Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 231 ENSGT01100000263567.a.b.b ENSGT00990000203553.c.a.a.b.b.b ENSGT01100000263504.a.b.b.b.a.b ENSGT01100000263474.a.b.a.b.b.b.a.b.b.a ENSGT01100000263504.a.b.b.b.b ENSGT01100000263559.A #22 ENSGT01020000230360.c.b.a.a.a.a.b.a.a.a.b.b ##21 ENSGT00990000203553.c.a.a.a.a.b ENSGT01100000263474.a.b.b.o.a.a ENSGT00950000183089.c.a #23 ENSGT01100000263474.a.b.a.b.a.d ENSGT00990000203553.c.a.a.b.a.a.a.a.b ENSGT01100000263504.a.b.b.b.a.a ENSGT01100000263474.a.b.b.o.b ENSGT01100000263559.B ##22 ENSGT00940000153092 Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 136 ENSGT01020000230360.c.b.a.b.b.d.a.a #21 ENSGT01100000263504.a.b.b.b.b ENSGT01100000263559.A #22 ENSGT01020000230360.c.b.a.a.a.a.b.a.a.a.b.b ##21 ENSGT00990000203553.c.a.a.a.a.b ENSGT01100000263474.a.b.b.o.a.a ENSGT00950000183089.c.a.k.a #23 ENSGT00990000203553.c.a.a.b.a.a.a.a.b ENSGT01100000263504.a.b.b.b.a.a ENSGT01100000263474.a.b.b.o.b ENSGT01100000263559.B ##22 ENSGT00940000153092 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 146 ENSGT00990000203553.c.a.a.b.a.a.b.b ENSGT01100000263504.a.b.b.b.b ENSGT01100000263559.A #22 ENSGT00950000183089.c.a.k.b.a.a ##23 ENSGT00990000203553.c.a.a.a.a.a ENSGT01020000230360.c.b.a.b.b.d.b.a.a ##21 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 48 ENSGT00990000203553.c.a.a.b.a.a.b.b ENSGT01100000263504.a.b.b.b.b.y ENSGT01100000263559.A #22 ENSGT00950000183089.c.a.k.b.a.a ##23 ENSGT00990000203553.c.a.a.a.a.a ENSGT01020000230360.c.b.a.b.b.d.b.a.a ##21 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000179738 ENSGT00950000183089.c.b ##23 ENSGT01100000263559.A #22 ENSGT00940000161860 ENSGT00940000158576.a.a ENSGT00940000164299.b.a ENSGT00940000160758 ENSGT00940000161105 ENSGT00440000035348 ENSGT00390000004190 ENSGT00390000006670 ENSGT00940000155911 ENSGT00390000007890 ENSGT00390000015797 ENSGT00390000004933.k.a ENSGT00390000002615 ENSGT00940000169980 ENSGT00940000158990.t Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 124 ENSGT01020000230360.c.b.a.b.a.a.a.a.b ##21 ENSGT00990000203553.c.a.a.b.a.a.a.a.b.n ENSGT01100000263559.A #22 Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263559.A #22 Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263559.A #22 Mangrove rivulus MODERN SPECIES 59 STXBP5 (ENSKMAG00000015200) #7 GRM1 (ENSKMAG00000015089) #8 SHPRH (ENSKMAG00000014992) #9 ENSKMAG00000014944 #10 fbxo30a (ENSKMAG00000014928) #11 stx11a (ENSKMAG00000014913) #12 STX11 (ENSKMAG00000014884) #13 ENSKMAG00000014866 #14 rmnd1 (ENSKMAG00000014835) #15 ENSKMAG00000014539 #16 ENSKMAG00000014436 #17 TULP4 (ENSKMAG00000014370) #18 slc18b1 (ENSKMAG00000014308) #19 ahi1 (ENSKMAG00000014264) #20 ENSKMAG00000014241 #21 hist2h3ca1 (ENSKMAG00000014201) #22 ENSKMAG00000014180 #23 OTOF (ENSKMAG00000014101) #24 mapre3a (ENSKMAG00000014053) #25 dpysl5a (ENSKMAG00000013999) #26 dnmt3ab (ENSKMAG00000013869) #27 dtnbb (ENSKMAG00000013696) #28 ASXL2 (ENSKMAG00000013630) #29 kif3cb (ENSKMAG00000013602) #30 hadhab (ENSKMAG00000013503) #31 RPS6KA5 (ENSKMAG00000013410) #32 mbip (ENSKMAG00000013349) #33 nkx2.1 (ENSKMAG00000013335) #34 NKX2-8 (ENSKMAG00000013325) #35 pax9 (ENSKMAG00000013301) #36 slc25a21 (ENSKMAG00000013224) #37 Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263559.A #22 NAME_4 ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263559.A #22 Sheepshead minnow MODERN SPECIES 513 tnpo3 (ENSCVAG00000020285) rpl18a (ENSCVAG00000020360) xpot (ENSCVAG00000020453) ENSCVAG00000020489 ENSCVAG00000020519 lta4h (ENSCVAG00000020551) pthlha (ENSCVAG00000020592) C11orf98 (ENSCVAG00000020626) ENSCVAG00000020670 lrp6 (ENSCVAG00000020775) tbk1 (ENSCVAG00000020828) gpr19 (ENSCVAG00000020861) crebl2 (ENSCVAG00000020882) dusp16 (ENSCVAG00000020964) eps8a (ENSCVAG00000021049) H3-7 (ENSCVAG00000021142) #22 ENSCVAG00000021174 ##21 tmem185 (ENSCVAG00000021221) Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263559.A #22 Poecilia ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263559.A #22 Guppy MODERN SPECIES 448 ENSPREG00000008166 ENSPREG00000008177 ENSPREG00000008189 ENSPREG00000008202 ENSPREG00000008226 MYADM (ENSPREG00000008232) ENSPREG00000008275 vangl2 (ENSPREG00000008575) ENSPREG00000008591 ENSPREG00000008607 ENSPREG00000008626 ENSPREG00000008636 ENSPREG00000008658 ##21 ENSPREG00000008666 ##23 ENSPREG00000008688 ENSPREG00000008773 #22 ENSPREG00000008787 ENSPREG00000008876 supt16h (ENSPREG00000008906) ENSPREG00000009055 SLC12A6 (ENSPREG00000009136) nop10 (ENSPREG00000009335) lpcat4 (ENSPREG00000009344) emc4 (ENSPREG00000009381) ENSPREG00000009389 ENSPREG00000009404 ENSPREG00000009430 ENSPREG00000009460 ENSPREG00000009478 ENSPREG00000009497 ENSPREG00000009513 Oryzias ANCESTRAL SPECIES 221 ENSGT00990000203553.c.a.a.b.a.a.a.a.b.n ENSGT01100000263559.A #22 Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263559.A #22 Javanese ricefish DUPLICATION Javanese ricefish MODERN SPECIES rcor3 (ENSOJAG00000015116) ENSOJAG00000015267 ENSOJAG00000015364 ENSOJAG00000016656 ENSOJAG00000016669 HNRNPLL (ENSOJAG00000016717) slc22a7a (ENSOJAG00000017051) ENSOJAG00000017062 ENSOJAG00000017069 JAG1 (ENSOJAG00000017134) RRP36 (ENSOJAG00000017700) ENSOJAG00000017712 tp53bp2b (ENSOJAG00000017756) gtpbp2b (ENSOJAG00000003655) ENSOJAG00000003702 ##21 ENSOJAG00000003721 #22 ENSOJAG00000003778 si:dkey-23a13.20 (ENSOJAG00000003800) ##21 ENSOJAG00000003845 ENSOJAG00000003966 ENSOJAG00000003989 ENSOJAG00000003995 ENSOJAG00000004003 ENSOJAG00000004022 ##21 zgc:163040 (ENSOJAG00000004049) ENSOJAG00000004060 #23 DDX5 (ENSOJAG00000004468) POLG2 (ENSOJAG00000006845) ENSOJAG00000007145 evpla (ENSOJAG00000007176) ten1 (ENSOJAG00000007194) Javanese ricefish MODERN SPECIES 5 ENSOJAG00000007551 ENSOJAG00000007596 fam53c (ENSOJAG00000007624) ENSOJAG00000007648 slbp2 (ENSOJAG00000007696) zmat2 (ENSOJAG00000007711) ENSOJAG00000007791 ENSOJAG00000007799 nhp2 (ENSOJAG00000007825) ENSOJAG00000007847 ENSOJAG00000007872 ENSOJAG00000007885 ADRA1B (ENSOJAG00000007903) ENSOJAG00000007929 ##21 ENSOJAG00000007941 ENSOJAG00000007954 #22 ENSOJAG00000007980 ENSOJAG00000007994 ENSOJAG00000008018 ##23 dscama (ENSOJAG00000008078) ENSOJAG00000009454 ENSOJAG00000009544 ENSOJAG00000009560 usp25 (ENSOJAG00000009773) WSCD1 (ENSOJAG00000012395) ENSOJAG00000012528 ENSOJAG00000012535 ENSOJAG00000012543 nup98 (ENSOJAG00000012558) ENSOJAG00000012663 ENSOJAG00000012678 Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000162439 ENSGT00390000003183 ENSGT00390000018434 ENSGT00940000155093.b ENSGT00390000017523 ENSGT01030000234555.a.a.a.c.a ENSGT00940000153592.B.a ENSGT00950000183145.D.i ENSGT01090000260061.c.a.c.a.a.b ENSGT00940000155882.a.a ENSGT00940000162625 ENSGT00940000159210 ENSGT00390000018406 ENSGT00940000156747 ENSGT00990000203553.c.a.a.b.a.a.a.a.b.n ENSGT01100000263559.A #22 ENSGT00950000183089.c.a.k.b.b.j ##23 ENSGT01020000230351.C ENSGT00940000154890.a.a ENSGT00940000174983 ENSGT00940000155668.j ENSGT01060000250877 ENSGT00940000155045 ENSGT00940000160156 ENSGT00940000156179 ENSGT00940000155228 ENSGT00390000005976.a.a.a ENSGT00390000005976.a.a.b ENSGT00390000003917 ENSGT01000000214434.E ENSGT00940000158512.b Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES UBE2O (ENSORLG00000000718) aanat1 (ENSORLG00000000725) RHBDF2 (ENSORLG00000000754) acox1 (ENSORLG00000000785) ten1 (ENSORLG00000000792) evpla (ENSORLG00000000815) ENSORLG00000025993 ENSORLG00000000825 ENSORLG00000000822 srp68 (ENSORLG00000000849) POLG2 (ENSORLG00000000860) DDX5 (ENSORLG00000000866) ENSORLG00000030472 ENSORLG00000000157 #23 ENSORLG00000023254 ##21 ENSORLG00000001338 #22 gtpbp2b (ENSORLG00000000909) tp53bp2b (ENSORLG00000000954) rrp36 (ENSORLG00000029500) ENSORLG00000000972 ENSORLG00000030418 ENSORLG00000025624 slc22a7a (ENSORLG00000000981) HNRNPLL (ENSORLG00000001005) ENSORLG00000001049 ENSORLG00000001076 ENSORLG00000001087 ENSORLG00000001109 rcor3 (ENSORLG00000001117) ENSORLG00000001160 ENSORLG00000022684 #23 Chinese medaka MODERN SPECIES 1129 CENPV (ENSOSIG00000022092) pigl (ENSOSIG00000022090) ncor1 (ENSOSIG00000022073) zswim7 (ENSOSIG00000022055) adora2b (ENSOSIG00000022048) SPECC1 (ENSOSIG00000022044) ENSOSIG00000022020 YWHAG (ENSOSIG00000022008) hspb1 (ENSOSIG00000022005) ENSOSIG00000022004 ENSOSIG00000021997 c1qbp (ENSOSIG00000021992) dhx33 (ENSOSIG00000021988) ENSOSIG00000021976 ENSOSIG00000021975 ENSOSIG00000021972 #22 ENSOSIG00000021969 ##23 p2rx1 (ENSOSIG00000021966) camkk1a (ENSOSIG00000021963) ENSOSIG00000021956 ATP2A3 (ENSOSIG00000020170) ZZEF1 (ENSOSIG00000019949) cyb5d2 (ENSOSIG00000019925) ankfy1 (ENSOSIG00000019919) ube2g1a (ENSOSIG00000019900) spns3 (ENSOSIG00000019886) SPNS2 (ENSOSIG00000019300) emc6 (ENSOSIG00000019248) SHPK (ENSOSIG00000019245) trpv1 (ENSOSIG00000019243) fam222ba (ENSOSIG00000019238) Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 135 ENSGT00940000179738 ENSGT00950000183089.c.b ##23 ENSGT01100000263559.A #22 Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 404 ENSGT01020000230360.c.b.a.b.a.b.c.a.b ##21 ENSGT01100000263559.A #22 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 480 ENSGT01020000230360.c.b.a.b.a.b.c.a.b ##21 ENSGT01100000263559.A #22 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 468 ENSGT01020000230360.c.b.a.b.a.b.c.a.b ##21 ENSGT01100000263559.A #22 Lyretail cichlid MODERN SPECIES 291 kcnj8 (ENSNBRG00000013212) ECHDC3 (ENSNBRG00000013230) acot15 (ENSNBRG00000013263) AVPR1A (ENSNBRG00000013319) srgap1b (ENSNBRG00000013523) kics2 (ENSNBRG00000013555) TMEM19 (ENSNBRG00000013564) rab3ip (ENSNBRG00000013590) ENSNBRG00000013615 UPF2 (ENSNBRG00000013629) slc35e3 (ENSNBRG00000013679) nup107 (ENSNBRG00000013724) mdm2 (ENSNBRG00000013973) ENSNBRG00000014005 #23 ENSNBRG00000014015 ##21 ENSNBRG00000014026 #22 ENSNBRG00000014094 ENSNBRG00000014112 ENSNBRG00000014139 ENSNBRG00000014162 ENSNBRG00000014171 dyrk2 (ENSNBRG00000014202) ifng1 (ENSNBRG00000014224) ENSNBRG00000014233 ENSNBRG00000014247 ENSNBRG00000014261 cand1 (ENSNBRG00000014291) grip1 (ENSNBRG00000014378) lsm8 (ENSNBRG00000014441) TYMP (ENSNBRG00000014459) SHANK3 (ENSNBRG00000014507) Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 487 ENSGT01020000230360.c.b.a.b.a.b.c.a.b ##21 ENSGT01100000263559.A #22 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 447 ENSGT01020000230360.c.b.a.b.a.b.c.a.b ##21 ENSGT01100000263559.A #22 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 47 ENSGT00390000003512.r ENSGT00940000156048.e.a.a.a.a ENSGT00390000011529 ENSGT00940000153342.b ENSGT00940000158966 ENSGT01020000231800 ENSGT00390000002789 ENSGT00530000067736 ENSGT01100000264738.a ENSGT00940000166495 ENSGT00390000007529 ENSGT00550000074956 ENSGT00940000157824.i.a ENSGT00940000153408.B.s.b ENSGT00940000158659 ENSGT01100000263559.A #22 ENSGT01100000263514.A.e.a ENSGT01060000248528.b.we.a ENSGT00950000183089.c.a.k.a.sb.a #23 ENSGT00990000203553.c.a.b ENSGT00390000007870.k.b ENSGT00390000012029 ENSGT00940000155345.r ENSGT01100000263601 ENSGT00940000167432 ENSGT00530000063410.a.q.b ENSGT00940000153464.B.z.a ENSGT00390000000583 ENSGT00950000183050.b.b.b.a.a.a.b ENSGT00950000182898.a.a.a.a.a.h ENSGT00940000155337.`b Zebra mbuna DUPLICATION Zebra mbuna MODERN SPECIES 1109 ENSMZEG00005005426 nup133 (ENSMZEG00005005378) taf5l (ENSMZEG00005005370) capn9 (ENSMZEG00005005346) ENSMZEG00005005327 ltv1 (ENSMZEG00005005315) ifngr1 (ENSMZEG00005005285) ENSMZEG00005005275 ENSMZEG00005005260 ENSMZEG00005005230 pus10 (ENSMZEG00005005211) cct4 (ENSMZEG00005005184) FAM161A (ENSMZEG00005005167) XPO1 (ENSMZEG00005005105) USP34 (ENSMZEG00005005014) ENSMZEG00005004765 #22 ENSMZEG00005004064 ENSMZEG00005003954 ##21 ENSMZEG00005003650 #22 ENSMZEG00005003630 ENSMZEG00005003616 ENSMZEG00005003038 ENSMZEG00005002098 ENSMZEG00005002087 #23 ENSMZEG00005002082 ENSMZEG00005002076 ENSMZEG00005002063 ENSMZEG00005002053 ENSMZEG00005002043 ENSMZEG00005001785 sap30bp (ENSMZEG00005001777) Zebra mbuna MODERN SPECIES 1109 ENSMZEG00005001070 si:dkey-102c8.3 (ENSMZEG00005001077) ENSMZEG00005001101 chchd10 (ENSMZEG00005001153) ddt (ENSMZEG00005001156) gstt1b (ENSMZEG00005001399) gstt1b (ENSMZEG00005001411) ENSMZEG00005001425 ENSMZEG00005001434 ENSMZEG00005001448 b3gnt2a (ENSMZEG00005001456) commd1 (ENSMZEG00005001460) ENSMZEG00005001470 ENSMZEG00005001480 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(ENSMZEG00005001777) ENSMZEG00005001692 ENSMZEG00005001686 #23 ENSMZEG00005001598 #22 Eastern happy DUPLICATION Eastern happy MODERN SPECIES 18 pus10 (ENSACLG00000015870) cct4 (ENSACLG00000015808) ENSACLG00000015802 ENSACLG00000015773 ENSACLG00000015748 XPO1 (ENSACLG00000015669) USP34 (ENSACLG00000015410) ENSACLG00000015308 #22 ENSACLG00000015194 ENSACLG00000015117 ##21 ENSACLG00000015026 ENSACLG00000014987 ENSACLG00000014970 ENSACLG00000014956 ##21 ENSACLG00000014940 ENSACLG00000014877 #22 ENSACLG00000014860 