Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 43 ENSGT00390000009925.b ENSGT00940000156895 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000162951 ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a #22 ENSGT00940000167259 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00940000157800 ENSGT00930000151032.B ENSGT00940000155335 ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00940000158025.b ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a Amniota ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a #22 ENSGT00940000167259 ENSGT01100000263504.a.b.a.b.a.a ##22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00520000062027 ENSGT00940000157800 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000181148 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 Mammalia ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000002970 ENSGT00390000013448.a.a #15 ENSGT00570000079239 #14 ENSGT00950000182834.B #13 ENSGT00940000153634.b #12 ENSGT00950000182834.A.a.b.c #11 ENSGT00390000000412 ENSGT00940000165101 ENSGT00390000000417.a.a.b.a.b #8 ENSGT00940000157376 #7 ENSGT00390000018505 ENSGT00390000002210.d #16 ENSGT00940000159576 #17 ENSGT00390000010056 #18 ENSGT00530000063402.b #21 ENSGT01100000263504.a.a #22 ENSGT00530000063651.a #23 ENSGT00940000162190 #24 ENSGT00390000003188 #25 ENSGT00940000156058 #26 ENSGT00390000008003 #27 ENSGT00940000156764.a #28 ENSGT00940000157923 #29 ENSGT00940000156810 #30 ENSGT01030000234517.H.b #31 ENSGT00390000018900 #32 ENSGT00940000163104 #33 ENSGT00390000004799 #34 ENSGT00390000005861 #35 ENSGT00940000171704 ENSGT00950000183142.a.b.a.b #36 Theria ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000013448.a.a #15 ENSGT00570000079239 #14 ENSGT00950000182834.B #13 ENSGT00940000153634.b #12 ENSGT00950000182834.A.a.b.c #11 ENSGT00390000000412 ENSGT00940000160505 #9 ENSGT00390000000417.a.a.b.a.b #8 ENSGT00940000157376 #7 ENSGT00390000018505 ENSGT00390000002210.d #16 ENSGT00940000159576 #17 ENSGT00950000183044.a.a.a.c #19 ENSGT00390000010056 #18 ENSGT00530000063402.b #21 ENSGT01100000263504.a.a #22 ENSGT00530000063651.a #23 ENSGT00940000162190 #24 ENSGT00390000003188 #25 ENSGT00940000156058 #26 ENSGT00390000008003 #27 ENSGT00940000156764.a #28 ENSGT00940000157923 #29 ENSGT00940000156810 #30 ENSGT01030000234517.H.b #31 ENSGT00390000018900 #32 ENSGT00940000163104 #33 ENSGT00390000004799 #34 ENSGT00390000005861 #35 ENSGT00940000171704 ENSGT00950000183142.a.b.a.b #36 Eutheria ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00520000062027 ENSGT00940000157800 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000181148 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a ENSGT00390000014620 Boreoeutheria DUPLICATION Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00520000062027 ENSGT00940000157800 ENSGT00930000151032.B ENSGT00940000155335 ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000181148 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00940000170136 ENSGT00940000157800 ENSGT00940000165228 ENSGT00520000062027 ENSGT00930000151032.B ENSGT00940000155335 ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00940000170136 ENSGT00940000165228 ENSGT00520000062027 ENSGT00940000157800 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a Glires ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00940000170136 ENSGT00940000165228 ENSGT00520000062027 ENSGT00940000157800 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a Rodentia ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00940000165228 ENSGT00520000062027 ENSGT00940000157800 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a ENSGT00390000014620 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000156895 ENSGT00390000003595 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00940000167442 ENSGT00520000062027 ENSGT00940000157800 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a ENSGT00390000014620 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000156895 ENSGT00390000003595 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00940000167442 ENSGT00520000062027 ENSGT00940000157800 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a ENSGT00390000014620 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000156895 ENSGT00390000003595 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00940000167442 ENSGT00520000062027 ENSGT00940000157800 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a ENSGT00390000014620 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000156895 ENSGT00390000003595 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00940000167442 ENSGT00520000062027 ENSGT00940000157800 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a ENSGT00390000014620 Murinae ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000156895 ENSGT00390000003595 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT01100000263504.a.b.a.a ##22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00940000167442 ENSGT00520000062027 ENSGT00940000157800 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a Mus ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000156895 ENSGT00390000003595 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT01100000263504.a.b.a.a ##22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00940000167442 ENSGT00520000062027 ENSGT00940000157800 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a Mus_A ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000156895 ENSGT00390000003595 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT01100000263504.a.b.a.a ##22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870.d ENSGT00940000167442 ENSGT00520000062027 ENSGT00940000157800 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a Mus_B ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT01000000214622.a.a.a #10 ENSGT00950000182834.A.a.b.c #11 ENSGT00940000153634.b #12 ENSGT00950000182834.B #13 ENSGT00570000079239 #14 ENSGT00390000013448.a.a.j.b ##15 ENSGT00390000013448.a.a.j.a #15 ENSGT00390000002210.d #16 ENSGT00940000159576 #17 ENSGT00390000010056.z #18 ENSGT00950000183044.a.a.a.c #19 ENSGT00390000010056.y.b #20 ENSGT00390000010056.y.a.b ##18 ENSGT00390000010056.y.a.a ##18 ENSGT00530000063402.b #21 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT00530000063651.a #23 ENSGT00940000162190 #24 ENSGT00390000003188 #25 ENSGT00940000156058 #26 ENSGT00390000008003 #27 ENSGT00940000156764.a #28 ENSGT00940000157923 #29 ENSGT00940000156810 #30 ENSGT01030000234517.H.b #31 ENSGT00860000135936 ENSGT00390000018900 #32 ENSGT00940000163104 #33 ENSGT00390000004799 #34 ENSGT00390000005861 #35 ENSGT00950000183142.a.b.a.b #36 Mouse MODERN SPECIES Enah (ENSMUSG00000022995) #7 Lbr (ENSMUSG00000004880) #8 Dnah14 (ENSMUSG00000047369) #9 Ccdc121rt1 (ENSMUSG00000050625) #10 Cnih3 (ENSMUSG00000026514) #11 Wdr26 (ENSMUSG00000038733) #12 Cnih4 (ENSMUSG00000062169) #13 Nvl (ENSMUSG00000026516) #14 9130409I23Rik (ENSMUSG00000038768) #15 Ephx1 (ENSMUSG00000038776) #16 Tmem63a (ENSMUSG00000026519) #17 Lefty1 (ENSMUSG00000038793) #18 Pycr2 (ENSMUSG00000026520) #19 Lefty2 (ENSMUSG00000066652) #20 Sde2 (ENSMUSG00000038806) #21 H3f3a (ENSMUSG00000060743) #22 Acbd3 (ENSMUSG00000026499) #23 Mixl1 (ENSMUSG00000026497) #24 Lin9 (ENSMUSG00000058729) #25 Parp1 (ENSMUSG00000026496) #26 Stum (ENSMUSG00000053963) #27 Itpkb (ENSMUSG00000038855) #28 Psen2 (ENSMUSG00000010609) #29 Coq8a (ENSMUSG00000026489) #30 Cdc42bpa (ENSMUSG00000026490) #31 Ahctf1 (ENSMUSG00000026491) #32 Kif28 (ENSMUSG00000087236) #33 Sccpdh (ENSMUSG00000038936) #34 Cnst (ENSMUSG00000038949) #35 Tfb2m (ENSMUSG00000026492) #36 Smyd3 (ENSMUSG00000055067) #37 Mus_C ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000156895 ENSGT00390000003595 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870.d ENSGT00940000157800 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a ENSGT00390000014620 ENSGT00940000157333 ENSGT00390000000204 spretus MODERN SPECIES 2 Foxj1 (MGP_SPRETEiJ_G0018285) Exoc7 (MGP_SPRETEiJ_G0018284) Galr2 (MGP_SPRETEiJ_G0018283) Srp68 (MGP_SPRETEiJ_G0018282) Evpl (MGP_SPRETEiJ_G0018281) Cdk3 (MGP_SPRETEiJ_G0009409) Ten1 (MGP_SPRETEiJ_G0018280) Acox1 (MGP_SPRETEiJ_G0018279) Fbf1 (MGP_SPRETEiJ_G0018278) Mrpl38 (MGP_SPRETEiJ_G0018277) Trim65 (MGP_SPRETEiJ_G0018276) Trim47 (MGP_SPRETEiJ_G0018275) Wbp2 (MGP_SPRETEiJ_G0018274) Unc13d (MGP_SPRETEiJ_G0018273) Unk (MGP_SPRETEiJ_G0018272) MGP_SPRETEiJ_G0018271 #22 Galk1 (MGP_SPRETEiJ_G0018270) Itgb4 (MGP_SPRETEiJ_G0018269) Sap30bp (MGP_SPRETEiJ_G0018268) Smim6 (MGP_SPRETEiJ_G0018267) Smim5 (MGP_SPRETEiJ_G0018266) Recql5 (MGP_SPRETEiJ_G0018265) Myo15b (MGP_SPRETEiJ_G0018264) Llgl2 (MGP_SPRETEiJ_G0018263) Tsen54 (MGP_SPRETEiJ_G0018262) Caskin2 (MGP_SPRETEiJ_G0018261) Tmem94 (MGP_SPRETEiJ_G0018260) Grb2 (MGP_SPRETEiJ_G0018259) Slc25a19 (MGP_SPRETEiJ_G0018258) Mif4gd (MGP_SPRETEiJ_G0018257) Mrps7 (MGP_SPRETEiJ_G0018256) Ryukyu mouse MODERN SPECIES 2 Foxj1 (MGP_CAROLIEiJ_G0017440) Exoc7 (MGP_CAROLIEiJ_G0017439) Galr2 (MGP_CAROLIEiJ_G0017438) Srp68 (MGP_CAROLIEiJ_G0017437) Evpl (MGP_CAROLIEiJ_G0017436) MGP_CAROLIEiJ_G0008948 Ten1 (MGP_CAROLIEiJ_G0017435) Acox1 (MGP_CAROLIEiJ_G0017434) Fbf1 (MGP_CAROLIEiJ_G0017433) Mrpl38 (MGP_CAROLIEiJ_G0017432) Trim65 (MGP_CAROLIEiJ_G0017431) Trim47 (MGP_CAROLIEiJ_G0017430) Wbp2 (MGP_CAROLIEiJ_G0017429) Unc13d (MGP_CAROLIEiJ_G0017428) Unk (MGP_CAROLIEiJ_G0017427) MGP_CAROLIEiJ_G0017426 #22 Galk1 (MGP_CAROLIEiJ_G0017425) Itgb4 (MGP_CAROLIEiJ_G0017424) Sap30bp (MGP_CAROLIEiJ_G0017423) Smim6 (MGP_CAROLIEiJ_G0017422) Smim5 (MGP_CAROLIEiJ_G0017421) Recql5 (MGP_CAROLIEiJ_G0017420) Myo15b (MGP_CAROLIEiJ_G0017419) Llgl2 (MGP_CAROLIEiJ_G0017418) Tsen54 (MGP_CAROLIEiJ_G0017417) Caskin2 (MGP_CAROLIEiJ_G0017416) MGP_CAROLIEiJ_G0017415 Grb2 (MGP_CAROLIEiJ_G0017414) Slc25a19 (MGP_CAROLIEiJ_G0017413) Mif4gd (MGP_CAROLIEiJ_G0017412) Mrps7 (MGP_CAROLIEiJ_G0017411) Rat MODERN SPECIES 4 Lbr (ENSRNOG00000052574) #8 Dnah14 (ENSRNOG00000070092) #9 Ccdc121rt (ENSRNOG00000022717) #10 Cnih3 (ENSRNOG00000022724) #11 Wdr26 (ENSRNOG00000003723) #12 Cnih4 (ENSRNOG00000003717) #13 Nvl (ENSRNOG00000003629) #14 RGD1564463 (ENSRNOG00000003601) ##15 LOC498300 (ENSRNOG00000050163) #15 Ephx1 (ENSRNOG00000003515) #16 Tmem63a (ENSRNOG00000003310) #17 Lefty1 (ENSRNOG00000003263) #18 Pycr2 (ENSRNOG00000003267) #19 Lefty2 (ENSRNOG00000060325) #20 Sde2 (ENSRNOG00000003247) #21 H3f3b (ENSRNOG00000003220) #22 Acbd3 (ENSRNOG00000003185) #23 Mixl1 (ENSRNOG00000003176) #24 Lin9 (ENSRNOG00000023304) #25 Parp1 (ENSRNOG00000003084) #26 Stum (ENSRNOG00000071066) #27 Itpkb (ENSRNOG00000002969) #28 Psen2 (ENSRNOG00000002879) #29 Coq8a (ENSRNOG00000043201) #30 Cdc42bpa (ENSRNOG00000002841) #31 Ahctf1 (ENSRNOG00000023541) #32 Kif28p (ENSRNOG00000050602) #33 Sccpdh (ENSRNOG00000066712) #34 Cnst (ENSRNOG00000002710) #35 Tfb2m (ENSRNOG00000002695) #36 Smyd3 (ENSRNOG00000066304) #37 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000156895 ENSGT00390000003595 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00520000062027 ENSGT00940000157800 ENSGT00940000167442 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a ENSGT00390000014620 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000156895 ENSGT00390000003595 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00520000062027 ENSGT00940000157800 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a ENSGT00390000014620 ENSGT00940000157333 Prairie vole MODERN SPECIES 13 Exog (ENSMOCG00000020900) Acvr2b (ENSMOCG00000019420) Xylb (ENSMOCG00000006242) ENSMOCG00000021760 Myd88 (ENSMOCG00000001673) Oxsr1 (ENSMOCG00000017814) ENSMOCG00000015259 Slc22a14 (ENSMOCG00000003432) ENSMOCG00000005097 Dlec1 (ENSMOCG00000020565) Plcd1 (ENSMOCG00000020441) Vill (ENSMOCG00000013015) Ctdspl (ENSMOCG00000012026) Itga9 (ENSMOCG00000004653) Golga4 (ENSMOCG00000022389) ENSMOCG00000010349 #22 Eomes (ENSMOCG00000020156) Cmc1 (ENSMOCG00000020815) Azi2 (ENSMOCG00000018171) Rbms3 (ENSMOCG00000006997) Tgfbr2 (ENSMOCG00000012279) Gadl1 (ENSMOCG00000005000) Stt3b (ENSMOCG00000021697) Osbpl10 (ENSMOCG00000019718) ENSMOCG00000012300 Cmtm8 (ENSMOCG00000010377) ENSMOCG00000008730 Cmtm6 (ENSMOCG00000001815) Dync1li1 (ENSMOCG00000020559) Cnot10 (ENSMOCG00000018672) Trim71 (ENSMOCG00000018592) Northern American deer mouse DUPLICATION Northern American deer mouse MODERN SPECIES 475 Phf8 (ENSPEMG00000018201) Huwe1 (ENSPEMG00000007064) ENSPEMG00000006148 ENSPEMG00000003682 Hsd17b10 (ENSPEMG00000016342) Ribc1 (ENSPEMG00000012701) Smc1a (ENSPEMG00000003801) Iqsec2 (ENSPEMG00000016485) Kdm5c (ENSPEMG00000018041) Kantr (ENSPEMG00000026622) Tspyl2 (ENSPEMG00000006058) Gpr173 (ENSPEMG00000027332) ENSPEMG00000025543 ENSPEMG00000028842 ENSPEMG00000026567 ENSPEMG00000028039 #22 Shroom2 (ENSPEMG00000025197) Gpr143 (ENSPEMG00000023764) ENSPEMG00000024517 ENSPEMG00000012532 Clcn4 (ENSPEMG00000010296) Msl3 (ENSPEMG00000011959) Amelx (ENSPEMG00000009304) Arhgap6 (ENSPEMG00000013179) ENSPEMG00000009950 Hccs (ENSPEMG00000006006) ENSPEMG00000029909 ENSPEMG00000025019 ENSPEMG00000025449 ENSPEMG00000029567 ENSPEMG00000024903 Northern American deer mouse MODERN SPECIES 21 Foxj1 (ENSPEMG00000024551) Exoc7 (ENSPEMG00000017693) Galr2 (ENSPEMG00000017199) Srp68 (ENSPEMG00000015825) Evpl (ENSPEMG00000008116) Cdk3 (ENSPEMG00000018810) Ten1 (ENSPEMG00000010295) Acox1 (ENSPEMG00000002591) Fbf1 (ENSPEMG00000017634) Mrpl38 (ENSPEMG00000012196) Trim65 (ENSPEMG00000030571) Trim47 (ENSPEMG00000016814) Wbp2 (ENSPEMG00000014097) Unc13d (ENSPEMG00000010076) Unk (ENSPEMG00000016145) ENSPEMG00000029709 #22 Galk1 (ENSPEMG00000011665) Itgb4 (ENSPEMG00000013750) Sap30bp (ENSPEMG00000019248) Smim5 (ENSPEMG00000029199) Recql5 (ENSPEMG00000011938) ENSPEMG00000016324 Llgl2 (ENSPEMG00000008966) Tsen54 (ENSPEMG00000014857) Caskin2 (ENSPEMG00000007480) Tmem94 (ENSPEMG00000007436) Grb2 (ENSPEMG00000009134) Slc25a19 (ENSPEMG00000010997) Mif4gd (ENSPEMG00000012309) Mrps7 (ENSPEMG00000019065) Gga3 (ENSPEMG00000013193) Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000156895 ENSGT00390000003595 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00940000157800 ENSGT00940000167442 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a ENSGT00390000014620 ENSGT00940000157333 Chinese hamster chok1gshd DUPLICATION Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 202 Gucy1a2 (ENSCGRG00001016426) ENSCGRG00001018331 Kbtbd3 (ENSCGRG00001018771) Msantd4 (ENSCGRG00001019387) Gria4 (ENSCGRG00001016770) Casp1 (ENSCGRG00001009135) Casp12 (ENSCGRG00001018352) ENSCGRG00001004505 Pdgfd (ENSCGRG00001019661) Ddi1 (ENSCGRG00001005855) Dync2h1 (ENSCGRG00001013236) Dcun1d5 (ENSCGRG00001014535) Mmp13 (ENSCGRG00001006492) Mmp12 (ENSCGRG00001013053) Mmp3 (ENSCGRG00001015501) ENSCGRG00001009381 #22 ENSCGRG00001020530 ENSCGRG00001014094 Mmp8 (ENSCGRG00001015038) Mmp27 (ENSCGRG00001021757) Mmp20 (ENSCGRG00001000330) ENSCGRG00001015482 Tmem123 (ENSCGRG00001018797) ENSCGRG00001022513 Birc2 (ENSCGRG00001023266) Birc3 (ENSCGRG00001008505) Yap1 (ENSCGRG00001011573) Cfap300 (ENSCGRG00001021391) Cep126 (ENSCGRG00001023949) Trpc6 (ENSCGRG00001006368) Pgr (ENSCGRG00001019400) Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 33 Foxj1 (ENSCGRG00001024967) Exoc7 (ENSCGRG00001000581) Galr2 (ENSCGRG00001003541) Srp68 (ENSCGRG00001023743) Evpl (ENSCGRG00001023621) Cdk3 (ENSCGRG00001016520) Ten1 (ENSCGRG00001013875) Acox1 (ENSCGRG00001016959) Fbf1 (ENSCGRG00001020602) Mrpl38 (ENSCGRG00001003973) Trim65 (ENSCGRG00001025012) Trim47 (ENSCGRG00001024475) Wbp2 (ENSCGRG00001016669) Unc13d (ENSCGRG00001021529) Unk (ENSCGRG00001024874) ENSCGRG00001024976 #22 Galk1 (ENSCGRG00001022998) Itgb4 (ENSCGRG00001016672) Sap30bp (ENSCGRG00001016528) Smim6 (ENSCGRG00001012751) ENSCGRG00001012081 Recql5 (ENSCGRG00001011255) Myo15b (ENSCGRG00001018601) Llgl2 (ENSCGRG00001024918) Tsen54 (ENSCGRG00001020029) Caskin2 (ENSCGRG00001006565) Tmem94 (ENSCGRG00001022237) Grb2 (ENSCGRG00001017474) Slc25a19 (ENSCGRG00001015218) Mif4gd (ENSCGRG00001021723) Mrps7 (ENSCGRG00001021002) Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00940000167442 ENSGT00940000170136 ENSGT00940000157800 ENSGT00940000165228 ENSGT00520000062027 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00940000157800 ENSGT00940000165228 ENSGT00520000062027 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a ENSGT00390000014620 Marmotini ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a.e ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00940000165228 ENSGT00520000062027 ENSGT00940000157800 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a ENSGT00390000014620 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a.e ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00940000165228 ENSGT00520000062027 ENSGT00940000157800 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a ENSGT00390000014620 Squirrel MODERN SPECIES 194 EXOC7 (ENSSTOG00000007475) ZACN (ENSSTOG00000007453) GALR2 (ENSSTOG00000007442) SRP68 (ENSSTOG00000007424) EVPL (ENSSTOG00000022668) CDK3 (ENSSTOG00000007350) TEN1 (ENSSTOG00000019554) ACOX1 (ENSSTOG00000013437) FBF1 (ENSSTOG00000013411) MRPL38 (ENSSTOG00000013400) TRIM65 (ENSSTOG00000013392) TRIM47 (ENSSTOG00000013386) ENSSTOG00000021421 UNC13D (ENSSTOG00000013367) UNK (ENSSTOG00000013344) ENSSTOG00000024226 #22 GALK1 (ENSSTOG00000013326) ITGB4 (ENSSTOG00000025173) SAP30BP (ENSSTOG00000012995) ENSSTOG00000033976 SMIM5 (ENSSTOG00000022610) RECQL5 (ENSSTOG00000012970) ENSSTOG00000030239 ENSSTOG00000021155 LLGL2 (ENSSTOG00000012891) TSEN54 (ENSSTOG00000012883) CASKIN2 (ENSSTOG00000021787) TMEM94 (ENSSTOG00000012842) GRB2 (ENSSTOG00000012661) ENSSTOG00000015212 MIF4GD (ENSSTOG00000022390) Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 12 RBMS1 (ENSSVLG00005011820) ITGB6 (ENSSVLG00005011104) PLA2R1 (ENSSVLG00005010982) ENSSVLG00005010937 LY75 (ENSSVLG00005010649) CD302 (ENSSVLG00005010561) MARCHF7 (ENSSVLG00005010418) BAZ2B (ENSSVLG00005010334) WDSUB1 (ENSSVLG00005010265) TANC1 (ENSSVLG00005009095) DAPL1 (ENSSVLG00005008852) ENSSVLG00005008811 PKP4 (ENSSVLG00005008751) CCDC148 (ENSSVLG00005008598) UPP2 (ENSSVLG00005008546) ENSSVLG00005008520 #22 ACVR1 (ENSSVLG00005008490) ACVR1C (ENSSVLG00005008270) CYTIP (ENSSVLG00005008173) ERMN (ENSSVLG00005008084) ENSSVLG00005008042 GPD2 (ENSSVLG00005007886) NR4A2 (ENSSVLG00005007787) KCNJ3 (ENSSVLG00005007729) ENSSVLG00005007594 RPRM (ENSSVLG00005007559) ENSSVLG00005007524 PRPF40A (ENSSVLG00005007429) ENSSVLG00005007428 FMNL2 (ENSSVLG00005007277) STAM2 (ENSSVLG00005007197) Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000156895 ENSGT00390000003595 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00940000170136 ENSGT00940000157800 ENSGT00520000062027 ENSGT00930000151032.B ENSGT00940000167865 ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a Naked mole-rat female DUPLICATION Naked mole-rat female MODERN SPECIES 30 ENSHGLG00000001115 ENSHGLG00000048867 ENSHGLG00000002041 