Vertebrata ANCESTRAL SPECIES ENSGT01050000244866.B #22 Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES ENSGT01050000244866.B #22 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 585 ENSGT00940000162507.B ENSGT01050000244866.B #22 ENSGT00950000183094.b.a #23 ENSGT00390000009748 #24 ENSGT00940000159381 #25 ENSGT00390000006931 #26 Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 526 ENSGT00940000162507.B ENSGT01050000244866.B #22 ENSGT00950000183094.b.a #23 ENSGT00390000009748 #24 ENSGT00940000159381 #25 ENSGT00390000006931 #26 Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 56 ENSGT00940000162507.B ENSGT01050000244866.B #22 ENSGT00950000183094.b.a #23 ENSGT00390000009748 #24 ENSGT00940000159381 #25 ENSGT00390000006931 #26 ENSGT00390000014105 #28 ENSGT00940000158250 #30 ENSGT00390000003422 #31 ENSGT00950000183154.b.b #32 ENSGT00390000002635 #33 ENSGT01030000234633.B.b ENSGT00940000160046 ENSGT00940000155458 ENSGT00940000159849 ENSGT00940000155308 ENSGT00390000007796 Amniota ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000158738 ENSGT00940000157198 ENSGT00940000160566 ENSGT00390000015634 ENSGT00940000153739.a.a ENSGT00520000055578.a.a.c ENSGT00940000157729 ENSGT00390000012419 ENSGT00940000156928 ENSGT00490000043329.a.a.a ENSGT00940000163617 ENSGT01100000263546.e.a.a.b ENSGT00940000160361 ENSGT01100000263545.a.a #18 ENSGT00940000161174 #21 ENSGT01050000244866.B #22 ENSGT00950000183094.b.a #23 ENSGT00390000009748 #24 ENSGT00940000159381 #25 ENSGT00390000006931 #26 ENSGT00390000014105 #28 ENSGT00940000158250 #30 ENSGT00390000003422 #31 ENSGT00950000183154.b.b #32 ENSGT00390000002635 #33 ENSGT01030000234633.B.b ENSGT00940000160046 ENSGT00950000182893.a.a.b ENSGT00940000158901 ENSGT00940000155006 ENSGT00940000160486 Mammalia ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000015634 ENSGT00940000153739.a.a ENSGT00520000055578.a.a.c ENSGT00940000157729 ENSGT00390000012419 ENSGT00940000156928 ENSGT00490000043329.a.a.a ENSGT00940000163617 ENSGT01100000263546.e.a.a.b ENSGT00940000155225 ENSGT01100000263546.e.a.b ENSGT00940000160361 ENSGT01100000263545.a.a.b #18 ENSGT01100000263545.a.a.a #19 ENSGT00940000161174 #21 ENSGT01050000244866.B #22 ENSGT00950000183094.b.a #23 ENSGT00390000009748 #24 ENSGT00940000159381 #25 ENSGT00390000006931 #26 ENSGT00390000014105 #28 ENSGT00940000158250 #30 ENSGT00390000003422 #31 ENSGT00950000183154.b.b #32 ENSGT00390000002635 #33 Theria ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00390000012419 ENSGT00940000156928 ENSGT00490000043329.a.a.a ENSGT00940000163617 ENSGT00940000155225 ENSGT01100000263546.e.a.a.b ENSGT01100000263546.e.b ENSGT01100000263546.e.a.b ENSGT01100000263546.e.a.a.a.b ENSGT01010000222653 ENSGT01100000263546.d.b.b ENSGT00940000160361 ENSGT01100000263545.a.a.b #18 ENSGT01100000263545.a.a.a #19 ENSGT00940000161174 #21 ENSGT01050000244866.B #22 ENSGT00950000183094.b.a #23 ENSGT00390000009748 #24 ENSGT00940000159381 #25 ENSGT00390000006931 #26 ENSGT00390000014105 #28 ENSGT00940000158250 #30 ENSGT00390000003422 #31 ENSGT00950000183154.b.b #32 ENSGT00390000002635 #33 ENSGT00940000160596 #34 ENSGT00950000183202.a.a #36 ENSGT00390000013867 #37 ENSGT00940000161648 ENSGT00950000182982.B ENSGT00390000011347 Eutheria ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00950000182893.a.a.b ENSGT00940000158901 ENSGT00940000155006 ENSGT00940000160486 ENSGT00940000156142 ENSGT00940000158405 ENSGT00940000154090.b ENSGT00720000108866 #12 ENSGT00490000043380 #13 ENSGT00940000162174 #14 ENSGT00390000018723 #16 ENSGT00700000104550.a #17 ENSGT01100000263545.a.a.b #18 ENSGT01100000263545.a.a.a #19 ENSGT00940000161174 #21 ENSGT01050000244866.B #22 ENSGT00950000183094.b.a #23 ENSGT00390000009748 #24 ENSGT00940000159381 #25 ENSGT00390000006931 #26 ENSGT00390000007412 #27 ENSGT00390000014105 #28 ENSGT00940000158250 #30 ENSGT00390000003422 #31 ENSGT00950000183154.b.b #32 ENSGT00390000002635 #33 ENSGT00940000160596 #34 ENSGT00950000183202.a.a #36 ENSGT00390000013867 #37 ENSGT00940000161648 ENSGT00950000182982.B Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000158901 ENSGT00940000155006 ENSGT00940000160486 ENSGT00940000156142 ENSGT00940000158405 ENSGT00940000154090.b ENSGT00720000108866 #12 ENSGT00490000043380 #13 ENSGT00940000162174 #14 ENSGT00390000018723 #16 ENSGT00700000104550.a #17 ENSGT00940000175704 ENSGT01100000263545.a.a.b #18 ENSGT01100000263545.a.a.a #19 ENSGT00940000161174 #21 ENSGT01050000244866.B #22 ENSGT00950000183094.b.a #23 ENSGT00390000009748 #24 ENSGT00940000159381 #25 ENSGT00390000006931 #26 ENSGT00900000143635 ENSGT00390000007412 #27 ENSGT00390000014105 #28 ENSGT00940000158250 #30 ENSGT00390000003422 #31 ENSGT00950000183154.b.b #32 ENSGT00390000002635 #33 ENSGT00940000160596 #34 ENSGT00950000183202.a.a #36 ENSGT00390000013867 #37 ENSGT00940000161648 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000158901 ENSGT00940000155006 ENSGT00940000160486 ENSGT00940000156142 ENSGT00940000158405 ENSGT00940000154090.b ENSGT00720000108866 #12 ENSGT00490000043380 #13 ENSGT00940000162174 #14 ENSGT00390000018723 #16 ENSGT00700000104550.a #17 ENSGT00940000175704 ENSGT01100000263545.a.a.b #18 ENSGT01100000263545.a.a.a #19 ENSGT00940000161174 #21 ENSGT01050000244866.B #22 ENSGT00950000183094.b.a #23 ENSGT00390000009748 #24 ENSGT00940000159381 #25 ENSGT00390000006931 #26 ENSGT00900000143635 ENSGT00390000007412 #27 ENSGT00390000014105 #28 ENSGT00940000158250 #30 ENSGT00390000003422 #31 ENSGT00950000183154.b.b #32 ENSGT00390000002635 #33 ENSGT00940000160596 #34 ENSGT00950000183202.a.a #36 ENSGT00390000013867 #37 ENSGT00940000161648 Primates ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00950000182893.a.a.b ENSGT00940000158901 ENSGT00940000155006 ENSGT00940000160486 ENSGT00940000156142 ENSGT00940000158405 ENSGT00940000154090.b ENSGT00720000108866 #12 ENSGT00490000043380 #13 ENSGT00940000162174 #14 ENSGT00390000018723 #16 ENSGT00700000104550.a #17 ENSGT01100000263545.a.a.b #18 ENSGT01100000263545.a.a.a #19 ENSGT00940000161174 #21 ENSGT01050000244866.B #22 ENSGT00950000183094.b.a #23 ENSGT00390000009748 #24 ENSGT00940000159381 #25 ENSGT00390000006931 #26 ENSGT00900000143635 ENSGT00390000007412 #27 ENSGT00390000014105 #28 ENSGT00940000158250 #30 ENSGT00390000003422 #31 ENSGT00950000183154.b.b #32 ENSGT00390000002635 #33 ENSGT00940000160596 #34 ENSGT00950000183202.a.a #36 ENSGT00390000013867 #37 ENSGT00940000161648 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00950000182893.a.a.b ENSGT00940000158901 ENSGT00940000155006 ENSGT00940000160486 ENSGT00940000156142 ENSGT00940000158405 ENSGT00940000154090.b ENSGT00720000108866 #12 ENSGT00490000043380 #13 ENSGT00940000162174 #14 ENSGT00390000018723 #16 ENSGT00700000104550.a #17 ENSGT01100000263545.a.a.b #18 ENSGT01100000263545.a.a.a #19 ENSGT00940000161174 #21 ENSGT01050000244866.B #22 ENSGT00950000183094.b.a #23 ENSGT00390000009748 #24 ENSGT00940000159381 #25 ENSGT00390000006931 #26 ENSGT00900000143635 ENSGT00390000007412 #27 ENSGT00390000014105 #28 ENSGT00940000158250 #30 ENSGT00390000003422 #31 ENSGT00950000183154.b.b #32 ENSGT00390000002635 #33 ENSGT00940000160596 #34 ENSGT00950000183202.a.a #36 ENSGT00390000013867 #37 ENSGT00940000161648 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000158901 ENSGT00940000155006 ENSGT00940000160486 ENSGT00940000156142 ENSGT00940000158405 ENSGT00940000154090.b ENSGT00720000108866 #12 ENSGT00490000043380 #13 ENSGT00940000162174 #14 ENSGT00390000018723 #16 ENSGT00700000104550.a #17 ENSGT00910000147305 ENSGT01100000263545.a.a.b #18 ENSGT01100000263545.a.a.a #19 ENSGT00940000161174 #21 ENSGT01050000244866.B #22 ENSGT00950000183094.b.a #23 ENSGT00390000009748 #24 ENSGT00940000159381 #25 ENSGT00390000006931.q #26 ENSGT00900000141068.n ENSGT00900000143635 ENSGT00390000007412 #27 ENSGT00390000014105 #28 ENSGT00940000158250 #30 ENSGT00390000003422 #31 ENSGT00950000183154.b.b #32 ENSGT00390000002635 #33 ENSGT00940000160596 #34 ENSGT00950000183202.a.a #36 ENSGT00390000013867 #37 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000160486 ENSGT00940000156142 ENSGT00940000158405 ENSGT00940000154090.b ENSGT00720000108866 #12 ENSGT00490000043380 #13 ENSGT00390000007838.o.b #15 ENSGT00940000162174 #14 ENSGT00390000018723 #16 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ENSGT00950000183094.b.a #23 ENSGT00390000009748 #24 ENSGT00940000159381 #25 ENSGT00390000006931.q #26 ENSGT00900000143635 ENSGT00390000007412 #27 ENSGT00390000014105 #28 ENSGT00940000155193.a.a.f.a.b ENSGT00940000158250 #30 ENSGT00390000003422.k.b #31 ENSGT00950000183154.b.b #32 ENSGT00390000002635 #33 ENSGT00940000160596 #34 ENSGT00950000183202.a.a #36 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000155006 ENSGT00940000160486 ENSGT00940000156142 ENSGT00940000158405 ENSGT00940000154090.b ENSGT00720000108866 #12 ENSGT00490000043380 #13 ENSGT00940000162174 #14 ENSGT00390000018723 #16 ENSGT00700000104550.a #17 ENSGT00910000147305 ENSGT01100000263545.a.a.b #18 ENSGT01100000263545.a.a.a #19 ENSGT00910000146863 #20 ENSGT00940000161174 #21 ENSGT01050000244866.B #22 ENSGT00910000147755 ENSGT00950000183094.b.a #23 ENSGT00390000009748 #24 ENSGT00940000159381 #25 ENSGT00390000006931.q #26 ENSGT00900000143635 ENSGT00390000007412 #27 ENSGT00390000014105 #28 ENSGT00940000155193.a.a.f.a.b 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ENSGT00950000183202.a.a #36 Bonobo MODERN SPECIES 11 MAFB (ENSPPAG00000021479) DHX35 (ENSPPAG00000038372) FAM83D (ENSPPAG00000035388) PPP1R16B (ENSPPAG00000027501) ACTR5 (ENSPPAG00000006443) #12 SLC32A1 (ENSPPAG00000038157) #13 ENSPPAG00000036350 #15 ARHGAP40 (ENSPPAG00000035531) #14 ADIG (ENSPPAG00000034057) #16 RALGAPB (ENSPPAG00000034748) #17 ENSPPAG00000038154 LBP (ENSPPAG00000035862) #18 BPI (ENSPPAG00000032802) #19 ENSPPAG00000021428 #20 KIAA1755 (ENSPPAG00000035547) #21 TGM2 (ENSPPAG00000028674) #22 RPRD1B (ENSPPAG00000031323) #23 TTI1 (ENSPPAG00000029633) #24 VSTM2L (ENSPPAG00000030362) #25 CTNNBL1 (ENSPPAG00000016009) #26 ENSPPAG00000043848 ENSPPAG00000032395 NNAT (ENSPPAG00000041820) #27 BLCAP (ENSPPAG00000016853) #28 ENSPPAG00000029689 SRC (ENSPPAG00000040681) #30 MANBAL (ENSPPAG00000040808) #31 GHRH (ENSPPAG00000035360) #32 RPN2 (ENSPPAG00000039264) #33 MROH8 (ENSPPAG00000036111) #34 ENSPPAG00000032979 ##35 Chimpanzee MODERN SPECIES 11 TOP1 (ENSPTRG00000013498) MAFB 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Capuchin MODERN SPECIES 18 ZHX3 (ENSCCAG00000034611) PLCG1 (ENSCCAG00000023196) TOP1 (ENSCCAG00000029846) MAFB (ENSCCAG00000001296) DHX35 (ENSCCAG00000030551) FAM83D (ENSCCAG00000029858) PPP1R16B (ENSCCAG00000029989) ACTR5 (ENSCCAG00000022502) #12 SLC32A1 (ENSCCAG00000021614) #13 ARHGAP40 (ENSCCAG00000022162) #14 ADIG (ENSCCAG00000037897) #16 ENSCCAG00000028551 #17 LBP (ENSCCAG00000029313) #18 BPI (ENSCCAG00000037281) #19 KIAA1755 (ENSCCAG00000037579) #21 TGM2 (ENSCCAG00000031124) #22 RPRD1B (ENSCCAG00000024668) #23 TTI1 (ENSCCAG00000036522) #24 VSTM2L (ENSCCAG00000024524) #25 CTNNBL1 (ENSCCAG00000021849) #26 ENSCCAG00000035571 NNAT (ENSCCAG00000034940) #27 BLCAP (ENSCCAG00000017425) #28 SRC (ENSCCAG00000022057) #30 MANBAL (ENSCCAG00000035779) #31 GHRH (ENSCCAG00000034445) #32 RPN2 (ENSCCAG00000031778) #33 MROH8 (ENSCCAG00000037283) #34 ENSCCAG00000012154 RBL1 (ENSCCAG00000022786) #36 ENSCCAG00000027441 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 126 PLCG1 (ENSSBOG00000028216) TOP1 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ENSGT01100000263545.a.a.a #19 ENSGT00940000161174 #21 ENSGT01050000244866.B #22 ENSGT00950000183094.b.a #23 ENSGT00390000009748 #24 ENSGT00940000159381 #25 ENSGT00390000006931 #26 ENSGT00390000007412 #27 ENSGT00390000014105 #28 ENSGT00940000158250 #30 ENSGT00390000003422 #31 ENSGT00950000183154.b.b #32 ENSGT00390000002635 #33 ENSGT00940000160596 #34 ENSGT00950000183202.a.a #36 ENSGT00390000013867 #37 ENSGT00940000161648 ENSGT00950000182982.B Kangaroo rat MODERN SPECIES 332 Emilin3 (ENSDORG00000010874) Lpin3 (ENSDORG00000010870) Zhx3 (ENSDORG00000012139) Plcg1 (ENSDORG00000012133) Top1 (ENSDORG00000012118) Mafb (ENSDORG00000016730) Dhx35 (ENSDORG00000005573) Fam83d (ENSDORG00000010647) Ppp1r16b (ENSDORG00000010645) Actr5 (ENSDORG00000009179) #12 Slc32a1 (ENSDORG00000009178) #13 Adig (ENSDORG00000027370) #16 ENSDORG00000023907 #17 Lbp (ENSDORG00000006452) #18 D630003M21Rik (ENSDORG00000002064) #21 Tgm2 (ENSDORG00000010816) #22 Rprd1b (ENSDORG00000010813) #23 Tti1 (ENSDORG00000010808) #24 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Tldc2 (ENSJJAG00000016246) Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00950000182893.a.a.b ENSGT00940000158901 ENSGT00940000155006 ENSGT00940000160486 ENSGT00940000156142 ENSGT00940000158405 ENSGT00940000154090.b ENSGT00720000108866 #12 ENSGT00490000043380 #13 ENSGT00390000018723 #16 ENSGT00700000104550.a #17 ENSGT00940000175704 ENSGT01100000263545.a.a.b #18 ENSGT01100000263545.a.a.a #19 ENSGT00940000161174 #21 ENSGT01050000244866.B #22 ENSGT00950000183094.b.a #23 ENSGT00390000009748 #24 ENSGT00940000159381 #25 ENSGT00390000006931 #26 ENSGT00390000007412 #27 ENSGT00390000014105 #28 ENSGT00940000158250 #30 ENSGT00390000003422 #31 ENSGT00950000183154.b.b #32 ENSGT00390000002635 #33 ENSGT00940000160596 #34 ENSGT00950000183202.a.a #36 ENSGT00390000013867 #37 ENSGT00940000161648 ENSGT00950000182982.B Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00950000182893.a.a.b ENSGT00940000158901 ENSGT00940000155006 ENSGT00940000160486 ENSGT00940000156142 ENSGT00940000158405 ENSGT00940000154090.b ENSGT00720000108866 #12 ENSGT00490000043380 #13 ENSGT00390000018723 #16 ENSGT00700000104550.a #17 ENSGT00940000175704 ENSGT01100000263545.a.a.b #18 ENSGT01100000263545.a.a.a #19 ENSGT00940000161174 #21 ENSGT01050000244866.B #22 ENSGT00950000183094.b.a #23 ENSGT00390000009748 #24 ENSGT00940000159381 #25 ENSGT00390000006931 #26 ENSGT00390000007412 #27 ENSGT00390000014105 #28 ENSGT00940000158250 #30 ENSGT00390000003422 #31 ENSGT00950000183154.b.b #32 ENSGT00390000002635 #33 ENSGT00940000160596 #34 ENSGT00950000183202.a.a #36 ENSGT00390000013867 #37 ENSGT00940000161648 ENSGT00950000182982.B Marmotini ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00950000182893.a.a.b ENSGT00940000158901 ENSGT00940000155006 ENSGT00940000160486 ENSGT00940000156142 ENSGT00940000158405 ENSGT00940000154090.b ENSGT00720000108866 #12 ENSGT00490000043380 #13 ENSGT00390000018723 #16 ENSGT00700000104550.a #17 ENSGT00940000175704 ENSGT01100000263545.a.a.b #18 ENSGT01100000263545.a.a.a #19 ENSGT00940000161174 #21 ENSGT01050000244866.B #22 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#30 ENSGT00390000003422 #31 ENSGT00950000183154.b.b #32 ENSGT00390000002635 #33 ENSGT00940000160596 #34 ENSGT00950000183202.a.a #36 ENSGT00390000013867 #37 ENSGT00940000161648 ENSGT00950000182982.B Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 152 LPIN3 (ENSCLAG00000011160) ZHX3 (ENSCLAG00000010431) PLCG1 (ENSCLAG00000011612) TOP1 (ENSCLAG00000008693) MAFB (ENSCLAG00000013826) DHX35 (ENSCLAG00000006320) FAM83D (ENSCLAG00000008915) PPP1R16B (ENSCLAG00000007143) ACTR5 (ENSCLAG00000008698) #12 SLC32A1 (ENSCLAG00000009070) #13 ADIG (ENSCLAG00000010538) #16 RALGAPB (ENSCLAG00000008957) #17 LBP (ENSCLAG00000012963) #18 BPI (ENSCLAG00000013805) #19 KIAA1755 (ENSCLAG00000015023) #21 TGM2 (ENSCLAG00000007875) #22 RPRD1B (ENSCLAG00000012069) #23 TTI1 (ENSCLAG00000008247) #24 VSTM2L (ENSCLAG00000008531) #25 CTNNBL1 (ENSCLAG00000010146) #26 BLCAP (ENSCLAG00000010029) #28 ENSCLAG00000010875 #27 SRC (ENSCLAG00000012861) #30 Degu MODERN SPECIES 78 ZHX3 (ENSODEG00000014535) PLCG1 (ENSODEG00000015157) 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ENSGT00940000161648 ENSGT00950000182982.B Chacoan peccary MODERN SPECIES 801 LPIN3 (ENSCWAG00000009197) ZHX3 (ENSCWAG00000009444) PLCG1 (ENSCWAG00000009488) TOP1 (ENSCWAG00000009868) MAFB (ENSCWAG00000009982) DHX35 (ENSCWAG00000010048) FAM83D (ENSCWAG00000010706) PPP1R16B (ENSCWAG00000010757) ACTR5 (ENSCWAG00000010910) #12 SLC32A1 (ENSCWAG00000010990) #13 ADIG (ENSCWAG00000011065) #16 RALGAPB (ENSCWAG00000011097) #17 LBP (ENSCWAG00000011247) #18 BPI (ENSCWAG00000011413) #19 KIAA1755 (ENSCWAG00000011844) #21 TGM2 (ENSCWAG00000012085) #22 RPRD1B (ENSCWAG00000012209) #23 TTI1 (ENSCWAG00000012246) #24 VSTM2L (ENSCWAG00000012303) #25 CTNNBL1 (ENSCWAG00000012363) #26 NNAT (ENSCWAG00000012574) #27 SRC (ENSCWAG00000012607) #30 MANBAL (ENSCWAG00000012659) #31 GHRH (ENSCWAG00000012690) #32 RPN2 (ENSCWAG00000012754) #33 RBL1 (ENSCWAG00000012873) #36 SAMHD1 (ENSCWAG00000013253) #37 TLDC2 (ENSCWAG00000013475) SOGA1 (ENSCWAG00000013540) DSN1 (ENSCWAG00000013772) ENSCWAG00000014087 Pig MODERN SPECIES 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#18 ENSGT01100000263545.a.a.a #19 ENSGT00940000161174 #21 ENSGT01050000244866.B #22 ENSGT00950000183094.b.a #23 ENSGT00390000009748 #24 ENSGT00390000006931 #26 ENSGT01050000248443 ENSGT00390000007412 #27 ENSGT00390000014105 #28 ENSGT00940000158250 #30 ENSGT00390000003422 #31 ENSGT00950000183154.b.b #32 ENSGT00390000002635 #33 ENSGT00940000160596 #34 ENSGT00950000183202.a.a #36 ENSGT00390000013867 #37 ENSGT00940000161648 ENSGT00950000182982.B Arabian camel MODERN SPECIES 10 ZHX3 (ENSCDRG00005009932) PLCG1 (ENSCDRG00005009801) TOP1 (ENSCDRG00005009676) MAFB (ENSCDRG00005009652) DHX35 (ENSCDRG00005008403) FAM83D (ENSCDRG00005008292) PPP1R16B (ENSCDRG00005008166) ACTR5 (ENSCDRG00005008072) #12 SLC32A1 (ENSCDRG00005008052) #13 ADIG (ENSCDRG00005008020) #16 RALGAPB (ENSCDRG00005007970) #17 LBP (ENSCDRG00005019398) #18 BPI (ENSCDRG00005019311) #19 ENSCDRG00005019300 KIAA1755 (ENSCDRG00005019278) #21 TGM2 (ENSCDRG00005019249) #22 RPRD1B (ENSCDRG00005019203) #23 TTI1 (ENSCDRG00005019180) #24 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#18 ENSGT01100000263545.a.a.a #19 ENSGT00940000161174 #21 ENSGT01050000244866.B #22 ENSGT00950000183094.b.a #23 ENSGT00390000009748 #24 ENSGT00940000159381 #25 ENSGT00390000006931 #26 ENSGT00900000143635 ENSGT00390000007412 #27 ENSGT00390000014105 #28 ENSGT00940000158250 #30 ENSGT00390000003422 #31 ENSGT00950000183154.b.b #32 ENSGT00390000002635 #33 ENSGT00940000160596 #34 ENSGT00950000183202.a.a #36 ENSGT00390000013867 #37 ENSGT00940000161648 Cetacea ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00950000182893.a.a.b ENSGT00940000158901 ENSGT00940000155006 ENSGT00940000160486 ENSGT00940000156142 ENSGT00940000158405 ENSGT00940000154090.b ENSGT00720000108866 #12 ENSGT00490000043380 #13 ENSGT00940000162174 #14 ENSGT00390000018723 #16 ENSGT00700000104550.a #17 ENSGT01100000263545.a.a.b #18 ENSGT01100000263545.a.a.a #19 ENSGT00940000161174 #21 ENSGT01050000244866.B #22 ENSGT00950000183094.b.a #23 ENSGT00390000009748 #24 ENSGT00940000159381 #25 ENSGT00390000006931 #26 ENSGT00900000143635 ENSGT00390000007412 #27 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Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00950000182893.a.a.b ENSGT00940000158901 ENSGT00940000155006 ENSGT00940000160486 ENSGT00940000156142 ENSGT00940000158405 ENSGT00940000154090.b ENSGT00720000108866 #12 ENSGT00490000043380 #13 ENSGT00940000162174 #14 ENSGT00390000018723 #16 ENSGT00700000104550.a #17 ENSGT01100000263545.a.a.b #18 ENSGT01100000263545.a.a.a #19 ENSGT00940000161174 #21 ENSGT01050000244866.B #22 ENSGT00950000183094.b.a #23 ENSGT00390000009748 #24 ENSGT00940000159381 #25 ENSGT00390000006931 #26 ENSGT00900000143635 ENSGT00390000007412 #27 ENSGT00390000014105 #28 ENSGT00940000158250 #30 ENSGT00390000003422 #31 ENSGT00950000183154.b.b #32 ENSGT00390000002635 #33 ENSGT00950000183202.a.a #36 ENSGT00390000013867 #37 ENSGT00940000161648 ENSGT00950000182982.B Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000160046 ENSGT00950000182893.a.a.b ENSGT00940000158901 ENSGT00940000155006 ENSGT00940000160486 ENSGT00940000156142 ENSGT00940000158405 ENSGT00940000154090.b ENSGT00720000108866 #12 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ENSGT00390000009748 #24 ENSGT00940000159381 #25 ENSGT00390000006931 #26 ENSGT00900000143635 ENSGT00390000007412 #27 ENSGT00390000014105.m #28 ENSGT00940000158250 #30 ENSGT00390000003422 #31 ENSGT00950000183154.b.b #32 ENSGT00390000002635 #33 ENSGT00950000183202.a.a #36 ENSGT00390000013867 #37 ENSGT00940000161648 ENSGT00950000182982.B Beluga whale MODERN SPECIES 36 EMILIN3 (ENSDLEG00000003894) ENSDLEG00000003909 ZHX3 (ENSDLEG00000003925) PLCG1 (ENSDLEG00000003983) TOP1 (ENSDLEG00000004091) MAFB (ENSDLEG00000004111) DHX35 (ENSDLEG00000004147) PPP1R16B (ENSDLEG00000004202) ACTR5 (ENSDLEG00000004209) #12 SLC32A1 (ENSDLEG00000004216) #13 ADIG (ENSDLEG00000004221) #16 RALGAPB (ENSDLEG00000004232) #17 LBP (ENSDLEG00000012928) #18 BPI (ENSDLEG00000012968) #19 KIAA1755 (ENSDLEG00000013053) #21 TGM2 (ENSDLEG00000013090) #22 RPRD1B (ENSDLEG00000013134) #23 TTI1 (ENSDLEG00000013162) #24 VSTM2L (ENSDLEG00000013181) #25 CTNNBL1 (ENSDLEG00000013200) #26 ENSDLEG00000013229 NNAT (ENSDLEG00000013247) 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SAMHD1 (ENSPSNG00000006927) #37 TLDC2 (ENSPSNG00000007105) SOGA1 (ENSPSNG00000007157) DSN1 (ENSPSNG00000007248) Dolphin MODERN SPECIES 2731 LBP (ENSTTRG00000016773) #18 BPI (ENSTTRG00000016769) #19 KIAA1755 (ENSTTRG00000016763) #21 TGM2 (ENSTTRG00000016755) #22 RPRD1B (ENSTTRG00000016751) #23 TTI1 (ENSTTRG00000016747) #24 VSTM2L (ENSTTRG00000016744) #25 CTNNBL1 (ENSTTRG00000016739) #26 Sperm whale MODERN SPECIES 1054 TGM2 (ENSPCTG00005019459) #22 Blue whale MODERN SPECIES 6 LPIN3 (ENSBMSG00010020902) ZHX3 (ENSBMSG00010020946) PLCG1 (ENSBMSG00010020965) TOP1 (ENSBMSG00010021001) MAFB (ENSBMSG00010021010) DHX35 (ENSBMSG00010021036) FAM83D (ENSBMSG00010021077) PPP1R16B (ENSBMSG00010021089) ACTR5 (ENSBMSG00010021120) #12 SLC32A1 (ENSBMSG00010021142) #13 ADIG (ENSBMSG00010021150) #16 RALGAPB (ENSBMSG00010021169) #17 LBP (ENSBMSG00010021233) #18 BPI (ENSBMSG00010021264) #19 KIAA1755 (ENSBMSG00010021331) #21 TGM2 (ENSBMSG00010021356) #22 RPRD1B (ENSBMSG00010021383) #23 TTI1 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ENSGT00950000183154.b.b #32 ENSGT00390000002635 #33 ENSGT00940000160596 #34 ENSGT00950000183202.a.a #36 ENSGT00390000013867 #37 ENSGT00940000161648 ENSGT00950000182982.B Yarkand deer MODERN SPECIES 15 ZHX3 (ENSCHYG00000024334) PLCG1 (ENSCHYG00000024140) ENSCHYG00000024046 ENSCHYG00000023883 MAFB (ENSCHYG00000023859) DHX35 (ENSCHYG00000023557) FAM83D (ENSCHYG00000023508) PPP1R16B (ENSCHYG00000023385) ACTR5 (ENSCHYG00000023266) #12 SLC32A1 (ENSCHYG00000023239) #13 ADIG (ENSCHYG00000023223) #16 RALGAPB (ENSCHYG00000022738) #17 LBP (ENSCHYG00000022522) #18 BPI (ENSCHYG00000022181) #19 KIAA1755 (ENSCHYG00000021882) #21 TGM2 (ENSCHYG00000021780) #22 RPRD1B (ENSCHYG00000021724) #23 TTI1 (ENSCHYG00000021634) #24 VSTM2L (ENSCHYG00000021582) #25 CTNNBL1 (ENSCHYG00000021155) #26 ENSCHYG00000021117 NNAT (ENSCHYG00000021072) #27 SRC (ENSCHYG00000020614) #30 MANBAL (ENSCHYG00000020565) #31 GHRH (ENSCHYG00000020503) #32 RPN2 (ENSCHYG00000020017) #33 MROH8 (ENSCHYG00000019757) #34 RBL1 (ENSCHYG00000019572) #36 SAMHD1 (ENSCHYG00000018383) #37 TLDC2 (ENSCHYG00000018324) SOGA1 (ENSCHYG00000017667) Percora_a ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000160046 ENSGT00950000182893.a.a.b ENSGT00940000158901 ENSGT00940000155006 ENSGT00940000160486 ENSGT00940000156142 ENSGT00940000158405 ENSGT00940000154090.b ENSGT00720000108866 #12 ENSGT00490000043380 #13 ENSGT00390000018723 #16 ENSGT00700000104550.a #17 ENSGT01100000263545.a.a.b #18 ENSGT01100000263545.a.a.a #19 ENSGT00940000161174 #21 ENSGT01050000244866.B #22 ENSGT00950000183094.b.a #23 ENSGT00390000009748 #24 ENSGT00940000159381 #25 ENSGT00390000006931 #26 ENSGT00390000007412 #27 ENSGT00390000014105 #28 ENSGT00940000158250 #30 ENSGT00390000003422 #31 ENSGT00950000183154.b.b #32 ENSGT00390000002635 #33 ENSGT00940000160596 #34 ENSGT00950000183202.a.a #36 ENSGT00390000013867 #37 ENSGT00940000161648 ENSGT00950000182982.B Bovidae ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000160046 ENSGT00950000182893.a.a.b ENSGT00940000158901 ENSGT00940000155006 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19 