Pecora	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000161046	ENSGT00940000156887 #7	ENSGT00390000018541 #8	ENSGT00390000010157.b #9	ENSGT00940000160377 #10	ENSGT00390000008862 #11	ENSGT00940000158445 #12	ENSGT00940000155764.C #13	ENSGT00530000063679.B #14	ENSGT00940000156719 #15	ENSGT00940000158178 #16	ENSGT00940000159089 #17	ENSGT00940000159801.B #18	ENSGT00390000005605 #19	ENSGT00530000063000.a.a.b #20	ENSGT01050000244887.A.a.a.a #22	ENSGT00940000159543	ENSGT00940000159788.b	ENSGT00390000013443.c	ENSGT00940000159869	ENSGT00940000159005	ENSGT00940000160550	ENSGT00940000161143	ENSGT00470000042444	ENSGT00940000162184	ENSGT00940000162431	ENSGT00940000162311.c.a	ENSGT00390000014512	ENSGT01050000244887.A.a.a.b ##22	ENSGT00390000005100	ENSGT00510000047802
Percora_a	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000156887 #7	ENSGT00390000018541 #8	ENSGT00390000010157.b #9	ENSGT00940000160377 #10	ENSGT00390000008862 #11	ENSGT00940000158445 #12	ENSGT00940000155764.C #13	ENSGT00530000063679.B #14	ENSGT00940000156719 #15	ENSGT00940000158178 #16	ENSGT00940000159089 #17	ENSGT00940000159801.B #18	ENSGT00390000005605 #19	ENSGT00530000063000.a.a.b #20	ENSGT00390000003710.d.c.b.b #21	ENSGT01050000244887.A.a.a.a #22	ENSGT00940000159543	ENSGT00940000159788.b	ENSGT00390000013443.c	ENSGT00940000159869	ENSGT00940000159005	ENSGT00940000160550	ENSGT00940000161143	ENSGT00470000042444	ENSGT00940000162184	ENSGT00940000162431	ENSGT00940000162311.c.a	ENSGT00940000162311.c.b	ENSGT00390000014512	ENSGT01050000244887.A.a.a.b ##22	ENSGT00390000005100
Bovidae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000156887 #7	ENSGT00390000018541 #8	ENSGT00390000010157.b #9	ENSGT00940000160377 #10	ENSGT00390000008862 #11	ENSGT00940000158445 #12	ENSGT00940000155764.C #13	ENSGT00530000063679.B #14	ENSGT00940000156719 #15	ENSGT00940000158178 #16	ENSGT00940000159089 #17	ENSGT00940000159801.B #18	ENSGT00390000005605 #19	ENSGT00530000063000.a.a.b #20	ENSGT00390000003710.d.c.b.b #21	ENSGT01050000244887.A.a.a.a #22	ENSGT00940000159543	ENSGT00940000159788.b	ENSGT00390000013443.c	ENSGT00940000159869	ENSGT00940000159005	ENSGT00940000160550	ENSGT00940000161143	ENSGT00470000042444	ENSGT00940000162184	ENSGT00940000162431	ENSGT00940000162311.c.a	ENSGT00940000162311.c.b	ENSGT00390000014512	ENSGT01050000244887.A.a.a.b ##22	ENSGT00390000005100
