Vertebrata DUPLICATION Vertebrata DUPLICATION Vertebrata DUPLICATION Vertebrata ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES 308 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000153393.B ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000175089 ENSGT00530000063687.b.a ##20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 52 ENSGT00940000164258 ENSGT00390000015136 ENSGT00940000165132 ENSGT00390000013132 ENSGT00390000009671 ENSGT00390000005194 ENSGT00390000013951 ENSGT00940000154583 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000153393.B ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000158890 ENSGT00940000175089 ENSGT00530000063687.b.a ##20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00960000189798 ENSGT00930000152979 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00950000183006.A.a.b ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00390000014353 ENSGT00940000155616 ENSGT01010000222866 ENSGT00940000153393.B ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000153973 #18 ENSGT00940000175089 ENSGT00530000063687.b.a ##20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00960000189798 ENSGT00930000152979 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000163873 ENSGT00950000183006.A.a.b ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00390000014353 ENSGT00940000159835 ENSGT00940000155616 ENSGT00940000153393.B ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00960000189798 ENSGT00930000152979 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000154583 ENSGT00390000013951 Amniota ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00390000014353 ENSGT00940000159835 ENSGT00940000155616 ENSGT00390000004064 ENSGT00940000153393.B ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000158890 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00960000189798 ENSGT00930000152979 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000154583 ENSGT00390000013951 Mammalia ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000153973 #18 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000154583 ENSGT00390000013951 ENSGT00390000005194 ENSGT00390000009671 Theria ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00390000000616 #7 ENSGT00940000159798 #9 ENSGT00940000156062 #8 ENSGT00940000158273 #10 ENSGT00390000013266 #11 ENSGT00390000003839 #12 ENSGT01030000235208 ENSGT00950000183077.a.b #13 ENSGT00940000156084 #14 ENSGT00390000017530 #15 ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000153973 #18 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000154583 ENSGT00390000013951 ENSGT00390000005194 ENSGT00390000009671 Eutheria ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000159798 #9 ENSGT00940000156062 #8 ENSGT00940000158273 #10 ENSGT00390000013266 #11 ENSGT00390000003839 #12 ENSGT01030000235208 ENSGT00950000183077.a.b #13 ENSGT00940000156084 #14 ENSGT00390000017530 #15 ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000153973.c.a.a ##18 ENSGT00940000153973.c.a.b.b ##18 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000154583 ENSGT00390000013951 ENSGT00390000005194 ENSGT00390000009671 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000159798 #9 ENSGT00940000156062 #8 ENSGT00940000158273 #10 ENSGT00390000013266 #11 ENSGT00390000003839 #12 ENSGT01030000235208 ENSGT00950000183077.a.b #13 ENSGT00940000156084 #14 ENSGT00390000017530 #15 ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000153973.c.a.a ##18 ENSGT00940000153973.c.a.b.b ##18 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000175447 ENSGT00930000152979 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000154583 ENSGT00390000013951 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000003282.B ENSGT00390000000616 #7 ENSGT00940000156062 #8 ENSGT00940000159798 #9 ENSGT00940000158273 #10 ENSGT00390000013266 #11 ENSGT00390000003839 #12 ENSGT00950000183077.a.b #13 ENSGT00940000156084 #14 ENSGT00390000017530 #15 ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000153973.c.a.a ##18 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT00930000152979 ENSGT00940000175447 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000154583 ENSGT00390000013951 Primates ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000000616 #7 ENSGT00940000156062 #8 ENSGT00940000159798 #9 ENSGT00940000158273 #10 ENSGT00390000013266 #11 ENSGT00390000003839 #12 ENSGT00950000183077.a.b #13 ENSGT00940000156084 #14 ENSGT00390000017530 #15 ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000153973.c.a.a ##18 ENSGT00940000153973.c.a.b.b ##18 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000175447 ENSGT00930000152979 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000154583 ENSGT00390000013951 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000003282.B ENSGT00390000000616 #7 ENSGT00940000159798 #9 ENSGT00940000156062 #8 ENSGT00940000158273 #10 ENSGT00390000013266 #11 ENSGT00390000003839 #12 ENSGT00950000183077.a.b #13 ENSGT00940000156084 #14 ENSGT00390000017530 #15 ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000153973.c.a.a ##18 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000154583 ENSGT00390000013951 ENSGT00390000005194 ENSGT00390000009671 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES 76 ENSGT00390000003282.B ENSGT00390000000616 #7 ENSGT00940000159798 #9 ENSGT00940000156062 #8 ENSGT00940000158273 #10 ENSGT00390000013266 #11 ENSGT00390000003839 #12 ENSGT00950000183077.a.b #13 ENSGT00940000156084 #14 ENSGT00390000017530 #15 ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000153973.c.a.a ##18 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES 162 ENSGT00390000003282.B ENSGT00390000000616 #7 ENSGT00940000159798 #9 ENSGT00940000156062 #8 ENSGT00940000158273 #10 ENSGT00390000013266 #11 ENSGT00390000003839 #12 ENSGT00950000183077.a.b #13 ENSGT00940000156084 #14 ENSGT00390000017530 #15 ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000153973.c.a.a ##18 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 130 TAMM41 (ENSPSMG00000000346) #7 SYN2 (ENSPSMG00000000398) #8 TIMP4 (ENSPSMG00000000419) #9 PPARG (ENSPSMG00000000463) #10 TSEN2 (ENSPSMG00000000537) #11 MKRN2OS (ENSPSMG00000000584) #12 MKRN2 (ENSPSMG00000000636) #13 RAF1 (ENSPSMG00000000725) #14 TMEM40 (ENSPSMG00000000837) #15 ENSPSMG00000000888 #16 CAND2 (ENSPSMG00000000926) #17 ENSPSMG00000000953 #18 EFCAB12 (ENSPSMG00000000969) #19 MBD4 (ENSPSMG00000001016) #20 IFT122 (ENSPSMG00000001543) #21 RHO (ENSPSMG00000002457) #22 H1-8 (ENSPSMG00000002466) #23 ENSPSMG00000002470 #24 Coquerels sifaka MODERN SPECIES 614 TAMM41 (ENSPCOG00000021554) #7 TIMP4 (ENSPCOG00000025232) #9 SYN2 (ENSPCOG00000020181) #8 PPARG (ENSPCOG00000017510) #10 TSEN2 (ENSPCOG00000019328) #11 MKRN2OS (ENSPCOG00000027519) #12 MKRN2 (ENSPCOG00000013481) #13 RAF1 (ENSPCOG00000013436) #14 ENSPCOG00000024646 TMEM40 (ENSPCOG00000027785) #15 CAND2 (ENSPCOG00000020368) #17 ENSPCOG00000026378 ##18 EFCAB12 (ENSPCOG00000020532) #19 ENSPCOG00000018583 #20 IFT122 (ENSPCOG00000023934) #21 RHO (ENSPCOG00000024236) #22 H1-8 (ENSPCOG00000024479) #23 PLXND1 (ENSPCOG00000027312) #24 Mouse lemur MODERN SPECIES 15 ENSMICG00000012731 SYN2 (ENSMICG00000003565) #8 TIMP4 (ENSMICG00000045817) #9 PPARG (ENSMICG00000016663) #10 TSEN2 (ENSMICG00000016672) #11 MKRN2OS (ENSMICG00000038087) #12 MKRN2 (ENSMICG00000012164) #13 RAF1 (ENSMICG00000012172) #14 ENSMICG00000033639 TMEM40 (ENSMICG00000003715) #15 CAND2 (ENSMICG00000041434) #17 ENSMICG00000034607 ##18 EFCAB12 (ENSMICG00000008010) #19 MBD4 (ENSMICG00000008022) #20 IFT122 (ENSMICG00000008033) #21 RHO (ENSMICG00000047910) #22 H1-8 (ENSMICG00000030377) #23 PLXND1 (ENSMICG00000008079) #24 ENSMICG00000028823 MSX2 (ENSMICG00000026941) NSG2 (ENSMICG00000035993) C5orf47 (ENSMICG00000047468) CPEB4 (ENSMICG00000029322) ENSMICG00000035035 STC2 (ENSMICG00000032988) NKX2-5 (ENSMICG00000017468) ENSMICG00000009130 ENSMICG00000017726 CREBRF (ENSMICG00000030817) ATP6V0E1 (ENSMICG00000011317) RPL26L1 (ENSMICG00000002762) Bushbaby MODERN SPECIES 216 ENSOGAG00000031076 ENSOGAG00000006595 TIMP4 (ENSOGAG00000016704) #9 SYN2 (ENSOGAG00000016700) #8 PPARG (ENSOGAG00000002971) #10 ENSOGAG00000002976 #11 MKRN2OS (ENSOGAG00000031425) #12 MKRN2 (ENSOGAG00000003255) #13 RAF1 (ENSOGAG00000003256) #14 TMEM40 (ENSOGAG00000003261) #15 CAND2 (ENSOGAG00000028928) #17 RPL32 (ENSOGAG00000028498) ##18 ENSOGAG00000010234 #19 MBD4 (ENSOGAG00000010236) #20 IFT122 (ENSOGAG00000010245) #21 RHO (ENSOGAG00000010259) #22 PLXND1 (ENSOGAG00000010266) #24 ENSOGAG00000032612 TMCC1 (ENSOGAG00000010283) ENSOGAG00000031381 TRH (ENSOGAG00000017199) RBSN (ENSOGAG00000014042) MRPS25 (ENSOGAG00000014041) NR2C2 (ENSOGAG00000014038) FGD5 (ENSOGAG00000013279) C3orf20 (ENSOGAG00000013270) CCDC174 (ENSOGAG00000013264) GRIP2 (ENSOGAG00000002892) SLC6A6 (ENSOGAG00000002891) ENSOGAG00000007659 XPC (ENSOGAG00000024108) Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 52 ENSGT00940000153973.c.a.b.b ##18 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000175447 ENSGT00930000152979 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000154583 ENSGT00390000013951 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000157312 ENSGT00390000008330 ENSGT00940000163561 ENSGT00390000007219 ENSGT00950000183014.f.b.a.b ENSGT00530000064244.a ENSGT00940000161980 ENSGT00390000014109 ENSGT00950000183041.A.e ENSGT00390000016313.a.b ENSGT00390000018439 ENSGT00730000111536 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000175447 ENSGT00930000152979 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00910000146921 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000154583 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000157312 ENSGT00390000008330 ENSGT00940000163561 ENSGT00390000007219 ENSGT00950000183014.f.b.a.b ENSGT00530000064244.a ENSGT00940000161980 ENSGT00390000014109 ENSGT00950000183041.A.e ENSGT00390000016313.a.b ENSGT00390000018439 ENSGT00730000111536 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000175447 ENSGT00930000152979 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00910000148131 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00910000146921 ENSGT00940000155615 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000157312 ENSGT00390000008330 ENSGT00940000163561 ENSGT00390000007219 ENSGT00950000183014.f.b.a.b ENSGT00530000064244.a ENSGT00940000161980 ENSGT00390000014109 ENSGT00950000183041.A.e ENSGT00390000016313.a.b.c ENSGT00390000018439 ENSGT00730000111536 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000175447 ENSGT00930000152979 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00910000148131 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00910000146921 ENSGT00940000155615 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000157312 ENSGT00390000008330 ENSGT00940000163561 ENSGT00390000007219 ENSGT00950000183014.f.b.a.b ENSGT00530000064244.a ENSGT00940000161980 ENSGT00390000014109 ENSGT00950000183041.A.e ENSGT00390000016313.a.b.c ENSGT00390000018439 ENSGT00730000111536 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000175447 ENSGT00930000152979 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00910000148131 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00910000146921 ENSGT00940000155615 Vervet Monkey MODERN SPECIES 14 RPN1 (ENSCSAG00000008622) RAB7A (ENSCSAG00000008628) ACAD9 (ENSCSAG00000008707) CFAP92 (ENSCSAG00000008754) EFCC1 (ENSCSAG00000008762) GP9 (ENSCSAG00000018812) RAB43 (ENSCSAG00000008765) ISY1 (ENSCSAG00000008798) CNBP (ENSCSAG00000008817) COPG1 (ENSCSAG00000008921) HMCES (ENSCSAG00000008979) H1-10 (ENSCSAG00000018811) EFCAB12 (ENSCSAG00000009011) #19 MBD4 (ENSCSAG00000009037) #20 IFT122 (ENSCSAG00000009059) #21 RHO (ENSCSAG00000009088) #22 H1-8 (ENSCSAG00000009112) #23 PLXND1 (ENSCSAG00000009144) #24 TMCC1 (ENSCSAG00000009154) TRH (ENSCSAG00000009163) RBSN (ENSCSAG00000009184) MRPS25 (ENSCSAG00000009193) NR2C2 (ENSCSAG00000009209) FGD5 (ENSCSAG00000009224) C3orf20 (ENSCSAG00000009277) CCDC174 (ENSCSAG00000009294) GRIP2 (ENSCSAG00000009353) SLC6A6 (ENSCSAG00000009391) XPC (ENSCSAG00000009411) TMEM43 (ENSCSAG00000009426) CHCHD4 (ENSCSAG00000009431) Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000157312 ENSGT00390000008330 ENSGT00940000163561 ENSGT00390000007219 ENSGT00950000183014.f.b.a.b ENSGT00530000064244.a ENSGT00940000161980 ENSGT00390000014109 ENSGT00950000183041.A.e ENSGT00390000016313.a.b.c ENSGT00390000018439 ENSGT00730000111536 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000175447 ENSGT00930000152979 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00910000148131 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00910000146921 ENSGT00940000155615 Macaca ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00910000147229 ENSGT00940000157312 ENSGT00390000008330 ENSGT00390000007219 ENSGT00950000183014.f.b.a.b ENSGT00530000064244.a ENSGT00940000161980 ENSGT00390000014109 ENSGT00950000183041.A.e ENSGT00390000016313.a.b.c ENSGT00390000018439 ENSGT00730000111536 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000175447 ENSGT00930000152979 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00910000148131 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00910000146921 ENSGT00940000155615 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000009630 ENSGT00940000155864.a.b ENSGT00940000157312 ENSGT00390000008330 ENSGT00950000183014.f.b.a.b ENSGT00940000161627.a.b.b.a.b.b.b ENSGT00940000161980 ENSGT00390000014109 ENSGT00950000183041.A.e ENSGT00390000016313.a.b.c ENSGT00390000018439 ENSGT00730000111536 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000175447 ENSGT00930000152979 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000154583 ENSGT00390000013951 Crab-eating macaque MODERN SPECIES 11 ENSMFAG00000031120 ENSMFAG00000054493 RAB7A (ENSMFAG00000050771) ENSMFAG00000057913 #21 ACAD9 (ENSMFAG00000045035) CFAP92 (ENSMFAG00000043199) EFCC1 (ENSMFAG00000046117) ENSMFAG00000064038 RAB43 (ENSMFAG00000040013) ISY1 (ENSMFAG00000061497) CNBP (ENSMFAG00000030262) COPG1 (ENSMFAG00000031940) HMCES (ENSMFAG00000032291) ENSMFAG00000040136 #19 IFT122 (ENSMFAG00000030257) #21 RHO (ENSMFAG00000004044) #22 ENSMFAG00000017755 ENSMFAG00000056765 PLXND1 (ENSMFAG00000000589) #24 TMCC1 (ENSMFAG00000045092) TRH (ENSMFAG00000042203) RBSN (ENSMFAG00000052478) MRPS25 (ENSMFAG00000035383) NR2C2 (ENSMFAG00000045119) ENSMFAG00000051869 FGD5 (ENSMFAG00000045664) C3orf20 (ENSMFAG00000029993) CCDC174 (ENSMFAG00000042348) GRIP2 (ENSMFAG00000035973) SLC6A6 (ENSMFAG00000038570) LSM3 (ENSMFAG00000063615) Rhesus MODERN SPECIES 11 CFAP92 (ENSMMUG00000006343) EFCC1 (ENSMMUG00000047061) ENSMMUG00000062320 GP9 (ENSMMUG00000019799) ISY1 (ENSMMUG00000011580) ENSMMUG00000047632 CNBP (ENSMMUG00000058753) COPG1 (ENSMMUG00000013163) HMCES (ENSMMUG00000013167) H1-10 (ENSMMUG00000043091) ENSMMUG00000063541 EFCAB12 (ENSMMUG00000012721) #19 MBD4 (ENSMMUG00000012723) #20 ENSMMUG00000062379 IFT122 (ENSMMUG00000012727) #21 RHO (ENSMMUG00000055315) #22 H1-8 (ENSMMUG00000012736) #23 PLXND1 (ENSMMUG00000012737) #24 TMCC1 (ENSMMUG00000016793) TRH (ENSMMUG00000046670) RBSN (ENSMMUG00000005158) MRPS25 (ENSMMUG00000064556) NR2C2 (ENSMMUG00000005156) FGD5 (ENSMMUG00000018446) C2H3orf20 (ENSMMUG00000014780) CCDC174 (ENSMMUG00000044822) ENSMMUG00000062011 GRIP2 (ENSMMUG00000006342) SLC6A6 (ENSMMUG00000006340) TMEM43 (ENSMMUG00000023124) XPC (ENSMMUG00000023125) Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 546 ENSMNEG00000015696 ACAD9 (ENSMNEG00000040449) ENSMNEG00000031067 ENSMNEG00000029835 EFCC1 (ENSMNEG00000040739) GP9 (ENSMNEG00000008633) RAB43 (ENSMNEG00000029051) ISY1 (ENSMNEG00000043206) CNBP (ENSMNEG00000028473) COPG1 (ENSMNEG00000033067) HMCES (ENSMNEG00000042145) H1-10 (ENSMNEG00000025518) EFCAB12 (ENSMNEG00000030732) #19 MBD4 (ENSMNEG00000029752) #20 IFT122 (ENSMNEG00000041458) #21 RHO (ENSMNEG00000038092) #22 H1-8 (ENSMNEG00000045142) #23 PLXND1 (ENSMNEG00000036132) #24 TMCC1 (ENSMNEG00000040170) TRH (ENSMNEG00000030919) RBSN (ENSMNEG00000044914) MRPS25 (ENSMNEG00000034531) NR2C2 (ENSMNEG00000030133) ENSMNEG00000006121 FGD5 (ENSMNEG00000029420) C3orf20 (ENSMNEG00000041322) CCDC174 (ENSMNEG00000042119) ENSMNEG00000008483 GRIP2 (ENSMNEG00000044173) SLC6A6 (ENSMNEG00000040859) ENSMNEG00000043632 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007704 ENSGT00910000147229 ENSGT00940000157312 ENSGT00390000008330 ENSGT00950000183014.f.b.a.b ENSGT00530000064244.a ENSGT00940000161980 ENSGT00390000014109 ENSGT00950000183041.A.e ENSGT00390000016313.a.b.c ENSGT00390000018439 ENSGT00730000111536 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00910000146921 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000154583 ENSGT00390000013951 ENSGT00390000005194 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00910000147229 ENSGT00940000157312 ENSGT00390000008330 ENSGT00940000163561 ENSGT00950000183014.f.b.a.b ENSGT00530000064244.a ENSGT00940000161980 ENSGT00390000014109 ENSGT00950000183041.A.e ENSGT00390000016313.a.b.c ENSGT00390000018439 ENSGT00730000111536 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00910000146921 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000154583 ENSGT00390000013951 ENSGT00390000005194 Drill MODERN SPECIES 438 IFT122 (ENSMLEG00000030347) #21 RHO (ENSMLEG00000041762) #22 H1-8 (ENSMLEG00000039762) #23 ENSMLEG00000037726 #24 TMCC1 (ENSMLEG00000031663) Sooty mangabey MODERN SPECIES 650 ENSCATG00000037989 ENSCATG00000039946 #21 ACAD9 (ENSCATG00000038107) ENSCATG00000030214 EFCC1 (ENSCATG00000037868) GP9 (ENSCATG00000002905) RAB43 (ENSCATG00000038321) ISY1 (ENSCATG00000030672) CNBP (ENSCATG00000020089) COPG1 (ENSCATG00000031185) HMCES (ENSCATG00000040383) H1-10 (ENSCATG00000002340) EFCAB12 (ENSCATG00000038259) #19 MBD4 (ENSCATG00000035211) #20 IFT122 (ENSCATG00000017582) #21 RHO (ENSCATG00000038589) #22 H1-8 (ENSCATG00000040635) #23 PLXND1 (ENSCATG00000041419) #24 TMCC1 (ENSCATG00000017209) TRH (ENSCATG00000030883) RBSN (ENSCATG00000029332) MRPS25 (ENSCATG00000042651) NR2C2 (ENSCATG00000040182) FGD5 (ENSCATG00000034854) C3orf20 (ENSCATG00000037971) CCDC174 (ENSCATG00000029674) ENSCATG00000022779 GRIP2 (ENSCATG00000030249) SLC6A6 (ENSCATG00000027535) ENSCATG00000039421 XPC (ENSCATG00000036725) Olive baboon MODERN SPECIES 11 ENSPANG00000041869 RAB7A (ENSPANG00000031173) ENSPANG00000033246 ACAD9 (ENSPANG00000018818) CFAP92 (ENSPANG00000013114) EFCC1 (ENSPANG00000024679) GP9 (ENSPANG00000008215) RAB43 (ENSPANG00000012533) ISY1 (ENSPANG00000004750) CNBP (ENSPANG00000007815) COPG1 (ENSPANG00000018819) HMCES (ENSPANG00000012065) H1-10 (ENSPANG00000018283) MBD4 (ENSPANG00000015047) #20 IFT122 (ENSPANG00000006164) #21 RHO (ENSPANG00000008230) #22 H1-8 (ENSPANG00000017383) #23 PLXND1 (ENSPANG00000005560) #24 TMCC1 (ENSPANG00000022860) TRH (ENSPANG00000009555) RBSN (ENSPANG00000016555) MRPS25 (ENSPANG00000029339) NR2C2 (ENSPANG00000005929) FGD5 (ENSPANG00000012066) C3orf20 (ENSPANG00000018820) CCDC174 (ENSPANG00000021119) GRIP2 (ENSPANG00000010990) SLC6A6 (ENSPANG00000009556) LSM3 (ENSPANG00000009378) XPC (ENSPANG00000004175) TMEM43 (ENSPANG00000012906) Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 35 ENSGT00390000007704 ENSGT00910000147229 ENSGT00940000157312 ENSGT00390000008330 ENSGT00950000183014.f.b.a.b ENSGT00530000064244.a ENSGT00940000161980 ENSGT00390000014109 ENSGT00950000183041.A.e ENSGT00390000016313.a.b.c ENSGT00390000018439 ENSGT00730000111536 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00910000146921 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000154583 ENSGT00390000013951 ENSGT00940000158362 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 772 ENSRBIG00000025725 ENSRBIG00000043768 ACAD9 (ENSRBIG00000036154) ENSRBIG00000035587 EFCC1 (ENSRBIG00000036553) GP9 (ENSRBIG00000010960) RAB43 (ENSRBIG00000038082) ISY1 (ENSRBIG00000028747) CNBP (ENSRBIG00000030361) COPG1 (ENSRBIG00000021306) HMCES (ENSRBIG00000043914) H1-10 (ENSRBIG00000024996) EFCAB12 (ENSRBIG00000015767) #19 MBD4 (ENSRBIG00000027722) #20 IFT122 (ENSRBIG00000038785) #21 RHO (ENSRBIG00000035830) #22 H1-8 (ENSRBIG00000033982) #23 PLXND1 (ENSRBIG00000034816) #24 TMCC1 (ENSRBIG00000032447) ENSRBIG00000043034 ENSRBIG00000042411 ZNF556 (ENSRBIG00000044050) ZNF555 (ENSRBIG00000034160) ZNF554 (ENSRBIG00000044669) THOP1 (ENSRBIG00000036595) SGTA (ENSRBIG00000041971) SLC39A3 (ENSRBIG00000038664) UBAP1L (ENSRBIG00000038643) RASL12 (ENSRBIG00000041270) SLC51B (ENSRBIG00000025591) MTFMT (ENSRBIG00000018525) Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2280 EFCAB12 (ENSRROG00000039253) #19 MBD4 (ENSRROG00000029136) #20 IFT122 (ENSRROG00000044243) #21 RHO (ENSRROG00000033776) #22 H1-8 (ENSRROG00000037123) #23 PLXND1 (ENSRROG00000002091) #24 TMCC1 (ENSRROG00000027034) ENSRROG00000044977 TRH (ENSRROG00000030136) RBSN (ENSRROG00000015856) MRPS25 (ENSRROG00000034718) NR2C2 (ENSRROG00000041550) FGD5 (ENSRROG00000031500) C3orf20 (ENSRROG00000044103) CCDC174 (ENSRROG00000031345) ENSRROG00000042275 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000157312 ENSGT00390000008330 ENSGT00950000183014.f.b.a.b ENSGT00390000007219 ENSGT00940000163561 ENSGT00530000064244.a ENSGT00940000161980 ENSGT00390000014109 ENSGT00950000183041.A.e ENSGT00390000016313.a.b ENSGT00390000018439 ENSGT00730000111536 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00910000148131 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00910000146921 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000154583.i ENSGT00390000013951 Hominidae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000155864.a.b ENSGT00390000007704 ENSGT00940000157312 ENSGT00390000008330 ENSGT00950000183014.f.b.a.b ENSGT00530000064244.a ENSGT00940000161980 ENSGT00390000014109 ENSGT00950000183041.A.e ENSGT00390000016313.a.b ENSGT00390000018439 ENSGT00730000111536 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00910000148131 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00910000146921 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000154583.i ENSGT00390000013951 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000007704 ENSGT00940000157312 ENSGT00390000008330 ENSGT00940000163561 ENSGT00950000183014.f.b.a.b ENSGT00530000064244.a ENSGT00940000161980 ENSGT00390000014109 ENSGT00950000183041.A.e ENSGT00390000016313.a.b ENSGT00390000018439 ENSGT00730000111536 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00510000047003.i.a.a.a.a.b ENSGT00940000162990 ENSGT00940000155619 ENSGT00390000016225 ENSGT00940000155351.cb ENSGT00940000156421 ENSGT00390000010145.c.b ENSGT00940000160525 ENSGT00390000016224.j.a.e.b ENSGT00390000016224.j.a.f ENSGT00390000011422.l Gorilla MODERN SPECIES 16 RAB7A (ENSGGOG00000005557) ENSGGOG00000026638 ACAD9 (ENSGGOG00000009603) ENSGGOG00000025242 EFCC1 (ENSGGOG00000005037) GP9 (ENSGGOG00000012908) RAB43 (ENSGGOG00000027408) ISY1 (ENSGGOG00000038733) CNBP (ENSGGOG00000010085) COPG1 (ENSGGOG00000014201) HMCES (ENSGGOG00000016921) H1-10 (ENSGGOG00000016927) EFCAB12 (ENSGGOG00000026446) #19 MBD4 (ENSGGOG00000010698) #20 IFT122 (ENSGGOG00000010703) #21 RHO (ENSGGOG00000010728) #22 H1-8 (ENSGGOG00000000735) #23 PLXND1 (ENSGGOG00000000736) #24 ENSGGOG00000003969 ENSGGOG00000037304 ENSGGOG00000009280 ALG1L2 (ENSGGOG00000027087) ENSGGOG00000026930 COL6A5 (ENSGGOG00000006695) COL6A6 (ENSGGOG00000000023) PIK3R4 (ENSGGOG00000005790) ATP2C1 (ENSGGOG00000002535) ENSGGOG00000041984 NEK11 (ENSGGOG00000002547) ENSGGOG00000037870 ENSGGOG00000042296 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00520000059425 ENSGT00390000007704 ENSGT00940000157312 ENSGT00390000008330 ENSGT00950000183014.f.b.a.b ENSGT00530000064244.a ENSGT00940000161980 ENSGT00390000014109 ENSGT00950000183041.A.e ENSGT00390000016313.a.b ENSGT00390000018439 ENSGT00730000111536 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000008647.e.a.b ENSGT00510000047003.i.b.a.b ENSGT00510000047003.i.a.a.a.a.b ENSGT00940000162990 ENSGT00940000155619 ENSGT00390000016225 ENSGT00940000155351.cb ENSGT00940000156421 ENSGT00390000010145.c.b ENSGT00940000160525 ENSGT00390000016224.j.a.e.b Human MODERN SPECIES 15 RAB7A (ENSG00000075785) ACAD9 (ENSG00000177646) CFAP92 (ENSG00000114656) EFCC1 (ENSG00000114654) GP9 (ENSG00000169704) RAB43 (ENSG00000172780) ISY1-RAB43 (ENSG00000261796) ISY1 (ENSG00000240682) CNBP (ENSG00000169714) COPG1 (ENSG00000181789) HMCES (ENSG00000183624) H1-10 (ENSG00000184897) EFCAB12 (ENSG00000172771) #19 IFT122 (ENSG00000163913) #21 MBD4 (ENSG00000129071) #20 RHO (ENSG00000163914) #22 H1-8 (ENSG00000178804) #23 PLXND1 (ENSG00000004399) #24 TMCC1 (ENSG00000172765) TRH (ENSG00000170893) ALG1L2 (ENSG00000251287) COL6A5 (ENSG00000172752) COL6A6 (ENSG00000206384) PIK3R4 (ENSG00000196455) ATP2C1 (ENSG00000017260) ASTE1 (ENSG00000034533) NEK11 (ENSG00000114670) NUDT16 (ENSG00000198585) MRPL3 (ENSG00000114686) CPNE4 (ENSG00000196353) ACP3 (ENSG00000014257) Pan ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000007704 ENSGT00940000157312 ENSGT00390000008330 ENSGT00940000163561 ENSGT00950000183014.f.b.a.b ENSGT00530000064244.a ENSGT00940000161980 ENSGT00390000014109 ENSGT00950000183041.A.e ENSGT00390000016313.a.b ENSGT00390000018439 ENSGT00730000111536 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000008647.e.a.b ENSGT00510000047003.i.b.a.b ENSGT00510000047003.i.a.a.a.a.b.a ENSGT00940000162990 ENSGT00940000155619 ENSGT00390000016225 ENSGT00940000155351.cb ENSGT00940000156421 ENSGT00390000010145.c.b ENSGT00940000160525 ENSGT00390000016224.j.a.e.b Bonobo MODERN SPECIES 16 ENSPPAG00000036440 ENSPPAG00000030098 ENSPPAG00000011218 ACAD9 (ENSPPAG00000041609) ENSPPAG00000043474 ENSPPAG00000036989 GP9 (ENSPPAG00000004366) RAB43 (ENSPPAG00000025920) ISY1 (ENSPPAG00000042141) CNBP (ENSPPAG00000028059) COPG1 (ENSPPAG00000028236) HMCES (ENSPPAG00000030370) EFCAB12 (ENSPPAG00000040617) #19 MBD4 (ENSPPAG00000036528) #20 IFT122 (ENSPPAG00000037293) #21 RHO (ENSPPAG00000041243) #22 H1-8 (ENSPPAG00000026022) #23 ENSPPAG00000009247 #24 TMCC1 (ENSPPAG00000035364) TRH (ENSPPAG00000041209) ENSPPAG00000025254 COL6A5 (ENSPPAG00000017205) COL6A6 (ENSPPAG00000037829) PIK3R4 (ENSPPAG00000030160) ATP2C1 (ENSPPAG00000032801) ASTE1 (ENSPPAG00000027980) NEK11 (ENSPPAG00000024112) ENSPPAG00000037844 ENSPPAG00000031532 MRPL3 (ENSPPAG00000015358) ENSPPAG00000036016 Chimpanzee MODERN SPECIES 16 RAB7A (ENSPTRG00000015359) ENSPTRG00000049707 ACAD9 (ENSPTRG00000015362) ENSPTRG00000015363 EFCC1 (ENSPTRG00000015366) GP9 (ENSPTRG00000041466) RAB43 (ENSPTRG00000050264) ISY1 (ENSPTRG00000015367) CNBP (ENSPTRG00000015369) COPG1 (ENSPTRG00000015370) HMCES (ENSPTRG00000015372) H1-10 (ENSPTRG00000015374) EFCAB12 (ENSPTRG00000015376) #19 MBD4 (ENSPTRG00000015377) #20 IFT122 (ENSPTRG00000015378) #21 RHO (ENSPTRG00000015379) #22 H1-8 (ENSPTRG00000015380) #23 PLXND1 (ENSPTRG00000015381) #24 TMCC1 (ENSPTRG00000015382) TRH (ENSPTRG00000015383) ENSPTRG00000052736 ENSPTRG00000051071 COL6A5 (ENSPTRG00000015386) COL6A6 (ENSPTRG00000030122) PIK3R4 (ENSPTRG00000015388) ENSPTRG00000047268 ATP2C1 (ENSPTRG00000015390) ASTE1 (ENSPTRG00000015391) NEK11 (ENSPTRG00000015392) ENSPTRG00000046697 NUDT16 (ENSPTRG00000041330) Orangutan MODERN SPECIES 16 ENSPPYG00000039972 #21 ACAD9 (ENSPPYG00000013429) CFAP92 (ENSPPYG00000013428) EFCC1 (ENSPPYG00000013427) GP9 (ENSPPYG00000013425) ENSPPYG00000038696 RAB43 (ENSPPYG00000038432) ISY1 (ENSPPYG00000013424) CNBP (ENSPPYG00000013423) COPG1 (ENSPPYG00000013422) HMCES (ENSPPYG00000013421) H1-10 (ENSPPYG00000013420) EFCAB12 (ENSPPYG00000013418) #19 MBD4 (ENSPPYG00000013417) #20 IFT122 (ENSPPYG00000013416) #21 RHO (ENSPPYG00000013415) #22 ENSPPYG00000013414 PLXND1 (ENSPPYG00000013413) #24 TMCC1 (ENSPPYG00000013412) TRH (ENSPPYG00000013411) RBSN (ENSPPYG00000013410) MRPS25 (ENSPPYG00000032891) NR2C2 (ENSPPYG00000013408) FGD5 (ENSPPYG00000013407) C3orf20 (ENSPPYG00000013406) CCDC174 (ENSPPYG00000013405) GRIP2 (ENSPPYG00000013404) SLC6A6 (ENSPPYG00000013403) LSM3 (ENSPPYG00000013402) XPC (ENSPPYG00000013401) TMEM43 (ENSPPYG00000013400) Gibbon MODERN SPECIES 13 RPN1 (ENSNLEG00000014337) RAB7A (ENSNLEG00000029309) ACAD9 (ENSNLEG00000014382) ENSNLEG00000014439 ENSNLEG00000028765 ENSNLEG00000014447 RAB43 (ENSNLEG00000028802) ISY1 (ENSNLEG00000028747) CNBP (ENSNLEG00000035879) COPG1 (ENSNLEG00000014499) HMCES (ENSNLEG00000014523) H1-10 (ENSNLEG00000019298) EFCAB12 (ENSNLEG00000005355) #19 MBD4 (ENSNLEG00000005337) #20 IFT122 (ENSNLEG00000005298) #21 RHO (ENSNLEG00000005288) #22 H1-8 (ENSNLEG00000005285) #23 PLXND1 (ENSNLEG00000005261) #24 TMCC1 (ENSNLEG00000005249) TRH (ENSNLEG00000005245) RBSN (ENSNLEG00000005222) MRPS25 (ENSNLEG00000031537) NR2C2 (ENSNLEG00000005193) FGD5 (ENSNLEG00000005177) C3orf20 (ENSNLEG00000005161) CCDC174 (ENSNLEG00000005142) GRIP2 (ENSNLEG00000005114) SLC6A6 (ENSNLEG00000005084) LSM3 (ENSNLEG00000005079) XPC (ENSNLEG00000005000) TMEM43 (ENSNLEG00000004956) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000155864.a.b ENSGT00390000007704 ENSGT00940000157312 ENSGT00390000008330 ENSGT00950000183014.f.b.a.b ENSGT00530000064244.a ENSGT00940000161980 ENSGT00390000014109 ENSGT00950000183041.A.e.a ENSGT00390000016313.a.b.e.b ENSGT00390000018439 ENSGT00730000111536 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00910000146921 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000154583 ENSGT00390000013951 ENSGT00390000005194 Cebidae ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000155864.a.b ENSGT00390000007704 ENSGT00940000157312 ENSGT00390000008330 ENSGT00950000183014.f.b.a.b ENSGT00530000064244.a ENSGT00940000161980 ENSGT00390000014109 ENSGT00950000183041.A.e.a ENSGT00390000016313.a.b.e.b ENSGT00390000018439 ENSGT00730000111536 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00910000146921 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000154583 ENSGT00390000013951 ENSGT00390000005194 Marmoset MODERN SPECIES 6 EFCC1 (ENSCJAG00000017469) GP9 (ENSCJAG00000017461) ENSCJAG00000087267 RAB43 (ENSCJAG00000035984) ISY1 (ENSCJAG00000017419) CNBP (ENSCJAG00000017430) ENSCJAG00000083673 COPG1 (ENSCJAG00000017327) HMCES (ENSCJAG00000017396) H1-10 (ENSCJAG00000039596) EFCAB12 (ENSCJAG00000017314) #19 MBD4 (ENSCJAG00000017293) #20 IFT122 (ENSCJAG00000017213) #21 ENSCJAG00000087235 #23 ENSCJAG00000076224 RHO (ENSCJAG00000017195) #22 ENSCJAG00000017209 #23 PLXND1 (ENSCJAG00000005429) #24 TMCC1 (ENSCJAG00000017178) ENSCJAG00000021040 TRH (ENSCJAG00000047087) RBSN (ENSCJAG00000017163) MRPS25 (ENSCJAG00000017160) ENSCJAG00000058001 NR2C2 (ENSCJAG00000017131) FGD5 (ENSCJAG00000017099) C3orf20 (ENSCJAG00000017083) CCDC174 (ENSCJAG00000017045) GRIP2 (ENSCJAG00000017014) SLC6A6 (ENSCJAG00000016992) ENSCJAG00000079599 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES 47 ENSGT00390000009630 ENSGT00940000155864.a.b ENSGT00390000007704 ENSGT00940000157312 ENSGT00390000008330 ENSGT00950000183014.f.b.a.b ENSGT00940000161980 ENSGT00390000014109 ENSGT00950000183041.A.e.a ENSGT00390000016313.a.b.e.b ENSGT00390000018439 ENSGT00730000111536 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00910000146921 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000154583 ENSGT00390000013951 ENSGT00390000005194 Capuchin MODERN SPECIES 332 EFCAB12 (ENSCCAG00000037525) #19 MBD4 (ENSCCAG00000029796) #20 IFT122 (ENSCCAG00000034647) #21 RHO (ENSCCAG00000003711) #22 H1-8 (ENSCCAG00000028548) #23 PLXND1 (ENSCCAG00000026590) #24 TMCC1 (ENSCCAG00000034223) TRH (ENSCCAG00000025977) RBSN (ENSCCAG00000015545) MRPS25 (ENSCCAG00000029293) NR2C2 (ENSCCAG00000028267) FGD5 (ENSCCAG00000034009) C3orf20 (ENSCCAG00000025317) CCDC174 (ENSCCAG00000030530) ENSCCAG00000021896 GRIP2 (ENSCCAG00000023870) SLC6A6 (ENSCCAG00000024571) ENSCCAG00000036499 XPC (ENSCCAG00000021946) Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 59 RAB7A (ENSSBOG00000014322) ENSSBOG00000012845 ACAD9 (ENSSBOG00000032638) ENSSBOG00000034861 ENSSBOG00000018727 ##18 EFCC1 (ENSSBOG00000030437) RAB43 (ENSSBOG00000021775) ISY1 (ENSSBOG00000029301) CNBP (ENSSBOG00000023735) COPG1 (ENSSBOG00000031709) HMCES (ENSSBOG00000023491) H1-10 (ENSSBOG00000019873) EFCAB12 (ENSSBOG00000024520) #19 MBD4 (ENSSBOG00000016810) #20 IFT122 (ENSSBOG00000035867) #21 RHO (ENSSBOG00000020736) #22 H1-8 (ENSSBOG00000020996) #23 PLXND1 (ENSSBOG00000025455) #24 TMCC1 (ENSSBOG00000032556) TRH (ENSSBOG00000032057) RBSN (ENSSBOG00000029767) ENSSBOG00000035105 NR2C2 (ENSSBOG00000024072) FGD5 (ENSSBOG00000035174) C3orf20 (ENSSBOG00000031678) CCDC174 (ENSSBOG00000020532) ENSSBOG00000024640 ENSSBOG00000029285 GRIP2 (ENSSBOG00000004102) SLC6A6 (ENSSBOG00000029944) ENSSBOG00000024310 Mas night monkey MODERN SPECIES 321 EFCAB12 (ENSANAG00000028408) #19 MBD4 (ENSANAG00000005085) #20 IFT122 (ENSANAG00000033342) #21 RHO (ENSANAG00000032928) #22 ENSANAG00000026706 #23 PLXND1 (ENSANAG00000037480) #24 TMCC1 (ENSANAG00000024697) TRH (ENSANAG00000024416) ENSANAG00000022989 RBSN (ENSANAG00000022849) MRPS25 (ENSANAG00000036121) NR2C2 (ENSANAG00000037853) ENSANAG00000019989 FGD5 (ENSANAG00000021931) C3orf20 (ENSANAG00000020657) CCDC174 (ENSANAG00000036650) GRIP2 (ENSANAG00000037475) SLC6A6 (ENSANAG00000025733) LSM3 (ENSANAG00000034627) Tarsier MODERN SPECIES 1622 RPL32 (ENSTSYG00000037015) ##18 EFCAB12 (ENSTSYG00000011145) #19 ENSTSYG00000011147 #20 IFT122 (ENSTSYG00000011151) #21 RHO (ENSTSYG00000032662) #22 H1-8 (ENSTSYG00000012036) #23 ENSTSYG00000035139 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000003282.B ENSGT00390000000616 #7 ENSGT00940000156062 #8 ENSGT00940000159798 #9 ENSGT00940000158273 #10 ENSGT00390000013266 #11 ENSGT00390000003839 #12 ENSGT00950000183077.a.b #13 ENSGT00940000156084 #14 ENSGT00390000017530 #15 ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000153973.c.a.a ##18 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000154583 ENSGT00390000013951 ENSGT00390000005194 ENSGT00390000009671 Tree shrew MODERN SPECIES 3159 ENSTBEG00000011354 #22 Glires ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000003282.B ENSGT00390000000616 #7 ENSGT00940000156062 #8 ENSGT00940000159798 #9 ENSGT00940000158273 #10 ENSGT00390000013266 #11 ENSGT00390000003839 #12 ENSGT00950000183077.a.b #13 ENSGT00940000156084 #14 ENSGT00390000017530 #15 ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000153973.c.a.a ##18 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000154583 ENSGT00390000013951 ENSGT00390000005194 ENSGT00390000009671 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES 105 ENSGT00390000003282.B ENSGT00390000000616 #7 ENSGT00940000156062 #8 ENSGT00940000159798 #9 ENSGT00940000158273 #10 ENSGT00390000013266 #11 ENSGT00390000003839 #12 ENSGT00950000183077.a.b #13 ENSGT00940000156084 #14 ENSGT00390000017530 #15 ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000153973.c.a.b.b ##18 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000175447 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000154583 ENSGT00390000013951 ENSGT00390000005194 ENSGT00390000009671 Rabbit MODERN SPECIES 20 ATG7 (ENSOCUG00000001908) VGLL4 (ENSOCUG00000001911) TIMP4 (ENSOCUG00000015952) #9 ENSOCUG00000015932 #8 PPARG (ENSOCUG00000013194) #10 TSEN2 (ENSOCUG00000013203) #11 MKRN2OS (ENSOCUG00000033126) #12 MKRN2 (ENSOCUG00000014171) #13 RAF1 (ENSOCUG00000014175) #14 ENSOCUG00000031173 #15 CAND2 (ENSOCUG00000009266) #17 ENSOCUG00000023407 ##18 ENSOCUG00000012999 #19 MBD4 (ENSOCUG00000013006) #20 IFT122 (ENSOCUG00000013015) #21 RHO (ENSOCUG00000013036) #22 ENSOCUG00000029379 PLXND1 (ENSOCUG00000013049) #24 TMCC1 (ENSOCUG00000013071) TRH (ENSOCUG00000006337) RBSN (ENSOCUG00000006988) MRPS25 (ENSOCUG00000006984) NR2C2 (ENSOCUG00000006975) FGD5 (ENSOCUG00000006961) ENSOCUG00000025023 ENSOCUG00000015577 ENSOCUG00000039627 CCDC174 (ENSOCUG00000008451) GRIP2 (ENSOCUG00000001145) SLC6A6 (ENSOCUG00000001144) ENSOCUG00000011088 Pika MODERN SPECIES 2815 IFT122 (ENSOPRG00000011506) #21 RHO (ENSOPRG00000011547) #22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000003282.B ENSGT00390000000616 #7 ENSGT00940000156062 #8 ENSGT00940000159798 #9 ENSGT00940000158273 #10 ENSGT00390000013266 #11 ENSGT00390000003839 #12 ENSGT00950000183077.a.b #13 ENSGT00940000156084 #14 ENSGT00390000017530 #15 ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000153973.c.a.a ##18 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000154583 ENSGT00390000013951 ENSGT00390000005194 ENSGT00390000009671 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00390000003282.B ENSGT00390000000616 #7 ENSGT00940000156062 #8 ENSGT00940000159798 #9 ENSGT00940000158273 #10 ENSGT00390000013266 #11 ENSGT00390000003839 #12 ENSGT00950000183077.a.b #13 ENSGT00940000156084 #14 ENSGT00390000017530 #15 ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000153973.c.a.a ##18 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000154583 ENSGT00390000013951 ENSGT00390000005194 ENSGT00390000009671 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00390000003282.B ENSGT00390000000616 #7 ENSGT00940000156062 #8 ENSGT00940000159798 #9 ENSGT00940000158273 #10 ENSGT00390000013266 #11 ENSGT00390000003839 #12 ENSGT00950000183077.a.b #13 ENSGT00940000156084 #14 ENSGT00390000017530 #15 ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000153973.c.a.a ##18 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000154583 ENSGT00390000013951 ENSGT00390000005194 ENSGT00390000009671 Muroidea ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00390000003282.B ENSGT00390000000616 #7 ENSGT00940000156062 #8 ENSGT00940000159798 #9 ENSGT00940000158273 #10 ENSGT00390000013266 #11 ENSGT00390000003839 #12 ENSGT00950000183077.a.b #13 ENSGT00940000156084 #14 ENSGT00390000017530 #15 ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000153973.c.a.a ##18 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000154583 ENSGT00390000013951 ENSGT00390000005194 ENSGT00390000009671 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000003282.B ENSGT00390000000616 #7 ENSGT00940000156062 #8 ENSGT00940000159798 #9 ENSGT00940000158273 #10 ENSGT00390000013266 #11 ENSGT00390000003839 #12 ENSGT00950000183077.a.b #13 ENSGT00940000156084 #14 ENSGT00390000017530 #15 ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000153973.c.a.a ##18 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00940000153997.b.a.a ENSGT00940000155716 ENSGT00940000158282 ENSGT00940000156111 ENSGT01060000248581.D.a.b.a.b ENSGT01090000260086.F.a.a.a.b ENSGT01090000260086.F.a.a.a.a ENSGT01090000260086.F.a.a.b ENSGT01100000263491.a.b.a.a.a.a.a.b.c.a ENSGT00940000160176 ENSGT00390000017909 ENSGT00390000006888 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000000616 #7 ENSGT00940000156062 #8 ENSGT00940000159798 #9 ENSGT00940000158273 #10 ENSGT00390000013266 #11 ENSGT00390000003839 #12 ENSGT00950000183077.a.b #13 ENSGT00940000156084 #14 ENSGT00390000017530 #15 ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000153973.c.a.a ##18 ENSGT00940000153973.d ##18 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00940000153997.b.a.a ENSGT00940000155716 ENSGT00940000158282 ENSGT00940000156111 ENSGT01060000248581.D.a.b.a.b ENSGT01090000260086.F.a.a.a.b ENSGT01090000260086.F.a.a.a.a ENSGT01090000260086.F.a.a.b ENSGT01100000263491.a.b.a.a.a.a.a.b.c.a ENSGT00940000160176 ENSGT00390000017909 ENSGT00390000006888 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000003282.B ENSGT00390000000616 #7 ENSGT00940000159798 #9 ENSGT00940000156062 #8 ENSGT00940000158273 #10 ENSGT00390000013266 #11 ENSGT00390000003839 #12 ENSGT00950000183077.a.b #13 ENSGT00940000156084 #14 ENSGT00390000017530 #15 ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000153973.d ##18 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00940000153997.b.a.a ENSGT00940000155716 ENSGT00940000158282 ENSGT00940000156111 ENSGT01060000248581.D.a.b.a.b ENSGT01090000260086.F.a.a.a.b ENSGT01090000260086.F.a.a.a.a ENSGT01090000260086.F.a.a.b ENSGT01100000263491.a.b.a.a.a.a.a.b.c.a ENSGT00940000160176 ENSGT00390000017909 ENSGT00390000006888 Golden Hamster MODERN SPECIES 622 Tamm41 (ENSMAUG00000017519) #7 ENSMAUG00000013097 Timp4 (ENSMAUG00000018049) #9 ENSMAUG00000020153 #8 ENSMAUG00000012323 #10 ENSMAUG00000013859 #11 Mkrn2os (ENSMAUG00000010492) #12 Mkrn2 (ENSMAUG00000014200) #13 Raf1 (ENSMAUG00000015447) #14 Tmem40 (ENSMAUG00000015454) #15 Cand2 (ENSMAUG00000005693) #17 ENSMAUG00000020260 Efcab12 (ENSMAUG00000010638) #19 ENSMAUG00000014245 #20 Ift122 (ENSMAUG00000005778) #21 Rho (ENSMAUG00000002081) #22 H1f8 (ENSMAUG00000011359) #23 Plxnd1 (ENSMAUG00000021112) #24 ENSMAUG00000021669 Washc2 (ENSMAUG00000020725) ENSMAUG00000008109 ENSMAUG00000021879 Alox5 (ENSMAUG00000018983) Zfp422 (ENSMAUG00000020581) Depp1 (ENSMAUG00000020591) Rassf4 (ENSMAUG00000010012) Tmem72 (ENSMAUG00000013084) Cxcl12 (ENSMAUG00000018837) ENSMAUG00000009574 Zfp637 (ENSMAUG00000013704) Zfp239 (ENSMAUG00000007787) Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 144 Vgll4 (ENSCGRG00001001705) Tamm41 (ENSCGRG00001003506) #7 Syn2 (ENSCGRG00001007902) #8 Timp4 (ENSCGRG00001010158) #9 Pparg (ENSCGRG00001013849) #10 Tsen2 (ENSCGRG00001017681) #11 Mkrn2os (ENSCGRG00001018483) #12 ENSCGRG00001019373 #13 Raf1 (ENSCGRG00001020096) #14 Tmem40 (ENSCGRG00001022432) #15 Cand2 (ENSCGRG00001024197) #17 ENSCGRG00001000039 ##18 Efcab12 (ENSCGRG00001000767) #19 Mbd4 (ENSCGRG00001003507) #20 Ift122 (ENSCGRG00001012761) #21 Rho (ENSCGRG00001018161) #22 H1f8 (ENSCGRG00001024504) #23 Plxnd1 (ENSCGRG00001007901) #24 Tmcc1 (ENSCGRG00001016263) Washc2 (ENSCGRG00001019572) Zfand4 (ENSCGRG00001023303) Marchf8 (ENSCGRG00001003616) Alox5 (ENSCGRG00001010128) ENSCGRG00001008362 Or13a1 (ENSCGRG00001006479) ENSCGRG00001006315 Or6d14 (ENSCGRG00001014920) Or6d15 (ENSCGRG00001006290) Zfp422 (ENSCGRG00001008275) Rassf4 (ENSCGRG00001016965) Depp1 (ENSCGRG00001006038) Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00390000003282.B ENSGT00390000000616 #7 ENSGT00940000156062 #8 ENSGT00940000159798 #9 ENSGT00940000158273 #10 ENSGT00390000013266 #11 ENSGT00390000003839 #12 ENSGT00950000183077.a.b #13 ENSGT00940000156084 #14 ENSGT00390000017530 #15 ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000153973.c.a.a ##18 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00940000153997.b.a.a ENSGT00940000155716 ENSGT00940000158282 ENSGT00940000156111 ENSGT01060000248581.D.a.b.a.b ENSGT01090000260086.F.a.a.a.b ENSGT01090000260086.F.a.a.a.a ENSGT01090000260086.F.a.a.b ENSGT01100000263491.a.b.a.a.a.a.a.b.c.a ENSGT00940000160176 ENSGT00390000017909 ENSGT00390000006888 Prairie vole MODERN SPECIES 84 Syn2 (ENSMOCG00000000368) #8 Timp4 (ENSMOCG00000013297) #9 ENSMOCG00000013854 Pparg (ENSMOCG00000017202) #10 Tsen2 (ENSMOCG00000020824) #11 Mkrn2os (ENSMOCG00000010265) #12 Mkrn2 (ENSMOCG00000015472) #13 Raf1 (ENSMOCG00000012403) #14 Tmem40 (ENSMOCG00000021932) #15 Cand2 (ENSMOCG00000012580) #17 ENSMOCG00000015206 ##18 Efcab12 (ENSMOCG00000020496) #19 ENSMOCG00000019929 #20 ENSMOCG00000002466 #20 Ift122 (ENSMOCG00000014549) #21 Rho (ENSMOCG00000022070) #22 H1f8 (ENSMOCG00000005594) #23 Plxnd1 (ENSMOCG00000014026) #24 Tmcc1 (ENSMOCG00000009713) Washc2 (ENSMOCG00000018011) ENSMOCG00000018066 ENSMOCG00000002394 Alox5 (ENSMOCG00000006115) ENSMOCG00000013924 ENSMOCG00000022087 Zfp422 (ENSMOCG00000016875) Rassf4 (ENSMOCG00000019978) Depp1 (ENSMOCG00000013888) Tmem72 (ENSMOCG00000017328) Cxcl12 (ENSMOCG00000017332) Zfp637 (ENSMOCG00000007702) Northern American deer mouse MODERN SPECIES 16 Vgll4 (ENSPEMG00000026845) Tamm41 (ENSPEMG00000017033) #7 Syn2 (ENSPEMG00000016120) #8 Timp4 (ENSPEMG00000026166) #9 Pparg (ENSPEMG00000013545) #10 Tsen2 (ENSPEMG00000013175) #11 Mkrn2os (ENSPEMG00000012076) #12 Mkrn2 (ENSPEMG00000002776) #13 Raf1 (ENSPEMG00000012728) #14 Tmem40 (ENSPEMG00000002944) #15 ENSPEMG00000029699 ##17 ENSPEMG00000012965 ##18 Efcab12 (ENSPEMG00000012553) #19 Mbd4 (ENSPEMG00000006226) #20 Ift122 (ENSPEMG00000017389) #21 Rho (ENSPEMG00000008463) #22 H1f8 (ENSPEMG00000011381) #23 Plxnd1 (ENSPEMG00000008271) #24 ENSPEMG00000024601 Tmcc1 (ENSPEMG00000000449) Washc2 (ENSPEMG00000017284) Zfand4 (ENSPEMG00000008943) Marchf8 (ENSPEMG00000015311) Alox5 (ENSPEMG00000015300) Or13a1 (ENSPEMG00000024638) ENSPEMG00000016818 ENSPEMG00000007925 Or6d14 (ENSPEMG00000025761) Or6d15 (ENSPEMG00000024672) Zfp422 (ENSPEMG00000019194) Rassf4 (ENSPEMG00000006777) Murinae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000003282.B ENSGT00390000000616 #7 ENSGT00940000156062 #8 ENSGT00940000159798 #9 ENSGT00940000158273 #10 ENSGT00390000013266 #11 ENSGT00390000003839 #12 ENSGT00950000183077.a.b #13 ENSGT00940000156084 #14 ENSGT00390000017530 #15 ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000153973.c.a.a ##18 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00940000153997.b.a.a ENSGT00940000155716 ENSGT00940000158282 ENSGT00940000156111 ENSGT01060000248581.D.a.b.a.b ENSGT01090000260086.F.a.a.a.b ENSGT01090000260086.F.a.a.a.a ENSGT01090000260086.F.a.a.b ENSGT01100000263491.a.b.a.a.a.a.a.b.c.a ENSGT00940000160176 ENSGT00390000017909 ENSGT00390000006888 Mus ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000003282.B ENSGT00390000000616 #7 ENSGT00940000156062 #8 ENSGT00940000159798 #9 ENSGT00940000158273 #10 ENSGT00390000013266 #11 ENSGT00390000003839 #12 ENSGT00950000183077.a.b #13 ENSGT00940000156084 #14 ENSGT00390000017530 #15 ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000153973.c.a.a ##18 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00940000153997.b.a.a ENSGT00940000155716 ENSGT00940000158282 ENSGT00940000156111 ENSGT01060000248581.D.a.b.a.b ENSGT01090000260086.F.a.a.a.b ENSGT01090000260086.F.a.a.a.a ENSGT01090000260086.F.a.a.b ENSGT01100000263491.a.b.a.a.a.a.a.b.c.a ENSGT00940000160176 ENSGT00390000017909 ENSGT00390000006888 Mus_A ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000003282.B ENSGT00390000000616 #7 ENSGT00940000156062 #8 ENSGT00940000159798 #9 ENSGT00940000158273 #10 ENSGT00390000013266 #11 ENSGT00390000003839 #12 ENSGT00950000183077.a.b #13 ENSGT00940000156084 #14 ENSGT00390000017530 #15 ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000153973.c.a.a ##18 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00940000153997.b.a.a ENSGT00940000155716.g ENSGT00940000155716.h ENSGT00940000158282 ENSGT00940000156111 ENSGT01060000248581.D.a.b.a.b ENSGT01090000260086.F.a.a.a.b.o ENSGT01090000260086.F.a.a.a.b.p ENSGT01090000260086.F.a.a.a.a ENSGT01090000260086.F.a.a.b ENSGT01100000263491.a.b.a.a.a.a.a.b.c.a ENSGT00940000160176 Mus_B ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000000616 #7 ENSGT00940000156062 #8 ENSGT00940000159798 #9 ENSGT00940000158273 #10 ENSGT00390000013266 #11 ENSGT00390000003839 #12 ENSGT00950000183077.a.b #13 ENSGT00940000156084 #14 ENSGT00390000017530 #15 ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000153973.c.a.a ##18 ENSGT00940000153973.c.a.b.b ##18 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00940000153997.b.a.a ENSGT00940000155716.g ENSGT00940000155716.h ENSGT00940000158282 ENSGT00940000156111 ENSGT01060000248581.D.a.b.a.b ENSGT01090000260086.F.a.a.a.b.o ENSGT01090000260086.F.a.a.a.b.p ENSGT01090000260086.F.a.a.a.a ENSGT01090000260086.F.a.a.b ENSGT01100000263491.a.b.a.a.a.a.a.b.c.a ENSGT00940000160176 Mus_C ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00390000003282.B ENSGT00390000000616 #7 ENSGT00940000156062 #8 ENSGT00940000159798 #9 ENSGT00940000158273 #10 ENSGT00390000013266 #11 ENSGT00390000003839 #12 ENSGT00950000183077.a.b #13 ENSGT00940000156084 #14 ENSGT00390000017530 #15 ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000153973.c.a.a ##18 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00940000153997.b.a.a ENSGT00940000155716.g ENSGT00940000155716.h ENSGT00940000158282 ENSGT00940000156111 ENSGT01060000248581.D.a.b.a.b ENSGT01090000260086.F.a.a.a.b.o ENSGT01090000260086.F.a.a.a.b.p ENSGT01090000260086.F.a.a.a.a ENSGT01090000260086.F.a.a.b ENSGT01100000263491.a.b.a.a.a.a.a.b.c.a ENSGT00940000160176 spretus MODERN SPECIES 15 Tamm41 (MGP_SPRETEiJ_G0029775) #7 Syn2 (MGP_SPRETEiJ_G0029776) #8 MGP_SPRETEiJ_G0029777 Timp4 (MGP_SPRETEiJ_G0029778) #9 Pparg (MGP_SPRETEiJ_G0029779) #10 Tsen2 (MGP_SPRETEiJ_G0029780) #11 Mkrn2os (MGP_SPRETEiJ_G0029781) #12 Mkrn2 (MGP_SPRETEiJ_G0029782) #13 Raf1 (MGP_SPRETEiJ_G0029783) #14 Tmem40 (MGP_SPRETEiJ_G0029784) #15 Cand2 (MGP_SPRETEiJ_G0029785) #17 MGP_SPRETEiJ_G0029786 ##18 Efcab12 (MGP_SPRETEiJ_G0029787) #19 Mbd4 (MGP_SPRETEiJ_G0029788) #20 Ift122 (MGP_SPRETEiJ_G0029789) #21 Rho (MGP_SPRETEiJ_G0029790) #22 H1f8 (MGP_SPRETEiJ_G0029791) #23 Plxnd1 (MGP_SPRETEiJ_G0029792) #24 MGP_SPRETEiJ_G0029793 Washc2 (MGP_SPRETEiJ_G0029794) Zfand4 (MGP_SPRETEiJ_G0029795) MGP_SPRETEiJ_G0029796 Marchf8 (MGP_SPRETEiJ_G0029797) Alox5 (MGP_SPRETEiJ_G0029798) Or13a1 (MGP_SPRETEiJ_G0029799) MGP_SPRETEiJ_G0029800 Or6d13 (MGP_SPRETEiJ_G0029801) Or6d14 (MGP_SPRETEiJ_G0029802) Or6d15 (MGP_SPRETEiJ_G0029803) Zfp422 (MGP_SPRETEiJ_G0029804) Rassf4 (MGP_SPRETEiJ_G0029805) Steppe mouse MODERN SPECIES 3022 ENSMSIG00000031931 #7 Syn2 (ENSMSIG00000031932) #8 ENSMSIG00000031933 Timp4 (ENSMSIG00000031934) #9 Pparg (ENSMSIG00000031935) #10 Tsen2 (ENSMSIG00000031936) #11 Mkrn2os (ENSMSIG00000031937) #12 ENSMSIG00000031938 #13 Raf1 (ENSMSIG00000000188) #14 Tmem40 (ENSMSIG00000000359) #15 Cand2 (ENSMSIG00000000651) #17 Rpl32 (ENSMSIG00000000692) ##18 Efcab12 (ENSMSIG00000000741) #19 Mbd4 (ENSMSIG00000000793) #20 Ift122 (ENSMSIG00000000881) #21 Rho (ENSMSIG00000001309) #22 ENSMSIG00000001359 H1f8 (ENSMSIG00000001367) #23 ENSMSIG00000001422 #24 Tmcc1 (ENSMSIG00000001659) ENSMSIG00000001776 Washc2 (ENSMSIG00000001796) Zfand4 (ENSMSIG00000001904) Marchf8 (ENSMSIG00000002032) Alox5 (ENSMSIG00000002190) Or13a1 (ENSMSIG00000002481) Or6d12 (ENSMSIG00000002492) Or6d14 (ENSMSIG00000002505) Mouse MODERN SPECIES 15 Vgll4 (ENSMUSG00000030315) Tamm41 (ENSMUSG00000030316) #7 Syn2 (ENSMUSG00000009394) #8 Timp4 (ENSMUSG00000030317) #9 Pparg (ENSMUSG00000000440) #10 Tsen2 (ENSMUSG00000042389) #11 Mkrn2os (ENSMUSG00000068011) #12 Mkrn2 (ENSMUSG00000000439) #13 Raf1 (ENSMUSG00000000441) #14 Tmem40 (ENSMUSG00000059900) #15 Cand2 (ENSMUSG00000030319) #17 Rpl32 (ENSMUSG00000057841) ##18 Efcab12 (ENSMUSG00000030321) #19 Mbd4 (ENSMUSG00000030322) #20 Ift122 (ENSMUSG00000030323) #21 Rho (ENSMUSG00000030324) #22 H1f8 (ENSMUSG00000042279) #23 Plxnd1 (ENSMUSG00000030123) #24 Tmcc1 (ENSMUSG00000030126) Washc2 (ENSMUSG00000024104) Zfand4 (ENSMUSG00000042213) Marchf8 (ENSMUSG00000025702) Alox5 (ENSMUSG00000025701) Or13a1 (ENSMUSG00000053391) Or6d12 (ENSMUSG00000053251) Or6d13 (ENSMUSG00000081649) Eif4a3l2 (ENSMUSG00000107906) Or6d14 (ENSMUSG00000051046) Or6d15 (ENSMUSG00000050654) Zfp422 (ENSMUSG00000059878) Rassf4 (ENSMUSG00000042129) Ryukyu mouse MODERN SPECIES 15 Tamm41 (MGP_CAROLIEiJ_G0028747) #7 Syn2 (MGP_CAROLIEiJ_G0028748) #8 MGP_CAROLIEiJ_G0028749 Timp4 (MGP_CAROLIEiJ_G0028750) #9 Pparg (MGP_CAROLIEiJ_G0028751) #10 Tsen2 (MGP_CAROLIEiJ_G0028752) #11 Mkrn2os (MGP_CAROLIEiJ_G0028753) #12 Mkrn2 (MGP_CAROLIEiJ_G0028754) #13 Raf1 (MGP_CAROLIEiJ_G0028755) #14 MGP_CAROLIEiJ_G0028756 #15 Cand2 (MGP_CAROLIEiJ_G0028757) #17 MGP_CAROLIEiJ_G0028758 ##18 Efcab12 (MGP_CAROLIEiJ_G0028759) #19 Mbd4 (MGP_CAROLIEiJ_G0028760) #20 Ift122 (MGP_CAROLIEiJ_G0028761) #21 Rho (MGP_CAROLIEiJ_G0028762) #22 H1f8 (MGP_CAROLIEiJ_G0028763) #23 Plxnd1 (MGP_CAROLIEiJ_G0028764) #24 Tmcc1 (MGP_CAROLIEiJ_G0028765) Washc2 (MGP_CAROLIEiJ_G0028766) Zfand4 (MGP_CAROLIEiJ_G0028767) MGP_CAROLIEiJ_G0028768 Marchf8 (MGP_CAROLIEiJ_G0028769) Alox5 (MGP_CAROLIEiJ_G0028770) Or13a1 (MGP_CAROLIEiJ_G0028771) MGP_CAROLIEiJ_G0028772 Or6d13 (MGP_CAROLIEiJ_G0028773) Or6d14 (MGP_CAROLIEiJ_G0028774) Or6d15 (MGP_CAROLIEiJ_G0028775) Zfp422 (MGP_CAROLIEiJ_G0028776) Rassf4 (MGP_CAROLIEiJ_G0028777) Shrew mouse MODERN SPECIES 11 Tamm41 (MGP_PahariEiJ_G0022498) #7 Syn2 (MGP_PahariEiJ_G0022499) #8 MGP_PahariEiJ_G0022500 Timp4 (MGP_PahariEiJ_G0022501) #9 Pparg (MGP_PahariEiJ_G0022502) #10 Tsen2 (MGP_PahariEiJ_G0022503) #11 Mkrn2os (MGP_PahariEiJ_G0022504) #12 Mkrn2 (MGP_PahariEiJ_G0022505) #13 Raf1 (MGP_PahariEiJ_G0022506) #14 Tmem40 (MGP_PahariEiJ_G0022507) #15 Cand2 (MGP_PahariEiJ_G0022508) #17 MGP_PahariEiJ_G0022509 ##18 Efcab12 (MGP_PahariEiJ_G0022510) #19 MGP_PahariEiJ_G0022511 #20 Ift122 (MGP_PahariEiJ_G0022512) #21 Rho (MGP_PahariEiJ_G0022513) #22 H1f8 (MGP_PahariEiJ_G0022514) #23 Plxnd1 (MGP_PahariEiJ_G0022515) #24 Tmcc1 (MGP_PahariEiJ_G0022516) Washc2 (MGP_PahariEiJ_G0022517) MGP_PahariEiJ_G0022518 MGP_PahariEiJ_G0022519 Marchf8 (MGP_PahariEiJ_G0022520) Alox5 (MGP_PahariEiJ_G0022521) Or13a1 (MGP_PahariEiJ_G0022522) MGP_PahariEiJ_G0022523 MGP_PahariEiJ_G0022524 Or6d14 (MGP_PahariEiJ_G0022525) Or6d15 (MGP_PahariEiJ_G0022526) Zfp422 (MGP_PahariEiJ_G0022527) Rassf4 (MGP_PahariEiJ_G0022528) Rat MODERN SPECIES 14 ENSRNOG00000067395 AC128901.1 (ENSRNOG00000028826) ENSRNOG00000069227 Timp4 (ENSRNOG00000007955) #9 Pparg (ENSRNOG00000008839) #10 Tsen2 (ENSRNOG00000060175) #11 Mkrn2os (ENSRNOG00000070957) #12 Mkrn2 (ENSRNOG00000009176) #13 Raf1 (ENSRNOG00000010153) #14 Tmem40 (ENSRNOG00000010430) #15 Cand2 (ENSRNOG00000010473) #17 Rpl32 (ENSRNOG00000010746) ##18 Efcab12 (ENSRNOG00000026176) #19 Mbd4 (ENSRNOG00000010919) #20 Ift122 (ENSRNOG00000010952) #21 Rho (ENSRNOG00000011144) #22 H1f8 (ENSRNOG00000025251) #23 Plxnd1 (ENSRNOG00000025209) #24 AABR07061825.2 (ENSRNOG00000059964) Tmcc1 (ENSRNOG00000011614) LOC680385 (ENSRNOG00000011606) Washc2c (ENSRNOG00000011653) Zfand4 (ENSRNOG00000011791) ENSRNOG00000066609 Marchf8 (ENSRNOG00000012297) LOC680441 (ENSRNOG00000033439) ENSRNOG00000064887 Alox5 (ENSRNOG00000012972) Or13a1 (ENSRNOG00000068733) Or6d12 (ENSRNOG00000070535) Or6d13b (ENSRNOG00000064203) Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 1707 Vgll4 (ENSNGAG00000013946) Tamm41 (ENSNGAG00000013592) #7 Syn2 (ENSNGAG00000022266) #8 Timp4 (ENSNGAG00000021746) #9 Pparg (ENSNGAG00000014683) #10 ENSNGAG00000013561 #11 Mkrn2os (ENSNGAG00000019573) #12 Mkrn2 (ENSNGAG00000012579) #13 Raf1 (ENSNGAG00000019548) #14 Tmem40 (ENSNGAG00000021850) #15 Cand2 (ENSNGAG00000024002) #17 ENSNGAG00000024001 ##18 Efcab12 (ENSNGAG00000008314) #19 ENSNGAG00000017381 #20 Ift122 (ENSNGAG00000022462) #21 Rho (ENSNGAG00000020656) #22 H1f8 (ENSNGAG00000023630) #23 Plxnd1 (ENSNGAG00000020476) #24 Tmcc1 (ENSNGAG00000010573) Trh (ENSNGAG00000022332) Rbsn (ENSNGAG00000022967) Mrps25 (ENSNGAG00000021861) Nr2c2 (ENSNGAG00000022501) Fgd5 (ENSNGAG00000024178) Ccdc174 (ENSNGAG00000011049) Grip2 (ENSNGAG00000011926) Slc6a6 (ENSNGAG00000022156) ENSNGAG00000022450 Xpc (ENSNGAG00000022710) Tmem43 (ENSNGAG00000000844) Chchd4 (ENSNGAG00000010995) Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 45 Tamm41 (ENSJJAG00000015841) #7 Timp4 (ENSJJAG00000015654) #9 ENSJJAG00000015072 #8 ENSJJAG00000012036 Pparg (ENSJJAG00000023734) #10 ENSJJAG00000002861 #11 ENSJJAG00000015646 Mkrn2os (ENSJJAG00000022652) #12 Mkrn2 (ENSJJAG00000019765) #13 ENSJJAG00000016961 #14 Tmem40 (ENSJJAG00000009444) #15 Cand2 (ENSJJAG00000018247) #17 ENSJJAG00000021233 ##18 ENSJJAG00000016695 #20 Ift122 (ENSJJAG00000020288) #21 Rho (ENSJJAG00000022285) #22 ENSJJAG00000014828 #23 Plxnd1 (ENSJJAG00000014069) #24 ENSJJAG00000020659 Tmcc1 (ENSJJAG00000019999) ENSJJAG00000023012 Rbsn (ENSJJAG00000024360) Mrps25 (ENSJJAG00000013413) Nr2c2 (ENSJJAG00000016580) Fgd5 (ENSJJAG00000001082) 4930590J08Rik (ENSJJAG00000010892) Ccdc174 (ENSJJAG00000014232) Kcnn2 (ENSJJAG00000014162) Trim36 (ENSJJAG00000016437) Pggt1b (ENSJJAG00000022637) Ccdc112 (ENSJJAG00000018302) Kangaroo rat MODERN SPECIES 331 Atg7 (ENSDORG00000004380) Vgll4 (ENSDORG00000004378) Tamm41 (ENSDORG00000002091) #7 Timp4 (ENSDORG00000009509) #9 ENSDORG00000009507 #8 Pparg (ENSDORG00000003445) #10 Tsen2 (ENSDORG00000003395) #11 Mkrn2os (ENSDORG00000028573) #12 Mkrn2 (ENSDORG00000015621) #13 Raf1 (ENSDORG00000015622) #14 ENSDORG00000023579 #15 Cand2 (ENSDORG00000008424) #17 Rpl32 (ENSDORG00000008426) ##18 ENSDORG00000000902 #20 Ift122 (ENSDORG00000000906) #21 Rho (ENSDORG00000000911) #22 ENSDORG00000026967 #23 Plxnd1 (ENSDORG00000000912) #24 Tmcc1 (ENSDORG00000026595) Rbsn (ENSDORG00000009815) Mrps25 (ENSDORG00000026838) Nr2c2 (ENSDORG00000007038) Fgd5 (ENSDORG00000016297) 4930590J08Rik (ENSDORG00000007329) Ccdc174 (ENSDORG00000007328) Grip2 (ENSDORG00000014464) Slc6a6 (ENSDORG00000011320) ENSDORG00000006894 Xpc (ENSDORG00000002105) Tmem43 (ENSDORG00000002103) ENSDORG00000025656 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00390000003282.B ENSGT00390000000616 #7 ENSGT00940000159798 #9 ENSGT00940000156062 #8 ENSGT00940000158273 #10 ENSGT00390000013266 #11 ENSGT00390000003839 #12 ENSGT00950000183077.a.b #13 ENSGT00940000156084 #14 ENSGT00390000017530 #15 ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000153973.c.a.a ##18 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000154583 ENSGT00390000013951 ENSGT00390000005194 ENSGT00390000009671 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES 48 ENSGT00390000003839 #12 ENSGT00950000183077.a.b #13 ENSGT00940000156084 #14 ENSGT00390000017530 #15 ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000153973.c.a.a ##18 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00390000016951 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000154583 ENSGT00390000013951 ENSGT00390000005194 ENSGT00390000009671 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 27 ENSHGLG00000032284 ENSHGLG00000045316 ENSHGLG00000017856 #12 ENSHGLG00000018194 #13 ENSHGLG00000018214 #14 ENSHGLG00000037560 ENSHGLG00000032617 ENSHGLG00000039038 ENSHGLG00000033042 ENSHGLG00000015498 #15 ENSHGLG00000015580 #17 ENSHGLG00000040769 ##18 ENSHGLG00000015777 #19 MBD4 (ENSHGLG00000009034) #20 IFT122 (ENSHGLG00000009113) #21 RHO (ENSHGLG00000006668) #22 ENSHGLG00000040416 #23 ENSHGLG00000040044 ENSHGLG00000000240 ENSHGLG00000000266 KBTBD12 (ENSHGLG00000000289) ENSHGLG00000033458 ENSHGLG00000007193 ENSHGLG00000049201 ENSHGLG00000007514 MRPS25 (ENSHGLG00000037247) NR2C2 (ENSHGLG00000038117) ENSHGLG00000032475 ENSHGLG00000037703 ENSHGLG00000048268 SLC6A6 (ENSHGLG00000000641) Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000158155 ENSGT00390000003219 ENSGT00940000158804 ENSGT00390000006066 ENSGT00390000005378 ENSGT00940000157200 ENSGT00940000157312.h ENSGT00390000003839 #12 ENSGT00950000183077.a.b #13 ENSGT00940000156084 #14 ENSGT00390000017530 #15 ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000153973.c.a.a ##18 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000154583 ENSGT00390000013951 ENSGT00390000005194 ENSGT00390000009671 ENSGT00390000013132 ENSGT00940000159178 Guinea pig MODERN SPECIES 109 ENKUR (ENSCPOG00000009590) ARHGAP21 (ENSCPOG00000004505) ENSCPOG00000031884 ENSCPOG00000005850 ITFG2 (ENSCPOG00000021230) FKBP4 (ENSCPOG00000002453) ENSCPOG00000009944 MKRN2OS (ENSCPOG00000032819) #12 MKRN2 (ENSCPOG00000001208) #13 RAF1 (ENSCPOG00000001210) #14 TMEM40 (ENSCPOG00000025632) #15 CAND2 (ENSCPOG00000023286) #17 RPL32 (ENSCPOG00000019967) #18 ENSCPOG00000004970 #20 IFT122 (ENSCPOG00000004975) #21 RHO (ENSCPOG00000004984) #22 PLXND1 (ENSCPOG00000004989) #24 TMCC1 (ENSCPOG00000009299) RBSN (ENSCPOG00000003200) MRPS25 (ENSCPOG00000020398) NR2C2 (ENSCPOG00000001512) FGD5 (ENSCPOG00000013157) C3orf20 (ENSCPOG00000006783) CCDC174 (ENSCPOG00000039402) GRIP2 (ENSCPOG00000021047) SLC6A6 (ENSCPOG00000014967) LSM3 (ENSCPOG00000034071) XPC (ENSCPOG00000006655) TMEM43 (ENSCPOG00000024656) CHCHD4 (ENSCPOG00000034611) TXNRD3 (ENSCPOG00000007296) Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000158155 ENSGT00390000003219 ENSGT00940000158804 ENSGT00390000006066 ENSGT00390000005378 ENSGT00940000157200 ENSGT00940000157312.h ENSGT00390000003839 #12 ENSGT00950000183077.a.b #13 ENSGT00940000156084 #14 ENSGT00390000017530 #15 ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000153973.c.a.a ##18 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000154583 ENSGT00390000013951 ENSGT00390000005194 ENSGT00390000009671 ENSGT00390000013132 ENSGT00940000159178 Degu MODERN SPECIES 274 TAMM41 (ENSODEG00000002076) #7 ENSODEG00000018794 ENSODEG00000002124 ATG7 (ENSODEG00000002299) SLC6A1 (ENSODEG00000002644) SLC6A11 (ENSODEG00000002665) ENSODEG00000002676 MKRN2OS (ENSODEG00000002688) #12 MKRN2 (ENSODEG00000002702) #13 RAF1 (ENSODEG00000002734) #14 TMEM40 (ENSODEG00000002755) #15 CAND2 (ENSODEG00000002821) #17 ENSODEG00000002891 ##18 ENSODEG00000002902 #20 IFT122 (ENSODEG00000003013) #21 RHO (ENSODEG00000003304) #22 PLXND1 (ENSODEG00000003347) #24 TMCC1 (ENSODEG00000001710) ENSODEG00000001772 ENSODEG00000001849 ENSODEG00000001861 NR2C2 (ENSODEG00000001892) MRPS25 (ENSODEG00000001966) RBSN (ENSODEG00000001991) ENSODEG00000002030 Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 136 TULP3 (ENSCLAG00000017345) RHNO1 (ENSCLAG00000017326) FOXM1 (ENSCLAG00000014183) TEX52 (ENSCLAG00000013429) ITFG2 (ENSCLAG00000016639) FKBP4 (ENSCLAG00000013510) ENSCLAG00000011764 MKRN2OS (ENSCLAG00000009109) #12 MKRN2 (ENSCLAG00000008755) #13 RAF1 (ENSCLAG00000010316) #14 TMEM40 (ENSCLAG00000009668) #15 CAND2 (ENSCLAG00000007541) #17 ENSCLAG00000007426 ##18 MBD4 (ENSCLAG00000008974) #20 IFT122 (ENSCLAG00000006170) #21 RHO (ENSCLAG00000006233) #22 PLXND1 (ENSCLAG00000012627) #24 TMCC1 (ENSCLAG00000014727) RBSN (ENSCLAG00000011613) MRPS25 (ENSCLAG00000008381) NR2C2 (ENSCLAG00000011082) FGD5 (ENSCLAG00000011953) C3orf20 (ENSCLAG00000013841) CCDC174 (ENSCLAG00000011014) GRIP2 (ENSCLAG00000013538) SLC6A6 (ENSCLAG00000010187) LSM3 (ENSCLAG00000015997) XPC (ENSCLAG00000013400) TMEM43 (ENSCLAG00000014810) CHCHD4 (ENSCLAG00000015153) TXNRD3 (ENSCLAG00000010439) Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 41 ENSGT00390000003282.B ENSGT00390000000616 #7 ENSGT00940000156062 #8 ENSGT00940000159798 #9 ENSGT00940000158273 #10 ENSGT00390000013266 #11 ENSGT00390000003839 #12 ENSGT00950000183077.a.b #13 ENSGT00940000156084 #14 ENSGT00390000017530 #15 ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000153973.c.a.a ##18 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000154583 ENSGT00390000013951 ENSGT00390000005194 ENSGT00390000009671 Marmotini ANCESTRAL SPECIES 49 ENSGT00390000003282.B ENSGT00390000000616 #7 ENSGT00940000156062 #8 ENSGT00940000159798 #9 ENSGT00940000158273 #10 ENSGT00390000013266 #11 ENSGT00390000003839 #12 ENSGT00950000183077.a.b #13 ENSGT00940000156084 #14 ENSGT00390000017530 #15 ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000153973.c.a.a ##18 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000154583 ENSGT00390000013951 ENSGT00390000005194 ENSGT00390000009671 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 62 ENSGT00390000003282.B ENSGT00390000000616 #7 ENSGT00940000156062 #8 ENSGT00940000159798 #9 ENSGT00940000158273 #10 ENSGT00390000013266 #11 ENSGT00390000003839 #12 ENSGT00950000183077.a.b #13 ENSGT00940000156084 #14 ENSGT00390000017530 #15 ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000153973.c.a.a ##18 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000154583 ENSGT00390000013951 ENSGT00390000005194 ENSGT00390000009671 Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 23 ENSUPAG00010023027 #7 SYN2 (ENSUPAG00010023028) #8 TIMP4 (ENSUPAG00010023029) #9 PPARG (ENSUPAG00010023031) #10 TSEN2 (ENSUPAG00010023034) #11 MKRN2OS (ENSUPAG00010023035) #12 MKRN2 (ENSUPAG00010023036) #13 RAF1 (ENSUPAG00010023038) #14 TMEM40 (ENSUPAG00010023040) #15 CAND2 (ENSUPAG00010023044) #17 ENSUPAG00010023046 ##18 EFCAB12 (ENSUPAG00010023049) #19 ENSUPAG00010023052 #20 ENSUPAG00010023053 #20 IFT122 (ENSUPAG00010023058) #21 RHO (ENSUPAG00010023066) #22 H1-8 (ENSUPAG00010023069) #23 PLXND1 (ENSUPAG00010000023) #24 TMCC1 (ENSUPAG00010000491) TRH (ENSUPAG00010000545) RBSN (ENSUPAG00010000555) MRPS25 (ENSUPAG00010000567) NR2C2 (ENSUPAG00010000576) FGD5 (ENSUPAG00010000616) C3orf20 (ENSUPAG00010000647) CCDC174 (ENSUPAG00010000716) GRIP2 (ENSUPAG00010000760) SLC6A6 (ENSUPAG00010000886) LSM3 (ENSUPAG00010000896) XPC (ENSUPAG00010000908) TMEM43 (ENSUPAG00010000942) Squirrel MODERN SPECIES 202 HRH1 (ENSSTOG00000015286) ATG7 (ENSSTOG00000015288) VGLL4 (ENSSTOG00000025247) ENSSTOG00000028589 TIMP4 (ENSSTOG00000034531) #9 SYN2 (ENSSTOG00000011519) #8 PPARG (ENSSTOG00000012778) #10 TSEN2 (ENSSTOG00000000538) #11 MKRN2OS (ENSSTOG00000031428) #12 MKRN2 (ENSSTOG00000010520) #13 RAF1 (ENSSTOG00000025146) #14 CAND2 (ENSSTOG00000023136) #17 ENSSTOG00000026505 ##18 MBD4 (ENSSTOG00000020663) #20 IFT122 (ENSSTOG00000004353) #21 RHO (ENSSTOG00000028352) #22 PLXND1 (ENSSTOG00000024621) #24 TMCC1 (ENSSTOG00000019869) TRH (ENSSTOG00000026247) RBSN (ENSSTOG00000022986) MRPS25 (ENSSTOG00000030962) NR2C2 (ENSSTOG00000005250) FGD5 (ENSSTOG00000005202) C3orf20 (ENSSTOG00000002907) CCDC174 (ENSSTOG00000027414) GRIP2 (ENSSTOG00000000954) ENSSTOG00000023459 LSM3 (ENSSTOG00000006842) XPC (ENSSTOG00000033914) TMEM43 (ENSSTOG00000029232) CHCHD4 (ENSSTOG00000006836) Alpin marmot MODERN SPECIES 40 TAMM41 (ENSMMMG00000010322) #7 SYN2 (ENSMMMG00000010440) #8 ENSMMMG00000010687 #9 PPARG (ENSMMMG00000010840) #10 ENSMMMG00000010899 #11 ENSMMMG00000010907 #11 MKRN2OS (ENSMMMG00000010915) #12 MKRN2 (ENSMMMG00000010927) #13 ENSMMMG00000010950 RAF1 (ENSMMMG00000010957) #14 ENSMMMG00000010993 #17 ENSMMMG00000010997 ##18 EFCAB12 (ENSMMMG00000011023) #19 MBD4 (ENSMMMG00000011043) #20 IFT122 (ENSMMMG00000011068) #21 RHO (ENSMMMG00000011272) #22 ENSMMMG00000011299 #23 ENSMMMG00000011319 #24 TMCC1 (ENSMMMG00000011365) TRH (ENSMMMG00000011424) RBSN (ENSMMMG00000011435) MRPS25 (ENSMMMG00000011452) NR2C2 (ENSMMMG00000011464) FGD5 (ENSMMMG00000011473) C3orf20 (ENSMMMG00000011543) CCDC174 (ENSMMMG00000011603) GRIP2 (ENSMMMG00000011620) SLC6A6 (ENSMMMG00000011651) LSM3 (ENSMMMG00000011665) XPC (ENSMMMG00000011669) TMEM43 (ENSMMMG00000011785) Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 10 ENSSVLG00005021494 TAMM41 (ENSSVLG00005021448) #7 TIMP4 (ENSSVLG00005021374) #9 SYN2 (ENSSVLG00005021130) #8 PPARG (ENSSVLG00005020780) #10 TSEN2 (ENSSVLG00005020543) #11 MKRN2OS (ENSSVLG00005020454) #12 MKRN2 (ENSSVLG00005020340) #13 ENSSVLG00005019978 #14 TMEM40 (ENSSVLG00005019760) #15 CAND2 (ENSSVLG00005019570) #17 ENSSVLG00005019450 ##18 EFCAB12 (ENSSVLG00005019404) #19 MBD4 (ENSSVLG00005019308) #20 IFT122 (ENSSVLG00005018941) #21 RHO (ENSSVLG00005018827) #22 ENSSVLG00005018771 #23 PLXND1 (ENSSVLG00005018384) #24 TMCC1 (ENSSVLG00005018250) ENSSVLG00005018231 TRH (ENSSVLG00005018181) RBSN (ENSSVLG00005018031) MRPS25 (ENSSVLG00005017966) NR2C2 (ENSSVLG00005017625) FGD5 (ENSSVLG00005017167) C3orf20 (ENSSVLG00005020807) CCDC174 (ENSSVLG00005020744) GRIP2 (ENSSVLG00005020528) SLC6A6 (ENSSVLG00005020466) LSM3 (ENSSVLG00005020441) XPC (ENSSVLG00005020171) Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000000616 #7 ENSGT00940000159798 #9 ENSGT00940000156062 #8 ENSGT00940000158273 #10 ENSGT00390000013266 #11 ENSGT00390000003839 #12 ENSGT01030000235208 ENSGT00950000183077.a.b #13 ENSGT00940000156084 #14 ENSGT00390000017530 #15 ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000153973.c.a.b.b ##18 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000175447 ENSGT00930000152979 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000154583 ENSGT00390000013951 Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 Hedgehog MODERN SPECIES 12773 RHO (ENSEEUG00000008285) #22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000000616 #7 ENSGT00940000159798 #9 ENSGT00940000156062 #8 ENSGT00940000158273 #10 ENSGT00390000013266 #11 ENSGT00390000003839 #12 ENSGT01030000235208 ENSGT00950000183077.a.b #13 ENSGT00940000156084 #14 ENSGT00390000017530 #15 ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000153973.c.a.b.b ##18 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT00930000152979 ENSGT00940000175447 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000154583 ENSGT00390000013951 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000159798 #9 ENSGT00940000156062 #8 ENSGT00940000158273 #10 ENSGT00390000013266 #11 ENSGT00390000003839 #12 ENSGT00950000183077.a.b #13 ENSGT00940000156084 #14 ENSGT00390000017530 #15 ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000153973.d ##18 ENSGT00940000153973.c.a.b.b ##18 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT01010000229800 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT00930000152979 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000154583 ENSGT00390000013951 ENSGT00390000005194 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00390000000616 #7 ENSGT00940000159798 #9 ENSGT00940000156062 #8 ENSGT00940000158273 #10 ENSGT00390000013266 #11 ENSGT00390000003839 #12 ENSGT00950000183077.a.b #13 ENSGT00940000156084 #14 ENSGT00390000017530 #15 ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000153973.d ##18 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT01010000229800 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT00940000175447 ENSGT00930000152979 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000154583 ENSGT00390000013951 Camelidae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000003282.B ENSGT00390000000616 #7 ENSGT00940000156062 #8 ENSGT00940000159798 #9 ENSGT00940000158273 #10 ENSGT00390000013266 #11 ENSGT00390000003839 #12 ENSGT00950000183077.a.b #13 ENSGT00940000156084 #14 ENSGT00390000017530 #15 ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000153973.c.b ##18 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000175447 ENSGT00930000152979 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000154583 ENSGT00390000013951 ENSGT00390000005194 Arabian camel MODERN SPECIES 8 VGLL4 (ENSCDRG00005016647) TAMM41 (ENSCDRG00005016988) #7 SYN2 (ENSCDRG00005017059) #8 TIMP4 (ENSCDRG00005017087) #9 PPARG (ENSCDRG00005017141) #10 TSEN2 (ENSCDRG00005017293) #11 MKRN2OS (ENSCDRG00005017382) #12 MKRN2 (ENSCDRG00005017406) #13 RAF1 (ENSCDRG00005017576) #14 TMEM40 (ENSCDRG00005017673) #15 CAND2 (ENSCDRG00005017872) #17 ENSCDRG00005018038 ##18 EFCAB12 (ENSCDRG00005018119) #19 MBD4 (ENSCDRG00005018206) #20 IFT122 (ENSCDRG00005018267) #21 RHO (ENSCDRG00005018442) #22 ENSCDRG00005018477 ENSCDRG00005018504 ENSCDRG00005018533 #24 PLXND1 (ENSCDRG00005018551) #24 TMCC1 (ENSCDRG00005018594) TRH (ENSCDRG00005003364) RBSN (ENSCDRG00005003390) MRPS25 (ENSCDRG00005003419) NR2C2 (ENSCDRG00005003539) FGD5 (ENSCDRG00005003759) C3orf20 (ENSCDRG00005003918) CCDC174 (ENSCDRG00005003993) ENSCDRG00005004055 GRIP2 (ENSCDRG00005004071) SLC6A6 (ENSCDRG00005004206) Alpaca MODERN SPECIES 2237 RHO (ENSVPAG00000003334) #22 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00390000000616 #7 ENSGT00940000159798 #9 ENSGT00940000156062 #8 ENSGT00940000158273 #10 ENSGT00390000013266 #11 ENSGT00390000003839 #12 ENSGT00950000183077.a.b #13 ENSGT00940000156084 #14 ENSGT00390000017530 #15 ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000153973.d ##18 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT01010000229800 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT00930000152979 ENSGT00940000175447 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000154583 ENSGT00390000013951 Pecora ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00390000003282.B ENSGT00390000000616 #7 ENSGT00940000159798 #9 ENSGT00940000156062 #8 ENSGT00940000158273 #10 ENSGT00390000013266 #11 ENSGT00390000003839 #12 ENSGT00950000183077.a.b #13 ENSGT00940000156084 #14 ENSGT00390000017530 #15 ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000153973.d ##18 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000154583 ENSGT00390000013951 ENSGT00390000005194 ENSGT00390000009671 Percora_a ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00390000003282.B ENSGT00390000000616 #7 ENSGT00940000159798 #9 ENSGT00940000156062 #8 ENSGT00940000158273 #10 ENSGT00390000013266 #11 ENSGT00390000003839 #12 ENSGT00950000183077.a.b #13 ENSGT00940000156084 #14 ENSGT00390000017530 #15 ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000153973.d ##18 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000154583 ENSGT00390000013951 ENSGT00390000005194 ENSGT00390000009671 Bovidae ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00390000007159 ENSGT00390000000616.l #7 ENSGT00940000159798 #9 ENSGT00940000156062 #8 ENSGT00940000158273 #10 ENSGT00390000013266 #11 ENSGT00390000003839 #12 ENSGT00950000183077.a.b #13 ENSGT00940000156084 #14 ENSGT00390000017530 #15 ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000153973.d ##18 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000000616.k #7 ENSGT00390000003282.B ENSGT00390000017509 ENSGT00940000160690 ENSGT00940000156027 ENSGT00940000157569 ENSGT00940000161461 ENSGT00910000147252 ENSGT00940000153393.B ENSGT00390000004064 ENSGT00940000155616.c.a.b Caprinae ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000007159 ENSGT00390000000616.l #7 ENSGT00940000159798 #9 ENSGT00940000156062 #8 ENSGT00940000158273 #10 ENSGT00390000013266 #11 ENSGT00390000003839 #12 ENSGT00950000183077.a.b #13 ENSGT00940000156084 #14 ENSGT00390000017530 #15 ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000153973.d ##18 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000000616.k #7 ENSGT00390000003282.B ENSGT00390000017509 ENSGT00940000160690 ENSGT00940000156027 ENSGT00940000157569 ENSGT00940000161461 ENSGT00910000147252 ENSGT00940000153393.B.bb ENSGT00390000004064 ENSGT00940000155616.c.a.b Goat MODERN SPECIES 14 MRPS25 (ENSCHIG00000009931) RBSN (ENSCHIG00000019361) ENSCHIG00000027078 #7 TIMP4 (ENSCHIG00000017995) #9 SYN2 (ENSCHIG00000024912) #8 PPARG (ENSCHIG00000015877) #10 TSEN2 (ENSCHIG00000013772) #11 MKRN2OS (ENSCHIG00000013445) #12 MKRN2 (ENSCHIG00000021098) #13 RAF1 (ENSCHIG00000006954) #14 CAND2 (ENSCHIG00000017799) #17 RPL32 (ENSCHIG00000011099) ##18 EFCAB12 (ENSCHIG00000024180) #19 MBD4 (ENSCHIG00000009760) #20 IFT122 (ENSCHIG00000018009) #21 RHO (ENSCHIG00000019086) #22 H1-8 (ENSCHIG00000015286) #23 PLXND1 (ENSCHIG00000008763) #24 ENSCHIG00000016746 ENSCHIG00000015861 TRH (ENSCHIG00000025325) ENSCHIG00000002443 #7 VGLL4 (ENSCHIG00000019976) ATG7 (ENSCHIG00000018813) HRH1 (ENSCHIG00000012387) SLC6A1 (ENSCHIG00000012437) SLC6A11 (ENSCHIG00000023325) ATP2B2 (ENSCHIG00000017389) ENSCHIG00000015273 ENSCHIG00000018149 ENSCHIG00000023857 Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 10 MRPS25 (ENSOARG00020025871) RBSN (ENSOARG00020025862) ENSOARG00020025856 #9 SYN2 (ENSOARG00020025846) #8 PPARG (ENSOARG00020025834) #10 TSEN2 (ENSOARG00020025828) #11 MKRN2OS (ENSOARG00020025824) #12 MKRN2 (ENSOARG00020025818) #13 RAF1 (ENSOARG00020025810) #14 TMEM40 (ENSOARG00020025803) #15 CAND2 (ENSOARG00020025794) #17 RPL32 (ENSOARG00020025785) ##18 EFCAB12 (ENSOARG00020025775) #19 MBD4 (ENSOARG00020025769) #20 IFT122 (ENSOARG00020025765) #21 RHO (ENSOARG00020025763) #22 ENSOARG00020025760 PLXND1 (ENSOARG00020025735) #24 TMCC1 (ENSOARG00020025721) TRH (ENSOARG00020025716) TAMM41 (ENSOARG00020025710) #7 ENSOARG00020025707 VGLL4 (ENSOARG00020025701) ATG7 (ENSOARG00020025688) HRH1 (ENSOARG00020025679) SLC6A1 (ENSOARG00020025620) SLC6A11 (ENSOARG00020025603) ATP2B2 (ENSOARG00020025546) ENSOARG00020025530 SEC13 (ENSOARG00020025523) GHRL (ENSOARG00020025502) Bovinae ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00390000007159 ENSGT00390000000616.l #7 ENSGT00940000159798 #9 ENSGT00940000156062 #8 ENSGT00940000158273 #10 ENSGT00390000013266 #11 ENSGT00390000003839 #12 ENSGT00950000183077.a.b #13 ENSGT00940000156084 #14 ENSGT00390000017530 #15 ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000153973.d ##18 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000175447 ENSGT00930000152979 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000000616.k #7 ENSGT00390000003282.B ENSGT00390000017509 ENSGT00940000160690 ENSGT00940000156027 ENSGT00940000157569 ENSGT00940000161461 ENSGT00940000153393.B ENSGT00390000004064 Bos ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00390000007159 ENSGT00390000000616.l #7 ENSGT00940000159798 #9 ENSGT00940000156062 #8 ENSGT00940000158273 #10 ENSGT00390000013266 #11 ENSGT00390000003839 #12 ENSGT00950000183077.a.b #13 ENSGT00940000156084 #14 ENSGT00390000017530 #15 ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000153973.d ##18 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000175447 ENSGT00930000152979 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000000616.k #7 ENSGT00390000003282.B ENSGT00390000017509 ENSGT00940000160690 ENSGT00940000156027 ENSGT00940000157569 ENSGT00940000161461 ENSGT00940000153393.B ENSGT00390000004064 Bos_a ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000158393 ENSGT00640000091558 ENSGT00390000007159 ENSGT00940000159798 #9 ENSGT00940000156062 #8 ENSGT00940000158273 #10 ENSGT00390000003839 #12 ENSGT00950000183077.a.b #13 ENSGT00940000156084 #14 ENSGT00390000017530 #15 ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000153973.d ##18 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT00940000175447 ENSGT00930000152979 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000000616.k #7 ENSGT00390000003282.B ENSGT00390000017509 ENSGT00940000160690 ENSGT00940000156027 ENSGT00940000157569 ENSGT00940000161461 ENSGT00940000153393.B ENSGT00390000004064 ENSGT00940000155616.c.a.b Domestic yak MODERN SPECIES 14 NR2C2 (ENSBGRG00000021614) MRPS25 (ENSBGRG00000021676) RBSN (ENSBGRG00000021762) SYN2 (ENSBGRG00000021920) #8 TIMP4 (ENSBGRG00000022226) #9 ENSBGRG00000022315 #10 MKRN2OS (ENSBGRG00000022696) #12 MKRN2 (ENSBGRG00000022735) #13 RAF1 (ENSBGRG00000022891) #14 TMEM40 (ENSBGRG00000023210) #15 CAND2 (ENSBGRG00000023333) #17 RPL32 (ENSBGRG00000023548) ##18 EFCAB12 (ENSBGRG00000023675) #19 MBD4 (ENSBGRG00000023851) #20 IFT122 (ENSBGRG00000023990) #21 RHO (ENSBGRG00000024373) #22 ENSBGRG00000024409 #23 ENSBGRG00000024437 ENSBGRG00000024462 TMCC1 (ENSBGRG00000024493) ENSBGRG00000024583 TRH (ENSBGRG00000024598) TAMM41 (ENSBGRG00000024630) #7 ENSBGRG00000024715 ATG7 (ENSBGRG00000024846) HRH1 (ENSBGRG00000025141) SLC6A1 (ENSBGRG00000025174) SLC6A11 (ENSBGRG00000025316) ATP2B2 (ENSBGRG00000025371) SEC13 (ENSBGRG00000025449) ENSBGRG00000025505 Wild yak MODERN SPECIES 1473 ENSBMUG00000011252 #9 SYN2 (ENSBMUG00000011214) #8 PPARG (ENSBMUG00000011177) #10 MKRN2OS (ENSBMUG00000011070) #12 MKRN2 (ENSBMUG00000011049) #13 RAF1 (ENSBMUG00000011029) #14 ENSBMUG00000010983 TMEM40 (ENSBMUG00000010953) #15 CAND2 (ENSBMUG00000010855) #17 RPL32 (ENSBMUG00000010768) ##18 EFCAB12 (ENSBMUG00000010745) #19 MBD4 (ENSBMUG00000010711) #20 IFT122 (ENSBMUG00000010042) #21 RHO (ENSBMUG00000009767) #22 ENSBMUG00000009729 ENSBMUG00000009719 TMCC1 (ENSBMUG00000009638) ENSBMUG00000009609 TRH (ENSBMUG00000009602) Bos_b ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00390000007159 ENSGT00390000000616.l #7 ENSGT00940000159798 #9 ENSGT00940000156062 #8 ENSGT00940000158273 #10 ENSGT00390000013266 #11 ENSGT00390000003839 #12 ENSGT00950000183077.a.b #13 ENSGT00940000156084 #14 ENSGT00390000017530 #15 ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000153973.d ##18 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000000616.k #7 ENSGT00390000003282.B ENSGT00390000017509 ENSGT00940000160690 ENSGT00940000156027 ENSGT00940000157569 ENSGT00940000161461 ENSGT00940000153393.B ENSGT00390000004064 ENSGT00940000155616.c.a.b ENSGT00390000012690 Cow MODERN SPECIES 14 RBSN (ENSBTAG00000013725) ENSBTAG00000031115 #7 TIMP4 (ENSBTAG00000020263) #9 SYN2 (ENSBTAG00000020260) #8 PPARG (ENSBTAG00000001333) #10 TSEN2 (ENSBTAG00000037980) #11 MKRN2OS (ENSBTAG00000024991) #12 MKRN2 (ENSBTAG00000004512) #13 RAF1 (ENSBTAG00000045748) #14 TMEM40 (ENSBTAG00000000161) #15 CAND2 (ENSBTAG00000015273) #17 RPL32 (ENSBTAG00000015283) ##18 EFCAB12 (ENSBTAG00000021643) #19 MBD4 (ENSBTAG00000021645) #20 IFT122 (ENSBTAG00000019121) #21 RHO (ENSBTAG00000001310) #22 H1-8 (ENSBTAG00000001812) #23 PLXND1 (ENSBTAG00000001814) #24 TMCC1 (ENSBTAG00000006614) TRH (ENSBTAG00000005306) TAMM41 (ENSBTAG00000003328) #7 VGLL4 (ENSBTAG00000018600) ATG7 (ENSBTAG00000035827) SLC6A1 (ENSBTAG00000005857) SLC6A11 (ENSBTAG00000038962) ATP2B2 (ENSBTAG00000001305) SEC13 (ENSBTAG00000017825) GHRL (ENSBTAG00000012328) TMEM42 (ENSBTAG00000016731) ZDHHC3 (ENSBTAG00000011484) EXOSC7 (ENSBTAG00000018329) Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 14 FGD5 (ENSBIXG00005027347) NR2C2 (ENSBIXG00005026766) MRPS25 (ENSBIXG00005026733) RBSN (ENSBIXG00005026693) SYN2 (ENSBIXG00005026582) #8 TIMP4 (ENSBIXG00005026516) #9 ENSBIXG00005026465 #10 MKRN2OS (ENSBIXG00005026155) #12 MKRN2 (ENSBIXG00005026143) #13 RAF1 (ENSBIXG00005004450) #14 TMEM40 (ENSBIXG00005026020) #15 CAND2 (ENSBIXG00005025955) #17 RPL32 (ENSBIXG00005025898) ##18 MBD4 (ENSBIXG00005025831) #20 IFT122 (ENSBIXG00005025735) #21 RHO (ENSBIXG00005025616) #22 ENSBIXG00005025593 #23 PLXND1 (ENSBIXG00005025560) #24 TMCC1 (ENSBIXG00005025216) ENSBIXG00005025137 ENSBIXG00005025108 TRH (ENSBIXG00005025098) ENSBIXG00005025048 ATG7 (ENSBIXG00005024877) HRH1 (ENSBIXG00005024745) SLC6A1 (ENSBIXG00005024690) SLC6A11 (ENSBIXG00005024278) ATP2B2 (ENSBIXG00005024165) SEC13 (ENSBIXG00005023854) ENSBIXG00005023770 ENSBIXG00005004068 American bison MODERN SPECIES 3340 MRPS25 (ENSBBBG00000011234) RBSN (ENSBBBG00000011250) TIMP4 (ENSBBBG00000011264) #9 SYN2 (ENSBBBG00000011280) #8 PPARG (ENSBBBG00000011336) #10 TSEN2 (ENSBBBG00000002087) #11 MKRN2OS (ENSBBBG00000006934) #12 MKRN2 (ENSBBBG00000011440) #13 RAF1 (ENSBBBG00000011493) #14 TMEM40 (ENSBBBG00000011569) #15 CAND2 (ENSBBBG00000002144) #17 RPL32 (ENSBBBG00000002148) ##18 EFCAB12 (ENSBBBG00000011681) #19 MBD4 (ENSBBBG00000011698) #20 IFT122 (ENSBBBG00000002240) #21 RHO (ENSBBBG00000012003) #22 ENSBBBG00000012007 ENSBBBG00000012012 TMCC1 (ENSBBBG00000012034) ENSBBBG00000012036 TRH (ENSBBBG00000012040) TAMM41 (ENSBBBG00000012063) #7 VGLL4 (ENSBBBG00000012100) ATG7 (ENSBBBG00000012188) HRH1 (ENSBBBG00000012197) SLC6A1 (ENSBBBG00000012788) SLC6A11 (ENSBBBG00000001746) ATP2B2 (ENSBBBG00000013332) SEC13 (ENSBBBG00000002763) GHRL (ENSBBBG00000013480) ENSBBBG00000002767 Siberian musk deer MODERN SPECIES 1221 VGLL4 (ENSMMSG00000015264) TAMM41 (ENSMMSG00000015235) #7 TIMP4 (ENSMMSG00000015209) #9 SYN2 (ENSMMSG00000015141) #8 PPARG (ENSMMSG00000015004) #10 TSEN2 (ENSMMSG00000014963) #11 MKRN2OS (ENSMMSG00000014926) #12 MKRN2 (ENSMMSG00000014895) #13 RAF1 (ENSMMSG00000024157) #14 TMEM40 (ENSMMSG00000024144) #15 CAND2 (ENSMMSG00000024132) #17 RPL32 (ENSMMSG00000024124) ##18 EFCAB12 (ENSMMSG00000024116) #19 MBD4 (ENSMMSG00000024114) #20 IFT122 (ENSMMSG00000024092) #21 RHO (ENSMMSG00000024086) #22 ENSMMSG00000024082 #23 PLXND1 (ENSMMSG00000024073) #24 TMCC1 (ENSMMSG00000024064) ENSMMSG00000024063 TRH (ENSMMSG00000024061) RBSN (ENSMMSG00000024056) MRPS25 (ENSMMSG00000024052) NR2C2 (ENSMMSG00000024042) FGD5 (ENSMMSG00000023995) C3orf20 (ENSMMSG00000023974) ENSMMSG00000023958 GRIP2 (ENSMMSG00000023940) SLC6A6 (ENSMMSG00000023907) LSM3 (ENSMMSG00000023892) XPC (ENSMMSG00000023884) Yarkand deer MODERN SPECIES 16 ENSCHYG00000025128 #8 TIMP4 (ENSCHYG00000025170) #9 PPARG (ENSCHYG00000025198) #10 TSEN2 (ENSCHYG00000025333) #11 MKRN2OS (ENSCHYG00000025406) #12 MKRN2 (ENSCHYG00000025428) #13 RAF1 (ENSCHYG00000025496) #14 ENSCHYG00000013805 TMEM40 (ENSCHYG00000013848) #15 CAND2 (ENSCHYG00000014141) #17 ENSCHYG00000014472 ENSCHYG00000014488 ##18 EFCAB12 (ENSCHYG00000014606) #19 MBD4 (ENSCHYG00000014755) #20 IFT122 (ENSCHYG00000015047) #21 RHO (ENSCHYG00000017188) #22 H1-8 (ENSCHYG00000017241) #23 ENSCHYG00000017294 #24 TMCC1 (ENSCHYG00000017484) TRH (ENSCHYG00000017738) TAMM41 (ENSCHYG00000017796) #7 VGLL4 (ENSCHYG00000017989) ATG7 (ENSCHYG00000018188) HRH1 (ENSCHYG00000019012) SLC6A1 (ENSCHYG00000019091) SLC6A11 (ENSCHYG00000019466) ATP2B2 (ENSCHYG00000019655) SEC13 (ENSCHYG00000020226) ENSCHYG00000020622 TMEM42 (ENSCHYG00000020765) ENSCHYG00000020843 Cetacea ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000000616 #7 ENSGT00940000156062 #8 ENSGT00940000159798 #9 ENSGT00940000158273 #10 ENSGT00390000013266 #11 ENSGT00390000003839 #12 ENSGT00950000183077.a.b #13 ENSGT00940000156084 #14 ENSGT00390000017530 #15 ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000153973.c.a.b.b ##18 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT01010000229800 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT00930000152979 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000154583 ENSGT00390000013951 ENSGT00390000005194 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000003282.B ENSGT00390000000616 #7 ENSGT00940000156062 #8 ENSGT00940000159798 #9 ENSGT00940000158273 #10 ENSGT00390000013266 #11 ENSGT00390000003839 #12 ENSGT00950000183077.a.b #13 ENSGT00940000156084 #14 ENSGT00390000017530 #15 ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000153973.c.a.b.b ##18 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT00930000152979 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558.n ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000154583 ENSGT00390000013951 ENSGT00390000005194 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000003282.B ENSGT00390000000616 #7 ENSGT00940000156062 #8 ENSGT00940000159798 #9 ENSGT00940000158273 #10 ENSGT00390000013266 #11 ENSGT00390000003839 #12 ENSGT00950000183077.a.b #13 ENSGT00940000156084 #14 ENSGT00390000017530 #15 ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000153973.c.a.b.b ##18 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558.n ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000154583 ENSGT00390000013951 ENSGT00390000005194 ENSGT00390000009671 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000003282.B ENSGT00390000000616 #7 ENSGT00940000156062 #8 ENSGT00940000159798 #9 ENSGT00940000158273 #10 ENSGT00390000013266 #11 ENSGT00390000003839 #12 ENSGT00950000183077.a.b #13 ENSGT00940000156084 #14 ENSGT00390000017530 #15 ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000153973.c.a.b.b ##18 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558.n ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000154583 ENSGT00390000013951 ENSGT00390000005194 ENSGT00390000009671 Monodontidae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000003282.B ENSGT00390000000616 #7 ENSGT00940000156062 #8 ENSGT00940000159798 #9 ENSGT00940000158273 #10 ENSGT00390000013266 #11 ENSGT00390000003839 #12 ENSGT00950000183077.a.b #13 ENSGT00940000156084 #14 ENSGT00390000017530 #15 ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000153973.c.a.b.b ##18 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558.n ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000154583 ENSGT00390000013951 ENSGT00390000005194 ENSGT00390000009671 Narwhal MODERN SPECIES 310 VGLL4 (ENSMMNG00015011616) TAMM41 (ENSMMNG00015011672) #7 SYN2 (ENSMMNG00015011708) #8 TIMP4 (ENSMMNG00015011737) #9 PPARG (ENSMMNG00015011771) #10 TSEN2 (ENSMMNG00015011810) #11 MKRN2OS (ENSMMNG00015011881) #12 MKRN2 (ENSMMNG00015011904) #13 RAF1 (ENSMMNG00015011951) #14 TMEM40 (ENSMMNG00015012000) #15 CAND2 (ENSMMNG00015012039) #17 RPL32 (ENSMMNG00015012118) ##18 EFCAB12 (ENSMMNG00015012144) #19 MBD4 (ENSMMNG00015012156) #20 IFT122 (ENSMMNG00015012203) #21 RHO (ENSMMNG00015012293) #22 H1-8 (ENSMMNG00015012313) #23 PLXND1 (ENSMMNG00015012370) #24 TMCC1 (ENSMMNG00015012483) TRH (ENSMMNG00015012517) RBSN (ENSMMNG00015012525) ENSMMNG00015012540 NR2C2 (ENSMMNG00015012595) FGD5 (ENSMMNG00015012622) ENSMMNG00015012683 CCDC174 (ENSMMNG00015012708) ENSMMNG00015012733 ENSMMNG00015012756 SLC6A6 (ENSMMNG00015012780) LSM3 (ENSMMNG00015012798) XPC (ENSMMNG00015012813) Beluga whale MODERN SPECIES 66 HRH1 (ENSDLEG00000021424) ATG7 (ENSDLEG00000021427) TAMM41 (ENSDLEG00000021438) #7 SYN2 (ENSDLEG00000021448) #8 TIMP4 (ENSDLEG00000021450) #9 ENSDLEG00000021458 #10 ENSDLEG00000021477 MKRN2 (ENSDLEG00000021478) #13 RAF1 (ENSDLEG00000007956) #14 TMEM40 (ENSDLEG00000008007) #15 CAND2 (ENSDLEG00000008059) #17 RPL32 (ENSDLEG00000008175) ##18 ENSDLEG00000008201 #19 MBD4 (ENSDLEG00000008239) #20 IFT122 (ENSDLEG00000008304) #21 RHO (ENSDLEG00000008470) #22 H1-8 (ENSDLEG00000008521) #23 PLXND1 (ENSDLEG00000008614) #24 TMCC1 (ENSDLEG00000008842) TRH (ENSDLEG00000008893) RBSN (ENSDLEG00000008914) ENSDLEG00000008956 ENSDLEG00000008967 NR2C2 (ENSDLEG00000008987) FGD5 (ENSDLEG00000009061) CCDC174 (ENSDLEG00000009174) GRIP2 (ENSDLEG00000009241) SLC6A6 (ENSDLEG00000009533) ENSDLEG00000009566 XPC (ENSDLEG00000009595) TMEM43 (ENSDLEG00000009650) Vaquita MODERN SPECIES 2 VGLL4 (ENSPSNG00000011411) TAMM41 (ENSPSNG00000011313) #7 TIMP4 (ENSPSNG00000011214) #9 SYN2 (ENSPSNG00000010964) #8 PPARG (ENSPSNG00000010554) #10 TSEN2 (ENSPSNG00000010460) #11 MKRN2OS (ENSPSNG00000010409) #12 MKRN2 (ENSPSNG00000010288) #13 RAF1 (ENSPSNG00000010184) #14 TMEM40 (ENSPSNG00000010002) #15 CAND2 (ENSPSNG00000009832) #17 RPL32 (ENSPSNG00000022724) #18 EFCAB12 (ENSPSNG00000022723) #19 MBD4 (ENSPSNG00000022722) #20 IFT122 (ENSPSNG00000022721) #21 RHO (ENSPSNG00000022720) #22 H1-8 (ENSPSNG00000022719) #23 PLXND1 (ENSPSNG00000022718) #24 ENSPSNG00000022717 ENSPSNG00000022714 TRH (ENSPSNG00000022713) RBSN (ENSPSNG00000022712) ENSPSNG00000022711 NR2C2 (ENSPSNG00000022710) FGD5 (ENSPSNG00000022708) CCDC174 (ENSPSNG00000022707) GRIP2 (ENSPSNG00000022705) SLC6A6 (ENSPSNG00000022704) ENSPSNG00000022703 XPC (ENSPSNG00000022702) TMEM43 (ENSPSNG00000022701) Dolphin MODERN SPECIES 2924 CAND2 (ENSTTRG00000011258) #17 EFCAB12 (ENSTTRG00000011264) #19 MBD4 (ENSTTRG00000011265) #20 IFT122 (ENSTTRG00000011266) #21 RHO (ENSTTRG00000011273) #22 H1-8 (ENSTTRG00000011276) #23 PLXND1 (ENSTTRG00000011279) #24 TMCC1 (ENSTTRG00000011283) Sperm whale MODERN SPECIES 9 HRH1 (ENSPCTG00005006823) ATG7 (ENSPCTG00005006565) VGLL4 (ENSPCTG00005006432) TAMM41 (ENSPCTG00005006384) #7 TIMP4 (ENSPCTG00005006355) #9 SYN2 (ENSPCTG00005006330) #8 PPARG (ENSPCTG00005006236) #10 MKRN2OS (ENSPCTG00005006199) #12 MKRN2 (ENSPCTG00005006141) #13 RAF1 (ENSPCTG00005006081) #14 ENSPCTG00005006042 #17 ENSPCTG00005006016 ##18 EFCAB12 (ENSPCTG00005005960) #19 MBD4 (ENSPCTG00005005918) #20 IFT122 (ENSPCTG00005005825) #21 RHO (ENSPCTG00005005781) #22 H1-8 (ENSPCTG00005005747) #23 ENSPCTG00005005647 ENSPCTG00005005684 #24 TRH (ENSPCTG00005005621) ENSPCTG00005005601 TMCC1 (ENSPCTG00005005558) RBSN (ENSPCTG00005005519) MRPS25 (ENSPCTG00005005475) NR2C2 (ENSPCTG00005005417) ENSPCTG00005005367 FGD5 (ENSPCTG00005004623) C3orf20 (ENSPCTG00005004416) CCDC174 (ENSPCTG00005004364) ENSPCTG00005004303 SLC6A6 (ENSPCTG00005022008) Blue whale MODERN SPECIES 2 TAMM41 (ENSBMSG00010010044) #7 SYN2 (ENSBMSG00010010076) #8 TIMP4 (ENSBMSG00010010106) #9 PPARG (ENSBMSG00010010135) #10 TSEN2 (ENSBMSG00010010317) #11 MKRN2OS (ENSBMSG00010010343) #12 MKRN2 (ENSBMSG00010010365) #13 RAF1 (ENSBMSG00010010408) #14 TMEM40 (ENSBMSG00010010438) #15 CAND2 (ENSBMSG00010010467) #17 RPL32 (ENSBMSG00010010483) ##18 EFCAB12 (ENSBMSG00010010503) #19 ENSBMSG00010010533 #20 ENSBMSG00010010542 IFT122 (ENSBMSG00010010593) #21 RHO (ENSBMSG00010010727) #22 ENSBMSG00010010803 PLXND1 (ENSBMSG00010010833) #24 TMCC1 (ENSBMSG00010010919) TRH (ENSBMSG00010010946) RBSN (ENSBMSG00010010963) MRPS25 (ENSBMSG00010010976) NR2C2 (ENSBMSG00010010995) FGD5 (ENSBMSG00010011044) C3orf20 (ENSBMSG00010011129) CCDC174 (ENSBMSG00010011163) GRIP2 (ENSBMSG00010011207) SLC6A6 (ENSBMSG00010011361) LSM3 (ENSBMSG00010011411) XPC (ENSBMSG00010011503) TMEM43 (ENSBMSG00010011796) Suina ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000156062 #8 ENSGT00940000159798 #9 ENSGT00940000158273 #10 ENSGT00390000013266 #11 ENSGT00390000003839 #12 ENSGT01030000235208 ENSGT00950000183077.a.b #13 ENSGT00940000156084 #14 ENSGT00390000017530 #15 ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000153973.c.a.b.b ##18 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT01010000229800 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000154583 ENSGT00390000013951 ENSGT00390000005194 ENSGT00390000009671 Chacoan peccary MODERN SPECIES 950 SYN2 (ENSCWAG00000016935) #8 TIMP4 (ENSCWAG00000017007) #9 PPARG (ENSCWAG00000017057) #10 TSEN2 (ENSCWAG00000017441) #11 ENSCWAG00000017774 MKRN2 (ENSCWAG00000017797) #13 RAF1 (ENSCWAG00000017888) #14 TMEM40 (ENSCWAG00000017953) #15 CAND2 (ENSCWAG00000018031) #17 RPL32 (ENSCWAG00000018094) ##18 EFCAB12 (ENSCWAG00000018153) #19 ENSCWAG00000018222 #20 ENSCWAG00000018236 #20 ENSCWAG00000018255 IFT122 (ENSCWAG00000018289) #21 RHO (ENSCWAG00000018568) #22 H1-8 (ENSCWAG00000018609) #23 PLXND1 (ENSCWAG00000018660) #24 TMCC1 (ENSCWAG00000018870) TRH (ENSCWAG00000018918) RBSN (ENSCWAG00000018943) MRPS25 (ENSCWAG00000018966) NR2C2 (ENSCWAG00000018980) FGD5 (ENSCWAG00000019086) C3orf20 (ENSCWAG00000019265) CCDC174 (ENSCWAG00000019402) GRIP2 (ENSCWAG00000019448) SLC6A6 (ENSCWAG00000019647) LSM3 (ENSCWAG00000019659) XPC (ENSCWAG00000019670) TMEM43 (ENSCWAG00000019695) Pig MODERN SPECIES 4 SYN2 (ENSSSCG00000023225) #8 TIMP4 (ENSSSCG00000033000) #9 PPARG (ENSSSCG00000011579) #10 TSEN2 (ENSSSCG00000011580) #11 MKRN2OS (ENSSSCG00000011581) #12 ENSSSCG00000045850 MKRN2 (ENSSSCG00000029877) #13 RAF1 (ENSSSCG00000024453) #14 ENSSSCG00000056163 TMEM40 (ENSSSCG00000011583) #15 CAND2 (ENSSSCG00000011582) #17 RPL32 (ENSSSCG00000035811) #18 EFCAB12 (ENSSSCG00000011587) #19 MBD4 (ENSSSCG00000033303) #20 IFT122 (ENSSSCG00000011589) #21 RHO (ENSSSCG00000011590) #22 H1-8 (ENSSSCG00000011591) #23 PLXND1 (ENSSSCG00000011592) #24 TMCC1 (ENSSSCG00000011593) ENSSSCG00000040441 ENSSSCG00000044894 TRH (ENSSSCG00000055507) RBSN (ENSSSCG00000036643) MRPS25 (ENSSSCG00000034318) NR2C2 (ENSSSCG00000011594) FGD5 (ENSSSCG00000011598) CCDC174 (ENSSSCG00000040702) GRIP2 (ENSSSCG00000011599) SLC6A6 (ENSSSCG00000011600) LSM3 (ENSSSCG00000011601) XPC (ENSSSCG00000011602) Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000159798 #9 ENSGT00940000156062 #8 ENSGT00940000158273 #10 ENSGT00390000013266 #11 ENSGT00390000003839 #12 ENSGT01030000235208 ENSGT00950000183077.a.b #13 ENSGT00940000156084 #14 ENSGT00950000186178 ENSGT00390000017530 #15 ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000153973.c.a.b.b.d ##18 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000154583 ENSGT00390000013951 ENSGT00390000005194 ENSGT00390000009671 Carnivora ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000156062 #8 ENSGT00940000158273 #10 ENSGT00390000013266 #11 ENSGT00390000003839 #12 ENSGT01030000235208 ENSGT00950000183077.a.b #13 ENSGT00940000156084 #14 ENSGT00950000186178 ENSGT00390000017530 #15 ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000153973.c.a.b.a.b #18 ENSGT00940000153973.c.a.b.b.d ##18 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000154583 ENSGT00390000013951 ENSGT00390000005194 ENSGT00390000009671 Felidae ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00390000003282.B ENSGT00390000000616 #7 ENSGT00940000159798 #9 ENSGT00940000156062 #8 ENSGT00940000158273 #10 ENSGT00390000013266 #11 ENSGT00390000003839 #12 ENSGT00950000183077.a.b #13 ENSGT00940000156084 #14 ENSGT00390000017530 #15 ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000153973.c.a.b.b.d ##18 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000154583 ENSGT00500000045038.m.b ENSGT00390000013951 ENSGT00390000005194 Panthera ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000003282.B ENSGT00390000000616 #7 ENSGT00940000159798 #9 ENSGT00940000156062 #8 ENSGT00940000158273 #10 ENSGT00390000013266 #11 ENSGT00390000003839 #12 ENSGT00950000183077.a.b #13 ENSGT00940000156084 #14 ENSGT00390000017530 #15 ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000153973.c.a.b.b.d ##18 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000154583 ENSGT00500000045038.m.b ENSGT00390000013951 ENSGT00390000005194 Panthera_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003282.B ENSGT00390000000616 #7 ENSGT00940000159798 #9 ENSGT00940000156062 #8 ENSGT00940000158273 #10 ENSGT00390000013266 #11 ENSGT00390000003839 #12 ENSGT00950000183077.a.b #13 ENSGT00940000156084 #14 ENSGT00390000017530 #15 ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000153973.c.a.b.b.d ##18 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000154583 ENSGT00500000045038.m.b ENSGT00390000013951 ENSGT00390000005194 lion MODERN SPECIES 2 VGLL4 (ENSPLOG00000001346) TAMM41 (ENSPLOG00000001396) #7 SYN2 (ENSPLOG00000001422) #8 TIMP4 (ENSPLOG00000001454) #9 PPARG (ENSPLOG00000001496) #10 TSEN2 (ENSPLOG00000001594) #11 MKRN2OS (ENSPLOG00000001659) #12 MKRN2 (ENSPLOG00000001691) #13 RAF1 (ENSPLOG00000001743) #14 TMEM40 (ENSPLOG00000001779) #15 CAND2 (ENSPLOG00000001847) #17 RPL32 (ENSPLOG00000001870) ##18 EFCAB12 (ENSPLOG00000001903) #19 MBD4 (ENSPLOG00000002021) #20 IFT122 (ENSPLOG00000002159) #21 RHO (ENSPLOG00000002405) #22 H1-8 (ENSPLOG00000002423) #23 PLXND1 (ENSPLOG00000002460) #24 TMCC1 (ENSPLOG00000002518) TRH (ENSPLOG00000002548) RBSN (ENSPLOG00000002563) MRPS25 (ENSPLOG00000002725) NR2C2 (ENSPLOG00000002757) FGD5 (ENSPLOG00000002817) C3orf20 (ENSPLOG00000002933) CCDC174 (ENSPLOG00000002974) GRIP2 (ENSPLOG00000003035) SLC6A6 (ENSPLOG00000003114) ENSPLOG00000003139 LSM3 (ENSPLOG00000003173) XPC (ENSPLOG00000003191) leopard MODERN SPECIES 154 MKRN2OS (ENSPPRG00000021987) #12 MKRN2 (ENSPPRG00000021887) #13 RAF1 (ENSPPRG00000021390) #14 TMEM40 (ENSPPRG00000018566) #15 CAND2 (ENSPPRG00000017246) #17 RPL32 (ENSPPRG00000016964) #18 EFCAB12 (ENSPPRG00000016816) #19 MBD4 (ENSPPRG00000016480) #20 IFT122 (ENSPPRG00000015865) #21 ENSPPRG00000014504 RHO (ENSPPRG00000014471) #22 H1-8 (ENSPPRG00000014444) #23 PLXND1 (ENSPPRG00000014283) #24 TMCC1 (ENSPPRG00000014113) TRH (ENSPPRG00000013952) RBSN (ENSPPRG00000013941) MRPS25 (ENSPPRG00000013901) NR2C2 (ENSPPRG00000013873) FGD5 (ENSPPRG00000013574) C3orf20 (ENSPPRG00000013356) CCDC174 (ENSPPRG00000013291) GRIP2 (ENSPPRG00000013151) SLC6A6 (ENSPPRG00000013003) ENSPPRG00000012913 ENSPPRG00000012912 XPC (ENSPPRG00000012784) Tiger MODERN SPECIES 57 VGLL4 (ENSPTIG00000011766) TAMM41 (ENSPTIG00000009439) #7 TIMP4 (ENSPTIG00000009274) #9 SYN2 (ENSPTIG00000005386) #8 PPARG (ENSPTIG00000021339) #10 TSEN2 (ENSPTIG00000021018) #11 MKRN2OS (ENSPTIG00000020689) #12 MKRN2 (ENSPTIG00000020261) #13 RAF1 (ENSPTIG00000019431) #14 TMEM40 (ENSPTIG00000016867) #15 CAND2 (ENSPTIG00000014551) #17 RPL32 (ENSPTIG00000013290) ##18 EFCAB12 (ENSPTIG00000012496) #19 ENSPTIG00000012068 #20 IFT122 (ENSPTIG00000017825) #21 RHO (ENSPTIG00000016846) #22 H1-8 (ENSPTIG00000016687) #23 ENSPTIG00000016640 ENSPTIG00000016501 Cat MODERN SPECIES 1 SYN2 (ENSFCAG00000006229) #8 TIMP4 (ENSFCAG00000028966) #9 PPARG (ENSFCAG00000006231) #10 TSEN2 (ENSFCAG00000025500) #11 MKRN2OS (ENSFCAG00000046813) #12 ENSFCAG00000049119 MKRN2 (ENSFCAG00000007979) #13 RAF1 (ENSFCAG00000026299) #14 TMEM40 (ENSFCAG00000037003) #15 ENSFCAG00000052196 CAND2 (ENSFCAG00000008340) #17 RPL32 (ENSFCAG00000030450) ##18 EFCAB12 (ENSFCAG00000000081) #19 MBD4 (ENSFCAG00000000083) #20 IFT122 (ENSFCAG00000000086) #21 RHO (ENSFCAG00000000092) #22 H1-8 (ENSFCAG00000000094) #23 PLXND1 (ENSFCAG00000000095) #24 TMCC1 (ENSFCAG00000027586) TRH (ENSFCAG00000029423) RBSN (ENSFCAG00000025901) MRPS25 (ENSFCAG00000027687) NR2C2 (ENSFCAG00000003537) FGD5 (ENSFCAG00000026112) CA2H3orf20 (ENSFCAG00000007658) CCDC174 (ENSFCAG00000027124) GRIP2 (ENSFCAG00000007655) SLC6A6 (ENSFCAG00000007651) ENSFCAG00000036915 ENSFCAG00000038453 XPC (ENSFCAG00000001865) Caniformia ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000159798 #9 ENSGT00940000156062 #8 ENSGT00940000158273 #10 ENSGT00390000013266 #11 ENSGT00390000003839 #12 ENSGT01030000235208 ENSGT00950000183077.a.b #13 ENSGT00940000156084 #14 ENSGT00950000186178 ENSGT00390000017530 #15 ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000153973.c.a.a ##18 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000154583 ENSGT00390000013951 ENSGT00390000005194 ENSGT00390000009671 Canidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000000616 #7 ENSGT00940000159798 #9 ENSGT00940000156062 #8 ENSGT00940000158273 #10 ENSGT00390000013266 #11 ENSGT00390000003839 #12 ENSGT01030000235208 ENSGT00950000183077.a.b #13 ENSGT00940000156084 #14 ENSGT00390000017530 #15 ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000153973.c.a.b.a.b #18 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000154583 ENSGT00390000013951.eb ENSGT00390000005194 ENSGT00390000009671 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000162517.e.b.b ENSGT00390000000616 #7 ENSGT00940000159798 #9 ENSGT00940000156062 #8 ENSGT00940000158273 #10 ENSGT00390000013266 #11 ENSGT00390000003839 #12 ENSGT00950000183077.a.b #13 ENSGT00940000156084 #14 ENSGT00390000017530 #15 ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000153973.c.a.b.a.b #18 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00950000183087.A.a.a.b.p.a.a ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000154583 ENSGT00390000013951.eb ENSGT00390000005194 Dingo MODERN SPECIES 236 TAMM41 (ENSCAFG00020007562) #7 TIMP4 (ENSCAFG00020007541) #9 SYN2 (ENSCAFG00020007281) #8 PPARG (ENSCAFG00020007261) #10 TSEN2 (ENSCAFG00020007250) #11 MKRN2OS (ENSCAFG00020007247) #12 ENSCAFG00020007244 MKRN2 (ENSCAFG00020007243) #13 RAF1 (ENSCAFG00020007230) #14 TMEM40 (ENSCAFG00020007225) #15 CAND2 (ENSCAFG00020007135) #17 RPL32 (ENSCAFG00020007109) #18 EFCAB12 (ENSCAFG00020007096) #19 MBD4 (ENSCAFG00020007082) #20 IFT122 (ENSCAFG00020006537) #21 RHO (ENSCAFG00020006492) #22 H1-8 (ENSCAFG00020006486) #23 PLXND1 (ENSCAFG00020006389) #24 ENSCAFG00020006372 ENSCAFG00020006362 ENSCAFG00020006358 ENSCAFG00020006352 TRH (ENSCAFG00020006350) RBSN (ENSCAFG00020006347) MRPS25 (ENSCAFG00020006345) NR2C2 (ENSCAFG00020006182) FGD5 (ENSCAFG00020006160) C3orf20 (ENSCAFG00020006113) CCDC174 (ENSCAFG00020006016) GRIP2 (ENSCAFG00020005863) SLC6A6 (ENSCAFG00020005700) Dog MODERN SPECIES 12 TIMP4 (ENSCAFG00845029189) #9 SYN2 (ENSCAFG00845029109) #8 PPARG (ENSCAFG00845029007) #10 TSEN2 (ENSCAFG00845028923) #11 MKRN2OS (ENSCAFG00845028857) #12 ENSCAFG00845028837 MKRN2 (ENSCAFG00845028765) #13 ENSCAFG00845028720 RAF1 (ENSCAFG00845028676) #14 TMEM40 (ENSCAFG00845028589) #15 CAND2 (ENSCAFG00845028524) #17 RPL32 (ENSCAFG00845028446) #18 ENSCAFG00845028379 #19 MBD4 (ENSCAFG00845028304) #20 IFT122 (ENSCAFG00845027707) #21 RHO (ENSCAFG00845027581) #22 H1-8 (ENSCAFG00845027541) #23 PLXND1 (ENSCAFG00845026992) #24 RPL26 (ENSCAFG00845026761) TMCC1 (ENSCAFG00845026698) ENSCAFG00845026667 TRH (ENSCAFG00845026628) ENSCAFG00845026464 MRPS25 (ENSCAFG00845026361) NR2C2 (ENSCAFG00845026116) FGD5 (ENSCAFG00845025740) C3orf20 (ENSCAFG00845025479) CCDC174 (ENSCAFG00845025324) GRIP2 (ENSCAFG00845024472) SLC6A6 (ENSCAFG00845024299) LSM3 (ENSCAFG00845024243) Red fox MODERN SPECIES 130 ENSVVUG00000015270 PPARG (ENSVVUG00000015266) #10 TSEN2 (ENSVVUG00000015253) #11 ENSVVUG00000015251 #12 ENSVVUG00000015247 ENSVVUG00000015244 ENSVVUG00000015242 MKRN2 (ENSVVUG00000015240) #13 RAF1 (ENSVVUG00000015233) #14 ENSVVUG00000015228 CAND2 (ENSVVUG00000014272) #17 RPL32 (ENSVVUG00000014231) ##18 EFCAB12 (ENSVVUG00000014226) #19 MBD4 (ENSVVUG00000014222) #20 IFT122 (ENSVVUG00000014184) #21 RHO (ENSVVUG00000014149) #22 H1-8 (ENSVVUG00000014145) #23 PLXND1 (ENSVVUG00000013916) #24 TMCC1 (ENSVVUG00000013886) TRH (ENSVVUG00000013865) RBSN (ENSVVUG00000013853) MRPS25 (ENSVVUG00000013846) ENSVVUG00000013842 NR2C2 (ENSVVUG00000013819) FGD5 (ENSVVUG00000013818) C3orf20 (ENSVVUG00000013813) CCDC174 (ENSVVUG00000013811) GRIP2 (ENSVVUG00000013780) SLC6A6 (ENSVVUG00000013760) Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00390000000616 #7 ENSGT00940000156062 #8 ENSGT00940000159798 #9 ENSGT00940000158273 #10 ENSGT00390000013266 #11 ENSGT00390000003839 #12 ENSGT00950000183077.a.b #13 ENSGT00940000156084 #14 ENSGT00950000186178 ENSGT00390000017530 #15 ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000153973.c.a.a ##18 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000154583 ENSGT00390000013951 ENSGT00390000005194 ENSGT00390000009671 Mustelinae ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00390000000616 #7 ENSGT00940000156062 #8 ENSGT00940000159798 #9 ENSGT00940000158273 #10 ENSGT00390000013266 #11 ENSGT00390000003839 #12 ENSGT00950000183077.a.b #13 ENSGT00940000156084 #14 ENSGT00950000186178 ENSGT00390000017530 #15 ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000153973.c.a.a ##18 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000154583 ENSGT00390000013951.gb ENSGT00390000005194 ENSGT00390000009671 Ferret MODERN SPECIES 163 VGLL4 (ENSMPUG00000017174) TAMM41 (ENSMPUG00000017175) #7 SYN2 (ENSMPUG00000017176) #8 TIMP4 (ENSMPUG00000017178) #9 PPARG (ENSMPUG00000017181) #10 TSEN2 (ENSMPUG00000017182) #11 MKRN2OS (ENSMPUG00000017183) #12 MKRN2 (ENSMPUG00000017184) #13 RAF1 (ENSMPUG00000017185) #14 TMEM40 (ENSMPUG00000017187) #15 CAND2 (ENSMPUG00000017188) #17 ENSMPUG00000017189 ##18 EFCAB12 (ENSMPUG00000017190) #19 MBD4 (ENSMPUG00000017195) #20 IFT122 (ENSMPUG00000017197) #21 RHO (ENSMPUG00000017225) #22 ENSMPUG00000017237 PLXND1 (ENSMPUG00000017238) #24 ENSMPUG00000017241 TMCC1 (ENSMPUG00000017243) TRH (ENSMPUG00000017246) RBSN (ENSMPUG00000017247) MRPS25 (ENSMPUG00000017248) NR2C2 (ENSMPUG00000017249) FGD5 (ENSMPUG00000017250) C3orf20 (ENSMPUG00000017251) CCDC174 (ENSMPUG00000017252) GRIP2 (ENSMPUG00000017253) SLC6A6 (ENSMPUG00000017255) ENSMPUG00000017256 ENSMPUG00000017257 American mink MODERN SPECIES 287 SYN2 (ENSNVIG00000008362) #8 ENSNVIG00000008402 TIMP4 (ENSNVIG00000008416) #9 PPARG (ENSNVIG00000008444) #10 TSEN2 (ENSNVIG00000008550) #11 MKRN2OS (ENSNVIG00000008607) #12 MKRN2 (ENSNVIG00000008629) #13 RAF1 (ENSNVIG00000008700) #14 ENSNVIG00000008812 TMEM40 (ENSNVIG00000008852) #15 CAND2 (ENSNVIG00000008985) #17 ENSNVIG00000009040 #18 EFCAB12 (ENSNVIG00000009088) #19 MBD4 (ENSNVIG00000009126) #20 IFT122 (ENSNVIG00000009217) #21 RHO (ENSNVIG00000009693) #22 H1-8 (ENSNVIG00000009706) #23 PLXND1 (ENSNVIG00000009720) #24 TMCC1 (ENSNVIG00000009775) TRH (ENSNVIG00000009787) RBSN (ENSNVIG00000009795) MRPS25 (ENSNVIG00000009805) NR2C2 (ENSNVIG00000009821) FGD5 (ENSNVIG00000009850) C3orf20 (ENSNVIG00000009902) ENSNVIG00000009972 ENSNVIG00000010012 GRIP2 (ENSNVIG00000010025) SLC6A6 (ENSNVIG00000010115) LSM3 (ENSNVIG00000010143) XPC (ENSNVIG00000010151) Ursidae DUPLICATION Ursidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.c #22 Giant Panda MODERN SPECIES 2150 ENSAMEG00000028383 #22 Ursidae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000000616 #7 ENSGT00940000156062 #8 ENSGT00940000159798 #9 ENSGT00940000158273 #10 ENSGT00390000013266 #11 ENSGT00390000003839 #12 ENSGT00950000183077.a.b #13 ENSGT00940000156084 #14 ENSGT00950000186178 ENSGT00390000017530 #15 ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000153973.c.a.b.b.d ##18 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.d #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000154583 ENSGT00390000013951 ENSGT00390000005194 ENSGT00390000009671 Ursus ANCESTRAL SPECIES 43 ENSGT00390000000616 #7 ENSGT00940000159798 #9 ENSGT00940000156062 #8 ENSGT00940000158273 #10 ENSGT00390000013266 #11 ENSGT00390000003839 #12 ENSGT00950000183077.a.b #13 ENSGT00940000156084 #14 ENSGT00390000017530 #15 ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000153973.c.a.b.b.c.a ##18 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000012138.a.a.j.s.b ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.d #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000154583 ENSGT00390000013951 ENSGT00390000005194 ENSGT00390000009671 American black bear MODERN SPECIES 1810 CAND2 (ENSUAMG00000000579) #17 RPL32 (ENSUAMG00000000711) ##18 EFCAB12 (ENSUAMG00000000773) #19 MBD4 (ENSUAMG00000000814) #20 ENSUAMG00000000828 IFT122 (ENSUAMG00000000962) #21 RHO (ENSUAMG00000002736) #22 H1-8 (ENSUAMG00000002750) #23 ENSUAMG00000002755 #24 Polar bear MODERN SPECIES 210 TAMM41 (ENSUMAG00000017859) #7 TIMP4 (ENSUMAG00000017853) #9 SYN2 (ENSUMAG00000017656) #8 PPARG (ENSUMAG00000017617) #10 TSEN2 (ENSUMAG00000017610) #11 MKRN2OS (ENSUMAG00000017608) #12 MKRN2 (ENSUMAG00000017606) #13 RAF1 (ENSUMAG00000017600) #14 TMEM40 (ENSUMAG00000017596) #15 CAND2 (ENSUMAG00000017566) #17 RPL32 (ENSUMAG00000017557) ##18 EFCAB12 (ENSUMAG00000017549) #19 ENSUMAG00000017544 MBD4 (ENSUMAG00000017542) #20 IFT122 (ENSUMAG00000017522) #21 RHO (ENSUMAG00000017511) #22 PLXND1 (ENSUMAG00000017372) #24 TMCC1 (ENSUMAG00000017322) TRH (ENSUMAG00000017316) RBSN (ENSUMAG00000017308) MRPS25 (ENSUMAG00000017301) NR2C2 (ENSUMAG00000017295) FGD5 (ENSUMAG00000017065) C3orf20 (ENSUMAG00000017032) CCDC174 (ENSUMAG00000017022) GRIP2 (ENSUMAG00000016889) SLC6A6 (ENSUMAG00000016085) LSM3 (ENSUMAG00000015905) XPC (ENSUMAG00000015898) TMEM43 (ENSUMAG00000015893) CHCHD4 (ENSUMAG00000015891) Giant Panda MODERN SPECIES 14 SYN2 (ENSAMEG00000004794) #8 TIMP4 (ENSAMEG00000004836) #9 PPARG (ENSAMEG00000004774) #10 TSEN2 (ENSAMEG00000004748) #11 MKRN2OS (ENSAMEG00000004745) #12 MKRN2 (ENSAMEG00000004720) #13 RAF1 (ENSAMEG00000004650) #14 ENSAMEG00000025362 TMEM40 (ENSAMEG00000004646) #15 CAND2 (ENSAMEG00000004596) #17 RPL32 (ENSAMEG00000004583) ##18 ENSAMEG00000004574 #19 MBD4 (ENSAMEG00000004562) #20 ENSAMEG00000030948 IFT122 (ENSAMEG00000004471) #21 RHO (ENSAMEG00000004453) #22 H1-8 (ENSAMEG00000004448) #23 PLXND1 (ENSAMEG00000004387) #24 TMCC1 (ENSAMEG00000004384) TRH (ENSAMEG00000025033) ENSAMEG00000004361 MRPS25 (ENSAMEG00000027927) NR2C2 (ENSAMEG00000004318) FGD5 (ENSAMEG00000009227) C3orf20 (ENSAMEG00000009263) CCDC174 (ENSAMEG00000009271) GRIP2 (ENSAMEG00000009300) SLC6A6 (ENSAMEG00000009329) LSM3 (ENSAMEG00000009405) XPC (ENSAMEG00000009407) TMEM43 (ENSAMEG00000009426) Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000159798 #9 ENSGT00940000156062 #8 ENSGT00940000158273 #10 ENSGT00390000013266 #11 ENSGT00390000003839 #12 ENSGT00950000183077.a.b #13 ENSGT00940000156084 #14 ENSGT00950000186178 ENSGT00390000017530 #15 ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000153973.d ##18 ENSGT00940000153973.c.a.b.b.d ##18 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000154583 ENSGT00390000013951 ENSGT00390000005194 ENSGT00390000009671 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES 54 ENSGT00390000003282.B ENSGT00390000000616 #7 ENSGT00940000159798 #9 ENSGT00940000156062 #8 ENSGT00940000158273 #10 ENSGT00390000013266 #11 ENSGT00390000003839 #12 ENSGT00950000183077.a.b #13 ENSGT00940000156084 #14 ENSGT00390000017530 #15 ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000153973.c.a.b.b.d ##18 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000154583 ENSGT00390000013951 ENSGT00390000005194 ENSGT00390000009671 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00390000003282.B ENSGT00390000000616 #7 ENSGT00940000159798 #9 ENSGT00940000156062 #8 ENSGT00940000158273 #10 ENSGT00390000013266 #11 ENSGT00390000003839 #12 ENSGT00950000183077.a.b #13 ENSGT00940000156084 #14 ENSGT00390000017530 #15 ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000153973.c.a.b.b.d ##18 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000154583 ENSGT00390000013951 ENSGT00390000005194 ENSGT00390000009671 Microbat MODERN SPECIES 945 VGLL4 (ENSMLUG00000010597) TAMM41 (ENSMLUG00000015063) #7 TIMP4 (ENSMLUG00000006263) #9 SYN2 (ENSMLUG00000006253) #8 PPARG (ENSMLUG00000017638) #10 TSEN2 (ENSMLUG00000017641) #11 MKRN2OS (ENSMLUG00000024734) #12 MKRN2 (ENSMLUG00000017643) #13 RAF1 (ENSMLUG00000017645) #14 TMEM40 (ENSMLUG00000002835) #15 CAND2 (ENSMLUG00000006333) #17 RPL32 (ENSMLUG00000022528) ##18 ENSMLUG00000014759 #19 MBD4 (ENSMLUG00000014766) #20 IFT122 (ENSMLUG00000014771) #21 RHO (ENSMLUG00000014786) #22 ENSMLUG00000025226 #23 PLXND1 (ENSMLUG00000014790) #24 TMCC1 (ENSMLUG00000016755) TRH (ENSMLUG00000007249) RBSN (ENSMLUG00000010088) ENSMLUG00000017504 NR2C2 (ENSMLUG00000010062) FGD5 (ENSMLUG00000010008) C3orf20 (ENSMLUG00000010404) CCDC174 (ENSMLUG00000010390) GRIP2 (ENSMLUG00000003868) SLC6A6 (ENSMLUG00000003862) LSM3 (ENSMLUG00000010677) XPC (ENSMLUG00000010655) TMEM43 (ENSMLUG00000010638) Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 8 VGLL4 (ENSRFEG00010019005) TAMM41 (ENSRFEG00010018912) #7 TIMP4 (ENSRFEG00010018875) #9 SYN2 (ENSRFEG00010018840) #8 PPARG (ENSRFEG00010018692) #10 TSEN2 (ENSRFEG00010018592) #11 MKRN2OS (ENSRFEG00010018565) #12 MKRN2 (ENSRFEG00010018469) #13 RAF1 (ENSRFEG00010018423) #14 TMEM40 (ENSRFEG00010018278) #15 CAND2 (ENSRFEG00010018212) #17 RPL32 (ENSRFEG00010018162) ##18 EFCAB12 (ENSRFEG00010018070) #19 MBD4 (ENSRFEG00010018007) #20 IFT122 (ENSRFEG00010017745) #21 RHO (ENSRFEG00010017659) #22 PLXND1 (ENSRFEG00010017592) #24 TMCC1 (ENSRFEG00010017473) ENSRFEG00010017442 TRH (ENSRFEG00010017403) RBSN (ENSRFEG00010017337) MRPS25 (ENSRFEG00010017280) ENSRFEG00010017258 NR2C2 (ENSRFEG00010017049) FGD5 (ENSRFEG00010016481) C3orf20 (ENSRFEG00010016242) CCDC174 (ENSRFEG00010016163) ENSRFEG00010016101 GRIP2 (ENSRFEG00010015722) SLC6A6 (ENSRFEG00010015647) LSM3 (ENSRFEG00010015559) Megabat MODERN SPECIES 5028 RHO (ENSPVAG00000007112) #22 H1-8 (ENSPVAG00000007110) #23 Equus ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000000616 #7 ENSGT00940000159798 #9 ENSGT00940000156062 #8 ENSGT00940000158273 #10 ENSGT00390000013266 #11 ENSGT01030000235208 ENSGT00390000003839 #12 ENSGT00950000183077.a.b #13 ENSGT00940000156084.ab.a.b #14 ENSGT00950000186178 ENSGT00390000017530 #15 ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000153973.d ##18 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000154583.l ENSGT00390000013951 ENSGT00390000005194 ENSGT00390000009671 Donkey MODERN SPECIES 13 TAMM41 (ENSEASG00005014302) #7 SYN2 (ENSEASG00005014311) #8 TIMP4 (ENSEASG00005030754) #9 PPARG (ENSEASG00005014732) #10 TSEN2 (ENSEASG00005014763) #11 ENSEASG00005014772 MKRN2OS (ENSEASG00005035083) #12 MKRN2 (ENSEASG00005014776) #13 ENSEASG00005014777 #14 TMEM40 (ENSEASG00005033260) #15 ENSEASG00005025405 CAND2 (ENSEASG00005014788) #17 ENSEASG00005014792 ##18 MBD4 (ENSEASG00005014800) #20 IFT122 (ENSEASG00005014840) #21 RHO (ENSEASG00005015347) #22 H1-8 (ENSEASG00005025925) #23 PLXND1 (ENSEASG00005015351) #24 TMCC1 (ENSEASG00005015373) ENSEASG00005015376 ENSEASG00005015384 ENSEASG00005015419 NR2C2 (ENSEASG00005015422) ENSEASG00005015425 FGD5 (ENSEASG00005015426) C3orf20 (ENSEASG00005015430) CCDC174 (ENSEASG00005015436) GRIP2 (ENSEASG00005015437) SLC6A6 (ENSEASG00005015439) LSM3 (ENSEASG00005034598) XPC (ENSEASG00005015444) Horse MODERN SPECIES 7 TAMM41 (ENSECAG00000013860) #7 TIMP4 (ENSECAG00000011609) #9 SYN2 (ENSECAG00000049642) #8 PPARG (ENSECAG00000016664) #10 ENSECAG00000039510 TSEN2 (ENSECAG00000012813) #11 MKRN2OS (ENSECAG00000012416) MKRN2 (ENSECAG00000024404) #13 RAF1 (ENSECAG00000011807) #14 ENSECAG00000033555 TMEM40 (ENSECAG00000008940) #15 RPL32 (ENSECAG00000049946) ##18 CAND2 (ENSECAG00000010515) #17 MBD4 (ENSECAG00000022106) #20 IFT122 (ENSECAG00000015360) #21 RHO (ENSECAG00000013709) #22 H1-8 (ENSECAG00000013614) #23 PLXND1 (ENSECAG00000009159) #24 TMCC1 (ENSECAG00000006725) TRH (ENSECAG00000006178) RBSN (ENSECAG00000021486) MRPS25 (ENSECAG00000020841) NR2C2 (ENSECAG00000003791) FGD5 (ENSECAG00000016458) C16H3orf20 (ENSECAG00000013357) ENSECAG00000049631 CCDC174 (ENSECAG00000000540) GRIP2 (ENSECAG00000013613) SLC6A6 (ENSECAG00000012750) LSM3 (ENSECAG00000007803) XPC (ENSECAG00000015499) Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00390000000616 #7 ENSGT00940000156062 #8 ENSGT00940000159798 #9 ENSGT00940000158273 #10 ENSGT00390000013266 #11 ENSGT00390000003839 #12 ENSGT00950000183077.a.b #13 ENSGT00940000156084 #14 ENSGT00390000017530 #15 ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000153973.c.a.a ##18 ENSGT00940000153973.c.a.b.b ##18 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000154583 ENSGT00390000013951 ENSGT00390000005194 ENSGT00390000009671 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES 868 ENSGT00940000153973.c.a.b.b ##18 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 Armadillo MODERN SPECIES 3629 RPL32 (ENSDNOG00000043660) ##18 EFCAB12 (ENSDNOG00000049183) #19 MBD4 (ENSDNOG00000049619) #20 IFT122 (ENSDNOG00000015117) #21 RHO (ENSDNOG00000015133) #22 PLXND1 (ENSDNOG00000038684) #24 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00940000156027 ENSGT00940000160690 ENSGT00390000017509 ENSGT00390000003282.B ENSGT00390000000616 #7 ENSGT00940000158273 #10 ENSGT00390000013266 #11 ENSGT00950000183077.a.b #13 ENSGT00940000156084 #14 ENSGT00390000017530 #15 ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000153973.c.a.a ##18 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000154583 ENSGT00390000013951 ENSGT00390000005194 ENSGT00390000009671 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00390000017509 ENSGT00390000003282.B ENSGT00390000000616 #7 ENSGT00940000159798 #9 ENSGT00940000156062 #8 ENSGT00940000158273 #10 ENSGT00390000013266 #11 ENSGT00950000183077.a.b #13 ENSGT00940000156084 #14 ENSGT00390000017530 #15 ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000153973.c.a.a ##18 