ENSGT00950000182893.a.a.b ENSGT00940000158901 ENSGT00940000155006 ENSGT00960000189497 ENSGT00940000160486 ENSGT00940000156142 ENSGT00940000158405 ENSGT00940000154090.b ENSGT00720000108866 #12 ENSGT00490000043380 #13 ENSGT00390000018723 #16 ENSGT00700000104550.a #17 ENSGT01100000263545.a.a.b #18 ENSGT01100000263545.a.a.a #19 ENSGT00940000161174 #21 ENSGT01050000244866.B #22 ENSGT00950000183094.b.a #23 ENSGT00390000009748 #24 ENSGT00940000159381 #25 ENSGT00390000006931 #26 ENSGT00390000007412 #27 ENSGT00390000014105 #28 ENSGT00940000158250 #30 ENSGT00390000003422 #31 ENSGT00950000183154.b.b #32 ENSGT00390000002635 #33 ENSGT00940000160596 #34 ENSGT00950000183202.a.a #36 ENSGT00390000013867 #37 ENSGT00940000161648 ENSGT00950000182982.B Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00950000182893.a.a.b ENSGT00940000158901 ENSGT00940000155006 ENSGT00960000189497 ENSGT00940000160486 ENSGT00940000156142.e ENSGT00940000158405 ENSGT00940000154090.b ENSGT00720000108866 #12 ENSGT00490000043380 #13 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#36 ENSGT00390000013867 #37 ENSGT00940000161648 ENSGT00950000182982.B Ursidae ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00950000182893.a.a.b ENSGT00940000158901 ENSGT00940000155006 ENSGT00940000160486 ENSGT00990000210656 ENSGT00940000156142 ENSGT00940000158405 ENSGT00940000154090.b ENSGT00720000108866 #12 ENSGT00490000043380 #13 ENSGT00390000018723 #16 ENSGT00700000104550.a #17 ENSGT01100000263545.a.a.b #18 ENSGT01100000263545.a.a.a #19 ENSGT00940000161174 #21 ENSGT01050000244866.B #22 ENSGT00950000183094.b.a #23 ENSGT00390000009748 #24 ENSGT00940000159381 #25 ENSGT00390000006931 #26 ENSGT00390000007412 #27 ENSGT00390000014105 #28 ENSGT00940000158250 #30 ENSGT00390000003422 #31 ENSGT00950000183154.b.b #32 ENSGT00390000002635 #33 ENSGT00940000160596 #34 ENSGT00950000183202.a.a #36 ENSGT00390000013867 #37 ENSGT00940000161648 ENSGT00950000182982.B Ursus ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000160046 ENSGT00950000182893.a.a.b ENSGT00940000158901 ENSGT00940000155006 ENSGT00990000210656 ENSGT00940000156142 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(ENSNVIG00000013358) #24 VSTM2L (ENSNVIG00000013369) #25 CTNNBL1 (ENSNVIG00000013384) #26 ENSNVIG00000013480 BLCAP (ENSNVIG00000013485) #28 SRC (ENSNVIG00000013498) #30 MANBL (ENSNVIG00000013547) #31 GHRH (ENSNVIG00000013556) #32 RPN2 (ENSNVIG00000013568) #33 MROH8 (ENSNVIG00000013646) #34 RBL1 (ENSNVIG00000013685) #36 ENSNVIG00000013698 SAMHD1 (ENSNVIG00000013706) #37 TLDC2 (ENSNVIG00000013746) Ferret MODERN SPECIES 180 PLCG1 (ENSMPUG00000017700) TOP1 (ENSMPUG00000017701) ENSMPUG00000017702 MAFB (ENSMPUG00000017703) DHX35 (ENSMPUG00000017704) FAM83D (ENSMPUG00000017724) PPP1R16B (ENSMPUG00000017725) ACTR5 (ENSMPUG00000017731) #12 SLC32A1 (ENSMPUG00000017734) #13 ENSMPUG00000017738 #16 RALGAPB (ENSMPUG00000017739) #17 ENSMPUG00000017740 #18 LBP (ENSMPUG00000017743) #18 BPI (ENSMPUG00000017746) #19 KIAA1755 (ENSMPUG00000017756) #21 TGM2 (ENSMPUG00000017757) #22 RPRD1B (ENSMPUG00000017758) #23 TTI1 (ENSMPUG00000017759) #24 VSTM2L (ENSMPUG00000017760) #25 CTNNBL1 (ENSMPUG00000017761) #26 SRC (ENSMPUG00000017762) #30 GHRH (ENSMPUG00000017763) #32 RPN2 (ENSMPUG00000017764) #33 MROH8 (ENSMPUG00000017767) #34 RBL1 (ENSMPUG00000017768) #36 SAMHD1 (ENSMPUG00000017769) #37 TLDC2 (ENSMPUG00000017770) SOGA1 (ENSMPUG00000017772) DSN1 (ENSMPUG00000017773) NDRG3 (ENSMPUG00000017775) SLA2 (ENSMPUG00000017776) Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000158901 ENSGT00940000155006 ENSGT00940000160486 ENSGT00950000185863 ENSGT00940000156142 ENSGT00940000158405 ENSGT00940000154090.b ENSGT00720000108866 #12 ENSGT00490000043380 #13 ENSGT00940000162174 #14 ENSGT00390000018723 #16 ENSGT00700000104550.a #17 ENSGT01100000263545.a.a.b #18 ENSGT01100000263545.a.a.a #19 ENSGT00940000161174 #21 ENSGT01050000244866.B #22 ENSGT00950000183094.b.a #23 ENSGT00390000009748 #24 ENSGT00940000159381 #25 ENSGT00390000006931 #26 ENSGT00390000007412 #27 ENSGT00390000014105 #28 ENSGT00940000158250 #30 ENSGT00390000003422 #31 ENSGT00950000183154.b.b #32 ENSGT00390000002635 #33 ENSGT00940000160596 #34 ENSGT00950000183202.a.a #36 ENSGT00390000013867 #37 ENSGT00940000161648 ENSGT00950000182982.B Equus ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000158901 ENSGT00940000155006 ENSGT00940000160486 ENSGT00950000185863 ENSGT00940000156142 ENSGT00940000158405 ENSGT00940000154090.b ENSGT00720000108866 #12 ENSGT00490000043380 #13 ENSGT00940000162174 #14 ENSGT00390000018723 #16 ENSGT00700000104550.a #17 ENSGT01100000263545.a.a.b #18 ENSGT01100000263545.a.a.a #19 ENSGT00940000161174 #21 ENSGT01050000244866.B #22 ENSGT00950000183094.b.a #23 ENSGT00390000009748 #24 ENSGT00940000159381 #25 ENSGT00390000006931 #26 ENSGT00390000007412 #27 ENSGT00390000014105 #28 ENSGT00940000158250 #30 ENSGT00390000003422 #31 ENSGT00950000183154.b.b #32 ENSGT00390000002635 #33 ENSGT00940000160596 #34 ENSGT00950000183202.a.a #36 ENSGT00390000013867 #37 ENSGT00940000161648 ENSGT00950000182982.B Donkey MODERN SPECIES 6 MAFB (ENSEASG00005029044) ENSEASG00005023462 DHX35 (ENSEASG00005023467) FAM83D (ENSEASG00005023471) PPP1R16B (ENSEASG00005023472) ACTR5 (ENSEASG00005023474) #12 SLC32A1 (ENSEASG00005023475) #13 ARHGAP40 (ENSEASG00005023476) #14 ADIG (ENSEASG00005023477) #16 ENSEASG00005023481 RALGAPB (ENSEASG00005023478) #17 ENSEASG00005035432 #18 LBP (ENSEASG00005000076) #18 BPI (ENSEASG00005035129) #19 KIAA1755 (ENSEASG00005000302) #21 TGM2 (ENSEASG00005000356) #22 RPRD1B (ENSEASG00005000365) #23 TTI1 (ENSEASG00005000367) #24 VSTM2L (ENSEASG00005035486) #25 CTNNBL1 (ENSEASG00005000391) #26 ENSEASG00005025456 #27 BLCAP (ENSEASG00005000409) #28 SRC (ENSEASG00005000578) #30 MANBAL (ENSEASG00005003207) #31 GHRH (ENSEASG00005003208) #32 RPN2 (ENSEASG00005003220) #33 MROH8 (ENSEASG00005003243) #34 RBL1 (ENSEASG00005003296) #36 SAMHD1 (ENSEASG00005003301) #37 TLDC2 (ENSEASG00005003305) SOGA1 (ENSEASG00005003310) Horse MODERN SPECIES 14 PLCG1 (ENSECAG00000021031) TOP1 (ENSECAG00000000383) MAFB (ENSECAG00000024705) ENSECAG00000051307 DHX35 (ENSECAG00000013881) FAM83D (ENSECAG00000013238) PPP1R16B (ENSECAG00000008784) ACTR5 (ENSECAG00000024781) #12 SLC32A1 (ENSECAG00000022995) #13 ARHGAP40 (ENSECAG00000020026) #14 ADIG (ENSECAG00000019945) #16 RALGAPB (ENSECAG00000004465) #17 ENSECAG00000052976 #18 BPI (ENSECAG00000022085) #19 KIAA1755 (ENSECAG00000017454) #21 TGM2 (ENSECAG00000006290) #22 RPRD1B (ENSECAG00000018017) #23 TTI1 (ENSECAG00000013760) #24 VSTM2L (ENSECAG00000037272) #25 CTNNBL1 (ENSECAG00000017144) #26 ENSECAG00000052890 #27 SRC (ENSECAG00000012072) #30 MANBAL (ENSECAG00000011341) #31 GHRH (ENSECAG00000011318) #32 RPN2 (ENSECAG00000018381) #33 MROH8 (ENSECAG00000011332) #34 RBL1 (ENSECAG00000024316) #36 SAMHD1 (ENSECAG00000008959) #37 TLDC2 (ENSECAG00000008789) SOGA1 (ENSECAG00000019507) NDRG3 (ENSECAG00000016390) Chiroptera ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00950000182893.a.a.b ENSGT00940000158901 ENSGT00940000155006 ENSGT00940000160486 ENSGT00940000156142 ENSGT00940000158405 ENSGT00940000154090.b ENSGT00720000108866 #12 ENSGT00490000043380 #13 ENSGT00940000162174 #14 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ENSGT00490000043380 #13 ENSGT00940000162174 #14 ENSGT00390000018723 #16 ENSGT00700000104550.a #17 ENSGT01100000263545.a.a.b #18 ENSGT01100000263545.a.a.a #19 ENSGT00940000161174 #21 ENSGT01050000244866.B #22 ENSGT00950000183094.b.a #23 ENSGT00390000009748 #24 ENSGT00940000159381 #25 ENSGT00390000006931 #26 ENSGT00390000007412 #27 ENSGT00390000014105 #28 ENSGT00940000158250 #30 ENSGT00390000003422 #31 ENSGT00950000183154.b.b #32 ENSGT00390000002635 #33 ENSGT00940000160596 #34 ENSGT00950000183202.a.a #36 ENSGT00390000013867 #37 ENSGT00940000161648 ENSGT00950000182982.B Microbat MODERN SPECIES 1330 ENSMLUG00000028250 ENSMLUG00000023893 #18 LBP (ENSMLUG00000016551) #18 BPI (ENSMLUG00000010167) #19 KIAA1755 (ENSMLUG00000017056) #21 TGM2 (ENSMLUG00000025838) #22 RPRD1B (ENSMLUG00000012053) #23 TTI1 (ENSMLUG00000012038) #24 VSTM2L (ENSMLUG00000015285) #25 ENSMLUG00000015803 #26 NNAT (ENSMLUG00000013436) #27 BLCAP (ENSMLUG00000013433) #28 Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 15 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ENSLAFG00000017275 #27 BLCAP (ENSLAFG00000017270) #28 SRC (ENSLAFG00000014637) #30 MANBAL (ENSLAFG00000016489) #31 GHRH (ENSLAFG00000016485) #32 ENSLAFG00000032303 RPN2 (ENSLAFG00000003327) #33 MROH8 (ENSLAFG00000003320) #34 RBL1 (ENSLAFG00000022292) #36 SAMHD1 (ENSLAFG00000001940) #37 TLDC2 (ENSLAFG00000001938) Xenarthra ANCESTRAL SPECIES 871 ENSGT00940000161174 #21 ENSGT01050000244866.B #22 ENSGT00950000183094.b.a #23 ENSGT00390000009748 #24 ENSGT00940000159381 #25 ENSGT00390000006931 #26 Sloth MODERN SPECIES 7471 ENSCHOG00000011349 #22 Armadillo MODERN SPECIES 2067 ENSDNOG00000034339 #18 LBP (ENSDNOG00000004983) #18 KIAA1755 (ENSDNOG00000046945) #21 TGM2 (ENSDNOG00000034335) #22 RPRD1B (ENSDNOG00000048446) #23 TTI1 (ENSDNOG00000038039) #24 VSTM2L (ENSDNOG00000032950) #25 ENSDNOG00000044125 #26 Marsupialia ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000012419 ENSGT00940000156928 ENSGT00490000043329.a.a.a ENSGT00940000163617 ENSGT00940000155225 ENSGT01100000263546.e.a.a.b ENSGT01100000263546.e.a.b 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#28 DHRS7C (ENSOANG00000028736) GLP2R (ENSOANG00000040079) RCVRN (ENSOANG00000049018) GAS7 (ENSOANG00000036957) ENSOANG00000036840 MYH4 (ENSOANG00000009355) MYH1 (ENSOANG00000003374) Sauria ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000153739.a.a ENSGT00520000055578.a.a.c ENSGT00940000157729 ENSGT00390000012419 ENSGT00940000156928 ENSGT00490000043329.a.a.a ENSGT00940000163617 ENSGT01100000263546.e.a.a.b ENSGT01100000263546.e.b ENSGT01100000263546.e.a.b ENSGT01100000263546.e.a.a.a.b ENSGT01010000222653 ENSGT00940000160361 ENSGT01100000263545.a.a #18 ENSGT00940000161174 #21 ENSGT01050000244866.B #22 ENSGT00950000183094.b.a #23 ENSGT00390000009748 #24 ENSGT00940000159381 #25 ENSGT00390000006931 #26 ENSGT00940000164331 ENSGT00730000111410 ENSGT00940000165527 ENSGT01100000263895 ENSGT00940000165273.b ENSGT00510000047836 ENSGT00930000150941 ENSGT00940000153725.a.a ENSGT00940000153541.C ENSGT00530000063759.b ENSGT00390000004207 Archelosauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153739.a.a 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ENSSPUG00000018889 POFUT1 (ENSSPUG00000018894) ENSSPUG00000018901 KIF3B (ENSSPUG00000018906) ENSSPUG00000018911 NOL4L (ENSSPUG00000018916) COMMD7 (ENSSPUG00000018924) DNMT3B (ENSSPUG00000018931) MAPRE1 (ENSSPUG00000018937) BPIFB4 (ENSSPUG00000018943) CDK5RAP1 (ENSSPUG00000018959) ENSSPUG00000018973 ENSSPUG00000018977 #18 TGM2 (ENSSPUG00000018984) #22 RPRD1B (ENSSPUG00000018992) #23 TTI1 (ENSSPUG00000018997) #24 VSTM2L (ENSSPUG00000019002) #25 ENSSPUG00000019005 #26 ENSSPUG00000019009 #26 ENSSPUG00000019011 ENSSPUG00000019015 ENSSPUG00000019024 ENSSPUG00000019026 ENSSPUG00000019028 ENSSPUG00000019030 ENSSPUG00000019032 ENSSPUG00000019035 ENSSPUG00000019038 Anura ANCESTRAL SPECIES 50 ENSGT00940000162507.B ENSGT01050000244866.B #22 ENSGT00950000183094.b.a #23 ENSGT00390000009748 #24 ENSGT00940000159381 #25 ENSGT00390000006931 #26 ENSGT00390000014105 #28 ENSGT00940000158250 #30 ENSGT00390000003422 #31 ENSGT00940000169850 ENSGT00390000002635 #33 ENSGT01030000234633.B.b ENSGT00940000160046 ENSGT00940000155458 ENSGT00940000159849 ENSGT00940000155308 ENSGT00390000007796 Leishan spiny toad MODERN SPECIES 3 ENSLLEG00000031106 ENSLLEG00000021476 ENSLLEG00000021523 CDK5RAP1 (ENSLLEG00000021578) ENSLLEG00000021863 ENSLLEG00000021900 ENSLLEG00000021928 ENSLLEG00000021952 ENSLLEG00000021988 ENSLLEG00000022214 ENSLLEG00000022243 ENSLLEG00000022263 ENSLLEG00000022312 ENSLLEG00000022409 #18 ENSLLEG00000022602 TGM2 (ENSLLEG00000022678) #22 ENSLLEG00000023080 RPRD1B (ENSLLEG00000023109) #23 TTI1 (ENSLLEG00000023243) #24 VSTM2L (ENSLLEG00000023418) #25 ENSLLEG00000023568 #26 Frog MODERN SPECIES 1 trhr3 (ENSXETG00000001766) ENSXETG00000001765 ENSXETG00000001762 ENSXETG00000036987 ENSXETG00000035176 ENSXETG00000001764 ENSXETG00000046730 ENSXETG00000045048 ENSXETG00000045903 bpi.4 (ENSXETG00000017331) #18 ENSXETG00000041625 ENSXETG00000017325 bpi (ENSXETG00000017326) #18 ENSXETG00000043614 ENSXETG00000043249 tgm2 (ENSXETG00000017323) #22 rprd1b (ENSXETG00000017322) #23 tti1 (ENSXETG00000017321) #24 vstm2l (ENSXETG00000043172) #25 ctnnbl1 (ENSXETG00000017319) #26 blcap (ENSXETG00000025511) #28 src (ENSXETG00000017318) #30 ghrh (ENSXETG00000036851) manbal (ENSXETG00000038300) #31 rpn2 (ENSXETG00000017317) #33 emilin3 (ENSXETG00000038952) lpin3 (ENSXETG00000017314) myl9 (ENSXETG00000036705) tgif2 (ENSXETG00000036550) dlgap4 (ENSXETG00000017308) aar2 (ENSXETG00000012109) Coelacanth MODERN SPECIES 1771 TGM2 (ENSLACG00000010545) #22 RPRD1B (ENSLACG00000009195) #23 TTI1 (ENSLACG00000008978) #24 VSTM2L (ENSLACG00000008500) #25 CTNNBL1 (ENSLACG00000004941) #26 Actinopterygii DUPLICATION Actinopterygii DUPLICATION Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT01050000244866.B.c.a #22 Reedfish MODERN SPECIES 1 ENSECRG00000010135 SERINC3 (ENSECRG00000010143) ttpal (ENSECRG00000010153) hnf4a (ENSECRG00000010169) R3HDML (ENSECRG00000010189) rtel1 (ENSECRG00000010241) STMN3 (ENSECRG00000010316) GMEB2 (ENSECRG00000011254) HELZ2 (ENSECRG00000011279) pdyn (ENSECRG00000011311) stk35 (ENSECRG00000011324) ada (ENSECRG00000011354) ENSECRG00000011376 ptpn1 (ENSECRG00000011392) ENSECRG00000011410 tgm2b (ENSECRG00000011556) #22 manbal (ENSECRG00000012200) #31 src (ENSECRG00000012226) #30 TTI1 (ENSECRG00000012275) #24 rprd1b (ENSECRG00000012316) #23 DLGAP4 (ENSECRG00000012358) ENSECRG00000012389 myl9a (ENSECRG00000012401) ENSECRG00000012414 ENSECRG00000012430 mybl2b (ENSECRG00000012440) ift52 (ENSECRG00000012465) sgk2a (ENSECRG00000012498) ENSECRG00000012517 ENSECRG00000012528 srsf6a (ENSECRG00000012559) Neopterygii ANCESTRAL SPECIES 44 ENSGT00950000183154.b.b #32 ENSGT00390000002635 #33 ENSGT00940000158442 ENSGT00940000156213 ENSGT00940000159708 ENSGT00940000153776.a.b ENSGT00390000011581 ENSGT00940000156091.b ENSGT00940000160046 ENSGT00940000155458 ENSGT00940000158052.a.h ENSGT00940000156220 ENSGT00940000155230 ENSGT00940000155308 ENSGT00940000165533 ENSGT01050000244866.B.c.a #22 ENSGT00940000162507.B ENSGT01050000244866.B.c.b #22 ENSGT00950000183094.b.a #23 ENSGT00390000009748 #24 ENSGT00940000159381 #25 ENSGT00390000006931 #26 ENSGT01050000244866.D.b.a ##22 ENSGT00940000159472 ENSGT00390000001562 ENSGT00390000000546 ENSGT00940000157014 ENSGT00950000183131.a ENSGT00950000183176.a ENSGT00950000182863.A.a.b ENSGT00940000155581.A Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 67 ENSGT00940000153110.B.e.b ENSGT00940000156977.e ENSGT00940000160913 ENSGT00950000183042.b.b ENSGT00940000161154.a ENSGT00940000159178 ENSGT01050000244850.A.b.b ENSGT00390000000903.b.a ENSGT00390000016807 ENSGT00940000160046 ENSGT00940000155458 ENSGT00940000156220.k ENSGT00940000155230 ENSGT00940000155308.d ENSGT00940000165533 ENSGT01050000244866.B.c.a #22 ENSGT00940000162507.B ENSGT01050000244866.B.c.b #22 ENSGT00950000183094.b.a #23 ENSGT00390000009748 #24 ENSGT00940000159381 #25 ENSGT00390000006931 #26 ENSGT01050000244866.D.b.a ##22 ENSGT00940000159472 ENSGT00390000001562 ENSGT00390000000546 ENSGT00940000157014 ENSGT00950000183131.a.f ENSGT00950000183176.a ENSGT00950000182863.A.a.b ENSGT00940000158764 Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 198 ENSGT00940000153110.B.e.b ENSGT00940000156977.e ENSGT00940000160913 ENSGT00950000183042.b.b ENSGT00940000161154.a ENSGT00940000159178 ENSGT01050000244850.A.b.b ENSGT00390000000903.b.a ENSGT00390000016807 ENSGT00940000165151.b ENSGT00940000160046 ENSGT00940000155458 ENSGT00940000159849 ENSGT00940000155308.d ENSGT00940000165533.c ENSGT01050000244866.B.c.a #22 ENSGT00940000159381.d #25 ENSGT00390000001562 ENSGT00940000157014.f ENSGT00950000183131.a.f ENSGT00950000183176.a ENSGT00950000182863.A.a.b ENSGT00940000158764.g ENSGT00700000104550.a.j.b #17 ENSGT00940000160093.a ENSGT00940000156407 Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000164716.C ENSGT00390000016221 ENSGT00940000154127.A ENSGT00940000154127.B ENSGT00530000063851.a.b ENSGT00940000154610.e.b.b ENSGT01050000244850.A.b.a.a.j ENSGT00390000000903.b.a ENSGT00390000016807 ENSGT00940000165151.b ENSGT00940000160046 ENSGT00940000155458 ENSGT00940000159849 ENSGT00940000155308.d ENSGT00940000165533.c ENSGT01050000244866.B.c.a #22 ENSGT00940000159381.d #25 ENSGT00940000161090.B.c.b.a.a.b ENSGT00940000161090.B.c.a.b ENSGT00940000163961.a.b ENSGT00940000153336.a.b ENSGT00940000163886.B.b.b ENSGT00940000155473.c.b ENSGT00940000159065.b ENSGT00940000163428.a.a.a ENSGT00390000002307.f.a ENSGT00390000002307.f.b.b ENSGT00940000158061.b ENSGT00950000182882.A.a.i.a ENSGT00940000159178 ENSGT00940000161154.a Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00390000000483.b ENSGT00390000014853 ENSGT00940000164716.C ENSGT00390000016221 ENSGT00940000154127.A ENSGT00940000154127.B ENSGT00530000063851.a.b ENSGT00940000154610.e.b.b ENSGT01050000244850.A.b.a.a.j ENSGT00390000000903.b.a ENSGT00390000016807 ENSGT00940000165151.b ENSGT00940000160046 ENSGT00940000155308.d ENSGT00940000165533.c ENSGT01050000244866.B.c.a #22 ENSGT00940000159381.d #25 ENSGT00940000161090.B.c.b.a.a.b ENSGT00940000161090.B.c.a.b ENSGT00940000163961.a.b 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ENSGT00390000014853.f ENSGT00940000164716.C.a ENSGT00390000016221.xb.b ENSGT00530000063851.a.b.a ENSGT00940000154610.e.b.b.a ENSGT01050000244850.A.b.a.a.j.o.a.b ENSGT00390000016807.f ENSGT00940000165151.b.e.a ENSGT00940000165151.b.e.b ENSGT00940000160046.a ENSGT00940000155458.j.b ENSGT00940000155230.f.a ENSGT00940000155308.d.`b.a ENSGT01100000263541.a.a.a.b.b.b.a.b.a.a.a.b ENSGT00940000165533.c.a ENSGT01050000244866.B.c.a.a #22 ENSGT00940000159381.d.b #25 ENSGT01020000230338.a.b.b.a.b.b.b ENSGT00940000161090.B.c.b.a.a.b ENSGT00940000161090.B.c.a.b.e ENSGT00940000163961.a.b.a ENSGT00940000153336.a.b.b ENSGT00940000163886.B.b.b.c.a.b.a.a ENSGT00940000155473.c.b.b ENSGT00940000159065.b.c.b ENSGT00390000002307.f.b.a.a ENSGT00940000158061.b.b ENSGT00950000182882.A.a.i.a.a ENSGT00940000159178.m.a ENSGT00940000161154.a.f ENSGT00950000183042.b.b.a.b Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000014853.f ENSGT00940000164716.C.a ENSGT00390000016221.xb.b ENSGT00530000063851.a.b.a 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ENSSSAG00000096794 slc48a1b (ENSSSAG00000090768) Huchen MODERN SPECIES 2513 quo (ENSHHUG00000044177) tgm2b (ENSHHUG00000044102) #22 Northern pike MODERN SPECIES 16 CYTL1 (ENSELUG00000011229) EVC2 (ENSELUG00000011257) EVC (ENSELUG00000011280) ENSELUG00000011284 ENSELUG00000011317 ENSELUG00000032058 PLXNA1 (ENSELUG00000011440) chchd6b (ENSELUG00000011503) tpra1 (ENSELUG00000011526) ENSELUG00000001359 ENSELUG00000011557 myl9a (ENSELUG00000011604) ENSELUG00000011622 DLGAP4 (ENSELUG00000011678) quo (ENSELUG00000011735) tgm2b (ENSELUG00000011784) #22 VSTM2L (ENSELUG00000011818) #25 ENSELUG00000027911 ENSELUG00000034466 ENSELUG00000026777 ENSELUG00000024885 ENSELUG00000028903 ENSELUG00000028860 zgc:158846 (ENSELUG00000032891) krt4 (ENSELUG00000011913) krt18b (ENSELUG00000011941) eif4bb (ENSELUG00000011962) ENSELUG00000012041 vdrb (ENSELUG00000012103) ENSELUG00000012228 ENSELUG00000012277 Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00940000164716.C ENSGT00390000016221 ENSGT00940000154127.A 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ENSGT00940000165359.a ENSGT00940000155356.d.a Amazon molly MODERN SPECIES 313 msx1a (ENSPFOG00000006593) CYTL1 (ENSPFOG00000006552) EVC2 (ENSPFOG00000006425) ENSPFOG00000006178 MINAR1 (ENSPFOG00000006143) ENSPFOG00000005961 ENSPFOG00000003917 chchd6b (ENSPFOG00000003776) tpra1 (ENSPFOG00000003645) ENSPFOG00000020502 LPIN3 (ENSPFOG00000003481) myl9a (ENSPFOG00000003448) ENSPFOG00000003437 DLGAP4 (ENSPFOG00000003334) quo (ENSPFOG00000003050) tgm2b (ENSPFOG00000002843) #22 ENSPFOG00000002815 #25 krt4 (ENSPFOG00000022335) ENSPFOG00000002463 krt18b (ENSPFOG00000002284) ENSPFOG00000002274 eif4bb (ENSPFOG00000002142) ENSPFOG00000001816 vdrb (ENSPFOG00000001655) ENSPFOG00000001452 ENSPFOG00000020501 slc48a1b (ENSPFOG00000001321) PHF13 (ENSPFOG00000001271) DNAJC11 (ENSPFOG00000001055) ENSPFOG00000000859 HIPK1 (ENSPFOG00000000703) Sailfin molly MODERN SPECIES 673 ENSPLAG00000000529 tpra1 (ENSPLAG00000016008) ENSPLAG00000016019 LPIN3 (ENSPLAG00000016032) myl9a (ENSPLAG00000016045) TGIF2 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DUPLICATION Sheepshead minnow MODERN SPECIES 331 tgm2b (ENSCVAG00000021601) #22 ENSCVAG00000021596 #25 krt4 (ENSCVAG00000021589) ENSCVAG00000021587 krt18b (ENSCVAG00000021577) eif4bb (ENSCVAG00000021559) ENSCVAG00000021541 syndig1l (ENSCVAG00000021512) dll4 (ENSCVAG00000021491) chac1 (ENSCVAG00000021478) ino80 (ENSCVAG00000021470) vps18 (ENSCVAG00000021446) rhov (ENSCVAG00000021363) pigh (ENSCVAG00000021357) ZFYVE1 (ENSCVAG00000021348) wdr21 (ENSCVAG00000021256) Sheepshead minnow MODERN SPECIES 1279 ENSCVAG00000006932 tgm2b (ENSCVAG00000007659) #22 Oryzias ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000164716.C ENSGT00390000016221 ENSGT00940000154127.A ENSGT00940000154127.B ENSGT00530000063851.a.b ENSGT00940000154610.e.b.b ENSGT01050000244850.A.b.a.a.j ENSGT00390000000903.b.a ENSGT00390000016807 ENSGT00940000165151.b ENSGT00940000160046 ENSGT00940000155458 ENSGT00940000159849 ENSGT00940000155308.d ENSGT00940000165533.c ENSGT01050000244866.B.c.a #22 ENSGT00940000159381.d #25 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ENSGT00530000063882.a ENSGT00860000133842.m ENSGT00940000165359.a ENSGT00940000155356.d.a ENSGT00940000177111 Indian medaka MODERN SPECIES 8 ENSOMEG00000017072 TGIF2 (ENSOMEG00000017083) ENSOMEG00000017099 DLGAP4 (ENSOMEG00000017195) hmx4 (ENSOMEG00000017226) hmx1 (ENSOMEG00000017240) adra2c (ENSOMEG00000017256) ENSOMEG00000017277 ENSOMEG00000017295 JUNB (ENSOMEG00000017314) ENSOMEG00000017401 ENSOMEG00000000435 ENSOMEG00000017504 ENSOMEG00000017525 quo (ENSOMEG00000017614) tgm2b (ENSOMEG00000017672) #22 ENSOMEG00000017692 ENSOMEG00000017706 #25 krt4 (ENSOMEG00000017746) ENSOMEG00000017808 krt18b (ENSOMEG00000017836) eif4bb (ENSOMEG00000000454) ENSOMEG00000018061 vdrb (ENSOMEG00000018135) ENSOMEG00000018241 ENSOMEG00000018303 slc48a1b (ENSOMEG00000018316) PHF13 (ENSOMEG00000018337) DNAJC11 (ENSOMEG00000018394) ENSOMEG00000018528 HIPK1 (ENSOMEG00000018647) Javanese ricefish MODERN SPECIES 19 ENSOJAG00000010687 ENSOJAG00000010705 PLXNA1 (ENSOJAG00000010893) chchd6b (ENSOJAG00000013704) 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ENSGT01050000244866.B.c.a #22 ENSGT00940000159381.d #25 ENSGT00940000161090.B.c.b.a.a.b ENSGT00940000161090.B.c.a.b.d ENSGT00940000163961.a.b ENSGT00940000153336.a.b ENSGT00940000163886.B.b.b ENSGT00940000155473.c.b ENSGT00940000159065.b ENSGT00940000163428.a.a.a ENSGT00390000002307.f.a ENSGT00530000063882.a ENSGT00860000133842.m ENSGT00940000165359.b ENSGT00940000165359.a ENSGT00940000155356.d.a Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 19 MINAR1 (ENSORLG00000016707) ENSORLG00000016701 ENSORLG00000016679 chchd6b (ENSORLG00000016662) tpra1 (ENSORLG00000016658) ENSORLG00000029161 LPIN3 (ENSORLG00000016643) myl9a (ENSORLG00000016619) ENSORLG00000022604 DLGAP4 (ENSORLG00000016608) ENSORLG00000022054 ENSORLG00000024114 ENSORLG00000024972 ENSORLG00000022705 quo (ENSORLG00000016585) tgm2b (ENSORLG00000016570) #22 ENSORLG00000022850 ENSORLG00000025459 ENSORLG00000016568 #25 krt4 (ENSORLG00000016561) ENSORLG00000016551 krt18b (ENSORLG00000016545) eif4bb (ENSORLG00000016502) ENSORLG00000016468 vdr (ENSORLG00000016402) ENSORLG00000016388 ENSORLG00000016373 slc48a1b (ENSORLG00000016368) PHF13 (ENSORLG00000016362) ENSORLG00000016353 ENSORLG00000025982 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000164716.C ENSGT00390000016221 ENSGT00940000154127.A ENSGT00940000154127.B