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Guinea pig	MODERN SPECIES	13	INTS7 (ENSCPOG00000014960) #7	DTL (ENSCPOG00000014965) #8	PPP2R5A (ENSCPOG00000040049) #9	PACC1 (ENSCPOG00000009329) #10	ENSCPOG00000033847 #11	ATF3 (ENSCPOG00000034947) #12	BATF3 (ENSCPOG00000032323) #13	NSL1 (ENSCPOG00000002451) #14	TATDN3 (ENSCPOG00000002454) #15	SPATA45 (ENSCPOG00000002457) #16	FLVCR1 (ENSCPOG00000011300) #17	ENSCPOG00000023888 #18	VASH2 (ENSCPOG00000003871) #19	ANGEL2 (ENSCPOG00000003875) #20	RPS6KC1 (ENSCPOG00000009490) #21	PROX1 (ENSCPOG00000011987) #22	SMYD2 (ENSCPOG00000024400) #23	PTPN14 (ENSCPOG00000013729) #24	CENPF (ENSCPOG00000014374) #25	KCNK2 (ENSCPOG00000014507) #26	KCTD3 (ENSCPOG00000007778) #27	USH2A (ENSCPOG00000007786) #28	ESRRG (ENSCPOG00000036099) #29	GPATCH2 (ENSCPOG00000003966) #30	SPATA17 (ENSCPOG00000003975) #31	RRP15 (ENSCPOG00000007644) #32	TGFB2 (ENSCPOG00000007647) #33	LYPLAL1 (ENSCPOG00000010837) #34	SLC30A10 (ENSCPOG00000003584) #35	EPRS1 (ENSCPOG00000003586) #36	BPNT1 (ENSCPOG00000037184) #37
Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000011724 #7	ENSGT00530000064210 #8	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #9	ENSGT00390000017528 #10	ENSGT00940000162504	ENSGT00940000156376 #12	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000161120 #13	ENSGT00390000001374.d #14	ENSGT00720000108846.a #15	ENSGT00390000018676 #16	ENSGT01030000234625.B.c #17	ENSGT00390000012703.a #19	ENSGT00940000157391 #20	ENSGT00940000155656 #21	ENSGT00940000154790.a.a.b #22	ENSGT00940000157082 #23	ENSGT00940000156874 #24	ENSGT00730000111187.b #25	ENSGT00940000156560 #26	ENSGT00940000153881.a #27	ENSGT00940000158456 #28	ENSGT00940000153433.B.a.b #29	ENSGT00410000025698.a #30	ENSGT00390000011270 #31	ENSGT00390000001960 #32	ENSGT00940000157390 #33	ENSGT00940000159171 #34	ENSGT00940000159967 #35	ENSGT00550000074815 #36	ENSGT00940000157359 #37
Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	113	NEK2 (ENSCLAG00000010880)	LPGAT1 (ENSCLAG00000011509)	INTS7 (ENSCLAG00000011748) #7	DTL (ENSCLAG00000014236) #8	PPP2R5A (ENSCLAG00000012816) #9	PACC1 (ENSCLAG00000009570) #10	ENSCLAG00000007912 #11	ATF3 (ENSCLAG00000013767) #12	NSL1 (ENSCLAG00000015217) #14	TATDN3 (ENSCLAG00000008909) #15	SPATA45 (ENSCLAG00000008856) #16	FLVCR1 (ENSCLAG00000012241) #17	VASH2 (ENSCLAG00000008864) #19	ANGEL2 (ENSCLAG00000007133) #20	RPS6KC1 (ENSCLAG00000008718) #21	PROX1 (ENSCLAG00000009881) #22	SMYD2 (ENSCLAG00000010831) #23	PTPN14 (ENSCLAG00000007231) #24	CENPF (ENSCLAG00000010635) #25	KCNK2 (ENSCLAG00000015253) #26	KCTD3 (ENSCLAG00000008084) #27	USH2A (ENSCLAG00000009662) #28	ESRRG (ENSCLAG00000006694) #29	GPATCH2 (ENSCLAG00000009274) #30	SPATA17 (ENSCLAG00000006629) #31	RRP15 (ENSCLAG00000008564) #32	TGFB2 (ENSCLAG00000007436) #33
Degu	MODERN SPECIES	58	DTL (ENSODEG00000016385) #8	PPP2R5A (ENSODEG00000014272) #9	PACC1 (ENSODEG00000013328) #10	NENF (ENSODEG00000016432)	ATF3 (ENSODEG00000013598) #12	GARIN4 (ENSODEG00000013574)	ENSODEG00000013720 #13	NSL1 (ENSODEG00000014696) #14	TATDN3 (ENSODEG00000013799) #15	SPATA45 (ENSODEG00000014271) #16	FLVCR1 (ENSODEG00000013456) #17	VASH2 (ENSODEG00000014165) #19	ANGEL2 (ENSODEG00000014913) #20	ENSODEG00000013498	RPS6KC1 (ENSODEG00000014689) #21	PROX1 (ENSODEG00000014117) #22	SMYD2 (ENSODEG00000014303) #23	PTPN14 (ENSODEG00000015282) #24	CENPF (ENSODEG00000013904) #25	KCNK2 (ENSODEG00000015231) #26	KCTD3 (ENSODEG00000014449) #27	USH2A (ENSODEG00000014824) #28	ESRRG (ENSODEG00000013965) #29	GPATCH2 (ENSODEG00000014927) #30	SPATA17 (ENSODEG00000016248) #31	RRP15 (ENSODEG00000013879) #32	TGFB2 (ENSODEG00000015102) #33	ENSODEG00000013760	ENSODEG00000015201	LYPLAL1 (ENSODEG00000014681) #34	SLC30A10 (ENSODEG00000014204) #35
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