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000154583 ENSGT00390000013951 ENSGT00390000005194 ENSGT00390000009671 Elephant MODERN SPECIES 49 ATG7 (ENSLAFG00000017130) VGLL4 (ENSLAFG00000017133) TAMM41 (ENSLAFG00000011239) #7 TIMP4 (ENSLAFG00000004660) #9 SYN2 (ENSLAFG00000004657) #8 PPARG (ENSLAFG00000030870) #10 TSEN2 (ENSLAFG00000009300) #11 MKRN2 (ENSLAFG00000011601) #13 RAF1 (ENSLAFG00000011608) #14 TMEM40 (ENSLAFG00000010230) #15 CAND2 (ENSLAFG00000017706) #17 ENSLAFG00000032737 ##18 EFCAB12 (ENSLAFG00000010605) #19 MBD4 (ENSLAFG00000010609) #20 IFT122 (ENSLAFG00000010612) #21 RHO (ENSLAFG00000001359) #22 PLXND1 (ENSLAFG00000003012) #24 TMCC1 (ENSLAFG00000013730) TRH (ENSLAFG00000015165) RBSN (ENSLAFG00000004227) MRPS25 (ENSLAFG00000022178) NR2C2 (ENSLAFG00000010224) FGD5 (ENSLAFG00000010491) C3orf20 (ENSLAFG00000015670) CCDC174 (ENSLAFG00000012663) GRIP2 (ENSLAFG00000032264) SLC6A6 (ENSLAFG00000015145) LSM3 (ENSLAFG00000023308) XPC (ENSLAFG00000022512) TMEM43 (ENSLAFG00000006731) CHCHD4 (ENSLAFG00000018489) Hyrax MODERN SPECIES 2091 MBD4 (ENSPCAG00000012915) #20 IFT122 (ENSPCAG00000012964) #21 RHO (ENSPCAG00000013147) #22 H1-8 (ENSPCAG00000013200) #23 PLXND1 (ENSPCAG00000013240) #24 TMCC1 (ENSPCAG00000013426) Tenrec MODERN SPECIES 5531 IFT122 (ENSETEG00000000276) #21 RHO (ENSETEG00000000282) #22 Marsupialia ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00390000000616 #7 ENSGT00940000156062 #8 ENSGT00940000159798 #9 ENSGT00940000158273 #10 ENSGT00390000013266 #11 ENSGT00390000003839 #12 ENSGT00950000183077.a.b #13 ENSGT00940000156084 #14 ENSGT00390000017530 #15 ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000153973 #18 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a.a #20 ENSGT00530000063687.a.b #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00510000050664 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000154583 ENSGT00390000013951 ENSGT00390000005194 Opossum MODERN SPECIES 5 ENSMODG00000006153 #7 SYN2 (ENSMODG00000006159) #8 TIMP4 (ENSMODG00000006199) #9 PPARG (ENSMODG00000006233) #10 TSEN2 (ENSMODG00000006249) #11 MKRN2OS (ENSMODG00000006265) #12 MKRN2 (ENSMODG00000006280) #13 RAF1 (ENSMODG00000006307) #14 ENSMODG00000025518 #15 CAND2 (ENSMODG00000006377) #17 RPL32 (ENSMODG00000037211) #18 ENSMODG00000006335 #19 ENSMODG00000006399 #20 ENSMODG00000042737 #20 IFT122 (ENSMODG00000006462) #21 RHO (ENSMODG00000006488) #22 ENSMODG00000028422 #23 PLXND1 (ENSMODG00000006963) #24 TMCC1 (ENSMODG00000006987) ENSMODG00000044035 ENSMODG00000042057 ENSMODG00000028708 RBSN (ENSMODG00000007011) MRPS25 (ENSMODG00000007018) NR2C2 (ENSMODG00000007047) ENSMODG00000028915 FGD5 (ENSMODG00000007131) ENSMODG00000046894 CCDC174 (ENSMODG00000007181) ENSMODG00000038869 ENSMODG00000007232 Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00390000000616 #7 ENSGT00940000156062 #8 ENSGT00940000159798 #9 ENSGT00940000158273 #10 ENSGT00390000013266 #11 ENSGT00390000003839 #12 ENSGT00950000183077.a.b #13 ENSGT00940000156084 #14 ENSGT00390000017530 #15 ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000153973 #18 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a.a #20 ENSGT00530000063687.a.b #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00510000050664 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000154583 ENSGT00390000013951 ENSGT00390000005194 Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000000616 #7 ENSGT00940000156062 #8 ENSGT00940000159798 #9 ENSGT00940000158273 #10 ENSGT00390000013266 #11 ENSGT00390000003839 #12 ENSGT00950000183077.a.b #13 ENSGT00940000156084 #14 ENSGT00390000017530 #15 ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000153973 #18 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a.a #20 ENSGT00530000063687.a.b #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00510000050664 ENSGT00940000157922 ENSGT00440000033958 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000154583 ENSGT00390000013951 ENSGT00390000005194 ENSGT00390000009671 ENSGT00390000013132 Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000000616 #7 ENSGT00940000156062 #8 ENSGT00940000159798 #9 ENSGT00940000158273 #10 ENSGT00390000013266 #11 ENSGT00390000003839 #12 ENSGT00950000183077.a.b #13 ENSGT00940000156084 #14 ENSGT00390000017530 #15 ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000153973 #18 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a.a #20 ENSGT00530000063687.a.b #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00510000050664 ENSGT00940000157922 ENSGT00440000033958 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000154583 ENSGT00390000013951 ENSGT00390000005194 ENSGT00390000009671 ENSGT00390000013132 koala MODERN SPECIES 10 TAMM41 (ENSPCIG00000036857) #7 SYN2 (ENSPCIG00000002007) #8 TIMP4 (ENSPCIG00000002040) #9 PPARG (ENSPCIG00000002060) #10 TSEN2 (ENSPCIG00000002191) #11 MKRN2OS (ENSPCIG00000002201) #12 MKRN2 (ENSPCIG00000031653) #13 RAF1 (ENSPCIG00000009694) #14 TMEM40 (ENSPCIG00000002215) #15 CAND2 (ENSPCIG00000002229) #17 RPL32 (ENSPCIG00000036095) #18 ENSPCIG00000002263 #19 ENSPCIG00000002276 #20 ENSPCIG00000035263 #20 IFT122 (ENSPCIG00000002304) #21 RHO (ENSPCIG00000002359) #22 PLXND1 (ENSPCIG00000002459) #24 TMCC1 (ENSPCIG00000002496) ENSPCIG00000023527 RBSN (ENSPCIG00000023528) ENSPCIG00000023530 NR2C2 (ENSPCIG00000023531) FGD5 (ENSPCIG00000023533) ENSPCIG00000014781 GRIP2 (ENSPCIG00000024617) SLC6A6 (ENSPCIG00000025392) LSM3 (ENSPCIG00000036405) XPC (ENSPCIG00000007579) TMEM43 (ENSPCIG00000007570) ENSPCIG00000007567 ENSPCIG00000007553 Common wonbat MODERN SPECIES 1012 TAMM41 (ENSVURG00010013046) #7 ENSVURG00010013071 #8 TIMP4 (ENSVURG00010013076) #9 ENSVURG00010013080 #8 PPARG (ENSVURG00010013093) #10 TSEN2 (ENSVURG00010013138) #11 MKRN2OS (ENSVURG00010013158) #12 MKRN2 (ENSVURG00010013169) #13 RAF1 (ENSVURG00010013196) #14 TMEM40 (ENSVURG00010013215) #15 CAND2 (ENSVURG00010013279) #17 ENSVURG00010014192 #18 ENSVURG00010014212 #19 ENSVURG00010014225 #20 IFT122 (ENSVURG00010014263) #21 RHO (ENSVURG00010014434) #22 PLXND1 (ENSVURG00010014456) #24 TMCC1 (ENSVURG00010014518) RBSN (ENSVURG00010014533) MRPS25 (ENSVURG00010014548) NR2C2 (ENSVURG00010014575) ENSVURG00010014858 FGD5 (ENSVURG00010014863) CCDC174 (ENSVURG00010014898) GRIP2 (ENSVURG00010014963) SLC6A6 (ENSVURG00010015726) ENSVURG00010015743 XPC (ENSVURG00010015746) TMEM43 (ENSVURG00010015761) CHCHD4 (ENSVURG00010015776) ENSVURG00010015780 Wallaby MODERN SPECIES 3491 RHO (ENSMEUG00000007196) #22 Tasmanian devil MODERN SPECIES ENSSHAG00000018702 TAMM41 (ENSSHAG00000018802) #7 SYN2 (ENSSHAG00000006422) #8 TIMP4 (ENSSHAG00000006738) #9 PPARG (ENSSHAG00000008610) #10 TSEN2 (ENSSHAG00000010530) #11 MKRN2OS (ENSSHAG00000010787) #12 ENSSHAG00000011021 #13 RAF1 (ENSSHAG00000011099) #14 TMEM40 (ENSSHAG00000012194) #15 CAND2 (ENSSHAG00000012567) #17 ENSSHAG00000012782 #18 ENSSHAG00000012822 #19 MBD4 (ENSSHAG00000012953) #20 IFT122 (ENSSHAG00000013078) #21 RHO (ENSSHAG00000013534) #22 ENSSHAG00000029482 #23 PLXND1 (ENSSHAG00000013651) #24 TMCC1 (ENSSHAG00000014733) ENSSHAG00000026312 ENSSHAG00000015988 NR2C2 (ENSSHAG00000016078) ENSSHAG00000024996 FGD5 (ENSSHAG00000016383) ENSSHAG00000017083 CCDC174 (ENSSHAG00000017233) GRIP2 (ENSSHAG00000017717) SLC6A6 (ENSSHAG00000017858) LSM3 (ENSSHAG00000031935) XPC (ENSSHAG00000001194) TMEM43 (ENSSHAG00000029957) Platypus MODERN SPECIES 84 ENSOANG00000012192 ENSOANG00000011702 SHQ1 (ENSOANG00000013705) GXYLT2 (ENSOANG00000036924) ENSOANG00000036060 PDZRN3 (ENSOANG00000042812) ENSOANG00000048399 SEC13 (ENSOANG00000009346) ENSOANG00000003781 #17 ENSOANG00000040437 RPL32 (ENSOANG00000037596) ENSOANG00000028240 MBD4 (ENSOANG00000004589) #20 IFT122 (ENSOANG00000010892) #21 PLXND1 (ENSOANG00000050054) #24 RHO (ENSOANG00000003778) #22 ENSOANG00000037378 #23 ANPEP (ENSOANG00000000369) AP3S2 (ENSOANG00000041499) ARPIN (ENSOANG00000036108) ZNF710 (ENSOANG00000046750) IDH2 (ENSOANG00000015236) SEMA4B (ENSOANG00000013510) CIB1 (ENSOANG00000050542) GDPGP1 (ENSOANG00000036614) VPS33B (ENSOANG00000040875) HDDC3 (ENSOANG00000043013) ENSOANG00000039607 TTLL13 (ENSOANG00000006840) PRC1 (ENSOANG00000038100) UNC45A (ENSOANG00000022352) Sauria ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00390000014353 ENSGT00940000159835 ENSGT00940000155616 ENSGT00390000004064 ENSGT00940000153393.B ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000158890 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000154583 ENSGT00390000013951 ENSGT00390000005194 ENSGT00390000009671 Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00390000014353 ENSGT00940000159835 ENSGT00940000155616 ENSGT00390000004064 ENSGT00940000153393.B ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000158890 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000154583 ENSGT00390000013951 ENSGT00390000005194 ENSGT00390000009671 ENSGT00390000013132 tuatara MODERN SPECIES 1257 RAD18 (ENSSPUG00000017486) SRGAP3 (ENSSPUG00000017469) THUMPD3 (ENSSPUG00000017461) ENSSPUG00000017457 IRAK2 (ENSSPUG00000017447) TATDN2 (ENSSPUG00000017440) GHRL (ENSSPUG00000017426) SEC13 (ENSSPUG00000017415) CAND2 (ENSSPUG00000017390) #17 ENSSPUG00000017356 MBD4 (ENSSPUG00000017344) #20 IFT122 (ENSSPUG00000017322) #21 RHO (ENSSPUG00000017307) #22 PLXND1 (ENSSPUG00000017263) #24 ENSSPUG00000017249 ENSSPUG00000017245 TRH (ENSSPUG00000017236) RBSN (ENSSPUG00000017211) MRPS25 (ENSSPUG00000017201) NR2C2 (ENSSPUG00000017164) FGD5 (ENSSPUG00000017109) CCDC174 (ENSSPUG00000017085) GRIP2 (ENSSPUG00000017068) ENSSPUG00000017063 ENSSPUG00000017055 ENSSPUG00000017047 XPC (ENSSPUG00000017028) TMEM43 (ENSSPUG00000017015) Episquamata ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000163873.k ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00390000014353 ENSGT00940000159835 ENSGT00940000155616 ENSGT00390000004064 ENSGT00940000153393.B ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000158890 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000154583 ENSGT00390000013951 ENSGT00390000005194 ENSGT00390000009671 ENSGT00390000013132 Laterata ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000163873.k ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00390000014353 ENSGT00940000159835 ENSGT00940000155616 ENSGT00390000004064 ENSGT00940000153393.B ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000158890 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000154583 ENSGT00390000013951.d ENSGT00390000005194 ENSGT00390000009671 ENSGT00390000013132 Common wall lizard MODERN SPECIES 10 OXTR (ENSPMRG00000005313) RAD18 (ENSPMRG00000005296) ENSPMRG00000005292 SRGAP3 (ENSPMRG00000005264) THUMPD3 (ENSPMRG00000005254) ENSPMRG00000005246 IRAK2 (ENSPMRG00000005238) TATDN2 (ENSPMRG00000005231) GHRL (ENSPMRG00000005213) SEC13 (ENSPMRG00000005203) CAND2 (ENSPMRG00000005087) #17 ENSPMRG00000005060 ENSPMRG00000005051 #19 MBD4 (ENSPMRG00000005046) #20 IFT122 (ENSPMRG00000005031) #21 RHO (ENSPMRG00000005016) #22 PLXND1 (ENSPMRG00000005004) #24 TMCC1 (ENSPMRG00000004998) RBSN (ENSPMRG00000004989) MRPS25 (ENSPMRG00000004986) NR2C2 (ENSPMRG00000004983) FGD5 (ENSPMRG00000004976) C3orf20 (ENSPMRG00000004963) CCDC174 (ENSPMRG00000004947) GRIP2 (ENSPMRG00000004886) SLC6A6 (ENSPMRG00000004867) LSM3 (ENSPMRG00000004857) XPC (ENSPMRG00000011328) TMEM43 (ENSPMRG00000011312) CHCHD4 (ENSPMRG00000011303) ENSPMRG00000011299 Argentine black and white tegu MODERN SPECIES 8 OXTR (ENSSMRG00000003334) RAD18 (ENSSMRG00000003315) ENSSMRG00000003306 SRGAP3 (ENSSMRG00000003257) THUMPD3 (ENSSMRG00000003192) ENSSMRG00000003190 IRAK2 (ENSSMRG00000003184) TATDN2 (ENSSMRG00000003178) GHRL (ENSSMRG00000003101) SEC13 (ENSSMRG00000003096) CAND2 (ENSSMRG00000003068) #17 ENSSMRG00000003058 ENSSMRG00000003057 #19 MBD4 (ENSSMRG00000003044) #20 IFT122 (ENSSMRG00000003022) #21 RHO (ENSSMRG00000003021) #22 PLXND1 (ENSSMRG00000002931) #24 TMCC1 (ENSSMRG00000002914) TRH (ENSSMRG00000002898) RBSN (ENSSMRG00000002888) MRPS25 (ENSSMRG00000002859) NR2C2 (ENSSMRG00000002839) FGD5 (ENSSMRG00000002830) C3orf20 (ENSSMRG00000002762) CCDC174 (ENSSMRG00000002656) GRIP2 (ENSSMRG00000002602) SLC6A6 (ENSSMRG00000002572) ENSSMRG00000002551 XPC (ENSSMRG00000002538) TMEM43 (ENSSMRG00000002526) CHCHD4 (ENSSMRG00000002521) Toxicofera ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT01030000235965 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00390000014353 ENSGT00940000159835 ENSGT00940000155616 ENSGT00390000004064 ENSGT00940000153393.B ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000158890 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000154583 ENSGT00390000013951 ENSGT00390000005194 ENSGT00390000009671 ENSGT00390000013132 Elapidae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000163873.k ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT01030000235965 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00390000014353 ENSGT00940000159835 ENSGT00940000155616 ENSGT00940000153393.B ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000158890 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000154583 ENSGT00390000013951 ENSGT00390000005194 ENSGT00390000009671 ENSGT00390000013132 Indian cobra MODERN SPECIES 1 LMCD1 (ENSNNAG00000018484) SSUH2 (ENSNNAG00000018487) ENSNNAG00000018494 OXTR (ENSNNAG00000018500) ENSNNAG00000018503 SRGAP3 (ENSNNAG00000018519) THUMPD3 (ENSNNAG00000018537) ENSNNAG00000018544 ENSNNAG00000018550 TATDN2 (ENSNNAG00000018553) SEC13 (ENSNNAG00000018559) CAND2 (ENSNNAG00000018590) #17 ENSNNAG00000018642 ENSNNAG00000018649 #19 IFT122 (ENSNNAG00000018719) #21 RHO (ENSNNAG00000018891) #22 ENSNNAG00000018895 ENSNNAG00000018896 TMCC1 (ENSNNAG00000018897) TRH (ENSNNAG00000018901) RBSN (ENSNNAG00000018903) MRPS25 (ENSNNAG00000018905) NR2C2 (ENSNNAG00000018912) FGD5 (ENSNNAG00000018923) C3orf20 (ENSNNAG00000018933) CCDC174 (ENSNNAG00000018938) GRIP2 (ENSNNAG00000018949) SLC6A6 (ENSNNAG00000018965) LSM3 (ENSNNAG00000018966) XPC (ENSNNAG00000018970) TMEM43 (ENSNNAG00000018972) Elapidae_a ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00440000038003 ENSGT00940000163873.k ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a.c ENSGT00530000063557.a ENSGT00390000014353 ENSGT00940000159835 ENSGT00940000155616.e ENSGT00940000153393.B ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000158890 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000154583 ENSGT00390000013951 ENSGT00390000005194 ENSGT00390000009671 ENSGT00390000013132 Blue-lipped sea krait MODERN SPECIES 10440 RHO (ENSLLTG00000011725) #22 Acanthophiinae ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00440000038003 ENSGT00940000163873.k ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a.c ENSGT00530000063557.a ENSGT00390000014353 ENSGT00940000159835 ENSGT00940000155616.e ENSGT00940000153393.B ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000158890 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000154583 ENSGT00390000013951 ENSGT00390000005194 ENSGT00390000009671 ENSGT00390000013132 Eastern brown snake MODERN SPECIES 3 ENSPTXG00000002905 OXTR (ENSPTXG00000002906) RAD18 (ENSPTXG00000002908) SRGAP3 (ENSPTXG00000002911) THUMPD3 (ENSPTXG00000002916) ENSPTXG00000002920 IRAK2 (ENSPTXG00000002922) ENSPTXG00000002923 SEC13 (ENSPTXG00000002924) CAND2 (ENSPTXG00000002928) #17 ENSPTXG00000002933 ENSPTXG00000002935 #19 MBD4 (ENSPTXG00000002936) #20 ENSPTXG00000002938 #21 ENSPTXG00000002940 #21 RHO (ENSPTXG00000002941) #22 PLXND1 (ENSPTXG00000002956) #24 TMCC1 (ENSPTXG00000003030) RBSN (ENSPTXG00000003032) MRPS25 (ENSPTXG00000003034) NR2C2 (ENSPTXG00000003035) FGD5 (ENSPTXG00000003045) C3orf20 (ENSPTXG00000003048) CCDC174 (ENSPTXG00000003052) GRIP2 (ENSPTXG00000003056) SLC6A6 (ENSPTXG00000003063) LSM3 (ENSPTXG00000003064) XPC (ENSPTXG00000003066) TMEM43 (ENSPTXG00000003067) CHCHD4 (ENSPTXG00000003068) ENSPTXG00000003070 Mainland tiger snake MODERN SPECIES 2 LMCD1 (ENSNSUG00000006355) SSUH2 (ENSNSUG00000006353) ENSNSUG00000006350 OXTR (ENSNSUG00000006347) ENSNSUG00000006346 SRGAP3 (ENSNSUG00000006301) THUMPD3 (ENSNSUG00000006295) ENSNSUG00000006287 IRAK2 (ENSNSUG00000006285) ENSNSUG00000006283 SEC13 (ENSNSUG00000006282) CAND2 (ENSNSUG00000006281) #17 ENSNSUG00000006279 ENSNSUG00000006278 #20 IFT122 (ENSNSUG00000006277) #21 RHO (ENSNSUG00000006276) #22 ENSNSUG00000006275 ENSNSUG00000006274 TMCC1 (ENSNSUG00000006273) TRH (ENSNSUG00000006272) RBSN (ENSNSUG00000006202) MRPS25 (ENSNSUG00000006200) NR2C2 (ENSNSUG00000006199) FGD5 (ENSNSUG00000006181) C3orf20 (ENSNSUG00000006177) CCDC174 (ENSNSUG00000006176) GRIP2 (ENSNSUG00000006160) SLC6A6 (ENSNSUG00000002092) LSM3 (ENSNSUG00000002076) XPC (ENSNSUG00000002003) TMEM43 (ENSNSUG00000001998) Lizard MODERN SPECIES 887 OXTR (ENSACAG00000011241) ENSACAG00000037426 ENSACAG00000014985 THUMPD3 (ENSACAG00000014974) vhl (ENSACAG00000042965) ENSACAG00000039666 IRAK2 (ENSACAG00000014931) TATDN2 (ENSACAG00000014909) GHRL (ENSACAG00000043636) SEC13 (ENSACAG00000014855) ENSACAG00000014771 #17 rpl32 (ENSACAG00000037005) ENSACAG00000014760 #19 MBD4 (ENSACAG00000014733) #20 IFT122 (ENSACAG00000014304) #21 rho (ENSACAG00000014258) #22 PLXND1 (ENSACAG00000014092) #24 TMCC1 (ENSACAG00000014065) Archelosauria ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00390000014353 ENSGT00940000159835 ENSGT00940000155616 ENSGT00390000004064 ENSGT00940000153393.B ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000158890 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000154583 ENSGT00390000013951 ENSGT00390000005194 ENSGT00390000009671 Archosauria ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00390000014353 ENSGT00940000159835 ENSGT00940000155616 ENSGT00390000004064 ENSGT00940000153393.B ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000158890 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 Aves ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00390000014353 ENSGT00940000159835 ENSGT00390000004064 ENSGT00940000153393.B ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000158890 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 Neognathae ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00390000014353 ENSGT00940000159835 ENSGT00390000004064 ENSGT00940000153393.B ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000158890 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 Neognathae_b ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00390000014353 ENSGT00940000159835 ENSGT00940000153393.B ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000158890 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 Neognathae_c ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00390000014353 ENSGT00940000159835 ENSGT00940000153393.B ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000158890 ENSGT00390000014874.d #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 Kakapo MODERN SPECIES 3 H1-10 (ENSSHBG00005018576) ENSSHBG00005018580 HMCES (ENSSHBG00005018584) COPG1 (ENSSHBG00005018592) ENSSHBG00005018599 UQCRC1 (ENSSHBG00005018615) SLC26A6 (ENSSHBG00005018632) CELSR3 (ENSSHBG00005018745) NCKIPSD (ENSSHBG00005019000) IP6K2 (ENSSHBG00005019005) SEC13 (ENSSHBG00005019010) CAND2 (ENSSHBG00005019016) #17 ENSSHBG00005019020 MBD4 (ENSSHBG00005019025) #20 IFT122 (ENSSHBG00005019033) #21 RHO (ENSSHBG00005019040) #22 ENSSHBG00005019044 #23 PLXND1 (ENSSHBG00005019050) #24 TMCC1 (ENSSHBG00005019058) TRH (ENSSHBG00005019061) RBSN (ENSSHBG00005019063) MRPS25 (ENSSHBG00005019064) NR2C2 (ENSSHBG00005019067) FGD5 (ENSSHBG00005019073) Golden eagle MODERN SPECIES 12 LMCD1 (ENSACCG00020010014) SSUH2 (ENSACCG00020010024) CAV3 (ENSACCG00020010035) OXTR (ENSACCG00020010045) RAD18 (ENSACCG00020010080) SRGAP3 (ENSACCG00020010374) THUMPD3 (ENSACCG00020010551) ENSACCG00020010562 IRAK2 (ENSACCG00020010579) SEC13 (ENSACCG00020010591) CAND2 (ENSACCG00020010611) #17 ENSACCG00020010634 ENSACCG00020010648 #19 MBD4 (ENSACCG00020010658) #20 IFT122 (ENSACCG00020010690) #21 RHO (ENSACCG00020010735) #22 ENSACCG00020010746 #23 PLXND1 (ENSACCG00020010906) #24 TMCC1 (ENSACCG00020011044) TRH (ENSACCG00020011054) RBSN (ENSACCG00020011067) MRPS25 (ENSACCG00020011077) NR2C2 (ENSACCG00020011085) FGD5 (ENSACCG00020011108) Passeriformes ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000157717 ENSGT01030000234648.a.a.d ENSGT00940000158813 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00390000014353 ENSGT00940000159835 ENSGT00940000153393.B ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000158890 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 Great tit MODERN SPECIES 3 GRM7 (ENSPMJG00000005895) LMCD1 (ENSPMJG00000005956) CAV3 (ENSPMJG00000005958) OXTR (ENSPMJG00000005959) RAD18 (ENSPMJG00000005960) ENSPMJG00000005966 SRGAP3 (ENSPMJG00000005970) THUMPD3 (ENSPMJG00000005977) ENSPMJG00000005978 IRAK2 (ENSPMJG00000005988) SEC13 (ENSPMJG00000006004) CAND2 (ENSPMJG00000006009) #17 ENSPMJG00000006014 MBD4 (ENSPMJG00000006016) #20 IFT122 (ENSPMJG00000006019) #21 RHO (ENSPMJG00000006031) #22 ENSPMJG00000006034 #23 PLXND1 (ENSPMJG00000006035) #24 TMCC1 (ENSPMJG00000006039) TRH (ENSPMJG00000006045) RBSN (ENSPMJG00000006048) MRPS25 (ENSPMJG00000006051) NR2C2 (ENSPMJG00000006052) FGD5 (ENSPMJG00000006055) Passeriformes_d ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000157717 ENSGT01030000234648.a.a.d ENSGT00940000158813 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00390000014353 ENSGT00940000159835 ENSGT00940000153393.B ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000158890 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 Flycatcher MODERN SPECIES 3 ENSFALG00000025075 LMCD1 (ENSFALG00000013612) CAV3 (ENSFALG00000024966) OXTR (ENSFALG00000013622) RAD18 (ENSFALG00000013625) SRGAP3 (ENSFALG00000013628) ENSFALG00000023660 ENSFALG00000026425 THUMPD3 (ENSFALG00000013631) ENSFALG00000013639 ENSFALG00000013647 ENSFALG00000013653 #17 ENSFALG00000013662 MBD4 (ENSFALG00000013663) #20 IFT122 (ENSFALG00000013670) #21 RHO (ENSFALG00000013673) #22 ENSFALG00000013675 #23 PLXND1 (ENSFALG00000013678) #24 ENSFALG00000025056 TMCC1 (ENSFALG00000013680) TRH (ENSFALG00000027430) RBSN (ENSFALG00000025775) ENSFALG00000013684 NR2C2 (ENSFALG00000013685) ENSFALG00000013687 Passeriformes_g ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000157717 ENSGT01030000234648.a.a.d ENSGT00940000158813 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00390000014353 ENSGT00940000159835 ENSGT00940000153393.B ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000158890 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 Medium ground finch MODERN SPECIES 123 GRM7 (ENSGFOG00000008966) LMCD1 (ENSGFOG00000008974) ENSGFOG00000008981 CAV3 (ENSGFOG00000008983) OXTR (ENSGFOG00000008986) RAD18 (ENSGFOG00000008990) SRGAP3 (ENSGFOG00000009033) THUMPD3 (ENSGFOG00000009508) ENSGFOG00000009517 IRAK2 (ENSGFOG00000009530) SEC13 (ENSGFOG00000009539) CAND2 (ENSGFOG00000009552) #17 ENSGFOG00000009571 ENSGFOG00000009581 #20 IFT122 (ENSGFOG00000009686) #21 RHO (ENSGFOG00000012583) #22 ENSGFOG00000012587 #23 PLXND1 (ENSGFOG00000012603) #24 TMCC1 (ENSGFOG00000012645) TRH (ENSGFOG00000012648) RBSN (ENSGFOG00000012655) MRPS25 (ENSGFOG00000012665) NR2C2 (ENSGFOG00000012670) FGD5 (ENSGFOG00000012681) Passeroidea ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000157717 ENSGT01030000234648.a.a.d ENSGT00940000158813 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00390000014353 ENSGT00940000159835 ENSGT00940000153393.B ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000158890 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 Zebra finch MODERN SPECIES 3 EDEM1 (ENSTGUG00000010316) GRM7 (ENSTGUG00000010358) LMCD1 (ENSTGUG00000010388) CAV3 (ENSTGUG00000010401) OXTR (ENSTGUG00000020441) RAD18 (ENSTGUG00000010405) SRGAP3 (ENSTGUG00000010415) THUMPD3 (ENSTGUG00000010440) ENSTGUG00000024732 IRAK2 (ENSTGUG00000010449) SEC13 (ENSTGUG00000010453) CAND2 (ENSTGUG00000010461) #17 MBD4 (ENSTGUG00000010478) #20 RPL32 (ENSTGUG00000010472) IFT122 (ENSTGUG00000010483) #21 RHO (ENSTGUG00000024955) #22 ENSTGUG00000025075 #23 PLXND1 (ENSTGUG00000010534) #24 ENSTGUG00000027084 ENSTGUG00000010564 TRH (ENSTGUG00000010565) RBSN (ENSTGUG00000010568) MRPS25 (ENSTGUG00000023381) NR2C2 (ENSTGUG00000010590) FGD5 (ENSTGUG00000010607) Common canary MODERN SPECIES 86 ENSSCAG00000015338 LMCD1 (ENSSCAG00000015348) CAV3 (ENSSCAG00000015351) OXTR (ENSSCAG00000015355) RAD18 (ENSSCAG00000015359) SRGAP3 (ENSSCAG00000015492) THUMPD3 (ENSSCAG00000015878) ENSSCAG00000015885 IRAK2 (ENSSCAG00000015888) SEC13 (ENSSCAG00000015892) CAND2 (ENSSCAG00000015898) #17 ENSSCAG00000015908 MBD4 (ENSSCAG00000015913) #20 IFT122 (ENSSCAG00000016026) #21 RHO (ENSSCAG00000016206) #22 ENSSCAG00000016208 #23 PLXND1 (ENSSCAG00000016217) #24 TMCC1 (ENSSCAG00000016238) TRH (ENSSCAG00000016240) RBSN (ENSSCAG00000016242) MRPS25 (ENSSCAG00000016246) NR2C2 (ENSSCAG00000016251) FGD5 (ENSSCAG00000016268) Galloanserae ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00390000014353 ENSGT00940000159835 ENSGT00390000004064 ENSGT00940000153393.B ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000158890 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 Anatidae ANCESTRAL SPECIES 41 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00390000014353 ENSGT00940000159835 ENSGT00390000004064 ENSGT00940000153393.B ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000158890 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 Pink-footed goose MODERN SPECIES 49 LMCD1 (ENSABRG00000009469) SSUH2 (ENSABRG00000009453) CAV3 (ENSABRG00000009447) OXTR (ENSABRG00000009437) RAD18 (ENSABRG00000009421) SRGAP3 (ENSABRG00000009392) THUMPD3 (ENSABRG00000009373) ENSABRG00000009365 IRAK2 (ENSABRG00000009344) GHRL (ENSABRG00000009307) SEC13 (ENSABRG00000009259) CAND2 (ENSABRG00000008196) #17 ENSABRG00000008104 ENSABRG00000008088 #20 IFT122 (ENSABRG00000005701) #21 RHO (ENSABRG00000005524) #22 ENSABRG00000005508 #23 PLXND1 (ENSABRG00000005465) #24 ENSABRG00000005456 ENSABRG00000005451 TRH (ENSABRG00000005446) RBSN (ENSABRG00000005426) MRPS25 (ENSABRG00000005422) NR2C2 (ENSABRG00000004647) FGD5 (ENSABRG00000004533) Duck MODERN SPECIES 4 GRM7 (ENSAPLG00000002555) LMCD1 (ENSAPLG00000002970) SSUH2 (ENSAPLG00000003015) CAV3 (ENSAPLG00000003098) OXTR (ENSAPLG00000003100) RAD18 (ENSAPLG00000003138) SRGAP3 (ENSAPLG00000003289) THUMPD3 (ENSAPLG00000003598) ENSAPLG00000003676 IRAK2 (ENSAPLG00000003679) GHRL (ENSAPLG00000003792) SEC13 (ENSAPLG00000003815) CAND2 (ENSAPLG00000003936) #17 ENSAPLG00000004194 IFT122 (ENSAPLG00000004234) #21 RHO (ENSAPLG00000005189) #22 ENSAPLG00000005857 #23 ENSAPLG00000024672 PLXND1 (ENSAPLG00000005859) #24 TMCC1 (ENSAPLG00000007270) TRH (ENSAPLG00000007356) RBSN (ENSAPLG00000007412) MRPS25 (ENSAPLG00000029888) NR2C2 (ENSAPLG00000007538) FGD5 (ENSAPLG00000007924) ENSAPLG00000004192 TPRA1 (ENSAPLG00000004211) MCM2 (ENSAPLG00000004520) PODXL2 (ENSAPLG00000005040) ABTB1 (ENSAPLG00000005102) MGLL (ENSAPLG00000005523) Phasianidae ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT01030000234648.a.a.d ENSGT00940000158813 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a.e ENSGT00530000063557.a ENSGT00390000014353 ENSGT00940000159835 ENSGT00390000004064 ENSGT00940000153393.B ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000158890 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 Phasianidae_b ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT01030000234648.a.a.d ENSGT00940000158813 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a.e ENSGT00530000063557.a ENSGT00390000014353 ENSGT00940000159835 ENSGT00390000004064 ENSGT00940000153393.B ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000158890 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 Chicken MODERN SPECIES 3 GRM7 (ENSGALG00010019426) LMCD1 (ENSGALG00010019441) CAV3 (ENSGALG00010019451) OXTR (ENSGALG00010019473) RAD18 (ENSGALG00010019584) SRGAP3 (ENSGALG00010019624) THUMPD3 (ENSGALG00010018999) ENSGALG00010019006 IRAK2 (ENSGALG00010019017) GHRL (ENSGALG00010019047) SEC13 (ENSGALG00010022642) CAND2 (ENSGALG00010019065) #17 RPL32 (ENSGALG00010019093) MBD4 (ENSGALG00010019110) #20 IFT122 (ENSGALG00010019144) #21 RHO (ENSGALG00010019173) #22 ENSGALG00010019190 #23 PLXND1 (ENSGALG00010019208) #24 TMCC1 (ENSGALG00010021874) TRH (ENSGALG00010021890) RBSN (ENSGALG00010021905) MRPS25 (ENSGALG00010021916) NR2C2 (ENSGALG00010021978) FGD5 (ENSGALG00010022028) Turkey MODERN SPECIES 5 GRM7 (ENSMGAG00000010102) ENSMGAG00000018916 ENSMGAG00000019285 ENSMGAG00000010131 OXTR (ENSMGAG00000010127) ENSMGAG00000010109 ENSMGAG00000010119 ENSMGAG00000010182 IRAK2 (ENSMGAG00000010194) ENSMGAG00000010214 SEC13 (ENSMGAG00000010222) ENSMGAG00000010238 #17 ENSMGAG00000010254 MBD4 (ENSMGAG00000010259) #20 IFT122 (ENSMGAG00000010263) #21 RHO (ENSMGAG00000010301) #22 PLXND1 (ENSMGAG00000010317) #24 TMCC1 (ENSMGAG00000010363) TRH (ENSMGAG00000010403) ENSMGAG00000010410 ENSMGAG00000010421 NR2C2 (ENSMGAG00000010372) ENSMGAG00000010431 Japanese quail MODERN SPECIES 3 ENSCJPG00005020540 LMCD1 (ENSCJPG00005020541) CAV3 (ENSCJPG00005020542) OXTR (ENSCJPG00005020543) RAD18 (ENSCJPG00005020544) SRGAP3 (ENSCJPG00005020553) THUMPD3 (ENSCJPG00005020742) ENSCJPG00005020743 IRAK2 (ENSCJPG00005020747) GHRL (ENSCJPG00005020750) SEC13 (ENSCJPG00005020751) CAND2 (ENSCJPG00005020756) #17 ENSCJPG00005020793 MBD4 (ENSCJPG00005020795) #20 IFT122 (ENSCJPG00005020797) #21 RHO (ENSCJPG00005020821) #22 ENSCJPG00005020822 #23 PLXND1 (ENSCJPG00005020823) #24 TMCC1 (ENSCJPG00005020824) TRH (ENSCJPG00005020825) RBSN (ENSCJPG00005020826) MRPS25 (ENSCJPG00005020827) NR2C2 (ENSCJPG00005020828) FGD5 (ENSCJPG00005020848) African ostrich MODERN SPECIES 833 SSUH2 (ENSSCUG00000012848) CAV3 (ENSSCUG00000012850) OXTR (ENSSCUG00000012851) RAD18 (ENSSCUG00000012857) SRGAP3 (ENSSCUG00000012949) THUMPD3 (ENSSCUG00000013073) ENSSCUG00000013075 IRAK2 (ENSSCUG00000013076) GHRL (ENSSCUG00000013078) SEC13 (ENSSCUG00000013080) CAND2 (ENSSCUG00000013081) #17 ENSSCUG00000013083 ENSSCUG00000013085 #19 MBD4 (ENSSCUG00000013086) #20 IFT122 (ENSSCUG00000013103) #21 RHO (ENSSCUG00000013118) #22 PLXND1 (ENSSCUG00000013120) #24 TMCC1 (ENSSCUG00000013132) TRH (ENSSCUG00000013135) RBSN (ENSSCUG00000013136) MRPS25 (ENSSCUG00000013138) NR2C2 (ENSSCUG00000013140) FGD5 (ENSSCUG00000013145) Australian saltwater crocodile MODERN SPECIES 37 ENSCPRG00005012717 CAV3 (ENSCPRG00005012711) OXTR (ENSCPRG00005012696) RAD18 (ENSCPRG00005012686) SRGAP3 (ENSCPRG00005012679) THUMPD3 (ENSCPRG00005012665) ENSCPRG00005012662 IRAK2 (ENSCPRG00005012647) TATDN2 (ENSCPRG00005012643) GHRL (ENSCPRG00005012641) RPL32 (ENSCPRG00005012635) #18 CAND2 (ENSCPRG00005012618) #17 SEC13 (ENSCPRG00005012608) MBD4 (ENSCPRG00005012600) #20 IFT122 (ENSCPRG00005012588) #21 RHO (ENSCPRG00005012583) #22 ENSCPRG00005012577 #23 PLXND1 (ENSCPRG00005012554) #24 TMCC1 (ENSCPRG00005012541) TRH (ENSCPRG00005012536) RBSN (ENSCPRG00005012530) MRPS25 (ENSCPRG00005012524) NR2C2 (ENSCPRG00005012515) FGD5 (ENSCPRG00005012493) Cryptodira ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00390000003964.b ENSGT00390000014353 ENSGT00940000159835 ENSGT00940000155616 ENSGT00390000004064 ENSGT00940000153393.B ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000158890 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000154583 ENSGT00390000013951 ENSGT00390000005194 ENSGT00390000009671 Testudinoidea ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00390000003964.b ENSGT00390000014353 ENSGT00940000159835 ENSGT00940000155616 ENSGT00390000004064 ENSGT00940000153393.B ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000158890 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000154583 ENSGT00390000013951 ENSGT00390000005194 ENSGT00390000009671 Emydidae ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00390000003964.b ENSGT00390000014353 ENSGT00940000159835 ENSGT00940000155616 ENSGT00390000004064 ENSGT00940000153393.B ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000158890 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000154583 ENSGT00390000013951 ENSGT00390000005194 ENSGT00390000009671 Three-toed box turtle MODERN SPECIES 33 CAV3 (ENSTMTG00000019214) OXTR (ENSTMTG00000019224) RAD18 (ENSTMTG00000019261) SRGAP3 (ENSTMTG00000019297) THUMPD3 (ENSTMTG00000019533) ENSTMTG00000019550 IRAK2 (ENSTMTG00000019566) TATDN2 (ENSTMTG00000019600) GHRL (ENSTMTG00000019620) SEC13 (ENSTMTG00000019636) CAND2 (ENSTMTG00000019657) #17 ENSTMTG00000019675 ENSTMTG00000019685 #19 MBD4 (ENSTMTG00000019713) #20 IFT122 (ENSTMTG00000019743) #21 RHO (ENSTMTG00000019780) #22 PLXND1 (ENSTMTG00000019795) #24 TMCC1 (ENSTMTG00000019834) RBSN (ENSTMTG00000019843) MRPS25 (ENSTMTG00000019859) NR2C2 (ENSTMTG00000019882) FGD5 (ENSTMTG00000019978) C3orf20 (ENSTMTG00000019995) CCDC174 (ENSTMTG00000020018) GRIP2 (ENSTMTG00000020040) SLC6A6 (ENSTMTG00000020095) XPC (ENSTMTG00000020128) TMEM43 (ENSTMTG00000020161) CHCHD4 (ENSTMTG00000020171) ENSTMTG00000009407 UROC1 (ENSTMTG00000009635) painted turtle MODERN SPECIES 699 RAD18 (ENSCPBG00000014787) SRGAP3 (ENSCPBG00000014775) THUMPD3 (ENSCPBG00000014771) ENSCPBG00000014768 ENSCPBG00000014760 IRAK2 (ENSCPBG00000014750) TATDN2 (ENSCPBG00000014748) ENSCPBG00000014745 ENSCPBG00000014743 SEC13 (ENSCPBG00000014738) CAND2 (ENSCPBG00000014726) #17 ENSCPBG00000014717 ENSCPBG00000014711 #19 MBD4 (ENSCPBG00000014704) #20 IFT122 (ENSCPBG00000014673) #21 RHO (ENSCPBG00000014659) #22 ENSCPBG00000014657 #23 PLXND1 (ENSCPBG00000014635) #24 ENSCPBG00000014630 TMCC1 (ENSCPBG00000014628) TRH (ENSCPBG00000014625) RBSN (ENSCPBG00000014619) MRPS25 (ENSCPBG00000014615) NR2C2 (ENSCPBG00000014597) FGD5 (ENSCPBG00000014583) C3orf20 (ENSCPBG00000014579) CCDC174 (ENSCPBG00000014576) GRIP2 (ENSCPBG00000014559) SLC6A6 (ENSCPBG00000014544) ENSCPBG00000014537 LSM3 (ENSCPBG00000014531) Testudinidae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00390000014353 ENSGT00940000159835 ENSGT00940000155616 ENSGT00390000004064 ENSGT00940000153393.B ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00940000158890 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000154583 ENSGT00390000013951 ENSGT00390000005194 ENSGT00390000009671 Goode s thornscrub tortoise MODERN SPECIES 21 CAV3 (ENSGEVG00005009176) OXTR (ENSGEVG00005009121) RAD18 (ENSGEVG00005009041) SRGAP3 (ENSGEVG00005007925) THUMPD3 (ENSGEVG00005007694) ENSGEVG00005007674 IRAK2 (ENSGEVG00005007624) TATDN2 (ENSGEVG00005007577) GHRL (ENSGEVG00005007550) SEC13 (ENSGEVG00005007518) CAND2 (ENSGEVG00005007489) #17 ENSGEVG00005007461 ENSGEVG00005007414 #19 MBD4 (ENSGEVG00005007387) #20 IFT122 (ENSGEVG00005007237) #21 RHO (ENSGEVG00005007149) #22 ENSGEVG00005007135 #24 ENSGEVG00005007103 #24 TMCC1 (ENSGEVG00005007088) TRH (ENSGEVG00005007060) RBSN (ENSGEVG00005007029) MRPS25 (ENSGEVG00005007010) NR2C2 (ENSGEVG00005006949) FGD5 (ENSGEVG00005006787) C3orf20 (ENSGEVG00005006712) ENSGEVG00005006694 GRIP2 (ENSGEVG00005006526) SLC6A6 (ENSGEVG00005006475) LSM3 (ENSGEVG00005006455) XPC (ENSGEVG00005006405) TMEM43 (ENSGEVG00005006361) Abingdon island giant tortoise MODERN SPECIES 1018 CAV3 (ENSCABG00000017812) OXTR (ENSCABG00000017814) RAD18 (ENSCABG00000017818) SRGAP3 (ENSCABG00000000091) THUMPD3 (ENSCABG00000000193) ENSCABG00000000206 IRAK2 (ENSCABG00000000217) TATDN2 (ENSCABG00000000234) GHRL (ENSCABG00000000251) SEC13 (ENSCABG00000000279) CAND2 (ENSCABG00000000379) #17 ENSCABG00000001473 ENSCABG00000001478 #19 MBD4 (ENSCABG00000001485) #20 IFT122 (ENSCABG00000001571) #21 RHO (ENSCABG00000004147) #22 ENSCABG00000004148 #23 PLXND1 (ENSCABG00000004151) #24 TMCC1 (ENSCABG00000004160) TRH (ENSCABG00000004165) RBSN (ENSCABG00000004167) MRPS25 (ENSCABG00000004172) NR2C2 (ENSCABG00000004178) FGD5 (ENSCABG00000004259) C3orf20 (ENSCABG00000004270) CCDC174 (ENSCABG00000004271) GRIP2 (ENSCABG00000004277) SLC6A6 (ENSCABG00000004290) LSM3 (ENSCABG00000004295) XPC (ENSCABG00000004301) TMEM43 (ENSCABG00000004679) Chinese turtle MODERN SPECIES 1835 OXTR (ENSPSIG00000006867) RAD18 (ENSPSIG00000006928) SRGAP3 (ENSPSIG00000007033) THUMPD3 (ENSPSIG00000007370) ENSPSIG00000007377 ENSPSIG00000007384 IRAK2 (ENSPSIG00000007409) TATDN2 (ENSPSIG00000007521) GHRL (ENSPSIG00000020346) SEC13 (ENSPSIG00000007526) CAND2 (ENSPSIG00000007584) #17 ENSPSIG00000007588 ENSPSIG00000007825 #19 MBD4 (ENSPSIG00000007892) #20 IFT122 (ENSPSIG00000007925) #21 RHO (ENSPSIG00000007938) #22 PLXND1 (ENSPSIG00000008008) #24 TMCC1 (ENSPSIG00000008825) TRH (ENSPSIG00000008868) RBSN (ENSPSIG00000008874) MRPS25 (ENSPSIG00000008882) NR2C2 (ENSPSIG00000008928) FGD5 (ENSPSIG00000008933) ENSPSIG00000008945 C3orf20 (ENSPSIG00000008963) CCDC174 (ENSPSIG00000009004) GRIP2 (ENSPSIG00000009010) SLC6A6 (ENSPSIG00000009043) Anura ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00390000017740.a.b #17 ENSGT00390000014874 #19 ENSGT00530000063687.a #20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160900 #23 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 ENSGT00440000033958 ENSGT00940000155615 ENSGT00940000154583 ENSGT00390000013951 ENSGT00390000005194 ENSGT00390000009671 ENSGT00390000013132 Leishan spiny toad MODERN SPECIES 11 ENSLLEG00000021307 LSM3 (ENSLLEG00000021377) ENSLLEG00000021422 ENSLLEG00000021445 ENSLLEG00000021551 ENSLLEG00000021585 ENSLLEG00000021643 ENSLLEG00000022449 ENSLLEG00000022464 ENSLLEG00000022485 THUMPD3 (ENSLLEG00000022520) ENSLLEG00000022788 ENSLLEG00000022910 ENSLLEG00000022931 SEC13 (ENSLLEG00000022998) RHO (ENSLLEG00000008001) #22 ENSLLEG00000008046 #23 PLXND1 (ENSLLEG00000008132) #24 ENSLLEG00000008397 ENSLLEG00000008428 TRH (ENSLLEG00000008447) ENSLLEG00000008473 RBSN (ENSLLEG00000008498) MRPS25 (ENSLLEG00000008585) Coelacanth MODERN SPECIES 636 ENSLACG00000015953 ENSLACG00000015485 USP19 (ENSLACG00000015154) LAMB2 (ENSLACG00000014833) ENSLACG00000014341 ENSLACG00000014041 ENSLACG00000014016 SEC13 (ENSLACG00000013908) CAND2 (ENSLACG00000013720) #17 RPL32 (ENSLACG00000013692) #18 ENSLACG00000013572 ENSLACG00000013513 ##20 IFT122 (ENSLACG00000013147) #21 RHO (ENSLACG00000013050) #22 ENSLACG00000012953 #23 PLXND1 (ENSLACG00000012134) #24 ENSLACG00000011971 TRH (ENSLACG00000009747) RBSN (ENSLACG00000009214) MRPS25 (ENSLACG00000009006) NR2C2 (ENSLACG00000008303) FGD5 (ENSLACG00000006660) CCDC174 (ENSLACG00000003678) Actinopterygii DUPLICATION Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.a #22 Neopterygii ANCESTRAL SPECIES 59 ENSGT00940000155048 ENSGT00390000005214 ENSGT00940000160100 ENSGT00590000083094.a.a ENSGT00940000153456.b.b ENSGT01030000234637.b.d.a.a ENSGT01030000234637.b.d.b ENSGT00390000003322 ENSGT00940000173126 ENSGT00390000002873 ENSGT00940000157279 ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000166173 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00940000156409 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.a #22 ENSGT00940000155820 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000158502 ENSGT00940000158653 ENSGT00940000164303 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000162607 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000156493 ENSGT00390000010697 ENSGT00550000074831 ENSGT00390000008631.a ENSGT00940000159731 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000156326 Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 85 ENSGT00510000047967 ENSGT00940000155048.d.a ENSGT00390000005214 ENSGT00940000160100 ENSGT00590000083094.a.a.c.a ENSGT00940000153456.b.b ENSGT01030000234637.b.d.a.a ENSGT00940000173126 ENSGT00390000002873 ENSGT00940000157279 ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000166173 ENSGT00940000153629.a.a.b ENSGT00940000156409 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.a #22 ENSGT00940000155820.a ENSGT00550000074950 ENSGT00940000158502 ENSGT00940000158653 ENSGT00940000164303.b.a ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000162607.b ENSGT00940000159882 ENSGT00940000156493 ENSGT00390000010697 ENSGT00550000074831.k ENSGT00390000008631.a.o.a ENSGT01020000230354.A.a.a ENSGT00940000156326.a.b ENSGT00940000165309 Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 193 ENSGT00940000155189.pb.b ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.b ENSGT00940000163342.b ENSGT00730000111360.a ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 ENSGT00940000155241.c ENSGT00390000016228.b ENSGT00940000153629.a.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.a #22 ENSGT00940000155820.b ENSGT00940000157898 ENSGT00390000015805.b Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000155189.pb.b ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.b.a.a ENSGT00940000163342.b ENSGT00730000111360.a ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 ENSGT00940000155241.c ENSGT00390000016228.b ENSGT00940000153629.a.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.a #22 ENSGT00940000155820.b ENSGT00940000157898 ENSGT00390000015805.b ENSGT00940000157007.i.a ENSGT00940000157261.k.b ENSGT00550000074865 ENSGT00940000170563 ENSGT00940000165387.a ENSGT00950000182844.a.a.b ENSGT00940000154468.tb.b.b ENSGT00940000157106 ENSGT01090000260040.b.a.b.y.a ENSGT00950000182952.C.g.a ENSGT00940000157238.b ENSGT00390000013390 Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000155189.pb.b ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.b.a.a ENSGT00940000163342.b ENSGT00730000111360.a ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 ENSGT00940000155241.c ENSGT00390000016228.b ENSGT00940000153629.a.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.a #22 ENSGT00940000155820.b ENSGT00940000157898 ENSGT00390000015805.b ENSGT00940000157007.i.a ENSGT00940000157261.k.b ENSGT00550000074865 ENSGT00940000170563 ENSGT00940000165387.a ENSGT00950000182844.a.a.b ENSGT00940000154468.tb.b.b ENSGT00940000157106 ENSGT01090000260040.b.a.b.y.a ENSGT00940000157238.b ENSGT00390000013390 ENSGT00940000157869.e.a Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000155189.pb.b ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.b.a.a ENSGT00940000163342.b ENSGT00730000111360.a ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 ENSGT00940000155241.c ENSGT00390000016228.b ENSGT00940000153629.a.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.a #22 ENSGT00940000155820.b ENSGT00940000157898 ENSGT00390000015805.b ENSGT00940000157007.i.a ENSGT00940000157261.k.b ENSGT00550000074865 ENSGT00940000170563 ENSGT00940000165387.a ENSGT00950000182844.a.a.b ENSGT00940000154468.tb.b.b ENSGT00940000157106 ENSGT01090000260040.b.a.b.y.a ENSGT00940000157238.b ENSGT00390000013390 ENSGT00940000157869.e.a Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000155189.pb.b ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.b.a.a ENSGT00940000163342.b ENSGT00730000111360.a ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 ENSGT00940000155241.c ENSGT00390000016228.b ENSGT00940000153629.a.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.a #22 ENSGT00940000155820.b ENSGT00940000157898 ENSGT00390000015805.b ENSGT00940000157007.i.a ENSGT00940000157261.k.b ENSGT00550000074865 ENSGT00940000170563 ENSGT00940000165387.a ENSGT00950000182844.a.a.b ENSGT00940000154468.tb.b.b ENSGT00940000157106 ENSGT01090000260040.b.a.b.y.a ENSGT00940000157238.b ENSGT00390000013390 ENSGT00940000157869.e.a Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 404 ihhb (ENSHCOG00000007869) nhej1 (ENSHCOG00000007870) ENSHCOG00000007906 dnpep (ENSHCOG00000007928) tmem198b (ENSHCOG00000007941) ENSHCOG00000007980 nr2c2 (ENSHCOG00000008017) B3GALT4 (ENSHCOG00000008027) wdr46 (ENSHCOG00000008102) ENSHCOG00000008114 ENSHCOG00000008134 ogg1 (ENSHCOG00000008142) qars1 (ENSHCOG00000008150) QRICH1 (ENSHCOG00000008161) prickle2a (ENSHCOG00000008264) rho (ENSHCOG00000008782) #22 MAGI1 (ENSHCOG00000008943) ren (ENSHCOG00000009027) ENSHCOG00000009067 eif2d (ENSHCOG00000009140) ENSHCOG00000009190 rh50 (ENSHCOG00000009197) rbm39b (ENSHCOG00000009222) pabpc1l (ENSHCOG00000009270) YWHAB (ENSHCOG00000009295) ognb (ENSHCOG00000009316) ENSHCOG00000009321 kctd6b (ENSHCOG00000009336) abhd6b (ENSHCOG00000009366) slmapb (ENSHCOG00000009375) cers5 (ENSHCOG00000009402) Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.b.a.a ENSGT00940000163342.b.a ENSGT00940000163342.b.b ENSGT00730000111360.a ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 ENSGT00940000155241.c ENSGT00940000164079 ENSGT00390000016228.b ENSGT00940000153629.a.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.a #22 ENSGT00940000155820.b ENSGT00940000157898 ENSGT00390000015805.b ENSGT00940000157007.i.a ENSGT00940000157261.k.b ENSGT00550000074865 ENSGT00940000170563 ENSGT00940000165387.a ENSGT00950000182844.a.a.b ENSGT00940000154468.tb.b.b ENSGT00940000157106 ENSGT01090000260040.b.a.b.y.a ENSGT00940000157238.b ENSGT00390000013390 ENSGT00940000157869.e.a Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.b.a.a ENSGT00940000163342.b.a ENSGT00940000163342.b.b ENSGT00730000111360.a ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 ENSGT00940000155241.c ENSGT00940000164079 ENSGT00390000016228.b ENSGT00940000153629.a.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.a #22 ENSGT00940000155820.b ENSGT00940000157898 ENSGT00390000015805.b ENSGT00940000157007.i.a ENSGT00940000157261.k.b ENSGT00550000074865 ENSGT00940000165387.a ENSGT00950000182844.a.a.b ENSGT00940000154468.tb.b.b ENSGT00940000157106 ENSGT01090000260040.b.a.b.y.a ENSGT00940000157238.b ENSGT00390000013390 ENSGT00940000157869.e.a ENSGT00510000047225.b Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.b.a.a ENSGT00940000163342.b.a ENSGT00940000163342.a.b.a.b.b ENSGT00730000111360.a ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 ENSGT00940000155241.c ENSGT00940000164079 ENSGT00390000016228.b ENSGT00940000153629.a.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.a #22 ENSGT00940000155820.b ENSGT00940000157898 ENSGT00390000015805.b ENSGT00940000157007.i.a ENSGT00940000157261.k.b ENSGT00550000074865 ENSGT00940000165387.a ENSGT00950000182844.a.a.b ENSGT00940000154468.tb.b.b ENSGT00940000157106 ENSGT01090000260040.b.a.b.y.a ENSGT00940000157238.b ENSGT00390000013390 ENSGT00940000157869.e.a ENSGT00510000047225.b Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.b.a.a ENSGT00940000163342.b.a ENSGT00940000163342.a.b.a.b.b ENSGT00730000111360.a ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 ENSGT00940000155241.c ENSGT00940000164079 ENSGT00390000016228.b ENSGT00940000153629.a.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.a #22 ENSGT00940000155820.b ENSGT00940000157898 ENSGT00390000015805.b ENSGT00940000157007.i.a ENSGT00940000157261.k.b ENSGT00550000074865 ENSGT00940000165387.a ENSGT00950000182844.a.a.b ENSGT00940000154468.tb.b.b ENSGT00940000157106 ENSGT01090000260040.b.a.b.y.a ENSGT00940000157238.b ENSGT00390000013390 ENSGT00940000157869.e.a ENSGT00510000047225.b Ballan wrasse MODERN SPECIES 26 ENSLBEG00000007971 TAF4 (ENSLBEG00000007994) nr2c2 (ENSLBEG00000008028) ENSLBEG00000008057 wdr46 (ENSLBEG00000008068) ENSLBEG00000008109 ENSLBEG00000008156 ENSLBEG00000008197 ENSLBEG00000008244 ogg1 (ENSLBEG00000008269) qars1 (ENSLBEG00000008312) QRICH1 (ENSLBEG00000008381) ENSLBEG00000008431 ENSLBEG00000008455 prickle2a (ENSLBEG00000008475) rho (ENSLBEG00000008570) #22 MAGI1 (ENSLBEG00000009222) ren (ENSLBEG00000009527) csf1b (ENSLBEG00000009565) FMOD (ENSLBEG00000009614) mapkapk2b (ENSLBEG00000009647) eif2d (ENSLBEG00000009691) ENSLBEG00000009743 rh50 (ENSLBEG00000009823) ENSLBEG00000009849 rbm39b (ENSLBEG00000009909) pabpc1l (ENSLBEG00000010084) YWHAB (ENSLBEG00000010229) UQCC5 (ENSLBEG00000010296) ognb (ENSLBEG00000010276) kctd6b (ENSLBEG00000010311) Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.b.a.a ENSGT00940000163342.b.a ENSGT00940000163342.a.b.a.b.b ENSGT00730000111360.a ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 ENSGT00940000155241.c ENSGT00940000164079 ENSGT00390000016228.b ENSGT00940000153629.a.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.a #22 ENSGT00940000155820.b ENSGT00940000157898 ENSGT00390000015805.b ENSGT00940000157007.i.a ENSGT00940000157261.k.b ENSGT00550000074865 ENSGT00940000165387.a ENSGT00950000182844.a.a.b ENSGT00940000154468.tb.b.b ENSGT00940000157106 ENSGT01090000260040.b.a.b.y.a ENSGT00940000157238.b ENSGT00390000013390 ENSGT00940000157869.e.a ENSGT00510000047225.b Perciformes ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.b.a.a ENSGT00940000163342.a.b.a.b.b ENSGT00730000111360.a ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 ENSGT00940000155241.c ENSGT00940000164079 ENSGT00390000016228.b ENSGT00940000153629.a.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.a #22 ENSGT00940000155820.b ENSGT00940000157898 ENSGT00390000015805.b ENSGT00940000157007.i.a ENSGT00940000157261.k.b ENSGT00550000074865 ENSGT00940000165387.a ENSGT00950000182844.a.a.b ENSGT00940000154468.tb.b.b ENSGT00940000157106 ENSGT01090000260040.b.a.b.y.a ENSGT00940000157238.b ENSGT00390000013390 ENSGT00940000157869.e.a ENSGT00510000047225.b Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189.pb.b ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.b.a.a ENSGT00730000111360.a ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 ENSGT00940000155241.c ENSGT00390000016228.b ENSGT00940000153629.a.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.a #22 ENSGT00940000155820.b ENSGT00940000157898 ENSGT00390000015805.b ENSGT00940000157007.i.a ENSGT00940000157261.k.b ENSGT00550000074865 ENSGT00940000165387.a ENSGT00950000182844.a.a.b ENSGT00940000154468.tb.b.b ENSGT00940000157106 ENSGT01090000260040.b.a.b.y.a ENSGT00940000157238.b ENSGT00390000013390 ENSGT00940000157869.e.a ENSGT00510000047225.b Lumpfish MODERN SPECIES 22 trh (ENSCLMG00005003615) RBSN (ENSCLMG00005003623) mrps25 (ENSCLMG00005003863) nr2c2 (ENSCLMG00005003864) B3GALT4 (ENSCLMG00005003866) wdr46 (ENSCLMG00005003869) sult1st3 (ENSCLMG00005003979) ENSCLMG00005003982 ogg1 (ENSCLMG00005003983) qars1 (ENSCLMG00005003995) QRICH1 (ENSCLMG00005004174) ENSCLMG00005004175 ENSCLMG00005004176 prickle2a (ENSCLMG00005004177) ENSCLMG00005004191 rho (ENSCLMG00005004192) #22 MAGI1 (ENSCLMG00005004193) ren (ENSCLMG00005004194) csf1b (ENSCLMG00005004196) FMOD (ENSCLMG00005004224) mapkapk2b (ENSCLMG00005004244) eif2d (ENSCLMG00005005341) ENSCLMG00005006457 rbm39b (ENSCLMG00005006469) pabpc1l (ENSCLMG00005006743) YWHAB (ENSCLMG00005006748) ognb (ENSCLMG00005006750) UQCC5 (ENSCLMG00005006798) kctd6b (ENSCLMG00005006799) abhd6b (ENSCLMG00005006802) slmapb (ENSCLMG00005006806) Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.b.a.a ENSGT00940000163342.a.b.a.b.b ENSGT00730000111360.a ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 ENSGT00940000155241.c ENSGT00940000164079 ENSGT00390000016228.b ENSGT00940000153629.a.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.a #22 ENSGT00940000155820.b ENSGT00940000157898 ENSGT00390000015805.b ENSGT00940000157007.i.a ENSGT00940000157261.k.b ENSGT00550000074865 ENSGT00940000165387.a ENSGT00940000154468.tb.b.b ENSGT00940000157106 ENSGT01090000260040.b.a.b.y.a ENSGT00940000157238.b ENSGT00390000013390 ENSGT00940000157869.e.a ENSGT00510000047225.b ENSGT00940000167624 Channel bull blenny MODERN SPECIES 21 trh (ENSCGOG00000005180) RBSN (ENSCGOG00000005194) mrps25 (ENSCGOG00000005370) nr2c2 (ENSCGOG00000005378) ENSCGOG00000005438 wdr46 (ENSCGOG00000005451) ENSCGOG00000005490 ENSCGOG00000005496 ENSCGOG00000005506 ENSCGOG00000005517 ogg1 (ENSCGOG00000005521) qars1 (ENSCGOG00000005587) QRICH1 (ENSCGOG00000007379) ENSCGOG00000007388 prickle2a (ENSCGOG00000007391) rho (ENSCGOG00000007398) #22 MAGI1 (ENSCGOG00000007405) ren (ENSCGOG00000007421) csf1b (ENSCGOG00000007422) FMOD (ENSCGOG00000007427) mapkapk2b (ENSCGOG00000007435) eif2d (ENSCGOG00000008040) ENSCGOG00000008718 rbm39b (ENSCGOG00000008741) pabpc1l (ENSCGOG00000009547) ywhaba (ENSCGOG00000013044) UQCC5 (ENSCGOG00000013070) ognb (ENSCGOG00000013073) kctd6b (ENSCGOG00000013075) abhd6b (ENSCGOG00000013079) slmapb (ENSCGOG00000013086) Pike perch MODERN SPECIES 31 trh (ENSSLUG00000021796) RBSN (ENSSLUG00000021654) mrps25 (ENSSLUG00000021639) nr2c2 (ENSSLUG00000021614) ENSSLUG00000021608 wdr46 (ENSSLUG00000021597) ENSSLUG00000021580 ENSSLUG00000021468 ENSSLUG00000021458 ogg1 (ENSSLUG00000021455) qars1 (ENSSLUG00000021327) QRICH1 (ENSSLUG00000021268) ENSSLUG00000021261 ENSSLUG00000021259 prickle2a (ENSSLUG00000021192) rho (ENSSLUG00000021180) #22 MAGI1 (ENSSLUG00000021146) ren (ENSSLUG00000021135) csf1b (ENSSLUG00000021130) FMOD (ENSSLUG00000021124) mapkapk2b (ENSSLUG00000021095) eif2d (ENSSLUG00000021074) ENSSLUG00000021066 rbm39b (ENSSLUG00000020976) pabpc1l (ENSSLUG00000020743) YWHAB (ENSSLUG00000020724) ognb (ENSSLUG00000020719) UQCC5 (ENSSLUG00000020717) kctd6b (ENSSLUG00000020714) abhd6b (ENSSLUG00000020703) slmapb (ENSSLUG00000020699) Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.b.a.a ENSGT00940000163342.b.a ENSGT00940000163342.a.b.a.b.b ENSGT00730000111360.a ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 ENSGT00940000155241.c ENSGT00390000016228.b ENSGT00940000153629.a.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.a #22 ENSGT00940000155820.b ENSGT00940000157898 ENSGT00390000015805.b ENSGT00940000157007.i.a ENSGT00940000157261.k.b ENSGT00550000074865 ENSGT00940000165387.a ENSGT00910000148654 ENSGT00940000154468.tb.b.b ENSGT00940000157106 ENSGT01090000260040.b.a.b.y.a ENSGT00940000157238.b ENSGT00390000013390 ENSGT00940000157869.e.a ENSGT00510000047225.b Gilthead seabream MODERN SPECIES 21 porcn (ENSSAUG00010014451) wdr13 (ENSSAUG00010014496) ENSSAUG00010014504 tspy (ENSSAUG00010014505) sema3ga (ENSSAUG00010014522) WAS (ENSSAUG00010015723) SLC38A5 (ENSSAUG00010015749) apex2 (ENSSAUG00010016046) zgc:162200 (ENSSAUG00010016049) ENSSAUG00010016055 ogg1 (ENSSAUG00010016056) qars1 (ENSSAUG00010016081) QRICH1 (ENSSAUG00010018281) ENSSAUG00010018286 prickle2a (ENSSAUG00010018288) rho (ENSSAUG00010018292) #22 MAGI1 (ENSSAUG00010018307) ren (ENSSAUG00010019322) csf1b (ENSSAUG00010019341) FMOD (ENSSAUG00010019342) mapkapk2b (ENSSAUG00010019349) eif2d (ENSSAUG00010020557) ENSSAUG00010020574 rbm39b (ENSSAUG00010020893) pabpc1l (ENSSAUG00010021044) YWHAB (ENSSAUG00010021386) OGN2 (ENSSAUG00010021388) UQCC5 (ENSSAUG00010021391) pfkfb2a (ENSSAUG00010021414) ENSSAUG00010023246 ENSSAUG00010023247 Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.b.a.a ENSGT00940000163342.b.a ENSGT00940000163342.a.b.a.b.b ENSGT00730000111360.a ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 ENSGT00940000155241.c ENSGT00390000016228.b ENSGT00940000153629.a.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.a #22 ENSGT00940000155820.b ENSGT00940000157898 ENSGT00390000015805.b ENSGT00940000157007.i.a ENSGT00940000157261.k.b ENSGT00550000074865 ENSGT00940000165387.a ENSGT00910000148654 ENSGT00940000154468.tb.b.b ENSGT00940000157106 ENSGT01090000260040.b.a.b.y.a ENSGT00940000157238.b ENSGT00390000013390 ENSGT00940000157869.e.a ENSGT00510000047225.b European seabass MODERN SPECIES 14 TMCC1 (ENSDLAG00005009862) trh (ENSDLAG00005009871) ENSDLAG00005009879 nr2c2 (ENSDLAG00005009955) ENSDLAG00005010075 wdr46 (ENSDLAG00005026705) ENSDLAG00005010203 ENSDLAG00005010241 ENSDLAG00005010413 ENSDLAG00005010529 ENSDLAG00005034137 qars1 (ENSDLAG00005010569) ENSDLAG00005011036 ENSDLAG00005029930 prickle2a (ENSDLAG00005011112) ENSDLAG00005011122 #22 ENSDLAG00005011139 ENSDLAG00005011385 ENSDLAG00005011416 ENSDLAG00005011429 mapkapk2b (ENSDLAG00005011451) eif2d (ENSDLAG00005011815) ENSDLAG00005034949 ENSDLAG00005011945 rbm39b (ENSDLAG00005017893) ENSDLAG00005018136 ognb (ENSDLAG00005018884) ENSDLAG00005018894 kctd6b (ENSDLAG00005018903) abhd6b (ENSDLAG00005018910) slmapb (ENSDLAG00005018921) Large yellow croaker MODERN SPECIES 487 ENSLCRG00005009546 ENSLCRG00005009545 ENSLCRG00005009544 ENSLCRG00005009543 gcnt4a (ENSLCRG00005009542) ENSLCRG00005009541 HMGCR (ENSLCRG00005009494) fxn (ENSLCRG00005009491) ENSLCRG00005009489 ENSLCRG00005009488 ogg1 (ENSLCRG00005009487) qars1 (ENSLCRG00005006325) QRICH1 (ENSLCRG00005022448) ENSLCRG00005022446 prickle2a (ENSLCRG00005022445) rho (ENSLCRG00005022443) #22 MAGI1 (ENSLCRG00005022438) ren (ENSLCRG00005022436) csf1b (ENSLCRG00005022435) FMOD (ENSLCRG00005022433) mapkapk2b (ENSLCRG00005022427) eif2d (ENSLCRG00005022360) ENSLCRG00005017888 ENSLCRG00005017767 rbm39b (ENSLCRG00005017727) pabpc1l (ENSLCRG00005017683) YWHAB (ENSLCRG00005017677) ognb (ENSLCRG00005017676) UQCC5 (ENSLCRG00005017675) kctd6b (ENSLCRG00005017674) abhd6b (ENSLCRG00005017668) Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000155189.pb.b ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.b.a.a ENSGT00940000163342.b.a ENSGT00940000163342.a.b.a.b.b ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 ENSGT00940000155241.c ENSGT00940000154814.b ENSGT00940000153629.a.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.a #22 ENSGT00940000155820.b.b ENSGT00940000157898 ENSGT00390000015805.b ENSGT00940000157007.i.a ENSGT00550000074865 ENSGT00940000166133 ENSGT00940000165387.a ENSGT00940000154468.tb.b.b ENSGT00940000157106 ENSGT01090000260040.b.a.b.y.a ENSGT00940000157238.b ENSGT00390000013390 ENSGT00940000157869.e.a ENSGT00510000047225.b ENSGT00940000167624 Fugu MODERN SPECIES 15 mrps25 (ENSTRUG00000011566) nr2c2 (ENSTRUG00000011580) ENSTRUG00000011725 wdr46 (ENSTRUG00000011745) ENSTRUG00000003656 ENSTRUG00000001170 ENSTRUG00000000731 ENSTRUG00000025178 ENSTRUG00000024150 ENSTRUG00000003123 ogg1 (ENSTRUG00000003379) qars1 (ENSTRUG00000021416) QRICH1 (ENSTRUG00000003738) ENSTRUG00000029081 prickle2a (ENSTRUG00000004254) rho (ENSTRUG00000004527) #22 MAGI1 (ENSTRUG00000012813) ren (ENSTRUG00000012604) csf1b (ENSTRUG00000025945) FMOD (ENSTRUG00000012573) eif2d (ENSTRUG00000012383) ENSTRUG00000011523 rbm39b (ENSTRUG00000011352) pabpc1l (ENSTRUG00000011085) YWHAB (ENSTRUG00000011035) ognb (ENSTRUG00000019749) smim4 (ENSTRUG00000029515) kctd6b (ENSTRUG00000022471) abhd6b (ENSTRUG00000010887) slmapb (ENSTRUG00000010853) cers5 (ENSTRUG00000010435) Tetraodon MODERN SPECIES 24 PLXND1 (ENSTNIG00000017924) #24 TMCC1 (ENSTNIG00000017923) trh (ENSTNIG00000017922) RBSN (ENSTNIG00000017921) mrps25 (ENSTNIG00000017920) nr2c2 (ENSTNIG00000017919) ENSTNIG00000017918 wdr46 (ENSTNIG00000017917) sult1st3 (ENSTNIG00000017915) ENSTNIG00000017916 ogg1 (ENSTNIG00000017914) qars1 (ENSTNIG00000017913) QRICH1 (ENSTNIG00000017912) ENSTNIG00000017911 prickle2a (ENSTNIG00000017910) rho (ENSTNIG00000017909) #22 ren (ENSTNIG00000017908) FMOD (ENSTNIG00000017907) eif2d (ENSTNIG00000017906) ENSTNIG00000000366 ENSTNIG00000017905 rbm39b (ENSTNIG00000017904) pabpc1l (ENSTNIG00000017903) YWHAB (ENSTNIG00000017902) ognb (ENSTNIG00000017901) kctd6b (ENSTNIG00000017900) abhd6b (ENSTNIG00000017899) slmapb (ENSTNIG00000017898) cers5 (ENSTNIG00000017897) ENSTNIG00000017896 ENSTNIG00000001338 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.b.a.a ENSGT00940000163342.b.a ENSGT00940000163342.b.b ENSGT00730000111360.a ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 ENSGT00940000155241.c ENSGT00940000164079 ENSGT00390000016228.b ENSGT00940000153629.a.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.a #22 ENSGT00940000155820.b ENSGT00940000157898 ENSGT00390000015805.b ENSGT00940000157007.i.a ENSGT00940000157261.k.b ENSGT00550000074865 ENSGT00940000165387.a ENSGT00910000148654 ENSGT00940000154468.tb.b.b ENSGT00940000157106 ENSGT01090000260040.b.a.b.y.a ENSGT00940000157238.b ENSGT00390000013390 ENSGT00940000157869.e.a ENSGT00510000047225.b Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.b.a.a ENSGT00940000163342.b.a ENSGT00940000163342.b.b ENSGT00730000111360.a ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 ENSGT00940000155241.c ENSGT00940000166600 ENSGT00390000016228.b ENSGT00940000153629.a.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.a #22 ENSGT00940000155820.b ENSGT00940000157898 ENSGT00390000015805.b ENSGT00940000157007.i.a ENSGT00550000074865 ENSGT00940000165387.a ENSGT00910000148654 ENSGT00940000154468.tb.b.b ENSGT00940000157106 ENSGT01090000260040.b.a.b.y.a ENSGT00940000157238.b ENSGT00390000013390 ENSGT00940000157869.e.a ENSGT00510000047225.b ENSGT00940000167624 Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.b.a.a ENSGT00940000163342.b.a ENSGT00940000163342.b.b ENSGT00730000111360.a ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 ENSGT00940000155241.c ENSGT00390000016228.b ENSGT00940000153629.a.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.a #22 ENSGT00940000155820.b ENSGT00940000157898 ENSGT00390000015805.b ENSGT00940000157007.i.a ENSGT00550000074865 ENSGT00940000165387.a ENSGT00910000148654 ENSGT00940000154468.tb.b.b ENSGT00940000157106 ENSGT01090000260040.b.a.b.y.a ENSGT00940000157238.b ENSGT00390000013390 ENSGT00940000157869.e.a ENSGT00510000047225.b ENSGT00940000167624 Climbing perch MODERN SPECIES 20 trh (ENSATEG00000009215) ENSATEG00000028613 mrps25 (ENSATEG00000009141) nr2c2 (ENSATEG00000009047) ENSATEG00000009032 wdr46 (ENSATEG00000009023) ENSATEG00000008967 ENSATEG00000008954 ENSATEG00000008943 ENSATEG00000030071 ENSATEG00000008904 qars1 (ENSATEG00000008797) ENSATEG00000008718 ENSATEG00000008701 prickle2a (ENSATEG00000008671) ENSATEG00000007888 #22 ENSATEG00000007752 ENSATEG00000007638 ENSATEG00000007599 ENSATEG00000007591 eif2d (ENSATEG00000007580) ENSATEG00000007511 ENSATEG00000029417 rbm39b (ENSATEG00000007482) ENSATEG00000007428 ENSATEG00000007409 ognb (ENSATEG00000007291) ENSATEG00000027780 kctd6b (ENSATEG00000007279) abhd6b (ENSATEG00000007229) slmapb (ENSATEG00000007215) Siamese fighting fish MODERN SPECIES 18 B3GALT4 (ENSBSLG00000015756) wdr46 (ENSBSLG00000015764) ENSBSLG00000015859 ENSBSLG00000016083 ENSBSLG00000016094 ENSBSLG00000016108 ENSBSLG00000016123 ENSBSLG00000016130 ENSBSLG00000016164 ogg1 (ENSBSLG00000016172) qars1 (ENSBSLG00000016208) QRICH1 (ENSBSLG00000016482) ENSBSLG00000016506 ENSBSLG00000016508 prickle2a (ENSBSLG00000016519) rho (ENSBSLG00000017206) #22 MAGI1 (ENSBSLG00000017328) ren (ENSBSLG00000019643) csf1b (ENSBSLG00000019659) FMOD (ENSBSLG00000019666) ENSBSLG00000019677 ENSBSLG00000020504 rbm39b (ENSBSLG00000020511) pabpc1l (ENSBSLG00000020550) YWHAB (ENSBSLG00000020594) ognb (ENSBSLG00000020595) UQCC5 (ENSBSLG00000020597) kctd6b (ENSBSLG00000020601) abhd6b (ENSBSLG00000020603) slmapb (ENSBSLG00000020604) cers5 (ENSBSLG00000020609) Zig-zag eel MODERN SPECIES 21 trh (ENSMAMG00000013128) ENSMAMG00000025442 mrps25 (ENSMAMG00000013121) nr2c2 (ENSMAMG00000013058) ENSMAMG00000013047 wdr46 (ENSMAMG00000012974) sult1st3 (ENSMAMG00000012921) ENSMAMG00000012899 ENSMAMG00000026158 ENSMAMG00000012857 qars1 (ENSMAMG00000012801) ENSMAMG00000012785 ENSMAMG00000012769 ENSMAMG00000012763 prickle2a (ENSMAMG00000012732) ENSMAMG00000012215 #22 ENSMAMG00000012125 ENSMAMG00000012112 ENSMAMG00000012084 ENSMAMG00000012065 eif2d (ENSMAMG00000012055) ENSMAMG00000011911 rbm39b (ENSMAMG00000011883) ENSMAMG00000027544 ENSMAMG00000011854 ENSMAMG00000024726 ENSMAMG00000011849 ognb (ENSMAMG00000011839) ENSMAMG00000011833 kctd6b (ENSMAMG00000011809) abhd6b (ENSMAMG00000011788) Carangaria ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.b.a.a ENSGT00940000163342.a.b.a.b.b ENSGT00940000163342.b.a ENSGT00940000163342.b.b ENSGT00730000111360.a ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 ENSGT00940000155241.c ENSGT00940000164079 ENSGT00390000016228.b ENSGT00940000153629.a.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.a #22 ENSGT00940000155820.b ENSGT00940000157898 ENSGT00390000015805.b ENSGT00940000157007.i.a ENSGT00940000157261.k.b ENSGT00550000074865 ENSGT00940000165387.a ENSGT00940000154468.tb.b.b ENSGT00940000157106 ENSGT01090000260040.b.a.b.y.a ENSGT00940000157238.b ENSGT00390000013390 ENSGT00940000157869.e.a ENSGT00510000047225.b ENSGT00940000167624 Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT00940000155189.pb.b ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.b.a ENSGT00730000111360.a ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 ENSGT00940000155241.c ENSGT00940000164079 ENSGT00390000016228.b ENSGT00940000153629.a.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.a #22 ENSGT00940000155820.b ENSGT00940000157898 ENSGT00390000015805.b ENSGT00940000157007.i.a ENSGT00550000074865 ENSGT00940000165387.a ENSGT00940000154468.tb.b.b ENSGT00940000157106 ENSGT01090000260040.b.a.b.y.a ENSGT00940000157238.b ENSGT00390000013390 ENSGT00940000157869.e.a ENSGT00510000047225.b ENSGT00940000167624 ENSGT01030000234515.a.a.a.l Tongue sole MODERN SPECIES 1 SLC6A6 (ENSCSEG00000021398) ENSCSEG00000021397 ENSCSEG00000021396 B3GALT4 (ENSCSEG00000021395) wdr46 (ENSCSEG00000021394) nr2c2 (ENSCSEG00000021393) mrps25 (ENSCSEG00000021392) ENSCSEG00000021391 dnase1l4.1 (ENSCSEG00000021390) ABTB1 (ENSCSEG00000021389) ogg1 (ENSCSEG00000021388) qars1 (ENSCSEG00000021387) QRICH1 (ENSCSEG00000021386) ENSCSEG00000021385 prickle2a (ENSCSEG00000021384) rho (ENSCSEG00000021368) #22 MAGI1 (ENSCSEG00000021364) ren (ENSCSEG00000021336) csf1b (ENSCSEG00000021332) FMOD (ENSCSEG00000021331) eif2d (ENSCSEG00000021328) ENSCSEG00000021308 rbm39b (ENSCSEG00000021307) RBSN (ENSCSEG00000021306) ENSCSEG00000021305 cers5 (ENSCSEG00000021304) slmapb (ENSCSEG00000021303) abhd6b (ENSCSEG00000021302) kctd6b (ENSCSEG00000021300) UQCC5 (ENSCSEG00000021299) ognb (ENSCSEG00000021298) Turbot MODERN SPECIES 2 TMCC1 (ENSSMAG00000012052) trh (ENSSMAG00000012040) ENSSMAG00000012023 mrps25 (ENSSMAG00000022586) nr2c2 (ENSSMAG00000011972) ENSSMAG00000011963 wdr46 (ENSSMAG00000011942) ENSSMAG00000011921 ENSSMAG00000011909 ENSSMAG00000011897 ENSSMAG00000011758 ENSSMAG00000011743 ENSSMAG00000011702 ENSSMAG00000022952 prickle2a (ENSSMAG00000011662) RH1 (ENSSMAG00000011348) #22 ENSSMAG00000011004 ENSSMAG00000010970 ENSSMAG00000034093 ENSSMAG00000010908 eif2d (ENSSMAG00000010879) ENSSMAG00000010831 rbm39b (ENSSMAG00000010777) ENSSMAG00000010516 ENSSMAG00000030749 ognb (ENSSMAG00000031900) ENSSMAG00000010458 kctd6b (ENSSMAG00000010455) abhd6b (ENSSMAG00000010436) slmapb (ENSSMAG00000010413) ENSSMAG00000010365 Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.b.a.a ENSGT00940000163342.b.a ENSGT00940000163342.a.b.a.b.b ENSGT00940000163342.b.b ENSGT00730000111360.a ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 ENSGT00940000155241.c ENSGT00390000016228.b ENSGT00940000153629.a.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.a #22 ENSGT00940000155820.b ENSGT00940000157898 ENSGT00390000015805.b ENSGT00940000157007.i.a ENSGT00940000157261.k.b ENSGT00550000074865 ENSGT00940000165387.a ENSGT00940000154468.tb.b.b ENSGT00940000157106 ENSGT01090000260040.b.a.b.y.a ENSGT00940000157238.b ENSGT00390000013390 ENSGT00940000157869.e.a ENSGT00510000047225.b ENSGT00940000167624 Barramundi perch MODERN SPECIES 156 ENSLCAG00010018711 ENSLCAG00010018704 ENSLCAG00010018696 ENSLCAG00010018687 ENSLCAG00010018682 ogg1 (ENSLCAG00010018676) qars1 (ENSLCAG00010018618) QRICH1 (ENSLCAG00010018581) ENSLCAG00010018570 prickle2a (ENSLCAG00010018565) rho (ENSLCAG00010018543) #22 MAGI1 (ENSLCAG00010018495) ren (ENSLCAG00010018469) csf1b (ENSLCAG00010018464) FMOD (ENSLCAG00010018462) mapkapk2b (ENSLCAG00010018297) eif2d (ENSLCAG00010018271) ENSLCAG00010018265 ENSLCAG00010016285 rbm39b (ENSLCAG00010015800) pabpc1l (ENSLCAG00010015754) YWHAB (ENSLCAG00010015738) ognb (ENSLCAG00010015733) UQCC5 (ENSLCAG00010015732) kctd6b (ENSLCAG00010015731) abhd6b (ENSLCAG00010015729) Seriola ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.b.a.b.b.b ENSGT00940000163342.b.a ENSGT00940000163342.a.b.a.b.b.a ENSGT00940000163342.b.b ENSGT00730000111360.a ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 ENSGT00940000155241.c ENSGT00940000154814.b.mc ENSGT00390000016228.b ENSGT00940000153629.a.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.a #22 ENSGT00940000155820.b ENSGT00940000157898 ENSGT00390000015805.b ENSGT00940000157007.i.a ENSGT00940000157261.k.b ENSGT00550000074865 ENSGT01060000248802.b ENSGT00940000165387.a ENSGT00940000154468.tb.b.b ENSGT00940000157106 ENSGT01090000260040.b.a.b.y.a ENSGT00940000157238.b ENSGT00390000013390 ENSGT00940000157869.e.a ENSGT00510000047225.b Greater amberjack MODERN SPECIES 16 RBSN (ENSSDUG00000012924) mrps25 (ENSSDUG00000012983) nr2c2 (ENSSDUG00000013049) B3GALT4 (ENSSDUG00000013121) wdr46 (ENSSDUG00000013128) ENSSDUG00000013164 ENSSDUG00000013232 ENSSDUG00000013295 ENSSDUG00000013871 ENSSDUG00000013905 ogg1 (ENSSDUG00000013964) qars1 (ENSSDUG00000014004) QRICH1 (ENSSDUG00000014102) ENSSDUG00000014128 prickle2a (ENSSDUG00000014144) rho (ENSSDUG00000014169) #22 MAGI1 (ENSSDUG00000014188) ren (ENSSDUG00000014357) csf1b (ENSSDUG00000014430) FMOD (ENSSDUG00000014453) mapkapk2b (ENSSDUG00000014467) eif2d (ENSSDUG00000014517) ENSSDUG00000014569 ENSSDUG00000014587 ENSSDUG00000014600 rbm39b (ENSSDUG00000014712) pabpc1l (ENSSDUG00000014743) YWHAB (ENSSDUG00000014803) ognb (ENSSDUG00000014819) UQCC5 (ENSSDUG00000014836) kctd6b (ENSSDUG00000014858) Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 3047 nr2c2 (ENSSLDG00000004935) wdr46 (ENSSLDG00000005016) B3GALT4 (ENSSLDG00000005046) ENSSLDG00000005059 ENSSLDG00000005087 ENSSLDG00000005120 sult1st3 (ENSSLDG00000005168) ENSSLDG00000005363 ENSSLDG00000005413 ogg1 (ENSSLDG00000005428) qars1 (ENSSLDG00000005475) QRICH1 (ENSSLDG00000005585) ENSSLDG00000005647 ENSSLDG00000005695 prickle2a (ENSSLDG00000005721) rho (ENSSLDG00000005814) #22 MAGI1 (ENSSLDG00000006379) ren (ENSSLDG00000006598) csf1b (ENSSLDG00000006617) FMOD (ENSSLDG00000006633) mapkapk2b (ENSSLDG00000006641) eif2d (ENSSLDG00000006671) ENSSLDG00000006709 ENSSLDG00000006761 ENSSLDG00000006775 ENSSLDG00000006815 rbm39b (ENSSLDG00000006938) pabpc1l (ENSSLDG00000006981) YWHAB (ENSSLDG00000007130) UQCC5 (ENSSLDG00000007154) ognb (ENSSLDG00000007165) Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.b.a.a ENSGT00940000163342.b.a ENSGT00940000163342.b.b ENSGT00730000111360.a ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 ENSGT00940000155241.c ENSGT00940000164079 ENSGT00390000016228.b ENSGT00940000153629.a.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.a #22 ENSGT00940000155820.b ENSGT00940000157898 ENSGT00390000015805.b ENSGT00940000157007.i.a ENSGT00940000157261.k.b ENSGT00550000074865 ENSGT00940000170563 ENSGT00940000165387.a ENSGT00950000182844.a.a.b ENSGT00940000154468.tb.b.b ENSGT00940000157106 ENSGT01090000260040.b.a.b.y.a ENSGT00940000157238.b ENSGT00390000013390 ENSGT00940000157869.e.a Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.b.a.a ENSGT00940000163342.b.a ENSGT00940000163342.b.b ENSGT00730000111360.a ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 ENSGT00940000155241.c ENSGT00390000016228.b ENSGT00940000153629.a.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.a #22 ENSGT00940000155820.b ENSGT00940000157898 ENSGT00390000015805.b ENSGT00940000157007.i.a ENSGT00550000074865 ENSGT00940000170563 ENSGT00940000165387.a ENSGT00950000182844.a.a.b ENSGT00940000154468.tb.b.b ENSGT00940000157106 ENSGT01090000260040.b.a.b.y.a ENSGT00940000157238.b ENSGT00390000013390 ENSGT00940000157869.e.a ENSGT00510000047225.b Oryzias ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.b.a.a.u ENSGT00940000163342.a.b.a.a.v ENSGT00940000163342.b.b ENSGT00730000111360.a ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 ENSGT00940000155241.c ENSGT00940000154814.b ENSGT00940000164079 ENSGT00390000016228.b ENSGT00940000153629.a.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.a #22 ENSGT00940000155820.b ENSGT00940000157898 ENSGT00390000015805.b ENSGT00940000157007.i.a ENSGT00550000074865 ENSGT00940000165387.a ENSGT00950000182844.a.a.b ENSGT00940000154468.tb.b.b ENSGT00940000157106 ENSGT01090000260040.b.a.b.y.a ENSGT00390000013390 ENSGT00940000157869.e.a ENSGT00510000047225.b ENSGT00940000167624 ENSGT01030000234515.a.a.a.l Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.b.a.a.u ENSGT00940000163342.b.b ENSGT00730000111360.a ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 ENSGT00940000155241.c ENSGT00940000154814.b ENSGT00390000016228.b ENSGT00940000153629.a.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.a #22 ENSGT00940000155820.b ENSGT00940000157898 ENSGT00390000015805.b ENSGT00940000157007.i.a ENSGT00550000074865 ENSGT00940000165387.a ENSGT00940000154468.tb.b.b ENSGT00940000157106 ENSGT01090000260040.b.a.b.y.a ENSGT00390000013390 ENSGT00940000157869.e.a ENSGT00510000047225.b ENSGT00940000167624 ENSGT01030000234515.a.a.a.l ENSGT01100000263573.b.b Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 21 trh (ENSORLG00000010934) RBSN (ENSORLG00000010921) mrps25 (ENSORLG00000010890) nr2c2 (ENSORLG00000010877) ENSORLG00000010842 wdr46 (ENSORLG00000010831) sult1st3 (ENSORLG00000010795) ENSORLG00000010801 ENSORLG00000027427 ogg1 (ENSORLG00000010758) qars1 (ENSORLG00000010737) QRICH1 (ENSORLG00000010668) ENSORLG00000029590 ENSORLG00000010636 prickle2a (ENSORLG00000010626) rho (ENSORLG00000010599) #22 MAGI1 (ENSORLG00000010588) ren (ENSORLG00000010506) csf1b (ENSORLG00000010501) ENSORLG00000023753 ENSORLG00000023007 eif2d (ENSORLG00000010491) ENSORLG00000024979 ENSORLG00000010451 rbm39b (ENSORLG00000010370) pabpc1l (ENSORLG00000010322) YWHAB (ENSORLG00000010283) UQCC5 (ENSORLG00000010275) kctd6b (ENSORLG00000029105) abhd6b (ENSORLG00000010260) slmapb (ENSORLG00000010228) Chinese medaka MODERN SPECIES 499 wdr46 (ENSOSIG00000014177) ENSOSIG00000014178 nr2c2 (ENSOSIG00000014182) mrps25 (ENSOSIG00000015019) RBSN (ENSOSIG00000015023) ENSOSIG00000015025 ENSOSIG00000015027 ENSOSIG00000015030 ogg1 (ENSOSIG00000015031) qars1 (ENSOSIG00000015053) ENSOSIG00000018045 prickle2a (ENSOSIG00000018051) rho (ENSOSIG00000018058) #22 MAGI1 (ENSOSIG00000018149) ren (ENSOSIG00000019064) csf1b (ENSOSIG00000019068) FMOD (ENSOSIG00000019069) eif2d (ENSOSIG00000019116) ENSOSIG00000019904 rbm39b (ENSOSIG00000023463) pabpc1l (ENSOSIG00000023475) ywhaba (ENSOSIG00000023483) UQCC5 (ENSOSIG00000023486) kctd6b (ENSOSIG00000023488) abhd6b (ENSOSIG00000023490) slmapb (ENSOSIG00000023491) cers5 (ENSOSIG00000023495) ENSOSIG00000023497 Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.b.a.a.u ENSGT00940000163342.a.b.a.a.v ENSGT00940000163342.b.b ENSGT00730000111360.a ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 ENSGT00940000155241.c ENSGT00940000154814.b ENSGT00940000164079 ENSGT00390000016228.b ENSGT00940000153629.a.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.a #22 ENSGT00940000155820.b ENSGT00940000157898 ENSGT00390000015805.b ENSGT00940000157007.i.a ENSGT00550000074865 ENSGT00940000165387.a ENSGT00950000182844.a.a.b ENSGT00940000154468.tb.b.b ENSGT00940000157106 ENSGT01090000260040.b.a.b.y.a ENSGT00390000013390 ENSGT00940000157869.e.a ENSGT00510000047225.b ENSGT00940000167624 ENSGT01100000263573.b.b Indian medaka MODERN SPECIES 23 nr2c2 (ENSOMEG00000009402) ENSOMEG00000009432 ENSOMEG00000009439 wdr46 (ENSOMEG00000009465) ENSOMEG00000009482 ENSOMEG00000009497 ENSOMEG00000009518 ENSOMEG00000009533 ogg1 (ENSOMEG00000009550) qars1 (ENSOMEG00000009629) QRICH1 (ENSOMEG00000009708) ENSOMEG00000009735 ENSOMEG00000009751 ENSOMEG00000009774 prickle2a (ENSOMEG00000009828) rho (ENSOMEG00000010155) #22 MAGI1 (ENSOMEG00000010364) ren (ENSOMEG00000010462) csf1b (ENSOMEG00000010499) FMOD (ENSOMEG00000010504) eif2d (ENSOMEG00000010533) ENSOMEG00000010597 rh50 (ENSOMEG00000010626) rbm39b (ENSOMEG00000010704) pabpc1l (ENSOMEG00000010789) YWHAB (ENSOMEG00000010819) UQCC5 (ENSOMEG00000010835) kctd6b (ENSOMEG00000010855) abhd6b (ENSOMEG00000010886) slmapb (ENSOMEG00000010916) cers5 (ENSOMEG00000010954) Javanese ricefish MODERN SPECIES 21 RBSN (ENSOJAG00000004715) mrps25 (ENSOJAG00000004674) nr2c2 (ENSOJAG00000004240) ENSOJAG00000004201 wdr46 (ENSOJAG00000004006) ENSOJAG00000003944 ENSOJAG00000003901 ENSOJAG00000021351 ogg1 (ENSOJAG00000021331) qars1 (ENSOJAG00000021167) QRICH1 (ENSOJAG00000021145) ENSOJAG00000021135 ENSOJAG00000021128 ENSOJAG00000021107 prickle2a (ENSOJAG00000021097) rho (ENSOJAG00000021091) #22 MAGI1 (ENSOJAG00000021039) ren (ENSOJAG00000021013) csf1b (ENSOJAG00000021003) FMOD (ENSOJAG00000021000) eif2d (ENSOJAG00000020652) ENSOJAG00000017821 rbm39b (ENSOJAG00000017107) pabpc1l (ENSOJAG00000016862) YWHAB (ENSOJAG00000016751) UQCC5 (ENSOJAG00000016742) kctd6b (ENSOJAG00000016729) abhd6b (ENSOJAG00000016718) slmapb (ENSOJAG00000016704) cers5 (ENSOJAG00000016329) ENSOJAG00000016299 Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.b.a.a ENSGT00940000163342.b.a ENSGT00940000163342.b.b ENSGT00730000111360.a ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 ENSGT00940000155241.c ENSGT00940000154814.b ENSGT00390000016228.b ENSGT00940000153629.a.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.a #22 ENSGT00940000155820.b ENSGT00940000157898 ENSGT00390000015805.b ENSGT00940000157007.i.a ENSGT00550000074865 ENSGT00940000170563 ENSGT00940000165387.a ENSGT00950000182844.a.a.b ENSGT00940000154468.tb.b.b ENSGT00940000157106 ENSGT01090000260040.b.a.b.y.a ENSGT00940000157238.b ENSGT00390000013390 ENSGT00940000157869.e.a ENSGT00510000047225.b Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.b.a.a ENSGT00940000163342.b.a ENSGT00940000163342.b.b ENSGT00730000111360.a ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 ENSGT00940000155241.c ENSGT00940000154814.b ENSGT00390000016228.b ENSGT00940000153629.a.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.a #22 ENSGT00940000155820.b ENSGT00940000157898 ENSGT00390000015805.b ENSGT00940000157007.i.a ENSGT00550000074865 ENSGT00940000170563 ENSGT00940000165387.a ENSGT00950000182844.a.a.b ENSGT00940000154468.tb.b.b ENSGT00940000157106 ENSGT01090000260040.b.a.b.y.a ENSGT00940000157238.b ENSGT00390000013390 ENSGT00940000157869.e.a ENSGT00510000047225.b Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.b.a.a ENSGT00940000163342.b.a ENSGT00940000163342.b.b ENSGT00730000111360.a ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 ENSGT00940000155241.c ENSGT00940000154814.b ENSGT00390000016228.b ENSGT00940000153629.a.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.a #22 ENSGT00940000155820.b ENSGT00940000157898 ENSGT00390000015805.b ENSGT00940000157007.i.a ENSGT00550000074865 ENSGT00940000170563 ENSGT00940000165387.a ENSGT00950000182844.a.a.b ENSGT00940000154468.tb.b.b ENSGT00940000157106 ENSGT01090000260040.b.a.b.y.a ENSGT00940000157238.b ENSGT00390000013390 ENSGT00940000157869.e.a ENSGT00510000047225.b Poecilia ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.b.a.a.eb ENSGT00940000163342.b.a ENSGT00940000163342.b.b ENSGT00730000111360.a ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 ENSGT00940000155241.c ENSGT00940000154814.b ENSGT00390000016228.b ENSGT00940000153629.a.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.a #22 ENSGT00940000155820.b ENSGT00940000157898 ENSGT00390000015805.b ENSGT00940000157007.i.a ENSGT00550000074865 ENSGT00940000170563 ENSGT00940000165387.a ENSGT00950000182844.a.a.b ENSGT00940000154468.tb.b.b ENSGT00940000157106 ENSGT01090000260040.b.a.b.y.a ENSGT00940000182056 ENSGT00390000013390 ENSGT00940000157869.e.a ENSGT00510000047225.b NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 42 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.b.a.a.eb ENSGT00940000163342.b.a ENSGT00940000163342.b.b ENSGT00730000111360.a ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 ENSGT00940000155241.c ENSGT00940000154814.b ENSGT00390000016228.b ENSGT00940000153629.a.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.a #22 ENSGT00940000155820.b ENSGT00940000157898 ENSGT00390000015805.b ENSGT00940000157007.i.a ENSGT00550000074865 ENSGT00940000170563 ENSGT00940000165387.a ENSGT00950000182844.a.a.b ENSGT00940000154468.tb.b.b ENSGT00940000157106 ENSGT01090000260040.b.a.b.y.a ENSGT00940000182056 ENSGT00390000013390 ENSGT00940000157869.e.a ENSGT00510000047225.b Sailfin molly MODERN SPECIES 808 ENSPLAG00000013095 ENSPLAG00000013075 ENSPLAG00000012935 ENSPLAG00000012925 ogg1 (ENSPLAG00000012916) qars1 (ENSPLAG00000012885) QRICH1 (ENSPLAG00000012805) ENSPLAG00000012795 prickle2a (ENSPLAG00000012778) rho (ENSPLAG00000012740) #22 MAGI1 (ENSPLAG00000012357) Amazon molly MODERN SPECIES 385 mrps25 (ENSPFOG00000011720) nr2c2 (ENSPFOG00000011747) ENSPFOG00000020468 wdr46 (ENSPFOG00000011880) ENSPFOG00000022022 ENSPFOG00000012047 ENSPFOG00000011991 ENSPFOG00000012069 ENSPFOG00000012073 ogg1 (ENSPFOG00000012077) qars1 (ENSPFOG00000012143) QRICH1 (ENSPFOG00000012427) ENSPFOG00000012521 ENSPFOG00000012526 prickle2a (ENSPFOG00000012548) rho (ENSPFOG00000020469) #22 ENSPFOG00000020470 MAGI1 (ENSPFOG00000012659) ren (ENSPFOG00000012876) csf1b (ENSPFOG00000012904) FMOD (ENSPFOG00000012928) eif2d (ENSPFOG00000012940) ENSPFOG00000024038 ENSPFOG00000013014 rh50 (ENSPFOG00000023302) rbm39b (ENSPFOG00000013197) pabpc1l (ENSPFOG00000013241) YWHAB (ENSPFOG00000013465) UQCC5 (ENSPFOG00000013472) kctd6b (ENSPFOG00000013475) abhd6b (ENSPFOG00000013485) Guppy MODERN SPECIES 459 ABTB1 (ENSPREG00000016953) dnase1l4.1 (ENSPREG00000016864) ENSPREG00000016784 RBSN (ENSPREG00000016737) mrps25 (ENSPREG00000016711) nr2c2 (ENSPREG00000016689) ENSPREG00000016683 wdr46 (ENSPREG00000016613) ENSPREG00000016595 ENSPREG00000016468 ENSPREG00000016400 ENSPREG00000016386 ogg1 (ENSPREG00000016339) qars1 (ENSPREG00000016290) prickle2a (ENSPREG00000016262) rho (ENSPREG00000016208) #22 MAGI1 (ENSPREG00000016168) ren (ENSPREG00000016088) csf1b (ENSPREG00000016049) FMOD (ENSPREG00000015996) eif2d (ENSPREG00000015967) ENSPREG00000015953 ENSPREG00000015913 rh50 (ENSPREG00000015903) pabpc1l (ENSPREG00000015886) YWHAB (ENSPREG00000015866) ENSPREG00000015835 UQCC5 (ENSPREG00000015812) kctd6b (ENSPREG00000015801) abhd6b (ENSPREG00000015783) slmapb (ENSPREG00000015729) Platyfish MODERN SPECIES ENSXMAG00000006874 RBSN (ENSXMAG00000015881) mrps25 (ENSXMAG00000023324) nr2c2 (ENSXMAG00000015890) ENSXMAG00000025003 wdr46 (ENSXMAG00000029925) ENSXMAG00000015904 ENSXMAG00000022225 ENSXMAG00000015924 ENSXMAG00000024292 ogg1 (ENSXMAG00000015928) qars1 (ENSXMAG00000015931) QRICH1 (ENSXMAG00000015947) ENSXMAG00000015969 prickle2a (ENSXMAG00000029369) rho (ENSXMAG00000019635) #22 MAGI1 (ENSXMAG00000016982) ren (ENSXMAG00000017042) csf1b (ENSXMAG00000017069) eif2d (ENSXMAG00000014696) ENSXMAG00000017075 rh50 (ENSXMAG00000017078) rbm39b (ENSXMAG00000017099) pabpc1l (ENSXMAG00000017135) YWHAB (ENSXMAG00000017156) ognb (ENSXMAG00000024264) UQCC5 (ENSXMAG00000017172) kctd6b (ENSXMAG00000025640) abhd6b (ENSXMAG00000017177) slmapb (ENSXMAG00000017184) cers5 (ENSXMAG00000017186) NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 87 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.b.a.a ENSGT00940000163342.b.a ENSGT00940000163342.b.b ENSGT00730000111360.a ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 ENSGT00940000155241.c ENSGT00940000154814.b ENSGT00390000016228.b ENSGT00940000153629.a.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.a #22 ENSGT00940000155820.b ENSGT00940000157898 ENSGT00390000015805.b Mummichog MODERN SPECIES 2194 RBSN (ENSFHEG00000003446) mrps25 (ENSFHEG00000003470) ENSFHEG00000003455 nr2c2 (ENSFHEG00000003489) wdr46 (ENSFHEG00000003499) ENSFHEG00000003520 ENSFHEG00000003535 ENSFHEG00000003541 ENSFHEG00000003549 ogg1 (ENSFHEG00000003555) qars1 (ENSFHEG00000003621) QRICH1 (ENSFHEG00000003674) ENSFHEG00000003719 ENSFHEG00000003736 prickle2a (ENSFHEG00000000101) rho (ENSFHEG00000004108) #22 MAGI1 (ENSFHEG00000004189) ren (ENSFHEG00000004239) csf1b (ENSFHEG00000004245) Sheepshead minnow MODERN SPECIES 405 ENSCVAG00000012395 mrps25 (ENSCVAG00000012389) RBSN (ENSCVAG00000012378) nr2c2 (ENSCVAG00000012369) ENSCVAG00000012295 wdr46 (ENSCVAG00000012283) ENSCVAG00000012273 ENSCVAG00000012266 ENSCVAG00000012245 ENSCVAG00000012239 ogg1 (ENSCVAG00000012226) qars1 (ENSCVAG00000012209) QRICH1 (ENSCVAG00000012043) ENSCVAG00000012027 prickle2a (ENSCVAG00000012013) rho (ENSCVAG00000011962) #22 MAGI1 (ENSCVAG00000011941) ren (ENSCVAG00000011718) ENSCVAG00000011610 Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.b.a.a ENSGT00940000163342.b.a ENSGT00940000163342.b.b ENSGT00730000111360.a ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 ENSGT00940000155241.c ENSGT00940000154814.b ENSGT00390000016228.b ENSGT00940000153629.a.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.a #22 ENSGT00940000155820.b ENSGT00940000157898 ENSGT00390000015805.b ENSGT00940000157007.i.a ENSGT00550000074865 ENSGT00940000165387.a ENSGT00940000154468.tb.b.b ENSGT00940000157106 ENSGT01090000260040.b.a.b.y.a ENSGT00390000013390 ENSGT00940000157869.e.a ENSGT00510000047225.b ENSGT00940000167624 ENSGT01030000234515.a.a.a.l ENSGT01100000263573.b.b Mangrove rivulus MODERN SPECIES 13 mrps25 (ENSKMAG00000015394) nr2c2 (ENSKMAG00000015414) B3GALT4 (ENSKMAG00000015442) wdr46 (ENSKMAG00000015454) ENSKMAG00000015482 ENSKMAG00000015514 ENSKMAG00000015529 ENSKMAG00000015568 ENSKMAG00000015654 ENSKMAG00000015676 ogg1 (ENSKMAG00000015692) qars1 (ENSKMAG00000015716) QRICH1 (ENSKMAG00000015803) ENSKMAG00000015831 prickle2a (ENSKMAG00000015859) rho (ENSKMAG00000016002) #22 MAGI1 (ENSKMAG00000016402) ren (ENSKMAG00000016620) ENSKMAG00000016642 FMOD (ENSKMAG00000016671) eif2d (ENSKMAG00000016689) ENSKMAG00000016723 ENSKMAG00000016752 rbm39b (ENSKMAG00000016811) pabpc1l (ENSKMAG00000016847) YWHAB (ENSKMAG00000016900) UQCC5 (ENSKMAG00000016917) kctd6b (ENSKMAG00000016932) abhd6b (ENSKMAG00000016937) slmapb (ENSKMAG00000016951) cers5 (ENSKMAG00000016971) Turquoise killifish MODERN SPECIES 1624 NCOA3 (ENSNFUG00015025105) Nfu_g_1_001626 (ENSNFUG00015025097) ENSNFUG00015025096 prkcbp1l (ENSNFUG00015025000) DIDO1 (ENSNFUG00015024959) ENSNFUG00015024958 ENSNFUG00015024951 PRRT3 (ENSNFUG00015024947) OGG1 (ENSNFUG00015024943) QARS (ENSNFUG00015024897) QRICH1 (ENSNFUG00015024878) ENSNFUG00015024875 ENSNFUG00015024874 ENSNFUG00015024871 PRICKLE2 (ENSNFUG00015024870) RHO (ENSNFUG00015024867) #22 ENSNFUG00015024866 MAGI1 (ENSNFUG00015024839) ren (ENSNFUG00015024819) CSF1B (ENSNFUG00015024812) FMOD (ENSNFUG00015024811) ENSNFUG00015024805 ENSNFUG00015024803 ENSNFUG00015024662 ENSNFUG00015024651 ENSNFUG00015024628 BRPF1 (ENSNFUG00015024609) ENSNFUG00015024608 ENSNFUG00015024607 ENSNFUG00015024605 ctdsp2 (ENSNFUG00015024600) Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.b.a.a ENSGT00940000163342.b.a.d ENSGT00940000163342.b.b ENSGT00730000111360.a ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 ENSGT00940000155241.c ENSGT00940000164079 ENSGT00390000016228.b ENSGT00940000153629.a.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.a #22 ENSGT00940000155820.b ENSGT00940000157898 ENSGT00390000015805.b ENSGT00940000157007.i.a ENSGT00940000157261.k.b ENSGT00550000074865 ENSGT00940000170563 ENSGT00940000165387.a ENSGT00950000182844.a.a.b ENSGT00940000154468.tb.b.b ENSGT00940000157106 ENSGT01090000260040.b.a.b.y.a ENSGT00940000157238.b ENSGT00390000013390 ENSGT00940000157869.e.a Cichlidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.b.a.a ENSGT00940000163342.b.a.d.b.b.a.b.b ENSGT00940000163342.b.a.d.b.a ENSGT00940000163342.b.a.d.b.b.a.a ENSGT00940000163342.b.b ENSGT00730000111360.a ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 ENSGT00940000155241.c ENSGT00390000016228.b ENSGT00940000153629.a.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.a #22 ENSGT00940000155820.b ENSGT00940000157898 ENSGT00390000015805.b ENSGT00940000157007.i.a ENSGT00550000074865 ENSGT00940000170563 ENSGT00940000165387.a ENSGT00950000182844.a.a.b ENSGT00940000154468.tb.b.b ENSGT00940000157106 ENSGT01090000260040.b.a.b.y.a ENSGT00940000157238.b ENSGT00390000013390 ENSGT00940000157869.e.a ENSGT00510000047225.b Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000163342.a.b.a.a.t.b ENSGT00940000163342.b.a.c.b ENSGT00940000163342.a.b.a.a.t.a ENSGT00940000163342.b.a.d.b.b.a.b.b ENSGT00940000163342.b.a.d.b.b.a.b.a ENSGT00940000163342.b.a.d.b.b.b.a ENSGT00940000163342.b.a.d.b.a.a ENSGT00940000163342.b.a.d.b.b.a.a ENSGT00940000163342.b.b ENSGT00730000111360.a ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 ENSGT00940000155241.c ENSGT00390000016228.b ENSGT00940000153629.a.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.a #22 ENSGT00940000155820.b ENSGT00940000157898 ENSGT00390000015805.b ENSGT00940000157007.i.a ENSGT00550000074865 ENSGT00940000170563 ENSGT00940000165387.a ENSGT00950000182844.a.a.b ENSGT00940000154468.tb.b.b ENSGT00940000157106 ENSGT01090000260040.b.a.b.y.a ENSGT00940000157238.b ENSGT00390000013390 ENSGT00940000157869.e.a ENSGT00510000047225.b Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000163342.b.a.c.b ENSGT00940000163342.a.b.a.a.t.a ENSGT00940000163342.b.a.d.b.b.a.b.b ENSGT00940000163342.b.a.d.b.b.a.b.a ENSGT00940000163342.b.a.d.b.b.b.a ENSGT00940000163342.b.a.d.b.b.b.b ENSGT00940000163342.b.a.d.b.a.a ENSGT00940000163342.b.a.d.b.b.a.a ENSGT00940000163342.b.b ENSGT00730000111360.a ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 ENSGT00940000155241.c ENSGT00390000016228.b ENSGT00940000153629.a.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.a #22 ENSGT00940000155820.b ENSGT00940000157898 ENSGT00390000015805.b ENSGT00940000157007.i.a ENSGT00550000074865 ENSGT00940000170563 ENSGT00940000165387.a ENSGT00950000182844.a.a.b ENSGT00940000154468.tb.b.b ENSGT00940000157106 ENSGT01090000260040.b.a.b.y.a ENSGT00940000157238.b ENSGT00390000013390 ENSGT00940000157869.e.a ENSGT00510000047225.b Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000163342.b.a.c.b ENSGT00940000163342.a.b.a.a.t.a ENSGT00940000163342.b.a.d.b.b.a.b.b ENSGT00940000163342.b.a.d.b.b.a.b.a ENSGT00940000163342.b.a.d.b.b.b.a.b.b ENSGT00940000163342.b.a.d.b.b.b.b ENSGT00940000163342.b.a.d.b.a.a ENSGT00940000163342.b.a.d.b.b.a.a ENSGT00940000163342.b.b ENSGT00730000111360.a ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 ENSGT00940000155241.c ENSGT00390000016228.b ENSGT00940000153629.a.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.a #22 ENSGT00940000155820.b ENSGT00940000157898 ENSGT00390000015805.b ENSGT00940000157007.i.a ENSGT00550000074865 ENSGT00940000170563 ENSGT00940000165387.a ENSGT00950000182844.a.a.b ENSGT00940000154468.tb.b.b ENSGT00940000157106 ENSGT01090000260040.b.a.b.y.a ENSGT00940000157238.b ENSGT00390000013390 ENSGT00940000157869.e.a ENSGT00510000047225.b Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 404 ENSHBUG00000000171 ENSHBUG00000000908 ogg1 (ENSHBUG00000006860) qars1 (ENSHBUG00000000168) QRICH1 (ENSHBUG00000006774) ENSHBUG00000006711 ENSHBUG00000006680 prickle2a (ENSHBUG00000006665) rhodopsin (ENSHBUG00000006609) #22 MAGI1 (ENSHBUG00000006562) ren (ENSHBUG00000006331) ENSHBUG00000006322 FMOD (ENSHBUG00000006305) eif2d (ENSHBUG00000006298) ENSHBUG00000006285 ENSHBUG00000006258 rh50 (ENSHBUG00000006172) rbm39b (ENSHBUG00000006158) pabpc1l (ENSHBUG00000006134) YWHAB (ENSHBUG00000006046) ognb (ENSHBUG00000006025) UQCC5 (ENSHBUG00000006030) kctd6b (ENSHBUG00000006019) abhd6b (ENSHBUG00000005994) Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000163342.a.b.a.a.t.a ENSGT00940000163342.b.a.d.b.b.a.b.b.c ENSGT00940000163342.b.a.d.b.b.a.b.b.d ENSGT00940000163342.b.a.d.b.b.a.b.a ENSGT00940000163342.b.a.d.b.b.b.a.b.b ENSGT00940000163342.b.a.d.b.b.b.b ENSGT00940000163342.b.a.d.b.a.a ENSGT00940000163342.b.a.d.b.b.a.a ENSGT00940000163342.b.b ENSGT00730000111360.a ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 ENSGT00940000155241.c ENSGT00390000016228.b ENSGT00940000153629.a.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.a #22 ENSGT00940000155820.b ENSGT00940000157898 ENSGT00390000015805.b ENSGT00940000157007.i.a ENSGT00550000074865 ENSGT00940000166133 ENSGT00940000170563 ENSGT00940000165387.a ENSGT00950000182844.a.a.b ENSGT00940000154468.tb.b.b ENSGT00940000157106 ENSGT01090000260040.b.a.b.y.a ENSGT00940000157238.b ENSGT00390000013390 ENSGT00940000157869.e.a Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.b.a.a.t.b ENSGT00940000163342.a.b.a.a.t.a ENSGT00940000163342.b.a.d.b.b.a.b.b.c ENSGT00940000163342.b.a.d.b.b.b.a.b.b ENSGT00940000163342.b.a.d.b.b.b.b ENSGT00940000163342.b.a.d.b.a.a ENSGT00940000163342.b.a.d.b.b.a.a ENSGT00940000163342.b.b ENSGT00730000111360.a ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 ENSGT00940000155241.c ENSGT00390000016228.b ENSGT00940000153629.a.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.a #22 ENSGT00940000155820.b ENSGT00940000157898 ENSGT00390000015805.b ENSGT00940000157007.i.a ENSGT00550000074865 ENSGT00940000170563 ENSGT00940000165387.a ENSGT00950000182844.a.a.b ENSGT00940000154468.tb.b.b ENSGT00940000157106 ENSGT01090000260040.b.a.b.y.a ENSGT00390000013390 ENSGT00940000157238.b ENSGT00940000157869.e.a ENSGT00510000047225.b Zebra mbuna MODERN SPECIES 1103 ENSMZEG00005024885 ENSMZEG00005024231 ENSMZEG00005024223 ENSMZEG00005024218 ENSMZEG00005024213 ENSMZEG00005024212 ENSMZEG00005024209 ENSMZEG00005024206 ogg1 (ENSMZEG00005024202) qars1 (ENSMZEG00005024193) QRICH1 (ENSMZEG00005024186) ENSMZEG00005024184 ENSMZEG00005024180 ENSMZEG00005024176 prickle2a (ENSMZEG00005024166) rho (ENSMZEG00005023772) #22 MAGI1 (ENSMZEG00005023753) ren (ENSMZEG00005023745) ENSMZEG00005023742 FMOD (ENSMZEG00005023740) eif2d (ENSMZEG00005023738) ENSMZEG00005023735 ENSMZEG00005023733 rh50 (ENSMZEG00005023727) rbm39b (ENSMZEG00005023724) pabpc1l (ENSMZEG00005023713) YWHAB (ENSMZEG00005023712) UQCC5 (ENSMZEG00005023708) ognb (ENSMZEG00005023709) kctd6b (ENSMZEG00005023707) abhd6b (ENSMZEG00005023704) P. nyererei MODERN SPECIES 395 ENSPNYG00000006266 ENSPNYG00000005625 ENSPNYG00000005506 ENSPNYG00000005485 ENSPNYG00000005462 ENSPNYG00000005445 ENSPNYG00000005434 ogg1 (ENSPNYG00000005382) qars1 (ENSPNYG00000005285) QRICH1 (ENSPNYG00000005258) ENSPNYG00000005231 ENSPNYG00000005215 prickle2a (ENSPNYG00000005176) rho (ENSPNYG00000004784) #22 MAGI1 (ENSPNYG00000004648) ren (ENSPNYG00000004564) ENSPNYG00000004521 FMOD (ENSPNYG00000004512) eif2d (ENSPNYG00000004459) ENSPNYG00000004422 ENSPNYG00000004347 rh50 (ENSPNYG00000004335) rbm39b (ENSPNYG00000004315) pabpc1l (ENSPNYG00000004101) YWHAB (ENSPNYG00000004043) ognb (ENSPNYG00000004017) UQCC5 (ENSPNYG00000004035) kctd6b (ENSPNYG00000003973) abhd6b (ENSPNYG00000003928) Lyretail cichlid MODERN SPECIES 334 ENSNBRG00000019220 ENSNBRG00000018980 ENSNBRG00000018938 ENSNBRG00000018334 ENSNBRG00000018164 ENSNBRG00000018146 ENSNBRG00000018129 ENSNBRG00000018121 ogg1 (ENSNBRG00000018078) qars1 (ENSNBRG00000018005) ENSNBRG00000017984 QRICH1 (ENSNBRG00000017950) ENSNBRG00000017922 ENSNBRG00000017913 prickle2a (ENSNBRG00000017890) rho (ENSNBRG00000017435) #22 MAGI1 (ENSNBRG00000017348) ren (ENSNBRG00000017285) ENSNBRG00000017253 FMOD (ENSNBRG00000017243) eif2d (ENSNBRG00000017231) ENSNBRG00000017222 ENSNBRG00000017133 rh50 (ENSNBRG00000017067) rbm39b (ENSNBRG00000017035) pabpc1l (ENSNBRG00000016633) YWHAB (ENSNBRG00000016560) ognb (ENSNBRG00000016469) UQCC5 (ENSNBRG00000016456) kctd6b (ENSNBRG00000016454) abhd6b (ENSNBRG00000016434) Nile tilapia MODERN SPECIES 12 nr2c2 (ENSONIG00000017240) B3GALT4 (ENSONIG00000021141) wdr46 (ENSONIG00000017243) sult1st3 (ENSONIG00000039142) ENSONIG00000028103 ENSONIG00000017258 ENSONIG00000043155 ENSONIG00000039507 ENSONIG00000039747 ENSONIG00000042997 ogg1 (ENSONIG00000017261) qars (ENSONIG00000038539) QRICH1 (ENSONIG00000017265) ENSONIG00000017271 prickle2a (ENSONIG00000017272) rho (ENSONIG00000021142) #22 MAGI1 (ENSONIG00000017273) ren (ENSONIG00000017285) ENSONIG00000017291 FMOD (ENSONIG00000017292) eif2d (ENSONIG00000017293) ENSONIG00000017301 rbm39b (ENSONIG00000017310) pabpc1l (ENSONIG00000017314) YWHAB (ENSONIG00000027100) ognb (ENSONIG00000017318) UQCC5 (ENSONIG00000039104) kctd6b (ENSONIG00000017322) abhd6b (ENSONIG00000017324) slmapb (ENSONIG00000017328) cers5 (ENSONIG00000017329) Midas cichlid MODERN SPECIES 622 ENSACIG00000021284 ENSACIG00000021303 ENSACIG00000021602 ENSACIG00000021964 ENSACIG00000022113 ENSACIG00000022327 ogg1 (ENSACIG00000022385) qars1 (ENSACIG00000022417) QRICH1 (ENSACIG00000022454) ENSACIG00000022492 ENSACIG00000022510 prickle2a (ENSACIG00000022521) rho (ENSACIG00000022548) #22 MAGI1 (ENSACIG00000022881) ren (ENSACIG00000022907) ENSACIG00000022940 FMOD (ENSACIG00000022952) Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.b.a.a ENSGT00940000163342.a.b.a.b.b ENSGT00940000163342.b.a.c.a ENSGT00730000111360.a ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 ENSGT00940000155241.c ENSGT00940000164079 ENSGT00390000016228.b ENSGT00940000153629.a.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.a #22 ENSGT00940000155820.b ENSGT00940000157898 ENSGT00390000015805.b ENSGT00940000157007.i.a ENSGT00940000157261.k.b ENSGT00550000074865 ENSGT00940000165387.a ENSGT00950000182844.a.a.b ENSGT00940000154468.tb.b.b ENSGT00940000157106 ENSGT01090000260040.b.a.b.y.a ENSGT00940000157238.b ENSGT00390000013390 ENSGT00940000157869.e.a ENSGT00510000047225.b Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000166600 ENSGT00390000016228.b ENSGT00940000153629.a.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.a #22 ENSGT00940000155820.b ENSGT00940000157898 ENSGT00390000015805.b ENSGT00940000157007.i.a ENSGT00940000157261.k.b ENSGT00550000074865 ENSGT00940000165387.a ENSGT00940000154468.tb.b.b ENSGT00940000157106 ENSGT01090000260040.b.a.b.y.a ENSGT00940000157238.b ENSGT00390000013390 ENSGT00940000157869.e.a ENSGT00510000047225.b ENSGT00940000167624 Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000166600 ENSGT00390000016228.b ENSGT00940000153629.a.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.a #22 ENSGT00940000155820.b ENSGT00940000157898 ENSGT00390000015805.b ENSGT00940000157007.i.a ENSGT00940000157261.k.b ENSGT00550000074865 ENSGT00940000165387.a ENSGT00940000154468.tb.b.b ENSGT00940000157106 ENSGT01090000260040.b.a.b.y.a ENSGT00940000157238.b ENSGT00390000013390 ENSGT00940000157869.e.a ENSGT00510000047225.b ENSGT00940000167624 Clown anemonefish MODERN SPECIES 1599 intu (ENSAOCG00000019137) ino80b (ENSAOCG00000019122) AADAT (ENSAOCG00000019102) mfap3l (ENSAOCG00000019054) CLCN3 (ENSAOCG00000019023) nit1 (ENSAOCG00000018937) pfdn2 (ENSAOCG00000018923) b4gat1 (ENSAOCG00000018900) six7 (ENSAOCG00000002782) zgc:101810 (ENSAOCG00000018874) QRICH1 (ENSAOCG00000018842) ENSAOCG00000018778 ENSAOCG00000018751 prickle2a (ENSAOCG00000018729) rho (ENSAOCG00000018646) #22 MAGI1 (ENSAOCG00000018032) ren (ENSAOCG00000017916) csf1b (ENSAOCG00000017881) FMOD (ENSAOCG00000017842) mapkapk2b (ENSAOCG00000017822) ENSAOCG00000017640 eif2d (ENSAOCG00000017584) ENSAOCG00000017522 ENSAOCG00000017415 ENSAOCG00000002019 styk1b (ENSAOCG00000017365) phc1 (ENSAOCG00000017285) Orange clownfish MODERN SPECIES 22 rbm38 (ENSAPEG00000013137) mipb (ENSAPEG00000013129) ENSAPEG00000013107 ENSAPEG00000013083 ENSAPEG00000013068 ptges3b (ENSAPEG00000013037) naca (ENSAPEG00000012967) ENSAPEG00000012945 ENSAPEG00000012932 ogg1 (ENSAPEG00000012908) qars1 (ENSAPEG00000012849) QRICH1 (ENSAPEG00000012799) ENSAPEG00000012765 ENSAPEG00000012751 prickle2a (ENSAPEG00000012729) rho (ENSAPEG00000012211) #22 MAGI1 (ENSAPEG00000012080) ren (ENSAPEG00000012034) ENSAPEG00000011986 FMOD (ENSAPEG00000011965) ENSAPEG00000011748 mapkapk2b (ENSAPEG00000011445) eif2d (ENSAPEG00000011347) ENSAPEG00000011233 rbm39b (ENSAPEG00000011141) pabpc1l (ENSAPEG00000010558) YWHAB (ENSAPEG00000010510) ognb (ENSAPEG00000010499) ENSAPEG00000010479 kctd6b (ENSAPEG00000010468) abhd6b (ENSAPEG00000010420) Spiny chromis MODERN SPECIES 469 nhlh2 (ENSAPOG00000002819) vangl1 (ENSAPOG00000002844) casq2 (ENSAPOG00000002876) KCNE2 (ENSAPOG00000002888) SLC5A3 (ENSAPOG00000002894) DOP1B (ENSAPOG00000003000) ENSAPOG00000003043 ENSAPOG00000003055 chaf1b (ENSAPOG00000003088) ENSAPOG00000003097 bcl9 (ENSAPOG00000003113) acp6 (ENSAPOG00000003134) gja5a (ENSAPOG00000003144) rho (ENSAPOG00000003170) #22 MAGI1 (ENSAPOG00000003337) ren (ENSAPOG00000003412) ENSAPOG00000003429 FMOD (ENSAPOG00000003439) mapkapk2b (ENSAPOG00000003470) eif2d (ENSAPOG00000003524) Bicolor damselfish MODERN SPECIES 1382 rho (ENSSPAG00000005627) #22 MAGI1 (ENSSPAG00000005538) ren (ENSSPAG00000005517) csf1b (ENSSPAG00000005486) FMOD (ENSSPAG00000005478) MAPKAPK2 (ENSSPAG00000005464) Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 21 TMCC1 (ENSMMDG00005012775) trh (ENSMMDG00005012773) RBSN (ENSMMDG00005012646) mrps25 (ENSMMDG00005012633) nr2c2 (ENSMMDG00005012018) B3GALT4 (ENSMMDG00005012002) wdr46 (ENSMMDG00005011998) ENSMMDG00005011324 ENSMMDG00005011296 ENSMMDG00005011289 ogg1 (ENSMMDG00005011288) qars1 (ENSMMDG00005011040) QRICH1 (ENSMMDG00005010845) ENSMMDG00005010842 prickle2a (ENSMMDG00005010835) rho (ENSMMDG00005010831) #22 MAGI1 (ENSMMDG00005010828) ren (ENSMMDG00005010824) ENSMMDG00005010822 FMOD (ENSMMDG00005010820) mapkapk2b (ENSMMDG00005010785) eif2d (ENSMMDG00005010750) ENSMMDG00005010724 rbm39b (ENSMMDG00005010666) pabpc1l (ENSMMDG00005010521) YWHAB (ENSMMDG00005010500) ognb (ENSMMDG00005010494) UQCC5 (ENSMMDG00005010493) kctd6b (ENSMMDG00005010490) abhd6b (ENSMMDG00005010446) ENSMMDG00005010405 Cod MODERN SPECIES ENSGMOG00000022246 wdr46 (ENSGMOG00000017015) ENSGMOG00000024772 ENSGMOG00000016998 ENSGMOG00000016964 ENSGMOG00000002124 ENSGMOG00000036454 ENSGMOG00000030380 ENSGMOG00000032214 ENSGMOG00000016907 ENSGMOG00000016875 ENSGMOG00000016855 ENSGMOG00000031632 prickle2a (ENSGMOG00000016816) ENSGMOG00000031308 ENSGMOG00000020380 #22 ENSGMOG00000016734 ENSGMOG00000016720 ENSGMOG00000016713 ENSGMOG00000016703 eif2d (ENSGMOG00000016667) ENSGMOG00000016616 rbm39b (ENSGMOG00000004740) ENSGMOG00000004437 ENSGMOG00000004357 ognb (ENSGMOG00000004281) ENSGMOG00000026622 kctd6b (ENSGMOG00000004254) gstm.1 (ENSGMOG00000004235) eps8l3b (ENSGMOG00000004190) ENSGMOG00000036162 Protacanthopterygii DUPLICATION Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189.pb.b ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.b.b ENSGT00730000111360.a ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 ENSGT00940000155241.c ENSGT00390000016228.b ENSGT00940000153629.a.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.a.a #22 ENSGT00940000155820.b ENSGT00940000157898 ENSGT00390000015805.b ENSGT00940000157007.i.a ENSGT00940000157261.k.b ENSGT00550000074865 ENSGT00940000166133 ENSGT00940000165387.a ENSGT00950000182844.a.a.b ENSGT00940000154468.tb.b.b ENSGT00940000157106 ENSGT01090000260040.b.a.b.y.a ENSGT00950000182952.C.g.a ENSGT00940000157238.b ENSGT00390000013390 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 160 ENSGT00940000158219.a ENSGT00390000007159.d ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798.`b ENSGT00390000007075.e ENSGT00940000163342.a.b.b.e ENSGT00940000163342.a.b.b.f ENSGT00730000111360.a.c ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 ENSGT00940000155241.c ENSGT00940000154814.b.oc ENSGT00390000016228.b.a ENSGT00940000153629.a.a.a.d ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.a.a #22 ENSGT00940000155820.b.c ENSGT00940000157898.j ENSGT00390000015805.b.d ENSGT00940000157007.i.a ENSGT00940000157261.k.b.c ENSGT00550000074865.j ENSGT00940000165387.a.d ENSGT00940000154468.tb.b.b.a ENSGT00940000157106 ENSGT01090000260040.b.a.b.y.a.c ENSGT00950000182952.C.g.a ENSGT00940000157238.b.e ENSGT00390000013390 ENSGT00940000155306.a.o.a ENSGT00940000157869.e.a Huchen MODERN SPECIES 602 prickle2a (ENSHHUG00000002974) rho (ENSHHUG00000002989) #22 MAGI1 (ENSHHUG00000003177) ren (ENSHHUG00000003227) ENSHHUG00000003274 mapkapk2b (ENSHHUG00000003329) eif2d (ENSHHUG00000003385) ENSHHUG00000003467 ENSHHUG00000003483 rh50 (ENSHHUG00000005564) rbm39b (ENSHHUG00000005715) pabpc1l (ENSHHUG00000005875) YWHAB (ENSHHUG00000006008) ENSHHUG00000006200 ognb (ENSHHUG00000006396) UQCC5 (ENSHHUG00000006402) Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000158219.a ENSGT00390000007159.d ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798.`b ENSGT00390000007075.e ENSGT00940000163342.a.b.b.e.a.a ENSGT00940000163342.a.b.b.e.a.b ENSGT00940000163342.a.b.b.f ENSGT00730000111360.a.c ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 ENSGT00940000155241.c ENSGT00390000016228.b.a ENSGT00940000153629.a.a.a.d ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.a.a #22 ENSGT00940000155820.b.c ENSGT00940000157898.j ENSGT00390000015805.b.d ENSGT00940000157007.i.a ENSGT00940000157261.k.b.c ENSGT00550000074865.j ENSGT00940000165387.a.d ENSGT00940000154468.tb.b.b.a ENSGT00940000157106 ENSGT01090000260040.b.a.b.y.a.c ENSGT00950000182952.C.g.a ENSGT00940000157238.b.e ENSGT00390000013390 ENSGT00940000155306.a.o.a ENSGT00940000157869.e.a Salmo ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000016951.e ENSGT00940000158219.a ENSGT00390000007159.d ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798.`b ENSGT00390000007075.e ENSGT00940000163342.a.b.b.e.a.a ENSGT00940000163342.a.b.b.e.a.b ENSGT00730000111360.a.c ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 ENSGT00940000155241.c.a ENSGT00390000016228.b.a ENSGT00940000153629.a.a.a.d ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.a.a #22 ENSGT00940000155820.b.c ENSGT00940000157898.j ENSGT00390000015805.b.d ENSGT00940000157007.i.a ENSGT00940000157261.k.b.c ENSGT00550000074865.j ENSGT00940000165387.a.d ENSGT00940000154468.tb.b.b.a ENSGT00940000157106 ENSGT01090000260040.b.a.b.y.a.c ENSGT00950000182952.C.g.a ENSGT00940000157238.b.e ENSGT00390000013390 ENSGT00940000155306.a.o.a ENSGT00940000157869.e.a River trout MODERN SPECIES 23 ENSSTUG00000009405 trh (ENSSTUG00000009415) ENSSTUG00000009428 RBSN (ENSSTUG00000009436) mrps25 (ENSSTUG00000009557) nr2c2 (ENSSTUG00000009579) ENSSTUG00000009753 wdr46 (ENSSTUG00000009762) ENSSTUG00000009782 ENSSTUG00000009871 ENSSTUG00000009961 ogg1 (ENSSTUG00000009971) qars1 (ENSSTUG00000010084) QRICH1 (ENSSTUG00000013207) ENSSTUG00000013221 rho (ENSSTUG00000013243) #22 MAGI1 (ENSSTUG00000013270) ren (ENSSTUG00000013416) ENSSTUG00000013584 ENSSTUG00000013636 mapkapk2b (ENSSTUG00000013649) eif2d (ENSSTUG00000013871) ENSSTUG00000014014 rbm39b (ENSSTUG00000018124) pabpc1l (ENSSTUG00000018308) YWHAB (ENSSTUG00000018543) ENSSTUG00000018700 ognb (ENSSTUG00000018703) UQCC5 (ENSSTUG00000018727) ENSSTUG00000018730 kctd6b (ENSSTUG00000018735) Atlantic salmon MODERN SPECIES 4 ENSSSAG00000084122 ENSSSAG00000079043 mrps25 (ENSSSAG00000079033) nr2c2 (ENSSSAG00000078763) ENSSSAG00000078743 wdr46 (ENSSSAG00000078719) st1s3 (ENSSSAG00000078712) ENSSSAG00000078689 ENSSSAG00000095223 ogg1 (ENSSSAG00000078670) qars (ENSSSAG00000078464) ENSSSAG00000078423 ENSSSAG00000078419 ENSSSAG00000122027 prickle2a (ENSSSAG00000078410) ENSSSAG00000078406 #22 ENSSSAG00000078255 ENSSSAG00000078153 ENSSSAG00000078129 ENSSSAG00000078124 mapkapk2b (ENSSSAG00000078059) eif2d (ENSSSAG00000078013) ENSSSAG00000071223 rbm39b (ENSSSAG00000070603) ENSSSAG00000068975 ENSSSAG00000068584 BTG1 (ENSSSAG00000068577) ognb (ENSSSAG00000068572) smim4 (ENSSSAG00000068570) ENSSSAG00000107860 kctd6b (ENSSSAG00000068564) Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000158219.a ENSGT00390000007159.d ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798.`b ENSGT00390000007075.e ENSGT00940000163342.a.b.b.e.a.a.a ENSGT00940000163342.a.b.b.e.a.b ENSGT00940000163342.a.b.b.f ENSGT00730000111360.a.c ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 ENSGT00940000155241.c ENSGT00390000016228.b.a ENSGT00940000153629.a.a.a.d ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.a.a #22 ENSGT00940000155820.b.c ENSGT00940000157898.j ENSGT00390000015805.b.d ENSGT00940000157261.k.b.c ENSGT00550000074865.j ENSGT00940000165387.a.d ENSGT00940000154468.tb.b.b.a ENSGT00940000157106 ENSGT01090000260040.b.a.b.y.a.c ENSGT00950000182952.C.g.a ENSGT00940000157238.b.e ENSGT00390000013390 ENSGT00940000155306.a.o.a ENSGT00940000157869.e.a ENSGT00510000047225.b Rainbow trout MODERN SPECIES 7 mrps25 (ENSOMYG00000033140) ENSOMYG00000066076 ENSOMYG00000060283 nr2c2 (ENSOMYG00000033215) ENSOMYG00000033511 wdr46 (ENSOMYG00000033533) ENSOMYG00000033620 ENSOMYG00000033696 ENSOMYG00000033881 ENSOMYG00000033867 ENSOMYG00000033900 qars1 (ENSOMYG00000033968) ENSOMYG00000034441 ENSOMYG00000034465 prickle2a (ENSOMYG00000034488) rho (ENSOMYG00000034515) #22 ENSOMYG00000034539 ENSOMYG00000034641 csf1-2 (ENSOMYG00000034839) ENSOMYG00000034995 ENSOMYG00000049275 ENSOMYG00000036271 ENSOMYG00000036993 ENSOMYG00000037552 ENSOMYG00000037881 ENSOMYG00000038161 ognb (ENSOMYG00000038166) ENSOMYG00000038171 ENSOMYG00000038182 kctd6b (ENSOMYG00000038189) abhd6b (ENSOMYG00000038205) Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000016951.e ENSGT00940000158219.a ENSGT00390000007159.d ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798.`b ENSGT00390000007075.e ENSGT00940000163342.a.b.b.e.b ENSGT00940000163342.a.b.b.e.a.b ENSGT00730000111360.a.c ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 ENSGT00940000155241.c ENSGT00390000016228.b.a ENSGT00940000153629.a.a.a.d ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.a.a #22 ENSGT00940000155820.b.c ENSGT00940000157898.j ENSGT00390000015805.b.d ENSGT00940000157261.k.b.c ENSGT00550000074865.j ENSGT00940000165387.a.d ENSGT00940000154468.tb.b.b.a ENSGT00940000157106 ENSGT01090000260040.b.a.b.y.a.c ENSGT00950000182952.C.g.a ENSGT00940000157238.b.e ENSGT00390000013390 ENSGT00940000155306.a.o.a ENSGT00940000157869.e.a ENSGT00510000047225.b Coho salmon MODERN SPECIES 16 mrps25 (ENSOKIG00005022188) trh (ENSOKIG00005022200) ENSOKIG00005022226 RBSN (ENSOKIG00005022235) nr2c2 (ENSOKIG00005022281) ENSOKIG00005023072 wdr46 (ENSOKIG00005023089) ENSOKIG00005023167 ENSOKIG00005023330 ENSOKIG00005023411 ogg1 (ENSOKIG00005023434) qars1 (ENSOKIG00005023491) QRICH1 (ENSOKIG00005025765) ENSOKIG00005006173 prickle2a (ENSOKIG00005006218) rho (ENSOKIG00005006244) #22 MAGI1 (ENSOKIG00005006281) REN (ENSOKIG00005006402) ENSOKIG00005006474 mapkapk2b (ENSOKIG00005006524) ENSOKIG00005006940 ENSOKIG00005007249 rbm39b (ENSOKIG00005012301) pabpc1l (ENSOKIG00005012571) YWHAB (ENSOKIG00005012677) ENSOKIG00005012915 ognb (ENSOKIG00005012922) UQCC5 (ENSOKIG00005012934) ENSOKIG00005012938 kctd6b (ENSOKIG00005012943) abhd6b (ENSOKIG00005012954) Chinook salmon MODERN SPECIES 14 trh (ENSOTSG00005032366) ENSOTSG00005032370 RBSN (ENSOTSG00005032374) mrps25 (ENSOTSG00005032376) nr2c2 (ENSOTSG00005032379) B3GALT4 (ENSOTSG00005033054) wdr46 (ENSOTSG00005033056) ENSOTSG00005033134 ENSOTSG00005033167 ENSOTSG00005033168 ogg1 (ENSOTSG00005033170) qars1 (ENSOTSG00005033175) QRICH1 (ENSOTSG00005036390) ENSOTSG00005036393 prickle2a (ENSOTSG00005036394) rho (ENSOTSG00005036395) #22 MAGI1 (ENSOTSG00005036397) ren (ENSOTSG00005036679) ENSOTSG00005037103 mapkapk2b (ENSOTSG00005037107) ENSOTSG00005037110 ENSOTSG00005037142 rbm39b (ENSOTSG00005044319) pabpc1l (ENSOTSG00005044378) YWHAB (ENSOTSG00005044379) ENSOTSG00005044381 ognb (ENSOTSG00005044382) UQCC5 (ENSOTSG00005044383) ENSOTSG00005044384 kctd6b (ENSOTSG00005044385) abhd6b (ENSOTSG00005044386) Northern pike MODERN SPECIES 11 ENSELUG00000031756 trh (ENSELUG00000023514) RBSN (ENSELUG00000023595) mrps25 (ENSELUG00000023537) ENSELUG00000031650 nr2c2 (ENSELUG00000023672) B3GALT4 (ENSELUG00000023696) wdr46 (ENSELUG00000023712) sult1st1 (ENSELUG00000023977) ENSELUG00000024008 ogg1 (ENSELUG00000024024) qars1 (ENSELUG00000024142) QRICH1 (ENSELUG00000024155) ENSELUG00000024192 prickle2a (ENSELUG00000024293) rho (ENSELUG00000024311) #22 MAGI1 (ENSELUG00000024590) ren (ENSELUG00000024611) ENSELUG00000001787 ENSELUG00000024616 FMOD (ENSELUG00000001788) ENSELUG00000001789 eif2d (ENSELUG00000001790) ENSELUG00000001791 ENSELUG00000001793 rbm39b (ENSELUG00000001796) ENSELUG00000027816 ENSELUG00000025560 or90j1 (ENSELUG00000032119) ENSELUG00000001801 ENSELUG00000001800 Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00510000047967 ENSGT00940000155048.d.a ENSGT00390000005214 ENSGT00940000160100 ENSGT00590000083094.a.a.c.a ENSGT00940000153456.b.b ENSGT01030000234637.b.d.a.a ENSGT00940000164201.c.a ENSGT00940000155686 ENSGT00390000002873 ENSGT00940000157279 ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000166173 ENSGT00940000153629.a.a.b ENSGT00940000156409 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.a.b #22 ENSGT00940000155820.a ENSGT00550000074950 ENSGT00940000158502 ENSGT00940000158653 ENSGT00940000163880 ENSGT00940000155644.b.a.a ENSGT00940000156493 ENSGT00390000010697 ENSGT00550000074831.k ENSGT00940000157922.b ENSGT00940000155327.g ENSGT00940000157363 ENSGT00940000153920.b ENSGT00940000153920.a.b.b ENSGT00940000154554.a Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 396 ENSGT00510000047967 ENSGT00940000155048.d.a.b ENSGT00390000005214 ENSGT00940000160100.d ENSGT00590000083094.a.a.c.a.n ENSGT00940000153456.b.b ENSGT01030000234637.b.d.a.a.e ENSGT00940000164201.c.a.s ENSGT00940000155686 ENSGT00950000185997 ENSGT00940000157279.k ENSGT00510000046608.B.r ENSGT00940000166173 ENSGT00940000153629.a.a.b.d ENSGT00940000156409.f ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.a.b #22 ENSGT00940000155820.a.f.b Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00510000047967 ENSGT00940000155048.d.a.b ENSGT00390000005214 ENSGT00940000160100.d ENSGT00590000083094.a.a.c.a.n ENSGT00940000153456.b.b ENSGT01030000234637.b.d.a.a.e ENSGT00940000164201.c.a.s ENSGT00940000155686 ENSGT00390000002873.fb.a ENSGT00940000157279.k ENSGT00510000046608.B.r ENSGT00940000166173 ENSGT00940000153629.a.a.b.d ENSGT00940000156409.f ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.a.b #22 ENSGT00940000155820.a.f.b ENSGT00550000074950.a ENSGT00940000158502.f ENSGT00940000158653.l ENSGT00940000164303.b.a.b ENSGT00390000010170.a.a.b ENSGT00940000162607.b ENSGT00940000155644.b.a.a ENSGT00940000156493.e ENSGT00390000010697.e ENSGT00940000157922.b.e.b ENSGT00940000155327.g.a ENSGT00940000157363.i.b ENSGT00940000153920.b.d ENSGT00990000213681 Salmo ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00510000047967 ENSGT00940000155048.d.a.b ENSGT00390000005214 ENSGT00940000160100.d ENSGT00590000083094.a.a.c.a.n ENSGT00940000153456.b.b ENSGT01030000234637.b.d.a.a.e ENSGT00940000164201.c.a.s ENSGT00940000155686 ENSGT00390000002873.fb.a ENSGT00940000157279.k ENSGT00510000046608.B.r ENSGT00940000166173 ENSGT00940000153629.a.a.b.d ENSGT00940000156409.f ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.a.b #22 ENSGT00940000155820.a.f.b ENSGT00550000074950.a ENSGT00940000158502.f ENSGT00940000158653.l ENSGT00940000164303.b.a.b ENSGT00390000010170.a.a.b ENSGT00940000162607.b.c ENSGT00940000159882.l.f.a ENSGT00940000156493.e ENSGT00390000010697.e ENSGT01060000253495 ENSGT00940000157922.b.e.b ENSGT00940000155327.g.a ENSGT00940000157363.i.b ENSGT00940000153920.b.d River trout MODERN SPECIES 5 ENSSTUG00000049660 fhit (ENSSTUG00000049656) ptprga (ENSSTUG00000048747) C3orf14 (ENSSTUG00000048691) fezf2 (ENSSTUG00000048682) ENSSTUG00000047683 nampt2 (ENSSTUG00000047600) ENSSTUG00000047594 mxa (ENSSTUG00000046959) ENSSTUG00000046924 ATXN7 (ENSSTUG00000046907) psmd6 (ENSSTUG00000046866) slc2a9l1 (ENSSTUG00000046802) prickle2b (ENSSTUG00000046785) ADAMTS9 (ENSSTUG00000045845) RHO (ENSSTUG00000045775) #22 magi1b (ENSSTUG00000045570) slc25a26 (ENSSTUG00000045459) LRIG1 (ENSSTUG00000045194) kbtbd8 (ENSSTUG00000045170) ENSSTUG00000045152 suclg2 (ENSSTUG00000044590) TAFA1 (ENSSTUG00000044557) TAFA4 (ENSSTUG00000044548) EOGT (ENSSTUG00000044445) tmf1 (ENSSTUG00000044281) ENSSTUG00000044270 ENSSTUG00000044246 PRKCD (ENSSTUG00000044077) SFMBT1 (ENSSTUG00000043856) stimate (ENSSTUG00000043841) Atlantic salmon MODERN SPECIES 3 fhit (ENSSSAG00000091443) PTPRG (ENSSSAG00000066821) ENSSSAG00000098297 fezf2 (ENSSSAG00000071953) ENSSSAG00000072132 nampt2 (ENSSSAG00000077480) synpr (ENSSSAG00000085340) mx2 (ENSSSAG00000077530) ENSSSAG00000098558 thoc7 (ENSSSAG00000077684) atxn7 (ENSSSAG00000077698) psmd6 (ENSSSAG00000077709) slc2a9l1 (ENSSSAG00000077730) prickle2b (ENSSSAG00000077734) ADAMTS9 (ENSSSAG00000077769) ENSSSAG00000077893 #22 magi1b (ENSSSAG00000078077) SAMC (ENSSSAG00000078485) LRIG1 (ENSSSAG00000078515) ENSSSAG00000087561 kbtbd8 (ENSSSAG00000078589) ENSSSAG00000078595 suclg2 (ENSSSAG00000078618) TAFA1 (ENSSSAG00000078671) tafa4b (ENSSSAG00000121989) EOGT (ENSSSAG00000078690) tmf1 (ENSSSAG00000111964) ENSSSAG00000100253 ENSSSAG00000078755 ENSSSAG00000078795 ENSSSAG00000079512 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.a.b #22 Rainbow trout MODERN SPECIES 8 PTPRG (ENSOMYG00000030506) ENSOMYG00000070386 C3orf14 (ENSOMYG00000035610) fezf2 (ENSOMYG00000035616) ENSOMYG00000035992 nampt2 (ENSOMYG00000038345) SYNPR (ENSOMYG00000038398) mx (ENSOMYG00000038725) ENSOMYG00000039416 ATXN7 (ENSOMYG00000039430) psmd6 (ENSOMYG00000039477) slc2a9l1 (ENSOMYG00000039507) prickle2b (ENSOMYG00000039526) ADAMTS9 (ENSOMYG00000039854) ENSOMYG00000064509 ENSOMYG00000040100 #22 magi1b (ENSOMYG00000040244) slc25a26 (ENSOMYG00000040359) LRIG1 (ENSOMYG00000040365) kbtbd8 (ENSOMYG00000040387) ENSOMYG00000040394 suclg2 (ENSOMYG00000040429) ENSOMYG00000040447 ENSOMYG00000073737 EOGT (ENSOMYG00000075266) tmf1 (ENSOMYG00000040456) ENSOMYG00000040466 ENSOMYG00000051566 ENSOMYG00000051694 ENSOMYG00000047997 ENSOMYG00000040618 Huchen MODERN SPECIES 939 ENSHHUG00000005127 thoc7 (ENSHHUG00000005051) ATXN7 (ENSHHUG00000005042) psmd6 (ENSHHUG00000005013) prickle2b (ENSHHUG00000004936) ADAMTS9 (ENSHHUG00000004666) RHO (ENSHHUG00000004305) #22 magi1b (ENSHHUG00000004146) Otomorpha DUPLICATION Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 142 ENSGT00390000014429.a ENSGT00390000011228.b.a.e.a ENSGT00510000047967 ENSGT00940000155048.d.a ENSGT00390000005214 ENSGT00940000160100 ENSGT00590000083094.a.a.c.a ENSGT00940000153456.b.b ENSGT01030000234637.b.d.a.a ENSGT00390000002873 ENSGT00940000157279 ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000166173 ENSGT00940000153629.a.a.b ENSGT00940000156409 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.a.c #22 ENSGT00940000155820.a ENSGT00550000074950 ENSGT00940000158502 ENSGT00940000158653 ENSGT00940000164303.b.a ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000162607.b ENSGT00940000155644.b.a.a ENSGT00940000156493 ENSGT00390000010697 ENSGT00550000074831.k ENSGT00940000157922.b ENSGT00940000155327.g ENSGT00940000157363 ENSGT00940000153920.b Otophysi ANCESTRAL SPECIES 262 ENSGT00390000005214 ENSGT00940000160100 ENSGT00590000083094.a.a.c.a ENSGT00940000153456.b.b ENSGT01030000234637.b.d.a.a ENSGT00390000002873 ENSGT00940000157279 ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000166173 ENSGT00940000153629.a.a.b ENSGT00940000156409 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.a.c #22 ENSGT00940000155820.a ENSGT00550000074950 ENSGT00940000158502 ENSGT00940000158653 ENSGT00940000164303.b.a ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000162607.b ENSGT00940000155644.b.a.a ENSGT00940000156493 ENSGT00390000010697 ENSGT00550000074831.k Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00940000153920.b ENSGT00940000157363.f ENSGT00940000155327.g ENSGT00940000157922.b ENSGT00390000005214 ENSGT00940000160100 ENSGT00590000083094.a.a.c.a ENSGT00940000153456.b.b ENSGT01030000234637.b.d.a.a ENSGT00390000002873 ENSGT00940000157279 ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000166173 ENSGT00940000153629.a.a.b ENSGT00940000156409 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.a.c #22 ENSGT00940000155820.a ENSGT00550000074950 ENSGT00940000158502 ENSGT00940000158653 ENSGT00940000164303.b.a ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000162607.b ENSGT00940000159882 ENSGT00940000156493 ENSGT00390000010697 ENSGT00550000074831.k ENSGT00940000155864.a.b ENSGT00390000018439 ENSGT00390000008947 ENSGT00390000016233.e.b Channel catfish MODERN SPECIES 13 tmem110 (ENSIPUG00000023613) SFMBT1 (ENSIPUG00000023595) PRKCD (ENSIPUG00000023580) ENSIPUG00000023568 c21h3orf14 (ENSIPUG00000023563) fezf2 (ENSIPUG00000023562) cadps (ENSIPUG00000023525) nampt2 (ENSIPUG00000023511) synpr (ENSIPUG00000023506) thoc7 (ENSIPUG00000023494) atxn7 (ENSIPUG00000023487) psmd6 (ENSIPUG00000023471) slc2a9l1 (ENSIPUG00000023460) prickle2 (ENSIPUG00000023453) ADAMTS9 (ENSIPUG00000023410) rhol (ENSIPUG00000022715) #22 magi1 (ENSIPUG00000022691) slc25a26 (ENSIPUG00000022658) LRIG1 (ENSIPUG00000022644) kbtbd8 (ENSIPUG00000022640) ENSIPUG00000022630 ENSIPUG00000022626 suclg2 (ENSIPUG00000022597) TAFA1 (ENSIPUG00000022567) FAM19A4 (ENSIPUG00000022548) eogt (ENSIPUG00000022513) tmf1 (ENSIPUG00000022461) rab7a (ENSIPUG00000022445) hmces (ENSIPUG00000022435) tada3 (ENSIPUG00000022423) arpc4l (ENSIPUG00000022412) Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000153920.b ENSGT00940000157363.f ENSGT00940000155327.g ENSGT00940000157922.b ENSGT00390000005214 ENSGT00940000160100 ENSGT00590000083094.a.a.c.a ENSGT00940000153456.b.b ENSGT01030000234637.b.d.a.a ENSGT00390000002873 ENSGT00940000157279 ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000166173 ENSGT00940000153629.a.a.b ENSGT00940000156409 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.a.c #22 ENSGT00940000155820.a ENSGT00550000074950 ENSGT00940000158502 ENSGT00940000158653 ENSGT00940000164303.b.a ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000162607.b ENSGT00940000155644.b.a.a ENSGT00940000156493 ENSGT00390000010697 ENSGT00550000074831.k ENSGT00940000155864.a.b ENSGT00390000018439 ENSGT00390000008947 ENSGT00390000016233.e.b Characoidei ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000157363.f ENSGT00940000155327.g ENSGT00940000157922.b ENSGT00390000005214 ENSGT00940000160100 ENSGT00590000083094.a.a.c.a ENSGT00940000153456.b.b ENSGT01030000234637.b.d.a.a ENSGT00390000002873 ENSGT00940000157279 ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000166173.h ENSGT00940000166173.g ENSGT00940000153629.a.a.b ENSGT00940000156409 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.a.c #22 ENSGT00940000155820.a ENSGT00550000074950 ENSGT00940000158502 ENSGT00940000158653 ENSGT00940000164303.b.a ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000163880 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000156493 ENSGT00390000010697 ENSGT00550000074831.k ENSGT00940000155864.a.b ENSGT00390000018439 ENSGT00390000008947 ENSGT00390000016233.e.b Mexicana tetra MODERN SPECIES 14 ENSAMXG00000014950 nampt2 (ENSAMXG00000014630) SYNPR (ENSAMXG00000033187) ENSAMXG00000040770 thoc7 (ENSAMXG00000014367) ATXN7 (ENSAMXG00000014312) psmd6 (ENSAMXG00000014223) slc2a9l1 (ENSAMXG00000043633) slc2a9l1 (ENSAMXG00000018046) ENSAMXG00000032656 ENSAMXG00000035712 prickle2b (ENSAMXG00000009231) ENSAMXG00000035440 ENSAMXG00000038363 ADAMTS9 (ENSAMXG00000009208) rhol (ENSAMXG00000024894) #22 magi1b (ENSAMXG00000009203) Red-bellied piranha MODERN SPECIES 6 C3orf14 (ENSPNAG00000013651) fezf2 (ENSPNAG00000002872) ENSPNAG00000013996 nampt2 (ENSPNAG00000014075) SYNPR (ENSPNAG00000014106) thoc7 (ENSPNAG00000003038) ATXN7 (ENSPNAG00000014199) psmd6 (ENSPNAG00000003057) slc2a9l1 (ENSPNAG00000014276) slc2a9l1 (ENSPNAG00000014307) slc2a9l1 (ENSPNAG00000014345) slc2a9l1 (ENSPNAG00000014380) ENSPNAG00000014405 prickle2b (ENSPNAG00000014453) ADAMTS9 (ENSPNAG00000014476) rhol (ENSPNAG00000014670) #22 magi1b (ENSPNAG00000014718) slc25a26 (ENSPNAG00000014744) LRIG1 (ENSPNAG00000014762) ENSPNAG00000014775 kbtbd8 (ENSPNAG00000007189) ENSPNAG00000014813 suclg2 (ENSPNAG00000014836) ENSPNAG00000003282 ENSPNAG00000003293 TAFA4 (ENSPNAG00000003303) EOGT (ENSPNAG00000006724) tmf1 (ENSPNAG00000015005) uba3 (ENSPNAG00000015103) rab7a (ENSPNAG00000015164) hmces (ENSPNAG00000005410) Electric eel MODERN SPECIES 242 ENSEEEG00000011192 ENSEEEG00000011240 SPHK1 (ENSEEEG00000011242) ENSEEEG00000011244 rhol (ENSEEEG00000011249) #22 magi1b (ENSEEEG00000011377) slc25a26 (ENSEEEG00000011400) LRIG1 (ENSEEEG00000011403) kbtbd8 (ENSEEEG00000011407) ENSEEEG00000011409 suclg2 (ENSEEEG00000011449) TAFA1 (ENSEEEG00000011454) tafa4b (ENSEEEG00000011467) EOGT (ENSEEEG00000011470) tmf1 (ENSEEEG00000011481) Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000159688 ENSGT00390000011620.a.a.b.e ENSGT00940000158073.b ENSGT00390000018730.A.f ENSGT00390000005214 ENSGT00940000160100 ENSGT00590000083094.a.a.c.a ENSGT00940000153456.b.b ENSGT01030000234637.b.d.a.a.c ENSGT00390000002873 ENSGT00940000157279 ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000166173 ENSGT00940000153629.a.a.b ENSGT00940000156409 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.a.c #22 ENSGT00940000155820.a ENSGT00390000011648.b ENSGT00950000182835.d.a.k.a ENSGT00940000161109 ENSGT00950000183021.a.b.d ENSGT00940000154897.r ENSGT00940000155532 ENSGT00940000157922.b ENSGT00940000155327.g ENSGT00940000157363 ENSGT00940000153920.b ENSGT00940000153920.a.b.b ENSGT00940000155189.pb.a ENSGT01030000234812 ENSGT00730000111360.b Cyprininae DUPLICATION Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 520 ENSGT00940000153456.b.b.b ENSGT01030000234637.b.d.a.a.c.a.b ENSGT00390000002873.eb ENSGT00940000157279.x ENSGT00510000046608.B.i ENSGT00940000166173.k ENSGT00940000153629.a.a.b.b ENSGT00940000156409.