Vertebrata ANCESTRAL SPECIES ENSGT01050000244888.b.a #22 Gnathostomata DUPLICATION Gnathostomata DUPLICATION Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00390000008820.f ENSGT00940000159568 ENSGT00390000012178 ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159971 ENSGT00940000160039 ENSGT00730000110943.C ENSGT00940000160658 ENSGT00390000012807 ENSGT00940000158330 ENSGT00730000111263 ENSGT00390000016972 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT00390000010687.a.b ENSGT00940000159688 #24 ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000157557 ENSGT01030000234518.C.a.b.b ENSGT00950000182897.B.a.b.a ENSGT00950000183071.a.b ENSGT01050000244897.a.b.a ENSGT01050000244955.a.b ENSGT00390000013938 ENSGT00390000004360.a.b.a.a.a ENSGT00950000182865.b.a.b.b.b.b ENSGT00940000155028 ENSGT00390000015476 ENSGT00590000083134.b ENSGT00940000155266 ENSGT00390000016655.a.b ENSGT00510000047104 Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00950000182988.a.b.b.b 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ENSMOCG00000002287 #23 Slc6a14 (ENSMOCG00000011819) #24 Northern American deer mouse MODERN SPECIES 475 ENSPEMG00000025703 ENSPEMG00000025810 Pwwp3b (ENSPEMG00000031298) Fam199x (ENSPEMG00000022328) ENSPEMG00000022336 ENSPEMG00000030442 Tex13a (ENSPEMG00000009571) ENSPEMG00000031375 ENSPEMG00000008826 Il1rapl2 (ENSPEMG00000002784) ENSPEMG00000009338 Serpina7 (ENSPEMG00000016392) ENSPEMG00000028394 ENSPEMG00000026482 ENSPEMG00000026764 Agtr2 (ENSPEMG00000003517) #22 Slc6a14 (ENSPEMG00000022771) #24 ENSPEMG00000028133 ENSPEMG00000027715 ENSPEMG00000025640 ENSPEMG00000030303 ENSPEMG00000027120 ENSPEMG00000026541 ENSPEMG00000030325 Radx (ENSPEMG00000023178) Rnf128 (ENSPEMG00000003063) Tbc1d8b (ENSPEMG00000018650) ENSPEMG00000017766 Cldn2 (ENSPEMG00000012046) Morc4 (ENSPEMG00000008507) Rbm41 (ENSPEMG00000015991) Cricetinae ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00940000160983 ENSGT00950000182988.a.b.b.b ENSGT00940000156128.b ENSGT00940000161570 ENSGT00950000183232 ENSGT00510000047493 ENSGT00390000018248 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ENSGT00390000012484.c ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000159688 #24 ENSGT00860000135780 ENSGT00940000154359.f ENSGT00940000157557 ENSGT00940000155993.d.b ENSGT00940000155993.d.a.b ENSGT00940000155658 ENSGT00940000160896 ENSGT01030000234522.C.b.e.a.b.c ENSGT00440000033329.b.a.b ENSGT00940000170289 ENSGT00940000163031.b.a ENSGT00940000160619 ENSGT00440000039314.b ENSGT00940000160686 Mouse MODERN SPECIES 37 Ndufb11 (ENSMUSG00000031059) Rbm10 (ENSMUSG00000031060) Uba1 (ENSMUSG00000001924) Cdk16 (ENSMUSG00000031065) Usp11 (ENSMUSG00000031066) Araf (ENSMUSG00000001127) Syn1 (ENSMUSG00000037217) Timp1 (ENSMUSG00000001131) Cfp (ENSMUSG00000001128) Elk1 (ENSMUSG00000009406) Uxt (ENSMUSG00000001134) Zfp182 (ENSMUSG00000054737) Spaca5 (ENSMUSG00000037167) Zfp300 (ENSMUSG00000031079) Ssxa1 (ENSMUSG00000062814) Agtr2 (ENSMUSG00000068122) #22 Slc6a14 (ENSMUSG00000031089) #24 Gm28269 (ENSMUSG00000101818) Klhl13 (ENSMUSG00000036782) Wdr44 (ENSMUSG00000036769) Tesl1 (ENSMUSG00000068113) 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spretus MODERN SPECIES 19 Rbm10 (MGP_SPRETEiJ_G0034113) Uba1 (MGP_SPRETEiJ_G0034114) Cdk16 (MGP_SPRETEiJ_G0034115) Usp11 (MGP_SPRETEiJ_G0034116) Araf (MGP_SPRETEiJ_G0034117) Syn1 (MGP_SPRETEiJ_G0034118) Timp1 (MGP_SPRETEiJ_G0034119) Cfp (MGP_SPRETEiJ_G0034120) Elk1 (MGP_SPRETEiJ_G0034121) Uxt (MGP_SPRETEiJ_G0034122) Zfp182 (MGP_SPRETEiJ_G0034123) Spaca5 (MGP_SPRETEiJ_G0034124) Zfp300 (MGP_SPRETEiJ_G0034125) MGP_SPRETEiJ_G0034126 MGP_SPRETEiJ_G0034127 Agtr2 (MGP_SPRETEiJ_G0034128) #22 Slc6a14 (MGP_SPRETEiJ_G0034129) #24 Gm28269 (MGP_SPRETEiJ_G0034130) Klhl13 (MGP_SPRETEiJ_G0034131) MGP_SPRETEiJ_G0034132 MGP_SPRETEiJ_G0034133 Tesl1 (MGP_SPRETEiJ_G0034134) MGP_SPRETEiJ_G0034135 Dock11 (MGP_SPRETEiJ_G0034136) Il13ra1 (MGP_SPRETEiJ_G0034137) Zcchc12 (MGP_SPRETEiJ_G0034138) Lonrf3 (MGP_SPRETEiJ_G0034139) MGP_SPRETEiJ_G0034140 Gm14569 (MGP_SPRETEiJ_G0034141) Pgrmc1 (MGP_SPRETEiJ_G0034142) Akap17b (MGP_SPRETEiJ_G0034143) Steppe mouse MODERN SPECIES 1994 Agtr2 (ENSMSIG00000002524) #22 Ryukyu mouse MODERN SPECIES 19 Rbm10 (MGP_CAROLIEiJ_G0032963) Uba1 (MGP_CAROLIEiJ_G0032964) Cdk16 (MGP_CAROLIEiJ_G0032965) Usp11 (MGP_CAROLIEiJ_G0032966) Araf (MGP_CAROLIEiJ_G0032967) Syn1 (MGP_CAROLIEiJ_G0032968) Timp1 (MGP_CAROLIEiJ_G0032969) Cfp (MGP_CAROLIEiJ_G0032970) Elk1 (MGP_CAROLIEiJ_G0032971) Uxt (MGP_CAROLIEiJ_G0032972) Zfp182 (MGP_CAROLIEiJ_G0032973) Spaca5 (MGP_CAROLIEiJ_G0032974) Zfp300 (MGP_CAROLIEiJ_G0032975) Ssxa1 (MGP_CAROLIEiJ_G0032976) MGP_CAROLIEiJ_G0032977 Agtr2 (MGP_CAROLIEiJ_G0032978) #22 Slc6a14 (MGP_CAROLIEiJ_G0032979) #24 Gm28269 (MGP_CAROLIEiJ_G0032980) Klhl13 (MGP_CAROLIEiJ_G0032981) Wdr44 (MGP_CAROLIEiJ_G0032982) Dock11 (MGP_CAROLIEiJ_G0032983) Il13ra1 (MGP_CAROLIEiJ_G0032984) Zcchc12 (MGP_CAROLIEiJ_G0032985) Lonrf3 (MGP_CAROLIEiJ_G0032986) MGP_CAROLIEiJ_G0032987 Gm14569 (MGP_CAROLIEiJ_G0032988) Pgrmc1 (MGP_CAROLIEiJ_G0032989) Akap17b (MGP_CAROLIEiJ_G0032990) Slc25a43 (MGP_CAROLIEiJ_G0032991) Slc25a5 (MGP_CAROLIEiJ_G0032992) Steep1 (MGP_CAROLIEiJ_G0032993) Shrew mouse MODERN SPECIES 23 Ndufb11 (MGP_PahariEiJ_G0031505) Rbm10 (MGP_PahariEiJ_G0031506) Uba1 (MGP_PahariEiJ_G0031507) Cdk16 (MGP_PahariEiJ_G0031508) Usp11 (MGP_PahariEiJ_G0031509) Araf (MGP_PahariEiJ_G0031510) Syn1 (MGP_PahariEiJ_G0031511) Timp1 (MGP_PahariEiJ_G0031512) Cfp (MGP_PahariEiJ_G0031513) Elk1 (MGP_PahariEiJ_G0031514) Uxt (MGP_PahariEiJ_G0031515) Zfp182 (MGP_PahariEiJ_G0031516) Spaca5 (MGP_PahariEiJ_G0031517) Zfp300 (MGP_PahariEiJ_G0031518) Ssxa1 (MGP_PahariEiJ_G0031519) Agtr2 (MGP_PahariEiJ_G0031520) #22 Slc6a14 (MGP_PahariEiJ_G0031521) #24 MGP_PahariEiJ_G0031522 Klhl13 (MGP_PahariEiJ_G0031523) Wdr44 (MGP_PahariEiJ_G0031524) Tesl1 (MGP_PahariEiJ_G0031525) MGP_PahariEiJ_G0031526 MGP_PahariEiJ_G0031527 Il13ra1 (MGP_PahariEiJ_G0031528) Zcchc12 (MGP_PahariEiJ_G0031529) Lonrf3 (MGP_PahariEiJ_G0031530) MGP_PahariEiJ_G0031531 Gm14569 (MGP_PahariEiJ_G0031532) Pgrmc1 (MGP_PahariEiJ_G0031533) MGP_PahariEiJ_G0031534 Slc25a43 (MGP_PahariEiJ_G0031535) Rat MODERN SPECIES 46 Trpc5 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ENSGT00440000033329.b.a.b ENSGT00940000163031.b.a ENSGT00940000160619 ENSGT00440000039314.b ENSGT00940000160686 ENSGT00940000154400.b ENSGT00390000002197 ENSGT00940000155075.a.b.