Vertebrata ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a #22 Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES 679 ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT01100000263504.a.a #22 ENSGT00940000167259 ENSGT00950000183187.B Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 168 ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00970000197298 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000162951 ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a #22 ENSGT00940000171204 ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00940000157800 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT01100000263504.a.b.b.a.b ##21 ENSGT00940000167259 ENSGT00950000183187.B Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES 457 ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a #22 ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00940000157800 ENSGT00950000183187.B Neopterygii ANCESTRAL SPECIES 169 ENSGT01090000260051.b.a.b ENSGT00940000156819.a.b 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ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a #22 ENSGT00940000167259 ENSGT00940000163587.a.b.a.c.b ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT01000000216149 ENSGT00940000176223 ENSGT00390000018570.b.a ENSGT00390000013268 Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000156819.a.b ENSGT00940000157017.a.b.a ENSGT00390000005895.h ENSGT01030000234534.C ENSGT00390000005895.g ENSGT00390000014852.a ENSGT00390000004691 ENSGT00940000153514.a.b ENSGT00390000013574 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000162951 ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.b.a.a #21 ENSGT01100000263504.a.a #22 ENSGT00940000167259 ENSGT00940000163587.a.b.a.c.b ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT01000000216149 ENSGT00390000018570.b.a ENSGT00390000013268 ENSGT00940000167542 ENSGT00940000157510 ENSGT00940000155709.i ENSGT00940000162720.b.a.a.a ENSGT00940000156854.s ENSGT00940000154076.C.d ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c ENSGT00940000154744.a.b Salmoninae DUPLICATION Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.ob.b #22 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.ob.b #22 Salmo ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000160308.b #7 ENSGT00390000009409.mb #8 ENSGT00940000165978 #9 ENSGT00940000159343 ENSGT00940000158344.a.a.c #11 ENSGT00910000144115.b.dc.b.a #12 ENSGT01030000234642.a.b.b.d.b.c.a.d #13 ENSGT00940000159610.n #14 ENSGT00940000160281.o #15 ENSGT00940000161057.h #16 ENSGT00940000154866.A.f #17 ENSGT00940000160500 #18 ENSGT01090000260005.a.b.a.b.b.i.c #19 ENSGT00390000017267.c #20 ENSGT01100000263504.a.b.a.a #21 ENSGT01100000263504.a.a.ob.b #22 ENSGT00940000164977.b.f #24 ENSGT00550000074807.c.e.a #25 ENSGT00940000153792.A.i #27 ENSGT00940000156265.h #26 ENSGT00940000160533.b ENSGT00530000064222.a.a #28 ENSGT00940000158965.o #29 ENSGT00940000160957.g #30 ENSGT00940000165302.d #31 ENSGT00940000160692.e.b #32 ENSGT01030000234592.A.b.a.db.a.a #34 ENSGT00390000017365.a.a.b.a #37 ENSGT00940000159302 ENSGT00940000154525.b.b.b ENSGT00940000162775.d Atlantic salmon MODERN SPECIES 28 ENSSSAG00000064553 #7 ENSSSAG00000064454 #8 ENSSSAG00000113410 #9 ENSSSAG00000048510 #10 ENSSSAG00000085876 #11 ENSSSAG00000046230 #12 ENSSSAG00000098949 #13 ech1 (ENSSSAG00000044971) #14 ENSSSAG00000044874 #15 meis3 (ENSSSAG00000109909) #16 ENSSSAG00000044807 #17 dmac2 (ENSSSAG00000044797) #18 ENSSSAG00000044772 #19 nop53 (ENSSSAG00000044707) #20 ENSSSAG00000044665 #21 h3f3a (ENSSSAG00000095049) #22 ENSSSAG00000103523 #23 ENSSSAG00000121667 #24 ENSSSAG00000044595 #25 si:dkey-260j18.2 (ENSSSAG00000044497) #26 ENSSSAG00000042477 #27 fbxo46 (ENSSSAG00000042440) #28 coq8b (ENSSSAG00000042284) #29 numbl (ENSSSAG00000042218) #30 ENSSSAG00000048744 #31 dpf1 (ENSSSAG00000095651) #32 ENSSSAG00000053210 #33 ENSSSAG00000094013 #34 ENSSSAG00000101842 #35 ENSSSAG00000109424 #36 ENSSSAG00000009240 #37 Huchen MODERN SPECIES 565 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ENSGT00940000160957.h ##30 ENSGT00940000165302.c ##31 ENSGT00940000160692.e.a.a ##32 ENSGT01030000234592.A.b.a.db.a.b ##34 ENSGT00390000017365.a.a.b.b ##33 ENSGT01000000219184 ENSGT00940000165141.a River trout MODERN SPECIES 18 ENSSTUG00000020526 ##7 eif3k (ENSSTUG00000020428) ##8 actn4 (ENSSTUG00000019334) ##10 ENSSTUG00000019263 ENSSTUG00000019254 slc8a2b (ENSSTUG00000019177) ##11 srsf7a (ENSSTUG00000019123) ##12 hnrnpl2 (ENSSTUG00000018829) ##13 ech1 (ENSSTUG00000018505) ##14 ENSSTUG00000018423 ##15 meis3 (ENSSTUG00000018343) ##16 ENSSTUG00000018331 ##17 sirt2 (ENSSTUG00000018168) GJD2 (ENSSTUG00000018157) ##19 nop53 (ENSSTUG00000018111) ##20 ENSSTUG00000018105 ##21 ENSSTUG00000018091 ##21 ENSSTUG00000018083 ##24 psma6l (ENSSTUG00000018066) ##25 ENSSTUG00000018059 si:dkey-260j18.2 (ENSSTUG00000018020) ##26 slc5a2 (ENSSTUG00000017792) fbxo46 (ENSSTUG00000017765) ##28 ENSSTUG00000017761 coq8b (ENSSTUG00000016640) ##29 numbl (ENSSTUG00000016566) ##30 ENSSTUG00000016459 ##31 dpf1 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Huchen DUPLICATION Huchen MODERN SPECIES 261 ENSHHUG00000046514 ##7 eif3k (ENSHHUG00000046571) ##8 ENSHHUG00000046631 #9 actn4 (ENSHHUG00000046636) ##10 ENSHHUG00000046941 ENSHHUG00000046950 ##11 srsf7a (ENSHHUG00000046960) ##12 hnrnpl2 (ENSHHUG00000046979) ##13 ech1 (ENSHHUG00000047019) ##14 ENSHHUG00000047027 ##15 meis3 (ENSHHUG00000047034) ##16 ENSHHUG00000047075 ##17 sirt2 (ENSHHUG00000047080) GJD2 (ENSHHUG00000047103) ##19 nop53 (ENSHHUG00000047111) ##20 ENSHHUG00000047124 ##21 ENSHHUG00000047174 ##21 ENSHHUG00000047224 ##24 ENSHHUG00000047230 ##25 ENSHHUG00000047252 sars2 (ENSHHUG00000047256) ##27 si:dkey-260j18.2 (ENSHHUG00000047268) ##26 slc5a2 (ENSHHUG00000047281) fbxo46 (ENSHHUG00000047334) ##28 coq8b (ENSHHUG00000047335) ##29 numbl (ENSHHUG00000047344) ##30 ENSHHUG00000047353 ##31 Huchen MODERN SPECIES 261 eif3k (ENSHHUG00000046571) ##8 ENSHHUG00000046631 #9 actn4 (ENSHHUG00000046636) ##10 ENSHHUG00000046941 ENSHHUG00000046950 ##11 srsf7a (ENSHHUG00000046960) ##12 hnrnpl2 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ENSSSAG00000055144 ENSSSAG00000055169 River trout DUPLICATION River trout MODERN SPECIES 1 ENSSTUG00000047589 SPATA20 (ENSSTUG00000047647) CACNA1G (ENSSTUG00000048221) ENSSTUG00000048883 ENSSTUG00000048885 ENSSTUG00000048886 ogfod3 (ENSSTUG00000048888) hexdc (ENSSTUG00000048898) cybc1 (ENSSTUG00000048928) narf (ENSSTUG00000048943) ENSSTUG00000048996 ENSSTUG00000049048 wbp2 (ENSSTUG00000049052) ENSSTUG00000049056 unk (ENSSTUG00000049080) ENSSTUG00000049120 ##21 ENSSTUG00000049124 zgc:194990 (ENSSTUG00000049131) itgb4 (ENSSTUG00000049169) sap30bp (ENSSTUG00000049372) CDR2L (ENSSTUG00000049375) MRPL58 (ENSSTUG00000049377) wdr45b (ENSSTUG00000049379) foxk2a (ENSSTUG00000049400) ENSSTUG00000049406 SHISA6 (ENSSTUG00000011015) ENSSTUG00000011156 MYOCD (ENSSTUG00000015524) map2k4b (ENSSTUG00000015568) adprm (ENSSTUG00000015966) ENSSTUG00000015969 River trout MODERN SPECIES 1 ENSSTUG00000011102 PRR35 (ENSSTUG00000011107) ENSSTUG00000011125 metrn (ENSSTUG00000011129) tmem204 (ENSSTUG00000011138) 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ENSGT00940000160651 ENSGT00530000064671 ENSGT00940000159396 ENSGT00940000156610 ENSGT00390000000306 ENSGT01100000263504.a.a.db.a #22 ENSGT00510000049652 ENSGT00940000154307.A ENSGT00390000006068 ENSGT00390000017838 ENSGT00510000048359 ENSGT00390000014665 ENSGT00940000155267 ENSGT00940000160374 ENSGT00550000075088.a.a ENSGT00940000167095.A ENSGT00940000166841 ENSGT00940000154323.a ENSGT00940000160435 ENSGT00390000002866.a ENSGT00940000164729.a.b Large yellow croaker MODERN SPECIES 488 rab11fip3 (ENSLCRG00005008089) decr2 (ENSLCRG00005008091) RDH13 (ENSLCRG00005008107) ENSLCRG00005008108 NLRC3 (ENSLCRG00005008110) ENSLCRG00005008113 WDR90 (ENSLCRG00005008125) rhot2 (ENSLCRG00005008269) h1-0 (ENSLCRG00005010659) rhbdl1 (ENSLCRG00005010662) zgc:112496 (ENSLCRG00005010667) wdr24 (ENSLCRG00005010670) anks3 (ENSLCRG00005010672) ENSLCRG00005010673 zgc:112185 (ENSLCRG00005010676) ENSLCRG00005010677 #22 ENSLCRG00005010679 ENSLCRG00005010681 ENSLCRG00005010682 ENSLCRG00005010683 gnptg (ENSLCRG00005010687) tsr3 (ENSLCRG00005010703) pdpk1b (ENSLCRG00005010738) kctd5a (ENSLCRG00005011379) ube2ia (ENSLCRG00005011384) ENSLCRG00005011423 ENSLCRG00005011425 ENSLCRG00005011427 phkg2 (ENSLCRG00005011429) RNF40 (ENSLCRG00005011434) ENSLCRG00005011555 Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000006095 ENSGT00940000157522 ENSGT00940000156342.d ENSGT00940000161398.e ENSGT00940000164578.a.a ENSGT00390000004360.a.a ENSGT00950000183115.a.a.a ENSGT00950000183136.b.b.d ENSGT00940000160281 #15 ENSGT00940000161057 #16 ENSGT00940000154866.A #17 ENSGT00940000157514.a ENSGT00940000160500 #18 ENSGT01090000260005.a.b.a.b.b.i #19 ENSGT00390000017267 #20 ENSGT01100000263504.a.a.db.b #22 ENSGT00940000164977.b #24 ENSGT01100000263514.A.f.x.a.b.b ENSGT01100000263504.a.b.b.a.b ##21 ENSGT00940000161634 ENSGT00550000074807.c #25 ENSGT00390000001278.a ENSGT00940000153792.A #27 ENSGT00940000156265 #26 ENSGT00940000160533 ENSGT00530000064222.a #28 ENSGT00940000158965 #29 ENSGT00940000160957 #30 ENSGT00940000165302 #31 ENSGT00940000160692 #32 ENSGT01030000234592.A.b.a #34 Perciformes ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000006095 ENSGT00940000157522 ENSGT00940000156342.d ENSGT00940000161398.e ENSGT00940000164578.a.a ENSGT00390000004360.a.a ENSGT00950000183115.a.a.a ENSGT00950000183136.b.b.d ENSGT00940000160281 #15 ENSGT00940000161057 #16 ENSGT00940000154866.A #17 ENSGT00940000157514.a ENSGT00940000160500 #18 ENSGT01090000260005.a.b.a.b.b.i #19 ENSGT00390000017267 #20 ENSGT01100000263504.a.a.db.b #22 ENSGT00940000164977.b #24 ENSGT00550000074807.c #25 ENSGT00390000001278.a ENSGT00940000153792.A #27 ENSGT00940000156265 #26 ENSGT00940000160533 ENSGT00530000064222.a #28 ENSGT00940000158965 #29 ENSGT00940000160957 #30 ENSGT00940000165302 #31 ENSGT00940000160692 #32 ENSGT01030000234592.A.b.a #34 ENSGT00390000017365.b ##33 ENSGT00940000159302 ENSGT00940000165141.a Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000006095 ENSGT00940000157522 ENSGT00940000156342.d ENSGT00940000161398.e ENSGT00940000164578.a.a ENSGT00390000004360.a.a ENSGT00950000183115.a.a.a ENSGT00950000183136.b.b.d ENSGT00940000160281 #15 ENSGT00940000161057 #16 ENSGT00940000154866.A #17 ENSGT00940000157514.a ENSGT00940000160500 #18 ENSGT01090000260005.a.b.a.b.b.i #19 ENSGT00390000017267 #20 ENSGT01100000263504.a.a.db.b #22 ENSGT00940000164977.b #24 ENSGT00550000074807.c #25 ENSGT00390000001278.a ENSGT00940000153792.A #27 ENSGT00940000156265 #26 ENSGT00940000160533 ENSGT00530000064222.a #28 ENSGT00940000158965 #29 ENSGT00940000160957 #30 ENSGT00940000165302 #31 ENSGT00940000160692 #32 ENSGT01030000234592.A.b.a #34 ENSGT00390000017365.b ##33 ENSGT00940000159302 ENSGT00940000165141.a Pike perch MODERN SPECIES 60 PER2 (ENSSLUG00000022765) her13 (ENSSLUG00000022759) her8.2 (ENSSLUG00000022756) ENSSLUG00000022753 ENSSLUG00000022750 ITM2C (ENSSLUG00000022743) lpar5b (ENSSLUG00000022740) ENSSLUG00000022736 #15 meis3 (ENSSLUG00000022723) #16 ENSSLUG00000022715 #17 sirt2 (ENSSLUG00000022155) dmac2 (ENSSLUG00000022120) #18 ENSSLUG00000022111 GJD2 (ENSSLUG00000022109) #19 nop53 (ENSSLUG00000022102) #20 H3-3A (ENSSLUG00000022098) #22 ENSSLUG00000022092 #24 psma6l (ENSSLUG00000022085) #25 ENSSLUG00000022078 sars2 (ENSSLUG00000021922) #27 si:dkey-260j18.2 (ENSSLUG00000021904) #26 slc5a2 (ENSSLUG00000020493) fbxo46 (ENSSLUG00000020394) #28 coq8b (ENSSLUG00000020073) #29 numbl (ENSSLUG00000020055) #30 ENSSLUG00000020047 #31 dpf1 (ENSSLUG00000020024) #32 ENSSLUG00000020020 #34 ENSSLUG00000020002 ##33 