ENSHGLG00000005865 ENSHGLG00000004774 ENSHGLG00000000234 ENSHGLG00000043321 ENSHGLG00000015276 HMGXB4 (ENSHGLG00000037083) TOM1 (ENSHGLG00000015296) HMOX1 (ENSHGLG00000008950) MCM5 (ENSHGLG00000008256) RASD2 (ENSHGLG00000007940) ENSHGLG00000007308 ENSHGLG00000006549 ENSHGLG00000036993 #22 ARHGAP19 (ENSHGLG00000043596) ENSHGLG00000039731 FRAT2 (ENSHGLG00000021387) RRP12 (ENSHGLG00000016772) PGAM1 (ENSHGLG00000016865) EXOSC1 (ENSHGLG00000016927) ZDHHC16 (ENSHGLG00000017705) MMS19 (ENSHGLG00000019329) UBTD1 (ENSHGLG00000006858) ANKRD2 (ENSHGLG00000008161) ENSHGLG00000033035 HOGA1 (ENSHGLG00000038633) MORN4 (ENSHGLG00000018443) PI4K2A (ENSHGLG00000013652) AVPI1 (ENSHGLG00000010646) Naked mole-rat female MODERN SPECIES 12 EXOC7 (ENSHGLG00000012895) GALR2 (ENSHGLG00000012244) SRP68 (ENSHGLG00000010531) EVPL (ENSHGLG00000009178) ENSHGLG00000039392 TEN1 (ENSHGLG00000032200) ACOX1 (ENSHGLG00000005696) ENSHGLG00000012999 FBF1 (ENSHGLG00000009386) MRPL38 (ENSHGLG00000008639) TRIM65 (ENSHGLG00000035048) TRIM47 (ENSHGLG00000015373) WBP2 (ENSHGLG00000018617) UNC13D (ENSHGLG00000008486) UNK (ENSHGLG00000007512) ENSHGLG00000043049 #22 GALK1 (ENSHGLG00000006114) ITGB4 (ENSHGLG00000004560) SAP30BP (ENSHGLG00000013084) RECQL5 (ENSHGLG00000013222) ENSHGLG00000033122 ENSHGLG00000033495 LLGL2 (ENSHGLG00000011075) TSEN54 (ENSHGLG00000007979) CASKIN2 (ENSHGLG00000005483) TMEM94 (ENSHGLG00000006986) GRB2 (ENSHGLG00000005883) SLC25A19 (ENSHGLG00000005191) ENSHGLG00000050052 ENSHGLG00000050152 ENSHGLG00000040381 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000156895 ENSGT00390000003595 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00940000170136 ENSGT00940000157800 ENSGT00520000062027 ENSGT00930000151032.B ENSGT00940000167865 ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000156895 ENSGT00390000003595 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00940000157800 ENSGT00520000062027 ENSGT00930000151032.B ENSGT00940000167865 ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a ENSGT00390000014620 Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 213 FOXJ1 (ENSCLAG00000009305) EXOC7 (ENSCLAG00000012049) GALR2 (ENSCLAG00000015674) SRP68 (ENSCLAG00000013646) EVPL (ENSCLAG00000006624) CDK3 (ENSCLAG00000007409) TEN1 (ENSCLAG00000015964) ACOX1 (ENSCLAG00000016733) FBF1 (ENSCLAG00000011326) MRPL38 (ENSCLAG00000007129) TRIM65 (ENSCLAG00000007508) TRIM47 (ENSCLAG00000008148) WBP2 (ENSCLAG00000008822) UNC13D (ENSCLAG00000010782) UNK (ENSCLAG00000008106) H3f3b (ENSCLAG00000009278) #22 GALK1 (ENSCLAG00000006961) ITGB4 (ENSCLAG00000008871) SAP30BP (ENSCLAG00000007597) ENSCLAG00000007976 RECQL5 (ENSCLAG00000006680) SMIM5 (ENSCLAG00000008647) ENSCLAG00000008750 ENSCLAG00000008934 Degu DUPLICATION Degu MODERN SPECIES 172 ENSODEG00000009205 ENSODEG00000006478 #19 ENSODEG00000008453 #18 SDE2 (ENSODEG00000007391) #21 ENSODEG00000006974 ENSODEG00000006347 #22 ENSODEG00000007126 ACBD3 (ENSODEG00000007029) #23 ENSODEG00000006883 #24 LIN9 (ENSODEG00000007495) #25 PARP1 (ENSODEG00000007424) #26 STUM (ENSODEG00000006865) #27 ITPKB (ENSODEG00000006556) #28 RD3 (ENSODEG00000010438) TRAF5 (ENSODEG00000010010) RCOR3 (ENSODEG00000007158) KCNH1 (ENSODEG00000006391) HHAT (ENSODEG00000006027) SERTAD4 (ENSODEG00000006307) ENSODEG00000019253 ENSODEG00000007057 Degu MODERN SPECIES 48 RDH11 (ENSODEG00000013053) VTI1B (ENSODEG00000013143) ARG2 (ENSODEG00000014261) ENSODEG00000014130 PLEKHH1 (ENSODEG00000015158) TMEM229B (ENSODEG00000020052) ENSODEG00000014817 EIF2S1 (ENSODEG00000013168) ENSODEG00000013948 PALS1 (ENSODEG00000014070) GARIN2 (ENSODEG00000013098) GPHN (ENSODEG00000013064) ENSODEG00000014813 CCDC196 (ENSODEG00000014992) FUT8 (ENSODEG00000013606) ENSODEG00000020197 #22 ENSODEG00000014922 FNTB (ENSODEG00000013903) RAB15 (ENSODEG00000013827) GPX2 (ENSODEG00000014599) CHURC1 (ENSODEG00000013343) SPTB (ENSODEG00000014818) PLEKHG3 (ENSODEG00000013350) PPP1R36 (ENSODEG00000014421) HSPA2 (ENSODEG00000015284) ZBTB1 (ENSODEG00000013207) ENSODEG00000013493 MTHFD1 (ENSODEG00000014455) ENSODEG00000020084 ENSODEG00000020168 ENSODEG00000014746 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES 90 ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00940000157800 ENSGT00940000165228 ENSGT00520000062027 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a ENSGT00390000014620 Pika MODERN SPECIES 3973 ENSOPRG00000015952 #22 Rabbit DUPLICATION Rabbit MODERN SPECIES 578 UNK (ENSOCUG00000014994) ENSOCUG00000014989 #22 GALK1 (ENSOCUG00000014973) ITGB4 (ENSOCUG00000014951) SAP30BP (ENSOCUG00000016220) RECQL5 (ENSOCUG00000016202) SMIM6 (ENSOCUG00000036696) ENSOCUG00000030919 ENSOCUG00000016181 LLGL2 (ENSOCUG00000022899) TSEN54 (ENSOCUG00000009875) ENSOCUG00000011862 TMEM94 (ENSOCUG00000005331) GRB2 (ENSOCUG00000006469) ENSOCUG00000017928 ENSOCUG00000006603 GGA3 (ENSOCUG00000006657) Rabbit MODERN SPECIES 7 ENSOCUG00000007393 LYPLAL1 (ENSOCUG00000000388) TGFB2 (ENSOCUG00000005279) RRP15 (ENSOCUG00000017863) SPATA17 (ENSOCUG00000014523) GPATCH2 (ENSOCUG00000014512) ENSOCUG00000033147 ESRRG (ENSOCUG00000000984) ENSOCUG00000014710 KCTD3 (ENSOCUG00000001943) KCNK2 (ENSOCUG00000008629) PTPN14 (ENSOCUG00000015400) SMYD2 (ENSOCUG00000015379) PROX1 (ENSOCUG00000008274) RPS6KC1 (ENSOCUG00000013953) ENSOCUG00000013968 #22 ENSOCUG00000035779 ANGEL2 (ENSOCUG00000008585) VASH2 (ENSOCUG00000008579) FLVCR1 (ENSOCUG00000004804) SPATA45 (ENSOCUG00000004799) ENSOCUG00000004792 NSL1 (ENSOCUG00000004789) GARIN4 (ENSOCUG00000017415) ATF3 (ENSOCUG00000017424) PACC1 (ENSOCUG00000009061) NENF (ENSOCUG00000010810) PPP2R5A (ENSOCUG00000017572) ENSOCUG00000023322 DTL (ENSOCUG00000000437) INTS7 (ENSOCUG00000004204) Tree shrew DUPLICATION Tree shrew MODERN SPECIES 3055 ENSTBEG00000006177 #22 ACBD3 (ENSTBEG00000006409) #23 ENSTBEG00000006687 Tree shrew MODERN SPECIES 1441 TRIM47 (ENSTBEG00000016386) ENSTBEG00000016178 ENSTBEG00000016171 #22 ENSTBEG00000015673 SAP30BP (ENSTBEG00000015623) RECQL5 (ENSTBEG00000015250) ENSTBEG00000015024 Primates ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00940000157800 ENSGT00940000165228 ENSGT00520000062027 ENSGT00930000151032.B ENSGT00940000155335 ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a Haplorrhini DUPLICATION Haplorrhini DUPLICATION Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.yb.m.a #22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.yb.m.a #22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.yb.m.a #22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.yb.m.a #22 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 70 ENSGT01080000257365.b.a.b.a.a ENSGT00940000157408 ENSGT00950000183064.b ENSGT00910000147749 ENSGT01100000263504.a.a.yb.m.a #22 ENSGT00940000154465.C.o ENSGT00390000013771.u ENSGT00730000111429 ENSGT00390000002960 ENSGT00940000159985 ENSGT00940000161312 ENSGT00550000074968.a ENSGT00940000160495 ENSGT00390000016421.b.a ENSGT00940000162541 ENSGT00510000046499 ENSGT00940000153577.A ENSGT00940000159255 ENSGT00940000159602 ENSGT00940000159870 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 581 KCNJ6 (ENSRROG00000034548) DYRK1A (ENSRROG00000013490) VPS26C (ENSRROG00000039521) ENSRROG00000040777 TTC3 (ENSRROG00000042556) ENSRROG00000004087 #22 PIGP (ENSRROG00000036631) RIPPLY3 (ENSRROG00000038710) HLCS (ENSRROG00000034799) SIM2 (ENSRROG00000035852) CLDN14 (ENSRROG00000010989) CHAF1B (ENSRROG00000027429) MORC3 (ENSRROG00000027382) DOP1B (ENSRROG00000031861) CBR3 (ENSRROG00000037282) CBR1 (ENSRROG00000031699) SETD4 (ENSRROG00000044000) ENSRROG00000043469 ENSRROG00000039344 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1186 KCNJ6 (ENSRBIG00000039466) DYRK1A (ENSRBIG00000044558) VPS26C (ENSRBIG00000031672) ENSRBIG00000033842 ENSRBIG00000005142 #22 TTC3 (ENSRBIG00000044668) PIGP (ENSRBIG00000036738) RIPPLY3 (ENSRBIG00000033745) ENSRBIG00000028452 HLCS (ENSRBIG00000040559) SIM2 (ENSRBIG00000037240) CLDN14 (ENSRBIG00000011059) CHAF1B (ENSRBIG00000017497) Tarsier MODERN SPECIES 6584 NCOA6 (ENSTSYG00000030130) ENSTSYG00000029672 GGT7 (ENSTSYG00000003672) ACSS2 (ENSTSYG00000004518) GSS (ENSTSYG00000000906) ENSTSYG00000037054 #22 MYH7B (ENSTSYG00000007695) TRPC4AP (ENSTSYG00000007739) EDEM2 (ENSTSYG00000002139) PROCR (ENSTSYG00000037554) MMP24 (ENSTSYG00000005981) EIF6 (ENSTSYG00000030850) FAM83C (ENSTSYG00000036093) ENSTSYG00000036365 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.yb.m.b #22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.yb.m.b #22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.yb.m.b #22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.yb.m.b #22 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.yb.m.b #22 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1471 ENSRROG00000028587 ENSRROG00000004863 #22 DZANK1 (ENSRROG00000002317) POLR3F (ENSRROG00000039911) RBBP9 (ENSRROG00000042932) SEC23B (ENSRROG00000044371) DTD1 (ENSRROG00000039552) SLC24A3 (ENSRROG00000042604) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.yb.m.b #22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.yb.m.b #22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.yb.m.b #22 Capuchin MODERN SPECIES 112 ENSCCAG00000015027 BACE2 (ENSCCAG00000035482) FAM3B (ENSCCAG00000030600) MX2 (ENSCCAG00000029612) ENSCCAG00000020180 #22 MX1 (ENSCCAG00000025192) TMPRSS2 (ENSCCAG00000030906) RIPK4 (ENSCCAG00000029896) PRDM15 (ENSCCAG00000030489) ENSCCAG00000029556 ZBTB21 (ENSCCAG00000037414) ENSCCAG00000030168 UMODL1 (ENSCCAG00000028529) ABCG1 (ENSCCAG00000022414) TFF3 (ENSCCAG00000022195) TFF2 (ENSCCAG00000022205) TFF1 (ENSCCAG00000022303) TMPRSS3 (ENSCCAG00000038076) UBASH3A (ENSCCAG00000029676) RSPH1 (ENSCCAG00000029158) Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb.n #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00940000157800 ENSGT00940000165228 ENSGT00520000062027 ENSGT00930000151032.B ENSGT00940000155335 ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a Tarsier MODERN SPECIES 2014 TRIM47 (ENSTSYG00000026333) WBP2 (ENSTSYG00000027971) UNC13D (ENSTSYG00000008180) UNK (ENSTSYG00000008096) ENSTSYG00000034925 #22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb.n #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00940000157800 ENSGT00940000165228 ENSGT00520000062027 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00940000164172 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb.n #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00940000157800 ENSGT00940000165228 ENSGT00520000062027 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00940000164172 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A.c ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb.n #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00940000157800 ENSGT00940000165228 ENSGT00520000062027 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00940000164172 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a Gibbon MODERN SPECIES 20 ENSNLEG00000032682 GPR180 (ENSNLEG00000016532) TGDS (ENSNLEG00000016509) DCT (ENSNLEG00000016495) GPC6 (ENSNLEG00000016493) GPC5 (ENSNLEG00000016490) ENSNLEG00000016486 ENSNLEG00000033876 SLITRK5 (ENSNLEG00000016482) ENSNLEG00000030993 ENSNLEG00000016480 SLITRK6 (ENSNLEG00000016473) ENSNLEG00000034721 SLITRK1 (ENSNLEG00000019091) SPRY2 (ENSNLEG00000034212) ENSNLEG00000031272 #22 NDFIP2 (ENSNLEG00000016460) RBM26 (ENSNLEG00000016429) OBI1 (ENSNLEG00000016406) ENSNLEG00000016405 EDNRB (ENSNLEG00000016385) SLAIN1 (ENSNLEG00000016365) SCEL (ENSNLEG00000016322) MYCBP2 (ENSNLEG00000016250) FBXL3 (ENSNLEG00000016246) ENSNLEG00000016242 ACOD1 (ENSNLEG00000016240) ENSNLEG00000027709 LMO7 (ENSNLEG00000016172) UCHL3 (ENSNLEG00000027639) ENSNLEG00000031435 Hominidae ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A.c ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb.n #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00940000165228 ENSGT00520000062027 ENSGT00940000157800 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000161656.r ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a Orangutan DUPLICATION Orangutan MODERN SPECIES 3 SLC2A13 (ENSPPYG00000004415) C12orf40 (ENSPPYG00000004414) ABCD2 (ENSPPYG00000004413) KIF21A (ENSPPYG00000004412) CPNE8 (ENSPPYG00000004411) ALG10B (ENSPPYG00000004409) ENSPPYG00000034107 ALG10 (ENSPPYG00000004410) SYT10 (ENSPPYG00000004408) PKP2 (ENSPPYG00000004407) YARS2 (ENSPPYG00000004406) DNM1L (ENSPPYG00000004405) FGD4 (ENSPPYG00000004404) BICD1 (ENSPPYG00000004403) RESF1 (ENSPPYG00000004402) H3-5 (ENSPPYG00000004401) #22 AMN1 (ENSPPYG00000004400) ETFBKMT (ENSPPYG00000037212) DENND5B (ENSPPYG00000004398) ENSPPYG00000035593 SINHCAF (ENSPPYG00000004396) TSPAN11 (ENSPPYG00000039901) CAPRIN2 (ENSPPYG00000004394) IPO8 (ENSPPYG00000034647) TMTC1 (ENSPPYG00000004392) OVCH1 (ENSPPYG00000004391) ERGIC2 (ENSPPYG00000004390) FAR2 (ENSPPYG00000004389) CCDC91 (ENSPPYG00000004387) PTHLH (ENSPPYG00000004386) KLHL42 (ENSPPYG00000033094) Orangutan MODERN SPECIES 242 ENSPPYG00000020681 ZBTB33 (ENSPPYG00000020682) TMEM255A (ENSPPYG00000020683) ATP1B4 (ENSPPYG00000020684) LAMP2 (ENSPPYG00000020685) CUL4B (ENSPPYG00000020686) MCTS1 (ENSPPYG00000020687) C1GALT1C1 (ENSPPYG00000020689) ENSPPYG00000039491 CT47B1 (ENSPPYG00000033587) ENSPPYG00000020691 GLUD2 (ENSPPYG00000020692) ENSPPYG00000033514 ENSPPYG00000034575 GRIA3 (ENSPPYG00000020694) ENSPPYG00000033691 #22 THOC2 (ENSPPYG00000020695) XIAP (ENSPPYG00000020696) STAG2 (ENSPPYG00000020697) SH2D1A (ENSPPYG00000020698) TENM1 (ENSPPYG00000020699) ENSPPYG00000031077 DCAF12L2 (ENSPPYG00000037362) DCAF12L1 (ENSPPYG00000037034) PRR32 (ENSPPYG00000020701) ACTRT1 (ENSPPYG00000020702) SMARCA1 (ENSPPYG00000020703) OCRL (ENSPPYG00000020704) ENSPPYG00000041441 APLN (ENSPPYG00000020705) XPNPEP2 (ENSPPYG00000020706) Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A.c ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb.n #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00940000165228 ENSGT00520000062027 ENSGT00940000157800 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000161656.r ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a Gorilla MODERN SPECIES 18 FOXJ1 (ENSGGOG00000007282) EXOC7 (ENSGGOG00000008820) ZACN (ENSGGOG00000008814) GALR2 (ENSGGOG00000008813) SRP68 (ENSGGOG00000013895) EVPL (ENSGGOG00000013873) CDK3 (ENSGGOG00000013863) ACOX1 (ENSGGOG00000004590) FBF1 (ENSGGOG00000012586) MRPL38 (ENSGGOG00000013193) TRIM65 (ENSGGOG00000010533) TRIM47 (ENSGGOG00000009236) WBP2 (ENSGGOG00000009241) UNC13D (ENSGGOG00000009219) UNK (ENSGGOG00000009203) ENSGGOG00000037327 #22 GALK1 (ENSGGOG00000009534) ITGB4 (ENSGGOG00000009509) SAP30BP (ENSGGOG00000009499) RECQL5 (ENSGGOG00000009481) SMIM6 (ENSGGOG00000037869) SMIM5 (ENSGGOG00000009493) MYO15B (ENSGGOG00000009450) LLGL2 (ENSGGOG00000009428) TSEN54 (ENSGGOG00000009417) CASKIN2 (ENSGGOG00000009406) TMEM94 (ENSGGOG00000009391) GRB2 (ENSGGOG00000006122) SLC25A19 (ENSGGOG00000025764) MIF4GD (ENSGGOG00000028603) MRPS7 (ENSGGOG00000007640) Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000013448.a.a #15 ENSGT00570000079239 #14 ENSGT00950000182834.B #13 ENSGT00940000153634.b #12 ENSGT00950000182834.A.a.b.c #11 ENSGT00940000160505 #9 ENSGT00390000000417.a.a.b.a.b #8 ENSGT00940000157376 #7 ENSGT00390000018505.b ENSGT00390000002210.d #16 ENSGT00940000159576 #17 ENSGT00390000010056.q.b #18 ENSGT00950000183044.a.a.a.c #19 ENSGT00390000010056.q.a #18 ENSGT00530000063402.b #21 ENSGT01100000263504.a.a.yb.n #22 ENSGT00530000063651.a #23 ENSGT00940000162190 #24 ENSGT00390000003188 #25 ENSGT00940000156058 #26 ENSGT00940000157177.i.b ENSGT00390000008003 #27 ENSGT00940000156764.a #28 ENSGT00940000157923 #29 ENSGT00940000156810 #30 ENSGT01030000234517.H.b #31 ENSGT00940000154251.A.a.a.a ENSGT00940000159380 ENSGT00910000147389 ENSGT00950000182843.b ENSGT00940000154494.a Pan ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000013448.a.a #15 ENSGT00570000079239 #14 ENSGT00950000182834.B #13 ENSGT00940000153634.b #12 ENSGT00950000182834.A.a.b.c #11 ENSGT00940000160505 #9 ENSGT00390000000417.a.a.b.a.b #8 ENSGT00940000157376 #7 ENSGT00390000018505.b ENSGT00390000002210.d #16 ENSGT00940000159576 #17 ENSGT00390000010056.q.b #18 ENSGT00950000183044.a.a.a.c #19 ENSGT00390000010056.q.a #18 ENSGT00530000063402.b #21 ENSGT01100000263504.a.a.yb.n #22 ENSGT00530000063651.a #23 ENSGT00940000162190 #24 ENSGT00390000003188 #25 ENSGT00940000156058 #26 ENSGT00940000157177.i.b ENSGT00390000008003 #27 ENSGT00940000156764.a #28 ENSGT00940000157923 #29 ENSGT00940000156810 #30 ENSGT01030000234517.H.b #31 ENSGT00940000154251.A.a.a.a ENSGT00940000159380 ENSGT00910000147389 ENSGT00950000182843.b ENSGT00940000154494.a Bonobo MODERN SPECIES DEGS1 (ENSPPAG00000033472) #15 NVL (ENSPPAG00000030596) #14 CNIH4 (ENSPPAG00000037258) #13 WDR26 (ENSPPAG00000030839) #12 CNIH3 (ENSPPAG00000041930) #11 DNAH14 (ENSPPAG00000033548) #9 LBR (ENSPPAG00000029928) #8 ENSPPAG00000027545 #7 SRP9 (ENSPPAG00000042680) EPHX1 (ENSPPAG00000037369) #16 TMEM63A (ENSPPAG00000035003) #17 LEFTY1 (ENSPPAG00000031732) #18 PYCR2 (ENSPPAG00000029624) #19 LEFTY2 (ENSPPAG00000029951) #18 SDE2 (ENSPPAG00000037583) #21 ENSPPAG00000003422 #22 ACBD3 (ENSPPAG00000034288) #23 ENSPPAG00000013035 #24 LIN9 (ENSPPAG00000029947) #25 PARP1 (ENSPPAG00000040862) #26 ENSPPAG00000035608 ENSPPAG00000026314 #27 ITPKB (ENSPPAG00000034181) #28 PSEN2 (ENSPPAG00000029453) #29 COQ8A (ENSPPAG00000038783) #30 CDC42BPA (ENSPPAG00000030700) #31 ENSPPAG00000042857 ENSPPAG00000042694 JMJD4 (ENSPPAG00000041921) ENSPPAG00000043934 SNAP47 (ENSPPAG00000030087) Human DUPLICATION Human MODERN SPECIES 3 LRRK2 (ENSG00000188906) SLC2A13 (ENSG00000151229) C12orf40 (ENSG00000180116) ABCD2 (ENSG00000173208) KIF21A (ENSG00000139116) CPNE8 (ENSG00000139117) ALG10B (ENSG00000175548) ALG10 (ENSG00000139133) SYT10 (ENSG00000110975) PKP2 (ENSG00000057294) YARS2 (ENSG00000139131) DNM1L (ENSG00000087470) FGD4 (ENSG00000139132) BICD1 (ENSG00000151746) RESF1 (ENSG00000174718) H3-5 (ENSG00000188375) #22 AMN1 (ENSG00000151743) ETFBKMT (ENSG00000139160) AK4P3 (ENSG00000233381) DENND5B (ENSG00000170456) SINHCAF (ENSG00000139146) DDX11 (ENSG00000013573) TSPAN11 (ENSG00000110900) CAPRIN2 (ENSG00000110888) IPO8 (ENSG00000133704) TMTC1 (ENSG00000133687) OVCH1 (ENSG00000187950) ERGIC2 (ENSG00000087502) FAR2 (ENSG00000064763) CCDC91 (ENSG00000123106) PTHLH (ENSG00000087494) Human MODERN SPECIES 8 EXOC7 (ENSG00000182473) GALR2 (ENSG00000182687) ZACN (ENSG00000186919) SRP68 (ENSG00000167881) EVPL (ENSG00000167880) CDK3 (ENSG00000250506) TEN1 (ENSG00000257949) ACOX1 (ENSG00000161533) FBF1 (ENSG00000188878) MRPL38 (ENSG00000204316) TRIM65 (ENSG00000141569) TRIM47 (ENSG00000132481) WBP2 (ENSG00000132471) UNC13D (ENSG00000092929) UNK (ENSG00000132478) H3-3B (ENSG00000132475) #22 GALK1 (ENSG00000108479) ITGB4 (ENSG00000132470) SAP30BP (ENSG00000161526) SMIM6 (ENSG00000259120) SMIM5 (ENSG00000204323) RECQL5 (ENSG00000108469) MYO15B (ENSG00000266714) LLGL2 (ENSG00000073350) TSEN54 (ENSG00000182173) CASKIN2 (ENSG00000177303) TMEM94 (ENSG00000177728) GRB2 (ENSG00000177885) SLC25A19 (ENSG00000125454) MIF4GD (ENSG00000125457) MRPS7 (ENSG00000125445) Human MODERN SPECIES NVL (ENSG00000143748) #14 CNIH4 (ENSG00000143771) #13 WDR26 (ENSG00000162923) #12 CNIH3 (ENSG00000143786) #11 DNAH14 (ENSG00000185842) #9 LBR (ENSG00000143815) #8 ENAH (ENSG00000154380) #7 SRP9 (ENSG00000143742) EPHX1 (ENSG00000143819) #16 TMEM63A (ENSG00000196187) #17 LEFTY1 (ENSG00000243709) #18 ENSG00000255835 PYCR2 (ENSG00000143811) #19 LEFTY2 (ENSG00000143768) #18 SDE2 (ENSG00000143751) #21 H3-3A (ENSG00000163041) #22 ACBD3 (ENSG00000182827) #23 MIXL1 (ENSG00000185155) #24 LIN9 (ENSG00000183814) #25 PARP1 (ENSG00000143799) #26 STUM (ENSG00000203685) #27 ITPKB (ENSG00000143772) #28 PSEN2 (ENSG00000143801) #29 COQ8A (ENSG00000163050) #30 CDC42BPA (ENSG00000143776) #31 ZNF678 (ENSG00000181450) SNAP47 (ENSG00000143740) JMJD4 (ENSG00000081692) PRSS38 (ENSG00000185888) WNT9A (ENSG00000143816) WNT3A (ENSG00000154342) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb.n #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00940000157800 ENSGT00940000165228 ENSGT00520000062027 ENSGT00930000151032.B ENSGT00940000155335 ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.yb.n #22 Golden snub-nosed monkey DUPLICATION Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 591 LRIG1 (ENSRROG00000042136) SLC25A26 (ENSRROG00000030090) ENSRROG00000041210 ENSRROG00000025517 #22 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2251 ENSRROG00000015387 #22 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1023 HES7 (ENSRROG00000045527) ALOXE3 (ENSRROG00000028855) ALOX12B (ENSRROG00000036486) ALOX15B (ENSRROG00000039498) ENSRROG00000019216 GUCY2D (ENSRROG00000005382) CNTROB (ENSRROG00000043667) TRAPPC1 (ENSRROG00000029283) KCNAB3 (ENSRROG00000040156) RNF227 (ENSRROG00000037731) CHD3 (ENSRROG00000029554) CYB5D1 (ENSRROG00000033738) NAA38 (ENSRROG00000037370) TMEM88 (ENSRROG00000043517) KDM6B (ENSRROG00000030681) ENSRROG00000028496 #22 DNAH2 (ENSRROG00000035849) EFNB3 (ENSRROG00000045493) WRAP53 (ENSRROG00000032629) TP53 (ENSRROG00000037163) ATP1B2 (ENSRROG00000043331) SHBG (ENSRROG00000041036) SAT2 (ENSRROG00000002103) FXR2 (ENSRROG00000035470) SOX15 (ENSRROG00000035518) MPDU1 (ENSRROG00000039715) CD68 (ENSRROG00000036188) EIF4A1 (ENSRROG00000032175) SENP3 (ENSRROG00000036921) TNFSF13 (ENSRROG00000043005) TNFSF12 (ENSRROG00000040782) Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2267 ENSRROG00000025495 #22 KIF26B (ENSRROG00000034054) SMYD3 (ENSRROG00000034618) #37 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb.n #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00940000157800 ENSGT00940000165228 ENSGT00520000062027 ENSGT00930000151032.B ENSGT00940000155335 ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a Vervet Monkey MODERN SPECIES 7 EXOC7 (ENSCSAG00000004994) ZACN (ENSCSAG00000004988) GALR2 (ENSCSAG00000004985) SRP68 (ENSCSAG00000004983) EVPL (ENSCSAG00000004972) CDK3 (ENSCSAG00000004957) TEN1 (ENSCSAG00000004942) ACOX1 (ENSCSAG00000004941) FBF1 (ENSCSAG00000004938) MRPL38 (ENSCSAG00000004925) TRIM65 (ENSCSAG00000004905) TRIM47 (ENSCSAG00000004896) WBP2 (ENSCSAG00000004889) UNC13D (ENSCSAG00000004874) UNK (ENSCSAG00000004859) ENSCSAG00000004855 #22 GALK1 (ENSCSAG00000004853) ENSCSAG00000004846 SAP30BP (ENSCSAG00000004844) RECQL5 (ENSCSAG00000004842) SMIM6 (ENSCSAG00000000540) SMIM5 (ENSCSAG00000004839) ENSCSAG00000004836 ENSCSAG00000004826 LLGL2 (ENSCSAG00000004819) TSEN54 (ENSCSAG00000004809) CASKIN2 (ENSCSAG00000004791) TMEM94 (ENSCSAG00000004752) GRB2 (ENSCSAG00000004740) SLC25A19 (ENSCSAG00000004737) MIF4GD (ENSCSAG00000004732) Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb.n #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00940000157800 ENSGT00940000165228 ENSGT00520000062027 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a ENSGT00390000014620 Macaca ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.b.q ##22 ENSGT01100000263504.a.a.yb.n #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00940000157800 ENSGT00520000062027 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a ENSGT00390000014620 ENSGT00940000157333 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.b.q ##22 ENSGT01100000263504.a.a.yb.n #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00940000157800 ENSGT00520000062027 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000157333 ENSGT00390000014620 ENSGT00390000000204 Crab-eating macaque DUPLICATION Crab-eating macaque MODERN SPECIES SERPINC1 (ENSMFAG00000031906) RC3H1 (ENSMFAG00000033725) ENSMFAG00000048032 RABGAP1L (ENSMFAG00000034332) ENSMFAG00000050651 ENSMFAG00000064994 ENSMFAG00000000624 ENSMFAG00000048388 TNN (ENSMFAG00000001813) KIAA0040 (ENSMFAG00000051710) TNR (ENSMFAG00000038286) ENSMFAG00000048892 ENSMFAG00000064374 ENSMFAG00000056458 COP1 (ENSMFAG00000035358) ENSMFAG00000061100 #22 PAPPA2 (ENSMFAG00000040580) ENSMFAG00000029702 ASTN1 (ENSMFAG00000003043) BRINP2 (ENSMFAG00000036550) SEC16B (ENSMFAG00000040538) RASAL2 (ENSMFAG00000032705) CLEC20A (ENSMFAG00000040960) TEX35 (ENSMFAG00000046254) RALGPS2 (ENSMFAG00000001541) ANGPTL1 (ENSMFAG00000031474) FAM20B (ENSMFAG00000051981) TOR3A (ENSMFAG00000041376) ABL2 (ENSMFAG00000036564) ENSMFAG00000056060 SOAT1 (ENSMFAG00000037136) Crab-eating macaque MODERN SPECIES 7 GALR2 (ENSMFAG00000041508) SRP68 (ENSMFAG00000036758) EVPL (ENSMFAG00000039301) CDK3 (ENSMFAG00000032132) ENSMFAG00000056933 TRIM65 (ENSMFAG00000051824) TRIM47 (ENSMFAG00000040084) FBF1 (ENSMFAG00000000793) WBP2 (ENSMFAG00000031565) UNC13D (ENSMFAG00000026038) UNK (ENSMFAG00000037148) ENSMFAG00000053154 ENSMFAG00000035941 GALK1 (ENSMFAG00000016278) ITGB4 (ENSMFAG00000001695) ENSMFAG00000056670 #22 SAP30BP (ENSMFAG00000000434) SMIM5 (ENSMFAG00000034483) RECQL5 (ENSMFAG00000044550) ENSMFAG00000039726 LLGL2 (ENSMFAG00000001433) TSEN54 (ENSMFAG00000000712) CASKIN2 (ENSMFAG00000037054) TMEM94 (ENSMFAG00000003142) ENSMFAG00000059418 ENSMFAG00000048713 GRB2 (ENSMFAG00000000037) SLC25A19 (ENSMFAG00000030383) MRPS7 (ENSMFAG00000042971) GGA3 (ENSMFAG00000000928) NUP85 (ENSMFAG00000041786) Rhesus DUPLICATION Rhesus MODERN SPECIES TAF5L (ENSMMUG00000009508) ABCB10 (ENSMMUG00000022094) NUP133 (ENSMMUG00000022091) ENSMMUG00000054977 ACTA1 (ENSMMUG00000022086) ENSMMUG00000055996 CCSAP (ENSMMUG00000017722) RAB4A (ENSMMUG00000017720) ENSMMUG00000031107 RHOU (ENSMMUG00000057995) CCDC190 (ENSMMUG00000002585) RGS4 (ENSMMUG00000005185) RGS5 (ENSMMUG00000005186) ENSMMUG00000058513 NUF2 (ENSMMUG00000001152) ENSMMUG00000061702 #22 ENSMMUG00000056247 ENSMMUG00000031260 PBX1 (ENSMMUG00000019108) LMX1A (ENSMMUG00000006300) RXRG (ENSMMUG00000002892) LRRC52 (ENSMMUG00000015518) MGST3 (ENSMMUG00000015948) ALDH9A1 (ENSMMUG00000015946) ENSMMUG00000062066 TMCO1 (ENSMMUG00000005585) UCK2 (ENSMMUG00000053859) FAM78B (ENSMMUG00000057426) POGK (ENSMMUG00000017789) TADA1 (ENSMMUG00000017790) ILDR2 (ENSMMUG00000023462) Rhesus MODERN SPECIES NVL (ENSMMUG00000022510) #14 CNIH4 (ENSMMUG00000063959) #13 WDR26 (ENSMMUG00000012227) #12 CNIH3 (ENSMMUG00000010335) #11 ENSMMUG00000060677 ENSMMUG00000051471 LBR (ENSMMUG00000003472) #8 ENAH (ENSMMUG00000002227) #7 SRP9 (ENSMMUG00000000134) EPHX1 (ENSMMUG00000005782) #16 TMEM63A (ENSMMUG00000005785) #17 PYCR2 (ENSMMUG00000011434) #18 ENSMMUG00000011435 #18 ENSMMUG00000056097 SDE2 (ENSMMUG00000042699) #21 H3-3A (ENSMMUG00000055584) #22 ENSMMUG00000059492 ACBD3 (ENSMMUG00000019058) #23 ENSMMUG00000063956 MIXL1 (ENSMMUG00000005129) #24 LIN9 (ENSMMUG00000016014) #25 ENSMMUG00000050685 PARP1 (ENSMMUG00000021820) #26 STUM (ENSMMUG00000008640) #27 ITPKB (ENSMMUG00000061649) #28 PSEN2 (ENSMMUG00000018525) #29 COQ8A (ENSMMUG00000008636) #30 CDC42BPA (ENSMMUG00000008638) #31 ENSMMUG00000031497 JMJD4 (ENSMMUG00000053969) SNAP47 (ENSMMUG00000001869) Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb.n #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00940000157800 ENSGT00940000165228 ENSGT00520000062027 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a ENSGT00390000014620 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb.n #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00940000157800 ENSGT00520000062027 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT01100000263915.D ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a ENSGT00390000014620 Sooty mangabey MODERN SPECIES 513 NVL (ENSCATG00000040317) #14 CNIH4 (ENSCATG00000043768) #13 WDR26 (ENSCATG00000035046) #12 ENSCATG00000030513 CNIH3 (ENSCATG00000042269) #11 DNAH14 (ENSCATG00000039957) #9 LBR (ENSCATG00000031289) #8 ENAH (ENSCATG00000006720) #7 SRP9 (ENSCATG00000041813) EPHX1 (ENSCATG00000039564) #16 TMEM63A (ENSCATG00000039227) #17 ENSCATG00000019235 #18 PYCR2 (ENSCATG00000045074) #19 ENSCATG00000038680 #18 SDE2 (ENSCATG00000035151) #21 H3-3A (ENSCATG00000036239) #22 ACBD3 (ENSCATG00000043891) #23 MIXL1 (ENSCATG00000042419) #24 LIN9 (ENSCATG00000035907) #25 PARP1 (ENSCATG00000038981) #26 STUM (ENSCATG00000035656) #27 ITPKB (ENSCATG00000031660) #28 PSEN2 (ENSCATG00000043861) #29 COQ8A (ENSCATG00000005294) #30 CDC42BPA (ENSCATG00000036374) #31 Drill DUPLICATION Drill MODERN SPECIES 226 CYP2C8 (ENSMLEG00000038189) ENSMLEG00000042053 CYP2C93 (ENSMLEG00000038282) ENSMLEG00000040880 ENSMLEG00000043966 ENSMLEG00000024585 #22 PDLIM1 (ENSMLEG00000039026) SORBS1 (ENSMLEG00000036005) ALDH18A1 (ENSMLEG00000040804) TCTN3 (ENSMLEG00000032599) ENTPD1 (ENSMLEG00000032678) ENSMLEG00000031797 CC2D2B (ENSMLEG00000041340) CCNJ (ENSMLEG00000021833) ZNF518A (ENSMLEG00000020642) BLNK (ENSMLEG00000037312) DNTT (ENSMLEG00000041343) OPALIN (ENSMLEG00000028586) TLL2 (ENSMLEG00000042598) TM9SF3 (ENSMLEG00000032756) PIK3AP1 (ENSMLEG00000036975) Drill MODERN SPECIES 65 ENSMLEG00000013323 ZACN (ENSMLEG00000025220) GALR2 (ENSMLEG00000030156) SRP68 (ENSMLEG00000036941) EVPL (ENSMLEG00000033908) CDK3 (ENSMLEG00000027941) TEN1 (ENSMLEG00000008883) ACOX1 (ENSMLEG00000025380) FBF1 (ENSMLEG00000034808) MRPL38 (ENSMLEG00000043494) ENSMLEG00000042670 TRIM47 (ENSMLEG00000024755) WBP2 (ENSMLEG00000030522) UNC13D (ENSMLEG00000034592) UNK (ENSMLEG00000043327) ENSMLEG00000033321 #22 GALK1 (ENSMLEG00000028979) ITGB4 (ENSMLEG00000034614) SAP30BP (ENSMLEG00000029210) SMIM5 (ENSMLEG00000030911) RECQL5 (ENSMLEG00000033070) ENSMLEG00000043467 LLGL2 (ENSMLEG00000038952) TSEN54 (ENSMLEG00000044168) CASKIN2 (ENSMLEG00000028492) TMEM94 (ENSMLEG00000040372) GRB2 (ENSMLEG00000033030) ENSMLEG00000024923 SLC25A19 (ENSMLEG00000040542) MIF4GD (ENSMLEG00000031604) MRPS7 (ENSMLEG00000032202) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00390000002970 ENSGT00390000013448.a.a #15 ENSGT00570000079239 #14 ENSGT00950000182834.B #13 ENSGT00940000153634.b #12 ENSGT00950000182834.A.a.b.c #11 ENSGT00940000160505 #9 ENSGT00390000000417.a.a.b.a.b #8 ENSGT00940000157376 #7 ENSGT00390000018505.b ENSGT00390000002210.d #16 ENSGT00940000159576 #17 ENSGT00950000183044.a.a.a.c #19 ENSGT00390000010056 #18 ENSGT00530000063402.b #21 ENSGT01100000263504.a.a.yb.n #22 ENSGT00530000063651.a #23 ENSGT00940000162190 #24 ENSGT00390000003188 #25 ENSGT00940000156058 #26 ENSGT00390000008003 #27 ENSGT00940000156764.a #28 ENSGT00940000157923 #29 ENSGT00390000001627.f ENSGT00940000156810 #30 ENSGT01030000234517.H.b #31 ENSGT00940000156644 ENSGT00910000146652 ENSGT00940000157464 ENSGT00390000003512 ENSGT00940000156048.b Mas night monkey MODERN SPECIES 958 CNIH4 (ENSANAG00000022995) #13 WDR26 (ENSANAG00000028722) #12 ENSANAG00000017155 CNIH3 (ENSANAG00000035993) #11 ENSANAG00000029822 ENSANAG00000037634 #9 LBR (ENSANAG00000021538) #8 ENSANAG00000027368 #7 SRP9 (ENSANAG00000022626) EPHX1 (ENSANAG00000027514) #16 TMEM63A (ENSANAG00000020164) #17 ENSANAG00000029521 #18 PYCR2 (ENSANAG00000027686) #19 ENSANAG00000030058 #18 SDE2 (ENSANAG00000028299) #21 ENSANAG00000022092 #22 ENSANAG00000017653 ACBD3 (ENSANAG00000034586) #23 MIXL1 (ENSANAG00000029392) #24 LIN9 (ENSANAG00000004587) #25 PARP1 (ENSANAG00000032699) #26 STUM (ENSANAG00000027408) #27 ITPKB (ENSANAG00000024650) #28 PSEN2 (ENSANAG00000028143) #29 ENSANAG00000020132 COQ8A (ENSANAG00000027573) #30 CDC42BPA (ENSANAG00000030280) #31 ENSANAG00000028192 RHOU (ENSANAG00000023279) ENSANAG00000020122 RAB4A (ENSANAG00000032124) Cebidae ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00390000013448.a.a #15 ENSGT00570000079239 #14 ENSGT00950000182834.B #13 ENSGT00940000153634.b #12 ENSGT00950000182834.A.a.b.c #11 ENSGT00940000160505 #9 ENSGT00390000000417.a.a.b.a.b #8 ENSGT00940000157376 #7 ENSGT00390000018505.b ENSGT00390000002210.d #16 ENSGT00940000159576 #17 ENSGT00390000010056.l #18 ENSGT00950000183044.a.a.a.c #19 ENSGT00390000010056.k #18 ENSGT00530000063402.b #21 ENSGT01100000263504.a.a.yb.n #22 ENSGT00530000063651.a #23 ENSGT00940000162190 #24 ENSGT00390000003188 #25 ENSGT00940000156058 #26 ENSGT00390000008003 #27 ENSGT00940000156764.a #28 ENSGT00940000157923 #29 ENSGT00390000001627.f ENSGT00940000156810 #30 ENSGT01030000234517.H.b #31 ENSGT00940000156644 ENSGT00940000157464 ENSGT00390000003512 ENSGT00940000156048.b ENSGT00390000011529 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000013448.a.a #15 ENSGT00570000079239 #14 ENSGT00950000182834.B #13 ENSGT00940000153634.b #12 ENSGT00950000182834.A.a.b.c #11 ENSGT00940000160505 #9 ENSGT00390000000417.a.a.b.a.b #8 ENSGT00940000157376 #7 ENSGT00390000018505.b ENSGT00390000002210.d #16 ENSGT00940000159576 #17 ENSGT00390000010056.l #18 ENSGT00950000183044.a.a.a.c #19 ENSGT00390000010056.k #18 ENSGT00530000063402.b #21 ENSGT01100000263504.a.a.yb.n #22 ENSGT00530000063651.a #23 ENSGT00940000162190 #24 ENSGT00390000003188 #25 ENSGT00940000156058 #26 ENSGT00390000008003 #27 ENSGT00940000156764.a #28 ENSGT00940000157923 #29 ENSGT00390000001627.f ENSGT00940000156810 #30 ENSGT01030000234517.H.b #31 ENSGT00940000156644 ENSGT00940000157464 ENSGT00390000003512 ENSGT00940000156048.b ENSGT00390000011529 Capuchin MODERN SPECIES 234 RAB3D (ENSCCAG00000025383) TMEM205 (ENSCCAG00000036980) CCDC159 (ENSCCAG00000031662) PLPPR2 (ENSCCAG00000032464) SWSAP1 (ENSCCAG00000027417) EPOR (ENSCCAG00000036869) RGL3 (ENSCCAG00000028640) ODAD3 (ENSCCAG00000028303) PRKCSH (ENSCCAG00000022230) ELAVL3 (ENSCCAG00000034350) ZNF653 (ENSCCAG00000027104) ECSIT (ENSCCAG00000030491) ENSCCAG00000016051 CNN1 (ENSCCAG00000028138) ELOF1 (ENSCCAG00000033676) ENSCCAG00000018398 #22 ACP5 (ENSCCAG00000031739) ENSCCAG00000037049 ENSCCAG00000015998 ZNF823 (ENSCCAG00000037280) ZNF441 (ENSCCAG00000024894) ENSCCAG00000034489 ZNF433 (ENSCCAG00000031149) ZNF878 (ENSCCAG00000033113) ENSCCAG00000029056 ENSCCAG00000024419 ZNF20 (ENSCCAG00000000011) ZNF625 (ENSCCAG00000030631) ZNF136 (ENSCCAG00000017462) ZNF44 (ENSCCAG00000036843) ZNF563 (ENSCCAG00000030288) Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 79 WDR26 (ENSSBOG00000031377) #12 CNIH3 (ENSSBOG00000028177) #11 ENSSBOG00000026740 ENSSBOG00000030414 ENSSBOG00000028635 DNAH14 (ENSSBOG00000027125) #9 LBR (ENSSBOG00000032928) #8 ENAH (ENSSBOG00000032372) #7 SRP9 (ENSSBOG00000034573) EPHX1 (ENSSBOG00000019277) #16 TMEM63A (ENSSBOG00000034751) #17 ENSSBOG00000025223 #18 PYCR2 (ENSSBOG00000030067) #19 ENSSBOG00000024940 #18 SDE2 (ENSSBOG00000023524) #21 ENSSBOG00000034792 #22 ACBD3 (ENSSBOG00000033136) #23 MIXL1 (ENSSBOG00000030522) #24 LIN9 (ENSSBOG00000034500) #25 PARP1 (ENSSBOG00000010144) #26 ENSSBOG00000010799 STUM (ENSSBOG00000035359) #27 ITPKB (ENSSBOG00000029300) #28 PSEN2 (ENSSBOG00000028763) #29 COQ8A (ENSSBOG00000030114) #30 CDC42BPA (ENSSBOG00000035079) #31 Marmoset DUPLICATION Marmoset MODERN SPECIES 17 POLDIP2 (ENSCJAG00000012566) TNFAIP1 (ENSCJAG00000043671) ENSCJAG00000012534 NLK (ENSCJAG00000012490) ENSCJAG00000056336 LYRM9 (ENSCJAG00000012486) NOS2 (ENSCJAG00000012477) ENSCJAG00000012425 KSR1 (ENSCJAG00000012392) ENSCJAG00000072231 WSB1 (ENSCJAG00000012351) PELP1 (ENSCJAG00000012265) ARRB2 (ENSCJAG00000012115) MED11 (ENSCJAG00000045340) ZMYND15 (ENSCJAG00000012052) ENSCJAG00000079926 #22 ENSCJAG00000055994 ENSCJAG00000012044 VMO1 (ENSCJAG00000012039) GLTPD2 (ENSCJAG00000012028) PSMB6 (ENSCJAG00000012010) C17orf114 (ENSCJAG00000045517) PLD2 (ENSCJAG00000011918) MINK1 (ENSCJAG00000011830) CHRNE (ENSCJAG00000011799) C17orf107 (ENSCJAG00000042888) GP1BA (ENSCJAG00000076324) SLC25A11 (ENSCJAG00000011768) RNF167 (ENSCJAG00000011735) ENSCJAG00000011679 SPAG7 (ENSCJAG00000011659) Marmoset MODERN SPECIES 15 CSN1S1 (ENSCJAG00000014246) SULT1E1 (ENSCJAG00000014226) SULT1B1 (ENSCJAG00000014206) UGT2A1 (ENSCJAG00000014192) UGT2B4 (ENSCJAG00000013877) ENSCJAG00000047976 TMPRSS11E (ENSCJAG00000009972) YTHDC1 (ENSCJAG00000009934) TMPRSS11B (ENSCJAG00000009907) TMPRSS11F (ENSCJAG00000009889) TMPRSS11A (ENSCJAG00000009860) TMPRSS11D (ENSCJAG00000009845) GNRHR (ENSCJAG00000040295) UBA6 (ENSCJAG00000009707) STAP1 (ENSCJAG00000044149) ENSCJAG00000083470 #22 CENPC (ENSCJAG00000019497) ENSCJAG00000035174 ENSCJAG00000080261 EPHA5 (ENSCJAG00000020565) ENSCJAG00000071810 ENSCJAG00000071013 ENSCJAG00000007677 TECRL (ENSCJAG00000053305) ADGRL3 (ENSCJAG00000020576) ENSCJAG00000081106 IGFBP7 (ENSCJAG00000042323) POLR2B (ENSCJAG00000004118) NOA1 (ENSCJAG00000004102) REST (ENSCJAG00000004081) ENSCJAG00000085494 Marmoset MODERN SPECIES 10 CRB1 (ENSCJAG00000004825) ZBTB41 (ENSCJAG00000004794) ASPM (ENSCJAG00000004680) LBR (ENSCJAG00000004629) #8 ENAH (ENSCJAG00000012510) #7 ENSCJAG00000057654 SRP9 (ENSCJAG00000040095) ENSCJAG00000074178 EPHX1 (ENSCJAG00000012582) #16 TMEM63A (ENSCJAG00000012604) #17 ENSCJAG00000081248 #18 PYCR2 (ENSCJAG00000035770) #19 ENSCJAG00000074352 #18 ENSCJAG00000083204 SDE2 (ENSCJAG00000012685) #21 ENSCJAG00000085157 #22 ACBD3 (ENSCJAG00000038924) #23 MIXL1 (ENSCJAG00000012740) #24 ENSCJAG00000023047 LIN9 (ENSCJAG00000012743) #25 PARP1 (ENSCJAG00000012831) #26 STUM (ENSCJAG00000012889) #27 ITPKB (ENSCJAG00000012894) #28 PSEN2 (ENSCJAG00000012908) #29 COQ8A (ENSCJAG00000012948) #30 CDC42BPA (ENSCJAG00000012980) #31 ENSCJAG00000075541 RHOU (ENSCJAG00000046177) ENSCJAG00000011215 CCSAP (ENSCJAG00000011187) ACTA1 (ENSCJAG00000011114) Marmoset MODERN SPECIES 11 SSBP2 (ENSCJAG00000019418) ENSCJAG00000062963 ENSCJAG00000072035 RPS23 (ENSCJAG00000011247) ENSCJAG00000042632 ENSCJAG00000077051 XRCC4 (ENSCJAG00000011227) VCAN (ENSCJAG00000011161) ENSCJAG00000078201 HAPLN1 (ENSCJAG00000063471) ENSCJAG00000085055 ENSCJAG00000077518 EDIL3 (ENSCJAG00000040007) ENSCJAG00000073835 ENSCJAG00000072368 ENSCJAG00000083390 #22 ENSCJAG00000087022 RASA1 (ENSCJAG00000010941) CCNH (ENSCJAG00000010902) TMEM161B (ENSCJAG00000041282) ENSCJAG00000084377 MEF2C (ENSCJAG00000010799) CETN3 (ENSCJAG00000010761) MBLAC2 (ENSCJAG00000039786) ENSCJAG00000010747 LYSMD3 (ENSCJAG00000066019) ADGRV1 (ENSCJAG00000010578) ARRDC3 (ENSCJAG00000010525) ENSCJAG00000078673 ENSCJAG00000085926 ENSCJAG00000072601 