Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00950000183171.A.b.a.a #8 ENSGT00940000158321 #9 ENSGT00390000015280 #10 ENSGT00530000065159 #11 ENSGT00940000158562 #12 ENSGT00940000158733 #13 ENSGT00940000156571 #15 ENSGT00940000155967 #17 ENSGT00510000047710 #18 ENSGT00940000161622 #19 ENSGT00940000153725.b #20 ENSGT00530000063775 ENSGT00950000182909.a #21 ENSGT00940000154484.B.a.a ENSGT00940000163637 ENSGT01010000222287.B.b.b #22 ENSGT00390000014071 ENSGT00950000183142.a.a #27 ENSGT00940000155570 #28 ENSGT00940000155496.b #30 ENSGT00390000008903 #31 ENSGT00940000155496.a.a ##30 ENSGT00940000165045 ENSGT00390000002743 #32 ENSGT00390000009065 #33 ENSGT01050000244838.H.c #34 ENSGT00950000182976.b.b #35 ENSGT00660000097043 ENSGT00510000051272 ENSGT00950000183297 ENSGT00940000155674 #36 Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00950000183171.A.b.a.a #8 ENSGT00940000158321 #9 ENSGT00390000015280 #10 ENSGT00530000065159 #11 ENSGT00940000158562 #12 ENSGT00940000158733 #13 ENSGT00390000006243 #14 ENSGT00940000156571 #15 ENSGT00940000155967 #17 ENSGT00510000047710 #18 ENSGT00940000161622 #19 ENSGT00940000153725.b #20 ENSGT00950000182909.a #21 ENSGT00940000154484.B.a.a ENSGT00940000163637 ENSGT01010000222287.B.b.b #22 ENSGT00390000014071 ENSGT00950000183142.a.a #27 ENSGT00940000155570 #28 ENSGT00940000155496.b #30 ENSGT00390000008903 #31 ENSGT00940000165045 ENSGT00390000002743 #32 ENSGT00390000009065 #33 ENSGT01050000244838.H.c #34 ENSGT00950000182976.b.b #35 ENSGT00660000097043 ENSGT00510000051272 ENSGT00950000183297 ENSGT00940000155674 #36 ENSGT00940000157368 Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES ENSGT01010000222287.B.b.b #22 Amniota ANCESTRAL SPECIES ENSGT01010000222287.B.b.b #22 Mammalia ANCESTRAL SPECIES ENSGT01010000222287.B.b.b #22 Theria ANCESTRAL SPECIES ENSGT01010000222287.B.b.b #22 Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT01010000222287.B.b.b #22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT01010000222287.B.b.b #22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT01010000222287.B.b.b #22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT01010000222287.B.b.b #22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT01010000222287.B.b.b #22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT01010000222287.B.b.b #22 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT01010000222287.B.b.b #22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT01010000222287.B.b.b #22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT01010000222287.B.b.b #22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT01010000222287.B.b.b #22 Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01010000222287.B.b.b #22 Rat MODERN SPECIES 11 Erbin (ENSRNOG00000047137) #7 Nln (ENSRNOG00000011561) #8 Sgtb (ENSRNOG00000011937) #9 Trappc13 (ENSRNOG00000012124) #10 Shld3 (ENSRNOG00000066555) #11 Trim23 (ENSRNOG00000012354) #12 Ppwd1 (ENSRNOG00000012505) #13 Cenpk (ENSRNOG00000039740) #14 Adamts6 (ENSRNOG00000012655) #15 ENSRNOG00000069632 #16 Cwc27 (ENSRNOG00000013252) #17 Srek1ip1-ps1 (ENSRNOG00000047506) #18 Shisal2b (ENSRNOG00000013372) #19 Rgs7bp (ENSRNOG00000013389) #20 Rnf180 (ENSRNOG00000043329) #21 Htr1a (ENSRNOG00000010254) #22 LOC499522 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ENSGT00530000065159 #11 ENSGT00940000158562 #12 ENSGT00940000158733 #13 ENSGT00390000006243 #14 ENSGT00940000156571 #15 ENSGT00940000155967 #17 ENSGT00510000047710 #18 ENSGT00940000153725.b #20 ENSGT00950000182909.a #21 ENSGT01010000222287.B.b.b #22 ENSGT00390000014071 ENSGT00940000163637 ENSGT00950000183142.a.a #27 ENSGT00940000155570.j.b #28 ENSGT00940000155496.b.d.a #30 ENSGT00940000165045 ENSGT00390000002743 #32 ENSGT00390000009065 #33 ENSGT01050000244838.H.c #34 ENSGT00950000182976.b.b #35 ENSGT00510000051272 ENSGT01030000234840 ENSGT00940000155674 #36 ENSGT00940000157368 ENSGT00940000158739 Great tit MODERN SPECIES 642 MAST4 (ENSPMJG00000016119) ENSPMJG00000016117 SREK1 (ENSPMJG00000016116) ERBIN (ENSPMJG00000016115) #7 NLN (ENSPMJG00000016112) #8 SGTB (ENSPMJG00000016111) #9 TRAPPC13 (ENSPMJG00000016110) #10 TRIM23 (ENSPMJG00000016109) #12 PPWD1 (ENSPMJG00000016108) #13 CENPK (ENSPMJG00000016107) #14 ADAMTS6 (ENSPMJG00000016106) #15 CWC27 (ENSPMJG00000016105) #17 ENSPMJG00000016104 RGS7BP (ENSPMJG00000016103) #20 RNF180 (ENSPMJG00000016101) #21 ENSPMJG00000016099 #22 ZSWIM6 (ENSPMJG00000016098) #30 KIF2A (ENSPMJG00000016096) #28 DIMT1 (ENSPMJG00000016095) #27 IPO11 (ENSPMJG00000016094) ENSPMJG00000016089 NDUFAF2 (ENSPMJG00000016088) #32 ERCC8 (ENSPMJG00000016087) #33 ELOVL7 (ENSPMJG00000016086) #34 DEPDC1B (ENSPMJG00000016085) #35 ENSPMJG00000016083 ENSPMJG00000016082 PDE4D (ENSPMJG00000016081) #36 RAB3C (ENSPMJG00000016080) PLK2 (ENSPMJG00000016079) GPBP1 (ENSPMJG00000016075) Passeriformes_d ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000167247 ENSGT00730000110872.a ENSGT00940000159526 #7 ENSGT00950000183171.A.b.a.a #8 ENSGT00940000158321 #9 ENSGT00390000015280 #10 ENSGT00530000065159 #11 ENSGT00940000158562 #12 ENSGT00940000158733 #13 ENSGT00390000006243 #14 ENSGT00940000156571 #15 ENSGT00940000155967 #17 ENSGT00510000047710 #18 ENSGT00940000153725.b #20 ENSGT00950000182909.a #21 ENSGT01010000222287.B.b.b #22 ENSGT00390000014071 ENSGT00940000163637 ENSGT00950000183142.a.a #27 ENSGT00940000155570.j.b #28 ENSGT00940000155496.b.d.a #30 ENSGT00940000165045 ENSGT00390000002743 #32 ENSGT00390000009065 #33 ENSGT01050000244838.H.c #34 ENSGT00950000182976.b.b #35 ENSGT00510000051272 ENSGT01030000234840 ENSGT00940000155674 #36 ENSGT00940000157368 ENSGT00940000158739 Passeriformes_g ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000156399 ENSGT00730000110872.a ENSGT00940000159526 #7 ENSGT00950000183171.A.b.a.a #8 ENSGT00940000158321 #9 ENSGT00390000015280 #10 ENSGT00530000065159 #11 ENSGT00940000158562 #12 ENSGT00940000158733 #13 ENSGT00390000006243 #14 ENSGT00940000156571 #15 ENSGT00940000155967 #17 ENSGT00510000047710 #18 ENSGT00940000153725.b #20 ENSGT00950000182909.a #21 ENSGT01010000222287.B.b.b #22 ENSGT00390000014071 ENSGT00940000163637 ENSGT00950000183142.a.a #27 ENSGT00940000155570.j.b #28 ENSGT00940000155496.b.d.a #30 ENSGT00940000165045 ENSGT00390000002743 #32 ENSGT00390000009065 #33 ENSGT01050000244838.H.c #34 ENSGT00950000182976.b.b #35 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ENSGT00940000158733 #13 ENSGT00390000006243 #14 ENSGT00940000156571 #15 ENSGT00940000155967 #17 ENSGT00510000047710 #18 ENSGT00940000153725.b #20 ENSGT00950000182909.a #21 ENSGT00940000154484.B.a.a ENSGT01010000222287.B.b.b #22 ENSGT00940000163637 ENSGT00390000014071 ENSGT00950000183142.a.a #27 ENSGT00940000155570 #28 ENSGT00940000155496.b.c #30 ENSGT00940000165045 ENSGT00390000008903 #31 ENSGT00390000002743 #32 ENSGT00390000009065 #33 ENSGT01050000244838.H.c #34 ENSGT00950000182976.b.b #35 ENSGT00510000051272 ENSGT00940000155674 #36 ENSGT00940000157368 ENSGT00940000158739 Duck MODERN SPECIES 4281 ENSAPLG00000020460 SREK1 (ENSAPLG00000003948) ERBIN (ENSAPLG00000002753) #7 NLN (ENSAPLG00000001243) #8 SGTB (ENSAPLG00000029083) #9 TRAPPC13 (ENSAPLG00000014926) #10 SHLD3 (ENSAPLG00000000697) #11 TRIM23 (ENSAPLG00000009065) #12 PPWD1 (ENSAPLG00000009096) #13 CENPK (ENSAPLG00000009176) #14 ADAMTS6 (ENSAPLG00000009190) #15 CWC27 (ENSAPLG00000009278) #17 SREK1IP1 (ENSAPLG00000009287) #18 RGS7BP (ENSAPLG00000009292) #20 RNF180 (ENSAPLG00000009315) #21 ENSAPLG00000022536 #22 IPO11 (ENSAPLG00000009338) DIMT1 (ENSAPLG00000009464) #27 KIF2A (ENSAPLG00000009519) #28 ZSWIM6 (ENSAPLG00000006992) #30 ENSAPLG00000021244 NDUFAF2 (ENSAPLG00000009796) #32 ERCC8 (ENSAPLG00000009673) #33 ELOVL7 (ENSAPLG00000009660) #34 DEPDC1B (ENSAPLG00000009617) #35 ENSAPLG00000017301 PDE4D (ENSAPLG00000005416) #36 RAB3C (ENSAPLG00000005718) PLK2 (ENSAPLG00000005719) GPBP1 (ENSAPLG00000006435) SETD9 (ENSAPLG00000030605) Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT01010000222287.B.b.b #22 Episquamata ANCESTRAL SPECIES ENSGT01010000222287.B.b.b #22 Laterata ANCESTRAL SPECIES ENSGT01010000222287.B.b.b #22 Argentine black and white tegu MODERN SPECIES 10 CD180 (ENSSMRG00000000711) MAST4 (ENSSMRG00000000438) SREK1 (ENSSMRG00000000402) ERBIN (ENSSMRG00000000269) #7 NLN (ENSSMRG00000000147) #8 SGTB (ENSSMRG00000000115) #9 TRAPPC13 (ENSSMRG00000000020) #10 TRIM23 (ENSSMRG00000019930) #12 PPWD1 (ENSSMRG00000019929) #13 CENPK (ENSSMRG00000019928) #14 ADAMTS6 (ENSSMRG00000019925) #15 CWC27 (ENSSMRG00000019919) #17 SREK1IP1 (ENSSMRG00000019916) #18 