Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.b.a.b.a.b #22 Laurasiatheria_a DUPLICATION Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.b.a.b.a.b.ib #22 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.b.a.b.a.b.ib #22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.b.a.b.a.b.ib #22 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.b.a.b.a.b.ib #22 Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.b.a.b.a.b.ib #22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.b.a.b.a.b.ib #22 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.b.a.b.a.b.ib #22 Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.b.a.b.a.b.ib #22 Rambouillet Sheep DUPLICATION Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 2 ZACN (ENSOARG00020012158) #7 GALR2 (ENSOARG00020012118) #8 SRP68 (ENSOARG00020011952) #9 ENSOARG00020011593 #10 CDK3 (ENSOARG00020011491) #11 ENSOARG00020011444 #12 TEN1 (ENSOARG00020011418) #13 ACOX1 (ENSOARG00020011301) #14 MRPL38 (ENSOARG00020011228) #15 TRIM65 (ENSOARG00020011145) #16 FBF1 (ENSOARG00020010978) #17 TRIM47 (ENSOARG00020010837) #18 WBP2 (ENSOARG00020010630) #19 UNC13D (ENSOARG00020010518) #20 UNK (ENSOARG00020010345) #21 H3F3A (ENSOARG00020010273) #22 GALK1 (ENSOARG00020010209) #23 ITGB4 (ENSOARG00020009797) #24 SAP30BP (ENSOARG00020009689) #25 SMIM5 (ENSOARG00020009636) #26 RECQL5 (ENSOARG00020009478) #27 ENSOARG00020007814 #28 LLGL2 (ENSOARG00020007369) #29 TSEN54 (ENSOARG00020007255) #30 CASKIN2 (ENSOARG00020007127) #31 TMEM94 (ENSOARG00020006269) #32 GRB2 (ENSOARG00020006190) #33 SLC25A19 (ENSOARG00020006160) #34 MIF4GD (ENSOARG00020006079) #35 MRPS7 (ENSOARG00020006002) #36 GGA3 (ENSOARG00020005717) #37 Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 4 TLDC2 (ENSOARG00020007972) SOGA1 (ENSOARG00020007906) DSN1 (ENSOARG00020007612) NDRG3 (ENSOARG00020007088) SLA2 (ENSOARG00020006981) RAB5IF (ENSOARG00020006916) TGIF2 (ENSOARG00020006869) MYL9 (ENSOARG00020006826) DLGAP4 (ENSOARG00020006383) AAR2 (ENSOARG00020006319) EPB41L1 (ENSOARG00020005892) CNBD2 (ENSOARG00020005681) SCAND1 (ENSOARG00020005660) ATP5MD (ENSOARG00020005650) PHF20 (ENSOARG00020005596) ENSOARG00020005582 ##22 RBM39 (ENSOARG00020005497) ENSOARG00020005473 ROMO1 (ENSOARG00020005455) NFS1 (ENSOARG00020005227) CPNE1 (ENSOARG00020005144) SPAG4 (ENSOARG00020005086) ENSOARG00020005073 ENSOARG00020004424 ERGIC3 (ENSOARG00020004342) ENSOARG00020004304 ENSOARG00020004249 CEP250 (ENSOARG00020004083) ENSOARG00020004055 GDF5 (ENSOARG00020004033) UQCC1 (ENSOARG00020003944) Goat DUPLICATION Goat MODERN SPECIES 21 PCNX3 (ENSCHIG00000014153) MAP3K11 (ENSCHIG00000010206) KCNK7 (ENSCHIG00000019755) EHBP1L1 (ENSCHIG00000013648) FAM89B (ENSCHIG00000013562) ZNRD2 (ENSCHIG00000024780) LTBP3 (ENSCHIG00000023571) SCYL1 (ENSCHIG00000001421) FRMD8 (ENSCHIG00000013492) SLC25A45 (ENSCHIG00000015690) TIGD3 (ENSCHIG00000006241) DPF2 (ENSCHIG00000011852) CDC42EP2 (ENSCHIG00000010857) POLA2 (ENSCHIG00000021506) ENSCHIG00000018381 ENSCHIG00000008287 #22 CAPN1 (ENSCHIG00000022422) SPDYC (ENSCHIG00000008930) SYVN1 (ENSCHIG00000023946) ENSCHIG00000010487 ENSCHIG00000017446 MRPL49 (ENSCHIG00000013156) ZNHIT2 (ENSCHIG00000009990) TM7SF2 (ENSCHIG00000008956) VPS51 (ENSCHIG00000024782) ZFPL1 (ENSCHIG00000018515) ENSCHIG00000013142 NAALADL1 (ENSCHIG00000023747) SAC3D1 (ENSCHIG00000017675) SNX15 (ENSCHIG00000017487) ARL2 (ENSCHIG00000021231) Goat MODERN SPECIES 210 ENSCHIG00000014301 ENSCHIG00000000956 #22 Bovinae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000003420.b ENSGT00730000111899 ENSGT01030000234559.a.a.a ENSGT00950000183102.A.a ENSGT00940000159258 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000160384 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000163572 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000154662 ENSGT01100000263504.a.b.a.b.a.b.ib #22 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000162053 ENSGT00940000153487.b.a ENSGT00940000159261 ENSGT00940000160088 ENSGT01000000215054 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160050 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000159004 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159440 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000160191 ENSGT00940000154737.c Bos ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000003420.b ENSGT00730000111899 ENSGT01030000234559.a.a.a ENSGT00950000183102.A.a ENSGT00940000159258 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000160384 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000163572 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000154662 ENSGT01100000263504.a.b.a.b.a.b.ib #22 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000162053 ENSGT00940000153487.b.a ENSGT00940000159261 ENSGT00940000160088 ENSGT01000000215054 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160050 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000159004 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159440 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000160191 ENSGT00940000154737.c Bos_b ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000003420.b ENSGT00730000111899 ENSGT01030000234559.a.a.a ENSGT00950000183102.A.a