Vertebrata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153498.B.b #22 Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES 155 ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 ENSGT00940000155377 ENSGT00940000156143 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00530000063929.a.b ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00390000007445 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 ENSGT00940000155377 ENSGT00940000156143 Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00390000007445 ENSGT00940000165946 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 ENSGT00940000155377 ENSGT00940000156143 Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00390000007445 ENSGT00940000165946 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 ENSGT00940000155377 ENSGT00940000156143 Amniota ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00390000007445 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 ENSGT00940000155377 ENSGT00940000156143 Mammalia ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000163170 ENSGT00390000002042 ENSGT00940000165946 ENSGT00390000007445 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 ENSGT00940000155377 ENSGT00940000156143 Theria ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000163170 ENSGT00390000002042 ENSGT00940000165946 ENSGT00390000007445 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000018829 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 ENSGT00940000155377 Eutheria ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000164734 ENSGT00390000002042 ENSGT01030000235833 ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000018829 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 ENSGT00940000155377 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000007445 ENSGT01030000235833 ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00950000186137 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000010020 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000018829 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00900000143654 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000007445 ENSGT01030000235833 ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00950000186137 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000010020 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000018829 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00900000143654 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000007445 ENSGT01030000235833 ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00950000186137 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000010020 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000018829 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00900000143654 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 Tree shrew MODERN SPECIES 5440 ENSTBEG00000005753 #21 PDSS2 (ENSTBEG00000005164) #22 BEND3 (ENSTBEG00000003684) #23 MTRES1 (ENSTBEG00000003521) #24 Glires ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000007445 ENSGT01030000235833 ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00950000186137 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000010020 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000018829 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00900000143654 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000165257 ENSGT00940000164734 ENSGT00390000002042 ENSGT00390000007445 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000010020 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 ENSGT00940000155377 Rabbit MODERN SPECIES 3 CD164 (ENSOCUG00000029127) ENSOCUG00000006035 CEP57L1 (ENSOCUG00000023847) SESN1 (ENSOCUG00000011814) ARMC2 (ENSOCUG00000011789) ENSOCUG00000010471 AFG1L (ENSOCUG00000005862) SNX3 (ENSOCUG00000005858) NR2E1 (ENSOCUG00000005853) OSTM1 (ENSOCUG00000016073) SEC63 (ENSOCUG00000016430) ENSOCUG00000035467 ENSOCUG00000013095 SOBP (ENSOCUG00000027804) ENSOCUG00000030811 PDSS2 (ENSOCUG00000011259) #22 BEND3 (ENSOCUG00000011254) #23 ENSOCUG00000030127 MTRES1 (ENSOCUG00000011248) #24 QRSL1 (ENSOCUG00000028175) CRYBG1 (ENSOCUG00000013366) ENSOCUG00000033572 RTN4IP1 (ENSOCUG00000013383) ATG5 (ENSOCUG00000013358) PRDM1 (ENSOCUG00000015495) PREP (ENSOCUG00000000188) POPDC3 (ENSOCUG00000025973) BVES (ENSOCUG00000016944) LIN28B (ENSOCUG00000017850) ENSOCUG00000037658 ENSOCUG00000036629 Pika MODERN SPECIES 2884 ENSOPRG00000000595 SOBP (ENSOPRG00000000589) PDSS2 (ENSOPRG00000000582) #22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT01030000235833 ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00940000168689 ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00950000186137 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000018829 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00900000143654 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00940000168689 ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00950000186137 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000018829 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00900000143654 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES 41 ENSGT00390000009166 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000018829 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 ENSGT00940000155377 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES 46 ENSGT00390000009166 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000018829 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 ENSGT00940000155377 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES 41 ENSGT00390000009166 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000018829 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 ENSGT00940000155377 Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 118 PPIL6 (ENSCLAG00000009714) CD164 (ENSCLAG00000009279) ENSCLAG00000009929 CEP57L1 (ENSCLAG00000010353) SESN1 (ENSCLAG00000012296) ENSCLAG00000009751 ENSCLAG00000009801 ENSCLAG00000010630 AFG1L (ENSCLAG00000012599) SNX3 (ENSCLAG00000011964) NR2E1 (ENSCLAG00000017092) OSTM1 (ENSCLAG00000014636) SEC63 (ENSCLAG00000010535) SCML4 (ENSCLAG00000009941) SOBP (ENSCLAG00000009567) PDSS2 (ENSCLAG00000011033) #22 BEND3 (ENSCLAG00000009701) #23 MTRES1 (ENSCLAG00000017356) #24 CD24 (ENSCLAG00000011622) QRSL1 (ENSCLAG00000017367) RTN4IP1 (ENSCLAG00000014920) CRYBG1 (ENSCLAG00000009357) ATG5 (ENSCLAG00000012682) PRDM1 (ENSCLAG00000011847) PREP (ENSCLAG00000014176) POPDC3 (ENSCLAG00000011005) BVES (ENSCLAG00000010963) LIN28B (ENSCLAG00000010534) HACE1 (ENSCLAG00000016992) GRIK2 (ENSCLAG00000011506) ASCC3 (ENSCLAG00000009794) Guinea pig MODERN SPECIES 63 SMPD2 (ENSCPOG00000003102) PPIL6 (ENSCPOG00000003098) CD164 (ENSCPOG00000034850) ENSCPOG00000012574 CEP57L1 (ENSCPOG00000035572) SESN1 (ENSCPOG00000013793) ARMC2 (ENSCPOG00000006505) ENSCPOG00000021906 AFG1L (ENSCPOG00000011326) SNX3 (ENSCPOG00000032088) NR2E1 (ENSCPOG00000000097) OSTM1 (ENSCPOG00000010183) SEC63 (ENSCPOG00000002486) SCML4 (ENSCPOG00000012909) SOBP (ENSCPOG00000012904) PDSS2 (ENSCPOG00000009293) #22 BEND3 (ENSCPOG00000036541) #23 MTRES1 (ENSCPOG00000003134) #24 QRSL1 (ENSCPOG00000021670) RTN4IP1 (ENSCPOG00000007055) ENSCPOG00000003512 ATG5 (ENSCPOG00000014065) PRDM1 (ENSCPOG00000014064) PREP (ENSCPOG00000012377) POPDC3 (ENSCPOG00000040175) BVES (ENSCPOG00000034314) LIN28B (ENSCPOG00000006178) HACE1 (ENSCPOG00000001068) GRIK2 (ENSCPOG00000001674) ASCC3 (ENSCPOG00000013989) SIM1 (ENSCPOG00000013987) Naked mole-rat female MODERN SPECIES ENSHGLG00000013638 ENSHGLG00000002635 ENSHGLG00000033612 ENSHGLG00000048021 ENSHGLG00000002946 AFG1L (ENSHGLG00000003193) ENSHGLG00000035411 ENSHGLG00000003277 NR2E1 (ENSHGLG00000003792) OSTM1 (ENSHGLG00000012295) ENSHGLG00000041350 SEC63 (ENSHGLG00000012594) ENSHGLG00000048253 SCML4 (ENSHGLG00000013722) SOBP (ENSHGLG00000006724) PDSS2 (ENSHGLG00000002304) #22 BEND3 (ENSHGLG00000002571) #23 ENSHGLG00000002930 #24 ENSHGLG00000045391 ENSHGLG00000003147 ENSHGLG00000034826 QRSL1 (ENSHGLG00000003294) RTN4IP1 (ENSHGLG00000005284) CRYBG1 (ENSHGLG00000002704) ATG5 (ENSHGLG00000003994) ENSHGLG00000004528 ENSHGLG00000006497 ENSHGLG00000009582 ENSHGLG00000032977 ENSHGLG00000041910 ENSHGLG00000044554 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT01030000235833 ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00940000168689 ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00950000186137 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000018829 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00900000143654 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 Marmotini ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT01030000235833 ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00940000168689 ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00950000186137 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000018829.u.a.b ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00900000143654 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00390000016836.b.d Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 86 ENSGT00940000165946 ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00940000168689 ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00950000186137 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000018829.u.a.b ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00900000143654 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00390000016836.b.d Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 70 PPIL6 (ENSUPAG00010011347) ENSUPAG00010011356 ENSUPAG00010011362 CEP57L1 (ENSUPAG00010011576) SESN1 (ENSUPAG00010011586) ARMC2 (ENSUPAG00010011607) ENSUPAG00010011642 AFG1L (ENSUPAG00010011647) SNX3 (ENSUPAG00010011668) NR2E1 (ENSUPAG00010011686) OSTM1 (ENSUPAG00010011701) SEC63 (ENSUPAG00010011708) SCML4 (ENSUPAG00010011728) ENSUPAG00010011737 SOBP (ENSUPAG00010011741) PDSS2 (ENSUPAG00010011770) #22 MTRES1 (ENSUPAG00010011795) #24 ENSUPAG00010011806 ENSUPAG00010011822 QRSL1 (ENSUPAG00010011831) RTN4IP1 (ENSUPAG00010011859) CRYBG1 (ENSUPAG00010011893) ENSUPAG00010012436 ATG5 (ENSUPAG00010012440) PRDM1 (ENSUPAG00010012448) PREP (ENSUPAG00010012470) POPDC3 (ENSUPAG00010012491) BVES (ENSUPAG00010012511) ENSUPAG00010012519 LIN28B (ENSUPAG00010012532) HACE1 (ENSUPAG00010012542) Squirrel MODERN SPECIES 164 PPIL6 (ENSSTOG00000011426) ENSSTOG00000011417 CEP57L1 (ENSSTOG00000019505) SESN1 (ENSSTOG00000011391) ENSSTOG00000000896 ENSSTOG00000032092 ENSSTOG00000021457 ENSSTOG00000022339 AFG1L (ENSSTOG00000001115) SNX3 (ENSSTOG00000007274) NR2E1 (ENSSTOG00000007248) ENSSTOG00000012195 SEC63 (ENSSTOG00000009628) SCML4 (ENSSTOG00000004682) SOBP (ENSSTOG00000025137) PDSS2 (ENSSTOG00000015790) #22 BEND3 (ENSSTOG00000026766) #23 MTRES1 (ENSSTOG00000015779) #24 ENSSTOG00000030850 QRSL1 (ENSSTOG00000009177) RTN4IP1 (ENSSTOG00000009165) CRYBG1 (ENSSTOG00000026542) ATG5 (ENSSTOG00000016507) PRDM1 (ENSSTOG00000016505) PREP (ENSSTOG00000023845) POPDC3 (ENSSTOG00000003846) BVES (ENSSTOG00000003822) LIN28B (ENSSTOG00000002692) HACE1 (ENSSTOG00000028610) ENSSTOG00000025714 Alpin marmot MODERN SPECIES 2 SMPD2 (ENSMMMG00000014360) PPIL6 (ENSMMMG00000014353) ENSMMMG00000014239 ENSMMMG00000014119 CEP57L1 (ENSMMMG00000014071) SESN1 (ENSMMMG00000014034) ARMC2 (ENSMMMG00000013988) ENSMMMG00000013982 ENSMMMG00000013964 AFG1L (ENSMMMG00000013948) ENSMMMG00000013918 NR2E1 (ENSMMMG00000013897) OSTM1 (ENSMMMG00000013885) SEC63 (ENSMMMG00000013834) SCML4 (ENSMMMG00000013821) PDSS2 (ENSMMMG00000013802) #22 BEND3 (ENSMMMG00000013770) #23 MTRES1 (ENSMMMG00000013762) #24 ENSMMMG00000013748 QRSL1 (ENSMMMG00000013712) RTN4IP1 (ENSMMMG00000013695) ENSMMMG00000013691 CRYBG1 (ENSMMMG00000012703) ATG5 (ENSMMMG00000012672) PRDM1 (ENSMMMG00000012643) PREP (ENSMMMG00000012625) POPDC3 (ENSMMMG00000012617) BVES (ENSMMMG00000012613) ENSMMMG00000012601 HACE1 (ENSMMMG00000012570) ENSMMMG00000012563 Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 16 ENSSVLG00005015947 ENSSVLG00005016041 CEP57L1 (ENSSVLG00005016399) SESN1 (ENSSVLG00005016522) ARMC2 (ENSSVLG00005016787) ENSSVLG00005006650 AFG1L (ENSSVLG00005006691) ENSSVLG00005006775 ENSSVLG00005006799 SNX3 (ENSSVLG00005006830) NR2E1 (ENSSVLG00005006886) OSTM1 (ENSSVLG00005006950) SEC63 (ENSSVLG00005006987) SCML4 (ENSSVLG00005007050) SOBP (ENSSVLG00005007145) PDSS2 (ENSSVLG00005007210) #22 BEND3 (ENSSVLG00005007266) #23 MTRES1 (ENSSVLG00005007294) #24 ENSSVLG00005007327 QRSL1 (ENSSVLG00005007356) RTN4IP1 (ENSSVLG00005007400) CRYBG1 (ENSSVLG00005007465) ENSSVLG00005007633 ATG5 (ENSSVLG00005007670) PRDM1 (ENSSVLG00005007837) PREP (ENSSVLG00005007952) POPDC3 (ENSSVLG00005007986) BVES (ENSSVLG00005008016) ENSSVLG00005008028 LIN28B (ENSSVLG00005008061) HACE1 (ENSSVLG00005008141) Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000165946 ENSGT00390000007445 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00940000168689 ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00950000186137 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000018829 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00900000143654 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 Kangaroo rat MODERN SPECIES 381 Ccdc162 (ENSDORG00000025217) Cep57l1 (ENSDORG00000016514) Sesn1 (ENSDORG00000016747) Armc2 (ENSDORG00000016746) Foxo3 (ENSDORG00000029794) Afg1l (ENSDORG00000014557) ENSDORG00000027527 Snx3 (ENSDORG00000024533) ENSDORG00000007523 Ostm1 (ENSDORG00000025626) Sec63 (ENSDORG00000002266) ENSDORG00000012141 ENSDORG00000028096 ENSDORG00000030234 ENSDORG00000023606 Pdss2 (ENSDORG00000001388) #22 Bend3 (ENSDORG00000013215) #23 Mtres1 (ENSDORG00000014894) #24 ENSDORG00000024012 Qrsl1 (ENSDORG00000007837) Rtn4ip1 (ENSDORG00000007834) ENSDORG00000015211 ENSDORG00000024871 Prdm1 (ENSDORG00000014237) Prep (ENSDORG00000001108) Popdc3 (ENSDORG00000024694) Bves (ENSDORG00000006341) ENSDORG00000009587 Hace1 (ENSDORG00000012054) Grik2 (ENSDORG00000015175) Ascc3 (ENSDORG00000008572) Myomorpha ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000165946 ENSGT00390000007445 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00940000168689 ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00950000186137 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000018829 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00900000143654 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 78 Cd164 (ENSJJAG00000016224) Ccdc162 (ENSJJAG00000016412) ENSJJAG00000022720 Sesn1 (ENSJJAG00000017360) ENSJJAG00000010323 ENSJJAG00000013525 Foxo3 (ENSJJAG00000002701) Afg1l (ENSJJAG00000009959) Snx3 (ENSJJAG00000021440) Nr2e1 (ENSJJAG00000022055) ENSJJAG00000018243 Sec63 (ENSJJAG00000015157) Scml4 (ENSJJAG00000010133) Sobp (ENSJJAG00000013825) ENSJJAG00000013046 Pdss2 (ENSJJAG00000018660) #22 Bend3 (ENSJJAG00000015264) #23 Mtres1 (ENSJJAG00000023519) #24 Qrsl1 (ENSJJAG00000012030) Rtn4ip1 (ENSJJAG00000016075) ENSJJAG00000017114 Atg5 (ENSJJAG00000015537) Prdm1 (ENSJJAG00000023075) Prep (ENSJJAG00000020209) Popdc3 (ENSJJAG00000014670) Bves (ENSJJAG00000012371) Lin28b (ENSJJAG00000011024) Hace1 (ENSJJAG00000013574) ENSJJAG00000000658 ENSJJAG00000023039 Grik2 (ENSJJAG00000019973) Muroidea ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000165946 ENSGT00390000007445 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00940000168689 ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00950000186137 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000018829 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00900000143654 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000165946 ENSGT00390000007445 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00950000186137 ENSGT00940000154164.c ENSGT01100000264286 ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000018829 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00900000143654 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT01100000264286 ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000018829 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 ENSGT00940000155377 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT01100000264286 ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000018829 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 ENSGT00940000155377 Prairie vole MODERN SPECIES 358 Ppil6 (ENSMOCG00000007659) Cd164 (ENSMOCG00000013486) Ccdc162 (ENSMOCG00000020202) Cep57l1 (ENSMOCG00000006001) Sesn1 (ENSMOCG00000014884) Armc2 (ENSMOCG00000008778) Foxo3 (ENSMOCG00000013546) Afg1l (ENSMOCG00000022771) Snx3 (ENSMOCG00000020843) Nr2e1 (ENSMOCG00000003990) Ostm1 (ENSMOCG00000021275) Sec63 (ENSMOCG00000012910) Scml4 (ENSMOCG00000004057) Sobp (ENSMOCG00000019494) ENSMOCG00000020152 Pdss2 (ENSMOCG00000002520) #22 Bend3 (ENSMOCG00000007344) #23 Mtres1 (ENSMOCG00000016820) #24 ENSMOCG00000019641 Cd24a (ENSMOCG00000004145) Qrsl1 (ENSMOCG00000015511) Rtn4ip1 (ENSMOCG00000022655) Crybg1 (ENSMOCG00000017311) ENSMOCG00000019458 ENSMOCG00000021295 ENSMOCG00000012673 Rsph4a (ENSMOCG00000015792) Zup1 (ENSMOCG00000007844) ENSMOCG00000016429 Fam162b (ENSMOCG00000016808) Gprc6a (ENSMOCG00000001619) Northern American deer mouse MODERN SPECIES 7 Smpd2 (ENSPEMG00000018109) Ppil6 (ENSPEMG00000005372) ENSPEMG00000025622 ENSPEMG00000010187 Cep57l1 (ENSPEMG00000011459) Sesn1 (ENSPEMG00000012311) Armc2 (ENSPEMG00000011502) Foxo3 (ENSPEMG00000017580) Afg1l (ENSPEMG00000016981) ENSPEMG00000001898 Nr2e1 (ENSPEMG00000014789) Ostm1 (ENSPEMG00000001749) Sec63 (ENSPEMG00000018907) Scml4 (ENSPEMG00000017707) Sobp (ENSPEMG00000026852) Pdss2 (ENSPEMG00000010336) #22 Bend3 (ENSPEMG00000031300) #23 Mtres1 (ENSPEMG00000019114) #24 ENSPEMG00000029014 ENSPEMG00000009329 Qrsl1 (ENSPEMG00000009855) Rtn4ip1 (ENSPEMG00000009749) Crybg1 (ENSPEMG00000006428) Atg5 (ENSPEMG00000023746) Prdm1 (ENSPEMG00000023622) Prep (ENSPEMG00000015306) Popdc3 (ENSPEMG00000012534) Bves (ENSPEMG00000014540) Lin28b (ENSPEMG00000015724) Hace1 (ENSPEMG00000006907) ENSPEMG00000025768 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000009166 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000018829 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00900000143654 Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 160 Ppil6 (ENSCGRG00001020658) Cd164 (ENSCGRG00001020972) ENSCGRG00001022426 Cep57l1 (ENSCGRG00001000573) Sesn1 (ENSCGRG00001004292) Armc2 (ENSCGRG00001011760) Foxo3 (ENSCGRG00001017319) ENSCGRG00001018045 Afg1l (ENSCGRG00001021263) ENSCGRG00001021917 Nr2e1 (ENSCGRG00001022746) Ostm1 (ENSCGRG00001023136) Sec63 (ENSCGRG00001023456) Scml4 (ENSCGRG00001000202) Sobp (ENSCGRG00001000885) Pdss2 (ENSCGRG00001005143) #22 ENSCGRG00001006245 Bend3 (ENSCGRG00001006904) #23 Mtres1 (ENSCGRG00001007384) #24 ENSCGRG00001008340 QRSL1 (ENSCGRG00001008633) Rtn4ip1 (ENSCGRG00001010026) Crybg1 (ENSCGRG00001010879) ENSCGRG00001015093 Golden Hamster MODERN SPECIES 655 Ppil6 (ENSMAUG00000002966) Cd164 (ENSMAUG00000021208) ENSMAUG00000019439 ENSMAUG00000014530 Cep57l1 (ENSMAUG00000014039) Sesn1 (ENSMAUG00000018424) Armc2 (ENSMAUG00000012693) Foxo3 (ENSMAUG00000013798) Afg1l (ENSMAUG00000009033) Snx3 (ENSMAUG00000006058) Nr2e1 (ENSMAUG00000013609) Ostm1 (ENSMAUG00000022061) Sec63 (ENSMAUG00000021173) Scml4 (ENSMAUG00000016828) Sobp (ENSMAUG00000003509) Pdss2 (ENSMAUG00000006752) #22 Bend3 (ENSMAUG00000021184) #23 Mtres1 (ENSMAUG00000015280) #24 ENSMAUG00000020710 Qrsl1 (ENSMAUG00000016387) Rtn4ip1 (ENSMAUG00000001630) Crybg1 (ENSMAUG00000017911) Murinae ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00940000165946 ENSGT00390000007445 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00950000186137 ENSGT00940000154164.c ENSGT01100000264286 ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000018829 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00900000143654 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 Mus ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000163170 ENSGT00940000165946 ENSGT00390000007445 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT01100000264286 ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000018829 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 ENSGT00940000155377 Mus_A ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000163170 ENSGT00940000165946 ENSGT00390000007445 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT01100000264286 ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000018829 ENSGT00900000143316 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 Mus_B ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000163170 ENSGT00940000165946 ENSGT00390000007445 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT01100000264286 ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000018829.o ENSGT00900000143316 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 Mouse MODERN SPECIES 1 Smpd2 (ENSMUSG00000019822) Ppil6 (ENSMUSG00000078451) Cd164 (ENSMUSG00000019818) Ccdc162 (ENSMUSG00000075225) Cep57l1 (ENSMUSG00000019813) Sesn1 (ENSMUSG00000038332) Armc2 (ENSMUSG00000071324) Foxo3 (ENSMUSG00000048756) Afg1l (ENSMUSG00000038302) Snx3 (ENSMUSG00000019804) Nr2e1 (ENSMUSG00000019803) Ostm1 (ENSMUSG00000038280) Sec63 (ENSMUSG00000019802) Scml4 (ENSMUSG00000044770) Sobp (ENSMUSG00000038248) Pdss2 (ENSMUSG00000038240) #22 Bend3 (ENSMUSG00000038214) #23 Pam16l (ENSMUSG00000045886) Mtres1 (ENSMUSG00000019797) #24 Cd24a (ENSMUSG00000047139) Qrsl1 (ENSMUSG00000019863) Rtn4ip1 (ENSMUSG00000019864) Crybg1 (ENSMUSG00000019866) Atg5 (ENSMUSG00000038160) Prdm1 (ENSMUSG00000038151) Prep (ENSMUSG00000019849) Popdc3 (ENSMUSG00000019848) Bves (ENSMUSG00000071317) Lin28b (ENSMUSG00000063804) Hace1 (ENSMUSG00000038822) Grik2 (ENSMUSG00000056073) Mus_C ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000163170 ENSGT00940000165946 ENSGT00390000007445 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT01100000264286 ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000018829.o ENSGT00900000143316 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 Steppe mouse MODERN SPECIES 3355 Ppil6 (ENSMSIG00000030455) Cd164 (ENSMSIG00000030453) Ccdc162 (ENSMSIG00000030406) Cep57l1 (ENSMSIG00000030394) Sesn1 (ENSMSIG00000030386) Armc2 (ENSMSIG00000030380) Foxo3 (ENSMSIG00000030372) Afg1l (ENSMSIG00000030363) ENSMSIG00000030359 Nr2e1 (ENSMSIG00000030352) Ostm1 (ENSMSIG00000030347) Sec63 (ENSMSIG00000030343) Scml4 (ENSMSIG00000030317) Sobp (ENSMSIG00000030314) ENSMSIG00000030312 Pdss2 (ENSMSIG00000030310) #22 Bend3 (ENSMSIG00000030306) #23 Mtres1 (ENSMSIG00000030303) #24 ENSMSIG00000030302 ENSMSIG00000030301 Qrsl1 (ENSMSIG00000030298) Rtn4ip1 (ENSMSIG00000030296) Crybg1 (ENSMSIG00000030293) ENSMSIG00000030292 Atg5 (ENSMSIG00000030288) Prdm1 (ENSMSIG00000030278) ENSMSIG00000030269 Popdc3 (ENSMSIG00000030266) Bves (ENSMSIG00000030263) Lin28b (ENSMSIG00000030258) Hace1 (ENSMSIG00000030256) spretus MODERN SPECIES 1 MGP_SPRETEiJ_G0016080 MGP_SPRETEiJ_G0016081 MGP_SPRETEiJ_G0016082 Cep57l1 (MGP_SPRETEiJ_G0016083) Sesn1 (MGP_SPRETEiJ_G0016084) Armc2 (MGP_SPRETEiJ_G0016085) Foxo3 (MGP_SPRETEiJ_G0016086) Afg1l (MGP_SPRETEiJ_G0016087) Snx3 (MGP_SPRETEiJ_G0016088) Nr2e1 (MGP_SPRETEiJ_G0016089) Ostm1 (MGP_SPRETEiJ_G0016090) Sec63 (MGP_SPRETEiJ_G0016091) Scml4 (MGP_SPRETEiJ_G0016092) Sobp (MGP_SPRETEiJ_G0016093) MGP_SPRETEiJ_G0016094 Pdss2 (MGP_SPRETEiJ_G0016095) #22 Bend3 (MGP_SPRETEiJ_G0016096) #23 Mtres1 (MGP_SPRETEiJ_G0016097) #24 MGP_SPRETEiJ_G0016098 MGP_SPRETEiJ_G0016099 Qrsl1 (MGP_SPRETEiJ_G0016100) Rtn4ip1 (MGP_SPRETEiJ_G0016101) Crybg1 (MGP_SPRETEiJ_G0016102) Atg5 (MGP_SPRETEiJ_G0016103) Prdm1 (MGP_SPRETEiJ_G0016104) Prep (MGP_SPRETEiJ_G0016105) Popdc3 (MGP_SPRETEiJ_G0016106) Bves (MGP_SPRETEiJ_G0016107) Lin28b (MGP_SPRETEiJ_G0016108) Hace1 (MGP_SPRETEiJ_G0016109) Grik2 (MGP_SPRETEiJ_G0016110) Ryukyu mouse MODERN SPECIES 1 MGP_CAROLIEiJ_G0015271 MGP_CAROLIEiJ_G0015272 MGP_CAROLIEiJ_G0015273 Cep57l1 (MGP_CAROLIEiJ_G0015274) Sesn1 (MGP_CAROLIEiJ_G0015275) Armc2 (MGP_CAROLIEiJ_G0015276) Foxo3 (MGP_CAROLIEiJ_G0015277) Afg1l (MGP_CAROLIEiJ_G0015278) Snx3 (MGP_CAROLIEiJ_G0015279) Nr2e1 (MGP_CAROLIEiJ_G0015280) Ostm1 (MGP_CAROLIEiJ_G0015281) Sec63 (MGP_CAROLIEiJ_G0015282) Scml4 (MGP_CAROLIEiJ_G0015283) Sobp (MGP_CAROLIEiJ_G0015284) MGP_CAROLIEiJ_G0015285 Pdss2 (MGP_CAROLIEiJ_G0015286) #22 Bend3 (MGP_CAROLIEiJ_G0015287) #23 Mtres1 (MGP_CAROLIEiJ_G0015288) #24 MGP_CAROLIEiJ_G0015289 MGP_CAROLIEiJ_G0015290 Qrsl1 (MGP_CAROLIEiJ_G0015291) Rtn4ip1 (MGP_CAROLIEiJ_G0015292) Crybg1 (MGP_CAROLIEiJ_G0015293) Atg5 (MGP_CAROLIEiJ_G0015294) Prdm1 (MGP_CAROLIEiJ_G0015295) Prep (MGP_CAROLIEiJ_G0015296) Popdc3 (MGP_CAROLIEiJ_G0015297) Bves (MGP_CAROLIEiJ_G0015298) Lin28b (MGP_CAROLIEiJ_G0015299) Hace1 (MGP_CAROLIEiJ_G0015300) Grik2 (MGP_CAROLIEiJ_G0015301) Shrew mouse MODERN SPECIES 22 MGP_PahariEiJ_G0030689 MGP_PahariEiJ_G0030690 MGP_PahariEiJ_G0030691 Cep57l1 (MGP_PahariEiJ_G0030692) Sesn1 (MGP_PahariEiJ_G0030693) Armc2 (MGP_PahariEiJ_G0030694) Foxo3 (MGP_PahariEiJ_G0030695) Afg1l (MGP_PahariEiJ_G0030696) Snx3 (MGP_PahariEiJ_G0030697) Nr2e1 (MGP_PahariEiJ_G0030698) Ostm1 (MGP_PahariEiJ_G0030699) Sec63 (MGP_PahariEiJ_G0030700) Scml4 (MGP_PahariEiJ_G0030701) Sobp (MGP_PahariEiJ_G0030702) MGP_PahariEiJ_G0030703 Pdss2 (MGP_PahariEiJ_G0030704) #22 Bend3 (MGP_PahariEiJ_G0030705) #23 Mtres1 (MGP_PahariEiJ_G0030706) #24 MGP_PahariEiJ_G0030707 Qrsl1 (MGP_PahariEiJ_G0030708) Rtn4ip1 (MGP_PahariEiJ_G0030709) Crybg1 (MGP_PahariEiJ_G0030710) Atg5 (MGP_PahariEiJ_G0030711) Prdm1 (MGP_PahariEiJ_G0030712) Prep (MGP_PahariEiJ_G0030713) Popdc3 (MGP_PahariEiJ_G0030714) Bves (MGP_PahariEiJ_G0030715) Lin28b (MGP_PahariEiJ_G0030716) Hace1 (MGP_PahariEiJ_G0030717) Grik2 (MGP_PahariEiJ_G0030718) Ascc3 (MGP_PahariEiJ_G0030719) Rat MODERN SPECIES 12 Cep57l1 (ENSRNOG00000000303) Sesn1 (ENSRNOG00000000302) LOC499469 (ENSRNOG00000049990) Armc2 (ENSRNOG00000026217) Foxo3 (ENSRNOG00000000299) Afg1l (ENSRNOG00000043033) Snx3 (ENSRNOG00000046705) Nr2e1 (ENSRNOG00000050550) Ostm1 (ENSRNOG00000037647) ENSRNOG00000062845 Sec63 (ENSRNOG00000000314) Scml4 (ENSRNOG00000026110) ENSRNOG00000069773 Sobp (ENSRNOG00000000316) LOC688390 (ENSRNOG00000026080) Pdss2 (ENSRNOG00000042962) #22 Rpl37a-ps5 (ENSRNOG00000032964) Bend3 (ENSRNOG00000046505) #23 Mtres1 (ENSRNOG00000047118) #24 AABR07045462.1 (ENSRNOG00000000320) Cd24 (ENSRNOG00000000321) Qrsl1 (ENSRNOG00000026049) Rtn4ip1 (ENSRNOG00000000279) Crybg1 (ENSRNOG00000025998) AABR07045487.1 (ENSRNOG00000037628) Atg5 (ENSRNOG00000000322) Prdm1 (ENSRNOG00000000323) Prep (ENSRNOG00000051061) Popdc3 (ENSRNOG00000047102) Bves (ENSRNOG00000043199) Lin28b (ENSRNOG00000025938) Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 1522 Afg1l (ENSNGAG00000004401) Snx3 (ENSNGAG00000023818) Nr2e1 (ENSNGAG00000021311) Ostm1 (ENSNGAG00000024096) ENSNGAG00000022978 Scml4 (ENSNGAG00000021906) Sobp (ENSNGAG00000001438) Pdss2 (ENSNGAG00000022824) #22 Bend3 (ENSNGAG00000021369) #23 Mtres1 (ENSNGAG00000015067) #24 ENSNGAG00000022212 ENSNGAG00000022687 Qrsl1 (ENSNGAG00000023213) Rtn4ip1 (ENSNGAG00000022333) Crybg1 (ENSNGAG00000010488) Atg5 (ENSNGAG00000017886) Prdm1 (ENSNGAG00000022787) Prep (ENSNGAG00000024271) Popdc3 (ENSNGAG00000024046) Bves (ENSNGAG00000024027) Lin28b (ENSNGAG00000022808) Hace1 (ENSNGAG00000017799) Primates ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00390000002042 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000018829 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00900000143654 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000009166 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000018829.z ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00950000186448 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 Tarsier MODERN SPECIES 7120 SCML4 (ENSTSYG00000008656) ENSTSYG00000034950 PDSS2 (ENSTSYG00000004161) #22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00910000147202 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366.c.a #24 ENSGT00390000018829.z ENSGT00550000074866.i ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00950000186448 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00910000147202 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366.d #24 ENSGT00390000018829.z ENSGT00550000074866.i ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b.a ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 ENSGT00940000155377 Cebidae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00910000147202 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366.d #24 ENSGT00390000018829.y.a.a ENSGT00550000074866.i ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b.a ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 ENSGT00940000155377 Marmoset MODERN SPECIES 16 CEP57L1 (ENSCJAG00000005825) SESN1 (ENSCJAG00000005880) ARMC2 (ENSCJAG00000005915) ENSCJAG00000005929 AFG1L (ENSCJAG00000045868) SNX3 (ENSCJAG00000005955) NR2E1 (ENSCJAG00000005966) ENSCJAG00000059326 ENSCJAG00000070984 OSTM1 (ENSCJAG00000040617) SEC63 (ENSCJAG00000005998) SCML4 (ENSCJAG00000006102) SOBP (ENSCJAG00000006119) ENSCJAG00000084385 ENSCJAG00000076519 PDSS2 (ENSCJAG00000006153) #22 ENSCJAG00000080202 BEND3 (ENSCJAG00000039628) #23 MTRES1 (ENSCJAG00000046921) #24 ENSCJAG00000073856 ENSCJAG00000058620 QRSL1 (ENSCJAG00000006200) RTN4IP1 (ENSCJAG00000006218) ENSCJAG00000079990 CRYBG1 (ENSCJAG00000006246) ENSCJAG00000074624 PRDM1 (ENSCJAG00000006332) ENSCJAG00000079207 ATG5 (ENSCJAG00000006306) ENSCJAG00000085831 ENSCJAG00000074740 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES 88 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b.e.a ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00910000147202 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366.d #24 ENSGT00390000018829.y.a.a ENSGT00550000074866.i ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b.a ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 121 SESN1 (ENSSBOG00000034887) ARMC2 (ENSSBOG00000034359) ENSSBOG00000025905 ENSSBOG00000026053 AFG1L (ENSSBOG00000032088) SNX3 (ENSSBOG00000028606) NR2E1 (ENSSBOG00000027068) ENSSBOG00000019719 OSTM1 (ENSSBOG00000018033) ENSSBOG00000035021 SEC63 (ENSSBOG00000020518) ENSSBOG00000022627 SCML4 (ENSSBOG00000023263) ENSSBOG00000012379 SOBP (ENSSBOG00000031278) PDSS2 (ENSSBOG00000021644) #22 ENSSBOG00000029782 #23 MTRES1 (ENSSBOG00000020668) #24 ENSSBOG00000034823 ENSSBOG00000032630 QRSL1 (ENSSBOG00000022441) RTN4IP1 (ENSSBOG00000027877) CRYBG1 (ENSSBOG00000033025) ATG5 (ENSSBOG00000031707) PRDM1 (ENSSBOG00000023139) ENSSBOG00000024567 POPDC3 (ENSSBOG00000025829) BVES (ENSSBOG00000024089) LIN28B (ENSSBOG00000025323) HACE1 (ENSSBOG00000024126) NTNG2 (ENSSBOG00000030323) Capuchin MODERN SPECIES 160 FOXO3 (ENSCCAG00000030927) AFG1L (ENSCCAG00000022433) ENSCCAG00000033758 ENSCCAG00000022069 NR2E1 (ENSCCAG00000034016) OSTM1 (ENSCCAG00000025943) SEC63 (ENSCCAG00000024413) SCML4 (ENSCCAG00000033652) SOBP (ENSCCAG00000036289) PDSS2 (ENSCCAG00000036171) #22 BEND3 (ENSCCAG00000032949) #23 CD24 (ENSCCAG00000034871) QRSL1 (ENSCCAG00000021243) RTN4IP1 (ENSCCAG00000015806) CRYBG1 (ENSCCAG00000022546) ATG5 (ENSCCAG00000022296) PRDM1 (ENSCCAG00000031062) PREP (ENSCCAG00000033502) POPDC3 (ENSCCAG00000036176) BVES (ENSCCAG00000027637) LIN28B (ENSCCAG00000020904) HACE1 (ENSCCAG00000028892) Mas night monkey MODERN SPECIES 478 ENSANAG00000036298 CEP57L1 (ENSANAG00000031702) SESN1 (ENSANAG00000026899) ARMC2 (ENSANAG00000027283) ENSANAG00000023931 AFG1L (ENSANAG00000033061) SNX3 (ENSANAG00000028701) ENSANAG00000030536 NR2E1 (ENSANAG00000020325) ENSANAG00000037950 ENSANAG00000019987 SEC63 (ENSANAG00000022108) SCML4 (ENSANAG00000021645) ENSANAG00000025986 SOBP (ENSANAG00000034007) PDSS2 (ENSANAG00000015555) #22 BEND3 (ENSANAG00000021126) #23 ENSANAG00000037315 #24 ENSANAG00000036990 ENSANAG00000037838 ENSANAG00000003965 RTN4IP1 (ENSANAG00000037479) CRYBG1 (ENSANAG00000023839) ENSANAG00000027713 ATG5 (ENSANAG00000022796) PRDM1 (ENSANAG00000030675) ENSANAG00000024327 ENSANAG00000015673 POPDC3 (ENSANAG00000026735) BVES (ENSANAG00000015115) ENSANAG00000036677 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00910000147202 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366.c.a #24 ENSGT00390000018829.z ENSGT00550000074866.i ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00950000186448 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b.a.a ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00910000147202 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366.c.a #24 ENSGT00390000018829.y.b ENSGT00550000074866.i ENSGT00880000138028.b.b.a ENSGT00940000155695 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 ENSGT00940000155377 Hominidae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000009166 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b.a.a ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366.c.a #24 ENSGT00390000018829.y.b ENSGT00550000074866.i ENSGT00880000138028.b.b.a ENSGT00940000155695 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 ENSGT00940000155377 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00530000063695.b.a.a ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00510000046986.n.a.a.b ENSGT00390000000663 ENSGT00390000005306.v ENSGT00950000182895.a.a.a.a.b.k ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000017606.a.a.i.a.b.a.b.a.a.b ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366.c.a #24 ENSGT00390000018829.y.b ENSGT00550000074866.i ENSGT00880000138028.b.b.a ENSGT00940000155695 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 ENSGT00940000155377 Gorilla MODERN SPECIES 19 SESN1 (ENSGGOG00000008196) ENSGGOG00000024963 ARMC2 (ENSGGOG00000008179) ENSGGOG00000043953 ENSGGOG00000040628 ENSGGOG00000003517 AFG1L (ENSGGOG00000004244) SNX3 (ENSGGOG00000043438) NR2E1 (ENSGGOG00000038410) ENSGGOG00000041051 OSTM1 (ENSGGOG00000009031) ENSGGOG00000026319 SEC63 (ENSGGOG00000002560) SCML4 (ENSGGOG00000006782) SOBP (ENSGGOG00000015284) PDSS2 (ENSGGOG00000040827) #22 BEND3 (ENSGGOG00000005456) #23 MTRES1 (ENSGGOG00000006113) #24 QRSL1 (ENSGGOG00000008261) RTN4IP1 (ENSGGOG00000008254) CRYBG1 (ENSGGOG00000016733) PRDM1 (ENSGGOG00000001929) ATG5 (ENSGGOG00000016633) PREP (ENSGGOG00000017196) POPDC3 (ENSGGOG00000017179) BVES (ENSGGOG00000026505) LIN28B (ENSGGOG00000015437) HACE1 (ENSGGOG00000008591) ENSGGOG00000043856 GRIK2 (ENSGGOG00000000114) ASCC3 (ENSGGOG00000002790) Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00530000063695.b.a.a ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00510000046986.n.a.a.b ENSGT00390000000663 ENSGT00390000005306.v ENSGT00950000182895.a.a.a.a.b.k ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000017606.a.a.i.a.b.a.b.a.a.b ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366.c.a #24 ENSGT00390000018829.y.b ENSGT00550000074866.i ENSGT00880000138028.b.b.a ENSGT00940000155695 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 ENSGT00940000155377 Pan ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00530000063695.b.a.a ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00510000046986.n.a.a.b ENSGT00390000000663 ENSGT00390000005306.v ENSGT00950000182895.a.a.a.a.b.k ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000017606.a.a.i.a.b.a.b.a.a.b ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366.c.a #24 ENSGT00940000167536 ENSGT00550000074866.i ENSGT00880000138028.b.b.a ENSGT00940000155695 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 ENSGT00940000155377 Chimpanzee MODERN SPECIES 19 CEP57L1 (ENSPTRG00000018480) SESN1 (ENSPTRG00000018479) ENSPTRG00000045969 ARMC2 (ENSPTRG00000018477) ENSPTRG00000052234 ENSPTRG00000045358 FOXO3 (ENSPTRG00000018476) AFG1L (ENSPTRG00000018474) SNX3 (ENSPTRG00000018473) NR2E1 (ENSPTRG00000018472) OSTM1 (ENSPTRG00000018471) ENSPTRG00000049504 SEC63 (ENSPTRG00000018470) SCML4 (ENSPTRG00000018469) SOBP (ENSPTRG00000018467) PDSS2 (ENSPTRG00000018466) #22 BEND3 (ENSPTRG00000018465) #23 MTRES1 (ENSPTRG00000018464) #24 ENSPTRG00000042685 QRSL1 (ENSPTRG00000018462) RTN4IP1 (ENSPTRG00000018461) CRYBG1 (ENSPTRG00000018459) PRDM1 (ENSPTRG00000018457) ATG5 (ENSPTRG00000018458) PREP (ENSPTRG00000018456) POPDC3 (ENSPTRG00000018455) BVES (ENSPTRG00000018454) LIN28B (ENSPTRG00000018453) HACE1 (ENSPTRG00000018451) GRIK2 (ENSPTRG00000018449) ENSPTRG00000047929 Bonobo MODERN SPECIES 19 CEP57L1 (ENSPPAG00000042916) SESN1 (ENSPPAG00000041767) ENSPPAG00000011766 ARMC2 (ENSPPAG00000029392) ENSPPAG00000031267 ENSPPAG00000037969 ENSPPAG00000000536 AFG1L (ENSPPAG00000019727) SNX3 (ENSPPAG00000032382) NR2E1 (ENSPPAG00000038954) OSTM1 (ENSPPAG00000043416) ENSPPAG00000033502 SEC63 (ENSPPAG00000011744) SCML4 (ENSPPAG00000020145) SOBP (ENSPPAG00000037988) PDSS2 (ENSPPAG00000035956) #22 BEND3 (ENSPPAG00000039227) #23 MTRES1 (ENSPPAG00000032445) #24 ENSPPAG00000028244 QRSL1 (ENSPPAG00000030790) RTN4IP1 (ENSPPAG00000031639) CRYBG1 (ENSPPAG00000030684) ATG5 (ENSPPAG00000040499) PRDM1 (ENSPPAG00000025287) PREP (ENSPPAG00000014953) POPDC3 (ENSPPAG00000031101) BVES (ENSPPAG00000036836) LIN28B (ENSPPAG00000038725) HACE1 (ENSPPAG00000043105) GRIK2 (ENSPPAG00000037072) ASCC3 (ENSPPAG00000030772) Human MODERN SPECIES 18 MICAL1 (ENSG00000135596) SMPD2 (ENSG00000135587) PPIL6 (ENSG00000185250) CD164 (ENSG00000135535) CEP57L1 (ENSG00000183137) SESN1 (ENSG00000080546) ARMC2 (ENSG00000118690) FOXO3 (ENSG00000118689) AFG1L (ENSG00000135537) SNX3 (ENSG00000112335) NR2E1 (ENSG00000112333) OSTM1 (ENSG00000081087) SEC63 (ENSG00000025796) SCML4 (ENSG00000146285) SOBP (ENSG00000112320) PDSS2 (ENSG00000164494) #22 BEND3 (ENSG00000178409) #23 MTRES1 (ENSG00000130349) #24 CD24 (ENSG00000272398) QRSL1 (ENSG00000130348) RTN4IP1 (ENSG00000130347) CRYBG1 (ENSG00000112297) ATG5 (ENSG00000057663) PRDM1 (ENSG00000057657) PREP (ENSG00000085377) POPDC3 (ENSG00000132429) BVES (ENSG00000112276) LIN28B (ENSG00000187772) HACE1 (ENSG00000085382) GRIK2 (ENSG00000164418) ASCC3 (ENSG00000112249) Orangutan MODERN SPECIES 19 ENSPPYG00000016907 CD164 (ENSPPYG00000016906) CEP57L1 (ENSPPYG00000016901) SESN1 (ENSPPYG00000016900) ARMC2 (ENSPPYG00000016899) ENSPPYG00000016897 ENSPPYG00000016896 AFG1L (ENSPPYG00000016895) SNX3 (ENSPPYG00000016894) NR2E1 (ENSPPYG00000016893) OSTM1 (ENSPPYG00000016892) ENSPPYG00000031910 SEC63 (ENSPPYG00000016891) SCML4 (ENSPPYG00000016890) SOBP (ENSPPYG00000016889) PDSS2 (ENSPPYG00000016887) #22 BEND3 (ENSPPYG00000016886) #23 MTRES1 (ENSPPYG00000016885) #24 CD24 (ENSPPYG00000016884) ENSPPYG00000016334 QRSL1 (ENSPPYG00000016883) RTN4IP1 (ENSPPYG00000016882) CRYBG1 (ENSPPYG00000016881) PRDM1 (ENSPPYG00000016879) ATG5 (ENSPPYG00000016880) PREP (ENSPPYG00000029726) POPDC3 (ENSPPYG00000016878) BVES (ENSPPYG00000016876) LIN28B (ENSPPYG00000031457) HACE1 (ENSPPYG00000016873) GRIK2 (ENSPPYG00000016870) Gibbon MODERN SPECIES 18 PPIL6 (ENSNLEG00000012561) CD164 (ENSNLEG00000012527) ENSNLEG00000012520 CEP57L1 (ENSNLEG00000012502) SESN1 (ENSNLEG00000012476) ARMC2 (ENSNLEG00000012451) ENSNLEG00000012446 AFG1L (ENSNLEG00000013680) SNX3 (ENSNLEG00000033323) NR2E1 (ENSNLEG00000013646) OSTM1 (ENSNLEG00000013621) SEC63 (ENSNLEG00000013526) SCML4 (ENSNLEG00000013516) ENSNLEG00000027102 SOBP (ENSNLEG00000013498) PDSS2 (ENSNLEG00000013484) #22 BEND3 (ENSNLEG00000013464) #23 MTRES1 (ENSNLEG00000013450) #24 QRSL1 (ENSNLEG00000013383) RTN4IP1 (ENSNLEG00000013349) CRYBG1 (ENSNLEG00000013318) PRDM1 (ENSNLEG00000013211) ATG5 (ENSNLEG00000013268) PREP (ENSNLEG00000014171) POPDC3 (ENSNLEG00000014163) BVES (ENSNLEG00000014155) LIN28B (ENSNLEG00000014146) HACE1 (ENSNLEG00000014061) GRIK2 (ENSNLEG00000013983) ENSNLEG00000013981 ASCC3 (ENSNLEG00000013890) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00390000005306.v ENSGT00950000182895.a.a.a.a.b.k ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00910000147202 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366.c.a #24 ENSGT00390000018829.z ENSGT00550000074866.i ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00950000186448 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00390000005306.v ENSGT00950000182895.a.a.a.a.b.k ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366.c.a.a #24 ENSGT00390000018829.z ENSGT00550000074866.i ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00950000186448 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000003560 ENSGT00390000004028 ENSGT00390000013264.d.e.b ENSGT00940000155913 ENSGT00910000147301 ENSGT00390000007183 ENSGT00940000155616.c.a.f ENSGT00940000154531.y.a ENSGT00940000160610 ENSGT01090000260082.d.b ENSGT00390000001376.ab.b.a.a.b ENSGT00390000015164.l ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366.c.a.a #24 ENSGT00390000018829.z ENSGT00550000074866.i ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00950000186448 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00550000074968.b ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 Macaca ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000160715 ENSGT00390000003560 ENSGT00390000004028 ENSGT00390000013264.d.e.b ENSGT00940000155913 ENSGT00910000147301 ENSGT00390000007183 ENSGT00940000154531.y.a ENSGT00940000160610 ENSGT01090000260082.d.b ENSGT00390000001376.ab.b.a.a.b.a ENSGT00390000015164.l ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366.c.a.a #24 ENSGT00390000018829.z ENSGT00550000074866.i ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00950000186448 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00550000074968.b ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 553 SYNJ2 (ENSMNEG00000017211) SERAC1 (ENSMNEG00000041761) GTF2H5 (ENSMNEG00000036678) ENSMNEG00000038872 TULP4 (ENSMNEG00000036789) ENSMNEG00000038298 TMEM181 (ENSMNEG00000028961) DYNLT1 (ENSMNEG00000036826) SYTL3 (ENSMNEG00000043100) EZR (ENSMNEG00000039070) ENSMNEG00000028772 ENSMNEG00000035124 SEC63 (ENSMNEG00000037461) SCML4 (ENSMNEG00000036341) SOBP (ENSMNEG00000037530) PDSS2 (ENSMNEG00000027986) #22 BEND3 (ENSMNEG00000036299) #23 ENSMNEG00000028746 #24 ENSMNEG00000034018 ENSMNEG00000043762 ENSMNEG00000039721 QRSL1 (ENSMNEG00000039617) RTN4IP1 (ENSMNEG00000045014) CRYBG1 (ENSMNEG00000033538) ATG5 (ENSMNEG00000032866) PRDM1 (ENSMNEG00000032369) ENSMNEG00000045422 PREP (ENSMNEG00000043839) POPDC3 (ENSMNEG00000014319) BVES (ENSMNEG00000033730) LIN28B (ENSMNEG00000038148) Macaca_a ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000156483 ENSGT00940000156557 ENSGT00940000160715 ENSGT00390000003560 ENSGT00390000004028 ENSGT00940000155913 ENSGT00390000007183 ENSGT00940000154531.y.a ENSGT00940000160610 ENSGT01090000260082.d.b ENSGT00390000001376.ab.b.a.a.b.a ENSGT00390000015164.l ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366.c.a.a #24 ENSGT00390000018829.z ENSGT00550000074866.i ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00950000186448 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 Crab-eating macaque MODERN SPECIES 14 SYNJ2 (ENSMFAG00000040552) SERAC1 (ENSMFAG00000042904) GTF2H5 (ENSMFAG00000037102) TULP4 (ENSMFAG00000002792) TMEM181 (ENSMFAG00000003593) DYNLT1 (ENSMFAG00000033424) SYTL3 (ENSMFAG00000001875) ENSMFAG00000063938 EZR (ENSMFAG00000002822) ENSMFAG00000034442 ENSMFAG00000041251 SEC63 (ENSMFAG00000034177) ENSMFAG00000047785 SCML4 (ENSMFAG00000000713) SOBP (ENSMFAG00000031853) PDSS2 (ENSMFAG00000031137) #22 BEND3 (ENSMFAG00000043850) #23 ENSMFAG00000034144 #24 ENSMFAG00000064133 ENSMFAG00000037584 RTN4IP1 (ENSMFAG00000045409) CRYBG1 (ENSMFAG00000038353) ENSMFAG00000051465 ATG5 (ENSMFAG00000041362) PRDM1 (ENSMFAG00000037637) PREP (ENSMFAG00000038505) POPDC3 (ENSMFAG00000040532) BVES (ENSMFAG00000045432) LIN28B (ENSMFAG00000065717) HACE1 (ENSMFAG00000039999) ENSMFAG00000052218 Rhesus MODERN SPECIES 14 ARID1B (ENSMMUG00000002270) TMEM242 (ENSMMUG00000052641) ZDHHC14 (ENSMMUG00000015872) SNX9 (ENSMMUG00000007142) SYNJ2 (ENSMMUG00000007153) SERAC1 (ENSMMUG00000029510) GTF2H5 (ENSMMUG00000049294) TULP4 (ENSMMUG00000019448) TMEM181 (ENSMMUG00000019450) DYNLT1 (ENSMMUG00000019454) SYTL3 (ENSMMUG00000058074) EZR (ENSMMUG00000019457) SEC63 (ENSMMUG00000016598) SCML4 (ENSMMUG00000014936) SOBP (ENSMMUG00000022950) PDSS2 (ENSMMUG00000002271) #22 BEND3 (ENSMMUG00000052231) #23 MTRES1 (ENSMMUG00000050334) #24 ENSMMUG00000056792 QRSL1 (ENSMMUG00000008330) RTN4IP1 (ENSMMUG00000008121) CRYBG1 (ENSMMUG00000008120) ATG5 (ENSMMUG00000019679) PRDM1 (ENSMMUG00000021401) PREP (ENSMMUG00000013483) POPDC3 (ENSMMUG00000014473) BVES (ENSMMUG00000014471) LIN28B (ENSMMUG00000064609) HACE1 (ENSMMUG00000014703) ENSMMUG00000055978 GRIK2 (ENSMMUG00000009856) Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00390000003560 ENSGT00390000004028 ENSGT00390000013264.d.e.b ENSGT00940000155913 ENSGT00910000147301 ENSGT00390000007183 ENSGT00940000155616.c.a.f ENSGT00940000154531.y.a ENSGT00940000160610 ENSGT01090000260082.d.b ENSGT00390000001376.ab.b.a.a.b ENSGT00390000015164.l ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366.c.a.a #24 ENSGT00550000074866.i ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00950000186448 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00550000074968.b ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 Olive baboon MODERN SPECIES 16 ZDHHC14 (ENSPANG00000007490) SNX9 (ENSPANG00000008674) SYNJ2 (ENSPANG00000010755) SERAC1 (ENSPANG00000019055) GTF2H5 (ENSPANG00000039941) TULP4 (ENSPANG00000022014) TMEM181 (ENSPANG00000018078) DYNLT1 (ENSPANG00000021141) SYTL3 (ENSPANG00000011916) EZR (ENSPANG00000016175) ENSPANG00000034964 ENSPANG00000043729 SEC63 (ENSPANG00000004976) SCML4 (ENSPANG00000017725) SOBP (ENSPANG00000021646) PDSS2 (ENSPANG00000017550) #22 BEND3 (ENSPANG00000024031) #23 MTRES1 (ENSPANG00000025271) #24 ENSPANG00000037991 ENSPANG00000040240 ENSPANG00000049765 ENSPANG00000041919 ENSPANG00000044349 QRSL1 (ENSPANG00000016880) RTN4IP1 (ENSPANG00000008266) CRYBG1 (ENSPANG00000021647) PRDM1 (ENSPANG00000050119) ATG5 (ENSPANG00000025450) ENSPANG00000046918 PREP (ENSPANG00000015134) POPDC3 (ENSPANG00000010757) Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 35 ENSGT00390000003560 ENSGT00390000004028 ENSGT00390000013264.d.e.b ENSGT00940000155913 ENSGT00910000147301 ENSGT00390000007183 ENSGT00940000155616.c.a.f ENSGT00940000154531.y.a ENSGT00940000160610 ENSGT01090000260082.d.b ENSGT00390000001376.ab.b.a.a.b ENSGT00390000015164.l ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366.c.a.a #24 ENSGT00940000167536 ENSGT00390000018318.u.b.a.b.a.a.a ENSGT00550000074866.i ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00950000186448 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00550000074968.b ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b Drill MODERN SPECIES 1200 ENSMLEG00000030698 ENSMLEG00000016056 ENSMLEG00000035536 ENSMLEG00000023103 ENSMLEG00000033113 ENSMLEG00000032648 PDSS2 (ENSMLEG00000043220) #22 BEND3 (ENSMLEG00000028839) #23 ENSMLEG00000034658 ENSMLEG00000021892 QRSL1 (ENSMLEG00000039233) RTN4IP1 (ENSMLEG00000033710) Sooty mangabey MODERN SPECIES 139 SYNJ2 (ENSCATG00000042943) SERAC1 (ENSCATG00000040610) GTF2H5 (ENSCATG00000044459) ENSCATG00000045359 TULP4 (ENSCATG00000030922) ENSCATG00000016948 TMEM181 (ENSCATG00000037574) ENSCATG00000041684 DYNLT1 (ENSCATG00000042124) SYTL3 (ENSCATG00000033317) EZR (ENSCATG00000030432) ENSCATG00000020673 SEC63 (ENSCATG00000041502) SCML4 (ENSCATG00000031314) SOBP (ENSCATG00000045250) PDSS2 (ENSCATG00000045083) #22 BEND3 (ENSCATG00000044885) #23 ENSCATG00000000450 #24 ENSCATG00000030902 ENSCATG00000031493 ENSCATG00000041315 QRSL1 (ENSCATG00000041686) RTN4IP1 (ENSCATG00000045221) CRYBG1 (ENSCATG00000030957) ATG5 (ENSCATG00000032926) PRDM1 (ENSCATG00000029610) ENSCATG00000003731 PREP (ENSCATG00000029835) POPDC3 (ENSCATG00000018981) BVES (ENSCATG00000037642) LIN28B (ENSCATG00000037900) Vervet Monkey MODERN SPECIES 4 PPIL6 (ENSCSAG00000015318) CD164 (ENSCSAG00000015315) ENSCSAG00000015288 CEP57L1 (ENSCSAG00000015274) SESN1 (ENSCSAG00000015254) ARMC2 (ENSCSAG00000015188) ENSCSAG00000015174 AFG1L (ENSCSAG00000015166) SNX3 (ENSCSAG00000015156) NR2E1 (ENSCSAG00000015143) OSTM1 (ENSCSAG00000015115) SEC63 (ENSCSAG00000015043) SCML4 (ENSCSAG00000014941) SOBP (ENSCSAG00000014908) ENSCSAG00000014888 PDSS2 (ENSCSAG00000014881) #22 BEND3 (ENSCSAG00000014875) #23 MTRES1 (ENSCSAG00000014865) #24 QRSL1 (ENSCSAG00000014852) RTN4IP1 (ENSCSAG00000014845) CRYBG1 (ENSCSAG00000014817) ENSCSAG00000014764 ATG5 (ENSCSAG00000014751) PRDM1 (ENSCSAG00000014744) PREP (ENSCSAG00000014741) POPDC3 (ENSCSAG00000014725) BVES (ENSCSAG00000014711) LIN28B (ENSCSAG00000014708) HACE1 (ENSCSAG00000014704) ENSCSAG00000014695 ENSCSAG00000018976 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 282 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00390000005306.v ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00910000147202 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 Black snub-nosed monkey DUPLICATION Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 669 ENSRBIG00000034899 #22 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 611 PPIL6 (ENSRBIG00000039141) CD164 (ENSRBIG00000017887) ENSRBIG00000029996 CEP57L1 (ENSRBIG00000032920) SESN1 (ENSRBIG00000044534) ARMC2 (ENSRBIG00000039423) ENSRBIG00000041006 AFG1L (ENSRBIG00000043286) SNX3 (ENSRBIG00000036801) NR2E1 (ENSRBIG00000032455) OSTM1 (ENSRBIG00000033044) SEC63 (ENSRBIG00000029238) SCML4 (ENSRBIG00000042673) ENSRBIG00000027620 ENSRBIG00000017827 ENSRBIG00000044333 #22 Golden snub-nosed monkey DUPLICATION Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1189 ENSRROG00000041554 #22 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2360 ENSRROG00000000604 SESN1 (ENSRROG00000039007) ARMC2 (ENSRROG00000038321) ENSRROG00000015070 ENSRROG00000028438 AFG1L (ENSRROG00000028996) SNX3 (ENSRROG00000037899) NR2E1 (ENSRROG00000044660) OSTM1 (ENSRROG00000029748) SEC63 (ENSRROG00000035523) SCML4 (ENSRROG00000027116) ENSRROG00000024279 SOBP (ENSRROG00000039171) ENSRROG00000033386 #22 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00390000002042 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b.f ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000018829 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00900000143654 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 Bushbaby MODERN SPECIES 117 SMPD2 (ENSOGAG00000015505) CD164 (ENSOGAG00000015500) ENSOGAG00000015493 ENSOGAG00000015488 ENSOGAG00000015479 SESN1 (ENSOGAG00000015235) ARMC2 (ENSOGAG00000010324) ENSOGAG00000027196 ENSOGAG00000004119 SNX3 (ENSOGAG00000012282) NR2E1 (ENSOGAG00000011992) OSTM1 (ENSOGAG00000015357) SEC63 (ENSOGAG00000015346) SCML4 (ENSOGAG00000006345) SOBP (ENSOGAG00000006342) PDSS2 (ENSOGAG00000006339) #22 BEND3 (ENSOGAG00000027957) #23 MTRES1 (ENSOGAG00000008839) #24 ENSOGAG00000024102 QRSL1 (ENSOGAG00000012707) RTN4IP1 (ENSOGAG00000012703) ENSOGAG00000012697 ENSOGAG00000032847 ATG5 (ENSOGAG00000004787) PRDM1 (ENSOGAG00000014036) PREP (ENSOGAG00000015233) POPDC3 (ENSOGAG00000011048) BVES (ENSOGAG00000011044) ENSOGAG00000029797 LIN28B (ENSOGAG00000011042) HACE1 (ENSOGAG00000011034) Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000009166 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b.f ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000018829.ab ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00900000143654 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES 63 ENSGT00390000009166 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b.f ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000018829.ab ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00900000143654 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 Coquerels sifaka MODERN SPECIES 492 SMPD2 (ENSPCOG00000001714) PPIL6 (ENSPCOG00000016101) CD164 (ENSPCOG00000028678) CEP57L1 (ENSPCOG00000020909) SESN1 (ENSPCOG00000023817) ARMC2 (ENSPCOG00000027583) ENSPCOG00000024701 ENSPCOG00000018259 AFG1L (ENSPCOG00000014543) SNX3 (ENSPCOG00000020531) NR2E1 (ENSPCOG00000019521) OSTM1 (ENSPCOG00000025401) SEC63 (ENSPCOG00000021091) SCML4 (ENSPCOG00000022920) SOBP (ENSPCOG00000025980) PDSS2 (ENSPCOG00000005947) #22 BEND3 (ENSPCOG00000017387) #23 ENSPCOG00000027220 #24 CD24 (ENSPCOG00000014613) ENSPCOG00000019397 RTN4IP1 (ENSPCOG00000027386) ENSPCOG00000025469 CRYBG1 (ENSPCOG00000022574) PRDM1 (ENSPCOG00000002322) ATG5 (ENSPCOG00000015617) PREP (ENSPCOG00000018527) POPDC3 (ENSPCOG00000022458) BVES (ENSPCOG00000023354) LIN28B (ENSPCOG00000016875) HACE1 (ENSPCOG00000016340) ENSPCOG00000020641 Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 187 ENSPSMG00000002940 ARMC2 (ENSPSMG00000002952) ENSPSMG00000002963 AFG1L (ENSPSMG00000002975) ENSPSMG00000002992 NR2E1 (ENSPSMG00000003030) OSTM1 (ENSPSMG00000003042) SEC63 (ENSPSMG00000003081) SCML4 (ENSPSMG00000003119) SOBP (ENSPSMG00000003137) PDSS2 (ENSPSMG00000003161) #22 ENSPSMG00000003169 BEND3 (ENSPSMG00000003180) #23 MTRES1 (ENSPSMG00000003201) #24 ENSPSMG00000003206 QRSL1 (ENSPSMG00000003285) RTN4IP1 (ENSPSMG00000003357) CRYBG1 (ENSPSMG00000003403) ENSPSMG00000003411 ATG5 (ENSPSMG00000003484) PRDM1 (ENSPSMG00000003598) PREP (ENSPSMG00000003663) POPDC3 (ENSPSMG00000003691) BVES (ENSPSMG00000003702) LIN28B (ENSPSMG00000003723) HACE1 (ENSPSMG00000003828) Mouse lemur MODERN SPECIES 28 PPIL6 (ENSMICG00000014430) CD164 (ENSMICG00000014422) ENSMICG00000014404 CEP57L1 (ENSMICG00000014373) SESN1 (ENSMICG00000038030) ENSMICG00000042143 ENSMICG00000035769 AFG1L (ENSMICG00000014294) ENSMICG00000004669 SNX3 (ENSMICG00000043331) NR2E1 (ENSMICG00000014274) OSTM1 (ENSMICG00000027511) SEC63 (ENSMICG00000014221) SCML4 (ENSMICG00000004168) SOBP (ENSMICG00000030144) PDSS2 (ENSMICG00000032777) #22 BEND3 (ENSMICG00000043137) #23 ENSMICG00000004137 #24 ENSMICG00000011517 ENSMICG00000029426 QRSL1 (ENSMICG00000015754) RTN4IP1 (ENSMICG00000015741) CRYBG1 (ENSMICG00000030885) ATG5 (ENSMICG00000010334) PRDM1 (ENSMICG00000010329) PREP (ENSMICG00000000906) POPDC3 (ENSMICG00000045084) BVES (ENSMICG00000041560) LIN28B (ENSMICG00000047923) HACE1 (ENSMICG00000002280) ENSMICG00000046073 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000002042 ENSGT00390000007445 ENSGT00940000165946 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00950000186137 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000010020 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000018829 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00900000143654 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153498.B.b #22 Hedgehog MODERN SPECIES 1459 PDSS2 (ENSEEUG00000003290) #22 Common shrew MODERN SPECIES 4509 PDSS2 (ENSSARG00000008131) #22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000165946 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463.y.b ENSGT00940000157463.z ENSGT00950000186137 ENSGT00940000157463.y.a ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000010020 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000018829 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00900000143654 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463.y.b ENSGT00940000157463.z ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000010020 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000018829 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00900000143654 ENSGT00940000155695 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 Carnivora ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000164355 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463.y.b ENSGT00940000157463.z ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000010020 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000018829.f.a ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00900000143654 ENSGT00940000155695 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 Felidae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT01090000260200 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000153305.c.e.a ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b.y.a ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00550000074820.g.b.b ENSGT00940000153096.b.c.b.a.a.c.a ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463.z ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010020 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000018829.f.a ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00900000143654 ENSGT00940000155695 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 Panthera ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT01090000260200 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000153305.c.e.a ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b.y.a ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00550000074820.g.b.b ENSGT00940000153096.b.c.b.a.a.c.a ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463.z ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000018829.f.a ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00900000143654 ENSGT00940000155695 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 Tiger MODERN SPECIES 120 CEP57L1 (ENSPTIG00000010364) ENSPTIG00000006465 SESN1 (ENSPTIG00000010634) ARMC2 (ENSPTIG00000010930) ENSPTIG00000010993 ENSPTIG00000006470 AFG1L (ENSPTIG00000011075) SNX3 (ENSPTIG00000011144) NR2E1 (ENSPTIG00000011245) OSTM1 (ENSPTIG00000011589) ENSPTIG00000011769 ENSPTIG00000006485 SEC63 (ENSPTIG00000011850) SCML4 (ENSPTIG00000012438) ENSPTIG00000012569 PDSS2 (ENSPTIG00000012627) #22 BEND3 (ENSPTIG00000012683) #23 MTRES1 (ENSPTIG00000012699) #24 CD24 (ENSPTIG00000012956) Panthera_a ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000163170 ENSGT01090000260200 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000153305.c.e.a ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b.y.a ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00550000074820.g.b.b ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463.z ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000018829.f.a ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00900000143654 ENSGT00940000155695 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 leopard MODERN SPECIES 8 CD164 (ENSPPRG00000002917) ENSPPRG00000006527 CEP57L1 (ENSPPRG00000011525) SESN1 (ENSPPRG00000012293) ARMC2 (ENSPPRG00000012871) ENSPPRG00000013820 ENSPPRG00000015115 AFG1L (ENSPPRG00000015710) SNX3 (ENSPPRG00000017937) NR2E1 (ENSPPRG00000022189) OSTM1 (ENSPPRG00000023255) ENSPPRG00000022699 SEC63 (ENSPPRG00000001303) SCML4 (ENSPPRG00000003028) SOBP (ENSPPRG00000003897) PDSS2 (ENSPPRG00000005402) #22 BEND3 (ENSPPRG00000006060) #23 MTRES1 (ENSPPRG00000006302) #24 ENSPPRG00000006560 CD24 (ENSPPRG00000006861) QRSL1 (ENSPPRG00000008093) RTN4IP1 (ENSPPRG00000009483) CRYBG1 (ENSPPRG00000010238) ATG5 (ENSPPRG00000012874) PRDM1 (ENSPPRG00000011148) PREP (ENSPPRG00000013298) POPDC3 (ENSPPRG00000013616) BVES (ENSPPRG00000015358) LIN28B (ENSPPRG00000016158) HACE1 (ENSPPRG00000021923) ENSPPRG00000001508 lion MODERN SPECIES 5 ENSPLOG00000001764 ENSPLOG00000001710 CEP57L1 (ENSPLOG00000001647) SESN1 (ENSPLOG00000001551) ARMC2 (ENSPLOG00000001510) ENSPLOG00000001495 ENSPLOG00000001485 AFG1L (ENSPLOG00000001460) ENSPLOG00000001431 NR2E1 (ENSPLOG00000001392) OSTM1 (ENSPLOG00000001361) ENSPLOG00000001352 SEC63 (ENSPLOG00000001298) SCML4 (ENSPLOG00000001239) SOBP (ENSPLOG00000001199) PDSS2 (ENSPLOG00000001162) #22 ENSPLOG00000001144 BEND3 (ENSPLOG00000001134) #23 MTRES1 (ENSPLOG00000001114) #24 CD24 (ENSPLOG00000001102) QRSL1 (ENSPLOG00000001072) RTN4IP1 (ENSPLOG00000001021) ENSPLOG00000000998 CRYBG1 (ENSPLOG00000000953) ATG5 (ENSPLOG00000000881) PRDM1 (ENSPLOG00000000820) PREP (ENSPLOG00000000781) POPDC3 (ENSPLOG00000000761) BVES (ENSPLOG00000000733) ENSPLOG00000000717 LIN28B (ENSPLOG00000000691) Cat MODERN SPECIES 236 ENSFCAG00000042749 CEP57L1 (ENSFCAG00000026443) SESN1 (ENSFCAG00000031995) ARMC2 (ENSFCAG00000018743) ENSFCAG00000029035 FOXO3 (ENSFCAG00000030227) AFG1L (ENSFCAG00000003437) ENSFCAG00000024997 NR2E1 (ENSFCAG00000002255) ENSFCAG00000032904 OSTM1 (ENSFCAG00000024755) ENSFCAG00000024634 SEC63 (ENSFCAG00000002253) SCML4 (ENSFCAG00000003739) SOBP (ENSFCAG00000028431) PDSS2 (ENSFCAG00000024608) #22 ENSFCAG00000051054 BEND3 (ENSFCAG00000008869) #23 MTRES1 (ENSFCAG00000046698) #24 ENSFCAG00000032455 QRSL1 (ENSFCAG00000005096) RTN4IP1 (ENSFCAG00000030660) ENSFCAG00000053486 CRYBG1 (ENSFCAG00000005094) ATG5 (ENSFCAG00000031909) PRDM1 (ENSFCAG00000010755) PREP (ENSFCAG00000005061) POPDC3 (ENSFCAG00000005060) BVES (ENSFCAG00000005059) LIN28B (ENSFCAG00000044308) HACE1 (ENSFCAG00000022001) Caniformia ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000164355 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463.y.b ENSGT00940000157463.z ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000010020 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000018829.f.a ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00900000143654 ENSGT00940000155695 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000164355 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463.y.b ENSGT00940000157463.z ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000010020 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000018829.f.a ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00900000143654 ENSGT00940000155695 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 Mustelinae ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000164355 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463.y.b ENSGT00940000157463.z ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000010020 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000018829.f.a ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00900000143654 ENSGT00940000155695 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 Ferret MODERN SPECIES 201 SESN1 (ENSMPUG00000009860) ARMC2 (ENSMPUG00000009852) ENSMPUG00000009848 ENSMPUG00000009847 AFG1L (ENSMPUG00000009823) ENSMPUG00000009816 SNX3 (ENSMPUG00000009812) NR2E1 (ENSMPUG00000009805) OSTM1 (ENSMPUG00000009774) ENSMPUG00000009757 SEC63 (ENSMPUG00000009752) ENSMPUG00000009747 SCML4 (ENSMPUG00000009746) SOBP (ENSMPUG00000009696) ENSMPUG00000009693 PDSS2 (ENSMPUG00000009682) #22 BEND3 (ENSMPUG00000009678) #23 ENSMPUG00000019102 MTRES1 (ENSMPUG00000009672) #24 CD24 (ENSMPUG00000009669) QRSL1 (ENSMPUG00000009661) RTN4IP1 (ENSMPUG00000009654) CRYBG1 (ENSMPUG00000009543) ATG5 (ENSMPUG00000009534) PRDM1 (ENSMPUG00000009522) PREP (ENSMPUG00000009513) POPDC3 (ENSMPUG00000009505) BVES (ENSMPUG00000009502) LIN28B (ENSMPUG00000009489) ENSMPUG00000009481 ENSMPUG00000009479 American mink MODERN SPECIES 4 CEP57L1 (ENSNVIG00000004602) SESN1 (ENSNVIG00000004555) ARMC2 (ENSNVIG00000004503) ENSNVIG00000004489 ENSNVIG00000004481 LACE1 (ENSNVIG00000004442) SNX3 (ENSNVIG00000004406) NR2E1 (ENSNVIG00000004390) OSTM1 (ENSNVIG00000004375) ENSNVIG00000004361 SEC63 (ENSNVIG00000004305) ENSNVIG00000004288 ENSNVIG00000004283 SOBP (ENSNVIG00000004254) ENSNVIG00000004244 PDSS2 (ENSNVIG00000004192) #22 BEND3 (ENSNVIG00000004176) #23 MTRES1 (ENSNVIG00000004157) #24 ENSNVIG00000004145 QRSL1 (ENSNVIG00000004081) RTN4IP1 (ENSNVIG00000004067) ENSNVIG00000004058 CRYBG1 (ENSNVIG00000003998) ATG5 (ENSNVIG00000003945) PRDM1 (ENSNVIG00000003863) PREP (ENSNVIG00000003825) POPD3 (ENSNVIG00000003813) POPD1 (ENSNVIG00000003747) LIN28B (ENSNVIG00000003725) HACE1 (ENSNVIG00000003630) ENSNVIG00000003598 Ursidae ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463.y.b ENSGT00940000157463.y.a ENSGT00940000157463.z ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000010020 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000018829.f.a ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00900000143654 ENSGT00940000155695 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 Giant Panda MODERN SPECIES 1 PPIL6 (ENSAMEG00000016447) CD164 (ENSAMEG00000016459) ENSAMEG00000016463 CEP57L1 (ENSAMEG00000008220) SESN1 (ENSAMEG00000008179) ARMC2 (ENSAMEG00000008162) ENSAMEG00000008158 AFG1L (ENSAMEG00000008150) SNX3 (ENSAMEG00000008145) NR2E1 (ENSAMEG00000008117) OSTM1 (ENSAMEG00000008114) SEC63 (ENSAMEG00000008074) SCML4 (ENSAMEG00000008065) SOBP (ENSAMEG00000008061) ENSAMEG00000025863 PDSS2 (ENSAMEG00000008056) #22 BEND3 (ENSAMEG00000008053) #23 ENSAMEG00000023827 MTRES1 (ENSAMEG00000008052) #24 CD24 (ENSAMEG00000031404) QRSL1 (ENSAMEG00000002571) ENSAMEG00000029538 ENSAMEG00000024019 CRYBG1 (ENSAMEG00000001523) PRDM1 (ENSAMEG00000001482) ATG5 (ENSAMEG00000001503) PREP (ENSAMEG00000011361) POPDC3 (ENSAMEG00000011433) BVES (ENSAMEG00000028861) ENSAMEG00000026936 LIN28B (ENSAMEG00000011453) Ursus ANCESTRAL SPECIES 131 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463.y.b ENSGT00940000157463.y.a ENSGT00940000157463.z ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00390000004766 ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 ENSGT00940000155377 ENSGT00940000156143 ENSGT00940000154272.A Polar bear MODERN SPECIES 268 ENSUMAG00000019838 SEC63 (ENSUMAG00000019843) SCML4 (ENSUMAG00000019857) SOBP (ENSUMAG00000019861) PDSS2 (ENSUMAG00000019867) #22 MTRES1 (ENSUMAG00000019879) #24 QRSL1 (ENSUMAG00000019887) RTN4IP1 (ENSUMAG00000019890) CRYBG1 (ENSUMAG00000019920) ATG5 (ENSUMAG00000020055) PREP (ENSUMAG00000020265) POPDC3 (ENSUMAG00000020909) BVES (ENSUMAG00000020912) LIN28B (ENSUMAG00000020916) ENSUMAG00000020919 HACE1 (ENSUMAG00000020920) GRIK2 (ENSUMAG00000020951) ENSUMAG00000021158 ASCC3 (ENSUMAG00000021200) SIM1 (ENSUMAG00000021405) Canidae ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b.w.a ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463.y.b ENSGT00940000157463.y.a ENSGT00940000157463.z ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000010020 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000018829.f.a.d ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 Red fox MODERN SPECIES 54 CD164 (ENSVVUG00000004986) ENSVVUG00000004923 CEP57L1 (ENSVVUG00000004884) SESN1 (ENSVVUG00000004879) ARMC2 (ENSVVUG00000004847) ENSVVUG00000004833 AFG1L (ENSVVUG00000004813) ENSVVUG00000004798 ENSVVUG00000004795 OSTM1 (ENSVVUG00000004771) SEC63 (ENSVVUG00000004763) ENSVVUG00000004750 ENSVVUG00000004745 ENSVVUG00000004735 SOBP (ENSVVUG00000004706) PDSS2 (ENSVVUG00000004658) #22 ENSVVUG00000004652 BEND3 (ENSVVUG00000004649) #23 ENSVVUG00000004648 #24 QRSL1 (ENSVVUG00000004637) RTN4IP1 (ENSVVUG00000004632) CRYBG1 (ENSVVUG00000004496) ATG5 (ENSVVUG00000004478) PRDM1 (ENSVVUG00000004465) PREP (ENSVVUG00000003825) POPDC3 (ENSVVUG00000003775) BVES (ENSVVUG00000003754) LIN28B (ENSVVUG00000003739) HACE1 (ENSVVUG00000003691) ENSVVUG00000003658 ENSVVUG00000003647 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b.w.a ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463.y.b ENSGT00940000157463.y.a ENSGT00940000157463.z ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000010020 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000018829.f.a.d ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000154737.d Dingo MODERN SPECIES 370 PPIL6 (ENSCAFG00020017980) ENSCAFG00020017976 ENSCAFG00020017941 CEP57L1 (ENSCAFG00020017933) SESN1 (ENSCAFG00020017928) ARMC2 (ENSCAFG00020017910) ENSCAFG00020017905 AFG1L (ENSCAFG00020017899) ENSCAFG00020017882 NR2E1 (ENSCAFG00020017858) OSTM1 (ENSCAFG00020017831) SEC63 (ENSCAFG00020017827) ENSCAFG00020017824 ENSCAFG00020017819 SOBP (ENSCAFG00020017814) PDSS2 (ENSCAFG00020017808) #22 BEND3 (ENSCAFG00020017802) #23 MTRES1 (ENSCAFG00020017801) #24 QRSL1 (ENSCAFG00020017795) RTN4IP1 (ENSCAFG00020017789) ENSCAFG00020017786 CRYBG1 (ENSCAFG00020017663) ATG5 (ENSCAFG00020017640) PRDM1 (ENSCAFG00020017630) PREP (ENSCAFG00020017616) POPDC3 (ENSCAFG00020017612) BVES (ENSCAFG00020017609) LIN28B (ENSCAFG00020017606) HACE1 (ENSCAFG00020017333) ENSCAFG00020017311 ENSCAFG00020017309 Dog MODERN SPECIES 3 PPIL6 (ENSCAFG00845010913) CD164 (ENSCAFG00845010838) ENSCAFG00845010542 CEP57L1 (ENSCAFG00845010196) SESN1 (ENSCAFG00845009981) ARMC2 (ENSCAFG00845009746) FOXO3 (ENSCAFG00845009586) ENSCAFG00845009536 AFG1L (ENSCAFG00845009423) SNX3 (ENSCAFG00845009178) NR2E1 (ENSCAFG00845008978) OSTM1 (ENSCAFG00845008927) SEC63 (ENSCAFG00845008872) SCML4 (ENSCAFG00845008805) SOBP (ENSCAFG00845008693) PDSS2 (ENSCAFG00845008531) #22 BEND3 (ENSCAFG00845008452) #23 ENSCAFG00845008420 MTRES1 (ENSCAFG00845008387) #24 ENSCAFG00845008352 QRSL1 (ENSCAFG00845008279) RTN4IP1 (ENSCAFG00845008205) CRYBG1 (ENSCAFG00845008056) ATG5 (ENSCAFG00845007954) PRDM1 (ENSCAFG00845007842) PREP (ENSCAFG00845007652) POPDC3 (ENSCAFG00845007572) BVES (ENSCAFG00845007542) LIN28B (ENSCAFG00845007472) HACE1 (ENSCAFG00845006967) ENSCAFG00845006846 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000009166 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463.z ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000010020 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000018829 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00900000143654 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 Equus ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000165946 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463.y.a ENSGT00940000157463.z ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000010020 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000018829.b ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 Horse MODERN SPECIES 1 CD164 (ENSECAG00000031619) ENSECAG00000013532 CEP57L1 (ENSECAG00000009776) SESN1 (ENSECAG00000001101) ARMC2 (ENSECAG00000024506) FOXO3 (ENSECAG00000024499) AFG1L (ENSECAG00000023503) SNX3 (ENSECAG00000022664) NR2E1 (ENSECAG00000018990) OSTM1 (ENSECAG00000016887) SEC63 (ENSECAG00000006392) ENSECAG00000046423 SCML4 (ENSECAG00000024152) SOBP (ENSECAG00000036081) ENSECAG00000052219 PDSS2 (ENSECAG00000024085) #22 BEND3 (ENSECAG00000023993) #23 ENSECAG00000047274 MTRES1 (ENSECAG00000023985) #24 ENSECAG00000031607 QRSL1 (ENSECAG00000021023) RTN4IP1 (ENSECAG00000019289) ATG5 (ENSECAG00000013971) CRYBG1 (ENSECAG00000015079) PRDM1 (ENSECAG00000009044) ENSECAG00000053373 PREP (ENSECAG00000023502) POPDC3 (ENSECAG00000021367) BVES (ENSECAG00000038417) LIN28B (ENSECAG00000020994) HACE1 (ENSECAG00000015445) Donkey MODERN SPECIES 16 PPIL6 (ENSEASG00005033540) CD164 (ENSEASG00005006477) ENSEASG00005006467 CEP57L1 (ENSEASG00005006465) SESN1 (ENSEASG00005006463) ARMC2 (ENSEASG00005006460) ENSEASG00005006457 AFG1L (ENSEASG00005006455) SNX3 (ENSEASG00005027377) NR2E1 (ENSEASG00005006452) OSTM1 (ENSEASG00005006451) SEC63 (ENSEASG00005006449) SCML4 (ENSEASG00005006447) ENSEASG00005028878 SOBP (ENSEASG00005006446) PDSS2 (ENSEASG00005006444) #22 BEND3 (ENSEASG00005037754) #23 ENSEASG00005029634 MTRES1 (ENSEASG00005006440) #24 ENSEASG00005006439 QRSL1 (ENSEASG00005006438) RTN4IP1 (ENSEASG00005006435) CRYBG1 (ENSEASG00005006430) ATG5 (ENSEASG00005006428) PRDM1 (ENSEASG00005006427) ENSEASG00005033880 PREP (ENSEASG00005006425) POPDC3 (ENSEASG00005006424) BVES (ENSEASG00005006423) LIN28B (ENSEASG00005026575) HACE1 (ENSEASG00005006421) Chiroptera ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000009166 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463.z ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000018829 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00900000143654 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 Megabat MODERN SPECIES 2810 SEC63 (ENSPVAG00000004446) SCML4 (ENSPVAG00000004445) SOBP (ENSPVAG00000004444) PDSS2 (ENSPVAG00000004443) #22 BEND3 (ENSPVAG00000004442) #23 MTRES1 (ENSPVAG00000004438) #24 ENSPVAG00000004436 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000009166 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463.z ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000018829 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00900000143654 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 Microbat MODERN SPECIES 1153 NR2E1 (ENSMLUG00000005543) OSTM1 (ENSMLUG00000005540) ENSMLUG00000030351 SEC63 (ENSMLUG00000005529) SCML4 (ENSMLUG00000005526) SOBP (ENSMLUG00000029995) PDSS2 (ENSMLUG00000002328) #22 BEND3 (ENSMLUG00000002324) #23 ENSMLUG00000002326 MTRES1 (ENSMLUG00000009524) #24 QRSL1 (ENSMLUG00000025602) RTN4IP1 (ENSMLUG00000002947) CRYBG1 (ENSMLUG00000002929) ATG5 (ENSMLUG00000014090) PRDM1 (ENSMLUG00000014085) Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 21 SMPD2 (ENSRFEG00010012782) PPIL6 (ENSRFEG00010012502) CD164 (ENSRFEG00010012454) ENSRFEG00010012005 CEP57L1 (ENSRFEG00010011653) SESN1 (ENSRFEG00010011576) ARMC2 (ENSRFEG00010011463) ENSRFEG00010011401 AFG1L (ENSRFEG00010011287) SNX3 (ENSRFEG00010011106) NR2E1 (ENSRFEG00010010957) OSTM1 (ENSRFEG00010010906) SEC63 (ENSRFEG00010010840) SCML4 (ENSRFEG00010010598) SOBP (ENSRFEG00010010519) PDSS2 (ENSRFEG00010010408) #22 BEND3 (ENSRFEG00010010319) #23 MTRES1 (ENSRFEG00010003814) #24 ENSRFEG00010003796 QRSL1 (ENSRFEG00010003777) CRYBG1 (ENSRFEG00010003739) ENSRFEG00010003711 RTN4IP1 (ENSRFEG00010003684) PRDM1 (ENSRFEG00010003594) ATG5 (ENSRFEG00010003510) PREP (ENSRFEG00010003440) POPDC3 (ENSRFEG00010003422) BVES (ENSRFEG00010003402) LIN28B (ENSRFEG00010003383) HACE1 (ENSRFEG00010003307) ENSRFEG00010003252 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00390000007445 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463.y.b ENSGT00940000157463.z ENSGT00950000186137 ENSGT00940000157463.y.a ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000018829 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00900000143654 ENSGT00940000155695 ENSGT00950000186448 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 Suina ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00390000009166 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463.z ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000018829 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 ENSGT00940000155377 Pig MODERN SPECIES CEP57L1 (ENSSSCG00000004391) ENSSSCG00000004389 ENSSSCG00000052903 SESN1 (ENSSSCG00000004390) ARMC2 (ENSSSCG00000004388) ENSSSCG00000004387 AFG1L (ENSSSCG00000040199) SNX3 (ENSSSCG00000004385) NR2E1 (ENSSSCG00000004384) OSTM1 (ENSSSCG00000004383) SEC63 (ENSSSCG00000004382) ENSSSCG00000059436 SCML4 (ENSSSCG00000033392) SOBP (ENSSSCG00000004379) ENSSSCG00000043730 PDSS2 (ENSSSCG00000036168) #22 BEND3 (ENSSSCG00000031159) #23 MTRES1 (ENSSSCG00000037985) #24 ENSSSCG00000037071 CD24 (ENSSSCG00000056379) QRSL1 (ENSSSCG00000004374) RTN4IP1 (ENSSSCG00000004373) ENSSSCG00000041504 ENSSSCG00000046528 CRYBG1 (ENSSSCG00000004371) PRDM1 (ENSSSCG00000004369) ATG5 (ENSSSCG00000004370) PREP (ENSSSCG00000004368) ENSSSCG00000045756 POPDC3 (ENSSSCG00000004367) BVES (ENSSSCG00000004366) Chacoan peccary MODERN SPECIES 61 PPIL6 (ENSCWAG00000006750) CD164 (ENSCWAG00000006667) ENSCWAG00000006462 CEP57L1 (ENSCWAG00000005725) SESN1 (ENSCWAG00000005592) ARMC2 (ENSCWAG00000005470) ENSCWAG00000005437 ENSCWAG00000005422 AFG1L (ENSCWAG00000005377) SNX3 (ENSCWAG00000005325) NR2E1 (ENSCWAG00000005279) OSTM1 (ENSCWAG00000005241) SEC63 (ENSCWAG00000005214) SCML4 (ENSCWAG00000005085) SOBP (ENSCWAG00000005052) PDSS2 (ENSCWAG00000004925) #22 BEND3 (ENSCWAG00000004892) #23 MTRES1 (ENSCWAG00000004864) #24 ENSCWAG00000004851 QRSL1 (ENSCWAG00000019699) RTN4IP1 (ENSCWAG00000019680) CRYBG1 (ENSCWAG00000019206) PRDM1 (ENSCWAG00000019085) ATG5 (ENSCWAG00000018963) PREP (ENSCWAG00000018924) POPDC3 (ENSCWAG00000018902) BVES (ENSCWAG00000018883) LIN28B (ENSCWAG00000018839) HACE1 (ENSCWAG00000018801) GRIK2 (ENSCWAG00000017386) ASCC3 (ENSCWAG00000017256) Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00390000007445 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463.y.b ENSGT00940000157463.z ENSGT00950000186137 ENSGT00940000157463.y.a ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000018829.g.b ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00900000143654 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00410000028929 ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 Camelidae ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00390000009166 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463.z ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000018829.g.b ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00410000028929 ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 Arabian camel MODERN SPECIES 34 PPIL6 (ENSCDRG00005007281) ENSCDRG00005007462 ENSCDRG00005007597 CEP57L1 (ENSCDRG00005007702) SESN1 (ENSCDRG00005008310) ARMC2 (ENSCDRG00005008518) ENSCDRG00005008590 ENSCDRG00005008617 AFG1L (ENSCDRG00005008669) SNX3 (ENSCDRG00005008756) NR2E1 (ENSCDRG00005008907) OSTM1 (ENSCDRG00005009034) SEC63 (ENSCDRG00005009103) SCML4 (ENSCDRG00005009375) ENSCDRG00005009503 PDSS2 (ENSCDRG00005009549) #22 BEND3 (ENSCDRG00005009651) #23 MTRES1 (ENSCDRG00005009712) #24 ENSCDRG00005009820 QRSL1 (ENSCDRG00005009875) RTN4IP1 (ENSCDRG00005009990) ENSCDRG00005010087 ATG5 (ENSCDRG00005010191) PRDM1 (ENSCDRG00005010476) PREP (ENSCDRG00005010990) POPDC3 (ENSCDRG00005011183) BVES (ENSCDRG00005011229) LIN28B (ENSCDRG00005011271) HACE1 (ENSCDRG00005011438) ENSCDRG00005011925 GRIK2 (ENSCDRG00005012001) Alpaca MODERN SPECIES 912 SEC63 (ENSVPAG00000011376) SCML4 (ENSVPAG00000011375) SOBP (ENSVPAG00000011373) ENSVPAG00000011372 PDSS2 (ENSVPAG00000011371) #22 BEND3 (ENSVPAG00000011370) #23 MTRES1 (ENSVPAG00000011369) #24 ENSVPAG00000011368 QRSL1 (ENSVPAG00000011367) RTN4IP1 (ENSVPAG00000011366) CRYBG1 (ENSVPAG00000011365) ATG5 (ENSVPAG00000011364) PRDM1 (ENSVPAG00000011363) Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00390000007445 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463.y.b ENSGT00940000157463.z ENSGT00950000186137 ENSGT00940000157463.y.a ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000018829.g.b ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00900000143654 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00410000028929 ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 Pecora ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463.z ENSGT00950000186137 ENSGT00940000157463.y.a ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000018829.g.b ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00900000143654 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT01030000236423 Yarkand deer MODERN SPECIES 20 ENSCHYG00000017708 CD164 (ENSCHYG00000017778) CEP57L1 (ENSCHYG00000018844) SESN1 (ENSCHYG00000019343) ARMC2 (ENSCHYG00000019746) ENSCHYG00000019977 AFG1L (ENSCHYG00000020011) SNX3 (ENSCHYG00000020227) NR2E1 (ENSCHYG00000020431) ENSCHYG00000020616 ENSCHYG00000020693 OSTM1 (ENSCHYG00000020769) SEC63 (ENSCHYG00000020896) SCML4 (ENSCHYG00000021381) SOBP (ENSCHYG00000021447) PDSS2 (ENSCHYG00000021575) #22 ENSCHYG00000021717 BEND3 (ENSCHYG00000021757) #23 MTRES1 (ENSCHYG00000021800) #24 ENSCHYG00000021838 QRSL1 (ENSCHYG00000021880) RTN4IP1 (ENSCHYG00000021960) CRYBG1 (ENSCHYG00000022057) ATG5 (ENSCHYG00000022719) PRDM1 (ENSCHYG00000022882) PREP (ENSCHYG00000023040) ENSCHYG00000023289 POPDC3 (ENSCHYG00000023314) BVES (ENSCHYG00000023334) LIN28B (ENSCHYG00000023383) HACE1 (ENSCHYG00000023545) Percora_a ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463.z ENSGT00950000186137 ENSGT00940000157463.y.a ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000018829.g.b ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00900000143654 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT01010000228077 ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 Bovidae ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00940000158886.g.b ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463.z ENSGT00950000186137 ENSGT00940000157463.y.a ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000018829.g.b ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00900000143654 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT01010000228077 ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 Bovinae ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00390000005569.x.a.b.b.b ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00940000158886.g.b ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463.z ENSGT00950000186137 ENSGT00940000157463.y.a ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000018829.g.b ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00950000186448 ENSGT00960000190646 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00390000004856.w.a.a.b.b.a.b.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b Bos ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00390000005569.x.a.b.b.b ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00940000158886.g.b ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463.z ENSGT00950000186137 ENSGT00940000157463.y.a ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000018829.g.b ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00950000186448 ENSGT00960000190646 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00390000004856.w.a.a.b.b.a.b.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b Bos_b ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00390000005569.x.a.b.b.b ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00940000158886.g.b ENSGT00390000012341 ENSGT00390000013102.e.b ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463.z ENSGT00950000186137 ENSGT00940000157463.y.a ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000018829.g.b.e ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT01100000263481.n.a.a.a.a.a.b.b.b ENSGT01030000236423 Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 28 ARMC2 (ENSBIXG00005008081) ENSBIXG00005008024 ENSBIXG00005008006 AFG1L (ENSBIXG00005007990) ENSBIXG00005007977 SNX3 (ENSBIXG00005007963) ENSBIXG00005007943 NR2E1 (ENSBIXG00005007933) ENSBIXG00005000025 OSTM1 (ENSBIXG00005007909) ENSBIXG00005007898 SEC63 (ENSBIXG00005007877) SCML4 (ENSBIXG00005029296) ENSBIXG00005029333 SOBP (ENSBIXG00005029342) PDSS2 (ENSBIXG00005029375) #22 BEND3 (ENSBIXG00005029403) #23 MTRES1 (ENSBIXG00005029440) #24 ENSBIXG00005029470 ENSBIXG00005029500 ENSBIXG00005029552 CRYBG1 (ENSBIXG00005029620) ATG5 (ENSBIXG00005029723) PRDM1 (ENSBIXG00005029779) ENSBIXG00005029830 ENSBIXG00005029840 PREP (ENSBIXG00005029865) POPDC3 (ENSBIXG00005029917) BVES (ENSBIXG00005029927) ENSBIXG00005029941 LIN28B (ENSBIXG00005029958) Cow MODERN SPECIES 28 CEP57L1 (ENSBTAG00000019410) SESN1 (ENSBTAG00000003015) ARMC2 (ENSBTAG00000036087) FOXO3 (ENSBTAG00000011234) AFG1L (ENSBTAG00000014592) ENSBTAG00000045504 SNX3 (ENSBTAG00000018801) NR2E1 (ENSBTAG00000013991) ENSBTAG00000010148 OSTM1 (ENSBTAG00000010134) ENSBTAG00000023792 SEC63 (ENSBTAG00000016562) SCML4 (ENSBTAG00000005699) SOBP (ENSBTAG00000019175) ENSBTAG00000052829 PDSS2 (ENSBTAG00000021859) #22 BEND3 (ENSBTAG00000012534) #23 MTRES1 (ENSBTAG00000021398) #24 ENSBTAG00000052465 QRSL1 (ENSBTAG00000017557) RTN4IP1 (ENSBTAG00000017554) CRYBG1 (ENSBTAG00000017527) ENSBTAG00000052057 ATG5 (ENSBTAG00000005400) PRDM1 (ENSBTAG00000000816) PREP (ENSBTAG00000016281) POPDC3 (ENSBTAG00000046017) BVES (ENSBTAG00000018790) LIN28B (ENSBTAG00000043973) HACE1 (ENSBTAG00000001533) ENSBTAG00000051738 Bos_a ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00390000005569.x.a.b.b.b ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00940000158886.g.b ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463.z ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000018829.g.b ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00390000004856.w.a.a.b.b.a.b.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 Domestic yak MODERN SPECIES 1 CD164 (ENSBGRG00000008478) ENSBGRG00000008378 CEP57L1 (ENSBGRG00000008020) SESN1 (ENSBGRG00000007696) ARMC2 (ENSBGRG00000007272) ENSBGRG00000007174 AFG1L (ENSBGRG00000007086) ENSBGRG00000007070 ENSBGRG00000006976 NR2E1 (ENSBGRG00000006910) ENSBGRG00000006887 OSTM1 (ENSBGRG00000006844) SEC63 (ENSBGRG00000006724) SCML4 (ENSBGRG00000006677) SOBP (ENSBGRG00000006590) PDSS2 (ENSBGRG00000006508) #22 ENSBGRG00000006478 MTRES1 (ENSBGRG00000006439) #24 ENSBGRG00000006411 ENSBGRG00000006389 ENSBGRG00000006311 QRSL1 (ENSBGRG00000006270) ENSBGRG00000006262 RTN4IP1 (ENSBGRG00000006146) CRYBG1 (ENSBGRG00000005685) ATG5 (ENSBGRG00000005379) PRDM1 (ENSBGRG00000005178) ENSBGRG00000005152 ENSBGRG00000005146 ENSBGRG00000005140 PREP (ENSBGRG00000005031) Wild yak MODERN SPECIES 972 ENSBMUG00000010221 ENSBMUG00000010234 SNX3 (ENSBMUG00000010256) NR2E1 (ENSBMUG00000010262) ENSBMUG00000010280 OSTM1 (ENSBMUG00000010287) ENSBMUG00000010297 SEC63 (ENSBMUG00000010331) SCML4 (ENSBMUG00000010375) SOBP (ENSBMUG00000010395) PDSS2 (ENSBMUG00000010415) #22 BEND3 (ENSBMUG00000010421) #23 MTRES1 (ENSBMUG00000010433) #24 CD24 (ENSBMUG00000010442) ENSBMUG00000010451 QRSL1 (ENSBMUG00000010508) RTN4IP1 (ENSBMUG00000010550) CRYBG1 (ENSBMUG00000010584) ENSBMUG00000010608 ENSBMUG00000010621 American bison MODERN SPECIES 3287 CEP57L1 (ENSBBBG00000001939) SESN1 (ENSBBBG00000001906) ARMC2 (ENSBBBG00000001902) ENSBBBG00000010823 AFG1L (ENSBBBG00000009042) ENSBBBG00000001898 SNX3 (ENSBBBG00000010797) NR2E1 (ENSBBBG00000010790) ENSBBBG00000010783 OSTM1 (ENSBBBG00000010779) ENSBBBG00000010776 SEC63 (ENSBBBG00000010770) SCML4 (ENSBBBG00000001886) ENSBBBG00000001880 ENSBBBG00000010739 PDSS2 (ENSBBBG00000010733) #22 BEND3 (ENSBBBG00000001878) #23 MTRES1 (ENSBBBG00000001874) #24 ENSBBBG00000010715 ENSBBBG00000010700 ENSBBBG00000010682 RTN4IP1 (ENSBBBG00000001868) CRYBG1 (ENSBBBG00000010653) ENSBBBG00000010639 ENSBBBG00000010638 ATG5 (ENSBBBG00000010625) PRDM1 (ENSBBBG00000010598) ENSBBBG00000001852 PREP (ENSBBBG00000010572) ENSBBBG00000001850 POPDC3 (ENSBBBG00000007299) Caprinae ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00940000158886.g.b ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463.z ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000018829.g.b ENSGT00550000074866.c ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00900000143654 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT01010000228077 ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 24 SMPD2 (ENSOARG00020008673) PPIL6 (ENSOARG00020008709) CD164 (ENSOARG00020008950) ENSOARG00020009174 CEP57L1 (ENSOARG00020009709) SESN1 (ENSOARG00020009820) ARMC2 (ENSOARG00020009986) FOXO3 (ENSOARG00020010382) AFG1L (ENSOARG00020010438) SNX3 (ENSOARG00020010555) NR2E1 (ENSOARG00020010722) OSTM1 (ENSOARG00020010926) SEC63 (ENSOARG00020011009) SCML4 (ENSOARG00020011208) SOBP (ENSOARG00020011474) PDSS2 (ENSOARG00020011577) #22 BEND3 (ENSOARG00020011619) #23 MTRES1 (ENSOARG00020011697) #24 CD24 (ENSOARG00020011839) QRSL1 (ENSOARG00020011934) RTN4IP1 (ENSOARG00020012231) CRYBG1 (ENSOARG00020012867) ENSOARG00020013506 ATG5 (ENSOARG00020013575) PRDM1 (ENSOARG00020013852) CYCS (ENSOARG00020014198) ENSOARG00020014217 PREP (ENSOARG00020014297) POPDC3 (ENSOARG00020014545) BVES (ENSOARG00020014598) ENSOARG00020014675 Goat MODERN SPECIES 28 PPIL6 (ENSCHIG00000003703) CD164 (ENSCHIG00000021803) ENSCHIG00000013583 CEP57L1 (ENSCHIG00000015261) SESN1 (ENSCHIG00000017822) ARMC2 (ENSCHIG00000014666) ENSCHIG00000018293 AFG1L (ENSCHIG00000015722) SNX3 (ENSCHIG00000003391) NR2E1 (ENSCHIG00000020755) ENSCHIG00000023983 OSTM1 (ENSCHIG00000017859) SEC63 (ENSCHIG00000021240) SCML4 (ENSCHIG00000010706) SOBP (ENSCHIG00000007832) PDSS2 (ENSCHIG00000015163) #22 BEND3 (ENSCHIG00000010728) #23 MTRES1 (ENSCHIG00000005527) #24 CD24 (ENSCHIG00000015151) ENSCHIG00000017313 RTN4IP1 (ENSCHIG00000011362) CRYBG1 (ENSCHIG00000020732) ATG5 (ENSCHIG00000019684) PRDM1 (ENSCHIG00000023368) PREP (ENSCHIG00000019257) POPDC3 (ENSCHIG00000016800) BVES (ENSCHIG00000008491) LIN28B (ENSCHIG00000011133) ENSCHIG00000015439 HACE1 (ENSCHIG00000025754) ENSCHIG00000025858 Siberian musk deer MODERN SPECIES 57 ENSMMSG00000008937 AFG1L (ENSMMSG00000008965) ENSMMSG00000009017 SNX3 (ENSMMSG00000009040) NR2E1 (ENSMMSG00000009124) ENSMMSG00000009182 OSTM1 (ENSMMSG00000009222) SEC63 (ENSMMSG00000009260) SCML4 (ENSMMSG00000009358) SOBP (ENSMMSG00000009483) PDSS2 (ENSMMSG00000009520) #22 ENSMMSG00000009562 BEND3 (ENSMMSG00000009582) #23 MTRES1 (ENSMMSG00000009604) #24 CD24 (ENSMMSG00000009656) ENSMMSG00000009682 QRSL1 (ENSMMSG00000009700) RTN4IP1 (ENSMMSG00000009752) CRYBG1 (ENSMMSG00000009812) ATG5 (ENSMMSG00000009989) PRDM1 (ENSMMSG00000010156) PREP (ENSMMSG00000010324) POPDC3 (ENSMMSG00000010364) BVES (ENSMMSG00000010405) ENSMMSG00000010511 LIN28B (ENSMMSG00000010589) Cetacea ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00390000007445 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b.