`b Naked mole-rat female MODERN SPECIES 31 LHFPL1 (ENSHGLG00000013759) ENSHGLG00000012297 ENSHGLG00000013791 ENSHGLG00000035431 ENSHGLG00000035102 ENSHGLG00000001226 ENSHGLG00000041493 ENSHGLG00000001151 ENSHGLG00000001104 LRCH2 (ENSHGLG00000001011) ENSHGLG00000028563 ENSHGLG00000039724 ENSHGLG00000000853 ENSHGLG00000019727 ENSHGLG00000044858 ENSHGLG00000040362 #22 ENSHGLG00000043063 ENSHGLG00000001647 #24 ENSHGLG00000051011 ENSHGLG00000042774 ENSHGLG00000002833 ENSHGLG00000002893 KLHL13 (ENSHGLG00000003690) ENSHGLG00000046500 ENSHGLG00000003366 ENSHGLG00000033083 DOCK11 (ENSHGLG00000000806) IL13RA1 (ENSHGLG00000001323) ZCCHC12 (ENSHGLG00000036218) LONRF3 (ENSHGLG00000002169) ENSHGLG00000011436 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES 65 ENSGT00940000160983 ENSGT00950000182988.a.b.b.b ENSGT00940000156128.b ENSGT00940000161570 ENSGT00950000183232 ENSGT00940000159922.b ENSGT00390000018248 ENSGT01060000248594.e.a ENSGT00990000203589.a.b.a.b ENSGT00940000159055 ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159971 ENSGT00940000160039 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT00390000010165.i.b.b.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000159688 #24 ENSGT00390000018873 ENSGT00940000154359.f ENSGT00940000157557 ENSGT00940000155658 ENSGT00940000160896 ENSGT01030000234522.C.b.e.a.b ENSGT00440000033329.b.a.b ENSGT00940000163031.b.a ENSGT00940000160619 ENSGT00440000039314.b ENSGT00940000160686 ENSGT00940000154400.b ENSGT00390000002197 ENSGT00940000155075.a.b.`b Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES 107 ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000159688 #24 ENSGT00390000018873 ENSGT00940000154359.f ENSGT00940000157557 ENSGT00940000155658 ENSGT00940000160896 ENSGT01030000234522.C.b.e.a.b ENSGT00440000033329.b.a.b ENSGT00940000163031.b.a ENSGT00940000160619 ENSGT00440000039314.b ENSGT00940000160686 ENSGT00940000154400.b ENSGT00390000002197 ENSGT00940000155075.a.b.`b Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 241 ENSCLAG00000017619 AGTR2 (ENSCLAG00000017599) #22 ENSCLAG00000008811 #24 ENSCLAG00000004474 ENSCLAG00000008615 KLHL13 (ENSCLAG00000007440) WDR44 (ENSCLAG00000002582) DOCK11 (ENSCLAG00000006793) IL13RA1 (ENSCLAG00000006075) ENSCLAG00000017563 LONRF3 (ENSCLAG00000003297) ENSCLAG00000002989 PGRMC1 (ENSCLAG00000002952) ENSCLAG00000002233 SLC25A43 (ENSCLAG00000002149) SLC25A5 (ENSCLAG00000004099) STEEP1 (ENSCLAG00000003523) Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00950000182988.a.b.b.b ENSGT00940000156128.b ENSGT00940000161570 ENSGT00950000183232 ENSGT00510000047493 ENSGT00940000159922.b ENSGT00390000018248 ENSGT01060000248594.e.a ENSGT00940000163925 ENSGT00990000203589.a.b.a.b ENSGT00940000159055 ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159971 ENSGT00940000160039 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000159688 #24 ENSGT00940000154359.f ENSGT00940000157557 ENSGT00940000155658 ENSGT00940000160896 ENSGT01030000234522.C.b.e.a.b.a ENSGT00440000033329.b.a.b ENSGT00940000163031.b.a ENSGT00940000160619 ENSGT00440000039314.b ENSGT00940000160686 ENSGT00940000154400.b ENSGT00390000002197.t ENSGT00940000155075.a.b.`b ENSGT00940000157256 Marmotini ANCESTRAL SPECIES 63 ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000159688 #24 ENSGT00940000154359.f ENSGT00940000157557 ENSGT00940000155658 ENSGT00940000160896 ENSGT01030000234522.C.b.e.a.b.a ENSGT00440000033329.b.a.b ENSGT00940000160619 ENSGT00440000039314.b ENSGT00940000160686 ENSGT00940000154400.b ENSGT00390000002197.t ENSGT00940000155075.a.b.`b ENSGT00940000157256 ENSGT00940000158026 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 78 ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000159688 #24 ENSGT00390000007430.r ENSGT00940000154359.f ENSGT00940000157557 ENSGT00940000155658 ENSGT00940000160896 ENSGT01030000234522.C.b.e.a.b.a ENSGT00440000033329.b.a.b ENSGT00940000163031.b.a ENSGT00940000160619 ENSGT00440000039314.b ENSGT00940000160686 ENSGT00940000154400.b ENSGT00390000002197.t ENSGT00940000155075.a.b.`b Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 785 AGTR2 (ENSUPAG00010005469) #22 ENSUPAG00010005475 #24 Squirrel MODERN SPECIES 79 GARIN1B (ENSSTOG00000026261) GARIN1A (ENSSTOG00000008506) HILPDA (ENSSTOG00000029766) IMPDH1 (ENSSTOG00000002177) PRRT4 (ENSSTOG00000023582) RBM28 (ENSSTOG00000002169) LEP (ENSSTOG00000027970) LRRC4 (ENSSTOG00000021081) SND1 (ENSSTOG00000002140) PAX4 (ENSSTOG00000002127) FSCN3 (ENSSTOG00000002115) ARF5 (ENSSTOG00000002104) GCC1 (ENSSTOG00000002099) ZNF800 (ENSSTOG00000023294) GRM8 (ENSSTOG00000006490) AGTR2 (ENSSTOG00000012524) #22 ENSSTOG00000007147 #24 ENSSTOG00000029519 KLHL13 (ENSSTOG00000012035) WDR44 (ENSSTOG00000007251) DOCK11 (ENSSTOG00000007295) IL13RA1 (ENSSTOG00000024422) ENSSTOG00000022238 LONRF3 (ENSSTOG00000015024) PGRMC1 (ENSSTOG00000024047) SLC25A43 (ENSSTOG00000004872) ENSSTOG00000020438 STEEP1 (ENSSTOG00000011579) UBE2A (ENSSTOG00000011583) NKRF (ENSSTOG00000020483) SEPTIN6 (ENSSTOG00000011593) Alpin marmot MODERN SPECIES 54 AGTR2 (ENSMMMG00000007695) #22 ENSMMMG00000007671 #24 ENSMMMG00000007666 KLHL13 (ENSMMMG00000007467) WDR44 (ENSMMMG00000007422) DOCK11 (ENSMMMG00000007293) IL13RA1 (ENSMMMG00000007276) ENSMMMG00000007268 ENSMMMG00000007240 ENSMMMG00000007229 ENSMMMG00000007220 SLC25A43 (ENSMMMG00000007207) SLC25A5 (ENSMMMG00000007201) ENSMMMG00000007184 UBE2A (ENSMMMG00000007093) NKRF (ENSMMMG00000007091) Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 156 AMOT (ENSSVLG00005013525) ENSSVLG00005019330 ENSSVLG00005019275 ENSSVLG00005019228 ENSSVLG00005019177 ENSSVLG00005019126 ENSSVLG00005019077 HTR2C (ENSSVLG00005018984) ENSSVLG00005018928 IL13RA2 (ENSSVLG00005018862) LRCH2 (ENSSVLG00005018464) ENSSVLG00005018369 ENSSVLG00005018340 PLS3 (ENSSVLG00005018046) ENSSVLG00005017980 AGTR2 (ENSSVLG00005017968) #22 ENSSVLG00005017948 ENSSVLG00005017904 SLC6A14 (ENSSVLG00005017746) CT83 (ENSSVLG00005017691) ENSSVLG00005017648 KLHL13 (ENSSVLG00005017370) WDR44 (ENSSVLG00005017220) DOCK11 (ENSSVLG00005016279) IL13RA1 (ENSSVLG00005016116) ENSSVLG00005016098 ENSSVLG00005016082 LONRF3 (ENSSVLG00005015856) ENSSVLG00005015710 PGRMC1 (ENSSVLG00005015662) ENSSVLG00005015613 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES 53 ENSGT00390000010397.a ENSGT00730000110943.A.d ENSGT00940000160983 ENSGT00950000182988.a.b.b.b ENSGT00940000156128.b ENSGT00940000161570 ENSGT00940000166730 ENSGT01060000248594.e.a ENSGT00390000018248 ENSGT00990000203589.a.b.a.b ENSGT00940000159055 ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159971 ENSGT00940000160039 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00390000018873 ENSGT00940000154359.f ENSGT00940000157557 ENSGT00940000155658 ENSGT00940000160896 ENSGT01030000234522.C.b.e.a.b ENSGT00440000033329.b.a.b ENSGT00390000002253 ENSGT00940000164744 ENSGT00940000160619 ENSGT00440000039314.b ENSGT00940000160686 ENSGT00940000154400.b ENSGT00390000002197 ENSGT00940000155075.a.b Rabbit MODERN SPECIES 1401 RTL4 (ENSOCUG00000005364) ENSOCUG00000027921 LHFPL1 (ENSOCUG00000013710) AMOT (ENSOCUG00000004881) ENSOCUG00000036470 ENSOCUG00000013331 