21	Taf4b (ENSRNOG00000026023) #22	Kctd1 (ENSRNOG00000016467) #24	Rpl39 (ENSRNOG00000034237)	Aqp4 (ENSRNOG00000016043) #25	Chst9 (ENSRNOG00000015867) #26	AC118833.1 (ENSRNOG00000038412)	Cdh2 (ENSRNOG00000015602) #27	Dsc3 (ENSRNOG00000017159)	Dsc2 (ENSRNOG00000039969)	Dsc1 (ENSRNOG00000056258)	ENSRNOG00000069260	ENSRNOG00000062351	Dsg1 (ENSRNOG00000016853)	Dsg3 (ENSRNOG00000016632)	Dsg2 (ENSRNOG00000016526)	Ttr (ENSRNOG00000016275)
Upper Galilee mountains blind mole rat	MODERN SPECIES	1398	Tmem241 (ENSNGAG00000005814)	Riok3 (ENSNGAG00000011446)	Rmc1 (ENSNGAG00000017431)	Npc1 (ENSNGAG00000013904)	Ankrd29 (ENSNGAG00000015734)	Lama3 (ENSNGAG00000016262)	Ttc39c (ENSNGAG00000000053)	ENSNGAG00000000982 #16	ENSNGAG00000016344 #17	ENSNGAG00000018573 #17	Impact (ENSNGAG00000000315) #18	ENSNGAG00000001463	Zfp521 (ENSNGAG00000011355) #19	Ss18 (ENSNGAG00000013134) #20	Psma8 (ENSNGAG00000015507) #21	Taf4b (ENSNGAG00000016659) #22	ENSNGAG00000011519	Kctd1 (ENSNGAG00000019580) #24	Aqp4 (ENSNGAG00000020272) #25	Chst9 (ENSNGAG00000002874) #26
Lesser Egyptian jerboa	MODERN SPECIES	55	Rmc1 (ENSJJAG00000018244)	Npc1 (ENSJJAG00000012547)	Ankrd29 (ENSJJAG00000016034)	ENSJJAG00000018224	ENSJJAG00000006606	Ttc39c (ENSJJAG00000019984)	ENSJJAG00000016642 #16	ENSJJAG00000016064 #17	ENSJJAG00000015785 #17	Impact (ENSJJAG00000024285) #18	Hrh4 (ENSJJAG00000016339)	Zfp521 (ENSJJAG00000021105) #19	Ss18 (ENSJJAG00000018177) #20	Psma8 (ENSJJAG00000022332) #21	ENSJJAG00000020342	Taf4b (ENSJJAG00000022407) #22	Kctd1 (ENSJJAG00000014053) #24	Aqp4 (ENSJJAG00000010534) #25	Chst9 (ENSJJAG00000018791) #26	ENSJJAG00000017817 #27	Dsc3 (ENSJJAG00000021751)	Dsc2 (ENSJJAG00000018645)	Dsc1 (ENSJJAG00000019058)	ENSJJAG00000024247	Dsg4 (ENSJJAG00000020875)	Dsg3 (ENSJJAG00000000893)	ENSJJAG00000023133	Ttr (ENSJJAG00000013612)	B4galt6 (ENSJJAG00000001465)	ENSJJAG00000022562	Plpp2 (ENSJJAG00000022738)
Rodentia_A	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00400000022086.a	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a.a.b	ENSGT01030000234624.a.a.a	ENSGT01030000234624.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.b
Hystricomorpha	ANCESTRAL SPECIES	32	ENSGT00400000022086.a	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a.a.b	ENSGT01030000234624.a.a.a	ENSGT01030000234624.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.b
Naked mole-rat female	MODERN SPECIES	9	RMC1 (ENSHGLG00000009136)	NPC1 (ENSHGLG00000004320)	ANKRD29 (ENSHGLG00000003687)	ENSHGLG00000047717	LAMA3 (ENSHGLG00000007164)	TTC39C (ENSHGLG00000004150)	ENSHGLG00000033917	ENSHGLG00000007031 #16	OSBPL1A (ENSHGLG00000005475) #17	IMPACT (ENSHGLG00000032618) #18	ENSHGLG00000043231	ZNF521 (ENSHGLG00000003785) #19	SS18 (ENSHGLG00000007496) #20	ENSHGLG00000020165	PSMA8 (ENSHGLG00000009316) #21	TAF4B (ENSHGLG00000007544) #22	KCTD1 (ENSHGLG00000018260) #24	AQP4 (ENSHGLG00000039169) #25	CHST9 (ENSHGLG00000042304) #26	ENSHGLG00000007487 #27	ENSHGLG00000040245	ENSHGLG00000004019	ENSHGLG00000049706	ENSHGLG00000042691	ENSHGLG00000018510	DSC2 (ENSHGLG00000018208)	DSC1 (ENSHGLG00000007182)	DSG1 (ENSHGLG00000003726)	DSG4 (ENSHGLG00000007440)	DSG3 (ENSHGLG00000033832)	DSG2 (ENSHGLG00000018540)
Hystricomorpha_a	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00400000022086.a	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a.a.b	ENSGT01030000234624.a.a.a	ENSGT01030000234624.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.b
Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00400000022086.a	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a.a.b	ENSGT01030000234624.a.a.a	ENSGT01030000234624.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.b
Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	109	CABLES1 (ENSCLAG00000009135)	TMEM241 (ENSCLAG00000008159)	RIOK3 (ENSCLAG00000006767)	RMC1 (ENSCLAG00000007215)	NPC1 (ENSCLAG00000008539)	ENSCLAG00000009107	ENSCLAG00000010376	TTC39C (ENSCLAG00000012781)	ENSCLAG00000015684 #16	OSBPL1A (ENSCLAG00000011248) #17	IMPACT (ENSCLAG00000008879) #18	HRH4 (ENSCLAG00000009200)	ZNF521 (ENSCLAG00000010565) #19	SS18 (ENSCLAG00000012381) #20	PSMA8 (ENSCLAG00000009449) #21	TAF4B (ENSCLAG00000006974) #22	KCTD1 (ENSCLAG00000007823) #24	CHST9 (ENSCLAG00000008170) #26	CDH2 (ENSCLAG00000015205) #27	ENSCLAG00000016416	DSC3 (ENSCLAG00000016462)	DSC2 (ENSCLAG00000010145)	DSC1 (ENSCLAG00000012931)	DSG1 (ENSCLAG00000009520)	DSG4 (ENSCLAG00000014083)	DSG3 (ENSCLAG00000014163)	ENSCLAG00000012614	TTR (ENSCLAG00000016064)	B4GALT6 (ENSCLAG00000016196)	TRAPPC8 (ENSCLAG00000016681)	RNF125 (ENSCLAG00000008643)
Degu	MODERN SPECIES	44												ENSODEG00000018302	ZNF521 (ENSODEG00000018410) #19	SS18 (ENSODEG00000018466) #20	PSMA8 (ENSODEG00000018364) #21	TAF4B (ENSODEG00000018462) #22	ENSODEG00000020494	KCTD1 (ENSODEG00000018447) #24	AQP4 (ENSODEG00000018294) #25	CHST9 (ENSODEG00000018320) #26	CDH2 (ENSODEG00000018382) #27	ENSODEG00000020488	DSC3 (ENSODEG00000018293)	DSC2 (ENSODEG00000018413)	DSC1 (ENSODEG00000018325)	DSG1 (ENSODEG00000018310)	DSG4 (ENSODEG00000018468)	DSG3 (ENSODEG00000018316)	ENSODEG00000018312	TTR (ENSODEG00000018347)	B4GALT6 (ENSODEG00000018324)
Guinea pig	MODERN SPECIES	14	CABLES1 (ENSCPOG00000010935)	ENSCPOG00000007986	RIOK3 (ENSCPOG00000007991)	RMC1 (ENSCPOG00000006222)	NPC1 (ENSCPOG00000006230)	ANKRD29 (ENSCPOG00000007611)	LAMA3 (ENSCPOG00000007620)	TTC39C (ENSCPOG00000025455)	CABYR (ENSCPOG00000008281) #16	OSBPL1A (ENSCPOG00000008285) #17	IMPACT (ENSCPOG00000035662) #18	HRH4 (ENSCPOG00000001943)	ZNF521 (ENSCPOG00000015173) #19	SS18 (ENSCPOG00000004706) #20	PSMA8 (ENSCPOG00000012268) #21	TAF4B (ENSCPOG00000001414) #22	ENSCPOG00000003866 #24	AQP4 (ENSCPOG00000004446) #25	CHST9 (ENSCPOG00000010439) #26	CDH2 (ENSCPOG00000012391) #27	DSC2 (ENSCPOG00000005506)	DSC1 (ENSCPOG00000038286)	DSG1 (ENSCPOG00000005375)	DSG4 (ENSCPOG00000005388)	ENSCPOG00000036894	DSG2 (ENSCPOG00000038318)	TTR (ENSCPOG00000012845)	B4GALT6 (ENSCPOG00000039163)	TRAPPC8 (ENSCPOG00000012560)	RNF125 (ENSCPOG00000033178)	RNF138 (ENSCPOG00000003463)
Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES	31	ENSGT00400000022086.a	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a.a.b	ENSGT01030000234624.a.a.a	ENSGT01030000234624.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.b
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	31	ENSGT00400000022086.a	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638.qb	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a.a.b	ENSGT01030000234624.a.a.a	ENSGT01030000234624.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.b
Alpin marmot	MODERN SPECIES	10	RMC1 (ENSMMMG00000009792)	NPC1 (ENSMMMG00000009738)	ANKRD29 (ENSMMMG00000009665)	ENSMMMG00000009651	ENSMMMG00000009558	TTC39C (ENSMMMG00000009511)	ENSMMMG00000009452 #16	OSBPL1A (ENSMMMG00000009196) #17	IMPACT (ENSMMMG00000009173) #18	HRH4 (ENSMMMG00000009142)	ZNF521 (ENSMMMG00000009091) #19	ENSMMMG00000009075	ENSMMMG00000008900 #20	PSMA8 (ENSMMMG00000008885) #21	ENSMMMG00000008879	TAF4B (ENSMMMG00000008851) #22	ENSMMMG00000008841 #24	ENSMMMG00000008830	AQP4 (ENSMMMG00000008817) #25	CHST9 (ENSMMMG00000008809) #26	CDH2 (ENSMMMG00000008743) #27	DSC3 (ENSMMMG00000008685)	DSC2 (ENSMMMG00000008624)	DSC1 (ENSMMMG00000008573)	DSG1 (ENSMMMG00000008551)	DSG4 (ENSMMMG00000008531)	DSG3 (ENSMMMG00000008516)	DSG2 (ENSMMMG00000008445)	ENSMMMG00000008437	B4GALT6 (ENSMMMG00000008421)	TRAPPC8 (ENSMMMG00000008335)
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	146	ENSGT00400000022086.a	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638.qb	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27
Squirrel	MODERN SPECIES	150	CABLES1 (ENSSTOG00000010410)	TMEM241 (ENSSTOG00000030216)	RIOK3 (ENSSTOG00000006517)	RMC1 (ENSSTOG00000006546)	NPC1 (ENSSTOG00000006597)	ANKRD29 (ENSSTOG00000006644)	LAMA3 (ENSSTOG00000006658)	TTC39C (ENSSTOG00000028349)	CABYR (ENSSTOG00000015498) #16	OSBPL1A (ENSSTOG00000006443) #17	IMPACT (ENSSTOG00000027817) #18	HRH4 (ENSSTOG00000010835)	ZNF521 (ENSSTOG00000012398) #19	SS18 (ENSSTOG00000015699) #20	PSMA8 (ENSSTOG00000015708) #21	TAF4B (ENSSTOG00000015714) #22	ENSSTOG00000020222 #24	AQP4 (ENSSTOG00000013318) #25	CHST9 (ENSSTOG00000013145) #26	CDH2 (ENSSTOG00000002172) #27
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	55	RIOK3 (ENSUPAG00010012142)	RMC1 (ENSUPAG00010012152)	NPC1 (ENSUPAG00010012172)	ANKRD29 (ENSUPAG00010012216)	ENSUPAG00010012267	ENSUPAG00010012301	TTC39C (ENSUPAG00010012342)	ENSUPAG00010012372 #16	OSBPL1A (ENSUPAG00010012424) #17	ENSUPAG00010012655	IMPACT (ENSUPAG00010012665) #18	HRH4 (ENSUPAG00010012682)	ZNF521 (ENSUPAG00010012699) #19	SS18 (ENSUPAG00010012720) #20	PSMA8 (ENSUPAG00010012791) #21	TAF4B (ENSUPAG00010012814) #22	KCTD1 (ENSUPAG00010012862) #24	AQP4 (ENSUPAG00010012893) #25	CHST9 (ENSUPAG00010012950) #26	CDH2 (ENSUPAG00010012964) #27
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	4	ENSSVLG00005006776	ENSSVLG00005006800	ENSSVLG00005006973	RMC1 (ENSSVLG00005007150)	NPC1 (ENSSVLG00005007206)	ANKRD29 (ENSSVLG00005007255)	TTC39C (ENSSVLG00005009532)	CABYR (ENSSVLG00005009576) #16	OSBPL1A (ENSSVLG00005009639) #17	ENSSVLG00005009739 #18	HRH4 (ENSSVLG00005009808)	ZNF521 (ENSSVLG00005010017) #19	ENSSVLG00005010156	SS18 (ENSSVLG00005010199) #20	PSMA8 (ENSSVLG00005010327) #21	TAF4B (ENSSVLG00005010504) #22	KCTD1 (ENSSVLG00005010735) #24	ENSSVLG00005010820	ENSSVLG00005010863	AQP4 (ENSSVLG00005010877) #25	CHST9 (ENSSVLG00005010956) #26	ENSSVLG00005011071	CDH2 (ENSSVLG00005011122) #27	ENSSVLG00005011342	DSC3 (ENSSVLG00005011401)	DSC2 (ENSSVLG00005011858)	DSC1 (ENSSVLG00005012411)	DSG1 (ENSSVLG00005012802)	DSG4 (ENSSVLG00005013149)	ENSSVLG00005013223	DSG2 (ENSSVLG00005013337)
Lagomorpha	ANCESTRAL SPECIES	41	ENSGT00400000022086.a	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a.a.b	ENSGT01030000234624.a.a.a	ENSGT01030000234624.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.b
Rabbit	MODERN SPECIES	20	RIOK3 (ENSOCUG00000016820)	RMC1 (ENSOCUG00000009837)	NPC1 (ENSOCUG00000009850)	ANKRD29 (ENSOCUG00000009866)	LAMA3 (ENSOCUG00000009869)	TTC39C (ENSOCUG00000017109)	ENSOCUG00000024121 #16	OSBPL1A (ENSOCUG00000008393) #17	ENSOCUG00000029300	IMPACT (ENSOCUG00000013901) #18	HRH4 (ENSOCUG00000001327)	ZNF521 (ENSOCUG00000005774) #19	SS18 (ENSOCUG00000009081) #20	PSMA8 (ENSOCUG00000009092) #21	ENSOCUG00000013818	TAF4B (ENSOCUG00000005480) #22	ENSOCUG00000014635 #24	ENSOCUG00000035713	ENSOCUG00000037440	AQP4 (ENSOCUG00000008833) #25	CHST9 (ENSOCUG00000004444) #26	CDH2 (ENSOCUG00000003656) #27	ENSOCUG00000023260	ENSOCUG00000034452	ENSOCUG00000030006	ENSOCUG00000021903	DSC3 (ENSOCUG00000029143)	DSC2 (ENSOCUG00000012518)	DSC1 (ENSOCUG00000012534)	DSG1 (ENSOCUG00000006498)	DSG4 (ENSOCUG00000007342)
Pika	MODERN SPECIES	3426																ENSOPRG00000010329 #22	ENSOPRG00000010369
Tree shrew	MODERN SPECIES	2013																TAF4B (ENSTBEG00000002967) #22	ENSTBEG00000003350 #24
Laurasiatheria	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00940000167019	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a.a.b	ENSGT01030000234624.a.a.a	ENSGT01030000234624.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.b
Eulipotyphla	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00390000011620.a.a.a #22
Common shrew	MODERN SPECIES	2932																TAF4B (ENSSARG00000006618) #22
Laurasiatheria_a	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00940000167019	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a.a.b	ENSGT01030000234624.a.a.a	ENSGT01030000234624.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.b
Artiodactyla	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295.p #17	ENSGT00940000167019	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a.a.b	ENSGT01030000234624.a.a.a	ENSGT01030000234624.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.b
Suina	ANCESTRAL SPECIES	40	ENSGT00400000022086.a	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295.p #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a.a.b	ENSGT01030000234624.a.a.a	ENSGT01030000234624.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.b
Pig	MODERN SPECIES	14	CABLES1 (ENSSSCG00000003705)	TMEM241 (ENSSSCG00000040452)	RIOK3 (ENSSSCG00000029518)	RMC1 (ENSSSCG00000026851)	NPC1 (ENSSSCG00000003707)	ANKRD29 (ENSSSCG00000003708)	LAMA3 (ENSSSCG00000003709)	TTC39C (ENSSSCG00000003710)	CABYR (ENSSSCG00000003711) #16	OSBPL1A (ENSSSCG00000003712) #17	IMPACT (ENSSSCG00000003713) #18	HRH4 (ENSSSCG00000059661)	ZNF521 (ENSSSCG00000003715) #19	SS18 (ENSSSCG00000003716) #20	PSMA8 (ENSSSCG00000003717) #21	TAF4B (ENSSSCG00000003718) #22	KCTD1 (ENSSSCG00000003719) #24	AQP4 (ENSSSCG00000035965) #25	CHST9 (ENSSSCG00000003721) #26	ENSSSCG00000045209	CDH2 (ENSSSCG00000003722) #27	ENSSSCG00000045075	ENSSSCG00000042553	ENSSSCG00000042793	DSC3 (ENSSSCG00000057415)	DSC2 (ENSSSCG00000024800)	DSC1 (ENSSSCG00000003726)	DSG1 (ENSSSCG00000020694)	DSG4 (ENSSSCG00000020740)	DSG3 (ENSSSCG00000027160)	DSG2 (ENSSSCG00000022739)
Chacoan peccary	MODERN SPECIES	862	TMEM241 (ENSCWAG00000005565)	RIOK3 (ENSCWAG00000005515)	RMC1 (ENSCWAG00000005478)	NPC1 (ENSCWAG00000005449)	ANKRD29 (ENSCWAG00000005404)	LAMA3 (ENSCWAG00000004026)	ENSCWAG00000020189	TTC39C (ENSCWAG00000020146)	ENSCWAG00000020085 #16	OSBPL1A (ENSCWAG00000019990) #17	IMPACT (ENSCWAG00000019973) #18	HRH4 (ENSCWAG00000019958)	ZNF521 (ENSCWAG00000019923) #19	SS18 (ENSCWAG00000019844) #20	PSMA8 (ENSCWAG00000019755) #21	TAF4B (ENSCWAG00000019686) #22	KCTD1 (ENSCWAG00000019661) #24	AQP4 (ENSCWAG00000019645) #25	CHST9 (ENSCWAG00000019603) #26	CDH2 (ENSCWAG00000019535) #27	ENSCWAG00000019494	DSC3 (ENSCWAG00000019325)	DSC2 (ENSCWAG00000019274)	DSC1 (ENSCWAG00000019142)	DSG1 (ENSCWAG00000018793)	DSG4 (ENSCWAG00000018350)	DSG3 (ENSCWAG00000018245)	DSG2 (ENSCWAG00000018119)	TTR (ENSCWAG00000018057)	B4GALT6 (ENSCWAG00000017832)	TRAPPC8 (ENSCWAG00000017730)
Artiodactyla_a	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295.p #17	ENSGT00940000167019	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a.a.b	ENSGT01030000234624.a.a.a	ENSGT01030000234624.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.b
Camelidae	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00400000022086.a	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295.p #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a.a.b	ENSGT01030000234624.a.a.a	ENSGT01030000234624.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.b
Arabian camel	MODERN SPECIES	16	CABLES1 (ENSCDRG00005019795)	TMEM241 (ENSCDRG00005019764)	RIOK3 (ENSCDRG00005019730)	RMC1 (ENSCDRG00005019664)	NPC1 (ENSCDRG00005019635)	ANKRD29 (ENSCDRG00005019608)	LAMA3 (ENSCDRG00005018027)	TTC39C (ENSCDRG00005017842)	CABYR (ENSCDRG00005017825) #16	OSBPL1A (ENSCDRG00005017640) #17	IMPACT (ENSCDRG00005017568) #18	HRH4 (ENSCDRG00005017544)	ZNF521 (ENSCDRG00005017464) #19	SS18 (ENSCDRG00005017334) #20	PSMA8 (ENSCDRG00005017287) #21	TAF4B (ENSCDRG00005017258) #22	ENSCDRG00005017234 #24	AQP4 (ENSCDRG00005017200) #25	CHST9 (ENSCDRG00005017144) #26	CDH2 (ENSCDRG00005017031) #27	DSC3 (ENSCDRG00005016750)	DSC2 (ENSCDRG00005016676)	DSC1 (ENSCDRG00005016376)	DSG1 (ENSCDRG00005016118)	DSG4 (ENSCDRG00005015973)	DSG3 (ENSCDRG00005015844)	DSG2 (ENSCDRG00005015720)	TTR (ENSCDRG00005015690)	B4GALT6 (ENSCDRG00005015481)	TRAPPC8 (ENSCDRG00005014692)	RNF125 (ENSCDRG00005014604)
Alpaca	MODERN SPECIES	2720													ZNF521 (ENSVPAG00000011339) #19	SS18 (ENSVPAG00000011342) #20	PSMA8 (ENSVPAG00000011344) #21	TAF4B (ENSVPAG00000011346) #22
Artiodactyla_b	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295.p #17	ENSGT00940000167019	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a.a.b	ENSGT01030000234624.a.a.a	ENSGT01030000234624.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.b
Cetacea	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295.p #17	ENSGT00940000167019	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a.a.b	ENSGT01030000234624.a.a.a	ENSGT01030000234624.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.b	ENSGT00950000182909.b.a.a
Odontoceti	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000173219	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295.p #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a.a.b	ENSGT01030000234624.a.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.b	ENSGT00950000182909.b.a.a	ENSGT00950000183111.b.a
Odontoceti_a	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000173219	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295.p #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a.a.b	ENSGT01030000234624.a.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.b	ENSGT00950000182909.b.a.a	ENSGT00950000183111.b.a
Odontoceti_b	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000173219	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295.p #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00390000011776.f	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a.a.b	ENSGT01030000234624.a.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT00950000183087.A.a.a.a.b.b.a.b.a.a	ENSGT00390000007685.h	ENSGT00390000000568
Monodontidae	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000173219	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295.p #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00390000011776.f	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a.a.b	ENSGT01030000234624.a.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT00950000183087.A.a.a.a.b.b.a.b.a.a	ENSGT00390000007685.h	ENSGT00390000000568
Narwhal	MODERN SPECIES	295	TMEM241 (ENSMMNG00015002295)	RIOK3 (ENSMMNG00015002244)	RMC1 (ENSMMNG00015002190)	NPC1 (ENSMMNG00015002098)	ANKRD29 (ENSMMNG00015002037)	LAMA3 (ENSMMNG00015001617)	TTC39C (ENSMMNG00015001372)	ENSMMNG00015001325 #16	OSBPL1A (ENSMMNG00015001205) #17	IMPACT (ENSMMNG00015001153) #18	HRH4 (ENSMMNG00015001127)	ZNF521 (ENSMMNG00015001108) #19	ENSMMNG00015001086 #19	SS18 (ENSMMNG00015001019) #20	PSMA8 (ENSMMNG00015000923) #21	TAF4B (ENSMMNG00015000855) #22	KCTD1 (ENSMMNG00015000811) #24	AMD1 (ENSMMNG00015000790)	AQP4 (ENSMMNG00015000774) #25	CHST9 (ENSMMNG00015000747) #26	CDH2 (ENSMMNG00015000659) #27	DSC3 (ENSMMNG00015000550)	DSC2 (ENSMMNG00015000465)	DSG1 (ENSMMNG00015000381)	DSG3 (ENSMMNG00015000308)	DSG2 (ENSMMNG00015000258)	TTR (ENSMMNG00015000227)	B4GALT6 (ENSMMNG00015000197)	ENSMMNG00015000161	ENSMMNG00015000145	TRAPPC8 (ENSMMNG00015000071)
Beluga whale	MODERN SPECIES	11	ENSDLEG00000002769	ENSDLEG00000002775	RIOK3 (ENSDLEG00000002781)	CUNH18orf8 (ENSDLEG00000002795)	NPC1 (ENSDLEG00000002888)	ANKRD29 (ENSDLEG00000002958)	LAMA3 (ENSDLEG00000003188)	TTC39C (ENSDLEG00000003460)	ENSDLEG00000003488 #16	OSBPL1A (ENSDLEG00000003564) #17	IMPACT (ENSDLEG00000003771) #18	HRH4 (ENSDLEG00000003777)	ZNF521 (ENSDLEG00000003793) #19	SS18 (ENSDLEG00000003880) #20	PSMA8 (ENSDLEG00000003904) #21	TAF4B (ENSDLEG00000003952) #22	KCTD1 (ENSDLEG00000003970) #24	AMD1 (ENSDLEG00000003978)	AQP4 (ENSDLEG00000003985) #25	CHST9 (ENSDLEG00000003994) #26	CDH2 (ENSDLEG00000004000) #27	DSC3 (ENSDLEG00000004017)	DSG1 (ENSDLEG00000004534)	DSG3 (ENSDLEG00000004550)	DSG2 (ENSDLEG00000004576)	ENSDLEG00000004599	ENSDLEG00000004605	ENSDLEG00000004612	B4GALT6 (ENSDLEG00000004625)	ENSDLEG00000004641	ENSDLEG00000004652
Vaquita	MODERN SPECIES	5	CABLES1 (ENSPSNG00000009762)	TMEM241 (ENSPSNG00000009641)	RIOK3 (ENSPSNG00000009505)	RMC1 (ENSPSNG00000009338)	NPC1 (ENSPSNG00000009174)	ANKRD29 (ENSPSNG00000009122)	LAMA3 (ENSPSNG00000008984)	TTC39C (ENSPSNG00000008785)	ENSPSNG00000008710 #16	OSBPL1A (ENSPSNG00000008616) #17	IMPACT (ENSPSNG00000008545) #18	ENSPSNG00000008502	ZNF521 (ENSPSNG00000008452) #19	SS18 (ENSPSNG00000008316) #20	PSMA8 (ENSPSNG00000008154) #21	TAF4B (ENSPSNG00000008105) #22	KCTD1 (ENSPSNG00000008060) #24	AMD1 (ENSPSNG00000008027)	AQP4 (ENSPSNG00000007970) #25	CHST9 (ENSPSNG00000007952) #26	ENSPSNG00000007913	CDH2 (ENSPSNG00000007787) #27	ENSPSNG00000007734	DSC3 (ENSPSNG00000007681)	DSC2 (ENSPSNG00000007597)	DSG1 (ENSPSNG00000007476)	DSG3 (ENSPSNG00000007363)	DSG2 (ENSPSNG00000007220)	TTR (ENSPSNG00000007168)	B4GALT6 (ENSPSNG00000007068)	ENSPSNG00000007001
Dolphin	MODERN SPECIES	1170															PSMA8 (ENSTTRG00000014586) #21	TAF4B (ENSTTRG00000014587) #22	KCTD1 (ENSTTRG00000014588) #24
Sperm whale	MODERN SPECIES	10	CABLES1 (ENSPCTG00005022117)	TMEM241 (ENSPCTG00005022186)	RIOK3 (ENSPCTG00005022208)	RMC1 (ENSPCTG00005022219)	NPC1 (ENSPCTG00005022232)	ANKRD29 (ENSPCTG00005022261)	LAMA3 (ENSPCTG00005022309)	TTC39C (ENSPCTG00005022342)	ENSPCTG00005022352 #16	OSBPL1A (ENSPCTG00005022359) #17	IMPACT (ENSPCTG00005022371) #18	HRH4 (ENSPCTG00005022384)	ZNF521 (ENSPCTG00005022406) #19	SS18 (ENSPCTG00005022418) #20	PSMA8 (ENSPCTG00005022434) #21	TAF4B (ENSPCTG00005022465) #22	ENSPCTG00005022469 #24	ENSPCTG00005022475	AQP4 (ENSPCTG00005022481) #25	CHST9 (ENSPCTG00005022483) #26	CDH2 (ENSPCTG00005022489) #27	ENSPCTG00005022497	DSC3 (ENSPCTG00005022499)	DSC2 (ENSPCTG00005022506)	DSG1 (ENSPCTG00005022535)	DSG3 (ENSPCTG00005022542)	DSG2 (ENSPCTG00005022548)	TTR (ENSPCTG00005022550)	B4GALT6 (ENSPCTG00005022552)	ENSPCTG00005022563	TRAPPC8 (ENSPCTG00005022572)
Blue whale	MODERN SPECIES	5	RIOK3 (ENSBMSG00010013347)	RMC1 (ENSBMSG00010013380)	NPC1 (ENSBMSG00010013397)	ANKRD29 (ENSBMSG00010013429)	ENSBMSG00010013460	ENSBMSG00010013526	TTC39C (ENSBMSG00010013630)	ENSBMSG00010013674 #16	OSBPL1A (ENSBMSG00010013730) #17	ENSBMSG00010013746	IMPACT (ENSBMSG00010013762) #18	ENSBMSG00010013781	ZNF521 (ENSBMSG00010013791) #19	SS18 (ENSBMSG00010013837) #20	PSMA8 (ENSBMSG00010013887) #21	TAF4B (ENSBMSG00010013965) #22	KCTD1 (ENSBMSG00010014015) #24	AQP4 (ENSBMSG00010014087) #25	CHST9 (ENSBMSG00010014144) #26	CDH2 (ENSBMSG00010013919) #27	DSC3 (ENSBMSG00010014116)	DSC2 (ENSBMSG00010014259)	DSC1 (ENSBMSG00010014439)	DSG1 (ENSBMSG00010014619)	DSG3 (ENSBMSG00010014691)	DSG2 (ENSBMSG00010014748)	TTR (ENSBMSG00010014822)	B4GALT6 (ENSBMSG00010014860)	ENSBMSG00010015035	TRAPPC8 (ENSBMSG00010015070)	RNF125 (ENSBMSG00010015130)
Pecora	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00400000022086.a	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295.p #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a.a.b	ENSGT01030000234624.a.a.a	ENSGT01030000234624.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.b
Yarkand deer	MODERN SPECIES	19	TMEM241 (ENSCHYG00000021258)	RIOK3 (ENSCHYG00000021752)	RMC1 (ENSCHYG00000021923)	NPC1 (ENSCHYG00000022083)	ANKRD29 (ENSCHYG00000022311)	LAMA3 (ENSCHYG00000022890)	TTC39C (ENSCHYG00000025288)	ENSCHYG00000025325 #16	OSBPL1A (ENSCHYG00000025361) #17	IMPACT (ENSCHYG00000025487) #18	HRH4 (ENSCHYG00000025602)	ENSCHYG00000025622	ZNF521 (ENSCHYG00000025646) #19	SS18 (ENSCHYG00000025725) #20	PSMA8 (ENSCHYG00000025804) #21	TAF4B (ENSCHYG00000025823) #22	KCTD1 (ENSCHYG00000025850) #24	AQP4 (ENSCHYG00000025868) #25	CHST9 (ENSCHYG00000025890) #26	CDH2 (ENSCHYG00000025907) #27	ENSCHYG00000025944	ENSCHYG00000025978	ENSCHYG00000025965	DSC3 (ENSCHYG00000026008)	DSC2 (ENSCHYG00000026115)	ENSCHYG00000026180	DSG1 (ENSCHYG00000026189)	DSG4 (ENSCHYG00000026207)	DSG3 (ENSCHYG00000026242)	TTR (ENSCHYG00000026307)	B4GALT6 (ENSCHYG00000026327)
Percora_a	ANCESTRAL SPECIES	28	ENSGT00400000022086.a	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295.p #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a.a.b	ENSGT01030000234624.a.a.a	ENSGT01030000234624.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.b
Bovidae	ANCESTRAL SPECIES	28	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00390000004856.w.a.a.b.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295.p #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352.l #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a.a.b	ENSGT01030000234624.a.a.a	ENSGT01030000234624.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.b
Bovinae	ANCESTRAL SPECIES	28	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00390000004856.w.a.a.b.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295.p #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352.l #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00390000001562.b	ENSGT00390000016713.b	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a.a.b	ENSGT01030000234624.a.a.a	ENSGT01030000234624.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138
Bos	ANCESTRAL SPECIES	29	ENSGT00400000022086.a	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295.p #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352.l #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00390000001562.b.b	ENSGT00390000016713.b	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a.a.b	ENSGT01030000234624.a.a.a	ENSGT01030000234624.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138
Bos_b	ANCESTRAL SPECIES	34	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT01100000263480.a.a.b.b.b.a.a.a.a.a.a.a.b	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295.p #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352.l #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00390000001562.b.b	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00390000016713.b	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a.a.b	ENSGT01030000234624.a.a.a	ENSGT01030000234624.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138
Cow	MODERN SPECIES	16	RMC1 (ENSBTAG00000015190)	NPC1 (ENSBTAG00000015195)	ANKRD29 (ENSBTAG00000000517)	ENSBTAG00000051310	LAMA3 (ENSBTAG00000027181)	ENSBTAG00000055205	TTC39C (ENSBTAG00000005635)	CABYR (ENSBTAG00000005638) #16	OSBPL1A (ENSBTAG00000023259) #17	IMPACT (ENSBTAG00000003035) #18	HRH4 (ENSBTAG00000020467)	ZNF521 (ENSBTAG00000007383) #19	ENSBTAG00000050912	SS18 (ENSBTAG00000011531) #20	PSMA8 (ENSBTAG00000017698) #21	TAF4B (ENSBTAG00000004257) #22	KCTD1 (ENSBTAG00000050380) #24	AQP4 (ENSBTAG00000051072) #25	ENSBTAG00000034032	CHST9 (ENSBTAG00000014082) #26	ENSBTAG00000044212	CDH2 (ENSBTAG00000021190) #27	DSC3 (ENSBTAG00000015238)	DSC2 (ENSBTAG00000040584)	DSC1 (ENSBTAG00000019876)	DSG1 (ENSBTAG00000013831)	DSG4 (ENSBTAG00000040126)	DSG3 (ENSBTAG00000039483)	DSG2 (ENSBTAG00000021923)	TTR (ENSBTAG00000010991)	B4GALT6 (ENSBTAG00000044063)
Hybrid Bos Indicus	MODERN SPECIES	16	RIOK3 (ENSBIXG00005015293)	RMC1 (ENSBIXG00005002251)	NPC1 (ENSBIXG00005006342)	ANKRD29 (ENSBIXG00005015389)	ENSBIXG00005015416	LAMA3 (ENSBIXG00005015748)	TTC39C (ENSBIXG00005000166)	ENSBIXG00005015863 #16	ENSBIXG00005015877	ENSBIXG00005015918 #17	IMPACT (ENSBIXG00005016003) #18	HRH4 (ENSBIXG00005016024)	ZNF521 (ENSBIXG00005016101) #19	SS18 (ENSBIXG00005016267) #20	PSMA8 (ENSBIXG00005016367) #21	TAF4B (ENSBIXG00005016451) #22	KCTD1 (ENSBIXG00005006350) #24	ENSBIXG00005016522	AQP4 (ENSBIXG00005016607) #25	ENSBIXG00005002677	CHST9 (ENSBIXG00005016684) #26	ENSBIXG00005016729	CDH2 (ENSBIXG00005016836) #27	DSC2 (ENSBIXG00005017035)	DSG1 (ENSBIXG00005017148)	DSG2 (ENSBIXG00005017262)	TTR (ENSBIXG00005017301)	B4GALT6 (ENSBIXG00005006868)	TRAPPC8 (ENSBIXG00005017378)	RNF125 (ENSBIXG00005017425)	RNF138 (ENSBIXG00005017505)
Bos_a	ANCESTRAL SPECIES	28	ENSGT00400000022086.a	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295.p #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352.l #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00390000001562.b.b	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a.a.b	ENSGT01030000234624.a.a.a	ENSGT01030000234624.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT00390000000568
Wild yak	MODERN SPECIES	1833													ZNF521 (ENSBMUG00000016252) #19	ENSBMUG00000016291 #20	PSMA8 (ENSBMUG00000016299) #21	TAF4B (ENSBMUG00000016359) #22	KCTD1 (ENSBMUG00000016424) #24	AQP4 (ENSBMUG00000016437) #25	ENSBMUG00000016443 #26	ENSBMUG00000016450
Domestic yak	MODERN SPECIES	13	NPC1 (ENSBGRG00000025764)	ANKRD29 (ENSBGRG00000025736)	ENSBGRG00000025725	ENSBGRG00000025723	LAMA3 (ENSBGRG00000025081)	TTC39C (ENSBGRG00000025000)	CABYR (ENSBGRG00000024984) #16	ENSBGRG00000024973	ENSBGRG00000024936 #17	IMPACT (ENSBGRG00000024891) #18	ENSBGRG00000024882	ENSBGRG00000024872	ZNF521 (ENSBGRG00000024829) #19	SS18 (ENSBGRG00000024680) #20	PSMA8 (ENSBGRG00000024651) #21	TAF4B (ENSBGRG00000024498) #22	KCTD1 (ENSBGRG00000024405) #24	AQP4 (ENSBGRG00000024349) #25	ENSBGRG00000024321	CHST9 (ENSBGRG00000024193) #26	CDH2 (ENSBGRG00000023975) #27	ENSBGRG00000023902	DSC2 (ENSBGRG00000023388)	DSC1 (ENSBGRG00000023106)	DSG1 (ENSBGRG00000023015)	DSG4 (ENSBGRG00000022932)	DSG3 (ENSBGRG00000022834)	DSG2 (ENSBGRG00000022705)	TTR (ENSBGRG00000022634)	B4GALT6 (ENSBGRG00000022553)	TRAPPC8 (ENSBGRG00000022272)
American bison	MODERN SPECIES	3353	TMEM241 (ENSBBBG00000020754)	RIOK3 (ENSBBBG00000020738)	RMC1 (ENSBBBG00000005582)	NPC1 (ENSBBBG00000020529)	ANKRD29 (ENSBBBG00000000563)	LAMA3 (ENSBBBG00000000608)	ENSBBBG00000020155	TTC39C (ENSBBBG00000020150)	CABYR (ENSBBBG00000020139) #16	ENSBBBG00000020113 #17	IMPACT (ENSBBBG00000020060) #18	HRH4 (ENSBBBG00000020050)	ZNF521 (ENSBBBG00000020027) #19	SS18 (ENSBBBG00000020014) #20	PSMA8 (ENSBBBG00000019972) #21	TAF4B (ENSBBBG00000005395) #22	ENSBBBG00000019929 #24	AQP4 (ENSBBBG00000019912) #25	CHST9 (ENSBBBG00000005388) #26	ENSBBBG00000006970	ENSBBBG00000019869	CDH2 (ENSBBBG00000019864) #27	DSC3 (ENSBBBG00000019832)	DSC2 (ENSBBBG00000019761)	DSC1 (ENSBBBG00000019687)	DSG1 (ENSBBBG00000019650)	DSG4 (ENSBBBG00000005298)	DSG3 (ENSBBBG00000005283)	DSG2 (ENSBBBG00000019513)	TTR (ENSBBBG00000019495)	B4GALT6 (ENSBBBG00000019479)
Caprinae	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00390000004856.w.a.a.b.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295.p #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352.l #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a.a.b	ENSGT01030000234624.a.a.a	ENSGT01030000234624.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.b
Goat	MODERN SPECIES	16	RIOK3 (ENSCHIG00000009312)	ENSCHIG00000024653	ENSCHIG00000021287	ANKRD29 (ENSCHIG00000018673)	ENSCHIG00000015951	LAMA3 (ENSCHIG00000013633)	TTC39C (ENSCHIG00000009120)	CABYR (ENSCHIG00000009351) #16	OSBPL1A (ENSCHIG00000000386) #17	IMPACT (ENSCHIG00000000286) #18	HRH4 (ENSCHIG00000000251)	ZNF521 (ENSCHIG00000000138) #19	SS18 (ENSCHIG00000000067) #20	ENSCHIG00000000490 #20	PSMA8 (ENSCHIG00000018832) #21	TAF4B (ENSCHIG00000022055) #22	KCTD1 (ENSCHIG00000013103) #24	AQP4 (ENSCHIG00000010124) #25	CHST9 (ENSCHIG00000021685) #26	ENSCHIG00000003085	CDH2 (ENSCHIG00000018662) #27	ENSCHIG00000007130	DSC3 (ENSCHIG00000021926)	DSC2 (ENSCHIG00000020827)	DSC1 (ENSCHIG00000006661)	DSG1 (ENSCHIG00000019924)	DSG4 (ENSCHIG00000024819)	DSG3 (ENSCHIG00000021842)	DSG2 (ENSCHIG00000016271)	TTR (ENSCHIG00000009995)	B4GALT6 (ENSCHIG00000000421)
Rambouillet Sheep	MODERN SPECIES	15	CABLES1 (ENSOARG00020025896)	TMEM241 (ENSOARG00020025890)	RIOK3 (ENSOARG00020025882)	RMC1 (ENSOARG00020025860)	ENSOARG00020025767	ANKRD29 (ENSOARG00020025754)	LAMA3 (ENSOARG00020025616)	TTC39C (ENSOARG00020025558)	CABYR (ENSOARG00020025548) #16	OSBPL1A (ENSOARG00020025534) #17	ENSOARG00020025524 #18	HRH4 (ENSOARG00020025511)	ZNF521 (ENSOARG00020025499) #19	SS18 (ENSOARG00020025456) #20	PSMA8 (ENSOARG00020025430) #21	TAF4B (ENSOARG00020025408) #22	KCTD1 (ENSOARG00020025395) #24	AQP4 (ENSOARG00020025374) #25	CHST9 (ENSOARG00020025358) #26	ENSOARG00020025350	CDH2 (ENSOARG00020025259) #27	ENSOARG00020025211	DSC2 (ENSOARG00020025065)	DSC1 (ENSOARG00020024999)	DSG1 (ENSOARG00020024979)	DSG4 (ENSOARG00020024957)	DSG2 (ENSOARG00020024912)	TTR (ENSOARG00020024865)	B4GALT6 (ENSOARG00020024733)	TRAPPC8 (ENSOARG00020024583)	RNF125 (ENSOARG00020024558)
Siberian musk deer	MODERN SPECIES	134													ENSMMSG00000013355	SS18 (ENSMMSG00000013386) #20	PSMA8 (ENSMMSG00000013624) #21	TAF4B (ENSMMSG00000013698) #22	KCTD1 (ENSMMSG00000013715) #24	AQP4 (ENSMMSG00000013736) #25	CHST9 (ENSMMSG00000013757) #26	ENSMMSG00000013798	CDH2 (ENSMMSG00000013812) #27	ENSMMSG00000013827	DSC3 (ENSMMSG00000013852)	DSC2 (ENSMMSG00000013889)	DSC1 (ENSMMSG00000014056)	DSG1 (ENSMMSG00000014105)	DSG4 (ENSMMSG00000014133)	DSG3 (ENSMMSG00000014240)	DSG2 (ENSMMSG00000014273)	TTR (ENSMMSG00000014292)	B4GALT6 (ENSMMSG00000014329)
Laurasiatheria_b	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00940000167019	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a.a.b	ENSGT01030000234624.a.a.a	ENSGT01030000234624.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.b
Carnivora	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00940000167019	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a.a.b	ENSGT01030000234624.a.a.a	ENSGT01030000234624.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.b
Caniformia	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00940000167019	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000162118.e	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a.a.b	ENSGT01030000234624.a.a.a	ENSGT01030000234624.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.b
Canidae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00400000022086.a	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000162118.e	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT00980000198488.m.a.a.b.b	ENSGT01030000234624.a.a.b	ENSGT01030000234624.a.a.a	ENSGT01030000234624.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT00390000000568
Canis_lupus	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00400000022086.a	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000162118.e	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT00390000004553.v	ENSGT00980000198488.m.a.a.b.b	ENSGT01030000234624.a.a.b	ENSGT01030000234624.a.a.a	ENSGT01030000234624.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138
Dingo	MODERN SPECIES	271	RIOK3 (ENSCAFG00020014801)	RMC1 (ENSCAFG00020014780)	NPC1 (ENSCAFG00020014675)	ANKRD29 (ENSCAFG00020014654)	LAMA3 (ENSCAFG00020014281)	TTC39C (ENSCAFG00020014227)	ENSCAFG00020014222 #16	ENSCAFG00020014086 #17	ENSCAFG00020013993 #17	IMPACT (ENSCAFG00020013938) #18	ENSCAFG00020013917	ENSCAFG00020013914	ZNF521 (ENSCAFG00020013903) #19	SS18 (ENSCAFG00020013878) #20	PSMA8 (ENSCAFG00020013698) #21	TAF4B (ENSCAFG00020013685) #22	KCTD1 (ENSCAFG00020013668) #24	AQP4 (ENSCAFG00020013646) #25	CHST9 (ENSCAFG00020013635) #26	CDH2 (ENSCAFG00020013609) #27	ENSCAFG00020013571	ENSCAFG00020013564	DSC3 (ENSCAFG00020013446)	DSC2 (ENSCAFG00020013421)	DSC1 (ENSCAFG00020013393)	DSG1 (ENSCAFG00020013329)	DSG4 (ENSCAFG00020013300)	DSG3 (ENSCAFG00020013288)	DSG2 (ENSCAFG00020013244)	TTR (ENSCAFG00020013232)	B4GALT6 (ENSCAFG00020013195)
Dog	MODERN SPECIES	35	CABLES1 (ENSCAFG00845015409)	TMEM241 (ENSCAFG00845015272)	RIOK3 (ENSCAFG00845015169)	RMC1 (ENSCAFG00845015104)	NPC1 (ENSCAFG00845014993)	NPC1 (ENSCAFG00845014901)	LAMA3 (ENSCAFG00845013821)	TTC39C (ENSCAFG00845013441)	CABYR (ENSCAFG00845013397) #16	OSBPL1A (ENSCAFG00845013281) #17	IMPACT (ENSCAFG00845013207) #18	HRH4 (ENSCAFG00845013170)	ZNF521 (ENSCAFG00845013072) #19	SS18 (ENSCAFG00845012949) #20	PSMA8 (ENSCAFG00845012864) #21	TAF4B (ENSCAFG00845012684) #22	KCTD1 (ENSCAFG00845012599) #24	AQP4 (ENSCAFG00845012372) #25	CHST9 (ENSCAFG00845012262) #26	CDH2 (ENSCAFG00845012116) #27	NACA (ENSCAFG00845012021)	ENSCAFG00845011983	ENSCAFG00845011961	ENSCAFG00845011726	DSC1 (ENSCAFG00845011207)	DSG1 (ENSCAFG00845011100)	DSG4 (ENSCAFG00845011015)	DSG3 (ENSCAFG00845010787)	DSG3 (ENSCAFG00845010678)	TTR (ENSCAFG00845010593)	B4GALT6 (ENSCAFG00845010375)
Red fox	MODERN SPECIES	59	RMC1 (ENSVVUG00000003607)	NPC1 (ENSVVUG00000003568)	ANKRD29 (ENSVVUG00000003517)	ENSVVUG00000003344	ENSVVUG00000003076	TTC39C (ENSVVUG00000002483)	ENSVVUG00000002436	ENSVVUG00000002402 #16	OSBPL1A (ENSVVUG00000002376) #17	IMPACT (ENSVVUG00000002343) #18	ENSVVUG00000002311	ENSVVUG00000002292	ZNF521 (ENSVVUG00000002266) #19	SS18 (ENSVVUG00000002235) #20	PSMA8 (ENSVVUG00000002220) #21	TAF4B (ENSVVUG00000001125) #22	KCTD1 (ENSVVUG00000001039) #24	AQP4 (ENSVVUG00000001023) #25	CHST9 (ENSVVUG00000001006) #26
Caniformia_b	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00940000167019	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000162118.e	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a.a.b	ENSGT01030000234624.a.a.a	ENSGT01030000234624.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.b
Mustelinae	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00400000022086.a	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000162118.e	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a.a.b	ENSGT01030000234624.a.a.a	ENSGT01030000234624.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.b
American mink	MODERN SPECIES	1	RIOK3 (ENSNVIG00000018076)	RMC1 (ENSNVIG00000018147)	NPC1 (ENSNVIG00000018281)	ANR29 (ENSNVIG00000018355)	LAMA3 (ENSNVIG00000018409)	ENSNVIG00000018571	TTC39C (ENSNVIG00000018583)	ENSNVIG00000018609 #16	OSBPL1A (ENSNVIG00000018623) #17	IMPACT (ENSNVIG00000018693) #18	ENSNVIG00000018708	ENSNVIG00000018716	ZNF521 (ENSNVIG00000018732) #19	SS18 (ENSNVIG00000018774) #20	PSMA8 (ENSNVIG00000018831) #21	TAF4B (ENSNVIG00000018854) #22	ENSNVIG00000018893 #24	ENSNVIG00000018920	AQP4 (ENSNVIG00000018926) #25	CHST9 (ENSNVIG00000018950) #26	CDH2 (ENSNVIG00000019000) #27	ENSNVIG00000019096	ENSNVIG00000019102	DSC3 (ENSNVIG00000019127)	DSC2 (ENSNVIG00000019179)	DSC1 (ENSNVIG00000019253)	ENSNVIG00000019336	ENSNVIG00000019374	DSG4 (ENSNVIG00000019385)	DSG3 (ENSNVIG00000019418)	DSG2 (ENSNVIG00000019460)
Ferret	MODERN SPECIES	170	RMC1 (ENSMPUG00000005780)	NPC1 (ENSMPUG00000005792)	ANKRD29 (ENSMPUG00000005801)	LAMA3 (ENSMPUG00000005805)	TTC39C (ENSMPUG00000005831)	ENSMPUG00000005839 #16	OSBPL1A (ENSMPUG00000005858) #17	IMPACT (ENSMPUG00000006271) #18	HRH4 (ENSMPUG00000006279)	ENSMPUG00000006318	ZNF521 (ENSMPUG00000006327) #19	ENSMPUG00000006336	ENSMPUG00000006340	SS18 (ENSMPUG00000006348) #20	PSMA8 (ENSMPUG00000006359) #21	TAF4B (ENSMPUG00000006462) #22	ENSMPUG00000006530 #24	AQP4 (ENSMPUG00000006589) #25	CHST9 (ENSMPUG00000006597) #26	CDH2 (ENSMPUG00000006602) #27	ENSMPUG00000006618	DSC3 (ENSMPUG00000006644)	DSC2 (ENSMPUG00000006720)	DSC1 (ENSMPUG00000006835)	DSG1 (ENSMPUG00000006844)	DSG4 (ENSMPUG00000006860)	DSG3 (ENSMPUG00000006917)	DSG2 (ENSMPUG00000006935)	TTR (ENSMPUG00000006945)	B4GALT6 (ENSMPUG00000006952)	TRAPPC8 (ENSMPUG00000006957)
Ursidae	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00940000167019	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000162118.e	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a.a.b	ENSGT01030000234624.a.a.a	ENSGT01030000234624.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.b
Ursus	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638.eb	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00940000167019	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000162118.e	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT00390000007046.b.a.a	ENSGT00940000162838	ENSGT01030000234624.a.a.b	ENSGT01030000234624.a.a.a	ENSGT01030000234624.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138
Polar bear	MODERN SPECIES	96	ENSUMAG00000020203	RIOK3 (ENSUMAG00000020218)	RMC1 (ENSUMAG00000020262)	NPC1 (ENSUMAG00000020524)	ANKRD29 (ENSUMAG00000021234)	LAMA3 (ENSUMAG00000021281)	TTC39C (ENSUMAG00000021402)	CABYR (ENSUMAG00000021463) #16	OSBPL1A (ENSUMAG00000021473) #17	ENSUMAG00000021518	IMPACT (ENSUMAG00000021522) #18	HRH4 (ENSUMAG00000021529)	ZNF521 (ENSUMAG00000021540) #19	SS18 (ENSUMAG00000021552) #20	PSMA8 (ENSUMAG00000021564) #21	TAF4B (ENSUMAG00000021608) #22	ENSUMAG00000021638 #24	AQP4 (ENSUMAG00000021644) #25	CHST9 (ENSUMAG00000021649) #26	CDH2 (ENSUMAG00000021664) #27	ENSUMAG00000000069	DSC3 (ENSUMAG00000000224)	DSC2 (ENSUMAG00000000461)	DSC1 (ENSUMAG00000000916)	DSG1 (ENSUMAG00000001090)	DSG4 (ENSUMAG00000001230)	DSG3 (ENSUMAG00000001331)	ENSUMAG00000001379	TTR (ENSUMAG00000001418)	B4GALT6 (ENSUMAG00000001499)	TRAPPC8 (ENSUMAG00000001511)
American black bear	MODERN SPECIES	4800															ENSUAMG00000026371	TAF4B (ENSUAMG00000026372) #22
Giant Panda	MODERN SPECIES	5	TMEM241 (ENSAMEG00000013748)	RIOK3 (ENSAMEG00000013754)	RMC1 (ENSAMEG00000013782)	NPC1 (ENSAMEG00000013828)	ANKRD29 (ENSAMEG00000013881)	LAMA3 (ENSAMEG00000013890)	TTC39C (ENSAMEG00000014026)	ENSAMEG00000014040 #16	OSBPL1A (ENSAMEG00000014045) #17	IMPACT (ENSAMEG00000014120) #18	ENSAMEG00000031092	ENSAMEG00000027220	ZNF521 (ENSAMEG00000014151) #19	SS18 (ENSAMEG00000014156) #20	PSMA8 (ENSAMEG00000014174) #21	TAF4B (ENSAMEG00000014196) #22	KCTD1 (ENSAMEG00000014212) #24	AQP4 (ENSAMEG00000014219) #25	CHST9 (ENSAMEG00000014226) #26	ENSAMEG00000011916 #27	ENSAMEG00000009932	ENSAMEG00000009920	MEP1B (ENSAMEG00000009890)	GAREM1 (ENSAMEG00000009884)	KLHL14 (ENSAMEG00000024996)	ENSAMEG00000025674	ENSAMEG00000014913	CCDC178 (ENSAMEG00000000566)	ASXL3 (ENSAMEG00000023934)	NOL4 (ENSAMEG00000000547)	ENSAMEG00000019611
Felidae	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00940000167019	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a.a.b	ENSGT01030000234624.a.a.a	ENSGT01030000234624.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.b
Panthera	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00940000167019	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00520000055616.a.q.a.a	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a.a.b	ENSGT01030000234624.a.a.a	ENSGT01030000234624.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.b
Tiger	MODERN SPECIES	75	RIOK3 (ENSPTIG00000000960)	RMC1 (ENSPTIG00000009904)	NPC1 (ENSPTIG00000015286)	ANKRD29 (ENSPTIG00000017790)	LAMA3 (ENSPTIG00000019801)	TTC39C (ENSPTIG00000018592)	ENSPTIG00000002843 #16	ENSPTIG00000008065 #17	ENSPTIG00000011000	IMPACT (ENSPTIG00000011421) #18	HRH4 (ENSPTIG00000013208)	ZNF521 (ENSPTIG00000014126) #19	ENSPTIG00000000680	SS18 (ENSPTIG00000017644) #20	PSMA8 (ENSPTIG00000005108) #21	TAF4B (ENSPTIG00000007195) #22	ENSPTIG00000010059 #24	AQP4 (ENSPTIG00000013254) #25	CHST9 (ENSPTIG00000014271) #26	CDH2 (ENSPTIG00000016332) #27
Panthera_a	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00520000055616.a.q.a.a	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a.a.b	ENSGT01030000234624.a.a.a	ENSGT01030000234624.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.b
leopard	MODERN SPECIES	46	RIOK3 (ENSPPRG00000023302)	RMC1 (ENSPPRG00000001151)	NPC1 (ENSPPRG00000002275)	ANKRD29 (ENSPPRG00000005196)	LAMA3 (ENSPPRG00000001850)	TTC39C (ENSPPRG00000002996)	ENSPPRG00000004985 #16	ENSPPRG00000005488	ENSPPRG00000005863	IMPACT (ENSPPRG00000007184) #18	HRH4 (ENSPPRG00000007547)	ZNF521 (ENSPPRG00000009183) #19	ENSPPRG00000018553	SS18 (ENSPPRG00000010055) #20	PSMA8 (ENSPPRG00000011553) #21	TAF4B (ENSPPRG00000012654) #22	ENSPPRG00000016224 #24	AQP4 (ENSPPRG00000019143) #25	CHST9 (ENSPPRG00000020253) #26	CDH2 (ENSPPRG00000023850) #27	ENSPPRG00000023603	DSC3 (ENSPPRG00000000357)	DSC2 (ENSPPRG00000001123)	DSC1 (ENSPPRG00000002669)	DSG1 (ENSPPRG00000003619)	DSG4 (ENSPPRG00000004122)	DSG3 (ENSPPRG00000004874)	ENSPPRG00000005216	TTR (ENSPPRG00000005939)	B4GALT6 (ENSPPRG00000007304)	TRAPPC8 (ENSPPRG00000011622)
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Cat	MODERN SPECIES	243	TMEM241 (ENSFCAG00000038945)	RIOK3 (ENSFCAG00000000517)	ENSFCAG00000035470	RMC1 (ENSFCAG00000000518)	NPC1 (ENSFCAG00000000519)	ANKRD29 (ENSFCAG00000030826)	LAMA3 (ENSFCAG00000009601)	TTC39C (ENSFCAG00000009603)	CABYR (ENSFCAG00000033624) #16	OSBPL1A (ENSFCAG00000046822) #17	IMPACT (ENSFCAG00000028133) #18	HRH4 (ENSFCAG00000010923)	ZNF521 (ENSFCAG00000024512) #19	SS18 (ENSFCAG00000030098) #20	PSMA8 (ENSFCAG00000022853) #21	TAF4B (ENSFCAG00000011715) #22	KCTD1 (ENSFCAG00000010474) #24	AQP4 (ENSFCAG00000037651) #25	CHST9 (ENSFCAG00000003134) #26	CDH2 (ENSFCAG00000012301) #27	ENSFCAG00000036706	DSC2 (ENSFCAG00000042132)	DSC1 (ENSFCAG00000000646)	DSG1 (ENSFCAG00000028996)	DSG4 (ENSFCAG00000027450)	DSG3 (ENSFCAG00000044968)	DSG2 (ENSFCAG00000031128)	TTR (ENSFCAG00000011314)	B4GALT6 (ENSFCAG00000019056)	TRAPPC8 (ENSFCAG00000022822)	RNF125 (ENSFCAG00000023041)
Laurasiatheria_c	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00400000022086.a	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a.a.b	ENSGT01030000234624.a.a.a	ENSGT01030000234624.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.b
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Donkey	MODERN SPECIES	27	DLGAP1 (ENSEASG00005003653)	AKAIN1 (ENSEASG00005038786)	ENSEASG00005004330	ENSEASG00005004417	ENSEASG00005004519	ENSEASG00005029371	ENSEASG00005004560 #16	ENSEASG00005004612 #17	ENSEASG00005005115	IMPACT (ENSEASG00005005120) #18	HRH4 (ENSEASG00005029823)	ZNF521 (ENSEASG00005005129) #19	ENSEASG00005005135	PSMA8 (ENSEASG00005005145) #21	SS18 (ENSEASG00005005139) #20	TAF4B (ENSEASG00005005256) #22	KCTD1 (ENSEASG00005005261) #24	AQP4 (ENSEASG00005005263) #25	CHST9 (ENSEASG00005027091) #26	CDH2 (ENSEASG00005016811) #27	ENSEASG00005024422	DSC3 (ENSEASG00005016795)	DSC2 (ENSEASG00005016787)	DSC1 (ENSEASG00005016782)	DSG1 (ENSEASG00005016766)	DSG4 (ENSEASG00005016759)	DSG3 (ENSEASG00005016749)	DSG2 (ENSEASG00005016682)	TTR (ENSEASG00005034244)	B4GALT6 (ENSEASG00005016659)	TRAPPC8 (ENSEASG00005016655)
Horse	MODERN SPECIES	29	ZBTB14 (ENSECAG00000019218)	LAMA3 (ENSECAG00000021277)	ENSECAG00000054828	ENSECAG00000043961	TTC39C (ENSECAG00000010545)	CABYR (ENSECAG00000014148) #16	OSBPL1A (ENSECAG00000015182) #17	ENSECAG00000056623	IMPACT (ENSECAG00000020098) #18	HRH4 (ENSECAG00000006494)	ZNF521 (ENSECAG00000006546) #19	ENSECAG00000004392	ENSECAG00000049495	PSMA8 (ENSECAG00000013028) #21	SS18 (ENSECAG00000007703) #20	TAF4B (ENSECAG00000016769) #22	KCTD1 (ENSECAG00000031182) #24	AQP4 (ENSECAG00000004242) #25	ENSECAG00000058320	CHST9 (ENSECAG00000008182) #26	CDH2 (ENSECAG00000009663) #27	ENSECAG00000045544	DSC3 (ENSECAG00000022564)	DSC2 (ENSECAG00000007761)	DSC1 (ENSECAG00000013809)	DSG1 (ENSECAG00000018040)	DSG4 (ENSECAG00000006970)	DSG3 (ENSECAG00000044697)	DSG2 (ENSECAG00000013616)	B4GALT6 (ENSECAG00000017478)	TTR (ENSECAG00000015875)
Chiroptera	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00530000063835.b	ENSGT00400000022086.a	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444.b #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a.a.b	ENSGT01030000234624.a.a.a	ENSGT01030000234624.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.b
Microchiroptera	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00940000160814	ENSGT00530000063835.b	ENSGT00400000022086.a	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00390000000444.b #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a.a.b	ENSGT01030000234624.a.a.a	ENSGT01030000234624.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.b
Greater horseshoe bat	MODERN SPECIES	10	GATA6 (ENSRFEG00010019389)	RBBP8 (ENSRFEG00010019440)	CABLES1 (ENSRFEG00010019516)	TMEM241 (ENSRFEG00010019573)	RIOK3 (ENSRFEG00010019628)	RMC1 (ENSRFEG00010019707)	NPC1 (ENSRFEG00010019799)	ANKRD29 (ENSRFEG00010019862)	LAMA3 (ENSRFEG00010020190)	ENSRFEG00010021435 #16	OSBPL1A (ENSRFEG00010021452) #17	IMPACT (ENSRFEG00010021480) #18	ZNF521 (ENSRFEG00010021509) #19	SS18 (ENSRFEG00010021529) #20	PSMA8 (ENSRFEG00010021557) #21	TAF4B (ENSRFEG00010021574) #22	KCTD1 (ENSRFEG00010021589) #24	AQP4 (ENSRFEG00010021600) #25	CHST9 (ENSRFEG00010021612) #26	CDH2 (ENSRFEG00010021632) #27	DSC3 (ENSRFEG00010021665)	DSC2 (ENSRFEG00010021679)	DSC1 (ENSRFEG00010021707)	DSG1 (ENSRFEG00010021727)	DSG4 (ENSRFEG00010021739)	DSG3 (ENSRFEG00010021747)	DSG2 (ENSRFEG00010021760)	TTR (ENSRFEG00010021771)	B4GALT6 (ENSRFEG00010021781)	TRAPPC8 (ENSRFEG00010021804)	RNF125 (ENSRFEG00010021841)
Microbat	MODERN SPECIES	1699																ENSMLUG00000016736 #22	ENSMLUG00000000698 #24
Megabat	MODERN SPECIES	980														SS18 (ENSPVAG00000009955) #20	PSMA8 (ENSPVAG00000009963) #21	TAF4B (ENSPVAG00000009968) #22	ENSPVAG00000009970 #24
Atlantogenata	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00400000022086.a	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a.a.b	ENSGT01030000234624.a.a.a	ENSGT01030000234624.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.b
Afrotheria	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00400000022086.a	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a.a.b	ENSGT01030000234624.a.a.a	ENSGT01030000234624.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.b
Afrotheria_a	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00400000022086.a	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a.a.b	ENSGT01030000234624.a.a.a	ENSGT01030000234624.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.b
Elephant	MODERN SPECIES	375	CABLES1 (ENSLAFG00000017513)	TMEM241 (ENSLAFG00000017889)	RIOK3 (ENSLAFG00000001380)	RMC1 (ENSLAFG00000001383)	NPC1 (ENSLAFG00000023357)	ANKRD29 (ENSLAFG00000015310)	LAMA3 (ENSLAFG00000008275)	TTC39C (ENSLAFG00000008293)	ENSLAFG00000014928 #16	OSBPL1A (ENSLAFG00000014931) #17	IMPACT (ENSLAFG00000003990) #18	HRH4 (ENSLAFG00000003994)	ZNF521 (ENSLAFG00000013445) #19	SS18 (ENSLAFG00000006230) #20	PSMA8 (ENSLAFG00000000981) #21	TAF4B (ENSLAFG00000000982) #22	ENSLAFG00000015479 #24	AQP4 (ENSLAFG00000006158) #25	CHST9 (ENSLAFG00000006162) #26	CDH2 (ENSLAFG00000014957) #27	DSC3 (ENSLAFG00000021823)	DSC2 (ENSLAFG00000006211)	DSC1 (ENSLAFG00000005525)	DSG1 (ENSLAFG00000017709)	DSG4 (ENSLAFG00000017728)	DSG2 (ENSLAFG00000028117)	TTR (ENSLAFG00000014816)	B4GALT6 (ENSLAFG00000018431)	TRAPPC8 (ENSLAFG00000008854)	RNF125 (ENSLAFG00000008839)	RNF138 (ENSLAFG00000003811)
Hyrax	MODERN SPECIES	3074																ENSPCAG00000014020 #22
Tenrec	MODERN SPECIES	3748																TAF4B (ENSETEG00000011393) #22
Xenarthra	ANCESTRAL SPECIES	134	ENSGT00400000022086.a	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22
Armadillo	MODERN SPECIES	2207	TMEM241 (ENSDNOG00000034375)	RIOK3 (ENSDNOG00000039433)	RMC1 (ENSDNOG00000009862)	NPC1 (ENSDNOG00000009884)	ANKRD29 (ENSDNOG00000000204)	LAMA3 (ENSDNOG00000003485)	TTC39C (ENSDNOG00000047226)	CABYR (ENSDNOG00000040624) #16	OSBPL1A (ENSDNOG00000001431) #17	IMPACT (ENSDNOG00000033485) #18	ENSDNOG00000006700	ENSDNOG00000048966	ZNF521 (ENSDNOG00000040834) #19	SS18 (ENSDNOG00000045501) #20	PSMA8 (ENSDNOG00000002450) #21	TAF4B (ENSDNOG00000031698) #22	ENSDNOG00000040409	KCTD1 (ENSDNOG00000036092) #24
Sloth	MODERN SPECIES	3441																ENSCHOG00000007830 #22
Marsupialia	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT01030000234522.C.b	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00930000153033	ENSGT00940000167019	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a.a.b	ENSGT01030000234624.a.a.a	ENSGT01030000234624.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.b
Marsupialia_b	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000170513	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT01030000234522.C.b	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a.a.b	ENSGT01030000234624.a.a.a	ENSGT01030000234624.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.b
Diprotodontia	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000170513	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT01030000234522.C.b	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.b	ENSGT00950000182909.b.a.a	ENSGT00950000183111.b.a.c	ENSGT00530000063834.e.a
Diprotodontia_a	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000170513	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT01030000234522.C.b	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.b	ENSGT01030000234624.b.a.b.a.a	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.b	ENSGT00950000182909.b.a.a	ENSGT00950000183111.b.a.c	ENSGT00530000063834.e.a
Common wonbat	DUPLICATION
Common wonbat	MODERN SPECIES	1199	ENSVURG00010009707	ENSVURG00010009685	ENSVURG00010009660	ENSVURG00010009652	ENSVURG00010009552	ENSVURG00010009516	ENSVURG00010009510 #16	ENSVURG00010009506 #16	ENSVURG00010009471 #17	ENSVURG00010009455 #18	ENSVURG00010009443	ENSVURG00010009420	ENSVURG00010009371 #19	ENSVURG00010009324 #20	ENSVURG00010009291 #21	ENSVURG00010009270 #22	ENSVURG00010009242 #24	ENSVURG00010009205 #25	ENSVURG00010009195 #26	ENSVURG00010004443 #27	ENSVURG00010004144	ENSVURG00010004116	ENSVURG00010004066	ENSVURG00010004020	ENSVURG00010003861	ENSVURG00010003783	ENSVURG00010003771	ENSVURG00010003731	ENSVURG00010003685	ENSVURG00010003669	ENSVURG00010003666
Common wonbat	MODERN SPECIES	1048	ENSVURG00010023313	ENSVURG00010023319	ENSVURG00010000104	ENSVURG00010000143	ENSVURG00010000388	ENSVURG00010001298	ENSVURG00010001342 #16	ENSVURG00010001349 #16	ENSVURG00010001380 #17	ENSVURG00010001423 #18	ENSVURG00010001456	ENSVURG00010001502	ENSVURG00010001794 #19	ENSVURG00010001937 #20	ENSVURG00010002005 #21	ENSVURG00010002056 #22	ENSVURG00010002153 #24	ENSVURG00010002223 #25	ENSVURG00010002286 #26	ENSVURG00010002372 #27	ENSVURG00010002401	ENSVURG00010002416	ENSVURG00010002425	ENSVURG00010002437	ENSVURG00010002514	ENSVURG00010002683	ENSVURG00010002752	ENSVURG00010002770	ENSVURG00010002777	ENSVURG00010002825	ENSVURG00010002967
koala	MODERN SPECIES	184	RIOK3 (ENSPCIG00000013991)	RMC1 (ENSPCIG00000013988)	NPC1 (ENSPCIG00000013979)	ANKRD29 (ENSPCIG00000013967)	ENSPCIG00000018053	LAMA3 (ENSPCIG00000023566)	TTC39C (ENSPCIG00000023567)	ENSPCIG00000023578 #16	OSBPL1A (ENSPCIG00000023587) #17	IMPACT (ENSPCIG00000023600) #18	ENSPCIG00000024530	ZNF521 (ENSPCIG00000020692) #19	ENSPCIG00000024795	SS18 (ENSPCIG00000024793) #20	PSMA8 (ENSPCIG00000024784) #21	TAF4B (ENSPCIG00000024780) #22	ENSPCIG00000032661	ENSPCIG00000024772 #24	ENSPCIG00000035998	AQP4 (ENSPCIG00000024767) #25	CHST9 (ENSPCIG00000006330) #26
Wallaby	MODERN SPECIES	4869																TAF4B (ENSMEUG00000009323) #22
Tasmanian devil	MODERN SPECIES		RIOK3 (ENSSHAG00000011854)	RMC1 (ENSSHAG00000031200)	NPC1 (ENSSHAG00000011464)	ANKRD29 (ENSSHAG00000030344)	ENSSHAG00000023619	ENSSHAG00000020485	ENSSHAG00000008451	TTC39C (ENSSHAG00000006605)	ENSSHAG00000006149 #16	OSBPL1A (ENSSHAG00000000429) #17	IMPACT (ENSSHAG00000030966) #18	ENSSHAG00000021646	ZNF521 (ENSSHAG00000018217) #19	SS18 (ENSSHAG00000028851) #20	PSMA8 (ENSSHAG00000016945) #21	TAF4B (ENSSHAG00000016570) #22	KCTD1 (ENSSHAG00000031155) #24	CHST9 (ENSSHAG00000014819) #26	ENSSHAG00000025009	AQP4 (ENSSHAG00000014974) #25	ENSSHAG00000010494	CDH2 (ENSSHAG00000006524) #27	ENSSHAG00000029202	ENSSHAG00000021841	DSC3 (ENSSHAG00000010085)	DSC2 (ENSSHAG00000009756)	DSC1 (ENSSHAG00000026478)	DSG1 (ENSSHAG00000006939)	DSG4 (ENSSHAG00000006082)	DSG3 (ENSSHAG00000004811)	DSG2 (ENSSHAG00000003295)
Opossum	MODERN SPECIES	2	NPC1 (ENSMODG00000021498)	ANKRD29 (ENSMODG00000021499)	ENSMODG00000021501	LAMA3 (ENSMODG00000021502)	ENSMODG00000042718 #16	ENSMODG00000021505 #17	ENSMODG00000036935	TTC39C (ENSMODG00000021503)	ENSMODG00000036638	IMPACT (ENSMODG00000040981) #18	ENSMODG00000025619	ENSMODG00000042471	ZNF521 (ENSMODG00000021509) #19	SS18 (ENSMODG00000021510) #20	PSMA8 (ENSMODG00000021511) #21	TAF4B (ENSMODG00000021512) #22	ENSMODG00000027618	KCTD1 (ENSMODG00000021513) #24	AQP4 (ENSMODG00000021514) #25	CHST9 (ENSMODG00000021515) #26	ENSMODG00000024783	ENSMODG00000044526	ENSMODG00000021517 #27	RAB27B (ENSMODG00000050980)	CCDC68 (ENSMODG00000020457)	ENSMODG00000024788	TCF4 (ENSMODG00000020455)	TXNL1 (ENSMODG00000020454)	WDR7 (ENSMODG00000020452)	ST8SIA3 (ENSMODG00000020449)	ONECUT2 (ENSMODG00000020448)
Platypus	MODERN SPECIES	18	RIOK3 (ENSOANG00000012074)	RMC1 (ENSOANG00000001464)	NPC1 (ENSOANG00000012193)	ENSOANG00000020428	LAMA3 (ENSOANG00000003469)	TTC39C (ENSOANG00000003123)	ENSOANG00000031837 #16	OSBPL1A (ENSOANG00000022107) #17	IMPACT (ENSOANG00000045979) #18	ENSOANG00000011424	ENSOANG00000037355	ENSOANG00000039243	ENSOANG00000040926	ZNF521 (ENSOANG00000009055) #19	SS18 (ENSOANG00000009058) #20	ENSOANG00000009062 #22	KCTD1 (ENSOANG00000009068) #24	AQP4 (ENSOANG00000009069) #25	CHST9 (ENSOANG00000004983) #26	CDH2 (ENSOANG00000005632) #27	ENSOANG00000005628	DSC1 (ENSOANG00000005624)	DSG1 (ENSOANG00000005622)	DSG4 (ENSOANG00000005621)	DSG3 (ENSOANG00000005620)	ENSOANG00000049343	TTR (ENSOANG00000005619)	B4GALT6 (ENSOANG00000036755)	TRAPPC8 (ENSOANG00000005617)	ENSOANG00000046725	RNF138 (ENSOANG00000005616)
Sauria	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000170513	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000163206.b	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a	ENSGT01030000234624.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT01100000263524.B.b.b	ENSGT00940000162714	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.b	ENSGT00950000182909.b.a.a	ENSGT00950000183111.b.a
Archelosauria	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000170513	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000163206.b	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a	ENSGT01030000234624.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT01100000263524.B.b.b	ENSGT00940000162714	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.b	ENSGT00950000182909.b.a.a	ENSGT00950000183111.b.a
Archosauria	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000163206.b	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00960000189753	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a	ENSGT01030000234624.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT01100000263524.B.b.b	ENSGT00940000162714	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.b	ENSGT00950000182909.b.a.a
Aves	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00400000022086.a	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000163206.b	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00960000189753	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a	ENSGT01030000234624.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT01100000263524.B.b.b	ENSGT00940000162714	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.b	ENSGT00950000182909.b.a.a
Neognathae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00400000022086.a	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000163206.b	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00960000189753	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT00960000189675	ENSGT01030000234624.a	ENSGT01030000234624.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT01050000245154	ENSGT00940000158138	ENSGT01100000263524.B.b.b	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.b
Neognathae_b	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00530000063835.b	ENSGT00400000022086.a	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000163206.b	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00960000189753	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT00960000189675	ENSGT01030000234624.a	ENSGT01030000234624.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT01050000245154	ENSGT00940000158138	ENSGT01100000263524.B.b.b	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.b
Passeriformes	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00400000022086.a	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000163206.b.k	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000163206.b.l	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT00960000189675	ENSGT01030000234624.a	ENSGT01030000234624.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.a	ENSGT00950000183111.b.a	ENSGT00530000063834.e.a	ENSGT00940000166646
Great tit	MODERN SPECIES	11	RBBP8 (ENSPMJG00000014691)	CABLES1 (ENSPMJG00000014693)	TMEM241 (ENSPMJG00000014694)	RIOK3 (ENSPMJG00000014695)	RMC1 (ENSPMJG00000014696)	NPC1 (ENSPMJG00000014697)	ANKRD29 (ENSPMJG00000014699)	LAMA3 (ENSPMJG00000014703)	TTC39C (ENSPMJG00000014721)	OSBPL1A (ENSPMJG00000014724) #17	IMPACT (ENSPMJG00000014725) #18	ENSPMJG00000014726	ENSPMJG00000014727	ZNF521 (ENSPMJG00000014732) #19	SS18 (ENSPMJG00000014736) #20	TAF4B (ENSPMJG00000014737) #22	KCTD1 (ENSPMJG00000014738) #24	AQP4 (ENSPMJG00000014739) #25	CHST9 (ENSPMJG00000014740) #26	CDH2 (ENSPMJG00000014743) #27	ENSPMJG00000014744	ENSPMJG00000014750	ENSPMJG00000014751	DSG2 (ENSPMJG00000014752)	ENSPMJG00000014753	TTR (ENSPMJG00000014754)	B4GALT6 (ENSPMJG00000014755)	TRAPPC8 (ENSPMJG00000014756)	RNF138 (ENSPMJG00000014757)	MEP1B (ENSPMJG00000014758)	GAREM1 (ENSPMJG00000014760)
Passeriformes_d	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00530000063835.b	ENSGT00400000022086.a	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638.h	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000163206.b.k	ENSGT00940000163206.b.l	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT00960000189675	ENSGT01030000234624.a	ENSGT01030000234624.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.a	ENSGT00950000183111.b.a	ENSGT00530000063834.e.a	ENSGT00940000166646
Passeriformes_g	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00400000022086.a	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638.h	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000163206.b.k	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000163206.b.l	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT00960000189675	ENSGT01030000234624.a	ENSGT01030000234624.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.a	ENSGT00950000183111.b.a	ENSGT00530000063834.e.a	ENSGT00940000166646
Medium ground finch	MODERN SPECIES	8	RBBP8 (ENSGFOG00000005486)	CABLES1 (ENSGFOG00000005494)	TMEM241 (ENSGFOG00000005506)	RIOK3 (ENSGFOG00000005522)	RMC1 (ENSGFOG00000005533)	NPC1 (ENSGFOG00000005575)	ANKRD29 (ENSGFOG00000005614)	ENSGFOG00000005670	TTC39C (ENSGFOG00000005970)	OSBPL1A (ENSGFOG00000006028) #17	IMPACT (ENSGFOG00000006045) #18	ENSGFOG00000006056	ENSGFOG00000006143	ZNF521 (ENSGFOG00000006166) #19	SS18 (ENSGFOG00000006185) #20	TAF4B (ENSGFOG00000006200) #22	KCTD1 (ENSGFOG00000006239) #24	AQP4 (ENSGFOG00000006250) #25	CHST9 (ENSGFOG00000006321) #26	CDH2 (ENSGFOG00000006326) #27	ENSGFOG00000006365	ENSGFOG00000006410	DSG2 (ENSGFOG00000006416)	ENSGFOG00000006434	TTR (ENSGFOG00000006439)	B4GALT6 (ENSGFOG00000006443)	TRAPPC8 (ENSGFOG00000006449)	RNF138 (ENSGFOG00000006499)	MEP1B (ENSGFOG00000006510)	GAREM1 (ENSGFOG00000006533)	ENSGFOG00000006538
Passeroidea	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00400000022086.a	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638.h	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000163206.b.k	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000163206.b.l	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT00960000189675	ENSGT01030000234624.a	ENSGT01030000234624.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.a	ENSGT00950000183111.b.a	ENSGT00530000063834.e.a	ENSGT00940000166646
Zebra finch	MODERN SPECIES	12	TMEM241 (ENSTGUG00000010387)	RIOK3 (ENSTGUG00000010392)	RMC1 (ENSTGUG00000010413)	NPC1 (ENSTGUG00000010427)	ANKRD29 (ENSTGUG00000010477)	ENSTGUG00000028768	ENSTGUG00000010481	TTC39C (ENSTGUG00000010516)	OSBPL1A (ENSTGUG00000010525) #17	IMPACT (ENSTGUG00000010551) #18	ENSTGUG00000022147	ENSTGUG00000024544	ENSTGUG00000010562	ZNF521 (ENSTGUG00000010575) #19	SS18 (ENSTGUG00000010587) #20	TAF4B (ENSTGUG00000010600) #22	KCTD1 (ENSTGUG00000010606) #24	AQP4 (ENSTGUG00000020250) #25	CHST9 (ENSTGUG00000010618) #26	CDH2 (ENSTGUG00000010620) #27	ENSTGUG00000010651	ENSTGUG00000010666	DSG2 (ENSTGUG00000010683)	TTR (ENSTGUG00000010708)	TTR (ENSTGUG00000010734)	B4GALT6 (ENSTGUG00000010735)	TRAPPC8 (ENSTGUG00000027784)	MEP1B (ENSTGUG00000010758)	GAREM1 (ENSTGUG00000010770)	ENSTGUG00000010771	KLHL14 (ENSTGUG00000010774)
Common canary	MODERN SPECIES		CABLES1 (ENSSCAG00000010334)	TMEM241 (ENSSCAG00000010342)	RIOK3 (ENSSCAG00000010350)	RMC1 (ENSSCAG00000010357)	NPC1 (ENSSCAG00000010365)	ANKRD29 (ENSSCAG00000010383)	LAMA3 (ENSSCAG00000010510)	TTC39C (ENSSCAG00000011187)	ENSSCAG00000011217 #17	ENSSCAG00000011403 #17	IMPACT (ENSSCAG00000011455) #18	ENSSCAG00000011461	ENSSCAG00000011464	ZNF521 (ENSSCAG00000011472) #19	SS18 (ENSSCAG00000011495) #20	TAF4B (ENSSCAG00000011517) #22	KCTD1 (ENSSCAG00000011534) #24	AQP4 (ENSSCAG00000011555) #25	CHST9 (ENSSCAG00000011560) #26	CDH2 (ENSSCAG00000011659) #27	ENSSCAG00000012046	ENSSCAG00000012052	ENSSCAG00000012064	DSG2 (ENSSCAG00000012074)	ENSSCAG00000012083	TTR (ENSSCAG00000012088)	B4GALT6 (ENSSCAG00000012092)	TRAPPC8 (ENSSCAG00000012117)	RNF138 (ENSSCAG00000012169)	MEP1B (ENSSCAG00000012174)	GAREM1 (ENSSCAG00000012179)
Flycatcher	MODERN SPECIES	11	TMEM241 (ENSFALG00000006149)	RIOK3 (ENSFALG00000006145)	ENSFALG00000025348	RMC1 (ENSFALG00000006142)	NPC1 (ENSFALG00000006135)	ANKRD29 (ENSFALG00000027285)	ENSFALG00000023167	ENSFALG00000006094	TTC39C (ENSFALG00000006085)	OSBPL1A (ENSFALG00000006083) #17	IMPACT (ENSFALG00000006073) #18	ENSFALG00000006069	ENSFALG00000027497	ZNF521 (ENSFALG00000006065) #19	SS18 (ENSFALG00000006062) #20	TAF4B (ENSFALG00000006055) #22	KCTD1 (ENSFALG00000028651) #24	AQP4 (ENSFALG00000006038) #25	CHST9 (ENSFALG00000028190) #26	CDH2 (ENSFALG00000006017) #27	ENSFALG00000005996	ENSFALG00000005990	DSG2 (ENSFALG00000005980)	ENSFALG00000005970	B4GALT6 (ENSFALG00000005950)	TTR (ENSFALG00000024765)	TRAPPC8 (ENSFALG00000005939)	RNF138 (ENSFALG00000005931)	MEP1B (ENSFALG00000005911)	GAREM1 (ENSFALG00000005902)	ENSFALG00000005895
Neognathae_c	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00530000063835.b	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.a	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000163206.b	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00960000189753	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT00960000189675	ENSGT01030000234624.a	ENSGT01030000234624.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT01050000245154	ENSGT00940000158138	ENSGT01100000263524.B.b.b	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.b
Kakapo	MODERN SPECIES		CABLES1 (ENSSHBG00005009082)	TMEM241 (ENSSHBG00005009059)	RIOK3 (ENSSHBG00005009049)	RMC1 (ENSSHBG00005009040)	NPC1 (ENSSHBG00005007877)	ANKRD29 (ENSSHBG00005007302)	LAMA3 (ENSSHBG00005005135)	TTC39C (ENSSHBG00005005036)	OSBPL1A (ENSSHBG00005005020) #17	IMPACT (ENSSHBG00005005008) #18	ENSSHBG00005004994	ENSSHBG00005004985	ENSSHBG00005004981	ZNF521 (ENSSHBG00005004975) #19	SS18 (ENSSHBG00005004969) #20	TAF4B (ENSSHBG00005004954) #22	KCTD1 (ENSSHBG00005004941) #24	AQP4 (ENSSHBG00005004933) #25	CHST9 (ENSSHBG00005004926) #26	ENSSHBG00005004915	CDH2 (ENSSHBG00005004911) #27	ENSSHBG00005004880	ENSSHBG00005004865	ENSSHBG00005004856	DSG2 (ENSSHBG00005004817)	TTR (ENSSHBG00005004802)	ENSSHBG00005004799	B4GALT6 (ENSSHBG00005004796)	ENSSHBG00005004792	TRAPPC8 (ENSSHBG00005004779)	RNF138 (ENSSHBG00005004770)
Golden eagle	MODERN SPECIES	20	RMC1 (ENSACCG00020006842)	NPC1 (ENSACCG00020006806)	ANKRD29 (ENSACCG00020006785)	LAMA3 (ENSACCG00020006451)	TTC39C (ENSACCG00020006206)	ENSACCG00020006196	ENSACCG00020006193	OSBPL1A (ENSACCG00020006060) #17	IMPACT (ENSACCG00020005943) #18	ENSACCG00020005874	ENSACCG00020005727	ENSACCG00020005657	ENSACCG00020005642	ZNF521 (ENSACCG00020005631) #19	SS18 (ENSACCG00020005608) #20	TAF4B (ENSACCG00020005569) #22	KCTD1 (ENSACCG00020005550) #24	AQP4 (ENSACCG00020005533) #25	CHST9 (ENSACCG00020005523) #26	CDH2 (ENSACCG00020005505) #27	ENSACCG00020005491	ENSACCG00020005463	ENSACCG00020005412	DSG2 (ENSACCG00020005394)	TTR (ENSACCG00020005383)	ENSACCG00020005363	B4GALT6 (ENSACCG00020005350)	ENSACCG00020005338	TRAPPC8 (ENSACCG00020005223)	RNF125 (ENSACCG00020005168)	RNF138 (ENSACCG00020005153)
Galloanserae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00530000063835.b	ENSGT00400000022086.a	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000163206.b	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT00960000189675	ENSGT01030000234624.a	ENSGT01030000234624.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT01050000245154	ENSGT00940000158138	ENSGT01100000263524.B.b.b	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.a	ENSGT00950000183111.b.a
Anatidae	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00400000022086.a	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000163206.b.h	ENSGT00940000163206.b.g	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a	ENSGT01030000234624.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT01050000245154	ENSGT00940000158138	ENSGT01100000263524.B.b.b	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.a	ENSGT00950000183111.b.a	ENSGT00530000063834.e.a
Pink-footed goose	MODERN SPECIES	13	CABLES1 (ENSABRG00000016944)	TMEM241 (ENSABRG00000016931)	RIOK3 (ENSABRG00000016913)	RMC1 (ENSABRG00000016910)	NPC1 (ENSABRG00000016905)	ANKRD29 (ENSABRG00000016904)	LAMA3 (ENSABRG00000016127)	TTC39C (ENSABRG00000015992)	ENSABRG00000015984 #16	OSBPL1A (ENSABRG00000015967) #17	IMPACT (ENSABRG00000015961) #18	ENSABRG00000015958	ENSABRG00000015956	ZNF521 (ENSABRG00000015952) #19	SS18 (ENSABRG00000015928) #20	TAF4B (ENSABRG00000015907) #22	KCTD1 (ENSABRG00000015895) #24	AQP4 (ENSABRG00000015887) #25	CHST9 (ENSABRG00000015884) #26	CDH2 (ENSABRG00000015865) #27	ENSABRG00000015840	ENSABRG00000015836	DSG2 (ENSABRG00000015828)	TTR (ENSABRG00000015823)	ENSABRG00000015819	B4GALT6 (ENSABRG00000015807)	ENSABRG00000015792	TRAPPC8 (ENSABRG00000015775)	RNF138 (ENSABRG00000015769)	MEP1B (ENSABRG00000015768)	GAREM1 (ENSABRG00000015765)
Duck	MODERN SPECIES	10	ENSAPLG00000020117	MRPL15 (ENSAPLG00000004466)	LYPLA1 (ENSAPLG00000004475)	TCEA1 (ENSAPLG00000004621)	RGS20 (ENSAPLG00000004749)	ATP6V1H (ENSAPLG00000003861)	OPRK1 (ENSAPLG00000003797)	ENSAPLG00000003336	CABYR (ENSAPLG00000022835) #16	OSBPL1A (ENSAPLG00000015641) #17	IMPACT (ENSAPLG00000002625) #18	ENSAPLG00000025102	ENSAPLG00000030325	ZNF521 (ENSAPLG00000003518) #19	SS18 (ENSAPLG00000003628) #20	TAF4B (ENSAPLG00000003724) #22	KCTD1 (ENSAPLG00000003981) #24	AQP4 (ENSAPLG00000004032) #25	CHST9 (ENSAPLG00000018165) #26	CDH2 (ENSAPLG00000004203) #27	ENSAPLG00000005803	ENSAPLG00000007015	DSG2 (ENSAPLG00000007729)	ENSAPLG00000008874	TTR (ENSAPLG00000009008)	B4GALT6 (ENSAPLG00000009022)	ENSAPLG00000030375	TRAPPC8 (ENSAPLG00000007624)	RNF138 (ENSAPLG00000019822)	MEP1B (ENSAPLG00000007098)	GAREM1 (ENSAPLG00000006848)
Phasianidae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00400000022086.a	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638.d	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295.w #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000163206.b.i	ENSGT00940000163206.b.j	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT00960000189675	ENSGT01030000234624.a	ENSGT01030000234624.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT01100000263524.B.b.b	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.a	ENSGT00950000183111.b.a	ENSGT00530000063834.e.a
Japanese quail	MODERN SPECIES	11	TMEM241 (ENSCJPG00005009277)	RIOK3 (ENSCJPG00005009278)	RMC1 (ENSCJPG00005009279)	NPC1 (ENSCJPG00005009280)	ANKRD29 (ENSCJPG00005009281)	ENSCJPG00005009282	ENSCJPG00005009283	TTC39C (ENSCJPG00005009285)	ENSCJPG00005009286	ENSCJPG00005009288 #17	IMPACT (ENSCJPG00005009803) #18	ENSCJPG00005009806	ENSCJPG00005009807	ZNF521 (ENSCJPG00005009819) #19	SS18 (ENSCJPG00005009831) #20	TAF4B (ENSCJPG00005009836) #22	KCTD1 (ENSCJPG00005009840) #24	AQP4 (ENSCJPG00005009848) #25	CHST9 (ENSCJPG00005009853) #26	CDH2 (ENSCJPG00005009862) #27	ENSCJPG00005009871	ENSCJPG00005009872	DSG2 (ENSCJPG00005009873)	B4GALT6 (ENSCJPG00005009874)	TTR (ENSCJPG00005009886)	ENSCJPG00005009891	ENSCJPG00005009897	ENSCJPG00005009898	TRAPPC8 (ENSCJPG00005009907)	RNF138 (ENSCJPG00005009915)	MEP1B (ENSCJPG00005009919)
Phasianidae_b	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00400000022086.a	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638.d	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295.w #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000163206.b.i	ENSGT00940000163206.b.j	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT00960000189675	ENSGT01030000234624.a	ENSGT01030000234624.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT01100000263524.B.b.b	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.a	ENSGT00950000183111.b.a	ENSGT00530000063834.e.a
Turkey	MODERN SPECIES	22	RBBP8 (ENSMGAG00000010015)	CABLES1 (ENSMGAG00000010058)	TMEM241 (ENSMGAG00000010071)	RMC1 (ENSMGAG00000010079)	NPC1 (ENSMGAG00000010105)	ANKRD29 (ENSMGAG00000010143)	LAMA3 (ENSMGAG00000010165)	TTC39C (ENSMGAG00000010250)	ENSMGAG00000017783 #16	OSBPL1A (ENSMGAG00000010264) #17	IMPACT (ENSMGAG00000010303) #18	ENSMGAG00000010333	ENSMGAG00000020694	ZNF521 (ENSMGAG00000010352) #19	SS18 (ENSMGAG00000010358) #20	TAF4B (ENSMGAG00000010380) #22	KCTD1 (ENSMGAG00000010382) #24	AQP4 (ENSMGAG00000010390) #25	CHST9 (ENSMGAG00000010389) #26	CDH2 (ENSMGAG00000010400) #27	ENSMGAG00000018029	ENSMGAG00000019994	ENSMGAG00000010851	ENSMGAG00000021300	ENSMGAG00000010842	ENSMGAG00000019025	ENSMGAG00000010820	PPDPFL (ENSMGAG00000021330)	ENSMGAG00000010813	ENSMGAG00000020855	ENSMGAG00000010806
Chicken	MODERN SPECIES	11	CABLES1 (ENSGALG00010004191)	TMEM241 (ENSGALG00010004244)	RIOK3 (ENSGALG00010004787)	RMC1 (ENSGALG00010004803)	NPC1 (ENSGALG00010004859)	ANKRD29 (ENSGALG00010004902)	LAMA3 (ENSGALG00010004966)	TTC39C (ENSGALG00010005148)	ENSGALG00010005152	OSBPL1A (ENSGALG00010005172) #17	IMPACT (ENSGALG00010005181) #18	ENSGALG00010005188	ENSGALG00010005190	ZNF521 (ENSGALG00010005228) #19	SS18 (ENSGALG00010005508) #20	TAF4B (ENSGALG00010005536) #22	KCTD1 (ENSGALG00010005542) #24	AQP4 (ENSGALG00010005544) #25	CHST9 (ENSGALG00010005573) #26	CDH2 (ENSGALG00010005621) #27	ENSGALG00010005627	ENSGALG00010004256	ENSGALG00010004296	DSG2 (ENSGALG00010004308)	TTR (ENSGALG00010006069)	TTR (ENSGALG00010004315)	B4GALT6 (ENSGALG00010004339)	OPN5L1 (ENSGALG00010004347)	TRAPPC8 (ENSGALG00010004356)	RNF138 (ENSGALG00010004044)	MEP1B (ENSGALG00010004061)
African ostrich	MODERN SPECIES	328	CABLES1 (ENSSCUG00000005338)	TMEM241 (ENSSCUG00000005336)	RIOK3 (ENSSCUG00000005331)	RMC1 (ENSSCUG00000005329)	NPC1 (ENSSCUG00000005328)	ANKRD29 (ENSSCUG00000005323)	LAMA3 (ENSSCUG00000005292)	TTC39C (ENSSCUG00000005273)	CABYR (ENSSCUG00000005271) #16	OSBPL1A (ENSSCUG00000005265) #17	IMPACT (ENSSCUG00000005259) #18	ENSSCUG00000005256	ZNF521 (ENSSCUG00000005250) #19	SS18 (ENSSCUG00000005240) #20	ENSSCUG00000005234	TAF4B (ENSSCUG00000005222) #22	KCTD1 (ENSSCUG00000005214) #24	AQP4 (ENSSCUG00000005211) #25	CHST9 (ENSSCUG00000005208) #26
Australian saltwater crocodile	MODERN SPECIES		NPC1 (ENSCPRG00005014264)	ANKRD29 (ENSCPRG00005014266)	ENSCPRG00005014270	ENSCPRG00005014285	TTC39C (ENSCPRG00005014293)	ENSCPRG00005014296 #16	OSBPL1A (ENSCPRG00005014312) #17	ENSCPRG00005014351	IMPACT (ENSCPRG00005014357) #18	ENSCPRG00005014362	ENSCPRG00005014365	ZNF521 (ENSCPRG00005014429) #19	ENSCPRG00005014481	SS18 (ENSCPRG00005014488) #20	PSMA8 (ENSCPRG00005014498) #21	TAF4B (ENSCPRG00005014526) #22	ENSCPRG00005014535 #24	AQP4 (ENSCPRG00005014557) #25	CHST9 (ENSCPRG00005014575) #26	ENSCPRG00005014598	CDH2 (ENSCPRG00005014667) #27	ENSCPRG00005015077	ENSCPRG00005015084	ENSCPRG00005015094	DSG2 (ENSCPRG00005015098)	TTR (ENSCPRG00005015105)	B4GALT6 (ENSCPRG00005015110)	ENSCPRG00005015122	TRAPPC8 (ENSCPRG00005015136)	RNF125 (ENSCPRG00005015190)	RNF138 (ENSCPRG00005015223)
Cryptodira	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000170513	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000163206.b	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00510000049120	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a	ENSGT01030000234624.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT01100000263524.B.b.b	ENSGT00940000162714	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.b	ENSGT00950000182909.b.a.a
Testudinoidea	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000170513	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000163206.b	ENSGT00940000158492.x	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00510000049120	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a	ENSGT01030000234624.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT01100000263524.B.b.b	ENSGT00940000162714	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.b	ENSGT00950000182909.b.a.a
Emydidae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000170513	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT01100000266288	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000163206.b	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00510000049120	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a	ENSGT01030000234624.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT01100000263524.B.b.b	ENSGT00940000162714	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.b	ENSGT00950000182909.b.a.a
Three-toed box turtle	MODERN SPECIES	24	RIOK3 (ENSTMTG00000020778)	RMC1 (ENSTMTG00000020785)	NPC1 (ENSTMTG00000020810)	ANKRD29 (ENSTMTG00000020834)	ENSTMTG00000020852	ENSTMTG00000020894	TTC39C (ENSTMTG00000021074)	CABYR (ENSTMTG00000021089) #16	OSBPL1A (ENSTMTG00000021103) #17	ENSTMTG00000021114	IMPACT (ENSTMTG00000021118) #18	ENSTMTG00000021133	ZNF521 (ENSTMTG00000021164) #19	SS18 (ENSTMTG00000021185) #20	PSMA8 (ENSTMTG00000021218) #21	TAF4B (ENSTMTG00000021248) #22	KCTD1 (ENSTMTG00000021272) #24	AQP4 (ENSTMTG00000021277) #25	CHST9 (ENSTMTG00000021285) #26	CDH2 (ENSTMTG00000021321) #27	ENSTMTG00000021472	ENSTMTG00000021477	ENSTMTG00000021484	ENSTMTG00000021487	DSG2 (ENSTMTG00000021494)	ENSTMTG00000021504	TTR (ENSTMTG00000021508)	B4GALT6 (ENSTMTG00000003890)	ENSTMTG00000003904	TRAPPC8 (ENSTMTG00000003965)	RNF138 (ENSTMTG00000004246)
painted turtle	MODERN SPECIES	706															PSMA8 (ENSCPBG00000021090) #21	TAF4B (ENSCPBG00000021084) #22	KCTD1 (ENSCPBG00000021082) #24	ENSCPBG00000021080	AQP4 (ENSCPBG00000021077) #25	CHST9 (ENSCPBG00000021075) #26	CDH2 (ENSCPBG00000021062) #27	ENSCPBG00000021056	ENSCPBG00000021050	ENSCPBG00000021045	ENSCPBG00000021041	TTR (ENSCPBG00000021030)	B4GALT6 (ENSCPBG00000021024)	ENSCPBG00000021020	ENSCPBG00000021018	TRAPPC8 (ENSCPBG00000021007)	RNF125 (ENSCPBG00000021003)
Testudinidae	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000164586.f	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000163206.b	ENSGT00940000158492.x	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01000000220486	ENSGT01030000234624.a	ENSGT01030000234624.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT00940000162714	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.b	ENSGT00950000182909.b.a.a	ENSGT00950000183111.b.a
Abingdon island giant tortoise	MODERN SPECIES	2073					TTC39C (ENSCABG00000002992)	CABYR (ENSCABG00000002990) #16	OSBPL1A (ENSCABG00000002835) #17	ENSCABG00000002829	ENSCABG00000002827	IMPACT (ENSCABG00000002825) #18	ENSCABG00000002803	ENSCABG00000002800	ZNF521 (ENSCABG00000002798) #19	SS18 (ENSCABG00000002796) #20	PSMA8 (ENSCABG00000002724) #21	TAF4B (ENSCABG00000002710) #22	KCTD1 (ENSCABG00000002706) #24	AQP4 (ENSCABG00000002673) #25	CHST9 (ENSCABG00000002672) #26	CDH2 (ENSCABG00000002667) #27	ENSCABG00000002665	ENSCABG00000002664
Goode s thornscrub tortoise	MODERN SPECIES	11	ENSGEVG00005004910	RIOK3 (ENSGEVG00005004956)	RMC1 (ENSGEVG00005004985)	NPC1 (ENSGEVG00005005091)	ANKRD29 (ENSGEVG00005005172)	LAMA3 (ENSGEVG00005005489)	TTC39C (ENSGEVG00005006326)	ENSGEVG00005006379 #16	ENSGEVG00005006400 #16	OSBPL1A (ENSGEVG00005006440) #17	IMPACT (ENSGEVG00005006510) #18	ENSGEVG00005006529	ZNF521 (ENSGEVG00005006578) #19	SS18 (ENSGEVG00005006624) #20	PSMA8 (ENSGEVG00005006672) #21	TAF4B (ENSGEVG00005006771) #22	KCTD1 (ENSGEVG00005007068) #24	AQP4 (ENSGEVG00005007101) #25	CHST9 (ENSGEVG00005007125) #26	CDH2 (ENSGEVG00005007155) #27	ENSGEVG00005007245	ENSGEVG00005007482	ENSGEVG00005008796	DSG2 (ENSGEVG00005008948)	ENSGEVG00005009129	TTR (ENSGEVG00005009167)	B4GALT6 (ENSGEVG00005009239)	ENSGEVG00005009392	TRAPPC8 (ENSGEVG00005009486)	RNF125 (ENSGEVG00005009755)	RNF138 (ENSGEVG00005009812)
Chinese turtle	MODERN SPECIES	1358										OSBPL1A (ENSPSIG00000002416) #17	IMPACT (ENSPSIG00000002499) #18	ENSPSIG00000002516	ZNF521 (ENSPSIG00000002538) #19	SS18 (ENSPSIG00000002550) #20	PSMA8 (ENSPSIG00000002603) #21	TAF4B (ENSPSIG00000002612) #22	KCTD1 (ENSPSIG00000002625) #24	AQP4 (ENSPSIG00000002629) #25	CHST9 (ENSPSIG00000002647) #26	CDH2 (ENSPSIG00000002658) #27	ENSPSIG00000002716
Lepidosauria	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000160814	ENSGT00530000063835.b	ENSGT00400000022086.a	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a	ENSGT01030000234624.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT01100000263524.B.b.b	ENSGT00940000162714	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.b	ENSGT00950000182909.b.a.a	ENSGT00950000183111.b.a
Episquamata	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000160814	ENSGT00530000063835.b	ENSGT00400000022086.a	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a.e	ENSGT01030000234624.a.f	ENSGT01030000234624.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT01100000263524.B.b.b	ENSGT00940000162714	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.b	ENSGT00950000182909.b.a.a