ENSACLG00000014852 ENSACLG00000014842 ENSACLG00000014834 sap30bp (ENSACLG00000014823) ENSACLG00000014815 ENSACLG00000014801 ENSACLG00000014792 H3C1 (ENSACLG00000014721) ENSACLG00000014709 ##21 ENSACLG00000014587 commd1 (ENSACLG00000014571) b3gnt2a (ENSACLG00000014561) ENSACLG00000014485 ENSACLG00000014463 Eastern happy MODERN SPECIES 18 taf5l (ENSACLG00000016330) capn9 (ENSACLG00000016284) ENSACLG00000016277 ltv1 (ENSACLG00000016248) ENSACLG00000016176 ENSACLG00000016161 ENSACLG00000016143 ENSACLG00000016107 pus10 (ENSACLG00000015870) cct4 (ENSACLG00000015808) ENSACLG00000015802 ENSACLG00000015773 ENSACLG00000015748 XPO1 (ENSACLG00000015669) USP34 (ENSACLG00000015410) ENSACLG00000015308 #22 ENSACLG00000015194 ENSACLG00000015117 ##21 ENSACLG00000015026 ENSACLG00000014987 ENSACLG00000014970 ENSACLG00000014956 ##21 ENSACLG00000014940 ENSACLG00000014877 #22 ENSACLG00000014860 ENSACLG00000014852 ENSACLG00000014842 ENSACLG00000014834 sap30bp (ENSACLG00000014823) ENSACLG00000014815 ENSACLG00000014801 Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 371 ENSGT00990000203553.c.a.a.b.a.a.a.a.b.n ENSGT01100000263559.A #22 Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 397 ENSGT00990000203553.c.a.a.b.a.a.a.a.b.n ENSGT01100000263559.A #22 Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 424 ENSGT00990000203553.c.a.a.b.a.a.a.a.b.n ENSGT01100000263559.A #22 Orange clownfish DUPLICATION Orange clownfish DUPLICATION Orange clownfish DUPLICATION Orange clownfish MODERN SPECIES 17 ENSAPEG00000019308 ##21 ENSAPEG00000019321 ##23 ENSAPEG00000019330 ENSAPEG00000019340 ENSAPEG00000019367 ENSAPEG00000019386 ENSAPEG00000019396 ENSAPEG00000019488 ##21 ENSAPEG00000019505 ENSAPEG00000019513 ENSAPEG00000019523 ENSAPEG00000019553 ENSAPEG00000019611 ENSAPEG00000019641 #22 ENSAPEG00000019718 ENSAPEG00000019864 #22 ENSAPEG00000019940 ##21 ENSAPEG00000019947 ##21 ENSAPEG00000019955 #22 ENSAPEG00000020054 ENSAPEG00000020088 ENSAPEG00000020120 ##21 ENSAPEG00000020220 #22 ENSAPEG00000020288 ENSAPEG00000020331 GRIA2 (ENSAPEG00000020344) ENSAPEG00000020400 ENSAPEG00000020417 glrba (ENSAPEG00000020433) ndufs8a (ENSAPEG00000020467) p2rx3b (ENSAPEG00000020485) Orange clownfish MODERN SPECIES 17 slc22a7a (ENSAPEG00000020591) ENSAPEG00000020528 pold4 (ENSAPEG00000020510) p2rx3b (ENSAPEG00000020485) ndufs8a (ENSAPEG00000020467) glrba (ENSAPEG00000020433) ENSAPEG00000020417 ENSAPEG00000020400 GRIA2 (ENSAPEG00000020344) ENSAPEG00000020331 ENSAPEG00000020288 ENSAPEG00000020220 #22 ENSAPEG00000020120 ##21 ENSAPEG00000020088 ENSAPEG00000020054 ENSAPEG00000019955 #22 ENSAPEG00000019947 ##21 ENSAPEG00000019940 ##21 ENSAPEG00000019864 #22 ENSAPEG00000019718 ENSAPEG00000019641 #22 ENSAPEG00000019611 ENSAPEG00000019553 ENSAPEG00000019523 ENSAPEG00000019513 ENSAPEG00000019505 ENSAPEG00000019488 ##21 ENSAPEG00000019396 ENSAPEG00000019386 ENSAPEG00000019367 ENSAPEG00000019340 Orange clownfish MODERN SPECIES 17 ENSAPEG00000019283 ENSAPEG00000019298 ENSAPEG00000019308 ##21 ENSAPEG00000019321 ##23 ENSAPEG00000019330 ENSAPEG00000019340 ENSAPEG00000019367 ENSAPEG00000019386 ENSAPEG00000019396 ENSAPEG00000019488 ##21 ENSAPEG00000019505 ENSAPEG00000019513 ENSAPEG00000019523 ENSAPEG00000019553 