ENSGT00530000063851.a.b ENSGT00940000154610.e.b.b ENSGT01050000244850.A.b.a.a.j ENSGT00390000000903.b.a ENSGT00390000016807 ENSGT00940000165151.b ENSGT00940000160046 ENSGT00940000155458 ENSGT00940000159849 ENSGT00940000155308.d ENSGT00940000165533.c ENSGT01050000244866.B.c.a #22 ENSGT00940000159381.d #25 ENSGT00940000161090.B.c.b.a.a.b ENSGT00940000161090.B.c.a.b ENSGT00940000163961.a.b ENSGT00940000153336.a.b ENSGT00940000163886.B.b.b ENSGT00940000155473.c.b ENSGT00940000159065.b ENSGT00940000163428.a.a.a ENSGT00390000002307.f.a ENSGT00530000063882.a ENSGT00860000133842.m ENSGT00940000165359.b ENSGT00940000165359.a ENSGT00940000155356.d.a Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000164716.C ENSGT00390000016221 ENSGT00940000154127.A ENSGT00940000154127.B ENSGT00530000063851.a.b ENSGT00940000154610.e.b.b ENSGT01050000244850.A.b.a.a.j ENSGT00390000000903.b.a ENSGT00390000016807 ENSGT00940000165151.b ENSGT00940000160046 ENSGT00940000155458 ENSGT00940000159849 ENSGT00940000155308.d ENSGT00940000165533.c ENSGT01050000244866.B.c.a #22 ENSGT00940000159381.d #25 ENSGT00940000161090.B.c.b.a.a.b ENSGT00940000161090.B.c.a.b ENSGT00940000163961.a.b ENSGT00940000153336.a.b ENSGT00940000163886.B.b.b ENSGT00940000155473.c.b ENSGT00940000159065.b ENSGT00940000163428.a.a.a ENSGT00390000002307.f.a ENSGT00530000063882.a ENSGT00860000133842.m ENSGT00940000165359.b ENSGT00940000165359.a ENSGT00940000155356.d.a Carangaria ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000164716.C ENSGT00390000016221 ENSGT00940000154127.A ENSGT00940000154127.B ENSGT00530000063851.a.b ENSGT00940000154610.e.b.b ENSGT01050000244850.A.b.a.a.j ENSGT00390000000903.b.a ENSGT00390000016807 ENSGT00940000165151.b ENSGT00940000160046 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SPECIES ENSGT00940000164716.C ENSGT00390000016221 ENSGT00940000154127.A ENSGT00940000154127.B ENSGT00530000063851.a.b ENSGT00940000154610.e.b.b ENSGT01050000244850.A.b.a.a.j ENSGT00390000000903.b.a ENSGT00390000016807 ENSGT00940000165151.b ENSGT00940000160046 ENSGT00940000155458 ENSGT00940000159849 ENSGT00940000155308.d ENSGT00940000165533.c ENSGT01050000244866.B.c.a #22 ENSGT00940000159381.d #25 ENSGT00940000161090.B.c.b.a.a.b ENSGT00940000161090.B.c.a.b ENSGT00940000163961.a.b ENSGT00940000153336.a.b ENSGT00940000163886.B.b.b ENSGT00940000155473.c.b ENSGT00940000159065.b ENSGT00940000163428.a.a.a ENSGT00390000002307.f.a ENSGT00530000063882.a ENSGT00860000133842.m ENSGT00940000165359.b ENSGT00940000165359.a ENSGT00940000155356.d.a Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000000483.b ENSGT00390000014853 ENSGT00940000164716.C ENSGT00390000016221 ENSGT00940000154127.A ENSGT00940000154127.B ENSGT00530000063851.a.b ENSGT00940000154610.e.b.b ENSGT01050000244850.A.b.a.a.j 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ENSGT00940000155356.d.a Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164716.C ENSGT00390000016221 ENSGT00940000154127.A ENSGT00940000154127.B ENSGT00530000063851.a.b ENSGT00940000154610.e.b.b ENSGT01050000244850.A.b.a.a.j ENSGT00390000000903.b.a ENSGT00390000016807 ENSGT00940000165151.b ENSGT00940000160046 ENSGT00940000155458 ENSGT00940000159849 ENSGT00940000155308.d ENSGT00940000165533.c ENSGT01050000244866.B.c.a #22 ENSGT00940000159381.d #25 ENSGT00940000161090.B.c.b.a.a.b ENSGT00940000161090.B.c.a.b ENSGT00940000163961.a.b ENSGT00940000153336.a.b ENSGT00940000163886.B.b.b ENSGT00940000155473.c.b ENSGT00940000159065.b ENSGT00940000163428.a.a.a ENSGT00390000002307.f.a ENSGT00530000063882.a ENSGT00860000133842.m ENSGT00940000165359.a ENSGT00940000155356.d.a ENSGT00940000177111 European seabass MODERN SPECIES 10 ENSDLAG00005002056 NSG1 (ENSDLAG00005002078) MSX1 (ENSDLAG00005026929) EVC2 (ENSDLAG00005002102) EVC (ENSDLAG00005002119) ENSDLAG00005002133 ENSDLAG00005002139 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ENSSAUG00010019642 slc48a1b (ENSSAUG00010019641) ENSSAUG00010019639 DNAJC11 (ENSSAUG00010019633) ENSSAUG00010019628 ENSSAUG00010019626 HIPK1 (ENSSAUG00010019222) Perciformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164716.C ENSGT00390000016221 ENSGT00940000154127.A ENSGT00940000154127.B ENSGT00530000063851.a.b ENSGT00940000154610.e.b.b ENSGT01050000244850.A.b.a.a.j ENSGT00390000000903.b.a ENSGT00390000016807 ENSGT00940000165151.b ENSGT00940000160046 ENSGT00940000155458 ENSGT00940000159849 ENSGT00940000155308.d ENSGT00940000165533.c ENSGT01050000244866.B.c.a #22 ENSGT00940000159381.d #25 ENSGT00940000161090.B.c.b.a.a.b ENSGT00940000161090.B.c.a.b ENSGT00940000163961.a.b ENSGT00940000153336.a.b ENSGT00940000163886.B.b.b ENSGT00940000155473.c.b ENSGT00940000159065.b ENSGT00940000163428.a.a.a ENSGT00390000002307.f.a ENSGT00530000063882.a ENSGT00860000133842.m ENSGT00940000165359.a ENSGT00940000155356.d.a ENSGT00940000177111 Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000164716.C ENSGT00390000016221 ENSGT00940000154127.A ENSGT00940000154127.B ENSGT00530000063851.a.b ENSGT00940000154610.e.b.b ENSGT01050000244850.A.b.a.a.j ENSGT00390000000903.b.a ENSGT00390000016807 ENSGT00940000165151.b ENSGT00940000160046 ENSGT00940000155458 ENSGT00940000159849 ENSGT00940000155308.d ENSGT00940000165533.c ENSGT01050000244866.B.c.a #22 ENSGT00940000159381.d #25 ENSGT00940000161090.B.c.b.a.a.b ENSGT00940000161090.B.c.a.b ENSGT00940000163961.a.b ENSGT00940000153336.a.b ENSGT00940000163886.B.b.b ENSGT00940000155473.c.b ENSGT00940000159065.b ENSGT00940000163428.a.a.a ENSGT00390000002307.f.a ENSGT00530000063882.a ENSGT00860000133842.m ENSGT00940000165359.a ENSGT00940000155356.d.a ENSGT00940000177111 Channel bull blenny MODERN SPECIES 19 CYTL1 (ENSCGOG00000007229) EVC2 (ENSCGOG00000007230) EVC (ENSCGOG00000007234) ENSCGOG00000007254 ENSCGOG00000007263 PLXNA1 (ENSCGOG00000007402) chchd6b (ENSCGOG00000012083) tpra1 (ENSCGOG00000012102) ENSCGOG00000012387 LPIN3 (ENSCGOG00000012389) myl9a (ENSCGOG00000012717) ENSCGOG00000012744 ENSCGOG00000012745 DLGAP4 (ENSCGOG00000012747) quo (ENSCGOG00000012749) tgm2b (ENSCGOG00000012775) #22 VSTM2L (ENSCGOG00000013297) #25 krt4 (ENSCGOG00000013299) krt4 (ENSCGOG00000013301) krt4 (ENSCGOG00000013308) ENSCGOG00000013406 krt18b (ENSCGOG00000013427) eif4bb (ENSCGOG00000013432) ENSCGOG00000013447 ENSCGOG00000000104 vdrb (ENSCGOG00000000153) ENSCGOG00000000212 slc48a1b (ENSCGOG00000000243) PHF13 (ENSCGOG00000000247) DNAJC11 (ENSCGOG00000000253) ENSCGOG00000000278 Cottioidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT00730000111121 ENSGT00390000000483.b ENSGT00390000014853 ENSGT00940000164716.C ENSGT00390000016221 ENSGT00940000154127.A ENSGT00940000154127.B ENSGT00530000063851.a.b ENSGT00940000154610.e.b.b ENSGT01050000244850.A.b.a.a.j ENSGT00390000000903.b.a ENSGT00390000016807 ENSGT00940000165151.b ENSGT00940000160046 ENSGT00940000165533.c ENSGT01050000244866.B.c.a #22 ENSGT00940000159381.d #25 ENSGT00940000161090.B.c.b.a.a.b ENSGT00940000161090.B.c.a.b ENSGT00940000163961.a.b ENSGT00940000153336.a.b ENSGT00940000163886.B.b.b ENSGT00940000155473.c.b ENSGT00940000159065.b ENSGT00940000163428.a.a.a ENSGT00390000002307.f.a ENSGT00530000063882.a ENSGT00860000133842.m ENSGT00940000165359.a ENSGT00940000155356.d.a ENSGT00940000156173 Stickleback MODERN SPECIES 17 ENSGACG00000008307 msx1a (ENSGACG00000008291) EVC2 (ENSGACG00000008268) EVC (ENSGACG00000008237) ENSGACG00000008234 ENSGACG00000008215 PLXNA1 (ENSGACG00000008199) chchd6b (ENSGACG00000008196) tpra1 (ENSGACG00000008190) ENSGACG00000008188 ENSGACG00000008176 myl9a (ENSGACG00000008160) TGIF2 (ENSGACG00000008156) DLGAP4 (ENSGACG00000008148) quo (ENSGACG00000008135) tgm2b (ENSGACG00000008115) #22 krt4 (ENSGACG00000008104) ENSGACG00000008085 krt18b (ENSGACG00000008033) eif4bb (ENSGACG00000008010) ENSGACG00000007995 vdrb (ENSGACG00000007975) ENSGACG00000007965 ENSGACG00000007963 slc48a1b (ENSGACG00000007949) PHF13 (ENSGACG00000007946) DNAJC11 (ENSGACG00000007927) ENSGACG00000007914 HIPK1 (ENSGACG00000007904) ube2j2 (ENSGACG00000007882) acap3b (ENSGACG00000007862) Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 179 ENSGT00940000153110.B.e.b ENSGT00940000156977.e ENSGT00940000160913 ENSGT00950000183042.b.b ENSGT00940000161154.a ENSGT00940000159178 ENSGT01050000244850.A.b.a.a ENSGT00390000000903.b.a ENSGT00390000016807 ENSGT00940000165151.b ENSGT00940000160046 ENSGT00940000155458.e.a ENSGT00940000159849 ENSGT00940000155308.d ENSGT00940000165533.c ENSGT01050000244866.B.c.a #22 ENSGT00940000159381.d #25 ENSGT01050000244866.D.b.a ##22 ENSGT00390000001562 ENSGT00940000157014.f ENSGT00950000183131.a.f ENSGT00950000183176.a ENSGT00950000182863.A.a.b ENSGT00940000163999.a ENSGT00940000158764.g ENSGT00700000104550.a.j.b #17 ENSGT00940000160093.a ENSGT00940000156407 ENSGT01030000234597.a.b.b.f ENSGT00940000160694.g.a ENSGT00530000063106.A.s.a.b Otophysi ANCESTRAL SPECIES 226 ENSGT00940000153110.B.e.b ENSGT00940000156977.e ENSGT00940000160913 ENSGT00950000183042.b.b ENSGT00940000161154.a ENSGT00940000159178 ENSGT01050000244850.A.b.a.a ENSGT00390000000903.b.a ENSGT00390000016807 ENSGT00940000165151.b ENSGT00940000160046 ENSGT00940000155458.e.a ENSGT00940000159849 ENSGT00940000155308.d ENSGT00940000165533.c ENSGT01050000244866.B.c.a #22 ENSGT00940000159381.d #25 ENSGT01050000244866.D.b.a ##22 ENSGT00390000001562 Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000153110.B.e.b ENSGT00940000156977.e ENSGT00940000160913 ENSGT00950000183042.b.b ENSGT00940000161154.a ENSGT00940000159178 ENSGT01050000244850.A.b.a.a.d ENSGT00390000000903.b.a ENSGT00390000016807 ENSGT00940000165151.b ENSGT00940000160046 ENSGT00940000155458.e.a ENSGT00940000159849 ENSGT00940000155308.d ENSGT00940000165533.c ENSGT01050000244866.B.c.a #22 ENSGT00940000159381.d #25 ENSGT01050000244866.D.b.a ##22 ENSGT00390000001562 ENSGT01030000234648.a.b.a.a.a.f.b.b ENSGT00940000155664.a.a ENSGT00940000153820.a ENSGT00390000001414 ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000153709.A.e ENSGT00940000154899.fb.a ENSGT00950000183091.B.b 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ENSGT00940000160913 ENSGT00950000183042.b.b ENSGT00940000161154.a ENSGT00940000159178 ENSGT01050000244850.A.b.a.a.d ENSGT00390000000903.b.a ENSGT00390000016807 ENSGT00940000165151.b ENSGT00940000160046 ENSGT00940000155458.e.a ENSGT00940000159849 ENSGT00940000155308.d ENSGT00940000165533.c ENSGT01050000244866.B.c.a #22 ENSGT00940000159381.d #25 ENSGT01050000244866.D.b.a ##22 ENSGT00390000001562 ENSGT01030000234648.a.b.a.a.a.f.b.b ENSGT00940000155664.a.a ENSGT00940000153820.a ENSGT00390000001414 ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000153709.A.e ENSGT00940000154899.fb.a ENSGT00950000183091.B.b ENSGT00940000158489.a.b ENSGT00940000154857.yb.b ENSGT00940000158931 ENSGT01000000215056 Characoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153110.B.e.b ENSGT00940000156977.e ENSGT00940000160913 ENSGT00950000183042.b.b ENSGT00940000161154.a ENSGT00940000159178 ENSGT01050000244850.A.b.a.a.d ENSGT00390000000903.b.a ENSGT00390000016807 ENSGT00940000165151.b ENSGT00940000160046 ENSGT00940000155458.e.a ENSGT00940000159849 ENSGT00940000155308.d ENSGT00940000165533.c ENSGT01050000244866.B.c.a #22 ENSGT00940000159381.d #25 ENSGT01050000244866.D.b.a ##22 ENSGT00390000001562 ENSGT01030000234648.a.b.a.a.a.f.b.b ENSGT00940000155664.a.a ENSGT00940000153820.a ENSGT00390000001414 ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000153709.A.e ENSGT00940000154899.fb.a ENSGT00950000183091.B.b ENSGT00940000158489.a.b ENSGT00940000154857.yb.b ENSGT00940000158931 ENSGT01000000215056 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 53 cfap100 (ENSPNAG00000029969) KLF15 (ENSPNAG00000029961) aldh1l1 (ENSPNAG00000029951) SLC41A3 (ENSPNAG00000029936) CHST13 (ENSPNAG00000004684) txnrd3 (ENSPNAG00000029926) PLXNA1 (ENSPNAG00000029910) chchd6b (ENSPNAG00000029874) tpra1 (ENSPNAG00000029855) ENSPNAG00000029848 LPIN3 (ENSPNAG00000029841) myl9b (ENSPNAG00000029834) TGIF2 (ENSPNAG00000029829) DLGAP4 (ENSPNAG00000029812) quo (ENSPNAG00000029790) tgm2b (ENSPNAG00000029776) #22 ENSPNAG00000029762 #25 tgm5l (ENSPNAG00000006893) ##22 pxmp4 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(ENSDCDG00000035467) tgm2b (ENSDCDG00000035483) #22 ENSDCDG00000035511 #25 tgm5l (ENSDCDG00000015020) ##22 pxmp4 (ENSDCDG00000015025) itcha (ENSDCDG00000015061) NECAB3 (ENSDCDG00000015678) cbfa2t2 (ENSDCDG00000015692) SNTA1 (ENSDCDG00000016443) tlr22 (ENSDCDG00000016451) tox2 (ENSDCDG00000016457) RALGAPB (ENSDCDG00000016481) #17 KCNQ2 (ENSDCDG00000016550) ENSDCDG00000016691 arfrp1 (ENSDCDG00000016693) STMN3 (ENSDCDG00000016696) HELZ2 (ENSDCDG00000016701) Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000156977.e.b ENSGT00940000160913 ENSGT00950000183042.b.a ENSGT00950000183042.b.b.h ENSGT00940000161154.a ENSGT00940000159178.b.a ENSGT01050000244850.A.b.a.a ENSGT01010000223084 ENSGT00390000000903.b.a ENSGT00390000016807.b ENSGT00940000160046 ENSGT00940000155458.c.a ENSGT00940000155230.b.b.b.a ENSGT00940000155308.d ENSGT00940000165533.a ENSGT01050000244866.B.c.a #22 ENSGT00950000183094.b.a.p #23 ENSGT00940000159381.b #25 ENSGT01050000244866.D.b.a ##22 ENSGT00940000157014.h ENSGT00950000183131.a.f ENSGT00950000183176.a.a ENSGT00950000182863.A.a.b ENSGT00940000158764.e ENSGT00700000104550.a.j.a.b #17 ENSGT00700000104550.a.j.a.a #17 ENSGT00940000160093.a ENSGT00940000156407 ENSGT01030000234597.a.b.b.f.h ENSGT00410000025596.a.a ENSGT00940000160694.g.a P. kingsleyae MODERN SPECIES 308 ENSPKIG00000010064 tpra1 (ENSPKIG00000010098) LPIN3 (ENSPKIG00000010167) myl9b (ENSPKIG00000010247) ENSPKIG00000010277 DLGAP4 (ENSPKIG00000010318) tgm2b (ENSPKIG00000010396) #22 RPRD1B (ENSPKIG00000010430) #23 VSTM2L (ENSPKIG00000010454) #25 tgm5l (ENSPKIG00000010469) ##22 ITCH (ENSPKIG00000010515) cbfa2t2 (ENSPKIG00000010565) SNTA1 (ENSPKIG00000010628) tox2 (ENSPKIG00000010730) RALGAPB (ENSPKIG00000010870) #17 Asian bonytongue MODERN SPECIES 14 txnrd3 (ENSSFOG00015019409) ENSSFOG00015025913 ENSSFOG00015019395 txnrd3 (ENSSFOG00015027236) PLXNA1 (ENSSFOG00015019458) chchd6b (ENSSFOG00015019571) tpra1 (ENSSFOG00015032751) LPIN3 (ENSSFOG00015019641) myl9b (ENSSFOG00015019678) ENSSFOG00015019684 DLGAP4 (ENSSFOG00015019695) ENSSFOG00015031459 ENSSFOG00015032394 ENSSFOG00015019751 ENSSFOG00015019791 tgm2b (ENSSFOG00015019841) #22 rprd1b (ENSSFOG00015019874) #23 VSTM2L (ENSSFOG00015019919) #25 tgm5l (ENSSFOG00015019930) ##22 ITCH (ENSSFOG00015019968) ENSSFOG00015025239 ENSSFOG00015031799 cbfa2t2 (ENSSFOG00015020083) SNTA1 (ENSSFOG00015020141) tox2 (ENSSFOG00015020204) RALGAPB (ENSSFOG00015020305) #17 KCNQ2 (ENSSFOG00015020469) CHRNA4 (ENSSFOG00015020486) arfrp1 (ENSSFOG00015020500) STMN3 (ENSSFOG00015020531) GMEB2 (ENSSFOG00015020551) Spotted gar MODERN SPECIES 656 CDK5RAP1 (ENSLOCG00000001505) ENSLOCG00000001496 rpn2 (ENSLOCG00000001480) #33 EPB41L1 (ENSLOCG00000001454) ENSLOCG00000001442 L3MBTL1 (ENSLOCG00000001414) sgk2a (ENSLOCG00000001397) ift52 (ENSLOCG00000001372) ENSLOCG00000001358 mybl2b (ENSLOCG00000001337) LPIN3 (ENSLOCG00000001295) myl9a (ENSLOCG00000001277) ENSLOCG00000001261 DLGAP4 (ENSLOCG00000001238) ENSLOCG00000001193 tgm2b (ENSLOCG00000001167) #22 rprd1b (ENSLOCG00000001144) #23 TTI1 (ENSLOCG00000001130) #24 VSTM2L (ENSLOCG00000001095) #25 ctnnbl1 (ENSLOCG00000001069) #26 tgm5l (ENSLOCG00000001036) ##22 E2F1 (ENSLOCG00000001016) pxmp4 (ENSLOCG00000000996) znf341 (ENSLOCG00000000947) itcha (ENSLOCG00000000888) NECAB3 (ENSLOCG00000000865) cbfa2t2 (ENSLOCG00000000816) SNTA1 (ENSLOCG00000000786) ENSLOCG00000000750 tox2 (ENSLOCG00000000720) ENSLOCG00000000690 Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES 185 ENSGT00950000183154.b.b #32 ENSGT00390000002635 #33 ENSGT00940000158442 ENSGT00940000155448 ENSGT00940000159708 ENSGT00940000153776.a.b ENSGT00390000011581 ENSGT00940000156091.b ENSGT00940000160046 ENSGT00940000155458 ENSGT00940000158052.a.h ENSGT00940000156220 ENSGT00940000155230 ENSGT00940000155308 ENSGT00940000162507.B ENSGT01050000244866.B.c.b #22 ENSGT00950000183094.b.a #23 ENSGT00390000009748 #24 ENSGT00940000159381 #25 ENSGT00390000006931 #26 Neopterygii ANCESTRAL SPECIES 44 ENSGT00940000158442 ENSGT00940000156213 ENSGT00940000159708 ENSGT00940000153776.a.b ENSGT00390000011581 ENSGT00940000156091.b ENSGT00940000160046 ENSGT00940000155458 ENSGT00940000158052.a.h ENSGT00940000156220 ENSGT00940000155230 ENSGT00940000155308 ENSGT00940000165533 ENSGT01050000244866.B.c.a #22 ENSGT00940000162507.B ENSGT01050000244866.B.c.b #22 ENSGT00950000183094.b.a #23 ENSGT00390000009748 #24 ENSGT00940000159381 #25 ENSGT00390000006931 #26 ENSGT01050000244866.D.b.a ##22 ENSGT00940000159472 ENSGT00390000001562 ENSGT00390000000546 ENSGT00940000157014 ENSGT00950000183131.a ENSGT00950000183176.a ENSGT00950000182863.A.a.b ENSGT00940000155581.A ENSGT00940000158764 ENSGT00700000104550.a.j #17 Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 67 ENSGT00940000160913 ENSGT00950000183042.b.b ENSGT00940000161154.a ENSGT00940000159178 ENSGT01050000244850.A.b.b ENSGT00390000000903.b.a ENSGT00390000016807 ENSGT00940000160046 ENSGT00940000155458 ENSGT00940000156220.k ENSGT00940000155230 ENSGT00940000155308.d ENSGT00940000165533 ENSGT01050000244866.B.c.a #22 ENSGT00940000162507.B ENSGT01050000244866.B.c.b #22 ENSGT00950000183094.b.a #23 ENSGT00390000009748 #24 ENSGT00940000159381 #25 ENSGT00390000006931 #26 ENSGT01050000244866.D.b.a ##22 ENSGT00940000159472 ENSGT00390000001562 ENSGT00390000000546 ENSGT00940000157014 ENSGT00950000183131.a.f ENSGT00950000183176.a ENSGT00950000182863.A.a.b ENSGT00940000158764 ENSGT00700000104550.a.j.b #17 ENSGT00940000159925 Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 90 ENSGT00950000182973.a.c.a.d ENSGT00940000157549.b ENSGT00490000043415.k.a ENSGT00490000043415.k.b ENSGT00730000110997 ENSGT00600000084428.a ENSGT00390000013228 ENSGT00940000155806.c.a ENSGT00390000017874.b ENSGT00940000153185.a.a.b ENSGT00940000163310.l ENSGT00940000154967.a.a.a ENSGT00950000182835.d.a.k.b ENSGT00940000155308.c ENSGT00940000165533.d ENSGT01050000244866.B.c.b #22 ENSGT00950000183094.b.a #23 ENSGT00390000009748 #24 ENSGT00940000159381.c #25 ENSGT00390000006931 #26 ENSGT01050000244866.D.b.a ##22 ENSGT00940000159472 ENSGT00390000000546 ENSGT00940000157014.e Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 44 ENSGT00950000182973.a.c.a.d ENSGT00940000157549.b ENSGT00490000043415.k.a ENSGT00490000043415.k.b ENSGT00730000110997 ENSGT00600000084428.a ENSGT00390000013228 ENSGT00940000155806.c.a ENSGT00390000017874.b ENSGT00940000153185.a.a.b ENSGT00940000163310.l ENSGT00940000154967.a.a.a ENSGT00950000182835.d.a.k.b ENSGT00940000155308.c ENSGT00940000165533.d ENSGT01050000244866.B.c.b #22 ENSGT00950000183094.b.a #23 ENSGT00390000009748 #24 ENSGT00940000159381.c #25 ENSGT00390000006931 #26 ENSGT00940000159472 ENSGT00390000000546 ENSGT00940000157014.e ENSGT00940000159898 ENSGT00940000155473.c.a ENSGT00940000159065.a ENSGT00940000163428.a.a.b ENSGT00940000167073 ENSGT00390000000903.b.b ENSGT01050000244850.A.b.a.b ENSGT00940000161154.b Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 132 ENSGT00940000155769.`b.a ENSGT00940000164142 ENSGT00940000167348 ENSGT00950000182810.A.a.a.b ENSGT01100000263545.a.b.c.b ##18 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SPECIES ENSGT00940000155769.`b.a ENSGT00940000156300.j ENSGT00940000164142 ENSGT00940000167348 ENSGT00950000182810.A.a.a.b ENSGT01100000263545.a.b.c.b ##18 ENSGT00490000043380.b #13 ENSGT00720000108866 #12 ENSGT00940000161040.b ENSGT00390000002762.a.a.b.b.b ENSGT00950000182883.b.a.b.b ENSGT00950000183092.a.d.b ENSGT00530000064137.a.a ENSGT00940000159439.a ENSGT00940000162507.B ENSGT01050000244866.B.c.b #22 ENSGT00940000154664.h.n.d ENSGT00950000183094.b.a #23 ENSGT00940000166394 ENSGT00940000163190.h.a.a ENSGT00940000163346.b ENSGT00940000175890 ENSGT00600000084471 ENSGT00390000002461 ENSGT00440000033870.a.a ENSGT00390000004367 ENSGT00390000009368 ENSGT00940000171598 ENSGT00940000154721 ENSGT00940000153341 ENSGT01030000234571.a.b Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000155769.`b.a ENSGT00940000156300.j ENSGT00940000164142 ENSGT00940000167348 ENSGT00950000182810.A.a.a.b ENSGT01100000263545.a.b.c.b ##18 ENSGT00490000043380.b #13 ENSGT00720000108866 #12 ENSGT00940000161040.b ENSGT00390000002762.a.a.b.b.b ENSGT00950000182883.b.a.b.b ENSGT00950000183092.a.d.b ENSGT00530000064137.a.a ENSGT00940000159439.a ENSGT00940000162507.B ENSGT01050000244866.B.c.b #22 ENSGT00940000154664.h.n.d ENSGT00950000183094.b.a #23 ENSGT00940000166394 ENSGT00940000163190.h.a.a ENSGT00940000163346.b ENSGT00940000175890 ENSGT00600000084471 ENSGT00390000002461 ENSGT00440000033870.a.a ENSGT00390000004367 ENSGT00390000009368 ENSGT00940000171598 ENSGT00940000154721 ENSGT00940000153341 ENSGT01030000234571.a.b Nile tilapia MODERN SPECIES 12 VAPB (ENSONIG00000001934) GNAS (ENSONIG00000001943) ENSONIG00000001944 atp5f1e (ENSONIG00000001947) PRELID3B (ENSONIG00000001949) ENSONIG00000001951 ##18 SLC32A1 (ENSONIG00000031364) #13 actr5 (ENSONIG00000001957) #12 NDUFA4L2 (ENSONIG00000028879) SHMT2 (ENSONIG00000001961) NXPH4 (ENSONIG00000036015) stac3 (ENSONIG00000001975) ENSONIG00000033634 kif5aa (ENSONIG00000001977) ENSONIG00000029137 tgm2a (ENSONIG00000001994) #22 ENSONIG00000002008 rprd1b (ENSONIG00000002010) #23 tas1r1 (ENSONIG00000002014) her12 (ENSONIG00000002028) her4.1 (ENSONIG00000029742) UBR4 (ENSONIG00000002035) EMC1 (ENSONIG00000002047) ENSONIG00000028710 zgc:154075 (ENSONIG00000002053) taf10 (ENSONIG00000002055) ENSONIG00000042534 ENSONIG00000041341 ppih (ENSONIG00000002058) ybx1 (ENSONIG00000002062) arhgef16 (ENSONIG00000002067) Midas cichlid MODERN SPECIES 1346 GNAS (ENSACIG00000023586) ENSACIG00000023565 ENSACIG00000023545 atp5f1e (ENSACIG00000023536) PRELID3B (ENSACIG00000023522) ENSACIG00000023515 ##18 SLC32A1 (ENSACIG00000023512) #13 actr5 (ENSACIG00000023509) #12 ENSACIG00000023505 NXPH4 (ENSACIG00000023501) SHMT2 (ENSACIG00000023264) stac3 (ENSACIG00000023213) ENSACIG00000023199 kif5aa (ENSACIG00000023167) ENSACIG00000023112 tgm2a (ENSACIG00000022798) #22 rprd1b (ENSACIG00000022766) #23 tas1r1 (ENSACIG00000022758) her12 (ENSACIG00000022752) her4.1 (ENSACIG00000022747) si:ch73-21g5.7 (ENSACIG00000022735) UBR4 (ENSACIG00000022631) EMC1 (ENSACIG00000022600) ENSACIG00000022590 zgc:154075 (ENSACIG00000022574) taf10 (ENSACIG00000022564) ppih (ENSACIG00000022542) ENSACIG00000022536 ybx1 (ENSACIG00000022321) arhgef16 (ENSACIG00000022282) espn (ENSACIG00000022273) Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT01090000260250 ENSGT00940000156300.j ENSGT00940000164142 ENSGT00940000167348 ENSGT00950000182810.A.a.a.b ENSGT01100000263545.a.b.c.b ##18 ENSGT00490000043380.b #13 ENSGT00720000108866 #12 ENSGT00940000161040.b ENSGT00390000002762.a.a.b.b ENSGT00950000182883.b.a.b.b ENSGT00950000183092.a.d.b ENSGT00530000064137.a.a ENSGT00940000159439.a ENSGT00940000162507.B ENSGT01050000244866.B.c.b #22 ENSGT00950000183094.b.a #23 ENSGT00940000166394 ENSGT00940000163190.h.a.a ENSGT00940000163346.b ENSGT00940000175890 ENSGT00600000084471 ENSGT00390000002461 ENSGT00440000033870.a.a ENSGT00390000004367 ENSGT00390000009368 ENSGT00940000171598 ENSGT00940000154721 ENSGT00940000153341 ENSGT01030000234571.a.b ENSGT00940000160408 Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000155769.`b.a ENSGT01090000260250 ENSGT00940000156300.j ENSGT00940000164142 ENSGT00940000167348 ENSGT00950000182810.A.a.a.b.c ENSGT01100000263545.a.b.c.b ##18 ENSGT00490000043380.b #13 ENSGT00720000108866 #12 ENSGT00940000161040.b ENSGT00390000002762.a.a.b.b ENSGT00950000182883.b.a.b.b ENSGT00950000183092.a.d.b ENSGT00530000064137.a.a ENSGT00940000159439.a ENSGT01050000244866.B.c.b #22 ENSGT00950000183094.b.a #23 ENSGT00940000166394 ENSGT00940000163190.h.a.a ENSGT00940000163346.b ENSGT00940000175890 ENSGT00600000084471 ENSGT00390000002461 ENSGT00440000033870.a.a ENSGT00390000004367 ENSGT00390000009368 ENSGT00940000154721 ENSGT00940000171598 ENSGT00940000153341 ENSGT01030000234571.a.b ENSGT00940000160408 Spiny chromis DUPLICATION Spiny chromis MODERN SPECIES 2813 ENSAPOG00000009223 ENSAPOG00000009245 #22 Spiny chromis MODERN SPECIES 2508 tgm2a (ENSAPOG00000012736) #22 rprd1b (ENSAPOG00000012776) #23 tas1r1 (ENSAPOG00000012784) her12 (ENSAPOG00000012813) her4.2 (ENSAPOG00000012821) Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT01090000260250 ENSGT00940000155769.