RGS7BP (ENSSMRG00000019913) #20 RNF180 (ENSSMRG00000019912) #21 ENSSMRG00000019910 #22 IPO11 (ENSSMRG00000019906) DIMT1 (ENSSMRG00000019904) #27 KIF2A (ENSSMRG00000019023) #28 ZSWIM6 (ENSSMRG00000019019) #30 NDUFAF2 (ENSSMRG00000019017) #32 ERCC8 (ENSSMRG00000019016) #33 ELOVL7 (ENSSMRG00000019015) #34 DEPDC1B (ENSSMRG00000019014) #35 ENSSMRG00000019011 ENSSMRG00000019010 PDE4D (ENSSMRG00000018951) #36 ENSSMRG00000018950 RAB3C (ENSSMRG00000018949) PLK2 (ENSSMRG00000018948) GPBP1 (ENSSMRG00000018947) Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT01010000222287.B.b.b #22 Neopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT01010000222287.B.b.b #22 Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 604 ENSGT00940000153725.b.d #20 ENSGT00950000182909.a.f #21 ENSGT01010000222287.B.b.b #22 Clupeocephala DUPLICATION Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 78 ENSGT00940000157299.c ENSGT00950000182964.a.b.a.a.a ENSGT00940000160343 ENSGT00940000165543 ENSGT00940000154668 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00940000165107.B ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.b.d.a ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156804.a ENSGT00940000153725.b.d #20 ENSGT00530000063775.b ENSGT00950000182909.a.f #21 ENSGT01010000222287.B.b.b.a #22 ENSGT00390000014071 ENSGT00940000160266 ENSGT00940000163752 ENSGT00940000161328 ENSGT00940000159011 ENSGT00390000016390 ENSGT00940000155211 ENSGT00940000155876 ENSGT00940000164995 ENSGT00640000091523 ENSGT00940000157140.a ENSGT00940000158126 ENSGT00730000113416 ENSGT00940000155496.a.a ##30 ENSGT00940000165045 Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00940000157299.c ENSGT00950000182964.a.b.a.a.a ENSGT00940000160343 ENSGT00940000165543 ENSGT00940000154668 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00940000165107.B ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.b.d.a ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156804.a ENSGT00940000153725.b.d #20 ENSGT00530000063775.b ENSGT00950000182909.a.f #21 ENSGT01010000222287.B.b.b.a #22 ENSGT00390000014071 ENSGT00940000160266 ENSGT00940000161328 ENSGT00940000159011 ENSGT00390000016390 ENSGT00940000155211 ENSGT00940000155876 ENSGT00940000164995 ENSGT00640000091523 ENSGT00940000157140.a ENSGT00940000158126 ENSGT00390000005250 ENSGT00730000113416 ENSGT00940000155496.a.a ##30 ENSGT00940000165045 Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 307 ENSGT00530000063775.b ENSGT00950000182909.a.f #21 ENSGT01010000222287.B.b.b.a #22 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 580 ENSGT00940000153725.b.d.c #20 ENSGT00530000063775.b.a.a ENSGT00530000063775.b.a.b ENSGT00950000182909.a.f #21 ENSGT01010000222287.B.b.b.a #22 ENSGT00390000014071 ENSGT00390000018644 ENSGT00390000000543.a ENSGT00940000158560.e ENSGT00940000161618.a ENSGT00440000038604.j.e ENSGT00940000154149.a.b.c ENSGT00940000155127.a.b.e ENSGT00950000183002.B.a.a.i.a ENSGT00530000063843.a.e ENSGT00390000014658.l ENSGT00950000182975.a.a.b.k.e Huchen DUPLICATION Huchen MODERN SPECIES 337 ENSHHUG00000041093 gadd45ga (ENSHHUG00000041086) creb3l3l (ENSHHUG00000041079) ENSHHUG00000041072 znf131 (ENSHHUG00000041067) ENSHHUG00000041055 ghra (ENSHHUG00000041052) FBXO4 (ENSHHUG00000041050) rimoc1 (ENSHHUG00000041046) oxct1a (ENSHHUG00000040999) plcxd3 (ENSHHUG00000040990) ENSHHUG00000040878 rgs7bpa (ENSHHUG00000040850) #20 ENSHHUG00000040844 ENSHHUG00000040829 #21 htr1aa (ENSHHUG00000040821) #22 ipo11 (ENSHHUG00000040809) dph7 (ENSHHUG00000040794) paxx (ENSHHUG00000040754) ABCA2 (ENSHHUG00000040713) FUT7 (ENSHHUG00000040712) ENSHHUG00000040710 niban2b (ENSHHUG00000040704) stxbp1b (ENSHHUG00000040626) WHRN (ENSHHUG00000040551) ENSHHUG00000040533 ubac1 (ENSHHUG00000040432) camsap1b (ENSHHUG00000040422) Huchen MODERN SPECIES 3596 htr1aa (ENSHHUG00000045306) #22 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 50 ENSGT00940000155899.f.a ENSGT00520000055591.b.d ENSGT00670000098074.h ENSGT00940000160237.b ENSGT01010000222762.a.b ENSGT00990000212022 ENSGT00510000049555.f ENSGT00940000154668.h ENSGT00510000049326.b.b.f ENSGT00940000165107.B.c ENSGT00390000011383.j ENSGT00390000009130.b.d.a.e ENSGT00940000158747.i ENSGT00940000153725.b.d.c #20 ENSGT00530000063775.b.a.a ENSGT01010000222287.B.b.b.a #22 ENSGT00950000185904 #26 ENSGT00390000000543.b ENSGT00940000158560.f ENSGT00940000161618.b ENSGT00440000038604.j.f ENSGT00940000154149.a.b.d ENSGT00940000155127.a.b.f ENSGT00950000183002.B.a.a.i.b ENSGT00530000063843.a.f ENSGT00390000014658.m ENSGT00950000182975.a.a.b.k.f.b ENSGT00940000156880.c.b.f ENSGT00940000155161.y.a ENSGT00940000162727.a.a.b ENSGT00940000153189.B Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000155899.f.a ENSGT00520000055591.b.d ENSGT00670000098074.h ENSGT00940000160237.b ENSGT01010000222762.a.b ENSGT00990000212022 ENSGT00510000049555.f ENSGT00940000154668.h ENSGT00510000049326.b.b.f ENSGT00940000165107.B.c ENSGT00390000011383.j ENSGT00390000009130.b.d.a.e ENSGT00940000158747.i ENSGT00940000153725.b.d.c #20 ENSGT00530000063775.b.a.a ENSGT01010000222287.B.b.b.a #22 ENSGT00950000185904 #26 ENSGT00390000000543.b ENSGT00940000158560.f ENSGT00940000161618.b ENSGT00440000038604.j.f ENSGT00940000154149.a.b.d ENSGT00940000155127.a.b.f ENSGT00950000183002.B.a.a.i.b ENSGT00530000063843.a.f ENSGT00390000014658.m ENSGT00950000182975.a.a.b.k.f.b ENSGT00940000156880.c.b.f ENSGT00940000155161.y.a ENSGT00940000162727.a.a.b ENSGT00940000153189.B Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000157299.c.f ENSGT00510000048363 ENSGT00940000155899.f.a ENSGT00520000055591.b.d ENSGT00670000098074.h ENSGT00940000160237.b ENSGT00510000049555.f ENSGT00940000154668.h ENSGT00510000049326.b.b.f ENSGT00940000165107.B.c ENSGT00390000011383.j ENSGT00390000009130.b.d.a.e ENSGT00940000158747.i ENSGT00940000153725.b.d.c #20 ENSGT00530000063775.b.a.a ENSGT01010000222287.B.b.b.a #22 ENSGT00950000185904 #26 ENSGT00390000000543.b ENSGT00940000158560.f ENSGT00940000161618.b ENSGT00940000154149.a.b.d ENSGT00940000155127.a.b.f ENSGT00950000183002.B.a.a.i.b ENSGT00530000063843.a.f ENSGT00390000014658.m ENSGT00950000182975.a.a.b.k.f.b ENSGT00940000156880.c.b.f ENSGT00940000155161.y.a ENSGT00940000162727.a.a.b ENSGT00940000153189.B ENSGT00940000163579 Chinook salmon MODERN SPECIES 3 efna5b (ENSOTSG00005018367) PRXL2C (ENSOTSG00005018363) ENSOTSG00005018360 ENSOTSG00005018351 znf367 (ENSOTSG00005018347) SLC35D2 (ENSOTSG00005018346) ubox5 (ENSOTSG00005018342) znf131 (ENSOTSG00005018315) ENSOTSG00005018311 ghra (ENSOTSG00005018304) rimoc1 (ENSOTSG00005018294) oxct1a (ENSOTSG00005011807) plcxd3 (ENSOTSG00005011799) rgs7bpa (ENSOTSG00005011763) #20 ENSOTSG00005011762 htr1aa (ENSOTSG00005011761) #22 ENSOTSG00005011760 #26 FUT7 (ENSOTSG00005011757) niban2b (ENSOTSG00005011553) stxbp1b (ENSOTSG00005011291) WHRN (ENSOTSG00005011287) noxa1 (ENSOTSG00005011285) ubac1 (ENSOTSG00005011282) camsap1b (ENSOTSG00005011172) KCNT1 (ENSOTSG00005010655) ENSOTSG00005010652 ppil3 (ENSOTSG00005010646) LRRC8A (ENSOTSG00005010645) hscb (ENSOTSG00005010644) rtn4r (ENSOTSG00005010643) SCARF2 (ENSOTSG00005010642) Coho salmon MODERN SPECIES 28 ENSOKIG00005037757 ENSOKIG00005037612 znf367 (ENSOKIG00005037587) ENSOKIG00005037441 ENSOKIG00005037421 ENSOKIG00005037403 ubox5 (ENSOKIG00005037372) znf131 (ENSOKIG00005037348) ENSOKIG00005037335 ghra (ENSOKIG00005037268) rimoc1 (ENSOKIG00005037233) oxct1a (ENSOKIG00005031847) plcxd3 (ENSOKIG00005031591) rgs7bpa (ENSOKIG00005031498) #20 ENSOKIG00005031469 ENSOKIG00005031452 #22 ENSOKIG00005031449 #26 ENSOKIG00005031443 ABCA2 (ENSOKIG00005030990) FUT7 (ENSOKIG00005030943) niban2b (ENSOKIG00005024132) stxbp1b (ENSOKIG00005021395) WHRN (ENSOKIG00005021200) noxa1 (ENSOKIG00005021180) ubac1 (ENSOKIG00005021141) camsap1b (ENSOKIG00005020910) KCNT1 (ENSOKIG00005014410) ENSOKIG00005014128 ENSOKIG00005014110 PPIL3 (ENSOKIG00005014086) LRRC8A (ENSOKIG00005014071) Rainbow trout MODERN SPECIES 2 ENSOMYG00000019502 ENSOMYG00000058833 znf367 (ENSOMYG00000019562) ENSOMYG00000019599 ENSOMYG00000019636 ubox5 (ENSOMYG00000019647) ENSOMYG00000063957 znf131 (ENSOMYG00000019538) ENSOMYG00000019658 ghra (ENSOMYG00000019673) rimoc1 (ENSOMYG00000019700) oxct1a (ENSOMYG00000019820) plcxd3 (ENSOMYG00000020978) rgs7bpa (ENSOMYG00000021006) #20 ENSOMYG00000021017 htr1aa (ENSOMYG00000021022) #22 ENSOMYG00000021026 ENSOMYG00000057586 ENSOMYG00000021540 ENSOMYG00000069883 ENSOMYG00000025308 niban2b (ENSOMYG00000026086) stxbp1b (ENSOMYG00000028858) ENSOMYG00000029199 noxa1 (ENSOMYG00000029250) ENSOMYG00000029888 camsap1b (ENSOMYG00000029735) ENSOMYG00000030451 col27a1b (ENSOMYG00000065872) ENSOMYG00000050168 ENSOMYG00000011684 Salmo ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00520000055591.b.d ENSGT00670000098074.h ENSGT00940000160237.b ENSGT01010000222762.a.b ENSGT00990000212022 ENSGT00510000049555.f ENSGT00940000154668.h ENSGT00510000049326.b.b.f ENSGT00940000165107.B.c ENSGT00390000011383.j.a ENSGT00390000009130.b.d.a.e ENSGT00940000158747.i ENSGT00940000156804.a.b ENSGT00940000153725.b.d.c #20 ENSGT00530000063775.b.a.a ENSGT01010000222287.B.b.b.a #22 ENSGT00950000185904 #26 ENSGT00390000000543.b ENSGT00940000158560.f ENSGT00940000161618.b ENSGT00440000038604.j.f ENSGT00940000154149.a.b.d ENSGT00940000155127.a.b.f ENSGT00950000183002.B.a.a.i.b ENSGT00530000063843.a.f ENSGT00390000014658.m ENSGT00950000182975.a.a.b.k.f.b ENSGT00940000156880.c.b.f ENSGT00940000155161.y.a ENSGT00940000162727.a.a.b ENSGT00940000153189.B Atlantic salmon MODERN SPECIES 16 GA45G (ENSSSAG00000065713) creb3l3l (ENSSSAG00000065706) ENSSSAG00000065702 znf131 (ENSSSAG00000065695) SELENOP (ENSSSAG00000065688) ENSSSAG00000100196 ghra (ENSSSAG00000065355) FBXO4 (ENSSSAG00000065337) rimoc1 (ENSSSAG00000096235) ENSSSAG00000116430 oxct1a (ENSSSAG00000059838) plcxd3 (ENSSSAG00000106187) ENSSSAG00000059619 ENSSSAG00000059317 ENSSSAG00000118668 htr1aa (ENSSSAG00000059201) #22 rgs7bpa (ENSSSAG00000089700) #20 ENSSSAG00000121590 ENSSSAG00000053267 ENSSSAG00000053078 paxx (ENSSSAG00000053062) ENSSSAG00000048721 ENSSSAG00000048621 ENSSSAG00000090209 niban2b (ENSSSAG00000043835) stxbp1b (ENSSSAG00000051866) ENSSSAG00000121311 ENSSSAG00000023361 noxa1 (ENSSSAG00000101747) ENSSSAG00000022135 camsap1b (ENSSSAG00000015587) River trout MODERN SPECIES 39 SLC35D2 (ENSSTUG00000016270) ENSSTUG00000016307 ENSSTUG00000016327 ubox5 (ENSSTUG00000016355) znf131 (ENSSTUG00000016372) ENSSTUG00000016381 ENSSTUG00000016385 ENSSTUG00000016394 ghra (ENSSTUG00000016401) rimoc1 (ENSSTUG00000016468) oxct1a (ENSSTUG00000016515) plcxd3 (ENSSTUG00000017570) ENSSTUG00000017582 rgs7bpa (ENSSTUG00000017611) #20 ENSSTUG00000017622 htr1aa (ENSSTUG00000017638) #22 ENSSTUG00000017647 #26 paxx (ENSSTUG00000017656) ABCA2 (ENSSTUG00000017757) FUT7 (ENSSTUG00000020283) ENSSTUG00000020295 niban2b (ENSSTUG00000020328) stxbp1b (ENSSTUG00000020523) ENSSTUG00000020873 ENSSTUG00000020883 noxa1 (ENSSTUG00000020899) ubac1 (ENSSTUG00000020917) camsap1b (ENSSTUG00000020976) KCNT1 (ENSSTUG00000021279) ENSSTUG00000026760 ENSSTUG00000026778 Northern pike MODERN SPECIES 12 znf367 (ENSELUG00000002552) SLC35D2 (ENSELUG00000002596) ENSELUG00000002607 avp (ENSELUG00000002611) ubox5 (ENSELUG00000002634) znf131 (ENSELUG00000002645) ENSELUG00000002654 ghra (ENSELUG00000002668) FBXO4 (ENSELUG00000002684) rimoc1 (ENSELUG00000002695) oxct1a (ENSELUG00000002721) ENSELUG00000002766 rgs7bpa (ENSELUG00000002775) #20 ENSELUG00000002783 ENSELUG00000000073 htr1aa (ENSELUG00000002805) #22 ipo11 (ENSELUG00000002842) dph7 (ENSELUG00000002866) ENSELUG00000002874 ABCA2 (ENSELUG00000002901) FUT7 (ENSELUG00000002916) ENSELUG00000001390 niban2b (ENSELUG00000002955) stxbp1b (ENSELUG00000003020) WHRN (ENSELUG00000003045) noxa1 (ENSELUG00000000095) ENSELUG00000024708 ubac1 (ENSELUG00000003081) camsap1b (ENSELUG00000003150) ENSELUG00000003193 KCNT1 (ENSELUG00000003400) Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000156973 ENSGT00940000157299.c ENSGT00950000182964.a.b.a.a.a ENSGT00940000160343 ENSGT00940000165543 ENSGT00940000154668 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00940000165107.B ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.b.d.a ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156804.a ENSGT00940000153725.b.d #20 ENSGT00950000182909.a.f #21 ENSGT01010000222287.B.b.b.a #22 ENSGT00390000014071 ENSGT00940000160266 ENSGT00940000161328 ENSGT00940000159011 ENSGT00390000016390 ENSGT00940000155211 ENSGT00940000155876 ENSGT00940000164995 ENSGT00640000091523 ENSGT00940000157140.a ENSGT00940000158126 ENSGT00730000113416 ENSGT00940000155496.a.a ##30 ENSGT00940000165045 ENSGT00390000002743 #32 Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000156973 ENSGT00940000157299.c ENSGT00950000182964.a.b.a.a.a ENSGT00940000160343 ENSGT00940000165543 ENSGT00940000154668 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00940000165107.B ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.b.d.a ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156804.a ENSGT00940000153725.b.d #20 ENSGT00950000182909.a.f #21 ENSGT01010000222287.B.b.b.a #22 ENSGT00390000014071 ENSGT00940000160266 ENSGT00940000161328 ENSGT00940000159011 ENSGT00390000016390 ENSGT00940000155211 ENSGT00940000155876 ENSGT00940000164995 ENSGT00640000091523 ENSGT00940000157140.a ENSGT00940000158126 ENSGT00730000113416 ENSGT00940000155496.a.a ##30 ENSGT00940000165045 ENSGT00390000002743 #32 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01010000222287.B.b.b.a #22 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000156973 ENSGT00940000157299.c ENSGT00950000182964.a.b.a.a.a ENSGT00940000160343 ENSGT00940000165543 ENSGT00940000154668 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00940000165107.B ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.b.d.a ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156804.a ENSGT00940000153725.b.d #20 ENSGT00950000182909.a.f #21 ENSGT01010000222287.B.b.b.a #22 ENSGT00390000014071 ENSGT00940000160266 ENSGT01000000221631 ENSGT00940000161328 ENSGT00940000159011 ENSGT00390000016390 ENSGT00940000155211 ENSGT00940000155876 ENSGT00940000164995 ENSGT00640000091523 ENSGT00940000157140.a ENSGT00940000158126 ENSGT00730000113416 ENSGT00940000155496.a.a ##30 ENSGT00940000165045 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000156973 ENSGT00940000157299.c ENSGT00950000182964.a.b.a.a.a ENSGT00940000160343 ENSGT00940000165543 ENSGT00940000154668 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00940000165107.B ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.b.d.a ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156804.a ENSGT00940000153725.b.d #20 ENSGT00950000182909.a.f #21 ENSGT01010000222287.B.b.b.a #22 ENSGT00390000014071 ENSGT00940000160266 ENSGT01000000221631 ENSGT00940000161328 ENSGT00940000159011 ENSGT00390000016390 ENSGT00940000155211 ENSGT00940000182304 ENSGT00940000155876 ENSGT00640000091523 ENSGT00940000157140.a ENSGT00940000158126 ENSGT00730000113416 ENSGT00940000155496.a.a ##30 ENSGT00940000165045 Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000156973 ENSGT00940000157299.c ENSGT00950000182964.a.b.a.a.a ENSGT00940000160343 ENSGT00940000165543 ENSGT00940000154668 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00940000165107.B ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.b.d.a ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156804.a ENSGT00940000153725.b.d #20 ENSGT00950000182909.a.f #21 ENSGT01010000222287.B.b.b.a #22 ENSGT00390000014071 ENSGT00940000160266 ENSGT01000000221631 ENSGT00940000161328 ENSGT00940000159011 ENSGT00390000016390 ENSGT00940000155211 ENSGT00940000182304 ENSGT00940000155876 ENSGT00640000091523 ENSGT00940000157140.a ENSGT00940000158126 ENSGT00730000113416 ENSGT00940000155496.a.a ##30 ENSGT00940000165045 Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000156973 ENSGT00940000157299.c ENSGT00950000182964.a.b.a.a.a ENSGT00940000160343 ENSGT00940000165543 ENSGT00940000154668 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00940000165107.B ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.b.d.a ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156804.a ENSGT00940000153725.b.d #20 ENSGT00950000182909.a.f #21 ENSGT01010000222287.B.b.b.a #22 ENSGT00390000014071 ENSGT00940000160266 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ENSGT00390000009065 #33 Mangrove rivulus MODERN SPECIES 151 FBXO4 (ENSKMAG00000013390) rimoc1 (ENSKMAG00000013406) oxct1a (ENSKMAG00000013433) plcxd3 (ENSKMAG00000013497) ENSKMAG00000013531 rgs7bpa (ENSKMAG00000013564) #20 ENSKMAG00000013588 #21 htr1aa (ENSKMAG00000013604) #22 ipo11 (ENSKMAG00000013674) hsd17b3 (ENSKMAG00000013874) ercc6l2 (ENSKMAG00000013907) ptch1 (ENSKMAG00000013994) ENSKMAG00000014111 AOPEP (ENSKMAG00000014160) DOCK8 (ENSKMAG00000014240) cbwd (ENSKMAG00000014426) foxd5 (ENSKMAG00000014470) pgm5 (ENSKMAG00000014485) ENSKMAG00000014535 ZSWIM6 (ENSKMAG00000014559) ##30 ndufaf2 (ENSKMAG00000014591) #32 smim15 (ENSKMAG00000014604) ercc8 (ENSKMAG00000014623) #33 Turquoise killifish