ENSAPEG00000019611 ENSAPEG00000019641 #22 ENSAPEG00000019718 ENSAPEG00000019864 #22 ENSAPEG00000019940 ##21 ENSAPEG00000019947 ##21 ENSAPEG00000019955 #22 ENSAPEG00000020054 ENSAPEG00000020088 ENSAPEG00000020120 ##21 ENSAPEG00000020220 #22 ENSAPEG00000020288 ENSAPEG00000020331 GRIA2 (ENSAPEG00000020344) ENSAPEG00000020400 ENSAPEG00000020417 glrba (ENSAPEG00000020433) Orange clownfish MODERN SPECIES 17 ENSAPEG00000020740 ATL2 (ENSAPEG00000020696) HNRNPLL (ENSAPEG00000020648) ENSAPEG00000020639 slc22a7a (ENSAPEG00000020591) ENSAPEG00000020528 pold4 (ENSAPEG00000020510) p2rx3b (ENSAPEG00000020485) ndufs8a (ENSAPEG00000020467) glrba (ENSAPEG00000020433) ENSAPEG00000020417 ENSAPEG00000020400 GRIA2 (ENSAPEG00000020344) ENSAPEG00000020331 ENSAPEG00000020288 ENSAPEG00000020220 #22 ENSAPEG00000020120 ##21 ENSAPEG00000020088 ENSAPEG00000020054 ENSAPEG00000019955 #22 ENSAPEG00000019947 ##21 ENSAPEG00000019940 ##21 ENSAPEG00000019864 #22 ENSAPEG00000019718 ENSAPEG00000019641 #22 ENSAPEG00000019611 ENSAPEG00000019553 ENSAPEG00000019523 ENSAPEG00000019513 ENSAPEG00000019505 ENSAPEG00000019488 ##21 Clown anemonefish DUPLICATION Clown anemonefish MODERN SPECIES 1086 ENSAOCG00000007756 pold4 (ENSAOCG00000007770) p2rx3b (ENSAOCG00000007795) ndufs8a (ENSAOCG00000000440) glrba (ENSAOCG00000007864) ENSAOCG00000007886 GRIA2 (ENSAOCG00000007977) ENSAOCG00000008026 ENSAOCG00000000458 #22 ENSAOCG00000008103 ##23 ENSAOCG00000000467 ENSAOCG00000000470 ENSAOCG00000000477 ENSAOCG00000008242 ENSAOCG00000008280 ##23 ENSAOCG00000008392 ##21 H4C5 (ENSAOCG00000008402) Clown anemonefish MODERN SPECIES 2841 ENSAOCG00000015954 ENSAOCG00000016042 histh1l1 (ENSAOCG00000016071) ##23 ENSAOCG00000016169 #22 calua (ENSAOCG00000002824) opn1sw1 (ENSAOCG00000001112) Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT01100000263569.a.b.a.b.a.a ENSGT01100000263504.a.b.b.b.b.y ENSGT01100000263559.A #22 ENSGT01100000263474.a.b.b.o.a.a.c.a ENSGT00950000183089.c.a.k.a #23 ENSGT00990000203553.c.a.a.b.a.a.a.a.b.n ENSGT01100000263504.a.b.b.b.a.a.bb.b ENSGT01100000263474.a.b.b.o.b.b ENSGT01100000263514.A.f.w.b ENSGT01020000230360.c.b.a.b.a.b.c.b.b.b ##21 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263559.A #22 Carangaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263559.A #22 Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263559.A #22 Seriola ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263559.A #22 Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 2962 ATP8A2 (ENSSLDG00000003891) SHISA2 (ENSSLDG00000003874) spice1 (ENSSLDG00000003858) boc (ENSSLDG00000003818) USF3 (ENSSLDG00000003795) naa50 (ENSSLDG00000003753) ATP6V1A (ENSSLDG00000003688) GRAMD1C (ENSSLDG00000003657) zdhhc23b (ENSSLDG00000003636) ccdc191 (ENSSLDG00000003578) qtrt2 (ENSSLDG00000003543) drd3 (ENSSLDG00000003527) ENSSLDG00000003496 ENSSLDG00000003226 ENSSLDG00000003017 ##21 ENSSLDG00000002986 #22 ENSSLDG00000002909 ENSSLDG00000002878 ENSSLDG00000002857 ##21 ENSSLDG00000002782 #23 ENSSLDG00000002715 ENSSLDG00000002536 ENSSLDG00000002431 ##21 ENSSLDG00000002350 ENSSLDG00000002286 ENSSLDG00000002265 #23 ENSSLDG00000002111 ##21 Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 47 