`b.a ENSGT00940000156300.j ENSGT00940000164142 ENSGT00940000167348 ENSGT00950000182810.A.a.a.b.c ENSGT01100000263545.a.b.c.b ##18 ENSGT00490000043380.b #13 ENSGT00720000108866 #12 ENSGT00940000161040.b ENSGT00390000002762.a.a.b.b ENSGT00950000182883.b.a.b.b ENSGT00950000183092.a.d.b ENSGT00530000064137.a.a ENSGT00940000159439.a ENSGT01050000244866.B.c.b #22 ENSGT00950000183094.b.a #23 ENSGT00940000166394 ENSGT00940000163190.h.a.a.j ENSGT00940000163190.h.a.a.i ENSGT00940000163346.b ENSGT00940000175890 ENSGT00600000084471 ENSGT00390000002461 ENSGT00440000033870.a.a ENSGT00390000004367 ENSGT00390000009368 ENSGT00940000171598 ENSGT00940000154721 ENSGT00940000153341 ENSGT01030000234571.a.b Orange clownfish MODERN SPECIES 22 ENSAPEG00000013240 GNAS (ENSAPEG00000013251) ENSAPEG00000013292 ENSAPEG00000013311 atp5f1e (ENSAPEG00000013340) PRELID3B (ENSAPEG00000013361) ENSAPEG00000013380 ##18 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(ENSSPAG00000002822) #12 NDUFA4L2 (ENSSPAG00000002858) SHMT2 (ENSSPAG00000002882) NXPH4 (ENSSPAG00000002918) stac3 (ENSSPAG00000002956) ENSSPAG00000002982 kif5aa (ENSSPAG00000003008) ENSSPAG00000003080 tgm2a (ENSSPAG00000003164) #22 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000156300.j ENSGT00940000164142 ENSGT00940000167348 ENSGT00950000182810.A.a.a.b ENSGT01100000263545.a.b.c.b ##18 ENSGT00490000043380.b #13 ENSGT00720000108866 #12 ENSGT00940000161040.b ENSGT00390000002762.a.a.b.b ENSGT00950000182883.b.a.b.b ENSGT00950000183092.a.d.b ENSGT00530000064137.a.a ENSGT00960000186992 ENSGT00940000159439.a ENSGT00940000162507.B ENSGT01050000244866.B.c.b #22 ENSGT00940000154664.h.n.d ENSGT00950000183094.b.a #23 ENSGT00940000166394 ENSGT00940000163190.h.a.a ENSGT00940000163346.b ENSGT00940000175890 ENSGT00600000084471 ENSGT00390000002461 ENSGT00440000033870.a.a ENSGT01000000215262 ENSGT00390000004367 ENSGT00390000009368 ENSGT00940000171598 ENSGT00940000154721 ENSGT00940000153341 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000156300.j ENSGT00940000164142 ENSGT00940000167348 ENSGT00950000182810.A.a.a.b ENSGT01100000263545.a.b.c.b ##18 ENSGT00490000043380.b #13 ENSGT00720000108866 #12 ENSGT00940000161040.b ENSGT00390000002762.a.a.b.b ENSGT00950000182883.b.a.b.b ENSGT00950000183092.a.d.b ENSGT00530000064137.a.a ENSGT00960000186992 ENSGT00940000159439.a ENSGT00940000162507.B ENSGT01050000244866.B.c.b #22 ENSGT00940000154664.h.n.d ENSGT00950000183094.b.a #23 ENSGT00940000166394 ENSGT00940000163190.h.a.a ENSGT00940000163346.b ENSGT00940000175890 ENSGT00600000084471 ENSGT00390000002461 ENSGT00440000033870.a.a ENSGT01000000215262 ENSGT00390000004367 ENSGT00390000009368 ENSGT00940000171598 ENSGT00940000154721 ENSGT00940000153341 Carangaria ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000156300.j ENSGT00940000164142 ENSGT00940000167348 ENSGT00950000182810.A.a.a.b ENSGT01100000263545.a.b.c.b ##18 ENSGT00490000043380.b #13 ENSGT00720000108866 #12 ENSGT00940000161040.b 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ENSGT00950000183094.b.a #23 ENSGT00940000166394 ENSGT00940000163190.h.a.a ENSGT00940000163346.b ENSGT00600000084471 ENSGT00390000002461 ENSGT00440000033870.a.a ENSGT01000000215262 ENSGT00390000004367 ENSGT00390000009368 ENSGT00940000171598 ENSGT00940000154721 ENSGT00940000153341 ENSGT01030000234571.a.b Seriola ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000156300.j ENSGT00940000164142 ENSGT00940000167348 ENSGT00950000182810.A.a.a.b ENSGT01100000263545.a.b.c.b ##18 ENSGT00490000043380.b #13 ENSGT00720000108866 #12 ENSGT00940000161040.b ENSGT00390000002762.a.a.b.b ENSGT00950000182883.b.a.b.b ENSGT00950000183092.a.d.b ENSGT00530000064137.a.a ENSGT00940000159439.a ENSGT00960000186992 ENSGT00940000162507.B ENSGT01050000244866.B.c.b #22 ENSGT00940000154664.h.n.d ENSGT00950000183094.b.a #23 ENSGT00940000166394 ENSGT00940000163190.h.a.a ENSGT00940000163346.b ENSGT00600000084471 ENSGT00390000002461 ENSGT00440000033870.a.a ENSGT00390000004367 ENSGT00390000009368 ENSGT00940000171598 ENSGT00940000154721 ENSGT00940000153341 ENSGT01030000234571.a.b ENSGT00940000162571 Greater amberjack MODERN SPECIES 23 ENSSDUG00000020077 ENSSDUG00000020095 atp5f1e (ENSSDUG00000020116) PRELID3B (ENSSDUG00000020123) ENSSDUG00000020147 ##18 SLC32A1 (ENSSDUG00000020196) #13 actr5 (ENSSDUG00000020223) #12 NDUFA4L2 (ENSSDUG00000020233) SHMT2 (ENSSDUG00000020246) NXPH4 (ENSSDUG00000020269) KLHL10 (ENSSDUG00000020282) stac3 (ENSSDUG00000020294) ENSSDUG00000020305 kif5aa (ENSSDUG00000020329) ENSSDUG00000020376 TGM2 (ENSSDUG00000020384) #22 KLHL10 (ENSSDUG00000020403) rprd1b (ENSSDUG00000020412) #23 tas1r1 (ENSSDUG00000020433) ENSSDUG00000020443 her12 (ENSSDUG00000020452) her4.2 (ENSSDUG00000020456) UBR4 (ENSSDUG00000020475) EMC1 (ENSSDUG00000020664) ENSSDUG00000020713 zgc:154075 (ENSSDUG00000020737) taf10 (ENSSDUG00000020784) ppih (ENSSDUG00000020802) ENSSDUG00000020845 ybx1 (ENSSDUG00000020859) arhgef16 (ENSSDUG00000000070) Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 3155 atp5f1e (ENSSLDG00000023311) PRELID3B 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#13 actr5 (ENSLCAG00010000950) #12 NDUFA4L2 (ENSLCAG00010000943) SHMT2 (ENSLCAG00010000819) NXPH4 (ENSLCAG00010000762) stac3 (ENSLCAG00010000750) ENSLCAG00010000744 kif5aa (ENSLCAG00010000601) ENSLCAG00010000465 tgm2a (ENSLCAG00010000374) #22 KLHL10 (ENSLCAG00010000289) rprd1b (ENSLCAG00010000281) #23 tas1r1 (ENSLCAG00010000273) ENSLCAG00010027628 ENSLCAG00010027626 her4.2 (ENSLCAG00010027623) EMC1 (ENSLCAG00010027577) ENSLCAG00010027559 ENSLCAG00010027557 zgc:154075 (ENSLCAG00010027553) taf10 (ENSLCAG00010027550) ENSLCAG00010027547 ppih (ENSLCAG00010027545) ybx1 (ENSLCAG00010027543) arhgef16 (ENSLCAG00010027541) Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000155769.`b.a ENSGT00940000156300.j ENSGT00940000164142 ENSGT00940000167348 ENSGT00950000182810.A.a.a.b ENSGT01100000263545.a.b.c.b ##18 ENSGT00490000043380.b #13 ENSGT00720000108866 #12 ENSGT00940000161040.b ENSGT00950000182883.b.a.b.b ENSGT00950000183092.a.d.b ENSGT00530000064137.a.a ENSGT00960000186992 ENSGT00940000159439.a 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Large yellow croaker MODERN SPECIES 487 snai1b (ENSLCRG00005013873) ENSLCRG00005013871 samhd1 (ENSLCRG00005013032) #37 ENSLCRG00005013025 #37 SLC26A6 (ENSLCRG00005012484) mgll (ENSLCRG00005012466) prkar2aa (ENSLCRG00005012464) ENSLCRG00005012455 stac3 (ENSLCRG00005012448) ENSLCRG00005012445 ENSLCRG00005012443 kif5aa (ENSLCRG00005005717) ENSLCRG00005005659 KLHL10 (ENSLCRG00005005658) ENSLCRG00005005649 tgm2a (ENSLCRG00005004272) #22 KLHL10 (ENSLCRG00005004257) rprd1b (ENSLCRG00005004254) #23 tas1r1 (ENSLCRG00005004100) tas1r1 (ENSLCRG00005003998) ENSLCRG00005003994 ENSLCRG00005003993 her4.2 (ENSLCRG00005003992) UBR4 (ENSLCRG00005000955) EMC1 (ENSLCRG00005019367) ENSLCRG00005019360 zgc:154075 (ENSLCRG00005019357) taf10 (ENSLCRG00005019356) ENSLCRG00005019355 ppih (ENSLCRG00005019308) ybx1 (ENSLCRG00005019297) Perciformes ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000156300.j ENSGT00940000164142 ENSGT00940000167348 ENSGT00950000182810.A.a.a.b ENSGT01100000263545.a.b.c.b ##18 ENSGT00490000043380.b #13 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ENSGT01050000244866.B.c.b #22 ENSGT00940000154664.h.n.d ENSGT00950000183094.b.a #23 ENSGT00940000166394 ENSGT00940000163190.h.a.a ENSGT00940000163346.b ENSGT00390000002461 ENSGT00440000033870.a.a ENSGT00390000004367 ENSGT00390000009368 ENSGT00940000171598 ENSGT00940000154721 ENSGT00940000153341 ENSGT01030000234571.a.b ENSGT00940000160408 ENSGT00940000161602.i Pike perch MODERN SPECIES 7 chmp4bb (ENSSLUG00000005066) VAPB (ENSSLUG00000005083) ENSSLUG00000005108 ENSSLUG00000005128 atp5f1e (ENSSLUG00000005144) PRELID3B (ENSSLUG00000005154) ENSSLUG00000005176 ##18 SLC32A1 (ENSSLUG00000005207) #13 actr5 (ENSSLUG00000005220) #12 NDUFA4L2 (ENSSLUG00000005241) SHMT2 (ENSSLUG00000005459) stac3 (ENSSLUG00000007931) ENSSLUG00000007935 kif5aa (ENSSLUG00000007969) ENSSLUG00000008181 ENSSLUG00000008212 #22 KLHL10 (ENSSLUG00000008322) rprd1b (ENSSLUG00000008333) #23 tas1r1 (ENSSLUG00000008341) ENSSLUG00000008351 her12 (ENSSLUG00000008354) her4.1 (ENSSLUG00000008359) EMC1 (ENSSLUG00000008979) 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ENSCGOG00000000987 arhgef16 (ENSCGOG00000000986) Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000156300.j ENSGT00940000164142 ENSGT00940000167348 ENSGT00950000182810.A.a.a.b ENSGT01100000263545.a.b.c.b ##18 ENSGT00490000043380.b #13 ENSGT00720000108866 #12 ENSGT00940000161040.b ENSGT00390000002762.a.a.b.b ENSGT00950000182883.b.a.b.b ENSGT00940000161131.a.a ENSGT00950000183092.a.d.b ENSGT00530000064137.a.a ENSGT00940000159439.a ENSGT00940000162507.B ENSGT01050000244866.B.c.b #22 ENSGT00940000154664.h.n.d ENSGT00950000183094.b.a #23 ENSGT00940000166394 ENSGT00940000163190.h.a.a ENSGT00940000163346.b ENSGT00600000084471 ENSGT00390000002461 ENSGT00440000033870.a.a ENSGT00390000004367 ENSGT00390000009368 ENSGT00940000154721 ENSGT00940000171598 ENSGT00940000153341 ENSGT01030000234571.a.b ENSGT00940000160408 Lumpfish MODERN SPECIES 22 ENSCLMG00005000819 GNAS (ENSCLMG00005000856) ENSCLMG00005001268 atp5f1e (ENSCLMG00005001271) PRELID3B (ENSCLMG00005001272) ENSCLMG00005001273 ##18 actr5 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ENSLBEG00000006403 kif5aa (ENSLBEG00000006347) ENSLBEG00000006292 tgm2a (ENSLBEG00000006262) #22 KLHL10 (ENSLBEG00000006176) rprd1b (ENSLBEG00000006134) #23 tas1r1 (ENSLBEG00000005946) her12 (ENSLBEG00000005907) her4.1 (ENSLBEG00000005884) si:ch73-21g5.7 (ENSLBEG00000005872) ENSLBEG00000005792 ENSLBEG00000005771 EMC1 (ENSLBEG00000005691) zgc:154075 (ENSLBEG00000005643) taf10 (ENSLBEG00000005615) ENSLBEG00000005597 ppih (ENSLBEG00000005543) ybx1 (ENSLBEG00000005509) arhgef16 (ENSLBEG00000005463) Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000154663.a.a ENSGT00940000155769.`b.a ENSGT00940000156300.j ENSGT00940000164142 ENSGT00940000167348 ENSGT00950000182810.A.a.a.b ENSGT01100000263545.a.b.c.b ##18 ENSGT00490000043380.b #13 ENSGT00720000108866 #12 ENSGT00940000161040.b ENSGT00390000002762.a.a.b.b ENSGT00950000183092.a.d.b ENSGT00530000064137.a.a ENSGT00940000159439.a ENSGT00940000162507.B ENSGT01050000244866.B.c.b #22 ENSGT00950000183094.b.a #23 ENSGT00940000166394 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ENSOMYG00000039754 ENSOMYG00000040053 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000157882.j.b ENSGT00440000034918.g.b.b ENSGT00950000182973.a.c.a.d.d ENSGT00940000157549.b.b ENSGT00490000043415.k.a.a ENSGT00730000110997.i.b ENSGT00600000084428.a.j ENSGT00990000214154 ENSGT00940000155806.c.a.c ENSGT00390000017874.b.a ENSGT00940000153185.a.a.b.g ENSGT00940000154967.a.a.a.a ENSGT00950000182835.d.a.k.b.i ENSGT00940000155308.c.ab ENSGT00940000165533.d.b ENSGT01050000244866.B.c.b #22 ENSGT00950000183094.b.a.k #23 ENSGT00390000009748 #24 ENSGT00940000159381.c.a.b #25 ENSGT00390000006931.a #26 ENSGT00940000159472.g ENSGT00390000000546.r ENSGT00940000157014.e.j ENSGT00940000159898.g ENSGT00940000155473.c.a.d ENSGT00940000159065.a.c ENSGT00940000163428.a.a.b.b ENSGT00940000167073.a ENSGT01050000244850.A.b.a.b.c ENSGT00940000153395.b ENSGT01030000235198.d Coho salmon MODERN SPECIES 16 ENSOKIG00005047337 pacsin1a (ENSOKIG00005047396) SPDEF (ENSOKIG00005047452) ILRUN (ENSOKIG00005047463) SNRPC (ENSOKIG00005047480) BLTP3A (ENSOKIG00005047496) ENSOKIG00005047506 ANKS1A (ENSOKIG00005013688) ENSOKIG00005013807 ENSOKIG00005013814 SCUBE3 (ENSOKIG00005013852) ENSOKIG00005014039 pfkfb2a (ENSOKIG00005014088) DLGAP4 (ENSOKIG00005014253) ENSOKIG00005014262 tgm2a (ENSOKIG00005014316) #22 rprd1b (ENSOKIG00005015687) #23 TTI1 (ENSOKIG00005015710) #24 VSTM2L (ENSOKIG00005015723) #25 CTNNBL1 (ENSOKIG00005015786) #26 