ENSOCUG00000031433 ENSOCUG00000021705 ENSOCUG00000032360 HTR2C (ENSOCUG00000015900) IL13RA2 (ENSOCUG00000014747) LRCH2 (ENSOCUG00000016267) ENSOCUG00000026035 PLS3 (ENSOCUG00000006041) ENSOCUG00000021665 AGTR2 (ENSOCUG00000012363) #22 SLC6A14 (ENSOCUG00000015028) ENSOCUG00000036103 KLHL13 (ENSOCUG00000001993) WDR44 (ENSOCUG00000013619) DOCK11 (ENSOCUG00000013642) IL13RA1 (ENSOCUG00000013687) ENSOCUG00000016135 ENSOCUG00000030538 LONRF3 (ENSOCUG00000012990) ENSOCUG00000021455 ENSOCUG00000015860 PGRMC1 (ENSOCUG00000010280) ENSOCUG00000022039 SLC25A43 (ENSOCUG00000013248) ENSOCUG00000013268 Primates ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00950000183232 ENSGT00510000047493 ENSGT00940000159922.b ENSGT01060000248594.e.a ENSGT00390000018248 ENSGT00940000163925 ENSGT00990000203589.a.b.a.b ENSGT00940000159055 ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159971 ENSGT00940000160039 ENSGT00990000204264 ENSGT00940000165469 ENSGT00990000205098 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000159688 #24 ENSGT00390000018873 ENSGT00940000154359.f ENSGT00940000157557 ENSGT00940000155658 ENSGT00940000160896 ENSGT01030000234522.C.b.e.a.b ENSGT00440000033329.b.a.b ENSGT00390000002253 ENSGT00940000163031.b.a ENSGT00940000160619 ENSGT00440000039314.b ENSGT00940000160686 ENSGT00940000154400.b ENSGT00390000002197 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000161570 ENSGT00950000183232 ENSGT00940000159922.b ENSGT01060000248594.e.a ENSGT00390000018248 ENSGT00940000163925 ENSGT00990000203589.a.b.a.b ENSGT00940000159055 ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159971 ENSGT00940000160039 ENSGT00990000204264 ENSGT00940000165469 ENSGT00990000205098 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000159688 #24 ENSGT00390000018873 ENSGT00940000154359.f ENSGT00940000157557 ENSGT00940000155658 ENSGT00940000160896 ENSGT01030000234522.C.b.e.a.b ENSGT00440000033329.b.a.b ENSGT00390000002253 ENSGT00940000163031.b.a ENSGT00940000160619 ENSGT00440000039314.b ENSGT00940000160686 ENSGT00940000154400.a.b ENSGT00940000154400.b Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000156128.b ENSGT00940000161570 ENSGT00950000183232 ENSGT00940000159922.b ENSGT01060000248594.e.a ENSGT00390000018248 ENSGT00940000163925 ENSGT00990000203589.a.b.a.b ENSGT00940000159055 ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159971 ENSGT00940000160039 ENSGT00990000204264 ENSGT00990000205098 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00390000018873 ENSGT00940000154359.f ENSGT00940000157557 ENSGT00940000155658 ENSGT00940000160896 ENSGT01030000234522.C.b.e.a.b.f ENSGT00440000033329.b.a.b ENSGT00390000002253.a ENSGT00940000163031.b.a ENSGT00940000160619 ENSGT00440000039314.b ENSGT00940000160686 ENSGT00940000154400.a.b ENSGT00390000002197.p ENSGT00940000155075.a.b Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00910000147631 ENSGT00940000161570 ENSGT00950000183232 ENSGT00940000159922.b ENSGT01060000248594.e.a ENSGT00390000018248 ENSGT00940000163925 ENSGT00990000203589.a.b.a.b ENSGT00940000159055 ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159971 ENSGT00940000160039 ENSGT00940000162929.l ENSGT00950000183340 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00390000018873.c ENSGT00390000018873.d ENSGT00940000154359.f ENSGT00940000157557 ENSGT00940000155658.bb.a ENSGT00940000160896 ENSGT01030000234522.C.b.e.a.b.f ENSGT00440000033329.b.a.b ENSGT00390000002253.a ENSGT00940000163031.b.a ENSGT00940000160619 ENSGT00440000039314.b ENSGT00940000160686 ENSGT00940000154400.a.b ENSGT00390000002197.p Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00910000147631 ENSGT00940000161570 ENSGT00950000183232 ENSGT00940000159922.b ENSGT01060000248594.e.a ENSGT00390000018248 ENSGT00940000163925 ENSGT00990000203589.a.b.a.b ENSGT00940000159055 ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159971 ENSGT00940000160039 ENSGT00940000162929.l ENSGT00950000183340 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00390000018873.c ENSGT00390000018873.d ENSGT00940000154359.f ENSGT00940000157557 ENSGT00940000155658.bb.a ENSGT00940000160896 ENSGT01030000234522.C.b.e.a.b.f ENSGT00440000033329.b.a.b ENSGT00390000002253.a ENSGT00940000163031.b.a ENSGT00940000160619 ENSGT00440000039314.b ENSGT00940000160686 ENSGT00940000154400.b ENSGT00390000002197.p Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 694 AGTR2 (ENSRBIG00000031065) #22 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1855 AGTR2 (ENSRROG00000015641) #22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000161570 ENSGT00950000183232 ENSGT00940000159922.b ENSGT00390000017282.r.a.b ENSGT01060000248594.e.a ENSGT00390000018248 ENSGT00940000163925 ENSGT00990000203589.a.b.a.b ENSGT00940000159055 ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159971 ENSGT00940000160039 ENSGT00940000162929.l ENSGT00950000183340 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00390000018873.c ENSGT00390000018873.d ENSGT00940000154359.f ENSGT00940000157557 ENSGT00940000155658.bb.a ENSGT00940000160896 ENSGT01030000234522.C.b.e.a.b.f ENSGT00440000033329.b.a.b ENSGT00390000002253.a ENSGT00940000163031.b.a ENSGT00940000160619 ENSGT00440000039314.b ENSGT00940000160686 ENSGT00940000154400.b ENSGT00940000154400.a.b Vervet Monkey MODERN SPECIES 193 AGTR2 (ENSCSAG00000019502) #22 SLC6A14 (ENSCSAG00000018276) ENSCSAG00000018271 KLHL13 (ENSCSAG00000018270) WDR44 (ENSCSAG00000018269) PLS3 (ENSCSAG00000018267) Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000161570 ENSGT00950000183232 ENSGT00940000159922.b ENSGT00390000017282.r.a.b ENSGT01060000248594.e.a ENSGT00390000018248 ENSGT00940000163925 ENSGT00990000203589.a.b.a.b ENSGT00940000159055 ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159971 ENSGT00940000160039 ENSGT00940000162929.l ENSGT00950000183340 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00390000018873.c ENSGT00940000154359.f ENSGT00940000157557 ENSGT00940000155658.bb.a ENSGT00940000160896 ENSGT01030000234522.C.b.e.a.b.f ENSGT00440000033329.b.a.b ENSGT00950000185370 ENSGT00940000160619 ENSGT00440000039314.b ENSGT00940000160686 ENSGT00940000154400.b ENSGT00390000002197.p ENSGT00940000155075.a.b ENSGT00940000157256 Macaca ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000161570 ENSGT00950000183232 ENSGT00940000159922.b ENSGT00390000017282.r.a.b ENSGT01060000248594.e.a ENSGT00390000018248 ENSGT00940000163925 ENSGT00990000203589.a.b.a.b ENSGT00940000159055 ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159971 ENSGT00940000160039 ENSGT00940000162929.l ENSGT00950000183340 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00390000018873.c ENSGT00940000154359.f ENSGT00940000157557 ENSGT00940000155658.bb.a ENSGT00940000160896 ENSGT01030000234522.C.b.e.a.b.f