ENSGT00940000159258 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000160384 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000163572 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000154662 ENSGT01100000263504.a.b.a.b.a.b.ib #22 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000162053 ENSGT00940000153487.b.a ENSGT00940000159261 ENSGT00940000160088 ENSGT01000000215054 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160050 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000159004 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159440 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000160191 ENSGT00940000154737.c Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 7 NVL (ENSBIXG00005028887) DEGS1 (ENSBIXG00005028737) CNIH4 (ENSBIXG00005002358) WDR26 (ENSBIXG00005002380) CNIH3 (ENSBIXG00005028617) DNAH14 (ENSBIXG00005004917) LBR (ENSBIXG00005028146) ENAH (ENSBIXG00005028092) SRP9 (ENSBIXG00005027974) EPHX1 (ENSBIXG00005027913) TMEM63A (ENSBIXG00005027791) ENSBIXG00005004759 PYCR2 (ENSBIXG00005004750) ENSBIXG00005027638 SDE2 (ENSBIXG00005027604) ENSBIXG00005027583 #22 ACBD3 (ENSBIXG00005027541) ENSBIXG00005027464 MIXL1 (ENSBIXG00005027457) LIN9 (ENSBIXG00005027424) PARP1 (ENSBIXG00005027371) ENSBIXG00005007774 ENSBIXG00005027292 ENSBIXG00005027257 ITPKB (ENSBIXG00005027239) PSEN2 (ENSBIXG00005004681) COQ8A (ENSBIXG00005027082) CDC42BPA (ENSBIXG00005026924) AHCTF1 (ENSBIXG00005026527) ENSBIXG00005026353 ENSBIXG00005004497 Cow DUPLICATION Cow MODERN SPECIES 26 GIPC3 (ENSBTAG00000050809) ENSBTAG00000053812 TBXA2R (ENSBTAG00000014944) CACTIN (ENSBTAG00000010373) PIP5K1C (ENSBTAG00000000710) TJP3 (ENSBTAG00000018342) APBA3 (ENSBTAG00000008395) MRPL54 (ENSBTAG00000008396) RAX2 (ENSBTAG00000009750) MATK (ENSBTAG00000006619) ZFR2 (ENSBTAG00000000755) ATCAY (ENSBTAG00000018375) NMRK2 (ENSBTAG00000031573) DAPK3 (ENSBTAG00000020417) EEF2 (ENSBTAG00000004258) ENSBTAG00000045914 #22 PIAS4 (ENSBTAG00000000753) ZBTB7A (ENSBTAG00000020117) MAP2K2 (ENSBTAG00000024450) CREB3L3 (ENSBTAG00000010215) SIRT6 (ENSBTAG00000019909) ENSBTAG00000052694 ENSBTAG00000054046 EBI3 (ENSBTAG00000012829) YJU2 (ENSBTAG00000012830) SHD (ENSBTAG00000039696) TMIGD2 (ENSBTAG00000004936) FSD1 (ENSBTAG00000005999) ENSBTAG00000054165 STAP2 (ENSBTAG00000006001) MPND (ENSBTAG00000006005) Cow MODERN SPECIES 7 DEGS1 (ENSBTAG00000012705) NVL (ENSBTAG00000006718) CNIH4 (ENSBTAG00000019471) WDR26 (ENSBTAG00000011785) CNIH3 (ENSBTAG00000053199) DNAH14 (ENSBTAG00000008449) LBR (ENSBTAG00000008453) ENAH (ENSBTAG00000016185) SRP9 (ENSBTAG00000033322) EPHX1 (ENSBTAG00000000140) TMEM63A (ENSBTAG00000002854) LEFTY2 (ENSBTAG00000055022) PYCR2 (ENSBTAG00000005835) ENSBTAG00000054752 SDE2 (ENSBTAG00000012787) H3-3A (ENSBTAG00000024561) #22 ACBD3 (ENSBTAG00000013128) MIXL1 (ENSBTAG00000002139) LIN9 (ENSBTAG00000033267) PARP1 (ENSBTAG00000000837) ENSBTAG00000047233 STUM (ENSBTAG00000024560) ENSBTAG00000033252 ITPKB (ENSBTAG00000053007) PSEN2 (ENSBTAG00000013197) COQ8A (ENSBTAG00000021880) CDC42BPA (ENSBTAG00000022777) AHCTF1 (ENSBTAG00000013949) ENSBTAG00000049714 SCCPDH (ENSBTAG00000003804) H3-3D (ENSBTAG00000011508) ##22 Bos_a ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000161213 ENSGT00390000003420.b ENSGT01030000234559.a.a.a ENSGT00950000183102.A.a ENSGT00940000159258 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000160384 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000163572 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000154662 ENSGT01100000263504.a.b.a.b.a.b.ib #22 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000162053 ENSGT00940000153487.b.a ENSGT00940000159261 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160050 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000159004 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159440 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000160191 ENSGT00940000154737.c ENSGT00440000034888 Domestic yak MODERN SPECIES 27 HMG20B (ENSBGRG00000021064) GIPC3 (ENSBGRG00000021004) TBXA2R (ENSBGRG00000020972) CACTIN (ENSBGRG00000020942) PIP5K1C (ENSBGRG00000020521) TJP3 (ENSBGRG00000019950) APBA3 (ENSBGRG00000019857) MRPL54 (ENSBGRG00000019811) RAX2 (ENSBGRG00000019785) 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HMG20B (ENSBBBG00000023190) GIPC3 (ENSBBBG00000000334) TBXA2R (ENSBBBG00000000372) CACTIN (ENSBBBG00000000388) PIP5K1C (ENSBBBG00000000451) TJP3 (ENSBBBG00000023169) APBA3 (ENSBBBG00000006868) MRPL54 (ENSBBBG00000023057) RAX2 (ENSBBBG00000008182) MATK (ENSBBBG00000023026) ENSBBBG00000023003 ATCAY (ENSBBBG00000022991) ENSBBBG00000006028 DAPK3 (ENSBBBG00000022951) EEF2 (ENSBBBG00000022915) ENSBBBG00000022877 #22 PIAS4 (ENSBBBG00000022869) ZBTB7A (ENSBBBG00000022852) MAP2K2 (ENSBBBG00000022851) CREB3L3 (ENSBBBG00000022831) SIRT6 (ENSBBBG00000022808) ENSBBBG00000008311 EBI3 (ENSBBBG00000022773) YJU2 (ENSBBBG00000022764) SHD (ENSBBBG00000022746) TMIGD2 (ENSBBBG00000022717) FSD1 (ENSBBBG00000022701) STAP2 (ENSBBBG00000008960) MPND (ENSBBBG00000022616) SH3GL1 (ENSBBBG00000022500) CHAF1A (ENSBBBG00000022444) American bison MODERN SPECIES 3054 ENSBBBG00000000689 #22 VSTM2A (ENSBBBG00000000659) Siberian