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT01100000263504.a.b.a.a ##22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00520000062027 ENSGT00940000157800 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a ENSGT00390000014620 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 Mouse lemur MODERN SPECIES 8 ENSMICG00000030956 WDR26 (ENSMICG00000006896) #12 CNIH3 (ENSMICG00000031871) #11 DNAH14 (ENSMICG00000037251) #9 ENSMICG00000031047 LBR (ENSMICG00000010070) #8 ENAH (ENSMICG00000010930) #7 ENSMICG00000009785 ENSMICG00000030104 EPHX1 (ENSMICG00000034513) #16 TMEM63A (ENSMICG00000004058) #17 ENSMICG00000027213 PYCR2 (ENSMICG00000017416) #19 ENSMICG00000041934 #18 SDE2 (ENSMICG00000004083) #21 H3-3A (ENSMICG00000044151) #22 ACBD3 (ENSMICG00000035503) #23 MIXL1 (ENSMICG00000046165) #24 LIN9 (ENSMICG00000017073) #25 PARP1 (ENSMICG00000017076) #26 STUM (ENSMICG00000042487) #27 ITPKB (ENSMICG00000038100) #28 PSEN2 (ENSMICG00000013427) #29 COQ8A (ENSMICG00000013440) #30 CDC42BPA (ENSMICG00000013466) #31 AHCTF1 (ENSMICG00000014617) #32 ENSMICG00000034974 SCCPDH (ENSMICG00000014588) #34 CNST (ENSMICG00000036496) #35 TFB2M (ENSMICG00000016790) #36 SMYD3 (ENSMICG00000005665) #37 Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 Coquerels sifaka MODERN SPECIES 213 STK38L (ENSPCOG00000018208) BMAL2 (ENSPCOG00000026401) ENSPCOG00000026042 C12orf71 (ENSPCOG00000025010) PPFIBP1 (ENSPCOG00000024753) ENSPCOG00000015665 MANSC4 (ENSPCOG00000024207) KLHL42 (ENSPCOG00000028752) ENSPCOG00000013305 PTHLH (ENSPCOG00000027440) ENSPCOG00000020695 ENSPCOG00000023013 FAR2 (ENSPCOG00000027898) ERGIC2 (ENSPCOG00000014778) ENSPCOG00000028682 ENSPCOG00000026485 #22 TMTC1 (ENSPCOG00000023799) IPO8 (ENSPCOG00000018051) CAPRIN2 (ENSPCOG00000024022) ENSPCOG00000003937 SINHCAF (ENSPCOG00000017031) ENSPCOG00000013437 DENND5B (ENSPCOG00000005713) ETFBKMT (ENSPCOG00000008785) ENSPCOG00000003031 AMN1 (ENSPCOG00000020340) RESF1 (ENSPCOG00000017729) BICD1 (ENSPCOG00000017875) FGD4 (ENSPCOG00000025045) DNM1L (ENSPCOG00000022418) YARS2 (ENSPCOG00000026397) Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 732 ENSPSMG00000008603 CISD2 (ENSPSMG00000008448) ENSPSMG00000008428 #22 SLC9B1 (ENSPSMG00000008420) Bushbaby DUPLICATION Bushbaby MODERN SPECIES 133 GGA3 (ENSOGAG00000008100) MRPS7 (ENSOGAG00000008103) MIF4GD (ENSOGAG00000011973) SLC25A19 (ENSOGAG00000003064) GRB2 (ENSOGAG00000003066) TMEM94 (ENSOGAG00000001436) CASKIN2 (ENSOGAG00000001439) TSEN54 (ENSOGAG00000001442) LLGL2 (ENSOGAG00000001444) ENSOGAG00000001451 ENSOGAG00000001455 RECQL5 (ENSOGAG00000001457) SAP30BP (ENSOGAG00000001462) ITGB4 (ENSOGAG00000001913) GALK1 (ENSOGAG00000001918) ENSOGAG00000034528 #22 ENSOGAG00000025933 #22 UNK (ENSOGAG00000001922) UNC13D (ENSOGAG00000001927) WBP2 (ENSOGAG00000001934) TRIM47 (ENSOGAG00000001935) TRIM65 (ENSOGAG00000001937) MRPL38 (ENSOGAG00000001939) FBF1 (ENSOGAG00000001940) ACOX1 (ENSOGAG00000001941) TEN1 (ENSOGAG00000025806) CDK3 (ENSOGAG00000001943) EVPL (ENSOGAG00000032503) SRP68 (ENSOGAG00000001948) GALR2 (ENSOGAG00000027563) ZACN (ENSOGAG00000001951) Bushbaby MODERN SPECIES 133 EXOC7 (ENSOGAG00000001955) ZACN (ENSOGAG00000001951) GALR2 (ENSOGAG00000027563) SRP68 (ENSOGAG00000001948) EVPL (ENSOGAG00000032503) CDK3 (ENSOGAG00000001943) TEN1 (ENSOGAG00000025806) ACOX1 (ENSOGAG00000001941) FBF1 (ENSOGAG00000001940) MRPL38 (ENSOGAG00000001939) TRIM65 (ENSOGAG00000001937) TRIM47 (ENSOGAG00000001935) WBP2 (ENSOGAG00000001934) UNC13D (ENSOGAG00000001927) UNK (ENSOGAG00000001922) ENSOGAG00000025933 #22 ENSOGAG00000034528 #22 GALK1 (ENSOGAG00000001918) ITGB4 (ENSOGAG00000001913) SAP30BP (ENSOGAG00000001462) RECQL5 (ENSOGAG00000001457) ENSOGAG00000001455 ENSOGAG00000001451 LLGL2 (ENSOGAG00000001444) TSEN54 (ENSOGAG00000001442) CASKIN2 (ENSOGAG00000001439) TMEM94 (ENSOGAG00000001436) GRB2 (ENSOGAG00000003066) SLC25A19 (ENSOGAG00000003064) MIF4GD (ENSOGAG00000011973) MRPS7 (ENSOGAG00000008103) Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00520000062027 ENSGT00940000157800 ENSGT00930000151032.B ENSGT00940000155335 ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000181148 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00520000062027 ENSGT00940000157800 ENSGT00930000151032.B ENSGT00940000155335 ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000181148 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00520000062027 ENSGT00940000157800 ENSGT00930000151032.B ENSGT00940000155335 ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000181148 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a Carnivora ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00520000062027 ENSGT00940000157800 ENSGT00930000151032.B ENSGT00940000155335 ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000181148 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a Felidae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00940000157800 ENSGT00940000165228 ENSGT00520000062027 ENSGT00930000151032.B ENSGT00940000155335 ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a Cat MODERN SPECIES 245 FOXJ1 (ENSFCAG00000005772) EXOC7 (ENSFCAG00000005771) ZACN (ENSFCAG00000005769) ENSFCAG00000045598 SRP68 (ENSFCAG00000005768) EVPL (ENSFCAG00000029136) CDK3 (ENSFCAG00000005766) ACOX1 (ENSFCAG00000005765) FBF1 (ENSFCAG00000005764) MRPL38 (ENSFCAG00000005763) TRIM65 (ENSFCAG00000046456) TRIM47 (ENSFCAG00000005761) WBP2 (ENSFCAG00000043985) UNC13D (ENSFCAG00000005759) UNK (ENSFCAG00000005757) H3-3B (ENSFCAG00000030424) #22 GALK1 (ENSFCAG00000005755) ITGB4 (ENSFCAG00000005754) SAP30BP (ENSFCAG00000036444) ENSFCAG00000051160 SMIM6 (ENSFCAG00000044791) SMIM5 (ENSFCAG00000029987) RECQL5 (ENSFCAG00000005751) MYO15B (ENSFCAG00000005749) LLGL2 (ENSFCAG00000005747) TSEN54 (ENSFCAG00000023712) CASKIN2 (ENSFCAG00000005745) TMEM94 (ENSFCAG00000005744) GRB2 (ENSFCAG00000022474) SLC25A19 (ENSFCAG00000014520) MIF4GD (ENSFCAG00000014518) Panthera ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00390000002970 ENSGT00390000013448.a.a.v #15 ENSGT00570000079239 #14 ENSGT00950000182834.B #13 ENSGT00940000153634.b #12 ENSGT00950000182834.A.a.b.c #11 ENSGT00940000160505 #9 ENSGT00390000000417.a.a.b.a.b #8 ENSGT00940000157376 #7 ENSGT00390000018505.b ENSGT00390000002210.d #16 ENSGT00940000159576 #17 ENSGT00950000183044.a.a.a.c #19 ENSGT00390000010056 #18 ENSGT00530000063402.b #21 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT00530000063651.a #23 ENSGT00940000162190 #24 ENSGT00390000003188 #25 ENSGT00940000156058 #26 ENSGT00390000008003 #27 ENSGT00940000156764.a #28 ENSGT00940000157923 #29 ENSGT00940000156810 #30 ENSGT01030000234517.H.b #31 ENSGT00390000018900 #32 ENSGT00940000163104 #33 ENSGT00390000004799 #34 ENSGT00390000005861 #35 ENSGT00950000183142.a.b.a.b #36 ENSGT00940000156766 #37 Panthera_a ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00390000002970 ENSGT00390000013448.a.a.v #15 ENSGT00570000079239 #14 ENSGT00950000182834.B #13 ENSGT00940000153634.b #12 ENSGT00950000182834.A.a.b.c #11 ENSGT00940000160505 #9 ENSGT00390000000417.a.a.b.a.b #8 ENSGT00940000157376 #7 ENSGT00390000018505.b ENSGT00390000002210.d #16 ENSGT00940000159576 #17 ENSGT00950000183044.a.a.a.c #19 ENSGT00390000010056 #18 ENSGT00530000063402.b #21 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT00530000063651.a #23 ENSGT00940000162190 #24 ENSGT00390000003188 #25 ENSGT00940000156058 #26 ENSGT00390000008003 #27 ENSGT00940000156764.a #28 ENSGT00940000157923 #29 ENSGT00940000156810 #30 ENSGT01030000234517.H.b #31 ENSGT00390000018900 #32 ENSGT00940000163104 #33 ENSGT00390000004799 #34 ENSGT00390000005861 #35 ENSGT00950000183142.a.b.a.b #36 ENSGT00940000156766 #37 lion MODERN SPECIES 8 TAFA3 (ENSPLOG00000020057) ENSPLOG00000020035 ENSPLOG00000020002 LRIG2 (ENSPLOG00000019954) MAGI3 (ENSPLOG00000019634) PHTF1 (ENSPLOG00000019325) RSBN1 (ENSPLOG00000019230) PTPN22 (ENSPLOG00000018355) BCL2L15 (ENSPLOG00000018045) AP4B1 (ENSPLOG00000017914) DCLRE1B (ENSPLOG00000017828) HIPK1 (ENSPLOG00000017319) OLFML3 (ENSPLOG00000017170) SYT6 (ENSPLOG00000017004) TRIM33 (ENSPLOG00000016841) ENSPLOG00000016808 #22 BCAS2 (ENSPLOG00000016764) DENND2C (ENSPLOG00000016707) AMPD1 (ENSPLOG00000016449) NRAS (ENSPLOG00000016315) CSDE1 (ENSPLOG00000015680) SIKE1 (ENSPLOG00000015473) ENSPLOG00000015461 ENSPLOG00000015234 SYCP1 (ENSPLOG00000014657) TSHB (ENSPLOG00000014568) TSPAN2 (ENSPLOG00000014519) ENSPLOG00000014415 NGF (ENSPLOG00000014389) VANGL1 (ENSPLOG00000014377) CASQ2 (ENSPLOG00000014262) leopard MODERN SPECIES 4 DNAH14 (ENSPPRG00000006163) #9 LBR (ENSPPRG00000018166) #8 ENAH (ENSPPRG00000015078) #7 SRP9 (ENSPPRG00000011732) EPHX1 (ENSPPRG00000011566) #16 TMEM63A (ENSPPRG00000010133) #17 ENSPPRG00000008898 #18 PYCR2 (ENSPPRG00000008433) #19 ENSPPRG00000006189 #18 SDE2 (ENSPPRG00000005139) #21 H3-3A (ENSPPRG00000004900) #22 ENSPPRG00000004470 #23 MIXL1 (ENSPPRG00000004369) #24 LIN9 (ENSPPRG00000003816) #25 PARP1 (ENSPPRG00000003528) #26 STUM (ENSPPRG00000002817) #27 ITPKB (ENSPPRG00000002311) #28 PSEN2 (ENSPPRG00000002017) #29 COQ8A (ENSPPRG00000022935) #30 CDC42BPA (ENSPPRG00000024128) #31 ENSPPRG00000009605 #33 SCCPDH (ENSPPRG00000008599) #34 CNST (ENSPPRG00000008188) #35 TFB2M (ENSPPRG00000007350) #36 SMYD3 (ENSPPRG00000007149) #37 KIF26B (ENSPPRG00000005611) Tiger DUPLICATION Tiger MODERN SPECIES 353 UBALD2 (ENSPTIG00000013491) RNF157 (ENSPTIG00000013103) EXOC7 (ENSPTIG00000011056) ZACN (ENSPTIG00000010722) ENSPTIG00000010540 SRP68 (ENSPTIG00000010191) ENSPTIG00000009173 CDK3 (ENSPTIG00000009022) TEN1 (ENSPTIG00000008942) ACOX1 (ENSPTIG00000008661) MRPL38 (ENSPTIG00000007049) TRIM65 (ENSPTIG00000006979) TRIM47 (ENSPTIG00000006661) WBP2 (ENSPTIG00000006329) UNK (ENSPTIG00000005435) ENSPTIG00000004952 #22 GALK1 (ENSPTIG00000003631) ITGB4 (ENSPTIG00000021246) SAP30BP (ENSPTIG00000021057) SMIM6 (ENSPTIG00000009586) SMIM5 (ENSPTIG00000020992) RECQL5 (ENSPTIG00000020601) ENSPTIG00000020332 ENSPTIG00000020188 ENSPTIG00000020097 ENSPTIG00000019340 TSEN54 (ENSPTIG00000019312) ENSPTIG00000019291 TMEM94 (ENSPTIG00000018810) GRB2 (ENSPTIG00000018194) SLC25A19 (ENSPTIG00000018082) Tiger MODERN SPECIES 571 TP53BP2 (ENSPTIG00000013719) FBXO28 (ENSPTIG00000013765) DEGS1 (ENSPTIG00000013966) #15 NVL (ENSPTIG00000013981) #14 CNIH4 (ENSPTIG00000014093) #13 WDR26 (ENSPTIG00000014132) #12 CNIH3 (ENSPTIG00000014198) #11 DNAH14 (ENSPTIG00000014279) #9 LBR (ENSPTIG00000014694) #8 ENAH (ENSPTIG00000014773) #7 SRP9 (ENSPTIG00000014838) ENSPTIG00000014848 #16 TMEM63A (ENSPTIG00000014886) #17 PYCR2 (ENSPTIG00000014933) #19 SDE2 (ENSPTIG00000015111) #21 ENSPTIG00000015121 #22 ACBD3 (ENSPTIG00000015131) #23 Caniformia ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00520000062027 ENSGT00940000157800 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000181148 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a ENSGT00390000014620 Canidae ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00520000062027 ENSGT00940000157800 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000181148 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a ENSGT00390000014620 Red fox MODERN SPECIES 31 FOXJ1 (ENSVVUG00000015093) EXOC7 (ENSVVUG00000015044) GALR2 (ENSVVUG00000015033) SRP68 (ENSVVUG00000015027) ENSVVUG00000014941 CDK3 (ENSVVUG00000014925) TEN1 (ENSVVUG00000014922) ACOX1 (ENSVVUG00000014918) FBF1 (ENSVVUG00000014915) MRPL38 (ENSVVUG00000014914) TRIM65 (ENSVVUG00000014913) TRIM47 (ENSVVUG00000014911) WBP2 (ENSVVUG00000014910) UNC13D (ENSVVUG00000014822) UNK (ENSVVUG00000014786) ENSVVUG00000014780 #22 GALK1 (ENSVVUG00000014776) ITGB4 (ENSVVUG00000011733) SAP30BP (ENSVVUG00000011535) SMIM5 (ENSVVUG00000011531) RECQL5 (ENSVVUG00000011515) ENSVVUG00000011506 ENSVVUG00000011461 LLGL2 (ENSVVUG00000011427) TSEN54 (ENSVVUG00000011411) CASKIN2 (ENSVVUG00000011393) TMEM94 (ENSVVUG00000011343) GRB2 (ENSVVUG00000011327) SLC25A19 (ENSVVUG00000011319) MIF4GD (ENSVVUG00000011277) MRPS7 (ENSVVUG00000011263) Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00520000062027 ENSGT00940000157800 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a ENSGT00390000014620 ENSGT00940000157333 Ursidae ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00520000062027 ENSGT00940000157800 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a ENSGT00390000014620 ENSGT00940000157333 Giant Panda DUPLICATION Giant Panda MODERN SPECIES 1467 ENSAMEG00000026636 #22 Giant Panda MODERN SPECIES 4 FOXJ1 (ENSAMEG00000010217) EXOC7 (ENSAMEG00000010140) ZACN (ENSAMEG00000010133) GALR2 (ENSAMEG00000010124) SRP68 (ENSAMEG00000010078) ENSAMEG00000010053 CDK3 (ENSAMEG00000010028) ACOX1 (ENSAMEG00000009993) FBF1 (ENSAMEG00000009960) MRPL38 (ENSAMEG00000009947) TRIM65 (ENSAMEG00000030442) TRIM47 (ENSAMEG00000009928) WBP2 (ENSAMEG00000027016) UNC13D (ENSAMEG00000009825) UNK (ENSAMEG00000009769) H3-3B (ENSAMEG00000009765) #22 GALK1 (ENSAMEG00000009739) ITGB4 (ENSAMEG00000009619) SAP30BP (ENSAMEG00000009518) SMIM5 (ENSAMEG00000009617) RECQL5 (ENSAMEG00000009566) MYO15B (ENSAMEG00000027824) LLGL2 (ENSAMEG00000009430) TSEN54 (ENSAMEG00000009414) CASKIN2 (ENSAMEG00000009400) TMEM94 (ENSAMEG00000009346) GRB2 (ENSAMEG00000009339) SLC25A19 (ENSAMEG00000009328) MIF4GD (ENSAMEG00000009313) MRPS7 (ENSAMEG00000009287) GGA3 (ENSAMEG00000009242) Mustelinae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00520000062027 ENSGT00940000157800 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a ENSGT00390000014620 ENSGT00940000157333 American mink MODERN SPECIES 27 EXOC7 (ENSNVIG00000012102) ZACN (ENSNVIG00000012074) GALR2 (ENSNVIG00000012065) SRP68 (ENSNVIG00000012003) ENSNVIG00000011966 CDK3 (ENSNVIG00000011927) TEN1 (ENSNVIG00000011899) ACOX1 (ENSNVIG00000011817) FBF1 (ENSNVIG00000011665) MRPL38 (ENSNVIG00000011652) TRIM65 (ENSNVIG00000011629) TRIM47 (ENSNVIG00000011613) WBP2 (ENSNVIG00000011593) UNC13D (ENSNVIG00000011435) UNK (ENSNVIG00000011415) ENSNVIG00000011392 #22 GALK1 (ENSNVIG00000011378) ITGB4 (ENSNVIG00000011198) SAP30BP (ENSNVIG00000011161) SMIM5 (ENSNVIG00000011133) RECQL5 (ENSNVIG00000011059) ENSNVIG00000011041 ENSNVIG00000011005 LLGL2 (ENSNVIG00000010973) TSEN54 (ENSNVIG00000010933) CASKIN2 (ENSNVIG00000010892) TMEM94 (ENSNVIG00000010819) GRB2 (ENSNVIG00000010758) SLC25A19 (ENSNVIG00000010719) MIF4GD (ENSNVIG00000010666) MRPS7 (ENSNVIG00000010616) Ferret DUPLICATION Ferret MODERN SPECIES 246 FBXO28 (ENSMPUG00000004002) DEGS1 (ENSMPUG00000004010) #15 NVL (ENSMPUG00000004031) #14 WDR26 (ENSMPUG00000004049) #12 CNIH3 (ENSMPUG00000004163) #11 ENSMPUG00000004174 #9 LBR (ENSMPUG00000004384) #8 ENAH (ENSMPUG00000004394) #7 EPHX1 (ENSMPUG00000004409) #16 ENSMPUG00000004459 TMEM63A (ENSMPUG00000004462) #17 PYCR2 (ENSMPUG00000004479) #19 ENSMPUG00000004487 #18 ENSMPUG00000004540 SDE2 (ENSMPUG00000004543) #21 ENSMPUG00000004555 #22 ACBD3 (ENSMPUG00000004563) #23 LIN9 (ENSMPUG00000004573) #25 PARP1 (ENSMPUG00000004585) #26 ITPKB (ENSMPUG00000004596) #28 ENSMPUG00000018474 PRDX6 (ENSMPUG00000004648) SLC9C2 (ENSMPUG00000004656) ANKRD45 (ENSMPUG00000004688) KLHL20 (ENSMPUG00000004695) CENPL (ENSMPUG00000004707) DARS2 (ENSMPUG00000004716) ZBTB37 (ENSMPUG00000004728) SERPINC1 (ENSMPUG00000004735) RC3H1 (ENSMPUG00000004747) ENSMPUG00000004762 Ferret MODERN SPECIES 186 EXOC7 (ENSMPUG00000013525) ZACN (ENSMPUG00000013532) GALR2 (ENSMPUG00000013542) SRP68 (ENSMPUG00000013547) ENSMPUG00000013619 CDK3 (ENSMPUG00000013625) ENSMPUG00000013676 ACOX1 (ENSMPUG00000013679) FBF1 (ENSMPUG00000013754) MRPL38 (ENSMPUG00000013759) TRIM65 (ENSMPUG00000013762) TRIM47 (ENSMPUG00000013773) WBP2 (ENSMPUG00000013775) UNC13D (ENSMPUG00000013795) UNK (ENSMPUG00000013806) ENSMPUG00000013811 #22 GALK1 (ENSMPUG00000013819) ITGB4 (ENSMPUG00000013821) SAP30BP (ENSMPUG00000013829) RECQL5 (ENSMPUG00000013833) ENSMPUG00000013837 LLGL2 (ENSMPUG00000013865) TSEN54 (ENSMPUG00000013870) CASKIN2 (ENSMPUG00000013874) TMEM94 (ENSMPUG00000013877) GRB2 (ENSMPUG00000013882) SLC25A19 (ENSMPUG00000013885) MIF4GD (ENSMPUG00000013909) MRPS7 (ENSMPUG00000013928) GGA3 (ENSMPUG00000013944) NUP85 (ENSMPUG00000013951) Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00520000062027 ENSGT00940000157800 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a ENSGT00390000014620 ENSGT00940000157333 Equus ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 Donkey MODERN SPECIES 3 REEP2 (ENSEASG00005020807) KDM3B (ENSEASG00005020793) FAM53C (ENSEASG00005020786) ENSEASG00005020781 CDC25C (ENSEASG00005020776) GFRA3 (ENSEASG00005020771) CDC23 (ENSEASG00005020721) KIF20A (ENSEASG00005020674) BRD8 (ENSEASG00005020657) NME5 (ENSEASG00005020647) WNT8A (ENSEASG00005038334) FAM13B (ENSEASG00005020624) PKD2L2 (ENSEASG00005020612) MYOT (ENSEASG00005020604) ENSEASG00005020596 ENSEASG00005038534 #22 HNRNPA0 (ENSEASG00005028445) KLHL3 (ENSEASG00005020585) SPOCK1 (ENSEASG00005020567) TRPC7 (ENSEASG00005020538) SMIM32 (ENSEASG00005020531) SMAD5 (ENSEASG00005020529) TGFBI (ENSEASG00005020514) LECT2 (ENSEASG00005026412) ENSEASG00005023760 IL9 (ENSEASG00005020504) SLC25A48 (ENSEASG00005020501) ENSEASG00005020496 ENSEASG00005036931 NEUROG1 (ENSEASG00005020492) TIFAB (ENSEASG00005020490) Chiroptera ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00520000062027 ENSGT00940000157800 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a ENSGT00390000014620 ENSGT00940000157333 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00390000013448.a.a #15 ENSGT00570000079239 #14 ENSGT00950000182834.B #13 ENSGT00940000153634.b #12 ENSGT00950000182834.A.a.b.c #11 ENSGT00940000160505 #9 ENSGT00390000000417.a.a.b.a.b #8 ENSGT00940000157376 #7 ENSGT00390000018505.b ENSGT00390000002210.d #16 ENSGT00940000159576 #17 ENSGT00950000183044.a.a.a.c #19 ENSGT00390000010056 #18 ENSGT00530000063402.b #21 ENSGT01100000263504.a.b.b.b.b ##22 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT00530000063651.a #23 ENSGT00940000162190 #24 ENSGT00390000003188 #25 ENSGT00940000156058 #26 ENSGT00390000008003 #27 ENSGT00940000156764.a #28 ENSGT00940000157923 #29 ENSGT00940000156810 #30 ENSGT01030000234517.H.b #31 ENSGT00390000018900 #32 ENSGT00940000178689 ENSGT00390000004799 #34 ENSGT00390000005861 #35 ENSGT00950000183142.a.b.a.b #36 ENSGT00940000156766 #37 Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 10 ENSRFEG00010010493 ENSRFEG00010017327 NDUFV2 (ENSRFEG00010017276) ANKRD12 (ENSRFEG00010017178) ENSRFEG00010017125 TWSG1 (ENSRFEG00010017042) ENSRFEG00010017006 RALBP1 (ENSRFEG00010016953) PPP4R1 (ENSRFEG00010016839) RAB31 (ENSRFEG00010016775) ENSRFEG00010016552 VAPA (ENSRFEG00010016518) APCDD1 (ENSRFEG00010016460) NAPG (ENSRFEG00010016419) ENSRFEG00010016354 ENSRFEG00010016335 #22 PIEZO2 (ENSRFEG00010011535) ENSRFEG00010011333 GNAL (ENSRFEG00010011263) MPPE1 (ENSRFEG00010011175) IMPA2 (ENSRFEG00010011097) CIDEA (ENSRFEG00010011034) TUBB6 (ENSRFEG00010010921) AFG3L2 (ENSRFEG00010010859) PRELID3A (ENSRFEG00010010757) SPIRE1 (ENSRFEG00010010443) CEP76 (ENSRFEG00010010291) PSMG2 (ENSRFEG00010010190) ENSRFEG00010010139 PTPN2 (ENSRFEG00010010030) ENSRFEG00010010007 Microbat DUPLICATION Microbat MODERN SPECIES 2057 ENSMLUG00000015277 #22 ACBD3 (ENSMLUG00000008288) #23 Microbat DUPLICATION Microbat MODERN SPECIES 1672 ENSMLUG00000003474 TMEM160 (ENSMLUG00000023661) ARHGAP35 (ENSMLUG00000003739) ENSMLUG00000027160 ENSMLUG00000022578 #22 Microbat MODERN SPECIES 1085 ADRA1A (ENSMLUG00000027812) ENSMLUG00000023958 ENSMLUG00000025762 #22 DPYSL2 (ENSMLUG00000000271) BNIP3L (ENSMLUG00000014949) PPP2R2A (ENSMLUG00000030355) EBF2 (ENSMLUG00000011509) CDCA2 (ENSMLUG00000006321) KCTD9 (ENSMLUG00000006310) GNRH1 (ENSMLUG00000006306) DOCK5 (ENSMLUG00000006278) ENSMLUG00000029940 ADAM7 (ENSMLUG00000009580) ADAMDEC1 (ENSMLUG00000009552) ADAM28 (ENSMLUG00000009526) ENSMLUG00000027935 ENSMLUG00000023520 STC1 (ENSMLUG00000010663) Microbat MODERN SPECIES 1476 ENSMLUG00000025680 ENSMLUG00000003919 #37 ENSMLUG00000027768 #22 TFB2M (ENSMLUG00000003923) #36 ENSMLUG00000014074 Megabat DUPLICATION Megabat MODERN SPECIES 2194 EXOC7 (ENSPVAG00000008490) ZACN (ENSPVAG00000008488) GALR2 (ENSPVAG00000008486) SRP68 (ENSPVAG00000008484) ENSPVAG00000008481 CDK3 (ENSPVAG00000008480) TEN1 (ENSPVAG00000008478) ACOX1 (ENSPVAG00000008477) FBF1 (ENSPVAG00000008471) MRPL38 (ENSPVAG00000008468) TRIM65 (ENSPVAG00000008466) TRIM47 (ENSPVAG00000008464) WBP2 (ENSPVAG00000008463) UNC13D (ENSPVAG00000008462) UNK (ENSPVAG00000008460) ENSPVAG00000008459 #22 GALK1 (ENSPVAG00000008457) ITGB4 (ENSPVAG00000008456) SAP30BP (ENSPVAG00000008454) RECQL5 (ENSPVAG00000008452) ENSPVAG00000008451 ENSPVAG00000008449 ENSPVAG00000008448 LLGL2 (ENSPVAG00000008447) TSEN54 (ENSPVAG00000008446) CASKIN2 (ENSPVAG00000008444) TMEM94 (ENSPVAG00000008441) GRB2 (ENSPVAG00000008439) SLC25A19 (ENSPVAG00000008437) MIF4GD (ENSPVAG00000008435) MRPS7 (ENSPVAG00000008433) Megabat MODERN SPECIES 1071 EPHX1 (ENSPVAG00000004784) #16 TMEM63A (ENSPVAG00000004786) #17 ENSPVAG00000004790 #18 PYCR2 (ENSPVAG00000004794) #19 ENSPVAG00000004795 #18 SDE2 (ENSPVAG00000004796) #21 ENSPVAG00000004797 #22 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00520000062027 ENSGT00940000157800 ENSGT00930000151032.B ENSGT00940000155335 ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a ENSGT00390000014620 Suina ANCESTRAL SPECIES 55 ENSGT00390000013448.a.a #15 ENSGT00570000079239 #14 ENSGT00950000182834.B #13 ENSGT00940000153634.b #12 ENSGT00950000182834.A.a.b.c #11 ENSGT00940000160505 #9 ENSGT00390000000417.a.a.b.a.b #8 ENSGT00940000157376 #7 ENSGT00390000018505.b ENSGT00390000002210.d #16 ENSGT00940000159576 #17 ENSGT00950000183044.a.a.a.c #19 ENSGT00390000010056 #18 ENSGT00530000063402.b #21 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT01100000263504.a.b.b.a.b ##22 ENSGT00530000063651.a #23 ENSGT00940000162190 #24 ENSGT00390000003188 #25 ENSGT00940000156058 #26 ENSGT00390000008003 #27 ENSGT00940000156764.a.b #28 ENSGT00940000157923 #29 ENSGT00940000156810 #30 ENSGT01030000234517.H.b #31 ENSGT00390000018900 #32 ENSGT00940000163104 #33 ENSGT00390000004799.j #34 ENSGT00390000005861 #35 ENSGT00950000183142.a.b.a.b #36 Pig MODERN SPECIES 16 KDR (ENSSSCG00000008844) ENSSSCG00000008845 ENSSSCG00000034355 ENSSSCG00000053955 ENSSSCG00000008850 ENSSSCG00000008892 ENSSSCG00000057119 ENSSSCG00000061357 ENSSSCG00000036417 ENSSSCG00000042370 ENSSSCG00000043541 MAP9 (ENSSSCG00000008852) TLL1 (ENSSSCG00000008853) ENSSSCG00000046178 CPE (ENSSSCG00000008854) ENSSSCG00000008855 #22 MSMO1 (ENSSSCG00000008857) KLHL2 (ENSSSCG00000008858) TMEM192 (ENSSSCG00000020868) ENSSSCG00000046428 ENSSSCG00000008860 ENSSSCG00000044849 ENSSSCG00000045736 ENSSSCG00000062623 ENSSSCG00000051162 ENSSSCG00000050154 ENSSSCG00000047847 ENSSSCG00000048616 GUCY1A1 (ENSSSCG00000008866) GUCY1B1 (ENSSSCG00000008870) ASIC5 (ENSSSCG00000008869) Chacoan peccary MODERN SPECIES 50 NVL (ENSCWAG00000008427) #14 CNIH4 (ENSCWAG00000008250) #13 WDR26 (ENSCWAG00000008179) #12 ENSCWAG00000008140 ##11 ENSCWAG00000007925 ENSCWAG00000007839 #9 ENSCWAG00000007806 #9 LBR (ENSCWAG00000007748) #8 ENAH (ENSCWAG00000007692) #7 SRP9 (ENSCWAG00000007657) EPHX1 (ENSCWAG00000007633) #16 TMEM63A (ENSCWAG00000007524) #17 PYCR2 (ENSCWAG00000007472) #19 ENSCWAG00000007440 #18 SDE2 (ENSCWAG00000007407) #21 H3-3A (ENSCWAG00000007368) #22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00520000062027 ENSGT00940000157800 ENSGT00930000151032.B ENSGT00940000155335 ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a ENSGT00390000014620 Camelidae ANCESTRAL SPECIES 42 ENSGT00390000013448.a.a #15 ENSGT00570000079239 #14 ENSGT00950000182834.B #13 ENSGT00940000153634.b #12 ENSGT00950000182834.A.a.b.c #11 ENSGT00390000000412 ENSGT00940000160505 #9 ENSGT00390000000417.a.a.b.a.b #8 ENSGT00940000157376 #7 ENSGT00390000018505.b ENSGT00390000002210.d #16 ENSGT00940000159576 #17 ENSGT00950000183044.a.a.a.c #19 ENSGT00390000010056 #18 ENSGT00530000063402.b #21 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT00530000063651.a #23 ENSGT00940000162190 #24 ENSGT00390000003188 #25 ENSGT00940000156058 #26 ENSGT00390000008003 #27 ENSGT00940000156764.a #28 ENSGT00940000157923 #29 ENSGT00940000156810 #30 ENSGT01030000234517.H.b #31 ENSGT00390000018900 #32 ENSGT00940000163104 #33 ENSGT00390000004799 #34 ENSGT00390000005861 #35 ENSGT00950000183142.a.b.a.b #36 ENSGT00940000156766 #37 Alpaca MODERN SPECIES 409 ENSVPAG00000011534 ENSVPAG00000011532 ENSVPAG00000011531 #22 Arabian camel MODERN SPECIES 15 NVL (ENSCDRG00005019414) #14 CNIH4 (ENSCDRG00005019545) #13 WDR26 (ENSCDRG00005019563) #12 CNIH3 (ENSCDRG00005019575) #11 DNAH14 (ENSCDRG00005019610) #9 LBR (ENSCDRG00005019758) #8 ENAH (ENSCDRG00005019805) #7 ENSCDRG00005019933 SRP9 (ENSCDRG00005019952) EPHX1 (ENSCDRG00005019981) #16 TMEM63A (ENSCDRG00005020005) #17 ENSCDRG00005020045 #18 PYCR2 (ENSCDRG00005020074) #19 ENSCDRG00005003588 #18 SDE2 (ENSCDRG00005003707) #21 ENSCDRG00005003751 #22 ENSCDRG00005003780 ACBD3 (ENSCDRG00005003797) #23 MIXL1 (ENSCDRG00005003819) #24 LIN9 (ENSCDRG00005003856) #25 PARP1 (ENSCDRG00005004094) #26 STUM (ENSCDRG00005004232) #27 ITPKB (ENSCDRG00005004264) #28 PSEN2 (ENSCDRG00005004293) #29 COQ8A (ENSCDRG00005004392) #30 CDC42BPA (ENSCDRG00005004650) #31 AHCTF1 (ENSCDRG00005008653) #32 ENSCDRG00005009657 #33 SCCPDH (ENSCDRG00005009923) #34 CNST (ENSCDRG00005010140) #35 ENSCDRG00005010260 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00520000062027 ENSGT00940000157800 ENSGT00930000151032.B ENSGT00940000155335 ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a ENSGT00390000014620 Pecora ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00520000062027 ENSGT00940000157800 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a ENSGT00390000014620 ENSGT00940000157333 Yarkand deer DUPLICATION Yarkand deer MODERN SPECIES 13 RB1CC1 (ENSCHYG00000022542) ALKAL1 (ENSCHYG00000022488) ENSCHYG00000022445 ENSCHYG00000022400 ST18 (ENSCHYG00000021991) PCMTD1 (ENSCHYG00000021921) ENSCHYG00000021851 SNTG1 (ENSCHYG00000020644) ENSCHYG00000020498 PPDPFL (ENSCHYG00000020457) SNAI2 (ENSCHYG00000020385) CLXN (ENSCHYG00000020174) UBE2V2 (ENSCHYG00000020085) MCM4 (ENSCHYG00000019115) PRKDC (ENSCHYG00000016168) ENSCHYG00000015631 #22 ENSCHYG00000015611 SPIDR (ENSCHYG00000015121) CEBPD (ENSCHYG00000015055) ENSCHYG00000015002 ENSCHYG00000014945 ENSCHYG00000014858 ENSCHYG00000014834 ENSCHYG00000014796 ENSCHYG00000014767 ENSCHYG00000014650 ZHX2 (ENSCHYG00000014631) DERL1 (ENSCHYG00000014504) TBC1D31 (ENSCHYG00000013609) FAM83A (ENSCHYG00000026816) C8orf76 (ENSCHYG00000026803) Yarkand deer MODERN SPECIES 5 CNIH4 (ENSCHYG00000007424) #13 WDR26 (ENSCHYG00000007505) #12 ENSCHYG00000007572 CNIH3 (ENSCHYG00000007606) #11 ENSCHYG00000007678 ENSCHYG00000007691 DNAH14 (ENSCHYG00000007743) #9 LBR (ENSCHYG00000008100) #8 ENAH (ENSCHYG00000008178) #7 EPHX1 (ENSCHYG00000008370) #16 TMEM63A (ENSCHYG00000008498) #17 ENSCHYG00000008576 #18 PYCR2 (ENSCHYG00000008616) #19 ENSCHYG00000008669 #18 SDE2 (ENSCHYG00000008711) #21 ENSCHYG00000008774 #22 ACBD3 (ENSCHYG00000008896) #23 MIXL1 (ENSCHYG00000008961) #24 LIN9 (ENSCHYG00000009023) #25 PARP1 (ENSCHYG00000009348) #26 ENSCHYG00000009567 #27 ITPKB (ENSCHYG00000009603) #28 PSEN2 (ENSCHYG00000009644) #29 COQ8A (ENSCHYG00000009793) #30 CDC42BPA (ENSCHYG00000010016) #31 ENSCHYG00000011242 AHCTF1 (ENSCHYG00000011282) #32 ENSCHYG00000011764 #33 ENSCHYG00000011947 #34 ENSCHYG00000011989 ##22 ENSCHYG00000012025 Percora_a ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00520000062027 ENSGT00940000157800 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a ENSGT00390000014620 ENSGT00940000157333 Siberian musk deer DUPLICATION Siberian musk deer DUPLICATION Siberian musk deer MODERN SPECIES 1275 GPR33 (ENSMMSG00000022855) DTD2 (ENSMMSG00000022862) HEATR5A (ENSMMSG00000022882) ENSMMSG00000022922 #22 HECTD1 (ENSMMSG00000022929) AP4S1 (ENSMMSG00000022976) STRN3 (ENSMMSG00000022995) ENSMMSG00000023033 SCFD1 (ENSMMSG00000023110) G2E3 (ENSMMSG00000023121) PRKD1 (ENSMMSG00000023150) FOXG1 (ENSMMSG00000023196) NOVA1 (ENSMMSG00000023209) Siberian musk deer MODERN SPECIES 1210 ENSMMSG00000017814 ANKRD40 (ENSMMSG00000017837) ABCC3 (ENSMMSG00000017877) CACNA1G (ENSMMSG00000019001) SPATA20 (ENSMMSG00000024429) EPN3 (ENSMMSG00000024431) MYCBPAP (ENSMMSG00000024432) RSAD1 (ENSMMSG00000024434) ACSF2 (ENSMMSG00000024435) CHAD (ENSMMSG00000024437) LRRC59 (ENSMMSG00000024438) EME1 (ENSMMSG00000024439) MRPL27 (ENSMMSG00000024440) XYLT2 (ENSMMSG00000024441) TMEM92 (ENSMMSG00000024442) ENSMMSG00000024443 #22 COL1A1 (ENSMMSG00000024445) SGCA (ENSMMSG00000024448) ENSMMSG00000024449 PPP1R9B (ENSMMSG00000024450) SAMD14 (ENSMMSG00000024451) PDK2 (ENSMMSG00000024453) ITGA3 (ENSMMSG00000024456) DLX3 (ENSMMSG00000024461) DLX4 (ENSMMSG00000024462) TAC4 (ENSMMSG00000024465) KAT7 (ENSMMSG00000024468) FAM117A (ENSMMSG00000024473) SLC35B1 (ENSMMSG00000024476) ENSMMSG00000024479 NXPH3 (ENSMMSG00000024480) Siberian musk deer MODERN SPECIES 1210 EXOC7 (ENSMMSG00000023963) ZACN (ENSMMSG00000024001) GALR2 (ENSMMSG00000024006) SRP68 (ENSMMSG00000024024) ENSMMSG00000024038 CDK3 (ENSMMSG00000024048) TEN1 (ENSMMSG00000024049) ACOX1 (ENSMMSG00000024054) FBF1 (ENSMMSG00000024060) MRPL38 (ENSMMSG00000024071) TRIM65 (ENSMMSG00000024076) TRIM47 (ENSMMSG00000024078) WBP2 (ENSMMSG00000024083) UNC13D (ENSMMSG00000024093) UNK (ENSMMSG00000024105) ENSMMSG00000024113 #22 GALK1 (ENSMMSG00000024117) ITGB4 (ENSMMSG00000024137) SAP30BP (ENSMMSG00000024161) RECQL5 (ENSMMSG00000024167) SMIM6 (ENSMMSG00000024174) SMIM5 (ENSMMSG00000012703) ENSMMSG00000012749 LLGL2 (ENSMMSG00000013031) TSEN54 (ENSMMSG00000013144) CASKIN2 (ENSMMSG00000013186) TMEM94 (ENSMMSG00000013252) GRB2 (ENSMMSG00000013432) SLC25A19 (ENSMMSG00000013488) ENSMMSG00000013512 MRPS7 (ENSMMSG00000013525) Siberian musk deer MODERN SPECIES 127 SNAI2 (ENSMMSG00000001745) CLXN (ENSMMSG00000001763) UBE2V2 (ENSMMSG00000001792) MCM4 (ENSMMSG00000001854) PRKDC (ENSMMSG00000002095) ENSMMSG00000002200 #22 SPIDR (ENSMMSG00000002218) ENSMMSG00000002289 CEBPD (ENSMMSG00000002300) Bovidae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00520000062027 ENSGT00940000157800 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a ENSGT00390000014620 ENSGT00940000157333 Caprinae ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00390000003289 ENSGT00940000157341 ENSGT00940000161936 ENSGT00390000015871 ENSGT00940000159969.a ENSGT00390000007918.g.b ENSGT00940000159905 ENSGT00950000183032.A.a.g.a ENSGT00950000182863.B.a ENSGT00390000009113.a.b ENSGT00940000154511.b ENSGT00940000159968 ENSGT00740000115534.a.b.f.a.b ENSGT01050000244824.A ENSGT00940000155633.D ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT00390000014654 ENSGT00940000163032 ENSGT01030000235502 ENSGT00940000162302 ENSGT00390000010337.B.a.b.k.b ENSGT00950000182893.a.a.a.b ENSGT00530000063156.b ENSGT00940000153859.b ENSGT00940000160768 ENSGT00390000011435 ENSGT00950000182893.a.a.a.a ENSGT00550000074694.a ENSGT00390000014398 ENSGT00390000004915.a ENSGT00940000157647 Goat MODERN SPECIES 5 OPRK1 (ENSCHIG00000023230) NPBWR1 (ENSCHIG00000010898) RB1CC1 (ENSCHIG00000017614) ENSCHIG00000027047 ENSCHIG00000015420 ST18 (ENSCHIG00000013632) ENSCHIG00000024195 ENSCHIG00000011128 SNTG1 (ENSCHIG00000023177) PPDPFL (ENSCHIG00000017544) SNAI2 (ENSCHIG00000024410) CLXN (ENSCHIG00000017174) ENSCHIG00000013718 MCM4 (ENSCHIG00000018094) PRKDC (ENSCHIG00000013822) ENSCHIG00000011570 #22 SPIDR (ENSCHIG00000018290) CEBPD (ENSCHIG00000010420) ENSCHIG00000011893 ENSCHIG00000026116 ENSCHIG00000006578 ENSCHIG00000011424 ENSCHIG00000023961 ZHX2 (ENSCHIG00000019817) DERL1 (ENSCHIG00000018920) TBC1D31 (ENSCHIG00000012277) FAM83A (ENSCHIG00000011014) C8orf76 (ENSCHIG00000011058) ZHX1 (ENSCHIG00000011497) ATAD2 (ENSCHIG00000021918) NTAQ1 (ENSCHIG00000006384) Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 25 RGS20 (ENSOARG00020025341) ATP6V1H (ENSOARG00020025312) OPRK1 (ENSOARG00020025297) NPBWR1 (ENSOARG00020025293) RB1CC1 (ENSOARG00020025223) ALKAL1 (ENSOARG00020025195) ENSOARG00020025180 ST18 (ENSOARG00020025124) PCMTD1 (ENSOARG00020025108) SNTG1 (ENSOARG00020024728) PPDPFL (ENSOARG00020024587) SNAI2 (ENSOARG00020024572) CLXN (ENSOARG00020024519) MCM4 (ENSOARG00020024419) PRKDC (ENSOARG00020010704) ENSOARG00020009951 #22 CEBPD (ENSOARG00020009877) ENSOARG00020016702 ENSOARG00020016522 HAS2 (ENSOARG00020016454) ENSOARG00020016416 ZHX2 (ENSOARG00020016397) DERL1 (ENSOARG00020016190) TBC1D31 (ENSOARG00020015866) ENSOARG00020015775 C9H8orf76 (ENSOARG00020015718) ZHX1 (ENSOARG00020015701) ATAD2 (ENSOARG00020015273) NTAQ1 (ENSOARG00020015073) FBXO32 (ENSOARG00020014812) KLHL38 (ENSOARG00020014756) Bovinae DUPLICATION Bovinae DUPLICATION Bovinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.yb.fb.a #22 American bison MODERN SPECIES 3285 EXOC7 (ENSBBBG00000020401) ZACN (ENSBBBG00000000677) GALR2 (ENSBBBG00000000673) SRP68 (ENSBBBG00000000600) ENSBBBG00000000572 CDK3 (ENSBBBG00000000554) ENSBBBG00000000549 ACOX1 (ENSBBBG00000000512) FBF1 (ENSBBBG00000020556) MRPL38 (ENSBBBG00000020581) TRIM65 (ENSBBBG00000005555) TRIM47 (ENSBBBG00000020624) WBP2 (ENSBBBG00000020634) UNC13D (ENSBBBG00000020720) UNK (ENSBBBG00000020765) ENSBBBG00000020784 #22 GALK1 (ENSBBBG00000020807) ITGB4 (ENSBBBG00000005640) SAP30BP (ENSBBBG00000021035) SMIM5 (ENSBBBG00000021056) RECQL5 (ENSBBBG00000021117) MYO15B (ENSBBBG00000021484) LLGL2 (ENSBBBG00000021610) TSEN54 (ENSBBBG00000021631) CASKIN2 (ENSBBBG00000021684) TMEM94 (ENSBBBG00000021836) GRB2 (ENSBBBG00000005799) SLC25A19 (ENSBBBG00000021969) ENSBBBG00000021980 MRPS7 (ENSBBBG00000022001) GGA3 (ENSBBBG00000022100) Bovinae ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000157341 ENSGT00940000161936 ENSGT00390000015871 ENSGT00940000159969.a ENSGT00390000002144.i.b ENSGT00390000007918.g.b ENSGT00940000159905 ENSGT00950000183032.A.a.g.a ENSGT00950000182863.B.a ENSGT00390000009113.a.b ENSGT00940000154511.b ENSGT00940000159968 ENSGT00740000115534.a.b.f.a.a ENSGT01050000244824.A ENSGT00940000155633.D ENSGT01100000263504.a.a.yb.fb.b #22 ENSGT00390000014654 ENSGT00940000163032 ENSGT00940000162302 ENSGT00940000165552 ENSGT00390000010337.B.a.b ENSGT00950000182893.a.a.a.b ENSGT00530000063156.b ENSGT00940000153859.b ENSGT00940000160768 ENSGT00390000011435 ENSGT00950000182893.a.a.a.a ENSGT00550000074694.a ENSGT00390000014398 ENSGT00390000004915.a ENSGT00910000146912 American bison MODERN SPECIES 3036 OPRK1 (ENSBBBG00000017852) NPBWR1 (ENSBBBG00000017860) RB1CC1 (ENSBBBG00000017917) ALKAL1 (ENSBBBG00000004408) ENSBBBG00000017946 ENSBBBG00000004417 ST18 (ENSBBBG00000017983) ENSBBBG00000004427 SNTG1 (ENSBBBG00000018671) PPDPFL (ENSBBBG00000018734) SNAI2 (ENSBBBG00000018743) CLXN (ENSBBBG00000018768) UBE2V2 (ENSBBBG00000018781) MCM4 (ENSBBBG00000018801) PRKDC (ENSBBBG00000004878) ENSBBBG00000019084 #22 SPIDR (ENSBBBG00000019113) ENSBBBG00000019149 ENSBBBG00000019155 ENSBBBG00000004933 ENSBBBG00000019172 ZHX2 (ENSBBBG00000008388) DERL1 (ENSBBBG00000019213) TBC1D31 (ENSBBBG00000019387) FAM83A (ENSBBBG00000019415) C8orf76 (ENSBBBG00000019423) ZHX1 (ENSBBBG00000019432) ATAD2 (ENSBBBG00000005218) NTAQ1 (ENSBBBG00000019510) FBXO32 (ENSBBBG00000019539) ENSBBBG00000019545 Bos ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000157341 ENSGT00940000161936 ENSGT00390000015871 ENSGT00940000159969.a ENSGT00390000002144.i.b ENSGT00390000007918.g.b ENSGT00940000159905 ENSGT00950000183032.A.a.g.a ENSGT00950000182863.B.a ENSGT00390000009113.a.b ENSGT00940000154511.b ENSGT00940000159968 ENSGT00740000115534.a.b.f.a.a ENSGT01050000244824.A ENSGT00940000155633.D ENSGT01100000263504.a.a.yb.fb.b #22 ENSGT00390000014654 ENSGT00940000163032 ENSGT00940000162302 ENSGT00940000165552 ENSGT00390000010337.B.a.b.h ENSGT00950000182893.a.a.a.b ENSGT00530000063156.b ENSGT00940000153859.b ENSGT00940000160768 ENSGT00390000011435 ENSGT00950000182893.a.a.a.a ENSGT00550000074694.a ENSGT00390000014398 ENSGT00390000004915.a ENSGT00910000146912 Bos_a ANCESTRAL SPECIES 92 ENSGT00390000003289.g.a ENSGT00940000157341 ENSGT00940000161936 ENSGT00390000015871 ENSGT00940000159969.a ENSGT00390000002144.i.b ENSGT00390000007918.g.b ENSGT00940000159905 ENSGT00950000183032.A.a.g.a ENSGT00950000182863.B.a ENSGT00940000154511.b ENSGT00940000159968 ENSGT00740000115534.a.b.f.a.a ENSGT01050000244824.A ENSGT00940000155633.D ENSGT01100000263504.a.a.yb.fb.b #22 ENSGT00390000014654 ENSGT00940000162302 ENSGT00940000165552 ENSGT00390000010337.B.a.b.h Wild yak MODERN SPECIES 452 NPBWR1 (ENSBMUG00000013137) RB1CC1 (ENSBMUG00000013120) ENSBMUG00000013083 ENSBMUG00000013069 ENSBMUG00000013053 ST18 (ENSBMUG00000013031) PCMTD1 (ENSBMUG00000012986) ENSBMUG00000012936 SNTG1 (ENSBMUG00000011959) ENSBMUG00000011359 SNAI2 (ENSBMUG00000011335) CLXN (ENSBMUG00000011311) UBE2V2 (ENSBMUG00000011242) MCM4 (ENSBMUG00000011227) PRKDC (ENSBMUG00000011197) ENSBMUG00000010962 #22 SPIDR (ENSBMUG00000010938) ENSBMUG00000010902 ENSBMUG00000010886 ENSBMUG00000010853 ENSBMUG00000010840 ENSBMUG00000010821 ENSBMUG00000010772 Bos_b ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00390000003289.g.a ENSGT00940000157341 ENSGT00940000161936 ENSGT00390000015871 ENSGT00940000159969.a ENSGT00390000007918.g.b ENSGT00940000159905 ENSGT00950000183032.A.a.g.a ENSGT00950000182863.B.a ENSGT00390000009113.a.b ENSGT00940000154511.b ENSGT00940000159968 ENSGT00740000115534.a.b.f.a.a ENSGT01050000244824.A ENSGT00940000155633.D ENSGT01100000263504.a.a.yb.fb.b #22 ENSGT00390000014654 ENSGT00940000163032 ENSGT00960000186612.B.a.a.d ENSGT00940000162302 ENSGT00940000165552 ENSGT00390000010337.B.a.b.h ENSGT00950000182893.a.a.a.b ENSGT00530000063156.b ENSGT00940000153859.b ENSGT00940000160768 ENSGT00390000011435 ENSGT00950000182893.a.a.a.a ENSGT00550000074694.a ENSGT00390000014398 ENSGT00390000004915.a Cow MODERN SPECIES 5 ATP6V1H (ENSBTAG00000003450) OPRK1 (ENSBTAG00000000914) NPBWR1 (ENSBTAG00000016159) RB1CC1 (ENSBTAG00000000878) ENSBTAG00000048814 ST18 (ENSBTAG00000005560) PCMTD1 (ENSBTAG00000017492) SNTG1 (ENSBTAG00000002448) ENSBTAG00000027760 PPDPFL (ENSBTAG00000038286) SNAI2 (ENSBTAG00000013227) CLXN (ENSBTAG00000008693) UBE2V2 (ENSBTAG00000023218) MCM4 (ENSBTAG00000017021) PRKDC (ENSBTAG00000017019) H3-5 (ENSBTAG00000017016) #22 SPIDR (ENSBTAG00000044106) CEBPD (ENSBTAG00000046307) ENSBTAG00000040351 ENSBTAG00000054983 ENSBTAG00000009474 HAS2 (ENSBTAG00000019892) ZHX2 (ENSBTAG00000026309) DERL1 (ENSBTAG00000020693) TBC1D31 (ENSBTAG00000021156) FAM83A (ENSBTAG00000005877) C14H8orf76 (ENSBTAG00000015319) ZHX1 (ENSBTAG00000015334) ATAD2 (ENSBTAG00000002002) ATAD2 (ENSBTAG00000051782) NTAQ1 (ENSBTAG00000009916) Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 5 ALKAL1 (ENSBIXG00005024331) ENSBIXG00005024381 ST18 (ENSBIXG00005024438) ENSBIXG00005004177 ENSBIXG00005024471 PCMTD1 (ENSBIXG00005004184) ENSBIXG00005004193 SNTG1 (ENSBIXG00005024969) ENSBIXG00005025067 ENSBIXG00005025099 SNAI2 (ENSBIXG00005025145) CLXN (ENSBIXG00005025221) ENSBIXG00005025298 MCM4 (ENSBIXG00005025814) PRKDC (ENSBIXG00005026568) ENSBIXG00005026643 #22 SPIDR (ENSBIXG00005004566) CEBPD (ENSBIXG00005026750) ENSBIXG00005026755 ENSBIXG00005026768 ENSBIXG00005026793 ENSBIXG00005026808 ENSBIXG00005006616 ZHX2 (ENSBIXG00005004591) DERL1 (ENSBIXG00005026942) TBC1D31 (ENSBIXG00005027049) FAM83A (ENSBIXG00005027081) C8orf76 (ENSBIXG00005027102) ZHX1 (ENSBIXG00005027195) ATAD2 (ENSBIXG00005004691) NTAQ1 (ENSBIXG00005027306) Bovinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb.gb #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00520000062027 ENSGT00940000157800 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a ENSGT00390000014620 ENSGT00940000157333 American bison DUPLICATION American bison MODERN SPECIES 2926 DSPP (ENSBBBG00000023372) SPARCL1 (ENSBBBG00000023397) NUDT9 (ENSBBBG00000023429) HSD17B11 (ENSBBBG00000023455) HSD17B13 (ENSBBBG00000023490) ENSBBBG00000023511 #22 KLHL8 (ENSBBBG00000023566) AFF1 (ENSBBBG00000006166) C4orf36 (ENSBBBG00000023619) SLC10A6 (ENSBBBG00000023627) PTPN13 (ENSBBBG00000000291) ENSBBBG00000008209 ENSBBBG00000006300 American bison MODERN SPECIES 3231 NVL (ENSBBBG00000002471) #14 CNIH4 (ENSBBBG00000012671) #13 WDR26 (ENSBBBG00000012642) #12 ENSBBBG00000012622 CNIH3 (ENSBBBG00000002423) #11 DNAH14 (ENSBBBG00000007448) #9 LBR (ENSBBBG00000012450) #8 ENAH (ENSBBBG00000002368) #7 SRP9 (ENSBBBG00000002346) EPHX1 (ENSBBBG00000002344) #16 TMEM63A (ENSBBBG00000012352) #17 ENSBBBG00000012339 #18 PYCR2 (ENSBBBG00000012333) #19 ENSBBBG00000012320 #18 SDE2 (ENSBBBG00000012313) #21 ENSBBBG00000012307 #22 ACBD3 (ENSBBBG00000012298) #23 ENSBBBG00000001928 LIN9 (ENSBBBG00000002326) #25 PARP1 (ENSBBBG00000012265) #26 ENSBBBG00000012249 STUM (ENSBBBG00000012244) #27 ITPKB (ENSBBBG00000012230) #28 PSEN2 (ENSBBBG00000012223) #29 COQ8A (ENSBBBG00000012196) #30 CDC42BPA (ENSBBBG00000012129) #31 AHCTF1 (ENSBBBG00000011807) #32 ENSBBBG00000002173 #33 SCCPDH (ENSBBBG00000011719) #34 ENSBBBG00000011707 ##22 ENSBBBG00000002158 Bos ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb.gb #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00520000062027 ENSGT00940000157800 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a ENSGT00390000014620 ENSGT00940000157333 Bos_b ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb.gb #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00940000157800 ENSGT00520000062027 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a ENSGT00390000014620 ENSGT00940000157333 Cow DUPLICATION Cow MODERN SPECIES 25 CRMP1 (ENSBTAG00000004292) ENSBTAG00000021729 JAKMIP1 (ENSBTAG00000011170) ENSBTAG00000054994 WFS1 (ENSBTAG00000046671) PPP2R2C (ENSBTAG00000020598) ENSBTAG00000006508 ENSBTAG00000017829 DMP1 (ENSBTAG00000019132) DSPP (ENSBTAG00000045714) SPARCL1 (ENSBTAG00000004094) NUDT9 (ENSBTAG00000011354) ENSBTAG00000052418 HSD17B11 (ENSBTAG00000006307) HSD17B13 (ENSBTAG00000031679) ENSBTAG00000047432 #22 KLHL8 (ENSBTAG00000002455) AFF1 (ENSBTAG00000018488) C4orf36 (ENSBTAG00000051915) ENSBTAG00000050963 ENSBTAG00000047514 PTPN13 (ENSBTAG00000014947) ENSBTAG00000050276 ENSBTAG00000045839 MAPK10 (ENSBTAG00000020048) ARHGAP24 (ENSBTAG00000003959) WDFY3 (ENSBTAG00000013495) CDS1 (ENSBTAG00000045787) NKX6-1 (ENSBTAG00000002518) GPAT3 (ENSBTAG00000017592) ABRAXAS1 (ENSBTAG00000014076) Cow MODERN SPECIES 10 EXOC7 (ENSBTAG00000007910) ZACN (ENSBTAG00000007906) GALR2 (ENSBTAG00000024910) SRP68 (ENSBTAG00000009228) EVPL (ENSBTAG00000010517) CDK3 (ENSBTAG00000010509) TEN1 (ENSBTAG00000044038) ACOX1 (ENSBTAG00000030174) FBF1 (ENSBTAG00000030175) MRPL38 (ENSBTAG00000022009) TRIM65 (ENSBTAG00000022006) TRIM47 (ENSBTAG00000018920) WBP2 (ENSBTAG00000008634) UNC13D (ENSBTAG00000013556) UNK (ENSBTAG00000016287) H3-3B (ENSBTAG00000024909) #22 GALK1 (ENSBTAG00000014964) ITGB4 (ENSBTAG00000018169) SAP30BP (ENSBTAG00000011717) RECQL5 (ENSBTAG00000011715) SMIM6 (ENSBTAG00000047510) SMIM5 (ENSBTAG00000010758) ENSBTAG00000011713 LLGL2 (ENSBTAG00000020067) TSEN54 (ENSBTAG00000000824) CASKIN2 (ENSBTAG00000007220) TMEM94 (ENSBTAG00000007217) GRB2 (ENSBTAG00000004736) SLC25A19 (ENSBTAG00000000202) MIF4GD (ENSBTAG00000030168) MRPS7 (ENSBTAG00000016133) Hybrid Bos Indicus DUPLICATION Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 25 EVC (ENSBIXG00005014829) CRMP1 (ENSBIXG00005002160) ENSBIXG00005014962 JAKMIP1 (ENSBIXG00005015199) ENSBIXG00005015285 WFS1 (ENSBIXG00005015314) PPP2R2C (ENSBIXG00005015372) ENSBIXG00005015774 ENSBIXG00005016537 DMP1 (ENSBIXG00005016673) ENSBIXG00005016723 SPARCL1 (ENSBIXG00005007329) NUDT9 (ENSBIXG00005016830) ENSBIXG00005016839 HSD17B11 (ENSBIXG00005005731) ENSBIXG00005016946 #22 KLHL8 (ENSBIXG00005017118) AFF1 (ENSBIXG00005017161) C4orf36 (ENSBIXG00005017196) ENSBIXG00005017214 ENSBIXG00005002799 SLC10A6 (ENSBIXG00005017247) ENSBIXG00005017276 ENSBIXG00005017372 ENSBIXG00005002829 ENSBIXG00005005513 MAPK10 (ENSBIXG00005018360) ARHGAP24 (ENSBIXG00005018506) WDFY3 (ENSBIXG00005018815) CDS1 (ENSBIXG00005000063) NKX6-1 (ENSBIXG00005003082) Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 10 FOXJ1 (ENSBIXG00005029634) EXOC7 (ENSBIXG00005029710) ZACN (ENSBIXG00005029808) GALR2 (ENSBIXG00005029831) SRP68 (ENSBIXG00005029841) ENSBIXG00005029860 CDK3 (ENSBIXG00005029883) ACOX1 (ENSBIXG00005029916) FBF1 (ENSBIXG00005029946) MRPL38 (ENSBIXG00005029980) TRIM65 (ENSBIXG00005029987) TRIM47 (ENSBIXG00005029996) ENSBIXG00005030026 UNC13D (ENSBIXG00005030070) UNK (ENSBIXG00005030104) ENSBIXG00005030136 #22 GALK1 (ENSBIXG00005030162) ITGB4 (ENSBIXG00005030176) CASKIN2 (ENSBIXG00005030216) SAP30BP (ENSBIXG00005030247) RECQL5 (ENSBIXG00005030270) SMIM5 (ENSBIXG00005030288) LLGL2 (ENSBIXG00005030411) TSEN54 (ENSBIXG00005030427) TMEM94 (ENSBIXG00005030466) GRB2 (ENSBIXG00005030500) ENSBIXG00005030511 SLC25A19 (ENSBIXG00005030519) MIF4GD (ENSBIXG00005030536) MRPS7 (ENSBIXG00005030545) GGA3 (ENSBIXG00005030554) Bos_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb.gb #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00520000062027 ENSGT00940000157800 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a ENSGT00390000014620 ENSGT00940000157333 Wild yak MODERN SPECIES 2179 EXOC7 (ENSBMUG00000010470) ZACN (ENSBMUG00000010274) GALR2 (ENSBMUG00000010265) SRP68 (ENSBMUG00000010248) ENSBMUG00000010056 CDK3 (ENSBMUG00000009896) ENSBMUG00000009886 ACOX1 (ENSBMUG00000009865) ENSBMUG00000009836 MRPL38 (ENSBMUG00000009777) TRIM65 (ENSBMUG00000009760) TRIM47 (ENSBMUG00000009733) WBP2 (ENSBMUG00000009675) UNC13D (ENSBMUG00000009648) UNK (ENSBMUG00000009624) ENSBMUG00000009607 #22 GALK1 (ENSBMUG00000009596) ITGB4 (ENSBMUG00000009554) SAP30BP (ENSBMUG00000009507) SMIM5 (ENSBMUG00000009473) RECQL5 (ENSBMUG00000009453) ENSBMUG00000009426 ENSBMUG00000009401 LLGL2 (ENSBMUG00000009320) TSEN54 (ENSBMUG00000009235) CASKIN2 (ENSBMUG00000009108) TMEM94 (ENSBMUG00000008975) ENSBMUG00000008805 GRB2 (ENSBMUG00000008776) SLC25A19 (ENSBMUG00000008730) MIF4GD (ENSBMUG00000008707) Domestic yak MODERN SPECIES 5 WDR26 (ENSBGRG00000011013) #12 CNIH3 (ENSBGRG00000011424) #11 ENSBGRG00000003672 ENSBGRG00000003740 #9 ENSBGRG00000003785 #9 LBR (ENSBGRG00000003827) #8 ENAH (ENSBGRG00000003960) #7 SRP9 (ENSBGRG00000004171) EPHX1 (ENSBGRG00000004302) #16 TMEM63A (ENSBGRG00000004465) #17 ENSBGRG00000004607 #18 PYCR2 (ENSBGRG00000004674) #19 ENSBGRG00000004709 #18 SDE2 (ENSBGRG00000004760) #21 ENSBGRG00000004846 H3-3A (ENSBGRG00000004866) #22 ENSBGRG00000004896 ACBD3 (ENSBGRG00000004916) #23 ENSBGRG00000004942 MIXL1 (ENSBGRG00000004952) #24 LIN9 (ENSBGRG00000005002) #25 PARP1 (ENSBGRG00000005223) #26 ENSBGRG00000005664 #27 ITPKB (ENSBGRG00000005683) #28 PSEN2 (ENSBGRG00000005715) #29 COQ8A (ENSBGRG00000005906) #30 CDC42BPA (ENSBGRG00000006051) #31 AHCTF1 (ENSBGRG00000006477) #32 ENSBGRG00000006504 ENSBGRG00000006527 #33 ENSBGRG00000006630 Cetacea ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589.c ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00940000157800 ENSGT00520000062027 ENSGT00930000151032.B ENSGT00940000155335 ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a ENSGT00390000014620.k Blue whale DUPLICATION Blue whale MODERN SPECIES WDR26 (ENSBMSG00010003042) #12 CNIH3 (ENSBMSG00010003002) #11 ENSBMSG00010002975 ENSBMSG00010002972 ENSBMSG00010002963 #9 LBR (ENSBMSG00010002944) #8 ENSBMSG00010002887 #7 ENSBMSG00010002862 ENSBMSG00010002850 EPHX1 (ENSBMSG00010002828) #16 TMEM63A (ENSBMSG00010002709) #17 ENSBMSG00010002682 #18 PYCR2 (ENSBMSG00010002659) #19 ENSBMSG00010002616 #18 SDE2 (ENSBMSG00010002582) #21 ENSBMSG00010002563 #22 ACBD3 (ENSBMSG00010002517) #23 MIXL1 (ENSBMSG00010002500) #24 LIN9 (ENSBMSG00010002409) #25 PARP1 (ENSBMSG00010002247) #26 STUM (ENSBMSG00010002214) #27 ITPKB (ENSBMSG00010002191) #28 PSEN2 (ENSBMSG00010002147) #29 COQ8A (ENSBMSG00010002111) #30 CDC42BPA (ENSBMSG00010001349) #31 ENSBMSG00010001133 AHCTF1 (ENSBMSG00010000995) #32 ENSBMSG00010000922 #33 SCCPDH (ENSBMSG00010000887) #34 CNST (ENSBMSG00010000841) #35 TFB2M (ENSBMSG00010000824) #36 Blue whale MODERN SPECIES 15 ENSBMSG00010008736 TBCCD1 (ENSBMSG00010008761) DNAJB11 (ENSBMSG00010008785) AHSG (ENSBMSG00010008864) FETUB (ENSBMSG00010008904) ENSBMSG00010008942 KNG1 (ENSBMSG00010008972) ENSBMSG00010009019 EIF4A2 (ENSBMSG00010009040) RFC4 (ENSBMSG00010009103) ADIPOQ (ENSBMSG00010009114) ST6GAL1 (ENSBMSG00010009124) RTP1 (ENSBMSG00010009135) MASP1 (ENSBMSG00010009153) RTP4 (ENSBMSG00010009175) ENSBMSG00010009179 #22 SST (ENSBMSG00010009185) RTP2 (ENSBMSG00010009198) ENSBMSG00010009203 BCL6 (ENSBMSG00010009207) ENSBMSG00010009218 LPP (ENSBMSG00010009229) TPRG1 (ENSBMSG00010009246) TP63 (ENSBMSG00010009317) P3H2 (ENSBMSG00010009465) CLDN1 (ENSBMSG00010009478) CLDN16 (ENSBMSG00010009495) TMEM207 (ENSBMSG00010009508) IL1RAP (ENSBMSG00010009519) GMNC (ENSBMSG00010009539) ENSBMSG00010009554 Blue whale MODERN SPECIES 11 SPPL2A (ENSBMSG00010004699) AP4E1 (ENSBMSG00010004683) TNFAIP8L3 (ENSBMSG00010004677) ENSBMSG00010004669 ENSBMSG00010004647 ENSBMSG00010004634 ENSBMSG00010004614 ENSBMSG00010004570 GLDN (ENSBMSG00010004518) GNB5 (ENSBMSG00010004454) MYO5C (ENSBMSG00010004347) MYO5A (ENSBMSG00010003804) ENSBMSG00010003723 ENSBMSG00010003708 ATOSA (ENSBMSG00010003683) ENSBMSG00010003671 #22 ONECUT1 (ENSBMSG00010003664) WDR72 (ENSBMSG00010003589) ENSBMSG00010003580 UNC13C (ENSBMSG00010003454) ENSBMSG00010003426 RAB27A (ENSBMSG00010003416) PIGBOS1 (ENSBMSG00010003409) ENSBMSG00010003401 PIGB (ENSBMSG00010003389) CCPG1 (ENSBMSG00010003354) PIERCE2 (ENSBMSG00010003343) DNAAF4 (ENSBMSG00010003330) PYGO1 (ENSBMSG00010003306) ENSBMSG00010003291 PRTG (ENSBMSG00010003236) Odontoceti ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589.c ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00940000157800 ENSGT00520000062027 ENSGT00930000151032.B ENSGT00940000155335 ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a ENSGT00390000014620.k Sperm whale DUPLICATION Sperm whale MODERN SPECIES 14 PSMB2 (ENSPCTG00005004049) CLSPN (ENSPCTG00005004034) AGO4 (ENSPCTG00005004016) AGO1 (ENSPCTG00005003991) AGO3 (ENSPCTG00005003950) ENSPCTG00005003935 ADPRHL2 (ENSPCTG00005003914) COL8A2 (ENSPCTG00005003905) ENSPCTG00005003892 EVA1B (ENSPCTG00005003886) STK40 (ENSPCTG00005003877) LSM10 (ENSPCTG00005003868) OSCP1 (ENSPCTG00005003848) GRIK3 (ENSPCTG00005003798) ENSPCTG00005003777 ENSPCTG00005003767 #22 ENSPCTG00005003762 MANEAL (ENSPCTG00005003753) YRDC (ENSPCTG00005003745) C3H1orf122 (ENSPCTG00005003734) MTF1 (ENSPCTG00005003715) INPP5B (ENSPCTG00005003696) SF3A3 (ENSPCTG00005003674) ##21 GNL2 (ENSPCTG00005003644) DNALI1 (ENSPCTG00005003612) SNIP1 (ENSPCTG00005003594) MEAF6 (ENSPCTG00005003560) NDUFS5 (ENSPCTG00005003540) AKIRIN1 (ENSPCTG00005003521) ENSPCTG00005003503 ENSPCTG00005003493 Sperm whale MODERN SPECIES 1171 ENSPCTG00005017065 #22 ENSPCTG00005017109 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589.c ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00940000157800 ENSGT00520000062027 ENSGT00930000151032.B ENSGT00940000155335 ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a ENSGT00390000014620.k Dolphin MODERN SPECIES 2122 EXOC7 (ENSTTRG00000015914) ZACN (ENSTTRG00000015913) GALR2 (ENSTTRG00000015909) SRP68 (ENSTTRG00000015907) ENSTTRG00000015903 CDK3 (ENSTTRG00000015901) TEN1 (ENSTTRG00000015899) ACOX1 (ENSTTRG00000015897) FBF1 (ENSTTRG00000015896) MRPL38 (ENSTTRG00000015895) TRIM65 (ENSTTRG00000015894) TRIM47 (ENSTTRG00000015893) WBP2 (ENSTTRG00000015892) UNC13D (ENSTTRG00000015891) UNK (ENSTTRG00000015890) ENSTTRG00000015889 #22 GALK1 (ENSTTRG00000015888) ITGB4 (ENSTTRG00000015887) SAP30BP (ENSTTRG00000015886) RECQL5 (ENSTTRG00000015879) ENSTTRG00000015877 ENSTTRG00000015865 LLGL2 (ENSTTRG00000015839) TSEN54 (ENSTTRG00000015828) CASKIN2 (ENSTTRG00000015807) TMEM94 (ENSTTRG00000015787) Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000002970 ENSGT00390000013448.a.a #15 ENSGT00570000079239 #14 ENSGT00950000182834.B #13 ENSGT00940000153634.b #12 ENSGT00950000182834.A.a.b.c #11 ENSGT00390000000417.a.a.b.a.b #8 ENSGT00940000157376.tb.a #7 ENSGT00390000018505.b ENSGT00390000013102.e.a.c.b ENSGT00390000002210.d #16 ENSGT00940000159576 #17 ENSGT00390000010056 #18 ENSGT00950000183044.a.a.a.c #19 ENSGT00530000063402.b #21 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT00530000063651.a #23 ENSGT00940000162190 #24 ENSGT00390000003188 #25 ENSGT00940000156058 #26 ENSGT00390000008003 #27 ENSGT00940000156764.a #28 ENSGT00940000157923 #29 ENSGT00940000156810 #30 ENSGT01030000234517.H.b #31 ENSGT00390000018900 #32 ENSGT00940000163104 #33 ENSGT00390000004799 #34 ENSGT00390000005861 #35 ENSGT00950000183142.a.b.a.b #36 ENSGT01010000223738 Vaquita DUPLICATION Vaquita MODERN SPECIES DEGS1 (ENSPSNG00000000518) #15 NVL (ENSPSNG00000000479) #14 CNIH4 (ENSPSNG00000000427) #13 WDR26 (ENSPSNG00000000396) #12 CNIH3 (ENSPSNG00000000369) #11 LBR (ENSPSNG00000000326) #8 ENSPSNG00000000246 #7 ENSPSNG00000000145 ENSPSNG00000000117 EPHX1 (ENSPSNG00000000088) #16 TMEM63A (ENSPSNG00000000052) #17 ENSPSNG00000003871 #18 PYCR2 (ENSPSNG00000003860) #19 ENSPSNG00000003838 #18 SDE2 (ENSPSNG00000003818) #21 H3-3A (ENSPSNG00000003793) #22 ACBD3 (ENSPSNG00000003774) #23 MIXL1 (ENSPSNG00000003754) #24 LIN9 (ENSPSNG00000003691) #25 PARP1 (ENSPSNG00000003624) #26 STUM (ENSPSNG00000003602) #27 ITPKB (ENSPSNG00000003506) #28 PSEN2 (ENSPSNG00000003404) #29 COQ8A (ENSPSNG00000003309) #30 ENSPSNG00000003290 CDC42BPA (ENSPSNG00000003179) #31 AHCTF1 (ENSPSNG00000003012) #32 ENSPSNG00000002969 SCCPDH (ENSPSNG00000002932) #34 CNST (ENSPSNG00000002886) #35 TFB2M (ENSPSNG00000002861) #36 Vaquita MODERN SPECIES 12 FOXJ1 (ENSPSNG00000013938) EXOC7 (ENSPSNG00000014059) GALR2 (ENSPSNG00000014730) SRP68 (ENSPSNG00000014800) ENSPSNG00000014979 CDK3 (ENSPSNG00000015253) TEN1 (ENSPSNG00000015294) ACOX1 (ENSPSNG00000015365) FBF1 (ENSPSNG00000015481) MRPL38 (ENSPSNG00000015594) TRIM65 (ENSPSNG00000015646) TRIM47 (ENSPSNG00000015694) WBP2 (ENSPSNG00000015790) UNC13D (ENSPSNG00000015977) UNK (ENSPSNG00000016123) ENSPSNG00000016178 #22 GALK1 (ENSPSNG00000016224) ITGB4 (ENSPSNG00000016316) SAP30BP (ENSPSNG00000017385) ENSPSNG00000017480 RECQL5 (ENSPSNG00000017584) SMIM5 (ENSPSNG00000017821) ENSPSNG00000017920 LLGL2 (ENSPSNG00000018735) TSEN54 (ENSPSNG00000019026) CASKIN2 (ENSPSNG00000019079) TMEM94 (ENSPSNG00000019220) GRB2 (ENSPSNG00000019721) ENSPSNG00000019796 ENSPSNG00000019911 GGA3 (ENSPSNG00000019955) Monodontidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000002970 ENSGT00390000013448.a.a #15 ENSGT00570000079239 #14 ENSGT00950000182834.B #13 ENSGT00940000153634.b #12 ENSGT00950000182834.A.a.b.c #11 ENSGT00390000000417.a.a.b.a.b #8 ENSGT00940000157376.tb.a #7 ENSGT00390000018505.b ENSGT00390000013102.e.a.c.b ENSGT00390000002210.d #16 ENSGT00940000159576 #17 ENSGT00390000010056 #18 ENSGT00950000183044.a.a.a.c #19 ENSGT00530000063402.b #21 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT00530000063651.a #23 ENSGT00940000162190 #24 ENSGT00390000003188 #25 ENSGT00940000156058 #26 ENSGT00390000008003 #27 ENSGT00940000156764.a #28 ENSGT00940000157923 #29 ENSGT00940000156810 #30 ENSGT01030000234517.H.b #31 ENSGT00530000063929.a.a.e.a ENSGT00390000014577.a.b ENSGT00390000018900 #32 ENSGT00940000163104 #33 ENSGT00390000004799 #34 ENSGT00390000005861 #35 Narwhal MODERN SPECIES 295 SNRPD3 (ENSMMNG00015004825) LRRC75B (ENSMMNG00015004822) ENSMMNG00015004820 GGT5 (ENSMMNG00015004809) SUSD2 (ENSMMNG00015004805) CABIN1 (ENSMMNG00015004770) ENSMMNG00015004721 ENSMMNG00015004713 GSTT4 (ENSMMNG00015004703) ENSMMNG00015004695 MIF (ENSMMNG00015004692) SLC2A11 (ENSMMNG00015004683) DERL3 (ENSMMNG00015004675) SMARCB1 (ENSMMNG00015004655) MMP11 (ENSMMNG00015004644) ENSMMNG00015004637 #22 CHCHD10 (ENSMMNG00015004630) C22orf15 (ENSMMNG00015004620) VPREB3 (ENSMMNG00015004325) ZNF70 (ENSMMNG00015004317) ENSMMNG00015004309 VPREB1 (ENSMMNG00015004302) TOP3B (ENSMMNG00015004277) PPM1F (ENSMMNG00015004261) MAPK1 (ENSMMNG00015004241) ENSMMNG00015004224 PPIL2 (ENSMMNG00015004209) ENSMMNG00015004192 SDF2L1 (ENSMMNG00015004175) ENSMMNG00015004165 YDJC (ENSMMNG00015004150) Beluga whale DUPLICATION Beluga whale MODERN SPECIES 60 LRRC75B (ENSDLEG00000016498) GGT1 (ENSDLEG00000016492) GGT5 (ENSDLEG00000016444) SUSD2 (ENSDLEG00000016411) CABIN1 (ENSDLEG00000016282) ENSDLEG00000016254 ENSDLEG00000016234 ENSDLEG00000016198 GSTT4 (ENSDLEG00000016181) ENSDLEG00000016152 MIF (ENSDLEG00000016140) SLC2A11 (ENSDLEG00000015978) DERL3 (ENSDLEG00000015928) SMARCB1 (ENSDLEG00000015913) MMP11 (ENSDLEG00000015894) ENSDLEG00000015886 #22 CHCHD10 (ENSDLEG00000015863) C22orf15 (ENSDLEG00000015843) VPREB3 (ENSDLEG00000015833) ZNF70 (ENSDLEG00000015829) ENSDLEG00000015819 ENSDLEG00000015806 TOP3B (ENSDLEG00000015780) PPM1F (ENSDLEG00000015765) MAPK1 (ENSDLEG00000015738) ENSDLEG00000015726 PPIL2 (ENSDLEG00000015699) ENSDLEG00000015679 