ENSGT00440000033329.b.a.b ENSGT00950000185370 ENSGT00940000160619 ENSGT00530000064130.c.a.b ENSGT00940000160686 ENSGT00940000154400.b ENSGT00390000002197.p ENSGT00940000155075.a.b ENSGT00940000157256 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 419 AGTR2 (ENSMNEG00000027643) #22 SLC6A14 (ENSMNEG00000043764) CT83 (ENSMNEG00000034180) KLHL13 (ENSMNEG00000029163) WDR44 (ENSMNEG00000028012) DOCK11 (ENSMNEG00000034085) IL13RA1 (ENSMNEG00000038953) ZCCHC12 (ENSMNEG00000026384) LONRF3 (ENSMNEG00000045507) CT47C1 (ENSMNEG00000043721) KIAA1210 (ENSMNEG00000041033) PGRMC1 (ENSMNEG00000035406) SLC25A43 (ENSMNEG00000040923) ENSMNEG00000038553 STEEP1 (ENSMNEG00000030076) UBE2A (ENSMNEG00000035208) Macaca_a ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00950000182988.a.b.b.b ENSGT00940000156128.b ENSGT00940000161570 ENSGT00940000159922.b ENSGT01060000248594.e.a ENSGT00390000018248 ENSGT00940000163925 ENSGT00990000203589.a.b.a.b ENSGT00940000159055 ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159971 ENSGT00940000160039 ENSGT00990000204264 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT00940000156297.p.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00390000018873.c ENSGT00390000018873.d ENSGT00940000154359.f ENSGT00940000157557 ENSGT00940000155658.bb.a ENSGT00940000160896 ENSGT01030000234522.C.b.e.a.b.f ENSGT00440000033329.b.a.b ENSGT00950000185370 ENSGT00940000160619 ENSGT00530000064130.c.a.b ENSGT00940000160686 ENSGT00940000154400.b ENSGT00940000155075.a.b ENSGT00940000157256 Rhesus MODERN SPECIES 327 CAPN6 (ENSMMUG00000015308) DCX (ENSMMUG00000015312) ALG13 (ENSMMUG00000010421) TRPC5 (ENSMMUG00000010424) TRPC5OS (ENSMMUG00000064574) RTL4 (ENSMMUG00000059768) LHFPL1 (ENSMMUG00000000903) AMOT (ENSMMUG00000007688) HTR2C (ENSMMUG00000009607) IL13RA2 (ENSMMUG00000022224) LRCH2 (ENSMMUG00000017323) ENSMMUG00000060939 ENSMMUG00000007515 PLS3 (ENSMMUG00000006377) ENSMMUG00000019688 AGTR2 (ENSMMUG00000055906) #22 SLC6A14 (ENSMMUG00000057063) CT83 (ENSMMUG00000020849) ENSMMUG00000032363 ENSMMUG00000017109 KLHL13 (ENSMMUG00000002293) WDR44 (ENSMMUG00000011497) DOCK11 (ENSMMUG00000011498) IL13RA1 (ENSMMUG00000053844) ZCCHC12 (ENSMMUG00000017574) LONRF3 (ENSMMUG00000016431) CT47C1 (ENSMMUG00000019534) KIAA1210 (ENSMMUG00000019533) PGRMC1 (ENSMMUG00000014466) SLC25A43 (ENSMMUG00000020282) UBE2A (ENSMMUG00000022667) Crab-eating macaque MODERN SPECIES 175 TRPC5 (ENSMFAG00000003102) TRPC5OS (ENSMFAG00000047357) ENSMFAG00000055408 RTL4 (ENSMFAG00000064863) ENSMFAG00000047521 LHFPL1 (ENSMFAG00000003226) AMOT (ENSMFAG00000032269) ENSMFAG00000032031 ENSMFAG00000049831 HTR2C (ENSMFAG00000064910) IL13RA2 (ENSMFAG00000003923) ENSMFAG00000048522 LUZP4 (ENSMFAG00000042600) PLS3 (ENSMFAG00000031185) ENSMFAG00000045515 AGTR2 (ENSMFAG00000008335) #22 ENSMFAG00000049076 ENSMFAG00000056981 ENSMFAG00000062982 SLC6A14 (ENSMFAG00000035389) CT83 (ENSMFAG00000052975) ENSMFAG00000000247 ENSMFAG00000065339 ENSMFAG00000055250 ENSMFAG00000057933 ENSMFAG00000059238 ENSMFAG00000052835 ENSMFAG00000024766 ENSMFAG00000049555 ENSMFAG00000065173 KLHL13 (ENSMFAG00000043732) Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00940000161570 ENSGT00950000183232 ENSGT00940000159922.b ENSGT00390000017282.r.a.b ENSGT01060000248594.e.a ENSGT00390000018248 ENSGT00940000163925 ENSGT00990000203589.a.b.a.b ENSGT00940000159055 ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159971 ENSGT00940000160039 ENSGT00990000204264 ENSGT00950000183340 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00390000018873.c ENSGT00940000154359.f ENSGT00940000157557 ENSGT00940000155658.bb.a ENSGT00940000160896 ENSGT01030000234522.C.b.e.a.b.f ENSGT00440000033329.b.a.b ENSGT00390000002253.a ENSGT00940000163031.b.a ENSGT00940000160619 ENSGT00440000039314.b ENSGT00940000160686 ENSGT00940000154400.a.b ENSGT00390000002197.p ENSGT00940000155075.a.b Olive baboon MODERN SPECIES 792 AMOT (ENSPANG00000021026) LHFPL1 (ENSPANG00000004576) RTL4 (ENSPANG00000044292) TRPC5OS (ENSPANG00000049143) TRPC5 (ENSPANG00000012213) ENSPANG00000044568 ENSPANG00000043135 ENSPANG00000051365 HTR2C (ENSPANG00000010092) IL13RA2 (ENSPANG00000012467) ENSPANG00000017967 LRCH2 (ENSPANG00000015253) ENSPANG00000024419 PLS3 (ENSPANG00000018366) ENSPANG00000044711 AGTR2 (ENSPANG00000022415) #22 SLC6A14 (ENSPANG00000002929) CT83 (ENSPANG00000025705) ENSPANG00000037716 ENSPANG00000043465 ENSPANG00000038296 KLHL13 (ENSPANG00000006811) ENSPANG00000044557 ENSPANG00000046605 ENSPANG00000049849 WDR44 (ENSPANG00000012048) DOCK11 (ENSPANG00000024417) IL13RA1 (ENSPANG00000018627) ZCCHC12 (ENSPANG00000033496) LONRF3 (ENSPANG00000015252) CT47C1 (ENSPANG00000039371) Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 89 ENSGT00940000156128.b ENSGT00910000147631 ENSGT00940000161570 ENSGT00950000183232 ENSGT00940000159922.b ENSGT00390000017282.r.a.b ENSGT01060000248594.e.a ENSGT00990000203589.a.b.a.b ENSGT00940000159055 ENSGT00940000164104.b ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159971 ENSGT00940000160039 ENSGT00950000183340 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00390000018873.c ENSGT00940000154359.f ENSGT00940000157557 ENSGT00940000155658.bb.a ENSGT00940000160896 ENSGT01030000234522.C.b.e.a.b.f ENSGT00440000033329.b.a.b ENSGT00390000002253.a ENSGT00940000163031.b.a ENSGT00940000160619 ENSGT00940000160686 ENSGT00940000154400.a.b ENSGT00390000002197.p ENSGT00940000155075.a.b ENSGT00940000157256 Sooty mangabey MODERN SPECIES 283 ENSCATG00000039884 SERTM2 (ENSCATG00000013352) ALG13 (ENSCATG00000032824) TRPC5 (ENSCATG00000029734) LHFPL1 (ENSCATG00000041033) AMOT (ENSCATG00000035828) ENSCATG00000028931 ENSCATG00000043275 ENSCATG00000038904 HTR2C (ENSCATG00000031908) IL13RA2 (ENSCATG00000037283) LRCH2 (ENSCATG00000037702) LUZP4 (ENSCATG00000012199) PLS3 (ENSCATG00000038506) ENSCATG00000045172 AGTR2 (ENSCATG00000020256) #22 SLC6A14 (ENSCATG00000038946) CT83 (ENSCATG00000034454) KLHL13 (ENSCATG00000040977) WDR44 (ENSCATG00000044289) DOCK11 (ENSCATG00000038401) ENSCATG00000009670 ENSCATG00000040411 IL13RA1 (ENSCATG00000034378) ZCCHC12 (ENSCATG00000006188) LONRF3 (ENSCATG00000040361) CT47C1 (ENSCATG00000038614) KIAA1210 (ENSCATG00000015100) ENSCATG00000040418 PGRMC1 (ENSCATG00000039960) SLC25A43 (ENSCATG00000045150) Drill MODERN SPECIES 633 AGTR2 (ENSMLEG00000019955) #22 SLC6A14 (ENSMLEG00000036629) CT83 (ENSMLEG00000044123) ENSMLEG00000042967 KLHL13 (ENSMLEG00000023263) WDR44 (ENSMLEG00000043429) DOCK11 (ENSMLEG00000013685) IL13RA1 (ENSMLEG00000042144) ZCCHC12 (ENSMLEG00000017941) LONRF3 (ENSMLEG00000030948) CT47C1 (ENSMLEG00000042244) KIAA1210 (ENSMLEG00000041621) ENSMLEG00000036214 PGRMC1 (ENSMLEG00000031520) SLC25A43 (ENSMLEG00000033832) SLC25A5 (ENSMLEG00000031806) Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000161570 