Toxicofera	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000160814	ENSGT00530000063835.b	ENSGT00400000022086.a	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a.e	ENSGT01030000234624.a.f	ENSGT01030000234624.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT00940000162714	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.b	ENSGT00950000182909.b.a.a	ENSGT00950000183111.b.a
Elapidae	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000160814	ENSGT00530000063835.b.tb.a	ENSGT00400000022086.a	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a.e	ENSGT01030000234624.a.f	ENSGT01030000234624.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT00940000162714	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.b	ENSGT00950000182909.b.a.a	ENSGT00530000063834.e.a
Indian cobra	MODERN SPECIES	2	GATA6 (ENSNNAG00000008083)	RBBP8 (ENSNNAG00000008109)	CABLES1 (ENSNNAG00000008205)	TMEM241 (ENSNNAG00000008294)	RIOK3 (ENSNNAG00000008388)	RMC1 (ENSNNAG00000008454)	NPC1 (ENSNNAG00000008894)	ANKRD29 (ENSNNAG00000009076)	LAMA3 (ENSNNAG00000009401)	TTC39C (ENSNNAG00000014129)	ENSNNAG00000014202 #16	OSBPL1A (ENSNNAG00000014229) #17	IMPACT (ENSNNAG00000014349) #18	ZNF521 (ENSNNAG00000014371) #19	SS18 (ENSNNAG00000014426) #20	TAF4B (ENSNNAG00000014494) #22	KCTD1 (ENSNNAG00000014547) #24	AQP4 (ENSNNAG00000014566) #25	CHST9 (ENSNNAG00000014585) #26	CDH2 (ENSNNAG00000014600) #27	ENSNNAG00000014656	ENSNNAG00000014740	ENSNNAG00000014783	ENSNNAG00000014805	DSG2 (ENSNNAG00000014820)	TTR (ENSNNAG00000014857)	B4GALT6 (ENSNNAG00000014898)	ENSNNAG00000015038	TRAPPC8 (ENSNNAG00000015059)	RNF125 (ENSNNAG00000015154)	RNF138 (ENSNNAG00000015165)
Elapidae_a	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000160814	ENSGT00530000063835.b.tb.a	ENSGT00400000022086.a	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a.e	ENSGT01030000234624.a.f	ENSGT01030000234624.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT00940000162714	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.b	ENSGT00950000182909.b.a.a	ENSGT00530000063834.e.a
Acanthophiinae	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000160814	ENSGT00530000063835.b.tb.a	ENSGT00400000022086.a	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a.e	ENSGT01030000234624.a.f	ENSGT01030000234624.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT00940000162714	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.b	ENSGT00950000182909.b.a.a	ENSGT00530000063834.e.a
Eastern brown snake	MODERN SPECIES	11	CABLES1 (ENSPTXG00000005638)	TMEM241 (ENSPTXG00000006075)	RIOK3 (ENSPTXG00000006074)	RMC1 (ENSPTXG00000006072)	NPC1 (ENSPTXG00000005156)	ANKRD29 (ENSPTXG00000005146)	ENSPTXG00000005143	ENSPTXG00000005137	TTC39C (ENSPTXG00000005135)	ENSPTXG00000005134 #16	OSBPL1A (ENSPTXG00000002585) #17	IMPACT (ENSPTXG00000002520) #18	ENSPTXG00000002516 #19	ENSPTXG00000002512 #19	SS18 (ENSPTXG00000002503) #20	TAF4B (ENSPTXG00000002485) #22	KCTD1 (ENSPTXG00000002483) #24	AQP4 (ENSPTXG00000002480) #25	CHST9 (ENSPTXG00000002478) #26	CDH2 (ENSPTXG00000002473) #27	ENSPTXG00000002470	ENSPTXG00000002463	ENSPTXG00000002461	ENSPTXG00000002459	DSG2 (ENSPTXG00000002458)	TTR (ENSPTXG00000002456)	B4GALT6 (ENSPTXG00000002450)	ENSPTXG00000002445	TRAPPC8 (ENSPTXG00000002439)	RNF125 (ENSPTXG00000002437)	RNF138 (ENSPTXG00000002436)
Mainland tiger snake	MODERN SPECIES	32	ENSNSUG00000019722	CABLES1 (ENSNSUG00000019723)	RIOK3 (ENSNSUG00000019726)	RMC1 (ENSNSUG00000019727)	NPC1 (ENSNSUG00000019739)	ANKRD29 (ENSNSUG00000019866)	ENSNSUG00000019867	ENSNSUG00000019868	TTC39C (ENSNSUG00000019869)	ENSNSUG00000019870 #16	ENSNSUG00000019871 #16	OSBPL1A (ENSNSUG00000019877) #17	IMPACT (ENSNSUG00000019957) #18	ZNF521 (ENSNSUG00000019958) #19	SS18 (ENSNSUG00000019959) #20	TAF4B (ENSNSUG00000019960) #22	KCTD1 (ENSNSUG00000019964) #24	AQP4 (ENSNSUG00000019966) #25	CHST9 (ENSNSUG00000019968) #26	CDH2 (ENSNSUG00000019972) #27	ENSNSUG00000019976	ENSNSUG00000019977	ENSNSUG00000019979	ENSNSUG00000019980	ENSNSUG00000019982	ENSNSUG00000019985	ENSNSUG00000019987	TTR (ENSNSUG00000019991)	B4GALT6 (ENSNSUG00000020003)	ENSNSUG00000020015	TRAPPC8 (ENSNSUG00000020037)
Blue-lipped sea krait	MODERN SPECIES	1242																ENSLLTG00000010729 #22
Lizard	MODERN SPECIES	3	RBBP8 (ENSACAG00000007768)	ENSACAG00000040717	CABLES1 (ENSACAG00000000154)	TMEM241 (ENSACAG00000028555)	RIOK3 (ENSACAG00000000159)	RMC1 (ENSACAG00000000175)	NPC1 (ENSACAG00000000201)	ANKRD29 (ENSACAG00000044259)	LAMA3 (ENSACAG00000000304)	TTC39C (ENSACAG00000001210)	ENSACAG00000034791 #16	OSBPL1A (ENSACAG00000001327) #17	IMPACT (ENSACAG00000001663) #18	ZNF521 (ENSACAG00000001799) #19	SS18 (ENSACAG00000001853) #20	TAF4B (ENSACAG00000002056) #22	KCTD1 (ENSACAG00000037445) #24	AQP4 (ENSACAG00000002159) #25	CHST9 (ENSACAG00000002223) #26	CDH2 (ENSACAG00000010838) #27	ENSACAG00000038800	ENSACAG00000041775	HNF4G (ENSACAG00000013245)	ENSACAG00000035528	CRISPLD1 (ENSACAG00000013173)	ENSACAG00000041357	PI15 (ENSACAG00000041134)	GDAP1 (ENSACAG00000040293)	ENSACAG00000037438	JPH1 (ENSACAG00000013059)	ENSACAG00000040149
Laterata	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000160814	ENSGT00530000063835.b	ENSGT00400000022086.a	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a.e	ENSGT01030000234624.a.f	ENSGT01030000234624.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT01100000263524.B.b.b	ENSGT00940000162714	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.b	ENSGT00950000182909.b.a.a
Common wall lizard	MODERN SPECIES	15	RBBP8 (ENSPMRG00000005295)	CABLES1 (ENSPMRG00000005285)	TMEM241 (ENSPMRG00000005271)	RIOK3 (ENSPMRG00000005262)	RMC1 (ENSPMRG00000005247)	NPC1 (ENSPMRG00000006953)	ANKRD29 (ENSPMRG00000006924)	LAMA3 (ENSPMRG00000006100)	TTC39C (ENSPMRG00000005770)	ENSPMRG00000005743 #16	OSBPL1A (ENSPMRG00000005702) #17	IMPACT (ENSPMRG00000005677) #18	ZNF521 (ENSPMRG00000005662) #19	SS18 (ENSPMRG00000005630) #20	ENSPMRG00000005615	TAF4B (ENSPMRG00000005603) #22	ENSPMRG00000005595	KCTD1 (ENSPMRG00000005589) #24	ENSPMRG00000005586	AQP4 (ENSPMRG00000005572) #25	CHST9 (ENSPMRG00000005534) #26	CDH2 (ENSPMRG00000005502) #27	ENSPMRG00000005491	ENSPMRG00000005467	ENSPMRG00000005404	ENSPMRG00000005372	DSG2 (ENSPMRG00000005350)	TTR (ENSPMRG00000005339)	B4GALT6 (ENSPMRG00000005192)	ENSPMRG00000005160	ENSPMRG00000005150
Argentine black and white tegu	MODERN SPECIES	4	RBBP8 (ENSSMRG00000012281)	CABLES1 (ENSSMRG00000012280)	TMEM241 (ENSSMRG00000012279)	RIOK3 (ENSSMRG00000012259)	RMC1 (ENSSMRG00000012256)	NPC1 (ENSSMRG00000012250)	ANKRD29 (ENSSMRG00000012247)	ENSSMRG00000012246	ENSSMRG00000012150	TTC39C (ENSSMRG00000012148)	ENSSMRG00000012144 #16	OSBPL1A (ENSSMRG00000012088) #17	IMPACT (ENSSMRG00000012086) #18	ZNF521 (ENSSMRG00000011955) #19	SS18 (ENSSMRG00000011862) #20	TAF4B (ENSSMRG00000011842) #22	KCTD1 (ENSSMRG00000011841) #24	AQP4 (ENSSMRG00000011810) #25	CHST9 (ENSSMRG00000011802) #26	CDH2 (ENSSMRG00000011749) #27	ENSSMRG00000011727	ENSSMRG00000011648	ENSSMRG00000011610	ENSSMRG00000011527	ENSSMRG00000011523	ENSSMRG00000011521	ENSSMRG00000011517	ENSSMRG00000011515	TTR (ENSSMRG00000011513)	ENSSMRG00000011512	ENSSMRG00000011510
tuatara	MODERN SPECIES	273															SS18 (ENSSPUG00000010505) #20	TAF4B (ENSSPUG00000010416) #22	KCTD1 (ENSSPUG00000010358) #24	AQP4 (ENSSPUG00000010331) #25	CHST9 (ENSSPUG00000010316) #26	CDH2 (ENSSPUG00000010288) #27
Anura	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00510000048348	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000163206.b.s.a.a	ENSGT00930000153033	ENSGT00940000167019	ENSGT00940000163206.b.s.b	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a.c.a #25	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a	ENSGT01030000234624.b.a.b	ENSGT01030000234624.b.a.a	ENSGT01050000245154	ENSGT00940000158138	ENSGT01100000263524.B.b.b	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.b	ENSGT00950000182909.b.a.a	ENSGT00950000183111.b.a.e	ENSGT00530000063834.e.a	ENSGT00940000166646
Frog	MODERN SPECIES	6	ENSXETG00000039885	hrh4.d1 (ENSXETG00000038347)	ENSXETG00000049465	ENSXETG00000036840	ENSXETG00000037265	ENSXETG00000034924	hrh4.f5 (ENSXETG00000042386)	ENSXETG00000048779	ENSXETG00000039739	ENSXETG00000037091	ENSXETG00000040284	ENSXETG00000037773	znf521 (ENSXETG00000036616) #19	ss18 (ENSXETG00000006922) #20	ENSXETG00000049166	taf4b (ENSXETG00000032722) #22	kctd1 (ENSXETG00000006930) #24	aqp4 (ENSXETG00000033655) #25	cdh2 (ENSXETG00000006932) #27	XB5854344 [provisional:nufip2] (ENSXETG00000004721)	dsg1 (ENSXETG00000031232)	ENSXETG00000048662	dsg2 (ENSXETG00000034243)	ttr (ENSXETG00000004725)	ENSXETG00000049004	b4galt6 (ENSXETG00000004726)	ENSXETG00000049479	ENSXETG00000004729	trappc8 (ENSXETG00000004734)	rnf125 (ENSXETG00000034351)	rnf138 (ENSXETG00000004739)
Leishan spiny toad	MODERN SPECIES	8	ENSLLEG00000010847	ENSLLEG00000010705	ENSLLEG00000010685	ENSLLEG00000010658	ENSLLEG00000010249	ENSLLEG00000009345	ENSLLEG00000009040	ENSLLEG00000008975	ENSLLEG00000008906	ENSLLEG00000008746	ENSLLEG00000008574	ZNF521 (ENSLLEG00000008181) #19	ENSLLEG00000008138	ENSLLEG00000008121	SS18 (ENSLLEG00000007953) #20	TAF4B (ENSLLEG00000007843) #22	KCTD1 (ENSLLEG00000007778) #24	ENSLLEG00000007724 #25	ENSLLEG00000007693	ENSLLEG00000007685	CDH2 (ENSLLEG00000007406) #27	ENSLLEG00000007353	ENSLLEG00000007244	ENSLLEG00000007077	ENSLLEG00000007041	DSG2 (ENSLLEG00000006964)	ENSLLEG00000006768	B4GALT6 (ENSLLEG00000006713)	ENSLLEG00000006679	TRAPPC8 (ENSLLEG00000006292)	ENSLLEG00000006244
Coelacanth	MODERN SPECIES	1419														SS18 (ENSLACG00000011732) #20	PSMA8 (ENSLACG00000011602) #21	TAF4B (ENSLACG00000010597) #22	KCTD1 (ENSLACG00000008773) #24	AQP4 (ENSLACG00000006947) #25	CHST9 (ENSLACG00000006591) #26
Actinopterygii	ANCESTRAL SPECIES	66	ENSGT00940000157008	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000153321.b.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00990000204641	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00940000167019	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000160563 #26	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a	ENSGT01030000234624.b.b	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT00940000157210	ENSGT01100000263524.B.b.a	ENSGT00530000063956.a	ENSGT00950000182909.b.b.a	ENSGT00940000160486	ENSGT00940000156142	ENSGT00940000158405
Neopterygii	ANCESTRAL SPECIES	101	ENSGT00390000009127	ENSGT00940000156182	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000153321.b.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444 #16	ENSGT00990000204641	ENSGT00970000194032	ENSGT00940000155295 #17	ENSGT00940000167019	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a #25	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a	ENSGT01030000234624.b.b	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT01100000263524.B.b.b	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.a.cb	ENSGT00950000182909.b.a.a.db	ENSGT00950000183111.b.a
Osteoglossocephalai	ANCESTRAL SPECIES	98	ENSGT00990000204641	ENSGT00940000155295.y #17	ENSGT00940000167019	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000163206.b.a.a	ENSGT00940000163206.b.b	ENSGT00940000155638.wb.a	ENSGT00950000182917.b.a.a	ENSGT00970000194032	ENSGT00940000155295.z #17	ENSGT00940000163206.b.a.b	ENSGT00940000159287 #19	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a.f #25	ENSGT00940000155981 #27	ENSGT01030000234624.a	ENSGT01030000234624.b.b.c.b	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158019	ENSGT01100000263524.B.b.b	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.a.db	ENSGT00950000183111.b.a.b	ENSGT01030000234597.a.b.a.b	ENSGT00940000156618.c.a	ENSGT01050000244824.B	ENSGT00940000159860
Osteoglossiformes	ANCESTRAL SPECIES	119	ENSGT00390000020445	ENSGT00940000155281.o	ENSGT00940000158227	ENSGT00950000183019.f.a.c.a	ENSGT00390000002407.c.c	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.a.a	ENSGT00940000153902.a	ENSGT00940000153321.b.a	ENSGT00950000182917.b.a.b	ENSGT00940000155295.y #17	ENSGT00390000017571 #18	ENSGT00940000163206.b.b	ENSGT00940000159287.i #19	ENSGT00940000156352.d #20	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000156037.a.e #25	ENSGT00940000155981.e #27	ENSGT01030000234624.a.v	ENSGT01030000234624.b.b.d.b	ENSGT01030000234624.b.b.d.a.a	ENSGT00940000158019.l	ENSGT01100000263524.B.b.b	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000183102.A.b.a	ENSGT00940000158137.c.a.c	ENSGT00390000009122	ENSGT00940000155842.s.b	ENSGT00940000156080.l	ENSGT00940000154872.B
P. kingsleyae	MODERN SPECIES	226	GALNT11 (ENSPKIG00000017665)	prkag2a (ENSPKIG00000017549)	ENSPKIG00000017491	bcl2a (ENSPKIG00000017475)	ENSPKIG00000017466	ankrd29 (ENSPKIG00000017446)	ENSPKIG00000017416	ttc39c (ENSPKIG00000017393)	OSBPL1A (ENSPKIG00000017293) #17	impact (ENSPKIG00000017235) #18	ENSPKIG00000017201	ENSPKIG00000017178	ZNF521 (ENSPKIG00000017121) #19	SS18 (ENSPKIG00000017040) #20	psma8 (ENSPKIG00000017000) #21	TAF4B (ENSPKIG00000016978) #22	KCTD1 (ENSPKIG00000016947) #24	aqp4 (ENSPKIG00000016924) #25	cdh2 (ENSPKIG00000016865) #27
Asian bonytongue	MODERN SPECIES	10	actr3b (ENSSFOG00015009213)	XRCC2 (ENSSFOG00015009252)	KMT2C (ENSSFOG00015030733)	GALNT11 (ENSSFOG00015009344)	PRKAG2 (ENSSFOG00015009377)	cox4i1l (ENSSFOG00015033082)	bcl2a (ENSSFOG00015029290)	ankrd29 (ENSSFOG00015009434)	ENSSFOG00015009492	OSBPL1A (ENSSFOG00015009895) #17	impact (ENSSFOG00015028822) #18	ENSSFOG00015024307	ZNF521 (ENSSFOG00015010128) #19	SS18 (ENSSFOG00015010184) #20	psma8 (ENSSFOG00015010234) #21	TAF4B (ENSSFOG00015010259) #22	KCTD1 (ENSSFOG00015025639) #24	aqp4 (ENSSFOG00015010438) #25	cdh2 (ENSSFOG00015030474) #27	ENSSFOG00015010975	ENSSFOG00015011027	ENSSFOG00015030217	ENSSFOG00015011178	B4GALT5 (ENSSFOG00015026026)	opn7a (ENSSFOG00015011229)	TRAPPC8 (ENSSFOG00015011261)	mcm3l (ENSSFOG00015011464)	si:ch211-191a24.4 (ENSSFOG00015011524)	PHLPP1 (ENSSFOG00015011540)	tbc1d7 (ENSSFOG00015013112)	PHACTR1 (ENSSFOG00015013145)
Clupeocephala	ANCESTRAL SPECIES	242																ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.b	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158019	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.a.db	ENSGT00950000183111.b.a.b	ENSGT00950000183102.A.b.a	ENSGT00940000163886.A	ENSGT00940000156328.a.b	ENSGT00940000158092.o	ENSGT00940000157394.a	ENSGT00940000154872.B	ENSGT00940000156080.l	ENSGT00940000155842.s
Otomorpha	ANCESTRAL SPECIES	220	ENSGT00940000163886.A	ENSGT00950000183102.A.b.a	ENSGT00950000183111.b.a.b	ENSGT00950000182909.b.a.a.db	ENSGT00390000000568	ENSGT01100000263524.B.b.b	ENSGT00940000158019	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.a	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.b	ENSGT01030000234624.a	ENSGT00940000155981.h #27	ENSGT00940000156037.a.e #25	ENSGT00510000049120	ENSGT00940000156453.b ##24	ENSGT00390000011620.a.a.a #22
Otophysi	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000163886.A	ENSGT00950000183102.A.b.a	ENSGT00950000183111.b.a.b	ENSGT00950000182909.b.a.a.db	ENSGT00390000000568	ENSGT01100000263524.B.b.b	ENSGT00940000158019	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.a	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.b	ENSGT01030000234624.a	ENSGT00940000155981.h #27	ENSGT00940000156037.a.e #25	ENSGT00510000049120	ENSGT00940000156453.b ##24	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT01100000263537.b.b.c.b.k.a	ENSGT00390000013955	ENSGT01030000234517.H.a	ENSGT00940000164834.b	ENSGT01030000234613.b.a.a.c.b	ENSGT00390000016478.c.a	ENSGT00940000160562	ENSGT00940000159097	ENSGT00390000016168.a	ENSGT01070000253766.C.o.a	ENSGT00940000157818	ENSGT00390000014037.c	ENSGT00450000040279	ENSGT00940000161092
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Characiphysae_b	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.a.t.b	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.a.t.a	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.a.s	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.b	ENSGT01030000234624.a	ENSGT00550000075038.a	ENSGT00940000162478	ENSGT01030000234592.A.b.b.b.a	ENSGT00940000165400	ENSGT00940000179222	ENSGT00940000155981.h.i #27	ENSGT00940000156037.a.e #25	ENSGT00940000156453.b ##24	ENSGT00510000049120	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT01100000263537.b.b.c.b.k.a	ENSGT00390000013955	ENSGT01030000234517.H.a	ENSGT00940000164834.b	ENSGT01030000234613.b.a.a.c.b	ENSGT00390000016478.c.a	ENSGT00940000160562	ENSGT00940000159097	ENSGT00390000016168.a	ENSGT01070000253766.C.o.a	ENSGT00940000157818	ENSGT00390000014037.c	ENSGT00450000040279	ENSGT00940000161092
Characoidei	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00950000183102.A.b.a	ENSGT00950000183111.b.a.b	ENSGT00950000182909.b.a.a.db	ENSGT00390000000568	ENSGT00940000158019	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.a.t.b	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.a.t.a	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.a.s	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.b	ENSGT01030000234624.a	ENSGT00940000155981.h.i #27	ENSGT00940000156037.a.e #25	ENSGT00940000156453.b ##24	ENSGT00510000049120	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00940000167949	ENSGT00950000183136.a.b.c	ENSGT00390000013955	ENSGT01030000234517.H.a	ENSGT00940000164834.b	ENSGT01030000234613.b.a.a.c.b.a	ENSGT00390000016478.c.a	ENSGT00940000160562	ENSGT00940000159097	ENSGT00390000016168.a	ENSGT01070000253766.C.o.a	ENSGT00940000157818	ENSGT00390000014037.c	ENSGT00450000040279
Red-bellied piranha	MODERN SPECIES	13	ENSPNAG00000028337	TRAPPC8 (ENSPNAG00000028290)	opn7a (ENSPNAG00000028088)	b4galt6 (ENSPNAG00000028079)	ttr (ENSPNAG00000028049)	ENSPNAG00000028033	ENSPNAG00000005279	ENSPNAG00000027969	ENSPNAG00000027949	dsc2l (ENSPNAG00000027829)	si:dkey-5n18.1 (ENSPNAG00000027804)	cdh2 (ENSPNAG00000027771) #27	aqp4 (ENSPNAG00000027697) #25	ENSPNAG00000027690 ##24	ENSPNAG00000027661	ENSPNAG00000027636 #22	ENSPNAG00000027567	psma8 (ENSPNAG00000027550) #21	ENSPNAG00000027496	ENSPNAG00000027468	ENSPNAG00000027434	ENSPNAG00000007096	ENSPNAG00000006212	vipas39 (ENSPNAG00000027327)
Mexicana tetra	MODERN SPECIES	18	slain2 (ENSAMXG00000002454)	anapc4 (ENSAMXG00000002444)	TRAPPC8 (ENSAMXG00000002438)	opn7a (ENSAMXG00000040803)	b4galt6 (ENSAMXG00000002432)	ttr (ENSAMXG00000002423)	ENSAMXG00000002421	ENSAMXG00000002407	ENSAMXG00000030767	ENSAMXG00000039417	dsc2l (ENSAMXG00000002361)	si:dkey-5n18.1 (ENSAMXG00000032780)	cdh2 (ENSAMXG00000040605) #27	aqp4 (ENSAMXG00000019647) #25	ENSAMXG00000032444 ##24	ENSAMXG00000019513 #22	ENSAMXG00000030268	psma8 (ENSAMXG00000038711) #21	ENSAMXG00000035866	clic5b (ENSAMXG00000035157)	mark3b (ENSAMXG00000001388)	daam1b (ENSAMXG00000001378)	L3HYPDH (ENSAMXG00000032989)	nudt14 (ENSAMXG00000029131)	jag2b (ENSAMXG00000020545)	esr2a (ENSAMXG00000036234)	ENSAMXG00000029675	ENSAMXG00000038470	btbd6b (ENSAMXG00000036054)	brf1b (ENSAMXG00000020489)	xrcc3 (ENSAMXG00000020479)
Channel catfish	MODERN SPECIES	17	si:ch211-191a24.4 (ENSIPUG00000014382)	mcm3l (ENSIPUG00000014393)	mep1b (ENSIPUG00000014431)	ENSIPUG00000014461	trappc8 (ENSIPUG00000014508)	B4galt6 (ENSIPUG00000014871)	TTR (ENSIPUG00000014900)	ENSIPUG00000014914	ENSIPUG00000014933	dsc2l (ENSIPUG00000014955)	si:dkey-5n18.1 (ENSIPUG00000014981)	cdh2 (ENSIPUG00000014994) #27	aqp4 (ENSIPUG00000015039) #25	ENSIPUG00000015055 ##24	ENSIPUG00000015072	ENSIPUG00000015081 #22	psma8 (ENSIPUG00000015106) #21	ENSIPUG00000015145	ENSIPUG00000015160	vipas39 (ENSIPUG00000015175)	Cdc42bpb (ENSIPUG00000015388)	ENSIPUG00000015881	si:dkeyp-72h1.1 (ENSIPUG00000015915)	tnfaip2a (ENSIPUG00000015920)	MPEG1 (ENSIPUG00000015946)	EIF5 (ENSIPUG00000015961)	Enpp5 (ENSIPUG00000016016)	fam167ab (ENSIPUG00000016026)	ccm2 (ENSIPUG00000016046)	xkr6b (ENSIPUG00000016093)	mtmr9 (ENSIPUG00000016118)
Cyprinoidei	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000163886.A.a.a	ENSGT00950000183102.A.b.a	ENSGT00950000183111.b.a.b	ENSGT00950000182909.b.a.a.db	ENSGT00390000000568	ENSGT01100000263524.B.b.b	ENSGT00940000158019	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.a	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.b	ENSGT01030000234624.a	ENSGT00940000155981.h #27	ENSGT00940000156037.a.e #25	ENSGT00510000049120	ENSGT00940000156453.b ##24	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00940000159287.n #19	ENSGT01100000263537.b.b.c.b.k.a	ENSGT00950000183136.a.b.c	ENSGT00390000013955	ENSGT01030000234517.H.a	ENSGT00940000164834.b	ENSGT01030000234613.b.a.a.c.b	ENSGT00390000016478.c.a	ENSGT00940000160562	ENSGT00940000159097	ENSGT00390000016168.a	ENSGT01070000253766.C.o.a	ENSGT00940000157818	ENSGT00390000014037.c
Cyprininae	DUPLICATION
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	121			ENSGT00390000000568.i	ENSGT01100000263524.B.b.b.c	ENSGT00940000158019.f	ENSGT00940000153229.A.a.b.eb	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.a.v	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.a.u.b	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.b.a	ENSGT01030000234624.a.h	ENSGT00940000162478.f	ENSGT00940000155981.h.g #27	ENSGT00940000156037.a.e.f #25	ENSGT00510000049120.h.a	ENSGT00940000156453.b.k ##24	ENSGT00390000011620.a.a.a.e #22	ENSGT00940000160354.l #21	ENSGT00940000159287.n.a #19	ENSGT01100000263537.b.b.c.b.k.a	ENSGT00390000013955.j	ENSGT01030000234517.H.a.s	ENSGT00940000164834.b	ENSGT01030000234613.b.a.a.c.b.d	ENSGT00390000016478.c.a.a.a	ENSGT00940000160562.f	ENSGT00940000159097.`b.b	ENSGT00390000016168.a.d	ENSGT01070000253766.C.o.a.a	ENSGT00940000157818.n	ENSGT00390000014037.c.b	ENSGT00450000040279.m
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	177	ENSGT00950000183111.b.a.b.d.a.a.b	ENSGT00950000182909.b.a.a.db.b	ENSGT00390000000568.i	ENSGT01100000263524.B.b.b.c	ENSGT00940000158019.f	ENSGT00940000153229.A.a.b.eb	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.a.v	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.a.u.b	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.b.a	ENSGT01030000234624.a.h	ENSGT00940000162478.f	ENSGT00940000155981.h.g #27	ENSGT00940000156037.a.e.f #25	ENSGT00510000049120.h.a	ENSGT00940000156453.b.k ##24	ENSGT00390000011620.a.a.a.e #22	ENSGT00940000160354.l #21	ENSGT00940000159287.n.a #19	ENSGT01100000263537.b.b.c.b.k.a	ENSGT00950000183136.a.b.c.b	ENSGT00390000013955.j	ENSGT01030000234517.H.a.s	ENSGT00940000164834.b.a	ENSGT01030000234613.b.a.a.c.b.d	ENSGT00390000016478.c.a.a.a	ENSGT00940000160562.f	ENSGT00940000159097.`b.b	ENSGT00390000016168.a.d	ENSGT01070000253766.C.o.a.a	ENSGT00940000157818.n	ENSGT00390000014037.c.b
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	752												cdh2 (ENSSGRG00000044271) #27	aqp4 (ENSSGRG00000044247) #25	ENSSGRG00000044246	ENSSGRG00000044244 ##24	ENSSGRG00000044242 #22	psma8 (ENSSGRG00000044241) #21	ENSSGRG00000044239 #19	ENSSGRG00000044238	vipas39 (ENSSGRG00000044237)	cdc42bpb (ENSSGRG00000039180)	si:dkeyp-72h1.1 (ENSSGRG00000039056)	tnfaip2a (ENSSGRG00000039055)
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Goldfish	MODERN SPECIES	12	NEK1 (ENSCARG00000005642)	sh3rf1 (ENSCARG00000005697)	ENSCARG00000005723	ENSCARG00000005736	ENSCARG00000005750	ginm1 (ENSCARG00000005759)	ginm1 (ENSCARG00000005771)	ENSCARG00000005775	sh3rf1 (ENSCARG00000005807)	ENSCARG00000006024	jag2b (ENSCARG00000006065)	ENSCARG00000006377	aqp4 (ENSCARG00000006391) #25	ENSCARG00000006426 ##24	ENSCARG00000006458	ENSCARG00000006472 #22	psma7 (ENSCARG00000006496) #21	ENSCARG00000006603 #19	gpr132b (ENSCARG00000006616)	cdc42bpb (ENSCARG00000007029)	si:dkeyp-72h1.1 (ENSCARG00000013475)	tnfaip2a (ENSCARG00000013484)	ENSCARG00000013511	eif5 (ENSCARG00000013519)	enpp5 (ENSCARG00000013541)	fam167ab (ENSCARG00000013544)	ccm2 (ENSCARG00000013551)	xkr6b (ENSCARG00000013592)	mtmr9 (ENSCARG00000013598)	tdh (ENSCARG00000013607)	pinx1 (ENSCARG00000013617)
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	318	ENSGT01050000244824.B.eb	ENSGT00950000183111.b.a.b.c	ENSGT00950000183111.b.a.b.d.a.a.b	ENSGT00950000182909.b.a.a.db	ENSGT00390000000568.j	ENSGT01100000263524.B.b.b.d	ENSGT01090000260029.a.b.b.b.a.a.a.b.c	ENSGT01050000245154	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.a.u.a	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.b.b	ENSGT01030000234624.a.g	ENSGT00940000155981.h.h #27	ENSGT00940000156037.a.e.e #25	ENSGT00510000049120.h.b	ENSGT00940000156453.b.l ##24	ENSGT00390000011620.a.a.a.f #22	ENSGT00940000160354.k #21	ENSGT00940000159287.n.b #19	ENSGT00950000183136.a.b.c	ENSGT00390000013955.i	ENSGT01030000234517.H.a.t
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	34	ENSGT00950000183102.A.b.a.h	ENSGT01050000244824.B.eb	ENSGT00950000182909.b.a.a.db.a	ENSGT00390000000568.j	ENSGT01100000263524.B.b.b.d	ENSGT01090000260029.a.b.b.b.a.a.a.b.c	ENSGT00940000158019.e.b	ENSGT00940000153229.A.a.b.db	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.a.u.a	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.b.b	ENSGT01030000234624.a.g	ENSGT00940000155981.h.h #27	ENSGT00940000156037.a.e.e #25	ENSGT00510000049120.h.b	ENSGT00940000156453.b.l ##24	ENSGT00390000011620.a.a.a.f #22	ENSGT00940000160354.k #21	ENSGT00940000159287.n.b #19	ENSGT00950000183136.a.b.c.a	ENSGT00390000013955.i	ENSGT01030000234517.H.a.t	ENSGT00940000164834.b.b	ENSGT01030000234613.b.a.a.c.b.c	ENSGT00390000016478.c.a.a.b	ENSGT00390000016478.d	ENSGT00940000160562.e	ENSGT00940000159097.`b.a	ENSGT00390000016168.a.c	ENSGT01070000253766.C.o.a.b	ENSGT00940000157818.m	ENSGT00390000014037.c.a
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	1688													aqp4 (ENSSGRG00000032352) #25	ENSSGRG00000032354	ENSSGRG00000032355 ##24	ENSSGRG00000032361 #22	psma8 (ENSSGRG00000032371) #21	ENSSGRG00000032541 #19	ENSSGRG00000032542	vipas39 (ENSSGRG00000032543)	cdc42bpb (ENSSGRG00000032564)
Zebrafish	MODERN SPECIES	12	gtf2a1 (ENSDARG00000011000)	ches1 (ENSDARG00000043553)	tmem30ab (ENSDARG00000043555)	kcnk13b (ENSDARG00000043557)	psmc1b (ENSDARG00000043561)	calm1b (ENSDARG00000034187)	ENSDARG00000018047	nfkbiaa (ENSDARG00000005481)	psma6b (ENSDARG00000013966)	ENSDARG00000062750	si:dkey-5n18.1 (ENSDARG00000043436)	ENSDARG00000101333	cdh2 (ENSDARG00000018693) #27	aqp4 (ENSDARG00000010565) #25	ENSDARG00000074056 ##24	ENSDARG00000075732 #22	psma8 (ENSDARG00000010965) #21	ENSDARG00000086825 #19	gpr132b (ENSDARG00000103540)	vipas39 (ENSDARG00000103690)	ENSDARG00000100732	cdc42bpb (ENSDARG00000019383)	si:dkeyp-72h1.1 (ENSDARG00000095347)	tnfaip2a (ENSDARG00000043416)	eif5 (ENSDARG00000003681)	enpp5 (ENSDARG00000070625)	fam167ab (ENSDARG00000023952)	ccm2 (ENSDARG00000013705)	xkr6b (ENSDARG00000043410)	mtmr9 (ENSDARG00000015860)	ENSDARG00000110494
Clupeiformes	ANCESTRAL SPECIES	92										ENSGT01030000234624.b.b.c.b	ENSGT01030000234624.a	ENSGT00940000155981.h #27	ENSGT00940000156037.a.e #25	ENSGT00510000049120	ENSGT00940000156453.b ##24	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000155981.g #27	ENSGT00940000156037.a.f #25	ENSGT00940000156453.a #24	ENSGT00940000160354 #21	ENSGT00940000156352 #20	ENSGT00940000159287.m #19	ENSGT00940000163206.b.a.b	ENSGT00940000155295.z #17	ENSGT00970000194032	ENSGT01000000217386	ENSGT00990000204641.a	ENSGT00950000182917.b.a.a	ENSGT00940000155638.xb	ENSGT00940000157532.b	ENSGT00940000155450.c
Atlantic herring	MODERN SPECIES	1	mcm3l (ENSCHAG00000000597)	mep1ba (ENSCHAG00000000890)	ENSCHAG00000000954	TRAPPC8 (ENSCHAG00000001395)	ENSCHAG00000005560	b4galt6 (ENSCHAG00000005696)	ttr (ENSCHAG00000005935)	ENSCHAG00000005948	ENSCHAG00000006042	ENSCHAG00000006129	dsc2l (ENSCHAG00000006228)	cdh2 (ENSCHAG00000006482) #27	aqp4 (ENSCHAG00000008107) #25	ENSCHAG00000008111	ENSCHAG00000008119 ##24	ENSCHAG00000008130 #22	psma8 (ENSCHAG00000008146) #21	ENSCHAG00000008234	ENSCHAG00000008307	ENSCHAG00000008340	ENSCHAG00000008390	XCR1 (ENSCHAG00000008459)	cwc15 (ENSCHAG00000008467)	FYCO1 (ENSCHAG00000008519)	ENSCHAG00000008642	ENSCHAG00000008757	rabggta (ENSCHAG00000008769)	tgm1l4 (ENSCHAG00000008831)	ENSCHAG00000009173	olfml2ba (ENSCHAG00000009203)	atf6 (ENSCHAG00000009211)
Euteleosteomorpha	ANCESTRAL SPECIES	304																ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.b ##24	ENSGT00510000049120	ENSGT00940000156037.a.e #25	ENSGT00940000155981.h #27	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.b	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158019	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.a.db	ENSGT00950000183111.b.a.b
Protacanthopterygii	ANCESTRAL SPECIES	34	ENSGT00940000160138	ENSGT00940000163676	ENSGT00390000010047.g.b.b	ENSGT00660000095605.e	ENSGT00940000163762.a.b	ENSGT00390000011838	ENSGT00390000018402	ENSGT00390000005462	ENSGT00940000155060.C.a.b	ENSGT00940000154930.eb	ENSGT00940000157285.f	ENSGT00950000182993.B.a.d	ENSGT00940000156897	ENSGT00390000015908	ENSGT00940000160354.j #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.b ##24	ENSGT00510000049120	ENSGT00940000156037.a.e #25	ENSGT00940000155981.h #27	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.b	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158019	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.a.db	ENSGT00950000183111.b.a.b
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT01100000263497.E.b.r.b.c	ENSGT00950000182964.a.a.g.a.b	ENSGT00940000160138	ENSGT00940000163676.c	ENSGT00390000010047.g.b.b.b	ENSGT00940000163762.a.b.f	ENSGT00390000011838.o	ENSGT00390000018402.i.b	ENSGT00390000005462	ENSGT00940000155060.C.a.b.f	ENSGT00940000154930.eb.r	ENSGT00940000157285.f.c	ENSGT00950000182993.B.a.d.a	ENSGT00940000156897	ENSGT00940000160354.j.a.a #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.b.a ##24	ENSGT00510000049120.l	ENSGT00940000156037.a.e.d #25	ENSGT00940000155981.h.e #27	ENSGT01030000234624.a.t	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.b	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158019.g	ENSGT01100000263524.B.b.b.n	ENSGT00390000000568.n	ENSGT01050000245154	ENSGT00940000158019.h.a.a	ENSGT00390000000568.m	ENSGT00950000182909.b.a.a.db
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT01100000263497.E.b.r.b.c	ENSGT00950000182964.a.a.g.a.b	ENSGT00940000160138	ENSGT00940000163676.c	ENSGT00390000010047.g.b.b.b	ENSGT00940000163762.a.b.f	ENSGT00390000011838.o	ENSGT00390000018402.i.b	ENSGT00390000005462	ENSGT00940000155060.C.a.b.f	ENSGT00940000154930.eb.r	ENSGT00940000157285.f.c	ENSGT00950000182993.B.a.d.a	ENSGT00940000156897	ENSGT00940000160354.j.a.a #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.b.a ##24	ENSGT00510000049120.l	ENSGT00940000156037.a.e.d #25	ENSGT00940000155981.h.e #27	ENSGT01030000234624.a.t	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.b	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158019.g	ENSGT01100000263524.B.b.b.n	ENSGT00390000000568.n	ENSGT00950000182909.b.a.a.db.d	ENSGT00950000183111.b.a.b	ENSGT01050000244824.B.n	ENSGT00390000003161.d
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT01100000263497.E.b.r.b.c	ENSGT00950000182964.a.a.g.a.b	ENSGT00940000160138	ENSGT00940000163676.c	ENSGT00390000010047.g.b.b.b	ENSGT00940000163762.a.b.f	ENSGT00390000011838.o	ENSGT00390000018402.i.b	ENSGT00390000005462	ENSGT00940000155060.C.a.b.f	ENSGT00940000154930.eb.r	ENSGT00940000157285.f.c	ENSGT00950000182993.B.a.d.a	ENSGT00940000156897	ENSGT00940000160354.j.a.a #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.b.a ##24	ENSGT00940000156037.a.e.d #25	ENSGT00940000155981.h.e #27	ENSGT01030000234624.a.t	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.b	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158019.g	ENSGT01100000263524.B.b.b.n	ENSGT00390000000568.n	ENSGT00950000182909.b.a.a.db.d	ENSGT00950000183111.b.a.b	ENSGT01050000244824.B.n	ENSGT00390000003161.d	ENSGT00390000004681.a.a.g
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	1	gadd45ab (ENSSSAG00000046763)	ENSSSAG00000116852	ENSSSAG00000092029	ENSSSAG00000046774	ENSSSAG00000046786	pbx1b (ENSSSAG00000046818)	med8 (ENSSSAG00000047902)	SZT2 (ENSSSAG00000047962)	hyi (ENSSSAG00000048518)	ptprf (ENSSSAG00000050060)	ENSSSAG00000078968	st3gal3a (ENSSSAG00000079100)	ENSSSAG00000118852	rad54l (ENSSSAG00000079143)	PSMA8 (ENSSSAG00000079190) #21	TAF4B (ENSSSAG00000079213) #22	ENSSSAG00000079220 ##24	AQP4 (ENSSSAG00000079222) #25	cdh2 (ENSSSAG00000079280) #27	ENSSSAG00000079892	ENSSSAG00000079910	ENSSSAG00000079927	ttr (ENSSSAG00000118339)	b4galt6 (ENSSSAG00000079954)	opn7a (ENSSSAG00000080081)	ENSSSAG00000080164	ENSSSAG00000120970	mep1ba (ENSSSAG00000080805)	mcm3l (ENSSSAG00000080838)	ENSSSAG00000080932	ENSSSAG00000107918
River trout	MODERN SPECIES	14	ENSSTUG00000003655	ENSSTUG00000003784	glula (ENSSTUG00000003802)	ENSSTUG00000003895	pbx1b (ENSSTUG00000003938)	med8 (ENSSTUG00000004211)	SZT2 (ENSSTUG00000004277)	hyi (ENSSTUG00000004666)	ENSSTUG00000004724	ENSSTUG00000004733	ptprfa (ENSSTUG00000004807)	ENSSTUG00000006107	st3gal3a (ENSSTUG00000006906)	rad54l (ENSSTUG00000007046)	psma8 (ENSSTUG00000007376) #21	TAF4B (ENSSTUG00000007439) #22	ENSSTUG00000007457 ##24	aqp4 (ENSSTUG00000007478) #25	cdh2 (ENSSTUG00000007612) #27	dsc2l (ENSSTUG00000010779)	ENSSTUG00000010842	ENSSTUG00000010844	ENSSTUG00000010898	ttr (ENSSTUG00000010910)	b4galt6 (ENSSTUG00000010928)	opn7a (ENSSTUG00000010998)	TRAPPC8 (ENSSTUG00000011036)	ENSSTUG00000011223	mep1ba (ENSSTUG00000011231)	mcm3l (ENSSTUG00000011263)	ARHGAP39 (ENSSTUG00000011571)
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00550000075010.b	ENSGT01100000263497.E.b.r.b.c	ENSGT00950000182964.a.a.g.a.b	ENSGT00940000160138	ENSGT00940000163676.c	ENSGT00390000010047.g.b.b.b	ENSGT00940000163762.a.b.f	ENSGT00390000011838.o	ENSGT00390000005462.k	ENSGT00940000155060.C.a.b.f	ENSGT00940000154930.eb.r	ENSGT00940000157285.f.c	ENSGT00950000182993.B.a.d.a	ENSGT00940000156897	ENSGT00940000160354.j.a.a #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.b.a ##24	ENSGT00510000049120.l.b	ENSGT00940000156037.a.e.d #25	ENSGT00940000155981.h.e #27	ENSGT01030000234624.a.t	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.b	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158019.g	ENSGT00940000158019.h.a.b	ENSGT00390000000568.n	ENSGT00970000197999	ENSGT00950000183111.b.a.b	ENSGT01050000244824.B.n	ENSGT00390000003161.d
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT01000000222023	ENSGT01100000263497.E.b.r.b.c	ENSGT00950000182964.a.a.g.a.b	ENSGT00940000160138	ENSGT00940000163676.c	ENSGT00390000010047.g.b.b.b	ENSGT00940000163762.a.b.f	ENSGT00390000011838.o	ENSGT00390000005462.k	ENSGT00940000155060.C.a.b.f	ENSGT00940000154930.eb.r	ENSGT00940000157285.f.c	ENSGT00950000182993.B.a.d.a	ENSGT00940000156897	ENSGT00940000160354.j.a.a #21	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.b.a ##24	ENSGT00940000156037.a.e.d #25	ENSGT00940000155981.h.e #27	ENSGT01030000234624.a.t	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.b	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158019.h.a.b	ENSGT00390000000568.n	ENSGT00970000197999	ENSGT00950000183111.b.a.b	ENSGT01050000244824.B.n	ENSGT00390000004681.a.a.g	ENSGT00740000115898	ENSGT00950000183044.a.b
Coho salmon	MODERN SPECIES	4	GNG12 (ENSOKIG00005044946)	gadd45ab (ENSOKIG00005044931)	ENSOKIG00005044920	ZNF648 (ENSOKIG00005044896)	GLUL (ENSOKIG00005044865)	pbx1b (ENSOKIG00005044767)	med8 (ENSOKIG00005044736)	hyi (ENSOKIG00005044713)	ENSOKIG00005044705	ptprfa (ENSOKIG00005034160)	ENSOKIG00005033687	st3gal3a (ENSOKIG00005033651)	ENSOKIG00005033633	rad54l (ENSOKIG00005033381)	psma8 (ENSOKIG00005033272) #21	ENSOKIG00005033215 #22	ENSOKIG00005033194 ##24	ENSOKIG00005033184	ENSOKIG00005033160	cdh2 (ENSOKIG00005030494) #27	ENSOKIG00005030210	ENSOKIG00005030102	ENSOKIG00005030011	ENSOKIG00005029986	b4galt6 (ENSOKIG00005029921)	TRAPPC8 (ENSOKIG00005029499)	ENSOKIG00005029429	mep1ba (ENSOKIG00005029383)	mcm3l (ENSOKIG00005030023)	GFUS (ENSOKIG00005029673)	bmb (ENSOKIG00005029642)
Chinook salmon	MODERN SPECIES	29	ENSOTSG00005035209	pthlha (ENSOTSG00005035210)	rpl18a (ENSOTSG00005035212)	ENSOTSG00005035214	med8 (ENSOTSG00005035215)	hyi (ENSOTSG00005035216)	ENSOTSG00005035223	ENSOTSG00005035261	smx5 (ENSOTSG00005035264)	ENSOTSG00005035265	ptprfa (ENSOTSG00005035285)	ENSOTSG00005036935	st3gal3a (ENSOTSG00005011424)	rad54l (ENSOTSG00005011427)	psma8 (ENSOTSG00005011680) #21	ENSOTSG00005011684 #22	ENSOTSG00005011685 ##24	aqp4 (ENSOTSG00005011686) #25	cdh2 (ENSOTSG00005011689) #27	dsc2l (ENSOTSG00005011714)	ENSOTSG00005011717	ENSOTSG00005011720	ttr (ENSOTSG00005011725)	b4galt6 (ENSOTSG00005011729)	TRAPPC8 (ENSOTSG00005011769)	ENSOTSG00005011932	mep1ba (ENSOTSG00005011933)	mcm3l (ENSOTSG00005011938)	ENSOTSG00005013978	bmb (ENSOTSG00005013986)	pycr3 (ENSOTSG00005013987)
Rainbow trout	MODERN SPECIES	26	ENSOMYG00000015940	ENSOMYG00000015950	pbx1b (ENSOMYG00000015967)	med8 (ENSOMYG00000016002)	ENSOMYG00000064166	ENSOMYG00000056996	ENSOMYG00000066005	hyi (ENSOMYG00000019816)	ENSOMYG00000066133	ENSOMYG00000055917	ptprfa (ENSOMYG00000020475)	ENSOMYG00000031038	st3gal3a (ENSOMYG00000031744)	rad54l (ENSOMYG00000031865)	PSMA8 (ENSOMYG00000031952) #21	TAF4B (ENSOMYG00000032028) #22	ENSOMYG00000055279 ##24	ENSOMYG00000032056	AQP4 (ENSOMYG00000070209) #25	cdh2 (ENSOMYG00000032078) #27	ENSOMYG00000063226	ENSOMYG00000032104	ENSOMYG00000032128	ENSOMYG00000032154	ttr (ENSOMYG00000032166)	ENSOMYG00000032203	ENSOMYG00000067818	ENSOMYG00000056633	ENSOMYG00000032386	ENSOMYG00000069389	ENSOMYG00000043268
Huchen	MODERN SPECIES	150	ENSHHUG00000042233	SOST (ENSHHUG00000042239)	meox1 (ENSHHUG00000042244)	etv4 (ENSHHUG00000042254)	DHX8 (ENSHHUG00000042276)	THRA (ENSHHUG00000042494)	ormdl3 (ENSHHUG00000043012)	wnt3 (ENSHHUG00000043016)	ENSHHUG00000043024	ptprfa (ENSHHUG00000043036)	ENSHHUG00000044902	st3gal3a (ENSHHUG00000044967)	ENSHHUG00000044975	rad54l (ENSHHUG00000044982)	psma8 (ENSHHUG00000045008) #21	ENSHHUG00000045034 #22	ENSHHUG00000045041 ##24	ENSHHUG00000045043
Northern pike	MODERN SPECIES	7	gadd45ab (ENSELUG00000002845)	ENSELUG00000002817	ENSELUG00000002686	glula (ENSELUG00000002681)	pbx1b (ENSELUG00000002662)	med8 (ENSELUG00000002630)	SZT2 (ENSELUG00000002583)	hyi (ENSELUG00000002519)	ENSELUG00000032995	ptprfa (ENSELUG00000002466)	ENSELUG00000002353	st3gal3a (ENSELUG00000002316)	ENSELUG00000002303	ENSELUG00000000063	psma8 (ENSELUG00000002277) #21	TAF4B (ENSELUG00000002260) #22	ENSELUG00000002251 ##24	aqp4 (ENSELUG00000002244) #25	cdh2 (ENSELUG00000002228) #27	ENSELUG00000002204	dsc2l (ENSELUG00000002197)	ENSELUG00000002186	ttr (ENSELUG00000000062)	b4galt6 (ENSELUG00000002166)	opn7a (ENSELUG00000002161)	ENSELUG00000034701	TRAPPC8 (ENSELUG00000002149)	ENSELUG00000002121	mep1ba (ENSELUG00000000058)	mcm3l (ENSELUG00000002112)	ARHGAP39 (ENSELUG00000002107)
Acanthomorphata	ANCESTRAL SPECIES	291																ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.b ##24	ENSGT00510000049120	ENSGT00940000156037.a.e #25	ENSGT00940000155981.h #27	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.b	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158019
Euacanthomorphacea	ANCESTRAL SPECIES	79						ENSGT00390000003161	ENSGT00390000015908	ENSGT00940000156897	ENSGT00950000182993.B.a.d	ENSGT00940000157285.f	ENSGT00940000154930.eb	ENSGT00940000155060.C.a.b	ENSGT00390000005462	ENSGT00390000018402	ENSGT00550000074980	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.b ##24	ENSGT00510000049120	ENSGT00940000156037.a.e #25	ENSGT00940000155981.h #27	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.b	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158019	ENSGT00510000046760.b	ENSGT00390000008489	ENSGT00940000160274	ENSGT00390000011943.b	ENSGT00530000063553.b.a	ENSGT00390000007212	ENSGT00390000012434
Percomorphaceae	ANCESTRAL SPECIES	104							ENSGT00390000003161	ENSGT00940000156897	ENSGT00950000182993.B.a.d	ENSGT00940000157285.f	ENSGT00940000154930.eb	ENSGT00940000155060.C.a.b	ENSGT00390000005462	ENSGT00390000018402	ENSGT00550000074980	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.b ##24	ENSGT00510000049120	ENSGT00940000156037.a.e #25	ENSGT00940000155981.h #27	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.b	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158019
Percomorphaceae_B	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00730000111147	ENSGT00940000164495.c.b	ENSGT00940000155438.b	ENSGT00390000012078.a.a	ENSGT00950000182915.b.b.a.b.c.a	ENSGT00390000003161	ENSGT00390000015908	ENSGT00940000156897	ENSGT00950000182993.B.a.d	ENSGT00940000157285.f	ENSGT00940000154930.eb	ENSGT00940000155060.C.a.b	ENSGT00390000005462	ENSGT00390000018402	ENSGT00550000074980	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.b ##24	ENSGT00510000049120	ENSGT00940000156037.a.e #25	ENSGT00940000155981.h #27	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.b.d	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158019	ENSGT00550000074917	ENSGT00940000161734	ENSGT00940000159676.a	ENSGT00940000156299	ENSGT00390000015332	ENSGT00940000155789	ENSGT01030000234598.a.b
Ovalentaria	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00730000111147	ENSGT00940000164495.c.b	ENSGT00940000155438.b	ENSGT00390000012078.a.a	ENSGT00950000182915.b.b.a.b.c.a	ENSGT00390000003161	ENSGT00390000015908	ENSGT00940000156897	ENSGT00950000182993.B.a.d	ENSGT00940000157285.f	ENSGT00940000154930.eb	ENSGT00940000155060.C.a.b	ENSGT00390000005462	ENSGT00390000018402	ENSGT00550000074980	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.b ##24	ENSGT00510000049120	ENSGT00940000156037.a.e #25	ENSGT00940000155981.h #27	ENSGT00550000074917	ENSGT00940000161734	ENSGT00940000159676.a	ENSGT00940000156299	ENSGT00390000015332	ENSGT00940000155789	ENSGT01030000234598.a.b	ENSGT00940000153421.a.a.a.b	ENSGT00950000183039.B.b.c	ENSGT00950000183111.b.a.b	ENSGT00940000157769
Atherinomorphae	ANCESTRAL SPECIES	77						ENSGT00940000155438.b	ENSGT00950000182915.b.b.a.b.c.a	ENSGT00390000003161	ENSGT00390000015908	ENSGT00940000156897	ENSGT00940000154930.eb	ENSGT00940000155060.C.a.b	ENSGT00390000005462	ENSGT00390000018402	ENSGT00550000074980	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.b ##24	ENSGT00510000049120
Oryzias	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000155136	ENSGT00940000157668	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.a.f	ENSGT00940000165098	ENSGT00940000155026.d	ENSGT00940000159943	ENSGT00940000156750	ENSGT00940000158998	ENSGT00390000003182.f	ENSGT00940000160221.c	ENSGT00940000154930.eb	ENSGT00940000155060.C.a.b	ENSGT00390000005462	ENSGT00390000018402	ENSGT00550000074980	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.b ##24	ENSGT00510000049120	ENSGT00940000158019	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.b.d	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.a.n	ENSGT00940000156897	ENSGT00390000015908	ENSGT00390000003161	ENSGT00950000182915.b.b.a.b.c.a	ENSGT00390000012434	ENSGT00390000005338	ENSGT00940000155438.b	ENSGT00940000165232	ENSGT00390000008489	ENSGT00950000183070.a.a.mb.b
Oryzias_b	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00940000157668	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.a.f	ENSGT00940000165098	ENSGT00940000155026.d	ENSGT00940000159943	ENSGT00940000156750	ENSGT00940000158998	ENSGT00390000003182.f	ENSGT00940000160221.c	ENSGT00940000154930.eb	ENSGT00940000155060.C.a.b	ENSGT00940000155060.C.b.kb.e	ENSGT00390000005462	ENSGT00390000018402	ENSGT00550000074980	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.b ##24	ENSGT00510000049120	ENSGT00940000158019	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.b.d	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.a.n	ENSGT00940000156897	ENSGT00390000015908	ENSGT00390000003161	ENSGT00950000182915.b.b.a.b.c.a	ENSGT00390000012434	ENSGT00390000005338	ENSGT00940000155438.b	ENSGT00940000165232	ENSGT00390000008489	ENSGT00950000183070.a.a.mb.b
Javanese ricefish	MODERN SPECIES	18	tm2d1 (ENSOJAG00000001319)	nfia (ENSOJAG00000001201)	frem1b (ENSOJAG00000001136)	ENSOJAG00000000888	ENSOJAG00000000878	dbt (ENSOJAG00000000870)	lrrc39 (ENSOJAG00000000863)	trmt13 (ENSOJAG00000000854)	MAP1S (ENSOJAG00000000848)	ENSOJAG00000000568	ENSOJAG00000000279	hyi (ENSOJAG00000013036)	ENSOJAG00000013007	zgc:172121 (ENSOJAG00000012996)	ENSOJAG00000012992	ENSOJAG00000012955 #22	ENSOJAG00000012881 ##24	ENSOJAG00000012860	b4galt6 (ENSOJAG00000012559)	ENSOJAG00000012532	ENSOJAG00000012525	ENSOJAG00000012443	rad54l (ENSOJAG00000012165)	ENSOJAG00000012139	ARHGAP39 (ENSOJAG00000012040)	ENSOJAG00000011915	ndufa11 (ENSOJAG00000011890)	ctns (ENSOJAG00000011848)	EPS15L1 (ENSOJAG00000011758)	zgc:171480 (ENSOJAG00000011746)	commd2 (ENSOJAG00000011736)
Indian medaka	MODERN SPECIES	34	ENSOMEG00000006951	SEMA5B (ENSOMEG00000006995)	CACNB4 (ENSOMEG00000007060)	ENSOMEG00000007084	etv5b (ENSOMEG00000007117)	ENSOMEG00000007135	ENSOMEG00000007192	ENSOMEG00000007220	crygmxl1 (ENSOMEG00000007230)	crygm6 (ENSOMEG00000007245)	ENSOMEG00000007266	SATB2 (ENSOMEG00000007330)	ENSOMEG00000007374	fam184aa (ENSOMEG00000007423)	ENSOMEG00000007443	ENSOMEG00000000183 #22	ENSOMEG00000007520 ##24	b4galt6 (ENSOMEG00000007573)	ENSOMEG00000007667	ENSOMEG00000007718	rad54l (ENSOMEG00000007770)	ENSOMEG00000007802	ARHGAP39 (ENSOMEG00000007853)	ENSOMEG00000007906	ndufa11 (ENSOMEG00000007925)	ctns (ENSOMEG00000007944)	EPS15L1 (ENSOMEG00000008128)	zgc:171480 (ENSOMEG00000008184)	commd2 (ENSOMEG00000008208)	phb2b (ENSOMEG00000008241)	pde6d (ENSOMEG00000008268)
Oryzias_a	ANCESTRAL SPECIES	71	ENSGT00940000155136	ENSGT00940000157668	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.a.f	ENSGT00940000165098	ENSGT00940000155026.d	ENSGT00940000159943	ENSGT00940000156750	ENSGT00940000158998	ENSGT00390000003182.f	ENSGT00940000160221.c	ENSGT00940000154930.eb	ENSGT00940000155060.C.a.b	ENSGT00390000005462	ENSGT00390000018402	ENSGT00550000074980	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.b ##24	ENSGT00940000158019	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.b.d	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.a.n	ENSGT00940000156897	ENSGT00390000015908	ENSGT00390000003161	ENSGT00950000182915.b.b.a.b.c.a.d	ENSGT00390000005338	ENSGT00940000155438.b	ENSGT00940000165232	ENSGT00390000008489	ENSGT00950000183070.a.a.mb.b	ENSGT00390000000263	ENSGT00390000011943.b
Chinese medaka	MODERN SPECIES	593		nfia (ENSOSIG00000006930)	ENSOSIG00000006929	frem1b (ENSOSIG00000006927)	RAB3B (ENSOSIG00000006918)	dbt (ENSOSIG00000006917)	lrrc39 (ENSOSIG00000006916)	trmt13 (ENSOSIG00000006915)	MAP1S (ENSOSIG00000006914)	ENSOSIG00000006913	ENSOSIG00000006911	ENSOSIG00000006910	ENSOSIG00000006909	hyi (ENSOSIG00000006908)	ENSOSIG00000006906	ENSOSIG00000006905 #22
Japanese Medaka HdrR	MODERN SPECIES	18	ENSORLG00000022989	frem1b (ENSORLG00000003500)	ENSORLG00000029015	nrd1b (ENSORLG00000003474)	RAB3B (ENSORLG00000029024)	dbt (ENSORLG00000003352)	lrrc39 (ENSORLG00000003329)	trmt13 (ENSORLG00000003320)	MAP1S (ENSORLG00000003304)	ENSORLG00000003264	ptprfa (ENSORLG00000003198)	hyi (ENSORLG00000003173)	SZT2 (ENSORLG00000003146)	ENSORLG00000003078	ENSORLG00000003073	ENSORLG00000003056 #22	ENSORLG00000003016 ##24	ENSORLG00000025611	b4galt6 (ENSORLG00000003005)	ENSORLG00000002986	ENSORLG00000002978	rad54l (ENSORLG00000002958)	ENSORLG00000026799	ARHGAP39 (ENSORLG00000022761)	ENSORLG00000002923	ctns (ENSORLG00000002869)	EPS15L1 (ENSORLG00000002847)	ENSORLG00000026616	commd2 (ENSORLG00000002784)	phb2b (ENSORLG00000002753)	pde6d (ENSORLG00000029770)
Cyprinodontiformes	ANCESTRAL SPECIES	80							ENSGT00940000155438.b	ENSGT00390000003161	ENSGT00390000015908	ENSGT00940000156897	ENSGT00940000154930.eb	ENSGT00940000155060.C.a.b	ENSGT00390000005462	ENSGT00390000018402	ENSGT00550000074980	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.b ##24
Aplocheiloidei	ANCESTRAL SPECIES	145							ENSGT00940000155438.b	ENSGT00390000003161	ENSGT00390000015908	ENSGT00940000156897	ENSGT00940000154930.eb	ENSGT00940000155060.C.a.b	ENSGT00390000005462	ENSGT00390000018402	ENSGT00550000074980	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.b ##24	ENSGT00940000156968	ENSGT00390000000263	ENSGT00390000011943.b	ENSGT00940000160274	ENSGT00390000008489	ENSGT00390000012434	ENSGT00940000165232	ENSGT00390000005338
Turquoise killifish	MODERN SPECIES	1621	ENSNFUG00015015412	UHMK1 (ENSNFUG00015013126)	AKR1A1B (ENSNFUG00015013149)	ENSNFUG00015013179	cherp (ENSNFUG00015013209)	DOHH (ENSNFUG00015013572)	EPS15L1A (ENSNFUG00015013696)	ENSNFUG00015016391	ARHGAP39 (ENSNFUG00015016394)	LRRC41 (ENSNFUG00015016406)	RAD54L (ENSNFUG00015016422)	KDM4A (ENSNFUG00015016697)	ptprfa (ENSNFUG00015017023)	HYI (ENSNFUG00015021903)	DDX10 (ENSNFUG00015021959)	ENSNFUG00015021961 #22	ENSNFUG00015021970 ##24	LRRC40 (ENSNFUG00015022014)	pde6d (ENSNFUG00015022281)	RPL36 (ENSNFUG00015022284)	LMNB2 (ENSNFUG00015022297)	COMMD2 (ENSNFUG00015022447)	NDUFA11 (ENSNFUG00015022450)	zgc:171480 (ENSNFUG00015022451)	CTNS (ENSNFUG00015022453)	pacrg (ENSNFUG00015022457)	TRAPPC8 (ENSNFUG00015022483)	ENSNFUG00015022729	slc5a9 (ENSNFUG00015022772)	cdh2 (ENSNFUG00015023117) #27	CHUK (ENSNFUG00015024034)
Cyprinodontoidei	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00390000011620.a.a.a #22
NAME_4	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00390000011620.a.a.a #22
Mummichog	MODERN SPECIES	1830																ENSFHEG00000005649 #22	ENSFHEG00000005639
Ovalentaria_B	ANCESTRAL SPECIES	8										ENSGT00940000159889.b.a	ENSGT00940000154930.eb	ENSGT00940000155060.C.a.b	ENSGT00390000005462	ENSGT00390000018402	ENSGT00550000074980	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.b ##24	ENSGT00510000049120	ENSGT00940000156037.a.e #25	ENSGT00940000155981.h #27	ENSGT00550000074917	ENSGT00940000161734	ENSGT00940000159676.a	ENSGT00940000156299	ENSGT00390000015332	ENSGT00940000155789	ENSGT01030000234598.a.b	ENSGT00940000153421.a.a.a.b	ENSGT00950000183039.B.b.c	ENSGT00950000183111.b.a.b	ENSGT00940000157769
Pomacentridae	ANCESTRAL SPECIES	14													ENSGT00940000156037.a.e #25	ENSGT00510000049120	ENSGT00940000156453.b ##24	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00550000074980	ENSGT00390000018402	ENSGT00390000005462	ENSGT00940000155060.C.a.b	ENSGT00940000154930.eb	ENSGT00940000159889.b.a	ENSGT00530000063000.a.b.b	ENSGT00940000154030.a.a	ENSGT00940000153241.B.c	ENSGT01030000234527.B	ENSGT00950000182917.b.a.b	ENSGT00940000156474.a.b.d	ENSGT00940000157773	ENSGT00940000156970.c.b	ENSGT00940000158597
Bicolor damselfish	MODERN SPECIES	353															ENSSPAG00000015471 ##24	ENSSPAG00000015526 #22	ENSSPAG00000015548	SZT2 (ENSSPAG00000015570)	hyi (ENSSPAG00000015691)	ptprfa (ENSSPAG00000015750)	ENSSPAG00000016117	ENSSPAG00000016146	ENSSPAG00000016245	atg4b (ENSSPAG00000016249)	dtymk (ENSSPAG00000016267)
Pomacentridae_A	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00950000183111.b.a.b	ENSGT00950000183039.B.b.c	ENSGT00940000153421.a.a.a.b	ENSGT00940000158512.a.k	ENSGT01030000234598.a.b	ENSGT00940000155789	ENSGT00390000015332	ENSGT00940000156299	ENSGT00940000159676.a	ENSGT00940000161734	ENSGT00550000074917	ENSGT00940000155981.h #27	ENSGT00940000156037.a.e #25	ENSGT00510000049120	ENSGT00940000156453.b ##24	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00550000074980	ENSGT00390000018402	ENSGT00390000005462	ENSGT00940000155060.C.a.b	ENSGT00940000154930.eb	ENSGT00940000161131.a.b.b	ENSGT00940000159889.b.a	ENSGT00530000063000.a.b.b	ENSGT00940000154030.a.a	ENSGT00940000153241.B.c	ENSGT01030000234527.B	ENSGT00950000182917.b.a.b	ENSGT00940000156474.a.b.d	ENSGT00940000157773	ENSGT00940000156970.c.b
Amphiprion	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000157769	ENSGT00950000183039.B.b.c	ENSGT00940000153421.a.a.a.b	ENSGT00940000158512.a.k	ENSGT01030000234598.a.b	ENSGT00940000155789	ENSGT00390000015332	ENSGT00940000156299	ENSGT00940000159676.a	ENSGT00940000161734	ENSGT00550000074917	ENSGT00940000155981.h #27	ENSGT00940000156037.a.e #25	ENSGT00510000049120	ENSGT00940000156453.b ##24	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00550000074980	ENSGT00390000018402	ENSGT00390000005462	ENSGT00940000155060.C.a.b	ENSGT00940000154930.eb	ENSGT00940000161131.a.b.b	ENSGT00940000159889.b.a	ENSGT00530000063000.a.b.b	ENSGT00940000154030.a.a	ENSGT00940000153241.B.c	ENSGT01030000234527.B	ENSGT00950000182917.b.a.b	ENSGT00940000156474.a.b.d	ENSGT00940000157773	ENSGT00940000156970.c.b
Clown anemonefish	MODERN SPECIES	570							ENSAOCG00000021457	ect2 (ENSAOCG00000002671)	b3gnt5a (ENSAOCG00000021630)	MCF2L2 (ENSAOCG00000021687)	rfc4 (ENSAOCG00000021730)	cdh2 (ENSAOCG00000021803) #27	aqp4 (ENSAOCG00000021830) #25	ENSAOCG00000021850	ENSAOCG00000021882 ##24	ENSAOCG00000021907 #22	ENSAOCG00000021917	ENSAOCG00000021951	SZT2 (ENSAOCG00000022066)	hyi (ENSAOCG00000022117)	ptprfa (ENSAOCG00000022333)	ENSAOCG00000022446
Spiny chromis	MODERN SPECIES	102													cdh2 (ENSAPOG00000009139) #27	aqp4 (ENSAPOG00000009151) #25	ENSAPOG00000000882 ##24	ENSAPOG00000009226 #22	ENSAPOG00000009242	ENSAPOG00000009265	SZT2 (ENSAPOG00000009423)	hyi (ENSAPOG00000009482)	ptprfa (ENSAPOG00000009749)	ENSAPOG00000009807	ENSAPOG00000009825
Cichlidae	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00530000063749.c.a	ENSGT00940000162978.b	ENSGT00940000159915.a	ENSGT00950000182964.a.b.b.a.a.a.a	ENSGT00940000175916	ENSGT00390000018319.a.b.b.b.a.a	ENSGT00400000024256	ENSGT00940000165071	ENSGT00530000064649	ENSGT00940000159889.b.a	ENSGT00940000154930.eb	ENSGT00940000155060.C.a.b	ENSGT00390000005462	ENSGT00390000018402	ENSGT00550000074980	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.b ##24	ENSGT00510000049120	ENSGT00940000156037.a.e #25	ENSGT00940000155981.h #27
Pseudocrenilabrinae	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000159915.a	ENSGT00950000182964.a.b.b.a.a.a.a	ENSGT00950000182964.a.b.b.a.a.a.b.b	ENSGT00950000182964.a.b.b.a.a.a.b.a	ENSGT00940000175916	ENSGT00390000018319.a.b.b.b.a.a	ENSGT00400000024256	ENSGT00940000165071	ENSGT00530000064649	ENSGT00940000159889.b.a	ENSGT00940000154930.eb	ENSGT00940000155060.C.a.b	ENSGT00390000005462	ENSGT00390000018402	ENSGT00550000074980	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.b ##24	ENSGT00510000049120	ENSGT00940000156037.a.e #25	ENSGT00940000155981.h #27
Pseudocrenilabrinae_A	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000159915.a	ENSGT00950000182964.a.b.b.a.a.a.a	ENSGT00950000182964.a.b.b.a.a.a.b.b	ENSGT00950000182964.a.b.b.a.a.a.b.a	ENSGT00940000175916	ENSGT00390000018319.a.b.b.b.a.a	ENSGT00400000024256	ENSGT00940000165071	ENSGT00530000064649	ENSGT00940000159889.b.a	ENSGT00940000154930.eb	ENSGT00940000155060.C.a.b	ENSGT00390000005462	ENSGT00390000018402	ENSGT00550000074980	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.b ##24	ENSGT00510000049120	ENSGT00940000156037.a.e #25	ENSGT00940000155981.h #27	ENSGT00950000183138.a.b.r.a	ENSGT01090000260051.b.b.dc.a	ENSGT00940000156557.g	ENSGT00730000111696.a	ENSGT00980000198690.a	ENSGT00940000154907.a.a.x.b	ENSGT01100000263520.a.b.a.a.a.b.a.b.c.d.a.a.a	ENSGT00530000063715.b	ENSGT00950000182910.a.a.d	ENSGT00390000003896	ENSGT00390000014995
Haplochromini	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00950000182964.a.b.b.a.a.a.a	ENSGT00950000182964.a.b.b.a.a.a.b.b	ENSGT00950000182964.a.b.b.a.a.a.b.a	ENSGT00940000175916	ENSGT00390000018319.a.b.b.b.a.a	ENSGT00400000024256	ENSGT00940000165071	ENSGT00530000064649	ENSGT00940000159889.b.a	ENSGT00940000154930.eb	ENSGT00940000155060.C.a.b	ENSGT00940000155060.C.b.kb.d.b	ENSGT00390000005462	ENSGT00390000018402	ENSGT00550000074980	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.b ##24	ENSGT00510000049120	ENSGT00940000156037.a.e #25	ENSGT00940000155981.h #27	ENSGT00950000183138.a.b.r.a	ENSGT01090000260051.b.b.dc.a	ENSGT00940000156557.g.e	ENSGT00730000111696.a	ENSGT00980000198690.a
Burton s mouthbrooder	MODERN SPECIES	325	APC2 (ENSHBUG00000012944)	ENSHBUG00000012933	DIRAS1 (ENSHBUG00000012919)	GADD45B (ENSHBUG00000012913)	CARTPT (ENSHBUG00000012900)	ENSHBUG00000012884	camk4 (ENSHBUG00000000371)	ENSHBUG00000012862	ENSHBUG00000012849	ENSHBUG00000001041	ptprfa (ENSHBUG00000012811)	hyi (ENSHBUG00000012676)	SZT2 (ENSHBUG00000012648)	ENSHBUG00000012494	DDX10 (ENSHBUG00000012476)	TAF4B (ENSHBUG00000000352) #22	ENSHBUG00000012414 ##24	aqp4 (ENSHBUG00000012407) #25	cdh2 (ENSHBUG00000012367) #27
Haplochromini_A	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00950000182964.a.b.b.a.a.a.a	ENSGT00950000182964.a.b.b.a.a.a.b.b	ENSGT00950000182964.a.b.b.a.a.a.b.a	ENSGT00940000175916	ENSGT00390000018319.a.b.b.b.a.a	ENSGT00400000024256	ENSGT00940000165071	ENSGT00530000064649	ENSGT00940000159889.b.a	ENSGT00940000154930.eb	ENSGT00940000155060.C.a.b	ENSGT00940000155060.C.b.kb.d.b	ENSGT00390000005462	ENSGT00390000018402	ENSGT00550000074980	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.b ##24	ENSGT00510000049120	ENSGT00940000156037.a.e #25	ENSGT00940000155981.h #27	ENSGT00950000183138.a.b.r.a	ENSGT01090000260051.b.b.dc.a	ENSGT00940000156557.g.e	ENSGT00730000111696.a	ENSGT00940000162403	ENSGT00950000183014.f.a	ENSGT00970000193449	ENSGT00940000154907.a.a.x.b	ENSGT00530000063715.b	ENSGT01100000263520.a.b.a.a.a.b.a.b.c.d.a.a.a	ENSGT00950000182910.a.a.d
Haplochromini_B	ANCESTRAL SPECIES	29	ENSGT00950000182964.a.b.b.a.a.a.a	ENSGT00950000182964.a.b.b.a.a.a.b.b	ENSGT00950000182964.a.b.b.a.a.a.b.a	ENSGT00940000175916	ENSGT00390000018319.a.b.b.b.a.a	ENSGT00400000024256	ENSGT00940000165071	ENSGT00530000064649	ENSGT00940000159889.b.a	ENSGT00940000154930.eb	ENSGT00940000155060.C.a.b	ENSGT00940000155060.C.b.kb.d.b	ENSGT00390000005462	ENSGT00390000018402	ENSGT00550000074980	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.b ##24	ENSGT00510000049120	ENSGT00940000156037.a.e #25	ENSGT00940000155981.h #27	ENSGT00940000156258.f.a.a.a	ENSGT00950000183138.a.b.r.a	ENSGT01090000260051.b.b.dc.a	ENSGT00940000176853.A	ENSGT00940000156557.g.e	ENSGT00730000111696.a	ENSGT00980000198690.a	ENSGT00950000183014.f.a	ENSGT00970000193449	ENSGT00940000154907.a.a.x.b	ENSGT00530000063715.b
Zebra mbuna	MODERN SPECIES	1097	ENSMZEG00005003065	ENSMZEG00005003101	ENSMZEG00005003112	CARTPT (ENSMZEG00005003127)	ENSMZEG00005003146	ENSMZEG00005003162	ENSMZEG00005003176	ENSMZEG00005003191	ENSMZEG00005003207	ptprfa (ENSMZEG00005003235)	ENSMZEG00005003341	hyi (ENSMZEG00005003394)	SZT2 (ENSMZEG00005003433)	ENSMZEG00005003575	DDX10 (ENSMZEG00005003586)	ENSMZEG00005003611 #22	ENSMZEG00005003642 ##24	ENSMZEG00005003708	ENSMZEG00005003726	cd59 (ENSMZEG00005003755)	ENSMZEG00005003773	eef1b2 (ENSMZEG00005003788)	ENSMZEG00005003811	ENSMZEG00005003842	ENSMZEG00005003860	ebpl (ENSMZEG00005003878)	ENSMZEG00005003894	cavin2b (ENSMZEG00005003917)	vps16 (ENSMZEG00005003978)	rgn (ENSMZEG00005004076)	ENSMZEG00005004100
Eastern happy	MODERN SPECIES	6	ENSACLG00000002817	ENSACLG00000002833	CARTPT (ENSACLG00000002852)	ENSACLG00000002871	ENSACLG00000002882	ENSACLG00000002889	ENSACLG00000002894	ENSACLG00000002940	ptprfa (ENSACLG00000003205)	ENSACLG00000003388	ENSACLG00000003396	hyi (ENSACLG00000003405)	SZT2 (ENSACLG00000003431)	ENSACLG00000003535	DDX10 (ENSACLG00000003559)	ENSACLG00000003572 #22	ENSACLG00000003585 ##24	aqp4 (ENSACLG00000003595) #25	cdh2 (ENSACLG00000003613) #27	ENSACLG00000003650	ENSACLG00000003657	ENSACLG00000003662	ENSACLG00000003672	mlpha (ENSACLG00000003689)	ACKR3 (ENSACLG00000003728)	ENSACLG00000003732	ENSACLG00000003739	SNX9 (ENSACLG00000003794)	cd59 (ENSACLG00000003836)	ENSACLG00000003852	ENSACLG00000003860
P. nyererei	MODERN SPECIES	356	DIRAS1 (ENSPNYG00000000903)	GADD45B (ENSPNYG00000000960)	ENSPNYG00000001014	CARTPT (ENSPNYG00000001282)	ENSPNYG00000001293	ENSPNYG00000001304	ENSPNYG00000001370	ENSPNYG00000001376	ENSPNYG00000001382	ENSPNYG00000001388	ptprfa (ENSPNYG00000001412)	hyi (ENSPNYG00000001535)	SZT2 (ENSPNYG00000001578)	ENSPNYG00000001746	DDX10 (ENSPNYG00000001756)	ENSPNYG00000001771 #22	ENSPNYG00000001803 ##24	ENSPNYG00000001861	aqp4 (ENSPNYG00000001878) #25	cdh2 (ENSPNYG00000001907) #27	ENSPNYG00000001972	ENSPNYG00000001993	mlpha (ENSPNYG00000002012)	ACKR3 (ENSPNYG00000002062)	SNX9 (ENSPNYG00000002081)	cd59 (ENSPNYG00000002135)	ENSPNYG00000002143	eef1b2 (ENSPNYG00000002183)	ENSPNYG00000002322	ENSPNYG00000003113	vps16 (ENSPNYG00000003154)
Midas cichlid	MODERN SPECIES	1114	ENSACIG00000012374	ENSACIG00000012457	si:ch211-191a24.4 (ENSACIG00000012534)	CARTPT (ENSACIG00000012539)	ENSACIG00000012552	ENSACIG00000012569	ENSACIG00000012583	ENSACIG00000012651	ENSACIG00000012660	ENSACIG00000012669	ptprfa (ENSACIG00000012701)	hyi (ENSACIG00000012771)	SZT2 (ENSACIG00000012806)	ENSACIG00000012919	DDX10 (ENSACIG00000012927)	ENSACIG00000012937 #22	ENSACIG00000012964 ##24	ENSACIG00000013030	aqp4 (ENSACIG00000013051) #25	cdh2 (ENSACIG00000013175) #27
Percomorphaceae_C	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00730000111147	ENSGT00940000164495.c.b	ENSGT00940000155438.b	ENSGT00390000012078.a.a	ENSGT00950000182915.b.b.a.b.c.a	ENSGT00390000003161	ENSGT00390000015908	ENSGT00940000156897	ENSGT00950000182993.B.a.d	ENSGT00940000157285.f	ENSGT00940000154930.eb	ENSGT00940000155060.C.a.b	ENSGT00390000005462	ENSGT00390000018402	ENSGT00550000074980	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.b ##24	ENSGT00510000049120	ENSGT00940000156037.a.e #25	ENSGT00940000155981.h #27	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.b.d	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158019	ENSGT00550000074917	ENSGT00940000161734	ENSGT00940000159676.a	ENSGT00940000156299	ENSGT00390000015332	ENSGT00940000155789	ENSGT01030000234598.a.b
Percomorphaceae_D	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00730000111147	ENSGT00940000164495.c.b	ENSGT00940000155438.b	ENSGT00390000012078.a.a	ENSGT00950000182915.b.b.a.b.c.a	ENSGT00390000003161	ENSGT00390000015908	ENSGT00940000156897	ENSGT00950000182993.B.a.d	ENSGT00940000157285.f	ENSGT00940000154930.eb	ENSGT00940000155060.C.a.b	ENSGT00390000005462	ENSGT00390000018402	ENSGT00550000074980	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.b ##24	ENSGT00510000049120	ENSGT00940000155981.h #27	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.b.d	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.b.c.b	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158019	ENSGT00550000074917	ENSGT00940000161734	ENSGT00940000159676.a	ENSGT00940000156299	ENSGT00390000015332	ENSGT00940000155789	ENSGT01030000234598.a.b
Anabantaria	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00730000111147	ENSGT00940000164495.c.b	ENSGT00940000155438.b	ENSGT00390000012078.a.a	ENSGT00950000182915.b.b.a.b.c.a	ENSGT00390000003161	ENSGT00390000015908	ENSGT00940000156897	ENSGT00950000182993.B.a.d	ENSGT00940000157285.f	ENSGT00940000154930.eb	ENSGT00940000155060.C.a.b	ENSGT00390000005462	ENSGT00390000018402	ENSGT00550000074980	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.b ##24	ENSGT00510000049120	ENSGT00940000155981.h #27	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.b.d	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158019	ENSGT00550000074917	ENSGT00940000161734	ENSGT00940000159676.a	ENSGT00940000156299	ENSGT00940000155789	ENSGT01030000234598.a.b	ENSGT00940000153421.a.a.a.b	ENSGT00950000183039.B.b.c
Zig-zag eel	MODERN SPECIES	18	ENSMAMG00000022202	ENSMAMG00000022197	ENSMAMG00000022193	ENSMAMG00000022195	rad54l (ENSMAMG00000022180)	st3gal3a (ENSMAMG00000028614)	ENSMAMG00000022165	ptprfa (ENSMAMG00000022139)	ENSMAMG00000022161	ENSMAMG00000025331	ENSMAMG00000022135	hyi (ENSMAMG00000022129)	SZT2 (ENSMAMG00000022118)	ENSMAMG00000022111	ENSMAMG00000022277	ENSMAMG00000028011 #22	ENSMAMG00000024310 ##24	ENSMAMG00000022106	cdh2 (ENSMAMG00000006737) #27	ENSMAMG00000006788	ENSMAMG00000006823	ENSMAMG00000006841	TTR (ENSMAMG00000006873)	ENSMAMG00000006918	ENSMAMG00000006970	ENSMAMG00000007016	b3gnt5a (ENSMAMG00000007064)	ect2 (ENSMAMG00000007079)	nlgn1 (ENSMAMG00000007147)	ENSMAMG00000025926	ENSMAMG00000024981
Anabantoidei	ANCESTRAL SPECIES	33	ENSGT00730000111147	ENSGT00940000164495.c.b	ENSGT00940000155438.b	ENSGT00390000012078.a.a	ENSGT00950000182915.b.b.a.b.c.a	ENSGT00390000003161	ENSGT00390000015908	ENSGT00940000156897	ENSGT00950000182993.B.a.d	ENSGT00940000157285.f	ENSGT00940000154930.eb	ENSGT00940000155060.C.a.b	ENSGT00390000005462	ENSGT00390000018402	ENSGT00550000074980	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.b ##24	ENSGT00510000049120	ENSGT00940000155981.h #27	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.b.d	ENSGT00550000074917	ENSGT00940000161734	ENSGT00940000159676.a	ENSGT00940000156299	ENSGT00940000155789	ENSGT01030000234598.a.b	ENSGT00940000153421.a.a.a.b	ENSGT00950000183039.B.b.c	ENSGT00950000183111.b.a.b
Climbing perch	MODERN SPECIES	17	ENSATEG00000006227	ENSATEG00000006341	ENSATEG00000006372	ENSATEG00000006383	ENSATEG00000006551	ENSATEG00000006598	ENSATEG00000006654	ENSATEG00000006759	rad54l (ENSATEG00000006767)	ENSATEG00000006836	st3gal3a (ENSATEG00000026417)	ENSATEG00000006859	ptprfa (ENSATEG00000006874)	hyi (ENSATEG00000007012)	ENSATEG00000007227	ENSATEG00000027172 #22	ENSATEG00000027909 ##24	ENSATEG00000007286	ENSATEG00000029607	CDH2 (ENSATEG00000007302) #27	ENSATEG00000028170	ENSATEG00000029321	ENSATEG00000007537	ENSATEG00000007575	b3gnt5a (ENSATEG00000007604)	ect2 (ENSATEG00000007614)	ENSATEG00000007727	SPATA16 (ENSATEG00000007733)	ENSATEG00000030109	NLGN1 (ENSATEG00000007830)	NAALADL2 (ENSATEG00000007892)
Carangaria	ANCESTRAL SPECIES	37		ENSGT00940000164495.c.b	ENSGT00940000155438.b	ENSGT00390000012078.a.a	ENSGT00950000182915.b.b.a.b.c.a	ENSGT00390000003161	ENSGT00390000015908	ENSGT00940000156897	ENSGT00950000182993.B.a.d	ENSGT00940000157285.f	ENSGT00940000154930.eb	ENSGT00940000155060.C.a.b	ENSGT00390000005462	ENSGT00390000018402	ENSGT00550000074980	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.b ##24	ENSGT00510000049120	ENSGT00940000155981.h #27	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.b.d	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158019
Carangaria_A	ANCESTRAL SPECIES	91											ENSGT00940000154930.eb	ENSGT00940000155060.C.a.b	ENSGT00390000005462	ENSGT00390000018402	ENSGT00550000074980	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.b ##24	ENSGT00510000049120	ENSGT00940000155981.h #27	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.b.d	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158019	ENSGT00940000157285.f	ENSGT00950000182993.B.a.d	ENSGT00940000156897	ENSGT00390000015908	ENSGT00390000003161	ENSGT00950000182915.b.b.a.b.c.a	ENSGT00390000012078.a.a	ENSGT00940000155438.b
Seriola	ANCESTRAL SPECIES	131												ENSGT00940000155060.C.a.b	ENSGT00390000005462	ENSGT00390000018402	ENSGT00550000074980	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.b ##24	ENSGT00510000049120	ENSGT00940000155981.h #27	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.b.d.g	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.b.d.h	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158019	ENSGT01060000248556.A.a.a.a.b.a.b	ENSGT00940000154930.eb	ENSGT00940000157285.f	ENSGT00950000182993.B.a.d	ENSGT00940000156897	ENSGT00390000015908	ENSGT00390000003161
Greater amberjack	MODERN SPECIES	108						ENSSDUG00000017821	ENSSDUG00000017829	ptprfa (ENSSDUG00000017848)	ENSSDUG00000017895	ENSSDUG00000017911	hyi (ENSSDUG00000017940)	SZT2 (ENSSDUG00000018123)	ENSSDUG00000018221	ENSSDUG00000018238	DDX10 (ENSSDUG00000018245)	ENSSDUG00000018256 #22	ENSSDUG00000018284 ##24	ENSSDUG00000018333	ENSSDUG00000018343	cdh2 (ENSSDUG00000018365) #27	ENSSDUG00000018419	ENSSDUG00000018507	ENSSDUG00000018527	ENSSDUG00000018592	ttr (ENSSDUG00000018623)	b4galt6 (ENSSDUG00000018662)	crata (ENSSDUG00000018733)	ENSSDUG00000018982	st3gal3a (ENSSDUG00000019075)	ENSSDUG00000019108	ENSSDUG00000019120
Yellowtail amberjack	MODERN SPECIES	3221	spp2 (ENSSLDG00000012693)	alg11 (ENSSLDG00000012678)	cpb2 (ENSSLDG00000012664)	ENSSLDG00000012646	ENSSLDG00000012610	chst10 (ENSSLDG00000012582)	rpl31 (ENSSLDG00000012384)	MAP4K4 (ENSSLDG00000012306)	ENSSLDG00000012268	ENSSLDG00000012252	hyi (ENSSLDG00000012220)	ENSSLDG00000012201	SZT2 (ENSSLDG00000012083)	ENSSLDG00000012059	DDX10 (ENSSLDG00000012041)	ENSSLDG00000012017 #22	ENSSLDG00000011998 ##24	ENSSLDG00000011964	pcdh18b (ENSSLDG00000011936)	ENSSLDG00000011918	pcdh10b (ENSSLDG00000011899)	hspa9 (ENSSLDG00000011830)	ENSSLDG00000011811	ENSSLDG00000011795	ENSSLDG00000011783	ENSSLDG00000011767	SLITRK2 (ENSSLDG00000011756)	ENSSLDG00000011727	ENSSLDG00000011709	ENSSLDG00000011696	ENSSLDG00000011683
Barramundi perch	MODERN SPECIES	337														SZT2 (ENSLCAG00010025961)	DDX10 (ENSLCAG00010025970)	ENSLCAG00010025971 #22	ENSLCAG00010025972 ##24	ENSLCAG00010025974	rfc4 (ENSLCAG00010025975)	ENSLCAG00010025983	b3gnt5a (ENSLCAG00010025999)	ect2 (ENSLCAG00010026020)	ENSLCAG00010026072
Pleuronectoidei	ANCESTRAL SPECIES	66	ENSGT00390000012434	ENSGT00940000164495.c.b	ENSGT00940000155438.b	ENSGT00390000012078.a.a	ENSGT00950000182915.b.b.a.b.c.a	ENSGT00390000003161	ENSGT00390000015908	ENSGT00940000156897	ENSGT00950000182993.B.a.d	ENSGT00940000157285.f	ENSGT00940000154930.eb	ENSGT00940000155060.C.a.b	ENSGT00390000005462	ENSGT00390000018402	ENSGT00550000074980	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.b ##24	ENSGT00510000049120	ENSGT00940000155981.h #27	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.b.d	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158019
Turbot	MODERN SPECIES	3	ENSSMAG00000034336	ENSSMAG00000015363	trappc3 (ENSSMAG00000035435)	ENSSMAG00000023143	ENSSMAG00000027812	ENSSMAG00000028775	ENSSMAG00000027470	rad54l (ENSSMAG00000025409)	ENSSMAG00000037156	st3gal3a (ENSSMAG00000030052)	ENSSMAG00000034089	ptprfa (ENSSMAG00000036071)	hyi (ENSSMAG00000018790)	SZT2 (ENSSMAG00000018747)	ENSSMAG00000018735	ENSSMAG00000029796 #22	ENSSMAG00000018691 ##24	ENSSMAG00000023652	ENSSMAG00000018666	ENSSMAG00000018656	ENSSMAG00000018650	ENSSMAG00000021814	ENSSMAG00000028022	ENSSMAG00000030055	ENSSMAG00000035436	ENSSMAG00000005019	ENSSMAG00000005047	ENSSMAG00000027522	ENSSMAG00000005118	ENSSMAG00000005322	ENSSMAG00000005362
Tongue sole	MODERN SPECIES	11	ARHGAP39 (ENSCSEG00000001973)	ENSCSEG00000001980	rad54l (ENSCSEG00000001983)	ttc12 (ENSCSEG00000001990)	ENSCSEG00000001993	st3gal3a (ENSCSEG00000001995)	ENSCSEG00000002011	ENSCSEG00000002015	ENSCSEG00000002020	ENSCSEG00000002023	ptprfa (ENSCSEG00000002028)	hyi (ENSCSEG00000002042)	SZT2 (ENSCSEG00000002054)	ENSCSEG00000002077	DDX10 (ENSCSEG00000002080)	ENSCSEG00000002082 #22	ENSCSEG00000002086 ##24	ENSCSEG00000002098	cdh2 (ENSCSEG00000002100) #27	ENSCSEG00000002118	ENSCSEG00000002167	ENSCSEG00000002178	ttr (ENSCSEG00000002182)	b4galt6 (ENSCSEG00000002190)	BPHL (ENSCSEG00000002210)	ENSCSEG00000002216	SLC22A23 (ENSCSEG00000002224)	DSP (ENSCSEG00000002245)	tbc1d7 (ENSCSEG00000002278)	PHACTR1 (ENSCSEG00000002267)	sirt5 (ENSCSEG00000002284)
Eupercaria	ANCESTRAL SPECIES	8											ENSGT00940000154930.eb	ENSGT00940000155060.C.a.b	ENSGT00390000005462	ENSGT00390000018402	ENSGT00550000074980	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.b ##24	ENSGT00510000049120	ENSGT00940000156037.a.e #25	ENSGT00940000155981.h #27	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.b.d	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158019	ENSGT00550000074917	ENSGT00940000161734	ENSGT00940000159676.a	ENSGT00940000156299	ENSGT00390000015332	ENSGT00940000155789	ENSGT01030000234598.a.b
Tetraodontidae	ANCESTRAL SPECIES	77	ENSGT00390000006932	ENSGT00950000182930.C.f	ENSGT00530000063553.b.a	ENSGT00500000044869.a.b	ENSGT00940000165304	ENSGT00730000111147	ENSGT00940000164495.c.b	ENSGT00940000155438.b	ENSGT00390000003161	ENSGT00390000015908	ENSGT00940000156897	ENSGT00940000154930.eb	ENSGT00940000155060.C.a.b	ENSGT00390000005462	ENSGT00550000074980	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.b ##24
Fugu	MODERN SPECIES	12	cherp (ENSTRUG00000007429)	ENSTRUG00000029023	EPS15L1 (ENSTRUG00000007862)	ARHGAP39 (ENSTRUG00000008303)	ENSTRUG00000025668	rad54l (ENSTRUG00000008410)	ENSTRUG00000008660	ptprfa (ENSTRUG00000008928)	ift57 (ENSTRUG00000010380)	hyi (ENSTRUG00000010400)	ENSTRUG00000010881	ENSTRUG00000026671	slc5a9 (ENSTRUG00000010971)	ENSTRUG00000033114	ENSTRUG00000032498	ENSTRUG00000011095 #22	ENSTRUG00000032873 ##24	ENSTRUG00000011239	ENSTRUG00000025418	ENSTRUG00000032257	ttc39c (ENSTRUG00000011251)	zgc:103559 (ENSTRUG00000011363)	dtymk (ENSTRUG00000029570)	atg4b (ENSTRUG00000029746)	dtymk (ENSTRUG00000011656)	atg4b (ENSTRUG00000011726)	boka (ENSTRUG00000011955)	FARP2 (ENSTRUG00000012014)	hdlbpa (ENSTRUG00000012148)	SOX14 (ENSTRUG00000012630)	HS2ST1 (ENSTRUG00000012639)
Tetraodon	MODERN SPECIES	26	ENSTNIG00000005116	fxr2 (ENSTNIG00000005118)	haus4 (ENSTNIG00000005119)	dock11 (ENSTNIG00000005120)	ENSTNIG00000000661	ENSTNIG00000005122	e2f7 (ENSTNIG00000005126)	csrp2 (ENSTNIG00000005127)	zdhhc17 (ENSTNIG00000005128)	MORN4 (ENSTNIG00000005131)	hoga1 (ENSTNIG00000005132)	ENSTNIG00000005143	ENSTNIG00000001619	slc5a9 (ENSTNIG00000005144)	slc5a9 (ENSTNIG00000005145)	ENSTNIG00000005146 #22	ENSTNIG00000005147 ##24	ENSTNIG00000005974	ENSTNIG00000005149	palm1b (ENSTNIG00000005153)	SLC1A3 (ENSTNIG00000005166)	ENSTNIG00000005167	ENSTNIG00000005168	ENSTNIG00000005169	e2f4 (ENSTNIG00000005170)	zgc:154077 (ENSTNIG00000005171)	ENSTNIG00000005185	ENSTNIG00000005186	ENSTNIG00000005188	ENSTNIG00000005189	ENSTNIG00000005190
Eupecaria_A	ANCESTRAL SPECIES	11											ENSGT00940000154930.eb	ENSGT00940000155060.C.a.b	ENSGT00390000005462	ENSGT00390000018402	ENSGT00550000074980	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.b ##24	ENSGT00510000049120	ENSGT00940000156037.a.e #25	ENSGT00940000155981.h #27	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.b.d	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158019	ENSGT00550000074917	ENSGT00940000161734	ENSGT00940000159676.a	ENSGT00940000156299	ENSGT00390000015332	ENSGT00940000155789	ENSGT01030000234598.a.b
Eupecaria_B	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00730000111147	ENSGT00940000164495.c.b	ENSGT00940000155438.b	ENSGT00390000012078.a.a	ENSGT00950000182915.b.b.a.b.c.a	ENSGT00390000003161	ENSGT00390000015908	ENSGT00940000156897	ENSGT00950000182993.B.a.d	ENSGT00940000157285.f	ENSGT00940000154930.eb	ENSGT00940000155060.C.a.b	ENSGT00390000005462	ENSGT00390000018402	ENSGT00550000074980	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.b ##24	ENSGT00510000049120	ENSGT00940000156037.a.e #25	ENSGT00940000155981.h #27	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.b.d	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158019	ENSGT00550000074917	ENSGT00940000161734	ENSGT00940000159676.a	ENSGT00940000156299	ENSGT00390000015332	ENSGT00940000155789	ENSGT01030000234598.a.b
Perciformes	ANCESTRAL SPECIES	39	ENSGT00730000111147	ENSGT00940000164495.c.b	ENSGT00940000155438.b	ENSGT00390000012078.a.a	ENSGT00950000182915.b.b.a.b.c.a	ENSGT00390000003161	ENSGT00390000015908	ENSGT00940000156897	ENSGT00950000182993.B.a.d	ENSGT00940000157285.f	ENSGT00940000154930.eb	ENSGT00940000155060.C.a.b	ENSGT00390000005462	ENSGT00390000018402	ENSGT00550000074980	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.b ##24	ENSGT00510000049120	ENSGT00940000156037.a.f.e #25	ENSGT00940000155981.h #27	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.b.d	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.a	ENSGT01050000245154	ENSGT00940000158019	ENSGT00940000157546	ENSGT00390000012434	ENSGT00940000165232	ENSGT00390000005338	ENSGT00390000000568	ENSGT00390000008489	ENSGT00940000160274
Cottioidei	ANCESTRAL SPECIES	61	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.b.d	ENSGT00390000011943.b	ENSGT00940000160274	ENSGT00390000008489	ENSGT00390000000568	ENSGT00390000005338	ENSGT00390000012434	ENSGT00940000165232	ENSGT00940000157546	ENSGT00940000158019	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.a	ENSGT00940000155981.h #27	ENSGT00940000156037.a.f.e #25	ENSGT00510000049120	ENSGT00940000156453.b ##24	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00550000074980	ENSGT00390000018402	ENSGT00390000005462	ENSGT00940000155060.C.a.b	ENSGT00940000154930.eb
Stickleback	MODERN SPECIES	8											si:ch211-214c7.5 (ENSGACG00000002920)	ENSGACG00000002924	cdh2 (ENSGACG00000002928) #27	ENSGACG00000002930	ENSGACG00000002934 ##24	ENSGACG00000002940 #22	ENSGACG00000002948	ENSGACG00000002950	SZT2 (ENSGACG00000002952)	hyi (ENSGACG00000002976)	ptprfa (ENSGACG00000002994)	ENSGACG00000003008	ENSGACG00000003018	klf2a (ENSGACG00000003021)	EPS15L1 (ENSGACG00000003029)	rad23ab (ENSGACG00000003046)	ENSGACG00000003052	ARHGAP39 (ENSGACG00000003082)	ST3GAL3 (ENSGACG00000003093)	rad54l (ENSGACG00000003111)	ENSGACG00000003125
Lumpfish	MODERN SPECIES	19	rpl36 (ENSCLMG00005019733)	lmnb2 (ENSCLMG00005019742)	commd2 (ENSCLMG00005020022)	TRAPPC8 (ENSCLMG00005020031)	ctns (ENSCLMG00005020082)	ndufa11 (ENSCLMG00005020083)	zgc:171480 (ENSCLMG00005020087)	slc5a9 (ENSCLMG00005020095)	b4galt6 (ENSCLMG00005020243)	ENSCLMG00005020258	cdh2 (ENSCLMG00005020259) #27	ENSCLMG00005020293	ENSCLMG00005020294 #25	ENSCLMG00005020295	ENSCLMG00005020296 ##24	ENSCLMG00005020297 #22	ENSCLMG00005020298	ENSCLMG00005000206	hyi (ENSCLMG00005000212)	ptprfa (ENSCLMG00005000384)	ENSCLMG00005009510	ENSCLMG00005010982	rad54l (ENSCLMG00005010988)	ENSCLMG00005011654	st3gal3a (ENSCLMG00005011655)	ARHGAP39 (ENSCLMG00005011657)	dohh (ENSCLMG00005011670)	RSPH6A (ENSCLMG00005011672)	LONP1 (ENSCLMG00005011674)	LRRC24 (ENSCLMG00005011705)	sass6 (ENSCLMG00005011708)
Perciformes_a	ANCESTRAL SPECIES	47	ENSGT00730000111147	ENSGT00940000164495.c.b	ENSGT00940000155438.b	ENSGT00390000012078.a.a	ENSGT00950000182915.b.b.a.b.c.a	ENSGT00390000003161	ENSGT00390000015908	ENSGT00940000156897	ENSGT00950000182993.B.a.d	ENSGT00940000157285.f	ENSGT00940000154930.eb	ENSGT00940000155060.C.a.b	ENSGT00390000005462	ENSGT00390000018402	ENSGT00550000074980	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.b ##24	ENSGT00940000156037.a.e #25	ENSGT00940000155981.h #27	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.b.d	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.a	ENSGT01050000245154	ENSGT00940000158019	ENSGT00940000157546	ENSGT00390000012434	ENSGT00940000165232	ENSGT00390000005338	ENSGT00390000000568	ENSGT00390000008489	ENSGT00940000160274	ENSGT00390000011943.b
Pike perch	MODERN SPECIES	26	EPS15L1 (ENSSLUG00000000648)	NQO1 (ENSSLUG00000000876)	rad23ab (ENSSLUG00000000882)	ENSSLUG00000000888	ARHGAP39 (ENSSLUG00000000897)	ENSSLUG00000000909	rad54l (ENSSLUG00000000942)	ENSSLUG00000000974	st3gal3a (ENSSLUG00000000977)	ENSSLUG00000000985	ENSSLUG00000000999	ptprfa (ENSSLUG00000001867)	hyi (ENSSLUG00000018892)	SZT2 (ENSSLUG00000018929)	ENSSLUG00000019035	ENSSLUG00000019036 #22	ENSSLUG00000019045 ##24	cdh2 (ENSSLUG00000019144) #27	ENSSLUG00000020930	ENSSLUG00000020936	ENSSLUG00000020949	ENSSLUG00000020971	b4galt6 (ENSSLUG00000021003)	slc5a9 (ENSSLUG00000021204)	ndufa11 (ENSSLUG00000021213)	zgc:171480 (ENSSLUG00000021217)	ctns (ENSSLUG00000021220)	TRAPPC8 (ENSSLUG00000021244)	commd2 (ENSSLUG00000021290)	lmnb2 (ENSSLUG00000021344)	ENSSLUG00000022160
Channel bull blenny	MODERN SPECIES	18	cherp (ENSCGOG00000002405)	cherp (ENSCGOG00000002423)	ENSCGOG00000002475	klf2a (ENSCGOG00000002476)	EPS15L1 (ENSCGOG00000002499)	ARHGAP39 (ENSCGOG00000002947)	ENSCGOG00000002952	rad54l (ENSCGOG00000002968)	ENSCGOG00000003519	st3gal3a (ENSCGOG00000003522)	ENSCGOG00000003562	ptprfa (ENSCGOG00000004545)	hyi (ENSCGOG00000007598)	SZT2 (ENSCGOG00000007602)	ENSCGOG00000007621	TAF4B (ENSCGOG00000007623) #22	ENSCGOG00000007624 ##24	aqp4 (ENSCGOG00000007648) #25	ENSCGOG00000007948	ENSCGOG00000007955	cdh2 (ENSCGOG00000008039) #27	ENSCGOG00000011181	ENSCGOG00000011182	ttr (ENSCGOG00000011190)	b4galt6 (ENSCGOG00000011204)	slc5a9 (ENSCGOG00000011737)	ndufa11 (ENSCGOG00000015413)	zgc:171480 (ENSCGOG00000015416)	ctns (ENSCGOG00000015418)	TRAPPC8 (ENSCGOG00000015459)	commd2 (ENSCGOG00000017153)
Eupecaria_C	ANCESTRAL SPECIES	4		ENSGT00940000164495.c.b	ENSGT00940000155438.b	ENSGT00390000012078.a.a	ENSGT00950000182915.b.b.a.b.c.a	ENSGT00390000003161	ENSGT00390000015908	ENSGT00940000156897	ENSGT00950000182993.B.a.d	ENSGT00940000157285.f	ENSGT00940000154930.eb	ENSGT00940000155060.C.a.b	ENSGT00390000005462	ENSGT00390000018402	ENSGT00550000074980	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.b ##24	ENSGT00510000049120	ENSGT00940000156037.a.e #25	ENSGT00940000155981.h #27	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.b.d	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158019	ENSGT00550000074917	ENSGT00940000161734	ENSGT00940000159676.a	ENSGT00940000156299	ENSGT00390000015332	ENSGT00940000155789	ENSGT01030000234598.a.b