ENSSLUG00000019990 ##33 ENSSLUG00000019982 ##33 Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000159664 ENSGT00940000156819.a.b ENSGT01090000260051.b.a.b ENSGT00940000157017.a.b.a ENSGT00390000005895 ENSGT00390000014852.a ENSGT00390000004691 ENSGT00940000153514.a.b ENSGT00940000178199 ENSGT00390000013574 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000162951 ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.db.b #22 ENSGT00940000167259 ENSGT00940000163587.a.b.a.c.b 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ENSGT00940000177816 Large yellow croaker MODERN SPECIES 488 ENSLCRG00005022476 SPATA20 (ENSLCRG00005022373) CACNA1G (ENSLCRG00005021924) UTS2R (ENSLCRG00005021908) ENSLCRG00005021907 ogfod3 (ENSLCRG00005021906) hexdc (ENSLCRG00005021901) cybc1 (ENSLCRG00005021900) narf (ENSLCRG00005021898) FDXR (ENSLCRG00005021888) mrpl38 (ENSLCRG00005021882) ENSLCRG00005021878 wbp2 (ENSLCRG00005021877) UNC13D (ENSLCRG00005021875) unk (ENSLCRG00005021872) ENSLCRG00005021869 #22 ENSLCRG00005021860 zgc:194990 (ENSLCRG00005021857) itgb4 (ENSLCRG00005020330) sap30bp (ENSLCRG00005020272) ENSLCRG00005020270 CDR2L (ENSLCRG00005020268) MRPL58 (ENSLCRG00005020266) DAGLB (ENSLCRG00005020262) SPAG9 (ENSLCRG00005020016) tob1b (ENSLCRG00005020008) ENSLCRG00005020006 ENSLCRG00005014216 ENSLCRG00005014111 ENSLCRG00005014110 ENSLCRG00005014108 Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000159664 ENSGT01090000260051.b.a.b ENSGT00940000157017.a.b.a ENSGT00940000156819.a.b ENSGT00390000005895 ENSGT00390000014852.a 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#19 nop53 (ENSDLAG00005034277) #20 ENSDLAG00005032621 #22 ENSDLAG00005022137 ENSDLAG00005033478 #25 ENSDLAG00005022147 sars2 (ENSDLAG00005022167) #27 si:dkey-260j18.2 (ENSDLAG00005022282) #26 slc5a2 (ENSDLAG00005022301) fbxo46 (ENSDLAG00005030638) #28 coq8b (ENSDLAG00005022986) #29 ENSDLAG00005023689 #31 dpf1 (ENSDLAG00005023757) #32 ENSDLAG00005026930 #34 ENSDLAG00005023788 ##33 ENSDLAG00005022133 ##33 ENSDLAG00005034454 ENSDLAG00005027397 Perciformes ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000004836 ENSGT00940000159664 ENSGT00940000157017.a.b.a ENSGT00940000156819.a.b ENSGT00390000005895 ENSGT00390000014852.a ENSGT00390000004691 ENSGT00940000153514.a.b ENSGT00940000178199 ENSGT00390000013574 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000162951 ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.eb #22 ENSGT00940000167259 ENSGT00940000163587.a.b.a.c.b ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00940000176223 ENSGT00390000018570.b.a ENSGT00940000167542 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ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000181148 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 Mammalia ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000002970 ENSGT00390000013448.a.a ENSGT00570000079239 ENSGT00950000182834.B ENSGT00940000153634.b ENSGT00950000182834.A.a.b.c ENSGT00390000000412 ENSGT00940000165101 ENSGT00390000000417.a.a.b.a.b ENSGT00940000157376 ENSGT00390000018505 ENSGT00390000002210.d ENSGT00940000159576 ENSGT00390000010056 ENSGT00530000063402.b ENSGT01100000263504.a.a #22 ENSGT00530000063651.a ENSGT00940000162190 ENSGT00390000003188 ENSGT00940000156058 ENSGT00390000008003 ENSGT00940000156764.a ENSGT00940000157923 ENSGT00940000156810 ENSGT01030000234517.H.b ENSGT00390000018900 ENSGT00940000163104 ENSGT00390000004799 ENSGT00390000005861 ENSGT00940000171704 ENSGT00950000183142.a.b.a.b Platypus DUPLICATION Platypus MODERN SPECIES 45 UBALD2 (ENSOANG00000038253) RNF157 (ENSOANG00000014383) FOXJ1 (ENSOANG00000014384) EXOC7 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(ENSOANG00000050463) EPHX1 (ENSOANG00000001473) ENSOANG00000001474 ENSOANG00000001480 SDE2 (ENSOANG00000001481) ENSOANG00000037953 #22 ENSOANG00000050350 ENSOANG00000043340 MIXL1 (ENSOANG00000001484) LIN9 (ENSOANG00000001486) PARP1 (ENSOANG00000001488) ENSOANG00000050466 ENSOANG00000001517 PSEN2 (ENSOANG00000010238) COQ8A (ENSOANG00000010237) CDC42BPA (ENSOANG00000010240) AHCTF1 (ENSOANG00000010242) SCCPDH (ENSOANG00000010244) CNST (ENSOANG00000010245) ENSOANG00000041467 SMYD3 (ENSOANG00000019760) Theria ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000013448.a.a ENSGT00570000079239 ENSGT00950000182834.B ENSGT00940000153634.b ENSGT00950000182834.A.a.b.c ENSGT00390000000412 ENSGT00940000160505 ENSGT00390000000417.a.a.b.a.b ENSGT00940000157376 ENSGT00390000018505 ENSGT00390000002210.d ENSGT00940000159576 ENSGT00950000183044.a.a.a.c ENSGT00390000010056 ENSGT00530000063402.b ENSGT01100000263504.a.a #22 ENSGT00530000063651.a ENSGT00940000162190 ENSGT00390000003188 ENSGT00940000156058 ENSGT00390000008003 ENSGT00940000156764.a ENSGT00940000157923 ENSGT00940000156810 ENSGT01030000234517.H.b ENSGT00390000018900 ENSGT00940000163104 ENSGT00390000004799 ENSGT00390000005861 ENSGT00940000171704 ENSGT00950000183142.a.b.a.b Eutheria ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00520000062027 ENSGT00940000157800 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000181148 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a ENSGT00390000014620 Boreoeutheria DUPLICATION Boreoeutheria DUPLICATION Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.xb.a #22 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.xb.a #22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.xb.a #22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.xb.a #22 Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.xb.a #22 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.xb.a #22 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.xb.a #22 Ursidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.xb.a #22 Ursus ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000156895 ENSGT00390000003595 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.xb.a #22 ENSGT01100000263504.a.b.a.b.a.a ##21 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00940000157800 ENSGT00520000062027 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a ENSGT00390000014620 Polar bear MODERN SPECIES 185 ENSUMAG00000013360 RNF157 (ENSUMAG00000013352) EXOC7 (ENSUMAG00000011405) SRP68 (ENSUMAG00000010865) ENSUMAG00000010767 CDK3 (ENSUMAG00000010750) TEN1 (ENSUMAG00000010744) ACOX1 (ENSUMAG00000010732) FBF1 (ENSUMAG00000010714) MRPL38 (ENSUMAG00000010702) TRIM65 (ENSUMAG00000010696) TRIM47 (ENSUMAG00000010694) WBP2 (ENSUMAG00000010671) UNC13D (ENSUMAG00000010601) UNK (ENSUMAG00000010576) H3-5 (ENSUMAG00000010572) #22 ENSUMAG00000010571 ITGB4 (ENSUMAG00000009253) SAP30BP (ENSUMAG00000009122) ENSUMAG00000009118 RECQL5 (ENSUMAG00000009115) ENSUMAG00000009111 LLGL2 (ENSUMAG00000009023) TSEN54 (ENSUMAG00000008979) ENSUMAG00000008973 TMEM94 (ENSUMAG00000008703) GRB2 (ENSUMAG00000008668) SLC25A19 (ENSUMAG00000008660) MIF4GD (ENSUMAG00000008655) MRPS7 (ENSUMAG00000008652) GGA3 (ENSUMAG00000008648) Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.xb.a #22 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.xb.a #22 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.xb.a #22 Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 30 NEBL (ENSRFEG00010007581) ENSRFEG00010007544 ENSRFEG00010007528 PLXDC2 (ENSRFEG00010007490) MALRD1 (ENSRFEG00010007438) ARL5B (ENSRFEG00010007388) NSUN6 (ENSRFEG00010007349) CACNB2 (ENSRFEG00010006472) SLC39A12 (ENSRFEG00010005999) MRC1 (ENSRFEG00010021400) TMEM236 (ENSRFEG00010021386) STAM (ENSRFEG00010021374) HACD1 (ENSRFEG00010021363) ST8SIA6 (ENSRFEG00010021356) VIM (ENSRFEG00010021345) ENSRFEG00010021330 #22 TRDMT1 (ENSRFEG00010021313) CUBN (ENSRFEG00010020510) RSU1 (ENSRFEG00010020311) C1QL3 (ENSRFEG00010020295) PTER (ENSRFEG00010020253) ENSRFEG00010020221 MINDY3 (ENSRFEG00010020170) ITGA8 (ENSRFEG00010019917) FAM171A1 (ENSRFEG00010019859) NMT2 (ENSRFEG00010019775) RPP38 (ENSRFEG00010019749) ACBD7 (ENSRFEG00010019720) OLAH (ENSRFEG00010019677) MEIG1 (ENSRFEG00010019650) DCLRE1C (ENSRFEG00010019540) Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.xb.a #22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.xb.a #22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.xb.a #22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.xb.a #22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.xb.a #22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.xb.a #22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.xb.a #22 Vervet Monkey MODERN SPECIES 10 HDHD5 (ENSCSAG00000014527) ADA2 (ENSCSAG00000014485) CECR2 (ENSCSAG00000014471) SLC25A18 (ENSCSAG00000014445) ATP6V1E1 (ENSCSAG00000014403) BCL2L13 (ENSCSAG00000014293) BID (ENSCSAG00000014281) MICAL3 (ENSCSAG00000014264) PEX26 (ENSCSAG00000014211) TUBA8 (ENSCSAG00000014167) USP18 (ENSCSAG00000014166) ENSCSAG00000014145 ENSCSAG00000014140 ENSCSAG00000014136 BCR (ENSCSAG00000014105) ENSCSAG00000019267 #22 RAB36 (ENSCSAG00000014082) RSPH14 (ENSCSAG00000014070) GNAZ (ENSCSAG00000014024) ENSCSAG00000014016 ENSCSAG00000014011 ENSCSAG00000014009 IGLV4-3 (ENSCSAG00000013977) ENSCSAG00000013975 IGLV3-9 (ENSCSAG00000013971) IGLV3-10 (ENSCSAG00000013966) ENSCSAG00000013960 ENSCSAG00000013935 ENSCSAG00000013933 ENSCSAG00000013931 ENSCSAG00000013923 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.xb.a #22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.xb.a #22 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.xb.a #22 Rabbit MODERN SPECIES 4 TMED5 (ENSOCUG00000012427) MTF2 (ENSOCUG00000013736) DIPK1A (ENSOCUG00000027778) ENSOCUG00000010089 EVI5 (ENSOCUG00000001807) GFI1 (ENSOCUG00000023553) RPAP2 (ENSOCUG00000001804) ENSOCUG00000001803 C1orf146 (ENSOCUG00000003953) ENSOCUG00000021982 BTBD8 (ENSOCUG00000011062) EPHX4 (ENSOCUG00000017476) BRDT (ENSOCUG00000017466) TGFBR3 (ENSOCUG00000016083) CDC7 (ENSOCUG00000026347) ENSOCUG00000024863 #22 HFM1 (ENSOCUG00000029252) ENSOCUG00000036391 ENSOCUG00000005209 BARHL2 (ENSOCUG00000004213) ZNF326 (ENSOCUG00000012291) LRRC8D (ENSOCUG00000022362) LRRC8C (ENSOCUG00000010782) LRRC8B (ENSOCUG00000010780) ENSOCUG00000023473 ENSOCUG00000014931 ENSOCUG00000003764 ENSOCUG00000036036 ENSOCUG00000034762 ENSOCUG00000038599 ENSOCUG00000008656 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.xb.b #22 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.xb.b #22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.xb.b #22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.xb.b #22 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.xb.b #22 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.xb.b #22 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.xb.b #22 Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 16 PGBD2 (ENSRFEG00010012615) ZNF692 (ENSRFEG00010012694) ENSRFEG00010013162 OR2T6 (ENSRFEG00010013205) ENSRFEG00010013256 ENSRFEG00010013308 ENSRFEG00010013524 OR2W3 (ENSRFEG00010013571) TRIM58 (ENSRFEG00010013589) OR11L1 (ENSRFEG00010010995) ENSRFEG00010011051 #22 ENSRFEG00010011138 OR13G1 (ENSRFEG00010011201) OR14K1 (ENSRFEG00010011310) OR2G3 (ENSRFEG00010011480) OR2G2 (ENSRFEG00010011520) GCSAML (ENSRFEG00010011703) OR2B11 (ENSRFEG00010011877) NLRP3 (ENSRFEG00010011921) ENSRFEG00010012199 ZNF496 (ENSRFEG00010012279) ENSRFEG00010012356 ENSRFEG00010012392 RNF187 (ENSRFEG00010012412) H2AC25 (ENSRFEG00010012511) H3-4 (ENSRFEG00010012529) Microbat MODERN SPECIES 941 SLC16A2 (ENSMLUG00000007771) EDA2R (ENSMLUG00000015826) ENSMLUG00000024201 ENSMLUG00000023153 ENSMLUG00000028292 ENSMLUG00000024925 AR (ENSMLUG00000014191) OPHN1 (ENSMLUG00000001484) YIPF6 (ENSMLUG00000014760) STARD8 (ENSMLUG00000015899) EFNB1 (ENSMLUG00000012361) PJA1 (ENSMLUG00000004315) ENSMLUG00000030216 ENSMLUG00000026107 ENSMLUG00000028972 ENSMLUG00000029796 #22 ENSMLUG00000028775 EDA (ENSMLUG00000008882) AWAT2 (ENSMLUG00000008905) ENSMLUG00000004183 ENSMLUG00000004190 ENSMLUG00000004179 DGAT2L6 (ENSMLUG00000001856) AWAT1 (ENSMLUG00000011002) P2RY4 (ENSMLUG00000011018) PDZD11 (ENSMLUG00000011031) KIF4A (ENSMLUG00000011048) GDPD2 (ENSMLUG00000011115) DLG3 (ENSMLUG00000011155) TEX11 (ENSMLUG00000006578) SLC7A3 (ENSMLUG00000023615) Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.xb.b #22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.xb.b #22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.xb.b #22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.xb.b #22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.xb.b #22 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.xb.b #22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.xb.b #22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.xb.b #22 Gorilla MODERN SPECIES 523 RHOXF1 (ENSGGOG00000016112) ZBTB33 (ENSGGOG00000010306) TMEM255A (ENSGGOG00000010310) ATP1B4 (ENSGGOG00000006495) LAMP2 (ENSGGOG00000000555) CUL4B (ENSGGOG00000011167) MCTS1 (ENSGGOG00000009420) C1GALT1C1 (ENSGGOG00000026235) ENSGGOG00000037852 ENSGGOG00000011433 CT47B1 (ENSGGOG00000015773) GLUD2 (ENSGGOG00000022665) ENSGGOG00000039654 ENSGGOG00000024589 GRIA3 (ENSGGOG00000009569) ENSGGOG00000044134 #22 THOC2 (ENSGGOG00000000486) ENSGGOG00000008637 STAG2 (ENSGGOG00000004109) SH2D1A (ENSGGOG00000034950) TENM1 (ENSGGOG00000003488) ENSGGOG00000039541 DCAF12L2 (ENSGGOG00000005923) DCAF12L1 (ENSGGOG00000016198) PRR32 (ENSGGOG00000022006) ACTRT1 (ENSGGOG00000015345) ENSGGOG00000041367 ENSGGOG00000012841 OCRL (ENSGGOG00000000824) APLN (ENSGGOG00000040354) XPNPEP2 (ENSGGOG00000015184) Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.xb.b #22 Bushbaby MODERN SPECIES 130 FEZF2 (ENSOGAG00000008112) ENSOGAG00000008116 SYNPR (ENSOGAG00000000442) SNTN (ENSOGAG00000016059) ENSOGAG00000030192 C3orf49 (ENSOGAG00000015268) THOC7 (ENSOGAG00000024865) ATXN7 (ENSOGAG00000031555) PSMD6 (ENSOGAG00000015279) ENSOGAG00000028241 PRICKLE2 (ENSOGAG00000009507) ADAMTS9 (ENSOGAG00000015548) MAGI1 (ENSOGAG00000000286) ENSOGAG00000033711 SLC25A26 (ENSOGAG00000002219) ENSOGAG00000007944 #22 LRIG1 (ENSOGAG00000002220) ENSOGAG00000006131 ENSOGAG00000024724 KBTBD8 (ENSOGAG00000024533) ENSOGAG00000006190 ENSOGAG00000028255 TAFA4 (ENSOGAG00000012090) EOGT (ENSOGAG00000012093) TMF1 (ENSOGAG00000007764) UBA3 (ENSOGAG00000007771) ARL6IP5 (ENSOGAG00000007773) LMOD3 (ENSOGAG00000002704) FRMD4B (ENSOGAG00000002705) MITF (ENSOGAG00000000043) MDFIC2 (ENSOGAG00000030030) Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.xb.b #22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.xb.b #22 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.xb.b #22 Rabbit MODERN SPECIES 8 VCPKMT (ENSOCUG00000006049) ARF6 (ENSOCUG00000001692) NEMF (ENSOCUG00000017384) KLHDC2 (ENSOCUG00000017378) KLHDC1 (ENSOCUG00000017367) ENSOCUG00000031174 POLE2 (ENSOCUG00000015480) ENSOCUG00000015466 MGAT2 (ENSOCUG00000015463) ENSOCUG00000027946 LRR1 (ENSOCUG00000000121) ENSOCUG00000027423 ENSOCUG00000033024 MDGA2 (ENSOCUG00000017002) RPL10L (ENSOCUG00000015485) ENSOCUG00000012678 #22 ENSOCUG00000021198 ENSOCUG00000027427 ENSOCUG00000035475 ENSOCUG00000007451 MIS18BP1 (ENSOCUG00000007550) FANCM (ENSOCUG00000007539) ENSOCUG00000007535 PRPF39 (ENSOCUG00000007531) TOGARAM1 (ENSOCUG00000006378) KLHL28 (ENSOCUG00000006372) ENSOCUG00000008733 ENSOCUG00000031408 ENSOCUG00000010014 ENSOCUG00000038158 ENSOCUG00000036762 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00520000062027 ENSGT00940000157800 ENSGT00930000151032.B ENSGT00940000155335 ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000181148 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00940000170136 ENSGT00940000157800 ENSGT00940000165228 ENSGT00520000062027 ENSGT00930000151032.B ENSGT00940000155335 ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00940000170136 ENSGT00940000165228 ENSGT00520000062027 ENSGT00940000157800 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a Glires ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00940000170136 ENSGT00940000165228 ENSGT00520000062027 ENSGT00940000157800 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a Rodentia ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00940000165228 ENSGT00520000062027 ENSGT00940000157800 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a ENSGT00390000014620 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000156895 ENSGT00390000003595 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00940000167442 ENSGT00520000062027 ENSGT00940000157800 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a ENSGT00390000014620 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000156895 ENSGT00390000003595 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00940000167442 ENSGT00520000062027 ENSGT00940000157800 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a ENSGT00390000014620 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000156895 ENSGT00390000003595 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00940000167442 ENSGT00520000062027 ENSGT00940000157800 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a ENSGT00390000014620 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000156895 ENSGT00390000003595 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00940000167442 ENSGT00520000062027 ENSGT00940000157800 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a ENSGT00390000014620 Murinae ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000156895 ENSGT00390000003595 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT01100000263504.a.b.a.a #21 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00940000167442 ENSGT00520000062027 ENSGT00940000157800 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a Rat MODERN SPECIES 4 Lbr (ENSRNOG00000052574) Dnah14 (ENSRNOG00000070092) Ccdc121rt (ENSRNOG00000022717) Cnih3 (ENSRNOG00000022724) Wdr26 (ENSRNOG00000003723) Cnih4 (ENSRNOG00000003717) Nvl (ENSRNOG00000003629) RGD1564463 (ENSRNOG00000003601) LOC498300 (ENSRNOG00000050163) Ephx1 (ENSRNOG00000003515) Tmem63a (ENSRNOG00000003310) Lefty1 (ENSRNOG00000003263) Pycr2 (ENSRNOG00000003267) Lefty2 (ENSRNOG00000060325) Sde2 (ENSRNOG00000003247) H3f3b (ENSRNOG00000003220) #22 Acbd3 (ENSRNOG00000003185) Mixl1 (ENSRNOG00000003176) Lin9 (ENSRNOG00000023304) Parp1 (ENSRNOG00000003084) Stum (ENSRNOG00000071066) Itpkb (ENSRNOG00000002969) Psen2 (ENSRNOG00000002879) Coq8a (ENSRNOG00000043201) Cdc42bpa (ENSRNOG00000002841) Ahctf1 (ENSRNOG00000023541) Kif28p (ENSRNOG00000050602) Sccpdh (ENSRNOG00000066712) Cnst (ENSRNOG00000002710) Tfb2m (ENSRNOG00000002695) Smyd3 (ENSRNOG00000066304) Mus ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000156895 ENSGT00390000003595 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT01100000263504.a.b.a.a #21 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00940000167442 ENSGT00520000062027 ENSGT00940000157800 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a Mus_A ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000156895 ENSGT00390000003595 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT01100000263504.a.b.a.a #21 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870.d ENSGT00940000167442 ENSGT00520000062027 ENSGT00940000157800 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a Ryukyu mouse MODERN SPECIES 2 Foxj1 (MGP_CAROLIEiJ_G0017440) Exoc7 (MGP_CAROLIEiJ_G0017439) Galr2 (MGP_CAROLIEiJ_G0017438) Srp68 (MGP_CAROLIEiJ_G0017437) Evpl (MGP_CAROLIEiJ_G0017436) MGP_CAROLIEiJ_G0008948 Ten1 (MGP_CAROLIEiJ_G0017435) Acox1 (MGP_CAROLIEiJ_G0017434) Fbf1 (MGP_CAROLIEiJ_G0017433) Mrpl38 (MGP_CAROLIEiJ_G0017432) Trim65 (MGP_CAROLIEiJ_G0017431) Trim47 (MGP_CAROLIEiJ_G0017430) Wbp2 (MGP_CAROLIEiJ_G0017429) Unc13d (MGP_CAROLIEiJ_G0017428) Unk (MGP_CAROLIEiJ_G0017427) MGP_CAROLIEiJ_G0017426 #22 Galk1 (MGP_CAROLIEiJ_G0017425) Itgb4 (MGP_CAROLIEiJ_G0017424) Sap30bp (MGP_CAROLIEiJ_G0017423) Smim6 (MGP_CAROLIEiJ_G0017422) Smim5 (MGP_CAROLIEiJ_G0017421) Recql5 (MGP_CAROLIEiJ_G0017420) Myo15b (MGP_CAROLIEiJ_G0017419) Llgl2 (MGP_CAROLIEiJ_G0017418) Tsen54 (MGP_CAROLIEiJ_G0017417) Caskin2 (MGP_CAROLIEiJ_G0017416) MGP_CAROLIEiJ_G0017415 Grb2 (MGP_CAROLIEiJ_G0017414) Slc25a19 (MGP_CAROLIEiJ_G0017413) Mif4gd (MGP_CAROLIEiJ_G0017412) Mrps7 (MGP_CAROLIEiJ_G0017411) Mus_B ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT01000000214622.a.a.a ENSGT00950000182834.A.a.b.c ENSGT00940000153634.b ENSGT00950000182834.B ENSGT00570000079239 ENSGT00390000013448.a.a.j.b ENSGT00390000013448.a.a.j.a ENSGT00390000002210.d ENSGT00940000159576 ENSGT00390000010056.z ENSGT00950000183044.a.a.a.c ENSGT00390000010056.y.b ENSGT00390000010056.y.a.b ENSGT00390000010056.y.a.a ENSGT00530000063402.b ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT00530000063651.a ENSGT00940000162190 ENSGT00390000003188 ENSGT00940000156058 ENSGT00390000008003 ENSGT00940000156764.a ENSGT00940000157923 ENSGT00940000156810 ENSGT01030000234517.H.b ENSGT00860000135936 ENSGT00390000018900 ENSGT00940000163104 ENSGT00390000004799 ENSGT00390000005861 ENSGT00950000183142.a.b.a.b Mouse MODERN SPECIES Enah (ENSMUSG00000022995) Lbr (ENSMUSG00000004880) Dnah14 (ENSMUSG00000047369) Ccdc121rt1 (ENSMUSG00000050625) Cnih3 (ENSMUSG00000026514) Wdr26 (ENSMUSG00000038733) Cnih4 (ENSMUSG00000062169) Nvl (ENSMUSG00000026516) 9130409I23Rik (ENSMUSG00000038768) Ephx1 (ENSMUSG00000038776) Tmem63a (ENSMUSG00000026519) Lefty1 (ENSMUSG00000038793) Pycr2 (ENSMUSG00000026520) Lefty2 (ENSMUSG00000066652) Sde2 (ENSMUSG00000038806) H3f3a (ENSMUSG00000060743) #22 Acbd3 (ENSMUSG00000026499) Mixl1 (ENSMUSG00000026497) Lin9 (ENSMUSG00000058729) Parp1 (ENSMUSG00000026496) Stum (ENSMUSG00000053963) Itpkb (ENSMUSG00000038855) Psen2 (ENSMUSG00000010609) Coq8a (ENSMUSG00000026489) Cdc42bpa (ENSMUSG00000026490) Ahctf1 (ENSMUSG00000026491) Kif28 (ENSMUSG00000087236) Sccpdh (ENSMUSG00000038936) Cnst (ENSMUSG00000038949) Tfb2m (ENSMUSG00000026492) Smyd3 (ENSMUSG00000055067) Mus_C ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000156895 ENSGT00390000003595 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870.d ENSGT00940000157800 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a ENSGT00390000014620 ENSGT00940000157333 ENSGT00390000000204 spretus MODERN SPECIES 2 Foxj1 (MGP_SPRETEiJ_G0018285) Exoc7 (MGP_SPRETEiJ_G0018284) Galr2 (MGP_SPRETEiJ_G0018283) Srp68 (MGP_SPRETEiJ_G0018282) Evpl (MGP_SPRETEiJ_G0018281) Cdk3 (MGP_SPRETEiJ_G0009409) Ten1 (MGP_SPRETEiJ_G0018280) Acox1 (MGP_SPRETEiJ_G0018279) Fbf1 (MGP_SPRETEiJ_G0018278) Mrpl38 (MGP_SPRETEiJ_G0018277) Trim65 (MGP_SPRETEiJ_G0018276) Trim47 (MGP_SPRETEiJ_G0018275) Wbp2 (MGP_SPRETEiJ_G0018274) Unc13d (MGP_SPRETEiJ_G0018273) Unk (MGP_SPRETEiJ_G0018272) MGP_SPRETEiJ_G0018271 #22 Galk1 (MGP_SPRETEiJ_G0018270) Itgb4 (MGP_SPRETEiJ_G0018269) Sap30bp (MGP_SPRETEiJ_G0018268) Smim6 (MGP_SPRETEiJ_G0018267) Smim5 (MGP_SPRETEiJ_G0018266) Recql5 (MGP_SPRETEiJ_G0018265) Myo15b (MGP_SPRETEiJ_G0018264) Llgl2 (MGP_SPRETEiJ_G0018263) Tsen54 (MGP_SPRETEiJ_G0018262) Caskin2 (MGP_SPRETEiJ_G0018261) Tmem94 (MGP_SPRETEiJ_G0018260) Grb2 (MGP_SPRETEiJ_G0018259) Slc25a19 (MGP_SPRETEiJ_G0018258) Mif4gd (MGP_SPRETEiJ_G0018257) Mrps7 (MGP_SPRETEiJ_G0018256) Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000156895 ENSGT00390000003595 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00520000062027 ENSGT00940000157800 ENSGT00940000167442 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a ENSGT00390000014620 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000156895 ENSGT00390000003595 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00520000062027 ENSGT00940000157800 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a ENSGT00390000014620 ENSGT00940000157333 