ENSGT00950000183232 ENSGT00390000015797.d.m.a ENSGT00940000159922.b ENSGT01060000248594.e.a ENSGT00390000018248 ENSGT00940000163925 ENSGT00990000203589.a.b.a.b ENSGT00940000159055 ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159971 ENSGT00940000160039 ENSGT00940000162929.l ENSGT00950000183340 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00390000018873.c ENSGT00390000018873.d ENSGT00940000154359.f ENSGT00940000157557 ENSGT00940000155658.bb.a ENSGT00940000160896 ENSGT01030000234522.C.b.e.a.b.f ENSGT00940000164191.b ENSGT00440000033329.b.a.b ENSGT00390000002253.a ENSGT00940000163031.b.a ENSGT00940000160619 ENSGT00530000064130.c.a.b ENSGT00940000160686 ENSGT00940000154400.a.b Hominidae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000161570 ENSGT00950000183232 ENSGT00390000015797.d.m.a ENSGT00940000159922.b ENSGT01060000248594.e.a ENSGT00390000018248 ENSGT00940000163925 ENSGT00990000203589.a.b.a.b ENSGT00940000159055 ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159971 ENSGT00940000160039 ENSGT00940000162929.l ENSGT00950000183340 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00390000018873.c ENSGT00390000018873.d ENSGT00940000154359.f ENSGT00940000157557 ENSGT00940000155658.bb.a ENSGT00940000160896 ENSGT01030000234522.C.b.e.a.b.f ENSGT00940000164191.b ENSGT00440000033329.b.a.b ENSGT00390000002253.a ENSGT00940000163031.b.a ENSGT00940000160619 ENSGT00530000064130.c.a.b ENSGT00940000160686 ENSGT00940000154400.a.b Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00950000183232 ENSGT00940000153336.e.a.a.a.a.f.b ENSGT00390000015797.d.m.a ENSGT00940000159922.b ENSGT01060000248594.e.a ENSGT00390000018248 ENSGT00940000163925 ENSGT00990000203589.a.b.a.b ENSGT00940000159055 ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159971 ENSGT00940000160039 ENSGT00940000162929.l ENSGT00950000183340 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00390000018873.c ENSGT00390000018873.d ENSGT00940000154359.f ENSGT00940000157557 ENSGT00940000155658.bb.a ENSGT00940000160896 ENSGT01030000234522.C.b.e.a.b.f ENSGT00940000164191.b ENSGT00440000033329.b.a.b ENSGT00390000002253.a ENSGT00940000163031.b.a ENSGT00940000160619 ENSGT00530000064130.c.a.b ENSGT00940000160686 ENSGT00940000154400.a.b Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00950000183232 ENSGT00940000153336.e.a.a.a.a.f.b ENSGT00390000015797.d.m.a ENSGT00940000159922.b ENSGT01060000248594.e.a ENSGT00390000018248 ENSGT00940000163925 ENSGT00990000203589.a.b.a.b ENSGT00940000159055 ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159971 ENSGT00940000160039 ENSGT00940000162929.l ENSGT00950000183340 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00390000018873.c ENSGT00940000154359.f ENSGT00940000157557 ENSGT00940000155658.bb.a ENSGT00940000160896 ENSGT01030000234522.C.b.e.a.b.f ENSGT00940000164191.b ENSGT00440000033329.b.a.b ENSGT00390000002253.a ENSGT00940000163031.b.a ENSGT00940000160619 ENSGT00530000064130.c.a.b ENSGT00940000160686 ENSGT00940000154400.a.b ENSGT00390000002197.p Pan ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000015797.d.m.a ENSGT00940000159922.b ENSGT01060000248594.e.a ENSGT00390000018248 ENSGT00940000163925 ENSGT00990000203589.a.b.a.b ENSGT00940000159055 ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159971 ENSGT00940000160039 ENSGT00940000162929.l ENSGT00950000183340 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT00390000007552.f.x.i ENSGT00390000010991.f.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00390000018873.c 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AGTR2 (ENSPPYG00000020654) #22 SLC6A14 (ENSPPYG00000020656) CT83 (ENSPPYG00000020657) ENSPPYG00000031592 KLHL13 (ENSPPYG00000020658) WDR44 (ENSPPYG00000020659) DOCK11 (ENSPPYG00000020660) IL13RA1 (ENSPPYG00000020661) ZCCHC12 (ENSPPYG00000020662) LONRF3 (ENSPPYG00000020663) CT47C1 (ENSPPYG00000020664) KIAA1210 (ENSPPYG00000020665) PGRMC1 (ENSPPYG00000020666) SLC25A43 (ENSPPYG00000035637) ENSPPYG00000033592 SLC25A5 (ENSPPYG00000020669) Gibbon MODERN SPECIES 449 ENSNLEG00000028689 ALG13 (ENSNLEG00000014546) TRPC5 (ENSNLEG00000014606) RTL4 (ENSNLEG00000014618) LHFPL1 (ENSNLEG00000014619) AMOT (ENSNLEG00000014625) ENSNLEG00000027151 HTR2C (ENSNLEG00000030638) ENSNLEG00000033896 IL13RA2 (ENSNLEG00000014640) LRCH2 (ENSNLEG00000014656) ENSNLEG00000028889 ENSNLEG00000033339 PLS3 (ENSNLEG00000014671) ENSNLEG00000028901 AGTR2 (ENSNLEG00000032737) #22 SLC6A14 (ENSNLEG00000014716) ENSNLEG00000014732 ENSNLEG00000034861 KLHL13 (ENSNLEG00000014736) WDR44 (ENSNLEG00000014755) DOCK11 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ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00950000182988.a.b.b.b ENSGT00940000156128.b ENSGT00940000161570.a ENSGT00950000183232 ENSGT00940000159922.b ENSGT01060000248594.e.a ENSGT00390000018248 ENSGT00990000203589.a.b.a.b ENSGT00940000159055 ENSGT00940000158041.c.b ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159971 ENSGT00940000160039 ENSGT00990000204264 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00390000018873.a ENSGT00940000154359.f ENSGT00550000074618.a.a.j.a ENSGT00940000157557 ENSGT00940000155658 ENSGT00940000160896 ENSGT01030000234522.C.b.e.a.b.f ENSGT00440000033329.b.a.b ENSGT00390000002253.a ENSGT00940000163031.b.a ENSGT00940000160619 ENSGT00530000064130.c.a ENSGT00940000160686 ENSGT00940000154400.a.b.b ENSGT00390000002197.p Marmoset MODERN SPECIES 78 ENSCJAG00000073196 ALG13 (ENSCJAG00000007056) TRPC5 (ENSCJAG00000007053) TRPC5OS (ENSCJAG00000046018) LHFPL1 (ENSCJAG00000070219) AMOT (ENSCJAG00000007004) ENSCJAG00000023432 ENSCJAG00000066287 ENSCJAG00000076352 HTR2C (ENSCJAG00000006967) IL13RA2 (ENSCJAG00000006949) ENSCJAG00000070981 ENSCJAG00000001968 ENSCJAG00000077783 PLS3 (ENSCJAG00000001982) AGTR2 (ENSCJAG00000002516) #22 SLC6A14 (ENSCJAG00000043509) ENSCJAG00000002485 ENSCJAG00000074258 ENSCJAG00000078021 ENSCJAG00000053773 ENSCJAG00000083115 KLHL13 (ENSCJAG00000002447) WDR44 (ENSCJAG00000002408) DOCK11 (ENSCJAG00000002281) ENSCJAG00000064943 ENSCJAG00000086389 IL13RA1 (ENSCJAG00000040932) ZCCHC12 (ENSCJAG00000039059) LONRF3 (ENSCJAG00000005189) ENSCJAG00000064726 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES 67 ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00390000018873.a ENSGT00940000154359.f ENSGT00550000074618.a.a.j.a ENSGT00940000157557 ENSGT00940000155658 ENSGT00940000160896 ENSGT00440000033329.b.a.b ENSGT00390000002253.a ENSGT00950000185370 ENSGT00940000160619 ENSGT00530000064130.c.a ENSGT00940000160686 ENSGT00940000154400.a.b.b ENSGT00390000002197.p ENSGT00940000155075.a.b.v.b Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 85 AGTR2 (ENSSBOG00000015085) #22 ENSSBOG00000034479 SLC6A14 (ENSSBOG00000025912) CT83 (ENSSBOG00000028750) KLHL13 (ENSSBOG00000001403) ENSSBOG00000023834 WDR44 (ENSSBOG00000035467) DOCK11 (ENSSBOG00000018795) IL13RA1 (ENSSBOG00000014267) LONRF3 (ENSSBOG00000026750) CT47C1 (ENSSBOG00000028868) PGRMC1 (ENSSBOG00000020615) ENSSBOG00000030322 SLC25A43 (ENSSBOG00000019634) STEEP1 (ENSSBOG00000024579) UBE2A (ENSSBOG00000032134) Capuchin MODERN SPECIES 861 AGTR2 (ENSCCAG00000031674) #22 Mas night monkey MODERN SPECIES 928 AGTR2 (ENSANAG00000015473) #22 SLC6A14 (ENSANAG00000026701) ENSANAG00000035121 ENSANAG00000020579 KLHL13 (ENSANAG00000034243) ENSANAG00000023743 WDR44 (ENSANAG00000025934) DOCK11 (ENSANAG00000030286) IL13RA1 (ENSANAG00000002047) LONRF3 (ENSANAG00000020507) CT47C1 (ENSANAG00000027186) KIAA1210 (ENSANAG00000036561) PGRMC1 (ENSANAG00000035662) ENSANAG00000023853 SLC25A43 (ENSANAG00000017265) SLC25A5 (ENSANAG00000028035) Tarsier MODERN SPECIES 3890 AGTR2 (ENSTSYG00000007517) #22 SLC6A14 (ENSTSYG00000014708) #24 CT83 (ENSTSYG00000014709) Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000159688 #24 ENSGT00390000018873 ENSGT00940000154359.f ENSGT00940000157557 ENSGT00940000155658 ENSGT00940000160896 ENSGT01030000234522.C.b.e.a.b.g ENSGT00440000033329.b.a.b ENSGT00940000163031.b.a ENSGT00940000160619 ENSGT00440000039314.b ENSGT00940000160686 ENSGT00940000154400.b ENSGT00390000002197 ENSGT00940000155075.a.b Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES 79 ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000159688 #24 ENSGT00390000018873 ENSGT00940000154359.f ENSGT00940000157557 ENSGT00940000155658 ENSGT00940000160896 ENSGT01030000234522.C.b.e.a.b.g ENSGT00440000033329.b.a.b ENSGT00940000160619 ENSGT00940000160686 ENSGT00940000154400.b ENSGT00390000002197 ENSGT00940000155075.a.b ENSGT00940000157256 ENSGT00940000158026 Mouse lemur MODERN SPECIES 169 ENSMICG00000041850 IL13RA2 (ENSMICG00000032540) LRCH2 (ENSMICG00000047056) ENSMICG00000032868 ENSMICG00000042645 ENSMICG00000046847 ENSMICG00000001553 ENSMICG00000047685 ENSMICG00000028066 ENSMICG00000030188 ENSMICG00000027684 ENSMICG00000042624 ENSMICG00000038657 XIAP (ENSMICG00000004339) STAG2 (ENSMICG00000033289) AGTR2 (ENSMICG00000044784) #22 ENSMICG00000037304 #24 CT83 (ENSMICG00000029868) ENSMICG00000026999 KLHL13 (ENSMICG00000035307) ENSMICG00000034601 WDR44 (ENSMICG00000000877) DOCK11 (ENSMICG00000011698) ENSMICG00000031264 IL13RA1 (ENSMICG00000046669) ENSMICG00000041498 LONRF3 (ENSMICG00000004246) PGRMC1 (ENSMICG00000004265) SLC25A43 (ENSMICG00000043952) ENSMICG00000035994 ENSMICG00000030606 Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 Coquerels sifaka MODERN SPECIES 580 ENSPCOG00000013043 ENSPCOG00000021221 AGTR2 (ENSPCOG00000025934) #22 ENSPCOG00000019015 SLC6A14 (ENSPCOG00000015850) CT83 (ENSPCOG00000010682) Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 1367 ENSPSMG00000016145 ENSPSMG00000016135 AGTR2 (ENSPSMG00000016131) #22 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000161570 ENSGT00950000183232 ENSGT00510000047493 ENSGT00940000159922.b ENSGT01060000248594.e.a ENSGT00390000018248 ENSGT00940000163925 ENSGT00990000203589.a.b.a.b ENSGT00940000159055 ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159971 ENSGT00940000160039 ENSGT00990000204264 ENSGT00990000205098 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000159688 #24 ENSGT00390000018873 ENSGT00940000154359.f ENSGT00940000157557 ENSGT00940000155658 ENSGT00940000160896 ENSGT00440000033329.b.a.b ENSGT00390000002253 ENSGT00950000185370 ENSGT00940000163031.b.a ENSGT00940000160619 ENSGT00440000039314.b ENSGT00940000160686 ENSGT00940000154400.b ENSGT00390000002197 Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 Hedgehog MODERN SPECIES 10618 AGTR2 (ENSEEUG00000012908) #22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000156128.b ENSGT00940000161570 ENSGT00950000183232 ENSGT00510000047493 ENSGT00940000159922.b ENSGT01060000248594.e.a ENSGT00390000018248 ENSGT00940000163925 ENSGT00990000203589.a.b.a.b ENSGT00940000159055 ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159971 ENSGT00940000160039 ENSGT00990000205098 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000159688 #24 ENSGT00390000018873 ENSGT00940000154359.f ENSGT00940000157557 ENSGT00940000155658 ENSGT00940000160896 ENSGT01030000234522.C.b.e.a.b.i ENSGT00440000033329.b.a.b ENSGT00940000163031.b.a ENSGT00950000185370 ENSGT00940000160619 ENSGT00440000039314.b ENSGT00940000160686 ENSGT00940000154400.b ENSGT00390000002197 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000155075.a.b ENSGT00390000002197 ENSGT00940000154400.b ENSGT00940000160686 ENSGT00440000039314.b ENSGT00940000160619 ENSGT00950000185370 ENSGT00440000033329.b.a.b ENSGT01030000234522.C.b.e.a.b.i ENSGT00940000160896 ENSGT00940000155658 ENSGT00940000157557 ENSGT00940000154359.f ENSGT00390000018873 ENSGT00940000159688 #24 ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT00990000205098 ENSGT00940000160039 ENSGT00940000159971 ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159055 ENSGT00990000203589.a.b.a.b ENSGT00940000163925 ENSGT01060000248594.e.a ENSGT00390000018248 ENSGT00940000159922.b ENSGT00510000047493 ENSGT00950000183232 ENSGT00940000161570 ENSGT00940000156128.b Suina ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000002197 ENSGT00940000154400.b ENSGT00940000160686 ENSGT00440000039314.b ENSGT00940000160619 ENSGT00950000185370 ENSGT00940000164744 ENSGT00440000033329.b.a.b ENSGT01030000234522.C.b.e.a.b.i ENSGT00940000160896 ENSGT00940000155658 ENSGT00940000157557 ENSGT00940000154359.f ENSGT00390000018873 ENSGT00940000159688 #24 ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT00990000205098 ENSGT00940000160039 ENSGT00940000159971 ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159055 ENSGT00990000203589.a.b.a.b ENSGT00940000163925 ENSGT01060000248594.e.a ENSGT00940000159922.b ENSGT00510000047493 ENSGT00950000183232 ENSGT00940000161570 ENSGT00940000156128.b ENSGT00950000182988.a.b.b.b Chacoan peccary MODERN SPECIES 13 SLC25A5 (ENSCWAG00000001184) SLC25A43 (ENSCWAG00000001161) ENSCWAG00000001137 PGRMC1 (ENSCWAG00000001119) ENSCWAG00000001094 ENSCWAG00000001076 LONRF3 (ENSCWAG00000001042) ENSCWAG00000001019 IL13RA1 (ENSCWAG00000000991) DOCK11 (ENSCWAG00000000777) WDR44 (ENSCWAG00000000683) ENSCWAG00000000660 KLHL13 (ENSCWAG00000000596) CT83 (ENSCWAG00000000556) SLC6A14 (ENSCWAG00000000524) AGTR2 (ENSCWAG00000000504) #22 PLS3 (ENSCWAG00000000418) ENSCWAG00000000389 LRCH2 (ENSCWAG00000000257) IL13RA2 (ENSCWAG00000000117) HTR2C (ENSCWAG00000000082) AMOT (ENSCWAG00000016473) LHFPL1 (ENSCWAG00000016438) RTL4 (ENSCWAG00000016426) TRPC5 (ENSCWAG00000016289) ENSCWAG00000016190 ENSCWAG00000016146 SERTM2 (ENSCWAG00000016129) DCX (ENSCWAG00000016049) CAPN6 (ENSCWAG00000015954) PAK3 (ENSCWAG00000015653) Pig MODERN SPECIES 