Eupercaria_incertae_sedis	ANCESTRAL SPECIES	3				ENSGT00390000012078.a.a	ENSGT00950000182915.b.b.a.b.c.a	ENSGT00390000003161	ENSGT00390000015908	ENSGT00940000156897	ENSGT00950000182993.B.a.d	ENSGT00940000157285.f	ENSGT00940000154930.eb	ENSGT00940000155060.C.a.b	ENSGT00390000005462	ENSGT00390000018402	ENSGT00550000074980	ENSGT00390000011620.a.a.a #22	ENSGT00940000156453.b ##24	ENSGT00510000049120	ENSGT00940000156037.a.e #25	ENSGT00940000155981.h #27	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.b.d	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.a	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158019	ENSGT00550000074917	ENSGT00940000161734	ENSGT00940000159676.a	ENSGT00940000156299	ENSGT00390000015332	ENSGT00940000155789	ENSGT01030000234598.a.b
European seabass	MODERN SPECIES	17	ENSDLAG00005034664	ENSDLAG00005015454	ENSDLAG00005016158	ENSDLAG00005015398	ENSDLAG00005015384	ENSDLAG00005032783	ENSDLAG00005033353	rad54l (ENSDLAG00005015312)	ENSDLAG00005015291	ENSDLAG00005015203	ptprfa (ENSDLAG00005013697)	ENSDLAG00005026628	hyi (ENSDLAG00005034526)	SZT2 (ENSDLAG00005013045)	ENSDLAG00005033585	ENSDLAG00005034967 #22	ENSDLAG00005029757 ##24	ENSDLAG00005012937	aqp4 (ENSDLAG00005012929) #25	ENSDLAG00005012919	cdh2 (ENSDLAG00005008669) #27	ENSDLAG00005008504	ENSDLAG00005030275	ENSDLAG00005008474	TTR (ENSDLAG00005031018)	ENSDLAG00005008401	ENSDLAG00005034981	b3gnt5a (ENSDLAG00005032048)	ENSDLAG00005007937	ect2 (ENSDLAG00005007777)	SPATA16 (ENSDLAG00005007751)
Large yellow croaker	MODERN SPECIES	489	ENSLCRG00005023377	ENSLCRG00005009737	macir (ENSLCRG00005009739)	rad23ab (ENSLCRG00005009745)	ENSLCRG00005009751	ARHGAP39 (ENSLCRG00005009758)	ENSLCRG00005009763	rad54l (ENSLCRG00005009767)	ENSLCRG00005009949	st3gal3a (ENSLCRG00005009950)	ENSLCRG00005009987	ptprfa (ENSLCRG00005010102)	hyi (ENSLCRG00005012008)	SZT2 (ENSLCRG00005012011)	ENSLCRG00005012013	TAF4B (ENSLCRG00005012016) #22	ENSLCRG00005012020 ##24	aqp4 (ENSLCRG00005012025) #25	cdh2 (ENSLCRG00005012107) #27	ENSLCRG00005015772	ENSLCRG00005015775	ENSLCRG00005015778	ENSLCRG00005015779	ENSLCRG00005015780	ENSLCRG00005015781	ENSLCRG00005015782	ttr (ENSLCRG00005015784)	b4galt6 (ENSLCRG00005015788)	rfc4 (ENSLCRG00005015835)	MCF2L2 (ENSLCRG00005015840)	b3gnt5a (ENSLCRG00005015904)
Gilthead seabream	MODERN SPECIES	2	lmnb2 (ENSSAUG00010023215)	commd2 (ENSSAUG00010023211)	ENSSAUG00010023206	ctns (ENSSAUG00010023205)	ENSSAUG00010023204	NDUFA11 (ENSSAUG00010023201)	ENSSAUG00010023200	zgc:171480 (ENSSAUG00010023199)	slc5a9 (ENSSAUG00010020023)	ENSSAUG00010019927	ENSSAUG00010019926	sass6 (ENSSAUG00010019923)	pde6d (ENSSAUG00010019860)	lrrc40 (ENSSAUG00010019857)	ENSSAUG00010019424	ENSSAUG00010019414 #22	ENSSAUG00010019410 ##24	ENSSAUG00010019409	ENSSAUG00010019407	SZT2 (ENSSAUG00010019387)	hyi (ENSSAUG00010019382)	ENSSAUG00010019381	ENSSAUG00010019380	ENSSAUG00010019379	ptprfa (ENSSAUG00010013643)	ENSSAUG00010013603	ENSSAUG00010013602	cdh2 (ENSSAUG00010008405) #27	cherp (ENSSAUG00010008340)	ENSSAUG00010008333	dohh (ENSSAUG00010008331)
Ballan wrasse	MODERN SPECIES	43	ENSLBEG00000010709	ankrd29 (ENSLBEG00000010797)	ENSLBEG00000010819	ENSLBEG00000010861	zgc:171480 (ENSLBEG00000010915)	ndufa11 (ENSLBEG00000010937)	ctns (ENSLBEG00000010945)	slc5a9 (ENSLBEG00000010966)	ENSLBEG00000010995	ptprfa (ENSLBEG00000011071)	hyi (ENSLBEG00000011314)	SZT2 (ENSLBEG00000011405)	ENSLBEG00000011562	ENSLBEG00000011587	DDX10 (ENSLBEG00000011602)	ENSLBEG00000011624 #22	ENSLBEG00000011662 ##24
Pinecone sodierfish	MODERN SPECIES	18	ENSMMDG00005021291	ENSMMDG00005021297	ENSMMDG00005021332	MEP1B (ENSMMDG00005021333)	mep1ba (ENSMMDG00005021337)	MEP1B (ENSMMDG00005021343)	ARHGAP39 (ENSMMDG00005021351)	ENSMMDG00005021356	rad54l (ENSMMDG00005021382)	st3gal3a (ENSMMDG00005021615)	ENSMMDG00005021620	ptprfa (ENSMMDG00005021676)	hyi (ENSMMDG00005021718)	ENSMMDG00005021727	DDX10 (ENSMMDG00005021736)	TAF4B (ENSMMDG00005021761) #22	ENSMMDG00005021766	ENSMMDG00005021770 ##24	aqp4 (ENSMMDG00005002791) #25	cdh2 (ENSMMDG00005003329) #27	ENSMMDG00005007692	ENSMMDG00005007694	dsc2l (ENSMMDG00005007697)	ENSMMDG00005007702	ENSMMDG00005007706	ENSMMDG00005007712	ENSMMDG00005007717	ENSMMDG00005007720	gjc4b (ENSMMDG00005007723)	ENSMMDG00005007724	ENSMMDG00005007727
Spotted gar	MODERN SPECIES	675	ENSLOCG00000006619	ENSLOCG00000006605	ENSLOCG00000006588	ENSLOCG00000006559	ENSLOCG00000006540	ttc39c (ENSLOCG00000006521)	ENSLOCG00000006503 #16	ENSLOCG00000017817	ENSLOCG00000006489	OSBPL1A (ENSLOCG00000006462) #17	impact (ENSLOCG00000006429) #18	ENSLOCG00000006411	ZNF521 (ENSLOCG00000006396) #19	ss18 (ENSLOCG00000006375) #20	psma8 (ENSLOCG00000006356) #21	TAF4B (ENSLOCG00000006335) #22	KCTD1 (ENSLOCG00000006322) #24	aqp4 (ENSLOCG00000006310) #25	ENSLOCG00000006272	cdh2 (ENSLOCG00000006252) #27	ENSLOCG00000006212	ASXL3 (ENSLOCG00000006197)	NOL4 (ENSLOCG00000006177)	dtna (ENSLOCG00000006152)	mapre2 (ENSLOCG00000006134)	ENSLOCG00000006110	SPIDR (ENSLOCG00000006093)	cebpd (ENSLOCG00000017816)	PRKDC (ENSLOCG00000006046)	mcm4 (ENSLOCG00000006026)	ube2v2 (ENSLOCG00000006012)
Reedfish	MODERN SPECIES	14	abhd3 (ENSECRG00000005433)	ESCO1 (ENSECRG00000005412)	greb1l (ENSECRG00000005353)	rock1 (ENSECRG00000005295)	usp14 (ENSECRG00000005197)	thoc1 (ENSECRG00000005147)	OSBPL1A (ENSECRG00000004879) #17	ENSECRG00000004834	impact (ENSECRG00000004821) #18	ENSECRG00000004810	ZNF521 (ENSECRG00000004785) #19	ENSECRG00000004751	ENSECRG00000004745	ENSECRG00000004741 #20	psma8 (ENSECRG00000004585) #21	TAF4B (ENSECRG00000004492) #22	ENSECRG00000004475 #24	aqp4 (ENSECRG00000004461) #25	CHST9 (ENSECRG00000004450) #26	cdh2 (ENSECRG00000001506) #27	ENSECRG00000001132	dsc2l (ENSECRG00000001086)	DSG4 (ENSECRG00000001006)	TTR (ENSECRG00000006316)	B4GALT6 (ENSECRG00000006307)	SBSPON (ENSECRG00000006293)	TERF1 (ENSECRG00000006277)	KCNB2 (ENSECRG00000006266)	ENSECRG00000006258	trpa1a (ENSECRG00000006244)	MSC (ENSECRG00000006231)
Elephant shark	MODERN SPECIES	1522	ENSCMIG00000004320	ENSCMIG00000004293	ttc39c (ENSCMIG00000004231)	ENSCMIG00000004203	ENSCMIG00000004200	ENSCMIG00000004197	ENSCMIG00000004174 #17	ENSCMIG00000004156 #17	ENSCMIG00000004145	ENSCMIG00000004137 #18	ENSCMIG00000004125 #18	ENSCMIG00000004116	ZNF521 (ENSCMIG00000004113) #19	ss18 (ENSCMIG00000004083) #20	psma8 (ENSCMIG00000004051) #21	ENSCMIG00000004039 #22	ENSCMIG00000004036	KCTD1 (ENSCMIG00000004032) #24	AQP4 (ENSCMIG00000003851) #25	CHST9 (ENSCMIG00000003762) #26	cdh2 (ENSCMIG00000003589) #27	ENSCMIG00000003471	VPS13B (ENSCMIG00000003443)	osr2 (ENSCMIG00000003392)	STK3 (ENSCMIG00000002976)	KCNS2 (ENSCMIG00000002790)	NIPAL2 (ENSCMIG00000002786)	POP1 (ENSCMIG00000002779)	rida (ENSCMIG00000002755)	rpl30 (ENSCMIG00000002733)	MATN2 (ENSCMIG00000002718)
Gnathostomata	ANCESTRAL SPECIES	362								ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00740000116961	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22
Euteleostomi	ANCESTRAL SPECIES	530												ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000161589
Sarcopterygii	ANCESTRAL SPECIES	230	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00740000116961	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000161589
Tetrapoda	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00390000014827	ENSGT00940000158980	ENSGT00950000182810.A.a.a	ENSGT00960000187407	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799
Amniota	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00390000014718	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.p	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a	ENSGT00390000015470	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799	ENSGT01090000260114	ENSGT00940000156300
Mammalia	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00390000014718	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.p	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a	ENSGT00390000015470	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799	ENSGT01090000260114	ENSGT00940000156300
Theria	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00390000014718	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.p	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a	ENSGT00390000015470	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799	ENSGT01090000260114	ENSGT00940000156300
Marsupialia	DUPLICATION
Marsupialia	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00390000014718	ENSGT01080000257410.C	ENSGT01020000230601	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.p	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b.a ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000171292	ENSGT00950000182810.A.a.a.c	ENSGT00390000015470	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799	ENSGT00940000156300	ENSGT00940000164142
Marsupialia_b	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00390000014718	ENSGT01080000257410.C	ENSGT01020000230601	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a.q	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.p	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b.a ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000171292	ENSGT00950000182810.A.a.a.c	ENSGT00390000015470	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799	ENSGT00940000156300	ENSGT00940000164142
Diprotodontia	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000014718	ENSGT01080000257410.C	ENSGT01020000230601	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a.q	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.p	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b.a ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000157562.c.a	ENSGT00940000157562.d	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000171292	ENSGT00950000182810.A.a.a.c	ENSGT00390000015470.d	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799	ENSGT00940000156300	ENSGT00530000063255.A	ENSGT01000000214440.B
Diprotodontia_a	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000014718	ENSGT01080000257410.C	ENSGT01020000230601	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a.q	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.p	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b.a ##22	ENSGT00990000204247	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000157562.c.a	ENSGT00940000157562.d	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000171292	ENSGT00950000182810.A.a.a.c	ENSGT00390000015470.d	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799	ENSGT00940000156300	ENSGT00530000063255.A
Common wonbat	MODERN SPECIES	35	SLCO4A1 (ENSVURG00010017751)	ENSVURG00010017753	GATA5 (ENSVURG00010017761)	ENSVURG00010017765	ENSVURG00010017777	ENSVURG00010017789	LAMA5 (ENSVURG00010017852)	ADRM1 (ENSVURG00010018150)	OSBPL2 (ENSVURG00010018163)	ENSVURG00010018174	HRH3 (ENSVURG00010018176)	MTG2 (ENSVURG00010018180)	SS18L1 (ENSVURG00010018186)	PSMA7 (ENSVURG00010018194)	LSM14B (ENSVURG00010018211)	TAF4 (ENSVURG00010018221) ##22	ENSVURG00010018232	CDH4 (ENSVURG00010018245)	CDH26 (ENSVURG00010018281)	ENSVURG00010018295	PHACTR3 (ENSVURG00010018312)	ENSVURG00010018328	ENSVURG00010018336	PRELID3B (ENSVURG00010018349)	ENSVURG00010018360	TUBB1 (ENSVURG00010018364)	CTSZ (ENSVURG00010018367)	NELFCD (ENSVURG00010018377)	GNAS (ENSVURG00010018387)	NPEPL1 (ENSVURG00010018402)	STX16 (ENSVURG00010018432)
koala	MODERN SPECIES	11	NTSR1 (ENSPCIG00000017192)	ENSPCIG00000009708	SLCO4A1 (ENSPCIG00000009707)	GATA5 (ENSPCIG00000013193)	ENSPCIG00000013194	CABLES2 (ENSPCIG00000013195)	ENSPCIG00000013196	LAMA5 (ENSPCIG00000013197)	ADRM1 (ENSPCIG00000013388)	OSBPL2 (ENSPCIG00000013390)	HRH3 (ENSPCIG00000037430)	MTG2 (ENSPCIG00000013399)	SS18L1 (ENSPCIG00000013402)	PSMA7 (ENSPCIG00000013403)	LSM14B (ENSPCIG00000013405)	ENSPCIG00000013407 ##22	ENSPCIG00000029897	CDH4 (ENSPCIG00000013421)	ENSPCIG00000005030	ENSPCIG00000004436	ENSPCIG00000004449	ENSPCIG00000004520	ENSPCIG00000034992	ENSPCIG00000035600	ENSPCIG00000030684	PRELID3B (ENSPCIG00000004576)	ATP5F1E (ENSPCIG00000004581)	TUBB1 (ENSPCIG00000004588)	CTSZ (ENSPCIG00000004592)	NELFCD (ENSPCIG00000004596)	GNAS (ENSPCIG00000004602)
Tasmanian devil	MODERN SPECIES	1	DIDO1 (ENSSHAG00000009621)	TCFL5 (ENSSHAG00000009928)	ENSSHAG00000025084	ENSSHAG00000010685	NTSR1 (ENSSHAG00000025949)	SLCO4A1 (ENSSHAG00000007017)	GATA5 (ENSSHAG00000012125)	ENSSHAG00000013047	CABLES2 (ENSSHAG00000029271)	ENSSHAG00000028487	ENSSHAG00000014512	HRH3 (ENSSHAG00000030195)	ENSSHAG00000015339	PSMA7 (ENSSHAG00000021848)	LSM14B (ENSSHAG00000022375)	TAF4 (ENSSHAG00000030211) ##22	ENSSHAG00000030481	CDH4 (ENSSHAG00000016271)	CDH26 (ENSSHAG00000004232)	ENSSHAG00000026572	PPP1R3D (ENSSHAG00000028027)	SYCP2 (ENSSHAG00000005477)	PHACTR3 (ENSSHAG00000007450)	ENSSHAG00000011144	ENSSHAG00000022108	ENSSHAG00000012601	PRELID3B (ENSSHAG00000031416)	TUBB1 (ENSSHAG00000013053)	ENSSHAG00000013277	CTSZ (ENSSHAG00000022820)	NELFCD (ENSSHAG00000013323)
Opossum	MODERN SPECIES		SLCO4A1 (ENSMODG00000016783)	ENSMODG00000047181	GATA5 (ENSMODG00000016774)	ENSMODG00000023265	CABLES2 (ENSMODG00000023264)	ENSMODG00000016769	LAMA5 (ENSMODG00000016753)	ADRM1 (ENSMODG00000016715)	OSBPL2 (ENSMODG00000016709)	HRH3 (ENSMODG00000016705)	MTG2 (ENSMODG00000016699)	SS18L1 (ENSMODG00000016697)	ENSMODG00000016692	LSM14B (ENSMODG00000016690)	ENSMODG00000045678	ENSMODG00000016684 ##22	CDH4 (ENSMODG00000016675)	ENSMODG00000043435	ENSMODG00000045124	ENSMODG00000041278	ENSMODG00000016629	ENSMODG00000027400	ENSMODG00000044206	FAM217B (ENSMODG00000045143)	PPP1R3D (ENSMODG00000023260)	ENSMODG00000016617	PHACTR3 (ENSMODG00000016615)	ENSMODG00000016611	ENSMODG00000047827	ENSMODG00000050414	ENSMODG00000016608
Marsupialia	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00390000011620.a.a.b.b ##22
Marsupialia_b	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00390000011620.a.a.b.b ##22
Diprotodontia	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00390000011620.a.a.b.b ##22
Diprotodontia_a	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00390000011620.a.a.b.b ##22
koala	MODERN SPECIES	254	ENSPCIG00000002180	RXRB (ENSPCIG00000002153)	COL11A2 (ENSPCIG00000031838)	BRD2 (ENSPCIG00000002017)	HLA-DMA (ENSPCIG00000001972)	Phci-DMB (ENSPCIG00000019944)	ENSPCIG00000036230	PSMB9 (ENSPCIG00000022552)	ENSPCIG00000034298	ENSPCIG00000008486	ENSPCIG00000001956	ENSPCIG00000001943	ENSPCIG00000034822	ENSPCIG00000005091	ENSPCIG00000001868	ENSPCIG00000001804 ##22	ENSPCIG00000001719	ENSPCIG00000009007	ENSPCIG00000008629	ENSPCIG00000005151	ENSPCIG00000008365	Phci-DBA (ENSPCIG00000018833)	Phci-DAA (ENSPCIG00000018830)	ENSPCIG00000018822	ENSPCIG00000018816	ENSPCIG00000018813	ENSPCIG00000018812	ENSPCIG00000018808	GPSM3 (ENSPCIG00000018807)	PBX2 (ENSPCIG00000033599)	AGER (ENSPCIG00000018805)
Wallaby	MODERN SPECIES	3622																TAF4 (ENSMEUG00000013666) ##22
Opossum	MODERN SPECIES	2	ENSMODG00000037538	ENSMODG00000038513	ENSMODG00000003770	ENSMODG00000046751	ENSMODG00000050219	ENSMODG00000040037	ENSMODG00000044469	ENSMODG00000037521	ENSMODG00000048371	ENSMODG00000048854	ENSMODG00000011986	ENSMODG00000011998	ENSMODG00000036995	ENSMODG00000042761	ENSMODG00000011981	ENSMODG00000012015 ##22	ENSMODG00000038680	ENSMODG00000012002	ENSMODG00000012024	TBX5 (ENSMODG00000012045)	TBX3 (ENSMODG00000012059)	ENSMODG00000041838	MED13L (ENSMODG00000012109)	PLA2G1B (ENSMODG00000003205)	MSI1 (ENSMODG00000003189)	COX6A1 (ENSMODG00000003168)	TRIAP1 (ENSMODG00000003157)	ENSMODG00000044919	SRSF9 (ENSMODG00000003146)	ENSMODG00000003133	ENSMODG00000045676
Eutheria	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00390000014718	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.p	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a	ENSGT00390000015470	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799	ENSGT01090000260114	ENSGT00940000156300
Boreoeutheria	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00390000014718	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00960000192285	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.o.b	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a	ENSGT00390000015470	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799	ENSGT01090000260114	ENSGT00940000156300.d
Laurasiatheria	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00390000014718	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00960000192285	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.o.b	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a	ENSGT00390000015470	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799	ENSGT01090000260114	ENSGT00940000156300.d
Eulipotyphla	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22
Hedgehog	MODERN SPECIES	2766																ENSEEUG00000008763 ##22
Laurasiatheria_a	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00390000014718	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00960000192285	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.o.b	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a	ENSGT00390000015470	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799	ENSGT00940000156300.c.a	ENSGT01100000264672
Artiodactyla	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT00390000014718	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.o.b	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a	ENSGT00390000015470	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799	ENSGT00940000156300.d	ENSGT01090000260114
Suina	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT00390000014718	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.o.b	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a	ENSGT00390000015470	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799	ENSGT01090000260114	ENSGT00940000156300.d	ENSGT00390000006634
Pig	MODERN SPECIES	8	NTSR1 (ENSSSCG00000038278)	ENSSSCG00000040565	SLCO4A1 (ENSSSCG00000039419)	GATA5 (ENSSSCG00000007538)	RBBP8NL (ENSSSCG00000007539)	CABLES2 (ENSSSCG00000007540)	RPS21 (ENSSSCG00000021825)	LAMA5 (ENSSSCG00000032761)	ADRM1 (ENSSSCG00000038718)	OSBPL2 (ENSSSCG00000036835)	HRH3 (ENSSSCG00000038578)	MTG2 (ENSSSCG00000037369)	SS18L1 (ENSSSCG00000035448)	PSMA7 (ENSSSCG00000033332)	LSM14B (ENSSSCG00000026052)	TAF4 (ENSSSCG00000024694) ##22	ENSSSCG00000046508	CDH4 (ENSSSCG00000025784)	FAM217B (ENSSSCG00000007531)	PPP1R3D (ENSSSCG00000007530)	SYCP2 (ENSSSCG00000007529)	PHACTR3 (ENSSSCG00000007528)	ENSSSCG00000007527	ZNF831 (ENSSSCG00000007526)	ENSSSCG00000007525	ENSSSCG00000060915	TUBB1 (ENSSSCG00000007523)	CTSZ (ENSSSCG00000007522)	NELFCD (ENSSSCG00000007521)	ENSSSCG00000032457	ENSSSCG00000058036
Chacoan peccary	MODERN SPECIES	27									ADRM1 (ENSCWAG00000000013)	OSBPL2 (ENSCWAG00000000041)	HRH3 (ENSCWAG00000000080)	MTG2 (ENSCWAG00000000101)	SS18L1 (ENSCWAG00000000125)	PSMA7 (ENSCWAG00000000146)	LSM14B (ENSCWAG00000000175)	TAF4 (ENSCWAG00000000252) ##22	CDH4 (ENSCWAG00000000431)
Artiodactyla_a	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00390000014718	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.o.b	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a	ENSGT00390000015470	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799	ENSGT00940000156300.d	ENSGT01090000260114
Camelidae	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT00390000014718	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00940000160139	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.o.b	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000161589	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a	ENSGT00390000015470	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799	ENSGT00940000156300.d	ENSGT01090000260114
Arabian camel	MODERN SPECIES	10	ENSCDRG00005006839	OGFR (ENSCDRG00005006813)	MRGBP (ENSCDRG00005006775)	NTSR1 (ENSCDRG00005006734)	ENSCDRG00005006702	SLCO4A1 (ENSCDRG00005006674)	GATA5 (ENSCDRG00005006581)	ENSCDRG00005006256	RPS21 (ENSCDRG00005006197)	ADRM1 (ENSCDRG00005005112)	HRH3 (ENSCDRG00005005077)	MTG2 (ENSCDRG00005005059)	SS18L1 (ENSCDRG00005005016)	PSMA7 (ENSCDRG00005004975)	LSM14B (ENSCDRG00005004926)	TAF4 (ENSCDRG00005004789) ##22	CDH4 (ENSCDRG00005004411)	CDH26 (ENSCDRG00005004313)	ENSCDRG00005004290	PPP1R3D (ENSCDRG00005004276)	PHACTR3 (ENSCDRG00005003583)	EDN3 (ENSCDRG00005003447)	ZNF831 (ENSCDRG00005019675)	PRELID3B (ENSCDRG00005019644)	ATP5F1E (ENSCDRG00005019637)	TUBB1 (ENSCDRG00005019625)	CTSZ (ENSCDRG00005019619)	NELFCD (ENSCDRG00005019582)	ENSCDRG00005019549	GNAS (ENSCDRG00005019285)	ENSCDRG00005019259
Artiodactyla_b	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00390000014718	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.o.b	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00390000018145.wc.a.a	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a	ENSGT00390000015470.m.b	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799.i.a	ENSGT00940000156300.d
Cetacea	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00390000014718	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.o.b	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853.l	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000168632	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a	ENSGT00390000015470.m.b	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799.i.a	ENSGT00940000156300.d	ENSGT01090000260114
Odontoceti	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00390000014718	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.o.b	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853.l	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000168632	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a	ENSGT00390000015470.m.b	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799.i.a	ENSGT00940000156300.d	ENSGT01090000260114
Odontoceti_a	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00390000014718	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.o.b	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853.l	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000168632	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a	ENSGT00390000015470.m.b	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a.j	ENSGT00390000001799.i.a	ENSGT00940000156300.d	ENSGT01090000260114
Odontoceti_b	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00390000014718	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.o.b	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853.l	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000168632	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a	ENSGT00390000015470.m.b	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a.j	ENSGT00390000001799.i.a	ENSGT00940000156300.d	ENSGT01090000260114
Monodontidae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00390000014718	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.o.b	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853.l	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000168632	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a	ENSGT00390000015470.m.b	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a.j	ENSGT00390000001799.i.a	ENSGT00940000156300.d	ENSGT01090000260114
Narwhal	MODERN SPECIES	299	NTSR1 (ENSMMNG00015002962)	SLCO4A1 (ENSMMNG00015002992)	ENSMMNG00015003015	GATA5 (ENSMMNG00015003060)	RBBP8NL (ENSMMNG00015003088)	CABLES2 (ENSMMNG00015003141)	RPS21 (ENSMMNG00015003199)	ENSMMNG00015003249	ADRM1 (ENSMMNG00015003347)	OSBPL2 (ENSMMNG00015003407)	HRH3 (ENSMMNG00015003462)	MTG2 (ENSMMNG00015003488)	SS18L1 (ENSMMNG00015003519)	PSMA7 (ENSMMNG00015003566)	LSM14B (ENSMMNG00015003641)	TAF4 (ENSMMNG00015003692) ##22	CDH4 (ENSMMNG00015003737)	ENSMMNG00015003795	FAM217B (ENSMMNG00015003840)	PPP1R3D (ENSMMNG00015003856)	SYCP2 (ENSMMNG00015003943)	PHACTR3 (ENSMMNG00015004056)	ENSMMNG00015004125	EDN3 (ENSMMNG00015004148)	ZNF831 (ENSMMNG00015004179)	ENSMMNG00015004193	PRELID3B (ENSMMNG00015004211)	ATP5F1E (ENSMMNG00015004225)	TUBB1 (ENSMMNG00015004239)	CTSZ (ENSMMNG00015004260)	ENSMMNG00015004284
Beluga whale	MODERN SPECIES	36	NTSR1 (ENSDLEG00000006619)	SLCO4A1 (ENSDLEG00000006657)	ENSDLEG00000006849	GATA5 (ENSDLEG00000006862)	RBBP8NL (ENSDLEG00000006866)	CABLES2 (ENSDLEG00000006872)	RPS21 (ENSDLEG00000006898)	LAMA5 (ENSDLEG00000006920)	ADRM1 (ENSDLEG00000007029)	OSBPL2 (ENSDLEG00000007046)	HRH3 (ENSDLEG00000007062)	MTG2 (ENSDLEG00000007066)	SS18L1 (ENSDLEG00000007157)	PSMA7 (ENSDLEG00000007179)	LSM14B (ENSDLEG00000007209)	TAF4 (ENSDLEG00000000226) ##22	CDH4 (ENSDLEG00000000382)	FAM217B (ENSDLEG00000000421)	PPP1R3D (ENSDLEG00000000434)	SYCP2 (ENSDLEG00000000502)	PHACTR3 (ENSDLEG00000000651)	EDN3 (ENSDLEG00000000784)	ZNF831 (ENSDLEG00000000808)	PRELID3B (ENSDLEG00000000826)	ENSDLEG00000000845	TUBB1 (ENSDLEG00000000861)	CTSZ (ENSDLEG00000000883)	NELFCD (ENSDLEG00000000907)	GNAS (ENSDLEG00000000944)	ENSDLEG00000000970	ENSDLEG00000000999
Vaquita	MODERN SPECIES	6	MRGBP (ENSPSNG00000021374)	NTSR1 (ENSPSNG00000021395)	SLCO4A1 (ENSPSNG00000021425)	ENSPSNG00000021451	GATA5 (ENSPSNG00000021484)	RBBP8NL (ENSPSNG00000021519)	CABLES2 (ENSPSNG00000021622)	ENSPSNG00000009820	ADRM1 (ENSPSNG00000013077)	OSBPL2 (ENSPSNG00000013262)	HRH3 (ENSPSNG00000013409)	MTG2 (ENSPSNG00000013478)	SS18L1 (ENSPSNG00000013560)	PSMA7 (ENSPSNG00000013641)	LSM14B (ENSPSNG00000013767)	TAF4 (ENSPSNG00000013933) ##22	CDH4 (ENSPSNG00000014451)	ENSPSNG00000014879	FAM217B (ENSPSNG00000014948)	PPP1R3D (ENSPSNG00000014976)	ENSPSNG00000015007	PHACTR3 (ENSPSNG00000015277)	EDN3 (ENSPSNG00000015678)	PRELID3B (ENSPSNG00000016155)	ENSPSNG00000016225	TUBB1 (ENSPSNG00000016273)	CTSZ (ENSPSNG00000016349)	ENSPSNG00000016419	ENSPSNG00000016734	ENSPSNG00000017316	ENSPSNG00000017471
Dolphin	MODERN SPECIES	2168																TAF4 (ENSTTRG00000009139) ##22	CDH4 (ENSTTRG00000009069)
Sperm whale	MODERN SPECIES	5	MRGBP (ENSPCTG00005010826)	NTSR1 (ENSPCTG00005010880)	SLCO4A1 (ENSPCTG00005010945)	ENSPCTG00005011020	GATA5 (ENSPCTG00005011063)	RBBP8NL (ENSPCTG00005011159)	CABLES2 (ENSPCTG00005011308)	ENSPCTG00005011426	ADRM1 (ENSPCTG00005014185)	OSBPL2 (ENSPCTG00005014366)	HRH3 (ENSPCTG00005014655)	MTG2 (ENSPCTG00005014701)	SS18L1 (ENSPCTG00005014758)	PSMA7 (ENSPCTG00005014933)	LSM14B (ENSPCTG00005015013)	TAF4 (ENSPCTG00005015206) ##22	CDH4 (ENSPCTG00005015443)	ENSPCTG00005015819	FAM217B (ENSPCTG00005015882)	PPP1R3D (ENSPCTG00005015919)	PHACTR3 (ENSPCTG00005016503)	EDN3 (ENSPCTG00005016895)	ZNF831 (ENSPCTG00005017120)	C14H20orf85 (ENSPCTG00005017200)	PCK1 (ENSPCTG00005017262)	CTCFL (ENSPCTG00005017424)	NELFCD (ENSPCTG00005017957)	CTSZ (ENSPCTG00005018064)	GNAS (ENSPCTG00005018125)	ENSPCTG00005018682	ANKRD60 (ENSPCTG00005018795)
Blue whale	MODERN SPECIES	6	MRGBP (ENSBMSG00010011280)	NTSR1 (ENSBMSG00010011293)	SLCO4A1 (ENSBMSG00010011305)	ENSBMSG00010011317	GATA5 (ENSBMSG00010011332)	RBBP8NL (ENSBMSG00010011353)	ENSBMSG00010011386	RPS21 (ENSBMSG00010011407)	ADRM1 (ENSBMSG00010011687)	OSBPL2 (ENSBMSG00010011717)	HRH3 (ENSBMSG00010011747)	MTG2 (ENSBMSG00010011756)	SS18L1 (ENSBMSG00010011768)	PSMA7 (ENSBMSG00010011783)	LSM14B (ENSBMSG00010011814)	TAF4 (ENSBMSG00010011906) ##22	CDH4 (ENSBMSG00010011951)	ENSBMSG00010011984	FAM217B (ENSBMSG00010011998)	PPP1R3D (ENSBMSG00010012002)	PHACTR3 (ENSBMSG00010012068)	EDN3 (ENSBMSG00010012138)	ZNF831 (ENSBMSG00010012169)	PRELID3B (ENSBMSG00010012185)	ATP5F1E (ENSBMSG00010012196)	TUBB1 (ENSBMSG00010012204)	CTSZ (ENSBMSG00010012214)	ENSBMSG00010012230	ENSBMSG00010014082	ENSBMSG00010015067	ENSBMSG00010015157
Pecora	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00390000014718	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.o.b	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00390000018145.wc.a.a	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a	ENSGT00390000015470.m.b	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799.i.a	ENSGT00940000156300.d
Percora_a	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT00390000014718	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.o.b	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a	ENSGT00390000015470.m.b.b	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799.i.a	ENSGT00940000156300.d	ENSGT01090000260114
Bovidae	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00390000014718	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.o.b	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a	ENSGT00390000015470.m.b.b	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799.i.a	ENSGT00940000156300.d	ENSGT01090000260114
Bovinae	ANCESTRAL SPECIES	23														ENSGT00940000159695.g	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562.e	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a.o.a	ENSGT00390000015470.m.b.b	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799.i.a	ENSGT01090000260114	ENSGT00940000156300.d
Bos	ANCESTRAL SPECIES	24														ENSGT00940000159695.g	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562.e	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a.o.a	ENSGT00390000015470.m.b.b.d	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799.i.a	ENSGT00940000156300.d	ENSGT01090000260114
Bos_a	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00390000014718	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.o.b	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695.g	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562.e	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00950000182810.A.a.a.o.a	ENSGT00390000015470.m.b.b.d	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799.i.a	ENSGT00940000156300.d	ENSGT01090000260114	ENSGT00390000006634
Domestic yak	MODERN SPECIES	3	ENSBGRG00000020718	NTSR1 (ENSBGRG00000020731)	SLCO4A1 (ENSBGRG00000020768)	GATA5 (ENSBGRG00000020941)	ENSBGRG00000021000	CABLES2 (ENSBGRG00000021073)	RPS21 (ENSBGRG00000021116)	LAMA5 (ENSBGRG00000021195)	ADRM1 (ENSBGRG00000022694)	OSBPL2 (ENSBGRG00000022810)	HRH3 (ENSBGRG00000022906)	MTG2 (ENSBGRG00000022940)	SS18L1 (ENSBGRG00000022962)	ENSBGRG00000023084	LSM14B (ENSBGRG00000023122)	TAF4 (ENSBGRG00000023255) ##22	CDH4 (ENSBGRG00000023355)	CDH26 (ENSBGRG00000024093)	FAM217B (ENSBGRG00000024168)	PPP1R3D (ENSBGRG00000024222)	SYCP2 (ENSBGRG00000024249)	ENSBGRG00000024487	ENSBGRG00000024502	EDN3 (ENSBGRG00000024625)	ENSBGRG00000024759	ENSBGRG00000024809	TUBB1 (ENSBGRG00000024823)	CTSZ (ENSBGRG00000024860)	ENSBGRG00000024898	ENSBGRG00000025028	ENSBGRG00000025497
Wild yak	MODERN SPECIES	2738																TAF4 (ENSBMUG00000008592) ##22	CDH4 (ENSBMUG00000008457)
Bos_b	ANCESTRAL SPECIES	26														ENSGT00940000159695.g	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562.e	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a.o.a	ENSGT00390000015470.m.b.b.d	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799.i.a	ENSGT00940000156300.d	ENSGT01090000260114
Cow	MODERN SPECIES	4	NTSR1 (ENSBTAG00000021727)	SLCO4A1 (ENSBTAG00000016388)	ENSBTAG00000051754	GATA5 (ENSBTAG00000047944)	RBBP8NL (ENSBTAG00000003163)	CABLES2 (ENSBTAG00000020797)	RPS21 (ENSBTAG00000020795)	LAMA5 (ENSBTAG00000003061)	ADRM1 (ENSBTAG00000003058)	OSBPL2 (ENSBTAG00000017402)	HRH3 (ENSBTAG00000031625)	MTG2 (ENSBTAG00000014442)	SS18L1 (ENSBTAG00000014438)	PSMA7 (ENSBTAG00000005127)	LSM14B (ENSBTAG00000021558)	TAF4 (ENSBTAG00000047991) ##22	CDH4 (ENSBTAG00000015058)	CDH26 (ENSBTAG00000020261)	FAM217B (ENSBTAG00000045509)	PPP1R3D (ENSBTAG00000027397)	SYCP2 (ENSBTAG00000003608)	PHACTR3 (ENSBTAG00000015080)	EDN3 (ENSBTAG00000012109)	ZNF831 (ENSBTAG00000011940)	PRELID3B (ENSBTAG00000004402)	ATP5F1E (ENSBTAG00000039208)	TUBB1 (ENSBTAG00000018785)	CTSZ (ENSBTAG00000018784)	NELFCD (ENSBTAG00000018783)	GNAS (ENSBTAG00000052413)	GNAS (ENSBTAG00000047223)
Hybrid Bos Indicus	MODERN SPECIES	4	MRGBP (ENSBIXG00005006040)	NTSR1 (ENSBIXG00005020774)	ENSBIXG00005020790	SLCO4A1 (ENSBIXG00005020865)	GATA5 (ENSBIXG00005006262)	RBBP8NL (ENSBIXG00005020989)	CABLES2 (ENSBIXG00005006264)	RPS21 (ENSBIXG00005003553)	ADRM1 (ENSBIXG00005003573)	HRH3 (ENSBIXG00005007067)	MTG2 (ENSBIXG00005021227)	SS18L1 (ENSBIXG00005021240)	ENSBIXG00005021267	LSM14B (ENSBIXG00005021304)	OSBPL2 (ENSBIXG00005021374)	TAF4 (ENSBIXG00005021394) ##22	CDH4 (ENSBIXG00005021467)	CDH26 (ENSBIXG00005003632)	ENSBIXG00005021566	PPP1R3D (ENSBIXG00005000015)	ENSBIXG00005000007	SYCP2 (ENSBIXG00005021751)	ENSBIXG00005021908	EDN3 (ENSBIXG00005021971)	ZNF831 (ENSBIXG00005007218)	PRELID3B (ENSBIXG00005022046)	ENSBIXG00005003739	TUBB1 (ENSBIXG00005003743)	CTSZ (ENSBIXG00005022102)	ENSBIXG00005022164	ENSBIXG00005022205
American bison	MODERN SPECIES	3089				GATA5 (ENSBBBG00000021683)	RBBP8NL (ENSBBBG00000021697)	CABLES2 (ENSBBBG00000007197)	RPS21 (ENSBBBG00000021727)	LAMA5 (ENSBBBG00000023435)	ADRM1 (ENSBBBG00000023624)	OSBPL2 (ENSBBBG00000023688)	ENSBBBG00000008484	MTG2 (ENSBBBG00000023710)	SS18L1 (ENSBBBG00000023728)	ENSBBBG00000023734	LSM14B (ENSBBBG00000023774)	TAF4 (ENSBBBG00000023791) ##22	CDH4 (ENSBBBG00000023802)	CDH26 (ENSBBBG00000008691)	FAM217B (ENSBBBG00000008802)	PPP1R3D (ENSBBBG00000023860)	ENSBBBG00000023882	ENSBBBG00000023967	EDN3 (ENSBBBG00000008863)	ENSBBBG00000024074	ENSBBBG00000024085	TUBB1 (ENSBBBG00000024089)	CTSZ (ENSBBBG00000008647)	ENSBBBG00000024184	ENSBBBG00000008650	ENSBBBG00000024382	ENSBBBG00000024413
Caprinae	ANCESTRAL SPECIES	21														ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a.r.a	ENSGT00390000015470.m.b.a.b	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799.i.a	ENSGT00940000156300.d	ENSGT01090000260114
Rambouillet Sheep	MODERN SPECIES	4	OGFR (ENSOARG00020005520)	MRGBP (ENSOARG00020005556)	NTSR1 (ENSOARG00020005581)	GATA5 (ENSOARG00020005701)	RBBP8NL (ENSOARG00020005734)	CABLES2 (ENSOARG00020005784)	RPS21 (ENSOARG00020005843)	LAMA5 (ENSOARG00020005901)	ADRM1 (ENSOARG00020006278)	OSBPL2 (ENSOARG00020006432)	HRH3 (ENSOARG00020006602)	MTG2 (ENSOARG00020006674)	SS18L1 (ENSOARG00020006781)	PSMA7 (ENSOARG00020007065)	ENSOARG00020007136	TAF4 (ENSOARG00020007283) ##22	CDH4 (ENSOARG00020007577)	CDH26 (ENSOARG00020007709)	FAM217B (ENSOARG00020007830)	PPP1R3D (ENSOARG00020007845)	SYCP2 (ENSOARG00020007921)	PHACTR3 (ENSOARG00020009712)	EDN3 (ENSOARG00020009904)	PRELID3B (ENSOARG00020010008)	ENSOARG00020010128	TUBB1 (ENSOARG00020010178)	CTSZ (ENSOARG00020010226)	NELFCD (ENSOARG00020010385)	ENSOARG00020010739	ENSOARG00020011802	ENSOARG00020011940
Goat	MODERN SPECIES	4	ENSCHIG00000014569	NTSR1 (ENSCHIG00000026075)	SLCO4A1 (ENSCHIG00000020363)	GATA5 (ENSCHIG00000014469)	RBBP8NL (ENSCHIG00000025293)	CABLES2 (ENSCHIG00000016200)	RPS21 (ENSCHIG00000013467)	LAMA5 (ENSCHIG00000011048)	ADRM1 (ENSCHIG00000015510)	OSBPL2 (ENSCHIG00000021852)	HRH3 (ENSCHIG00000006885)	MTG2 (ENSCHIG00000022564)	SS18L1 (ENSCHIG00000024560)	PSMA7 (ENSCHIG00000014692)	ENSCHIG00000010284	TAF4 (ENSCHIG00000012545) ##22	CDH4 (ENSCHIG00000007626)	CDH26 (ENSCHIG00000027057)	FAM217B (ENSCHIG00000011525)	PPP1R3D (ENSCHIG00000012459)	SYCP2 (ENSCHIG00000013442)	PHACTR3 (ENSCHIG00000021023)	EDN3 (ENSCHIG00000017167)	ZNF831 (ENSCHIG00000026441)	ENSCHIG00000013750	ENSCHIG00000023373	TUBB1 (ENSCHIG00000025696)	CTSZ (ENSCHIG00000011423)	ENSCHIG00000021753	GNAS (ENSCHIG00000011782)	ENSCHIG00000013806
Siberian musk deer	MODERN SPECIES	1193	NTSR1 (ENSMMSG00000020812)	ENSMMSG00000020792	SLCO4A1 (ENSMMSG00000020739)	GATA5 (ENSMMSG00000020681)	RBBP8NL (ENSMMSG00000020610)	CABLES2 (ENSMMSG00000020551)	RPS21 (ENSMMSG00000020504)	LAMA5 (ENSMMSG00000020211)	ADRM1 (ENSMMSG00000020092)	OSBPL2 (ENSMMSG00000020018)	HRH3 (ENSMMSG00000019990)	MTG2 (ENSMMSG00000019960)	SS18L1 (ENSMMSG00000019914)	PSMA7 (ENSMMSG00000019883)	LSM14B (ENSMMSG00000019784)	TAF4 (ENSMMSG00000019546) ##22	CDH4 (ENSMMSG00000019459)	CDH26 (ENSMMSG00000019362)	FAM217B (ENSMMSG00000019344)	PPP1R3D (ENSMMSG00000019328)	ENSMMSG00000019309	PHACTR3 (ENSMMSG00000018838)	EDN3 (ENSMMSG00000018744)	ZNF831 (ENSMMSG00000018706)	PRELID3B (ENSMMSG00000018651)	ENSMMSG00000018619	ENSMMSG00000018608	TUBB1 (ENSMMSG00000018536)	CTSZ (ENSMMSG00000018517)	ENSMMSG00000018476	ENSMMSG00000018427
Yarkand deer	MODERN SPECIES	15	MRGBP (ENSCHYG00000024816)	NTSR1 (ENSCHYG00000024836)	SLCO4A1 (ENSCHYG00000024856)	ENSCHYG00000024915	GATA5 (ENSCHYG00000024947)	RBBP8NL (ENSCHYG00000025000)	ENSCHYG00000025117	ENSCHYG00000025132	ADRM1 (ENSCHYG00000025424)	OSBPL2 (ENSCHYG00000025489)	HRH3 (ENSCHYG00000025598)	MTG2 (ENSCHYG00000025616)	SS18L1 (ENSCHYG00000025661)	PSMA7 (ENSCHYG00000025756)	LSM14B (ENSCHYG00000025784)	TAF4 (ENSCHYG00000025826) ##22	CDH4 (ENSCHYG00000025855)	ENSCHYG00000013703	CDH26 (ENSCHYG00000013755)	ENSCHYG00000014153	PPP1R3D (ENSCHYG00000014208)	SYCP2 (ENSCHYG00000014285)	PHACTR3 (ENSCHYG00000014507)	EDN3 (ENSCHYG00000014695)	ZNF831 (ENSCHYG00000014868)	PRELID3B (ENSCHYG00000014946)	ENSCHYG00000015158	TUBB1 (ENSCHYG00000015260)	CTSZ (ENSCHYG00000015333)	ENSCHYG00000015411	ENSCHYG00000016008
Laurasiatheria_b	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00390000014718	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00960000192285	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.o.b	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a	ENSGT00390000015470	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799	ENSGT01100000264672	ENSGT00940000156300.d
Carnivora	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00390000014718	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00960000192285	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.o.b	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a	ENSGT00390000015470	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799	ENSGT01100000264672	ENSGT00940000156300.d	ENSGT01090000260114	ENSGT00390000006634	ENSGT00530000063255.A
Caniformia	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000014718	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00960000192285	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.o.b	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a	ENSGT00390000015470	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799	ENSGT01100000264672	ENSGT00940000156300.d	ENSGT01090000260114	ENSGT00390000006634	ENSGT00530000063255.A
Canidae	ANCESTRAL SPECIES	41	ENSGT00390000014718	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.o.b	ENSGT00390000017515.p	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a	ENSGT00390000015470	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799	ENSGT01090000260114	ENSGT00940000156300.d
Canis_lupus	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00390000014718	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.o.b	ENSGT00390000017515.p	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a	ENSGT00390000015470	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799	ENSGT01090000260114	ENSGT00940000156300.d
Dog	MODERN SPECIES	16	MRGBP (ENSCAFG00845017766)	NTSR1 (ENSCAFG00845017702)	ENSCAFG00845017679	SLCO4A1 (ENSCAFG00845017528)	GATA5 (ENSCAFG00845017212)	RBBP8NL (ENSCAFG00845017078)	CABLES2 (ENSCAFG00845016981)	RPS21 (ENSCAFG00845016932)	ADRM1 (ENSCAFG00845016538)	OSBPL2 (ENSCAFG00845016342)	HRH3 (ENSCAFG00845016267)	MTG2 (ENSCAFG00845016227)	SS18L1 (ENSCAFG00845016170)	ENSCAFG00845016116	LSM14B (ENSCAFG00845015999)	TAF4 (ENSCAFG00845015879) ##22	CDH4 (ENSCAFG00845015748)	CDH26 (ENSCAFG00845015611)	ENSCAFG00845015558	PPP1R3D (ENSCAFG00845015533)	SYCP2 (ENSCAFG00845014669)	PHACTR3 (ENSCAFG00845014288)	EDN3 (ENSCAFG00845014217)	ZNF831 (ENSCAFG00845014176)	PRELID3B (ENSCAFG00845014151)	ATP5F1E (ENSCAFG00845014129)	TUBB1 (ENSCAFG00845014111)	CTSZ (ENSCAFG00845014050)	NELFCD (ENSCAFG00845013969)	ENSCAFG00845013928	GNAS (ENSCAFG00845013733)
Dingo	MODERN SPECIES	343	NTSR1 (ENSCAFG00020001009)	ENSCAFG00020001006	SLCO4A1 (ENSCAFG00020000949)	GATA5 (ENSCAFG00020000926)	RBBP8NL (ENSCAFG00020000919)	CABLES2 (ENSCAFG00020000888)	ENSCAFG00020000870	ENSCAFG00020000144	ADRM1 (ENSCAFG00020000118)	OSBPL2 (ENSCAFG00020000096)	HRH3 (ENSCAFG00020022208)	MTG2 (ENSCAFG00020022198)	SS18L1 (ENSCAFG00020022196)	PSMA7 (ENSCAFG00020022159)	LSM14B (ENSCAFG00020022150)	TAF4 (ENSCAFG00020022127) ##22	CDH4 (ENSCAFG00020022116)	CDH26 (ENSCAFG00020022110)	FAM217B (ENSCAFG00020022109)	PHACTR3 (ENSCAFG00020022081)	EDN3 (ENSCAFG00020022074)	ZNF831 (ENSCAFG00020022068)	PRELID3B (ENSCAFG00020022066)	ATP5F1E (ENSCAFG00020022064)	TUBB1 (ENSCAFG00020022060)	CTSZ (ENSCAFG00020022056)	NELFCD (ENSCAFG00020022050)	ENSCAFG00020022047	GNAS (ENSCAFG00020022045)	ENSCAFG00020022044	ENSCAFG00020022038
Red fox	MODERN SPECIES	108	MRGBP (ENSVVUG00000015402)	NTSR1 (ENSVVUG00000015408)	SLCO4A1 (ENSVVUG00000015410)	ENSVVUG00000015436	GATA5 (ENSVVUG00000015452)	RBBP8NL (ENSVVUG00000015483)	ENSVVUG00000015488	ENSVVUG00000015503	ADRM1 (ENSVVUG00000015782)	OSBPL2 (ENSVVUG00000015789)	HRH3 (ENSVVUG00000015800)	MTG2 (ENSVVUG00000015810)	SS18L1 (ENSVVUG00000015825)	PSMA7 (ENSVVUG00000015857)	LSM14B (ENSVVUG00000015920)	TAF4 (ENSVVUG00000015939) ##22	CDH4 (ENSVVUG00000016015)	CDH26 (ENSVVUG00000016039)	ENSVVUG00000016075	PPP1R3D (ENSVVUG00000016077)	SYCP2 (ENSVVUG00000016091)	PHACTR3 (ENSVVUG00000016145)	EDN3 (ENSVVUG00000016155)	ZNF831 (ENSVVUG00000016165)	PRELID3B (ENSVVUG00000016188)	ATP5F1E (ENSVVUG00000016192)	TUBB1 (ENSVVUG00000016193)	CTSZ (ENSVVUG00000016198)	NELFCD (ENSVVUG00000016260)	GNAS (ENSVVUG00000016830)	ENSVVUG00000016833
Caniformia_b	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000014718	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00960000192285	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.o.b	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a	ENSGT00390000015470	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799	ENSGT01100000264672	ENSGT00940000156300.d
Ursidae	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00960000192285	ENSGT00390000014718	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.o.b.x	ENSGT00940000156537	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695.d	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a	ENSGT00390000015470	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799	ENSGT00940000156300.d	ENSGT01090000260114
Giant Panda	MODERN SPECIES	4	COL9A3 (ENSAMEG00000017342)	ENSAMEG00000029718	ENSAMEG00000025015	SLCO4A1 (ENSAMEG00000023949)	ENSAMEG00000025108	GATA5 (ENSAMEG00000028627)	RBBP8NL (ENSAMEG00000017386)	ENSAMEG00000017392	ENSAMEG00000024061	ENSAMEG00000013512	HRH3 (ENSAMEG00000013427)	MTG2 (ENSAMEG00000026455)	SS18L1 (ENSAMEG00000013466)	PSMA7 (ENSAMEG00000013451)	LSM14B (ENSAMEG00000013430)	TAF4 (ENSAMEG00000024016) ##22	CDH4 (ENSAMEG00000012866)	CDH26 (ENSAMEG00000012384)	SYCP2 (ENSAMEG00000012412)	PHACTR3 (ENSAMEG00000027213)	EDN3 (ENSAMEG00000012458)	ZNF831 (ENSAMEG00000028490)	PRELID3B (ENSAMEG00000012470)	ATP5F1E (ENSAMEG00000019808)	ENSAMEG00000028999	CTSZ (ENSAMEG00000012483)	NELFCD (ENSAMEG00000012493)	ENSAMEG00000031308	ENSAMEG00000024248	ENSAMEG00000019810	NPEPL1 (ENSAMEG00000012570)
Ursus	ANCESTRAL SPECIES	106	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT00390000014718	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.o.b.x	ENSGT00940000156537	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695.d	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562
Polar bear	MODERN SPECIES	148	SLC17A9 (ENSUMAG00000022304)	GID8 (ENSUMAG00000022317)	DIDO1 (ENSUMAG00000022326)	ENSUMAG00000022355	ENSUMAG00000022356	ENSUMAG00000022360	NTSR1 (ENSUMAG00000022365)	ENSUMAG00000022371	ENSUMAG00000022375	CABLES2 (ENSUMAG00000022377)	ENSUMAG00000022396	MTG2 (ENSUMAG00000022407)	SS18L1 (ENSUMAG00000000050)	PSMA7 (ENSUMAG00000000149)	LSM14B (ENSUMAG00000000480)	TAF4 (ENSUMAG00000000503) ##22	CDH4 (ENSUMAG00000000805)	CDH26 (ENSUMAG00000000888)	ENSUMAG00000001001	SYCP2 (ENSUMAG00000001014)	PHACTR3 (ENSUMAG00000001100)
Mustelinae	ANCESTRAL SPECIES	58	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00390000014718	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.o.b	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a	ENSGT00390000015470	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799	ENSGT01100000264672	ENSGT00940000156300.d	ENSGT00390000006634	ENSGT00530000063255.A
American mink	MODERN SPECIES	82	NTSR1 (ENSNVIG00000020055)	SLCO4A1 (ENSNVIG00000020066)	ENSNVIG00000020092	GATA5 (ENSNVIG00000020102)	RBBP8NL (ENSNVIG00000020118)	CABLES2 (ENSNVIG00000020141)	RPS21 (ENSNVIG00000020157)	LAMA5 (ENSNVIG00000020229)	ADRM1 (ENSNVIG00000021284)	OSBPL2 (ENSNVIG00000021309)	HRH3 (ENSNVIG00000021366)	MTG2 (ENSNVIG00000021425)	SS18L1 (ENSNVIG00000021432)	PSMA7 (ENSNVIG00000021436)	LSM14B (ENSNVIG00000021449)	TAF4 (ENSNVIG00000021480) ##22	CDH4 (ENSNVIG00000021602)	FAM217B (ENSNVIG00000021647)	SYCP2 (ENSNVIG00000021662)	PHACTR3 (ENSNVIG00000021744)	EDN3 (ENSNVIG00000021795)	ZNF831 (ENSNVIG00000021814)	ENSNVIG00000021823	ENSNVIG00000021833	TUBB1 (ENSNVIG00000021841)	CTSZ (ENSNVIG00000021856)	NELFCD (ENSNVIG00000021864)	ENSNVIG00000021887	ENSNVIG00000021954	ENSNVIG00000021981	NPEPL1 (ENSNVIG00000022000)
Ferret	MODERN SPECIES	236	ENSMPUG00000020176	ENSMPUG00000007889	GATA5 (ENSMPUG00000007886)	RBBP8NL (ENSMPUG00000007879)	CABLES2 (ENSMPUG00000007872)	ENSMPUG00000020175	LAMA5 (ENSMPUG00000007845)	ADRM1 (ENSMPUG00000007782)	OSBPL2 (ENSMPUG00000007774)	ENSMPUG00000007771	HRH3 (ENSMPUG00000007765)	MTG2 (ENSMPUG00000007761)	SS18L1 (ENSMPUG00000007669)	PSMA7 (ENSMPUG00000007664)	LSM14B (ENSMPUG00000007584)	TAF4 (ENSMPUG00000007569) ##22	CDH4 (ENSMPUG00000007233)	ENSMPUG00000007229	ENSMPUG00000007220	CDH26 (ENSMPUG00000007152)	PPP1R3D (ENSMPUG00000020174)	FAM217B (ENSMPUG00000007144)	SYCP2 (ENSMPUG00000007114)	PHACTR3 (ENSMPUG00000007105)	ZNF831 (ENSMPUG00000007096)	ENSMPUG00000007089	ENSMPUG00000007083	PRELID3B (ENSMPUG00000007075)	TUBB1 (ENSMPUG00000007062)	CTSZ (ENSMPUG00000007010)	NELFCD (ENSMPUG00000006914)
Felidae	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.o.b	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00930000152812	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a.g	ENSGT00390000015470	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799	ENSGT00940000156300.d
Panthera	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.o.b	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00930000152812	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a.g	ENSGT00390000015470	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799	ENSGT00940000156300.d
Panthera_a	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.o.b	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00930000152812	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a.g	ENSGT00390000015470	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799	ENSGT00940000156300.d
leopard	MODERN SPECIES	105	ENSPPRG00000009399	MRGBP (ENSPPRG00000008348)	NTSR1 (ENSPPRG00000007852)	SLCO4A1 (ENSPPRG00000007640)	GATA5 (ENSPPRG00000006784)	RBBP8NL (ENSPPRG00000005756)	CABLES2 (ENSPPRG00000005036)	RPS21 (ENSPPRG00000004689)	ADRM1 (ENSPPRG00000020760)	OSBPL2 (ENSPPRG00000018989)	HRH3 (ENSPPRG00000013350)	MTG2 (ENSPPRG00000010251)	SS18L1 (ENSPPRG00000010006)	PSMA7 (ENSPPRG00000009414)	LSM14B (ENSPPRG00000009197)	TAF4 (ENSPPRG00000007879) ##22	CDH4 (ENSPPRG00000007638)	ENSPPRG00000003048	CDH26 (ENSPPRG00000001923)	PPP1R3D (ENSPPRG00000017666)	SYCP2 (ENSPPRG00000000712)	PHACTR3 (ENSPPRG00000022438)	EDN3 (ENSPPRG00000014380)	PRELID3B (ENSPPRG00000012981)	ENSPPRG00000011697	TUBB1 (ENSPPRG00000011192)	CTSZ (ENSPPRG00000010021)	NELFCD (ENSPPRG00000008415)	ENSPPRG00000007770	ENSPPRG00000003473	ENSPPRG00000016818
lion	MODERN SPECIES	3	MRGBP (ENSPLOG00000016026)	NTSR1 (ENSPLOG00000015983)	SLCO4A1 (ENSPLOG00000015950)	GATA5 (ENSPLOG00000015886)	ENSPLOG00000015816	CABLES2 (ENSPLOG00000015700)	RPS21 (ENSPLOG00000015612)	ENSPLOG00000015480	ADRM1 (ENSPLOG00000015368)	OSBPL2 (ENSPLOG00000015228)	HRH3 (ENSPLOG00000015155)	MTG2 (ENSPLOG00000015109)	SS18L1 (ENSPLOG00000015011)	PSMA7 (ENSPLOG00000014943)	LSM14B (ENSPLOG00000014849)	TAF4 (ENSPLOG00000014564) ##22	CDH4 (ENSPLOG00000014187)	ENSPLOG00000014142	ENSPLOG00000014104	CDH26 (ENSPLOG00000013915)	FAM217B (ENSPLOG00000013894)	PPP1R3D (ENSPLOG00000013873)	SYCP2 (ENSPLOG00000013329)	PHACTR3 (ENSPLOG00000013025)	EDN3 (ENSPLOG00000012864)	ZNF831 (ENSPLOG00000012771)	PRELID3B (ENSPLOG00000012723)	ATP5F1E (ENSPLOG00000012683)	TUBB1 (ENSPLOG00000012649)	CTSZ (ENSPLOG00000012619)	NELFCD (ENSPLOG00000012546)
Tiger	MODERN SPECIES	253	YTHDF1 (ENSPTIG00000017355)	SLC17A9 (ENSPTIG00000018794)	GID8 (ENSPTIG00000019701)	ENSPTIG00000020540	ENSPTIG00000006278	NTSR1 (ENSPTIG00000009080)	ENSPTIG00000009938	CABLES2 (ENSPTIG00000011195)	ENSPTIG00000012625	ADRM1 (ENSPTIG00000012974)	OSBPL2 (ENSPTIG00000015979)	MTG2 (ENSPTIG00000018100)	SS18L1 (ENSPTIG00000019059)	PSMA7 (ENSPTIG00000020131)	LSM14B (ENSPTIG00000021518)	ENSPTIG00000003361 ##22	CDH4 (ENSPTIG00000006626)	ENSPTIG00000012110	CDH26 (ENSPTIG00000012314)	SYCP2 (ENSPTIG00000014762)	PHACTR3 (ENSPTIG00000021575)	PRELID3B (ENSPTIG00000005352)	ATP5F1E (ENSPTIG00000006905)	ENSPTIG00000007750	ENSPTIG00000011803	NELFCD (ENSPTIG00000012328)	GNAS (ENSPTIG00000013655)	ENSPTIG00000015863	NPEPL1 (ENSPTIG00000016930)	STX16 (ENSPTIG00000018391)	VAPB (ENSPTIG00000006830)
Cat	MODERN SPECIES	2	ENSFCAG00000043168	MRGBP (ENSFCAG00000028818)	NTSR1 (ENSFCAG00000000383)	SLCO4A1 (ENSFCAG00000000381)	GATA5 (ENSFCAG00000001058)	RBBP8NL (ENSFCAG00000001057)	CABLES2 (ENSFCAG00000001056)	RPS21 (ENSFCAG00000033393)	LAMA5 (ENSFCAG00000018350)	OSBPL2 (ENSFCAG00000003247)	HRH3 (ENSFCAG00000026486)	MTG2 (ENSFCAG00000003250)	SS18L1 (ENSFCAG00000018839)	PSMA7 (ENSFCAG00000003249)	LSM14B (ENSFCAG00000003248)	TAF4 (ENSFCAG00000011994) ##22	CDH4 (ENSFCAG00000011987)	TETY1 (ENSFCAG00000036141)	CDH26 (ENSFCAG00000005129)	FAM217B (ENSFCAG00000005128)	PPP1R3D (ENSFCAG00000031527)	SYCP2 (ENSFCAG00000005127)	PHACTR3 (ENSFCAG00000005126)	EDN3 (ENSFCAG00000046428)	ZNF831 (ENSFCAG00000000850)	NELFCD (ENSFCAG00000000844)	PRELID3B (ENSFCAG00000031431)	TUBB1 (ENSFCAG00000014627)	CTSZ (ENSFCAG00000000845)	ENSFCAG00000034898	ENSFCAG00000037901
Laurasiatheria_c	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT00390000014718	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.o.b	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a	ENSGT00390000015470	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799	ENSGT00940000156300.d	ENSGT01090000260114
Chiroptera	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00390000014718	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.o.b	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a.e	ENSGT00390000015470	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799	ENSGT00940000156300.d	ENSGT00390000006634
Microchiroptera	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00390000014718	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.o.b	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a.e	ENSGT00390000015470	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799	ENSGT00940000156300.d	ENSGT00390000006634
Greater horseshoe bat	MODERN SPECIES	15	MRGBP (ENSRFEG00010017510)	NTSR1 (ENSRFEG00010017545)	SLCO4A1 (ENSRFEG00010017567)	ENSRFEG00010017737	GATA5 (ENSRFEG00010017774)	RBBP8NL (ENSRFEG00010017852)	CABLES2 (ENSRFEG00010017891)	RPS21 (ENSRFEG00010018046)	ADRM1 (ENSRFEG00010019448)	OSBPL2 (ENSRFEG00010019536)	HRH3 (ENSRFEG00010019606)	MTG2 (ENSRFEG00010019620)	SS18L1 (ENSRFEG00010019636)	PSMA7 (ENSRFEG00010019679)	LSM14B (ENSRFEG00010019740)	TAF4 (ENSRFEG00010019851) ##22	CDH4 (ENSRFEG00010020057)	CDH26 (ENSRFEG00010020152)	FAM217B (ENSRFEG00010020258)	PPP1R3D (ENSRFEG00010020266)	SYCP2 (ENSRFEG00010020278)	PHACTR3 (ENSRFEG00010020491)	EDN3 (ENSRFEG00010020608)	ZNF831 (ENSRFEG00010020646)	ENSRFEG00010020690	ATP5F1E (ENSRFEG00010020727)	TUBB1 (ENSRFEG00010020749)	CTSZ (ENSRFEG00010020760)	NELFCD (ENSRFEG00010020786)	ENSRFEG00010020869	ENSRFEG00010021007
Microbat	MODERN SPECIES	1489			SLCO4A1 (ENSMLUG00000012879)	GATA5 (ENSMLUG00000000363)	RBBP8NL (ENSMLUG00000000353)	CABLES2 (ENSMLUG00000000350)	RPS21 (ENSMLUG00000000346)	LAMA5 (ENSMLUG00000000325)	ADRM1 (ENSMLUG00000000322)	OSBPL2 (ENSMLUG00000000316)	HRH3 (ENSMLUG00000000314)	MTG2 (ENSMLUG00000000311)	SS18L1 (ENSMLUG00000015710)	PSMA7 (ENSMLUG00000000308)	LSM14B (ENSMLUG00000000304)	TAF4 (ENSMLUG00000010291) ##22
Megabat	MODERN SPECIES	2566												MTG2 (ENSPVAG00000017921)	SS18L1 (ENSPVAG00000017920)	PSMA7 (ENSPVAG00000017919)	LSM14B (ENSPVAG00000017918)	TAF4 (ENSPVAG00000017917) ##22	CDH4 (ENSPVAG00000017916)
Equus	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT00390000014718	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.o.b	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000161589	ENSGT00390000018266.r	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a	ENSGT00390000015470	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799	ENSGT00940000156300.d
Donkey	MODERN SPECIES	6	MRGBP (ENSEASG00005026220)	NTSR1 (ENSEASG00005023199)	SLCO4A1 (ENSEASG00005023200)	GATA5 (ENSEASG00005023204)	RBBP8NL (ENSEASG00005023205)	CABLES2 (ENSEASG00005023206)	ENSEASG00005032761	LAMA5 (ENSEASG00005023208)	ADRM1 (ENSEASG00005023210)	OSBPL2 (ENSEASG00005023211)	HRH3 (ENSEASG00005034836)	MTG2 (ENSEASG00005033789)	SS18L1 (ENSEASG00005023216)	PSMA7 (ENSEASG00005023217)	LSM14B (ENSEASG00005023218)	TAF4 (ENSEASG00005023219) ##22	ENSEASG00005023220	CDH26 (ENSEASG00005023223)	ENSEASG00005038533	FAM217B (ENSEASG00005029653)	PPP1R3D (ENSEASG00005034180)	SYCP2 (ENSEASG00005023226)	PHACTR3 (ENSEASG00005023227)	ENSEASG00005023228	ZNF831 (ENSEASG00005023229)	PRELID3B (ENSEASG00005023230)	ENSEASG00005023231	TUBB1 (ENSEASG00005025539)	CTSZ (ENSEASG00005023235)	NELFCD (ENSEASG00005023236)	ENSEASG00005035219
Horse	MODERN SPECIES	14	NTSR1 (ENSECAG00000019337)	ENSECAG00000030764	SLCO4A1 (ENSECAG00000016658)	GATA5 (ENSECAG00000034866)	RBBP8NL (ENSECAG00000015475)	CABLES2 (ENSECAG00000013898)	ENSECAG00000044360	LAMA5 (ENSECAG00000023274)	ADRM1 (ENSECAG00000052775)	OSBPL2 (ENSECAG00000010200)	HRH3 (ENSECAG00000008149)	MTG2 (ENSECAG00000020567)	SS18L1 (ENSECAG00000018310)	PSMA7 (ENSECAG00000014168)	LSM14B (ENSECAG00000010659)	TAF4 (ENSECAG00000023048) ##22	CDH4 (ENSECAG00000023333)	CDH26 (ENSECAG00000020738)	ENSECAG00000036432	PPP1R3D (ENSECAG00000004743)	FAM217B (ENSECAG00000004770)	SYCP2 (ENSECAG00000016085)	PHACTR3 (ENSECAG00000007706)	EDN3 (ENSECAG00000006225)	ZNF831 (ENSECAG00000004219)	PRELID3B (ENSECAG00000000513)	ENSECAG00000060119	TUBB1 (ENSECAG00000025099)	CTSZ (ENSECAG00000024967)	NELFCD (ENSECAG00000016334)	GNAS (ENSECAG00000024243)
Euarchontoglires	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00390000014718	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00960000192285	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.o.b	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a	ENSGT00390000015470	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799	ENSGT01090000260114	ENSGT00940000156300.d
Primates	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT00390000014718	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.o.b	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a	ENSGT00390000015470	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799	ENSGT00940000156300.d	ENSGT01090000260114
Haplorrhini	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT00390000014718	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.o.b	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a	ENSGT00390000015470	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799	ENSGT00940000156300.d	ENSGT01090000260114
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Catarrhini	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT00390000014718	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.o.b	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00910000147450	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a.lb	ENSGT00390000015470	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799	ENSGT00940000156300.d
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Pan	DUPLICATION
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Chimpanzee	MODERN SPECIES	789																ENSPTRG00000045525 ##22
Bonobo	MODERN SPECIES	11	SLCO4A1 (ENSPPAG00000040142)	GATA5 (ENSPPAG00000033487)	ENSPPAG00000013876	RBBP8NL (ENSPPAG00000020970)	ENSPPAG00000041254	ENSPPAG00000043545	ENSPPAG00000014667	LAMA5 (ENSPPAG00000030723)	ADRM1 (ENSPPAG00000025509)	OSBPL2 (ENSPPAG00000013340)	HRH3 (ENSPPAG00000025470)	MTG2 (ENSPPAG00000042468)	SS18L1 (ENSPPAG00000035700)	PSMA7 (ENSPPAG00000026506)	LSM14B (ENSPPAG00000035799)	ENSPPAG00000028916 ##22	CDH4 (ENSPPAG00000031709)	ENSPPAG00000026709	CDH26 (ENSPPAG00000036425)	FAM217B (ENSPPAG00000018830)	SYCP2 (ENSPPAG00000031071)	PHACTR3 (ENSPPAG00000037635)	EDN3 (ENSPPAG00000035671)	ZNF831 (ENSPPAG00000034101)	PRELID3B (ENSPPAG00000027568)	ATP5F1E (ENSPPAG00000017445)	TUBB1 (ENSPPAG00000006799)	CTSZ (ENSPPAG00000043518)	NELFCD (ENSPPAG00000042809)	ENSPPAG00000032982	ENSPPAG00000033296
Pan	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00390000011620.a.a.b.d ##22
Chimpanzee	MODERN SPECIES	11	SLCO4A1 (ENSPTRG00000013715)	GATA5 (ENSPTRG00000013711)	ENSPTRG00000045349	RBBP8NL (ENSPTRG00000013710)	CABLES2 (ENSPTRG00000013709)	ENSPTRG00000013708	ENSPTRG00000052490	ENSPTRG00000049805	ADRM1 (ENSPTRG00000013704)	OSBPL2 (ENSPTRG00000013703)	HRH3 (ENSPTRG00000013702)	MTG2 (ENSPTRG00000013701)	SS18L1 (ENSPTRG00000013700)	PSMA7 (ENSPTRG00000013699)	LSM14B (ENSPTRG00000013696)	TAF4 (ENSPTRG00000013695) ##22	CDH4 (ENSPTRG00000013693)	ENSPTRG00000051090	CDH26 (ENSPTRG00000013690)	FAM217B (ENSPTRG00000052443)	PPP1R3D (ENSPTRG00000049506)	SYCP2 (ENSPTRG00000013687)	PHACTR3 (ENSPTRG00000013686)	EDN3 (ENSPTRG00000013684)	ZNF831 (ENSPTRG00000013683)	ENSPTRG00000044912	PRELID3B (ENSPTRG00000013682)	ATP5F1E (ENSPTRG00000013681)	TUBB1 (ENSPTRG00000013680)	CTSZ (ENSPTRG00000013679)	NELFCD (ENSPTRG00000013678)
Human	MODERN SPECIES	12	MRGBP (ENSG00000101189)	NTSR1 (ENSG00000101188)	SLCO4A1 (ENSG00000101187)	GATA5 (ENSG00000130700)	RBBP8NL (ENSG00000130701)	CABLES2 (ENSG00000149679)	RPS21 (ENSG00000171858)	LAMA5 (ENSG00000130702)	ADRM1 (ENSG00000130706)	OSBPL2 (ENSG00000130703)	HRH3 (ENSG00000101180)	MTG2 (ENSG00000101181)	SS18L1 (ENSG00000184402)	PSMA7 (ENSG00000101182)	LSM14B (ENSG00000149657)	TAF4 (ENSG00000130699) ##22	CDH4 (ENSG00000179242)	CDH26 (ENSG00000124215)	PPP1R3D (ENSG00000132825)	FAM217B (ENSG00000196227)	SYCP2 (ENSG00000196074)	PHACTR3 (ENSG00000087495)	EDN3 (ENSG00000124205)	ZNF831 (ENSG00000124203)	PRELID3B (ENSG00000101166)	ATP5F1E (ENSG00000124172)	TUBB1 (ENSG00000101162)	CTSZ (ENSG00000101160)	NELFCD (ENSG00000101158)	GNAS (ENSG00000087460)	NPEPL1 (ENSG00000215440)
Gorilla	MODERN SPECIES	11	ENSGGOG00000042804	SLCO4A1 (ENSGGOG00000007516)	GATA5 (ENSGGOG00000000120)	ENSGGOG00000043681	RBBP8NL (ENSGGOG00000000119)	CABLES2 (ENSGGOG00000000117)	ENSGGOG00000023745	LAMA5 (ENSGGOG00000008462)	ADRM1 (ENSGGOG00000008457)	OSBPL2 (ENSGGOG00000008445)	HRH3 (ENSGGOG00000005654)	MTG2 (ENSGGOG00000005648)	SS18L1 (ENSGGOG00000005638)	PSMA7 (ENSGGOG00000005634)	LSM14B (ENSGGOG00000005630)	ENSGGOG00000002111 ##22	CDH4 (ENSGGOG00000000182)	ENSGGOG00000036542	ENSGGOG00000012463	ENSGGOG00000038222	FAM217B (ENSGGOG00000043885)	SYCP2 (ENSGGOG00000010064)	PHACTR3 (ENSGGOG00000014774)	EDN3 (ENSGGOG00000012885)	ZNF831 (ENSGGOG00000016623)	PRELID3B (ENSGGOG00000004803)	ATP5F1E (ENSGGOG00000016625)	TUBB1 (ENSGGOG00000016621)	CTSZ (ENSGGOG00000016618)	NELFCD (ENSGGOG00000006713)	ENSGGOG00000002843
Orangutan	MODERN SPECIES	11	COL9A3 (ENSPPYG00000037415)	ENSPPYG00000011218	ENSPPYG00000011217	NTSR1 (ENSPPYG00000011216)	SLCO4A1 (ENSPPYG00000011213)	GATA5 (ENSPPYG00000011208)	RBBP8NL (ENSPPYG00000011207)	CABLES2 (ENSPPYG00000011206)	ENSPPYG00000011205	OSBPL2 (ENSPPYG00000011201)	HRH3 (ENSPPYG00000011199)	MTG2 (ENSPPYG00000011198)	SS18L1 (ENSPPYG00000011197)	PSMA7 (ENSPPYG00000034580)	LSM14B (ENSPPYG00000011194)	TAF4 (ENSPPYG00000029916) ##22	CDH4 (ENSPPYG00000011193)	CDH26 (ENSPPYG00000011189)	FAM217B (ENSPPYG00000011188)	PPP1R3D (ENSPPYG00000011187)	SYCP2 (ENSPPYG00000011186)	PHACTR3 (ENSPPYG00000011185)	EDN3 (ENSPPYG00000011184)	ZNF831 (ENSPPYG00000011183)	TUBB1 (ENSPPYG00000011180)	CTSZ (ENSPPYG00000011179)	NELFCD (ENSPPYG00000011178)	ENSPPYG00000034786	ENSPPYG00000011177	NPEPL1 (ENSPPYG00000011176)	STX16 (ENSPPYG00000011175)
Gibbon	MODERN SPECIES	3	ENSNLEG00000031811	GATA5 (ENSNLEG00000015926)	ENSNLEG00000034192	RBBP8NL (ENSNLEG00000015942)	CABLES2 (ENSNLEG00000015932)	ENSNLEG00000028252	ENSNLEG00000027234	LAMA5 (ENSNLEG00000028345)	ADRM1 (ENSNLEG00000015858)	OSBPL2 (ENSNLEG00000015814)	HRH3 (ENSNLEG00000026621)	MTG2 (ENSNLEG00000015799)	ENSNLEG00000015795	PSMA7 (ENSNLEG00000015772)	LSM14B (ENSNLEG00000015757)	TAF4 (ENSNLEG00000015722) ##22	CDH4 (ENSNLEG00000015745)	ENSNLEG00000034131	ENSNLEG00000031666	FAM217B (ENSNLEG00000032511)	PPP1R3D (ENSNLEG00000018277)	SYCP2 (ENSNLEG00000009617)	PHACTR3 (ENSNLEG00000009596)	EDN3 (ENSNLEG00000032826)	ZNF831 (ENSNLEG00000009590)	ENSNLEG00000029922	PRELID3B (ENSNLEG00000009579)	ATP5F1E (ENSNLEG00000018656)	TUBB1 (ENSNLEG00000009571)	CTSZ (ENSNLEG00000009558)	NELFCD (ENSNLEG00000009524)
Cercopithecidae	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00390000014718	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.o.b	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00910000148025	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00910000147450	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a.lb	ENSGT00390000015470	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799	ENSGT00940000156300.d
Cercopithecinae	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00390000014718	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.o.b	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00910000148025	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00910000147450	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a.lb	ENSGT00390000015470	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799	ENSGT00940000156300.d
Vervet Monkey	MODERN SPECIES	11	NTSR1 (ENSCSAG00000016088)	SLCO4A1 (ENSCSAG00000016079)	ENSCSAG00000016074	GATA5 (ENSCSAG00000016070)	RBBP8NL (ENSCSAG00000016058)	CABLES2 (ENSCSAG00000016030)	RPS21 (ENSCSAG00000016013)	LAMA5 (ENSCSAG00000015940)	ADRM1 (ENSCSAG00000015796)	OSBPL2 (ENSCSAG00000015788)	HRH3 (ENSCSAG00000015781)	MTG2 (ENSCSAG00000015774)	SS18L1 (ENSCSAG00000015769)	PSMA7 (ENSCSAG00000015753)	LSM14B (ENSCSAG00000015729)	TAF4 (ENSCSAG00000015714) ##22	CDH4 (ENSCSAG00000015698)	ENSCSAG00000015691	ENSCSAG00000015686	PPP1R3D (ENSCSAG00000018738)	SYCP2 (ENSCSAG00000015657)	PHACTR3 (ENSCSAG00000015613)	EDN3 (ENSCSAG00000015608)	ZNF831 (ENSCSAG00000015605)	ATP5F1E (ENSCSAG00000015600)	TUBB1 (ENSCSAG00000015595)	CTSZ (ENSCSAG00000015592)	NELFCD (ENSCSAG00000015585)	GNAS (ENSCSAG00000015577)	ENSCSAG00000018739	NPEPL1 (ENSCSAG00000015570)
Cercopithecinae_a	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00390000014718	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.o.b	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00910000148025	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00910000147450	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a.lb.c	ENSGT00390000015470	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799	ENSGT00940000156300.d
Cercopithecinae_b	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00390000014718	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.o.b	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00910000148025	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a.lb.c	ENSGT00390000015470	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799	ENSGT00940000156300.d	ENSGT00390000006634
Olive baboon	MODERN SPECIES	7	MRGBP (ENSPANG00000043588)	NTSR1 (ENSPANG00000014255)	ENSPANG00000030177	SLCO4A1 (ENSPANG00000014254)	GATA5 (ENSPANG00000035220)	RBBP8NL (ENSPANG00000018571)	CABLES2 (ENSPANG00000018573)	ENSPANG00000021054	ADRM1 (ENSPANG00000021463)	OSBPL2 (ENSPANG00000011171)	HRH3 (ENSPANG00000011170)	MTG2 (ENSPANG00000024124)	ENSPANG00000040229	PSMA7 (ENSPANG00000020513)	LSM14B (ENSPANG00000011747)	TAF4 (ENSPANG00000022570) ##22	CDH4 (ENSPANG00000011746)	CDH26 (ENSPANG00000021462)	FAM217B (ENSPANG00000015362)	PPP1R3D (ENSPANG00000018275)	SYCP2 (ENSPANG00000020632)	PHACTR3 (ENSPANG00000020631)	EDN3 (ENSPANG00000000369)	ZNF831 (ENSPANG00000000370)	ENSPANG00000049124	ATP5F1E (ENSPANG00000048306)	TUBB1 (ENSPANG00000019323)	CTSZ (ENSPANG00000020630)	NELFCD (ENSPANG00000011168)	GNAS (ENSPANG00000020508)	ENSPANG00000043768
Cercopithecinae_d	ANCESTRAL SPECIES	47	ENSGT00390000014718	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.o.b	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00910000148025	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a.lb.c	ENSGT00390000015470	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799	ENSGT00940000156300.d	ENSGT00390000006634
Sooty mangabey	MODERN SPECIES	187	ENSCATG00000021769	SLCO4A1 (ENSCATG00000031528)	ENSCATG00000036195	GATA5 (ENSCATG00000036346)	RBBP8NL (ENSCATG00000011302)	CABLES2 (ENSCATG00000008047)	RPS21 (ENSCATG00000031953)	LAMA5 (ENSCATG00000014362)	ADRM1 (ENSCATG00000042561)	OSBPL2 (ENSCATG00000012207)	HRH3 (ENSCATG00000028495)	MTG2 (ENSCATG00000032978)	SS18L1 (ENSCATG00000038095)	PSMA7 (ENSCATG00000012259)	LSM14B (ENSCATG00000036006)	TAF4 (ENSCATG00000002458) ##22	CDH4 (ENSCATG00000042334)
Drill	MODERN SPECIES	1087	ENSMLEG00000031976	SLCO4A1 (ENSMLEG00000026008)	GATA5 (ENSMLEG00000032309)	RBBP8NL (ENSMLEG00000031990)	CABLES2 (ENSMLEG00000042843)	ENSMLEG00000036605	LAMA5 (ENSMLEG00000036374)	ADRM1 (ENSMLEG00000041503)	ENSMLEG00000042538	OSBPL2 (ENSMLEG00000043090)	HRH3 (ENSMLEG00000027666)	MTG2 (ENSMLEG00000040729)	SS18L1 (ENSMLEG00000037833)	PSMA7 (ENSMLEG00000033853)	LSM14B (ENSMLEG00000040895)	TAF4 (ENSMLEG00000041573) ##22	CDH4 (ENSMLEG00000040626)	CDH26 (ENSMLEG00000033250)	FAM217B (ENSMLEG00000009217)	PPP1R3D (ENSMLEG00000027435)	SYCP2 (ENSMLEG00000030694)	PHACTR3 (ENSMLEG00000032882)	EDN3 (ENSMLEG00000031308)	ZNF831 (ENSMLEG00000030734)	ENSMLEG00000030481	ATP5F1E (ENSMLEG00000032031)	TUBB1 (ENSMLEG00000037666)	CTSZ (ENSMLEG00000038716)	NELFCD (ENSMLEG00000012484)	ENSMLEG00000031316	ENSMLEG00000018242
Macaca	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT00390000014718	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.o.b	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00910000147450	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a.lb.c	ENSGT00390000015470	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799	ENSGT00940000156300.d
Macaca_a	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT00390000014718	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.o.b	ENSGT00390000017515.p	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a.lb.c	ENSGT00390000015470	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799	ENSGT00940000156300.d	ENSGT00960000189526
Rhesus	MODERN SPECIES	1	OGFR (ENSMMUG00000016856)	MRGBP (ENSMMUG00000046848)	NTSR1 (ENSMMUG00000016854)	ENSMMUG00000016851	SLCO4A1 (ENSMMUG00000016848)	GATA5 (ENSMMUG00000017584)	RBBP8NL (ENSMMUG00000020933)	CABLES2 (ENSMMUG00000005011)	RPS21 (ENSMMUG00000005006)	OSBPL2 (ENSMMUG00000012623)	HRH3 (ENSMMUG00000050324)	MTG2 (ENSMMUG00000012607)	SS18L1 (ENSMMUG00000012606)	PSMA7 (ENSMMUG00000018354)	LSM14B (ENSMMUG00000014084)	TAF4 (ENSMMUG00000008696) ##22	CDH4 (ENSMMUG00000012314)	ENSMMUG00000052443	CDH26 (ENSMMUG00000008123)	PPP1R3D (ENSMMUG00000019469)	FAM217B (ENSMMUG00000057303)	SYCP2 (ENSMMUG00000016294)	PHACTR3 (ENSMMUG00000016292)	EDN3 (ENSMMUG00000016131)	ZNF831 (ENSMMUG00000020745)	PRELID3B (ENSMMUG00000007560)	ATP5F1E (ENSMMUG00000053623)	TUBB1 (ENSMMUG00000012164)	CTSZ (ENSMMUG00000015391)	NELFCD (ENSMMUG00000015390)	GNAS (ENSMMUG00000010266)
Crab-eating macaque	MODERN SPECIES	1	MRGBP (ENSMFAG00000058768)	ENSMFAG00000030438	ENSMFAG00000001871	SLCO4A1 (ENSMFAG00000041624)	GATA5 (ENSMFAG00000041967)	RBBP8NL (ENSMFAG00000037646)	CABLES2 (ENSMFAG00000016607)	RPS21 (ENSMFAG00000002515)	OSBPL2 (ENSMFAG00000030160)	HRH3 (ENSMFAG00000040768)	MTG2 (ENSMFAG00000045680)	ADRM1 (ENSMFAG00000042099)	SS18L1 (ENSMFAG00000038339)	PSMA7 (ENSMFAG00000000723)	LSM14B (ENSMFAG00000041479)	TAF4 (ENSMFAG00000002330) ##22	CDH4 (ENSMFAG00000042158)	ENSMFAG00000063149	CDH26 (ENSMFAG00000034675)	FAM217B (ENSMFAG00000030015)	SYCP2 (ENSMFAG00000000376)	PHACTR3 (ENSMFAG00000034633)	EDN3 (ENSMFAG00000039249)	ZNF831 (ENSMFAG00000040583)	PRELID3B (ENSMFAG00000039743)	ATP5F1E (ENSMFAG00000049506)	TUBB1 (ENSMFAG00000038605)	CTSZ (ENSMFAG00000001397)	NELFCD (ENSMFAG00000002141)	GNAS (ENSMFAG00000056056)	ENSMFAG00000043651
Pig-tailed macaque	MODERN SPECIES	462	SLCO4A1 (ENSMNEG00000031292)	ENSMNEG00000037283	GATA5 (ENSMNEG00000041625)	RBBP8NL (ENSMNEG00000034032)	CABLES2 (ENSMNEG00000032286)	ENSMNEG00000045270	LAMA5 (ENSMNEG00000040397)	ADRM1 (ENSMNEG00000025734)	OSBPL2 (ENSMNEG00000032024)	ENSMNEG00000034576	HRH3 (ENSMNEG00000044771)	MTG2 (ENSMNEG00000035874)	SS18L1 (ENSMNEG00000039319)	PSMA7 (ENSMNEG00000027997)	LSM14B (ENSMNEG00000045573)	TAF4 (ENSMNEG00000035762) ##22	CDH4 (ENSMNEG00000020065)	ENSMNEG00000036031	CDH26 (ENSMNEG00000045267)	FAM217B (ENSMNEG00000011065)	PPP1R3D (ENSMNEG00000005403)	SYCP2 (ENSMNEG00000034411)	PHACTR3 (ENSMNEG00000033528)	EDN3 (ENSMNEG00000039101)	ZNF831 (ENSMNEG00000038486)	ENSMNEG00000035689	ATP5F1E (ENSMNEG00000030079)	ENSMNEG00000043401	TUBB1 (ENSMNEG00000030119)	CTSZ (ENSMNEG00000036117)	NELFCD (ENSMNEG00000032684)
Rhinopithecus	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00390000014718	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.o.b	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00910000148025	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000168632	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a.lb	ENSGT00390000015470	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799	ENSGT00940000156300.d	ENSGT00390000006634	ENSGT00530000063255.A
Black snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	671	NTSR1 (ENSRBIG00000034200)	ENSRBIG00000033976	SLCO4A1 (ENSRBIG00000027762)	GATA5 (ENSRBIG00000043083)	RBBP8NL (ENSRBIG00000041927)	CABLES2 (ENSRBIG00000039825)	RPS21 (ENSRBIG00000023738)	LAMA5 (ENSRBIG00000020450)	ADRM1 (ENSRBIG00000032506)	OSBPL2 (ENSRBIG00000008547)	HRH3 (ENSRBIG00000036605)	MTG2 (ENSRBIG00000039343)	SS18L1 (ENSRBIG00000043216)	PSMA7 (ENSRBIG00000030294)	LSM14B (ENSRBIG00000033461)	TAF4 (ENSRBIG00000039196) ##22
Golden snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	1209	ENSRROG00000043466	SLCO4A1 (ENSRROG00000036205)	GATA5 (ENSRROG00000031877)	RBBP8NL (ENSRROG00000040315)	CABLES2 (ENSRROG00000043457)	RPS21 (ENSRROG00000038602)	LAMA5 (ENSRROG00000035759)	ADRM1 (ENSRROG00000019480)	ENSRROG00000038495	OSBPL2 (ENSRROG00000029664)	HRH3 (ENSRROG00000042867)	MTG2 (ENSRROG00000030772)	SS18L1 (ENSRROG00000040133)	PSMA7 (ENSRROG00000043126)	LSM14B (ENSRROG00000042949)	TAF4 (ENSRROG00000043238) ##22	CDH4 (ENSRROG00000029814)	ENSRROG00000044130	PPP1R3D (ENSRROG00000041886)	SYCP2 (ENSRROG00000036065)	PHACTR3 (ENSRROG00000014403)	EDN3 (ENSRROG00000041099)	ZNF831 (ENSRROG00000033836)	PRELID3B (ENSRROG00000044337)	ATP5F1E (ENSRROG00000014776)	TUBB1 (ENSRROG00000029741)	CTSZ (ENSRROG00000039294)	NELFCD (ENSRROG00000032620)	ENSRROG00000042757	ENSRROG00000042384	NPEPL1 (ENSRROG00000038029)
Platyrrhini	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.o.b	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000168632	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a.lb.a	ENSGT00390000015470	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799	ENSGT00940000156300.d.k.a	ENSGT00390000006634
Cebidae	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.o.b	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000168632	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a.lb.a	ENSGT00390000015470	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799	ENSGT00940000156300.d.k.a	ENSGT00390000006634
Cebidae_a	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.o.b	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000161589	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a.lb.a	ENSGT00390000015470	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799	ENSGT00940000156300.d.k.a	ENSGT00390000006634	ENSGT00530000063255.A	ENSGT00910000148824
Capuchin	MODERN SPECIES	311	ENSCCAG00000034861	NTSR1 (ENSCCAG00000014565)	SLCO4A1 (ENSCCAG00000020112)	GATA5 (ENSCCAG00000015339)	RBBP8NL (ENSCCAG00000030370)	CABLES2 (ENSCCAG00000029965)	ENSCCAG00000036700	LAMA5 (ENSCCAG00000021643)	ADRM1 (ENSCCAG00000027146)	OSBPL2 (ENSCCAG00000035550)	HRH3 (ENSCCAG00000033589)	MTG2 (ENSCCAG00000035332)	SS18L1 (ENSCCAG00000034514)	PSMA7 (ENSCCAG00000019388)	LSM14B (ENSCCAG00000021267)	TAF4 (ENSCCAG00000020328) ##22	CDH4 (ENSCCAG00000022146)	CDH26 (ENSCCAG00000020268)	SYCP2 (ENSCCAG00000016906)	PHACTR3 (ENSCCAG00000030544)	EDN3 (ENSCCAG00000029067)	ZNF831 (ENSCCAG00000018807)	PRELID3B (ENSCCAG00000027593)	ATP5F1E (ENSCCAG00000019746)	TUBB1 (ENSCCAG00000023136)	CTSZ (ENSCCAG00000023398)	NELFCD (ENSCCAG00000033432)	ENSCCAG00000025793	ENSCCAG00000020784	ENSCCAG00000030335
Bolivian squirrel monkey	MODERN SPECIES	93	ENSSBOG00000023786	NTSR1 (ENSSBOG00000001221)	SLCO4A1 (ENSSBOG00000030164)	GATA5 (ENSSBOG00000034203)	RBBP8NL (ENSSBOG00000028400)	CABLES2 (ENSSBOG00000032273)	RPS21 (ENSSBOG00000021410)	LAMA5 (ENSSBOG00000032418)	ADRM1 (ENSSBOG00000026290)	OSBPL2 (ENSSBOG00000021294)	HRH3 (ENSSBOG00000032318)	MTG2 (ENSSBOG00000029055)	SS18L1 (ENSSBOG00000021541)	PSMA7 (ENSSBOG00000030036)	LSM14B (ENSSBOG00000032820)	TAF4 (ENSSBOG00000017534) ##22	CDH4 (ENSSBOG00000028115)	ENSSBOG00000014792	SYCP2 (ENSSBOG00000030028)	ENSSBOG00000027818	EDN3 (ENSSBOG00000024971)	ZNF831 (ENSSBOG00000031251)	PRELID3B (ENSSBOG00000019233)	ATP5F1E (ENSSBOG00000032643)	TUBB1 (ENSSBOG00000031264)	CTSZ (ENSSBOG00000029319)	NELFCD (ENSSBOG00000024245)	ENSSBOG00000032092	ENSSBOG00000013127	NPEPL1 (ENSSBOG00000002808)	STX16 (ENSSBOG00000035326)
Marmoset	MODERN SPECIES	17	OGFR (ENSCJAG00000043786)	MRGBP (ENSCJAG00000041703)	NTSR1 (ENSCJAG00000041245)	SLCO4A1 (ENSCJAG00000009785)	RBBP8NL (ENSCJAG00000014173)	CABLES2 (ENSCJAG00000014189)	ENSCJAG00000014195	ENSCJAG00000074394	ENSCJAG00000014274	OSBPL2 (ENSCJAG00000014300)	HRH3 (ENSCJAG00000048407)	MTG2 (ENSCJAG00000014360)	SS18L1 (ENSCJAG00000014377)	PSMA7 (ENSCJAG00000014419)	LSM14B (ENSCJAG00000014434)	TAF4 (ENSCJAG00000014438) ##22	ENSCJAG00000072353	CDH4 (ENSCJAG00000042612)	FAM217B (ENSCJAG00000018823)	PPP1R3D (ENSCJAG00000018830)	SYCP2 (ENSCJAG00000018836)	ENSCJAG00000087087	PHACTR3 (ENSCJAG00000045721)	EDN3 (ENSCJAG00000018885)	ZNF831 (ENSCJAG00000047641)	ENSCJAG00000085698	ENSCJAG00000048161	ENSCJAG00000073740	TUBB1 (ENSCJAG00000018914)	CTSZ (ENSCJAG00000018918)	NELFCD (ENSCJAG00000018927)
Mas night monkey	MODERN SPECIES	628	ENSANAG00000020630	NTSR1 (ENSANAG00000028125)	SLCO4A1 (ENSANAG00000025751)	GATA5 (ENSANAG00000032190)	RBBP8NL (ENSANAG00000026519)	CABLES2 (ENSANAG00000032007)	RPS21 (ENSANAG00000026964)	LAMA5 (ENSANAG00000030209)	ENSANAG00000022779	OSBPL2 (ENSANAG00000000648)	HRH3 (ENSANAG00000037989)	MTG2 (ENSANAG00000038077)	SS18L1 (ENSANAG00000037732)	PSMA7 (ENSANAG00000010130)	LSM14B (ENSANAG00000037915)	TAF4 (ENSANAG00000025843) ##22	CDH4 (ENSANAG00000021592)
Tarsier	MODERN SPECIES	1324																TAF4 (ENSTSYG00000036619) ##22	CDH4 (ENSTSYG00000010646)
Strepsirrhini	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT00390000014718	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.o.b	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a	ENSGT00390000015470	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799	ENSGT00940000156300.d	ENSGT01090000260114
Bushbaby	MODERN SPECIES	138	MRGBP (ENSOGAG00000011183)	NTSR1 (ENSOGAG00000027155)	SLCO4A1 (ENSOGAG00000005124)	GATA5 (ENSOGAG00000025085)	RBBP8NL (ENSOGAG00000000946)	CABLES2 (ENSOGAG00000000945)	RPS21 (ENSOGAG00000016673)	LAMA5 (ENSOGAG00000000942)	ADRM1 (ENSOGAG00000000941)	OSBPL2 (ENSOGAG00000000939)	HRH3 (ENSOGAG00000027837)	MTG2 (ENSOGAG00000000933)	SS18L1 (ENSOGAG00000034040)	ENSOGAG00000000931	LSM14B (ENSOGAG00000003915)	TAF4 (ENSOGAG00000024820) ##22	ENSOGAG00000028531	CDH4 (ENSOGAG00000007919)	ENSOGAG00000026737	CDH26 (ENSOGAG00000004717)	FAM217B (ENSOGAG00000004716)	PPP1R3D (ENSOGAG00000025179)	SYCP2 (ENSOGAG00000004710)	ENSOGAG00000027091	PHACTR3 (ENSOGAG00000004707)	EDN3 (ENSOGAG00000029876)	ZNF831 (ENSOGAG00000026401)	PRELID3B (ENSOGAG00000013382)	ATP5F1E (ENSOGAG00000029763)	TUBB1 (ENSOGAG00000013378)	CTSZ (ENSOGAG00000014271)
Lemuriformes	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT00390000014718	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.o.b	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a	ENSGT00390000015470	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799	ENSGT00940000156300.d	ENSGT01090000260114
Lemuriformes_a	ANCESTRAL SPECIES	139	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT00390000014718	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.o.b	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073
Coquerels sifaka	MODERN SPECIES	594	MRGBP (ENSPCOG00000023597)	NTSR1 (ENSPCOG00000015702)	SLCO4A1 (ENSPCOG00000021209)	GATA5 (ENSPCOG00000007837)	RBBP8NL (ENSPCOG00000028470)	CABLES2 (ENSPCOG00000025315)	RPS21 (ENSPCOG00000013052)	LAMA5 (ENSPCOG00000019475)	ADRM1 (ENSPCOG00000021357)	OSBPL2 (ENSPCOG00000016868)	HRH3 (ENSPCOG00000026734)	MTG2 (ENSPCOG00000022764)	SS18L1 (ENSPCOG00000013363)	PSMA7 (ENSPCOG00000012673)	LSM14B (ENSPCOG00000013625)	TAF4 (ENSPCOG00000028002) ##22	CDH4 (ENSPCOG00000027008)
Greater bamboo lemur	MODERN SPECIES	1319								ENSPSMG00000004220	ENSPSMG00000004265	OSBPL2 (ENSPSMG00000004583)	HRH3 (ENSPSMG00000004735)	MTG2 (ENSPSMG00000004777)	SS18L1 (ENSPSMG00000004820)	PSMA7 (ENSPSMG00000004865)	LSM14B (ENSPSMG00000004907)	TAF4 (ENSPSMG00000004918) ##22
Mouse lemur	MODERN SPECIES	9	MRGBP (ENSMICG00000048156)	NTSR1 (ENSMICG00000026504)	SLCO4A1 (ENSMICG00000001139)	GATA5 (ENSMICG00000037048)	RBBP8NL (ENSMICG00000031675)	ENSMICG00000006412	RPS21 (ENSMICG00000046562)	LAMA5 (ENSMICG00000013411)	ADRM1 (ENSMICG00000013395)	OSBPL2 (ENSMICG00000013373)	HRH3 (ENSMICG00000003541)	MTG2 (ENSMICG00000035055)	SS18L1 (ENSMICG00000032545)	PSMA7 (ENSMICG00000014687)	LSM14B (ENSMICG00000014675)	TAF4 (ENSMICG00000004029) ##22	CDH4 (ENSMICG00000004615)	CDH26 (ENSMICG00000002587)	FAM217B (ENSMICG00000002583)	SYCP2 (ENSMICG00000002560)	PHACTR3 (ENSMICG00000006160)	EDN3 (ENSMICG00000042154)	ZNF831 (ENSMICG00000028622)	ENSMICG00000014902	ATP5F1E (ENSMICG00000014899)	TUBB1 (ENSMICG00000037644)	CTSZ (ENSMICG00000014882)	NELFCD (ENSMICG00000014872)	ENSMICG00000029253	GNAS (ENSMICG00000008427)	ENSMICG00000046510
Euarchontoglires_A	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00390000014718	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00960000192285	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.o.b	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a	ENSGT00390000015470	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799	ENSGT01090000260114	ENSGT00940000156300.d
Tree shrew	MODERN SPECIES	1336																ENSTBEG00000007812 ##22
Glires	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00390000014718	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00960000192285	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.o.b	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a	ENSGT00390000015470	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799	ENSGT01090000260114	ENSGT00940000156300.d
Rodentia	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00390000014718	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00960000192285	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.o.b	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a	ENSGT00390000015470	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799	ENSGT00940000155271	ENSGT01090000260114
Rodentia_A	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.o.b.i.b	ENSGT00390000017515.o.b.j	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a	ENSGT00390000015470	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799	ENSGT00940000156300.d	ENSGT01090000260114	ENSGT00940000165887
Hystricomorpha	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b.i	ENSGT00390000017515.o.b.i.b	ENSGT00400000022086.b.b.j	ENSGT00390000017515.o.b.j	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a	ENSGT00390000015470.s	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799	ENSGT00940000155271	ENSGT01090000260114	ENSGT00940000156300.d