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.a.c.a #22 ENSGT00940000155820.a.c.a ENSGT00390000011648.b.b ENSGT00950000182835.d.a.k.a.b ENSGT00940000161109.r ENSGT00950000183021.a.b.d.b ENSGT00940000154897.r.b ENSGT00940000155532.ke.b ENSGT00940000157922.b.c ENSGT00940000155327.g.g ENSGT00940000157363.c ENSGT00940000153920.b.e ENSGT00940000155189.pb.a.c Goldfish MODERN SPECIES 2 tbl1xr1a (ENSCARG00000067314) ENSCARG00000067305 arpc4l (ENSCARG00000067293) tada3l (ENSCARG00000067281) hmces (ENSCARG00000067270) rab7a (ENSCARG00000067216) slc25a26 (ENSCARG00000067144) LRIG1 (ENSCARG00000066715) si:ch211-1a19.2 (ENSCARG00000066680) ENSCARG00000066675 wdr18 (ENSCARG00000066669) psmd6 (ENSCARG00000066657) slc2a9l1 (ENSCARG00000066650) prickle2b (ENSCARG00000066624) ADAMTS9 (ENSCARG00000066277) rhol (ENSCARG00000066229) #22 magi1b (ENSCARG00000066168) phtf1 (ENSCARG00000066096) PFKFB2 (ENSCARG00000063770) id1 (ENSCARG00000063633) NCOA3 (ENSCARG00000063621) ZMYND8 (ENSCARG00000062313) dido1 (ENSCARG00000062262) FGD5 (ENSCARG00000062126) PRKCD (ENSCARG00000061907) SFMBT1 (ENSCARG00000061695) stimate (ENSCARG00000061623) tmcc1b (ENSCARG00000061606) ptbp1b (ENSCARG00000061104) fam174c (ENSCARG00000061069) ENSCARG00000061061 Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000159688.d ENSGT00390000011620.a.a.b.e.c ENSGT00940000158073.b.b ENSGT00390000018730.A.f.f ENSGT00390000005214.e.b ENSGT00940000160100.b ENSGT00590000083094.a.a.c.a.p ENSGT00940000153456.b.b.b ENSGT01030000234637.b.d.a.a.c.a.a ENSGT00390000002873.eb ENSGT00940000157279.x ENSGT00510000046608.B.i ENSGT00940000166173.k ENSGT00940000153629.a.a.b.b ENSGT00940000156409.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.a.c.a #22 ENSGT00940000155820.a.c.a ENSGT00390000011648.b.b ENSGT00950000182835.d.a.k.a.b ENSGT00940000161109.r ENSGT00950000183021.a.b.d.b ENSGT00940000154897.r.b ENSGT00940000155532.ke.b ENSGT00940000157922.b.c ENSGT00940000155327.g.g ENSGT00940000157363.c ENSGT00940000153920.b.e ENSGT00940000155189.pb.a.c ENSGT00730000111360.b.b ENSGT00940000155241.d.d Golden-line barbel MODERN SPECIES 124 zgc:113307 (ENSSGRG00000024600) slc6a14 (ENSSGRG00000024612) cdh4 (ENSSGRG00000024649) ENSSGRG00000024653 ENSSGRG00000024654 fezf2 (ENSSGRG00000024656) ENSSGRG00000024672 nampt2 (ENSSGRG00000025420) ENSSGRG00000025679 thoc7 (ENSSGRG00000025681) ATXN7 (ENSSGRG00000025722) psmd6 (ENSSGRG00000025727) slc2a9l1 (ENSSGRG00000025769) prickle2b (ENSSGRG00000025776) ADAMTS9 (ENSSGRG00000025790) rhol (ENSSGRG00000025799) #22 magi1b (ENSSGRG00000025803) phtf1 (ENSSGRG00000025809) PFKFB2 (ENSSGRG00000025842) id1 (ENSSGRG00000026462) NCOA3 (ENSSGRG00000026463) Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 104 ENSGT00940000159688.c ENSGT00390000011620.a.a.b.e.d ENSGT00940000158073.b.a ENSGT00390000018730.A.f.e.a ENSGT00390000018730.A.f.e.b ENSGT00390000005214.e.a ENSGT00940000160100.a ENSGT00590000083094.a.a.c.a.o ENSGT00940000153456.b.b.a ENSGT01030000234637.b.d.a.a.c.b ENSGT00390000002873.db ENSGT00940000157279.w ENSGT00510000046608.B.j ENSGT00940000153629.a.a.b.a ENSGT00940000156409.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.a.c.b #22 ENSGT00940000155820.a.c.b ENSGT00390000011648.b.a ENSGT00950000182835.d.a.k.a.a ENSGT00940000161109.q ENSGT00950000183021.a.b.d.a ENSGT00940000154897.r.a ENSGT00940000155532.ke.a ENSGT01030000234812.c.a ENSGT00940000157922.b.d ENSGT00940000155327.g.h ENSGT00940000157363.d ENSGT00940000153920.b.f ENSGT00940000163969.A.c.b Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000159688.c ENSGT00390000011620.a.a.b.e.d ENSGT00940000158073.b.a ENSGT00390000018730.A.f.e.a ENSGT00390000018730.A.f.e.b ENSGT00390000005214.e.a ENSGT00940000160100.a ENSGT00590000083094.a.a.c.a.o ENSGT00940000153456.b.b.a ENSGT01030000234637.b.d.a.a.c.b ENSGT00390000002873.db ENSGT00940000157279.w ENSGT00510000046608.B.j ENSGT00940000153629.a.a.b.a ENSGT00940000156409.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.a.c.b #22 ENSGT00940000155820.a.c.b ENSGT00390000011648.b.a ENSGT00950000182835.d.a.k.a.a ENSGT00940000161109.q ENSGT00950000183021.a.b.d.a ENSGT00940000154897.r.a ENSGT00940000155532.ke.a ENSGT01030000234812.c.a ENSGT00940000157922.b.d ENSGT00940000155327.g.h ENSGT00940000157363.d ENSGT00940000153920.b.f ENSGT00940000163969.A.c.b ENSGT00940000155189.pb.a.d.b ENSGT01030000234812.d Golden-line barbel MODERN SPECIES 1 fmoda (ENSSGRG00000046209) slc6a14 (ENSSGRG00000046210) ENSSGRG00000046212 cdh4 (ENSSGRG00000046225) ENSSGRG00000047042 C3orf14 (ENSSGRG00000047044) fezf2 (ENSSGRG00000047045) ENSSGRG00000047060 nampt2 (ENSSGRG00000049206) SYNPR (ENSSGRG00000049398) thoc7 (ENSSGRG00000049402) ATXN7 (ENSSGRG00000049405) psmd6 (ENSSGRG00000049410) prickle2b (ENSSGRG00000049467) ADAMTS9 (ENSSGRG00000049470) rhol (ENSSGRG00000049473) #22 magi1b (ENSSGRG00000049475) phtf1 (ENSSGRG00000049523) PFKFB2 (ENSSGRG00000049546) id1 (ENSSGRG00000049547) NCOA3 (ENSSGRG00000049548) ZMYND8 (ENSSGRG00000049570) dido1 (ENSSGRG00000050399) Goldfish MODERN SPECIES 29 fmoda (ENSCARG00000028990) slc6a14 (ENSCARG00000029024) cdh4 (ENSCARG00000029449) ENSCARG00000035665 ENSCARG00000035682 C3orf14 (ENSCARG00000035736) fezf2 (ENSCARG00000035746) ENSCARG00000035868 nampt2 (ENSCARG00000036768) SYNPR (ENSCARG00000036815) thoc7 (ENSCARG00000036830) ATXN7 (ENSCARG00000036875) psmd6 (ENSCARG00000036886) prickle2b (ENSCARG00000037057) ADAMTS9 (ENSCARG00000037338) rhol (ENSCARG00000038606) #22 magi1b (ENSCARG00000038632) phtf1 (ENSCARG00000038765) ENSCARG00000038851 id1 (ENSCARG00000038860) NCOA3 (ENSCARG00000038885) ZMYND8 (ENSCARG00000039082) dido1 (ENSCARG00000045186) ENSCARG00000045211 ENSCARG00000045234 ENSCARG00000045309 PRKCD (ENSCARG00000045393) SFMBT1 (ENSCARG00000046287) stimate (ENSCARG00000046590) ENSCARG00000046739 ENSCARG00000046745 Zebrafish MODERN SPECIES 2 ENSDARG00000103677 ENSDARG00000068192 cdh4 (ENSDARG00000015002) ogfr2 (ENSDARG00000024815) fezf2 (ENSDARG00000070677) C11H3orf14 (ENSDARG00000086324) ENSDARG00000043661 nampt2 (ENSDARG00000027183) SYNPR (ENSDARG00000037587) thoc7 (ENSDARG00000015394) ATXN7 (ENSDARG00000074804) psmd6 (ENSDARG00000070674) slc2a9l1 (ENSDARG00000070672) prickle2b (ENSDARG00000037593) adamts9 (ENSDARG00000077778) rhol (ENSDARG00000070666) #22 magi1b (ENSDARG00000003169) phtf1 (ENSDARG00000057708) PFKFB2 (ENSDARG00000002037) id1 (ENSDARG00000040764) NCOA3 (ENSDARG00000077404) ZMYND8 (ENSDARG00000007601) dido1 (ENSDARG00000057940) ENSDARG00000088801 PRKCD (ENSDARG00000070651) SFMBT1 (ENSDARG00000109830) stimate (ENSDARG00000013694) mustn1b (ENSDARG00000089086) tmcc1b (ENSDARG00000060954) ENSDARG00000116193 ENSDARG00000113425 Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00510000047967 ENSGT00940000155048.d.a ENSGT00390000005214 ENSGT00940000160100 ENSGT00590000083094.a.a.c.a ENSGT00940000153456.b.b ENSGT01030000234637.b.d.a.a ENSGT00390000002873 ENSGT00940000157279 ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000166173 ENSGT00940000153629.a.a.b ENSGT00940000156409 ENSGT00940000155820.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.a.c #22 ENSGT00940000155820.a.b ENSGT00550000074950 ENSGT00940000158502 ENSGT00940000158653 ENSGT00940000164303.b.a ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000162607.b ENSGT00940000155644.b.a.a ENSGT00940000156493 ENSGT00390000010697 ENSGT00550000074831.k ENSGT00940000157922.b ENSGT00940000155327.g ENSGT00940000157363 ENSGT00940000153920.b Atlantic herring MODERN SPECIES 21 ENSCHAG00000009477 FHIT (ENSCHAG00000009456) ptprga (ENSCHAG00000001641) C3orf14 (ENSCHAG00000000696) fezf2 (ENSCHAG00000026734) ENSCHAG00000026464 nampt2 (ENSCHAG00000026435) SYNPR (ENSCHAG00000026426) ENSCHAG00000026422 thoc7 (ENSCHAG00000026411) ATXN7 (ENSCHAG00000026399) psmd6 (ENSCHAG00000026389) slc2a9l1 (ENSCHAG00000026386) prickle2b (ENSCHAG00000026382) ADAMTS9 (ENSCHAG00000025948) rhol (ENSCHAG00000025884) #22 magi1b (ENSCHAG00000025769) slc25a26 (ENSCHAG00000025725) LRIG1 (ENSCHAG00000025634) suclg2 (ENSCHAG00000025337) TAFA1 (ENSCHAG00000025295) tafa4b (ENSCHAG00000025288) EOGT (ENSCHAG00000025205) tmf1 (ENSCHAG00000024737) uba3 (ENSCHAG00000024652) ENSCHAG00000024610 PRKCD (ENSCHAG00000024129) SFMBT1 (ENSCHAG00000023789) stimate (ENSCHAG00000023699) mustn1b (ENSCHAG00000023683) ITIH3 (ENSCHAG00000022080) Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 106 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189.pb.b ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.a.b ENSGT00730000111360.a ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 ENSGT00940000155241.c ENSGT00390000016228.b ENSGT00940000153629.a.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.a.d #22 ENSGT00940000155820.b ENSGT00940000157898 ENSGT00390000015805.b ENSGT00940000154468.tb.b.b ENSGT00950000182844.a.a.b ENSGT00940000165387.a ENSGT00940000170563 ENSGT00550000074865 ENSGT00940000157261.k.b Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 285 ENSGT00730000111482 ENSGT00390000017213.B ENSGT00940000155229 ENSGT00940000161602.n.a ENSGT00940000161602.m ENSGT00940000160408 ENSGT00550000074972 ENSGT00940000155241.c ENSGT00940000153629.a.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.a.d #22 ENSGT00940000155820.b ENSGT00940000157898 ENSGT00390000015805.b ENSGT00950000182944.B.a ENSGT00940000154468.tb.b.b ENSGT00950000182844.a.a.b ENSGT00940000165387.a ENSGT00550000074865 ENSGT00940000157261.k.b ENSGT00940000157007.i.a Denticle herring MODERN SPECIES 1 ENSDCDG00000028998 CDH4 (ENSDCDG00000025404) TAF4 (ENSDCDG00000025155) lsm14b (ENSDCDG00000025151) ENSDCDG00000025143 SS18L1 (ENSDCDG00000025139) MTG2 (ENSDCDG00000025136) her3 (ENSDCDG00000025135) GPR153 (ENSDCDG00000025132) acot7 (ENSDCDG00000025020) hes2.2 (ENSDCDG00000025002) espn (ENSDCDG00000024995) qars1 (ENSDCDG00000024876) QRICH1 (ENSDCDG00000024832) prickle2a (ENSDCDG00000024823) rho (ENSDCDG00000024819) #22 ENSDCDG00000024817 ENSDCDG00000024815 MAGI1 (ENSDCDG00000023403) ren (ENSDCDG00000023354) csf1b (ENSDCDG00000023348) ENSDCDG00000023344 neu4 (ENSDCDG00000023253) rbm39b (ENSDCDG00000023139) rh50 (ENSDCDG00000023117) ENSDCDG00000023107 ENSDCDG00000022663 eif2d (ENSDCDG00000022643) mapkapk2b (ENSDCDG00000022612) FMOD (ENSDCDG00000022475) pabpc1l (ENSDCDG00000022431) Atlantic herring MODERN SPECIES 20 HCK (ENSCHAG00000026993) gata5 (ENSCHAG00000026919) ENSCHAG00000026911 ENSCHAG00000026909 her3 (ENSCHAG00000026907) GPR153 (ENSCHAG00000026905) acot7 (ENSCHAG00000026796) hes2.2 (ENSCHAG00000026777) HES2 (ENSCHAG00000026775) espn (ENSCHAG00000026767) qars1 (ENSCHAG00000026024) ENSCHAG00000025895 ENSCHAG00000025886 ENSCHAG00000025879 ENSCHAG00000025875 rho (ENSCHAG00000025873) #22 MAGI1 (ENSCHAG00000025774) tbc1d25 (ENSCHAG00000025739) nt5dc2 (ENSCHAG00000025665) ccdc22 (ENSCHAG00000025621) slc38a5b (ENSCHAG00000024776) wasb (ENSCHAG00000024714) sema3gb (ENSCHAG00000023679) ENSCHAG00000023582 gpr173 (ENSCHAG00000023579) suv39h1a (ENSCHAG00000023568) ENSCHAG00000023563 porcnl (ENSCHAG00000023537) PDZD4 (ENSCHAG00000023531) IQSEC2 (ENSCHAG00000023492) ENSCHAG00000023482 Otophysi ANCESTRAL SPECIES 434 ENSGT00940000155241.c ENSGT00390000016228.b ENSGT00940000153629.a.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.a.d #22 ENSGT00940000155820.b Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 285 ENSGT00390000016228.b ENSGT00940000153629.a.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.a.d #22 ENSGT00940000155820.b Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 1082 ENSGT00390000016228.b ENSGT00940000153629.a.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.a.d #22 ENSGT00940000155820.b.e Goldfish DUPLICATION Goldfish MODERN SPECIES 649 ENSCARG00000027345 PTCHD3 (ENSCARG00000027334) ENSCARG00000027322 prickle2a (ENSCARG00000027298) rho (ENSCARG00000027276) #22 MAGI1 (ENSCARG00000026617) RHO (ENSCARG00000026550) #22 PLXND1 (ENSCARG00000026310) #24 Goldfish MODERN SPECIES 2005 ENSCARG00000042071 rho (ENSCARG00000042045) #22 ENSCARG00000042039 ENSCARG00000042028 MAGI1 (ENSCARG00000041790) ENSCARG00000041730 ENSCARG00000041721 IFT122 (ENSCARG00000040431) #21 exorh (ENSCARG00000040341) #22 ENSCARG00000040325 ENSCARG00000040318 ENSCARG00000040307 Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 760 ENSGT00390000016228.b ENSGT00940000153629.a.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.a.d #22 ENSGT00940000155820.b.e Common carp reference DUPLICATION Common carp reference MODERN SPECIES 23 ENSCCRG00000070557 ENSCCRG00000075842 prickle2a (ENSCCRG00000038149) ENSCCRG00000057393 ENSCCRG00000054567 rho (ENSCCRG00000009712) #22 ENSCCRG00000031669 ENSCCRG00000065954 ENSCCRG00000072229 exorh (ENSCCRG00000020764) #22 PLXND1 (ENSCCRG00000062039) #24 TMCC1 (ENSCCRG00000063241) ENSCCRG00000052417 ENSCCRG00000067391 ENSCCRG00000077981 ENSCCRG00000062721 trh (ENSCCRG00000045246) ENSCCRG00000045252 ##20 ENSCCRG00000010514 ENSCCRG00000028830 ENSCCRG00000075920 Common carp reference MODERN SPECIES 17 ENSCCRG00000058174 #22 ENSCCRG00000053638 ENSCCRG00000066059 ENSCCRG00000065980 IFT122 (ENSCCRG00000064748) #21 exorh (ENSCCRG00000075419) #22 PLXND1 (ENSCCRG00000020744) #24 TMCC1 (ENSCCRG00000079068) trh (ENSCCRG00000010511) ENSCCRG00000010512 ENSCCRG00000015060 ENSCCRG00000072902 ENSCCRG00000080063 ENSCCRG00000038260 ENSCCRG00000050892 ENSCCRG00000065129 Golden-line barbel MODERN SPECIES 3931 rho (ENSSGRG00000008596) #22 Zebrafish MODERN SPECIES 23 exorh (ENSDARG00000111860) #22 ENSDARG00000086057 #24 TMCC1 (ENSDARG00000076747) trh (ENSDARG00000006868) ENSDARG00000110298 ##20 CRELD1 (ENSDARG00000006990) ENSDARG00000105863 BRPF1 (ENSDARG00000103665) prickle2a (ENSDARG00000020982) rho (ENSDARG00000002193) #22 MAGI1 (ENSDARG00000070145) ENSDARG00000099650 SLC35E2B (ENSDARG00000109717) cdk11b (ENSDARG00000102546) MMP23B (ENSDARG00000043079) ubiad1 (ENSDARG00000013009) mib2 (ENSDARG00000103609) BSN (ENSDARG00000111110) ENSDARG00000008703 tlr9 (ENSDARG00000044490) wnt5a (ENSDARG00000104973) lrtm1 (ENSDARG00000098742) CACNA2D3 (ENSDARG00000106018) parapinopsina (ENSDARG00000116976) selenok (ENSDARG00000100823) Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 69 ENSGT00940000157794 ENSGT00940000157161.a.b ENSGT01030000235645 ENSGT00940000159597 ENSGT00940000154471.a.b.a.a.b.b ENSGT00940000158097 ENSGT00390000012439 ENSGT00940000161187 ENSGT00940000158459 ENSGT00940000159351 ENSGT00520000060938 ENSGT00390000013792 ENSGT00940000155241.c ENSGT00390000016228.b ENSGT00940000153629.a.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.a.d #22 ENSGT00940000155820.b ENSGT00940000160122 ENSGT00900000141054 ENSGT01000000214413.b.a.b.b.a ENSGT00940000155552.r ENSGT00940000158818 ENSGT00940000154839.A ENSGT00920000150085 ENSGT00530000063260 ENSGT01030000235284 ENSGT00390000001763 ENSGT00390000016119 ENSGT01100000263502.A.b.a.a ENSGT00940000155766.a ENSGT00940000158933 Channel catfish MODERN SPECIES 24 ENSIPUG00000023557 ENSIPUG00000023564 susd3 (ENSIPUG00000023585) fgd3 (ENSIPUG00000023591) BICD2 (ENSIPUG00000023601) mib2 (ENSIPUG00000023607) ubiad1 (ENSIPUG00000023631) mmp23b (ENSIPUG00000023634) cdk11b (ENSIPUG00000023640) SLC35E2B (ENSIPUG00000023657) ENSIPUG00000023663 nadk (ENSIPUG00000024154) ENSIPUG00000024161 ENSIPUG00000024164 prickle2a (ENSIPUG00000024167) rho (ENSIPUG00000024180) #22 MAGI1 (ENSIPUG00000024280) gabrd (ENSIPUG00000024293) cfap74 (ENSIPUG00000024295) gnb1a (ENSIPUG00000024302) tkt (ENSIPUG00000024304) dcp1a (ENSIPUG00000024374) CACNA1D (ENSIPUG00000024379) chdh (ENSIPUG00000024382) ENSIPUG00000024383 actr8 (ENSIPUG00000024385) selenok (ENSIPUG00000024390) KCNJ1 (ENSIPUG00000024391) parapinopsina (ENSIPUG00000024392) CACNA2D3 (ENSIPUG00000024489) LRTM1 (ENSIPUG00000024506) Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 68 ENSGT00940000158892.b.i.b ENSGT00940000164282.a ENSGT00940000168452 ENSGT00940000159597 ENSGT00940000154471.a.b.a.a.b.b ENSGT00940000158097 ENSGT00390000012439 ENSGT00940000161187 ENSGT00940000158459 ENSGT00940000159351 ENSGT00520000060938 ENSGT00390000013792 ENSGT00940000155241.c ENSGT00390000016228.b ENSGT00940000153629.a.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.a.d #22 ENSGT00940000155820.b ENSGT00940000160122 ENSGT00900000141054 ENSGT01000000214413.b.a.b.b.a ENSGT00940000155552.r ENSGT00940000158818 ENSGT00940000154839.A ENSGT00920000150085 ENSGT00530000063260 ENSGT01030000235284 ENSGT00390000001763 ENSGT00390000016119 ENSGT01100000263502.A.b.a.a ENSGT00940000158933 ENSGT00940000155766.a Characoidei ANCESTRAL SPECIES 114 ENSGT00940000157161.a.b ENSGT00940000158892.b.i.b ENSGT00940000164282.a ENSGT00940000168452 ENSGT00940000159597 ENSGT00940000154471.a.b.a.a.b.b ENSGT00940000158097 ENSGT00390000012439 ENSGT00940000161187 ENSGT00940000158459 ENSGT00940000159351 ENSGT00520000060938 ENSGT00390000013792 ENSGT00940000155241.c ENSGT00940000153629.a.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.a.d #22 ENSGT00940000155820.b ENSGT00940000160122 ENSGT00900000141054 ENSGT01000000214413.b.a.b.b.a ENSGT00940000155552.r ENSGT00940000158818 ENSGT00940000154839.A ENSGT00920000150085 ENSGT00530000063260 ENSGT01030000235284 ENSGT00390000001763 ENSGT00390000016119 ENSGT00940000163205.c ENSGT01100000263502.A.b.a.a ENSGT00940000155766.a Mexicana tetra MODERN SPECIES 21 FGD3 (ENSAMXG00000015438) BICD2 (ENSAMXG00000015418) ENSAMXG00000026348 ENSAMXG00000037634 ENSAMXG00000031961 ENSAMXG00000043825 mib2 (ENSAMXG00000015366) ubiad1 (ENSAMXG00000029286) MMP23B (ENSAMXG00000015304) cdk11b (ENSAMXG00000015292) SLC35E2B (ENSAMXG00000041242) ENSAMXG00000015254 nadka (ENSAMXG00000038095) QRICH1 (ENSAMXG00000015226) prickle2a (ENSAMXG00000015173) rho (ENSAMXG00000026346) #22 MAGI1 (ENSAMXG00000015135) GABRD (ENSAMXG00000015087) ENSAMXG00000015017 gnb1a (ENSAMXG00000014987) ENSAMXG00000033276 TKT (ENSAMXG00000014979) ENSAMXG00000029751 dcp1a (ENSAMXG00000014974) CACNA1D (ENSAMXG00000014965) ENSAMXG00000035781 CHDH (ENSAMXG00000014958) ENSAMXG00000042027 actr8 (ENSAMXG00000014954) selenok (ENSAMXG00000014949) gstt1a (ENSAMXG00000014946) Red-bellied piranha MODERN SPECIES 881 QRICH1 (ENSPNAG00000024390) prickle2a (ENSPNAG00000024417) rho (ENSPNAG00000004073) #22 Electric eel MODERN SPECIES 232 ENSEEEG00000002097 FGD3 (ENSEEEG00000002017) ENSEEEG00000002015 BICD2 (ENSEEEG00000002007) mib2 (ENSEEEG00000001971) ubiad1 (ENSEEEG00000001958) MMP23B (ENSEEEG00000001951) cdk11b (ENSEEEG00000001930) SLC35E2B (ENSEEEG00000001928) ENSEEEG00000001925 nadka (ENSEEEG00000001700) QRICH1 (ENSEEEG00000001680) ENSEEEG00000001677 prickle2a (ENSEEEG00000001674) rho (ENSEEEG00000001671) #22 MAGI1 (ENSEEEG00000001668) GABRD (ENSEEEG00000001664) ENSEEEG00000001662 gnb1a (ENSEEEG00000001623) dcp1a (ENSEEEG00000001619) CHDH (ENSEEEG00000001615) ENSEEEG00000001613 actr8 (ENSEEEG00000001612) selenok (ENSEEEG00000001610) ENSEEEG00000001603 Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 54 ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00510000047967 ENSGT00940000155048.d.a ENSGT00390000005214 ENSGT00940000160100 ENSGT00590000083094.a.a.c.a ENSGT00940000153456.b.b ENSGT01030000234637.b.d.a.a.a ENSGT00940000173126 ENSGT00390000002873 ENSGT00940000157279.i ENSGT00510000046608.B.s ENSGT00940000166173 ENSGT00940000153629.a.a.b ENSGT00940000156409 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.a #22 ENSGT00940000155820.a ENSGT00550000074950 ENSGT00940000158502 ENSGT00940000158653.i ENSGT00940000158653.j ENSGT00940000164303.b.a ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000162607.b ENSGT00940000159882 ENSGT00940000159508.a ENSGT00940000165407 ENSGT00940000156493 ENSGT00390000010697 ENSGT00550000074831.k ENSGT00390000008631.a.o.a Asian bonytongue MODERN SPECIES 14 FAM107A (ENSSFOG00015018963) ENSSFOG00015018952 fhit (ENSSFOG00015018887) ptprga (ENSSFOG00015018812) ENSSFOG00015018799 fezf2 (ENSSFOG00015018740) ENSSFOG00015018359 nampt2 (ENSSFOG00015018243) SYNPR (ENSSFOG00015018227) thoc7 (ENSSFOG00015018204) ATXN7 (ENSSFOG00015018162) psmd6 (ENSSFOG00015018135) slc2a9l1 (ENSSFOG00015018103) prickle2b (ENSSFOG00015030418) ADAMTS9 (ENSSFOG00015017953) rho (ENSSFOG00015017939) #22 magi1b (ENSSFOG00015017375) slc25a26 (ENSSFOG00015017281) LRIG1 (ENSSFOG00015017174) kbtbd8 (ENSSFOG00015032441) ENSSFOG00015017078 suclg2 (ENSSFOG00015017035) TAFA1 (ENSSFOG00015017007) tafa4b (ENSSFOG00015016988) EOGT (ENSSFOG00015016943) tmf1 (ENSSFOG00015016904) uba3 (ENSSFOG00015016867) arl6ip5a (ENSSFOG00015025753) FRMD4B (ENSSFOG00015016690) mitfa (ENSSFOG00015016521) zgc:113054 (ENSSFOG00015016449) Spotted gar MODERN SPECIES 671 ENSLOCG00000010456 ptprga (ENSLOCG00000010428) C3orf14 (ENSLOCG00000010418) fezf2 (ENSLOCG00000010412) ENSLOCG00000010394 nampt2 (ENSLOCG00000010385) SYNPR (ENSLOCG00000010367) SNTN (ENSLOCG00000010361) ENSLOCG00000010350 thoc7 (ENSLOCG00000010342) ATXN7 (ENSLOCG00000010319) psmd6 (ENSLOCG00000010311) slc2a9l1 (ENSLOCG00000010306) prickle2b (ENSLOCG00000010297) ADAMTS9 (ENSLOCG00000010273) rho (ENSLOCG00000018246) #22 magi1b (ENSLOCG00000010248) slc25a26 (ENSLOCG00000010233) LRIG1 (ENSLOCG00000010211) ENSLOCG00000010198 kbtbd8 (ENSLOCG00000010195) slc16a7 (ENSLOCG00000010177) suclg2 (ENSLOCG00000010157) ENSLOCG00000010154 TAFA4 (ENSLOCG00000010139) EOGT (ENSLOCG00000010125) tmf1 (ENSLOCG00000010119) uba3 (ENSLOCG00000010113) arl6ip5b (ENSLOCG00000010101) LMOD3 (ENSLOCG00000010083) FRMD4B (ENSLOCG00000010065) Reedfish MODERN SPECIES 9 trappc6b (ENSECRG00000018376) ENSECRG00000018350 USP19 (ENSECRG00000018313) ENSECRG00000018297 rps25 (ENSECRG00000018233) KLHDC8B (ENSECRG00000018202) ENSECRG00000018177 ENSECRG00000018150 CRP (ENSECRG00000018128) kbtbd12 (ENSECRG00000018104) MGLL (ENSECRG00000018082) xpc (ENSECRG00000018047) TMEM43 (ENSECRG00000018022) ENSECRG00000017997 ##20 IFT122 (ENSECRG00000017601) #21 rho (ENSECRG00000017447) #22 ENSECRG00000017422 PLXND1 (ENSECRG00000017364) #24 tmcc1b (ENSECRG00000017338) ENSECRG00000017298 ENSECRG00000017126 GPX1 (ENSECRG00000016812) ENSECRG00000016756 emc3 (ENSECRG00000016728) fancd2 (ENSECRG00000016630) tex264a (ENSECRG00000016593) grm2b (ENSECRG00000016569) rrp9 (ENSECRG00000016528) parp3 (ENSECRG00000016494) parp3 (ENSECRG00000016445) ENSECRG00000016428 Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES 199 ENSGT00940000158319 ENSGT00610000087444 ENSGT00940000157255 ENSGT01100000263515.a.b.a.b.b ENSGT00940000156836 ENSGT00390000011364 ENSGT00390000005194 ENSGT00390000009671 ENSGT00530000063687.b.a ##20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.b #22 ENSGT00960000189798 ENSGT00930000152979 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 Neopterygii ANCESTRAL SPECIES 75 ENSGT00940000162970 ENSGT00930000152681 ENSGT00940000160061 ENSGT01020000230394.e.a.a.a ##24 ENSGT00940000157810 ENSGT00940000158319 ENSGT00610000087444 ENSGT00940000157255 ENSGT01100000263515.a.b.a.b.b ENSGT00940000156836 ENSGT00390000011364 ENSGT00390000005194 ENSGT00390000009671 ENSGT00530000063687.b.a ##20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.b #22 ENSGT00960000189798 ENSGT00930000152979 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00940000155616 Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 188 ENSGT00940000154471.a.b.a.a.b.b ENSGT00940000159597 ENSGT00940000168452 ENSGT00940000164282.a ENSGT00940000158892.b.i.b ENSGT00940000179763 ENSGT00940000157794 ENSGT00940000161421 ENSGT00730000111286 ENSGT00940000160255 ENSGT00660000097455 ENSGT00530000063687.b.b.a ##20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.b #22 ENSGT00960000189798 ENSGT00930000152979 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189 ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342 ENSGT00730000111360.a ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 ENSGT00940000155241 Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 223 ENSGT00940000154471.a.b.a.a.a ENSGT00940000159597 ENSGT00940000168452 ENSGT00940000164282.a ENSGT00940000158892.b.i.a ENSGT00940000157161.a.a.b ENSGT00940000154554.b ENSGT00740000116959 ENSGT00940000179763 ENSGT00940000157794 ENSGT00940000168503.A ENSGT00940000160255 ENSGT00530000063687.b.b.a ##20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.b #22 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189.nb ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.c ENSGT00730000111360.a ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 ENSGT00940000155241.f Asian bonytongue MODERN SPECIES 11 osbpl2b (ENSSFOG00015016249) SOGA1 (ENSSFOG00015016141) acss2 (ENSSFOG00015016031) mapre1b (ENSSFOG00015028863) BICD2 (ENSSFOG00015016754) FGD3 (ENSSFOG00015016685) ENSSFOG00015016666 ENSSFOG00015024492 ninj1 (ENSSFOG00015016601) WNK2 (ENSSFOG00015016470) BRPF1 (ENSSFOG00015016392) ENSSFOG00015016346 CRELD1 (ENSSFOG00015016303) ENSSFOG00015016292 ##20 IFT122 (ENSSFOG00015016200) #21 exorh (ENSSFOG00015016170) #22 PLXND1 (ENSSFOG00015029894) #24 tmcc1b (ENSSFOG00015016085) trh (ENSSFOG00015016071) RBSN (ENSSFOG00015024858) mrps25 (ENSSFOG00015016016) nr2c2 (ENSSFOG00015015971) ENSSFOG00015029674 wdr46 (ENSSFOG00015015934) sult1st3 (ENSSFOG00015015915) ENSSFOG00015015904 ogg1 (ENSSFOG00015015886) qars1 (ENSSFOG00015015812) qrich1 (ENSSFOG00015015775) tcta (ENSSFOG00015029579) glyctk (ENSSFOG00015030587) P. kingsleyae MODERN SPECIES 171 BICD2 (ENSPKIG00000012689) ENSPKIG00000012623 ENSPKIG00000012581 ENSPKIG00000012559 ENSPKIG00000012542 ENSPKIG00000012509 ENSPKIG00000012491 BRPF1 (ENSPKIG00000012428) ENSPKIG00000012369 CRELD1 (ENSPKIG00000012326) ENSPKIG00000012306 ##20 IFT122 (ENSPKIG00000012198) #21 exorh (ENSPKIG00000012132) #22 PLXND1 (ENSPKIG00000011947) #24 TMCC1 (ENSPKIG00000011848) trh (ENSPKIG00000011838) RBSN (ENSPKIG00000011784) mrps25 (ENSPKIG00000011826) nr2c2 (ENSPKIG00000011741) ENSPKIG00000011729 B3GALT4 (ENSPKIG00000011720) wdr46 (ENSPKIG00000011681) ENSPKIG00000011646 ENSPKIG00000011614 ENSPKIG00000011563 ENSPKIG00000011530 ENSPKIG00000011505 ogg1 (ENSPKIG00000011480) Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 193 ENSGT00940000154471.a.b.a.a.b.b ENSGT00940000159597 ENSGT00940000168452 ENSGT00940000164282.a ENSGT00940000158892.b.i.b ENSGT00940000157161.a.b ENSGT00940000157794 ENSGT00940000161421 ENSGT00730000111286 ENSGT00940000160255 ENSGT00530000063687.b.b.a ##20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.b #22 ENSGT00960000189798 ENSGT00930000152979 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189.pb.b ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.b ENSGT00940000163342.b ENSGT00730000111360.a ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 106 ENSGT00390000005874.i ENSGT00940000155514.d ENSGT00940000154471.a.b.a.a.b.b ENSGT00940000159597 ENSGT00940000168452 ENSGT00940000164282.a ENSGT00940000158892.b.i.b ENSGT00940000157161.a.b ENSGT00940000157794 ENSGT00940000161421 ENSGT00940000168503.B ENSGT00730000111286 ENSGT00940000160255 ENSGT00530000063687.b.b.a ##20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.b #22 ENSGT00960000189798 ENSGT00930000152979 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189.pb.b ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.a.b ENSGT00730000111360.a ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 ENSGT00940000155241.c Otophysi ANCESTRAL SPECIES 220 ENSGT00940000154471.a.b.a.a.b.b ENSGT00940000159597 ENSGT00940000168452 ENSGT00940000164282.a ENSGT00940000158892.b.i.b ENSGT00940000157161.a.b ENSGT00940000157794 ENSGT00940000161421 ENSGT00940000168503.B ENSGT00730000111286 ENSGT00940000160255 ENSGT00530000063687.b.b.a ##20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.b #22 ENSGT00960000189798 ENSGT00930000152979 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189.pb.b ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.a.b ENSGT00730000111360.a ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 ENSGT00930000151037 Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 69 ENSGT00940000159351 ENSGT00940000158459 ENSGT00940000161187 ENSGT00390000012439 ENSGT00940000158097 ENSGT00940000154471.a.b.a.a.b.b ENSGT00940000159597 ENSGT01030000235645 ENSGT00940000157161.a.b ENSGT00940000157794 ENSGT00940000161421 ENSGT00940000168503.B ENSGT00940000160255 ENSGT00530000063687.b.b.a ##20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.b #22 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189.pb.b ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.a.b.b ENSGT00940000163342.a.a.b.a ENSGT00940000163342.a.a.a ENSGT00730000111360.a ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 ENSGT00930000151037 Channel catfish MODERN SPECIES 24 cdk11b (ENSIPUG00000023640) mmp23b (ENSIPUG00000023634) ubiad1 (ENSIPUG00000023631) mib2 (ENSIPUG00000023607) BICD2 (ENSIPUG00000023601) fgd3 (ENSIPUG00000023591) susd3 (ENSIPUG00000023585) ENSIPUG00000023564 ENSIPUG00000023557 brpf1 (ENSIPUG00000023545) ENSIPUG00000023537 ENSIPUG00000023536 Creld1 (ENSIPUG00000023523) ENSIPUG00000023518 ##20 ift122 (ENSIPUG00000023491) #21 exorh (ENSIPUG00000022599) #22 plxnd1 (ENSIPUG00000022519) #24 tmcc1 (ENSIPUG00000022503) trh (ENSIPUG00000022493) mrps25 (ENSIPUG00000022462) nr2c2 (ENSIPUG00000022437) ENSIPUG00000022431 wdr46 (ENSIPUG00000022420) st1s3 (ENSIPUG00000022384) ENSIPUG00000022375 ENSIPUG00000022361 ENSIPUG00000022192 ENSIPUG00000022172 prrt3 (ENSIPUG00000022168) Ogg1 (ENSIPUG00000022146) qars1 (ENSIPUG00000022101) Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 68 ENSGT00940000161187 ENSGT00390000012439 ENSGT00940000158097 ENSGT00940000154471.a.b.a.a.b.b ENSGT00940000159597 ENSGT00940000168452 ENSGT00940000164282.a ENSGT00940000158892.b.i.b ENSGT00940000157161.a.b ENSGT00940000157794 ENSGT00940000161421 ENSGT00940000168503.B ENSGT00940000160255 ENSGT00530000063687.b.b.a ##20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.b #22 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189.pb.b ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.a.b.a.a ENSGT00940000163342.a.a.b.a.b.a.a ENSGT00940000163342.a.a.a ENSGT00730000111360.a ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 ENSGT00930000151037 Electric eel MODERN SPECIES 382 IFT122 (ENSEEEG00000000912) #21 exorh (ENSEEEG00000000876) #22 PLXND1 (ENSEEEG00000000830) #24 TMCC1 (ENSEEEG00000000801) RBSN (ENSEEEG00000000780) mrps25 (ENSEEEG00000000773) nr2c2 (ENSEEEG00000000716) ENSEEEG00000000697 wdr46 (ENSEEEG00000000550) ENSEEEG00000000522 ENSEEEG00000000507 ENSEEEG00000000489 ENSEEEG00000000457 ENSEEEG00000000443 ogg1 (ENSEEEG00000000432) qars1 (ENSEEEG00000000275) angptl7 (ENSEEEG00000021451) Characoidei ANCESTRAL SPECIES 114 ENSGT00940000161187 ENSGT00390000012439 ENSGT00940000158097 ENSGT00940000154471.a.b.a.a.b.b ENSGT00940000159597 ENSGT00940000168452 ENSGT00940000164282.a ENSGT00940000158892.b.i.b ENSGT00940000157161.a.b ENSGT00940000157794 ENSGT00940000161421 ENSGT00940000168503.B ENSGT00940000160255 ENSGT00530000063687.b.b.a ##20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.b #22 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189.pb.b ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.a.b.a.a.a Red-bellied piranha MODERN SPECIES 113 ENSPNAG00000008018 ENSPNAG00000000581 BRPF1 (ENSPNAG00000007904) ENSPNAG00000007881 ENSPNAG00000007864 CRELD1 (ENSPNAG00000007855) ENSPNAG00000000509 ##20 IFT122 (ENSPNAG00000007835) #21 exorh (ENSPNAG00000000255) #22 PLXND1 (ENSPNAG00000007399) #24 TMCC1 (ENSPNAG00000007398) trh (ENSPNAG00000007396) RBSN (ENSPNAG00000000161) mrps25 (ENSPNAG00000000160) nr2c2 (ENSPNAG00000007395) B3GALT4 (ENSPNAG00000007394) wdr46 (ENSPNAG00000007393) ENSPNAG00000000159 ENSPNAG00000007392 ENSPNAG00000007391 ENSPNAG00000000158 ENSPNAG00000007390 ENSPNAG00000029502 ENSPNAG00000029498 Mexicana tetra MODERN SPECIES 21 snrnp200 (ENSAMXG00000005684) DTX1 (ENSAMXG00000035252) ENSAMXG00000005777 tssk6 (ENSAMXG00000021341) tssk6 (ENSAMXG00000031512) dgcr6 (ENSAMXG00000039795) ENSAMXG00000033873 ENSAMXG00000030759 ENSAMXG00000039873 ENSAMXG00000037200 LRRTM4 (ENSAMXG00000019110) ENSAMXG00000037733 CRELD1 (ENSAMXG00000036937) ENSAMXG00000017271 ##20 IFT122 (ENSAMXG00000017213) #21 exorh (ENSAMXG00000017182) #22 PLXND1 (ENSAMXG00000017099) #24 TMCC1 (ENSAMXG00000034799) trh (ENSAMXG00000029674) RBSN (ENSAMXG00000019879) mrps25 (ENSAMXG00000019894) nr2c2 (ENSAMXG00000019916) B3GALT4 (ENSAMXG00000024986) wdr46 (ENSAMXG00000019928) ENSAMXG00000014616 ENSAMXG00000003670 BRPF1 (ENSAMXG00000003661) WNK2 (ENSAMXG00000003641) ENSAMXG00000003632 NINJ1 (ENSAMXG00000032325) ENSAMXG00000041555 Cyprinoidei DUPLICATION Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 175 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.b.a #22 ENSGT01020000230394.e.b.a.h #24 ENSGT00960000189798 ENSGT00930000152979 ENSGT01020000230394.e.b.a.g #24 ENSGT00940000155189.pb.b ENSGT00390000016951 ENSGT00530000063687.b.b.a ##20 ENSGT00940000160255.k ENSGT00730000111286 ENSGT00940000175110 ENSGT00940000161421 ENSGT00940000157794 ENSGT00940000157161.a.b ENSGT00940000158892.b.i.b ENSGT00940000168452 Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 613 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.b.a #22 ENSGT01020000230394.e.b.a.g.a #24 ENSGT00940000155189.pb.b.d.a ENSGT01020000230394.e.b.a.h #24 ENSGT00940000155189.pb.b.c ENSGT00390000016951.c ENSGT00940000160255.k.a ENSGT00940000161421.s ENSGT00940000157161.a.b.c ENSGT00940000168452.c ENSGT00940000159597.b ENSGT00940000159351.c.a ENSGT00940000158459.o ENSGT00940000161187.f ENSGT00940000158097.j Goldfish DUPLICATION Goldfish MODERN SPECIES 2005 ENSCARG00000042071 rho (ENSCARG00000042045) #22 ENSCARG00000042039 ENSCARG00000042028 MAGI1 (ENSCARG00000041790) ENSCARG00000041730 ENSCARG00000041721 IFT122 (ENSCARG00000040431) #21 exorh (ENSCARG00000040341) #22 ENSCARG00000040325 ENSCARG00000040318 ENSCARG00000040307 Goldfish MODERN SPECIES 649 ENSCARG00000027345 PTCHD3 (ENSCARG00000027334) ENSCARG00000027322 prickle2a (ENSCARG00000027298) rho (ENSCARG00000027276) #22 MAGI1 (ENSCARG00000026617) RHO (ENSCARG00000026550) #22 PLXND1 (ENSCARG00000026310) #24 Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 438 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.b.a #22 ENSGT01020000230394.e.b.a.g.a #24 ENSGT00940000155189.pb.b.d.a ENSGT01020000230394.e.b.a.h #24 ENSGT00940000155189.pb.b.c ENSGT00390000016951.c ENSGT00530000063687.b.b.a ##20 ENSGT00940000160255.k.b ENSGT00730000111286 ENSGT00940000161421.t ENSGT00940000157794 ENSGT00940000179763 ENSGT00940000158892.b.i.b.b ENSGT00940000168452.c ENSGT00940000159597.b ENSGT00940000159351.d Common carp reference DUPLICATION Common carp reference MODERN SPECIES 17 ENSCCRG00000058174 #22 ENSCCRG00000053638 ENSCCRG00000066059 ENSCCRG00000065980 IFT122 (ENSCCRG00000064748) #21 exorh (ENSCCRG00000075419) #22 PLXND1 (ENSCCRG00000020744) #24 TMCC1 (ENSCCRG00000079068) trh (ENSCCRG00000010511) ENSCCRG00000010512 ENSCCRG00000015060 ENSCCRG00000072902 ENSCCRG00000080063 ENSCCRG00000038260 ENSCCRG00000050892 ENSCCRG00000065129 ENSCCRG00000054980 ENSCCRG00000033063 ENSCCRG00000033067 SLC35E2B (ENSCCRG00000042957) ENSCCRG00000075588 Common carp reference MODERN SPECIES 23 ENSCCRG00000070557 ENSCCRG00000075842 prickle2a (ENSCCRG00000038149) ENSCCRG00000057393 ENSCCRG00000054567 rho (ENSCCRG00000009712) #22 ENSCCRG00000031669 ENSCCRG00000065954 ENSCCRG00000072229 exorh (ENSCCRG00000020764) #22 PLXND1 (ENSCCRG00000062039) #24 TMCC1 (ENSCCRG00000063241) ENSCCRG00000052417 ENSCCRG00000067391 ENSCCRG00000077981 ENSCCRG00000062721 trh (ENSCCRG00000045246) ENSCCRG00000045252 ##20 ENSCCRG00000010514 ENSCCRG00000028830 ENSCCRG00000075920 ENSCCRG00000052810 ENSCCRG00000054181 ENSCCRG00000054242 ENSCCRG00000028837 Golden-line barbel DUPLICATION Golden-line barbel MODERN SPECIES 353 prickle2a (ENSSGRG00000049094) ENSSGRG00000049095 MAGI1 (ENSSGRG00000049096) IFT122 (ENSSGRG00000049101) #21 exorh (ENSSGRG00000049458) #22 PLXND1 (ENSSGRG00000049474) #24 ENSSGRG00000049476 ENSSGRG00000049477 TMCC1 (ENSSGRG00000049479) ENSSGRG00000049482 ENSSGRG00000049483 CRELD1 (ENSSGRG00000049484) ENSSGRG00000049491 BRPF1 (ENSSGRG00000049496) ENSSGRG00000049499 ENSSGRG00000049506 ENSSGRG00000049508 ENSSGRG00000049510 ENSSGRG00000049511 Golden-line barbel MODERN SPECIES 3090 exorh (ENSSGRG00000001410) #22 ENSSGRG00000001407 ENSSGRG00000001401 Zebrafish MODERN SPECIES 23 exorh (ENSDARG00000111860) #22 ENSDARG00000086057 #24 TMCC1 (ENSDARG00000076747) trh (ENSDARG00000006868) ENSDARG00000110298 ##20 CRELD1 (ENSDARG00000006990) ENSDARG00000105863 BRPF1 (ENSDARG00000103665) prickle2a (ENSDARG00000020982) rho (ENSDARG00000002193) #22 MAGI1 (ENSDARG00000070145) ENSDARG00000099650 SLC35E2B (ENSDARG00000109717) cdk11b (ENSDARG00000102546) MMP23B (ENSDARG00000043079) ubiad1 (ENSDARG00000013009) Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.b.b #22 Zebrafish MODERN SPECIES 976 RHO (ENSDARG00000103574) #22 Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 154 ENSGT00720000108866 ENSGT00490000043380.b ENSGT01100000263545.a.b.c.b ENSGT00940000167348 ENSGT00940000164142 ENSGT00940000156300.l ENSGT01090000261049 ENSGT00940000155769.`b.a ENSGT00390000005874.i ENSGT00940000155514.d ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.b #22 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189.pb.b ENSGT00390000016951 ENSGT00940000156963.a.a ENSGT00390000006813 ENSGT00940000164642 ENSGT00940000163342.a.a.a ENSGT00730000111360.a ENSGT00640000091554 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.a.b.e ENSGT00940000163873.c.a ENSGT00940000155615.i.b Atlantic herring MODERN SPECIES ENSCHAG00000027460 ENSCHAG00000027436 ccnf (ENSCHAG00000027357) ABCA3 (ENSCHAG00000026851) actr5 (ENSCHAG00000026751) SLC32A1 (ENSCHAG00000026750) ENSCHAG00000026748 atp5f1e (ENSCHAG00000026747) ENSCHAG00000026729 ENSCHAG00000026723 GNAS (ENSCHAG00000026666) VAPB (ENSCHAG00000026656) DCAF1 (ENSCHAG00000026637) DOCK3 (ENSCHAG00000025595) IFT122 (ENSCHAG00000024796) #21 exorh (ENSCHAG00000024744) #22 PLXND1 (ENSCHAG00000024489) #24 TMCC1 (ENSCHAG00000024474) trh (ENSCHAG00000024472) ENSCHAG00000024394 cs (ENSCHAG00000024358) ENSCHAG00000024341 ENSCHAG00000024336 ogg1 (ENSCHAG00000024331) nr2c2 (ENSCHAG00000024228) ENSCHAG00000024212 wdr46 (ENSCHAG00000024207) sult1st3 (ENSCHAG00000024205) ssuh2rs1 (ENSCHAG00000024187) grip2a (ENSCHAG00000023254) slc6a6a (ENSCHAG00000022868) Denticle herring MODERN SPECIES 17 HSPA2 (ENSDCDG00000012196) ENSDCDG00000012201 pitpnbl (ENSDCDG00000012215) cabp5b (ENSDCDG00000012274) sun1b (ENSDCDG00000012310) actr5 (ENSDCDG00000012348) SLC32A1 (ENSDCDG00000012356) ENSDCDG00000012366 atp5f1e (ENSDCDG00000012392) ENSDCDG00000012412 GNAS (ENSDCDG00000012458) ENSDCDG00000012506 VAPB (ENSDCDG00000012511) DCAF1 (ENSDCDG00000012534) IFT122 (ENSDCDG00000013175) #21 RHO (ENSDCDG00000016639) #22 PLXND1 (ENSDCDG00000016646) #24 TMCC1 (ENSDCDG00000016677) ENSDCDG00000016678 ENSDCDG00000016690 cs (ENSDCDG00000018730) ENSDCDG00000020100 ENSDCDG00000020110 ogg1 (ENSDCDG00000020113) nr2c2 (ENSDCDG00000020122) B3GALT4 (ENSDCDG00000020152) ENSDCDG00000020157 ENSDCDG00000020167 ENSDCDG00000020169 ENSDCDG00000020171 ENSDCDG00000020174 Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000164112.a ENSGT00530000064244.a ENSGT00940000156915.f.a ENSGT00390000009491.d ENSGT00940000156047.b ENSGT00940000158523.c.a ENSGT00940000162955 ENSGT00940000179763 ENSGT00940000157794 ENSGT00940000161421 ENSGT00730000111286 ENSGT00940000160255 ENSGT00660000097455 ENSGT00530000063687.b.b.a ##20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.b #22 ENSGT00930000152979 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189.pb.b ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.b.a.a ENSGT00940000163342.b ENSGT00730000111360.a ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 ENSGT00940000155241.c Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000162955 ENSGT00940000164549.a.a ENSGT00940000154471.a.b.a.a.b.b ENSGT00940000159597 ENSGT00940000168452 ENSGT00940000164282.a ENSGT00940000158892.b.i.b ENSGT00940000157161.a.b ENSGT00940000157794 ENSGT00940000161421 ENSGT00730000111286 ENSGT00940000160255 ENSGT00660000097455 ENSGT00530000063687.b.b.a ##20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.b #22 ENSGT00930000152979 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189.pb.b ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.b.a.a ENSGT00940000163342.b ENSGT00730000111360.a ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 ENSGT00940000155241.c Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000162955 ENSGT00940000164549.a.a ENSGT00940000154471.a.b.a.a.b.b ENSGT00940000159597 ENSGT00940000168452 ENSGT00940000164282.a ENSGT00940000158892.b.i.b ENSGT00940000157161.a.b ENSGT00940000157794 ENSGT00940000161421 ENSGT00730000111286 ENSGT00940000160255 ENSGT00660000097455 ENSGT00530000063687.b.b.a ##20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.b #22 ENSGT00930000152979 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189.pb.b ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.b.a.a ENSGT00940000163342.b ENSGT00730000111360.a ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 ENSGT00940000155241.c Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000162955 ENSGT00940000164549.a.a ENSGT00940000154471.a.b.a.a.b.b ENSGT00940000159597 ENSGT00940000168452 ENSGT00940000164282.a ENSGT00940000158892.b.i.b ENSGT00940000157161.a.b ENSGT00940000157794 ENSGT00940000161421 ENSGT00730000111286 ENSGT00940000160255 ENSGT00660000097455 ENSGT00530000063687.b.b.a ##20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.b #22 ENSGT00930000152979 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189.pb.b ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.b.a.a ENSGT00940000163342.b ENSGT00730000111360.a ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 ENSGT00940000155241.c Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 483 ENSHCOG00000005692 ENSHCOG00000005702 BRPF1 (ENSHCOG00000005790) ENSHCOG00000005807 CRELD1 (ENSHCOG00000005852) ENSHCOG00000005866 ##20 IFT122 (ENSHCOG00000005902) #21 ENSHCOG00000005909 RHO (ENSHCOG00000012881) #22 ENSHCOG00000013214 #24 ENSHCOG00000013247 TMCC1 (ENSHCOG00000013286) Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000162955 ENSGT00940000164549.a.a ENSGT00940000154471.a.b.a.a.b.b ENSGT00940000159597 ENSGT00940000168452 ENSGT00940000164282.a ENSGT00940000158892.b.i.b ENSGT00940000157161.a.b ENSGT00940000157794 ENSGT00940000161421 ENSGT00730000111286 ENSGT00940000160255 ENSGT00660000097455 ENSGT00530000063687.b.b.a ##20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.b #22 ENSGT00930000152979 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189.pb.b ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.b.a.a ENSGT00940000163342.b.a ENSGT00940000163342.b.b ENSGT00730000111360.a ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000162955 ENSGT00940000164549.a.a ENSGT00940000154471.a.b.a.a.b.b ENSGT00940000159597 ENSGT00940000168452 ENSGT00940000164282.a ENSGT00940000158892.b.i.b ENSGT00940000157161.a.b ENSGT00940000157794 ENSGT00940000161421 ENSGT00940000168503.B ENSGT00940000160255 ENSGT00660000097455 ENSGT00530000063687.b.b.a ##20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.b #22 ENSGT00930000152979 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189.pb.b ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.b.a.a ENSGT00940000163342.b.a ENSGT00940000163342.b.b ENSGT00730000111360.a ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000162955 ENSGT00940000164549.a.a ENSGT00940000154471.a.b.a.a.b.b ENSGT00940000159597 ENSGT00940000168452 ENSGT00940000164282.a ENSGT00940000158892.b.i.b ENSGT00940000157161.a.b ENSGT00940000157794 ENSGT00940000161421 ENSGT00940000168503.B ENSGT00940000160255 ENSGT00660000097455 ENSGT00530000063687.b.b.a ##20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.b #22 ENSGT00930000152979 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189.pb.b ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.b.a.a ENSGT00940000163342.b.a ENSGT00940000163342.b.b ENSGT00730000111360.a ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000164549.a.a ENSGT00940000154471.a.b.a.a.b.b ENSGT00940000159597 ENSGT00940000168452 ENSGT00940000164282.a ENSGT00940000158892.b.i.b ENSGT00940000157161.a.b ENSGT00940000157794 ENSGT00940000161421 ENSGT00940000168503.B ENSGT00730000111286 ENSGT00940000160255 ENSGT00660000097455 ENSGT00530000063687.b.b.a ##20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.b #22 ENSGT00930000152979 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189.pb.b ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.b.a.a ENSGT00940000163342.b.a ENSGT00940000163342.b.b ENSGT00730000111360.a ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000158523.c.a ENSGT00940000162955 ENSGT00940000164549.a.a.f ENSGT00940000154471.a.b.a.a.b.b ENSGT00940000159597 ENSGT00940000168452 ENSGT00940000164282.a ENSGT00940000158892.b.i.b ENSGT00940000157161.a.b ENSGT00940000157794 ENSGT00940000161421 ENSGT00940000168503.B ENSGT00940000160255 ENSGT00530000063687.b.b.a ##20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.b #22 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189.pb.b ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.b.a.a ENSGT00940000163342.b.a ENSGT00940000163342.b.b ENSGT00730000111360.a ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 ENSGT00940000155241.c Turquoise killifish MODERN SPECIES 1624 TAF11 (ENSNFUG00015022519) TMEM194A (ENSNFUG00015022508) ORMDL2 (ENSNFUG00015022504) ENSNFUG00015022502 PAN2 (ENSNFUG00015022494) SPATS2 (ENSNFUG00015022490) WIBG (ENSNFUG00015022489) MMP19 (ENSNFUG00015022487) Nfu_g_1_001587 (ENSNFUG00015022482) CABZ01084942.1 (ENSNFUG00015022478) ocstamp (ENSNFUG00015022476) SLC13A3 (ENSNFUG00015022459) PAR1 (ENSNFUG00015022454) MBD4 (ENSNFUG00015022452) ##20 IFT122 (ENSNFUG00015022257) #21 RHO (ENSNFUG00015022237) #22 PLXND1 (ENSNFUG00015021954) #24 TMCC1 (ENSNFUG00015021913) ENSNFUG00015021911 ZFYVE20 (ENSNFUG00015021902) MRPS25 (ENSNFUG00015021896) nr2c2 (ENSNFUG00015021858) ENSNFUG00015021850 WDR46 (ENSNFUG00015021745) XKR7 (ENSNFUG00015021734) CCM2L (ENSNFUG00015021731) CABLES2B (ENSNFUG00015021730) jph2 (ENSNFUG00015021726) ENSNFUG00015021724 CABZ01112331.1 (ENSNFUG00015021717) RND1 (ENSNFUG00015021714) Mangrove rivulus MODERN SPECIES 13 WNT7A (ENSKMAG00000014419) zgc:171857 (ENSKMAG00000014464) ENSKMAG00000014515 BICD2 (ENSKMAG00000014540) ENSKMAG00000014587 ENSKMAG00000014615 ENSKMAG00000014636 ENSKMAG00000014665 ENSKMAG00000014704 BRPF1 (ENSKMAG00000014768) ENSKMAG00000014832 ENSKMAG00000014963 CRELD1 (ENSKMAG00000014995) ENSKMAG00000015015 ##20 IFT122 (ENSKMAG00000015070) #21 exorh (ENSKMAG00000015211) #22 PLXND1 (ENSKMAG00000015247) #24 TMCC1 (ENSKMAG00000015294) ENSKMAG00000015318 trh (ENSKMAG00000015345) RBSN (ENSKMAG00000015370) mrps25 (ENSKMAG00000015394) nr2c2 (ENSKMAG00000015414) B3GALT4 (ENSKMAG00000015442) wdr46 (ENSKMAG00000015454) ENSKMAG00000015482 ENSKMAG00000015514 ENSKMAG00000015529 ENSKMAG00000015568 ENSKMAG00000015654 ENSKMAG00000015676 Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000162955 ENSGT00940000164549.a.a ENSGT00940000154471.a.b.a.a.b.b ENSGT00940000159597 ENSGT00940000168452 ENSGT00940000164282.a ENSGT00940000158892.b.i.b ENSGT00940000157161.a.b ENSGT00940000157794 ENSGT00940000161421 ENSGT00730000111286 ENSGT00940000160255 ENSGT00660000097455 ENSGT00530000063687.b.b.a ##20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.b #22 ENSGT00930000152979 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189.pb.b ENSGT00390000016951 ENSGT01100000263573.b.b ENSGT01030000234515.a.a.a.l ENSGT00940000167624 ENSGT00510000047225.b ENSGT00940000157869.e.a ENSGT00390000013390 ENSGT00940000157238.b ENSGT01090000260040.b.a.b.y.a ENSGT00940000157106 ENSGT00940000154468.tb.b.b ENSGT00950000182844.a.a.b NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 101 ENSGT00940000164549.a.a ENSGT00940000154471.a.b.a.a.b.b ENSGT00940000159597 ENSGT00940000168452 ENSGT00940000164282.a ENSGT00940000158892.b.i.b ENSGT01010000229954 ENSGT00940000157161.a.b ENSGT00940000157794 ENSGT00940000161421 ENSGT00730000111286 ENSGT00940000160255 ENSGT00940000179063 ENSGT00530000063687.b.b.a ##20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.b #22 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189.pb.b ENSGT00390000016951 ENSGT01100000263573.b.b ENSGT01030000234515.a.a.a.l ENSGT00940000167624 ENSGT00510000047225.b ENSGT00940000157869.e.a ENSGT00390000013390 ENSGT01090000260040.b.a.b.y.a ENSGT00940000157106 ENSGT00940000154468.tb.b.b ENSGT00950000182844.a.a.b ENSGT00940000165387.a ENSGT00550000074865 Sheepshead minnow MODERN SPECIES 816 IFT122 (ENSCVAG00000014587) #21 exorh (ENSCVAG00000014601) #22 PLXND1 (ENSCVAG00000014730) #24 TMCC1 (ENSCVAG00000000948) trh (ENSCVAG00000014802) ENSCVAG00000014823 cers5 (ENSCVAG00000014856) slmapb (ENSCVAG00000014884) abhd6b (ENSCVAG00000014912) kctd6b (ENSCVAG00000014917) ENSCVAG00000014920 YWHAB (ENSCVAG00000014934) pabpc1l (ENSCVAG00000015943) rbm39b (ENSCVAG00000015985) rh50 (ENSCVAG00000015989) ENSCVAG00000016053 eif2d (ENSCVAG00000016064) Mummichog MODERN SPECIES 277 FGD3 (ENSFHEG00000001260) ENSFHEG00000001265 ENSFHEG00000001268 NINJ1 (ENSFHEG00000001272) WNK2 (ENSFHEG00000001287) BRPF1 (ENSFHEG00000001299) ENSFHEG00000001307 ENSFHEG00000001316 CRELD1 (ENSFHEG00000001323) ENSFHEG00000001327 ENSFHEG00000001329 ##20 ENSFHEG00000001333 ##20 IFT122 (ENSFHEG00000001341) #21 exorh (ENSFHEG00000002887) #22 PLXND1 (ENSFHEG00000003171) #24 TMCC1 (ENSFHEG00000003206) trh (ENSFHEG00000003237) ENSFHEG00000003271 cers5 (ENSFHEG00000003287) slmapb (ENSFHEG00000003299) abhd6b (ENSFHEG00000003313) kctd6b (ENSFHEG00000003324) UQCC5 (ENSFHEG00000003329) ENSFHEG00000003343 YWHAB (ENSFHEG00000003358) pabpc1l (ENSFHEG00000003398) rbm39b (ENSFHEG00000003421) rh50 (ENSFHEG00000003430) ENSFHEG00000003466 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000164549.a.a ENSGT00940000154471.a.b.a.a.b.b ENSGT00940000159597 ENSGT00940000168452 ENSGT00940000164282.a ENSGT00940000158892.b.i.b ENSGT00940000157161.a.b ENSGT00940000157794 ENSGT00940000161421 ENSGT00940000168503.B ENSGT00730000111286 ENSGT00940000160255 ENSGT00660000097455 ENSGT00530000063687.b.b.a ##20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.b #22 ENSGT00930000152979 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189.pb.b ENSGT00390000016951 ENSGT01100000263573.b.b ENSGT01030000234515.a.a.a.l ENSGT00940000167624 ENSGT00510000047225.b ENSGT00940000157869.e.a ENSGT00390000013390 ENSGT00940000157238.b ENSGT01090000260040.b.a.b.y.a ENSGT00940000157106 ENSGT00940000154468.tb.b.b ENSGT00950000182844.a.a.b Poecilia ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000164549.a.a ENSGT00940000154471.a.b.a.a.b.b ENSGT00940000159597 ENSGT00940000168452 ENSGT00940000164282.a ENSGT00940000158892.b.i.b ENSGT00940000157161.a.b ENSGT00940000157794 ENSGT00940000161421 ENSGT00940000168503.B ENSGT00730000111286 ENSGT00940000160255 ENSGT00660000097455 ENSGT00530000063687.b.b.a ##20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.b #22 ENSGT00930000152979 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189.pb.b ENSGT00390000016951 ENSGT01100000263573.b.b ENSGT01030000234515.a.a.a.l ENSGT00940000167624 ENSGT00510000047225.b ENSGT00940000157869.e.a ENSGT00390000013390 ENSGT00940000182056 ENSGT01090000260040.b.a.b.y.a ENSGT00940000157106 ENSGT00940000154468.tb.b.b ENSGT00950000182844.a.a.b NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 42 ENSGT00940000162955 ENSGT00940000164549.a.a ENSGT00940000154471.a.b.a.a.b.b ENSGT00940000159597 ENSGT00940000168452 ENSGT00940000164282.a ENSGT00940000158892.b.i.b ENSGT00940000157161.a.b ENSGT00940000157794 ENSGT00940000161421 ENSGT00940000168503.B ENSGT00940000160255 ENSGT00660000097455 ENSGT00530000063687.b.b.a ##20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.b #22 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189.pb.b ENSGT00390000016951 ENSGT01100000263573.b.b ENSGT01030000234515.a.a.a.l ENSGT00940000167624 ENSGT00510000047225.b ENSGT00940000157869.e.a ENSGT00390000013390 ENSGT00940000182056 ENSGT01090000260040.b.a.b.y.a ENSGT00940000157106 ENSGT00940000154468.tb.b.b ENSGT00950000182844.a.a.b ENSGT00940000165387.a Amazon molly MODERN SPECIES 385 WNT7A (ENSPFOG00000015340) zgc:171857 (ENSPFOG00000015281) ENSPFOG00000015229 BICD2 (ENSPFOG00000015060) FGD3 (ENSPFOG00000014867) ENSPFOG00000014832 ENSPFOG00000014800 NINJ1 (ENSPFOG00000014789) WNK2 (ENSPFOG00000014671) BRPF1 (ENSPFOG00000014633) ENSPFOG00000014615 ENSPFOG00000014596 CRELD1 (ENSPFOG00000014494) ENSPFOG00000014471 ##20 IFT122 (ENSPFOG00000014227) #21 exorh (ENSPFOG00000014183) #22 PLXND1 (ENSPFOG00000013788) #24 TMCC1 (ENSPFOG00000013746) trh (ENSPFOG00000013724) ENSPFOG00000013643 cers5 (ENSPFOG00000013551) slmapb (ENSPFOG00000013510) abhd6b (ENSPFOG00000013485) kctd6b (ENSPFOG00000013475) UQCC5 (ENSPFOG00000013472) YWHAB (ENSPFOG00000013465) pabpc1l (ENSPFOG00000013241) rbm39b (ENSPFOG00000013197) rh50 (ENSPFOG00000023302) ENSPFOG00000013014 ENSPFOG00000024038 Sailfin molly MODERN SPECIES 267 ARHGEF18 (ENSPLAG00000022203) insrb (ENSPLAG00000022777) ENSPLAG00000022812 CRELD1 (ENSPLAG00000022854) ENSPLAG00000022876 ENSPLAG00000022897 ##20 IFT122 (ENSPLAG00000023031) #21 exorh (ENSPLAG00000023049) #22 PLXND1 (ENSPLAG00000023198) #24 TMCC1 (ENSPLAG00000023265) trh (ENSPLAG00000000651) ENSPLAG00000023324 cers5 (ENSPLAG00000023403) slmapb (ENSPLAG00000023558) abhd6b (ENSPLAG00000023610) kctd6b (ENSPLAG00000023618) UQCC5 (ENSPLAG00000023624) ENSPLAG00000023654 YWHAB (ENSPLAG00000023680) ENSPLAG00000023686 Guppy MODERN SPECIES 459 WNT7A (ENSPREG00000009481) zgc:171857 (ENSPREG00000009493) ENSPREG00000009524 BICD2 (ENSPREG00000009582) FGD3 (ENSPREG00000009601) ENSPREG00000009611 ENSPREG00000009661 ENSPREG00000009706 BRPF1 (ENSPREG00000009793) ENSPREG00000009839 ENSPREG00000009868 CRELD1 (ENSPREG00000009879) ENSPREG00000009892 ENSPREG00000009897 ##20 IFT122 (ENSPREG00000009914) #21 exorh (ENSPREG00000010582) #22 ENSPREG00000015559 ENSPREG00000015582 #24 TMCC1 (ENSPREG00000015624) trh (ENSPREG00000015648) ENSPREG00000015658 cers5 (ENSPREG00000015692) slmapb (ENSPREG00000015729) abhd6b (ENSPREG00000015783) kctd6b (ENSPREG00000015801) UQCC5 (ENSPREG00000015812) ENSPREG00000015835 YWHAB (ENSPREG00000015866) pabpc1l (ENSPREG00000015886) rh50 (ENSPREG00000015903) ENSPREG00000015913 Platyfish MODERN SPECIES WNT7A (ENSXMAG00000017615) zgc:171857 (ENSXMAG00000017604) ENSXMAG00000017581 BICD2 (ENSXMAG00000017565) FGD3 (ENSXMAG00000017525) ENSXMAG00000017523 ENSXMAG00000027075 NINJ1 (ENSXMAG00000022037) WNK2 (ENSXMAG00000017487) BRPF1 (ENSXMAG00000017474) ENSXMAG00000028393 ENSXMAG00000023161 CRELD1 (ENSXMAG00000017448) ENSXMAG00000021129 ##20 IFT122 (ENSXMAG00000017357) #21 exorh (ENSXMAG00000017297) #22 PLXND1 (ENSXMAG00000017238) #24 TMCC1 (ENSXMAG00000029828) trh (ENSXMAG00000017210) cers5 (ENSXMAG00000017186) slmapb (ENSXMAG00000017184) abhd6b (ENSXMAG00000017177) kctd6b (ENSXMAG00000025640) UQCC5 (ENSXMAG00000017172) ognb (ENSXMAG00000024264) YWHAB (ENSXMAG00000017156) pabpc1l (ENSXMAG00000017135) rbm39b (ENSXMAG00000017099) rh50 (ENSXMAG00000017078) ENSXMAG00000017075 eif2d (ENSXMAG00000014696) Oryzias ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000156047.b ENSGT00940000158523.c.a ENSGT00940000162955 ENSGT00940000164549.a.a ENSGT00940000154471.a.b.a.a.b.b ENSGT00940000159597 ENSGT00940000168452 ENSGT00940000164282.a ENSGT00940000157161.a.b ENSGT00940000157794 ENSGT00940000161421 ENSGT00940000168503.B ENSGT00940000160255 ENSGT00530000063687.b.b.a ##20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.b #22 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189.pb.b ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.b.a.a.u ENSGT00940000163342.a.b.a.a.v ENSGT00940000163342.b.b ENSGT00730000111360.a ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 ENSGT00940000155241.c Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000156047.b ENSGT00940000158523.c.a ENSGT00940000162955 ENSGT00940000164549.a.a ENSGT00940000154471.a.b.a.a.b.b ENSGT00940000159597 ENSGT00940000168452 ENSGT00940000164282.a ENSGT00940000157161.a.b ENSGT00940000157794 ENSGT00940000161421 ENSGT00940000168503.B ENSGT00940000160255 ENSGT00530000063687.b.b.a ##20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.b #22 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189.pb.b ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.b.a.a.u ENSGT00940000163342.a.b.a.a.v ENSGT00940000163342.b.b ENSGT00730000111360.a ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 ENSGT00940000155241.c Javanese ricefish MODERN SPECIES 21 FBLN2 (ENSOJAG00000009396) WNT7A (ENSOJAG00000009382) zgc:171857 (ENSOJAG00000009361) ENSOJAG00000009289 BICD2 (ENSOJAG00000008579) FGD3 (ENSOJAG00000008354) ENSOJAG00000008326 ENSOJAG00000008294 ENSOJAG00000008248 BRPF1 (ENSOJAG00000008182) ENSOJAG00000008169 ENSOJAG00000008157 CRELD1 (ENSOJAG00000008031) ENSOJAG00000007990 ##20 IFT122 (ENSOJAG00000005486) #21 exorh (ENSOJAG00000005343) #22 PLXND1 (ENSOJAG00000004987) #24 TMCC1 (ENSOJAG00000004917) ENSOJAG00000004905 trh (ENSOJAG00000004879) RBSN (ENSOJAG00000004715) mrps25 (ENSOJAG00000004674) nr2c2 (ENSOJAG00000004240) ENSOJAG00000004201 wdr46 (ENSOJAG00000004006) ENSOJAG00000003944 ENSOJAG00000003901 ENSOJAG00000021351 ogg1 (ENSOJAG00000021331) qars1 (ENSOJAG00000021167) QRICH1 (ENSOJAG00000021145) Indian medaka MODERN SPECIES 23 FBLN2 (ENSOMEG00000008281) WNT7A (ENSOMEG00000008310) zgc:171857 (ENSOMEG00000008331) ENSOMEG00000008380 BICD2 (ENSOMEG00000008421) FGD3 (ENSOMEG00000008487) ENSOMEG00000008523 ENSOMEG00000008552 ENSOMEG00000008590 BRPF1 (ENSOMEG00000008644) ENSOMEG00000008694 ENSOMEG00000008746 CRELD1 (ENSOMEG00000008795) ENSOMEG00000008819 ##20 IFT122 (ENSOMEG00000008964) #21 exorh (ENSOMEG00000009015) #22 PLXND1 (ENSOMEG00000009160) #24 TMCC1 (ENSOMEG00000009233) trh (ENSOMEG00000009262) RBSN (ENSOMEG00000009298) mrps25 (ENSOMEG00000009352) nr2c2 (ENSOMEG00000009402) ENSOMEG00000009432 ENSOMEG00000009439 wdr46 (ENSOMEG00000009465) ENSOMEG00000009482 ENSOMEG00000009497 ENSOMEG00000009518 ENSOMEG00000009533 ogg1 (ENSOMEG00000009550) qars1 (ENSOMEG00000009629) Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000158523.c.a ENSGT00940000162955 ENSGT00940000164549.a.a ENSGT00940000154471.a.b.a.a.b.b ENSGT00940000159438 ENSGT00940000157503.j ENSGT00940000168452 ENSGT00940000164282.a ENSGT00940000157161.a.b ENSGT00940000157794 ENSGT00940000161421 ENSGT00940000168503.B ENSGT00940000160255 ENSGT00530000063687.b.b.a ##20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.b #22 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189.pb.b ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.b.a.a.u ENSGT00940000163342.b.b ENSGT00730000111360.a ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 ENSGT00940000155241.c ENSGT00940000154814.b Chinese medaka MODERN SPECIES 98 FBLN2 (ENSOSIG00000000095) WNT7A (ENSOSIG00000000057) zgc:171857 (ENSOSIG00000020987) ENSOSIG00000020978 BICD2 (ENSOSIG00000020906) ENSOSIG00000020500 ENSOSIG00000020448 ENSOSIG00000020446 ENSOSIG00000020444 BRPF1 (ENSOSIG00000020422) ENSOSIG00000020410 ENSOSIG00000020403 CRELD1 (ENSOSIG00000020387) ENSOSIG00000020382 ##20 IFT122 (ENSOSIG00000019491) #21 exorh (ENSOSIG00000019409) #22 PLXND1 (ENSOSIG00000019203) #24 TMCC1 (ENSOSIG00000019172) Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 21 zgc:171857 (ENSORLG00000011233) ENSORLG00000030368 zgc:171857 (ENSORLG00000023903) ENSORLG00000011215 BICD2 (ENSORLG00000011196) ENSORLG00000011170 ENSORLG00000027599 ENSORLG00000027702 ENSORLG00000011157 brpf1 (ENSORLG00000011135) ENSORLG00000026604 ENSORLG00000025205 CRELD1 (ENSORLG00000011083) ENSORLG00000011049 ##20 IFT122 (ENSORLG00000011039) #21 exorh (ENSORLG00000010979) #22 PLXND1 (ENSORLG00000010969) #24 TMCC1 (ENSORLG00000010939) trh (ENSORLG00000010934) RBSN (ENSORLG00000010921) mrps25 (ENSORLG00000010890) nr2c2 (ENSORLG00000010877) ENSORLG00000010842 wdr46 (ENSORLG00000010831) sult1st3 (ENSORLG00000010795) ENSORLG00000010801 ENSORLG00000027427 ogg1 (ENSORLG00000010758) qars1 (ENSORLG00000010737) QRICH1 (ENSORLG00000010668) ENSORLG00000029590 Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000162955 ENSGT00940000164549.a.a ENSGT00940000154471.a.b.a.a.b.b ENSGT00940000159597 ENSGT00940000168452 ENSGT00940000164282.a ENSGT00940000158892.b.i.b ENSGT00940000157161.a.b ENSGT00940000157794 ENSGT00940000161421 ENSGT00940000168503.B ENSGT00940000160255 ENSGT00660000097455 ENSGT00530000063687.b.b.a ##20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.b #22 ENSGT00930000152979 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189.pb.b ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.b.a.a ENSGT00940000163342.b.a.d ENSGT00940000163342.b.b ENSGT00730000111360.a ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 Cichlidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162955 ENSGT00940000164549.a.a ENSGT00940000154471.a.b.a.a.b.b ENSGT00940000159597 ENSGT00940000168452 ENSGT00940000164282.a ENSGT00940000158892.b.i.b ENSGT00940000157161.a.b ENSGT00940000157794 ENSGT00940000161421 ENSGT00940000168503.B ENSGT00940000160255 ENSGT00660000097455 ENSGT00530000063687.b.b.a ##20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.b #22 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189.pb.b ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.b.a.a ENSGT00940000163342.b.a.d.b.b.a.b.b ENSGT00940000163342.b.a.d.b.a ENSGT00940000163342.b.a.d.b.b.a.a ENSGT00940000163342.b.b ENSGT00730000111360.a ENSGT00640000091554 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000162955 ENSGT00940000164549.a.a ENSGT00940000154471.a.b.a.a.b.b ENSGT00940000159597 ENSGT00940000168452 ENSGT00940000164282.a ENSGT00940000158892.b.i.b ENSGT00940000157161.a.b ENSGT00940000157794 ENSGT00940000161421 ENSGT00940000168503.B ENSGT00940000160255 ENSGT00660000097455 ENSGT00530000063687.b.b.a ##20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.b #22 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189.pb.b ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.b.a.a.t.b ENSGT00940000163342.b.a.c.b ENSGT00940000163342.a.b.a.a.t.a ENSGT00940000163342.b.a.d.b.b.a.b.b ENSGT00940000163342.b.a.d.b.b.a.b.a ENSGT00940000163342.b.a.d.b.b.b.a ENSGT00940000163342.b.a.d.b.a.a Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000162955 ENSGT00940000164549.a.a ENSGT00940000154471.a.b.a.a.b.b ENSGT00940000159597 ENSGT00940000168452 ENSGT00940000164282.a ENSGT00940000158892.b.i.b ENSGT00940000157161.a.b ENSGT00940000157794 ENSGT00940000161421 ENSGT00940000168503.B ENSGT00940000160255 ENSGT00660000097455 ENSGT00530000063687.b.b.a ##20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.b #22 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189.pb.b ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.b.a.a.t.b ENSGT00940000163342.b.a.c.b ENSGT00940000163342.a.b.a.a.t.a ENSGT00940000163342.b.a.d.b.b.a.b.b ENSGT00940000163342.b.a.d.b.b.a.b.a ENSGT00940000163342.b.a.d.b.b.b.a ENSGT00940000163342.b.a.d.b.b.b.b Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000158523.c.a ENSGT00940000162955 ENSGT00940000164549.a.a ENSGT00940000154471.a.b.a.a.b.b ENSGT00940000168452 ENSGT00940000164282.a ENSGT00940000158892.b.i.b ENSGT00940000157161.a.b ENSGT00940000157794 ENSGT00940000161421 ENSGT00940000168503.B ENSGT00940000160255 ENSGT00660000097455 ENSGT00530000063687.b.b.a ##20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.b #22 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189.pb.b ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.b.a.a.t.b ENSGT00940000163342.b.a.c.b ENSGT00940000163342.a.b.a.a.t.a ENSGT00940000163342.b.a.d.b.b.a.b.b ENSGT00940000163342.b.a.d.b.b.a.b.a ENSGT00940000163342.b.a.d.b.b.b.a.b.b ENSGT00940000163342.b.a.d.b.b.b.b Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000158523.c.a ENSGT00940000162955 ENSGT00940000164549.a.a ENSGT00940000154471.a.b.a.a.b.b ENSGT00940000168452 ENSGT00940000164282.a ENSGT00940000158892.b.i.b ENSGT00940000157161.a.b ENSGT00940000157794 ENSGT00940000161421 ENSGT00940000168503.B ENSGT00940000160255 ENSGT00660000097455 ENSGT00530000063687.b.b.a ##20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.b #22 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189.pb.b ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.b.a.a.t.b ENSGT00940000163342.a.b.a.a.t.a ENSGT00940000163342.b.a.d.b.b.a.b.b.c ENSGT00940000163342.b.a.d.b.b.a.b.b.d ENSGT00940000163342.b.a.d.b.b.a.b.a ENSGT00940000163342.b.a.d.b.b.b.a.b.b ENSGT00940000163342.b.a.d.b.b.b.b Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000158523.c.a ENSGT00940000162955 ENSGT00940000164549.a.a ENSGT00940000154471.a.b.a.a.b.b ENSGT00940000168452 ENSGT00940000164282.a ENSGT00940000158892.b.i.b ENSGT00940000157161.a.b ENSGT00940000157794 ENSGT00940000161421 ENSGT00940000168503.B ENSGT00940000160255 ENSGT00530000063687.b.b.a ##20 ENSGT00660000097455 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.b #22 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189.pb.b ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.b.a.a.t.b ENSGT00940000163342.a.b.a.a.t.a ENSGT00940000163342.b.a.d.b.b.a.b.b.c ENSGT00940000163342.b.a.d.b.b.b.a.b.b ENSGT00940000163342.b.a.d.b.b.b.b ENSGT00940000163342.b.a.d.b.a.a ENSGT00940000163342.b.a.d.b.b.a.a Zebra mbuna MODERN SPECIES 1103 zgc:171857 (ENSMZEG00005025886) ENSMZEG00005025883 BICD2 (ENSMZEG00005025878) ENSMZEG00005025875 ENSMZEG00005025872 ENSMZEG00005025870 ENSMZEG00005025867 ENSMZEG00005025842 BRPF1 (ENSMZEG00005025832) ENSMZEG00005025826 ENSMZEG00005025823 CRELD1 (ENSMZEG00005025820) ENSMZEG00005025818 ##20 ENSMZEG00005025816 IFT122 (ENSMZEG00005025809) #21 exorh (ENSMZEG00005000753) #22 PLXND1 (ENSMZEG00005000320) #24 TMCC1 (ENSMZEG00005000257) trh (ENSMZEG00005000237) RBSN (ENSMZEG00005000219) mrps25 (ENSMZEG00005000200) nr2c2 (ENSMZEG00005000121) B3GALT4 (ENSMZEG00005000102) wdr46 (ENSMZEG00005000085) ENSMZEG00005000074 ENSMZEG00005024885 ENSMZEG00005024231 ENSMZEG00005024223 ENSMZEG00005024218 ENSMZEG00005024213 ENSMZEG00005024212 P. nyererei MODERN SPECIES 531 WNT7A (ENSPNYG00000005254) zgc:171857 (ENSPNYG00000005269) ENSPNYG00000005294 BICD2 (ENSPNYG00000005388) ENSPNYG00000005435 ENSPNYG00000005454 ENSPNYG00000005474 ENSPNYG00000005498 BRPF1 (ENSPNYG00000005540) ENSPNYG00000005584 ENSPNYG00000005617 CRELD1 (ENSPNYG00000005664) ENSPNYG00000005693 ENSPNYG00000005711 ##20 IFT122 (ENSPNYG00000005734) #21 exorh (ENSPNYG00000006451) #22 PLXND1 (ENSPNYG00000010311) #24 TMCC1 (ENSPNYG00000010356) trh (ENSPNYG00000010407) RBSN (ENSPNYG00000010478) mrps25 (ENSPNYG00000010498) nr2c2 (ENSPNYG00000010516) B3GALT4 (ENSPNYG00000010537) wdr46 (ENSPNYG00000010545) ENSPNYG00000010568 ENSPNYG00000010662 ENSPNYG00000011148 ENSPNYG00000011799 ENSPNYG00000011813 Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 527 zgc:171857 (ENSHBUG00000021967) ENSHBUG00000022074 BICD2 (ENSHBUG00000022158) ENSHBUG00000022176 ENSHBUG00000022185 ENSHBUG00000022201 ENSHBUG00000022206 ENSHBUG00000022254 BRPF1 (ENSHBUG00000022319) ENSHBUG00000022337 ENSHBUG00000022349 CRELD1 (ENSHBUG00000022362) ENSHBUG00000022374 ##20 ENSHBUG00000022401 IFT122 (ENSHBUG00000022481) #21 exorh (ENSHBUG00000022500) #22 PLXND1 (ENSHBUG00000022641) #24 TMCC1 (ENSHBUG00000022747) trh (ENSHBUG00000022787) RBSN (ENSHBUG00000022796) mrps25 (ENSHBUG00000022813) nr2c2 (ENSHBUG00000022856) B3GALT4 (ENSHBUG00000022866) wdr46 (ENSHBUG00000022883) ENSHBUG00000022891 ENSHBUG00000022910 ENSHBUG00000022930 ENSHBUG00000022953 Lyretail cichlid MODERN SPECIES 334 zgc:171857 (ENSNBRG00000021856) ENSNBRG00000021804 BICD2 (ENSNBRG00000021765) FGD3 (ENSNBRG00000021738) ENSNBRG00000021708 ENSNBRG00000021693 ENSNBRG00000021650 ENSNBRG00000021634 BRPF1 (ENSNBRG00000021603) ENSNBRG00000021566 ENSNBRG00000021534 CRELD1 (ENSNBRG00000021509) ENSNBRG00000021489 ##20 ENSNBRG00000021469 IFT122 (ENSNBRG00000021383) #21 exorh (ENSNBRG00000019945) #22 PLXND1 (ENSNBRG00000019706) #24 TMCC1 (ENSNBRG00000019669) trh (ENSNBRG00000019607) RBSN (ENSNBRG00000019589) mrps25 (ENSNBRG00000019573) nr2c2 (ENSNBRG00000019536) B3GALT4 (ENSNBRG00000019529) wdr46 (ENSNBRG00000019455) ENSNBRG00000019272 ENSNBRG00000019227 ENSNBRG00000019220 ENSNBRG00000018980 ENSNBRG00000018938 ENSNBRG00000018334 ENSNBRG00000018164 Nile tilapia MODERN SPECIES 12 zgc:171857 (ENSONIG00000017191) ENSONIG00000017192 BICD2 (ENSONIG00000017193) ENSONIG00000017195 ENSONIG00000017197 ENSONIG00000017198 ENSONIG00000017200 ENSONIG00000017202 BRPF1 (ENSONIG00000017204) ENSONIG00000037042 ENSONIG00000027927 CRELD1 (ENSONIG00000017206) ENSONIG00000039922 ENSONIG00000017212 ##20 IFT122 (ENSONIG00000017213) #21 exorh (ENSONIG00000017219) #22 PLXND1 (ENSONIG00000017220) #24 TMCC1 (ENSONIG00000017228) trh (ENSONIG00000017229) RBSN (ENSONIG00000017232) mrps25 (ENSONIG00000017238) nr2c2 (ENSONIG00000017240) B3GALT4 (ENSONIG00000021141) wdr46 (ENSONIG00000017243) sult1st3 (ENSONIG00000039142) ENSONIG00000028103 ENSONIG00000017258 ENSONIG00000043155 ENSONIG00000039507 ENSONIG00000039747 ENSONIG00000042997 Midas cichlid MODERN SPECIES 732 zgc:171857 (ENSACIG00000003897) ENSACIG00000003923 BICD2 (ENSACIG00000003992) FGD3 (ENSACIG00000004039) ENSACIG00000004152 ENSACIG00000004171 ENSACIG00000004211 WNK2 (ENSACIG00000004233) BRPF1 (ENSACIG00000004291) ENSACIG00000004329 ENSACIG00000004345 CRELD1 (ENSACIG00000004374) ENSACIG00000004411 ENSACIG00000004429 ##20 IFT122 (ENSACIG00000004449) #21 exorh (ENSACIG00000004619) #22 PLXND1 (ENSACIG00000007593) #24 trh (ENSACIG00000007687) RBSN (ENSACIG00000007763) mrps25 (ENSACIG00000007796) nr2c2 (ENSACIG00000007808) ENSACIG00000007847 wdr46 (ENSACIG00000007854) Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000162955 ENSGT00940000164549.a.a ENSGT00940000154471.a.b.a.a.b.b ENSGT00940000159597 ENSGT00940000168452 ENSGT00940000164282.a ENSGT00940000158892.b.i.b ENSGT00940000157161.a.b ENSGT00940000157794 ENSGT00940000161421 ENSGT00940000168503.B ENSGT00940000160255 ENSGT00660000097455 ENSGT00530000063687.b.b.a ##20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.b #22 ENSGT00930000152979 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189.pb.b ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.b.a.a ENSGT00940000163342.a.b.a.b.b ENSGT00940000163342.b.a.c.a ENSGT00730000111360.a ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 200 ENSGT00940000160255 ENSGT00660000097455 ENSGT00530000063687.b.b.a ##20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.b #22 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189.pb.b ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.b.a.a.o ENSGT00940000163342.a.b.a.b.b Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 216 ENSGT00940000160255 ENSGT00660000097455 ENSGT00530000063687.b.b.a ##20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.b #22 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189.pb.b ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.b.a.a.o ENSGT00940000163342.a.b.a.b.b ENSGT00390000011466 ENSGT00940000155606.b ENSGT00940000158666.a.b Clown anemonefish MODERN SPECIES 1063 CRELD1 (ENSAOCG00000001153) ENSAOCG00000016643 ENSAOCG00000001157 ##20 IFT122 (ENSAOCG00000016754) #21 exorh (ENSAOCG00000016801) #22 PLXND1 (ENSAOCG00000016853) #24 TMCC1 (ENSAOCG00000016898) trh (ENSAOCG00000016914) RBSN (ENSAOCG00000016994) mrps25 (ENSAOCG00000017022) nr2c2 (ENSAOCG00000017082) ENSAOCG00000017093 wdr46 (ENSAOCG00000001181) ENSAOCG00000017147 ENSAOCG00000017164 ENSAOCG00000017266 prim1 (ENSAOCG00000017330) ddx23 (ENSAOCG00000017348) rnd1a (ENSAOCG00000017378) Orange clownfish MODERN SPECIES 22 FGD3 (ENSAPEG00000015625) ENSAPEG00000015636 ENSAPEG00000015643 NINJ1 (ENSAPEG00000015654) WNK2 (ENSAPEG00000015669) BRPF1 (ENSAPEG00000015709) ENSAPEG00000015774 ENSAPEG00000015823 ENSAPEG00000015886 BRPF1 (ENSAPEG00000015943) ENSAPEG00000016042 CRELD1 (ENSAPEG00000016084) ENSAPEG00000016109 ENSAPEG00000016131 ##20 IFT122 (ENSAPEG00000016146) #21 exorh (ENSAPEG00000016240) #22 PLXND1 (ENSAPEG00000016271) #24 TMCC1 (ENSAPEG00000016424) trh (ENSAPEG00000016502) RBSN (ENSAPEG00000016516) mrps25 (ENSAPEG00000016566) nr2c2 (ENSAPEG00000016591) ENSAPEG00000016647 wdr46 (ENSAPEG00000016705) ENSAPEG00000016715 ENSAPEG00000016725 ENSAPEG00000016764 ENSAPEG00000016775 prim1 (ENSAPEG00000016812) ddx23 (ENSAPEG00000016857) rnd1a (ENSAPEG00000016875) Spiny chromis MODERN SPECIES 57 ENSAPOG00000021574 ENSAPOG00000021626 COQ8A (ENSAPOG00000021640) STUM (ENSAPOG00000001019) ENSAPOG00000021661 ENSAPOG00000021668 ##20 IFT122 (ENSAPOG00000021814) #21 exorh (ENSAPOG00000021829) #22 PLXND1 (ENSAPOG00000021880) #24 TMCC1 (ENSAPOG00000021915) trh (ENSAPOG00000021930) RBSN (ENSAPOG00000021975) mrps25 (ENSAPOG00000022005) nr2c2 (ENSAPOG00000022068) ENSAPOG00000000627 B3GALT4 (ENSAPOG00000022095) ENSAPOG00000022109 rad51d (ENSAPOG00000022131) tmem132e (ENSAPOG00000022142) Bicolor damselfish MODERN SPECIES 854 ENSSPAG00000020262 ENSSPAG00000020242 ##20 CRELD1 (ENSSPAG00000020232) IFT122 (ENSSPAG00000020175) #21 exorh (ENSSPAG00000012452) #22 ENSSPAG00000011896 ENSSPAG00000011874 #24 TMCC1 (ENSSPAG00000011820) trh (ENSSPAG00000011774) RBSN (ENSSPAG00000011709) mrps25 (ENSSPAG00000011672) nr2c2 (ENSSPAG00000011625) ENSSPAG00000011618 wdr46 (ENSSPAG00000011591) ENSSPAG00000011310 ENSSPAG00000011240 ENSSPAG00000010964 ENSSPAG00000010926 ENSSPAG00000010910 ogg1 (ENSSPAG00000010888) Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000162955 ENSGT00940000164549.a.a ENSGT00940000154471.a.b.a.a.b.b ENSGT00940000159597 ENSGT00940000168452 ENSGT00940000164282.a ENSGT00940000158892.b.i.b ENSGT00940000157161.a.b ENSGT00940000157794 ENSGT00940000161421 ENSGT00940000168503.B ENSGT00940000160255 ENSGT00660000097455 ENSGT00530000063687.b.b.a ##20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.b #22 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189.pb.b ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.b.a.a ENSGT00940000163342.b.a ENSGT00940000163342.b.b ENSGT00730000111360.a ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 ENSGT00940000155241.c Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000162955 ENSGT00940000164549.a.a ENSGT00940000154471.a.b.a.a.b.b ENSGT00940000159597 ENSGT00940000168452 ENSGT00940000164282.a ENSGT00940000158892.b.i.b ENSGT00940000157161.a.b ENSGT00940000157794 ENSGT00940000161421 ENSGT00940000168503.B ENSGT00940000160255 ENSGT00660000097455 ENSGT00530000063687.b.b.a ##20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.b #22 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189.pb.b ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.b.a.a ENSGT00940000163342.b.a ENSGT00940000163342.a.b.a.b.b ENSGT00730000111360.a ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 ENSGT00940000155241.c Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000158523.c.a ENSGT00940000162955 ENSGT00940000164549.a.a ENSGT00940000154471.a.b.a.a.b.b ENSGT00940000159597 ENSGT01030000235645 ENSGT00940000164282.a ENSGT00940000157161.a.b ENSGT00940000157794 ENSGT00940000161421 ENSGT00730000111286 ENSGT00940000160255 ENSGT00940000179063 ENSGT00530000063687.b.b.a ##20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.b #22 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189.pb.b ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.b.a.a ENSGT00940000163342.b.a ENSGT00940000163342.a.b.a.b.b ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 ENSGT00940000155241.c ENSGT00940000154814.b Tetraodon MODERN SPECIES 24 NUP210 (ENSTNIG00000017937) FBLN2 (ENSTNIG00000017936) WNT7A (ENSTNIG00000017935) zgc:171857 (ENSTNIG00000000393) ENSTNIG00000017934 BICD2 (ENSTNIG00000017933) FGD3 (ENSTNIG00000017932) ENSTNIG00000001362 ENSTNIG00000017931 BRPF1 (ENSTNIG00000017930) ENSTNIG00000000358 ENSTNIG00000017929 CRELD1 (ENSTNIG00000017928) ENSTNIG00000017927 ##20 IFT122 (ENSTNIG00000017926) #21 exorh (ENSTNIG00000017925) #22 PLXND1 (ENSTNIG00000017924) #24 TMCC1 (ENSTNIG00000017923) trh (ENSTNIG00000017922) RBSN (ENSTNIG00000017921) mrps25 (ENSTNIG00000017920) nr2c2 (ENSTNIG00000017919) ENSTNIG00000017918 wdr46 (ENSTNIG00000017917) sult1st3 (ENSTNIG00000017915) ENSTNIG00000017916 ogg1 (ENSTNIG00000017914) qars1 (ENSTNIG00000017913) QRICH1 (ENSTNIG00000017912) ENSTNIG00000017911 prickle2a (ENSTNIG00000017910) Fugu MODERN SPECIES 15 zgc:171857 (ENSTRUG00000008671) ENSTRUG00000008689 BICD2 (ENSTRUG00000008866) FGD3 (ENSTRUG00000009033) ENSTRUG00000009573 ENSTRUG00000029197 ENSTRUG00000009590 ENSTRUG00000032059 BRPF1 (ENSTRUG00000009699) ENSTRUG00000023076 ENSTRUG00000009944 CRELD1 (ENSTRUG00000022535) ENSTRUG00000026775 ENSTRUG00000010124 ##20 IFT122 (ENSTRUG00000010146) #21 rho (ENSTRUG00000010617) #22 PLXND1 (ENSTRUG00000010718) #24 TMCC1 (ENSTRUG00000011412) trh (ENSTRUG00000011453) RBSN (ENSTRUG00000022554) mrps25 (ENSTRUG00000011566) nr2c2 (ENSTRUG00000011580) ENSTRUG00000011725 wdr46 (ENSTRUG00000011745) ENSTRUG00000003656 ENSTRUG00000001170 ENSTRUG00000000731 ENSTRUG00000025178 ENSTRUG00000024150 ENSTRUG00000003123 ogg1 (ENSTRUG00000003379) Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000162955 ENSGT00940000164549.a.a ENSGT00940000154471.a.b.a.a.b.b ENSGT00940000159597 ENSGT00940000168452 ENSGT00940000164282.a ENSGT00940000158892.b.i.b ENSGT00940000157161.a.b ENSGT00940000157794 ENSGT00940000161421 ENSGT00940000168503.B ENSGT00940000160255 ENSGT00660000097455 ENSGT00530000063687.b.b.a ##20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.b #22 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189.pb.b ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.b.a.a ENSGT00940000163342.b.a ENSGT00940000163342.a.b.a.b.b ENSGT00730000111360.a ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 ENSGT00940000155241.c Ballan wrasse MODERN SPECIES 26 zgc:171857 (ENSLBEG00000006494) ENSLBEG00000006398 BICD2 (ENSLBEG00000006328) FGD3 (ENSLBEG00000006231) ENSLBEG00000006185 ENSLBEG00000006155 ENSLBEG00000006123 WNK2 (ENSLBEG00000006022) BRPF1 (ENSLBEG00000005929) ENSLBEG00000005810 ENSLBEG00000005735 CRELD1 (ENSLBEG00000005708) ENSLBEG00000005683 ENSLBEG00000005669 ##20 IFT122 (ENSLBEG00000005516) #21 exorh (ENSLBEG00000005459) #22 PLXND1 (ENSLBEG00000005350) #24 TMCC1 (ENSLBEG00000005271) trh (ENSLBEG00000005242) mrps25 (ENSLBEG00000005216) RBSN (ENSLBEG00000005180) ENSLBEG00000005163 ENSLBEG00000004989 Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000162955 ENSGT00940000164549.a.a ENSGT00940000154471.a.b.a.a.b.b ENSGT00940000159597 ENSGT00940000168452 ENSGT00940000164282.a ENSGT00940000158892.b.i.b ENSGT00940000157161.a.b ENSGT00940000157794 ENSGT00940000161421 ENSGT00940000168503.B ENSGT00940000160255 ENSGT00660000097455 ENSGT00530000063687.b.b.a ##20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.b #22 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189.pb.b ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.b.a.a ENSGT00940000163342.b.a ENSGT00940000163342.a.b.a.b.b ENSGT00730000111360.a ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 ENSGT00940000155241.c Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000164549.a.a ENSGT00940000154471.a.b.a.a.b.b ENSGT00940000159597 ENSGT00940000168452 ENSGT00940000164282.a ENSGT00940000158892.b.i.b ENSGT00940000157161.a.b.j ENSGT00940000157794 ENSGT00940000161421 ENSGT00940000168503.B ENSGT00940000160255 ENSGT00660000097455 ENSGT00940000179063 ENSGT00530000063687.b.b.a ##20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.b #22 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189.pb.b ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.b.a.a ENSGT00940000163342.b.a ENSGT00940000163342.a.b.a.b.b ENSGT00730000111360.a ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 ENSGT00940000155241.c Gilthead seabream MODERN SPECIES 21 zgc:171857 (ENSSAUG00010013155) ENSSAUG00010013152 BICD2 (ENSSAUG00010012894) ENSSAUG00010012891 ENSSAUG00010012889 ENSSAUG00010012888 ENSSAUG00010012887 ENSSAUG00010012885 ENSSAUG00010012884 BRPF1 (ENSSAUG00010012817) ENSSAUG00010012815 ENSSAUG00010012814 CRELD1 (ENSSAUG00010012811) ENSSAUG00010012809 IFT122 (ENSSAUG00010012507) #21 exorh (ENSSAUG00010012479) #22 PLXND1 (ENSSAUG00010011902) #24 TMCC1 (ENSSAUG00010011888) trh (ENSSAUG00010011884) RBSN (ENSSAUG00010011722) mrps25 (ENSSAUG00010011715) nr2c2 (ENSSAUG00010011630) ENSSAUG00010011629 wdr46 (ENSSAUG00010011621) ENSSAUG00010011611 nt5dc2 (ENSSAUG00010011417) rap1gapa (ENSSAUG00010011409) aurkaip1 (ENSSAUG00010011407) mxra8b (ENSSAUG00010011406) dvl1b (ENSSAUG00010010210) tnfrsf9a (ENSSAUG00010010188) Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000162955 ENSGT00940000164549.a.a ENSGT00940000154471.a.b.a.a.b.b ENSGT00940000159597 ENSGT00940000168452 ENSGT00940000164282.a ENSGT00940000158892.b.i.b ENSGT00940000157161.a.b.j ENSGT00940000157794 ENSGT00940000161421 ENSGT00940000168503.B ENSGT00940000160255 ENSGT00940000179063 ENSGT00530000063687.b.b.a ##20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.b #22 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189.pb.b ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.b.a.a ENSGT00940000163342.b.a ENSGT00940000163342.a.b.a.b.b ENSGT00730000111360.a ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 ENSGT00940000155241.c European seabass MODERN SPECIES 14 zgc:171857 (ENSDLAG00005008532) ENSDLAG00005008548 ENSDLAG00005008696 ENSDLAG00005008852 ENSDLAG00005027932 ENSDLAG00005009176 ENSDLAG00005031065 ENSDLAG00005009188 ENSDLAG00005009222 ENSDLAG00005009228 ENSDLAG00005009246 ENSDLAG00005009295 ENSDLAG00005009317 ENSDLAG00005035111 ##20 IFT122 (ENSDLAG00005009407) #21 exorh (ENSDLAG00005009507) #22 PLXND1 (ENSDLAG00005009532) #24 TMCC1 (ENSDLAG00005009862) trh (ENSDLAG00005009871) ENSDLAG00005009879 nr2c2 (ENSDLAG00005009955) ENSDLAG00005010075 wdr46 (ENSDLAG00005026705) ENSDLAG00005010203 ENSDLAG00005010241 ENSDLAG00005010413 ENSDLAG00005010529 ENSDLAG00005034137 qars1 (ENSDLAG00005010569) ENSDLAG00005011036 ENSDLAG00005029930 Large yellow croaker MODERN SPECIES 18 zgc:171857 (ENSLCRG00005006407) ENSLCRG00005006368 BICD2 (ENSLCRG00005006354) FGD3 (ENSLCRG00005006289) ENSLCRG00005006285 ENSLCRG00005006274 NINJ1 (ENSLCRG00005006270) WNK2 (ENSLCRG00005006266) BRPF1 (ENSLCRG00005006259) ENSLCRG00005006251 ENSLCRG00005006244 CRELD1 (ENSLCRG00005006235) ENSLCRG00005006232 ENSLCRG00005006229 ##20 IFT122 (ENSLCRG00005005928) #21 exorh (ENSLCRG00005005920) #22 ENSLCRG00005005919 PLXND1 (ENSLCRG00005005888) #24 trh (ENSLCRG00005005876) RBSN (ENSLCRG00005005874) mrps25 (ENSLCRG00005005871) nr2c2 (ENSLCRG00005005851) ENSLCRG00005005846 wdr46 (ENSLCRG00005005768) ENSLCRG00005005764 ENSLCRG00005005642 Perciformes ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000162955 ENSGT00940000164549.a.a ENSGT00940000154471.a.b.a.a.b.b ENSGT00940000159597 ENSGT00940000168452 ENSGT00940000164282.a ENSGT01010000229954 ENSGT00940000157161.a.b.g ENSGT00940000157794 ENSGT00940000161421 ENSGT00940000168503.B ENSGT00940000160255 ENSGT00660000097455 ENSGT00530000063687.b.b.a ##20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.b #22 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189.pb.b ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.b.a.a ENSGT00940000163342.a.b.a.b.b ENSGT00730000111360.a ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 ENSGT00940000155241.c ENSGT00940000164079 Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000162955 ENSGT00940000164549.a.a ENSGT00940000154471.a.b.a.a.b.b ENSGT00940000159597 ENSGT00940000168452 ENSGT00940000164282.a ENSGT01010000229954 ENSGT00940000157161.a.b.g ENSGT00940000157794 ENSGT00940000161421 ENSGT00940000168503.B ENSGT00940000160255 ENSGT00660000097455 ENSGT00530000063687.b.b.a ##20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.b #22 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189.pb.b ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.b.a.a ENSGT00730000111360.a ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 ENSGT00940000155241.c ENSGT00390000016228.b ENSGT00940000153629.a.a.a Lumpfish MODERN SPECIES 22 zgc:171857 (ENSCLMG00005018983) ENSCLMG00005018985 BICD2 (ENSCLMG00005018986) FGD3 (ENSCLMG00005018989) ENSCLMG00005019085 ENSCLMG00005019086 ENSCLMG00005019087 ENSCLMG00005019090 BRPF1 (ENSCLMG00005019092) ENSCLMG00005019103 ENSCLMG00005019104 CRELD1 (ENSCLMG00005019105) ENSCLMG00005019107 ENSCLMG00005019108 ##20 IFT122 (ENSCLMG00005019109) #21 exorh (ENSCLMG00005002977) #22 PLXND1 (ENSCLMG00005003063) #24 TMCC1 (ENSCLMG00005003612) trh (ENSCLMG00005003615) RBSN (ENSCLMG00005003623) mrps25 (ENSCLMG00005003863) nr2c2 (ENSCLMG00005003864) B3GALT4 (ENSCLMG00005003866) wdr46 (ENSCLMG00005003869) sult1st3 (ENSCLMG00005003979) ENSCLMG00005003982 ogg1 (ENSCLMG00005003983) qars1 (ENSCLMG00005003995) QRICH1 (ENSCLMG00005004174) ENSCLMG00005004175 ENSCLMG00005004176 Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000162955 ENSGT00940000164549.a.a ENSGT00940000154471.a.b.a.a.b.b ENSGT00940000159438 ENSGT00940000157503.j ENSGT00940000168452 ENSGT00940000164282.a ENSGT00940000157161.a.b.g ENSGT00940000157794 ENSGT00940000161421 ENSGT00940000168503.B ENSGT00940000160255 ENSGT00660000097455 ENSGT00530000063687.b.b.a ##20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.b #22 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189.pb.b ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.b.a.a ENSGT00940000163342.a.b.a.b.b ENSGT00730000111360.a ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 ENSGT00940000155241.c ENSGT00940000164079 Pike perch MODERN SPECIES 31 ENSSLUG00000001665 BICD2 (ENSSLUG00000001602) ENSSLUG00000001463 ENSSLUG00000001444 ENSSLUG00000001441 ENSSLUG00000023233 ENSSLUG00000023230 ENSSLUG00000023225 BRPF1 (ENSSLUG00000023217) ENSSLUG00000023184 ENSSLUG00000023181 CRELD1 (ENSSLUG00000023171) ENSSLUG00000023165 ENSSLUG00000023164 ##20 IFT122 (ENSSLUG00000022036) #21 exorh (ENSSLUG00000021970) #22 PLXND1 (ENSSLUG00000021847) #24 TMCC1 (ENSSLUG00000021808) trh (ENSSLUG00000021796) RBSN (ENSSLUG00000021654) mrps25 (ENSSLUG00000021639) nr2c2 (ENSSLUG00000021614) ENSSLUG00000021608 wdr46 (ENSSLUG00000021597) ENSSLUG00000021580 ENSSLUG00000021468 ENSSLUG00000021458 ogg1 (ENSSLUG00000021455) qars1 (ENSSLUG00000021327) QRICH1 (ENSSLUG00000021268) ENSSLUG00000021261 Channel bull blenny MODERN SPECIES 21 BICD2 (ENSCGOG00000020666) ENSCGOG00000020673 ENSCGOG00000020840 ENSCGOG00000020843 ENSCGOG00000020849 ENSCGOG00000003853 ENSCGOG00000003881 BRPF1 (ENSCGOG00000003910) ENSCGOG00000003987 ENSCGOG00000003995 ENSCGOG00000003996 CRELD1 (ENSCGOG00000004006) ENSCGOG00000004154 ENSCGOG00000004161 ##20 IFT122 (ENSCGOG00000004195) #21 exorh (ENSCGOG00000004974) #22 PLXND1 (ENSCGOG00000005002) #24 TMCC1 (ENSCGOG00000005176) trh (ENSCGOG00000005180) RBSN (ENSCGOG00000005194) mrps25 (ENSCGOG00000005370) nr2c2 (ENSCGOG00000005378) ENSCGOG00000005438 wdr46 (ENSCGOG00000005451) ENSCGOG00000005490 ENSCGOG00000005496 ENSCGOG00000005506 ENSCGOG00000005517 ogg1 (ENSCGOG00000005521) qars1 (ENSCGOG00000005587) QRICH1 (ENSCGOG00000007379) Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000164549.a.a ENSGT00940000154471.a.b.a.a.b.b ENSGT00940000159597 ENSGT00940000168452 ENSGT00940000164282.a ENSGT00940000158892.b.i.b ENSGT00940000157161.a.b ENSGT00940000157794 ENSGT00940000161421 ENSGT00940000168503.B ENSGT00730000111286 ENSGT00940000160255 ENSGT00660000097455 ENSGT00530000063687.b.b.a ##20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.b #22 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189.pb.b ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.b.a.a ENSGT00940000163342.b.a ENSGT00940000163342.b.b ENSGT00730000111360.a ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 ENSGT00940000155241.c Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000162955 ENSGT00940000164549.a.a ENSGT00940000154471.a.b.a.a.b.b ENSGT00940000159597 ENSGT00940000168452 ENSGT00940000164282.a ENSGT00940000158892.b.i.b ENSGT00940000157161.a.b ENSGT00940000157794 ENSGT00940000161421 ENSGT00730000111286 ENSGT00940000160255 ENSGT00660000097455 ENSGT00530000063687.b.b.a ##20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.b #22 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189.pb.b ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.b.a.a ENSGT00940000163342.b.a ENSGT00940000163342.b.b ENSGT00730000111360.a ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 ENSGT00940000155241.c Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000162955 ENSGT00940000164549.a.a ENSGT00940000154471.a.b.a.a.b.b ENSGT00940000159597 ENSGT00940000168452 ENSGT00940000164282.a ENSGT00940000158892.b.i.b ENSGT00940000157161.a.b ENSGT00940000157794 ENSGT00940000161421 ENSGT00940000168503.B ENSGT00940000160255 ENSGT00660000097455 ENSGT00530000063687.b.b.a ##20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.b #22 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189.pb.b ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.b.a.a ENSGT00940000163342.b.a ENSGT00940000163342.b.b ENSGT00730000111360.a ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 ENSGT00940000155241.c Climbing perch MODERN SPECIES 20 ENSATEG00000015120 zgc:171857 (ENSATEG00000015110) ENSATEG00000015065 FGD3 (ENSATEG00000014910) ENSATEG00000014884 ENSATEG00000014866 ENSATEG00000014845 ENSATEG00000028766 ENSATEG00000014715 ENSATEG00000014675 ENSATEG00000014659 ENSATEG00000014609 ENSATEG00000014603 ENSATEG00000014594 ##20 IFT122 (ENSATEG00000014483) #21 exorh (ENSATEG00000009473) #22 PLXND1 (ENSATEG00000009264) #24 TMCC1 (ENSATEG00000009224) trh (ENSATEG00000009215) ENSATEG00000028613 mrps25 (ENSATEG00000009141) nr2c2 (ENSATEG00000009047) ENSATEG00000009032 wdr46 (ENSATEG00000009023) ENSATEG00000008967 ENSATEG00000008954 ENSATEG00000008943 ENSATEG00000030071 ENSATEG00000008904 qars1 (ENSATEG00000008797) ENSATEG00000008718 Siamese fighting fish MODERN SPECIES 18 FBLN2 (ENSBSLG00000012590) WNT7A (ENSBSLG00000013059) zgc:171857 (ENSBSLG00000013102) ENSBSLG00000013265 BICD2 (ENSBSLG00000013666) FGD3 (ENSBSLG00000014105) ENSBSLG00000014448 NINJ1 (ENSBSLG00000014476) WNK2 (ENSBSLG00000014520) BRPF1 (ENSBSLG00000014570) ENSBSLG00000014665 CRELD1 (ENSBSLG00000014702) ENSBSLG00000014779 ENSBSLG00000014789 ##20 IFT122 (ENSBSLG00000014801) #21 exorh (ENSBSLG00000015044) #22 PLXND1 (ENSBSLG00000015054) #24 TMCC1 (ENSBSLG00000015463) trh (ENSBSLG00000015661) RBSN (ENSBSLG00000015683) mrps25 (ENSBSLG00000015708) nr2c2 (ENSBSLG00000015728) B3GALT4 (ENSBSLG00000015756) wdr46 (ENSBSLG00000015764) ENSBSLG00000015859 ENSBSLG00000016083 ENSBSLG00000016094 ENSBSLG00000016108 ENSBSLG00000016123 ENSBSLG00000016130 ENSBSLG00000016164 Zig-zag eel MODERN SPECIES 21 zgc:171857 (ENSMAMG00000024099) ENSMAMG00000024098 ENSMAMG00000024097 ENSMAMG00000024096 ENSMAMG00000024095 ENSMAMG00000024094 ENSMAMG00000024093 ENSMAMG00000027098 ENSMAMG00000024090 ENSMAMG00000024089 ENSMAMG00000024088 CRELD1 (ENSMAMG00000024087) ENSMAMG00000024086 ENSMAMG00000024084 ##20 IFT122 (ENSMAMG00000024083) #21 exorh (ENSMAMG00000013645) #22 PLXND1 (ENSMAMG00000013234) #24 TMCC1 (ENSMAMG00000013203) trh (ENSMAMG00000013128) ENSMAMG00000025442 mrps25 (ENSMAMG00000013121) nr2c2 (ENSMAMG00000013058) ENSMAMG00000013047 wdr46 (ENSMAMG00000012974) sult1st3 (ENSMAMG00000012921) ENSMAMG00000012899 ENSMAMG00000026158 ENSMAMG00000012857 qars1 (ENSMAMG00000012801) ENSMAMG00000012785 ENSMAMG00000012769 Carangaria ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000162955 ENSGT00940000164549.a.a ENSGT00940000154471.a.b.a.a.b.b ENSGT00940000159597 ENSGT00940000168452 ENSGT00940000164282.a ENSGT00940000158892.b.i.b ENSGT00940000157161.a.b ENSGT00940000157794 ENSGT00940000161421 ENSGT00940000168503.B ENSGT00940000160255 ENSGT00660000097455 ENSGT00530000063687.b.b.a ##20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.b #22 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189.pb.b ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.b.a.a ENSGT00940000163342.a.b.a.b.b ENSGT00940000163342.b.a ENSGT00940000163342.b.b ENSGT00730000111360.a ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT00940000162955 ENSGT00940000164549.a.a ENSGT00940000154471.a.b.a.a.b.b ENSGT00940000159597 ENSGT00940000168452 ENSGT00940000164282.a ENSGT00940000158892.b.i.b ENSGT00940000157161.a.b ENSGT00940000157794 ENSGT00940000161421 ENSGT00940000168503.B ENSGT00940000160255 ENSGT00660000097455 ENSGT00530000063687.b.b.a ##20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.b #22 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189.pb.b ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.b.a ENSGT00730000111360.a ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 ENSGT00940000155241.c ENSGT00940000164079 ENSGT00390000016228.b Turbot MODERN SPECIES 2 cnbpa (ENSSMAG00000029786) ENSSMAG00000032588 ENSSMAG00000012972 ENSSMAG00000012928 tsr2 (ENSSMAG00000012882) SRPK3 (ENSSMAG00000012744) ENSSMAG00000012623 ##24 abcd1 (ENSSMAG00000012522) ENSSMAG00000012502 ENSSMAG00000012466 ENSSMAG00000012458 ##20 ENSSMAG00000012446 ENSSMAG00000012438 ENSSMAG00000012385 IFT122 (ENSSMAG00000012276) #21 exorh (ENSSMAG00000012265) #22 PLXND1 (ENSSMAG00000012111) #24 TMCC1 (ENSSMAG00000012052) trh (ENSSMAG00000012040) ENSSMAG00000012023 mrps25 (ENSSMAG00000022586) nr2c2 (ENSSMAG00000011972) ENSSMAG00000011963 wdr46 (ENSSMAG00000011942) ENSSMAG00000011921 ENSSMAG00000011909 ENSSMAG00000011897 ENSSMAG00000011758 ENSSMAG00000011743 ENSSMAG00000011702 ENSSMAG00000022952 Tongue sole MODERN SPECIES 1 pcbp4 (ENSCSEG00000021041) DOCK3 (ENSCSEG00000021042) DCAF1 (ENSCSEG00000021043) ssuh2rs1 (ENSCSEG00000021044) rpl32 (ENSCSEG00000021045) BICD2 (ENSCSEG00000021046) ENSCSEG00000021047 ENSCSEG00000021048 ENSCSEG00000021049 BRPF1 (ENSCSEG00000021109) ENSCSEG00000021111 CRELD1 (ENSCSEG00000021112) ENSCSEG00000021113 ENSCSEG00000021114 ##20 IFT122 (ENSCSEG00000021116) #21 exorh (ENSCSEG00000021130) #22 TMCC1 (ENSCSEG00000021293) trh (ENSCSEG00000021294) pabpc1l (ENSCSEG00000021295) YWHAB (ENSCSEG00000021297) ognb (ENSCSEG00000021298) UQCC5 (ENSCSEG00000021299) kctd6b (ENSCSEG00000021300) abhd6b (ENSCSEG00000021302) slmapb (ENSCSEG00000021303) cers5 (ENSCSEG00000021304) ENSCSEG00000021305 RBSN (ENSCSEG00000021306) rbm39b (ENSCSEG00000021307) ENSCSEG00000021308 eif2d (ENSCSEG00000021328) Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000162955 ENSGT00940000164549.a.a ENSGT00940000154471.a.b.a.a.b.b ENSGT00940000159597 ENSGT00940000168452 ENSGT00940000164282.a ENSGT00940000158892.b.i.b ENSGT00940000157161.a.b ENSGT00940000157794 ENSGT00940000161421 ENSGT00940000168503.B ENSGT00940000160255 ENSGT00660000097455 ENSGT00530000063687.b.b.a ##20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.b #22 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189.pb.b ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.b.a.a ENSGT00940000163342.b.a ENSGT00940000163342.a.b.a.b.b ENSGT00940000163342.b.b ENSGT00730000111360.a ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 Barramundi perch MODERN SPECIES 500 CRELD1 (ENSLCAG00010009742) ENSLCAG00010009746 IFT122 (ENSLCAG00010009766) #21 exorh (ENSLCAG00010009776) #22 PLXND1 (ENSLCAG00010009798) #24 TMCC1 (ENSLCAG00010009833) trh (ENSLCAG00010009835) RBSN (ENSLCAG00010009843) mrps25 (ENSLCAG00010009862) nr2c2 (ENSLCAG00010009877) B3GALT4 (ENSLCAG00010009908) wdr46 (ENSLCAG00010009914) ENSLCAG00010009922 Seriola ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000158523.c.a ENSGT00940000162955 ENSGT00940000164549.a.a ENSGT00940000154471.a.b.a.a.b.b ENSGT00940000159597 ENSGT00940000168452 ENSGT00940000164282.a ENSGT00940000157161.a.b ENSGT00940000157794 ENSGT00940000161421 ENSGT00940000168503.B ENSGT00940000160255 ENSGT00660000097455 ENSGT00530000063687.b.b.a ##20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.b #22 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189.pb.b ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.b.a.b.b.b ENSGT00940000163342.b.a ENSGT00940000163342.a.b.a.b.b.a ENSGT00940000163342.b.b ENSGT00730000111360.a ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 Greater amberjack MODERN SPECIES 16 WNT7A (ENSSDUG00000000696) zgc:171857 (ENSSDUG00000000727) ENSSDUG00000000747 BICD2 (ENSSDUG00000000859) FGD3 (ENSSDUG00000000908) ENSSDUG00000000993 ENSSDUG00000000999 ENSSDUG00000001021 ENSSDUG00000001060 BRPF1 (ENSSDUG00000001144) ENSSDUG00000001236 ENSSDUG00000001283 ENSSDUG00000001361 ENSSDUG00000001365 ##20 IFT122 (ENSSDUG00000001388) #21 exorh (ENSSDUG00000002263) #22 PLXND1 (ENSSDUG00000012735) #24 TMCC1 (ENSSDUG00000012875) trh (ENSSDUG00000012915) RBSN (ENSSDUG00000012924) mrps25 (ENSSDUG00000012983) nr2c2 (ENSSDUG00000013049) B3GALT4 (ENSSDUG00000013121) wdr46 (ENSSDUG00000013128) ENSSDUG00000013164 ENSSDUG00000013232 ENSSDUG00000013295 ENSSDUG00000013871 ENSSDUG00000013905 ogg1 (ENSSDUG00000013964) qars1 (ENSSDUG00000014004) Yellowtail amberjack DUPLICATION Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 3185 zgc:171857 (ENSSLDG00000011065) ENSSLDG00000011040 BICD2 (ENSSLDG00000011006) FGD3 (ENSSLDG00000010948) ENSSLDG00000010926 ENSSLDG00000010903 ENSSLDG00000010887 ENSSLDG00000010605 BRPF1 (ENSSLDG00000010500) ENSSLDG00000010436 ENSSLDG00000010393 CRELD1 (ENSSLDG00000010351) ENSSLDG00000010330 ENSSLDG00000010295 ##20 IFT122 (ENSSLDG00000010195) #21 RHO (ENSSLDG00000010164) #22 Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 3047 exorh (ENSSLDG00000004543) #22 PLXND1 (ENSSLDG00000004569) #24 TMCC1 (ENSSLDG00000004707) trh (ENSSLDG00000004771) RBSN (ENSSLDG00000004795) mrps25 (ENSSLDG00000004856) nr2c2 (ENSSLDG00000004935) wdr46 (ENSSLDG00000005016) B3GALT4 (ENSSLDG00000005046) ENSSLDG00000005059 ENSSLDG00000005087 ENSSLDG00000005120 sult1st3 (ENSSLDG00000005168) ENSSLDG00000005363 ENSSLDG00000005413 ogg1 (ENSSLDG00000005428) Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 21 ENSMMDG00005016785 adtrp1 (ENSMMDG00005016780) BICD2 (ENSMMDG00005016751) FGD3 (ENSMMDG00005016742) ENSMMDG00005016733 ENSMMDG00005016726 ENSMMDG00005016723 WNK2 (ENSMMDG00005016715) BRPF1 (ENSMMDG00005016680) ENSMMDG00005016675 ENSMMDG00005016671 CRELD1 (ENSMMDG00005016645) ENSMMDG00005016632 ENSMMDG00005016629 ##20 IFT122 (ENSMMDG00005013012) #21 exorh (ENSMMDG00005012947) #22 PLXND1 (ENSMMDG00005012798) #24 TMCC1 (ENSMMDG00005012775) trh (ENSMMDG00005012773) RBSN (ENSMMDG00005012646) mrps25 (ENSMMDG00005012633) nr2c2 (ENSMMDG00005012018) B3GALT4 (ENSMMDG00005012002) wdr46 (ENSMMDG00005011998) ENSMMDG00005011324 ENSMMDG00005011296 ENSMMDG00005011289 ogg1 (ENSMMDG00005011288) qars1 (ENSMMDG00005011040) QRICH1 (ENSMMDG00005010845) ENSMMDG00005010842 Cod MODERN SPECIES ENSGMOG00000017264 adtrp1 (ENSGMOG00000033011) ENSGMOG00000034969 ENSGMOG00000017305 ENSGMOG00000017340 ENSGMOG00000035790 ENSGMOG00000024353 ENSGMOG00000035251 ENSGMOG00000017543 ENSGMOG00000032403 ENSGMOG00000026224 ENSGMOG00000017600 ENSGMOG00000032033 ENSGMOG00000013830 ##20 IFT122 (ENSGMOG00000026380) #21 exorh (ENSGMOG00000013755) #22 PLXND1 (ENSGMOG00000018236) #24 TMCC1 (ENSGMOG00000033131) trh (ENSGMOG00000017121) ENSGMOG00000017086 mrps25 (ENSGMOG00000017071) nr2c2 (ENSGMOG00000017040) ENSGMOG00000022246 wdr46 (ENSGMOG00000017015) ENSGMOG00000024772 ENSGMOG00000016998 ENSGMOG00000016964 ENSGMOG00000002124 ENSGMOG00000036454 ENSGMOG00000030380 ENSGMOG00000032214 Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00940000162955 ENSGT00940000164549.a.a ENSGT00940000154471.a.b.a.a.b.b ENSGT00940000159597 ENSGT00940000168452 ENSGT00940000164282.a ENSGT00940000158892.b.i.b ENSGT00940000157161.a.b ENSGT00940000157794 ENSGT00940000161421 ENSGT00940000168503.B ENSGT00940000160255 ENSGT00660000097455 ENSGT00530000063687.b.b.a ##20 ENSGT00390000001016.b #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.b #22 ENSGT01020000230394.e.b.a #24 ENSGT00940000155189.pb.b ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.b.b ENSGT00730000111360.a ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 ENSGT00940000155241.c ENSGT00390000016228.b ENSGT00940000153629.a.a.a Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 160 ENSGT00940000154471.a.b.a.a.b.b.d ENSGT00940000159597.d ENSGT00940000168452.b ENSGT00940000164282.a.a ENSGT00940000158892.b.i.b ENSGT00940000157161.a.b.f.b ENSGT00940000157794.n ENSGT00940000161421.r ENSGT00940000168503.B ENSGT00940000160255.i ENSGT00390000001016.b.i #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.b.e #22 ENSGT01020000230394.e.b.a.j.b #24 ENSGT00940000155189.pb.b.b ENSGT00390000016951.e ENSGT00940000158219.a ENSGT00390000007159.d ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798.`b ENSGT00390000007075.e ENSGT00940000163342.a.b.b.e ENSGT00940000163342.a.b.b.f ENSGT00730000111360.a.c ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 ENSGT00940000155241.c Huchen MODERN SPECIES 1239 ENSHHUG00000015077 ENSHHUG00000015090 CRELD1 (ENSHHUG00000015131) IFT122 (ENSHHUG00000015168) #21 RHO (ENSHHUG00000015650) #22 PLXND1 (ENSHHUG00000015893) #24 TMCC1 (ENSHHUG00000015908) ENSHHUG00000015917 trh (ENSHHUG00000015933) ENSHHUG00000015936 RBSN (ENSHHUG00000015942) mrps25 (ENSHHUG00000015950) nr2c2 (ENSHHUG00000015960) ENSHHUG00000016008 wdr46 (ENSHHUG00000016021) ENSHHUG00000016037 ENSHHUG00000016148 ENSHHUG00000016163 ogg1 (ENSHHUG00000016171) qars1 (ENSHHUG00000016189) Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000156047.b.d ENSGT00940000158523.c.a.c ENSGT00940000164549.a.a.d ENSGT00940000158284.vb.b ENSGT00940000154471.a.b.a.a.b.b.d ENSGT00940000159597.d ENSGT00940000168452.b ENSGT00940000164282.a.a ENSGT00940000158892.b.i.b ENSGT00940000157161.a.b.f.b ENSGT00940000157794.n ENSGT00940000161421.r ENSGT00940000168503.B ENSGT00940000160255.i ENSGT00390000001016.b.i #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.b.e #22 ENSGT01020000230394.e.b.a.j.b #24 ENSGT00940000155189.pb.b.b ENSGT00390000016951.e ENSGT00940000158219.a ENSGT00390000007159.d ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798.`b ENSGT00390000007075.e ENSGT00940000163342.a.b.b.e.a.a ENSGT00940000163342.a.b.b.e.a.b ENSGT00940000163342.a.b.b.f ENSGT00730000111360.a.c ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 Salmo ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000156047.b.d ENSGT00940000158523.c.a.c ENSGT00940000164549.a.a.d ENSGT00940000158284.vb.b ENSGT00940000154471.a.b.a.a.b.b.d ENSGT00940000159597.d ENSGT00940000168452.b ENSGT00940000164282.a.a ENSGT00940000158892.b.i.b ENSGT00940000157161.a.b.f.b ENSGT00940000157794.n ENSGT00940000161421.r ENSGT00940000168503.B ENSGT00940000160255.i ENSGT00390000001016.b.i #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.b.e #22 ENSGT01020000230394.e.b.a.j.b #24 ENSGT00940000155189.pb.b.b ENSGT00390000016951.e ENSGT00940000158219.a ENSGT00390000007159.d ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798.`b ENSGT00390000007075.e ENSGT00940000163342.a.b.b.e.a.a ENSGT00940000163342.a.b.b.e.a.b ENSGT00730000111360.a.c ENSGT00640000091554 ENSGT00550000074972 ENSGT00940000155241.c.a Atlantic salmon MODERN SPECIES 4 WNT7A (ENSSSAG00000098279) ENSSSAG00000008699 adtrp1 (ENSSSAG00000008678) ENSSSAG00000119561 ENSSSAG00000007544 ENSSSAG00000086223 ENSSSAG00000007478 SUSD3 (ENSSSAG00000007472) ENSSSAG00000007466 ENSSSAG00000098234 ENSSSAG00000007436 ENSSSAG00000102076 ENSSSAG00000007212 ENSSSAG00000101866 IFT122 (ENSSSAG00000004394) #21 RHO (ENSSSAG00000083338) #22 PLXND1 (ENSSSAG00000079145) #24 TMCC1 (ENSSSAG00000079133) trh (ENSSSAG00000079119) ENSSSAG00000084122 ENSSSAG00000079043 mrps25 (ENSSSAG00000079033) nr2c2 (ENSSSAG00000078763) ENSSSAG00000078743 wdr46 (ENSSSAG00000078719) st1s3 (ENSSSAG00000078712) ENSSSAG00000078689 ENSSSAG00000095223 ogg1 (ENSSSAG00000078670) qars (ENSSSAG00000078464) ENSSSAG00000078423 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.b.e #22 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.b.e #22 Chinook salmon MODERN SPECIES 7 BICD2 (ENSOTSG00005007187) ENSOTSG00005007179 ENSOTSG00005007175 ciz1b (ENSOTSG00005007173) ENSOTSG00005007171 snap29 (ENSOTSG00005007169) ENSOTSG00005007150 ENSOTSG00005007148 ENSOTSG00005007126 BRPF1 (ENSOTSG00005007054) ENSOTSG00005007047 ENSOTSG00005007043 CRELD1 (ENSOTSG00005007034) ENSOTSG00005007032 ENSOTSG00005007031 ##20 RHO (ENSOTSG00005007029) #22 PLXND1 (ENSOTSG00005006970) #24 TMCC1 (ENSOTSG00005006966) trh (ENSOTSG00005006965) ENSOTSG00005006962 RBSN (ENSOTSG00005006868) ENSOTSG00005006865 ENSOTSG00005006862 prickle2a (ENSOTSG00005006860) MAGI1 (ENSOTSG00005006837) ren (ENSOTSG00005006825) ENSOTSG00005006824 ENSOTSG00005006823 mapkapk2b (ENSOTSG00005006808) eif2d (ENSOTSG00005005726) ENSOTSG00005004654 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 704 ENSGT00940000157161.a.b.f.a ENSGT00940000157794.m ENSGT00940000161421.q ENSGT00940000175110 ENSGT00940000160255.j ENSGT00660000097455 ENSGT00530000063687.b.b.a ##20 ENSGT00390000001016.b.j #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.b.f #22 ENSGT01020000230394.e.b.a.j.a #24 ENSGT00940000155189.pb.b.a ENSGT00390000016951.f Huchen MODERN SPECIES 40 ENSHHUG00000026056 adtrp1 (ENSHHUG00000026055) BICD2 (ENSHHUG00000025955) FGD3 (ENSHHUG00000025935) ENSHHUG00000025934 ENSHHUG00000025931 ENSHHUG00000025886 BRPF1 (ENSHHUG00000025878) ENSHHUG00000025871 CRELD1 (ENSHHUG00000025840) ENSHHUG00000025830 ENSHHUG00000025774 ##20 ENSHHUG00000025770 ENSHHUG00000025765 ENSHHUG00000025762 exorh (ENSHHUG00000025731) #22 PLXND1 (ENSHHUG00000025605) #24 TMCC1 (ENSHHUG00000025581) Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 128 ENSGT00940000157161.a.b.f.a ENSGT00940000157794.m ENSGT00940000161421.q ENSGT00940000175110 ENSGT00940000160255.j ENSGT00660000097455 ENSGT00530000063687.b.b.a ##20 ENSGT00390000001016.b.j #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.b.f #22 ENSGT01020000230394.e.b.a.j.a #24 ENSGT00940000155189.pb.b.a ENSGT00390000016951.f ENSGT00940000161798.ab ENSGT00390000007159.c ENSGT00730000111360.a.d ENSGT01010000229500 ENSGT00390000016228.b.b ENSGT00940000153629.a.a.a.c ENSGT00940000155820.b.d ENSGT00940000157898.i ENSGT00390000015805.b.c ENSGT00940000157261.k.b.d ENSGT00550000074865.i ENSGT00940000165387.a.c Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 93 ENSGT00940000157161.a.b.f.a ENSGT00940000157794.m ENSGT00940000161421.q ENSGT00940000175110 ENSGT00940000160255.j ENSGT00660000097455 ENSGT00530000063687.b.b.a ##20 ENSGT00390000001016.b.j #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.b.f #22 ENSGT01020000230394.e.b.a.j.a #24 ENSGT00940000155189.pb.b.a ENSGT00390000016951.f ENSGT00940000161798.ab ENSGT00390000007159.c ENSGT00730000111360.a.d ENSGT01010000229500 ENSGT00390000016228.b.b ENSGT00940000153629.a.a.a.c ENSGT00940000155820.b.d ENSGT00940000157898.i ENSGT00390000015805.b.c ENSGT00940000157261.k.b.d ENSGT00550000074865.i ENSGT00940000165387.a.c Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000158284.vb.a ENSGT00940000154471.a.b.a.a.b.b.c ENSGT00940000159597.c ENSGT00940000168452.a ENSGT00940000164282.a.b ENSGT00440000039084.a.a ENSGT00950000182843.a.b ENSGT00940000153385.b.