Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT01050000244868.a.a.b.b.b.a #9 ENSGT01050000244868.a.a.b.b.b.b #10 ENSGT01050000244868.a.a.b.b.a.b #11 ENSGT01050000244868.a.a.b.a.b #12 ENSGT00940000153116.D ##14 ENSGT00940000153116.C.a #14 ENSGT00390000016002 #15 ENSGT00390000016543 ENSGT00390000002738.a #16 ENSGT00940000162046 ENSGT00390000008519 #17 ENSGT00940000156621 #18 ENSGT00730000111276 #19 ENSGT00440000034309 #20 ENSGT01050000244868.b.b #21 ENSGT01100000263580 #22 ENSGT01050000244868.a.a.b.a.a ##9 ENSGT00390000000543 #23 ENSGT00940000161243 #24 ENSGT00940000158560 #25 ENSGT00940000161618 #26 ENSGT00440000038604 #27 ENSGT01100000263542.B.b #28 ENSGT00390000008072 #29 ENSGT00940000153464.A.a #30 ENSGT00940000159838 #31 ENSGT00940000155422 #32 ENSGT00940000158016.d #33 ENSGT00940000162780 #35 ENSGT00390000008939 #36 ENSGT00390000016127 #37 Marmotini ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT01050000244868.a.a.b.b.b.a #9 ENSGT01050000244868.a.a.b.b.b.b #10 ENSGT01050000244868.a.a.b.b.a.b #11 ENSGT01050000244868.a.a.b.a.b #12 ENSGT00940000153116.D ##14 ENSGT00940000153116.C.a #14 ENSGT00390000016002 #15 ENSGT00390000016543 ENSGT00390000002738.a #16 ENSGT00940000162046 ENSGT00390000008519 #17 ENSGT00940000156621 #18 ENSGT00730000111276 #19 ENSGT00440000034309 #20 ENSGT01050000244868.b.b #21 ENSGT01100000263580 #22 ENSGT01050000244868.a.a.b.a.a ##9 ENSGT00390000000543 #23 ENSGT00940000161243 #24 ENSGT00940000158560 #25 ENSGT00940000161618 #26 ENSGT00440000038604 #27 ENSGT01100000263542.B.b #28 ENSGT00390000008072 #29 ENSGT00940000153464.A.a #30 ENSGT00940000159838 #31 ENSGT00940000155422 #32 ENSGT00940000158016.d #33 ENSGT00940000162780 #35 ENSGT00390000008939 #36 ENSGT00390000016127 #37 Alpin marmot MODERN SPECIES 106 AGPAT2 (ENSMMMG00000009810) #7 DIPK1B (ENSMMMG00000009805) #8 LCN10 (ENSMMMG00000009747) #9 LCN6 (ENSMMMG00000009705) #10 LCN8 (ENSMMMG00000009685) #11 LCN15 (ENSMMMG00000009670) #12 ENSMMMG00000009663 #13 ENSMMMG00000009637 #14 RABL6 (ENSMMMG00000009622) #15 PHPT1 (ENSMMMG00000009614) #16 EDF1 (ENSMMMG00000009463) #17 TRAF2 (ENSMMMG00000009429) #18 FBXW5 (ENSMMMG00000009406) #19 C8G (ENSMMMG00000009391) #20 LCN12 (ENSMMMG00000009372) #21 PTGDS (ENSMMMG00000009339) #22 PAXX (ENSMMMG00000009327) #23 CLIC3 (ENSMMMG00000009308) #24 ENSMMMG00000009264 #25 FUT7 (ENSMMMG00000009252) #26 NPDC1 (ENSMMMG00000008941) #27 ENTPD2 (ENSMMMG00000008921) #28 SAPCD2 (ENSMMMG00000008899) #29 UAP1L1 (ENSMMMG00000008871) #30 DPP7 (ENSMMMG00000008858) #31 MAN1B1 (ENSMMMG00000008828) #32 ENSMMMG00000008815 #33 ENSMMMG00000008804 #34 LRRC26 (ENSMMMG00000008800) #35 TMEM210 (ENSMMMG00000008792) #36 ANAPC2 (ENSMMMG00000008771) #37 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT01050000244868.a.a.b.b.b.a #9 ENSGT01050000244868.a.a.b.b.b.b #10 ENSGT01050000244868.a.a.b.b.a.b #11 ENSGT01050000244868.a.a.b.a.b #12 ENSGT00940000153116.D ##14 ENSGT00940000153116.C.a #14 ENSGT00390000016002 #15 ENSGT00390000016543 ENSGT00390000002738.a #16 ENSGT00940000162046 ENSGT00390000008519 #17 ENSGT00940000156621 #18 ENSGT00730000111276 #19 ENSGT00440000034309 #20 ENSGT01050000244868.b.b #21 ENSGT01100000263580 #22 ENSGT01050000244868.a.a.b.a.a ##9 ENSGT00390000000543 #23 