musk deer DUPLICATION Siberian musk deer DUPLICATION Siberian musk deer MODERN SPECIES 243 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23 ENSGT00390000002970 ENSGT00390000013448.a.a ENSGT00570000079239 ENSGT00950000182834.B ENSGT00940000153634.b ENSGT00950000182834.A.a.b.c ENSGT00940000160505 ENSGT00390000000417.a.a.b.a.b ENSGT00940000157376.tb.a ENSGT00390000018505.b ENSGT00390000002210.d ENSGT00940000159576 ENSGT00950000183044.a.a.a.c ENSGT00390000010056 ENSGT00530000063402.b ENSGT01100000263504.a.b.a.b.a.b.ib #22 ENSGT00530000063651.a ENSGT00940000162190 ENSGT00390000003188 ENSGT00940000156058 ENSGT00390000008003 ENSGT00940000156764.a ENSGT00940000157923 ENSGT00940000156810 ENSGT01030000234517.H.b ENSGT00390000018900 ENSGT00940000163104 ENSGT00390000004799 ENSGT00390000005861 ENSGT00950000183142.a.b.a.b ENSGT00940000156766 Blue whale DUPLICATION Blue whale MODERN SPECIES 12 CDC27 (ENSBMSG00010018547) KANSL1 (ENSBMSG00010018746) ENSBMSG00010019109 SPPL2C (ENSBMSG00010019321) CRHR1 (ENSBMSG00010019636) ENSBMSG00010020964 NSF (ENSBMSG00010021007) WNT3 (ENSBMSG00010021104) WNT9B (ENSBMSG00010021124) GOSR2 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ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 ENSGT00550000074845 ENSGT00950000182865.b.a.a ENSGT00950000183024.a.b.a ENSGT00940000160678.a ENSGT00940000154563.m.b ENSGT01100000263504.a.b.a.b.a.b.ib #22 ENSGT00940000155573 ENSGT00940000156499 ENSGT01030000234551.k.d.b.a.a.a.b.b.b ENSGT01030000234551.k.d.b.a.a.a.a ENSGT01030000234551.k.d.b.a.a.a.b.a ENSGT01030000234551.k.d.b.a.a.b ENSGT01000000214889 ENSGT00390000000337 ENSGT00940000161993.a ENSGT00940000162110 ENSGT00940000161519 ENSGT00940000160923 ENSGT00940000160206 ENSGT00940000159445 ENSGT00950000182966.C.b Vaquita MODERN SPECIES 11 ENSPSNG00000017433 NUBPL (ENSPSNG00000017395) DTD2 (ENSPSNG00000017275) HEATR5A (ENSPSNG00000017090) HECTD1 (ENSPSNG00000016911) AP4S1 (ENSPSNG00000016811) STRN3 (ENSPSNG00000016653) COCH (ENSPSNG00000016321) ENSPSNG00000016285 SCFD1 (ENSPSNG00000016119) G2E3 (ENSPSNG00000015993) PRKD1 (ENSPSNG00000015859) FOXG1 (ENSPSNG00000015806) ENSPSNG00000015766 ENSPSNG00000015742 ENSPSNG00000015685 #22 NOVA1 (ENSPSNG00000015532) STXBP6 (ENSPSNG00000015449) GZMB (ENSPSNG00000015289) ENSPSNG00000015017 GZMH (ENSPSNG00000014903) ENSPSNG00000014784 ENSPSNG00000014761 ENSPSNG00000014746 ENSPSNG00000014555 ENSPSNG00000014424 KHNYN (ENSPSNG00000014301) CBLN3 (ENSPSNG00000014168) NYNRIN (ENSPSNG00000014032) NFATC4 (ENSPSNG00000013549) ADCY4 (ENSPSNG00000013215) Monodontidae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00910000147163 ENSGT00950000183193.B ENSGT01020000230438.B.b.b.a ENSGT00940000153431.a ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 ENSGT00550000074845 ENSGT00950000182865.b.a.a ENSGT00950000183024.a.b.a ENSGT00940000160678.a ENSGT00940000154563.m.b ENSGT01100000263504.a.b.a.b.a.b.ib #22 ENSGT00940000155573 ENSGT00940000156499 ENSGT01030000234551.k.d.b.a.a.a.b.b.b ENSGT01030000234551.k.d.b.a.a.a.a ENSGT01030000234551.k.d.b.a.a.a.b.a ENSGT01030000234551.k.d.b.a.a.b ENSGT01100000263511.b.a.a.a.b.a.a.a.b.a.b.a.a.b.a.a.a.a.b.a Beluga whale DUPLICATION Beluga whale MODERN SPECIES 44 ARHGAP5 (ENSDLEG00000012779) ENSDLEG00000012791 NUBPL (ENSDLEG00000013432) GPR33 (ENSDLEG00000013450) DTD2 (ENSDLEG00000013452) HEATR5A (ENSDLEG00000013600) HECTD1 (ENSDLEG00000015830) AP4S1 (ENSDLEG00000015895) STRN3 (ENSDLEG00000015905) COCH (ENSDLEG00000015954) SCFD1 (ENSDLEG00000016160) G2E3 (ENSDLEG00000017592) PRKD1 (ENSDLEG00000017654) FOXG1 (ENSDLEG00000017768) ENSDLEG00000017774 ENSDLEG00000017806 #22 NOVA1 (ENSDLEG00000017821) STXBP6 (ENSDLEG00000017850) GZMB (ENSDLEG00000017882) ENSDLEG00000017935 GZMH (ENSDLEG00000018044) ENSDLEG00000018087 ENSDLEG00000018089 CMA1 (ENSDLEG00000018102) SDR39U1 (ENSDLEG00000018121) ENSDLEG00000018130 ENSDLEG00000018139 CBLN3 (ENSDLEG00000018158) NYNRIN (ENSDLEG00000018176) NFATC4 (ENSDLEG00000018182) ENSDLEG00000018197 Beluga whale MODERN SPECIES 42 ARHGAP25 (ENSDLEG00000005744) ENSDLEG00000005710 BMP10 (ENSDLEG00000005697) ENSDLEG00000005689 GKN2 (ENSDLEG00000005673) GKN1 (ENSDLEG00000005657) ANTXR1 (ENSDLEG00000005620) GFPT1 (ENSDLEG00000005570) NFU1 (ENSDLEG00000005546) ENSDLEG00000005538 AAK1 (ENSDLEG00000005437) ANXA4 (ENSDLEG00000005419) GMCL1 (ENSDLEG00000005398) SNRNP27 (ENSDLEG00000005387) MXD1 (ENSDLEG00000005379) ENSDLEG00000005374 #22 PCBP1 (ENSDLEG00000005372) ENSDLEG00000005367 CUNH2orf42 (ENSDLEG00000005359) ENSDLEG00000005347 PCYOX1 (ENSDLEG00000005335) SNRPG (ENSDLEG00000005308) ENSDLEG00000005295 TGFA (ENSDLEG00000005282) ADD2 (ENSDLEG00000005235) FIGLA (ENSDLEG00000005189) CLEC4F (ENSDLEG00000005176) CD207 (ENSDLEG00000005170) VAX2 (ENSDLEG00000005165) ATP6V1B1 (ENSDLEG00000005137) ANKRD53 (ENSDLEG00000005126) Narwhal DUPLICATION Narwhal MODERN SPECIES 308 ENSMMNG00015018891 NUBPL (ENSMMNG00015018841) GPR33 (ENSMMNG00015018815) DTD2 (ENSMMNG00015018797) HEATR5A (ENSMMNG00015018679) HECTD1 (ENSMMNG00015018463) AP4S1 (ENSMMNG00015018404) STRN3 (ENSMMNG00015018258) COCH (ENSMMNG00015018104) ENSMMNG00015018060 SCFD1 (ENSMMNG00015017990) G2E3 (ENSMMNG00015017922) PRKD1 (ENSMMNG00015017800) FOXG1 (ENSMMNG00015017758) ENSMMNG00015017733 ENSMMNG00015017696 #22 NOVA1 (ENSMMNG00015017472) STXBP6 (ENSMMNG00015017391) GZMB (ENSMMNG00015017321) ENSMMNG00015017165 GZMH (ENSMMNG00015017095) ENSMMNG00015017063 ENSMMNG00015016597 ENSMMNG00015016445 ENSMMNG00015016428 CMA1 (ENSMMNG00015016383) ENSMMNG00015016329 ENSMMNG00015016268 CBLN3 (ENSMMNG00015016201) NYNRIN (ENSMMNG00015016108) NFATC4 (ENSMMNG00015015977) Narwhal MODERN SPECIES 305 PROKR1 (ENSMMNG00015015283) ARHGAP25 (ENSMMNG00015015108) BMP10 (ENSMMNG00015015084) ENSMMNG00015015070 GKN2 (ENSMMNG00015015048) GKN1 (ENSMMNG00015015029) ANTXR1 (ENSMMNG00015015005) GFPT1 (ENSMMNG00015014974) NFU1 (ENSMMNG00015014943) ENSMMNG00015014934 AAK1 (ENSMMNG00015014881) ANXA4 (ENSMMNG00015014849) ENSMMNG00015014824 ENSMMNG00015014799 MXD1 (ENSMMNG00015014776) ENSMMNG00015014724 #22 PCBP1 (ENSMMNG00015014717) ENSMMNG00015014704 C2orf42 (ENSMMNG00015014664) ENSMMNG00015014614 PCYOX1 (ENSMMNG00015014565) ENSMMNG00015014552 ENSMMNG00015014529 TGFA (ENSMMNG00015014512) ADD2 (ENSMMNG00015014473) FIGLA (ENSMMNG00015014439) CLEC4F (ENSMMNG00015014409) CD207 (ENSMMNG00015014384) VAX2 (ENSMMNG00015014367) ATP6V1B1 (ENSMMNG00015014343) ANKRD53 (ENSMMNG00015014327) Narwhal MODERN SPECIES 304 ENSMMNG00015008235 DEGS1 (ENSMMNG00015008254) NVL (ENSMMNG00015008286) CNIH4 (ENSMMNG00015008342) WDR26 (ENSMMNG00015008361) CNIH3 (ENSMMNG00015008371) LBR (ENSMMNG00015008386) ENSMMNG00015008420 SRP9 (ENSMMNG00015008443) EPHX1 (ENSMMNG00015008464) TMEM63A (ENSMMNG00015008488) ENSMMNG00015008515 PYCR2 (ENSMMNG00015008531) ENSMMNG00015008553 SDE2 (ENSMMNG00015008574) ENSMMNG00015008586 #22 ACBD3 (ENSMMNG00015008597) MIXL1 (ENSMMNG00015008612) LIN9 (ENSMMNG00015008632) PARP1 (ENSMMNG00015008660) STUM (ENSMMNG00015008698) ITPKB (ENSMMNG00015000098) PSEN2 (ENSMMNG00015000131) COQ8A (ENSMMNG00015000182) CDC42BPA (ENSMMNG00015000504) ENSMMNG00015001190 AHCTF1 (ENSMMNG00015001241) ENSMMNG00015001366 SCCPDH (ENSMMNG00015001432) CNST (ENSMMNG00015001499) TFB2M (ENSMMNG00015001555) Suina ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.b.a.b.a.b.ib #22 Pig MODERN SPECIES 17 OR2D2 (ENSSSCG00000031270) OR10A4 (ENSSSCG00000014602) ENSSSCG00000039077 ENSSSCG00000058386 OR6A2 (ENSSSCG00000014617) ENSSSCG00000061291 ENSSSCG00000059395 ENSSSCG00000014608 ENSSSCG00000014605 ENSSSCG00000043559 ENSSSCG00000062060 ENSSSCG00000057645 ENSSSCG00000055916 ENSSSCG00000057155 ENSSSCG00000052518 ENSSSCG00000053780 #22 ENSSSCG00000033089 ENSSSCG00000058696 ENSSSCG00000061858 ENSSSCG00000014618 MRPL17 (ENSSSCG00000024693) DCHS1 (ENSSSCG00000029189) TPP1 (ENSSSCG00000023080) TAF10 (ENSSSCG00000029630) ILK (ENSSSCG00000023272) RRP8 (ENSSSCG00000023880) ENSSSCG00000039799 ENSSSCG00000045625 TIMM10B (ENSSSCG00000037299) ARFIP2 (ENSSSCG00000014625) TRIM3 (ENSSSCG00000059302) Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.b.a.b.a.b.ib #22 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.b.a.b.a.b.ib #22 Equus ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.b.a.b.a.b.ib #22 Horse MODERN SPECIES 2 NUFIP2 (ENSECAG00000004975) MYO18A (ENSECAG00000020855) PIPOX (ENSECAG00000020327) SEZ6 (ENSECAG00000017142) PHF12 (ENSECAG00000016493) DHRS13 (ENSECAG00000014655) FLOT2 (ENSECAG00000012055) ERAL1 (ENSECAG00000013325) FAM222B (ENSECAG00000012016) TRAF4 (ENSECAG00000011568) NEK8 (ENSECAG00000009500) ENSECAG00000008928 TLCD1 (ENSECAG00000009427) PROCA1 (ENSECAG00000007184) SUPT6H (ENSECAG00000020521) ENSECAG00000051975 #22 KIAA0100 (ENSECAG00000017711) RSKR (ENSECAG00000017356) SPAG5 (ENSECAG00000015456) ALDOC (ENSECAG00000013037) UNC119 (ENSECAG00000011487) SLC13A2 (ENSECAG00000008304) SLC46A1 (ENSECAG00000006826) SARM1 (ENSECAG00000004020) VTN (ENSECAG00000015904) SEBOX (ENSECAG00000015882) TMEM199 (ENSECAG00000015855) POLDIP2 (ENSECAG00000014272) TNFAIP1 (ENSECAG00000012727) TMEM97 (ENSECAG00000012404) IFT20 (ENSECAG00000009950) Chiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.b.a.b.a.b.ib #22 Megabat MODERN SPECIES 2385 ENSPVAG00000014903 #22 ACP5 (ENSPVAG00000014902) ELOF1 (ENSPVAG00000014901) CNN1 (ENSPVAG00000014900) ECSIT (ENSPVAG00000014898) ZNF653 (ENSPVAG00000014895) ELAVL3 (ENSPVAG00000014893) PRKCSH (ENSPVAG00000014889) ODAD3 (ENSPVAG00000014886) RGL3 (ENSPVAG00000014884) EPOR (ENSPVAG00000014883) SWSAP1 (ENSPVAG00000014882) Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.b.a.b.a.b.ib #22 Greater horseshoe bat DUPLICATION Greater horseshoe bat DUPLICATION Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 22 RB1 (ENSRFEG00010000766) RCBTB2 (ENSRFEG00010000664) CYSLTR2 (ENSRFEG00010000615) ENSRFEG00010000603 FNDC3A (ENSRFEG00010000465) MLNR (ENSRFEG00010000358) CDADC1 (ENSRFEG00010000313) CAB39L (ENSRFEG00010000253) SETDB2 (ENSRFEG00010020537) PHF11 (ENSRFEG00010020499) RCBTB1 (ENSRFEG00010020444) ARL11 (ENSRFEG00010020430) ENSRFEG00010020394 KPNA3 (ENSRFEG00010020282) SPRYD7 (ENSRFEG00010020230) ENSRFEG00010020217 #22 TRIM13 (ENSRFEG00010020213) KCNRG (ENSRFEG00010020187) DLEU7 (ENSRFEG00010020159) RNASEH2B (ENSRFEG00010020021) C13orf42 (ENSRFEG00010019956) FAM124A (ENSRFEG00010019925) INTS6 (ENSRFEG00010019695) WDFY2 (ENSRFEG00010019666) ATP7B (ENSRFEG00010019450) ALG11 (ENSRFEG00010019348) NEK5 (ENSRFEG00010018995) NEK3 (ENSRFEG00010018905) ENSRFEG00010018646 VPS36 (ENSRFEG00010018568) THSD1 (ENSRFEG00010018507) Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 24 EFCAB11 (ENSRFEG00010009733) FOXN3 (ENSRFEG00010009812) TTC8 (ENSRFEG00010009898) EML5 (ENSRFEG00010010199) ZC3H14 (ENSRFEG00010010356) PTPN21 (ENSRFEG00010010878) SPATA7 (ENSRFEG00010010944) ENSRFEG00010011077 KCNK10 (ENSRFEG00010011135) ENSRFEG00010011219 GPR65 (ENSRFEG00010011274) GALC (ENSRFEG00010011294) ENSRFEG00010011765 FLRT2 (ENSRFEG00010011812) ENSRFEG00010011830 ENSRFEG00010011871 #22 SEL1L (ENSRFEG00010011889) STON2 (ENSRFEG00010011966) ENSRFEG00010011999 GTF2A1 (ENSRFEG00010012049) TSHR (ENSRFEG00010012154) CEP128 (ENSRFEG00010012759) ENSRFEG00010012930 NRXN3 (ENSRFEG00010013015) ENSRFEG00010014071 ENSRFEG00010014112 ENSRFEG00010014135 ENSRFEG00010014210 ENSRFEG00010014256 ADCK1 (ENSRFEG00010014308) ENSRFEG00010014422 Greater horseshoe bat DUPLICATION Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 2 CFAP68 (ENSRFEG00010012325) ALG9 (ENSRFEG00010012163) PPP2R1B (ENSRFEG00010011926) SIK2 (ENSRFEG00010011852) LAYN (ENSRFEG00010011444) HOATZ (ENSRFEG00010011320) BTG4 (ENSRFEG00010011226) POU2AF1 (ENSRFEG00010011189) POU2AF3 (ENSRFEG00010011079) POU2AF2 (ENSRFEG00010011003) ARHGAP20 (ENSRFEG00010010551) ENSRFEG00010010451 RDX (ENSRFEG00010010314) ZC3H12C (ENSRFEG00010010192) C11orf87 (ENSRFEG00010010156) ENSRFEG00010010141 #22 DDX10 (ENSRFEG00010010069) ACAT1 (ENSRFEG00010010049) NPAT (ENSRFEG00010009984) ENSRFEG00010009954 ATM (ENSRFEG00010009837) C11orf65 (ENSRFEG00010009749) POGLUT3 (ENSRFEG00010009660) EXPH5 (ENSRFEG00010009629) CUL5 (ENSRFEG00010009566) RAB39A (ENSRFEG00010009515) SLC35F2 (ENSRFEG00010009447) ENSRFEG00010009424 ELMOD1 (ENSRFEG00010009290) ALKBH8 (ENSRFEG00010009220) CWF19L2 (ENSRFEG00010009178) Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 13 EXOC7 (ENSRFEG00010013084) ZACN (ENSRFEG00010012899) #7 GALR2 (ENSRFEG00010012876) #8 SRP68 (ENSRFEG00010012745) #9 ENSRFEG00010012619 #10 CDK3 (ENSRFEG00010012596) #11 TEN1 (ENSRFEG00010012500) #13 ACOX1 (ENSRFEG00010012060) #14 FBF1 (ENSRFEG00010010985) #17 MRPL38 (ENSRFEG00010010908) #15 TRIM65 (ENSRFEG00010010806) #16 TRIM47 (ENSRFEG00010010689) #18 WBP2 (ENSRFEG00010010485) #19 UNC13D (ENSRFEG00010016420) #20 UNK (ENSRFEG00010016271) #21 ENSRFEG00010016176 #22 GALK1 (ENSRFEG00010016104) #23 ITGB4 (ENSRFEG00010015927) #24 ENSRFEG00010015848 SAP30BP (ENSRFEG00010015732) #25 SMIM5 (ENSRFEG00010015623) #26 RECQL5 (ENSRFEG00010015234) #27 ENSRFEG00010013837 LLGL2 (ENSRFEG00010013729) #29 TSEN54 (ENSRFEG00010013644) #30 CASKIN2 (ENSRFEG00010013505) #31 TMEM94 (ENSRFEG00010013061) #32 GRB2 (ENSRFEG00010012913) #33 SLC25A19 (ENSRFEG00010012851) #34 MIF4GD (ENSRFEG00010012677) #35 ENSRFEG00010012535 #36 Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.b.a.b.a.b.ib #22 Felidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.b.a.b.a.b.ib #22 Panthera ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000154427.A ENSGT01100000263540.A.b ENSGT00390000015152 ENSGT00940000159998 ENSGT00940000158098 ENSGT00940000156793 ENSGT00940000157459 ENSGT01030000234522.C.b.e.b.a.a.a ENSGT00390000016904 ENSGT01010000222336.a.a.a.pb ENSGT01010000222336.a.a.a.ob.b ENSGT01010000222336.a.a.a.ob.a.b ENSGT01010000222336.a.a.a.ob.a.a ENSGT00390000000083.a ENSGT00390000013207 ENSGT01100000263504.a.b.a.b.a.b.ib #22 ENSGT00940000156005.f ENSGT00940000156891 ENSGT00940000158751 ENSGT00730000111019 ENSGT00390000016097 ENSGT00390000009546 ENSGT00940000159153 ENSGT00940000157159 ENSGT00950000183779 ENSGT00940000155944 ENSGT00940000157417 ENSGT00940000158243 ENSGT00940000161472 ENSGT00390000017666 ENSGT00940000161067 Tiger MODERN SPECIES 490 VSX2 (ENSPTIG00000016197) LIN52 (ENSPTIG00000016204) ALDH6A1 (ENSPTIG00000016228) BBOF1 (ENSPTIG00000016264) ENTPD5 (ENSPTIG00000016301) COQ6 (ENSPTIG00000016344) FAM161B (ENSPTIG00000016429) ZNF410 (ENSPTIG00000016457) PTGR2 (ENSPTIG00000016591) MIDEAS (ENSPTIG00000016612) PNMA1 (ENSPTIG00000006614) DNAL1 (ENSPTIG00000016650) ENSPTIG00000016670 ENSPTIG00000016688 HEATR4 (ENSPTIG00000016707) ENSPTIG00000006627 #22 NUMB (ENSPTIG00000017010) PAPLN (ENSPTIG00000017131) PSEN1 (ENSPTIG00000017262) RBM25 (ENSPTIG00000017309) ZFYVE1 (ENSPTIG00000017344) ENSPTIG00000017388 DPF3 (ENSPTIG00000017482) RGS6 (ENSPTIG00000017631) SIPA1L1 (ENSPTIG00000017821) PCNX1 (ENSPTIG00000017962) MAP3K9 (ENSPTIG00000018191) MED6 (ENSPTIG00000018243) ENSPTIG00000018360 ENSPTIG00000018363 SYNJ2BP (ENSPTIG00000018377) Panthera_a ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000154427.A ENSGT01100000263540.A.b ENSGT00390000015152 ENSGT00940000159998 ENSGT00940000158098 ENSGT00940000156793 ENSGT00940000157459 ENSGT01030000234522.C.b.e.b.a.a.a ENSGT00390000016904 ENSGT01010000222336.a.a.a.pb ENSGT01010000222336.a.a.a.ob.b ENSGT01010000222336.a.a.a.ob.a.b ENSGT01010000222336.a.a.a.ob.a.a ENSGT00390000000083.a ENSGT00390000013207 ENSGT01100000263504.a.b.a.b.a.b.ib #22 ENSGT00940000156005.f ENSGT00940000156891 ENSGT00940000158751 ENSGT00730000111019 ENSGT00390000016097 ENSGT00390000009546 ENSGT00940000159153 ENSGT00940000157159 