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00940000157794.m ENSGT00940000161421.q ENSGT00940000175110 ENSGT00940000160255.j ENSGT00660000097455 ENSGT00530000063687.b.b.a ##20 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.b.f #22 ENSGT01020000230394.e.b.a.j.a #24 ENSGT00940000155189.pb.b.a ENSGT00390000016951.f ENSGT00940000161798.ab ENSGT00390000007159.c ENSGT00730000111360.a.d ENSGT01010000229500 ENSGT00390000016228.b.b ENSGT00940000153629.a.a.a.c ENSGT00940000155820.b.d ENSGT00940000157898.i ENSGT00390000015805.b.c ENSGT00940000157261.k.b.d ENSGT00550000074865.i ENSGT00940000165387.a.c Coho salmon MODERN SPECIES 8 ENSOKIG00005038393 ENSOKIG00005038373 ciz1b (ENSOKIG00005038298) snap29 (ENSOKIG00005038273) ENSOKIG00005038224 ENSOKIG00005038207 ENSOKIG00005038199 ENSOKIG00005038167 ENSOKIG00005038149 BRPF1 (ENSOKIG00005037995) ENSOKIG00005037955 CRELD1 (ENSOKIG00005037740) ENSOKIG00005037696 ENSOKIG00005037687 ##20 ENSOKIG00005037650 exorh (ENSOKIG00005037616) #22 PLXND1 (ENSOKIG00005036680) #24 TMCC1 (ENSOKIG00005036589) trh (ENSOKIG00005036568) ENSOKIG00005036324 RBSN (ENSOKIG00005035505) ENSOKIG00005035464 ENSOKIG00005035457 ENSOKIG00005035406 ENSOKIG00005035353 PRICKLE2 (ENSOKIG00005035312) MAGI1 (ENSOKIG00005034935) REN (ENSOKIG00005034802) ENSOKIG00005034759 mapkapk2b (ENSOKIG00005034502) eif2d (ENSOKIG00005033500) Rainbow trout MODERN SPECIES 30 ENSOMYG00000068493 ENSOMYG00000048952 ENSOMYG00000012692 ENSOMYG00000012712 ENSOMYG00000064288 ENSOMYG00000012736 ENSOMYG00000012769 ENSOMYG00000052684 ENSOMYG00000033861 ENSOMYG00000033788 ENSOMYG00000033773 ENSOMYG00000033751 ENSOMYG00000033741 ENSOMYG00000033732 ##20 ENSOMYG00000077025 #21 exorh (ENSOMYG00000033723) #22 ENSOMYG00000033713 PLXND1 (ENSOMYG00000033458) #24 TMCC1 (ENSOMYG00000033319) ENSOMYG00000067067 trh (ENSOMYG00000033292) ENSOMYG00000049575 ENSOMYG00000072323 ENSOMYG00000033198 ENSOMYG00000065103 ENSOMYG00000033123 ENSOMYG00000058926 ENSOMYG00000033091 ENSOMYG00000051482 ENSOMYG00000033059 ENSOMYG00000069855 Salmo ANCESTRAL SPECIES 39 ENSGT00940000157161.a.b.f.a ENSGT00940000157794.m ENSGT00940000161421.q ENSGT00940000160255.j ENSGT00530000063687.b.b.a ##20 ENSGT00390000001016.b.j #21 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.b.f #22 ENSGT01020000230394.e.b.a.j.a #24 ENSGT00940000155189.pb.b.a ENSGT00390000016951.f ENSGT00940000161798.ab ENSGT00390000007159.c ENSGT00730000111360.a.d ENSGT00390000016228.b.b ENSGT00940000153629.a.a.a.c ENSGT00940000155820.b.d ENSGT00940000157898.i ENSGT00390000015805.b.c ENSGT00940000157261.k.b.d ENSGT00550000074865.i ENSGT00940000165387.a.c ENSGT00950000182844.a.a.b Atlantic salmon MODERN SPECIES 6 cd164 (ENSSSAG00000083978) sesn1 (ENSSSAG00000055139) armc2 (ENSSSAG00000055198) foxo3b (ENSSSAG00000055241) ENSSSAG00000098707 snx3 (ENSSSAG00000055389) nr2e1 (ENSSSAG00000108206) OSTM1 (ENSSSAG00000055399) ENSSSAG00000055427 ENSSSAG00000055508 ENSSSAG00000006716 ENSSSAG00000006676 ENSSSAG00000006651 ENSSSAG00000006635 ##20 IFT122 (ENSSSAG00000098697) #21 exorh (ENSSSAG00000006623) #22 PLXND1 (ENSSSAG00000005934) #24 TMCC1 (ENSSSAG00000109496) trh (ENSSSAG00000077925) ENSSSAG00000077809 ENSSSAG00000077668 ENSSSAG00000077650 ENSSSAG00000077635 ENSSSAG00000106287 pphln (ENSSSAG00000077622) ENSSSAG00000077610 ENSSSAG00000077457 ENSSSAG00000077398 ENSSSAG00000077389 MAPK2 (ENSSSAG00000077364) eif2d (ENSSSAG00000077056) River trout MODERN SPECIES 20 knstrn (ENSSTUG00000034099) ENSSTUG00000033862 BRPF1 (ENSSTUG00000033770) ENSSTUG00000033640 CRELD1 (ENSSTUG00000033532) ENSSTUG00000033508 ##20 exorh (ENSSTUG00000033486) #22 PLXND1 (ENSSTUG00000033209) #24 TMCC1 (ENSSTUG00000033166) trh (ENSSTUG00000033159) ENSSTUG00000033145 ENSSTUG00000033134 RBSN (ENSSTUG00000032654) ENSSTUG00000032638 ENSSTUG00000032629 prickle2a (ENSSTUG00000032625) ENSSTUG00000032611 MAGI1 (ENSSTUG00000032508) ren (ENSSTUG00000032390) ENSSTUG00000032365 mapkapk2b (ENSSTUG00000032003) eif2d (ENSSTUG00000030030) Northern pike MODERN SPECIES 11 ENSELUG00000018054 adtrp1 (ENSELUG00000018080) BICD2 (ENSELUG00000018122) ENSELUG00000018160 ENSELUG00000000751 ENSELUG00000018198 ENSELUG00000000766 ENSELUG00000018271 BRPF1 (ENSELUG00000018372) ENSELUG00000018395 ENSELUG00000018450 CRELD1 (ENSELUG00000000786) ENSELUG00000018473 ENSELUG00000018483 ##20 IFT122 (ENSELUG00000018672) #21 exorh (ENSELUG00000022948) #22 PLXND1 (ENSELUG00000023407) #24 TMCC1 (ENSELUG00000023499) ENSELUG00000031756 trh (ENSELUG00000023514) RBSN (ENSELUG00000023595) mrps25 (ENSELUG00000023537) ENSELUG00000031650 nr2c2 (ENSELUG00000023672) B3GALT4 (ENSELUG00000023696) wdr46 (ENSELUG00000023712) sult1st1 (ENSELUG00000023977) ENSELUG00000024008 ogg1 (ENSELUG00000024024) qars1 (ENSELUG00000024142) QRICH1 (ENSELUG00000024155) Spotted gar MODERN SPECIES 671 trappc6b (ENSLOCG00000013125) USP19 (ENSLOCG00000013120) ENSLOCG00000013114 ENSLOCG00000013109 ENSLOCG00000013104 ENSLOCG00000013101 ENSLOCG00000013096 ENSLOCG00000013088 ENSLOCG00000013082 kbtbd12 (ENSLOCG00000013077) mgll (ENSLOCG00000013071) xpc (ENSLOCG00000013060) TMEM43 (ENSLOCG00000013056) ENSLOCG00000013054 ##20 IFT122 (ENSLOCG00000013048) #21 exorh (ENSLOCG00000013037) #22 PLXND1 (ENSLOCG00000013025) #24 tmcc1b (ENSLOCG00000013017) AFAP1L2 (ENSLOCG00000013005) ablim1a (ENSLOCG00000012991) fhip2a (ENSLOCG00000012984) trub1 (ENSLOCG00000012979) ATRNL1 (ENSLOCG00000012964) gfra1b (ENSLOCG00000012958) CCDC172 (ENSLOCG00000012950) si:ch1073-126c3.2 (ENSLOCG00000012943) ENSLOCG00000012938 ENSLOCG00000012932 SH2D4B (ENSLOCG00000012928) tspan14 (ENSLOCG00000012923) bms1 (ENSLOCG00000012914) Elephant shark MODERN SPECIES 1500 tusc2a (ENSCMIG00000020083) ENSCMIG00000020084 oxtr (ENSCMIG00000020085) cav3 (ENSCMIG00000020086) cav4a (ENSCMIG00000020087) ENSCMIG00000020088 ENSCMIG00000020089 GRIP2 (ENSCMIG00000020090) sec13 (ENSCMIG00000020091) cand2 (ENSCMIG00000020092) #17 CCDC174 (ENSCMIG00000020093) ENSCMIG00000020094 ENSCMIG00000020095 ENSCMIG00000000225 ##20 IFT122 (ENSCMIG00000000237) #21 rho (ENSCMIG00000000254) #22 ENSCMIG00000000328 #23 PLXND1 (ENSCMIG00000000415) #24 tmcc1b (ENSCMIG00000000535) abhd14a (ENSCMIG00000000546) tmem115 (ENSCMIG00000000556) CACNA2D2 (ENSCMIG00000000661) acy1 (ENSCMIG00000001032) ENSCMIG00000001047 IP6K1 (ENSCMIG00000001052) RNF123 (ENSCMIG00000001075) AMIGO3 (ENSCMIG00000001099) gmppb (ENSCMIG00000001112) abhd14b (ENSCMIG00000001132) ENSCMIG00000001144 MST1 (ENSCMIG00000001169) Cyclostomata ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b #22 Hagfish MODERN SPECIES 928 rpn1 (ENSEBUG00000002783) ENSEBUG00000007132 ENSEBUG00000003385 ENSEBUG00000004596 ENSEBUG00000006196 ENSEBUG00000008979 iars1 (ENSEBUG00000016686) rho (ENSEBUG00000016733) #22 ENSEBUG00000012445 ENSEBUG00000015014 ENSEBUG00000005853 Vertebrata ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a ##22 Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES 1520 ENSGT00940000160955 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a ##22 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 767 ENSGT00510000048041 ENSGT00940000160887 ENSGT00940000160955 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a ##22 Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 310 ENSGT00940000163908 ENSGT00390000014270 ENSGT00390000006988 ENSGT00940000156616 ENSGT00390000012980.b ENSGT00950000182815.b ENSGT01090000260100.A ENSGT00970000198189 ENSGT00940000157078 ENSGT00510000048041 ENSGT00940000160887 ENSGT00940000160955 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a ##22 Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 195 ENSGT00940000163908 ENSGT00390000014270 ENSGT00390000006988 ENSGT00940000156616 ENSGT00390000012980.b ENSGT00950000182815.b ENSGT01090000260100.A ENSGT00940000157078 ENSGT00510000048041 ENSGT00940000160887 ENSGT00940000160955 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a ##22 Amniota ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a ##22 Sauria ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000158700 ENSGT00940000153835.a.a ENSGT00470000042297 ENSGT00940000164212 ENSGT00390000015714 ENSGT00390000006988 ENSGT00940000156616 ENSGT00390000012980.b ENSGT00950000182815.b ENSGT01090000260100.A ENSGT00940000157078 ENSGT00510000048041 ENSGT00940000160887 ENSGT00940000160955 ENSGT00390000000489 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a ##22 ENSGT01030000234648.a.b.a.a.a ENSGT00730000111329 ENSGT00410000025882.b ENSGT00940000157882 ENSGT00440000034918.r ENSGT00950000182973.a.c.a ENSGT00940000157549 ENSGT00490000043415 ENSGT00730000110997 ENSGT00600000084428.a ENSGT00390000013228 ENSGT00940000155806 ENSGT00940000160792 ENSGT00940000153185.a.a.b ENSGT00940000160911 Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES 56 ENSGT00390000015714 ENSGT00390000006988 ENSGT00940000156616 ENSGT00390000012980.b ENSGT00950000182815.b ENSGT01090000260100.A ENSGT00940000157078 ENSGT00510000048041 ENSGT00940000160887 ENSGT00940000160955 ENSGT00390000000489 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a ##22 ENSGT01030000234648.a.b.a.a.a ENSGT00730000111329 ENSGT00410000025882.b ENSGT00940000157882 ENSGT00440000034918.r ENSGT00950000182973.a.c.a ENSGT00940000157549 ENSGT00490000043415 ENSGT00730000110997 ENSGT00600000084428.a ENSGT00390000013228 ENSGT00940000155806 ENSGT00940000160792 ENSGT00940000153185.a.a.b ENSGT00940000160911 Episquamata ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00910000144115.a ENSGT00940000169569 ENSGT00940000153544.a ENSGT00390000007975.b ENSGT00940000162211 ENSGT00390000015714 ENSGT00390000006988 ENSGT00940000156616 ENSGT00390000012980.b ENSGT01090000260100.A ENSGT00940000157078 ENSGT00510000048041 ENSGT00940000160887 ENSGT00940000160955 ENSGT00390000000489 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a ##22 ENSGT01030000234648.a.b.a.a.a ENSGT00730000111329 ENSGT00410000025882.b ENSGT00940000157882 ENSGT00440000034918.r ENSGT00950000182973.a.c.a ENSGT00940000157549 ENSGT00490000043415 ENSGT00730000110997 ENSGT00600000084428.a ENSGT00390000013228 ENSGT00940000155806 ENSGT00940000160792 ENSGT00940000153185.a.a.b ENSGT00940000160911 Toxicofera ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a ##22 Lizard MODERN SPECIES 3 ETV7 (ENSACAG00000016570) NFYA (ENSACAG00000016527) OARD1 (ENSACAG00000016516) APOBEC2 (ENSACAG00000016506) TSPO2 (ENSACAG00000042000) ENSACAG00000039795 BAK1 (ENSACAG00000016485) ENSACAG00000036976 ENSACAG00000045112 ITPR3 (ENSACAG00000016163) UQCC2 (ENSACAG00000038971) IP6K3 (ENSACAG00000016147) ENSACAG00000016140 MLN (ENSACAG00000022014) ENSACAG00000039336 rh2 (ENSACAG00000016065) ##22 ENSACAG00000045221 ENSACAG00000039763 ENSACAG00000036298 ENSACAG00000016044 ENSACAG00000042036 GRM4 (ENSACAG00000015953) HMGA1 (ENSACAG00000015910) SMIM29 (ENSACAG00000024314) NUDT3 (ENSACAG00000028344) ENSACAG00000015886 PACSIN1 (ENSACAG00000015801) SPDEF (ENSACAG00000015770) ENSACAG00000037538 ILRUN (ENSACAG00000015742) SNRPC (ENSACAG00000015721) Laterata ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00910000144115.a ENSGT00940000169569 ENSGT00940000153544.a ENSGT00390000007975.b ENSGT00940000162211 ENSGT00390000015714 ENSGT00390000006988 ENSGT00940000156616 ENSGT00390000012980.b ENSGT01090000260100.A ENSGT00940000157078 ENSGT00510000048041 ENSGT00940000160887 ENSGT00940000160955 ENSGT00390000000489 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a ##22 ENSGT01030000234648.a.b.a.a.a ENSGT00730000111329 ENSGT00410000025882.b ENSGT00940000157882 ENSGT00440000034918.r ENSGT00950000182973.a.c.a ENSGT00940000157549 ENSGT00490000043415 ENSGT00730000110997 ENSGT00600000084428.a ENSGT00390000013228 ENSGT00940000155806 ENSGT00940000160792 ENSGT00940000153185.a.a.b ENSGT00940000160911 Common wall lizard MODERN SPECIES 14 ENSPMRG00000007217 ENSPMRG00000007228 KCTD20 (ENSPMRG00000007241) ETV7 (ENSPMRG00000007255) NFYA (ENSPMRG00000007262) OARD1 (ENSPMRG00000007277) APOBEC2 (ENSPMRG00000007289) TSPO2 (ENSPMRG00000007294) BAK1 (ENSPMRG00000007303) ENSPMRG00000007310 ITPR3 (ENSPMRG00000008140) UQCC2 (ENSPMRG00000012294) IP6K3 (ENSPMRG00000012298) LEMD2 (ENSPMRG00000012303) MLN (ENSPMRG00000012308) ENSPMRG00000012313 ##22 GRM4 (ENSPMRG00000012324) HMGA1 (ENSPMRG00000012333) SMIM29 (ENSPMRG00000012339) NUDT3 (ENSPMRG00000012347) RPS10 (ENSPMRG00000012353) PACSIN1 (ENSPMRG00000012362) SPDEF (ENSPMRG00000012387) ILRUN (ENSPMRG00000012393) SNRPC (ENSPMRG00000012398) BLTP3A (ENSPMRG00000012404) ANKS1A (ENSPMRG00000012513) ENSPMRG00000012945 ENSPMRG00000013016 SCUBE3 (ENSPMRG00000013119) ENSPMRG00000013624 Argentine black and white tegu MODERN SPECIES 16 SRSF3 (ENSSMRG00000021016) ENSSMRG00000021017 STK38 (ENSSMRG00000021018) KCTD20 (ENSSMRG00000021019) ETV7 (ENSSMRG00000021020) NFYA (ENSSMRG00000021023) OARD1 (ENSSMRG00000021024) APOBEC2 (ENSSMRG00000021025) TSPO2 (ENSSMRG00000021026) BAK1 (ENSSMRG00000021028) ITPR3 (ENSSMRG00000021174) UQCC2 (ENSSMRG00000023116) IP6K3 (ENSSMRG00000023117) LEMD2 (ENSSMRG00000023118) ENSSMRG00000000018 ENSSMRG00000000044 ##22 GRM4 (ENSSMRG00000000779) ENSSMRG00000000807 SMIM29 (ENSSMRG00000000816) NUDT3 (ENSSMRG00000000821) RPS10 (ENSSMRG00000000829) PACSIN1 (ENSSMRG00000000840) SPDEF (ENSSMRG00000000860) ILRUN (ENSSMRG00000000912) SNRPC (ENSSMRG00000000931) BLTP3A (ENSSMRG00000000949) ENSSMRG00000000997 ANKS1A (ENSSMRG00000001033) ENSSMRG00000001079 ENSSMRG00000001082 SCUBE3 (ENSSMRG00000001879) tuatara MODERN SPECIES 943 TBC1D22B (ENSSPUG00000010671) ENSSPUG00000010679 BRPF3 (ENSSPUG00000010698) MAPK13 (ENSSPUG00000010741) MAPK14 (ENSSPUG00000010797) NFYA (ENSSPUG00000010813) OARD1 (ENSSPUG00000010828) APOBEC2 (ENSSPUG00000010839) TSPO2 (ENSSPUG00000010848) UNC5CL (ENSSPUG00000010858) BAK1 (ENSSPUG00000010867) ENSSPUG00000011057 IP6K3 (ENSSPUG00000011063) LEMD2 (ENSSPUG00000011077) MLN (ENSSPUG00000011091) ENSSPUG00000011123 ##22 Archelosauria ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000153835.a.a ENSGT00470000042297 ENSGT00950000185061 ENSGT00940000164212 ENSGT00390000015714 ENSGT00390000006988 ENSGT00940000156616 ENSGT00390000012980.b ENSGT00950000182815.b ENSGT01090000260100.A ENSGT00940000157078 ENSGT00510000048041 ENSGT00940000160887 ENSGT00940000160955 ENSGT00390000000489 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a ##22 ENSGT01030000234648.a.b.a.a.a ENSGT00730000111329 ENSGT00410000025882.b ENSGT00940000157882 ENSGT00440000034918.r ENSGT00950000182973.a.c.a ENSGT00940000157549 ENSGT00490000043415 ENSGT00730000110997 ENSGT00600000084428.a ENSGT00390000013228 ENSGT00940000155806 ENSGT00940000160792 ENSGT00940000153185.a.a.b ENSGT00390000008767.c.b Cryptodira ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000153835.a.a.c ENSGT00470000042297 ENSGT00940000153835.a.b ENSGT00950000185061 ENSGT00940000164212 ENSGT00390000015714 ENSGT00390000006988 ENSGT00940000156616 ENSGT00390000012980.b ENSGT01090000260100.A ENSGT00940000157078 ENSGT00510000048041 ENSGT00940000160887 ENSGT00940000160955 ENSGT00390000000489 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a ##22 ENSGT01030000234648.a.b.a.a.a ENSGT00730000111329 ENSGT00410000025882.b ENSGT00940000157882 ENSGT00440000034918.r ENSGT00950000182973.a.c.a ENSGT00940000157549 ENSGT00490000043415 ENSGT00730000110997 ENSGT00600000084428.a ENSGT00390000013228 ENSGT00940000155806 ENSGT00940000160792 ENSGT00940000153185.a.a.b ENSGT00390000008767.d Testudinoidea ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00470000042297 ENSGT00940000153835.a.b ENSGT00950000185061.a.b.a ENSGT00950000185061.a.a ENSGT00940000164212 ENSGT00390000015714 ENSGT00390000006988 ENSGT00940000156616 ENSGT00390000012980.b ENSGT01090000260100.A ENSGT00940000157078 ENSGT00510000048041 ENSGT00940000160887 ENSGT00940000160955 ENSGT00390000000489 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a ##22 ENSGT01030000234648.a.b.a.a.a ENSGT00730000111329 ENSGT00410000025882.b ENSGT00940000157882 ENSGT00440000034918.r.cb ENSGT00950000182973.a.c.a ENSGT00940000157549 ENSGT00490000043415 ENSGT00730000110997 ENSGT00600000084428.a ENSGT00390000013228 ENSGT00940000155806 ENSGT00940000160792 ENSGT00940000153185.a.a.b ENSGT00390000008767.c.b Emydidae ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000159691 ENSGT00940000160187.f ENSGT00940000158700 ENSGT00940000153835.a.a.c.c ENSGT00940000164212 ENSGT00390000015714 ENSGT00390000006988 ENSGT00940000156616 ENSGT00390000012980.b ENSGT01090000260100.A ENSGT00940000157078 ENSGT00510000048041 ENSGT00940000160887 ENSGT00940000160955 ENSGT00390000000489 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a ##22 ENSGT01030000234648.a.b.a.a.a ENSGT00730000111329 ENSGT00940000157882 ENSGT00440000034918.r.bb ENSGT00950000182973.a.c.a ENSGT00940000157549 ENSGT00490000043415 ENSGT00730000110997 ENSGT00600000084428.a ENSGT00390000013228 ENSGT00940000155806 ENSGT00940000160792 ENSGT00940000153185.a.a.b ENSGT00390000008767.c.a ENSGT00940000160911.e Three-toed box turtle DUPLICATION Three-toed box turtle MODERN SPECIES 95 ENSTMTG00000005379 ENSTMTG00000005411 ENSTMTG00000005423 MDFI (ENSTMTG00000005448) ENSTMTG00000005463 ENSTMTG00000005539 ENSTMTG00000005553 ENSTMTG00000005591 ENSTMTG00000005607 ENSTMTG00000005633 ENSTMTG00000005658 ENSTMTG00000005741 ENSTMTG00000005933 ENSTMTG00000005946 ENSTMTG00000005966 ENSTMTG00000006002 ##22 ENSTMTG00000006048 HMGA1 (ENSTMTG00000006160) Three-toed box turtle MODERN SPECIES 94 ENSTMTG00000013740 ENSTMTG00000013764 ENSTMTG00000013874 ENSTMTG00000013887 ENSTMTG00000013901 ENSTMTG00000013914 ENSTMTG00000013922 ENSTMTG00000013971 UQCC2 (ENSTMTG00000014119) ENSTMTG00000014127 ENSTMTG00000014142 ENSTMTG00000014169 MLN (ENSTMTG00000014180) ENSTMTG00000014196 ##22 ENSTMTG00000014223 ENSTMTG00000014285 painted turtle MODERN SPECIES 914 ENSCPBG00000027128 ##22 ENSCPBG00000027130 GRM4 (ENSCPBG00000027131) ENSCPBG00000027133 ENSCPBG00000027135 PACSIN1 (ENSCPBG00000027137) SPDEF (ENSCPBG00000027138) ILRUN (ENSCPBG00000027140) SNRPC (ENSCPBG00000027142) BLTP3A (ENSCPBG00000027144) ENSCPBG00000027153 ANKS1A (ENSCPBG00000027158) ENSCPBG00000027163 SCUBE3 (ENSCPBG00000027165) ENSCPBG00000027167 TBC1D22B (ENSCPBG00000027169) Testudinidae ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00470000042297 ENSGT00940000153835.a.b ENSGT00950000185061.a.b.a ENSGT00950000185061.a.a ENSGT00940000164212 ENSGT00390000015714 ENSGT00390000006988 ENSGT00940000156616 ENSGT00390000012980.b ENSGT01090000260100.A ENSGT00940000157078 ENSGT00510000048041 ENSGT00940000160887 ENSGT00940000160955 ENSGT01030000236145 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a ##22 ENSGT01030000234648.a.b.a.a.a ENSGT00730000111329 ENSGT00410000025882.b ENSGT00940000157882 ENSGT00440000034918.r.cb ENSGT00950000182973.a.c.a ENSGT00940000157549 ENSGT00490000043415 ENSGT00730000110997 ENSGT00600000084428.a ENSGT00390000013228 ENSGT00940000155806 ENSGT00940000160792 ENSGT00940000153185.a.a.b ENSGT00390000008767.c.b Abingdon island giant tortoise MODERN SPECIES 221 ENSCABG00000009248 ENSCABG00000009250 ENSCABG00000009254 ENSCABG00000009257 NFYA (ENSCABG00000009267) OARD1 (ENSCABG00000009436) APOBEC2 (ENSCABG00000009438) TSPO2 (ENSCABG00000009439) BAK1 (ENSCABG00000009441) ITPR3 (ENSCABG00000009445) UQCC2 (ENSCABG00000009447) IP6K3 (ENSCABG00000009449) LEMD2 (ENSCABG00000009453) ENSCABG00000009454 ENSCABG00000009455 ENSCABG00000009456 ##22 GRM4 (ENSCABG00000009553) Goode s thornscrub tortoise MODERN SPECIES 18 TREM2 (ENSGEVG00005003645) ENSGEVG00005003638 ENSGEVG00005003622 ENSGEVG00005003594 ENSGEVG00005003574 NFYA (ENSGEVG00005003561) OARD1 (ENSGEVG00005003547) APOBEC2 (ENSGEVG00005003537) TSPO2 (ENSGEVG00005003523) BAK1 (ENSGEVG00005003511) ITPR3 (ENSGEVG00005003357) UQCC2 (ENSGEVG00005003169) IP6K3 (ENSGEVG00005003153) LEMD2 (ENSGEVG00005003130) ENSGEVG00005003122 ENSGEVG00005003110 ##22 ENSGEVG00005003101 GRM4 (ENSGEVG00005003070) HMGA1 (ENSGEVG00005003047) SMIM29 (ENSGEVG00005003030) ENSGEVG00005003018 NUDT3 (ENSGEVG00005003006) ENSGEVG00005002990 PACSIN1 (ENSGEVG00005002971) SPDEF (ENSGEVG00005002951) ILRUN (ENSGEVG00005002910) SNRPC (ENSGEVG00005002884) BLTP3A (ENSGEVG00005002842) ENSGEVG00005002812 ANKS1A (ENSGEVG00005002406) ENSGEVG00005002149 Chinese turtle MODERN SPECIES 774 FOXP4 (ENSPSIG00000011832) ENSPSIG00000001498 ENSPSIG00000012572 TREM2 (ENSPSIG00000012815) ENSPSIG00000012825 ENSPSIG00000012831 ENSPSIG00000012854 NFYA (ENSPSIG00000013239) OARD1 (ENSPSIG00000013464) APOBEC2 (ENSPSIG00000013480) TSPO2 (ENSPSIG00000013531) BAK1 (ENSPSIG00000013536) ITPR3 (ENSPSIG00000013648) IP6K3 (ENSPSIG00000014194) MLN (ENSPSIG00000014243) ENSPSIG00000014246 ##22 GRM4 (ENSPSIG00000014424) Archosauria ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000153835.a.a ENSGT00470000042297 ENSGT00950000185061 ENSGT00940000164212 ENSGT00390000015714 ENSGT00390000006988 ENSGT00940000156616 ENSGT00390000012980.b ENSGT00950000182815.b ENSGT01090000260100.A ENSGT00940000157078 ENSGT00510000048041 ENSGT00940000160887 ENSGT00940000160955 ENSGT00390000000489 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a ##22 ENSGT01030000234648.a.b.a.a.a ENSGT00730000111329 ENSGT00410000025882.b ENSGT00940000157882 ENSGT00440000034918.r ENSGT00950000182973.a.c.a ENSGT00940000157549 ENSGT00490000043415 ENSGT00730000110997 ENSGT00600000084428.a ENSGT00390000013228 ENSGT00940000155806 ENSGT00940000160792 ENSGT00940000153185.a.a.b ENSGT00390000008767.c.b Aves ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000158700 ENSGT00940000153835.a.a ENSGT00470000042297 ENSGT00950000185061 ENSGT00940000153835.a.b ENSGT00390000015714 ENSGT00390000006988 ENSGT00940000156616 ENSGT00390000012980.b ENSGT01090000260100.A ENSGT00940000157078 ENSGT00510000048041 ENSGT00940000160887 ENSGT00940000160955 ENSGT00390000000489 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a ##22 ENSGT01030000234648.a.b.a.a.a ENSGT00730000111329 ENSGT00410000025882.b ENSGT00940000157882 ENSGT00440000034918.r ENSGT00950000182973.a.c.a ENSGT00940000157549 ENSGT00490000043415 ENSGT00730000110997 ENSGT00600000084428.a ENSGT00390000013228 ENSGT00940000155806 ENSGT00940000160792 ENSGT00940000153185.a.a.b ENSGT00390000008767.d Neognathae ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000158700 ENSGT00940000153835.a.a ENSGT00470000042297 ENSGT00950000185061 ENSGT00940000153835.a.b ENSGT00390000015714 ENSGT00390000006988 ENSGT00940000156616 ENSGT00390000012980.b ENSGT01090000260100.A ENSGT00940000157078 ENSGT00510000048041 ENSGT00940000160887 ENSGT00940000160955 ENSGT00390000000489 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a ##22 ENSGT01030000234648.a.b.a.a.a ENSGT00730000111329 ENSGT00410000025882.b ENSGT00940000157882 ENSGT00440000034918.r ENSGT00950000182973.a.c.a ENSGT00940000157549 ENSGT00490000043415 ENSGT00730000110997 ENSGT00600000084428.a ENSGT00390000013228 ENSGT00940000155806 ENSGT00940000160792 ENSGT00940000153185.a.a.b ENSGT00390000008767.d Neognathae_b ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000159691 ENSGT00940000160187 ENSGT00940000158700 ENSGT00940000153835.a.a ENSGT00470000042297 ENSGT00390000015714 ENSGT00390000006988 ENSGT00940000156616 ENSGT00390000012980.b ENSGT01090000260100.A ENSGT00940000157078 ENSGT00510000048041 ENSGT00940000160887 ENSGT00940000160955 ENSGT00390000000489 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a ##22 ENSGT01030000234648.a.b.a.a.a ENSGT00730000111329 ENSGT00410000025882.b ENSGT00940000157882 ENSGT00440000034918.r ENSGT00950000182973.a.c.a ENSGT00940000157549 ENSGT00490000043415 ENSGT00730000110997 ENSGT00600000084428.a ENSGT00390000013228 ENSGT00940000155806 ENSGT00940000160792 ENSGT00940000153185.a.a.b ENSGT00390000008767.d Neognathae_c ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000163644.d ENSGT00940000159691 ENSGT00940000160187 ENSGT00940000158700 ENSGT00940000153835.a.a ENSGT00470000042297 ENSGT00390000015714 ENSGT00390000006988 ENSGT00940000156616 ENSGT00390000012980.b ENSGT01090000260100.A ENSGT00940000157078 ENSGT00510000048041 ENSGT00940000160887 ENSGT00940000160955 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a ##22 ENSGT01030000234648.a.b.a.a.a ENSGT00730000111329 ENSGT00980000202402 ENSGT00940000157882 ENSGT00440000034918.r ENSGT00950000182973.a.c.a ENSGT00940000157549 ENSGT00490000043415 ENSGT00730000110997 ENSGT00600000084428.a ENSGT00390000013228 ENSGT00940000155806 ENSGT00940000160792 ENSGT00940000153185.a.a.b ENSGT00390000008767.d Golden eagle MODERN SPECIES 16 TFEB (ENSACCG00020012423) MDFI (ENSACCG00020012448) FOXP4 (ENSACCG00020012478) ENSACCG00020012512 TREM2 (ENSACCG00020012540) NFYA (ENSACCG00020012588) OARD1 (ENSACCG00020012645) APOBEC2 (ENSACCG00020012676) TSPO2 (ENSACCG00020012685) BAK1 (ENSACCG00020012707) ITPR3 (ENSACCG00020013187) UQCC2 (ENSACCG00020013440) IP6K3 (ENSACCG00020013460) LEMD2 (ENSACCG00020013479) ENSACCG00020013499 ENSACCG00020013519 ##22 GRM4 (ENSACCG00020013536) HMGA1 (ENSACCG00020013561) ENSACCG00020013578 NUDT3 (ENSACCG00020013597) RPS10 (ENSACCG00020013618) PACSIN1 (ENSACCG00020013637) SPDEF (ENSACCG00020013661) ILRUN (ENSACCG00020013698) SNRPC (ENSACCG00020013719) BLTP3A (ENSACCG00020013757) ENSACCG00020013787 ANKS1A (ENSACCG00020014223) ENSACCG00020014760 SCUBE3 (ENSACCG00020014785) RPL10A (ENSACCG00020014808) Kakapo MODERN SPECIES 30 TFEB (ENSSHBG00005013753) MDFI (ENSSHBG00005013778) FOXP4 (ENSSHBG00005013805) ENSSHBG00005014059 ENSSHBG00005014070 TREM2 (ENSSHBG00005014084) NFYA (ENSSHBG00005014091) OARD1 (ENSSHBG00005014103) APOBEC2 (ENSSHBG00005014113) TSPO2 (ENSSHBG00005014125) BAK1 (ENSSHBG00005014138) ITPR3 (ENSSHBG00005014174) UQCC2 (ENSSHBG00005014215) IP6K3 (ENSSHBG00005014223) LEMD2 (ENSSHBG00005014246) ENSSHBG00005014478 ##22 GRM4 (ENSSHBG00005014485) NUDT3 (ENSSHBG00005014490) SMIM29 (ENSSHBG00005014502) RPS10 (ENSSHBG00005014508) PACSIN1 (ENSSHBG00005014517) SPDEF (ENSSHBG00005014525) ILRUN (ENSSHBG00005014536) SNRPC (ENSSHBG00005014545) ENSSHBG00005014557 ENSSHBG00005014571 INKA2 (ENSSHBG00005014581) DDX20 (ENSSHBG00005014590) KCND3 (ENSSHBG00005014608) CTTNBP2NL (ENSSHBG00005014616) WNT2B (ENSSHBG00005014626) Passeriformes ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000159691 ENSGT00940000160187 ENSGT00940000158700 ENSGT00940000153835.a.a ENSGT00470000042297 ENSGT00390000015714 ENSGT00390000006988 ENSGT00940000156616 ENSGT00390000012980.b ENSGT01090000260100.A ENSGT00940000157078 ENSGT00510000048041 ENSGT00940000160887 ENSGT00940000160955 ENSGT00390000000489 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a ##22 ENSGT01030000234648.a.b.a.a.a ENSGT00730000111329 ENSGT00410000025882.b ENSGT00940000157882 ENSGT00440000034918.r ENSGT00950000182973.a.c.a ENSGT00940000157549 ENSGT00490000043415 ENSGT00730000110997 ENSGT00600000084428.a ENSGT00390000013228 ENSGT00940000155806 ENSGT00940000153185.a.a.b ENSGT00390000008767.d ENSGT00940000160911 Great tit MODERN SPECIES 19 MDFI (ENSPMJG00000016258) FOXP4 (ENSPMJG00000016256) ENSPMJG00000016253 ENSPMJG00000016252 TREM2 (ENSPMJG00000016251) NFYA (ENSPMJG00000016250) OARD1 (ENSPMJG00000016249) APOBEC2 (ENSPMJG00000016248) BAK1 (ENSPMJG00000016247) ENSPMJG00000016246 ITPR3 (ENSPMJG00000012531) UQCC2 (ENSPMJG00000012530) IP6K3 (ENSPMJG00000012529) LEMD2 (ENSPMJG00000012528) ENSPMJG00000012527 ENSPMJG00000012526 ##22 GRM4 (ENSPMJG00000012525) HMGA1 (ENSPMJG00000012524) SMIM29 (ENSPMJG00000012523) NUDT3 (ENSPMJG00000012522) PACSIN1 (ENSPMJG00000012521) SPDEF (ENSPMJG00000012520) RPS10 (ENSPMJG00000012519) ILRUN (ENSPMJG00000012517) SNRPC (ENSPMJG00000012516) BLTP3A (ENSPMJG00000012515) ENSPMJG00000012514 ANKS1A (ENSPMJG00000012513) SCUBE3 (ENSPMJG00000012391) RPL10A (ENSPMJG00000012390) ENSPMJG00000012389 Passeriformes_d ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000159691 ENSGT00940000160187 ENSGT00940000158700.n ENSGT00940000153835.a.a ENSGT00470000042297 ENSGT00390000015714 ENSGT00390000006988 ENSGT00940000156616 ENSGT00390000012980.b ENSGT01090000260100.A ENSGT00940000157078 ENSGT00510000048041 ENSGT00940000160887.j ENSGT00940000160955 ENSGT00390000000489 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a ##22 ENSGT01030000234648.a.b.a.a.a ENSGT00730000111329 ENSGT00980000202402 ENSGT00410000025882.b ENSGT00940000157882 ENSGT00440000034918.r ENSGT00950000182973.a.c.a ENSGT00940000157549 ENSGT00490000043415 ENSGT00730000110997 ENSGT00600000084428.a ENSGT00390000013228 ENSGT00940000155806 ENSGT00940000153185.a.a.b ENSGT00390000008767.d Passeriformes_g ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000160187 ENSGT00940000158700.n ENSGT01000000215036 ENSGT00940000153835.a.a ENSGT00470000042297 ENSGT00390000015714 ENSGT00390000006988 ENSGT00940000156616 ENSGT00390000012980.b ENSGT01090000260100.A ENSGT00940000157078 ENSGT00510000048041 ENSGT00940000160887.j ENSGT00940000160955 ENSGT00390000000489 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a ##22 ENSGT01030000234648.a.b.a.a.a ENSGT00730000111329 ENSGT00980000202402 ENSGT00410000025882.b ENSGT00940000157882 ENSGT00440000034918.r ENSGT00950000182973.a.c.a ENSGT00940000157549 ENSGT00490000043415 ENSGT00730000110997 ENSGT00600000084428.a ENSGT00390000013228 ENSGT00940000155806 ENSGT00940000153185.a.a.b ENSGT00390000008767.d Passeroidea ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000159691 ENSGT00940000160187 ENSGT00940000158700.n ENSGT00940000153835.a.a ENSGT00470000042297 ENSGT00390000015714 ENSGT00390000006988 ENSGT00940000156616 ENSGT00390000012980.b ENSGT01090000260100.A ENSGT00940000157078 ENSGT00510000048041 ENSGT00940000160887.j ENSGT00940000160955 ENSGT00390000000489 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a ##22 ENSGT01030000234648.a.b.a.a.a ENSGT00730000111329 ENSGT00980000202402 ENSGT00410000025882.b ENSGT00940000157882 ENSGT00440000034918.r ENSGT00950000182973.a.c.a ENSGT00940000157549 ENSGT00490000043415 ENSGT00730000110997 ENSGT00600000084428.a ENSGT00390000013228 ENSGT00940000155806 ENSGT00940000153185.a.a.b ENSGT00390000008767.d Common canary MODERN SPECIES 62 MDFI (ENSSCAG00000000116) ENSSCAG00000000104 FOXP4 (ENSSCAG00000000094) ENSSCAG00000016897 TREM2 (ENSSCAG00000016895) NFYA (ENSSCAG00000016893) OARD1 (ENSSCAG00000016891) APOBEC2 (ENSSCAG00000016889) TSPO2 (ENSSCAG00000016888) BAK1 (ENSSCAG00000016887) ITPR3 (ENSSCAG00000016393) UQCC2 (ENSSCAG00000016021) IP6K3 (ENSSCAG00000016016) LEMD2 (ENSSCAG00000016012) MLN (ENSSCAG00000016010) ENSSCAG00000015998 ##22 GRM4 (ENSSCAG00000015992) HMGA1 (ENSSCAG00000015991) ENSSCAG00000015990 NUDT3 (ENSSCAG00000015988) RPS10 (ENSSCAG00000015987) PACSIN1 (ENSSCAG00000015981) SPDEF (ENSSCAG00000015977) ILRUN (ENSSCAG00000015976) SNRPC (ENSSCAG00000015974) BLTP3A (ENSSCAG00000015969) ENSSCAG00000015962 ANKS1A (ENSSCAG00000015899) SCUBE3 (ENSSCAG00000015844) ENSSCAG00000015837 RPL10A (ENSSCAG00000015835) Zebra finch MODERN SPECIES 19 ENSTGUG00000027526 TFEB (ENSTGUG00000024407) FOXP4 (ENSTGUG00000001837) ENSTGUG00000001836 ENSTGUG00000024731 TREM2 (ENSTGUG00000001835) NFYA (ENSTGUG00000001832) OARD1 (ENSTGUG00000001830) APOBEC2 (ENSTGUG00000018533) TSPO2 (ENSTGUG00000021855) ITPR3 (ENSTGUG00000001798) UQCC2 (ENSTGUG00000001797) IP6K3 (ENSTGUG00000019985) LEMD2 (ENSTGUG00000001795) ENSTGUG00000026122 ENSTGUG00000001791 ##22 GRM4 (ENSTGUG00000021157) ENSTGUG00000022185 NUDT3 (ENSTGUG00000025458) RPS10 (ENSTGUG00000001782) SPDEF (ENSTGUG00000001781) PACSIN1 (ENSTGUG00000013694) ILRUN (ENSTGUG00000001777) SNRPC (ENSTGUG00000001773) BLTP3A (ENSTGUG00000001768) TAF11 (ENSTGUG00000001766) ANKS1A (ENSTGUG00000001756) SCUBE3 (ENSTGUG00000001750) RPL10A (ENSTGUG00000001749) ZNF76 (ENSTGUG00000001745) DEF6 (ENSTGUG00000001738) Medium ground finch MODERN SPECIES 215 TFEB (ENSGFOG00000012506) MDFI (ENSGFOG00000012504) FOXP4 (ENSGFOG00000012493) ENSGFOG00000012486 ENSGFOG00000012484 ENSGFOG00000012479 NFYA (ENSGFOG00000012476) OARD1 (ENSGFOG00000012469) APOBEC2 (ENSGFOG00000012466) TSPO2 (ENSGFOG00000012449) BAK1 (ENSGFOG00000012443) ITPR3 (ENSGFOG00000012137) IP6K3 (ENSGFOG00000012101) LEMD2 (ENSGFOG00000012096) ENSGFOG00000012092 ENSGFOG00000012087 ##22 GRM4 (ENSGFOG00000012082) ENSGFOG00000012076 NUDT3 (ENSGFOG00000012072) ENSGFOG00000012068 PACSIN1 (ENSGFOG00000012062) ILRUN (ENSGFOG00000012059) SNRPC (ENSGFOG00000012057) BLTP3A (ENSGFOG00000012052) ANKS1A (ENSGFOG00000010716) SCUBE3 (ENSGFOG00000009691) RPL10A (ENSGFOG00000009647) ENSGFOG00000009644 ZNF76 (ENSGFOG00000009638) ENSGFOG00000009636 DEF6 (ENSGFOG00000009628) Flycatcher MODERN SPECIES 18 ENSFALG00000024293 ENSFALG00000028135 USP49 (ENSFALG00000002945) MED20 (ENSFALG00000002933) BYSL (ENSFALG00000026746) CCND3 (ENSFALG00000002849) ENSFALG00000003916 ENSFALG00000023379 ENSFALG00000003903 BAK1 (ENSFALG00000003897) ITPR3 (ENSFALG00000003884) ENSFALG00000025988 IP6K3 (ENSFALG00000003865) LEMD2 (ENSFALG00000003858) ENSFALG00000003856 ENSFALG00000003843 ##22 ENSFALG00000003816 ENSFALG00000025014 ENSFALG00000026051 HMGA1 (ENSFALG00000003795) ENSFALG00000028104 NUDT3 (ENSFALG00000003788) RPS10 (ENSFALG00000025571) PACSIN1 (ENSFALG00000003773) SPDEF (ENSFALG00000027495) ILRUN (ENSFALG00000023018) ENSFALG00000028356 BLTP3A (ENSFALG00000003722) ENSFALG00000024921 ANKS1A (ENSFALG00000003711) SCUBE3 (ENSFALG00000003706) Galloanserae ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00940000158700 ENSGT00940000153835.a.a ENSGT00470000042297 ENSGT00950000185061 ENSGT00940000153835.a.b ENSGT00390000015714 ENSGT00390000006988 ENSGT00940000156616 ENSGT00390000012980.b ENSGT01090000260100.A ENSGT00940000157078 ENSGT00510000048041 ENSGT00940000160887 ENSGT00940000160955 ENSGT00390000000489 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a ##22 ENSGT01030000234648.a.b.a.a.a ENSGT00730000111329 ENSGT00410000025882.b ENSGT00940000157882 ENSGT00440000034918.r ENSGT00950000182973.a.c.a ENSGT00940000157549 ENSGT00490000043415 ENSGT00730000110997 ENSGT00600000084428.a ENSGT00390000013228 ENSGT00940000155806 ENSGT00940000160792 ENSGT00940000153185.a.a.b ENSGT00390000008767.d Anatidae ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT00940000157365 ENSGT00940000165883 ENSGT00390000017353 ENSGT01030000234578.B.b ENSGT00950000183117.a.b ENSGT00390000015714 ENSGT00390000006988 ENSGT00940000156616 ENSGT00390000012980.b ENSGT01090000260100.A ENSGT00940000157078 ENSGT00510000048041 ENSGT00940000160887.g ENSGT00940000160955 ENSGT00390000000489 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a ##22 ENSGT01030000234648.a.b.a.a.a ENSGT01030000235038 ENSGT00940000157882 ENSGT00440000034918.r ENSGT00950000182973.a.c.a ENSGT00940000157549 ENSGT00490000043415 ENSGT00730000110997 ENSGT00600000084428.a ENSGT00390000013228 ENSGT00940000155806 ENSGT00940000160792 ENSGT00940000153185.a.a.b ENSGT00390000008767.d ENSGT00940000160911 Pink-footed goose MODERN SPECIES 237 UBE2T (ENSABRG00000011089) ENSABRG00000011096 LRIF1 (ENSABRG00000011108) DRAM2 (ENSABRG00000011112) CEPT1 (ENSABRG00000011119) NFYA (ENSABRG00000011138) OARD1 (ENSABRG00000011155) APOBEC2 (ENSABRG00000011171) TSPO2 (ENSABRG00000011186) BAK1 (ENSABRG00000011204) ITPR3 (ENSABRG00000011227) UQCC2 (ENSABRG00000011317) IP6K3 (ENSABRG00000011341) LEMD2 (ENSABRG00000011346) MLN (ENSABRG00000011350) ENSABRG00000011362 ##22 GRM4 (ENSABRG00000011490) ENSABRG00000011498 NUDT3 (ENSABRG00000011504) RPS10 (ENSABRG00000011511) PACSIN1 (ENSABRG00000011521) SPDEF (ENSABRG00000011532) ILRUN (ENSABRG00000011537) ENSABRG00000011549 BLTP3A (ENSABRG00000011558) ENSABRG00000011563 ANKS1A (ENSABRG00000011633) ENSABRG00000012693 SCUBE3 (ENSABRG00000012752) RPL10A (ENSABRG00000013328) ZNF76 (ENSABRG00000013332) Duck MODERN SPECIES 18 TIMM17A (ENSAPLG00000016139) ADIPOR1 (ENSAPLG00000016148) ENSAPLG00000016240 UBE2T (ENSAPLG00000016278) ENSAPLG00000016298 LRIF1 (ENSAPLG00000001746) CEPT1 (ENSAPLG00000002219) DRAM2 (ENSAPLG00000001918) NFYA (ENSAPLG00000002694) OARD1 (ENSAPLG00000002869) APOBEC2 (ENSAPLG00000002895) TSPO2 (ENSAPLG00000002897) BAK1 (ENSAPLG00000003058) ITPR3 (ENSAPLG00000003078) LEMD2 (ENSAPLG00000028691) ENSAPLG00000005325 ##22 ENSAPLG00000005514 NUDT3 (ENSAPLG00000026621) RPS10 (ENSAPLG00000008728) PACSIN1 (ENSAPLG00000008350) SPDEF (ENSAPLG00000017680) ILRUN (ENSAPLG00000019995) SNRPC (ENSAPLG00000023212) BLTP3A (ENSAPLG00000007589) ANKS1A (ENSAPLG00000006934) ENSAPLG00000023437 ENSAPLG00000006673 SOX13 (ENSAPLG00000016687) ETNK2 (ENSAPLG00000012663) REN (ENSAPLG00000012376) GOLT1A (ENSAPLG00000027994) Phasianidae ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000160187 ENSGT00940000158700 ENSGT00940000153835.a.a ENSGT00940000153835.b ENSGT00940000153835.a.b ENSGT00390000015714 ENSGT00390000006988 ENSGT00940000156616 ENSGT00390000012980.b ENSGT01090000260100.A ENSGT00940000157078 ENSGT00510000048041 ENSGT00940000160887 ENSGT00940000160955 ENSGT00390000000489 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a ##22 ENSGT01030000234648.a.b.a.a.a ENSGT00730000111329 ENSGT00410000025882.b ENSGT00940000157882 ENSGT00440000034918.r ENSGT00950000182973.a.c.a ENSGT00940000157549 ENSGT00490000043415 ENSGT00730000110997 ENSGT00600000084428.a ENSGT00390000013228 ENSGT00940000155806 ENSGT00940000160792 ENSGT00940000153185.a.a.b ENSGT00390000008767.d Phasianidae_b ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000160187 ENSGT00940000158700 ENSGT00940000153835.a.a ENSGT00940000153835.b ENSGT00940000153835.a.b ENSGT00390000015714 ENSGT00390000006988 ENSGT00940000156616 ENSGT00390000012980.b ENSGT01090000260100.A ENSGT00940000157078 ENSGT00510000048041 ENSGT00940000160887 ENSGT00940000160955 ENSGT00390000000489 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a ##22 ENSGT01030000234648.a.b.a.a.a ENSGT00730000111329 ENSGT00410000025882.b ENSGT00940000157882 ENSGT00440000034918.r ENSGT00950000182973.a.c.a ENSGT00940000157549 ENSGT00490000043415 ENSGT00730000110997 ENSGT00600000084428.a ENSGT00390000013228 ENSGT00940000155806 ENSGT00940000160792.d ENSGT00940000153185.a.a.b ENSGT00390000008767.d Turkey MODERN SPECIES 20 ENSMGAG00000018669 ENSMGAG00000020028 ENSMGAG00000005929 ENSMGAG00000006015 ENSMGAG00000005996 ENSMGAG00000006054 ILRUN (ENSMGAG00000006067) ENSMGAG00000002732 ENSMGAG00000002725 ENSMGAG00000002756 ENSMGAG00000002783 ENSMGAG00000002804 ENSMGAG00000018879 ENSMGAG00000006072 ENSMGAG00000019397 ENSMGAG00000006145 ##22 ENSMGAG00000009787 UQCC2 (ENSMGAG00000018544) ENSMGAG00000009872 LEMD2 (ENSMGAG00000005990) ENSMGAG00000020491 ENSMGAG00000010175 ENSMGAG00000009782 ENSMGAG00000010170 ENSMGAG00000010140 ENSMGAG00000010124 ENSMGAG00000020405 ENSMGAG00000010137 ENSMGAG00000017990 ENSMGAG00000018095 AHCYL1 (ENSMGAG00000002223) Chicken MODERN SPECIES 18 FOXP4 (ENSGALG00010027702) TREMB2 (ENSGALG00010027695) TREM2 (ENSGALG00010027674) TREMB1 (ENSGALG00010027664) NFYA (ENSGALG00010027648) OARD1 (ENSGALG00010027627) APOBEC2 (ENSGALG00010027623) TSPO2 (ENSGALG00010027621) BAK1 (ENSGALG00010027612) ENSGALG00010027604 ITPR3 (ENSGALG00010027594) C26H6ORF125 (ENSGALG00010027579) IP6K3 (ENSGALG00010027265) LEMD2 (ENSGALG00010027260) MLN (ENSGALG00010027373) OPN1MSW (ENSGALG00010027226) ##22 GRM4 (ENSGALG00010024446) HMGA1 (ENSGALG00010026300) SMIM29 (ENSGALG00010026192) NUDT3 (ENSGALG00010026184) RPS10 (ENSGALG00010026148) PACSIN1 (ENSGALG00010026124) SPDEF (ENSGALG00010026109) C6orf106 (ENSGALG00010026094) SNRPC (ENSGALG00010026088) BLTP3A (ENSGALG00010026068) TAF11 (ENSGALG00010026051) ANKS1A (ENSGALG00010026001) ENSGALG00010025941 SCUBE3 (ENSGALG00010025917) RPL10A (ENSGALG00010025904) Japanese quail MODERN SPECIES 18 MDFI (ENSCJPG00005018940) FOXP4 (ENSCJPG00005018938) ENSCJPG00005018936 ENSCJPG00005018935 ENSCJPG00005018934 NFYA (ENSCJPG00005018933) OARD1 (ENSCJPG00005018932) APOBEC2 (ENSCJPG00005018931) TSPO2 (ENSCJPG00005018930) BAK1 (ENSCJPG00005018929) ITPR3 (ENSCJPG00005018010) UQCC2 (ENSCJPG00005018009) IP6K3 (ENSCJPG00005018008) LEMD2 (ENSCJPG00005018007) MLN (ENSCJPG00005018006) ENSCJPG00005018003 ##22 GRM4 (ENSCJPG00005017950) ENSCJPG00005017949 SMIM29 (ENSCJPG00005017948) NUDT3 (ENSCJPG00005017947) RPS10 (ENSCJPG00005017946) PACSIN1 (ENSCJPG00005017903) SPDEF (ENSCJPG00005017897) ILRUN (ENSCJPG00005017896) BLTP3A (ENSCJPG00005017862) ENSCJPG00005017861 ANKS1A (ENSCJPG00005017800) SCUBE3 (ENSCJPG00005017799) RPL10A (ENSCJPG00005017798) ENSCJPG00005017797 DEF6 (ENSCJPG00005017796) African ostrich MODERN SPECIES 505 ENSSCUG00000005003 TREM2 (ENSSCUG00000005005) NFYA (ENSSCUG00000005007) OARD1 (ENSSCUG00000005008) APOBEC2 (ENSSCUG00000005011) BAK1 (ENSSCUG00000005012) ITPR3 (ENSSCUG00000005311) ENSSCUG00000005955 IP6K3 (ENSSCUG00000005956) ENSSCUG00000005959 ENSSCUG00000005961 ##22 GRM4 (ENSSCUG00000005965) NUDT3 (ENSSCUG00000005966) RPS10 (ENSSCUG00000005968) PACSIN1 (ENSSCUG00000005970) ILRUN (ENSSCUG00000005972) ENSSCUG00000005973 BLTP3A (ENSSCUG00000005976) ENSSCUG00000005990 ANKS1A (ENSSCUG00000006006) ENSSCUG00000006009 RPL10A (ENSSCUG00000006016) ZNF76 (ENSSCUG00000006018) PPARD (ENSSCUG00000006020) ENSSCUG00000006021 ##13 FANCE (ENSSCUG00000006023) Coelacanth MODERN SPECIES 480 PTPN7 (ENSLACG00000014965) LGR6 (ENSLACG00000015257) UBE2T (ENSLACG00000015472) ENSLACG00000015518 SYT2 (ENSLACG00000015670) OARD1 (ENSLACG00000015951) APOBEC2 (ENSLACG00000015985) TSPO2 (ENSLACG00000022560) UNC5CL (ENSLACG00000016048) BAK1 (ENSLACG00000016117) ENSLACG00000022188 ENSLACG00000016209 UQCC2 (ENSLACG00000016392) IP6K3 (ENSLACG00000016436) LEMD2 (ENSLACG00000016500) opn1mw1 (ENSLACG00000016590) ##22 Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES 605 ENSGT00940000156616 ENSGT00390000006988 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a ##22 ENSGT00390000014270 Reedfish MODERN SPECIES 11 ENSECRG00000013402 SRSF3 (ENSECRG00000013416) SRSF3 (ENSECRG00000013440) ENSECRG00000013460 ENSECRG00000013471 fkbp5 (ENSECRG00000013521) ENSECRG00000013612 ENSECRG00000013658 ENSECRG00000013681 arl8a (ENSECRG00000013702) GPR37L1 (ENSECRG00000013722) ELF3 (ENSECRG00000013734) oard1 (ENSECRG00000013773) apobec2b (ENSECRG00000013828) itpr3 (ENSECRG00000013863) opn1mw1 (ENSECRG00000013984) ##22 ENSECRG00000014009 ENSECRG00000014026 ENSECRG00000014089 ENSECRG00000014231 ENSECRG00000014275 ENSECRG00000014315 ENSECRG00000014344 ENSECRG00000014439 ENSECRG00000014571 PLXNA2 (ENSECRG00000014644) ENSECRG00000014772 ENSECRG00000014804 ENSECRG00000014843 ENSECRG00000014914 ENSECRG00000015073 Neopterygii ANCESTRAL SPECIES 212 ENSGT00940000154189.A ENSGT00940000157493 ENSGT00940000153792.B ENSGT00980000201766 ENSGT00940000159669 ENSGT00940000160379 ENSGT00940000159918.a.b ENSGT00910000144115.a ENSGT00940000158726 ENSGT00940000160979 ENSGT00940000159657.d ENSGT01100000263518.B.b.a ENSGT00940000158955 ENSGT00940000156616 ENSGT00390000006988 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a ##22 ENSGT00390000014270 Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a ##22 Clupeocephala DUPLICATION Clupeocephala DUPLICATION Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000154388 ENSGT00940000154110.a ENSGT00940000166668 ENSGT00390000012071 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000160058 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773 ENSGT01100000263542.B.a ENSGT00940000160379 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000158726 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000158891 ENSGT00940000154388 ENSGT00940000154110.a ENSGT00940000166668 ENSGT00390000012071 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000160058 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773 ENSGT00940000160379 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000158726 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00390000005497 ENSGT00940000178103 ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00390000011228.b.a.e.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000157304 ENSGT00940000165342.a ENSGT00390000008325.b.a ENSGT00940000154899.fb.b ENSGT00940000153709.A.f Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000154388 ENSGT00940000154110.a ENSGT00940000166668 ENSGT00390000012071 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000166177 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000160058 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773 ENSGT00940000160379 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000158726 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00390000005497 ENSGT00940000178103 ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00390000011228.b.a.e.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000157304 ENSGT00940000165342.a ENSGT00390000008325.b.a ENSGT00940000154899.fb.b ENSGT00940000153709.A.f Pinecone sodierfish DUPLICATION Pinecone sodierfish DUPLICATION Pinecone sodierfish DUPLICATION Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 19 ENSMMDG00005005828 EIF4ENIF1 (ENSMMDG00005005804) PATZ1 (ENSMMDG00005005796) ENSMMDG00005005785 SLC2A11 (ENSMMDG00005005284) tgfa (ENSMMDG00005005273) hdhd3 (ENSMMDG00005005270) trub2 (ENSMMDG00005005268) srsf3a (ENSMMDG00005005266) fkbp5 (ENSMMDG00005005247) slc6a22.1 (ENSMMDG00005004379) slc6a22.2 (ENSMMDG00005004005) opn1mw1 (ENSMMDG00005003988) ##22 ENSMMDG00005014366 ##22 ENSMMDG00005014231 ##22 ENSMMDG00005014196 ##22 ENSMMDG00005014190 ##22 ENSMMDG00005014055 ##22 synprb (ENSMMDG00005013988) ENSMMDG00005013780 PTPRG (ENSMMDG00005013274) ENSMMDG00005013249 ENSMMDG00005013244 ENSMMDG00005013232 ENSMMDG00005013228 CAMK1 (ENSMMDG00005013217) pbrm1l (ENSMMDG00005012721) stau1 (ENSMMDG00005012622) ENSMMDG00005012611 ENSMMDG00005012607 KCNB1 (ENSMMDG00005012602) Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 19 EIF4ENIF1 (ENSMMDG00005005804) PATZ1 (ENSMMDG00005005796) ENSMMDG00005005785 SLC2A11 (ENSMMDG00005005284) tgfa (ENSMMDG00005005273) hdhd3 (ENSMMDG00005005270) trub2 (ENSMMDG00005005268) srsf3a (ENSMMDG00005005266) fkbp5 (ENSMMDG00005005247) slc6a22.1 (ENSMMDG00005004379) slc6a22.2 (ENSMMDG00005004005) opn1mw1 (ENSMMDG00005003988) ##22 ENSMMDG00005014366 ##22 ENSMMDG00005014231 ##22 ENSMMDG00005014196 ##22 ENSMMDG00005014190 ##22 ENSMMDG00005014055 ##22 synprb (ENSMMDG00005013988) ENSMMDG00005013780 PTPRG (ENSMMDG00005013274) ENSMMDG00005013249 ENSMMDG00005013244 ENSMMDG00005013232 ENSMMDG00005013228 CAMK1 (ENSMMDG00005013217) pbrm1l (ENSMMDG00005012721) stau1 (ENSMMDG00005012622) ENSMMDG00005012611 ENSMMDG00005012607 KCNB1 (ENSMMDG00005012602) ptgis (ENSMMDG00005012309) Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 19 sxph (ENSMMDG00005005844) ENSMMDG00005005828 EIF4ENIF1 (ENSMMDG00005005804) PATZ1 (ENSMMDG00005005796) ENSMMDG00005005785 SLC2A11 (ENSMMDG00005005284) tgfa (ENSMMDG00005005273) hdhd3 (ENSMMDG00005005270) trub2 (ENSMMDG00005005268) srsf3a (ENSMMDG00005005266) fkbp5 (ENSMMDG00005005247) slc6a22.1 (ENSMMDG00005004379) slc6a22.2 (ENSMMDG00005004005) opn1mw1 (ENSMMDG00005003988) ##22 ENSMMDG00005014366 ##22 ENSMMDG00005014231 ##22 ENSMMDG00005014196 ##22 ENSMMDG00005014190 ##22 ENSMMDG00005014055 ##22 synprb (ENSMMDG00005013988) ENSMMDG00005013780 PTPRG (ENSMMDG00005013274) ENSMMDG00005013249 ENSMMDG00005013244 ENSMMDG00005013232 ENSMMDG00005013228 CAMK1 (ENSMMDG00005013217) pbrm1l (ENSMMDG00005012721) stau1 (ENSMMDG00005012622) ENSMMDG00005012611 ENSMMDG00005012607 Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 19 sirt4 (ENSMMDG00005005860) sxph (ENSMMDG00005005844) ENSMMDG00005005828 EIF4ENIF1 (ENSMMDG00005005804) PATZ1 (ENSMMDG00005005796) ENSMMDG00005005785 SLC2A11 (ENSMMDG00005005284) tgfa (ENSMMDG00005005273) hdhd3 (ENSMMDG00005005270) trub2 (ENSMMDG00005005268) srsf3a (ENSMMDG00005005266) fkbp5 (ENSMMDG00005005247) slc6a22.1 (ENSMMDG00005004379) slc6a22.2 (ENSMMDG00005004005) opn1mw1 (ENSMMDG00005003988) ##22 ENSMMDG00005014366 ##22 ENSMMDG00005014231 ##22 ENSMMDG00005014196 ##22 ENSMMDG00005014190 ##22 ENSMMDG00005014055 ##22 synprb (ENSMMDG00005013988) ENSMMDG00005013780 PTPRG (ENSMMDG00005013274) ENSMMDG00005013249 ENSMMDG00005013244 ENSMMDG00005013232 ENSMMDG00005013228 CAMK1 (ENSMMDG00005013217) pbrm1l (ENSMMDG00005012721) stau1 (ENSMMDG00005012622) ENSMMDG00005012611 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000154388 ENSGT00940000154110.a ENSGT00940000166668 ENSGT00390000012071 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000166177 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000160058 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773 ENSGT00940000160379 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000158726 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00390000005497 ENSGT00940000178103 ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00390000011228.b.a.e.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000157304 ENSGT00940000165342.a ENSGT00390000008325.b.a ENSGT00940000154899.fb.b ENSGT00940000153709.A.f Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000154388 ENSGT00940000154110.a ENSGT00940000166668 ENSGT00390000012071 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000166177 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000160058 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773 ENSGT00940000160379 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000158726 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00390000005497 ENSGT00940000178103 ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00390000011228.b.a.e.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000157304 ENSGT00940000165342.a ENSGT00390000008325.b.a ENSGT00940000154899.fb.b ENSGT00940000153709.A.f Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000154388 ENSGT00940000154110.a ENSGT00940000166668 ENSGT00390000012071 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000166177 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000160058 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773 ENSGT00940000160379 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000158726 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00390000005497 ENSGT00940000178103 ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00390000011228.b.a.e.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000157304 ENSGT00940000165342.a ENSGT00390000008325.b.a ENSGT00940000154899.fb.b ENSGT00940000153709.A.f Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000002240 ENSGT00940000158891 ENSGT00940000154388 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000012071 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000160058 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773 ENSGT00940000160379 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000158726 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00390000005497 ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000157304 ENSGT00940000154899.fb.b ENSGT00940000153709.A.f ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b ENSGT01050000244882.a.a.b.a.a ENSGT00950000183006.A.a.a.b ENSGT00950000182998.C.b.b Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000002240 ENSGT00940000158891 ENSGT00940000154388 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000012071 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000160058 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773 ENSGT00940000160379 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000158726 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00390000005497 ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000157304 ENSGT00940000154899.fb.b ENSGT00940000153709.A.f ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b ENSGT01050000244882.a.a.b.a.a ENSGT00950000183006.A.a.a.b ENSGT00950000182998.C.b.b Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000002240 ENSGT00940000158891 ENSGT00940000154388 ENSGT00940000166668 ENSGT00390000012071 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000160058 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773 ENSGT00940000160379 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000158726 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00390000005497 ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000157304 ENSGT00940000154899.fb.b ENSGT00940000153709.A.f ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b ENSGT01050000244882.a.a.b.a.a ENSGT00950000183006.A.a.a.b ENSGT00950000182998.C.b.b Mangrove rivulus MODERN SPECIES 10 sxph (ENSKMAG00000008278) ENSKMAG00000008219 EIF4ENIF1 (ENSKMAG00000008185) PATZ1 (ENSKMAG00000008157) ENSKMAG00000008127 ENSKMAG00000007971 hdhd3 (ENSKMAG00000007904) tgfa (ENSKMAG00000007895) trub2 (ENSKMAG00000007861) ENSKMAG00000007843 srsf3a (ENSKMAG00000007829) fkbp5 (ENSKMAG00000007812) slc6a22.1 (ENSKMAG00000007782) slc6a22.2 (ENSKMAG00000007753) ENSKMAG00000007725 ##22 ENSKMAG00000007693 ##22 synprb (ENSKMAG00000007673) ENSKMAG00000007463 PTPRG (ENSKMAG00000007347) ENSKMAG00000007328 ENSKMAG00000007313 CAMK1 (ENSKMAG00000007272) pbrm1l (ENSKMAG00000007201) stau1 (ENSKMAG00000007135) KCNB1 (ENSKMAG00000007106) ptgis (ENSKMAG00000006899) SRGAP3 (ENSKMAG00000006834) OXTR (ENSKMAG00000006821) cav4a (ENSKMAG00000006815) ENSKMAG00000006803 rrp9 (ENSKMAG00000006788) Turquoise killifish MODERN SPECIES 1619 PPIL1 (ENSNFUG00015021758) CU855953.1 (ENSNFUG00015021770) TSPO (ENSNFUG00015021774) SIRT4 (ENSNFUG00015021777) ENSNFUG00015021783 EIF4ENIF1 (ENSNFUG00015021787) PATZ1 (ENSNFUG00015021798) ENSNFUG00015021803 tgfa (ENSNFUG00015022056) HDHD3 (ENSNFUG00015022062) trub2 (ENSNFUG00015022069) ENSNFUG00015022099 srsf3a (ENSNFUG00015022103) fkbp5 (ENSNFUG00015022105) SLC6A13 (ENSNFUG00015022130) opn1mw1 (ENSNFUG00015022200) ##22 SYNPR (ENSNFUG00015022226) CADPSB (ENSNFUG00015022397) CA16B (ENSNFUG00015024541) ENSNFUG00015024855 ENSNFUG00015024857 ENSNFUG00015024858 cfap20dc (ENSNFUG00015024860) ENSNFUG00015024861 CAMK1 (ENSNFUG00015024900) pbrm1l (ENSNFUG00015025092) STAU1 (ENSNFUG00015004728) KCNB1 (ENSNFUG00015004774) PTGIS (ENSNFUG00015004815) SRGAP3 (ENSNFUG00015005261) ENSNFUG00015006951 Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000002240 ENSGT00940000158891 ENSGT00940000154388 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000012071 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000160058 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773 ENSGT00940000160379 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000158726 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00390000005497 ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000157304 ENSGT00940000154899.fb.b ENSGT00940000153709.A.f ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b ENSGT01050000244882.a.a.b.a.a ENSGT00950000183006.A.a.a.b ENSGT00950000182998.C.b.b Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000002240 ENSGT00940000158891 ENSGT00940000154388 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000012071 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000160058 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773 ENSGT00940000160379 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000158726 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00390000005497 ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000157304 ENSGT00940000154899.fb.b.b ENSGT00940000153709.A.f ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b ENSGT01050000244882.a.a.b.a.a ENSGT00950000183006.A.a.a.b ENSGT00950000182998.C.b.b Poecilia ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00390000002240 ENSGT00940000158891 ENSGT00940000154388 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000012071 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000160058 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773 ENSGT00940000160379 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000158726 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00390000005497 ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000157304 ENSGT00940000154899.fb.b.b ENSGT00940000153709.A.f ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b ENSGT01050000244882.a.a.b.a.a ENSGT00950000183006.A.a.a.b ENSGT00950000182998.C.b.b NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000002240 ENSGT00940000158891 ENSGT00940000154388 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000012071 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000160058 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773 ENSGT00940000160379 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000158726 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00390000005497 ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000157304 ENSGT00940000154899.fb.b.b ENSGT00940000153709.A.f ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b ENSGT01050000244882.a.a.b.a.a ENSGT00950000183006.A.a.a.b ENSGT00950000182998.C.b.b Amazon molly MODERN SPECIES 254 zgc:112163 (ENSPFOG00000020367) sirt4 (ENSPFOG00000018154) sxph (ENSPFOG00000018133) SFI1 (ENSPFOG00000018097) EIF4ENIF1 (ENSPFOG00000018072) PATZ1 (ENSPFOG00000018058) SLC2A11 (ENSPFOG00000018035) tgfa (ENSPFOG00000022903) hdhd3 (ENSPFOG00000018032) trub2 (ENSPFOG00000018018) ENSPFOG00000024194 srsf3a (ENSPFOG00000018005) fkbp5 (ENSPFOG00000017970) slc6a22.1 (ENSPFOG00000017791) slc6a22.2 (ENSPFOG00000017541) ENSPFOG00000017510 ##22 ENSPFOG00000017487 ##22 synprb (ENSPFOG00000017471) ENSPFOG00000017467 PTPRG (ENSPFOG00000017406) cfap20dc (ENSPFOG00000017372) CAMK1 (ENSPFOG00000017343) pbrm1l (ENSPFOG00000017300) stau1 (ENSPFOG00000017253) KCNB1 (ENSPFOG00000017250) ptgis (ENSPFOG00000017222) SRGAP3 (ENSPFOG00000017034) OXTR (ENSPFOG00000016999) cav4a (ENSPFOG00000016995) ENSPFOG00000016992 ENSPFOG00000016991 Sailfin molly MODERN SPECIES 585 zgc:112163 (ENSPLAG00000010301) sirt4 (ENSPLAG00000010305) sxph (ENSPLAG00000010362) SFI1 (ENSPLAG00000010384) EIF4ENIF1 (ENSPLAG00000010395) PATZ1 (ENSPLAG00000010425) SLC2A11 (ENSPLAG00000010459) tgfa (ENSPLAG00000010466) hdhd3 (ENSPLAG00000010477) trub2 (ENSPLAG00000010484) ENSPLAG00000010491 srsf3a (ENSPLAG00000010499) fkbp5 (ENSPLAG00000010504) slc6a22.1 (ENSPLAG00000010543) slc6a22.2 (ENSPLAG00000010581) ENSPLAG00000010607 ##22 ENSPLAG00000011920 ##22 synprb (ENSPLAG00000012108) Guppy MODERN SPECIES 457 tomm6 (ENSPREG00000002252) sirt4 (ENSPREG00000002272) sxph (ENSPREG00000002303) ENSPREG00000002357 EIF4ENIF1 (ENSPREG00000002386) PATZ1 (ENSPREG00000002440) SLC2A11 (ENSPREG00000002470) tgfa (ENSPREG00000002503) hdhd3 (ENSPREG00000002532) trub2 (ENSPREG00000002549) ENSPREG00000002590 srsf3a (ENSPREG00000002610) fkbp5 (ENSPREG00000002675) slc6a22.1 (ENSPREG00000002693) slc6a22.2 (ENSPREG00000002732) ENSPREG00000002751 ##22 ENSPREG00000002827 ##22 synprb (ENSPREG00000002900) ENSPREG00000002986 PTPRG (ENSPREG00000003236) cfap20dc (ENSPREG00000003271) ENSPREG00000003296 CAMK1 (ENSPREG00000003322) pbrm1l (ENSPREG00000003383) stau1 (ENSPREG00000003477) KCNB1 (ENSPREG00000003499) ptgis (ENSPREG00000003505) SRGAP3 (ENSPREG00000003536) OXTR (ENSPREG00000003635) ENSPREG00000003638 cav4a (ENSPREG00000003651) Platyfish MODERN SPECIES 12 zgc:112163 (ENSXMAG00000019907) sirt4 (ENSXMAG00000028241) sxph (ENSXMAG00000015574) SFI1 (ENSXMAG00000015570) EIF4ENIF1 (ENSXMAG00000015541) PATZ1 (ENSXMAG00000015531) ENSXMAG00000015500 tgfa (ENSXMAG00000015497) hdhd3 (ENSXMAG00000015492) trub2 (ENSXMAG00000015478) ENSXMAG00000029063 srsf3a (ENSXMAG00000015454) fkbp5 (ENSXMAG00000015416) slc6a22.1 (ENSXMAG00000015360) slc6a22.2 (ENSXMAG00000015285) ENSXMAG00000015275 ##22 ENSXMAG00000015253 ##22 synprb (ENSXMAG00000015238) ENSXMAG00000022668 ENSXMAG00000015230 PTPRG (ENSXMAG00000023102) cfap20dc (ENSXMAG00000014709) ENSXMAG00000027028 CAMK1 (ENSXMAG00000016140) pbrm1l (ENSXMAG00000016160) stau1 (ENSXMAG00000016175) KCNB1 (ENSXMAG00000016193) ptgis (ENSXMAG00000016194) SRGAP3 (ENSXMAG00000016217) OXTR (ENSXMAG00000016299) cav4a (ENSXMAG00000016303) NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000158891 ENSGT00940000154388 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000012071 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000161061.b.x ENSGT00940000161061.b.w.b ENSGT00940000160058 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773 ENSGT00940000160379 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000158726 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00390000005497 ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000157304 ENSGT00940000154899.fb.b ENSGT00940000153709.A.f ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b ENSGT01050000244882.a.a.b.a.a ENSGT00950000183006.A.a.a.b ENSGT00950000182998.C.b.b Sheepshead minnow MODERN SPECIES 1272 ENSCVAG00000009294 synprb (ENSCVAG00000009700) ENSCVAG00000009729 ##22 ENSCVAG00000009753 ##22 ENSCVAG00000009764 ##22 slc6a22.2 (ENSCVAG00000009796) slc6a22.1 (ENSCVAG00000009821) fkbp5 (ENSCVAG00000009838) srsf3a (ENSCVAG00000009865) ENSCVAG00000000809 trub2 (ENSCVAG00000009901) hdhd3 (ENSCVAG00000009902) tgfa (ENSCVAG00000009914) ENSCVAG00000009927 Mummichog MODERN SPECIES 2305 sirt4 (ENSFHEG00000014872) sxph (ENSFHEG00000014862) SFI1 (ENSFHEG00000000358) EIF4ENIF1 (ENSFHEG00000014788) PATZ1 (ENSFHEG00000014755) ENSFHEG00000014726 ENSFHEG00000014705 tgfa (ENSFHEG00000014669) hdhd3 (ENSFHEG00000014663) trub2 (ENSFHEG00000014655) ENSFHEG00000014620 srsf3a (ENSFHEG00000014610) fkbp5 (ENSFHEG00000014553) slc6a22.1 (ENSFHEG00000014526) slc6a22.2 (ENSFHEG00000014474) ENSFHEG00000014365 ##22 synprb (ENSFHEG00000014323) ENSFHEG00000013898 PTPRG (ENSFHEG00000013802) cfap20dc (ENSFHEG00000013787) ENSFHEG00000013771 CAMK1 (ENSFHEG00000013750) pbrm1l (ENSFHEG00000013719) stau1 (ENSFHEG00000013517) KCNB1 (ENSFHEG00000013464) ptgis (ENSFHEG00000013447) SRGAP3 (ENSFHEG00000013436) OXTR (ENSFHEG00000013425) cav4a (ENSFHEG00000013419) ENSFHEG00000013403 rrp9 (ENSFHEG00000013392) Oryzias ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000002240 ENSGT00940000158891 ENSGT00940000154388 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000012071 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000160058 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773 ENSGT00940000160379 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000158726 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b.w ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b.x ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00390000005497 ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000157304 ENSGT00940000154899.fb.b ENSGT00940000153709.A.f ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b ENSGT01050000244882.a.a.b.a.a ENSGT00950000183006.A.a.a.b Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 85 ENSGT00390000002240 ENSGT00940000158891 ENSGT00940000154388.c ENSGT00940000154388.d ENSGT00390000012071 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000160058 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773.c ENSGT00940000160379 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000158726 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b.w ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b.x ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 19 zgc:112163 (ENSORLG00000019928) sirt4 (ENSORLG00000019934) sxph (ENSORLG00000019946) ENSORLG00000025902 eif4enif1 (ENSORLG00000019961) PATZ1 (ENSORLG00000027129) SLC2A11 (ENSORLG00000019991) tgfa (ENSORLG00000023298) hdhd3 (ENSORLG00000028269) trub2 (ENSORLG00000020011) ENSORLG00000024741 srsf3a (ENSORLG00000020054) fkbp5 (ENSORLG00000029600) slc6a22.1 (ENSORLG00000020091) ENSORLG00000023153 kfh-g (ENSORLG00000020100) ##22 ENSORLG00000028704 ##22 ENSORLG00000020133 ##22 synprb (ENSORLG00000026402) ENSORLG00000025356 ENSORLG00000030464 PTPRG (ENSORLG00000020215) ENSORLG00000027895 Chinese medaka MODERN SPECIES 3331 ENSOSIG00000002213 ##22 Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000002240 ENSGT00940000158891 ENSGT00940000154388 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000012071 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000160058 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773 ENSGT00940000160379 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000158726 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b.w ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b.x ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00390000005497 ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000157304 ENSGT00940000154899.fb.b ENSGT00940000153709.A.f ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b ENSGT01050000244882.a.a.b.a.a ENSGT00950000183006.A.a.a.b Javanese ricefish MODERN SPECIES 19 zgc:112163 (ENSOJAG00000015377) sirt4 (ENSOJAG00000015369) sxph (ENSOJAG00000015229) ENSOJAG00000015215 EIF4ENIF1 (ENSOJAG00000015181) PATZ1 (ENSOJAG00000015149) SLC2A11 (ENSOJAG00000014798) tgfa (ENSOJAG00000014767) hdhd3 (ENSOJAG00000014754) trub2 (ENSOJAG00000014724) ENSOJAG00000014707 srsf3a (ENSOJAG00000014634) fkbp5 (ENSOJAG00000014430) slc6a22.1 (ENSOJAG00000013860) slc6a22.2 (ENSOJAG00000013176) ENSOJAG00000012957 ##22 ENSOJAG00000012883 ##22 synprb (ENSOJAG00000012866) ENSOJAG00000012081 PTPRG (ENSOJAG00000010037) cfap20dc (ENSOJAG00000009907) ENSOJAG00000009882 CAMK1 (ENSOJAG00000009200) pbrm1l (ENSOJAG00000003954) stau1 (ENSOJAG00000003262) KCNB1 (ENSOJAG00000003247) ptgis (ENSOJAG00000003197) SRGAP3 (ENSOJAG00000001990) OXTR (ENSOJAG00000001760) cav4a (ENSOJAG00000001753) ENSOJAG00000001743 Indian medaka MODERN SPECIES 8 zgc:112163 (ENSOMEG00000006454) sirt4 (ENSOMEG00000006473) sxph (ENSOMEG00000006516) ENSOMEG00000006539 EIF4ENIF1 (ENSOMEG00000000155) PATZ1 (ENSOMEG00000006636) SLC2A11 (ENSOMEG00000006658) tgfa (ENSOMEG00000006671) hdhd3 (ENSOMEG00000006682) trub2 (ENSOMEG00000006702) ENSOMEG00000006718 srsf3a (ENSOMEG00000006746) fkbp5 (ENSOMEG00000006787) slc6a22.1 (ENSOMEG00000006935) slc6a22.2 (ENSOMEG00000007010) ENSOMEG00000007059 ##22 ENSOMEG00000007091 ##22 ENSOMEG00000007148 ##22 synprb (ENSOMEG00000007182) ENSOMEG00000007413 PTPRG (ENSOMEG00000007483) ENSOMEG00000007506 ENSOMEG00000007525 ENSOMEG00000007539 ENSOMEG00000007557 ENSOMEG00000007579 ENSOMEG00000007630 atp6ap1a (ENSOMEG00000007690) tafazzin (ENSOMEG00000007792) acss2 (ENSOMEG00000007920) mapre1b (ENSOMEG00000007955) Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000154388 ENSGT00940000154110.a ENSGT00940000166668 ENSGT00390000012071 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000166177 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000160058 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773 ENSGT00940000160379 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000158726 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00390000005497 ENSGT00940000178103 ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00390000011228.b.a.e.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000157304 ENSGT00940000165342.a ENSGT00390000008325.b.a ENSGT00940000154899.fb.b ENSGT00940000153709.A.f Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000154388 ENSGT00940000154110.a ENSGT00940000166668 ENSGT00390000012071 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000166177 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000160058 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773 ENSGT00940000160379 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000158726 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00390000005497 ENSGT00940000178103 ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00390000011228.b.a.e.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000157304 ENSGT00940000165342.a ENSGT00940000154899.fb.b ENSGT00940000153709.A.f ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000154388 ENSGT00940000154110.a ENSGT00940000166668 ENSGT00390000012071 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000166177 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000160058 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773 ENSGT00940000160379 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000158726 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b.cb ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b.bb ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00390000005497 ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00390000011228.b.a.e.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000157304 ENSGT00940000165342.a ENSGT00940000154899.fb.b ENSGT00940000153709.A.f ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000154388 ENSGT00940000154110.a ENSGT00940000166668 ENSGT00390000012071 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000166177 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000160058 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773 ENSGT00940000160379 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000158726 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b.cb ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b.bb ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00390000005497 ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00390000011228.b.a.e.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000157304 ENSGT00940000165342.a ENSGT00940000154899.fb.b ENSGT00940000153709.A.f ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000154388 ENSGT00940000154110.a ENSGT00940000166668 ENSGT00390000012071 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000166177 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000160058 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773 ENSGT00940000160379 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000158726 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b.cb ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b.bb ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00390000005497 ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00390000011228.b.a.e.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000157304 ENSGT00940000165342.a ENSGT00940000154899.fb.b ENSGT00940000153709.A.f ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 356 ENSHBUG00000022321 tgfa (ENSHBUG00000022338) hdhd3 (ENSHBUG00000022347) trub2 (ENSHBUG00000022384) ENSHBUG00000022390 srsf3a (ENSHBUG00000022402) fkbp5 (ENSHBUG00000022411) slc6a22.1 (ENSHBUG00000022446) slc6a22.2 (ENSHBUG00000022489) ENSHBUG00000022547 ##22 ENSHBUG00000022586 ##22 ENSHBUG00000022646 ##22 synprb (ENSHBUG00000022658) ENSHBUG00000022995 PTPRG (ENSHBUG00000023031) cfap20dc (ENSHBUG00000023060) ENSHBUG00000023220 FAM107A (ENSHBUG00000023239) CAMK1 (ENSHBUG00000023294) pbrm1l (ENSHBUG00000023605) stau1 (ENSHBUG00000023668) ENSHBUG00000023677 ENSHBUG00000023703 KCNB1 (ENSHBUG00000023718) ptgis (ENSHBUG00000000721) Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000176155.e.b ENSGT00940000154388 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000012071 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000166177 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000160058 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773 ENSGT00940000160379 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000158726 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b.cb ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b.bb ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00390000005497 ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00390000011228.b.a.e.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000157304 ENSGT00940000165342.a ENSGT00940000154899.fb.b ENSGT00940000153709.A.f ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b P. nyererei MODERN SPECIES 307 ENSPNYG00000013358 sxph (ENSPNYG00000013376) SFI1 (ENSPNYG00000013422) EIF4ENIF1 (ENSPNYG00000013471) PATZ1 (ENSPNYG00000013542) ENSPNYG00000013570 SLC2A11 (ENSPNYG00000013599) tgfa (ENSPNYG00000013629) hdhd3 (ENSPNYG00000013649) trub2 (ENSPNYG00000013666) ENSPNYG00000013698 srsf3a (ENSPNYG00000013747) fkbp5 (ENSPNYG00000013801) slc6a22.1 (ENSPNYG00000013819) slc6a22.2 (ENSPNYG00000013897) ENSPNYG00000013978 ##22 ENSPNYG00000013994 ##22 ENSPNYG00000014010 ##22 synprb (ENSPNYG00000014029) ENSPNYG00000014061 PTPRG (ENSPNYG00000014118) ENSPNYG00000014163 ENSPNYG00000014199 ENSPNYG00000014239 CAMK1 (ENSPNYG00000014260) pbrm1l (ENSPNYG00000014336) stau1 (ENSPNYG00000014436) ENSPNYG00000014472 KCNB1 (ENSPNYG00000014507) ptgis (ENSPNYG00000014521) SRGAP3 (ENSPNYG00000014550) Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000176155.e.b ENSGT00940000154388 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000012071 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000166177 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000160058 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773 ENSGT00940000160379 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000158726 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b.cb ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b.bb ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00390000005497 ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00390000011228.b.a.e.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000157304 ENSGT00940000165342.a ENSGT00940000154899.fb.b ENSGT00940000153709.A.f ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b Eastern happy MODERN SPECIES 17 ENSACLG00000010495 sxph (ENSACLG00000010508) SFI1 (ENSACLG00000010590) EIF4ENIF1 (ENSACLG00000010640) PATZ1 (ENSACLG00000010690) ENSACLG00000010703 SLC2A11 (ENSACLG00000010716) tgfa (ENSACLG00000010739) hdhd3 (ENSACLG00000010788) trub2 (ENSACLG00000010793) ENSACLG00000010848 srsf3a (ENSACLG00000010873) fkbp5 (ENSACLG00000010908) slc6a22.1 (ENSACLG00000010928) slc6a22.2 (ENSACLG00000010967) ENSACLG00000011010 ##22 ENSACLG00000011041 ##22 ENSACLG00000011070 ##22 synprb (ENSACLG00000011098) ENSACLG00000011254 PTPRG (ENSACLG00000011378) cfap20dc (ENSACLG00000011721) ENSACLG00000011755 FAM107A (ENSACLG00000011901) CAMK1 (ENSACLG00000011925) pbrm1l (ENSACLG00000012002) stau1 (ENSACLG00000012270) ENSACLG00000012361 KCNB1 (ENSACLG00000012373) ptgis (ENSACLG00000012392) SRGAP3 (ENSACLG00000012441) Zebra mbuna MODERN SPECIES 1108 ENSMZEG00005016105 sxph (ENSMZEG00005016092) ENSMZEG00005016087 EIF4ENIF1 (ENSMZEG00005016063) PATZ1 (ENSMZEG00005016051) ENSMZEG00005016042 ENSMZEG00005016033 tgfa (ENSMZEG00005016026) hdhd3 (ENSMZEG00005016024) trub2 (ENSMZEG00005016018) ENSMZEG00005016014 srsf3a (ENSMZEG00005016010) fkbp5 (ENSMZEG00005016000) slc6a22.1 (ENSMZEG00005015991) slc6a22.2 (ENSMZEG00005015949) ENSMZEG00005015909 ##22 ENSMZEG00005015892 ##22 ENSMZEG00005015885 ##22 synprb (ENSMZEG00005015880) ENSMZEG00005015862 PTPRG (ENSMZEG00005015811) ENSMZEG00005015780 ENSMZEG00005015770 ENSMZEG00005015745 ENSMZEG00005015736 CAMK1 (ENSMZEG00005015730) pbrm1l (ENSMZEG00005015649) stau1 (ENSMZEG00005015605) ENSMZEG00005015591 KCNB1 (ENSMZEG00005015573) ptgis (ENSMZEG00005015522) Lyretail cichlid MODERN SPECIES 294 ENSNBRG00000015850 sxph (ENSNBRG00000015865) ENSNBRG00000015901 EIF4ENIF1 (ENSNBRG00000015925) PATZ1 (ENSNBRG00000016032) ENSNBRG00000016070 ENSNBRG00000016097 tgfa (ENSNBRG00000016157) hdhd3 (ENSNBRG00000016279) trub2 (ENSNBRG00000016294) ENSNBRG00000016337 srsf3a (ENSNBRG00000016360) fkbp5 (ENSNBRG00000016378) slc6a22.1 (ENSNBRG00000016451) slc6a22.2 (ENSNBRG00000016737) ENSNBRG00000016795 ##22 ENSNBRG00000016841 ##22 ENSNBRG00000016907 ##22 synprb (ENSNBRG00000017171) ENSNBRG00000017208 PTPRG (ENSNBRG00000017259) ENSNBRG00000017330 ENSNBRG00000017372 FAM107A (ENSNBRG00000017436) CAMK1 (ENSNBRG00000017444) pbrm1l (ENSNBRG00000017496) stau1 (ENSNBRG00000017596) ENSNBRG00000017633 KCNB1 (ENSNBRG00000017665) ptgis (ENSNBRG00000017712) SRGAP3 (ENSNBRG00000017824) Nile tilapia MODERN SPECIES 17 ENSONIG00000021323 sxph (ENSONIG00000004257) SFI1 (ENSONIG00000004256) EIF4ENIF1 (ENSONIG00000004251) patz1 (ENSONIG00000004248) ENSONIG00000004244 ENSONIG00000004236 tgfa (ENSONIG00000035959) hdhd3 (ENSONIG00000004233) trub2 (ENSONIG00000004230) ENSONIG00000039490 fkbp5 (ENSONIG00000004221) srsf3a (ENSONIG00000004224) slc6a22.1 (ENSONIG00000004216) slc6a22.2 (ENSONIG00000004210) ENSONIG00000004207 ##22 ENSONIG00000004206 ##22 ENSONIG00000004204 ##22 synprb (ENSONIG00000004202) ENSONIG00000004194 PTPRG (ENSONIG00000004184) cfap20dc (ENSONIG00000004176) ENSONIG00000004174 FAM107A (ENSONIG00000004173) CAMK1 (ENSONIG00000004166) pbrm1l (ENSONIG00000004158) stau1 (ENSONIG00000004152) ENSONIG00000004150 KCNB1 (ENSONIG00000004149) ptgis (ENSONIG00000004143) SRGAP3 (ENSONIG00000004135) Midas cichlid MODERN SPECIES 1343 zgc:112163 (ENSACIG00000016994) sirt4 (ENSACIG00000016969) sxph (ENSACIG00000016918) EIF4ENIF1 (ENSACIG00000016848) PATZ1 (ENSACIG00000016779) SLC2A11 (ENSACIG00000016741) tgfa (ENSACIG00000016584) hdhd3 (ENSACIG00000016541) trub2 (ENSACIG00000016500) ENSACIG00000016471 srsf3a (ENSACIG00000016419) fkbp5 (ENSACIG00000016383) slc6a22.1 (ENSACIG00000016350) ENSACIG00000016335 slc6a22.2 (ENSACIG00000016308) ENSACIG00000016288 ##22 ENSACIG00000016277 ##22 synprb (ENSACIG00000016263) ENSACIG00000016210 PTPRG (ENSACIG00000016138) ENSACIG00000016112 ENSACIG00000016098 ENSACIG00000016060 FAM107A (ENSACIG00000016041) CAMK1 (ENSACIG00000016025) pbrm1l (ENSACIG00000015948) stau1 (ENSACIG00000015918) ENSACIG00000015908 KCNB1 (ENSACIG00000015902) ptgis (ENSACIG00000015884) SRGAP3 (ENSACIG00000015847) Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000002240 ENSGT00940000158891 ENSGT00940000154388 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000012071 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000160058 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773 ENSGT00940000160379 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000158726 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00390000005497 ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00390000011228.b.a.e.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000157304 ENSGT00940000165342.a ENSGT00390000008325.b.a ENSGT00940000154899.fb.b ENSGT00940000153709.A.f ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000002240 ENSGT00940000158891 ENSGT00940000154388 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000012071 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000160058 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773 ENSGT00940000160379 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000158726 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00390000005497 ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00390000011228.b.a.e.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000157304 ENSGT00940000165342.a ENSGT00390000008325.b.a ENSGT00940000154899.fb.b ENSGT00940000153709.A.f ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 49 ENSGT00390000002240 ENSGT00940000158891 ENSGT00940000154388 ENSGT00940000166668 ENSGT00390000012071 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000160058 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773 ENSGT00940000160379 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000158726 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00390000005497 ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00390000011228.b.a.e.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000157304 ENSGT00940000165342.a ENSGT00390000008325.b.a ENSGT00940000154899.fb.b ENSGT00940000153709.A.f ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b Clown anemonefish MODERN SPECIES 1475 sirt4 (ENSAOCG00000010446) sxph (ENSAOCG00000010556) ENSAOCG00000010579 EIF4ENIF1 (ENSAOCG00000010670) PATZ1 (ENSAOCG00000010686) ENSAOCG00000010732 ENSAOCG00000010809 tgfa (ENSAOCG00000010826) hdhd3 (ENSAOCG00000010837) trub2 (ENSAOCG00000002330) ENSAOCG00000000679 srsf3a (ENSAOCG00000002405) fkbp5 (ENSAOCG00000000690) slc6a22.1 (ENSAOCG00000010964) slc6a22.2 (ENSAOCG00000000703) ENSAOCG00000011229 ##22 ENSAOCG00000011243 ##22 ENSAOCG00000011271 ##22 synprb (ENSAOCG00000011312) ENSAOCG00000011557 PTPRG (ENSAOCG00000011780) ENSAOCG00000011812 ENSAOCG00000011870 FAM107A (ENSAOCG00000011928) CAMK1 (ENSAOCG00000011985) pbrm1l (ENSAOCG00000012154) stau1 (ENSAOCG00000012224) ENSAOCG00000012261 ENSAOCG00000012289 KCNB1 (ENSAOCG00000012301) ptgis (ENSAOCG00000000759) Spiny chromis MODERN SPECIES 59 sxph (ENSAPOG00000018651) SFI1 (ENSAPOG00000018474) EIF4ENIF1 (ENSAPOG00000018460) PATZ1 (ENSAPOG00000018447) ENSAPOG00000018431 ENSAPOG00000018375 tgfa (ENSAPOG00000018319) hdhd3 (ENSAPOG00000018303) trub2 (ENSAPOG00000018284) trub2 (ENSAPOG00000018216) ENSAPOG00000018190 srsf3a (ENSAPOG00000018179) fkbp5 (ENSAPOG00000018147) slc6a22.1 (ENSAPOG00000018136) slc6a22.2 (ENSAPOG00000018086) ENSAPOG00000018073 ##22 ENSAPOG00000018038 ##22 synprb (ENSAPOG00000018001) ENSAPOG00000017984 PTPRG (ENSAPOG00000017779) ENSAPOG00000017625 ENSAPOG00000017615 ENSAPOG00000017572 CAMK1 (ENSAPOG00000017490) pbrm1l (ENSAPOG00000000473) stau1 (ENSAPOG00000017260) ENSAPOG00000017170 ENSAPOG00000017110 KCNB1 (ENSAPOG00000017097) ptgis (ENSAPOG00000017080) SRGAP3 (ENSAPOG00000016964) Bicolor damselfish MODERN SPECIES 246 sxph (ENSSPAG00000017479) SFI1 (ENSSPAG00000017632) EIF4ENIF1 (ENSSPAG00000017672) PATZ1 (ENSSPAG00000017709) ENSSPAG00000017723 SLC2A11 (ENSSPAG00000017764) tgfa (ENSSPAG00000017847) hdhd3 (ENSSPAG00000017863) trub2 (ENSSPAG00000017865) ENSSPAG00000017880 srsf3a (ENSSPAG00000017902) fkbp5 (ENSSPAG00000017911) slc6a22.1 (ENSSPAG00000017938) slc6a22.2 (ENSSPAG00000018011) odad3 (ENSSPAG00000018598) ENSSPAG00000018702 ##22 ENSSPAG00000018720 ##22 synprb (ENSSPAG00000018733) ENSSPAG00000018760 PTPRG (ENSSPAG00000018833) ENSSPAG00000018947 ENSSPAG00000018981 FAM107A (ENSSPAG00000019002) CAMK1 (ENSSPAG00000019054) pbrm1l (ENSSPAG00000019107) stau1 (ENSSPAG00000019275) ENSSPAG00000019296 ENSSPAG00000019324 KCNB1 (ENSSPAG00000019351) ptgis (ENSSPAG00000019362) SRGAP3 (ENSSPAG00000019377) Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000154388 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000012071 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000166177 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000160058 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773 ENSGT00940000160379 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000158726 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00390000005497 ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00390000011228.b.a.e.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000157304 ENSGT00940000165342.a ENSGT00390000008325.b.a ENSGT00940000154899.fb.b ENSGT00940000153709.A.f ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b ENSGT01050000244882.a.a.b.a.a Eupercaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154388 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000012071 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000166177 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000160058 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773 ENSGT00940000160379.h ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000158726 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00390000005497 ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00390000011228.b.a.e.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000157304 ENSGT00940000165342.a ENSGT00390000008325.b.a ENSGT00940000154899.fb.b ENSGT00940000153709.A.f ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b ENSGT01050000244882.a.a.b.a.a Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000002240 ENSGT00940000158891 ENSGT00940000154388 ENSGT00940000166668 ENSGT00390000012071 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000160058 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773 ENSGT00940000160379.h ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000158726 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00390000011228.b.a.e.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000157304 ENSGT00940000165342.a ENSGT00940000154899.fb.b ENSGT00940000153709.A.f ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b ENSGT01050000244882.a.a.b.a.a ENSGT00950000183006.A.a.a.b Fugu MODERN SPECIES 10 ENSTRUG00000031157 EIF4ENIF1 (ENSTRUG00000015303) PATZ1 (ENSTRUG00000015366) ENSTRUG00000025708 SLC2A11 (ENSTRUG00000015382) tgfa (ENSTRUG00000024683) hdhd3 (ENSTRUG00000033187) trub2 (ENSTRUG00000015499) ENSTRUG00000022896 srsf3a (ENSTRUG00000023965) fkbp5 (ENSTRUG00000015512) slc6a22.1 (ENSTRUG00000028380) slc6a22.1 (ENSTRUG00000032801) slc6a22.2 (ENSTRUG00000003053) slc6a22.2 (ENSTRUG00000003335) ENSTRUG00000002306 ##22 ENSTRUG00000002372 ##22 synprb (ENSTRUG00000003258) ENSTRUG00000003536 PTPRG (ENSTRUG00000004636) ENSTRUG00000024993 ENSTRUG00000021663 CAMK1 (ENSTRUG00000005116) pbrm1l (ENSTRUG00000005335) stau1 (ENSTRUG00000005837) ENSTRUG00000006351 KCNB1 (ENSTRUG00000006520) ptgis (ENSTRUG00000006596) SRGAP3 (ENSTRUG00000006997) OXTR (ENSTRUG00000007606) cav4a (ENSTRUG00000007707) Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154388 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000012071 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000166177 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000160058 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773 ENSGT00940000160379.h ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000158726 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00390000005497 ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00390000011228.b.a.e.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000157304 ENSGT00940000165342.a ENSGT00390000008325.b.a ENSGT00940000154899.fb.b ENSGT00940000153709.A.f ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b ENSGT01050000244882.a.a.b.a.a Ballan wrasse MODERN SPECIES 415 tmcc1b (ENSLBEG00000001275) sxph (ENSLBEG00000001183) ENSLBEG00000001109 EIF4ENIF1 (ENSLBEG00000001074) PATZ1 (ENSLBEG00000001052) ENSLBEG00000001011 ENSLBEG00000000958 tgfa (ENSLBEG00000000942) hdhd3 (ENSLBEG00000000931) trub2 (ENSLBEG00000000907) ENSLBEG00000000894 srsf3a (ENSLBEG00000000877) fkbp5 (ENSLBEG00000000833) slc6a22.1 (ENSLBEG00000000806) slc6a22.2 (ENSLBEG00000000639) ENSLBEG00000000588 ##22 Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000154388 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000012071 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000166177 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000160058 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773 ENSGT00940000160379.h ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000158726 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00390000005497 ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00390000011228.b.a.e.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000157304 ENSGT00940000165342.a ENSGT00390000008325.b.a ENSGT00940000154899.fb.b ENSGT00940000153709.A.f ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b ENSGT01050000244882.a.a.b.a.a Perciformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154388 ENSGT00940000166668 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000012071 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000166177 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000160058 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773 ENSGT00940000160379.h ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000158726 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00390000005497 ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00390000011228.b.a.e.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000157304 ENSGT00940000165342.a ENSGT00390000008325.b.a ENSGT00940000154899.fb.b ENSGT00940000153709.A.f ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000002240 ENSGT00940000158891 ENSGT00940000154388 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000012071 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000160058 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773 ENSGT00940000160379.h ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000158726 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00390000005497 ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00390000011228.b.a.e.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000157304 ENSGT00940000165342.a ENSGT00390000008325.b.a ENSGT00940000154899.gb ENSGT00940000154899.fb.b ENSGT00940000153709.A.f Pike perch DUPLICATION Pike perch MODERN SPECIES 73 sirt4 (ENSSLUG00000018076) sxph (ENSSLUG00000018056) SFI1 (ENSSLUG00000018032) EIF4ENIF1 (ENSSLUG00000018005) PATZ1 (ENSSLUG00000017989) SLC2A11 (ENSSLUG00000017824) tgfa (ENSSLUG00000017819) hdhd3 (ENSSLUG00000017817) trub2 (ENSSLUG00000017813) ENSSLUG00000017808 srsf3a (ENSSLUG00000017804) ENSSLUG00000017802 fkbp5 (ENSSLUG00000017747) slc6a22.1 (ENSSLUG00000015066) slc6a22.2 (ENSSLUG00000014859) ENSSLUG00000014813 ##22 synprb (ENSSLUG00000014798) ENSSLUG00000013930 PTPRG (ENSSLUG00000010937) cfap20dc (ENSSLUG00000010785) ENSSLUG00000010769 FAM107A (ENSSLUG00000010766) CAMK1 (ENSSLUG00000008510) pbrm1l (ENSSLUG00000007847) ENSSLUG00000007798 Pike perch MODERN SPECIES 204 ENSSLUG00000021998 ENSSLUG00000022000 ##22 ENSSLUG00000022006 ENSSLUG00000022007 ENSSLUG00000022009 CALML4 (ENSSLUG00000022011) ENSSLUG00000022017 ENSSLUG00000022018 ENSSLUG00000022019 ENSSLUG00000022025 ENSSLUG00000022028 ENSSLUG00000022032 CLN6 (ENSSLUG00000022044) ENSSLUG00000022091 ITGA11 (ENSSLUG00000022105) ENSSLUG00000022142 ENSSLUG00000022145 Cottioidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000158891 ENSGT00940000154388 ENSGT00940000166668 ENSGT00390000012071 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000166177 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000160058 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773 ENSGT00940000160379.h ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000158726 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00940000178103 ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00390000011228.b.a.e.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000157304 ENSGT00940000165342.a ENSGT00390000008325.b.a ENSGT00940000154899.fb.b ENSGT00940000153709.A.f ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b Lumpfish MODERN SPECIES 20 sirt4 (ENSCLMG00005014192) sxph (ENSCLMG00005014194) ENSCLMG00005014195 EIF4ENIF1 (ENSCLMG00005014197) PATZ1 (ENSCLMG00005014201) ENSCLMG00005014211 ENSCLMG00005014214 tgfa (ENSCLMG00005014520) hdhd3 (ENSCLMG00005014522) trub2 (ENSCLMG00005014524) ENSCLMG00005014529 srsf3a (ENSCLMG00005014530) fkbp5 (ENSCLMG00005014532) slc6a22.1 (ENSCLMG00005014566) slc6a22.2 (ENSCLMG00005017409) ENSCLMG00005017578 ##22 ENSCLMG00005017597 ##22 ENSCLMG00005017605 ##22 synprb (ENSCLMG00005017658) ENSCLMG00005017692 PTPRG (ENSCLMG00005017865) ENSCLMG00005018393 ENSCLMG00005018394 ENSCLMG00005018395 CAMK1 (ENSCLMG00005018396) pbrm1l (ENSCLMG00005018411) stau1 (ENSCLMG00005018555) ENSCLMG00005018559 ENSCLMG00005018561 ENSCLMG00005018563 KCNB1 (ENSCLMG00005018567) Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154388 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000012071 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000166177 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000160058 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773 ENSGT00940000160379.h ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000158726 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00390000005497 ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00390000011228.b.a.e.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000157304 ENSGT00940000165342.a ENSGT00390000008325.b.a ENSGT00940000154899.fb.b ENSGT00940000153709.A.f ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b ENSGT01050000244882.a.a.b.a.a Gilthead seabream MODERN SPECIES 20 sxph (ENSSAUG00010021558) SFI1 (ENSSAUG00010021551) EIF4ENIF1 (ENSSAUG00010021532) PATZ1 (ENSSAUG00010021531) ENSSAUG00010021530 SLC2A11 (ENSSAUG00010021332) tgfa (ENSSAUG00010021324) hdhd3 (ENSSAUG00010021323) trub2 (ENSSAUG00010021321) ENSSAUG00010021320 srsf3a (ENSSAUG00010021319) fkbp5 (ENSSAUG00010021302) slc6a22.1 (ENSSAUG00010021239) slc6a22.2 (ENSSAUG00010020171) ENSSAUG00010020148 ##22 ENSSAUG00010020129 ##22 synprb (ENSSAUG00010020127) ENSSAUG00010014963 PTPRG (ENSSAUG00010014428) cfap20dc (ENSSAUG00010014413) ENSSAUG00010014409 FAM107A (ENSSAUG00010014408) CAMK1 (ENSSAUG00010012768) pbrm1l (ENSSAUG00010003714) stau1 (ENSSAUG00010003501) ENSSAUG00010003491 ENSSAUG00010003487 KCNB1 (ENSSAUG00010003485) ptgis (ENSSAUG00010003471) SRGAP3 (ENSSAUG00010000587) OXTR (ENSSAUG00010000360) Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000002240 ENSGT00940000158891 ENSGT00940000154388 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000012071 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000160058 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773 ENSGT00940000160379.h ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000158726 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00390000005497 ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00390000011228.b.a.e.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000157304 ENSGT00940000165342.a ENSGT00390000008325.b.a ENSGT00940000154899.fb.b ENSGT00940000153709.A.f ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b European seabass MODERN SPECIES 10 PATZ1 (ENSDLAG00005026428) ENSDLAG00005026856 ENSDLAG00005023149 ENSDLAG00005023163 tgfa (ENSDLAG00005027901) hdhd3 (ENSDLAG00005023238) ENSDLAG00005023240 ENSDLAG00005023244 fkbp5 (ENSDLAG00005031856) slc6a22.1 (ENSDLAG00005033698) slc6a22.2 (ENSDLAG00005028850) ENSDLAG00005003100 ##22 ENSDLAG00005019649 ENSDLAG00005030434 ##22 slc6a22.1 (ENSDLAG00005032723) ENSDLAG00005018127 ##22 ENSDLAG00005020236 ##22 synprb (ENSDLAG00005032345) ENSDLAG00005011156 ##22 ENSDLAG00005011443 PTPRG (ENSDLAG00005018629) cfap20dc (ENSDLAG00005020705) ENSDLAG00005020713 FAM107A (ENSDLAG00005018013) ENSDLAG00005020763 pbrm1l (ENSDLAG00005021862) ENSDLAG00005022190 ENSDLAG00005022207 ENSDLAG00005022209 ptgis (ENSDLAG00005022212) ENSDLAG00005022263 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000002240 ENSGT00940000158891 ENSGT00940000154388 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000012071 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000160058 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773 ENSGT00940000160379 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000158726 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00390000005497 ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00390000011228.b.a.e.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000157304 ENSGT00940000165342.a ENSGT00390000008325.b.a ENSGT00940000154899.fb.b ENSGT00940000153709.A.f ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b Carangaria ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00550000075011 ENSGT00390000018446.b ENSGT00390000017965 ENSGT00940000156166.a.i.a ENSGT00940000168333 ENSGT00950000183210.g.b ENSGT00390000006452.b.b.h ENSGT00950000183180.b ENSGT00940000153190.A.g ENSGT00940000164612.a ENSGT00390000005897.j ENSGT01100000263497.E.b.q.a ENSGT00950000182964.a.a.g.b ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000155505.a.a ENSGT00940000153665.b.a.b ENSGT00390000003860.hb ENSGT00530000063561 ENSGT01050000244902.a.a.b ENSGT00950000182993.B.a.c ENSGT00940000157285.e ENSGT00940000154930.db ENSGT00390000007336.a.b ENSGT00390000012240 ENSGT00390000007029.e.b ENSGT00940000157019.g.b ENSGT00390000006166.a ENSGT00940000160748.b Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000002240 ENSGT00940000158891 ENSGT00940000154388 ENSGT00940000166668 ENSGT00390000012071 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000160058 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773 ENSGT00940000160379 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000158726 ENSGT00940000163827.a.b.u.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00390000005497 ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000157304 ENSGT00940000165342.a ENSGT00390000008325.b.a ENSGT00940000154899.fb.b ENSGT00940000153709.A.f ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b ENSGT01050000244882.a.a.b.a.a Turbot MODERN SPECIES 18 sirt4 (ENSSMAG00000020864) sxph (ENSSMAG00000020862) ENSSMAG00000020856 ENSSMAG00000020846 ENSSMAG00000024088 ENSSMAG00000020843 ENSSMAG00000020832 tgfa (ENSSMAG00000020829) hdhd3 (ENSSMAG00000020823) ENSSMAG00000020820 ENSSMAG00000033456 srsf3a (ENSSMAG00000020812) fkbp5 (ENSSMAG00000020806) slc6a22.1 (ENSSMAG00000020801) slc6a22.2 (ENSSMAG00000020739) RH2-A1 (ENSSMAG00000018072) ##22 RH2-B1 (ENSSMAG00000018084) ##22 RH2-B2 (ENSSMAG00000018144) ##22 synprb (ENSSMAG00000022669) ENSSMAG00000017781 ENSSMAG00000017683 cfap20dc (ENSSMAG00000017654) ENSSMAG00000017637 ENSSMAG00000017597 pbrm1l (ENSSMAG00000017461) stau1 (ENSSMAG00000017410) ENSSMAG00000017385 ENSSMAG00000017363 ENSSMAG00000029776 ptgis (ENSSMAG00000017341) SRGAP3 (ENSSMAG00000017241) Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00550000074822 ENSGT00550000075011 ENSGT00390000018446.b ENSGT00390000017965 ENSGT00940000168333 ENSGT00950000183210.g.b ENSGT00390000006452.b.b.h ENSGT00950000183180.b ENSGT00940000153190.A.g ENSGT00940000164612.a ENSGT00390000005897.j ENSGT01100000263497.E.b.q.a ENSGT00950000182964.a.a.g.b ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000155505.a.a ENSGT00940000153665.b.a.b ENSGT00390000003860.hb ENSGT00530000063561 ENSGT01050000244902.a.a.b ENSGT00950000182993.B.a.c ENSGT00940000157285.e ENSGT00940000154930.db ENSGT00390000007336.a.b ENSGT00390000012240 ENSGT00390000007029.e.b ENSGT00940000157019.g.b ENSGT00390000006166.a ENSGT00940000160748.b Seriola ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00390000002376 ENSGT00390000002240 ENSGT00940000158891 ENSGT00940000154388 ENSGT00390000012071 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000160058 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773 ENSGT00940000160379 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000158726 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b.c ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT00940000155048.d.b.d ENSGT00390000005497 ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00390000011228.b.a.e.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000157304 ENSGT00940000165342.a ENSGT00390000008325.b.a ENSGT00940000154899.fb.b ENSGT00940000153709.A.f Greater amberjack DUPLICATION Greater amberjack MODERN SPECIES 47 sirt4 (ENSSDUG00000016662) sxph (ENSSDUG00000016688) EIF4ENIF1 (ENSSDUG00000016719) PATZ1 (ENSSDUG00000016819) ENSSDUG00000016825 SLC2A11 (ENSSDUG00000016856) tgfa (ENSSDUG00000016889) hdhd3 (ENSSDUG00000016917) trub2 (ENSSDUG00000016928) ENSSDUG00000016963 srsf3a (ENSSDUG00000016982) fkbp5 (ENSSDUG00000017003) slc6a22.1 (ENSSDUG00000017029) slc6a22.2 (ENSSDUG00000017092) ENSSDUG00000017178 ##22 ENSSDUG00000019004 ##22 ENSSDUG00000019022 ##22 ENSSDUG00000019040 ##22 synprb (ENSSDUG00000019054) ENSSDUG00000019087 PTPRG (ENSSDUG00000019155) ENSSDUG00000019206 cfap20dc (ENSSDUG00000019218) ENSSDUG00000019238 FAM107A (ENSSDUG00000019338) CAMK1 (ENSSDUG00000019354) pbrm1l (ENSSDUG00000019381) stau1 (ENSSDUG00000019439) ENSSDUG00000019462 ENSSDUG00000019489 KCNB1 (ENSSDUG00000019497) Greater amberjack MODERN SPECIES 47 zgc:112163 (ENSSDUG00000016660) sirt4 (ENSSDUG00000016662) sxph (ENSSDUG00000016688) EIF4ENIF1 (ENSSDUG00000016719) PATZ1 (ENSSDUG00000016819) ENSSDUG00000016825 SLC2A11 (ENSSDUG00000016856) tgfa (ENSSDUG00000016889) hdhd3 (ENSSDUG00000016917) trub2 (ENSSDUG00000016928) ENSSDUG00000016963 srsf3a (ENSSDUG00000016982) fkbp5 (ENSSDUG00000017003) slc6a22.1 (ENSSDUG00000017029) slc6a22.2 (ENSSDUG00000017092) ENSSDUG00000017178 ##22 ENSSDUG00000019004 ##22 ENSSDUG00000019022 ##22 ENSSDUG00000019040 ##22 synprb (ENSSDUG00000019054) ENSSDUG00000019087 PTPRG (ENSSDUG00000019155) ENSSDUG00000019206 cfap20dc (ENSSDUG00000019218) ENSSDUG00000019238 FAM107A (ENSSDUG00000019338) CAMK1 (ENSSDUG00000019354) pbrm1l (ENSSDUG00000019381) stau1 (ENSSDUG00000019439) ENSSDUG00000019462 ENSSDUG00000019489 Yellowtail amberjack DUPLICATION Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 2920 sirt4 (ENSSLDG00000024613) sxph (ENSSLDG00000024629) EIF4ENIF1 (ENSSLDG00000024645) PATZ1 (ENSSLDG00000024660) ENSSLDG00000024668 ENSSLDG00000024676 tgfa (ENSSLDG00000024688) hdhd3 (ENSSLDG00000024696) trub2 (ENSSLDG00000024701) ENSSLDG00000024714 srsf3a (ENSSLDG00000024723) fkbp5 (ENSSLDG00000024729) slc6a22.1 (ENSSLDG00000024738) slc6a22.2 (ENSSLDG00000024762) ENSSLDG00000024793 ##22 ENSSLDG00000024797 ##22 ENSSLDG00000024799 ##22 ENSSLDG00000024804 ##22 synprb (ENSSLDG00000024813) ENSSLDG00000024839 PTPRG (ENSSLDG00000024938) cfap20dc (ENSSLDG00000024956) ENSSLDG00000024962 ENSSLDG00000024971 CAMK1 (ENSSLDG00000024978) pbrm1l (ENSSLDG00000025003) stau1 (ENSSLDG00000025040) ENSSLDG00000025055 ENSSLDG00000025066 Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 2920 zgc:112163 (ENSSLDG00000024607) sirt4 (ENSSLDG00000024613) sxph (ENSSLDG00000024629) EIF4ENIF1 (ENSSLDG00000024645) PATZ1 (ENSSLDG00000024660) ENSSLDG00000024668 ENSSLDG00000024676 tgfa (ENSSLDG00000024688) hdhd3 (ENSSLDG00000024696) trub2 (ENSSLDG00000024701) ENSSLDG00000024714 srsf3a (ENSSLDG00000024723) fkbp5 (ENSSLDG00000024729) slc6a22.1 (ENSSLDG00000024738) slc6a22.2 (ENSSLDG00000024762) ENSSLDG00000024793 ##22 ENSSLDG00000024797 ##22 ENSSLDG00000024799 ##22 ENSSLDG00000024804 ##22 synprb (ENSSLDG00000024813) ENSSLDG00000024839 PTPRG (ENSSLDG00000024938) cfap20dc (ENSSLDG00000024956) ENSSLDG00000024962 ENSSLDG00000024971 CAMK1 (ENSSLDG00000024978) pbrm1l (ENSSLDG00000025003) stau1 (ENSSLDG00000025040) ENSSLDG00000025055 ENSSLDG00000025066 Barramundi perch DUPLICATION Barramundi perch MODERN SPECIES 315 sirt4 (ENSLCAG00010009714) sxph (ENSLCAG00010009709) EIF4ENIF1 (ENSLCAG00010009681) ENSLCAG00010009671 ENSLCAG00010009650 tgfa (ENSLCAG00010009624) hdhd3 (ENSLCAG00010009619) trub2 (ENSLCAG00010009596) ENSLCAG00010009588 srsf3a (ENSLCAG00010009579) fkbp5 (ENSLCAG00010009571) slc6a22.1 (ENSLCAG00010009562) slc6a22.2 (ENSLCAG00010009557) ENSLCAG00010009551 ENSLCAG00010009464 ##22 ENSLCAG00010009155 ##22 Barramundi perch MODERN SPECIES 315 zgc:112163 (ENSLCAG00010009717) sirt4 (ENSLCAG00010009714) sxph (ENSLCAG00010009709) EIF4ENIF1 (ENSLCAG00010009681) ENSLCAG00010009671 ENSLCAG00010009650 tgfa (ENSLCAG00010009624) hdhd3 (ENSLCAG00010009619) trub2 (ENSLCAG00010009596) ENSLCAG00010009588 srsf3a (ENSLCAG00010009579) fkbp5 (ENSLCAG00010009571) slc6a22.1 (ENSLCAG00010009562) slc6a22.2 (ENSLCAG00010009557) ENSLCAG00010009551 ENSLCAG00010009464 ##22 ENSLCAG00010009155 ##22 Protacanthopterygii DUPLICATION Protacanthopterygii DUPLICATION Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000166668 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000012071 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000160058 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773 ENSGT01100000263542.B.a ENSGT00940000160379 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000158726 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a.k.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a.k.a ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT00950000183006.A.a.a.b ENSGT01050000244882.a.a.b.a.a ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b ENSGT00940000153709.A.f ENSGT00940000154899.fb.b ENSGT00390000008325.b.a ENSGT00940000165342.a ENSGT00940000157304 ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000156378.a.b.c.b ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT00950000182998.C.b.b ENSGT00940000158328 Salmoninae DUPLICATION Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 92 ENSGT00940000159296.s ENSGT00940000161061.b.r.a.a ENSGT00940000160058.d ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773.h ENSGT01100000263542.B.a.w ENSGT00940000160379.e ENSGT00910000144115.a.hc.a.f.b ENSGT00910000144115.a.hc.a.e ENSGT00940000158726.o ENSGT00940000163827.a.b.i.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a.k.b.a.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a.k.b.a.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a.l ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a.k.a.a.a ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b.b Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000159296.s ENSGT00940000161061.b.r.a.a ENSGT00940000160058.d ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773.h ENSGT01100000263542.B.a.w ENSGT00940000160379.e ENSGT00910000144115.a.hc.a.f.b.a ENSGT00910000144115.a.hc.a.e ENSGT00940000158726.o ENSGT00940000163827.a.b.i.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a.k.b.a.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a.k.b.a.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a.l ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a.k.a.a.a ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b.b ENSGT00950000183006.A.a.a.b.f ENSGT00950000183006.B.f.b.b.cb.a ENSGT01050000244882.a.a.b.a.a.b ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b.b ENSGT00940000153709.A.f.e ENSGT00940000154899.fb.b.c ENSGT00390000008325.b.a.c ENSGT00940000157304.m ENSGT00390000003017.c.b.b.e ENSGT00940000156378.a.b.d ENSGT01020000230338.a.b.b.a.b.a.a.a.a.a.a.a.a.b ENSGT00990000211485.a.a ENSGT00940000155048.d.b.e ENSGT00590000083094.a.a.c.b.c.b Salmo ANCESTRAL SPECIES 42 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000012071.s ENSGT00940000159296.s ENSGT00940000161061.b.q.b ENSGT00940000160058.d ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773.h ENSGT01100000263542.B.a.w ENSGT00940000160379.e ENSGT00910000144115.a.hc.a.e ENSGT00940000158726.o ENSGT00940000163827.a.b.i.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a.k.b.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a.l ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a.k.a.a.a ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b.b ENSGT00950000183006.A.a.a.b.f ENSGT00950000183006.B.f.b.b.cb.a ENSGT01050000244882.a.a.b.a.a.b ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b.b ENSGT00940000153709.A.f.e ENSGT00940000154899.fb.b.c ENSGT00390000008325.b.a.c ENSGT00940000157304.m ENSGT00390000003017.c.b.b.e ENSGT00940000156378.a.b.c.b ENSGT00990000212577 ENSGT01020000230338.a.b.b.a.b.a.a.a.a.a.a.a.a.b ENSGT00990000211485.a.a ENSGT00940000155048.d.b.e Atlantic salmon MODERN SPECIES 14 ENSSSAG00000054000 tgfa (ENSSSAG00000054011) ENSSSAG00000117392 trub2 (ENSSSAG00000054021) ENSSSAG00000104706 ENSSSAG00000085612 entpd8 (ENSSSAG00000054031) ENSSSAG00000105670 ENSSSAG00000054070 ENSSSAG00000122006 fkbp5 (ENSSSAG00000099623) slc6a22.1 (ENSSSAG00000104794) slc6a22.2 (ENSSSAG00000054751) ENSSSAG00000055587 ##22 ENSSSAG00000110368 ##22 ENSSSAG00000088508 ##22 ENSSSAG00000093435 ##22 synprb (ENSSSAG00000083113) CAV3 (ENSSSAG00000071903) ENSSSAG00000122213 SRGAP3 (ENSSSAG00000055833) ptgis (ENSSSAG00000064171) ENSSSAG00000064298 ENSSSAG00000064305 stau1 (ENSSSAG00000064428) pbrm1l (ENSSSAG00000065235) ENSSSAG00000073372 ENSSSAG00000112938 ENSSSAG00000075480 ENSSSAG00000075534 ENSSSAG00000098557 River trout MODERN SPECIES 7 SFI1 (ENSSTUG00000043931) EIF4ENIF1 (ENSSTUG00000043690) PATZ1 (ENSSTUG00000043668) ENSSTUG00000043615 tgfa (ENSSTUG00000043603) hdhd3 (ENSSTUG00000043602) trub2 (ENSSTUG00000043575) entpd8 (ENSSTUG00000043537) ENSSTUG00000043514 SRSF3 (ENSSTUG00000043493) fkbp5 (ENSSTUG00000043404) slc6a22.1 (ENSSTUG00000043118) ENSSTUG00000043084 ENSSTUG00000043008 ##22 ENSSTUG00000042937 ##22 ENSSTUG00000042555 ##22 synprb (ENSSTUG00000042351) ENSSTUG00000042325 cav3 (ENSSTUG00000042300) OXTR (ENSSTUG00000042286) SRGAP3 (ENSSTUG00000039778) ptgis (ENSSTUG00000039563) KCNB1 (ENSSTUG00000039548) stau1 (ENSSTUG00000038881) pbrm1l (ENSSTUG00000029132) CAMK1 (ENSSTUG00000028454) ENSSTUG00000028427 ENSSTUG00000028365 ENSSTUG00000028354 PTPRG (ENSSTUG00000026560) ENSSTUG00000019260 Huchen MODERN SPECIES 2328 slc6a22.2 (ENSHHUG00000045699) ENSHHUG00000046134 ##22 ENSHHUG00000046799 ##22 ENSHHUG00000046829 ##22 ENSHHUG00000046962 ##22 ENSHHUG00000047042 ##22 synprb (ENSHHUG00000047193) Salmoninae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a.k.a.a.b ##22 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a.k.a.a.b ##22 Salmo ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a.k.a.a.b ##22 Atlantic salmon MODERN SPECIES 14 tgfa (ENSSSAG00000054011) ENSSSAG00000117392 trub2 (ENSSSAG00000054021) ENSSSAG00000104706 ENSSSAG00000085612 entpd8 (ENSSSAG00000054031) ENSSSAG00000105670 ENSSSAG00000054070 ENSSSAG00000122006 fkbp5 (ENSSSAG00000099623) slc6a22.1 (ENSSSAG00000104794) slc6a22.2 (ENSSSAG00000054751) ENSSSAG00000055587 ##22 ENSSSAG00000110368 ##22 ENSSSAG00000088508 ##22 ENSSSAG00000093435 ##22 synprb (ENSSSAG00000083113) CAV3 (ENSSSAG00000071903) ENSSSAG00000122213 SRGAP3 (ENSSSAG00000055833) ptgis (ENSSSAG00000064171) ENSSSAG00000064298 ENSSSAG00000064305 stau1 (ENSSSAG00000064428) pbrm1l (ENSSSAG00000065235) ENSSSAG00000073372 ENSSSAG00000112938 ENSSSAG00000075480 ENSSSAG00000075534 ENSSSAG00000098557 ENSSSAG00000076633 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a.k.a.b ##22 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a.k.a.b ##22 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a.k.a.b ##22 Rainbow trout MODERN SPECIES 28 EIF4ENIF1 (ENSOMYG00000009732) PATZ1 (ENSOMYG00000009823) ENSOMYG00000009834 tgfa (ENSOMYG00000009867) hdhd3 (ENSOMYG00000009888) trub2 (ENSOMYG00000009941) entpd8 (ENSOMYG00000010002) ENSOMYG00000071671 ENSOMYG00000010087 ENSOMYG00000075502 ENSOMYG00000049906 fkbp5 (ENSOMYG00000010194) slc6a22.1 (ENSOMYG00000010268) slc6a22.2 (ENSOMYG00000010327) ENSOMYG00000010467 ##22 ENSOMYG00000010506 ##22 synprb (ENSOMYG00000010550) ENSOMYG00000010564 CAV3 (ENSOMYG00000029688) ENSOMYG00000029701 ENSOMYG00000073533 SRGAP3 (ENSOMYG00000030878) ENSOMYG00000051904 ptgis (ENSOMYG00000036530) ENSOMYG00000036544 ENSOMYG00000036561 ENSOMYG00000055564 stau1 (ENSOMYG00000062808) pbrm1l (ENSOMYG00000036827) ENSOMYG00000059623 ENSOMYG00000037384 Northern pike DUPLICATION Northern pike DUPLICATION Northern pike MODERN SPECIES 16 ENSELUG00000025308 ppil1 (ENSELUG00000024592) slc6a11a (ENSELUG00000002210) FRS3 (ENSELUG00000002212) tspo (ENSELUG00000002218) uqcc2 (ENSELUG00000002223) tomm6 (ENSELUG00000002226) zgc:112163 (ENSELUG00000002229) sirt4 (ENSELUG00000002235) sxph (ENSELUG00000002257) ENSELUG00000002294 EIF4ENIF1 (ENSELUG00000002320) PATZ1 (ENSELUG00000002333) SLC2A11 (ENSELUG00000002342) tgfa (ENSELUG00000002351) ENSELUG00000002359 ##22 ENSELUG00000002364 ##22 ENSELUG00000002376 entpd8 (ENSELUG00000002381) ENSELUG00000032848 srsf3a (ENSELUG00000002390) fkbp5 (ENSELUG00000002397) slc6a22.1 (ENSELUG00000002406) slc6a22.2 (ENSELUG00000002414) synprb (ENSELUG00000002418) cav4a (ENSELUG00000002429) cav3 (ENSELUG00000002434) OXTR (ENSELUG00000002439) SRGAP3 (ENSELUG00000002479) ptgis (ENSELUG00000002501) KCNB1 (ENSELUG00000002510) Northern pike MODERN SPECIES 16 ppil1 (ENSELUG00000024592) slc6a11a (ENSELUG00000002210) FRS3 (ENSELUG00000002212) tspo (ENSELUG00000002218) uqcc2 (ENSELUG00000002223) tomm6 (ENSELUG00000002226) zgc:112163 (ENSELUG00000002229) sirt4 (ENSELUG00000002235) sxph (ENSELUG00000002257) ENSELUG00000002294 EIF4ENIF1 (ENSELUG00000002320) PATZ1 (ENSELUG00000002333) SLC2A11 (ENSELUG00000002342) tgfa (ENSELUG00000002351) ENSELUG00000002359 ##22 ENSELUG00000002364 ##22 ENSELUG00000002376 entpd8 (ENSELUG00000002381) ENSELUG00000032848 srsf3a (ENSELUG00000002390) fkbp5 (ENSELUG00000002397) slc6a22.1 (ENSELUG00000002406) slc6a22.2 (ENSELUG00000002414) synprb (ENSELUG00000002418) cav4a (ENSELUG00000002429) cav3 (ENSELUG00000002434) OXTR (ENSELUG00000002439) SRGAP3 (ENSELUG00000002479) ptgis (ENSELUG00000002501) KCNB1 (ENSELUG00000002510) stau1 (ENSELUG00000002529) Northern pike DUPLICATION Northern pike MODERN SPECIES 16 sypl2a (ENSELUG00000007465) atxn7l2a (ENSELUG00000007334) cyb561d1 (ENSELUG00000007317) ENSELUG00000007291 USP48 (ENSELUG00000007244) ENSELUG00000007191 ENSELUG00000033945 ENSELUG00000007152 camk1ga (ENSELUG00000007085) ENSELUG00000028466 rpl10a (ENSELUG00000007032) PPARD (ENSELUG00000006945) DEF6 (ENSELUG00000006924) ENSELUG00000006889 cacna1sa (ENSELUG00000001596) ENSELUG00000005940 ##22 ENSELUG00000026096 ##22 ENSELUG00000004050 STK38 (ENSELUG00000004033) cept1b (ENSELUG00000004021) ENSELUG00000003995 dram2b (ENSELUG00000003977) dennd2db (ENSELUG00000003966) ENSELUG00000027523 zgc:153675 (ENSELUG00000003951) cry3b (ENSELUG00000003926) rbbp5 (ENSELUG00000003872) ENSELUG00000003843 btg2 (ENSELUG00000003829) znf76 (ENSELUG00000003812) zgc:162255 (ENSELUG00000003782) Northern pike MODERN SPECIES 16 atxn7l2a (ENSELUG00000007334) cyb561d1 (ENSELUG00000007317) ENSELUG00000007291 USP48 (ENSELUG00000007244) ENSELUG00000007191 ENSELUG00000033945 ENSELUG00000007152 camk1ga (ENSELUG00000007085) ENSELUG00000028466 rpl10a (ENSELUG00000007032) PPARD (ENSELUG00000006945) DEF6 (ENSELUG00000006924) ENSELUG00000006889 cacna1sa (ENSELUG00000001596) ENSELUG00000005940 ##22 ENSELUG00000026096 ##22 ENSELUG00000004050 STK38 (ENSELUG00000004033) cept1b (ENSELUG00000004021) ENSELUG00000003995 dram2b (ENSELUG00000003977) dennd2db (ENSELUG00000003966) ENSELUG00000027523 zgc:153675 (ENSELUG00000003951) cry3b (ENSELUG00000003926) rbbp5 (ENSELUG00000003872) ENSELUG00000003843 btg2 (ENSELUG00000003829) znf76 (ENSELUG00000003812) zgc:162255 (ENSELUG00000003782) arl8a (ENSELUG00000003770) Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000154388 ENSGT00940000166668 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000012071 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000160058 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773 ENSGT01100000263542.B.a ENSGT00940000160379 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000158726 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a.k.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a.k.a ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT00950000183006.A.a.a.b ENSGT01050000244882.a.a.b.a.a ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b ENSGT00940000153709.A.f ENSGT00940000154899.fb.b ENSGT00390000008325.b.a ENSGT00940000165342.a ENSGT00940000157304 ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000156378.a.b.c.b ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT00950000182998.C.b.b Salmoninae DUPLICATION Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 92 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000012071.s ENSGT00940000159296.s ENSGT00940000161061.b.r.a.a ENSGT00940000160058.d ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773.h ENSGT01100000263542.B.a.w ENSGT00940000160379.e ENSGT00910000144115.a.hc.a.f.b ENSGT00910000144115.a.hc.a.e ENSGT00940000158726.o ENSGT00940000163827.a.b.i.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a.k.b.a.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a.k.b.a.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a.l ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a.k.a.a.a ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b.b Huchen MODERN SPECIES 2328 slc6a22.2 (ENSHHUG00000045699) ENSHHUG00000046134 ##22 ENSHHUG00000046799 ##22 ENSHHUG00000046829 ##22 ENSHHUG00000046962 ##22 ENSHHUG00000047042 ##22 synprb (ENSHHUG00000047193) Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000012071.s ENSGT00940000159296.s ENSGT00940000161061.b.r.a.a ENSGT00940000160058.d ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773.h ENSGT01100000263542.B.a.w ENSGT00940000160379.e ENSGT00910000144115.a.hc.a.f.b.a ENSGT00910000144115.a.hc.a.e ENSGT00940000158726.o ENSGT00940000163827.a.b.i.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a.k.b.a.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a.k.b.a.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a.l ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a.k.a.a.a ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b.b ENSGT00950000183006.A.a.a.b.f ENSGT00950000183006.B.f.b.b.cb.a ENSGT01050000244882.a.a.b.a.a.b ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b.b ENSGT00940000153709.A.f.e ENSGT00940000154899.fb.b.c ENSGT00390000008325.b.a.c ENSGT00940000157304.m ENSGT00390000003017.c.b.b.e ENSGT00940000156378.a.b.d ENSGT01020000230338.a.b.b.a.b.a.a.a.a.a.a.a.a.b ENSGT00990000211485.a.a Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000012071.s ENSGT00940000159296.s ENSGT00940000161061.b.r.a.a ENSGT00940000160058.d ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773.h ENSGT01100000263542.B.a.w ENSGT00940000160379.e ENSGT00910000144115.a.hc.a.f.b.a ENSGT00910000144115.a.hc.a.e ENSGT00940000158726.o ENSGT00940000163827.a.b.i.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a.k.b.a.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a.k.b.a.a ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b.b ENSGT00950000183006.A.a.a.b.f ENSGT00950000183006.B.f.b.b.cb.a ENSGT01050000244882.a.a.b.a.a.b ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b.b ENSGT00940000153709.A.f.e ENSGT00940000154899.fb.b.c ENSGT00390000008325.b.a.c ENSGT00940000157304.m ENSGT00390000003017.c.b.b.e ENSGT00940000156378.a.b.d ENSGT01020000230338.a.b.b.a.b.a.a.a.a.a.a.a.a.b.b ENSGT00990000211485.a.a ENSGT00940000155048.d.b.e ENSGT00590000083094.a.a.c.b.c.b Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000012071.s ENSGT00940000159296.s ENSGT00940000161061.b.r.a.a ENSGT00940000160058.d ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773.h ENSGT01100000263542.B.a.w ENSGT00940000160379.e ENSGT00910000144115.a.hc.a.f.b.a ENSGT00910000144115.a.hc.a.e ENSGT00940000158726.o ENSGT00940000163827.a.b.i.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a.k.b.a.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a.k.b.a.a ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b.b ENSGT00950000183006.A.a.a.b.f ENSGT00950000183006.B.f.b.b.cb.a ENSGT01050000244882.a.a.b.a.a.b ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b.b ENSGT00940000153709.A.f.e ENSGT00940000154899.fb.b.c ENSGT00390000008325.b.a.c ENSGT00940000157304.m ENSGT00390000003017.c.b.b.e ENSGT00940000156378.a.b.d ENSGT01020000230338.a.b.b.a.b.a.a.a.a.a.a.a.a.b.b ENSGT00940000155048.d.b.e ENSGT00590000083094.a.a.c.b.c.b ENSGT00950000182998.C.b.b.c Chinook salmon MODERN SPECIES 31 zgc:112163 (ENSOTSG00005025629) SFI1 (ENSOTSG00005025637) EIF4ENIF1 (ENSOTSG00005025649) PATZ1 (ENSOTSG00005025650) ENSOTSG00005025652 tgfa (ENSOTSG00005025653) hdhd3 (ENSOTSG00005025654) trub2 (ENSOTSG00005025655) entpd8 (ENSOTSG00005025658) ENSOTSG00005025659 SRSF3 (ENSOTSG00005025660) fkbp5 (ENSOTSG00005025663) slc6a22.1 (ENSOTSG00005025680) slc6a22.2 (ENSOTSG00005025685) ENSOTSG00005025689 ##22 ENSOTSG00005025694 ##22 synprb (ENSOTSG00005025699) cav4a (ENSOTSG00005025701) cav3 (ENSOTSG00005025702) OXTR (ENSOTSG00005025703) ENSOTSG00005025704 SRGAP3 (ENSOTSG00005025722) ptgis (ENSOTSG00005026781) KCNB1 (ENSOTSG00005026884) stau1 (ENSOTSG00005026885) pbrm1l (ENSOTSG00005027078) ENSOTSG00005027759 PTPRG (ENSOTSG00005027775) ENSOTSG00005028099 ENSOTSG00005033010 rrp9 (ENSOTSG00005033012) Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 92 ENSGT00940000158891.f ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000012071.s ENSGT00940000159296.s ENSGT00940000161061.b.r.a.a ENSGT00940000160058.d ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773.h ENSGT01100000263542.B.a.w ENSGT00940000160379.e ENSGT00910000144115.a.hc.a.f.b ENSGT00910000144115.a.hc.a.e ENSGT00940000158726.o ENSGT00940000163827.a.b.i.