Bovinae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000156887 #7	ENSGT00390000018541 #8	ENSGT00390000010157.b #9	ENSGT00940000160377 #10	ENSGT00390000008862 #11	ENSGT00940000158445 #12	ENSGT00940000155764.C #13	ENSGT00530000063679.B #14	ENSGT00940000156719 #15	ENSGT00940000158178 #16	ENSGT00940000159089 #17	ENSGT00940000159801.B #18	ENSGT00390000005605 #19	ENSGT00530000063000.a.a.b #20	ENSGT00390000003710.d.c.b.b #21	ENSGT01050000244887.A.a.a.a #22	ENSGT00940000159543	ENSGT00940000159788.b	ENSGT00390000013443.c	ENSGT00940000159869	ENSGT00940000159005	ENSGT00940000160550	ENSGT00940000161143	ENSGT00470000042444	ENSGT00940000162184	ENSGT00940000162431	ENSGT00940000162311.c.a	ENSGT00940000162311.c.b	ENSGT00390000014512	ENSGT01050000244887.A.a.a.b ##22	ENSGT00390000005100
Bos	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000156887 #7	ENSGT00390000018541 #8	ENSGT00390000010157.b #9	ENSGT00940000160377 #10	ENSGT00390000008862 #11	ENSGT00940000158445 #12	ENSGT00940000155764.C #13	ENSGT00530000063679.B #14	ENSGT00940000156719 #15	ENSGT00940000158178 #16	ENSGT00940000159089 #17	ENSGT00940000159801.B #18	ENSGT00390000005605 #19	ENSGT00530000063000.a.a.b #20	ENSGT00390000003710.d.c.b.b #21	ENSGT01050000244887.A.a.a.a #22	ENSGT00940000159543	ENSGT00940000159788.b	ENSGT00390000013443.c	ENSGT00940000159869	ENSGT00940000159005	ENSGT00940000160550	ENSGT00940000161143	ENSGT00470000042444	ENSGT00940000162184	ENSGT00940000162431	ENSGT00940000162311.c.a	ENSGT00940000162311.c.b	ENSGT00390000014512	ENSGT01050000244887.A.a.a.b ##22	ENSGT00390000005100
Bos_a	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000156887 #7	ENSGT00390000018541 #8	ENSGT00390000010157.b #9	ENSGT00940000160377 #10	ENSGT00390000008862 #11	ENSGT00940000158445 #12	ENSGT00940000155764.C #13	ENSGT00530000063679.B #14	ENSGT00940000156719 #15	ENSGT00940000158178 #16	ENSGT00940000159089 #17	ENSGT00940000159801.B #18	ENSGT00390000005605 #19	ENSGT00530000063000.a.a.b #20	ENSGT00390000003710.d.c.b.b #21	ENSGT01050000244887.A.a.a.a #22	ENSGT00940000159543	ENSGT00940000159788.b	ENSGT00390000013443.c	ENSGT00940000159869	ENSGT00940000159005	ENSGT00940000160550	ENSGT00940000161143	ENSGT00470000042444	ENSGT00940000162184	ENSGT00940000162431	ENSGT00940000162311.c.a	ENSGT00390000014512	ENSGT01050000244887.A.a.a.b ##22	ENSGT00390000005100	ENSGT00510000047802.p
Wild yak	MODERN SPECIES	347	SMARCA4 (ENSBMUG00000001526) #7	TIMM29 (ENSBMUG00000002186) #8	YIPF2 (ENSBMUG00000002282) #9	CARM1 (ENSBMUG00000003201) #10	C19orf38 (ENSBMUG00000003745) #11	TMED1 (ENSBMUG00000003776) #12	DNM2 (ENSBMUG00000003859) #13	QTRT1 (ENSBMUG00000003900) #14	ILF3 (ENSBMUG00000004135) #15	SLC44A2 (ENSBMUG00000004323) #16	AP1M2 (ENSBMUG00000004367) #17	CDKN2D (ENSBMUG00000004379) #18	KRI1 (ENSBMUG00000004481) #19	ATG4D (ENSBMUG00000004558) #20	ENSBMUG00000004581 #21	S1PR5 (ENSBMUG00000004599) #22