ENSGT01100000263569.a.b.a.b.a.a ENSGT01100000263504.a.b.b.b.b.y ENSGT01100000263559.A #22 ENSGT01100000263474.a.b.b.o.a.a.c.a ENSGT00950000183089.c.a.k.a #23 ENSGT01100000263474.a.b.b.o.a.a.d ENSGT01060000248528.b ENSGT01100000263567.a.b.b ENSGT00990000203553.c.a.a.b.b.b Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 45 ENSGT01100000263559.A #22 ENSGT01100000263474.a.b.b.o.a.a.c.a ENSGT00950000183089.c.a.k.a #23 ENSGT01100000263474.a.b.b.o.a.a.d ENSGT01060000248528.b ENSGT01100000263567.a.b.b ENSGT00990000203553.c.a.a.b.b.b Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 44 ENSGT01100000263559.A #22 ENSGT01100000263474.a.b.b.o.a.a.c.a ENSGT00950000183089.c.a.k.a #23 ENSGT01100000263474.a.b.b.o.a.a.d ENSGT01060000248528.b ENSGT01100000263567.a.b.b ENSGT00990000203553.c.a.a.b.b.b Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT01100000263474.a.b.b.o.a.a.c.b.a ENSGT01100000263506.a.d ENSGT01100000263474.a.b.b.o.a.a.d ENSGT01060000248528.b ENSGT01100000263474.a.b.b.o.a.a.c.a ENSGT00950000183089.c.a.k.a #23 ENSGT01100000263559.A #22 ENSGT00550000075117.m.a ENSGT00940000163460.b ENSGT00390000000159 ENSGT00940000155858.f ENSGT00940000155159.C ENSGT00940000155004.s ENSGT00940000157864.a.a ENSGT00940000160755 ENSGT00390000015579.a.a.a ENSGT00940000159027 ENSGT00940000157287 ENSGT00390000017589 ENSGT00940000153578.A.f ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153759.a.b Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 135 ENSGT01100000263474.a.b.b.o.a.a.c.b.b ENSGT00950000183089.c.a.k.a #23 ENSGT01100000263559.A #22 European seabass MODERN SPECIES 20 ENSDLAG00005020069 ENSDLAG00005020239 ENSDLAG00005020523 ENSDLAG00005030147 ENSDLAG00005020533 ENSDLAG00005031944 ENSDLAG00005020618 ENSDLAG00005011310 ENSDLAG00005027683 ENSDLAG00005033228 ENSDLAG00005030474 ENSDLAG00005003701 ##21 ENSDLAG00005008327 #23 ENSDLAG00005026635 ENSDLAG00005029157 #23 ENSDLAG00005033675 #22 ENSDLAG00005028741 ENSDLAG00005006818 ENSDLAG00005029616 ENSDLAG00005033819 ENSDLAG00005027654 ENSDLAG00005034704 ENSDLAG00005020626 ENSDLAG00005020639 ENSDLAG00005021120 srp68 (ENSDLAG00005021131) evpla (ENSDLAG00005021372) ten1 (ENSDLAG00005034984) acox1 (ENSDLAG00005021462) RHBDF2 (ENSDLAG00005021517) aanat1 (ENSDLAG00005021664) Large yellow croaker DUPLICATION Large yellow croaker MODERN SPECIES 481 PKN1 (ENSLCRG00005010875) map2k7 (ENSLCRG00005010593) myh9a (ENSLCRG00005009088) ENSLCRG00005009062 #22 ENSLCRG00005009059 ##21 ENSLCRG00005009057 #23 ENSLCRG00005009044 ENSLCRG00005009042 ENSLCRG00005009041 ##21 ENSLCRG00005009040 ENSLCRG00005009039 ENSLCRG00005009038 ENSLCRG00005009034 ENSLCRG00005009033 ENSLCRG00005009032 #23 ENSLCRG00005009031 #22 ENSLCRG00005009029 ENSLCRG00005009028 ENSLCRG00005009023 ENSLCRG00005009020 ENSLCRG00005009018 ENSLCRG00005009016 DDX5 (ENSLCRG00005008160) POLG2 (ENSLCRG00005008140) srp68 (ENSLCRG00005007813) evpla (ENSLCRG00005007792) ten1 (ENSLCRG00005007788) acox1 (ENSLCRG00005004566) RHBDF2 (ENSLCRG00005003314) aanat1 (ENSLCRG00005003294) UBE2O (ENSLCRG00005002453) Large yellow croaker MODERN SPECIES 481 ENSLCRG00005009023 ENSLCRG00005009028 ENSLCRG00005009029 ENSLCRG00005009031 #22 ENSLCRG00005009032 #23 ENSLCRG00005009033 ENSLCRG00005009034 