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a.k.b.a.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a.k.b.a.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a.l ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a.k.a.a.a ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b.b Huchen DUPLICATION Huchen MODERN SPECIES 2328 slc6a22.2 (ENSHHUG00000045699) ENSHHUG00000046134 ##22 ENSHHUG00000046799 ##22 ENSHHUG00000046829 ##22 ENSHHUG00000046962 ##22 ENSHHUG00000047042 ##22 synprb (ENSHHUG00000047193) Huchen MODERN SPECIES 2328 slc6a22.2 (ENSHHUG00000045699) ENSHHUG00000046134 ##22 ENSHHUG00000046799 ##22 ENSHHUG00000046829 ##22 ENSHHUG00000046962 ##22 ENSHHUG00000047042 ##22 synprb (ENSHHUG00000047193) Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000158891.f ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000012071.s ENSGT00940000159296.s ENSGT00940000161061.b.r.a.a ENSGT00940000160058.d ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773.h ENSGT01100000263542.B.a.w ENSGT00940000160379.e ENSGT00910000144115.a.hc.a.f.b.a ENSGT00910000144115.a.hc.a.e ENSGT00940000158726.o ENSGT00940000163827.a.b.i.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a.k.b.a.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a.k.b.a.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a.l ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a.k.a.a.a ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b.b ENSGT00950000183006.A.a.a.b.f ENSGT00950000183006.B.f.b.b.cb.a ENSGT01050000244882.a.a.b.a.a.b ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b.b ENSGT00940000153709.A.f.e ENSGT00940000154899.fb.b.c ENSGT00390000008325.b.a.c ENSGT00940000157304.m ENSGT00390000003017.c.b.b.e ENSGT00940000156378.a.b.d ENSGT01020000230338.a.b.b.a.b.a.a.a.a.a.a.a.a.b Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000002240 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000012071.s ENSGT00940000159296.s ENSGT00940000161061.b.r.a.a ENSGT00940000160058.d ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773.h ENSGT01100000263542.B.a.w ENSGT00940000160379.e ENSGT00910000144115.a.hc.a.f.b.a ENSGT00910000144115.a.hc.a.e ENSGT00940000158726.o ENSGT00940000163827.a.b.i.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a.k.b.a.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a.k.b.a.a ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b.b ENSGT00950000183006.A.a.a.b.f ENSGT00950000183006.B.f.b.b.cb.a ENSGT01050000244882.a.a.b.a.a.b ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b.b ENSGT00940000153709.A.f.e ENSGT00940000154899.fb.b.c ENSGT00390000008325.b.a.c ENSGT00940000157304.m ENSGT00390000003017.c.b.b.e ENSGT00940000156378.a.b.d ENSGT01020000230338.a.b.b.a.b.a.a.a.a.a.a.a.a.b.b ENSGT00990000211485.a.a ENSGT00940000155048.d.b.e Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000002240 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000012071.s ENSGT00940000159296.s ENSGT00940000161061.b.r.a.a ENSGT00940000160058.d ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773.h ENSGT01100000263542.B.a.w ENSGT00940000160379.e ENSGT00910000144115.a.hc.a.f.b.a ENSGT00910000144115.a.hc.a.e ENSGT00940000158726.o ENSGT00940000163827.a.b.i.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a.k.b.a.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a.k.b.a.a ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b.b ENSGT00950000183006.A.a.a.b.f ENSGT00950000183006.B.f.b.b.cb.a ENSGT01050000244882.a.a.b.a.a.b ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b.b ENSGT00940000153709.A.f.e ENSGT00940000154899.fb.b.c ENSGT00390000008325.b.a.c ENSGT00940000157304.m ENSGT00390000003017.c.b.b.e ENSGT00940000156378.a.b.d ENSGT01020000230338.a.b.b.a.b.a.a.a.a.a.a.a.a.b.b ENSGT00940000155048.d.b.e ENSGT00590000083094.a.a.c.b.c.b Coho salmon MODERN SPECIES 25 SFI1 (ENSOKIG00005001086) EIF4ENIF1 (ENSOKIG00005001108) PATZ1 (ENSOKIG00005001122) ENSOKIG00005001128 ENSOKIG00005001136 tgfa (ENSOKIG00005001143) hdhd3 (ENSOKIG00005001148) trub2 (ENSOKIG00005001154) entpd8 (ENSOKIG00005001163) ENSOKIG00005001167 SRSF3 (ENSOKIG00005001176) fkbp5 (ENSOKIG00005001207) ENSOKIG00005001257 slc6a22.1 (ENSOKIG00005001261) slc6a22.2 (ENSOKIG00005001326) opn1mw1 (ENSOKIG00005001493) ##22 synprb (ENSOKIG00005001513) cav4a (ENSOKIG00005001516) CAV3 (ENSOKIG00005001520) OXTR (ENSOKIG00005001525) SRGAP3 (ENSOKIG00005001629) ptgis (ENSOKIG00005002348) KCNB1 (ENSOKIG00005002383) ENSOKIG00005002396 stau1 (ENSOKIG00005002424) pbrm1l (ENSOKIG00005002602) CAMK1 (ENSOKIG00005003084) ENSOKIG00005003182 PTPRG (ENSOKIG00005003249) ENSOKIG00005003636 ENSOKIG00005005075 Chinook salmon MODERN SPECIES 31 tomm6 (ENSOTSG00005025627) zgc:112163 (ENSOTSG00005025629) SFI1 (ENSOTSG00005025637) EIF4ENIF1 (ENSOTSG00005025649) PATZ1 (ENSOTSG00005025650) ENSOTSG00005025652 tgfa (ENSOTSG00005025653) hdhd3 (ENSOTSG00005025654) trub2 (ENSOTSG00005025655) entpd8 (ENSOTSG00005025658) ENSOTSG00005025659 SRSF3 (ENSOTSG00005025660) fkbp5 (ENSOTSG00005025663) slc6a22.1 (ENSOTSG00005025680) slc6a22.2 (ENSOTSG00005025685) ENSOTSG00005025689 ##22 ENSOTSG00005025694 ##22 synprb (ENSOTSG00005025699) cav4a (ENSOTSG00005025701) cav3 (ENSOTSG00005025702) OXTR (ENSOTSG00005025703) ENSOTSG00005025704 SRGAP3 (ENSOTSG00005025722) ptgis (ENSOTSG00005026781) KCNB1 (ENSOTSG00005026884) stau1 (ENSOTSG00005026885) pbrm1l (ENSOTSG00005027078) ENSOTSG00005027759 PTPRG (ENSOTSG00005027775) ENSOTSG00005028099 ENSOTSG00005033010 Rainbow trout MODERN SPECIES 28 SFI1 (ENSOMYG00000009519) EIF4ENIF1 (ENSOMYG00000009732) PATZ1 (ENSOMYG00000009823) ENSOMYG00000009834 tgfa (ENSOMYG00000009867) hdhd3 (ENSOMYG00000009888) trub2 (ENSOMYG00000009941) entpd8 (ENSOMYG00000010002) ENSOMYG00000071671 ENSOMYG00000010087 ENSOMYG00000075502 ENSOMYG00000049906 fkbp5 (ENSOMYG00000010194) slc6a22.1 (ENSOMYG00000010268) slc6a22.2 (ENSOMYG00000010327) ENSOMYG00000010467 ##22 ENSOMYG00000010506 ##22 synprb (ENSOMYG00000010550) ENSOMYG00000010564 CAV3 (ENSOMYG00000029688) ENSOMYG00000029701 ENSOMYG00000073533 SRGAP3 (ENSOMYG00000030878) ENSOMYG00000051904 ptgis (ENSOMYG00000036530) ENSOMYG00000036544 ENSOMYG00000036561 ENSOMYG00000055564 stau1 (ENSOMYG00000062808) pbrm1l (ENSOMYG00000036827) ENSOMYG00000059623 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a.k.b.b ##22 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a.k.b.b ##22 Salmo ANCESTRAL SPECIES 42 ENSGT00390000002240 ENSGT00940000158891.f ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000012071.s ENSGT00940000159296.s ENSGT00940000161061.b.q.b ENSGT00940000160058.d ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773.h ENSGT01100000263542.B.a.w ENSGT00940000160379.e ENSGT00910000144115.a.hc.a.e ENSGT00940000158726.o ENSGT00940000163827.a.b.i.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a.k.b.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a.l ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a.k.a.a.a ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b.b ENSGT00950000183006.A.a.a.b.f ENSGT00950000183006.B.f.b.b.cb.a ENSGT01050000244882.a.a.b.a.a.b ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b.b ENSGT00940000153709.A.f.e ENSGT00940000154899.fb.b.c ENSGT00390000008325.b.a.c ENSGT00940000157304.m ENSGT00390000003017.c.b.b.e ENSGT00940000156378.a.b.c.b ENSGT00990000212577 ENSGT01020000230338.a.b.b.a.b.a.a.a.a.a.a.a.a.b River trout MODERN SPECIES 7 zgc:112163 (ENSSTUG00000044018) sirt4 (ENSSTUG00000043998) SFI1 (ENSSTUG00000043931) EIF4ENIF1 (ENSSTUG00000043690) PATZ1 (ENSSTUG00000043668) ENSSTUG00000043615 tgfa (ENSSTUG00000043603) hdhd3 (ENSSTUG00000043602) trub2 (ENSSTUG00000043575) entpd8 (ENSSTUG00000043537) ENSSTUG00000043514 SRSF3 (ENSSTUG00000043493) fkbp5 (ENSSTUG00000043404) slc6a22.1 (ENSSTUG00000043118) ENSSTUG00000043084 ENSSTUG00000043008 ##22 ENSSTUG00000042937 ##22 ENSSTUG00000042555 ##22 synprb (ENSSTUG00000042351) ENSSTUG00000042325 cav3 (ENSSTUG00000042300) OXTR (ENSSTUG00000042286) SRGAP3 (ENSSTUG00000039778) ptgis (ENSSTUG00000039563) KCNB1 (ENSSTUG00000039548) stau1 (ENSSTUG00000038881) pbrm1l (ENSSTUG00000029132) CAMK1 (ENSSTUG00000028454) ENSSTUG00000028427 ENSSTUG00000028365 ENSSTUG00000028354 Atlantic salmon MODERN SPECIES 14 PATZ1 (ENSSSAG00000116588) ENSSSAG00000053988 ENSSSAG00000054000 tgfa (ENSSSAG00000054011) ENSSSAG00000117392 trub2 (ENSSSAG00000054021) ENSSSAG00000104706 ENSSSAG00000085612 entpd8 (ENSSSAG00000054031) ENSSSAG00000105670 ENSSSAG00000054070 ENSSSAG00000122006 fkbp5 (ENSSSAG00000099623) slc6a22.1 (ENSSSAG00000104794) slc6a22.2 (ENSSSAG00000054751) ENSSSAG00000055587 ##22 ENSSSAG00000110368 ##22 ENSSSAG00000088508 ##22 ENSSSAG00000093435 ##22 synprb (ENSSSAG00000083113) CAV3 (ENSSSAG00000071903) ENSSSAG00000122213 SRGAP3 (ENSSSAG00000055833) ptgis (ENSSSAG00000064171) ENSSSAG00000064298 ENSSSAG00000064305 stau1 (ENSSSAG00000064428) pbrm1l (ENSSSAG00000065235) ENSSSAG00000073372 ENSSSAG00000112938 ENSSSAG00000075480 Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a.l ##22 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 92 ENSGT00390000012071.s ENSGT00940000159296.s ENSGT00940000161061.b.r.a.a ENSGT00940000160058.d ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773.h ENSGT01100000263542.B.a.w ENSGT00940000160379.e ENSGT00910000144115.a.hc.a.f.b ENSGT00910000144115.a.hc.a.e ENSGT00940000158726.o ENSGT00940000163827.a.b.i.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a.k.b.a.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a.k.b.a.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a.l ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a.k.a.a.a ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b.b Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000012071.s ENSGT00940000159296.s ENSGT00940000161061.b.r.a.a ENSGT00940000160058.d ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773.h ENSGT01100000263542.B.a.w ENSGT00940000160379.e ENSGT00910000144115.a.hc.a.f.b.a ENSGT00910000144115.a.hc.a.e ENSGT00940000158726.o ENSGT00940000163827.a.b.i.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a.k.b.a.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a.k.b.a.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a.l ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a.k.a.a.a ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b.b ENSGT00950000183006.A.a.a.b.f ENSGT00950000183006.B.f.b.b.cb.a ENSGT01050000244882.a.a.b.a.a.b ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b.b ENSGT00940000153709.A.f.e ENSGT00940000154899.fb.b.c ENSGT00390000008325.b.a.c ENSGT00940000157304.m ENSGT00390000003017.c.b.b.e ENSGT00940000156378.a.b.d ENSGT01020000230338.a.b.b.a.b.a.a.a.a.a.a.a.a.b ENSGT00990000211485.a.a ENSGT00940000155048.d.b.e Salmo ANCESTRAL SPECIES 42 ENSGT00940000158891.f ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000012071.s ENSGT00940000159296.s ENSGT00940000161061.b.q.b ENSGT00940000160058.d ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773.h ENSGT01100000263542.B.a.w ENSGT00940000160379.e ENSGT00910000144115.a.hc.a.e ENSGT00940000158726.o ENSGT00940000163827.a.b.i.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a.k.b.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a.l ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a.k.a.a.a ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b.b ENSGT00950000183006.A.a.a.b.f ENSGT00950000183006.B.f.b.b.cb.a ENSGT01050000244882.a.a.b.a.a.b ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b.b ENSGT00940000153709.A.f.e ENSGT00940000154899.fb.b.c ENSGT00390000008325.b.a.c ENSGT00940000157304.m ENSGT00390000003017.c.b.b.e ENSGT00940000156378.a.b.c.b ENSGT00990000212577 ENSGT01020000230338.a.b.b.a.b.a.a.a.a.a.a.a.a.b ENSGT00990000211485.a.a Atlantic salmon MODERN SPECIES 14 ENSSSAG00000053988 ENSSSAG00000054000 tgfa (ENSSSAG00000054011) ENSSSAG00000117392 trub2 (ENSSSAG00000054021) ENSSSAG00000104706 ENSSSAG00000085612 entpd8 (ENSSSAG00000054031) ENSSSAG00000105670 ENSSSAG00000054070 ENSSSAG00000122006 fkbp5 (ENSSSAG00000099623) slc6a22.1 (ENSSSAG00000104794) slc6a22.2 (ENSSSAG00000054751) ENSSSAG00000055587 ##22 ENSSSAG00000110368 ##22 ENSSSAG00000088508 ##22 ENSSSAG00000093435 ##22 synprb (ENSSSAG00000083113) CAV3 (ENSSSAG00000071903) ENSSSAG00000122213 SRGAP3 (ENSSSAG00000055833) ptgis (ENSSSAG00000064171) ENSSSAG00000064298 ENSSSAG00000064305 stau1 (ENSSSAG00000064428) pbrm1l (ENSSSAG00000065235) ENSSSAG00000073372 ENSSSAG00000112938 ENSSSAG00000075480 ENSSSAG00000075534 River trout MODERN SPECIES 7 sirt4 (ENSSTUG00000043998) SFI1 (ENSSTUG00000043931) EIF4ENIF1 (ENSSTUG00000043690) PATZ1 (ENSSTUG00000043668) ENSSTUG00000043615 tgfa (ENSSTUG00000043603) hdhd3 (ENSSTUG00000043602) trub2 (ENSSTUG00000043575) entpd8 (ENSSTUG00000043537) ENSSTUG00000043514 SRSF3 (ENSSTUG00000043493) fkbp5 (ENSSTUG00000043404) slc6a22.1 (ENSSTUG00000043118) ENSSTUG00000043084 ENSSTUG00000043008 ##22 ENSSTUG00000042937 ##22 ENSSTUG00000042555 ##22 synprb (ENSSTUG00000042351) ENSSTUG00000042325 cav3 (ENSSTUG00000042300) OXTR (ENSSTUG00000042286) SRGAP3 (ENSSTUG00000039778) ptgis (ENSSTUG00000039563) KCNB1 (ENSSTUG00000039548) stau1 (ENSSTUG00000038881) pbrm1l (ENSSTUG00000029132) CAMK1 (ENSSTUG00000028454) ENSSTUG00000028427 ENSSTUG00000028365 ENSSTUG00000028354 PTPRG (ENSSTUG00000026560) Huchen MODERN SPECIES 2328 slc6a22.2 (ENSHHUG00000045699) ENSHHUG00000046134 ##22 ENSHHUG00000046799 ##22 ENSHHUG00000046829 ##22 ENSHHUG00000046962 ##22 ENSHHUG00000047042 ##22 synprb (ENSHHUG00000047193) Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b ##22 Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b ##22 Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000154388 ENSGT00940000154110.a ENSGT00940000166668 ENSGT00390000012071 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000160058 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773 ENSGT00940000160379 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000158726 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00390000005497 ENSGT00940000178103 ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00390000011228.b.a.e.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000157304 ENSGT00940000165342.a ENSGT00390000008325.b.a ENSGT00940000154899.fb.b ENSGT00940000153709.A.f ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000154110.a ENSGT00940000166668 ENSGT00390000012071 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000166177 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000160058 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773 ENSGT00940000160379 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000158726 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00390000005497 ENSGT00940000178103 ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00390000011228.b.a.e.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000157304 ENSGT00940000165342.a ENSGT00390000008325.b.a ENSGT00940000154899.fb.b ENSGT00940000153709.A.f ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000154110.a ENSGT00940000166668 ENSGT00390000012071 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000166177 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000160058 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773 ENSGT00940000160379 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000158726 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00390000005497 ENSGT00940000178103 ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00390000011228.b.a.e.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000157304 ENSGT00940000165342.a ENSGT00390000008325.b.a ENSGT00940000154899.fb.b ENSGT00940000153709.A.f ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 460 sxph (ENSHCOG00000017495) ENSHCOG00000017516 EIF4ENIF1 (ENSHCOG00000017603) PATZ1 (ENSHCOG00000017644) ENSHCOG00000017674 SLC2A11 (ENSHCOG00000017703) tgfa (ENSHCOG00000017712) ENSHCOG00000017718 trub2 (ENSHCOG00000017748) ENSHCOG00000017776 srsf3a (ENSHCOG00000017795) fkbp5 (ENSHCOG00000017809) slc6a22.1 (ENSHCOG00000017840) slc6a22.2 (ENSHCOG00000017881) ENSHCOG00000017899 opn1mw1 (ENSHCOG00000017910) ##22 synprb (ENSHCOG00000017944) ENSHCOG00000018022 PTPRG (ENSHCOG00000018143) ENSHCOG00000018188 ENSHCOG00000018205 CAMK1 (ENSHCOG00000018224) pbrm1l (ENSHCOG00000018411) stau1 (ENSHCOG00000018461) ENSHCOG00000018473 KCNB1 (ENSHCOG00000018482) ptgis (ENSHCOG00000018498) SRGAP3 (ENSHCOG00000018857) OXTR (ENSHCOG00000018896) cav4a (ENSHCOG00000018903) rrp9 (ENSHCOG00000018967) Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000154110.a ENSGT00940000166668 ENSGT00390000012071 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000166177 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000160058 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773 ENSGT00940000160379 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000158726 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00390000005497 ENSGT00940000178103 ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00390000011228.b.a.e.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000157304 ENSGT00940000165342.a ENSGT00390000008325.b.a ENSGT00940000154899.fb.b ENSGT00940000153709.A.f ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b ENSGT00940000153709.A.f ENSGT00940000154899.fb.b ENSGT00390000008325.b.a ENSGT00940000165342.a ENSGT00940000157304 ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00390000011228.b.a.e.b ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00390000005497 ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000166826 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000158726 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000160379 ENSGT00940000156773 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000160058 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000166177 ENSGT00940000159296 ENSGT00390000012071 ENSGT00940000154110.a ENSGT00940000154388 ENSGT00940000158891 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT01050000244882.a.a.b.a.a ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b ENSGT00940000153709.A.f ENSGT00940000154899.fb.b ENSGT00390000008325.b.a ENSGT00940000165342.a ENSGT00940000157304 ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00390000011228.b.a.e.b ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00390000005497 ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT00940000166826 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000158726 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000160379 ENSGT00940000156773 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000160058 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000159296 ENSGT00390000012071 ENSGT00940000154110.a ENSGT00940000154388 ENSGT00940000158891 Anabantaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182998.C.b.b ENSGT00950000183006.A.a.a.b ENSGT01050000244882.a.a.b.a.a ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b ENSGT00940000153709.A.f ENSGT00940000154899.fb.b ENSGT00940000165342.a ENSGT00940000157304 ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00390000005497 ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000166826 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000158726 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000160379 ENSGT00940000156773 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000160058 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000159296 ENSGT00390000012071 ENSGT00940000154110.a ENSGT00940000154388 ENSGT00940000158891 ENSGT00390000002240 Anabantoidei DUPLICATION Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00950000183006.A.a.a.b ENSGT01050000244882.a.a.b.a.a ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b ENSGT00940000153709.A.f ENSGT00940000154899.fb.b ENSGT00940000165342.a ENSGT00940000157304 ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00390000005497 ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b.b.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b.a ##22 ENSGT00940000166826 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000158726 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000160379 ENSGT00940000156773 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000160058 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000159296 ENSGT00390000012071 ENSGT00940000154110.a ENSGT00940000154388 ENSGT00940000158891 ENSGT00390000002240 Climbing perch MODERN SPECIES 18 ENSATEG00000024620 ptgis (ENSATEG00000024612) ENSATEG00000024609 ENSATEG00000024607 stau1 (ENSATEG00000024600) pbrm1l (ENSATEG00000024583) ENSATEG00000024573 ENSATEG00000024569 ENSATEG00000029054 cfap20dc (ENSATEG00000024563) ENSATEG00000024537 ENSATEG00000024512 synprb (ENSATEG00000024507) ENSATEG00000027793 ##22 ENSATEG00000029137 ##22 ENSATEG00000027686 ##22 slc6a22.2 (ENSATEG00000011564) slc6a22.1 (ENSATEG00000011540) fkbp5 (ENSATEG00000011527) srsf3a (ENSATEG00000011511) ENSATEG00000011482 ENSATEG00000011371 hdhd3 (ENSATEG00000011364) tgfa (ENSATEG00000011337) ENSATEG00000011327 PATZ1 (ENSATEG00000027651) EIF4ENIF1 (ENSATEG00000011226) SFI1 (ENSATEG00000011204) sxph (ENSATEG00000011155) sirt4 (ENSATEG00000011134) zgc:112163 (ENSATEG00000011130) Siamese fighting fish MODERN SPECIES 16 cav4a (ENSBSLG00000013039) OXTR (ENSBSLG00000012650) SRGAP3 (ENSBSLG00000009662) ptgis (ENSBSLG00000009572) KCNB1 (ENSBSLG00000009571) stau1 (ENSBSLG00000009518) pbrm1l (ENSBSLG00000009393) CAMK1 (ENSBSLG00000008335) ENSBSLG00000003501 ENSBSLG00000003498 ENSBSLG00000003497 PTPRG (ENSBSLG00000003489) ENSBSLG00000003452 synprb (ENSBSLG00000003422) ENSBSLG00000003420 ##22 ENSBSLG00000003418 ##22 slc6a22.2 (ENSBSLG00000003417) slc6a22.1 (ENSBSLG00000003405) fkbp5 (ENSBSLG00000003377) srsf3a (ENSBSLG00000003375) ENSBSLG00000003374 trub2 (ENSBSLG00000003373) hdhd3 (ENSBSLG00000003370) tgfa (ENSBSLG00000003369) SLC2A11 (ENSBSLG00000003366) PATZ1 (ENSBSLG00000003365) EIF4ENIF1 (ENSBSLG00000003363) SFI1 (ENSBSLG00000003361) sxph (ENSBSLG00000003359) sirt4 (ENSBSLG00000003357) zgc:112163 (ENSBSLG00000003356) Anabantoidei DUPLICATION Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b.b.a ##22 Climbing perch MODERN SPECIES 18 sirt4 (ENSATEG00000011134) sxph (ENSATEG00000011155) SFI1 (ENSATEG00000011204) EIF4ENIF1 (ENSATEG00000011226) PATZ1 (ENSATEG00000027651) ENSATEG00000011327 tgfa (ENSATEG00000011337) hdhd3 (ENSATEG00000011364) ENSATEG00000011371 ENSATEG00000011482 srsf3a (ENSATEG00000011511) fkbp5 (ENSATEG00000011527) slc6a22.1 (ENSATEG00000011540) slc6a22.2 (ENSATEG00000011564) ENSATEG00000027686 ##22 ENSATEG00000029137 ##22 ENSATEG00000027793 ##22 synprb (ENSATEG00000024507) ENSATEG00000024512 ENSATEG00000024537 cfap20dc (ENSATEG00000024563) ENSATEG00000029054 ENSATEG00000024569 ENSATEG00000024573 pbrm1l (ENSATEG00000024583) stau1 (ENSATEG00000024600) ENSATEG00000024607 ENSATEG00000024609 ptgis (ENSATEG00000024612) ENSATEG00000024620 ENSATEG00000024633 Siamese fighting fish MODERN SPECIES 16 sirt4 (ENSBSLG00000003357) sxph (ENSBSLG00000003359) SFI1 (ENSBSLG00000003361) EIF4ENIF1 (ENSBSLG00000003363) PATZ1 (ENSBSLG00000003365) SLC2A11 (ENSBSLG00000003366) tgfa (ENSBSLG00000003369) hdhd3 (ENSBSLG00000003370) trub2 (ENSBSLG00000003373) ENSBSLG00000003374 srsf3a (ENSBSLG00000003375) fkbp5 (ENSBSLG00000003377) slc6a22.1 (ENSBSLG00000003405) slc6a22.2 (ENSBSLG00000003417) ENSBSLG00000003418 ##22 ENSBSLG00000003420 ##22 synprb (ENSBSLG00000003422) ENSBSLG00000003452 PTPRG (ENSBSLG00000003489) ENSBSLG00000003497 ENSBSLG00000003498 ENSBSLG00000003501 CAMK1 (ENSBSLG00000008335) pbrm1l (ENSBSLG00000009393) stau1 (ENSBSLG00000009518) KCNB1 (ENSBSLG00000009571) ptgis (ENSBSLG00000009572) SRGAP3 (ENSBSLG00000009662) OXTR (ENSBSLG00000012650) cav4a (ENSBSLG00000013039) ENSBSLG00000013072 Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00950000182998.C.b.b ENSGT00950000183006.A.a.a.b ENSGT01050000244882.a.a.b.a.a ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b ENSGT00940000153709.A.f ENSGT00940000154899.fb.b ENSGT00940000165342.a ENSGT00940000157304 ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00390000005497 ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b.b.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b.a ##22 ENSGT00940000166826 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000158726 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000160379 ENSGT00940000156773 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000160058 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000159296 ENSGT00390000012071 ENSGT00940000154110.a ENSGT00940000154388 ENSGT00940000158891 Climbing perch MODERN SPECIES 18 cav4a (ENSATEG00000024636) ENSATEG00000024633 ENSATEG00000024620 ptgis (ENSATEG00000024612) ENSATEG00000024609 ENSATEG00000024607 stau1 (ENSATEG00000024600) pbrm1l (ENSATEG00000024583) ENSATEG00000024573 ENSATEG00000024569 ENSATEG00000029054 cfap20dc (ENSATEG00000024563) ENSATEG00000024537 ENSATEG00000024512 synprb (ENSATEG00000024507) ENSATEG00000027793 ##22 ENSATEG00000029137 ##22 ENSATEG00000027686 ##22 slc6a22.2 (ENSATEG00000011564) slc6a22.1 (ENSATEG00000011540) fkbp5 (ENSATEG00000011527) srsf3a (ENSATEG00000011511) ENSATEG00000011482 ENSATEG00000011371 hdhd3 (ENSATEG00000011364) tgfa (ENSATEG00000011337) ENSATEG00000011327 PATZ1 (ENSATEG00000027651) EIF4ENIF1 (ENSATEG00000011226) SFI1 (ENSATEG00000011204) sxph (ENSATEG00000011155) Zig-zag eel MODERN SPECIES 19 ENSMAMG00000017440 cav4a (ENSMAMG00000017443) ENSMAMG00000027583 ENSMAMG00000025453 ENSMAMG00000017479 ptgis (ENSMAMG00000017564) ENSMAMG00000017578 stau1 (ENSMAMG00000017586) pbrm1l (ENSMAMG00000017609) ENSMAMG00000017713 ENSMAMG00000017723 ENSMAMG00000017732 ENSMAMG00000017759 ENSMAMG00000017890 synprb (ENSMAMG00000017945) ENSMAMG00000018094 ##22 slc6a22.2 (ENSMAMG00000023626) slc6a22.1 (ENSMAMG00000023629) fkbp5 (ENSMAMG00000023634) srsf3a (ENSMAMG00000023637) ENSMAMG00000023640 ENSMAMG00000023643 hdhd3 (ENSMAMG00000027507) tgfa (ENSMAMG00000027992) ENSMAMG00000023647 PATZ1 (ENSMAMG00000024829) EIF4ENIF1 (ENSMAMG00000023655) ENSMAMG00000023657 sxph (ENSMAMG00000023660) sirt4 (ENSMAMG00000023664) zgc:112163 (ENSMAMG00000023668) Carangaria ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000167296 ENSGT00940000160748.b ENSGT00390000006166.a ENSGT00940000157019.g.b ENSGT00390000007029.e.b ENSGT00390000012240 ENSGT00390000007336.a.b ENSGT00940000154930.db ENSGT00940000157285.e ENSGT00950000182993.B.a.c ENSGT01050000244902.a.a.b ENSGT00530000063561 ENSGT00390000003860.hb ENSGT00940000153665.b.a.b ENSGT00940000155505.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT00940000166826 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00950000182964.a.a.g.b ENSGT01100000263497.E.b.q.a ENSGT00390000005897.j ENSGT00940000164612.a ENSGT00940000153190.A.g ENSGT00950000183180.b ENSGT00390000006452.b.b.h ENSGT00950000183210.g.b ENSGT00940000168333 ENSGT00940000156166.a.i.a ENSGT00390000017965 ENSGT00390000018446.b Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000167296 ENSGT00940000160748.b ENSGT00390000006166.a ENSGT00940000157019.g.b ENSGT00390000007029.e.b ENSGT00390000012240 ENSGT00390000007336.a.b ENSGT00940000154930.db ENSGT00940000157285.e ENSGT00950000182993.B.a.c ENSGT01050000244902.a.a.b ENSGT00530000063561 ENSGT00390000003860.hb ENSGT00940000153665.b.a.b ENSGT00940000155505.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT00940000166826 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00950000182964.a.a.g.b ENSGT01100000263497.E.b.q.a ENSGT00390000005897.j ENSGT00940000164612.a ENSGT00940000153190.A.g ENSGT00950000183180.b ENSGT00390000006452.b.b.h ENSGT00950000183210.g.b ENSGT00940000168333 ENSGT00390000017965 ENSGT00390000018446.b ENSGT00550000075011 Seriola DUPLICATION Seriola ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000158891 ENSGT00940000154388 ENSGT00390000012071 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000160058 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773 ENSGT00940000160379 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000158726 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b.c ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT00940000155048.d.b.d ENSGT00390000005497 ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00390000011228.b.a.e.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000157304 ENSGT00940000165342.a ENSGT00390000008325.b.a ENSGT00940000154899.fb.b ENSGT00940000153709.A.f ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b ENSGT01050000244882.a.a.b.a.a Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 2920 EIF4ENIF1 (ENSSLDG00000024645) PATZ1 (ENSSLDG00000024660) ENSSLDG00000024668 ENSSLDG00000024676 tgfa (ENSSLDG00000024688) hdhd3 (ENSSLDG00000024696) trub2 (ENSSLDG00000024701) ENSSLDG00000024714 srsf3a (ENSSLDG00000024723) fkbp5 (ENSSLDG00000024729) slc6a22.1 (ENSSLDG00000024738) slc6a22.2 (ENSSLDG00000024762) ENSSLDG00000024793 ##22 ENSSLDG00000024797 ##22 ENSSLDG00000024799 ##22 ENSSLDG00000024804 ##22 synprb (ENSSLDG00000024813) ENSSLDG00000024839 PTPRG (ENSSLDG00000024938) cfap20dc (ENSSLDG00000024956) ENSSLDG00000024962 ENSSLDG00000024971 CAMK1 (ENSSLDG00000024978) pbrm1l (ENSSLDG00000025003) stau1 (ENSSLDG00000025040) ENSSLDG00000025055 ENSSLDG00000025066 Greater amberjack MODERN SPECIES 47 EIF4ENIF1 (ENSSDUG00000016719) PATZ1 (ENSSDUG00000016819) ENSSDUG00000016825 SLC2A11 (ENSSDUG00000016856) tgfa (ENSSDUG00000016889) hdhd3 (ENSSDUG00000016917) trub2 (ENSSDUG00000016928) ENSSDUG00000016963 srsf3a (ENSSDUG00000016982) fkbp5 (ENSSDUG00000017003) slc6a22.1 (ENSSDUG00000017029) slc6a22.2 (ENSSDUG00000017092) ENSSDUG00000017178 ##22 ENSSDUG00000019004 ##22 ENSSDUG00000019022 ##22 ENSSDUG00000019040 ##22 synprb (ENSSDUG00000019054) ENSSDUG00000019087 PTPRG (ENSSDUG00000019155) ENSSDUG00000019206 cfap20dc (ENSSDUG00000019218) ENSSDUG00000019238 FAM107A (ENSSDUG00000019338) CAMK1 (ENSSDUG00000019354) pbrm1l (ENSSDUG00000019381) stau1 (ENSSDUG00000019439) ENSSDUG00000019462 ENSSDUG00000019489 KCNB1 (ENSSDUG00000019497) ptgis (ENSSDUG00000019508) SRGAP3 (ENSSDUG00000019582) Seriola ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b ENSGT00940000153709.A.f ENSGT00940000154899.fb.b ENSGT00390000008325.b.a ENSGT00940000165342.a ENSGT00940000157304 ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00390000011228.b.a.e.b ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00390000005497 ENSGT00940000155048.d.b.d ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b.c ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT00940000166826 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000158726 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000160379 ENSGT00940000156773 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000160058 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000159296 ENSGT00390000012071 ENSGT00940000154388 ENSGT00940000158891 ENSGT00390000002240 Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 2920 ENSSLDG00000025066 ENSSLDG00000025055 stau1 (ENSSLDG00000025040) pbrm1l (ENSSLDG00000025003) CAMK1 (ENSSLDG00000024978) ENSSLDG00000024971 ENSSLDG00000024962 cfap20dc (ENSSLDG00000024956) PTPRG (ENSSLDG00000024938) ENSSLDG00000024839 synprb (ENSSLDG00000024813) ENSSLDG00000024804 ##22 ENSSLDG00000024799 ##22 ENSSLDG00000024797 ##22 ENSSLDG00000024793 ##22 slc6a22.2 (ENSSLDG00000024762) slc6a22.1 (ENSSLDG00000024738) fkbp5 (ENSSLDG00000024729) srsf3a (ENSSLDG00000024723) ENSSLDG00000024714 trub2 (ENSSLDG00000024701) hdhd3 (ENSSLDG00000024696) tgfa (ENSSLDG00000024688) ENSSLDG00000024676 ENSSLDG00000024668 PATZ1 (ENSSLDG00000024660) EIF4ENIF1 (ENSSLDG00000024645) sxph (ENSSLDG00000024629) Greater amberjack MODERN SPECIES 47 ptgis (ENSSDUG00000019508) KCNB1 (ENSSDUG00000019497) ENSSDUG00000019489 ENSSDUG00000019462 stau1 (ENSSDUG00000019439) pbrm1l (ENSSDUG00000019381) CAMK1 (ENSSDUG00000019354) FAM107A (ENSSDUG00000019338) ENSSDUG00000019238 cfap20dc (ENSSDUG00000019218) ENSSDUG00000019206 PTPRG (ENSSDUG00000019155) ENSSDUG00000019087 synprb (ENSSDUG00000019054) ENSSDUG00000019040 ##22 ENSSDUG00000019022 ##22 ENSSDUG00000019004 ##22 ENSSDUG00000017178 ##22 slc6a22.2 (ENSSDUG00000017092) slc6a22.1 (ENSSDUG00000017029) fkbp5 (ENSSDUG00000017003) srsf3a (ENSSDUG00000016982) ENSSDUG00000016963 trub2 (ENSSDUG00000016928) hdhd3 (ENSSDUG00000016917) tgfa (ENSSDUG00000016889) SLC2A11 (ENSSDUG00000016856) ENSSDUG00000016825 PATZ1 (ENSSDUG00000016819) EIF4ENIF1 (ENSSDUG00000016719) sxph (ENSSDUG00000016688) Barramundi perch DUPLICATION Barramundi perch MODERN SPECIES 346 ptgis (ENSLCAG00010009685) KCNB1 (ENSLCAG00010009693) ENSLCAG00010009695 ENSLCAG00010009704 ENSLCAG00010009708 stau1 (ENSLCAG00010009716) pbrm1l (ENSLCAG00010009764) CAMK1 (ENSLCAG00010009838) FAM107A (ENSLCAG00010009844) ENSLCAG00010009848 cfap20dc (ENSLCAG00010009859) PTPRG (ENSLCAG00010009905) ENSLCAG00010010421 synprb (ENSLCAG00010012532) ENSLCAG00010012667 ##22 ENSLCAG00010013145 ##22 Barramundi perch MODERN SPECIES 346 ENSLCAG00010013145 ##22 ENSLCAG00010012667 ##22 synprb (ENSLCAG00010012532) ENSLCAG00010010421 PTPRG (ENSLCAG00010009905) cfap20dc (ENSLCAG00010009859) ENSLCAG00010009848 FAM107A (ENSLCAG00010009844) CAMK1 (ENSLCAG00010009838) pbrm1l (ENSLCAG00010009764) stau1 (ENSLCAG00010009716) ENSLCAG00010009708 ENSLCAG00010009704 ENSLCAG00010009695 KCNB1 (ENSLCAG00010009693) ptgis (ENSLCAG00010009685) SRGAP3 (ENSLCAG00010009556) Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00950000183006.A.a.a.b ENSGT01050000244882.a.a.b.a.a ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b ENSGT00940000153709.A.f ENSGT00940000154899.fb.b ENSGT00390000008325.b.a ENSGT00940000165342.a ENSGT00940000157304 ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00390000005497 ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT00940000166826 ENSGT00940000163827.a.b.u.b ENSGT00940000158726 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000160379 ENSGT00940000156773 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000160058 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000159296 ENSGT00390000012071 ENSGT00940000166668 ENSGT00940000154388 ENSGT00940000158891 Tongue sole DUPLICATION Tongue sole MODERN SPECIES 2 cav4a (ENSCSEG00000000668) OXTR (ENSCSEG00000000683) SRGAP3 (ENSCSEG00000000715) ptgis (ENSCSEG00000000773) KCNB1 (ENSCSEG00000000781) ENSCSEG00000000785 stau1 (ENSCSEG00000000792) pbrm1l (ENSCSEG00000000804) CAMK1 (ENSCSEG00000000819) ENSCSEG00000000831 cfap20dc (ENSCSEG00000000837) PTPRG (ENSCSEG00000000859) ENSCSEG00000000914 synprb (ENSCSEG00000001065) ENSCSEG00000001074 ##22 ENSCSEG00000001078 ##22 slc6a22.2 (ENSCSEG00000001079) slc6a22.1 (ENSCSEG00000001110) slc6a22.1 (ENSCSEG00000001298) fkbp5 (ENSCSEG00000001306) srsf3a (ENSCSEG00000001311) ENSCSEG00000001322 trub2 (ENSCSEG00000001331) hdhd3 (ENSCSEG00000001353) tgfa (ENSCSEG00000001356) ENSCSEG00000001362 ENSCSEG00000001380 PATZ1 (ENSCSEG00000001385) ENSCSEG00000001390 EIF4ENIF1 (ENSCSEG00000001394) ENSCSEG00000001406 Tongue sole MODERN SPECIES 2 EIF4ENIF1 (ENSCSEG00000001394) ENSCSEG00000001390 PATZ1 (ENSCSEG00000001385) ENSCSEG00000001380 ENSCSEG00000001362 tgfa (ENSCSEG00000001356) hdhd3 (ENSCSEG00000001353) trub2 (ENSCSEG00000001331) ENSCSEG00000001322 srsf3a (ENSCSEG00000001311) fkbp5 (ENSCSEG00000001306) slc6a22.1 (ENSCSEG00000001298) slc6a22.1 (ENSCSEG00000001110) slc6a22.2 (ENSCSEG00000001079) ENSCSEG00000001078 ##22 ENSCSEG00000001074 ##22 synprb (ENSCSEG00000001065) ENSCSEG00000000914 PTPRG (ENSCSEG00000000859) cfap20dc (ENSCSEG00000000837) ENSCSEG00000000831 CAMK1 (ENSCSEG00000000819) pbrm1l (ENSCSEG00000000804) stau1 (ENSCSEG00000000792) ENSCSEG00000000785 KCNB1 (ENSCSEG00000000781) ptgis (ENSCSEG00000000773) SRGAP3 (ENSCSEG00000000715) OXTR (ENSCSEG00000000683) cav4a (ENSCSEG00000000668) ENSCSEG00000000662 Turbot DUPLICATION Turbot DUPLICATION Turbot MODERN SPECIES 18 ENSSMAG00000017218 SRGAP3 (ENSSMAG00000017241) ptgis (ENSSMAG00000017341) ENSSMAG00000029776 ENSSMAG00000017363 ENSSMAG00000017385 stau1 (ENSSMAG00000017410) pbrm1l (ENSSMAG00000017461) ENSSMAG00000017597 ENSSMAG00000017637 cfap20dc (ENSSMAG00000017654) ENSSMAG00000017683 ENSSMAG00000017781 synprb (ENSSMAG00000022669) RH2-B2 (ENSSMAG00000018144) ##22 RH2-B1 (ENSSMAG00000018084) ##22 RH2-A1 (ENSSMAG00000018072) ##22 slc6a22.2 (ENSSMAG00000020739) slc6a22.1 (ENSSMAG00000020801) fkbp5 (ENSSMAG00000020806) srsf3a (ENSSMAG00000020812) ENSSMAG00000033456 ENSSMAG00000020820 hdhd3 (ENSSMAG00000020823) tgfa (ENSSMAG00000020829) ENSSMAG00000020832 ENSSMAG00000020843 ENSSMAG00000024088 ENSSMAG00000020846 ENSSMAG00000020856 sxph (ENSSMAG00000020862) Turbot MODERN SPECIES 18 ENSSMAG00000020856 ENSSMAG00000020846 ENSSMAG00000024088 ENSSMAG00000020843 ENSSMAG00000020832 tgfa (ENSSMAG00000020829) hdhd3 (ENSSMAG00000020823) ENSSMAG00000020820 ENSSMAG00000033456 srsf3a (ENSSMAG00000020812) fkbp5 (ENSSMAG00000020806) slc6a22.1 (ENSSMAG00000020801) slc6a22.2 (ENSSMAG00000020739) RH2-A1 (ENSSMAG00000018072) ##22 RH2-B1 (ENSSMAG00000018084) ##22 RH2-B2 (ENSSMAG00000018144) ##22 synprb (ENSSMAG00000022669) ENSSMAG00000017781 ENSSMAG00000017683 cfap20dc (ENSSMAG00000017654) ENSSMAG00000017637 ENSSMAG00000017597 pbrm1l (ENSSMAG00000017461) stau1 (ENSSMAG00000017410) ENSSMAG00000017385 ENSSMAG00000017363 ENSSMAG00000029776 ptgis (ENSSMAG00000017341) SRGAP3 (ENSSMAG00000017241) ENSSMAG00000017218 CAV3 (ENSSMAG00000017215) Turbot MODERN SPECIES 20 pgap4 (ENSSMAG00000021151) ENSSMAG00000035115 ENSSMAG00000029348 ENSSMAG00000021152 ENSSMAG00000034132 ENSSMAG00000021153 ENSSMAG00000021154 ENSSMAG00000021155 rcor3 (ENSSMAG00000021156) ENSSMAG00000021157 ENSSMAG00000021158 ENSSMAG00000021159 ENSSMAG00000021160 ENSSMAG00000021161 ENSSMAG00000020991 ENSSMAG00000020988 ##22 ENSSMAG00000020964 ENSSMAG00000020962 ENSSMAG00000020961 map1lc3c (ENSSMAG00000020959) ENSSMAG00000020957 tomm20b (ENSSMAG00000020956) rbm34 (ENSSMAG00000020955) tbce (ENSSMAG00000020949) NID1 (ENSSMAG00000020946) ENSSMAG00000020945 ero1b (ENSSMAG00000020943) ENSSMAG00000020942 ENSSMAG00000020926 ENSSMAG00000020922 ENSSMAG00000031291 Eupercaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b ENSGT00940000153709.A.f ENSGT00940000154899.fb.b ENSGT00390000008325.b.a ENSGT00940000165342.a ENSGT00940000157304 ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00390000011228.b.a.e.b ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00390000005497 ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000166826 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000158726 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000160379.h ENSGT00940000156773 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000160058 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000166177 ENSGT00940000159296 ENSGT00390000012071 ENSGT00940000154110.a ENSGT00940000154388 ENSGT00940000158891 Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00950000182998.C.b.b ENSGT00950000183006.A.a.a.b ENSGT01050000244882.a.a.b.a.a ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b ENSGT00940000153709.A.f ENSGT00940000154899.fb.b ENSGT00940000165342.a ENSGT00940000157304 ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00390000011228.b.a.e.b ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT00940000166826 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000158726 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000160379.h ENSGT00940000156773 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000160058 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000159296 ENSGT00390000012071 ENSGT00940000166668 ENSGT00940000154388 ENSGT00940000158891 Fugu MODERN SPECIES 10 ENSTRUG00000021435 cav4a (ENSTRUG00000007707) OXTR (ENSTRUG00000007606) SRGAP3 (ENSTRUG00000006997) ptgis (ENSTRUG00000006596) KCNB1 (ENSTRUG00000006520) ENSTRUG00000006351 stau1 (ENSTRUG00000005837) pbrm1l (ENSTRUG00000005335) CAMK1 (ENSTRUG00000005116) ENSTRUG00000021663 ENSTRUG00000024993 PTPRG (ENSTRUG00000004636) ENSTRUG00000003536 synprb (ENSTRUG00000003258) ENSTRUG00000002372 ##22 ENSTRUG00000002306 ##22 slc6a22.2 (ENSTRUG00000003335) slc6a22.2 (ENSTRUG00000003053) slc6a22.1 (ENSTRUG00000032801) slc6a22.1 (ENSTRUG00000028380) fkbp5 (ENSTRUG00000015512) srsf3a (ENSTRUG00000023965) ENSTRUG00000022896 trub2 (ENSTRUG00000015499) hdhd3 (ENSTRUG00000033187) tgfa (ENSTRUG00000024683) SLC2A11 (ENSTRUG00000015382) ENSTRUG00000025708 PATZ1 (ENSTRUG00000015366) EIF4ENIF1 (ENSTRUG00000015303) Tetraodon MODERN SPECIES 2 BRK1 (ENSTNIG00000000700) grm2b (ENSTNIG00000014741) rrp9 (ENSTNIG00000014740) cav4a (ENSTNIG00000014738) OXTR (ENSTNIG00000014737) SRGAP3 (ENSTNIG00000014736) ptgis (ENSTNIG00000014735) KCNB1 (ENSTNIG00000014734) ENSTNIG00000014733 stau1 (ENSTNIG00000014732) pbrm1l (ENSTNIG00000014731) CAMK1 (ENSTNIG00000014730) PTPRG (ENSTNIG00000014729) ENSTNIG00000014728 synprb (ENSTNIG00000014727) opn1mw1 (ENSTNIG00000014726) ##22 ENSTNIG00000000105 slc6a22.2 (ENSTNIG00000014725) slc6a22.1 (ENSTNIG00000014724) fkbp5 (ENSTNIG00000014723) srsf3a (ENSTNIG00000001003) ENSTNIG00000014722 trub2 (ENSTNIG00000014721) hdhd3 (ENSTNIG00000001351) tgfa (ENSTNIG00000014720) EIF4ENIF1 (ENSTNIG00000014719) ENSTNIG00000014718 PATZ1 (ENSTNIG00000014714) sxph (ENSTNIG00000014717) uqcc2 (ENSTNIG00000014716) tspo (ENSTNIG00000014715) Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b ENSGT00940000153709.A.f ENSGT00940000154899.fb.b ENSGT00390000008325.b.a ENSGT00940000165342.a ENSGT00940000157304 ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00390000011228.b.a.e.b ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00390000005497 ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000166826 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000158726 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000160379.h ENSGT00940000156773 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000160058 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000166177 ENSGT00940000159296 ENSGT00390000012071 ENSGT00940000154110.a ENSGT00940000154388 ENSGT00940000158891 Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse MODERN SPECIES 911 ENSLBEG00000003144 ##22 ENSLBEG00000003169 ##22 ENSLBEG00000003197 ##22 synprb (ENSLBEG00000003223) ENSLBEG00000003255 Ballan wrasse MODERN SPECIES 911 ENSLBEG00000003144 ##22 ENSLBEG00000003169 ##22 ENSLBEG00000003197 ##22 synprb (ENSLBEG00000003223) ENSLBEG00000003255 Ballan wrasse MODERN SPECIES 911 ENSLBEG00000003255 synprb (ENSLBEG00000003223) ENSLBEG00000003197 ##22 ENSLBEG00000003169 ##22 ENSLBEG00000003144 ##22 Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b ENSGT00940000153709.A.f ENSGT00940000154899.fb.b ENSGT00390000008325.b.a ENSGT00940000165342.a ENSGT00940000157304 ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00390000011228.b.a.e.b ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00390000005497 ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000166826 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000158726 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000160379.h ENSGT00940000156773 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000160058 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000166177 ENSGT00940000159296 ENSGT00390000012071 ENSGT00940000154110.a ENSGT00940000154388 ENSGT00940000158891 Perciformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000166668 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000012071 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000166177 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000160058 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773 ENSGT00940000160379.h ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000158726 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00390000005497 ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00390000011228.b.a.e.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000157304 ENSGT00940000165342.a ENSGT00390000008325.b.a ENSGT00940000154899.fb.b ENSGT00940000153709.A.f ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b ENSGT01050000244882.a.a.b.a.a Cottioidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT01050000244882.a.a.b.a.a ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b ENSGT00940000153709.A.f ENSGT00940000154899.fb.b ENSGT00390000008325.b.a ENSGT00940000165342.a ENSGT00940000157304 ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00390000011228.b.a.e.b ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00940000178103 ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT00940000166826 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000158726 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000160379.h ENSGT00940000156773 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000160058 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000166177 ENSGT00940000159296 ENSGT00390000012071 ENSGT00940000166668 ENSGT00940000154388 Lumpfish DUPLICATION Lumpfish MODERN SPECIES 20 ptgis (ENSCLMG00005018568) KCNB1 (ENSCLMG00005018567) ENSCLMG00005018563 ENSCLMG00005018561 ENSCLMG00005018559 stau1 (ENSCLMG00005018555) pbrm1l (ENSCLMG00005018411) CAMK1 (ENSCLMG00005018396) ENSCLMG00005018395 ENSCLMG00005018394 ENSCLMG00005018393 PTPRG (ENSCLMG00005017865) ENSCLMG00005017692 synprb (ENSCLMG00005017658) ENSCLMG00005017605 ##22 ENSCLMG00005017597 ##22 ENSCLMG00005017578 ##22 slc6a22.2 (ENSCLMG00005017409) slc6a22.1 (ENSCLMG00005014566) fkbp5 (ENSCLMG00005014532) srsf3a (ENSCLMG00005014530) ENSCLMG00005014529 trub2 (ENSCLMG00005014524) hdhd3 (ENSCLMG00005014522) tgfa (ENSCLMG00005014520) ENSCLMG00005014214 ENSCLMG00005014211 PATZ1 (ENSCLMG00005014201) EIF4ENIF1 (ENSCLMG00005014197) ENSCLMG00005014195 sxph (ENSCLMG00005014194) Lumpfish MODERN SPECIES 20 ENSCLMG00005014195 EIF4ENIF1 (ENSCLMG00005014197) PATZ1 (ENSCLMG00005014201) ENSCLMG00005014211 ENSCLMG00005014214 tgfa (ENSCLMG00005014520) hdhd3 (ENSCLMG00005014522) trub2 (ENSCLMG00005014524) ENSCLMG00005014529 srsf3a (ENSCLMG00005014530) fkbp5 (ENSCLMG00005014532) slc6a22.1 (ENSCLMG00005014566) slc6a22.2 (ENSCLMG00005017409) ENSCLMG00005017578 ##22 ENSCLMG00005017597 ##22 ENSCLMG00005017605 ##22 synprb (ENSCLMG00005017658) ENSCLMG00005017692 PTPRG (ENSCLMG00005017865) ENSCLMG00005018393 ENSCLMG00005018394 ENSCLMG00005018395 CAMK1 (ENSCLMG00005018396) pbrm1l (ENSCLMG00005018411) stau1 (ENSCLMG00005018555) ENSCLMG00005018559 ENSCLMG00005018561 ENSCLMG00005018563 KCNB1 (ENSCLMG00005018567) ptgis (ENSCLMG00005018568) SRGAP3 (ENSCLMG00005018577) Stickleback DUPLICATION Stickleback MODERN SPECIES 281 sxph (ENSGACG00000001495) ENSGACG00000001493 ENSGACG00000001490 EIF4ENIF1 (ENSGACG00000001486) ENSGACG00000001485 PATZ1 (ENSGACG00000001483) ENSGACG00000001480 ENSGACG00000001478 hdhd3 (ENSGACG00000001477) trub2 (ENSGACG00000001476) ENSGACG00000001475 srsf3a (ENSGACG00000001473) fkbp5 (ENSGACG00000001466) slc6a22.1 (ENSGACG00000001437) ENSGACG00000001434 ##22 ENSGACG00000001398 ##22 synprb (ENSGACG00000001392) ENSGACG00000001382 PTPRG (ENSGACG00000001373) CAMK1 (ENSGACG00000001365) ENSGACG00000001361 stau1 (ENSGACG00000001352) ENSGACG00000001346 KCNB1 (ENSGACG00000001336) ptgis (ENSGACG00000001327) SRGAP3 (ENSGACG00000001317) C3orf18 (ENSGACG00000001312) mst1 (ENSGACG00000001303) abhd14b (ENSGACG00000001300) ENSGACG00000001297 HYAL2 (ENSGACG00000001294) Stickleback MODERN SPECIES 281 ENSGACG00000001297 abhd14b (ENSGACG00000001300) mst1 (ENSGACG00000001303) C3orf18 (ENSGACG00000001312) SRGAP3 (ENSGACG00000001317) ptgis (ENSGACG00000001327) KCNB1 (ENSGACG00000001336) ENSGACG00000001346 stau1 (ENSGACG00000001352) ENSGACG00000001361 CAMK1 (ENSGACG00000001365) PTPRG (ENSGACG00000001373) ENSGACG00000001382 synprb (ENSGACG00000001392) ENSGACG00000001398 ##22 ENSGACG00000001434 ##22 slc6a22.1 (ENSGACG00000001437) fkbp5 (ENSGACG00000001466) srsf3a (ENSGACG00000001473) ENSGACG00000001475 trub2 (ENSGACG00000001476) hdhd3 (ENSGACG00000001477) ENSGACG00000001478 ENSGACG00000001480 PATZ1 (ENSGACG00000001483) ENSGACG00000001485 EIF4ENIF1 (ENSGACG00000001486) ENSGACG00000001490 ENSGACG00000001493 sxph (ENSGACG00000001495) sirt4 (ENSGACG00000001497) Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000158891 ENSGT00940000154388 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000012071 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000160058 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773 ENSGT00940000160379.h ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000158726 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00390000005497 ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00390000011228.b.a.e.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000157304 ENSGT00940000165342.a ENSGT00390000008325.b.a ENSGT00940000154899.gb ENSGT00940000154899.fb.b ENSGT00940000153709.A.f ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b Channel bull blenny DUPLICATION Channel bull blenny MODERN SPECIES 19 sxph (ENSCGOG00000014016) ENSCGOG00000014012 EIF4ENIF1 (ENSCGOG00000014008) PATZ1 (ENSCGOG00000014005) ENSCGOG00000014004 ENSCGOG00000013857 tgfa (ENSCGOG00000013849) hdhd3 (ENSCGOG00000013846) trub2 (ENSCGOG00000013841) ENSCGOG00000013836 srsf3a (ENSCGOG00000013827) fkbp5 (ENSCGOG00000013303) slc6a22.1 (ENSCGOG00000013045) slc6a22.2 (ENSCGOG00000009909) ENSCGOG00000008811 ##22 ENSCGOG00000008512 ##22 synprb (ENSCGOG00000008490) ENSCGOG00000003906 PTPRG (ENSCGOG00000002828) ENSCGOG00000002649 ENSCGOG00000002623 ENSCGOG00000009770 FAM107A (ENSCGOG00000009764) CAMK1 (ENSCGOG00000007260) pbrm1l (ENSCGOG00000006523) stau1 (ENSCGOG00000006396) ENSCGOG00000006350 ENSCGOG00000006338 KCNB1 (ENSCGOG00000006337) ptgis (ENSCGOG00000006278) SRGAP3 (ENSCGOG00000004386) Channel bull blenny MODERN SPECIES 19 sirt4 (ENSCGOG00000014032) sxph (ENSCGOG00000014016) ENSCGOG00000014012 EIF4ENIF1 (ENSCGOG00000014008) PATZ1 (ENSCGOG00000014005) ENSCGOG00000014004 ENSCGOG00000013857 tgfa (ENSCGOG00000013849) hdhd3 (ENSCGOG00000013846) trub2 (ENSCGOG00000013841) ENSCGOG00000013836 srsf3a (ENSCGOG00000013827) fkbp5 (ENSCGOG00000013303) slc6a22.1 (ENSCGOG00000013045) slc6a22.2 (ENSCGOG00000009909) ENSCGOG00000008811 ##22 ENSCGOG00000008512 ##22 synprb (ENSCGOG00000008490) ENSCGOG00000003906 PTPRG (ENSCGOG00000002828) ENSCGOG00000002649 ENSCGOG00000002623 ENSCGOG00000009770 FAM107A (ENSCGOG00000009764) CAMK1 (ENSCGOG00000007260) pbrm1l (ENSCGOG00000006523) stau1 (ENSCGOG00000006396) ENSCGOG00000006350 ENSCGOG00000006338 KCNB1 (ENSCGOG00000006337) ptgis (ENSCGOG00000006278) Pike perch MODERN SPECIES 17 ENSSLUG00000019075 ENSSLUG00000019010 inka1b (ENSSLUG00000018990) ENSSLUG00000018989 gnai2b (ENSSLUG00000018977) SLC38A3 (ENSSLUG00000014449) rbm5 (ENSSLUG00000014206) brk1 (ENSSLUG00000014192) ENSSLUG00000014186 TEX264 (ENSSLUG00000014181) grm2b (ENSSLUG00000014169) rrp9 (ENSSLUG00000014141) ENSSLUG00000014136 cav4a (ENSSLUG00000014135) OXTR (ENSSLUG00000014130) ENSSLUG00000014120 ##22 ENSSLUG00000014115 SRGAP3 (ENSSLUG00000012689) ptgis (ENSSLUG00000012612) ENSSLUG00000012571 ENSSLUG00000012557 ENSSLUG00000012501 stau1 (ENSSLUG00000012409) ENSSLUG00000012384 Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b ENSGT00940000153709.A.f ENSGT00940000154899.fb.b ENSGT00390000008325.b.a ENSGT00940000165342.a ENSGT00940000157304 ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00390000011228.b.a.e.b ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00390000005497 ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000166826 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000158726 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000160379.h ENSGT00940000156773 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000160058 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000166177 ENSGT00940000159296 ENSGT00390000012071 ENSGT00940000154110.a ENSGT00940000154388 ENSGT00940000158891 Gilthead seabream MODERN SPECIES 20 SRGAP3 (ENSSAUG00010000587) ptgis (ENSSAUG00010003471) KCNB1 (ENSSAUG00010003485) ENSSAUG00010003487 ENSSAUG00010003491 stau1 (ENSSAUG00010003501) pbrm1l (ENSSAUG00010003714) CAMK1 (ENSSAUG00010012768) FAM107A (ENSSAUG00010014408) ENSSAUG00010014409 cfap20dc (ENSSAUG00010014413) PTPRG (ENSSAUG00010014428) ENSSAUG00010014963 synprb (ENSSAUG00010020127) ENSSAUG00010020129 ##22 ENSSAUG00010020148 ##22 slc6a22.2 (ENSSAUG00010020171) slc6a22.1 (ENSSAUG00010021239) fkbp5 (ENSSAUG00010021302) srsf3a (ENSSAUG00010021319) ENSSAUG00010021320 trub2 (ENSSAUG00010021321) hdhd3 (ENSSAUG00010021323) tgfa (ENSSAUG00010021324) SLC2A11 (ENSSAUG00010021332) ENSSAUG00010021530 PATZ1 (ENSSAUG00010021531) EIF4ENIF1 (ENSSAUG00010021532) SFI1 (ENSSAUG00010021551) sxph (ENSSAUG00010021558) sirt4 (ENSSAUG00010021560) Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES ENSGT01050000244882.a.a.b.a.a ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b ENSGT00940000153709.A.f ENSGT00940000154899.fb.b ENSGT00390000008325.b.a ENSGT00940000165342.a ENSGT00940000157304 ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00390000011228.b.a.e.b ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00390000005497 ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT00940000166826 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000158726 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000160379.h ENSGT00940000156773 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000160058 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000159296 ENSGT00390000012071 ENSGT00940000154110.a ENSGT00940000154388 ENSGT00940000158891 Large yellow croaker DUPLICATION Large yellow croaker MODERN SPECIES 478 SRGAP3 (ENSLCRG00005012334) ptgis (ENSLCRG00005012296) KCNB1 (ENSLCRG00005012288) ENSLCRG00005012285 ENSLCRG00005012267 stau1 (ENSLCRG00005012188) pbrm1l (ENSLCRG00005006349) CAMK1 (ENSLCRG00005005644) FAM107A (ENSLCRG00005005631) ENSLCRG00005005628 cfap20dc (ENSLCRG00005005625) PTPRG (ENSLCRG00005000378) ENSLCRG00005023840 synprb (ENSLCRG00005023839) ENSLCRG00005023837 ##22 ENSLCRG00005023836 ##22 slc6a22.2 (ENSLCRG00005023835) slc6a22.1 (ENSLCRG00005023829) fkbp5 (ENSLCRG00005023820) srsf3a (ENSLCRG00005023818) ENSLCRG00005023817 trub2 (ENSLCRG00005023816) hdhd3 (ENSLCRG00005023815) tgfa (ENSLCRG00005023814) SLC2A11 (ENSLCRG00005023813) ENSLCRG00005023812 PATZ1 (ENSLCRG00005023811) EIF4ENIF1 (ENSLCRG00005023810) SFI1 (ENSLCRG00005023809) sxph (ENSLCRG00005023806) sirt4 (ENSLCRG00005023805) Large yellow croaker MODERN SPECIES 478 sxph (ENSLCRG00005023806) SFI1 (ENSLCRG00005023809) EIF4ENIF1 (ENSLCRG00005023810) PATZ1 (ENSLCRG00005023811) ENSLCRG00005023812 SLC2A11 (ENSLCRG00005023813) tgfa (ENSLCRG00005023814) hdhd3 (ENSLCRG00005023815) trub2 (ENSLCRG00005023816) ENSLCRG00005023817 srsf3a (ENSLCRG00005023818) fkbp5 (ENSLCRG00005023820) slc6a22.1 (ENSLCRG00005023829) slc6a22.2 (ENSLCRG00005023835) ENSLCRG00005023836 ##22 ENSLCRG00005023837 ##22 synprb (ENSLCRG00005023839) ENSLCRG00005023840 PTPRG (ENSLCRG00005000378) cfap20dc (ENSLCRG00005005625) ENSLCRG00005005628 FAM107A (ENSLCRG00005005631) CAMK1 (ENSLCRG00005005644) pbrm1l (ENSLCRG00005006349) stau1 (ENSLCRG00005012188) ENSLCRG00005012267 ENSLCRG00005012285 KCNB1 (ENSLCRG00005012288) ptgis (ENSLCRG00005012296) SRGAP3 (ENSLCRG00005012334) OXTR (ENSLCRG00005017752) European seabass DUPLICATION European seabass DUPLICATION European seabass DUPLICATION European seabass MODERN SPECIES 10 zgc:112163 (ENSDLAG00005030798) sxph (ENSDLAG00005023068) SFI1 (ENSDLAG00005033487) EIF4ENIF1 (ENSDLAG00005023111) PATZ1 (ENSDLAG00005026428) ENSDLAG00005026856 ENSDLAG00005023149 ENSDLAG00005023163 tgfa (ENSDLAG00005027901) hdhd3 (ENSDLAG00005023238) ENSDLAG00005023240 ENSDLAG00005023244 fkbp5 (ENSDLAG00005031856) slc6a22.1 (ENSDLAG00005033698) slc6a22.2 (ENSDLAG00005028850) ENSDLAG00005003100 ##22 ENSDLAG00005019649 ENSDLAG00005030434 ##22 slc6a22.1 (ENSDLAG00005032723) ENSDLAG00005018127 ##22 ENSDLAG00005020236 ##22 synprb (ENSDLAG00005032345) ENSDLAG00005011156 ##22 ENSDLAG00005011443 PTPRG (ENSDLAG00005018629) cfap20dc (ENSDLAG00005020705) ENSDLAG00005020713 FAM107A (ENSDLAG00005018013) ENSDLAG00005020763 pbrm1l (ENSDLAG00005021862) ENSDLAG00005022190 European seabass MODERN SPECIES 10 SFI1 (ENSDLAG00005033487) EIF4ENIF1 (ENSDLAG00005023111) PATZ1 (ENSDLAG00005026428) ENSDLAG00005026856 ENSDLAG00005023149 ENSDLAG00005023163 tgfa (ENSDLAG00005027901) hdhd3 (ENSDLAG00005023238) ENSDLAG00005023240 ENSDLAG00005023244 fkbp5 (ENSDLAG00005031856) slc6a22.1 (ENSDLAG00005033698) slc6a22.2 (ENSDLAG00005028850) ENSDLAG00005003100 ##22 ENSDLAG00005019649 ENSDLAG00005030434 ##22 slc6a22.1 (ENSDLAG00005032723) ENSDLAG00005018127 ##22 ENSDLAG00005020236 ##22 synprb (ENSDLAG00005032345) ENSDLAG00005011156 ##22 ENSDLAG00005011443 PTPRG (ENSDLAG00005018629) cfap20dc (ENSDLAG00005020705) ENSDLAG00005020713 FAM107A (ENSDLAG00005018013) ENSDLAG00005020763 pbrm1l (ENSDLAG00005021862) ENSDLAG00005022190 ENSDLAG00005022207 ENSDLAG00005022209 European seabass MODERN SPECIES 10 ENSDLAG00005023163 tgfa (ENSDLAG00005027901) hdhd3 (ENSDLAG00005023238) ENSDLAG00005023240 ENSDLAG00005023244 fkbp5 (ENSDLAG00005031856) slc6a22.1 (ENSDLAG00005033698) slc6a22.2 (ENSDLAG00005028850) ENSDLAG00005003100 ##22 ENSDLAG00005019649 ENSDLAG00005030434 ##22 slc6a22.1 (ENSDLAG00005032723) ENSDLAG00005018127 ##22 ENSDLAG00005020236 ##22 synprb (ENSDLAG00005032345) ENSDLAG00005011156 ##22 ENSDLAG00005011443 PTPRG (ENSDLAG00005018629) cfap20dc (ENSDLAG00005020705) ENSDLAG00005020713 FAM107A (ENSDLAG00005018013) ENSDLAG00005020763 pbrm1l (ENSDLAG00005021862) ENSDLAG00005022190 ENSDLAG00005022207 ENSDLAG00005022209 ptgis (ENSDLAG00005022212) ENSDLAG00005022263 ENSDLAG00005023113 cav4a (ENSDLAG00005030654) ENSDLAG00005023122 European seabass MODERN SPECIES 10 ENSDLAG00005023113 ENSDLAG00005022263 ptgis (ENSDLAG00005022212) ENSDLAG00005022209 ENSDLAG00005022207 ENSDLAG00005022190 pbrm1l (ENSDLAG00005021862) ENSDLAG00005020763 FAM107A (ENSDLAG00005018013) ENSDLAG00005020713 cfap20dc (ENSDLAG00005020705) PTPRG (ENSDLAG00005018629) ENSDLAG00005011443 ENSDLAG00005011156 ##22 synprb (ENSDLAG00005032345) ENSDLAG00005020236 ##22 ENSDLAG00005018127 ##22 slc6a22.1 (ENSDLAG00005032723) ENSDLAG00005030434 ##22 ENSDLAG00005019649 ENSDLAG00005003100 ##22 slc6a22.2 (ENSDLAG00005028850) slc6a22.1 (ENSDLAG00005033698) fkbp5 (ENSDLAG00005031856) ENSDLAG00005023244 ENSDLAG00005023240 hdhd3 (ENSDLAG00005023238) tgfa (ENSDLAG00005027901) ENSDLAG00005023163 ENSDLAG00005023149 ENSDLAG00005026856 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000154110.a ENSGT00940000166668 ENSGT00390000012071 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000166177 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000160058 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773 ENSGT00940000160379 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000158726 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00390000005497 ENSGT00940000178103 ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00390000011228.b.a.e.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000157304 ENSGT00940000165342.a ENSGT00390000008325.b.a ENSGT00940000154899.fb.b ENSGT00940000153709.A.f ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000158891 ENSGT00940000154388 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000012071 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000160058 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773 ENSGT00940000160379 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000158726 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00390000005497 ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000157304 ENSGT00940000154899.fb.b ENSGT00940000153709.A.f ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b ENSGT01050000244882.a.a.b.a.a ENSGT00950000183006.A.a.a.b ENSGT00950000182998.C.b.b ENSGT00530000069347 Oryzias DUPLICATION Oryzias ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000158891 ENSGT00940000154388 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000012071 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000160058 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773 ENSGT00940000160379 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000158726 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b.w ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b.x ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00390000005497 ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000157304 ENSGT00940000154899.fb.b ENSGT00940000153709.A.f ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b ENSGT01050000244882.a.a.b.a.a ENSGT00950000183006.A.a.a.b ENSGT00950000182998.C.b.b Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 85 ENSGT00940000158891 ENSGT00940000154388.c ENSGT00940000154388.d ENSGT00390000012071 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000160058 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773.c ENSGT00940000160379 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000158726 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b.w ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b.x ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b Chinese medaka MODERN SPECIES 3530 ENSOSIG00000003332 ##22 Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 19 sirt4 (ENSORLG00000019934) sxph (ENSORLG00000019946) ENSORLG00000025902 eif4enif1 (ENSORLG00000019961) PATZ1 (ENSORLG00000027129) SLC2A11 (ENSORLG00000019991) tgfa (ENSORLG00000023298) hdhd3 (ENSORLG00000028269) trub2 (ENSORLG00000020011) ENSORLG00000024741 srsf3a (ENSORLG00000020054) fkbp5 (ENSORLG00000029600) slc6a22.1 (ENSORLG00000020091) ENSORLG00000023153 kfh-g (ENSORLG00000020100) ##22 ENSORLG00000028704 ##22 ENSORLG00000020133 ##22 synprb (ENSORLG00000026402) ENSORLG00000025356 ENSORLG00000030464 PTPRG (ENSORLG00000020215) ENSORLG00000027895 Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000158891 ENSGT00940000154388 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000012071 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000160058 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773 ENSGT00940000160379 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000158726 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b.w ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b.x ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00390000005497 ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000157304 ENSGT00940000154899.fb.b ENSGT00940000153709.A.f ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b ENSGT01050000244882.a.a.b.a.a ENSGT00950000183006.A.a.a.b ENSGT00950000182998.C.b.b Indian medaka MODERN SPECIES 8 sirt4 (ENSOMEG00000006473) sxph (ENSOMEG00000006516) ENSOMEG00000006539 EIF4ENIF1 (ENSOMEG00000000155) PATZ1 (ENSOMEG00000006636) SLC2A11 (ENSOMEG00000006658) tgfa (ENSOMEG00000006671) hdhd3 (ENSOMEG00000006682) trub2 (ENSOMEG00000006702) ENSOMEG00000006718 srsf3a (ENSOMEG00000006746) fkbp5 (ENSOMEG00000006787) slc6a22.1 (ENSOMEG00000006935) slc6a22.2 (ENSOMEG00000007010) ENSOMEG00000007059 ##22 ENSOMEG00000007091 ##22 ENSOMEG00000007148 ##22 synprb (ENSOMEG00000007182) ENSOMEG00000007413 PTPRG (ENSOMEG00000007483) ENSOMEG00000007506 ENSOMEG00000007525 ENSOMEG00000007539 ENSOMEG00000007557 ENSOMEG00000007579 ENSOMEG00000007630 atp6ap1a (ENSOMEG00000007690) tafazzin (ENSOMEG00000007792) acss2 (ENSOMEG00000007920) mapre1b (ENSOMEG00000007955) dnmt3bb.2 (ENSOMEG00000008012) Oryzias ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000154388 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000012071 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000160058 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773 ENSGT00940000160379 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000158726 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b.w ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b.x ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00390000005497 ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000157304 ENSGT00940000154899.fb.b ENSGT00940000153709.A.f ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b ENSGT01050000244882.a.a.b.a.a ENSGT00950000183006.A.a.a.b ENSGT00950000182998.C.b.b ENSGT00940000158328 Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 85 ENSGT00940000154388.c ENSGT00940000154388.d ENSGT00390000012071 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000160058 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773.c ENSGT00940000160379 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000158726 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b.w ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b.x ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b Chinese medaka MODERN SPECIES 4876 ENSOSIG00000004652 ##22 Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 19 sxph (ENSORLG00000019946) ENSORLG00000025902 eif4enif1 (ENSORLG00000019961) PATZ1 (ENSORLG00000027129) SLC2A11 (ENSORLG00000019991) tgfa (ENSORLG00000023298) hdhd3 (ENSORLG00000028269) trub2 (ENSORLG00000020011) ENSORLG00000024741 srsf3a (ENSORLG00000020054) fkbp5 (ENSORLG00000029600) slc6a22.1 (ENSORLG00000020091) ENSORLG00000023153 kfh-g (ENSORLG00000020100) ##22 ENSORLG00000028704 ##22 ENSORLG00000020133 ##22 synprb (ENSORLG00000026402) ENSORLG00000025356 ENSORLG00000030464 PTPRG (ENSORLG00000020215) ENSORLG00000027895 Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000154388 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000012071 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000160058 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773 ENSGT00940000160379 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000158726 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b.w ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b.x ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00390000005497 ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000157304 ENSGT00940000154899.fb.b ENSGT00940000153709.A.f ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b ENSGT01050000244882.a.a.b.a.a ENSGT00950000183006.A.a.a.b ENSGT00950000182998.C.b.b ENSGT00940000158328 Indian medaka MODERN SPECIES 8 sxph (ENSOMEG00000006516) ENSOMEG00000006539 EIF4ENIF1 (ENSOMEG00000000155) PATZ1 (ENSOMEG00000006636) SLC2A11 (ENSOMEG00000006658) tgfa (ENSOMEG00000006671) hdhd3 (ENSOMEG00000006682) trub2 (ENSOMEG00000006702) ENSOMEG00000006718 srsf3a (ENSOMEG00000006746) fkbp5 (ENSOMEG00000006787) slc6a22.1 (ENSOMEG00000006935) slc6a22.2 (ENSOMEG00000007010) ENSOMEG00000007059 ##22 ENSOMEG00000007091 ##22 ENSOMEG00000007148 ##22 synprb (ENSOMEG00000007182) ENSOMEG00000007413 PTPRG (ENSOMEG00000007483) ENSOMEG00000007506 ENSOMEG00000007525 ENSOMEG00000007539 ENSOMEG00000007557 ENSOMEG00000007579 ENSOMEG00000007630 atp6ap1a (ENSOMEG00000007690) tafazzin (ENSOMEG00000007792) acss2 (ENSOMEG00000007920) mapre1b (ENSOMEG00000007955) dnmt3bb.2 (ENSOMEG00000008012) ENSOMEG00000008030 Javanese ricefish MODERN SPECIES 19 sirt4 (ENSOJAG00000015369) sxph (ENSOJAG00000015229) ENSOJAG00000015215 EIF4ENIF1 (ENSOJAG00000015181) PATZ1 (ENSOJAG00000015149) SLC2A11 (ENSOJAG00000014798) tgfa (ENSOJAG00000014767) hdhd3 (ENSOJAG00000014754) trub2 (ENSOJAG00000014724) ENSOJAG00000014707 srsf3a (ENSOJAG00000014634) fkbp5 (ENSOJAG00000014430) slc6a22.1 (ENSOJAG00000013860) slc6a22.2 (ENSOJAG00000013176) ENSOJAG00000012957 ##22 ENSOJAG00000012883 ##22 synprb (ENSOJAG00000012866) ENSOJAG00000012081 PTPRG (ENSOJAG00000010037) cfap20dc (ENSOJAG00000009907) ENSOJAG00000009882 CAMK1 (ENSOJAG00000009200) pbrm1l (ENSOJAG00000003954) stau1 (ENSOJAG00000003262) KCNB1 (ENSOJAG00000003247) ptgis (ENSOJAG00000003197) SRGAP3 (ENSOJAG00000001990) OXTR (ENSOJAG00000001760) cav4a (ENSOJAG00000001753) ENSOJAG00000001743 grm2b (ENSOJAG00000001598) Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000158891 ENSGT00940000154388 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000012071 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000160058 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773 ENSGT00940000160379 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000158726 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00390000005497 ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000157304 ENSGT00940000154899.fb.b ENSGT00940000153709.A.f ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b ENSGT01050000244882.a.a.b.a.a ENSGT00950000183006.A.a.a.b ENSGT00950000182998.C.b.b ENSGT00530000069347 Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000158891 ENSGT00940000154388 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000012071 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000160058 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773 ENSGT00940000160379 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000158726 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00390000005497 ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000157304 ENSGT00940000154899.fb.b ENSGT00940000153709.A.f ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b ENSGT01050000244882.a.a.b.a.a ENSGT00950000183006.A.a.a.b ENSGT00950000182998.C.b.b ENSGT00530000069347 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000158891 ENSGT00940000154388 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000012071 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000160058 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773 ENSGT00940000160379 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000158726 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00390000005497 ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000157304 ENSGT00940000154899.fb.b.b ENSGT00940000153709.A.f ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b ENSGT01050000244882.a.a.b.a.a ENSGT00950000183006.A.a.a.b ENSGT00950000182998.C.b.b ENSGT00530000069347 Poecilia ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000158891 ENSGT00940000154388 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000012071 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000160058 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773 ENSGT00940000160379 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000158726 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00390000005497 ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000157304 ENSGT00940000154899.fb.b.b ENSGT00940000153709.A.f ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b ENSGT01050000244882.a.a.b.a.a ENSGT00950000183006.A.a.a.b ENSGT00950000182998.C.b.b ENSGT00530000069347 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000158891 ENSGT00940000154388 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000012071 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000160058 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773 ENSGT00940000160379 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000158726 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00390000005497 ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000157304 ENSGT00940000154899.fb.b.b ENSGT00940000153709.A.f ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b ENSGT01050000244882.a.a.b.a.a ENSGT00950000183006.A.a.a.b ENSGT00950000182998.C.b.b ENSGT00530000069347 Amazon molly MODERN SPECIES 254 sirt4 (ENSPFOG00000018154) sxph (ENSPFOG00000018133) SFI1 (ENSPFOG00000018097) EIF4ENIF1 (ENSPFOG00000018072) PATZ1 (ENSPFOG00000018058) SLC2A11 (ENSPFOG00000018035) tgfa (ENSPFOG00000022903) hdhd3 (ENSPFOG00000018032) trub2 (ENSPFOG00000018018) ENSPFOG00000024194 srsf3a (ENSPFOG00000018005) fkbp5 (ENSPFOG00000017970) slc6a22.1 (ENSPFOG00000017791) slc6a22.2 (ENSPFOG00000017541) ENSPFOG00000017510 ##22 ENSPFOG00000017487 ##22 synprb (ENSPFOG00000017471) ENSPFOG00000017467 PTPRG (ENSPFOG00000017406) cfap20dc (ENSPFOG00000017372) CAMK1 (ENSPFOG00000017343) pbrm1l (ENSPFOG00000017300) stau1 (ENSPFOG00000017253) KCNB1 (ENSPFOG00000017250) ptgis (ENSPFOG00000017222) SRGAP3 (ENSPFOG00000017034) OXTR (ENSPFOG00000016999) cav4a (ENSPFOG00000016995) ENSPFOG00000016992 ENSPFOG00000016991 rrp9 (ENSPFOG00000016947) Sailfin molly MODERN SPECIES 585 sirt4 (ENSPLAG00000010305) sxph (ENSPLAG00000010362) SFI1 (ENSPLAG00000010384) EIF4ENIF1 (ENSPLAG00000010395) PATZ1 (ENSPLAG00000010425) SLC2A11 (ENSPLAG00000010459) tgfa (ENSPLAG00000010466) hdhd3 (ENSPLAG00000010477) trub2 (ENSPLAG00000010484) ENSPLAG00000010491 srsf3a (ENSPLAG00000010499) fkbp5 (ENSPLAG00000010504) slc6a22.1 (ENSPLAG00000010543) slc6a22.2 (ENSPLAG00000010581) ENSPLAG00000010607 ##22 ENSPLAG00000011920 ##22 synprb (ENSPLAG00000012108) Guppy MODERN SPECIES 457 sirt4 (ENSPREG00000002272) sxph (ENSPREG00000002303) ENSPREG00000002357 EIF4ENIF1 (ENSPREG00000002386) PATZ1 (ENSPREG00000002440) SLC2A11 (ENSPREG00000002470) tgfa (ENSPREG00000002503) hdhd3 (ENSPREG00000002532) trub2 (ENSPREG00000002549) ENSPREG00000002590 srsf3a (ENSPREG00000002610) fkbp5 (ENSPREG00000002675) slc6a22.1 (ENSPREG00000002693) slc6a22.2 (ENSPREG00000002732) ENSPREG00000002751 ##22 ENSPREG00000002827 ##22 synprb (ENSPREG00000002900) ENSPREG00000002986 PTPRG (ENSPREG00000003236) cfap20dc (ENSPREG00000003271) ENSPREG00000003296 CAMK1 (ENSPREG00000003322) pbrm1l (ENSPREG00000003383) stau1 (ENSPREG00000003477) KCNB1 (ENSPREG00000003499) ptgis (ENSPREG00000003505) SRGAP3 (ENSPREG00000003536) OXTR (ENSPREG00000003635) ENSPREG00000003638 cav4a (ENSPREG00000003651) ENSPREG00000003676 Platyfish MODERN SPECIES 12 sirt4 (ENSXMAG00000028241) sxph (ENSXMAG00000015574) SFI1 (ENSXMAG00000015570) EIF4ENIF1 (ENSXMAG00000015541) PATZ1 (ENSXMAG00000015531) ENSXMAG00000015500 tgfa (ENSXMAG00000015497) hdhd3 (ENSXMAG00000015492) trub2 (ENSXMAG00000015478) ENSXMAG00000029063 srsf3a (ENSXMAG00000015454) fkbp5 (ENSXMAG00000015416) slc6a22.1 (ENSXMAG00000015360) slc6a22.2 (ENSXMAG00000015285) ENSXMAG00000015275 ##22 ENSXMAG00000015253 ##22 synprb (ENSXMAG00000015238) ENSXMAG00000022668 ENSXMAG00000015230 PTPRG (ENSXMAG00000023102) cfap20dc (ENSXMAG00000014709) ENSXMAG00000027028 CAMK1 (ENSXMAG00000016140) pbrm1l (ENSXMAG00000016160) stau1 (ENSXMAG00000016175) KCNB1 (ENSXMAG00000016193) ptgis (ENSXMAG00000016194) SRGAP3 (ENSXMAG00000016217) OXTR (ENSXMAG00000016299) cav4a (ENSXMAG00000016303) ENSXMAG00000019600 NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000154388 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000012071 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000161061.b.x ENSGT00940000161061.b.w.b ENSGT00940000160058 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773 ENSGT00940000160379 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000158726 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00390000005497 ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000157304 ENSGT00940000154899.fb.b ENSGT00940000153709.A.f ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b ENSGT01050000244882.a.a.b.a.a ENSGT00950000183006.A.a.a.b ENSGT00950000182998.C.b.b ENSGT00940000158328 Sheepshead minnow DUPLICATION Sheepshead minnow MODERN SPECIES 1272 ENSCVAG00000009927 tgfa (ENSCVAG00000009914) hdhd3 (ENSCVAG00000009902) trub2 (ENSCVAG00000009901) ENSCVAG00000000809 srsf3a (ENSCVAG00000009865) fkbp5 (ENSCVAG00000009838) slc6a22.1 (ENSCVAG00000009821) slc6a22.2 (ENSCVAG00000009796) ENSCVAG00000009764 ##22 ENSCVAG00000009753 ##22 ENSCVAG00000009729 ##22 synprb (ENSCVAG00000009700) ENSCVAG00000009294 Sheepshead minnow MODERN SPECIES 1272 ENSCVAG00000009927 tgfa (ENSCVAG00000009914) hdhd3 (ENSCVAG00000009902) trub2 (ENSCVAG00000009901) ENSCVAG00000000809 srsf3a (ENSCVAG00000009865) fkbp5 (ENSCVAG00000009838) slc6a22.1 (ENSCVAG00000009821) slc6a22.2 (ENSCVAG00000009796) ENSCVAG00000009764 ##22 ENSCVAG00000009753 ##22 ENSCVAG00000009729 ##22 synprb (ENSCVAG00000009700) ENSCVAG00000009294 Mummichog MODERN SPECIES 1845 ENSFHEG00000005124 ##22 Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000158891 ENSGT00940000154388 ENSGT00940000166668 ENSGT00390000012071 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000160058 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773 ENSGT00940000160379 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000158726 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00390000005497 ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000157304 ENSGT00940000154899.fb.b ENSGT00940000153709.A.f ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b ENSGT01050000244882.a.a.b.a.a ENSGT00950000183006.A.a.a.b ENSGT00950000182998.C.b.b ENSGT00940000158328 Mangrove rivulus MODERN SPECIES 10 sirt4 (ENSKMAG00000008384) sxph (ENSKMAG00000008278) ENSKMAG00000008219 EIF4ENIF1 (ENSKMAG00000008185) PATZ1 (ENSKMAG00000008157) ENSKMAG00000008127 ENSKMAG00000007971 hdhd3 (ENSKMAG00000007904) tgfa (ENSKMAG00000007895) trub2 (ENSKMAG00000007861) ENSKMAG00000007843 srsf3a (ENSKMAG00000007829) fkbp5 (ENSKMAG00000007812) slc6a22.1 (ENSKMAG00000007782) slc6a22.2 (ENSKMAG00000007753) ENSKMAG00000007725 ##22 ENSKMAG00000007693 ##22 synprb (ENSKMAG00000007673) ENSKMAG00000007463 PTPRG (ENSKMAG00000007347) ENSKMAG00000007328 ENSKMAG00000007313 CAMK1 (ENSKMAG00000007272) pbrm1l (ENSKMAG00000007201) stau1 (ENSKMAG00000007135) KCNB1 (ENSKMAG00000007106) ptgis (ENSKMAG00000006899) SRGAP3 (ENSKMAG00000006834) OXTR (ENSKMAG00000006821) cav4a (ENSKMAG00000006815) ENSKMAG00000006803 Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000154110.a ENSGT00940000166668 ENSGT00390000012071 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000166177 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000160058 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773 ENSGT00940000160379 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000158726 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00390000005497 ENSGT00940000178103 ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00390000011228.b.a.e.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000157304 ENSGT00940000165342.a ENSGT00390000008325.b.a ENSGT00940000154899.fb.b ENSGT00940000153709.A.f ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000158891 ENSGT00940000154388 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000012071 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000160058 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773 ENSGT00940000160379 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000158726 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00390000005497 ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00390000011228.b.a.e.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000157304 ENSGT00940000165342.a ENSGT00390000008325.b.a ENSGT00940000154899.fb.b ENSGT00940000153709.A.f ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b ENSGT01050000244882.a.a.b.a.a Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000158891 ENSGT00940000154388 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000012071 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000160058 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773 ENSGT00940000160379 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000158726 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00390000005497 ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00390000011228.b.a.e.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000157304 ENSGT00940000165342.a ENSGT00390000008325.b.a ENSGT00940000154899.fb.b ENSGT00940000153709.A.f ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b ENSGT01050000244882.a.a.b.a.a Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 49 ENSGT00940000158891 ENSGT00940000154388 ENSGT00940000166668 ENSGT00390000012071 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000160058 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773 ENSGT00940000160379 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000158726 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00390000005497 ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00390000011228.b.a.e.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000157304 ENSGT00940000165342.a ENSGT00390000008325.b.a ENSGT00940000154899.fb.b ENSGT00940000153709.A.f ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b ENSGT01050000244882.a.a.b.a.a Clown anemonefish DUPLICATION Clown anemonefish MODERN SPECIES 1475 ENSAOCG00000010579 EIF4ENIF1 (ENSAOCG00000010670) PATZ1 (ENSAOCG00000010686) ENSAOCG00000010732 ENSAOCG00000010809 tgfa (ENSAOCG00000010826) hdhd3 (ENSAOCG00000010837) trub2 (ENSAOCG00000002330) ENSAOCG00000000679 srsf3a (ENSAOCG00000002405) fkbp5 (ENSAOCG00000000690) slc6a22.1 (ENSAOCG00000010964) slc6a22.2 (ENSAOCG00000000703) ENSAOCG00000011229 ##22 ENSAOCG00000011243 ##22 ENSAOCG00000011271 ##22 synprb (ENSAOCG00000011312) ENSAOCG00000011557 PTPRG (ENSAOCG00000011780) ENSAOCG00000011812 ENSAOCG00000011870 FAM107A (ENSAOCG00000011928) CAMK1 (ENSAOCG00000011985) pbrm1l (ENSAOCG00000012154) stau1 (ENSAOCG00000012224) ENSAOCG00000012261 ENSAOCG00000012289 KCNB1 (ENSAOCG00000012301) ptgis (ENSAOCG00000000759) ENSAOCG00000012350 ENSAOCG00000012363 Clown anemonefish MODERN SPECIES 1475 sxph (ENSAOCG00000010556) ENSAOCG00000010579 EIF4ENIF1 (ENSAOCG00000010670) PATZ1 (ENSAOCG00000010686) ENSAOCG00000010732 ENSAOCG00000010809 tgfa (ENSAOCG00000010826) hdhd3 (ENSAOCG00000010837) trub2 (ENSAOCG00000002330) ENSAOCG00000000679 srsf3a (ENSAOCG00000002405) fkbp5 (ENSAOCG00000000690) slc6a22.1 (ENSAOCG00000010964) slc6a22.2 (ENSAOCG00000000703) ENSAOCG00000011229 ##22 ENSAOCG00000011243 ##22 ENSAOCG00000011271 ##22 synprb (ENSAOCG00000011312) ENSAOCG00000011557 PTPRG (ENSAOCG00000011780) ENSAOCG00000011812 ENSAOCG00000011870 FAM107A (ENSAOCG00000011928) CAMK1 (ENSAOCG00000011985) pbrm1l (ENSAOCG00000012154) stau1 (ENSAOCG00000012224) ENSAOCG00000012261 ENSAOCG00000012289 KCNB1 (ENSAOCG00000012301) ptgis (ENSAOCG00000000759) ENSAOCG00000012350 Orange clownfish MODERN SPECIES 20 sirt4 (ENSAPEG00000013484) sxph (ENSAPEG00000013422) ENSAPEG00000013401 EIF4ENIF1 (ENSAPEG00000013379) PATZ1 (ENSAPEG00000013354) ENSAPEG00000013322 ENSAPEG00000013245 tgfa (ENSAPEG00000013206) hdhd3 (ENSAPEG00000013199) trub2 (ENSAPEG00000013177) ENSAPEG00000013150 srsf3a (ENSAPEG00000013125) fkbp5 (ENSAPEG00000013085) slc6a22.1 (ENSAPEG00000013024) slc6a22.2 (ENSAPEG00000012976) opn1mw1 (ENSAPEG00000012915) ##22 synprb (ENSAPEG00000012864) ENSAPEG00000012798 PTPRG (ENSAPEG00000012727) cfap20dc (ENSAPEG00000012655) ENSAPEG00000012558 FAM107A (ENSAPEG00000012516) CAMK1 (ENSAPEG00000012457) pbrm1l (ENSAPEG00000012360) stau1 (ENSAPEG00000012308) ENSAPEG00000012264 ENSAPEG00000012240 KCNB1 (ENSAPEG00000012207) ptgis (ENSAPEG00000012169) SRGAP3 (ENSAPEG00000012088) OXTR (ENSAPEG00000012071) Spiny chromis MODERN SPECIES 59 SFI1 (ENSAPOG00000018474) EIF4ENIF1 (ENSAPOG00000018460) PATZ1 (ENSAPOG00000018447) ENSAPOG00000018431 ENSAPOG00000018375 tgfa (ENSAPOG00000018319) hdhd3 (ENSAPOG00000018303) trub2 (ENSAPOG00000018284) trub2 (ENSAPOG00000018216) ENSAPOG00000018190 srsf3a (ENSAPOG00000018179) fkbp5 (ENSAPOG00000018147) slc6a22.1 (ENSAPOG00000018136) slc6a22.2 (ENSAPOG00000018086) ENSAPOG00000018073 ##22 ENSAPOG00000018038 ##22 synprb (ENSAPOG00000018001) ENSAPOG00000017984 PTPRG (ENSAPOG00000017779) ENSAPOG00000017625 ENSAPOG00000017615 ENSAPOG00000017572 CAMK1 (ENSAPOG00000017490) pbrm1l (ENSAPOG00000000473) stau1 (ENSAPOG00000017260) ENSAPOG00000017170 ENSAPOG00000017110 KCNB1 (ENSAPOG00000017097) ptgis (ENSAPOG00000017080) SRGAP3 (ENSAPOG00000016964) OXTR (ENSAPOG00000016876) Bicolor damselfish MODERN SPECIES 246 SFI1 (ENSSPAG00000017632) EIF4ENIF1 (ENSSPAG00000017672) PATZ1 (ENSSPAG00000017709) ENSSPAG00000017723 SLC2A11 (ENSSPAG00000017764) tgfa (ENSSPAG00000017847) hdhd3 (ENSSPAG00000017863) trub2 (ENSSPAG00000017865) ENSSPAG00000017880 srsf3a (ENSSPAG00000017902) fkbp5 (ENSSPAG00000017911) slc6a22.1 (ENSSPAG00000017938) slc6a22.2 (ENSSPAG00000018011) odad3 (ENSSPAG00000018598) ENSSPAG00000018702 ##22 ENSSPAG00000018720 ##22 synprb (ENSSPAG00000018733) ENSSPAG00000018760 PTPRG (ENSSPAG00000018833) ENSSPAG00000018947 ENSSPAG00000018981 FAM107A (ENSSPAG00000019002) CAMK1 (ENSSPAG00000019054) pbrm1l (ENSSPAG00000019107) stau1 (ENSSPAG00000019275) ENSSPAG00000019296 ENSSPAG00000019324 KCNB1 (ENSSPAG00000019351) ptgis (ENSSPAG00000019362) SRGAP3 (ENSSPAG00000019377) OXTR (ENSSPAG00000019480) Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000154110.a ENSGT00940000166668 ENSGT00390000012071 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000166177 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000160058 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773 ENSGT00940000160379 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000158726 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00390000005497 ENSGT00940000178103 ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00390000011228.b.a.e.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000157304 ENSGT00940000165342.a ENSGT00940000154899.fb.b ENSGT00940000153709.A.f ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b ENSGT01050000244882.a.a.b.a.a Pseudocrenilabrinae DUPLICATION Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000166668 ENSGT00390000012071 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000166177 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000160058 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773 ENSGT00940000160379 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000158726 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b.cb ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b.bb ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00390000005497 ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00390000011228.b.a.e.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000157304 ENSGT00940000165342.a ENSGT00940000154899.fb.b ENSGT00940000153709.A.f ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b ENSGT01050000244882.a.a.b.a.a ENSGT00950000183006.A.a.a.b Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000166668 ENSGT00390000012071 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000166177 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000160058 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773 ENSGT00940000160379 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000158726 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b.cb ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b.bb ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00390000005497 ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00390000011228.b.a.e.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000157304 ENSGT00940000165342.a ENSGT00940000154899.fb.b ENSGT00940000153709.A.f ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b ENSGT01050000244882.a.a.b.a.a ENSGT00950000183006.A.a.a.b Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000166668 ENSGT00390000012071 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000166177 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000160058 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773 ENSGT00940000160379 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000158726 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b.cb ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b.bb ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00390000005497 ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00390000011228.b.a.e.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000157304 ENSGT00940000165342.a ENSGT00940000154899.fb.b ENSGT00940000153709.A.f ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b ENSGT01050000244882.a.a.b.a.a ENSGT00950000183006.A.a.a.b Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 356 ENSHBUG00000022321 tgfa (ENSHBUG00000022338) hdhd3 (ENSHBUG00000022347) trub2 (ENSHBUG00000022384) ENSHBUG00000022390 srsf3a (ENSHBUG00000022402) fkbp5 (ENSHBUG00000022411) slc6a22.1 (ENSHBUG00000022446) slc6a22.2 (ENSHBUG00000022489) ENSHBUG00000022547 ##22 ENSHBUG00000022586 ##22 ENSHBUG00000022646 ##22 synprb (ENSHBUG00000022658) ENSHBUG00000022995 PTPRG (ENSHBUG00000023031) cfap20dc (ENSHBUG00000023060) ENSHBUG00000023220 FAM107A (ENSHBUG00000023239) CAMK1 (ENSHBUG00000023294) pbrm1l (ENSHBUG00000023605) stau1 (ENSHBUG00000023668) ENSHBUG00000023677 ENSHBUG00000023703 KCNB1 (ENSHBUG00000023718) ptgis (ENSHBUG00000000721) SRGAP3 (ENSHBUG00000023791) OXTR (ENSHBUG00000001833) Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000012071 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000166177 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000160058 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773 ENSGT00940000160379 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000158726 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b.cb ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b.bb ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00390000005497 ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00390000011228.b.a.e.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000157304 ENSGT00940000165342.a ENSGT00940000154899.fb.b ENSGT00940000153709.A.f ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b ENSGT01050000244882.a.a.b.a.a ENSGT00950000183006.A.a.a.b P. nyererei MODERN SPECIES 307 SFI1 (ENSPNYG00000013422) EIF4ENIF1 (ENSPNYG00000013471) PATZ1 (ENSPNYG00000013542) ENSPNYG00000013570 SLC2A11 (ENSPNYG00000013599) tgfa (ENSPNYG00000013629) hdhd3 (ENSPNYG00000013649) trub2 (ENSPNYG00000013666) ENSPNYG00000013698 srsf3a (ENSPNYG00000013747) fkbp5 (ENSPNYG00000013801) slc6a22.1 (ENSPNYG00000013819) slc6a22.2 (ENSPNYG00000013897) ENSPNYG00000013978 ##22 ENSPNYG00000013994 ##22 ENSPNYG00000014010 ##22 synprb (ENSPNYG00000014029) ENSPNYG00000014061 PTPRG (ENSPNYG00000014118) ENSPNYG00000014163 ENSPNYG00000014199 ENSPNYG00000014239 CAMK1 (ENSPNYG00000014260) pbrm1l (ENSPNYG00000014336) stau1 (ENSPNYG00000014436) ENSPNYG00000014472 KCNB1 (ENSPNYG00000014507) ptgis (ENSPNYG00000014521) SRGAP3 (ENSPNYG00000014550) OXTR (ENSPNYG00000014581) cav4a (ENSPNYG00000014593) Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000012071 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000166177 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000160058 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773 ENSGT00940000160379 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000158726 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b.cb ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b.bb ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00390000005497 ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00390000011228.b.a.e.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000157304 ENSGT00940000165342.a ENSGT00940000154899.fb.b ENSGT00940000153709.A.f ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b ENSGT01050000244882.a.a.b.a.a ENSGT00950000183006.A.a.a.b Eastern happy MODERN SPECIES 17 SFI1 (ENSACLG00000010590) EIF4ENIF1 (ENSACLG00000010640) PATZ1 (ENSACLG00000010690) ENSACLG00000010703 SLC2A11 (ENSACLG00000010716) tgfa (ENSACLG00000010739) hdhd3 (ENSACLG00000010788) trub2 (ENSACLG00000010793) ENSACLG00000010848 srsf3a (ENSACLG00000010873) fkbp5 (ENSACLG00000010908) slc6a22.1 (ENSACLG00000010928) slc6a22.2 (ENSACLG00000010967) ENSACLG00000011010 ##22 ENSACLG00000011041 ##22 ENSACLG00000011070 ##22 synprb (ENSACLG00000011098) ENSACLG00000011254 PTPRG (ENSACLG00000011378) cfap20dc (ENSACLG00000011721) ENSACLG00000011755 FAM107A (ENSACLG00000011901) CAMK1 (ENSACLG00000011925) pbrm1l (ENSACLG00000012002) stau1 (ENSACLG00000012270) ENSACLG00000012361 KCNB1 (ENSACLG00000012373) ptgis (ENSACLG00000012392) SRGAP3 (ENSACLG00000012441) cav4a (ENSACLG00000012508) OXTR (ENSACLG00000012539) Zebra mbuna MODERN SPECIES 1108 ENSMZEG00005016087 EIF4ENIF1 (ENSMZEG00005016063) PATZ1 (ENSMZEG00005016051) ENSMZEG00005016042 ENSMZEG00005016033 tgfa (ENSMZEG00005016026) hdhd3 (ENSMZEG00005016024) trub2 (ENSMZEG00005016018) ENSMZEG00005016014 srsf3a (ENSMZEG00005016010) fkbp5 (ENSMZEG00005016000) slc6a22.1 (ENSMZEG00005015991) slc6a22.2 (ENSMZEG00005015949) ENSMZEG00005015909 ##22 ENSMZEG00005015892 ##22 ENSMZEG00005015885 ##22 synprb (ENSMZEG00005015880) ENSMZEG00005015862 PTPRG (ENSMZEG00005015811) ENSMZEG00005015780 ENSMZEG00005015770 ENSMZEG00005015745 ENSMZEG00005015736 CAMK1 (ENSMZEG00005015730) pbrm1l (ENSMZEG00005015649) stau1 (ENSMZEG00005015605) ENSMZEG00005015591 KCNB1 (ENSMZEG00005015573) ptgis (ENSMZEG00005015522) SRGAP3 (ENSMZEG00005015480) OXTR (ENSMZEG00005015467) Lyretail cichlid MODERN SPECIES 294 ENSNBRG00000015901 EIF4ENIF1 (ENSNBRG00000015925) PATZ1 (ENSNBRG00000016032) ENSNBRG00000016070 ENSNBRG00000016097 tgfa (ENSNBRG00000016157) hdhd3 (ENSNBRG00000016279) trub2 (ENSNBRG00000016294) ENSNBRG00000016337 srsf3a (ENSNBRG00000016360) fkbp5 (ENSNBRG00000016378) slc6a22.1 (ENSNBRG00000016451) slc6a22.2 (ENSNBRG00000016737) ENSNBRG00000016795 ##22 ENSNBRG00000016841 ##22 ENSNBRG00000016907 ##22 synprb (ENSNBRG00000017171) ENSNBRG00000017208 PTPRG (ENSNBRG00000017259) ENSNBRG00000017330 ENSNBRG00000017372 FAM107A (ENSNBRG00000017436) CAMK1 (ENSNBRG00000017444) pbrm1l (ENSNBRG00000017496) stau1 (ENSNBRG00000017596) ENSNBRG00000017633 KCNB1 (ENSNBRG00000017665) ptgis (ENSNBRG00000017712) SRGAP3 (ENSNBRG00000017824) OXTR (ENSNBRG00000017883) cav4a (ENSNBRG00000017945) Nile tilapia MODERN SPECIES 17 SFI1 (ENSONIG00000004256) EIF4ENIF1 (ENSONIG00000004251) patz1 (ENSONIG00000004248) ENSONIG00000004244 ENSONIG00000004236 tgfa (ENSONIG00000035959) hdhd3 (ENSONIG00000004233) trub2 (ENSONIG00000004230) ENSONIG00000039490 fkbp5 (ENSONIG00000004221) srsf3a (ENSONIG00000004224) slc6a22.1 (ENSONIG00000004216) slc6a22.2 (ENSONIG00000004210) ENSONIG00000004207 ##22 ENSONIG00000004206 ##22 ENSONIG00000004204 ##22 synprb (ENSONIG00000004202) ENSONIG00000004194 PTPRG (ENSONIG00000004184) cfap20dc (ENSONIG00000004176) ENSONIG00000004174 FAM107A (ENSONIG00000004173) CAMK1 (ENSONIG00000004166) pbrm1l (ENSONIG00000004158) stau1 (ENSONIG00000004152) ENSONIG00000004150 KCNB1 (ENSONIG00000004149) ptgis (ENSONIG00000004143) SRGAP3 (ENSONIG00000004135) ENSONIG00000035170 OXTR (ENSONIG00000037102) Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT01050000244882.a.a.b.a.a ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b ENSGT00940000153709.A.f ENSGT00940000154899.fb.b ENSGT00940000165342.a ENSGT00940000157304 ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00390000011228.b.a.e.b ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00390000005497 ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b.bb ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b.cb ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT00940000166826 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000158726 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000160379 ENSGT00940000156773 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000160058 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000166177 ENSGT00940000159296 ENSGT00390000012071 ENSGT00940000166668 ENSGT00940000154110.a Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT01050000244882.a.a.b.a.a ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b ENSGT00940000153709.A.f ENSGT00940000154899.fb.b ENSGT00940000165342.a ENSGT00940000157304 ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00390000011228.b.a.e.b ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00390000005497 ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b.bb ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b.cb ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT00940000166826 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000158726 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000160379 ENSGT00940000156773 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000160058 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000166177 ENSGT00940000159296 ENSGT00390000012071 ENSGT00940000166668 ENSGT00940000154110.a Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT01050000244882.a.a.b.a.a ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b ENSGT00940000153709.A.f ENSGT00940000154899.fb.b ENSGT00940000165342.a ENSGT00940000157304 ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00390000011228.b.a.e.b ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00390000005497 ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b.bb ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b.cb ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT00940000166826 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000158726 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000160379 ENSGT00940000156773 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000160058 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000166177 ENSGT00940000159296 ENSGT00390000012071 ENSGT00940000166668 ENSGT00940000154110.a Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 356 SRGAP3 (ENSHBUG00000023791) ptgis (ENSHBUG00000000721) KCNB1 (ENSHBUG00000023718) ENSHBUG00000023703 ENSHBUG00000023677 stau1 (ENSHBUG00000023668) pbrm1l (ENSHBUG00000023605) CAMK1 (ENSHBUG00000023294) FAM107A (ENSHBUG00000023239) ENSHBUG00000023220 cfap20dc (ENSHBUG00000023060) PTPRG (ENSHBUG00000023031) ENSHBUG00000022995 synprb (ENSHBUG00000022658) ENSHBUG00000022646 ##22 ENSHBUG00000022586 ##22 ENSHBUG00000022547 ##22 slc6a22.2 (ENSHBUG00000022489) slc6a22.1 (ENSHBUG00000022446) fkbp5 (ENSHBUG00000022411) srsf3a (ENSHBUG00000022402) ENSHBUG00000022390 trub2 (ENSHBUG00000022384) hdhd3 (ENSHBUG00000022347) tgfa (ENSHBUG00000022338) ENSHBUG00000022321 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT01050000244882.a.a.b.a.a ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b ENSGT00940000153709.A.f ENSGT00940000154899.fb.b ENSGT00940000165342.a ENSGT00940000157304 ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00390000011228.b.a.e.b ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00390000005497 ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b.bb ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b.cb ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT00940000166826 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000158726 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000160379 ENSGT00940000156773 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000160058 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000166177 ENSGT00940000159296 ENSGT00390000012071 ENSGT00940000154110.a ENSGT00940000154388 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT01050000244882.a.a.b.a.a ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b ENSGT00940000153709.A.f ENSGT00940000154899.fb.b ENSGT00940000165342.a ENSGT00940000157304 ENSGT00390000003017.c.b.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00390000011228.b.a.e.b ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00390000005497 ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b.bb ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b.cb ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT00940000166826 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000158726 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000160379 ENSGT00940000156773 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000160058 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000166177 ENSGT00940000159296 ENSGT00390000012071 ENSGT00940000154110.a ENSGT00940000154388 Eastern happy MODERN SPECIES 17 cav4a (ENSACLG00000012508) SRGAP3 (ENSACLG00000012441) ptgis (ENSACLG00000012392) KCNB1 (ENSACLG00000012373) ENSACLG00000012361 stau1 (ENSACLG00000012270) pbrm1l (ENSACLG00000012002) CAMK1 (ENSACLG00000011925) FAM107A (ENSACLG00000011901) ENSACLG00000011755 cfap20dc (ENSACLG00000011721) PTPRG (ENSACLG00000011378) ENSACLG00000011254 synprb (ENSACLG00000011098) ENSACLG00000011070 ##22 ENSACLG00000011041 ##22 ENSACLG00000011010 ##22 slc6a22.2 (ENSACLG00000010967) slc6a22.1 (ENSACLG00000010928) fkbp5 (ENSACLG00000010908) srsf3a (ENSACLG00000010873) ENSACLG00000010848 trub2 (ENSACLG00000010793) hdhd3 (ENSACLG00000010788) tgfa (ENSACLG00000010739) SLC2A11 (ENSACLG00000010716) ENSACLG00000010703 PATZ1 (ENSACLG00000010690) EIF4ENIF1 (ENSACLG00000010640) SFI1 (ENSACLG00000010590) sxph (ENSACLG00000010508) Zebra mbuna MODERN SPECIES 1108 SRGAP3 (ENSMZEG00005015480) ptgis (ENSMZEG00005015522) KCNB1 (ENSMZEG00005015573) ENSMZEG00005015591 stau1 (ENSMZEG00005015605) pbrm1l (ENSMZEG00005015649) CAMK1 (ENSMZEG00005015730) ENSMZEG00005015736 ENSMZEG00005015745 ENSMZEG00005015770 ENSMZEG00005015780 PTPRG (ENSMZEG00005015811) ENSMZEG00005015862 synprb (ENSMZEG00005015880) ENSMZEG00005015885 ##22 ENSMZEG00005015892 ##22 ENSMZEG00005015909 ##22 slc6a22.2 (ENSMZEG00005015949) slc6a22.1 (ENSMZEG00005015991) fkbp5 (ENSMZEG00005016000) srsf3a (ENSMZEG00005016010) ENSMZEG00005016014 trub2 (ENSMZEG00005016018) hdhd3 (ENSMZEG00005016024) tgfa (ENSMZEG00005016026) ENSMZEG00005016033 ENSMZEG00005016042 PATZ1 (ENSMZEG00005016051) EIF4ENIF1 (ENSMZEG00005016063) ENSMZEG00005016087 sxph (ENSMZEG00005016092) P. nyererei MODERN SPECIES 307 OXTR (ENSPNYG00000014581) SRGAP3 (ENSPNYG00000014550) ptgis (ENSPNYG00000014521) KCNB1 (ENSPNYG00000014507) ENSPNYG00000014472 stau1 (ENSPNYG00000014436) pbrm1l (ENSPNYG00000014336) CAMK1 (ENSPNYG00000014260) ENSPNYG00000014239 ENSPNYG00000014199 ENSPNYG00000014163 PTPRG (ENSPNYG00000014118) ENSPNYG00000014061 synprb (ENSPNYG00000014029) ENSPNYG00000014010 ##22 ENSPNYG00000013994 ##22 ENSPNYG00000013978 ##22 slc6a22.2 (ENSPNYG00000013897) slc6a22.1 (ENSPNYG00000013819) fkbp5 (ENSPNYG00000013801) srsf3a (ENSPNYG00000013747) ENSPNYG00000013698 trub2 (ENSPNYG00000013666) hdhd3 (ENSPNYG00000013649) tgfa (ENSPNYG00000013629) SLC2A11 (ENSPNYG00000013599) ENSPNYG00000013570 PATZ1 (ENSPNYG00000013542) EIF4ENIF1 (ENSPNYG00000013471) SFI1 (ENSPNYG00000013422) sxph (ENSPNYG00000013376) Lyretail cichlid MODERN SPECIES 294 OXTR (ENSNBRG00000017883) SRGAP3 (ENSNBRG00000017824) ptgis (ENSNBRG00000017712) KCNB1 (ENSNBRG00000017665) ENSNBRG00000017633 stau1 (ENSNBRG00000017596) pbrm1l (ENSNBRG00000017496) CAMK1 (ENSNBRG00000017444) FAM107A (ENSNBRG00000017436) ENSNBRG00000017372 ENSNBRG00000017330 PTPRG (ENSNBRG00000017259) ENSNBRG00000017208 synprb (ENSNBRG00000017171) ENSNBRG00000016907 ##22 ENSNBRG00000016841 ##22 ENSNBRG00000016795 ##22 slc6a22.2 (ENSNBRG00000016737) slc6a22.1 (ENSNBRG00000016451) fkbp5 (ENSNBRG00000016378) srsf3a (ENSNBRG00000016360) ENSNBRG00000016337 trub2 (ENSNBRG00000016294) hdhd3 (ENSNBRG00000016279) tgfa (ENSNBRG00000016157) ENSNBRG00000016097 ENSNBRG00000016070 PATZ1 (ENSNBRG00000016032) EIF4ENIF1 (ENSNBRG00000015925) ENSNBRG00000015901 sxph (ENSNBRG00000015865) Nile tilapia MODERN SPECIES 17 ENSONIG00000035170 SRGAP3 (ENSONIG00000004135) ptgis (ENSONIG00000004143) KCNB1 (ENSONIG00000004149) ENSONIG00000004150 stau1 (ENSONIG00000004152) pbrm1l (ENSONIG00000004158) CAMK1 (ENSONIG00000004166) FAM107A (ENSONIG00000004173) ENSONIG00000004174 cfap20dc (ENSONIG00000004176) PTPRG (ENSONIG00000004184) ENSONIG00000004194 synprb (ENSONIG00000004202) ENSONIG00000004204 ##22 ENSONIG00000004206 ##22 ENSONIG00000004207 ##22 slc6a22.2 (ENSONIG00000004210) slc6a22.1 (ENSONIG00000004216) srsf3a (ENSONIG00000004224) fkbp5 (ENSONIG00000004221) ENSONIG00000039490 trub2 (ENSONIG00000004230) hdhd3 (ENSONIG00000004233) tgfa (ENSONIG00000035959) ENSONIG00000004236 ENSONIG00000004244 patz1 (ENSONIG00000004248) EIF4ENIF1 (ENSONIG00000004251) SFI1 (ENSONIG00000004256) sxph (ENSONIG00000004257) Midas cichlid MODERN SPECIES 1343 sirt4 (ENSACIG00000016969) sxph (ENSACIG00000016918) EIF4ENIF1 (ENSACIG00000016848) PATZ1 (ENSACIG00000016779) SLC2A11 (ENSACIG00000016741) tgfa (ENSACIG00000016584) hdhd3 (ENSACIG00000016541) trub2 (ENSACIG00000016500) ENSACIG00000016471 srsf3a (ENSACIG00000016419) fkbp5 (ENSACIG00000016383) slc6a22.1 (ENSACIG00000016350) ENSACIG00000016335 slc6a22.2 (ENSACIG00000016308) ENSACIG00000016288 ##22 ENSACIG00000016277 ##22 synprb (ENSACIG00000016263) ENSACIG00000016210 PTPRG (ENSACIG00000016138) ENSACIG00000016112 ENSACIG00000016098 ENSACIG00000016060 FAM107A (ENSACIG00000016041) CAMK1 (ENSACIG00000016025) pbrm1l (ENSACIG00000015948) stau1 (ENSACIG00000015918) ENSACIG00000015908 KCNB1 (ENSACIG00000015902) ptgis (ENSACIG00000015884) SRGAP3 (ENSACIG00000015847) OXTR (ENSACIG00000015830) Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 19 PATZ1 (ENSMMDG00005005796) ENSMMDG00005005785 SLC2A11 (ENSMMDG00005005284) tgfa (ENSMMDG00005005273) hdhd3 (ENSMMDG00005005270) trub2 (ENSMMDG00005005268) srsf3a (ENSMMDG00005005266) fkbp5 (ENSMMDG00005005247) slc6a22.1 (ENSMMDG00005004379) slc6a22.2 (ENSMMDG00005004005) opn1mw1 (ENSMMDG00005003988) ##22 ENSMMDG00005014366 ##22 ENSMMDG00005014231 ##22 ENSMMDG00005014196 ##22 ENSMMDG00005014190 ##22 ENSMMDG00005014055 ##22 synprb (ENSMMDG00005013988) ENSMMDG00005013780 PTPRG (ENSMMDG00005013274) ENSMMDG00005013249 ENSMMDG00005013244 ENSMMDG00005013232 ENSMMDG00005013228 CAMK1 (ENSMMDG00005013217) pbrm1l (ENSMMDG00005012721) stau1 (ENSMMDG00005012622) ENSMMDG00005012611 ENSMMDG00005012607 KCNB1 (ENSMMDG00005012602) ptgis (ENSMMDG00005012309) SRGAP3 (ENSMMDG00005004952) Cod DUPLICATION Cod MODERN SPECIES 4 cav4a (ENSGMOG00000030221) ENSGMOG00000031309 ENSGMOG00000016745 ptgis (ENSGMOG00000016802) ENSGMOG00000028035 ENSGMOG00000016833 stau1 (ENSGMOG00000016850) pbrm1l (ENSGMOG00000016872) ENSGMOG00000016883 ENSGMOG00000016897 ENSGMOG00000017097 PTPRG (ENSGMOG00000017157) ENSGMOG00000017240 ENSGMOG00000017300 ENSGMOG00000017343 ##22 ENSGMOG00000017321 ##22 ENSGMOG00000031019 ENSGMOG00000027015 ninj1 (ENSGMOG00000017428) card19 (ENSGMOG00000017439) ENSGMOG00000028357 ENSGMOG00000023920 cacna1da (ENSGMOG00000017493) parapinopsinb (ENSGMOG00000017584) ENSGMOG00000017604 ENSGMOG00000017664 tmcc1b (ENSGMOG00000017680) ENSGMOG00000034613 ENSGMOG00000017700 rpusd4 (ENSGMOG00000017726) ENSGMOG00000036802 Cod MODERN SPECIES 4 rpusd4 (ENSGMOG00000017726) ENSGMOG00000017700 ENSGMOG00000034613 tmcc1b (ENSGMOG00000017680) ENSGMOG00000017664 ENSGMOG00000017604 parapinopsinb (ENSGMOG00000017584) cacna1da (ENSGMOG00000017493) ENSGMOG00000023920 ENSGMOG00000028357 card19 (ENSGMOG00000017439) ninj1 (ENSGMOG00000017428) ENSGMOG00000027015 ENSGMOG00000031019 ENSGMOG00000017321 ##22 ENSGMOG00000017343 ##22 ENSGMOG00000017300 ENSGMOG00000017240 PTPRG (ENSGMOG00000017157) ENSGMOG00000017097 ENSGMOG00000016897 ENSGMOG00000016883 pbrm1l (ENSGMOG00000016872) stau1 (ENSGMOG00000016850) ENSGMOG00000016833 ENSGMOG00000028035 ptgis (ENSGMOG00000016802) ENSGMOG00000016745 ENSGMOG00000031309 cav4a (ENSGMOG00000030221) ENSGMOG00000025182 Otomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b ##22 Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.b ##22 Atlantic herring MODERN SPECIES 2 ENSCHAG00000019381 macc1 (ENSCHAG00000019484) ENSCHAG00000019495 hdac9b (ENSCHAG00000019505) DEPDC7 (ENSCHAG00000019569) lin37 (ENSCHAG00000019603) ENSCHAG00000019610 ENSCHAG00000019618 hsc70 (ENSCHAG00000019635) ENSCHAG00000020007 rnf183 (ENSCHAG00000020024) dhx16 (ENSCHAG00000020072) ppt2a.2 (ENSCHAG00000020768) ENSCHAG00000020818 ENSCHAG00000020869 ENSCHAG00000021397 ##22 AIF1 (ENSCHAG00000021437) fzd6 (ENSCHAG00000021440) mc2r (ENSCHAG00000021448) ENSCHAG00000021548 ENSCHAG00000021682 ENSCHAG00000021711 ENSCHAG00000021843 ENSCHAG00000021960 agmo (ENSCHAG00000021968) crppa (ENSCHAG00000022035) etv1 (ENSCHAG00000022050) ENSCHAG00000022328 mag (ENSCHAG00000022340) ankmy2a (ENSCHAG00000000795) lsr (ENSCHAG00000001564) Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000154388 ENSGT00940000154110.a ENSGT00940000166668 ENSGT00390000012071 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000160058 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773 ENSGT01100000263542.B.a ENSGT00940000160379 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000158726 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.d ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT00940000155048.d.b ENSGT00390000005497 ENSGT00940000178103 ENSGT00950000183004.a.a.b ENSGT00390000011228.b.a.e.b ENSGT00940000156378.a.b ENSGT00390000003017.c.b ENSGT00940000157304 ENSGT00940000165342.a ENSGT00390000008325.b.a ENSGT00940000154899.fb.b ENSGT00940000158328 ENSGT00940000154899.gb Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.d ##22 Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.d ##22 Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.d ##22 Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 19 zgc:112163 (ENSMMDG00005005864) sirt4 (ENSMMDG00005005860) sxph (ENSMMDG00005005844) ENSMMDG00005005828 EIF4ENIF1 (ENSMMDG00005005804) PATZ1 (ENSMMDG00005005796) ENSMMDG00005005785 SLC2A11 (ENSMMDG00005005284) tgfa (ENSMMDG00005005273) hdhd3 (ENSMMDG00005005270) trub2 (ENSMMDG00005005268) srsf3a (ENSMMDG00005005266) fkbp5 (ENSMMDG00005005247) slc6a22.1 (ENSMMDG00005004379) slc6a22.2 (ENSMMDG00005004005) opn1mw1 (ENSMMDG00005003988) ##22 ENSMMDG00005014366 ##22 ENSMMDG00005014231 ##22 ENSMMDG00005014196 ##22 ENSMMDG00005014190 ##22 ENSMMDG00005014055 ##22 synprb (ENSMMDG00005013988) ENSMMDG00005013780 PTPRG (ENSMMDG00005013274) ENSMMDG00005013249 ENSMMDG00005013244 ENSMMDG00005013232 ENSMMDG00005013228 CAMK1 (ENSMMDG00005013217) pbrm1l (ENSMMDG00005012721) stau1 (ENSMMDG00005012622) Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 101 ENSGT00940000158891 ENSGT00940000154388 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000012071 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000160058 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773 ENSGT01100000263542.B.a ENSGT00940000160379 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000158726 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.d ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b Otophysi ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000158891 ENSGT00940000154388 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000012071 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000160058 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773 ENSGT01100000263542.B.a ENSGT00940000160379 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000158726 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.d ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT00390000006521 ENSGT00390000010674.a ENSGT00530000063965.w ENSGT00530000063868.a.a ENSGT00940000157392.o.a ENSGT00390000014125 ENSGT00950000182824.a.b.a.j.a ENSGT00390000011230 ENSGT01050000244882.a.a.b.a.b ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT00950000183006.A.a.a.a ENSGT00950000182998.C.b.a ENSGT00940000158855 Cyprinoidei DUPLICATION Cyprinoidei DUPLICATION Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000012071 ENSGT00940000174874 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000161061.b.kc ENSGT00940000160058 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773 ENSGT01100000263542.B.a ENSGT00940000160379.d.b ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000158726 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.d.a.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.d.a.a ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT00390000006521 ENSGT00390000010674.a ENSGT00530000063965.w ENSGT00530000063868.a.a ENSGT00940000157392.o.a ENSGT00390000014125 ENSGT00950000182824.a.b.a.j.a ENSGT00390000011230 ENSGT01050000244882.a.a.b.a.b ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT00950000183006.A.a.a.a ENSGT00950000182998.C.b.a ENSGT00940000158855 Cyprininae DUPLICATION Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 140 ENSGT00940000158726.n ENSGT00940000163827.a.b.e ENSGT00940000166826.v ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.d.a.a.a ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b.c ENSGT00590000083094.a.a.c.b.b ENSGT00390000006521.h ENSGT00390000010674.a ENSGT00530000063965.w.b ENSGT00530000063868.a.a ENSGT00940000157392.o.a.a ENSGT00390000014125.b ENSGT00950000182824.a.b.a.j.a.d ENSGT00390000011230.i ENSGT01050000244882.a.a.b.a.b.a.b ENSGT00950000183006.B.f.b.b.l ENSGT00950000183006.A.a.a.a ENSGT00950000182998.C.b.a.a ENSGT00940000158855.b Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000158726.n ENSGT00940000163827.a.b.e ENSGT00940000166826.v ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.d.a.a.a ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b.c ENSGT00590000083094.a.a.c.b.b ENSGT00390000006521.h ENSGT00390000010674.a ENSGT00530000063965.w.b ENSGT00530000063868.a.a ENSGT00940000157392.o.a.a ENSGT00390000014125.b ENSGT00950000182824.a.b.a.j.a.d ENSGT00390000011230.i ENSGT01050000244882.a.a.b.a.b.a.b ENSGT00950000183006.B.f.b.b.l ENSGT00950000182998.C.b.a.a ENSGT00940000158855.b ENSGT01030000234595.B.c.a.c.a Golden-line barbel MODERN SPECIES 1124 entpd8 (ENSSGRG00000034899) entpd8 (ENSSGRG00000034898) ENSSGRG00000034897 SRSF3 (ENSSGRG00000034895) fkbp5 (ENSSGRG00000034184) slc6a22.1 (ENSSGRG00000033641) slc6a22.2 (ENSSGRG00000032778) opn1mw4 (ENSSGRG00000032560) ##22 synprb (ENSSGRG00000032559) ENSSGRG00000029412 cplane2 (ENSSGRG00000029388) wdr82 (ENSSGRG00000029021) cish (ENSSGRG00000029018) cish (ENSSGRG00000029017) hemk1 (ENSSGRG00000029016) SRGAP3 (ENSSGRG00000027284) rad18 (ENSSGRG00000027213) ENSSGRG00000027209 parp3 (ENSSGRG00000027208) GRM2 (ENSSGRG00000027207) tex264a (ENSSGRG00000027206) Common carp reference MODERN SPECIES 16 sirt4 (ENSCCRG00000078466) SFI1 (ENSCCRG00000011474) EIF4ENIF1 (ENSCCRG00000011470) PATZ1 (ENSCCRG00000068419) ENSCCRG00000018330 tgfa (ENSCCRG00000070703) hdhd3 (ENSCCRG00000061262) entpd8 (ENSCCRG00000072737) ENSCCRG00000062023 ENSCCRG00000068848 fkbp5 (ENSCCRG00000014479) slc6a22.1 (ENSCCRG00000014353) slc6a22.2 (ENSCCRG00000017119) opn1mw3 (ENSCCRG00000078209) ##22 synprb (ENSCCRG00000018463) opn1mw4 (ENSCCRG00000018441) ##22 ENSCCRG00000018667 cplane2 (ENSCCRG00000036727) ENSCCRG00000063069 wdr82 (ENSCCRG00000057982) twf2a (ENSCCRG00000036755) cish (ENSCCRG00000062818) hemk1 (ENSCCRG00000036863) SRGAP3 (ENSCCRG00000036971) rad18 (ENSCCRG00000079191) oxtra (ENSCCRG00000023334) cav3 (ENSCCRG00000036312) ENSCCRG00000031983 ENSCCRG00000031986 parp3 (ENSCCRG00000063799) ENSCCRG00000064341 Goldfish MODERN SPECIES 24 RFT1 (ENSCARG00000056625) zgc:112163 (ENSCARG00000056922) sirt4 (ENSCARG00000056939) sxph (ENSCARG00000057126) EIF4ENIF1 (ENSCARG00000057216) PATZ1 (ENSCARG00000057257) ENSCARG00000057273 tgfa (ENSCARG00000057315) hdhd3 (ENSCARG00000057331) entpd8 (ENSCARG00000057349) ENSCARG00000057387 SRSF3 (ENSCARG00000057422) fkbp5 (ENSCARG00000057465) slc6a22.1 (ENSCARG00000057516) slc6a22.2 (ENSCARG00000057539) opn1mw4 (ENSCARG00000057618) ##22 synprb (ENSCARG00000057667) ENSCARG00000058115 cplane2 (ENSCARG00000005804) ENSCARG00000005836 wdr82 (ENSCARG00000005881) cish (ENSCARG00000006005) hemk1 (ENSCARG00000006015) SRGAP3 (ENSCARG00000006137) rad18 (ENSCARG00000007356) oxtra (ENSCARG00000007370) cav3 (ENSCARG00000007392) ENSCARG00000007404 ENSCARG00000007410 parp3 (ENSCARG00000007415) GRM2 (ENSCARG00000007443) Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 266 ENSGT00940000160058.a ENSGT00390000015582.b ENSGT00940000160058.b ENSGT00390000015582.a ENSGT00940000156773 ENSGT01100000263542.B.a.u ENSGT00940000160379.d.b ENSGT00910000144115.a.hc.a.b ENSGT01100000263542.B.a.v ENSGT00940000160379.d.a ENSGT00910000144115.a.hc.a.a ENSGT00940000158726.m ENSGT00940000163827.a.b.f ENSGT00940000166826.u ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.d.a.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.d.a.a.b ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b.d ENSGT00590000083094.a.a.c.b.a ENSGT00390000006521.g ENSGT00530000063965.w.a ENSGT00940000157392.o.a.b ENSGT00390000014125.a ENSGT00950000182824.a.b.a.j.a.c ENSGT00390000011230.j ENSGT01050000244882.a.a.b.a.b.a.a ENSGT00950000183006.B.f.b.b.k ENSGT00950000182998.C.b.a.b ENSGT00940000158855.a ENSGT01030000234595.B.c.a.c.b Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 273 ENSGT00940000159296.u.a ENSGT00940000161061.b.jc ENSGT00940000160058.a ENSGT00390000015582.b ENSGT00940000156773 ENSGT01100000263542.B.a.u ENSGT00940000160379.d.b ENSGT00910000144115.a.hc.a.b ENSGT01100000263542.B.a.v ENSGT00940000160379.d.a ENSGT00910000144115.a.hc.a.a ENSGT00940000158726.m ENSGT00940000163827.a.b.f ENSGT00940000166826.u ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.d.a.