Domestic yak	MODERN SPECIES	27	SMARCA4 (ENSBGRG00000005725) #7	TIMM29 (ENSBGRG00000005681) #8	YIPF2 (ENSBGRG00000005541) #9	CARM1 (ENSBGRG00000005309) #10	C19orf38 (ENSBGRG00000005246) #11	TMED1 (ENSBGRG00000005206) #12	DNM2 (ENSBGRG00000004270) #13	QTRT1 (ENSBGRG00000004106) #14	ILF3 (ENSBGRG00000003981) #15	SLC44A2 (ENSBGRG00000003649) #16	AP1M2 (ENSBGRG00000003553) #17	CDKN2D (ENSBGRG00000003538) #18	KRI1 (ENSBGRG00000003495) #19	ATG4D (ENSBGRG00000003396) #20	ENSBGRG00000003351 #21	S1PR5 (ENSBGRG00000003343) #22	ENSBGRG00000003338	PDE4A (ENSBGRG00000003241)	CDC37 (ENSBGRG00000003152)	TYK2 (ENSBGRG00000003025)	ICAM3 (ENSBGRG00000002967)	RAVER1 (ENSBGRG00000002843)	FDX2 (ENSBGRG00000002821)	ZGLP1 (ENSBGRG00000002807)	ICAM5 (ENSBGRG00000002740)	ICAM4 (ENSBGRG00000002716)	ENSBGRG00000002625	MRPL4 (ENSBGRG00000002458)	S1PR2 (ENSBGRG00000002416) ##22	DNMT1 (ENSBGRG00000002388)	EIF3G (ENSBGRG00000002308)
Bos_b	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000156887 #7	ENSGT00390000018541 #8	ENSGT00390000010157.b #9	ENSGT00940000160377 #10	ENSGT00390000008862 #11	ENSGT00940000158445 #12	ENSGT00940000155764.C #13	ENSGT00530000063679.B #14	ENSGT00940000156719 #15	ENSGT00940000158178 #16	ENSGT00940000159089 #17	ENSGT00940000159801.B #18	ENSGT00390000005605 #19	ENSGT00530000063000.a.a.b #20	ENSGT00390000003710.d.c.b.b #21	ENSGT01050000244887.A.a.a.a #22	ENSGT00940000159543	ENSGT00940000159788.b	ENSGT00390000013443.c	ENSGT00940000159869	ENSGT00940000159005	ENSGT00940000160550	ENSGT00940000161143	ENSGT00470000042444	ENSGT00940000162184	ENSGT00940000162431	ENSGT00940000162311.c.a	ENSGT00940000162311.c.b	ENSGT00940000162311.d	ENSGT00950000185283	ENSGT00390000014512
Hybrid Bos Indicus	MODERN SPECIES	26	SMARCA4 (ENSBIXG00005028150) #7	TIMM29 (ENSBIXG00005004808) #8	YIPF2 (ENSBIXG00005027965) #9	CARM1 (ENSBIXG00005004797) #10	C19orf38 (ENSBIXG00005006957) #11	TMED1 (ENSBIXG00005027829) #12	DNM2 (ENSBIXG00005027715) #13	QTRT1 (ENSBIXG00005027486) #14	ILF3 (ENSBIXG00005027423) #15	SLC44A2 (ENSBIXG00005027228) #16	AP1M2 (ENSBIXG00005027157) #17	CDKN2D (ENSBIXG00005027099) #18	KRI1 (ENSBIXG00005027063) #19	ATG4D (ENSBIXG00005004641) #20	ENSBIXG00005027013 #21	S1PR5 (ENSBIXG00005026991) #22	KEAP1 (ENSBIXG00005026956)	PDE4A (ENSBIXG00005026880)	CDC37 (ENSBIXG00005026794)	TYK2 (ENSBIXG00005004567)	ICAM3 (ENSBIXG00005026686)	RAVER1 (ENSBIXG00005026635)	FDX2 (ENSBIXG00005026494)	ZGLP1 (ENSBIXG00005007249)	ICAM5 (ENSBIXG00005026475)	ICAM4 (ENSBIXG00005026456)	ENSBIXG00005026437	ENSBIXG00005026424	MRPL4 (ENSBIXG00005026363)	S1PR2 (ENSBIXG00005002546) ##22	DNMT1 (ENSBIXG00005026225)