ENSGT00940000161243 #24 ENSGT00940000158560 #25 ENSGT00940000161618 #26 ENSGT00440000038604 #27 ENSGT01100000263542.B.b #28 ENSGT00390000008072 #29 ENSGT00940000153464.A.a #30 ENSGT00940000159838 #31 ENSGT00940000155422 #32 ENSGT00940000158016.d #33 ENSGT00940000162780 #35 ENSGT00390000008939 #36 ENSGT00390000016127 #37 Squirrel MODERN SPECIES 269 LCN10 (ENSSTOG00000028192) #9 LCN6 (ENSSTOG00000021330) #10 LCN8 (ENSSTOG00000009404) #11 LCN15 (ENSSTOG00000024610) #12 TMEM141 (ENSSTOG00000029115) ##14 ENSSTOG00000022489 #14 RABL6 (ENSSTOG00000021251) #15 AJM1 (ENSSTOG00000026589) PHPT1 (ENSSTOG00000019599) #16 MAMDC4 (ENSSTOG00000015455) EDF1 (ENSSTOG00000025154) #17 TRAF2 (ENSSTOG00000012096) #18 FBXW5 (ENSSTOG00000021979) #19 C8G (ENSSTOG00000014108) #20 LCN12 (ENSSTOG00000024098) #21 PTGDS (ENSSTOG00000019805) #22 ENSSTOG00000019684 ##9 PAXX (ENSSTOG00000025601) #23 CLIC3 (ENSSTOG00000023657) #24 ABCA2 (ENSSTOG00000013825) #25 FUT7 (ENSSTOG00000013862) #26 NPDC1 (ENSSTOG00000019775) #27 ENTPD2 (ENSSTOG00000010778) #28 SAPCD2 (ENSSTOG00000010785) #29 UAP1L1 (ENSSTOG00000010790) #30 DPP7 (ENSSTOG00000008730) #31 MAN1B1 (ENSSTOG00000021513) #32 GRIN1 (ENSSTOG00000026607) #33 LRRC26 (ENSSTOG00000027229) #35 TMEM210 (ENSSTOG00000003550) #36 ANAPC2 (ENSSTOG00000004113) #37 Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 156 LCN10 (ENSUPAG00010006573) #9 LCN6 (ENSUPAG00010006550) #10 LCN8 (ENSUPAG00010006538) #11 LCN15 (ENSUPAG00010006536) #12 TMEM141 (ENSUPAG00010006528) ##14 ENSUPAG00010006516 #14 RABL6 (ENSUPAG00010006504) #15 AJM1 (ENSUPAG00010006500) PHPT1 (ENSUPAG00010006497) #16 MAMDC4 (ENSUPAG00010006442) EDF1 (ENSUPAG00010006437) #17 TRAF2 (ENSUPAG00010006407) #18 FBXW5 (ENSUPAG00010006399) #19 C8G (ENSUPAG00010006391) #20 LCN12 (ENSUPAG00010006378) #21 PTGDS (ENSUPAG00010006372) #22 ENSUPAG00010006364 #23 CLIC3 (ENSUPAG00010006357) #24 ENSUPAG00010006296 #25 FUT7 (ENSUPAG00010006288) #26 NPDC1 (ENSUPAG00010006257) #27 ENTPD2 (ENSUPAG00010006251) #28 SAPCD2 (ENSUPAG00010006246) #29 UAP1L1 (ENSUPAG00010006239) #30 DPP7 (ENSUPAG00010006226) #31 MAN1B1 (ENSUPAG00010006185) #32 ENSUPAG00010006176 #33 ENSUPAG00010006171 #33 LRRC26 (ENSUPAG00010006170) #35 TMEM210 (ENSUPAG00010006162) #36 ANAPC2 (ENSUPAG00010006139) #37 Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 6 DIPK1B (ENSSVLG00005025614) #8 LCN10 (ENSSVLG00005025638) #9 LCN6 (ENSSVLG00005025649) #10 LCN8 (ENSSVLG00005025658) #11 LCN15 (ENSSVLG00005025667) #12 TMEM141 (ENSSVLG00005025675) ##14 ENSSVLG00005016575 #14 RABL6 (ENSSVLG00005016617) #15 AJM1 (ENSSVLG00005016763) PHPT1 (ENSSVLG00005016779) #16 ENSSVLG00005017849 #17 TRAF2 (ENSSVLG00005017919) #18 FBXW5 (ENSSVLG00005017960) #19 C8G (ENSSVLG00005017987) #20 LCN12 (ENSSVLG00005018084) #21 PTGDS (ENSSVLG00005018156) #22 PAXX (ENSSVLG00005018285) #23 CLIC3 (ENSSVLG00005018309) #24 ENSSVLG00005018392 #25 FUT7 (ENSSVLG00005018791) #26 NPDC1 (ENSSVLG00005018818) #27 ENTPD2 (ENSSVLG00005018860) #28 SAPCD2 (ENSSVLG00005018916) #29 UAP1L1 (ENSSVLG00005019001) #30 DPP7 (ENSSVLG00005019137) #31 MAN1B1 (ENSSVLG00005019401) #32 ENSSVLG00005019495 #33 ENSSVLG00005019547 #33 LRRC26 (ENSSVLG00005019594) #35 TMEM210 (ENSSVLG00005019652) #36 ANAPC2 (ENSSVLG00005019762) #37