ENSGT00950000183779 ENSGT00940000155944 ENSGT00940000157417 ENSGT00940000158243 ENSGT00940000161472 ENSGT00390000017666 ENSGT00940000161067 leopard MODERN SPECIES 109 ALDH6A1 (ENSPPRG00000016252) BBOF1 (ENSPPRG00000018080) ENTPD5 (ENSPPRG00000021643) COQ6 (ENSPPRG00000025059) FAM161B (ENSPPRG00000025014) ZNF410 (ENSPPRG00000024973) PTGR2 (ENSPPRG00000024906) MIDEAS (ENSPPRG00000024652) PNMA1 (ENSPPRG00000020738) DNAL1 (ENSPPRG00000024432) ENSPPRG00000024290 ACOT4 (ENSPPRG00000024125) ENSPPRG00000024078 RIOX1 (ENSPPRG00000024007) HEATR4 (ENSPPRG00000000114) ENSPPRG00000020804 #22 NUMB (ENSPPRG00000004643) PAPLN (ENSPPRG00000008382) PSEN1 (ENSPPRG00000009940) RBM25 (ENSPPRG00000017374) ZFYVE1 (ENSPPRG00000024613) ENSPPRG00000000080 lion MODERN SPECIES 6 BBOF1 (ENSPLOG00000001180) ENTPD5 (ENSPLOG00000001145) COQ6 (ENSPLOG00000001111) FAM161B (ENSPLOG00000001079) ZNF410 (ENSPLOG00000001034) PTGR2 (ENSPLOG00000000929) MIDEAS (ENSPLOG00000000882) PNMA1 (ENSPLOG00000000861) DNAL1 (ENSPLOG00000000836) ENSPLOG00000000753 ACOT6 (ENSPLOG00000000692) ACOT4 (ENSPLOG00000000671) ENSPLOG00000000646 RIOX1 (ENSPLOG00000000634) ENSPLOG00000000621 ENSPLOG00000000607 #22 ENSPLOG00000000547 PAPLN (ENSPLOG00000000483) PSEN1 (ENSPLOG00000019082) RBM25 (ENSPLOG00000019022) ZFYVE1 (ENSPLOG00000018965) ENSPLOG00000018852 DPF3 (ENSPLOG00000018551) RGS6 (ENSPLOG00000018169) ENSPLOG00000018078 SIPA1L1 (ENSPLOG00000017972) PCNX1 (ENSPLOG00000017454) MAP3K9 (ENSPLOG00000017344) TTC9 (ENSPLOG00000017301) MED6 (ENSPLOG00000017203) ADAM20 (ENSPLOG00000017171) Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.b.a.b.a.b.ib #22 Canidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.b.a.b.a.b.ib #22 Red fox MODERN SPECIES 44 CIITA (ENSVVUG00000017857) CLEC16A (ENSVVUG00000017880) SOCS1 (ENSVVUG00000017915) ENSVVUG00000017918 ENSVVUG00000017923 ENSVVUG00000017927 LITAF (ENSVVUG00000017969) SNN (ENSVVUG00000017985) TXNDC11 (ENSVVUG00000018015) ZC3H7A (ENSVVUG00000018163) RSL1D1 (ENSVVUG00000018170) GSPT1 (ENSVVUG00000018198) TNFRSF17 (ENSVVUG00000019344) ENSVVUG00000019349 SNX29 (ENSVVUG00000019366) ENSVVUG00000019436 #22 CPPED1 (ENSVVUG00000019438) ENSVVUG00000019440 ENSVVUG00000019443 ENSVVUG00000019446 ERCC4 (ENSVVUG00000019453) MRTFB (ENSVVUG00000019462) PARN (ENSVVUG00000019509) BFAR (ENSVVUG00000019515) PLA2G10 (ENSVVUG00000019519) ENSVVUG00000019523 RRN3 (ENSVVUG00000019527) NTAN1 (ENSVVUG00000019538) PDXDC1 (ENSVVUG00000019544) MPV17L (ENSVVUG00000019567) ENSVVUG00000019570 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182938.b.b.b.b.b.b ENSGT00940000162144 ENSGT00940000154470.a ENSGT00390000015600.c.b ENSGT00530000063340 ENSGT00940000154437 ENSGT00390000018044.b.a ENSGT00940000160524 ENSGT00940000156873 ENSGT00940000158002 ENSGT01030000234618.E ENSGT00390000016258 ENSGT00950000183103.d.a.b ENSGT01030000234535.E ENSGT00940000155301 ENSGT01100000263504.a.b.a.b.a.b.ib #22 ENSGT00940000156170 ENSGT00940000159129 ENSGT00950000183065.C ENSGT00940000157449 ENSGT00730000111785 ENSGT00390000008823 ENSGT00940000161788 ENSGT00940000159487 ENSGT00950000183005.a.b ENSGT00940000158867 ENSGT00940000153112.D.h.b ENSGT00940000160973 ENSGT00940000157435 ENSGT00730000111224 ENSGT00950000183134.c.b Dog MODERN SPECIES CPLX4 (ENSCAFG00845000529) RAX (ENSCAFG00845000544) GRP (ENSCAFG00845000570) SEC11C (ENSCAFG00845000586) OACYL (ENSCAFG00845000613) ZNF532 (ENSCAFG00845000673) MALT1 (ENSCAFG00845000742) ALPK2 (ENSCAFG00845000830) NEDD4L (ENSCAFG00845001211) ATP8B1 (ENSCAFG00845001746) NARS1 (ENSCAFG00845001801) FECH (ENSCAFG00845001850) ONECUT2 (ENSCAFG00845001888) ST8SIA3 (ENSCAFG00845001921) WDR7 (ENSCAFG00845002062) ENSCAFG00845002237 #22 TXNL1 (ENSCAFG00845002269) TCF4 (ENSCAFG00845002403) CCDC68 (ENSCAFG00845002566) RAB27B (ENSCAFG00845002581) ENSCAFG00845002605 CUPIN1 (ENSCAFG00845002731) STARD6 (ENSCAFG00845002868) POLI (ENSCAFG00845002887) MBD2 (ENSCAFG00845002942) ENSCAFG00845002966 DCC (ENSCAFG00845003053) ENSCAFG00845003189 MEX3C (ENSCAFG00845003206) SMAD4 (ENSCAFG00845003229) SMAD4 (ENSCAFG00845003249) Dingo DUPLICATION Dingo MODERN SPECIES 125 CPLX4 (ENSCAFG00020020089) RAX (ENSCAFG00020020090) GRP (ENSCAFG00020020093) SEC11C (ENSCAFG00020020098) ENSCAFG00020020107 ZNF532 (ENSCAFG00020020115) MALT1 (ENSCAFG00020020119) ALPK2 (ENSCAFG00020020128) NEDD4L (ENSCAFG00020020172) ATP8B1 (ENSCAFG00020020470) NARS1 (ENSCAFG00020021055) FECH (ENSCAFG00020021062) ONECUT2 (ENSCAFG00020021090) ST8SIA3 (ENSCAFG00020021095) WDR7 (ENSCAFG00020021129) ENSCAFG00020021173 #22 TXNL1 (ENSCAFG00020021181) ENSCAFG00020021197 ENSCAFG00020021285 CCDC68 (ENSCAFG00020021589) RAB27B (ENSCAFG00020021594) ENSCAFG00020021601 ENSCAFG00020021603 C18orf54 (ENSCAFG00020021611) STARD6 (ENSCAFG00020021613) ENSCAFG00020021615 POLI (ENSCAFG00020021618) MBD2 (ENSCAFG00020021622) DCC (ENSCAFG00020021641) ENSCAFG00020021658 MEX3C (ENSCAFG00020021673) Dingo MODERN SPECIES 271 ENSCAFG00020001153 ENSCAFG00020001167 AHCTF1 (ENSCAFG00020001201) ENSCAFG00020001339 ENSCAFG00020001351 CDC42BPA (ENSCAFG00020001364) COQ8A (ENSCAFG00020001368) PSEN2 (ENSCAFG00020001399) ITPKB (ENSCAFG00020001406) STUM (ENSCAFG00020001421) PARP1 (ENSCAFG00020001660) LIN9 (ENSCAFG00020003192) ENSCAFG00020003200 