Cow	MODERN SPECIES	26	TIMM29 (ENSBTAG00000045893) #8	YIPF2 (ENSBTAG00000025606) #9	CARM1 (ENSBTAG00000012048) #10	C7H19orf38 (ENSBTAG00000004224) #11	TMED1 (ENSBTAG00000010968) #12	DNM2 (ENSBTAG00000013362) #13	QTRT1 (ENSBTAG00000037941) #14	ENSBTAG00000051140	ILF3 (ENSBTAG00000040076) #15	SLC44A2 (ENSBTAG00000002628) #16	AP1M2 (ENSBTAG00000021160) #17	CDKN2D (ENSBTAG00000010731) #18	KRI1 (ENSBTAG00000010729) #19	ATG4D (ENSBTAG00000010727) #20	ENSBTAG00000051490 #21	S1PR5 (ENSBTAG00000003544) #22	KEAP1 (ENSBTAG00000003543)	PDE4A (ENSBTAG00000012032)	CDC37 (ENSBTAG00000011699)	TYK2 (ENSBTAG00000011698)	ICAM3 (ENSBTAG00000015742)	RAVER1 (ENSBTAG00000015721)	FDX2 (ENSBTAG00000010318)	ZGLP1 (ENSBTAG00000038976)	ICAM5 (ENSBTAG00000010316)	ICAM4 (ENSBTAG00000010314)	ICAM1 (ENSBTAG00000010303)	ENSBTAG00000049560	ENSBTAG00000053933	MRPL4 (ENSBTAG00000001419)	S1PR2 (ENSBTAG00000002738) ##22
American bison	MODERN SPECIES	3349	LDLR (ENSBBBG00000017534)	SMARCA4 (ENSBBBG00000017202) #7	YIPF2 (ENSBBBG00000000756) #9	CARM1 (ENSBBBG00000016525) #10	C19orf38 (ENSBBBG00000004061) #11	TMED1 (ENSBBBG00000004053) #12	DNM2 (ENSBBBG00000016364) #13	QTRT1 (ENSBBBG00000016137) #14	ILF3 (ENSBBBG00000016084) #15	SLC44A2 (ENSBBBG00000015812) #16	AP1M2 (ENSBBBG00000015730) #17	CDKN2D (ENSBBBG00000015703) #18	KRI1 (ENSBBBG00000015696) #19	ATG4D (ENSBBBG00000015641) #20	ENSBBBG00000003902 #21	S1PR5 (ENSBBBG00000003420) #22	KEAP1 (ENSBBBG00000003432)	PDE4A (ENSBBBG00000003458)	CDC37 (ENSBBBG00000003882)	TYK2 (ENSBBBG00000003878)	ICAM3 (ENSBBBG00000015517)	RAVER1 (ENSBBBG00000015499)	FDX2 (ENSBBBG00000015465)	ENSBBBG00000015460	ICAM5 (ENSBBBG00000003849)	ICAM4 (ENSBBBG00000003843)	ICAM1 (ENSBBBG00000015412)	MRPL4 (ENSBBBG00000015394)	S1PR2 (ENSBBBG00000015343) ##22	DNMT1 (ENSBBBG00000003484)	EIF3G (ENSBBBG00000001326)
Caprinae	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000161046	ENSGT00940000156887 #7	ENSGT00390000018541.m #8	ENSGT00390000010157.b #9	ENSGT00940000160377 #10	ENSGT00390000008862 #11	ENSGT00940000158445 #12	ENSGT00940000155764.C #13	ENSGT00530000063679.B #14	ENSGT00940000156719 #15	ENSGT00940000158178 #16	ENSGT00940000159089 #17	ENSGT00940000159801.B #18	ENSGT00390000005605 #19	ENSGT00530000063000.a.a.b #20	ENSGT01050000244887.A.a.a.a #22	ENSGT00940000159543	ENSGT00940000159788.b	ENSGT00390000013443.c	ENSGT00940000159869	ENSGT00940000159005	ENSGT00940000160550	ENSGT00940000161143	ENSGT00470000042444	ENSGT00940000162184	ENSGT00940000162431	ENSGT00940000162311.c.a	ENSGT00390000014512	ENSGT01050000244887.A.a.a.b ##22	ENSGT00390000005100	ENSGT00510000047802