Prairie vole MODERN SPECIES 13 Exog (ENSMOCG00000020900) Acvr2b (ENSMOCG00000019420) Xylb (ENSMOCG00000006242) ENSMOCG00000021760 Myd88 (ENSMOCG00000001673) Oxsr1 (ENSMOCG00000017814) ENSMOCG00000015259 Slc22a14 (ENSMOCG00000003432) ENSMOCG00000005097 Dlec1 (ENSMOCG00000020565) Plcd1 (ENSMOCG00000020441) Vill (ENSMOCG00000013015) Ctdspl (ENSMOCG00000012026) Itga9 (ENSMOCG00000004653) Golga4 (ENSMOCG00000022389) ENSMOCG00000010349 #22 Eomes (ENSMOCG00000020156) Cmc1 (ENSMOCG00000020815) Azi2 (ENSMOCG00000018171) Rbms3 (ENSMOCG00000006997) Tgfbr2 (ENSMOCG00000012279) Gadl1 (ENSMOCG00000005000) Stt3b (ENSMOCG00000021697) Osbpl10 (ENSMOCG00000019718) ENSMOCG00000012300 Cmtm8 (ENSMOCG00000010377) ENSMOCG00000008730 Cmtm6 (ENSMOCG00000001815) Dync1li1 (ENSMOCG00000020559) Cnot10 (ENSMOCG00000018672) Trim71 (ENSMOCG00000018592) Northern American deer mouse DUPLICATION Northern American deer mouse MODERN SPECIES 475 Phf8 (ENSPEMG00000018201) Huwe1 (ENSPEMG00000007064) ENSPEMG00000006148 ENSPEMG00000003682 Hsd17b10 (ENSPEMG00000016342) Ribc1 (ENSPEMG00000012701) Smc1a (ENSPEMG00000003801) Iqsec2 (ENSPEMG00000016485) Kdm5c (ENSPEMG00000018041) Kantr (ENSPEMG00000026622) Tspyl2 (ENSPEMG00000006058) Gpr173 (ENSPEMG00000027332) ENSPEMG00000025543 ENSPEMG00000028842 ENSPEMG00000026567 ENSPEMG00000028039 #22 Shroom2 (ENSPEMG00000025197) Gpr143 (ENSPEMG00000023764) ENSPEMG00000024517 ENSPEMG00000012532 Clcn4 (ENSPEMG00000010296) Msl3 (ENSPEMG00000011959) Amelx (ENSPEMG00000009304) Arhgap6 (ENSPEMG00000013179) ENSPEMG00000009950 Hccs (ENSPEMG00000006006) ENSPEMG00000029909 ENSPEMG00000025019 ENSPEMG00000025449 ENSPEMG00000029567 ENSPEMG00000024903 Northern American deer mouse MODERN SPECIES 21 Foxj1 (ENSPEMG00000024551) Exoc7 (ENSPEMG00000017693) Galr2 (ENSPEMG00000017199) Srp68 (ENSPEMG00000015825) Evpl (ENSPEMG00000008116) Cdk3 (ENSPEMG00000018810) Ten1 (ENSPEMG00000010295) Acox1 (ENSPEMG00000002591) Fbf1 (ENSPEMG00000017634) Mrpl38 (ENSPEMG00000012196) Trim65 (ENSPEMG00000030571) Trim47 (ENSPEMG00000016814) Wbp2 (ENSPEMG00000014097) Unc13d (ENSPEMG00000010076) Unk (ENSPEMG00000016145) ENSPEMG00000029709 #22 Galk1 (ENSPEMG00000011665) Itgb4 (ENSPEMG00000013750) Sap30bp (ENSPEMG00000019248) Smim5 (ENSPEMG00000029199) Recql5 (ENSPEMG00000011938) ENSPEMG00000016324 Llgl2 (ENSPEMG00000008966) Tsen54 (ENSPEMG00000014857) Caskin2 (ENSPEMG00000007480) Tmem94 (ENSPEMG00000007436) Grb2 (ENSPEMG00000009134) Slc25a19 (ENSPEMG00000010997) Mif4gd (ENSPEMG00000012309) Mrps7 (ENSPEMG00000019065) Gga3 (ENSPEMG00000013193) Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000156895 ENSGT00390000003595 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00940000157800 ENSGT00940000167442 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a ENSGT00390000014620 ENSGT00940000157333 Chinese hamster chok1gshd DUPLICATION Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 202 Gucy1a2 (ENSCGRG00001016426) ENSCGRG00001018331 Kbtbd3 (ENSCGRG00001018771) Msantd4 (ENSCGRG00001019387) Gria4 (ENSCGRG00001016770) Casp1 (ENSCGRG00001009135) Casp12 (ENSCGRG00001018352) ENSCGRG00001004505 Pdgfd (ENSCGRG00001019661) Ddi1 (ENSCGRG00001005855) Dync2h1 (ENSCGRG00001013236) Dcun1d5 (ENSCGRG00001014535) Mmp13 (ENSCGRG00001006492) Mmp12 (ENSCGRG00001013053) Mmp3 (ENSCGRG00001015501) ENSCGRG00001009381 #22 ENSCGRG00001020530 ENSCGRG00001014094 Mmp8 (ENSCGRG00001015038) Mmp27 (ENSCGRG00001021757) Mmp20 (ENSCGRG00001000330) ENSCGRG00001015482 Tmem123 (ENSCGRG00001018797) ENSCGRG00001022513 Birc2 (ENSCGRG00001023266) Birc3 (ENSCGRG00001008505) Yap1 (ENSCGRG00001011573) Cfap300 (ENSCGRG00001021391) Cep126 (ENSCGRG00001023949) Trpc6 (ENSCGRG00001006368) Pgr (ENSCGRG00001019400) Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 33 Foxj1 (ENSCGRG00001024967) Exoc7 (ENSCGRG00001000581) Galr2 (ENSCGRG00001003541) Srp68 (ENSCGRG00001023743) Evpl (ENSCGRG00001023621) Cdk3 (ENSCGRG00001016520) Ten1 (ENSCGRG00001013875) Acox1 (ENSCGRG00001016959) Fbf1 (ENSCGRG00001020602) Mrpl38 (ENSCGRG00001003973) Trim65 (ENSCGRG00001025012) Trim47 (ENSCGRG00001024475) Wbp2 (ENSCGRG00001016669) Unc13d (ENSCGRG00001021529) Unk (ENSCGRG00001024874) ENSCGRG00001024976 #22 Galk1 (ENSCGRG00001022998) Itgb4 (ENSCGRG00001016672) Sap30bp (ENSCGRG00001016528) Smim6 (ENSCGRG00001012751) ENSCGRG00001012081 Recql5 (ENSCGRG00001011255) Myo15b (ENSCGRG00001018601) Llgl2 (ENSCGRG00001024918) Tsen54 (ENSCGRG00001020029) Caskin2 (ENSCGRG00001006565) Tmem94 (ENSCGRG00001022237) Grb2 (ENSCGRG00001017474) Slc25a19 (ENSCGRG00001015218) Mif4gd (ENSCGRG00001021723) Mrps7 (ENSCGRG00001021002) Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00940000167442 ENSGT00940000170136 ENSGT00940000157800 ENSGT00940000165228 ENSGT00520000062027 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00940000157800 ENSGT00940000165228 ENSGT00520000062027 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a ENSGT00390000014620 Marmotini ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l 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ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a ENSGT00390000014620 Squirrel MODERN SPECIES 194 EXOC7 (ENSSTOG00000007475) ZACN (ENSSTOG00000007453) GALR2 (ENSSTOG00000007442) SRP68 (ENSSTOG00000007424) EVPL (ENSSTOG00000022668) CDK3 (ENSSTOG00000007350) TEN1 (ENSSTOG00000019554) ACOX1 (ENSSTOG00000013437) FBF1 (ENSSTOG00000013411) MRPL38 (ENSSTOG00000013400) TRIM65 (ENSSTOG00000013392) TRIM47 (ENSSTOG00000013386) ENSSTOG00000021421 UNC13D (ENSSTOG00000013367) UNK (ENSSTOG00000013344) ENSSTOG00000024226 #22 GALK1 (ENSSTOG00000013326) ITGB4 (ENSSTOG00000025173) SAP30BP (ENSSTOG00000012995) ENSSTOG00000033976 SMIM5 (ENSSTOG00000022610) RECQL5 (ENSSTOG00000012970) ENSSTOG00000030239 ENSSTOG00000021155 LLGL2 (ENSSTOG00000012891) TSEN54 (ENSSTOG00000012883) CASKIN2 (ENSSTOG00000021787) TMEM94 (ENSSTOG00000012842) GRB2 (ENSSTOG00000012661) ENSSTOG00000015212 MIF4GD (ENSSTOG00000022390) Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 12 RBMS1 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ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00940000170136 ENSGT00940000157800 ENSGT00520000062027 ENSGT00930000151032.B ENSGT00940000167865 ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a Naked mole-rat female DUPLICATION Naked mole-rat female MODERN SPECIES 30 ENSHGLG00000001115 ENSHGLG00000048867 ENSHGLG00000002041 ENSHGLG00000005865 ENSHGLG00000004774 ENSHGLG00000000234 ENSHGLG00000043321 ENSHGLG00000015276 HMGXB4 (ENSHGLG00000037083) TOM1 (ENSHGLG00000015296) HMOX1 (ENSHGLG00000008950) MCM5 (ENSHGLG00000008256) RASD2 (ENSHGLG00000007940) ENSHGLG00000007308 ENSHGLG00000006549 ENSHGLG00000036993 #22 ARHGAP19 (ENSHGLG00000043596) ENSHGLG00000039731 FRAT2 (ENSHGLG00000021387) RRP12 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TMEM94 (ENSHGLG00000006986) GRB2 (ENSHGLG00000005883) SLC25A19 (ENSHGLG00000005191) ENSHGLG00000050052 ENSHGLG00000050152 ENSHGLG00000040381 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000156895 ENSGT00390000003595 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00940000170136 ENSGT00940000157800 ENSGT00520000062027 ENSGT00930000151032.B ENSGT00940000167865 ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000156895 ENSGT00390000003595 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A 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(ENSCLAG00000008106) H3f3b (ENSCLAG00000009278) #22 GALK1 (ENSCLAG00000006961) ITGB4 (ENSCLAG00000008871) SAP30BP (ENSCLAG00000007597) ENSCLAG00000007976 RECQL5 (ENSCLAG00000006680) SMIM5 (ENSCLAG00000008647) ENSCLAG00000008750 ENSCLAG00000008934 Degu DUPLICATION Degu MODERN SPECIES 172 ENSODEG00000009205 ENSODEG00000006478 ENSODEG00000008453 SDE2 (ENSODEG00000007391) ENSODEG00000006974 ENSODEG00000006347 #22 ENSODEG00000007126 ACBD3 (ENSODEG00000007029) ENSODEG00000006883 LIN9 (ENSODEG00000007495) PARP1 (ENSODEG00000007424) STUM (ENSODEG00000006865) ITPKB (ENSODEG00000006556) RD3 (ENSODEG00000010438) TRAF5 (ENSODEG00000010010) RCOR3 (ENSODEG00000007158) KCNH1 (ENSODEG00000006391) HHAT (ENSODEG00000006027) SERTAD4 (ENSODEG00000006307) ENSODEG00000019253 ENSODEG00000007057 Degu MODERN SPECIES 48 RDH11 (ENSODEG00000013053) VTI1B (ENSODEG00000013143) ARG2 (ENSODEG00000014261) ENSODEG00000014130 PLEKHH1 (ENSODEG00000015158) TMEM229B (ENSODEG00000020052) ENSODEG00000014817 EIF2S1 (ENSODEG00000013168) ENSODEG00000013948 PALS1 (ENSODEG00000014070) GARIN2 (ENSODEG00000013098) GPHN (ENSODEG00000013064) ENSODEG00000014813 CCDC196 (ENSODEG00000014992) FUT8 (ENSODEG00000013606) ENSODEG00000020197 #22 ENSODEG00000014922 FNTB (ENSODEG00000013903) RAB15 (ENSODEG00000013827) GPX2 (ENSODEG00000014599) CHURC1 (ENSODEG00000013343) SPTB (ENSODEG00000014818) PLEKHG3 (ENSODEG00000013350) PPP1R36 (ENSODEG00000014421) HSPA2 (ENSODEG00000015284) ZBTB1 (ENSODEG00000013207) ENSODEG00000013493 MTHFD1 (ENSODEG00000014455) ENSODEG00000020084 ENSODEG00000020168 ENSODEG00000014746 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES 90 ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00940000157800 ENSGT00940000165228 ENSGT00520000062027 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a ENSGT00390000014620 Pika MODERN SPECIES 3973 ENSOPRG00000015952 #22 Rabbit DUPLICATION Rabbit MODERN SPECIES 578 UNK (ENSOCUG00000014994) ENSOCUG00000014989 #22 GALK1 (ENSOCUG00000014973) ITGB4 (ENSOCUG00000014951) SAP30BP (ENSOCUG00000016220) RECQL5 (ENSOCUG00000016202) SMIM6 (ENSOCUG00000036696) ENSOCUG00000030919 ENSOCUG00000016181 LLGL2 (ENSOCUG00000022899) TSEN54 (ENSOCUG00000009875) ENSOCUG00000011862 TMEM94 (ENSOCUG00000005331) GRB2 (ENSOCUG00000006469) ENSOCUG00000017928 ENSOCUG00000006603 GGA3 (ENSOCUG00000006657) Rabbit MODERN SPECIES 7 ENSOCUG00000007393 LYPLAL1 (ENSOCUG00000000388) TGFB2 (ENSOCUG00000005279) RRP15 (ENSOCUG00000017863) SPATA17 (ENSOCUG00000014523) GPATCH2 (ENSOCUG00000014512) ENSOCUG00000033147 ESRRG (ENSOCUG00000000984) ENSOCUG00000014710 KCTD3 (ENSOCUG00000001943) KCNK2 (ENSOCUG00000008629) PTPN14 (ENSOCUG00000015400) SMYD2 (ENSOCUG00000015379) PROX1 (ENSOCUG00000008274) RPS6KC1 (ENSOCUG00000013953) ENSOCUG00000013968 #22 ENSOCUG00000035779 ANGEL2 (ENSOCUG00000008585) VASH2 (ENSOCUG00000008579) FLVCR1 (ENSOCUG00000004804) SPATA45 (ENSOCUG00000004799) ENSOCUG00000004792 NSL1 (ENSOCUG00000004789) GARIN4 (ENSOCUG00000017415) ATF3 (ENSOCUG00000017424) PACC1 (ENSOCUG00000009061) NENF (ENSOCUG00000010810) PPP2R5A (ENSOCUG00000017572) ENSOCUG00000023322 DTL (ENSOCUG00000000437) INTS7 (ENSOCUG00000004204) Tree shrew DUPLICATION Tree shrew MODERN SPECIES 3055 ENSTBEG00000006177 #22 ACBD3 (ENSTBEG00000006409) ENSTBEG00000006687 Tree shrew MODERN SPECIES 1441 TRIM47 (ENSTBEG00000016386) ENSTBEG00000016178 ENSTBEG00000016171 #22 ENSTBEG00000015673 SAP30BP (ENSTBEG00000015623) RECQL5 (ENSTBEG00000015250) ENSTBEG00000015024 Primates ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00940000157800 ENSGT00940000165228 ENSGT00520000062027 ENSGT00930000151032.B ENSGT00940000155335 ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a Haplorrhini DUPLICATION Haplorrhini DUPLICATION Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.yb.m.a #22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.yb.m.a #22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.yb.m.a #22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.yb.m.a #22 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 70 ENSGT01080000257365.b.a.b.a.a ENSGT00940000157408 ENSGT00950000183064.b ENSGT00910000147749 ENSGT01100000263504.a.a.yb.m.a #22 ENSGT00940000154465.C.o ENSGT00390000013771.u ENSGT00730000111429 ENSGT00390000002960 ENSGT00940000159985 ENSGT00940000161312 ENSGT00550000074968.a ENSGT00940000160495 