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.d.a.a.b ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b.d ENSGT00590000083094.a.a.c.b.a ENSGT00390000006521.g ENSGT01060000253611 ENSGT00530000063965.w.a ENSGT00940000157392.o.a.b ENSGT00390000014125.a ENSGT00950000182824.a.b.a.j.a.c ENSGT00390000011230.j ENSGT01050000244882.a.a.b.a.b.a.a ENSGT00950000183006.B.f.b.b.k ENSGT00950000183006.A.a.a.a ENSGT00950000182998.C.b.a.b ENSGT00940000158855.a ENSGT01030000234595.B.c.a.c.b Common carp reference MODERN SPECIES 10 zgc:112163 (ENSCCRG00000063827) sxph (ENSCCRG00000045053) ENSCCRG00000005770 eif4enif1 (ENSCCRG00000005795) ENSCCRG00000056410 ENSCCRG00000024730 tgfa (ENSCCRG00000026257) hdhd3 (ENSCCRG00000055272) trub2 (ENSCCRG00000074468) entpd8 (ENSCCRG00000014438) ENSCCRG00000014458 ENSCCRG00000061375 fkbp5 (ENSCCRG00000072230) slc6a22.1 (ENSCCRG00000067329) slc6a22.2 (ENSCCRG00000018439) opn1mw4 (ENSCCRG00000073092) ##22 synprb (ENSCCRG00000009142) ENSCCRG00000076732 ENSCCRG00000074941 wdr82 (ENSCCRG00000064412) twf2a (ENSCCRG00000080820) hemk1 (ENSCCRG00000036259) SRGAP3 (ENSCCRG00000021972) rad18 (ENSCCRG00000040556) oxtra (ENSCCRG00000036316) cav3 (ENSCCRG00000049151) ENSCCRG00000069999 parp3 (ENSCCRG00000031993) ENSCCRG00000023457 fancd2 (ENSCCRG00000016553) ENSCCRG00000022775 Golden-line barbel MODERN SPECIES 59 PATZ1 (ENSSGRG00000030555) SLC2A11 (ENSSGRG00000030558) hdhd3 (ENSSGRG00000030633) trub2 (ENSSGRG00000030634) entpd8 (ENSSGRG00000030636) ENSSGRG00000030637 ENSSGRG00000030638 ENSSGRG00000030639 SRSF3 (ENSSGRG00000030641) fkbp5 (ENSSGRG00000030642) slc6a22.1 (ENSSGRG00000030654) slc6a22.1 (ENSSGRG00000030657) slc6a22.1 (ENSSGRG00000030658) slc6a22.2 (ENSSGRG00000030660) opn1mw3 (ENSSGRG00000030661) ##22 opn1mw4 (ENSSGRG00000030682) ##22 synprb (ENSSGRG00000030685) ENSSGRG00000030770 cplane2 (ENSSGRG00000033624) ENSSGRG00000033625 wdr82 (ENSSGRG00000033627) cish (ENSSGRG00000033845) hemk1 (ENSSGRG00000033847) SRGAP3 (ENSSGRG00000033898) rad18 (ENSSGRG00000036442) oxtra (ENSSGRG00000036447) cav3 (ENSSGRG00000036452) ENSSGRG00000036454 ENSSGRG00000036457 parp3 (ENSSGRG00000036459) GRM2 (ENSSGRG00000036485) Goldfish MODERN SPECIES 46 zgc:112163 (ENSCARG00000008479) sirt4 (ENSCARG00000008483) SFI1 (ENSCARG00000008489) EIF4ENIF1 (ENSCARG00000008496) PATZ1 (ENSCARG00000008510) SLC2A11 (ENSCARG00000008589) tgfa (ENSCARG00000009186) hdhd3 (ENSCARG00000009193) trub2 (ENSCARG00000009200) entpd8 (ENSCARG00000009215) ENSCARG00000009227 SRSF3 (ENSCARG00000009242) fkbp5 (ENSCARG00000009260) slc6a22.1 (ENSCARG00000009300) slc6a22.2 (ENSCARG00000009332) opn1mw4 (ENSCARG00000009348) ##22 synprb (ENSCARG00000009353) ENSCARG00000009710 cplane2 (ENSCARG00000020291) wdr82 (ENSCARG00000020355) cish (ENSCARG00000020401) hemk1 (ENSCARG00000020408) SRGAP3 (ENSCARG00000020449) rad18 (ENSCARG00000020948) oxtra (ENSCARG00000020971) cav3 (ENSCARG00000020991) ENSCARG00000021005 parp3 (ENSCARG00000021008) GRM2 (ENSCARG00000021020) fancd2 (ENSCARG00000021069) gpx1b (ENSCARG00000021179) Zebrafish MODERN SPECIES 21 PATZ1 (ENSDARG00000076584) ENSDARG00000053961 tgfa (ENSDARG00000053939) hdhd3 (ENSDARG00000053934) trub2 (ENSDARG00000028379) entpd8 (ENSDARG00000005565) ENSDARG00000028389 srsf3a (ENSDARG00000025397) srsf3a (ENSDARG00000100815) fkbp5 (ENSDARG00000028396) slc6a22.1 (ENSDARG00000000730) slc6a22.2 (ENSDARG00000001354) opn1mw1 (ENSDARG00000097008) ##22 opn1mw2 (ENSDARG00000044280) ##22 opn1mw3 (ENSDARG00000044279) ##22 opn1mw4 (ENSDARG00000000638) ##22 synprb (ENSDARG00000044278) ENSDARG00000070567 cplane2 (ENSDARG00000028442) wdr82 (ENSDARG00000014083) twf2a (ENSDARG00000094792) cish (ENSDARG00000060316) hemk1 (ENSDARG00000078894) SRGAP3 (ENSDARG00000060309) rad18 (ENSDARG00000027938) oxtra (ENSDARG00000033956) cav3 (ENSDARG00000024141) ENSDARG00000003900 parp3 (ENSDARG00000003961) GRM2 (ENSDARG00000004150) tex264a (ENSDARG00000092154) Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000154388 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000012071 ENSGT00940000174874 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000161061.b.kc ENSGT00940000160058 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773 ENSGT01100000263542.B.a ENSGT00940000160379.d.b ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000158726 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.d.a.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.d.a.a ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT00390000006521 ENSGT00390000010674.a ENSGT00530000063965.w ENSGT00530000063868.a.a ENSGT00940000157392.o.a ENSGT00390000014125 ENSGT00950000182824.a.b.a.j.a ENSGT00390000011230 ENSGT01050000244882.a.a.b.a.b ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT00950000183006.A.a.a.a ENSGT00950000182998.C.b.a Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 266 ENSGT00940000161061.b.kc.b ENSGT00940000160058.a ENSGT00390000015582.b ENSGT00940000160058.b ENSGT00390000015582.a ENSGT00940000156773 ENSGT01100000263542.B.a.u ENSGT00940000160379.d.b ENSGT00910000144115.a.hc.a.b ENSGT01100000263542.B.a.v ENSGT00940000160379.d.a ENSGT00910000144115.a.hc.a.a ENSGT00940000158726.m ENSGT00940000163827.a.b.f ENSGT00940000166826.u ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.d.a.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.d.a.a.b ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b.d ENSGT00590000083094.a.a.c.b.a ENSGT00390000006521.g ENSGT00530000063965.w.a ENSGT00940000157392.o.a.b ENSGT00390000014125.a ENSGT00950000182824.a.b.a.j.a.c ENSGT00390000011230.j ENSGT01050000244882.a.a.b.a.b.a.a ENSGT00950000183006.B.f.b.b.k ENSGT00950000182998.C.b.a.b ENSGT00940000158855.a ENSGT01030000234595.B.c.a.c.b Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 273 ENSGT00390000012071.v ENSGT00940000159296.u.a ENSGT00940000161061.b.jc ENSGT00940000160058.a ENSGT00390000015582.b ENSGT00940000156773 ENSGT01100000263542.B.a.u ENSGT00940000160379.d.b ENSGT00910000144115.a.hc.a.b ENSGT01100000263542.B.a.v ENSGT00940000160379.d.a ENSGT00910000144115.a.hc.a.a ENSGT00940000158726.m ENSGT00940000163827.a.b.f ENSGT00940000166826.u ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.d.a.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.d.a.a.b ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b.d ENSGT00590000083094.a.a.c.b.a ENSGT00390000006521.g ENSGT01060000253611 ENSGT00530000063965.w.a ENSGT00940000157392.o.a.b ENSGT00390000014125.a ENSGT00950000182824.a.b.a.j.a.c ENSGT00390000011230.j ENSGT01050000244882.a.a.b.a.b.a.a ENSGT00950000183006.B.f.b.b.k ENSGT00950000183006.A.a.a.a ENSGT00950000182998.C.b.a.b ENSGT00940000158855.a Common carp reference MODERN SPECIES 16 ENSCCRG00000045151 zgc:112163 (ENSCCRG00000078194) sirt4 (ENSCCRG00000078466) SFI1 (ENSCCRG00000011474) EIF4ENIF1 (ENSCCRG00000011470) PATZ1 (ENSCCRG00000068419) ENSCCRG00000018330 tgfa (ENSCCRG00000070703) hdhd3 (ENSCCRG00000061262) entpd8 (ENSCCRG00000072737) ENSCCRG00000062023 ENSCCRG00000068848 fkbp5 (ENSCCRG00000014479) slc6a22.1 (ENSCCRG00000014353) slc6a22.2 (ENSCCRG00000017119) opn1mw3 (ENSCCRG00000078209) ##22 synprb (ENSCCRG00000018463) opn1mw4 (ENSCCRG00000018441) ##22 ENSCCRG00000018667 cplane2 (ENSCCRG00000036727) ENSCCRG00000063069 wdr82 (ENSCCRG00000057982) twf2a (ENSCCRG00000036755) cish (ENSCCRG00000062818) hemk1 (ENSCCRG00000036863) SRGAP3 (ENSCCRG00000036971) rad18 (ENSCCRG00000079191) oxtra (ENSCCRG00000023334) cav3 (ENSCCRG00000036312) ENSCCRG00000031983 ENSCCRG00000031986 Golden-line barbel MODERN SPECIES 59 EIF4ENIF1 (ENSSGRG00000030553) PATZ1 (ENSSGRG00000030555) SLC2A11 (ENSSGRG00000030558) hdhd3 (ENSSGRG00000030633) trub2 (ENSSGRG00000030634) entpd8 (ENSSGRG00000030636) ENSSGRG00000030637 ENSSGRG00000030638 ENSSGRG00000030639 SRSF3 (ENSSGRG00000030641) fkbp5 (ENSSGRG00000030642) slc6a22.1 (ENSSGRG00000030654) slc6a22.1 (ENSSGRG00000030657) slc6a22.1 (ENSSGRG00000030658) slc6a22.2 (ENSSGRG00000030660) opn1mw3 (ENSSGRG00000030661) ##22 opn1mw4 (ENSSGRG00000030682) ##22 synprb (ENSSGRG00000030685) ENSSGRG00000030770 cplane2 (ENSSGRG00000033624) ENSSGRG00000033625 wdr82 (ENSSGRG00000033627) cish (ENSSGRG00000033845) hemk1 (ENSSGRG00000033847) SRGAP3 (ENSSGRG00000033898) rad18 (ENSSGRG00000036442) oxtra (ENSSGRG00000036447) cav3 (ENSSGRG00000036452) ENSSGRG00000036454 ENSSGRG00000036457 parp3 (ENSSGRG00000036459) Zebrafish MODERN SPECIES 21 eif4enif1 (ENSDARG00000016177) PATZ1 (ENSDARG00000076584) ENSDARG00000053961 tgfa (ENSDARG00000053939) hdhd3 (ENSDARG00000053934) trub2 (ENSDARG00000028379) entpd8 (ENSDARG00000005565) ENSDARG00000028389 srsf3a (ENSDARG00000025397) srsf3a (ENSDARG00000100815) fkbp5 (ENSDARG00000028396) slc6a22.1 (ENSDARG00000000730) slc6a22.2 (ENSDARG00000001354) opn1mw1 (ENSDARG00000097008) ##22 opn1mw2 (ENSDARG00000044280) ##22 opn1mw3 (ENSDARG00000044279) ##22 opn1mw4 (ENSDARG00000000638) ##22 synprb (ENSDARG00000044278) ENSDARG00000070567 cplane2 (ENSDARG00000028442) wdr82 (ENSDARG00000014083) twf2a (ENSDARG00000094792) cish (ENSDARG00000060316) hemk1 (ENSDARG00000078894) SRGAP3 (ENSDARG00000060309) rad18 (ENSDARG00000027938) oxtra (ENSDARG00000033956) cav3 (ENSDARG00000024141) ENSDARG00000003900 parp3 (ENSDARG00000003961) GRM2 (ENSDARG00000004150) Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.d.b ##22 Zebrafish DUPLICATION Zebrafish MODERN SPECIES 21 ENSDARG00000053992 eif4enif1 (ENSDARG00000016177) PATZ1 (ENSDARG00000076584) ENSDARG00000053961 tgfa (ENSDARG00000053939) hdhd3 (ENSDARG00000053934) trub2 (ENSDARG00000028379) entpd8 (ENSDARG00000005565) ENSDARG00000028389 srsf3a (ENSDARG00000025397) srsf3a (ENSDARG00000100815) fkbp5 (ENSDARG00000028396) slc6a22.1 (ENSDARG00000000730) slc6a22.2 (ENSDARG00000001354) opn1mw1 (ENSDARG00000097008) ##22 opn1mw2 (ENSDARG00000044280) ##22 opn1mw3 (ENSDARG00000044279) ##22 opn1mw4 (ENSDARG00000000638) ##22 synprb (ENSDARG00000044278) ENSDARG00000070567 cplane2 (ENSDARG00000028442) wdr82 (ENSDARG00000014083) twf2a (ENSDARG00000094792) cish (ENSDARG00000060316) hemk1 (ENSDARG00000078894) SRGAP3 (ENSDARG00000060309) rad18 (ENSDARG00000027938) oxtra (ENSDARG00000033956) cav3 (ENSDARG00000024141) ENSDARG00000003900 parp3 (ENSDARG00000003961) Zebrafish MODERN SPECIES 21 sxph (ENSDARG00000013240) ENSDARG00000053992 eif4enif1 (ENSDARG00000016177) PATZ1 (ENSDARG00000076584) ENSDARG00000053961 tgfa (ENSDARG00000053939) hdhd3 (ENSDARG00000053934) trub2 (ENSDARG00000028379) entpd8 (ENSDARG00000005565) ENSDARG00000028389 srsf3a (ENSDARG00000025397) srsf3a (ENSDARG00000100815) fkbp5 (ENSDARG00000028396) slc6a22.1 (ENSDARG00000000730) slc6a22.2 (ENSDARG00000001354) opn1mw1 (ENSDARG00000097008) ##22 opn1mw2 (ENSDARG00000044280) ##22 opn1mw3 (ENSDARG00000044279) ##22 opn1mw4 (ENSDARG00000000638) ##22 synprb (ENSDARG00000044278) ENSDARG00000070567 cplane2 (ENSDARG00000028442) wdr82 (ENSDARG00000014083) twf2a (ENSDARG00000094792) cish (ENSDARG00000060316) hemk1 (ENSDARG00000078894) SRGAP3 (ENSDARG00000060309) rad18 (ENSDARG00000027938) oxtra (ENSDARG00000033956) cav3 (ENSDARG00000024141) ENSDARG00000003900 Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000158891 ENSGT00940000154388 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000012071 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000160058 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773 ENSGT01100000263542.B.a ENSGT00940000160379 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000158726 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.d ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT00390000006521 ENSGT00390000010674.a ENSGT00530000063965.w ENSGT00530000063868.a.a ENSGT00940000157392.o.a ENSGT00390000014125 ENSGT00950000182824.a.b.a.j.a ENSGT00390000011230 ENSGT01050000244882.a.a.b.a.b ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT00950000183006.A.a.a.a ENSGT00950000182998.C.b.a ENSGT00940000158855 Channel catfish MODERN SPECIES 8 ENSIPUG00000016524 ENSIPUG00000016500 ENSIPUG00000016485 ENSIPUG00000016470 ENSIPUG00000016432 ENSIPUG00000016412 ENSIPUG00000016395 ENSIPUG00000016384 ENSIPUG00000016375 Csnk1g2 (ENSIPUG00000016316) mfsd12a (ENSIPUG00000016251) Prrx1 (ENSIPUG00000016228) kifap3b (ENSIPUG00000016067) ENSIPUG00000016042 msh5 (ENSIPUG00000016018) RH11 (ENSIPUG00000016013) ##22 ROBO1 (ENSIPUG00000015850) robo2 (ENSIPUG00000015618) ENSIPUG00000015562 ENSIPUG00000015551 ENSIPUG00000015481 stim1a (ENSIPUG00000015417) Rhog (ENSIPUG00000015404) ENSIPUG00000015385 ENSIPUG00000015338 ENSIPUG00000015316 ENSIPUG00000015304 ENSIPUG00000015284 ENSIPUG00000015276 ENSIPUG00000015268 Mrps23 (ENSIPUG00000015227) Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000158891 ENSGT00940000154388 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000012071 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000160058 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773 ENSGT01100000263542.B.a ENSGT00940000160379 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000158726 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.d ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT00390000006521 ENSGT00390000010674.a ENSGT00530000063965.w ENSGT00530000063868.a.a ENSGT00940000157392.o.a ENSGT00390000014125 ENSGT00950000182824.a.b.a.j.a ENSGT00390000011230 ENSGT01050000244882.a.a.b.a.b ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT00950000183006.A.a.a.a ENSGT00950000182998.C.b.a ENSGT00940000158855 Electric eel MODERN SPECIES 303 NBEA (ENSEEEG00000013229) ENSEEEG00000013217 ENSEEEG00000013212 trmt9b (ENSEEEG00000013210) PDS5B (ENSEEEG00000012959) ENSEEEG00000012938 ENSEEEG00000012934 rps5 (ENSEEEG00000012881) MSH5 (ENSEEEG00000012879) opn1mw1 (ENSEEEG00000012877) ##22 ROBO1 (ENSEEEG00000012870) robo2 (ENSEEEG00000012865) Characoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000158891 ENSGT00940000154388 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000012071 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000160058 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773 ENSGT01100000263542.B.a ENSGT00940000160379 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000158726 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.d ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT00390000006521 ENSGT00390000010674.a ENSGT00530000063965.w ENSGT00530000063868.a.a ENSGT00940000157392.o.a ENSGT00390000014125 ENSGT00950000182824.a.b.a.j.a ENSGT00390000011230 ENSGT01050000244882.a.a.b.a.b ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT00950000183006.A.a.a.a ENSGT00950000182998.C.b.a ENSGT00940000158855 Mexicana tetra MODERN SPECIES 749 ENSAMXG00000001278 ENSAMXG00000037833 MSH5 (ENSAMXG00000001273) opn1mw1 (ENSAMXG00000001266) ##22 Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha MODERN SPECIES 204 slc6a22.2 (ENSPNAG00000016597) ENSPNAG00000016591 ##22 synprb (ENSPNAG00000016547) ENSPNAG00000003421 cplane2 (ENSPNAG00000016332) ENSPNAG00000016327 wdr82 (ENSPNAG00000016298) twf2a (ENSPNAG00000016250) cish (ENSPNAG00000016230) hemk1 (ENSPNAG00000016216) SRGAP3 (ENSPNAG00000016170) rad18 (ENSPNAG00000016082) oxtra (ENSPNAG00000016063) cav3 (ENSPNAG00000016047) ENSPNAG00000016030 ENSPNAG00000015991 parp3 (ENSPNAG00000015983) Red-bellied piranha MODERN SPECIES 126 ENSPNAG00000018279 lta (ENSPNAG00000018264) ENSPNAG00000018252 GABBR1 (ENSPNAG00000018238) sh3bp5la (ENSPNAG00000018161) mgat1a (ENSPNAG00000018099) rnf183 (ENSPNAG00000018083) dhx16 (ENSPNAG00000018065) ppt2a.1 (ENSPNAG00000017993) ENSPNAG00000017887 ENSPNAG00000017879 ENSPNAG00000017869 MSH5 (ENSPNAG00000017859) opn1mw4 (ENSPNAG00000017727) ##22 ROBO1 (ENSPNAG00000016376) robo2 (ENSPNAG00000016285) ENSPNAG00000016041 ENSPNAG00000016026 ENSPNAG00000015975 stim1a (ENSPNAG00000015878) rhoga (ENSPNAG00000015827) CHRNA10 (ENSPNAG00000015806) mrps23 (ENSPNAG00000015802) NOS2 (ENSPNAG00000015774) NOS2 (ENSPNAG00000015647) lyrm9 (ENSPNAG00000015585) nlk2 (ENSPNAG00000003401) ENSPNAG00000015559 ENSPNAG00000015551 Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000158891 ENSGT00940000154388 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000012071.w ENSGT00940000159296 ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000160058 ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773 ENSGT01100000263542.B.a ENSGT00940000160379 ENSGT00910000144115.a.hc.a ENSGT00940000158726 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000166826.w ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.d ##22 ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT00590000083094.a.a.c.b Atlantic herring DUPLICATION Atlantic herring DUPLICATION Atlantic herring MODERN SPECIES 21 ENSCHAG00000006755 ENSCHAG00000006546 ENSCHAG00000006535 SLC2A11 (ENSCHAG00000006356) ENSCHAG00000006339 ENSCHAG00000006317 tgfa (ENSCHAG00000006299) hdhd3 (ENSCHAG00000006288) trub2 (ENSCHAG00000006274) entpd8 (ENSCHAG00000006264) ENSCHAG00000006252 ENSCHAG00000006219 ENSCHAG00000006198 slc6a22.2 (ENSCHAG00000005445) ENSCHAG00000005367 ##22 ENSCHAG00000005251 ##22 ENSCHAG00000005223 ENSCHAG00000005015 ##22 synprb (ENSCHAG00000004740) ENSCHAG00000004724 ENSCHAG00000004662 ENSCHAG00000001407 ddi2 (ENSCHAG00000022280) ENSCHAG00000022274 wdr82 (ENSCHAG00000022046) CISH (ENSCHAG00000022038) hemk1 (ENSCHAG00000022022) nprl2 (ENSCHAG00000021953) zmynd10 (ENSCHAG00000021791) ENSCHAG00000021779 RASSF1 (ENSCHAG00000021774) Atlantic herring MODERN SPECIES 21 ENSCHAG00000006535 SLC2A11 (ENSCHAG00000006356) ENSCHAG00000006339 ENSCHAG00000006317 tgfa (ENSCHAG00000006299) hdhd3 (ENSCHAG00000006288) trub2 (ENSCHAG00000006274) entpd8 (ENSCHAG00000006264) ENSCHAG00000006252 ENSCHAG00000006219 ENSCHAG00000006198 slc6a22.2 (ENSCHAG00000005445) ENSCHAG00000005367 ##22 ENSCHAG00000005251 ##22 ENSCHAG00000005223 ENSCHAG00000005015 ##22 synprb (ENSCHAG00000004740) ENSCHAG00000004724 ENSCHAG00000004662 ENSCHAG00000001407 ddi2 (ENSCHAG00000022280) ENSCHAG00000022274 wdr82 (ENSCHAG00000022046) CISH (ENSCHAG00000022038) hemk1 (ENSCHAG00000022022) nprl2 (ENSCHAG00000021953) zmynd10 (ENSCHAG00000021791) ENSCHAG00000021779 RASSF1 (ENSCHAG00000021774) tusc2a (ENSCHAG00000021763) HYAL2 (ENSCHAG00000021760) Atlantic herring MODERN SPECIES 21 ENSCHAG00000006790 ENSCHAG00000006755 ENSCHAG00000006546 ENSCHAG00000006535 SLC2A11 (ENSCHAG00000006356) ENSCHAG00000006339 ENSCHAG00000006317 tgfa (ENSCHAG00000006299) hdhd3 (ENSCHAG00000006288) trub2 (ENSCHAG00000006274) entpd8 (ENSCHAG00000006264) ENSCHAG00000006252 ENSCHAG00000006219 ENSCHAG00000006198 slc6a22.2 (ENSCHAG00000005445) ENSCHAG00000005367 ##22 ENSCHAG00000005251 ##22 ENSCHAG00000005223 ENSCHAG00000005015 ##22 synprb (ENSCHAG00000004740) ENSCHAG00000004724 ENSCHAG00000004662 ENSCHAG00000001407 ddi2 (ENSCHAG00000022280) ENSCHAG00000022274 wdr82 (ENSCHAG00000022046) CISH (ENSCHAG00000022038) hemk1 (ENSCHAG00000022022) nprl2 (ENSCHAG00000021953) zmynd10 (ENSCHAG00000021791) ENSCHAG00000021779 Denticle herring DUPLICATION Denticle herring MODERN SPECIES 15 ENSDCDG00000028433 tnfb (ENSDCDG00000028429) GABBR1 (ENSDCDG00000026708) sh3bp5la (ENSDCDG00000026682) ENSDCDG00000026681 mgat1a (ENSDCDG00000026679) rnf183 (ENSDCDG00000026678) dhx16 (ENSDCDG00000022891) ENSDCDG00000022791 ENSDCDG00000022785 ENSDCDG00000022789 ENSDCDG00000022778 ENSDCDG00000022741 ENSDCDG00000022734 MSH5 (ENSDCDG00000022730) ENSDCDG00000022728 ##22 ENSDCDG00000022726 csnk2b (ENSDCDG00000022717) AIF1 (ENSDCDG00000022712) fzd6 (ENSDCDG00000022703) mc2r (ENSDCDG00000022699) mc5rb (ENSDCDG00000022695) rspo1 (ENSDCDG00000022690) gnl2 (ENSDCDG00000022680) dnali1 (ENSDCDG00000022669) u2af1 (ENSDCDG00000022651) cbsa (ENSDCDG00000020653) cryaa (ENSDCDG00000020625) ENSDCDG00000020623 HSF2BP (ENSDCDG00000020621) ankrd10a (ENSDCDG00000020618) Denticle herring MODERN SPECIES 245 slc6a22.1 (ENSDCDG00000007525) slc6a22.2 (ENSDCDG00000008678) opn1mw1 (ENSDCDG00000012623) ##22 TASOR (ENSDCDG00000012641) arhgef3 (ENSDCDG00000012724) ENSDCDG00000016080 cyc1 (ENSDCDG00000016086) il17rd (ENSDCDG00000016093) HESX1 (ENSDCDG00000016102) appl1 (ENSDCDG00000016125) ENSDCDG00000016310 synprb (ENSDCDG00000018820) ENSDCDG00000019362 IP6K1 (ENSDCDG00000019387) gmppb (ENSDCDG00000019390) lmcd1 (ENSDCDG00000019397) ENSDCDG00000019416 pfdn5 (ENSDCDG00000019421) Spotted gar MODERN SPECIES 669 ENSLOCG00000012541 zgc:64051 (ENSLOCG00000012534) ENSLOCG00000012526 cdkn1a (ENSLOCG00000012523) srsf3a (ENSLOCG00000012519) fkbp5 (ENSLOCG00000012508) slc6a22.1 (ENSLOCG00000012488) ENSLOCG00000012483 PTPN7 (ENSLOCG00000012475) arl8a (ENSLOCG00000012467) GPR37L1 (ENSLOCG00000012462) ELF3 (ENSLOCG00000012450) itpr3 (ENSLOCG00000012422) apobec2b (ENSLOCG00000012415) oard1 (ENSLOCG00000012410) opn1mw1 (ENSLOCG00000012404) ##22 zgc:162255 (ENSLOCG00000012396) ENSLOCG00000012391 slc6a11a (ENSLOCG00000012363) AMPD2 (ENSLOCG00000012353) gnat2 (ENSLOCG00000012347) gnai3 (ENSLOCG00000012341) GPR61 (ENSLOCG00000017943) AMIGO1 (ENSLOCG00000017942) cyb561d1 (ENSLOCG00000012336) atxn7l2a (ENSLOCG00000012332) sypl2a (ENSLOCG00000012322) psma5 (ENSLOCG00000012319) sort1a (ENSLOCG00000012309) ngrn (ENSLOCG00000012302) nfya (ENSLOCG00000012292) Elephant shark MODERN SPECIES 1518 LGR6 (ENSCMIG00000001050) ube2t (ENSCMIG00000001059) arl8a (ENSCMIG00000001067) GPR37L1 (ENSCMIG00000001074) ENSCMIG00000001079 ENSCMIG00000001083 itpr3 (ENSCMIG00000001206) ENSCMIG00000001379 nudt3a (ENSCMIG00000001383) ENSCMIG00000001387 ENSCMIG00000001396 ENSCMIG00000001401 ENSCMIG00000001407 ENSCMIG00000001414 ENSCMIG00000001419 opn1mw3 (ENSCMIG00000001426) ##22 ENSCMIG00000001435 RNF122 (ENSCMIG00000001449) ENSCMIG00000001465 ENSCMIG00000001474 ENSCMIG00000001482 ENSCMIG00000001484 ENSCMIG00000001491 ENSCMIG00000001495 ENSCMIG00000001506 ENSCMIG00000001514 ENSCMIG00000001519 ENSCMIG00000001521 LMOD1 (ENSCMIG00000001528) timm17a (ENSCMIG00000001556) rnpep (ENSCMIG00000001620) Vertebrata ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a ##22 Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a ##22 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 152 ENSGT00940000159855 ENSGT01030000234637.b.c ENSGT00940000153629.a.b ENSGT00940000158528 ENSGT00600000085663 ENSGT00990000203541.b ENSGT00940000159563 ENSGT00940000159128 ENSGT00940000166196 ENSGT00940000161383 ENSGT00940000160502 ENSGT00530000063687.b.b.b ##20 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00730000111044 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00950000182827.B ENSGT00940000161689 ENSGT00940000158963 ENSGT00940000155317.a.a ENSGT00390000002062 ENSGT01030000234648.a.b.a.b ENSGT00390000012692 Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES 136 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.b ENSGT00940000155317.a.a ENSGT00940000156963.a.b ENSGT00390000012692 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.a ENSGT00390000002062 ENSGT00600000085663 ENSGT00990000203541.b ENSGT00940000159563 ENSGT00940000166313 ENSGT00940000159128 ENSGT00940000166196 ENSGT00940000161383 ENSGT00940000160502 ENSGT00530000063687.b.b.b ##20 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00730000111044 ENSGT00950000183005.a.a Neopterygii ANCESTRAL SPECIES 131 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.b ENSGT00940000155317.a.a ENSGT00940000156963.a.b ENSGT00390000012692 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.a ENSGT00390000002062 ENSGT00600000085663 ENSGT00990000203541.b ENSGT00940000159563 ENSGT00940000166313 ENSGT00940000159128 ENSGT00940000166196 ENSGT00940000161383 ENSGT00940000160502 ENSGT00530000063687.b.b.b ##20 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00730000111044 ENSGT00950000183005.a.a Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 356 ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000161383.d.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00730000111044 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 50 ENSGT00940000164196.c.b ENSGT00940000159667.b ENSGT00940000164755.D.b ENSGT00390000015154 ENSGT00950000183102.C ENSGT00390000017780.e.ab ENSGT00390000008631.b ENSGT00940000166169 ENSGT00940000159855 ENSGT01030000234637.b.c.h ENSGT00940000158528 ENSGT00940000153629.a.b.d ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000161383.c.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000158963.b.a ENSGT00510000048007 ENSGT00940000154343.fb ENSGT00510000047137.y ENSGT00940000156136 ENSGT00730000111482.a ENSGT00390000017213.B.b ENSGT00940000160408.g ENSGT01030000234571.a.b.f ENSGT00940000153341.l.a Asian bonytongue MODERN SPECIES 14 PDZD4 (ENSSFOG00015032743) kdm5c (ENSSFOG00015010111) IQSEC2 (ENSSFOG00015009998) ENSSFOG00015029093 gpkow (ENSSFOG00015009901) pqbp1 (ENSSFOG00015032016) TIMM17B (ENSSFOG00015028880) praf2 (ENSSFOG00015009826) ENSSFOG00015026127 sypb (ENSSFOG00015009670) plp2b (ENSSFOG00015024717) PRICKLE3 (ENSSFOG00015009613) gata1a (ENSSFOG00015009587) si:dkey-13a21.4 (ENSSFOG00015009566) HCFC1 (ENSSFOG00015009466) opn1sw2 (ENSSFOG00015009411) ##22 ENSSFOG00015009394 ##22 ENSSFOG00015032823 ENSSFOG00015008941 ##22 ENSSFOG00015008893 gnl3l (ENSSFOG00015008883) tfe3b (ENSSFOG00015008689) ccdc120b (ENSSFOG00015008622) ENSSFOG00015008591 otud5b (ENSSFOG00015027588) cenps (ENSSFOG00015026443) tardbpb (ENSSFOG00015008512) RER1 (ENSSFOG00015008467) tas1r2.1 (ENSSFOG00015008301) ENSSFOG00015008268 GPR153 (ENSSFOG00015008256) P. kingsleyae MODERN SPECIES 32 IQSEC2 (ENSPKIG00000008307) ENSPKIG00000008365 gpkow (ENSPKIG00000008382) pqbp1 (ENSPKIG00000008420) timm17b (ENSPKIG00000008438) praf2 (ENSPKIG00000008455) ENSPKIG00000008476 ENSPKIG00000008537 ENSPKIG00000008552 sypb (ENSPKIG00000008577) plp2b (ENSPKIG00000008615) PRICKLE3 (ENSPKIG00000008640) gata1a (ENSPKIG00000008667) si:dkey-13a21.4 (ENSPKIG00000008691) HCFC1 (ENSPKIG00000008723) opn1sw2 (ENSPKIG00000009651) ##22 opn1lw1 (ENSPKIG00000011983) ##22 gnl3l (ENSPKIG00000012014) tfe3b (ENSPKIG00000012043) ccdc120b (ENSPKIG00000012066) otud5b (ENSPKIG00000012110) cenps (ENSPKIG00000012136) tardbpb (ENSPKIG00000012179) RER1 (ENSPKIG00000012231) tas1r2.1 (ENSPKIG00000012286) her3 (ENSPKIG00000012352) GPR153 (ENSPKIG00000012380) espn (ENSPKIG00000012406) ARHGEF16 (ENSPKIG00000012442) ybx1 (ENSPKIG00000012488) ENSPKIG00000012512 Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 189 ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000161383.d.a ENSGT00940000167532 ENSGT00940000160502 ENSGT00530000063687.b.b.b ##20 ENSGT00390000003348 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000157503.i.a ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00730000111044 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 257 ENSGT00940000160318.c.b ENSGT00940000154681.b.d ENSGT00980000199461 ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000161383.d.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h Otophysi ANCESTRAL SPECIES 303 ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000161383.d.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00940000158963.b.a ENSGT00390000006665.b.g ENSGT00940000155056.b ENSGT00940000163942.a ENSGT00940000158374.d ENSGT00940000166894 ENSGT00390000009278.a ENSGT00940000154570.a.a Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000154360.A.a ENSGT00940000155224.c.a ENSGT00940000160318.c.b ENSGT00940000154681.b.d ENSGT00980000199461 ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000161383.d.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a Characoidei ANCESTRAL SPECIES 214 ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000161383.d.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00940000158963.b.a ENSGT00390000006665.b.g ENSGT00940000155056.b ENSGT00940000163942.a ENSGT00940000158374.d Mexicana tetra MODERN SPECIES 14 ephb2b (ENSAMXG00000006326) fam83d (ENSAMXG00000036827) adnpa (ENSAMXG00000006355) gata1a (ENSAMXG00000040272) si:dkey-13a21.4 (ENSAMXG00000032663) opn1sw2 (ENSAMXG00000037260) ##22 opn1lw1 (ENSAMXG00000006368) ##22 gnl3l (ENSAMXG00000006376) tfe3b (ENSAMXG00000020781) cxxc1b (ENSAMXG00000006383) ccdc120b (ENSAMXG00000042805) grm6b (ENSAMXG00000006398) MON1B (ENSAMXG00000006415) BRPF3 (ENSAMXG00000041882) ENSAMXG00000031120 PLCH2 (ENSAMXG00000006425) ENSAMXG00000024789 LACTBL1 (ENSAMXG00000004600) ENSAMXG00000043590 ENSAMXG00000029622 smarcd1 (ENSAMXG00000004577) Red-bellied piranha MODERN SPECIES 348 ENSPNAG00000009321 myh7ba (ENSPNAG00000009413) ENSPNAG00000009446 myg1 (ENSPNAG00000009469) ENSPNAG00000009483 top1a (ENSPNAG00000009507) ENSPNAG00000009533 fam83d (ENSPNAG00000009546) ENSPNAG00000009555 ENSPNAG00000009623 adnpa (ENSPNAG00000009630) gata1a (ENSPNAG00000009646) si:dkey-13a21.4 (ENSPNAG00000009664) HCFC1 (ENSPNAG00000009697) opn1sw2 (ENSPNAG00000009708) ##22 ENSPNAG00000009733 ##22 ENSPNAG00000009746 ##22 gnl3l (ENSPNAG00000005179) tfe3b (ENSPNAG00000001347) cxxc1b (ENSPNAG00000006461) Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00390000018330 ENSGT00940000160318.c.b ENSGT00940000160318.c.a ENSGT00940000154681.b.d ENSGT00980000199461 ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000161531.b ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT01060000253577 ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00730000111044 ENSGT00940000169444 ENSGT00940000154102.b.a.b ENSGT00950000182955.a.b.a ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.b ##24 ENSGT00940000157877.b.g ENSGT00390000012692 ENSGT00940000156963.a.b Cyprininae DUPLICATION Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 212 ENSGT00940000160331.l ENSGT00390000018330.n.b ENSGT00940000160318.c.b ENSGT00940000154681.b.d.e ENSGT00530000063829.C.a.a ENSGT00390000018123.b.a ENSGT00940000155006.e.a.f ENSGT00950000182893.a.a.b.b.b ENSGT00940000158405.e ENSGT00940000161531.b.a ENSGT00940000164411.b ENSGT00530000063631.b.n.a.a ENSGT00940000166313.a.a ENSGT00940000166196.f ENSGT00940000164702.b.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b.gb ##22 ENSGT00940000155877.b ENSGT00940000157503.i.b.b ENSGT01060000253577 ENSGT00940000166392.a ENSGT00950000183005.a.a.f ENSGT00940000154102.b.a.a.b ENSGT00940000155317.a.a.j.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b.b ENSGT00940000158963.b.a.a ENSGT00390000006665.b.g.b ENSGT00940000155056.b.a ENSGT00940000163942.a.b ENSGT00940000158374.d.a ENSGT00940000166894.a Goldfish MODERN SPECIES 142 arhgap46a (ENSCARG00000034008) ENSCARG00000034061 ndrg3a (ENSCARG00000034089) trpc4apa (ENSCARG00000034821) myh7ba (ENSCARG00000035006) snai1a (ENSCARG00000035323) tp53inp2 (ENSCARG00000035332) ENSCARG00000035337 top1a (ENSCARG00000035362) ENSCARG00000036550 fam83d (ENSCARG00000036570) mafbb (ENSCARG00000036595) adnpa (ENSCARG00000036603) gata1a (ENSCARG00000036620) hcfc1a (ENSCARG00000036717) opn1sw2 (ENSCARG00000037260) ##22 ENSCARG00000037307 ##22 tfe3b (ENSCARG00000037442) cxxc1b (ENSCARG00000040392) mbd1b (ENSCARG00000040889) ccdc120b (ENSCARG00000040903) comtb (ENSCARG00000040935) grm6b (ENSCARG00000040997) otud5b (ENSCARG00000042249) MON1B (ENSCARG00000042471) BRPF3 (ENSCARG00000042547) ENSCARG00000042717 PLCH2 (ENSCARG00000042766) skib (ENSCARG00000043193) tmem51b (ENSCARG00000043270) kaznb (ENSCARG00000043310) Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000160331.l ENSGT00390000018330.n.b ENSGT00940000160318.c.b ENSGT00940000154681.b.d.e ENSGT00530000063829.C.a.a ENSGT00390000018123.b.a ENSGT00940000155006.e.a.f ENSGT00950000182893.a.a.b.b.b ENSGT00940000158405.e ENSGT00940000161531.b.a ENSGT00940000164411.b ENSGT00530000063631.b.n.a.a ENSGT00940000166313.a.a ENSGT00940000166196.f ENSGT00940000164702.b.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b.gb ##22 ENSGT00940000155877.b ENSGT00940000157503.i.b.b ENSGT01060000253577 ENSGT00940000166392.a ENSGT00950000183005.a.a.f ENSGT00940000154102.b.a.a.b ENSGT00940000155317.a.a.j.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b.b ENSGT00940000158963.b.a.a ENSGT00390000006665.b.g.b ENSGT00940000155056.b.a ENSGT00940000163942.a.b ENSGT00940000158374.d.a ENSGT00940000166894.a Common carp reference MODERN SPECIES 42 sulf2a (ENSCCRG00000041869) arhgap46a (ENSCCRG00000003147) ENSCCRG00000039400 ndrg3a (ENSCCRG00000006676) trpc4apa (ENSCCRG00000017847) myh7ba (ENSCCRG00000017821) snai1a (ENSCCRG00000057413) tp53inp2 (ENSCCRG00000043585) ENSCCRG00000063625 ENSCCRG00000043578 top1a (ENSCCRG00000076066) fam83d (ENSCCRG00000043564) ENSCCRG00000043364 adnpa (ENSCCRG00000043343) hcfc1a (ENSCCRG00000058227) opn1sw2 (ENSCCRG00000034760) ##22 ENSCCRG00000042194 ##22 tfe3b (ENSCCRG00000076795) ENSCCRG00000082624 cxxc1b (ENSCCRG00000041918) mbd1b (ENSCCRG00000079505) ccdc120b (ENSCCRG00000040452) comtb (ENSCCRG00000055844) grm6b (ENSCCRG00000040460) otud5b (ENSCCRG00000039550) ENSCCRG00000039580 ENSCCRG00000039624 ENSCCRG00000066958 ENSCCRG00000040353 skib (ENSCCRG00000055470) kaznb (ENSCCRG00000048175) Golden-line barbel MODERN SPECIES 1 ENSSGRG00000037577 ndrg3a (ENSSGRG00000037502) ENSSGRG00000037500 trpc4apa (ENSSGRG00000037499) trpc4apa (ENSSGRG00000037498) myh7ba (ENSSGRG00000030364) snai1a (ENSSGRG00000030274) tp53inp2 (ENSSGRG00000030273) top1a (ENSSGRG00000029390) fam83d (ENSSGRG00000029370) mafbb (ENSSGRG00000029369) ENSSGRG00000029368 ENSSGRG00000029367 si:dkey-13a21.4 (ENSSGRG00000029365) hcfc1a (ENSSGRG00000028465) opn1sw2 (ENSSGRG00000028454) ##22 LWS1 (ENSSGRG00000028050) ##22 gnl3l (ENSSGRG00000028038) tfe3b (ENSSGRG00000028032) cxxc1b (ENSSGRG00000027621) mbd1b (ENSSGRG00000027615) ccdc120b (ENSSGRG00000027614) comtb (ENSSGRG00000027613) grm6b (ENSSGRG00000027612) otud5b (ENSSGRG00000027407) ENSSGRG00000027405 BRPF3 (ENSSGRG00000027403) ENSSGRG00000027402 ENSSGRG00000027280 skib (ENSSGRG00000027272) tmem51b (ENSSGRG00000027271) Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b.h ENSGT00390000018330.n.a ENSGT00940000160318.c.a ENSGT00940000154681.b.d.f ENSGT00980000199461 ENSGT00390000018123.b.b ENSGT00940000155006.e.a.e ENSGT00950000182893.a.a.b.b.a ENSGT00940000158405.f ENSGT00940000161531.b.b ENSGT00940000164411.a ENSGT00530000063631.b.n.a.b ENSGT00940000166313.a.b ENSGT00940000166196.e ENSGT00940000164702.b.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b.fb ##22 ENSGT00940000155877.a ENSGT00940000157503.i.b.a ENSGT00940000166392.b ENSGT00950000183005.a.a.e ENSGT00940000154102.b.a.a.a ENSGT00940000155317.a.a.j.b ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b.a ENSGT00940000158963.b.a.b ENSGT00390000006665.b.g.a ENSGT00940000155056.b.b ENSGT00940000163942.a.a ENSGT00940000158374.d.b ENSGT00940000166894.b ENSGT00390000009278.a.a Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b.h ENSGT00390000018330.n.a ENSGT00940000160318.c.a ENSGT00940000154681.b.d.f ENSGT00530000063829.C.a.b ENSGT00390000018123.b.b ENSGT00940000155006.e.a.e ENSGT00950000182893.a.a.b.b.a ENSGT00940000158405.f ENSGT00940000161531.b.b ENSGT00940000164411.a ENSGT00530000063631.b.n.a.b ENSGT00940000166313.a.b ENSGT00940000166196.e ENSGT00940000164702.b.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b.fb ##22 ENSGT00940000155877.a ENSGT00940000157503.i.b.a ENSGT00940000166392.b ENSGT00950000183005.a.a.e ENSGT00940000154102.b.a.a.a ENSGT00940000155317.a.a.j.b ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b.a ENSGT00940000158963.b.a.b ENSGT00390000006665.b.g.a ENSGT00940000155056.b.b ENSGT00940000163942.a.a ENSGT00940000158374.d.b ENSGT00940000166894.b ENSGT00390000009278.a.a Golden-line barbel MODERN SPECIES 2 ENSSGRG00000052625 ndrg3a (ENSSGRG00000052628) trpc4apa (ENSSGRG00000052675) ENSSGRG00000052699 snai1a (ENSSGRG00000052701) tp53inp2 (ENSSGRG00000052702) ENSSGRG00000052703 top1a (ENSSGRG00000052705) ENSSGRG00000052959 fam83d (ENSSGRG00000052960) ENSSGRG00000052961 adnpa (ENSSGRG00000052962) gata1a (ENSSGRG00000052963) si:dkey-13a21.4 (ENSSGRG00000052964) hcfc1a (ENSSGRG00000052971) opn1sw2 (ENSSGRG00000053033) ##22 ENSSGRG00000053037 ##22 gnl3l (ENSSGRG00000053063) cxxc1b (ENSSGRG00000053088) mbd1b (ENSSGRG00000053211) ccdc120b (ENSSGRG00000053213) grm6b (ENSSGRG00000053215) otud5b (ENSSGRG00000053241) MON1B (ENSSGRG00000053261) BRPF3 (ENSSGRG00000053264) ENSSGRG00000053265 PLCH2 (ENSSGRG00000053266) skib (ENSSGRG00000053270) tmem51b (ENSSGRG00000053271) ENSSGRG00000053273 kaznb (ENSSGRG00000053276) Goldfish MODERN SPECIES 2 ndrg3a (ENSCARG00000011862) ENSCARG00000011729 trpc4apa (ENSCARG00000011552) snai1a (ENSCARG00000011521) ENSCARG00000011514 ENSCARG00000011508 top1a (ENSCARG00000011328) ENSCARG00000011309 fam83d (ENSCARG00000011289) mafbb (ENSCARG00000011282) ENSCARG00000011231 adnpa (ENSCARG00000011224) gata1a (ENSCARG00000011209) si:dkey-13a21.4 (ENSCARG00000011198) hcfc1a (ENSCARG00000010684) opn1sw2 (ENSCARG00000010620) ##22 ENSCARG00000010595 ##22 gnl3l (ENSCARG00000010084) tfe3b (ENSCARG00000010567) cxxc1b (ENSCARG00000009899) mbd1b (ENSCARG00000009878) ccdc120b (ENSCARG00000009875) comtb (ENSCARG00000009856) grm6b (ENSCARG00000009850) otud5b (ENSCARG00000009489) MON1B (ENSCARG00000009463) BRPF3 (ENSCARG00000009425) ENSCARG00000009384 skib (ENSCARG00000009364) tmem51b (ENSCARG00000009358) kaznb (ENSCARG00000009343) Zebrafish MODERN SPECIES 2 ENSDARG00000099887 trpc4apa (ENSDARG00000018840) myh7ba (ENSDARG00000076075) snai1a (ENSDARG00000056995) tp53inp2 (ENSDARG00000088178) ENSDARG00000089724 top1a (ENSDARG00000070545) ENSDARG00000087186 fam83d (ENSDARG00000077883) mafbb (ENSDARG00000070542) ENSDARG00000070541 adnpa (ENSDARG00000062002) gata1a (ENSDARG00000013477) si:dkey-13a21.4 (ENSDARG00000026098) hcfc1a (ENSDARG00000015990) opn1sw2 (ENSDARG00000017274) ##22 opn1lw1 (ENSDARG00000044862) ##22 opn1lw2 (ENSDARG00000044861) ##22 gnl3l (ENSDARG00000020595) tfe3b (ENSDARG00000019457) si:dkey-245f22.3 (ENSDARG00000097510) cxxc1b (ENSDARG00000025718) mbd1b (ENSDARG00000025699) ccdc120b (ENSDARG00000032856) comtb (ENSDARG00000025679) grm6b (ENSDARG00000025671) otud5b (ENSDARG00000056840) MON1B (ENSDARG00000077434) BRPF3 (ENSDARG00000070513) ENSDARG00000070511 PLCH2 (ENSDARG00000056805) Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000154681.b.d ENSGT00980000199461 ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000161531.b ENSGT00940000160486.d.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000161383.d.a ENSGT00530000063687.b.b.b.u ##20 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b Denticle herring MODERN SPECIES 3 ENSDCDG00000024731 trpc4apa (ENSDCDG00000024032) snai1a (ENSDCDG00000024020) ENSDCDG00000024019 ENSDCDG00000024016 top1a (ENSDCDG00000023981) ENSDCDG00000023946 fam83d (ENSDCDG00000023929) mafbb (ENSDCDG00000023928) ENSDCDG00000023924 adnpa (ENSDCDG00000023922) gata1a (ENSDCDG00000023920) si:dkey-13a21.4 (ENSDCDG00000023906) HCFC1 (ENSDCDG00000023838) MECP2 (ENSDCDG00000023819) ##20 opn1sw2 (ENSDCDG00000023817) ##22 opn1lw1 (ENSDCDG00000023816) ##22 gnl3l (ENSDCDG00000023810) tfe3b (ENSDCDG00000023742) ITPR1 (ENSDCDG00000023173) pfkfb4b (ENSDCDG00000015652) ENSDCDG00000015409 uroc1 (ENSDCDG00000015360) arl8bb (ENSDCDG00000015351) ENSDCDG00000015348 SEMA3F (ENSDCDG00000021551) camkvb (ENSDCDG00000021439) ENSDCDG00000021427 mon1a (ENSDCDG00000021422) ENSDCDG00000021417 ENSDCDG00000021412 Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000154681.b.d ENSGT00980000199461 ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000161383.d.a ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000154861.n.a Acanthomorphata DUPLICATION Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 42 ENSGT00940000160318.c.b ENSGT00940000154681.b.d ENSGT00980000199461 ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000161383.d.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c ##22 ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000160318.c.b ENSGT00940000154681.b.d ENSGT00980000199461 ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000156703.e.a Percomorphaceae DUPLICATION Percomorphaceae DUPLICATION Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.a ##22 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.a ##22 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000154681.b.d ENSGT00980000199461 ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.a ##22 ENSGT00940000161383.d.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000181969 ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a Eupercaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000160318.c.b ENSGT00940000154681.b.d ENSGT00980000199461 ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.a ##22 ENSGT00940000166196 ENSGT00940000161383.d.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000181969 ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000160318.c.b ENSGT00940000154681.b.d ENSGT00980000199461 ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.a ##22 ENSGT00940000166196 ENSGT00940000161383.d.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000181969 ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.a ##22 Perciformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.a ##22 Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000154681.b.d ENSGT00980000199461 ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00730000111044 ENSGT00940000159563 ENSGT00990000203541.b ENSGT01030000234637.b.c.g ENSGT00940000160502 ENSGT00940000167532 ENSGT00940000154102.b.a.b ENSGT00950000182955.a.b.a ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.b ##24 ENSGT00940000157877.b.g ENSGT00390000012692 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.a Pike perch MODERN SPECIES 11 myh7ba (ENSSLUG00000021243) snai1a (ENSSLUG00000021306) ENSSLUG00000021307 ENSSLUG00000021311 ENSSLUG00000021321 top1a (ENSSLUG00000021371) ENSSLUG00000021794 fam83d (ENSSLUG00000021803) MAFB (ENSSLUG00000021811) ENSSLUG00000021816 adnpa (ENSSLUG00000021822) BCL2L1 (ENSSLUG00000021825) gata1a (ENSSLUG00000021830) si:dkey-13a21.4 (ENSSLUG00000021834) hcfc1a (ENSSLUG00000021854) opn1sw2 (ENSSLUG00000021888) ##22 ENSSLUG00000021893 ##22 ENSSLUG00000021896 ##22 ENSSLUG00000021899 ##22 ENSSLUG00000021917 ##22 gnl3l (ENSSLUG00000021972) tfe3b (ENSSLUG00000022004) CXXC1 (ENSSLUG00000022049) mbd1b (ENSSLUG00000022140) ccdc120b (ENSSLUG00000022153) SRPK3 (ENSSLUG00000022192) comtb (ENSSLUG00000022361) grm6b (ENSSLUG00000022374) traip (ENSSLUG00000022387) mon1a (ENSSLUG00000022403) ENSSLUG00000022410 Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.a ##22 Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.a ##22 Large yellow croaker MODERN SPECIES 478 myh7ba (ENSLCRG00005022334) snai1a (ENSLCRG00005022344) ENSLCRG00005022347 ENSLCRG00005022348 top1a (ENSLCRG00005022352) ENSLCRG00005022423 fam83d (ENSLCRG00005022424) MAFB (ENSLCRG00005022425) ENSLCRG00005022426 adnpa (ENSLCRG00005022428) ENSLCRG00005022429 gata1a (ENSLCRG00005022430) si:dkey-13a21.4 (ENSLCRG00005022432) hcfc1a (ENSLCRG00005022434) opn1sw2 (ENSLCRG00005022439) ##22 opn1sw2 (ENSLCRG00005022440) ##22 opn1lw1 (ENSLCRG00005022441) ##22 gnl3l (ENSLCRG00005022442) tfe3b (ENSLCRG00005022462) cxxc1b (ENSLCRG00005002269) ap5b1 (ENSLCRG00005004025) zgc:112255 (ENSLCRG00005004027) P3H1 (ENSLCRG00005004095) cldn19 (ENSLCRG00005004160) ENSLCRG00005004286 nucks1a (ENSLCRG00005004986) slc45a3 (ENSLCRG00005005000) ENSLCRG00005005013 elk4 (ENSLCRG00005005023) ENSLCRG00005005096 ephb2b (ENSLCRG00005005574) Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000154681.b.d ENSGT00980000199461 ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a.n ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000156703.e.a Anabantaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154681.b.d ENSGT00980000199461 ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a.n ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000156703.e.a Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000018330 ENSGT00940000160318.c.b ENSGT00940000154681.b.d ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a.n ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000156703.e.a Climbing perch MODERN SPECIES 18 ndrg3a (ENSATEG00000015891) trpc4apa (ENSATEG00000015800) myh7ba (ENSATEG00000015668) snai1a (ENSATEG00000015639) ENSATEG00000025418 ENSATEG00000015102 top1a (ENSATEG00000015061) ENSATEG00000015047 fam83d (ENSATEG00000015038) ENSATEG00000029851 adnpa (ENSATEG00000015001) ENSATEG00000014989 gata1a (ENSATEG00000014966) si:dkey-13a21.4 (ENSATEG00000014958) hcfc1a (ENSATEG00000014798) opn1sw2 (ENSATEG00000014765) ##22 opn1sw2 (ENSATEG00000014431) ##22 ENSATEG00000011811 ##22 ENSATEG00000009817 ##22 gnl3l (ENSATEG00000009762) tfe3b (ENSATEG00000009661) cxxc1b (ENSATEG00000009642) mbd1b (ENSATEG00000009608) ccdc120b (ENSATEG00000009583) ENSATEG00000009561 comtb (ENSATEG00000009551) grm6b (ENSATEG00000009522) traip (ENSATEG00000009440) mon1a (ENSATEG00000009424) ENSATEG00000009407 camkvb (ENSATEG00000009278) Siamese fighting fish MODERN SPECIES 16 trpc4apa (ENSBSLG00000022759) myh7ba (ENSBSLG00000023220) snai1a (ENSBSLG00000023459) ENSBSLG00000023478 ENSBSLG00000023500 top1a (ENSBSLG00000023553) ENSBSLG00000023820 fam83d (ENSBSLG00000023822) MAFB (ENSBSLG00000023841) ENSBSLG00000023864 adnpa (ENSBSLG00000023899) BCL2L1 (ENSBSLG00000023910) gata1a (ENSBSLG00000023916) si:dkey-13a21.4 (ENSBSLG00000007864) hcfc1a (ENSBSLG00000007920) opn1sw2 (ENSBSLG00000008108) ##22 opn1sw2 (ENSBSLG00000008155) ##22 opn1lw1 (ENSBSLG00000008207) ##22 gnl3l (ENSBSLG00000008417) tfe3b (ENSBSLG00000008528) cxxc1b (ENSBSLG00000008835) mbd1b (ENSBSLG00000009328) ccdc120b (ENSBSLG00000009387) SRPK3 (ENSBSLG00000009779) comtb (ENSBSLG00000010327) grm6b (ENSBSLG00000010337) traip (ENSBSLG00000010544) mon1a (ENSBSLG00000010555) ENSBSLG00000010560 camkvb (ENSBSLG00000010678) SEMA3F (ENSBSLG00000010913) Zig-zag eel MODERN SPECIES 19 snai1a (ENSMAMG00000020994) ENSMAMG00000021002 ENSMAMG00000021009 ENSMAMG00000021021 top1a (ENSMAMG00000021024) ENSMAMG00000021039 fam83d (ENSMAMG00000021041) ENSMAMG00000021043 ENSMAMG00000021047 ENSMAMG00000027960 ENSMAMG00000024557 gata1a (ENSMAMG00000021092) si:dkey-13a21.4 (ENSMAMG00000021095) hcfc1a (ENSMAMG00000021100) opn1sw2 (ENSMAMG00000026245) ##22 opn1sw2 (ENSMAMG00000021134) ##22 ENSMAMG00000022442 ##22 ENSMAMG00000022455 ##22 gnl3l (ENSMAMG00000023332) tfe3b (ENSMAMG00000023336) ENSMAMG00000023337 cxxc1b (ENSMAMG00000023339) ENSMAMG00000027411 ccdc120b (ENSMAMG00000024568) ENSMAMG00000023345 comtb (ENSMAMG00000023349) grm6b (ENSMAMG00000023356) mon1a (ENSMAMG00000023358) traip (ENSMAMG00000023357) ENSMAMG00000023360 camkvb (ENSMAMG00000023367) Carangaria ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000160318.c.b ENSGT00940000154681.b.d ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a.n ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000156703.e.a Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000160318.c.b ENSGT00940000154681.b.d ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a.n ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000156703.e.a Seriola ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000160318.c.b ENSGT00940000154681.b.d ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a.n ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000156703.e.a Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 2037 myh7ba (ENSSLDG00000011295) snai1a (ENSSLDG00000011412) GGT7 (ENSSLDG00000011429) ENSSLDG00000011453 top1a (ENSSLDG00000011470) ENSSLDG00000011497 fam83d (ENSSLDG00000011509) ENSSLDG00000011521 MAFB (ENSSLDG00000011540) adnpa (ENSSLDG00000011550) BCL2L1 (ENSSLDG00000011562) gata1a (ENSSLDG00000011572) si:dkey-13a21.4 (ENSSLDG00000011597) hcfc1a (ENSSLDG00000011619) opn1sw2 (ENSSLDG00000011730) ##22 opn1sw2 (ENSSLDG00000012051) ##22 opn1sw2 (ENSSLDG00000012230) ##22 opn1lw1 (ENSSLDG00000012258) ##22 gnl3l (ENSSLDG00000012278) tfe3b (ENSSLDG00000012336) cxxc1b (ENSSLDG00000012368) mbd1b (ENSSLDG00000012422) ccdc120b (ENSSLDG00000012502) SRPK3 (ENSSLDG00000012560) comtb (ENSSLDG00000012626) Greater amberjack MODERN SPECIES 37 myh7ba (ENSSDUG00000019946) snai1a (ENSSDUG00000019933) GGT7 (ENSSDUG00000019918) ENSSDUG00000019899 top1a (ENSSDUG00000019876) ENSSDUG00000019863 fam83d (ENSSDUG00000019848) MAFB (ENSSDUG00000019845) ENSSDUG00000019804 adnpa (ENSSDUG00000019791) BCL2L1 (ENSSDUG00000019783) gata1a (ENSSDUG00000019759) si:dkey-13a21.4 (ENSSDUG00000019738) hcfc1a (ENSSDUG00000019688) opn1sw2 (ENSSDUG00000017946) ##22 opn1sw2 (ENSSDUG00000017835) ##22 opn1sw2 (ENSSDUG00000015046) ##22 opn1lw1 (ENSSDUG00000013219) ##22 gnl3l (ENSSDUG00000013117) tfe3b (ENSSDUG00000013054) cxxc1b (ENSSDUG00000013022) mbd1b (ENSSDUG00000012996) ccdc120b (ENSSDUG00000012978) SRPK3 (ENSSDUG00000012949) comtb (ENSSDUG00000012936) grm6b (ENSSDUG00000012908) traip (ENSSDUG00000012887) mon1a (ENSSDUG00000012873) MST1R (ENSSDUG00000012803) camkvb (ENSSDUG00000012707) SEMA3F (ENSSDUG00000012565) Barramundi perch MODERN SPECIES 93 myh7ba (ENSLCAG00010019690) snai1a (ENSLCAG00010019688) GGT7 (ENSLCAG00010019687) ENSLCAG00010019685 top1a (ENSLCAG00010019460) ENSLCAG00010019417 fam83d (ENSLCAG00010019414) MAFB (ENSLCAG00010019413) ENSLCAG00010019399 ENSLCAG00010019393 adnpa (ENSLCAG00010019391) BCL2L1 (ENSLCAG00010019389) gata1a (ENSLCAG00010019384) si:dkey-13a21.4 (ENSLCAG00010019380) opn1sw2 (ENSLCAG00010019363) ##22 opn1sw2 (ENSLCAG00010019332) ##22 opn1sw2 (ENSLCAG00010019314) ##22 opn1lw1 (ENSLCAG00010019185) ##22 gnl3l (ENSLCAG00010019117) tfe3b (ENSLCAG00010018845) cxxc1b (ENSLCAG00010018774) mbd1b (ENSLCAG00010018764) ccdc120b (ENSLCAG00010018757) SRPK3 (ENSLCAG00010018737) comtb (ENSLCAG00010018721) grm6b (ENSLCAG00010018700) traip (ENSLCAG00010018680) mon1a (ENSLCAG00010018669) ENSLCAG00010018663 camkvb (ENSLCAG00010018655) SEMA3F (ENSLCAG00010018634) Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000160318.c.b ENSGT00940000154681.b.d ENSGT00980000199461 ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000156703.e.a Tiger tail seahorse DUPLICATION Tiger tail seahorse DUPLICATION Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 280 ndrg3a (ENSHCOG00000003247) ENSHCOG00000003293 trpc4apa (ENSHCOG00000003326) ENSHCOG00000003377 ENSHCOG00000003397 snai1a (ENSHCOG00000003407) ENSHCOG00000000102 top1a (ENSHCOG00000003669) ENSHCOG00000003720 fam83d (ENSHCOG00000003731) MAFB (ENSHCOG00000003739) adnpa (ENSHCOG00000003771) ENSHCOG00000003780 gata1a (ENSHCOG00000003808) HCFC1 (ENSHCOG00000003837) opn1sw2 (ENSHCOG00000005841) ##22 opn1sw2 (ENSHCOG00000006937) ##22 opn1sw2 (ENSHCOG00000007007) ##22 ENSHCOG00000008361 ##22 ENSHCOG00000009761 ##22 gnl3l (ENSHCOG00000009877) tfe3b (ENSHCOG00000009907) cxxc1b (ENSHCOG00000009945) mbd1b (ENSHCOG00000009952) ccdc120b (ENSHCOG00000000314) SRPK3 (ENSHCOG00000009982) comtb (ENSHCOG00000010157) grm6b (ENSHCOG00000010199) traip (ENSHCOG00000010255) mon1a (ENSHCOG00000010263) ENSHCOG00000010321 Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 280 ENSHCOG00000003293 trpc4apa (ENSHCOG00000003326) ENSHCOG00000003377 ENSHCOG00000003397 snai1a (ENSHCOG00000003407) ENSHCOG00000000102 top1a (ENSHCOG00000003669) ENSHCOG00000003720 fam83d (ENSHCOG00000003731) MAFB (ENSHCOG00000003739) adnpa (ENSHCOG00000003771) ENSHCOG00000003780 gata1a (ENSHCOG00000003808) HCFC1 (ENSHCOG00000003837) opn1sw2 (ENSHCOG00000005841) ##22 opn1sw2 (ENSHCOG00000006937) ##22 opn1sw2 (ENSHCOG00000007007) ##22 ENSHCOG00000008361 ##22 ENSHCOG00000009761 ##22 gnl3l (ENSHCOG00000009877) tfe3b (ENSHCOG00000009907) cxxc1b (ENSHCOG00000009945) mbd1b (ENSHCOG00000009952) ccdc120b (ENSHCOG00000000314) SRPK3 (ENSHCOG00000009982) comtb (ENSHCOG00000010157) grm6b (ENSHCOG00000010199) traip (ENSHCOG00000010255) mon1a (ENSHCOG00000010263) ENSHCOG00000010321 camkvb (ENSHCOG00000010400) Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 280 trpc4apa (ENSHCOG00000003326) ENSHCOG00000003377 ENSHCOG00000003397 snai1a (ENSHCOG00000003407) ENSHCOG00000000102 top1a (ENSHCOG00000003669) ENSHCOG00000003720 fam83d (ENSHCOG00000003731) MAFB (ENSHCOG00000003739) adnpa (ENSHCOG00000003771) ENSHCOG00000003780 gata1a (ENSHCOG00000003808) HCFC1 (ENSHCOG00000003837) opn1sw2 (ENSHCOG00000005841) ##22 opn1sw2 (ENSHCOG00000006937) ##22 opn1sw2 (ENSHCOG00000007007) ##22 ENSHCOG00000008361 ##22 ENSHCOG00000009761 ##22 gnl3l (ENSHCOG00000009877) tfe3b (ENSHCOG00000009907) cxxc1b (ENSHCOG00000009945) mbd1b (ENSHCOG00000009952) ccdc120b (ENSHCOG00000000314) SRPK3 (ENSHCOG00000009982) comtb (ENSHCOG00000010157) grm6b (ENSHCOG00000010199) traip (ENSHCOG00000010255) mon1a (ENSHCOG00000010263) ENSHCOG00000010321 camkvb (ENSHCOG00000010400) SEMA3F (ENSHCOG00000010442) Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00980000199461 ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.b ##22 ENSGT00940000166196 ENSGT00940000161383.d.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000181969 ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000154681.b.d ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.b ##22 ENSGT00940000166196 ENSGT00940000161383.d.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000181969 ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000018330 ENSGT00940000160318.c.b ENSGT00940000154681.b.d ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000161383.d.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.b ##22 ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000018330 ENSGT00940000160318.c.b ENSGT00940000154681.b.d ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000161383.d.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000156703.e.a Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000018330 ENSGT00940000160318.c.b ENSGT00940000154681.b.d ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000161383.d.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000156703.e.a Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000018330 ENSGT00940000160318.c.b ENSGT00940000154681.b.d ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000161383.d.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000156703.e.a Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000018330 ENSGT00940000160318.c.b ENSGT00940000154681.b.d ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000161383.d.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000156703.e.a Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018330 ENSGT00940000160318.c.b ENSGT00940000154681.b.d ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000161383.d.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000179368 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018330 ENSGT00940000160318.c.b ENSGT00940000154681.b.d ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000161383.d.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000179368 Eastern happy MODERN SPECIES 17 ndrg3a (ENSACLG00000020577) ENSACLG00000020665 trpc4apa (ENSACLG00000020695) myh7ba (ENSACLG00000020780) snai1a (ENSACLG00000020860) ENSACLG00000020873 ENSACLG00000020905 top1a (ENSACLG00000020954) ENSACLG00000021023 fam83d (ENSACLG00000021027) ENSACLG00000021036 adnpa (ENSACLG00000021065) gata1a (ENSACLG00000021090) si:dkey-13a21.4 (ENSACLG00000021109) ENSACLG00000021128 opn1sw2 (ENSACLG00000021147) ##22 opn1sw2 (ENSACLG00000021193) ##22 opn1lw1 (ENSACLG00000021226) ##22 gnl3l (ENSACLG00000021244) tfe3b (ENSACLG00000021271) cxxc1b (ENSACLG00000021315) mbd1b (ENSACLG00000021383) ENSACLG00000021406 ccdc120b (ENSACLG00000021415) SRPK3 (ENSACLG00000021452) comtb (ENSACLG00000021475) grm6b (ENSACLG00000021488) traip (ENSACLG00000021544) mon1a (ENSACLG00000021606) ENSACLG00000021639 camkvb (ENSACLG00000021669) Zebra mbuna MODERN SPECIES 1108 trpc4apa (ENSMZEG00005009964) myh7ba (ENSMZEG00005009993) snai1a (ENSMZEG00005010038) ENSMZEG00005010045 ENSMZEG00005010062 top1a (ENSMZEG00005010072) ENSMZEG00005010126 fam83d (ENSMZEG00005010134) MAFB (ENSMZEG00005010140) ENSMZEG00005010154 adnpa (ENSMZEG00005010188) ENSMZEG00005010193 gata1a (ENSMZEG00005010202) si:dkey-13a21.4 (ENSMZEG00005010220) ENSMZEG00005010225 opn1sw2 (ENSMZEG00005010240) ##22 opn1sw2 (ENSMZEG00005010258) ##22 opn1lw1 (ENSMZEG00005010329) ##22 gnl3l (ENSMZEG00005010346) tfe3b (ENSMZEG00005010367) cxxc1b (ENSMZEG00005010397) mbd1b (ENSMZEG00005010421) ccdc120b (ENSMZEG00005010446) SRPK3 (ENSMZEG00005010462) comtb (ENSMZEG00005010499) grm6b (ENSMZEG00005010508) traip (ENSMZEG00005010532) mon1a (ENSMZEG00005010548) ENSMZEG00005010556 camkvb (ENSMZEG00005010584) ENSMZEG00005010650 P. nyererei MODERN SPECIES 473 myh7ba (ENSPNYG00000018959) snai1a (ENSPNYG00000018944) ENSPNYG00000018904 ENSPNYG00000018819 top1a (ENSPNYG00000018784) ENSPNYG00000018777 fam83d (ENSPNYG00000018750) MAFB (ENSPNYG00000018735) ENSPNYG00000018683 adnpa (ENSPNYG00000018659) ENSPNYG00000018650 gata1a (ENSPNYG00000018638) ENSPNYG00000018625 si:dkey-13a21.4 (ENSPNYG00000018613) ENSPNYG00000018593 opn1sw2 (ENSPNYG00000018575) ##22 opn1sw2 (ENSPNYG00000018558) ##22 opn1lw1 (ENSPNYG00000017356) ##22 gnl3l (ENSPNYG00000017256) tfe3b (ENSPNYG00000017235) Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 279 trpc4apa (ENSHBUG00000013367) myh7ba (ENSHBUG00000013480) snai1a (ENSHBUG00000013491) ENSHBUG00000013554 ENSHBUG00000000973 top1a (ENSHBUG00000013826) ENSHBUG00000013843 fam83d (ENSHBUG00000013851) MAFB (ENSHBUG00000013860) ENSHBUG00000013980 adnpa (ENSHBUG00000014001) ENSHBUG00000013989 gata1a (ENSHBUG00000014016) si:dkey-13a21.4 (ENSHBUG00000014023) hcfc1a (ENSHBUG00000014047) opn1sw2 (ENSHBUG00000014102) ##22 opn1sw2 (ENSHBUG00000014119) ##22 opn1lw1 (ENSHBUG00000014159) ##22 gnl3l (ENSHBUG00000014227) tfe3b (ENSHBUG00000014246) cxxc1b (ENSHBUG00000014254) mbd1b (ENSHBUG00000014270) ccdc120b (ENSHBUG00000014281) SRPK3 (ENSHBUG00000014340) comtb (ENSHBUG00000014357) grm6b (ENSHBUG00000014416) traip (ENSHBUG00000014431) mon1a (ENSHBUG00000014446) ENSHBUG00000014460 camkvb (ENSHBUG00000014473) SEMA3F (ENSHBUG00000014574) Lyretail cichlid MODERN SPECIES 296 SLA2 (ENSNBRG00000023001) trpc4apa (ENSNBRG00000023021) myh7ba (ENSNBRG00000023051) snai1a (ENSNBRG00000023091) ENSNBRG00000023107 top1a (ENSNBRG00000023138) ENSNBRG00000023151 fam83d (ENSNBRG00000023160) ENSNBRG00000023169 MAFB (ENSNBRG00000023180) adnpa (ENSNBRG00000023187) ENSNBRG00000023195 gata1a (ENSNBRG00000023206) si:dkey-13a21.4 (ENSNBRG00000023214) ENSNBRG00000023227 opn1sw2 (ENSNBRG00000023236) ##22 opn1sw2 (ENSNBRG00000023247) ##22 opn1lw1 (ENSNBRG00000023323) ##22 gnl3l (ENSNBRG00000023334) tfe3b (ENSNBRG00000023362) cxxc1b (ENSNBRG00000023408) ccdc120b (ENSNBRG00000023464) ENSNBRG00000023479 comtb (ENSNBRG00000023483) grm6b (ENSNBRG00000023489) traip (ENSNBRG00000023496) ENSNBRG00000023505 camkvb (ENSNBRG00000023513) SEMA3F (ENSNBRG00000023532) arl8bb (ENSNBRG00000023542) ENSNBRG00000023549 Nile tilapia MODERN SPECIES 17 myh7ba (ENSONIG00000020306) snai1a (ENSONIG00000031723) ENSONIG00000020304 ENSONIG00000033933 ENSONIG00000035826 top1a (ENSONIG00000020303) ENSONIG00000035626 fam83d (ENSONIG00000020301) MAFB (ENSONIG00000020811) ENSONIG00000020300 ENSONIG00000028248 ENSONIG00000020298 gata1a (ENSONIG00000020297) si:dkey-13a21.4 (ENSONIG00000020296) hcfc1a (ENSONIG00000020295) opn1sw2 (ENSONIG00000020294) ##22 opn1sw2 (ENSONIG00000020293) ##22 opn1lw1 (ENSONIG00000020292) ##22 gnl3l (ENSONIG00000029260) tfe3b (ENSONIG00000020291) cxxc1b (ENSONIG00000020290) ccdc120b (ENSONIG00000020288) SRPK3 (ENSONIG00000020287) comtb (ENSONIG00000020286) grm6b (ENSONIG00000020285) traip (ENSONIG00000020284) mon1a (ENSONIG00000020283) ENSONIG00000020282 camkvb (ENSONIG00000036268) SEMA3F (ENSONIG00000020280) ENSONIG00000028560 Midas cichlid MODERN SPECIES 1043 ENSACIG00000011644 trpc4apa (ENSACIG00000011610) ENSACIG00000011366 snai1a (ENSACIG00000011318) ENSACIG00000011285 top1a (ENSACIG00000011152) ENSACIG00000011131 fam83d (ENSACIG00000011115) MAFB (ENSACIG00000011110) ENSACIG00000011089 adnpa (ENSACIG00000011073) ENSACIG00000011059 gata1a (ENSACIG00000011048) si:dkey-13a21.4 (ENSACIG00000011024) ENSACIG00000011009 opn1sw2 (ENSACIG00000010993) ##22 opn1sw2 (ENSACIG00000010980) ##22 opn1lw1 (ENSACIG00000010960) ##22 gnl3l (ENSACIG00000010900) tfe3b (ENSACIG00000010840) cxxc1b (ENSACIG00000010624) mbd1b (ENSACIG00000010590) ccdc120b (ENSACIG00000010542) SRPK3 (ENSACIG00000010338) comtb (ENSACIG00000010204) grm6b (ENSACIG00000010172) traip (ENSACIG00000010020) mon1a (ENSACIG00000009986) MST1R (ENSACIG00000009876) camkvb (ENSACIG00000009801) SEMA3F (ENSACIG00000009744) Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000160318.c.b ENSGT00940000154681.b.d ENSGT00980000199461 ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.a ##22 ENSGT00940000161383.d.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000181969 ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 Eupercaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018330 ENSGT00940000160318.c.b ENSGT00940000154681.b.d ENSGT00980000199461 ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.a ##22 ENSGT00940000166196 ENSGT00940000161383.d.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000181969 ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018330 ENSGT00940000160318.c.b ENSGT00940000154681.b.d ENSGT00980000199461 ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.a ##22 ENSGT00940000166196 ENSGT00940000161383.d.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000181969 ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000160318.c.b ENSGT00940000154681.b.d ENSGT00980000199461 ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000181969 ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f Perciformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000160318.c.b ENSGT00940000154681.b.d ENSGT00980000199461 ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000181969 ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000160318.c.b ENSGT00940000154681.b.d ENSGT00980000199461 ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00730000111044 ENSGT00940000159563 ENSGT00990000203541.b ENSGT01030000234637.b.c.g ENSGT00940000160502 ENSGT00940000167532 ENSGT00940000154102.b.a.b ENSGT00950000182955.a.b.a ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.b ##24 ENSGT00940000157877.b.g ENSGT00390000012692 Channel bull blenny MODERN SPECIES 19 trpc4apa (ENSCGOG00000002360) myh7ba (ENSCGOG00000002037) snai1a (ENSCGOG00000002015) ENSCGOG00000002001 ENSCGOG00000001997 top1a (ENSCGOG00000001478) ENSCGOG00000001439 fam83d (ENSCGOG00000001435) ENSCGOG00000001432 MAFB (ENSCGOG00000001430) adnpa (ENSCGOG00000001427) BCL2L1 (ENSCGOG00000001425) gata1a (ENSCGOG00000001418) si:dkey-13a21.4 (ENSCGOG00000001417) hcfc1a (ENSCGOG00000001124) opn1sw2 (ENSCGOG00000001101) ##22 opn1sw2 (ENSCGOG00000001089) ##22 opn1lw1 (ENSCGOG00000001051) ##22 gnl3l (ENSCGOG00000001042) tfe3b (ENSCGOG00000001023) cxxc1a (ENSCGOG00000000995) ENSCGOG00000000992 ENSCGOG00000000965 ccdc120b (ENSCGOG00000000963) SRPK3 (ENSCGOG00000000936) comtb (ENSCGOG00000000932) grm6b (ENSCGOG00000000769) traip (ENSCGOG00000000727) mon1a (ENSCGOG00000000725) ENSCGOG00000000720 camkvb (ENSCGOG00000000660) Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018330 ENSGT00940000160318.c.b ENSGT00940000154681.b.d ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000156703.e.a Gilthead seabream MODERN SPECIES 20 ENSSAUG00010012035 trpc4apa (ENSSAUG00010012056) myh7ba (ENSSAUG00010013596) snai1a (ENSSAUG00010013621) ENSSAUG00010013623 ENSSAUG00010013624 top1a (ENSSAUG00010013632) ENSSAUG00010014343 fam83d (ENSSAUG00010014344) MAFB (ENSSAUG00010014345) ENSSAUG00010014348 BCL2L (ENSSAUG00010014353) gata1a (ENSSAUG00010014355) si:dkey-13a21.4 (ENSSAUG00010014358) hcfc1a (ENSSAUG00010014373) opn1sw2 (ENSSAUG00010014432) ##22 opn1sw2 (ENSSAUG00010014437) ##22 opn1lw1 (ENSSAUG00010014442) ##22 gnl3l (ENSSAUG00010014448) tfe3b (ENSSAUG00010014478) cxxc1b (ENSSAUG00010014492) mbd1b (ENSSAUG00010014539) ccdc120b (ENSSAUG00010014546) SRPK3 (ENSSAUG00010014567) comtb (ENSSAUG00010017170) grm6b (ENSSAUG00010017188) traip (ENSSAUG00010017395) mon1a (ENSSAUG00010017406) ENSSAUG00010017412 camkvb (ENSSAUG00010017420) SEMA3F (ENSSAUG00010017498) Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018330 ENSGT00940000160318.c.b ENSGT00940000154681.b.d ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000156703.e.a Large yellow croaker MODERN SPECIES 478 trpc4apa (ENSLCRG00005022321) myh7ba (ENSLCRG00005022334) snai1a (ENSLCRG00005022344) ENSLCRG00005022347 ENSLCRG00005022348 top1a (ENSLCRG00005022352) ENSLCRG00005022423 fam83d (ENSLCRG00005022424) MAFB (ENSLCRG00005022425) ENSLCRG00005022426 adnpa (ENSLCRG00005022428) ENSLCRG00005022429 gata1a (ENSLCRG00005022430) si:dkey-13a21.4 (ENSLCRG00005022432) hcfc1a (ENSLCRG00005022434) opn1sw2 (ENSLCRG00005022439) ##22 opn1sw2 (ENSLCRG00005022440) ##22 opn1lw1 (ENSLCRG00005022441) ##22 gnl3l (ENSLCRG00005022442) tfe3b (ENSLCRG00005022462) cxxc1b (ENSLCRG00005002269) ap5b1 (ENSLCRG00005004025) zgc:112255 (ENSLCRG00005004027) P3H1 (ENSLCRG00005004095) cldn19 (ENSLCRG00005004160) ENSLCRG00005004286 nucks1a (ENSLCRG00005004986) slc45a3 (ENSLCRG00005005000) ENSLCRG00005005013 elk4 (ENSLCRG00005005023) ENSLCRG00005005096 European seabass MODERN SPECIES 10 trpc4apa (ENSDLAG00005005884) myh7ba (ENSDLAG00005005626) SNAI (ENSDLAG00005033824) ENSDLAG00005005462 ENSDLAG00005005453 top1a (ENSDLAG00005004446) ENSDLAG00005004319 fam83d (ENSDLAG00005025742) ENSDLAG00005025739 MAFB (ENSDLAG00005029273) adnpa (ENSDLAG00005025737) ENSDLAG00005025736 gata1a (ENSDLAG00005025735) RAB7A (ENSDLAG00005031533) hcfc1a (ENSDLAG00005025731) opn1sw2 (ENSDLAG00005025729) ##22 opn1sw2 (ENSDLAG00005025726) ##22 opn1lw1 (ENSDLAG00005025724) ##22 gnl3l (ENSDLAG00005025705) tfe3b (ENSDLAG00005025703) ENSDLAG00005025682 mbd1b (ENSDLAG00005025679) ccdc120b (ENSDLAG00005025677) ENSDLAG00005025559 grm6b (ENSDLAG00005025480) traip (ENSDLAG00005025462) ENSDLAG00005025454 CAMKV (ENSDLAG00005025437) ENSDLAG00005025304 ARL8B (ENSDLAG00005034963) ENSDLAG00005025286 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000160318.c.b ENSGT00940000154681.b.d ENSGT00980000199461 ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a.n ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f Anabantaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000160318.c.b ENSGT00940000154681.b.d ENSGT00980000199461 ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a.n ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f Zig-zag eel MODERN SPECIES 19 myh7ba (ENSMAMG00000020947) snai1a (ENSMAMG00000020994) ENSMAMG00000021002 ENSMAMG00000021009 ENSMAMG00000021021 top1a (ENSMAMG00000021024) ENSMAMG00000021039 fam83d (ENSMAMG00000021041) ENSMAMG00000021043 ENSMAMG00000021047 ENSMAMG00000027960 ENSMAMG00000024557 gata1a (ENSMAMG00000021092) si:dkey-13a21.4 (ENSMAMG00000021095) hcfc1a (ENSMAMG00000021100) opn1sw2 (ENSMAMG00000026245) ##22 opn1sw2 (ENSMAMG00000021134) ##22 ENSMAMG00000022442 ##22 ENSMAMG00000022455 ##22 gnl3l (ENSMAMG00000023332) tfe3b (ENSMAMG00000023336) ENSMAMG00000023337 cxxc1b (ENSMAMG00000023339) ENSMAMG00000027411 ccdc120b (ENSMAMG00000024568) ENSMAMG00000023345 comtb (ENSMAMG00000023349) grm6b (ENSMAMG00000023356) mon1a (ENSMAMG00000023358) traip (ENSMAMG00000023357) ENSMAMG00000023360 Carangaria ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000018330 ENSGT00940000160318.c.b ENSGT00940000154681.b.d ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a.n ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000018330 ENSGT00940000160318.c.b ENSGT00940000154681.b.d ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a.n ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f Seriola ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000018330 ENSGT00940000160318.c.b ENSGT00940000154681.b.d ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a.n ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 2037 trpc4apa (ENSSLDG00000011202) myh7ba (ENSSLDG00000011295) snai1a (ENSSLDG00000011412) GGT7 (ENSSLDG00000011429) ENSSLDG00000011453 top1a (ENSSLDG00000011470) ENSSLDG00000011497 fam83d (ENSSLDG00000011509) ENSSLDG00000011521 MAFB (ENSSLDG00000011540) adnpa (ENSSLDG00000011550) BCL2L1 (ENSSLDG00000011562) gata1a (ENSSLDG00000011572) si:dkey-13a21.4 (ENSSLDG00000011597) hcfc1a (ENSSLDG00000011619) opn1sw2 (ENSSLDG00000011730) ##22 opn1sw2 (ENSSLDG00000012051) ##22 opn1sw2 (ENSSLDG00000012230) ##22 opn1lw1 (ENSSLDG00000012258) ##22 gnl3l (ENSSLDG00000012278) tfe3b (ENSSLDG00000012336) cxxc1b (ENSSLDG00000012368) mbd1b (ENSSLDG00000012422) ccdc120b (ENSSLDG00000012502) SRPK3 (ENSSLDG00000012560) comtb (ENSSLDG00000012626) Greater amberjack MODERN SPECIES 37 trpc4apa (ENSSDUG00000020023) myh7ba (ENSSDUG00000019946) snai1a (ENSSDUG00000019933) GGT7 (ENSSDUG00000019918) ENSSDUG00000019899 top1a (ENSSDUG00000019876) ENSSDUG00000019863 fam83d (ENSSDUG00000019848) MAFB (ENSSDUG00000019845) ENSSDUG00000019804 adnpa (ENSSDUG00000019791) BCL2L1 (ENSSDUG00000019783) gata1a (ENSSDUG00000019759) si:dkey-13a21.4 (ENSSDUG00000019738) hcfc1a (ENSSDUG00000019688) opn1sw2 (ENSSDUG00000017946) ##22 opn1sw2 (ENSSDUG00000017835) ##22 opn1sw2 (ENSSDUG00000015046) ##22 opn1lw1 (ENSSDUG00000013219) ##22 gnl3l (ENSSDUG00000013117) tfe3b (ENSSDUG00000013054) cxxc1b (ENSSDUG00000013022) mbd1b (ENSSDUG00000012996) ccdc120b (ENSSDUG00000012978) SRPK3 (ENSSDUG00000012949) comtb (ENSSDUG00000012936) grm6b (ENSSDUG00000012908) traip (ENSSDUG00000012887) mon1a (ENSSDUG00000012873) MST1R (ENSSDUG00000012803) camkvb (ENSSDUG00000012707) Barramundi perch MODERN SPECIES 93 trpc4apa (ENSLCAG00010019718) myh7ba (ENSLCAG00010019690) snai1a (ENSLCAG00010019688) GGT7 (ENSLCAG00010019687) ENSLCAG00010019685 top1a (ENSLCAG00010019460) ENSLCAG00010019417 fam83d (ENSLCAG00010019414) MAFB (ENSLCAG00010019413) ENSLCAG00010019399 ENSLCAG00010019393 adnpa (ENSLCAG00010019391) BCL2L1 (ENSLCAG00010019389) gata1a (ENSLCAG00010019384) si:dkey-13a21.4 (ENSLCAG00010019380) opn1sw2 (ENSLCAG00010019363) ##22 opn1sw2 (ENSLCAG00010019332) ##22 opn1sw2 (ENSLCAG00010019314) ##22 opn1lw1 (ENSLCAG00010019185) ##22 gnl3l (ENSLCAG00010019117) tfe3b (ENSLCAG00010018845) cxxc1b (ENSLCAG00010018774) mbd1b (ENSLCAG00010018764) ccdc120b (ENSLCAG00010018757) SRPK3 (ENSLCAG00010018737) comtb (ENSLCAG00010018721) grm6b (ENSLCAG00010018700) traip (ENSLCAG00010018680) mon1a (ENSLCAG00010018669) ENSLCAG00010018663 camkvb (ENSLCAG00010018655) Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 281 ENSGT00940000161383.d.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.b ##22 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000018330 ENSGT00940000160318.c.b ENSGT00940000154681.b.d ENSGT00980000199461 ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.b ##22 ENSGT00940000166196 ENSGT00940000161383.d.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000181969 ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000160331 ENSGT00390000018330 ENSGT00940000160318.c.b ENSGT00940000154681.b.d ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.b ##22 ENSGT00940000166196 ENSGT00940000161383.d.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000181969 ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000160331 ENSGT00390000018330 ENSGT00940000154681.b.d ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000181969 ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f Oryzias ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000160331 ENSGT00390000018330 ENSGT00940000154681.b.d ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000156703.e.a Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b ENSGT00940000160331 ENSGT00390000018330 ENSGT00940000154681.b.d ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.b ##22 ENSGT00940000166196 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f Chinese medaka MODERN SPECIES 655 ndrg3a (ENSOSIG00000013905) ENSOSIG00000013872 trpc4apa (ENSOSIG00000011196) snai1a (ENSOSIG00000011180) ENSOSIG00000011178 top1a (ENSOSIG00000009347) ENSOSIG00000009333 fam83d (ENSOSIG00000009332) MAFB (ENSOSIG00000009330) ENSOSIG00000009299 adnpa (ENSOSIG00000009297) BCL2L1 (ENSOSIG00000009295) gata1a (ENSOSIG00000009293) si:dkey-13a21.4 (ENSOSIG00000009290) hcfc1a (ENSOSIG00000009288) opn1sw2 (ENSOSIG00000009284) ##22 opn1sw2 (ENSOSIG00000009282) ##22 ENSOSIG00000009264 ##22 gnl3l (ENSOSIG00000008975) tfe3b (ENSOSIG00000008770) cxxc1b (ENSOSIG00000008735) ENSOSIG00000008731 ccdc120b (ENSOSIG00000008730) SRPK3 (ENSOSIG00000006352) comtb (ENSOSIG00000006338) grm6b (ENSOSIG00000006276) traip (ENSOSIG00000006266) mon1a (ENSOSIG00000006264) ENSOSIG00000006262 camkvb (ENSOSIG00000006258) tomm34 (ENSOSIG00000004563) Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 19 ENSORLG00000013828 trpc4apa (ENSORLG00000013852) snai1a (ENSORLG00000023047) ENSORLG00000024833 ENSORLG00000013875 top1a (ENSORLG00000013917) ENSORLG00000013922 fam83d (ENSORLG00000013925) ENSORLG00000013930 ENSORLG00000013948 adnpa (ENSORLG00000013954) ENSORLG00000024903 gata1a (ENSORLG00000013980) si:dkey-13a21.4 (ENSORLG00000025098) hcfc1a (ENSORLG00000014012) kfh-b (ENSORLG00000028370) ##22 ENSORLG00000014058 ##22 kfh-r (ENSORLG00000014088) ##22 gnl3l (ENSORLG00000014117) tfe3b (ENSORLG00000014134) ENSORLG00000029478 cxxc1b (ENSORLG00000014161) mbd1b (ENSORLG00000029390) ccdc120b (ENSORLG00000014183) ENSORLG00000014212 comtb (ENSORLG00000014228) grm6b (ENSORLG00000014253) traip (ENSORLG00000014261) mon1a (ENSORLG00000014273) ENSORLG00000014291 camkvb (ENSORLG00000014299) Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.b ##22 Indian medaka MODERN SPECIES 8 ENSOMEG00000023815 ndrg3a (ENSOMEG00000000639) ENSOMEG00000023796 trpc4apa (ENSOMEG00000023783) snai1a (ENSOMEG00000023773) ENSOMEG00000000745 ENSOMEG00000023760 top1a (ENSOMEG00000023745) ENSOMEG00000023740 fam83d (ENSOMEG00000023737) MAFB (ENSOMEG00000023734) ENSOMEG00000000634 adnpa (ENSOMEG00000023725) ENSOMEG00000023723 gata1a (ENSOMEG00000023720) opn1sw2 (ENSOMEG00000023716) ##22 ENSOMEG00000023708 opn1sw2 (ENSOMEG00000023704) ##22 opn1lw1 (ENSOMEG00000023693) ##22 gnl3l (ENSOMEG00000023685) tfe3b (ENSOMEG00000023677) cxxc1b (ENSOMEG00000023668) mbd1b (ENSOMEG00000023660) ccdc120b (ENSOMEG00000023649) ENSOMEG00000023641 ENSOMEG00000023630 comtb (ENSOMEG00000023614) grm6b (ENSOMEG00000023604) traip (ENSOMEG00000023576) mon1a (ENSOMEG00000023547) ENSOMEG00000023525 Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000160331 ENSGT00390000018330 ENSGT00940000154681.b.d ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000181969 ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000160331 ENSGT00390000018330 ENSGT00940000154681.b.d ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b.s ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000181969 ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 63 ENSGT00940000160331 ENSGT00390000018330 ENSGT00940000154681.b.d ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411.f ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b.s ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000156703.e.a Mummichog MODERN SPECIES 681 top1a (ENSFHEG00000002423) ENSFHEG00000002437 fam83d (ENSFHEG00000002445) MAFB (ENSFHEG00000002455) ENSFHEG00000002462 ENSFHEG00000002477 adnpa (ENSFHEG00000002485) BCL2L1 (ENSFHEG00000002488) gata1a (ENSFHEG00000002494) si:dkey-13a21.4 (ENSFHEG00000002502) HCFC1 (ENSFHEG00000002519) opn1sw2 (ENSFHEG00000002618) ##22 opn1sw2 (ENSFHEG00000002627) ##22 ENSFHEG00000002642 ##22 ENSFHEG00000002660 ##22 ENSFHEG00000002671 ENSFHEG00000003999 ##22 Sheepshead minnow MODERN SPECIES 141 SYNPR (ENSCVAG00000000606) ENSCVAG00000000611 chchd4a (ENSCVAG00000000614) SEC61A1 (ENSCVAG00000001133) ip6k2a (ENSCVAG00000001135) top1a (ENSCVAG00000001139) ENSCVAG00000001141 fam83d (ENSCVAG00000001142) MAFB (ENSCVAG00000000044) ENSCVAG00000001145 adnpa (ENSCVAG00000001146) BCL2L1 (ENSCVAG00000001147) gata1a (ENSCVAG00000001149) si:dkey-13a21.4 (ENSCVAG00000001150) hcfc1a (ENSCVAG00000001152) opn1sw2 (ENSCVAG00000000046) ##22 opn1sw2 (ENSCVAG00000001155) ##22 ENSCVAG00000001006 ##22 ENSCVAG00000001157 ##22 ENSCVAG00000001159 ##22 gnl3l (ENSCVAG00000001161) tfe3b (ENSCVAG00000001163) cxxc1b (ENSCVAG00000001165) mbd1b (ENSCVAG00000001167) ccdc120b (ENSCVAG00000001169) SRPK3 (ENSCVAG00000001172) comtb (ENSCVAG00000001175) grm6b (ENSCVAG00000001176) traip (ENSCVAG00000001182) mon1a (ENSCVAG00000001185) ENSCVAG00000001188 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b ENSGT00940000160331 ENSGT00390000018330 ENSGT00940000154681.b.d ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b.s.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b.s.a ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000181969 ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b Poecilia ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000160331 ENSGT00390000018330 ENSGT00940000154681.b.d ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b.s.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b.s.a ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00940000165164.b.j ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b Guppy MODERN SPECIES 457 ndrg3a (ENSPREG00000022358) ENSPREG00000022344 trpc4apa (ENSPREG00000022319) snai1a (ENSPREG00000022303) ENSPREG00000022295 top1a (ENSPREG00000022283) ENSPREG00000022277 fam83d (ENSPREG00000022272) MAFB (ENSPREG00000022267) ENSPREG00000022260 adnpa (ENSPREG00000022255) BCL2L1 (ENSPREG00000022250) gata1a (ENSPREG00000022245) si:dkey-13a21.4 (ENSPREG00000022241) hcfc1a (ENSPREG00000022223) opn1sw2 (ENSPREG00000022208) ##22 opn1sw2 (ENSPREG00000022188) ##22 ENSPREG00000022153 ##22 ENSPREG00000022087 ##22 ENSPREG00000022016 ##22 gnl3l (ENSPREG00000021994) tfe3b (ENSPREG00000021875) cxxc1b (ENSPREG00000021824) mbd1b (ENSPREG00000021805) ccdc120b (ENSPREG00000021798) SRPK3 (ENSPREG00000021760) comtb (ENSPREG00000021730) grm6b (ENSPREG00000021714) traip (ENSPREG00000021665) ENSPREG00000021636 mon1a (ENSPREG00000021632) NAME_6 ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.b ##22 Sailfin molly MODERN SPECIES 1687 ENSPLAG00000019502 top1a (ENSPLAG00000019552) ENSPLAG00000019571 fam83d (ENSPLAG00000019577) MAFB (ENSPLAG00000019581) ENSPLAG00000019649 adnpa (ENSPLAG00000019660) BCL2L1 (ENSPLAG00000019679) gata1a (ENSPLAG00000019685) si:dkey-13a21.4 (ENSPLAG00000019688) hcfc1a (ENSPLAG00000019703) opn1sw2 (ENSPLAG00000019745) ##22 opn1sw2 (ENSPLAG00000019768) ##22 Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 76 ENSGT00940000160331 ENSGT00390000018330 ENSGT00940000154681.b.d ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000161383.d.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.b ##22 ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f Turquoise killifish MODERN SPECIES 1619 ARHGAP39 (ENSNFUG00015015660) PHF20A (ENSNFUG00015015596) ENSNFUG00015015589 ENSNFUG00015015578 snai1a (ENSNFUG00015015574) ENSNFUG00015015511 ENSNFUG00015015492 TOP1L (ENSNFUG00015015254) FAM83D (ENSNFUG00015015187) MAFBB (ENSNFUG00015015180) adnpa (ENSNFUG00015015148) BCL2L1 (ENSNFUG00015015141) GATA1A (ENSNFUG00015015117) si:dkey-13a21.4 (ENSNFUG00015015097) HCFC1 (ENSNFUG00015014937) opn1sw2 (ENSNFUG00015014885) ##22 opn1sw2 (ENSNFUG00015014824) ##22 ENSNFUG00015014685 ##22 Nfu_g_1_021486 (ENSNFUG00015014616) ##22 GNL3L (ENSNFUG00015014553) tfe3b (ENSNFUG00015014314) CXXC1 (ENSNFUG00015014008) ENSNFUG00015013989 CCDC120 (ENSNFUG00015013984) SRPK3 (ENSNFUG00015013920) COMTB (ENSNFUG00015013912) grm6b (ENSNFUG00015013210) TRAIP (ENSNFUG00015013172) MON1A (ENSNFUG00015013166) ENSNFUG00015013156 ITGA5 (ENSNFUG00015013119) Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.a ##22 ENSGT00940000161383.d.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000181969 ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.b ##22 Carangaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.b ##22 Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000018330 ENSGT00940000160318.c.b ENSGT00940000154681.b.d ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a.n ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000156703.e.a Turbot MODERN SPECIES 18 trpc4apa (ENSSMAG00000013512) myh7ba (ENSSMAG00000013574) snai1a (ENSSMAG00000013652) ENSSMAG00000013670 ENSSMAG00000013722 top1a (ENSSMAG00000013729) ENSSMAG00000026820 fam83d (ENSSMAG00000013878) ENSSMAG00000013891 ENSSMAG00000013903 ENSSMAG00000013917 ENSSMAG00000028451 gata1a (ENSSMAG00000013930) si:dkey-13a21.4 (ENSSMAG00000013945) hcfc1a (ENSSMAG00000013953) opn1sw2 (ENSSMAG00000014006) ##22 opn1sw2 (ENSSMAG00000014457) ##22 opn1lw1 (ENSSMAG00000014476) ##22 gnl3l (ENSSMAG00000014518) tfe3b (ENSSMAG00000014563) cxxc1b (ENSSMAG00000014604) mbd1b (ENSSMAG00000014640) ccdc120b (ENSSMAG00000014764) ENSSMAG00000014783 comtb (ENSSMAG00000014805) grm6b (ENSSMAG00000014847) traip (ENSSMAG00000014911) mon1a (ENSSMAG00000014977) ENSSMAG00000014995 camkvb (ENSSMAG00000015020) ENSSMAG00000015037 Tongue sole MODERN SPECIES 2 igsf8 (ENSCSEG00000010672) soat2 (ENSCSEG00000010682) KIF5A (ENSCSEG00000010724) dctn2 (ENSCSEG00000010766) ddit3 (ENSCSEG00000010799) mars1 (ENSCSEG00000010816) ARHGAP9 (ENSCSEG00000010868) ENSCSEG00000010889 gli1 (ENSCSEG00000010901) INHBC (ENSCSEG00000010908) R3HDM2 (ENSCSEG00000010925) STAC3 (ENSCSEG00000011014) NXPH4 (ENSCSEG00000011029) shmt2 (ENSCSEG00000011047) hcfc1a (ENSCSEG00000011118) opn1sw2 (ENSCSEG00000011138) ##22 KCNK15 (ENSCSEG00000011149) ubap2a (ENSCSEG00000011158) dido1 (ENSCSEG00000011175) gnl3l (ENSCSEG00000011209) opn1lw1 (ENSCSEG00000011345) ##22 dcaf12 (ENSCSEG00000012439) ubap1 (ENSCSEG00000012455) ube2r2 (ENSCSEG00000012472) nudt2 (ENSCSEG00000012479) rfesd (ENSCSEG00000012484) ENSCSEG00000012505 ell2 (ENSCSEG00000012516) ENSCSEG00000012527 pcsk1 (ENSCSEG00000012536) ENSCSEG00000012578 Eupercaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.a ##22 ENSGT00940000166196 ENSGT00940000161383.d.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000181969 ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.a ##22 ENSGT00940000166196 ENSGT00940000161383.d.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000181969 ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 111 ENSGT00940000161383.d.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.b ##22 Perciformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154681.b.d ENSGT00980000199461 ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000181969 ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f Cottioidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154681.b.d ENSGT00980000199461 ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000161383.d.a ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000181969 ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f Lumpfish MODERN SPECIES 20 trpc4apa (ENSCLMG00005013282) myh7ba (ENSCLMG00005013269) snai1a (ENSCLMG00005013267) ENSCLMG00005013266 ENSCLMG00005013265 top1a (ENSCLMG00005013136) ENSCLMG00005013131 fam83d (ENSCLMG00005013129) MAFB (ENSCLMG00005013128) ENSCLMG00005013112 ENSCLMG00005013109 BCL2L1 (ENSCLMG00005013107) gata1a (ENSCLMG00005013105) si:dkey-13a21.4 (ENSCLMG00005013104) HCFC1 (ENSCLMG00005012898) opn1sw2 (ENSCLMG00005012893) ##22 opn1sw2 (ENSCLMG00005012891) ##22 opn1lw1 (ENSCLMG00005012888) ##22 gnl3l (ENSCLMG00005012879) tfe3b (ENSCLMG00005012790) ENSCLMG00005012788 cxxc1b (ENSCLMG00005012498) ENSCLMG00005012492 ccdc120b (ENSCLMG00005012490) ENSCLMG00005012489 ENSCLMG00005012487 SRPK3 (ENSCLMG00005012486) comtb (ENSCLMG00005012436) grm6b (ENSCLMG00005012426) traip (ENSCLMG00005012422) mon1a (ENSCLMG00005012421) Stickleback MODERN SPECIES 17 PHF20 (ENSGACG00000010085) ndrg3a (ENSGACG00000010090) trpc4apa (ENSGACG00000010137) snai1a (ENSGACG00000010147) ENSGACG00000010154 ENSGACG00000010157 ENSGACG00000010167 top1a (ENSGACG00000010175) fam83d (ENSGACG00000010183) MAFB (ENSGACG00000010185) ENSGACG00000010189 adnpa (ENSGACG00000010194) BCL2L1 (ENSGACG00000010199) gata1a (ENSGACG00000010218) hcfc1a (ENSGACG00000010222) opn1sw2 (ENSGACG00000010229) ##22 opn1lw1 (ENSGACG00000010287) ##22 gnl3l (ENSGACG00000010320) tfe3b (ENSGACG00000010355) cav4a (ENSGACG00000010378) ENSGACG00000010382 ENSGACG00000010387 rrp9 (ENSGACG00000010391) grm2b (ENSGACG00000010427) TEX264 (ENSGACG00000010452) ENSGACG00000010455 BRK1 (ENSGACG00000010458) rbm5 (ENSGACG00000010469) SLC38A3 (ENSGACG00000010478) gnai2b (ENSGACG00000010512) inka1b (ENSGACG00000010537) Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.b ##22 Channel bull blenny MODERN SPECIES 19 myh7ba (ENSCGOG00000002037) snai1a (ENSCGOG00000002015) ENSCGOG00000002001 ENSCGOG00000001997 top1a (ENSCGOG00000001478) ENSCGOG00000001439 fam83d (ENSCGOG00000001435) ENSCGOG00000001432 MAFB (ENSCGOG00000001430) adnpa (ENSCGOG00000001427) BCL2L1 (ENSCGOG00000001425) gata1a (ENSCGOG00000001418) si:dkey-13a21.4 (ENSCGOG00000001417) hcfc1a (ENSCGOG00000001124) opn1sw2 (ENSCGOG00000001101) ##22 opn1sw2 (ENSCGOG00000001089) ##22 opn1lw1 (ENSCGOG00000001051) ##22 gnl3l (ENSCGOG00000001042) tfe3b (ENSCGOG00000001023) cxxc1a (ENSCGOG00000000995) ENSCGOG00000000992 ENSCGOG00000000965 ccdc120b (ENSCGOG00000000963) SRPK3 (ENSCGOG00000000936) comtb (ENSCGOG00000000932) grm6b (ENSCGOG00000000769) traip (ENSCGOG00000000727) mon1a (ENSCGOG00000000725) ENSCGOG00000000720 camkvb (ENSCGOG00000000660) SEMA3F (ENSCGOG00000000535) Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 19 myh7ba (ENSMMDG00005006989) snai1a (ENSMMDG00005007012) ENSMMDG00005007015 ENSMMDG00005007017 ENSMMDG00005007023 top1a (ENSMMDG00005007045) ZHX3 (ENSMMDG00005007888) fam83d (ENSMMDG00005007889) MAFB (ENSMMDG00005007892) ENSMMDG00005007895 adnpa (ENSMMDG00005007898) BCL2L1 (ENSMMDG00005007904) gata1a (ENSMMDG00005007905) si:dkey-13a21.4 (ENSMMDG00005007907) hcfc1a (ENSMMDG00005007918) opn1sw2 (ENSMMDG00005007982) ##22 opn1sw2 (ENSMMDG00005008017) ##22 opn1lw1 (ENSMMDG00005008024) ##22 gnl3l (ENSMMDG00005008026) tfe3b (ENSMMDG00005008031) cxxc1b (ENSMMDG00005008061) mbd1b (ENSMMDG00005008899) ccdc120b (ENSMMDG00005008902) SRPK3 (ENSMMDG00005008906) comtb (ENSMMDG00005008931) grm6b (ENSMMDG00005008936) traip (ENSMMDG00005008941) mon1a (ENSMMDG00005008952) ENSMMDG00005008960 camkvb (ENSMMDG00005008983) SEMA3F (ENSMMDG00005008991) Cod MODERN SPECIES 4 ENSGMOG00000017663 trpc4apa (ENSGMOG00000017782) myh7ba (ENSGMOG00000028291) snai1a (ENSGMOG00000017815) ENSGMOG00000017837 top1a (ENSGMOG00000017862) ENSGMOG00000017894 fam83d (ENSGMOG00000025512) ENSGMOG00000033843 ENSGMOG00000017945 adnpa (ENSGMOG00000036285) ENSGMOG00000025656 gata1a (ENSGMOG00000029187) si:dkey-13a21.4 (ENSGMOG00000024459) ENSGMOG00000018011 opn1sw2 (ENSGMOG00000018045) ##22 opn1sw2 (ENSGMOG00000018054) ##22 gnl3l (ENSGMOG00000018085) tfe3b (ENSGMOG00000018115) cxxc1b (ENSGMOG00000002734) ENSGMOG00000036759 ccdc120b (ENSGMOG00000029914) ENSGMOG00000002647 ENSGMOG00000011937 ENSGMOG00000020337 ENSGMOG00000002636 grm6b (ENSGMOG00000002607) traip (ENSGMOG00000002576) mon1a (ENSGMOG00000024519) ENSGMOG00000032890 camkvb (ENSGMOG00000002479) Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 42 ENSGT00980000199461 ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000161383.d.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c ##22 ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000154861.n.a Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000154681.b.d ENSGT00980000199461 ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000154861.n.a Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000154681.b.d ENSGT00980000199461 ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000154861.n.a Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.b ##22 ENSGT00940000166196 ENSGT00940000161383.d.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000181969 ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000156703.e.a Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.b ##22 ENSGT00940000166196 ENSGT00940000161383.d.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000181969 ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000156703.e.a Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000018330 ENSGT00940000154681.b.d ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000181969 ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000156703.e.a Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000018330 ENSGT00940000154681.b.d ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000181969 ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000156703.e.a Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 76 ENSGT00940000154681.b.d ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000161383.d.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.b ##22 ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000154861.n.a Turquoise killifish MODERN SPECIES 1619 PHF20A (ENSNFUG00015015596) ENSNFUG00015015589 ENSNFUG00015015578 snai1a (ENSNFUG00015015574) ENSNFUG00015015511 ENSNFUG00015015492 TOP1L (ENSNFUG00015015254) FAM83D (ENSNFUG00015015187) MAFBB (ENSNFUG00015015180) adnpa (ENSNFUG00015015148) BCL2L1 (ENSNFUG00015015141) GATA1A (ENSNFUG00015015117) si:dkey-13a21.4 (ENSNFUG00015015097) HCFC1 (ENSNFUG00015014937) opn1sw2 (ENSNFUG00015014885) ##22 opn1sw2 (ENSNFUG00015014824) ##22 ENSNFUG00015014685 ##22 Nfu_g_1_021486 (ENSNFUG00015014616) ##22 GNL3L (ENSNFUG00015014553) tfe3b (ENSNFUG00015014314) CXXC1 (ENSNFUG00015014008) ENSNFUG00015013989 CCDC120 (ENSNFUG00015013984) SRPK3 (ENSNFUG00015013920) COMTB (ENSNFUG00015013912) grm6b (ENSNFUG00015013210) TRAIP (ENSNFUG00015013172) MON1A (ENSNFUG00015013166) ENSNFUG00015013156 ITGA5 (ENSNFUG00015013119) BIN2B (ENSNFUG00015013099) Mangrove rivulus MODERN SPECIES 139 ENSKMAG00000021276 trpc4apa (ENSKMAG00000021251) snai1a (ENSKMAG00000021206) ENSKMAG00000021175 ENSKMAG00000021153 top1a (ENSKMAG00000021133) ENSKMAG00000021125 fam83d (ENSKMAG00000021120) MAFB (ENSKMAG00000021111) ENSKMAG00000021087 adnpa (ENSKMAG00000021072) BCL2L1 (ENSKMAG00000021065) gata1a (ENSKMAG00000021051) si:dkey-13a21.4 (ENSKMAG00000021039) hcfc1a (ENSKMAG00000020984) opn1sw2 (ENSKMAG00000020951) ##22 opn1lw1 (ENSKMAG00000020908) ##22 gnl3l (ENSKMAG00000020874) tfe3b (ENSKMAG00000020858) ENSKMAG00000020845 cxxc1b (ENSKMAG00000020802) mbd1b (ENSKMAG00000020760) ccdc120b (ENSKMAG00000020721) SRPK3 (ENSKMAG00000020698) ENSKMAG00000020685 comtb (ENSKMAG00000020662) grm6b (ENSKMAG00000020636) traip (ENSKMAG00000020606) mon1a (ENSKMAG00000020581) ENSKMAG00000020521 camkvb (ENSKMAG00000020494) Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000018330 ENSGT00940000154681.b.d ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b.s ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000181969 ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000156703.e.a NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 63 ENSGT00390000018330 ENSGT00940000154681.b.d ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411.f ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b.s ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000154861.n.a Mummichog MODERN SPECIES 681 top1a (ENSFHEG00000002423) ENSFHEG00000002437 fam83d (ENSFHEG00000002445) MAFB (ENSFHEG00000002455) ENSFHEG00000002462 ENSFHEG00000002477 adnpa (ENSFHEG00000002485) BCL2L1 (ENSFHEG00000002488) gata1a (ENSFHEG00000002494) si:dkey-13a21.4 (ENSFHEG00000002502) HCFC1 (ENSFHEG00000002519) opn1sw2 (ENSFHEG00000002618) ##22 opn1sw2 (ENSFHEG00000002627) ##22 ENSFHEG00000002642 ##22 ENSFHEG00000002660 ##22 ENSFHEG00000002671 ENSFHEG00000003999 ##22 Sheepshead minnow MODERN SPECIES 141 ENSCVAG00000000611 chchd4a (ENSCVAG00000000614) SEC61A1 (ENSCVAG00000001133) ip6k2a (ENSCVAG00000001135) top1a (ENSCVAG00000001139) ENSCVAG00000001141 fam83d (ENSCVAG00000001142) MAFB (ENSCVAG00000000044) ENSCVAG00000001145 adnpa (ENSCVAG00000001146) BCL2L1 (ENSCVAG00000001147) gata1a (ENSCVAG00000001149) si:dkey-13a21.4 (ENSCVAG00000001150) hcfc1a (ENSCVAG00000001152) opn1sw2 (ENSCVAG00000000046) ##22 opn1sw2 (ENSCVAG00000001155) ##22 ENSCVAG00000001006 ##22 ENSCVAG00000001157 ##22 ENSCVAG00000001159 ##22 gnl3l (ENSCVAG00000001161) tfe3b (ENSCVAG00000001163) cxxc1b (ENSCVAG00000001165) mbd1b (ENSCVAG00000001167) ccdc120b (ENSCVAG00000001169) SRPK3 (ENSCVAG00000001172) comtb (ENSCVAG00000001175) grm6b (ENSCVAG00000001176) traip (ENSCVAG00000001182) mon1a (ENSCVAG00000001185) ENSCVAG00000001188 camkvb (ENSCVAG00000001192) Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000160331 ENSGT00390000018330 ENSGT00940000154681.b.d ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b.s.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b.s.a ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000181969 ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f Poecilia ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00390000018330 ENSGT00940000154681.b.d ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b.s.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b.s.a ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00940000165164.b.j ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 87 ENSGT00940000160331 ENSGT00390000018330 ENSGT00940000154681.b.d ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 Amazon molly MODERN SPECIES 431 ndrg3a (ENSPFOG00000015809) ENSPFOG00000015788 trpc4apa (ENSPFOG00000015720) snai1a (ENSPFOG00000015709) ENSPFOG00000015700 top1a (ENSPFOG00000015574) ENSPFOG00000015549 fam83d (ENSPFOG00000015533) MAFB (ENSPFOG00000020839) ENSPFOG00000015495 adnpa (ENSPFOG00000015469) BCL2L1 (ENSPFOG00000015465) gata1a (ENSPFOG00000015435) si:dkey-13a21.4 (ENSPFOG00000015409) hcfc1a (ENSPFOG00000015276) opn1sw2 (ENSPFOG00000015237) ##22 Sailfin molly MODERN SPECIES 1687 ENSPLAG00000019502 top1a (ENSPLAG00000019552) ENSPLAG00000019571 fam83d (ENSPLAG00000019577) MAFB (ENSPLAG00000019581) ENSPLAG00000019649 adnpa (ENSPLAG00000019660) BCL2L1 (ENSPLAG00000019679) gata1a (ENSPLAG00000019685) si:dkey-13a21.4 (ENSPLAG00000019688) hcfc1a (ENSPLAG00000019703) opn1sw2 (ENSPLAG00000019745) ##22 opn1sw2 (ENSPLAG00000019768) ##22 Guppy MODERN SPECIES 457 ENSPREG00000022344 trpc4apa (ENSPREG00000022319) snai1a (ENSPREG00000022303) ENSPREG00000022295 top1a (ENSPREG00000022283) ENSPREG00000022277 fam83d (ENSPREG00000022272) MAFB (ENSPREG00000022267) ENSPREG00000022260 adnpa (ENSPREG00000022255) BCL2L1 (ENSPREG00000022250) gata1a (ENSPREG00000022245) si:dkey-13a21.4 (ENSPREG00000022241) hcfc1a (ENSPREG00000022223) opn1sw2 (ENSPREG00000022208) ##22 opn1sw2 (ENSPREG00000022188) ##22 ENSPREG00000022153 ##22 ENSPREG00000022087 ##22 ENSPREG00000022016 ##22 gnl3l (ENSPREG00000021994) tfe3b (ENSPREG00000021875) cxxc1b (ENSPREG00000021824) mbd1b (ENSPREG00000021805) ccdc120b (ENSPREG00000021798) SRPK3 (ENSPREG00000021760) comtb (ENSPREG00000021730) grm6b (ENSPREG00000021714) traip (ENSPREG00000021665) ENSPREG00000021636 mon1a (ENSPREG00000021632) ENSPREG00000021618 Platyfish MODERN SPECIES 12 ndrg3a (ENSXMAG00000009706) ENSXMAG00000026267 trpc4apa (ENSXMAG00000009644) snai1a (ENSXMAG00000027735) ENSXMAG00000009633 top1a (ENSXMAG00000009598) ENSXMAG00000009597 fam83d (ENSXMAG00000009595) MAFB (ENSXMAG00000020173) ENSXMAG00000009587 adnpa (ENSXMAG00000009584) BCL2L1 (ENSXMAG00000009583) gata1a (ENSXMAG00000024533) si:dkey-13a21.4 (ENSXMAG00000021749) hcfc1a (ENSXMAG00000009558) opn1sw2 (ENSXMAG00000009549) ##22 ENSXMAG00000025688 ##22 ENSXMAG00000007683 ##22 ENSXMAG00000007671 ##22 gnl3l (ENSXMAG00000007665) tfe3b (ENSXMAG00000007656) ENSXMAG00000027960 cxxc1b (ENSXMAG00000005630) mbd1b (ENSXMAG00000005628) ccdc120b (ENSXMAG00000005626) SRPK3 (ENSXMAG00000005597) comtb (ENSXMAG00000005592) pcsk1 (ENSXMAG00000005561) ENSXMAG00000021253 ell2 (ENSXMAG00000005547) glrx (ENSXMAG00000026354) Oryzias ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000018330 ENSGT00940000154681.b.d ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000154697.a.b Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000160331 ENSGT00390000018330 ENSGT00940000154681.b.d ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000154697.a.b Javanese ricefish MODERN SPECIES 19 ENSOJAG00000022710 trpc4apa (ENSOJAG00000022441) snai1a (ENSOJAG00000022353) ENSOJAG00000022221 top1a (ENSOJAG00000021632) ENSOJAG00000021518 fam83d (ENSOJAG00000021517) ENSOJAG00000021515 MAFB (ENSOJAG00000021511) ENSOJAG00000021506 adnpa (ENSOJAG00000021497) ENSOJAG00000021490 gata1a (ENSOJAG00000021488) si:dkey-13a21.4 (ENSOJAG00000021482) hcfc1a (ENSOJAG00000021155) opn1sw2 (ENSOJAG00000021110) ##22 ENSOJAG00000021068 ##22 ENSOJAG00000021046 ##22 gnl3l (ENSOJAG00000021019) tfe3b (ENSOJAG00000020986) cxxc1b (ENSOJAG00000020840) mbd1b (ENSOJAG00000020799) ccdc120b (ENSOJAG00000020787) SRPK3 (ENSOJAG00000020679) comtb (ENSOJAG00000020667) grm6b (ENSOJAG00000020220) traip (ENSOJAG00000020144) mon1a (ENSOJAG00000020130) ENSOJAG00000020111 camkvb (ENSOJAG00000020021) SEMA3F (ENSOJAG00000019102) Indian medaka MODERN SPECIES 8 ENSOMEG00000023796 trpc4apa (ENSOMEG00000023783) snai1a (ENSOMEG00000023773) ENSOMEG00000000745 ENSOMEG00000023760 top1a (ENSOMEG00000023745) ENSOMEG00000023740 fam83d (ENSOMEG00000023737) MAFB (ENSOMEG00000023734) ENSOMEG00000000634 adnpa (ENSOMEG00000023725) ENSOMEG00000023723 gata1a (ENSOMEG00000023720) opn1sw2 (ENSOMEG00000023716) ##22 ENSOMEG00000023708 opn1sw2 (ENSOMEG00000023704) ##22 opn1lw1 (ENSOMEG00000023693) ##22 gnl3l (ENSOMEG00000023685) tfe3b (ENSOMEG00000023677) cxxc1b (ENSOMEG00000023668) mbd1b (ENSOMEG00000023660) ccdc120b (ENSOMEG00000023649) ENSOMEG00000023641 ENSOMEG00000023630 comtb (ENSOMEG00000023614) grm6b (ENSOMEG00000023604) traip (ENSOMEG00000023576) mon1a (ENSOMEG00000023547) ENSOMEG00000023525 camkvb (ENSOMEG00000023496) ormdl1 (ENSOMEG00000023479) Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000018330 ENSGT00940000154681.b.d ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.b ##22 ENSGT00940000166196 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000154697.a.b Chinese medaka MODERN SPECIES 655 ENSOSIG00000013872 trpc4apa (ENSOSIG00000011196) snai1a (ENSOSIG00000011180) ENSOSIG00000011178 top1a (ENSOSIG00000009347) ENSOSIG00000009333 fam83d (ENSOSIG00000009332) MAFB (ENSOSIG00000009330) ENSOSIG00000009299 adnpa (ENSOSIG00000009297) BCL2L1 (ENSOSIG00000009295) gata1a (ENSOSIG00000009293) si:dkey-13a21.4 (ENSOSIG00000009290) hcfc1a (ENSOSIG00000009288) opn1sw2 (ENSOSIG00000009284) ##22 opn1sw2 (ENSOSIG00000009282) ##22 ENSOSIG00000009264 ##22 gnl3l (ENSOSIG00000008975) tfe3b (ENSOSIG00000008770) cxxc1b (ENSOSIG00000008735) ENSOSIG00000008731 ccdc120b (ENSOSIG00000008730) SRPK3 (ENSOSIG00000006352) comtb (ENSOSIG00000006338) grm6b (ENSOSIG00000006276) traip (ENSOSIG00000006266) mon1a (ENSOSIG00000006264) ENSOSIG00000006262 camkvb (ENSOSIG00000006258) tomm34 (ENSOSIG00000004563) BHLHE40 (ENSOSIG00000004561) Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000154681.b.d ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000161383.d.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.b ##22 ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000154861.n.a Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000160318.c.b ENSGT00940000154681.b.d ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000161383.d.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000154861.n.a Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000160318.c.b ENSGT00940000154681.b.d ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000161383.d.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000154861.n.a Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000160318.c.b ENSGT00940000154681.b.d ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000161383.d.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000154861.n.a Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000160318.c.b ENSGT00940000154681.b.d ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000161383.d.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000154861.n.a Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 279 myh7ba (ENSHBUG00000013480) snai1a (ENSHBUG00000013491) ENSHBUG00000013554 ENSHBUG00000000973 top1a (ENSHBUG00000013826) ENSHBUG00000013843 fam83d (ENSHBUG00000013851) MAFB (ENSHBUG00000013860) ENSHBUG00000013980 adnpa (ENSHBUG00000014001) ENSHBUG00000013989 gata1a (ENSHBUG00000014016) si:dkey-13a21.4 (ENSHBUG00000014023) hcfc1a (ENSHBUG00000014047) opn1sw2 (ENSHBUG00000014102) ##22 opn1sw2 (ENSHBUG00000014119) ##22 opn1lw1 (ENSHBUG00000014159) ##22 gnl3l (ENSHBUG00000014227) tfe3b (ENSHBUG00000014246) cxxc1b (ENSHBUG00000014254) mbd1b (ENSHBUG00000014270) ccdc120b (ENSHBUG00000014281) SRPK3 (ENSHBUG00000014340) comtb (ENSHBUG00000014357) grm6b (ENSHBUG00000014416) traip (ENSHBUG00000014431) mon1a (ENSHBUG00000014446) ENSHBUG00000014460 camkvb (ENSHBUG00000014473) SEMA3F (ENSHBUG00000014574) arl8bb (ENSHBUG00000014610) Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000160318.c.b ENSGT00940000154681.b.d ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000161383.d.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000179368 ENSGT00940000156703.e.a P. nyererei MODERN SPECIES 473 snai1a (ENSPNYG00000018944) ENSPNYG00000018904 ENSPNYG00000018819 top1a (ENSPNYG00000018784) ENSPNYG00000018777 fam83d (ENSPNYG00000018750) MAFB (ENSPNYG00000018735) ENSPNYG00000018683 adnpa (ENSPNYG00000018659) ENSPNYG00000018650 gata1a (ENSPNYG00000018638) ENSPNYG00000018625 si:dkey-13a21.4 (ENSPNYG00000018613) ENSPNYG00000018593 opn1sw2 (ENSPNYG00000018575) ##22 opn1sw2 (ENSPNYG00000018558) ##22 opn1lw1 (ENSPNYG00000017356) ##22 gnl3l (ENSPNYG00000017256) tfe3b (ENSPNYG00000017235) Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000160318.c.b ENSGT00940000154681.b.d ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000161383.d.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000179368 ENSGT00940000156703.e.a Eastern happy MODERN SPECIES 17 ENSACLG00000020665 trpc4apa (ENSACLG00000020695) myh7ba (ENSACLG00000020780) snai1a (ENSACLG00000020860) ENSACLG00000020873 ENSACLG00000020905 top1a (ENSACLG00000020954) ENSACLG00000021023 fam83d (ENSACLG00000021027) ENSACLG00000021036 adnpa (ENSACLG00000021065) gata1a (ENSACLG00000021090) si:dkey-13a21.4 (ENSACLG00000021109) ENSACLG00000021128 opn1sw2 (ENSACLG00000021147) ##22 opn1sw2 (ENSACLG00000021193) ##22 opn1lw1 (ENSACLG00000021226) ##22 gnl3l (ENSACLG00000021244) tfe3b (ENSACLG00000021271) cxxc1b (ENSACLG00000021315) mbd1b (ENSACLG00000021383) ENSACLG00000021406 ccdc120b (ENSACLG00000021415) SRPK3 (ENSACLG00000021452) comtb (ENSACLG00000021475) grm6b (ENSACLG00000021488) traip (ENSACLG00000021544) mon1a (ENSACLG00000021606) ENSACLG00000021639 camkvb (ENSACLG00000021669) ENSACLG00000021691 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1108 myh7ba (ENSMZEG00005009993) snai1a (ENSMZEG00005010038) ENSMZEG00005010045 ENSMZEG00005010062 top1a (ENSMZEG00005010072) ENSMZEG00005010126 fam83d (ENSMZEG00005010134) MAFB (ENSMZEG00005010140) ENSMZEG00005010154 adnpa (ENSMZEG00005010188) ENSMZEG00005010193 gata1a (ENSMZEG00005010202) si:dkey-13a21.4 (ENSMZEG00005010220) ENSMZEG00005010225 opn1sw2 (ENSMZEG00005010240) ##22 opn1sw2 (ENSMZEG00005010258) ##22 opn1lw1 (ENSMZEG00005010329) ##22 gnl3l (ENSMZEG00005010346) tfe3b (ENSMZEG00005010367) cxxc1b (ENSMZEG00005010397) mbd1b (ENSMZEG00005010421) ccdc120b (ENSMZEG00005010446) SRPK3 (ENSMZEG00005010462) comtb (ENSMZEG00005010499) grm6b (ENSMZEG00005010508) traip (ENSMZEG00005010532) mon1a (ENSMZEG00005010548) ENSMZEG00005010556 camkvb (ENSMZEG00005010584) ENSMZEG00005010650 SEMA3F (ENSMZEG00005010665) Lyretail cichlid MODERN SPECIES 296 trpc4apa (ENSNBRG00000023021) myh7ba (ENSNBRG00000023051) snai1a (ENSNBRG00000023091) ENSNBRG00000023107 top1a (ENSNBRG00000023138) ENSNBRG00000023151 fam83d (ENSNBRG00000023160) ENSNBRG00000023169 MAFB (ENSNBRG00000023180) adnpa (ENSNBRG00000023187) ENSNBRG00000023195 gata1a (ENSNBRG00000023206) si:dkey-13a21.4 (ENSNBRG00000023214) ENSNBRG00000023227 opn1sw2 (ENSNBRG00000023236) ##22 opn1sw2 (ENSNBRG00000023247) ##22 opn1lw1 (ENSNBRG00000023323) ##22 gnl3l (ENSNBRG00000023334) tfe3b (ENSNBRG00000023362) cxxc1b (ENSNBRG00000023408) ccdc120b (ENSNBRG00000023464) ENSNBRG00000023479 comtb (ENSNBRG00000023483) grm6b (ENSNBRG00000023489) traip (ENSNBRG00000023496) ENSNBRG00000023505 camkvb (ENSNBRG00000023513) SEMA3F (ENSNBRG00000023532) arl8bb (ENSNBRG00000023542) ENSNBRG00000023549 BHLHE40 (ENSNBRG00000023554) Nile tilapia MODERN SPECIES 17 snai1a (ENSONIG00000031723) ENSONIG00000020304 ENSONIG00000033933 ENSONIG00000035826 top1a (ENSONIG00000020303) ENSONIG00000035626 fam83d (ENSONIG00000020301) MAFB (ENSONIG00000020811) ENSONIG00000020300 ENSONIG00000028248 ENSONIG00000020298 gata1a (ENSONIG00000020297) si:dkey-13a21.4 (ENSONIG00000020296) hcfc1a (ENSONIG00000020295) opn1sw2 (ENSONIG00000020294) ##22 opn1sw2 (ENSONIG00000020293) ##22 opn1lw1 (ENSONIG00000020292) ##22 gnl3l (ENSONIG00000029260) tfe3b (ENSONIG00000020291) cxxc1b (ENSONIG00000020290) ccdc120b (ENSONIG00000020288) SRPK3 (ENSONIG00000020287) comtb (ENSONIG00000020286) grm6b (ENSONIG00000020285) traip (ENSONIG00000020284) mon1a (ENSONIG00000020283) ENSONIG00000020282 camkvb (ENSONIG00000036268) SEMA3F (ENSONIG00000020280) ENSONIG00000028560 arl8bb (ENSONIG00000020279) Midas cichlid MODERN SPECIES 1043 trpc4apa (ENSACIG00000011610) ENSACIG00000011366 snai1a (ENSACIG00000011318) ENSACIG00000011285 top1a (ENSACIG00000011152) ENSACIG00000011131 fam83d (ENSACIG00000011115) MAFB (ENSACIG00000011110) ENSACIG00000011089 adnpa (ENSACIG00000011073) ENSACIG00000011059 gata1a (ENSACIG00000011048) si:dkey-13a21.4 (ENSACIG00000011024) ENSACIG00000011009 opn1sw2 (ENSACIG00000010993) ##22 opn1sw2 (ENSACIG00000010980) ##22 opn1lw1 (ENSACIG00000010960) ##22 gnl3l (ENSACIG00000010900) tfe3b (ENSACIG00000010840) cxxc1b (ENSACIG00000010624) mbd1b (ENSACIG00000010590) ccdc120b (ENSACIG00000010542) SRPK3 (ENSACIG00000010338) comtb (ENSACIG00000010204) grm6b (ENSACIG00000010172) traip (ENSACIG00000010020) mon1a (ENSACIG00000009986) MST1R (ENSACIG00000009876) camkvb (ENSACIG00000009801) SEMA3F (ENSACIG00000009744) arl8bb (ENSACIG00000009595) Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00940000158489.a.b ENSGT00390000008947 ENSGT00390000016233.e.a ENSGT00950000182835.c.d.c.a ENSGT00940000154089.a.c ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h.c ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000154861.n.a Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000158489.a.b ENSGT00390000008947 ENSGT00390000016233.e.a ENSGT00950000182835.c.d.c.a ENSGT00940000154089.a.c ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h.c ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000154861.n.a Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT00940000158489.a.b ENSGT00390000008947 ENSGT00390000016233.e.a ENSGT00950000182835.c.d.c.a ENSGT00940000154089.a.c ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h.c ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000154861.n.a Orange clownfish MODERN SPECIES 20 RBM38 (ENSAPEG00000023581) tada3l (ENSAPEG00000023555) arpc4 (ENSAPEG00000023544) pfkfb4a (ENSAPEG00000023519) MAPKAPK3 (ENSAPEG00000023504) top1a (ENSAPEG00000023452) ENSAPEG00000023431 fam83d (ENSAPEG00000023418) MAFB (ENSAPEG00000023407) ENSAPEG00000023397 adnpa (ENSAPEG00000023391) BCL2L1 (ENSAPEG00000023385) gata1a (ENSAPEG00000023372) si:dkey-13a21.4 (ENSAPEG00000023338) ENSAPEG00000023323 opn1sw2 (ENSAPEG00000023305) ##22 opn1lw1 (ENSAPEG00000023291) ##22 gnl3l (ENSAPEG00000023280) tfe3b (ENSAPEG00000023266) cxxc1b (ENSAPEG00000023253) mbd1b (ENSAPEG00000023230) ccdc120b (ENSAPEG00000023200) SRPK3 (ENSAPEG00000023166) comtb (ENSAPEG00000023151) grm6b (ENSAPEG00000023124) traip (ENSAPEG00000023069) mon1a (ENSAPEG00000023054) ENSAPEG00000022994 camkvb (ENSAPEG00000022969) SEMA3F (ENSAPEG00000022941) arl8bb (ENSAPEG00000022867) Clown anemonefish MODERN SPECIES 1386 FAM124A (ENSAOCG00000020634) top1a (ENSAOCG00000020616) ENSAOCG00000020600 fam83d (ENSAOCG00000020591) MAFB (ENSAOCG00000002415) ENSAOCG00000020574 adnpa (ENSAOCG00000020540) BCL2L1 (ENSAOCG00000020533) gata1a (ENSAOCG00000020528) si:dkey-13a21.4 (ENSAOCG00000020491) hcfc1a (ENSAOCG00000020454) opn1sw2 (ENSAOCG00000020417) ##22 opn1lw1 (ENSAOCG00000020394) ##22 gnl3l (ENSAOCG00000020369) tfe3b (ENSAOCG00000020357) cxxc1b (ENSAOCG00000020325) mbd1b (ENSAOCG00000020272) ccdc120b (ENSAOCG00000020252) ENSAOCG00000020237 ENSAOCG00000020213 comtb (ENSAOCG00000020195) grm6b (ENSAOCG00000020181) traip (ENSAOCG00000020147) mon1a (ENSAOCG00000020133) ENSAOCG00000020104 camkvb (ENSAOCG00000020082) Spiny chromis MODERN SPECIES 5 ENSAPOG00000009939 tada3l (ENSAPOG00000009973) arpc4 (ENSAPOG00000010010) pfkfb4a (ENSAPOG00000010120) MAPKAPK3 (ENSAPOG00000010180) top1a (ENSAPOG00000010207) ENSAPOG00000010239 fam83d (ENSAPOG00000010249) MAFB (ENSAPOG00000010261) ENSAPOG00000010385 adnpa (ENSAPOG00000010396) BCL2L1 (ENSAPOG00000010408) gata1a (ENSAPOG00000010416) si:dkey-13a21.4 (ENSAPOG00000010446) hcfc1a (ENSAPOG00000010487) opn1sw2 (ENSAPOG00000010519) ##22 opn1lw1 (ENSAPOG00000012463) ##22 gnl3l (ENSAPOG00000012629) tfe3b (ENSAPOG00000012695) cxxc1b (ENSAPOG00000012779) mbd1b (ENSAPOG00000012810) ccdc120b (ENSAPOG00000012838) SRPK3 (ENSAPOG00000012864) comtb (ENSAPOG00000012877) grm6b (ENSAPOG00000012948) traip (ENSAPOG00000013037) mon1a (ENSAPOG00000000350) ENSAPOG00000013161 camkvb (ENSAPOG00000013178) SEMA3F (ENSAPOG00000013275) arl8bb (ENSAPOG00000013328) Bicolor damselfish MODERN SPECIES 1122 RBM38 (ENSSPAG00000020989) tada3l (ENSSPAG00000021006) ARPC4 (ENSSPAG00000021038) PFKFB4 (ENSSPAG00000021065) ENSSPAG00000021102 top1a (ENSSPAG00000021140) ENSSPAG00000021203 fam83d (ENSSPAG00000021210) MAFB (ENSSPAG00000021215) ENSSPAG00000021221 adnpa (ENSSPAG00000021247) BCL2L1 (ENSSPAG00000021255) gata1a (ENSSPAG00000021259) si:dkey-13a21.4 (ENSSPAG00000021279) hcfc1a (ENSSPAG00000021303) opn1sw2 (ENSSPAG00000021344) ##22 opn1lw1 (ENSSPAG00000021356) ##22 gnl3l (ENSSPAG00000021373) tfe3b (ENSSPAG00000021389) cxxc1b (ENSSPAG00000021410) mbd1b (ENSSPAG00000021447) ccdc120b (ENSSPAG00000021482) SRPK3 (ENSSPAG00000021517) comtb (ENSSPAG00000021543) grm6b (ENSSPAG00000021631) traip (ENSSPAG00000021659) mon1a (ENSSPAG00000021702) ENSSPAG00000021727 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.a ##22 ENSGT00940000161383.d.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000181969 ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000156703.e.a Eupercaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.a ##22 ENSGT00940000166196 ENSGT00940000161383.d.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000181969 ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000156703.e.a Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000160331 ENSGT00390000018330 ENSGT00940000160318.c.b ENSGT00940000154681.b.d ENSGT00980000199461 ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l.a ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000154861.n.a Fugu MODERN SPECIES 10 ndrg3a (ENSTRUG00000010616) trpc4apa (ENSTRUG00000010773) myh7ba (ENSTRUG00000011087) sna1 (ENSTRUG00000031120) ENSTRUG00000024117 top1a (ENSTRUG00000012346) ENSTRUG00000019804 fam83d (ENSTRUG00000023235) MAFB (ENSTRUG00000032052) ENSTRUG00000012597 adnpa (ENSTRUG00000033492) ENSTRUG00000030489 BCL2L1 (ENSTRUG00000012724) gata1a (ENSTRUG00000012781) hcfc1a (ENSTRUG00000012807) opn1sw2 (ENSTRUG00000013002) ##22 opn1lw1 (ENSTRUG00000013052) ##22 gnl3l (ENSTRUG00000013131) tfe3b (ENSTRUG00000013198) cxxc1b (ENSTRUG00000013293) mbd1b (ENSTRUG00000013422) ccdc120b (ENSTRUG00000013456) SRPK3 (ENSTRUG00000029636) comtb (ENSTRUG00000013666) grm6b (ENSTRUG00000013670) traip (ENSTRUG00000013872) mon1a (ENSTRUG00000013941) ENSTRUG00000013975 camkvb (ENSTRUG00000014152) SEMA3F (ENSTRUG00000014242) arl8bb (ENSTRUG00000011496) Tetraodon MODERN SPECIES 2 trpc4apa (ENSTNIG00000007309) myh7ba (ENSTNIG00000007310) snai1a (ENSTNIG00000007311) ENSTNIG00000002452 ENSTNIG00000007312 top1a (ENSTNIG00000007313) ENSTNIG00000001316 ENSTNIG00000007314 fam83d (ENSTNIG00000007315) MAFB (ENSTNIG00000007316) ENSTNIG00000000511 adnpa (ENSTNIG00000007317) BCL2L1 (ENSTNIG00000007318) gata1a (ENSTNIG00000007319) hcfc1a (ENSTNIG00000007320) opn1sw2 (ENSTNIG00000007321) ##22 opn1lw1 (ENSTNIG00000007322) ##22 gnl3l (ENSTNIG00000007323) tfe3b (ENSTNIG00000007324) cxxc1b (ENSTNIG00000007325) ENSTNIG00000007326 ccdc120b (ENSTNIG00000007327) SRPK3 (ENSTNIG00000007328) comtb (ENSTNIG00000007329) grm6b (ENSTNIG00000007330) traip (ENSTNIG00000007331) mon1a (ENSTNIG00000007332) MST1R (ENSTNIG00000007333) camkvb (ENSTNIG00000007334) SEMA3F (ENSTNIG00000007335) arl8bb (ENSTNIG00000007336) Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.a ##22 ENSGT00940000166196 ENSGT00940000161383.d.