Hystricomorpha_a	ANCESTRAL SPECIES	66	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b.i	ENSGT00390000017515.o.b.i.b	ENSGT00390000017515.o.b.j	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562
Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES	83	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b.i	ENSGT00390000017515.o.b.i.b	ENSGT00390000017515.o.b.j	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562
Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	235	ENSCLAG00000002627	NTSR1 (ENSCLAG00000002645)	SLCO4A1 (ENSCLAG00000007190)	CABLES2 (ENSCLAG00000007291)	GATA5 (ENSCLAG00000007559)	RBBP8NL (ENSCLAG00000006833)	RPS21 (ENSCLAG00000007566)	LAMA5 (ENSCLAG00000009241)	ADRM1 (ENSCLAG00000005222)	OSBPL2 (ENSCLAG00000005408)	HRH3 (ENSCLAG00000005909)	MTG2 (ENSCLAG00000002886)	SS18L1 (ENSCLAG00000003078)	PSMA7 (ENSCLAG00000003150)	LSM14B (ENSCLAG00000003186)	TAF4 (ENSCLAG00000003706) ##22	CDH4 (ENSCLAG00000003861)	SYCP2 (ENSCLAG00000004302)	PHACTR3 (ENSCLAG00000002652)
Degu	MODERN SPECIES	235	MRGBP (ENSODEG00000004674)	NTSR1 (ENSODEG00000004689)	SLCO4A1 (ENSODEG00000004720)	GATA5 (ENSODEG00000003615)	RBBP8NL (ENSODEG00000003634)	CABLES2 (ENSODEG00000003674)	ENSODEG00000003715	LAMA5 (ENSODEG00000003782)	ADRM1 (ENSODEG00000003910)	OSBPL2 (ENSODEG00000003927)	HRH3 (ENSODEG00000003961)	MTG2 (ENSODEG00000004006)	SS18L1 (ENSODEG00000004038)	PSMA7 (ENSODEG00000004073)	LSM14B (ENSODEG00000004099)	TAF4 (ENSODEG00000004136) ##22	CDH4 (ENSODEG00000004169)	FAM217B (ENSODEG00000004205)	PPP1R3D (ENSODEG00000004216)	ENSODEG00000004232	PHACTR3 (ENSODEG00000004273)
Guinea pig	MODERN SPECIES	119	MRGBP (ENSCPOG00000020272)	NTSR1 (ENSCPOG00000033878)	SLCO4A1 (ENSCPOG00000015749)	GATA5 (ENSCPOG00000030979)	RBBP8NL (ENSCPOG00000030864)	CABLES2 (ENSCPOG00000001967)	RPS21 (ENSCPOG00000001965)	LAMA5 (ENSCPOG00000009593)	ADRM1 (ENSCPOG00000009588)	OSBPL2 (ENSCPOG00000006907)	HRH3 (ENSCPOG00000007127)	MTG2 (ENSCPOG00000023202)	SS18L1 (ENSCPOG00000002513)	PSMA7 (ENSCPOG00000014168)	LSM14B (ENSCPOG00000038080)	TAF4 (ENSCPOG00000030707) ##22	CDH4 (ENSCPOG00000005520)	FAM217B (ENSCPOG00000032600)	ENSCPOG00000009549	PHACTR3 (ENSCPOG00000004795)
Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.p	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a	ENSGT00390000015470	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799	ENSGT01090000260114	ENSGT00940000156300.d	ENSGT00940000165887
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.p	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379.a	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00940000160207	ENSGT00940000160902	ENSGT00940000158934	ENSGT01090000260040.b.a.b	ENSGT00940000157106	ENSGT00940000161058.a.a	ENSGT00940000159787	ENSGT00940000160096	ENSGT00730000111369	ENSGT00390000002529
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.p	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379.a	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00940000160207	ENSGT00940000160902	ENSGT00940000158934	ENSGT01090000260040.b.a.b	ENSGT00940000157106	ENSGT00940000161058.a.a	ENSGT00940000161058.b	ENSGT00940000159787	ENSGT00940000160096	ENSGT00730000111369
Squirrel	MODERN SPECIES	114	MRGBP (ENSSTOG00000012953)	NTSR1 (ENSSTOG00000026120)	SLCO4A1 (ENSSTOG00000019826)	GATA5 (ENSSTOG00000010454)	RBBP8NL (ENSSTOG00000024557)	CABLES2 (ENSSTOG00000001031)	RPS21 (ENSSTOG00000001029)	LAMA5 (ENSSTOG00000026668)	ADRM1 (ENSSTOG00000002691)	OSBPL2 (ENSSTOG00000011355)	HRH3 (ENSSTOG00000021350)	MTG2 (ENSSTOG00000024521)	SS18L1 (ENSSTOG00000022485)	PSMA7 (ENSSTOG00000012489)	LSM14B (ENSSTOG00000020482)	TAF4 (ENSSTOG00000014768) ##22	CDH4 (ENSSTOG00000024476)	FAM217B (ENSSTOG00000028925)	PPP1R3D (ENSSTOG00000027059)	ENSSTOG00000032010	PHACTR3 (ENSSTOG00000000260)	CCN5 (ENSSTOG00000025361)	KCNK15 (ENSSTOG00000030351)	RIMS4 (ENSSTOG00000022472)	YWHAB (ENSSTOG00000003733)	PABPC1L (ENSSTOG00000003739)	TOMM34 (ENSSTOG00000019477)	ENSSTOG00000031644	STK4 (ENSSTOG00000009251)	KCNS1 (ENSSTOG00000009257)	WFDC5 (ENSSTOG00000030004)
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	372	OGFR (ENSUPAG00010009496)	MRGBP (ENSUPAG00010009485)	NTSR1 (ENSUPAG00010009468)	SLCO4A1 (ENSUPAG00010009439)	GATA5 (ENSUPAG00010009409)	RBBP8NL (ENSUPAG00010009390)	CABLES2 (ENSUPAG00010009371)	ENSUPAG00010009364	ADRM1 (ENSUPAG00010008614)	OSBPL2 (ENSUPAG00010008572)	HRH3 (ENSUPAG00010008523)	MTG2 (ENSUPAG00010008487)	SS18L1 (ENSUPAG00010008474)	PSMA7 (ENSUPAG00010008463)	LSM14B (ENSUPAG00010008440)	TAF4 (ENSUPAG00010008419) ##22	CDH4 (ENSUPAG00010008395)
Alpin marmot	MODERN SPECIES		OGFR (ENSMMMG00000003753)	MRGBP (ENSMMMG00000003862)	NTSR1 (ENSMMMG00000003907)	SLCO4A1 (ENSMMMG00000003911)	GATA5 (ENSMMMG00000003966)	RBBP8NL (ENSMMMG00000004035)	CABLES2 (ENSMMMG00000004085)	RPS21 (ENSMMMG00000004100)	ADRM1 (ENSMMMG00000004549)	OSBPL2 (ENSMMMG00000004561)	HRH3 (ENSMMMG00000004618)	ENSMMMG00000004646	SS18L1 (ENSMMMG00000004657)	ENSMMMG00000004668	LSM14B (ENSMMMG00000004672)	ENSMMMG00000004719 ##22	CDH4 (ENSMMMG00000004760)	FAM217B (ENSMMMG00000004800)	PPP1R3D (ENSMMMG00000004802)	ENSMMMG00000004806	PHACTR3 (ENSMMMG00000004853)	CCN5 (ENSMMMG00000004881)	KCNK15 (ENSMMMG00000004903)	RIMS4 (ENSMMMG00000004946)	YWHAB (ENSMMMG00000004966)	PABPC1L (ENSMMMG00000004982)	ENSMMMG00000005008	STK4 (ENSMMMG00000005028)	WFDC5 (ENSMMMG00000005050)	ENSMMMG00000005063	SLPI (ENSMMMG00000005081)
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	11	ENSSVLG00005003605	MRGBP (ENSSVLG00005003577)	NTSR1 (ENSSVLG00005003558)	SLCO4A1 (ENSSVLG00005003525)	GATA5 (ENSSVLG00005003441)	RBBP8NL (ENSSVLG00005003383)	CABLES2 (ENSSVLG00005003344)	ENSSVLG00005003318	ENSSVLG00005003084	OSBPL2 (ENSSVLG00005003034)	HRH3 (ENSSVLG00005003009)	ENSSVLG00005002984	SS18L1 (ENSSVLG00005002951)	ENSSVLG00005002918	LSM14B (ENSSVLG00005002868)	TAF4 (ENSSVLG00005002767) ##22	CDH4 (ENSSVLG00005002684)	ENSSVLG00005002662	PPP1R3D (ENSSVLG00005002650)	ENSSVLG00005002613	PHACTR3 (ENSSVLG00005002529)	EDN3 (ENSSVLG00005002438)	ZNF831 (ENSSVLG00005002392)	ENSSVLG00005002362	ENSSVLG00005002334	TUBB1 (ENSSVLG00005002321)	CTSZ (ENSSVLG00005002304)	NELFCD (ENSSVLG00005002237)	ENSSVLG00005002195	ENSSVLG00005002163	GNAS (ENSSVLG00005002064)
Rodentia_B	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00390000014718	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00960000192285	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.o.b	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a	ENSGT00390000015470	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799	ENSGT00940000155271	ENSGT00950000182832.D.b
Myomorpha	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00390000014718	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00960000192285	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.o.b	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a	ENSGT00390000015470	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799	ENSGT00940000155271	ENSGT00950000182832.D.b
Muroidea	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00390000014718	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00960000192285	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.o.b	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a	ENSGT00390000015470	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799	ENSGT01090000260114	ENSGT00940000156300.d
Muroidea_A	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000014718	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00960000192285	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.o.b	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a	ENSGT00390000015470	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799	ENSGT01090000260114	ENSGT00940000156300.d
Cricetidae	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00390000014718	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.o.b.e.a.b	ENSGT00390000017515.o.b.f	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a	ENSGT00390000015470	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799	ENSGT01090000260114	ENSGT00940000156300.d
Cricetinae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a	ENSGT00390000015470	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799	ENSGT01090000260114	ENSGT00940000156300.d
Golden Hamster	MODERN SPECIES	664	Col9a3 (ENSMAUG00000012721)	Ogfr (ENSMAUG00000018534)	Mrgbp (ENSMAUG00000017237)	Ntsr1 (ENSMAUG00000017871)	Slco4a1 (ENSMAUG00000009594)	Gata5 (ENSMAUG00000004902)	Rbbp8nl (ENSMAUG00000009217)	Lama5 (ENSMAUG00000015139)	ENSMAUG00000021991	Osbpl2 (ENSMAUG00000014762)	Hrh3 (ENSMAUG00000012652)	Mtg2 (ENSMAUG00000018040)	Ss18l1 (ENSMAUG00000016777)	Psma7 (ENSMAUG00000011223)	Lsm14b (ENSMAUG00000020700)	Taf4 (ENSMAUG00000015258) ##22	Cdh4 (ENSMAUG00000001328)	Cdh26 (ENSMAUG00000000843)	Fam217b (ENSMAUG00000018766)	Ppp1r3d (ENSMAUG00000008145)	ENSMAUG00000006215	Phactr3 (ENSMAUG00000014908)	Edn3 (ENSMAUG00000017986)	Zfp831 (ENSMAUG00000020089)	Prelid3b (ENSMAUG00000012780)	Atp5e (ENSMAUG00000011798)	Tubb1 (ENSMAUG00000000615)	Ctsz (ENSMAUG00000000692)	Nelfcd (ENSMAUG00000000986)	ENSMAUG00000014610	Gnas (ENSMAUG00000018730)
Chinese hamster chok1gshd	MODERN SPECIES	195								Lama5 (ENSCGRG00001014677)	ENSCGRG00001008593	Osbpl2 (ENSCGRG00001005341)	Hrh3 (ENSCGRG00001000439)	Mtg2 (ENSCGRG00001022321)	Ss18l1 (ENSCGRG00001020942)	Psma7 (ENSCGRG00001019663)	Lsm14b (ENSCGRG00001018399)	Taf4 (ENSCGRG00001017027) ##22	Cdh4 (ENSCGRG00001014899)	Cdh26 (ENSCGRG00001011499)	Fam217b (ENSCGRG00001009960)	Ppp1r3d (ENSCGRG00001005943)	Sycp2 (ENSCGRG00001005901)	Phactr3 (ENSCGRG00001000442)	ENSCGRG00001000962	ENSCGRG00001023234	Edn3 (ENSCGRG00001022875)	Zfp831 (ENSCGRG00001022524)	PRELID3B (ENSCGRG00001020600)	Atp5e (ENSCGRG00001020080)	Tubb1 (ENSCGRG00001019710)	ctsz (ENSCGRG00001019207)	Nelfcd (ENSCGRG00001017868)
Cricetidae_B	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT00390000014718	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.o.b.f	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a	ENSGT00390000015470	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799	ENSGT01090000260114	ENSGT00940000156300.d
Northern American deer mouse	MODERN SPECIES	17	Ntsr1 (ENSPEMG00000019912)	ENSPEMG00000031188	Slco4a1 (ENSPEMG00000019875)	Gata5 (ENSPEMG00000009349)	Rbbp8nl (ENSPEMG00000008846)	Cables2 (ENSPEMG00000014665)	ENSPEMG00000012806	ENSPEMG00000026336	ENSPEMG00000020024	Osbpl2 (ENSPEMG00000019925)	Hrh3 (ENSPEMG00000008738)	Mtg2 (ENSPEMG00000008216)	Ss18l1 (ENSPEMG00000002000)	ENSPEMG00000000274	Lsm14b (ENSPEMG00000017688)	Taf4 (ENSPEMG00000015031) ##22	Cdh4 (ENSPEMG00000013577)	Cdh26 (ENSPEMG00000001082)	Fam217b (ENSPEMG00000026646)	Ppp1r3d (ENSPEMG00000013652)	Sycp2 (ENSPEMG00000011694)	Phactr3 (ENSPEMG00000014292)	Edn3 (ENSPEMG00000029290)	Zfp831 (ENSPEMG00000007113)	Prelid3b (ENSPEMG00000018251)	ENSPEMG00000029167	Tubb1 (ENSPEMG00000025434)	Ctsz (ENSPEMG00000016766)	Nelfcd (ENSPEMG00000015186)	ENSPEMG00000013336	ENSPEMG00000012296
Prairie vole	MODERN SPECIES	357	Mrgbp (ENSMOCG00000000356)	Ntsr1 (ENSMOCG00000006208)	Slco4a1 (ENSMOCG00000018880)	Gata5 (ENSMOCG00000017810)	Rbbp8nl (ENSMOCG00000019010)	Cables2 (ENSMOCG00000022984)	ENSMOCG00000021976	Lama5 (ENSMOCG00000017230)	ENSMOCG00000014522	Osbpl2 (ENSMOCG00000021030)	Hrh3 (ENSMOCG00000019433)	Mtg2 (ENSMOCG00000018038)	Ss18l1 (ENSMOCG00000015419)	ENSMOCG00000000346	ENSMOCG00000020600	Taf4 (ENSMOCG00000007554) ##22	Cdh4 (ENSMOCG00000021512)	Cdh26 (ENSMOCG00000015531)	Fam217b (ENSMOCG00000014566)	Ppp1r3d (ENSMOCG00000009566)	ENSMOCG00000011369	Phactr3 (ENSMOCG00000018527)	Edn3 (ENSMOCG00000012874)	Zfp831 (ENSMOCG00000020881)	Prelid3b (ENSMOCG00000001444)	Atp5e (ENSMOCG00000015267)	Tubb1 (ENSMOCG00000020454)	Ctsz (ENSMOCG00000000772)	Nelfcd (ENSMOCG00000002859)	ENSMOCG00000019997	ENSMOCG00000000293
Murinae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000014718	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00960000192285	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.o.b	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a	ENSGT00390000015470	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799	ENSGT01090000260114	ENSGT00940000156300.d
Mus	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00960000192285	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.o.b	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a	ENSGT00390000015470	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799	ENSGT01090000260114	ENSGT00940000156300.d
Mus_A	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00960000192285	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.o.b	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a.u	ENSGT00390000015470	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799	ENSGT01090000260114	ENSGT00940000156300.d
Mus_B	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00960000192285	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.o.b	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a.u	ENSGT00390000015470	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799	ENSGT01090000260114	ENSGT00940000156300.d
Mouse	MODERN SPECIES	11	Mrgbp (ENSMUSG00000027569)	Ntsr1 (ENSMUSG00000027568)	Slco4a1 (ENSMUSG00000038963)	Gata5 (ENSMUSG00000015627)	Rbbp8nl (ENSMUSG00000038980)	Cables2 (ENSMUSG00000038990)	Rps21 (ENSMUSG00000039001)	Lama5 (ENSMUSG00000015647)	Adrm1 (ENSMUSG00000039041)	Osbpl2 (ENSMUSG00000039050)	Hrh3 (ENSMUSG00000039059)	Mtg2 (ENSMUSG00000039069)	Ss18l1 (ENSMUSG00000039086)	Psma7 (ENSMUSG00000027566)	Lsm14b (ENSMUSG00000039108)	Taf4 (ENSMUSG00000039117) ##22	Cdh4 (ENSMUSG00000000305)	Cdh26 (ENSMUSG00000039155)	Fam217b (ENSMUSG00000070476)	Ppp1r3d (ENSMUSG00000049999)	Sycp2 (ENSMUSG00000060445)	Phactr3 (ENSMUSG00000027525)	Zfp931 (ENSMUSG00000078861)	Zfp971 (ENSMUSG00000074519)	Gm14326 (ENSMUSG00000078862)	Zfp972 (ENSMUSG00000074529)	Gm14327 (ENSMUSG00000074521)	Gm14325 (ENSMUSG00000095362)	Gm14322 (ENSMUSG00000078864)	Gm14406 (ENSMUSG00000078865)	Gm14403 (ENSMUSG00000094786)
Mus_C	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00960000192285	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.o.b	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a.u	ENSGT00390000015470	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799	ENSGT01090000260114	ENSGT00940000156300.d
spretus	MODERN SPECIES	11	Mrgbp (MGP_SPRETEiJ_G0025707)	Ntsr1 (MGP_SPRETEiJ_G0025706)	Slco4a1 (MGP_SPRETEiJ_G0025705)	Gata5 (MGP_SPRETEiJ_G0025704)	Rbbp8nl (MGP_SPRETEiJ_G0025703)	Cables2 (MGP_SPRETEiJ_G0025702)	Rps21 (MGP_SPRETEiJ_G0025701)	Lama5 (MGP_SPRETEiJ_G0025700)	MGP_SPRETEiJ_G0025699	Osbpl2 (MGP_SPRETEiJ_G0025698)	Hrh3 (MGP_SPRETEiJ_G0025697)	MGP_SPRETEiJ_G0025696	Ss18l1 (MGP_SPRETEiJ_G0025695)	Psma7 (MGP_SPRETEiJ_G0025694)	Lsm14b (MGP_SPRETEiJ_G0025693)	MGP_SPRETEiJ_G0025692 ##22	Cdh4 (MGP_SPRETEiJ_G0025691)	Cdh26 (MGP_SPRETEiJ_G0025690)	Fam217b (MGP_SPRETEiJ_G0025689)	Ppp1r3d (MGP_SPRETEiJ_G0025688)	Sycp2 (MGP_SPRETEiJ_G0025687)	Phactr3 (MGP_SPRETEiJ_G0025686)	Edn3 (MGP_SPRETEiJ_G0025685)	Zfp831 (MGP_SPRETEiJ_G0025684)	Prelid3b (MGP_SPRETEiJ_G0025683)	Atp5e (MGP_SPRETEiJ_G0025682)	Tubb1 (MGP_SPRETEiJ_G0025681)	Ctsz (MGP_SPRETEiJ_G0025680)	Nelfcd (MGP_SPRETEiJ_G0025679)	MGP_SPRETEiJ_G0025678	Gnas (MGP_SPRETEiJ_G0025677)
Steppe mouse	MODERN SPECIES	3150	Ogfr (ENSMSIG00000017554)	Mrgbp (ENSMSIG00000017522)	Ntsr1 (ENSMSIG00000017500)	Slco4a1 (ENSMSIG00000017476)	ENSMSIG00000017437	Gata5 (ENSMSIG00000017417)	Rbbp8nl (ENSMSIG00000017371)	Cables2 (ENSMSIG00000017347)	ENSMSIG00000017324	ENSMSIG00000016398	ENSMSIG00000016249	ENSMSIG00000016190	ENSMSIG00000016142	Psma7 (ENSMSIG00000016080)	ENSMSIG00000016029	ENSMSIG00000015731 ##22	ENSMSIG00000015713	Cdh4 (ENSMSIG00000015601)	ENSMSIG00000015591	Cdh26 (ENSMSIG00000015463)	Fam217b (ENSMSIG00000015440)	Ppp1r3d (ENSMSIG00000015432)	Sycp2 (ENSMSIG00000015299)	Phactr3 (ENSMSIG00000015132)	ENSMSIG00000015117
Ryukyu mouse	MODERN SPECIES	11	Col9a3 (MGP_CAROLIEiJ_G0024784)	Ogfr (MGP_CAROLIEiJ_G0024783)	Mrgbp (MGP_CAROLIEiJ_G0024782)	Ntsr1 (MGP_CAROLIEiJ_G0024781)	MGP_CAROLIEiJ_G0024780	Gata5 (MGP_CAROLIEiJ_G0024779)	MGP_CAROLIEiJ_G0024778	MGP_CAROLIEiJ_G0024777	MGP_CAROLIEiJ_G0024776	MGP_CAROLIEiJ_G0024775	Hrh3 (MGP_CAROLIEiJ_G0024774)	MGP_CAROLIEiJ_G0024773	Ss18l1 (MGP_CAROLIEiJ_G0024772)	Psma7 (MGP_CAROLIEiJ_G0024771)	Lsm14b (MGP_CAROLIEiJ_G0024770)	MGP_CAROLIEiJ_G0024769 ##22	Cdh4 (MGP_CAROLIEiJ_G0024768)	Ppp1r3d (MGP_CAROLIEiJ_G0024767)	Phactr3 (MGP_CAROLIEiJ_G0024765)	Edn3 (MGP_CAROLIEiJ_G0024764)	Zfp831 (MGP_CAROLIEiJ_G0024763)	Prelid3b (MGP_CAROLIEiJ_G0024762)	Atp5e (MGP_CAROLIEiJ_G0024761)	Tubb1 (MGP_CAROLIEiJ_G0024760)	Ctsz (MGP_CAROLIEiJ_G0024759)	Nelfcd (MGP_CAROLIEiJ_G0024758)	MGP_CAROLIEiJ_G0024757	Gnas (MGP_CAROLIEiJ_G0024756)	Npepl1 (MGP_CAROLIEiJ_G0024755)	Stx16 (MGP_CAROLIEiJ_G0024754)	Vapb (MGP_CAROLIEiJ_G0024753)
Shrew mouse	MODERN SPECIES	16	Ntsr1 (MGP_PahariEiJ_G0026228)	Slco4a1 (MGP_PahariEiJ_G0026227)	Gata5 (MGP_PahariEiJ_G0026226)	Rbbp8nl (MGP_PahariEiJ_G0026225)	Cables2 (MGP_PahariEiJ_G0026224)	Rps21 (MGP_PahariEiJ_G0026223)	Lama5 (MGP_PahariEiJ_G0026222)	MGP_PahariEiJ_G0026221	MGP_PahariEiJ_G0026220	Osbpl2 (MGP_PahariEiJ_G0026219)	Hrh3 (MGP_PahariEiJ_G0026218)	MGP_PahariEiJ_G0026217	Ss18l1 (MGP_PahariEiJ_G0026216)	Psma7 (MGP_PahariEiJ_G0026215)	Lsm14b (MGP_PahariEiJ_G0026214)	MGP_PahariEiJ_G0026213 ##22	Cdh4 (MGP_PahariEiJ_G0026212)	Cdh26 (MGP_PahariEiJ_G0026211)	Fam217b (MGP_PahariEiJ_G0026210)	Ppp1r3d (MGP_PahariEiJ_G0026209)	Sycp2 (MGP_PahariEiJ_G0026208)	Phactr3 (MGP_PahariEiJ_G0026207)	Edn3 (MGP_PahariEiJ_G0026206)	Zfp831 (MGP_PahariEiJ_G0026205)	Prelid3b (MGP_PahariEiJ_G0026204)	MGP_PahariEiJ_G0026202	Ctsz (MGP_PahariEiJ_G0026201)	Nelfcd (MGP_PahariEiJ_G0026200)	MGP_PahariEiJ_G0026199	Gnas (MGP_PahariEiJ_G0026198)	Npepl1 (MGP_PahariEiJ_G0026197)
Rat	MODERN SPECIES	13	ENSRNOG00000064180	Slco4a1 (ENSRNOG00000053430)	AC115322.1 (ENSRNOG00000054405)	Gata5 (ENSRNOG00000058983)	Rbbp8nl (ENSRNOG00000057245)	Cables2 (ENSRNOG00000051420)	Rps21 (ENSRNOG00000060449)	Lama5 (ENSRNOG00000053691)	Adrm1 (ENSRNOG00000055984)	Osbpl2 (ENSRNOG00000057756)	Hrh3 (ENSRNOG00000061153)	Mtg2 (ENSRNOG00000059919)	Ss18l1 (ENSRNOG00000060010)	Psma7 (ENSRNOG00000056853)	Lsm14b (ENSRNOG00000054557)	Taf4 (ENSRNOG00000054497) ##22	Cdh4 (ENSRNOG00000052405)	Cdh26 (ENSRNOG00000053332)	Ppp1r3d (ENSRNOG00000053869)	Fam217b (ENSRNOG00000053607)	AC127963.2 (ENSRNOG00000056063)	Sycp2 (ENSRNOG00000061690)	LOC120101827 (ENSRNOG00000048080)	Phactr3 (ENSRNOG00000057996)	ENSRNOG00000067266	ENSRNOG00000063156	ENSRNOG00000070854	ENSRNOG00000066844	ENSRNOG00000066687	ENSRNOG00000062563	ENSRNOG00000066179
Upper Galilee mountains blind mole rat	MODERN SPECIES	1229	Ogfr (ENSNGAG00000000640)	Mrgbp (ENSNGAG00000021492)	Ntsr1 (ENSNGAG00000021420)	Slco4a1 (ENSNGAG00000021326)	Cables2 (ENSNGAG00000019648)	ENSNGAG00000017987	Lama5 (ENSNGAG00000010780)	ENSNGAG00000001016	Osbpl2 (ENSNGAG00000000345)	Hrh3 (ENSNGAG00000019357)	Mtg2 (ENSNGAG00000018854)	Ss18l1 (ENSNGAG00000018258)	Psma7 (ENSNGAG00000017073)	Lsm14b (ENSNGAG00000016550)	ENSNGAG00000016305	Taf4 (ENSNGAG00000015546) ##22	Cdh4 (ENSNGAG00000014651)
Lesser Egyptian jerboa	MODERN SPECIES	171	Ogfr (ENSJJAG00000020054)	Mrgbp (ENSJJAG00000019784)	Ntsr1 (ENSJJAG00000019264)	Slco4a1 (ENSJJAG00000018715)	Gata5 (ENSJJAG00000018164)	Cables2 (ENSJJAG00000017409)	Rps21 (ENSJJAG00000016454)	Lama5 (ENSJJAG00000014033)	ENSJJAG00000011363	Osbpl2 (ENSJJAG00000011104)	Hrh3 (ENSJJAG00000010764)	Mtg2 (ENSJJAG00000010435)	Ss18l1 (ENSJJAG00000009378)	ENSJJAG00000008311	Lsm14b (ENSJJAG00000012728)	Taf4 (ENSJJAG00000011875) ##22	Cdh4 (ENSJJAG00000010912)	Cdh26 (ENSJJAG00000007415)	Fam217b (ENSJJAG00000004859)	ENSJJAG00000002434	Phactr3 (ENSJJAG00000022387)	Edn3 (ENSJJAG00000021058)	Zfp831 (ENSJJAG00000020817)	ENSJJAG00000020252	Atp5e (ENSJJAG00000019610)	Tubb1 (ENSJJAG00000019495)	Ctsz (ENSJJAG00000019111)	Nelfcd (ENSJJAG00000018738)	ENSJJAG00000018466	ENSJJAG00000018225	ENSJJAG00000017931
Kangaroo rat	MODERN SPECIES	448	ENSDORG00000027453	Ntsr1 (ENSDORG00000025445)	Slco4a1 (ENSDORG00000001161)	ENSDORG00000026178	Rbbp8nl (ENSDORG00000007635)	ENSDORG00000025770	Rps21 (ENSDORG00000007632)	Lama5 (ENSDORG00000016589)	ENSDORG00000016587	Osbpl2 (ENSDORG00000016585)	Hrh3 (ENSDORG00000003326)	Mtg2 (ENSDORG00000003325)	Ss18l1 (ENSDORG00000003324)	Psma7 (ENSDORG00000016684)	Lsm14b (ENSDORG00000016683)	Taf4 (ENSDORG00000006800) ##22	Cdh4 (ENSDORG00000000209)
Lagomorpha	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22
Pika	MODERN SPECIES	1057																ENSOPRG00000004667 ##22
Rabbit	MODERN SPECIES	1094																ENSOCUG00000022377 ##22
Atlantogenata	ANCESTRAL SPECIES	78	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.p	ENSGT00940000156537.e	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073
Xenarthra	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22
Armadillo	MODERN SPECIES	2670																TAF4 (ENSDNOG00000047565) ##22
Afrotheria	ANCESTRAL SPECIES	86	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.p	ENSGT00940000156537.e	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073
Afrotheria_a	ANCESTRAL SPECIES	88	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.p	ENSGT00940000156537.e	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073
Elephant	MODERN SPECIES	52	MRGBP (ENSLAFG00000018296)	NTSR1 (ENSLAFG00000008862)	SLCO4A1 (ENSLAFG00000007102)	GATA5 (ENSLAFG00000002741)	RBBP8NL (ENSLAFG00000029543)	CABLES2 (ENSLAFG00000023040)	RPS21 (ENSLAFG00000015793)	ENSLAFG00000028993	ADRM1 (ENSLAFG00000003207)	OSBPL2 (ENSLAFG00000009506)	HRH3 (ENSLAFG00000021662)	MTG2 (ENSLAFG00000011420)	ENSLAFG00000031634	PSMA7 (ENSLAFG00000030070)	LSM14B (ENSLAFG00000007492)	TAF4 (ENSLAFG00000001807) ##22	CDH4 (ENSLAFG00000008770)
Hyrax	MODERN SPECIES	2182																TAF4 (ENSPCAG00000004596) ##22
Platypus	MODERN SPECIES	19	ENSOANG00000004976	MRGBP (ENSOANG00000050356)	NTSR1 (ENSOANG00000004978)	SLCO4A1 (ENSOANG00000004979)	GATA5 (ENSOANG00000004981)	ENSOANG00000038125	ENSOANG00000003361	LAMA5 (ENSOANG00000003362)	ADRM1 (ENSOANG00000003363)	OSBPL2 (ENSOANG00000036569)	HRH3 (ENSOANG00000037021)	MTG2 (ENSOANG00000046024)	SS18L1 (ENSOANG00000003368)	PSMA7 (ENSOANG00000003369)	LSM14B (ENSOANG00000003370)	TAF4 (ENSOANG00000003371) ##22	CDH4 (ENSOANG00000003373)	ENSOANG00000009286	PPP1R3D (ENSOANG00000038878)	ENSOANG00000009282	PHACTR3 (ENSOANG00000009281)	ENSOANG00000044353	ENSOANG00000046037	PRELID3B (ENSOANG00000049774)	ATP5F1E (ENSOANG00000019899)	TUBB1 (ENSOANG00000009278)	CTSZ (ENSOANG00000040362)	NELFCD (ENSOANG00000009277)	GNAS (ENSOANG00000009275)	ENSOANG00000009272	NPEPL1 (ENSOANG00000009270)
Sauria	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT01020000230601	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00390000014718	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.p	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00390000014827	ENSGT00940000158980	ENSGT00950000182810.A.a.a	ENSGT00390000015470	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799
Archelosauria	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT01090000262302	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00390000014718	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.p	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00390000014827	ENSGT00940000158980	ENSGT00950000182810.A.a.a	ENSGT00940000167348	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799
Archosauria	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT01090000262302	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00390000014718	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.p	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a	ENSGT00940000167348	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799	ENSGT00940000156300	ENSGT00940000164142.tc
Aves	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT01090000262302	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00390000014718	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.p	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a	ENSGT00940000167348	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799	ENSGT00940000156300	ENSGT00940000164142.tc
Neognathae	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT01090000262302	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00390000014718	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.p	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a	ENSGT00940000167348	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799	ENSGT00940000156300	ENSGT00530000063255.A
Galloanserae	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01090000262302	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.p	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a	ENSGT00940000167348	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799	ENSGT00940000156300	ENSGT00530000063255.A
Phasianidae	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01090000262302	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.p	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00940000155154.b	ENSGT00390000018016	ENSGT01050000244866.A.b	ENSGT01050000244866.A.a.a.a.a.f	ENSGT01050000244866.A.a.a.a.a.e	ENSGT01050000244866.A.a.a.a.b	ENSGT00940000154899	ENSGT00390000008325.b.a	ENSGT00940000157304	ENSGT00550000074884
Phasianidae_b	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.p	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00940000155154.b	ENSGT00390000018016	ENSGT01050000244866.A.b	ENSGT01050000244866.A.a.a.a.a.f	ENSGT01050000244866.A.a.a.a.a.e	ENSGT01050000244866.A.a.a.a.b	ENSGT00940000154899	ENSGT00390000008325.b.a	ENSGT00940000157304	ENSGT00550000074884
Chicken	MODERN SPECIES	12	MRGBP (ENSGALG00010022299)	NTSR1 (ENSGALG00010021510)	SLCO4A1 (ENSGALG00010022597)	GATA5 (ENSGALG00010022343)	RBBP8NL (ENSGALG00010022609)	CABLES2 (ENSGALG00010021350)	RPS21 (ENSGALG00010021346)	LAMA5 (ENSGALG00010022979)	ADRM1 (ENSGALG00010022954)	OSBPL2 (ENSGALG00010022888)	HRH3 (ENSGALG00010022833)	MTG2 (ENSGALG00010022830)	SS18L1 (ENSGALG00010022825)	PSMA7 (ENSGALG00010022808)	LSM14B (ENSGALG00010022801)	TAF4 (ENSGALG00010022795) ##22	CDH4 (ENSGALG00010022776)	FAM217B (ENSGALG00010024565)	PPP1R3D (ENSGALG00010024564)	ENSGALG00010024559	PHACTR3 (ENSGALG00010024545)	ZNFX1 (ENSGALG00010024542)	CCNDBP1 (ENSGALG00010024512)	EPB42 (ENSGALG00010024537)	TGM6 (ENSGALG00010024526)	ENSGALG00010024518	TGM3 (ENSGALG00010024490)	KCNB1 (ENSGALG00010024476)	ENSGALG00010024467	STAU1 (ENSGALG00010024030)	CSE1L (ENSGALG00010024009)
Turkey	MODERN SPECIES	14	ENSMGAG00000004719	ENSMGAG00000004880	ENSMGAG00000004887	ENSMGAG00000005069	ENSMGAG00000004893	ENSMGAG00000017740	ENSMGAG00000005090	ENSMGAG00000005029	ENSMGAG00000004978	ENSMGAG00000005119	FAM217B (ENSMGAG00000018760)	PPP1R3D (ENSMGAG00000005191)	ENSMGAG00000020445	ENSMGAG00000022482	ENSMGAG00000005220	ENSMGAG00000005271 ##22	ENSMGAG00000005300	ENSMGAG00000005318	SS18L1 (ENSMGAG00000005356)	ENSMGAG00000005442	ENSMGAG00000005418	OSBPL2 (ENSMGAG00000005451)	ENSMGAG00000019345	ENSMGAG00000005514	ENSMGAG00000005506	ENSMGAG00000005698	ENSMGAG00000005708	ENSMGAG00000005727	ENSMGAG00000005744	ENSMGAG00000005776	ENSMGAG00000005841
Japanese quail	MODERN SPECIES	12	ENSCJPG00005003087	ENSCJPG00005003085	SLCO4A1 (ENSCJPG00005003076)	GATA5 (ENSCJPG00005003073)	RBBP8NL (ENSCJPG00005003069)	CABLES2 (ENSCJPG00005003062)	RPS21 (ENSCJPG00005003060)	LAMA5 (ENSCJPG00005003027)	ADRM1 (ENSCJPG00005003018)	OSBPL2 (ENSCJPG00005003003)	HRH3 (ENSCJPG00005002991)	MTG2 (ENSCJPG00005002986)	SS18L1 (ENSCJPG00005002978)	PSMA7 (ENSCJPG00005002975)	LSM14B (ENSCJPG00005002974)	TAF4 (ENSCJPG00005002970) ##22	CDH4 (ENSCJPG00005002963)	FAM217B (ENSCJPG00005002957)	PPP1R3D (ENSCJPG00005002953)	ENSCJPG00005002942	PHACTR3 (ENSCJPG00005002932)	ZNFX1 (ENSCJPG00005002920)	EPB42 (ENSCJPG00005002907)	TGM6 (ENSCJPG00005002474)	ENSCJPG00005002472	TGM3 (ENSCJPG00005002469)	KCNB1 (ENSCJPG00005002468)	ENSCJPG00005002463	STAU1 (ENSCJPG00005002450)	CSE1L (ENSCJPG00005002442)	ARFGEF2 (ENSCJPG00005002426)
Anatidae	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.p	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a	ENSGT00940000167348	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799	ENSGT00940000156300	ENSGT00530000063255.A
Duck	MODERN SPECIES	12	OGFR (ENSAPLG00000028652)	MRGBP (ENSAPLG00000029735)	SLCO4A1 (ENSAPLG00000003398)	ENSAPLG00000017580	RBBP8NL (ENSAPLG00000015008)	CABLES2 (ENSAPLG00000025571)	RPS21 (ENSAPLG00000002422)	LAMA5 (ENSAPLG00000010163)	ADRM1 (ENSAPLG00000011362)	OSBPL2 (ENSAPLG00000011733)	HRH3 (ENSAPLG00000012513)	MTG2 (ENSAPLG00000012536)	ENSAPLG00000020842	PSMA7 (ENSAPLG00000012972)	LSM14B (ENSAPLG00000013203)	TAF4 (ENSAPLG00000013454) ##22	CDH4 (ENSAPLG00000013848)	CDH26 (ENSAPLG00000013919)	FAM217B (ENSAPLG00000014012)	PPP1R3D (ENSAPLG00000014074)	SYCP2 (ENSAPLG00000014080)	PHACTR3 (ENSAPLG00000014492)	PRELID3B (ENSAPLG00000014562)	ZNF831 (ENSAPLG00000017059)	ENSAPLG00000014652	NELFCD (ENSAPLG00000014867)	GNAS (ENSAPLG00000015373)	NPEPL1 (ENSAPLG00000001462)	STX16 (ENSAPLG00000002465)	APCDD1L (ENSAPLG00000002562)	VAPB (ENSAPLG00000002565)
Neognathae_b	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT01020000230601	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00390000014718	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.p	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a	ENSGT00940000167348	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799	ENSGT00940000156300	ENSGT00530000063255.A
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Great tit	MODERN SPECIES	12	MRGBP (ENSPMJG00000007370)	NTSR1 (ENSPMJG00000007373)	SLCO4A1 (ENSPMJG00000007375)	ENSPMJG00000007384	GATA5 (ENSPMJG00000007390)	RBBP8NL (ENSPMJG00000007392)	CABLES2 (ENSPMJG00000007397)	LAMA5 (ENSPMJG00000007407)	ADRM1 (ENSPMJG00000007633)	OSBPL2 (ENSPMJG00000007636)	HRH3 (ENSPMJG00000007640)	MTG2 (ENSPMJG00000007641)	SS18L1 (ENSPMJG00000007653)	PSMA7 (ENSPMJG00000007654)	LSM14B (ENSPMJG00000007655)	TAF4 (ENSPMJG00000007656) ##22	CDH4 (ENSPMJG00000007666)	CDH26 (ENSPMJG00000008768)	FAM217B (ENSPMJG00000008769)	PPP1R3D (ENSPMJG00000008770)	PHACTR3 (ENSPMJG00000008771)	EDN3 (ENSPMJG00000008777)	ZNF831 (ENSPMJG00000008779)	PRELID3B (ENSPMJG00000008780)	ENSPMJG00000008781	TUBB1 (ENSPMJG00000008782)	CTSZ (ENSPMJG00000008783)	NELFCD (ENSPMJG00000008784)	GNAS (ENSPMJG00000008787)	NPEPL1 (ENSPMJG00000009015)	STX16 (ENSPMJG00000009016)
Passeriformes_d	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT01020000230601	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00390000014718	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.p	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00680000101501	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a	ENSGT00940000167348	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799	ENSGT00940000156300
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Passeroidea	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00390000014718	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.p	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a	ENSGT00940000167348	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799	ENSGT00940000156300	ENSGT00530000063255.A	ENSGT01000000214440.B
Common canary	MODERN SPECIES	21	SLCO4A1 (ENSSCAG00000014874)	ENSSCAG00000014901	GATA5 (ENSSCAG00000014913)	RBBP8NL (ENSSCAG00000014918)	CABLES2 (ENSSCAG00000014923)	RPS21 (ENSSCAG00000014930)	LAMA5 (ENSSCAG00000015010)	ADRM1 (ENSSCAG00000015218)	OSBPL2 (ENSSCAG00000015222)	HRH3 (ENSSCAG00000015240)	MTG2 (ENSSCAG00000015244)	ENSSCAG00000015247	PSMA7 (ENSSCAG00000015249)	ENSSCAG00000015251	ENSSCAG00000015252	TAF4 (ENSSCAG00000015255) ##22	ENSSCAG00000015262	CDH4 (ENSSCAG00000015267)	FAM217B (ENSSCAG00000015272)	PPP1R3D (ENSSCAG00000015274)	PHACTR3 (ENSSCAG00000015276)	ENSSCAG00000015284	PRELID3B (ENSSCAG00000015286)	ENSSCAG00000015289	TUBB1 (ENSSCAG00000015290)	CTSZ (ENSSCAG00000015294)	NELFCD (ENSSCAG00000015298)	NPEPL1 (ENSSCAG00000015308)	STX16 (ENSSCAG00000015340)	APCDD1L (ENSSCAG00000015346)	VAPB (ENSSCAG00000015350)
Zebra finch	MODERN SPECIES	13	MRGBP (ENSTGUG00000007684)	NTSR1 (ENSTGUG00000029344)	SLCO4A1 (ENSTGUG00000007700)	ENSTGUG00000024863	GATA5 (ENSTGUG00000007723)	RBBP8NL (ENSTGUG00000007735)	CABLES2 (ENSTGUG00000007738)	RPS21 (ENSTGUG00000007750)	LAMA5 (ENSTGUG00000007752)	ADRM1 (ENSTGUG00000007836)	OSBPL2 (ENSTGUG00000021939)	HRH3 (ENSTGUG00000007816)	MTG2 (ENSTGUG00000007823)	PSMA7 (ENSTGUG00000007864)	LSM14B (ENSTGUG00000007884)	TAF4 (ENSTGUG00000007892) ##22	CDH4 (ENSTGUG00000007909)	ENSTGUG00000028411	PPP1R3D (ENSTGUG00000023326)	SYCP2 (ENSTGUG00000018179)	PHACTR3 (ENSTGUG00000007984)	ENSTGUG00000008033	EDN3 (ENSTGUG00000028676)	PRELID3B (ENSTGUG00000021702)	ENSTGUG00000023581	ZNF831 (ENSTGUG00000023988)	TUBB1 (ENSTGUG00000008035)	CTSZ (ENSTGUG00000008040)	NELFCD (ENSTGUG00000008047)	GNAS (ENSTGUG00000008082)	NPEPL1 (ENSTGUG00000008119)
Medium ground finch	MODERN SPECIES	59		ENSGFOG00000011429	ENSGFOG00000011430	ENSGFOG00000011437	ENSGFOG00000011440	ENSGFOG00000011443	ENSGFOG00000011452	LAMA5 (ENSGFOG00000011491)	ADRM1 (ENSGFOG00000011757)	OSBPL2 (ENSGFOG00000011797)	HRH3 (ENSGFOG00000011809)	MTG2 (ENSGFOG00000011824)	SS18L1 (ENSGFOG00000011833)	PSMA7 (ENSGFOG00000011839)	LSM14B (ENSGFOG00000011844)	TAF4 (ENSGFOG00000011855) ##22	CDH4 (ENSGFOG00000011962)	FAM217B (ENSGFOG00000013388)	PPP1R3D (ENSGFOG00000000054)	PHACTR3 (ENSGFOG00000000446)	ZNF831 (ENSGFOG00000000798)	PRELID3B (ENSGFOG00000000916)	ENSGFOG00000000926	TUBB1 (ENSGFOG00000000937)	CTSZ (ENSGFOG00000000944)	NELFCD (ENSGFOG00000000954)	GNAS (ENSGFOG00000001019)	NPEPL1 (ENSGFOG00000001173)	STX16 (ENSGFOG00000001190)	APCDD1L (ENSGFOG00000001208)	VAPB (ENSGFOG00000001216)
Neognathae_c	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00940000160139	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.p	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a	ENSGT00940000167348	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799	ENSGT00940000156300	ENSGT00530000063255.A	ENSGT01000000214440.B
Kakapo	MODERN SPECIES	5	OGFR (ENSSHBG00005017855)	MRGBP (ENSSHBG00005017850)	NTSR1 (ENSSHBG00005017846)	SLCO4A1 (ENSSHBG00005017837)	GATA5 (ENSSHBG00005017822)	CABLES2 (ENSSHBG00005017818)	RPS21 (ENSSHBG00005017812)	LAMA5 (ENSSHBG00005017731)	ADRM1 (ENSSHBG00005017710)	OSBPL2 (ENSSHBG00005017699)	HRH3 (ENSSHBG00005017696)	MTG2 (ENSSHBG00005017692)	SS18L1 (ENSSHBG00005017686)	PSMA7 (ENSSHBG00005017680)	LSM14B (ENSSHBG00005017664)	TAF4 (ENSSHBG00005017650) ##22	ENSSHBG00005017632	CPNE1 (ENSSHBG00005017622)	RBM12 (ENSSHBG00005017618)	NFS1 (ENSSHBG00005017616)	ROMO1 (ENSSHBG00005017611)	ENSSHBG00005017608	RBM39 (ENSSHBG00005017603)	ENSSHBG00005017593	PHF20 (ENSSHBG00005017575)	SLA2 (ENSSHBG00005017565)	NDRG3 (ENSSHBG00005017560)	RALGAPB (ENSSHBG00005017544)	ENSSHBG00005017534	CHD6 (ENSSHBG00005008746)	RBL1 (ENSSHBG00005008287)
Golden eagle	MODERN SPECIES	19	OGFR (ENSACCG00020001936)	MRGBP (ENSACCG00020001964)	NTSR1 (ENSACCG00020001989)	SLCO4A1 (ENSACCG00020002023)	GATA5 (ENSACCG00020002058)	CABLES2 (ENSACCG00020002089)	RPS21 (ENSACCG00020002111)	LAMA5 (ENSACCG00020002277)	ADRM1 (ENSACCG00020002454)	OSBPL2 (ENSACCG00020002481)	HRH3 (ENSACCG00020002540)	MTG2 (ENSACCG00020002568)	SS18L1 (ENSACCG00020002584)	PSMA7 (ENSACCG00020002600)	LSM14B (ENSACCG00020002620)	TAF4 (ENSACCG00020002670) ##22	CDH4 (ENSACCG00020003105)	CDH26 (ENSACCG00020003451)	FAM217B (ENSACCG00020003465)	PPP1R3D (ENSACCG00020003480)	PHACTR3 (ENSACCG00020003489)	EDN3 (ENSACCG00020003509)	ZNF831 (ENSACCG00020003516)	PRELID3B (ENSACCG00020003538)	ENSACCG00020003552	TUBB1 (ENSACCG00020003570)	CTSZ (ENSACCG00020003594)	NELFCD (ENSACCG00020003640)	GNAS (ENSACCG00020003676)	NPEPL1 (ENSACCG00020003702)	STX16 (ENSACCG00020003714)
African ostrich	MODERN SPECIES	150	TCFL5 (ENSSCUG00000002792)	OGFR (ENSSCUG00000002790)	ENSSCUG00000002789	NTSR1 (ENSSCUG00000002787)	SLCO4A1 (ENSSCUG00000002786)	CABLES2 (ENSSCUG00000002778)	RPS21 (ENSSCUG00000002776)	LAMA5 (ENSSCUG00000002770)	ADRM1 (ENSSCUG00000002760)	OSBPL2 (ENSSCUG00000002759)	HRH3 (ENSSCUG00000002751)	MTG2 (ENSSCUG00000002746)	SS18L1 (ENSSCUG00000002742)	PSMA7 (ENSSCUG00000002740)	LSM14B (ENSSCUG00000002739)	TAF4 (ENSSCUG00000002737) ##22	CDH4 (ENSSCUG00000002734)	CDH26 (ENSSCUG00000002730)	FAM217B (ENSSCUG00000002728)	PPP1R3D (ENSSCUG00000002726)	ENSSCUG00000002722	PHACTR3 (ENSSCUG00000002721)	ZNF831 (ENSSCUG00000002717)	ENSSCUG00000002716	PRELID3B (ENSSCUG00000002713)	TUBB1 (ENSSCUG00000002711)	CTSZ (ENSSCUG00000002709)	NELFCD (ENSSCUG00000002706)	GNAS (ENSSCUG00000002700)	ENSSCUG00000002697	NPEPL1 (ENSSCUG00000002668)
Australian saltwater crocodile	MODERN SPECIES	59	ENSCPRG00005005699	NTSR1 (ENSCPRG00005005694)	ENSCPRG00005005684	SLCO4A1 (ENSCPRG00005005674)	GATA5 (ENSCPRG00005005663)	RBBP8NL (ENSCPRG00005005655)	CABLES2 (ENSCPRG00005005641)	RPS21 (ENSCPRG00005005632)	LAMA5 (ENSCPRG00005005529)	ADRM1 (ENSCPRG00005005435)	OSBPL2 (ENSCPRG00005005417)	HRH3 (ENSCPRG00005005411)	SS18L1 (ENSCPRG00005005399)	PSMA7 (ENSCPRG00005005389)	LSM14B (ENSCPRG00005005381)	TAF4 (ENSCPRG00005005323) ##22	CDH4 (ENSCPRG00005005277)	CDH26 (ENSCPRG00005005229)	FAM217B (ENSCPRG00005005224)	PPP1R3D (ENSCPRG00005005223)	ENSCPRG00005005220	ENSCPRG00005005209	EDN3 (ENSCPRG00005005205)	ZNF831 (ENSCPRG00005005201)	PRELID3B (ENSCPRG00005005194)	ENSCPRG00005005193	ENSCPRG00005005191	ENSCPRG00005005185	TUBB1 (ENSCPRG00005005181)	CTSZ (ENSCPRG00005005179)	NELFCD (ENSCPRG00005005167)
Cryptodira	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01090000262302	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.p	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00390000014827	ENSGT00940000158980	ENSGT00950000182810.A.a.a	ENSGT00940000167348	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799
Testudinoidea	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01090000262302	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.p	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00390000014827	ENSGT00940000158980	ENSGT00950000182810.A.a.a	ENSGT00940000167348	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799
Emydidae	ANCESTRAL SPECIES	31	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01090000262302	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.p	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a	ENSGT00940000167348	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799	ENSGT00940000156300	ENSGT00940000164142
Three-toed box turtle	MODERN SPECIES	60	OGFR (ENSTMTG00000001726)	MRGBP (ENSTMTG00000001733)	NTSR1 (ENSTMTG00000001739)	SLCO4A1 (ENSTMTG00000001763)	GATA5 (ENSTMTG00000001881)	CABLES2 (ENSTMTG00000001905)	RPS21 (ENSTMTG00000001966)	LAMA5 (ENSTMTG00000002020)	ADRM1 (ENSTMTG00000002296)	OSBPL2 (ENSTMTG00000002303)	HRH3 (ENSTMTG00000002329)	MTG2 (ENSTMTG00000002360)	SS18L1 (ENSTMTG00000002365)	PSMA7 (ENSTMTG00000002377)	LSM14B (ENSTMTG00000002386)	TAF4 (ENSTMTG00000002398) ##22	CDH4 (ENSTMTG00000002415)	CDH26 (ENSTMTG00000002435)	FAM217B (ENSTMTG00000002444)	ENSTMTG00000002448	EDN3 (ENSTMTG00000002451)	ZNF831 (ENSTMTG00000002455)	ENSTMTG00000002460	ENSTMTG00000002464	PRELID3B (ENSTMTG00000000164)	ENSTMTG00000000180	ENSTMTG00000000192	CTSZ (ENSTMTG00000000204)	NELFCD (ENSTMTG00000000443)	GNAS (ENSTMTG00000000827)	ENSTMTG00000000871
painted turtle	MODERN SPECIES	2365	ENSCPBG00000027156	ENSCPBG00000027155	SLCO4A1 (ENSCPBG00000027154)	GATA5 (ENSCPBG00000027143)	RBBP8NL (ENSCPBG00000027139)	CABLES2 (ENSCPBG00000027134)	RPS21 (ENSCPBG00000027132)	LAMA5 (ENSCPBG00000027113)	ADRM1 (ENSCPBG00000027092)	OSBPL2 (ENSCPBG00000027086)	HRH3 (ENSCPBG00000027081)	MTG2 (ENSCPBG00000027075)	SS18L1 (ENSCPBG00000027069)	PSMA7 (ENSCPBG00000027066)	LSM14B (ENSCPBG00000027065)	TAF4 (ENSCPBG00000027063) ##22	ENSCPBG00000027060	CDH4 (ENSCPBG00000027058)	CDH26 (ENSCPBG00000027050)	FAM217B (ENSCPBG00000027049)	PPP1R3D (ENSCPBG00000027047)	ENSCPBG00000027042	PHACTR3 (ENSCPBG00000027032)	EDN3 (ENSCPBG00000027021)	ZNF831 (ENSCPBG00000027016)	ENSCPBG00000027014	ENSCPBG00000027012	PRELID3B (ENSCPBG00000027011)	ENSCPBG00000027009	TUBB1 (ENSCPBG00000027008)	CTSZ (ENSCPBG00000027007)
Testudinidae	ANCESTRAL SPECIES	28	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00940000160139	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.p	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00390000014827	ENSGT00940000158980	ENSGT00950000182810.A.a.a	ENSGT00940000167348	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799
Goode s thornscrub tortoise	MODERN SPECIES	5	MRGBP (ENSGEVG00005006691)	NTSR1 (ENSGEVG00005006730)	SLCO4A1 (ENSGEVG00005006781)	ENSGEVG00005006884	GATA5 (ENSGEVG00005006923)	CABLES2 (ENSGEVG00005006972)	RPS21 (ENSGEVG00005007045)	LAMA5 (ENSGEVG00005007203)	ADRM1 (ENSGEVG00005007944)	OSBPL2 (ENSGEVG00005007990)	HRH3 (ENSGEVG00005008097)	MTG2 (ENSGEVG00005008248)	SS18L1 (ENSGEVG00005008266)	PSMA7 (ENSGEVG00005008318)	LSM14B (ENSGEVG00005008338)	TAF4 (ENSGEVG00005008424) ##22	CDH4 (ENSGEVG00005008691)	CDH26 (ENSGEVG00005008809)	FAM217B (ENSGEVG00005008881)	PPP1R3D (ENSGEVG00005008930)	ENSGEVG00005008964	ENSGEVG00005009057	EDN3 (ENSGEVG00005009100)	ZNF831 (ENSGEVG00005009136)	ENSGEVG00005009188	ENSGEVG00005009225	PRELID3B (ENSGEVG00005009301)	ENSGEVG00005009337	TUBB1 (ENSGEVG00005009359)	ENSGEVG00005009389	CTSZ (ENSGEVG00005009483)
Abingdon island giant tortoise	MODERN SPECIES	2211	ENSCABG00000004407	MRGBP (ENSCABG00000004395)	NTSR1 (ENSCABG00000004391)	SLCO4A1 (ENSCABG00000004384)	GATA5 (ENSCABG00000004377)	CABLES2 (ENSCABG00000004375)	RPS21 (ENSCABG00000004374)	ENSCABG00000004369	ADRM1 (ENSCABG00000004366)	OSBPL2 (ENSCABG00000004242)	HRH3 (ENSCABG00000004142)	MTG2 (ENSCABG00000004040)	ENSCABG00000004025	PSMA7 (ENSCABG00000004021)	LSM14B (ENSCABG00000004016)	TAF4 (ENSCABG00000004009) ##22	CDH4 (ENSCABG00000003998)
Chinese turtle	MODERN SPECIES	1282	MRGBP (ENSPSIG00000004671)	NTSR1 (ENSPSIG00000004655)	SLCO4A1 (ENSPSIG00000004478)	GATA5 (ENSPSIG00000004394)	RBBP8NL (ENSPSIG00000004354)	CABLES2 (ENSPSIG00000004339)	RPS21 (ENSPSIG00000004333)	LAMA5 (ENSPSIG00000003797)	ADRM1 (ENSPSIG00000003713)	OSBPL2 (ENSPSIG00000003694)	HRH3 (ENSPSIG00000003664)	MTG2 (ENSPSIG00000003651)	SS18L1 (ENSPSIG00000016427)	PSMA7 (ENSPSIG00000016150)	LSM14B (ENSPSIG00000014762)	TAF4 (ENSPSIG00000013059) ##22	CDH4 (ENSPSIG00000009585)	ENSPSIG00000000044	CDH26 (ENSPSIG00000007630)	FAM217B (ENSPSIG00000007355)	PPP1R3D (ENSPSIG00000000043)	SYCP2 (ENSPSIG00000015686)	ENSPSIG00000015553
Lepidosauria	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C	ENSGT01020000230601	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.p	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00390000014827	ENSGT00940000158980	ENSGT00950000182810.A.a.a	ENSGT00390000015470	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799	ENSGT00940000156300
Episquamata	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C	ENSGT01020000230601	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.p	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00390000014827	ENSGT00940000158980	ENSGT00950000182810.A.a.a	ENSGT00390000015470	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799	ENSGT00940000156300
Laterata	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01020000230601	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.p	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00390000005534.b.c.a.a	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a	ENSGT00390000015470	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799	ENSGT00940000156300
Argentine black and white tegu	MODERN SPECIES	49	MRGBP (ENSSMRG00000012660)	NTSR1 (ENSSMRG00000012659)	SLCO4A1 (ENSSMRG00000012647)	GATA5 (ENSSMRG00000012640)	RBBP8NL (ENSSMRG00000012639)	CABLES2 (ENSSMRG00000012638)	RPS21 (ENSSMRG00000012637)	LAMA5 (ENSSMRG00000012631)	ADRM1 (ENSSMRG00000012629)	OSBPL2 (ENSSMRG00000012628)	HRH3 (ENSSMRG00000012624)	MTG2 (ENSSMRG00000012623)	SS18L1 (ENSSMRG00000012622)	PSMA7 (ENSSMRG00000012621)	LSM14B (ENSSMRG00000012615)	TAF4 (ENSSMRG00000012607) ##22	CDH4 (ENSSMRG00000012600)	CDH26 (ENSSMRG00000012589)	FAM217B (ENSSMRG00000012588)	PPP1R3D (ENSSMRG00000012586)	PHACTR3 (ENSSMRG00000012571)	EDN3 (ENSSMRG00000012557)	ENSSMRG00000012556	ENSSMRG00000012555	ENSSMRG00000012554	ENSSMRG00000012553	ENSSMRG00000012550	PRELID3B (ENSSMRG00000012549)	ATP5F1E (ENSSMRG00000012547)	TUBB1 (ENSSMRG00000012546)	CTSZ (ENSSMRG00000012545)
Common wall lizard	MODERN SPECIES	14	SLCO4A1 (ENSPMRG00000004613)	GATA5 (ENSPMRG00000004600)	RBBP8NL (ENSPMRG00000004595)	CABLES2 (ENSPMRG00000004586)	ENSPMRG00000004578	ENSPMRG00000004576	LAMA5 (ENSPMRG00000004278)	ADRM1 (ENSPMRG00000004214)	OSBPL2 (ENSPMRG00000004161)	ENSPMRG00000004148	HRH3 (ENSPMRG00000004103)	MTG2 (ENSPMRG00000004089)	SS18L1 (ENSPMRG00000004078)	PSMA7 (ENSPMRG00000004069)	LSM14B (ENSPMRG00000004055)	TAF4 (ENSPMRG00000003939) ##22	CDH4 (ENSPMRG00000003908)	ENSPMRG00000003904	ENSPMRG00000003899	CDH26 (ENSPMRG00000003890)	PPP1R3D (ENSPMRG00000003887)	FAM217B (ENSPMRG00000003885)	ENSPMRG00000003880	PHACTR3 (ENSPMRG00000003862)	EDN3 (ENSPMRG00000003851)	ENSPMRG00000003837	ZNF831 (ENSPMRG00000003836)	ENSPMRG00000003833	ENSPMRG00000003831	ENSPMRG00000003830	PRELID3B (ENSPMRG00000003829)
Toxicofera	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C	ENSGT01020000230601	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.p	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00390000014827	ENSGT00940000158980	ENSGT00950000182810.A.a.a	ENSGT00390000015470	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799	ENSGT00940000156300
Elapidae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C	ENSGT01020000230601	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.p	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762.b	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000161589.w	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00940000157562.p	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00390000014827	ENSGT00940000158980	ENSGT00950000182810.A.a.a	ENSGT00390000015470	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a.o	ENSGT00390000001799	ENSGT00940000156300
Elapidae_a	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C	ENSGT01020000230601	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.p	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762.b	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000161589.w	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00940000157562.p	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00390000014827	ENSGT00940000158980	ENSGT00950000182810.A.a.a	ENSGT00390000015470	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a.o	ENSGT00390000001799	ENSGT00940000156300
Acanthophiinae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C	ENSGT01020000230601	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515.p	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762.b	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000161589.w	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00940000157562.p	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a	ENSGT00390000015470	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a.o	ENSGT00390000001799	ENSGT00940000156300	ENSGT00940000164142	ENSGT00530000063255.A
Eastern brown snake	MODERN SPECIES	8	MRGBP (ENSPTXG00000013211)	NTSR1 (ENSPTXG00000013212)	SLCO4A1 (ENSPTXG00000013213)	GATA5 (ENSPTXG00000013216)	RBBP8NL (ENSPTXG00000013217)	CABLES2 (ENSPTXG00000000034)	RPS21 (ENSPTXG00000000063)	LAMA5 (ENSPTXG00000000396)	ADRM1 (ENSPTXG00000001974)	OSBPL2 (ENSPTXG00000001975)	HRH3 (ENSPTXG00000001977)	MTG2 (ENSPTXG00000001990)	SS18L1 (ENSPTXG00000001994)	PSMA7 (ENSPTXG00000001998)	LSM14B (ENSPTXG00000002004)	TAF4 (ENSPTXG00000002009) ##22	CDH4 (ENSPTXG00000002014)	CDH26 (ENSPTXG00000002018)	FAM217B (ENSPTXG00000002019)	PPP1R3D (ENSPTXG00000002020)	ENSPTXG00000002022	EDN3 (ENSPTXG00000002026)	ENSPTXG00000002035	ENSPTXG00000002036	PRELID3B (ENSPTXG00000002037)	ATP5F1E (ENSPTXG00000002039)	ENSPTXG00000002041	CTSZ (ENSPTXG00000002042)	NELFCD (ENSPTXG00000002043)	GNAS (ENSPTXG00000002044)	ENSPTXG00000002049
Mainland tiger snake	MODERN SPECIES	10		NTSR1 (ENSNSUG00000014059)	SLCO4A1 (ENSNSUG00000014060)	ENSNSUG00000014062	GATA5 (ENSNSUG00000014066)	CABLES2 (ENSNSUG00000014090)	RPS21 (ENSNSUG00000014091)	ENSNSUG00000014092	ADRM1 (ENSNSUG00000014093)	OSBPL2 (ENSNSUG00000014095)	HRH3 (ENSNSUG00000014096)	MTG2 (ENSNSUG00000014143)	ENSNSUG00000014144	PSMA7 (ENSNSUG00000014145)	LSM14B (ENSNSUG00000014146)	TAF4 (ENSNSUG00000014148) ##22	CDH4 (ENSNSUG00000014149)	CDH26 (ENSNSUG00000014151)	FAM217B (ENSNSUG00000014152)	PPP1R3D (ENSNSUG00000014154)	ENSNSUG00000014155	EDN3 (ENSNSUG00000014157)	ENSNSUG00000014158	ENSNSUG00000014159	PRELID3B (ENSNSUG00000014160)	ENSNSUG00000014161	TUBB1 (ENSNSUG00000014162)	ENSNSUG00000014163	ENSNSUG00000014164	NELFCD (ENSNSUG00000014165)	GNAS (ENSNSUG00000014166)
Indian cobra	MODERN SPECIES	2	SLCO4A1 (ENSNNAG00000000979)	ENSNNAG00000001003	ENSNNAG00000001023	ENSNNAG00000001032	GATA5 (ENSNNAG00000001050)	RBBP8NL (ENSNNAG00000001075)	CABLES2 (ENSNNAG00000001114)	LAMA5 (ENSNNAG00000001168)	ADRM1 (ENSNNAG00000001451)	OSBPL2 (ENSNNAG00000001487)	HRH3 (ENSNNAG00000001540)	MTG2 (ENSNNAG00000001619)	SS18L1 (ENSNNAG00000001633)	PSMA7 (ENSNNAG00000001644)	LSM14B (ENSNNAG00000001657)	TAF4 (ENSNNAG00000001673) ##22	CDH4 (ENSNNAG00000001810)	ENSNNAG00000002410	ENSNNAG00000002425	FAM217B (ENSNNAG00000002449)	PPP1R3D (ENSNNAG00000002459)	PHACTR3 (ENSNNAG00000002466)	ENSNNAG00000002503	EDN3 (ENSNNAG00000002512)	ZNF831 (ENSNNAG00000002523)	ENSNNAG00000002533	ENSNNAG00000002542	PRELID3B (ENSNNAG00000002552)	ENSNNAG00000002561	ENSNNAG00000002567	ENSNNAG00000002569
Lizard	MODERN SPECIES	3	SLCO4A1 (ENSACAG00000005096)	GATA5 (ENSACAG00000005064)	CABLES2 (ENSACAG00000005032)	RPS21 (ENSACAG00000037786)	ENSACAG00000039758	LAMA5 (ENSACAG00000004758)	ADRM1 (ENSACAG00000004732)	OSBPL2 (ENSACAG00000004657)	ENSACAG00000039986	ENSACAG00000004624	ENSACAG00000043437	MTG2 (ENSACAG00000016072)	SS18L1 (ENSACAG00000016087)	PSMA7 (ENSACAG00000016158)	LSM14B (ENSACAG00000016195)	TAF4 (ENSACAG00000016214) ##22	CDH4 (ENSACAG00000016236)	ENSACAG00000035574	ENSACAG00000038730	ENSACAG00000037619	CDH26 (ENSACAG00000003897)	FAM217B (ENSACAG00000025908)	PPP1R3D (ENSACAG00000003895)	ENSACAG00000036499	ENSACAG00000003951	ENSACAG00000043340	PHACTR3 (ENSACAG00000003686)	ENSACAG00000040825	CEBPB (ENSACAG00000015567)	ENSACAG00000015580	ENSACAG00000025937
tuatara	MODERN SPECIES	1214	OGFR (ENSSPUG00000014989)	MRGBP (ENSSPUG00000014844)	NTSR1 (ENSSPUG00000014802)	SLCO4A1 (ENSSPUG00000014790)	GATA5 (ENSSPUG00000014763)	CABLES2 (ENSSPUG00000014749)	ENSSPUG00000014739	LAMA5 (ENSSPUG00000014592)	ADRM1 (ENSSPUG00000014518)	OSBPL2 (ENSSPUG00000014462)	MTG2 (ENSSPUG00000014422)	SS18L1 (ENSSPUG00000014410)	ENSSPUG00000014401	PSMA7 (ENSSPUG00000014388)	LSM14B (ENSSPUG00000014360)	TAF4 (ENSSPUG00000014338) ##22	CDH4 (ENSSPUG00000014313)
Anura	ANCESTRAL SPECIES	31	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00940000160139	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00400000022086.b.b	ENSGT00390000017515	ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839	ENSGT00940000158762	ENSGT00940000161502	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000154543.a	ENSGT00940000161921	ENSGT00530000063859.b	ENSGT00940000157562	ENSGT00950000183053.C	ENSGT00940000161664	ENSGT00950000182810.A.a.a	ENSGT00960000187407	ENSGT00940000159809	ENSGT00940000155569.a.a	ENSGT00390000001799	ENSGT01090000260114	ENSGT00940000156300
Frog	MODERN SPECIES	1	ENSXETG00000011260	slco4a1 (ENSXETG00000011257)	gata5 (ENSXETG00000005127)	rbbp8nl (ENSXETG00000002015)	cables2 (ENSXETG00000002013)	rps21 (ENSXETG00000002012)	ENSXETG00000002008	ENSXETG00000048930	adrm1 (ENSXETG00000002006)	hrh3 (ENSXETG00000049145)	mtg2 (ENSXETG00000002001)	ss18l1 (ENSXETG00000039365)	psma7 (ENSXETG00000001998)	lsm14b (ENSXETG00000001997)	ENSXETG00000047018	taf4 (ENSXETG00000001996) ##22	ENSXETG00000045999	ENSXETG00000047028	ENSXETG00000044861	cdh4 (ENSXETG00000049321)	ENSXETG00000042813	ENSXETG00000005046	fam217b (ENSXETG00000039310)	ppp1r3d (ENSXETG00000037956)	cdh26 (ENSXETG00000026460)	sycp2 (ENSXETG00000031145)	phactr3 (ENSXETG00000005049)	edn3 (ENSXETG00000043917)	znf831 (ENSXETG00000040847)	ENSXETG00000042701	PRELID3B (ENSXETG00000044004)
Leishan spiny toad	MODERN SPECIES	3	MRGBP (ENSLLEG00000029499)	NTSR1 (ENSLLEG00000029511)	ENSLLEG00000029519	SLCO4A1 (ENSLLEG00000029528)	GATA5 (ENSLLEG00000029551)	ENSLLEG00000029575	CABLES2 (ENSLLEG00000029586)	LAMA5 (ENSLLEG00000029653)	ADRM1 (ENSLLEG00000029790)	OSBPL2 (ENSLLEG00000029968)	HRH3 (ENSLLEG00000030077)	MTG2 (ENSLLEG00000030106)	SS18L1 (ENSLLEG00000030159)	PSMA7 (ENSLLEG00000030206)	ENSLLEG00000030338	TAF4 (ENSLLEG00000030383) ##22	CDH4 (ENSLLEG00000014748)	ENSLLEG00000017422	ENSLLEG00000017493	CDH26 (ENSLLEG00000018521)	FAM217B (ENSLLEG00000019972)	PPP1R3D (ENSLLEG00000020009)	PHACTR3 (ENSLLEG00000020053)	EDN3 (ENSLLEG00000020159)	ENSLLEG00000020215	ENSLLEG00000020282	PRELID3B (ENSLLEG00000020377)	SNTA1 (ENSLLEG00000020660)	ENSLLEG00000020769	TOX2 (ENSLLEG00000020800)	RALGAPB (ENSLLEG00000021136)
Coelacanth	MODERN SPECIES	544	SLCO4A1 (ENSLACG00000016459)	sh3bgrl (ENSLACG00000016177)	GATA5 (ENSLACG00000014444)	ENSLACG00000013497	CABLES2 (ENSLACG00000012872)	rps21 (ENSLACG00000012753)	LAMA5 (ENSLACG00000009138)	ADRM1 (ENSLACG00000008853)	OSBPL2 (ENSLACG00000008076)	HRH3 (ENSLACG00000006816)	ENSLACG00000006466	MTG2 (ENSLACG00000006066)	SS18L1 (ENSLACG00000005205)	PSMA7 (ENSLACG00000004628)	LSM14B (ENSLACG00000003849)	TAF4 (ENSLACG00000000501) ##22
Actinopterygii	ANCESTRAL SPECIES	115	ENSGT00980000202953	ENSGT00940000156490	ENSGT00940000162011	ENSGT00940000163813	ENSGT00390000005939.a.b	ENSGT00940000165182	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000155218.A	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000163206.b	ENSGT00740000116961	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073
Neopterygii	ANCESTRAL SPECIES	49	ENSGT00390000001787	ENSGT00980000202953	ENSGT00940000156490.b.a	ENSGT00940000163813	ENSGT00390000005939.a.b	ENSGT00940000165182	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000155218.A	ENSGT00940000162118	ENSGT00940000163206.b	ENSGT00740000116961	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000160902	ENSGT00390000018730.A.e	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000155532	ENSGT00940000154897	ENSGT00510000046470.a.a.b	ENSGT00950000183021.a.b	ENSGT00940000159151	ENSGT00950000183029.C	ENSGT00390000007823	ENSGT00940000161109	ENSGT00940000156478	ENSGT00940000164502
Osteoglossocephalai	ANCESTRAL SPECIES	28		ENSGT00940000156245.b	ENSGT00390000001787	ENSGT00980000202953	ENSGT00940000156490.b.a	ENSGT00940000163813	ENSGT00390000005939.a.b.a	ENSGT00940000165182	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000155218.A.d	ENSGT00740000116961	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010.db	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000156010.eb	ENSGT00940000158073	ENSGT00940000160902.c.a	ENSGT00390000018730.A.f	ENSGT00940000160902.c.b	ENSGT00390000018730.A.e	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000155532	ENSGT00940000154897	ENSGT00510000046470.a.a.b	ENSGT00950000183021.a.b	ENSGT00940000156478	ENSGT00940000161109	ENSGT00390000007823
Clupeocephala	DUPLICATION
Clupeocephala	ANCESTRAL SPECIES	95	ENSGT00940000166464	ENSGT00390000013132.b.a	ENSGT00390000003721.d.a.g.a	ENSGT00940000156310.p	ENSGT01050000244841.A.b.b.b.a	ENSGT00390000018596.A.a.a	ENSGT01000000215056	ENSGT00940000158931	ENSGT00940000154857.yb.b	ENSGT00940000158489.a.b	ENSGT00950000183091.B.b	ENSGT00940000156490.b.b	ENSGT00390000005939.a.b.b	ENSGT00940000165182.d	ENSGT00940000155218.A.c	ENSGT00390000011620.a.a.b.e ##22	ENSGT00940000156010.eb	ENSGT00940000158073.b	ENSGT00940000160902.c.a	ENSGT00390000018730.A.f
Euteleosteomorpha	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00950000182835.c.d.c.a	ENSGT00940000154089.a.c	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000166464	ENSGT00940000165427	ENSGT00390000018596.A.a.a	ENSGT01000000215056	ENSGT00940000158931	ENSGT00940000154857.yb.b	ENSGT00940000158489.a.b	ENSGT00950000183091.B.b	ENSGT00940000156490.b.b	ENSGT00390000005939.a.b.b	ENSGT00940000165182.d	ENSGT00940000156010.eb	ENSGT00390000011620.a.a.b.e ##22	ENSGT00940000158073.b	ENSGT00940000177296	ENSGT00940000160902.c.a	ENSGT00390000018730.A.f	ENSGT00940000155532	ENSGT00940000154897.r	ENSGT00950000183021.a.b.d	ENSGT00940000161109	ENSGT00940000166926	ENSGT00940000164502.a.b	ENSGT00940000156477.d.a	ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b	ENSGT00940000160331	ENSGT00390000018330	ENSGT00940000163461.b
Protacanthopterygii	ANCESTRAL SPECIES	24		ENSGT00390000013132.b.a	ENSGT00390000003721.d.a.g.a	ENSGT00940000156310.p	ENSGT01050000244841.A.b.b.b.a	ENSGT00390000018596.A.a.a	ENSGT01000000215056	ENSGT00940000158931	ENSGT00940000154857.yb.b	ENSGT00940000158489.a.b	ENSGT00950000183091.B.b.c	ENSGT00940000156490.b.b	ENSGT00390000005939.a.b.b	ENSGT00940000165182.d	ENSGT00940000156010.eb	ENSGT00390000011620.a.a.b.e ##22	ENSGT00940000158073.b	ENSGT00940000177296	ENSGT00940000160902.c.a	ENSGT00390000018730.A.f	ENSGT00940000155532	ENSGT00940000154897.q	ENSGT00510000046470.a.a.b	ENSGT00950000183021.a.b.c	ENSGT00940000154897.r	ENSGT00950000183021.a.b.d	ENSGT00940000161109	ENSGT00940000166926	ENSGT00940000164502.a.b	ENSGT00940000156477.d.a	ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	103				ENSGT00390000003721.d.a.g.a.a	ENSGT00940000156310.p.d	ENSGT01050000244841.A.b.b.b.a.e	ENSGT00390000018596.A.a.a.h	ENSGT01000000215056.a	ENSGT00940000158931.k	ENSGT00940000154857.yb.b	ENSGT00940000158489.a.b.a	ENSGT00950000183091.B.b.c	ENSGT00940000156490.b.b.c	ENSGT00390000005939.a.b.b.d	ENSGT00940000165182.d.c	ENSGT00390000011620.a.a.b.e ##22	ENSGT00940000158073.b.g	ENSGT00940000177296	ENSGT00940000160902.c.a.b	ENSGT00390000018730.A.f.p.a	ENSGT00940000155532.vd.a	ENSGT00940000154897.r.d	ENSGT00950000183021.a.b.d.d	ENSGT00940000161109.n.b	ENSGT00940000166926.d	ENSGT00940000164502.a.b.d	ENSGT00940000156477.d.a.j	ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b.a.b	ENSGT00940000160331.f.b	ENSGT00390000018330.f.b	ENSGT00940000154681.b.d.c
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	29	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000166464.d	ENSGT00390000013132.b.a.d	ENSGT00390000003721.d.a.g.a.a	ENSGT00940000156310.p.d	ENSGT01050000244841.A.b.b.b.a.e	ENSGT00390000018596.A.a.a.h	ENSGT01000000215056.a	ENSGT00940000158931.k	ENSGT00940000154857.yb.b	ENSGT00940000158489.a.b.a	ENSGT00950000183091.B.b.c	ENSGT00940000156490.b.b.c	ENSGT00390000005939.a.b.b.d	ENSGT00940000165182.d.c	ENSGT00390000011620.a.a.b.e ##22	ENSGT00940000158073.b.g	ENSGT00940000177296	ENSGT00940000160902.c.a.b	ENSGT00390000018730.A.f.p.a	ENSGT00940000155532.vd.a.b.a	ENSGT00940000155532.vd.a.b.b	ENSGT00940000154897.r.d	ENSGT00950000183021.a.b.d.d	ENSGT00940000161109.n.b	ENSGT00940000166926.d	ENSGT00940000164502.a.b.d	ENSGT00940000156477.d.a.j	ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b.a.b	ENSGT00940000160331.f.b	ENSGT00390000018330.f.b
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	33	ENSGT00940000154089.a.c.h	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000166464.d	ENSGT00390000013132.b.a.d	ENSGT00390000003721.d.a.g.a.a	ENSGT00940000156310.p.d	ENSGT01050000244841.A.b.b.b.a.e	ENSGT00390000018596.A.a.a.h	ENSGT01000000215056.a	ENSGT00940000158931.k	ENSGT00940000154857.yb.b	ENSGT00940000158489.a.b.a	ENSGT00940000156490.b.b.c	ENSGT00390000005939.a.b.b.d	ENSGT00940000165182.d.c	ENSGT00390000011620.a.a.b.e ##22	ENSGT00940000158073.b.g	ENSGT00940000160902.c.a.b	ENSGT00390000018730.A.f.p.a	ENSGT00390000018730.A.f.p.b	ENSGT00940000155532.vd.a.a	ENSGT00940000155532.vd.a.b.b	ENSGT00940000154897.r.d	ENSGT00950000183021.a.b.d.d	ENSGT00940000161109.n.b	ENSGT00940000166926.d	ENSGT00940000164502.a.b.d	ENSGT00940000156477.d.a.j	ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b.a.b	ENSGT00940000160331.f.b	ENSGT00390000018330.f.b
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	3	ENSSSAG00000079996	pfkfb4a (ENSSSAG00000080031)	mapkapk3 (ENSSSAG00000120343)	ENSSSAG00000080363	ENSSSAG00000104861	s61a1 (ENSSSAG00000080810)	ENSSSAG00000084614	ENSSSAG00000109190	ENSSSAG00000088324	ENSSSAG00000080884	ENSSSAG00000080939	ENSSSAG00000081039	ENSSSAG00000102513	ENSSSAG00000081051	ENSSSAG00000087159	ENSSSAG00000081057 ##22	ENSSSAG00000081100	ENSSSAG00000081295	ENSSSAG00000081297	ENSSSAG00000111766	ENSSSAG00000081301	ENSSSAG00000004266	ENSSSAG00000004953	id1 (ENSSSAG00000004998)	sulf2a (ENSSSAG00000005047)	arhgap46a (ENSSSAG00000005505)	ENSSSAG00000005509	ndrg3a (ENSSSAG00000005546)	ENSSSAG00000005663	trpc4apa (ENSSSAG00000005687)	ENSSSAG00000088124
River trout	MODERN SPECIES	5	DNAH1 (ENSSTUG00000034096)	ENSSTUG00000033807	chchd4a (ENSSTUG00000030053)	SEC61A1 (ENSSTUG00000029598)	ip6k2a (ENSSTUG00000029574)	ENSSTUG00000029572	CIDEC (ENSSTUG00000029528)	ENSSTUG00000029517	uqcrc1 (ENSSTUG00000025251)	ENSSTUG00000025107	TTLL3 (ENSSTUG00000025056)	ENSSTUG00000025039	bmp7a (ENSSTUG00000025030)	ENSSTUG00000025018	ENSSTUG00000025009	TAF4 (ENSSTUG00000024908) ##22	cdh4 (ENSSTUG00000024471)	ENSSTUG00000024454	KCNK15 (ENSSTUG00000024440)	ENSSTUG00000024412	ENSSTUG00000024400	ENSSTUG00000024377	ENSSTUG00000024392	ZMYND8 (ENSSTUG00000019792)	NCOA3 (ENSSTUG00000019605)	id1 (ENSSTUG00000019588)	sulf2a (ENSSTUG00000018981)	arhgap46a (ENSSTUG00000018936)	ENSSTUG00000018894	ndrg3a (ENSSTUG00000018686)	ENSSTUG00000018631
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000166464.d	ENSGT00390000013132.b.a.d	ENSGT00390000003721.d.a.g.a.a	ENSGT00940000156310.p.d	ENSGT01050000244841.A.b.b.b.a.e	ENSGT00390000018596.A.a.a.h	ENSGT01000000215056.a	ENSGT00940000158931.k	ENSGT00940000154857.yb.b	ENSGT00940000158489.a.b.a	ENSGT00950000183091.B.b.c	ENSGT00940000156490.b.b.c	ENSGT00390000005939.a.b.b.d	ENSGT00940000165182.d.c	ENSGT00390000011620.a.a.b.e ##22	ENSGT00940000158073.b.g	ENSGT00940000177296	ENSGT00940000160902.c.a.b	ENSGT00390000018730.A.f.p.a	ENSGT00940000155532.vd.a.b.a	ENSGT00940000155532.vd.a.b.b	ENSGT00940000154897.r.d	ENSGT00950000183021.a.b.d.d	ENSGT00940000161109.n.b	ENSGT00940000166926.d	ENSGT00940000164502.a.b.d	ENSGT00940000156477.d.a.j	ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b.a.b	ENSGT00940000160331.f.b	ENSGT00390000018330.f.b
Rainbow trout	MODERN SPECIES	8	chchd4a (ENSOMYG00000043928)	ENSOMYG00000043931	ENSOMYG00000043959	ENSOMYG00000044147	ENSOMYG00000044148	ENSOMYG00000044153	ENSOMYG00000044159	ENSOMYG00000044179	ENSOMYG00000044488	RBM38 (ENSOMYG00000044496)	RAE1 (ENSOMYG00000044503)	BMP7 (ENSOMYG00000044505)	ENSOMYG00000063650	ENSOMYG00000076707	ENSOMYG00000044516	ENSOMYG00000044533 ##22	ENSOMYG00000044618	ENSOMYG00000065846	ENSOMYG00000044770	ENSOMYG00000044783	ENSOMYG00000061045	ENSOMYG00000044786	ENSOMYG00000007315	ENSOMYG00000008594	ID1C (ENSOMYG00000008617)	sulf2a (ENSOMYG00000008664)	arhgap46a (ENSOMYG00000008693)	ENSOMYG00000008739	ndrg3a (ENSOMYG00000010054)	trpc4apa (ENSOMYG00000015342)	snai1a (ENSOMYG00000016028)
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000166464.d	ENSGT00390000013132.b.a.d	ENSGT00390000003721.d.a.g.a.a	ENSGT00940000156310.p.d	ENSGT01050000244841.A.b.b.b.a.e	ENSGT00390000018596.A.a.a.h	ENSGT01000000215056.a	ENSGT00940000158931.k	ENSGT00940000154857.yb.b	ENSGT00940000158489.a.b.a	ENSGT00950000183091.B.b.c	ENSGT00940000156490.b.b.c	ENSGT00390000005939.a.b.b.d	ENSGT00940000165182.d.c	ENSGT00390000011620.a.a.b.e ##22	ENSGT00940000158073.b.g	ENSGT00940000160902.c.a.b	ENSGT00390000018730.A.f.p.a	ENSGT00940000155532.vd.a.b.a	ENSGT00940000154897.r.d	ENSGT00950000183021.a.b.d.d	ENSGT00940000161109.n.b	ENSGT00940000166926.d	ENSGT00940000164502.a.b.d	ENSGT00940000156477.d.a.j	ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b.a.b	ENSGT00940000160331.f.b	ENSGT00390000018330.f.b	ENSGT00940000154681.b.d.c	ENSGT00980000199461.b
Coho salmon	MODERN SPECIES		chchd4a (ENSOKIG00005017799)	SEC61A1 (ENSOKIG00005017474)	ENSOKIG00005017453	IP6K2 (ENSOKIG00005017446)	ENSOKIG00005017443	ENSOKIG00005017439	ENSOKIG00005017419	ENSOKIG00005017414	uqcrc1 (ENSOKIG00005013809)	TTLL3 (ENSOKIG00005013519)	RBM38 (ENSOKIG00005013496)	RAE1 (ENSOKIG00005013425)	BMP7 (ENSOKIG00005013410)	ENSOKIG00005013398	ENSOKIG00005013390	TAF4 (ENSOKIG00005013008) ##22	CDH4 (ENSOKIG00005012598)	KCNK15 (ENSOKIG00005012526)	ENSOKIG00005012510	ENSOKIG00005012459	ZMYND8 (ENSOKIG00005004939)	NCOA3 (ENSOKIG00005004526)	id1 (ENSOKIG00005004490)	sulf2a (ENSOKIG00005004206)	arhgap46a (ENSOKIG00005004149)	ENSOKIG00005004131	ndrg3a (ENSOKIG00005016490)	ENSOKIG00005016457	trpc4apa (ENSOKIG00005016395)	snai1a (ENSOKIG00005016381)	ENSOKIG00005016366
Chinook salmon	MODERN SPECIES	11	ENSOTSG00005017252	chchd4a (ENSOTSG00005017254)	SEC61A1 (ENSOTSG00005017265)	IP6K2 (ENSOTSG00005018228)	ENSOTSG00005018230	cidec (ENSOTSG00005018232)	ENSOTSG00005018233	uqcrc1 (ENSOTSG00005018265)	TTLL3 (ENSOTSG00005024119)	RBM38 (ENSOTSG00005024120)	rae1 (ENSOTSG00005024121)	bmp7a (ENSOTSG00005024122)	ENSOTSG00005024123	ENSOTSG00005024124	ENSOTSG00005024125	TAF4 (ENSOTSG00005024127) ##22	cdh4 (ENSOTSG00005024227)	ENSOTSG00005029555	ENSOTSG00005029557	ZMYND8 (ENSOTSG00005029575)	NCOA3 (ENSOTSG00005042192)	id1 (ENSOTSG00005042195)	sulf2a (ENSOTSG00005042198)	arhgap46a (ENSOTSG00005042201)	ENSOTSG00005042203	ndrg3a (ENSOTSG00005042210)	ENSOTSG00005042216	trpc4apa (ENSOTSG00005042217)	snai1a (ENSOTSG00005042218)	ENSOTSG00005042220	GGT7 (ENSOTSG00005042221)
Huchen	MODERN SPECIES	625				SEC61A1 (ENSHHUG00000043092)	ip6k2a (ENSHHUG00000043206)	ENSHHUG00000043209	ENSHHUG00000043210	ENSHHUG00000043212	ENSHHUG00000043213	uqcrc1 (ENSHHUG00000043221)	TTLL3 (ENSHHUG00000043288)	ENSHHUG00000043300	bmp7a (ENSHHUG00000043309)	ENSHHUG00000043332	LSM14B (ENSHHUG00000043335)	TAF4 (ENSHHUG00000043348) ##22	ENSHHUG00000043443	cdh4 (ENSHHUG00000043456)
Northern pike	MODERN SPECIES	16	ENSELUG00000006181	chchd4a (ENSELUG00000006166)	SEC61A1 (ENSELUG00000006142)	ip6k2a (ENSELUG00000006086)	ENSELUG00000025158	ENSELUG00000006029	cidec (ENSELUG00000006000)	ENSELUG00000005948	uqcrc1 (ENSELUG00000005895)	RBM38 (ENSELUG00000005849)	rae1 (ENSELUG00000005833)	bmp7a (ENSELUG00000005817)	ENSELUG00000005806	ENSELUG00000005799	LSM14B (ENSELUG00000005780)	TAF4 (ENSELUG00000005741) ##22	cdh4 (ENSELUG00000005693)	KCNK15 (ENSELUG00000000159)	ENSELUG00000031326	ENSELUG00000005607	ENSELUG00000033279	ZMYND8 (ENSELUG00000005483)	ENSELUG00000005397	id1 (ENSELUG00000005365)	sulf2a (ENSELUG00000005287)	arhgap46a (ENSELUG00000005147)	ENSELUG00000005071	ndrg3a (ENSELUG00000004982)	SLA2 (ENSELUG00000004947)	trpc4apa (ENSELUG00000004927)	myh7ba (ENSELUG00000004892)
Acanthomorphata	ANCESTRAL SPECIES	42									ENSGT00940000158489.a.b	ENSGT00950000183091.B.b	ENSGT00940000156490.b.b	ENSGT00390000005939.a.b.b	ENSGT00940000165182.d	ENSGT00940000155218.A.c	ENSGT00940000156010.eb	ENSGT00390000011620.a.a.b.e ##22	ENSGT00940000158073.b	ENSGT00940000177296	ENSGT00940000160902.c.a	ENSGT00390000018730.A.f	ENSGT00940000154897.r	ENSGT00950000183021.a.b.d	ENSGT00940000161109	ENSGT00940000166926	ENSGT00940000164502.a.b	ENSGT00940000156477.d.a	ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b	ENSGT00940000160331	ENSGT00390000018330	ENSGT00940000163461.b	ENSGT00940000160318.c.b
Euacanthomorphacea	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000166464	ENSGT00940000174829	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000154089.a.c	ENSGT00950000182835.c.d.c.a	ENSGT00390000016233.e.a	ENSGT00390000008947	ENSGT00940000156245.b	ENSGT00940000158489.a.b	ENSGT00950000183091.B.b	ENSGT00940000156490.b.b	ENSGT00390000005939.a.b.b	ENSGT00940000165182.d	ENSGT00940000155218.A.c	ENSGT00940000156010.eb	ENSGT00390000011620.a.a.b.e ##22	ENSGT00940000158073.b	ENSGT00940000177296	ENSGT00940000160902.c.a	ENSGT00390000018730.A.f	ENSGT00940000154897.r	ENSGT00950000183021.a.b.d	ENSGT00940000161109	ENSGT00940000166926	ENSGT00940000164502.a.b	ENSGT00940000156477.d.a	ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b	ENSGT00940000160331	ENSGT00390000018330	ENSGT00940000163461.b	ENSGT00940000160318.c.b
Percomorphaceae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000013132.b.a	ENSGT00940000166464	ENSGT00940000174829	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000154089.a.c	ENSGT00950000182835.c.d.c.a	ENSGT00390000016233.e.a	ENSGT00390000008947	ENSGT00940000158489.a.b	ENSGT00950000183091.B.b	ENSGT00940000156490.b.b	ENSGT00390000005939.a.b.b	ENSGT00940000165182.d	ENSGT00940000155218.A.c	ENSGT00940000156010.eb	ENSGT00390000011620.a.a.b.e ##22	ENSGT00940000158073.b	ENSGT00940000177296	ENSGT00940000160902.c.a	ENSGT00390000018730.A.f	ENSGT00940000154897.r	ENSGT00950000183021.a.b.d	ENSGT00940000161109	ENSGT00940000166926	ENSGT00940000164502.a.b	ENSGT00940000156477.d.a	ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b	ENSGT00940000160331	ENSGT00390000018330	ENSGT00940000163461.b	ENSGT00940000160318.c.b
Tiger tail seahorse	MODERN SPECIES	510						ENSHCOG00000005676	ZMYND8 (ENSHCOG00000005670)	ARPC4 (ENSHCOG00000005642)	tada3l (ENSHCOG00000005625)	RBM38 (ENSHCOG00000005622)	rae1 (ENSHCOG00000005616)	BMP7 (ENSHCOG00000005555)	ENSHCOG00000004876	LSM14B (ENSHCOG00000004867)	ENSHCOG00000004862	ENSHCOG00000004847 ##22	cdh4 (ENSHCOG00000004825)	ENSHCOG00000004773	slc25a26 (ENSHCOG00000004718)	ENSHCOG00000004706	LRIG1 (ENSHCOG00000004691)	kbtbd8 (ENSHCOG00000004650)	ENSHCOG00000004623	suclg2 (ENSHCOG00000004615)	ENSHCOG00000004607	tafa4b (ENSHCOG00000004598)	EOGT (ENSHCOG00000004579)	tmf1 (ENSHCOG00000004533)	ENSHCOG00000000829	PRKCD (ENSHCOG00000004336)
Percomorphaceae_B	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00390000013132.b.a	ENSGT00940000166464	ENSGT00940000174829	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000154089.a.c	ENSGT00950000182835.c.d.c.a	ENSGT00390000016233.e.a	ENSGT00390000008947	ENSGT00940000158489.a.b	ENSGT00950000183091.B.b	ENSGT00940000156490.b.b	ENSGT00390000005939.a.b.b	ENSGT00940000165182.d	ENSGT00940000155218.A.c	ENSGT00940000156010.eb	ENSGT00390000011620.a.a.b.e ##22	ENSGT00940000158073.b	ENSGT00940000177296	ENSGT00940000160902.c.a	ENSGT00390000018730.A.f	ENSGT00940000154897.r	ENSGT00950000183021.a.b.d	ENSGT00940000161109	ENSGT00940000166926	ENSGT00940000164502.a.b	ENSGT00940000156477.d.a	ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b	ENSGT00940000160331	ENSGT00390000018330	ENSGT00940000160318.c.b	ENSGT00940000154681.b.d
Ovalentaria	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000013132.b.a	ENSGT00940000166464	ENSGT00940000174829	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000154089.a.c	ENSGT00950000182835.c.d.c.a	ENSGT00390000016233.e.a	ENSGT00390000008947	ENSGT00940000158489.a.b	ENSGT00950000183091.B.b	ENSGT00940000156490.b.b	ENSGT00390000005939.a.b.b	ENSGT00940000165182.d	ENSGT00940000155218.A.c	ENSGT00940000156010.eb	ENSGT00390000011620.a.a.b.e ##22	ENSGT00940000158073.b	ENSGT00940000177296	ENSGT00940000160902.c.a	ENSGT00390000018730.A.f	ENSGT00940000154897.r	ENSGT00950000183021.a.b.d	ENSGT00940000161109	ENSGT00940000166926	ENSGT00940000164502.a.b	ENSGT00940000156477.d.a	ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b	ENSGT00940000160331	ENSGT00390000018330	ENSGT00940000160318.c.b	ENSGT00940000154681.b.d
Ovalentaria_B	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00390000003721.d.a.g.a	ENSGT00390000013132.b.a	ENSGT00940000166464	ENSGT00940000174829	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000154089.a.c	ENSGT00950000182835.c.d.c.a	ENSGT00390000016233.e.a	ENSGT00390000008947	ENSGT00940000158489.a.b	ENSGT00950000183091.B.b	ENSGT00940000156490.b.b	ENSGT00940000165182.d	ENSGT00940000155218.A.c	ENSGT00940000156010.eb	ENSGT00390000011620.a.a.b.e ##22	ENSGT00940000158073.b	ENSGT00940000177296	ENSGT00940000160902.c.a	ENSGT00390000018730.A.f	ENSGT00940000154897.r	ENSGT00950000183021.a.b.d	ENSGT00940000161109	ENSGT00940000166926	ENSGT00940000164502.a.b	ENSGT00940000156477.d.a	ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b	ENSGT00940000160331	ENSGT00390000018330	ENSGT00940000160318.c.b	ENSGT00940000154681.b.d
Pomacentridae	ANCESTRAL SPECIES	33	ENSGT00940000164411	ENSGT00940000160486.d	ENSGT00940000158405	ENSGT00950000182893.a.a.b.b	ENSGT00940000155006.e.a	ENSGT00940000154089.a.c	ENSGT00950000182835.c.d.c.a	ENSGT00390000016233.e.a	ENSGT00390000008947	ENSGT00940000158489.a.b	ENSGT00950000183091.B.b	ENSGT00940000156490.b.b	ENSGT00940000165182.d	ENSGT00940000155218.A.c	ENSGT00940000156010.eb	ENSGT00390000011620.a.a.b.e ##22	ENSGT00940000158073.b	ENSGT00940000177296	ENSGT00940000160902.c.a	ENSGT00390000018730.A.f	ENSGT00940000154897.r	ENSGT00950000183021.a.b.d	ENSGT00940000161109	ENSGT00940000166926	ENSGT00940000164502.a.b	ENSGT00940000156477.d.a	ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b	ENSGT00940000160331	ENSGT00390000018330	ENSGT00940000160318.c.b	ENSGT00940000154681.b.d
Pomacentridae_A	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000164411	ENSGT00940000160486.d	ENSGT00940000158405	ENSGT00950000182893.a.a.b.b	ENSGT00940000155006.e.a	ENSGT00940000154089.a.c	ENSGT00950000182835.c.d.c.a	ENSGT00390000016233.e.a	ENSGT00390000008947	ENSGT00940000158489.a.b	ENSGT00950000183091.B.b	ENSGT00940000156490.b.b	ENSGT00940000165182.d	ENSGT00940000155218.A.c	ENSGT00940000156010.eb	ENSGT00390000011620.a.a.b.e ##22	ENSGT00940000158073.b	ENSGT00940000177296	ENSGT00940000160902.c.a	ENSGT00390000018730.A.f	ENSGT00940000154897.r	ENSGT00950000183021.a.b.d	ENSGT00940000161109	ENSGT00940000166926	ENSGT00940000164502.a.b	ENSGT00940000156477.d.a	ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b	ENSGT00940000160331	ENSGT00390000018330	ENSGT00940000160318.c.b	ENSGT00940000154681.b.d
Amphiprion	ANCESTRAL SPECIES	38	ENSGT00940000164411	ENSGT00940000160486.d	ENSGT00940000158405	ENSGT00950000182893.a.a.b.b	ENSGT00940000155006.e.a	ENSGT00940000154089.a.c	ENSGT00950000182835.c.d.c.a	ENSGT00390000016233.e.a	ENSGT00390000008947	ENSGT00940000158489.a.b	ENSGT00950000183091.B.b	ENSGT00940000156490.b.b	ENSGT00940000165182.d	ENSGT00940000155218.A.c	ENSGT00940000156010.eb	ENSGT00390000011620.a.a.b.e ##22	ENSGT00940000158073.b	ENSGT00940000160902.c.a	ENSGT00390000018730.A.f	ENSGT00940000154897.r	ENSGT00950000183021.a.b.d	ENSGT00940000161109	ENSGT00940000166926	ENSGT00940000164502.a.b	ENSGT00940000156477.d.a	ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b	ENSGT00940000160331	ENSGT00390000018330	ENSGT00940000160318.c.b	ENSGT00940000154681.b.d	ENSGT00940000156917.b
Orange clownfish	MODERN SPECIES	20	ENSAPEG00000023397	MAFB (ENSAPEG00000023407)	fam83d (ENSAPEG00000023418)	ENSAPEG00000023431	top1a (ENSAPEG00000023452)	MAPKAPK3 (ENSAPEG00000023504)	pfkfb4a (ENSAPEG00000023519)	arpc4 (ENSAPEG00000023544)	tada3l (ENSAPEG00000023555)	RBM38 (ENSAPEG00000023581)	rae1 (ENSAPEG00000023589)	bmp7a (ENSAPEG00000023610)	ENSAPEG00000023619	ENSAPEG00000023624	LSM14B (ENSAPEG00000023633)	ENSAPEG00000023671 ##22	cdh4 (ENSAPEG00000023708)	ENSAPEG00000023796	ogfr2 (ENSAPEG00000023804)	ENSAPEG00000023815	ZMYND8 (ENSAPEG00000023865)	NCOA3 (ENSAPEG00000024040)	id1 (ENSAPEG00000024079)	sulf2a (ENSAPEG00000024100)	arhgap46a (ENSAPEG00000024124)	PHF20 (ENSAPEG00000024148)	ndrg3a (ENSAPEG00000024175)	ENSAPEG00000024204	trpc4apa (ENSAPEG00000024210)	myh7ba (ENSAPEG00000024252)	snai1a (ENSAPEG00000024286)
Clown anemonefish	MODERN SPECIES	1068										RBM38 (ENSAOCG00000012559)	rae1 (ENSAOCG00000012519)	bmp7a (ENSAOCG00000012469)	ENSAOCG00000012441	ENSAOCG00000012394	LSM14B (ENSAOCG00000012380)	ENSAOCG00000012362 ##22
Spiny chromis	MODERN SPECIES	2429												bmp7a (ENSAPOG00000001722)	ENSAPOG00000001734	ENSAPOG00000001769	ENSAPOG00000001780	ENSAPOG00000001831 ##22
Bicolor damselfish	MODERN SPECIES	1122	adnpa (ENSSPAG00000021247)	ENSSPAG00000021221	MAFB (ENSSPAG00000021215)	fam83d (ENSSPAG00000021210)	ENSSPAG00000021203	top1a (ENSSPAG00000021140)	ENSSPAG00000021102	PFKFB4 (ENSSPAG00000021065)	ARPC4 (ENSSPAG00000021038)	tada3l (ENSSPAG00000021006)	RBM38 (ENSSPAG00000020989)	rae1 (ENSSPAG00000020972)	bmp7a (ENSSPAG00000020958)	ENSSPAG00000020949	ENSSPAG00000020915	ENSSPAG00000020887 ##22
Cichlidae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000003721.d.a.g.a	ENSGT00390000013132.b.a	ENSGT00940000166464	ENSGT00940000174829	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000154089.a.c	ENSGT00950000182835.c.d.c.a	ENSGT00390000016233.e.a	ENSGT00390000008947	ENSGT00940000158489.a.b	ENSGT00950000183091.B.b	ENSGT00940000156490.b.b	ENSGT00940000165182.d	ENSGT00940000155218.A.c	ENSGT00940000156010.eb	ENSGT00390000011620.a.a.b.e ##22	ENSGT00940000158073.b	ENSGT00940000177296	ENSGT00940000160902.c.a	ENSGT00390000018730.A.f	ENSGT00940000154897.r	ENSGT00950000183021.a.b.d	ENSGT00940000161109	ENSGT00940000166926	ENSGT00940000164502.a.b	ENSGT00940000156477.d.a	ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b	ENSGT00940000160331	ENSGT00390000018330	ENSGT00940000160318.c.b	ENSGT00940000154681.b.d
Pseudocrenilabrinae	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000003721.d.a.g.a	ENSGT00390000013132.b.a	ENSGT00940000166464	ENSGT00940000174829	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000154089.a.c	ENSGT00950000182835.c.d.c.a	ENSGT00390000016233.e.a	ENSGT00390000008947	ENSGT00940000158489.a.b	ENSGT00950000183091.B.b	ENSGT00940000156490.b.b	ENSGT00940000165182.d	ENSGT00940000155218.A.c	ENSGT00940000156010.eb	ENSGT00390000011620.a.a.b.e ##22	ENSGT00940000158073.b	ENSGT00940000177296	ENSGT00940000160902.c.a	ENSGT00390000018730.A.f	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000155532	ENSGT00940000154897.r	ENSGT00950000183021.a.b.d	ENSGT00940000161109	ENSGT00940000166926	ENSGT00940000164502.a.b	ENSGT00940000156477.d.a	ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b.f	ENSGT00940000160331
Pseudocrenilabrinae_A	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000003721.d.a.g.a	ENSGT00390000013132.b.a	ENSGT00940000166464	ENSGT00940000174829	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000154089.a.c	ENSGT00950000182835.c.d.c.a	ENSGT00390000016233.e.a	ENSGT00390000008947	ENSGT00940000158489.a.b	ENSGT00950000183091.B.b	ENSGT00940000156490.b.b	ENSGT00940000165182.d	ENSGT00940000155218.A.c	ENSGT00940000156010.eb	ENSGT00390000011620.a.a.b.e ##22	ENSGT00940000158073.b	ENSGT00940000177296	ENSGT00940000160902.c.a	ENSGT00390000018730.A.f	ENSGT00940000155532	ENSGT00940000154897.r	ENSGT00950000183021.a.b.d	ENSGT00940000161109	ENSGT00940000166926	ENSGT00940000164502.a.b	ENSGT00940000156477.d.a	ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b.f	ENSGT00940000160331	ENSGT00390000018330	ENSGT00940000160318.c.b
Haplochromini	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000003721.d.a.g.a	ENSGT00390000013132.b.a	ENSGT00940000166464	ENSGT00940000174829	ENSGT00940000154791.sb.a	ENSGT00940000154089.a.c	ENSGT00950000182835.c.d.c.a	ENSGT00390000016233.e.a	ENSGT00390000008947	ENSGT00940000158489.a.b	ENSGT00950000183091.B.b	ENSGT00940000156490.b.b	ENSGT00940000165182.d	ENSGT00940000155218.A.c	ENSGT00940000156010.eb	ENSGT00390000011620.a.a.b.e ##22	ENSGT00940000158073.b	ENSGT00940000177296	ENSGT00940000160902.c.a	ENSGT00390000018730.A.f.l	ENSGT00940000154897.r	ENSGT00950000183021.a.b.d	ENSGT00940000161109	ENSGT00940000166926	ENSGT00940000164502.a.b	ENSGT00940000156477.d.a	ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b.f	ENSGT00940000160331	ENSGT00390000018330	ENSGT00940000160318.c.b	ENSGT00940000154681.b.d
Haplochromini_A	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000003721.d.a.g.a	ENSGT00390000013132.b.a	ENSGT00940000166464	ENSGT00940000174829	ENSGT00940000154791.sb.a	ENSGT00940000154089.a.c	ENSGT00950000182835.c.d.c.a	ENSGT00390000016233.e.a	ENSGT00390000008947	ENSGT00940000158489.a.b	ENSGT00950000183091.B.b	ENSGT00940000156490.b.b	ENSGT00940000165182.d	ENSGT00940000155218.A.c	ENSGT00940000156010.eb	ENSGT00390000011620.a.a.b.e ##22	ENSGT00940000158073.b	ENSGT00940000177296	ENSGT00940000160902.c.a	ENSGT00390000018730.A.f.l	ENSGT00940000154897.r	ENSGT00950000183021.a.b.d	ENSGT00940000161109	ENSGT00940000166926	ENSGT00940000164502.a.b	ENSGT00940000156477.d.a	ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b.f	ENSGT00940000160331	ENSGT00390000018330	ENSGT00940000160318.c.b	ENSGT00940000154681.b.d