ENSGT00390000016421.b.a ENSGT00940000162541 ENSGT00510000046499 ENSGT00940000153577.A ENSGT00940000159255 ENSGT00940000159602 ENSGT00940000159870 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 581 KCNJ6 (ENSRROG00000034548) DYRK1A (ENSRROG00000013490) VPS26C (ENSRROG00000039521) ENSRROG00000040777 TTC3 (ENSRROG00000042556) ENSRROG00000004087 #22 PIGP (ENSRROG00000036631) RIPPLY3 (ENSRROG00000038710) HLCS (ENSRROG00000034799) SIM2 (ENSRROG00000035852) CLDN14 (ENSRROG00000010989) CHAF1B (ENSRROG00000027429) MORC3 (ENSRROG00000027382) DOP1B (ENSRROG00000031861) CBR3 (ENSRROG00000037282) CBR1 (ENSRROG00000031699) SETD4 (ENSRROG00000044000) ENSRROG00000043469 ENSRROG00000039344 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1186 KCNJ6 (ENSRBIG00000039466) DYRK1A (ENSRBIG00000044558) VPS26C (ENSRBIG00000031672) ENSRBIG00000033842 ENSRBIG00000005142 #22 TTC3 (ENSRBIG00000044668) PIGP (ENSRBIG00000036738) RIPPLY3 (ENSRBIG00000033745) ENSRBIG00000028452 HLCS (ENSRBIG00000040559) SIM2 (ENSRBIG00000037240) CLDN14 (ENSRBIG00000011059) CHAF1B (ENSRBIG00000017497) Tarsier MODERN SPECIES 6584 NCOA6 (ENSTSYG00000030130) ENSTSYG00000029672 GGT7 (ENSTSYG00000003672) ACSS2 (ENSTSYG00000004518) GSS (ENSTSYG00000000906) ENSTSYG00000037054 #22 MYH7B (ENSTSYG00000007695) TRPC4AP (ENSTSYG00000007739) EDEM2 (ENSTSYG00000002139) PROCR (ENSTSYG00000037554) MMP24 (ENSTSYG00000005981) EIF6 (ENSTSYG00000030850) FAM83C (ENSTSYG00000036093) ENSTSYG00000036365 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.yb.m.b #22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.yb.m.b #22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.yb.m.b #22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.yb.m.b #22 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.yb.m.b #22 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1471 ENSRROG00000028587 ENSRROG00000004863 #22 DZANK1 (ENSRROG00000002317) POLR3F (ENSRROG00000039911) RBBP9 (ENSRROG00000042932) SEC23B (ENSRROG00000044371) DTD1 (ENSRROG00000039552) SLC24A3 (ENSRROG00000042604) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.yb.m.b #22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.yb.m.b #22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.yb.m.b #22 Capuchin MODERN SPECIES 112 ENSCCAG00000015027 BACE2 (ENSCCAG00000035482) FAM3B (ENSCCAG00000030600) MX2 (ENSCCAG00000029612) ENSCCAG00000020180 #22 MX1 (ENSCCAG00000025192) TMPRSS2 (ENSCCAG00000030906) RIPK4 (ENSCCAG00000029896) PRDM15 (ENSCCAG00000030489) ENSCCAG00000029556 ZBTB21 (ENSCCAG00000037414) ENSCCAG00000030168 UMODL1 (ENSCCAG00000028529) ABCG1 (ENSCCAG00000022414) TFF3 (ENSCCAG00000022195) TFF2 (ENSCCAG00000022205) TFF1 (ENSCCAG00000022303) TMPRSS3 (ENSCCAG00000038076) UBASH3A (ENSCCAG00000029676) RSPH1 (ENSCCAG00000029158) Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb.n #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00940000157800 ENSGT00940000165228 ENSGT00520000062027 ENSGT00930000151032.B ENSGT00940000155335 ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a Tarsier MODERN SPECIES 2014 TRIM47 (ENSTSYG00000026333) WBP2 (ENSTSYG00000027971) UNC13D (ENSTSYG00000008180) UNK (ENSTSYG00000008096) ENSTSYG00000034925 #22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb.n #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00940000157800 ENSGT00940000165228 ENSGT00520000062027 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00940000164172 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb.n #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00940000157800 ENSGT00940000165228 ENSGT00520000062027 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00940000164172 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A.c ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb.n #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00940000157800 ENSGT00940000165228 ENSGT00520000062027 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00940000164172 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a Gibbon MODERN SPECIES 20 ENSNLEG00000032682 GPR180 (ENSNLEG00000016532) TGDS (ENSNLEG00000016509) DCT (ENSNLEG00000016495) GPC6 (ENSNLEG00000016493) GPC5 (ENSNLEG00000016490) ENSNLEG00000016486 ENSNLEG00000033876 SLITRK5 (ENSNLEG00000016482) ENSNLEG00000030993 ENSNLEG00000016480 SLITRK6 (ENSNLEG00000016473) ENSNLEG00000034721 SLITRK1 (ENSNLEG00000019091) SPRY2 (ENSNLEG00000034212) ENSNLEG00000031272 #22 NDFIP2 (ENSNLEG00000016460) RBM26 (ENSNLEG00000016429) OBI1 (ENSNLEG00000016406) ENSNLEG00000016405 EDNRB (ENSNLEG00000016385) SLAIN1 (ENSNLEG00000016365) SCEL (ENSNLEG00000016322) MYCBP2 (ENSNLEG00000016250) FBXL3 (ENSNLEG00000016246) ENSNLEG00000016242 ACOD1 (ENSNLEG00000016240) ENSNLEG00000027709 LMO7 (ENSNLEG00000016172) UCHL3 (ENSNLEG00000027639) ENSNLEG00000031435 Hominidae ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A.c ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb.n #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00940000165228 ENSGT00520000062027 ENSGT00940000157800 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000161656.r ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a Orangutan DUPLICATION Orangutan MODERN SPECIES 3 SLC2A13 (ENSPPYG00000004415) C12orf40 (ENSPPYG00000004414) ABCD2 (ENSPPYG00000004413) KIF21A (ENSPPYG00000004412) CPNE8 (ENSPPYG00000004411) ALG10B (ENSPPYG00000004409) ENSPPYG00000034107 ALG10 (ENSPPYG00000004410) SYT10 (ENSPPYG00000004408) PKP2 (ENSPPYG00000004407) YARS2 (ENSPPYG00000004406) DNM1L (ENSPPYG00000004405) FGD4 (ENSPPYG00000004404) BICD1 (ENSPPYG00000004403) RESF1 (ENSPPYG00000004402) H3-5 (ENSPPYG00000004401) #22 AMN1 (ENSPPYG00000004400) ETFBKMT (ENSPPYG00000037212) DENND5B (ENSPPYG00000004398) ENSPPYG00000035593 SINHCAF (ENSPPYG00000004396) TSPAN11 (ENSPPYG00000039901) CAPRIN2 (ENSPPYG00000004394) IPO8 (ENSPPYG00000034647) TMTC1 (ENSPPYG00000004392) OVCH1 (ENSPPYG00000004391) ERGIC2 (ENSPPYG00000004390) FAR2 (ENSPPYG00000004389) CCDC91 (ENSPPYG00000004387) PTHLH (ENSPPYG00000004386) KLHL42 (ENSPPYG00000033094) Orangutan MODERN SPECIES 242 ENSPPYG00000020681 ZBTB33 (ENSPPYG00000020682) TMEM255A (ENSPPYG00000020683) ATP1B4 (ENSPPYG00000020684) LAMP2 (ENSPPYG00000020685) CUL4B (ENSPPYG00000020686) MCTS1 (ENSPPYG00000020687) C1GALT1C1 (ENSPPYG00000020689) ENSPPYG00000039491 CT47B1 (ENSPPYG00000033587) ENSPPYG00000020691 GLUD2 (ENSPPYG00000020692) ENSPPYG00000033514 ENSPPYG00000034575 GRIA3 (ENSPPYG00000020694) ENSPPYG00000033691 #22 THOC2 (ENSPPYG00000020695) XIAP (ENSPPYG00000020696) STAG2 (ENSPPYG00000020697) SH2D1A (ENSPPYG00000020698) TENM1 (ENSPPYG00000020699) ENSPPYG00000031077 DCAF12L2 (ENSPPYG00000037362) DCAF12L1 (ENSPPYG00000037034) PRR32 (ENSPPYG00000020701) ACTRT1 (ENSPPYG00000020702) SMARCA1 (ENSPPYG00000020703) OCRL (ENSPPYG00000020704) ENSPPYG00000041441 APLN (ENSPPYG00000020705) XPNPEP2 (ENSPPYG00000020706) Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A.c ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb.n #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00940000165228 ENSGT00520000062027 ENSGT00940000157800 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000161656.r ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a Gorilla MODERN SPECIES 18 FOXJ1 (ENSGGOG00000007282) EXOC7 (ENSGGOG00000008820) ZACN (ENSGGOG00000008814) GALR2 (ENSGGOG00000008813) SRP68 (ENSGGOG00000013895) EVPL (ENSGGOG00000013873) CDK3 (ENSGGOG00000013863) ACOX1 (ENSGGOG00000004590) FBF1 (ENSGGOG00000012586) MRPL38 (ENSGGOG00000013193) TRIM65 (ENSGGOG00000010533) TRIM47 (ENSGGOG00000009236) WBP2 (ENSGGOG00000009241) UNC13D (ENSGGOG00000009219) UNK (ENSGGOG00000009203) ENSGGOG00000037327 #22 GALK1 (ENSGGOG00000009534) ITGB4 (ENSGGOG00000009509) SAP30BP (ENSGGOG00000009499) RECQL5 (ENSGGOG00000009481) SMIM6 (ENSGGOG00000037869) SMIM5 (ENSGGOG00000009493) MYO15B (ENSGGOG00000009450) LLGL2 (ENSGGOG00000009428) TSEN54 (ENSGGOG00000009417) CASKIN2 (ENSGGOG00000009406) TMEM94 (ENSGGOG00000009391) GRB2 (ENSGGOG00000006122) SLC25A19 (ENSGGOG00000025764) MIF4GD (ENSGGOG00000028603) MRPS7 (ENSGGOG00000007640) Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000013448.a.a ENSGT00570000079239 ENSGT00950000182834.B ENSGT00940000153634.b ENSGT00950000182834.A.a.b.c ENSGT00940000160505 ENSGT00390000000417.a.a.b.a.b ENSGT00940000157376 ENSGT00390000018505.b ENSGT00390000002210.d ENSGT00940000159576 ENSGT00390000010056.q.b ENSGT00950000183044.a.a.a.c ENSGT00390000010056.q.a ENSGT00530000063402.b ENSGT01100000263504.a.a.yb.n #22 ENSGT00530000063651.a ENSGT00940000162190 ENSGT00390000003188 ENSGT00940000156058 ENSGT00940000157177.i.b ENSGT00390000008003 ENSGT00940000156764.a ENSGT00940000157923 ENSGT00940000156810 ENSGT01030000234517.H.b ENSGT00940000154251.A.a.a.a ENSGT00940000159380 ENSGT00910000147389 ENSGT00950000182843.b ENSGT00940000154494.a Pan ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000013448.a.a ENSGT00570000079239 ENSGT00950000182834.B ENSGT00940000153634.b ENSGT00950000182834.A.a.b.c ENSGT00940000160505 ENSGT00390000000417.a.a.b.a.b ENSGT00940000157376 ENSGT00390000018505.b ENSGT00390000002210.d ENSGT00940000159576 ENSGT00390000010056.q.b ENSGT00950000183044.a.a.a.c ENSGT00390000010056.q.a ENSGT00530000063402.b ENSGT01100000263504.a.a.yb.n #22 ENSGT00530000063651.a ENSGT00940000162190 ENSGT00390000003188 ENSGT00940000156058 ENSGT00940000157177.i.b ENSGT00390000008003 ENSGT00940000156764.a ENSGT00940000157923 ENSGT00940000156810 ENSGT01030000234517.H.b ENSGT00940000154251.A.a.a.a ENSGT00940000159380 ENSGT00910000147389 ENSGT00950000182843.b ENSGT00940000154494.a Bonobo MODERN SPECIES DEGS1 (ENSPPAG00000033472) NVL (ENSPPAG00000030596) CNIH4 (ENSPPAG00000037258) WDR26 (ENSPPAG00000030839) CNIH3 (ENSPPAG00000041930) DNAH14 (ENSPPAG00000033548) LBR (ENSPPAG00000029928) ENSPPAG00000027545 SRP9 (ENSPPAG00000042680) EPHX1 (ENSPPAG00000037369) TMEM63A (ENSPPAG00000035003) LEFTY1 (ENSPPAG00000031732) PYCR2 (ENSPPAG00000029624) LEFTY2 (ENSPPAG00000029951) SDE2 (ENSPPAG00000037583) ENSPPAG00000003422 #22 ACBD3 (ENSPPAG00000034288) ENSPPAG00000013035 LIN9 (ENSPPAG00000029947) PARP1 (ENSPPAG00000040862) ENSPPAG00000035608 ENSPPAG00000026314 ITPKB (ENSPPAG00000034181) PSEN2 (ENSPPAG00000029453) COQ8A (ENSPPAG00000038783) CDC42BPA (ENSPPAG00000030700) ENSPPAG00000042857 ENSPPAG00000042694 JMJD4 (ENSPPAG00000041921) ENSPPAG00000043934 SNAP47 (ENSPPAG00000030087) Human DUPLICATION Human MODERN SPECIES 3 LRRK2 (ENSG00000188906) SLC2A13 (ENSG00000151229) C12orf40 (ENSG00000180116) ABCD2 (ENSG00000173208) KIF21A (ENSG00000139116) CPNE8 (ENSG00000139117) ALG10B (ENSG00000175548) ALG10 (ENSG00000139133) SYT10 (ENSG00000110975) PKP2 (ENSG00000057294) YARS2 (ENSG00000139131) DNM1L (ENSG00000087470) FGD4 (ENSG00000139132) BICD1 (ENSG00000151746) RESF1 (ENSG00000174718) H3-5 (ENSG00000188375) #22 AMN1 (ENSG00000151743) ETFBKMT (ENSG00000139160) AK4P3 (ENSG00000233381) DENND5B (ENSG00000170456) SINHCAF (ENSG00000139146) DDX11 (ENSG00000013573) TSPAN11 (ENSG00000110900) CAPRIN2 (ENSG00000110888) IPO8 (ENSG00000133704) TMTC1 (ENSG00000133687) OVCH1 (ENSG00000187950) ERGIC2 (ENSG00000087502) FAR2 (ENSG00000064763) CCDC91 (ENSG00000123106) PTHLH (ENSG00000087494) Human MODERN SPECIES 8 EXOC7 (ENSG00000182473) GALR2 (ENSG00000182687) ZACN (ENSG00000186919) SRP68 (ENSG00000167881) EVPL (ENSG00000167880) CDK3 (ENSG00000250506) TEN1 (ENSG00000257949) ACOX1 (ENSG00000161533) FBF1 (ENSG00000188878) MRPL38 (ENSG00000204316) TRIM65 (ENSG00000141569) TRIM47 (ENSG00000132481) WBP2 (ENSG00000132471) UNC13D (ENSG00000092929) UNK (ENSG00000132478) H3-3B (ENSG00000132475) #22 GALK1 (ENSG00000108479) ITGB4 (ENSG00000132470) SAP30BP (ENSG00000161526) SMIM6 (ENSG00000259120) SMIM5 (ENSG00000204323) RECQL5 (ENSG00000108469) MYO15B (ENSG00000266714) LLGL2 (ENSG00000073350) TSEN54 (ENSG00000182173) CASKIN2 (ENSG00000177303) TMEM94 (ENSG00000177728) GRB2 (ENSG00000177885) SLC25A19 (ENSG00000125454) MIF4GD (ENSG00000125457) MRPS7 (ENSG00000125445) Human MODERN SPECIES NVL (ENSG00000143748) CNIH4 (ENSG00000143771) WDR26 (ENSG00000162923) CNIH3 (ENSG00000143786) DNAH14 (ENSG00000185842) LBR (ENSG00000143815) ENAH (ENSG00000154380) SRP9 (ENSG00000143742) EPHX1 (ENSG00000143819) TMEM63A (ENSG00000196187) LEFTY1 (ENSG00000243709) ENSG00000255835 PYCR2 (ENSG00000143811) LEFTY2 (ENSG00000143768) SDE2 (ENSG00000143751) H3-3A (ENSG00000163041) #22 ACBD3 (ENSG00000182827) MIXL1 (ENSG00000185155) LIN9 (ENSG00000183814) PARP1 (ENSG00000143799) STUM (ENSG00000203685) ITPKB 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ENSGT01100000263504.a.a.yb.n #22 Golden snub-nosed monkey DUPLICATION Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 591 LRIG1 (ENSRROG00000042136) SLC25A26 (ENSRROG00000030090) ENSRROG00000041210 ENSRROG00000025517 #22 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2251 ENSRROG00000015387 #22 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1023 HES7 (ENSRROG00000045527) ALOXE3 (ENSRROG00000028855) ALOX12B (ENSRROG00000036486) ALOX15B (ENSRROG00000039498) ENSRROG00000019216 GUCY2D (ENSRROG00000005382) CNTROB (ENSRROG00000043667) TRAPPC1 (ENSRROG00000029283) KCNAB3 (ENSRROG00000040156) RNF227 (ENSRROG00000037731) CHD3 (ENSRROG00000029554) CYB5D1 (ENSRROG00000033738) NAA38 (ENSRROG00000037370) TMEM88 (ENSRROG00000043517) KDM6B (ENSRROG00000030681) ENSRROG00000028496 #22 DNAH2 (ENSRROG00000035849) EFNB3 (ENSRROG00000045493) WRAP53 (ENSRROG00000032629) TP53 (ENSRROG00000037163) ATP1B2 (ENSRROG00000043331) SHBG (ENSRROG00000041036) SAT2 (ENSRROG00000002103) FXR2 (ENSRROG00000035470) SOX15 (ENSRROG00000035518) MPDU1 (ENSRROG00000039715) CD68 (ENSRROG00000036188) EIF4A1 (ENSRROG00000032175) SENP3 (ENSRROG00000036921) TNFSF13 (ENSRROG00000043005) TNFSF12 (ENSRROG00000040782) Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2267 ENSRROG00000025495 #22 KIF26B (ENSRROG00000034054) SMYD3 (ENSRROG00000034618) Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb.n #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00940000157800 ENSGT00940000165228 ENSGT00520000062027 ENSGT00930000151032.B ENSGT00940000155335 ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a Vervet Monkey MODERN SPECIES 7 EXOC7 (ENSCSAG00000004994) ZACN (ENSCSAG00000004988) GALR2 (ENSCSAG00000004985) SRP68 (ENSCSAG00000004983) EVPL (ENSCSAG00000004972) CDK3 (ENSCSAG00000004957) TEN1 (ENSCSAG00000004942) ACOX1 (ENSCSAG00000004941) FBF1 (ENSCSAG00000004938) MRPL38 (ENSCSAG00000004925) TRIM65 (ENSCSAG00000004905) TRIM47 (ENSCSAG00000004896) WBP2 (ENSCSAG00000004889) UNC13D (ENSCSAG00000004874) UNK (ENSCSAG00000004859) ENSCSAG00000004855 #22 GALK1 (ENSCSAG00000004853) ENSCSAG00000004846 SAP30BP (ENSCSAG00000004844) RECQL5 (ENSCSAG00000004842) SMIM6 (ENSCSAG00000000540) SMIM5 (ENSCSAG00000004839) ENSCSAG00000004836 ENSCSAG00000004826 LLGL2 (ENSCSAG00000004819) TSEN54 (ENSCSAG00000004809) CASKIN2 (ENSCSAG00000004791) TMEM94 (ENSCSAG00000004752) GRB2 (ENSCSAG00000004740) SLC25A19 (ENSCSAG00000004737) MIF4GD (ENSCSAG00000004732) Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb.n #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00940000157800 ENSGT00940000165228 ENSGT00520000062027 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a ENSGT00390000014620 Macaca ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.b.q ##21 ENSGT01100000263504.a.a.yb.n #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b 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DUPLICATION Crab-eating macaque MODERN SPECIES SERPINC1 (ENSMFAG00000031906) RC3H1 (ENSMFAG00000033725) ENSMFAG00000048032 RABGAP1L (ENSMFAG00000034332) ENSMFAG00000050651 ENSMFAG00000064994 ENSMFAG00000000624 ENSMFAG00000048388 TNN (ENSMFAG00000001813) KIAA0040 (ENSMFAG00000051710) TNR (ENSMFAG00000038286) ENSMFAG00000048892 ENSMFAG00000064374 ENSMFAG00000056458 COP1 (ENSMFAG00000035358) ENSMFAG00000061100 #22 PAPPA2 (ENSMFAG00000040580) ENSMFAG00000029702 ASTN1 (ENSMFAG00000003043) BRINP2 (ENSMFAG00000036550) SEC16B (ENSMFAG00000040538) RASAL2 (ENSMFAG00000032705) CLEC20A (ENSMFAG00000040960) TEX35 (ENSMFAG00000046254) RALGPS2 (ENSMFAG00000001541) ANGPTL1 (ENSMFAG00000031474) FAM20B (ENSMFAG00000051981) TOR3A (ENSMFAG00000041376) ABL2 (ENSMFAG00000036564) ENSMFAG00000056060 SOAT1 (ENSMFAG00000037136) Crab-eating macaque MODERN SPECIES 7 GALR2 (ENSMFAG00000041508) SRP68 (ENSMFAG00000036758) EVPL (ENSMFAG00000039301) CDK3 (ENSMFAG00000032132) ENSMFAG00000056933 TRIM65 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ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb.n #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00940000157800 ENSGT00520000062027 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT01100000263915.D ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a ENSGT00390000014620 Sooty mangabey MODERN SPECIES 513 NVL (ENSCATG00000040317) CNIH4 (ENSCATG00000043768) WDR26 (ENSCATG00000035046) ENSCATG00000030513 CNIH3 (ENSCATG00000042269) DNAH14 (ENSCATG00000039957) LBR (ENSCATG00000031289) ENAH (ENSCATG00000006720) SRP9 (ENSCATG00000041813) EPHX1 (ENSCATG00000039564) TMEM63A 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lemur MODERN SPECIES 732 ENSPSMG00000008603 CISD2 (ENSPSMG00000008448) ENSPSMG00000008428 #22 SLC9B1 (ENSPSMG00000008420) Bushbaby DUPLICATION Bushbaby MODERN SPECIES 133 GGA3 (ENSOGAG00000008100) MRPS7 (ENSOGAG00000008103) MIF4GD (ENSOGAG00000011973) SLC25A19 (ENSOGAG00000003064) GRB2 (ENSOGAG00000003066) TMEM94 (ENSOGAG00000001436) CASKIN2 (ENSOGAG00000001439) TSEN54 (ENSOGAG00000001442) LLGL2 (ENSOGAG00000001444) ENSOGAG00000001451 ENSOGAG00000001455 RECQL5 (ENSOGAG00000001457) SAP30BP (ENSOGAG00000001462) ITGB4 (ENSOGAG00000001913) GALK1 (ENSOGAG00000001918) ENSOGAG00000034528 #22 ENSOGAG00000025933 #22 UNK (ENSOGAG00000001922) UNC13D (ENSOGAG00000001927) WBP2 (ENSOGAG00000001934) TRIM47 (ENSOGAG00000001935) TRIM65 (ENSOGAG00000001937) MRPL38 (ENSOGAG00000001939) FBF1 (ENSOGAG00000001940) ACOX1 (ENSOGAG00000001941) TEN1 (ENSOGAG00000025806) CDK3 (ENSOGAG00000001943) EVPL (ENSOGAG00000032503) SRP68 (ENSOGAG00000001948) GALR2 (ENSOGAG00000027563) ZACN (ENSOGAG00000001951) Bushbaby 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ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00940000157800 ENSGT00940000165228 ENSGT00520000062027 ENSGT00930000151032.B ENSGT00940000155335 ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a Cat MODERN SPECIES 245 FOXJ1 (ENSFCAG00000005772) EXOC7 (ENSFCAG00000005771) ZACN (ENSFCAG00000005769) ENSFCAG00000045598 SRP68 (ENSFCAG00000005768) EVPL (ENSFCAG00000029136) CDK3 (ENSFCAG00000005766) ACOX1 (ENSFCAG00000005765) FBF1 (ENSFCAG00000005764) MRPL38 (ENSFCAG00000005763) TRIM65 (ENSFCAG00000046456) TRIM47 (ENSFCAG00000005761) WBP2 (ENSFCAG00000043985) UNC13D (ENSFCAG00000005759) UNK (ENSFCAG00000005757) H3-3B (ENSFCAG00000030424) #22 GALK1 (ENSFCAG00000005755) ITGB4 (ENSFCAG00000005754) SAP30BP (ENSFCAG00000036444) ENSFCAG00000051160 SMIM6 (ENSFCAG00000044791) SMIM5 (ENSFCAG00000029987) RECQL5 (ENSFCAG00000005751) 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ENSGT00390000013448.a.a.v ENSGT00570000079239 ENSGT00950000182834.B ENSGT00940000153634.b ENSGT00950000182834.A.a.b.c ENSGT00940000160505 ENSGT00390000000417.a.a.b.a.b ENSGT00940000157376 ENSGT00390000018505.b ENSGT00390000002210.d ENSGT00940000159576 ENSGT00950000183044.a.a.a.c ENSGT00390000010056 ENSGT00530000063402.b ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT00530000063651.a ENSGT00940000162190 ENSGT00390000003188 ENSGT00940000156058 ENSGT00390000008003 ENSGT00940000156764.a ENSGT00940000157923 ENSGT00940000156810 ENSGT01030000234517.H.b ENSGT00390000018900 ENSGT00940000163104 ENSGT00390000004799 ENSGT00390000005861 ENSGT00950000183142.a.b.a.b ENSGT00940000156766 lion MODERN SPECIES 8 TAFA3 (ENSPLOG00000020057) ENSPLOG00000020035 ENSPLOG00000020002 LRIG2 (ENSPLOG00000019954) MAGI3 (ENSPLOG00000019634) PHTF1 (ENSPLOG00000019325) RSBN1 (ENSPLOG00000019230) PTPN22 (ENSPLOG00000018355) BCL2L15 (ENSPLOG00000018045) AP4B1 (ENSPLOG00000017914) DCLRE1B (ENSPLOG00000017828) HIPK1 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(ENSPTIG00000018194) SLC25A19 (ENSPTIG00000018082) Tiger MODERN SPECIES 571 TP53BP2 (ENSPTIG00000013719) FBXO28 (ENSPTIG00000013765) DEGS1 (ENSPTIG00000013966) NVL (ENSPTIG00000013981) CNIH4 (ENSPTIG00000014093) WDR26 (ENSPTIG00000014132) CNIH3 (ENSPTIG00000014198) DNAH14 (ENSPTIG00000014279) LBR (ENSPTIG00000014694) ENAH (ENSPTIG00000014773) SRP9 (ENSPTIG00000014838) ENSPTIG00000014848 TMEM63A (ENSPTIG00000014886) PYCR2 (ENSPTIG00000014933) SDE2 (ENSPTIG00000015111) ENSPTIG00000015121 #22 ACBD3 (ENSPTIG00000015131) Caniformia ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00520000062027 ENSGT00940000157800 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000181148 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a ENSGT00390000014620 Canidae ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00520000062027 ENSGT00940000157800 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000181148 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a ENSGT00390000014620 Red fox MODERN SPECIES 31 FOXJ1 (ENSVVUG00000015093) EXOC7 (ENSVVUG00000015044) GALR2 (ENSVVUG00000015033) SRP68 (ENSVVUG00000015027) ENSVVUG00000014941 CDK3 (ENSVVUG00000014925) TEN1 (ENSVVUG00000014922) ACOX1 (ENSVVUG00000014918) FBF1 (ENSVVUG00000014915) MRPL38 (ENSVVUG00000014914) TRIM65 (ENSVVUG00000014913) TRIM47 (ENSVVUG00000014911) WBP2 (ENSVVUG00000014910) UNC13D (ENSVVUG00000014822) UNK (ENSVVUG00000014786) ENSVVUG00000014780 #22 GALK1 (ENSVVUG00000014776) ITGB4 (ENSVVUG00000011733) SAP30BP (ENSVVUG00000011535) SMIM5 (ENSVVUG00000011531) RECQL5 (ENSVVUG00000011515) ENSVVUG00000011506 ENSVVUG00000011461 LLGL2 (ENSVVUG00000011427) TSEN54 (ENSVVUG00000011411) CASKIN2 (ENSVVUG00000011393) TMEM94 (ENSVVUG00000011343) GRB2 (ENSVVUG00000011327) SLC25A19 (ENSVVUG00000011319) MIF4GD (ENSVVUG00000011277) MRPS7 (ENSVVUG00000011263) Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00520000062027 ENSGT00940000157800 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a ENSGT00390000014620 ENSGT00940000157333 Ursidae ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00520000062027 ENSGT00940000157800 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a ENSGT00390000014620 ENSGT00940000157333 Giant Panda DUPLICATION Giant Panda MODERN SPECIES 1467 ENSAMEG00000026636 #22 Giant Panda MODERN SPECIES 4 FOXJ1 (ENSAMEG00000010217) EXOC7 (ENSAMEG00000010140) ZACN (ENSAMEG00000010133) GALR2 (ENSAMEG00000010124) SRP68 (ENSAMEG00000010078) ENSAMEG00000010053 CDK3 (ENSAMEG00000010028) ACOX1 (ENSAMEG00000009993) FBF1 (ENSAMEG00000009960) MRPL38 (ENSAMEG00000009947) TRIM65 (ENSAMEG00000030442) TRIM47 (ENSAMEG00000009928) WBP2 (ENSAMEG00000027016) UNC13D (ENSAMEG00000009825) UNK (ENSAMEG00000009769) H3-3B (ENSAMEG00000009765) #22 GALK1 (ENSAMEG00000009739) ITGB4 (ENSAMEG00000009619) SAP30BP (ENSAMEG00000009518) SMIM5 (ENSAMEG00000009617) RECQL5 (ENSAMEG00000009566) MYO15B (ENSAMEG00000027824) LLGL2 (ENSAMEG00000009430) TSEN54 (ENSAMEG00000009414) CASKIN2 (ENSAMEG00000009400) TMEM94 (ENSAMEG00000009346) GRB2 (ENSAMEG00000009339) SLC25A19 (ENSAMEG00000009328) MIF4GD (ENSAMEG00000009313) MRPS7 (ENSAMEG00000009287) GGA3 (ENSAMEG00000009242) Mustelinae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00520000062027 ENSGT00940000157800 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a ENSGT00390000014620 ENSGT00940000157333 