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000181969 ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000156703.e.a Ballan wrasse MODERN SPECIES 61 trpc4apa (ENSLBEG00000017389) myh7ba (ENSLBEG00000017468) snai1a (ENSLBEG00000017605) ENSLBEG00000017621 ENSLBEG00000017656 top1a (ENSLBEG00000017737) ENSLBEG00000017950 fam83d (ENSLBEG00000017964) MAFB (ENSLBEG00000017971) ENSLBEG00000017986 adnpa (ENSLBEG00000018017) BCL2L1 (ENSLBEG00000018039) gata1a (ENSLBEG00000018106) hcfc1a (ENSLBEG00000018128) si:dkey-13a21.4 (ENSLBEG00000018180) opn1sw2 (ENSLBEG00000018213) ##22 ENSLBEG00000018236 ##22 gnl3l (ENSLBEG00000018256) tfe3b (ENSLBEG00000018288) cxxc1b (ENSLBEG00000018337) ENSLBEG00000018506 ccdc120b (ENSLBEG00000018545) SRPK3 (ENSLBEG00000018572) comtb (ENSLBEG00000018603) grm6b (ENSLBEG00000018623) traip (ENSLBEG00000018662) mon1a (ENSLBEG00000018702) MST1R (ENSLBEG00000018750) camkvb (ENSLBEG00000018889) SEMA3F (ENSLBEG00000018957) arl8bb (ENSLBEG00000019016) Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000154681.b.d ENSGT00980000199461 ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000181969 ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000156703.e.a Perciformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00980000199461 ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000181969 ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000156703.e.a Cottioidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT00980000199461 ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000161383.d.a ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000181969 ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000156703.e.a Lumpfish MODERN SPECIES 20 myh7ba (ENSCLMG00005013269) snai1a (ENSCLMG00005013267) ENSCLMG00005013266 ENSCLMG00005013265 top1a (ENSCLMG00005013136) ENSCLMG00005013131 fam83d (ENSCLMG00005013129) MAFB (ENSCLMG00005013128) ENSCLMG00005013112 ENSCLMG00005013109 BCL2L1 (ENSCLMG00005013107) gata1a (ENSCLMG00005013105) si:dkey-13a21.4 (ENSCLMG00005013104) HCFC1 (ENSCLMG00005012898) opn1sw2 (ENSCLMG00005012893) ##22 opn1sw2 (ENSCLMG00005012891) ##22 opn1lw1 (ENSCLMG00005012888) ##22 gnl3l (ENSCLMG00005012879) tfe3b (ENSCLMG00005012790) ENSCLMG00005012788 cxxc1b (ENSCLMG00005012498) ENSCLMG00005012492 ccdc120b (ENSCLMG00005012490) ENSCLMG00005012489 ENSCLMG00005012487 SRPK3 (ENSCLMG00005012486) comtb (ENSCLMG00005012436) grm6b (ENSCLMG00005012426) traip (ENSCLMG00005012422) mon1a (ENSCLMG00005012421) ENSCLMG00005012418 Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000160318.c.b ENSGT00940000154681.b.d ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000154861.n.a Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000160318.c.b ENSGT00940000154681.b.d ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000154861.n.a European seabass MODERN SPECIES 10 myh7ba (ENSDLAG00005005626) SNAI (ENSDLAG00005033824) ENSDLAG00005005462 ENSDLAG00005005453 top1a (ENSDLAG00005004446) ENSDLAG00005004319 fam83d (ENSDLAG00005025742) ENSDLAG00005025739 MAFB (ENSDLAG00005029273) adnpa (ENSDLAG00005025737) ENSDLAG00005025736 gata1a (ENSDLAG00005025735) RAB7A (ENSDLAG00005031533) hcfc1a (ENSDLAG00005025731) opn1sw2 (ENSDLAG00005025729) ##22 opn1sw2 (ENSDLAG00005025726) ##22 opn1lw1 (ENSDLAG00005025724) ##22 gnl3l (ENSDLAG00005025705) tfe3b (ENSDLAG00005025703) ENSDLAG00005025682 mbd1b (ENSDLAG00005025679) ccdc120b (ENSDLAG00005025677) ENSDLAG00005025559 grm6b (ENSDLAG00005025480) traip (ENSDLAG00005025462) ENSDLAG00005025454 CAMKV (ENSDLAG00005025437) ENSDLAG00005025304 ARL8B (ENSDLAG00005034963) ENSDLAG00005025286 bhlhe40 (ENSDLAG00005025285) Gilthead seabream MODERN SPECIES 20 trpc4apa (ENSSAUG00010012056) myh7ba (ENSSAUG00010013596) snai1a (ENSSAUG00010013621) ENSSAUG00010013623 ENSSAUG00010013624 top1a (ENSSAUG00010013632) ENSSAUG00010014343 fam83d (ENSSAUG00010014344) MAFB (ENSSAUG00010014345) ENSSAUG00010014348 BCL2L (ENSSAUG00010014353) gata1a (ENSSAUG00010014355) si:dkey-13a21.4 (ENSSAUG00010014358) hcfc1a (ENSSAUG00010014373) opn1sw2 (ENSSAUG00010014432) ##22 opn1sw2 (ENSSAUG00010014437) ##22 opn1lw1 (ENSSAUG00010014442) ##22 gnl3l (ENSSAUG00010014448) tfe3b (ENSSAUG00010014478) cxxc1b (ENSSAUG00010014492) mbd1b (ENSSAUG00010014539) ccdc120b (ENSSAUG00010014546) SRPK3 (ENSSAUG00010014567) comtb (ENSSAUG00010017170) grm6b (ENSSAUG00010017188) traip (ENSSAUG00010017395) mon1a (ENSSAUG00010017406) ENSSAUG00010017412 camkvb (ENSSAUG00010017420) SEMA3F (ENSSAUG00010017498) arl8bb (ENSSAUG00010018930) Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00980000199461 ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a.n ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000154861.n.a Carangaria ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000154681.b.d ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a.n ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000154861.n.a Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000154681.b.d ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a.n ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000154861.n.a Seriola ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000154681.b.d ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a.n ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000154861.n.a Greater amberjack MODERN SPECIES 37 snai1a (ENSSDUG00000019933) GGT7 (ENSSDUG00000019918) ENSSDUG00000019899 top1a (ENSSDUG00000019876) ENSSDUG00000019863 fam83d (ENSSDUG00000019848) MAFB (ENSSDUG00000019845) ENSSDUG00000019804 adnpa (ENSSDUG00000019791) BCL2L1 (ENSSDUG00000019783) gata1a (ENSSDUG00000019759) si:dkey-13a21.4 (ENSSDUG00000019738) hcfc1a (ENSSDUG00000019688) opn1sw2 (ENSSDUG00000017946) ##22 opn1sw2 (ENSSDUG00000017835) ##22 opn1sw2 (ENSSDUG00000015046) ##22 opn1lw1 (ENSSDUG00000013219) ##22 gnl3l (ENSSDUG00000013117) tfe3b (ENSSDUG00000013054) cxxc1b (ENSSDUG00000013022) mbd1b (ENSSDUG00000012996) ccdc120b (ENSSDUG00000012978) SRPK3 (ENSSDUG00000012949) comtb (ENSSDUG00000012936) grm6b (ENSSDUG00000012908) traip (ENSSDUG00000012887) mon1a (ENSSDUG00000012873) MST1R (ENSSDUG00000012803) camkvb (ENSSDUG00000012707) SEMA3F (ENSSDUG00000012565) ENSSDUG00000012547 Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 2037 snai1a (ENSSLDG00000011412) GGT7 (ENSSLDG00000011429) ENSSLDG00000011453 top1a (ENSSLDG00000011470) ENSSLDG00000011497 fam83d (ENSSLDG00000011509) ENSSLDG00000011521 MAFB (ENSSLDG00000011540) adnpa (ENSSLDG00000011550) BCL2L1 (ENSSLDG00000011562) gata1a (ENSSLDG00000011572) si:dkey-13a21.4 (ENSSLDG00000011597) hcfc1a (ENSSLDG00000011619) opn1sw2 (ENSSLDG00000011730) ##22 opn1sw2 (ENSSLDG00000012051) ##22 opn1sw2 (ENSSLDG00000012230) ##22 opn1lw1 (ENSSLDG00000012258) ##22 gnl3l (ENSSLDG00000012278) tfe3b (ENSSLDG00000012336) cxxc1b (ENSSLDG00000012368) mbd1b (ENSSLDG00000012422) ccdc120b (ENSSLDG00000012502) SRPK3 (ENSSLDG00000012560) comtb (ENSSLDG00000012626) Barramundi perch MODERN SPECIES 93 snai1a (ENSLCAG00010019688) GGT7 (ENSLCAG00010019687) ENSLCAG00010019685 top1a (ENSLCAG00010019460) ENSLCAG00010019417 fam83d (ENSLCAG00010019414) MAFB (ENSLCAG00010019413) ENSLCAG00010019399 ENSLCAG00010019393 adnpa (ENSLCAG00010019391) BCL2L1 (ENSLCAG00010019389) gata1a (ENSLCAG00010019384) si:dkey-13a21.4 (ENSLCAG00010019380) opn1sw2 (ENSLCAG00010019363) ##22 opn1sw2 (ENSLCAG00010019332) ##22 opn1sw2 (ENSLCAG00010019314) ##22 opn1lw1 (ENSLCAG00010019185) ##22 gnl3l (ENSLCAG00010019117) tfe3b (ENSLCAG00010018845) cxxc1b (ENSLCAG00010018774) mbd1b (ENSLCAG00010018764) ccdc120b (ENSLCAG00010018757) SRPK3 (ENSLCAG00010018737) comtb (ENSLCAG00010018721) grm6b (ENSLCAG00010018700) traip (ENSLCAG00010018680) mon1a (ENSLCAG00010018669) ENSLCAG00010018663 camkvb (ENSLCAG00010018655) SEMA3F (ENSLCAG00010018634) arl8bb (ENSLCAG00010018615) Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000160318.c.b ENSGT00940000154681.b.d ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a.n ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000154861.n.a Turbot MODERN SPECIES 18 myh7ba (ENSSMAG00000013574) snai1a (ENSSMAG00000013652) ENSSMAG00000013670 ENSSMAG00000013722 top1a (ENSSMAG00000013729) ENSSMAG00000026820 fam83d (ENSSMAG00000013878) ENSSMAG00000013891 ENSSMAG00000013903 ENSSMAG00000013917 ENSSMAG00000028451 gata1a (ENSSMAG00000013930) si:dkey-13a21.4 (ENSSMAG00000013945) hcfc1a (ENSSMAG00000013953) opn1sw2 (ENSSMAG00000014006) ##22 opn1sw2 (ENSSMAG00000014457) ##22 opn1lw1 (ENSSMAG00000014476) ##22 gnl3l (ENSSMAG00000014518) tfe3b (ENSSMAG00000014563) cxxc1b (ENSSMAG00000014604) mbd1b (ENSSMAG00000014640) ccdc120b (ENSSMAG00000014764) ENSSMAG00000014783 comtb (ENSSMAG00000014805) grm6b (ENSSMAG00000014847) traip (ENSSMAG00000014911) mon1a (ENSSMAG00000014977) ENSSMAG00000014995 camkvb (ENSSMAG00000015020) ENSSMAG00000015037 arl8bb (ENSSMAG00000036408) Anabantaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00980000199461 ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.b ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a.n ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000154861.n.a Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000160318.c.b ENSGT00940000154681.b.d ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a.n ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000154861.n.a Climbing perch MODERN SPECIES 18 trpc4apa (ENSATEG00000015800) myh7ba (ENSATEG00000015668) snai1a (ENSATEG00000015639) ENSATEG00000025418 ENSATEG00000015102 top1a (ENSATEG00000015061) ENSATEG00000015047 fam83d (ENSATEG00000015038) ENSATEG00000029851 adnpa (ENSATEG00000015001) ENSATEG00000014989 gata1a (ENSATEG00000014966) si:dkey-13a21.4 (ENSATEG00000014958) hcfc1a (ENSATEG00000014798) opn1sw2 (ENSATEG00000014765) ##22 opn1sw2 (ENSATEG00000014431) ##22 ENSATEG00000011811 ##22 ENSATEG00000009817 ##22 gnl3l (ENSATEG00000009762) tfe3b (ENSATEG00000009661) cxxc1b (ENSATEG00000009642) mbd1b (ENSATEG00000009608) ccdc120b (ENSATEG00000009583) ENSATEG00000009561 comtb (ENSATEG00000009551) grm6b (ENSATEG00000009522) traip (ENSATEG00000009440) mon1a (ENSATEG00000009424) ENSATEG00000009407 camkvb (ENSATEG00000009278) ENSATEG00000009213 Siamese fighting fish MODERN SPECIES 16 myh7ba (ENSBSLG00000023220) snai1a (ENSBSLG00000023459) ENSBSLG00000023478 ENSBSLG00000023500 top1a (ENSBSLG00000023553) ENSBSLG00000023820 fam83d (ENSBSLG00000023822) MAFB (ENSBSLG00000023841) ENSBSLG00000023864 adnpa (ENSBSLG00000023899) BCL2L1 (ENSBSLG00000023910) gata1a (ENSBSLG00000023916) si:dkey-13a21.4 (ENSBSLG00000007864) hcfc1a (ENSBSLG00000007920) opn1sw2 (ENSBSLG00000008108) ##22 opn1sw2 (ENSBSLG00000008155) ##22 opn1lw1 (ENSBSLG00000008207) ##22 gnl3l (ENSBSLG00000008417) tfe3b (ENSBSLG00000008528) cxxc1b (ENSBSLG00000008835) mbd1b (ENSBSLG00000009328) ccdc120b (ENSBSLG00000009387) SRPK3 (ENSBSLG00000009779) comtb (ENSBSLG00000010327) grm6b (ENSBSLG00000010337) traip (ENSBSLG00000010544) mon1a (ENSBSLG00000010555) ENSBSLG00000010560 camkvb (ENSBSLG00000010678) SEMA3F (ENSBSLG00000010913) arl8bb (ENSBSLG00000013136) Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 19 snai1a (ENSMMDG00005007012) ENSMMDG00005007015 ENSMMDG00005007017 ENSMMDG00005007023 top1a (ENSMMDG00005007045) ZHX3 (ENSMMDG00005007888) fam83d (ENSMMDG00005007889) MAFB (ENSMMDG00005007892) ENSMMDG00005007895 adnpa (ENSMMDG00005007898) BCL2L1 (ENSMMDG00005007904) gata1a (ENSMMDG00005007905) si:dkey-13a21.4 (ENSMMDG00005007907) hcfc1a (ENSMMDG00005007918) opn1sw2 (ENSMMDG00005007982) ##22 opn1sw2 (ENSMMDG00005008017) ##22 opn1lw1 (ENSMMDG00005008024) ##22 gnl3l (ENSMMDG00005008026) tfe3b (ENSMMDG00005008031) cxxc1b (ENSMMDG00005008061) mbd1b (ENSMMDG00005008899) ccdc120b (ENSMMDG00005008902) SRPK3 (ENSMMDG00005008906) comtb (ENSMMDG00005008931) grm6b (ENSMMDG00005008936) traip (ENSMMDG00005008941) mon1a (ENSMMDG00005008952) ENSMMDG00005008960 camkvb (ENSMMDG00005008983) SEMA3F (ENSMMDG00005008991) arl8bb (ENSMMDG00005008996) Cod MODERN SPECIES 4 trpc4apa (ENSGMOG00000017782) myh7ba (ENSGMOG00000028291) snai1a (ENSGMOG00000017815) ENSGMOG00000017837 top1a (ENSGMOG00000017862) ENSGMOG00000017894 fam83d (ENSGMOG00000025512) ENSGMOG00000033843 ENSGMOG00000017945 adnpa (ENSGMOG00000036285) ENSGMOG00000025656 gata1a (ENSGMOG00000029187) si:dkey-13a21.4 (ENSGMOG00000024459) ENSGMOG00000018011 opn1sw2 (ENSGMOG00000018045) ##22 opn1sw2 (ENSGMOG00000018054) ##22 gnl3l (ENSGMOG00000018085) tfe3b (ENSGMOG00000018115) cxxc1b (ENSGMOG00000002734) ENSGMOG00000036759 ccdc120b (ENSGMOG00000029914) ENSGMOG00000002647 ENSGMOG00000011937 ENSGMOG00000020337 ENSGMOG00000002636 grm6b (ENSGMOG00000002607) traip (ENSGMOG00000002576) mon1a (ENSGMOG00000024519) ENSGMOG00000032890 camkvb (ENSGMOG00000002479) ENSGMOG00000002430 Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00390000013764.hb ENSGT00940000160318.c.b ENSGT00940000154681.b.d ENSGT00980000199461 ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000161383.d.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b.cb.a ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392.c ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000154861.n.a Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 103 ENSGT00940000160331.f.b ENSGT00390000018330.f.b ENSGT00940000154681.b.d.c ENSGT00980000199461.b ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b.d ENSGT00940000155006.e.a.d ENSGT00950000182893.a.a.b.b.e ENSGT00940000158405.h ENSGT00940000160486.d.b ENSGT00940000164411.d ENSGT00530000063631.b.n.a.d ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l.d ENSGT00940000166313.a.d ENSGT00940000161383.d.a.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b.cb.a.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b.cb.a.b.a ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b.d ENSGT00940000166392.c.a ENSGT00950000183005.a.a.d ENSGT00940000154102.b.a.a.d ENSGT00940000157877.b.h.g ENSGT00940000155317.a.a.q.b ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b.e ENSGT00980000202247 ENSGT00390000006665.a.a ENSGT00940000157842.b.e ENSGT00940000156468.f.d ENSGT00940000156703.e.a.a Huchen MODERN SPECIES 42 ENSHHUG00000028753 snai1a (ENSHHUG00000028755) ENSHHUG00000028758 GGT7 (ENSHHUG00000028799) ENSHHUG00000028811 top1a (ENSHHUG00000028821) ZHX3 (ENSHHUG00000028869) fam83d (ENSHHUG00000028870) ENSHHUG00000028880 MAFB (ENSHHUG00000028885) ENSHHUG00000000011 adnpa (ENSHHUG00000000079) BCL2L1 (ENSHHUG00000000089) gata1a (ENSHHUG00000000102) HCFC1 (ENSHHUG00000000123) opn1sw2 (ENSHHUG00000000400) ##22 ENSHHUG00000000425 ##22 ENSHHUG00000000749 ##22 gnl3l (ENSHHUG00000001091) tfe3b (ENSHHUG00000001218) cxxc1b (ENSHHUG00000001362) mbd1b (ENSHHUG00000001603) ccdc120b (ENSHHUG00000001636) SRPK3 (ENSHHUG00000001646) comtb (ENSHHUG00000002247) grm6b (ENSHHUG00000002259) ENSHHUG00000002603 mon1a (ENSHHUG00000002609) ENSHHUG00000002620 ENSHHUG00000002638 camkvb (ENSHHUG00000002647) Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00940000160331.f.b ENSGT00390000018330.f.b ENSGT00940000154681.b.d.c ENSGT00980000199461.b ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b.d ENSGT00940000155006.e.a.d ENSGT00950000182893.a.a.b.b.e ENSGT00940000158405.h ENSGT00940000160486.d.b ENSGT00940000164411.d ENSGT00530000063631.b.n.a.d ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l.d ENSGT00940000166313.a.d ENSGT00940000161383.d.a.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b.cb.a.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b.cb.a.b.a ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b.d ENSGT00940000166392.c.a ENSGT00950000183005.a.a.d ENSGT00940000154102.b.a.a.d ENSGT00940000157877.b.h.g ENSGT00940000155317.a.a.q.b ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b.e ENSGT00980000202247 ENSGT00390000006665.a.a ENSGT00940000157842.b.e ENSGT00940000156468.f.d ENSGT00940000156703.e.a.a Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000160331.f.b ENSGT00390000018330.f.b ENSGT00940000154681.b.d.c ENSGT00980000199461.b ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b.d ENSGT00940000155006.e.a.d ENSGT00950000182893.a.a.b.b.e ENSGT00940000158405.h ENSGT00940000160486.d.b ENSGT00940000164411.d ENSGT00530000063631.b.n.a.d ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l.d ENSGT00940000166313.a.d ENSGT00940000161383.d.a.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b.cb.a.b.a ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b.d ENSGT00940000166392.c.a ENSGT00950000183005.a.a.d ENSGT00940000154102.b.a.a.d ENSGT00940000157877.b.h.g ENSGT00940000155317.a.a.q.b ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b.e ENSGT00980000202247 ENSGT00390000006665.a.a ENSGT00940000157842.b.e ENSGT00940000156468.f.d ENSGT00940000156703.e.a.a ENSGT00940000154861.n.a Rainbow trout MODERN SPECIES 8 snai1a (ENSOMYG00000016028) ENSOMYG00000016036 ENSOMYG00000016059 ENSOMYG00000016211 top1a (ENSOMYG00000016294) ENSOMYG00000017866 fam83d (ENSOMYG00000017880) ENSOMYG00000017882 ENSOMYG00000067327 adnpa (ENSOMYG00000017914) ENSOMYG00000017923 gata1a (ENSOMYG00000017940) ENSOMYG00000066542 ENSOMYG00000018008 ENSOMYG00000019621 opn1sw2 (ENSOMYG00000019627) ##22 ENSOMYG00000019730 ##22 gnl3l (ENSOMYG00000019850) tfe3b (ENSOMYG00000020367) cxxc1b (ENSOMYG00000020532) mbd1b (ENSOMYG00000020593) ccdc120b (ENSOMYG00000020609) ENSOMYG00000020776 comtb (ENSOMYG00000021878) grm6b (ENSOMYG00000021991) ENSOMYG00000075273 mon1a (ENSOMYG00000022263) ENSOMYG00000022319 camkvb (ENSOMYG00000022384) ENSOMYG00000022540 arl8bb (ENSOMYG00000022701) Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000160331.f.b ENSGT00390000018330.f.b ENSGT00940000154681.b.d.c ENSGT00980000199461.b ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b.d ENSGT00940000155006.e.a.d ENSGT00950000182893.a.a.b.b.e ENSGT00940000158405.h ENSGT00940000160486.d.b ENSGT00940000164411.d ENSGT00530000063631.b.n.a.d ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l.d ENSGT00940000166313.a.d ENSGT00940000161383.d.a.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b.cb.a.b.a ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b.d ENSGT00940000166392.c.a ENSGT00950000183005.a.a.d ENSGT00940000154102.b.a.a.d ENSGT00940000157877.b.h.g ENSGT00940000155317.a.a.q.b ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b.e ENSGT00980000202247 ENSGT00390000006665.a.a ENSGT00940000157842.b.e ENSGT00940000156468.f.d ENSGT00940000156703.e.a.a ENSGT00940000154861.n.a Coho salmon MODERN SPECIES ENSOKIG00005016457 trpc4apa (ENSOKIG00005016395) snai1a (ENSOKIG00005016381) ENSOKIG00005016366 GGT7 (ENSOKIG00005016175) ENSOKIG00005016152 top1a (ENSOKIG00005014623) ENSOKIG00005014529 fam83d (ENSOKIG00005014522) MAFB (ENSOKIG00005014519) adnpa (ENSOKIG00005014512) BCL2L1 (ENSOKIG00005014496) gata1a (ENSOKIG00005014483) HCFC1 (ENSOKIG00005014244) ENSOKIG00005014220 opn1sw2 (ENSOKIG00005014210) ##22 ENSOKIG00005014066 ##22 gnl3l (ENSOKIG00005013946) tfe3b (ENSOKIG00005013920) cxxc1b (ENSOKIG00005013660) mbd1b (ENSOKIG00005013620) ccdc120b (ENSOKIG00005013610) SRPK3 (ENSOKIG00005013561) comtb (ENSOKIG00005013536) grm6b (ENSOKIG00005013474) ENSOKIG00005013355 mon1a (ENSOKIG00005013313) MST1R (ENSOKIG00005013256) ENSOKIG00005013248 ENSOKIG00005013243 camkvb (ENSOKIG00005013204) Chinook salmon MODERN SPECIES 11 ENSOTSG00005042216 trpc4apa (ENSOTSG00005042217) snai1a (ENSOTSG00005042218) ENSOTSG00005042220 GGT7 (ENSOTSG00005042221) ENSOTSG00005042263 top1a (ENSOTSG00005042272) ENSOTSG00005043140 fam83d (ENSOTSG00005043143) MAFB (ENSOTSG00005043144) ENSOTSG00005043145 adnpa (ENSOTSG00005043146) BCL2L1 (ENSOTSG00005043147) gata1a (ENSOTSG00005043148) HCFC1 (ENSOTSG00005043149) opn1sw2 (ENSOTSG00005043152) ##22 ENSOTSG00005043155 ##22 gnl3l (ENSOTSG00005043179) tfe3b (ENSOTSG00005043372) cxxc1b (ENSOTSG00005043374) mbd1b (ENSOTSG00005043437) ccdc120b (ENSOTSG00005043438) SRPK3 (ENSOTSG00005043456) comtb (ENSOTSG00005045196) grm6b (ENSOTSG00005045198) ENSOTSG00005045212 mon1a (ENSOTSG00005045213) MST1R (ENSOTSG00005045214) camkvb (ENSOTSG00005000406) SEMA3F (ENSOTSG00005000749) arl8bb (ENSOTSG00005001141) Salmo ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00940000160331.f.b ENSGT00390000018330.f.b ENSGT00940000154681.b.d.c ENSGT00980000199461.b ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b.d ENSGT00940000155006.e.a.d ENSGT00950000182893.a.a.b.b.e ENSGT00940000158405.h ENSGT00940000160486.d.b ENSGT00940000164411.d ENSGT00530000063631.b.n.a.d ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l.d ENSGT00940000166313.a.d ENSGT00940000161383.d.a.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b.cb.a.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b.cb.a.b.a ##22 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b.d ENSGT00730000111044 ENSGT00950000183005.a.a.d ENSGT00940000154102.b.a.a.d ENSGT00940000157877.b.h.g ENSGT00940000155317.a.a.q.b ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b.e ENSGT00390000006665.a.a ENSGT00940000157842.b.e ENSGT00940000156468.f.d ENSGT00940000156703.e.a.a ENSGT00940000154861.n.a Atlantic salmon MODERN SPECIES 3 ENSSSAG00000121631 snai (ENSSSAG00000006387) ENSSSAG00000089348 ENSSSAG00000006413 ENSSSAG00000006547 top1a (ENSSSAG00000006599) ENSSSAG00000008483 fam83d (ENSSSAG00000110755) MAFB (ENSSSAG00000008494) ENSSSAG00000008500 adnpa (ENSSSAG00000008505) BCLX (ENSSSAG00000008513) gata1a (ENSSSAG00000008520) ENSSSAG00000089688 ENSSSAG00000008592 opn1sw2 (ENSSSAG00000104363) ##22 ENSSSAG00000010443 ##22 ENSSSAG00000114717 ##22 gnl3l (ENSSSAG00000015523) ENSSSAG00000118599 tfe3b (ENSSSAG00000015673) ENSSSAG00000020016 ENSSSAG00000092788 mbd1b (ENSSSAG00000035232) ccdc120b (ENSSSAG00000035547) ENSSSAG00000036227 comtb (ENSSSAG00000042490) grm6b (ENSSSAG00000093082) mon1a (ENSSSAG00000043049) ENSSSAG00000043080 camkvb (ENSSSAG00000043153) River trout MODERN SPECIES 5 ENSSTUG00000018631 trpc4apa (ENSSTUG00000018336) snai1a (ENSSTUG00000018304) ENSSTUG00000018297 GGT7 (ENSSTUG00000018075) ENSSTUG00000018033 top1a (ENSSTUG00000017781) ENSSTUG00000017748 fam83d (ENSSTUG00000017744) MAFB (ENSSTUG00000017739) ENSSTUG00000017723 adnpa (ENSSTUG00000017712) BCL2L1 (ENSSTUG00000017701) gata1a (ENSSTUG00000017690) HCFC1 (ENSSTUG00000017458) opn1sw2 (ENSSTUG00000017425) ##22 ENSSTUG00000017235 ##22 ENSSTUG00000017145 ##22 gnl3l (ENSSTUG00000017058) tfe3b (ENSSTUG00000017011) CXXC1 (ENSSTUG00000016765) mbd1b (ENSSTUG00000016736) ENSSTUG00000016732 ccdc120b (ENSSTUG00000016723) SRPK3 (ENSSTUG00000016695) comtb (ENSSTUG00000016606) grm6b (ENSSTUG00000016561) traip (ENSSTUG00000016538) mon1a (ENSSTUG00000016521) ENSSTUG00000016484 camkvb (ENSSTUG00000016452) Spotted gar MODERN SPECIES 647 timm17b (ENSLOCG00000014774) ENSLOCG00000014772 ENSLOCG00000014770 sypb (ENSLOCG00000014767) PLP2 (ENSLOCG00000014766) pcsk1nl (ENSLOCG00000014765) ENSLOCG00000014763 ENSLOCG00000014762 gata1a (ENSLOCG00000014759) cdk20 (ENSLOCG00000014752) si:dkey-13a21.4 (ENSLOCG00000014749) HCFC1 (ENSLOCG00000014733) TMEM187 (ENSLOCG00000017979) IRAK1 (ENSLOCG00000014730) mecp2 (ENSLOCG00000014725) ##20 opn1sw2 (ENSLOCG00000014721) ##22 opn1lw1 (ENSLOCG00000014714) ##22 ENSLOCG00000014710 gnl3l (ENSLOCG00000014702) FGD1 (ENSLOCG00000014698) tfe3a (ENSLOCG00000014691) zgc:113363 (ENSLOCG00000014689) cxxc1a (ENSLOCG00000014684) ENSLOCG00000014682 abcd1 (ENSLOCG00000014676) PLXNB3 (ENSLOCG00000014660) ##24 SRPK3 (ENSLOCG00000014658) ENSLOCG00000014656 IQSEC2 (ENSLOCG00000014645) ENSLOCG00000014644 ENSLOCG00000014641 Reedfish MODERN SPECIES 2 ENSECRG00000019006 nt5dc2 (ENSECRG00000019029) zgc:162200 (ENSECRG00000019059) apex2 (ENSECRG00000019086) ENSECRG00000019105 sema3ga (ENSECRG00000019132) tspy (ENSECRG00000019185) wasb (ENSECRG00000019242) ENSECRG00000019275 ccdc22 (ENSECRG00000019320) ENSECRG00000019376 ENSECRG00000019430 gpr173 (ENSECRG00000019448) ENSECRG00000019467 suv39h1b (ENSECRG00000019506) opn1sw2 (ENSECRG00000019604) ##22 opn1lw1 (ENSECRG00000019957) ##22 SRPK3 (ENSECRG00000019992) ENSECRG00000020026 ##24 abcd1 (ENSECRG00000020092) ccdc120b (ENSECRG00000020130) tfe3a (ENSECRG00000020165) ENSECRG00000020187 cxxc1a (ENSECRG00000020205) ENSECRG00000007589 FGD1 (ENSECRG00000007611) gnl3l (ENSECRG00000007644) mecp2 (ENSECRG00000007685) ##20 IRAK1 (ENSECRG00000007760) ENSECRG00000007782 TMEM187 (ENSECRG00000007796) Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 277 ENSGT00940000159855 ENSGT01030000234637.b.c ENSGT00940000153629.a.b ENSGT00940000158528 ENSGT00600000085663 ENSGT00990000203541.b ENSGT00940000159563 ENSGT00940000159128 ENSGT00940000166196 ENSGT00940000161383 ENSGT00940000160502 ENSGT00530000063687.b.b.b ##20 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 Coelacanth MODERN SPECIES 922 CDK20 (ENSLACG00000014418) ENSLACG00000014206 HCFC1 (ENSLACG00000013598) TMEM187 (ENSLACG00000013533) IRAK1 (ENSLACG00000013100) ENSLACG00000011882 MECP2 (ENSLACG00000011281) ##20 opn1sw2 (ENSLACG00000010843) ##22 ENSLACG00000010305 FTSJ1 (ENSLACG00000009913) ENSLACG00000009383 ENSLACG00000009254 GPR173 (ENSLACG00000007798) ENSLACG00000006662 Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 272 ENSGT00940000166196 ENSGT00940000161383 ENSGT00940000160502 ENSGT00530000063687.b.b.b ##20 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 Anura ANCESTRAL SPECIES 326 ENSGT00940000166196 ENSGT00940000161383 ENSGT00390000011272 ENSGT00940000160502 ENSGT00530000063687.b.b.b ##20 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 Frog MODERN SPECIES 8 atp6v1g1 (ENSXETG00000043091) whrn (ENSXETG00000014264) akna (ENSXETG00000036617) stxbp1 (ENSXETG00000014261) niban2 (ENSXETG00000014260) slc31a2 (ENSXETG00000025574) emd (ENSXETG00000047326) ENSXETG00000047204 mgc75872 (ENSXETG00000014257) hcfc1 (ENSXETG00000014251) tmem187 (ENSXETG00000046949) irak1 (ENSXETG00000014246) mecp2 (ENSXETG00000014242) ##20 ENSXETG00000036700 ENSXETG00000044975 XB5817984 [provisional:opn1sw] (ENSXETG00000025579) ##22 opn1lw (ENSXETG00000014236) ##22 avpr2 (ENSXETG00000014233) ENSXETG00000044634 ENSXETG00000037697 ENSXETG00000045839 ENSXETG00000044239 ENSXETG00000044106 ENSXETG00000044823 brinp1 (ENSXETG00000036540) ENSXETG00000040192 astn2 (ENSXETG00000021737) trim32 (ENSXETG00000021730) XB5932841 [provisional:cav2] (ENSXETG00000032332) cav3.2 (ENSXETG00000021728) arhgap4 (ENSXETG00000021725) Leishan spiny toad MODERN SPECIES 12 SLC31A2 (ENSLLEG00000030208) NIBAN2 (ENSLLEG00000030175) STXBP1 (ENSLLEG00000030044) AKNA (ENSLLEG00000029979) WHRN (ENSLLEG00000029940) ATP6V1G1 (ENSLLEG00000029921) TMEM268 (ENSLLEG00000029890) FLNA (ENSLLEG00000029849) ENSLLEG00000029786 HCFC1 (ENSLLEG00000029710) TMEM187 (ENSLLEG00000029695) ENSLLEG00000029688 IRAK1 (ENSLLEG00000029624) ENSLLEG00000029612 MECP2 (ENSLLEG00000029597) ##20 ENSLLEG00000029506 ##22 ENSLLEG00000029429 ##22 ENSLLEG00000029412 ENSLLEG00000029395 NAA10 (ENSLLEG00000029337) RENBP (ENSLLEG00000029302) ENSLLEG00000029294 ENSLLEG00000029266 ENSLLEG00000029243 ENSLLEG00000029229 ENSLLEG00000029077 ENSLLEG00000028301 ENSLLEG00000028221 ENSLLEG00000028216 ENSLLEG00000028188 ENSLLEG00000028135 Amniota ANCESTRAL SPECIES 40 ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.b ##24 ENSGT00940000157877.b ENSGT00950000182989.D.a.a ENSGT00390000008992 ENSGT00950000183062.a.b ENSGT00940000157506 ENSGT01050000244882.b.c.b ENSGT00950000182824.a.b.b ENSGT00550000074803 ENSGT00390000013740 ENSGT00940000166196 ENSGT00940000161383 ENSGT00390000011272 ENSGT00940000160502 ENSGT00530000063687.b.b.b ##20 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000162843 ENSGT00940000161969 ENSGT00940000154471.a.a ENSGT00940000164911 ENSGT00390000002034 ENSGT00390000003897.s.a ENSGT00950000182846.a.a.a.a.b ENSGT00940000153588.b ENSGT00390000003897.s.b ENSGT00950000182846.a.a.a.a.a ENSGT00390000018621 ENSGT00940000156650 ENSGT00950000182994.B.a.a.a ENSGT00390000004735.C Mammalia ANCESTRAL SPECIES 46 ENSGT00950000182989.D.a.a ENSGT00390000008992 ENSGT00950000183062.a.b ENSGT00940000157506 ENSGT01050000244882.b.c.b ENSGT00950000183006.A.a.b ENSGT00950000182824.a.b.b ENSGT00390000016224.j.a ENSGT00550000074803 ENSGT00390000013740 ENSGT00940000166196 ENSGT00940000161383 ENSGT00390000011272 ENSGT00940000160502 ENSGT00530000063687.b.b.b ##20 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000162843 ENSGT00940000161969 ENSGT00940000154471.a.a ENSGT00940000164911 ENSGT00390000002034 ENSGT00940000153588.b ENSGT00390000003897.s.b ENSGT00950000182846.a.a.a.a.b ENSGT00390000003897.s.a ENSGT00950000182846.a.a.a.a.a ENSGT00390000018621 ENSGT00940000156650 ENSGT00950000182994.B.a.a.a ENSGT00390000004735.C Platypus MODERN SPECIES 17 SRPK3 (ENSOANG00000005184) IDH3G (ENSOANG00000005183) SSR4 (ENSOANG00000036977) PDZD4 (ENSOANG00000005181) L1CAM (ENSOANG00000009415) AVPR2 (ENSOANG00000005890) ENSOANG00000005889 ARHGAP4 (ENSOANG00000005180) NAA10 (ENSOANG00000002893) RENBP (ENSOANG00000002892) ENSOANG00000041748 HCFC1 (ENSOANG00000005871) TMEM187 (ENSOANG00000016003) IRAK1 (ENSOANG00000011027) ENSOANG00000040139 ##20 ENSOANG00000037077 ##22 OPN1LW (ENSOANG00000011023) ##22 ENSOANG00000045052 TKTL2 (ENSOANG00000045224) ENSOANG00000011020 ENSOANG00000011019 ENSOANG00000036188 FLNA (ENSOANG00000011016) ENSOANG00000011015 ENSOANG00000011014 ENSOANG00000049949 TAFAZZIN (ENSOANG00000012765) ENSOANG00000050800 GDI1 (ENSOANG00000042523) ENSOANG00000004116 PLXNA3 (ENSOANG00000007979) Sauria ANCESTRAL SPECIES 39 ENSGT00940000163880 ENSGT00390000017780.e ENSGT00950000183102.C ENSGT00950000182827.B ENSGT00940000161689 ENSGT00940000158963 ENSGT00950000182824.a.b.b ENSGT00390000016224.i ENSGT00550000074803 ENSGT00390000013740 ENSGT00940000166196 ENSGT00940000161383 ENSGT00390000011272 ENSGT00940000160502 ENSGT00530000063687.b.b.b ##20 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000162843 ENSGT00940000161969 ENSGT01060000248768 ENSGT00940000154471.a.a ENSGT00940000164911 ENSGT00390000002034 ENSGT00390000012715.a ENSGT01030000234637.b.c ENSGT00940000159855 ENSGT00390000003809 ENSGT00940000161807 ENSGT00390000013859 ENSGT00890000139436.A.b ENSGT00940000162821 Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT00950000183062.a.b ENSGT00940000157506 ENSGT01050000244882.b.c.b ENSGT00950000183006.A.a.b ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000157847 ENSGT00950000182824.a.b.b ENSGT00390000016224.i ENSGT00550000074803 ENSGT00390000013740 ENSGT00940000166196 ENSGT00940000161383 ENSGT00390000011272 ENSGT00940000160502 ENSGT00530000063687.b.b.b ##20 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000162843 ENSGT00940000161969 ENSGT01060000248768 ENSGT00940000154471.a.a ENSGT00940000164911 ENSGT00390000002034 ENSGT00390000012715.a ENSGT01030000234637.b.c ENSGT00940000159855 ENSGT00390000003809 ENSGT00940000161807 ENSGT00390000013859 ENSGT00890000139436.A.b ENSGT00940000162821 Episquamata ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000157506 ENSGT01050000244882.b.c.b ENSGT00950000183006.A.a.b ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT00950000182824.a.b.b ENSGT00390000016224.i ENSGT00550000074803 ENSGT00390000013740 ENSGT00940000166196 ENSGT00940000161383 ENSGT00390000011272 ENSGT00940000160502 ENSGT00530000063687.b.b.b ##20 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000162843 ENSGT00940000161969 ENSGT01060000248768 ENSGT00940000154471.a.a ENSGT00940000164911 ENSGT00390000002034 ENSGT00390000012715.a ENSGT01030000234637.b.c ENSGT00940000159855 ENSGT00390000003809 ENSGT00940000161807 ENSGT00390000013859 ENSGT00890000139436.A.b ENSGT00940000162821 Laterata ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000008992 ENSGT00950000183062.a.b ENSGT00940000157506 ENSGT01050000244882.b.c.b ENSGT00950000183006.A.a.b ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT00950000182824.a.b.b ENSGT00390000016224.i ENSGT00550000074803 ENSGT00390000013740 ENSGT00940000166196 ENSGT00940000161383 ENSGT00390000011272 ENSGT00940000160502 ENSGT00530000063687.b.b.b ##20 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000162843 ENSGT00940000161969 ENSGT00940000154471.a.a ENSGT00940000164911 ENSGT00390000002034 ENSGT00390000012715.a ENSGT01030000234637.b.c ENSGT00940000159855 ENSGT00390000003809 ENSGT00390000013859 ENSGT00890000139436.A.b ENSGT00940000162821 ENSGT00940000155170 ENSGT00390000010825.a Argentine black and white tegu MODERN SPECIES 12 PDZD4 (ENSSMRG00000002457) L1CAM (ENSSMRG00000002421) AVPR2 (ENSSMRG00000002377) ENSSMRG00000002373 CAV3 (ENSSMRG00000002372) ARHGAP4 (ENSSMRG00000002350) ENSSMRG00000002344 NAA10 (ENSSMRG00000002335) ENSSMRG00000002333 RENBP (ENSSMRG00000002327) ENSSMRG00000002324 HCFC1 (ENSSMRG00000001871) TMEM187 (ENSSMRG00000001862) IRAK1 (ENSSMRG00000001848) MECP2 (ENSSMRG00000001840) ##20 ENSSMRG00000000831 ##22 ENSSMRG00000000019 ##22 TEX28 (ENSSMRG00000015688) TKTL2 (ENSSMRG00000015686) ENSSMRG00000015685 ENSSMRG00000015648 ENSSMRG00000015647 ENSSMRG00000015646 TREX2 (ENSSMRG00000015645) SYP (ENSSMRG00000015644) CACNA1F (ENSSMRG00000015642) CCDC22 (ENSSMRG00000015640) PPP1R3F (ENSSMRG00000015639) GPR173 (ENSSMRG00000015637) TSPYL1 (ENSSMRG00000015636) HSD17B10 (ENSSMRG00000015635) Common wall lizard MODERN SPECIES 8 PDZD4 (ENSPMRG00000021208) L1CAM (ENSPMRG00000021230) ENSPMRG00000021287 ENSPMRG00000021296 AVPR2 (ENSPMRG00000021305) ENSPMRG00000021311 CAV3 (ENSPMRG00000021320) ARHGAP4 (ENSPMRG00000021373) NAA10 (ENSPMRG00000021587) RENBP (ENSPMRG00000021609) ENSPMRG00000021615 HCFC1 (ENSPMRG00000021629) TMEM187 (ENSPMRG00000021643) IRAK1 (ENSPMRG00000021661) MECP2 (ENSPMRG00000021754) ##20 ENSPMRG00000021757 ##22 ENSPMRG00000021772 ##22 TEX28 (ENSPMRG00000021784) ENSPMRG00000021797 ENSPMRG00000021817 ENSPMRG00000021824 TREX2 (ENSPMRG00000021832) SYP (ENSPMRG00000021837) CACNA1F (ENSPMRG00000022455) CCDC22 (ENSPMRG00000023634) PPP1R3F (ENSPMRG00000023641) GPR173 (ENSPMRG00000023644) TSPYL1 (ENSPMRG00000023646) ENSPMRG00000023649 RIBC1 (ENSPMRG00000023653) SMC1A (ENSPMRG00000023656) Toxicofera ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000008992 ENSGT00950000183062.a.b ENSGT00940000157506 ENSGT01050000244882.b.c.b ENSGT00950000183006.A.a.b ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT00950000182824.a.b.b ENSGT00390000016224.i ENSGT00550000074803 ENSGT00390000013740 ENSGT00940000166196 ENSGT00940000161383 ENSGT00390000011272 ENSGT00940000160502 ENSGT00530000063687.b.b.b ##20 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000162843 ENSGT00940000161969 ENSGT01060000248768 ENSGT00940000154471.a.a ENSGT00940000164911 ENSGT00390000002034 ENSGT00390000012715.a ENSGT01030000234637.b.c ENSGT00940000159855 ENSGT00390000003809 ENSGT00940000161807 ENSGT00390000013859 ENSGT00890000139436.A.b ENSGT00940000162821 Lizard MODERN SPECIES 1 ENSACAG00000040437 L1CAM (ENSACAG00000011487) AVPR2 (ENSACAG00000021016) ENSACAG00000011878 CAV3 (ENSACAG00000040122) ARHGAP4 (ENSACAG00000011924) ENSACAG00000012219 NAA10 (ENSACAG00000012233) RENBP (ENSACAG00000012283) ENSACAG00000012345 HCFC1 (ENSACAG00000012364) TMEM187 (ENSACAG00000012472) IRAK1 (ENSACAG00000012475) ENSACAG00000041142 MECP2 (ENSACAG00000012519) ##20 ENSACAG00000012537 ##22 ENSACAG00000012605 ##22 TEX28 (ENSACAG00000012680) ENSACAG00000012690 ENSACAG00000012827 ENSACAG00000012833 ENSACAG00000039495 ENSACAG00000024462 ENSACAG00000041583 ENSACAG00000012912 SYP (ENSACAG00000012914) CACNA1F (ENSACAG00000012965) ENSACAG00000044867 CCDC22 (ENSACAG00000013447) FOXP3 (ENSACAG00000013491) ENSACAG00000021937 tuatara MODERN SPECIES 802 HCFC1 (ENSSPUG00000011906) IRAK1 (ENSSPUG00000012015) ENSSPUG00000012166 ##22 ENSSPUG00000012390 ##22 TKTL2 (ENSSPUG00000012419) ENSSPUG00000012439 ENSSPUG00000012452 ENSSPUG00000012459 ENSSPUG00000012467 ENSSPUG00000012477 ENSSPUG00000012485 ENSSPUG00000012496 ENSSPUG00000012508 Archelosauria ANCESTRAL SPECIES 69 ENSGT00390000013740 ENSGT00940000161383 ENSGT00390000011272 ENSGT00940000160502 ENSGT00530000063687.b.b.b ##20 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000161969 ENSGT01060000248768 ENSGT00940000154471.a.a ENSGT00950000183062.a.b ENSGT00940000157506 ENSGT00390000008992 ENSGT00950000182989.D.a.a ENSGT00940000157877.b ENSGT00950000182955.a.b.a Cryptodira ANCESTRAL SPECIES 119 ENSGT00390000011272 ENSGT00940000160502 ENSGT00530000063687.b.b.b ##20 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000161969 ENSGT01060000248768 ENSGT00940000154471.a.a Testudinoidea ANCESTRAL SPECIES 51 ENSGT00390000011272 ENSGT00940000160502 ENSGT00530000063687.b.b.b.j ##20 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000161969 ENSGT01060000248768 ENSGT00940000154471.a.a ENSGT00940000155311.C ENSGT00940000160765 ENSGT00940000155445 ENSGT00940000161880 ENSGT00940000153588.b ENSGT00390000003897.s.a ENSGT00950000182846.a.a.a.a.b ENSGT00950000182846.a.a.a.a.a ENSGT00390000018621 ENSGT00940000156650 ENSGT00950000182994.B.a.a.a Emydidae ANCESTRAL SPECIES 161 ENSGT00390000011272 ENSGT00940000160502 ENSGT00530000063687.b.b.b.j ##20 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000161969 ENSGT01060000248768 painted turtle MODERN SPECIES 1371 TMEM187 (ENSCPBG00000006847) IRAK1 (ENSCPBG00000006854) MECP2 (ENSCPBG00000006868) ##20 ENSCPBG00000006874 ##22 ENSCPBG00000006893 ##22 TKTL2 (ENSCPBG00000006938) ENSCPBG00000007031 Testudinidae ANCESTRAL SPECIES 119 ENSGT00390000011272 ENSGT00940000160502 ENSGT00530000063687.b.b.b.j ##20 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000161969 ENSGT01060000248768 ENSGT00940000154471.a.a Abingdon island giant tortoise MODERN SPECIES 548 IRAK1 (ENSCABG00000011210) MECP2 (ENSCABG00000011208) ##20 ENSCABG00000011206 ##22 ENSCABG00000011205 ##22 Chinese turtle MODERN SPECIES 294 MECP2 (ENSPSIG00000002254) ##20 ENSPSIG00000002239 ##22 ENSPSIG00000002231 ##22 Archosauria ANCESTRAL SPECIES 108 ENSGT00390000013740 ENSGT00940000161383 ENSGT00530000063687.b.b.b ##20 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 Aves ANCESTRAL SPECIES 108 ENSGT00390000013740 ENSGT00940000161383 ENSGT00530000063687.b.b.b ##20 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 Neognathae ANCESTRAL SPECIES 82 ENSGT00390000013740 ENSGT00940000161383 ENSGT00530000063687.b.b.b ##20 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 Galloanserae ANCESTRAL SPECIES 162 ENSGT00530000063687.b.b.b ##20 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a ##22 Phasianidae ANCESTRAL SPECIES 124 ENSGT00530000063687.b.b.b ##20 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a ##22 Phasianidae_b ANCESTRAL SPECIES 121 ENSGT00530000063687.b.b.b ##20 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a ##22 Chicken MODERN SPECIES 129 WDR45 (ENSGALG00010001902) PLP2 (ENSGALG00010001870) ENSGALG00010001868 ENSGALG00010001853 MECP2 (ENSGALG00010001835) ##20 OPN2SW (ENSGALG00010001810) ##22 Neognathae_b ANCESTRAL SPECIES 76 ENSGT00390000013740 ENSGT00940000161383 ENSGT00530000063687.b.b.b ##20 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 Passeriformes ANCESTRAL SPECIES 99 ENSGT00390000013740 ENSGT00940000161383 ENSGT00530000063687.b.b.b ##20 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 Passeriformes_d ANCESTRAL SPECIES 94 ENSGT00390000013740 ENSGT00940000161383 ENSGT00530000063687.b.b.b ##20 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 Flycatcher MODERN SPECIES 419 ENSFALG00000009285 ##22 Passeriformes_g ANCESTRAL SPECIES 104 ENSGT00390000013740 ENSGT00940000161383 ENSGT00530000063687.b.b.b ##20 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 Passeroidea ANCESTRAL SPECIES 109 ENSGT00390000013740 ENSGT00940000161383 ENSGT00530000063687.b.b.b ##20 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ##22 Zebra finch DUPLICATION Zebra finch MODERN SPECIES 38 ENSTGUG00000015465 ENSTGUG00000021389 ENSTGUG00000028745 ENSTGUG00000028409 ENSTGUG00000026008 ENSTGUG00000019864 ENSTGUG00000019181 ENSTGUG00000016885 ENSTGUG00000028534 ENSTGUG00000023830 ENSTGUG00000022053 ENSTGUG00000019600 ENSTGUG00000024745 ENSTGUG00000021254 ENSTGUG00000020036 ##20 ENSTGUG00000021834 ##22 ENSTGUG00000028475 ##22 ENSTGUG00000017464 ENSTGUG00000021680 ENSTGUG00000029006 ENSTGUG00000029370 ENSTGUG00000019992 Zebra finch MODERN SPECIES 38 TRMT112 (ENSTGUG00000026050) ENSTGUG00000026133 ENSTGUG00000023429 ENSTGUG00000025676 ENSTGUG00000028030 ENSTGUG00000026708 ENSTGUG00000023010 ENSTGUG00000020916 ENSTGUG00000020650 ENSTGUG00000023057 ENSTGUG00000019880 ENSTGUG00000019525 ENSTGUG00000019253 ENSTGUG00000025859 ##20 ENSTGUG00000023188 SWS2 (ENSTGUG00000026520) ##22 LWS (ENSTGUG00000020605) ##22 ENSTGUG00000022784 ENSTGUG00000026390 ENSTGUG00000024305 ENSTGUG00000029033 ENSTGUG00000023368 ENSTGUG00000025286 ENSTGUG00000026718 SRPK3 (ENSTGUG00000021949) OTUD5 (ENSTGUG00000025602) ENSTGUG00000025634 ENSTGUG00000029601 ENSTGUG00000019568 ENSTGUG00000020951 ENSTGUG00000022796 Vertebrata ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 Cyclostomata ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 Lamprey MODERN SPECIES 1109 znf143a (ENSPMAG00000003747) ipo7 (ENSPMAG00000003697) ENSPMAG00000003694 nat10 (ENSPMAG00000003621) ENSPMAG00000003620 ##22 Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 101 ENSGT00390000000510 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000162027 ENSGT00730000111591 ENSGT00530000064743 ENSGT00550000074976 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000165441 ENSGT00940000153772.A ENSGT00660000097187 ENSGT00390000005529.b ENSGT00390000009899.b ENSGT01050000244956.a.b ENSGT00940000155263 ENSGT00940000154380.a Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 116 ENSGT00390000000510 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000162027 ENSGT00730000111591 ENSGT00530000064743 ENSGT00550000074976 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000165441 ENSGT00940000153772.A ENSGT00660000097187 ENSGT00390000005529.b ENSGT00390000009899.b ENSGT01050000244956.a.b ENSGT00940000155263 Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000000510 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000162027 ENSGT00730000111591 ENSGT00530000064743 ENSGT00550000074976 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000165441 ENSGT00940000153772.A ENSGT00660000097187 ENSGT00390000005529.b ENSGT00390000009899.b ENSGT00940000155263 ENSGT00940000154380.a Amniota ANCESTRAL SPECIES 45 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT01030000235325 ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000160284 ENSGT00940000156551 ENSGT00940000162777 ENSGT00940000153561.b.b ENSGT00940000157610 ENSGT00940000160461 ENSGT00390000003014 ENSGT00950000182939.a.b.a ENSGT00940000165068 ENSGT00940000156265 ENSGT01060000248595.b.a.a ENSGT00940000161995 ENSGT00390000009250 ENSGT00390000004323.a Sauria ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000153561.b.b ENSGT00940000157610 ENSGT00940000162777.b ENSGT00940000162777.a ENSGT00940000162430 ENSGT00940000156551 ENSGT00940000173712 ENSGT00940000158997 ENSGT00730000111007.a.a ENSGT00940000164333 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000159926 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159484 ENSGT00940000157206 ENSGT01030000235325 ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT00400000022095.a ENSGT00640000091917 ENSGT00390000006835 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006086 ENSGT00970000194206 ENSGT00940000155977 ENSGT00390000016897 Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000159926 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159484 ENSGT00940000157206 ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT00400000022095.a ENSGT00640000091917 ENSGT00390000006835 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006086 ENSGT00970000194206 ENSGT00940000155977 ENSGT00390000016897 ENSGT00390000013963 Episquamata ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00960000189403.b ENSGT00940000162430.a.a ENSGT00940000162777.a.l ENSGT00940000156551 ENSGT00940000173712 ENSGT00940000158997 ENSGT00730000111007.a.a ENSGT00940000164333 ENSGT00390000016211 ENSGT00530000063702.a ENSGT00390000014443 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000159926 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159484 ENSGT00940000157206 ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT00400000022095.a ENSGT00640000091917 ENSGT00390000006835 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006086 ENSGT00970000194206 ENSGT00940000155977 ENSGT00390000016897 ENSGT00390000013963 Toxicofera ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00940000162430.a.b ENSGT00940000162777.a.k.a.a.a ENSGT00940000162777.a.k.a.a.b ENSGT00940000162430.a.a ENSGT00940000162777.a.l ENSGT00940000156551 ENSGT00940000173712 ENSGT00940000158997 ENSGT00730000111007.a.a ENSGT00390000016211 ENSGT00530000063702.a ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000159926 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159484 ENSGT00940000157206 ENSGT00950000182981.b.f.a.e.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT00400000022095.a ENSGT00640000091917 ENSGT00390000006835 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006086 ENSGT00970000194206 ENSGT00940000155977 ENSGT00390000013963 Elapidae ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00940000162777.a.k.a.a.a ENSGT00940000162777.a.k.a.a.b ENSGT00940000162430.a.a ENSGT00940000162777.a.l ENSGT00940000156551 ENSGT00940000173712 ENSGT00940000158997 ENSGT00730000111007.a.a ENSGT00390000016211 ENSGT00530000063702.a ENSGT00950000182946.cb ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT01010000222360.E.c.l ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c.k ENSGT00940000159926.a ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159484 ENSGT00940000157206 ENSGT00950000182981.b.f.a.e.a ENSGT00400000022095.a ENSGT00640000091917 ENSGT00390000006835 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006086 ENSGT00970000194206 ENSGT00940000155977 ENSGT00390000013963 ENSGT00940000160121 Elapidae_a ANCESTRAL SPECIES 207 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c.k ENSGT00940000159926.a ENSGT00530000063347.B Acanthophiinae ANCESTRAL SPECIES 197 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c.k ENSGT00940000159926.a ENSGT00530000063347.B Eastern brown snake MODERN SPECIES 248 ENSPTXG00000014207 OPN1SW (ENSPTXG00000014206) ##22 CALU (ENSPTXG00000014205) IRF5 (ENSPTXG00000014204) TNPO3 (ENSPTXG00000013807) Blue-lipped sea krait MODERN SPECIES 4330 OPN1SW (ENSLLTG00000016447) ##22 Lizard MODERN SPECIES 1424 ENSACAG00000030946 OPN1SW (ENSACAG00000008827) ##22 CALU (ENSACAG00000008928) Laterata ANCESTRAL SPECIES 50 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000159926 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159484 ENSGT00940000157206 ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT00400000022095.a ENSGT00640000091917 ENSGT00390000006835 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006086 ENSGT00940000155977 ENSGT00390000016897 ENSGT00390000013963 ENSGT00940000160121 Common wall lizard MODERN SPECIES 1 ENSPMRG00000014111 ENSPMRG00000014098 ENSPMRG00000014092 ENSPMRG00000014085 ENSPMRG00000014078 ENSPMRG00000014072 ENSPMRG00000014060 ENSPMRG00000014046 ENSPMRG00000014031 ENSPMRG00000015750 ENSPMRG00000015732 ATP6V1FNB (ENSPMRG00000015731) ATP6V1F (ENSPMRG00000015729) FLNC (ENSPMRG00000014781) ENSPMRG00000014658 OPN1SW (ENSPMRG00000014651) ##22 CALU (ENSPMRG00000014645) IRF5 (ENSPMRG00000014637) TNPO3 (ENSPMRG00000014622) ENSPMRG00000014617 TSPAN33 (ENSPMRG00000014611) SMO (ENSPMRG00000014552) ENSPMRG00000014541 AHCYL2 (ENSPMRG00000014538) STRIP2 (ENSPMRG00000014533) SMKR1 (ENSPMRG00000014530) NRF1 (ENSPMRG00000014522) UBE2H (ENSPMRG00000014518) ZC3HC1 (ENSPMRG00000014510) KLHDC10 (ENSPMRG00000014505) ENSPMRG00000014461 Argentine black and white tegu MODERN SPECIES 6 SCO2 (ENSSMRG00000013625) ENSSMRG00000013624 ENSSMRG00000013623 TYMP (ENSSMRG00000013622) ENSSMRG00000013585 ENSSMRG00000013584 ENSSMRG00000013583 ENSSMRG00000013581 ENSSMRG00000013580 ENSSMRG00000013578 GARIN1B (ENSSMRG00000013577) ENSSMRG00000013576 ENSSMRG00000013575 FLNC (ENSSMRG00000013567) ENSSMRG00000013564 OPN1SW (ENSSMRG00000013555) ##22 CALU (ENSSMRG00000013554) IRF5 (ENSSMRG00000013552) TNPO3 (ENSSMRG00000013551) TSPAN33 (ENSSMRG00000013550) SMO (ENSSMRG00000013549) AHCYL2 (ENSSMRG00000013548) STRIP2 (ENSSMRG00000013547) SMKR1 (ENSSMRG00000013546) NRF1 (ENSSMRG00000013545) UBE2H (ENSSMRG00000013542) ZC3HC1 (ENSSMRG00000013541) KLHDC10 (ENSSMRG00000013540) ENSSMRG00000013480 ENSSMRG00000013477 TMEM209 (ENSSMRG00000013475) tuatara MODERN SPECIES 437 KCP (ENSSPUG00000007280) ATP6V1FNB (ENSSPUG00000007269) ATP6V1F (ENSSPUG00000007261) FLNC (ENSSPUG00000007046) ENSSPUG00000006999 OPN1SW (ENSSPUG00000006986) ##22 CALU (ENSSPUG00000006976) ODF3B (ENSSPUG00000006965) TYMP (ENSSPUG00000006955) ENSSPUG00000006950 NCAPH2 (ENSSPUG00000006882) MIOX (ENSSPUG00000006856) LMF2 (ENSSPUG00000006837) ENSSPUG00000006751 ENSSPUG00000006737 ENSSPUG00000006730 ENSSPUG00000006718 ENSSPUG00000006710 Archelosauria ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000157610 ENSGT00940000162777.b ENSGT00940000162777.a ENSGT00940000162430 ENSGT00940000156551 ENSGT00940000160284 ENSGT01100000263561.A ENSGT00940000158997 ENSGT00730000111007.a.a ENSGT00940000164333 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000159926 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159484 ENSGT00940000157206 ENSGT01030000235325 ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT00400000022095.a ENSGT00640000091917 ENSGT00390000006835 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006086 ENSGT00940000155977 ENSGT00390000016897 ENSGT00390000013963 Archosauria ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000003014 ENSGT00940000160461 ENSGT00940000153561.b.b ENSGT00940000157610 ENSGT00940000162777.a ENSGT00940000162430 ENSGT00940000156551 ENSGT00940000160284 ENSGT01100000263561.A ENSGT00940000158997 ENSGT00730000111007.a.a ENSGT00940000164333 ENSGT00940000165748 ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000159926 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159484 ENSGT00940000157206 ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT00400000022095.a ENSGT00640000091917 ENSGT00390000006835 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006086 ENSGT00940000155977 ENSGT00390000016897 ENSGT00390000013963 ENSGT00390000015907 Aves ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000003014 ENSGT00940000160461 ENSGT00940000153561.b.b ENSGT00940000157610 ENSGT00940000162777.a ENSGT00940000162430 ENSGT00940000156551 ENSGT00940000160284 ENSGT01100000263561.A ENSGT00940000158997 ENSGT00730000111007.a.a ENSGT00940000164333 ENSGT00940000165748 ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000159926 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159484 ENSGT00940000157206 ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT00400000022095.a ENSGT00640000091917 ENSGT00390000006835 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006086 ENSGT00940000155977 ENSGT00390000016897 ENSGT00390000013963 ENSGT00390000015907 Neognathae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000016211 ENSGT00940000154380.a ENSGT00940000155263 ENSGT00390000009899.b ENSGT00390000005529.b ENSGT00660000097187 ENSGT00940000153772.A ENSGT00940000156878 ENSGT00940000165441 ENSGT00940000161709 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000159260 ENSGT00940000165748 ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000159926 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159484 ENSGT00940000157206 ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT00400000022095.a ENSGT00640000091917 ENSGT00390000006835 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006086 ENSGT00940000155977 ENSGT00390000016897 ENSGT00390000013963 ENSGT00390000015907 Neognathae_b ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00530000063702.a ENSGT00390000016211 ENSGT00940000154380.a ENSGT00940000155263 ENSGT00390000009899.b ENSGT00390000005529.b ENSGT00940000181929 ENSGT00940000153772.A ENSGT00940000156878 ENSGT00940000165441 ENSGT00940000161709 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000159260 ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000159926 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159484 ENSGT00940000157206 ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT00400000022095.a ENSGT00640000091917 ENSGT00390000006835 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006086 ENSGT00940000155977 ENSGT00390000016897 ENSGT00390000013963 ENSGT00390000015907 Neognathae_c ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000009250 ENSGT00390000004323.a ENSGT00390000014443 ENSGT00530000063702.a ENSGT00390000016211 ENSGT00940000154380.a ENSGT00940000155263 ENSGT00390000009899.b ENSGT00390000005529.b ENSGT00940000153772.A ENSGT00940000156878 ENSGT00940000165441 ENSGT00940000161709 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000159260 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000159926 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159484 ENSGT00940000157206 ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT00400000022095.a ENSGT00640000091917 ENSGT00390000006835 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006086 ENSGT00940000155977 ENSGT00390000013963 ENSGT00390000015907 ENSGT00940000160121 Golden eagle MODERN SPECIES 21 MIOX (ENSACCG00020000341) ADM2 (ENSACCG00020000363) SBF1 (ENSACCG00020000513) PPP6R2 (ENSACCG00020000657) DENND6B (ENSACCG00020000731) GCC1 (ENSACCG00020000751) ENSACCG00020000771 PAX4 (ENSACCG00020000810) SND1 (ENSACCG00020000852) ENSACCG00020000929 LRRC4 (ENSACCG00020000969) ENSACCG00020000984 ENSACCG00020000999 ATP6V1F (ENSACCG00020001014) ENSACCG00020002182 OPN1SW (ENSACCG00020002213) ##22 CALU (ENSACCG00020002256) IRF5 (ENSACCG00020002280) TNPO3 (ENSACCG00020002315) TSPAN33 (ENSACCG00020002331) SMO (ENSACCG00020002346) AHCYL2 (ENSACCG00020002382) STRIP2 (ENSACCG00020002417) SMKR1 (ENSACCG00020002441) NRF1 (ENSACCG00020002465) UBE2H (ENSACCG00020002503) ZC3HC1 (ENSACCG00020002532) KLHDC10 (ENSACCG00020002560) TMEM209 (ENSACCG00020002593) ENSACCG00020002618 CPA2 (ENSACCG00020002634) Kakapo MODERN SPECIES 20 ENSSHBG00005012269 OPN1SW (ENSSHBG00005012285) ##22 CALU (ENSSHBG00005012307) IRF5 (ENSSHBG00005012323) TNPO3 (ENSSHBG00005012339) TSPAN33 (ENSSHBG00005012359) SMO (ENSSHBG00005012379) AHCYL2 (ENSSHBG00005012421) STRIP2 (ENSSHBG00005012450) SMKR1 (ENSSHBG00005012493) NRF1 (ENSSHBG00005012509) UBE2H (ENSSHBG00005012549) ZC3HC1 (ENSSHBG00005012560) KLHDC10 (ENSSHBG00005012575) TMEM209 (ENSSHBG00005012589) CPA2 (ENSSHBG00005012601) ENSSHBG00005012613 Passeriformes ANCESTRAL SPECIES 52 ENSGT00940000164333 ENSGT00730000111007.a.a ENSGT00940000158997 ENSGT01100000263561.A ENSGT00940000160284 ENSGT00940000156551 ENSGT00940000162777.a.b.b.a ENSGT00940000153561.b.b ENSGT00940000160461 ENSGT00390000003014 ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000159926 ENSGT00530000063347.B ENSGT00510000047270 ENSGT00940000159260 Great tit MODERN SPECIES 278 ENSPMJG00000000928 ENSPMJG00000000944 ENSPMJG00000000952 GOLGB1 (ENSPMJG00000000970) HCLS1 (ENSPMJG00000000982) OR10P1 (ENSPMJG00000000994) NME6 (ENSPMJG00000001027) ENSPMJG00000001048 ENSPMJG00000001059 ATP6V1F (ENSPMJG00000001066) ENSPMJG00000001069 ENSPMJG00000001073 OPN1SW (ENSPMJG00000001095) ##22 CALU (ENSPMJG00000001098) IRF5 (ENSPMJG00000001099) Passeriformes_d ANCESTRAL SPECIES 48 ENSGT00940000164333 ENSGT00730000111007.a.a ENSGT00940000158997 ENSGT01100000263561.A ENSGT00940000160284 ENSGT00940000156551 ENSGT00940000162777.a.b.b.a ENSGT00940000153561.b.b ENSGT00940000160461 ENSGT00390000003014 ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000159926 ENSGT00530000063347.B ENSGT00510000047270 ENSGT00940000159260 Passeriformes_g ANCESTRAL SPECIES 61 ENSGT00940000164333 ENSGT00730000111007.a.a ENSGT00940000158997 ENSGT01100000263561.A ENSGT00940000160284 ENSGT00940000156551 ENSGT00940000162777.a.b.b.a ENSGT00940000153561.b.b ENSGT00940000160461 ENSGT00390000003014 ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000159926 ENSGT00530000063347.B ENSGT00510000047270 ENSGT00940000159260 Passeroidea ANCESTRAL SPECIES 64 ENSGT00940000164333 ENSGT00730000111007.a.a ENSGT00940000158997 ENSGT01100000263561.A ENSGT00940000160284 ENSGT00940000156551 ENSGT00940000162777.a.b.b.a ENSGT00940000153561.b.b ENSGT00940000160461 ENSGT00390000003014 ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000159926 ENSGT00530000063347.B ENSGT00510000047270 ENSGT00940000159260 Zebra finch DUPLICATION Zebra finch MODERN SPECIES 72 ENSTGUG00000028384 IMPDH1 (ENSTGUG00000029733) ENSTGUG00000021573 ENSTGUG00000019852 ENSTGUG00000027720 OPN1SW (ENSTGUG00000025790) ##22 ENSTGUG00000016061 ATP6V1F (ENSTGUG00000028137) ENSTGUG00000028652 ENSTGUG00000024637 NME6 (ENSTGUG00000016027) OR10P1 (ENSTGUG00000016018) HCLS1 (ENSTGUG00000015985) GOLGB1 (ENSTGUG00000029414) ENSTGUG00000026659 ENSTGUG00000019562 ##22 ENSTGUG00000022849 ENSTGUG00000027747 ENSTGUG00000022869 ENSTGUG00000026101 ENSTGUG00000026707 ENSTGUG00000026944 Zebra finch MODERN SPECIES 72 ENSTGUG00000026707 ENSTGUG00000026101 ENSTGUG00000022869 ENSTGUG00000027747 ENSTGUG00000022849 ENSTGUG00000019562 ##22 ENSTGUG00000026659 GOLGB1 (ENSTGUG00000029414) HCLS1 (ENSTGUG00000015985) OR10P1 (ENSTGUG00000016018) NME6 (ENSTGUG00000016027) ENSTGUG00000024637 ENSTGUG00000028652 ATP6V1F (ENSTGUG00000028137) ENSTGUG00000016061 OPN1SW (ENSTGUG00000025790) ##22 ENSTGUG00000027720 ENSTGUG00000019852 ENSTGUG00000021573 IMPDH1 (ENSTGUG00000029733) ENSTGUG00000028384 RBM28 (ENSTGUG00000021871) LEP (ENSTGUG00000022426) ENSTGUG00000026385 ENSTGUG00000023344 ENSTGUG00000028323 ENSTGUG00000028871 ENSTGUG00000027032 NCAPH2 (ENSTGUG00000024475) ENSTGUG00000019547 CPT1B (ENSTGUG00000021686) Medium ground finch MODERN SPECIES 374 ENSGFOG00000014345 GOLGB1 (ENSGFOG00000014343) HCLS1 (ENSGFOG00000014339) ENSGFOG00000014335 ENSGFOG00000014328 ENSGFOG00000014323 ENSGFOG00000014320 FLNC (ENSGFOG00000012489) OPN1SW (ENSGFOG00000012265) ##22 CALU (ENSGFOG00000012260) ENSGFOG00000012257 TNPO3 (ENSGFOG00000012244) Flycatcher MODERN SPECIES 226 ENSFALG00000010561 ENSFALG00000010562 ENSFALG00000010568 ENSFALG00000023997 ENSFALG00000010574 ENSFALG00000024306 ENSFALG00000024055 ENSFALG00000028534 ENSFALG00000010581 ENSFALG00000025089 ENSFALG00000010598 ATP6V1F (ENSFALG00000023295) ENSFALG00000027211 ENSFALG00000010616 OPN1SW (ENSFALG00000010652) ##22 CALU (ENSFALG00000010657) ENSFALG00000027095 ENSFALG00000010667 Cryptodira ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000155977 ENSGT00390000006086 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT01030000235325 ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000159926 ENSGT00530000063347.B Testudinoidea ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000155977 ENSGT00390000006086 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT01030000235325 ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b.a ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000159926 ENSGT00530000063347.B Emydidae ANCESTRAL SPECIES 136 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b.a ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000159926 ENSGT00530000063347.B painted turtle MODERN SPECIES 882 OPN1SW (ENSCPBG00000015807) ##22 CALU (ENSCPBG00000015817) ENSCPBG00000015818 KCP (ENSCPBG00000015819) ENSCPBG00000015820 ATP6V1FNB (ENSCPBG00000015821) ATP6V1F (ENSCPBG00000015822) FLNC (ENSCPBG00000015869) ENSCPBG00000017496 TNPO3 (ENSCPBG00000017497) IRF5 (ENSCPBG00000017498) COPG2 (ENSCPBG00000017502) MEST (ENSCPBG00000017503) CEP41 (ENSCPBG00000017505) CPA1 (ENSCPBG00000017506) ENSCPBG00000017507 Three-toed box turtle MODERN SPECIES 361 ENSTMTG00000008386 KCP (ENSTMTG00000008409) ATP6V1FNB (ENSTMTG00000008491) ATP6V1F (ENSTMTG00000008515) ENSTMTG00000009378 ENSTMTG00000020484 OPN1SW (ENSTMTG00000020492) ##22 CALU (ENSTMTG00000020499) IRF5 (ENSTMTG00000020505) TNPO3 (ENSTMTG00000020512) Testudinidae ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000155977 ENSGT00390000006086 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT01030000235325 ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b.a ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000159926 ENSGT00530000063347.B Goode s thornscrub tortoise MODERN SPECIES TMEM209 (ENSGEVG00005006382) KLHDC10 (ENSGEVG00005006423) ZC3HC1 (ENSGEVG00005006460) UBE2H (ENSGEVG00005006498) NRF1 (ENSGEVG00005006539) ENSGEVG00005006597 STRIP2 (ENSGEVG00005006654) AHCYL2 (ENSGEVG00005006985) SMO (ENSGEVG00005007448) TSPAN33 (ENSGEVG00005007520) KCP (ENSGEVG00005007588) ATP6V1FNB (ENSGEVG00005007839) ATP6V1F (ENSGEVG00005007853) FLNC (ENSGEVG00005008504) ENSGEVG00005011240 OPN1SW (ENSGEVG00005011418) ##22 CALU (ENSGEVG00005011482) IRF5 (ENSGEVG00005011520) TNPO3 (ENSGEVG00005011559) ENSGEVG00005011590 ENSGEVG00005011660 ENSGEVG00005011748 ENSGEVG00005011824 ENSGEVG00005012039 ENSGEVG00005012107 ENSGEVG00005012288 ENSGEVG00005012331 ENSGEVG00005012346 ENSGEVG00005012380 ENSGEVG00005012402 ENSGEVG00005000006 Abingdon island giant tortoise MODERN SPECIES 2205 KCP (ENSCABG00000001788) ENSCABG00000001806 ATP6V1FNB (ENSCABG00000001807) ATP6V1F (ENSCABG00000001811) FLNC (ENSCABG00000001818) ENSCABG00000001837 OPN1SW (ENSCABG00000001840) ##22 CALU (ENSCABG00000001842) Chinese turtle MODERN SPECIES 16 ENSPSIG00000002294 OPN1SW (ENSPSIG00000002939) ##22 CALU (ENSPSIG00000002929) ENSPSIG00000000264 ENSPSIG00000002927 Mammalia ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT01030000235325 ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00940000154156.d ENSGT00530000064743 ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 ENSGT00940000153772.A ENSGT00390000008140 Theria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT01030000235325 ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00940000154156.d ENSGT00530000064743 ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 ENSGT00940000153772.A ENSGT00390000008140 Eutheria ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT01030000235325 ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00390000014201 ENSGT00940000154156.d ENSGT00530000064743 ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 ENSGT00940000153772.A Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT01030000235325 ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00940000169914 ENSGT00950000185983 ENSGT00390000014201 ENSGT00940000154156.d ENSGT00530000064743 ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT01030000235325 ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00390000014201 ENSGT00940000154156.d ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 ENSGT00940000153772.A ENSGT00390000008140 Primates ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT01030000235325 ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00390000014201 ENSGT00940000154156.d ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 ENSGT00940000153772.A ENSGT00390000008140 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT01030000235325 ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00390000014201 ENSGT00940000154156.d ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 ENSGT00940000153772.A ENSGT00390000008140 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT01030000235325 ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00390000014201 ENSGT00940000154156.d.n.a ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00550000076332 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 ENSGT00940000153772.A Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT01030000235325 ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00390000014201 ENSGT00940000154156.d.n.a.b ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00550000076332 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 ENSGT00940000153772.A Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00390000003721.d.a.d ENSGT00390000013354.d.a.a.a.a ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00390000014201 ENSGT00940000154156.d.n.a.b ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00550000076332 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 ENSGT00940000153772.A Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 90 ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00390000003721.d.a.d ENSGT00390000013354.d.a.a.a.a ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00390000014201 ENSGT00940000154156.d.n.a.b ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 ENSGT00940000153772.A ENSGT00390000008140 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1271 AHCYL2 (ENSRBIG00000041432) SMO (ENSRBIG00000044020) TSPAN33 (ENSRBIG00000039156) ENSRBIG00000014871 ENSRBIG00000041904 TNPO3 (ENSRBIG00000042549) IRF5 (ENSRBIG00000044839) ENSRBIG00000031121 KCP (ENSRBIG00000039481) ATP6V1FNB (ENSRBIG00000008769) ATP6V1F (ENSRBIG00000042625) FLNC (ENSRBIG00000026980) CCDC136 (ENSRBIG00000044440) OPN1SW (ENSRBIG00000037951) ##22 CALU (ENSRBIG00000032938) GARIN1B (ENSRBIG00000030558) GARIN1A (ENSRBIG00000039139) HILPDA (ENSRBIG00000027583) IMPDH1 (ENSRBIG00000030944) PRRT4 (ENSRBIG00000043786) RBM28 (ENSRBIG00000033990) LEP (ENSRBIG00000043909) ENSRBIG00000028651 LRRC4 (ENSRBIG00000001277) CCDC174 (ENSRBIG00000036299) ENSRBIG00000037898 GRIP2 (ENSRBIG00000040208) SLC6A6 (ENSRBIG00000029514) ENSRBIG00000034399 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2112 NRF1 (ENSRROG00000030640) SMKR1 (ENSRROG00000044193) STRIP2 (ENSRROG00000024509) AHCYL2 (ENSRROG00000036535) SMO (ENSRROG00000030252) TSPAN33 (ENSRROG00000030869) ENSRROG00000044830 ENSRROG00000002587 TNPO3 (ENSRROG00000039264) IRF5 (ENSRROG00000030142) KCP (ENSRROG00000041604) ATP6V1FNB (ENSRROG00000045325) ATP6V1F (ENSRROG00000041403) FLNC (ENSRROG00000027456) CCDC136 (ENSRROG00000039714) OPN1SW (ENSRROG00000035396) ##22 CALU (ENSRROG00000039876) GARIN1B (ENSRROG00000045564) GARIN1A (ENSRROG00000035800) HILPDA (ENSRROG00000022886) IMPDH1 (ENSRROG00000045406) PRRT4 (ENSRROG00000042520) RBM28 (ENSRROG00000040747) LEP (ENSRROG00000033244) LRRC4 (ENSRROG00000032151) SND1 (ENSRROG00000033020) PAX4 (ENSRROG00000015595) FSCN3 (ENSRROG00000042888) ARF5 (ENSRROG00000041157) GCC1 (ENSRROG00000031945) ENSRROG00000029281 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00390000003721.d.a.d ENSGT00390000013354.d.a.a.a.a ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208.u ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00390000014201 ENSGT00940000154156.d.n.a.b ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00550000076332 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 ENSGT00940000153772.A Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00390000003721.d.a.d ENSGT00390000013354.d.a.a.a.a ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208.u ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00390000014201 ENSGT00940000154156.d.n.a.b ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00550000076332 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 ENSGT00940000153772.A Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00390000003721.d.a.d ENSGT00390000013354.d.a.a.a.a ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208.u ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00390000014201 ENSGT00940000154156.d.n.a.b ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00550000076332 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 ENSGT00940000153772.A Olive baboon MODERN SPECIES 14 ENSPANG00000041876 UBE2H (ENSPANG00000025045) NRF1 (ENSPANG00000020183) SMKR1 (ENSPANG00000019785) STRIP2 (ENSPANG00000001240) AHCYL2 (ENSPANG00000014474) SMO (ENSPANG00000000814) TSPAN33 (ENSPANG00000000813) TNPO3 (ENSPANG00000022226) IRF5 (ENSPANG00000018384) KCP (ENSPANG00000021951) ATP6V1FNB (ENSPANG00000030450) ENSPANG00000021225 FLNC (ENSPANG00000025046) CCDC136 (ENSPANG00000018192) OPN1SW (ENSPANG00000010444) ##22 CALU (ENSPANG00000019818) GARIN1B (ENSPANG00000021952) GARIN1A (ENSPANG00000022684) ENSPANG00000043463 IMPDH1 (ENSPANG00000011996) PRRT4 (ENSPANG00000048387) RBM28 (ENSPANG00000022295) ENSPANG00000049281 LEP (ENSPANG00000000989) SND1 (ENSPANG00000011997) LRRC4 (ENSPANG00000000836) PAX4 (ENSPANG00000010445) FSCN3 (ENSPANG00000022296) ARF5 (ENSPANG00000032970) GCC1 (ENSPANG00000024025) Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00390000003721.d.a.d ENSGT00390000013354.d.a.a.a.a ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208.u ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00390000014201 ENSGT00940000154156.d.n.a.b ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 ENSGT00940000153772.A ENSGT00390000008140 Sooty mangabey MODERN SPECIES 283 SMKR1 (ENSCATG00000036171) STRIP2 (ENSCATG00000038915) AHCYL2 (ENSCATG00000039735) SMO (ENSCATG00000033618) TSPAN33 (ENSCATG00000032115) ENSCATG00000040381 ENSCATG00000033314 TNPO3 (ENSCATG00000030018) IRF5 (ENSCATG00000042022) ENSCATG00000043121 KCP (ENSCATG00000041916) ATP6V1FNB (ENSCATG00000045123) ATP6V1F (ENSCATG00000033101) FLNC (ENSCATG00000045130) CCDC136 (ENSCATG00000044881) OPN1SW (ENSCATG00000036352) ##22 CALU (ENSCATG00000045109) GARIN1B (ENSCATG00000040551) GARIN1A (ENSCATG00000035689) HILPDA (ENSCATG00000014956) IMPDH1 (ENSCATG00000044375) PRRT4 (ENSCATG00000039412) RBM28 (ENSCATG00000040497) LEP (ENSCATG00000031090) LRRC4 (ENSCATG00000039367) SND1 (ENSCATG00000035214) PAX4 (ENSCATG00000019674) FSCN3 (ENSCATG00000033014) ARF5 (ENSCATG00000010217) GCC1 (ENSCATG00000035591) ZNF800 (ENSCATG00000043593) Drill MODERN SPECIES 1191 NRF1 (ENSMLEG00000044405) SMKR1 (ENSMLEG00000030285) STRIP2 (ENSMLEG00000036316) AHCYL2 (ENSMLEG00000043174) SMO (ENSMLEG00000014098) TSPAN33 (ENSMLEG00000034615) ENSMLEG00000035786 ENSMLEG00000007953 TNPO3 (ENSMLEG00000037881) IRF5 (ENSMLEG00000030409) KCP (ENSMLEG00000044089) ATP6V1FNB (ENSMLEG00000038182) ATP6V1F (ENSMLEG00000037581) FLNC (ENSMLEG00000042309) CCDC136 (ENSMLEG00000028513) OPN1SW (ENSMLEG00000031571) ##22 CALU (ENSMLEG00000043790) GARIN1B (ENSMLEG00000036468) ENSMLEG00000035321 HILPDA (ENSMLEG00000027323) IMPDH1 (ENSMLEG00000037858) ENSMLEG00000006201 RBM28 (ENSMLEG00000037717) LEP (ENSMLEG00000041444) SND1 (ENSMLEG00000029040) LRRC4 (ENSMLEG00000005660) PAX4 (ENSMLEG00000039701) FSCN3 (ENSMLEG00000008758) ARF5 (ENSMLEG00000039540) GCC1 (ENSMLEG00000031210) ZNF800 (ENSMLEG00000021544) Macaca ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00390000003721.d.a.d ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208.u ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00940000154156.d.n.a.b ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 ENSGT00940000153772.A ENSGT00390000008140 ENSGT00950000182810.A.a.a.mb.a Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 95 ENSMNEG00000001209 CCDC136 (ENSMNEG00000032492) OPN1SW (ENSMNEG00000036912) ##22 CALU (ENSMNEG00000029701) GARIN1B (ENSMNEG00000028954) GARIN1A (ENSMNEG00000028708) IMPDH1 (ENSMNEG00000031042) PRRT4 (ENSMNEG00000031115) RBM28 (ENSMNEG00000036970) LEP (ENSMNEG00000034814) SND1 (ENSMNEG00000039808) LRRC4 (ENSMNEG00000037000) PAX4 (ENSMNEG00000043809) FSCN3 (ENSMNEG00000042501) ARF5 (ENSMNEG00000040893) GCC1 (ENSMNEG00000043499) ZNF800 (ENSMNEG00000041752) ENSMNEG00000003199 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000006086 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208.u ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00940000163244.d.b.a.b.b.b.b.a.b.a ENSGT00940000154156.d.n.a.b ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 ENSGT00940000153772.A ENSGT00390000008140 Crab-eating macaque MODERN SPECIES 13 SMKR1 (ENSMFAG00000039339) STRIP2 (ENSMFAG00000041411) AHCYL2 (ENSMFAG00000039128) SMO (ENSMFAG00000045402) ENSMFAG00000054840 TSPAN33 (ENSMFAG00000038610) ENSMFAG00000052465 TNPO3 (ENSMFAG00000032385) IRF5 (ENSMFAG00000043616) ENSMFAG00000037942 KCP (ENSMFAG00000035427) ATP6V1FNB (ENSMFAG00000038017) ENSMFAG00000049671 FLNC (ENSMFAG00000001934) CCDC136 (ENSMFAG00000001602) OPN1SW (ENSMFAG00000036697) ##22 CALU (ENSMFAG00000033268) GARIN1B (ENSMFAG00000000842) GARIN1A (ENSMFAG00000045927) ENSMFAG00000050825 IMPDH1 (ENSMFAG00000035403) ENSMFAG00000046010 RBM28 (ENSMFAG00000031036) LEP (ENSMFAG00000044033) LRRC4 (ENSMFAG00000040001) SND1 (ENSMFAG00000038114) PAX4 (ENSMFAG00000040823) FSCN3 (ENSMFAG00000036958) ARF5 (ENSMFAG00000019772) ENSMFAG00000038295 ZNF800 (ENSMFAG00000000453) Rhesus MODERN SPECIES 13 UBE2H (ENSMMUG00000017542) NRF1 (ENSMMUG00000041919) SMKR1 (ENSMMUG00000058224) STRIP2 (ENSMMUG00000019359) AHCYL2 (ENSMMUG00000019358) SMO (ENSMMUG00000012110) TSPAN33 (ENSMMUG00000012109) TNPO3 (ENSMMUG00000004311) IRF5 (ENSMMUG00000018478) ENSMMUG00000058562 KCP (ENSMMUG00000006306) ATP6V1FNB (ENSMMUG00000054920) ENSMMUG00000039360 FLNC (ENSMMUG00000006296) CCDC136 (ENSMMUG00000009625) OPN1SW (ENSMMUG00000060185) ##22 CALU (ENSMMUG00000009616) GARIN1B (ENSMMUG00000009612) GARIN1A (ENSMMUG00000014512) ENSMMUG00000059386 IMPDH1 (ENSMMUG00000014509) PRRT4 (ENSMMUG00000037473) RBM28 (ENSMMUG00000007250) LEP (ENSMMUG00000005322) ENSMMUG00000055746 LRRC4 (ENSMMUG00000015436) SND1 (ENSMMUG00000015432) PAX4 (ENSMMUG00000015429) FSCN3 (ENSMMUG00000015427) ARF5 (ENSMMUG00000046381) GCC1 (ENSMMUG00000015421) Vervet Monkey MODERN SPECIES 13 ZC3HC1 (ENSCSAG00000009881) UBE2H (ENSCSAG00000009886) NRF1 (ENSCSAG00000009893) ENSCSAG00000019139 SMKR1 (ENSCSAG00000009896) STRIP2 (ENSCSAG00000009916) AHCYL2 (ENSCSAG00000009928) SMO (ENSCSAG00000009935) TSPAN33 (ENSCSAG00000009943) ENSCSAG00000019138 TNPO3 (ENSCSAG00000009966) IRF5 (ENSCSAG00000009970) ATP6V1F (ENSCSAG00000009973) FLNC (ENSCSAG00000009985) CCDC136 (ENSCSAG00000010021) OPN1SW (ENSCSAG00000010043) ##22 CALU (ENSCSAG00000010054) GARIN1B (ENSCSAG00000010065) GARIN1A (ENSCSAG00000010068) HILPDA (ENSCSAG00000010075) IMPDH1 (ENSCSAG00000010128) PRRT4 (ENSCSAG00000010151) RBM28 (ENSCSAG00000010161) LEP (ENSCSAG00000010170) LRRC4 (ENSCSAG00000019137) SND1 (ENSCSAG00000010182) PAX4 (ENSCSAG00000010195) FSCN3 (ENSCSAG00000010205) ARF5 (ENSCSAG00000010208) GCC1 (ENSCSAG00000010213) ZNF800 (ENSCSAG00000010217) Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00510000046985.h.b.a.a.a ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT01030000235325 ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00390000014201 ENSGT00940000154156.d.n.a.b ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00550000076332 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 ENSGT00940000153772.A Hominidae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00510000046985.h.b.a.a.a ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT01030000235325 ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208.y.a ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00390000014201 ENSGT00940000154156.d.n.a.b ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00550000076332 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 ENSGT00940000153772.A Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT01030000235325 ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00940000153487.b.a.f ENSGT00390000003721.d.a.d ENSGT00390000013354.d.a.a.a.a ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208.y.a ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00910000147243 ENSGT00940000156059.k ENSGT00390000014201 ENSGT00940000154156.d.n.a.b ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00550000076332 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b Gorilla MODERN SPECIES 20 ENSGGOG00000022169 STRIP2 (ENSGGOG00000016807) AHCYL2 (ENSGGOG00000025074) SMO (ENSGGOG00000003227) TSPAN33 (ENSGGOG00000007835) ENSGGOG00000027737 ENSGGOG00000036972 ENSGGOG00000023221 TNPO3 (ENSGGOG00000008339) IRF5 (ENSGGOG00000012013) KCP (ENSGGOG00000015103) ATP6V1FNB (ENSGGOG00000038602) ATP6V1F (ENSGGOG00000023527) FLNC (ENSGGOG00000002420) CCDC136 (ENSGGOG00000005828) OPN1SW (ENSGGOG00000005822) ##22 CALU (ENSGGOG00000005817) ENSGGOG00000004895 GARIN1A (ENSGGOG00000026799) ENSGGOG00000039433 ENSGGOG00000040589 HILPDA (ENSGGOG00000038597) IMPDH (ENSGGOG00000003963) ENSGGOG00000043536 RBM28 (ENSGGOG00000004644) ENSGGOG00000027258 LEP (ENSGGOG00000000956) LRRC4 (ENSGGOG00000009627) ENSGGOG00000040596 SND1 (ENSGGOG00000009614) PAX4 (ENSGGOG00000002555) Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT01030000235325 ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00940000153487.b.a.f ENSGT00390000003721.d.a.d ENSGT00390000013354.d.a.a.a.a ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208.y.a.a ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00940000156059.l.b ENSGT00940000161358.c.a ENSGT00940000156059.k ENSGT00390000014201 ENSGT00940000154156.d.n.a.b ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00550000076332 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000161709 Human MODERN SPECIES 19 ZC3HC1 (ENSG00000091732) UBE2H (ENSG00000186591) NRF1 (ENSG00000106459) SMKR1 (ENSG00000240204) STRIP2 (ENSG00000128578) AHCYL2 (ENSG00000158467) SMO (ENSG00000128602) TSPAN33 (ENSG00000158457) TNPO3 (ENSG00000064419) IRF5 (ENSG00000128604) ATP6V1FNB (ENSG00000272899) ATP6V1F (ENSG00000128524) KCP (ENSG00000135253) FLNC (ENSG00000128591) CCDC136 (ENSG00000128596) OPN1SW (ENSG00000128617) ##22 CALU (ENSG00000128595) GARIN1B (ENSG00000135248) GARIN1A (ENSG00000205085) METTL2B (ENSG00000165055) HILPDA (ENSG00000135245) IMPDH1 (ENSG00000106348) PRRT4 (ENSG00000224940) RBM28 (ENSG00000106344) LEP (ENSG00000174697) LRRC4 (ENSG00000128594) SND1 (ENSG00000197157) PAX4 (ENSG00000106331) FSCN3 (ENSG00000106328) ARF5 (ENSG00000004059) GCC1 (ENSG00000179562) Pan ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT01030000235325 ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00940000153487.b.a.f ENSGT00390000003721.d.a.d ENSGT00390000013354.d.a.a.a.a ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208.y.a.a ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00940000156059.l.b ENSGT00940000161358.c.a ENSGT00940000156059.k ENSGT00390000014201 ENSGT00940000154156.d.n.a.b ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00550000076332 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000161709 Chimpanzee MODERN SPECIES 20 ENSPTRG00000048623 STRIP2 (ENSPTRG00000019682) AHCYL2 (ENSPTRG00000019681) SMO (ENSPTRG00000019680) TSPAN33 (ENSPTRG00000019678) ENSPTRG00000042432 ENSPTRG00000043840 ENSPTRG00000050813 TNPO3 (ENSPTRG00000019676) IRF5 (ENSPTRG00000019675) KCP (ENSPTRG00000045199) ATP6V1FNB (ENSPTRG00000050196) ATP6V1F (ENSPTRG00000019672) FLNC (ENSPTRG00000019671) CCDC136 (ENSPTRG00000019670) OPN1SW (ENSPTRG00000019669) ##22 CALU (ENSPTRG00000050961) GARIN1B (ENSPTRG00000019667) GARIN1A (ENSPTRG00000028396) ENSPTRG00000019664 ENSPTRG00000049622 HILPDA (ENSPTRG00000043255) IMPDH1 (ENSPTRG00000019660) PRRT4 (ENSPTRG00000041628) RBM28 (ENSPTRG00000019659) ENSPTRG00000044947 LEP (ENSPTRG00000047519) LRRC4 (ENSPTRG00000019656) SND1 (ENSPTRG00000023911) PAX4 (ENSPTRG00000019653) FSCN3 (ENSPTRG00000019652) Bonobo MODERN SPECIES 20 UBE2H (ENSPPAG00000040966) NRF1 (ENSPPAG00000040353) STRIP2 (ENSPPAG00000036173) AHCYL2 (ENSPPAG00000039508) SMO (ENSPPAG00000032237) TSPAN33 (ENSPPAG00000029860) ENSPPAG00000026536 ENSPPAG00000010380 TNPO3 (ENSPPAG00000034975) IRF5 (ENSPPAG00000031382) KCP (ENSPPAG00000001412) ATP6V1FNB (ENSPPAG00000034113) ENSPPAG00000027671 FLNC (ENSPPAG00000035541) CCDC136 (ENSPPAG00000038709) OPN1SW (ENSPPAG00000040601) ##22 CALU (ENSPPAG00000028481) ENSPPAG00000041706 GARIN1A (ENSPPAG00000036357) ENSPPAG00000041977 HILPDA (ENSPPAG00000022117) IMPDH1 (ENSPPAG00000037421) ENSPPAG00000030645 RBM28 (ENSPPAG00000041730) ENSPPAG00000001828 LEP (ENSPPAG00000035749) LRRC4 (ENSPPAG00000029697) SND1 (ENSPPAG00000042947) PAX4 (ENSPPAG00000033297) FSCN3 (ENSPPAG00000043161) ARF5 (ENSPPAG00000037755) Orangutan MODERN SPECIES 20 ZC3HC1 (ENSPPYG00000017998) UBE2H (ENSPPYG00000039929) NRF1 (ENSPPYG00000017996) SMKR1 (ENSPPYG00000040980) STRIP2 (ENSPPYG00000017995) AHCYL2 (ENSPPYG00000017994) SMO (ENSPPYG00000017993) TSPAN33 (ENSPPYG00000017992) TNPO3 (ENSPPYG00000017990) IRF5 (ENSPPYG00000017989) KCP (ENSPPYG00000017988) ATP6V1FNB (ENSPPYG00000031385) ATP6V1F (ENSPPYG00000017986) FLNC (ENSPPYG00000017985) CCDC136 (ENSPPYG00000017984) OPN1SW (ENSPPYG00000017983) ##22 CALU (ENSPPYG00000017982) GARIN1B (ENSPPYG00000017981) GARIN1A (ENSPPYG00000017980) ENSPPYG00000035564 ENSPPYG00000033487 ENSPPYG00000037429 IMPDH1 (ENSPPYG00000017976) PRRT4 (ENSPPYG00000039151) RBM28 (ENSPPYG00000017975) LEP (ENSPPYG00000017974) LRRC4 (ENSPPYG00000017973) SND1 (ENSPPYG00000017972) PAX4 (ENSPPYG00000017971) FSCN3 (ENSPPYG00000017970) ARF5 (ENSPPYG00000017969) Gibbon MODERN SPECIES 3 STRIP2 (ENSNLEG00000012629) AHCYL2 (ENSNLEG00000012581) SMO (ENSNLEG00000012575) TSPAN33 (ENSNLEG00000012558) ENSNLEG00000012555 ENSNLEG00000028436 ENSNLEG00000031882 ENSNLEG00000027686 TNPO3 (ENSNLEG00000012491) IRF5 (ENSNLEG00000012454) KCP (ENSNLEG00000012449) ATP6V1FNB (ENSNLEG00000012447) ATP6V1F (ENSNLEG00000012442) FLNC (ENSNLEG00000012428) CCDC136 (ENSNLEG00000012424) OPN1SW (ENSNLEG00000012417) ##22 CALU (ENSNLEG00000012380) ENSNLEG00000012374 ENSNLEG00000012368 HILPDA (ENSNLEG00000028127) ENSNLEG00000012341 PRRT4 (ENSNLEG00000012335) RBM28 (ENSNLEG00000012307) LEP (ENSNLEG00000012302) LRRC4 (ENSNLEG00000035843) SND1 (ENSNLEG00000012263) PAX4 (ENSNLEG00000012257) FSCN3 (ENSNLEG00000012245) ENSNLEG00000030696 GCC1 (ENSNLEG00000012234) ZNF800 (ENSNLEG00000012232) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT01030000235325 ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00390000014201 ENSGT00940000154156.d.m ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00550000076332 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 ENSGT00940000153772.A Cebidae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000006086 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00390000014201 ENSGT00940000154156.d.m ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00550000076332 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 ENSGT00940000153772.A Marmoset MODERN SPECIES 20 NRF1 (ENSCJAG00000010505) SMKR1 (ENSCJAG00000043602) STRIP2 (ENSCJAG00000010399) AHCYL2 (ENSCJAG00000010323) ENSCJAG00000085310 SMO (ENSCJAG00000010304) TSPAN33 (ENSCJAG00000010295) TNPO3 (ENSCJAG00000018085) IRF5 (ENSCJAG00000018061) KCP (ENSCJAG00000018035) ENSCJAG00000078135 ATP6V1FNB (ENSCJAG00000045477) ATP6V1F (ENSCJAG00000046281) FLNC (ENSCJAG00000017889) CCDC136 (ENSCJAG00000017866) OPN1SW (ENSCJAG00000017852) ##22 CALU (ENSCJAG00000017825) GARIN1B (ENSCJAG00000017818) ENSCJAG00000070472 GARIN1A (ENSCJAG00000017814) ENSCJAG00000072209 ENSCJAG00000017770 PRRT4 (ENSCJAG00000041855) RBM28 (ENSCJAG00000017731) LEP (ENSCJAG00000017729) SND1 (ENSCJAG00000017668) LRRC4 (ENSCJAG00000045218) PAX4 (ENSCJAG00000017652) FSCN3 (ENSCJAG00000017639) ARF5 (ENSCJAG00000017604) GCC1 (ENSCJAG00000017602) Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000006086 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00940000154156.d.m ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00550000076332 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 ENSGT00940000153772.A ENSGT00390000008140 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 44 UBE2H (ENSSBOG00000003551) ENSSBOG00000016230 NRF1 (ENSSBOG00000022785) SMKR1 (ENSSBOG00000023260) STRIP2 (ENSSBOG00000026530) AHCYL2 (ENSSBOG00000027053) SMO (ENSSBOG00000034649) TSPAN33 (ENSSBOG00000026557) TNPO3 (ENSSBOG00000029642) IRF5 (ENSSBOG00000024381) KCP (ENSSBOG00000024349) ATP6V1FNB (ENSSBOG00000021896) ATP6V1F (ENSSBOG00000029644) FLNC (ENSSBOG00000025708) CCDC136 (ENSSBOG00000028704) OPN1SW (ENSSBOG00000022139) ##22 CALU (ENSSBOG00000025729) GARIN1B (ENSSBOG00000031604) ENSSBOG00000022858 ENSSBOG00000002650 PRRT4 (ENSSBOG00000025268) RBM28 (ENSSBOG00000012308) ENSSBOG00000035277 LEP (ENSSBOG00000014945) SND1 (ENSSBOG00000032461) LRRC4 (ENSSBOG00000022816) PAX4 (ENSSBOG00000023750) FSCN3 (ENSSBOG00000035306) ARF5 (ENSSBOG00000021669) GCC1 (ENSSBOG00000021698) ZNF800 (ENSSBOG00000028846) Capuchin MODERN SPECIES 219 SMKR1 (ENSCCAG00000035007) STRIP2 (ENSCCAG00000034944) ENSCCAG00000030747 AHCYL2 (ENSCCAG00000024928) SMO (ENSCCAG00000014906) TSPAN33 (ENSCCAG00000016865) TNPO3 (ENSCCAG00000033826) IRF5 (ENSCCAG00000027172) KCP (ENSCCAG00000024511) ATP6V1FNB (ENSCCAG00000033294) ENSCCAG00000034897 FLNC (ENSCCAG00000022550) CCDC136 (ENSCCAG00000034758) OPN1SW (ENSCCAG00000037669) ##22 CALU (ENSCCAG00000037513) FAM71F1 (ENSCCAG00000032023) FAM71F2 (ENSCCAG00000028902) IMPDH (ENSCCAG00000020872) PRRT4 (ENSCCAG00000024784) RBM28 (ENSCCAG00000035105) ENSCCAG00000022053 LEP (ENSCCAG00000032161) ENSCCAG00000025380 LRRC4 (ENSCCAG00000002650) ENSCCAG00000014968 SND1 (ENSCCAG00000036847) PAX4 (ENSCCAG00000005730) FSCN3 (ENSCCAG00000026519) ENSCCAG00000027943 Mas night monkey MODERN SPECIES 299 UBE2H (ENSANAG00000037214) NRF1 (ENSANAG00000023619) STRIP2 (ENSANAG00000018966) AHCYL2 (ENSANAG00000037152) ENSANAG00000029950 SMO (ENSANAG00000020298) TSPAN33 (ENSANAG00000036420) TNPO3 (ENSANAG00000037940) IRF5 (ENSANAG00000038213) ENSANAG00000038296 KCP (ENSANAG00000037944) ATP6V1FNB (ENSANAG00000037209) ATP6V1F (ENSANAG00000030314) FLNC (ENSANAG00000026943) CCDC136 (ENSANAG00000022224) OPN1SW (ENSANAG00000021023) ##22 CALU (ENSANAG00000035615) GARIN1B (ENSANAG00000027825) GARIN1A (ENSANAG00000029574) ENSANAG00000025900 ENSANAG00000037340 PRRT4 (ENSANAG00000009262) RBM28 (ENSANAG00000033922) ENSANAG00000026541 LEP (ENSANAG00000026453) LRRC4 (ENSANAG00000022458) SND1 (ENSANAG00000034463) PAX4 (ENSANAG00000036211) FSCN3 (ENSANAG00000030175) ARF5 (ENSANAG00000026446) GCC1 (ENSANAG00000026102) Tarsier MODERN SPECIES 5404 GRK3 (ENSTSYG00000007859) MYO18B (ENSTSYG00000002448) SEZ6L (ENSTSYG00000011898) ASPHD2 (ENSTSYG00000008057) SMO (ENSTSYG00000033887) TSPAN33 (ENSTSYG00000004914) TNPO3 (ENSTSYG00000002989) ENSTSYG00000036632 ##18 IRF5 (ENSTSYG00000032877) KCP (ENSTSYG00000031612) ATP6V1FNB (ENSTSYG00000033671) ATP6V1F (ENSTSYG00000001415) FLNC (ENSTSYG00000012835) CCDC136 (ENSTSYG00000004111) OPN1SW (ENSTSYG00000009677) ##22 CALU (ENSTSYG00000009674) GARIN1B (ENSTSYG00000012829) FAM71F2 (ENSTSYG00000013591) Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000006086 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00940000154156.d ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00390000011772 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000159260 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 ENSGT00940000153772.A ENSGT00390000008140 ENSGT01030000234648.a.b.a.a.b Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000006086 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00940000154156.d ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00390000011772 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000159260 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 ENSGT00940000153772.A ENSGT00390000008140 ENSGT01030000234648.a.b.a.a.b Mouse lemur MODERN SPECIES 2 UBE2H (ENSMICG00000044025) NRF1 (ENSMICG00000004218) ENSMICG00000047458 SMKR1 (ENSMICG00000045930) STRIP2 (ENSMICG00000015996) AHCYL2 (ENSMICG00000015985) SMO (ENSMICG00000015350) TSPAN33 (ENSMICG00000015338) TNPO3 (ENSMICG00000000140) IRF5 (ENSMICG00000000138) KCP (ENSMICG00000000136) ATP6V1FNB (ENSMICG00000041907) ATP6V1F (ENSMICG00000046492) FLNC (ENSMICG00000000126) CCDC136 (ENSMICG00000000123) OPN1SW (ENSMICG00000045275) ##22 CALU (ENSMICG00000000120) GARIN1B (ENSMICG00000036122) GARIN1A (ENSMICG00000000114) IMPDH1 (ENSMICG00000000111) PRRT4 (ENSMICG00000027302) RBM28 (ENSMICG00000000107) LEP (ENSMICG00000031814) SND1 (ENSMICG00000000097) LRRC4 (ENSMICG00000000102) PAX4 (ENSMICG00000000095) FSCN3 (ENSMICG00000000092) ARF5 (ENSMICG00000000091) GCC1 (ENSMICG00000037038) ZNF800 (ENSMICG00000030435) GRM8 (ENSMICG00000008884) Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES 111 ENSGT00390000006086 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208.q ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00940000154156.d ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 ENSGT00940000153772.A ENSGT00390000008140 ENSGT01030000234648.a.b.a.a.b Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 1458 ATP6V1FNB (ENSPSMG00000012143) ENSPSMG00000012139 FLNC (ENSPSMG00000012127) CCDC136 (ENSPSMG00000012065) OPN1SW (ENSPSMG00000012026) ##22 CALU (ENSPSMG00000012001) GARIN1B (ENSPSMG00000011971) ENSPSMG00000011953 GARIN1A (ENSPSMG00000011948) ENSPSMG00000011938 ENSPSMG00000011932 Coquerels sifaka MODERN SPECIES 1007 UBE2H (ENSPCOG00000023838) NRF1 (ENSPCOG00000025682) SMKR1 (ENSPCOG00000022145) STRIP2 (ENSPCOG00000027430) AHCYL2 (ENSPCOG00000019538) SMO (ENSPCOG00000026716) TSPAN33 (ENSPCOG00000018235) ENSPCOG00000016900 TNPO3 (ENSPCOG00000023901) IRF5 (ENSPCOG00000011325) KCP (ENSPCOG00000017217) ATP6V1FNB (ENSPCOG00000021691) ATP6V1F (ENSPCOG00000015785) FLNC (ENSPCOG00000017493) CCDC136 (ENSPCOG00000019053) OPN1SW (ENSPCOG00000020982) ##22 CALU (ENSPCOG00000027459) GARIN1B (ENSPCOG00000019037) GARIN1A (ENSPCOG00000026970) IMPDH1 (ENSPCOG00000017804) PRRT4 (ENSPCOG00000014989) RBM28 (ENSPCOG00000016797) LEP (ENSPCOG00000014023) LRRC4 (ENSPCOG00000019833) ENSPCOG00000021188 SND1 (ENSPCOG00000026791) PAX4 (ENSPCOG00000019659) FSCN3 (ENSPCOG00000006185) ARF5 (ENSPCOG00000027640) GCC1 (ENSPCOG00000013515) MRPS30 (ENSPCOG00000018431) Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT01030000235325 ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00940000169914 ENSGT00390000014201 ENSGT00940000154156.d ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 ENSGT00940000153772.A Tree shrew MODERN SPECIES 5251 OPN1SW (ENSTBEG00000004393) ##22 CALU (ENSTBEG00000004111) GARIN1B (ENSTBEG00000003158) GARIN1A (ENSTBEG00000002423) Glires ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT01030000235325 ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00390000014201 ENSGT00940000154156.d ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 ENSGT00940000153772.A ENSGT00390000008140 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00390000006086 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208.`b ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00390000014201 ENSGT00940000154156.d ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00390000011772 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000159260 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 ENSGT00940000153772.A ENSGT00390000008140 Rabbit MODERN SPECIES 18 NRF1 (ENSOCUG00000012174) SMKR1 (ENSOCUG00000036751) ENSOCUG00000037307 STRIP2 (ENSOCUG00000008316) AHCYL2 (ENSOCUG00000011749) SMO (ENSOCUG00000013176) ENSOCUG00000027421 TSPAN33 (ENSOCUG00000013168) TNPO3 (ENSOCUG00000010105) IRF5 (ENSOCUG00000010101) KCP (ENSOCUG00000017565) ATP6V1FNB (ENSOCUG00000032998) ENSOCUG00000014136 FLNC (ENSOCUG00000011942) CCDC136 (ENSOCUG00000008182) OPN1SW (ENSOCUG00000008173) ##22 CALU (ENSOCUG00000008167) GARIN1B (ENSOCUG00000008160) GARIN1A (ENSOCUG00000013274) ENSOCUG00000013266 HILPDA (ENSOCUG00000011823) IMPDH1 (ENSOCUG00000003015) RBM28 (ENSOCUG00000003009) PRRT4 (ENSOCUG00000039585) LEP (ENSOCUG00000010189) SND1 (ENSOCUG00000001620) LRRC4 (ENSOCUG00000015121) PAX4 (ENSOCUG00000001612) FSCN3 (ENSOCUG00000001609) ARF5 (ENSOCUG00000024365) GCC1 (ENSOCUG00000006344) Pika MODERN SPECIES 40 ATP6V1F (ENSOPRG00000015367) FLNC (ENSOPRG00000015288) CCDC136 (ENSOPRG00000015246) OPN1SW (ENSOPRG00000015235) ##22 CALU (ENSOPRG00000015222) GARIN1B (ENSOPRG00000015209) IMPDH1 (ENSOPRG00000015168) RBM28 (ENSOPRG00000015140) ENSOPRG00000015136 Rodentia ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT01030000235325 ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00390000014201 ENSGT00940000154156.d ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 ENSGT00940000153772.A ENSGT00390000008140 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT01030000235325 ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00390000014201 ENSGT00940000154156.d ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 ENSGT00940000153772.A ENSGT00390000008140 Kangaroo rat MODERN SPECIES 367 Nrf1 (ENSDORG00000016661) Strip2 (ENSDORG00000004127) Ahcyl2 (ENSDORG00000013584) ENSDORG00000027273 Smo (ENSDORG00000005306) Tspan33 (ENSDORG00000006516) Tnpo3 (ENSDORG00000002433) Irf5 (ENSDORG00000010627) Kcp (ENSDORG00000015865) Atp6v1fnb (ENSDORG00000026486) Atp6v1f (ENSDORG00000028428) Flnc (ENSDORG00000011105) Ccdc136 (ENSDORG00000011103) Opn1sw (ENSDORG00000015986) ##22 Calu (ENSDORG00000015990) Garin1b (ENSDORG00000007174) Garin1a (ENSDORG00000010506) Impdh1 (ENSDORG00000015870) Prrt4 (ENSDORG00000028011) ENSDORG00000028147 Rbm28 (ENSDORG00000004184) Lep (ENSDORG00000004170) Snd1 (ENSDORG00000000336) Lrrc4 (ENSDORG00000023470) Pax4 (ENSDORG00000000332) Fscn3 (ENSDORG00000000330) Gcc1 (ENSDORG00000024135) Zfp800 (ENSDORG00000029548) Grm8 (ENSDORG00000006238) Myomorpha ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT01030000235325 ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00390000014201 ENSGT00940000154156.d ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 ENSGT00940000153772.A ENSGT00390000008140 Muroidea ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT01030000235325 ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00390000014201 ENSGT00940000154156.d ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 ENSGT00940000153772.A ENSGT00390000008140 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT01030000235325 ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00390000014201 ENSGT00940000154156.d ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 ENSGT00940000153772.A ENSGT00390000008140 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT01030000235325 ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00390000014201 ENSGT00940000154156.d ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 ENSGT00940000153772.A ENSGT00390000008140 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00390000006086 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006835 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT01030000235325 ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00390000014201 ENSGT00940000154156.d ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 ENSGT00940000153772.A ENSGT00390000008140 Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 54 Zc3hc1 (ENSCGRG00001018805) Ube2h (ENSCGRG00001022582) Nrf1 (ENSCGRG00001000193) Strip2 (ENSCGRG00001010227) Ahcyl2 (ENSCGRG00001022625) ENSCGRG00001020487 Smo (ENSCGRG00001018496) Tspan33 (ENSCGRG00001009176) Tnpo3 (ENSCGRG00001015925) Irf5 (ENSCGRG00001024087) Kcp (ENSCGRG00001000457) Atp6v1fnb (ENSCGRG00001009659) Atp6v1f (ENSCGRG00001000425) Flnc (ENSCGRG00001005204) Ccdc136 (ENSCGRG00001020446) Opn1sw (ENSCGRG00001021579) ##22 Calu (ENSCGRG00001002862) Garin1b (ENSCGRG00001009768) Garin1a (ENSCGRG00001000260) Hilpda (ENSCGRG00001012150) Impdh1 (ENSCGRG00001000560) Prrt4 (ENSCGRG00001020242) Rbm28 (ENSCGRG00001021278) Lep (ENSCGRG00001014943) Lrrc4 (ENSCGRG00001003915) Snd1 (ENSCGRG00001022514) Pax4 (ENSCGRG00001019051) Fscn3 (ENSCGRG00001005640) Arf5 (ENSCGRG00001024919) Gcc1 (ENSCGRG00001022730) Zfp800 (ENSCGRG00001012282) Golden Hamster MODERN SPECIES 994 ENSMAUG00000000480 ##22 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000006086 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00390000014201 ENSGT00940000154156.d ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 ENSGT00940000153772.A ENSGT00390000008140 Prairie vole MODERN SPECIES 87 Klhdc10 (ENSMOCG00000021616) Zc3hc1 (ENSMOCG00000015239) Ube2h (ENSMOCG00000017439) Nrf1 (ENSMOCG00000011585) Strip2 (ENSMOCG00000012799) Ahcyl2 (ENSMOCG00000016157) Smo (ENSMOCG00000019933) Tspan33 (ENSMOCG00000021014) Tnpo3 (ENSMOCG00000013264) Irf5 (ENSMOCG00000003344) Kcp (ENSMOCG00000008202) Atp6v1fnb (ENSMOCG00000013967) ENSMOCG00000000103 Flnc (ENSMOCG00000009597) Ccdc136 (ENSMOCG00000007022) Opn1sw (ENSMOCG00000018662) ##22 Calu (ENSMOCG00000015931) Garin1b (ENSMOCG00000017381) Garin1a (ENSMOCG00000010184) Hilpda (ENSMOCG00000001096) Impdh1 (ENSMOCG00000008218) Prrt4 (ENSMOCG00000020766) Rbm28 (ENSMOCG00000014615) Lep (ENSMOCG00000015600) Lrrc4 (ENSMOCG00000005637) Snd1 (ENSMOCG00000005040) Pax4 (ENSMOCG00000018632) Fscn3 (ENSMOCG00000005936) Arf5 (ENSMOCG00000022861) Gcc1 (ENSMOCG00000022632) ENSMOCG00000004985 Northern American deer mouse MODERN SPECIES 16 Zc3hc1 (ENSPEMG00000000514) Ube2h (ENSPEMG00000022383) Nrf1 (ENSPEMG00000023041) ENSPEMG00000030083 Strip2 (ENSPEMG00000020937) Ahcyl2 (ENSPEMG00000022072) Smo (ENSPEMG00000021296) Tspan33 (ENSPEMG00000020688) Tnpo3 (ENSPEMG00000000422) Irf5 (ENSPEMG00000020544) ENSPEMG00000026469 Atp6v1fnb (ENSPEMG00000022286) Atp6v1f (ENSPEMG00000020693) Flnc (ENSPEMG00000021414) Ccdc136 (ENSPEMG00000020774) Opn1sw (ENSPEMG00000013155) ##22 Calu (ENSPEMG00000000768) Garin1b (ENSPEMG00000020844) Hilpda (ENSPEMG00000027655) Impdh1 (ENSPEMG00000014779) Prrt4 (ENSPEMG00000016516) Rbm28 (ENSPEMG00000020673) Lep (ENSPEMG00000022204) Lrrc4 (ENSPEMG00000011142) Snd1 (ENSPEMG00000010240) Pax4 (ENSPEMG00000008639) Fscn3 (ENSPEMG00000021632) Arf5 (ENSPEMG00000021476) Gcc1 (ENSPEMG00000031326) Zfp800 (ENSPEMG00000011805) ENSPEMG00000014699 Murinae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000006086 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00390000014201 ENSGT00940000154156.d ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 ENSGT00940000153772.A ENSGT00390000008140 Mus ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00390000006086 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00390000014201 ENSGT00940000154156.d ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 ENSGT00940000153772.A ENSGT00390000008140 Mus_A ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000006086 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00390000014201 ENSGT00940000154156.d ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 ENSGT00940000153772.A ENSGT00390000008140 Mus_B ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00390000006086 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00390000014201 ENSGT00940000154156.d ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 ENSGT00940000153772.A ENSGT00390000008140 Mouse MODERN SPECIES 15 Klhdc10 (ENSMUSG00000029775) Zc3hc1 (ENSMUSG00000039130) Ube2h (ENSMUSG00000039159) Nrf1 (ENSMUSG00000058440) Strip2 (ENSMUSG00000039629) Ahcyl2 (ENSMUSG00000029772) Smo (ENSMUSG00000001761) Tspan33 (ENSMUSG00000001763) Tnpo3 (ENSMUSG00000012535) Irf5 (ENSMUSG00000029771) Kcp (ENSMUSG00000059022) Atp6v1fnb (ENSMUSG00000090685) Atp6v1f (ENSMUSG00000004285) Flnc (ENSMUSG00000068699) Ccdc136 (ENSMUSG00000029769) Opn1sw (ENSMUSG00000058831) ##22 Calu (ENSMUSG00000029767) Garin1b (ENSMUSG00000039742) Garin1a (ENSMUSG00000079652) Hilpda (ENSMUSG00000043421) Impdh1 (ENSMUSG00000003500) Prrt4 (ENSMUSG00000079654) Rbm28 (ENSMUSG00000029701) Lep (ENSMUSG00000059201) Lrrc4 (ENSMUSG00000049939) Snd1 (ENSMUSG00000001424) Pax4 (ENSMUSG00000029706) Fscn3 (ENSMUSG00000029707) Arf5 (ENSMUSG00000020440) Gcc1 (ENSMUSG00000029708) Zfp800 (ENSMUSG00000039841) Mus_C ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00390000006086 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00390000014201 ENSGT00940000154156.d ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 ENSGT00940000153772.A ENSGT00390000008140 spretus MODERN SPECIES 15 Klhdc10 (MGP_SPRETEiJ_G0029184) Zc3hc1 (MGP_SPRETEiJ_G0029183) Ube2h (MGP_SPRETEiJ_G0029182) Nrf1 (MGP_SPRETEiJ_G0029181) Strip2 (MGP_SPRETEiJ_G0029180) Ahcyl2 (MGP_SPRETEiJ_G0029179) Smo (MGP_SPRETEiJ_G0029178) Tspan33 (MGP_SPRETEiJ_G0029177) Tnpo3 (MGP_SPRETEiJ_G0029176) Irf5 (MGP_SPRETEiJ_G0029175) Kcp (MGP_SPRETEiJ_G0029174) Atp6v1fnb (MGP_SPRETEiJ_G0029173) Atp6v1f (MGP_SPRETEiJ_G0029172) Flnc (MGP_SPRETEiJ_G0029171) Ccdc136 (MGP_SPRETEiJ_G0029170) Opn1sw (MGP_SPRETEiJ_G0029169) ##22 Calu (MGP_SPRETEiJ_G0029168) Garin1b (MGP_SPRETEiJ_G0029167) Garin1a (MGP_SPRETEiJ_G0029166) Hilpda (MGP_SPRETEiJ_G0029165) Impdh1 (MGP_SPRETEiJ_G0029164) Prrt4 (MGP_SPRETEiJ_G0029163) Rbm28 (MGP_SPRETEiJ_G0029162) Lep (MGP_SPRETEiJ_G0029161) Lrrc4 (MGP_SPRETEiJ_G0029160) Snd1 (MGP_SPRETEiJ_G0029159) Pax4 (MGP_SPRETEiJ_G0029158) Fscn3 (MGP_SPRETEiJ_G0029157) Arf5 (MGP_SPRETEiJ_G0029156) Gcc1 (MGP_SPRETEiJ_G0029155) Zfp800 (MGP_SPRETEiJ_G0029154) Steppe mouse MODERN SPECIES 3280 Klhdc10 (ENSMSIG00000021851) Zc3hc1 (ENSMSIG00000021880) Ube2h (ENSMSIG00000022142) Nrf1 (ENSMSIG00000022240) ENSMSIG00000023350 Strip2 (ENSMSIG00000023355) Ahcyl2 (ENSMSIG00000023522) Smo (ENSMSIG00000023624) Tspan33 (ENSMSIG00000023646) Tnpo3 (ENSMSIG00000023671) Irf5 (ENSMSIG00000023744) Atp6v1fnb (ENSMSIG00000023991) Atp6v1f (ENSMSIG00000023998) Flnc (ENSMSIG00000024004) Ccdc136 (ENSMSIG00000024178) Opn1sw (ENSMSIG00000024409) ##22 Calu (ENSMSIG00000024426) Garin1b (ENSMSIG00000024512) Garin1a (ENSMSIG00000024563) Hilpda (ENSMSIG00000024578) Impdh1 (ENSMSIG00000024596) Prrt4 (ENSMSIG00000025011) Rbm28 (ENSMSIG00000025020) Lep (ENSMSIG00000025061) Snd1 (ENSMSIG00000025077) Lrrc4 (ENSMSIG00000025175) Pax4 (ENSMSIG00000025196) Fscn3 (ENSMSIG00000025356) Gcc1 (ENSMSIG00000025373) Arf5 (ENSMSIG00000025399) Zfp800 (ENSMSIG00000001989) Ryukyu mouse MODERN SPECIES 15 Klhdc10 (MGP_CAROLIEiJ_G0028184) Zc3hc1 (MGP_CAROLIEiJ_G0028183) Ube2h (MGP_CAROLIEiJ_G0028182) Nrf1 (MGP_CAROLIEiJ_G0028181) Strip2 (MGP_CAROLIEiJ_G0028180) Ahcyl2 (MGP_CAROLIEiJ_G0028179) Smo (MGP_CAROLIEiJ_G0028178) Tspan33 (MGP_CAROLIEiJ_G0028177) Tnpo3 (MGP_CAROLIEiJ_G0028176) Irf5 (MGP_CAROLIEiJ_G0028175) Kcp (MGP_CAROLIEiJ_G0028174) Atp6v1fnb (MGP_CAROLIEiJ_G0028173) Atp6v1f (MGP_CAROLIEiJ_G0028172) Flnc (MGP_CAROLIEiJ_G0028171) Ccdc136 (MGP_CAROLIEiJ_G0028170) Opn1sw (MGP_CAROLIEiJ_G0028169) ##22 Calu (MGP_CAROLIEiJ_G0028168) Garin1b (MGP_CAROLIEiJ_G0028167) Garin1a (MGP_CAROLIEiJ_G0028166) Hilpda (MGP_CAROLIEiJ_G0028165) Impdh1 (MGP_CAROLIEiJ_G0028164) Prrt4 (MGP_CAROLIEiJ_G0028163) Rbm28 (MGP_CAROLIEiJ_G0028162) Lep (MGP_CAROLIEiJ_G0028161) Lrrc4 (MGP_CAROLIEiJ_G0028160) Snd1 (MGP_CAROLIEiJ_G0028159) Pax4 (MGP_CAROLIEiJ_G0028158) Fscn3 (MGP_CAROLIEiJ_G0028157) Arf5 (MGP_CAROLIEiJ_G0028156) Gcc1 (MGP_CAROLIEiJ_G0028155) Zfp800 (MGP_CAROLIEiJ_G0028154) Shrew mouse MODERN SPECIES 11 Ube2h (MGP_PahariEiJ_G0021940) Nrf1 (MGP_PahariEiJ_G0021939) Strip2 (MGP_PahariEiJ_G0021938) Ahcyl2 (MGP_PahariEiJ_G0021937) Smo (MGP_PahariEiJ_G0021936) MGP_PahariEiJ_G0002044 MGP_PahariEiJ_G0002043 Tspan33 (MGP_PahariEiJ_G0021935) Tnpo3 (MGP_PahariEiJ_G0021934) Irf5 (MGP_PahariEiJ_G0021933) Kcp (MGP_PahariEiJ_G0021932) Atp6v1fnb (MGP_PahariEiJ_G0021931) Atp6v1f (MGP_PahariEiJ_G0021930) Flnc (MGP_PahariEiJ_G0021929) Ccdc136 (MGP_PahariEiJ_G0021928) Opn1sw (MGP_PahariEiJ_G0021927) ##22 Calu (MGP_PahariEiJ_G0021926) Garin1b (MGP_PahariEiJ_G0021925) Garin1a (MGP_PahariEiJ_G0021924) Hilpda (MGP_PahariEiJ_G0021923) Impdh1 (MGP_PahariEiJ_G0021922) Prrt4 (MGP_PahariEiJ_G0021921) Rbm28 (MGP_PahariEiJ_G0021920) Lep (MGP_PahariEiJ_G0021919) Lrrc4 (MGP_PahariEiJ_G0021918) Snd1 (MGP_PahariEiJ_G0021917) Pax4 (MGP_PahariEiJ_G0021916) Fscn3 (MGP_PahariEiJ_G0021915) Arf5 (MGP_PahariEiJ_G0021914) Gcc1 (MGP_PahariEiJ_G0021913) Zfp800 (MGP_PahariEiJ_G0021912) Rat MODERN SPECIES 14 Zc3hc1 (ENSRNOG00000010154) Ube2h (ENSRNOG00000048205) Nrf1 (ENSRNOG00000008752) Smkr1 (ENSRNOG00000070702) Strip2 (ENSRNOG00000057729) Ahcyl2 (ENSRNOG00000039300) Smo (ENSRNOG00000008332) Tspan33 (ENSRNOG00000007900) Tnpo3 (ENSRNOG00000021758) Irf5 (ENSRNOG00000007437) Kcp (ENSRNOG00000021855) ENSRNOG00000065235 Atp6v1fnb (ENSRNOG00000063021) Flnc (ENSRNOG00000007281) Ccdc136 (ENSRNOG00000007100) Opn1sw (ENSRNOG00000006874) ##22 Calu (ENSRNOG00000006197) Garin1b (ENSRNOG00000006132) Garin1a (ENSRNOG00000039383) Impdh1 (ENSRNOG00000020032) Prrt4 (ENSRNOG00000039388) Rbm28 (ENSRNOG00000005468) Lep (ENSRNOG00000045797) Lrrc4 (ENSRNOG00000008098) Snd1 (ENSRNOG00000031173) Pax4 (ENSRNOG00000008020) Fscn3 (ENSRNOG00000007942) Arf5 (ENSRNOG00000007806) Gcc1 (ENSRNOG00000007792) Zfp800 (ENSRNOG00000007662) ENSRNOG00000064958 Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 1325 Klhdc10 (ENSNGAG00000015572) Zc3hc1 (ENSNGAG00000019014) Ube2h (ENSNGAG00000011195) Nrf1 (ENSNGAG00000010100) Strip2 (ENSNGAG00000016151) Ahcyl2 (ENSNGAG00000018717) Smo (ENSNGAG00000019312) Tspan33 (ENSNGAG00000002066) Tnpo3 (ENSNGAG00000008722) Irf5 (ENSNGAG00000016077) Kcp (ENSNGAG00000013806) Atp6v1fnb (ENSNGAG00000015077) ENSNGAG00000016731 Flnc (ENSNGAG00000002362) Ccdc136 (ENSNGAG00000000731) Opn1sw (ENSNGAG00000018986) ##22 Calu (ENSNGAG00000004067) Garin1b (ENSNGAG00000007899) Garin1a (ENSNGAG00000010614) Hilpda (ENSNGAG00000016167) Impdh1 (ENSNGAG00000005531) Prrt4 (ENSNGAG00000018200) ENSNGAG00000006480 Lep (ENSNGAG00000010451) Snd1 (ENSNGAG00000011186) Lrrc4 (ENSNGAG00000019454) ENSNGAG00000008360 Pax4 (ENSNGAG00000018745) Fscn3 (ENSNGAG00000010217) Arf5 (ENSNGAG00000011743) Gcc1 (ENSNGAG00000017580) Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 81 Cpa4 (ENSJJAG00000000289) Ssmem1 (ENSJJAG00000023921) ENSJJAG00000012506 Klhdc10 (ENSJJAG00000012472) ENSJJAG00000008041 Strip2 (ENSJJAG00000021639) Ahcyl2 (ENSJJAG00000009214) Smo (ENSJJAG00000000655) Tspan33 (ENSJJAG00000002952) Tnpo3 (ENSJJAG00000013530) Irf5 (ENSJJAG00000018231) Atp6v1fnb (ENSJJAG00000023149) Atp6v1f (ENSJJAG00000023984) Flnc (ENSJJAG00000017159) ENSJJAG00000023327 Opn1sw (ENSJJAG00000000331) ##22 Calu (ENSJJAG00000019710) Garin1b (ENSJJAG00000011943) Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT01030000235325 ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00390000014201 ENSGT00940000154156.d ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 ENSGT00940000153772.A ENSGT00390000008140 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00390000006086 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00390000014201 ENSGT00940000154156.d ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 ENSGT00940000153772.A ENSGT00390000008140 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 5 UBE2H (ENSHGLG00000033292) NRF1 (ENSHGLG00000005939) ENSHGLG00000026519 STRIP2 (ENSHGLG00000003806) AHCYL2 (ENSHGLG00000007569) SMO (ENSHGLG00000004118) TSPAN33 (ENSHGLG00000004629) ENSHGLG00000032102 TNPO3 (ENSHGLG00000004463) IRF5 (ENSHGLG00000008448) ATP6V1FNB (ENSHGLG00000045075) ENSHGLG00000003789 FLNC (ENSHGLG00000007789) CCDC136 (ENSHGLG00000010818) ENSHGLG00000017204 OPN1SW (ENSHGLG00000012102) ##22 GARIN1B (ENSHGLG00000014946) GARIN1A (ENSHGLG00000013393) ENSHGLG00000045038 ENSHGLG00000003834 PRRT4 (ENSHGLG00000004653) RBM28 (ENSHGLG00000005409) LEP (ENSHGLG00000042168) ENSHGLG00000042470 SND1 (ENSHGLG00000003618) LRRC4 (ENSHGLG00000004237) PAX4 (ENSHGLG00000004644) FSCN3 (ENSHGLG00000006438) ARF5 (ENSHGLG00000007494) GCC1 (ENSHGLG00000050471) ZNF800 (ENSHGLG00000003680) Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES 43 ENSGT00940000155977 ENSGT00390000006086 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006835 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00940000169914 ENSGT00390000014201 ENSGT00940000154156.d ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 ENSGT00940000153772.A Guinea pig MODERN SPECIES 11 KLHDC10 (ENSCPOG00000003674) ZC3HC1 (ENSCPOG00000014034) UBE2H (ENSCPOG00000030275) NRF1 (ENSCPOG00000009384) STRIP2 (ENSCPOG00000025878) AHCYL2 (ENSCPOG00000021923) SMO (ENSCPOG00000013127) TSPAN33 (ENSCPOG00000026557) TNPO3 (ENSCPOG00000039784) IRF5 (ENSCPOG00000000246) KCP (ENSCPOG00000025035) ATP6V1FNB (ENSCPOG00000038022) ATP6V1F (ENSCPOG00000040466) FLNC (ENSCPOG00000001395) CCDC136 (ENSCPOG00000007170) OPN1SW (ENSCPOG00000010209) ##22 CALU (ENSCPOG00000010201) GARIN1B (ENSCPOG00000003688) GARIN1A (ENSCPOG00000020934) ENSCPOG00000037525 HILPDA (ENSCPOG00000037851) IMPDH1 (ENSCPOG00000006264) PRRT4 (ENSCPOG00000040639) RBM28 (ENSCPOG00000006253) LEP (ENSCPOG00000034742) LRRC4 (ENSCPOG00000032605) SND1 (ENSCPOG00000006251) PAX4 (ENSCPOG00000006244) FSCN3 (ENSCPOG00000005661) ARF5 (ENSCPOG00000006239) GCC1 (ENSCPOG00000038340) Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES 85 ENSGT00390000006086 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006835 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT01030000235325 ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00940000169914 ENSGT00940000154156.d ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 ENSGT00940000153772.A ENSGT00390000008140 Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 186 ENSCLAG00000014939 UBE2H (ENSCLAG00000014785) NRF1 (ENSCLAG00000011653) STRIP2 (ENSCLAG00000006452) ENSCLAG00000005979 AHCYL2 (ENSCLAG00000010097) SMO (ENSCLAG00000012672) TSPAN33 (ENSCLAG00000015056) TNPO3 (ENSCLAG00000016298) IRF5 (ENSCLAG00000010292) KCP (ENSCLAG00000008238) ATP6V1FNB (ENSCLAG00000008131) ATP6V1F (ENSCLAG00000007944) FLNC (ENSCLAG00000004512) ENSCLAG00000006490 OPN1SW (ENSCLAG00000006304) ##22 CALU (ENSCLAG00000005800) GARIN1B (ENSCLAG00000005300) GARIN1A (ENSCLAG00000005230) ENSCLAG00000005074 IMPDH1 (ENSCLAG00000004262) PRRT4 (ENSCLAG00000003937) RBM28 (ENSCLAG00000003707) LEP (ENSCLAG00000003590) LRRC4 (ENSCLAG00000003547) SND1 (ENSCLAG00000011796) PAX4 (ENSCLAG00000008291) FSCN3 (ENSCLAG00000008067) ARF5 (ENSCLAG00000007930) GCC1 (ENSCLAG00000007735) ZNF800 (ENSCLAG00000007288) Degu MODERN SPECIES 201 STRIP2 (ENSODEG00000014429) AHCYL2 (ENSODEG00000014499) ENSODEG00000020258 ENSODEG00000020155 ENSODEG00000012926 SMO (ENSODEG00000012811) TSPAN33 (ENSODEG00000012549) ENSODEG00000013695 TNPO3 (ENSODEG00000012826) IRF5 (ENSODEG00000013467) KCP (ENSODEG00000012598) ATP6V1FNB (ENSODEG00000012220) ATP6V1F (ENSODEG00000013471) FLNC (ENSODEG00000012609) ENSODEG00000013040 OPN1SW (ENSODEG00000013213) ##22 CALU (ENSODEG00000011897) GARIN1B (ENSODEG00000011956) GARIN1A (ENSODEG00000012901) IMPDH1 (ENSODEG00000013707) PRRT4 (ENSODEG00000013465) ENSODEG00000013217 LEP (ENSODEG00000012966) LRRC4 (ENSODEG00000013567) SND1 (ENSODEG00000011502) PAX4 (ENSODEG00000015565) FSCN3 (ENSODEG00000011950) ARF5 (ENSODEG00000011800) GCC1 (ENSODEG00000011696) ZNF800 (ENSODEG00000012385) GRM8 (ENSODEG00000012191) Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT01030000235325 ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00390000014201 ENSGT00940000154156.d ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 ENSGT00940000153772.A ENSGT00390000008140 Marmotini ANCESTRAL SPECIES 35 ENSGT01050000244841.A.b.b.a ENSGT00390000004586 ENSGT00550000074907 ENSGT00390000011863.d ENSGT01070000253775.a.d.a.a.a.a ENSGT00510000047522 ENSGT01070000253775.a.d.a.a.a.b ENSGT00550000074844 ENSGT00940000156003 ENSGT00940000162514 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00390000014201 ENSGT00940000154156.d ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000153314.a.a ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 ENSGT00940000153772.A Alpin marmot MODERN SPECIES 22 HBP1 (ENSMMMG00000016540) GPR22 (ENSMMMG00000016530) COG5 (ENSMMMG00000016519) DUS4L (ENSMMMG00000016513) BCAP29 (ENSMMMG00000016504) SLC26A4 (ENSMMMG00000016494) CBLL1 (ENSMMMG00000016477) SLC26A3 (ENSMMMG00000016464) DLD (ENSMMMG00000016446) LAMB1 (ENSMMMG00000016413) LAMB4 (ENSMMMG00000016384) ATP6V1FNB (ENSMMMG00000016351) ATP6V1F (ENSMMMG00000016346) FLNC (ENSMMMG00000016242) CCDC136 (ENSMMMG00000015944) OPN1SW (ENSMMMG00000015924) ##22 CALU (ENSMMMG00000015910) GARIN1B (ENSMMMG00000015890) GARIN1A (ENSMMMG00000015879) HILPDA (ENSMMMG00000015877) IMPDH1 (ENSMMMG00000015789) PRRT4 (ENSMMMG00000015777) RBM28 (ENSMMMG00000015736) LEP (ENSMMMG00000015724) ENSMMMG00000015714 LRRC4 (ENSMMMG00000015704) SND1 (ENSMMMG00000015627) ENSMMMG00000015616 PAX4 (ENSMMMG00000015595) FSCN3 (ENSMMMG00000015585) ARF5 (ENSMMMG00000015574) Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 65 ENSGT01050000244841.A.b.b.a ENSGT00390000004586 ENSGT00550000074907 ENSGT00390000011863.d ENSGT01070000253775.a.d.a.a.a.a ENSGT00510000047522 ENSGT01070000253775.a.d.a.a.a.b ENSGT00550000074844 ENSGT00940000156003 ENSGT00940000162514 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00390000014201 ENSGT00940000154156.d ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000153314.a.a ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 ENSGT00940000153772.A Squirrel MODERN SPECIES 79 GPR22 (ENSSTOG00000023580) COG5 (ENSSTOG00000034441) DUS4L (ENSSTOG00000000212) BCAP29 (ENSSTOG00000000215) SLC26A4 (ENSSTOG00000010945) CBLL1 (ENSSTOG00000027668) SLC26A3 (ENSSTOG00000010967) DLD (ENSSTOG00000007445) LAMB1 (ENSSTOG00000007474) LAMB4 (ENSSTOG00000031581) KCP (ENSSTOG00000014371) ATP6V1FNB (ENSSTOG00000024361) ATP6V1F (ENSSTOG00000014368) FLNC (ENSSTOG00000014349) ENSSTOG00000014335 OPN1SW (ENSSTOG00000026017) ##22 CALU (ENSSTOG00000022028) GARIN1B (ENSSTOG00000026261) GARIN1A (ENSSTOG00000008506) HILPDA (ENSSTOG00000029766) IMPDH1 (ENSSTOG00000002177) PRRT4 (ENSSTOG00000023582) RBM28 (ENSSTOG00000002169) LEP (ENSSTOG00000027970) LRRC4 (ENSSTOG00000021081) SND1 (ENSSTOG00000002140) PAX4 (ENSSTOG00000002127) FSCN3 (ENSSTOG00000002115) ARF5 (ENSSTOG00000002104) GCC1 (ENSSTOG00000002099) ZNF800 (ENSSTOG00000023294) Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 501 ATP6V1FNB (ENSUPAG00010002399) ATP6V1F (ENSUPAG00010002394) FLNC (ENSUPAG00010002251) CCDC136 (ENSUPAG00010002072) OPN1SW (ENSUPAG00010002051) ##22 CALU (ENSUPAG00010002015) GARIN1B (ENSUPAG00010001974) GARIN1A (ENSUPAG00010001961) HILPDA (ENSUPAG00010001958) IMPDH1 (ENSUPAG00010001856) PRRT4 (ENSUPAG00010001841) RBM28 (ENSUPAG00010001783) LEP (ENSUPAG00010001772) LRRC4 (ENSUPAG00010001766) SND1 (ENSUPAG00010001727) ENSUPAG00010001679 PAX4 (ENSUPAG00010001638) FSCN3 (ENSUPAG00010001614) ARF5 (ENSUPAG00010001595) GCC1 (ENSUPAG00010001589) Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 17 MORN2 (ENSSVLG00005004940) ENSSVLG00005004958 ENSSVLG00005004972 SMKR1 (ENSSVLG00005004987) STRIP2 (ENSSVLG00005005033) AHCYL2 (ENSSVLG00005005255) SMO (ENSSVLG00005005533) TSPAN33 (ENSSVLG00005005565) TNPO3 (ENSSVLG00005005607) IRF5 (ENSSVLG00005005731) KCP (ENSSVLG00005005808) ATP6V1FNB (ENSSVLG00005005988) ATP6V1F (ENSSVLG00005006014) FLNC (ENSSVLG00005006076) CCDC136 (ENSSVLG00005006165) OPN1SW (ENSSVLG00005006222) ##22 ENSSVLG00005006280 GARIN1B (ENSSVLG00005006383) GARIN1A (ENSSVLG00005006434) HILPDA (ENSSVLG00005006462) ENSSVLG00005006479 IMPDH1 (ENSSVLG00005006574) PRRT4 (ENSSVLG00005006756) RBM28 (ENSSVLG00005006856) LEP (ENSSVLG00005006935) SND1 (ENSSVLG00005006972) LRRC4 (ENSSVLG00005007018) ENSSVLG00005007031 PAX4 (ENSSVLG00005007068) FSCN3 (ENSSVLG00005007223) ARF5 (ENSSVLG00005007263) Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT01030000235325 ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00940000169914 ENSGT00950000185983 ENSGT00390000014201 ENSGT00940000154156.d ENSGT00530000064743 ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT01030000235325 ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00940000169914 ENSGT00950000185983 ENSGT00390000014201 ENSGT00940000154156.d ENSGT00530000064743 ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000006086 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00390000014201 ENSGT00940000154156.d ENSGT00530000064743 ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 ENSGT00940000153772.A Suina ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00390000006086 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00940000169914 ENSGT00940000154156.d ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 ENSGT00940000153772.A ENSGT00390000008140 Pig MODERN SPECIES 9 UBE2H (ENSSSCG00000016564) NRF1 (ENSSSCG00000016566) SMKR1 (ENSSSCG00000062966) STRIP2 (ENSSSCG00000016567) AHCYL2 (ENSSSCG00000016568) SMO (ENSSSCG00000016569) TSPAN33 (ENSSSCG00000016570) TNPO3 (ENSSSCG00000016572) ENSSSCG00000016571 IRF5 (ENSSSCG00000016573) KCP (ENSSSCG00000016574) ATP6V1FNB (ENSSSCG00000023540) ATP6V1F (ENSSSCG00000016577) FLNC (ENSSSCG00000016578) CCDC136 (ENSSSCG00000016579) OPN1SW (ENSSSCG00000016580) ##22 CALU (ENSSSCG00000016581) GARIN1B (ENSSSCG00000016582) GARIN1A (ENSSSCG00000016583) HILPDA (ENSSSCG00000031109) IMPDH1 (ENSSSCG00000016585) ENSSSCG00000048237 PRRT4 (ENSSSCG00000037087) RBM28 (ENSSSCG00000031847) LEP (ENSSSCG00000040464) SND1 (ENSSSCG00000016590) LRRC4 (ENSSSCG00000016589) PAX4 (ENSSSCG00000016591) FSCN3 (ENSSSCG00000016592) ARF5 (ENSSSCG00000016593) GCC1 (ENSSSCG00000035211) Chacoan peccary MODERN SPECIES 72 ZC3HC1 (ENSCWAG00000006305) UBE2H (ENSCWAG00000006246) NRF1 (ENSCWAG00000006180) ENSCWAG00000006167 STRIP2 (ENSCWAG00000006015) AHCYL2 (ENSCWAG00000005284) SMO (ENSCWAG00000005138) TSPAN33 (ENSCWAG00000005089) TNPO3 (ENSCWAG00000004965) IRF5 (ENSCWAG00000004691) KCP (ENSCWAG00000004551) ATP6V1FNB (ENSCWAG00000004520) ATP6V1F (ENSCWAG00000004495) FLNC (ENSCWAG00000004035) CCDC136 (ENSCWAG00000003906) OPN1SW (ENSCWAG00000003868) ##22 CALU (ENSCWAG00000003815) GARIN1B (ENSCWAG00000003788) GARIN1A (ENSCWAG00000003763) ENSCWAG00000003747 IMPDH1 (ENSCWAG00000003659) PRRT4 (ENSCWAG00000003635) RBM28 (ENSCWAG00000003603) LEP (ENSCWAG00000003589) LRRC4 (ENSCWAG00000003577) SND1 (ENSCWAG00000003558) PAX4 (ENSCWAG00000003505) FSCN3 (ENSCWAG00000003487) ARF5 (ENSCWAG00000003480) GCC1 (ENSCWAG00000003474) ZNF800 (ENSCWAG00000003466) Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000006086 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00390000014201 ENSGT00940000154156.d ENSGT00530000064743 ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 ENSGT00940000153772.A Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000006086 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00390000014201 ENSGT00940000154156.d ENSGT00530000064743 ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 ENSGT00940000153772.A Pecora ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000006086 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00390000014201 ENSGT00940000154156.d ENSGT00530000064743 ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 ENSGT00940000153772.A Yarkand deer MODERN SPECIES 9 ZC3HC1 (ENSCHYG00000021177) UBE2H (ENSCHYG00000021029) NRF1 (ENSCHYG00000020814) SMKR1 (ENSCHYG00000020757) STRIP2 (ENSCHYG00000020354) AHCYL2 (ENSCHYG00000019988) SMO (ENSCHYG00000019882) TSPAN33 (ENSCHYG00000019736) TNPO3 (ENSCHYG00000019439) IRF5 (ENSCHYG00000019113) KCP (ENSCHYG00000018473) ATP6V1FNB (ENSCHYG00000018427) ATP6V1F (ENSCHYG00000018387) FLNC (ENSCHYG00000016957) CCDC136 (ENSCHYG00000016583) OPN1SW (ENSCHYG00000016509) ##22 CALU (ENSCHYG00000016210) GARIN1B (ENSCHYG00000016076) GARIN1A (ENSCHYG00000015992) ENSCHYG00000015886 IMPDH1 (ENSCHYG00000015595) ENSCHYG00000015549 ENSCHYG00000015520 RBM28 (ENSCHYG00000015085) LEP (ENSCHYG00000014999) ENSCHYG00000014949 LRRC4 (ENSCHYG00000014918) SND1 (ENSCHYG00000014315) PAX4 (ENSCHYG00000014112) FSCN3 (ENSCHYG00000013994) ARF5 (ENSCHYG00000013895) Percora_a ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000006086 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00390000014201 ENSGT00940000154156.d ENSGT00530000064743 ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 ENSGT00940000153772.A Bovidae ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000006086 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00390000014201 ENSGT00940000154156.d ENSGT00530000064743 ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 ENSGT00940000153772.A Bovinae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000005102.f ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT00940000154431.f.c.b ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00390000014201 ENSGT00940000154156.d ENSGT00530000064743 ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 ENSGT00940000153772.A Bos ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000005102.f ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT00940000154431.f.c.b ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208.ob ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027.b ENSGT00390000014201 ENSGT00940000154156.d ENSGT00530000064743 ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 ENSGT00940000153772.A Bos_a ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000005102.f ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208.ob ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027.b ENSGT00390000014201 ENSGT00940000154156.d ENSGT00530000064743 ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 ENSGT00940000153772.A Wild yak MODERN SPECIES 1761 UBE2H (ENSBMUG00000023579) ENSBMUG00000023568 NRF1 (ENSBMUG00000023541) SMKR1 (ENSBMUG00000023521) STRIP2 (ENSBMUG00000023516) AHCYL2 (ENSBMUG00000023493) SMO (ENSBMUG00000023453) TSPAN33 (ENSBMUG00000023441) TNPO3 (ENSBMUG00000023399) IRF5 (ENSBMUG00000023320) KCP (ENSBMUG00000023263) ATP6V1FNB (ENSBMUG00000023140) ENSBMUG00000023139 FLNC (ENSBMUG00000023112) CCDC136 (ENSBMUG00000023016) OPN1SW (ENSBMUG00000022998) ##22 CALU (ENSBMUG00000022990) GARIN1B (ENSBMUG00000022914) Domestic yak MODERN SPECIES 23 ENSBGRG00000007949 NRF1 (ENSBGRG00000008004) SMKR1 (ENSBGRG00000008134) STRIP2 (ENSBGRG00000008162) AHCYL2 (ENSBGRG00000008318) ENSBGRG00000009523 SMO (ENSBGRG00000009570) TSPAN33 (ENSBGRG00000009713) TNPO3 (ENSBGRG00000009809) IRF5 (ENSBGRG00000010195) KCP (ENSBGRG00000010458) ATP6V1FNB (ENSBGRG00000011423) ENSBGRG00000011477 FLNC (ENSBGRG00000011802) CCDC136 (ENSBGRG00000022169) OPN1SW (ENSBGRG00000022278) ##22 CALU (ENSBGRG00000022337) GARIN1B (ENSBGRG00000022749) ENSBGRG00000022771 ENSBGRG00000022817 ENSBGRG00000022825 IMPDH1 (ENSBGRG00000022841) ENSBGRG00000023028 PRRT4 (ENSBGRG00000023047) RBM28 (ENSBGRG00000023073) LEP (ENSBGRG00000023249) SND1 (ENSBGRG00000023300) LRRC4 (ENSBGRG00000023653) PAX4 (ENSBGRG00000023672) FSCN3 (ENSBGRG00000023843) ARF5 (ENSBGRG00000023869) Bos_b ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000005102.f ENSGT00390000006835 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT00940000154431.f.c.b ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208.ob ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027.b ENSGT00940000154156.d ENSGT00530000064743 ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 ENSGT00940000153772.A ENSGT00390000008140 Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 23 ENSBIXG00005025101 NRF1 (ENSBIXG00005025039) STRIP2 (ENSBIXG00005024926) AHCYL2 (ENSBIXG00005024776) ENSBIXG00005024648 SMO (ENSBIXG00005004209) TSPAN33 (ENSBIXG00005024609) TNPO3 (ENSBIXG00005024544) IRF5 (ENSBIXG00005024387) KCP (ENSBIXG00005024276) ATP6V1FNB (ENSBIXG00005024258) ENSBIXG00005024244 FLNC (ENSBIXG00005024221) CCDC136 (ENSBIXG00005024099) ENSBIXG00005024008 OPN1SW (ENSBIXG00005023745) ##22 GARIN1A (ENSBIXG00005006904) ENSBIXG00005004057 IMPDH1 (ENSBIXG00005023654) ENSBIXG00005004012 PRRT4 (ENSBIXG00005023455) RBM28 (ENSBIXG00005023387) LEP (ENSBIXG00005003976) SND1 (ENSBIXG00005023220) LRRC4 (ENSBIXG00005023138) PAX4 (ENSBIXG00005007616) FSCN3 (ENSBIXG00005003929) ARF5 (ENSBIXG00005023029) GCC1 (ENSBIXG00005022996) ZNF800 (ENSBIXG00005022911) GRM8 (ENSBIXG00005022834) Cow MODERN SPECIES 23 UBE2H (ENSBTAG00000000911) ENSBTAG00000047845 NRF1 (ENSBTAG00000014273) STRIP2 (ENSBTAG00000007206) ENSBTAG00000051697 AHCYL2 (ENSBTAG00000001754) SMO (ENSBTAG00000013287) TSPAN33 (ENSBTAG00000007253) TNPO3 (ENSBTAG00000004992) IRF5 (ENSBTAG00000004989) KCP (ENSBTAG00000003449) ATP6V1FNB (ENSBTAG00000045645) ATP6V1F (ENSBTAG00000007572) FLNC (ENSBTAG00000006253) CCDC136 (ENSBTAG00000011002) OPN1SW (ENSBTAG00000016485) ##22 CALU (ENSBTAG00000016481) GARIN1B (ENSBTAG00000009867) GARIN1A (ENSBTAG00000024291) IMPDH1 (ENSBTAG00000000296) ENSBTAG00000031866 PRRT4 (ENSBTAG00000047482) RBM28 (ENSBTAG00000017001) LEP (ENSBTAG00000014911) LRRC4 (ENSBTAG00000010704) SND1 (ENSBTAG00000010692) PAX4 (ENSBTAG00000000410) FSCN3 (ENSBTAG00000009365) ARF5 (ENSBTAG00000009366) GCC1 (ENSBTAG00000003102) ZNF800 (ENSBTAG00000020004) American bison MODERN SPECIES 3374 ENSBBBG00000014555 NRF1 (ENSBBBG00000014541) SMKR1 (ENSBBBG00000014511) STRIP2 (ENSBBBG00000014505) AHCYL2 (ENSBBBG00000003347) ENSBBBG00000001412 SMO (ENSBBBG00000014370) ENSBBBG00000001413 TNPO3 (ENSBBBG00000003272) IRF5 (ENSBBBG00000003226) KCP (ENSBBBG00000003212) ATP6V1FNB (ENSBBBG00000013937) ATP6V1F (ENSBBBG00000013933) FLNC (ENSBBBG00000003024) ENSBBBG00000002958 OPN1SW (ENSBBBG00000013791) ##22 CALU (ENSBBBG00000002950) GARIN1B (ENSBBBG00000013746) GARIN1A (ENSBBBG00000013741) ENSBBBG00000002928 IMPDH1 (ENSBBBG00000002924) PRRT4 (ENSBBBG00000013673) RBM28 (ENSBBBG00000002849) LEP (ENSBBBG00000002840) SND1 (ENSBBBG00000013628) LRRC4 (ENSBBBG00000013605) PAX4 (ENSBBBG00000002828) FSCN3 (ENSBBBG00000013578) ARF5 (ENSBBBG00000002812) GCC1 (ENSBBBG00000013561) ZNF800 (ENSBBBG00000002809) Caprinae ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000006086 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00390000014201 ENSGT00940000154156.d ENSGT00530000064743 ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 ENSGT00940000153772.A Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 20 TMEM209 (ENSOARG00020000377) KLHDC10 (ENSOARG00020000341) ZC3HC1 (ENSOARG00020000306) UBE2H (ENSOARG00020000266) NRF1 (ENSOARG00020008138) STRIP2 (ENSOARG00020007865) AHCYL2 (ENSOARG00020006912) SMO (ENSOARG00020006736) TSPAN33 (ENSOARG00020006705) TNPO3 (ENSOARG00020006396) IRF5 (ENSOARG00020006152) KCP (ENSOARG00020005935) ATP6V1FNB (ENSOARG00020005898) ATP6V1F (ENSOARG00020005878) FLNC (ENSOARG00020005793) OPN1SW (ENSOARG00020005641) ##22 CALU (ENSOARG00020005456) GARIN1B (ENSOARG00020005402) FAM71F2 (ENSOARG00020005377) HILPDA (ENSOARG00020005363) IMPDH1 (ENSOARG00020005183) PRRT4 (ENSOARG00020005155) RBM28 (ENSOARG00020005071) ob (ENSOARG00020005038) LRRC4 (ENSOARG00020005020) ENSOARG00020004980 PAX4 (ENSOARG00020004842) FSCN3 (ENSOARG00020004792) ARF5 (ENSOARG00020004762) GCC1 (ENSOARG00020004708) ZNF800 (ENSOARG00020004613) Goat MODERN SPECIES 23 SMKR1 (ENSCHIG00000008143) STRIP2 (ENSCHIG00000008721) AHCYL2 (ENSCHIG00000019042) ENSCHIG00000022603 ENSCHIG00000023411 SMO (ENSCHIG00000023137) TSPAN33 (ENSCHIG00000021150) TNPO3 (ENSCHIG00000011721) IRF5 (ENSCHIG00000021193) KCP (ENSCHIG00000011656) ENSCHIG00000008503 ATP6V1FNB (ENSCHIG00000019543) ENSCHIG00000008493 FLNC (ENSCHIG00000021055) CCDC136 (ENSCHIG00000001208) OPN1SW (ENSCHIG00000017473) ##22 CALU (ENSCHIG00000025549) GARIN1B (ENSCHIG00000023839) GARIN1A (ENSCHIG00000018576) HILPDA (ENSCHIG00000009991) IMPDH1 (ENSCHIG00000017941) ENSCHIG00000017791 PRRT4 (ENSCHIG00000019622) RBM28 (ENSCHIG00000014146) LEP (ENSCHIG00000019616) SND1 (ENSCHIG00000023390) LRRC4 (ENSCHIG00000006081) PAX4 (ENSCHIG00000014419) FSCN3 (ENSCHIG00000011966) ARF5 (ENSCHIG00000018906) GCC1 (ENSCHIG00000013724) Siberian musk deer MODERN SPECIES 84 UBE2H (ENSMMSG00000017959) NRF1 (ENSMMSG00000018044) SMKR1 (ENSMMSG00000018106) STRIP2 (ENSMMSG00000018129) AHCYL2 (ENSMMSG00000018231) SMO (ENSMMSG00000018531) TSPAN33 (ENSMMSG00000018592) TNPO3 (ENSMMSG00000018649) ENSMMSG00000018787 IRF5 (ENSMMSG00000018827) KCP (ENSMMSG00000018961) ATP6V1FNB (ENSMMSG00000019402) ATP6V1F (ENSMMSG00000019428) FLNC (ENSMMSG00000019492) CCDC136 (ENSMMSG00000019946) OPN1SW (ENSMMSG00000020155) ##22 CALU (ENSMMSG00000020199) GARIN1B (ENSMMSG00000020348) GARIN1A (ENSMMSG00000020388) HILPDA (ENSMMSG00000020415) ENSMMSG00000020426 IMPDH1 (ENSMMSG00000020466) PRRT4 (ENSMMSG00000020652) RBM28 (ENSMMSG00000020692) LEP (ENSMMSG00000020786) SND1 (ENSMMSG00000020818) LRRC4 (ENSMMSG00000020883) PAX4 (ENSMMSG00000020894) FSCN3 (ENSMMSG00000020993) ARF5 (ENSMMSG00000021026) GCC1 (ENSMMSG00000021049) Cetacea ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00390000006086 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00390000014201 ENSGT00940000154156.d ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 ENSGT00940000153772.A ENSGT00390000008140 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000006086 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00390000014201 ENSGT00940000154156.d ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 ENSGT00940000153772.A ENSGT00390000008140 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00390000006086 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00390000014201 ENSGT00940000154156.d ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 ENSGT00940000153772.A ENSGT00390000008140 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00390000006086 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00390000014201 ENSGT00940000154156.d ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00390000011772 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000159260 ENSGT00940000158491.d ENSGT00390000011958.j ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 Monodontidae ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000006086 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00390000014201 ENSGT00940000154156.d ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00940000158491.d ENSGT00390000011958.j ENSGT00510000047270 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 Beluga whale MODERN SPECIES 72 ZC3HC1 (ENSDLEG00000010726) UBE2H (ENSDLEG00000010770) NRF1 (ENSDLEG00000010842) SMKR1 (ENSDLEG00000010881) STRIP2 (ENSDLEG00000010900) AHCYL2 (ENSDLEG00000011027) SMO (ENSDLEG00000011091) TSPAN33 (ENSDLEG00000011119) TNPO3 (ENSDLEG00000011142) IRF5 (ENSDLEG00000011208) KCP (ENSDLEG00000011415) ATP6V1FNB (ENSDLEG00000012188) ATP6V1F (ENSDLEG00000012202) FLNC (ENSDLEG00000012226) CCDC136 (ENSDLEG00000012339) OPN1SW (ENSDLEG00000012508) ##22 CALU (ENSDLEG00000012533) FAM71F1 (ENSDLEG00000012548) GARIN1A (ENSDLEG00000012559) HILPDA (ENSDLEG00000012580) ENSDLEG00000012587 PRRT4 (ENSDLEG00000012610) ENSDLEG00000012621 RBM28 (ENSDLEG00000012635) Ob (ENSDLEG00000012664) SND1 (ENSDLEG00000012684) LRRC4 (ENSDLEG00000012769) ENSDLEG00000012774 ENSDLEG00000012789 FSCN3 (ENSDLEG00000012802) ARF5 (ENSDLEG00000012847) Narwhal MODERN SPECIES 306 UBE2H (ENSMMNG00015006891) NRF1 (ENSMMNG00015006846) SMKR1 (ENSMMNG00015006808) STRIP2 (ENSMMNG00015006760) AHCYL2 (ENSMMNG00015006702) SMO (ENSMMNG00015006671) TSPAN33 (ENSMMNG00015006647) TNPO3 (ENSMMNG00015006506) IRF5 (ENSMMNG00015006384) KCP (ENSMMNG00015006151) ATP6V1FNB (ENSMMNG00015006027) ATP6V1F (ENSMMNG00015006017) FLNC (ENSMMNG00015005978) CCDC136 (ENSMMNG00015005873) ENSMMNG00015005806 OPN1SW (ENSMMNG00015005791) ##22 CALU (ENSMMNG00015005726) GARIN1B (ENSMMNG00015005673) GARIN1A (ENSMMNG00015005649) HILPDA (ENSMMNG00015005632) ENSMMNG00015005468 PRRT4 (ENSMMNG00015005396) RBM28 (ENSMMNG00015005356) LEP (ENSMMNG00015005324) LRRC4 (ENSMMNG00015005311) ENSMMNG00015005287 SND1 (ENSMMNG00015005249) ENSMMNG00015005220 PAX4 (ENSMMNG00015005191) FSCN3 (ENSMMNG00015009527) ARF5 (ENSMMNG00015009511) Vaquita MODERN SPECIES 20 UBE2H (ENSPSNG00000013546) NRF1 (ENSPSNG00000013708) SMKR1 (ENSPSNG00000013780) STRIP2 (ENSPSNG00000013854) AHCYL2 (ENSPSNG00000014033) SMO (ENSPSNG00000014582) TSPAN33 (ENSPSNG00000014660) TNPO3 (ENSPSNG00000014853) IRF5 (ENSPSNG00000015055) KCP (ENSPSNG00000015668) ATP6V1FNB (ENSPSNG00000017030) ATP6V1F (ENSPSNG00000017061) FLNC (ENSPSNG00000017209) ENSPSNG00000018084 ENSPSNG00000018193 OPN1SW (ENSPSNG00000018263) ##22 CALU (ENSPSNG00000018358) GARIN1B (ENSPSNG00000018506) GARIN1A (ENSPSNG00000018600) ENSPSNG00000018846 PRRT4 (ENSPSNG00000019177) RBM28 (ENSPSNG00000019283) LEP (ENSPSNG00000019352) SND1 (ENSPSNG00000019438) LRRC4 (ENSPSNG00000019500) ENSPSNG00000019518 PAX4 (ENSPSNG00000019551) FSCN3 (ENSPSNG00000019633) ARF5 (ENSPSNG00000019685) GCC1 (ENSPSNG00000019719) ZNF800 (ENSPSNG00000019763) Dolphin MODERN SPECIES 3300 TNPO3 (ENSTTRG00000014618) ENSTTRG00000014616 ENSTTRG00000014614 FLNC (ENSTTRG00000014609) CCDC136 (ENSTTRG00000014607) OPN1SW (ENSTTRG00000014605) ##22 CALU (ENSTTRG00000014604) GARIN1B (ENSTTRG00000014602) GARIN1A (ENSTTRG00000014601) IMPDH1 (ENSTTRG00000014598) Sperm whale MODERN SPECIES 16 CPA2 (ENSPCTG00005000773) SSMEM1 (ENSPCTG00005000796) TMEM209 (ENSPCTG00005000822) KLHDC10 (ENSPCTG00005000848) ZC3HC1 (ENSPCTG00005000871) UBE2H (ENSPCTG00005000914) NRF1 (ENSPCTG00005000937) SMKR1 (ENSPCTG00005000964) STRIP2 (ENSPCTG00005001003) AHCYL2 (ENSPCTG00005001116) ENSPCTG00005001339 SMO (ENSPCTG00005001356) TSPAN33 (ENSPCTG00005001375) TNPO3 (ENSPCTG00005001428) ENSPCTG00005001560 OPN1SW (ENSPCTG00005001574) ##22 CALU (ENSPCTG00005001613) GARIN1B (ENSPCTG00005001671) GARIN1A (ENSPCTG00005001694) HILPDA (ENSPCTG00005001716) IMPDH1 (ENSPCTG00005001748) PRRT4 (ENSPCTG00005001828) RBM28 (ENSPCTG00005001842) ENSPCTG00005001867 LEP (ENSPCTG00005001874) SND1 (ENSPCTG00005001983) ENSPCTG00005002338 ZNF800 (ENSPCTG00005002350) GRM8 (ENSPCTG00005002369) ENSPCTG00005002397 ENSPCTG00005002405 Blue whale MODERN SPECIES 20 ZC3HC1 (ENSBMSG00010020881) UBE2H (ENSBMSG00010020928) NRF1 (ENSBMSG00010020977) SMKR1 (ENSBMSG00010021051) STRIP2 (ENSBMSG00010021060) AHCYL2 (ENSBMSG00010021103) SMO (ENSBMSG00010021316) TSPAN33 (ENSBMSG00010021341) TNPO3 (ENSBMSG00010021371) IRF5 (ENSBMSG00010021438) KCP (ENSBMSG00010005056) ATP6V1FNB (ENSBMSG00010005193) ATP6V1F (ENSBMSG00010005201) FLNC (ENSBMSG00010005264) CCDC136 (ENSBMSG00010005379) OPN1SW (ENSBMSG00010005408) ##22 CALU (ENSBMSG00010005429) GARIN1B (ENSBMSG00010005451) GARIN1A (ENSBMSG00010005458) IMPDH1 (ENSBMSG00010005499) PRRT4 (ENSBMSG00010005567) ENSBMSG00010005580 RBM28 (ENSBMSG00010005595) LEP (ENSBMSG00010005621) SND1 (ENSBMSG00010005644) ENSBMSG00010005674 ENSBMSG00010005681 PAX4 (ENSBMSG00010005697) FSCN3 (ENSBMSG00010005721) ARF5 (ENSBMSG00010005732) GCC1 (ENSBMSG00010005744) Camelidae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000006086 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00940000169914 ENSGT00940000154156.d ENSGT00530000064743 ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 ENSGT00940000153772.A Alpaca MODERN SPECIES 539 ENSVPAG00000005079 OPN1SW (ENSVPAG00000005078) ##22 CALU (ENSVPAG00000005077) GARIN1B (ENSVPAG00000005076) ENSVPAG00000005075 Arabian camel MODERN SPECIES 33 ZC3HC1 (ENSCDRG00005000669) UBE2H (ENSCDRG00005000616) NRF1 (ENSCDRG00005000576) SMKR1 (ENSCDRG00005000557) STRIP2 (ENSCDRG00005000481) AHCYL2 (ENSCDRG00005000196) ENSCDRG00005000133 TSPAN33 (ENSCDRG00005000117) TNPO3 (ENSCDRG00005009872) IRF5 (ENSCDRG00005009623) KCP (ENSCDRG00005007916) ATP6V1FNB (ENSCDRG00005007847) ATP6V1F (ENSCDRG00005007832) FLNC (ENSCDRG00005006906) CCDC136 (ENSCDRG00005006752) OPN1SW (ENSCDRG00005006689) ##22 CALU (ENSCDRG00005006437) GARIN1B (ENSCDRG00005006342) GARIN1A (ENSCDRG00005006296) ENSCDRG00005006285 IMPDH1 (ENSCDRG00005006025) ENSCDRG00005005987 PRRT4 (ENSCDRG00005005971) RBM28 (ENSCDRG00005005861) LEP (ENSCDRG00005005841) LRRC4 (ENSCDRG00005005827) ENSCDRG00005005816 SND1 (ENSCDRG00005005782) PAX4 (ENSCDRG00005005680) FSCN3 (ENSCDRG00005005640) ARF5 (ENSCDRG00005005607) Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT01030000235325 ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00940000169914 ENSGT00950000185983 ENSGT00390000014201 ENSGT00940000154156.d ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 Carnivora ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000006086 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00940000169914.a ENSGT00950000185983 ENSGT00940000154156.d ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 ENSGT00940000153772.A Caniformia ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000006086 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00940000169914.a ENSGT00950000185983 ENSGT00940000154156.d ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 ENSGT00940000153772.A Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000006086 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00940000169914.a ENSGT00940000154156.d ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 ENSGT00940000153772.A ENSGT00390000008140 Ursidae ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000006086 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00940000169914.a ENSGT00940000154156.d ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 ENSGT00940000153772.A ENSGT00390000008140 Ursus ANCESTRAL SPECIES 82 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000168340 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00940000154156.d ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 ENSGT00940000153772.A ENSGT00390000008140 ENSGT01030000234648.a.b.a.a.b Polar bear MODERN SPECIES 281 UBE2H (ENSUMAG00000009264) NRF1 (ENSUMAG00000009234) SMKR1 (ENSUMAG00000009222) STRIP2 (ENSUMAG00000009078) AHCYL2 (ENSUMAG00000007310) SMO (ENSUMAG00000006946) TSPAN33 (ENSUMAG00000006916) TNPO3 (ENSUMAG00000006882) IRF5 (ENSUMAG00000006864) ENSUMAG00000006860 KCP (ENSUMAG00000006764) ATP6V1FNB (ENSUMAG00000006753) ATP6V1F (ENSUMAG00000006749) FLNC (ENSUMAG00000006701) CCDC136 (ENSUMAG00000006415) OPN1SW (ENSUMAG00000006346) ##22 CALU (ENSUMAG00000006337) GARIN1B (ENSUMAG00000006332) GARIN1A (ENSUMAG00000006328) IMPDH1 (ENSUMAG00000006045) RBM28 (ENSUMAG00000005997) LEP (ENSUMAG00000005993) LRRC4 (ENSUMAG00000005972) SND1 (ENSUMAG00000005960) ENSUMAG00000005899 FSCN3 (ENSUMAG00000005891) ENSUMAG00000005886 ENSUMAG00000005879 ZNF800 (ENSUMAG00000005877) GRM8 (ENSUMAG00000005860) POT1 (ENSUMAG00000005740) American black bear MODERN SPECIES 1204 SMO (ENSUAMG00000021232) TSPAN33 (ENSUAMG00000021280) TNPO3 (ENSUAMG00000021281) IRF5 (ENSUAMG00000021285) ENSUAMG00000021288 KCP (ENSUAMG00000021291) ATP6V1FNB (ENSUAMG00000021294) ATP6V1F (ENSUAMG00000021295) FLNC (ENSUAMG00000021311) CCDC136 (ENSUAMG00000022367) OPN1SW (ENSUAMG00000022372) ##22 CALU (ENSUAMG00000022373) Giant Panda MODERN SPECIES ZC3HC1 (ENSAMEG00000005425) UBE2H (ENSAMEG00000029524) NRF1 (ENSAMEG00000005353) SMKR1 (ENSAMEG00000025309) STRIP2 (ENSAMEG00000005285) AHCYL2 (ENSAMEG00000005214) SMO (ENSAMEG00000005185) TSPAN33 (ENSAMEG00000005167) TNPO3 (ENSAMEG00000005135) IRF5 (ENSAMEG00000005109) KCP (ENSAMEG00000005092) ATP6V1FNB (ENSAMEG00000005091) ATP6V1F (ENSAMEG00000005090) FLNC (ENSAMEG00000004952) CCDC136 (ENSAMEG00000004945) OPN1SW (ENSAMEG00000004922) ##22 CALU (ENSAMEG00000004885) GARIN1B (ENSAMEG00000004877) GARIN1A (ENSAMEG00000004872) ENSAMEG00000004871 IMPDH1 (ENSAMEG00000004824) RBM28 (ENSAMEG00000004776) LEP (ENSAMEG00000027137) LRRC4 (ENSAMEG00000019025) SND1 (ENSAMEG00000004664) PAX4 (ENSAMEG00000004648) FSCN3 (ENSAMEG00000004642) ARF5 (ENSAMEG00000004635) GCC1 (ENSAMEG00000004631) ZNF800 (ENSAMEG00000004627) GRM8 (ENSAMEG00000004617) Mustelinae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000006086 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00940000169914.a ENSGT00940000154156.d ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00390000011772 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000159260 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 ENSGT00940000153772.A ENSGT00390000008140 American mink MODERN SPECIES 3 KLHDC10 (ENSNVIG00000022934) ZC3HC1 (ENSNVIG00000022938) UBE2H (ENSNVIG00000022946) NRF1 (ENSNVIG00000022959) STRIP2 (ENSNVIG00000023005) AHCYL2 (ENSNVIG00000023011) SMO (ENSNVIG00000023033) TSPAN33 (ENSNVIG00000023035) TNPO3 (ENSNVIG00000023041) IRF5 (ENSNVIG00000023089) KCP (ENSNVIG00000023112) ATP6V1FNB (ENSNVIG00000023138) ATP6V1F (ENSNVIG00000023142) FLNC (ENSNVIG00000023149) CCDC136 (ENSNVIG00000023245) OPN1SW (ENSNVIG00000000043) ##22 CALU (ENSNVIG00000000059) GARIN1B (ENSNVIG00000000204) GARIN1A (ENSNVIG00000000229) ENSNVIG00000000238 IMPDH1 (ENSNVIG00000000252) PRRT4 (ENSNVIG00000000314) RBM28 (ENSNVIG00000000320) LEP (ENSNVIG00000000369) E7ESM6 (ENSNVIG00000000397) LRRC4 (ENSNVIG00000000448) PAX4 (ENSNVIG00000000457) FSCN3 (ENSNVIG00000000474) ARF5 (ENSNVIG00000000489) GCC1 (ENSNVIG00000000492) ZNF800 (ENSNVIG00000000502) Ferret MODERN SPECIES 168 UBE2H (ENSMPUG00000005309) NRF1 (ENSMPUG00000005319) ENSMPUG00000018741 SMKR1 (ENSMPUG00000005431) STRIP2 (ENSMPUG00000005438) AHCYL2 (ENSMPUG00000005673) SMO (ENSMPUG00000005883) TSPAN33 (ENSMPUG00000005894) ENSMPUG00000006013 TNPO3 (ENSMPUG00000006021) IRF5 (ENSMPUG00000006034) KCP (ENSMPUG00000006115) ATP6V1F (ENSMPUG00000006253) FLNC (ENSMPUG00000006260) CCDC136 (ENSMPUG00000006305) OPN1SW (ENSMPUG00000006323) ##22 CALU (ENSMPUG00000006394) GARIN1B (ENSMPUG00000006404) GARIN1A (ENSMPUG00000006446) ENSMPUG00000006475 IMPDH1 (ENSMPUG00000006480) ENSMPUG00000006497 ENSMPUG00000006503 RBM28 (ENSMPUG00000006511) LEP (ENSMPUG00000006529) ENSMPUG00000006536 SND1 (ENSMPUG00000006545) LRRC4 (ENSMPUG00000006565) PAX4 (ENSMPUG00000006575) FSCN3 (ENSMPUG00000006639) ARF5 (ENSMPUG00000006675) Canidae ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT01030000235325 ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00940000169914.a ENSGT00950000185983 ENSGT00940000154156.d ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00940000167126 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT01030000235325 ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00940000169914.a ENSGT00950000185983 ENSGT00940000154156.d ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00940000167126 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 Dog MODERN SPECIES 5 NRF1 (ENSCAFG00845019891) STRIP2 (ENSCAFG00845020214) SMKR1 (ENSCAFG00845020464) AHCYL2 (ENSCAFG00845020537) ENSCAFG00845020690 SMO (ENSCAFG00845020728) TSPAN33 (ENSCAFG00845020805) TNPO3 (ENSCAFG00845020947) ENSCAFG00845021349 IRF5 (ENSCAFG00845021435) ENSCAFG00845021771 ATP6V1FNB (ENSCAFG00845022312) ATP6V1F (ENSCAFG00845022337) FLNC (ENSCAFG00845022554) CCDC136 (ENSCAFG00845023460) OPN1SW (ENSCAFG00845023668) ##22 CALU (ENSCAFG00845023757) FAM71F1 (ENSCAFG00845023982) GARIN1A (ENSCAFG00845024028) ENSCAFG00845024069 IMPDH (ENSCAFG00845024195) PRRT4 (ENSCAFG00845024597) RBM28 (ENSCAFG00845024695) LEP (ENSCAFG00845025165) SND1 (ENSCAFG00845025303) LRRC4 (ENSCAFG00845025632) ENSCAFG00845025672 PAX4 (ENSCAFG00845025704) FSCN3 (ENSCAFG00845025795) ARF5 (ENSCAFG00845025859) GCC1 (ENSCAFG00845025919) Dingo MODERN SPECIES 203 NRF1 (ENSCAFG00020023321) SMKR1 (ENSCAFG00020023320) STRIP2 (ENSCAFG00020023266) AHCYL2 (ENSCAFG00020022647) ENSCAFG00020022609 ENSCAFG00020022607 SMO (ENSCAFG00020022606) ENSCAFG00020022605 TNPO3 (ENSCAFG00020022462) IRF5 (ENSCAFG00020022461) KCP (ENSCAFG00020022439) ATP6V1FNB (ENSCAFG00020022431) ATP6V1F (ENSCAFG00020022430) FLNC (ENSCAFG00020021914) CCDC136 (ENSCAFG00020021687) OPN1SW (ENSCAFG00020021669) ##22 CALU (ENSCAFG00020021663) GARIN1B (ENSCAFG00020021654) GARIN1A (ENSCAFG00020021653) ENSCAFG00020021652 ENSCAFG00020021651 IMPDH1 (ENSCAFG00020021650) PRRT4 (ENSCAFG00020021649) RBM28 (ENSCAFG00020021648) LEP (ENSCAFG00020021646) LRRC4 (ENSCAFG00020021644) ENSCAFG00020021642 SND1 (ENSCAFG00020021639) PAX4 (ENSCAFG00020021633) FSCN3 (ENSCAFG00020021630) ARF5 (ENSCAFG00020021629) Red fox MODERN SPECIES 83 UBE2H (ENSVVUG00000012372) NRF1 (ENSVVUG00000012330) SMKR1 (ENSVVUG00000012317) STRIP2 (ENSVVUG00000012302) ENSVVUG00000012297 AHCYL2 (ENSVVUG00000012272) SMO (ENSVVUG00000012217) TSPAN33 (ENSVVUG00000012208) TNPO3 (ENSVVUG00000011004) IRF5 (ENSVVUG00000010949) KCP (ENSVVUG00000010493) ATP6V1FNB (ENSVVUG00000010471) ATP6V1F (ENSVVUG00000010470) FLNC (ENSVVUG00000010437) CCDC136 (ENSVVUG00000010413) OPN1SW (ENSVVUG00000010402) ##22 CALU (ENSVVUG00000010389) GARIN1B (ENSVVUG00000010383) GARIN1A (ENSVVUG00000010379) ENSVVUG00000010373 ENSVVUG00000010368 IMPDH1 (ENSVVUG00000007352) RBM28 (ENSVVUG00000007270) LEP (ENSVVUG00000007265) LRRC4 (ENSVVUG00000007250) ENSVVUG00000007246 SND1 (ENSVVUG00000007226) PAX4 (ENSVVUG00000007146) FSCN3 (ENSVVUG00000007136) ARF5 (ENSVVUG00000007062) GCC1 (ENSVVUG00000007055) Felidae ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00390000006086 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00940000169914.a ENSGT00940000154156.d ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 ENSGT00940000153772.A ENSGT00390000008140 Panthera ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000006086 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00960000187999 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00940000169914.a ENSGT00940000154156.d ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 ENSGT00940000153772.A ENSGT00390000008140 Tiger MODERN SPECIES 109 ZC3HC1 (ENSPTIG00000007823) UBE2H (ENSPTIG00000006312) NRF1 (ENSPTIG00000021708) ENSPTIG00000021137 SMKR1 (ENSPTIG00000020786) STRIP2 (ENSPTIG00000017007) AHCYL2 (ENSPTIG00000010641) SMO (ENSPTIG00000008685) TSPAN33 (ENSPTIG00000005418) TNPO3 (ENSPTIG00000016167) IRF5 (ENSPTIG00000011636) ATP6V1FNB (ENSPTIG00000016205) ATP6V1F (ENSPTIG00000015589) FLNC (ENSPTIG00000008651) ENSPTIG00000002833 OPN1SW (ENSPTIG00000000315) ##22 CALU (ENSPTIG00000018066) GARIN1B (ENSPTIG00000017013) GARIN1A (ENSPTIG00000016417) IMPDH1 (ENSPTIG00000012727) ENSPTIG00000011837 RBM28 (ENSPTIG00000008550) LEP (ENSPTIG00000008315) Panthera_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006086 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00960000187999 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00940000169914.a ENSGT00940000154156.d ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 ENSGT00940000153772.A ENSGT00390000008140 leopard MODERN SPECIES 23 UBE2H (ENSPPRG00000001068) NRF1 (ENSPPRG00000001152) ENSPPRG00000001228 ENSPPRG00000001236 SMKR1 (ENSPPRG00000001247) STRIP2 (ENSPPRG00000001272) AHCYL2 (ENSPPRG00000001412) SMO (ENSPPRG00000001467) TSPAN33 (ENSPPRG00000001477) TNPO3 (ENSPPRG00000002050) IRF5 (ENSPPRG00000002195) ATP6V1FNB (ENSPPRG00000002532) ATP6V1F (ENSPPRG00000002543) FLNC (ENSPPRG00000002721) ENSPPRG00000002789 OPN1SW (ENSPPRG00000002803) ##22 CALU (ENSPPRG00000002880) GARIN1B (ENSPPRG00000003211) GARIN1A (ENSPPRG00000003232) IMPDH1 (ENSPPRG00000004153) PRRT4 (ENSPPRG00000004214) RBM28 (ENSPPRG00000004420) LEP (ENSPPRG00000004465) LRRC4 (ENSPPRG00000004476) SND1 (ENSPPRG00000004494) PAX4 (ENSPPRG00000004640) FSCN3 (ENSPPRG00000004664) ARF5 (ENSPPRG00000004674) GCC1 (ENSPPRG00000004679) ZNF800 (ENSPPRG00000004753) GRM8 (ENSPPRG00000004848) lion MODERN SPECIES 2 UBE2H (ENSPLOG00000016346) ENSPLOG00000016280 NRF1 (ENSPLOG00000016212) SMKR1 (ENSPLOG00000016163) STRIP2 (ENSPLOG00000015863) AHCYL2 (ENSPLOG00000015366) SMO (ENSPLOG00000015145) TSPAN33 (ENSPLOG00000015074) TNPO3 (ENSPLOG00000014381) IRF5 (ENSPLOG00000014206) ENSPLOG00000014143 ATP6V1FNB (ENSPLOG00000014108) ATP6V1F (ENSPLOG00000014078) FLNC (ENSPLOG00000013283) CCDC136 (ENSPLOG00000012842) OPN1SW (ENSPLOG00000012745) ##22 CALU (ENSPLOG00000012712) GARIN1B (ENSPLOG00000012642) GARIN1A (ENSPLOG00000012554) ENSPLOG00000012531 IMPDH1 (ENSPLOG00000012239) PRRT4 (ENSPLOG00000012122) RBM28 (ENSPLOG00000012090) LEP (ENSPLOG00000012046) LRRC4 (ENSPLOG00000012023) SND1 (ENSPLOG00000011908) PAX4 (ENSPLOG00000011588) FSCN3 (ENSPLOG00000011529) ARF5 (ENSPLOG00000011492) GCC1 (ENSPLOG00000011454) ZNF800 (ENSPLOG00000011404) Cat MODERN SPECIES 1 ZC3HC1 (ENSFCAG00000010429) UBE2H (ENSFCAG00000044906) NRF1 (ENSFCAG00000010212) SMKR1 (ENSFCAG00000039173) STRIP2 (ENSFCAG00000023901) AHCYL2 (ENSFCAG00000028700) SMO (ENSFCAG00000026041) TSPAN33 (ENSFCAG00000014547) TNPO3 (ENSFCAG00000018186) IRF5 (ENSFCAG00000000956) KCP (ENSFCAG00000027848) ATP6V1FNB (ENSFCAG00000030475) ATP6V1F (ENSFCAG00000000364) FLNC (ENSFCAG00000000954) CCDC136 (ENSFCAG00000043434) OPN1SW (ENSFCAG00000000952) ##22 CALU (ENSFCAG00000034966) GARIN1B (ENSFCAG00000008096) GARIN1A (ENSFCAG00000000950) ENSFCAG00000023233 IMPDH1 (ENSFCAG00000000949) PRRT4 (ENSFCAG00000028746) LEP (ENSFCAG00000035912) LRRC4 (ENSFCAG00000031071) ENSFCAG00000051986 SND1 (ENSFCAG00000008289) PAX4 (ENSFCAG00000005485) FSCN3 (ENSFCAG00000005484) ARF5 (ENSFCAG00000005482) GCC1 (ENSFCAG00000005480) ZNF800 (ENSFCAG00000025630) Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00390000006086 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00390000014201 ENSGT00940000154156.d ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00390000011772 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000159260 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 ENSGT00940000153772.A ENSGT00390000008140 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES 41 ENSGT00390000006086 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00940000154156.d ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00390000011772 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000159260 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 ENSGT00940000153772.A ENSGT00390000008140 ENSGT01030000234648.a.b.a.a.b Megabat MODERN SPECIES 8267 CCDC136 (ENSPVAG00000001078) OPN1SW (ENSPVAG00000001081) ##22 CALU (ENSPVAG00000001082) Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00390000006086 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00940000169914 ENSGT00940000154156.d ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00390000011772 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000159260 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 ENSGT00940000153772.A ENSGT00390000008140 Microbat MODERN SPECIES 983 AHCYL2 (ENSMLUG00000017565) ENSMLUG00000023097 ENSMLUG00000023124 ENSMLUG00000029505 SMO (ENSMLUG00000000966) TSPAN33 (ENSMLUG00000000974) ENSMLUG00000030322 TNPO3 (ENSMLUG00000000947) ENSMLUG00000026557 IRF5 (ENSMLUG00000001406) KCP (ENSMLUG00000001394) ATP6V1FNB (ENSMLUG00000027620) ENSMLUG00000001392 FLNC (ENSMLUG00000001339) CCDC136 (ENSMLUG00000001322) OPN1SW (ENSMLUG00000001320) ##22 CALU (ENSMLUG00000001309) ENSMLUG00000026420 Equus ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000155977 ENSGT00390000006086 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00390000014201 ENSGT00940000154156.d ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000165441 ENSGT00940000153772.A ENSGT00390000008140 Donkey MODERN SPECIES KLHDC10 (ENSEASG00005008795) ZC3HC1 (ENSEASG00005008789) UBE2H (ENSEASG00005008786) NRF1 (ENSEASG00005008777) SMKR1 (ENSEASG00005037203) STRIP2 (ENSEASG00005008770) AHCYL2 (ENSEASG00005008764) SMO (ENSEASG00005008716) TSPAN33 (ENSEASG00005008685) TNPO3 (ENSEASG00005008677) IRF5 (ENSEASG00005008667) KCP (ENSEASG00005008620) ATP6V1FNB (ENSEASG00005026227) FLNC (ENSEASG00005008563) CCDC136 (ENSEASG00005008548) OPN1SW (ENSEASG00005008544) ##22 CALU (ENSEASG00005008542) GARIN1B (ENSEASG00005008541) GARIN1A (ENSEASG00005008539) HILPDA (ENSEASG00005008537) IMPDH1 (ENSEASG00005008533) PRRT4 (ENSEASG00005038080) RBM28 (ENSEASG00005008528) LEP (ENSEASG00005038822) SND1 (ENSEASG00005008513) LRRC4 (ENSEASG00005008518) PAX4 (ENSEASG00005008510) FSCN3 (ENSEASG00005008505) ENSEASG00005008504 GCC1 (ENSEASG00005008503) ZNF800 (ENSEASG00005008502) Horse MODERN SPECIES 25 TMEM209 (ENSECAG00000012438) ZC3HC1 (ENSECAG00000017886) KLHDC10 (ENSECAG00000007654) UBE2H (ENSECAG00000015420) NRF1 (ENSECAG00000012837) ENSECAG00000029629 STRIP2 (ENSECAG00000023334) AHCYL2 (ENSECAG00000014138) SMO (ENSECAG00000004904) TSPAN33 (ENSECAG00000019800) TNPO3 (ENSECAG00000012815) IRF5 (ENSECAG00000009902) KCP (ENSECAG00000024406) FLNC (ENSECAG00000010052) CCDC136 (ENSECAG00000004534) OPN1SW (ENSECAG00000023205) ##22 CALU (ENSECAG00000055523) GARIN1B (ENSECAG00000022119) GARIN1A (ENSECAG00000047048) ENSECAG00000003049 IMPDH1 (ENSECAG00000015391) PRRT4 (ENSECAG00000037532) RBM28 (ENSECAG00000007745) LEP (ENSECAG00000030283) LRRC4 (ENSECAG00000002958) SND1 (ENSECAG00000011451) PAX4 (ENSECAG00000008343) FSCN3 (ENSECAG00000021353) ARF5 (ENSECAG00000020291) GCC1 (ENSECAG00000019925) ZNF800 (ENSECAG00000019340) Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES 1103 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c Common shrew MODERN SPECIES 2383 OPN1SW (ENSSARG00000000634) ##22 CALU (ENSSARG00000000624) Hedgehog MODERN SPECIES 2643 OPN1SW (ENSEEUG00000006306) ##22 CALU (ENSEEUG00000006226) Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000006086 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00390000014201 ENSGT00940000154156.d ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 ENSGT00940000153772.A ENSGT00390000008140 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES 1724 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c Sloth MODERN SPECIES 2271 ENSCHOG00000012103 ##22 CALU (ENSCHOG00000012096) Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000013963 ENSGT00940000155977 ENSGT00390000006086 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006835 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00940000154156.d ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 ENSGT00940000153772.A ENSGT00390000008140 ENSGT01030000234648.a.b.a.a.b Tenrec MODERN SPECIES 2539 OPN1SW (ENSETEG00000018461) ##22 CALU (ENSETEG00000018460) Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000013963 ENSGT00940000155977 ENSGT00390000006086 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006835 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477 ENSGT00940000162027 ENSGT00940000154156.d ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 ENSGT00940000153772.A ENSGT00390000008140 ENSGT01030000234648.a.b.a.a.b Elephant MODERN SPECIES 428 TMEM209 (ENSLAFG00000005527) KLHDC10 (ENSLAFG00000005526) ZC3HC1 (ENSLAFG00000001292) UBE2H (ENSLAFG00000007810) NRF1 (ENSLAFG00000003500) STRIP2 (ENSLAFG00000021474) AHCYL2 (ENSLAFG00000005481) SMO (ENSLAFG00000013328) TSPAN33 (ENSLAFG00000025948) TNPO3 (ENSLAFG00000002738) IRF5 (ENSLAFG00000021568) KCP (ENSLAFG00000014260) ATP6V1F (ENSLAFG00000008724) FLNC (ENSLAFG00000008705) CCDC136 (ENSLAFG00000003804) OPN1SW (ENSLAFG00000003803) ##22 CALU (ENSLAFG00000003798) GARIN1B (ENSLAFG00000003795) GARIN1A (ENSLAFG00000029416) IMPDH1 (ENSLAFG00000008090) ENSLAFG00000030090 RBM28 (ENSLAFG00000010717) LEP (ENSLAFG00000010714) LRRC4 (ENSLAFG00000009705) SND1 (ENSLAFG00000009696) PAX4 (ENSLAFG00000005297) FSCN3 (ENSLAFG00000011474) ARF5 (ENSLAFG00000011469) GCC1 (ENSLAFG00000000145) ZNF800 (ENSLAFG00000000456) ENSLAFG00000029686 Marsupialia ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT01030000235325 ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477.a ENSGT00940000161477.b ENSGT00940000169914 ENSGT00950000185983 ENSGT00940000154156.d ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 ENSGT00940000153772.A Opossum MODERN SPECIES 7 ENSMODG00000024477 SMKR1 (ENSMODG00000041471) STRIP2 (ENSMODG00000014664) ENSMODG00000024483 ENSMODG00000014672 SMO (ENSMODG00000014680) TSPAN33 (ENSMODG00000014684) ENSMODG00000038571 TNPO3 (ENSMODG00000014700) ENSMODG00000049892 ENSMODG00000031839 ATP6V1FNB (ENSMODG00000029411) ATP6V1F (ENSMODG00000049684) FLNC (ENSMODG00000015048) ENSMODG00000015065 OPN1SW (ENSMODG00000015071) ##22 CALU (ENSMODG00000015080) ENSMODG00000015091 ENSMODG00000029529 ENSMODG00000038899 IMPDH1 (ENSMODG00000015140) RBM28 (ENSMODG00000015151) LEP (ENSMODG00000048845) LRRC4 (ENSMODG00000015194) ENSMODG00000040907 SND1 (ENSMODG00000015182) FSCN3 (ENSMODG00000015224) ARF5 (ENSMODG00000015229) GCC1 (ENSMODG00000015233) ENSMODG00000040001 ZNF800 (ENSMODG00000015235) Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT01030000235325 ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477.a ENSGT00940000161477.b ENSGT00940000169914 ENSGT00950000185983 ENSGT00940000154156.d ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 ENSGT00940000153772.A Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT01030000235325 ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477.a ENSGT00940000161477.b ENSGT00940000169914 ENSGT00950000185983 ENSGT00940000154156.d ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 ENSGT00940000153772.A Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00390000004852.a.b ENSGT00390000006835 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.f ENSGT01030000235325 ENSGT00940000157206 ENSGT00940000159484 ENSGT00530000063347.B ENSGT00940000159926 ENSGT00940000160243 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000161477.a ENSGT00940000161477.b ENSGT00940000169914 ENSGT00950000185983 ENSGT00940000154156.d ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000161709 ENSGT00950000183157.b ENSGT00940000156878 ENSGT00940000153772.A Common wonbat MODERN SPECIES 1071 ZC3HC1 (ENSVURG00010005087) UBE2H (ENSVURG00010005072) NRF1 (ENSVURG00010005027) SMKR1 (ENSVURG00010004988) STRIP2 (ENSVURG00010004937) AHCYL2 (ENSVURG00010004886) ENSVURG00010004854 SMO (ENSVURG00010004827) TSPAN33 (ENSVURG00010004797) TNPO3 (ENSVURG00010004478) IRF5 (ENSVURG00010004438) ATP6V1FNB (ENSVURG00010004431) ENSVURG00010004428 FLNC (ENSVURG00010004413) ENSVURG00010004398 OPN1SW (ENSVURG00010004385) ##22 CALU (ENSVURG00010004310) GARIN1B (ENSVURG00010004277) ENSVURG00010004265 IMPDH1 (ENSVURG00010003732) PRRT4 (ENSVURG00010003660) RBM28 (ENSVURG00010003624) LEP (ENSVURG00010003614) LRRC4 (ENSVURG00010003602) SND1 (ENSVURG00010003582) PAX4 (ENSVURG00010003324) FSCN3 (ENSVURG00010003289) GCC1 (ENSVURG00010003282) ENSVURG00010003258 ZNF800 (ENSVURG00010003230) ENSVURG00010003219 koala MODERN SPECIES 96 NRF1 (ENSPCIG00000020610) SMKR1 (ENSPCIG00000028737) STRIP2 (ENSPCIG00000028495) AHCYL2 (ENSPCIG00000000784) SMO (ENSPCIG00000011357) TSPAN33 (ENSPCIG00000011364) TNPO3 (ENSPCIG00000011366) IRF5 (ENSPCIG00000033269) ENSPCIG00000011377 KCP (ENSPCIG00000011394) ATP6V1FNB (ENSPCIG00000011493) ATP6V1F (ENSPCIG00000011494) ENSPCIG00000032966 ENSPCIG00000011585 ENSPCIG00000036887 OPN1SW (ENSPCIG00000012769) ##22 CALU (ENSPCIG00000012771) ENSPCIG00000012803 ENSPCIG00000012804 ENSPCIG00000012805 ENSPCIG00000031795 IMPDH1 (ENSPCIG00000012807) PRRT4 (ENSPCIG00000012808) ENSPCIG00000012809 RBM28 (ENSPCIG00000012810) LEP (ENSPCIG00000012815) SND1 (ENSPCIG00000011561) LRRC4 (ENSPCIG00000011570) PAX4 (ENSPCIG00000011481) FSCN3 (ENSPCIG00000011477) ARF5 (ENSPCIG00000037383) Wallaby MODERN SPECIES 3454 OPN1SW (ENSMEUG00000007021) ##22 CALU (ENSMEUG00000007006) Tasmanian devil MODERN SPECIES 4 KLHDC10 (ENSSHAG00000004388) ZC3HC1 (ENSSHAG00000002529) UBE2H (ENSSHAG00000027272) NRF1 (ENSSHAG00000011427) STRIP2 (ENSSHAG00000010279) AHCYL2 (ENSSHAG00000009906) SMO (ENSSHAG00000008843) TSPAN33 (ENSSHAG00000025493) TNPO3 (ENSSHAG00000006837) IRF5 (ENSSHAG00000006683) KCP (ENSSHAG00000005683) ATP6V1FNB (ENSSHAG00000005474) ATP6V1F (ENSSHAG00000021210) ENSSHAG00000003962 FLNC (ENSSHAG00000004623) OPN1SW (ENSSHAG00000021418) ##22 CALU (ENSSHAG00000002536) GARIN1B (ENSSHAG00000021537) ENSSHAG00000022514 IMPDH1 (ENSSHAG00000024079) PRRT4 (ENSSHAG00000029521) RBM28 (ENSSHAG00000017017) LEP (ENSSHAG00000024371) LRRC4 (ENSSHAG00000020655) ENSSHAG00000031981 SND1 (ENSSHAG00000015359) ENSSHAG00000015143 FSCN3 (ENSSHAG00000015072) ARF5 (ENSSHAG00000022657) GCC1 (ENSSHAG00000015034) ZNF800 (ENSSHAG00000014391) Anura ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000013208 ENSGT00390000003224.B ENSGT00940000160243 ENSGT00940000165748 ENSGT00940000159926 ENSGT00530000063347.B ENSGT00390000008126 ENSGT00730000111591 ENSGT00530000064743 ENSGT00550000074976 ENSGT00390000011772 ENSGT00940000159260 ENSGT00940000165785 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000154156.d ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00940000153772.A ENSGT00390000005529.b ENSGT00390000009899.b ENSGT00940000155263 ENSGT00940000175182 ENSGT00390000016211 ENSGT00530000063702.a ENSGT00390000014443 ENSGT00390000004323.a ENSGT00390000009250 ENSGT00940000161995 ENSGT00940000160284 ENSGT00940000156551 ENSGT00940000162777.f Leishan spiny toad MODERN SPECIES 6 TNPO3 (ENSLLEG00000026939) ENSLLEG00000026768 ENSLLEG00000026739 ENSLLEG00000026717 RBM28 (ENSLLEG00000026253) ENSLLEG00000026178 ENSLLEG00000026164 ENSLLEG00000026153 LRRC4 (ENSLLEG00000026134) ENSLLEG00000026109 SND1 (ENSLLEG00000024055) ENSLLEG00000023830 PAX4 (ENSLLEG00000023743) ENSLLEG00000023558 IMPDH1 (ENSLLEG00000023196) OPN1SW (ENSLLEG00000023103) ##22 CALU (ENSLLEG00000022911) ENSLLEG00000022856 DENND6B (ENSLLEG00000022454) PPP6R2 (ENSLLEG00000022134) SBF1 (ENSLLEG00000019370) ENSLLEG00000019227 ENSLLEG00000019191 MIOX (ENSLLEG00000018979) LMF2 (ENSLLEG00000018828) SCO2 (ENSLLEG00000018762) NCAPH2 (ENSLLEG00000018366) ENSLLEG00000018321 ENSLLEG00000018253 ENSLLEG00000018136 ENSLLEG00000017935 Frog MODERN SPECIES 3 kcp (ENSXETG00000014993) ENSXETG00000037895 irf5 (ENSXETG00000015005) tnpo3 (ENSXETG00000015009) ENSXETG00000047103 polr1h (ENSXETG00000040925) prrt4 (ENSXETG00000034558) XB5749398 [provisional] (ENSXETG00000027673) rbm28 (ENSXETG00000009271) lep (ENSXETG00000042746) ENSXETG00000049436 snd1 (ENSXETG00000023043) LRRC4 (ENSXETG00000030410) ENSXETG00000037969 impdh1 (ENSXETG00000023047) opn1sw (ENSXETG00000023057) ##22 calu (ENSXETG00000023059) gcc1 (ENSXETG00000023063) dennd6b (ENSXETG00000023066) ppp6r2 (ENSXETG00000023068) sbf1 (ENSXETG00000023079) ENSXETG00000034576 miox (ENSXETG00000023087) lmf2 (ENSXETG00000023089) ncaph2 (ENSXETG00000023090) ENSXETG00000049228 tymp (ENSXETG00000015724) odf3 (ENSXETG00000015719) nme6 (ENSXETG00000015714) rabl2b (ENSXETG00000015712) arsa.2 (ENSXETG00000033466) Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000158022 ENSGT00950000183119.b ENSGT00390000000873.a.b ENSGT00940000159231 ENSGT00880000138051.a ENSGT00940000158567 ENSGT00940000158293 ENSGT00730000111212 ENSGT00940000163982 ENSGT00390000013208 ENSGT00390000003224.B ENSGT00940000160243 ENSGT00940000165748 ENSGT00940000159926 ENSGT00530000063347.B ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00390000000510 ENSGT00940000154156.d ENSGT00910000146976 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000165441 ENSGT00940000153772.A ENSGT00660000097187 ENSGT00390000005529.b ENSGT00390000009899.b ENSGT00940000155263 ENSGT00940000154380.a.a.b ENSGT01050000244956.a.b ENSGT00940000154380.a.a.a Reedfish MODERN SPECIES st7 (ENSECRG00000010843) wnt2 (ENSECRG00000010952) asz1 (ENSECRG00000010962) cftr (ENSECRG00000011130) ENSECRG00000013120 ENSECRG00000013151 lsm8 (ENSECRG00000013166) ENSECRG00000013191 ENSECRG00000013243 atp6v1f (ENSECRG00000013258) ENSECRG00000013280 ENSECRG00000013312 KCP (ENSECRG00000013392) irf5 (ENSECRG00000013532) tnpo3 (ENSECRG00000013547) opn1sw1 (ENSECRG00000013590) ##22 calub (ENSECRG00000013667) ENSECRG00000013695 impdh1a (ENSECRG00000013797) ENSECRG00000013892 si:dkey-5i3.5 (ENSECRG00000013909) rbm28 (ENSECRG00000013936) ENSECRG00000013968 snd1 (ENSECRG00000014071) lrrc4.2 (ENSECRG00000014416) ENSECRG00000014436 ENSECRG00000014467 hgfa (ENSECRG00000014510) cacna2d1a (ENSECRG00000014602) ENSECRG00000014744 sema3e (ENSECRG00000014917) Neopterygii ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00950000183119.b ENSGT00390000000873.a.b ENSGT00940000159231 ENSGT00880000138051.a ENSGT00940000158567 ENSGT00940000158293 ENSGT00730000111212 ENSGT00940000163982 ENSGT00390000013208 ENSGT00390000003224.B ENSGT00940000160974.a ENSGT00940000160243 ENSGT00940000165748 ENSGT00940000159926 ENSGT00530000063347.B ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.d ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00390000000510 ENSGT00940000154156.d ENSGT00730000111591 ENSGT00530000064743 ENSGT00550000074976 ENSGT01060000248794 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000165441 ENSGT00940000153772.A ENSGT00660000097187 ENSGT00390000005529.b ENSGT00390000009899.b Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 55 ENSGT00950000183119.b ENSGT00390000000873.a.b ENSGT00940000159231 ENSGT00880000138051.a ENSGT00940000158567 ENSGT00940000158293 ENSGT00730000111212 ENSGT00940000163982 ENSGT00390000013208 ENSGT00390000003224.B ENSGT00940000160974.a ENSGT00940000160243 ENSGT00940000165748 ENSGT00940000159926 ENSGT00530000063347.B ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.d ENSGT00940000154156.d ENSGT00730000111591 ENSGT00530000064743.a ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00390000000510 ENSGT00530000064743.b ENSGT00550000074976 ENSGT01060000248794 ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000165785 ENSGT00940000156019 ENSGT00940000155209.mb ENSGT00940000165441 Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 300 ENSGT00940000160974.a ENSGT00940000159926.o ENSGT00530000063347.B ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.d ENSGT01010000222360.E.c ENSGT00390000000510 ENSGT00940000154156.d ENSGT00910000146976 ENSGT00730000111591 ENSGT00550000074976 ENSGT01060000248794.d ENSGT01060000248794.c ENSGT00940000159260 ENSGT00510000047270 ENSGT00940000156019.b ENSGT00940000155209.mb ENSGT00620000087961.a.b.a.a.b.b Asian bonytongue MODERN SPECIES 16 SERINC3 (ENSSFOG00015024781) ENSSFOG00015001815 tp53rk (ENSSFOG00015025433) slc2a10 (ENSSFOG00015001778) ENSSFOG00015001727 ENSSFOG00015029276 ASB14 (ENSSFOG00015001693) CTTNBP2 (ENSSFOG00015001684) ENSSFOG00015028096 ENSSFOG00015001668 atp6v1f (ENSSFOG00015027249) ENSSFOG00015030567 ENSSFOG00015028564 irf5 (ENSSFOG00015001567) tnpo3 (ENSSFOG00015001474) opn1sw1 (ENSSFOG00015001440) ##22 calua (ENSSFOG00015001402) ENSSFOG00015001369 ENSSFOG00015029139 IMPDH1 (ENSSFOG00015001260) PRRT4 (ENSSFOG00015001242) rbm28 (ENSSFOG00015001231) lepa (ENSSFOG00015001202) LRRC4 (ENSSFOG00015001192) snd1 (ENSSFOG00015001103) ENSSFOG00015001072 HGF (ENSSFOG00015001061) CACNA2D1 (ENSSFOG00015000923) ENSSFOG00015000881 sema3e (ENSSFOG00015000800) sema3ab (ENSSFOG00015000724) Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 216 ENSGT00940000156878.i.b.b ENSGT00390000016053 ENSGT00390000013208 ENSGT00390000003224.B ENSGT00940000160974.a ENSGT00940000165748.a ENSGT00940000159926 ENSGT00530000063347.B ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.d ENSGT00940000154156.d ENSGT00530000064743.b ENSGT00940000154156.c.b ENSGT00730000111591.b ENSGT00940000159260.h ENSGT00510000047270 ENSGT00940000165785 ENSGT00940000156019.c.b ENSGT00940000155209.mb ENSGT00620000087961.a.b.a.b.a ENSGT00940000167336 ENSGT00940000161249 ENSGT00940000155867.a.b ENSGT00440000033504.B.b Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00940000158632 ENSGT00940000155580.b.a.b ENSGT00940000163529 ENSGT00940000156375 ENSGT00390000005529.b ENSGT00940000153772.A ENSGT00940000156878.i.b.a.a ENSGT00940000156878.i.b.b ENSGT00390000016053 ENSGT00390000013208 ENSGT00390000003224.B ENSGT00940000160974.a ENSGT00940000165748.a ENSGT00940000159926 ENSGT00530000063347.B ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.d ENSGT00530000064318 ENSGT01010000222533 ENSGT00940000157926 ENSGT00940000156715 ENSGT00940000155461.A ENSGT00940000159247 ENSGT00390000006837 ENSGT00390000005903 ENSGT00940000157945 ENSGT00940000158317 ENSGT00940000153920.a.a ENSGT00940000158123 ENSGT00940000157638 ENSGT00950000182835.d.b Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 47 ENSGT00950000182824.a.a.a.a.b ENSGT00390000009583 ENSGT00940000158632 ENSGT00940000155580.b.a.b ENSGT00940000163529 ENSGT00940000156375 ENSGT00390000005529.b ENSGT00940000153772.A ENSGT00940000156878.i.b.a.a ENSGT00390000016053 ENSGT00390000013208 ENSGT00940000160974.a ENSGT00940000165748.a ENSGT00940000159926 ENSGT00530000063347.B ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.d ENSGT00530000064318 ENSGT01010000222533 ENSGT00940000157926 ENSGT00940000155461.A ENSGT01100000263550 ENSGT01040000240375.D ENSGT00390000006837 ENSGT00390000005903 ENSGT00940000157945 ENSGT00940000158317 ENSGT00940000153920.a.a ENSGT00940000158123 ENSGT00940000157638 ENSGT00940000159226 Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 64 ENSGT00940000158632 ENSGT00940000155580.b.a.b ENSGT00940000158780.e ENSGT00940000163529 ENSGT00940000156375 ENSGT00390000005529.b ENSGT00940000153772.A ENSGT00940000156878.i.b.a.a ENSGT00390000016053 ENSGT00390000013208 ENSGT01020000231185 ENSGT00940000160974.a ENSGT00940000165748.a ENSGT00940000159926 ENSGT00530000063347.B ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.d ENSGT00530000064318 ENSGT01010000222533 ENSGT00940000157926 ENSGT00940000156715 ENSGT00940000155461.A ENSGT00940000159247 ENSGT00390000006837 ENSGT00390000005903 ENSGT00940000157945 ENSGT00940000158317 ENSGT00940000153920.a.a ENSGT00940000158123 ENSGT00940000157638 ENSGT00940000159226 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 35 ENSGT00940000155580.b.a.b ENSGT00940000159401.c ENSGT00940000158780.e ENSGT00940000163529 ENSGT00940000156375 ENSGT00390000005529.b ENSGT00940000153772.A ENSGT00940000156878.i.b.a.a ENSGT00390000016053 ENSGT00390000013208 ENSGT01020000231185 ENSGT00940000160974.a ENSGT00940000165748.a ENSGT00940000159926 ENSGT00530000063347.B ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.d Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00530000063472.a ENSGT00940000158632 ENSGT00940000155580.b.a.b ENSGT00940000163529 ENSGT00940000156375 ENSGT00390000005529.b ENSGT00940000153772.A ENSGT00940000156878.i.b.a.a ENSGT00390000016053 ENSGT00390000013208 ENSGT01020000231185 ENSGT00940000160974.a ENSGT00940000165748.a ENSGT00940000159926 ENSGT00530000063347.B ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.d Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00530000063472.a ENSGT00940000158632 ENSGT00940000155580.b.a.b.f ENSGT00940000163529 ENSGT00940000155580.b.a.b.e.b ENSGT00940000156375 ENSGT00390000005529.b ENSGT00940000153772.A ENSGT00940000156878.i.b.a.a ENSGT00390000016053 ENSGT00390000013208 ENSGT00940000160974.a ENSGT00940000165748.a ENSGT00940000159926 ENSGT00530000063347.B ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.d Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00530000063472.a ENSGT00940000158632 ENSGT00940000155580.b.a.b.f ENSGT00940000163529 ENSGT00940000156375 ENSGT00390000005529.b ENSGT00940000153772.A ENSGT00940000156878.i.b.a.a ENSGT00390000016053 ENSGT00390000013208 ENSGT00940000160974.a ENSGT00940000165748.a ENSGT00940000159926 ENSGT00530000063347.B ENSGT01010000222360.E.d ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT00390000004323.a ENSGT00390000014443 ENSGT01020000230616 ENSGT00940000155472.a.b.a.a ENSGT00510000047764 ENSGT00940000156619 ENSGT00390000015216 ENSGT00940000157480 ENSGT00940000156566.d ENSGT00940000163017 ENSGT00940000164581.A.a.b ENSGT00940000153588.a.a.a ENSGT00940000157983 ENSGT00390000014448 ENSGT00940000154814.b Oryzias ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000159122.h ENSGT00530000063472.a ENSGT00940000158632 ENSGT00940000155580.b.a.b.f ENSGT00940000177211.a.a ENSGT00940000156375 ENSGT00390000005529.b ENSGT00940000153772.A ENSGT00940000156878.i.b.a.a ENSGT00390000016053 ENSGT00390000013208 ENSGT00940000160974.a ENSGT00940000165748.a ENSGT00940000159926 ENSGT00530000063347.B ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000157983 ENSGT00390000014448 ENSGT00940000160758 ENSGT00940000161105 ENSGT00440000035348 ENSGT00390000004190 ENSGT00390000006670 ENSGT00940000155911 ENSGT00390000007890 ENSGT00390000015797 ENSGT00390000004933.k.a ENSGT00390000002615 ENSGT00940000169980 ENSGT00940000158990.t ENSGT00950000182937.B.b Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000155472.a.b.a.a ENSGT00390000014443 ENSGT00390000004323.a ENSGT00940000159122.h ENSGT00530000063472.a ENSGT00940000158632 ENSGT00940000155580.b.a.b.f ENSGT00940000177211.a.a ENSGT00940000156878.i.b.a.a ENSGT00390000016053 ENSGT00390000013208 ENSGT00940000160974.a ENSGT00940000165748.a ENSGT00940000159926 ENSGT00530000063347.B ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000157983 ENSGT00390000014448 ENSGT00940000160758 ENSGT00940000161105 ENSGT00440000035348 ENSGT00390000004190 ENSGT00390000006670 ENSGT00940000155911 ENSGT00390000007890 ENSGT00390000015797 ENSGT00390000004933.k.a ENSGT00390000002615 ENSGT00940000169980 ENSGT00940000158990.t ENSGT00950000182937.B.b Indian medaka MODERN SPECIES 2 ENSOMEG00000020598 svopl (ENSOMEG00000020637) ENSOMEG00000020672 ENSOMEG00000020692 lta4h (ENSOMEG00000020722) gcc1 (ENSOMEG00000020737) dennd6b (ENSOMEG00000020800) zgc:77650 (ENSOMEG00000020821) lamtor4 (ENSOMEG00000020846) atp6v1f (ENSOMEG00000020862) ENSOMEG00000020875 ENSOMEG00000020882 ENSOMEG00000020895 irf5 (ENSOMEG00000020932) tnpo3 (ENSOMEG00000021006) opn1sw1 (ENSOMEG00000021044) ##22 socs2 (ENSOMEG00000021092) cradd (ENSOMEG00000021102) PHF21B (ENSOMEG00000021122) nup50 (ENSOMEG00000021157) kiaa0930 (ENSOMEG00000021189) fbxo7 (ENSOMEG00000021245) rtcb (ENSOMEG00000021278) xpot (ENSOMEG00000021300) rpl18a (ENSOMEG00000021320) pthlha (ENSOMEG00000021338) C11orf98 (ENSOMEG00000021351) ENSOMEG00000021360 lrp6 (ENSOMEG00000021408) tbk1 (ENSOMEG00000021476) gpr19 (ENSOMEG00000021484) Javanese ricefish MODERN SPECIES 15 ENSOJAG00000020998 wnt16 (ENSOJAG00000020224) ing3 (ENSOJAG00000020153) tspan12 (ENSOJAG00000020118) kcnd2 (ENSOJAG00000020108) ncaph2 (ENSOJAG00000020095) sco2 (ENSOJAG00000020090) ENSOJAG00000020049 ENSOJAG00000019823 gcc1 (ENSOJAG00000019243) ARF5 (ENSOJAG00000019186) lamtor4 (ENSOJAG00000019170) atp6v1f (ENSOJAG00000019162) ENSOJAG00000019132 irf5 (ENSOJAG00000019090) opn1sw1 (ENSOJAG00000018114) ##22 socs2 (ENSOJAG00000018105) cradd (ENSOJAG00000018099) ARHGAP8 (ENSOJAG00000018087) pdzrn4 (ENSOJAG00000018083) gxylt1b (ENSOJAG00000018071) yaf2 (ENSOJAG00000018041) zcrb1 (ENSOJAG00000018015) pphln1 (ENSOJAG00000017967) prickle1b (ENSOJAG00000017893) pus7l (ENSOJAG00000017858) ENSOJAG00000017850 ENSOJAG00000017800 ENSOJAG00000017788 lrrc17 (ENSOJAG00000017779) fgl2a (ENSOJAG00000017698) Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 96 ENSGT00940000155472.a.b.a.a ENSGT00940000159122.h ENSGT00530000063472.a ENSGT00940000158632 ENSGT00940000155580.b.a.b.f ENSGT00940000156375 ENSGT00390000005529.b ENSGT00940000153772.A ENSGT00940000156878.i.b.a.a ENSGT00390000016053 ENSGT00390000013208 ENSGT00940000160974.a ENSGT00940000165748.a ENSGT00940000159926 ENSGT00530000063347.B ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000157983 ENSGT00390000014448 Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 15 svopl (ENSORLG00000019435) ENSORLG00000023456 ENSORLG00000021810 ENSORLG00000026478 ENSORLG00000026298 lta4h (ENSORLG00000020578) dennd6b (ENSORLG00000020574) gcc1 (ENSORLG00000022380) arf5 (ENSORLG00000020571) lamtor4 (ENSORLG00000019289) atp6v1f (ENSORLG00000018592) ENSORLG00000020114 ENSORLG00000024325 irf5 (ENSORLG00000020118) tnpo3 (ENSORLG00000029369) opn1sw1 (ENSORLG00000019293) ##22 socs2 (ENSORLG00000019262) cradd (ENSORLG00000019259) ARHGAP8 (ENSORLG00000027028) PHF21B (ENSORLG00000023030) nup50 (ENSORLG00000020059) kiaa0930 (ENSORLG00000020067) fbxo7 (ENSORLG00000020080) rtcb (ENSORLG00000020093) xpot (ENSORLG00000020105) ENSORLG00000026195 ENSORLG00000027947 rpl18a (ENSORLG00000024868) ENSORLG00000028097 ENSORLG00000028493 C11orf98 (ENSORLG00000025008) Chinese medaka MODERN SPECIES 4541 opn1sw1 (ENSOSIG00000005477) ##22 Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000160974.a ENSGT00940000165748.a ENSGT00940000159926 ENSGT00530000063347.B ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.d ENSGT00390000004323.a ENSGT00390000014443 ENSGT01020000230616 ENSGT00940000155472.a.b.a.a ENSGT00510000047764 ENSGT00940000156619 ENSGT00390000015216 ENSGT00940000157480 ENSGT00940000156566.d ENSGT00940000163017 ENSGT00940000164581.A.a.b ENSGT00940000153588.a.a.a ENSGT00940000157983 ENSGT00390000014448 Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 267 ENSGT00940000165748.a ENSGT00940000159926 ENSGT00530000063347.B ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.d ENSGT00390000004323.a ENSGT00390000014443 Mangrove rivulus MODERN SPECIES 626 ENSKMAG00000010582 irf5 (ENSKMAG00000010547) tnpo3 (ENSKMAG00000010497) opn1sw1 (ENSKMAG00000010455) ##22 calua (ENSKMAG00000010439) sco2 (ENSKMAG00000010429) ncaph2 (ENSKMAG00000010398) ENSKMAG00000010362 Turquoise killifish MODERN SPECIES 900 opn1sw1 (ENSNFUG00015014948) ##22 calua (ENSNFUG00015014965) sco2 (ENSNFUG00015014985) Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 74 ENSGT00940000158632 ENSGT00530000063472.a ENSGT00940000159122.h ENSGT00940000160974.a ENSGT00940000165748.a ENSGT00940000159926 ENSGT00530000063347.B ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.d ENSGT00390000004323.a ENSGT00390000014443 ENSGT01020000230616 ENSGT00940000155472.a.b.a.a ENSGT00510000047764 ENSGT00940000156619 ENSGT00390000015216 ENSGT00940000157480 ENSGT00940000156566.d ENSGT00940000163017 ENSGT00940000164581.A.a.b ENSGT00940000153588.a.a.a ENSGT00940000157983 ENSGT00390000014448 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 57 ENSGT00940000158632 ENSGT00530000063472.a.e ENSGT00940000159122.h ENSGT00940000160974.a ENSGT00940000165748.a ENSGT00940000159926 ENSGT00530000063347.B ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.d ENSGT00390000004323.a ENSGT00390000014443 ENSGT00940000155472.a.b.a.a ENSGT00510000047764 ENSGT00940000156619 ENSGT00390000015216 ENSGT00940000157480 ENSGT00940000156566.d ENSGT00940000164581.A.a.b ENSGT00940000153588.a.a.a ENSGT00940000157983 ENSGT00390000014448 Poecilia ANCESTRAL SPECIES 95 ENSGT00940000158632 ENSGT00530000063472.a.e ENSGT00940000159122.h ENSGT00940000160974.a ENSGT00940000165748.a ENSGT00940000159926 ENSGT00530000063347.B ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.d ENSGT00390000004323.a ENSGT00390000014443 ENSGT00940000155472.a.b.a.a ENSGT00510000047764 ENSGT00940000156619 ENSGT00390000015216 ENSGT00940000157480 ENSGT00940000156566.d ENSGT00940000164581.A.a.b ENSGT00940000153588.a.a.a ENSGT00940000157983 ENSGT00390000014448 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 318 ENSGT00940000158632 ENSGT00530000063472.a.e ENSGT00940000159122.h ENSGT00940000160974.a ENSGT00940000159926 ENSGT00530000063347.B ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.d ENSGT00390000004323.a ENSGT00940000156566.d ENSGT00940000164581.A.a.b ENSGT00940000153588.a.a.a ENSGT00940000157983 ENSGT00390000014448 Sailfin molly MODERN SPECIES 3354 opn1sw1 (ENSPLAG00000021425) ##22 calua (ENSPLAG00000021406) ncaph2 (ENSPLAG00000021400) sco2 (ENSPLAG00000021386) Amazon molly MODERN SPECIES 842 ENSPFOG00000013236 svopl (ENSPFOG00000013243) ENSPFOG00000013411 ENSPFOG00000013456 ENSPFOG00000013492 ENSPFOG00000013518 irf5 (ENSPFOG00000013528) tnpo3 (ENSPFOG00000013592) opn1sw1 (ENSPFOG00000013853) ##22 calua (ENSPFOG00000013734) sco2 (ENSPFOG00000020921) stab2 (ENSPFOG00000024510) parp12b (ENSPFOG00000013881) FLNC (ENSPFOG00000013934) socs2 (ENSPFOG00000020922) cradd (ENSPFOG00000014260) Guppy MODERN SPECIES svopl (ENSPREG00000001219) ENSPREG00000001146 ENSPREG00000001116 ENSPREG00000001085 ENSPREG00000001046 irf5 (ENSPREG00000000909) tnpo3 (ENSPREG00000000839) tnpo3 (ENSPREG00000019847) opn1sw (ENSPREG00000019709) ##22 calua (ENSPREG00000019522) sco2 (ENSPREG00000019483) ncaph2 (ENSPREG00000019464) PTPRO (ENSPREG00000019338) cradd (ENSPREG00000019284) socs2 (ENSPREG00000019251) FLNC (ENSPREG00000019162) parp12b (ENSPREG00000019105) ENSPREG00000019047 ENSPREG00000019022 wnt16 (ENSPREG00000019014) ing3 (ENSPREG00000018984) tspan12 (ENSPREG00000018966) kcnd2 (ENSPREG00000018943) eps8a (ENSPREG00000018918) Platyfish MODERN SPECIES 8 svopl (ENSXMAG00000013022) ENSXMAG00000013039 ENSXMAG00000013040 ENSXMAG00000013045 ENSXMAG00000013048 ENSXMAG00000013054 irf5 (ENSXMAG00000013056) tnpo3 (ENSXMAG00000013062) calua (ENSXMAG00000013096) opn1sw1 (ENSXMAG00000013088) ##22 sco2 (ENSXMAG00000019502) ENSXMAG00000024480 kcnd2 (ENSXMAG00000019504) tspan12 (ENSXMAG00000000236) ing3 (ENSXMAG00000009535) wnt16 (ENSXMAG00000009523) stab2 (ENSXMAG00000009421) parp12b (ENSXMAG00000009417) ENSXMAG00000028847 ENSXMAG00000028977 ENSXMAG00000022597 ENSXMAG00000022945 socs2 (ENSXMAG00000028306) cradd (ENSXMAG00000009329) PTPRO (ENSXMAG00000009306) NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 208 ENSGT00940000158632 ENSGT00530000063472.a ENSGT00940000159122.h ENSGT00940000160974.a ENSGT00940000165748.a ENSGT00940000159926 ENSGT00530000063347.B ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.d ENSGT00390000004323.a ENSGT00390000014443 ENSGT01020000230616 ENSGT00940000155472.a.b.a.a ENSGT00510000047764 ENSGT00940000156619 ENSGT00390000015216 ENSGT00940000157480 ENSGT00940000156566.d ENSGT00940000163017 ENSGT00940000164581.A.a.b ENSGT00940000153588.a.a.a ENSGT00940000157983 ENSGT00390000014448 Mummichog DUPLICATION Mummichog MODERN SPECIES 2373 svopl (ENSFHEG00000013362) ENSFHEG00000013346 ENSFHEG00000013050 ENSFHEG00000012930 ENSFHEG00000012888 irf5 (ENSFHEG00000012870) tnpo3 (ENSFHEG00000012859) opn1sw1 (ENSFHEG00000012792) ##22 opn1sw1 (ENSFHEG00000012300) ##22 calua (ENSFHEG00000012115) ncaph2 (ENSFHEG00000012107) sco2 (ENSFHEG00000012099) ENSFHEG00000012086 kcnd2 (ENSFHEG00000012076) ENSFHEG00000012052 tspan12 (ENSFHEG00000012042) ing3 (ENSFHEG00000012033) ENSFHEG00000011962 wnt16 (ENSFHEG00000011958) ENSFHEG00000011953 ENSFHEG00000011925 ovch1 (ENSFHEG00000011871) ENSFHEG00000011857 FLNC (ENSFHEG00000011850) Mummichog MODERN SPECIES 2373 svopl (ENSFHEG00000013362) ENSFHEG00000013346 ENSFHEG00000013050 ENSFHEG00000012930 ENSFHEG00000012888 irf5 (ENSFHEG00000012870) tnpo3 (ENSFHEG00000012859) opn1sw1 (ENSFHEG00000012792) ##22 opn1sw1 (ENSFHEG00000012300) ##22 calua (ENSFHEG00000012115) ncaph2 (ENSFHEG00000012107) sco2 (ENSFHEG00000012099) ENSFHEG00000012086 kcnd2 (ENSFHEG00000012076) ENSFHEG00000012052 tspan12 (ENSFHEG00000012042) ing3 (ENSFHEG00000012033) ENSFHEG00000011962 wnt16 (ENSFHEG00000011958) ENSFHEG00000011953 ENSFHEG00000011925 ovch1 (ENSFHEG00000011871) ENSFHEG00000011857 Sheepshead minnow DUPLICATION Sheepshead minnow MODERN SPECIES 513 pthlha (ENSCVAG00000020592) lta4h (ENSCVAG00000020551) ENSCVAG00000020519 ENSCVAG00000020489 xpot (ENSCVAG00000020453) rpl18a (ENSCVAG00000020360) tnpo3 (ENSCVAG00000020285) irf5 (ENSCVAG00000020118) ENSCVAG00000020090 ENSCVAG00000020029 ENSCVAG00000019976 ENSCVAG00000019931 ENSCVAG00000019902 svopl (ENSCVAG00000019866) opn1sw1 (ENSCVAG00000019796) ##22 opn1sw1 (ENSCVAG00000019774) ##22 calua (ENSCVAG00000019744) sco2 (ENSCVAG00000019716) ncaph2 (ENSCVAG00000019673) ENSCVAG00000019603 ENSCVAG00000019576 Sheepshead minnow MODERN SPECIES 513 C11orf98 (ENSCVAG00000020626) pthlha (ENSCVAG00000020592) lta4h (ENSCVAG00000020551) ENSCVAG00000020519 ENSCVAG00000020489 xpot (ENSCVAG00000020453) rpl18a (ENSCVAG00000020360) tnpo3 (ENSCVAG00000020285) irf5 (ENSCVAG00000020118) ENSCVAG00000020090 ENSCVAG00000020029 ENSCVAG00000019976 ENSCVAG00000019931 ENSCVAG00000019902 svopl (ENSCVAG00000019866) opn1sw1 (ENSCVAG00000019796) ##22 opn1sw1 (ENSCVAG00000019774) ##22 calua (ENSCVAG00000019744) sco2 (ENSCVAG00000019716) ncaph2 (ENSCVAG00000019673) ENSCVAG00000019603 ENSCVAG00000019576 Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 42 ENSGT00530000063472.a ENSGT00940000158632 ENSGT00940000155580.b.a.b.f ENSGT00940000177211.a.b ENSGT00940000155580.b.a.b.e.b ENSGT00940000156375 ENSGT00390000005529.b ENSGT00940000153772.A ENSGT00940000156878.i.b.a.a ENSGT00390000016053 ENSGT00390000013208 ENSGT00940000160974.a ENSGT00940000165748.a ENSGT00940000159926 ENSGT00530000063347.B ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.d Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 63 ENSGT00530000063472.a ENSGT00940000158632 ENSGT00940000155580.b.a.b.e.a ENSGT00940000163529 ENSGT00940000155580.b.a.b.e.b ENSGT00940000156375 ENSGT00390000005529.b ENSGT00940000153772.A ENSGT00940000156878.i.b.a.a ENSGT00390000016053 ENSGT00390000013208 ENSGT00940000160974.a ENSGT00940000165748.a ENSGT00940000159926 ENSGT00530000063347.B ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.d Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000164581.A.a.b ENSGT00530000063472.a ENSGT00940000158632 ENSGT00940000155580.b.a.b.e.b ENSGT00940000155580.b.a.b.e.a ENSGT00940000156375 ENSGT00390000005529.b ENSGT00940000153772.A ENSGT00940000156878.i.b.a.a ENSGT00390000016053 ENSGT00390000013208 ENSGT00940000160974.a ENSGT00940000165748.a ENSGT00940000159926 ENSGT00530000063347.B ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.d ENSGT00940000160040.B.a.b ENSGT01030000234624.b.b.c.a.b.d.a.a ENSGT01030000234624.b.b.c.a.b.d.a.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000000568 ENSGT00390000005338 ENSGT00940000165232 ENSGT00390000012434 ENSGT00940000157546 ENSGT00940000156897 ENSGT00390000003161 ENSGT00950000182915.b.b.a.b.c.a ENSGT00390000012078.a.a ENSGT00940000155438.b Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000164581.A.a.b ENSGT00530000063472.a ENSGT00940000158632 ENSGT00940000155580.b.a.b.e.b ENSGT00940000155580.b.a.b.e.a ENSGT00940000156375 ENSGT00390000005529.b ENSGT00940000153772.A ENSGT00940000156878.i.b.a.a ENSGT00390000016053 ENSGT00390000013208 ENSGT00940000160974.a ENSGT00940000165748.a ENSGT00940000159926 ENSGT00530000063347.B ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.d ENSGT00940000160040.B.a.b ENSGT01030000234624.b.b.c.a.b.d.a.a ENSGT01030000234624.b.b.c.a.b.d.a.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000000568 ENSGT00390000005338 ENSGT00940000165232 ENSGT00390000012434 ENSGT00940000157546 ENSGT00940000156897 ENSGT00390000003161 ENSGT00950000182915.b.b.a.b.c.a ENSGT00390000012078.a.a ENSGT00940000155438.b Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000164581.A.a.b ENSGT00530000063472.a ENSGT00940000158632 ENSGT00940000155580.b.a.b.e.b ENSGT00940000155580.b.a.b.e.a ENSGT00940000156375 ENSGT00390000005529.b ENSGT00940000153772.A ENSGT00940000156878.i.b.a.a ENSGT00390000016053 ENSGT00390000013208 ENSGT00940000160974.a ENSGT00940000165748.a ENSGT00940000159926 ENSGT00530000063347.B ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.d ENSGT00940000160040.B.a.b ENSGT01030000234624.b.b.c.a.b.d.a.a ENSGT01030000234624.b.b.c.a.b.d.a.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000000568 ENSGT00390000005338 ENSGT00940000165232 ENSGT00390000012434 ENSGT00940000157546 ENSGT00940000156897 ENSGT00390000003161 ENSGT00950000182915.b.b.a.b.c.a ENSGT00390000012078.a.a ENSGT00940000155438.b Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 23 calua (ENSHBUG00000006825) opn1sw1 (ENSHBUG00000006816) ##22 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000164581.A.a.b ENSGT00530000063472.a ENSGT00940000158632 ENSGT00940000155580.b.a.b.e.b ENSGT00940000155580.b.a.b.e.a ENSGT00940000156375 ENSGT00390000005529.b ENSGT00940000153772.A ENSGT00940000156878.i.b.a.a ENSGT00390000016053 ENSGT00390000013208 ENSGT00940000160974.a ENSGT00940000165748.a ENSGT00940000159926 ENSGT00530000063347.B ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.d ENSGT00940000160040.B.a.b ENSGT01030000234624.b.b.c.a.b.d.a.a ENSGT01030000234624.b.b.c.a.b.d.a.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000000568 ENSGT00390000005338 ENSGT00940000165232 ENSGT00390000012434 ENSGT00940000157546 ENSGT00940000156897 ENSGT00390000003161 ENSGT00950000182915.b.b.a.b.c.a ENSGT00390000012078.a.a ENSGT00940000155438.b P. nyererei MODERN SPECIES 352 ovch1 (ENSPNYG00000001076) parp12b (ENSPNYG00000001143) ENSPNYG00000001198 svopl (ENSPNYG00000001385) ENSPNYG00000001497 lta4h (ENSPNYG00000001536) dennd6b (ENSPNYG00000001633) gcc1 (ENSPNYG00000001649) arf5 (ENSPNYG00000001663) lamtor4 (ENSPNYG00000001694) atp6v1f (ENSPNYG00000001709) ENSPNYG00000001719 ENSPNYG00000001798 irf5 (ENSPNYG00000001892) tnpo3 (ENSPNYG00000002349) opn1sw1 (ENSPNYG00000002459) ##22 calua (ENSPNYG00000002495) ENSPNYG00000002536 ENSPNYG00000002574 ENSPNYG00000002603 commd2 (ENSPNYG00000002645) TRAPPC8 (ENSPNYG00000002675) ctns (ENSPNYG00000002798) ENSPNYG00000002807 ndufa11 (ENSPNYG00000002828) slc5a9 (ENSPNYG00000002899) rad54l (ENSPNYG00000002942) ARHGAP39 (ENSPNYG00000003004) ENSPNYG00000003111 rad23ab (ENSPNYG00000003716) EPS15L1 (ENSPNYG00000003764) Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000164581.A.a.b ENSGT00530000063472.a ENSGT00940000158632 ENSGT00940000155580.b.a.b.e.b ENSGT00940000155580.b.a.b.e.a ENSGT00940000156375 ENSGT00390000005529.b ENSGT00940000153772.A ENSGT00940000156878.i.b.a.a ENSGT00390000016053 ENSGT00390000013208 ENSGT00940000160974.a ENSGT00940000165748.a ENSGT00940000159926 ENSGT00530000063347.B ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.d ENSGT00940000160040.B.a.b ENSGT01030000234624.b.b.c.a.b.d.a.a ENSGT01030000234624.b.b.c.a.b.d.a.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000000568 ENSGT00390000005338 ENSGT00940000165232 ENSGT00390000012434 Eastern happy MODERN SPECIES 8 ENSACLG00000005859 svopl (ENSACLG00000005841) ENSACLG00000005824 ENSACLG00000005818 lta4h (ENSACLG00000005775) dennd6b (ENSACLG00000005725) gcc1 (ENSACLG00000005766) arf5 (ENSACLG00000005705) atp6v1f (ENSACLG00000005693) lamtor4 (ENSACLG00000005682) ENSACLG00000005672 ENSACLG00000005645 irf5 (ENSACLG00000005611) tnpo3 (ENSACLG00000005561) calua (ENSACLG00000005521) opn1sw1 (ENSACLG00000005532) ##22 ENSACLG00000005517 ENSACLG00000005413 ENSACLG00000005380 commd2 (ENSACLG00000005371) TRAPPC8 (ENSACLG00000005197) ctns (ENSACLG00000005180) zgc:171480 (ENSACLG00000005172) ndufa11 (ENSACLG00000005154) KLHL10 (ENSACLG00000005146) piwil1 (ENSACLG00000005074) enkur (ENSACLG00000005061) ROR1 (ENSACLG00000005042) ENSACLG00000004998 ENSACLG00000004989 slc26a5 (ENSACLG00000004915) Zebra mbuna MODERN SPECIES 61 parp12b (ENSMZEG00005014937) ENSMZEG00005014949 svopl (ENSMZEG00005014962) ENSMZEG00005014969 ENSMZEG00005014976 lta4h (ENSMZEG00005014990) dennd6b (ENSMZEG00005015015) gcc1 (ENSMZEG00005015025) arf5 (ENSMZEG00005015033) lamtor4 (ENSMZEG00005015049) atp6v1f (ENSMZEG00005015054) ENSMZEG00005015059 ENSMZEG00005015068 irf5 (ENSMZEG00005015076) tnpo3 (ENSMZEG00005015084) opn1sw (ENSMZEG00005015119) ##22 calua (ENSMZEG00005015413) ENSMZEG00005015424 ENSMZEG00005015432 ENSMZEG00005015441 ENSMZEG00005015466 commd2 (ENSMZEG00005015502) TRAPPC8 (ENSMZEG00005015516) ctns (ENSMZEG00005015570) zgc:171480 (ENSMZEG00005015585) ndufa11 (ENSMZEG00005015592) Lyretail cichlid MODERN SPECIES 291 ENSNBRG00000018409 ENSNBRG00000018480 svopl (ENSNBRG00000018708) ENSNBRG00000018736 ENSNBRG00000018761 lta4h (ENSNBRG00000018778) dennd6b (ENSNBRG00000018813) gcc1 (ENSNBRG00000018839) arf5 (ENSNBRG00000018854) lamtor4 (ENSNBRG00000018872) atp6v1f (ENSNBRG00000018887) ENSNBRG00000018904 ENSNBRG00000018931 irf5 (ENSNBRG00000018961) tnpo3 (ENSNBRG00000019001) opn1sw1 (ENSNBRG00000019094) ##22 calua (ENSNBRG00000019126) ENSNBRG00000019147 ENSNBRG00000019167 ENSNBRG00000019186 commd2 (ENSNBRG00000019251) TRAPPC8 (ENSNBRG00000019291) ctns (ENSNBRG00000019430) zgc:171480 (ENSNBRG00000019447) ndufa11 (ENSNBRG00000019451) slc5a9 (ENSNBRG00000019467) rad54l (ENSNBRG00000019493) ARHGAP39 (ENSNBRG00000019535) ENSNBRG00000019757 rad23ab (ENSNBRG00000020303) EPS15L1 (ENSNBRG00000020320) Nile tilapia MODERN SPECIES 8 wnt16 (ENSONIG00000027358) ovch1 (ENSONIG00000007573) parp12b (ENSONIG00000007576) ENSONIG00000034767 svopl (ENSONIG00000007578) mical3b (ENSONIG00000007581) lta4h (ENSONIG00000007586) dennd6b (ENSONIG00000027228) gcc1 (ENSONIG00000040843) arf5 (ENSONIG00000007594) lamtor4 (ENSONIG00000038960) atp6v1f (ENSONIG00000028240) ENSONIG00000007597 irf5 (ENSONIG00000007600) tnpo3 (ENSONIG00000007604) opn1sw1 (ENSONIG00000007620) ##22 calua (ENSONIG00000007615) ENSONIG00000007621 ENSONIG00000032590 ENSONIG00000003673 commd2 (ENSONIG00000041512) TRAPPC8 (ENSONIG00000007639) ctns (ENSONIG00000007643) zgc:171480 (ENSONIG00000042367) ndufa11 (ENSONIG00000036286) slc5a9 (ENSONIG00000007647) rad54l (ENSONIG00000007659) ARHGAP39 (ENSONIG00000007661) ENSONIG00000007664 ENSONIG00000035183 EPS15L1 (ENSONIG00000007674) Midas cichlid MODERN SPECIES 698 ENSACIG00000005951 irf5 (ENSACIG00000005937) tnpo3 (ENSACIG00000005897) opn1sw1 (ENSACIG00000005879) ##22 atp6v1f (ENSACIG00000005873) lamtor4 (ENSACIG00000005858) arf5 (ENSACIG00000005843) gcc1 (ENSACIG00000005829) dennd6b (ENSACIG00000005789) lta4h (ENSACIG00000005748) ENSACIG00000005733 ENSACIG00000005721 ENSACIG00000005712 svopl (ENSACIG00000005639) ENSACIG00000005584 parp12b (ENSACIG00000005553) Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 75 ENSGT00940000163017 ENSGT00530000063472.a ENSGT00940000156375 ENSGT00940000177211.a.b ENSGT00940000155580.b.a.b.f ENSGT00940000158632 ENSGT00390000013208 ENSGT00390000016053 ENSGT00940000156878.i.b.a.a ENSGT00940000153772.A ENSGT00390000005529.b ENSGT00940000160974.a ENSGT00940000165748.a ENSGT00940000159926 ENSGT00530000063347.B ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.d ENSGT00950000183089.c.b ENSGT00990000203553.c.a.a.a.b.p.c.a ENSGT01100000263504.a.b.b.b.b.y ENSGT00390000001285.i ENSGT00950000183039.A ENSGT00940000156088.c.a ENSGT00940000157212.B ENSGT00940000166983.c.b ENSGT00940000156786 ENSGT00940000160214 ENSGT00530000063626.b ENSGT00550000074930 ENSGT00940000164590 ENSGT00940000157777 Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 116 ENSGT00390000005529.b ENSGT00940000160974.a ENSGT00940000165748.a ENSGT00940000159926 ENSGT00530000063347.B ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.d ENSGT00950000183089.c.b ENSGT00990000203553.c.a.a.a.b.p.c.a ENSGT01100000263504.a.b.b.b.b.y ENSGT00390000001285.i ENSGT00950000183039.A ENSGT00940000156088.c.a ENSGT00940000157212.B ENSGT00940000166983.c.b ENSGT00940000156786 ENSGT00940000160214 ENSGT00530000063626.b ENSGT00550000074930 ENSGT00940000164590 ENSGT00940000168658 Amphiprion DUPLICATION Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 277 ENSGT00390000005529.b ENSGT00940000160974.a ENSGT00940000165748.a ENSGT00940000159926 ENSGT00530000063347.B ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b.h ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b.g ##22 ENSGT01010000222360.E.d ENSGT00950000183089.c.b Clown anemonefish MODERN SPECIES 2841 opn1sw1 (ENSAOCG00000001112) ##22 calua (ENSAOCG00000002824) ENSAOCG00000016169 histh1l1 (ENSAOCG00000016071) ENSAOCG00000016042 ENSAOCG00000015954 Orange clownfish MODERN SPECIES 13 ing3 (ENSAPEG00000024493) tspan12 (ENSAPEG00000024481) kcnd2 (ENSAPEG00000024473) ncaph2 (ENSAPEG00000024465) sco2 (ENSAPEG00000024462) ENSAPEG00000024451 FLNC (ENSAPEG00000024425) socs2 (ENSAPEG00000024410) ENSAPEG00000024406 PTPRO (ENSAPEG00000024366) dennd6b (ENSAPEG00000024340) ENSAPEG00000024335 irf5 (ENSAPEG00000024328) tnpo3 (ENSAPEG00000024300) opn1sw1 (ENSAPEG00000024262) ##22 opn1sw1 (ENSAPEG00000024257) ##22 calua (ENSAPEG00000024235) ENSAPEG00000024229 ENSAPEG00000024223 ENSAPEG00000024214 ENSAPEG00000024187 ENSAPEG00000024176 ENSAPEG00000024171 CNOT2 (ENSAPEG00000024152) KCNMB4 (ENSAPEG00000024141) PTPRB (ENSAPEG00000024112) PTPRR (ENSAPEG00000024058) ENSAPEG00000024020 rab21 (ENSAPEG00000024002) LGR5 (ENSAPEG00000023978) ENSAPEG00000023962 Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 277 ENSGT00390000005529.b ENSGT00940000160974.a ENSGT00940000165748.a ENSGT00940000159926 ENSGT00530000063347.B ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b.h ##22 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b.g ##22 ENSGT01010000222360.E.d ENSGT00950000183089.c.b Clown anemonefish MODERN SPECIES 773 dennd6b (ENSAOCG00000008099) ENSAOCG00000008134 ENSAOCG00000008163 irf5 (ENSAOCG00000008199) tnpo3 (ENSAOCG00000008264) opn1sw1 (ENSAOCG00000008288) ##22 Orange clownfish MODERN SPECIES 13 ENSAPEG00000024502 ing3 (ENSAPEG00000024493) tspan12 (ENSAPEG00000024481) kcnd2 (ENSAPEG00000024473) ncaph2 (ENSAPEG00000024465) sco2 (ENSAPEG00000024462) ENSAPEG00000024451 FLNC (ENSAPEG00000024425) socs2 (ENSAPEG00000024410) ENSAPEG00000024406 PTPRO (ENSAPEG00000024366) dennd6b (ENSAPEG00000024340) ENSAPEG00000024335 irf5 (ENSAPEG00000024328) tnpo3 (ENSAPEG00000024300) opn1sw1 (ENSAPEG00000024262) ##22 opn1sw1 (ENSAPEG00000024257) ##22 calua (ENSAPEG00000024235) ENSAPEG00000024229 ENSAPEG00000024223 ENSAPEG00000024214 ENSAPEG00000024187 ENSAPEG00000024176 ENSAPEG00000024171 CNOT2 (ENSAPEG00000024152) KCNMB4 (ENSAPEG00000024141) PTPRB (ENSAPEG00000024112) PTPRR (ENSAPEG00000024058) ENSAPEG00000024020 rab21 (ENSAPEG00000024002) LGR5 (ENSAPEG00000023978) Spiny chromis MODERN SPECIES 1174 ENSAPOG00000018473 ENSAPOG00000018454 ENSAPOG00000018443 irf5 (ENSAPOG00000018390) tnpo3 (ENSAPOG00000018347) opn1sw1 (ENSAPOG00000018235) ##22 calua (ENSAPOG00000018215) ENSAPOG00000018184 ENSAPOG00000018165 ENSAPOG00000018150 ENSAPOG00000018021 ENSAPOG00000017962 CNOT2 (ENSAPOG00000017950) KCNMB4 (ENSAPOG00000017903) PTPRB (ENSAPOG00000017874) ENSAPOG00000017859 ENSAPOG00000017832 tmco6 (ENSAPOG00000017819) aldob (ENSAPOG00000017748) Bicolor damselfish MODERN SPECIES 1177 ovch1 (ENSSPAG00000014669) ENSSPAG00000014598 lta4h (ENSSPAG00000014533) ENSSPAG00000014520 ENSSPAG00000014504 svopl (ENSSPAG00000014479) atp6v1f (ENSSPAG00000014471) lamtor4 (ENSSPAG00000014458) arf5 (ENSSPAG00000014434) gcc1 (ENSSPAG00000014427) dennd6b (ENSSPAG00000014340) ENSSPAG00000014309 ENSSPAG00000014285 irf5 (ENSSPAG00000014262) tnpo3 (ENSSPAG00000014209) opn1sw1 (ENSSPAG00000014174) ##22 calua (ENSSPAG00000014149) ENSSPAG00000014037 CNOT2 (ENSSPAG00000013982) KCNMB4 (ENSSPAG00000013967) Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00530000063472.a ENSGT00940000158632 ENSGT00940000155580.b.a.b ENSGT00940000163529 ENSGT00940000156375 ENSGT00390000005529.b ENSGT00940000153772.A ENSGT00940000156878.i.b.a.a ENSGT00390000016053 ENSGT00390000013208 ENSGT01020000231185 ENSGT00940000160974.a ENSGT00940000165748.a ENSGT00940000159926 ENSGT00530000063347.B ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.d Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000163017 ENSGT00940000164581.A.a.b ENSGT00530000063472.a ENSGT00940000158632 ENSGT00940000155580.b.a.b ENSGT00940000156375 ENSGT00390000005529.b ENSGT00940000153772.A ENSGT00940000156878.i.b.a.a ENSGT00390000016053 ENSGT00390000013208 ENSGT01020000231185 ENSGT00940000160974.a ENSGT00940000159926 ENSGT00530000063347.B ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.d Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000164581.A.a.b ENSGT00530000063472.a ENSGT00940000158632 ENSGT00940000155580.b.a.b ENSGT00940000163529 ENSGT00940000156375 ENSGT00390000005529.b ENSGT00940000153772.A ENSGT00940000156878.i.b.a.a ENSGT00390000016053 ENSGT00390000013208 ENSGT01020000231185 ENSGT00940000160974.a ENSGT00940000159926 ENSGT00530000063347.B ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.d Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse MODERN SPECIES 837 ENSLBEG00000016208 ##24 ENSLBEG00000016261 nup107 (ENSLBEG00000016298) mdm2 (ENSLBEG00000016335) UPF2 (ENSLBEG00000016394) ENSLBEG00000016488 rab3ip (ENSLBEG00000016523) tnpo3 (ENSLBEG00000016595) opn1sw1 (ENSLBEG00000016673) ##22 calua (ENSLBEG00000016693) Ballan wrasse MODERN SPECIES 1622 opn1sw1 (ENSLBEG00000008530) ##22 calua (ENSLBEG00000008511) IRF5 (ENSLBEG00000008321) Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000164581.A.a.b ENSGT00530000063472.a ENSGT00940000158632 ENSGT00940000155580.b.a.b ENSGT00940000163529 ENSGT00940000156375 ENSGT00390000005529.b ENSGT00940000153772.A ENSGT00940000156878.i.b.a.a ENSGT00390000016053 ENSGT00390000013208 ENSGT01020000231185 ENSGT00940000160974.a ENSGT00940000159926 ENSGT00530000063347.B ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.d Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000163017 ENSGT00940000164581.A.a.b ENSGT00530000063472.a ENSGT00940000158632 ENSGT00940000155580.b.a.b ENSGT00940000156375 ENSGT00390000005529.b ENSGT00940000153772.A ENSGT00940000156878.i.b.a.a ENSGT00390000016053 ENSGT00390000013208 ENSGT01020000231185 ENSGT00940000160974.a ENSGT00940000159926 ENSGT00530000063347.B ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.d Gilthead seabream MODERN SPECIES 5 ENSSAUG00010005464 svopl (ENSSAUG00010005481) mical3b (ENSSAUG00010005511) mical3b (ENSSAUG00010005514) lta4h (ENSSAUG00010005528) dennd6b (ENSSAUG00010005606) gcc1 (ENSSAUG00010005679) arf5 (ENSSAUG00010005680) ENSSAUG00010005684 lamtor4 (ENSSAUG00010005685) atp6v1f (ENSSAUG00010005687) ENSSAUG00010005689 ENSSAUG00010005691 irf5 (ENSSAUG00010005695) tnpo3 (ENSSAUG00010005710) opn1sw1 (ENSSAUG00010005724) ##22 calua (ENSSAUG00010005727) Perciformes ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000163017 ENSGT00940000164581.A.a.b ENSGT00530000063472.a ENSGT00940000158632 ENSGT00940000155580.b.a.b ENSGT00940000163529 ENSGT00940000156375 ENSGT00390000013208 ENSGT00390000016053 ENSGT00940000156878.i.b.a.a ENSGT00940000153772.A ENSGT00390000005529.b ENSGT00940000160974.a ENSGT00940000159926 ENSGT00530000063347.B ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.d Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 55 ENSGT00940000163017 ENSGT00940000164581.A.a.b ENSGT00530000063472.a ENSGT00940000158632 ENSGT00940000155580.b.a.b ENSGT00940000163529 ENSGT00940000156375 ENSGT00390000013208 ENSGT00390000016053 ENSGT00940000156878.i.b.a.a ENSGT00940000153772.A ENSGT00390000005529.b ENSGT00940000167915.a ENSGT00940000159926 ENSGT00530000063347.B ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 Stickleback MODERN SPECIES 591 wnt16 (ENSGACG00000000657) ovch1 (ENSGACG00000000658) ENSGACG00000000660 svopl (ENSGACG00000000662) mical3b (ENSGACG00000000668) ENSGACG00000000673 lta4h (ENSGACG00000000675) atp6v1f (ENSGACG00000000683) lamtor4 (ENSGACG00000000684) arf5 (ENSGACG00000000686) gcc1 (ENSGACG00000000688) dennd6b (ENSGACG00000000689) ENSGACG00000000693 irf5 (ENSGACG00000000695) tnpo3 (ENSGACG00000000699) opn1sw1 (ENSGACG00000000716) ##22 Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 58 ENSGT00940000157480 ENSGT00940000163017 ENSGT00940000164581.A.a.b ENSGT00530000063472.a ENSGT00940000158632 ENSGT00940000155580.b.a.b ENSGT00940000156375 ENSGT00390000013208 ENSGT00390000016053 ENSGT00940000156878.i.b.a.a ENSGT00940000153772.A ENSGT00390000005529.b ENSGT00940000160974.a ENSGT00940000159926 ENSGT00530000063347.B ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.d Channel bull blenny MODERN SPECIES 67 wnt16 (ENSCGOG00000012352) ovch1 (ENSCGOG00000012192) parp12b (ENSCGOG00000012187) ENSCGOG00000012170 mical3b (ENSCGOG00000012150) lta4h (ENSCGOG00000012075) atp6v1f (ENSCGOG00000012068) lamtor4 (ENSCGOG00000012057) zgc:77650 (ENSCGOG00000011739) gcc1 (ENSCGOG00000011728) dennd6b (ENSCGOG00000011670) irf5 (ENSCGOG00000011650) tnpo3 (ENSCGOG00000011622) opn1sw1 (ENSCGOG00000011607) ##22 calua (ENSCGOG00000011605) Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000164581.A.a.b ENSGT00530000063472.a ENSGT00940000158632 ENSGT00940000155580.b.a.b ENSGT00940000156375 ENSGT00390000005529.b ENSGT00940000153772.A ENSGT00940000156878.i.b.a.a ENSGT00390000016053 ENSGT00390000013208 ENSGT01020000231185 ENSGT00940000160974.a ENSGT00940000165748.a ENSGT00940000159926 ENSGT00530000063347.B ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.d Carangaria ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00940000164581.A.a.b ENSGT00530000063472.a ENSGT00940000158632 ENSGT00940000155580.b.a.b ENSGT00940000156375 ENSGT00940000156878.i.b.a.a ENSGT00940000153772.A ENSGT00390000005529.b ENSGT00390000016053 ENSGT00390000013208 ENSGT01020000231185 ENSGT00940000160974.a ENSGT00940000165748.a ENSGT00940000159926 ENSGT00530000063347.B ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.d Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 61 ENSGT00940000156566.d ENSGT00940000163017 ENSGT00940000181823 ENSGT00940000158632 ENSGT00940000155580.b.a.b ENSGT00940000156375 ENSGT00940000156878.i.b.a.a ENSGT00940000153772.A ENSGT00390000005529.b ENSGT00390000016053 ENSGT00390000013208 ENSGT01020000231185 ENSGT00940000160974.a ENSGT00940000159926 ENSGT00530000063347.B ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.d Turbot MODERN SPECIES 11 wnt16 (ENSSMAG00000011086) ENSSMAG00000011097 ENSSMAG00000024126 ENSSMAG00000011235 mical3b (ENSSMAG00000011272) ENSSMAG00000011295 ENSSMAG00000011361 ENSSMAG00000013453 ENSSMAG00000013342 ENSSMAG00000027042 ATP6V1F (ENSSMAG00000030672) ENSSMAG00000013487 ENSSMAG00000018461 irf5 (ENSSMAG00000010470) tnpo3 (ENSSMAG00000010422) opn1sw1 (ENSSMAG00000010400) ##22 calua (ENSSMAG00000026592) Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 109 ENSGT00940000156375 ENSGT00940000156878.i.b.a.a ENSGT00940000153772.A ENSGT00390000005529.b ENSGT00390000016053 ENSGT00390000013208 ENSGT01020000231185 ENSGT00940000160974.a ENSGT00940000165748.a ENSGT00940000159926 ENSGT00530000063347.B ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.d Seriola ANCESTRAL SPECIES 170 ENSGT00940000156878.i.b.a.a ENSGT00940000153772.A ENSGT00390000005529.b ENSGT00390000016053 ENSGT00390000013208 ENSGT00940000160974.a ENSGT00940000165748.a ENSGT00940000159926 ENSGT00530000063347.B ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.d Yellowtail amberjack DUPLICATION Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 475 opn1sw1 (ENSSLDG00000012506) ##22 Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 3149 arf5 (ENSSLDG00000017188) dennd6b (ENSSLDG00000017168) lamtor4 (ENSSLDG00000017150) atp6v1f (ENSSLDG00000017110) ENSSLDG00000017066 ENSSLDG00000017030 irf5 (ENSSLDG00000017001) tnpo3 (ENSSLDG00000016927) opn1sw1 (ENSSLDG00000016878) ##22 calua (ENSSLDG00000016852) ENSSLDG00000016830 Greater amberjack MODERN SPECIES 254 arf5 (ENSSDUG00000005105) gcc1 (ENSSDUG00000005087) dennd6b (ENSSDUG00000005017) lamtor4 (ENSSDUG00000005000) atp6v1f (ENSSDUG00000004992) ENSSDUG00000004979 ENSSDUG00000004949 irf5 (ENSSDUG00000004912) tnpo3 (ENSSDUG00000004850) opn1sw1 (ENSSDUG00000004282) ##22 calua (ENSSDUG00000004228) Barramundi perch MODERN SPECIES 639 lta4h (ENSLCAG00010010687) arf5 (ENSLCAG00010010754) gcc1 (ENSLCAG00010010846) dennd6b (ENSLCAG00010010890) atp6v1f (ENSLCAG00010011257) ENSLCAG00010011262 ENSLCAG00010011267 ENSLCAG00010011271 irf5 (ENSLCAG00010011274) tnpo3 (ENSLCAG00010011292) opn1sw1 (ENSLCAG00010011335) ##22 calua (ENSLCAG00010011369) Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 15 ENSMMDG00005020465 parp12b (ENSMMDG00005020466) ENSMMDG00005020468 svopl (ENSMMDG00005020471) ENSMMDG00005020474 lta4h (ENSMMDG00005020483) dennd6b (ENSMMDG00005020835) gcc1 (ENSMMDG00005021070) ARF5 (ENSMMDG00005021072) lamtor4 (ENSMMDG00005021077) atp6v1f (ENSMMDG00005021078) ENSMMDG00005021081 ENSMMDG00005021087 irf5 (ENSMMDG00005021093) tnpo3 (ENSMMDG00005021110) opn1sw1 (ENSMMDG00005014431) ##22 calua (ENSMMDG00005014436) ENSMMDG00005014440 UPF2 (ENSMMDG00005014465) ENSMMDG00005014489 ECHDC3 (ENSMMDG00005014493) usp6nl (ENSMMDG00005014498) celf2 (ENSMMDG00005014675) gata3 (ENSMMDG00005017072) atp5f1c (ENSMMDG00005017078) kin (ENSMMDG00005017143) itih2 (ENSMMDG00005017156) ITIH5 (ENSMMDG00005017164) tmem110l (ENSMMDG00005017173) SFMBT2 (ENSMMDG00005017192) prkcq (ENSMMDG00005017277) Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 52 ENSGT00530000063472.a ENSGT00940000158632 ENSGT00940000155580.b.a.b ENSGT00940000163529 ENSGT00940000156375 ENSGT00390000005529.b ENSGT00940000153772.A ENSGT00940000156878.i.b.b ENSGT00390000016053 ENSGT00390000013208 ENSGT00390000003224.B ENSGT00940000160974.a ENSGT00940000165748.a ENSGT00940000159926 ENSGT00530000063347.B ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.d ENSGT00530000064318 ENSGT01030000235060 ENSGT00940000155197.a ENSGT00940000154098.a.f ENSGT00390000008708.b ENSGT00940000153525.i.a ENSGT00940000178181 ENSGT00390000018612.a.b ENSGT00390000012501 ENSGT00390000014507.a.b ENSGT00940000157013 ENSGT00390000014894 ENSGT00510000048671 ENSGT01080000257336.b.e.a.a Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 208 ENSGT00390000005529.b.d ENSGT00940000153772.A.b ENSGT00940000156878.i.b.b.a ENSGT00390000016053.b ENSGT00390000013208 ENSGT00390000003224.B ENSGT00940000160974.a.c ENSGT00940000165748.a.c ENSGT00940000156024.i.a ENSGT00940000160974.a.d ENSGT00940000165748.a.d ENSGT00940000159926.g ENSGT00530000063347.B.o ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b.m ##22 ENSGT01010000222360.E.d.h ENSGT00530000064318.j.b ENSGT01030000235060.e.b ENSGT00940000155197.a.a ENSGT00940000154098.a.f.f ENSGT00390000008708.b.a ENSGT00940000153525.i.a.a ENSGT00940000178181.a ENSGT00390000018612.a.b.f ENSGT00390000012501.f ENSGT00390000014507.a.b.b ENSGT00940000157013.g ENSGT00390000014894.h ENSGT00510000048671.b ENSGT01080000257336.b.e.a.a Huchen MODERN SPECIES 120 ENSHHUG00000030001 mical3b (ENSHHUG00000030005) ENSHHUG00000030009 lta4h (ENSHHUG00000030052) ENSHHUG00000030109 dennd6b (ENSHHUG00000030121) gcc1 (ENSHHUG00000030135) ARF5 (ENSHHUG00000030138) lamtor4 (ENSHHUG00000030188) atp6v1f (ENSHHUG00000030191) ENSHHUG00000030240 ENSHHUG00000030242 ENSHHUG00000030255 irf5 (ENSHHUG00000030286) tnpo3 (ENSHHUG00000030299) opn1sw1 (ENSHHUG00000030406) ##22 calua (ENSHHUG00000030509) UPF2 (ENSHHUG00000030516) ENSHHUG00000030551 strap (ENSHHUG00000030554) ENSHHUG00000030561 slc25a3b (ENSHHUG00000030564) LDHB (ENSHHUG00000030628) ENSHHUG00000030989 gys2 (ENSHHUG00000030997) spx (ENSHHUG00000031022) golt1ba (ENSHHUG00000031033) recql (ENSHHUG00000031041) pyroxd1 (ENSHHUG00000031091) IAPP (ENSHHUG00000031110) ENSHHUG00000031133 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00390000009583.f ENSGT00940000164581.A.a.b.d ENSGT00940000164581.A.a.b.c.b ENSGT00530000063472.a.j.b ENSGT00940000155580.b.a.b.g ENSGT00940000156375.i.a ENSGT00390000005529.b.d ENSGT00940000153772.A.b ENSGT00940000156878.i.b.b.a ENSGT00390000016053.b ENSGT00390000013208.g ENSGT00940000160974.a.d ENSGT00940000165748.a.d ENSGT00940000159926.g ENSGT00530000063347.B.o ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b.m ##22 ENSGT01010000222360.E.d.h ENSGT00530000064318.j.b ENSGT01030000235060.e.b ENSGT00940000155197.a.a ENSGT00940000154098.a.f.f ENSGT00390000008708.b.a ENSGT00940000153525.i.a.a ENSGT00940000178181.a ENSGT00390000018612.a.b.f ENSGT00390000012501.f ENSGT00390000014507.a.b.b ENSGT00940000157013.g ENSGT00390000014894.h ENSGT00510000048671.b ENSGT01080000257336.b.e.a.a Salmo ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00950000182824.a.a.a.a.b.e ENSGT00390000009583.f ENSGT00940000164581.A.a.b.c.b ENSGT00530000063472.a.j.b ENSGT00940000155580.b.a.b.g ENSGT00940000156375.i.b ENSGT00390000005529.b.d ENSGT00940000153772.A.b ENSGT00940000156878.i.b.b.a ENSGT00390000016053.b ENSGT00390000013208.g ENSGT00940000160974.a.d ENSGT00940000165748.a.d ENSGT00940000159926.g ENSGT00530000063347.B.o ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b.m ##22 ENSGT01010000222360.E.d.h ENSGT00530000064318.j.b ENSGT01030000235060.f ENSGT01060000252118 ENSGT00940000155197.a.a ENSGT00940000154098.a.f.f ENSGT00390000008708.b.a ENSGT00940000153525.i.a.a ENSGT00940000178181.a ENSGT00390000018612.a.b.f ENSGT00390000012501.f ENSGT00390000014507.a.b.b ENSGT00940000157013.g ENSGT00390000014894.h ENSGT00510000048671.b Atlantic salmon MODERN SPECIES 26 ENSSSAG00000092533 ENSSSAG00000040026 ENSSSAG00000082703 parp12b (ENSSSAG00000057009) ENSSSAG00000056982 ENSSSAG00000056968 ENSSSAG00000056914 mical3b (ENSSSAG00000095027) lkha4 (ENSSSAG00000056718) dennd6b (ENSSSAG00000056852) gcc1 (ENSSSAG00000056693) ENSSSAG00000093827 ENSSSAG00000056642 ENSSSAG00000056622 tnpo3 (ENSSSAG00000056232) ENSSSAG00000056188 ##22 calua (ENSSSAG00000056179) ENSSSAG00000117743 irf5 (ENSSSAG00000056586) ENSSSAG00000107414 ENSSSAG00000056061 tmpoa (ENSSSAG00000097715) ENSSSAG00000055931 LDHB (ENSSSAG00000055896) ENSSSAG00000055881 SPX (ENSSSAG00000066346) golt1ba (ENSSSAG00000079599) ENSSSAG00000088865 RECQL (ENSSSAG00000054755) PYROXD1 (ENSSSAG00000054729) IAPP (ENSSSAG00000054726) River trout MODERN SPECIES 38 kics2 (ENSSTUG00000004642) parp12b (ENSSTUG00000004626) ENSSTUG00000004614 ENSSTUG00000004604 mical3b (ENSSTUG00000004546) lta4h (ENSSTUG00000002935) dennd6b (ENSSTUG00000002776) gcc1 (ENSSTUG00000002769) ARF5 (ENSSTUG00000002729) lamtor4 (ENSSTUG00000002723) atp6v1f (ENSSTUG00000002716) ENSSTUG00000002702 ENSSTUG00000002680 irf5 (ENSSTUG00000002598) tnpo3 (ENSSTUG00000002337) opn1sw1 (ENSSTUG00000002306) ##22 calua (ENSSTUG00000002283) UPF2 (ENSSTUG00000002162) ENSSTUG00000002149 ENSSTUG00000002146 strap (ENSSTUG00000001717) ENSSTUG00000001489 slc25a3b (ENSSTUG00000001182) LDHB (ENSSTUG00000047233) ENSSTUG00000047222 ENSSTUG00000047220 gys2 (ENSSTUG00000047206) spx (ENSSTUG00000047180) golt1ba (ENSSTUG00000047171) recql (ENSSTUG00000046588) IAPP (ENSSTUG00000046548) Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00950000182824.a.a.a.a.b.e ENSGT00390000009583.f ENSGT00940000164581.A.a.b.c.b ENSGT00530000063472.a.j.b ENSGT00940000158632.j ENSGT00940000155580.b.a.b.g ENSGT00940000156375.i.a ENSGT00390000005529.b.d ENSGT00940000153772.A.b ENSGT00940000156878.i.b.b.a ENSGT00390000016053.b ENSGT00390000013208.g ENSGT00940000160974.a.d ENSGT00940000159926.g ENSGT00530000063347.B.o ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b.m ##22 ENSGT01010000222360.E.d.h ENSGT00530000064318.j.b ENSGT01030000235060.e.b ENSGT00940000155197.a.a ENSGT00940000154098.a.f.f ENSGT00390000008708.b.a ENSGT00940000153525.i.a.a ENSGT00940000178181.a ENSGT00390000018612.a.b.f ENSGT00390000012501.f ENSGT00390000014507.a.b.b ENSGT00940000157013.g ENSGT00390000014894.h ENSGT00510000048671.b ENSGT01080000257336.b.e.a.a Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00950000182824.a.a.a.a.b.e ENSGT00390000009583.f ENSGT00940000164581.A.a.b.c.b ENSGT00530000063472.a.j.b ENSGT00940000158632.j ENSGT00940000155580.b.a.b.g ENSGT00940000156375.i.a ENSGT00390000005529.b.d ENSGT00940000153772.A.b ENSGT00940000156878.i.b.b.a ENSGT00390000016053.b ENSGT00940000165748.a.d ENSGT00940000160974.a.d ENSGT00940000159926.g ENSGT00530000063347.B.o ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b.m ##22 ENSGT01010000222360.E.d.h ENSGT00530000064318.j.b ENSGT01030000235060.e.b ENSGT00940000155197.a.a ENSGT00940000154098.a.f.f ENSGT00390000008708.b.a ENSGT00940000153525.i.a.a ENSGT00940000178181.a ENSGT00390000018612.a.b.f ENSGT00390000012501.f.a.b ENSGT00390000014507.a.b.b ENSGT00940000157013.g ENSGT00510000048671.b ENSGT01080000257336.b.e.a.a ENSGT00940000155870.a.a.e.a Coho salmon MODERN SPECIES 29 srgap1b (ENSOKIG00005014977) kics2 (ENSOKIG00005015175) parp12b (ENSOKIG00005015187) ENSOKIG00005015204 mical3b (ENSOKIG00005015238) LTA4H (ENSOKIG00005015332) dennd6b (ENSOKIG00005016131) gcc1 (ENSOKIG00005016254) ENSOKIG00005016261 ARF5 (ENSOKIG00005016268) lamtor4 (ENSOKIG00005016304) ENSOKIG00005016332 ENSOKIG00005016354 irf5 (ENSOKIG00005016371) tnpo3 (ENSOKIG00005016417) opn1sw1 (ENSOKIG00005016572) ##22 calua (ENSOKIG00005016587) UPF2 (ENSOKIG00005016613) ENSOKIG00005016681 STRAP (ENSOKIG00005016702) ENSOKIG00005016776 SLC25A3 (ENSOKIG00005016823) SLC2A13 (ENSOKIG00005016874) ENSOKIG00005016944 SPX (ENSOKIG00005016956) golt1ba (ENSOKIG00005016993) RECQL (ENSOKIG00005017032) IAPP (ENSOKIG00005017586) ENSOKIG00005017631 ENSOKIG00005017902 ABCD2 (ENSOKIG00005017930) Chinook salmon MODERN SPECIES 6 ENSOTSG00005007624 TIMP3 (ENSOTSG00005008172) AVPR1A (ENSOTSG00005008183) srgap1b (ENSOTSG00005008186) kics2 (ENSOTSG00005008191) parp12b (ENSOTSG00005008195) ENSOTSG00005008198 gcc1 (ENSOTSG00005008209) dennd6b (ENSOTSG00005008272) ARF5 (ENSOTSG00005008274) lamtor4 (ENSOTSG00005008314) ENSOTSG00005008316 ENSOTSG00005008320 irf5 (ENSOTSG00005008326) tnpo3 (ENSOTSG00005008350) opn1sw1 (ENSOTSG00005009571) ##22 calua (ENSOTSG00005009575) UPF2 (ENSOTSG00005009583) ENSOTSG00005009586 ENSOTSG00005009588 strap (ENSOTSG00005009592) tmpoa (ENSOTSG00005009597) SLC25A3 (ENSOTSG00005009600) LDHB (ENSOTSG00005009639) ENSOTSG00005009640 gys2 (ENSOTSG00005009641) spx (ENSOTSG00005009646) golt1ba (ENSOTSG00005009657) recql (ENSOTSG00005009658) IAPP (ENSOTSG00005009675) ENSOTSG00005009676 Rainbow trout MODERN SPECIES 13 parp12b (ENSOMYG00000076210) parp12b (ENSOMYG00000012045) ENSOMYG00000012070 ENSOMYG00000012098 ENSOMYG00000057481 mical3b (ENSOMYG00000012110) ENSOMYG00000012253 dennd6b (ENSOMYG00000013776) gcc1 (ENSOMYG00000013805) arf4 (ENSOMYG00000013816) lamtor4 (ENSOMYG00000013848) vatf (ENSOMYG00000013870) ENSOMYG00000013878 irf5 (ENSOMYG00000013914) tnpo3 (ENSOMYG00000014006) opn1sw1 (ENSOMYG00000014218) ##22 calua (ENSOMYG00000014231) ENSOMYG00000014282 ENSOMYG00000014538 ENSOMYG00000014342 ENSOMYG00000014368 ENSOMYG00000014401 ENSOMYG00000014424 LDHB (ENSOMYG00000014451) ENSOMYG00000056535 GYS2 (ENSOMYG00000014475) SPX (ENSOMYG00000014546) GOLT1B (ENSOMYG00000014582) RECQL (ENSOMYG00000014649) PYROXD1 (ENSOMYG00000015641) IAPP (ENSOMYG00000015660) Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 1295 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b.n ##22 ENSGT01010000222360.E.d.g ENSGT00530000064318.j.a Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000158632 ENSGT00940000155580.b.a.b.h ENSGT00940000156375.i.b ENSGT00390000005529.b.c ENSGT00940000153772.A.a ENSGT00940000156878.i.b.b.b ENSGT00390000016053.a ENSGT00390000013208.h ENSGT00990000208688 ENSGT00390000003224.B ENSGT00940000160974.a.c ENSGT00940000165748.a.c ENSGT00940000156024.i.a ENSGT00940000159926.h ENSGT00530000063347.B.p ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b.n ##22 ENSGT01010000222360.E.d.g ENSGT00530000064318.j.a ENSGT01030000235060.e.a ENSGT00940000155197.a.b ENSGT00940000154098.a.f.e ENSGT00390000008708.b.b ENSGT00940000153525.i.a.b ENSGT00940000178181.b ENSGT00390000018612.a.b.e ENSGT00390000012501.e ENSGT00390000014507.a.b.a ENSGT00940000157013.h ENSGT00390000014894.g ENSGT00510000048671.a ENSGT01080000257336.b.e.a.b.e Salmo ANCESTRAL SPECIES 46 ENSGT00530000063472.a.j.a ENSGT00940000158632 ENSGT00940000155580.b.a.b.h ENSGT00940000156375.i.a ENSGT00390000005529.b.c ENSGT00940000153772.A.a ENSGT00940000156878.i.b.b.b ENSGT00390000016053.a ENSGT00390000013208.h ENSGT00990000208688 ENSGT00390000003224.B ENSGT00940000160974.a.c ENSGT00940000156024.i.a ENSGT00940000159926.h ENSGT00530000063347.B.p ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b.n ##22 ENSGT01010000222360.E.d.g ENSGT00530000064318.j.a ENSGT01030000235060.e.a ENSGT00940000155197.a.b ENSGT00940000154098.a.f.e ENSGT00390000008708.b.b ENSGT00940000153525.i.a.b ENSGT00940000178181.b ENSGT00390000018612.a.b.e ENSGT00390000012501.e ENSGT00390000014507.a.b.a ENSGT00940000157013.h ENSGT00390000014894.g ENSGT00510000048671.a ENSGT00940000165245.`b River trout MODERN SPECIES 34 svopl (ENSSTUG00000049756) mical3b (ENSSTUG00000049764) lta4h (ENSSTUG00000049777) dennd6b (ENSSTUG00000049811) gcc1 (ENSSTUG00000049878) ARF5 (ENSSTUG00000049881) lamtor4 (ENSSTUG00000049884) atp6v1f (ENSSTUG00000049886) ENSSTUG00000049888 ENSSTUG00000049889 cenpo (ENSSTUG00000049891) ENSSTUG00000049894 ENSSTUG00000049903 irf5 (ENSSTUG00000049928) tnpo3 (ENSSTUG00000049936) opn1sw1 (ENSSTUG00000050013) ##22 calua (ENSSTUG00000050018) UPF2 (ENSSTUG00000050026) ENSSTUG00000050056 strap (ENSSTUG00000050059) tmpoa (ENSSTUG00000050069) SLC25A3 (ENSSTUG00000050072) LDHB (ENSSTUG00000050083) ENSSTUG00000050091 gys2 (ENSSTUG00000050102) spx (ENSSTUG00000050113) golt1ba (ENSSTUG00000050115) recql (ENSSTUG00000050127) pyroxd1 (ENSSTUG00000050150) IAPP (ENSSTUG00000050160) ENSSTUG00000017604 Atlantic salmon MODERN SPECIES 8 parp12b (ENSSSAG00000088531) ENSSSAG00000114211 svopl (ENSSSAG00000070719) mical3b (ENSSSAG00000070662) ENSSSAG00000070633 dennd6b (ENSSSAG00000070597) ENSSSAG00000088615 ENSSSAG00000070562 gcc1 (ENSSSAG00000070590) ATP6V1FNB (ENSSSAG00000109324) ENSSSAG00000070552 ENSSSAG00000086006 ENSSSAG00000070425 irf5 (ENSSSAG00000070386) tnpo3 (ENSSSAG00000070281) opn1sw1 (ENSSSAG00000070270) ##22 calu (ENSSSAG00000070260) ENSSSAG00000118784 ENSSSAG00000070227 lap2 (ENSSSAG00000070216) ENSSSAG00000070203 ldhb (ENSSSAG00000070190) ENSSSAG00000070186 gys2 (ENSSSAG00000066364) golt1ba (ENSSSAG00000083550) RECQL (ENSSSAG00000069245) PYROXD1 (ENSSSAG00000070151) IAPP (ENSSSAG00000070176) ENSSSAG00000104362 ENSSSAG00000058815 ENSSSAG00000058788 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000158632.i ENSGT00940000155580.b.a.b.h ENSGT00940000156375.i.b ENSGT00390000005529.b.c ENSGT00940000153772.A.a ENSGT00940000156878.i.b.b.b ENSGT00390000016053.a ENSGT00390000013208.h ENSGT00990000208688 ENSGT00390000003224.B ENSGT00940000160974.a.c ENSGT00940000165748.a.c ENSGT00940000156024.i.a ENSGT00940000159926.h ENSGT00530000063347.B.p ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b.n ##22 ENSGT01010000222360.E.d.g ENSGT00530000064318.j.a ENSGT01030000235060.e.a ENSGT00940000155197.a.b ENSGT00940000154098.a.f.e ENSGT00390000008708.b.b ENSGT00940000153525.i.a.b ENSGT00940000178181.b ENSGT00390000018612.a.b.e ENSGT00390000012501.e ENSGT00390000014507.a.b.a ENSGT00940000157013.h ENSGT00390000014894.g ENSGT00510000048671.a ENSGT01080000257336.b.e.a.b.e Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000164581.A.a.b.c.a ENSGT00940000158632.i ENSGT00940000156375.i.b ENSGT00390000005529.b.c ENSGT00940000153772.A.a ENSGT00940000156878.i.b.b.b ENSGT00390000016053.a ENSGT00390000013208.h ENSGT00990000208688 ENSGT00390000003224.B ENSGT00940000160974.a.c ENSGT00940000165748.a.c ENSGT00940000156024.i.a ENSGT00940000159926.h ENSGT00530000063347.B.p ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b.n ##22 ENSGT01010000222360.E.d.g ENSGT00530000064318.j.a ENSGT01030000235060.e.a ENSGT00940000155197.a.b ENSGT00940000154098.a.f.e ENSGT00390000008708.b.b ENSGT00940000153525.i.a.b ENSGT00940000178181.b ENSGT00390000018612.a.b.e ENSGT00390000012501.f.a.a ENSGT00390000014507.a.b.a ENSGT00940000157013.h ENSGT00390000014894.g ENSGT00510000048671.a ENSGT01080000257336.b.e.a.b.e Chinook salmon MODERN SPECIES 8 parp12b (ENSOTSG00005002248) svopl (ENSOTSG00005002235) lta4h (ENSOTSG00005044207) dennd6b (ENSOTSG00005043794) gcc1 (ENSOTSG00005043785) ARF5 (ENSOTSG00005043784) lamtor4 (ENSOTSG00005043783) atp6v1f (ENSOTSG00005043782) ENSOTSG00005043781 ATP6V1FNB (ENSOTSG00005043780) ENSOTSG00005043779 ENSOTSG00005043778 ENSOTSG00005043776 irf5 (ENSOTSG00005043775) tnpo3 (ENSOTSG00005043771) opn1sw1 (ENSOTSG00005043769) ##22 calua (ENSOTSG00005043768) UPF2 (ENSOTSG00005043765) ENSOTSG00005043764 strap (ENSOTSG00005043731) tmpoa (ENSOTSG00005043730) SLC25A3 (ENSOTSG00005043725) LDHB (ENSOTSG00005043723) ENSOTSG00005043722 gys2 (ENSOTSG00005043721) spx (ENSOTSG00005043686) golt1ba (ENSOTSG00005043685) recql (ENSOTSG00005043231) pyroxd1 (ENSOTSG00005043228) IAPP (ENSOTSG00005043227) slco1d1 (ENSOTSG00005042992) Coho salmon MODERN SPECIES 10 svopl (ENSOKIG00005011222) lta4h (ENSOKIG00005011319) dennd6b (ENSOKIG00005011532) gcc1 (ENSOKIG00005011720) ARF5 (ENSOKIG00005011734) ENSOKIG00005011855 ENSOKIG00005011903 ENSOKIG00005011940 ATP6V1FNB (ENSOKIG00005011957) ENSOKIG00005011962 ENSOKIG00005011970 ENSOKIG00005011990 irf5 (ENSOKIG00005012073) tnpo3 (ENSOKIG00005012107) calua (ENSOKIG00005012337) opn1sw1 (ENSOKIG00005012362) ##22 UPF2 (ENSOKIG00005012409) ENSOKIG00005012542 strap (ENSOKIG00005012573) tmpoa (ENSOKIG00005012700) SLC25A3 (ENSOKIG00005012728) LDHB (ENSOKIG00005012775) ENSOKIG00005012784 gys2 (ENSOKIG00005012807) spx (ENSOKIG00005012878) GOLT1B (ENSOKIG00005012925) recql (ENSOKIG00005012959) pyroxd1 (ENSOKIG00005013238) IAPP (ENSOKIG00005013263) ENSOKIG00005013267 slco1d1 (ENSOKIG00005013300) Rainbow trout MODERN SPECIES 6 parp12b (ENSOMYG00000023475) ENSOMYG00000060071 svopl (ENSOMYG00000023403) mical3b (ENSOMYG00000023323) ENSOMYG00000022876 dennd6b (ENSOMYG00000022236) ENSOMYG00000022142 ENSOMYG00000022120 lamtor4 (ENSOMYG00000022092) ATP6V1FNB (ENSOMYG00000022076) ENSOMYG00000022065 ENSOMYG00000022049 ENSOMYG00000021554 irf5 (ENSOMYG00000022034) tnpo3 (ENSOMYG00000021841) opn1sw1 (ENSOMYG00000021760) ##22 calua (ENSOMYG00000021744) ENSOMYG00000021683 ENSOMYG00000065702 ENSOMYG00000021627 ENSOMYG00000068676 ENSOMYG00000021492 LDHB (ENSOMYG00000021471) ENSOMYG00000021456 gys2 (ENSOMYG00000021094) SPX (ENSOMYG00000020984) GOLT1B (ENSOMYG00000020964) RECQL (ENSOMYG00000020807) PYROXD1 (ENSOMYG00000020477) IAPP (ENSOMYG00000037564) ENSOMYG00000052158 Huchen MODERN SPECIES 5611 opn1sw1 (ENSHHUG00000017159) ##22 calua (ENSHHUG00000025203) UPF2 (ENSHHUG00000025231) Northern pike MODERN SPECIES 22 parp12b (ENSELUG00000012799) ENSELUG00000012722 svopl (ENSELUG00000030832) mical3b (ENSELUG00000012589) lta4h (ENSELUG00000012567) dennd6b (ENSELUG00000012489) gcc1 (ENSELUG00000012435) ARF5 (ENSELUG00000012409) lamtor4 (ENSELUG00000012339) atp6v1f (ENSELUG00000029099) ENSELUG00000012199 ENSELUG00000012189 ENSELUG00000012298 irf5 (ENSELUG00000000444) tnpo3 (ENSELUG00000012153) opn1sw1 (ENSELUG00000012075) ##22 calua (ENSELUG00000012047) UPF2 (ENSELUG00000012014) ENSELUG00000011949 strap (ENSELUG00000011937) tmpoa (ENSELUG00000011873) SLC25A3 (ENSELUG00000011737) LDHB (ENSELUG00000011710) ENSELUG00000011694 gys2 (ENSELUG00000000420) spx (ENSELUG00000011612) golt1ba (ENSELUG00000011564) recql (ENSELUG00000011528) pyroxd1 (ENSELUG00000011480) IAPP (ENSELUG00000011444) ENSELUG00000022541 Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 280 ENSGT00940000159926 ENSGT00530000063347.B ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.d ENSGT00940000154156.c.b ENSGT00730000111591.b ENSGT00980000199243 ENSGT00940000159260.h ENSGT00510000047270 ENSGT00940000165785 ENSGT00940000156019.c.b ENSGT00940000155209.mb ENSGT00940000165748.a ENSGT00940000160974.a ENSGT00390000013208 ENSGT00390000016053 ENSGT00940000156878.i.b.b ENSGT00940000153772.A Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 159 ENSGT00390000017006 ENSGT00390000016053 ENSGT00390000013208 ENSGT00390000003224.B ENSGT00940000160974.a ENSGT00940000165748.a ENSGT00940000159926 ENSGT00530000063347.B ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.d ENSGT00940000154156.c.b ENSGT00730000111591.b ENSGT00980000199243 ENSGT00940000159260.h ENSGT00510000047270 ENSGT00940000165785 ENSGT00940000156019.c.b ENSGT00940000155209.mb ENSGT00620000087961.a.b.a.b.a ENSGT00940000167336 ENSGT00940000161249 ENSGT00440000033504.B.b ENSGT00390000006546 ENSGT00530000063745.b Atlantic herring MODERN SPECIES 7 ENSCHAG00000009326 USP15 (ENSCHAG00000007794) ENSCHAG00000006632 ENSCHAG00000006524 KDM5A (ENSCHAG00000003306) ENSCHAG00000002998 rint1 (ENSCHAG00000002563) lamtor4 (ENSCHAG00000002505) atp6v1f (ENSCHAG00000002429) ENSCHAG00000002420 ATP6V1FNB (ENSCHAG00000002412) ENSCHAG00000021376 ENSCHAG00000021342 irf5 (ENSCHAG00000021334) tnpo3 (ENSCHAG00000021254) opn1sw1 (ENSCHAG00000021237) ##22 calua (ENSCHAG00000021224) impdh1b (ENSCHAG00000021027) ENSCHAG00000021016 lepb (ENSCHAG00000021001) ENSCHAG00000020985 ENSCHAG00000020977 LRRC4 (ENSCHAG00000020961) snd1 (ENSCHAG00000019912) pax4 (ENSCHAG00000019888) hgfa (ENSCHAG00000019773) cacna2d1a (ENSCHAG00000018976) ENSCHAG00000018926 ENSCHAG00000018785 CRACR2A (ENSCHAG00000018730) ccdc59 (ENSCHAG00000018719) Otophysi ANCESTRAL SPECIES 59 ENSGT00940000156680.b ENSGT00530000063554.b ENSGT00940000157529.i.b ENSGT00390000016228.a.a ENSGT00730000111061 ENSGT00390000013995.b.b.k.a ENSGT00940000156242.c.b ENSGT00950000183062.a.a.b.b.a ENSGT00940000155915.b ENSGT00940000155419.c.b ENSGT00940000154738.a.r ENSGT00390000003444 ENSGT00390000018647 ENSGT00940000159926 ENSGT00530000063347.B ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.d ENSGT00940000154156.c.b ENSGT00730000111591.b ENSGT00980000199243 ENSGT00940000159260.h ENSGT00510000047270 ENSGT00940000165785 ENSGT00940000156019.c.b ENSGT00940000155209.mb ENSGT00940000165748.a ENSGT00940000160974.a ENSGT00390000013208 ENSGT00390000016053 ENSGT00940000156878.i.b.b ENSGT00940000153772.A Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00810000125439.B.c.a ENSGT00530000063554.b ENSGT00940000157529.i.b ENSGT00390000016228.a.a ENSGT00730000111061 ENSGT00390000013995.b.b.k.a ENSGT00940000156242.c.b ENSGT00950000183062.a.a.b.b.a ENSGT00940000155915.b ENSGT00940000155419.c.b ENSGT00940000154738.a.r ENSGT00390000003444 ENSGT00390000018647 ENSGT00940000159926 ENSGT00530000063347.B ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222360.E.d ENSGT00390000004106 ENSGT00980000199676 ENSGT00940000178824 ENSGT00940000175936 ENSGT00390000007831.d ENSGT00390000007831.c ENSGT00940000180228 ENSGT00940000158113 ENSGT00740000116838 ENSGT00390000017740.a.a ##17 ENSGT00940000158692 ENSGT01050000244940.b ENSGT00940000180800 ENSGT00940000160401 Cyprininae DUPLICATION Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00810000125439.B.c.a.e ENSGT00530000063868.b.l.d.a ENSGT00940000157529.i.b.b ENSGT00390000016228.a.a.a ENSGT00730000111061.i.a ENSGT00390000013995.b.b.k.a.a.b ENSGT00940000156242.c.b.b ENSGT00950000183062.a.a.b.b.a.d ENSGT00940000155915.b.b ENSGT00940000155419.c.b.a ENSGT00940000154738.a.r.a ENSGT00390000003444.c ENSGT00390000018647 ENSGT00940000159926.m ENSGT00530000063347.B.i ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b.o ##22 ENSGT01010000222360.E.d.d ENSGT00390000004106.i ENSGT00980000199676.b ENSGT00940000178824.b ENSGT00940000175936.a ENSGT00390000007831.d.a ENSGT00390000007831.c.b ENSGT00940000180228 ENSGT00940000158113.h ENSGT00740000116838.b ENSGT00390000017740.a.a.h ##17 ENSGT00940000158692.d ENSGT01050000244940.b.f ENSGT00940000160401.a ENSGT00940000157643.p Goldfish DUPLICATION Goldfish MODERN SPECIES 33 tnnt2e (ENSCARG00000057414) ENSCARG00000057430 tnni4a (ENSCARG00000057495) LRRN3 (ENSCARG00000057520) dock4b (ENSCARG00000058171) ifrd1 (ENSCARG00000068532) tmem168a (ENSCARG00000068661) gpr85 (ENSCARG00000068666) ENSCARG00000068674 cntn1b (ENSCARG00000068699) nrcama (ENSCARG00000069031) ENSCARG00000069832 ENSCARG00000069841 irf5 (ENSCARG00000069845) tnpo3 (ENSCARG00000069857) opn1sw1 (ENSCARG00000069872) ##22 calua (ENSCARG00000069873) mdm1 (ENSCARG00000069875) ENSCARG00000069880 il26 (ENSCARG00000069884) ENSCARG00000069887 IFNgrel 1 (ENSCARG00000000133) ifng1 (ENSCARG00000000155) dyrk2 (ENSCARG00000000166) si:dkey-39a18.1 (ENSCARG00000000180) cand1 (ENSCARG00000000359) ##17 grip1 (ENSCARG00000000502) tmbim4 (ENSCARG00000000640) wif1 (ENSCARG00000000673) lemd3 (ENSCARG00000000773) ENSCARG00000000813 Goldfish MODERN SPECIES 1904 cntn1b (ENSCARG00000061962) nrcama (ENSCARG00000039469) ENSCARG00000038626 ENSCARG00000037498 ENSCARG00000037406 irf5 (ENSCARG00000037280) tnpo3 (ENSCARG00000037076) opn1sw1 (ENSCARG00000037034) ##22 calua (ENSCARG00000036996) mdm1 (ENSCARG00000036967) ENSCARG00000036938 il26 (ENSCARG00000036910) ENSCARG00000036892 ifng1r (ENSCARG00000036880) ifng1 (ENSCARG00000036862) Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 213 ENSGT00810000125439.B.c.a.e ENSGT00530000063868.b.l.d.a ENSGT00940000157529.i.b.b ENSGT00390000016228.a.a.a ENSGT00730000111061.i.a ENSGT00390000013995.b.b.k.a.a.b ENSGT00940000156242.c.b.b ENSGT00950000183062.a.a.b.b.a.d ENSGT00940000155915.b.b ENSGT00940000155419.c.b.a ENSGT00940000154738.a.r.a ENSGT00390000003444.c ENSGT00390000018647 ENSGT00940000159926.m ENSGT00530000063347.B.i ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b.o ##22 ENSGT01010000222360.E.d.d ENSGT00390000004106.i ENSGT00980000199676.b ENSGT00940000178824.b ENSGT00940000175936.a ENSGT00390000007831.d.a ENSGT00390000007831.c.b ENSGT00940000180228 ENSGT00940000158113.h ENSGT00740000116838.b ENSGT00390000017740.a.a.h ##17 ENSGT00940000158692.d ENSGT01050000244940.b.f ENSGT00940000160401.a ENSGT00940000157643.p Golden-line barbel MODERN SPECIES 89 twf1b (ENSSGRG00000050700) pus7l (ENSSGRG00000050699) prickle1b (ENSSGRG00000050696) pphln1 (ENSSGRG00000050694) zcrb1 (ENSSGRG00000050693) yaf2 (ENSSGRG00000050692) gxylt1b (ENSSGRG00000050691) pdzrn4 (ENSSGRG00000050690) cntn1b (ENSSGRG00000050186) nrcama (ENSSGRG00000045487) ENSSGRG00000045350 ENSSGRG00000045349 ENSSGRG00000045347 irf5 (ENSSGRG00000045204) tnpo3 (ENSSGRG00000044778) opn1sw1 (ENSSGRG00000044758) ##22 calua (ENSSGRG00000044756) ENSSGRG00000044754 ENSSGRG00000044753 ifng1r (ENSSGRG00000044752) ifng1 (ENSSGRG00000044747) dyrk2 (ENSSGRG00000044746) si:dkey-39a18.1 (ENSSGRG00000044745) cand1 (ENSSGRG00000044407) ##17 grip1 (ENSSGRG00000043548) tmbim4 (ENSSGRG00000043512) wif1 (ENSSGRG00000043495) lemd3 (ENSSGRG00000043480) msrb3 (ENSSGRG00000043479) ENSSGRG00000043478 b2m (ENSSGRG00000043476) Common carp reference MODERN SPECIES 8 ENSCCRG00000069855 twf1b (ENSCCRG00000051869) prickle1b (ENSCCRG00000017147) PPHLN1 (ENSCCRG00000052277) zcrb1 (ENSCCRG00000052279) yaf2 (ENSCCRG00000055663) gxylt1b (ENSCCRG00000022249) pdzrn4 (ENSCCRG00000076324) cntn1b (ENSCCRG00000019823) nrcama (ENSCCRG00000022642) ENSCCRG00000040957 ENSCCRG00000040966 ENSCCRG00000062302 irf5 (ENSCCRG00000040980) tnpo3 (ENSCCRG00000019437) opn1sw1 (ENSCCRG00000041076) ##22 calua (ENSCCRG00000020739) mdm1 (ENSCCRG00000041703) ENSCCRG00000004733 il26 (ENSCCRG00000041719) ENSCCRG00000041726 ifng1r (ENSCCRG00000041731) ifng1 (ENSCCRG00000041736) si:ch211-266a5.12 (ENSCCRG00000075958) dyrk2 (ENSCCRG00000062396) si:dkey-39a18.1 (ENSCCRG00000057419) cand1 (ENSCCRG00000041774) ##17 grip1 (ENSCCRG00000039461) ENSCCRG00000068364 ENSCCRG00000055743 tmbim4 (ENSCCRG00000054913) Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 223 ENSGT00940000159926.n ENSGT00530000063347.B.j ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b.p ##22 ENSGT01010000222360.E.d.c ENSGT00390000004106.j ENSGT00980000199676.a ENSGT00940000178824.a ENSGT00940000175936.b ENSGT00390000007831.d.b ENSGT00390000007831.c.a ENSGT00940000158113.g ENSGT00740000116838.a ENSGT00390000017740.a.a.g ##17 ENSGT00940000158692.c ENSGT01050000244940.b.e ENSGT00390000014353.cb ENSGT00940000160401.b ENSGT00940000157643.o Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 123 ENSGT00810000125439.B.c.a.f ENSGT00530000063868.b.l.d.b ENSGT00530000063554.b ENSGT00940000157529.i.b.a ENSGT00390000016228.a.a.b ENSGT00730000111061.i.b ENSGT00390000013995.b.b.k.a.a.a ENSGT00940000156242.c.b.a ENSGT00950000183062.a.a.b.b.a.c ENSGT00940000155915.b.a ENSGT00940000155419.c.b.b ENSGT00940000154738.a.r.b ENSGT00390000003444.d ENSGT00940000159926.n ENSGT00530000063347.B.j ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b.p ##22 ENSGT01010000222360.E.d.c ENSGT00390000004106.j ENSGT00980000199676.a ENSGT00940000178824.a ENSGT00940000175936.b ENSGT00390000007831.d.b ENSGT00390000007831.c.a ENSGT00940000158113.g ENSGT00740000116838.a ENSGT00390000017740.a.a.g ##17 ENSGT00940000158692.c ENSGT01050000244940.b.e ENSGT00940000180800 ENSGT00390000014353.cb ENSGT00940000160401.b Golden-line barbel MODERN SPECIES prl2 (ENSSGRG00000004889) NELL2 (ENSSGRG00000001888) twf1b (ENSSGRG00000001399) pus7l (ENSSGRG00000001367) prickle1b (ENSSGRG00000001360) yaf2 (ENSSGRG00000001358) gxylt1b (ENSSGRG00000001353) pphln1 (ENSSGRG00000001340) pdzrn4 (ENSSGRG00000001329) cntn1b (ENSSGRG00000000926) nrcama (ENSSGRG00000000923) ENSSGRG00000000922 PNPLA8 (ENSSGRG00000000920) irf5 (ENSSGRG00000000867) tnpo3 (ENSSGRG00000000853) opn1sw1 (ENSSGRG00000000818) ##22 calua (ENSSGRG00000000813) mdm1 (ENSSGRG00000000812) ENSSGRG00000000807 il26 (ENSSGRG00000000806) ENSSGRG00000000797 ENSSGRG00000000796 ifng1r (ENSSGRG00000000795) ifng1 (ENSSGRG00000000793) dyrk2 (ENSSGRG00000000790) si:dkey-39a18.1 (ENSSGRG00000000789) cand1 (ENSSGRG00000000725) ##17 grip1 (ENSSGRG00000000598) tmbim4 (ENSSGRG00000000591) vhll (ENSSGRG00000000593) wif1 (ENSSGRG00000000584) Zebrafish MODERN SPECIES 19 ENSDARG00000109403 prickle1b (ENSDARG00000045694) zcrb1 (ENSDARG00000045691) yaf2 (ENSDARG00000015966) pphln1 (ENSDARG00000045692) gxylt1b (ENSDARG00000022550) pdzrn4 (ENSDARG00000045687) cntn1b (ENSDARG00000045685) ENSDARG00000112990 nrcama (ENSDARG00000006396) ENSDARG00000105458 PNPLA8 (ENSDARG00000078745) ccdc87 (ENSDARG00000045683) irf5 (ENSDARG00000045681) tnpo3 (ENSDARG00000045680) opn1sw1 (ENSDARG00000045677) ##22 calua (ENSDARG00000045676) mdm1 (ENSDARG00000045675) il22 (ENSDARG00000045673) il26 (ENSDARG00000045672) ifng1r (ENSDARG00000045671) ifng1 (ENSDARG00000024211) si:ch211-266a5.12 (ENSDARG00000092714) dyrk2 (ENSDARG00000094646) si:dkey-39a18.1 (ENSDARG00000045669) cand1 (ENSDARG00000017841) ##17 grip1 (ENSDARG00000015053) si:dkey-6a5.3 (ENSDARG00000094001) ENSDARG00000110543 tmbim4 (ENSDARG00000014361) vhll (ENSDARG00000078613) Spotted gar DUPLICATION Spotted gar MODERN SPECIES 674 st7 (ENSLOCG00000015591) wnt2 (ENSLOCG00000015590) asz1 (ENSLOCG00000015587) cftr (ENSLOCG00000015585) CTTNBP2 (ENSLOCG00000015582) lsm8 (ENSLOCG00000015580) ANKRD26 (ENSLOCG00000015575) atp6v1f (ENSLOCG00000015574) ATP6V1FNB (ENSLOCG00000015573) ENSLOCG00000015570 KCP (ENSLOCG00000015566) ENSLOCG00000015564 irf5 (ENSLOCG00000015563) tnpo3 (ENSLOCG00000015556) opn1sw1 (ENSLOCG00000015553) ##22 opn1sw1 (ENSLOCG00000015552) ##22 calua (ENSLOCG00000015549) ENSLOCG00000015548 ENSLOCG00000015547 impdh1a (ENSLOCG00000015544) ENSLOCG00000015543 si:dkey-5i3.5 (ENSLOCG00000015542) rbm28 (ENSLOCG00000015541) ENSLOCG00000015540 lrrc4.2 (ENSLOCG00000017901) snd1 (ENSLOCG00000015537) pax4 (ENSLOCG00000015535) hgfa (ENSLOCG00000015530) cacna2d1a (ENSLOCG00000015521) ENSLOCG00000015517 apex1 (ENSLOCG00000015516) Spotted gar MODERN SPECIES 674 ENSLOCG00000015593 st7 (ENSLOCG00000015591) wnt2 (ENSLOCG00000015590) asz1 (ENSLOCG00000015587) cftr (ENSLOCG00000015585) CTTNBP2 (ENSLOCG00000015582) lsm8 (ENSLOCG00000015580) ANKRD26 (ENSLOCG00000015575) atp6v1f (ENSLOCG00000015574) ATP6V1FNB (ENSLOCG00000015573) ENSLOCG00000015570 KCP (ENSLOCG00000015566) ENSLOCG00000015564 irf5 (ENSLOCG00000015563) tnpo3 (ENSLOCG00000015556) opn1sw1 (ENSLOCG00000015553) ##22 opn1sw1 (ENSLOCG00000015552) ##22 calua (ENSLOCG00000015549) ENSLOCG00000015548 ENSLOCG00000015547 impdh1a (ENSLOCG00000015544) ENSLOCG00000015543 si:dkey-5i3.5 (ENSLOCG00000015542) rbm28 (ENSLOCG00000015541) ENSLOCG00000015540 lrrc4.2 (ENSLOCG00000017901) snd1 (ENSLOCG00000015537) pax4 (ENSLOCG00000015535) hgfa (ENSLOCG00000015530) cacna2d1a (ENSLOCG00000015521) ENSLOCG00000015517