SDF2L1 (ENSDLEG00000015664) ENSDLEG00000015653 YDJC (ENSDLEG00000015648) Beluga whale MODERN SPECIES 21 DEGS1 (ENSDLEG00000000439) #15 NVL (ENSDLEG00000000461) #14 CNIH4 (ENSDLEG00000000514) #13 WDR26 (ENSDLEG00000000539) #12 CNIH3 (ENSDLEG00000000564) #11 ENSDLEG00000000602 LBR (ENSDLEG00000000619) #8 ENSDLEG00000000835 #7 SRP9 (ENSDLEG00000001626) ENSDLEG00000001631 EPHX1 (ENSDLEG00000001643) #16 TMEM63A (ENSDLEG00000001668) #17 ENSDLEG00000001704 #18 PYCR2 (ENSDLEG00000001719) #19 SDE2 (ENSDLEG00000001732) #21 H3-3A (ENSDLEG00000001740) #22 ACBD3 (ENSDLEG00000001749) #23 MIXL1 (ENSDLEG00000001757) #24 LIN9 (ENSDLEG00000001768) #25 PARP1 (ENSDLEG00000001796) #26 STUM (ENSDLEG00000001836) #27 ITPKB (ENSDLEG00000001845) #28 PSEN2 (ENSDLEG00000001858) #29 COQ8A (ENSDLEG00000001874) #30 CDC42BPA (ENSDLEG00000003384) #31 ENSDLEG00000011842 ENSDLEG00000011853 AHCTF1 (ENSDLEG00000011885) #32 SCCPDH (ENSDLEG00000012147) #34 CNST (ENSDLEG00000012220) #35 TFB2M (ENSDLEG00000012259) #36 Boreoeutheria DUPLICATION Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.xb.a ##22 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.xb.a ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.xb.a ##22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.xb.a ##22 Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.xb.a ##22 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.xb.a ##22 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.xb.a ##22 Ursidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.xb.a ##22 Ursus ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000156895 ENSGT00390000003595 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.xb.a ##22 ENSGT01100000263504.a.b.a.b.a.a ##22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00940000157800 ENSGT00520000062027 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a ENSGT00390000014620 Polar bear MODERN SPECIES 185 ENSUMAG00000013360 RNF157 (ENSUMAG00000013352) EXOC7 (ENSUMAG00000011405) SRP68 (ENSUMAG00000010865) ENSUMAG00000010767 CDK3 (ENSUMAG00000010750) TEN1 (ENSUMAG00000010744) ACOX1 (ENSUMAG00000010732) FBF1 (ENSUMAG00000010714) MRPL38 (ENSUMAG00000010702) TRIM65 (ENSUMAG00000010696) TRIM47 (ENSUMAG00000010694) WBP2 (ENSUMAG00000010671) UNC13D (ENSUMAG00000010601) UNK (ENSUMAG00000010576) H3-5 (ENSUMAG00000010572) ##22 ENSUMAG00000010571 ITGB4 (ENSUMAG00000009253) SAP30BP (ENSUMAG00000009122) ENSUMAG00000009118 RECQL5 (ENSUMAG00000009115) ENSUMAG00000009111 LLGL2 (ENSUMAG00000009023) TSEN54 (ENSUMAG00000008979) ENSUMAG00000008973 TMEM94 (ENSUMAG00000008703) GRB2 (ENSUMAG00000008668) SLC25A19 (ENSUMAG00000008660) MIF4GD (ENSUMAG00000008655) MRPS7 (ENSUMAG00000008652) GGA3 (ENSUMAG00000008648) Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.xb.a ##22 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.xb.a ##22 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.xb.a ##22 Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 30 NEBL (ENSRFEG00010007581) ENSRFEG00010007544 ENSRFEG00010007528 PLXDC2 (ENSRFEG00010007490) MALRD1 (ENSRFEG00010007438) ARL5B (ENSRFEG00010007388) NSUN6 (ENSRFEG00010007349) CACNB2 (ENSRFEG00010006472) SLC39A12 (ENSRFEG00010005999) MRC1 (ENSRFEG00010021400) TMEM236 (ENSRFEG00010021386) STAM (ENSRFEG00010021374) HACD1 (ENSRFEG00010021363) ST8SIA6 (ENSRFEG00010021356) VIM (ENSRFEG00010021345) ENSRFEG00010021330 ##22 TRDMT1 (ENSRFEG00010021313) CUBN (ENSRFEG00010020510) RSU1 (ENSRFEG00010020311) C1QL3 (ENSRFEG00010020295) PTER (ENSRFEG00010020253) ENSRFEG00010020221 MINDY3 (ENSRFEG00010020170) ITGA8 (ENSRFEG00010019917) FAM171A1 (ENSRFEG00010019859) NMT2 (ENSRFEG00010019775) RPP38 (ENSRFEG00010019749) ACBD7 (ENSRFEG00010019720) OLAH (ENSRFEG00010019677) MEIG1 (ENSRFEG00010019650) DCLRE1C (ENSRFEG00010019540) Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.xb.a ##22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.xb.a ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.xb.a ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.xb.a ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.xb.a ##22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.xb.a ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.xb.a ##22 Vervet Monkey MODERN SPECIES 10 HDHD5 (ENSCSAG00000014527) ADA2 (ENSCSAG00000014485) CECR2 (ENSCSAG00000014471) SLC25A18 (ENSCSAG00000014445) ATP6V1E1 (ENSCSAG00000014403) BCL2L13 (ENSCSAG00000014293) BID (ENSCSAG00000014281) MICAL3 (ENSCSAG00000014264) PEX26 (ENSCSAG00000014211) TUBA8 (ENSCSAG00000014167) USP18 (ENSCSAG00000014166) ENSCSAG00000014145 ENSCSAG00000014140 ENSCSAG00000014136 BCR (ENSCSAG00000014105) ENSCSAG00000019267 ##22 RAB36 (ENSCSAG00000014082) RSPH14 (ENSCSAG00000014070) GNAZ (ENSCSAG00000014024) ENSCSAG00000014016 ENSCSAG00000014011 ENSCSAG00000014009 IGLV4-3 (ENSCSAG00000013977) ENSCSAG00000013975 IGLV3-9 (ENSCSAG00000013971) IGLV3-10 (ENSCSAG00000013966) ENSCSAG00000013960 ENSCSAG00000013935 ENSCSAG00000013933 ENSCSAG00000013931 ENSCSAG00000013923 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.xb.a ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.xb.a ##22 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.xb.a ##22 Rabbit MODERN SPECIES 4 TMED5 (ENSOCUG00000012427) MTF2 (ENSOCUG00000013736) DIPK1A (ENSOCUG00000027778) ENSOCUG00000010089 EVI5 (ENSOCUG00000001807) GFI1 (ENSOCUG00000023553) RPAP2 (ENSOCUG00000001804) ENSOCUG00000001803 C1orf146 (ENSOCUG00000003953) ENSOCUG00000021982 BTBD8 (ENSOCUG00000011062) EPHX4 (ENSOCUG00000017476) BRDT (ENSOCUG00000017466) TGFBR3 (ENSOCUG00000016083) CDC7 (ENSOCUG00000026347) ENSOCUG00000024863 ##22 HFM1 (ENSOCUG00000029252) ENSOCUG00000036391 ENSOCUG00000005209 BARHL2 (ENSOCUG00000004213) ZNF326 (ENSOCUG00000012291) LRRC8D (ENSOCUG00000022362) LRRC8C (ENSOCUG00000010782) LRRC8B (ENSOCUG00000010780) ENSOCUG00000023473 ENSOCUG00000014931 ENSOCUG00000003764 ENSOCUG00000036036 ENSOCUG00000034762 ENSOCUG00000038599 ENSOCUG00000008656 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.xb.b ##22 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.xb.b ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.xb.b ##22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.xb.b ##22 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.xb.b ##22 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.xb.b ##22 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.xb.b ##22 Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 16 PGBD2 (ENSRFEG00010012615) ZNF692 (ENSRFEG00010012694) ENSRFEG00010013162 OR2T6 (ENSRFEG00010013205) ENSRFEG00010013256 ENSRFEG00010013308 ENSRFEG00010013524 OR2W3 (ENSRFEG00010013571) TRIM58 (ENSRFEG00010013589) OR11L1 (ENSRFEG00010010995) ENSRFEG00010011051 ##22 ENSRFEG00010011138 OR13G1 (ENSRFEG00010011201) OR14K1 (ENSRFEG00010011310) OR2G3 (ENSRFEG00010011480) OR2G2 (ENSRFEG00010011520) GCSAML (ENSRFEG00010011703) OR2B11 (ENSRFEG00010011877) NLRP3 (ENSRFEG00010011921) ENSRFEG00010012199 ZNF496 (ENSRFEG00010012279) ENSRFEG00010012356 ENSRFEG00010012392 RNF187 (ENSRFEG00010012412) H2AC25 (ENSRFEG00010012511) H3-4 (ENSRFEG00010012529) Microbat MODERN SPECIES 941 SLC16A2 (ENSMLUG00000007771) EDA2R (ENSMLUG00000015826) ENSMLUG00000024201 ENSMLUG00000023153 ENSMLUG00000028292 ENSMLUG00000024925 AR (ENSMLUG00000014191) OPHN1 (ENSMLUG00000001484) YIPF6 (ENSMLUG00000014760) STARD8 (ENSMLUG00000015899) EFNB1 (ENSMLUG00000012361) PJA1 (ENSMLUG00000004315) ENSMLUG00000030216 ENSMLUG00000026107 ENSMLUG00000028972 ENSMLUG00000029796 ##22 ENSMLUG00000028775 EDA (ENSMLUG00000008882) AWAT2 (ENSMLUG00000008905) ENSMLUG00000004183 ENSMLUG00000004190 ENSMLUG00000004179 DGAT2L6 (ENSMLUG00000001856) AWAT1 (ENSMLUG00000011002) P2RY4 (ENSMLUG00000011018) PDZD11 (ENSMLUG00000011031) KIF4A (ENSMLUG00000011048) GDPD2 (ENSMLUG00000011115) DLG3 (ENSMLUG00000011155) TEX11 (ENSMLUG00000006578) SLC7A3 (ENSMLUG00000023615) Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.xb.b ##22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.xb.b ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.xb.b ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.xb.b ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.xb.b ##22 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.xb.b ##22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.xb.b ##22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.xb.b ##22 Gorilla MODERN SPECIES 523 RHOXF1 (ENSGGOG00000016112) ZBTB33 (ENSGGOG00000010306) TMEM255A (ENSGGOG00000010310) ATP1B4 (ENSGGOG00000006495) LAMP2 (ENSGGOG00000000555) CUL4B (ENSGGOG00000011167) MCTS1 (ENSGGOG00000009420) C1GALT1C1 (ENSGGOG00000026235) ENSGGOG00000037852 ENSGGOG00000011433 CT47B1 (ENSGGOG00000015773) GLUD2 (ENSGGOG00000022665) ENSGGOG00000039654 ENSGGOG00000024589 GRIA3 (ENSGGOG00000009569) ENSGGOG00000044134 ##22 THOC2 (ENSGGOG00000000486) ENSGGOG00000008637 STAG2 (ENSGGOG00000004109) SH2D1A (ENSGGOG00000034950) TENM1 (ENSGGOG00000003488) ENSGGOG00000039541 DCAF12L2 (ENSGGOG00000005923) DCAF12L1 (ENSGGOG00000016198) PRR32 (ENSGGOG00000022006) ACTRT1 (ENSGGOG00000015345) ENSGGOG00000041367 ENSGGOG00000012841 OCRL (ENSGGOG00000000824) APLN (ENSGGOG00000040354) XPNPEP2 (ENSGGOG00000015184) Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.xb.b ##22 Bushbaby MODERN SPECIES 130 FEZF2 (ENSOGAG00000008112) ENSOGAG00000008116 SYNPR (ENSOGAG00000000442) SNTN (ENSOGAG00000016059) ENSOGAG00000030192 C3orf49 (ENSOGAG00000015268) THOC7 (ENSOGAG00000024865) ATXN7 (ENSOGAG00000031555) PSMD6 (ENSOGAG00000015279) ENSOGAG00000028241 PRICKLE2 (ENSOGAG00000009507) ADAMTS9 (ENSOGAG00000015548) MAGI1 (ENSOGAG00000000286) ENSOGAG00000033711 SLC25A26 (ENSOGAG00000002219) ENSOGAG00000007944 ##22 LRIG1 (ENSOGAG00000002220) ENSOGAG00000006131 ENSOGAG00000024724 KBTBD8 (ENSOGAG00000024533) ENSOGAG00000006190 ENSOGAG00000028255 TAFA4 (ENSOGAG00000012090) EOGT (ENSOGAG00000012093) TMF1 (ENSOGAG00000007764) UBA3 (ENSOGAG00000007771) ARL6IP5 (ENSOGAG00000007773) LMOD3 (ENSOGAG00000002704) FRMD4B (ENSOGAG00000002705) MITF (ENSOGAG00000000043) MDFIC2 (ENSOGAG00000030030) Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.xb.b ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.xb.b ##22 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.xb.b ##22 Rabbit MODERN SPECIES 8 VCPKMT (ENSOCUG00000006049) ARF6 (ENSOCUG00000001692) NEMF (ENSOCUG00000017384) KLHDC2 (ENSOCUG00000017378) KLHDC1 (ENSOCUG00000017367) ENSOCUG00000031174 POLE2 (ENSOCUG00000015480) ENSOCUG00000015466 MGAT2 (ENSOCUG00000015463) ENSOCUG00000027946 LRR1 (ENSOCUG00000000121) ENSOCUG00000027423 ENSOCUG00000033024 MDGA2 (ENSOCUG00000017002) RPL10L (ENSOCUG00000015485) ENSOCUG00000012678 ##22 ENSOCUG00000021198 ENSOCUG00000027427 ENSOCUG00000035475 ENSOCUG00000007451 MIS18BP1 (ENSOCUG00000007550) FANCM (ENSOCUG00000007539) ENSOCUG00000007535 PRPF39 (ENSOCUG00000007531) TOGARAM1 (ENSOCUG00000006378) KLHL28 (ENSOCUG00000006372) ENSOCUG00000008733 ENSOCUG00000031408 ENSOCUG00000010014 ENSOCUG00000038158 ENSOCUG00000036762 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000156895 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00940000157800 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a ENSGT00390000014620 ENSGT00940000157333 ENSGT00390000000204 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000156895 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00940000157800 ENSGT00520000062027 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a ENSGT00390000014620 ENSGT00940000157333 Tenrec DUPLICATION Tenrec MODERN SPECIES 5364 ENSETEG00000013980 #22 Tenrec DUPLICATION Tenrec DUPLICATION Tenrec DUPLICATION Tenrec DUPLICATION Tenrec MODERN SPECIES 12271 ENSETEG00000014375 #22 Tenrec MODERN SPECIES 13572 ENSETEG00000005160 #22 Tenrec MODERN SPECIES 15481 ENSETEG00000009628 #22 Tenrec MODERN SPECIES 10262 ENSETEG00000010157 #22 Tenrec MODERN SPECIES 9271 ENSETEG00000009117 #22 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000156895 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00940000157800 ENSGT00520000062027 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000174605 ENSGT00940000153432.A.a ENSGT00390000014620 Hyrax MODERN SPECIES 9284 ENSPCAG00000009315 #22 Elephant MODERN SPECIES 424 ZACN (ENSLAFG00000031284) ENSLAFG00000026303 SRP68 (ENSLAFG00000014355) ENSLAFG00000017329 CDK3 (ENSLAFG00000017321) TEN1 (ENSLAFG00000020843) ACOX1 (ENSLAFG00000004394) FBF1 (ENSLAFG00000026122) MRPL38 (ENSLAFG00000013250) TRIM65 (ENSLAFG00000013248) ENSLAFG00000028610 TRIM47 (ENSLAFG00000004318) WBP2 (ENSLAFG00000031545) UNC13D (ENSLAFG00000026262) UNK (ENSLAFG00000022662) ENSLAFG00000008083 #22 GALK1 (ENSLAFG00000032105) ITGB4 (ENSLAFG00000025542) SAP30BP (ENSLAFG00000008498) RECQL5 (ENSLAFG00000008491) SMIM5 (ENSLAFG00000025822) ENSLAFG00000028478 ENSLAFG00000008488 ENSLAFG00000008472 LLGL2 (ENSLAFG00000011663) TSEN54 (ENSLAFG00000011655) CASKIN2 (ENSLAFG00000002671) TMEM94 (ENSLAFG00000008667) GRB2 (ENSLAFG00000005924) SLC25A19 (ENSLAFG00000002874) ENSLAFG00000032680 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a #22 Armadillo DUPLICATION Armadillo DUPLICATION Armadillo DUPLICATION Armadillo MODERN SPECIES 3066 ENSDNOG00000033129 #22 Armadillo MODERN SPECIES 3720 ENSDNOG00000034282 #22 Armadillo MODERN SPECIES 492 ENSDNOG00000042916 #22 Armadillo MODERN SPECIES 3557 ENSDNOG00000043536 #22 Sloth DUPLICATION Sloth MODERN SPECIES 13520 ENSCHOG00000009552 #22 Sloth MODERN SPECIES 13389 ENSCHOG00000009661 #22 Marsupialia ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870.a ENSGT00940000157800 ENSGT00520000062027 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a ENSGT00390000014620 ENSGT00940000157333 Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870.a ENSGT00940000157800 ENSGT00520000062027 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a ENSGT00390000014620 ENSGT00940000157333 Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870.a ENSGT00940000157800 ENSGT00520000062027 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a ENSGT00390000014620 ENSGT00940000157333 Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870.a ENSGT00940000157800 ENSGT00520000062027 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a ENSGT00390000014620 ENSGT00940000157333 Common wonbat MODERN SPECIES 1035 ENSVURG00010009330 #14 ENSVURG00010009318 #13 ENSVURG00010009303 #12 ENSVURG00010009284 #11 ENSVURG00010009246 ENSVURG00010009226 #9 ENSVURG00010009206 #8 ENSVURG00010009183 #7 ENSVURG00010009142 ENSVURG00010009136 #16 ENSVURG00010009115 #17 ENSVURG00010009085 ENSVURG00010009077 #19 ENSVURG00010009049 #18 ENSVURG00010009034 #21 H3-3A (ENSVURG00010009028) #22 ENSVURG00010008978 #23 ENSVURG00010008959 #24 ENSVURG00010008938 #25 ENSVURG00010008888 #26 ENSVURG00010008845 #27 ENSVURG00010008828 #28 ENSVURG00010008755 #29 ENSVURG00010008694 #30 ENSVURG00010008553 #31 ENSVURG00010008436 #32 ENSVURG00010008421 #34 ENSVURG00010008373 #35 ENSVURG00010008362 #36 ENSVURG00010008296 ENSVURG00010008267 koala DUPLICATION koala MODERN SPECIES 305 BVES (ENSPCIG00000019470) POPDC3 (ENSPCIG00000019476) ENSPCIG00000019477 #22 PREP (ENSPCIG00000019479) PRDM1 (ENSPCIG00000015185) ATG5 (ENSPCIG00000015179) QRSL1 (ENSPCIG00000027397) CD24 (ENSPCIG00000000403) ENSPCIG00000032453 koala MODERN SPECIES 97 EXOC7 (ENSPCIG00000002974) ZACN (ENSPCIG00000003053) GALR2 (ENSPCIG00000003080) SRP68 (ENSPCIG00000003210) ENSPCIG00000020255 CDK3 (ENSPCIG00000020260) TEN1 (ENSPCIG00000020265) ACOX1 (ENSPCIG00000020266) FBF1 (ENSPCIG00000020271) MRPL38 (ENSPCIG00000020275) TRIM65 (ENSPCIG00000020276) TRIM47 (ENSPCIG00000020279) WBP2 (ENSPCIG00000020281) UNC13D (ENSPCIG00000020287) UNK (ENSPCIG00000020300) H3-3B (ENSPCIG00000020305) #22 GALK1 (ENSPCIG00000020372) ITGB4 (ENSPCIG00000020375) ENSPCIG00000020395 RECQL5 (ENSPCIG00000020398) SMIM5 (ENSPCIG00000020404) ENSPCIG00000020414 LLGL2 (ENSPCIG00000023942) CASKIN2 (ENSPCIG00000020459) TMEM94 (ENSPCIG00000020473) GRB2 (ENSPCIG00000020065) SLC25A19 (ENSPCIG00000004843) MIF4GD (ENSPCIG00000004836) MRPS7 (ENSPCIG00000004824) GGA3 (ENSPCIG00000004778) NUP85 (ENSPCIG00000004754) Platypus DUPLICATION Platypus MODERN SPECIES 45 UBALD2 (ENSOANG00000038253) RNF157 (ENSOANG00000014383) FOXJ1 (ENSOANG00000014384) EXOC7 (ENSOANG00000003543) GALR2 (ENSOANG00000014385) SRP68 (ENSOANG00000014989) ENSOANG00000001866 TEN1 (ENSOANG00000043359) ACOX1 (ENSOANG00000001864) MRPL38 (ENSOANG00000001861) ENSOANG00000012909 TRIM47 (ENSOANG00000012910) WBP2 (ENSOANG00000040882) UNC13D (ENSOANG00000041715) UNK (ENSOANG00000041614) ENSOANG00000037145 #22 GALK1 (ENSOANG00000012912) ITGB4 (ENSOANG00000015842) SAP30BP (ENSOANG00000015843) ENSOANG00000045029 RECQL5 (ENSOANG00000015844) ENSOANG00000038802 LLGL2 (ENSOANG00000005718) TSEN54 (ENSOANG00000044411) ENSOANG00000008331 TMEM94 (ENSOANG00000008329) GRB2 (ENSOANG00000008328) SLC25A19 (ENSOANG00000008326) MIF4GD (ENSOANG00000008325) MRPS7 (ENSOANG00000008324) ENSOANG00000045951 Platypus MODERN SPECIES 10 TP53BP2 (ENSOANG00000001453) FBXO28 (ENSOANG00000001454) DEGS1 (ENSOANG00000001455) #15 NVL (ENSOANG00000001457) #14 CNIH4 (ENSOANG00000043482) #13 WDR26 (ENSOANG00000037128) #12 ENSOANG00000050981 #11 ENSOANG00000001463 LBR (ENSOANG00000001469) #8 ENAH (ENSOANG00000001471) #7 SRP9 (ENSOANG00000050463) EPHX1 (ENSOANG00000001473) #16 ENSOANG00000001474 #17 ENSOANG00000001480 #18 SDE2 (ENSOANG00000001481) #21 ENSOANG00000037953 #22 ENSOANG00000050350 #23 ENSOANG00000043340 #23 MIXL1 (ENSOANG00000001484) #24 LIN9 (ENSOANG00000001486) #25 PARP1 (ENSOANG00000001488) #26 ENSOANG00000050466 #27 ENSOANG00000001517 #28 PSEN2 (ENSOANG00000010238) #29 COQ8A (ENSOANG00000010237) #30 CDC42BPA (ENSOANG00000010240) #31 AHCTF1 (ENSOANG00000010242) #32 SCCPDH (ENSOANG00000010244) #34 CNST (ENSOANG00000010245) #35 ENSOANG00000041467 #36 SMYD3 (ENSOANG00000019760) #37 Sauria ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00940000165001.a.b ENSGT00940000162951.b ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a #22 ENSGT00940000167259 ENSGT01100000263504.a.b.a.b.a.a ##22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00520000062027 ENSGT00940000157800 ENSGT00940000170136 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000181148 ENSGT00940000155738 Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000156895 ENSGT00390000003595 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000165001.a.b ENSGT00940000162951.b ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a #22 ENSGT00940000167259 ENSGT01100000263504.a.b.a.b.a.a ##22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00940000170136 ENSGT00940000157800 ENSGT00520000062027 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000154272.B ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000181148 tuatara MODERN SPECIES 1150 EPHX1 (ENSSPUG00000007688) #16 ENSSPUG00000007703 #17 ENSSPUG00000007732 #18 SDE2 (ENSSPUG00000007741) #21 ENSSPUG00000007754 #22 ACBD3 (ENSSPUG00000007760) #23 LIN9 (ENSSPUG00000007769) #25 PARP1 (ENSSPUG00000007790) #26 Episquamata ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000156895 ENSGT00390000003595 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000165001.a.b ENSGT00940000162951.b ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a #22 ENSGT00940000167259 ENSGT01100000263504.a.b.a.b.a.a ##22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00940000170136 ENSGT00940000157800 ENSGT00520000062027 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000154272.B ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000181148 Laterata ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000156895 ENSGT00390000003595 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000165001.a.b.b ENSGT00940000162951.b ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a #22 ENSGT00940000167259 ENSGT01100000263504.a.b.a.b.a.a ##22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00940000157800 ENSGT00520000062027 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000154272.B ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 Common wall lizard MODERN SPECIES 16 PRKD2 (ENSPMRG00000008708) STRN4 (ENSPMRG00000008722) FKRP (ENSPMRG00000008731) SLC1A5 (ENSPMRG00000008739) AP2S1 (ENSPMRG00000008748) ARHGAP35 (ENSPMRG00000008755) ENSPMRG00000008759 TMEM160 (ENSPMRG00000008765) ENSPMRG00000008769 ENSPMRG00000008772 EHD2 (ENSPMRG00000008778) NOP53 (ENSPMRG00000008785) ENSPMRG00000008791 ENSPMRG00000008794 SELENOW (ENSPMRG00000008798) ENSPMRG00000008802 #22 CRX (ENSPMRG00000008809) ENSPMRG00000008813 DMAC2 (ENSPMRG00000008823) B3GNT8 (ENSPMRG00000008827) ENSPMRG00000008833 BCKDHA (ENSPMRG00000008839) EXOSC5 (ENSPMRG00000008845) TMEM91 (ENSPMRG00000008852) B9D2 (ENSPMRG00000008855) TGFB1 (ENSPMRG00000008860) CCDC97 (ENSPMRG00000008866) HNRNPUL1 (ENSPMRG00000008875) AXL (ENSPMRG00000008957) CLPTM1 (ENSPMRG00000009434) RELB (ENSPMRG00000009458) Argentine black and white tegu DUPLICATION Argentine black and white tegu MODERN SPECIES 59 ENSSMRG00000007620 PSMD8 (ENSSMRG00000007610) ENSSMRG00000007593 ENSSMRG00000007233 SLC8A2 (ENSSMRG00000007223) KPTN (ENSSMRG00000007219) NAPA (ENSSMRG00000007212) ENSSMRG00000007202 ZNF541 (ENSSMRG00000007167) BICRA (ENSSMRG00000007162) ENSSMRG00000007159 EHD2 (ENSSMRG00000007155) NOP53 (ENSSMRG00000007150) ENSSMRG00000007149 SELENOW (ENSSMRG00000007145) ENSSMRG00000007141 #22 ENSSMRG00000007137 ENSSMRG00000007133 DMAC2 (ENSSMRG00000007131) B3GNT8 (ENSSMRG00000007130) BCKDHA (ENSSMRG00000007126) EXOSC5 (ENSSMRG00000007123) TMEM91 (ENSSMRG00000007117) B9D2 (ENSSMRG00000007116) TGFB1 (ENSSMRG00000007113) CCDC97 (ENSSMRG00000007112) HNRNPUL1 (ENSSMRG00000007108) ENSSMRG00000007105 AXL (ENSSMRG00000007094) CLPTM1 (ENSSMRG00000007085) RELB (ENSSMRG00000007077) Argentine black and white tegu MODERN SPECIES 9 TRAPPC12 (ENSSMRG00000006552) ADI1 (ENSSMRG00000006539) RNASEH1 (ENSSMRG00000006529) RPS7 (ENSSMRG00000006525) COLEC11 (ENSSMRG00000006522) ALLC (ENSSMRG00000006519) DCDC2C (ENSSMRG00000006515) SOX11 (ENSSMRG00000006504) ENSSMRG00000006493 ENSSMRG00000006489 ENSSMRG00000006484 ENSSMRG00000006470 CMPK2 (ENSSMRG00000006467) RSAD2 (ENSSMRG00000006397) RNF144A (ENSSMRG00000006394) ENSSMRG00000006368 #22 ID2 (ENSSMRG00000006348) KIDINS220 (ENSSMRG00000006306) MBOAT2 (ENSSMRG00000006296) ASAP2 (ENSSMRG00000006275) ITGB1BP1 (ENSSMRG00000006271) CPSF3 (ENSSMRG00000006269) IAH1 (ENSSMRG00000006268) ADAM17 (ENSSMRG00000006231) YWHAQ (ENSSMRG00000006227) TAF1B (ENSSMRG00000006214) ENSSMRG00000006208 ENSSMRG00000006187 KLF11 (ENSSMRG00000006180) RRM2 (ENSSMRG00000006152) HPCAL1 (ENSSMRG00000006133) Argentine black and white tegu MODERN SPECIES 1 EXOC7 (ENSSMRG00000023167) GALR2 (ENSSMRG00000023168) SRP68 (ENSSMRG00000023169) ENSSMRG00000023170 CDK3 (ENSSMRG00000023171) TEN1 (ENSSMRG00000023172) ACOX1 (ENSSMRG00000023173) FBF1 (ENSSMRG00000023174) MRPL38 (ENSSMRG00000023175) ENSSMRG00000023176 ENSSMRG00000023177 ENSSMRG00000023178 WBP2 (ENSSMRG00000023179) UNC13D (ENSSMRG00000023180) UNK (ENSSMRG00000023181) ENSSMRG00000023182 #22 ENSSMRG00000023183 GALK1 (ENSSMRG00000023184) ITGB4 (ENSSMRG00000023185) SAP30BP (ENSSMRG00000023186) RECQL5 (ENSSMRG00000023187) SMIM5 (ENSSMRG00000023188) ENSSMRG00000023189 LLGL2 (ENSSMRG00000023193) TSEN54 (ENSSMRG00000023194) ENSSMRG00000023195 CASKIN2 (ENSSMRG00000023196) TMEM94 (ENSSMRG00000023197) GRB2 (ENSSMRG00000023198) SLC25A19 (ENSSMRG00000023199) MIF4GD (ENSSMRG00000023200) Argentine black and white tegu MODERN SPECIES 7 ENSSMRG00000000585 FBXO28 (ENSSMRG00000000640) DEGS1 (ENSSMRG00000000647) #15 NVL (ENSSMRG00000000653) #14 CNIH4 (ENSSMRG00000000692) #13 WDR26 (ENSSMRG00000000713) #12 CNIH3 (ENSSMRG00000000764) #11 ENSSMRG00000000780 LBR (ENSSMRG00000000922) #8 ENAH (ENSSMRG00000000950) #7 SRP9 (ENSSMRG00000000983) EPHX1 (ENSSMRG00000000993) #16 TMEM63A (ENSSMRG00000001043) #17 ENSSMRG00000001070 #18 SDE2 (ENSSMRG00000001076) #21 H3-3A (ENSSMRG00000001173) #22 ENSSMRG00000001178 ACBD3 (ENSSMRG00000001183) #23 LIN9 (ENSSMRG00000001191) #25 PARP1 (ENSSMRG00000001210) #26 ENSSMRG00000001231 STUM (ENSSMRG00000001238) #27 ITPKB (ENSSMRG00000001272) #28 PSEN2 (ENSSMRG00000001279) #29 COQ8A (ENSSMRG00000001316) #30 CDC42BPA (ENSSMRG00000001396) #31 XDH (ENSSMRG00000001429) ENSSMRG00000001438 ENSSMRG00000001440 GALNT14 (ENSSMRG00000001476) ENSSMRG00000001493 Toxicofera ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a #22 Elapidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a #22 Indian cobra MODERN SPECIES 11 ENSNNAG00000004328 ENSNNAG00000004317 ENSNNAG00000004295 PSMD8 (ENSNNAG00000004223) ENSNNAG00000003932 ENSNNAG00000003835 KPTN (ENSNNAG00000003787) ENSNNAG00000015768 ENSNNAG00000015751 ZNF541 (ENSNNAG00000015741) BICRA (ENSNNAG00000015716) EHD2 (ENSNNAG00000015707) NOP53 (ENSNNAG00000015645) GJD2 (ENSNNAG00000015624) ENSNNAG00000015613 ENSNNAG00000015606 #22 ENSNNAG00000015597 EXOSC5 (ENSNNAG00000015576) TMEM91 (ENSNNAG00000015567) ENSNNAG00000015558 CCDC97 (ENSNNAG00000015532) HNRNPUL1 (ENSNNAG00000015371) AXL (ENSNNAG00000015310) CLPTM1 (ENSNNAG00000015255) ENSNNAG00000015229 GEMIN7 (ENSNNAG00000015211) ENSNNAG00000015192 PPP1R37 (ENSNNAG00000015144) NKPD1 (ENSNNAG00000015129) ENSNNAG00000015097 ENSNNAG00000015084 Elapidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a #22 Blue-lipped sea krait DUPLICATION Blue-lipped sea krait MODERN SPECIES 9529 ENSLLTG00000014946 #22 Blue-lipped sea krait MODERN SPECIES 3280 ENSLLTG00000009620 #22 Archelosauria ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00940000165001.a.b ENSGT00940000162951.b ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a #22 ENSGT00940000167259 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00940000170136 ENSGT00940000157800 ENSGT00520000062027 ENSGT00930000151032.B ENSGT00940000155335 ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 Cryptodira ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00390000003595 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851.b ENSGT00940000165001.a.b ENSGT00940000162951.b ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a #22 ENSGT00940000167259 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00940000157800 ENSGT00520000062027 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000154272.B ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a Testudinoidea ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00390000003595 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851.a ENSGT00940000165001.a.b ENSGT00940000162951.b ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a #22 ENSGT00940000167259 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00940000157800 ENSGT00520000062027 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a ENSGT00390000014620 Testudinidae ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000156895 ENSGT00390000003595 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000165001.a.b ENSGT00940000162951.b ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a #22 ENSGT00940000167259 ENSGT01100000263504.a.b.a.b.a.a ##22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00940000157800 ENSGT00520000062027 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000154272.B ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 Goode s thornscrub tortoise DUPLICATION Goode s thornscrub tortoise MODERN SPECIES 6 FOXJ1 (ENSGEVG00005013705) EXOC7 (ENSGEVG00005013783) GALR2 (ENSGEVG00005014016) SRP68 (ENSGEVG00005014107) ENSGEVG00005014859 CDK3 (ENSGEVG00005016384) TEN1 (ENSGEVG00005016422) ACOX1 (ENSGEVG00005016444) FBF1 (ENSGEVG00005016494) MRPL38 (ENSGEVG00005016740) ENSGEVG00005016781 ENSGEVG00005016814 WBP2 (ENSGEVG00005016913) UNC13D (ENSGEVG00005016974) UNK (ENSGEVG00005017112) ENSGEVG00005017236 #22 ENSGEVG00005017268 GALK1 (ENSGEVG00005017355) ITGB4 (ENSGEVG00005017584) SAP30BP (ENSGEVG00005018740) RECQL5 (ENSGEVG00005018858) SMIM5 (ENSGEVG00005018909) ENSGEVG00005018948 LLGL2 (ENSGEVG00005019084) TSEN54 (ENSGEVG00005019163) ENSGEVG00005019177 ENSGEVG00005019182 TMEM94 (ENSGEVG00005019206) GRB2 (ENSGEVG00005019279) SLC25A19 (ENSGEVG00005019291) MRPS7 (ENSGEVG00005019299) Goode s thornscrub tortoise MODERN SPECIES 134 PSMD8 (ENSGEVG00005015680) ENSGEVG00005015651 CATSPERG (ENSGEVG00005015530) MEIS3 (ENSGEVG00005015459) SLC8A2 (ENSGEVG00005015381) KPTN (ENSGEVG00005015356) NAPA (ENSGEVG00005015284) ENSGEVG00005015256 ZNF541 (ENSGEVG00005015226) BICRA (ENSGEVG00005015175) CAPN12 (ENSGEVG00005015065) EHD2 (ENSGEVG00005015006) NOP53 (ENSGEVG00005014974) GJD2 (ENSGEVG00005014943) ENSGEVG00005014920 ENSGEVG00005014898 #22 ENSGEVG00005014823 PRSS16 (ENSGEVG00005014791) DMAC2 (ENSGEVG00005014708) Chinese turtle DUPLICATION Chinese turtle MODERN SPECIES 2110 EXOC7 (ENSPSIG00000014251) GALR2 (ENSPSIG00000014220) SRP68 (ENSPSIG00000013792) ENSPSIG00000013086 CDK3 (ENSPSIG00000012893) TEN1 (ENSPSIG00000012802) ACOX1 (ENSPSIG00000012513) FBF1 (ENSPSIG00000012425) MRPL38 (ENSPSIG00000010910) ENSPSIG00000010892 ENSPSIG00000010880 ENSPSIG00000010753 WBP2 (ENSPSIG00000010355) UNC13D (ENSPSIG00000010116) UNK (ENSPSIG00000009640) H3-3B (ENSPSIG00000009638) #22 ENSPSIG00000009542 GALK1 (ENSPSIG00000008689) ITGB4 (ENSPSIG00000005403) SAP30BP (ENSPSIG00000005165) ENSPSIG00000005110 ENSPSIG00000005098 ENSPSIG00000004729 ENSPSIG00000004008 ENSPSIG00000000729 LLGL2 (ENSPSIG00000012845) TSEN54 (ENSPSIG00000012807) ENSPSIG00000000715 CASKIN2 (ENSPSIG00000011273) TMEM94 (ENSPSIG00000009656) GRB2 (ENSPSIG00000009206) Chinese turtle MODERN SPECIES 951 ENSPSIG00000018181 ENSPSIG00000018187 SELENOW (ENSPSIG00000018188) ENSPSIG00000018192 #22 ENSPSIG00000018193 Archosauria ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000013448.a.a #15 ENSGT00570000079239 #14 ENSGT00940000170165 ENSGT00950000182834.B #13 ENSGT00940000153634.b #12 ENSGT00950000182834.A.a.b.c #11 ENSGT00390000000412 ENSGT00390000000417.a.a.b.a.b #8 ENSGT00940000165801 ENSGT00940000157376 #7 ENSGT00390000018505 ENSGT00390000002210.d #16 ENSGT00940000159576 #17 ENSGT00390000010056 #18 ENSGT00530000063402.b #21 ENSGT01100000263504.a.a #22 ENSGT00530000063651.a #23 ENSGT00940000162190 #24 ENSGT00390000003188 #25 ENSGT00940000156058 #26 ENSGT00390000008003 #27 ENSGT00940000156764.a #28 ENSGT00940000157923 #29 ENSGT00940000156810 #30 ENSGT01030000234517.H.b #31 ENSGT00950000183114.a.a ENSGT00940000159274 ENSGT00940000160421 ENSGT00940000158182 ENSGT00940000160921 ENSGT00950000182836.a Australian saltwater crocodile MODERN SPECIES 60 CNIH4 (ENSCPRG00005002963) #13 WDR26 (ENSCPRG00005002982) #12 CNIH3 (ENSCPRG00005003107) #11 ENSCPRG00005003133 ENSCPRG00005003164 ENSCPRG00005003169 LBR (ENSCPRG00005003175) #8 ENSCPRG00005003203 ENSCPRG00005003215 #7 ENSCPRG00005003221 #7 SRP9 (ENSCPRG00005003245) EPHX1 (ENSCPRG00005003255) #16 TMEM63A (ENSCPRG00005003380) #17 ENSCPRG00005003387 #18 SDE2 (ENSCPRG00005003391) #21 ENSCPRG00005003407 #22 ACBD3 (ENSCPRG00005003412) #23 LIN9 (ENSCPRG00005003428) #25 PARP1 (ENSCPRG00005003441) #26 PSEN2 (ENSCPRG00005003466) #29 COQ8A (ENSCPRG00005003488) #30 CDC42BPA (ENSCPRG00005004049) #31 XDH (ENSCPRG00005008316) EHD3 (ENSCPRG00005008338) CAPN14 (ENSCPRG00005008377) GALNT14 (ENSCPRG00005008412) ENSCPRG00005008477 LCLAT1 (ENSCPRG00005008504) ENSCPRG00005008514 LBH (ENSCPRG00005008519) ENSCPRG00005008522 Aves ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00940000165001.a.b ENSGT00940000162951.b ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a #22 ENSGT01100000263504.b ##22 ENSGT00940000171204 ENSGT01100000263504.a.b.a.a ##22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00520000062027 ENSGT00940000157800 ENSGT00940000170136 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000154272.B ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 Neognathae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a #22 Neognathae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a #22 Passeriformes ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000154784.D.a.b ENSGT00940000153463.b ENSGT00390000002970 ENSGT00390000013448.a.a #15 ENSGT00570000079239 #14 ENSGT00950000182834.B #13 ENSGT00940000153634.b #12 ENSGT00950000182834.A.a.b.c #11 ENSGT00390000000417.a.a.b.a.b #8 ENSGT00940000157376 #7 ENSGT00390000018505 ENSGT00390000002210.d #16 ENSGT00940000159576 #17 ENSGT00390000010056 #18 ENSGT00530000063402.b #21 ENSGT01100000263504.a.a #22 ENSGT01100000263504.a.b.b.a.b ##22 ENSGT00530000063651.a #23 ENSGT00940000162190 #24 ENSGT00390000003188 #25 ENSGT00940000156058 #26 ENSGT00390000008003 #27 ENSGT00940000156764.a #28 ENSGT00940000157923 #29 ENSGT00940000156810 #30 ENSGT01030000234517.H.b #31 ENSGT00950000183114.a.a ENSGT00960000189414 ENSGT00940000159274 ENSGT00940000160421 ENSGT00940000158182 Passeriformes_d ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000154784.D.a.b ENSGT00940000153463.b ENSGT00390000002970 ENSGT00390000013448.a.a #15 ENSGT00570000079239 #14 ENSGT00950000182834.B #13 ENSGT00940000153634.b #12 ENSGT00950000182834.A.a.b.c #11 ENSGT00390000000417.a.a.b.a.b #8 ENSGT00940000157376 #7 ENSGT00390000018505 ENSGT00390000002210.d #16 ENSGT00940000159576 #17 ENSGT00390000010056 #18 ENSGT00530000063402.b #21 ENSGT01100000263504.a.a #22 ENSGT00530000063651.a #23 ENSGT00940000162190 #24 ENSGT00390000003188 #25 ENSGT00940000156058 #26 ENSGT00390000008003 #27 ENSGT00940000156764.a #28 ENSGT00940000157923 #29 ENSGT00940000156810 #30 ENSGT01030000234517.H.b #31 ENSGT00950000183114.a.a ENSGT00960000189414 ENSGT00940000159274 ENSGT00940000160421 ENSGT00940000158182 ENSGT00940000160921 Flycatcher MODERN SPECIES 21 TP53BP2 (ENSFALG00000011838) FBXO28 (ENSFALG00000026434) ENSFALG00000024961 NVL (ENSFALG00000011798) #14 DEGS1 (ENSFALG00000011808) #15 WDR26 (ENSFALG00000011769) #12 CNIH3 (ENSFALG00000011756) #11 LBR (ENSFALG00000011738) #8 ENAH (ENSFALG00000011701) #7 ENSFALG00000024751 SRP9 (ENSFALG00000023050) EPHX1 (ENSFALG00000011683) #16 TMEM63A (ENSFALG00000011672) #17 ENSFALG00000011659 #18 SDE2 (ENSFALG00000011644) #21 ENSFALG00000011637 #22 ACBD3 (ENSFALG00000011626) #23 LIN9 (ENSFALG00000011618) #25 PARP1 (ENSFALG00000011578) #26 STUM (ENSFALG00000024398) #27 ENSFALG00000023589 ITPKB (ENSFALG00000027989) #28 PSEN2 (ENSFALG00000011534) #29 COQ8A (ENSFALG00000011530) #30 CDC42BPA (ENSFALG00000011522) #31 XDH (ENSFALG00000011478) ENSFALG00000025053 EHD3 (ENSFALG00000011448) CAPN14 (ENSFALG00000011401) GALNT14 (ENSFALG00000011373) CAPN13 (ENSFALG00000011346) Passeriformes_g ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000156895 ENSGT00390000003595 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT01030000235299.a.a.b ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870.h ENSGT00520000062027 ENSGT00390000007870.g.a ENSGT00940000157800 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000154272.B ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a Medium ground finch DUPLICATION Medium ground finch MODERN SPECIES 137 CAPN2 (ENSGFOG00000009111) TP53BP2 (ENSGFOG00000009095) FBXO28 (ENSGFOG00000009085) DEGS1 (ENSGFOG00000009082) #15 NVL (ENSGFOG00000008086) #14 CNIH4 (ENSGFOG00000008026) #13 WDR26 (ENSGFOG00000007978) #12 CNIH3 (ENSGFOG00000007963) #11 LBR (ENSGFOG00000007940) #8 ENAH (ENSGFOG00000007895) #7 SRP9 (ENSGFOG00000007887) EPHX1 (ENSGFOG00000007862) #16 TMEM63A (ENSGFOG00000007843) #17 ENSGFOG00000007831 #18 SDE2 (ENSGFOG00000007825) #21 ENSGFOG00000007821 #22 ACBD3 (ENSGFOG00000007812) #23 LIN9 (ENSGFOG00000007804) #25 PARP1 (ENSGFOG00000005482) #26 STUM (ENSGFOG00000005336) #27 ITPKB (ENSGFOG00000005295) #28 PSEN2 (ENSGFOG00000005275) #29 COQ8A (ENSGFOG00000005254) #30 CDC42BPA (ENSGFOG00000005198) #31 XDH (ENSGFOG00000005138) EHD3 (ENSGFOG00000005125) ENSGFOG00000005113 GALNT14 (ENSGFOG00000005014) ENSGFOG00000004987 Medium ground finch MODERN SPECIES 73 RNF157 (ENSGFOG00000007148) FOXJ1 (ENSGFOG00000007171) EXOC7 (ENSGFOG00000007198) ENSGFOG00000007362 SRP68 (ENSGFOG00000007377) ENSGFOG00000007906 CDK3 (ENSGFOG00000008032) TEN1 (ENSGFOG00000008051) ACOX1 (ENSGFOG00000008063) MRPL38 (ENSGFOG00000008085) ENSGFOG00000008096 ENSGFOG00000008107 WBP2 (ENSGFOG00000008114) UNC13D (ENSGFOG00000008126) UNK (ENSGFOG00000008191) ENSGFOG00000008245 #22 GALK1 (ENSGFOG00000008270) ITGB4 (ENSGFOG00000008281) SAP30BP (ENSGFOG00000008328) RECQL5 (ENSGFOG00000008340) ENSGFOG00000008351 LLGL2 (ENSGFOG00000008365) TSEN54 (ENSGFOG00000008392) MCHR1 (ENSGFOG00000008402) CASKIN2 (ENSGFOG00000008411) TMEM94 (ENSGFOG00000008472) GRB2 (ENSGFOG00000008751) SLC25A19 (ENSGFOG00000008758) MIF4GD (ENSGFOG00000008762) MRPS7 (ENSGFOG00000008769) GGA3 (ENSGFOG00000008773) Anura ANCESTRAL SPECIES 43 ENSGT00940000158822 ENSGT01100000263504.a.b.a.b.a.a ##22 ENSGT00510000049652 ENSGT01100000263504.a.a #22 ENSGT00940000154307.B ENSGT00390000015973 ENSGT00940000155698.A ENSGT00390000015750 ENSGT00940000155830 ENSGT00390000005666 ENSGT00940000157513 ENSGT00940000159039 ENSGT00940000162800 ENSGT00950000182951.A.a.a ENSGT00390000017961 ENSGT00950000183188.A.b ENSGT01060000248591.a.a.a.a ENSGT00940000153560.b.b.a ENSGT00510000048486 Leishan spiny toad MODERN SPECIES 10 ENSLLEG00000027779 ENSLLEG00000027699 ENSLLEG00000027686 ENSLLEG00000027673 GNPTG (ENSLLEG00000027612) TSR3 (ENSLLEG00000027588) ENSLLEG00000027577 ENSLLEG00000027566 BAIAP3 (ENSLLEG00000027426) UBE2I (ENSLLEG00000027381) KCTD5 (ENSLLEG00000027284) PDPK1 (ENSLLEG00000026951) ENSLLEG00000026874 ENSLLEG00000026726 UNKL (ENSLLEG00000026423) ENSLLEG00000026346 #22 ENSLLEG00000026322 GPER1 (ENSLLEG00000026262) ENSLLEG00000023231 GET4 (ENSLLEG00000022577) ENSLLEG00000022412 DNAAF5 (ENSLLEG00000022272) PRKAR1B (ENSLLEG00000022095) PDGFA (ENSLLEG00000021948) FOXL3 (ENSLLEG00000021895) FAM20C (ENSLLEG00000021798) ENSLLEG00000021776 ENSLLEG00000021731 ENSLLEG00000021713 ENSLLEG00000021184 ENSLLEG00000020930