ENSLCRG00005009038 ENSLCRG00005009039 ENSLCRG00005009040 ENSLCRG00005009041 ##21 ENSLCRG00005009042 ENSLCRG00005009044 ENSLCRG00005009057 #23 ENSLCRG00005009059 ##21 ENSLCRG00005009062 #22 myh9a (ENSLCRG00005009088) map2k7 (ENSLCRG00005010593) PKN1 (ENSLCRG00005010875) si:ch211-214c7.5 (ENSLCRG00005011064) ENSLCRG00005011065 mcoln1a (ENSLCRG00005011086) trappc5 (ENSLCRG00005012967) pglyrp2 (ENSLCRG00005012973) ENSLCRG00005012974 ENSLCRG00005012975 ENSLCRG00005012976 g-lysozyme (ENSLCRG00005012977) ENSLCRG00005012978 EVI5L (ENSLCRG00005012983) DDX39A (ENSLCRG00005014382) Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 196 ENSGT01100000263569.a.b.a.b.a.a ENSGT01100000263504.a.b.b.b.b.y ENSGT01100000263559.A #22 ENSGT00950000183089.c.a.k.b.a.a ##23 ENSGT01100000263559.B.lf ##22 ENSGT01060000248528.b ENSGT01020000230360.c.b.a.a.a.a.b.a.a.a.b.b.c.a ##21 Tetraodon MODERN SPECIES 10 slc2a15b (ENSTNIG00000019369) lbx1b (ENSTNIG00000019368) cenpk (ENSTNIG00000000157) SMAP1 (ENSTNIG00000019367) ENSTNIG00000001746 KRT19 (ENSTNIG00000019366) ENSTNIG00000019365 nsmce1 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ENSTRUG00000002689 ##23 ENSTRUG00000032970 #22 ENSTRUG00000025869 ENSTRUG00000023039 ##23 H3C1 (ENSTRUG00000023777) slc24a2 (ENSTRUG00000015445) xpa (ENSTRUG00000027763) kpna7 (ENSTRUG00000015372) fgf20a (ENSTRUG00000015359) MICU3 (ENSTRUG00000015336) vps37a (ENSTRUG00000015286) nsmce1 (ENSTRUG00000015276) ENSTRUG00000015253 krt94 (ENSTRUG00000015114) SMAP1 (ENSTRUG00000015069) Fugu MODERN SPECIES 8 cenpk (ENSTRUG00000015014) nsmce4a (ENSTRUG00000015029) SMAP1 (ENSTRUG00000015069) krt94 (ENSTRUG00000015114) ENSTRUG00000015253 nsmce1 (ENSTRUG00000015276) vps37a (ENSTRUG00000015286) MICU3 (ENSTRUG00000015336) fgf20a (ENSTRUG00000015359) kpna7 (ENSTRUG00000015372) xpa (ENSTRUG00000027763) slc24a2 (ENSTRUG00000015445) H3C1 (ENSTRUG00000023777) ENSTRUG00000023039 ##23 ENSTRUG00000025869 ENSTRUG00000032970 #22 ENSTRUG00000002689 ##23 ENSTRUG00000027124 #22 ENSTRUG00000026986 ENSTRUG00000029643 ENSTRUG00000029122 ENSTRUG00000032916 ENSTRUG00000024593 ENSTRUG00000032531 ##21 ENSTRUG00000024579 ENSTRUG00000032950 ##22 ENSTRUG00000021312 ##21 ENSTRUG00000026851 ##23 ENSTRUG00000026537 ##22 ENSTRUG00000032005 ENSTRUG00000020802 Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 281 pappaa (ENSHCOG00000003050) znf618 (ENSHCOG00000003019) rgs3a (ENSHCOG00000002999) rabepk (ENSHCOG00000002992) hspa5 (ENSHCOG00000002983) ENSHCOG00000002970 ENSHCOG00000002963 ENSHCOG00000002950 dnm1a (ENSHCOG00000002942) ENSHCOG00000002919 bbln (ENSHCOG00000002909) surf2 (ENSHCOG00000002899) ENSHCOG00000002892 ##21 zgc:113984 (ENSHCOG00000002850) #22 ENSHCOG00000002801 ENSHCOG00000002757 ##23 ENSHCOG00000002733 ##21 ENSHCOG00000002722 ENSHCOG00000002708 ##23 ENSHCOG00000002699 ##21 CEL (ENSHCOG00000002697) grin1a (ENSHCOG00000002688) ENTPD2 (ENSHCOG00000002661) phpt1 (ENSHCOG00000002621) ENSHCOG00000002609 glulc (ENSHCOG00000002588) ARRDC1 (ENSHCOG00000002581) slc31a2 (ENSHCOG00000002571) NARS1 (ENSHCOG00000002552) Cod MODERN SPECIES 11 ENSGMOG00000011605 ENSGMOG00000011599 ENSGMOG00000022808 ENSGMOG00000033872 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