MODERN SPECIES 1627 EFNA5 (ENSNFUG00015010093) gadd45ga (ENSNFUG00015010070) ENSNFUG00015010059 AL929453.1 (ENSNFUG00015010048) znf131 (ENSNFUG00015010023) ENSNFUG00015010015 GHRA (ENSNFUG00015009884) FBXO4 (ENSNFUG00015009864) C8H5ORF51 (ENSNFUG00015009857) ENSNFUG00015009848 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ENSGT01010000222287.B.b.b.a #22 ENSGT00390000014071 ENSGT00940000160266 ENSGT00940000161328 ENSGT00940000159011 ENSGT00390000016390 ENSGT00940000155211 ENSGT00940000155876 ENSGT00640000091523 ENSGT00940000157140.a ENSGT00940000158126 ENSGT00730000113416 ENSGT00940000155496.a.a ##30 ENSGT00940000165045 ENSGT00390000002743 #32 ENSGT00390000009065 #33 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000156973 ENSGT00940000157299.c ENSGT00950000182964.a.b.a.a.a ENSGT00940000160343 ENSGT00940000165543 ENSGT00940000154668 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00940000165107.B ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.b.d.a ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156804.a ENSGT00940000153725.b.d #20 ENSGT00950000182909.a.f #21 ENSGT01010000222287.B.b.b.a #22 ENSGT00390000014071 ENSGT00940000160266 ENSGT00940000161328 ENSGT00940000159011 ENSGT00390000016390 ENSGT00940000155211.e ENSGT00940000155876 ENSGT00640000091523 ENSGT00940000157140.a ENSGT00940000158126 ENSGT00730000113416 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ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000156973 ENSGT00940000157299.c ENSGT00950000182964.a.b.a.a.a ENSGT00940000160343 ENSGT00940000165543 ENSGT00940000154668 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00940000165107.B ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.b.d.a ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156804.a ENSGT00940000153725.b.d #20 ENSGT00950000182909.a.f #21 ENSGT01010000222287.B.b.b.a #22 ENSGT00390000014071 ENSGT00940000160266 ENSGT00940000161328 ENSGT00940000159011 ENSGT00390000016390 ENSGT00940000155211 ENSGT00940000155876 ENSGT00640000091523 ENSGT00940000157140.a ENSGT00940000158126 ENSGT00730000113416 ENSGT00940000155496.a.a ##30 ENSGT00940000165045 ENSGT00390000002743 #32 ENSGT00390000009065 #33 Mummichog MODERN SPECIES 2272 ENSFHEG00000018260 EFNA5 (ENSFHEG00000018241) gadd45ga (ENSFHEG00000018235) creb3l3l (ENSFHEG00000018222) ENSFHEG00000018204 ENSFHEG00000018191 ENSFHEG00000018183 ghra (ENSFHEG00000018151) FBXO4 (ENSFHEG00000018143) rimoc1 (ENSFHEG00000018130) oxct1a 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ENSGT00940000165543 ENSGT00940000154668 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00940000165107.B ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.b.d.a ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156804.a ENSGT00940000153725.b.d #20 ENSGT00950000182909.a.f #21 ENSGT01010000222287.B.b.b.a #22 ENSGT00390000014071 ENSGT00940000160266 ENSGT00940000161328 ENSGT00940000159011 ENSGT00390000016390 ENSGT00940000155211 ENSGT00940000182304 ENSGT00940000155876 ENSGT00940000178985 ENSGT00640000091523 ENSGT00940000157140.a ENSGT00940000158126 ENSGT00940000155496.a.a ##30 ENSGT00940000165045 ENSGT00390000002743 #32 Chinese medaka MODERN SPECIES 1064 ENSOSIG00000021773 EFNA5 (ENSOSIG00000021767) gadd45ga (ENSOSIG00000021757) ENSOSIG00000021752 ENSOSIG00000021749 znf131 (ENSOSIG00000021744) ENSOSIG00000021741 ghra (ENSOSIG00000021735) FBXO4 (ENSOSIG00000021731) rimoc1 (ENSOSIG00000021727) oxct1a (ENSOSIG00000021093) plcxd3 (ENSOSIG00000021053) ENSOSIG00000020996 rgs7bpa (ENSOSIG00000020968) #20 RNF180 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ENSGT00940000157299.c ENSGT00950000182964.a.b.a.a.a ENSGT00940000160343 ENSGT00940000165543 ENSGT00940000154668 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00940000165107.B ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.b.d.a ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156804.a ENSGT00940000153725.b.d #20 ENSGT00950000182909.a.f #21 ENSGT01010000222287.B.b.b.a #22 ENSGT00390000014071 ENSGT00940000160266 ENSGT00940000161328 ENSGT00940000159011 ENSGT00390000016390 ENSGT00940000155211 ENSGT00940000155876 ENSGT00640000091523 ENSGT00940000157140.a ENSGT00940000158126 ENSGT00940000155496.a.a ##30 ENSGT00940000165045 ENSGT00390000002743 #32 ENSGT00390000009065 #33 ENSGT01050000244838.H.c.a #34 Eastern happy MODERN SPECIES 3 ENSACLG00000014342 EFNA5 (ENSACLG00000014356) gadd45ga (ENSACLG00000014490) creb3l3l (ENSACLG00000014496) ENSACLG00000014501 znf131 (ENSACLG00000014569) SELENOP (ENSACLG00000014589) ghra (ENSACLG00000014631) FBXO4 (ENSACLG00000014664) rimoc1 (ENSACLG00000014689) oxct1a 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(ENSPNYG00000015390) ercc6l2 (ENSPNYG00000015347) Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 296 ENSHBUG00000003816 EFNA5 (ENSHBUG00000003831) gadd45ga (ENSHBUG00000003848) ENSHBUG00000003875 ENSHBUG00000003908 znf131 (ENSHBUG00000003921) SELENOP (ENSHBUG00000003962) ghra (ENSHBUG00000003997) FBXO4 (ENSHBUG00000004012) rimoc1 (ENSHBUG00000004021) oxct1a (ENSHBUG00000004046) plcxd3 (ENSHBUG00000004074) ENSHBUG00000004181 rgs7bpa (ENSHBUG00000004210) #20 RNF180 (ENSHBUG00000004227) #21 htr1aa (ENSHBUG00000004240) #22 ipo11 (ENSHBUG00000004364) hsd17b3 (ENSHBUG00000004399) ercc6l2 (ENSHBUG00000004419) ptch1 (ENSHBUG00000004492) fancc (ENSHBUG00000004521) AOPEP (ENSHBUG00000004548) DOCK8 (ENSHBUG00000004748) cbwd (ENSHBUG00000004792) pgm5 (ENSHBUG00000004830) ZSWIM6 (ENSHBUG00000004894) ##30 smim15 (ENSHBUG00000004906) ndufaf2 (ENSHBUG00000004931) #32 ercc8 (ENSHBUG00000004984) #33 elovl7a (ENSHBUG00000005012) #34 ENSHBUG00000005031 Lyretail cichlid MODERN SPECIES 306 FBXL17 (ENSNBRG00000014478) 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ENSGT01010000222287.B.b.b.a #22 ENSGT00390000014071 ENSGT00940000160266 ENSGT00940000161328 ENSGT00940000159011 ENSGT00390000016390 ENSGT00940000155211 ENSGT00940000182304 ENSGT00940000155876 ENSGT00640000091523 ENSGT00940000157140.a ENSGT00940000158126 ENSGT00730000113416 ENSGT00940000155496.a.a ##30 ENSGT00940000165045 ENSGT00390000002743 #32 Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT01010000222287.B.b.b.a #22 Amphiprion ANCESTRAL SPECIES ENSGT01010000222287.B.b.b.a #22 Clown anemonefish MODERN SPECIES 1587 ENSAOCG00000004640 rgs7bpa (ENSAOCG00000004584) #20 RNF180 (ENSAOCG00000004554) #21 htr1aa (ENSAOCG00000004544) #22 ipo11 (ENSAOCG00000000164) hsd17b3 (ENSAOCG00000004469) ercc6l2 (ENSAOCG00000004454) ptch1 (ENSAOCG00000004411) fancc (ENSAOCG00000004370) Spiny chromis MODERN SPECIES 100 ENSAPOG00000012172 large2 (ENSAPOG00000012160) SELENOP (ENSAPOG00000012136) ghra (ENSAPOG00000012111) FBXO4 (ENSAPOG00000012043) rimoc1 (ENSAPOG00000012025) oxct1a (ENSAPOG00000012006) plcxd3 (ENSAPOG00000011903) ENSAPOG00000011871 rgs7bpa (ENSAPOG00000011853) #20 ENSAPOG00000011832 #21 htr1aa (ENSAPOG00000011815) #22 ENSAPOG00000011804 Bicolor damselfish MODERN SPECIES 577 rgs7bpa (ENSSPAG00000004344) #20 RNF180 (ENSSPAG00000004368) #21 htr1aa (ENSSPAG00000004383) #22 ipo11 (ENSSPAG00000004399) hsd17b3 (ENSSPAG00000004468) ercc6l2 (ENSSPAG00000004484) ptch1 (ENSSPAG00000004577) fancc (ENSSPAG00000004668) AOPEP (ENSSPAG00000004720) DOCK8 (ENSSPAG00000004764) cbwd (ENSSPAG00000004873) pgm5 (ENSSPAG00000004943) ENSSPAG00000004956 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000156973 ENSGT00940000157299.c ENSGT00950000182964.a.b.a.a.a ENSGT00940000160343 ENSGT00940000165543 ENSGT00940000154668 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00940000165107.B ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.b.d.a ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156804.a ENSGT00940000153725.b.d #20 ENSGT00950000182909.a.f #21 ENSGT01010000222287.B.b.b.a #22 ENSGT00390000014071 ENSGT00940000160266 ENSGT01000000221631 ENSGT00940000161328 ENSGT00940000159011 ENSGT00390000016390 ENSGT00940000155211 ENSGT00940000155876 ENSGT00940000164995 ENSGT00640000091523 ENSGT00940000157140.a ENSGT00940000158126 ENSGT00730000113416 ENSGT00940000155496.a.a ##30 ENSGT00940000165045 Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000156973 ENSGT00940000157299.c ENSGT00950000182964.a.b.a.a.a ENSGT00940000160343 ENSGT00940000165543 ENSGT00940000154668 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00940000165107.B ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.b.d.a ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156804.a ENSGT00940000153725.b.d #20 ENSGT00950000182909.a.f #21 ENSGT01010000222287.B.b.b.a #22 ENSGT00390000014071 ENSGT00940000160266 ENSGT01000000221631 ENSGT00940000161328 ENSGT00940000159011 ENSGT00390000016390 ENSGT00940000155211 ENSGT00940000155876 ENSGT00940000164995 ENSGT00640000091523 ENSGT00940000157140.a ENSGT00940000158126 ENSGT00730000113416 ENSGT00940000155496.a.a ##30 ENSGT00940000165045 Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000156973 ENSGT00940000157299.c ENSGT00950000182964.a.b.a.a.a ENSGT00940000160343 ENSGT00940000165543 ENSGT00940000154668 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00940000165107.B ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.b.d.a ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156804.a ENSGT00940000153725.b.d #20 ENSGT00950000182909.a.f #21 ENSGT01010000222287.B.b.b.a #22 ENSGT00390000014071 ENSGT00940000160266 ENSGT01000000221631 ENSGT00940000161328 ENSGT00940000159011 ENSGT00390000016390 ENSGT00940000155211 ENSGT00940000155876 ENSGT00940000164995 ENSGT00640000091523 ENSGT00940000157140.a ENSGT00940000158126 ENSGT00730000113416 ENSGT00940000155496.a.a ##30 ENSGT00940000165045 Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000156973 ENSGT00940000157299.c ENSGT00950000182964.a.b.a.a.a ENSGT00940000160343 ENSGT00940000165543 ENSGT00940000154668 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00940000165107.B ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.b.d.a ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156804.a ENSGT00940000153725.b.d #20 ENSGT00950000182909.a.f #21 ENSGT01010000222287.B.b.b.a #22 ENSGT00390000014071 ENSGT00940000160266 ENSGT01000000221631 ENSGT00940000161328 ENSGT00940000159011 ENSGT00390000016390 ENSGT00940000155211 ENSGT00940000155876 ENSGT00640000091523 ENSGT00940000157140.a ENSGT00940000158126 ENSGT00730000113416 ENSGT00940000155496.a.a ##30 ENSGT00940000165045 ENSGT00390000002743 #32 Perciformes ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00510000048363 ENSGT00940000156973 ENSGT00940000157299.c ENSGT00950000182964.a.b.a.a.a ENSGT00940000160343 ENSGT00940000165543 ENSGT00940000154668 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00940000165107.B ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.b.d.a ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156804.a ENSGT00940000153725.b.d #20 ENSGT01010000222287.B.b.b.a #22 ENSGT00390000014071 ENSGT00940000160266 ENSGT01000000221631 ENSGT00940000161328 ENSGT00940000159011 ENSGT00390000016390 ENSGT00940000155211 ENSGT00940000155876 ENSGT00640000091523 ENSGT00940000157140.a ENSGT00940000158126 ENSGT00940000155496.a.a ##30 ENSGT00940000165045 ENSGT00390000002743 #32 ENSGT00390000009065 #33 Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00510000048363 ENSGT00940000156973 ENSGT00940000157299.c ENSGT00950000182964.a.b.a.a.a ENSGT00940000160343 ENSGT00940000165543 ENSGT00940000154668 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00940000165107.B ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.b.d.a ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156804.a ENSGT00940000153725.b.d #20 ENSGT01010000222287.B.b.b.a #22 ENSGT00390000014071 ENSGT00940000160266 ENSGT01000000221631 ENSGT00940000161328 ENSGT00940000159011 ENSGT00390000016390 ENSGT00940000155211 ENSGT00940000155876 ENSGT00640000091523 ENSGT00940000157140.a ENSGT00940000158126 ENSGT00940000155496.a.a ##30 ENSGT00940000165045 ENSGT00390000002743 #32 ENSGT00390000009065 #33 Pike perch MODERN SPECIES 2 ENSSLUG00000000416 EFNA5 (ENSSLUG00000000434) gadd45ga (ENSSLUG00000000447) creb3l3l (ENSSLUG00000000452) ENSSLUG00000000457 ENSSLUG00000000460 znf131 (ENSSLUG00000000466) ENSSLUG00000000478 ghra (ENSSLUG00000000512) FBXO4 (ENSSLUG00000000589) rimoc1 (ENSSLUG00000000596) oxct1a (ENSSLUG00000000798) plcxd3 (ENSSLUG00000001316) ENSSLUG00000001331 rgs7bpa (ENSSLUG00000001362) #20 htr1aa (ENSSLUG00000001367) #22 ipo11 (ENSSLUG00000001397) hsd17b3 (ENSSLUG00000001432) ENSSLUG00000001447 ENSSLUG00000001458 ptch1 (ENSSLUG00000001894) fancc (ENSSLUG00000002693) AOPEP (ENSSLUG00000002704) DOCK8 (ENSSLUG00000003759) Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000156973 ENSGT00940000157299.c ENSGT00950000182964.a.b.a.a.a ENSGT00940000160343 ENSGT00940000165543 ENSGT00940000154668 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00940000165107.B ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.b.d.a ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156804.a ENSGT00940000153725.b.d #20 ENSGT00950000182909.a.f #21 ENSGT01010000222287.B.b.b.a #22 ENSGT00390000014071 ENSGT00940000160266 ENSGT00940000161328 ENSGT00940000159011 ENSGT00390000016390 ENSGT00940000155211 ENSGT00940000155876 ENSGT00640000091523 ENSGT00940000157140.a ENSGT00940000158126 ENSGT00730000113416 ENSGT00940000155496.a.a ##30 ENSGT00940000165045 ENSGT00390000002743 #32 ENSGT00390000009065 #33 Gilthead seabream MODERN SPECIES 19 gadd45ga (ENSSAUG00010008420) creb3l3l (ENSSAUG00010008428) ENSSAUG00010008439 znf131 (ENSSAUG00010008465) ENSSAUG00010008470 ghra (ENSSAUG00010008479) ENSSAUG00010009180 FBXO4 (ENSSAUG00010009181) rimoc1 (ENSSAUG00010009182) oxct1a (ENSSAUG00010009214) plcxd3 (ENSSAUG00010009344) ENSSAUG00010009346 ENSSAUG00010009350 rgs7bpa (ENSSAUG00010009456) #20 ENSSAUG00010009458 #21 htr1aa (ENSSAUG00010009459) #22 ipo11 (ENSSAUG00010000361) hsd17b3 (ENSSAUG00010000426) ercc6l2 (ENSSAUG00010000452) ptch1 (ENSSAUG00010000573) fancc (ENSSAUG00010001006) AOPEP (ENSSAUG00010001009) DOCK8 (ENSSAUG00010001114) cbwd (ENSSAUG00010002992) foxd5 (ENSSAUG00010002995) pgm5 (ENSSAUG00010003068) ZSWIM6 (ENSSAUG00010003219) ##30 NDUFAF2 (ENSSAUG00010004730) #32 smim15 (ENSSAUG00010004733) ercc8 (ENSSAUG00010004743) #33 elovl7a (ENSSAUG00010004977) #34 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000157299.c ENSGT00950000182964.a.b.a.a.a ENSGT00940000160343 ENSGT00940000165543 ENSGT00940000154668 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00940000165107.B ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.b.d.a ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156804.a ENSGT00940000153725.b.d #20 ENSGT00950000182909.a.f #21 ENSGT00940000163614 ENSGT01010000222287.B.b.b.a #22 ENSGT00390000014071 ENSGT00940000160266 ENSGT00940000161328 ENSGT00940000159011 ENSGT00390000016390 ENSGT00940000155211 ENSGT00940000155876 ENSGT00640000091523 ENSGT00940000157140.a ENSGT00940000158126 ENSGT00730000113416 ENSGT00940000155496.a.a ##30 ENSGT00940000165045 ENSGT00390000002743 #32 ENSGT00390000009065 #33 Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000156973 ENSGT00940000157299.c ENSGT00950000182964.a.b.a.a.a ENSGT00940000160343 ENSGT00940000165543 ENSGT00940000154668 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00940000165107.B ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.b.d.a ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156804.a ENSGT00940000153725.b.d #20 ENSGT00950000182909.a.f #21 ENSGT01010000222287.B.b.b.a #22 ENSGT00940000163614 ENSGT00390000014071 ENSGT00940000160266 ENSGT00940000161328 ENSGT00940000159011 ENSGT00390000016390 ENSGT00940000155211 ENSGT00940000155876 ENSGT00640000091523 ENSGT00940000157140.a ENSGT00940000158126 ENSGT00730000113416 ENSGT00940000155496.a.a ##30 ENSGT00940000165045 ENSGT00390000002743 #32 Zig-zag eel MODERN SPECIES 23 ENSMAMG00000020773 efna5b (ENSMAMG00000020777) gadd45ga (ENSMAMG00000020783) creb3l3l (ENSMAMG00000020786) ENSMAMG00000020791 znf131 (ENSMAMG00000020805) ENSMAMG00000020808 ghra (ENSMAMG00000020811) FBXO4 (ENSMAMG00000020821) rimoc1 (ENSMAMG00000020824) oxct1a (ENSMAMG00000020833) plcxd3 (ENSMAMG00000020861) ENSMAMG00000020868 rgs7bpa (ENSMAMG00000020875) #20 ENSMAMG00000024920 #21 htr1aa (ENSMAMG00000020886) #22 ipo11 (ENSMAMG00000020889) hsd17b3 (ENSMAMG00000027364) ercc6l2 (ENSMAMG00000020924) ptch1 (ENSMAMG00000020929) fancc (ENSMAMG00000020949) AOPEP (ENSMAMG00000020954) ENSMAMG00000020962 cbwd (ENSMAMG00000020995) foxd5 (ENSMAMG00000027729) pgm5 (ENSMAMG00000021014) ZSWIM6 (ENSMAMG00000021028) ##30 smim15 (ENSMAMG00000021052) ndufaf2 (ENSMAMG00000024373) #32 ercc8 (ENSMAMG00000021062) #33 elovl7a (ENSMAMG00000021077) #34 Carangaria ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000157299.c ENSGT00950000182964.a.b.a.a.a ENSGT00940000160343 ENSGT00940000165543 ENSGT00940000154668 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00940000165107.B ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.b.d.a ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156804.a ENSGT00940000153725.b.d #20 ENSGT00950000182909.a.f #21 ENSGT00940000163614 ENSGT01010000222287.B.b.b.a #22 ENSGT00390000014071 ENSGT00940000160266 ENSGT00940000161328 ENSGT00940000159011 ENSGT00390000016390 ENSGT00940000155211 ENSGT00940000155876 ENSGT00640000091523 ENSGT00940000157140.a ENSGT00940000158126 ENSGT00730000113416 ENSGT00940000155496.a.a ##30 ENSGT00940000165045 ENSGT00390000002743 #32 ENSGT00390000009065 #33 Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000156973 ENSGT00940000157299.c ENSGT00950000182964.a.b.a.a.a ENSGT00940000160343 ENSGT00940000165543 ENSGT00940000154668 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00940000165107.B ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.b.d.a ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156804.a ENSGT00940000153725.b.d #20 ENSGT00950000182909.a.f #21 ENSGT01010000222287.B.b.b.a #22 ENSGT00390000014071 ENSGT00940000160266 ENSGT00940000161328 ENSGT00940000159011 ENSGT00390000016390 ENSGT00940000155211 ENSGT00940000155876 ENSGT00640000091523 ENSGT00940000157140.a ENSGT00940000158126 ENSGT00730000113416 ENSGT00940000155496.a.a ##30 ENSGT00940000165045 ENSGT00390000002743 #32 ENSGT00390000009065 #33 Barramundi perch MODERN SPECIES 9 PRXL2C (ENSLCAG00010005626) FBXL17 (ENSLCAG00010005631) efna5b (ENSLCAG00010005640) gadd45ga (ENSLCAG00010005643) ENSLCAG00010005654 ENSLCAG00010005660 znf131 (ENSLCAG00010005663) ENSLCAG00010005665 ghra (ENSLCAG00010005666) FBXO4 (ENSLCAG00010005673) rimoc1 (ENSLCAG00010005679) oxct1a (ENSLCAG00010005702) plcxd3 (ENSLCAG00010005735) ENSLCAG00010005740 rgs7bpa (ENSLCAG00010005741) #20 htr1aa (ENSLCAG00010005748) #22 ipo11 (ENSLCAG00010005775) hsd17b3 (ENSLCAG00010005836) ercc6l2 (ENSLCAG00010005857) ptch1 (ENSLCAG00010005908) Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 130 ENSGT00950000182964.a.b.a.a.a ENSGT00940000160343 ENSGT00940000165543 ENSGT00940000154668 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00940000165107.B ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.b.d.a ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156804.a ENSGT00940000153725.b.d #20 ENSGT00530000063775.b ENSGT00950000182909.a.f #21 ENSGT01010000222287.B.b.b.a #22 ENSGT00390000014071 ENSGT00940000160266 ENSGT00940000163752 ENSGT00940000161328 ENSGT00940000159011 ENSGT00390000016390 ENSGT00940000155211 ENSGT00940000155876 ENSGT00640000091523 ENSGT00940000157140.a ENSGT00940000158126 ENSGT00730000113416 ENSGT00940000165045 ENSGT00390000002743 #32 ENSGT00390000009065 #33 Otophysi ANCESTRAL SPECIES 215 ENSGT00950000182964.a.b.a.a.a ENSGT00940000160343 ENSGT00940000165543 ENSGT00940000154668 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00940000165107.B ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.b.d.a ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156804.a ENSGT00940000153725.b.d #20 ENSGT00950000182909.a.f #21 ENSGT01010000222287.B.b.b.a #22 ENSGT00390000014071 ENSGT00940000159394 ENSGT00940000166353 ENSGT01030000238468 ENSGT00940000164697.b ENSGT00530000064359.c.b.h ENSGT00940000155946.c.a ENSGT00940000154079.b.a ENSGT00940000159944 ENSGT00940000157955.d.b ENSGT00940000155945.i.b ENSGT00940000163762.b ENSGT00940000156611 ENSGT00390000003282.A ENSGT00390000016543.c Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000165688 ENSGT00390000016543.c ENSGT00950000182964.a.b.a.a.a ENSGT00940000160343 ENSGT00940000165543 ENSGT00940000154668 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00940000165107.B ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.b.d.a ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156804.a ENSGT00940000153725.b.d #20 ENSGT00950000182909.a.f #21 ENSGT01010000222287.B.b.b.a #22 ENSGT00390000014071 ENSGT00940000159394 ENSGT00940000166353 ENSGT00730000113053 ENSGT00990000209967 ENSGT00390000018225.B.b Cyprininae DUPLICATION Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00390000016543.c.a ENSGT00950000182964.a.b.a.a.a.f ENSGT00940000160343 ENSGT00940000165543.i.b ENSGT00940000154668.c ENSGT00940000165107.B.b ENSGT00390000014416.e ENSGT00390000011383.m ENSGT00390000009130.b.d.a.a.b ENSGT00940000158747.e ENSGT00940000156804.a ENSGT00940000153725.b.d.b #20 ENSGT00950000182909.a.f #21 ENSGT00940000154484.B.a.a.t ENSGT00390000014071.c ENSGT01010000222287.B.b.b.a.c #22 ENSGT00390000014071.d ENSGT00940000159394.a ENSGT00940000166353.a ENSGT00730000113053.c ENSGT00940000154603.B ENSGT00990000209967.b ENSGT00940000154645.B.j.a ENSGT00940000155946.c.a.c ENSGT00940000154079.b.a.b ENSGT00940000159944.h ENSGT00940000157955.d.b.d ENSGT00940000163762.b.g.a Goldfish DUPLICATION Goldfish MODERN SPECIES 434 syn1 (ENSCARG00000022347) ENSCARG00000022319 AJM1 (ENSCARG00000022313) gadd45ga (ENSCARG00000022310) creb3l3l (ENSCARG00000022272) ENSCARG00000022253 znf131 (ENSCARG00000022231) ghra (ENSCARG00000022093) FBXO4 (ENSCARG00000022079) rimoc1 (ENSCARG00000022068) oxct1a (ENSCARG00000021388) plcxd3 (ENSCARG00000021350) ENSCARG00000020813 rgs7bpa (ENSCARG00000020780) #20 htr1aa (ENSCARG00000020771) #22 htr1aa (ENSCARG00000020764) #22 ipo11 (ENSCARG00000020684) lipg (ENSCARG00000020638) mthfd2l (ENSCARG00000020621) ENSCARG00000020596 ENSCARG00000030306 ENSCARG00000030298 ncs1b (ENSCARG00000030288) angptl2b (ENSCARG00000030278) ralgps1 (ENSCARG00000030190) zbtb34 (ENSCARG00000030179) lmx1bb (ENSCARG00000030106) ENSCARG00000030094 ENSCARG00000029983 ENSCARG00000029956 ENSCARG00000029947 Goldfish MODERN SPECIES 434 vgll4l (ENSCARG00000022836) syn1 (ENSCARG00000022347) ENSCARG00000022319 AJM1 (ENSCARG00000022313) gadd45ga (ENSCARG00000022310) creb3l3l (ENSCARG00000022272) ENSCARG00000022253 znf131 (ENSCARG00000022231) ghra (ENSCARG00000022093) FBXO4 (ENSCARG00000022079) rimoc1 (ENSCARG00000022068) oxct1a (ENSCARG00000021388) plcxd3 (ENSCARG00000021350) ENSCARG00000020813 rgs7bpa (ENSCARG00000020780) #20 htr1aa (ENSCARG00000020771) #22 htr1aa (ENSCARG00000020764) #22 ipo11 (ENSCARG00000020684) lipg (ENSCARG00000020638) mthfd2l (ENSCARG00000020621) ENSCARG00000020596 ENSCARG00000030306 ENSCARG00000030298 ncs1b (ENSCARG00000030288) angptl2b (ENSCARG00000030278) ralgps1 (ENSCARG00000030190) zbtb34 (ENSCARG00000030179) lmx1bb (ENSCARG00000030106) ENSCARG00000030094 ENSCARG00000029983 ENSCARG00000029956 Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 45 ENSGT00390000003282.A.d ENSGT00940000165688.h ENSGT00390000016543.c.a 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plcxd3 (ENSDARG00000054794) ENSDARG00000042172 rgs7bpa (ENSDARG00000060601) #20 RNF180 (ENSDARG00000073720) #21 htr1aa (ENSDARG00000093745) #22 ipo11 (ENSDARG00000054224) lipg (ENSDARG00000031044) mthfd2l (ENSDARG00000054199) ENSDARG00000104992 ENSDARG00000089418 RFESD (ENSDARG00000042159) ncs1b (ENSDARG00000054186) ENSDARG00000086060 ENSDARG00000079327 zgc:194839 (ENSDARG00000078550) si:dkey-56i24.1 (ENSDARG00000078152) ralgps1 (ENSDARG00000068370) angptl2b (ENSDARG00000068369) si:dkey-191c17.2 (ENSDARG00000095445) zbtb34 (ENSDARG00000013492) Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 187 ENSGT00550000074853 ENSGT00390000013143 ENSGT00950000182964.a.b.a.a.a ENSGT00940000160343 ENSGT00940000165543 ENSGT00940000154668 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00940000165107.B ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.b.d.a ENSGT00940000158747 ENSGT00940000153725.b.d #20 ENSGT00530000063775.b ENSGT00950000182909.a.f #21 ENSGT01010000222287.B.b.b.a #22 ENSGT00390000014071 ENSGT00940000160266 ENSGT00940000161328 ENSGT00940000159011 ENSGT00390000016390 ENSGT00940000155211 ENSGT00940000155876 ENSGT00640000091523 ENSGT00940000157140.a ENSGT00940000158126 ENSGT00390000005250 ENSGT00940000165045 ENSGT00390000002743 #32 Atlantic herring MODERN SPECIES 9 gtf2h3 (ENSCHAG00000012938) gadd45ga (ENSCHAG00000012973) ENSCHAG00000012999 ENSCHAG00000013016 znf131 (ENSCHAG00000013095) ENSCHAG00000013109 ghra (ENSCHAG00000013116) FBXO4 (ENSCHAG00000013127) ENSCHAG00000013142 rimoc1 (ENSCHAG00000013163) oxct1a (ENSCHAG00000013275) plcxd3 (ENSCHAG00000016672) rgs7bpa (ENSCHAG00000016688) #20 ENSCHAG00000016697 ENSCHAG00000016760 #21 htr1aa (ENSCHAG00000016775) #22 ipo11 (ENSCHAG00000016802) hsd17b3 (ENSCHAG00000017029) ercc6l2 (ENSCHAG00000017079) PTCH1 (ENSCHAG00000017167) fancc (ENSCHAG00000018242) PTCH1 (ENSCHAG00000018386) fancc (ENSCHAG00000019095) AOPEP (ENSCHAG00000019188) DOCK8 (ENSCHAG00000019353) cbwd (ENSCHAG00000024950) foxd5 (ENSCHAG00000025090) pgm5 (ENSCHAG00000025097) TMEM252 (ENSCHAG00000025238) smim15 (ENSCHAG00000025240) ndufaf2 (ENSCHAG00000025242) #32 Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES ENSGT01010000222287.B.b.b.b #22 Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT01010000222287.B.b.b.b #22 Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES ENSGT01010000222287.B.b.b.b #22 Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT01010000222287.B.b.b.b #22 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 41 ENSGT00940000156117.e.b ENSGT00940000156820.a.b ENSGT00940000158634.b ENSGT00940000156639.d ENSGT00940000161979.A.b ENSGT00940000157299.d ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.e ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.f ENSGT00940000166638 ENSGT00390000010075 ENSGT00940000165107.A ENSGT00940000156804.b ENSGT00940000156814 ENSGT00940000153725.b.c #20 ENSGT00950000182909.a.e #21 ENSGT01010000222287.B.b.b.b #22 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT01010000222287.B.b.b.b #22 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT01010000222287.B.b.b.b #22 Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01010000222287.B.b.b.b #22 Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.e ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.f ENSGT00940000166638 ENSGT00390000010075 ENSGT00940000165107.A ENSGT00940000156804.b ENSGT00940000156814 ENSGT00940000153725.b.c #20 ENSGT00950000182909.a.e #21 ENSGT01010000222287.B.b.b.b #22 ENSGT01050000245201 ENSGT00400000024390 ENSGT00390000002216 ENSGT00940000155460.j ENSGT00940000157438.d ENSGT00390000015757 ENSGT00940000161555 ENSGT00960000186749 ENSGT00390000000360 ENSGT00940000157449.a ENSGT00940000167600 ENSGT00940000159129 ENSGT00940000155047.bc ENSGT01090000259997.a.d.b.a.a.a.a ENSGT00940000158002 Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 74 ENSGT00940000170723 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.a.a.a.b.td.b ENSGT00950000183005.a.b ENSGT00940000153832.j.a ENSGT00940000158867 ENSGT00940000166301 ENSGT00390000013355 ENSGT00950000182925.B.b ENSGT00940000168229 ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.e ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.f ENSGT00940000166638 ENSGT00940000165107.A ENSGT00940000156804.b ENSGT00950000182909.a.e #21 ENSGT01010000222287.B.b.b.b #22 ENSGT01050000245201 ENSGT00400000024390 ENSGT00390000002216 ENSGT00940000155460.j ENSGT00940000157438.d ENSGT00390000015757 ENSGT00390000000360 ENSGT00940000157449.a ENSGT00940000167600 Mangrove rivulus MODERN SPECIES 650 ENSKMAG00000014015 ENSKMAG00000014054 #21 ENSKMAG00000014070 #22 ENSKMAG00000014086 spp1 (ENSKMAG00000014097) Turquoise killifish MODERN SPECIES 1611 LYZ (ENSNFUG00015003351) MBD2 (ENSNFUG00015003349) ENSNFUG00015003346 wdr91 (ENSNFUG00015003332) THAP1 (ENSNFUG00015003323) Nfu_g_1_018246 (ENSNFUG00015003321) CRATA (ENSNFUG00015003294) ptpa (ENSNFUG00015003271) ier5l (ENSNFUG00015003268) NTMT1 (ENSNFUG00015003262) lrsam1 (ENSNFUG00015003125) ENSNFUG00015003092 c6 (ENSNFUG00015003065) rgs7bpb (ENSNFUG00015003052) #20 ENSNFUG00015003046 ENSNFUG00015003041 #22 ZER1 (ENSNFUG00015002969) TBC1D13 (ENSNFUG00015002932) thnsl2 (ENSNFUG00015002919) ENSNFUG00015002904 smyd1a (ENSNFUG00015002862) SPR (ENSNFUG00015002844) SLC1A3B (ENSNFUG00015002661) nadk2 (ENSNFUG00015002618) DYNC2I1 (ENSNFUG00015002609) sptan1 (ENSNFUG00015002171) ODF2 (ENSNFUG00015002036) SCAI (ENSNFUG00015001894) PPP6C (ENSNFUG00015001829) skp2 (ENSNFUG00015001788) ENSNFUG00015001770 Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000157299.d ENSGT00910000144278 ENSGT01030000234614.A.l.a ENSGT00940000154929.A ENSGT00940000165775.b ENSGT00940000165675.n ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.e ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.f ENSGT00940000166638 ENSGT00390000010075 ENSGT00940000165107.A ENSGT00940000156804.b ENSGT00940000156814 ENSGT00940000153725.b.c #20 ENSGT00950000182909.a.e #21 ENSGT01010000222287.B.b.b.b #22 ENSGT01050000245201 ENSGT00400000024390 ENSGT00390000002216 ENSGT00940000155460.j ENSGT00940000157438.d ENSGT00390000015757 ENSGT00940000161555 ENSGT00960000186749 ENSGT00390000000360 NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 52 ENSGT00940000161979.A.b.b ENSGT00940000157299.d ENSGT00910000144278 ENSGT01030000234614.A.l.a ENSGT00940000154929.A ENSGT00940000165675.n ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.e ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.f ENSGT00940000166638 ENSGT00390000010075 ENSGT00940000165107.A ENSGT00940000156804.b ENSGT00940000156814 ENSGT00940000153725.b.c #20 ENSGT00950000182909.a.e #21 ENSGT01010000222287.B.b.b.b #22 ENSGT01050000245201 ENSGT00400000024390 ENSGT00390000002216 ENSGT00940000155460.j ENSGT00940000157438.d ENSGT00390000015757 ENSGT00940000161555 ENSGT00940000156639.d ENSGT00940000158634.b.c ENSGT00940000158634.b.d ENSGT00940000156820.a.b ENSGT00940000156117.e.b ENSGT00940000155754 ENSGT00940000155221.gb ENSGT01050000244942.b.a.b.e.b Sheepshead minnow MODERN SPECIES 780 c7b (ENSCVAG00000014177) c6 (ENSCVAG00000014142) ENSCVAG00000014001 rgs7bpb (ENSCVAG00000013960) #20 rnf180b (ENSCVAG00000013848) #21 ENSCVAG00000013842 #22 ENSCVAG00000013827 ENSCVAG00000013807 lmbrd2b (ENSCVAG00000013784) ppp1r3b (ENSCVAG00000013775) Mummichog MODERN SPECIES 2387 EFNA5 (ENSFHEG00000000354) PIGO (ENSFHEG00000014708) stoml2 (ENSFHEG00000014744) UNC13B (ENSFHEG00000014843) ENSFHEG00000014904 ENSFHEG00000014923 GADD45G (ENSFHEG00000014938) gadd45gb.1 (ENSFHEG00000014954) ENSFHEG00000014968 ENSFHEG00000014970 ghrb (ENSFHEG00000015005) c7b (ENSFHEG00000015119) c6 (ENSFHEG00000000778) rgs7bpb (ENSFHEG00000015374) #20 rnf180b (ENSFHEG00000015392) #21 ENSFHEG00000015412 #22 spp1 (ENSFHEG00000015432) ENSFHEG00000015444 vldlr (ENSFHEG00000015525) KCNV2 (ENSFHEG00000015564) pum3 (ENSFHEG00000015576) pip5k1ba (ENSFHEG00000015687) ENSFHEG00000015823 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00910000144278 ENSGT01030000234614.A.l.a ENSGT00940000154929.A ENSGT00940000165775.b ENSGT00940000165675.n ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.e ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.f ENSGT00940000166638 ENSGT00390000010075 ENSGT00940000165107.A ENSGT00940000156804.b ENSGT00940000156814 ENSGT00940000153725.b.c #20 ENSGT00950000182909.a.e #21 ENSGT00940000165278 ENSGT01010000222287.B.b.b.b #22 ENSGT00400000024390 ENSGT00390000002216 ENSGT00940000155460.j ENSGT00940000157438.d ENSGT00390000015757 ENSGT00940000161555 ENSGT00940000164240 ENSGT00390000000360 ENSGT00940000166301 ENSGT00390000013355 ENSGT00390000016258 ENSGT00950000183103.d.a.b ENSGT01030000234535.E.d ENSGT00940000155301.f ENSGT00390000010767 Platyfish MODERN SPECIES 22 PIGO (ENSXMAG00000004993) stoml2 (ENSXMAG00000004975) ENSXMAG00000004965 ENSXMAG00000007437 ENSXMAG00000022376 ENSXMAG00000030038 ENSXMAG00000006614 ENSXMAG00000007429 GADD45G (ENSXMAG00000016542) gadd45gb.1 (ENSXMAG00000025959) ENSXMAG00000016535 ghrb (ENSXMAG00000016511) c7b (ENSXMAG00000016470) c6 (ENSXMAG00000016406) rgs7bpb (ENSXMAG00000021677) #20 ENSXMAG00000016395 #22 spp1 (ENSXMAG00000016380) ENSXMAG00000029027 ENSXMAG00000016349 vldlr (ENSXMAG00000016312) ENSXMAG00000028389 ENSXMAG00000023495 ENSXMAG00000021532 ENSXMAG00000025883 KCNV2 (ENSXMAG00000002918) pum3 (ENSXMAG00000002926) ENSXMAG00000002946 ENSXMAG00000026291 ENSXMAG00000022878 ENSXMAG00000026607 ENSXMAG00000028888 Poecilia ANCESTRAL SPECIES 108 ENSGT00940000165675.n ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.e ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.f ENSGT00940000166638 ENSGT00390000010075 ENSGT00940000165107.A ENSGT00940000156804.b ENSGT00940000156814 ENSGT00940000153725.b.c #20 ENSGT01010000222287.B.b.b.b #22 ENSGT00940000179605 ENSGT00400000024390 ENSGT00390000002216 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 334 ENSGT00940000165675.n ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.e ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.f ENSGT00940000166638 ENSGT00390000010075 ENSGT00940000165107.A ENSGT00940000156804.b ENSGT00940000156814 ENSGT00940000153725.b.c #20 ENSGT01010000222287.B.b.b.b #22 ENSGT00940000179605 ENSGT00400000024390 ENSGT00390000002216 Sailfin molly MODERN SPECIES 1507 ENSPLAG00000020398 rgs7bpb (ENSPLAG00000020356) #20 ENSPLAG00000020339 #22 ENSPLAG00000020319 ENSPLAG00000020311 ENSPLAG00000020294 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT01010000222287.B.b.b.b #22 Eupercaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT01010000222287.B.b.b.b #22 Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT01010000222287.B.b.b.b #22 Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT01010000222287.B.b.b.b #22 Perciformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT01010000222287.B.b.b.b #22 Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000155754 ENSGT00940000156117.e.b ENSGT00940000156820.a.b ENSGT00940000158634.b ENSGT00940000156639.d ENSGT00940000157299.d ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.e ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.f ENSGT00940000166638 ENSGT00390000010075 ENSGT00940000165107.A ENSGT00940000156804.b ENSGT00940000156814 ENSGT00940000153725.b.c #20 ENSGT00950000182909.a.e #21 ENSGT01010000222287.B.b.b.b #22 ENSGT00400000024390 ENSGT00390000002216 ENSGT00940000155460 ENSGT00940000157438.d ENSGT00390000015757 ENSGT00940000161555 ENSGT00390000000360 ENSGT01090000259997.a.d.b.a.a.b.b ENSGT00940000157449.a ENSGT00390000003050 ENSGT00940000158864 ENSGT00390000016188 ENSGT00390000012082 ENSGT00940000157302 ENSGT00940000155805 Lumpfish MODERN SPECIES 3 MAMDC2 (ENSCLMG00005021595) ENSCLMG00005004278 tjp2a (ENSCLMG00005004443) pip5k1ba (ENSCLMG00005005037) ENSCLMG00005005041 gadd45gb.1 (ENSCLMG00005005083) GADD45G (ENSCLMG00005005098) EFNA5 (ENSCLMG00005005440) ENSCLMG00005005459 ENSCLMG00005005462 ghrb (ENSCLMG00005005468) c7b (ENSCLMG00005005478) c6 (ENSCLMG00005006331) rgs7bpb (ENSCLMG00005006333) #20 rnf180b (ENSCLMG00005006334) #21 ENSCLMG00005006335 #22 spp1 (ENSCLMG00005006336) ENSCLMG00005006341 vldlr (ENSCLMG00005006358) KCNV2 (ENSCLMG00005007779) pum3 (ENSCLMG00005007780) ENSCLMG00005007782 ENSCLMG00005007785 BRCC3 (ENSCLMG00005007787) ENSCLMG00005007790 RAB27B (ENSCLMG00005007791) tmem267 (ENSCLMG00005007792) cntfr (ENSCLMG00005007793) galt (ENSCLMG00005007797) sigmar1 (ENSCLMG00005007865) katnal2 (ENSCLMG00005007867) Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 76 ENSGT00950000182909.a.e #21 ENSGT01010000222287.B.b.b.b #22 ENSGT00400000024390 ENSGT00390000002216 ENSGT00940000155460 ENSGT00390000015757 ENSGT00390000000360 ENSGT00940000157449.a ENSGT00940000167600 ENSGT00940000159129 ENSGT00940000158002 ENSGT00940000156170 ENSGT01030000234618.E ENSGT00390000016258 ENSGT00950000183103.d.a.b ENSGT01030000234535.E.d ENSGT00940000155301.f Fugu MODERN SPECIES 18 ddx21 (ENSTRUG00000017570) lrsam1 (ENSTRUG00000000726) ndor1 (ENSTRUG00000007332) ENSTRUG00000031347 ntmt1 (ENSTRUG00000007291) ier5l (ENSTRUG00000007279) ptpa (ENSTRUG00000007171) crata (ENSTRUG00000030328) THAP1 (ENSTRUG00000023030) wdr91 (ENSTRUG00000006084) ENSTRUG00000006045 #21 htr1a-B (ENSTRUG00000005939) #22 ENSTRUG00000029564 spp1 (ENSTRUG00000005889) ENSTRUG00000005580 vldlr (ENSTRUG00000004731) pum3 (ENSTRUG00000004074) BRCC3 (ENSTRUG00000003833) RAB27B (ENSTRUG00000003528) ENSTRUG00000030649 TCF4 (ENSTRUG00000002569) ATP8B1 (ENSTRUG00000000117) txnl1 (ENSTRUG00000029638) NARS1 (ENSTRUG00000026707) txnl1 (ENSTRUG00000029001) txnl1 (ENSTRUG00000026330) fech (ENSTRUG00000031706) Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES ENSGT01010000222287.B.b.b.b #22 Carangaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT01010000222287.B.b.b.b #22 Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000156820.a.b ENSGT00940000158634.b ENSGT00940000156639.d ENSGT01100000263556.a.a.q.c.a ENSGT00940000157299.d ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.e ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.f ENSGT00940000166638 ENSGT00390000010075 ENSGT00940000165107.A ENSGT00940000156804.b ENSGT00940000156814 ENSGT00940000153725.b.c #20 ENSGT00940000182054 ENSGT00950000182909.a.e #21 ENSGT01010000222287.B.b.b.b #22 ENSGT00400000024390 ENSGT00390000002216 ENSGT00940000155460 ENSGT00940000157438.d ENSGT00390000015757 ENSGT00390000000360 ENSGT00940000157449.a ENSGT00940000167600 ENSGT00940000159129 ENSGT00940000158002 ENSGT00940000156170 ENSGT01030000234618.E ENSGT00390000016258 ENSGT00950000183103.d.a.b ENSGT01030000234535.E.d Turbot MODERN SPECIES 7 ENSSMAG00000013950 ENSSMAG00000013926 ENSSMAG00000013909 ENSSMAG00000026039 ENSSMAG00000013757 pip5k1ba (ENSSMAG00000013703) ENSSMAG00000028025 ENSSMAG00000033150 ENSSMAG00000023822 gadd45gb.1 (ENSSMAG00000026637) 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(ENSCSEG00000001561) pum3 (ENSCSEG00000001565) ENSCSEG00000001571 ccng2 (ENSCSEG00000001579) ccni (ENSCSEG00000001583) ENSCSEG00000001595 ENSCSEG00000001602 ENSCSEG00000001617 ENSCSEG00000001635 tcf7l1a (ENSCSEG00000001637) dbnla (ENSCSEG00000001644) adra2b (ENSCSEG00000001650) Anabantaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT01010000222287.B.b.b.b #22 Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000155754 ENSGT00940000156117.e.b ENSGT00940000156820.a.b ENSGT00940000158634.b ENSGT00940000156639.d ENSGT00940000162287.A.j ENSGT00940000157299.d ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.e ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.f ENSGT00940000166638 ENSGT00390000010075 ENSGT00940000165107.A ENSGT00940000156804.b ENSGT00940000156814 ENSGT00950000182909.a.e #21 ENSGT01010000222287.B.b.b.b #22 ENSGT00400000024390 ENSGT00390000002216 ENSGT00940000155460 ENSGT00940000157438.d ENSGT00390000015757 ENSGT00940000161555 ENSGT00390000000360 ENSGT00940000157449.a ENSGT00940000167600 ENSGT00940000159129 ENSGT01090000259997.a.d.b.a.a.b.b 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ENSOMYG00000059079 ENSOMYG00000046945 ENSOMYG00000046943 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000155754 ENSGT01050000244942.b.a.b.e.b ENSGT00940000164966.b.a.c ENSGT00550000074816.B.f ENSGT00940000156820.a.b.n ENSGT00940000158634.b.j ENSGT00940000156639.d.l ENSGT00520000055591.b.c.b ENSGT00940000157299.d.d ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.e.d ENSGT00950000182964.a.b.a.a.b.f.d ENSGT00940000166638.b.a ENSGT00940000165107.A.a ENSGT00390000009130.b.d.b ENSGT00940000156814 ENSGT01010000222287.B.b.b.b #22 ENSGT00940000163919.b.d ENSGT00940000159932.b ENSGT00940000155760.t.b.f ENSGT00730000111146.f ENSGT00940000161685.A.a.a ENSGT00940000156208.i.d ENSGT00950000182926.b.c.i ENSGT00940000164254.a.b.a ENSGT00820000127055.b.e.a ENSGT00730000111140.hc ENSGT00390000006044.m.a ENSGT00940000154702.a.b.d ENSGT00940000166762.b ENSGT00950000183203.c.a.c ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b Chinook salmon MODERN SPECIES 26 ENSOTSG00005013102 TMC2 (ENSOTSG00005013101) zfand5b (ENSOTSG00005013098) smc5 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ENSHHUG00000032079 ENSHHUG00000032076 ENSHHUG00000032073 ENSHHUG00000032064 ftsj1 (ENSHHUG00000032060) nefma (ENSHHUG00000032056) neflb (ENSHHUG00000032053) pgam2 (ENSHHUG00000032048) ENSHHUG00000032033 Northern pike MODERN SPECIES 13 ENSELUG00000012280 MAMDC2 (ENSELUG00000012261) ENSELUG00000012214 tjp2a (ENSELUG00000012138) pip5k1ba (ENSELUG00000011993) zgc:103482 (ENSELUG00000011872) EFNA5 (ENSELUG00000034260) GADD45G (ENSELUG00000011831) gadd45gb.1 (ENSELUG00000011823) ENSELUG00000011802 ENSELUG00000028900 ghrb (ENSELUG00000011769) c7b (ENSELUG00000011733) c6 (ENSELUG00000011662) rnf180b (ENSELUG00000011598) #21 ENSELUG00000011574 #22 ndr1 (ENSELUG00000011567) ANK1 (ENSELUG00000011547) ftsj1 (ENSELUG00000011483) NEFM (ENSELUG00000011468) neflb (ENSELUG00000011459) pgam2 (ENSELUG00000011434) ENSELUG00000011420 crkl (ENSELUG00000011394) med15 (ENSELUG00000011355) si:ch211-222n4.2 (ENSELUG00000011289) smpd4 (ENSELUG00000011271) TMEM132C (ENSELUG00000011190) ENSELUG00000011149 ENSELUG00000011126 RIMBP2 (ENSELUG00000011063) Otomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT01010000222287.B.b.b.b #22 Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT01010000222287.B.b.b.b #22 Atlantic herring MODERN SPECIES 3 ENSCHAG00000019453 ENSCHAG00000019376 ENSCHAG00000019359 ENSCHAG00000019329 ENSCHAG00000019317 dpysl2b (ENSCHAG00000018801) bnip3lb (ENSCHAG00000018774) ppp2r2ab (ENSCHAG00000018406) LRRTM4 (ENSCHAG00000018372) ENSCHAG00000018355 ENSCHAG00000017417 c7b (ENSCHAG00000015098) c6 (ENSCHAG00000014259) rgs7bpb (ENSCHAG00000014219) #20 rnf180b (ENSCHAG00000014210) #21 ENSCHAG00000014203 #22 ndr1 (ENSCHAG00000014198) eif4ebp1 (ENSCHAG00000014175) ENSCHAG00000014170 ANK1 (ENSCHAG00000011691) ftsj1 (ENSCHAG00000011598) nefma (ENSCHAG00000011577) NEFL (ENSCHAG00000011569) pgam2 (ENSCHAG00000011550) ENSCHAG00000011489 crkl (ENSCHAG00000011467) med15 (ENSCHAG00000011210) si:ch211-222n4.2 (ENSCHAG00000011195) smpd4 (ENSCHAG00000010719) TMEM132C (ENSCHAG00000010691) ENSCHAG00000010683