`b.a ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT01000000221220 ENSGT00940000157463.z ENSGT00950000186137 ENSGT00940000157463.y.b ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000018829.g.a ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00900000143654 ENSGT00940000155695 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00940000158987.d ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00410000028929 ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b Blue whale MODERN SPECIES 3 PPIL6 (ENSBMSG00010013684) CD164 (ENSBMSG00010013715) ENSBMSG00010013794 CEP57L1 (ENSBMSG00010013852) SESN1 (ENSBMSG00010013987) ARMC2 (ENSBMSG00010014096) ENSBMSG00010014211 AFG1L (ENSBMSG00010014237) ENSBMSG00010014284 NR2E1 (ENSBMSG00010014344) OSTM1 (ENSBMSG00010014401) SEC63 (ENSBMSG00010014432) ENSBMSG00010014487 SCML4 (ENSBMSG00010014504) SOBP (ENSBMSG00010014588) PDSS2 (ENSBMSG00010014650) #22 BEND3 (ENSBMSG00010014671) #23 MTRES1 (ENSBMSG00010014698) #24 ENSBMSG00010014725 ENSBMSG00010014752 QRSL1 (ENSBMSG00010014781) RTN4IP1 (ENSBMSG00010014817) CRYBG1 (ENSBMSG00010014861) ENSBMSG00010014960 ATG5 (ENSBMSG00010015017) ENSBMSG00010015168 PRDM1 (ENSBMSG00010015211) ENSBMSG00010015421 PREP (ENSBMSG00010008712) POPDC3 (ENSBMSG00010008729) BVES (ENSBMSG00010008737) Odontoceti ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00390000007445 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b.`b.a ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT01000000221220 ENSGT00940000157463.y.b ENSGT00940000157463.z ENSGT00950000186137 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000018829.g.a ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00900000143654 ENSGT00940000155695 ENSGT00390000004766 ENSGT00390000004040.k.b ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00940000158987.d ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00410000028929 ENSGT00390000002563.a Sperm whale MODERN SPECIES 1 PPIL6 (ENSPCTG00005011484) CD164 (ENSPCTG00005011679) ENSPCTG00005012459 CEP57L1 (ENSPCTG00005012500) SESN1 (ENSPCTG00005012751) ARMC2 (ENSPCTG00005012871) FOXO3 (ENSPCTG00005013073) AFG1L (ENSPCTG00005013130) SNX3 (ENSPCTG00005013214) NR2E1 (ENSPCTG00005013389) OSTM1 (ENSPCTG00005013539) SEC63 (ENSPCTG00005013601) ENSPCTG00005013758 ENSPCTG00005013782 SOBP (ENSPCTG00005013850) PDSS2 (ENSPCTG00005013948) #22 BEND3 (ENSPCTG00005014036) #23 C10H6orf203 (ENSPCTG00005014085) #24 ENSPCTG00005014121 QRSL1 (ENSPCTG00005014148) RTN4IP1 (ENSPCTG00005014223) CRYBG1 (ENSPCTG00005014434) ENSPCTG00005014468 ENSPCTG00005014481 ATG5 (ENSPCTG00005014542) ENSPCTG00005014799 PRDM1 (ENSPCTG00005014867) ENSPCTG00005015126 PREP (ENSPCTG00005015210) POPDC3 (ENSPCTG00005015471) BVES (ENSPCTG00005015536) Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00390000007445 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b.`b.a ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT01000000221220 ENSGT00940000157463.y.b ENSGT00940000157463.z ENSGT00950000186137 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000018829.g.a ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00900000143654 ENSGT00940000155695 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00940000158987.d ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00410000028929 ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b Dolphin MODERN SPECIES 2147 PDSS2 (ENSTTRG00000007418) #22 BEND3 (ENSTTRG00000007417) #23 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT01000000221721 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b.`b.a ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT01000000221220 ENSGT00940000157463.y.b ENSGT00940000157463.z ENSGT00950000186137 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000018829.g.a ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00900000143654 ENSGT00940000155695 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00940000158987.d ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 Vaquita MODERN SPECIES 3 ENSPSNG00000012029 CEP57L1 (ENSPSNG00000012071) SESN1 (ENSPSNG00000012128) ARMC2 (ENSPSNG00000012236) ENSPSNG00000012269 ENSPSNG00000012289 AFG1L (ENSPSNG00000012339) SNX3 (ENSPSNG00000012388) NR2E1 (ENSPSNG00000012471) OSTM1 (ENSPSNG00000012562) ENSPSNG00000012614 SEC63 (ENSPSNG00000012696) ENSPSNG00000012847 SCML4 (ENSPSNG00000012885) SOBP (ENSPSNG00000013126) PDSS2 (ENSPSNG00000013250) #22 ENSPSNG00000013296 BEND3 (ENSPSNG00000013346) #23 MTRES1 (ENSPSNG00000013378) #24 ENSPSNG00000013443 QRSL1 (ENSPSNG00000013527) RTN4IP1 (ENSPSNG00000013614) CRYBG1 (ENSPSNG00000013720) ENSPSNG00000013855 ENSPSNG00000013913 ATG5 (ENSPSNG00000014006) ENSPSNG00000014192 PRDM1 (ENSPSNG00000014233) PREP (ENSPSNG00000014450) POPDC3 (ENSPSNG00000014548) BVES (ENSPSNG00000014643) Monodontidae ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b.`b.a ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT01000000221220 ENSGT00940000157463.y.b ENSGT00940000157463.z ENSGT00950000186137 ENSGT00940000154164.c ENSGT00390000012178.g.a.a ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366.l.a #24 ENSGT00390000018829.g.a ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00900000143654 ENSGT00940000155695 ENSGT00390000004856.w.b ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00940000158987.d ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b Beluga whale MODERN SPECIES 80 SESN1 (ENSDLEG00000017985) ARMC2 (ENSDLEG00000017871) FOXO3 (ENSDLEG00000017844) AFG1L (ENSDLEG00000017823) SNX3 (ENSDLEG00000017815) NR2E1 (ENSDLEG00000017794) ENSDLEG00000017771 ENSDLEG00000017753 SEC63 (ENSDLEG00000017708) ENSDLEG00000017689 ENSDLEG00000017674 SCML4 (ENSDLEG00000017668) ENSDLEG00000017650 SOBP (ENSDLEG00000017615) ENSDLEG00000017596 PDSS2 (ENSDLEG00000017583) #22 BEND3 (ENSDLEG00000017572) #23 CUNH6orf203 (ENSDLEG00000017561) #24 ENSDLEG00000017555 QRSL1 (ENSDLEG00000017520) RTN4IP1 (ENSDLEG00000017504) ENSDLEG00000017491 ENSDLEG00000017458 CRYBG1 (ENSDLEG00000017426) ENSDLEG00000017411 ATG5 (ENSDLEG00000017390) PRDM1 (ENSDLEG00000017371) ENSDLEG00000017350 PREP (ENSDLEG00000017313) POPDC3 (ENSDLEG00000017299) BVES (ENSDLEG00000017267) Narwhal MODERN SPECIES 301 CEP57L1 (ENSMMNG00015011010) SESN1 (ENSMMNG00015010978) ARMC2 (ENSMMNG00015010951) ENSMMNG00015010936 ENSMMNG00015010931 AFG1L (ENSMMNG00015010921) SNX3 (ENSMMNG00015010894) NR2E1 (ENSMMNG00015010867) ENSMMNG00015010843 OSTM1 (ENSMMNG00015010828) SEC63 (ENSMMNG00015010793) ENSMMNG00015010768 SCML4 (ENSMMNG00015010744) SOBP (ENSMMNG00015010729) ENSMMNG00015010718 PDSS2 (ENSMMNG00015010632) #22 BEND3 (ENSMMNG00015010606) #23 ENSMMNG00015010593 #24 ENSMMNG00015010579 QRSL1 (ENSMMNG00015010552) RTN4IP1 (ENSMMNG00015010517) ENSMMNG00015010497 CRYBG1 (ENSMMNG00015010430) ENSMMNG00015010395 ENSMMNG00015010386 PRDM1 (ENSMMNG00015010356) ATG5 (ENSMMNG00015010296) ENSMMNG00015010265 PREP (ENSMMNG00015010230) POPDC3 (ENSMMNG00015010209) BVES (ENSMMNG00015010194) Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000163170 ENSGT00940000165257 ENSGT00940000164734 ENSGT00390000002042 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000018829 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 ENSGT00940000155377 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000165257 ENSGT00940000164734 ENSGT00390000002042 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000018829 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 ENSGT00940000155377 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000165257 ENSGT00940000164734 ENSGT00390000002042 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000018829 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 ENSGT00940000155377 Elephant MODERN SPECIES 1 CD164 (ENSLAFG00000003292) ENSLAFG00000003291 ENSLAFG00000003290 ENSLAFG00000021442 CEP57L1 (ENSLAFG00000003209) SESN1 (ENSLAFG00000021864) ARMC2 (ENSLAFG00000005972) ENSLAFG00000005834 AFG1L (ENSLAFG00000005829) SNX3 (ENSLAFG00000018131) NR2E1 (ENSLAFG00000013583) OSTM1 (ENSLAFG00000000313) SEC63 (ENSLAFG00000017896) ENSLAFG00000013674 SOBP (ENSLAFG00000013670) PDSS2 (ENSLAFG00000013247) #22 BEND3 (ENSLAFG00000005298) #23 MTRES1 (ENSLAFG00000005301) #24 CD24 (ENSLAFG00000007742) QRSL1 (ENSLAFG00000012887) RTN4IP1 (ENSLAFG00000006744) ENSLAFG00000026098 ATG5 (ENSLAFG00000017057) PRDM1 (ENSLAFG00000013436) PREP (ENSLAFG00000006151) POPDC3 (ENSLAFG00000018065) BVES (ENSLAFG00000009474) LIN28B (ENSLAFG00000017788) HACE1 (ENSLAFG00000002989) GRIK2 (ENSLAFG00000016101) ASCC3 (ENSLAFG00000011363) Hyrax MODERN SPECIES 4779 SCML4 (ENSPCAG00000016440) SOBP (ENSPCAG00000016388) PDSS2 (ENSPCAG00000016350) #22 Tenrec MODERN SPECIES 5658 SOBP (ENSETEG00000000438) PDSS2 (ENSETEG00000000436) #22 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES 351 ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b Sloth MODERN SPECIES 5179 PDSS2 (ENSCHOG00000011631) #22 Armadillo MODERN SPECIES 3892 PDSS2 (ENSDNOG00000000559) #22 BEND3 (ENSDNOG00000035050) #23 ENSDNOG00000014433 #24 QRSL1 (ENSDNOG00000006990) RTN4IP1 (ENSDNOG00000006973) CRYBG1 (ENSDNOG00000006946) ENSDNOG00000046752 ATG5 (ENSDNOG00000013004) PRDM1 (ENSDNOG00000044646) PREP (ENSDNOG00000000259) POPDC3 (ENSDNOG00000041457) ENSDNOG00000033014 LIN28B (ENSDNOG00000015300) ENSDNOG00000040003 HACE1 (ENSDNOG00000015667) ENSDNOG00000032448 Marsupialia ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000009166 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000018829 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 ENSGT00940000155377 Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000009166 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000018829 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 ENSGT00940000155377 Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000009166 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000018829 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 ENSGT00940000155377 Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00390000009166 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000018829 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 ENSGT00940000155377 koala MODERN SPECIES 127 SMPD2 (ENSPCIG00000005984) PPIL6 (ENSPCIG00000005983) ENSPCIG00000005982 CEP57L1 (ENSPCIG00000005962) SESN1 (ENSPCIG00000005956) ARMC2 (ENSPCIG00000002328) ENSPCIG00000011521 AFG1L (ENSPCIG00000011135) SNX3 (ENSPCIG00000011129) NR2E1 (ENSPCIG00000011127) OSTM1 (ENSPCIG00000011126) SEC63 (ENSPCIG00000009133) SCML4 (ENSPCIG00000037215) ENSPCIG00000033617 ENSPCIG00000034417 PDSS2 (ENSPCIG00000020207) #22 BEND3 (ENSPCIG00000000335) #23 ENSPCIG00000000367 #24 Common wonbat MODERN SPECIES 36 SMPD2 (ENSVURG00010010716) PPIL6 (ENSVURG00010010703) ENSVURG00010010695 ENSVURG00010010606 CEP57L1 (ENSVURG00010010540) SESN1 (ENSVURG00010010516) ARMC2 (ENSVURG00010010463) ENSVURG00010010442 AFG1L (ENSVURG00010010424) SNX3 (ENSVURG00010010386) NR2E1 (ENSVURG00010010373) OSTM1 (ENSVURG00010010362) ENSVURG00010010352 SCML4 (ENSVURG00010010328) SOBP (ENSVURG00010010312) PDSS2 (ENSVURG00010010278) #22 BEND3 (ENSVURG00010010224) #23 MTRES1 (ENSVURG00010010203) #24 CD24 (ENSVURG00010010174) QRSL1 (ENSVURG00010010151) RTN4IP1 (ENSVURG00010010119) ENSVURG00010010101 CRYBG1 (ENSVURG00010010054) ATG5 (ENSVURG00010010025) PRDM1 (ENSVURG00010010010) PREP (ENSVURG00010009992) POPDC3 (ENSVURG00010009979) ENSVURG00010009977 BVES (ENSVURG00010009971) LIN28B (ENSVURG00010009956) HACE1 (ENSVURG00010009904) Wallaby MODERN SPECIES 7034 PDSS2 (ENSMEUG00000005839) #22 Tasmanian devil MODERN SPECIES 3 ENSSHAG00000029619 ENSSHAG00000007042 ENSSHAG00000032351 ENSSHAG00000021796 CEP57L1 (ENSSHAG00000005029) SESN1 (ENSSHAG00000002079) ARMC2 (ENSSHAG00000000930) ENSSHAG00000018299 AFG1L (ENSSHAG00000018044) SNX3 (ENSSHAG00000023627) NR2E1 (ENSSHAG00000017854) OSTM1 (ENSSHAG00000027777) SEC63 (ENSSHAG00000017510) SCML4 (ENSSHAG00000017079) SOBP (ENSSHAG00000029303) PDSS2 (ENSSHAG00000015599) #22 BEND3 (ENSSHAG00000015283) #23 MTRES1 (ENSSHAG00000015190) #24 QRSL1 (ENSSHAG00000013597) RTN4IP1 (ENSSHAG00000013285) CRYBG1 (ENSSHAG00000012880) ATG5 (ENSSHAG00000021331) PRDM1 (ENSSHAG00000010080) PREP (ENSSHAG00000014161) POPDC3 (ENSSHAG00000013513) BVES (ENSSHAG00000013121) LIN28B (ENSSHAG00000026134) HACE1 (ENSSHAG00000011274) GRIK2 (ENSSHAG00000018207) ASCC3 (ENSSHAG00000016496) SIM1 (ENSSHAG00000016220) Opossum MODERN SPECIES 1 PPIL6 (ENSMODG00000017973) ENSMODG00000017978 ENSMODG00000017983 CEP57L1 (ENSMODG00000017989) SESN1 (ENSMODG00000017990) ARMC2 (ENSMODG00000017993) ENSMODG00000017994 AFG1L (ENSMODG00000017996) SNX3 (ENSMODG00000044688) NR2E1 (ENSMODG00000018005) OSTM1 (ENSMODG00000018010) ENSMODG00000018012 SCML4 (ENSMODG00000018013) SOBP (ENSMODG00000018014) ENSMODG00000029480 PDSS2 (ENSMODG00000018016) #22 BEND3 (ENSMODG00000018019) #23 MTRES1 (ENSMODG00000018020) #24 ENSMODG00000018021 CD24 (ENSMODG00000049099) QRSL1 (ENSMODG00000018023) RTN4IP1 (ENSMODG00000018024) ENSMODG00000050075 CRYBG1 (ENSMODG00000023357) ATG5 (ENSMODG00000018027) PRDM1 (ENSMODG00000018029) ENSMODG00000028521 ENSMODG00000049471 ENSMODG00000023359 PREP (ENSMODG00000018031) POPDC3 (ENSMODG00000018033) Platypus MODERN SPECIES 10 ENSOANG00000038242 SESN1 (ENSOANG00000015028) ARMC2 (ENSOANG00000000766) ENSOANG00000000768 AFG1L (ENSOANG00000000769) SNX3 (ENSOANG00000000772) NR2E1 (ENSOANG00000000775) OSTM1 (ENSOANG00000000776) SEC63 (ENSOANG00000000777) SCML4 (ENSOANG00000036521) SOBP (ENSOANG00000048313) PDSS2 (ENSOANG00000000783) #22 BEND3 (ENSOANG00000050605) #23 ENSOANG00000000784 #24 QRSL1 (ENSOANG00000003897) RTN4IP1 (ENSOANG00000003898) ENSOANG00000003899 ATG5 (ENSOANG00000003900) PRDM1 (ENSOANG00000004176) PREP (ENSOANG00000004177) POPDC3 (ENSOANG00000004179) BVES (ENSOANG00000047336) ENSOANG00000047568 HACE1 (ENSOANG00000010300) GRIK2 (ENSOANG00000010302) ASCC3 (ENSOANG00000008944) SIM1 (ENSOANG00000008943) Sauria ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00390000007445 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00960000190953 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 ENSGT00940000155377 Archelosauria ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00390000007445 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00960000190953 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 ENSGT00940000155377 Archosauria ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00960000190953 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 ENSGT00940000155377 Aves ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00960000190953 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 ENSGT00940000155377 Neognathae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00960000190953 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 ENSGT00940000155377 Galloanserae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00960000190953 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 ENSGT00940000155377 Anatidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 ENSGT00940000155377 ENSGT00940000156143 Pink-footed goose MODERN SPECIES 43 ZBTB24 (ENSABRG00000002021) PPIL6 (ENSABRG00000002074) CD164 (ENSABRG00000002170) ENSABRG00000002188 CEP57L1 (ENSABRG00000002297) SESN1 (ENSABRG00000002320) ARMC2 (ENSABRG00000002385) ENSABRG00000002494 AFG1L (ENSABRG00000002507) SNX3 (ENSABRG00000002529) NR2E1 (ENSABRG00000002549) OSTM1 (ENSABRG00000002574) SEC63 (ENSABRG00000002590) SCML4 (ENSABRG00000002657) SOBP (ENSABRG00000002678) PDSS2 (ENSABRG00000002702) #22 BEND3 (ENSABRG00000002730) #23 MTRES1 (ENSABRG00000002742) #24 QRSL1 (ENSABRG00000002769) RTN4IP1 (ENSABRG00000002786) CRYBG1 (ENSABRG00000002822) ATG5 (ENSABRG00000002975) PRDM1 (ENSABRG00000003008) PREP (ENSABRG00000003068) POPDC3 (ENSABRG00000003098) BVES (ENSABRG00000003118) LIN28B (ENSABRG00000003182) HACE1 (ENSABRG00000003212) ENSABRG00000003277 Duck MODERN SPECIES 21 ENSAPLG00000013181 ENSAPLG00000013116 ZBTB24 (ENSAPLG00000012630) PPIL6 (ENSAPLG00000012560) ENSAPLG00000012348 ENSAPLG00000011913 SESN1 (ENSAPLG00000011647) ARMC2 (ENSAPLG00000011449) ENSAPLG00000011319 AFG1L (ENSAPLG00000011261) ENSAPLG00000021471 OSTM1 (ENSAPLG00000010663) SEC63 (ENSAPLG00000010176) SCML4 (ENSAPLG00000010070) SOBP (ENSAPLG00000019216) PDSS2 (ENSAPLG00000009546) #22 BEND3 (ENSAPLG00000009545) #23 MTRES1 (ENSAPLG00000009523) #24 QRSL1 (ENSAPLG00000009374) RTN4IP1 (ENSAPLG00000009151) CRYBG1 (ENSAPLG00000008606) ATG5 (ENSAPLG00000017968) PRDM1 (ENSAPLG00000013593) PREP (ENSAPLG00000014895) POPDC3 (ENSAPLG00000022652) BVES (ENSAPLG00000014413) LIN28B (ENSAPLG00000019549) HACE1 (ENSAPLG00000006280) ENSAPLG00000022892 ENSAPLG00000029538 ENSAPLG00000012994 Phasianidae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00960000190953 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 ENSGT00940000155377 Japanese quail MODERN SPECIES 21 ZBTB24 (ENSCJPG00005009404) PPIL6 (ENSCJPG00005009406) CD164 (ENSCJPG00005009407) ENSCJPG00005009408 ENSCJPG00005009411 SESN1 (ENSCJPG00005009414) ARMC2 (ENSCJPG00005009417) ENSCJPG00005009420 AFG1L (ENSCJPG00005009422) SNX3 (ENSCJPG00005009424) NR2E1 (ENSCJPG00005009425) SEC63 (ENSCJPG00005009426) SCML4 (ENSCJPG00005009429) SOBP (ENSCJPG00005009431) ENSCJPG00005009433 PDSS2 (ENSCJPG00005009434) #22 BEND3 (ENSCJPG00005009435) #23 MTRES1 (ENSCJPG00005009436) #24 QRSL1 (ENSCJPG00005009439) RTN4IP1 (ENSCJPG00005009443) CRYBG1 (ENSCJPG00005009445) ATG5 (ENSCJPG00005009448) PRDM1 (ENSCJPG00005009449) PREP (ENSCJPG00005009454) POPDC3 (ENSCJPG00005009455) BVES (ENSCJPG00005009456) LIN28B (ENSCJPG00005009457) HACE1 (ENSCJPG00005009458) GRIK2 (ENSCJPG00005009466) ASCC3 (ENSCJPG00005009467) SIM1 (ENSCJPG00005009469) Phasianidae_b ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00740000115564 ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000165946 ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00960000190953 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 ENSGT00940000155377 Chicken MODERN SPECIES 22 ZBTB24 (ENSGALG00010014135) PPIL6 (ENSGALG00010014142) CD164 (ENSGALG00010014156) ENSGALG00010014210 SESN1 (ENSGALG00010014244) ARMC2 (ENSGALG00010014288) ENSGALG00010014302 ENSGALG00010014309 AFG1L (ENSGALG00010014346) SNX3 (ENSGALG00010014380) NR2E1 (ENSGALG00010014453) OSTM1 (ENSGALG00010014487) SEC63 (ENSGALG00010014504) SCML4 (ENSGALG00010014550) SOBP (ENSGALG00010012445) PDSS2 (ENSGALG00010012466) #22 BEND3 (ENSGALG00010012529) #23 C6orf203 (ENSGALG00010012569) #24 CD24 (ENSGALG00010012582) QRSL1 (ENSGALG00010013016) RTN4IP1 (ENSGALG00010013076) CRYBG1 (ENSGALG00010013160) ATG5 (ENSGALG00010013247) PRDM1 (ENSGALG00010013292) PREP (ENSGALG00010013317) POPDC3 (ENSGALG00010013335) BVES (ENSGALG00010015800) LIN28B (ENSGALG00010013340) HACE1 (ENSGALG00010012419) GRIK2 (ENSGALG00010013006) ASCC3 (ENSGALG00010015140) Turkey MODERN SPECIES 11 ENSMGAG00000018692 ENSMGAG00000013379 AFG1L (ENSMGAG00000013490) SNX3 (ENSMGAG00000013494) NR2E1 (ENSMGAG00000013495) OSTM1 (ENSMGAG00000013498) ENSMGAG00000013524 ENSMGAG00000013523 ENSMGAG00000013520 ENSMGAG00000013519 ENSMGAG00000018204 ENSMGAG00000022679 QRSL1 (ENSMGAG00000013518) ENSMGAG00000013515 #23 ENSMGAG00000013517 #24 PDSS2 (ENSMGAG00000013514) #22 ENSMGAG00000013512 ENSMGAG00000021606 ENSMGAG00000020588 PREP (ENSMGAG00000013527) BVES (ENSMGAG00000013529) LIN28B (ENSMGAG00000013531) HACE1 (ENSMGAG00000013533) ENSMGAG00000015902 ENSMGAG00000018221 ENSMGAG00000019904 ENSMGAG00000022447 ENSMGAG00000013594 ENSMGAG00000021109 ENSMGAG00000019925 ENSMGAG00000022529 Neognathae_b ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00740000115564 ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 ENSGT00940000155377 ENSGT00940000156143 Neognathae_c ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00740000115564 ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 ENSGT00940000155377 ENSGT00940000156143 Golden eagle MODERN SPECIES 11 RFX6 (ENSACCG00020006700) VGLL2 (ENSACCG00020006724) ENSACCG00020006739 CEP57L1 (ENSACCG00020006757) SESN1 (ENSACCG00020006789) ARMC2 (ENSACCG00020006846) ENSACCG00020006878 AFG1L (ENSACCG00020006893) SNX3 (ENSACCG00020006910) NR2E1 (ENSACCG00020006946) OSTM1 (ENSACCG00020006965) SEC63 (ENSACCG00020006981) ENSACCG00020006999 ENSACCG00020007009 SOBP (ENSACCG00020007022) PDSS2 (ENSACCG00020007038) #22 BEND3 (ENSACCG00020007047) #23 MTRES1 (ENSACCG00020007067) #24 QRSL1 (ENSACCG00020007083) RTN4IP1 (ENSACCG00020007099) CRYBG1 (ENSACCG00020007223) ATG5 (ENSACCG00020007338) PRDM1 (ENSACCG00020007354) PREP (ENSACCG00020007365) POPDC3 (ENSACCG00020007382) BVES (ENSACCG00020007400) LIN28B (ENSACCG00020007419) HACE1 (ENSACCG00020007438) GRIK2 (ENSACCG00020007485) ASCC3 (ENSACCG00020007539) SIM1 (ENSACCG00020007595) Kakapo MODERN SPECIES 23 ZBTB24 (ENSSHBG00005000405) PPIL6 (ENSSHBG00005000409) ENSSHBG00005000411 ENSSHBG00005000412 ENSSHBG00005000414 SESN1 (ENSSHBG00005000417) ARMC2 (ENSSHBG00005000420) ENSSHBG00005000424 AFG1L (ENSSHBG00005006641) SNX3 (ENSSHBG00005006685) NR2E1 (ENSSHBG00005006698) OSTM1 (ENSSHBG00005006714) SEC63 (ENSSHBG00005006731) SCML4 (ENSSHBG00005006744) SOBP (ENSSHBG00005006768) PDSS2 (ENSSHBG00005006788) #22 BEND3 (ENSSHBG00005006817) #23 MTRES1 (ENSSHBG00005006842) #24 QRSL1 (ENSSHBG00005006858) RTN4IP1 (ENSSHBG00005006887) CRYBG1 (ENSSHBG00005006932) ATG5 (ENSSHBG00005006968) PRDM1 (ENSSHBG00005006993) PREP (ENSSHBG00005007018) POPDC3 (ENSSHBG00005007036) BVES (ENSSHBG00005007052) LIN28B (ENSSHBG00005007139) HACE1 (ENSSHBG00005007193) GRIK2 (ENSSHBG00005007267) ASCC3 (ENSSHBG00005007565) SIM1 (ENSSHBG00005008456) Passeriformes ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00740000115564 ENSGT00940000159373 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00960000191023 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 ENSGT00940000155377 ENSGT00940000156143 Great tit MODERN SPECIES 22 CD164 (ENSPMJG00000015306) CEP57L1 (ENSPMJG00000015311) SESN1 (ENSPMJG00000015312) ARMC2 (ENSPMJG00000015313) ENSPMJG00000015315 AFG1L (ENSPMJG00000015316) SNX3 (ENSPMJG00000015317) NR2E1 (ENSPMJG00000015318) OSTM1 (ENSPMJG00000015320) ENSPMJG00000015321 SEC63 (ENSPMJG00000015322) ENSPMJG00000015323 ENSPMJG00000015324 ENSPMJG00000015325 SOBP (ENSPMJG00000015326) PDSS2 (ENSPMJG00000015327) #22 BEND3 (ENSPMJG00000015328) #23 MTRES1 (ENSPMJG00000015329) #24 QRSL1 (ENSPMJG00000015332) RTN4IP1 (ENSPMJG00000015333) CRYBG1 (ENSPMJG00000015334) ATG5 (ENSPMJG00000000069) PRDM1 (ENSPMJG00000000106) PREP (ENSPMJG00000000193) POPDC3 (ENSPMJG00000000231) BVES (ENSPMJG00000000259) LIN28B (ENSPMJG00000000304) HACE1 (ENSPMJG00000000330) GRIK2 (ENSPMJG00000000444) ASCC3 (ENSPMJG00000000583) SIM1 (ENSPMJG00000000702) Passeriformes_d ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00740000115564 ENSGT00940000159373 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00960000191023 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 ENSGT00940000155377 ENSGT00940000156143 Passeriformes_g ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00740000115564 ENSGT00940000159373 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00960000191023 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 ENSGT00940000155377 ENSGT00940000156143 Passeroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00550000074943 ENSGT00740000115564 ENSGT00940000159373 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 ENSGT00940000155377 ENSGT00940000156143 Common canary MODERN SPECIES 1 AK9 (ENSSCAG00000000143) ZBTB24 (ENSSCAG00000000183) ENSSCAG00000000225 CEP57L1 (ENSSCAG00000000239) SESN1 (ENSSCAG00000000267) ARMC2 (ENSSCAG00000000302) ENSSCAG00000000367 AFG1L (ENSSCAG00000000396) SNX3 (ENSSCAG00000000476) NR2E1 (ENSSCAG00000000484) OSTM1 (ENSSCAG00000000492) SEC63 (ENSSCAG00000000504) SCML4 (ENSSCAG00000000531) ENSSCAG00000000536 SOBP (ENSSCAG00000000565) PDSS2 (ENSSCAG00000000586) #22 BEND3 (ENSSCAG00000000615) #23 MTRES1 (ENSSCAG00000000620) #24 QRSL1 (ENSSCAG00000000635) RTN4IP1 (ENSSCAG00000000647) CRYBG1 (ENSSCAG00000000675) ATG5 (ENSSCAG00000000793) PRDM1 (ENSSCAG00000000801) PREP (ENSSCAG00000000866) POPDC3 (ENSSCAG00000000884) BVES (ENSSCAG00000000898) LIN28B (ENSSCAG00000000914) HACE1 (ENSSCAG00000000966) GRIK2 (ENSSCAG00000001013) ASCC3 (ENSSCAG00000001112) SIM1 (ENSSCAG00000001136) Zebra finch MODERN SPECIES 23 AK9 (ENSTGUG00000012097) ZBTB24 (ENSTGUG00000012098) CD164 (ENSTGUG00000028695) CEP57L1 (ENSTGUG00000012107) SESN1 (ENSTGUG00000012113) ARMC2 (ENSTGUG00000012122) ENSTGUG00000012135 AFG1L (ENSTGUG00000012136) NR2E1 (ENSTGUG00000012147) SNX3 (ENSTGUG00000012141) OSTM1 (ENSTGUG00000012154) SEC63 (ENSTGUG00000012155) ENSTGUG00000012164 ENSTGUG00000027856 SOBP (ENSTGUG00000012167) PDSS2 (ENSTGUG00000012168) #22 BEND3 (ENSTGUG00000012175) #23 MTRES1 (ENSTGUG00000012177) #24 QRSL1 (ENSTGUG00000012180) RTN4IP1 (ENSTGUG00000012187) CRYBG1 (ENSTGUG00000012192) ATG5 (ENSTGUG00000012200) PRDM1 (ENSTGUG00000012204) PREP (ENSTGUG00000012206) POPDC3 (ENSTGUG00000029737) BVES (ENSTGUG00000012218) LIN28B (ENSTGUG00000029445) HACE1 (ENSTGUG00000012227) GRIK2 (ENSTGUG00000012240) ASCC3 (ENSTGUG00000012262) SIM1 (ENSTGUG00000012278) Medium ground finch MODERN SPECIES 9 ZBTB24 (ENSGFOG00000004946) AK9 (ENSGFOG00000004838) CD164 (ENSGFOG00000004802) CEP57L1 (ENSGFOG00000004778) SESN1 (ENSGFOG00000004752) ARMC2 (ENSGFOG00000004703) ENSGFOG00000004686 AFG1L (ENSGFOG00000004621) SNX3 (ENSGFOG00000004607) NR2E1 (ENSGFOG00000004562) OSTM1 (ENSGFOG00000004506) ENSGFOG00000004482 SEC63 (ENSGFOG00000004464) SCML4 (ENSGFOG00000004405) SOBP (ENSGFOG00000004389) PDSS2 (ENSGFOG00000004353) #22 BEND3 (ENSGFOG00000004347) #23 ENSGFOG00000004336 ADGRF5 (ENSGFOG00000004314) TNFRSF21 (ENSGFOG00000004293) CD2AP (ENSGFOG00000004279) ENSGFOG00000004244 OPN5 (ENSGFOG00000004205) PTCHD4 (ENSGFOG00000004194) ENSGFOG00000004175 MRPL19 (ENSGFOG00000004154) GCFC2 (ENSGFOG00000004136) ENSGFOG00000004125 ITSN2 (ENSGFOG00000004102) ENSGFOG00000004093 TP53I3 (ENSGFOG00000004084) Flycatcher MODERN SPECIES 21 ENSFALG00000026289 ENSFALG00000011862 ZBTB24 (ENSFALG00000011851) CD164 (ENSFALG00000024174) ENSFALG00000024436 SESN1 (ENSFALG00000011813) ARMC2 (ENSFALG00000011800) ENSFALG00000025540 AFG1L (ENSFALG00000028584) SNX3 (ENSFALG00000011775) NR2E1 (ENSFALG00000027672) OSTM1 (ENSFALG00000027733) SEC63 (ENSFALG00000011739) SCML4 (ENSFALG00000011729) SOBP (ENSFALG00000011712) PDSS2 (ENSFALG00000024360) #22 MTRES1 (ENSFALG00000011688) #24 QRSL1 (ENSFALG00000011682) RTN4IP1 (ENSFALG00000027502) CRYBG1 (ENSFALG00000028843) ATG5 (ENSFALG00000011631) PRDM1 (ENSFALG00000011624) PREP (ENSFALG00000011608) POPDC3 (ENSFALG00000011603) BVES (ENSFALG00000011583) LIN28B (ENSFALG00000023138) HACE1 (ENSFALG00000011548) GRIK2 (ENSFALG00000005281) ASCC3 (ENSFALG00000005260) SIM1 (ENSFALG00000009592) PRDM13 (ENSFALG00000025976) African ostrich MODERN SPECIES 685 PPIL6 (ENSSCUG00000008888) CD164 (ENSSCUG00000008884) ENSSCUG00000008873 CEP57L1 (ENSSCUG00000008859) SESN1 (ENSSCUG00000008852) ARMC2 (ENSSCUG00000008845) ENSSCUG00000008840 AFG1L (ENSSCUG00000008839) SNX3 (ENSSCUG00000008837) NR2E1 (ENSSCUG00000008835) OSTM1 (ENSSCUG00000008834) ENSSCUG00000008831 SEC63 (ENSSCUG00000008829) SCML4 (ENSSCUG00000008824) SOBP (ENSSCUG00000008820) PDSS2 (ENSSCUG00000008819) #22 BEND3 (ENSSCUG00000008817) #23 MTRES1 (ENSSCUG00000008816) #24 QRSL1 (ENSSCUG00000008810) RTN4IP1 (ENSSCUG00000008804) CRYBG1 (ENSSCUG00000008797) ATG5 (ENSSCUG00000008790) PRDM1 (ENSSCUG00000008787) PREP (ENSSCUG00000008776) POPDC3 (ENSSCUG00000008774) BVES (ENSSCUG00000008772) LIN28B (ENSSCUG00000008767) HACE1 (ENSSCUG00000008760) ENSSCUG00000008750 Australian saltwater crocodile MODERN SPECIES 38 PPIL6 (ENSCPRG00005001746) CD164 (ENSCPRG00005001741) ENSCPRG00005001734 CEP57L1 (ENSCPRG00005001707) SESN1 (ENSCPRG00005001512) ARMC2 (ENSCPRG00005001485) ENSCPRG00005001465 AFG1L (ENSCPRG00005001415) SNX3 (ENSCPRG00005001413) NR2E1 (ENSCPRG00005001409) OSTM1 (ENSCPRG00005001321) ENSCPRG00005001317 SEC63 (ENSCPRG00005001290) SCML4 (ENSCPRG00005001262) SOBP (ENSCPRG00005001260) PDSS2 (ENSCPRG00005001243) #22 BEND3 (ENSCPRG00005001204) #23 MTRES1 (ENSCPRG00005001199) #24 QRSL1 (ENSCPRG00005001174) RTN4IP1 (ENSCPRG00005001145) CRYBG1 (ENSCPRG00005001130) ATG5 (ENSCPRG00005001095) PRDM1 (ENSCPRG00005001075) PREP (ENSCPRG00005001045) POPDC3 (ENSCPRG00005001029) BVES (ENSCPRG00005001021) LIN28B (ENSCPRG00005001009) ENSCPRG00005000982 HACE1 (ENSCPRG00005000946) GRIK2 (ENSCPRG00005000722) ASCC3 (ENSCPRG00005000542) Cryptodira ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00390000007445 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 ENSGT00940000155377 ENSGT00940000156143 Testudinoidea ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 ENSGT00940000155377 ENSGT00940000156143 Emydidae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 ENSGT00940000155377 ENSGT00940000156143 painted turtle MODERN SPECIES 2422 CD164 (ENSCPBG00000006349) ENSCPBG00000006338 CEP57L1 (ENSCPBG00000006325) SESN1 (ENSCPBG00000006317) ARMC2 (ENSCPBG00000006308) ENSCPBG00000006292 AFG1L (ENSCPBG00000006280) SNX3 (ENSCPBG00000006271) NR2E1 (ENSCPBG00000006262) ENSCPBG00000006236 OSTM1 (ENSCPBG00000006232) ENSCPBG00000006227 SEC63 (ENSCPBG00000006213) SCML4 (ENSCPBG00000006199) SOBP (ENSCPBG00000006184) PDSS2 (ENSCPBG00000006170) #22 BEND3 (ENSCPBG00000006167) #23 MTRES1 (ENSCPBG00000006157) #24 QRSL1 (ENSCPBG00000006147) RTN4IP1 (ENSCPBG00000006136) CRYBG1 (ENSCPBG00000004238) ATG5 (ENSCPBG00000004179) PRDM1 (ENSCPBG00000004165) PREP (ENSCPBG00000004147) POPDC3 (ENSCPBG00000004134) BVES (ENSCPBG00000004119) LIN28B (ENSCPBG00000004104) HACE1 (ENSCPBG00000004045) ENSCPBG00000003987 ENSCPBG00000003981 GRIK2 (ENSCPBG00000003946) Three-toed box turtle MODERN SPECIES 15 ENSTMTG00000000710 CEP57L1 (ENSTMTG00000000745) SESN1 (ENSTMTG00000000764) ARMC2 (ENSTMTG00000000806) ENSTMTG00000000825 ENSTMTG00000000836 AFG1L (ENSTMTG00000000876) SNX3 (ENSTMTG00000000952) NR2E1 (ENSTMTG00000000962) OSTM1 (ENSTMTG00000000985) SEC63 (ENSTMTG00000000995) ENSTMTG00000001014 ENSTMTG00000001019 ENSTMTG00000001027 SOBP (ENSTMTG00000001041) PDSS2 (ENSTMTG00000001055) #22 BEND3 (ENSTMTG00000001065) #23 ENSTMTG00000001079 MTRES1 (ENSTMTG00000001088) #24 QRSL1 (ENSTMTG00000001095) RTN4IP1 (ENSTMTG00000001116) CRYBG1 (ENSTMTG00000001144) ATG5 (ENSTMTG00000001175) PRDM1 (ENSTMTG00000001194) PREP (ENSTMTG00000001210) POPDC3 (ENSTMTG00000001226) BVES (ENSTMTG00000001231) LIN28B (ENSTMTG00000001243) HACE1 (ENSTMTG00000001261) GRIK2 (ENSTMTG00000001374) ASCC3 (ENSTMTG00000001886) Testudinidae ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 ENSGT00940000155377 ENSGT00940000156143 Goode s thornscrub tortoise MODERN SPECIES 17 SESN1 (ENSGEVG00005010380) ARMC2 (ENSGEVG00005010280) ENSGEVG00005010206 ENSGEVG00005010163 ENSGEVG00005010097 ENSGEVG00005010074 AFG1L (ENSGEVG00005010032) SNX3 (ENSGEVG00005009991) NR2E1 (ENSGEVG00005009891) OSTM1 (ENSGEVG00005009859) ENSGEVG00005009841 SEC63 (ENSGEVG00005009790) ENSGEVG00005009741 ENSGEVG00005009696 SOBP (ENSGEVG00005009603) PDSS2 (ENSGEVG00005009557) #22 BEND3 (ENSGEVG00005009513) #23 MTRES1 (ENSGEVG00005009472) #24 QRSL1 (ENSGEVG00005009425) RTN4IP1 (ENSGEVG00005009393) CRYBG1 (ENSGEVG00005009083) ATG5 (ENSGEVG00005009020) PRDM1 (ENSGEVG00005003790) PREP (ENSGEVG00005003770) POPDC3 (ENSGEVG00005003754) BVES (ENSGEVG00005003745) LIN28B (ENSGEVG00005003726) HACE1 (ENSGEVG00005003662) ENSGEVG00005003633 GRIK2 (ENSGEVG00005003385) ASCC3 (ENSGEVG00005003199) Abingdon island giant tortoise MODERN SPECIES 829 PDSS2 (ENSCABG00000019834) #22 Chinese turtle MODERN SPECIES 1101 ENSPSIG00000008723 CEP57L1 (ENSPSIG00000008493) ENSPSIG00000008445 SESN1 (ENSPSIG00000008436) ARMC2 (ENSPSIG00000007818) ENSPSIG00000001197 ENSPSIG00000007776 ENSPSIG00000001187 AFG1L (ENSPSIG00000007699) SNX3 (ENSPSIG00000006770) NR2E1 (ENSPSIG00000006035) OSTM1 (ENSPSIG00000006027) SEC63 (ENSPSIG00000005853) SCML4 (ENSPSIG00000005585) SOBP (ENSPSIG00000005413) PDSS2 (ENSPSIG00000005144) #22 BEND3 (ENSPSIG00000005074) #23 MTRES1 (ENSPSIG00000005067) #24 QRSL1 (ENSPSIG00000018066) RTN4IP1 (ENSPSIG00000017894) ENSPSIG00000017793 Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00960000190953 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 ENSGT00940000155377 Episquamata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00960000190953 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 ENSGT00940000155377 Laterata ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 ENSGT00940000155377 ENSGT00940000156143 Common wall lizard MODERN SPECIES 11 PPIL6 (ENSPMRG00000003033) CD164 (ENSPMRG00000003020) ENSPMRG00000002961 CEP57L1 (ENSPMRG00000002944) SESN1 (ENSPMRG00000002928) ARMC2 (ENSPMRG00000002915) ENSPMRG00000002905 ENSPMRG00000002895 AFG1L (ENSPMRG00000002870) SNX3 (ENSPMRG00000002854) NR2E1 (ENSPMRG00000002845) OSTM1 (ENSPMRG00000002840) SEC63 (ENSPMRG00000002784) SCML4 (ENSPMRG00000002753) SOBP (ENSPMRG00000002743) PDSS2 (ENSPMRG00000002734) #22 BEND3 (ENSPMRG00000002730) #23 ENSPMRG00000002726 #24 QRSL1 (ENSPMRG00000002712) RTN4IP1 (ENSPMRG00000002681) CRYBG1 (ENSPMRG00000002468) ATG5 (ENSPMRG00000002433) PRDM1 (ENSPMRG00000002419) ENSPMRG00000002413 PREP (ENSPMRG00000002400) POPDC3 (ENSPMRG00000002395) BVES (ENSPMRG00000007832) LIN28B (ENSPMRG00000007830) ENSPMRG00000007826 GRIK2 (ENSPMRG00000007778) ASCC3 (ENSPMRG00000007709) Argentine black and white tegu MODERN SPECIES 2 ENSSMRG00000013284 ENSSMRG00000013285 CEP57L1 (ENSSMRG00000013290) SESN1 (ENSSMRG00000013292) ARMC2 (ENSSMRG00000013293) ENSSMRG00000013294 ENSSMRG00000013296 ENSSMRG00000013298 AFG1L (ENSSMRG00000013302) SNX3 (ENSSMRG00000013304) NR2E1 (ENSSMRG00000013306) OSTM1 (ENSSMRG00000013307) SEC63 (ENSSMRG00000013310) SCML4 (ENSSMRG00000013314) SOBP (ENSSMRG00000013316) PDSS2 (ENSSMRG00000013317) #22 BEND3 (ENSSMRG00000013319) #23 MTRES1 (ENSSMRG00000013320) #24 QRSL1 (ENSSMRG00000013322) RTN4IP1 (ENSSMRG00000013323) CRYBG1 (ENSSMRG00000013325) ATG5 (ENSSMRG00000013331) PRDM1 (ENSSMRG00000013332) PREP (ENSSMRG00000013333) POPDC3 (ENSSMRG00000013334) BVES (ENSSMRG00000013335) LIN28B (ENSSMRG00000013336) HACE1 (ENSSMRG00000013337) ENSSMRG00000013339 GRIK2 (ENSSMRG00000013342) ASCC3 (ENSSMRG00000013348) Toxicofera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00960000190953 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 ENSGT00940000155377 Elapidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00960000190953 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 ENSGT00940000155377 Elapidae_a ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00960000190953 ENSGT00550000074866.a ENSGT00550000074866.b ENSGT00880000138028.b.b.h ENSGT00880000138028.b.b.g ENSGT00940000155695 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 Acanthophiinae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00960000190953 ENSGT00550000074866.b ENSGT00880000138028.b.b.h ENSGT00880000138028.b.b.g ENSGT00940000155695 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 Eastern brown snake MODERN SPECIES 4 ENSPTXG00000014181 ENSPTXG00000014182 CEP57L1 (ENSPTXG00000006876) SESN1 (ENSPTXG00000006877) ARMC2 (ENSPTXG00000006879) ENSPTXG00000006882 ENSPTXG00000006886 AFG1L (ENSPTXG00000006888) SNX3 (ENSPTXG00000006890) NR2E1 (ENSPTXG00000006891) OSTM1 (ENSPTXG00000006893) SEC63 (ENSPTXG00000006895) SCML4 (ENSPTXG00000006896) ENSPTXG00000006897 SOBP (ENSPTXG00000006898) PDSS2 (ENSPTXG00000006900) #22 BEND3 (ENSPTXG00000006903) #23 MTRES1 (ENSPTXG00000006904) #24 ENSPTXG00000006905 ENSPTXG00000006906 ENSPTXG00000006907 RTN4IP1 (ENSPTXG00000006908) CRYBG1 (ENSPTXG00000006909) ATG5 (ENSPTXG00000006911) PRDM1 (ENSPTXG00000006912) PREP (ENSPTXG00000006913) POPDC3 (ENSPTXG00000006914) BVES (ENSPTXG00000006915) LIN28B (ENSPTXG00000006916) HACE1 (ENSPTXG00000006917) GRIK2 (ENSPTXG00000006929) Mainland tiger snake MODERN SPECIES 16 CD164 (ENSNSUG00000018313) ENSNSUG00000018312 CEP57L1 (ENSNSUG00000018311) SESN1 (ENSNSUG00000018253) ARMC2 (ENSNSUG00000018252) ENSNSUG00000018251 ENSNSUG00000018250 AFG1L (ENSNSUG00000018249) SNX3 (ENSNSUG00000018248) NR2E1 (ENSNSUG00000018247) OSTM1 (ENSNSUG00000018246) SEC63 (ENSNSUG00000018107) SCML4 (ENSNSUG00000018103) ENSNSUG00000018102 SOBP (ENSNSUG00000018101) PDSS2 (ENSNSUG00000018098) #22 BEND3 (ENSNSUG00000018097) #23 MTRES1 (ENSNSUG00000018096) #24 ENSNSUG00000018094 QRSL1 (ENSNSUG00000018093) ENSNSUG00000018092 ENSNSUG00000018090 CRYBG1 (ENSNSUG00000018073) ATG5 (ENSNSUG00000018071) PRDM1 (ENSNSUG00000018069) PREP (ENSNSUG00000017917) POPDC3 (ENSNSUG00000017913) BVES (ENSNSUG00000017912) LIN28B (ENSNSUG00000017911) HACE1 (ENSNSUG00000017909) GRIK2 (ENSNSUG00000017907) Blue-lipped sea krait MODERN SPECIES 4788 PDSS2 (ENSLLTG00000015532) #22 Indian cobra MODERN SPECIES ZBTB24 (ENSNNAG00000000761) PPIL6 (ENSNNAG00000000769) CD164 (ENSNNAG00000000779) ENSNNAG00000000796 CEP57L1 (ENSNNAG00000000903) SESN1 (ENSNNAG00000000946) ARMC2 (ENSNNAG00000000975) ENSNNAG00000000996 AFG1L (ENSNNAG00000001013) SNX3 (ENSNNAG00000001033) NR2E1 (ENSNNAG00000001048) OSTM1 (ENSNNAG00000001068) SEC63 (ENSNNAG00000001110) SCML4 (ENSNNAG00000001175) SOBP (ENSNNAG00000001188) PDSS2 (ENSNNAG00000001202) #22 BEND3 (ENSNNAG00000001219) #23 MTRES1 (ENSNNAG00000001224) #24 ENSNNAG00000001237 QRSL1 (ENSNNAG00000001246) RTN4IP1 (ENSNNAG00000001272) CRYBG1 (ENSNNAG00000001368) ATG5 (ENSNNAG00000001541) PRDM1 (ENSNNAG00000001559) PREP (ENSNNAG00000001576) POPDC3 (ENSNNAG00000001593) BVES (ENSNNAG00000001601) LIN28B (ENSNNAG00000001614) HACE1 (ENSNNAG00000001627) GRIK2 (ENSNNAG00000002042) ASCC3 (ENSNNAG00000002415) tuatara MODERN SPECIES 781 ENSSPUG00000006960 AFG1L (ENSSPUG00000006972) SNX3 (ENSSPUG00000006997) NR2E1 (ENSSPUG00000007007) OSTM1 (ENSSPUG00000007022) SEC63 (ENSSPUG00000007035) ENSSPUG00000007093 ENSSPUG00000007098 PDSS2 (ENSSPUG00000007117) #22 MTRES1 (ENSSPUG00000007141) #24 ENSSPUG00000007149 QRSL1 (ENSSPUG00000007158) ENSSPUG00000007163 ENSSPUG00000007175 CRYBG1 (ENSSPUG00000007257) ATG5 (ENSSPUG00000007600) PRDM1 (ENSSPUG00000007628) Anura ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.b ENSGT00940000165946 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a ENSGT00940000153295.b ENSGT00940000155839 ENSGT00940000155610 ENSGT00940000155377 ENSGT00940000156143 Leishan spiny toad MODERN SPECIES 7 ENSLLEG00000025950 ENSLLEG00000026751 NR2E1 (ENSLLEG00000026822) SNX3 (ENSLLEG00000027054) ENSLLEG00000027151 AFG1L (ENSLLEG00000027182) ENSLLEG00000027380 ENSLLEG00000027399 ARMC2 (ENSLLEG00000027469) ENSLLEG00000027615 SESN1 (ENSLLEG00000027639) ENSLLEG00000027733 SCML4 (ENSLLEG00000027770) ENSLLEG00000027857 SOBP (ENSLLEG00000027910) PDSS2 (ENSLLEG00000014579) #22 BEND3 (ENSLLEG00000014794) #23 QRSL1 (ENSLLEG00000014906) ENSLLEG00000015371 RTN4IP1 (ENSLLEG00000015388) CRYBG1 (ENSLLEG00000015541) ENSLLEG00000015884 ATG5 (ENSLLEG00000015928) PRDM1 (ENSLLEG00000016024) PREP (ENSLLEG00000016113) ENSLLEG00000016433 BVES (ENSLLEG00000016474) POPDC3 (ENSLLEG00000016822) ENSLLEG00000016881 LIN28B (ENSLLEG00000016986) ENSLLEG00000017051 Coelacanth MODERN SPECIES 349 ENSLACG00000017646 CEP57L1 (ENSLACG00000017598) SESN1 (ENSLACG00000017303) ENSLACG00000022629 ENSLACG00000016990 ENSLACG00000016385 AFG1L (ENSLACG00000016109) SNX3 (ENSLACG00000015744) NR2E1 (ENSLACG00000015675) SEC63 (ENSLACG00000014494) ENSLACG00000013995 SCML4 (ENSLACG00000013280) ENSLACG00000012669 PDSS2 (ENSLACG00000008720) #22 BEND3 (ENSLACG00000007666) #23 MTRES1 (ENSLACG00000007220) #24 Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES 132 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.b ENSGT00940000163170 ENSGT00390000007445 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b Reedfish MODERN SPECIES 11 cd164 (ENSECRG00000000670) ENSECRG00000000698 cep57l1 (ENSECRG00000000737) sesn1 (ENSECRG00000000779) ARMC2 (ENSECRG00000000830) FOXO3 (ENSECRG00000000874) afg1la (ENSECRG00000000902) ENSECRG00000000933 snx3 (ENSECRG00000000950) nr2e1 (ENSECRG00000001015) OSTM1 (ENSECRG00000001153) sec63 (ENSECRG00000001182) SCML4 (ENSECRG00000001212) ENSECRG00000001232 sobpa (ENSECRG00000001248) pdss2 (ENSECRG00000001266) #22 bend3 (ENSECRG00000001297) #23 mtres1 (ENSECRG00000001319) #24 rtn4ip1 (ENSECRG00000001347) ENSECRG00000001379 CEP162 (ENSECRG00000001445) mrap2a (ENSECRG00000001507) CYB5R4 (ENSECRG00000001521) sim1a (ENSECRG00000001559) ASCC3 (ENSECRG00000001635) GRIK2 (ENSECRG00000001851) ENSECRG00000001886 HACE1 (ENSECRG00000001907) lin28b (ENSECRG00000001972) bves (ENSECRG00000002028) popdc3 (ENSECRG00000002057) Neopterygii ANCESTRAL SPECIES 107 ENSGT00530000063929.a.b ENSGT00940000163170 ENSGT00390000007445 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00940000174412 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 70 ENSGT00390000009688 ENSGT00590000083139.c ENSGT00590000083139.d ENSGT00940000154645.A ENSGT00950000182995.e.a.a.a ENSGT00390000007900 ENSGT00390000004263.b ENSGT00940000155646 ENSGT00940000160213.b ENSGT00940000165355 ENSGT00940000160213.a ENSGT00940000154459.B ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.B.b ENSGT00940000154164.c.a ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695.i.b Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 359 ENSGT00590000083139.d.b ENSGT00940000154645.A ENSGT00940000155646 ENSGT00940000160213.b ENSGT00940000165355 ENSGT00940000160213.a ENSGT00940000154459.B ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.B.b ENSGT00940000154164.c.a ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 141 ENSGT00940000174412 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463.b ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00940000158432 ENSGT00390000018199.a ENSGT00390000003316.c.b.a ENSGT00940000156891.a.b ENSGT00940000153804.A ENSGT00940000160213.b ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.B.b ENSGT00940000154164.c.a ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00940000157581.a ENSGT00940000155745 ENSGT00940000155979.g ENSGT00940000160181.i Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 61 ENSGT00940000157229 ENSGT00940000164928 ENSGT00920000149143 ENSGT00940000158191.a ENSGT00950000183192.a.a ENSGT00950000183195.b.a ENSGT00730000111019.e.a ENSGT00940000160213.a ENSGT00940000154459.B ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.C ENSGT00940000154164.c.b ENSGT00880000138028.b.a ENSGT01030000234517.B.b ENSGT00940000154164.c.a ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00940000157581.a ENSGT00940000155745 ENSGT00940000155979.g ENSGT00940000160181.i Atlantic herring MODERN SPECIES 5 golga5 (ENSCHAG00000016339) trip11 (ENSCHAG00000017105) fbln5 (ENSCHAG00000017387) TC2N (ENSCHAG00000017844) plek2 (ENSCHAG00000017887) si:ch211-10a23.2 (ENSCHAG00000017899) zfyve26 (ENSCHAG00000017951) rdh12 (ENSCHAG00000017996) vti1b (ENSCHAG00000018067) arg2 (ENSCHAG00000018078) RBM25 (ENSCHAG00000018227) KCNF1 (ENSCHAG00000018430) si:dkey-18j18.3 (ENSCHAG00000018451) rock2a (ENSCHAG00000018502) sobpa (ENSCHAG00000019609) pdss2 (ENSCHAG00000019637) #22 bend3 (ENSCHAG00000019663) #23 mtres1 (ENSCHAG00000019672) #24 matn3b (ENSCHAG00000019678) wdr35 (ENSCHAG00000019703) kcns3a (ENSCHAG00000020115) rdh14a (ENSCHAG00000020116) nt5c1ba (ENSCHAG00000020134) ENSCHAG00000020183 ENSCHAG00000020189 nt5c1ba (ENSCHAG00000020198) osr1 (ENSCHAG00000020308) utp25 (ENSCHAG00000020321) SYT14 (ENSCHAG00000020513) SERTAD4 (ENSCHAG00000020525) ENSCHAG00000020532 Denticle herring MODERN SPECIES fbln5 (ENSDCDG00000021384) TC2N (ENSDCDG00000021389) plek2 (ENSDCDG00000021391) si:ch211-10a23.2 (ENSDCDG00000021393) zfyve26 (ENSDCDG00000021402) rdh12 (ENSDCDG00000021509) vti1b (ENSDCDG00000021523) arg2 (ENSDCDG00000021529) RBM25 (ENSDCDG00000021554) kcns3a (ENSDCDG00000021556) si:dkey-18j18.3 (ENSDCDG00000021557) slc66a3 (ENSDCDG00000021558) rock2a (ENSDCDG00000021612) ENSDCDG00000028650 sobpa (ENSDCDG00000028652) pdss2 (ENSDCDG00000028655) #22 bend3 (ENSDCDG00000028659) #23 mtres1 (ENSDCDG00000028660) #24 matn3b (ENSDCDG00000028663) wdr35 (ENSDCDG00000028679) rdh14a (ENSDCDG00000029283) osr1 (ENSDCDG00000029285) utp25 (ENSDCDG00000029290) SYT14 (ENSDCDG00000029303) SERTAD4 (ENSDCDG00000029304) clic4 (ENSDCDG00000029305) srrm1 (ENSDCDG00000029306) tdh2 (ENSDCDG00000029312) zgc:154055 (ENSDCDG00000029321) FAM167B (ENSDCDG00000029335) lck (ENSDCDG00000029414) Otophysi ANCESTRAL SPECIES 381 ENSGT00940000154164.c.a ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00940000157581.a ENSGT00940000155745 ENSGT00940000155979.g ENSGT00940000160181.i Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 222 ENSGT00940000154164.c.a ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00940000157581.a ENSGT00940000155745 ENSGT00940000155979.g ENSGT00940000160181.i Channel catfish MODERN SPECIES 22 fbln5 (ENSIPUG00000001912) tc2n (ENSIPUG00000001920) plek2 (ENSIPUG00000001927) lgalsl-b (ENSIPUG00000001935) zfyve26 (ENSIPUG00000001951) rdh11 (ENSIPUG00000001999) vti1b (ENSIPUG00000002018) arg2 (ENSIPUG00000002048) Kcnf1 (ENSIPUG00000002058) ENSIPUG00000002063 c3h2orf50 (ENSIPUG00000002067) rock2a (ENSIPUG00000002080) ENSIPUG00000002116 Pqlc3 (ENSIPUG00000002126) sobp (ENSIPUG00000002150) pdss2 (ENSIPUG00000002179) #22 ENSIPUG00000002211 bend3 (ENSIPUG00000002220) #23 c3h6orf203 (ENSIPUG00000002230) #24 matn3b (ENSIPUG00000002242) wdr35 (ENSIPUG00000002268) kcns3a (ENSIPUG00000002336) mrpl2 (ENSIPUG00000002348) Rdh14 (ENSIPUG00000002360) osr1 (ENSIPUG00000002374) diexf (ENSIPUG00000002388) SYT14 (ENSIPUG00000002431) sertad4 (ENSIPUG00000002455) hif1a (ENSIPUG00000002474) prkcha (ENSIPUG00000002545) slc38a6 (ENSIPUG00000002579) Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 252 ENSGT00940000154164.c.a ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00940000157581.a ENSGT00940000155745 ENSGT00940000155979.g ENSGT00940000160181.i Electric eel MODERN SPECIES 118 rtf1 (ENSEEEG00000022928) golga5 (ENSEEEG00000022932) trip11 (ENSEEEG00000022934) fbln5 (ENSEEEG00000022964) plek2 (ENSEEEG00000022966) si:ch211-10a23.2 (ENSEEEG00000022968) zfyve26 (ENSEEEG00000022971) rdh12 (ENSEEEG00000022973) vti1b (ENSEEEG00000022974) arg2 (ENSEEEG00000022975) KCNF1 (ENSEEEG00000022976) si:dkey-18j18.3 (ENSEEEG00000022977) rock2a (ENSEEEG00000022979) slc66a3 (ENSEEEG00000023133) sobpa (ENSEEEG00000023135) pdss2 (ENSEEEG00000023139) #22 bend3 (ENSEEEG00000023141) #23 mtres1 (ENSEEEG00000023144) #24 matn3b (ENSEEEG00000023146) wdr35 (ENSEEEG00000023148) kcns3a (ENSEEEG00000023152) rdh14a (ENSEEEG00000023153) nt5c1ba (ENSEEEG00000023156) osr1 (ENSEEEG00000023158) utp25 (ENSEEEG00000023159) SYT14 (ENSEEEG00000023160) ENSEEEG00000023162 hif1aa (ENSEEEG00000023163) prkcha (ENSEEEG00000023164) slc38a6 (ENSEEEG00000023167) trmt5 (ENSEEEG00000023168) Characoidei ANCESTRAL SPECIES 115 ENSGT00940000154164.c.a ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00940000157581.a ENSGT00940000155745 ENSGT00940000155979.g ENSGT00940000160181.i ENSGT00940000158993 ENSGT00390000000709 ENSGT00940000159420 ENSGT00530000063876.a ENSGT00940000156982 ENSGT00940000153304.B ENSGT00390000002319 ENSGT00940000167410 ENSGT00940000154832.db.b Red-bellied piranha MODERN SPECIES 321 fbln5 (ENSPNAG00000013422) TC2N (ENSPNAG00000013402) plek2 (ENSPNAG00000013391) si:ch211-10a23.2 (ENSPNAG00000013354) zfyve26 (ENSPNAG00000013325) rdh12 (ENSPNAG00000013212) vti1b (ENSPNAG00000013208) arg2 (ENSPNAG00000013195) KCNF1 (ENSPNAG00000002610) ENSPNAG00000002601 si:dkey-18j18.3 (ENSPNAG00000002599) rock2a (ENSPNAG00000013168) ENSPNAG00000013107 slc66a3 (ENSPNAG00000013095) sobpa (ENSPNAG00000013076) pdss2 (ENSPNAG00000013018) #22 bend3 (ENSPNAG00000012991) #23 mtres1 (ENSPNAG00000012980) #24 Mexicana tetra MODERN SPECIES 17 trip11 (ENSAMXG00000021047) fbln5 (ENSAMXG00000021074) TC2N (ENSAMXG00000021100) plek2 (ENSAMXG00000021117) si:ch211-10a23.2 (ENSAMXG00000032461) zfyve26 (ENSAMXG00000021142) rdh12 (ENSAMXG00000021155) vti1b (ENSAMXG00000037468) arg2 (ENSAMXG00000031756) KCNF1 (ENSAMXG00000039089) si:dkey-18j18.3 (ENSAMXG00000021199) ENSAMXG00000043463 rock2a (ENSAMXG00000021207) slc66a3 (ENSAMXG00000030208) sobpa (ENSAMXG00000021220) pdss2 (ENSAMXG00000021223) #22 bend3 (ENSAMXG00000021225) #23 mtres1 (ENSAMXG00000032830) #24 matn3b (ENSAMXG00000021233) wdr35 (ENSAMXG00000021236) kcns3a (ENSAMXG00000025019) rdh14a (ENSAMXG00000035074) ENSAMXG00000031055 osr1 (ENSAMXG00000021239) ENSAMXG00000031936 ENSAMXG00000040318 utp25 (ENSAMXG00000021243) SYT14 (ENSAMXG00000021250) SERTAD4 (ENSAMXG00000036453) hif1aa (ENSAMXG00000039550) prkcha (ENSAMXG00000031671) Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT00940000158774 ENSGT00390000009196 ENSGT00940000157229 ENSGT00940000164928 ENSGT00920000149143 ENSGT00940000158191.a ENSGT00950000183192.a.a ENSGT00950000183195.b.a ENSGT00730000111019.f ENSGT00940000160213.a ENSGT00940000154459.B ENSGT01030000234517.B.b ENSGT00940000178564 ENSGT00940000153916.B ENSGT00940000154164.c.a ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 Cyprininae DUPLICATION Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000018470.a ENSGT00710000106769.jb ENSGT00940000158774.a ENSGT00390000009196.b ENSGT00940000157229.d ENSGT00940000164928.b ENSGT00920000149143.b ENSGT00940000158191.a.a ENSGT00950000183192.a.a.db.b ENSGT00950000183195.b.a.k ENSGT00940000160213.a.b ENSGT00940000154459.B.b ENSGT01030000234517.B.b.b ENSGT00940000153916.B.u ENSGT00940000154164.c.a.b ENSGT00940000153498.B.b.e #22 ENSGT00390000010827.d #23 ENSGT00390000009366.v #24 ENSGT00940000157581.a.b ENSGT00940000155745.f Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 270 ENSGT00710000106769.jb ENSGT00940000158774.a ENSGT00390000009196.b ENSGT00940000157229.d ENSGT00940000164928.b ENSGT00920000149143.b ENSGT00940000158191.a.a ENSGT00950000183192.a.a.db.b ENSGT00950000183195.b.a.k ENSGT00730000111019.f.b ENSGT00940000160213.a.b ENSGT00940000154459.B.b ENSGT01030000234517.B.b.b ENSGT00940000153916.B.u ENSGT00940000154164.c.a.b ENSGT00940000153498.B.b.e #22 ENSGT00390000010827.d #23 ENSGT00390000009366.v #24 ENSGT00940000157581.a.b ENSGT00940000155745.f ENSGT00940000155745.e.b ENSGT00940000155979.g.l ENSGT00940000160181.i.b ENSGT00390000017767.b.a.t.b Golden-line barbel MODERN SPECIES 70 golga5 (ENSSGRG00000036013) trip11 (ENSSGRG00000035869) fbln5 (ENSSGRG00000035853) TC2N (ENSSGRG00000035852) plek2 (ENSSGRG00000035850) si:ch211-10a23.2 (ENSSGRG00000035848) rdh12 (ENSSGRG00000035844) ENSSGRG00000035841 arg2 (ENSSGRG00000035749) ENSSGRG00000035723 KCNF1 (ENSSGRG00000035722) ENSSGRG00000035721 rock2a (ENSSGRG00000034889) slc66a3 (ENSSGRG00000034872) sobpa (ENSSGRG00000034870) pdss2 (ENSSGRG00000034858) #22 bend3 (ENSSGRG00000034857) #23 mtres1 (ENSSGRG00000034856) #24 matn3b (ENSSGRG00000034850) ENSSGRG00000034848 kcns3a (ENSSGRG00000034845) rdh14a (ENSSGRG00000034844) nt5c1ba (ENSSGRG00000034843) Goldfish MODERN SPECIES 4 ENSCARG00000005198 fbln5 (ENSCARG00000004823) TC2N (ENSCARG00000004797) plek2 (ENSCARG00000004782) si:ch211-10a23.2 (ENSCARG00000004770) zfyve26 (ENSCARG00000004713) rdh12 (ENSCARG00000004672) vti1b (ENSCARG00000004664) arg2 (ENSCARG00000004616) KCNF1 (ENSCARG00000004589) si:dkey-18j18.3 (ENSCARG00000004583) ENSCARG00000004577 rock2a (ENSCARG00000004037) slc66a3 (ENSCARG00000003834) sobpa (ENSCARG00000003793) pdss2 (ENSCARG00000003768) #22 bend3 (ENSCARG00000003759) #23 mtres1 (ENSCARG00000003758) #24 prkcha (ENSCARG00000003746) slc38a6 (ENSCARG00000003730) trmt5 (ENSCARG00000003715) mnat1 (ENSCARG00000003688) six4a (ENSCARG00000003672) six1a (ENSCARG00000003663) ENSCARG00000003658 six6a (ENSCARG00000003653) ppm1aa (ENSCARG00000003645) dhrs7 (ENSCARG00000003638) ENSCARG00000003583 pgam1a (ENSCARG00000003554) mettl18 (ENSCARG00000003550) Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 218 ENSGT01030000234517.B.b.a ENSGT00940000178564 ENSGT00940000153916.B.v ENSGT00940000154164.c.a.a ENSGT00940000153498.B.b.f #22 ENSGT00390000010827.c #23 ENSGT00390000009366.u #24 ENSGT00940000157581.a.a ENSGT00940000155745.e.a ENSGT00940000155979.g.k ENSGT00940000160181.i.a ENSGT00390000017767.b.a.t.a ENSGT00940000158993.k ENSGT00390000000709.h ENSGT00940000159420.c ENSGT00530000063876.a.a ENSGT00940000156774.jb.a ENSGT00940000158220.o.b ENSGT00940000156982.c ENSGT00940000153304.B.d Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 150 ENSGT00940000158774.b ENSGT00390000009196.a ENSGT00940000157229.c ENSGT00940000164928.a ENSGT00920000149143.a ENSGT00940000158191.a.b ENSGT00950000183192.a.a.db.a ENSGT00950000183195.b.a.l ENSGT00730000111019.f.a ENSGT00940000160213.a.a ENSGT00940000154459.B.a ENSGT01030000234517.B.b.a ENSGT00940000178564 ENSGT00940000153916.B.v ENSGT00940000154164.c.a.a ENSGT00940000153498.B.b.f #22 ENSGT00390000010827.c #23 ENSGT00390000009366.u #24 ENSGT00940000157581.a.a ENSGT00940000155745.e.a ENSGT00940000155979.g.k ENSGT00940000160181.i.a ENSGT00390000017767.b.a.t.a ENSGT00940000158993.k ENSGT00390000000709.h ENSGT00940000159420.c ENSGT00530000063876.a.a ENSGT00940000156774.jb.a ENSGT00940000158220.o.b ENSGT00940000156982.c ENSGT00940000153304.B.d Common carp reference MODERN SPECIES 48 trip11 (ENSCCRG00000066378) fbln5 (ENSCCRG00000018586) TC2N (ENSCCRG00000018610) plek2 (ENSCCRG00000018808) si:ch211-10a23.2 (ENSCCRG00000051635) rdh12 (ENSCCRG00000070400) zfyve26 (ENSCCRG00000018835) vti1b (ENSCCRG00000020334) arg2 (ENSCCRG00000062079) ENSCCRG00000076401 ENSCCRG00000054402 ENSCCRG00000072420 rock2a (ENSCCRG00000047518) slc66a3 (ENSCCRG00000070432) sobpa (ENSCCRG00000047503) pdss2 (ENSCCRG00000047568) #22 bend3 (ENSCCRG00000047587) #23 mtres1 (ENSCCRG00000047576) #24 matn3b (ENSCCRG00000047597) wdr35 (ENSCCRG00000047620) kcns3a (ENSCCRG00000071313) nt5c1ba (ENSCCRG00000082898) osr1 (ENSCCRG00000019202) ENSCCRG00000045791 utp25 (ENSCCRG00000052414) ENSCCRG00000062977 SERTAD4 (ENSCCRG00000065844) hif1aa (ENSCCRG00000044316) prkcha (ENSCCRG00000061888) slc38a6 (ENSCCRG00000044331) trmt5 (ENSCCRG00000033175) Golden-line barbel MODERN SPECIES 105 trip11 (ENSSGRG00000030216) fbln5 (ENSSGRG00000030507) TC2N (ENSSGRG00000030510) plek2 (ENSSGRG00000030511) si:ch211-10a23.2 (ENSSGRG00000030515) rdh12 (ENSSGRG00000030522) vti1b (ENSSGRG00000030523) arg2 (ENSSGRG00000030525) ENSSGRG00000030773 KCNF1 (ENSSGRG00000030774) si:dkey-18j18.3 (ENSSGRG00000030775) rock2a (ENSSGRG00000030821) ENSSGRG00000033457 slc66a3 (ENSSGRG00000033458) sobpa (ENSSGRG00000033537) pdss2 (ENSSGRG00000033539) #22 bend3 (ENSSGRG00000033540) #23 mtres1 (ENSSGRG00000033541) #24 matn3b (ENSSGRG00000033542) wdr35 (ENSSGRG00000033543) kcns3a (ENSSGRG00000033712) rdh14a (ENSSGRG00000033713) nt5c1ba (ENSSGRG00000033714) osr1 (ENSSGRG00000033718) utp25 (ENSSGRG00000033723) SYT14 (ENSSGRG00000033729) ENSSGRG00000033734 SERTAD4 (ENSSGRG00000033736) hif1aa (ENSSGRG00000033749) prkcha (ENSSGRG00000034456) slc38a6 (ENSSGRG00000034458) Goldfish DUPLICATION Goldfish MODERN SPECIES 31 ENSCARG00000016984 ENSCARG00000017005 lhcgr (ENSCARG00000017091) ENSCARG00000017176 ENSCARG00000017301 vip (ENSCARG00000018077) fbxo5 (ENSCARG00000018093) slc29a1a (ENSCARG00000018115) ENSCARG00000018254 TMEM63B (ENSCARG00000018299) ATE1 (ENSCARG00000018426) fgfr2 (ENSCARG00000018959) ENSCARG00000036212 marcksl1a (ENSCARG00000036220) fgfr2 (ENSCARG00000036312) pdss2 (ENSCARG00000038533) #22 bend3 (ENSCARG00000038542) #23 mtres1 (ENSCARG00000038554) #24 matn3b (ENSCARG00000038571) wdr35 (ENSCARG00000038680) kcns3a (ENSCARG00000038845) fancl (ENSCARG00000038865) vrk2 (ENSCARG00000038926) ccdc85a (ENSCARG00000038984) nsmce4a (ENSCARG00000039001) ENSCARG00000039015 ENSCARG00000039100 ldb1a (ENSCARG00000039232) KCNF1 (ENSCARG00000039478) ENSCARG00000039483 arg2 (ENSCARG00000039526) Goldfish MODERN SPECIES 31 RIMS1 (ENSCARG00000010768) asrgl1 (ENSCARG00000010677) inaa (ENSCARG00000010665) pcgf6 (ENSCARG00000010656) polr1c (ENSCARG00000010548) ldb1a (ENSCARG00000010138) ENSCARG00000010091 ENSCARG00000010073 nsmce4a (ENSCARG00000010063) ENSCARG00000010000 ly6pge (ENSCARG00000009982) si:dkey-18j18.3 (ENSCARG00000009978) rock2a (ENSCARG00000009893) ENSCARG00000009866 sobpa (ENSCARG00000009853) pdss2 (ENSCARG00000009847) #22 bend3 (ENSCARG00000009840) #23 mtres1 (ENSCARG00000009837) #24 matn3b (ENSCARG00000009807) wdr35 (ENSCARG00000009784) kcns3a (ENSCARG00000009777) rdh14a (ENSCARG00000009774) nt5c1ba (ENSCARG00000009771) cxcl18a.1 (ENSCARG00000009768) ENSCARG00000009762 ENSCARG00000009757 ENSCARG00000009752 paox (ENSCARG00000009747) ENSCARG00000009741 zcchc24 (ENSCARG00000009735) ppifa (ENSCARG00000009732) Zebrafish MODERN SPECIES 4 trip11 (ENSDARG00000078381) fbln5 (ENSDARG00000039273) TC2N (ENSDARG00000095067) plek2 (ENSDARG00000012789) si:ch211-10a23.2 (ENSDARG00000060656) zfyve26 (ENSDARG00000040131) rdh12 (ENSDARG00000018069) vti1b (ENSDARG00000039270) arg2 (ENSDARG00000039269) ENSDARG00000039266 KCNF1 (ENSDARG00000027285) si:dkey-18j18.3 (ENSDARG00000078140) rock2a (ENSDARG00000017500) slc66a3 (ENSDARG00000054251) sobpa (ENSDARG00000054253) pdss2 (ENSDARG00000012563) #22 bend3 (ENSDARG00000076903) #23 mtres1 (ENSDARG00000077614) #24 matn3b (ENSDARG00000069265) wdr35 (ENSDARG00000069269) kcns3a (ENSDARG00000006891) rdh14a (ENSDARG00000039299) nt5c1ba (ENSDARG00000018153) osr1 (ENSDARG00000014091) utp25 (ENSDARG00000017696) SYT14 (ENSDARG00000010934) SERTAD4 (ENSDARG00000089795) hif1aa (ENSDARG00000006181) prkcha (ENSDARG00000018382) slc38a6 (ENSDARG00000054312) trmt5 (ENSDARG00000069278) Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 49 ENSGT00940000177852 ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b ENSGT00590000083139.d.a ENSGT00590000083139.d.b ENSGT00940000154645.A ENSGT00940000155646 ENSGT00940000160213.b ENSGT00940000165355.a ENSGT00940000165355.b ENSGT01030000234517.C ENSGT00940000160213.a ENSGT00940000154459.B ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.B.b ENSGT00940000154164.c.a ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000013762.b.a.a.b Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000155320 ENSGT00390000005572 ENSGT00940000156417.g.a ENSGT00390000002768.a ENSGT00940000166171 ENSGT00940000154524.b ENSGT00940000154239.b ENSGT00390000004254 ENSGT00530000069575 ENSGT00940000159280 ENSGT00940000157706 ENSGT00940000154459.B ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.B.b ENSGT00940000154164.c.a ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000013762.b.a.a.b ENSGT00390000000709 ENSGT00940000162520.g.b ENSGT00940000162520.h ENSGT00940000162520.g.a ENSGT00390000015369 ENSGT00940000166933 Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000155320 ENSGT00390000005572 ENSGT00940000156417.g.a ENSGT00390000002768.a ENSGT00940000166171 ENSGT00940000154524.b ENSGT00940000154239.b ENSGT00390000004254 ENSGT00530000069575 ENSGT00940000159280 ENSGT00940000157706 ENSGT00940000154459.B ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.B.b ENSGT00940000154164.c.a ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000013762.b.a.a.b ENSGT00390000000709 ENSGT00940000162520.g.b ENSGT00940000162520.h ENSGT00940000162520.g.a ENSGT00390000015369 ENSGT00940000166933 ENSGT00390000005524 ENSGT00950000182980.a.b.a.b.a.b ENSGT00940000158474 ENSGT00390000016736.a.i ENSGT00940000155583 ENSGT00390000002201 Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 14 ENSMMDG00005017205 ENSMMDG00005017203 supt7l (ENSMMDG00005017202) LRFN2 (ENSMMDG00005017201) ENSMMDG00005017045 spdya (ENSMMDG00005017036) trmt61b (ENSMMDG00005017035) wdr43 (ENSMMDG00005016982) ENSMMDG00005016977 CLIP4 (ENSMMDG00005016972) si:dkey-18j18.3 (ENSMMDG00005016970) slc66a3 (ENSMMDG00005016969) ENSMMDG00005016967 rock2a (ENSMMDG00005010307) sobpa (ENSMMDG00005010225) pdss2 (ENSMMDG00005010223) #22 bend3 (ENSMMDG00005010221) #23 mtres1 (ENSMMDG00005010219) #24 TMEM151B (ENSMMDG00005010218) hdac10 (ENSMMDG00005010205) DAAM2 (ENSMMDG00005010096) ENSMMDG00005010071 kif6 (ENSMMDG00005010066) KCNK16 (ENSMMDG00005010062) ENSMMDG00005010058 kcnk5a (ENSMMDG00005010056) rab3gap2 (ENSMMDG00005005564) iars2 (ENSMMDG00005005476) qrsl1 (ENSMMDG00005005455) rtn4ip1 (ENSMMDG00005005436) ENSMMDG00005005420 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00390000001612 ENSGT00940000155320 ENSGT00390000005572 ENSGT00940000156417.g.a ENSGT00390000002768.a ENSGT00940000154524.b ENSGT00940000154239.b ENSGT00390000004254 ENSGT00530000069575 ENSGT00940000159280 ENSGT00940000157706 ENSGT00940000154459.B ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.B.b ENSGT00940000154164.c.a ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000013762.b.a.a.b ENSGT00940000159219.a ENSGT00390000000709 ENSGT00940000162520.g.b ENSGT00940000162520.g.a ENSGT00940000162520.h ENSGT00390000015369 ENSGT00940000166933 ENSGT00390000005524 ENSGT00950000182980.a.b.a.b.a.b ENSGT00940000158474 ENSGT00390000016736.a.i ENSGT00940000155583 Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 251 ENSHCOG00000011135 ENSHCOG00000010414 ENSHCOG00000010383 ENSHCOG00000010367 slc66a3 (ENSHCOG00000010335) rock2a (ENSHCOG00000010292) sobpa (ENSHCOG00000010221) pdss2 (ENSHCOG00000010113) #22 bend3 (ENSHCOG00000010084) #23 mtres1 (ENSHCOG00000010074) #24 TMEM151B (ENSHCOG00000010065) ENSHCOG00000010061 utp25 (ENSHCOG00000010052) ENSHCOG00000010038 ENSHCOG00000010014 ENSHCOG00000009990 ENSHCOG00000009938 adprs (ENSHCOG00000000307) ENSHCOG00000000588 ENSHCOG00000009672 ENSHCOG00000009655 ENSHCOG00000000866 ENSHCOG00000009628 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000001612 ENSGT00940000155320 ENSGT00390000005572 ENSGT00940000156417.g.a ENSGT00390000002768.a ENSGT00940000154524.b ENSGT00940000154239.b ENSGT00390000004254 ENSGT00530000069575 ENSGT00940000159280 ENSGT00940000157706 ENSGT00940000154459.B ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.B.b ENSGT00940000154164.c.a ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000013762.b.a.a.b ENSGT00940000159219.a ENSGT00390000000709 ENSGT00940000162520.g.a ENSGT00940000162520.g.b ENSGT00940000162520.h ENSGT00390000015369.d ENSGT00940000166933 ENSGT00940000154394.b.a.b ENSGT00390000005524 ENSGT00950000182980.a.b.a.b.a.b ENSGT00940000158474 ENSGT00390000016736.a.i Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000001612 ENSGT00940000155320 ENSGT00390000005572 ENSGT00940000156417.g.a ENSGT00390000002768.a ENSGT00940000154524.b ENSGT00940000154239.b ENSGT00390000004254 ENSGT00530000069575 ENSGT00940000159280 ENSGT00940000157706 ENSGT00940000154459.B ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.B.b ENSGT00940000154164.c.a ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000013762.b.a.a.b ENSGT00940000159219.a ENSGT00390000000709 ENSGT00940000162520.g.a ENSGT00940000162520.g.b ENSGT00940000162520.h ENSGT00390000015369.d ENSGT00940000166933 ENSGT00940000154394.b.a.b ENSGT00390000005524 ENSGT00950000182980.a.b.a.b.a.b ENSGT00940000158474 ENSGT00390000016736.a.i Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000001612 ENSGT00940000155320 ENSGT00390000005572 ENSGT00940000156417.g.a ENSGT00390000002768.a ENSGT00940000154524.b ENSGT00940000154239.b ENSGT00390000004254 ENSGT00530000069575 ENSGT00940000159280 ENSGT00940000157706 ENSGT00940000177705 ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.B.b ENSGT00940000154164.c.a ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000013762.b.a.a.b ENSGT00940000159219.a ENSGT00390000000709 ENSGT00940000162520.g.a ENSGT00940000162520.g.b ENSGT00940000162520.h ENSGT00390000015369.d ENSGT00940000166933 ENSGT00940000154394.b.a.a.a.a.b ENSGT00940000154394.b.a.b ENSGT00390000005524 ENSGT00950000182980.a.b.a.b.a.b ENSGT00940000158474 Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00390000001612 ENSGT00940000155320 ENSGT00390000005572 ENSGT00940000156417.g.a ENSGT00390000002768.a ENSGT00940000154524.b ENSGT00940000154239.b ENSGT00390000004254 ENSGT00530000069575 ENSGT00940000159280 ENSGT00940000157706 ENSGT00940000177705 ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.B.b ENSGT00940000154164.c.a ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000013762.b.a.a.b ENSGT00940000159219.a ENSGT00390000000709 ENSGT00940000162520.g.a ENSGT00940000162520.h ENSGT00940000162520.g.b ENSGT00390000015369.d ENSGT00940000166933 ENSGT00940000154394.b.a.b ENSGT00390000005524 ENSGT00950000182980.a.b.a.b.a.b ENSGT00940000158474 ENSGT00390000016736.a.i Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT00390000010130 ENSGT00390000001612 ENSGT00940000155320 ENSGT00390000005572 ENSGT00940000156417.g.a ENSGT00390000002768.a ENSGT00940000154524.b ENSGT00940000154239.b ENSGT00390000004254 ENSGT00940000159280 ENSGT00940000157706 ENSGT00940000177705 ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.B.b ENSGT00940000154164.c.a ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000013762.b.a.a.b ENSGT00940000159219.a ENSGT00390000000709 ENSGT00940000162520.g.a ENSGT00940000162520.h ENSGT00390000015369.d ENSGT00940000166933 ENSGT00940000154394.b.a.b ENSGT00390000005524 ENSGT00950000182980.a.b.a.b.a.b ENSGT00940000158474 ENSGT00390000016736.a.i ENSGT00940000155583 Turquoise killifish MODERN SPECIES 8 ENSNFUG00015014163 PQLC3 (ENSNFUG00015014346) ROCK2A (ENSNFUG00015014384) sobpa (ENSNFUG00015014464) PDSS2 (ENSNFUG00015014519) #22 BEND3 (ENSNFUG00015014583) #23 mtres1 (ENSNFUG00015014593) #24 CU915814.1 (ENSNFUG00015014607) DIEXF (ENSNFUG00015014621) ENSNFUG00015014686 ENSNFUG00015014699 ENSNFUG00015014723 ENSNFUG00015014743 ADPRHL2 (ENSNFUG00015014785) ENSNFUG00015014794 ENSNFUG00015014891 NRDE2 (ENSNFUG00015014970) Nfu_g_1_007837 (ENSNFUG00015015030) ttc7b (ENSNFUG00015015184) fam177a1 (ENSNFUG00015015465) Mangrove rivulus MODERN SPECIES 89 SLC4A1AP (ENSKMAG00000009478) supt7l (ENSKMAG00000009446) LRFN2 (ENSKMAG00000009433) ENSKMAG00000009421 spdya (ENSKMAG00000009382) trmt61b (ENSKMAG00000009359) wdr43 (ENSKMAG00000009301) ENSKMAG00000009230 ENSKMAG00000009176 ENSKMAG00000009140 slc66a3 (ENSKMAG00000009110) rock2a (ENSKMAG00000008964) sobpa (ENSKMAG00000008887) pdss2 (ENSKMAG00000008844) #22 bend3 (ENSKMAG00000008831) #23 mtres1 (ENSKMAG00000008820) #24 TMEM151B (ENSKMAG00000008807) ENSKMAG00000008801 utp25 (ENSKMAG00000008780) ENSKMAG00000008768 ENSKMAG00000008746 adprs (ENSKMAG00000008754) ENSKMAG00000008676 TUBB4B (ENSKMAG00000008714) NRDE2 (ENSKMAG00000008647) ENSKMAG00000008616 ttc7b (ENSKMAG00000008484) fam177a1 (ENSKMAG00000008430) ppp2r3c (ENSKMAG00000008369) Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000001612 ENSGT00940000155320 ENSGT00390000005572 ENSGT00940000156417.g.a ENSGT00390000002768.a ENSGT00940000154524.b ENSGT00940000154239.b ENSGT00390000004254 ENSGT00530000069575 ENSGT00940000159280 ENSGT00940000157706 ENSGT00940000177705 ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.B.b ENSGT00940000154164.c.a ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000013762.b.a.a.b ENSGT00940000159219.a ENSGT00390000000709 ENSGT00940000162520.g.a ENSGT00940000162520.g.b ENSGT00940000162520.h ENSGT00390000015369.d ENSGT00940000166933 ENSGT00940000154394.b.a.a.a.a.a.b.d ENSGT00390000005524 ENSGT00950000182980.a.b.a.b.a.b ENSGT00940000158474 ENSGT00390000016736.a.i Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000005572 ENSGT00940000156417.g.a ENSGT00390000002768.a ENSGT00940000179180 ENSGT00940000154524.b ENSGT00940000154239.b ENSGT00390000004254 ENSGT00940000155397.a.a.c.a ENSGT00530000069575 ENSGT00940000159280 ENSGT00940000157706 ENSGT01010000225077 ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.B.b ENSGT00940000154164.c.a ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000013762.b.a.a.b ENSGT00940000159219.a ENSGT00390000000709 ENSGT00940000162520.g.a ENSGT00940000162520.g.b ENSGT00940000162520.h ENSGT00390000015369.d ENSGT00940000166933 ENSGT00390000005524 ENSGT00950000182980.a.b.a.b.a.b ENSGT00940000158474 ENSGT00390000016736.a.i ENSGT00940000155583 Poecilia ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000005572 ENSGT00940000156417.g.a ENSGT00390000002768.a ENSGT00940000179180 ENSGT00940000154524.b ENSGT00940000154239.b ENSGT00390000004254 ENSGT00940000155397.a.a.c.a ENSGT00530000069575 ENSGT00940000159280 ENSGT00940000157706 ENSGT01010000225077 ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.B.b ENSGT00940000154164.c.a ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000013762.b.a.a.b ENSGT00940000159219.a ENSGT00390000000709 ENSGT00940000162520.g.a ENSGT00940000162520.g.b ENSGT00940000162520.h ENSGT00390000015369.d ENSGT00940000166933 ENSGT00390000005524 ENSGT00950000182980.a.b.a.b.a.b ENSGT00940000158474 ENSGT00390000016736.a.i ENSGT00940000155583 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000155320 ENSGT00390000005572 ENSGT00940000156417.g.a ENSGT00390000002768.a ENSGT00940000154524.b ENSGT00940000154239.b ENSGT00390000004254 ENSGT00940000155397.a.a.c.a ENSGT00530000069575 ENSGT00940000159280 ENSGT00940000157706 ENSGT01010000225077 ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.B.b ENSGT00940000154164.c.a ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000013762.b.a.a.b ENSGT00940000159219.a ENSGT00390000000709 ENSGT00940000162520.g.a ENSGT00940000162520.g.b ENSGT00940000162520.h ENSGT00390000015369.d ENSGT00940000166933 ENSGT00390000005524 ENSGT00950000182980.a.b.a.b.a.b ENSGT00940000158474 ENSGT00390000016736.a.i ENSGT00940000155583 Sailfin molly MODERN SPECIES 617 sobpa (ENSPLAG00000022563) pdss2 (ENSPLAG00000022528) #22 bend3 (ENSPLAG00000022496) #23 mtres1 (ENSPLAG00000022492) #24 TMEM151B (ENSPLAG00000022486) ENSPLAG00000022476 utp25 (ENSPLAG00000022464) ENSPLAG00000022456 ENSPLAG00000000777 ENSPLAG00000022441 adprs (ENSPLAG00000022427) ENSPLAG00000022414 NRDE2 (ENSPLAG00000022350) ENSPLAG00000022338 ttc7b (ENSPLAG00000022318) fam177a1 (ENSPLAG00000022257) ppp2r3c (ENSPLAG00000022253) Amazon molly MODERN SPECIES 260 spdya (ENSPFOG00000011326) spdya (ENSPFOG00000011342) trmt61b (ENSPFOG00000011353) ENSPFOG00000011345 wdr43 (ENSPFOG00000011371) ENSPFOG00000011471 ENSPFOG00000022590 ENSPFOG00000011525 CLIP4 (ENSPFOG00000011775) slc66a3 (ENSPFOG00000012041) rock2a (ENSPFOG00000012091) sobpa (ENSPFOG00000024528) slc66a3 (ENSPFOG00000021671) rock2a (ENSPFOG00000012199) sobpa (ENSPFOG00000012779) pdss2 (ENSPFOG00000012829) #22 bend3 (ENSPFOG00000012907) #23 mtres1 (ENSPFOG00000012913) #24 TMEM151B (ENSPFOG00000012925) ENSPFOG00000020420 utp25 (ENSPFOG00000012932) ENSPFOG00000012992 adprs (ENSPFOG00000013049) ENSPFOG00000013111 NRDE2 (ENSPFOG00000013217) ENSPFOG00000013289 ttc7b (ENSPFOG00000013343) fam177a1 (ENSPFOG00000013620) ppp2r3c (ENSPFOG00000013645) PRORP (ENSPFOG00000013713) psma6a (ENSPFOG00000013811) Guppy MODERN SPECIES 453 supt7l (ENSPREG00000004886) LRFN2 (ENSPREG00000004903) ENSPREG00000004915 ENSPREG00000004928 spdya (ENSPREG00000004938) trmt61b (ENSPREG00000004948) wdr43 (ENSPREG00000004959) ENSPREG00000004975 ENSPREG00000004995 ENSPREG00000005011 CLIP4 (ENSPREG00000005043) ENSPREG00000005077 slc66a3 (ENSPREG00000005084) rock2a (ENSPREG00000005116) sobpa (ENSPREG00000005227) pdss2 (ENSPREG00000005275) #22 bend3 (ENSPREG00000005286) #23 mtres1 (ENSPREG00000005297) #24 TMEM151B (ENSPREG00000005318) ENSPREG00000005334 utp25 (ENSPREG00000005340) ENSPREG00000005386 adprs (ENSPREG00000005535) ENSPREG00000005546 uggt1 (ENSPREG00000005619) ENSPREG00000005818 ola1 (ENSPREG00000005840) TRA2B (ENSPREG00000005879) ENSPREG00000005907 pcnt (ENSPREG00000005947) atg9a (ENSPREG00000006117) Platyfish MODERN SPECIES 10 supt7l (ENSXMAG00000018409) ENSXMAG00000027775 ENSXMAG00000024474 LRFN2 (ENSXMAG00000018405) ENSXMAG00000022244 ENSXMAG00000023526 spdya (ENSXMAG00000018401) trmt61b (ENSXMAG00000018398) wdr43 (ENSXMAG00000018379) ENSXMAG00000018369 ALK (ENSXMAG00000009140) CLIP4 (ENSXMAG00000009152) slc66a3 (ENSXMAG00000009173) rock2a (ENSXMAG00000009185) sobpa (ENSXMAG00000009226) pdss2 (ENSXMAG00000022672) #22 bend3 (ENSXMAG00000009242) #23 mtres1 (ENSXMAG00000029879) #24 TMEM151B (ENSXMAG00000009244) ENSXMAG00000021816 utp25 (ENSXMAG00000009245) ENSXMAG00000009266 ENSXMAG00000020926 ENSXMAG00000023507 ENSXMAG00000025634 adprs (ENSXMAG00000024411) ENSXMAG00000009293 NRDE2 (ENSXMAG00000009320) ENSXMAG00000009332 ttc7b (ENSXMAG00000009343) fam177a1 (ENSXMAG00000009364) NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 97 ENSGT00940000156417.g.a ENSGT00390000002768.a ENSGT00940000154524.b ENSGT00940000154239.b ENSGT00390000004254 ENSGT00940000159280 ENSGT00940000157706 ENSGT00940000177705 ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.B.b ENSGT00940000154164.c.a ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000013762.b.a.a.b ENSGT00940000159219.a ENSGT00390000000709 ENSGT00940000162520.g.b ENSGT00940000162520.g.a ENSGT00390000015369.d ENSGT00940000162520.h ENSGT00390000015369.c.b ENSGT00940000166933 ENSGT00940000154394.b.a.a.a.a.a.b.d ENSGT00390000005524 ENSGT00950000182980.a.b.a.b.a.b ENSGT00940000158474 Mummichog MODERN SPECIES 2188 ENSFHEG00000000540 spdya (ENSFHEG00000021897) trmt61b (ENSFHEG00000021881) wdr43 (ENSFHEG00000021863) ENSFHEG00000021856 ENSFHEG00000021838 ENSFHEG00000021693 ENSFHEG00000000531 ENSFHEG00000021673 ENSFHEG00000021659 slc66a3 (ENSFHEG00000021650) ENSFHEG00000021637 ENSFHEG00000021616 ENSFHEG00000021594 sobpa (ENSFHEG00000021563) pdss2 (ENSFHEG00000021530) #22 bend3 (ENSFHEG00000021495) #23 mtres1 (ENSFHEG00000021484) #24 TMEM151B (ENSFHEG00000021481) utp25 (ENSFHEG00000021471) ENSFHEG00000021461 ENSFHEG00000021449 adprs (ENSFHEG00000021421) ENSFHEG00000021400 ENSFHEG00000021394 NRDE2 (ENSFHEG00000021385) ENSFHEG00000021373 ttc7b (ENSFHEG00000000870) fam177a1 (ENSFHEG00000021169) ppp2r3c (ENSFHEG00000021118) PRORP (ENSFHEG00000021082) Sheepshead minnow MODERN SPECIES 133 nusap1 (ENSCVAG00000022241) ENSCVAG00000022272 ENSCVAG00000022281 chp1 (ENSCVAG00000022309) lgmn (ENSCVAG00000022338) PCNX1 (ENSCVAG00000022446) med6 (ENSCVAG00000022478) TTC9 (ENSCVAG00000022496) MAP3K9 (ENSCVAG00000000579) ENSCVAG00000022781 CLIP4 (ENSCVAG00000022804) ENSCVAG00000022824 slc66a3 (ENSCVAG00000022833) rock2a (ENSCVAG00000022919) sobpa (ENSCVAG00000022929) pdss2 (ENSCVAG00000022969) #22 bend3 (ENSCVAG00000022975) #23 mtres1 (ENSCVAG00000022979) #24 TMEM151B (ENSCVAG00000022986) ENSCVAG00000022992 utp25 (ENSCVAG00000023004) ENSCVAG00000023018 ENSCVAG00000023030 adprs (ENSCVAG00000023037) ENSCVAG00000023044 ENSCVAG00000023058 ENSCVAG00000023086 NRDE2 (ENSCVAG00000023105) ENSCVAG00000023126 ttc7b (ENSCVAG00000023291) fam177a1 (ENSCVAG00000023316) Oryzias ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000005743 ENSGT00390000010130 ENSGT00390000001612 ENSGT00940000155320 ENSGT00390000005572 ENSGT00940000156417.g.a ENSGT00390000002768.a ENSGT00940000154524.b ENSGT00940000154239.b ENSGT00390000004254 ENSGT00940000159280 ENSGT00940000157706 ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.B.b ENSGT00940000154164.c.a ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000013762.b.a.a.b ENSGT00940000159219.a ENSGT00390000000709 ENSGT00940000162520.h ENSGT00940000162520.g.a ENSGT00390000015369.d ENSGT01030000235576.a.b ENSGT00940000166933 ENSGT00940000154394.b.a.a.a.a.b ENSGT00390000005524 ENSGT00950000182980.a.b.a.b.a.b ENSGT00940000158474 ENSGT00390000016736.a.i Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES 44 ENSGT00390000005743 ENSGT00390000010130 ENSGT00390000001612 ENSGT00940000155320 ENSGT00390000005572 ENSGT00940000156417.g.a ENSGT00390000002768.a ENSGT00940000154524.b ENSGT00940000154239.b ENSGT00390000004254 ENSGT00940000159280 ENSGT00940000157706 ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.B.b ENSGT00940000154164.c.a ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000013762.b.a.a.b ENSGT00940000159219.a ENSGT00390000000709 ENSGT00940000162520.h ENSGT00940000162520.g.a ENSGT00390000015369.d ENSGT01030000235576.a.b ENSGT00940000166933 ENSGT00940000154394.b.a.b ENSGT00390000005524 ENSGT00950000182980.a.b.a.b.a.b ENSGT00940000158474 ENSGT00390000016736.a.i Javanese ricefish MODERN SPECIES 14 ENSOJAG00000017735 ENSOJAG00000018277 ENSOJAG00000018297 LRFN2 (ENSOJAG00000018311) ENSOJAG00000018364 spdya (ENSOJAG00000018376) trmt61b (ENSOJAG00000018387) wdr43 (ENSOJAG00000018480) ENSOJAG00000018756 ENSOJAG00000018762 ENSOJAG00000018780 CLIP4 (ENSOJAG00000018838) slc66a3 (ENSOJAG00000018864) rock2a (ENSOJAG00000018887) sobpa (ENSOJAG00000019622) pdss2 (ENSOJAG00000019642) #22 bend3 (ENSOJAG00000019658) #23 mtres1 (ENSOJAG00000019667) #24 TMEM151B (ENSOJAG00000019682) utp25 (ENSOJAG00000019703) ENSOJAG00000019788 ENSOJAG00000019833 adprs (ENSOJAG00000019851) ENSOJAG00000019898 ENSOJAG00000019904 ENSOJAG00000019930 NRDE2 (ENSOJAG00000019961) ENSOJAG00000020038 ttc7b (ENSOJAG00000020109) fam177a1 (ENSOJAG00000020601) ppp2r3c (ENSOJAG00000020623) Indian medaka MODERN SPECIES ENSOMEG00000009661 ENSOMEG00000009780 supt7l (ENSOMEG00000009818) LRFN2 (ENSOMEG00000009832) ENSOMEG00000009845 spdya (ENSOMEG00000009871) trmt61b (ENSOMEG00000009895) wdr43 (ENSOMEG00000009928) ENSOMEG00000009950 ENSOMEG00000009960 ENSOMEG00000010054 CLIP4 (ENSOMEG00000010115) slc66a3 (ENSOMEG00000010144) rock2a (ENSOMEG00000010220) sobpa (ENSOMEG00000010253) pdss2 (ENSOMEG00000010302) #22 bend3 (ENSOMEG00000010338) #23 mtres1 (ENSOMEG00000010352) #24 TMEM151B (ENSOMEG00000010362) ENSOMEG00000010376 utp25 (ENSOMEG00000010397) ENSOMEG00000010426 ENSOMEG00000010449 ENSOMEG00000010506 adprs (ENSOMEG00000010543) ENSOMEG00000010753 ENSOMEG00000000260 NRDE2 (ENSOMEG00000010890) ENSOMEG00000010907 ttc7b (ENSOMEG00000011014) fam177a1 (ENSOMEG00000011073) Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT01060000248694 ENSGT00390000001612 ENSGT00940000155320 ENSGT00390000005572 ENSGT00940000156417.g.a ENSGT00390000002768.a ENSGT00940000154524.b ENSGT00940000154239.b ENSGT00390000004254 ENSGT01070000255940 ENSGT00940000159280 ENSGT00940000157706 ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.B.b ENSGT00940000154164.c.a ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000013762.b.a.a.b ENSGT00940000159219.a ENSGT00390000000709 ENSGT00940000162520.g.a Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 14 ENSORLG00000017274 ENSORLG00000027771 spdya (ENSORLG00000027512) trmt61b (ENSORLG00000029149) wdr43 (ENSORLG00000018236) ENSORLG00000028014 ENSORLG00000027046 ENSORLG00000029224 ENSORLG00000022549 ENSORLG00000027405 ENSORLG00000018248 slc66a3 (ENSORLG00000018253) rock2a (ENSORLG00000018255) sobpa (ENSORLG00000029385) ENSORLG00000023718 pdss2 (ENSORLG00000018892) #22 ENSORLG00000030281 bend3 (ENSORLG00000030483) #23 ENSORLG00000022894 mtres1 (ENSORLG00000019492) #24 ENSORLG00000014540 ENSORLG00000028184 ENSORLG00000026097 ENSORLG00000021983 utp25 (ENSORLG00000019107) ENSORLG00000026140 Chinese medaka MODERN SPECIES 1207 ENSOSIG00000023594 ENSOSIG00000023596 ENSOSIG00000010425 CLIP4 (ENSOSIG00000010426) slc66a3 (ENSOSIG00000010427) rock2a (ENSOSIG00000010469) ENSOSIG00000015805 sobpa (ENSOSIG00000015807) ENSOSIG00000015809 pdss2 (ENSOSIG00000015815) #22 bend3 (ENSOSIG00000015817) #23 mtres1 (ENSOSIG00000015819) #24 TMEM151B (ENSOSIG00000015820) ENSOSIG00000015821 ENSOSIG00000015824 utp25 (ENSOSIG00000015826) ENSOSIG00000015880 Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00390000010130 ENSGT00390000001612 ENSGT00940000155320 ENSGT00390000005572 ENSGT00940000156417.g.a ENSGT00390000002768.a ENSGT00940000154524.b ENSGT00940000154239.b ENSGT00390000004254 ENSGT00940000159280 ENSGT00940000157706 ENSGT00940000154459.B ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.B.b ENSGT00940000154164.c.a ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000013762.b.a.a.b ENSGT00940000159219.a ENSGT00390000000709 ENSGT00940000162520.g.a ENSGT00940000162520.g.b ENSGT00940000162520.h ENSGT00390000015369.d ENSGT00940000166933 ENSGT00940000154394.b.a.b ENSGT00390000005524 ENSGT00950000182980.a.b.a.b.a.b ENSGT00940000158474 ENSGT00390000016736.a.i Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00390000010130 ENSGT00390000001612 ENSGT00940000155320 ENSGT00390000005572 ENSGT00940000156417.g.a ENSGT00390000002768.a ENSGT00940000154524.b ENSGT00940000154239.b ENSGT00390000004254 ENSGT00940000159280 ENSGT00940000157706 ENSGT00940000177705 ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.B.b ENSGT00940000154164.c.a ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000013762.b.a.a.b ENSGT00940000159219.a ENSGT00390000000709 ENSGT00940000162520.g.a ENSGT00940000162520.g.b ENSGT00940000162520.h ENSGT00390000015369.d ENSGT00940000166933 ENSGT00940000154394.b.a.a.a.a.a.b.d ENSGT00390000005524 ENSGT00950000182980.a.b.a.b.a.b ENSGT00940000158474 ENSGT00390000016736.a.i Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000001612 ENSGT00940000155320 ENSGT00390000005572 ENSGT00940000156417.g.a ENSGT00390000002768.a ENSGT00940000154524.b ENSGT00940000154239.b ENSGT00390000004254 ENSGT00940000159280 ENSGT00940000157706 ENSGT00940000177705 ENSGT01090000260059.a.b.b.a.a.a.a.b.b.a.b ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.B.b ENSGT00940000154164.c.a ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000013762.b.a.a.b ENSGT00940000159219.a ENSGT00390000000709 ENSGT00940000162520.g.a ENSGT00940000162520.g.b ENSGT00940000162520.h.f ENSGT00940000162520.h.e ENSGT00390000015369.d ENSGT00940000166933 ENSGT00940000154394.b.a.a.a.a.a.b.d ENSGT00940000154394.b.a.a.a.a.b ENSGT00390000005524 ENSGT00950000182980.a.b.a.b.a.b Nile tilapia MODERN SPECIES 10 mrpl33 (ENSONIG00000036327) ENSONIG00000019546 SLC4A1AP (ENSONIG00000019545) supt7l (ENSONIG00000032572) LRFN2 (ENSONIG00000038324) ENSONIG00000031307 spdya (ENSONIG00000019542) trmt61b (ENSONIG00000041929) wdr43 (ENSONIG00000019540) ENSONIG00000019537 rock2a (ENSONIG00000019531) ENSONIG00000019535 ENSONIG00000028443 ENSONIG00000019533 sobpa (ENSONIG00000019530) pdss2 (ENSONIG00000019529) #22 mtres1 (ENSONIG00000019527) #24 TMEM151B (ENSONIG00000019526) utp25 (ENSONIG00000019525) ENSONIG00000019523 ENSONIG00000035925 ENSONIG00000039786 ENSONIG00000038868 adprs (ENSONIG00000019521) ENSONIG00000031573 NRDE2 (ENSONIG00000019512) ENSONIG00000041731 ttc7b (ENSONIG00000019504) fam177a1 (ENSONIG00000019503) ppp2r3c (ENSONIG00000019502) ENSONIG00000042139 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000001612 ENSGT00940000155320 ENSGT00390000005572 ENSGT00940000156417.g.a ENSGT00390000002768.a ENSGT00940000154524.b ENSGT00940000154239.b ENSGT00390000004254 ENSGT00940000159280 ENSGT00940000157706 ENSGT00940000177705 ENSGT01090000260059.a.b.b.a.a.a.a.b.b.a.b ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.B.b ENSGT00940000154164.c.a ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000013762.b.a.a.b ENSGT00940000159219.a ENSGT00390000000709 ENSGT00940000162520.g.a ENSGT00940000162520.g.b ENSGT00940000162520.h.f ENSGT00940000162520.h.e ENSGT00390000015369.d ENSGT00940000166933 ENSGT00940000154394.b.a.a.a.a.a.b.d ENSGT00390000005524 ENSGT00950000182980.a.b.a.b.a.b ENSGT00940000158474 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000001612 ENSGT00940000155320 ENSGT00390000005572 ENSGT00940000156417.g.a ENSGT00390000002768.a ENSGT00940000154524.b ENSGT00940000154239.b ENSGT00390000004254 ENSGT00940000159280 ENSGT00940000157706 ENSGT00940000177705 ENSGT01090000260059.a.b.b.a.a.a.a.b.b.a.b ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.B.b ENSGT00940000154164.c.a ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000013762.b.a.a.b ENSGT00940000159219.a ENSGT00390000000709 ENSGT00940000162520.g.a ENSGT00940000162520.g.b ENSGT00940000162520.h.f ENSGT00940000162520.h.e ENSGT00390000015369.d ENSGT00940000166933 ENSGT00940000154394.b.a.a.a.a.a.b.d ENSGT00390000005524 ENSGT00950000182980.a.b.a.b.a.b ENSGT00940000158474 Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 432 ENSHBUG00000017248 CLIP4 (ENSHBUG00000017203) ENSHBUG00000017173 ENSHBUG00000017163 slc66a3 (ENSHBUG00000017153) rock2a (ENSHBUG00000000510) sobpa (ENSHBUG00000000499) pdss2 (ENSHBUG00000016955) #22 bend3 (ENSHBUG00000016891) #23 mtres1 (ENSHBUG00000016877) #24 TMEM151B (ENSHBUG00000016869) TMEM151B (ENSHBUG00000016859) ENSHBUG00000016846 utp25 (ENSHBUG00000016835) ENSHBUG00000016823 ENSHBUG00000016815 adprs (ENSHBUG00000016800) ENSHBUG00000016773 ENSHBUG00000016755 NRDE2 (ENSHBUG00000016736) ENSHBUG00000016723 ttc7b (ENSHBUG00000016704) fam177a1 (ENSHBUG00000016602) Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000001612 ENSGT00940000155320 ENSGT00390000005572 ENSGT00940000156417.g.a ENSGT00390000002768.a ENSGT00940000154524.b ENSGT00940000154239.b ENSGT00390000004254 ENSGT00940000159280 ENSGT00940000157706 ENSGT00940000177705 ENSGT01090000260059.a.b.b.a.a.a.a.b.b.a.b ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.B.b ENSGT00940000154164.c.a ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000013762.b.a.a.b ENSGT00940000159219.a ENSGT00390000000709 ENSGT00940000162520.g.a ENSGT00940000162520.g.b.a ENSGT00940000162520.h.f ENSGT00940000162520.g.b.b ENSGT00940000162520.h.e ENSGT00390000015369.d ENSGT00940000166933 ENSGT00940000154394.b.a.a.a.a.a.b.d ENSGT00390000005524 ENSGT00950000182980.a.b.a.b.a.b Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00390000010130 ENSGT00390000001612 ENSGT00940000155320 ENSGT00390000005572 ENSGT00490000044642.a.a.a.a.a.b.a.a.a.g.b ENSGT00940000156417.g.a ENSGT00390000002768.a ENSGT00940000154524.b ENSGT00940000154239.b ENSGT00390000004254 ENSGT00940000159280 ENSGT00940000157706 ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.B.b ENSGT00940000154164.c.a ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000013762.b.a.a.b ENSGT00940000159219.a ENSGT00390000000709 ENSGT00940000162520.g.a ENSGT00940000162520.g.b.a.b ENSGT00940000162520.h.f.b ENSGT00940000162520.g.b.a.a ENSGT00940000162520.h.f.a ENSGT00940000162520.g.b.b ENSGT00940000162520.h.e ENSGT00390000015369.d ENSGT00940000166933 ENSGT00940000154394.b.a.a.a.a.a.b.d Eastern happy MODERN SPECIES 10 supt7l (ENSACLG00000025824) ENSACLG00000025822 ENSACLG00000025817 ENSACLG00000025800 LRFN2 (ENSACLG00000025794) ENSACLG00000025788 trmt61b (ENSACLG00000025694) spdya (ENSACLG00000025751) wdr43 (ENSACLG00000025675) ENSACLG00000025650 CLIP4 (ENSACLG00000025563) ENSACLG00000025540 slc66a3 (ENSACLG00000025529) rock2a (ENSACLG00000025432) sobpa (ENSACLG00000025395) pdss2 (ENSACLG00000025335) #22 bend3 (ENSACLG00000025331) #23 mtres1 (ENSACLG00000025315) #24 TMEM151B (ENSACLG00000025309) TMEM151B (ENSACLG00000025306) ENSACLG00000025300 utp25 (ENSACLG00000025295) ENSACLG00000025283 