Haplochromini_B	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000013132.b.a	ENSGT00940000166464	ENSGT00940000174829	ENSGT00940000154791.sb.a	ENSGT00940000154791.rb	ENSGT00940000154089.a.c	ENSGT00950000182835.c.d.c.a	ENSGT00390000016233.e.a	ENSGT00390000008947	ENSGT00940000158489.a.b	ENSGT00950000183091.B.b	ENSGT00940000156490.b.b	ENSGT00940000165182.d	ENSGT00940000155218.A.c	ENSGT00940000156010.eb	ENSGT00390000011620.a.a.b.e ##22	ENSGT00940000158073.b	ENSGT00940000177296	ENSGT00940000160902.c.a	ENSGT00390000018730.A.f.k.b	ENSGT00390000018730.A.f.k.a	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000155532	ENSGT00940000154897.r	ENSGT00950000183021.a.b.d	ENSGT00940000161109	ENSGT00940000166926	ENSGT00940000164502.a.b	ENSGT00940000156477.d.a	ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b.f
Zebra mbuna	MODERN SPECIES	93						ENSMZEG00005000673	mapkapk3 (ENSMZEG00005000733)	pfkfb4a (ENSMZEG00005000751)	ARPC4 (ENSMZEG00005000783)	tada3l (ENSMZEG00005000816)	RBM38 (ENSMZEG00005000849)	rae1 (ENSMZEG00005000880)	bmp7a (ENSMZEG00005000945)	ENSMZEG00005000975	LSM14B (ENSMZEG00005000987)	ENSMZEG00005000993 ##22	cdh4 (ENSMZEG00005001019)
Eastern happy	MODERN SPECIES	17	ENSACLG00000019127	ENSACLG00000019141	ENSACLG00000019156	ENSACLG00000019168	mapkapk3 (ENSACLG00000019207)	pfkfb4a (ENSACLG00000019236)	ARPC4 (ENSACLG00000019398)	tada3l (ENSACLG00000019436)	RBM38 (ENSACLG00000019514)	rae1 (ENSACLG00000019520)	bmp7a (ENSACLG00000019566)	ENSACLG00000019616	LSM14B (ENSACLG00000019624)	ENSACLG00000019631	LSM14B (ENSACLG00000019663)	ENSACLG00000019690 ##22	cdh4 (ENSACLG00000019714)	ENSACLG00000019811	ENSACLG00000019821	ENSACLG00000019829	ENSACLG00000019836	ENSACLG00000019845	ENSACLG00000019857	ENSACLG00000019879	ENSACLG00000019909	ZMYND8 (ENSACLG00000019966)	NCOA3 (ENSACLG00000020201)	id1 (ENSACLG00000020258)	sulf2a (ENSACLG00000020278)	arhgap46a (ENSACLG00000020479)	PHF20 (ENSACLG00000020535)
P. nyererei	MODERN SPECIES	473	chchd4a (ENSPNYG00000020167)	ENSPNYG00000020093	ENSPNYG00000020061	ENSPNYG00000020041	ENSPNYG00000020012	mapkapk3 (ENSPNYG00000019975)	pfkfb4a (ENSPNYG00000019923)	arpc4 (ENSPNYG00000019887)	tada3l (ENSPNYG00000019850)	RBM38 (ENSPNYG00000019727)	rae1 (ENSPNYG00000019671)	bmp7a (ENSPNYG00000019640)	ENSPNYG00000019630	ENSPNYG00000019619	ENSPNYG00000019601	ENSPNYG00000019582 ##22	cdh4 (ENSPNYG00000019555)	ENSPNYG00000019535	ENSPNYG00000019519	ENSPNYG00000019502	ENSPNYG00000019471	ENSPNYG00000019467	ENSPNYG00000019459	ZMYND8 (ENSPNYG00000019367)	NCOA3 (ENSPNYG00000019315)	id1 (ENSPNYG00000019305)	sulf2a (ENSPNYG00000019254)	arhgap46a (ENSPNYG00000019205)	PHF20 (ENSPNYG00000019175)	ndrg3a (ENSPNYG00000019122)	ENSPNYG00000019096
Burton s mouthbrooder	MODERN SPECIES	279	ENSHBUG00000011506	ENSHBUG00000011529	ENSHBUG00000011544	ENSHBUG00000011568	ENSHBUG00000011611	mapkapk3 (ENSHBUG00000011621)	pfkfb4a (ENSHBUG00000011691)	arpc4 (ENSHBUG00000011724)	tada3l (ENSHBUG00000011757)	RBM38 (ENSHBUG00000011778)	rae1 (ENSHBUG00000011788)	bmp7a (ENSHBUG00000011813)	ENSHBUG00000011818	ENSHBUG00000011850	ENSHBUG00000011864	ENSHBUG00000011873 ##22	cdh4 (ENSHBUG00000011974)	ENSHBUG00000011989	ogfr2 (ENSHBUG00000012008)	ENSHBUG00000012037	ENSHBUG00000012047	ZMYND8 (ENSHBUG00000012749)	NCOA3 (ENSHBUG00000012914)	id1 (ENSHBUG00000012928)	sulf2a (ENSHBUG00000013122)	arhgap46a (ENSHBUG00000013204)	PHF20 (ENSHBUG00000013233)	ndrg3a (ENSHBUG00000013277)	ENSHBUG00000013299	ENSHBUG00000013313	trpc4apa (ENSHBUG00000013367)
Lyretail cichlid	MODERN SPECIES	296	ip6k2a (ENSNBRG00000022225)	SEC61A1 (ENSNBRG00000022251)	chchd4a (ENSNBRG00000022279)	ENSNBRG00000022298	DNAH1 (ENSNBRG00000022360)	mapkapk3 (ENSNBRG00000022459)	pfkfb4a (ENSNBRG00000022474)	arpc4 (ENSNBRG00000022499)	tada3l (ENSNBRG00000022521)	RBM38 (ENSNBRG00000022545)	rae1 (ENSNBRG00000022557)	bmp7a (ENSNBRG00000022577)	ENSNBRG00000022586	ENSNBRG00000022596	ENSNBRG00000022606	ENSNBRG00000022625 ##22	cdh4 (ENSNBRG00000022687)	ENSNBRG00000022708	ENSNBRG00000022733	ogfr2 (ENSNBRG00000022773)	ENSNBRG00000022778	ENSNBRG00000022786	ZMYND8 (ENSNBRG00000022800)	NCOA3 (ENSNBRG00000022831)	id1 (ENSNBRG00000022856)	sulf2a (ENSNBRG00000022867)	arhgap46a (ENSNBRG00000022903)	PHF20 (ENSNBRG00000022942)	ndrg3a (ENSNBRG00000022974)	SLA2 (ENSNBRG00000023001)	trpc4apa (ENSNBRG00000023021)
Nile tilapia	MODERN SPECIES	17	ENSONIG00000035329	ip6k2a (ENSONIG00000037204)	SEC61A1 (ENSONIG00000020330)	chchd4a (ENSONIG00000028449)	ENSONIG00000020329	mapkapk3 (ENSONIG00000029677)	pfkfb4a (ENSONIG00000020327)	arpc4 (ENSONIG00000039568)	tada3l (ENSONIG00000020325)	RBM38 (ENSONIG00000020324)	rae1 (ENSONIG00000020323)	bmp7a (ENSONIG00000031028)	ENSONIG00000020321	ENSONIG00000020319	LSM14B (ENSONIG00000020318)	ENSONIG00000020317 ##22	cdh4 (ENSONIG00000020316)	ENSONIG00000032490	ENSONIG00000029288	ENSONIG00000038101	ENSONIG00000020315	ZMYND8 (ENSONIG00000020314)	NCOA3 (ENSONIG00000020313)	id1 (ENSONIG00000040265)	sulf2a (ENSONIG00000020311)	arhgap46a (ENSONIG00000020310)	PHF20 (ENSONIG00000020309)	ndrg3a (ENSONIG00000020308)	ENSONIG00000038267	trpc4apa (ENSONIG00000020307)	myh7ba (ENSONIG00000020306)
Midas cichlid	MODERN SPECIES	1043	SEC61A1 (ENSACIG00000013257)	chchd4a (ENSACIG00000013246)	ENSACIG00000013194	DNAH1 (ENSACIG00000013027)	mapkapk3 (ENSACIG00000012743)	pfkfb4a (ENSACIG00000012682)	ARPC4 (ENSACIG00000012667)	tada3l (ENSACIG00000012641)	RBM38 (ENSACIG00000012502)	rae1 (ENSACIG00000012474)	bmp7a (ENSACIG00000012446)	ENSACIG00000012413	ENSACIG00000012389	ENSACIG00000012314	LSM14B (ENSACIG00000012266)	TAF4 (ENSACIG00000012238) ##22	cdh4 (ENSACIG00000012125)	ENSACIG00000012101	ogfr2 (ENSACIG00000012087)	ENSACIG00000012081	ENSACIG00000012057	ZMYND8 (ENSACIG00000012003)	NCOA3 (ENSACIG00000011947)	id1 (ENSACIG00000011866)	sulf2a (ENSACIG00000011829)	arhgap46a (ENSACIG00000011796)	PHF20 (ENSACIG00000011707)	ndrg3a (ENSACIG00000011670)	ENSACIG00000011644	trpc4apa (ENSACIG00000011610)	ENSACIG00000011366
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Platyfish	MODERN SPECIES	12	ENSXMAG00000010223	ENSXMAG00000027752	ENSXMAG00000029051	ENSXMAG00000028173	ENSXMAG00000010195	mapkapk3 (ENSXMAG00000010191)	pfkfb4a (ENSXMAG00000010108)	arpc4 (ENSXMAG00000010093)	tada3l (ENSXMAG00000010075)	ENSXMAG00000028579	rae1 (ENSXMAG00000010051)	bmp7a (ENSXMAG00000010031)	ENSXMAG00000010028	ENSXMAG00000010019	ENSXMAG00000010013	ENSXMAG00000010003 ##22	KLHL10 (ENSXMAG00000009983)	ENSXMAG00000025212	ENSXMAG00000026588	ENSXMAG00000026384	cdh4 (ENSXMAG00000009921)	KCNK15 (ENSXMAG00000027413)	ENSXMAG00000009909	ENSXMAG00000009898	ZMYND8 (ENSXMAG00000009815)	NCOA3 (ENSXMAG00000001970)	id1 (ENSXMAG00000027482)	sulf2a (ENSXMAG00000026216)	ENSXMAG00000025875	arhgap46a (ENSXMAG00000009796)	ENSXMAG00000009778
NAME_4	ANCESTRAL SPECIES	96	ENSGT00940000156310.p	ENSGT00390000003721.d.a.g.a	ENSGT00390000013132.b.a	ENSGT00940000166464	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000154089.a.c	ENSGT00950000182835.c.d.c.a	ENSGT00390000016233.e.a	ENSGT00390000008947	ENSGT00940000158489.a.b	ENSGT00950000183091.B.b	ENSGT00940000156490.b.b	ENSGT00940000165182.d	ENSGT00940000155218.A.c	ENSGT00940000156010.eb	ENSGT00390000011620.a.a.b.e ##22	ENSGT00940000158073.b	ENSGT00940000177296
Mummichog	MODERN SPECIES	2193	SEC61A1 (ENSFHEG00000005808)	chchd4a (ENSFHEG00000005818)	ENSFHEG00000000153	ENSFHEG00000005843	ENSFHEG00000005957	mapkapk3 (ENSFHEG00000005970)	pfkfb4a (ENSFHEG00000006050)	ARPC4 (ENSFHEG00000006069)	tada3l (ENSFHEG00000006115)	RBM38 (ENSFHEG00000006160)	rae1 (ENSFHEG00000006179)	bmp7a (ENSFHEG00000006206)	ENSFHEG00000000168	ENSFHEG00000006228	LSM14B (ENSFHEG00000006237)	TAF4 (ENSFHEG00000006248) ##22	ENSFHEG00000006261	cdh4 (ENSFHEG00000006543)	ENSFHEG00000006572
Sheepshead minnow	DUPLICATION
Sheepshead minnow	MODERN SPECIES	690																ENSCVAG00000021140 ##22	cdh4 (ENSCVAG00000021193)
Sheepshead minnow	MODERN SPECIES	1288						ENSCVAG00000005291	pfkfb4a (ENSCVAG00000000972)	arpc4 (ENSCVAG00000005409)	tada3l (ENSCVAG00000005465)	RBM38 (ENSCVAG00000005472)	rae1 (ENSCVAG00000005499)	bmp7a (ENSCVAG00000000160)	ENSCVAG00000005527	ENSCVAG00000005549	ENSCVAG00000005570	ENSCVAG00000005577 ##22
Oryzias	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00620000088018	ENSGT00390000014109	ENSGT00530000065109	ENSGT00510000048121	ENSGT00940000154089.a.c	ENSGT00950000182835.c.d.c.a	ENSGT00390000016233.e.a	ENSGT00390000008947	ENSGT00940000158489.a.b	ENSGT00950000183091.B.b	ENSGT00940000156490.b.b	ENSGT00390000005939.a.b.b	ENSGT00940000165182.d	ENSGT00940000155218.A.c	ENSGT00940000156010.eb	ENSGT00390000011620.a.a.b.e ##22	ENSGT00940000158073.b	ENSGT00940000177296	ENSGT00940000154897.r	ENSGT00950000183021.a.b.d	ENSGT00940000161109	ENSGT00940000166926	ENSGT00940000164502.a.b	ENSGT00940000156477.d.a	ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b	ENSGT00940000160331	ENSGT00390000018330	ENSGT00940000154681.b.d	ENSGT00940000156917.b	ENSGT00390000018123.b	ENSGT00940000155006.e.a
Oryzias_a	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00620000088018	ENSGT00390000014109	ENSGT00530000065109	ENSGT00510000048121	ENSGT00940000154089.a.c	ENSGT00950000182835.c.d.c.a	ENSGT00390000016233.e.a	ENSGT00390000008947	ENSGT00940000158489.a.b	ENSGT00950000183091.B.b	ENSGT00940000156490.b.b	ENSGT00390000005939.a.b.b	ENSGT00940000165182.d	ENSGT00940000155218.A.c	ENSGT00940000156010.eb	ENSGT00390000011620.a.a.b.e ##22	ENSGT00940000158073.b	ENSGT00940000177296	ENSGT00940000154897.r	ENSGT00950000183021.a.b.d	ENSGT00940000161109	ENSGT00940000166926	ENSGT00940000164502.a.b	ENSGT00940000156477.d.a	ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b	ENSGT00940000160331	ENSGT00390000018330	ENSGT00940000154681.b.d	ENSGT00940000156917.b	ENSGT00390000018123.b	ENSGT00940000155006.e.a
Japanese Medaka HdrR	MODERN SPECIES	19	ENSORLG00000013213	CFAP57 (ENSORLG00000013222)	isy1 (ENSORLG00000013250)	HTD2 (ENSORLG00000013267)	RPP14 (ENSORLG00000028025)	ENSORLG00000013296	pfkfb4a (ENSORLG00000013355)	arpc4 (ENSORLG00000001339)	tada3l (ENSORLG00000013394)	RBM38 (ENSORLG00000027180)	rae1 (ENSORLG00000013438)	bmp7a (ENSORLG00000013494)	ENSORLG00000027733	ENSORLG00000026420	LSM14B (ENSORLG00000013525)	ENSORLG00000013539 ##22	cdh4 (ENSORLG00000013559)	ENSORLG00000026944	ENSORLG00000022878	ENSORLG00000013611	ENSORLG00000013704	id1 (ENSORLG00000013719)	sulf2a (ENSORLG00000013752)	arhgap46a (ENSORLG00000013769)	PHF20 (ENSORLG00000013802)	ndrg3a (ENSORLG00000013821)	ENSORLG00000013828	trpc4apa (ENSORLG00000013852)	snai1a (ENSORLG00000023047)	ENSORLG00000024833	ENSORLG00000013875
Chinese medaka	MODERN SPECIES	655	EFCC1 (ENSOSIG00000017427)	isy1 (ENSOSIG00000017420)	HTD2 (ENSOSIG00000017415)	RPP14 (ENSOSIG00000017411)	ENSOSIG00000016984	pfkfb4a (ENSOSIG00000016844)	arpc4 (ENSOSIG00000016829)	tada3l (ENSOSIG00000016827)	RBM38 (ENSOSIG00000016826)	rae1 (ENSOSIG00000016824)	bmp7a (ENSOSIG00000016656)	ENSOSIG00000016649	ENSOSIG00000016647	ENSOSIG00000016644	LSM14B (ENSOSIG00000016642)	ENSOSIG00000016641 ##22	cdh4 (ENSOSIG00000016623)	ENSOSIG00000016614	ENSOSIG00000016612	ENSOSIG00000016610	ZMYND8 (ENSOSIG00000016569)	NCOA3 (ENSOSIG00000016560)	id1 (ENSOSIG00000016556)	sulf2a (ENSOSIG00000016461)	arhgap46a (ENSOSIG00000016450)	ENSOSIG00000016438	ndrg3a (ENSOSIG00000013905)	ENSOSIG00000013872	trpc4apa (ENSOSIG00000011196)	snai1a (ENSOSIG00000011180)	ENSOSIG00000011178
Oryzias_b	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00620000088018	ENSGT00390000014109	ENSGT00530000065109	ENSGT00510000048121	ENSGT00940000154089.a.c	ENSGT00950000182835.c.d.c.a	ENSGT00390000016233.e.a	ENSGT00390000008947	ENSGT00940000158489.a.b	ENSGT00950000183091.B.b	ENSGT00940000156490.b.b	ENSGT00390000005939.a.b.b	ENSGT00940000165182.d	ENSGT00940000155218.A.c	ENSGT00940000156010.eb	ENSGT00390000011620.a.a.b.e ##22	ENSGT00940000158073.b	ENSGT00940000154897.r	ENSGT00950000183021.a.b.d	ENSGT00940000161109	ENSGT00940000166926	ENSGT00940000164502.a.b	ENSGT00940000156477.d.a	ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b	ENSGT00940000160331	ENSGT00390000018330	ENSGT00940000154681.b.d	ENSGT00940000156917.b	ENSGT00390000018123.b	ENSGT00940000155006.e.a	ENSGT00950000182893.a.a.b.b
Indian medaka	MODERN SPECIES	8	CDK18 (ENSOMEG00000023903)	CFAP57 (ENSOMEG00000023904)	isy1 (ENSOMEG00000023905)	HTD2 (ENSOMEG00000023906)	rpp14 (ENSOMEG00000023907)	mapkapk3 (ENSOMEG00000023908)	pfkfb4a (ENSOMEG00000023909)	arpc4 (ENSOMEG00000023910)	tada3l (ENSOMEG00000023911)	RBM38 (ENSOMEG00000023912)	rae1 (ENSOMEG00000023913)	bmp7a (ENSOMEG00000023914)	ENSOMEG00000023915	ENSOMEG00000023916	LSM14B (ENSOMEG00000023917)	ENSOMEG00000023918 ##22	cdh4 (ENSOMEG00000023919)	ENSOMEG00000023920	ZMYND8 (ENSOMEG00000023921)	NCOA3 (ENSOMEG00000023922)	id1 (ENSOMEG00000023923)	sulf2a (ENSOMEG00000023924)	arhgap46a (ENSOMEG00000023925)	ENSOMEG00000023815	ndrg3a (ENSOMEG00000000639)	ENSOMEG00000023796	trpc4apa (ENSOMEG00000023783)	snai1a (ENSOMEG00000023773)	ENSOMEG00000000745	ENSOMEG00000023760	top1a (ENSOMEG00000023745)
Javanese ricefish	MODERN SPECIES	19	EFCC1 (ENSOJAG00000010082)	CFAP57 (ENSOJAG00000010057)	isy1 (ENSOJAG00000010039)	rpp14 (ENSOJAG00000010026)	ENSOJAG00000009609	pfkfb4a (ENSOJAG00000003803)	ARPC4 (ENSOJAG00000003075)	tada3l (ENSOJAG00000003061)	RBM38 (ENSOJAG00000003047)	rae1 (ENSOJAG00000003015)	bmp7a (ENSOJAG00000002999)	ENSOJAG00000002991	ENSOJAG00000002977	ENSOJAG00000002961	LSM14B (ENSOJAG00000002952)	ENSOJAG00000002896 ##22	cdh4 (ENSOJAG00000001334)	ENSOJAG00000001046	ENSOJAG00000001033	ZMYND8 (ENSOJAG00000000530)	ENSOJAG00000000167	id1 (ENSOJAG00000000108)	sulf2a (ENSOJAG00000022902)	arhgap46a (ENSOJAG00000022861)	PHF20 (ENSOJAG00000022842)	ndrg3a (ENSOJAG00000022739)	ENSOJAG00000022710	trpc4apa (ENSOJAG00000022441)	snai1a (ENSOJAG00000022353)	ENSOJAG00000022221	top1a (ENSOJAG00000021632)
Percomorphaceae_C	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000013132.b.a	ENSGT00940000166464	ENSGT00940000174829	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000154089.a.c	ENSGT00950000182835.c.d.c.a	ENSGT00390000016233.e.a	ENSGT00390000008947	ENSGT00940000158489.a.b	ENSGT00950000183091.B.b	ENSGT00940000156490.b.b	ENSGT00390000005939.a.b.b	ENSGT00940000165182.d	ENSGT00940000155218.A.c	ENSGT00940000156010.eb	ENSGT00390000011620.a.a.b.e ##22	ENSGT00940000158073.b	ENSGT00940000177296	ENSGT00940000160902.c.a	ENSGT00390000018730.A.f	ENSGT01100000265393	ENSGT00940000154897.r	ENSGT00950000183021.a.b.d	ENSGT00940000161109	ENSGT00940000166926	ENSGT00940000164502.a.b	ENSGT00940000156477.d.a	ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b	ENSGT00940000160331	ENSGT00390000018330	ENSGT00940000160318.c.b
Eupercaria	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000003721.d.a.g.a	ENSGT00390000013132.b.a	ENSGT00940000166464	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000154089.a.c	ENSGT00950000182835.c.d.c.a	ENSGT00390000016233.e.a	ENSGT00390000008947	ENSGT00940000158489.a.b	ENSGT00950000183091.B.b	ENSGT00940000156490.b.b	ENSGT00390000005939.a.b.b	ENSGT00940000165182.d	ENSGT00940000155218.A.c	ENSGT00940000156010.eb	ENSGT00390000011620.a.a.b.e ##22	ENSGT00940000158073.b	ENSGT00940000177296	ENSGT00940000160902.c.a	ENSGT00390000018730.A.f	ENSGT01100000265393	ENSGT00940000154897.r	ENSGT00950000183021.a.b.d	ENSGT00940000161109	ENSGT00940000166926	ENSGT00940000164502.a.b	ENSGT00940000156477.d.a	ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b	ENSGT00940000160331	ENSGT00390000018330	ENSGT00940000160318.c.b
Eupecaria_A	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000003721.d.a.g.a	ENSGT00390000013132.b.a	ENSGT00940000166464	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000154089.a.c	ENSGT00950000182835.c.d.c.a	ENSGT00390000016233.e.a	ENSGT00390000008947	ENSGT00940000158489.a.b	ENSGT00950000183091.B.b	ENSGT00940000156490.b.b	ENSGT00390000005939.a.b.b	ENSGT00940000165182.d	ENSGT00940000155218.A.c	ENSGT00940000156010.eb	ENSGT00390000011620.a.a.b.e ##22	ENSGT00940000158073.b	ENSGT00940000177296	ENSGT00940000160902.c.a	ENSGT00390000018730.A.f	ENSGT01100000265393	ENSGT00940000154897.r	ENSGT00950000183021.a.b.d	ENSGT00940000161109	ENSGT00940000166926	ENSGT00940000164502.a.b	ENSGT00940000156477.d.a	ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b	ENSGT00940000160331	ENSGT00390000018330	ENSGT00940000160318.c.b
Ballan wrasse	MODERN SPECIES	61	SEC61A1 (ENSLBEG00000015811)	chchd4a (ENSLBEG00000015886)	ENSLBEG00000015858	ENSLBEG00000015912	mapkapk3 (ENSLBEG00000015951)	pfkfb4a (ENSLBEG00000015991)	ENSLBEG00000016013	ARPC4 (ENSLBEG00000016032)	tada3l (ENSLBEG00000016074)	RBM38 (ENSLBEG00000016163)	rae1 (ENSLBEG00000016318)	bmp7a (ENSLBEG00000016352)	ENSLBEG00000016364	ENSLBEG00000016384	LSM14B (ENSLBEG00000016427)	ENSLBEG00000016461 ##22	cdh4 (ENSLBEG00000016522)	ENSLBEG00000016578	ogfr2 (ENSLBEG00000016615)	ENSLBEG00000016645	ZMYND8 (ENSLBEG00000016737)	NCOA3 (ENSLBEG00000016835)	id1 (ENSLBEG00000016873)	sulf2a (ENSLBEG00000016951)	arhgap46a (ENSLBEG00000017106)	ENSLBEG00000017148	ndrg3a (ENSLBEG00000017241)	ENSLBEG00000017352	trpc4apa (ENSLBEG00000017389)	myh7ba (ENSLBEG00000017468)	snai1a (ENSLBEG00000017605)
Eupecaria_B	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000003721.d.a.g.a	ENSGT00390000013132.b.a	ENSGT00940000166464	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000154089.a.c	ENSGT00950000182835.c.d.c.a	ENSGT00390000016233.e.a	ENSGT00390000008947	ENSGT00940000158489.a.b	ENSGT00950000183091.B.b	ENSGT00940000156490.b.b	ENSGT00390000005939.a.b.b	ENSGT00940000165182.d	ENSGT00940000155218.A.c	ENSGT00940000156010.eb	ENSGT00390000011620.a.a.b.e ##22	ENSGT00940000158073.b	ENSGT00940000177296	ENSGT00940000160902.c.a	ENSGT00390000018730.A.f	ENSGT01100000265393	ENSGT00940000154897.r	ENSGT00950000183021.a.b.d	ENSGT00940000161109	ENSGT00940000166926	ENSGT00940000164502.a.b	ENSGT00940000156477.d.a	ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b	ENSGT00940000160331	ENSGT00390000018330	ENSGT00940000160318.c.b
Perciformes	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000156310.p	ENSGT00390000003721.d.a.g.a	ENSGT00390000013132.b.a	ENSGT00940000166464	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000154089.a.c	ENSGT00950000182835.c.d.c.a	ENSGT00390000016233.e.a	ENSGT00390000008947	ENSGT00940000158489.a.b	ENSGT00950000183091.B.b	ENSGT00940000156490.b.b	ENSGT00390000005939.a.b.b	ENSGT00940000165182.d	ENSGT00940000156010.eb	ENSGT00390000011620.a.a.b.e ##22	ENSGT00940000158073.b	ENSGT00940000177296	ENSGT00940000160902.c.a	ENSGT00390000018730.A.f	ENSGT01100000265393	ENSGT00940000154897.r	ENSGT00950000183021.a.b.d	ENSGT00940000161109	ENSGT00940000166926	ENSGT00940000164502.a.b	ENSGT00940000156477.d.a	ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b	ENSGT00940000160331	ENSGT00390000018330	ENSGT00940000160318.c.b
Perciformes_a	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000156310.p	ENSGT00390000003721.d.a.g.a	ENSGT00390000013132.b.a	ENSGT00940000166464	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000154089.a.c	ENSGT00950000182835.c.d.c.a	ENSGT00390000016233.e.a	ENSGT00390000008947	ENSGT00940000158489.a.b	ENSGT00950000183091.B.b	ENSGT00940000156490.b.b	ENSGT00390000005939.a.b.b	ENSGT00940000165182.d	ENSGT00940000156010.eb	ENSGT00390000011620.a.a.b.e ##22	ENSGT00940000158073.b	ENSGT00940000177296	ENSGT00940000160902.c.a	ENSGT00390000018730.A.f	ENSGT01100000265393	ENSGT00940000154897.r	ENSGT00950000183021.a.b.d	ENSGT00940000161109	ENSGT00940000166926	ENSGT00940000164502.a.b	ENSGT00940000156477.d.a	ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b	ENSGT00940000160331	ENSGT00390000018330	ENSGT00940000160318.c.b
Pike perch	MODERN SPECIES	11	ENSSLUG00000018082	ip6k2a (ENSSLUG00000018105)	SEC61A1 (ENSSLUG00000018118)	chchd4a (ENSSLUG00000018298)	ENSSLUG00000018301	DNAH1 (ENSSLUG00000018382)	mapkapk3 (ENSSLUG00000019098)	pfkfb4a (ENSSLUG00000019258)	ARPC4 (ENSSLUG00000019311)	tada3l (ENSSLUG00000019358)	RBM38 (ENSSLUG00000019363)	rae1 (ENSSLUG00000019370)	bmp7a (ENSSLUG00000019378)	ENSSLUG00000019385	LSM14B (ENSSLUG00000019388)	ENSSLUG00000019391 ##22	cdh4 (ENSSLUG00000019440)	ENSSLUG00000020087	ENSSLUG00000020091	ogfr2 (ENSSLUG00000020094)	ENSSLUG00000020096	ENSSLUG00000020099	ZMYND8 (ENSSLUG00000020124)	NCOA3 (ENSSLUG00000020177)	id1 (ENSSLUG00000020181)	sulf2a (ENSSLUG00000020211)	arhgap46a (ENSSLUG00000020428)	PHF20 (ENSSLUG00000020439)	ndrg3a (ENSSLUG00000020480)	ENSSLUG00000020607	trpc4apa (ENSSLUG00000020652)
Channel bull blenny	MODERN SPECIES	19	ENSCGOG00000015154	ENSCGOG00000015151	ENSCGOG00000015146	ENSCGOG00000015141	ENSCGOG00000015131	mapkapk3 (ENSCGOG00000015127)	ARPC4 (ENSCGOG00000015115)	pfkfb4a (ENSCGOG00000009602)	tada3l (ENSCGOG00000009306)	RBM38 (ENSCGOG00000009303)	rae1 (ENSCGOG00000009039)	bmp7a (ENSCGOG00000009027)	ENSCGOG00000009024	ENSCGOG00000009017	LSM14B (ENSCGOG00000009013)	ENSCGOG00000008986 ##22	cdh4 (ENSCGOG00000006404)	ENSCGOG00000006369	ogfr2 (ENSCGOG00000006367)	ENSCGOG00000006364	ENSCGOG00000006359	ENSCGOG00000006357	ZMYND8 (ENSCGOG00000005046)	ENSCGOG00000005006	NCOA3 (ENSCGOG00000004967)	id1 (ENSCGOG00000004959)	sulf2a (ENSCGOG00000002949)	arhgap46a (ENSCGOG00000002851)	ENSCGOG00000002830	ndrg3a (ENSCGOG00000002580)	ENSCGOG00000002577
Cottioidei	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000156310.p	ENSGT00390000003721.d.a.g.a	ENSGT00390000013132.b.a	ENSGT00940000166464	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000154089.a.c	ENSGT00950000182835.c.d.c.a	ENSGT00390000016233.e.a	ENSGT00390000008947	ENSGT00940000158489.a.b	ENSGT00950000183091.B.b	ENSGT00940000156490.b.b	ENSGT00940000165182.d	ENSGT00940000155218.A.c	ENSGT00940000156010.eb	ENSGT00390000011620.a.a.b.e ##22	ENSGT00940000158073.b	ENSGT00940000160902.c.a	ENSGT00390000018730.A.f	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000155532	ENSGT00940000154897.r	ENSGT00950000183021.a.b.d	ENSGT00940000161109	ENSGT00940000166926	ENSGT00940000164502.a.b	ENSGT00940000156477.d.a	ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b	ENSGT00940000160331	ENSGT00390000018330	ENSGT00940000160318.c.b
Stickleback	MODERN SPECIES	17	ENSGACG00000009699	ip6k2a (ENSGACG00000009703)	SEC61A1 (ENSGACG00000009707)	chchd4a (ENSGACG00000009778)	ENSGACG00000009779	ENSGACG00000009785	mapkapk3 (ENSGACG00000009789)	pfkfb4a (ENSGACG00000009822)	arpc4 (ENSGACG00000009846)	tada3l (ENSGACG00000009851)	RBM38 (ENSGACG00000009873)	rae1 (ENSGACG00000009882)	bmp7a (ENSGACG00000009945)	ENSGACG00000009971	LSM14B (ENSGACG00000009973)	ENSGACG00000009979 ##22	cdh4 (ENSGACG00000009983)	KCNK15 (ENSGACG00000009987)	ogfr2 (ENSGACG00000009988)	ENSGACG00000009996	ZMYND8 (ENSGACG00000010012)	NCOA3 (ENSGACG00000010036)	id1 (ENSGACG00000010046)	sulf2a (ENSGACG00000010055)	arhgap46a (ENSGACG00000010079)	PHF20 (ENSGACG00000010085)	ndrg3a (ENSGACG00000010090)	trpc4apa (ENSGACG00000010137)	snai1a (ENSGACG00000010147)	ENSGACG00000010154	ENSGACG00000010157
Lumpfish	MODERN SPECIES	20	ift52 (ENSCLMG00005019114)	acot8 (ENSCLMG00005019113)	SEC61A1 (ENSCLMG00005018984)	chchd4a (ENSCLMG00005018980)	ENSCLMG00005018979	mapkapk3 (ENSCLMG00005018910)	pfkfb4a (ENSCLMG00005018594)	arpc4 (ENSCLMG00005018588)	tada3l (ENSCLMG00005018586)	RBM38 (ENSCLMG00005018583)	rae1 (ENSCLMG00005018580)	bmp7a (ENSCLMG00005018443)	ENSCLMG00005018440	ENSCLMG00005018439	LSM14B (ENSCLMG00005018438)	TAF4 (ENSCLMG00005018437) ##22	cdh4 (ENSCLMG00005018116)	ENSCLMG00005018102	ogfr2 (ENSCLMG00005018101)	ENSCLMG00005018100	ZMYND8 (ENSCLMG00005015600)	NCOA3 (ENSCLMG00005015587)	id1 (ENSCLMG00005015586)	sulf2a (ENSCLMG00005015041)	arhgap46a (ENSCLMG00005015029)	PHF20 (ENSCLMG00005015025)	ndrg3a (ENSCLMG00005014900)	ENSCLMG00005014889	trpc4apa (ENSCLMG00005013282)	myh7ba (ENSCLMG00005013269)	snai1a (ENSCLMG00005013267)
Eupecaria_C	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000003721.d.a.g.a	ENSGT00390000013132.b.a	ENSGT00940000166464	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000154089.a.c	ENSGT00950000182835.c.d.c.a	ENSGT00390000016233.e.a	ENSGT00390000008947	ENSGT00940000158489.a.b	ENSGT00950000183091.B.b	ENSGT00940000156490.b.b	ENSGT00390000005939.a.b.b	ENSGT00940000165182.d	ENSGT00940000155218.A.c	ENSGT00940000156010.eb	ENSGT00390000011620.a.a.b.e ##22	ENSGT00940000158073.b	ENSGT00940000160902.c.a	ENSGT00390000018730.A.f	ENSGT00940000154897.r	ENSGT00950000183021.a.b.d	ENSGT00940000161109	ENSGT00940000166926	ENSGT00940000164502.a.b	ENSGT00940000156477.d.a	ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b	ENSGT00940000160331	ENSGT00390000018330	ENSGT00940000160318.c.b	ENSGT00940000154681.b.d	ENSGT00940000156917.b
Eupercaria_incertae_sedis	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000156310.p	ENSGT00390000003721.d.a.g.a	ENSGT00390000013132.b.a	ENSGT00940000166464	ENSGT00940000154791	ENSGT00950000182835.c.d.c.a	ENSGT00390000016233.e.a	ENSGT00390000008947	ENSGT00940000158489.a.b	ENSGT00950000183091.B.b	ENSGT00940000156490.b.b	ENSGT00390000005939.a.b.b	ENSGT00940000165182.d	ENSGT00940000155218.A.c	ENSGT00940000156010.eb	ENSGT00390000011620.a.a.b.e ##22	ENSGT00940000158073.b	ENSGT00940000160902.c.a	ENSGT00390000018730.A.f	ENSGT00940000154897.r	ENSGT00950000183021.a.b.d	ENSGT00940000161109	ENSGT00940000166926	ENSGT00940000164502.a.b	ENSGT00940000156477.d.a	ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b	ENSGT00940000160331	ENSGT00390000018330	ENSGT00940000160318.c.b	ENSGT00940000154681.b.d	ENSGT00940000156917.b
Large yellow croaker	MODERN SPECIES	478	ip6k2a (ENSLCRG00005014641)	SEC61A1 (ENSLCRG00005014642)	chchd4a (ENSLCRG00005014650)	ENSLCRG00005014651	DNAH1 (ENSLCRG00005014671)	ARPC4 (ENSLCRG00005014774)	pfkfb4a (ENSLCRG00005014790)	tada3l (ENSLCRG00005015134)	RBM38 (ENSLCRG00005015135)	rae1 (ENSLCRG00005015136)	bmp7a (ENSLCRG00005015137)	ENSLCRG00005015139	ENSLCRG00005015141	ENSLCRG00005015148	LSM14B (ENSLCRG00005015149)	ENSLCRG00005015150 ##22	cdh4 (ENSLCRG00005015193)	ENSLCRG00005018208	ogfr2 (ENSLCRG00005018210)	ENSLCRG00005018211	ZMYND8 (ENSLCRG00005018242)	NCOA3 (ENSLCRG00005020827)	id1 (ENSLCRG00005020828)	sulf2a (ENSLCRG00005020839)	arhgap46a (ENSLCRG00005021550)	PHF20 (ENSLCRG00005021552)	ndrg3a (ENSLCRG00005021568)	ENSLCRG00005022317	trpc4apa (ENSLCRG00005022321)	myh7ba (ENSLCRG00005022334)	snai1a (ENSLCRG00005022344)
European seabass	MODERN SPECIES	10	ENSDLAG00005033303	ENSDLAG00005019685	ENSDLAG00005019522	MIA40 (ENSDLAG00005028012)	ENSDLAG00005019493	ENSDLAG00005014576	pfkfb4a (ENSDLAG00005014215)	ENSDLAG00005014141	ENSDLAG00005014119	RB24B (ENSDLAG00005034430)	RAE1 (ENSDLAG00005014085)	BMP7B (ENSDLAG00005034944)	ENSDLAG00005014053	ENSDLAG00005014027	LSM14B (ENSDLAG00005013965)	ENSDLAG00005013961 ##22	CDH4 (ENSDLAG00005011657)	ENSDLAG00005029634	ogfr2 (ENSDLAG00005026653)	ENSDLAG00005011550	ZMYND8 (ENSDLAG00005008873)	ENSDLAG00005008706	ID1 (ENSDLAG00005033925)	sulf2a (ENSDLAG00005007742)	arhgap46a (ENSDLAG00005007687)	ENSDLAG00005007665	ndrg3a (ENSDLAG00005006458)	trpc4apa (ENSDLAG00005005884)	myh7ba (ENSDLAG00005005626)	SNAI (ENSDLAG00005033824)	ENSDLAG00005005462
Gilthead seabream	MODERN SPECIES	20	SEC61A1 (ENSSAUG00010000321)	ENSSAUG00010000364	chchd4a (ENSSAUG00010000373)	ENSSAUG00010000378	DNAH1 (ENSSAUG00010000485)	mapkapk3 (ENSSAUG00010000892)	pfkfb4a (ENSSAUG00010000909)	ARPC4 (ENSSAUG00010000982)	tada3l (ENSSAUG00010000984)	RBM38 (ENSSAUG00010000986)	rae1 (ENSSAUG00010000992)	bmp7a (ENSSAUG00010001062)	ENSSAUG00010001064	ENSSAUG00010001065	LSM14B (ENSSAUG00010001066)	TAF4 (ENSSAUG00010001070) ##22	cdh4 (ENSSAUG00010001139)	ENSSAUG00010006592	ogfr2 (ENSSAUG00010006601)	ENSSAUG00010006604	ZMYND8 (ENSSAUG00010006668)	ENSSAUG00010010183	id1 (ENSSAUG00010010185)	sulf2a (ENSSAUG00010010207)	arhgap46a (ENSSAUG00010010993)	PHF20 (ENSSAUG00010010994)	ndrg3a (ENSSAUG00010011005)	ENSSAUG00010012035	trpc4apa (ENSSAUG00010012056)	myh7ba (ENSSAUG00010013596)	snai1a (ENSSAUG00010013621)
Tetraodontidae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000002873	ENSGT00940000164201.c.a	ENSGT00940000156310.p	ENSGT00390000003721.d.a.g.a	ENSGT00390000013132.b.a	ENSGT00940000166464	ENSGT00940000154089.a.c	ENSGT00950000182835.c.d.c.a	ENSGT00390000016233.e.a	ENSGT00390000008947	ENSGT00940000158489.a.b	ENSGT00950000183091.B.b	ENSGT00940000156490.b.b	ENSGT00940000165182.d	ENSGT00940000156010.eb	ENSGT00390000011620.a.a.b.e ##22	ENSGT00940000158073.b	ENSGT00940000161997.b	ENSGT00940000156785	ENSGT00940000155637	ENSGT00390000006330.a.b	ENSGT00670000099474	ENSGT00950000183038.a.b.a.g	ENSGT00940000157144.c.a	ENSGT01000000214440.B	ENSGT00940000164642	ENSGT00940000155330.c	ENSGT00950000182908.B.c.a	ENSGT00530000063255.A	ENSGT00940000155569.a.a.e	ENSGT00390000001799
Fugu	MODERN SPECIES	10	thoc7 (ENSTRUG00000029292)	mxa (ENSTRUG00000009739)	ip6k2a (ENSTRUG00000020006)	SEC61A1 (ENSTRUG00000010155)	chchd4a (ENSTRUG00000025793)	ENSTRUG00000010374	mapkapk3 (ENSTRUG00000010458)	pfkfb4a (ENSTRUG00000022003)	arpc4 (ENSTRUG00000010785)	tada3l (ENSTRUG00000010855)	RBM38 (ENSTRUG00000019869)	rae1 (ENSTRUG00000011042)	bmp7a (ENSTRUG00000011215)	ENSTRUG00000028328	LSM14B (ENSTRUG00000011354)	TAF4 (ENSTRUG00000011488) ##22	cdh4 (ENSTRUG00000011567)	ENSTRUG00000012201	ENSTRUG00000012227	ENSTRUG00000020708	nab2 (ENSTRUG00000012284)	ENSTRUG00000024271	NR4A1 (ENSTRUG00000012317)	DGKA (ENSTRUG00000012452)	STX16 (ENSTRUG00000024770)	cnpy2 (ENSTRUG00000012744)	slc11a2 (ENSTRUG00000012806)	ANKRD52 (ENSTRUG00000013030)	npepl1 (ENSTRUG00000013153)	ctsz (ENSTRUG00000013236)	nelfcd (ENSTRUG00000020959)
Tetraodon	MODERN SPECIES	2	ATXN7 (ENSTNIG00000011140)	thoc7 (ENSTNIG00000006681)	MX1 (ENSTNIG00000006682)	ip6k2a (ENSTNIG00000007100)	SEC61A1 (ENSTNIG00000007099)	chchd4a (ENSTNIG00000007098)	mapkapk3 (ENSTNIG00000007097)	pfkfb4a (ENSTNIG00000007096)	ARPC4 (ENSTNIG00000007095)	tada3l (ENSTNIG00000007094)	RBM38 (ENSTNIG00000007093)	rae1 (ENSTNIG00000007092)	bmp7a (ENSTNIG00000007091)	ENSTNIG00000007090	LSM14B (ENSTNIG00000002445)	TAF4 (ENSTNIG00000007089) ##22	cdh4 (ENSTNIG00000007088)	ENSTNIG00000007087	ENSTNIG00000007086	ENSTNIG00000007085	nab2 (ENSTNIG00000007084)	NR4A1 (ENSTNIG00000007083)	DGKA (ENSTNIG00000007082)	STX16 (ENSTNIG00000007081)	cnpy2 (ENSTNIG00000007080)	slc11a2 (ENSTNIG00000007079)	ANKRD52 (ENSTNIG00000007078)	npepl1 (ENSTNIG00000001641)	npepl1 (ENSTNIG00000007077)	ctsz (ENSTNIG00000007076)	nelfcd (ENSTNIG00000007075)
Percomorphaceae_D	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00390000013132.b.a	ENSGT00940000166464	ENSGT00940000174829	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000154089.a.c	ENSGT00950000182835.c.d.c.a	ENSGT00390000016233.e.a	ENSGT00390000008947	ENSGT00940000158489.a.b	ENSGT00950000183091.B.b	ENSGT00940000156490.b.b	ENSGT00390000005939.a.b.b	ENSGT00940000165182.d	ENSGT00940000155218.A.c	ENSGT00940000156010.eb	ENSGT00390000011620.a.a.b.e ##22	ENSGT00940000158073.b	ENSGT00940000160902.c.a	ENSGT00390000018730.A.f	ENSGT01100000265393	ENSGT00940000154897.r	ENSGT00950000183021.a.b.d	ENSGT00940000161109	ENSGT00940000166926	ENSGT00940000164502.a.b	ENSGT00940000156477.d.a	ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b	ENSGT00940000160331	ENSGT00390000018330	ENSGT00940000160318.c.b	ENSGT00940000154681.b.d
Anabantaria	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000003721.d.a.g.a	ENSGT00390000013132.b.a	ENSGT00940000166464	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000154089.a.c	ENSGT00950000182835.c.d.c.a	ENSGT00390000016233.e.a	ENSGT00390000008947	ENSGT00940000158489.a.b	ENSGT00950000183091.B.b	ENSGT00940000156490.b.b	ENSGT00390000005939.a.b.b	ENSGT00940000165182.d	ENSGT00940000155218.A.c	ENSGT00940000156010.eb	ENSGT00390000011620.a.a.b.e ##22	ENSGT00940000158073.b	ENSGT00940000160902.c.a	ENSGT00390000018730.A.f	ENSGT00940000154897.r	ENSGT00950000183021.a.b.d	ENSGT00940000161109	ENSGT00940000166926	ENSGT00940000164502.a.b	ENSGT00940000156477.d.a	ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b	ENSGT00940000160331	ENSGT00390000018330	ENSGT00940000160318.c.b	ENSGT00940000154681.b.d	ENSGT00980000199461
Anabantoidei	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000003721.d.a.g.a	ENSGT00390000013132.b.a	ENSGT00940000166464	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000154089.a.c	ENSGT00950000182835.c.d.c.a	ENSGT00390000016233.e.a	ENSGT00390000008947	ENSGT00940000158489.a.b	ENSGT00950000183091.B.b	ENSGT00940000156490.b.b	ENSGT00390000005939.a.b.b	ENSGT00940000165182.d	ENSGT00940000155218.A.c	ENSGT00940000156010.eb	ENSGT00390000011620.a.a.b.e ##22	ENSGT00940000158073.b	ENSGT00940000160902.c.a	ENSGT00390000018730.A.f	ENSGT00940000154897.r	ENSGT00950000183021.a.b.d	ENSGT00940000161109	ENSGT00940000166926	ENSGT00940000164502.a.b	ENSGT00940000156477.d.a	ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b	ENSGT00940000160331	ENSGT00390000018330	ENSGT00940000160318.c.b	ENSGT00940000154681.b.d	ENSGT00940000156917.b
Climbing perch	MODERN SPECIES	18	ENSATEG00000017104	ENSATEG00000017072	ENSATEG00000017023	chchd4a (ENSATEG00000025788)	ENSATEG00000016990	pfkfb4a (ENSATEG00000016787)	ENSATEG00000016840	ENSATEG00000016724	RBM38 (ENSATEG00000016710)	RAE1 (ENSATEG00000016689)	bmp7a (ENSATEG00000016678)	ENSATEG00000027080	ENSATEG00000016649	ENSATEG00000016618	LSM14B (ENSATEG00000029061)	ENSATEG00000028405 ##22	CDH4 (ENSATEG00000016519)	ENSATEG00000016484	ogfr2 (ENSATEG00000016414)	ENSATEG00000028433	ENSATEG00000016340	ENSATEG00000016287	id1 (ENSATEG00000027640)	sulf2a (ENSATEG00000016107)	arhgap46a (ENSATEG00000016027)	ENSATEG00000015958	ndrg3a (ENSATEG00000015891)	trpc4apa (ENSATEG00000015800)	myh7ba (ENSATEG00000015668)	snai1a (ENSATEG00000015639)	ENSATEG00000025418
Siamese fighting fish	MODERN SPECIES	16	SEC61A1 (ENSBSLG00000008963)	chchd4a (ENSBSLG00000009054)	ENSBSLG00000009070	DNAH1 (ENSBSLG00000009294)	ENSBSLG00000012877	mapkapk3 (ENSBSLG00000012888)	pfkfb4a (ENSBSLG00000013352)	ARPC4 (ENSBSLG00000013860)	tada3l (ENSBSLG00000013887)	ENSBSLG00000013906	rae1 (ENSBSLG00000013920)	bmp7a (ENSBSLG00000013978)	ENSBSLG00000013991	ENSBSLG00000013993	LSM14B (ENSBSLG00000014018)	TAF4 (ENSBSLG00000014026) ##22	cdh4 (ENSBSLG00000014283)	ENSBSLG00000016388	ENSBSLG00000016576	ogfr2 (ENSBSLG00000016625)	ENSBSLG00000016672	ENSBSLG00000016705	ZMYND8 (ENSBSLG00000017118)	NCOA3 (ENSBSLG00000021022)	id1 (ENSBSLG00000021125)	sulf2a (ENSBSLG00000021353)	arhgap46a (ENSBSLG00000022463)	PHF20 (ENSBSLG00000022500)	ndrg3a (ENSBSLG00000022533)	ENSBSLG00000022660	trpc4apa (ENSBSLG00000022759)
Zig-zag eel	MODERN SPECIES	19	ENSMAMG00000020358	ENSMAMG00000020367	chchd4a (ENSMAMG00000024262)	ENSMAMG00000020386	ENSMAMG00000020411	mapkapk3 (ENSMAMG00000020448)	pfkfb4a (ENSMAMG00000020455)	ENSMAMG00000020477	ENSMAMG00000020485	RBM38 (ENSMAMG00000026027)	RAE1 (ENSMAMG00000020502)	BMP7 (ENSMAMG00000020511)	ENSMAMG00000026183	ENSMAMG00000020528	LSM14B (ENSMAMG00000020539)	ENSMAMG00000020545 ##22	CDH4 (ENSMAMG00000020558)	ENSMAMG00000020729	ogfr2 (ENSMAMG00000028481)	ENSMAMG00000027716	ENSMAMG00000020799	ENSMAMG00000020835	ENSMAMG00000027125	sulf2a (ENSMAMG00000020845)	arhgap46a (ENSMAMG00000020882)	ENSMAMG00000020899	ndrg3a (ENSMAMG00000020915)	trpc4apa (ENSMAMG00000020928)	myh7ba (ENSMAMG00000020947)	snai1a (ENSMAMG00000020994)	ENSMAMG00000021002
Carangaria	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00390000013132.b.a	ENSGT00940000166464	ENSGT00940000174829	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000154089.a.c	ENSGT00950000182835.c.d.c.a	ENSGT00390000016233.e.a	ENSGT00390000008947	ENSGT00940000158489.a.b	ENSGT00950000183091.B.b	ENSGT00940000156490.b.b	ENSGT00390000005939.a.b.b	ENSGT00940000165182.d	ENSGT00940000155218.A.c	ENSGT00940000156010.eb	ENSGT00390000011620.a.a.b.e ##22	ENSGT00940000158073.b	ENSGT00940000160902.c.a	ENSGT00390000018730.A.f	ENSGT01100000265393	ENSGT00940000154897.r	ENSGT00950000183021.a.b.d	ENSGT00940000161109	ENSGT00940000166926	ENSGT00940000164502.a.b	ENSGT00940000156477.d.a	ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b	ENSGT00940000160331	ENSGT00390000018330	ENSGT00940000160318.c.b	ENSGT00940000154681.b.d
Pleuronectoidei	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000003721.d.a.g.a	ENSGT00390000013132.b.a	ENSGT00940000166464	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000154089.a.c	ENSGT00950000182835.c.d.c.a	ENSGT00390000016233.e.a	ENSGT00390000008947	ENSGT00940000158489.a.b	ENSGT00950000183091.B.b	ENSGT00940000156490.b.b	ENSGT00390000005939.a.b.b	ENSGT00940000165182.d	ENSGT00940000155218.A.c	ENSGT00940000156010.eb	ENSGT00390000011620.a.a.b.e ##22	ENSGT00940000158073.b	ENSGT00940000160902.c.a	ENSGT00390000018730.A.f	ENSGT01100000265393	ENSGT00940000155532	ENSGT00940000154897.r	ENSGT00950000183021.a.b.d	ENSGT00940000161109	ENSGT00940000166926	ENSGT00940000164502.a.b	ENSGT00940000156477.d.a	ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b	ENSGT00940000160331	ENSGT00390000018330	ENSGT00940000160318.c.b
Turbot	MODERN SPECIES	18	ENSSMAG00000011753	ENSSMAG00000011790	chchd4a (ENSSMAG00000011850)	ENSSMAG00000011854	ENSSMAG00000011918	pfkfb4a (ENSSMAG00000012091)	ENSSMAG00000012173	ENSSMAG00000012632	RBM38 (ENSSMAG00000012663)	RAE1 (ENSSMAG00000012667)	bmp7a (ENSSMAG00000012679)	ENSSMAG00000031066	ENSSMAG00000012701	ENSSMAG00000012715	LSM14B (ENSSMAG00000012725)	ENSSMAG00000012736 ##22	CDH4 (ENSSMAG00000012762)	ENSSMAG00000012838	ogfr2 (ENSSMAG00000012850)	ENSSMAG00000012877	ENSSMAG00000012892	ENSSMAG00000012925	ENSSMAG00000013056	id1 (ENSSMAG00000013135)	sulf2a (ENSSMAG00000013143)	arhgap46a (ENSSMAG00000013248)	ENSSMAG00000037386	ENSSMAG00000013338	ndrg3a (ENSSMAG00000013395)	ENSSMAG00000027630	trpc4apa (ENSSMAG00000013512)
Tongue sole	MODERN SPECIES	2	foxp4 (ENSCSEG00000004532)	ENSCSEG00000004559	tfeb (ENSCSEG00000004566)	tmem183a (ENSCSEG00000004576)	ppfia4 (ENSCSEG00000004589)	myog (ENSCSEG00000004665)	mdm4 (ENSCSEG00000004669)	sort1a (ENSCSEG00000004676)	psma5 (ENSCSEG00000004690)	RBM38 (ENSCSEG00000004701)	rae1 (ENSCSEG00000004706)	bmp7a (ENSCSEG00000004712)	ENSCSEG00000004715	ENSCSEG00000004718	LSM14B (ENSCSEG00000004722)	ENSCSEG00000004725 ##22	ENSCSEG00000004737	ENSCSEG00000004739	chchd6b (ENSCSEG00000004751)	tpra1 (ENSCSEG00000004756)	ENSCSEG00000004759	LPIN3 (ENSCSEG00000004764)	myl9a (ENSCSEG00000004790)	ENSCSEG00000004794	ENSCSEG00000004799	ENSCSEG00000004807	quo (ENSCSEG00000004824)	tgm2b (ENSCSEG00000004838)	ENSCSEG00000004844	krt4 (ENSCSEG00000004846)	ENSCSEG00000004850
Carangaria_A	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00390000013132.b.a	ENSGT00940000166464	ENSGT00940000174829	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000154089.a.c	ENSGT00950000182835.c.d.c.a	ENSGT00390000016233.e.a	ENSGT00390000008947	ENSGT00940000158489.a.b	ENSGT00950000183091.B.b	ENSGT00940000156490.b.b	ENSGT00390000005939.a.b.b	ENSGT00940000165182.d	ENSGT00940000155218.A.c	ENSGT00940000156010.eb	ENSGT00390000011620.a.a.b.e ##22	ENSGT00940000158073.b	ENSGT00940000160902.c.a	ENSGT00390000018730.A.f	ENSGT00940000154897.r	ENSGT00950000183021.a.b.d	ENSGT00940000161109	ENSGT00940000166926	ENSGT00940000164502.a.b	ENSGT00940000156477.d.a	ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b	ENSGT00940000160331	ENSGT00390000018330	ENSGT00940000160318.c.b	ENSGT00940000154681.b.d	ENSGT00940000156917.b
Seriola	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00390000003721.d.a.g.a	ENSGT00390000013132.b.a	ENSGT00940000166464	ENSGT00940000174829	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000154089.a.c	ENSGT00950000182835.c.d.c.a	ENSGT00390000016233.e.a	ENSGT00390000008947	ENSGT00940000158489.a.b	ENSGT00950000183091.B.b	ENSGT00940000156490.b.b	ENSGT00940000165182.d	ENSGT00940000155218.A.c	ENSGT00940000156010.eb	ENSGT00390000011620.a.a.b.e ##22	ENSGT00940000158073.b	ENSGT00940000160902.c.a	ENSGT00390000018730.A.f	ENSGT00940000154897.r	ENSGT00950000183021.a.b.d	ENSGT00940000161109	ENSGT00940000166926	ENSGT00940000164502.a.b	ENSGT00940000156477.d.a	ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b	ENSGT00940000160331	ENSGT00390000018330	ENSGT00940000160318.c.b	ENSGT00940000154681.b.d	ENSGT00940000156917.b
Greater amberjack	MODERN SPECIES	37	ip6k2a (ENSSDUG00000021556)	SEC61A1 (ENSSDUG00000021526)	chchd4a (ENSSDUG00000021516)	ENSSDUG00000021490	DNAH1 (ENSSDUG00000021400)	mapkapk3 (ENSSDUG00000021242)	pfkfb4a (ENSSDUG00000021138)	ARPC4 (ENSSDUG00000021114)	tada3l (ENSSDUG00000021092)	RBM38 (ENSSDUG00000021082)	rae1 (ENSSDUG00000021046)	bmp7a (ENSSDUG00000021030)	ENSSDUG00000021025	ENSSDUG00000020987	LSM14B (ENSSDUG00000020977)	ENSSDUG00000020966 ##22	cdh4 (ENSSDUG00000020918)	ENSSDUG00000020910	ogfr2 (ENSSDUG00000020893)	ENSSDUG00000020864	ZMYND8 (ENSSDUG00000020647)	NCOA3 (ENSSDUG00000020589)	id1 (ENSSDUG00000020580)	sulf2a (ENSSDUG00000020359)	arhgap46a (ENSSDUG00000020279)	PHF20 (ENSSDUG00000020220)	ndrg3a (ENSSDUG00000020098)	ENSSDUG00000020064	trpc4apa (ENSSDUG00000020023)	myh7ba (ENSSDUG00000019946)	snai1a (ENSSDUG00000019933)
Yellowtail amberjack	MODERN SPECIES	3158	ENSSLDG00000012118	ENSSLDG00000012100	ENSSLDG00000012047	ENSSLDG00000012027	ENSSLDG00000011978	mapkapk3 (ENSSLDG00000011948)	pfkfb4a (ENSSLDG00000011879)	arpc4 (ENSSLDG00000011829)	tada3l (ENSSLDG00000011797)	RBM38 (ENSSLDG00000011778)	rae1 (ENSSLDG00000011747)	bmp7a (ENSSLDG00000011732)	ENSSLDG00000011714	ENSSLDG00000011706	ENSSLDG00000011678	TAF4 (ENSSLDG00000011644) ##22	ENSSLDG00000011622	cdh4 (ENSSLDG00000011438)
Barramundi perch	MODERN SPECIES	93	SEC61A1 (ENSLCAG00010021890)	chchd4a (ENSLCAG00010021865)	ENSLCAG00010021861	DNAH1 (ENSLCAG00010021659)	mapkapk3 (ENSLCAG00010021600)	pfkfb4a (ENSLCAG00010021278)	arpc4 (ENSLCAG00010021203)	tada3l (ENSLCAG00010021200)	RBM38 (ENSLCAG00010021196)	rae1 (ENSLCAG00010021188)	bmp7a (ENSLCAG00010021187)	ENSLCAG00010021186	ENSLCAG00010021185	ENSLCAG00010021184	LSM14B (ENSLCAG00010021182)	ENSLCAG00010021180 ##22	cdh4 (ENSLCAG00010021125)	ENSLCAG00010021094	ENSLCAG00010021083	ZMYND8 (ENSLCAG00010020497)	NCOA3 (ENSLCAG00010020363)	id1 (ENSLCAG00010020359)	sulf2a (ENSLCAG00010020064)	arhgap46a (ENSLCAG00010019930)	ENSLCAG00010019926	ENSLCAG00010019917	ndrg3a (ENSLCAG00010019837)	ENSLCAG00010019825	trpc4apa (ENSLCAG00010019718)	myh7ba (ENSLCAG00010019690)	snai1a (ENSLCAG00010019688)
Pinecone sodierfish	MODERN SPECIES	19	chchd4a (ENSMMDG00005018566)	ENSMMDG00005018568	ENSMMDG00005018572	ENSMMDG00005018574	ENSMMDG00005018582	mapkapk3 (ENSMMDG00005018617)	pfkfb4a (ENSMMDG00005018831)	ARPC4 (ENSMMDG00005018913)	tada3l (ENSMMDG00005018915)	ENSMMDG00005018918	rae1 (ENSMMDG00005018920)	bmp7a (ENSMMDG00005018945)	ENSMMDG00005019667	ENSMMDG00005019670	LSM14B (ENSMMDG00005019672)	ENSMMDG00005019674 ##22	cdh4 (ENSMMDG00005019715)	ENSMMDG00005020180	ENSMMDG00005020181	ogfr2 (ENSMMDG00005020184)	ENSMMDG00005020192	ZMYND8 (ENSMMDG00005020267)	NCOA3 (ENSMMDG00005021679)	id1 (ENSMMDG00005021683)	sulf2a (ENSMMDG00005021725)	arhgap46a (ENSMMDG00005004002)	PHF20 (ENSMMDG00005004009)	ndrg3a (ENSMMDG00005004130)	ENSMMDG00005005982	trpc4apa (ENSMMDG00005006010)	myh7ba (ENSMMDG00005006989)
Cod	MODERN SPECIES	4	ENSGMOG00000036049	ENSGMOG00000019276	ENSGMOG00000019270	ENSGMOG00000010010	ENSGMOG00000027022	ENSGMOG00000034646	ENSGMOG00000009988	ENSGMOG00000029494	RBM38 (ENSGMOG00000029207)	RAE1 (ENSGMOG00000016670)	bmp7a (ENSGMOG00000016691)	ENSGMOG00000036693	ENSGMOG00000032653	ENSGMOG00000016727	LSM14B (ENSGMOG00000017115)	ENSGMOG00000017138 ##22	CDH4 (ENSGMOG00000017191)	ENSGMOG00000025076	ogfr2 (ENSGMOG00000017268)	ENSGMOG00000022276	ENSGMOG00000027426	ENSGMOG00000022915	ENSGMOG00000017376	ENSGMOG00000017433	id1 (ENSGMOG00000037179)	sulf2a (ENSGMOG00000017504)	arhgap46a (ENSGMOG00000017547)	ENSGMOG00000017577	ENSGMOG00000027296	ndrg3a (ENSGMOG00000017636)	ENSGMOG00000017663
Otomorpha	ANCESTRAL SPECIES	142	ENSGT00510000047967	ENSGT00390000011228.b.a.e.a	ENSGT00390000014429.a	ENSGT00940000156378.a.a	ENSGT00940000157448	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000159273	ENSGT00940000158320	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00550000074884	ENSGT00940000165342.b	ENSGT00940000156490.b.b	ENSGT00390000005939.a.b.b	ENSGT00940000165182.d	ENSGT00940000155218.A.c	ENSGT00390000011620.a.a.b.e ##22
Clupeiformes	ANCESTRAL SPECIES	76	ENSGT00390000016901.a	ENSGT00940000165239.a	ENSGT00390000011082	ENSGT00940000157127.b	ENSGT00940000155125.a.b	ENSGT00940000157448	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000159273	ENSGT00940000158320	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00550000074884	ENSGT00940000165342.b	ENSGT00940000156490.b.b	ENSGT00390000005939.a.b.b	ENSGT00940000165182.d	ENSGT00390000011620.a.a.b.e ##22	ENSGT00940000158073.b	ENSGT00940000160902.c.a	ENSGT00390000018730.A.f	ENSGT00940000155532.yd.a	ENSGT00940000155532.yd.b	ENSGT00940000163561	ENSGT00390000008330	ENSGT00940000157312	ENSGT00940000156915.f.b	ENSGT00940000156308	ENSGT00940000156047.a	ENSGT00940000158523.c.b	ENSGT00940000164549.a.b	ENSGT00940000160218	ENSGT00940000158148
Atlantic herring	MODERN SPECIES	21	zgc:77375 (ENSCHAG00000022429)	isy1 (ENSCHAG00000022451)	BRK1 (ENSCHAG00000022547)	slc38a3a (ENSCHAG00000022606)	gnai2a (ENSCHAG00000023506)	ENSCHAG00000023548	nek4 (ENSCHAG00000023572)	spcs1 (ENSCHAG00000023587)	glt8d1 (ENSCHAG00000023598)	gnl3 (ENSCHAG00000023603)	PBRM1 (ENSCHAG00000023670)	cse1l (ENSCHAG00000025206)	ENSCHAG00000025328	bmp7a (ENSCHAG00000025373)	ENSCHAG00000025524	ENSCHAG00000025527 ##22	cdh4 (ENSCHAG00000025571)	ENSCHAG00000026215	ENSCHAG00000026218	ENSCHAG00000026219	ENSCHAG00000026223	ENSCHAG00000026226	ENSCHAG00000026231	acad9 (ENSCHAG00000026242)	IQSEC1 (ENSCHAG00000026309)	hdac11 (ENSCHAG00000026731)	FBLN2 (ENSCHAG00000026752)	wnt7aa (ENSCHAG00000026868)	ENSCHAG00000026871	ptpdc1a (ENSCHAG00000026875)	barx1 (ENSCHAG00000026876)
Denticle herring	MODERN SPECIES	3	rab43 (ENSDCDG00000017106)	zgc:77375 (ENSDCDG00000017107)	isy1 (ENSDCDG00000017109)	ENSDCDG00000017113	slc38a3a (ENSDCDG00000017180)	gnai2a (ENSDCDG00000021758)	nek4 (ENSDCDG00000021767)	spcs1 (ENSDCDG00000021776)	glt8d1 (ENSDCDG00000021782)	gnl3 (ENSDCDG00000021801)	PBRM1 (ENSDCDG00000021931)	cse1l (ENSDCDG00000025543)	bmp7a (ENSDCDG00000025594)	ENSDCDG00000025601	ENSDCDG00000025605	ENSDCDG00000025615 ##22	cdh4 (ENSDCDG00000025716)	ogfr2 (ENSDCDG00000027183)	ENSDCDG00000027185	ENSDCDG00000027186	ENSDCDG00000027187	ENSDCDG00000027189	acad9 (ENSDCDG00000027197)	IQSEC1 (ENSDCDG00000027239)	hdac11 (ENSDCDG00000028598)	FBLN2 (ENSDCDG00000028608)	wnt7aa (ENSDCDG00000028626)	ptpdc1a (ENSDCDG00000028640)	barx1 (ENSDCDG00000028860)	phf2 (ENSDCDG00000028892)	FAM120A (ENSDCDG00000029454)
Otophysi	ANCESTRAL SPECIES	211	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000156378.a.a	ENSGT00390000014429.a	ENSGT00390000011228.b.a.e.a	ENSGT00510000047967	ENSGT00940000155048.d.a.k	ENSGT00550000074884	ENSGT00940000156490.b.b	ENSGT00390000005939.a.b.b	ENSGT00940000165182.d	ENSGT00940000155218.A.c	ENSGT00390000011620.a.a.b.e ##22	ENSGT00940000158073.b	ENSGT00940000160902.c.a	ENSGT00390000018730.A.f	ENSGT00940000155532	ENSGT00940000154897.r	ENSGT00950000183021.a.b.d	ENSGT00940000161109	ENSGT00940000156478
Characiphysae	ANCESTRAL SPECIES	29	ENSGT00390000009630	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000156378.a.a	ENSGT00390000014429.a	ENSGT00390000011228.b.a.e.a	ENSGT00510000047967	ENSGT00940000155048.d.a.k	ENSGT00550000074884	ENSGT00940000156490.b.b	ENSGT00390000005939.a.b.b	ENSGT00940000165182.d	ENSGT00390000011620.a.a.b.e ##22	ENSGT00940000158073.b	ENSGT00940000160902.c.a	ENSGT00390000018730.A.f	ENSGT00940000155532	ENSGT00940000154897.r	ENSGT00950000183021.a.b.d	ENSGT00940000161109.s.a	ENSGT00950000182835.d.a.k.a	ENSGT00390000011648.b	ENSGT00940000157392.o.b	ENSGT00530000063868.a.b	ENSGT00940000158436	ENSGT00940000155241.d	ENSGT00730000111360.b	ENSGT01030000234812.a
Channel catfish	MODERN SPECIES	13	itih3 (ENSIPUG00000023620)	GATA2 (ENSIPUG00000023627)	rpn1 (ENSIPUG00000023633)	pbrm1 (ENSIPUG00000023639)	gnl3 (ENSIPUG00000023677)	glt8d1 (ENSIPUG00000023689)	spcs1 (ENSIPUG00000023691)	CAMK1 (ENSIPUG00000023697)	ccdc3b (ENSIPUG00000023706)	si:ch211-236d3.4 (ENSIPUG00000023707)	fhit (ENSIPUG00000023729)	ptprg (ENSIPUG00000023735)	cse1l (ENSIPUG00000023752)	Bmp7 (ENSIPUG00000023773)	ENSIPUG00000023776	taf4 (ENSIPUG00000023780) ##22	cdh4 (ENSIPUG00000023783)	ENSIPUG00000023794	ENSIPUG00000023797	ENSIPUG00000023802	ENSIPUG00000023813	ENSIPUG00000023814	dido1 (ENSIPUG00000023816)	ENSIPUG00000023819	ZMYND8 (ENSIPUG00000023824)	NCOA3 (ENSIPUG00000023848)	id1 (ENSIPUG00000023852)	PFKFB2 (ENSIPUG00000023854)	phtf1 (ENSIPUG00000023863)	cishb (ENSIPUG00000023872)	twf2b (ENSIPUG00000023875)
Characiphysae_b	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00390000009630	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000156378.a.a	ENSGT00390000014429.a	ENSGT00390000011228.b.a.e.a	ENSGT00510000047967	ENSGT00940000155048.d.a.k	ENSGT00550000074884	ENSGT00940000156490.b.b	ENSGT00390000005939.a.b.b	ENSGT00940000165182.d	ENSGT00390000011620.a.a.b.e ##22	ENSGT00940000158073.b	ENSGT00940000160902.c.a	ENSGT00390000018730.A.f	ENSGT00940000155532	ENSGT00940000154897.r	ENSGT00950000183021.a.b.d	ENSGT00940000161109.s.a	ENSGT00950000182835.d.a.k.a	ENSGT00390000011648.b	ENSGT00940000157392.o.b	ENSGT00530000063868.a.b	ENSGT00940000158436	ENSGT00940000155241.d	ENSGT00730000111360.b	ENSGT01030000234812.a
Characoidei	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00390000009630	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000156378.a.a	ENSGT00390000014429.a	ENSGT00390000011228.b.a.e.a	ENSGT00510000047967	ENSGT00940000155048.d.a.k	ENSGT00550000074884	ENSGT00940000156490.b.b	ENSGT00390000005939.a.b.b	ENSGT00940000165182.d	ENSGT00390000011620.a.a.b.e ##22	ENSGT00940000158073.b	ENSGT00940000160902.c.a	ENSGT00390000018730.A.f	ENSGT00940000154897.r	ENSGT00950000183021.a.b.d	ENSGT00940000161109.s.a	ENSGT00950000182835.d.a.k.a	ENSGT00390000011648.b	ENSGT00940000157392.o.b	ENSGT00530000063868.a.b	ENSGT00940000158436	ENSGT00940000155241.d	ENSGT00730000111360.b	ENSGT01030000234812.a	ENSGT00940000155189.pb.a
Red-bellied piranha	MODERN SPECIES	6	PBRM1 (ENSPNAG00000013202)	gnl3 (ENSPNAG00000013096)	glt8d1 (ENSPNAG00000002547)	spcs1 (ENSPNAG00000013052)	nek4 (ENSPNAG00000013047)	CAMK1 (ENSPNAG00000002527)	ccdc3b (ENSPNAG00000012983)	FAM107A (ENSPNAG00000012967)	fhit (ENSPNAG00000002483)	ENSPNAG00000005241	ptprga (ENSPNAG00000012931)	cse1l (ENSPNAG00000012903)	bmp7a (ENSPNAG00000002424)	ENSPNAG00000002414	ENSPNAG00000012810	TAF4 (ENSPNAG00000012794) ##22	cdh4 (ENSPNAG00000012744)	ENSPNAG00000002348	ENSPNAG00000002345	ENSPNAG00000012633	ENSPNAG00000002324	ENSPNAG00000002320	ENSPNAG00000012597	ZMYND8 (ENSPNAG00000002300)	NCOA3 (ENSPNAG00000012470)	id1 (ENSPNAG00000002251)	PFKFB2 (ENSPNAG00000012439)	phtf1 (ENSPNAG00000012360)	cishb (ENSPNAG00000002191)	twf2b (ENSPNAG00000012303)	rpusd4 (ENSPNAG00000012264)
Mexicana tetra	MODERN SPECIES	14	glt8d1 (ENSAMXG00000042559)	spcs1 (ENSAMXG00000017538)	nek4 (ENSAMXG00000031938)	CAMK1 (ENSAMXG00000017559)	zgc:194209 (ENSAMXG00000043132)	ENSAMXG00000042647	ccdc3b (ENSAMXG00000030925)	ENSAMXG00000042063	ENSAMXG00000037249	fhit (ENSAMXG00000016351)	ptprga (ENSAMXG00000016372)	cse1l (ENSAMXG00000016416)	bmp7a (ENSAMXG00000037549)	ENSAMXG00000041468	ENSAMXG00000043601	ENSAMXG00000016453 ##22	cdh4 (ENSAMXG00000016470)	ENSAMXG00000030049	ENSAMXG00000029646	dido1 (ENSAMXG00000006865)	ZMYND8 (ENSAMXG00000006882)	NCOA3 (ENSAMXG00000006902)	id1 (ENSAMXG00000030460)	PFKFB2 (ENSAMXG00000032440)	phtf1 (ENSAMXG00000006946)	cishb (ENSAMXG00000041177)	twf2b (ENSAMXG00000006961)	rpusd4 (ENSAMXG00000031479)	qrich1 (ENSAMXG00000006971)	ENSAMXG00000032492	ENSAMXG00000033226
Electric eel	MODERN SPECIES	454														bmp7a (ENSEEEG00000011144)	ENSEEEG00000011317	ENSEEEG00000011319 ##22	cdh4 (ENSEEEG00000011323)	ENSEEEG00000011328	ENSEEEG00000011332	ENSEEEG00000011335	ZMYND8 (ENSEEEG00000011372)
Cyprinoidei	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00940000159691	ENSGT00940000160187	ENSGT00940000158700	ENSGT00390000005106	ENSGT00950000182824.a.a.b.b	ENSGT00950000182937.B.a	ENSGT00940000159288	ENSGT00940000159878	ENSGT00940000157261.l	ENSGT00950000183124.A	ENSGT00950000183124.C	ENSGT00940000160163	ENSGT00940000158177.a	ENSGT00940000157007.i.b	ENSGT00940000159688	ENSGT00390000011620.a.a.b.e ##22	ENSGT00940000158073.b	ENSGT00390000018730.A.f	ENSGT00390000005214	ENSGT00940000160100	ENSGT00590000083094.a.a.c.a	ENSGT00940000153456.b.b	ENSGT01030000234637.b.d.a.a.c	ENSGT00390000002873	ENSGT00940000157279	ENSGT00510000046608.B	ENSGT00940000166173	ENSGT00940000153629.a.a.b	ENSGT00940000156409	ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.a.c	ENSGT00940000155820.a
Cyprininae	DUPLICATION
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000159691.j	ENSGT00940000160187.a	ENSGT00940000158700.b	ENSGT00390000005106.l	ENSGT00950000182824.a.a.b.b.b	ENSGT00950000182937.B.a.f	ENSGT00940000159288.d	ENSGT00940000159878.d	ENSGT00940000157261.l.a	ENSGT00950000183124.A.e.b	ENSGT00950000183124.C.d	ENSGT00940000160163.d	ENSGT00940000158177.a.b	ENSGT00940000157007.i.b.a	ENSGT00940000159688.d	ENSGT00390000011620.a.a.b.e.c ##22	ENSGT00940000158073.b.b
Goldfish	MODERN SPECIES	2	tfeb (ENSCARG00000031931)	ENSCARG00000031993	foxp4 (ENSCARG00000032067)	zgc:101564 (ENSCARG00000032458)	srgap2 (ENSCARG00000032519)	ikbke (ENSCARG00000033003)	RASSF5 (ENSCARG00000033048)	gfDYRK3 (ENSCARG00000033063)	mapkapk2a (ENSCARG00000033130)	il10 (ENSCARG00000033715)	ENSCARG00000033741	PRELP (ENSCARG00000033773)	ENSCARG00000033784	fmoda (ENSCARG00000033805)	slc6a14 (ENSCARG00000033887)	TAF4 (ENSCARG00000001938) ##22	cdh4 (ENSCARG00000002166)	ENSCARG00000002868	homer3b (ENSCARG00000002881)	ENSCARG00000002919	arrdc2 (ENSCARG00000002931)	ENSCARG00000002965	ENSCARG00000002982	nr2f6b (ENSCARG00000002987)	tax1bp3 (ENSCARG00000002994)	rpusd4 (ENSCARG00000003006)	qrich1 (ENSCARG00000003017)	psmd6 (ENSCARG00000003077)	slc2a9l1 (ENSCARG00000003090)	prickle2b (ENSCARG00000003106)	strn (ENSCARG00000003121)
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000159691.j	ENSGT00940000160187.a	ENSGT00940000158700.b	ENSGT00390000005106.l	ENSGT00950000182824.a.a.b.b.b	ENSGT00950000182937.B.a.f	ENSGT00940000159288.d	ENSGT00940000159878.d	ENSGT00940000157261.l.a	ENSGT00950000183124.A.e.b	ENSGT00950000183124.C.d	ENSGT00940000160163.d	ENSGT00940000158177.a.b	ENSGT00940000157007.i.b.a	ENSGT00940000159688.d	ENSGT00390000011620.a.a.b.e.c ##22	ENSGT00940000158073.b.b	ENSGT00390000018730.A.f.f	ENSGT00390000005214.e.b	ENSGT00940000160100.b	ENSGT00590000083094.a.a.c.a.p	ENSGT00940000153456.b.b.b	ENSGT01030000234637.b.d.a.a.c.a.a	ENSGT00390000002873.eb	ENSGT00940000157279.x	ENSGT00510000046608.B.i	ENSGT00940000166173.k	ENSGT00940000153629.a.a.b.b	ENSGT00940000156409.a	ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.a.c.a	ENSGT00940000155820.a.c.a
Common carp reference	MODERN SPECIES	13	tmem183a (ENSCCRG00000003185)	tfeb (ENSCCRG00000034741)	ENSCCRG00000075549	foxp4 (ENSCCRG00000043836)	zgc:101564 (ENSCCRG00000061267)	srgap2 (ENSCCRG00000037585)	ikbke (ENSCCRG00000037352)	RASSF5 (ENSCCRG00000082840)	dyrk3 (ENSCCRG00000054155)	mapkapk2a (ENSCCRG00000062136)	il19l (ENSCCRG00000028494)	ENSCCRG00000028493	zgc:113307 (ENSCCRG00000028491)	fmoda (ENSCCRG00000057559)	slc6a14 (ENSCCRG00000020342)	ENSCCRG00000020339 ##22	cdh4 (ENSCCRG00000069988)	ENSCCRG00000060780	ENSCCRG00000076284	C3orf14 (ENSCCRG00000022886)	fezf2 (ENSCCRG00000022884)	ENSCCRG00000054650	nampt2 (ENSCCRG00000060119)	SYNPR (ENSCCRG00000072101)	thoc7 (ENSCCRG00000025484)	ATXN7 (ENSCCRG00000012633)	psmd6 (ENSCCRG00000073683)	slc2a9l1 (ENSCCRG00000036799)	prickle2b (ENSCCRG00000036805)	ADAMTS9 (ENSCCRG00000039031)	magi1b (ENSCCRG00000039246)
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	3078																ENSSGRG00000011838 ##22
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	104	ENSGT00940000159691.i	ENSGT00940000160187.b	ENSGT00940000158700.a	ENSGT00390000005106.k	ENSGT00950000182824.a.a.b.b.a	ENSGT00950000182937.B.a.e	ENSGT00940000159288.c	ENSGT00940000159878.c	ENSGT00940000157261.l.b	ENSGT00950000183124.A.e.a	ENSGT00950000183124.C.c	ENSGT00940000160163.c	ENSGT00940000158177.a.a	ENSGT00940000157007.i.b.b	ENSGT00940000159688.c	ENSGT00390000011620.a.a.b.e.d ##22	ENSGT00940000158073.b.a	ENSGT00390000018730.A.f.e.a	ENSGT00390000018730.A.f.e.b	ENSGT00390000005214.e.a	ENSGT00940000160100.a	ENSGT00590000083094.a.a.c.a.o	ENSGT00940000153456.b.b.a	ENSGT01030000234637.b.d.a.a.c.b	ENSGT00390000002873.db	ENSGT00940000157279.w	ENSGT00510000046608.B.j	ENSGT00940000153629.a.a.b.a	ENSGT00940000156409.b	ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.a.c.b	ENSGT00940000155820.a.c.b
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000159691.i	ENSGT00940000160187.b	ENSGT00940000158700.a	ENSGT00390000005106.k	ENSGT00950000182824.a.a.b.b.a	ENSGT00950000182937.B.a.e	ENSGT00940000159288.c	ENSGT00940000159878.c	ENSGT00940000157261.l.b	ENSGT00950000183124.A.e.a	ENSGT00950000183124.C.c	ENSGT00940000160163.c	ENSGT00940000158177.a.a	ENSGT00940000157007.i.b.b	ENSGT00940000159688.c	ENSGT00390000011620.a.a.b.e.d ##22	ENSGT00940000158073.b.a	ENSGT00390000018730.A.f.e.a	ENSGT00390000018730.A.f.e.b	ENSGT00390000005214.e.a	ENSGT00940000160100.a	ENSGT00590000083094.a.a.c.a.o	ENSGT00940000153456.b.b.a	ENSGT01030000234637.b.d.a.a.c.b	ENSGT00390000002873.db	ENSGT00940000157279.w	ENSGT00510000046608.B.j	ENSGT00940000153629.a.a.b.a	ENSGT00940000156409.b	ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.a.c.b	ENSGT00940000155820.a.c.b
Common carp reference	MODERN SPECIES	42	tmem183a (ENSCCRG00000057482)	tfeb (ENSCCRG00000031918)	ENSCCRG00000070324	foxp4 (ENSCCRG00000025138)	zgc:101564 (ENSCCRG00000074850)	srgap2 (ENSCCRG00000044861)	ikbke (ENSCCRG00000045071)	RASSF5 (ENSCCRG00000056830)	dyrk3 (ENSCCRG00000067331)	mapkapk2a (ENSCCRG00000063236)	il10 (ENSCCRG00000020358)	il19l (ENSCCRG00000020353)	ENSCCRG00000020349	fmoda (ENSCCRG00000020344)	slc6a14 (ENSCCRG00000027901)	ENSCCRG00000027686 ##22	cdh4 (ENSCCRG00000059156)	ENSCCRG00000020830	ENSCCRG00000073603	C3orf14 (ENSCCRG00000044348)	fezf2 (ENSCCRG00000044352)	ENSCCRG00000049508	nampt2 (ENSCCRG00000069512)	SYNPR (ENSCCRG00000075099)	thoc7 (ENSCCRG00000040743)	ATXN7 (ENSCCRG00000040714)	psmd6 (ENSCCRG00000040693)	slc2a9l1 (ENSCCRG00000040669)	ADAMTS9 (ENSCCRG00000040660)	magi1b (ENSCCRG00000061477)	phtf1 (ENSCCRG00000027040)
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	1	tfeb (ENSSGRG00000046105)	ENSSGRG00000046106	foxp4 (ENSSGRG00000046107)	zgc:101564 (ENSSGRG00000046109)	srgap2 (ENSSGRG00000046111)	ikbke (ENSSGRG00000046121)	RASSF5 (ENSSGRG00000046177)	dyrk3 (ENSSGRG00000046179)	mapkapk2a (ENSSGRG00000046181)	il10 (ENSSGRG00000046204)	il19l (ENSSGRG00000046206)	PRELP (ENSSGRG00000046207)	zgc:113307 (ENSSGRG00000046208)	fmoda (ENSSGRG00000046209)	slc6a14 (ENSSGRG00000046210)	ENSSGRG00000046212 ##22	cdh4 (ENSSGRG00000046225)	ENSSGRG00000047042	C3orf14 (ENSSGRG00000047044)	fezf2 (ENSSGRG00000047045)	ENSSGRG00000047060	nampt2 (ENSSGRG00000049206)	SYNPR (ENSSGRG00000049398)	thoc7 (ENSSGRG00000049402)	ATXN7 (ENSSGRG00000049405)	psmd6 (ENSSGRG00000049410)	prickle2b (ENSSGRG00000049467)	ADAMTS9 (ENSSGRG00000049470)	rhol (ENSSGRG00000049473)	magi1b (ENSSGRG00000049475)	phtf1 (ENSSGRG00000049523)
Zebrafish	MODERN SPECIES	2	ENSDARG00000112164	srgap2 (ENSDARG00000032161)	ikbke (ENSDARG00000070606)	RASSF5 (ENSDARG00000070601)	dyrk3 (ENSDARG00000070600)	mapkapk2a (ENSDARG00000002552)	il10 (ENSDARG00000078147)	il19l (ENSDARG00000090344)	PRELP (ENSDARG00000070597)	zgc:113307 (ENSDARG00000044894)	fmoda (ENSDARG00000044895)	slc6a14 (ENSDARG00000029866)	ENSDARG00000114741	ENSDARG00000099409	ENSDARG00000103677	ENSDARG00000068192 ##22	cdh4 (ENSDARG00000015002)	ogfr2 (ENSDARG00000024815)	fezf2 (ENSDARG00000070677)	C11H3orf14 (ENSDARG00000086324)	ENSDARG00000043661	nampt2 (ENSDARG00000027183)	SYNPR (ENSDARG00000037587)	thoc7 (ENSDARG00000015394)	ATXN7 (ENSDARG00000074804)	psmd6 (ENSDARG00000070674)	slc2a9l1 (ENSDARG00000070672)	prickle2b (ENSDARG00000037593)	adamts9 (ENSDARG00000077778)	rhol (ENSDARG00000070666)	magi1b (ENSDARG00000003169)
Clupeocephala	ANCESTRAL SPECIES	180		ENSGT00940000156245.b	ENSGT00390000001787	ENSGT00980000202953	ENSGT00940000156490.b.a	ENSGT00940000163813	ENSGT00390000005939.a.b.a	ENSGT00940000165182.c	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000155218.A.d	ENSGT00740000116961	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010.db	ENSGT00390000011620.a.a.b.f ##22	ENSGT00940000158073.a	ENSGT00940000167904	ENSGT00940000160902.c.b	ENSGT00390000018730.A.e	ENSGT00940000163687	ENSGT00940000159233	ENSGT00940000160331	ENSGT00950000182872.f.a.a.a.a	ENSGT00940000156477.c	ENSGT00940000164502.a.a	ENSGT00940000159151	ENSGT00390000007823	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000155532
Otomorpha	ANCESTRAL SPECIES	35	ENSGT00940000156260.c	ENSGT00940000158489.a.a	ENSGT00390000001787	ENSGT00980000202953	ENSGT00940000156490.b.a	ENSGT00940000163813	ENSGT00390000005939.a.b.a	ENSGT00940000165182.c	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000155218.A.d	ENSGT00740000116961	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010.db	ENSGT00390000011620.a.a.b.f ##22	ENSGT00940000158073.a	ENSGT00940000167904	ENSGT00940000160902.c.b	ENSGT00390000018730.A.e	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000002821
Clupeiformes	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000159490	ENSGT00940000156037.b ##25	ENSGT00940000156260.c	ENSGT00940000158489.a.a	ENSGT00390000001787	ENSGT00940000156490.b.a	ENSGT00940000163813	ENSGT00390000005939.a.b.a	ENSGT00940000165182.c	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000155218.A.d	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010.db	ENSGT00390000011620.a.a.b.f ##22	ENSGT00940000158073.a	ENSGT00940000167904	ENSGT00940000160902.c.b	ENSGT00390000018730.A.e	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000155532.`e	ENSGT00390000018003.a	ENSGT00940000158954	ENSGT01030000234629.B	ENSGT00390000012992	ENSGT00940000156846	ENSGT00940000160409	ENSGT00950000182805.a.a.a.a.b	ENSGT00940000153615.a.a.a
Atlantic herring	MODERN SPECIES	20	baz2a (ENSCHAG00000023256)	ENSCHAG00000023236 ##25	mipb (ENSCHAG00000023231)	rbm38 (ENSCHAG00000023223)	spo11 (ENSCHAG00000023191)	bmp7b (ENSCHAG00000023183)	irf10 (ENSCHAG00000023178)	ENSCHAG00000023175	ENSCHAG00000023171	ENSCHAG00000023152	ENSCHAG00000023127	MTG2 (ENSCHAG00000023118)	SS18L1 (ENSCHAG00000023094)	PSMA7 (ENSCHAG00000023064)	lsm14b (ENSCHAG00000023053)	TAF4 (ENSCHAG00000023023) ##22	ebp (ENSCHAG00000023018)	ccdc115 (ENSCHAG00000023013)	ENSCHAG00000023009	apobec2b (ENSCHAG00000023007)	oard1 (ENSCHAG00000022998)	guca1b (ENSCHAG00000022983)	ENSCHAG00000022975	ENSCHAG00000022964	USP19 (ENSCHAG00000022835)	lamb2 (ENSCHAG00000020749)	ENSCHAG00000019282	ENSCHAG00000019059	TNNC2 (ENSCHAG00000019016)	tnnc2.2 (ENSCHAG00000018972)	taf13 (ENSCHAG00000018966)
Denticle herring	MODERN SPECIES	1	ENSDCDG00000024815	ENSDCDG00000024817	rho (ENSDCDG00000024819)	prickle2a (ENSDCDG00000024823)	QRICH1 (ENSDCDG00000024832)	qars1 (ENSDCDG00000024876)	espn (ENSDCDG00000024995)	hes2.2 (ENSDCDG00000025002)	acot7 (ENSDCDG00000025020)	GPR153 (ENSDCDG00000025132)	her3 (ENSDCDG00000025135)	MTG2 (ENSDCDG00000025136)	SS18L1 (ENSDCDG00000025139)	ENSDCDG00000025143 #21	lsm14b (ENSDCDG00000025151)	TAF4 (ENSDCDG00000025155) ##22	CDH4 (ENSDCDG00000025404)	ENSDCDG00000028998	kcnk15 (ENSDCDG00000028999)	ogfr (ENSDCDG00000029000)	ENSDCDG00000029003	ENSDCDG00000029005	SIKE1 (ENSDCDG00000029006)	slc25a33 (ENSDCDG00000029010)	spsb1 (ENSDCDG00000029014)	gpr157 (ENSDCDG00000029019)	slc2a5 (ENSDCDG00000029022)	CA6 (ENSDCDG00000029025)	eno1a (ENSDCDG00000029037)	RERE (ENSDCDG00000029107)	SAMD11 (ENSDCDG00000029126)
Otophysi	ANCESTRAL SPECIES	115					ENSGT00940000163813	ENSGT00390000005939.a.b.a	ENSGT00940000165182.c	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000155218.A.d.a	ENSGT00940000155218.A.d.b	ENSGT00740000116961	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010.db	ENSGT00390000011620.a.a.b.f ##22	ENSGT00940000158073.a	ENSGT00940000155141.x	ENSGT00940000160902.c.b	ENSGT00390000018730.A.e	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000155614.i.a	ENSGT00950000182835.c.c.g.a	ENSGT00940000164454	ENSGT00940000167069	ENSGT00390000018621	ENSGT00940000156650.j	ENSGT00940000157262.n	ENSGT00940000158342.a.a	ENSGT00940000153541.A
Characiphysae	ANCESTRAL SPECIES	73	ENSGT00940000160369	ENSGT00950000182945.b.a.a.a.b.b.a.b	ENSGT00390000013867.bc.b.a	ENSGT00940000157506.f	ENSGT00940000163813	ENSGT00390000005939.a.b.a	ENSGT00940000165182.c	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000155218.A.d.a	ENSGT00940000155218.A.d.b	ENSGT00740000116961	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010.db	ENSGT00390000011620.a.a.b.f ##22	ENSGT00940000158073.a	ENSGT00940000155141.x	ENSGT00940000160902.c.b	ENSGT00390000018730.A.e	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000167932.b	ENSGT00410000025882.b	ENSGT00940000157392.p	ENSGT00940000155614.i.a	ENSGT00950000182835.c.c.g.a	ENSGT00940000154681.b.c	ENSGT00530000063829.C.b	ENSGT00940000156917.a	ENSGT00730000111114
Characiphysae_b	ANCESTRAL SPECIES	141	ENSGT01020000230354.A.a.b	ENSGT00940000160369	ENSGT00950000182945.b.a.a.a.b.b.a.b	ENSGT00390000013867.bc.b.a	ENSGT00940000157506.f	ENSGT00940000163813	ENSGT00390000005939.a.b.a	ENSGT00940000165182.c	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000155218.A.d.a	ENSGT00740000116961	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010.db	ENSGT00390000011620.a.a.b.f ##22	ENSGT00940000158073.a
Characoidei	ANCESTRAL SPECIES	215	ENSGT00940000156326.a.a	ENSGT01020000230354.A.a.b	ENSGT00940000160369	ENSGT00950000182945.b.a.a.a.b.b.a.b	ENSGT00390000013867.bc.b.a	ENSGT00940000157506.f	ENSGT00940000163813	ENSGT00390000005939.a.b.a	ENSGT00940000165182.c	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000155218.A.d.a	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010.db	ENSGT00390000011620.a.a.b.f ##22	ENSGT00940000158073.a
Red-bellied piranha	MODERN SPECIES	478										ENSPNAG00000012655	ENSPNAG00000012673	MTG2 (ENSPNAG00000012691)	SS18L1 (ENSPNAG00000012700)	ENSPNAG00000012730	lsm14b (ENSPNAG00000012777)	TAF4 (ENSPNAG00000012792) ##22	CDH4 (ENSPNAG00000012844)
Mexicana tetra	MODERN SPECIES	55	LGR6 (ENSAMXG00000031251)	ENSAMXG00000032045	TULP1 (ENSAMXG00000005179)	ENSAMXG00000041624	ENSAMXG00000029908	irf10 (ENSAMXG00000032414)	ENSAMXG00000002724	ENSAMXG00000035993	ENSAMXG00000040727	ENSAMXG00000042674	MTG2 (ENSAMXG00000037141)	SS18L1 (ENSAMXG00000044015)	ENSAMXG00000041216	PSMA7 (ENSAMXG00000041229)	lsm14b (ENSAMXG00000002865)	TAF4 (ENSAMXG00000002886) ##22	CDH4 (ENSAMXG00000002925)
Electric eel	MODERN SPECIES	718								ENSEEEG00000001282	ENSEEEG00000001280	ENSEEEG00000001276	MTG2 (ENSEEEG00000001275)	ENSEEEG00000001274	ENSEEEG00000001273	ENSEEEG00000001272	ENSEEEG00000001270	ENSEEEG00000001268 ##22	CDH4 (ENSEEEG00000001230)
Euteleosteomorpha	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000156027.a	ENSGT00940000153541.A	ENSGT00940000157262.m.b	ENSGT00390000001787	ENSGT00940000156490.b.a	ENSGT00940000163813	ENSGT00390000005939.a.b.a	ENSGT00940000165182.c	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000155218.A.d	ENSGT00740000116961	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010.db	ENSGT00390000011620.a.a.b.f ##22	ENSGT00940000158073.a	ENSGT00940000167904	ENSGT00940000160902.c.b	ENSGT00390000018730.A.e	ENSGT00940000161930	ENSGT00940000154897.q	ENSGT00510000046470.a.a.b	ENSGT00950000183021.a.b.c	ENSGT00940000158489.a.a	ENSGT00940000156260.c	ENSGT00940000156037.b ##25	ENSGT00940000159490	ENSGT00940000154256.ac	ENSGT00440000033468	ENSGT00390000011466
Acanthomorphata	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000156027.a	ENSGT00940000153541.A	ENSGT00940000157262.m.b	ENSGT00940000156030.j	ENSGT00940000166256	ENSGT00390000001787	ENSGT00940000156490.b.a	ENSGT00940000163813	ENSGT00390000005939.a.b.a	ENSGT00940000165182.c	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000155218.A.d	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000156010.db	ENSGT00390000011620.a.a.b.f ##22	ENSGT00940000158073.a	ENSGT00940000160902.c.b	ENSGT00390000018730.A.e	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000155532	ENSGT00940000154897.q	ENSGT00510000046470.a.a.b	ENSGT00950000183021.a.b.c	ENSGT00940000158489.a.a	ENSGT00940000156245.b	ENSGT00940000156260.c	ENSGT00940000156037.b ##25	ENSGT00940000159490	ENSGT00940000154256.ac
Euacanthomorphacea	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000156027.a	ENSGT00940000153541.A	ENSGT00940000157262.m.b	ENSGT00940000156030.j	ENSGT00940000166256	ENSGT00390000001787	ENSGT00940000156490.b.a	ENSGT00940000163813	ENSGT00390000005939.a.b.a	ENSGT00940000165182.c	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000155218.A.d	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000156010.db	ENSGT00390000011620.a.a.b.f ##22	ENSGT00940000158073.a	ENSGT00990000209425	ENSGT00940000160902.c.b	ENSGT00390000018730.A.e	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000155532	ENSGT00940000154897.q	ENSGT00510000046470.a.a.b	ENSGT00950000183021.a.b.c	ENSGT00940000158489.a.a	ENSGT00940000156260.c	ENSGT00940000156037.b ##25	ENSGT00940000159490	ENSGT00940000154256.ac
Percomorphaceae	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000153541.A	ENSGT00940000157262.m.b	ENSGT00940000156030.j	ENSGT00940000166256	ENSGT00940000174536	ENSGT00390000001787	ENSGT00940000156490.b.a	ENSGT00940000163813	ENSGT00390000005939.a.b.a	ENSGT00940000165182.c	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000155218.A.d	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000156010.db	ENSGT00390000011620.a.a.b.f ##22	ENSGT00940000158073.a	ENSGT00990000209425	ENSGT00940000160902.c.b	ENSGT00390000018730.A.e	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000155532	ENSGT00940000154897.q	ENSGT00510000046470.a.a.b	ENSGT00950000183021.a.b.c	ENSGT00940000158489.a.a	ENSGT00940000156260.c	ENSGT00940000156037.b ##25	ENSGT00940000159490	ENSGT00940000154256.ac
Percomorphaceae_B	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000156062.n	ENSGT00390000003282.B.e	ENSGT00940000156027.a	ENSGT00940000153541.A	ENSGT00940000157262.m.b	ENSGT00390000001787	ENSGT00940000156490.b.a	ENSGT00940000163813	ENSGT00390000005939.a.b.a	ENSGT00940000165182.c	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000155218.A.d	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000156010.db	ENSGT00390000011620.a.a.b.f ##22	ENSGT00940000158073.a	ENSGT00990000209425	ENSGT00940000160902.c.b	ENSGT00390000018730.A.e	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000155532	ENSGT00940000154897.q	ENSGT00510000046470.a.a.b	ENSGT00950000183021.a.b.c	ENSGT00940000158489.a.a	ENSGT00940000156260.c	ENSGT00940000156037.b ##25	ENSGT00940000159490	ENSGT00940000154256.ac
Percomorphaceae_C	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000156062.n	ENSGT00390000003282.B.e	ENSGT00940000156027.a	ENSGT00940000153541.A	ENSGT00940000157262.m.b	ENSGT00390000001787	ENSGT00940000156490.b.a	ENSGT00940000163813	ENSGT00390000005939.a.b.a	ENSGT00940000165182.c	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000155218.A.d	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000156010.db	ENSGT00390000011620.a.a.b.f ##22	ENSGT00940000158073.a	ENSGT00940000160902.c.b	ENSGT00390000018730.A.e	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000155532	ENSGT00940000154897.q	ENSGT00510000046470.a.a.b	ENSGT00950000183021.a.b.c	ENSGT00940000158489.a.a	ENSGT00940000156260.c	ENSGT00940000156037.b ##25	ENSGT00940000159490	ENSGT00940000154256.ac	ENSGT00440000033468
Percomorphaceae_D	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000003282.B.e	ENSGT00940000156027.a	ENSGT00940000153541.A	ENSGT00940000157262.m.b	ENSGT00940000156030.j	ENSGT00390000001787	ENSGT00940000156490.b.a	ENSGT00940000163813	ENSGT00390000005939.a.b.a	ENSGT00940000165182.c	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000155218.A.d	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000156010.db	ENSGT00390000011620.a.a.b.f ##22	ENSGT00940000158073.a	ENSGT00940000160902.c.b	ENSGT00390000018730.A.e	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000155532	ENSGT00940000154897.q	ENSGT00510000046470.a.a.b	ENSGT00950000183021.a.b.c	ENSGT00940000158489.a.a	ENSGT00940000156260.c	ENSGT00940000156037.b ##25	ENSGT00940000159490	ENSGT00940000154256.ac	ENSGT00440000033468
Anabantaria	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00390000003282.B.e	ENSGT00940000156027.a	ENSGT00940000153541.A	ENSGT00940000157262.m.b	ENSGT00940000156030.j	ENSGT00390000001787	ENSGT00940000156490.b.a	ENSGT00940000163813	ENSGT00390000005939.a.b.a	ENSGT00940000165182.c	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000155218.A.d	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000156010.db	ENSGT00390000011620.a.a.b.f ##22	ENSGT00940000158073.a	ENSGT00940000160902.c.b	ENSGT00390000018730.A.e	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000155532	ENSGT00940000154897.q	ENSGT00510000046470.a.a.b	ENSGT00950000183021.a.b.c	ENSGT00940000158489.a.a	ENSGT00940000156260.c	ENSGT00940000156037.b ##25	ENSGT00940000159490	ENSGT00940000154256.ac	ENSGT00440000033468
Zig-zag eel	MODERN SPECIES	21	ENSMAMG00000024286	slc6a1a (ENSMAMG00000024110)	ENSMAMG00000024111	ENSMAMG00000024112	ENSMAMG00000024113	ENSMAMG00000024114	ENSMAMG00000024115	ENSMAMG00000024116	ENSMAMG00000024117	ENSMAMG00000024118	ENSMAMG00000024120	ENSMAMG00000024121	MTG2 (ENSMAMG00000024122)	ENSMAMG00000024685	LSM14B (ENSMAMG00000024124)	TAF4 (ENSMAMG00000024125) ##22	CDH4 (ENSMAMG00000024126)	ENSMAMG00000028231	kcnk15 (ENSMAMG00000024127)	OGFR (ENSMAMG00000024128)	ENSMAMG00000024129	ENSMAMG00000024431	ENSMAMG00000024131	ENSMAMG00000024132	ENSMAMG00000024133	ENSMAMG00000024134	rbm38 (ENSMAMG00000024135)	mipb (ENSMAMG00000024136)	ENSMAMG00000024137 ##25	baz2a (ENSMAMG00000024138)	ptges3b (ENSMAMG00000024139)
Anabantoidei	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000003282.B.e	ENSGT00940000156027.a	ENSGT00940000153541.A	ENSGT00940000157262.m.b	ENSGT00940000156030.j	ENSGT00390000001787	ENSGT00940000156490.b.a	ENSGT00940000163813	ENSGT00390000005939.a.b.a	ENSGT00940000165182.c	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000155218.A.d	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000156010.db	ENSGT00390000011620.a.a.b.f ##22	ENSGT00940000158073.a	ENSGT00940000160902.c.b	ENSGT00390000018730.A.e	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000155532	ENSGT00940000154897.q	ENSGT00510000046470.a.a.b	ENSGT00950000183021.a.b.c	ENSGT00940000158489.a.a	ENSGT00940000156260.c	ENSGT00940000156037.b ##25	ENSGT00940000159490	ENSGT00940000154256.ac	ENSGT00440000033468
Climbing perch	MODERN SPECIES	20	ENSATEG00000015602	slc6a1a (ENSATEG00000015611)	ENSATEG00000027776	ENSATEG00000015660	ENSATEG00000015672	ENSATEG00000015710	ENSATEG00000015733	ENSATEG00000015753	ENSATEG00000015767	ENSATEG00000026513	ENSATEG00000015788	ENSATEG00000015845	MTG2 (ENSATEG00000015862)	ENSATEG00000015876	LSM14B (ENSATEG00000015895)	TAF4 (ENSATEG00000015915) ##22	CDH4 (ENSATEG00000015956)	kcnk15 (ENSATEG00000028850)	ENSATEG00000016071	ENSATEG00000016084	ENSATEG00000028564	ENSATEG00000016186	ENSATEG00000016250	ENSATEG00000016274	ENSATEG00000016329	rbm38 (ENSATEG00000016366)	mipb (ENSATEG00000016400)	ENSATEG00000016551 ##25	baz2a (ENSATEG00000016605)	ptges3b (ENSATEG00000016669)	ENSATEG00000027021
Siamese fighting fish	MODERN SPECIES	18	pdyn (ENSBSLG00000014084)	GMEB2 (ENSBSLG00000014099)	tpk2 (ENSBSLG00000014122)	ENSBSLG00000014207	tpx2 (ENSBSLG00000014250)	plod1a (ENSBSLG00000014480)	si:dkeyp-104h9.5 (ENSBSLG00000015763)	phc2a (ENSBSLG00000016596)	ENSBSLG00000016631	rcc2 (ENSBSLG00000016722)	rpl22 (ENSBSLG00000016985)	ENSBSLG00000017139	MTG2 (ENSBSLG00000017198)	ENSBSLG00000017212	LSM14B (ENSBSLG00000017226)	TAF4 (ENSBSLG00000017261) ##22	CDH4 (ENSBSLG00000017726)	kcnk15 (ENSBSLG00000017936)	ogfr (ENSBSLG00000017938)	col9a3 (ENSBSLG00000017953)	ENSBSLG00000008226	ENSBSLG00000008243	ENSBSLG00000008260	prkcbp1l (ENSBSLG00000008515)	zgc:113278 (ENSBSLG00000011401)	NCOA3 (ENSBSLG00000011651)	rbm38 (ENSBSLG00000011817)	mipb (ENSBSLG00000011837)	ENSBSLG00000011886 ##25	baz2a (ENSBSLG00000011904)	ptges3b (ENSBSLG00000011971)
Carangaria	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000153541.A	ENSGT00940000157262.m.b	ENSGT00940000156030.j	ENSGT00940000166256.b	ENSGT00940000166256.a	ENSGT00390000001787	ENSGT00940000156490.b.a	ENSGT00940000163813	ENSGT00390000005939.a.b.a	ENSGT00940000165182.c	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000155218.A.d	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000156010.db	ENSGT00390000011620.a.a.b.f ##22	ENSGT00940000158073.a	ENSGT00940000160902.c.b	ENSGT00390000018730.A.e	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000155532	ENSGT00940000154897.q	ENSGT00510000046470.a.a.b	ENSGT00950000183021.a.b.c	ENSGT00940000158489.a.a	ENSGT00940000156260.c	ENSGT00940000156037.b ##25	ENSGT00940000159490	ENSGT00940000154256.ac	ENSGT00440000033468
Pleuronectoidei	ANCESTRAL SPECIES	38	ENSGT00940000156062.n	ENSGT00390000003282.B.e	ENSGT00940000156027.a	ENSGT00940000153541.A	ENSGT00940000157262.m.b	ENSGT00940000156030.j	ENSGT00390000001787	ENSGT00940000156490.b.a	ENSGT00940000163813	ENSGT00390000005939.a.b.a	ENSGT00940000165182.c	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000156010.db	ENSGT00390000011620.a.a.b.f ##22	ENSGT00940000158073.a	ENSGT00940000160902.c.b	ENSGT00390000018730.A.e	ENSGT00940000161930	ENSGT00940000154897.q	ENSGT00510000046470.a.a.b	ENSGT00950000183021.a.b.c	ENSGT00940000158489.a.a	ENSGT00940000156260.c	ENSGT00940000156037.b ##25	ENSGT00940000159490	ENSGT00940000154256.ac	ENSGT00440000033468	ENSGT00390000011466	ENSGT00940000158666.a.b
Turbot	MODERN SPECIES	2	slc6a1a (ENSSMAG00000020940)	ENSSMAG00000020950	ENSSMAG00000020951	ENSSMAG00000032794	ENSSMAG00000020952	ENSSMAG00000020963	ENSSMAG00000020985	ENSSMAG00000020987	ENSSMAG00000025353	ENSSMAG00000031631	ENSSMAG00000028209	ENSSMAG00000038052	MTG2 (ENSSMAG00000000126)	ENSSMAG00000000131	LSM14B (ENSSMAG00000000135)	TAF4 (ENSSMAG00000000140) ##22	CDH4 (ENSSMAG00000000251)	ENSSMAG00000024970	kcnk15 (ENSSMAG00000035293)	ENSSMAG00000032606	ENSSMAG00000000227	ENSSMAG00000000219	ENSSMAG00000031554	ENSSMAG00000000200	ENSSMAG00000000186	ENSSMAG00000000179	ENSSMAG00000000158	rbm38 (ENSSMAG00000000152)	mipb (ENSSMAG00000027662)	ENSSMAG00000000147 ##25	baz2a (ENSSMAG00000037563)
Carangaria_A	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000003282.B.e	ENSGT00940000156027.a	ENSGT00940000153541.A	ENSGT00940000157262.m.b	ENSGT00940000156030.j	ENSGT00390000001787	ENSGT00940000156490.b.a	ENSGT00940000163813	ENSGT00390000005939.a.b.a	ENSGT00940000165182.c	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000155218.A.d	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000156010.db	ENSGT00390000011620.a.a.b.f ##22	ENSGT00940000158073.a	ENSGT00940000160902.c.b	ENSGT00390000018730.A.e	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000155532	ENSGT00940000154897.q	ENSGT00510000046470.a.a.b	ENSGT00950000183021.a.b.c	ENSGT00940000158489.a.a	ENSGT00940000156260.c	ENSGT00940000156037.b ##25	ENSGT00940000159490	ENSGT00940000154256.ac	ENSGT00440000033468
Seriola	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000153541.A	ENSGT00940000157262.m.b	ENSGT00940000156030.j	ENSGT00940000166256.b	ENSGT00940000166256.a	ENSGT00390000001787	ENSGT00940000156490.b.a	ENSGT00940000163813	ENSGT00390000005939.a.b.a	ENSGT00940000165182.c	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000155218.A.d	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000156010.db	ENSGT00390000011620.a.a.b.f ##22	ENSGT00940000158073.a	ENSGT00940000160902.c.b	ENSGT00390000018730.A.e	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000155532	ENSGT00940000154897.q	ENSGT00510000046470.a.a.b	ENSGT00950000183021.a.b.c	ENSGT00940000158489.a.a	ENSGT00940000156260.c	ENSGT00940000156037.b ##25	ENSGT00940000159490	ENSGT00940000154256.ac	ENSGT00440000033468
Yellowtail amberjack	MODERN SPECIES	3175														lsm14b (ENSSLDG00000011354)	ENSSLDG00000011341	TAF4 (ENSSLDG00000011310) ##22	CDH4 (ENSSLDG00000011270)	kcnk15 (ENSSLDG00000011249)	ogfr (ENSSLDG00000011229)	col9a3 (ENSSLDG00000011159)	ENSSLDG00000011063	prkcbp1l (ENSSLDG00000010967)	zgc:113278 (ENSSLDG00000010912)	ENSSLDG00000010873	rbm38 (ENSSLDG00000010845)	mipb (ENSSLDG00000010819)	ENSSLDG00000010793 ##25	ENSSLDG00000010765	ENSSLDG00000010749	ptges3b (ENSSLDG00000010723)	ENSSLDG00000010609