American mink MODERN SPECIES 27 EXOC7 (ENSNVIG00000012102) ZACN (ENSNVIG00000012074) GALR2 (ENSNVIG00000012065) SRP68 (ENSNVIG00000012003) ENSNVIG00000011966 CDK3 (ENSNVIG00000011927) TEN1 (ENSNVIG00000011899) ACOX1 (ENSNVIG00000011817) FBF1 (ENSNVIG00000011665) MRPL38 (ENSNVIG00000011652) TRIM65 (ENSNVIG00000011629) TRIM47 (ENSNVIG00000011613) WBP2 (ENSNVIG00000011593) UNC13D (ENSNVIG00000011435) UNK (ENSNVIG00000011415) ENSNVIG00000011392 #22 GALK1 (ENSNVIG00000011378) ITGB4 (ENSNVIG00000011198) SAP30BP (ENSNVIG00000011161) SMIM5 (ENSNVIG00000011133) RECQL5 (ENSNVIG00000011059) ENSNVIG00000011041 ENSNVIG00000011005 LLGL2 (ENSNVIG00000010973) TSEN54 (ENSNVIG00000010933) CASKIN2 (ENSNVIG00000010892) TMEM94 (ENSNVIG00000010819) GRB2 (ENSNVIG00000010758) SLC25A19 (ENSNVIG00000010719) MIF4GD (ENSNVIG00000010666) MRPS7 (ENSNVIG00000010616) Ferret DUPLICATION Ferret MODERN SPECIES 246 FBXO28 (ENSMPUG00000004002) DEGS1 (ENSMPUG00000004010) NVL (ENSMPUG00000004031) WDR26 (ENSMPUG00000004049) CNIH3 (ENSMPUG00000004163) ENSMPUG00000004174 LBR (ENSMPUG00000004384) ENAH (ENSMPUG00000004394) EPHX1 (ENSMPUG00000004409) ENSMPUG00000004459 TMEM63A (ENSMPUG00000004462) PYCR2 (ENSMPUG00000004479) ENSMPUG00000004487 ENSMPUG00000004540 SDE2 (ENSMPUG00000004543) ENSMPUG00000004555 #22 ACBD3 (ENSMPUG00000004563) LIN9 (ENSMPUG00000004573) PARP1 (ENSMPUG00000004585) ITPKB (ENSMPUG00000004596) ENSMPUG00000018474 PRDX6 (ENSMPUG00000004648) SLC9C2 (ENSMPUG00000004656) ANKRD45 (ENSMPUG00000004688) KLHL20 (ENSMPUG00000004695) CENPL (ENSMPUG00000004707) DARS2 (ENSMPUG00000004716) ZBTB37 (ENSMPUG00000004728) SERPINC1 (ENSMPUG00000004735) RC3H1 (ENSMPUG00000004747) ENSMPUG00000004762 Ferret MODERN SPECIES 186 EXOC7 (ENSMPUG00000013525) ZACN (ENSMPUG00000013532) GALR2 (ENSMPUG00000013542) SRP68 (ENSMPUG00000013547) ENSMPUG00000013619 CDK3 (ENSMPUG00000013625) ENSMPUG00000013676 ACOX1 (ENSMPUG00000013679) FBF1 (ENSMPUG00000013754) MRPL38 (ENSMPUG00000013759) TRIM65 (ENSMPUG00000013762) TRIM47 (ENSMPUG00000013773) WBP2 (ENSMPUG00000013775) UNC13D (ENSMPUG00000013795) UNK (ENSMPUG00000013806) ENSMPUG00000013811 #22 GALK1 (ENSMPUG00000013819) ITGB4 (ENSMPUG00000013821) SAP30BP (ENSMPUG00000013829) RECQL5 (ENSMPUG00000013833) ENSMPUG00000013837 LLGL2 (ENSMPUG00000013865) TSEN54 (ENSMPUG00000013870) CASKIN2 (ENSMPUG00000013874) TMEM94 (ENSMPUG00000013877) GRB2 (ENSMPUG00000013882) SLC25A19 (ENSMPUG00000013885) MIF4GD (ENSMPUG00000013909) MRPS7 (ENSMPUG00000013928) GGA3 (ENSMPUG00000013944) NUP85 (ENSMPUG00000013951) Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00520000062027 ENSGT00940000157800 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a ENSGT00390000014620 ENSGT00940000157333 Equus ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 Donkey MODERN SPECIES 3 REEP2 (ENSEASG00005020807) KDM3B (ENSEASG00005020793) FAM53C (ENSEASG00005020786) ENSEASG00005020781 CDC25C (ENSEASG00005020776) GFRA3 (ENSEASG00005020771) CDC23 (ENSEASG00005020721) KIF20A (ENSEASG00005020674) BRD8 (ENSEASG00005020657) NME5 (ENSEASG00005020647) WNT8A (ENSEASG00005038334) FAM13B (ENSEASG00005020624) PKD2L2 (ENSEASG00005020612) MYOT (ENSEASG00005020604) ENSEASG00005020596 ENSEASG00005038534 #22 HNRNPA0 (ENSEASG00005028445) KLHL3 (ENSEASG00005020585) SPOCK1 (ENSEASG00005020567) TRPC7 (ENSEASG00005020538) SMIM32 (ENSEASG00005020531) SMAD5 (ENSEASG00005020529) TGFBI (ENSEASG00005020514) LECT2 (ENSEASG00005026412) ENSEASG00005023760 IL9 (ENSEASG00005020504) SLC25A48 (ENSEASG00005020501) ENSEASG00005020496 ENSEASG00005036931 NEUROG1 (ENSEASG00005020492) TIFAB (ENSEASG00005020490) Chiroptera ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00520000062027 ENSGT00940000157800 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a ENSGT00390000014620 ENSGT00940000157333 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00390000013448.a.a ENSGT00570000079239 ENSGT00950000182834.B ENSGT00940000153634.b ENSGT00950000182834.A.a.b.c ENSGT00940000160505 ENSGT00390000000417.a.a.b.a.b ENSGT00940000157376 ENSGT00390000018505.b ENSGT00390000002210.d ENSGT00940000159576 ENSGT00950000183044.a.a.a.c 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(ENSRFEG00010011034) TUBB6 (ENSRFEG00010010921) AFG3L2 (ENSRFEG00010010859) PRELID3A (ENSRFEG00010010757) SPIRE1 (ENSRFEG00010010443) CEP76 (ENSRFEG00010010291) PSMG2 (ENSRFEG00010010190) ENSRFEG00010010139 PTPN2 (ENSRFEG00010010030) ENSRFEG00010010007 Microbat DUPLICATION Microbat MODERN SPECIES 2057 ENSMLUG00000015277 #22 ACBD3 (ENSMLUG00000008288) Microbat DUPLICATION Microbat MODERN SPECIES 1672 ENSMLUG00000003474 TMEM160 (ENSMLUG00000023661) ARHGAP35 (ENSMLUG00000003739) ENSMLUG00000027160 ENSMLUG00000022578 #22 Microbat MODERN SPECIES 1085 ADRA1A (ENSMLUG00000027812) ENSMLUG00000023958 ENSMLUG00000025762 #22 DPYSL2 (ENSMLUG00000000271) BNIP3L (ENSMLUG00000014949) PPP2R2A (ENSMLUG00000030355) EBF2 (ENSMLUG00000011509) CDCA2 (ENSMLUG00000006321) KCTD9 (ENSMLUG00000006310) GNRH1 (ENSMLUG00000006306) DOCK5 (ENSMLUG00000006278) ENSMLUG00000029940 ADAM7 (ENSMLUG00000009580) ADAMDEC1 (ENSMLUG00000009552) ADAM28 (ENSMLUG00000009526) ENSMLUG00000027935 ENSMLUG00000023520 STC1 (ENSMLUG00000010663) Microbat MODERN SPECIES 1476 ENSMLUG00000025680 ENSMLUG00000003919 ENSMLUG00000027768 #22 TFB2M (ENSMLUG00000003923) ENSMLUG00000014074 Megabat DUPLICATION Megabat MODERN SPECIES 2194 EXOC7 (ENSPVAG00000008490) ZACN (ENSPVAG00000008488) GALR2 (ENSPVAG00000008486) SRP68 (ENSPVAG00000008484) ENSPVAG00000008481 CDK3 (ENSPVAG00000008480) TEN1 (ENSPVAG00000008478) ACOX1 (ENSPVAG00000008477) FBF1 (ENSPVAG00000008471) MRPL38 (ENSPVAG00000008468) TRIM65 (ENSPVAG00000008466) TRIM47 (ENSPVAG00000008464) WBP2 (ENSPVAG00000008463) UNC13D (ENSPVAG00000008462) UNK (ENSPVAG00000008460) ENSPVAG00000008459 #22 GALK1 (ENSPVAG00000008457) ITGB4 (ENSPVAG00000008456) SAP30BP (ENSPVAG00000008454) RECQL5 (ENSPVAG00000008452) ENSPVAG00000008451 ENSPVAG00000008449 ENSPVAG00000008448 LLGL2 (ENSPVAG00000008447) TSEN54 (ENSPVAG00000008446) CASKIN2 (ENSPVAG00000008444) TMEM94 (ENSPVAG00000008441) GRB2 (ENSPVAG00000008439) SLC25A19 (ENSPVAG00000008437) MIF4GD (ENSPVAG00000008435) MRPS7 (ENSPVAG00000008433) Megabat MODERN SPECIES 1071 EPHX1 (ENSPVAG00000004784) TMEM63A (ENSPVAG00000004786) ENSPVAG00000004790 PYCR2 (ENSPVAG00000004794) ENSPVAG00000004795 SDE2 (ENSPVAG00000004796) ENSPVAG00000004797 #22 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00520000062027 ENSGT00940000157800 ENSGT00930000151032.B ENSGT00940000155335 ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a ENSGT00390000014620 Suina ANCESTRAL SPECIES 55 ENSGT00390000013448.a.a ENSGT00570000079239 ENSGT00950000182834.B ENSGT00940000153634.b ENSGT00950000182834.A.a.b.c ENSGT00940000160505 ENSGT00390000000417.a.a.b.a.b ENSGT00940000157376 ENSGT00390000018505.b ENSGT00390000002210.d ENSGT00940000159576 ENSGT00950000183044.a.a.a.c ENSGT00390000010056 ENSGT00530000063402.b ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT01100000263504.a.b.b.a.b ##21 ENSGT00530000063651.a ENSGT00940000162190 ENSGT00390000003188 ENSGT00940000156058 ENSGT00390000008003 ENSGT00940000156764.a.b ENSGT00940000157923 ENSGT00940000156810 ENSGT01030000234517.H.b ENSGT00390000018900 ENSGT00940000163104 ENSGT00390000004799.j ENSGT00390000005861 ENSGT00950000183142.a.b.a.b Pig MODERN SPECIES 16 KDR (ENSSSCG00000008844) ENSSSCG00000008845 ENSSSCG00000034355 ENSSSCG00000053955 ENSSSCG00000008850 ENSSSCG00000008892 ENSSSCG00000057119 ENSSSCG00000061357 ENSSSCG00000036417 ENSSSCG00000042370 ENSSSCG00000043541 MAP9 (ENSSSCG00000008852) TLL1 (ENSSSCG00000008853) ENSSSCG00000046178 CPE (ENSSSCG00000008854) ENSSSCG00000008855 #22 MSMO1 (ENSSSCG00000008857) KLHL2 (ENSSSCG00000008858) TMEM192 (ENSSSCG00000020868) ENSSSCG00000046428 ENSSSCG00000008860 ENSSSCG00000044849 ENSSSCG00000045736 ENSSSCG00000062623 ENSSSCG00000051162 ENSSSCG00000050154 ENSSSCG00000047847 ENSSSCG00000048616 GUCY1A1 (ENSSSCG00000008866) GUCY1B1 (ENSSSCG00000008870) ASIC5 (ENSSSCG00000008869) Chacoan peccary MODERN SPECIES 50 NVL (ENSCWAG00000008427) CNIH4 (ENSCWAG00000008250) WDR26 (ENSCWAG00000008179) ENSCWAG00000008140 ENSCWAG00000007925 ENSCWAG00000007839 ENSCWAG00000007806 LBR (ENSCWAG00000007748) ENAH (ENSCWAG00000007692) SRP9 (ENSCWAG00000007657) EPHX1 (ENSCWAG00000007633) TMEM63A (ENSCWAG00000007524) PYCR2 (ENSCWAG00000007472) ENSCWAG00000007440 SDE2 (ENSCWAG00000007407) H3-3A (ENSCWAG00000007368) #22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 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ENSGT00940000161936 ENSGT00390000015871 ENSGT00940000159969.a ENSGT00390000007918.g.b ENSGT00940000159905 ENSGT00950000183032.A.a.g.a ENSGT00950000182863.B.a ENSGT00390000009113.a.b ENSGT00940000154511.b ENSGT00940000159968 ENSGT00740000115534.a.b.f.a.b ENSGT01050000244824.A ENSGT00940000155633.D ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT00390000014654 ENSGT00940000163032 ENSGT01030000235502 ENSGT00940000162302 ENSGT00390000010337.B.a.b.k.b ENSGT00950000182893.a.a.a.b ENSGT00530000063156.b ENSGT00940000153859.b ENSGT00940000160768 ENSGT00390000011435 ENSGT00950000182893.a.a.a.a ENSGT00550000074694.a ENSGT00390000014398 ENSGT00390000004915.a ENSGT00940000157647 Goat MODERN SPECIES 5 OPRK1 (ENSCHIG00000023230) NPBWR1 (ENSCHIG00000010898) RB1CC1 (ENSCHIG00000017614) ENSCHIG00000027047 ENSCHIG00000015420 ST18 (ENSCHIG00000013632) ENSCHIG00000024195 ENSCHIG00000011128 SNTG1 (ENSCHIG00000023177) PPDPFL (ENSCHIG00000017544) SNAI2 (ENSCHIG00000024410) CLXN (ENSCHIG00000017174) ENSCHIG00000013718 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SPECIES 3036 OPRK1 (ENSBBBG00000017852) NPBWR1 (ENSBBBG00000017860) RB1CC1 (ENSBBBG00000017917) ALKAL1 (ENSBBBG00000004408) ENSBBBG00000017946 ENSBBBG00000004417 ST18 (ENSBBBG00000017983) ENSBBBG00000004427 SNTG1 (ENSBBBG00000018671) PPDPFL (ENSBBBG00000018734) SNAI2 (ENSBBBG00000018743) CLXN (ENSBBBG00000018768) UBE2V2 (ENSBBBG00000018781) MCM4 (ENSBBBG00000018801) PRKDC (ENSBBBG00000004878) ENSBBBG00000019084 #22 SPIDR (ENSBBBG00000019113) ENSBBBG00000019149 ENSBBBG00000019155 ENSBBBG00000004933 ENSBBBG00000019172 ZHX2 (ENSBBBG00000008388) DERL1 (ENSBBBG00000019213) TBC1D31 (ENSBBBG00000019387) FAM83A (ENSBBBG00000019415) C8orf76 (ENSBBBG00000019423) ZHX1 (ENSBBBG00000019432) ATAD2 (ENSBBBG00000005218) NTAQ1 (ENSBBBG00000019510) FBXO32 (ENSBBBG00000019539) ENSBBBG00000019545 Bos ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000157341 ENSGT00940000161936 ENSGT00390000015871 ENSGT00940000159969.a ENSGT00390000002144.i.b ENSGT00390000007918.g.b ENSGT00940000159905 ENSGT00950000183032.A.a.g.a 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ENSGT00390000010337.B.a.b.h Wild yak MODERN SPECIES 452 NPBWR1 (ENSBMUG00000013137) RB1CC1 (ENSBMUG00000013120) ENSBMUG00000013083 ENSBMUG00000013069 ENSBMUG00000013053 ST18 (ENSBMUG00000013031) PCMTD1 (ENSBMUG00000012986) ENSBMUG00000012936 SNTG1 (ENSBMUG00000011959) ENSBMUG00000011359 SNAI2 (ENSBMUG00000011335) CLXN (ENSBMUG00000011311) UBE2V2 (ENSBMUG00000011242) MCM4 (ENSBMUG00000011227) PRKDC (ENSBMUG00000011197) ENSBMUG00000010962 #22 SPIDR (ENSBMUG00000010938) ENSBMUG00000010902 ENSBMUG00000010886 ENSBMUG00000010853 ENSBMUG00000010840 ENSBMUG00000010821 ENSBMUG00000010772 Bos_b ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00390000003289.g.a ENSGT00940000157341 ENSGT00940000161936 ENSGT00390000015871 ENSGT00940000159969.a ENSGT00390000007918.g.b ENSGT00940000159905 ENSGT00950000183032.A.a.g.a ENSGT00950000182863.B.a ENSGT00390000009113.a.b ENSGT00940000154511.b ENSGT00940000159968 ENSGT00740000115534.a.b.f.a.a ENSGT01050000244824.A ENSGT00940000155633.D ENSGT01100000263504.a.a.yb.fb.b #22 ENSGT00390000014654 ENSGT00940000163032 