ENSACLG00000025272 ENSACLG00000025263 ENSACLG00000025245 ENSACLG00000025241 ENSACLG00000025224 adprs (ENSACLG00000025218) ENSACLG00000025189 ENSACLG00000025175 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1101 wdr35 (ENSMZEG00005009317) kcns3a (ENSMZEG00005009263) ENSMZEG00005009241 ENSMZEG00005009225 LRFN2 (ENSMZEG00005009212) ENSMZEG00005009200 ENSMZEG00005009162 spdya (ENSMZEG00005009132) trmt61b (ENSMZEG00005009108) wdr43 (ENSMZEG00005009095) ENSMZEG00005009060 CLIP4 (ENSMZEG00005008923) slc66a3 (ENSMZEG00005009005) rock2a (ENSMZEG00005008775) sobpa (ENSMZEG00005008731) pdss2 (ENSMZEG00005008691) #22 bend3 (ENSMZEG00005008676) #23 mtres1 (ENSMZEG00005008665) #24 TMEM151B (ENSMZEG00005008654) TMEM151B (ENSMZEG00005008648) ENSMZEG00005008643 utp25 (ENSMZEG00005008636) ENSMZEG00005008621 ENSMZEG00005008605 ENSMZEG00005008597 ENSMZEG00005008587 ENSMZEG00005008577 ENSMZEG00005008573 ENSMZEG00005008407 adprs (ENSMZEG00005008382) ENSMZEG00005008362 P. nyererei MODERN SPECIES 381 SLC4A1AP (ENSPNYG00000000365) supt7l (ENSPNYG00000000362) ENSPNYG00000023133 LRFN2 (ENSPNYG00000023129) ENSPNYG00000023123 spdya (ENSPNYG00000023109) trmt61b (ENSPNYG00000023092) wdr43 (ENSPNYG00000023080) ENSPNYG00000023072 CLIP4 (ENSPNYG00000023053) ENSPNYG00000023047 ENSPNYG00000023045 slc66a3 (ENSPNYG00000023041) rock2a (ENSPNYG00000023013) sobpa (ENSPNYG00000022999) pdss2 (ENSPNYG00000022964) #22 bend3 (ENSPNYG00000022954) #23 mtres1 (ENSPNYG00000022947) #24 TMEM151B (ENSPNYG00000022941) TMEM151B (ENSPNYG00000022937) ENSPNYG00000022933 utp25 (ENSPNYG00000022925) ENSPNYG00000022920 ENSPNYG00000022916 adprs (ENSPNYG00000022908) ENSPNYG00000022888 ENSPNYG00000022880 NRDE2 (ENSPNYG00000022833) ENSPNYG00000022800 ttc7b (ENSPNYG00000022777) fam177a1 (ENSPNYG00000022771) Lyretail cichlid MODERN SPECIES 353 SLC4A1AP (ENSNBRG00000011279) supt7l (ENSNBRG00000011253) LRFN2 (ENSNBRG00000011233) ENSNBRG00000011213 spdya (ENSNBRG00000011146) trmt61b (ENSNBRG00000011097) wdr43 (ENSNBRG00000011062) ENSNBRG00000011006 ENSNBRG00000010989 ENSNBRG00000010984 ENSNBRG00000010972 ENSNBRG00000010960 slc66a3 (ENSNBRG00000010877) rock2a (ENSNBRG00000010802) sobpa (ENSNBRG00000010764) pdss2 (ENSNBRG00000010658) #22 bend3 (ENSNBRG00000010648) #23 mtres1 (ENSNBRG00000010635) #24 TMEM151B (ENSNBRG00000010627) TMEM151B (ENSNBRG00000010614) utp25 (ENSNBRG00000010582) ENSNBRG00000010530 adprs (ENSNBRG00000010466) ENSNBRG00000010449 ENSNBRG00000010325 NRDE2 (ENSNBRG00000010184) ENSNBRG00000010133 ttc7b (ENSNBRG00000010091) fam177a1 (ENSNBRG00000010080) ppp2r3c (ENSNBRG00000010050) PRORP (ENSNBRG00000010019) Midas cichlid MODERN SPECIES 186 SLC4A1AP (ENSACIG00000010936) supt7l (ENSACIG00000010921) LRFN2 (ENSACIG00000010908) ENSACIG00000010905 spdya (ENSACIG00000010888) trmt61b (ENSACIG00000010860) wdr43 (ENSACIG00000010675) ENSACIG00000010657 ENSACIG00000010621 ENSACIG00000010601 ENSACIG00000010586 ENSACIG00000010574 slc66a3 (ENSACIG00000010555) rock2a (ENSACIG00000010476) sobpa (ENSACIG00000010454) pdss2 (ENSACIG00000010387) #22 Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 86 ENSGT00390000010130 ENSGT00390000001612 ENSGT00940000155320 ENSGT00390000005572 ENSGT00940000156417.g.a ENSGT00390000002768.a ENSGT00940000154524.b ENSGT00940000154239.b ENSGT00390000004254 ENSGT00940000159280 ENSGT00940000157706 ENSGT00940000154459.B ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.B.b ENSGT00940000154164.c.a ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000013762.b.a.a.b ENSGT00940000159219.a ENSGT00390000000709 ENSGT00940000162520.g.a ENSGT00940000162520.g.b ENSGT00940000162520.h ENSGT00390000015369.d ENSGT00940000166933 ENSGT00940000154394.b.a.b ENSGT00390000005524 ENSGT00950000182980.a.b.a.b.a.b ENSGT00940000158474 ENSGT00390000016736.a.i Bicolor damselfish MODERN SPECIES 272 ENSSPAG00000021064 ENSSPAG00000021086 ENSSPAG00000000020 ENSSPAG00000000033 slc66a3 (ENSSPAG00000000045) rock2a (ENSSPAG00000000053) sobpa (ENSSPAG00000000109) pdss2 (ENSSPAG00000000135) #22 bend3 (ENSSPAG00000000176) #23 mtres1 (ENSSPAG00000000184) #24 TMEM151B (ENSSPAG00000000187) ENSSPAG00000000204 utp25 (ENSSPAG00000000211) ENSSPAG00000000312 ENSSPAG00000000354 ENSSPAG00000000376 adprs (ENSSPAG00000000397) ENSSPAG00000000422 ENSSPAG00000000518 NRDE2 (ENSSPAG00000000539) ENSSPAG00000000718 ttc7b (ENSSPAG00000000738) fam177a1 (ENSSPAG00000000821) Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 76 ENSGT00390000010130 ENSGT00390000001612 ENSGT00940000155320 ENSGT00390000005572 ENSGT00940000156417.g.a ENSGT00390000002768.a ENSGT00940000154524.b ENSGT00940000154239.b ENSGT00390000004254 ENSGT00940000159280 ENSGT00940000157706 ENSGT00940000154459.B ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.B.b ENSGT00940000154164.c.a ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000013762.b.a.a.b ENSGT00940000159219.a ENSGT00390000000709 ENSGT00940000162520.g.a ENSGT00940000162520.h ENSGT00390000015369.d ENSGT00940000166933 ENSGT00940000154394.b.a.b ENSGT00390000005524 ENSGT00950000182980.a.b.a.b.a.b ENSGT00940000158474 ENSGT00390000016736.a.i ENSGT00940000155583 Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 68 ENSGT00390000010130 ENSGT00390000001612 ENSGT00940000155320 ENSGT00390000005572 ENSGT00940000156417.g.a ENSGT00390000002768.a ENSGT00940000154524.b ENSGT00940000154239.b ENSGT00390000004254 ENSGT00940000159280 ENSGT00940000157706 ENSGT00940000154459.B ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.B.b ENSGT00940000154164.c.a ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000013762.b.a.a.b ENSGT00940000159219.a ENSGT00390000000709 ENSGT00940000162520.g.a ENSGT00940000162520.h ENSGT00390000015369.d ENSGT00940000166933 ENSGT00940000154394.b.a.b ENSGT00390000005524 ENSGT00950000182980.a.b.a.b.a.b ENSGT00940000158474 ENSGT00390000016736.a.i ENSGT00940000155583 Clown anemonefish MODERN SPECIES 2538 pdss2 (ENSAOCG00000019640) #22 bend3 (ENSAOCG00000001423) #23 mtres1 (ENSAOCG00000019566) #24 TMEM151B (ENSAOCG00000002685) ENSAOCG00000001420 utp25 (ENSAOCG00000019536) ENSAOCG00000019499 ENSAOCG00000019474 adprs (ENSAOCG00000019461) Orange clownfish MODERN SPECIES 9 SLC4A1AP (ENSAPEG00000023335) supt7l (ENSAPEG00000000325) ENSAPEG00000000379 LRFN2 (ENSAPEG00000000412) ENSAPEG00000000441 spdya (ENSAPEG00000000454) trmt61b (ENSAPEG00000000518) wdr43 (ENSAPEG00000000552) ENSAPEG00000000572 ENSAPEG00000000606 ENSAPEG00000000757 si:dkey-18j18.3 (ENSAPEG00000000764) slc66a3 (ENSAPEG00000000793) rock2a (ENSAPEG00000000856) sobpa (ENSAPEG00000001035) pdss2 (ENSAPEG00000001075) #22 bend3 (ENSAPEG00000001132) #23 mtres1 (ENSAPEG00000001145) #24 TMEM151B (ENSAPEG00000001201) ENSAPEG00000001229 ENSAPEG00000001239 ENSAPEG00000001249 fntb (ENSAPEG00000001258) ENSAPEG00000001286 ENSAPEG00000001290 ENSAPEG00000001300 ENSAPEG00000001336 adprs (ENSAPEG00000001365) ENSAPEG00000001400 ENSAPEG00000001517 NRDE2 (ENSAPEG00000001711) Spiny chromis MODERN SPECIES 145 ENSAPOG00000009330 CLIP4 (ENSAPOG00000009381) si:dkey-18j18.3 (ENSAPOG00000009402) slc66a3 (ENSAPOG00000009437) rock2a (ENSAPOG00000009562) sobpa (ENSAPOG00000009651) pdss2 (ENSAPOG00000009692) #22 bend3 (ENSAPOG00000009706) #23 mtres1 (ENSAPOG00000009725) #24 TMEM151B (ENSAPOG00000009743) ENSAPOG00000009761 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000001612 ENSGT00940000155320 ENSGT00390000005572 ENSGT00940000156417.g.a ENSGT00390000002768.a ENSGT00940000154524.b ENSGT00940000154239.b ENSGT00390000004254 ENSGT00530000069575 ENSGT00940000159280 ENSGT00940000157706 ENSGT00940000154459.B ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.B.b ENSGT00940000154164.c.a ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000013762.b.a.a.b ENSGT00940000159219.a ENSGT00390000000709 ENSGT00940000162520.g.a ENSGT00940000162520.g.b ENSGT00940000162520.h ENSGT00390000015369.d ENSGT00940000166933 ENSGT00940000154394.b.a.b ENSGT00390000005524 ENSGT00950000182980.a.b.a.b.a.b ENSGT00940000158474 ENSGT00390000016736.a.i Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000001612 ENSGT00940000155320 ENSGT00390000005572 ENSGT00940000156417.g.a ENSGT00390000002768.a ENSGT00940000154524.b ENSGT00940000154239.b ENSGT00390000004254 ENSGT00530000069575 ENSGT00940000159280 ENSGT00940000157706 ENSGT00940000154459.B ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.B.b ENSGT00940000154164.c.a ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000013762.b.a.a.b ENSGT00940000159219.a ENSGT00390000000709 ENSGT00940000162520.g.a ENSGT00940000162520.g.b ENSGT00940000162520.h ENSGT00390000015369.d ENSGT00940000166933 ENSGT00940000154394.b.a.b ENSGT00390000005524 ENSGT00950000182980.a.b.a.b.a.b ENSGT00940000158474 ENSGT00390000016736.a.i Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 45 ENSGT00940000156087.b ENSGT00390000016577.a ENSGT00390000005572 ENSGT00940000156417.g.a ENSGT00390000002768.a ENSGT00940000154524.b ENSGT00940000154239.b ENSGT00390000004254 ENSGT00530000069575 ENSGT00940000159280 ENSGT00940000157706 ENSGT00940000154459.B ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.B.b ENSGT00940000154164.c.a ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000013762.b.a.a.b ENSGT00390000000709 ENSGT00940000162520.g.a ENSGT00940000162520.h ENSGT00390000015369.d ENSGT00940000166933 ENSGT00390000004923.A.c.b ENSGT00940000166262 ENSGT00390000009361 ENSGT00940000165880.b ENSGT01030000234513.A.a.a.a.b.d.b ENSGT01010000222987 ENSGT00940000154383.b Tetraodon MODERN SPECIES 1 GPR68 (ENSTNIG00000008901) PALS1 (ENSTNIG00000008902) ENSTNIG00000008903 supt7l (ENSTNIG00000000868) LRFN2 (ENSTNIG00000008904) spdya (ENSTNIG00000008905) trmt61b (ENSTNIG00000008906) wdr43 (ENSTNIG00000008907) ENSTNIG00000008908 ENSTNIG00000008909 CLIP4 (ENSTNIG00000008910) slc66a3 (ENSTNIG00000008911) rock2a (ENSTNIG00000008912) ENSTNIG00000008913 ENSTNIG00000000612 pdss2 (ENSTNIG00000008914) #22 mtres1 (ENSTNIG00000001710) #24 TMEM151B (ENSTNIG00000008916) utp25 (ENSTNIG00000008917) ENSTNIG00000008918 adprs (ENSTNIG00000008919) ENSTNIG00000008920 FNDC5 (ENSTNIG00000008921) olig4 (ENSTNIG00000008922) bsdc1 (ENSTNIG00000008923) marcksl1a (ENSTNIG00000008924) gjb9a (ENSTNIG00000008925) ENSTNIG00000008926 ppp1r13ba (ENSTNIG00000003062) ENSTNIG00000003061 ATP6V1C2 (ENSTNIG00000001145) Fugu MODERN SPECIES 11 ENSTRUG00000031617 supt7l (ENSTRUG00000009632) LRFN2 (ENSTRUG00000009709) ENSTRUG00000028301 ENSTRUG00000022302 spdya (ENSTRUG00000019515) trmt61b (ENSTRUG00000022649) wdr43 (ENSTRUG00000009764) ENSTRUG00000010044 ENSTRUG00000029225 ENSTRUG00000010452 si:dkey-18j18.3 (ENSTRUG00000020237) slc66a3 (ENSTRUG00000010722) rock2a (ENSTRUG00000010769) sobpa (ENSTRUG00000011030) pdss2 (ENSTRUG00000011067) #22 bend3 (ENSTRUG00000011122) #23 mtres1 (ENSTRUG00000022825) #24 TMEM151B (ENSTRUG00000011127) utp25 (ENSTRUG00000025056) ENSTRUG00000030997 ENSTRUG00000011153 adprs (ENSTRUG00000011445) FNDC5 (ENSTRUG00000012090) FNDC5 (ENSTRUG00000032381) bsdc1 (ENSTRUG00000012146) marcksl1a (ENSTRUG00000020822) gjb9a (ENSTRUG00000031407) ENSTRUG00000030987 ptp4a2a (ENSTRUG00000012418) ppp1r13ba (ENSTRUG00000027459) Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000010130 ENSGT00390000001612 ENSGT00940000155320 ENSGT00390000005572 ENSGT00940000156417.g.a ENSGT00390000002768.a ENSGT00940000154524.b ENSGT00940000154239.b ENSGT00390000004254 ENSGT00940000159280 ENSGT00940000157706 ENSGT00940000154459.B ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.B.b ENSGT00940000154164.c.a ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000013762.b.a.a.b ENSGT00940000159219.a ENSGT00390000000709 ENSGT00940000162520.g.a ENSGT00940000162520.g.b ENSGT00940000162520.h ENSGT00390000015369.d ENSGT00940000166933 ENSGT00940000154394.b.a.b ENSGT00390000005524 ENSGT00950000182980.a.b.a.b.a.b ENSGT00940000158474 ENSGT00390000016736.a.i Ballan wrasse MODERN SPECIES 191 ENSLBEG00000020594 CLIP4 (ENSLBEG00000020664) si:dkey-18j18.3 (ENSLBEG00000020749) slc66a3 (ENSLBEG00000020773) rock2a (ENSLBEG00000020841) sobpa (ENSLBEG00000020988) pdss2 (ENSLBEG00000021080) #22 bend3 (ENSLBEG00000021118) #23 mtres1 (ENSLBEG00000021128) #24 TMEM151B (ENSLBEG00000021148) ENSLBEG00000021169 utp25 (ENSLBEG00000021180) ENSLBEG00000021204 ENSLBEG00000021226 ENSLBEG00000021256 adprs (ENSLBEG00000021277) ENSLBEG00000021301 ENSLBEG00000021350 ENSLBEG00000021365 NRDE2 (ENSLBEG00000021428) ENSLBEG00000021551 ttc7b (ENSLBEG00000021637) Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000010130 ENSGT00390000001612 ENSGT00940000155320 ENSGT00390000005572 ENSGT00940000156417.g.a ENSGT00390000002768.a ENSGT00940000154524.b ENSGT00940000154239.b ENSGT00390000004254 ENSGT00940000159280 ENSGT00940000157706 ENSGT00940000154459.B ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.B.b ENSGT00940000154164.c.a ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000013762.b.a.a.b ENSGT00940000159219.a ENSGT00390000000709 ENSGT00940000162520.g.a ENSGT00940000162520.g.b ENSGT00940000162520.h ENSGT00390000015369.d ENSGT00940000166933 ENSGT00940000154394.b.a.b ENSGT00390000005524 ENSGT00950000182980.a.b.a.b.a.b ENSGT00940000158474 ENSGT00390000016736.a.i Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000010130 ENSGT00390000001612 ENSGT00940000155320 ENSGT00390000005572 ENSGT00940000156417.g.a ENSGT00390000002768.a ENSGT00940000154524.b ENSGT00940000154239.b ENSGT00390000004254 ENSGT00940000159280 ENSGT00940000157706 ENSGT00940000154459.B ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.B.b ENSGT00940000154164.c.a ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000013762.b.a.a.b ENSGT00940000159219.a ENSGT00390000000709 ENSGT00940000162520.g.a ENSGT00940000162520.h ENSGT00390000015369.d ENSGT00940000166933 ENSGT00940000154394.b.a.b ENSGT00390000005524 ENSGT00950000182980.a.b.a.b.a.b ENSGT00940000158474 ENSGT00390000016736.a.i ENSGT00940000155583 Gilthead seabream MODERN SPECIES 7 ENSSAUG00010022623 ENSSAUG00010022621 ENSSAUG00010022615 ENSSAUG00010022613 LRFN2 (ENSSAUG00010022610) ENSSAUG00010022607 spdya (ENSSAUG00010022604) trmt61b (ENSSAUG00010022602) wdr43 (ENSSAUG00010022429) ENSSAUG00010022421 CLIP4 (ENSSAUG00010022413) si:dkey-18j18.3 (ENSSAUG00010022410) slc66a3 (ENSSAUG00010022408) rock2a (ENSSAUG00010021718) sobpa (ENSSAUG00010021688) pdss2 (ENSSAUG00010021685) #22 bend3 (ENSSAUG00010021682) #23 mtres1 (ENSSAUG00010021681) #24 TMEM151B (ENSSAUG00010021680) ENSSAUG00010021678 utp25 (ENSSAUG00010021676) ENSSAUG00010021672 ENSSAUG00010021666 ENSSAUG00010021647 adprs (ENSSAUG00010021641) ENSSAUG00010021635 ENSSAUG00010021631 NRDE2 (ENSSAUG00010021623) ENSSAUG00010021607 ttc7b (ENSSAUG00010021564) ENSSAUG00010021541 Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00390000010130 ENSGT00390000001612 ENSGT00940000155320 ENSGT00390000005572 ENSGT00940000156417.g.a ENSGT00390000002768.a ENSGT00940000154524.b ENSGT00940000154239.b ENSGT00390000004254 ENSGT00940000159280 ENSGT00940000157706 ENSGT00940000154459.B ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.B.b ENSGT00940000154164.c.a ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000013762.b.a.a.b ENSGT00390000000709 ENSGT00940000162520.g.a ENSGT00940000162520.h ENSGT00390000015369.d ENSGT00940000166933 ENSGT00940000154394.b.a.b ENSGT00390000005524 ENSGT00950000182980.a.b.a.b.a.b ENSGT00940000158474 ENSGT00390000016736.a.i ENSGT00940000155583 ENSGT00390000002201 European seabass MODERN SPECIES 2 ENSDLAG00005033439 SLC4A1AP (ENSDLAG00005020453) supt7l (ENSDLAG00005027881) ENSDLAG00005026421 ENSDLAG00005020474 ENSDLAG00005020493 spdya (ENSDLAG00005020481) ENSDLAG00005020500 wdr43 (ENSDLAG00005020517) ENSDLAG00005020655 C2orf50 (ENSDLAG00005020702) ENSDLAG00005020706 ROCK2 (ENSDLAG00005020789) ENSDLAG00005022748 sobpa (ENSDLAG00005022751) ENSDLAG00005022782 #22 bend3 (ENSDLAG00005033360) #23 ENSDLAG00005032370 ENSDLAG00005022798 ENSDLAG00005022814 ENSDLAG00005022818 ENSDLAG00005034977 ENSDLAG00005022912 ENSDLAG00005034899 ENSDLAG00005027203 ENSDLAG00005022941 ENSDLAG00005028404 ENSDLAG00005023016 fam177a1 (ENSDLAG00005023186) ppp2r3c (ENSDLAG00005023193) PRORP (ENSDLAG00005023262) Large yellow croaker MODERN SPECIES 495 rbks (ENSLCRG00005014268) mrpl33 (ENSLCRG00005014266) ENSLCRG00005023588 ENSLCRG00005023587 supt7l (ENSLCRG00005023586) LRFN2 (ENSLCRG00005023585) ENSLCRG00005023584 spdya (ENSLCRG00005023583) trmt61b (ENSLCRG00005023582) wdr43 (ENSLCRG00005023569) ENSLCRG00005023555 ENSLCRG00005023554 slc66a3 (ENSLCRG00005023553) rock2a (ENSLCRG00005022975) sobpa (ENSLCRG00005022963) pdss2 (ENSLCRG00005022961) #22 bend3 (ENSLCRG00005022960) #23 mtres1 (ENSLCRG00005022959) #24 TMEM151B (ENSLCRG00005022958) utp25 (ENSLCRG00005022957) ENSLCRG00005022956 ENSLCRG00005022955 ENSLCRG00005022954 adprs (ENSLCRG00005022953) ENSLCRG00005022950 ENSLCRG00005022949 NRDE2 (ENSLCRG00005022948) ENSLCRG00005022947 ttc7b (ENSLCRG00005022525) fam177a1 (ENSLCRG00005022515) ppp2r3c (ENSLCRG00005022514) Perciformes ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000010130 ENSGT00390000001612 ENSGT00940000155320 ENSGT00390000005572 ENSGT00940000156417.g.a ENSGT00390000002768.a ENSGT00940000154524.b ENSGT00940000154239.b ENSGT00390000004254 ENSGT00940000159280 ENSGT00940000157706 ENSGT00940000154459.B ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.B.b ENSGT00940000154164.c.a ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000013762.b.a.a.b ENSGT00390000000709 ENSGT00940000162520.g.a ENSGT00940000162520.g.b ENSGT00940000162520.h ENSGT00390000015369.d ENSGT00940000166933 ENSGT00940000154394.b.a.a.a.a.a.b ENSGT00390000005524 ENSGT00950000182980.a.b.a.b.a.b ENSGT00940000158474 ENSGT00390000016736.a.i ENSGT00940000155583 Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000010130 ENSGT00390000001612 ENSGT00940000155320 ENSGT00390000005572 ENSGT00940000156417.g.a ENSGT00390000002768.a ENSGT00940000154524.b ENSGT00940000154239.b ENSGT00390000004254 ENSGT00940000159280 ENSGT00940000157706 ENSGT00940000154459.B ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.B.b ENSGT00940000154164.c.a ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000013762.b.a.a.b ENSGT00390000000709 ENSGT00940000162520.g.a ENSGT00940000162520.g.b ENSGT00940000162520.h ENSGT00390000015369.d ENSGT00940000166933 ENSGT00940000154394.b.a.b ENSGT00390000005524 ENSGT00950000182980.a.b.a.b.a.b ENSGT00940000158474 ENSGT00390000016736.a.i ENSGT00940000155583 Lumpfish MODERN SPECIES 14 ENSCLMG00005009838 supt7l (ENSCLMG00005009839) ENSCLMG00005009840 LRFN2 (ENSCLMG00005009841) ENSCLMG00005009844 spdya (ENSCLMG00005009849) trmt61b (ENSCLMG00005009864) wdr43 (ENSCLMG00005009865) ENSCLMG00005009994 ENSCLMG00005009995 ENSCLMG00005009998 si:dkey-18j18.3 (ENSCLMG00005010012) slc66a3 (ENSCLMG00005010014) rock2a (ENSCLMG00005010027) sobpa (ENSCLMG00005010152) pdss2 (ENSCLMG00005010168) #22 bend3 (ENSCLMG00005010171) #23 mtres1 (ENSCLMG00005010172) #24 TMEM151B (ENSCLMG00005010174) utp25 (ENSCLMG00005010179) ENSCLMG00005010188 ENSCLMG00005010192 ENSCLMG00005010196 adprs (ENSCLMG00005010201) ENSCLMG00005010207 ENSCLMG00005010217 NRDE2 (ENSCLMG00005010221) ENSCLMG00005010226 ttc7b (ENSCLMG00005010278) fam177a1 (ENSCLMG00005010574) ppp2r3c (ENSCLMG00005010577) Stickleback MODERN SPECIES 15 babam2 (ENSGACG00000012929) rbks (ENSGACG00000012914) mrpl33 (ENSGACG00000012910) ENSGACG00000012907 ENSGACG00000012898 supt7l (ENSGACG00000012880) LRFN2 (ENSGACG00000012877) spdya (ENSGACG00000012873) trmt61b (ENSGACG00000012868) wdr43 (ENSGACG00000012843) ENSGACG00000012839 ENSGACG00000012823 slc66a3 (ENSGACG00000012819) rock2a (ENSGACG00000012788) sobpa (ENSGACG00000012782) pdss2 (ENSGACG00000012773) #22 bend3 (ENSGACG00000012772) #23 TMEM151B (ENSGACG00000012771) utp25 (ENSGACG00000012761) ENSGACG00000012713 adprs (ENSGACG00000012707) ENSGACG00000012698 ENSGACG00000012635 NRDE2 (ENSGACG00000012619) ENSGACG00000012607 ttc7b (ENSGACG00000012589) fam177a1 (ENSGACG00000012585) ppp2r3c (ENSGACG00000012545) PRORP (ENSGACG00000012540) psma6a (ENSGACG00000012527) nfkbiab (ENSGACG00000012514) Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000010130 ENSGT00390000001612 ENSGT00940000155320 ENSGT00390000005572 ENSGT00940000156417.g.a ENSGT00390000002768.a ENSGT00940000154524.b ENSGT00940000154239.b ENSGT00390000004254 ENSGT00940000159280 ENSGT00940000157706 ENSGT00940000154459.B ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.B.b ENSGT00940000154164.c.a ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000013762.b.a.a.b ENSGT00390000000709 ENSGT00940000162520.g.a ENSGT00940000162520.g.b ENSGT00940000162520.h ENSGT00390000015369.d ENSGT00940000166933 ENSGT00940000154394.b.a.a.a.a.a.b ENSGT00390000005524 ENSGT00950000182980.a.b.a.b.a.b ENSGT00940000158474 ENSGT00390000016736.a.i ENSGT00940000155583 Channel bull blenny MODERN SPECIES 14 ENSCGOG00000005237 SLC4A1AP (ENSCGOG00000005238) supt7l (ENSCGOG00000005242) LRFN2 (ENSCGOG00000005244) ENSCGOG00000005250 spdya (ENSCGOG00000005252) trmt61b (ENSCGOG00000005254) wdr43 (ENSCGOG00000005258) ENSCGOG00000005515 CLIP4 (ENSCGOG00000005564) si:dkey-18j18.3 (ENSCGOG00000005668) slc66a3 (ENSCGOG00000005669) rock2a (ENSCGOG00000005791) ENSCGOG00000010497 sobpa (ENSCGOG00000010499) pdss2 (ENSCGOG00000010500) #22 ENSCGOG00000010501 bend3 (ENSCGOG00000010502) #23 mtres1 (ENSCGOG00000010503) #24 mtres1 (ENSCGOG00000010505) #24 TMEM151B (ENSCGOG00000010507) utp25 (ENSCGOG00000010508) ENSCGOG00000010515 ENSCGOG00000010663 adprs (ENSCGOG00000010670) ENSCGOG00000010672 ENSCGOG00000010676 ENSCGOG00000010696 ENSCGOG00000010705 ENSCGOG00000010708 ttc7b (ENSCGOG00000010748) Pike perch MODERN SPECIES 39 ENSSLUG00000012202 supt7l (ENSSLUG00000012197) ENSSLUG00000012193 LRFN2 (ENSSLUG00000012187) ENSSLUG00000012180 spdya (ENSSLUG00000012179) trmt61b (ENSSLUG00000012175) wdr43 (ENSSLUG00000012118) ENSSLUG00000012084 ENSSLUG00000012079 CLIP4 (ENSSLUG00000012072) si:dkey-18j18.3 (ENSSLUG00000012057) slc66a3 (ENSSLUG00000012050) rock2a (ENSSLUG00000005970) sobpa (ENSSLUG00000005613) pdss2 (ENSSLUG00000005596) #22 bend3 (ENSSLUG00000005591) #23 mtres1 (ENSSLUG00000011507) #24 TMEM151B (ENSSLUG00000011502) utp25 (ENSSLUG00000011479) ENSSLUG00000011473 ENSSLUG00000011469 ENSSLUG00000011460 adprs (ENSSLUG00000011450) ENSSLUG00000011396 ENSSLUG00000011376 NRDE2 (ENSSLUG00000011349) ENSSLUG00000011345 ttc7b (ENSSLUG00000011178) fam177a1 (ENSSLUG00000011149) ppp2r3c (ENSSLUG00000011129) Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000001612 ENSGT00940000155320 ENSGT00390000005572 ENSGT00940000156417.g.a ENSGT00390000002768.a ENSGT00940000154524.b ENSGT00940000154239.b ENSGT00390000004254 ENSGT00530000069575 ENSGT00940000159280 ENSGT00940000157706 ENSGT00940000154459.B ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.B.b ENSGT00940000154164.c.a ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000013762.b.a.a.b ENSGT00940000159219.a ENSGT00390000000709 ENSGT00940000162520.g.a ENSGT00940000162520.g.b ENSGT00940000162520.h ENSGT00390000015369.d ENSGT00940000166933 ENSGT00940000154394.b.a.b ENSGT00390000005524 ENSGT00950000182980.a.b.a.b.a.b ENSGT00940000158474 ENSGT00390000016736.a.i Carangaria ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000010130 ENSGT00390000001612 ENSGT00940000155320 ENSGT00390000005572 ENSGT00940000156417.g.a ENSGT00390000002768.a ENSGT00940000154524.b ENSGT00940000154239.b ENSGT00390000004254 ENSGT00940000159280 ENSGT00940000157706 ENSGT00940000154459.B ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.B.b ENSGT00940000154164.c.a ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000013762.b.a.a.b ENSGT00940000159219.a ENSGT00390000000709 ENSGT00940000162520.g.a ENSGT00940000162520.g.b ENSGT00940000162520.h ENSGT00390000015369.d ENSGT00940000166933 ENSGT00940000154394.b.a.b ENSGT00390000005524 ENSGT00950000182980.a.b.a.b.a.b ENSGT00940000158474 ENSGT00390000016736.a.i Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000010130 ENSGT00390000001612 ENSGT00940000155320 ENSGT00390000005572 ENSGT00940000156417.g.a ENSGT00390000002768.a ENSGT00940000154524.b ENSGT00940000154239.b ENSGT00390000004254 ENSGT00940000159280 ENSGT00940000157706 ENSGT00940000154459.B ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.B.b ENSGT00940000154164.c.a ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000013762.b.a.a.b ENSGT00940000159219.a ENSGT00390000000709 ENSGT00940000162520.g.b ENSGT00940000162520.h ENSGT00390000015369.d ENSGT00940000162520.g.a ENSGT00390000015369.c.a ENSGT00940000166933 ENSGT00940000154394.b.a.b ENSGT00390000005524 ENSGT00950000182980.a.b.a.b.a.b ENSGT00940000158474 Seriola ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000010130 ENSGT00390000001612 ENSGT00940000155320 ENSGT00390000005572 ENSGT00940000156417.g.a ENSGT00390000002768.a ENSGT00940000154524.b ENSGT00940000154239.b ENSGT00390000004254 ENSGT00940000159280 ENSGT00940000157706 ENSGT00940000154459.B ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.B.b ENSGT00940000154164.c.a ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000013762.b.a.a.b ENSGT00940000159219.a ENSGT00390000000709 ENSGT00940000162520.g.b ENSGT00940000162520.h.m.a ENSGT00940000162520.g.a ENSGT00390000015369.c.a ENSGT00940000166933 ENSGT00940000154394.b.a.b ENSGT00390000005524 ENSGT00950000182980.a.b.a.b.a.b ENSGT00940000158474 ENSGT00390000016736.a.i Greater amberjack MODERN SPECIES 62 ENSSDUG00000018682 SLC4A1AP (ENSSDUG00000018659) supt7l (ENSSDUG00000018644) LRFN2 (ENSSDUG00000018637) ENSSDUG00000018628 spdya (ENSSDUG00000018618) trmt61b (ENSSDUG00000018591) wdr43 (ENSSDUG00000018532) ENSSDUG00000018515 ENSSDUG00000018479 ENSSDUG00000018388 si:dkey-18j18.3 (ENSSDUG00000018374) slc66a3 (ENSSDUG00000018363) rock2a (ENSSDUG00000018198) sobpa (ENSSDUG00000018152) pdss2 (ENSSDUG00000018117) #22 bend3 (ENSSDUG00000018114) #23 mtres1 (ENSSDUG00000018104) #24 TMEM151B (ENSSDUG00000018095) ENSSDUG00000018091 utp25 (ENSSDUG00000018076) ENSSDUG00000018053 ENSSDUG00000018047 adprs (ENSSDUG00000018020) ENSSDUG00000017979 ENSSDUG00000017968 NRDE2 (ENSSDUG00000017948) ENSSDUG00000017941 ttc7b (ENSSDUG00000017860) fam177a1 (ENSSDUG00000017841) ppp2r3c (ENSSDUG00000017770) Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 3213 rock2a (ENSSLDG00000024081) sobpa (ENSSLDG00000024065) pdss2 (ENSSLDG00000024043) #22 bend3 (ENSSLDG00000024019) #23 mtres1 (ENSSLDG00000024032) #24 TMEM151B (ENSSLDG00000024010) ENSSLDG00000024007 utp25 (ENSSLDG00000023994) ENSSLDG00000023988 ENSSLDG00000023985 ENSSLDG00000023978 adprs (ENSSLDG00000023967) ENSSLDG00000023912 ENSSLDG00000023897 NRDE2 (ENSSLDG00000023798) ENSSLDG00000023780 ttc7b (ENSSLDG00000023754) fam177a1 (ENSSLDG00000023711) Barramundi perch MODERN SPECIES 131 supt7l (ENSLCAG00010021898) LRFN2 (ENSLCAG00010021902) ENSLCAG00010021904 ENSLCAG00010021908 spdya (ENSLCAG00010021916) trmt61b (ENSLCAG00010021923) wdr43 (ENSLCAG00010021930) ENSLCAG00010021955 ENSLCAG00010021979 ENSLCAG00010022116 ENSLCAG00010022124 si:dkey-18j18.3 (ENSLCAG00010022132) slc66a3 (ENSLCAG00010022135) rock2a (ENSLCAG00010022162) sobpa (ENSLCAG00010022241) pdss2 (ENSLCAG00010022244) #22 bend3 (ENSLCAG00010022250) #23 mtres1 (ENSLCAG00010022254) #24 TMEM151B (ENSLCAG00010022256) ENSLCAG00010022259 utp25 (ENSLCAG00010022262) ENSLCAG00010022268 ENSLCAG00010022277 ENSLCAG00010022285 adprs (ENSLCAG00010022286) ENSLCAG00010022290 ENSLCAG00010022304 ENSLCAG00010022311 NRDE2 (ENSLCAG00010022322) ENSLCAG00010022328 ttc7b (ENSLCAG00010022340) Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000010130 ENSGT00390000001612 ENSGT00940000155320 ENSGT00390000005572 ENSGT00940000156417.g.a ENSGT00390000002768.a ENSGT00940000154524.b ENSGT00940000154239.b ENSGT00390000004254 ENSGT00940000159280 ENSGT00940000157706 ENSGT00940000154459.B ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.B.b ENSGT00940000154164.c.a ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000013762.b.a.a.b ENSGT00390000000709 ENSGT00940000162520.g.a ENSGT00940000162520.h ENSGT00390000015369.d ENSGT00940000166933 ENSGT00940000154394.b.a.a.a.b.a.b ENSGT00940000154394.b.a.a.a.a.a.b ENSGT00390000005524 ENSGT00950000182980.a.b.a.b.a.b ENSGT00940000158474 ENSGT00390000016736.a.i ENSGT00940000155583 Tongue sole MODERN SPECIES slc66a3 (ENSCSEG00000016243) rock2a (ENSCSEG00000016179) sobpa (ENSCSEG00000016155) bend3 (ENSCSEG00000016148) #23 mtres1 (ENSCSEG00000016137) #24 TMEM151B (ENSCSEG00000016131) utp25 (ENSCSEG00000016118) ENSCSEG00000016109 ENSCSEG00000016095 adprs (ENSCSEG00000016082) FBXO33 (ENSCSEG00000016069) gemin2 (ENSCSEG00000016057) pnn (ENSCSEG00000016051) ENSCSEG00000016048 ENSCSEG00000016038 pdss2 (ENSCSEG00000016013) #22 gjb9a (ENSCSEG00000016004) ENSCSEG00000015996 ppp1r13ba (ENSCSEG00000015971) ENSCSEG00000015928 PALS1 (ENSCSEG00000015895) ENSCSEG00000015884 ENSCSEG00000015851 ENSCSEG00000015841 GPR68 (ENSCSEG00000015834) DGLUCY (ENSCSEG00000015809) APOB (ENSCSEG00000015782) ldah (ENSCSEG00000015772) alkbh1 (ENSCSEG00000015769) slirp (ENSCSEG00000015766) adck1 (ENSCSEG00000015733) Turbot MODERN SPECIES 8 SLC4A1AP (ENSSMAG00000015211) supt7l (ENSSMAG00000015254) ENSSMAG00000015281 ENSSMAG00000015295 spdya (ENSSMAG00000015301) ENSSMAG00000015317 wdr43 (ENSSMAG00000015328) ENSSMAG00000012898 ENSSMAG00000012210 ENSSMAG00000012162 C2orf50 (ENSSMAG00000031188) ENSSMAG00000012148 ENSSMAG00000012139 ROCK2 (ENSSMAG00000012030) sobpa (ENSSMAG00000011994) pdss2 (ENSSMAG00000011964) #22 bend3 (ENSSMAG00000024135) #23 mtres1 (ENSSMAG00000011954) #24 ENSSMAG00000011940 ENSSMAG00000037124 ENSSMAG00000011901 ENSSMAG00000023453 ENSSMAG00000011860 ENSSMAG00000011845 ENSSMAG00000011745 ENSSMAG00000017567 ENSSMAG00000033678 ENSSMAG00000031003 ENSSMAG00000035007 ENSSMAG00000011671 ENSSMAG00000011642 Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000001612 ENSGT00940000155320 ENSGT00390000005572 ENSGT00940000156417.g.a ENSGT00390000002768.a ENSGT00940000154524.b ENSGT00940000154239.b ENSGT00390000004254 ENSGT00530000069575 ENSGT00940000159280 ENSGT00940000157706 ENSGT00940000154459.B ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.B.b ENSGT00940000154164.c.a ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000013762.b.a.a.b ENSGT00390000000709 ENSGT00940000162520.g.a ENSGT00940000162520.g.b ENSGT00390000015369.d ENSGT00940000166933 ENSGT00940000154394.b.a.a.a.a.b ENSGT00390000005524 ENSGT00950000182980.a.b.a.b.a.b ENSGT00940000158474 ENSGT00390000016736.a.i ENSGT00940000155583 ENSGT00550000074807.d.a.b Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000001612 ENSGT00940000155320 ENSGT00390000005572 ENSGT00940000156417.g.a ENSGT00390000002768.a ENSGT00940000154524.b ENSGT00940000154239.b ENSGT00390000004254 ENSGT00530000069575 ENSGT00940000159280 ENSGT00940000157706 ENSGT00940000154459.B ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.B.b ENSGT00940000154164.c.a ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000013762.b.a.a.b ENSGT00390000000709 ENSGT00940000162520.g.a ENSGT00940000162520.g.b ENSGT00390000015369.d ENSGT00940000166933 ENSGT00940000154394.b.a.a.a.a.a.b ENSGT00390000005524 ENSGT00950000182980.a.b.a.b.a.b ENSGT00940000158474 ENSGT00390000016736.a.i ENSGT00940000155583 ENSGT00550000074807.d.a.b Climbing perch MODERN SPECIES 3 ENSATEG00000011014 ENSATEG00000010986 supt7l (ENSATEG00000010956) ENSATEG00000010927 ENSATEG00000010899 spdya (ENSATEG00000010843) ENSATEG00000010826 wdr43 (ENSATEG00000010805) ENSATEG00000026482 ENSATEG00000010693 ENSATEG00000010631 C2orf50 (ENSATEG00000010612) ENSATEG00000026311 ROCK2 (ENSATEG00000010506) sobpa (ENSATEG00000010439) pdss2 (ENSATEG00000010396) #22 bend3 (ENSATEG00000010382) #23 mtres1 (ENSATEG00000010375) #24 ENSATEG00000010362 ENSATEG00000010354 ENSATEG00000028378 ENSATEG00000010347 ENSATEG00000010322 ENSATEG00000010299 ENSATEG00000010283 ENSATEG00000025502 ENSATEG00000010247 ENSATEG00000027865 ENSATEG00000010186 fam177a1 (ENSATEG00000010166) ppp2r3c (ENSATEG00000010137) Siamese fighting fish MODERN SPECIES 12 rbks (ENSBSLG00000024347) ENSBSLG00000024344 SLC4A1AP (ENSBSLG00000024332) supt7l (ENSBSLG00000024330) LRFN2 (ENSBSLG00000024326) ENSBSLG00000024324 spdya (ENSBSLG00000024310) trmt61b (ENSBSLG00000024300) wdr43 (ENSBSLG00000024215) ENSBSLG00000024187 CLIP4 (ENSBSLG00000024131) si:dkey-18j18.3 (ENSBSLG00000024128) slc66a3 (ENSBSLG00000024118) rock2a (ENSBSLG00000021617) sobpa (ENSBSLG00000021505) pdss2 (ENSBSLG00000021501) #22 bend3 (ENSBSLG00000021478) #23 mtres1 (ENSBSLG00000021472) #24 TMEM151B (ENSBSLG00000021468) utp25 (ENSBSLG00000021458) ENSBSLG00000021446 adprs (ENSBSLG00000021438) ENSBSLG00000021197 ENSBSLG00000021114 ENSBSLG00000021092 NRDE2 (ENSBSLG00000021071) ENSBSLG00000020983 ttc7b (ENSBSLG00000019068) fam177a1 (ENSBSLG00000018914) ppp2r3c (ENSBSLG00000018778) psma6a (ENSBSLG00000018536) Zig-zag eel MODERN SPECIES 14 ENSMAMG00000014341 ENSMAMG00000014287 supt7l (ENSMAMG00000014260) ENSMAMG00000014244 ENSMAMG00000025725 ENSMAMG00000014215 spdya (ENSMAMG00000014163) ENSMAMG00000014144 wdr43 (ENSMAMG00000014056) ENSMAMG00000014018 ENSMAMG00000013956 C2orf50 (ENSMAMG00000013937) ENSMAMG00000013930 ROCK2 (ENSMAMG00000013813) sobpa (ENSMAMG00000013791) pdss2 (ENSMAMG00000013730) #22 bend3 (ENSMAMG00000013708) #23 mtres1 (ENSMAMG00000028099) #24 ENSMAMG00000013667 ENSMAMG00000013646 ENSMAMG00000013631 ENSMAMG00000013607 ENSMAMG00000013591 ENSMAMG00000013558 ENSMAMG00000026240 ENSMAMG00000014021 ENSMAMG00000013452 ENSMAMG00000028594 ENSMAMG00000013346 fam177a1 (ENSMAMG00000028408) ppp2r3c (ENSMAMG00000027886) Cod MODERN SPECIES 18 SLC4A1AP (ENSGMOG00000001925) supt7l (ENSGMOG00000001686) ENSGMOG00000028546 ENSGMOG00000001912 ENSGMOG00000035284 spdya (ENSGMOG00000001737) ENSGMOG00000027535 wdr43 (ENSGMOG00000001695) ENSGMOG00000022925 ENSGMOG00000014962 ENSGMOG00000017793 C2orf50 (ENSGMOG00000017778) ENSGMOG00000017760 ROCK2 (ENSGMOG00000017704) sobpa (ENSGMOG00000023539) pdss2 (ENSGMOG00000017661) #22 bend3 (ENSGMOG00000017649) #23 mtres1 (ENSGMOG00000017626) #24 ENSGMOG00000017620 ENSGMOG00000017588 ENSGMOG00000025725 ENSGMOG00000017573 ENSGMOG00000017560 ENSGMOG00000036464 ENSGMOG00000017457 ENSGMOG00000015774 ENSGMOG00000033565 ENSGMOG00000015815 ppp2r3c (ENSGMOG00000017435) PRORP (ENSGMOG00000017423) nfkbiab (ENSGMOG00000017407) Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 108 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000157581.b ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000157575 ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b ENSGT00940000155646 ENSGT00940000160213.b ENSGT00940000165355.a ENSGT00940000165355.b ENSGT01030000234517.C ENSGT00940000160213.a ENSGT00940000154459.B ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.B.b ENSGT00940000154164.c.a ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00390000013762.b.a.a.b ENSGT00940000160140.b ENSGT00390000009688 ENSGT00590000083139.c Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 135 ENSGT00940000160193.c ENSGT00940000157266.a.f ENSGT00940000154245.B.a ENSGT00390000018121.t ENSGT00940000156728.v ENSGT00910000144274 ENSGT00390000013159.d ENSGT00940000153168.C.a.b.b ENSGT00940000159219.a ENSGT00950000182995.e.a.a.a.cc ENSGT00390000007900.e ENSGT00940000160213.a.c ENSGT00940000154459.B ENSGT01030000234517.B.b.k ENSGT00940000154164.c.a.c ENSGT00940000153498.B.b.g #22 ENSGT00390000010827.e #23 ENSGT00390000009366.s #24 ENSGT00940000160140.b.q ENSGT00390000009688.g ENSGT00940000162520.g.b ENSGT00940000162520.h ENSGT00950000182836.a.c ENSGT00390000009189.n ENSGT01020000230346.A.d ENSGT00940000159502.i ENSGT00940000156065.a.i ENSGT00390000013444.a.a.y ENSGT00940000156499.a.a.e ENSGT01090000260005.a.b.a.b.a.a.b.b ENSGT00940000154710.a.b.b.d Huchen MODERN SPECIES 85 ENSHHUG00000036805 GABRG1 (ENSHHUG00000036722) ENSHHUG00000036633 GABRB1 (ENSHHUG00000036628) commd8 (ENSHHUG00000036622) atp10d (ENSHHUG00000036562) dapp1 (ENSHHUG00000036543) lamtor3 (ENSHHUG00000036467) zgc:123321 (ENSHHUG00000036448) odc1 (ENSHHUG00000036434) nol10 (ENSHHUG00000036413) KCNF1 (ENSHHUG00000036409) si:dkey-18j18.3 (ENSHHUG00000036401) rock2a (ENSHHUG00000036228) sobpa (ENSHHUG00000036215) pdss2 (ENSHHUG00000036194) #22 bend3 (ENSHHUG00000036191) #23 mtres1 (ENSHHUG00000036186) #24 GDF7 (ENSHHUG00000036118) ldah (ENSHHUG00000036106) ENSHHUG00000036089 ypel5 (ENSHHUG00000036079) lclat1 (ENSHHUG00000036075) lbh (ENSHHUG00000036059) PSMC6 (ENSHHUG00000035954) bmp4 (ENSHHUG00000035926) DDHD1 (ENSHHUG00000035844) fermt2 (ENSHHUG00000035755) Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000160193.c ENSGT00940000157266.a.f ENSGT00940000154245.B.a ENSGT00390000018121.t ENSGT00940000156728.v ENSGT00910000144274 ENSGT00390000013159.d ENSGT00940000153168.C.a.b.b ENSGT00940000159219.a ENSGT00950000182995.e.a.a.a.cc ENSGT00390000007900.e ENSGT00940000160213.a.c ENSGT00940000154459.B ENSGT01030000234517.B.b.k ENSGT00940000154164.c.a.c ENSGT00940000153498.B.b.g #22 ENSGT00390000010827.e #23 ENSGT00390000009366.s #24 ENSGT00940000160140.b.q ENSGT00390000009688.g ENSGT00940000162520.g.b ENSGT00950000182836.a.c ENSGT00390000009189.m.b.a.b ENSGT00390000009189.n ENSGT01020000230346.A.d ENSGT00940000159502.i ENSGT00940000156065.a.i ENSGT00390000013444.a.a.y ENSGT00940000156499.a.a.e ENSGT01090000260005.a.b.a.b.a.a.b.b ENSGT00940000154710.a.b.b.d Salmo ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000160193.c ENSGT00940000157266.a.f ENSGT00940000154245.B.a ENSGT00390000018121.t ENSGT00940000156728.v ENSGT00910000144274 ENSGT00390000013159.d ENSGT00940000153168.C.a.b.b ENSGT00940000159219.a ENSGT00950000182995.e.a.a.a.cc ENSGT00390000007900.e ENSGT00940000160213.a.c ENSGT00940000154459.B ENSGT01030000234517.B.b.k ENSGT00940000154164.c.a.c ENSGT00940000153498.B.b.g #22 ENSGT00390000010827.e #23 ENSGT00390000009366.s #24 ENSGT00390000013762.b.a.a.b.t ENSGT00940000160140.b.q ENSGT00390000009688.g ENSGT00940000162520.g.b ENSGT00940000162520.h ENSGT00950000182836.a.c ENSGT00390000009189.m.b.a.b ENSGT00390000009189.n ENSGT01020000230346.A.d ENSGT00940000159502.i ENSGT00940000156065.a.i ENSGT00390000013444.a.a.y ENSGT00940000156499.a.a.e River trout MODERN SPECIES 26 ENSSTUG00000036086 GABRG1 (ENSSTUG00000036072) ENSSTUG00000035863 GABRB1 (ENSSTUG00000035832) commd8 (ENSSTUG00000035819) atp10d (ENSSTUG00000035000) dapp1 (ENSSTUG00000034936) lamtor3 (ENSSTUG00000034879) zgc:123321 (ENSSTUG00000034856) odc1 (ENSSTUG00000034815) nol10 (ENSSTUG00000034769) KCNF1 (ENSSTUG00000034755) si:dkey-18j18.3 (ENSSTUG00000034746) rock2a (ENSSTUG00000029880) sobpa (ENSSTUG00000029765) pdss2 (ENSSTUG00000034583) #22 bend3 (ENSSTUG00000034577) #23 mtres1 (ENSSTUG00000034564) #24 GDF7 (ENSSTUG00000034511) ldah (ENSSTUG00000034460) ENSSTUG00000034443 ENSSTUG00000034424 lclat1 (ENSSTUG00000034413) lbh (ENSSTUG00000034408) ENSSTUG00000034238 bmp4 (ENSSTUG00000034213) DDHD1 (ENSSTUG00000033139) fermt2 (ENSSTUG00000032757) ENSSTUG00000032735 stxbp6 (ENSSTUG00000032725) gjd2b (ENSSTUG00000032721) Atlantic salmon MODERN SPECIES ENSSSAG00000015487 ENSSSAG00000110250 GABRB1 (ENSSSAG00000015602) commd8 (ENSSSAG00000015639) atp10d (ENSSSAG00000015812) dapp1 (ENSSSAG00000040142) lamtor3 (ENSSSAG00000040275) ENSSSAG00000040331 ENSSSAG00000091043 ODC1 (ENSSSAG00000040444) NOL10 (ENSSSAG00000040538) KCNF1 (ENSSSAG00000040581) cssa01h2orf50 (ENSSSAG00000040584) rock2 (ENSSSAG00000040987) sobpa (ENSSSAG00000051698) pdss2 (ENSSSAG00000051717) #22 ENSSSAG00000104356 bend3 (ENSSSAG00000051724) #23 cssa01h6orf203 (ENSSSAG00000051730) #24 ENSSSAG00000051736 ENSSSAG00000108520 ENSSSAG00000106705 ENSSSAG00000051763 ENSSSAG00000099542 ENSSSAG00000051774 ENSSSAG00000051814 ENSSSAG00000051825 bmp4 (ENSSSAG00000051847) ENSSSAG00000051888 ENSSSAG00000000215 stxbp6 (ENSSSAG00000000550) Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000160193.c ENSGT00940000157266.a.f ENSGT00940000154245.B.a ENSGT00390000018121.t ENSGT00940000156728.v ENSGT00910000144274 ENSGT00390000013159.d ENSGT00940000153168.C.a.b.b ENSGT00940000159219.a ENSGT00950000182995.e.a.a.a.cc ENSGT00390000007900.e ENSGT00940000160213.a.c ENSGT00940000154459.B ENSGT01030000234517.B.b.k ENSGT00940000154164.c.a.c ENSGT00940000153498.B.b.g #22 ENSGT00390000010827.e #23 ENSGT00390000009366.s #24 ENSGT00940000160140.b.q ENSGT00390000009688.g ENSGT00940000162520.g.b ENSGT00950000182836.a.c ENSGT00390000009189.m.b.a.b ENSGT01020000230346.A.d ENSGT00940000159502.i ENSGT00940000156065.a.i ENSGT00390000013444.a.a.y ENSGT00940000156499.a.a.e ENSGT01090000260005.a.b.a.b.a.a.b.b ENSGT00940000154710.a.b.b.d ENSGT00940000156668.c Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000014316.c.a.a ENSGT00940000160193.c ENSGT00940000157266.a.f ENSGT00940000154245.B.a ENSGT00390000018121.t ENSGT00940000156728.v ENSGT00910000144274 ENSGT00390000013159.d ENSGT00940000159219.a ENSGT00950000182995.e.a.a.a.cc ENSGT00390000007900.e ENSGT00940000160213.a.c ENSGT00940000154459.B ENSGT01030000234517.B.b.k ENSGT00940000154164.c.a.c ENSGT00940000153498.B.b.g #22 ENSGT00390000010827.e #23 ENSGT00390000009366.s #24 ENSGT00940000160140.b.q ENSGT00390000009688.g ENSGT00940000162520.g.b ENSGT00950000182836.a.c ENSGT00390000009189.m.b.a.a ENSGT01020000230346.A.d ENSGT00940000159502.i ENSGT00940000156065.a.i ENSGT00390000013444.a.a.y ENSGT00940000156499.a.a.e ENSGT01090000260005.a.b.a.b.a.a.b.b ENSGT00940000154710.a.b.b.d ENSGT00940000156668.c Coho salmon MODERN SPECIES 27 ENSOKIG00005024757 GABRG1 (ENSOKIG00005023520) ENSOKIG00005023024 GABRB1 (ENSOKIG00005022975) commd8 (ENSOKIG00005022943) atp10d (ENSOKIG00005022796) dapp1 (ENSOKIG00005022695) ENSOKIG00005022650 ENSOKIG00005022605 ODC1 (ENSOKIG00005022584) nol10 (ENSOKIG00005022499) KCNF1 (ENSOKIG00005022475) si:dkey-18j18.3 (ENSOKIG00005022466) ROCK2 (ENSOKIG00005016710) sobpa (ENSOKIG00005016481) pdss2 (ENSOKIG00005016450) #22 bend3 (ENSOKIG00005016446) #23 mtres1 (ENSOKIG00005016441) #24 GDF7 (ENSOKIG00005016428) ldah (ENSOKIG00005016419) ENSOKIG00005016401 lclat1 (ENSOKIG00005016384) ENSOKIG00005016303 BMP4 (ENSOKIG00005016277) DDHD1 (ENSOKIG00005014924) fermt2 (ENSOKIG00005014174) stxbp6 (ENSOKIG00005014101) ENSOKIG00005014087 ACTC1 (ENSOKIG00005014015) aqr (ENSOKIG00005011047) ENSOKIG00005010886 Chinook salmon MODERN SPECIES 2 GNPDA2 (ENSOTSG00005014094) GABRG1 (ENSOTSG00005014093) ENSOTSG00005014085 GABRB1 (ENSOTSG00005014083) commd8 (ENSOTSG00005014082) atp10d (ENSOTSG00005014027) lamtor3 (ENSOTSG00005014026) dapp1 (ENSOTSG00005014022) ENSOTSG00005014017 odc1 (ENSOTSG00005014013) nol10 (ENSOTSG00005014004) KCNF1 (ENSOTSG00005013996) si:dkey-18j18.3 (ENSOTSG00005013995) rock2a (ENSOTSG00005001200) sobpa (ENSOTSG00005000814) pdss2 (ENSOTSG00005000803) #22 bend3 (ENSOTSG00005000795) #23 mtres1 (ENSOTSG00005000746) #24 GDF7 (ENSOTSG00005022329) ldah (ENSOTSG00005022328) ENSOTSG00005022325 lclat1 (ENSOTSG00005022320) lbh (ENSOTSG00005022318) ENSOTSG00005022316 bmp4 (ENSOTSG00005022312) DDHD1 (ENSOTSG00005021284) fermt2 (ENSOTSG00005021153) stxbp6 (ENSOTSG00005021152) gjd2b (ENSOTSG00005021151) actc2 (ENSOTSG00005021149) aqr (ENSOTSG00005018464) Rainbow trout MODERN SPECIES 10 commd8 (ENSOMYG00000021606) atp10d (ENSOMYG00000021562) dapp1 (ENSOMYG00000021504) lamtor3 (ENSOMYG00000021447) ENSOMYG00000021438 ENSOMYG00000021420 ENSOMYG00000062315 ENSOMYG00000021413 NOL10 (ENSOMYG00000021369) ENSOMYG00000021294 ENSOMYG00000021285 ENSOMYG00000055155 ENSOMYG00000009481 ENSOMYG00000058784 sobpa (ENSOMYG00000005575) pdss2 (ENSOMYG00000005476) #22 bend3 (ENSOMYG00000044013) #23 mtres1 (ENSOMYG00000044011) #24 ENSOMYG00000043998 ENSOMYG00000043988 ENSOMYG00000043970 ENSOMYG00000069049 ENSOMYG00000043953 ENSOMYG00000043936 ENSOMYG00000070609 ENSOMYG00000043925 ENSOMYG00000065201 ENSOMYG00000043789 ENSOMYG00000043475 stxbp6 (ENSOMYG00000043370) ENSOMYG00000043364 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 108 ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b.v ENSGT00590000083139.d.b.a ENSGT00590000083139.d.a ENSGT00590000083139.d.b.b ENSGT00940000154645.A.e.a ENSGT00940000155646.k ENSGT00940000160213.b ENSGT00940000165355.a ENSGT00940000165355.b ENSGT00950000182995.e.a.a.a.bc ENSGT00390000007900.f ENSGT00940000160213.a.d ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.B.b.l ENSGT00940000154164.c.a.d ENSGT00940000153498.B.b.h #22 ENSGT00390000010827.f #23 ENSGT00390000009366.t #24 ENSGT00390000013762.b.a.a.b ENSGT00940000160140.b.r ENSGT00390000009688.h ENSGT00590000083139.c ENSGT00390000013092 ENSGT00940000162520.g.a ENSGT00940000154800.j ENSGT00950000182836.a.d ENSGT00390000009189.m ENSGT00940000159502.j ENSGT00940000156065.a.j ENSGT00390000013444.a.a.z ENSGT00940000156499.a.a.f Huchen MODERN SPECIES 124 ENSHHUG00000037537 ENSHHUG00000037538 GABRB1 (ENSHHUG00000037555) commd8 (ENSHHUG00000037560) ENSHHUG00000037570 atp10d (ENSHHUG00000037573) lamtor3 (ENSHHUG00000037819) zgc:123321 (ENSHHUG00000037843) utp25 (ENSHHUG00000037850) odc1 (ENSHHUG00000037856) nol10 (ENSHHUG00000037870) KCNF1 (ENSHHUG00000037884) slc66a3 (ENSHHUG00000037889) rock2a (ENSHHUG00000037915) sobpa (ENSHHUG00000038476) pdss2 (ENSHHUG00000038479) #22 bend3 (ENSHHUG00000038484) #23 ENSHHUG00000038487 TMEM151B (ENSHHUG00000038500) GDF7 (ENSHHUG00000038506) ENSHHUG00000038568 APOB (ENSHHUG00000038598) hs1bp3 (ENSHHUG00000038612) ENSHHUG00000038620 ypel5 (ENSHHUG00000038641) lclat1 (ENSHHUG00000038652) lbh (ENSHHUG00000038735) ENSHHUG00000038750 bmp4 (ENSHHUG00000038767) ENSHHUG00000038789 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 42 ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b.v ENSGT00590000083139.d.a ENSGT00590000083139.d.b.b ENSGT00590000083139.d.b.a ENSGT00940000154645.A.e.a ENSGT00940000155646.k ENSGT00940000160213.b ENSGT00940000165355.a ENSGT00940000165355.b ENSGT00950000182995.e.a.a.a.bc ENSGT00390000007900.f ENSGT00940000160213.a.d ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.B.b.l ENSGT00940000154164.c.a.d ENSGT00940000153498.B.b.h #22 ENSGT00390000010827.f #23 ENSGT00390000009366.t #24 ENSGT00390000013762.b.a.a.b ENSGT00940000160140.b.r ENSGT00390000009688.h ENSGT00590000083139.c ENSGT00390000013092 ENSGT00940000162520.g.a ENSGT00940000154800.j ENSGT00950000182836.a.d ENSGT00390000009189.m.a ENSGT00390000009189.m.b.a.a ENSGT00940000159502.j ENSGT00940000156065.a.j ENSGT00390000013444.a.a.z Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 35 ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b.v ENSGT00590000083139.d.a ENSGT00590000083139.d.b.b ENSGT00590000083139.d.b.a ENSGT00940000154645.A.e.a ENSGT00940000155646.k ENSGT00940000160213.b ENSGT00940000165355.a ENSGT00940000165355.b ENSGT00950000182995.e.a.a.a.bc ENSGT00390000007900.f ENSGT00940000160213.a.d ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.B.b.l ENSGT00940000154164.c.a.d ENSGT00940000153498.B.b.h #22 ENSGT00390000010827.f #23 ENSGT00390000009366.t #24 ENSGT00390000013762.b.a.a.b ENSGT00940000160140.b.r ENSGT00390000009688.h ENSGT00590000083139.c ENSGT00390000013092 ENSGT00940000162520.g.a ENSGT00940000154800.j ENSGT00390000009189.m.b.b ENSGT00390000009189.m.b.a.a ENSGT00940000159502.j ENSGT00940000156065.a.j ENSGT00390000013444.a.a.z ENSGT00940000156499.a.a.f Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 50 ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b.v ENSGT00590000083139.d.a ENSGT00590000083139.d.b.b ENSGT00590000083139.d.b.a ENSGT00940000154645.A.e.a ENSGT00940000155646.k ENSGT00940000160213.b ENSGT00940000165355.a ENSGT00940000165355.b ENSGT00950000182995.e.a.a.a.bc ENSGT00390000007900.f ENSGT00940000160213.a.d ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.B.b.l ENSGT00940000154164.c.a.d ENSGT00940000153498.B.b.h #22 ENSGT00390000010827.f #23 ENSGT01000000220218 ENSGT00390000013762.b.a.a.b ENSGT00940000160140.b.r ENSGT00390000009688.h ENSGT00590000083139.c ENSGT00390000013092 ENSGT00940000162520.g.a ENSGT00940000154800.j ENSGT00390000009189.m.b.b ENSGT00940000159502.j ENSGT00940000156065.a.j ENSGT00390000013444.a.a.z ENSGT00940000156499.a.a.f ENSGT01090000260005.a.b.a.b.a.a.b.a Chinook salmon DUPLICATION Chinook salmon MODERN SPECIES 42 rrh (ENSOTSG00005045855) ENSOTSG00005045854 ENSOTSG00005045655 GABRB1 (ENSOTSG00005045575) commd8 (ENSOTSG00005045574) atp10d (ENSOTSG00005044630) lamtor3 (ENSOTSG00005044620) zgc:123321 (ENSOTSG00005044619) utp25 (ENSOTSG00005044615) odc1 (ENSOTSG00005044614) nol10 (ENSOTSG00005044613) KCNF1 (ENSOTSG00005044612) slc66a3 (ENSOTSG00005044611) rock2a (ENSOTSG00005043979) sobpa (ENSOTSG00005043975) pdss2 (ENSOTSG00005043971) #22 bend3 (ENSOTSG00005043969) #23 ENSOTSG00005043968 TMEM151B (ENSOTSG00005043967) GDF7 (ENSOTSG00005043966) ldah (ENSOTSG00005043874) APOB (ENSOTSG00005043872) hs1bp3 (ENSOTSG00005043866) ENSOTSG00005043865 ypel5 (ENSOTSG00005043864) lbh (ENSOTSG00005043863) zgc:92040 (ENSOTSG00005043862) ENSOTSG00005043860 ENSOTSG00005043859 ENSOTSG00005043857 PRR12 (ENSOTSG00005043856) Chinook salmon MODERN SPECIES 2934 enpep (ENSOTSG00005033277) rrh (ENSOTSG00005033272) ENSOTSG00005033269 ENSOTSG00005032438 GABRB1 (ENSOTSG00005032152) commd8 (ENSOTSG00005032151) atp10d (ENSOTSG00005031573) lamtor3 (ENSOTSG00005042521) zgc:123321 (ENSOTSG00005042519) utp25 (ENSOTSG00005042517) odc1 (ENSOTSG00005042515) nol10 (ENSOTSG00005042514) KCNF1 (ENSOTSG00005042512) slc66a3 (ENSOTSG00005042510) rock2a (ENSOTSG00005030695) pdss2 (ENSOTSG00005030652) #22 sobpa (ENSOTSG00005030649) bend3 (ENSOTSG00005030648) #23 ENSOTSG00005030647 TMEM151B (ENSOTSG00005030645) GDF7 (ENSOTSG00005030644) ldah (ENSOTSG00005030546) APOB (ENSOTSG00005030545) hs1bp3 (ENSOTSG00005030544) ENSOTSG00005030543 ypel5 (ENSOTSG00005030542) lbh (ENSOTSG00005030541) Coho salmon MODERN SPECIES 5 rrh (ENSOKIG00005014295) zgc:162509 (ENSOKIG00005014291) ENSOKIG00005013796 GABRB1 (ENSOKIG00005013514) commd8 (ENSOKIG00005013490) ATP10D (ENSOKIG00005012804) lamtor3 (ENSOKIG00005012718) zgc:123321 (ENSOKIG00005012708) utp25 (ENSOKIG00005012686) odc1 (ENSOKIG00005012678) ENSOKIG00005012665 KCNF1 (ENSOKIG00005012652) slc66a3 (ENSOKIG00005012641) rock2a (ENSOKIG00005006313) sobpa (ENSOKIG00005005829) pdss2 (ENSOKIG00005005789) #22 bend3 (ENSOKIG00005005776) #23 ENSOKIG00005005759 TMEM151B (ENSOKIG00005005753) GDF7 (ENSOKIG00005005746) ENSOKIG00005005729 ENSOKIG00005005723 APOB (ENSOKIG00005005631) hs1bp3 (ENSOKIG00005005588) ENSOKIG00005005577 YPEL5 (ENSOKIG00005005569) lbh (ENSOKIG00005005546) bmp4 (ENSOKIG00005005521) DDHD1 (ENSOKIG00005005417) FERMT2 (ENSOKIG00005004499) stxbp6 (ENSOKIG00005004235) Rainbow trout MODERN SPECIES 17 ENSOMYG00000033407 ENSOMYG00000076741 ENSOMYG00000033464 GABRB1 (ENSOMYG00000034072) ENSOMYG00000070289 commd8 (ENSOMYG00000034341) ATP10D (ENSOMYG00000034681) MK1I1 (ENSOMYG00000036352) ENSOMYG00000036389 ENSOMYG00000036412 ENSOMYG00000036468 KCNF1 (ENSOMYG00000036488) SLC66A3 (ENSOMYG00000036503) ROCK2 (ENSOMYG00000037255) sobpa (ENSOMYG00000042282) pdss2 (ENSOMYG00000042311) #22 bend3 (ENSOMYG00000042322) #23 mtres1 (ENSOMYG00000042327) #24 ENSOMYG00000042331 GDF7 (ENSOMYG00000042334) ENSOMYG00000042344 APOB (ENSOMYG00000042381) ENSOMYG00000042408 ENSOMYG00000042413 ENSOMYG00000042419 ENSOMYG00000068727 ENSOMYG00000042430 ENSOMYG00000042437 ENSOMYG00000042439 ENSOMYG00000059630 ENSOMYG00000042492 Salmo ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT01100000263524.I ENSGT00390000008061 ENSGT00390000014316.c.a.b ENSGT00940000160193.d ENSGT00940000157266.a.e ENSGT00940000154245.B.b ENSGT00390000018121.s ENSGT00940000156728.u ENSGT00390000013159.c ENSGT00940000153168.C.a.b.a ENSGT00390000000709 ENSGT00950000182995.e.a.a.a.bc ENSGT00940000160213.a.d ENSGT01030000234517.B.b.l ENSGT00940000154164.c.a.d ENSGT00940000153498.B.b.h #22 ENSGT00390000010827.f #23 ENSGT00390000009366.t #24 ENSGT00390000013762.b.a.a.b.s ENSGT00940000160140.b.r ENSGT00590000083139.c ENSGT00390000013092 ENSGT00940000162520.g.a ENSGT00940000154800.j ENSGT00950000182836.a.d ENSGT00390000009189.m.a ENSGT00940000159502.j ENSGT00940000156065.a.j ENSGT00390000013444.a.a.z ENSGT00940000156499.a.a.f ENSGT01090000260005.a.b.a.b.a.a.b.a River trout MODERN SPECIES 17 GABRG1 (ENSSTUG00000031505) ENSSTUG00000031009 GABRB1 (ENSSTUG00000030950) commd8 (ENSSTUG00000030927) atp10d (ENSSTUG00000028940) ENSSTUG00000028866 lamtor3 (ENSSTUG00000028839) zgc:123321 (ENSSTUG00000028832) ENSSTUG00000028825 utp25 (ENSSTUG00000028803) odc1 (ENSSTUG00000028737) KCNF1 (ENSSTUG00000028718) slc66a3 (ENSSTUG00000028690) rock2a (ENSSTUG00000020732) sobpa (ENSSTUG00000020323) pdss2 (ENSSTUG00000020280) #22 bend3 (ENSSTUG00000020279) #23 mtres1 (ENSSTUG00000018128) #24 TMEM151B (ENSSTUG00000018126) GDF7 (ENSSTUG00000018081) APOB (ENSSTUG00000017824) hs1bp3 (ENSSTUG00000017775) ENSSTUG00000017760 ypel5 (ENSSTUG00000017755) lclat1 (ENSSTUG00000017726) lbh (ENSSTUG00000017709) ENSSTUG00000017704 bmp4 (ENSSTUG00000017696) DDHD1 (ENSSTUG00000017667) fermt2 (ENSSTUG00000017296) stxbp6 (ENSSTUG00000017255) Northern pike MODERN SPECIES 14 btbd9 (ENSELUG00000000846) glo1 (ENSELUG00000032833) eprs1 (ENSELUG00000019744) spdya (ENSELUG00000019771) trmt61b (ENSELUG00000019782) wdr43 (ENSELUG00000019806) ALK (ENSELUG00000008935) CLIP4 (ENSELUG00000008827) olfcb1 (ENSELUG00000008740) ENSELUG00000008727 LRFN2 (ENSELUG00000008703) si:dkey-18j18.3 (ENSELUG00000027722) slc66a3 (ENSELUG00000008658) rock2a (ENSELUG00000008355) sobpa (ENSELUG00000008124) pdss2 (ENSELUG00000008000) #22 bend3 (ENSELUG00000007960) #23 mtres1 (ENSELUG00000031614) #24 GDF7 (ENSELUG00000007935) ldah (ENSELUG00000007913) APOB (ENSELUG00000007869) ENSELUG00000007824 ENSELUG00000007784 ENSELUG00000000277 lclat1 (ENSELUG00000007674) lbh (ENSELUG00000000271) psmc6 (ENSELUG00000007599) bmp4 (ENSELUG00000033797) DDHD1 (ENSELUG00000007374) fermt2 (ENSELUG00000007294) stxbp6 (ENSELUG00000007210) Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 48 ENSGT00940000160140.b ENSGT00950000185286 ENSGT00390000009688 ENSGT00590000083139.c ENSGT00590000083139.d ENSGT00940000154645.A ENSGT00950000182995.e.a.a.a ENSGT00390000007900 ENSGT00390000004263.b ENSGT00940000155646 ENSGT00940000160213.a ENSGT00940000154459.B ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.B.b ENSGT00940000154164.c.a ENSGT00940000153498.B.b #22 ENSGT00390000010827 #23 ENSGT00390000009366 #24 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695.i.b ENSGT00940000160188 ENSGT00510000050935 ENSGT00950000183092.b.b ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00940000155187.A ENSGT00940000164027 ENSGT00390000004173 ENSGT00950000183034.B ENSGT00940000154531.cc ENSGT00390000002053 Asian bonytongue MODERN SPECIES 6 hs1bp3 (ENSSFOG00015028023) GDF7 (ENSSFOG00015026533) ldah (ENSSFOG00015003305) APOB (ENSSFOG00015003291) ENSSFOG00015003230 hpcal1 (ENSSFOG00015025652) odc1 (ENSSFOG00015003183) nol10 (ENSSFOG00015003083) ATP6V1C2 (ENSSFOG00015003022) pdia6 (ENSSFOG00015002978) KCNF1 (ENSSFOG00015002954) si:dkey-18j18.3 (ENSSFOG00015031625) slc66a3 (ENSSFOG00015032661) rock2a (ENSSFOG00015002704) sobpa (ENSSFOG00015031132) pdss2 (ENSSFOG00015002616) #22 bend3 (ENSSFOG00015002605) #23 mtres1 (ENSSFOG00015002599) #24 qrsl1 (ENSSFOG00015002547) rtn4ip1 (ENSSFOG00015028543) ENSSFOG00015002356 tonsl (ENSSFOG00015002326) ENSSFOG00015002311 ENSSFOG00015002298 STAC (ENSSFOG00015032245) mtfr1l (ENSSFOG00015027531) ENSSFOG00015002185 selenon (ENSSFOG00015002125) znf593 (ENSSFOG00015002115) RLF (ENSSFOG00015002039) DYNLT1 (ENSSFOG00015029878) P. kingsleyae MODERN SPECIES 297 ENSPKIG00000023311 LDAH (ENSPKIG00000023322) ENSPKIG00000023333 ENSPKIG00000023346 APOB (ENSPKIG00000023371) hpcal1 (ENSPKIG00000023413) odc1 (ENSPKIG00000023433) nol10 (ENSPKIG00000023459) ATP6V1C2 (ENSPKIG00000023505) pdia6 (ENSPKIG00000000066) KCNF1 (ENSPKIG00000000077) si:dkey-18j18.3 (ENSPKIG00000000085) slc66a3 (ENSPKIG00000000100) rock2a (ENSPKIG00000000147) sobpa (ENSPKIG00000000247) pdss2 (ENSPKIG00000000271) #22 bend3 (ENSPKIG00000000294) #23 mtres1 (ENSPKIG00000000305) #24 qrsl1 (ENSPKIG00000000328) rtn4ip1 (ENSPKIG00000000366) ENSPKIG00000000401 ENSPKIG00000000424 tonsl (ENSPKIG00000000446) ENSPKIG00000000469 STAC (ENSPKIG00000000478) ENSPKIG00000000503 mtfr1l (ENSPKIG00000000553) selenon (ENSPKIG00000000584) znf593 (ENSPKIG00000000619) RLF (ENSPKIG00000000654) zmpste24 (ENSPKIG00000000685) Spotted gar MODERN SPECIES 647 KLHL29 (ENSLOCG00000016613) ENSLOCG00000016611 cep57l1 (ENSLOCG00000016609) ENSLOCG00000016608 sesn1 (ENSLOCG00000016607) ARMC2 (ENSLOCG00000016606) FOXO3 (ENSLOCG00000016605) afg1la (ENSLOCG00000016604) snx3 (ENSLOCG00000016603) nr2e1 (ENSLOCG00000016602) OSTM1 (ENSLOCG00000016601) ENSLOCG00000016599 sec63 (ENSLOCG00000016596) SCML4 (ENSLOCG00000016595) sobpa (ENSLOCG00000016593) pdss2 (ENSLOCG00000016588) #22 bend3 (ENSLOCG00000016586) #23 mtres1 (ENSLOCG00000016585) #24 qrsl1 (ENSLOCG00000016582) rtn4ip1 (ENSLOCG00000016579) ENSLOCG00000016575 cep162 (ENSLOCG00000016570) mrap2a (ENSLOCG00000016569) CYB5R4 (ENSLOCG00000016563) ENSLOCG00000016562 sim1a (ENSLOCG00000016561) ASCC3 (ENSLOCG00000016550) GRIK2 (ENSLOCG00000016542) HACE1 (ENSLOCG00000016540) lin28b (ENSLOCG00000016539) bves (ENSLOCG00000016536) Elephant shark MODERN SPECIES 1551 ZNRF3 (ENSCMIG00000008198) kremen1 (ENSCMIG00000008203) SUSD2 (ENSCMIG00000008212) ENSCMIG00000008217 ENSCMIG00000008221 ENSCMIG00000008224 slc35e4 (ENSCMIG00000008227) ENSCMIG00000008228 sppl3 (ENSCMIG00000008246) acads (ENSCMIG00000008290) ENSCMIG00000008292 mlec (ENSCMIG00000008297) cabp1a (ENSCMIG00000008302) ENSCMIG00000008306 rnf10 (ENSCMIG00000008310) pdss2 (ENSCMIG00000008316) #22 coq5 (ENSCMIG00000008328) ENSCMIG00000008333 ENSCMIG00000008335 ENSCMIG00000008338 GATC (ENSCMIG00000008344) ENSCMIG00000008346 ENSCMIG00000008348 bend3 (ENSCMIG00000008351) #23 mtres1 (ENSCMIG00000008352) #24 qrsl1 (ENSCMIG00000008358) rtn4ip1 (ENSCMIG00000008378) ENSCMIG00000008385 atg5 (ENSCMIG00000008396) prdm1a (ENSCMIG00000008406) prep (ENSCMIG00000008444) Cyclostomata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153498.B.b #22 Lamprey MODERN SPECIES 1517 ENSPMAG00000001867 ENSPMAG00000001846 ENSPMAG00000001843 mrps25 (ENSPMAG00000001827) ENSPMAG00000001822 ENSPMAG00000001820 KIF9 (ENSPMAG00000001803) ENSPMAG00000001798 ENSPMAG00000001779 nrf1 (ENSPMAG00000001772) slc35a2 (ENSPMAG00000001752) pdss2 (ENSPMAG00000001740) #22 ENSPMAG00000001739