Greater amberjack	MODERN SPECIES	16	VGLL4 (ENSSDUG00000000240)	slc6a1a (ENSSDUG00000000159)	ENSSDUG00000000111	DUSP7 (ENSSDUG00000000089)	ENSSDUG00000022838	spo11 (ENSSDUG00000022830)	bmp7b (ENSSDUG00000022821)	irf10 (ENSSDUG00000022811)	ENSSDUG00000022805	ENSSDUG00000022793	ENSSDUG00000022787	ENSSDUG00000022785	MTG2 (ENSSDUG00000022779)	ENSSDUG00000022774	lsm14b (ENSSDUG00000022770)	TAF4 (ENSSDUG00000022762) ##22	CDH4 (ENSSDUG00000022738)	kcnk15 (ENSSDUG00000022731)	ogfr (ENSSDUG00000022730)	col9a3 (ENSSDUG00000022709)	ENSSDUG00000022702	ENSSDUG00000022678	prkcbp1l (ENSSDUG00000022648)	zgc:113278 (ENSSDUG00000022639)	NCOA3 (ENSSDUG00000022617)	rbm38 (ENSSDUG00000022611)	mipb (ENSSDUG00000022586)	ENSSDUG00000022579 ##25	baz2a (ENSSDUG00000022561)	ptges3b (ENSSDUG00000022549)	naca (ENSSDUG00000022504)
Barramundi perch	MODERN SPECIES	252	VGLL4 (ENSLCAG00010019468)	slc6a1a (ENSLCAG00010019476)	ENSLCAG00010019519	DUSP7 (ENSLCAG00010019521)	ENSLCAG00010019529	spo11 (ENSLCAG00010019536)	bmp7b (ENSLCAG00010019543)	irf10 (ENSLCAG00010019557)	ENSLCAG00010019562	ENSLCAG00010019563	ENSLCAG00010019564	ENSLCAG00010019574	MTG2 (ENSLCAG00010019585)	SS18L1 (ENSLCAG00010019593)	lsm14b (ENSLCAG00010019596)	TAF4 (ENSLCAG00010019602) ##22	CDH4 (ENSLCAG00010019669)
Eupercaria	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000003282.B.e	ENSGT00940000156027.a	ENSGT00940000153541.A	ENSGT00940000157262.m.b	ENSGT00940000156030.j	ENSGT00390000001787	ENSGT00940000156490.b.a	ENSGT00940000163813	ENSGT00390000005939.a.b.a	ENSGT00940000165182.c	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000155218.A.d	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000156010.db	ENSGT00390000011620.a.a.b.f ##22	ENSGT00940000158073.a	ENSGT00940000160902.c.b	ENSGT00390000018730.A.e	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000155532	ENSGT00940000154897.q	ENSGT00510000046470.a.a.b	ENSGT00950000183021.a.b.c	ENSGT00940000158489.a.a	ENSGT00940000156260.c	ENSGT00940000156037.b ##25	ENSGT00940000159490	ENSGT00940000154256.ac	ENSGT00440000033468
Tetraodontidae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000156084	ENSGT00940000156062.n	ENSGT00390000003282.B.e	ENSGT00940000156027.a	ENSGT00940000153541.A	ENSGT00940000157262.m.b	ENSGT00390000001787	ENSGT00940000156490.b.a	ENSGT00940000163813	ENSGT00390000005939.a.b.a	ENSGT00940000165182.c	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000156010.db	ENSGT00390000011620.a.a.b.f ##22	ENSGT00940000158073.a	ENSGT00940000160902.c.b	ENSGT00390000018730.A.e	ENSGT00940000161930	ENSGT00940000174854	ENSGT00940000154897.q	ENSGT00510000046470.a.a.b	ENSGT00950000183021.a.b.c	ENSGT00940000158489.a.a	ENSGT00940000156260.c	ENSGT00940000156037.b ##25	ENSGT00940000159490	ENSGT00940000154256.ac	ENSGT00440000033468	ENSGT00390000011466
Fugu	MODERN SPECIES	15	raf1a (ENSTRUG00000006611)	Syn2B (ENSTRUG00000006203)	VGLL4 (ENSTRUG00000023743)	slc6a1a (ENSTRUG00000005690)	ENSTRUG00000005516	DUSP7 (ENSTRUG00000007779)	spo11 (ENSTRUG00000004583)	bmp7b (ENSTRUG00000003888)	irf10 (ENSTRUG00000002917)	ENSTRUG00000029935	ENSTRUG00000028740	ENSTRUG00000001661	MTG2 (ENSTRUG00000001561)	SS18L1 (ENSTRUG00000028532)	lsm14b (ENSTRUG00000001529)	TAF4 (ENSTRUG00000001439) ##22	CDH4 (ENSTRUG00000007673)	ENSTRUG00000027025	kcnk15 (ENSTRUG00000022486)	ogfr (ENSTRUG00000019853)	col9a3 (ENSTRUG00000006672)	ENSTRUG00000029510	ENSTRUG00000029106	prkcbp1l (ENSTRUG00000005834)	zgc:113278 (ENSTRUG00000005372)	NCOA3 (ENSTRUG00000004450)	rbm38 (ENSTRUG00000026395)	mipb (ENSTRUG00000028275)	ENSTRUG00000024312 ##25	ENSTRUG00000003058	ptges3b (ENSTRUG00000022850)
Tetraodon	MODERN SPECIES	24	cnbpa (ENSTNIG00000017940)	raf1a (ENSTNIG00000012621)	syn2a (ENSTNIG00000012620)	slc6a1a (ENSTNIG00000012619)	ENSTNIG00000012618	DUSP7 (ENSTNIG00000012617)	ENSTNIG00000012616	spo11 (ENSTNIG00000012615)	bmp7b (ENSTNIG00000012614)	irf10 (ENSTNIG00000012613)	ENSTNIG00000000162	ENSTNIG00000012612	MTG2 (ENSTNIG00000012611)	SS18L1 (ENSTNIG00000012610)	lsm14b (ENSTNIG00000012609)	TAF4 (ENSTNIG00000012608) ##22	CDH4 (ENSTNIG00000012607)	kcnk15 (ENSTNIG00000012606)	ogfr (ENSTNIG00000012605)	col9a3 (ENSTNIG00000012604)	ENSTNIG00000000421	prkcbp1l (ENSTNIG00000012603)	zgc:113278 (ENSTNIG00000012602)	NCOA3 (ENSTNIG00000012601)	ENSTNIG00000012600	mipb (ENSTNIG00000012599)	ENSTNIG00000012598	baz2a (ENSTNIG00000012597)	ptges3b (ENSTNIG00000012596)	naca (ENSTNIG00000012595)	ADCY6 (ENSTNIG00000012594)
Eupecaria_A	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000003282.B.e	ENSGT00940000156027.a	ENSGT00940000153541.A	ENSGT00940000157262.m.b	ENSGT00940000156030.j	ENSGT00390000001787	ENSGT00940000156490.b.a	ENSGT00940000163813	ENSGT00390000005939.a.b.a	ENSGT00940000165182.c	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000155218.A.d	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000156010.db	ENSGT00390000011620.a.a.b.f ##22	ENSGT00940000158073.a	ENSGT00940000160902.c.b	ENSGT00390000018730.A.e	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000155532	ENSGT00940000154897.q	ENSGT00510000046470.a.a.b	ENSGT00950000183021.a.b.c	ENSGT00940000158489.a.a	ENSGT00940000156260.c	ENSGT00940000156037.b ##25	ENSGT00940000159490	ENSGT00940000154256.ac	ENSGT00440000033468
Ballan wrasse	MODERN SPECIES	26	slc6a1a (ENSLBEG00000007443)	ENSLBEG00000007505	DUSP7 (ENSLBEG00000007544)	ENSLBEG00000007571	spo11 (ENSLBEG00000007627)	bmp7b (ENSLBEG00000007667)	irf10 (ENSLBEG00000007684)	ENSLBEG00000007715	ENSLBEG00000007734	ENSLBEG00000007774	ENSLBEG00000007883	MTG2 (ENSLBEG00000007918)	ENSLBEG00000007935	lsm14b (ENSLBEG00000007951)	ENSLBEG00000007971	TAF4 (ENSLBEG00000007994) ##22	nr2c2 (ENSLBEG00000008028)	ENSLBEG00000008057	wdr46 (ENSLBEG00000008068)	ENSLBEG00000008109	ENSLBEG00000008156	ENSLBEG00000008197	ENSLBEG00000008244	ogg1 (ENSLBEG00000008269)	qars1 (ENSLBEG00000008312)	QRICH1 (ENSLBEG00000008381)	ENSLBEG00000008431	ENSLBEG00000008455	prickle2a (ENSLBEG00000008475)	rho (ENSLBEG00000008570)	MAGI1 (ENSLBEG00000009222)
Eupecaria_B	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00390000003282.B.e	ENSGT00940000156027.a	ENSGT00940000153541.A	ENSGT00940000157262.m.b	ENSGT00940000156030.j	ENSGT00390000001787	ENSGT00940000156490.b.a	ENSGT00940000163813	ENSGT00390000005939.a.b.a	ENSGT00940000165182.c	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000155218.A.d	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000156010.db	ENSGT00390000011620.a.a.b.f ##22	ENSGT00940000158073.a	ENSGT00940000160902.c.b	ENSGT00390000018730.A.e	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000155532	ENSGT00940000154897.q	ENSGT00510000046470.a.a.b	ENSGT00950000183021.a.b.c	ENSGT00940000158489.a.a	ENSGT00940000156260.c	ENSGT00940000156037.b ##25	ENSGT00940000159490	ENSGT00940000154256.ac	ENSGT00440000033468
Eupecaria_C	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00390000003282.B.e	ENSGT00940000156027.a	ENSGT00940000153541.A	ENSGT00940000157262.m.b	ENSGT00940000156030.j	ENSGT00390000001787	ENSGT00940000156490.b.a	ENSGT00940000163813	ENSGT00390000005939.a.b.a	ENSGT00940000165182.c	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000155218.A.d	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000156010.db	ENSGT00390000011620.a.a.b.f ##22	ENSGT00940000158073.a	ENSGT00940000160902.c.b	ENSGT00390000018730.A.e	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000155532	ENSGT00940000154897.q	ENSGT00510000046470.a.a.b	ENSGT00950000183021.a.b.c	ENSGT00940000158489.a.a	ENSGT00940000156260.c	ENSGT00940000156037.b ##25	ENSGT00940000159490	ENSGT00940000154256.ac	ENSGT00440000033468
Eupercaria_incertae_sedis	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00390000003282.B.e	ENSGT00940000156027.a	ENSGT00940000153541.A	ENSGT00940000157262.m.b	ENSGT00940000156030.j	ENSGT00390000001787	ENSGT00940000156490.b.a	ENSGT00940000163813	ENSGT00390000005939.a.b.a	ENSGT00940000165182.c	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000155218.A.d	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000156010.db	ENSGT00390000011620.a.a.b.f ##22	ENSGT00940000158073.a	ENSGT00940000160902.c.b	ENSGT00390000018730.A.e	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000155532	ENSGT00940000154897.q	ENSGT00510000046470.a.a.b	ENSGT00950000183021.a.b.c	ENSGT00940000158489.a.a	ENSGT00940000156260.c	ENSGT00940000156037.b ##25	ENSGT00940000159490	ENSGT00940000154256.ac	ENSGT00440000033468
European seabass	MODERN SPECIES	14	ENSDLAG00005028508	slc6a1a (ENSDLAG00005004349)	ENSDLAG00005004200	ENSDLAG00005026444	ENSDLAG00005004136	ENSDLAG00005004117	ENSDLAG00005004070	ENSDLAG00005004052	ENSDLAG00005004048	ENSDLAG00005004039	ENSDLAG00005004017	ENSDLAG00005003982	MTG2 (ENSDLAG00005032440)	SS18L1 (ENSDLAG00005003909)	LSM14B (ENSDLAG00005003893)	TAF4 (ENSDLAG00005003568) ##22	CDH4 (ENSDLAG00005001494)	kcnk15 (ENSDLAG00005001321)	OGFR (ENSDLAG00005001310)	ENSDLAG00005001277	ENSDLAG00005001261	ENSDLAG00005033315	ENSDLAG00005025696	ENSDLAG00005025634	ENSDLAG00005025623	rbm38 (ENSDLAG00005025619)	mipb (ENSDLAG00005026810)	ENSDLAG00005031473	ENSDLAG00005035077 ##25	baz2a (ENSDLAG00005025601)	ptges3b (ENSDLAG00005025592)
Large yellow croaker	MODERN SPECIES	18	slc6a1a (ENSLCRG00005007120)	ENSLCRG00005007163	DUSP7 (ENSLCRG00005007164)	ENSLCRG00005007165	spo11 (ENSLCRG00005001447)	bmp7b (ENSLCRG00005001589)	IRF10 (ENSLCRG00005001665)	ENSLCRG00005001688	ENSLCRG00005001702	ENSLCRG00005001718	ENSLCRG00005001758	ENSLCRG00005001839	MTG2 (ENSLCRG00005001847)	SS18L1 (ENSLCRG00005001860)	lsm14b (ENSLCRG00005001876)	TAF4 (ENSLCRG00005001886) ##22	CDH4 (ENSLCRG00005002055)	ENSLCRG00005006171	kcnk15 (ENSLCRG00005006172)	ogfr (ENSLCRG00005006174)	col9a3 (ENSLCRG00005006177)	ENSLCRG00005006184	ENSLCRG00005006185	prkcbp1l (ENSLCRG00005006209)	zgc:113278 (ENSLCRG00005006718)	NCOA3 (ENSLCRG00005006720)	rbm38 (ENSLCRG00005006721)	mipb (ENSLCRG00005006722)	ENSLCRG00005006723 ##25	baz2a (ENSLCRG00005006725)	ptges3b (ENSLCRG00005006726)
Gilthead seabream	MODERN SPECIES	21	slc6a1a (ENSSAUG00010014234)	ENSSAUG00010014292	ENSSAUG00010014324	DUSP7 (ENSSAUG00010014328)	ENSSAUG00010014329	spo11 (ENSSAUG00010014336)	bmp7b (ENSSAUG00010014363)	irf10 (ENSSAUG00010014372)	ENSSAUG00010014374	ENSSAUG00010014377	ENSSAUG00010014380	ENSSAUG00010014382	MTG2 (ENSSAUG00010004113)	SS18L1 (ENSSAUG00010004145)	lsm14b (ENSSAUG00010004173)	TAF4 (ENSSAUG00010004212) ##22	CDH4 (ENSSAUG00010004420)	kcnk15 (ENSSAUG00010007910)	ogfr (ENSSAUG00010007911)	col9a3 (ENSSAUG00010007913)	ENSSAUG00010007920	ENSSAUG00010007921	prkcbp1l (ENSSAUG00010007956)	zgc:113278 (ENSSAUG00010012382)	NCOA3 (ENSSAUG00010012463)	rbm38 (ENSSAUG00010012466)	mipb (ENSSAUG00010012471)	ENSSAUG00010012473 ##25	baz2a (ENSSAUG00010012475)	naca (ENSSAUG00010012484)	prim1 (ENSSAUG00010012495)
Perciformes	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000003282.B.e	ENSGT00940000156027.a	ENSGT00940000153541.A	ENSGT00940000157262.m.b	ENSGT00940000156030.j	ENSGT00390000001787	ENSGT00940000156490.b.a	ENSGT00940000163813	ENSGT00390000005939.a.b.a	ENSGT00940000165182.c	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000155218.A.d	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000156010.db	ENSGT00390000011620.a.a.b.f ##22	ENSGT00940000158073.a	ENSGT00940000160902.c.b	ENSGT00390000018730.A.e	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000155532	ENSGT00940000154897.q	ENSGT00510000046470.a.a.b	ENSGT00950000183021.a.b.c	ENSGT00940000158489.a.a	ENSGT00940000156260.c	ENSGT00940000156037.b ##25	ENSGT00940000159490	ENSGT00940000154256.ac	ENSGT00440000033468
Cottioidei	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000003282.B.e	ENSGT00940000156027.a	ENSGT00940000153541.A	ENSGT00940000157262.m.b	ENSGT00940000156030.j	ENSGT00390000001787	ENSGT00940000156490.b.a	ENSGT00940000163813	ENSGT00390000005939.a.b.a	ENSGT00940000165182.c	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000155218.A.d	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000156010.db	ENSGT00390000011620.a.a.b.f ##22	ENSGT00940000158073.a	ENSGT00940000160902.c.b	ENSGT00390000018730.A.e	ENSGT00940000161930	ENSGT00940000154897.q	ENSGT00510000046470.a.a.b	ENSGT00950000183021.a.b.c	ENSGT00940000158489.a.a	ENSGT00940000156260.c	ENSGT00940000156037.b ##25	ENSGT00940000159490	ENSGT00940000154256.ac	ENSGT00440000033468	ENSGT00390000011466	ENSGT00940000158666.a.b
Lumpfish	MODERN SPECIES	22	syn2a (ENSCLMG00005017371)	VGLL4 (ENSCLMG00005017367)	slc6a1a (ENSCLMG00005017364)	ENSCLMG00005017362	DUSP7 (ENSCLMG00005017361)	ENSCLMG00005017344	spo11 (ENSCLMG00005017339)	bmp7b (ENSCLMG00005017337)	irf10 (ENSCLMG00005017332)	ENSCLMG00005017328	ENSCLMG00005017324	ENSCLMG00005017321	MTG2 (ENSCLMG00005017318)	ENSCLMG00005017314	LSM14B (ENSCLMG00005017294)	TAF4 (ENSCLMG00005017259) ##22	ENSCLMG00005017258	kcnk15 (ENSCLMG00005017257)	ogfr (ENSCLMG00005017255)	ENSCLMG00005017254	ENSCLMG00005017253	prkcbp1l (ENSCLMG00005012877)	zgc:113278 (ENSCLMG00005012847)	ENSCLMG00005012846	ENSCLMG00005012845	rbm38 (ENSCLMG00005012843)	mipb (ENSCLMG00005012841)	ENSCLMG00005012839 ##25	baz2a (ENSCLMG00005012837)	ptges3b (ENSCLMG00005012835)	naca (ENSCLMG00005012817)
Stickleback	MODERN SPECIES	512	slc6a1a (ENSGACG00000015157)	ENSGACG00000015155	ENSGACG00000015148	DUSP7 (ENSGACG00000015141)	ENSGACG00000015138	spo11 (ENSGACG00000015129)	bmp7b (ENSGACG00000015125)	irf10 (ENSGACG00000015123)	ENSGACG00000015121	ENSGACG00000015119	ENSGACG00000015114	ENSGACG00000015110	MTG2 (ENSGACG00000015104)	SS18L1 (ENSGACG00000015102)	lsm14b (ENSGACG00000015099)	TAF4 (ENSGACG00000015092) ##22	CDH4 (ENSGACG00000015086)
Perciformes_a	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000156062.n	ENSGT00390000003282.B.e	ENSGT00940000156027.a	ENSGT00940000153541.A	ENSGT00940000157262.m.b	ENSGT00940000156030.j	ENSGT00390000001787	ENSGT00940000156490.b.a	ENSGT00940000163813	ENSGT00390000005939.a.b.a	ENSGT00940000165182.c	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000156010.db	ENSGT00390000011620.a.a.b.f ##22	ENSGT00940000158073.a	ENSGT00940000160902.c.b	ENSGT00390000018730.A.e	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000155532	ENSGT00940000154897.q	ENSGT00510000046470.a.a.b	ENSGT00950000183021.a.b.c	ENSGT00940000158489.a.a	ENSGT00940000156260.c	ENSGT00940000156037.b ##25	ENSGT00940000159490	ENSGT00940000154256.ac	ENSGT00440000033468
Channel bull blenny	MODERN SPECIES	21	syn2a (ENSCGOG00000018244)	VGLL4 (ENSCGOG00000018227)	slc6a1a (ENSCGOG00000015410)	ENSCGOG00000015327	DUSP7 (ENSCGOG00000015322)	ENSCGOG00000015315	spo11 (ENSCGOG00000015307)	bmp7b (ENSCGOG00000015238)	ENSCGOG00000015232	irf10 (ENSCGOG00000015215)	ENSCGOG00000015211	ENSCGOG00000015209	MTG2 (ENSCGOG00000015183)	SS18L1 (ENSCGOG00000015178)	lsm14b (ENSCGOG00000015175)	TAF4 (ENSCGOG00000015172) ##22	CDH4 (ENSCGOG00000012741)	kcnk15 (ENSCGOG00000012702)	ogfr (ENSCGOG00000012700)	col9a3 (ENSCGOG00000012696)	ENSCGOG00000012695	ENSCGOG00000012692	prkcbp1l (ENSCGOG00000010252)	zgc:113278 (ENSCGOG00000009829)	ENSCGOG00000009798	NCOA3 (ENSCGOG00000009790)	rbm38 (ENSCGOG00000009788)	mipb (ENSCGOG00000009722)	ENSCGOG00000009708 ##25	baz2a (ENSCGOG00000009253)	ptges3b (ENSCGOG00000009199)
Pike perch	MODERN SPECIES	31	syn2a (ENSSLUG00000002630)	VGLL4 (ENSSLUG00000002747)	slc6a1a (ENSSLUG00000002771)	ENSSLUG00000002843	DUSP7 (ENSSLUG00000002848)	ENSSLUG00000002852	spo11 (ENSSLUG00000002873)	bmp7b (ENSSLUG00000002945)	irf10 (ENSSLUG00000002990)	ENSSLUG00000003021	ENSSLUG00000003028	ENSSLUG00000003044	MTG2 (ENSSLUG00000003074)	ENSSLUG00000003090	lsm14b (ENSSLUG00000003099)	TAF4 (ENSSLUG00000003116) ##22	CDH4 (ENSSLUG00000003193)	kcnk15 (ENSSLUG00000003516)	ogfr (ENSSLUG00000003543)	col9a3 (ENSSLUG00000003549)	ENSSLUG00000003594	ENSSLUG00000003600	ENSSLUG00000003606	prkcbp1l (ENSSLUG00000004010)	zgc:113278 (ENSSLUG00000010890)	NCOA3 (ENSSLUG00000010896)	rbm38 (ENSSLUG00000010900)	mipb (ENSSLUG00000010904)	ENSSLUG00000010907 ##25	baz2a (ENSSLUG00000010915)	ptges3b (ENSSLUG00000010925)
Ovalentaria	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000156062.n	ENSGT00390000003282.B.e	ENSGT00940000156027.a	ENSGT00940000153541.A	ENSGT00940000157262.m.b	ENSGT00390000001787	ENSGT00940000156490.b.a	ENSGT00940000163813	ENSGT00390000005939.a.b.a	ENSGT00940000165182.c	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000155218.A.d	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000156010.db	ENSGT00390000011620.a.a.b.f ##22	ENSGT00940000158073.a	ENSGT00990000209425	ENSGT00940000160902.c.b	ENSGT00390000018730.A.e	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000155532	ENSGT00940000154897.q	ENSGT00510000046470.a.a.b	ENSGT00950000183021.a.b.c	ENSGT00940000158489.a.a	ENSGT00940000156260.c	ENSGT00940000156037.b ##25	ENSGT00940000159490	ENSGT00940000154256.ac
Atherinomorphae	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000156062.n	ENSGT00390000003282.B.e	ENSGT00940000156027.a	ENSGT00940000153541.A	ENSGT00940000157262.m.b	ENSGT00390000001787	ENSGT00940000156490.b.a	ENSGT00940000163813	ENSGT00390000005939.a.b.a	ENSGT00940000165182.c	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000155218.A.d	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000156010.db	ENSGT00390000011620.a.a.b.f ##22	ENSGT00940000158073.a	ENSGT00990000209425	ENSGT00940000160902.c.b	ENSGT00390000018730.A.e	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000155532	ENSGT00940000154897.q	ENSGT00510000046470.a.a.b	ENSGT00950000183021.a.b.c	ENSGT00940000158489.a.a	ENSGT00940000156260.c	ENSGT00940000156037.b ##25	ENSGT00940000159490.g	ENSGT01050000247727
Cyprinodontiformes	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000156062.n	ENSGT00390000003282.B.e	ENSGT00940000156027.a	ENSGT00940000153541.A	ENSGT00940000157262.m.b	ENSGT00390000001787	ENSGT00940000156490.b.a	ENSGT00940000163813	ENSGT00390000005939.a.b.a	ENSGT00940000165182.c	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000155218.A.d	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000156010.db	ENSGT00390000011620.a.a.b.f ##22	ENSGT00940000158073.a	ENSGT00990000209425	ENSGT00940000160902.c.b	ENSGT00390000018730.A.e	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000155532	ENSGT00940000154897.q	ENSGT00510000046470.a.a.b	ENSGT00950000183021.a.b.c	ENSGT00940000158489.a.a	ENSGT00940000156260.c	ENSGT00940000156037.b ##25	ENSGT00940000159490.g	ENSGT01050000247727
Cyprinodontoidei	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00390000003282.B.e	ENSGT00940000156027.a	ENSGT00940000153541.A	ENSGT00940000157262.m.b	ENSGT00390000001787	ENSGT00940000156490.b.a	ENSGT00940000163813	ENSGT00390000005939.a.b.a	ENSGT00940000165182.c	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000155218.A.d.c	ENSGT00940000155218.A.d.d	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000156010.db	ENSGT00390000011620.a.a.b.f ##22	ENSGT00940000158073.a	ENSGT00990000209425	ENSGT00940000160902.c.b	ENSGT00390000018730.A.e	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000155532	ENSGT00940000154897.q	ENSGT00510000046470.a.a.b	ENSGT00950000183021.a.b.c	ENSGT00940000158489.a.a	ENSGT00940000156260.c	ENSGT00940000156037.b ##25	ENSGT00940000159490.g	ENSGT01050000247727
Poeciliinae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000156027.a	ENSGT00940000153541.A	ENSGT00940000157262.m.b	ENSGT00390000001787	ENSGT00940000156490.b.a	ENSGT00940000163813	ENSGT00390000005939.a.b.a	ENSGT00940000165182.c	ENSGT00940000161589.j	ENSGT00940000155218.A.d.c	ENSGT00940000155218.A.d.d	ENSGT00940000161589.i	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000156010.db	ENSGT00390000011620.a.a.b.f ##22	ENSGT00940000158073.a	ENSGT00990000209425	ENSGT00940000160902.c.b	ENSGT00390000018730.A.e	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000155532	ENSGT00940000154897.q	ENSGT00510000046470.a.a.b	ENSGT00950000183021.a.b.c	ENSGT00940000158489.a.a	ENSGT00940000156260.c	ENSGT00940000156037.b ##25	ENSGT00940000159490.g	ENSGT01050000247727
Poecilia	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000156027.a	ENSGT00940000153541.A	ENSGT00940000157262.m.b	ENSGT00390000001787	ENSGT00940000156490.b.a	ENSGT00940000163813	ENSGT00390000005939.a.b.a	ENSGT00940000165182.c	ENSGT00940000161589.j	ENSGT00940000155218.A.d.c	ENSGT00940000155218.A.d.d	ENSGT00940000161589.i	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000156010.db	ENSGT00390000011620.a.a.b.f ##22	ENSGT00940000158073.a	ENSGT00990000209425	ENSGT00940000160902.c.b	ENSGT00390000018730.A.e	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000155532	ENSGT00940000154897.q	ENSGT00510000046470.a.a.b	ENSGT00950000183021.a.b.c	ENSGT00940000158489.a.a	ENSGT00940000156260.c	ENSGT00940000156037.b ##25	ENSGT00940000159490.g	ENSGT01050000247727
NAME_6	ANCESTRAL SPECIES	42	ENSGT00940000156027.a	ENSGT00940000153541.A	ENSGT00940000157262.m.b	ENSGT00390000001787	ENSGT00940000156490.b.a	ENSGT00940000163813.i	ENSGT00390000005939.a.b.a	ENSGT00940000165182.c	ENSGT00940000161589.j	ENSGT00940000155218.A.d.c	ENSGT00940000155218.A.d.d	ENSGT00940000161589.i	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000156010.db	ENSGT00390000011620.a.a.b.f ##22	ENSGT00940000158073.a	ENSGT00940000160902.c.b	ENSGT00390000018730.A.e	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000155532	ENSGT00940000154897.q	ENSGT00510000046470.a.a.b	ENSGT00950000183021.a.b.c	ENSGT00940000158489.a.a	ENSGT00940000156260.c	ENSGT00940000156037.b ##25	ENSGT00940000159490.h	ENSGT00940000154256.ac	ENSGT00440000033468
Amazon molly	MODERN SPECIES	440	slc6a1a (ENSPFOG00000009044)	ENSPFOG00000009229	DUSP7 (ENSPFOG00000009304)	spo11 (ENSPFOG00000009343)	bmp7b (ENSPFOG00000009347)	irf10 (ENSPFOG00000009490)	ENSPFOG00000009556	ENSPFOG00000009566	ENSPFOG00000009600	ENSPFOG00000021739	ENSPFOG00000009787	ENSPFOG00000009894	MTG2 (ENSPFOG00000009959)	SS18L1 (ENSPFOG00000010044)	lsm14b (ENSPFOG00000010163)	TAF4 (ENSPFOG00000010171) ##22	CDH4 (ENSPFOG00000010273)	kcnk15 (ENSPFOG00000010789)	ogfr (ENSPFOG00000010824)	col9a3 (ENSPFOG00000010863)	ENSPFOG00000024328	ENSPFOG00000021714	prkcbp1l (ENSPFOG00000011234)	zgc:113278 (ENSPFOG00000011448)	NCOA3 (ENSPFOG00000011587)	rbm38 (ENSPFOG00000011658)	mipb (ENSPFOG00000011666)	ENSPFOG00000011726 ##25	baz2a (ENSPFOG00000011764)	ptges3b (ENSPFOG00000011978)	naca (ENSPFOG00000023414)
Sailfin molly	MODERN SPECIES	57										ENSPLAG00000005900	ENSPLAG00000005871	ENSPLAG00000005845	MTG2 (ENSPLAG00000005825)	SS18L1 (ENSPLAG00000005809)	LSM14B (ENSPLAG00000005793)	TAF4 (ENSPLAG00000005777) ##22	CDH4 (ENSPLAG00000005706)	kcnk15 (ENSPLAG00000005526)	ogfr (ENSPLAG00000005507)	col9a3 (ENSPLAG00000005488)	ENSPLAG00000005443	ENSPLAG00000005429	prkcbp1l (ENSPLAG00000005362)	zgc:113278 (ENSPLAG00000005272)	NCOA3 (ENSPLAG00000005231)	rbm38 (ENSPLAG00000005218)	mipb (ENSPLAG00000005206)	ENSPLAG00000005157 ##25	baz2a (ENSPLAG00000005140)	ptges3b (ENSPLAG00000005125)	naca (ENSPLAG00000005119)
Guppy	MODERN SPECIES	459	syn2a (ENSPREG00000008158)	VGLL4 (ENSPREG00000008150)	slc6a1a (ENSPREG00000008121)	ENSPREG00000008090	DUSP7 (ENSPREG00000008076)	spo11 (ENSPREG00000008058)	bmp7b (ENSPREG00000008041)	irf10 (ENSPREG00000007944)	ENSPREG00000007919	ENSPREG00000007912	ENSPREG00000007880	MTG2 (ENSPREG00000007861)	ENSPREG00000007853	ENSPREG00000007828	ENSPREG00000007817	TAF4 (ENSPREG00000007722) ##22	CDH4 (ENSPREG00000007680)	ENSPREG00000007664	ENSPREG00000007654	kcnk15 (ENSPREG00000007626)	ogfr (ENSPREG00000007614)	ENSPREG00000007590	prkcbp1l (ENSPREG00000007533)	zgc:113278 (ENSPREG00000007503)	NCOA3 (ENSPREG00000007429)	rbm38 (ENSPREG00000007398)	mipb (ENSPREG00000007285)	ENSPREG00000007252 ##25	ENSPREG00000007238	ENSPREG00000007227	ENSPREG00000007217
Platyfish	MODERN SPECIES		slc6a1a (ENSXMAG00000017742)	ENSXMAG00000021120	DUSP7 (ENSXMAG00000017789)	spo11 (ENSXMAG00000017799)	bmp7b (ENSXMAG00000017817)	irf10 (ENSXMAG00000017848)	ENSXMAG00000028965	ENSXMAG00000017854	ENSXMAG00000009659	ENSXMAG00000017866	ENSXMAG00000028553	ENSXMAG00000028070	MTG2 (ENSXMAG00000015450)	ENSXMAG00000022687	ENSXMAG00000015481	TAF4 (ENSXMAG00000015488) ##22	CDH4 (ENSXMAG00000015503)	ENSXMAG00000025331	kcnk15 (ENSXMAG00000029082)	ogfr (ENSXMAG00000009958)	col9a3 (ENSXMAG00000009969)	ENSXMAG00000028024	ENSXMAG00000010038	prkcbp1l (ENSXMAG00000010040)	zgc:113278 (ENSXMAG00000010064)	NCOA3 (ENSXMAG00000017470)	rbm38 (ENSXMAG00000023662)	mipb (ENSXMAG00000017461)	ENSXMAG00000017460 ##25	baz2a (ENSXMAG00000017451)	ptges3b (ENSXMAG00000017416)
NAME_4	ANCESTRAL SPECIES	101	ENSGT00940000156084	ENSGT00940000156062.n	ENSGT00390000003282.B.e	ENSGT00940000156027.a	ENSGT00940000153541.A	ENSGT00940000157262.m.b	ENSGT00390000001787	ENSGT00940000156490.b.a	ENSGT00940000163813	ENSGT00390000005939.a.b.a	ENSGT00940000165182.c	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000156010.db	ENSGT00390000011620.a.a.b.f ##22	ENSGT00940000158073.a
Mummichog	MODERN SPECIES	2287	DUSP7 (ENSFHEG00000003116)	spo11 (ENSFHEG00000003166)	bmp7b (ENSFHEG00000003184)	irf10 (ENSFHEG00000003215)	ENSFHEG00000003223	ENSFHEG00000003233	ENSFHEG00000003248	ENSFHEG00000003262	ENSFHEG00000003272	ENSFHEG00000003284	ENSFHEG00000003306	ENSFHEG00000003333	MTG2 (ENSFHEG00000003346)	ENSFHEG00000003356	LSM14B (ENSFHEG00000003362)	TAF4 (ENSFHEG00000003378) ##22	CDH4 (ENSFHEG00000003523)
Sheepshead minnow	MODERN SPECIES	320	VGLL4 (ENSCVAG00000012712)	slc6a1a (ENSCVAG00000012675)	ENSCVAG00000012631	DUSP7 (ENSCVAG00000012607)	spo11 (ENSCVAG00000012572)	bmp7b (ENSCVAG00000012517)	irf10 (ENSCVAG00000012497)	ENSCVAG00000012483	ENSCVAG00000000663	ENSCVAG00000012464	MTG2 (ENSCVAG00000012457)	SS18L1 (ENSCVAG00000012450)	ENSCVAG00000012444	ENSCVAG00000012433	ENSCVAG00000012411	TAF4 (ENSCVAG00000012402) ##22	CDH4 (ENSCVAG00000012370)
Aplocheiloidei	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000156062.n	ENSGT00390000003282.B.e	ENSGT00940000156027.a	ENSGT00940000153541.A	ENSGT00940000157262.m.b	ENSGT00390000001787	ENSGT00940000156490.b.a	ENSGT00940000163813	ENSGT00390000005939.a.b.a	ENSGT00940000165182.c	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000155218.A.d	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000156010.db	ENSGT00390000011620.a.a.b.f ##22	ENSGT00940000158073.a	ENSGT00940000160902.c.b	ENSGT00390000018730.A.e	ENSGT00940000161930	ENSGT00940000154897.q	ENSGT00510000046470.a.a.b	ENSGT00950000183021.a.b.c	ENSGT00940000158489.a.a	ENSGT00940000156260.c	ENSGT00940000156037.b ##25	ENSGT00940000159490.h	ENSGT00940000154256.ac	ENSGT00440000033468	ENSGT00390000011466	ENSGT00940000158666.a.b
Mangrove rivulus	MODERN SPECIES	13	slc6a1a (ENSKMAG00000013502)	ENSKMAG00000013462	DUSP7 (ENSKMAG00000013438)	spo11 (ENSKMAG00000013368)	bmp7b (ENSKMAG00000013338)	irf10 (ENSKMAG00000013286)	ENSKMAG00000013261	ENSKMAG00000013243	ENSKMAG00000013217	ENSKMAG00000012982	MTG2 (ENSKMAG00000012885)	ENSKMAG00000012873	ENSKMAG00000012859	ENSKMAG00000012850	ENSKMAG00000012834	TAF4 (ENSKMAG00000012754) ##22	CDH4 (ENSKMAG00000012691)	kcnk15 (ENSKMAG00000012670)	ogfr (ENSKMAG00000012656)	col9a3 (ENSKMAG00000012601)	ENSKMAG00000012559	prkcbp1l (ENSKMAG00000012490)	zgc:113278 (ENSKMAG00000012450)	NCOA3 (ENSKMAG00000012422)	rbm38 (ENSKMAG00000012402)	mipb (ENSKMAG00000012388)	ENSKMAG00000012365 ##25	baz2a (ENSKMAG00000012331)	ptges3b (ENSKMAG00000012312)	naca (ENSKMAG00000012234)	prim1 (ENSKMAG00000012150)
Oryzias	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000156062.n	ENSGT00390000003282.B.e	ENSGT00940000156027.a	ENSGT00940000153541.A	ENSGT00940000157262.m.b	ENSGT00390000001787	ENSGT00940000156490.b.a	ENSGT00940000163813	ENSGT00390000005939.a.b.a	ENSGT00940000165182.c	ENSGT00940000161589.l	ENSGT00940000155218.A.d	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000156010.db	ENSGT00390000011620.a.a.b.f ##22	ENSGT00940000158073.a	ENSGT00940000160902.c.b	ENSGT00390000018730.A.e	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000155532	ENSGT00940000154897.q	ENSGT00510000046470.a.a.b	ENSGT00950000183021.a.b.c	ENSGT00940000158489.a.a	ENSGT00940000156260.c	ENSGT00940000156037.b ##25	ENSGT00940000159490.h	ENSGT00940000154256.ac	ENSGT00440000033468
Oryzias_a	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000156062.n	ENSGT00390000003282.B.e	ENSGT00940000156027.a	ENSGT00940000153541.A	ENSGT00940000157262.m.b	ENSGT00390000001787	ENSGT00940000156490.b.a	ENSGT00940000163813	ENSGT00390000005939.a.b.a	ENSGT00940000165182.c	ENSGT00940000161589.l.a	ENSGT00940000155218.A.d	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000156010.db	ENSGT00390000011620.a.a.b.f ##22	ENSGT00940000158073.a	ENSGT00940000160902.c.b	ENSGT00390000018730.A.e	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000155532	ENSGT00940000154897.q	ENSGT00510000046470.a.a.b	ENSGT00950000183021.a.b.c	ENSGT00940000158489.a.a	ENSGT00940000156260.c	ENSGT00940000156037.b ##25	ENSGT00940000159490.h	ENSGT00940000154256.ac	ENSGT00440000033468
Japanese Medaka HdrR	MODERN SPECIES	21	ENSORLG00000011642	spo11 (ENSORLG00000011654)	bmp7b (ENSORLG00000011720)	irf10 (ENSORLG00000011745)	ENSORLG00000025783	ENSORLG00000023244	ENSORLG00000024787	ENSORLG00000026260	ENSORLG00000028288	ENSORLG00000022337	ENSORLG00000011759	ENSORLG00000011784	MTG2 (ENSORLG00000011791)	SS18L1 (ENSORLG00000011806)	LSM14B (ENSORLG00000028353)	TAF4 (ENSORLG00000011854) ##22	CDH4 (ENSORLG00000011866)	ENSORLG00000028947	kcnk15 (ENSORLG00000011872)	ogfr (ENSORLG00000028407)	col9a3 (ENSORLG00000011918)	ENSORLG00000028905	ENSORLG00000011946	prkcbp1l (ENSORLG00000012040)	zgc:113278 (ENSORLG00000012075)	NCOA3 (ENSORLG00000012143)	rbm38 (ENSORLG00000012154)	mipb (ENSORLG00000012169)	ENSORLG00000028732 ##25	baz2a (ENSORLG00000012214)	ptges3b (ENSORLG00000012236)
Chinese medaka	MODERN SPECIES	98	syn2a (ENSOSIG00000000496)	VGLL4 (ENSOSIG00000000954)	slc6a1a (ENSOSIG00000001003)	ENSOSIG00000006484	DUSP7 (ENSOSIG00000006493)	spo11 (ENSOSIG00000006498)	bmp7b (ENSOSIG00000006601)	irf10 (ENSOSIG00000006636)	ENSOSIG00000006639	ENSOSIG00000006642	ENSOSIG00000006648	ENSOSIG00000006655	MTG2 (ENSOSIG00000006658)	SS18L1 (ENSOSIG00000006660)	LSM14B (ENSOSIG00000006662)	TAF4 (ENSOSIG00000006667) ##22	CDH4 (ENSOSIG00000006682)
Oryzias_b	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000003282.B.e	ENSGT00940000156027.a	ENSGT00940000153541.A	ENSGT00940000157262.m.b	ENSGT00390000001787	ENSGT00940000156490.b.a	ENSGT00940000163813	ENSGT00390000005939.a.b.a	ENSGT00940000165182.c	ENSGT00940000161589.l	ENSGT00940000161589.k.b	ENSGT00940000161589.k.a	ENSGT00940000155218.A.d	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000156010.db	ENSGT00390000011620.a.a.b.f ##22	ENSGT00940000158073.a	ENSGT00940000160902.c.b	ENSGT00390000018730.A.e	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000155532	ENSGT00940000154897.q	ENSGT00510000046470.a.a.b	ENSGT00950000183021.a.b.c	ENSGT00940000158489.a.a	ENSGT00940000156260.c	ENSGT00940000156037.b ##25	ENSGT00940000159490.h	ENSGT00940000154256.ac	ENSGT00440000033468
Javanese ricefish	MODERN SPECIES	21	VGLL4 (ENSOJAG00000012101)	slc6a1a (ENSOJAG00000012121)	ENSOJAG00000012274	DUSP7 (ENSOJAG00000012303)	spo11 (ENSOJAG00000012351)	bmp7b (ENSOJAG00000012453)	irf10 (ENSOJAG00000012617)	ENSOJAG00000012623	ENSOJAG00000012627	ENSOJAG00000012635	ENSOJAG00000012648	ENSOJAG00000012822	ENSOJAG00000012868	MTG2 (ENSOJAG00000012886)	lsm14b (ENSOJAG00000012894)	TAF4 (ENSOJAG00000012903) ##22	CDH4 (ENSOJAG00000013014)	ENSOJAG00000013573	ENSOJAG00000013579	kcnk15 (ENSOJAG00000013592)	ogfr (ENSOJAG00000013604)	col9a3 (ENSOJAG00000013620)	ENSOJAG00000013732	ENSOJAG00000013748	prkcbp1l (ENSOJAG00000013803)	ENSOJAG00000015511	zgc:113278 (ENSOJAG00000015526)	NCOA3 (ENSOJAG00000015561)	rbm38 (ENSOJAG00000015643)	mipb (ENSOJAG00000015653)	ENSOJAG00000015679 ##25
Indian medaka	MODERN SPECIES	23	slc6a1a (ENSOMEG00000007745)	ENSOMEG00000007652	DUSP7 (ENSOMEG00000007613)	spo11 (ENSOMEG00000007582)	bmp7b (ENSOMEG00000007490)	irf10 (ENSOMEG00000007467)	ENSOMEG00000007446	ENSOMEG00000007441	ENSOMEG00000007403	ENSOMEG00000007324	ENSOMEG00000007305	ENSOMEG00000007287	MTG2 (ENSOMEG00000007270)	ENSOMEG00000000171	ENSOMEG00000007241	TAF4 (ENSOMEG00000007222) ##22	CDH4 (ENSOMEG00000007178)	kcnk15 (ENSOMEG00000007122)	ogfr (ENSOMEG00000007111)	col9a3 (ENSOMEG00000000165)	ENSOMEG00000007014	ENSOMEG00000006965	prkcbp1l (ENSOMEG00000006900)	zgc:113278 (ENSOMEG00000006851)	ENSOMEG00000006823	rbm38 (ENSOMEG00000006805)	mipb (ENSOMEG00000006781)	ENSOMEG00000006750 ##25	baz2a (ENSOMEG00000006706)	ptges3b (ENSOMEG00000006627)	RND1 (ENSOMEG00000000154)
Ovalentaria_B	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000003282.B.e	ENSGT00940000156027.a	ENSGT00940000153541.A	ENSGT00940000157262.m.b	ENSGT00940000156030.j	ENSGT00390000001787	ENSGT00940000156490.b.a	ENSGT00940000163813	ENSGT00390000005939.a.b.a	ENSGT00940000165182.c	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000155218.A.d	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000156010.db	ENSGT00390000011620.a.a.b.f ##22	ENSGT00940000158073.a	ENSGT00940000160902.c.b	ENSGT00390000018730.A.e	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000155532	ENSGT00940000154897.q	ENSGT00510000046470.a.a.b	ENSGT00950000183021.a.b.c	ENSGT00940000158489.a.a	ENSGT00940000156260.c	ENSGT00940000156037.b ##25	ENSGT00940000159490	ENSGT00940000154256.ac	ENSGT00440000033468
Pomacentridae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000003282.B.e	ENSGT00940000156027.a	ENSGT00940000153541.A	ENSGT00940000157262.m.b	ENSGT00940000156030.j	ENSGT00390000001787	ENSGT00940000156490.b.a	ENSGT00940000163813	ENSGT00390000005939.a.b.a	ENSGT00940000165182.c	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000155218.A.d	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000156010.db	ENSGT00390000011620.a.a.b.f ##22	ENSGT00940000158073.a	ENSGT00940000160902.c.b	ENSGT00390000018730.A.e	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000155532	ENSGT00940000154897.q	ENSGT00510000046470.a.a.b	ENSGT00950000183021.a.b.c	ENSGT00940000158489.a.a	ENSGT00940000156260.c	ENSGT00940000156037.b ##25	ENSGT00940000159490	ENSGT00940000154256.ac	ENSGT00440000033468
Pomacentridae_A	ANCESTRAL SPECIES	59	ENSGT00390000003282.B.e	ENSGT00940000156027.a	ENSGT00940000153541.A	ENSGT00940000157262.m.b	ENSGT00940000156030.j	ENSGT00390000001787	ENSGT00940000156490.b.a	ENSGT00940000163813	ENSGT00390000005939.a.b.a	ENSGT00940000165182.c	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000155218.A.d	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000156010.db	ENSGT00390000011620.a.a.b.f ##22	ENSGT00940000158073.a	ENSGT00940000160902.c.b	ENSGT00390000018730.A.e	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000155532	ENSGT00940000154897.q	ENSGT00510000046470.a.a.b	ENSGT00950000183021.a.b.c	ENSGT00940000158489.a.a	ENSGT00940000156260.c	ENSGT00940000156037.b ##25	ENSGT00940000159490	ENSGT00940000154256.ac	ENSGT00440000033468
Amphiprion	ANCESTRAL SPECIES	77	ENSGT00390000003282.B.e	ENSGT00940000156027.a	ENSGT00940000153541.A	ENSGT00940000157262.m.b	ENSGT00940000156030.j	ENSGT00390000001787	ENSGT00940000156490.b.a	ENSGT00940000163813	ENSGT00390000005939.a.b.a	ENSGT00940000165182.c	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000155218.A.d	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000156010.db	ENSGT00390000011620.a.a.b.f ##22	ENSGT00940000158073.a	ENSGT00940000160902.c.b	ENSGT00390000018730.A.e	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000155532	ENSGT00940000154897.q	ENSGT00510000046470.a.a.b	ENSGT00950000183021.a.b.c	ENSGT00940000158489.a.a	ENSGT00940000156260.c	ENSGT00940000156037.b ##25	ENSGT00940000159490	ENSGT00940000154256.ac	ENSGT00440000033468
Clown anemonefish	MODERN SPECIES	3397	VGLL4 (ENSAOCG00000006994)	slc6a1a (ENSAOCG00000006978)	ENSAOCG00000006927	DUSP7 (ENSAOCG00000006917)	ENSAOCG00000006909	spo11 (ENSAOCG00000006884)	bmp7b (ENSAOCG00000006837)	irf10 (ENSAOCG00000006804)	ENSAOCG00000006788	ENSAOCG00000006782	ENSAOCG00000006767	ENSAOCG00000006719	MTG2 (ENSAOCG00000006709)	SS18L1 (ENSAOCG00000006696)	lsm14b (ENSAOCG00000006667)	TAF4 (ENSAOCG00000006652) ##22
Orange clownfish	MODERN SPECIES	22	syn2a (ENSAPEG00000014339)	VGLL4 (ENSAPEG00000014321)	slc6a1a (ENSAPEG00000014269)	ENSAPEG00000014232	DUSP7 (ENSAPEG00000014224)	ENSAPEG00000014190	spo11 (ENSAPEG00000014057)	bmp7b (ENSAPEG00000013999)	irf10 (ENSAPEG00000013982)	ENSAPEG00000013961	ENSAPEG00000013941	ENSAPEG00000013856	MTG2 (ENSAPEG00000013840)	SS18L1 (ENSAPEG00000013802)	ENSAPEG00000013779	TAF4 (ENSAPEG00000013714) ##22	CDH4 (ENSAPEG00000013503)	kcnk15 (ENSAPEG00000013426)	ogfr (ENSAPEG00000013420)	col9a3 (ENSAPEG00000013325)	ENSAPEG00000013305	ENSAPEG00000013293	prkcbp1l (ENSAPEG00000013260)	zgc:113278 (ENSAPEG00000013249)	NCOA3 (ENSAPEG00000013225)	rbm38 (ENSAPEG00000013137)	mipb (ENSAPEG00000013129)	ENSAPEG00000013107 ##25	ENSAPEG00000013083	ENSAPEG00000013068	ptges3b (ENSAPEG00000013037)
Spiny chromis	MODERN SPECIES	533	VGLL4 (ENSAPOG00000010447)	slc6a1a (ENSAPOG00000010425)	ENSAPOG00000010361	DUSP7 (ENSAPOG00000010353)	ENSAPOG00000010344	spo11 (ENSAPOG00000010320)	bmp7b (ENSAPOG00000010229)	irf10 (ENSAPOG00000010188)	ENSAPOG00000010154	ENSAPOG00000010145	ENSAPOG00000010127	MTG2 (ENSAPOG00000010041)	SS18L1 (ENSAPOG00000010017)	ENSAPOG00000010003	ENSAPOG00000009997	TAF4 (ENSAPOG00000009970) ##22
Bicolor damselfish	MODERN SPECIES	1695					spo11 (ENSSPAG00000019066)	bmp7b (ENSSPAG00000019044)	irf10 (ENSSPAG00000018996)	ENSSPAG00000018983	ENSSPAG00000018974	ENSSPAG00000018929	ENSSPAG00000018899	MTG2 (ENSSPAG00000018882)	ENSSPAG00000018877	lsm14b (ENSSPAG00000018854)	ENSSPAG00000018837	TAF4 (ENSSPAG00000018804) ##22
Cichlidae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000003282.B.e	ENSGT00940000156027.a	ENSGT00940000153541.A	ENSGT00940000157262.m.b	ENSGT00940000156030.j	ENSGT00390000001787	ENSGT00940000156490.b.a	ENSGT00940000163813	ENSGT00390000005939.a.b.a	ENSGT00940000165182.c	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000155218.A.d	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000156010.db	ENSGT00390000011620.a.a.b.f ##22	ENSGT00940000158073.a	ENSGT00940000160902.c.b	ENSGT00390000018730.A.e	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000155532	ENSGT00940000154897.q	ENSGT00510000046470.a.a.b	ENSGT00950000183021.a.b.c	ENSGT00940000158489.a.a	ENSGT00940000156260.c	ENSGT00940000156037.b ##25	ENSGT00940000159490	ENSGT00940000154256.ac	ENSGT00440000033468
Pseudocrenilabrinae	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00390000003282.B.e	ENSGT00940000156027.a	ENSGT00940000153541.A	ENSGT00940000157262.m.b	ENSGT00940000156030.j	ENSGT00390000001787	ENSGT00940000156490.b.a	ENSGT00940000163813	ENSGT00390000005939.a.b.a	ENSGT00940000165182.c	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000155218.A.d	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000156010.db	ENSGT00390000011620.a.a.b.f ##22	ENSGT00940000158073.a	ENSGT00940000160902.c.b	ENSGT00390000018730.A.e	ENSGT00940000154897.q	ENSGT00510000046470.a.a.b	ENSGT00950000183021.a.b.c	ENSGT00940000158489.a.a	ENSGT00940000156260.c	ENSGT00940000156037.b ##25	ENSGT00940000159490	ENSGT00940000154256.ac	ENSGT00440000033468	ENSGT00390000011466	ENSGT00940000158666.a.b	ENSGT00940000155606.b
Pseudocrenilabrinae_A	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00390000003282.B.e	ENSGT00940000156027.a	ENSGT00940000153541.A	ENSGT00940000157262.m.b	ENSGT00940000156030.j	ENSGT00390000001787	ENSGT00940000156490.b.a	ENSGT00940000163813	ENSGT00390000005939.a.b.a	ENSGT00940000165182.c	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000155218.A.d	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000156010.db	ENSGT00390000011620.a.a.b.f ##22	ENSGT00940000158073.a	ENSGT00940000160902.c.b	ENSGT00390000018730.A.e	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000154897.q	ENSGT00510000046470.a.a.b	ENSGT00950000183021.a.b.c	ENSGT00940000158489.a.a	ENSGT00940000156260.c	ENSGT00940000156037.b ##25	ENSGT00940000159490	ENSGT00940000154256.ac	ENSGT00440000033468	ENSGT00390000011466
Haplochromini	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00390000003282.B.e	ENSGT00940000156027.a	ENSGT00940000153541.A	ENSGT00940000157262.m.b	ENSGT00940000156030.j	ENSGT00390000001787	ENSGT00940000156490.b.a	ENSGT00940000163813	ENSGT00390000005939.a.b.a	ENSGT00940000165182.c	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000155218.A.d	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000156010.db	ENSGT00390000011620.a.a.b.f ##22	ENSGT00940000158073.a	ENSGT00940000160902.c.b	ENSGT00390000018730.A.e	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000155532	ENSGT00940000154897.q	ENSGT00510000046470.a.a.b	ENSGT00950000183021.a.b.c	ENSGT00940000158489.a.a	ENSGT00940000156260.c	ENSGT00940000156037.b ##25	ENSGT00940000159490	ENSGT00940000154256.ac	ENSGT00440000033468
Haplochromini_A	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000156062.n	ENSGT00390000003282.B.e	ENSGT00940000156027.a	ENSGT00940000153541.A	ENSGT00940000157262.m.b	ENSGT00940000156030.j	ENSGT00390000001787	ENSGT00940000156490.b.a	ENSGT00940000163813	ENSGT00390000005939.a.b.a	ENSGT00940000165182.c	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000156010.db	ENSGT00390000011620.a.a.b.f ##22	ENSGT00940000158073.a	ENSGT00940000160902.c.b	ENSGT00390000018730.A.e	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000155532	ENSGT00940000154897.q	ENSGT00510000046470.a.a.b	ENSGT00950000183021.a.b.c	ENSGT00940000158489.a.a	ENSGT00940000156260.c	ENSGT00940000156037.b ##25	ENSGT00940000159490	ENSGT00940000154256.ac	ENSGT00440000033468
P. nyererei	MODERN SPECIES	339							KLHL10 (ENSPNYG00000022280)	spo11 (ENSPNYG00000022272)	bmp7b (ENSPNYG00000021960)	irf10 (ENSPNYG00000021778)	ENSPNYG00000021760	ENSPNYG00000021741	MTG2 (ENSPNYG00000021727)	ENSPNYG00000021719	ENSPNYG00000021706	TAF4 (ENSPNYG00000021689) ##22	ENSPNYG00000021674	CDH4 (ENSPNYG00000021653)	kcnk15 (ENSPNYG00000021593)	ogfr (ENSPNYG00000021562)	col9a3 (ENSPNYG00000021528)	ENSPNYG00000021479	prkcbp1l (ENSPNYG00000021453)	zgc:113278 (ENSPNYG00000021422)	NCOA3 (ENSPNYG00000021400)	rbm38 (ENSPNYG00000021373)	mipb (ENSPNYG00000021274)	ENSPNYG00000021232 ##25	ENSPNYG00000021212	ENSPNYG00000021194	ptges3b (ENSPNYG00000021178)
Haplochromini_B	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000156062.n	ENSGT00390000003282.B.e	ENSGT00940000156027.a	ENSGT00940000153541.A	ENSGT00940000157262.m.b	ENSGT00940000156030.j	ENSGT00390000001787	ENSGT00940000156490.b.a	ENSGT00940000163813	ENSGT00390000005939.a.b.a	ENSGT00940000165182.c	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000156010.db.m	ENSGT00390000011620.a.a.b.f ##22	ENSGT00940000158073.a	ENSGT00940000160902.c.b	ENSGT00390000018730.A.e	ENSGT00940000154897.q	ENSGT00510000046470.a.a.b	ENSGT00950000183021.a.b.c	ENSGT00940000158489.a.a	ENSGT00940000156260.c	ENSGT00940000156037.b ##25	ENSGT00940000159490	ENSGT00940000154256.ac	ENSGT00390000011466	ENSGT00940000158666.a.b	ENSGT00940000155606.b	ENSGT00950000182837.b.a.b
Zebra mbuna	MODERN SPECIES	1103	syn2a (ENSMZEG00005025923)	VGLL4 (ENSMZEG00005025925)	slc6a1a (ENSMZEG00005025927)	ENSMZEG00005025930	DUSP7 (ENSMZEG00005025931)	ENSMZEG00005025936	spo11 (ENSMZEG00005025972)	bmp7b (ENSMZEG00005025985)	irf10 (ENSMZEG00005025986)	ENSMZEG00005025990	ENSMZEG00005025992	ENSMZEG00005025993	MTG2 (ENSMZEG00005025997)	SS18L1 (ENSMZEG00005025998)	LSM14B (ENSMZEG00005026001)	TAF4 (ENSMZEG00005026003) ##22	CDH4 (ENSMZEG00005026005)	kcnk15 (ENSMZEG00005026009)	ogfr (ENSMZEG00005026010)	col9a3 (ENSMZEG00005026013)	ENSMZEG00005026018	ENSMZEG00005026020	prkcbp1l (ENSMZEG00005026024)	zgc:113278 (ENSMZEG00005026027)	NCOA3 (ENSMZEG00005026031)	rbm38 (ENSMZEG00005026036)	mipb (ENSMZEG00005026040)	ENSMZEG00005026043 ##25	baz2a (ENSMZEG00005026049)	ptges3b (ENSMZEG00005026058)	ENSMZEG00005026060
Burton s mouthbrooder	MODERN SPECIES	346										ENSHBUG00000012381	ENSHBUG00000012376	ENSHBUG00000012356	MTG2 (ENSHBUG00000012340)	SS18L1 (ENSHBUG00000000346)	ENSHBUG00000012323	TAF4 (ENSHBUG00000012310) ##22	CDH4 (ENSHBUG00000012301)	ENSHBUG00000012242	kcnk15 (ENSHBUG00000012226)	ogfr (ENSHBUG00000012216)	col9a3 (ENSHBUG00000012207)	ENSHBUG00000012134	prkcbp1l (ENSHBUG00000012117)	zgc:113278 (ENSHBUG00000012081)	NCOA3 (ENSHBUG00000012067)	rbm38 (ENSHBUG00000012058)	mipb (ENSHBUG00000012019)	ENSHBUG00000012010 ##25	baz2a (ENSHBUG00000011999)	ptges3b (ENSHBUG00000011995)	ENSHBUG00000011988
Lyretail cichlid	MODERN SPECIES	334	cnbpa (ENSNBRG00000022113)	raf1a (ENSNBRG00000022128)	syn2a (ENSNBRG00000022172)	VGLL4 (ENSNBRG00000022196)	slc6a1a (ENSNBRG00000022219)	ENSNBRG00000022240	DUSP7 (ENSNBRG00000022256)	ENSNBRG00000022260	spo11 (ENSNBRG00000022278)	bmp7b (ENSNBRG00000022300)	irf10 (ENSNBRG00000022314)	ENSNBRG00000022326	MTG2 (ENSNBRG00000022342)	ENSNBRG00000022365	ENSNBRG00000022370	TAF4 (ENSNBRG00000022380) ##22	CDH4 (ENSNBRG00000022425)	kcnk15 (ENSNBRG00000022515)	ogfr (ENSNBRG00000022529)	col9a3 (ENSNBRG00000022551)	ENSNBRG00000022599	prkcbp1l (ENSNBRG00000022618)	zgc:113278 (ENSNBRG00000022643)	ENSNBRG00000022659	ENSNBRG00000022671	rbm38 (ENSNBRG00000022685)	mipb (ENSNBRG00000022736)	ENSNBRG00000022808 ##25	ENSNBRG00000022823	ENSNBRG00000022838	ptges3b (ENSNBRG00000022841)
Nile tilapia	MODERN SPECIES	12	slc6a1a (ENSONIG00000017160)	ENSONIG00000017159	ENSONIG00000040172	spo11 (ENSONIG00000017154)	DUSP7 (ENSONIG00000017157)	bmp7b (ENSONIG00000017150)	irf10 (ENSONIG00000017148)	ENSONIG00000035271	ENSONIG00000017146	ENSONIG00000017145	ENSONIG00000017132	ENSONIG00000038637	ENSONIG00000041254	MTG2 (ENSONIG00000017130)	lsm14b (ENSONIG00000037640)	TAF4 (ENSONIG00000017122) ##22	CDH4 (ENSONIG00000017111)	kcnk15 (ENSONIG00000029925)	ogfr (ENSONIG00000017108)	col9a3 (ENSONIG00000017095)	ENSONIG00000034167	ENSONIG00000039814	prkcbp1l (ENSONIG00000017087)	zgc:113278 (ENSONIG00000017081)	NCOA3 (ENSONIG00000017075)	rbm38 (ENSONIG00000017073)	mipb (ENSONIG00000029660)	ENSONIG00000035177 ##25	baz2a (ENSONIG00000017063)	ptges3b (ENSONIG00000029831)	naca (ENSONIG00000017056)
Midas cichlid	MODERN SPECIES	732	VGLL4 (ENSACIG00000003459)	slc6a1a (ENSACIG00000003423)	ENSACIG00000003407	DUSP7 (ENSACIG00000003348)	ENSACIG00000003311	spo11 (ENSACIG00000003282)	ENSACIG00000003270	bmp7b (ENSACIG00000003253)	irf10 (ENSACIG00000003233)	ENSACIG00000003220	ENSACIG00000003197	MTG2 (ENSACIG00000003178)	ENSACIG00000003167	LSM14B (ENSACIG00000003147)	ENSACIG00000003134	TAF4 (ENSACIG00000003098) ##22	CDH4 (ENSACIG00000002869)
Cod	MODERN SPECIES		syn2a (ENSGMOG00000016959)	ENSGMOG00000023206	slc6a1a (ENSGMOG00000002873)	ENSGMOG00000002857	ENSGMOG00000002844	ENSGMOG00000002805	ENSGMOG00000002782	ENSGMOG00000002761	ENSGMOG00000002737	ENSGMOG00000036169	ENSGMOG00000024498	ENSGMOG00000002661	ENSGMOG00000002622	MTG2 (ENSGMOG00000002601)	ENSGMOG00000027726	TAF4 (ENSGMOG00000002528) ##22	CDH4 (ENSGMOG00000002481)	kcnk15 (ENSGMOG00000036247)	ENSGMOG00000036566	ENSGMOG00000013870	ENSGMOG00000013901	ENSGMOG00000027736	ENSGMOG00000014051	ENSGMOG00000014105	ENSGMOG00000016251	ENSGMOG00000029410	PRIM1 (ENSGMOG00000001218)	ENSGMOG00000001195	PTGES3 (ENSGMOG00000001184)	BAZ2A (ENSGMOG00000001100)	RND1 (ENSGMOG00000029984)
Protacanthopterygii	ANCESTRAL SPECIES	37	ENSGT00940000157262.m.b	ENSGT00940000156030.j	ENSGT00940000166256	ENSGT00390000001787	ENSGT00940000156490.b.a	ENSGT00940000163813	ENSGT00390000005939.a.b.a	ENSGT00940000165182.c	ENSGT00940000161589	ENSGT00940000155218.A.d	ENSGT00740000116961	ENSGT00940000157379	ENSGT00940000159853	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010.db	ENSGT00390000011620.a.a.b.f ##22	ENSGT00940000158073.a	ENSGT00940000167904	ENSGT00940000160902.c.b	ENSGT00390000018730.A.e	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000181232
Salmoninae	DUPLICATION
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	50	ENSGT00940000156062.n.c	ENSGT00390000003282.B.e.a	ENSGT00940000156027.a.e	ENSGT00940000153541.A.d	ENSGT00940000157262.m.b.a	ENSGT00990000211061	ENSGT00940000156490.b.a.c	ENSGT00940000163813.k	ENSGT00390000005939.a.b.a.a	ENSGT00940000161589.q	ENSGT00940000155218.A.d	ENSGT00740000116961.a	ENSGT00940000157379.l.a	ENSGT00940000159853.c	ENSGT00940000160354.j.b #21	ENSGT00390000011620.a.a.b.f.a ##22	ENSGT00940000158073.a.a	ENSGT00940000160902.c.b.b	ENSGT00390000018730.A.e.c	ENSGT00940000161930	ENSGT00940000155532.ud.a	ENSGT00940000154897.q.e	ENSGT00510000046470.a.a.b.d	ENSGT00950000183021.a.b.c.g	ENSGT00940000158489.a.a.c.a	ENSGT00940000156260.c.b	ENSGT00940000156037.b ##25	ENSGT00940000159490.e	ENSGT00390000011466.e.b	ENSGT00940000158666.a.a.b.a	ENSGT00940000155606.a.a.a
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000156062.n.c	ENSGT00390000003282.B.e.a	ENSGT00940000156027.a.e	ENSGT00940000153541.A.d	ENSGT00940000157262.m.b.a	ENSGT00990000211061	ENSGT00940000156490.b.a.c	ENSGT00940000163813.k	ENSGT00390000005939.a.b.a.a	ENSGT00940000161589.q	ENSGT00940000155218.A.d	ENSGT00740000116961.a	ENSGT00940000157379.l.a	ENSGT00940000159853.c	ENSGT00940000160354.j.b #21	ENSGT00390000011620.a.a.b.f.a ##22	ENSGT00940000158073.a.a	ENSGT00940000160902.c.b.b	ENSGT00390000018730.A.e.c	ENSGT00940000161930	ENSGT00940000155532.ud.a	ENSGT00940000154897.q.e	ENSGT00510000046470.a.a.b.d	ENSGT00950000183021.a.b.c.g	ENSGT00940000158489.a.a.c.a	ENSGT00940000156260.c.b	ENSGT00940000156037.b ##25	ENSGT00940000159490.e	ENSGT00390000011466.e.b	ENSGT00940000158666.a.a.b.a	ENSGT00940000155606.a.a.a
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000156084.a.a	ENSGT00940000158273.m.a	ENSGT00940000156062.n.c	ENSGT00390000003282.B.e.a	ENSGT00940000156027.a.e	ENSGT00940000153541.A.d	ENSGT00940000157262.m.b.a	ENSGT00940000156490.b.a.c	ENSGT00940000163813.k	ENSGT00390000005939.a.b.a.a	ENSGT00940000161589.q	ENSGT00940000155218.A.d	ENSGT00940000157379.l.a	ENSGT00940000159853.c	ENSGT00940000167759	ENSGT00390000011620.a.a.b.f.a ##22	ENSGT00940000158073.a.a	ENSGT00940000160902.c.b.b.b	ENSGT00940000160902.c.b.b.a	ENSGT00390000018730.A.e.c	ENSGT00940000161930	ENSGT00940000154897.q.e	ENSGT00510000046470.a.a.b.d	ENSGT00950000183021.a.b.c.g	ENSGT00940000158489.a.a.c.a	ENSGT00940000156260.c.b	ENSGT00940000156037.b ##25	ENSGT00940000159490.e	ENSGT00940000154256.ac.c	ENSGT00440000033468.k.a.b	ENSGT00390000011466.e.a
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000156084.a.a	ENSGT00940000158273.m.a	ENSGT00940000156062.n.c	ENSGT00390000003282.B.e.a	ENSGT00940000156027.a.e	ENSGT00940000153541.A.d	ENSGT00940000157262.m.b.a	ENSGT00940000156490.b.a.c	ENSGT00940000163813.k	ENSGT00390000005939.a.b.a.a	ENSGT00940000161589.q	ENSGT00940000155218.A.d	ENSGT00740000116961.a	ENSGT00940000159853.c	ENSGT00940000167759	ENSGT00390000011620.a.a.b.f.a ##22	ENSGT00940000158073.a.a	ENSGT00940000160902.c.b.b.a	ENSGT00390000018730.A.e.c	ENSGT00940000161930	ENSGT00940000154897.q.e	ENSGT00510000046470.a.a.b.d	ENSGT00950000183021.a.b.c.g	ENSGT00940000158489.a.a.c.a	ENSGT00940000156260.c.b	ENSGT00940000156037.b ##25	ENSGT00940000159490.e	ENSGT00940000154256.ac.c	ENSGT00440000033468.k.a.b	ENSGT00390000011466.e.a	ENSGT00940000158666.a.a.b.a
Coho salmon	MODERN SPECIES	8	syn2a (ENSOKIG00005005639)	VGLL4 (ENSOKIG00005007344)	slc6a1a (ENSOKIG00005007368)	ENSOKIG00005007471	DUSP7 (ENSOKIG00005007491)	ENSOKIG00005007514	bmp7b (ENSOKIG00005007536)	ENSOKIG00005007548	ENSOKIG00005007564	ENSOKIG00005007571	ENSOKIG00005007612	ENSOKIG00005007634	ENSOKIG00005007653	SS18L1 (ENSOKIG00005007666)	ENSOKIG00005007723	TAF4 (ENSOKIG00005007756) ##22	CDH4 (ENSOKIG00005007931)	ENSOKIG00005010355	ENSOKIG00005010362	ENSOKIG00005010365	KCNK15 (ENSOKIG00005010370)	ENSOKIG00005010380	col9a3 (ENSOKIG00005010390)	prkcbp1l (ENSOKIG00005010563)	zgc:113278 (ENSOKIG00005014357)	NCOA3 (ENSOKIG00005014427)	rbm38 (ENSOKIG00005014510)	ENSOKIG00005014516	mipb (ENSOKIG00005014521)	ENSOKIG00005014552 ##25	baz2a (ENSOKIG00005014583)
Chinook salmon	MODERN SPECIES	7	RAF1 (ENSOTSG00005011868)	ENSOTSG00005012312	syn2a (ENSOTSG00005012320)	VGLL4 (ENSOTSG00005013268)	slc6a1a (ENSOTSG00005013270)	ENSOTSG00005013323	DUSP7 (ENSOTSG00005013327)	bmp7b (ENSOTSG00005013340)	irf10 (ENSOTSG00005013342)	ENSOTSG00005013343	ENSOTSG00005013346	ENSOTSG00005013349	ENSOTSG00005013350	SS18L1 (ENSOTSG00005013352)	PSMA7 (ENSOTSG00005013358)	TAF4 (ENSOTSG00005013381) ##22	CDH4 (ENSOTSG00005013510)	rufy3 (ENSOTSG00005013737)	kcnk15 (ENSOTSG00005013740)	ogfr (ENSOTSG00005013743)	col9a3 (ENSOTSG00005013744)	prkcbp1l (ENSOTSG00005013763)	zgc:113278 (ENSOTSG00005025072)	ENSOTSG00005025073	NCOA3 (ENSOTSG00005025074)	rbm38 (ENSOTSG00005025076)	mipb (ENSOTSG00005025079)	ENSOTSG00005025081 ##25	baz2a (ENSOTSG00005025086)	ptges3b (ENSOTSG00005025088)	naca (ENSOTSG00005025089)
Rainbow trout	MODERN SPECIES	30	syn2a (ENSOMYG00000037514)	ENSOMYG00000038214	slc6a1a (ENSOMYG00000038238)	ENSOMYG00000038279	ENSOMYG00000038290	ENSOMYG00000065416	ENSOMYG00000038340	ENSOMYG00000038325	ENSOMYG00000038360	ENSOMYG00000038389	MTG2 (ENSOMYG00000038412)	SS18L1 (ENSOMYG00000038431)	ENSOMYG00000056500	ENSOMYG00000038478 #21	ENSOMYG00000038494	TAF4 (ENSOMYG00000038530) ##22	CDH4 (ENSOMYG00000039422)	kcnk15 (ENSOMYG00000065257)	ogfr (ENSOMYG00000060480)	ENSOMYG00000026545	ENSOMYG00000048836	ENSOMYG00000027990	ENSOMYG00000064567	ENSOMYG00000036146	ENSOMYG00000036161	ENSOMYG00000036166	rbm38 (ENSOMYG00000052153)	mipb (ENSOMYG00000036178)	ENSOMYG00000036186 ##25	baz2a (ENSOMYG00000036198)	ptges3b (ENSOMYG00000036228)
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	39	ENSGT00940000156062.n.c	ENSGT00390000003282.B.e.a	ENSGT00940000156027.a.e	ENSGT00940000153541.A.d	ENSGT00940000157262.m.b.a	ENSGT00990000211061	ENSGT00940000156490.b.a.c	ENSGT00940000163813.k	ENSGT00390000005939.a.b.a.a	ENSGT00940000161589.q	ENSGT00940000155218.A.d	ENSGT00740000116961.a	ENSGT00940000157379.l.a	ENSGT00940000159853.c	ENSGT00940000160354.j.b #21	ENSGT00390000011620.a.a.b.f.a ##22	ENSGT00940000158073.a.a	ENSGT00990000209425	ENSGT00940000160902.c.b.b	ENSGT00390000018730.A.e.c	ENSGT00940000161930	ENSGT00940000155532.ud.a	ENSGT00940000154897.q.e	ENSGT00510000046470.a.a.b.d	ENSGT00950000183021.a.b.c.g	ENSGT00940000158489.a.a.c.a	ENSGT00940000156260.c.b	ENSGT00940000156037.b ##25	ENSGT00940000159490.e	ENSGT00940000154256.ac.c	ENSGT00440000033468.k.a.a.a
River trout	MODERN SPECIES	20	slc6a1a (ENSSTUG00000023232)	ENSSTUG00000023300	DUSP7 (ENSSTUG00000023320)	ENSSTUG00000023348	ENSSTUG00000023360	bmp7b (ENSSTUG00000023390)	irf10 (ENSSTUG00000023405)	ENSSTUG00000023429	ENSSTUG00000023432	ENSSTUG00000023444	ENSSTUG00000023470	ENSSTUG00000023533	MTG2 (ENSSTUG00000023556)	SS18L1 (ENSSTUG00000023680)	ENSSTUG00000023700 #21	TAF4 (ENSSTUG00000023734) ##22	CDH4 (ENSSTUG00000023854)	ENSSTUG00000027079	ENSSTUG00000027085	kcnk15 (ENSSTUG00000027087)	ogfr (ENSSTUG00000027090)	col9a3 (ENSSTUG00000027107)	ENSSTUG00000027129	prkcbp1l (ENSSTUG00000027241)	zgc:113278 (ENSSTUG00000031197)	NCOA3 (ENSSTUG00000031267)	rbm38 (ENSSTUG00000031302)	mipb (ENSSTUG00000031311)	ENSSTUG00000031337 ##25	baz2a (ENSSTUG00000031359)	naca (ENSSTUG00000031545)
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	6	ENSSSAG00000089027	slc6a1a (ENSSSAG00000034299)	TNNC1 (ENSSSAG00000036263)	DUS7 (ENSSSAG00000036380)	ENSSSAG00000036866	ENSSSAG00000037152	ENSSSAG00000037663	ENSSSAG00000038413	ENSSSAG00000038288	ENSSSAG00000038989	ENSSSAG00000040049	ENSSSAG00000105660	MTG2 (ENSSSAG00000040162)	SS18L1 (ENSSSAG00000095110)	PSA7 (ENSSSAG00000040286) #21	TAF4 (ENSSSAG00000040325) ##22	CDH4 (ENSSSAG00000096125)	ENSSSAG00000119015	kcnk15 (ENSSSAG00000049673)	ogfr (ENSSSAG00000055938)	ENSSSAG00000049686	ENSSSAG00000103430	ENSSSAG00000055954	ENSSSAG00000086483	ENSSSAG00000056058	ENSSSAG00000064680	ENSSSAG00000045242	ENSSSAG00000117276	ENSSSAG00000064795	rbm38 (ENSSSAG00000103879)	mipb (ENSSSAG00000064885)
Huchen	MODERN SPECIES	138										ENSHHUG00000027496	ENSHHUG00000027506	ENSHHUG00000027512	MTG2 (ENSHHUG00000027520)	SS18L1 (ENSHHUG00000027543)	ENSHHUG00000027547 #21	TAF4 (ENSHHUG00000027561) ##22	CDH4 (ENSHHUG00000027578)	kcnk15 (ENSHHUG00000028327)	ogfr (ENSHHUG00000028329)	ENSHHUG00000028331	ENSHHUG00000028332	ENSHHUG00000028333	ENSHHUG00000028334	ENSHHUG00000028335	prkcbp1l (ENSHHUG00000028336)	zgc:113278 (ENSHHUG00000029802)
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	465	ENSGT00390000003282.B.e.b	ENSGT00940000156027.a.f	ENSGT00940000153541.A.c	ENSGT00940000157262.m.b.b	ENSGT00940000156030.j.j	ENSGT00390000001787	ENSGT00940000156490.b.a.d	ENSGT00940000163813.l	ENSGT00390000005939.a.b.a.b	ENSGT00940000165182.c	ENSGT00940000161589.r	ENSGT00940000157379.l.b	ENSGT00940000159853.d	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010.db	ENSGT00390000011620.a.a.b.f.b ##22	ENSGT00940000158073.a.b
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00940000156027.a.f	ENSGT00940000153541.A.c	ENSGT00940000157262.m.b.b	ENSGT00940000156030.j.j	ENSGT00390000001787	ENSGT00940000156490.b.a.d	ENSGT00940000163813.l	ENSGT00390000005939.a.b.a.b	ENSGT00940000165182.c	ENSGT00940000161589.r	ENSGT00740000116961.b	ENSGT00940000157379.l.b	ENSGT00940000159853.d	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010.db	ENSGT00390000011620.a.a.b.f.b ##22	ENSGT00940000158073.a.b	ENSGT00940000167904.a	ENSGT00940000160902.c.b.a	ENSGT00390000018730.A.e.d	ENSGT00940000163687	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000181232	ENSGT00940000155532.ud.b	ENSGT00940000154897.q.f	ENSGT00510000046470.a.a.b.c	ENSGT00950000183021.a.b.c.h	ENSGT00940000158489.a.a.c.b	ENSGT00940000156260.c.a	ENSGT00940000159490.f	ENSGT00940000154256.ac.d
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000003282.B.e.b	ENSGT00940000156027.a.f	ENSGT00940000153541.A.c	ENSGT00940000157262.m.b.b	ENSGT00940000156030.j.j	ENSGT00390000001787	ENSGT00940000156490.b.a.d	ENSGT00940000163813.l	ENSGT00390000005939.a.b.a.b	ENSGT00940000161589.r	ENSGT00740000116961.b	ENSGT00940000157379.l.b	ENSGT00940000159853.d	ENSGT00940000167759	ENSGT00940000156010.db	ENSGT00390000011620.a.a.b.f.b ##22	ENSGT00940000158073.a.b	ENSGT00940000160902.c.b.a	ENSGT00940000163687	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000181232	ENSGT00940000155532.ud.b	ENSGT00940000154897.q.f	ENSGT00510000046470.a.a.b.c	ENSGT00950000183021.a.b.c.h	ENSGT00940000158489.a.a.c.b	ENSGT00940000156260.c.a	ENSGT00940000159490.f	ENSGT00440000033468.k.a.a.b	ENSGT00390000011466.f	ENSGT00940000158666.a.a.b.b
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	4	slc6a1a (ENSSSAG00000043626)	ENSSSAG00000044930	ENSSSAG00000044955	ENSSSAG00000044979	ENSSSAG00000045416	ENSSSAG00000087720	ENSSSAG00000121498	ENSSSAG00000082434	ENSSSAG00000084801	ENSSSAG00000045657	y4629 (ENSSSAG00000045699)	mtg2 (ENSSSAG00000045717)	SS18L1 (ENSSSAG00000040243)	ENSSSAG00000045742	lsm14b (ENSSSAG00000045845)	taf4 (ENSSSAG00000045879) ##22	ENSSSAG00000109030	CDH4 (ENSSSAG00000094300)	ENSSSAG00000049133	ENSSSAG00000119432	ENSSSAG00000086261	COL9A3 (ENSSSAG00000055945)	ENSSSAG00000091903	ENSSSAG00000049704	ENSSSAG00000085802	ENSSSAG00000050085	ENSSSAG00000065224	ENSSSAG00000065912	rbm38 (ENSSSAG00000088600)	mipb (ENSSSAG00000041855)	baz2a (ENSSSAG00000065941)
River trout	MODERN SPECIES	23	ENSSTUG00000004031	VGLL4 (ENSSTUG00000003988)	slc6a1a (ENSSTUG00000003932)	ENSSTUG00000003897	DUSP7 (ENSSTUG00000003870)	ENSSTUG00000003633	spo11 (ENSSTUG00000050338)	bmp7b (ENSSTUG00000050322)	irf10 (ENSSTUG00000050316)	ENSSTUG00000050312	ENSSTUG00000050308	ENSSTUG00000050302	MTG2 (ENSSTUG00000050298)	ENSSTUG00000050289	lsm14b (ENSSTUG00000050286)	TAF4 (ENSSTUG00000050283) ##22	CDH4 (ENSSTUG00000050207)	kcnk15 (ENSSTUG00000050192)	COL9A3 (ENSSTUG00000050175)	ENSSTUG00000050171	ENSSTUG00000050164	ZMYND8 (ENSSTUG00000049434)	zgc:113278 (ENSSTUG00000049316)	NCOA3 (ENSSTUG00000049303)	rbm38 (ENSSTUG00000049299)	mipb (ENSSTUG00000049294)	ENSSTUG00000049292	baz2a (ENSSTUG00000049168)	ENSSTUG00000049107	prim1 (ENSSTUG00000049095)	RND1 (ENSSTUG00000049087)
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000156027.a.f	ENSGT00940000153541.A.c	ENSGT00940000157262.m.b.b	ENSGT00940000156030.j.j	ENSGT00390000001787	ENSGT00940000156490.b.a.d	ENSGT00940000163813.l	ENSGT00390000005939.a.b.a.b	ENSGT00940000165182.c	ENSGT00940000161589.r	ENSGT00740000116961.b	ENSGT00940000157379.l.b	ENSGT00940000159853.d	ENSGT00940000159695	ENSGT00940000156010.db	ENSGT00390000011620.a.a.b.f.b ##22	ENSGT00940000158073.a.b	ENSGT00940000167904.a	ENSGT00940000160902.c.b.a	ENSGT00390000018730.A.e.d	ENSGT00940000163687	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000181232	ENSGT00940000155532.ud.b	ENSGT00940000154897.q.f	ENSGT00510000046470.a.a.b.c	ENSGT00950000183021.a.b.c.h	ENSGT00940000158489.a.a.c.b	ENSGT00940000156260.c.a	ENSGT00940000159490.f	ENSGT00940000154256.ac.d
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00390000003282.B.e.b	ENSGT00940000156027.a.f	ENSGT00940000153541.A.c	ENSGT00940000157262.m.b.b	ENSGT00940000156030.j.j	ENSGT00390000001787	ENSGT00940000156490.b.a.d	ENSGT00940000163813.l	ENSGT00390000005939.a.b.a.b	ENSGT00940000165182.c	ENSGT00940000161589.r	ENSGT00940000157379.l.b	ENSGT00940000159853.d	ENSGT00940000159695.db	ENSGT00940000156010.db	ENSGT00390000011620.a.a.b.f.b ##22	ENSGT00940000158073.a.b	ENSGT00940000167904.a	ENSGT00940000160902.c.b.a	ENSGT00390000018730.A.e.d	ENSGT00940000163687	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000181232	ENSGT00940000155532.ud.b	ENSGT00940000154897.q.f	ENSGT00510000046470.a.a.b.c	ENSGT00950000183021.a.b.c.h	ENSGT00940000158489.a.a.c.b	ENSGT00940000156260.c.a	ENSGT00940000159490.f	ENSGT00940000154256.ac.d
Chinook salmon	MODERN SPECIES	14	mfge8b (ENSOTSG00005019050)	hapln3 (ENSOTSG00005019046)	ENSOTSG00005019043	PPIP5K1 (ENSOTSG00005019041)	prdm8b (ENSOTSG00005019039)	fgf5 (ENSOTSG00005019036)	ENSOTSG00005015796	irf10 (ENSOTSG00005015790)	ENSOTSG00005015789	ENSOTSG00005015788	ENSOTSG00005015779	ENSOTSG00005015776	SS18L1 (ENSOTSG00005015768)	PSMA7 (ENSOTSG00005015767)	lsm14b (ENSOTSG00005015766)	TAF4 (ENSOTSG00005015738) ##22	CDH4 (ENSOTSG00005013894)	rbm38 (ENSOTSG00005013880)	NCOA3 (ENSOTSG00005013879)	zgc:113278 (ENSOTSG00005013851)	ZMYND8 (ENSOTSG00005009748)	ENSOTSG00005009727	ENSOTSG00005009724	COL9A3 (ENSOTSG00005009722)	kcnk15 (ENSOTSG00005009718)	ENSOTSG00005009717	mipb (ENSOTSG00005009716)	baz2a (ENSOTSG00005009714)	ptges3b (ENSOTSG00005009713)	ENSOTSG00005009706	RND1 (ENSOTSG00005009704)
Coho salmon	MODERN SPECIES	16	VGLL4 (ENSOKIG00005014895)	slc6a1a (ENSOKIG00005014797)	ENSOKIG00005014774	DUSP7 (ENSOKIG00005014759)	ENSOKIG00005014605	spo11 (ENSOKIG00005014331)	BMP7 (ENSOKIG00005014314)	irf10 (ENSOKIG00005014293)	ENSOKIG00005014289	ENSOKIG00005014287	ENSOKIG00005014273	MTG2 (ENSOKIG00005014255)	SS18L1 (ENSOKIG00005014201)	PSMA7 (ENSOKIG00005014161)	LSM14B (ENSOKIG00005014146)	TAF4 (ENSOKIG00005014043) ##22	CDH4 (ENSOKIG00005013508)	ENSOKIG00005013456	kcnk15 (ENSOKIG00005013434)	ENSOKIG00005013374	COL9A3 (ENSOKIG00005013351)	ENSOKIG00005013339	ENSOKIG00005013326	ENSOKIG00005013311	ZMYND8 (ENSOKIG00005010491)	ENSOKIG00005010344	ENSOKIG00005010338	NCOA3 (ENSOKIG00005010323)	rbm38 (ENSOKIG00005010316)	MIP (ENSOKIG00005010296)	baz2a (ENSOKIG00005010151)
Rainbow trout	MODERN SPECIES	7	ENSOMYG00000047202	ENSOMYG00000047191	ENSOMYG00000047178	ENSOMYG00000047171	IRF10a (ENSOMYG00000047162)	ENSOMYG00000047156	ENSOMYG00000047149	ENSOMYG00000072712	ENSOMYG00000064417	ENSOMYG00000047146	ENSOMYG00000038406	MTG2 (ENSOMYG00000047141)	SS18L1 (ENSOMYG00000047136)	ENSOMYG00000047133	LSM14B (ENSOMYG00000047131)	TAF4 (ENSOMYG00000047125) ##22	ENSOMYG00000074002	CDH4 (ENSOMYG00000046953)	ENSOMYG00000046829	kcnk15 (ENSOMYG00000052604)	ENSOMYG00000046824	COL9A3 (ENSOMYG00000046803)	TCFL5 (ENSOMYG00000046789)	ENSOMYG00000046765	ENSOMYG00000046649	ENSOMYG00000046450	ENSOMYG00000071369	ENSOMYG00000046420	rbm38 (ENSOMYG00000067358)	mipb (ENSOMYG00000046401)	baz2a (ENSOMYG00000046366)
Huchen	MODERN SPECIES	1012						ENSHHUG00000049825	bmp7b (ENSHHUG00000049753)	irf10 (ENSHHUG00000049731)	ENSHHUG00000049723	ENSHHUG00000049713	ENSHHUG00000049680	MTG2 (ENSHHUG00000049664)	SS18L1 (ENSHHUG00000049653)	ENSHHUG00000049606	lsm14b (ENSHHUG00000049551)	TAF4 (ENSHHUG00000049535) ##22	CDH4 (ENSHHUG00000049465)
Northern pike	MODERN SPECIES	11	ENSELUG00000016512	bmp7b (ENSELUG00000000624)	irf10 (ENSELUG00000016496)	ENSELUG00000024742	ENSELUG00000016476	ENSELUG00000028265	ENSELUG00000026495	ENSELUG00000016466	ENSELUG00000016448	ENSELUG00000016417	ENSELUG00000016435	MTG2 (ENSELUG00000016399)	SS18L1 (ENSELUG00000016375)	ENSELUG00000016348	lsm14b (ENSELUG00000016299)	TAF4 (ENSELUG00000016276) ##22	CDH4 (ENSELUG00000016254)	ENSELUG00000034212	kcnk15 (ENSELUG00000016142)	ogfr (ENSELUG00000016123)	col9a3 (ENSELUG00000016066)	ENSELUG00000025183	ENSELUG00000015966	ENSELUG00000015953	prkcbp1l (ENSELUG00000015909)	zgc:113278 (ENSELUG00000015880)	NCOA3 (ENSELUG00000015831)	rbm38 (ENSELUG00000000585)	mipb (ENSELUG00000015746)	ENSELUG00000015734 ##25	baz2a (ENSELUG00000015700)
Osteoglossiformes	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000166842	ENSGT00390000011067.C	ENSGT01050000244841.A.b.b.b.a.a	ENSGT00390000018596.A.a.a	ENSGT01030000235510	ENSGT00940000158931.f	ENSGT00940000158489.a.a	ENSGT00940000158489.b	ENSGT00950000183091.B.b	ENSGT00940000156490.b.b	ENSGT00390000005939.a.b.b	ENSGT00940000163813.g	ENSGT00940000165182.b	ENSGT00940000159853.a.a	ENSGT00940000156010.eb	ENSGT00390000011620.a.a.b ##22	ENSGT00940000158073.c.a	ENSGT00940000160902.c.a	ENSGT00390000018730.A.f	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000181232	ENSGT00940000154897.s	ENSGT00950000183021.a.b.e	ENSGT00940000156478.d	ENSGT00940000161109	ENSGT00390000007823.ab	ENSGT00940000166926	ENSGT00940000164502.a.b	ENSGT00940000156477.d	ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b	ENSGT00940000160331.b
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P. kingsleyae	MODERN SPECIES	424												ENSPKIG00000003443	SS18L1 (ENSPKIG00000003373)	ENSPKIG00000003337 #21	LSM14B (ENSPKIG00000003275)	TAF4 (ENSPKIG00000003214) ##22	ENSPKIG00000003189	ENSPKIG00000003165	cdh4 (ENSPKIG00000003132)
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Reedfish	MODERN SPECIES	1	rae1 (ENSECRG00000008199)	SPO11 (ENSECRG00000008161)	bmp7a (ENSECRG00000008133)	ENSECRG00000008121	irf10 (ENSECRG00000008110)	ENSECRG00000008105	ENSECRG00000008094	ENSECRG00000008086	ENSECRG00000008070	ENSECRG00000008052	ENSECRG00000009917	MTG2 (ENSECRG00000009904)	SS18L1 (ENSECRG00000009876)	PSMA7 (ENSECRG00000009862)	lsm14b (ENSECRG00000009847)	TAF4 (ENSECRG00000009735) ##22	adrm1 (ENSECRG00000009663)	osbpl2b (ENSECRG00000009634)	SOGA1 (ENSECRG00000009600)	ENSECRG00000009576	acss2 (ENSECRG00000009543)	ENSECRG00000009523	TP53INP2 (ENSECRG00000009510)	NCOA6 (ENSECRG00000009492)	GGT7 (ENSECRG00000009465)	ENSECRG00000009424	zgc:114123 (ENSECRG00000009398)	top1a (ENSECRG00000009339)	plcg1 (ENSECRG00000009177)	zhx3b (ENSECRG00000009119)	ENSECRG00000009111
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Hagfish	DUPLICATION
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Lamprey	MODERN SPECIES	3105																ENSPMAG00000003074 ##22
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Osteoglossiformes	DUPLICATION
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P. kingsleyae	MODERN SPECIES	178		TOX3 (ENSPKIG00000005426)	ENSPKIG00000005398	sall1a (ENSPKIG00000005383)	SNX20 (ENSPKIG00000005366)	NKD1 (ENSPKIG00000005346)	brd7 (ENSPKIG00000005303)	adcy7 (ENSPKIG00000005166)	tent4b (ENSPKIG00000005085)	cnep1r1 (ENSPKIG00000005054)	sdr42e1 (ENSPKIG00000005042)	wtip (ENSPKIG00000005017)	gpib (ENSPKIG00000004922)	GARRE1 (ENSPKIG00000004853)	LSM14A (ENSPKIG00000004788)	ENSPKIG00000004730 ##22	KCTD15 (ENSPKIG00000004710)	CHST8 (ENSPKIG00000004680)	THSD4 (ENSPKIG00000004581)	ENSPKIG00000004536	ENSPKIG00000004523	larp6a (ENSPKIG00000004511)	adal (ENSPKIG00000004490)	ENSPKIG00000004476	CPLX3 (ENSPKIG00000004458)	csk (ENSPKIG00000004436)	edc3 (ENSPKIG00000004416)	cyp1a (ENSPKIG00000004398)	ENSPKIG00000004372	ENSPKIG00000004358	ENSPKIG00000004337
Osteoglossiformes	ANCESTRAL SPECIES	40	ENSGT00950000183202.a.b	ENSGT00940000158043.g	ENSGT00940000155938.b.a.b	ENSGT00390000018123.a.a	ENSGT00940000160934	ENSGT00440000033589.c.g	ENSGT00940000159096.e	ENSGT00940000158301.g	ENSGT00390000012529	ENSGT00390000009212	ENSGT00390000012054.b	ENSGT00940000160924.a	ENSGT00390000000707.y.a	ENSGT00390000003210.i	ENSGT00940000160407	ENSGT00390000011620.b.d ##22	ENSGT00940000159496	ENSGT00940000159100.i
P. kingsleyae	MODERN SPECIES	42	CYLD (ENSPKIG00000022297)	nod2 (ENSPKIG00000022380)	nkd1 (ENSPKIG00000000079)	adcy7 (ENSPKIG00000000122)	tent4b (ENSPKIG00000000206)	heatr3 (ENSPKIG00000000235)	mphosph6 (ENSPKIG00000000253)	zgc:101040 (ENSPKIG00000000263)	wtip (ENSPKIG00000000290)	ENSPKIG00000000317	gpia (ENSPKIG00000000351)	GARRE1 (ENSPKIG00000000417)	ENSPKIG00000000477	ss18l2 (ENSPKIG00000000487)	lsm14ab (ENSPKIG00000000497)	ENSPKIG00000000517 ##22	KCTD15 (ENSPKIG00000000545)	CHST8 (ENSPKIG00000000574)
Asian bonytongue	MODERN SPECIES	20	TOX3 (ENSSFOG00015020029)	sall1a (ENSSFOG00015020020)	CYLD (ENSSFOG00015019946)	nod2 (ENSSFOG00015019861)	nkd1 (ENSSFOG00015029086)	adcy7 (ENSSFOG00015019702)	tent4b (ENSSFOG00015019677)	heatr3 (ENSSFOG00015019635)	mphosph6 (ENSSFOG00015027140)	ENSSFOG00015019565	ENSSFOG00015019536	wtip (ENSSFOG00015027010)	gpia (ENSSFOG00015019464)	GARRE1 (ENSSFOG00015019374)	lsm14ab (ENSSFOG00015019348)	ENSSFOG00015019329 ##22	KCTD15 (ENSSFOG00015031424)	CHST8 (ENSSFOG00015028393)	idh3b (ENSSFOG00015019246)	aimp2 (ENSSFOG00015019233)	ENSSFOG00015019209	cbx2 (ENSSFOG00015029247)	stx1b (ENSSFOG00015019181)	ENSSFOG00015019171	si:dkeyp-113d7.1 (ENSSFOG00015019168)	UTP18 (ENSSFOG00015019158)	NME2 (ENSSFOG00015019139)	NLRC3 (ENSSFOG00015019088)	rhot2 (ENSSFOG00015019007)	IGFALS (ENSSFOG00015018942)	ENSSFOG00015018924
Clupeocephala	DUPLICATION
Clupeocephala	ANCESTRAL SPECIES	15		ENSGT00940000158070	ENSGT00940000160924	ENSGT00390000000707.y.b	ENSGT00390000003210	ENSGT00940000160407	ENSGT00940000154415.lb.a	ENSGT00390000011620.b.f ##22	ENSGT00940000156453.b ##24	ENSGT00510000049120	ENSGT00940000156037.a.e #25	ENSGT00940000155981.h #27	ENSGT00940000159100.h	ENSGT00940000159496.l	ENSGT00940000154415.lb.b	ENSGT00390000011620.b.e ##22	ENSGT00940000159496.k	ENSGT00940000159100.g	ENSGT00940000153657.B	ENSGT00940000156594	ENSGT00940000157011	ENSGT00940000159103	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000154969.a	ENSGT00940000157689	ENSGT00390000001195.b	ENSGT00950000182938.b.b.b.b.a	ENSGT00940000157431.d	ENSGT00950000183113.b.a	ENSGT00940000157431.c.a	ENSGT00390000016435
Euteleosteomorpha	ANCESTRAL SPECIES	419															ENSGT00940000154415.lb.b	ENSGT00390000011620.b.e ##22	ENSGT00940000159496.l	ENSGT00940000159100.h
Acanthomorphata	ANCESTRAL SPECIES	244										ENSGT00520000055620.B	ENSGT00530000063759.a	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000000707.y.a	ENSGT00940000154415.lb.b	ENSGT00390000011620.b.e ##22	ENSGT00940000159496.l	ENSGT00940000159100.h	ENSGT00940000154318.A.b	ENSGT00950000182885.A.b	ENSGT00940000156429	ENSGT00390000001116	ENSGT00940000160214
Euacanthomorphacea	ANCESTRAL SPECIES	39	ENSGT00990000203615.a.a.a.a	ENSGT00730000111696.b	ENSGT00940000159837	ENSGT00940000156124.c.b	ENSGT00940000156152.e.a.b	ENSGT00390000007640.b.b	ENSGT00940000160394.b	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000162591	ENSGT00520000055620.B	ENSGT00530000063759.a	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000000707.y.a	ENSGT00940000154415.lb.b	ENSGT00390000011620.b.e ##22	ENSGT00940000159496.l	ENSGT00940000159100.h	ENSGT00940000178960	ENSGT00940000154318.A.b	ENSGT00950000182885.A.b	ENSGT00940000156429	ENSGT00390000001116	ENSGT00940000160214	ENSGT00940000156088.c.b	ENSGT00940000157033.h	ENSGT00390000000972	ENSGT00940000154856.A.a.c.a.b.a.a.a	ENSGT00940000161051.a.a.b.b.b.b	ENSGT00940000154856.A.a.c.a.b.a.a.b	ENSGT00940000158293
Percomorphaceae	ANCESTRAL SPECIES	31	ENSGT00990000203615.a.a.a.a	ENSGT00730000111696.b	ENSGT00940000159837	ENSGT00940000156124.c.b	ENSGT00940000156152.e.a.b	ENSGT00390000007640.b.b	ENSGT00940000160394.b	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000162591	ENSGT00520000055620.B	ENSGT00530000063759.a	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000000707.y.a	ENSGT00940000154415.lb.b	ENSGT00390000011620.b.e ##22	ENSGT00940000159496.l	ENSGT00940000159100.h	ENSGT00940000178960	ENSGT00940000154318.A.b	ENSGT00950000182885.A.b	ENSGT00940000156429	ENSGT00390000001116	ENSGT00940000156088.c.b	ENSGT00940000157033.h	ENSGT00390000000972
Tiger tail seahorse	MODERN SPECIES	223	commd9 (ENSHCOG00000000294)	FCSK (ENSHCOG00000009528)	PCLAF (ENSHCOG00000009517)	nedd1 (ENSHCOG00000009501)	si:ch211-59o9.10 (ENSHCOG00000009443)	sycp3 (ENSHCOG00000009429)	actr6 (ENSHCOG00000009404)	ENSHCOG00000009365	ENSHCOG00000009353	ENSHCOG00000009334	ENSHCOG00000009323	ENSHCOG00000009317	mphosph6 (ENSHCOG00000009296)	gpia (ENSHCOG00000009272)	ENSHCOG00000009227	ENSHCOG00000009212 ##22	nup160 (ENSHCOG00000009178)	frs2b (ENSHCOG00000009170)	ENSHCOG00000009159	ENSHCOG00000009144	tbc1d15 (ENSHCOG00000009059)	tph2 (ENSHCOG00000009042)	rpgrip1l (ENSHCOG00000009004)	NOX5 (ENSHCOG00000008971)	ambra1b (ENSHCOG00000008935)	ENSHCOG00000008919	ENSHCOG00000008905	st8sia2 (ENSHCOG00000008890)	fam174b (ENSHCOG00000008871)	ENSHCOG00000008865	chd2 (ENSHCOG00000008855)
Percomorphaceae_B	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000156152.e.a.b	ENSGT00390000007640.b.b	ENSGT00940000160394.b	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000162591	ENSGT00520000055620.B	ENSGT00980000201244	ENSGT00940000159483.a.a	ENSGT00940000163250.A.b	ENSGT00940000175409	ENSGT00530000063759.a	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000000707.y.a	ENSGT00940000154415.lb.b	ENSGT00390000011620.b.e ##22	ENSGT00940000159496.l	ENSGT00940000159100.h	ENSGT00940000178960	ENSGT00940000154318.A.b	ENSGT00950000182885.A.b	ENSGT00940000156429	ENSGT00390000001116	ENSGT00940000156088.c.b	ENSGT00940000157033.h	ENSGT00390000000972	ENSGT00940000162514	ENSGT00940000156003.l.a	ENSGT00940000167873	ENSGT00940000163149.a.b.c.a.b	ENSGT00940000165244.a
Percomorphaceae_C	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000156124.c.b	ENSGT00940000156152.e.a.b	ENSGT00390000007640.b.b	ENSGT00940000160394.b	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000162591	ENSGT00520000055620.B	ENSGT00980000201244	ENSGT00940000159483.a.a	ENSGT00940000163250.A.b	ENSGT00530000063759.a	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000000707.y.a	ENSGT00940000154415.lb.b	ENSGT00390000011620.b.e ##22	ENSGT00940000159496.l	ENSGT00940000159100.h	ENSGT00940000178960	ENSGT00950000182885.A.b	ENSGT00940000156429	ENSGT00390000001116	ENSGT00940000156088.c.b	ENSGT00940000157033.h	ENSGT00390000000972	ENSGT00940000162514	ENSGT00940000156003.l.a	ENSGT00940000167873	ENSGT00940000163149.a.b.c.a.b	ENSGT00940000165244.a
Eupercaria	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000156124.c.b	ENSGT00940000156152.e.a.b	ENSGT00390000007640.b.b	ENSGT00940000160394.b	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000162591	ENSGT00520000055620.B	ENSGT00980000201244	ENSGT00940000159483.a.a	ENSGT00940000163250.A.b	ENSGT00530000063759.a	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000000707.y.a	ENSGT00940000154415.lb.b	ENSGT00390000011620.b.e ##22	ENSGT00940000159496.l	ENSGT00940000159100.h	ENSGT00950000182885.A.b	ENSGT00940000156429	ENSGT00390000001116	ENSGT00940000156088.c.b	ENSGT00940000157033.h	ENSGT00390000000972	ENSGT00940000167873	ENSGT00940000156003.l.a	ENSGT00940000165244.a
Tetraodontidae	ANCESTRAL SPECIES	103											ENSGT00530000063759.a	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000000707.y.a	ENSGT00940000154415.lb.b	ENSGT00390000011620.b.e ##22	ENSGT00940000159496.l	ENSGT00940000159100.h	ENSGT00950000182885.A.b	ENSGT00940000156429	ENSGT00390000001116	ENSGT00940000156088.c.b	ENSGT00940000157033.h	ENSGT00390000000972	ENSGT00940000167873	ENSGT00940000156003.l.a	ENSGT00940000165244.a
Fugu	MODERN SPECIES	21	ENSTRUG00000021520	smpd3 (ENSTRUG00000000633)	ENSTRUG00000000735	ENSTRUG00000026611	ENSTRUG00000029091	ENSTRUG00000031162	ndrg4 (ENSTRUG00000027964)	gins3 (ENSTRUG00000020212)	znrf1 (ENSTRUG00000002771)	ldhd (ENSTRUG00000033108)	SNX20 (ENSTRUG00000003516)	mphosph6 (ENSTRUG00000026500)	hsd17b2 (ENSTRUG00000030219)	gpia (ENSTRUG00000002860)	lsm14aa (ENSTRUG00000004046)	ENSTRUG00000028944 ##22	kctd15a (ENSTRUG00000030982)	CHST8 (ENSTRUG00000026043)	tph2 (ENSTRUG00000002970)	ENSTRUG00000031247	tbc1d15 (ENSTRUG00000003870)	ENSTRUG00000004528	ENSTRUG00000026047	ENSTRUG00000029152	ENSTRUG00000005772	nup160 (ENSTRUG00000005911)	ENSTRUG00000033095	calc (ENSTRUG00000027271)	psma1 (ENSTRUG00000008890)	ENSTRUG00000009056	LMO1 (ENSTRUG00000030196)
Tetraodon	MODERN SPECIES	26	ENSTNIG00000019716	ENSTNIG00000019523	ENSTNIG00000019454	ENSTNIG00000019584	aip (ENSTNIG00000019731)	ACSS3 (ENSTNIG00000019772)	itfg2 (ENSTNIG00000019706)	ENSTNIG00000019550	ENSTNIG00000005577	ENSTNIG00000019493	ENSTNIG00000019682	si:dkeyp-92c9.2 (ENSTNIG00000019642)	ENSTNIG00000019615	ENSTNIG00000019585	ENSTNIG00000019821	ENSTNIG00000019685 ##22	kctd15a (ENSTNIG00000019575)	ENSTNIG00000019535	ENSTNIG00000019691	ENSTNIG00000019655	hsd17b2 (ENSTNIG00000019720)	gpia (ENSTNIG00000019788)	ENSTNIG00000019704	abcg2c (ENSTNIG00000019778)	ENSTNIG00000019779	arpc1a (ENSTNIG00000019780)	arpc1b (ENSTNIG00000019781)	DNAL1 (ENSTNIG00000019602)	spra (ENSTNIG00000019699)	spra (ENSTNIG00000019718)	spra (ENSTNIG00000019712)
Eupecaria_A	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000156124.c.b	ENSGT00940000156152.e.a.b	ENSGT00390000007640.b.b	ENSGT00940000160394.b	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000162591	ENSGT00520000055620.B	ENSGT00980000201244	ENSGT00940000159483.a.a	ENSGT00940000163250.A.b	ENSGT00530000063759.a	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000000707.y.a	ENSGT00940000154415.lb.b	ENSGT00390000011620.b.e ##22	ENSGT00940000159496.l	ENSGT00940000159100.h	ENSGT00950000182885.A.b	ENSGT00940000156429	ENSGT00390000001116	ENSGT00940000156088.c.b	ENSGT00940000157033.h	ENSGT00390000000972	ENSGT00940000167873	ENSGT00940000156003.l.a	ENSGT00940000165244.a
Ballan wrasse	MODERN SPECIES	501									nup160 (ENSLBEG00000007403)	RBL2 (ENSLBEG00000007579)	SNX20 (ENSLBEG00000007664)	mphosph6 (ENSLBEG00000007680)	hsd17b2 (ENSLBEG00000007728)	gpia (ENSLBEG00000008294)	lsm14aa (ENSLBEG00000010487)	ENSLBEG00000010591 ##22	KCTD15 (ENSLBEG00000010626)	CHST8 (ENSLBEG00000010655)	tph2 (ENSLBEG00000011048)	tbc1d15 (ENSLBEG00000012281)	ENSLBEG00000012352	PTPRB (ENSLBEG00000012624)	FRS2 (ENSLBEG00000013163)	ENSLBEG00000013210	IRX5 (ENSLBEG00000013251)	ENSLBEG00000013268
Eupecaria_B	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000176877	ENSGT00940000156124.c.b	ENSGT00940000156152.e.a.b	ENSGT00390000007640.b.b	ENSGT00940000160394.b	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000162591	ENSGT00520000055620.B	ENSGT00980000201244	ENSGT00940000159483.a.a	ENSGT00530000063759.a	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000000707.y.a	ENSGT00940000154415.lb.b	ENSGT00390000011620.b.e ##22	ENSGT00940000159496.l	ENSGT00940000159100.h	ENSGT00950000182885.A.b	ENSGT00940000156429	ENSGT00940000177974	ENSGT00390000001116	ENSGT00940000156088.c.b	ENSGT00940000157033.h	ENSGT00390000000972	ENSGT00940000167873	ENSGT00940000156003.l.a	ENSGT00940000165244.a
Perciformes	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000159837	ENSGT00940000164249.b.a.b.b	ENSGT00940000156124.c.b	ENSGT00940000156152.e.a.b	ENSGT00390000007640.b.b	ENSGT00940000160394.b	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000162591	ENSGT00520000055620.B	ENSGT00940000159483.a.a	ENSGT00530000063759.a	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000000707.y.a	ENSGT00940000154415.lb.b	ENSGT00390000011620.b.e ##22	ENSGT00940000159496.l	ENSGT00940000159100.h	ENSGT00950000182885.A.b	ENSGT00940000156429	ENSGT00940000177974	ENSGT00390000001116	ENSGT00940000156088.c.b	ENSGT00940000157033.h	ENSGT00390000000972	ENSGT00940000167873	ENSGT00940000156003.l.a	ENSGT00940000165244.a
Cottioidei	ANCESTRAL SPECIES	37	ENSGT00990000203615.a.a.a.a	ENSGT00730000111696.b	ENSGT00940000159837	ENSGT00940000156124.c.b	ENSGT00940000156152.e.a.b	ENSGT00390000007640.b.b	ENSGT00940000160394.b	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000162591	ENSGT00520000055620.B	ENSGT00940000159483.a.a	ENSGT00530000063759.a	ENSGT00390000009212	ENSGT00390000000707.y.a	ENSGT00940000154415.lb.b	ENSGT00390000011620.b.e ##22	ENSGT00950000182885.A.b	ENSGT00940000156429	ENSGT00390000001116	ENSGT00940000156088.c.b	ENSGT00940000157033.h	ENSGT00390000000972	ENSGT00940000167873	ENSGT00940000156003.l.a	ENSGT00940000165244.a