300 UBE2A (ENSSSCG00000012621) SLC25A5 (ENSSSCG00000012623) ENSSSCG00000058323 SLC25A43 (ENSSSCG00000012624) ENSSSCG00000012627 PGRMC1 (ENSSSCG00000012625) ENSSSCG00000040820 LONRF3 (ENSSSCG00000012631) ENSSSCG00000062552 IL13RA1 (ENSSSCG00000012633) DOCK11 (ENSSSCG00000012634) WDR44 (ENSSSCG00000035488) KLHL13 (ENSSSCG00000012637) CT83 (ENSSSCG00000056534) SLC6A14 (ENSSSCG00000022372) #24 AGTR2 (ENSSSCG00000012600) #22 PLS3 (ENSSSCG00000012597) ENSSSCG00000044651 LRCH2 (ENSSSCG00000012595) IL13RA2 (ENSSSCG00000012594) HTR2C (ENSSSCG00000012593) AMOT (ENSSSCG00000012591) LHFPL1 (ENSSSCG00000012590) RTL4 (ENSSSCG00000012589) TRPC5 (ENSSSCG00000012587) ALG13 (ENSSSCG00000012586) ENSSSCG00000059772 SERTM2 (ENSSSCG00000047465) DCX (ENSSSCG00000012585) CAPN6 (ENSSSCG00000012584) PAK3 (ENSSSCG00000025306) Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000155075.a.b ENSGT00390000002197 ENSGT00940000154400.b ENSGT00940000160686 ENSGT00440000039314.b ENSGT00940000160619 ENSGT00950000185370 ENSGT00440000033329.b.a.b ENSGT01030000234522.C.b.e.a.b.i ENSGT00940000160896 ENSGT00940000155658 ENSGT00940000157557 ENSGT00940000154359.f ENSGT00390000018873 ENSGT00940000159688 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ENSGT00940000159922.b ENSGT00510000047493 Arabian camel MODERN SPECIES 204 SLC25A5 (ENSCDRG00005011360) SLC25A43 (ENSCDRG00005011317) ENSCDRG00005011276 PGRMC1 (ENSCDRG00005011247) ENSCDRG00005011180 ENSCDRG00005011124 LONRF3 (ENSCDRG00005010727) ENSCDRG00005010706 IL13RA1 (ENSCDRG00005010522) DOCK11 (ENSCDRG00005009656) WDR44 (ENSCDRG00005009484) KLHL13 (ENSCDRG00005009107) ENSCDRG00005009043 CT83 (ENSCDRG00005008988) ENSCDRG00005008836 #24 AGTR2 (ENSCDRG00005008814) #22 PLS3 (ENSCDRG00005008407) LRCH2 (ENSCDRG00005008234) IL13RA2 (ENSCDRG00005008060) HTR2C (ENSCDRG00005007965) ENSCDRG00005007907 ENSCDRG00005007889 ENSCDRG00005007838 AMOT (ENSCDRG00005007728) LHFPL1 (ENSCDRG00005007705) RTL4 (ENSCDRG00005007694) TRPC5 (ENSCDRG00005007632) ENSCDRG00005007576 ENSCDRG00005007494 ENSCDRG00005007416 TCEAL1 (ENSCDRG00005007397) Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000154400.b ENSGT00940000160686 ENSGT00440000039314.b ENSGT00940000160619 ENSGT00950000185370 ENSGT00940000155145 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ENSGT00940000159922.b ENSGT00510000047493 ENSGT00950000183232 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00390000002197.z ENSGT00940000154400.b ENSGT00940000160686 ENSGT00440000039314.b ENSGT00940000160619 ENSGT00950000185370 ENSGT00440000033329.b.a.b ENSGT01030000234522.C.b.e.a.b.i ENSGT00940000160896 ENSGT00940000155658 ENSGT00940000157557 ENSGT00940000154359.f ENSGT00390000018873 ENSGT00940000159688 #24 ENSGT00940000154672.i.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT00990000205098 ENSGT00940000160039 ENSGT00940000159971 ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00530000063867.a.b.l ENSGT00940000153112.E.f.a.b ENSGT00960000186788.d ENSGT00940000159055 ENSGT00990000203589.a.b.a.b ENSGT00390000018248 ENSGT01060000248594.e.a ENSGT00940000159922.b ENSGT00510000047493 ENSGT00950000183232 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00390000002197.z ENSGT00940000154400.b ENSGT00940000160686 ENSGT00440000039314.b ENSGT00940000160619 ENSGT00950000185370 ENSGT00440000033329.b.a.b 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ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000159818 Bos ANCESTRAL SPECIES 39 ENSGT00390000002197 ENSGT00940000154400.b ENSGT00940000160686 ENSGT00440000039314.b ENSGT00940000160619 ENSGT00950000185370 ENSGT00390000002253.d ENSGT00440000033329.b.a.b ENSGT01030000234522.C.b.e.a.b.i.b ENSGT00940000160896 ENSGT00940000155658 ENSGT00940000157557 ENSGT00940000154359.f ENSGT00390000018873 ENSGT00940000159688.r #24 ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000159818 Bos_a ANCESTRAL SPECIES 87 ENSGT00940000160686 ENSGT00440000039314.b ENSGT00940000160619 ENSGT00950000185370 ENSGT00390000002253.d ENSGT00440000033329.b.a.b ENSGT01030000234522.C.b.e.a.b.i.b ENSGT00940000160896 ENSGT00940000155658 ENSGT00940000157557 ENSGT00940000154359.f ENSGT00390000018873 ENSGT00940000159688.r #24 ENSGT00810000125439.A.qc.a ENSGT00940000154963 ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000159818 Wild yak MODERN SPECIES 1082 CT83 (ENSBMUG00000025772) SLC6A14 (ENSBMUG00000025769) AGTR2 (ENSBMUG00000025763) #22 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ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000159688 #24 ENSGT00390000018873 ENSGT00940000154359.f ENSGT00940000157557 ENSGT00940000155658 ENSGT00940000160896 ENSGT01030000234522.C.b.e.a.b.i ENSGT00440000033329.b.a.b ENSGT00940000163031.b.a ENSGT00390000003197.i.a.y.b ENSGT00940000160619.n ENSGT00440000039314.b ENSGT00940000160686 ENSGT00940000154400.b ENSGT00390000002197 Ursus ANCESTRAL SPECIES 189 ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000159688 #24 ENSGT00390000018873 ENSGT00940000154359.f ENSGT00940000157557 ENSGT00940000155658 ENSGT00940000160896 ENSGT01030000234522.C.b.e.a.b.i ENSGT00440000033329.b.a.b ENSGT00940000160619.n ENSGT00440000039314.b ENSGT00940000154400.b ENSGT00390000002197 ENSGT00940000155075.a.b ENSGT00940000157256 ENSGT00940000158026 American black bear MODERN SPECIES 665 AGTR2 (ENSUAMG00000023238) #22 ENSUAMG00000023235 #24 CT83 (ENSUAMG00000023234) Polar bear MODERN SPECIES 298 AGTR2 (ENSUMAG00000019507) #22 ENSUMAG00000019513 #24 CT83 (ENSUMAG00000019530) KLHL13 (ENSUMAG00000019537) WDR44 (ENSUMAG00000019545) ENSUMAG00000019551 ENSUMAG00000000062 ENSUMAG00000000730 IL13RA1 (ENSUMAG00000002031) ENSUMAG00000002035 ENSUMAG00000002060 ENSUMAG00000002083 ENSUMAG00000002093 SLC25A5 (ENSUMAG00000002112) STEEP1 (ENSUMAG00000002124) UBE2A (ENSUMAG00000002128) Giant Panda MODERN SPECIES 2288 ENSAMEG00000025064 TRPC5 (ENSAMEG00000011915) TRPC5OS (ENSAMEG00000018968) RTL4 (ENSAMEG00000019635) LHFPL1 (ENSAMEG00000004307) AMOT (ENSAMEG00000004286) ENSAMEG00000004279 ENSAMEG00000027115 HTR2C (ENSAMEG00000028664) ENSAMEG00000001146 ENSAMEG00000026826 ENSAMEG00000003557 ENSAMEG00000003575 ENSAMEG00000023786 PLS3 (ENSAMEG00000002330) AGTR2 (ENSAMEG00000019775) #22 ENSAMEG00000001736 #24 CT83 (ENSAMEG00000027143) KLHL13 (ENSAMEG00000001782) WDR44 (ENSAMEG00000001797) DOCK11 (ENSAMEG00000001871) ENSAMEG00000027135 IL13RA1 (ENSAMEG00000002053) ENSAMEG00000019781 LONRF3 (ENSAMEG00000002100) ENSAMEG00000029352 ENSAMEG00000019790 PGRMC1 (ENSAMEG00000028229) ENSAMEG00000029776 SLC25A43 (ENSAMEG00000030160) ENSAMEG00000025296 Felidae ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00950000183232 ENSGT00510000047493 ENSGT00940000159922.b ENSGT01060000248594.e.a ENSGT00390000018248 ENSGT00940000163925 ENSGT00990000203589.a.b.a.b ENSGT00940000159055 