ENSGT00960000186612.B.a.a.d ENSGT00940000162302 ENSGT00940000165552 ENSGT00390000010337.B.a.b.h ENSGT00950000182893.a.a.a.b ENSGT00530000063156.b ENSGT00940000153859.b ENSGT00940000160768 ENSGT00390000011435 ENSGT00950000182893.a.a.a.a ENSGT00550000074694.a ENSGT00390000014398 ENSGT00390000004915.a Cow MODERN SPECIES 5 ATP6V1H (ENSBTAG00000003450) OPRK1 (ENSBTAG00000000914) NPBWR1 (ENSBTAG00000016159) RB1CC1 (ENSBTAG00000000878) ENSBTAG00000048814 ST18 (ENSBTAG00000005560) PCMTD1 (ENSBTAG00000017492) SNTG1 (ENSBTAG00000002448) ENSBTAG00000027760 PPDPFL (ENSBTAG00000038286) SNAI2 (ENSBTAG00000013227) CLXN (ENSBTAG00000008693) UBE2V2 (ENSBTAG00000023218) MCM4 (ENSBTAG00000017021) PRKDC (ENSBTAG00000017019) H3-5 (ENSBTAG00000017016) #22 SPIDR (ENSBTAG00000044106) CEBPD (ENSBTAG00000046307) ENSBTAG00000040351 ENSBTAG00000054983 ENSBTAG00000009474 HAS2 (ENSBTAG00000019892) ZHX2 (ENSBTAG00000026309) DERL1 (ENSBTAG00000020693) TBC1D31 (ENSBTAG00000021156) FAM83A (ENSBTAG00000005877) C14H8orf76 (ENSBTAG00000015319) ZHX1 (ENSBTAG00000015334) ATAD2 (ENSBTAG00000002002) ATAD2 (ENSBTAG00000051782) NTAQ1 (ENSBTAG00000009916) Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 5 ALKAL1 (ENSBIXG00005024331) ENSBIXG00005024381 ST18 (ENSBIXG00005024438) ENSBIXG00005004177 ENSBIXG00005024471 PCMTD1 (ENSBIXG00005004184) ENSBIXG00005004193 SNTG1 (ENSBIXG00005024969) ENSBIXG00005025067 ENSBIXG00005025099 SNAI2 (ENSBIXG00005025145) CLXN (ENSBIXG00005025221) ENSBIXG00005025298 MCM4 (ENSBIXG00005025814) PRKDC (ENSBIXG00005026568) ENSBIXG00005026643 #22 SPIDR (ENSBIXG00005004566) CEBPD (ENSBIXG00005026750) ENSBIXG00005026755 ENSBIXG00005026768 ENSBIXG00005026793 ENSBIXG00005026808 ENSBIXG00005006616 ZHX2 (ENSBIXG00005004591) DERL1 (ENSBIXG00005026942) TBC1D31 (ENSBIXG00005027049) FAM83A (ENSBIXG00005027081) C8orf76 (ENSBIXG00005027102) ZHX1 (ENSBIXG00005027195) ATAD2 (ENSBIXG00005004691) NTAQ1 (ENSBIXG00005027306) Bovinae ANCESTRAL SPECIES 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ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00940000157800 ENSGT00520000062027 ENSGT00930000151032.B ENSGT00940000155335 ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a ENSGT00390000014620.k Dolphin MODERN SPECIES 2122 EXOC7 (ENSTTRG00000015914) ZACN (ENSTTRG00000015913) GALR2 (ENSTTRG00000015909) SRP68 (ENSTTRG00000015907) ENSTTRG00000015903 CDK3 (ENSTTRG00000015901) TEN1 (ENSTTRG00000015899) ACOX1 (ENSTTRG00000015897) FBF1 (ENSTTRG00000015896) MRPL38 (ENSTTRG00000015895) TRIM65 (ENSTTRG00000015894) TRIM47 (ENSTTRG00000015893) WBP2 (ENSTTRG00000015892) UNC13D (ENSTTRG00000015891) UNK (ENSTTRG00000015890) ENSTTRG00000015889 #22 GALK1 (ENSTTRG00000015888) ITGB4 (ENSTTRG00000015887) SAP30BP (ENSTTRG00000015886) RECQL5 (ENSTTRG00000015879) ENSTTRG00000015877 ENSTTRG00000015865 LLGL2 (ENSTTRG00000015839) TSEN54 (ENSTTRG00000015828) CASKIN2 (ENSTTRG00000015807) TMEM94 (ENSTTRG00000015787) Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000002970 ENSGT00390000013448.a.a ENSGT00570000079239 ENSGT00950000182834.B ENSGT00940000153634.b ENSGT00950000182834.A.a.b.c ENSGT00390000000417.a.a.b.a.b ENSGT00940000157376.tb.a ENSGT00390000018505.b ENSGT00390000013102.e.a.c.b ENSGT00390000002210.d ENSGT00940000159576 ENSGT00390000010056 ENSGT00950000183044.a.a.a.c ENSGT00530000063402.b ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT00530000063651.a ENSGT00940000162190 ENSGT00390000003188 ENSGT00940000156058 ENSGT00390000008003 ENSGT00940000156764.a ENSGT00940000157923 ENSGT00940000156810 ENSGT01030000234517.H.b ENSGT00390000018900 ENSGT00940000163104 ENSGT00390000004799 ENSGT00390000005861 ENSGT00950000183142.a.b.a.b ENSGT01010000223738 Vaquita DUPLICATION Vaquita MODERN SPECIES DEGS1 (ENSPSNG00000000518) NVL (ENSPSNG00000000479) CNIH4 (ENSPSNG00000000427) WDR26 (ENSPSNG00000000396) CNIH3 (ENSPSNG00000000369) LBR (ENSPSNG00000000326) ENSPSNG00000000246 ENSPSNG00000000145 ENSPSNG00000000117 EPHX1 (ENSPSNG00000000088) TMEM63A (ENSPSNG00000000052) ENSPSNG00000003871 PYCR2 (ENSPSNG00000003860) ENSPSNG00000003838 SDE2 (ENSPSNG00000003818) H3-3A (ENSPSNG00000003793) #22 ACBD3 (ENSPSNG00000003774) MIXL1 (ENSPSNG00000003754) LIN9 (ENSPSNG00000003691) PARP1 (ENSPSNG00000003624) STUM (ENSPSNG00000003602) ITPKB (ENSPSNG00000003506) PSEN2 (ENSPSNG00000003404) COQ8A (ENSPSNG00000003309) ENSPSNG00000003290 CDC42BPA (ENSPSNG00000003179) AHCTF1 (ENSPSNG00000003012) ENSPSNG00000002969 SCCPDH (ENSPSNG00000002932) CNST (ENSPSNG00000002886) TFB2M (ENSPSNG00000002861) Vaquita MODERN SPECIES 12 FOXJ1 (ENSPSNG00000013938) EXOC7 (ENSPSNG00000014059) GALR2 (ENSPSNG00000014730) SRP68 (ENSPSNG00000014800) ENSPSNG00000014979 CDK3 (ENSPSNG00000015253) TEN1 (ENSPSNG00000015294) ACOX1 (ENSPSNG00000015365) FBF1 (ENSPSNG00000015481) MRPL38 (ENSPSNG00000015594) TRIM65 (ENSPSNG00000015646) TRIM47 (ENSPSNG00000015694) WBP2 (ENSPSNG00000015790) UNC13D (ENSPSNG00000015977) UNK (ENSPSNG00000016123) ENSPSNG00000016178 #22 GALK1 (ENSPSNG00000016224) ITGB4 (ENSPSNG00000016316) SAP30BP (ENSPSNG00000017385) ENSPSNG00000017480 RECQL5 (ENSPSNG00000017584) SMIM5 (ENSPSNG00000017821) ENSPSNG00000017920 LLGL2 (ENSPSNG00000018735) TSEN54 (ENSPSNG00000019026) CASKIN2 (ENSPSNG00000019079) TMEM94 (ENSPSNG00000019220) GRB2 (ENSPSNG00000019721) ENSPSNG00000019796 ENSPSNG00000019911 GGA3 (ENSPSNG00000019955) Monodontidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000002970 ENSGT00390000013448.a.a ENSGT00570000079239 ENSGT00950000182834.B ENSGT00940000153634.b ENSGT00950000182834.A.a.b.c ENSGT00390000000417.a.a.b.a.b ENSGT00940000157376.tb.a ENSGT00390000018505.b ENSGT00390000013102.e.a.c.b ENSGT00390000002210.d ENSGT00940000159576 ENSGT00390000010056 ENSGT00950000183044.a.a.a.c ENSGT00530000063402.b ENSGT01100000263504.a.a.yb #22 ENSGT00530000063651.a ENSGT00940000162190 ENSGT00390000003188 ENSGT00940000156058 ENSGT00390000008003 ENSGT00940000156764.a ENSGT00940000157923 ENSGT00940000156810 ENSGT01030000234517.H.b ENSGT00530000063929.a.a.e.a ENSGT00390000014577.a.b ENSGT00390000018900 ENSGT00940000163104 ENSGT00390000004799 ENSGT00390000005861 Narwhal MODERN SPECIES 295 SNRPD3 (ENSMMNG00015004825) LRRC75B (ENSMMNG00015004822) ENSMMNG00015004820 GGT5 (ENSMMNG00015004809) SUSD2 (ENSMMNG00015004805) CABIN1 (ENSMMNG00015004770) ENSMMNG00015004721 ENSMMNG00015004713 GSTT4 (ENSMMNG00015004703) ENSMMNG00015004695 MIF (ENSMMNG00015004692) SLC2A11 (ENSMMNG00015004683) DERL3 (ENSMMNG00015004675) SMARCB1 (ENSMMNG00015004655) MMP11 (ENSMMNG00015004644) ENSMMNG00015004637 #22 CHCHD10 (ENSMMNG00015004630) C22orf15 (ENSMMNG00015004620) VPREB3 (ENSMMNG00015004325) ZNF70 (ENSMMNG00015004317) ENSMMNG00015004309 VPREB1 (ENSMMNG00015004302) TOP3B (ENSMMNG00015004277) PPM1F (ENSMMNG00015004261) MAPK1 (ENSMMNG00015004241) ENSMMNG00015004224 PPIL2 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SPECIES 9 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00730000110939.b ENSGT00940000159360 ENSGT01100000263504.a.a #22 ENSGT00950000183187.B ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870.a ENSGT00940000157800 ENSGT00520000062027 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a ENSGT00390000014620 ENSGT00940000157333 Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000003595 ENSGT00920000149199 ENSGT01090000260051.a ENSGT00390000011856 ENSGT00940000153578.A ENSGT00940000153335.a.a ENSGT00390000017589 ENSGT00940000157287 ENSGT00720000108861 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000161851 ENSGT00940000154334.l ENSGT00530000063718.a.a 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ENSVURG00010008296 ENSVURG00010008267 koala DUPLICATION koala MODERN SPECIES 305 BVES (ENSPCIG00000019470) POPDC3 (ENSPCIG00000019476) ENSPCIG00000019477 #22 PREP (ENSPCIG00000019479) PRDM1 (ENSPCIG00000015185) ATG5 (ENSPCIG00000015179) QRSL1 (ENSPCIG00000027397) CD24 (ENSPCIG00000000403) ENSPCIG00000032453 koala MODERN SPECIES 97 EXOC7 (ENSPCIG00000002974) ZACN (ENSPCIG00000003053) GALR2 (ENSPCIG00000003080) SRP68 (ENSPCIG00000003210) ENSPCIG00000020255 CDK3 (ENSPCIG00000020260) TEN1 (ENSPCIG00000020265) ACOX1 (ENSPCIG00000020266) FBF1 (ENSPCIG00000020271) MRPL38 (ENSPCIG00000020275) TRIM65 (ENSPCIG00000020276) TRIM47 (ENSPCIG00000020279) WBP2 (ENSPCIG00000020281) UNC13D (ENSPCIG00000020287) UNK (ENSPCIG00000020300) H3-3B (ENSPCIG00000020305) #22 GALK1 (ENSPCIG00000020372) ITGB4 (ENSPCIG00000020375) ENSPCIG00000020395 RECQL5 (ENSPCIG00000020398) SMIM5 (ENSPCIG00000020404) ENSPCIG00000020414 LLGL2 (ENSPCIG00000023942) CASKIN2 (ENSPCIG00000020459) TMEM94 (ENSPCIG00000020473) GRB2 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ENSGT01100000263555.b ENSGT00390000007870 ENSGT00940000157800 ENSGT00520000062027 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000154272.B ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 Common wall lizard MODERN SPECIES 16 PRKD2 (ENSPMRG00000008708) STRN4 (ENSPMRG00000008722) FKRP (ENSPMRG00000008731) SLC1A5 (ENSPMRG00000008739) AP2S1 (ENSPMRG00000008748) ARHGAP35 (ENSPMRG00000008755) ENSPMRG00000008759 TMEM160 (ENSPMRG00000008765) ENSPMRG00000008769 ENSPMRG00000008772 EHD2 (ENSPMRG00000008778) NOP53 (ENSPMRG00000008785) #20 ENSPMRG00000008791 #19 ENSPMRG00000008794 SELENOW (ENSPMRG00000008798) ENSPMRG00000008802 #22 CRX (ENSPMRG00000008809) ENSPMRG00000008813 #15 DMAC2 (ENSPMRG00000008823) #18 B3GNT8 (ENSPMRG00000008827) ENSPMRG00000008833 BCKDHA (ENSPMRG00000008839) EXOSC5 (ENSPMRG00000008845) TMEM91 (ENSPMRG00000008852) B9D2 (ENSPMRG00000008855) TGFB1 (ENSPMRG00000008860) CCDC97 (ENSPMRG00000008866) HNRNPUL1 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and white tegu MODERN SPECIES 9 TRAPPC12 (ENSSMRG00000006552) ADI1 (ENSSMRG00000006539) RNASEH1 (ENSSMRG00000006529) RPS7 (ENSSMRG00000006525) COLEC11 (ENSSMRG00000006522) ALLC (ENSSMRG00000006519) DCDC2C (ENSSMRG00000006515) SOX11 (ENSSMRG00000006504) ENSSMRG00000006493 ENSSMRG00000006489 ENSSMRG00000006484 ENSSMRG00000006470 CMPK2 (ENSSMRG00000006467) RSAD2 (ENSSMRG00000006397) RNF144A (ENSSMRG00000006394) ENSSMRG00000006368 #22 ID2 (ENSSMRG00000006348) KIDINS220 (ENSSMRG00000006306) MBOAT2 (ENSSMRG00000006296) ASAP2 (ENSSMRG00000006275) ITGB1BP1 (ENSSMRG00000006271) CPSF3 (ENSSMRG00000006269) IAH1 (ENSSMRG00000006268) ADAM17 (ENSSMRG00000006231) YWHAQ (ENSSMRG00000006227) TAF1B (ENSSMRG00000006214) ENSSMRG00000006208 ENSSMRG00000006187 KLF11 (ENSSMRG00000006180) RRM2 (ENSSMRG00000006152) HPCAL1 (ENSSMRG00000006133) Argentine black and white tegu MODERN SPECIES 1 EXOC7 (ENSSMRG00000023167) GALR2 (ENSSMRG00000023168) SRP68 (ENSSMRG00000023169) ENSSMRG00000023170 CDK3 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GALR2 (ENSPSIG00000014220) SRP68 (ENSPSIG00000013792) ENSPSIG00000013086 CDK3 (ENSPSIG00000012893) TEN1 (ENSPSIG00000012802) ACOX1 (ENSPSIG00000012513) FBF1 (ENSPSIG00000012425) MRPL38 (ENSPSIG00000010910) ENSPSIG00000010892 ENSPSIG00000010880 ENSPSIG00000010753 WBP2 (ENSPSIG00000010355) UNC13D (ENSPSIG00000010116) UNK (ENSPSIG00000009640) H3-3B (ENSPSIG00000009638) #22 ENSPSIG00000009542 GALK1 (ENSPSIG00000008689) ITGB4 (ENSPSIG00000005403) SAP30BP (ENSPSIG00000005165) ENSPSIG00000005110 ENSPSIG00000005098 ENSPSIG00000004729 ENSPSIG00000004008 ENSPSIG00000000729 LLGL2 (ENSPSIG00000012845) TSEN54 (ENSPSIG00000012807) ENSPSIG00000000715 CASKIN2 (ENSPSIG00000011273) TMEM94 (ENSPSIG00000009656) GRB2 (ENSPSIG00000009206) Chinese turtle MODERN SPECIES 951 ENSPSIG00000018181 #19 ENSPSIG00000018187 SELENOW (ENSPSIG00000018188) ENSPSIG00000018192 #22 ENSPSIG00000018193 Archosauria ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000013448.a.a ENSGT00570000079239 ENSGT00940000170165 ENSGT00950000182834.B 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