Lumpfish	MODERN SPECIES	21	DGKZ (ENSCLMG00005000500)	ENSCLMG00005000368	mdkb (ENSCLMG00005000367)	ENSCLMG00005000365	ambra1b (ENSCLMG00005000358)	NOX5 (ENSCLMG00005000163)	ENSCLMG00005022102	rpgrip1l (ENSCLMG00005022101)	IRX5 (ENSCLMG00005022100)	ENSCLMG00005022099	RBL2 (ENSCLMG00005021904)	SNX20 (ENSCLMG00005021896)	mphosph6 (ENSCLMG00005021895)	gpia (ENSCLMG00005021877)	lsm14aa (ENSCLMG00005021862)	ENSCLMG00005021858 ##22	tph2 (ENSCLMG00005021839)	tbc1d15 (ENSCLMG00005021714)	ENSCLMG00005021704	ENSCLMG00005021699	ENSCLMG00005021697	frs2b (ENSCLMG00005021693)	ENSCLMG00005021690	nup160 (ENSCLMG00005021665)	LAMB1 (ENSCLMG00005020415)	ENSCLMG00005020387
Stickleback	MODERN SPECIES	14	PHF21A (ENSGACG00000007895)	ENSGACG00000007891	ENSGACG00000007872	ENSGACG00000007866	ENSGACG00000007865	ENSGACG00000007858	ENSGACG00000007854	ambra1b (ENSGACG00000007844)	NOX5 (ENSGACG00000007833)	IRX5 (ENSGACG00000007829)	ENSGACG00000007787	SNX20 (ENSGACG00000007786)	mphosph6 (ENSGACG00000007779)	gpia (ENSGACG00000007744)	lsm14aa (ENSGACG00000007738)	ENSGACG00000007729 ##22	tph2 (ENSGACG00000007717)	tbc1d15 (ENSGACG00000007682)	ZFC3H1 (ENSGACG00000007651)	PTPRB (ENSGACG00000007601)	frs2b (ENSGACG00000007588)	nup160 (ENSGACG00000007560)	ENSGACG00000007545	lamb1a (ENSGACG00000007525)	ENSGACG00000007499	CSPG4 (ENSGACG00000007480)	snx33 (ENSGACG00000007474)	snupn (ENSGACG00000007450)	PTPN9 (ENSGACG00000007434)	sin3aa (ENSGACG00000007425)	crabp1a (ENSGACG00000007393)
Perciformes_a	ANCESTRAL SPECIES	102											ENSGT00530000063759.a	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000000707.y.a	ENSGT00940000154415.lb.b	ENSGT00390000011620.b.e ##22	ENSGT00940000159496.l	ENSGT00940000159100.h
Pike perch	MODERN SPECIES	293					ENSSLUG00000021919	ENSSLUG00000021912	ENSSLUG00000021910	mphosph6 (ENSSLUG00000021905)	ENSSLUG00000021900	ENSSLUG00000021898	ENSSLUG00000021897	hsd17b2 (ENSSLUG00000021837)	gpia (ENSSLUG00000021729)	lsm14aa (ENSSLUG00000021690)	ENSSLUG00000021685	ENSSLUG00000021671 ##22	KCTD15 (ENSSLUG00000021668)	CHST8 (ENSSLUG00000021651)	ENSSLUG00000021641	ZFC3H1 (ENSSLUG00000021629)	tbc1d15 (ENSSLUG00000020649)
Eupecaria_C	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000156152.e.a.b	ENSGT00390000007640.b.b	ENSGT00940000160394.b	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000162591	ENSGT00520000055620.B	ENSGT00980000201244	ENSGT00940000159483.a.a	ENSGT00950000183202.a.b	ENSGT00940000155938.b.b	ENSGT00530000063759.a	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000000707.y.a	ENSGT00940000154415.lb.b	ENSGT00390000011620.b.e ##22	ENSGT00940000159100.h	ENSGT00940000159496.l	ENSGT00950000182885.A.b	ENSGT00940000156429	ENSGT00940000177974	ENSGT00390000001116	ENSGT00940000156088.c.b	ENSGT00940000157033.h	ENSGT00390000000972	ENSGT00940000167873	ENSGT00940000156003.l.a	ENSGT00940000165244.a
Gilthead seabream	MODERN SPECIES	22	mdkb (ENSSAUG00010000755)	ENSSAUG00010000751	ambra1b (ENSSAUG00010000742)	NOX5 (ENSSAUG00010000717)	rpgrip1l (ENSSAUG00010000708)	ENSSAUG00010000706	ENSSAUG00010000705	ENSSAUG00010000701	RBL2 (ENSSAUG00010000686)	ENSSAUG00010000672	mphosph6 (ENSSAUG00010000670)	hsd17b2 (ENSSAUG00010000665)	ENSSAUG00010000662	gpia (ENSSAUG00010000582)	lsm14aa (ENSSAUG00010000513)	ENSSAUG00010000494 ##22	KCTD15 (ENSSAUG00010000484)	ENSSAUG00010000442	ENSSAUG00010000403	ENSSAUG00010000388	ENSSAUG00010024987	ENSSAUG00010024986	tbc1d15 (ENSSAUG00010024918)	tph2 (ENSSAUG00010024580)	CHST8 (ENSSAUG00010024567)	CHST8 (ENSSAUG00010024566)	tph2 (ENSSAUG00010024565)	lamb1a (ENSSAUG00010022264)	nup160 (ENSSAUG00010021898)	ENSSAUG00010021879	ENSSAUG00010021877
Eupercaria_incertae_sedis	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000156152.e.a.b	ENSGT00390000007640.b.b	ENSGT00940000160394.b	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000162591	ENSGT00520000055620.B	ENSGT00980000201244	ENSGT00940000159483.a.a	ENSGT00950000183202.a.b	ENSGT00940000155938.b.b	ENSGT00530000063759.a	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000000707.y.a	ENSGT00940000154415.lb.b	ENSGT00390000011620.b.e ##22	ENSGT00940000159100.h	ENSGT00940000159496.l	ENSGT00950000182885.A.b	ENSGT00940000156429	ENSGT00390000001116	ENSGT00940000156088.c.b	ENSGT00940000157033.h	ENSGT00390000000972	ENSGT00940000167873	ENSGT00940000156003.l.a	ENSGT00940000165244.a
European seabass	MODERN SPECIES	19	DGKZ (ENSDLAG00005003086)	mdkb (ENSDLAG00005007027)	ambra1b (ENSDLAG00005016487)	ENSDLAG00005031649	ENSDLAG00005015137	rpgrip1l (ENSDLAG00005017101)	ENSDLAG00005003030	ENSDLAG00005029375	ENSDLAG00005030892	ENSDLAG00005014447	ENSDLAG00005014855	ENSDLAG00005031693	hsd17b2 (ENSDLAG00005014913)	gpia (ENSDLAG00005014948)	lsm14aa (ENSDLAG00005026991)	ENSDLAG00005027638 ##22	CHST8 (ENSDLAG00005005479)	KCTD15 (ENSDLAG00005020257)	ENSDLAG00005029026	ENSDLAG00005032741	ENSDLAG00005003344	ENSDLAG00005027238	ENSDLAG00005004304	ENSDLAG00005017752	ENSDLAG00005016512	ENSDLAG00005029472	ENSDLAG00005016719	ENSDLAG00005028242	ENSDLAG00005027468	ENSDLAG00005029071	ENSDLAG00005026699
Large yellow croaker	MODERN SPECIES	39	ENSLCRG00005011189	ENSLCRG00005011187	actr6 (ENSLCRG00005011113)	sycp3 (ENSLCRG00005011110)	ambra1b (ENSLCRG00005011107)	NOX5 (ENSLCRG00005011101)	rpgrip1l (ENSLCRG00005010979)	ENSLCRG00005010971	ENSLCRG00005010961	RBL2 (ENSLCRG00005010934)	hsd17b2 (ENSLCRG00005010924)	mphosph6 (ENSLCRG00005010922)	SNX20 (ENSLCRG00005010921)	gpia (ENSLCRG00005010834)	lsm14aa (ENSLCRG00005010826)	ENSLCRG00005010823 ##22	KCTD15 (ENSLCRG00005010822)	CHST8 (ENSLCRG00005010820)	tph2 (ENSLCRG00005009883)	tbc1d15 (ENSLCRG00005009814)	ZFC3H1 (ENSLCRG00005009812)	ENSLCRG00005006641	lamb1a (ENSLCRG00005004108)	ENSLCRG00005004055	nup160 (ENSLCRG00005004049)	frs2b (ENSLCRG00005004048)	PTPRB (ENSLCRG00005001900)	ENSLCRG00005001731
Percomorphaceae_D	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000156152.e.a.b	ENSGT00390000007640.b.b	ENSGT00940000160394.b	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000162591	ENSGT00520000055620.B	ENSGT00940000159483.a.a	ENSGT00940000163250.A.b	ENSGT00950000183202.a.b	ENSGT00940000155938.b.b	ENSGT00530000063759.a	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000000707.y.a	ENSGT00940000154415.lb.b	ENSGT00390000011620.b.e ##22	ENSGT00940000159496.l	ENSGT00940000159100.h	ENSGT00940000178960	ENSGT00950000182885.A.b	ENSGT00940000156429	ENSGT00390000001116	ENSGT00940000156088.c.b	ENSGT00940000157033.h	ENSGT00390000000972	ENSGT00940000167873	ENSGT00940000163149.a.b.c.a.b	ENSGT00940000165244.a	ENSGT00940000162514	ENSGT00940000156003.l.a
Anabantaria	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000156124.c.b	ENSGT00940000156152.e.a.b	ENSGT00390000007640.b.b	ENSGT00940000160394.b	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000162591	ENSGT00520000055620.B	ENSGT00940000159483.a.a	ENSGT00950000183202.a.b	ENSGT00940000155938.b.b	ENSGT00530000063759.a	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000000707.y.a	ENSGT00940000154415.lb.b	ENSGT00390000011620.b.e ##22	ENSGT00940000159496.l	ENSGT00940000159100.h	ENSGT00940000178960	ENSGT00950000182885.A.b	ENSGT00940000156429	ENSGT00390000001116	ENSGT00940000156088.c.b	ENSGT00940000157033.h	ENSGT00390000000972	ENSGT00940000167873	ENSGT00940000163149.a.b.c.a.b	ENSGT00940000165244.a	ENSGT00940000162514	ENSGT00940000156003.l.a
Zig-zag eel	MODERN SPECIES	20	DGKZ (ENSMAMG00000015557)	mdkb (ENSMAMG00000015628)	ENSMAMG00000015636	ambra1b (ENSMAMG00000015652)	ENSMAMG00000015722	rpgrip1l (ENSMAMG00000015755)	ENSMAMG00000015781	ENSMAMG00000015799	ENSMAMG00000027445	ENSMAMG00000015874	ENSMAMG00000015884	mphosph6 (ENSMAMG00000015895)	hsd17b2 (ENSMAMG00000015920)	gpia (ENSMAMG00000015981)	lsm14aa (ENSMAMG00000016088)	ENSMAMG00000016141 ##22	KCTD15 (ENSMAMG00000016159)	ENSMAMG00000016275	ENSMAMG00000021317	ENSMAMG00000021320	ENSMAMG00000021327	ENSMAMG00000021340	ENSMAMG00000021345	ENSMAMG00000021354	ENSMAMG00000024737	ENSMAMG00000021373	ENSMAMG00000028108	ENSMAMG00000024363	ENSMAMG00000026457	ENSMAMG00000022673	ENSMAMG00000022680
Anabantoidei	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000156124.c.b	ENSGT00940000156152.e.a.b	ENSGT00390000007640.b.b	ENSGT00940000160394.b	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000162591	ENSGT00520000055620.B	ENSGT00940000159483.a.a	ENSGT00950000183202.a.b	ENSGT00940000155938.b.b	ENSGT00530000063759.a	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000000707.y.a	ENSGT00940000154415.lb.b	ENSGT00390000011620.b.e ##22	ENSGT00940000159496.l	ENSGT00940000159100.h	ENSGT00940000178960	ENSGT00950000182885.A.b	ENSGT00940000156429	ENSGT00390000001116	ENSGT00940000156088.c.b	ENSGT00940000157033.h	ENSGT00390000000972	ENSGT00940000167873	ENSGT00940000163149.a.b.c.a.b	ENSGT00940000165244.a	ENSGT00940000156003.l.a
Climbing perch	MODERN SPECIES	19	DGKZ (ENSATEG00000013496)	mdkb (ENSATEG00000013643)	ENSATEG00000027168	ENSATEG00000013658	ambra1b (ENSATEG00000013668)	ENSATEG00000013689	rpgrip1l (ENSATEG00000013724)	ENSATEG00000013755	ENSATEG00000013794	ENSATEG00000013859	ENSATEG00000028232	mphosph6 (ENSATEG00000013914)	hsd17b2 (ENSATEG00000029385)	gpia (ENSATEG00000013944)	lsm14aa (ENSATEG00000014002)	ENSATEG00000014024 ##22	KCTD15 (ENSATEG00000014037)	CHST8 (ENSATEG00000014050)	ENSATEG00000027634	ENSATEG00000014127	ENSATEG00000015322	ENSATEG00000015391	ENSATEG00000015475	ENSATEG00000015577	ENSATEG00000015619	ENSATEG00000015807	ENSATEG00000015985	ENSATEG00000016018	ENSATEG00000016060	ENSATEG00000016096
Siamese fighting fish	MODERN SPECIES	17	ENSBSLG00000004415	PRDM11 (ENSBSLG00000004419)	PHF21A (ENSBSLG00000004450)	DGKZ (ENSBSLG00000004551)	mdkb (ENSBSLG00000004571)	ENSBSLG00000004573	ambra1b (ENSBSLG00000004581)	rpgrip1l (ENSBSLG00000004609)	ENSBSLG00000004613	IRX5 (ENSBSLG00000004615)	SNX20 (ENSBSLG00000004685)	mphosph6 (ENSBSLG00000004687)	hsd17b2 (ENSBSLG00000004690)	gpia (ENSBSLG00000004693)	lsm14aa (ENSBSLG00000004696)	ENSBSLG00000004699 ##22	KCTD15 (ENSBSLG00000004701)	CHST8 (ENSBSLG00000004703)	ENSBSLG00000004704	tph2 (ENSBSLG00000004721)	tbc1d15 (ENSBSLG00000006113)	ENSBSLG00000006180	ENSBSLG00000006229	frs2b (ENSBSLG00000007318)	nup160 (ENSBSLG00000007344)	ENSBSLG00000007471	lamb1a (ENSBSLG00000008555)
Carangaria	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000156152.e.a.b	ENSGT00390000007640.b.b	ENSGT00940000160394.b	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000162591	ENSGT00520000055620.B	ENSGT00940000159483.a.a	ENSGT00940000163250.A.b	ENSGT00950000183202.a.b	ENSGT00940000155938.b.b	ENSGT00530000063759.a	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000000707.y.a	ENSGT00940000154415.lb.b	ENSGT00390000011620.b.e ##22	ENSGT00940000159496.l	ENSGT00940000159100.h	ENSGT00950000182885.A.b	ENSGT00940000156429	ENSGT00390000001116	ENSGT00940000156088.c.b	ENSGT00940000157033.h	ENSGT00390000000972	ENSGT00940000167873	ENSGT00940000163149.a.b.c.a.b	ENSGT00940000165244.a
Carangaria_A	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000156152.e.a.b	ENSGT00390000007640.b.b	ENSGT00940000160394.b	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000162591	ENSGT00520000055620.B	ENSGT00940000159483.a.a	ENSGT00940000163250.A.b	ENSGT00950000183202.a.b	ENSGT00940000155938.b.b	ENSGT00530000063759.a	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000000707.y.a	ENSGT00940000154415.lb.b	ENSGT00390000011620.b.e ##22	ENSGT00940000159496.l	ENSGT00940000159100.h	ENSGT00950000182885.A.b	ENSGT00940000156429	ENSGT00390000001116	ENSGT00940000156088.c.b	ENSGT00940000157033.h	ENSGT00390000000972	ENSGT00940000167873	ENSGT00940000163149.a.b.c.a.b	ENSGT00940000165244.a
Seriola	ANCESTRAL SPECIES	133	ENSGT00940000156152.e.a.b	ENSGT00390000007640.b.b	ENSGT00940000160394.b	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000162591	ENSGT00520000055620.B	ENSGT00940000159483.a.a	ENSGT00940000163250.A.b	ENSGT00950000183202.a.b	ENSGT00940000155938.b.b	ENSGT00530000063759.a	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000000707.y.a	ENSGT00940000154415.lb.b	ENSGT00390000011620.b.e ##22	ENSGT00940000159496.l	ENSGT00940000159100.h	ENSGT00950000182885.A.b	ENSGT00940000156429	ENSGT00390000001116
Yellowtail amberjack	MODERN SPECIES	3276							irx5b (ENSSLDG00000014373)	ENSSLDG00000014397	RBL2 (ENSSLDG00000014424)	ENSSLDG00000014465	SNX20 (ENSSLDG00000014476)	mphosph6 (ENSSLDG00000014502)	hsd17b2 (ENSSLDG00000014489)	gpia (ENSSLDG00000014526)	lsm14aa (ENSSLDG00000014548)	ENSSLDG00000014574 ##22	KCTD15 (ENSSLDG00000014606)
Greater amberjack	MODERN SPECIES	132	DGKZ (ENSSDUG00000001108)	mdkb (ENSSDUG00000001096)	ENSSDUG00000001083	ambra1b (ENSSDUG00000000986)	NOX5 (ENSSDUG00000000921)	rpgrip1l (ENSSDUG00000000904)	IRX5 (ENSSDUG00000000867)	ENSSDUG00000000844	RBL2 (ENSSDUG00000000771)	SALL1 (ENSSDUG00000000748)	SNX20 (ENSSDUG00000000736)	mphosph6 (ENSSDUG00000000703)	hsd17b2 (ENSSDUG00000000619)	gpia (ENSSDUG00000000541)	lsm14aa (ENSSDUG00000000495)	ENSSDUG00000000429 ##22	kctd15a (ENSSDUG00000000401)	CHST8 (ENSSDUG00000000397)	tph2 (ENSSDUG00000000350)	tbc1d15 (ENSSDUG00000000277)	ZFC3H1 (ENSSDUG00000000244)	PRDM11 (ENSSDUG00000000235)	ENSSDUG00000000211	ENSSDUG00000000204	ENSSDUG00000000167	ENSSDUG00000000117	ENSSDUG00000000086	ENSSDUG00000021488	actr6 (ENSSDUG00000021467)	sycp3 (ENSSDUG00000021453)	si:ch211-59o9.10 (ENSSDUG00000021442)
Barramundi perch	MODERN SPECIES	8			ENSLCAG00010026046	NOX5 (ENSLCAG00010026055)	ENSLCAG00010026059	IRX5 (ENSLCAG00010026062)	ENSLCAG00010026064	ENSLCAG00010026065	hsd17b2 (ENSLCAG00010026066)	mphosph6 (ENSLCAG00010026067)	SNX20 (ENSLCAG00010026070)	SALL1 (ENSLCAG00010026071)	RBL2 (ENSLCAG00010026080)	gpia (ENSLCAG00010026262)	ENSLCAG00010026430	ENSLCAG00010026432 ##22	KCTD15 (ENSLCAG00010026433)
Pleuronectoidei	ANCESTRAL SPECIES	102											ENSGT00530000063759.a	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000000707.y.a	ENSGT00940000154415.lb.b	ENSGT00390000011620.b.e ##22	ENSGT00940000159496.l	ENSGT00940000159100.h	ENSGT00950000182885.A.b	ENSGT00940000156429	ENSGT00390000001116	ENSGT00940000156088.c.b	ENSGT00940000157033.h	ENSGT00390000000972	ENSGT00940000167873	ENSGT00940000165244.a	ENSGT00940000156003.l.a
Turbot	MODERN SPECIES	1	ENSSMAG00000036455	ENSSMAG00000019069	ENSSMAG00000036853	ENSSMAG00000019083	ENSSMAG00000019136	ambra1b (ENSSMAG00000019264)	ENSSMAG00000032605	ENSSMAG00000032849	mdkb (ENSSMAG00000019302)	DGKZ (ENSSMAG00000019320)	ENSSMAG00000027847	PHF21A (ENSSMAG00000019347)	hsd17b2 (ENSSMAG00000019382)	GPI (ENSSMAG00000019390)	ENSSMAG00000029607	ENSSMAG00000019413 ##22	KCTD15 (ENSSMAG00000019428)	CHST8 (ENSSMAG00000019437)	ENSSMAG00000019445	ENSSMAG00000019733	ENSSMAG00000019783	ENSSMAG00000019806	ENSSMAG00000038103	ENSSMAG00000019901	ENSSMAG00000019909	ENSSMAG00000000122	ENSSMAG00000000133	ENSSMAG00000000143	ENSSMAG00000000157
Tongue sole	MODERN SPECIES	16	ENSCSEG00000021436	ckap5 (ENSCSEG00000021437)	cstpp1 (ENSCSEG00000021438)	mapk8ip1a (ENSCSEG00000021439)	cry2 (ENSCSEG00000021440)	anpeplb (ENSCSEG00000021448)	arpin (ENSCSEG00000021449)	ENSCSEG00000021450	ENSCSEG00000021451	ENSCSEG00000021452	slc12a3 (ENSCSEG00000021453)	mphosph6 (ENSCSEG00000021454)	hsd17b2 (ENSCSEG00000021455)	gpia (ENSCSEG00000021456)	lsm14aa (ENSCSEG00000021457)	ENSCSEG00000021458 ##22	tph2 (ENSCSEG00000021459)	tbc1d15 (ENSCSEG00000021460)	ENSCSEG00000021461	ZFC3H1 (ENSCSEG00000021462)	ENSCSEG00000021463	ENSCSEG00000021464	ENSCSEG00000021465	bmal1a (ENSCSEG00000021466)	ENSCSEG00000021467	PIGY (ENSCSEG00000021468)	zgc:162634 (ENSCSEG00000021469)	lamb1a (ENSCSEG00000021470)	ENSCSEG00000021472	ENSCSEG00000021473	nup160 (ENSCSEG00000021474)
Ovalentaria	ANCESTRAL SPECIES	37	ENSGT00940000165244.a	ENSGT00940000163149.a.b.c.a.b	ENSGT00390000000972	ENSGT00940000157033.h	ENSGT00940000156088.c.b	ENSGT00390000001116	ENSGT00940000156429	ENSGT00950000182885.A.b	ENSGT00940000154318.A.b	ENSGT00940000178960	ENSGT00530000063759.a	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000000707.y.a	ENSGT00940000154415.lb.b	ENSGT00390000011620.b.e ##22	ENSGT00940000159496.l	ENSGT00940000159100.h
Atherinomorphae	ANCESTRAL SPECIES	73		ENSGT00940000156003.l.a	ENSGT00940000165244.a	ENSGT00940000163149.a.b.c.a.b	ENSGT00940000167873	ENSGT00390000000972	ENSGT00940000157033.h	ENSGT00940000156088.c.b	ENSGT00390000001116	ENSGT00940000156429	ENSGT00950000182885.A.b	ENSGT00530000063759.a	ENSGT00390000009212	ENSGT00390000000707.y.a	ENSGT00940000154415.lb.b	ENSGT00390000011620.b.e ##22	ENSGT00940000159496.l	ENSGT00940000159100.h
Cyprinodontiformes	ANCESTRAL SPECIES	70								ENSGT00390000001116	ENSGT00940000156429	ENSGT00950000182885.A.b	ENSGT00940000154318.A.b	ENSGT00530000063759.a	ENSGT00390000009212	ENSGT00390000000707.y.a	ENSGT00940000154415.lb.b	ENSGT00390000011620.b.e ##22	ENSGT00940000159496.l	ENSGT00940000159100.h	ENSGT00940000156088.c.b	ENSGT00940000157033.h	ENSGT00390000000972	ENSGT00940000167873	ENSGT00940000163149.a.b.c.a.b	ENSGT00940000165244.a	ENSGT00940000156003.l.a
Aplocheiloidei	ANCESTRAL SPECIES	97												ENSGT00530000063759.a	ENSGT00390000009212	ENSGT00390000000707.y.a	ENSGT00940000154415.lb.b	ENSGT00390000011620.b.e ##22	ENSGT00940000159100.h	ENSGT00950000183004.a.b.b	ENSGT00640000091774.a.b	ENSGT00990000203615.a.a.a.a	ENSGT00730000111696.b	ENSGT00940000156124.c.b	ENSGT00940000156152.e.a.b	ENSGT00390000007640.b.b	ENSGT00940000160394.b	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000162591	ENSGT00520000055620.B	ENSGT00940000159483.a.a	ENSGT00950000183202.a.b	ENSGT00510000048252
Mangrove rivulus	MODERN SPECIES	724															lsm14aa (ENSKMAG00000006797)	ENSKMAG00000006890 ##22	CHST8 (ENSKMAG00000006945)	ENSKMAG00000006982	ENSKMAG00000007001	ENSKMAG00000007024	ENSKMAG00000007043	ENSKMAG00000007074
Turquoise killifish	MODERN SPECIES	1622	ENSNFUG00015006791	ENSNFUG00015006851	LAMB1 (ENSNFUG00015007776)	ENSNFUG00015013240	ENSNFUG00015017016	NUP160 (ENSNFUG00015017051)	FRS2B (ENSNFUG00015017412)	PTPRB (ENSNFUG00015017466)	tph2 (ENSNFUG00015017768)	TBC1D15 (ENSNFUG00015017940)	ZFC3H1 (ENSNFUG00015021134)	SNX20 (ENSNFUG00015021144)	MPHOSPH6 (ENSNFUG00015021146)	GPI (ENSNFUG00015021157)	ENSNFUG00015021652	ENSNFUG00015021656 ##22	ENSNFUG00015021661	ENSNFUG00015021688	KCNJ11L (ENSNFUG00015021694)	ENSNFUG00015021703	PHF21A (ENSNFUG00015021710)	ENSNFUG00015021729	CU181898.3 (ENSNFUG00015021766)	ENSNFUG00015021960	ENSNFUG00015021962	MDKB (ENSNFUG00015021966)	ambra1b (ENSNFUG00015021989)	NOX5 (ENSNFUG00015022021)	RPGRIP1L (ENSNFUG00015022052)	ENSNFUG00015022079	ENSNFUG00015022089
Cyprinodontoidei	ANCESTRAL SPECIES	7								ENSGT00390000001116	ENSGT00940000156429	ENSGT00950000182885.A.b	ENSGT00940000154318.A.b	ENSGT00530000063759.a	ENSGT00390000009212	ENSGT00390000000707.y.a	ENSGT00940000154415.lb.b	ENSGT00390000011620.b.e ##22	ENSGT00940000159496.l	ENSGT00940000159100.h	ENSGT00940000156088.c.b	ENSGT00940000157033.h	ENSGT00390000000972	ENSGT00940000167873	ENSGT00940000163149.a.b.c.a.b	ENSGT00940000165244.a	ENSGT00940000156003.l.a	ENSGT00940000158102	ENSGT00940000157319	ENSGT00950000182863.A.a.a.n	ENSGT00390000003058.b.a.b	ENSGT00940000162986.k.a.b.a	ENSGT00940000162986.k.a.b.b
NAME_4	ANCESTRAL SPECIES	30	ENSGT00940000159837	ENSGT00730000111696.b	ENSGT00990000203615.a.a.a.a	ENSGT00940000177432.a.a.b	ENSGT00640000091774.a.b	ENSGT00950000183004.a.b.b	ENSGT01100000263483.E.a.c.b.b	ENSGT00390000001116	ENSGT00940000156429	ENSGT00950000182885.A.b	ENSGT00940000154318.A.b	ENSGT00530000063759.a	ENSGT00390000009212	ENSGT00390000000707.y.a	ENSGT00940000154415.lb.b	ENSGT00390000011620.b.e ##22	ENSGT00940000159496.l	ENSGT00940000159100.h	ENSGT00940000156088.c.b	ENSGT00940000157033.h	ENSGT00390000000972	ENSGT00940000167873	ENSGT00940000163149.a.b.c.a.b	ENSGT00940000165244.a	ENSGT00940000156003.l.a	ENSGT00940000158102	ENSGT00940000157319	ENSGT00950000182863.A.a.a.n	ENSGT00390000003058.b.a.b	ENSGT00940000162986.k.a.b.a	ENSGT00940000162986.k.a.b.b
Mummichog	MODERN SPECIES	2241	PHF21A (ENSFHEG00000019123)	ENSFHEG00000019138	PRDM11 (ENSFHEG00000019163)	ENSFHEG00000019167	ENSFHEG00000019186	ENSFHEG00000019213	ENSFHEG00000019244	ENSFHEG00000019279	tbc1d15 (ENSFHEG00000019311)	tph2 (ENSFHEG00000019344)	ENSFHEG00000019352	SNX20 (ENSFHEG00000019358)	mphosph6 (ENSFHEG00000019377)	gpia (ENSFHEG00000019417)	lsm14aa (ENSFHEG00000019482)	ENSFHEG00000019573 ##22	KCTD15 (ENSFHEG00000019589)	CHST8 (ENSFHEG00000019601)	ENSFHEG00000019616	PTPRB (ENSFHEG00000019688)	frs2b (ENSFHEG00000019727)	nup160 (ENSFHEG00000019843)	ENSFHEG00000019875	ENSFHEG00000019902	ENSFHEG00000019924	lamb1a (ENSFHEG00000020037)	cdk10 (ENSFHEG00000020111)	vps4a (ENSFHEG00000020184)	SNTB2 (ENSFHEG00000020234)	spire2 (ENSFHEG00000020251)	chst6 (ENSFHEG00000020271)
Sheepshead minnow	MODERN SPECIES	1018							ENSCVAG00000019642	ENSCVAG00000019639	ENSCVAG00000019629	tbc1d15 (ENSCVAG00000019613)	tph2 (ENSCVAG00000019544)	SNX20 (ENSCVAG00000019504)	mphosph6 (ENSCVAG00000019498)	gpia (ENSCVAG00000019459)	lsm14aa (ENSCVAG00000019400)	ENSCVAG00000019382 ##22	kctd15a (ENSCVAG00000019372)	CHST8 (ENSCVAG00000019335)
Poeciliinae	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00640000091774.a.b	ENSGT00950000183004.a.b.b	ENSGT01100000263483.E.a.c.b.b.c.a.a.b.b	ENSGT01100000263483.E.a.c.b.b.c.a.a.a	ENSGT01100000263483.F.a	ENSGT01100000263483.E.a.c.b.b.d	ENSGT00390000001116	ENSGT00940000156429	ENSGT00950000182885.A.b	ENSGT00940000159100.h	ENSGT00940000178960	ENSGT00530000063759.a	ENSGT00390000009212	ENSGT00390000000707.y.a	ENSGT00940000154415.lb.b	ENSGT00390000011620.b.e ##22	ENSGT00940000159496.l	ENSGT00940000155728.o	ENSGT00940000159950	ENSGT00940000159982	ENSGT00940000177161	ENSGT00940000176894	ENSGT00580000081623	ENSGT00990000203541.a.a.a.a.b	ENSGT00940000154294	ENSGT00390000017249.f	ENSGT00940000158481.c	ENSGT00940000157667.c.d	ENSGT00940000159662.c.b	ENSGT00940000160199	ENSGT00940000153438.a.s
Poecilia	ANCESTRAL SPECIES	5							ENSGT01100000263483.E.a.c.b.b.d	ENSGT00390000001116	ENSGT00940000156429	ENSGT00950000182885.A.b	ENSGT00940000159100.h	ENSGT00530000063759.a	ENSGT00390000009212	ENSGT00390000000707.y.a	ENSGT00940000154415.lb.b	ENSGT00390000011620.b.e ##22	ENSGT00940000159496.l	ENSGT00940000155728.o	ENSGT00940000159950	ENSGT00940000159982	ENSGT00940000177161	ENSGT00940000176894	ENSGT00580000081623	ENSGT00990000203541.a.a.a.a.b	ENSGT00940000154294	ENSGT00390000017249.f	ENSGT00940000158481.c	ENSGT00940000157667.c.d	ENSGT00940000159662.c.b	ENSGT00940000160199	ENSGT00940000153438.a.s
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Sailfin molly	DUPLICATION
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Platyfish	MODERN SPECIES	11	ENSXMAG00000006930	ENSXMAG00000022832	ENSXMAG00000026760	ENSXMAG00000006931	ENSXMAG00000006932	ENSXMAG00000006933	tbc1d15 (ENSXMAG00000006966)	ENSXMAG00000024795	tph2 (ENSXMAG00000026324)	CHST8 (ENSXMAG00000007050)	ENSXMAG00000025358	SNX20 (ENSXMAG00000027217)	mphosph6 (ENSXMAG00000027153)	gpia (ENSXMAG00000007063)	lsm14aa (ENSXMAG00000007117)	ENSXMAG00000027680 ##22	kctd15a (ENSXMAG00000007138)	PLEKHA5 (ENSXMAG00000007144)	ENSXMAG00000007186	ENSXMAG00000007204	ENSXMAG00000024870	ENSXMAG00000022042	RELN (ENSXMAG00000007226)	LHFPL3 (ENSXMAG00000026242)	ENSXMAG00000007244	tp53i11b (ENSXMAG00000021035)	cd82b (ENSXMAG00000029000)	tspan18b (ENSXMAG00000007280)	alx4b (ENSXMAG00000007283)	lmo2 (ENSXMAG00000025090)	caprin1b (ENSXMAG00000007287)
Oryzias	ANCESTRAL SPECIES	52	ENSGT00950000182872.f.b.a.e	ENSGT00940000165415.i.b	ENSGT00940000165829	ENSGT00400000022168.b	ENSGT00980000198638.b	ENSGT00940000154222.c.c	ENSGT00390000000972	ENSGT00940000157033.h	ENSGT00940000156088.c.b	ENSGT00390000001116	ENSGT00940000156429	ENSGT00950000182885.A.b	ENSGT00530000063759.a	ENSGT00390000009212	ENSGT00390000000707.y.a	ENSGT00390000011620.b.e ##22	ENSGT00940000163149.a.b.c.a.b	ENSGT00940000156003.l.a	ENSGT01100000263545.a.b.d.a	ENSGT00390000017671.b	ENSGT00940000155044.B	ENSGT00940000178793	ENSGT00940000155456.f	ENSGT00610000087446	ENSGT00390000015889	ENSGT00940000170472	ENSGT00390000007975.a.b.b	ENSGT00940000157523.g.b	ENSGT01050000244951.a.b.a.a.g.a	ENSGT00940000171216	ENSGT00940000159028.f
Oryzias_b	ANCESTRAL SPECIES				ENSGT00400000022168.b	ENSGT00980000198638.b	ENSGT00940000154222.c.c	ENSGT00390000000972	ENSGT00940000154356.D.a.a.a.b.c.f	ENSGT00940000157033.h	ENSGT00940000156088.c.b	ENSGT00390000001116	ENSGT00940000156429	ENSGT00950000182885.A.b	ENSGT00530000063759.a	ENSGT00390000009212	ENSGT00390000000707.y.a	ENSGT00390000011620.b.e ##22	ENSGT00940000163149.a.b.c.a.b	ENSGT00940000156003.l.a	ENSGT01100000263545.a.b.d.a	ENSGT00390000017671.b	ENSGT00940000155044.B	ENSGT00940000178793	ENSGT00940000155456.f	ENSGT00610000087446	ENSGT00390000015889	ENSGT00940000170472	ENSGT00390000007975.a.b.b	ENSGT00940000157523.g.b	ENSGT01050000244951.a.b.a.a.g.a	ENSGT00940000171216	ENSGT00940000159028.f
Javanese ricefish	MODERN SPECIES	20	anpeplb (ENSOJAG00000004648)	arpin (ENSOJAG00000004661)	smpd3 (ENSOJAG00000004694)	ZNF622 (ENSOJAG00000004764)	ENSOJAG00000004873	septin15 (ENSOJAG00000004973)	nup160 (ENSOJAG00000005587)	ENSOJAG00000006666	frs2b (ENSOJAG00000006677)	PTPRB (ENSOJAG00000006801)	ENSOJAG00000007713	tbc1d15 (ENSOJAG00000007842)	tph2 (ENSOJAG00000009359)	ENSOJAG00000009433	mphosph6 (ENSOJAG00000009466)	ENSOJAG00000011153 ##22	ENSOJAG00000011161	lamb1a (ENSOJAG00000011261)	cetp (ENSOJAG00000012255)	herpud1 (ENSOJAG00000012337)	ENSOJAG00000012386	ENSOJAG00000012406	galnt18a (ENSOJAG00000012414)	zgc:162634 (ENSOJAG00000012464)	ENSOJAG00000012475	btbd10a (ENSOJAG00000012507)	bmal1a (ENSOJAG00000012606)	PPFIBP2 (ENSOJAG00000013403)	sb:cb470 (ENSOJAG00000013931)	poglut3 (ENSOJAG00000013948)	cyb5r2 (ENSOJAG00000013965)
Indian medaka	MODERN SPECIES	589	ENSOMEG00000014932	smpd3 (ENSOMEG00000014995)	ENSOMEG00000015025	septin15 (ENSOMEG00000015056)	nup160 (ENSOMEG00000015097)	ENSOMEG00000015115	frs2b (ENSOMEG00000015146)	PTPRB (ENSOMEG00000000682)	ENSOMEG00000015325	ENSOMEG00000015403	tbc1d15 (ENSOMEG00000015482)	tph2 (ENSOMEG00000015532)	ENSOMEG00000015553	mphosph6 (ENSOMEG00000015572)	gpia (ENSOMEG00000015637)	ENSOMEG00000000870 ##22	ENSOMEG00000015686	ENSOMEG00000015716	lamb1a (ENSOMEG00000015777)	cetp (ENSOMEG00000015843)	herpud1 (ENSOMEG00000015873)	slc12a3 (ENSOMEG00000015917)	ENSOMEG00000015934	galnt18a (ENSOMEG00000015986)	PIGY (ENSOMEG00000016035)	zgc:162634 (ENSOMEG00000016039)	ENSOMEG00000016044	btbd10a (ENSOMEG00000016104)	bmal1a (ENSOMEG00000016170)	PPFIBP2 (ENSOMEG00000016418)	sb:cb470 (ENSOMEG00000016477)
Oryzias_a	ANCESTRAL SPECIES	119										ENSGT00390000001116	ENSGT00940000156429	ENSGT00950000182885.A.b	ENSGT00530000063759.a	ENSGT00390000009212	ENSGT00390000000707.y.a	ENSGT00390000011620.b.e ##22	ENSGT00940000163149.a.b.c.a.b	ENSGT00940000156003.l.a	ENSGT01100000263545.a.b.d.a	ENSGT00390000017671.b	ENSGT00940000155044.B	ENSGT00940000178793
Japanese Medaka HdrR	MODERN SPECIES	20	ric8a (ENSORLG00000018382)	carmil2 (ENSORLG00000018366)	ENSORLG00000018357	ripor1 (ENSORLG00000018344)	ENSORLG00000018329	ENSORLG00000018320	faap24 (ENSORLG00000025560)	ENSORLG00000027859	ANKRD27 (ENSORLG00000018302)	slc13a1 (ENSORLG00000000145)	ENSORLG00000000155	tbc1d15 (ENSORLG00000000184)	tph2 (ENSORLG00000000223)	mphosph6 (ENSORLG00000000232)	gpia (ENSORLG00000000249)	ENSORLG00000000264 ##22	ENSORLG00000028042	ENSORLG00000000271	lamb1a (ENSORLG00000000356)	cetp (ENSORLG00000000375)	herpud1 (ENSORLG00000000388)	slc12a3 (ENSORLG00000000412)	ENSORLG00000000419	ENSORLG00000024966	ENSORLG00000024504	ENSORLG00000000450	dldh (ENSORLG00000000461)	ENSORLG00000025976	grm8b (ENSORLG00000000478)	pot1 (ENSORLG00000000493)	GPR37 (ENSORLG00000027795)
Chinese medaka	MODERN SPECIES	3114																ENSOSIG00000009538 ##22
Ovalentaria_B	ANCESTRAL SPECIES	63	ENSGT00940000156003.l.a	ENSGT00940000167873	ENSGT00390000000972	ENSGT00940000157033.h	ENSGT00940000156088.c.b	ENSGT00390000001116	ENSGT00940000156429	ENSGT00950000182885.A.b	ENSGT00940000159100.h	ENSGT00940000178960	ENSGT00530000063759.a	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000000707.y.a	ENSGT00940000154415.lb.b	ENSGT00390000011620.b.e ##22	ENSGT00940000159496.l
Cichlidae	ANCESTRAL SPECIES	87	ENSGT00940000165244.a	ENSGT00940000156003.l.a	ENSGT00940000167873	ENSGT00390000000972	ENSGT00940000157033.h	ENSGT00940000156088.c.b	ENSGT00390000001116	ENSGT00940000156429	ENSGT00950000182885.A.b	ENSGT00940000178960	ENSGT00530000063759.a	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000000707.y.a	ENSGT00940000154415.lb.b	ENSGT00390000011620.b.e ##22	ENSGT00940000159496.l	ENSGT00940000159100.h
Pseudocrenilabrinae	ANCESTRAL SPECIES	55		ENSGT00940000165244.a	ENSGT00940000156003.l.a	ENSGT00940000167873	ENSGT00390000000972	ENSGT00940000157033.h	ENSGT00940000156088.c.b	ENSGT00390000001116	ENSGT00940000156429	ENSGT00950000182885.A.b	ENSGT00940000178960	ENSGT00530000063759.a	ENSGT00390000009212	ENSGT00390000000707.y.a	ENSGT00940000154415.lb.b	ENSGT00390000011620.b.e ##22	ENSGT00940000159496.l	ENSGT00940000159100.h
Pseudocrenilabrinae_A	ANCESTRAL SPECIES	30		ENSGT00940000165244.a	ENSGT00940000156003.l.a.g	ENSGT00940000167873	ENSGT00390000000972	ENSGT00940000157033.h	ENSGT00940000156088.c.b	ENSGT00390000001116	ENSGT00940000156429	ENSGT00950000182885.A.b	ENSGT00940000178960	ENSGT00530000063759.a	ENSGT00390000009212	ENSGT00390000000707.y.a	ENSGT00940000154415.lb.b	ENSGT00390000011620.b.e ##22	ENSGT00940000159496.l	ENSGT00940000159100.h	ENSGT00940000159483.a.a	ENSGT00520000055620.B	ENSGT00940000162591	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.b	ENSGT00390000007640.b.b	ENSGT00940000156152.e.a.b	ENSGT00940000156124.c.b	ENSGT00940000159837	ENSGT00730000111696.b	ENSGT00990000203615.a.a.a.a	ENSGT00940000177432.a.a	ENSGT00640000091774.a.b
Haplochromini	ANCESTRAL SPECIES	27		ENSGT00940000165244.a	ENSGT00940000156003.l.a.g	ENSGT00940000167873	ENSGT00390000000972	ENSGT00940000157033.h.c	ENSGT00940000156088.c.b	ENSGT00390000001116	ENSGT00940000156429	ENSGT00950000182885.A.b	ENSGT00940000178960	ENSGT00530000063759.a	ENSGT00390000009212	ENSGT00390000000707.y.a	ENSGT00940000154415.lb.b	ENSGT00390000011620.b.e ##22	ENSGT00940000159496.l	ENSGT00940000159100.h	ENSGT00940000159483.a.a	ENSGT00520000055620.B	ENSGT00940000162591	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.b	ENSGT00390000007640.b.b	ENSGT00940000156152.e.a.b	ENSGT00940000156124.c.b	ENSGT00940000159837	ENSGT00730000111696.b	ENSGT00990000203615.a.a.a.a	ENSGT00940000177432.a.a	ENSGT00640000091774.a.b
Burton s mouthbrooder	MODERN SPECIES	483					nup160 (ENSHBUG00000000189)	frs2b (ENSHBUG00000007410)	PTPRB (ENSHBUG00000007375)	ENSHBUG00000007331	ENSHBUG00000007320	tbc1d15 (ENSHBUG00000007299)	tph2 (ENSHBUG00000007284)	SNX20 (ENSHBUG00000007256)	mphosph6 (ENSHBUG00000007233)	gpia (ENSHBUG00000007214)	lsm14aa (ENSHBUG00000007150)	ENSHBUG00000007133 ##22	KCTD15 (ENSHBUG00000007115)	CHST8 (ENSHBUG00000007065)	ENSHBUG00000007055	ENSHBUG00000007034	rpgrip1l (ENSHBUG00000006943)	NOX5 (ENSHBUG00000006926)	ambra1b (ENSHBUG00000006893)	ENSHBUG00000006849	mdkb (ENSHBUG00000000169)	DGKZ (ENSHBUG00000006799)	PHF21A (ENSHBUG00000006727)	PRDM11 (ENSHBUG00000006714)	ENSHBUG00000006689	ENSHBUG00000006678	ENSHBUG00000006654
Haplochromini_A	ANCESTRAL SPECIES	25		ENSGT00940000165244.a	ENSGT00940000156003.l.a.g	ENSGT00940000167873	ENSGT00390000000972	ENSGT00940000157033.h.c	ENSGT00940000156088.c.b	ENSGT00390000001116	ENSGT00940000156429	ENSGT00950000182885.A.b	ENSGT00940000178960	ENSGT00530000063759.a	ENSGT00390000009212	ENSGT00390000000707.y.a	ENSGT00940000154415.lb.b	ENSGT00390000011620.b.e ##22	ENSGT00940000159496.l	ENSGT00940000159100.h	ENSGT00520000055620.B.k.a	ENSGT00940000162591	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.b	ENSGT00390000007640.b.b	ENSGT00940000156152.e.a.b	ENSGT00940000156124.c.b	ENSGT00940000159837	ENSGT00730000111696.b	ENSGT00990000203615.a.a.a.a	ENSGT00940000177432.a.a	ENSGT00640000091774.a.b	ENSGT00950000183004.a.b.b
Haplochromini_B	ANCESTRAL SPECIES	67		ENSGT00940000165244.a	ENSGT00940000156003.l.a.g	ENSGT00940000167873.c.a	ENSGT00390000000972	ENSGT00940000157033.h.c	ENSGT00940000156088.c.b	ENSGT00390000001116	ENSGT00940000156429	ENSGT00950000182885.A.b	ENSGT00940000178960	ENSGT00530000063759.a	ENSGT00390000009212	ENSGT00390000000707.y.a	ENSGT00940000154415.lb.b	ENSGT00390000011620.b.e ##22	ENSGT00940000159496.l	ENSGT00940000159100.h	ENSGT00950000183202.a.b	ENSGT00520000055620.B.k.a	ENSGT00940000162591	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.b	ENSGT00390000007640.b.b	ENSGT00940000156152.e.a.b	ENSGT00940000156124.c.b	ENSGT00940000159837	ENSGT00730000111696.b	ENSGT00990000203615.a.a.a.a	ENSGT00940000177432.a.a	ENSGT00640000091774.a.b
Eastern happy	MODERN SPECIES	19	ENSACLG00000020826	ENSACLG00000020844	ENSACLG00000020870	ENSACLG00000020885	nup160 (ENSACLG00000020947)	frs2b (ENSACLG00000021122)	PTPRB (ENSACLG00000021170)	ZFC3H1 (ENSACLG00000021274)	tbc1d15 (ENSACLG00000021334)	tph2 (ENSACLG00000021378)	ENSACLG00000021431	SNX20 (ENSACLG00000021456)	mphosph6 (ENSACLG00000021473)	gpia (ENSACLG00000021501)	lsm14aa (ENSACLG00000021578)	ENSACLG00000021601 ##22	ENSACLG00000021635	KCTD15 (ENSACLG00000021689)	ENSACLG00000021701	CHST8 (ENSACLG00000021706)	ENSACLG00000021717	RBL2 (ENSACLG00000021722)	ENSACLG00000021798	rpgrip1l (ENSACLG00000021843)	NOX5 (ENSACLG00000021924)	ambra1b (ENSACLG00000022006)	ENSACLG00000022090	ENSACLG00000022189	mdkb (ENSACLG00000022271)	DGKZ (ENSACLG00000022285)	ENSACLG00000022387
Zebra mbuna	MODERN SPECIES	37	lamb1a (ENSMZEG00005020370)	ENSMZEG00005020384	ENSMZEG00005020392	ENSMZEG00005020400	ENSMZEG00005020418	nup160 (ENSMZEG00005020421)	frs2b (ENSMZEG00005020432)	PTPRB (ENSMZEG00005020444)	ENSMZEG00005020465	tbc1d15 (ENSMZEG00005020469)	tph2 (ENSMZEG00005020475)	SNX20 (ENSMZEG00005020482)	mphosph6 (ENSMZEG00005020488)	gpia (ENSMZEG00005020493)	lsm14aa (ENSMZEG00005020507)	ENSMZEG00005020513 ##22	KCTD15 (ENSMZEG00005020516)	CHST8 (ENSMZEG00005020518)	RBL2 (ENSMZEG00005020520)	ENSMZEG00005020522
P. nyererei	MODERN SPECIES	711						nup160 (ENSPNYG00000006131)	frs2b (ENSPNYG00000006086)	PTPRB (ENSPNYG00000006016)	ZFC3H1 (ENSPNYG00000005977)	tbc1d15 (ENSPNYG00000005952)	tph2 (ENSPNYG00000005910)	SNX20 (ENSPNYG00000005901)	mphosph6 (ENSPNYG00000005875)	gpia (ENSPNYG00000005793)	lsm14aa (ENSPNYG00000005760)	ENSPNYG00000005709 ##22	KCTD15 (ENSPNYG00000005690)
Lyretail cichlid	MODERN SPECIES	495						CALML4 (ENSNBRG00000004621)	CLN6 (ENSNBRG00000004653)	ENSNBRG00000004803	ITGA11 (ENSNBRG00000004815)	ENSNBRG00000004883	ENSNBRG00000004891	ENSNBRG00000004918	ENSNBRG00000004936	ENSNBRG00000004958	lsm14aa (ENSNBRG00000004982)	ENSNBRG00000004995 ##22	KCTD15 (ENSNBRG00000005041)	CHST8 (ENSNBRG00000005074)	ENSNBRG00000005138	ENSNBRG00000005162	IRX5 (ENSNBRG00000005222)	ENSNBRG00000005307	NOX5 (ENSNBRG00000005323)	ambra1b (ENSNBRG00000005362)	mdkb (ENSNBRG00000005398)	ENSNBRG00000005413	PRDM11 (ENSNBRG00000005434)	ENSNBRG00000005448	ENSNBRG00000005463	ENSNBRG00000005484	actr6 (ENSNBRG00000005495)
Nile tilapia	MODERN SPECIES	19	ENSONIG00000031707	nup160 (ENSONIG00000018279)	frs2b (ENSONIG00000018278)	PTPRB (ENSONIG00000018272)	ZFC3H1 (ENSONIG00000018271)	tbc1d15 (ENSONIG00000018266)	ENSONIG00000037639	ENSONIG00000042294	tph2 (ENSONIG00000018258)	SNX20 (ENSONIG00000036517)	ENSONIG00000038862	mphosph6 (ENSONIG00000039940)	gpia (ENSONIG00000018246)	ENSONIG00000029449	ENSONIG00000027880	ENSONIG00000035628 ##22	CHST8 (ENSONIG00000027541)	KCTD15 (ENSONIG00000018241)	RBL2 (ENSONIG00000018239)	IRX5 (ENSONIG00000018236)	ENSONIG00000017391	lamb1a (ENSONIG00000017383)	ENSONIG00000030463	ENSONIG00000038407	ENSONIG00000010649	ENSONIG00000040531	ENSONIG00000029844	ENSONIG00000010647	ANKRD27 (ENSONIG00000010635)	ENSONIG00000010630	faap24 (ENSONIG00000010629)
Midas cichlid	MODERN SPECIES	258	ENSACIG00000015232	ces3 (ENSACIG00000015245)	slc13a1 (ENSACIG00000015361)	nup160 (ENSACIG00000015433)	frs2b (ENSACIG00000015503)	ENSACIG00000015530	ENSACIG00000015641	ZFC3H1 (ENSACIG00000015672)	tbc1d15 (ENSACIG00000015764)	tph2 (ENSACIG00000015794)	SNX20 (ENSACIG00000015829)	mphosph6 (ENSACIG00000015842)	hsd17b2 (ENSACIG00000015859)	gpia (ENSACIG00000015893)	lsm14aa (ENSACIG00000015925)	ENSACIG00000015960 ##22	KCTD15 (ENSACIG00000015988)	CHST8 (ENSACIG00000016002)	ENSACIG00000016018
Pomacentridae	ANCESTRAL SPECIES	167												ENSGT00390000009212	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000000707.y.a	ENSGT00940000154415.lb.b	ENSGT00390000011620.b.e ##22	ENSGT00940000159496.l	ENSGT00940000159100.h	ENSGT00950000182885.A.b	ENSGT00940000156429	ENSGT00390000000972	ENSGT00940000157033.h	ENSGT00940000156088.c.b	ENSGT00390000001116	ENSGT00940000167873	ENSGT00940000163149.a.b.c.a.b	ENSGT00940000165244.a	ENSGT00940000156003.l.a
Pomacentridae_A	ANCESTRAL SPECIES	169								ENSGT00940000165415.i.a.c	ENSGT00940000165829	ENSGT00400000022168.b	ENSGT01070000253987	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000000707.y.a	ENSGT00940000154415.lb.b	ENSGT00390000011620.b.e ##22	ENSGT00940000159496.l	ENSGT00940000159100.h	ENSGT00950000182885.A.b.c	ENSGT00940000156429	ENSGT00390000000972	ENSGT00940000157033.h	ENSGT00940000156088.c.b	ENSGT00390000001116	ENSGT00940000167873	ENSGT00940000163149.a.b.c.a.b	ENSGT00940000165244.a	ENSGT00940000156003.l.a
Amphiprion	ANCESTRAL SPECIES	240														ENSGT00390000000707.y.a	ENSGT00940000154415.lb.b	ENSGT00390000011620.b.e ##22	ENSGT00940000159496.l	ENSGT00950000182885.A.b.c	ENSGT00940000156429	ENSGT00390000000972	ENSGT00940000157033.h	ENSGT00940000156088.c.b	ENSGT00390000001116	ENSGT00940000167873	ENSGT00940000163149.a.b.c.a.b.v	ENSGT00940000163149.a.b.c.a.b.u	ENSGT00940000165244.a	ENSGT00940000156003.l.a
Clown anemonefish	MODERN SPECIES	1708											tgfb3 (ENSAOCG00000004768)	ENSAOCG00000004815	GPATCH2L (ENSAOCG00000004839)	gpia (ENSAOCG00000004885)	lsm14aa (ENSAOCG00000004910)	ENSAOCG00000004919 ##22	KCTD15 (ENSAOCG00000000199)	tph2 (ENSAOCG00000004959)	tbc1d15 (ENSAOCG00000004984)	nup160 (ENSAOCG00000005044)	frs2b (ENSAOCG00000005068)	PTPRB (ENSAOCG00000005134)
Orange clownfish	MODERN SPECIES	18													gpia (ENSAPEG00000012252)	lsm14aa (ENSAPEG00000012119)	ENSAPEG00000012100	ENSAPEG00000012072 ##22	KCTD15 (ENSAPEG00000012041)	tph2 (ENSAPEG00000011968)	ENSAPEG00000011947	tbc1d15 (ENSAPEG00000011900)	nup160 (ENSAPEG00000011770)	frs2b (ENSAPEG00000011720)	ENSAPEG00000011681	ENSAPEG00000011658	ENSAPEG00000011627	ENSAPEG00000011614	ENSAPEG00000011598	ENSAPEG00000011566	ENSAPEG00000011182	ENSAPEG00000011128	ENSAPEG00000010763
Spiny chromis	MODERN SPECIES	1581												ENSAPOG00000003189	ENSAPOG00000003201	gpia (ENSAPOG00000000074)	lsm14aa (ENSAPOG00000000078)	ENSAPOG00000003893 ##22
Bicolor damselfish	MODERN SPECIES	1129	znf276 (ENSSPAG00000023396)	vps9d1 (ENSSPAG00000023398)	ENSSPAG00000023400	ENSSPAG00000023402	pdf (ENSSPAG00000023403)	ENSSPAG00000023405	tat (ENSSPAG00000023407)	zgc:56622 (ENSSPAG00000023408)	klhl36 (ENSSPAG00000023409)	cotl1 (ENSSPAG00000023410)	ENSSPAG00000023411	mphosph6 (ENSSPAG00000023413)	hsd17b2 (ENSSPAG00000023414)	gpia (ENSSPAG00000023420)	lsm14aa (ENSSPAG00000023422)	ENSSPAG00000023424 ##22	kctd15a (ENSSPAG00000023426)	CHST8 (ENSSPAG00000023428)
Pinecone sodierfish	MODERN SPECIES	20	PHF21A (ENSMMDG00005009902)	DGKZ (ENSMMDG00005010818)	mdkb (ENSMMDG00005018740)	ENSMMDG00005018745	ambra1b (ENSMMDG00005018757)	NOX5 (ENSMMDG00005018806)	rpgrip1l (ENSMMDG00005019013)	IRX5 (ENSMMDG00005019299)	RBL2 (ENSMMDG00005019300)	SALL1 (ENSMMDG00005019302)	SNX20 (ENSMMDG00005019304)	mphosph6 (ENSMMDG00005019307)	hsd17b2 (ENSMMDG00005019308)	gpia (ENSMMDG00005019325)	lsm14aa (ENSMMDG00005019605)	ENSMMDG00005019608 ##22	KCTD15 (ENSMMDG00005019610)	CHST8 (ENSMMDG00005019614)	ENSMMDG00005019618	tph2 (ENSMMDG00005019624)	tbc1d15 (ENSMMDG00005019721)	ZFC3H1 (ENSMMDG00005020158)	ENSMMDG00005020172	june (ENSMMDG00005020178)	PTPRB (ENSMMDG00005020188)	frs2b (ENSMMDG00005020201)	nup160 (ENSMMDG00005020277)	ENSMMDG00005004008	ENSMMDG00005004020	ENSMMDG00005004122	CTTNBP2 (ENSMMDG00005004768)
Cod	MODERN SPECIES	22	ENSGMOG00000009229	KLHL25 (ENSGMOG00000009219)	ENSGMOG00000009207	ENSGMOG00000030372	NTRK3 (ENSGMOG00000018317)	ENSGMOG00000015373	ENSGMOG00000036529	mphosph6 (ENSGMOG00000005632)	hsd17b2 (ENSGMOG00000005527)	gpia (ENSGMOG00000005500)	ENSGMOG00000033741	ENSGMOG00000034491	ENSGMOG00000022432	ENSGMOG00000032423	lsm14aa (ENSGMOG00000005472)	ENSGMOG00000005431 ##22	KCTD15 (ENSGMOG00000005377)	CHST8 (ENSGMOG00000020446)	hdhd5 (ENSGMOG00000016609)	ENSGMOG00000016598	ccdc34 (ENSGMOG00000016587)	ENSGMOG00000016574	tmem17 (ENSGMOG00000016564)	agbl2 (ENSGMOG00000016458)	fnbp4 (ENSGMOG00000016410)	ENSGMOG00000016402	ENSGMOG00000020359	cnot2 (ENSGMOG00000016382)	ENSGMOG00000016333	ENSGMOG00000034862	ENSGMOG00000016320
Protacanthopterygii	ANCESTRAL SPECIES	29	ENSGT00940000156131.a.a	ENSGT00550000075019	ENSGT00940000156469.a	ENSGT00390000009456	ENSGT00420000029847	ENSGT00940000157021	ENSGT00940000159483.a.a	ENSGT00520000055620.B	ENSGT00940000155938.b.b	ENSGT00530000063759.a	ENSGT00940000158301.l	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000000707.y.a	ENSGT00940000154415.lb.b	ENSGT00390000011620.b.e ##22	ENSGT00940000159496.l	ENSGT00940000159100.h	ENSGT00940000154318.A.b	ENSGT00950000182885.A.b	ENSGT00940000156429.t	ENSGT00390000001116	ENSGT00940000160214	ENSGT00940000158153.a.i	ENSGT00390000011055	ENSGT00940000168658	ENSGT00940000156088.c.b	ENSGT00940000157033.h	ENSGT00390000000972	ENSGT00940000161051.a.a.b.b.b.b	ENSGT00940000158293
Salmoninae	DUPLICATION
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	457															ENSGT00940000154415.lb.b.b	ENSGT00390000011620.b.e.e ##22	ENSGT00940000159496.l.i	ENSGT00940000159100.h.i	ENSGT00940000156429.t.a	ENSGT00390000001116.h	ENSGT00940000156088.c.b.g	ENSGT00940000157033.h.g	ENSGT00390000000972.e	ENSGT00940000158293.lb	ENSGT00940000158567.e	ENSGT00880000138051.a.f	ENSGT00940000159231.d	ENSGT00390000000873.a.b.g	ENSGT00950000183119.b.h	ENSGT00940000158022.n	ENSGT00950000183006.B.f.a.h
Huchen	MODERN SPECIES	951															LSM14A (ENSHHUG00000016196)	ENSHHUG00000016174 ##22	kctd15a (ENSHHUG00000016160)	CHST8 (ENSHHUG00000016157)	tbc1d15 (ENSHHUG00000016079)	ZFC3H1 (ENSHHUG00000016026)	PTPRB (ENSHHUG00000015693)	frs2b (ENSHHUG00000015684)	nup160 (ENSHHUG00000015656)	ENSHHUG00000015639
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	83	ENSGT00940000162514	ENSGT00940000156003.l.a.q	ENSGT00390000010382.d	ENSGT00550000075044.c.a	ENSGT00940000160513.b.a	ENSGT00940000156131.a.a.e	ENSGT00940000156469.a.a	ENSGT00390000009456.p	ENSGT00940000157021.q	ENSGT00940000159483.a.a.f	ENSGT00520000055620.B.g.a	ENSGT00950000183202.a.b.x.a	ENSGT00940000155938.b.b.a	ENSGT00940000158301.l.a	ENSGT00940000154415.lb.b.b	ENSGT00390000011620.b.e.e ##22	ENSGT00940000159496.l.i	ENSGT00940000159100.h.i	ENSGT00940000156429.t.a	ENSGT00390000001116.h	ENSGT00940000156088.c.b.g	ENSGT00940000157033.h.g	ENSGT00390000000972.e	ENSGT00940000158293.lb	ENSGT00940000158567.e	ENSGT00880000138051.a.f	ENSGT00940000159231.d	ENSGT00390000000873.a.b.g	ENSGT00950000183119.b.h	ENSGT00940000158022.n	ENSGT00950000183006.B.f.a.h
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	65	ENSGT00940000162514	ENSGT00940000156003.l.a.q	ENSGT00390000010382.d	ENSGT00940000160513.b.a	ENSGT00550000075044.c.a	ENSGT00940000156482.c.h	ENSGT00940000156131.a.a.e	ENSGT00940000156469.a.a	ENSGT00940000157021.q	ENSGT00940000159483.a.a.f	ENSGT00520000055620.B.g.a	ENSGT00950000183202.a.b.x.a	ENSGT00940000155938.b.b.a	ENSGT00940000158301.l.a	ENSGT00940000154415.lb.b.b	ENSGT00390000011620.b.e.e ##22	ENSGT00940000159496.l.i	ENSGT00940000159100.h.i	ENSGT00940000156429.t.a	ENSGT00390000001116.h	ENSGT00940000156088.c.b.g	ENSGT00940000157033.h.g	ENSGT00390000000972.e	ENSGT00940000158293.lb	ENSGT00940000158567.e	ENSGT00880000138051.a.f	ENSGT00940000159231.d	ENSGT00390000000873.a.b.g	ENSGT00950000183119.b.h	ENSGT00940000158022.n	ENSGT00950000183006.B.f.a.h
River trout	MODERN SPECIES	8	lamb1a (ENSSTUG00000025697)	bmt2 (ENSSTUG00000033838)	immp2l (ENSSTUG00000033854)	LRRN3 (ENSSTUG00000033874)	amfra (ENSSTUG00000033901)	ENSSTUG00000002665	SLC7A10 (ENSSTUG00000002705)	ANKRD27 (ENSSTUG00000002896)	IRX5 (ENSSTUG00000003101)	rpgrip1l (ENSSTUG00000003145)	RBL2 (ENSSTUG00000004200)	SALL1 (ENSSTUG00000004804)	tent4b (ENSSTUG00000004864)	GOLPH3 (ENSSTUG00000004973)	lsm14aa (ENSSTUG00000005011)	ENSSTUG00000005087 ##22	kctd15a (ENSSTUG00000005136)	CHST8 (ENSSTUG00000005152)	tbc1d15 (ENSSTUG00000005227)	ZFC3H1 (ENSSTUG00000007266)	PTPRB (ENSSTUG00000007393)	frs2b (ENSSTUG00000008038)	nup160 (ENSSTUG00000008048)	CTTNBP2 (ENSSTUG00000008192)	cftr (ENSSTUG00000008374)	asz1 (ENSSTUG00000017165)	wnt2 (ENSSTUG00000017200)	ST7 (ENSSTUG00000017299)	ENSSTUG00000020591	met (ENSSTUG00000020733)	cav1 (ENSSTUG00000021150)
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	7	ENSSSAG00000106237	ENSSSAG00000120751	ENSSSAG00000068162	ENSSSAG00000068156	ENSSSAG00000100300	ENSSSAG00000066231	ENSSSAG00000066328	ENSSSAG00000109682	ENSSSAG00000083462	ENSSSAG00000064592	ENSSSAG00000062821	ENSSSAG00000116904	ENSSSAG00000062773	ENSSSAG00000061656	LSM14A (ENSSSAG00000082344)	ENSSSAG00000061512 ##22	ENSSSAG00000106661	CHST8 (ENSSSAG00000061387)	ENSSSAG00000055845	ENSSSAG00000055782	ENSSSAG00000052924	ENSSSAG00000113660	nup160 (ENSSSAG00000052407)	ENSSSAG00000052354	cftr (ENSSSAG00000051689)	asz1 (ENSSSAG00000051643)	wnt2 (ENSSSAG00000051639)	ST7 (ENSSSAG00000045880)	capza2 (ENSSSAG00000045617)	met (ENSSSAG00000043126)	cav1 (ENSSSAG00000117092)
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000162514	ENSGT00940000156003.l.a.q	ENSGT00390000010382.d	ENSGT00550000075044.d	ENSGT00940000160513.b.a	ENSGT00940000156131.a.a.e	ENSGT00940000156469.a.a	ENSGT00390000009456.p	ENSGT00940000157021.q	ENSGT00940000159483.a.a.f	ENSGT00520000055620.B.g.a	ENSGT00950000183202.a.b.x.a	ENSGT00940000155938.b.b.a	ENSGT00940000158301.l.a	ENSGT00940000154415.lb.b.b	ENSGT00390000011620.b.e.e ##22	ENSGT00940000159496.l.i	ENSGT00940000159100.h.i	ENSGT00940000156429.t.a	ENSGT00390000001116.h	ENSGT00940000156088.c.b.g	ENSGT00940000157033.h.g	ENSGT00390000000972.e	ENSGT00940000158293.lb	ENSGT00940000158567.e	ENSGT00880000138051.a.f	ENSGT00940000159231.d	ENSGT00390000000873.a.b.g	ENSGT00950000183119.b.h	ENSGT00940000158022.n	ENSGT00950000183006.B.f.a.h
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000162514	ENSGT00940000156003.l.a.q	ENSGT00390000010382.d	ENSGT00550000075044.d	ENSGT00940000160513.b.a	ENSGT00940000156131.a.a.e	ENSGT00940000156469.a.a	ENSGT00390000009456.p	ENSGT00940000157021.q	ENSGT00940000159483.a.a.f	ENSGT00520000055620.B.g.a	ENSGT00950000183202.a.b.x.a	ENSGT00940000155938.b.b.a	ENSGT00940000158301.l.a	ENSGT00940000154415.lb.b.b	ENSGT00390000011620.b.e.e ##22	ENSGT00940000159496.l.i	ENSGT00940000159100.h.i	ENSGT00940000156429.t.a	ENSGT00390000001116.h	ENSGT00940000156088.c.b.g	ENSGT00940000157033.h.g	ENSGT00390000000972.e	ENSGT00940000158293.lb	ENSGT00940000158567.e	ENSGT00880000138051.a.f	ENSGT00940000159231.d	ENSGT00390000000873.a.b.g	ENSGT00950000183119.b.h	ENSGT00940000158022.n	ENSGT00950000183006.B.f.a.h
Coho salmon	MODERN SPECIES	24	lamb4 (ENSOKIG00005007077)	lamb1a (ENSOKIG00005007399)	BMT2 (ENSOKIG00005008359)	immp2l (ENSOKIG00005008371)	LRRN3 (ENSOKIG00005008415)	ENSOKIG00005008423	SLC7A10 (ENSOKIG00005008505)	faap24 (ENSOKIG00005009164)	ANKRD27 (ENSOKIG00005009231)	IRX5 (ENSOKIG00005009348)	rpgrip1l (ENSOKIG00005009469)	RBL2 (ENSOKIG00005011148)	SALL1 (ENSOKIG00005011299)	TENT4B (ENSOKIG00005011314)	LSM14A (ENSOKIG00005011378)	ENSOKIG00005011406 ##22	KCTD15 (ENSOKIG00005011433)	CHST8 (ENSOKIG00005011466)	TBC1D15 (ENSOKIG00005011765)	ZFC3H1 (ENSOKIG00005014581)	PTPRB (ENSOKIG00005014685)	frs2b (ENSOKIG00005015212)	nup160 (ENSOKIG00005015245)	CTTNBP2 (ENSOKIG00005015326)	cftr (ENSOKIG00005015381)	wnt2 (ENSOKIG00005015447)	ST7 (ENSOKIG00005015517)	ENSOKIG00005016563	met (ENSOKIG00005016627)	cav1 (ENSOKIG00005017117)	cav2 (ENSOKIG00005017132)
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Salmo	ANCESTRAL SPECIES	45	ENSGT00550000075019	ENSGT00940000156469.a.b	ENSGT00390000009456.o	ENSGT00420000029847	ENSGT00940000157021.r	ENSGT00940000159483.a.a.e	ENSGT00520000055620.B.g.b	ENSGT00950000183202.a.b.x.b	ENSGT00940000155938.b.b.b	ENSGT00530000063759.a	ENSGT00940000158301.l.b	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000000707.y.a	ENSGT00940000154415.lb.b.a	ENSGT00390000011620.b.e.f ##22	ENSGT00940000159496.l.j	ENSGT00940000159100.h.j	ENSGT00940000154318.A.b	ENSGT00950000182885.A.b	ENSGT00940000156429.t.b	ENSGT00390000001116.g	ENSGT00940000160214	ENSGT00940000158153.a.i.a	ENSGT00940000168658.h	ENSGT00940000156088.c.b.h	ENSGT00940000157033.h.h	ENSGT00390000000972.f	ENSGT00940000161051.a.a.b.b.b.b	ENSGT00940000158293.mb	ENSGT00940000158567.f
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Chinook salmon	MODERN SPECIES	10	ENSOTSG00005038820	DUS2 (ENSOTSG00005038831)	SLC7A10 (ENSOTSG00005038869)	faap24 (ENSOTSG00005038871)	ENSOTSG00005038876	ANKRD27 (ENSOTSG00005038903)	IRX5 (ENSOTSG00005039029)	RBL2 (ENSOTSG00005039041)	SALL1 (ENSOTSG00005039333)	SNX20 (ENSOTSG00005039338)	tent4b (ENSOTSG00005039351)	mphosph6 (ENSOTSG00005039468)	hsd17b2 (ENSOTSG00005039471)	gpia (ENSOTSG00005039480)	lsm14aa (ENSOTSG00005040167)	ENSOTSG00005040169 ##22	kctd15a (ENSOTSG00005006555)	CHST8 (ENSOTSG00005006558)	ENSOTSG00005006560	tph2 (ENSOTSG00005006563)	tbc1d15 (ENSOTSG00005006836)	ENSOTSG00005008963	LGR5 (ENSOTSG00005008966)	PTPRB (ENSOTSG00005008974)	frs2b (ENSOTSG00005011691)	ENSOTSG00005011693	ENSOTSG00005011694	ENSOTSG00005011695	cftr (ENSOTSG00005011712)	asz1 (ENSOTSG00005017193)	wnt2 (ENSOTSG00005017194)
Rainbow trout	MODERN SPECIES	11	faap24 (ENSOMYG00000008686)	ENSOMYG00000008764	ENSOMYG00000008891	ENSOMYG00000061906	ENSOMYG00000008919	ENSOMYG00000053257	ENSOMYG00000009205	ENSOMYG00000010051	ENSOMYG00000058232	ENSOMYG00000010055	ENSOMYG00000010133	mphosph6 (ENSOMYG00000010223)	hsd17b2 (ENSOMYG00000010229)	gpia (ENSOMYG00000010468)	ENSOMYG00000063934	ENSOMYG00000010647 ##22	KCTD15 (ENSOMYG00000010672)	CHST8 (ENSOMYG00000010677)	ENSOMYG00000010685	ENSOMYG00000010750	ENSOMYG00000011036	ENSOMYG00000011715	ENSOMYG00000011831	ENSOMYG00000012013	ENSOMYG00000012677	ENSOMYG00000012696	ENSOMYG00000012710	ENSOMYG00000071446	cftr (ENSOMYG00000012997)	ENSOMYG00000051537	ENSOMYG00000075285
Huchen	MODERN SPECIES	890	DUS2 (ENSHHUG00000028273)	SLC7A10 (ENSHHUG00000028314)	faap24 (ENSHHUG00000028357)	ENSHHUG00000028368	ANKRD27 (ENSHHUG00000028469)	IRX5 (ENSHHUG00000028510)	ENSHHUG00000028511	RBL2 (ENSHHUG00000028514)	SNX20 (ENSHHUG00000028543)	SALL1 (ENSHHUG00000028547)	TENT4B (ENSHHUG00000028550)	mphosph6 (ENSHHUG00000028558)	hsd17b2 (ENSHHUG00000028570)	gpia (ENSHHUG00000028573)	lsm14aa (ENSHHUG00000029006)	ENSHHUG00000029013 ##22	kctd15a (ENSHHUG00000029052)	ENSHHUG00000029060	CHST8 (ENSHHUG00000029061)	ENSHHUG00000029063	ENSHHUG00000029067	ENSHHUG00000029069
Northern pike	MODERN SPECIES	18	ENSELUG00000017494	ENSELUG00000031328	ANKRD27 (ENSELUG00000017570)	IRX5 (ENSELUG00000017608)	ENSELUG00000017634	ENSELUG00000017658	rpgrip1l (ENSELUG00000017693)	RBL2 (ENSELUG00000017736)	SALL1 (ENSELUG00000017774)	SNX20 (ENSELUG00000017791)	tent4b (ENSELUG00000017815)	mphosph6 (ENSELUG00000017839)	hsd17b2 (ENSELUG00000017899)	gpia (ENSELUG00000017973)	lsm14aa (ENSELUG00000018038)	ENSELUG00000018066 ##22	kctd15a (ENSELUG00000018083)	ENSELUG00000025420	CHST8 (ENSELUG00000018093)	ribc2 (ENSELUG00000018103)	GALNT8 (ENSELUG00000000739)	ADA2 (ENSELUG00000018180)	ENSELUG00000018239	ENSELUG00000018292	atp6v1e1a (ENSELUG00000018343)	bcl2l13 (ENSELUG00000018352)	ENSELUG00000034307	wee2 (ENSELUG00000018378)	dennd11 (ENSELUG00000018404)	agk (ENSELUG00000018420)	nup205 (ENSELUG00000018467)
Otomorpha	DUPLICATION
Otomorpha	ANCESTRAL SPECIES	47	ENSGT00940000178971	ENSGT00950000183090.A	ENSGT00940000166643	ENSGT00940000168208	ENSGT00940000154745.b	ENSGT00390000004930	ENSGT00530000063948.b	ENSGT00940000155943.a	ENSGT00940000158905	ENSGT00940000158070	ENSGT00940000160924	ENSGT00390000000707.y.b	ENSGT00390000003210	ENSGT00940000160407	ENSGT00940000154415.lb.a	ENSGT00390000011620.b.e.g ##22	ENSGT00940000159496.k	ENSGT00940000159100.g	ENSGT00940000153657.B	ENSGT00940000156594	ENSGT00940000157011	ENSGT00940000159103	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000154969.a	ENSGT00940000157689	ENSGT00390000001195.b	ENSGT00950000182938.b.b.b.b.a	ENSGT00940000157431.d	ENSGT00940000178010	ENSGT00940000157431.c.b	ENSGT00950000183037.A.a
Otophysi	ANCESTRAL SPECIES	76	ENSGT00940000178971	ENSGT00950000183090.A	ENSGT00940000166643	ENSGT00940000168208	ENSGT00940000154745.b	ENSGT00390000004930	ENSGT00530000063948.b	ENSGT00940000155943.a	ENSGT00940000158905	ENSGT00940000158070	ENSGT00940000160924	ENSGT00390000000707.y.b	ENSGT00390000003210	ENSGT00940000160407	ENSGT00940000154415.lb.a	ENSGT00390000011620.b.e.g ##22	ENSGT00940000159496.k	ENSGT00940000159100.g	ENSGT00940000153657.B	ENSGT00940000156594	ENSGT00940000157011	ENSGT00940000159103	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000154969.a	ENSGT00940000157689	ENSGT00390000001195.b	ENSGT00950000182938.b.b.b.b.a.e.a	ENSGT00940000157431.c.b	ENSGT00950000183037.A.a	ENSGT00390000014907.A	ENSGT00930000151452
Characiphysae	ANCESTRAL SPECIES	84	ENSGT00940000178971	ENSGT00950000183090.A	ENSGT00940000166643	ENSGT00940000168208	ENSGT00940000154745.b	ENSGT00390000004930	ENSGT00530000063948.b	ENSGT00940000155943.a	ENSGT00940000158905	ENSGT00940000158070	ENSGT00940000160924	ENSGT00390000000707.y.b	ENSGT00390000003210	ENSGT00940000160407	ENSGT00940000154415.lb.a	ENSGT00390000011620.b.e.g ##22	ENSGT00940000159496.k	ENSGT00940000159100.g	ENSGT00940000153657.B	ENSGT00940000156594	ENSGT00940000157011	ENSGT00940000159103	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000154969.a	ENSGT00940000157689	ENSGT00390000001195.b	ENSGT00950000182938.b.b.b.b.a.e.a	ENSGT00940000157431.c.b	ENSGT00950000183037.A.a	ENSGT00390000014907.A	ENSGT00930000151452
Channel catfish	MODERN SPECIES	23	Ulk3 (ENSIPUG00000010283)	tarsl2 (ENSIPUG00000010218)	tm2d3 (ENSIPUG00000010197)	larp6 (ENSIPUG00000010187)	ENSIPUG00000010170	ENSIPUG00000010147	thsd4 (ENSIPUG00000010126)	sdr42e1 (ENSIPUG00000010111)	ENSIPUG00000010096	ENSIPUG00000010090	wtip (ENSIPUG00000010060)	gpi (ENSIPUG00000009854)	ss18l2 (ENSIPUG00000009811)	kiaa0355 (ENSIPUG00000009759)	lsm14a (ENSIPUG00000009720)	ENSIPUG00000009666 ##22	KCTD15 (ENSIPUG00000009640)	ENSIPUG00000009594	CHST8 (ENSIPUG00000009578)	ENSIPUG00000009567	ENSIPUG00000009558	ENSIPUG00000009552	ENSIPUG00000009482	ENSIPUG00000009466	ENSIPUG00000009455	ENSIPUG00000009436	rbm7 (ENSIPUG00000009397)	barx2 (ENSIPUG00000009386)	KIRREL3 (ENSIPUG00000009294)	ets1 (ENSIPUG00000009227)	fli1 (ENSIPUG00000009118)
Characiphysae_b	ANCESTRAL SPECIES	85	ENSGT00940000178971	ENSGT00950000183090.A	ENSGT00940000166643	ENSGT00940000168208	ENSGT00940000154745.b	ENSGT00390000004930	ENSGT00530000063948.b	ENSGT00940000155943.a	ENSGT00940000158905	ENSGT00940000158070	ENSGT00940000160924	ENSGT00390000000707.y.b	ENSGT00390000003210	ENSGT00940000160407	ENSGT00940000154415.lb.a	ENSGT00390000011620.b.e.g ##22	ENSGT00940000159496.k	ENSGT00940000159100.g	ENSGT00940000153657.B	ENSGT00940000156594	ENSGT00940000157011	ENSGT00940000159103	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000154969.a	ENSGT00940000157689	ENSGT00390000001195.b	ENSGT00950000182938.b.b.b.b.a.e.a	ENSGT00940000157431.c.b	ENSGT00950000183037.A.a	ENSGT00390000014907.A	ENSGT00930000151452
Characoidei	ANCESTRAL SPECIES	238	ENSGT00940000156218	ENSGT00940000178971	ENSGT00950000183090.A	ENSGT00940000166643	ENSGT00940000168208	ENSGT00390000004930	ENSGT00530000063948.b	ENSGT00940000155943.a	ENSGT00940000158905	ENSGT00940000158070	ENSGT00940000160924	ENSGT00390000000707.y.b	ENSGT00390000003210	ENSGT00940000160407	ENSGT00940000154415.lb.a	ENSGT00390000011620.b.e.g ##22	ENSGT00940000159496.k	ENSGT00940000159100.g
Red-bellied piranha	MODERN SPECIES	106		rab27a (ENSPNAG00000006310)	pigb (ENSPNAG00000024867)	ENSPNAG00000024844	ENSPNAG00000024806	dnaaf4 (ENSPNAG00000024793)	pygo1 (ENSPNAG00000024784)	PRTG (ENSPNAG00000024772)	nedd4a (ENSPNAG00000024688)	sdr42e1 (ENSPNAG00000024627)	wtip (ENSPNAG00000024610)	gpib (ENSPNAG00000003834)	GARRE1 (ENSPNAG00000024462)	ss18l2 (ENSPNAG00000024414)	lsm14ab (ENSPNAG00000024375)	ENSPNAG00000006850 ##22	KCTD15 (ENSPNAG00000024286)	CHST8 (ENSPNAG00000024268)	nf2a (ENSPNAG00000024249)	FBXO21 (ENSPNAG00000003810)	tesca (ENSPNAG00000024087)	fbxw8 (ENSPNAG00000024075)	rnft2 (ENSPNAG00000024051)	spring1 (ENSPNAG00000024017)	CASTOR1 (ENSPNAG00000023978)	nipsnap1 (ENSPNAG00000023946)	LRRC74B (ENSPNAG00000003797)	nos1 (ENSPNAG00000023785)	KSR2 (ENSPNAG00000021534)	rfc5 (ENSPNAG00000021444)	wsb2 (ENSPNAG00000021414)
Mexicana tetra	MODERN SPECIES	9	pigb (ENSAMXG00000021163)	ENSAMXG00000021156	ENSAMXG00000034819	ENSAMXG00000021147	dnaaf4 (ENSAMXG00000040241)	pygo1 (ENSAMXG00000021119)	PRTG (ENSAMXG00000021079)	nedd4a (ENSAMXG00000021055)	sdr42e1 (ENSAMXG00000029717)	wtip (ENSAMXG00000021029)	gpib (ENSAMXG00000021015)	GARRE1 (ENSAMXG00000021005)	ss18l2 (ENSAMXG00000043890)	ENSAMXG00000042842	lsm14ab (ENSAMXG00000032221)	ENSAMXG00000029195 ##22	KCTD15 (ENSAMXG00000020953)	CHST8 (ENSAMXG00000020947)	ENSAMXG00000032824	pepd (ENSAMXG00000020929)	ENSAMXG00000030370	THSD7A (ENSAMXG00000024635)	ENSAMXG00000038842	ICA1 (ENSAMXG00000024636)	GLCCI1 (ENSAMXG00000042680)	mios (ENSAMXG00000024638)	col28a1b (ENSAMXG00000024639)	ENSAMXG00000024640	ENSAMXG00000024641	ENSAMXG00000038736	septin7b (ENSAMXG00000024643)
Electric eel	MODERN SPECIES	14	ENSEEEG00000000354	rab27a (ENSEEEG00000000360)	pigb (ENSEEEG00000000390)	ENSEEEG00000000449	PIERCE2 (ENSEEEG00000000456)	dnaaf4 (ENSEEEG00000000463)	pygo1 (ENSEEEG00000000475)	PRTG (ENSEEEG00000000492)	nedd4a (ENSEEEG00000000851)	sdr42e1 (ENSEEEG00000002041)	wtip (ENSEEEG00000002043)	gpib (ENSEEEG00000002049)	GARRE1 (ENSEEEG00000002164)	ss18l2 (ENSEEEG00000002167)	lsm14ab (ENSEEEG00000002168)	ENSEEEG00000002169 ##22	KCTD15 (ENSEEEG00000002170)	CHST8 (ENSEEEG00000002171)	pepd (ENSEEEG00000002182)	THSD4 (ENSEEEG00000002292)	ENSEEEG00000002348	larp6a (ENSEEEG00000002352)	tm2d3 (ENSEEEG00000002356)	ENSEEEG00000002436	ulk3 (ENSEEEG00000003815)	ENSEEEG00000003818	cplx3b (ENSEEEG00000003820)	CSK (ENSEEEG00000003863)	ENSEEEG00000004758	cyp1a (ENSEEEG00000004761)	ENSEEEG00000004765
Cyprinoidei	ANCESTRAL SPECIES	148	ENSGT00940000156218	ENSGT00940000178971	ENSGT00950000183090.A	ENSGT00940000166643	ENSGT00940000168208	ENSGT00390000004930	ENSGT00530000063948.b	ENSGT00940000155943.a	ENSGT00940000158905	ENSGT00940000158070	ENSGT00940000160924	ENSGT00390000000707.y.b	ENSGT00390000003210	ENSGT00940000160407	ENSGT00940000154415.lb.a.a	ENSGT00390000011620.b.e.g ##22	ENSGT00940000159496.k	ENSGT00940000159100.g	ENSGT00940000153657.B	ENSGT00940000164678.a	ENSGT00940000156195.q.b	ENSGT00390000007235	ENSGT00940000154743.B.o.a	ENSGT00390000007946.j	ENSGT00390000007946.i.b	ENSGT00390000008859.b.d.q	ENSGT00950000183129.b.b.b
Cyprininae	DUPLICATION
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	243	ENSGT00940000158330.w	ENSGT00390000010760.e.b.d.b.a	ENSGT00390000010760.e.b.c.a	ENSGT00940000155174.f.`b.b	ENSGT00940000156218.k.a	ENSGT00940000166643.d	ENSGT00530000063948.b	ENSGT00940000155943.a.d	ENSGT00940000158905	ENSGT00940000158070	ENSGT00940000160924.c	ENSGT00390000000707.y.b.b	ENSGT00390000003210.c	ENSGT00940000160407	ENSGT00940000154415.lb.a.a.b	ENSGT00390000011620.b.e.g.a ##22	ENSGT00940000159496.k.c	ENSGT00940000159100.g.f	ENSGT00940000153657.B.m	ENSGT00940000164678.a.h	ENSGT00390000011620.b.e.g.b ##22	ENSGT00940000159496.k.d.a	ENSGT00940000159100.g.e.b	ENSGT00940000153657.B.n	ENSGT00940000164678.a.g	ENSGT00940000156195.q.b.g	ENSGT00390000007235	ENSGT00940000154743.B.o.a.g	ENSGT00390000007946.j.f
Goldfish	MODERN SPECIES	37	ENSCARG00000053433	si:dkey-14d8.7 (ENSCARG00000039452)	cdh7a (ENSCARG00000039408)	UNC13C (ENSCARG00000038514)	ENSCARG00000038371	rab27a (ENSCARG00000038350)	ENSCARG00000038323	pygo1 (ENSCARG00000038302)	PRTG (ENSCARG00000038121)	nedd4a (ENSCARG00000035374)	sdr42e1 (ENSCARG00000035335)	wtip (ENSCARG00000035320)	GARRE1 (ENSCARG00000035275)	ss18l2 (ENSCARG00000035267)	lsm14ab (ENSCARG00000035248)	ENSCARG00000035226 ##22	KCTD15 (ENSCARG00000035206)	CHST8 (ENSCARG00000035195)	ENSCARG00000035190	ENSCARG00000035189	rffl (ENSCARG00000035171)	nptnb (ENSCARG00000035160)	pepd (ENSCARG00000032929)	ugt5f1 (ENSCARG00000032842)	nptnb (ENSCARG00000032834)	ENSCARG00000032822	HCN4 (ENSCARG00000032800)	dhdh.1 (ENSCARG00000032777)	pkma (ENSCARG00000032317)	PARP6 (ENSCARG00000031840)	ENSCARG00000031501
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	70	ENSGT00940000162467.a.a	ENSGT00940000158330.w	ENSGT00390000010760.e.b.d.b.a	ENSGT00390000010760.e.b.c.a	ENSGT00940000155174.f.`b.b	ENSGT00940000156218.k.a	ENSGT00530000063948.b	ENSGT00940000155943.a.d	ENSGT00940000158905	ENSGT00940000158070	ENSGT00940000160924.c	ENSGT00390000000707.y.b.b	ENSGT00390000003210.c	ENSGT00940000160407	ENSGT00940000154415.lb.a.a.b	ENSGT00390000011620.b.e.g.a ##22	ENSGT00940000159496.k.c	ENSGT00940000159100.g.f	ENSGT00940000153657.B.m	ENSGT00940000164678.a.h	ENSGT00390000011620.b.e.g.b ##22	ENSGT00940000159496.k.d.a	ENSGT00940000159100.g.e.b	ENSGT00940000153657.B.n	ENSGT00940000164678.a.g	ENSGT00940000156195.q.b.g	ENSGT00940000154743.B.o.a.g	ENSGT00390000007946.j.f
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	181									nedd4a (ENSSGRG00000048326)	wtip (ENSSGRG00000048318)	gpib (ENSSGRG00000048206)	GARRE1 (ENSSGRG00000047958)	ss18l2 (ENSSGRG00000047956)	ENSSGRG00000047955	lsm14ab (ENSSGRG00000047947)	ENSSGRG00000047943 ##22	KCTD15 (ENSSGRG00000047940)	CHST8 (ENSSGRG00000047938)	pepd (ENSSGRG00000047937)	ugt5f1 (ENSSGRG00000047935)	nptnb (ENSSGRG00000047934)	ENSSGRG00000047932	pak1 (ENSSGRG00000046226)	aqp11 (ENSSGRG00000046199)	clns1a (ENSSGRG00000046196)	RSF1 (ENSSGRG00000046193)	aamdc (ENSSGRG00000046192)	INTS4 (ENSSGRG00000046050)	KCTD14 (ENSSGRG00000046043)	rps3 (ENSSGRG00000045989)	ENSSGRG00000045979
Common carp reference	MODERN SPECIES	9	ENSCCRG00000074708	ENSCCRG00000056199	ENSCCRG00000021785	pigb (ENSCCRG00000021788)	ENSCCRG00000058915	ENSCCRG00000076556	PYGO1 (ENSCCRG00000013209)	PRTG (ENSCCRG00000001981)	nedd4a (ENSCCRG00000002187)	sdr42e1 (ENSCCRG00000054370)	wtip (ENSCCRG00000080362)	gpib (ENSCCRG00000082874)	ENSCCRG00000060913	ss18l2 (ENSCCRG00000057143)	lsm14ab (ENSCCRG00000078995)	ENSCCRG00000058062 ##22	ENSCCRG00000068231 ##22	KCTD15 (ENSCCRG00000075707)	CHST8 (ENSCCRG00000005285)	pepd (ENSCCRG00000060170)	ugt5f1 (ENSCCRG00000010451)	nptnb (ENSCCRG00000068320)	HCN4 (ENSCCRG00000065953)	REC114 (ENSCCRG00000080610)	ENSCCRG00000047888	ENSCCRG00000057392	ENSCCRG00000058772	rpp25b (ENSCCRG00000071304)	cox5ab (ENSCCRG00000026572)	ENSCCRG00000064040	ENSCCRG00000036777
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	243	ENSGT00940000166643.d	ENSGT00530000063948.b	ENSGT00940000155943.a.d	ENSGT00940000158905	ENSGT00940000158070	ENSGT00940000160924.c	ENSGT00390000000707.y.b.b	ENSGT00390000003210.c	ENSGT00940000160407	ENSGT00940000154415.lb.a.a.b	ENSGT00390000011620.b.e.g.a ##22	ENSGT00940000159496.k.c	ENSGT00940000159100.g.f	ENSGT00940000153657.B.m	ENSGT00940000164678.a.h	ENSGT00390000011620.b.e.g.b ##22	ENSGT00940000159496.k.d.a	ENSGT00940000159100.g.e.b	ENSGT00940000153657.B.n	ENSGT00940000164678.a.g	ENSGT00940000156195.q.b.g	ENSGT00390000007235	ENSGT00940000154743.B.o.a.g	ENSGT00390000007946.j.f
Goldfish	MODERN SPECIES	9	capn5a (ENSCARG00000004746)	dcun1d5 (ENSCARG00000004974)	serp1 (ENSCARG00000005005)	LRCH3 (ENSCARG00000005054)	UNC13C (ENSCARG00000005225)	rab27a (ENSCARG00000005637)	ENSCARG00000005667	ENSCARG00000005683	dnaaf4 (ENSCARG00000005696)	PRTG (ENSCARG00000005754)	nedd4a (ENSCARG00000006092)	wtip (ENSCARG00000009919)	gpib (ENSCARG00000009953)	GARRE1 (ENSCARG00000010023)	lsm14ab (ENSCARG00000010099)	ENSCARG00000010168 ##22	KCTD15 (ENSCARG00000010178)	CHST8 (ENSCARG00000010190)	ENSCARG00000010229	nptnb (ENSCARG00000010456)	pak1 (ENSCARG00000010506)	ENSCARG00000010691	aqp11 (ENSCARG00000010698)	clns1a (ENSCARG00000010708)	RSF1 (ENSCARG00000010736)	aamdc (ENSCARG00000010749)	INTS4 (ENSCARG00000010795)	KCTD14 (ENSCARG00000011600)	ENSCARG00000011615	ENSCARG00000011707	FCHSD2 (ENSCARG00000011798)
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	70	ENSGT00940000156218.k.a	ENSGT00530000063948.b	ENSGT00940000155943.a.d	ENSGT00940000158905	ENSGT00940000158070	ENSGT00940000160924.c	ENSGT00390000000707.y.b.b	ENSGT00390000003210.c	ENSGT00940000160407	ENSGT00940000154415.lb.a.a.b	ENSGT00390000011620.b.e.g.a ##22	ENSGT00940000159496.k.c	ENSGT00940000159100.g.f	ENSGT00940000153657.B.m	ENSGT00940000164678.a.h	ENSGT00390000011620.b.e.g.b ##22	ENSGT00940000159496.k.d.a	ENSGT00940000159100.g.e.b	ENSGT00940000153657.B.n	ENSGT00940000164678.a.g	ENSGT00940000156195.q.b.g	ENSGT00940000154743.B.o.a.g	ENSGT00390000007946.j.f
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	13	LRCH3 (ENSSGRG00000034687)	ENSSGRG00000034968	si:dkey-14d8.7 (ENSSGRG00000034969)	UNC13C (ENSSGRG00000034987)	rab27a (ENSSGRG00000036917)	ccpg1 (ENSSGRG00000036926)	pygo1 (ENSSGRG00000036927)	PRTG (ENSSGRG00000036928)	ENSSGRG00000036929	nedd4a (ENSSGRG00000036932)	sdr42e1 (ENSSGRG00000036933)	wtip (ENSSGRG00000036934)	gpib (ENSSGRG00000036946)	GARRE1 (ENSSGRG00000037073)	lsm14ab (ENSSGRG00000037204)	ENSSGRG00000037209 ##22	KCTD15 (ENSSGRG00000037210)
Common carp reference	MODERN SPECIES	9	ENSCCRG00000056199	ENSCCRG00000021785	pigb (ENSCCRG00000021788)	ENSCCRG00000058915	ENSCCRG00000076556	PYGO1 (ENSCCRG00000013209)	PRTG (ENSCCRG00000001981)	nedd4a (ENSCCRG00000002187)	sdr42e1 (ENSCCRG00000054370)	wtip (ENSCCRG00000080362)	gpib (ENSCCRG00000082874)	ENSCCRG00000060913	ss18l2 (ENSCCRG00000057143)	lsm14ab (ENSCCRG00000078995)	ENSCCRG00000058062 ##22	ENSCCRG00000068231 ##22	KCTD15 (ENSCCRG00000075707)	CHST8 (ENSCCRG00000005285)	pepd (ENSCCRG00000060170)	ugt5f1 (ENSCCRG00000010451)	nptnb (ENSCCRG00000068320)	HCN4 (ENSCCRG00000065953)	REC114 (ENSCCRG00000080610)	ENSCCRG00000047888	ENSCCRG00000057392	ENSCCRG00000058772	rpp25b (ENSCCRG00000071304)	cox5ab (ENSCCRG00000026572)	ENSCCRG00000064040	ENSCCRG00000036777	ENSCCRG00000053036
Clupeiformes	ANCESTRAL SPECIES	34						ENSGT01020000230346.E	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000154856.A.a.c.a.a	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000003210	ENSGT00940000160407	ENSGT00940000154415.lb.a	ENSGT00390000011620.b.e.g ##22	ENSGT00940000154415.mb	ENSGT00940000159496.k	ENSGT00940000159100.g	ENSGT00940000153657.B	ENSGT00940000156594	ENSGT00940000157011	ENSGT00940000159103	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000154969.a	ENSGT00940000157689	ENSGT00390000001195.b	ENSGT00950000182938.b.b.b.b.a	ENSGT00940000157431.c.b	ENSGT00940000157431.c.a	ENSGT00390000016435
Atlantic herring	MODERN SPECIES	22	npsn (ENSCHAG00000001396)	ENSCHAG00000001524	npsn (ENSCHAG00000001561)	c6ast1 (ENSCHAG00000001602)	ENSCHAG00000001628	ENSCHAG00000001637	ENSCHAG00000001669	ENSCHAG00000001745	ENSCHAG00000001766	ndufs3 (ENSCHAG00000001792)	ptpmt1 (ENSCHAG00000001853)	celf1 (ENSCHAG00000001891)	GARRE1 (ENSCHAG00000002288)	ss18l2 (ENSCHAG00000004241)	lsm14ab (ENSCHAG00000004313)	ENSCHAG00000004344 ##22	KCTD15 (ENSCHAG00000004450)	ENSCHAG00000004558	CHST8 (ENSCHAG00000004590)	ENSCHAG00000004602	ENSCHAG00000004608	pepd (ENSCHAG00000004629)	mrpl21 (ENSCHAG00000004645)	ENSCHAG00000004693	ENSCHAG00000004727	tollip (ENSCHAG00000004884)	rassf7b (ENSCHAG00000005064)	hrasb (ENSCHAG00000005068)	ENSCHAG00000005104	ENSCHAG00000005214	ENSCHAG00000005238
Otomorpha	ANCESTRAL SPECIES	670																ENSGT00390000011620.b.e.h ##22	ENSGT00940000159496.l	ENSGT00940000159100.h
Otophysi	ANCESTRAL SPECIES	104	ENSGT00390000010968.a	ENSGT00940000164299.b.b	ENSGT00940000158576.a.b	ENSGT00390000015299.a.b.b.a.e	ENSGT00390000000068.a.b	ENSGT00390000007427	ENSGT00940000165644.e	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.a.b	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.a.a	ENSGT00950000182926.a	ENSGT00940000153901.a.a.a	ENSGT00940000154709.a.b.b.c	ENSGT00940000155504	ENSGT00940000156246.c.a	ENSGT00390000011620.b.e.h ##22	ENSGT00940000159496.l	ENSGT00940000159100.h	ENSGT00950000183113.b.a	ENSGT00950000182938.b.b.b.b.a.e.b	ENSGT00940000157431.c.a	ENSGT00390000016435	ENSGT00530000064192	ENSGT00530000063113.A	ENSGT00940000155057.wb.f	ENSGT00940000153567.a.a.b.a	ENSGT00940000153567.a.a.b.b.b	ENSGT00940000158940.b	ENSGT00940000159857.a.b	ENSGT00530000063981.a.h	ENSGT00390000008766
Characiphysae	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00390000010968.a	ENSGT00940000164299.b.b	ENSGT00940000158576.a.b	ENSGT00390000015299.a.b.b.a.e	ENSGT00390000000068.a.b	ENSGT00390000007427	ENSGT00940000165644.e	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.a.b	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.a.a	ENSGT00950000182926.a	ENSGT00940000153901.a.a.a	ENSGT00940000154709.a.b.b.c	ENSGT00940000155504	ENSGT00940000156246.c.a	ENSGT00390000011620.b.e.h ##22	ENSGT00940000159496.l	ENSGT00940000159100.h	ENSGT00950000183113.b.a	ENSGT00950000182938.b.b.b.b.a.e.b	ENSGT00940000157431.c.a	ENSGT00390000016435	ENSGT00530000064192	ENSGT00530000063113.A	ENSGT00940000155057.wb.f	ENSGT00940000153567.a.a.b.a	ENSGT00940000153567.a.a.b.b.b	ENSGT00940000158940.b	ENSGT00940000159857.a.b	ENSGT00530000063981.a.h	ENSGT00390000008766
Channel catfish	MODERN SPECIES	27	ENSIPUG00000006451	KCNA1 (ENSIPUG00000006446)	tmem178ba (ENSIPUG00000006428)	cnot4 (ENSIPUG00000006393)	zgc:136858 (ENSIPUG00000006339)	ENSIPUG00000006327	ENSIPUG00000006305	tnni4b.2 (ENSIPUG00000006254)	ENSIPUG00000006229	ENSIPUG00000006197	bpgm (ENSIPUG00000006178)	ENSIPUG00000006161	tnnt2d (ENSIPUG00000006128)	dnm1l (ENSIPUG00000006021)	Dnajb9 (ENSIPUG00000006006)	ENSIPUG00000005936 ##22	kctd15l (ENSIPUG00000005894)	CHST8 (ENSIPUG00000005881)	adal (ENSIPUG00000005795)	cplx3 (ENSIPUG00000005778)	csk (ENSIPUG00000005716)	edc3 (ENSIPUG00000005695)	kxd1 (ENSIPUG00000005659)	ergic2 (ENSIPUG00000005608)	MAGI2 (ENSIPUG00000005235)	gnaia (ENSIPUG00000004369)	CHRM2 (ENSIPUG00000004348)	fbxl14a (ENSIPUG00000004339)	PRR5 (ENSIPUG00000004285)	rad52 (ENSIPUG00000004253)	Wnk1 (ENSIPUG00000004191)
Characiphysae_b	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00390000010968.a	ENSGT00940000164299.b.b	ENSGT00940000158576.a.b	ENSGT00390000015299.a.b.b.a.e	ENSGT00390000000068.a.b	ENSGT00390000007427	ENSGT00940000165644.e	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.a.b	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.a.a	ENSGT00950000182926.a	ENSGT00940000153901.a.a.a	ENSGT00940000154709.a.b.b.c	ENSGT00940000155504	ENSGT00940000156246.c.a	ENSGT00390000011620.b.e.h ##22	ENSGT00940000159496.l	ENSGT00940000159100.h	ENSGT00950000183113.b.a	ENSGT00950000182938.b.b.b.b.a.e.b	ENSGT00940000157431.c.a	ENSGT00390000016435	ENSGT00530000064192	ENSGT00530000063113.A	ENSGT00940000155057.wb.f	ENSGT00940000153567.a.a.b.a	ENSGT00940000153567.a.a.b.b.b	ENSGT00940000158940.b	ENSGT00940000159857.a.b	ENSGT00530000063981.a.h	ENSGT00390000008766
Characoidei	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000010968.a	ENSGT00940000164299.b.b	ENSGT00940000158576.a.b	ENSGT00390000015299.a.b.b.a.e	ENSGT00390000000068.a.b	ENSGT00390000007427	ENSGT00940000165644.e	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.a.b	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.a.a	ENSGT00950000182926.a	ENSGT00940000153901.a.a.a	ENSGT00940000154709.a.b.b.c	ENSGT00940000155504	ENSGT00940000156246.c.a	ENSGT00390000011620.b.e.h ##22	ENSGT00940000159496.l	ENSGT00940000159100.h	ENSGT00950000183113.b.a	ENSGT00950000182938.b.b.b.b.a.e.b	ENSGT00940000157431.c.a	ENSGT00390000016435	ENSGT00530000064192	ENSGT00530000063113.A	ENSGT00940000155057.wb.f	ENSGT00940000153567.a.a.b.a	ENSGT00940000153567.a.a.b.b.b	ENSGT00940000158940.b	ENSGT00940000159857.a.b	ENSGT00530000063981.a.h	ENSGT00390000008766
Red-bellied piranha	MODERN SPECIES	14	ENSPNAG00000020490	KCNA1 (ENSPNAG00000020478)	tmem178ba (ENSPNAG00000020457)	CNOT4 (ENSPNAG00000020433)	zgc:136858 (ENSPNAG00000020362)	ENSPNAG00000005186	ENSPNAG00000020311	tnni4b.2 (ENSPNAG00000020281)	ENSPNAG00000020275	ENSPNAG00000020254	bpgm (ENSPNAG00000020232)	ENSPNAG00000020214	tnnt2d (ENSPNAG00000020179)	dnm1l (ENSPNAG00000020017)	dnajb9a (ENSPNAG00000019951)	ENSPNAG00000019924 ##22	kctd15a (ENSPNAG00000019793)	CHST8 (ENSPNAG00000019778)	adal (ENSPNAG00000019774)	cplx3a (ENSPNAG00000003608)	csk (ENSPNAG00000019720)	edc3 (ENSPNAG00000019657)	kxd1 (ENSPNAG00000019635)	ergic2 (ENSPNAG00000019558)	MAGI2 (ENSPNAG00000019454)	gnaia (ENSPNAG00000018193)	CHRM2 (ENSPNAG00000018150)	PRR5 (ENSPNAG00000018123)	rad52 (ENSPNAG00000018067)	ENSPNAG00000018033	erc1a (ENSPNAG00000003494)
Mexicana tetra	MODERN SPECIES	16	GRAMD4 (ENSAMXG00000034463)	ENSAMXG00000035147	ENSAMXG00000033288	KCNA1 (ENSAMXG00000024909)	CNOT4 (ENSAMXG00000001373)	tmem178ba (ENSAMXG00000001358)	zgc:136858 (ENSAMXG00000001386)	ENSAMXG00000001401	ENSAMXG00000001410	ENSAMXG00000041360	bpgm (ENSAMXG00000043597)	ENSAMXG00000001442	tnnt2d (ENSAMXG00000001452)	dnm1l (ENSAMXG00000001473)	dnajb9a (ENSAMXG00000041051)	ENSAMXG00000001498 ##22	kctd15a (ENSAMXG00000001523)	CHST8 (ENSAMXG00000041509)	adal (ENSAMXG00000001538)	cplx3a (ENSAMXG00000040195)	csk (ENSAMXG00000001554)	edc3 (ENSAMXG00000001589)	kxd1 (ENSAMXG00000031268)	ergic2 (ENSAMXG00000034586)	MAGI2 (ENSAMXG00000001699)	gnaia (ENSAMXG00000040807)	CHRM2 (ENSAMXG00000001797)	fbxl14a (ENSAMXG00000030520)	PRR5 (ENSAMXG00000001812)	rad52 (ENSAMXG00000001835)	ENSAMXG00000001851
Electric eel	MODERN SPECIES	210	ENSEEEG00000021676	GRAMD4 (ENSEEEG00000021680)	ENSEEEG00000021741	KCNA1 (ENSEEEG00000021742)	tmem178ba (ENSEEEG00000021744)	CNOT4 (ENSEEEG00000021750)	zgc:136858 (ENSEEEG00000021808)	ENSEEEG00000021811	ENSEEEG00000021812	tnni4b.2 (ENSEEEG00000021817)	bpgm (ENSEEEG00000021875)	ENSEEEG00000021880	tnnt2d (ENSEEEG00000021889)	dnm1l (ENSEEEG00000021907)	dnajb9a (ENSEEEG00000021919)	ENSEEEG00000021922 ##22	kctd15a (ENSEEEG00000021924)	CHST8 (ENSEEEG00000021927)	adal (ENSEEEG00000021931)	cplx3a (ENSEEEG00000021934)	csk (ENSEEEG00000021940)	edc3 (ENSEEEG00000021958)	kxd1 (ENSEEEG00000021960)	ergic2 (ENSEEEG00000021964)	MAGI2 (ENSEEEG00000021972)	ENSEEEG00000021977	gnaia (ENSEEEG00000021980)	CHRM2 (ENSEEEG00000021997)	fbxl14a (ENSEEEG00000021998)	PRR5 (ENSEEEG00000021999)	rad52 (ENSEEEG00000022005)
Cyprinoidei	ANCESTRAL SPECIES	53	ENSGT00390000010968.a	ENSGT00940000164299.b.b	ENSGT00940000158576.a.b	ENSGT00390000015299.a.b.b.a.e	ENSGT00390000000068.a.b	ENSGT00390000007427	ENSGT00940000165644.e	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.a.b	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.a.a	ENSGT00950000182926.a	ENSGT00940000153901.a.a.a	ENSGT00940000154709.a.b.b.c	ENSGT00940000155504.j	ENSGT00940000156246.c.a	ENSGT00390000011620.b.e.h ##22	ENSGT00940000159496.l	ENSGT00940000159100.h	ENSGT00950000183113.b.a	ENSGT00950000182938.b.b.b.b.a.e.b	ENSGT00940000157431.c.a	ENSGT00390000016435	ENSGT00530000064192	ENSGT00530000063113.A	ENSGT00940000155057.wb.e.b	ENSGT00940000153567.a.a.b.b.b	ENSGT00940000158940.b.a	ENSGT00940000159857.a.b	ENSGT00530000063981.a.h	ENSGT00390000008766	ENSGT00940000155474.p.a
Cyprininae	DUPLICATION
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	197	ENSGT00940000159839.d.b.b	ENSGT00390000010968.a.b	ENSGT00940000158576.b	ENSGT00940000158576.a.b.f	ENSGT00390000015299.a.b.b.a.e.a	ENSGT00390000000068.a.b.a	ENSGT00390000007427.a	ENSGT00940000165644.e	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b.n.a	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.a.a.b	ENSGT00950000182926.a.r	ENSGT00940000153901.a.a.a.b	ENSGT00940000154709.a.b.b.c.f	ENSGT00940000155504.j.a	ENSGT00940000156246.c.a.b	ENSGT00390000011620.b.e.h.a ##22	ENSGT00940000159496.l.b	ENSGT00940000159100.h.b	ENSGT00950000183113.b.a	ENSGT00940000157431.c.a.a	ENSGT00390000016435.e
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Goldfish	MODERN SPECIES	45	ENSCARG00000030579	ENSCARG00000030683	GRAMD4 (ENSCARG00000033635)	kcna6a (ENSCARG00000033980)	KCNA1 (ENSCARG00000033987)	tmem178ba (ENSCARG00000033995)	CNOT4 (ENSCARG00000034017)	ENSCARG00000034142	ENSCARG00000034162	tnni4b.2 (ENSCARG00000034173)	bpgm (ENSCARG00000034210)	ENSCARG00000034231	tnnt2d (ENSCARG00000034258)	DNM1L (ENSCARG00000034349)	dnajb9a (ENSCARG00000035528)	ENSCARG00000035543 ##22	kctd15a (ENSCARG00000035628)	CHST8 (ENSCARG00000035707)	cplx3a (ENSCARG00000035721)	csk (ENSCARG00000035784)	edc3 (ENSCARG00000036373)	kxd1 (ENSCARG00000036381)	MAGI2 (ENSCARG00000036407)	gnaia (ENSCARG00000036512)	CHRM2 (ENSCARG00000036541)	fbxl14a (ENSCARG00000036548)	PRR5 (ENSCARG00000036564)	ENSCARG00000036865	ENSCARG00000036885	erc1a (ENSCARG00000036941)	ENSCARG00000037518
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	46	ENSGT00940000159839.d.b.a	ENSGT00390000010968.a.a	ENSGT00940000164299.b.b	ENSGT00940000158576.a.b.e	ENSGT00390000015299.a.b.b.a.e.b	ENSGT00390000000068.a.b.b	ENSGT00390000007427.b	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b.n.b	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.a.a.a	ENSGT00950000182926.a.q	ENSGT00940000153901.a.a.a.a	ENSGT00940000154709.a.b.b.c.e	ENSGT00940000155504.j.b	ENSGT00940000156246.c.a.a	ENSGT00390000011620.b.e.h.b ##22	ENSGT00940000159496.l.a	ENSGT00940000159100.h.a	ENSGT00950000182938.b.b.b.b.a.e.b	ENSGT00940000157431.c.a.b	ENSGT00390000016435.f	ENSGT00530000064192	ENSGT00530000063113.A.s.a	ENSGT00940000155057.wb.e.a	ENSGT00940000153567.a.a.b.b.b.a	ENSGT00940000158940.b.a.a	ENSGT00940000159857.a.b.b	ENSGT00530000063981.a.h.b	ENSGT00940000155474.p.a.h	ENSGT00650000093320.a.a.e.b.c.b	ENSGT00940000157946.f.a
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Clupeocephala	ANCESTRAL SPECIES	15										ENSGT00940000158070	ENSGT00940000160924	ENSGT00390000000707.y.b	ENSGT00390000003210	ENSGT00940000160407	ENSGT00940000154415.lb.a	ENSGT00390000011620.b.f ##22	ENSGT00940000156453.b ##24	ENSGT00510000049120	ENSGT00940000156037.a.e #25	ENSGT00940000155981.h #27	ENSGT00940000159100.h	ENSGT00940000159496.l	ENSGT00940000154415.lb.b	ENSGT00390000011620.b.e ##22	ENSGT00940000159496.k	ENSGT00940000159100.g	ENSGT00940000153657.B	ENSGT00940000156594	ENSGT00940000157011	ENSGT00940000159103	ENSGT00940000158389
Euteleosteomorpha	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00390000018123.a.a	ENSGT00940000160934	ENSGT00440000033589.c	ENSGT00950000183170.a	ENSGT00940000159096	ENSGT00940000158301	ENSGT00390000012529	ENSGT00390000008576	ENSGT00390000012054.b	ENSGT00940000158070	ENSGT00940000160924	ENSGT00390000000707.y.b	ENSGT00390000003210	ENSGT00940000160407	ENSGT00940000154415.lb.a	ENSGT00390000011620.b.f ##22	ENSGT00940000159496.k	ENSGT00940000159100.g	ENSGT00940000153657.B	ENSGT00940000156594	ENSGT00940000157011	ENSGT00940000159103	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000154969.a	ENSGT00940000157689	ENSGT00390000001195.b	ENSGT00950000182938.b.b.b.b.a	ENSGT00940000178010	ENSGT00940000157431.c.b	ENSGT00390000016435.g.b	ENSGT00950000183037.A.a
Acanthomorphata	ANCESTRAL SPECIES	64	ENSGT00940000155938.b.a	ENSGT00390000018123.a.a	ENSGT00940000160934	ENSGT00440000033589.c	ENSGT00950000183170.a	ENSGT00940000159096	ENSGT00940000158301	ENSGT00390000012529	ENSGT00390000008576	ENSGT00390000012054.b	ENSGT00940000158070	ENSGT00940000160924	ENSGT00390000000707.y.b	ENSGT00390000003210	ENSGT00940000154415.lb.a	ENSGT00390000011620.b.f ##22	ENSGT00940000159496.k	ENSGT00940000160407	ENSGT00940000159100.g	ENSGT00940000153657.B	ENSGT00940000156594	ENSGT00940000157011	ENSGT00940000159103	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000154969.a	ENSGT00940000157689	ENSGT00390000001195.b	ENSGT00950000182938.b.b.b.b.a	ENSGT00940000157431.c.b	ENSGT00390000016435.g.b	ENSGT00950000183037.A.a