ENSCAFG00020003202 ACBD3 (ENSCAFG00020003210) ENSCAFG00020003228 #22 SDE2 (ENSCAFG00020003247) ENSCAFG00020003248 PYCR2 (ENSCAFG00020003264) TMEM63A (ENSCAFG00020003274) EPHX1 (ENSCAFG00020003279) SRP9 (ENSCAFG00020003285) ENAH (ENSCAFG00020003296) LBR (ENSCAFG00020003321) ENSCAFG00020003326 ENSCAFG00020003333 ENSCAFG00020003357 ENSCAFG00020003361 ENSCAFG00020003365 CNIH3 (ENSCAFG00020003397) WDR26 (ENSCAFG00020003429) Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000013448.a.a ENSGT00570000079239 ENSGT00950000182834.B ENSGT00940000153634.b ENSGT00950000182834.A.a.b.c ENSGT00390000000412 ENSGT00940000160505 ENSGT00390000000417.a.a.b.a.b ENSGT00940000157376 ENSGT00390000018505.b ENSGT00390000002210.d ENSGT00940000159576 ENSGT00950000183044.a.a.a.c ENSGT00390000010056 ENSGT00530000063402.b ENSGT01100000263504.a.b.a.b.a.b.ib #22 ENSGT00530000063651.a ENSGT00940000162190 ENSGT00390000003188 ENSGT00940000156058 ENSGT00390000008003 ENSGT00940000156764.a ENSGT00940000157923 ENSGT00940000156810 ENSGT01030000234517.H.b ENSGT00390000018900 ENSGT00940000163104 ENSGT00390000004799 ENSGT00390000005861 ENSGT00950000183142.a.b.a.b ENSGT00940000156766 Mustelinae ANCESTRAL SPECIES 51 ENSGT00940000161841.n ENSGT00390000013448.a.a ENSGT00570000079239 ENSGT00950000182834.B ENSGT00940000153634.b ENSGT00950000182834.A.a.b.c ENSGT00940000160505 ENSGT00390000000417.a.a.b.a.b ENSGT00940000157376 ENSGT00390000018505.b ENSGT00390000002210.d ENSGT00940000159576 ENSGT00950000183044.a.a.a.c ENSGT00390000010056 ENSGT00530000063402.b ENSGT01100000263504.a.b.a.b.a.b.ib #22 ENSGT00530000063651.a ENSGT00390000003188 ENSGT00940000156058 ENSGT00390000008003 ENSGT00940000156764.a ENSGT00550000074794 ENSGT00940000162785 ENSGT00520000059630 ENSGT00390000008829 ENSGT00940000155161 ENSGT00390000013877 ENSGT01030000234618.B ENSGT00940000159554 ENSGT00940000157967 ENSGT00940000157143 American mink MODERN SPECIES 73 DEGS1 (ENSNVIG00000015892) NVL (ENSNVIG00000015670) CNIH4 (ENSNVIG00000015648) WDR26 (ENSNVIG00000015630) CNIH3 (ENSNVIG00000015610) DNAH14 (ENSNVIG00000015327) LBR (ENSNVIG00000015260) ENAH (ENSNVIG00000015156) SRP9 (ENSNVIG00000015125) EPHX1 (ENSNVIG00000015107) TMEM63A (ENSNVIG00000015042) ENSNVIG00000015022 PYCR2 (ENSNVIG00000014966) ENSNVIG00000014955 SDE2 (ENSNVIG00000014947) ENSNVIG00000014926 #22 ACBD3 (ENSNVIG00000014901) LIN9 (ENSNVIG00000014864) PARP1 (ENSNVIG00000014805) STUM (ENSNVIG00000014784) ITPKB (ENSNVIG00000014754) PRDX6 (ENSNVIG00000014746) SLC9C2 (ENSNVIG00000014705) TEX50 (ENSNVIG00000014691) ANKRD45 (ENSNVIG00000014684) KLHL20 (ENSNVIG00000014655) CENPL (ENSNVIG00000014636) DARS2 (ENSNVIG00000014589) ZBTB37 (ENSNVIG00000014530) SERPINC1 (ENSNVIG00000014501) RC3H1 (ENSNVIG00000014438) Ursidae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000013448.a.a ENSGT00570000079239 ENSGT00950000182834.B ENSGT00940000153634.b ENSGT00950000182834.A.a.b.c ENSGT00390000000412 ENSGT00940000160505 ENSGT00390000000417.a.a.b.a.b ENSGT00940000157376 ENSGT00390000018505.b ENSGT00390000002210.d ENSGT00940000159576 ENSGT00950000183044.a.a.a.c ENSGT00390000010056 ENSGT00530000063402.b ENSGT01100000263504.a.b.a.b.a.b.ib #22 ENSGT00530000063651.a ENSGT00940000162190 ENSGT00390000003188 ENSGT00940000156058 ENSGT00390000008003 ENSGT00940000156764.a ENSGT00940000157923 ENSGT00940000156810 ENSGT01030000234517.H.b ENSGT00390000018900 ENSGT00940000163104 ENSGT00390000004799 ENSGT00390000005861 ENSGT00950000183142.a.b.a.b ENSGT00940000156766 Giant Panda MODERN SPECIES 662 ENSAMEG00000025614 #22 Ursus ANCESTRAL SPECIES 90 ENSGT00390000013448.a.a ENSGT00570000079239 ENSGT00950000182834.B ENSGT00940000153634.b ENSGT00950000182834.A.a.b.c ENSGT00390000000412 ENSGT00940000160505.u ENSGT00390000000417.a.a.b.a.b ENSGT00940000157376 ENSGT00390000018505.b ENSGT00390000002210.d ENSGT00940000159576 ENSGT00950000183044.a.a.a.c ENSGT00390000010056 ENSGT00530000063402.b ENSGT01100000263504.a.b.a.b.a.b.ib #22 ENSGT00530000063651.a ENSGT00390000003188 ENSGT00940000156058 ENSGT00390000008003 ENSGT00940000156764.a ENSGT00940000157923 ENSGT00940000156810 ENSGT01030000234517.H.b ENSGT00390000018900 ENSGT00940000163104 ENSGT00390000004799 ENSGT00390000005861 ENSGT00950000183142.a.b.a.b ENSGT00940000156766 ENSGT00940000160590 Polar bear MODERN SPECIES 99 NVL (ENSUMAG00000016175) CNIH4 (ENSUMAG00000016149) WDR26 (ENSUMAG00000016061) CNIH3 (ENSUMAG00000016035) ENSUMAG00000016027 ENSUMAG00000015993 ENSUMAG00000015973 LBR (ENSUMAG00000015941) ENSUMAG00000015934 ENSUMAG00000015926 SRP9 (ENSUMAG00000015908) EPHX1 (ENSUMAG00000015847) TMEM63A (ENSUMAG00000015417) PYCR2 (ENSUMAG00000015272) SDE2 (ENSUMAG00000015254) ENSUMAG00000015236 #22 ACBD3 (ENSUMAG00000015197) LIN9 (ENSUMAG00000015190) PARP1 (ENSUMAG00000014555) ENSUMAG00000014454 PSEN2 (ENSUMAG00000014436) COQ8A (ENSUMAG00000014369) CDC42BPA (ENSUMAG00000014320) AHCTF1 (ENSUMAG00000013411) ENSUMAG00000013333 SCCPDH (ENSUMAG00000013328) ENSUMAG00000013325 TFB2M (ENSUMAG00000013324) ENSUMAG00000013322 ENSUMAG00000013317 EFCAB2 (ENSUMAG00000013304) Laurasiatheria_a DUPLICATION Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.b.a.b.a.b.hb.a ##22 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.b.a.b.a.b.hb.a ##22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.b.a.b.a.b.hb.a ##22 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.b.a.b.a.b.hb.a ##22 Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.b.a.b.a.b.hb.a ##22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.b.a.b.a.b.hb.a ##22 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.b.a.b.a.b.hb.a ##22 Bovinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.b.a.b.a.b.hb.a ##22 Bos ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.b.a.b.a.b.hb.a ##22 Bos_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.b.a.b.a.b.hb.a ##22 Wild yak MODERN SPECIES 1263 ENSBMUG00000021351 ##22 SP4 (ENSBMUG00000021359) DNAH11 (ENSBMUG00000021473) CDCA7L (ENSBMUG00000021552) RAPGEF5 (ENSBMUG00000021608) ENSBMUG00000021670 TOMM7 (ENSBMUG00000021681) ENSBMUG00000021704 HYCC1 (ENSBMUG00000021772) ENSBMUG00000021806 ENSBMUG00000021819 NUP42 (ENSBMUG00000021833) GPNMB (ENSBMUG00000021869) ENSBMUG00000021884 MALSU1 (ENSBMUG00000021893) IGF2BP3 (ENSBMUG00000021927) Siberian musk deer MODERN SPECIES 352 FAM124B (ENSMMSG00000021882) SERPINE2 (ENSMMSG00000021812) MRPL44 (ENSMMSG00000021791) WDFY1 (ENSMMSG00000021759) AP1S3 (ENSMMSG00000021716) ENSMMSG00000021703 SCG2 (ENSMMSG00000021697) ENSMMSG00000021680 KCNE4 (ENSMMSG00000021674) ACSL3 (ENSMMSG00000021637) MOGAT1 (ENSMMSG00000021600) ENSMMSG00000021587 FARSB (ENSMMSG00000021542) SGPP2 (ENSMMSG00000021520) ENSMMSG00000021504 ENSMMSG00000021479 ##22 PAX3 (ENSMMSG00000021422) EPHA4 (ENSMMSG00000021358) SLC4A3 (ENSMMSG00000021303) STK11IP (ENSMMSG00000021269) INHA (ENSMMSG00000021236) OBSL1 (ENSMMSG00000021176) TMEM198 (ENSMMSG00000021123) CHPF (ENSMMSG00000021090) ASIC4 (ENSMMSG00000020936) ENSMMSG00000020906 GMPPA (ENSMMSG00000020877) SPEGNB (ENSMMSG00000020840) ENSMMSG00000020814 SPEG (ENSMMSG00000020273) DES (ENSMMSG00000020180) Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.b.a.b.a.b.hb.b ##22 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.b.a.b.a.b.hb.b ##22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.b.a.b.a.b.hb.b ##22 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.b.a.b.a.b.hb.b ##22 Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.b.a.b.a.b.hb.b ##22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.b.a.b.a.b.hb.b ##22 Siberian musk deer MODERN SPECIES 188 NVL (ENSMMSG00000020360) ENSMMSG00000020244 WDR26 (ENSMMSG00000020076) CNIH3 (ENSMMSG00000020039) DNAH14 (ENSMMSG00000019767) LBR (ENSMMSG00000019704) ENAH (ENSMMSG00000019676) SRP9 (ENSMMSG00000019636) EPHX1 (ENSMMSG00000019599) TMEM63A (ENSMMSG00000019545) ENSMMSG00000019519 PYCR2 (ENSMMSG00000019466) ENSMMSG00000019436 ENSMMSG00000019422 SDE2 (ENSMMSG00000019388) ENSMMSG00000019373 ##22 ACBD3 (ENSMMSG00000019345) ENSMMSG00000019330 ENSMMSG00000019312 ENSMMSG00000019292 MIXL1 (ENSMMSG00000019256) LIN9 (ENSMMSG00000019171) PARP1 (ENSMMSG00000019082) Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.b.a.b.a.b.hb.b ##22 Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.b.a.b.a.b.hb.b ##22 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.b.a.b.a.b.hb.b ##22 Canidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.b.a.b.a.b.hb.b ##22 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 #7 ENSGT01090000260051.a #8 ENSGT00390000011856 #9 ENSGT00940000153578.A #10 ENSGT00940000153335.a.a #11 ENSGT00390000017589 #13 ENSGT00940000157287 #14 ENSGT00720000108861 #17 ENSGT00900000141125 #15 ENSGT00940000161851 #16 ENSGT00940000154334.l #18 ENSGT00530000063718.a.a #19 ENSGT00730000110939.b #20 ENSGT00940000159360 #21 ENSGT01100000263504.a.b.a.b.a.b.hb.b ##22 ENSGT00950000183187.B #23 ENSGT01100000263555.b #24 ENSGT00390000007870 #25 ENSGT00520000062027 #26 ENSGT00940000157800 #27 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b #29 ENSGT00390000004214 #30 ENSGT00940000158256 #31 ENSGT00390000016550 #32 ENSGT00940000181148 ENSGT00940000155738 #33 ENSGT00550000074902 #34 ENSGT00940000153432.A.a #35 ENSGT00390000014620 #36 Dingo MODERN SPECIES 68 EXOC7 (ENSCAFG00020005949) GALR2 (ENSCAFG00020005939) #8 SRP68 (ENSCAFG00020005284) #9 ENSCAFG00020005268 ENSCAFG00020004960 #10 CDK3 (ENSCAFG00020004948) #11 TEN1 (ENSCAFG00020004947) #13 ACOX1 (ENSCAFG00020004736) #14 FBF1 (ENSCAFG00020004706) #17 MRPL38 (ENSCAFG00020004693) #15 TRIM65 (ENSCAFG00020004679) #16 TRIM47 (ENSCAFG00020004657) #18 WBP2 (ENSCAFG00020004593) #19 UNC13D (ENSCAFG00020004480) #20 UNK (ENSCAFG00020004454) #21 ENSCAFG00020004444 ##22 GALK1 (ENSCAFG00020004441) #23 ITGB4 (ENSCAFG00020001183) #24 SAP30BP (ENSCAFG00020000844) #25 SMIM5 (ENSCAFG00020000833) #26 RECQL5 (ENSCAFG00020000819) #27 ENSCAFG00020000371 LLGL2 (ENSCAFG00020000323) #29 TSEN54 (ENSCAFG00020000312) #30 CASKIN2 (ENSCAFG00020000304) #31 TMEM94 (ENSCAFG00020000293) #32 ENSCAFG00020000272 GRB2 (ENSCAFG00020000264) #33 SLC25A19 (ENSCAFG00020000256) #34 MIF4GD (ENSCAFG00020000237) #35 MRPS7 (ENSCAFG00020000224) #36 Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.b.a.b.a.b #22 Common shrew MODERN SPECIES 12559 ENSSARG00000008590 #22 Hedgehog MODERN SPECIES 8898 IL17F (ENSEEUG00000004993) MCM3 (ENSEEUG00000005026) ENSEEUG00000005180 #22