ENSOKIG00005016801 E2F1 (ENSOKIG00005016810) znf341 (ENSOKIG00005016833) itchb (ENSOKIG00005016988) CALCRL (ENSOKIG00005018659) VDR (ENSOKIG00005018692) HDAC7 (ENSOKIG00005018759) twist3 (ENSOKIG00005018893) ENSOKIG00005018910 PLXNA1 (ENSOKIG00005019006) mad2l2 (ENSOKIG00005019344) Huchen MODERN SPECIES 39 SPDEF (ENSHHUG00000025441) ilrun (ENSHHUG00000025433) SNRPC (ENSHHUG00000025421) BLTP3A (ENSHHUG00000025391) ANKS1A (ENSHHUG00000025208) ENSHHUG00000025199 C1orf116 (ENSHHUG00000025195) ENSHHUG00000025188 scube3 (ENSHHUG00000025002) ENSHHUG00000024994 pfkfb2a 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ENSGT00940000159381.c #25 ENSGT00390000006931 #26 ENSGT00940000159472 ENSGT00390000000546 ENSGT00940000157014.e Otophysi ANCESTRAL SPECIES 235 ENSGT00390000003324.eb.b ENSGT00410000025596.a.a ENSGT00950000183149.B ENSGT00940000158197.d ENSGT00940000156473.e ENSGT00390000017874.b ENSGT00940000153185.a.a.b ENSGT00940000154967.a.a.a ENSGT00950000182835.d.a.k.b ENSGT00940000155458.e.b ENSGT00940000155308.c ENSGT00940000165533.d ENSGT01050000244866.B.c.b #22 ENSGT00950000183094.b.a #23 ENSGT00390000009748 #24 ENSGT00940000159381.c #25 ENSGT00390000006931 #26 ENSGT00940000159472 ENSGT00390000000546 ENSGT00940000157014.e ENSGT00390000011932 ENSGT00940000163277 ENSGT00940000159922.a.b ENSGT00390000015089.cb.a ENSGT00390000013722 ENSGT00940000156171.h ENSGT00390000004396.h Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000157607 ENSGT00550000075121 ENSGT01050000244939.a.a.b.a.b ENSGT00390000003324.eb.b ENSGT00410000025596.a.a ENSGT00950000183149.B ENSGT00940000158197.d ENSGT00940000156473.e 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ENSGT00390000009748 #24 ENSGT00940000159381.c #25 ENSGT00390000006931 #26 ENSGT00940000159472 ENSGT00390000000546 ENSGT00940000157014.e Characoidei ANCESTRAL SPECIES 318 ENSGT00940000165533.d ENSGT01050000244866.B.d #22 ENSGT01050000244866.B.c.b #22 ENSGT00950000183094.b.a #23 ENSGT00390000009748 #24 ENSGT00940000159381.c #25 ENSGT00390000006931 #26 ENSGT00940000159472 ENSGT00390000000546 ENSGT00940000157014.e Red-bellied piranha MODERN SPECIES 500 ENSPNAG00000026369 TGM2 (ENSPNAG00000004779) #22 tgm2a (ENSPNAG00000027041) #22 rprd1b (ENSPNAG00000027090) #23 TTI1 (ENSPNAG00000004170) #24 VSTM2L (ENSPNAG00000004173) #25 ctnnbl1 (ENSPNAG00000004176) #26 ENSPNAG00000004735 ##22 E2F1 (ENSPNAG00000027177) znf341 (ENSPNAG00000027229) itchb (ENSPNAG00000027443) Mexicana tetra MODERN SPECIES 146 ENSAMXG00000032827 ENSAMXG00000001066 TGM2 (ENSAMXG00000001072) #22 tgm2a (ENSAMXG00000001077) #22 rprd1b (ENSAMXG00000001081) #23 TTI1 (ENSAMXG00000001083) #24 VSTM2L (ENSAMXG00000001086) #25 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ENSGT01050000244866.B.c.b #22 ENSGT00950000183094.b.a #23 ENSGT00390000009748 #24 ENSGT00940000159381.c #25 ENSGT00390000006931 #26 ENSGT00940000159472 ENSGT00390000000546 ENSGT00940000157014.e ENSGT01050000244806.b.a.a.a ENSGT00390000011932 ENSGT00940000163277 ENSGT00940000159922.a.b ENSGT00390000015089.cb.b ENSGT00990000209824 ENSGT00390000015089.cb.a ENSGT00390000013722 Cyprininae DUPLICATION Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000156073.c.b.a.a ENSGT00940000160740.c.a.a ENSGT00940000154327.b.f.b.a ENSGT00390000003324.eb.a ENSGT00410000025596.a.a.b ENSGT00950000183149.B.c ENSGT00940000158197.d.h ENSGT00940000156473.e.c ENSGT00390000017874.b.c ENSGT00940000153185.a.a.b.e ENSGT00940000163310.l.b ENSGT00950000182835.d.a.k.b.b ENSGT00940000155458.e.b.b ENSGT00940000155308.c.bb ENSGT00940000165533.d ENSGT01050000244866.B.c.b.e #22 ENSGT01050000244806.b.a.a.a.a.b.a ENSGT01050000244806.b.a.a.a.a.a ENSGT00950000183094.b.a.m #23 ENSGT00390000009748.c #24 ENSGT00940000159381.c.d #25 ENSGT00390000006931 #26 ENSGT00940000159472.e ENSGT00940000159472.f ENSGT00390000000546 ENSGT00940000157014.e.k ENSGT01050000244806.b.a.a.a.b.a ENSGT00390000011932.f ENSGT00940000159922.a.b ENSGT00390000015089.cb.b ENSGT00390000013722.kc.a Goldfish DUPLICATION Goldfish MODERN SPECIES 298 ENSCARG00000047758 tgm2a (ENSCARG00000047910) #22 Goldfish MODERN SPECIES 1750 ENSCARG00000050434 tgm2a (ENSCARG00000050507) #22 ENSCARG00000050859 Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 302 ENSGT00390000003324.eb.a ENSGT00410000025596.a.a.b ENSGT00950000183149.B.c ENSGT00940000158197.d.h ENSGT00940000156473.e.c ENSGT00390000017874.b.c ENSGT00940000153185.a.a.b.e ENSGT00940000163310.l.b ENSGT00950000182835.d.a.k.b.b ENSGT00940000155458.e.b.b ENSGT00940000155308.c.bb ENSGT00940000165533.d ENSGT01050000244866.B.c.b.e #22 ENSGT01050000244806.b.a.a.a.a.b.a ENSGT00940000163472.i.a.b.b.a.a.b.a.b ENSGT01050000244806.b.a.a.a.a.a ENSGT00950000183094.b.a.m #23 ENSGT00390000009748.c #24 ENSGT00940000159381.c.d #25 ENSGT00390000006931.i #26 ENSGT00940000159472.e ENSGT00390000000546 ENSGT00940000157014.e.k ENSGT01050000244806.b.a.a.a.b.a ENSGT00390000011932.f ENSGT00990000209824.b ENSGT00390000015089.cb.b ENSGT00390000013722.kc.a Common carp reference MODERN SPECIES 49 ENSCCRG00000045429 scp2b (ENSCCRG00000051430) ENSCCRG00000051431 ENSCCRG00000038081 ENSCCRG00000077512 pdyn (ENSCCRG00000038089) ENSCCRG00000081496 ENSCCRG00000081433 stk35 (ENSCCRG00000065562) scube3 (ENSCCRG00000044177) ENSCCRG00000044161 pfkfb2a (ENSCCRG00000043523) myl9a (ENSCCRG00000056616) ENSCCRG00000030321 ENSCCRG00000018501 tgm2a (ENSCCRG00000018521) #22 ENSCCRG00000030441 ENSCCRG00000062982 ENSCCRG00000030484 ENSCCRG00000066221 ENSCCRG00000079777 rprd1b (ENSCCRG00000030457) #23 TTI1 (ENSCCRG00000030450) #24 VSTM2L (ENSCCRG00000064825) #25 CTNNBL1 (ENSCCRG00000063142) #26 itchb (ENSCCRG00000024242) ENSCCRG00000072053 slc10a7 (ENSCCRG00000044863) ENSCCRG00000060785 otud4 (ENSCCRG00000044879) abce1 (ENSCCRG00000054752) Golden-line barbel MODERN SPECIES 1341 pfkfb2a (ENSSGRG00000043867) myl9a (ENSSGRG00000043868) ENSSGRG00000043896 ENSSGRG00000043899 ift20 (ENSSGRG00000043901) rad1 (ENSSGRG00000043903) ENSSGRG00000043932 tgm2a (ENSSGRG00000043937) #22 ENSSGRG00000044252 ENSSGRG00000044253 Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 1062 ENSGT01050000244866.B.c.b.f #22 ENSGT00950000183094.b.a.n #23 ENSGT00390000009748.d #24 ENSGT00940000159381.c.c #25 Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01050000244866.B.c.b.f #22 Golden-line barbel MODERN SPECIES 388 ENSSGRG00000029736 scube3 (ENSSGRG00000029738) ENSSGRG00000029741 pfkfb2a (ENSSGRG00000029742) ENSSGRG00000029794 DLGAP4 (ENSSGRG00000029796) tgm2a (ENSSGRG00000029797) #22 rprd1b (ENSSGRG00000029801) #23 TTI1 (ENSSGRG00000029802) #24 VSTM2L (ENSSGRG00000029805) #25 ctnnbl1 (ENSSGRG00000029806) #26 znf410 (ENSSGRG00000029809) E2F1 (ENSSGRG00000029810) znf341 (ENSSGRG00000029811) itchb (ENSSGRG00000029874) slc10a7 (ENSSGRG00000031936) otud4 (ENSSGRG00000031941) ABCE1 (ENSSGRG00000031953) anapc10 (ENSSGRG00000032443) rnf150b (ENSSGRG00000032445) ENSSGRG00000032446 ENSSGRG00000032450 Zebrafish MODERN SPECIES 15 ENSDARG00000103766 cyp2aa8 (ENSDARG00000104540) ENSDARG00000103456 cyp2aa4 (ENSDARG00000098803) cyp2aa9 (ENSDARG00000098890) cyp2aa1 (ENSDARG00000099003) cyp2aa2 (ENSDARG00000104811) cyp2aa3 (ENSDARG00000103347) ENSDARG00000013524 ENSDARG00000110366 ENSDARG00000091584 pfkfb2a (ENSDARG00000023840) myl9a (ENSDARG00000038123) ENSDARG00000060849 ENSDARG00000103586 tgm2a (ENSDARG00000070157) #22 ENSDARG00000094316 zgc:174862 (ENSDARG00000077571) rprd1b (ENSDARG00000038113) #23 TTI1 (ENSDARG00000004114) #24 E2F1 (ENSDARG00000103868) znf341 (ENSDARG00000103725) itchb (ENSDARG00000099199) ENSDARG00000100939 slc10a7 (ENSDARG00000104508) otud4 (ENSDARG00000077810) abce1 (ENSDARG00000007216) anapc10 (ENSDARG00000090152) ENSDARG00000054548 rnf150b (ENSDARG00000009524) ENSDARG00000088882 Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT01050000244866.B.c.b #22 Atlantic herring MODERN SPECIES 20 snx21 (ENSCHAG00000021688) ENSCHAG00000021696 PIGT (ENSCHAG00000021719) phactr3a (ENSCHAG00000021830) ppp1r3da (ENSCHAG00000021849) ENSCHAG00000021858 ttll9 (ENSCHAG00000021869) edn3b (ENSCHAG00000021996) EPB41L1 (ENSCHAG00000022006) ENSCHAG00000022308 ENSCHAG00000022342 ENSCHAG00000023335 ENSCHAG00000023632 PDZRN3 (ENSCHAG00000024277) ppp4r2a (ENSCHAG00000024286) tgm2a (ENSCHAG00000000205) #22 tmem115 (ENSCHAG00000000451) ENSCHAG00000000515 sema3h (ENSCHAG00000000572) borcs6 (ENSCHAG00000000752) si:dkey-72l14.3 (ENSCHAG00000000922) xpc (ENSCHAG00000001180) taf8 (ENSCHAG00000001815) ENSCHAG00000001946 ENSCHAG00000001975 ENSCHAG00000001981 ENSCHAG00000002034 ENSCHAG00000002311 ENSCHAG00000002463 ENSCHAG00000002471 PLXNA2 (ENSCHAG00000003239) Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 228 ENSGT00940000165533.b ENSGT01050000244866.B.c.b #22 ENSGT00950000183094.b.a.o #23 ENSGT00390000009748 #24 ENSGT00940000159381.a #25 ENSGT00390000006931 #26 ENSGT00940000159472 ENSGT00390000001562 ENSGT00390000000546 ENSGT00940000157014.g ENSGT00950000183131.a.e ENSGT00950000183176.a.b ENSGT00940000155581.A ENSGT00390000003022 ENSGT00950000182945.b.a.a.a.b.b ENSGT00390000016016.B ENSGT00940000161969.k Asian bonytongue MODERN SPECIES 10 LHFPL4 (ENSSFOG00015015498) CPNE9 (ENSSFOG00015031295) ENSSFOG00015015452 KLF15 (ENSSFOG00015026322) ENSSFOG00015015400 CHST13 (ENSSFOG00015015388) txnrd3 (ENSSFOG00015015359) PLXNA1 (ENSSFOG00015015272) chchd6a (ENSSFOG00015015245) tpra1 (ENSSFOG00015015214) ENSSFOG00015032159 myl9b (ENSSFOG00015028858) ENSSFOG00015025668 DLGAP4 (ENSSFOG00015015142) ENSSFOG00015015078 tgm2a (ENSSFOG00015014823) #22 TTI1 (ENSSFOG00015014779) #24 VSTM2L (ENSSFOG00015014771) #25 ctnnbl1 (ENSSFOG00015014743) #26 E2F1 (ENSSFOG00015014719) pxmp4 (ENSSFOG00015014711) znf341 (ENSSFOG00015014678) itcha (ENSSFOG00015014587) NECAB3 (ENSSFOG00015014544) ENSSFOG00015014510 SLC7A5 (ENSSFOG00015014487) uba1 (ENSSFOG00015014366) ndufb11 (ENSSFOG00015032071) ENSSFOG00015014338 tpk2 (ENSSFOG00015014311) tktb (ENSSFOG00015014262) Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT01050000244866.B.d #22 Neopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT01050000244866.B.d #22 Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES ENSGT01050000244866.B.d #22 Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES ENSGT01050000244866.B.d #22 Otomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT01050000244866.B.d #22 Otophysi ANCESTRAL SPECIES ENSGT01050000244866.B.d #22 Characiphysae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01050000244866.B.d #22 Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 180 ENSGT01050000244939.a.a.b.a.b ENSGT00390000003324.eb.b ENSGT00410000025596.a.a ENSGT00950000183149.B ENSGT00940000158197.d ENSGT00940000156473.e ENSGT00390000017874.b ENSGT00940000153185.a.a.b ENSGT00940000154967.a.a.a ENSGT00950000182835.d.a.k.b ENSGT00940000155458.e.b ENSGT00940000155308.c ENSGT00940000165533.d ENSGT01050000244866.B.d #22 ENSGT01050000244866.B.c.b #22 ENSGT00950000183094.b.a #23 ENSGT00390000009748 #24 ENSGT00940000159381.c #25 ENSGT00390000006931 #26 ENSGT00940000159472 ENSGT00390000000546 ENSGT00940000157014.e Characoidei ANCESTRAL SPECIES 318 ENSGT00940000165533.d ENSGT01050000244866.B.d #22 ENSGT01050000244866.B.c.b #22 ENSGT00950000183094.b.a #23 ENSGT00390000009748 #24 ENSGT00940000159381.c #25 ENSGT00390000006931 #26 ENSGT00940000159472 ENSGT00390000000546 ENSGT00940000157014.e Mexicana tetra MODERN SPECIES 146 ENSAMXG00000032827 ENSAMXG00000001066 TGM2 (ENSAMXG00000001072) #22 tgm2a (ENSAMXG00000001077) #22 rprd1b (ENSAMXG00000001081) #23 TTI1 (ENSAMXG00000001083) #24 VSTM2L (ENSAMXG00000001086) #25 ENSAMXG00000037780 ctnnbl1 (ENSAMXG00000016978) #26 E2F1 (ENSAMXG00000016947) znf341 (ENSAMXG00000016921) itchb (ENSAMXG00000016876) ENSAMXG00000038141 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 500 ENSPNAG00000026369 TGM2 (ENSPNAG00000004779) #22 tgm2a (ENSPNAG00000027041) #22 rprd1b (ENSPNAG00000027090) #23 TTI1 (ENSPNAG00000004170) #24 VSTM2L (ENSPNAG00000004173) #25 ctnnbl1 (ENSPNAG00000004176) #26 ENSPNAG00000004735 ##22 E2F1 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