Rambouillet Sheep	MODERN SPECIES	21	LDLR (ENSOARG00020007651)	SMARCA4 (ENSOARG00020007539) #7	TIMM29 (ENSOARG00020007507) #8	YIPF2 (ENSOARG00020007419) #9	CARM1 (ENSOARG00020007076) #10	C19orf38 (ENSOARG00020006962) #11	TMED1 (ENSOARG00020006915) #12	DNM2 (ENSOARG00020006664) #13	QTRT1 (ENSOARG00020006553) #14	ILF3 (ENSOARG00020005811) #15	ENSOARG00020005505 #16	AP1M2 (ENSOARG00020005364) #17	CDKN2D (ENSOARG00020005338) #18	KRI1 (ENSOARG00020005100) #19	ATG4D (ENSOARG00020005015) #20	S1PR5 (ENSOARG00020004996) #22	KEAP1 (ENSOARG00020004964)	PDE4A (ENSOARG00020004490)	CDC37 (ENSOARG00020004409)	TYK2 (ENSOARG00020004293)	ICAM3 (ENSOARG00020004268)	RAVER1 (ENSOARG00020004220)	FDX2 (ENSOARG00020004158)	ENSOARG00020004133	ICAM5 (ENSOARG00020004084)	ICAM4 (ENSOARG00020004056)	ICAM1 (ENSOARG00020003991)	MRPL4 (ENSOARG00020003926)	S1PR2 (ENSOARG00020003905) ##22	DNMT1 (ENSOARG00020003738)	EIF3G (ENSOARG00020003676)
Goat	MODERN SPECIES	26	ENSCHIG00000008021 #8	YIPF2 (ENSCHIG00000017268) #9	CARM1 (ENSCHIG00000008507) #10	C19orf38 (ENSCHIG00000016641) #11	TMED1 (ENSCHIG00000026595) #12	DNM2 (ENSCHIG00000025917) #13	QTRT1 (ENSCHIG00000014137) #14	ILF3 (ENSCHIG00000024731) #15	SLC44A2 (ENSCHIG00000005817) #16	ENSCHIG00000008328	AP1M2 (ENSCHIG00000013386) #17	CDKN2D (ENSCHIG00000019940) #18	KRI1 (ENSCHIG00000011851) #19	ATG4D (ENSCHIG00000017777) #20	ENSCHIG00000018242	S1PR5 (ENSCHIG00000013199) #22	KEAP1 (ENSCHIG00000012093)	PDE4A (ENSCHIG00000020219)	CDC37 (ENSCHIG00000000718)	ENSCHIG00000000917	TYK2 (ENSCHIG00000018652)	ICAM3 (ENSCHIG00000008833)	RAVER1 (ENSCHIG00000006718)	FDX2 (ENSCHIG00000026261)	ZGLP1 (ENSCHIG00000017287)	ICAM5 (ENSCHIG00000024600)	ICAM4 (ENSCHIG00000006891)	ICAM1 (ENSCHIG00000015941)	MRPL4 (ENSCHIG00000000516)	S1PR2 (ENSCHIG00000010178) ##22	DNMT1 (ENSCHIG00000023294)
Siberian musk deer	MODERN SPECIES	1187									ENSMMSG00000015502	ENSMMSG00000015463	ENSMMSG00000015425 #17	CDKN2D (ENSMMSG00000015413) #18	KRI1 (ENSMMSG00000015359) #19	ATG4D (ENSMMSG00000015299) #20	ENSMMSG00000015283 #21	S1PR5 (ENSMMSG00000015275) #22	KEAP1 (ENSMMSG00000015254)	PDE4A (ENSMMSG00000015222)	CDC37 (ENSMMSG00000015195)
Yarkand deer	MODERN SPECIES	32	LDLR (ENSCHYG00000003225)	ENSCHYG00000003084	SMARCA4 (ENSCHYG00000003001) #7	ENSCHYG00000002972 #8	YIPF2 (ENSCHYG00000002943) #9	CARM1 (ENSCHYG00000002834) #10	C19orf38 (ENSCHYG00000002801) #11	TMED1 (ENSCHYG00000002770) #12	DNM2 (ENSCHYG00000002577) #13	ILF3 (ENSCHYG00000002410) #15	SLC44A2 (ENSCHYG00000002236) #16	AP1M2 (ENSCHYG00000002197) #17	CDKN2D (ENSCHYG00000002191) #18	KRI1 (ENSCHYG00000002126) #19	ATG4D (ENSCHYG00000002100) #20	S1PR5 (ENSCHYG00000002028) #22	KEAP1 (ENSCHYG00000002009)	PDE4A (ENSCHYG00000001936)	ENSCHYG00000001887	TYK2 (ENSCHYG00000001767)	ICAM3 (ENSCHYG00000001683)	RAVER1 (ENSCHYG00000001635)	FDX2 (ENSCHYG00000001580)	ZGLP1 (ENSCHYG00000001560)	ICAM5 (ENSCHYG00000001528)	ICAM4 (ENSCHYG00000001512)	ENSCHYG00000001506	MRPL4 (ENSCHYG00000001481)	S1PR2 (ENSCHYG00000001459) ##22	DNMT1 (ENSCHYG00000001426)	EIF3G (ENSCHYG00000001385)