Euacanthomorphacea	ANCESTRAL SPECIES	29	ENSGT00390000018123.a.a	ENSGT00940000160934	ENSGT00440000033589.c	ENSGT00950000183170.a	ENSGT00940000159096	ENSGT00940000158301	ENSGT00390000012529	ENSGT00390000008576	ENSGT00390000012054.b	ENSGT00940000158070	ENSGT00940000160924	ENSGT00390000000707.y.b	ENSGT00390000003210	ENSGT00940000160407	ENSGT00940000154415.lb.a	ENSGT00390000011620.b.f ##22	ENSGT00940000159496.k	ENSGT00940000159100.g	ENSGT00940000153657.B	ENSGT00940000156594	ENSGT00940000157011	ENSGT00940000159103	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000154969.a	ENSGT00940000157689	ENSGT00390000001195.b	ENSGT00950000182938.b.b.b.b.a	ENSGT00940000157431.c.b	ENSGT00390000016435.g.b	ENSGT00950000183037.A.a	ENSGT00390000014907.A
Percomorphaceae	ANCESTRAL SPECIES	27	ENSGT00390000018123.a.a	ENSGT00940000160934	ENSGT00440000033589.c	ENSGT00950000183170.a	ENSGT00940000159096	ENSGT00940000158301	ENSGT00390000012529	ENSGT00390000008576	ENSGT00390000012054.b	ENSGT00940000158070	ENSGT00940000160924	ENSGT00390000000707.y.b	ENSGT00390000003210	ENSGT00940000160407	ENSGT00940000154415.lb.a	ENSGT00390000011620.b.f ##22	ENSGT00940000159496.k	ENSGT00940000159100.g	ENSGT00940000153657.B	ENSGT00940000156594	ENSGT00940000157011	ENSGT00940000159103	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000154969.a	ENSGT00940000157689	ENSGT00390000001195.b	ENSGT00950000182938.b.b.b.b.a	ENSGT00940000157431.c.b	ENSGT00390000016435.g.b	ENSGT00950000183037.A.a	ENSGT00390000014907.A
Tiger tail seahorse	MODERN SPECIES	132	CYLD (ENSHCOG00000000981)	nod2 (ENSHCOG00000000996)	nkd1 (ENSHCOG00000001000)	brd7 (ENSHCOG00000001006)	adcy7 (ENSHCOG00000001020)	tent4b (ENSHCOG00000001028)	heatr3 (ENSHCOG00000001036)	cnep1r1 (ENSHCOG00000001041)	zgc:101040 (ENSHCOG00000000046)	sdr42e1 (ENSHCOG00000001052)	wtip (ENSHCOG00000001056)	gpib (ENSHCOG00000001069)	GARRE1 (ENSHCOG00000001080)	ss18l2 (ENSHCOG00000001083)	ENSHCOG00000001089	ENSHCOG00000001097 ##22	KCTD15 (ENSHCOG00000001101)	CHST8 (ENSHCOG00000001106)	pepd (ENSHCOG00000001121)	THSD4 (ENSHCOG00000001134)	ENSHCOG00000001206	larp6a (ENSHCOG00000001241)	tm2d3 (ENSHCOG00000001248)	ENSHCOG00000001263	ENSHCOG00000001270	ENSHCOG00000001275	cplx3a (ENSHCOG00000001280)	CSK (ENSHCOG00000001291)	cyp1a (ENSHCOG00000001298)	ENSHCOG00000001306	ENSHCOG00000001308
Percomorphaceae_B	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00390000018123.a.a	ENSGT00940000160934	ENSGT00440000033589.c	ENSGT00950000183170.a	ENSGT00940000159096	ENSGT00940000158301	ENSGT00390000012529	ENSGT00390000008576	ENSGT00390000012054.b	ENSGT00940000158070	ENSGT00940000160924	ENSGT00390000000707.y.b	ENSGT00390000003210	ENSGT00940000160407	ENSGT00940000154415.lb.a	ENSGT00390000011620.b.f ##22	ENSGT00940000159496.k	ENSGT00940000159100.g	ENSGT00940000153657.B	ENSGT00940000156594	ENSGT00940000157011	ENSGT00940000159103	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000154969.a	ENSGT00940000157689	ENSGT00390000001195.b	ENSGT00950000182938.b.b.b.b.a	ENSGT00940000157431.c.b	ENSGT00390000016435.g.b	ENSGT00950000183037.A.a	ENSGT00390000014907.A
Ovalentaria	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00390000018123.a.a	ENSGT00940000160934	ENSGT00440000033589.c	ENSGT00950000183170.a	ENSGT00940000159096	ENSGT00940000158301	ENSGT00390000012529	ENSGT00390000008576	ENSGT00390000012054.b.a.a	ENSGT00940000158070	ENSGT00940000160924	ENSGT00390000000707.y.b	ENSGT00390000003210	ENSGT00940000160407	ENSGT00940000154415.lb.a	ENSGT00390000011620.b.f ##22	ENSGT00940000159496.k	ENSGT00940000159100.g	ENSGT00940000153657.B	ENSGT00940000156594	ENSGT00940000157011	ENSGT00940000159103	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000154969.a	ENSGT00940000157689	ENSGT00390000001195.b	ENSGT00950000182938.b.b.b.b.a	ENSGT00940000157431.c.b	ENSGT00390000016435.g.b	ENSGT00950000183037.A.a	ENSGT00390000014907.A
Atherinomorphae	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00390000018123.a.a	ENSGT00940000160934	ENSGT00440000033589.c	ENSGT00950000183170.a	ENSGT00940000159096	ENSGT00940000158301	ENSGT00390000012529	ENSGT00390000008576	ENSGT00390000012054.b.a.a	ENSGT00940000158070	ENSGT00940000160924	ENSGT00390000000707.y.b	ENSGT00390000003210	ENSGT00940000160407	ENSGT00940000154415.lb.a	ENSGT00390000011620.b.f ##22	ENSGT00940000159496.k	ENSGT00940000159100.g	ENSGT00940000153657.B	ENSGT00940000156594	ENSGT00940000157011	ENSGT00940000159103	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000154969.a	ENSGT00940000157689	ENSGT00390000001195.b	ENSGT00950000182938.b.b.b.b.a	ENSGT00940000157431.c.b	ENSGT00390000016435.g.b	ENSGT00950000183037.A.a	ENSGT00390000014907.A
Cyprinodontiformes	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00390000018123.a.a	ENSGT00940000160934	ENSGT00440000033589.c	ENSGT00950000183170.a	ENSGT00940000159096	ENSGT00940000158301	ENSGT00390000012529	ENSGT00390000008576	ENSGT00390000012054.b.a.a	ENSGT00940000158070	ENSGT00940000160924	ENSGT00390000000707.y.b	ENSGT00390000003210	ENSGT00940000160407	ENSGT00940000154415.lb.a	ENSGT00390000011620.b.f ##22	ENSGT00940000159496.k	ENSGT00940000159100.g	ENSGT00940000153657.B	ENSGT00940000156594	ENSGT00940000157011	ENSGT00940000159103	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000154969.a	ENSGT00940000157689	ENSGT00390000001195.b	ENSGT00950000182938.b.b.b.b.a	ENSGT00940000157431.c.b	ENSGT00390000016435.g.b	ENSGT00950000183037.A.a	ENSGT00390000014907.A
Aplocheiloidei	ANCESTRAL SPECIES	40	ENSGT00940000158043	ENSGT00940000155938.b.a	ENSGT00390000018123.a.a	ENSGT00940000160934	ENSGT00440000033589.c	ENSGT00950000183170.a	ENSGT00940000159096	ENSGT00940000158301	ENSGT00390000012529	ENSGT00940000158070	ENSGT00940000160924	ENSGT00390000000707.y.b	ENSGT00390000003210	ENSGT00940000160407	ENSGT00940000154415.lb.a	ENSGT00390000011620.b.f ##22	ENSGT00940000159496.k	ENSGT00940000159100.g	ENSGT00940000153657.B	ENSGT00940000156594	ENSGT00940000157011	ENSGT00940000159103	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000154969.a	ENSGT00940000157689	ENSGT00390000001195.b	ENSGT00950000182938.b.b.b.b.a	ENSGT00940000157431.c.b	ENSGT00390000016435.g.b	ENSGT00950000183037.A.a	ENSGT00390000014907.A
Mangrove rivulus	MODERN SPECIES	114	CYLD (ENSKMAG00000000844)	nod2 (ENSKMAG00000000946)	nkd1 (ENSKMAG00000000993)	brd7 (ENSKMAG00000001007)	adcy7 (ENSKMAG00000001033)	tent4b (ENSKMAG00000001070)	heatr3 (ENSKMAG00000001086)	cnep1r1 (ENSKMAG00000001094)	zgc:101040 (ENSKMAG00000001117)	sdr42e1 (ENSKMAG00000001125)	wtip (ENSKMAG00000001146)	gpib (ENSKMAG00000001204)	GARRE1 (ENSKMAG00000001298)	ss18l2 (ENSKMAG00000001359)	lsm14ab (ENSKMAG00000001398)	ENSKMAG00000001447 ##22	KCTD15 (ENSKMAG00000001472)	CHST8 (ENSKMAG00000001490)	pepd (ENSKMAG00000001504)	DDX10 (ENSKMAG00000001578)	THSD4 (ENSKMAG00000001612)	ENSKMAG00000001681	larp6a (ENSKMAG00000001702)	tm2d3 (ENSKMAG00000001726)	ENSKMAG00000001740	ulk3 (ENSKMAG00000001839)	ENSKMAG00000001857	cplx3a (ENSKMAG00000001870)	CSK (ENSKMAG00000001906)	edc3 (ENSKMAG00000001987)	cyp1a (ENSKMAG00000002016)
Turquoise killifish	MODERN SPECIES	1616	SCAMP5 (ENSNFUG00015004482)	LOXL1 (ENSNFUG00015004478)	ENSNFUG00015004474	C18H15ORF59 (ENSNFUG00015004469)	cd276 (ENSNFUG00015004464)	UBL7 (ENSNFUG00015004456)	tent4b (ENSNFUG00015004422)	HEATR3 (ENSNFUG00015004394)	SDR42E1 (ENSNFUG00015004380)	WTIP (ENSNFUG00015004367)	GPI (ENSNFUG00015004311)	KIAA0355 (ENSNFUG00015004264)	ss18l2 (ENSNFUG00015004246)	lsm14ab (ENSNFUG00015023333)	ENSNFUG00015023298	ENSNFUG00015023286 ##22	kctd15a (ENSNFUG00015023278)	ENSNFUG00015023277	PEPD (ENSNFUG00015023263)	ADAMTSL7 (ENSNFUG00015023225)	ENSNFUG00015023203	larp6a (ENSNFUG00015023196)	TM2D3 (ENSNFUG00015023191)	TARSL2 (ENSNFUG00015023046)	ulk3 (ENSNFUG00015023023)	ENSNFUG00015023019	CPLX3 (ENSNFUG00015023016)	CSK (ENSNFUG00015022989)	ENSNFUG00015022980	EDC3 (ENSNFUG00015022976)	CYP1A (ENSNFUG00015022971)
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Sheepshead minnow	MODERN SPECIES	988																ENSCVAG00000013059 ##22	KCTD15 (ENSCVAG00000013028)	ENSCVAG00000013015	CHST8 (ENSCVAG00000013008)
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Sailfin molly	DUPLICATION
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Platyfish	MODERN SPECIES	18	nod2 (ENSXMAG00000016318)	nkd1 (ENSXMAG00000016338)	brd7 (ENSXMAG00000016346)	adcy7 (ENSXMAG00000016360)	tent4b (ENSXMAG00000023205)	heatr3 (ENSXMAG00000016449)	cnep1r1 (ENSXMAG00000016481)	ENSXMAG00000029165	ENSXMAG00000023908	sdr42e1 (ENSXMAG00000024494)	wtip (ENSXMAG00000016487)	gpib (ENSXMAG00000016488)	GARRE1 (ENSXMAG00000016500)	ss18l2 (ENSXMAG00000027005)	lsm14ab (ENSXMAG00000016519)	ENSXMAG00000016531 ##22	KCTD15 (ENSXMAG00000016539)	CHST8 (ENSXMAG00000016550)	pepd (ENSXMAG00000016552)	THSD4 (ENSXMAG00000016588)	ENSXMAG00000016602	larp6a (ENSXMAG00000021015)	tm2d3 (ENSXMAG00000022710)	ENSXMAG00000016645	ulk3 (ENSXMAG00000016706)	ENSXMAG00000016729	cplx3a (ENSXMAG00000026598)	CSK (ENSXMAG00000016732)	cyp1a (ENSXMAG00000016761)	ENSXMAG00000016783	ENSXMAG00000021603
Oryzias	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000160934	ENSGT00440000033589.c	ENSGT00950000183170.a	ENSGT00940000159096	ENSGT00940000158301	ENSGT00390000012529	ENSGT00390000008576	ENSGT00390000012054.b.a.a.d	ENSGT00390000012054.b.a.a.c	ENSGT00940000158070	ENSGT00940000160924	ENSGT00390000000707.y.b	ENSGT00390000003210	ENSGT00940000160407	ENSGT00940000154415.lb.a	ENSGT00390000011620.b.f ##22	ENSGT00940000159496.k	ENSGT00940000159100.g	ENSGT00940000153657.B	ENSGT00940000156594	ENSGT00940000157011	ENSGT00940000159103	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000154969.a	ENSGT00940000157689	ENSGT00390000001195.b	ENSGT00950000182938.b.b.b.b.a	ENSGT00940000157431.c.b	ENSGT00390000016435.g.b	ENSGT00950000183037.A.a	ENSGT00390000014907.A
Oryzias_b	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000160934	ENSGT00440000033589.c	ENSGT00950000183170.a	ENSGT00940000159096	ENSGT00940000158301	ENSGT00390000012529	ENSGT00390000008576	ENSGT00390000012054.b.a.a.d	ENSGT00390000012054.b.a.a.c	ENSGT00940000158070	ENSGT00940000160924	ENSGT00390000000707.y.b	ENSGT00390000003210	ENSGT00940000160407	ENSGT00940000154415.lb.a	ENSGT00390000011620.b.f ##22	ENSGT00940000159496.k	ENSGT00940000159100.g	ENSGT00940000153657.B	ENSGT00940000156594	ENSGT00940000157011	ENSGT00940000159103	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000154969.a	ENSGT00940000157689	ENSGT00390000001195.b	ENSGT00950000182938.b.b.b.b.a	ENSGT00940000157431.c.b	ENSGT00390000016435.g.b	ENSGT00950000183037.A.a	ENSGT00390000014907.A
Javanese ricefish	MODERN SPECIES	17	nod2 (ENSOJAG00000003016)	nkd1 (ENSOJAG00000003191)	brd7 (ENSOJAG00000003227)	adcy7 (ENSOJAG00000003248)	tent4b (ENSOJAG00000003379)	heatr3 (ENSOJAG00000003531)	ENSOJAG00000003611	cnep1r1 (ENSOJAG00000003644)	ENSOJAG00000003718	ENSOJAG00000003738	sdr42e1 (ENSOJAG00000003751)	wtip (ENSOJAG00000003763)	GARRE1 (ENSOJAG00000004308)	ss18l2 (ENSOJAG00000004906)	ENSOJAG00000004914	ENSOJAG00000004926 ##22	KCTD15 (ENSOJAG00000004965)	CHST8 (ENSOJAG00000004993)	pepd (ENSOJAG00000005003)	THSD4 (ENSOJAG00000005088)	ENSOJAG00000005354	larp6a (ENSOJAG00000005373)	tm2d3 (ENSOJAG00000005381)	ENSOJAG00000005474	ulk3 (ENSOJAG00000006288)	ENSOJAG00000006388	cplx3a (ENSOJAG00000006409)	CSK (ENSOJAG00000006549)	edc3 (ENSOJAG00000007768)	cyp1a (ENSOJAG00000007775)	ENSOJAG00000007796
Indian medaka	MODERN SPECIES	26	nod2 (ENSOMEG00000016186)	nkd1 (ENSOMEG00000016211)	brd7 (ENSOMEG00000016248)	adcy7 (ENSOMEG00000016330)	tent4b (ENSOMEG00000016359)	heatr3 (ENSOMEG00000016387)	cnep1r1 (ENSOMEG00000016405)	ENSOMEG00000016417	ENSOMEG00000016429	sdr42e1 (ENSOMEG00000016443)	wtip (ENSOMEG00000016486)	gpib (ENSOMEG00000016553)	GARRE1 (ENSOMEG00000016605)	ss18l2 (ENSOMEG00000016624)	ENSOMEG00000016637	ENSOMEG00000016761 ##22	KCTD15 (ENSOMEG00000016824)	CHST8 (ENSOMEG00000016858)	pepd (ENSOMEG00000016936)	THSD4 (ENSOMEG00000017012)	ENSOMEG00000017043	larp6a (ENSOMEG00000017049)	tm2d3 (ENSOMEG00000017062)	ENSOMEG00000017135	ulk3 (ENSOMEG00000017215)	ENSOMEG00000017241	cplx3a (ENSOMEG00000017251)	CSK (ENSOMEG00000017322)	edc3 (ENSOMEG00000017354)	cyp1a (ENSOMEG00000017398)	ENSOMEG00000017458
Oryzias_a	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000160934	ENSGT00440000033589.c	ENSGT00950000183170.a	ENSGT00940000159096	ENSGT00940000158301	ENSGT00390000012529	ENSGT00390000008576	ENSGT00390000012054.b.a.a.d	ENSGT00390000012054.b.a.a.c	ENSGT00940000158070	ENSGT00940000160924	ENSGT00390000000707.y.b	ENSGT00390000003210	ENSGT00940000160407	ENSGT00940000154415.lb.a	ENSGT00390000011620.b.f ##22	ENSGT00940000159496.k	ENSGT00940000159100.g	ENSGT00940000153657.B	ENSGT00940000156594	ENSGT00940000157011	ENSGT00940000159103	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000154969.a	ENSGT00940000157689	ENSGT00390000001195.b	ENSGT00950000182938.b.b.b.b.a	ENSGT00940000157431.c.b	ENSGT00390000016435.g.b	ENSGT00950000183037.A.a	ENSGT00390000014907.A
Chinese medaka	MODERN SPECIES	901	sall1a (ENSOSIG00000023302)	CYLD (ENSOSIG00000023298)	nod2 (ENSOSIG00000023253)	nkd1 (ENSOSIG00000023245)	brd7 (ENSOSIG00000023242)	adcy7 (ENSOSIG00000023229)	tent4b (ENSOSIG00000023212)	heatr3 (ENSOSIG00000023207)	zgc:101040 (ENSOSIG00000023189)	sdr42e1 (ENSOSIG00000023184)	wtip (ENSOSIG00000023182)	gpib (ENSOSIG00000023167)	GARRE1 (ENSOSIG00000023157)	ss18l2 (ENSOSIG00000023154)	lsm14ab (ENSOSIG00000023149)	ENSOSIG00000023144 ##22	KCTD15 (ENSOSIG00000023140)	CHST8 (ENSOSIG00000023138)	pepd (ENSOSIG00000023131)	THSD4 (ENSOSIG00000023104)	ENSOSIG00000023087	larp6a (ENSOSIG00000023078)	tm2d3 (ENSOSIG00000023074)	ENSOSIG00000022976	ulk3 (ENSOSIG00000022922)	ENSOSIG00000022914	cplx3a (ENSOSIG00000022913)	CSK (ENSOSIG00000022873)	edc3 (ENSOSIG00000022912)	cyp1a (ENSOSIG00000022847)	ENSOSIG00000022845
Ovalentaria_B	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00440000033589.c	ENSGT00950000183170.a	ENSGT00940000159096	ENSGT00940000158301	ENSGT00390000012529	ENSGT00390000008576	ENSGT00390000012054.b.a.a	ENSGT00390000012054.b.b	ENSGT00390000012054.b.a.b	ENSGT00940000158070	ENSGT00940000160924	ENSGT00390000000707.y.b	ENSGT00390000003210	ENSGT00940000160407	ENSGT00940000154415.lb.a	ENSGT00390000011620.b.f ##22	ENSGT00940000159496.k	ENSGT00940000159100.g	ENSGT00940000153657.B	ENSGT00940000156594	ENSGT00940000157011	ENSGT00940000159103	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000154969.a	ENSGT00940000157689	ENSGT00390000001195.b	ENSGT00950000182938.b.b.b.b.a	ENSGT00940000157431.c.b	ENSGT00390000016435.g.b	ENSGT00950000183037.A.a	ENSGT00390000014907.A
Cichlidae	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000160934	ENSGT00440000033589.c	ENSGT00950000183170.a	ENSGT00940000159096	ENSGT00940000158301	ENSGT00390000012529	ENSGT00390000008576	ENSGT00390000012054.b.a.a	ENSGT00390000012054.b.a.b	ENSGT00940000158070	ENSGT00940000160924	ENSGT00390000000707.y.b	ENSGT00390000003210	ENSGT00940000160407	ENSGT00940000154415.lb.a	ENSGT00390000011620.b.f ##22	ENSGT00940000159496.k	ENSGT00940000159100.g	ENSGT00940000153657.B	ENSGT00940000156594	ENSGT00940000157011	ENSGT00940000159103	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000154969.a	ENSGT00940000157689	ENSGT00390000001195.b	ENSGT00950000182938.b.b.b.b.a	ENSGT00940000157431.c.b	ENSGT00390000016435.g.b	ENSGT00950000183037.A.a	ENSGT00390000014907.A
Pseudocrenilabrinae	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00440000033589.c	ENSGT00950000183170.a	ENSGT00940000159096	ENSGT00940000158301	ENSGT00390000012529	ENSGT00390000008576	ENSGT00390000012054.b.a.a.f	ENSGT00390000012054.b.a.a.e	ENSGT00390000012054.b.a.b	ENSGT00940000158070	ENSGT00940000160924	ENSGT00390000000707.y.b	ENSGT00390000003210	ENSGT00940000160407	ENSGT00940000154415.lb.a	ENSGT00390000011620.b.f ##22	ENSGT00940000159496.k	ENSGT00940000159100.g	ENSGT00940000153657.B	ENSGT00940000156594	ENSGT00940000157011	ENSGT00940000159103	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000154969.a	ENSGT00940000157689	ENSGT00390000001195.b	ENSGT00950000182938.b.b.b.b.a	ENSGT00940000157431.c.b	ENSGT00390000016435.g.b	ENSGT00950000183037.A.a	ENSGT00390000014907.A
Nile tilapia	MODERN SPECIES		nkd1 (ENSONIG00000029445)	brd7 (ENSONIG00000002844)	adcy7 (ENSONIG00000002854)	tent4b (ENSONIG00000002860)	heatr3 (ENSONIG00000002862)	cnep1r1 (ENSONIG00000002867)	ENSONIG00000029863	ENSONIG00000020603	ENSONIG00000002868	sdr42e1 (ENSONIG00000002869)	wtip (ENSONIG00000002870)	gpib (ENSONIG00000002874)	GARRE1 (ENSONIG00000002881)	ss18l2 (ENSONIG00000027346)	ENSONIG00000033373	ENSONIG00000002889 ##22	KCTD15 (ENSONIG00000002890)	CHST8 (ENSONIG00000020604)	ENSONIG00000035293	ENSONIG00000030451	ENSONIG00000036005	ENSONIG00000039383	ENSONIG00000028379	ENSONIG00000015505	ENSONIG00000030417	pepd (ENSONIG00000002891)	THSD4 (ENSONIG00000002894)	ENSONIG00000002895	larp6a (ENSONIG00000033021)	tm2d3 (ENSONIG00000033542)	ENSONIG00000002904
Pseudocrenilabrinae_A	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00440000033589.c	ENSGT00950000183170.a	ENSGT00940000159096	ENSGT00940000158301	ENSGT00390000012529	ENSGT00390000008576	ENSGT00390000012054.b.a.a.f	ENSGT00390000012054.b.a.a.e	ENSGT00390000012054.b.a.b	ENSGT00940000158070	ENSGT00940000160924	ENSGT00390000000707.y.b	ENSGT00390000003210	ENSGT00940000160407	ENSGT00940000154415.lb.a	ENSGT00390000011620.b.f ##22	ENSGT00940000159496.k	ENSGT00940000159100.g	ENSGT00940000153657.B	ENSGT00940000156594	ENSGT00940000157011	ENSGT00940000159103	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000154969.a	ENSGT00940000157689	ENSGT00390000001195.b	ENSGT00950000182938.b.b.b.b.a	ENSGT00940000157431.c.b	ENSGT00390000016435.g.b	ENSGT00950000183037.A.a	ENSGT00390000014907.A
Haplochromini	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00440000033589.c	ENSGT00950000183170.a	ENSGT00940000159096	ENSGT00940000158301	ENSGT00390000012529	ENSGT00390000008576	ENSGT00390000012054.b.a.a.f	ENSGT00390000012054.b.a.a.e	ENSGT00390000012054.b.a.b	ENSGT00940000158070	ENSGT00940000160924	ENSGT00390000000707.y.b	ENSGT00390000003210	ENSGT00940000160407	ENSGT00940000154415.lb.a	ENSGT00390000011620.b.f ##22	ENSGT00940000159496.k	ENSGT00940000159100.g	ENSGT00940000153657.B	ENSGT00940000156594	ENSGT00940000157011	ENSGT00940000159103	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000154969.a	ENSGT00940000157689	ENSGT00390000001195.b	ENSGT00950000182938.b.b.b.b.a	ENSGT00940000157431.c.b	ENSGT00390000016435.g.b	ENSGT00950000183037.A.a	ENSGT00390000014907.A
Haplochromini_A	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00440000033589.c	ENSGT00950000183170.a	ENSGT00940000159096	ENSGT00940000158301	ENSGT00390000012529	ENSGT00390000008576	ENSGT00390000012054.b.a.a.f	ENSGT00390000012054.b.a.a.e	ENSGT00390000012054.b.a.b	ENSGT00940000158070	ENSGT00940000160924	ENSGT00390000000707.y.b	ENSGT00390000003210	ENSGT00940000160407	ENSGT00940000154415.lb.a	ENSGT00390000011620.b.f ##22	ENSGT00940000159496.k	ENSGT00940000159100.g	ENSGT00940000153657.B	ENSGT00940000179779	ENSGT00940000156594	ENSGT00940000157011	ENSGT00940000159103	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000154969.a	ENSGT00940000157689	ENSGT00390000001195.b	ENSGT00950000182938.b.b.b.b.a	ENSGT00940000157431.c.b	ENSGT00390000016435.g.b	ENSGT00950000183037.A.a
Haplochromini_B	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00440000033589.c	ENSGT00950000183170.a	ENSGT00940000159096	ENSGT00940000158301	ENSGT00390000012529	ENSGT00390000008576	ENSGT00390000012054.b.a.a.f	ENSGT00390000012054.b.a.a.e	ENSGT00390000012054.b.a.b	ENSGT00940000158070	ENSGT00940000160924	ENSGT00390000000707.y.b	ENSGT00390000003210	ENSGT00940000160407	ENSGT00940000154415.lb.a	ENSGT00390000011620.b.f ##22	ENSGT00940000159496.k	ENSGT00940000159100.g	ENSGT00940000153657.B	ENSGT00940000179779	ENSGT00940000156594	ENSGT00940000157011	ENSGT00940000159103	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000154969.a	ENSGT00940000157689	ENSGT00390000001195.b	ENSGT00950000182938.b.b.b.b.a	ENSGT00940000157431.c.b	ENSGT00390000016435.g.b	ENSGT00950000183037.A.a
Eastern happy	MODERN SPECIES		nkd1 (ENSACLG00000017488)	brd7 (ENSACLG00000017509)	adcy7 (ENSACLG00000017568)	tent4b (ENSACLG00000017633)	heatr3 (ENSACLG00000017658)	cnep1r1 (ENSACLG00000017758)	ENSACLG00000017784	ENSACLG00000017788	ENSACLG00000017815	sdr42e1 (ENSACLG00000017826)	wtip (ENSACLG00000017833)	gpib (ENSACLG00000017912)	GARRE1 (ENSACLG00000018026)	ss18l2 (ENSACLG00000018129)	ENSACLG00000018221	ENSACLG00000018235 ##22	KCTD15 (ENSACLG00000018268)	CHST8 (ENSACLG00000018303)	ENSACLG00000018309	pepd (ENSACLG00000018316)	ENSACLG00000018387	THSD4 (ENSACLG00000018475)	LRRC49 (ENSACLG00000018521)	larp6a (ENSACLG00000018561)	tm2d3 (ENSACLG00000018580)	ENSACLG00000018601	ulk3 (ENSACLG00000018653)	ENSACLG00000018685	cplx3a (ENSACLG00000018695)	CSK (ENSACLG00000018710)	edc3 (ENSACLG00000018776)
Zebra mbuna	MODERN SPECIES	1091	nkd1 (ENSMZEG00005006305)	brd7 (ENSMZEG00005006263)	adcy7 (ENSMZEG00005006215)	tent4b (ENSMZEG00005006186)	heatr3 (ENSMZEG00005006165)	cnep1r1 (ENSMZEG00005006145)	ENSMZEG00005006135	ENSMZEG00005006123	ENSMZEG00005006105	sdr42e1 (ENSMZEG00005006103)	wtip (ENSMZEG00005006076)	gpib (ENSMZEG00005006021)	GARRE1 (ENSMZEG00005005988)	ss18l2 (ENSMZEG00005005958)	ENSMZEG00005005945	ENSMZEG00005005903 ##22	KCTD15 (ENSMZEG00005005881)	CHST8 (ENSMZEG00005005878)	pepd (ENSMZEG00005005846)	ENSMZEG00005005829	THSD4 (ENSMZEG00005005793)	ENSMZEG00005005786	larp6a (ENSMZEG00005005774)	tm2d3 (ENSMZEG00005005769)	ENSMZEG00005005731	ulk3 (ENSMZEG00005005710)	ENSMZEG00005005704	cplx3a (ENSMZEG00005005699)	CSK (ENSMZEG00005005671)	edc3 (ENSMZEG00005005654)	cyp1a (ENSMZEG00005005645)
P. nyererei	MODERN SPECIES	320	nkd1 (ENSPNYG00000010683)	brd7 (ENSPNYG00000010644)	adcy7 (ENSPNYG00000010540)	tent4b (ENSPNYG00000010512)	heatr3 (ENSPNYG00000010490)	cnep1r1 (ENSPNYG00000010462)	ENSPNYG00000010450	ENSPNYG00000010428	ENSPNYG00000010408	sdr42e1 (ENSPNYG00000010400)	wtip (ENSPNYG00000010369)	gpib (ENSPNYG00000010315)	GARRE1 (ENSPNYG00000010277)	ss18l2 (ENSPNYG00000010263)	lsm14ab (ENSPNYG00000010236)	ENSPNYG00000010181 ##22	KCTD15 (ENSPNYG00000010156)	CHST8 (ENSPNYG00000010148)	pepd (ENSPNYG00000010092)	ENSPNYG00000009948	THSD4 (ENSPNYG00000009897)	LRRC49 (ENSPNYG00000009857)	larp6a (ENSPNYG00000009835)	tm2d3 (ENSPNYG00000009810)	ENSPNYG00000009768	ulk3 (ENSPNYG00000009745)	ENSPNYG00000009730	cplx3a (ENSPNYG00000009724)	CSK (ENSPNYG00000009686)	edc3 (ENSPNYG00000009669)	cyp1a (ENSPNYG00000009659)
Burton s mouthbrooder	MODERN SPECIES	272	nod2 (ENSHBUG00000021836)	nkd1 (ENSHBUG00000021793)	brd7 (ENSHBUG00000021765)	adcy7 (ENSHBUG00000021651)	tent4b (ENSHBUG00000021610)	heatr3 (ENSHBUG00000021602)	cnep1r1 (ENSHBUG00000021590)	ENSHBUG00000021556	ENSHBUG00000021546	sdr42e1 (ENSHBUG00000021502)	wtip (ENSHBUG00000000663)	gpib (ENSHBUG00000021470)	GARRE1 (ENSHBUG00000021415)	ss18l2 (ENSHBUG00000021367)	lsm14ab (ENSHBUG00000021356)	ENSHBUG00000021306 ##22	KCTD15 (ENSHBUG00000021266)	CHST8 (ENSHBUG00000021227)	pepd (ENSHBUG00000021215)	THSD4 (ENSHBUG00000021105)	LRRC49 (ENSHBUG00000021042)	larp6a (ENSHBUG00000021014)	tm2d3 (ENSHBUG00000021002)	ENSHBUG00000020986	ulk3 (ENSHBUG00000020921)	ENSHBUG00000020912	cplx3a (ENSHBUG00000020901)	CSK (ENSHBUG00000020879)	edc3 (ENSHBUG00000020817)	cyp1a (ENSHBUG00000020804)	ENSHBUG00000020795
Lyretail cichlid	MODERN SPECIES	290	nkd1 (ENSNBRG00000009143)	brd7 (ENSNBRG00000009096)	adcy7 (ENSNBRG00000008995)	tent4b (ENSNBRG00000008931)	heatr3 (ENSNBRG00000008875)	cnep1r1 (ENSNBRG00000008843)	ENSNBRG00000008815	ENSNBRG00000008797	ENSNBRG00000008776	sdr42e1 (ENSNBRG00000008768)	wtip (ENSNBRG00000008738)	gpib (ENSNBRG00000008511)	GARRE1 (ENSNBRG00000008401)	ss18l2 (ENSNBRG00000008363)	lsm14ab (ENSNBRG00000008333)	ENSNBRG00000008301 ##22	KCTD15 (ENSNBRG00000008272)	CHST8 (ENSNBRG00000008261)	pepd (ENSNBRG00000008227)	THSD4 (ENSNBRG00000008176)	LRRC49 (ENSNBRG00000008139)	larp6a (ENSNBRG00000008120)	tm2d3 (ENSNBRG00000008088)	ENSNBRG00000008049	ulk3 (ENSNBRG00000007987)	ENSNBRG00000007970	cplx3a (ENSNBRG00000007964)	CSK (ENSNBRG00000007926)	edc3 (ENSNBRG00000007881)	cyp1a (ENSNBRG00000007864)	ENSNBRG00000007845
Midas cichlid	MODERN SPECIES	109	nod2 (ENSACIG00000004283)	nkd1 (ENSACIG00000004309)	brd7 (ENSACIG00000004326)	adcy7 (ENSACIG00000004361)	tent4b (ENSACIG00000004518)	heatr3 (ENSACIG00000004545)	cnep1r1 (ENSACIG00000004627)	zgc:101040 (ENSACIG00000004648)	sdr42e1 (ENSACIG00000004653)	wtip (ENSACIG00000004662)	ENSACIG00000004698	gpib (ENSACIG00000004705)	GARRE1 (ENSACIG00000004748)	ss18l2 (ENSACIG00000004799)	lsm14ab (ENSACIG00000004874)	ENSACIG00000004913 ##22	KCTD15 (ENSACIG00000004941)	CHST8 (ENSACIG00000004955)	ca8 (ENSACIG00000004967)	pepd (ENSACIG00000004984)	pepd (ENSACIG00000005010)	THSD4 (ENSACIG00000005092)	LRRC49 (ENSACIG00000005140)	larp6a (ENSACIG00000005166)	tm2d3 (ENSACIG00000005175)	ENSACIG00000005189	ulk3 (ENSACIG00000005245)	ENSACIG00000005276	cplx3a (ENSACIG00000005284)	CSK (ENSACIG00000005315)	edc3 (ENSACIG00000005330)
Pomacentridae	ANCESTRAL SPECIES	76	ENSGT00390000018123.a.a	ENSGT00940000160934	ENSGT00440000033589.c	ENSGT00950000183170.a	ENSGT00940000159096	ENSGT00940000158301	ENSGT00390000012529	ENSGT00390000008576	ENSGT00390000012054.b.b	ENSGT00940000158070	ENSGT00940000160924	ENSGT00390000000707.y.b	ENSGT00390000003210	ENSGT00940000160407	ENSGT00940000154415.lb.a	ENSGT00390000011620.b.f ##22	ENSGT00940000159496.k	ENSGT00940000159100.g	ENSGT00940000153657.B.g
Pomacentridae_A	ANCESTRAL SPECIES	71	ENSGT00940000160934	ENSGT00440000033589.c	ENSGT00950000183170.a	ENSGT00940000159096	ENSGT00940000158301	ENSGT00390000012529	ENSGT00390000008576	ENSGT00390000012054.b.b.a	ENSGT00390000012054.b.b.b	ENSGT00940000158070	ENSGT00940000160924	ENSGT00390000000707.y.b	ENSGT00390000003210	ENSGT00940000160407	ENSGT00940000154415.lb.a	ENSGT00390000011620.b.f ##22	ENSGT00940000159496.k	ENSGT00940000159100.g	ENSGT00940000153657.B.g
Amphiprion	ANCESTRAL SPECIES	89	ENSGT00440000033589.c	ENSGT00940000180560	ENSGT00950000183170.a	ENSGT00940000159096	ENSGT00940000158301	ENSGT00390000012529	ENSGT00390000008576	ENSGT00390000012054.b.b.a	ENSGT00390000012054.b.b.b	ENSGT00940000158070	ENSGT00940000160924	ENSGT00390000000707.y.b	ENSGT00390000003210	ENSGT00940000160407	ENSGT00940000154415.lb.a	ENSGT00390000011620.b.f ##22	ENSGT00940000159496.k	ENSGT00940000159100.g	ENSGT00940000153657.B.g
Orange clownfish	MODERN SPECIES		nkd1 (ENSAPEG00000010329)	ENSAPEG00000010452	brd7 (ENSAPEG00000010466)	adcy7 (ENSAPEG00000010481)	tent4b (ENSAPEG00000010518)	heatr3 (ENSAPEG00000010532)	cnep1r1 (ENSAPEG00000010621)	ENSAPEG00000010642	ENSAPEG00000010663	sdr42e1 (ENSAPEG00000010696)	wtip (ENSAPEG00000010702)	gpib (ENSAPEG00000010747)	GARRE1 (ENSAPEG00000010830)	ss18l2 (ENSAPEG00000010908)	lsm14ab (ENSAPEG00000010936)	ENSAPEG00000010971 ##22	KCTD15 (ENSAPEG00000010989)	CHST8 (ENSAPEG00000011029)	ENSAPEG00000011035	ENSAPEG00000011041	pepd (ENSAPEG00000000291)	UNC13C (ENSAPEG00000000402)	onecut1 (ENSAPEG00000000531)	atosa (ENSAPEG00000000549)	arpp19b (ENSAPEG00000000557)	MYO5A (ENSAPEG00000000564)	gnb5b (ENSAPEG00000000676)	bcl2l10 (ENSAPEG00000000719)	trpm7 (ENSAPEG00000000737)	SPPL2A (ENSAPEG00000000833)	gnrhr2 (ENSAPEG00000000902)
Clown anemonefish	MODERN SPECIES	1291	nod2 (ENSAOCG00000018264)	nkd1 (ENSAOCG00000018231)	ENSAOCG00000018218	brd7 (ENSAOCG00000018201)	adcy7 (ENSAOCG00000018155)	tent4b (ENSAOCG00000018117)	heatr3 (ENSAOCG00000001286)	cnep1r1 (ENSAOCG00000018091)	zgc:101040 (ENSAOCG00000018073)	sdr42e1 (ENSAOCG00000018041)	ENSAOCG00000018020	gpib (ENSAOCG00000001273)	GARRE1 (ENSAOCG00000017946)	ss18l2 (ENSAOCG00000017890)	lsm14ab (ENSAOCG00000001256)	ENSAOCG00000017833 ##22	KCTD15 (ENSAOCG00000017787)	CHST8 (ENSAOCG00000017778)	ENSAOCG00000001244	ENSAOCG00000017754	ENSAOCG00000017643	ENSAOCG00000017621	pgap4 (ENSAOCG00000002061)	MAL (ENSAOCG00000002272)	lgalsla (ENSAOCG00000017580)	slc29a2 (ENSAOCG00000017530)	ENSAOCG00000017485	vps54 (ENSAOCG00000017438)
Spiny chromis	MODERN SPECIES	1	CYLD (ENSAPOG00000022732)	nod2 (ENSAPOG00000001020)	nkd1 (ENSAPOG00000022590)	brd7 (ENSAPOG00000022561)	adcy7 (ENSAPOG00000022420)	tent4b (ENSAPOG00000022376)	heatr3 (ENSAPOG00000022363)	cnep1r1 (ENSAPOG00000022325)	zgc:101040 (ENSAPOG00000022296)	sdr42e1 (ENSAPOG00000022272)	wtip (ENSAPOG00000022259)	gpib (ENSAPOG00000022181)	GARRE1 (ENSAPOG00000022098)	ss18l2 (ENSAPOG00000022048)	lsm14ab (ENSAPOG00000021998)	ENSAPOG00000021979 ##22	KCTD15 (ENSAPOG00000021937)	CHST8 (ENSAPOG00000000625)	pepd (ENSAPOG00000021905)	THSD4 (ENSAPOG00000021831)	LRRC49 (ENSAPOG00000021808)	larp6a (ENSAPOG00000021773)	tm2d3 (ENSAPOG00000021763)	ENSAPOG00000021756	ENSAPOG00000021704
Bicolor damselfish	MODERN SPECIES	1445												gpib (ENSSPAG00000003231)	GARRE1 (ENSSPAG00000003160)	ss18l2 (ENSSPAG00000003145)	lsm14ab (ENSSPAG00000003128)	ENSSPAG00000003104 ##22	KCTD15 (ENSSPAG00000003071)
Percomorphaceae_C	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00390000018123.a.a	ENSGT00940000160934	ENSGT00440000033589.c	ENSGT00950000183170.a	ENSGT00940000159096	ENSGT00940000158301	ENSGT00390000012529	ENSGT00390000008576	ENSGT00390000012054.b	ENSGT00940000158070	ENSGT00940000160924	ENSGT00390000000707.y.b	ENSGT00390000003210	ENSGT00940000160407	ENSGT00940000154415.lb.a	ENSGT00390000011620.b.f ##22	ENSGT00940000159496.k	ENSGT00940000159100.g	ENSGT00940000153657.B	ENSGT00940000156594	ENSGT00940000157011	ENSGT00940000159103	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000154969.a	ENSGT00940000157689	ENSGT00390000001195.b	ENSGT00950000182938.b.b.b.b.a	ENSGT00940000157431.c.b	ENSGT00390000016435.g.b	ENSGT00950000183037.A.a	ENSGT00390000014907.A
Eupercaria	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00390000018123.a.a	ENSGT00940000160934	ENSGT00440000033589.c	ENSGT00950000183170.a	ENSGT00940000159096	ENSGT00940000158301	ENSGT00390000012529	ENSGT00390000008576	ENSGT00390000012054.b	ENSGT00940000158070	ENSGT00940000160924	ENSGT00390000000707.y.b	ENSGT00390000003210	ENSGT00940000160407	ENSGT00940000154415.lb.a	ENSGT00390000011620.b.f ##22	ENSGT00940000159496.k	ENSGT00940000159100.g	ENSGT00940000153657.B	ENSGT00940000156594	ENSGT00940000157011	ENSGT00940000159103	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000154969.a	ENSGT00940000157689	ENSGT00390000001195.b	ENSGT00950000182938.b.b.b.b.a	ENSGT00940000157431.c.b	ENSGT00390000016435.g.b	ENSGT00950000183037.A.a	ENSGT00390000014907.A
Tetraodontidae	ANCESTRAL SPECIES	158										ENSGT00940000158070	ENSGT00940000160924	ENSGT00390000000707.y.b	ENSGT00390000003210	ENSGT00940000160407	ENSGT00940000154415.lb.a	ENSGT00390000011620.b.f ##22	ENSGT00940000159496.k	ENSGT00940000159100.g
Fugu	MODERN SPECIES	4	fah (ENSTRUG00000000711)	mthfs (ENSTRUG00000019947)	shcbp1 (ENSTRUG00000000594)	spg21 (ENSTRUG00000000560)	ENSTRUG00000019679	ENSTRUG00000028997	ENSTRUG00000032511	ENSTRUG00000033010	uqcrfs1 (ENSTRUG00000015996)	sdr42e1 (ENSTRUG00000015985)	wtip (ENSTRUG00000024569)	gpib (ENSTRUG00000015872)	GARRE1 (ENSTRUG00000015836)	ss18l2 (ENSTRUG00000026985)	lsm14ab (ENSTRUG00000015798)	ENSTRUG00000015791 ##22	KCTD15 (ENSTRUG00000015783)	CHST8 (ENSTRUG00000020165)	ENSTRUG00000029359	ccnd1 (ENSTRUG00000015754)	lto1 (ENSTRUG00000026152)	fgf3 (ENSTRUG00000027654)	ENSTRUG00000015724	THSD4 (ENSTRUG00000028384)	ENSTRUG00000024847	ENSTRUG00000024639	ENSTRUG00000024094	fam219b (ENSTRUG00000022531)	cox5aa (ENSTRUG00000015647)	SNAP25 (ENSTRUG00000015620)	LRRC28 (ENSTRUG00000015594)
Tetraodon	MODERN SPECIES	26	ENSTNIG00000001499	ENSTNIG00000003130	ENSTNIG00000003132	ccni (ENSTNIG00000000306)	ENSTNIG00000003133	ccni (ENSTNIG00000003134)	ccng2 (ENSTNIG00000003135)	WDR7 (ENSTNIG00000003136)	ONECUT2 (ENSTNIG00000003240)	sdr42e1 (ENSTNIG00000005014)	wtip (ENSTNIG00000010518)	gpib (ENSTNIG00000010519)	GARRE1 (ENSTNIG00000010520)	ss18l2 (ENSTNIG00000010521)	lsm14ab (ENSTNIG00000010522)	ENSTNIG00000010523 ##22	KCTD15 (ENSTNIG00000010524)	DIP2C (ENSTNIG00000006612)	xpr1b (ENSTNIG00000007175)	ENSTNIG00000001571	ACOT11 (ENSTNIG00000018696)	mrpl37 (ENSTNIG00000018697)	csnk1g2a (ENSTNIG00000018698)	mfsd12a (ENSTNIG00000018699)	ENSTNIG00000018700	apol1 (ENSTNIG00000004227)	ENSTNIG00000000576	ENSTNIG00000004226	ENSTNIG00000004225	zgc:66427 (ENSTNIG00000004224)	parp2 (ENSTNIG00000004223)
Eupecaria_A	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000160934	ENSGT00440000033589.c	ENSGT00950000183170.a	ENSGT00940000159096	ENSGT00940000158301	ENSGT00390000012529	ENSGT00390000008576	ENSGT00390000012054.b.d.a	ENSGT00390000012054.b.c	ENSGT00940000158070	ENSGT00940000160924	ENSGT00390000000707.y.b	ENSGT00390000003210	ENSGT00940000160407	ENSGT00940000154415.lb.a	ENSGT00390000011620.b.f ##22	ENSGT00940000159496.k	ENSGT00940000159100.g	ENSGT00940000153657.B	ENSGT00940000156594	ENSGT00940000157011	ENSGT00940000159103	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000154969.a	ENSGT00940000157689	ENSGT00390000001195.b	ENSGT00950000182938.b.b.b.b.a	ENSGT00940000157431.c.b	ENSGT00390000016435.g.b	ENSGT00950000183037.A.a	ENSGT00390000014907.A
Ballan wrasse	MODERN SPECIES		CSMD1 (ENSLBEG00000001403)	ENSLBEG00000001278	ddx21 (ENSLBEG00000001244)	ENSLBEG00000001218	ENSLBEG00000001209	mpc1 (ENSLBEG00000001184)	kifbp (ENSLBEG00000001158)	trpm7 (ENSLBEG00000000986)	ENSLBEG00000000864	sdr42e1 (ENSLBEG00000000843)	wtip (ENSLBEG00000000789)	gpib (ENSLBEG00000000726)	GARRE1 (ENSLBEG00000000666)	ss18l2 (ENSLBEG00000000544)	lsm14ab (ENSLBEG00000000455)	ENSLBEG00000000415 ##22	KCTD15 (ENSLBEG00000000379)	CHST8 (ENSLBEG00000000365)	ENSLBEG00000000344	pepd (ENSLBEG00000000291)	THSD4 (ENSLBEG00000000230)	LRRC49 (ENSLBEG00000000205)	ENSLBEG00000000187	larp6a (ENSLBEG00000000170)	tm2d3 (ENSLBEG00000000161)	ENSLBEG00000000155	ENSLBEG00000000138	zgc:165481 (ENSLBEG00000000133)	cep89 (ENSLBEG00000000128)	rhpn2 (ENSLBEG00000000125)	slc7a10a (ENSLBEG00000000096)
Eupecaria_B	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000160934	ENSGT00440000033589.c	ENSGT00950000183170.a	ENSGT00940000159096	ENSGT00940000158301	ENSGT00390000012529	ENSGT00390000008576	ENSGT00390000012054.b.d.a	ENSGT00390000012054.b.c	ENSGT00940000158070	ENSGT00940000160924	ENSGT00390000000707.y.b	ENSGT00390000003210	ENSGT00940000160407	ENSGT00940000154415.lb.a	ENSGT00390000011620.b.f ##22	ENSGT00940000159496.k	ENSGT00940000159100.g	ENSGT00940000153657.B	ENSGT00940000156594	ENSGT00940000157011	ENSGT00940000159103	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000154969.a	ENSGT00940000157689	ENSGT00390000001195.b	ENSGT00950000182938.b.b.b.b.a	ENSGT00940000157431.c.b	ENSGT00390000016435.g.b	ENSGT00950000183037.A.a	ENSGT00390000014907.A
Eupecaria_C	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00390000018123.a.a	ENSGT00940000160934	ENSGT00440000033589.c	ENSGT00950000183170.a	ENSGT00940000159096	ENSGT00940000158301	ENSGT00390000012529	ENSGT00390000008576	ENSGT00390000012054.b.d.a	ENSGT00940000158070	ENSGT00940000160924	ENSGT00390000000707.y.b	ENSGT00390000003210	ENSGT00940000160407	ENSGT00940000154415.lb.a	ENSGT00390000011620.b.f ##22	ENSGT00940000159496.k	ENSGT00940000159100.g	ENSGT00940000153657.B	ENSGT00940000156594	ENSGT00940000157011	ENSGT00940000159103	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000154969.a	ENSGT00940000157689	ENSGT00390000001195.b	ENSGT00950000182938.b.b.b.b.a	ENSGT00940000157431.c.b	ENSGT00390000016435.g.b	ENSGT00950000183037.A.a	ENSGT00390000014907.A
Eupercaria_incertae_sedis	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00390000018123.a.a	ENSGT00940000160934	ENSGT00440000033589.c	ENSGT00950000183170.a	ENSGT00940000159096	ENSGT00940000158301	ENSGT00390000012529	ENSGT00390000008576	ENSGT00390000012054.b.d.a	ENSGT00940000158070	ENSGT00940000160924	ENSGT00390000000707.y.b	ENSGT00390000003210	ENSGT00940000160407	ENSGT00940000154415.lb.a	ENSGT00390000011620.b.f ##22	ENSGT00940000159496.k	ENSGT00940000159100.g	ENSGT00940000153657.B	ENSGT00940000156594	ENSGT00940000157011	ENSGT00940000159103	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000154969.a	ENSGT00940000157689	ENSGT00390000001195.b	ENSGT00950000182938.b.b.b.b.a	ENSGT00940000157431.c.b	ENSGT00390000016435.g.b	ENSGT00950000183037.A.a	ENSGT00390000014907.A
European seabass	MODERN SPECIES	18	TOX3 (ENSDLAG00005025035)	sall1a (ENSDLAG00005025026)	CYLD (ENSDLAG00005025000)	nod2 (ENSDLAG00005024955)	nkd1 (ENSDLAG00005032053)	brd7 (ENSDLAG00005024941)	adcy7 (ENSDLAG00005024782)	tent4b (ENSDLAG00005024732)	heatr3 (ENSDLAG00005030804)	sdr42e1 (ENSDLAG00005026879)	wtip (ENSDLAG00005024678)	gpib (ENSDLAG00005024556)	ENSDLAG00005024531	ss18l2 (ENSDLAG00005024522)	lsm14ab (ENSDLAG00005030677)	ENSDLAG00005029772 ##22	KCTD15 (ENSDLAG00005027432)	CHST8 (ENSDLAG00005024494)	PEPD (ENSDLAG00005032315)	THSD4 (ENSDLAG00005024464)	ENSDLAG00005024451	LARP6 (ENSDLAG00005024448)	ENSDLAG00005023387	ULK3 (ENSDLAG00005023334)	ENSDLAG00005023333	ENSDLAG00005033157	CSK (ENSDLAG00005023158)	ENSDLAG00005030853	CYP1A2 (ENSDLAG00005023109)	ENSDLAG00005023100	ENSDLAG00005023097
Large yellow croaker	MODERN SPECIES	480	NOD2 (ENSLCRG00005002376)	nkd1 (ENSLCRG00005002547)	brd7 (ENSLCRG00005002572)	adcy7 (ENSLCRG00005003141)	tent4b (ENSLCRG00005003591)	heatr3 (ENSLCRG00005004088)	cnep1r1 (ENSLCRG00005004229)	ENSLCRG00005004230	ENSLCRG00005004232	sdr42e1 (ENSLCRG00005004234)	wtip (ENSLCRG00005004236)	gpib (ENSLCRG00005004325)	GARRE1 (ENSLCRG00005004472)	ss18l2 (ENSLCRG00005004473)	lsm14ab (ENSLCRG00005004476)	ENSLCRG00005004477 ##22	KCTD15 (ENSLCRG00005004485)	ENSLCRG00005004488	pepd (ENSLCRG00005004509)	THSD4 (ENSLCRG00005006051)	ENSLCRG00005006059	larp6a (ENSLCRG00005006061)	tm2d3 (ENSLCRG00005006062)	ENSLCRG00005006082	ulk3 (ENSLCRG00005010912)	ENSLCRG00005010915	cplx3a (ENSLCRG00005010917)	CSK (ENSLCRG00005010929)	edc3 (ENSLCRG00005012518)	cyp1a (ENSLCRG00005012519)	ENSLCRG00005012520
Gilthead seabream	MODERN SPECIES	18	nkd1 (ENSSAUG00010016522)	brd7 (ENSSAUG00010016523)	adcy7 (ENSSAUG00010016558)	tent4b (ENSSAUG00010018910)	heatr3 (ENSSAUG00010018924)	cnep1r1 (ENSSAUG00010019661)	zgc:101040 (ENSSAUG00010019675)	C19orf12 (ENSSAUG00010019677)	C19orf12 (ENSSAUG00010019680)	sdr42e1 (ENSSAUG00010019681)	wtip (ENSSAUG00010019683)	gpib (ENSSAUG00010019701)	GARRE1 (ENSSAUG00010020252)	ss18l2 (ENSSAUG00010020268)	lsm14ab (ENSSAUG00010020270)	ENSSAUG00010020271 ##22	KCTD15 (ENSSAUG00010020273)	CHST8 (ENSSAUG00010020275)	ENSSAUG00010020276	pepd (ENSSAUG00010020282)	THSD4 (ENSSAUG00010020295)	LRRC49 (ENSSAUG00010020318)	larp6a (ENSSAUG00010020321)	tm2d3 (ENSSAUG00010020323)	ENSSAUG00010020396	ulk3 (ENSSAUG00010023220)	ENSSAUG00010023221	cplx3a (ENSSAUG00010023222)	CSK (ENSSAUG00010023231)	edc3 (ENSSAUG00010023398)	cyp1a1 (ENSSAUG00010023400)
Perciformes	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00390000018123.a.a	ENSGT00940000160934	ENSGT00440000033589.c	ENSGT00950000183170.a	ENSGT00940000159096	ENSGT00940000158301	ENSGT00390000012529	ENSGT00390000008576	ENSGT00390000012054.b.c	ENSGT00940000158070	ENSGT00940000160924	ENSGT00390000000707.y.b	ENSGT00390000003210	ENSGT00940000160407	ENSGT00940000154415.lb.a	ENSGT00390000011620.b.f ##22	ENSGT00940000159496.k	ENSGT00940000159100.g	ENSGT00940000153657.B	ENSGT00940000156594	ENSGT00940000157011	ENSGT00940000159103	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000154969.a	ENSGT00940000157689	ENSGT00390000001195.b	ENSGT00950000182938.b.b.b.b.a	ENSGT00940000157431.c.b	ENSGT00390000016435.g.b	ENSGT00950000183037.A.a	ENSGT00390000014907.A
Cottioidei	ANCESTRAL SPECIES	35	ENSGT00940000154170.B	ENSGT00530000063760.a	ENSGT00390000000954	ENSGT00940000159506	ENSGT00940000160590	ENSGT00940000160728.i	ENSGT00390000010067	ENSGT00940000159763	ENSGT00390000010152	ENSGT00940000160143	ENSGT00730000110960.b	ENSGT00940000155463	ENSGT00940000154748.A	ENSGT00940000153942.b	ENSGT00940000154415.lb.a	ENSGT00390000011620.b.f ##22	ENSGT00940000159496.k	ENSGT00940000159100.g	ENSGT00940000153657.B	ENSGT00940000156594	ENSGT00940000157011	ENSGT00940000159103	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000154969.a	ENSGT00940000157689	ENSGT00390000001195.b	ENSGT00950000182938.b.b.b.b.a	ENSGT00940000157431.c.b	ENSGT00390000016435.g.b	ENSGT00950000183037.A.a	ENSGT00390000014907.A
Lumpfish	MODERN SPECIES	18	ap1s2 (ENSCLMG00005000950)	ZRSR2 (ENSCLMG00005000944)	nadsyn1 (ENSCLMG00005000929)	tpcn2 (ENSCLMG00005000927)	pop4 (ENSCLMG00005000926)	PLEKHF1 (ENSCLMG00005000924)	ENSCLMG00005000922	PCSK6 (ENSCLMG00005000916)	DOK4 (ENSCLMG00005000915)	ccdc102a (ENSCLMG00005000914)	txlng (ENSCLMG00005000905)	rbb4l (ENSCLMG00005000862)	HDGFL3 (ENSCLMG00005000852)	LSM14A (ENSCLMG00005000848)	ENSCLMG00005000847	ENSCLMG00005000844 ##22	KCTD15 (ENSCLMG00005000843)	CHST8 (ENSCLMG00005000840)	pepd (ENSCLMG00005000775)	THSD4 (ENSCLMG00005000767)	ENSCLMG00005000765	larp6a (ENSCLMG00005000763)	tm2d3 (ENSCLMG00005000762)	ENSCLMG00005000759	ulk3 (ENSCLMG00005000751)	ENSCLMG00005000749	cplx3a (ENSCLMG00005000747)	CSK (ENSCLMG00005000057)	EDC3 (ENSCLMG00005000006)	cyp1a (ENSCLMG00005022023)	ENSCLMG00005022020
Perciformes_a	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00390000018123.a.a	ENSGT00940000160934	ENSGT00440000033589.c	ENSGT00950000183170.a	ENSGT00940000159096	ENSGT00940000158301	ENSGT00390000012529	ENSGT00390000008576	ENSGT00390000012054.b.c	ENSGT00940000158070	ENSGT00940000160924	ENSGT00390000000707.y.b	ENSGT00390000003210	ENSGT00940000160407	ENSGT00940000154415.lb.a	ENSGT00390000011620.b.f ##22	ENSGT00940000159496.k	ENSGT00940000159100.g	ENSGT00940000153657.B	ENSGT00940000156594	ENSGT00940000157011	ENSGT00940000159103	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000154969.a	ENSGT00940000157689	ENSGT00390000001195.b	ENSGT00950000182938.b.b.b.b.a	ENSGT00940000157431.c.b	ENSGT00390000016435.g.b	ENSGT00950000183037.A.a	ENSGT00390000014907.A
Pike perch	MODERN SPECIES	56	CYLD (ENSSLUG00000019846)	nod2 (ENSSLUG00000019680)	nkd1 (ENSSLUG00000019666)	brd7 (ENSSLUG00000019658)	adcy7 (ENSSLUG00000017706)	tent4b (ENSSLUG00000017587)	heatr3 (ENSSLUG00000017500)	cnep1r1 (ENSSLUG00000017474)	zgc:101040 (ENSSLUG00000017466)	sdr42e1 (ENSSLUG00000017458)	wtip (ENSSLUG00000017397)	gpib (ENSSLUG00000016442)	GARRE1 (ENSSLUG00000016368)	ss18l2 (ENSSLUG00000016355)	lsm14ab (ENSSLUG00000016346)	ENSSLUG00000016335 ##22	KCTD15 (ENSSLUG00000016331)	CHST8 (ENSSLUG00000016329)	pepd (ENSSLUG00000015625)	ENSSLUG00000015559	THSD4 (ENSSLUG00000015530)	ENSSLUG00000015508	larp6a (ENSSLUG00000015497)	tm2d3 (ENSSLUG00000015491)	ENSSLUG00000012048	ulk3 (ENSSLUG00000011816)	ENSSLUG00000011800	cplx3a (ENSSLUG00000011793)	CSK (ENSSLUG00000011261)	edc3 (ENSSLUG00000011220)	cyp1a (ENSSLUG00000011217)
Channel bull blenny	MODERN SPECIES	17	sall1a (ENSCGOG00000023814)	CYLD (ENSCGOG00000023831)	nod2 (ENSCGOG00000023937)	nkd1 (ENSCGOG00000023948)	brd7 (ENSCGOG00000023953)	adcy7 (ENSCGOG00000023963)	tent4b (ENSCGOG00000024003)	heatr3 (ENSCGOG00000024017)	cnep1r1 (ENSCGOG00000024091)	sdr42e1 (ENSCGOG00000024095)	wtip (ENSCGOG00000024096)	gpib (ENSCGOG00000024133)	GARRE1 (ENSCGOG00000000516)	ss18l2 (ENSCGOG00000000637)	lsm14ab (ENSCGOG00000000640)	ENSCGOG00000000644 ##22	ENSCGOG00000000647	ap3s2 (ENSCGOG00000000654)	ANPEP (ENSCGOG00000000704)	mespaa (ENSCGOG00000000796)	mespba (ENSCGOG00000000799)	sv2ba (ENSCGOG00000000812)	ENSCGOG00000000840	ENSCGOG00000000842	NTRK3 (ENSCGOG00000000853)	mrpl46 (ENSCGOG00000000913)	mrps11 (ENSCGOG00000000914)	PDPR (ENSCGOG00000000920)	ENSCGOG00000000971	ENSCGOG00000000982	ppfia1 (ENSCGOG00000001031)
Percomorphaceae_D	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00390000018123.a.a	ENSGT00940000160934	ENSGT00440000033589.c	ENSGT00950000183170.a	ENSGT00940000159096	ENSGT00940000158301	ENSGT00390000012529	ENSGT00390000008576	ENSGT00390000012054.b	ENSGT00940000158070	ENSGT00940000160924	ENSGT00390000000707.y.b	ENSGT00390000003210	ENSGT00940000160407	ENSGT00940000154415.lb.a	ENSGT00390000011620.b.f ##22	ENSGT00940000159496.k	ENSGT00940000159100.g	ENSGT00940000153657.B	ENSGT00940000156594	ENSGT00940000157011	ENSGT00940000159103	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000154969.a	ENSGT00940000157689	ENSGT00390000001195.b	ENSGT00950000182938.b.b.b.b.a	ENSGT00940000157431.c.b	ENSGT00390000016435.g.b	ENSGT00950000183037.A.a	ENSGT00390000014907.A
Anabantaria	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00390000018123.a.a	ENSGT00940000160934	ENSGT00440000033589.c	ENSGT00950000183170.a	ENSGT00940000159096	ENSGT00940000158301	ENSGT00390000012529	ENSGT00390000008576	ENSGT00390000012054.b	ENSGT00940000158070	ENSGT00940000160924	ENSGT00390000000707.y.b	ENSGT00390000003210	ENSGT00940000160407	ENSGT00940000154415.lb.a	ENSGT00390000011620.b.f ##22	ENSGT00940000159496.k	ENSGT00940000159100.g	ENSGT00940000153657.B	ENSGT00940000156594	ENSGT00940000157011	ENSGT00940000159103	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000154969.a	ENSGT00940000157689	ENSGT00390000001195.b	ENSGT00950000182938.b.b.b.b.a	ENSGT00940000157431.c.b	ENSGT00390000016435.g.b	ENSGT00950000183037.A.a	ENSGT00390000014907.A
Zig-zag eel	MODERN SPECIES	17	CYLD (ENSMAMG00000004219)	nod2 (ENSMAMG00000004330)	nkd1 (ENSMAMG00000004411)	brd7 (ENSMAMG00000004453)	adcy7 (ENSMAMG00000004499)	tent4b (ENSMAMG00000004618)	heatr3 (ENSMAMG00000004653)	CNEP1R1 (ENSMAMG00000025311)	ENSMAMG00000004754	sdr42e1 (ENSMAMG00000028360)	wtip (ENSMAMG00000004782)	gpib (ENSMAMG00000004828)	ENSMAMG00000004885	ss18l2 (ENSMAMG00000004928)	lsm14ab (ENSMAMG00000004948)	ENSMAMG00000004995 ##22	KCTD15 (ENSMAMG00000005021)	CHST8 (ENSMAMG00000005035)	PEPD (ENSMAMG00000005061)	ENSMAMG00000005118	THSD4 (ENSMAMG00000005130)	ENSMAMG00000005238	larp6a (ENSMAMG00000005261)	ENSMAMG00000005273	ENSMAMG00000005294	ULK3 (ENSMAMG00000005332)	ENSMAMG00000005350	ENSMAMG00000028446	CSK (ENSMAMG00000005371)	ENSMAMG00000005423	CYP1A2 (ENSMAMG00000005442)
Anabantoidei	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00390000018123.a.a	ENSGT00940000160934	ENSGT00440000033589.c	ENSGT00950000183170.a	ENSGT00940000159096	ENSGT00940000158301	ENSGT00390000012529	ENSGT00390000008576	ENSGT00390000012054.b	ENSGT00940000158070	ENSGT00940000160924	ENSGT00390000000707.y.b	ENSGT00390000003210	ENSGT00940000160407	ENSGT00940000154415.lb.a	ENSGT00390000011620.b.f ##22	ENSGT00940000159496.k	ENSGT00940000159100.g	ENSGT00940000153657.B	ENSGT00940000156594	ENSGT00940000157011	ENSGT00940000159103	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000154969.a	ENSGT00940000157689	ENSGT00390000001195.b	ENSGT00950000182938.b.b.b.b.a	ENSGT00940000157431.c.b	ENSGT00390000016435.g.b	ENSGT00950000183037.A.a	ENSGT00390000014907.A
Climbing perch	MODERN SPECIES	16	nkd1 (ENSATEG00000003139)	brd7 (ENSATEG00000003146)	adcy7 (ENSATEG00000003161)	tent4b (ENSATEG00000003179)	heatr3 (ENSATEG00000026766)	CNEP1R1 (ENSATEG00000027563)	ENSATEG00000027001	ENSATEG00000029184	ENSATEG00000026266	sdr42e1 (ENSATEG00000003407)	wtip (ENSATEG00000003414)	gpib (ENSATEG00000003452)	ENSATEG00000003534	ss18l2 (ENSATEG00000003608)	lsm14ab (ENSATEG00000003629)	ENSATEG00000003635 ##22	KCTD15 (ENSATEG00000003653)	CHST8 (ENSATEG00000026470)	PEPD (ENSATEG00000003710)	PEPD (ENSATEG00000003776)	THSD4 (ENSATEG00000003949)	ENSATEG00000003958	ENSATEG00000026618	larp6a (ENSATEG00000004018)	ENSATEG00000004025	ENSATEG00000004034	ULK3 (ENSATEG00000004106)	ENSATEG00000004116	ENSATEG00000029741	ENSATEG00000028710	CSK (ENSATEG00000004157)
Siamese fighting fish	MODERN SPECIES	14	nod2 (ENSBSLG00000010171)	nkd1 (ENSBSLG00000010211)	brd7 (ENSBSLG00000010239)	adcy7 (ENSBSLG00000010726)	tent4b (ENSBSLG00000011102)	heatr3 (ENSBSLG00000011243)	ENSBSLG00000011295	ENSBSLG00000011299	ENSBSLG00000011302	sdr42e1 (ENSBSLG00000011637)	wtip (ENSBSLG00000011701)	gpib (ENSBSLG00000011985)	GARRE1 (ENSBSLG00000014094)	ss18l2 (ENSBSLG00000014237)	lsm14ab (ENSBSLG00000014255)	ENSBSLG00000014279 ##22	KCTD15 (ENSBSLG00000014356)	CHST8 (ENSBSLG00000014384)	pepd (ENSBSLG00000014423)	THSD4 (ENSBSLG00000015204)	ENSBSLG00000015417	larp6a (ENSBSLG00000015499)	tm2d3 (ENSBSLG00000015509)	ENSBSLG00000015529	ulk3 (ENSBSLG00000015924)	ENSBSLG00000016570	cplx3a (ENSBSLG00000016612)	CSK (ENSBSLG00000016793)	edc3 (ENSBSLG00000017511)	cyp1a (ENSBSLG00000017529)	ENSBSLG00000017570
Carangaria	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00390000018123.a.a	ENSGT00940000160934	ENSGT00440000033589.c	ENSGT00950000183170.a	ENSGT00940000159096	ENSGT00940000158301	ENSGT00390000012529	ENSGT00390000008576	ENSGT00390000012054.b	ENSGT00940000158070	ENSGT00940000160924	ENSGT00390000000707.y.b	ENSGT00390000003210	ENSGT00940000160407	ENSGT00940000154415.lb.a	ENSGT00390000011620.b.f ##22	ENSGT00940000159496.k	ENSGT00940000159100.g	ENSGT00940000153657.B	ENSGT00940000156594	ENSGT00940000157011	ENSGT00940000159103	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000154969.a	ENSGT00940000157689	ENSGT00390000001195.b	ENSGT00950000182938.b.b.b.b.a	ENSGT00940000157431.c.b	ENSGT00390000016435.g.b	ENSGT00950000183037.A.a	ENSGT00390000014907.A
Carangaria_A	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00390000018123.a.a	ENSGT00940000160934	ENSGT00440000033589.c	ENSGT00950000183170.a	ENSGT00940000159096	ENSGT00940000158301	ENSGT00390000012529	ENSGT00390000008576	ENSGT00390000012054.b	ENSGT00940000158070	ENSGT00940000160924	ENSGT00390000000707.y.b	ENSGT00390000003210	ENSGT00940000160407	ENSGT00940000154415.lb.a	ENSGT00390000011620.b.f ##22	ENSGT00940000159496.k	ENSGT00940000159100.g	ENSGT00940000153657.B	ENSGT00940000156594	ENSGT00940000157011	ENSGT00940000159103	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000154969.a	ENSGT00940000157689	ENSGT00390000001195.b	ENSGT00950000182938.b.b.b.b.a	ENSGT00940000157431.c.b	ENSGT00390000016435.g.b	ENSGT00950000183037.A.a	ENSGT00390000014907.A
Seriola	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000160934	ENSGT00440000033589.c	ENSGT00950000183170.a	ENSGT00940000159096	ENSGT00940000158301	ENSGT00390000012529	ENSGT00390000008576	ENSGT00390000012054.b.j	ENSGT00390000012054.b.i	ENSGT00940000158070	ENSGT00940000160924	ENSGT00390000000707.y.b	ENSGT00390000003210	ENSGT00940000160407	ENSGT00940000154415.lb.a	ENSGT00390000011620.b.f ##22	ENSGT00940000159496.k	ENSGT00940000159100.g	ENSGT00940000153657.B	ENSGT00940000156594	ENSGT00940000157011	ENSGT00940000159103	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000154969.a	ENSGT00940000157689	ENSGT00390000001195.b	ENSGT00950000182938.b.b.b.b.a	ENSGT00940000157431.c.b	ENSGT00390000016435.g.b	ENSGT00950000183037.A.a	ENSGT00390000014907.A
Greater amberjack	MODERN SPECIES	1	nod2 (ENSSDUG00000006648)	nkd1 (ENSSDUG00000006672)	brd7 (ENSSDUG00000006703)	adcy7 (ENSSDUG00000006797)	tent4b (ENSSDUG00000006848)	heatr3 (ENSSDUG00000006889)	cnep1r1 (ENSSDUG00000006917)	ENSSDUG00000006928	sdr42e1 (ENSSDUG00000006949)	ENSSDUG00000006958	wtip (ENSSDUG00000006988)	gpib (ENSSDUG00000007042)	GARRE1 (ENSSDUG00000007105)	ss18l2 (ENSSDUG00000007158)	lsm14ab (ENSSDUG00000007229)	ENSSDUG00000007248 ##22	KCTD15 (ENSSDUG00000007285)	CHST8 (ENSSDUG00000007299)	ENSSDUG00000007308	pepd (ENSSDUG00000007313)	THSD4 (ENSSDUG00000007334)	ENSSDUG00000007364	larp6a (ENSSDUG00000007438)	tm2d3 (ENSSDUG00000007455)	ENSSDUG00000007476	ulk3 (ENSSDUG00000007533)	ENSSDUG00000007561	ENSSDUG00000007572	CPLX3 (ENSSDUG00000007578)	CSK (ENSSDUG00000007607)	edc3 (ENSSDUG00000007671)
Yellowtail amberjack	MODERN SPECIES	3186	nod2 (ENSSLDG00000017497)	nkd1 (ENSSLDG00000017484)	brd7 (ENSSLDG00000017420)	adcy7 (ENSSLDG00000017343)	tent4b (ENSSLDG00000017282)	heatr3 (ENSSLDG00000017258)	cnep1r1 (ENSSLDG00000017238)	ENSSLDG00000017221	ENSSLDG00000017202	sdr42e1 (ENSSLDG00000017190)	wtip (ENSSLDG00000017162)	gpib (ENSSLDG00000017085)	ss18l2 (ENSSLDG00000016988)	GARRE1 (ENSSLDG00000016922)	lsm14ab (ENSSLDG00000016887)	ENSSLDG00000016833 ##22	KCTD15 (ENSSLDG00000016806)	CHST8 (ENSSLDG00000016796)	pepd (ENSSLDG00000016744)	THSD4 (ENSSLDG00000016691)	ENSSLDG00000016661	larp6a (ENSSLDG00000016647)	tm2d3 (ENSSLDG00000016630)	ENSSLDG00000016574	ulk3 (ENSSLDG00000016526)	ENSSLDG00000016506	cplx3a (ENSSLDG00000016499)	CSK (ENSSLDG00000016451)	ENSSLDG00000016431	cyp1a (ENSSLDG00000016420)	ENSSLDG00000016405
Barramundi perch	MODERN SPECIES	98	CYLD (ENSLCAG00010016261)	nod2 (ENSLCAG00010016222)	nkd1 (ENSLCAG00010016201)	brd7 (ENSLCAG00010016194)	adcy7 (ENSLCAG00010016137)	tent4b (ENSLCAG00010016119)	heatr3 (ENSLCAG00010016105)	cnep1r1 (ENSLCAG00010016091)	zgc:101040 (ENSLCAG00010016085)	sdr42e1 (ENSLCAG00010016081)	wtip (ENSLCAG00010016077)	gpib (ENSLCAG00010015967)	GARRE1 (ENSLCAG00010015925)	ss18l2 (ENSLCAG00010015916)	lsm14ab (ENSLCAG00010015909)	ENSLCAG00010015899 ##22	KCTD15 (ENSLCAG00010015893)	ENSLCAG00010015889
Pleuronectoidei	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000155938.b.a	ENSGT00390000018123.a.a	ENSGT00940000160934	ENSGT00440000033589.c	ENSGT00950000183170.a	ENSGT00940000159096	ENSGT00940000158301	ENSGT00390000012529	ENSGT00390000008576	ENSGT00940000158070	ENSGT00940000160924	ENSGT00390000000707.y.b	ENSGT00390000003210	ENSGT00940000160407	ENSGT00940000154415.lb.a	ENSGT00390000011620.b.f ##22	ENSGT00940000159496.k	ENSGT00940000159100.g	ENSGT00940000153657.B	ENSGT00940000156594	ENSGT00940000157011	ENSGT00940000159103	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000154969.a	ENSGT00940000157689	ENSGT00390000001195.b	ENSGT00950000182938.b.b.b.b.a	ENSGT00940000157431.c.b	ENSGT00390000016435.g.b	ENSGT00950000183037.A.a	ENSGT00390000014907.A
Turbot	MODERN SPECIES	17	ENSSMAG00000031343	CYLD (ENSSMAG00000009173)	nod2 (ENSSMAG00000009305)	nkd1 (ENSSMAG00000009368)	brd7 (ENSSMAG00000009397)	adcy7 (ENSSMAG00000009414)	tent4b (ENSSMAG00000009474)	heatr3 (ENSSMAG00000038075)	CNEP1R1 (ENSSMAG00000032497)	sdr42e1 (ENSSMAG00000035062)	wtip (ENSSMAG00000009606)	gpib (ENSSMAG00000009643)	ENSSMAG00000009697	ss18l2 (ENSSMAG00000009760)	lsm14ab (ENSSMAG00000009782)	ENSSMAG00000009805 ##22	KCTD15 (ENSSMAG00000009835)	CHST8 (ENSSMAG00000026831)	PEPD (ENSSMAG00000009882)	THSD4 (ENSSMAG00000009900)	ENSSMAG00000009926	ENSSMAG00000009949	larp6a (ENSSMAG00000009953)	ENSSMAG00000034282	ENSSMAG00000009984	ULK3 (ENSSMAG00000010042)	ENSSMAG00000010070	ENSSMAG00000024557	CSK (ENSSMAG00000010099)	ENSSMAG00000010176	CYP1A2 (ENSSMAG00000010200)
Tongue sole	MODERN SPECIES	15	TMEM266 (ENSCSEG00000011530)	zfand3 (ENSCSEG00000011514)	SLC7A9 (ENSCSEG00000011504)	nudt19 (ENSCSEG00000011497)	RGS9BP (ENSCSEG00000011493)	SLC7A9 (ENSCSEG00000011475)	zdhhc7 (ENSCSEG00000011457)	heatr3 (ENSCSEG00000011435)	cnep1r1 (ENSCSEG00000011418)	sdr42e1 (ENSCSEG00000011403)	wtip (ENSCSEG00000011397)	gpib (ENSCSEG00000011377)	GARRE1 (ENSCSEG00000011336)	ss18l2 (ENSCSEG00000011368)	lsm14ab (ENSCSEG00000011324)	ENSCSEG00000011298 ##22	KCTD15 (ENSCSEG00000011283)	CHST8 (ENSCSEG00000011273)	pepd (ENSCSEG00000011258)	THSD4 (ENSCSEG00000011238)	ENSCSEG00000011231	ENSCSEG00000011212	larp6a (ENSCSEG00000011196)	tm2d3 (ENSCSEG00000011181)	ENSCSEG00000011120	ENSCSEG00000011104	ENSCSEG00000011101	cplx3a (ENSCSEG00000011098)	CSK (ENSCSEG00000011082)	cyp1a (ENSCSEG00000011070)	ENSCSEG00000011049
Pinecone sodierfish	MODERN SPECIES	17	CYLD (ENSMMDG00005021080)	nod2 (ENSMMDG00005021064)	nkd1 (ENSMMDG00005021062)	brd7 (ENSMMDG00005021060)	adcy7 (ENSMMDG00005021034)	tent4b (ENSMMDG00005020799)	heatr3 (ENSMMDG00005020773)	cnep1r1 (ENSMMDG00005020763)	zgc:101040 (ENSMMDG00005020761)	sdr42e1 (ENSMMDG00005020759)	wtip (ENSMMDG00005020754)	gpib (ENSMMDG00005020599)	GARRE1 (ENSMMDG00005020552)	ss18l2 (ENSMMDG00005020537)	lsm14ab (ENSMMDG00005020532)	ENSMMDG00005020527 ##22	KCTD15 (ENSMMDG00005020525)	CHST8 (ENSMMDG00005020524)	pepd (ENSMMDG00005020521)	THSD4 (ENSMMDG00005020507)	ENSMMDG00005020499	larp6a (ENSMMDG00005020492)	tm2d3 (ENSMMDG00005020489)	ENSMMDG00005015544	ulk3 (ENSMMDG00005015450)	ENSMMDG00005015447	cplx3a (ENSMMDG00005015444)	CSK (ENSMMDG00005014956)	cyp1a (ENSMMDG00005014947)	ENSMMDG00005014945	ENSMMDG00005014943
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Salmo	DUPLICATION
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Oncorhynchus	DUPLICATION
Oncorhynchus	DUPLICATION
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	96	ENSGT00390000018123.a.a.k	ENSGT00940000160934	ENSGT00600000085600.k.b.b	ENSGT00440000033589.c.d.b	ENSGT00950000183170.a.lb	ENSGT00940000159096.l.a	ENSGT00940000158301.k.a.b.b	ENSGT00390000012529.p	ENSGT00390000008576.x	ENSGT00390000012054.b.l	ENSGT00940000158070.d	ENSGT00940000160924.g	ENSGT00390000000707.y.b.d	ENSGT00390000003210.h	ENSGT00940000154415.lb.a.c	ENSGT00390000011620.b.f.e.a ##22	ENSGT00940000159496.k.a.b	ENSGT00390000011620.b.f.e.b ##22	ENSGT00940000159496.k.b	ENSGT00940000159100.g.h.b	ENSGT00940000153657.B.l.b	ENSGT00940000156594.q.a.b	ENSGT00940000157011.o	ENSGT00940000159103.i.a	ENSGT00940000158389.d	ENSGT00940000154969.a.l	ENSGT00940000157689.h.b
Rainbow trout	MODERN SPECIES	27	brd7 (ENSOMYG00000039999)	adcy7 (ENSOMYG00000039924)	tent4b (ENSOMYG00000039746)	ENSOMYG00000070463	heatr3 (ENSOMYG00000038743)	CNEP1R1 (ENSOMYG00000038555)	ENSOMYG00000038543	sdr42e1 (ENSOMYG00000038513)	ENSOMYG00000052145	wtip (ENSOMYG00000038482)	gpib (ENSOMYG00000033529)	ENSOMYG00000032931	ENSOMYG00000072031	ENSOMYG00000032844	lsm14ab (ENSOMYG00000032834)	ENSOMYG00000072260 ##22	KCTD15 (ENSOMYG00000032775)	ENSOMYG00000061695	CHST8 (ENSOMYG00000032739)	ENSOMYG00000053833	PEPD (ENSOMYG00000032588)	THSD4 (ENSOMYG00000032435)	ENSOMYG00000032307	larp6a (ENSOMYG00000032260)	ENSOMYG00000032254	ENSOMYG00000051224	ENSOMYG00000030868	ULK3 (ENSOMYG00000030257)	ENSOMYG00000030182	ENSOMYG00000069182	CSK (ENSOMYG00000029466)
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00390000011620.b.f.e.a ##22
Coho salmon	MODERN SPECIES	28	ENSOKIG00005018428	nkd1 (ENSOKIG00005018410)	brd7 (ENSOKIG00005018363)	adcy7 (ENSOKIG00005018240)	tent4b (ENSOKIG00005018153)	heatr3 (ENSOKIG00005018102)	CNEP1R1 (ENSOKIG00005018027)	ENSOKIG00005018008	sdr42e1 (ENSOKIG00005018003)	wtip (ENSOKIG00005017960)	gpib (ENSOKIG00005017356)	ENSOKIG00005017323	ENSOKIG00005017313	ss18l2 (ENSOKIG00005017299)	ENSOKIG00005017295	ENSOKIG00005017277 ##22	KCTD15 (ENSOKIG00005017258)	CHST8 (ENSOKIG00005017251)	pepd (ENSOKIG00005016584)	ENSOKIG00005016545	THSD4 (ENSOKIG00005016391)	LRRC49 (ENSOKIG00005015954)	larp6a (ENSOKIG00005015918)	tm2d3 (ENSOKIG00005015908)	ENSOKIG00005014343	ulk3 (ENSOKIG00005014235)	ENSOKIG00005014227	ENSOKIG00005014222	CPLX3 (ENSOKIG00005014213)	CSK (ENSOKIG00005013791)	EDC3 (ENSOKIG00005013740)
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	96	ENSGT00600000085600.k.b.b	ENSGT00440000033589.c.d.b	ENSGT00950000183170.a.lb	ENSGT00940000159096.l.a	ENSGT00940000158301.k.a.b.b	ENSGT00390000012529.p	ENSGT00390000008576.x	ENSGT00390000012054.b.l	ENSGT00940000158070.d	ENSGT00940000160924.g	ENSGT00390000000707.y.b.d	ENSGT00390000003210.h	ENSGT00940000154415.lb.a.c	ENSGT00390000011620.b.f.e.a ##22	ENSGT00940000159496.k.a.b	ENSGT00390000011620.b.f.e.b ##22	ENSGT00940000159496.k.b	ENSGT00940000159100.g.h.b	ENSGT00940000153657.B.l.b	ENSGT00940000156594.q.a.b	ENSGT00940000157011.o	ENSGT00940000159103.i.a	ENSGT00940000158389.d	ENSGT00940000154969.a.l	ENSGT00940000157689.h.b
Rainbow trout	MODERN SPECIES	18	nkd1 (ENSOMYG00000045343)	brd7 (ENSOMYG00000045334)	ENSOMYG00000066122	adcy7 (ENSOMYG00000045295)	tent4b (ENSOMYG00000045259)	heatr3 (ENSOMYG00000045138)	CNEP1R1 (ENSOMYG00000045101)	ENSOMYG00000074522	sdr42e1 (ENSOMYG00000045098)	ENSOMYG00000053452	wtip (ENSOMYG00000045094)	gpib (ENSOMYG00000045032)	ENSOMYG00000044986	ss18l2 (ENSOMYG00000044973)	lsm14ab (ENSOMYG00000044968)	ENSOMYG00000044957 ##22	KCTD15 (ENSOMYG00000044944)	CHST8 (ENSOMYG00000044939)	PEPD (ENSOMYG00000044815)	THSD4 (ENSOMYG00000044758)	ENSOMYG00000044746	larp6a (ENSOMYG00000044740)	ENSOMYG00000044733	ENSOMYG00000042656	ULK3 (ENSOMYG00000042424)	ENSOMYG00000042418	ENSOMYG00000042415	CSK (ENSOMYG00000041698)	ENSOMYG00000041614	ENSOMYG00000041635	cyp1a3 (ENSOMYG00000041588)
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	630																ENSGT00390000011620.b.f.e.b ##22	ENSGT00940000159496.k.b
Coho salmon	MODERN SPECIES	22	nod2 (ENSOKIG00005027272)	ENSOKIG00005027171	nkd1 (ENSOKIG00005027105)	brd7 (ENSOKIG00005027019)	adcy7 (ENSOKIG00005026527)	tent4b (ENSOKIG00005026275)	heatr3 (ENSOKIG00005026183)	cnep1r1 (ENSOKIG00005025982)	ENSOKIG00005025972	sdr42e1 (ENSOKIG00005025953)	wtip (ENSOKIG00005025898)	gpib (ENSOKIG00005024131)	GARRE1 (ENSOKIG00005023767)	lsm14ab (ENSOKIG00005023723)	ENSOKIG00005023717	ENSOKIG00005023655 ##22	KCTD15 (ENSOKIG00005023630)	CHST8 (ENSOKIG00005023619)	PEPD (ENSOKIG00005023586)	THSD4 (ENSOKIG00005023548)	ENSOKIG00005023479	larp6a (ENSOKIG00005023462)	TM2D3 (ENSOKIG00005023453)	ENSOKIG00005020546	ULK3 (ENSOKIG00005020358)	ENSOKIG00005020342	CPLX3 (ENSOKIG00005020332)	CSK (ENSOKIG00005020163)	EDC3 (ENSOKIG00005020136)	cyp1a (ENSOKIG00005020076)	ENSOKIG00005020064
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00600000085600.k.b.a	ENSGT00440000033589.c.d.a.b	ENSGT00440000033589.c.d.a.a	ENSGT00950000183170.a.mb	ENSGT00940000159096.k	ENSGT00940000158301.k.a.a	ENSGT00390000012529.o.a	ENSGT00390000008576.w	ENSGT00390000012054.b.k	ENSGT00940000158070.c	ENSGT00940000160924.h	ENSGT00390000000707.y.b.c	ENSGT00390000003210.g	ENSGT00940000160407	ENSGT00940000154415.lb.a.d	ENSGT00390000011620.b.f.f ##22	ENSGT00940000159496.k.a.a	ENSGT00940000159100.g.h.a.a	ENSGT00940000153657.B.l.a	ENSGT00940000156594.q.a.a	ENSGT00940000157011.p	ENSGT00940000159103.i.b	ENSGT00940000158389.c	ENSGT00940000154969.a.k	ENSGT00940000157689.h.a	ENSGT00390000001195.b.f	ENSGT00950000182938.b.b.b.b.a.g.a	ENSGT00940000157431.c.b.m	ENSGT00390000016435.g.b.b	ENSGT00950000183037.A.a.m	ENSGT00390000014907.A.h
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000155938.b.a.f	ENSGT00390000018123.a.a.l	ENSGT00600000085600.k.b.a	ENSGT00440000033589.c.d.a.a	ENSGT00950000183170.a.mb	ENSGT00940000158301.k.a.a	ENSGT00390000012529.o.a	ENSGT00390000008576.w	ENSGT00390000012054.b.k	ENSGT00940000158070.c	ENSGT00940000160924.h	ENSGT00390000000707.y.b.c	ENSGT00390000003210.g	ENSGT00940000160407	ENSGT00940000154415.lb.a.d	ENSGT00390000011620.b.f.f ##22	ENSGT00940000159496.k.a.a	ENSGT00940000159100.g.h.a.a	ENSGT00940000153657.B.l.a	ENSGT00940000156594.q.a.a	ENSGT00940000157011.p	ENSGT00940000159103.i.b	ENSGT00940000158389.c	ENSGT00940000154969.a.k	ENSGT00940000157689.g	ENSGT00940000157689.h.a	ENSGT00390000001195.b.f	ENSGT00950000182938.b.b.b.b.a.g.a	ENSGT00940000157431.c.b.m	ENSGT00390000016435.g.b.b	ENSGT00950000183037.A.a.m
Chinook salmon	MODERN SPECIES	28	lsm14ab (ENSOTSG00005014575)	brd7 (ENSOTSG00005014571)	nkd1 (ENSOTSG00005014565)	ENSOTSG00005014878	adcy7 (ENSOTSG00005014877)	tent4b (ENSOTSG00005014800)	heatr3 (ENSOTSG00005014538)	cnep1r1 (ENSOTSG00005014532)	ENSOTSG00005014531	sdr42e1 (ENSOTSG00005014530)	wtip (ENSOTSG00005014529)	gpib (ENSOTSG00005014300)	GARRE1 (ENSOTSG00005014169)	ss18l2 (ENSOTSG00005014163)	lsm14ab (ENSOTSG00005014161)	ENSOTSG00005014159 ##22	KCTD15 (ENSOTSG00005014157)	CHST8 (ENSOTSG00005014154)	CHST8 (ENSOTSG00005014151)	pepd (ENSOTSG00005014150)	THSD4 (ENSOTSG00005014141)	ENSOTSG00005014139	larp6a (ENSOTSG00005014138)	tm2d3 (ENSOTSG00005014137)	ENSOTSG00005009446	ulk3 (ENSOTSG00005009437)	ENSOTSG00005009435	ENSOTSG00005009432	CSK (ENSOTSG00005009131)	edc3 (ENSOTSG00005009124)	cyp1a (ENSOTSG00005009121)
Huchen	DUPLICATION
Huchen	DUPLICATION
Huchen	MODERN SPECIES	499		ENSHHUG00000052839	brd7 (ENSHHUG00000052835)	adcy7 (ENSHHUG00000052827)	tent4b (ENSHHUG00000052826)	heatr3 (ENSHHUG00000052815)	cnep1r1 (ENSHHUG00000052812)	ENSHHUG00000052811	sdr42e1 (ENSHHUG00000052810)	wtip (ENSHHUG00000052809)	gpib (ENSHHUG00000052795)	GARRE1 (ENSHHUG00000052792)	ss18l2 (ENSHHUG00000052791)	lsm14ab (ENSHHUG00000052790)	ENSHHUG00000052789 ##22	ENSHHUG00000052788 ##22	KCTD15 (ENSHHUG00000052787)	CHST8 (ENSHHUG00000052783)	nrxn3a (ENSHHUG00000052779)
Huchen	MODERN SPECIES	499			ENSHHUG00000052839	brd7 (ENSHHUG00000052835)	adcy7 (ENSHHUG00000052827)	tent4b (ENSHHUG00000052826)	heatr3 (ENSHHUG00000052815)	cnep1r1 (ENSHHUG00000052812)	ENSHHUG00000052811	sdr42e1 (ENSHHUG00000052810)	wtip (ENSHHUG00000052809)	gpib (ENSHHUG00000052795)	GARRE1 (ENSHHUG00000052792)	ss18l2 (ENSHHUG00000052791)	lsm14ab (ENSHHUG00000052790)	ENSHHUG00000052789 ##22	ENSHHUG00000052788 ##22	KCTD15 (ENSHHUG00000052787)	CHST8 (ENSHHUG00000052783)	nrxn3a (ENSHHUG00000052779)
Huchen	MODERN SPECIES	4890																ENSHHUG00000015006 ##22	KCTD15 (ENSHHUG00000015017)	CHST8 (ENSHHUG00000015027)
Northern pike	MODERN SPECIES	1	nod2 (ENSELUG00000006299)	ENSELUG00000006328	nkd1 (ENSELUG00000006406)	brd7 (ENSELUG00000006474)	adcy7 (ENSELUG00000006551)	tent4b (ENSELUG00000006619)	heatr3 (ENSELUG00000006685)	cnep1r1 (ENSELUG00000006740)	zgc:101040 (ENSELUG00000006762)	sdr42e1 (ENSELUG00000006770)	wtip (ENSELUG00000006795)	gpib (ENSELUG00000006857)	GARRE1 (ENSELUG00000000230)	ss18l2 (ENSELUG00000007027)	lsm14ab (ENSELUG00000007050)	ENSELUG00000000251 ##22	KCTD15 (ENSELUG00000029944)	CHST8 (ENSELUG00000007147)	pepd (ENSELUG00000007192)	THSD4 (ENSELUG00000007238)	ENSELUG00000007312	larp6a (ENSELUG00000007341)	ENSELUG00000007414	ulk3 (ENSELUG00000007483)	ENSELUG00000007502	cplx3a (ENSELUG00000007512)	CSK (ENSELUG00000007566)	edc3 (ENSELUG00000007607)	cyp1a (ENSELUG00000007632)	ENSELUG00000007681	SWAP70 (ENSELUG00000007720)
Spotted gar	MODERN SPECIES	662	kcng4a (ENSLOCG00000002291)	ENSLOCG00000002278	hsbp1a (ENSLOCG00000002268)	ENSLOCG00000002229	mlycd (ENSLOCG00000002214)	CDH13 (ENSLOCG00000002199)	mphosph6 (ENSLOCG00000002187)	zgc:101040 (ENSLOCG00000017588)	hsd17b2 (ENSLOCG00000002170)	sdr42e1 (ENSLOCG00000002140)	wtip (ENSLOCG00000002111)	gpib (ENSLOCG00000002085)	GARRE1 (ENSLOCG00000002069)	ss18l2 (ENSLOCG00000002055)	lsm14ab (ENSLOCG00000002022)	ENSLOCG00000001983 ##22	kctd15a (ENSLOCG00000001969)	CHST8 (ENSLOCG00000001953)	pepd (ENSLOCG00000001905)	cebpg (ENSLOCG00000017587)	cebpa (ENSLOCG00000017586)	slc7a10a (ENSLOCG00000001884)	ENSLOCG00000001876	ENSLOCG00000001859	ENSLOCG00000001845	gpatch1 (ENSLOCG00000001800)	rhpn2 (ENSLOCG00000001772)	faap24 (ENSLOCG00000001761)	zgc:165481 (ENSLOCG00000017585)	CEP89 (ENSLOCG00000001728)	SLC7A9 (ENSLOCG00000001714)
Reedfish	MODERN SPECIES	17	ENSECRG00000007011	ZCCHC14 (ENSECRG00000007002)	map1lc3b (ENSECRG00000006993)	ENSECRG00000006987	FBXO31 (ENSECRG00000006978)	ENSECRG00000006883	ENSECRG00000006797	PDCD2L (ENSECRG00000006785)	uba2 (ENSECRG00000006760)	ENSECRG00000006744	wtip (ENSECRG00000006734)	gpib (ENSECRG00000006697)	GARRE1 (ENSECRG00000006672)	ss18l2 (ENSECRG00000006662)	lsm14ab (ENSECRG00000006650)	ENSECRG00000006636 ##22	kctd15a (ENSECRG00000006626)	CHST8 (ENSECRG00000006616)	pepd (ENSECRG00000006539)	cebpg (ENSECRG00000006505)	ENSECRG00000006494	cebpa (ENSECRG00000006483)	ENSECRG00000006438	ENSECRG00000006427	ENSECRG00000006414	ENSECRG00000006395	RGS9BP (ENSECRG00000006375)	nudt19 (ENSECRG00000006367)	ENSECRG00000006353	SLC7A9 (ENSECRG00000006336)	lrp3 (ENSECRG00000006321)
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Tetrapoda	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00390000005075	ENSGT00550000074901	ENSGT00940000159757	ENSGT00940000160687	ENSGT00940000165234	ENSGT00940000159836	ENSGT00390000017697.b	ENSGT00940000155200	ENSGT00940000158339	ENSGT00550000074924	ENSGT00940000160924	ENSGT00390000000707	ENSGT00390000003210	ENSGT00940000160407	ENSGT00940000154415	ENSGT00390000011620.b ##22	ENSGT00940000159496	ENSGT00940000159100	ENSGT00940000153657.B	ENSGT00940000160676	ENSGT00940000166016	ENSGT00940000162646	ENSGT00940000156469	ENSGT00940000160021	ENSGT00940000162291	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00730000111020.a	ENSGT00940000156370
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Lepidosauria	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00390000011620.b ##22
tuatara	DUPLICATION
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tuatara	MODERN SPECIES	668			ENSSPUG00000008892	ENSSPUG00000008885	ENSSPUG00000008871	PDCD2L (ENSSPUG00000008857)	ENSSPUG00000008853	ENSSPUG00000008834	WTIP (ENSSPUG00000008800)	GPI (ENSSPUG00000008783)	GARRE1 (ENSSPUG00000008759)	SS18L2 (ENSSPUG00000008743)	LSM14A (ENSSPUG00000008734)	ENSSPUG00000008725 ##22	ENSSPUG00000008717 ##22	ENSSPUG00000008705 ##22	KCTD15 (ENSSPUG00000008682)	CHST8 (ENSSPUG00000008672)	PEPD (ENSSPUG00000008654)	CEBPG (ENSSPUG00000008642)	CEBPA (ENSSPUG00000008636)
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Cryptodira	DUPLICATION
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Goode s thornscrub tortoise	MODERN SPECIES	3	ENSGEVG00005013944	RRAD (ENSGEVG00005013828)	CIAO2B (ENSGEVG00005013796)	ENSGEVG00005013731	ENSGEVG00005013150	ENSGEVG00005012420	PDCD2L (ENSGEVG00005012279)	ENSGEVG00005011513	UBA2 (ENSGEVG00005011268)	ENSGEVG00005011206	WTIP (ENSGEVG00005010949)	GPI (ENSGEVG00005010824)	GARRE1 (ENSGEVG00005010777)	SS18L2 (ENSGEVG00005010754)	LSM14A (ENSGEVG00005010715)	ENSGEVG00005010559 ##22	KCTD15 (ENSGEVG00005010441)	CHST8 (ENSGEVG00005010392)	PEPD (ENSGEVG00005010344)	CEBPG (ENSGEVG00005010316)	CEBPA (ENSGEVG00005010303)	ENSGEVG00005010278	SLC7A10 (ENSGEVG00005009940)	LRP3 (ENSGEVG00005009838)	WDR88 (ENSGEVG00005009737)	GPATCH1 (ENSGEVG00005009654)	RHPN2 (ENSGEVG00005009604)	FAAP24 (ENSGEVG00005009583)	ENSGEVG00005009542	CEP89 (ENSGEVG00005009487)	SLC7A9 (ENSGEVG00005017897)
Chinese turtle	MODERN SPECIES	1642	NAE1 (ENSPSIG00000007713)	CA7 (ENSPSIG00000011718)	PDP2 (ENSPSIG00000000169)	ENSPSIG00000011754	RRAD (ENSPSIG00000014134)	ENSPSIG00000014518	CIAO2B (ENSPSIG00000015187)	ENSPSIG00000015304	ENSPSIG00000007869	PDCD2L (ENSPSIG00000008695)	UBA2 (ENSPSIG00000009074)	WTIP (ENSPSIG00000010952)	GPI (ENSPSIG00000011429)	GARRE1 (ENSPSIG00000013491)	LSM14A (ENSPSIG00000014378)	ENSPSIG00000015334 ##22
Cryptodira	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000159836	ENSGT00940000155200.d.b	ENSGT00390000017697.b	ENSGT00940000155200.d.a.a	ENSGT00940000155200.d.a.b	ENSGT00940000158339	ENSGT00550000074924	ENSGT00940000171283	ENSGT00940000164507	ENSGT00940000160924	ENSGT00390000000707	ENSGT00390000003210	ENSGT00940000160407	ENSGT00940000154415	ENSGT00390000011620.b.i ##22	ENSGT00390000011620.b.j ##22	ENSGT00940000159496	ENSGT00940000159100	ENSGT00940000153657.B	ENSGT00940000160676	ENSGT00940000162646	ENSGT00940000156469	ENSGT00940000160021	ENSGT00940000162291	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00730000111020.a	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847
Testudinoidea	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00390000017697.b	ENSGT00940000155200.d.b.i	ENSGT00940000155200.d.a.a	ENSGT00940000155200.d.b.j	ENSGT00940000155200.d.a.b	ENSGT00940000158339	ENSGT00550000074924	ENSGT00940000171283	ENSGT00940000164507	ENSGT00940000160924	ENSGT00390000000707	ENSGT00390000003210	ENSGT00940000160407	ENSGT00940000154415	ENSGT00390000011620.b.i ##22	ENSGT00390000011620.b.j ##22	ENSGT00940000159496	ENSGT00940000159100	ENSGT00940000153657.B	ENSGT00940000160676	ENSGT00940000162646	ENSGT00940000156469	ENSGT00940000160021	ENSGT00940000162291	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00730000111020.a	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847
Emydidae	ANCESTRAL SPECIES	33	ENSGT00940000159836	ENSGT00390000017697.b	ENSGT00940000155200.d.b.i	ENSGT00940000155200.d.a.a	ENSGT00940000155200.d.b.j	ENSGT00940000155200.d.a.b	ENSGT00940000158339	ENSGT00550000074924	ENSGT00940000171283	ENSGT00940000164507	ENSGT00940000160924	ENSGT00390000000707	ENSGT00390000003210	ENSGT00940000160407	ENSGT00940000154415	ENSGT00390000011620.b.j ##22	ENSGT00940000159496	ENSGT00940000159100	ENSGT00940000153657.B	ENSGT00940000160676	ENSGT00940000162646	ENSGT00940000156469	ENSGT00940000160021	ENSGT00940000162291	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00730000111020.a	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847
painted turtle	MODERN SPECIES	4						ENSCPBG00000001583	ENSCPBG00000001574	PDCD2L (ENSCPBG00000001559)	UBA2 (ENSCPBG00000001539)	ENSCPBG00000001515	WTIP (ENSCPBG00000001496)	GPI (ENSCPBG00000001478)	GARRE1 (ENSCPBG00000001468)	SS18L2 (ENSCPBG00000001400)	LSM14A (ENSCPBG00000001387)	ENSCPBG00000001355 ##22	KCTD15 (ENSCPBG00000001320)	CHST8 (ENSCPBG00000001302)	PEPD (ENSCPBG00000001238)	CEBPG (ENSCPBG00000001227)	CEBPA (ENSCPBG00000001223)	ENSCPBG00000001219	SLC7A10 (ENSCPBG00000001106)	LRP3 (ENSCPBG00000001086)	WDR88 (ENSCPBG00000001046)	GPATCH1 (ENSCPBG00000000666)	RHPN2 (ENSCPBG00000000592)	FAAP24 (ENSCPBG00000000575)	ENSCPBG00000000531	CEP89 (ENSCPBG00000000457)	SLC7A9 (ENSCPBG00000000262)
Chinese turtle	MODERN SPECIES	348																ENSPSIG00000009441 ##22	KCTD15 (ENSPSIG00000008924)	CHST8 (ENSPSIG00000008763)	ENSPSIG00000008351	ENSPSIG00000008196	CBFB (ENSPSIG00000008065)
Archosauria	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000160687	ENSGT00940000165234	ENSGT00940000159836	ENSGT00390000017697.b	ENSGT00940000155200.d.b	ENSGT00940000155200.d.a.a	ENSGT00940000155200.d.a.b	ENSGT00940000158339	ENSGT00550000074924	ENSGT00940000171283	ENSGT00940000160924	ENSGT00390000000707	ENSGT00390000003210	ENSGT00940000160407	ENSGT00940000154415	ENSGT00390000011620.b ##22	ENSGT00940000159496	ENSGT00940000159100	ENSGT00940000153657.B	ENSGT00940000160676	ENSGT00940000162646	ENSGT00940000156469	ENSGT00940000160021	ENSGT00940000162291.f	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00730000111020.a	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847
Australian saltwater crocodile	MODERN SPECIES	35	PDP2 (ENSCPRG00005005299)	ENSCPRG00005005282	RRAD (ENSCPRG00005005256)	ENSCPRG00005005246	ENSCPRG00005005056	ENSCPRG00005005010	ENSCPRG00005004933	PDCD2L (ENSCPRG00005004926)	UBA2 (ENSCPRG00005004632)	WTIP (ENSCPRG00005004599)	GPI (ENSCPRG00005004580)	GARRE1 (ENSCPRG00005004566)	SS18L2 (ENSCPRG00005004548)	LSM14A (ENSCPRG00005004463)	ENSCPRG00005004453	ENSCPRG00005004418 ##22	KCTD15 (ENSCPRG00005004399)	CHST8 (ENSCPRG00005004397)	PEPD (ENSCPRG00005004378)	CEBPG (ENSCPRG00005004370)	SLC7A10 (ENSCPRG00005004357)	LRP3 (ENSCPRG00005004351)	WDR88 (ENSCPRG00005004346)	GPATCH1 (ENSCPRG00005004341)	RHPN2 (ENSCPRG00005004327)	FAAP24 (ENSCPRG00005004323)	ENSCPRG00005004318	ENSCPRG00005004315	ENSCPRG00005004311	CEP89 (ENSCPRG00005004305)	SLC7A9 (ENSCPRG00005004298)
Aves	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00550000074901	ENSGT00940000159757	ENSGT00940000160687	ENSGT00940000159836	ENSGT00390000017697.b	ENSGT00940000155200.d.b	ENSGT00940000155200.d.a.b	ENSGT00940000158339	ENSGT00550000074924	ENSGT00940000171283	ENSGT00940000160924	ENSGT00390000000707	ENSGT00390000003210	ENSGT00940000160407	ENSGT00940000154415	ENSGT00390000011620.b ##22	ENSGT00940000159496	ENSGT00940000159100	ENSGT00940000153657.B	ENSGT00940000160676	ENSGT00940000162646	ENSGT00940000156469	ENSGT00940000160021	ENSGT00940000162291.f	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00730000111020.a	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847
African ostrich	MODERN SPECIES	737												ENSSCUG00000012145	GPI (ENSSCUG00000012125)	GARRE1 (ENSSCUG00000012109)	LSM14A (ENSSCUG00000012107)	ENSSCUG00000012103 ##22	KCTD15 (ENSSCUG00000012101)	CHST8 (ENSSCUG00000012098)	PEPD (ENSSCUG00000012089)	CEBPG (ENSSCUG00000012082)	SLC7A10 (ENSSCUG00000012058)	LRP3 (ENSSCUG00000012050)	GPATCH1 (ENSSCUG00000012047)	RHPN2 (ENSSCUG00000012043)	FAAP24 (ENSSCUG00000012036)	ENSSCUG00000012035	CEP89 (ENSSCUG00000012031)	SLC7A9 (ENSSCUG00000011997)	TDRD12 (ENSSCUG00000011970)	ENSSCUG00000011968	RGS9BP (ENSSCUG00000011966)
Neognathae	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00550000074901	ENSGT00940000159757	ENSGT00940000160687	ENSGT00940000159836	ENSGT00390000017697.b	ENSGT00940000155200.d.b	ENSGT00940000155200.d.a.b	ENSGT00940000158339	ENSGT00550000074924	ENSGT00940000171283	ENSGT00940000160924	ENSGT00390000000707	ENSGT00390000003210	ENSGT00940000160407	ENSGT00940000154415	ENSGT00390000011620.b ##22	ENSGT00940000159496	ENSGT00940000159100	ENSGT00940000153657.B	ENSGT00940000160676	ENSGT00940000162646	ENSGT00940000156469	ENSGT00940000160021	ENSGT00940000162291.f	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00730000111020.a	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847
Galloanserae	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00390000005075	ENSGT00550000074901	ENSGT00940000159757	ENSGT00940000160687	ENSGT00940000159836	ENSGT00390000017697.b	ENSGT00940000155200.d.b	ENSGT00940000155200.d.a.b	ENSGT00940000158339	ENSGT00550000074924	ENSGT00940000160924	ENSGT00390000000707	ENSGT00390000003210	ENSGT00940000160407	ENSGT00940000154415	ENSGT00390000011620.b ##22	ENSGT00940000159496	ENSGT00940000159100	ENSGT00940000153657.B	ENSGT00940000160676	ENSGT00940000162646	ENSGT00940000156469	ENSGT00940000160021	ENSGT00940000162291.f	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858
Anatidae	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00390000005075	ENSGT00550000074901	ENSGT00940000159757	ENSGT00940000160687	ENSGT00940000159836	ENSGT00390000017697.b	ENSGT00940000155200.d.b	ENSGT00940000155200.d.a.b	ENSGT00940000158339	ENSGT00550000074924	ENSGT00940000160924	ENSGT00390000000707	ENSGT00390000003210	ENSGT00940000160407	ENSGT00940000154415	ENSGT00390000011620.b ##22	ENSGT00940000159496	ENSGT00940000159100	ENSGT00940000153657.B	ENSGT00940000160676	ENSGT00940000162646	ENSGT00940000156469	ENSGT00940000160021	ENSGT00940000162291.f	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858
Pink-footed goose	MODERN SPECIES	28	TERB1 (ENSABRG00000010307)	NAE1 (ENSABRG00000010292)	CA7 (ENSABRG00000010175)	PDP2 (ENSABRG00000010143)	RRAD (ENSABRG00000010135)	CIAO2B (ENSABRG00000010122)	ENSABRG00000010080	ENSABRG00000010045	PDCD2L (ENSABRG00000010029)	UBA2 (ENSABRG00000010006)	WTIP (ENSABRG00000009998)	GPI (ENSABRG00000009969)	GARRE1 (ENSABRG00000009931)	SS18L2 (ENSABRG00000009896)	LSM14A (ENSABRG00000009888)	ENSABRG00000009874 ##22	KCTD15 (ENSABRG00000009868)	CHST8 (ENSABRG00000009864)	PEPD (ENSABRG00000009852)	CEBPG (ENSABRG00000009845)	CEBPA (ENSABRG00000009838)	SLC7A10 (ENSABRG00000009798)	LRP3 (ENSABRG00000009781)	WDR88 (ENSABRG00000009752)	GPATCH1 (ENSABRG00000009725)	RHPN2 (ENSABRG00000009707)	FAAP24 (ENSABRG00000009705)	CEP89 (ENSABRG00000009562)	SLC7A9 (ENSABRG00000009059)	TDRD12 (ENSABRG00000008836)	ENSABRG00000008807
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Japanese quail	MODERN SPECIES	2	TERB1 (ENSCJPG00005014642)	NAE1 (ENSCJPG00005014641)	CA7 (ENSCJPG00005014640)	RRAD (ENSCJPG00005014637)	CIAO2B (ENSCJPG00005014636)	ENSCJPG00005014635	ENSCJPG00005014634	ENSCJPG00005014633	PDCD2L (ENSCJPG00005014632)	UBA2 (ENSCJPG00005014631)	WTIP (ENSCJPG00005014630)	GPI (ENSCJPG00005014628)	GARRE1 (ENSCJPG00005014627)	SS18L2 (ENSCJPG00005014626)	LSM14A (ENSCJPG00005014625)	ENSCJPG00005014624 ##22	KCTD15 (ENSCJPG00005014623)	CHST8 (ENSCJPG00005014622)	PEPD (ENSCJPG00005014621)	CEBPG (ENSCJPG00005014620)	CEBPA (ENSCJPG00005014618)	SLC7A10 (ENSCJPG00005014449)	LRP3 (ENSCJPG00005014448)	GPATCH1 (ENSCJPG00005014447)	RHPN2 (ENSCJPG00005014446)	FAAP24 (ENSCJPG00005014445)	CEP89 (ENSCJPG00005014444)	SLC7A9 (ENSCJPG00005014443)	TDRD12 (ENSCJPG00005014440)	NUDT19 (ENSCJPG00005014439)	RGS9BP (ENSCJPG00005014438)
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Chicken	MODERN SPECIES	2	DYNC1LI2 (ENSGALG00010007092)	NAE1 (ENSGALG00010007041)	CA7 (ENSGALG00010006979)	PDP2 (ENSGALG00010009761)	RRAD (ENSGALG00010009666)	FAM96B (ENSGALG00010009652)	ENSGALG00010009525	ENSGALG00010009619	ENSGALG00010010494	UBA2 (ENSGALG00010009494)	WTIP (ENSGALG00010009398)	GPI (ENSGALG00010009385)	GARRE1 (ENSGALG00010009355)	SS18L2 (ENSGALG00010009334)	LSM14A (ENSGALG00010009192)	ENSGALG00010009138 ##22	KCTD15 (ENSGALG00010009079)	CHST8 (ENSGALG00010025230)	PEPD (ENSGALG00010025200)	CEBPG (ENSGALG00010025114)	CEBPA (ENSGALG00010025039)	SLC7A10 (ENSGALG00010025010)	LRP3 (ENSGALG00010024977)	WDR88 (ENSGALG00010024895)	GPATCH1 (ENSGALG00010025949)	RHPN2 (ENSGALG00010024878)	FAAP24 (ENSGALG00010024868)	CEP89 (ENSGALG00010024852)	SLC7A9 (ENSGALG00010024831)	ENSGALG00010024827	ENSGALG00010025926
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Kakapo	MODERN SPECIES	19	TERB1 (ENSSHBG00005010733)	NAE1 (ENSSHBG00005010780)	CA7 (ENSSHBG00005010814)	PDP2 (ENSSHBG00005010851)	ENSSHBG00005010870	CIAO2B (ENSSHBG00005010884)	ENSSHBG00005010944	ENSSHBG00005011015	PDCD2L (ENSSHBG00005011043)	ENSSHBG00005011090	ENSSHBG00005011112	ENSSHBG00005011147	ENSSHBG00005011190	ENSSHBG00005011210	ENSSHBG00005011234	ENSSHBG00005011269 ##22	ENSSHBG00005011294	ENSSHBG00005011313	PEPD (ENSSHBG00005011339)	ENSSHBG00005011361	ENSSHBG00005011375	ENSSHBG00005011415	ENSSHBG00005011571	GPATCH1 (ENSSHBG00005011591)	ENSSHBG00005011625	ENSSHBG00005011638	ENSSHBG00005011660	CEP89 (ENSSHBG00005011674)	SLC7A9 (ENSSHBG00005011804)	TDRD12 (ENSSHBG00005014145)	NUDT19 (ENSSHBG00005014202)
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