ENSGT00960000186788 ENSGT00440000033468.c.b ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000157540.A.k.b ENSGT00940000159971 ENSGT00940000160039 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000159688 #24 ENSGT00390000018873 ENSGT00940000154359.f ENSGT00940000157557 ENSGT00940000155658 ENSGT00940000160896 ENSGT01030000234522.C.b.e.a.b.i ENSGT00440000033329.b.a.b ENSGT00940000163031.b.a ENSGT00940000160619 ENSGT00440000039314.b ENSGT00940000160686 ENSGT00940000154400.b ENSGT00390000002197 ENSGT00940000155075.a.b Panthera ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00950000183232 ENSGT00510000047493 ENSGT00940000159922.b ENSGT01060000248594.e.a ENSGT00390000018248 ENSGT00940000163925 ENSGT00990000203589.a.b.a.b ENSGT00940000159055 ENSGT00960000186788 ENSGT00440000033468.c.b ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000157540.A.k.b ENSGT00940000159971 ENSGT00940000160039 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000159688 #24 ENSGT00390000018873 ENSGT00940000154359.f ENSGT00940000157557 ENSGT00940000155658 ENSGT00940000160896 ENSGT01030000234522.C.b.e.a.b.i ENSGT00440000033329.b.a.b ENSGT00940000160619 ENSGT00440000039314.b ENSGT00940000160686 ENSGT00940000154400.b ENSGT00390000002197 ENSGT00940000155075.a.b ENSGT00940000157256 Tiger MODERN SPECIES 256 AGTR2 (ENSPTIG00000009635) #22 ENSPTIG00000007756 #24 CT83 (ENSPTIG00000008031) DYRK1B (ENSPTIG00000008058) FBL (ENSPTIG00000008381) ENSPTIG00000008725 PSMC4 (ENSPTIG00000009877) ENSPTIG00000010398 ENSPTIG00000010530 ENSPTIG00000010643 ENSPTIG00000010806 AKT2 (ENSPTIG00000010966) C19orf47 (ENSPTIG00000011865) PLD3 (ENSPTIG00000011966) HIPK4 (ENSPTIG00000012551) ENSPTIG00000012781 Panthera_a ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00510000047493 ENSGT00940000159922.b ENSGT01060000248594.e.a ENSGT00390000018248 ENSGT00940000163925 ENSGT00990000203589.a.b.a.b ENSGT00940000159055 ENSGT00960000186788 ENSGT00440000033468.c.b ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000157540.A.k.b ENSGT00940000159971 ENSGT00940000160039 ENSGT01020000230624.a ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000159688 #24 ENSGT00390000018873 ENSGT00940000154359.f ENSGT00940000157557 ENSGT00940000155658 ENSGT00940000160896 ENSGT01030000234522.C.b.e.a.b.i ENSGT00440000033329.b.a.b ENSGT00940000160619 ENSGT00440000039314.b ENSGT00940000160686 ENSGT00940000154400.b ENSGT00390000002197 ENSGT00940000155075.a.b ENSGT00940000157256 lion MODERN SPECIES 88 ENSPLOG00000014399 TRPC5OS (ENSPLOG00000014375) TRPC5 (ENSPLOG00000022151) RTL4 (ENSPLOG00000022145) LHFPL1 (ENSPLOG00000022139) AMOT (ENSPLOG00000022107) ENSPLOG00000022089 ENSPLOG00000022079 ENSPLOG00000022069 HTR2C (ENSPLOG00000022042) IL13RA2 (ENSPLOG00000022032) 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ENSGT00940000155658 ENSGT00940000160896 ENSGT01030000234522.C.b.e.a.b.i ENSGT00440000033329.b.a.b ENSGT00950000185370 ENSGT00940000160619 ENSGT00440000039314.b ENSGT00940000160686 ENSGT00940000154400.b ENSGT00390000002197 ENSGT00940000155075.a.b Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00390000010397.a ENSGT00730000110943.A.d ENSGT00940000160983 ENSGT00950000182988.a.b.b.b ENSGT00940000156128.b ENSGT00940000154895.a.b ENSGT00390000018248 ENSGT01060000248594.e.a ENSGT00940000163925 ENSGT00990000203589.a.b.a.b ENSGT00940000159055 ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159971 ENSGT00940000160039 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000159688 #24 ENSGT00390000018873 ENSGT00940000154359.f ENSGT00940000157557 ENSGT00940000155658 ENSGT00940000160896 ENSGT01030000234522.C.b.e.a.b.i ENSGT00440000033329.b.a.b ENSGT00950000185370 ENSGT00940000160619 ENSGT00440000039314.b ENSGT00940000160686 ENSGT00940000154400.b ENSGT00390000002197 ENSGT00940000155075.a.b Microbat MODERN SPECIES 939 CAPN6 (ENSMLUG00000005892) ENSMLUG00000005902 ENSMLUG00000028647 ALG13 (ENSMLUG00000006264) TRPC5 (ENSMLUG00000003191) RTL4 (ENSMLUG00000016922) LHFPL1 (ENSMLUG00000009118) AMOT (ENSMLUG00000003647) ENSMLUG00000028246 ENSMLUG00000030503 HTR2C (ENSMLUG00000000264) IL13RA2 (ENSMLUG00000010477) ENSMLUG00000025585 LRCH2 (ENSMLUG00000001866) PLS3 (ENSMLUG00000005398) AGTR2 (ENSMLUG00000004283) #22 ENSMLUG00000005842 #24 ENSMLUG00000005847 ENSMLUG00000028410 ENSMLUG00000009996 KLHL13 (ENSMLUG00000027393) WDR44 (ENSMLUG00000013400) DOCK11 (ENSMLUG00000017040) IL13RA1 (ENSMLUG00000017055) ENSMLUG00000014630 LONRF3 (ENSMLUG00000009240) ENSMLUG00000028852 ENSMLUG00000001892 PGRMC1 (ENSMLUG00000000278) ENSMLUG00000029168 SLC25A43 (ENSMLUG00000015726) Megabat MODERN SPECIES 4392 AGTR2 (ENSPVAG00000011251) #22 Equus ANCESTRAL SPECIES 39 ENSGT00940000156128.b ENSGT00940000161570 ENSGT00950000183232 ENSGT00510000047493 ENSGT00940000159922.b ENSGT00390000018248 ENSGT01060000248594.e.a ENSGT00940000163925 ENSGT00990000203589.a.b.a.b ENSGT00940000159055 ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159971 ENSGT00940000160039 ENSGT00940000165469 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000159688 #24 ENSGT00390000018873 ENSGT00940000154359.f ENSGT00940000157557 ENSGT00940000155658 ENSGT00940000160896 ENSGT01030000234522.C.b.e.a.b.i ENSGT00440000033329.b.a.b ENSGT00950000185370 ENSGT00940000160619 ENSGT00440000039314.b ENSGT00940000154400.b ENSGT00390000002197 ENSGT00940000155075.a.b ENSGT00940000157256 Horse MODERN SPECIES 480 ENSECAG00000053523 ENSECAG00000039392 ENSECAG00000056183 ALG13 (ENSECAG00000022134) TRPC5 (ENSECAG00000023439) TRPC5OS (ENSECAG00000056999) RTL4 (ENSECAG00000003482) LHFPL1 (ENSECAG00000015524) AMOT (ENSECAG00000015878) ENSECAG00000051999 HTR2C (ENSECAG00000021540) IL13RA2 (ENSECAG00000024016) LRCH2 (ENSECAG00000000625) ENSECAG00000031884 PLS3 (ENSECAG00000013135) AGTR2 (ENSECAG00000018905) #22 SLC6A14 (ENSECAG00000021061) #24 CT83 (ENSECAG00000007887) ENSECAG00000057751 KLHL13 (ENSECAG00000008237) WDR44 (ENSECAG00000012077) DOCK11 (ENSECAG00000020337) ENSECAG00000057731 IL13RA1 (ENSECAG00000019115) ZCCHC12 (ENSECAG00000003626) ENSECAG00000047780 LONRF3 (ENSECAG00000024139) ENSECAG00000055470 KIAA1210 (ENSECAG00000009081) PGRMC1 (ENSECAG00000039508) AKAP17B (ENSECAG00000003863) Donkey MODERN SPECIES 36 PAK3 (ENSEASG00005008209) CAPN6 (ENSEASG00005008193) SERTM2 (ENSEASG00005030037) ENSEASG00005038348 ENSEASG00005038576 TRPC5OS (ENSEASG00005032981) TRPC5 (ENSEASG00005019621) RTL4 (ENSEASG00005019628) LHFPL1 (ENSEASG00005019629) AMOT (ENSEASG00005019632) HTR2C (ENSEASG00005020350) IL13RA2 (ENSEASG00005020346) LRCH2 (ENSEASG00005017932) ENSEASG00005038083 PLS3 (ENSEASG00005012825) AGTR2 (ENSEASG00005029442) #22 ENSEASG00005019583 #24 CT83 (ENSEASG00005032681) KLHL13 (ENSEASG00005016421) WDR44 (ENSEASG00005016476) DOCK11 (ENSEASG00005010428) IL13RA1 (ENSEASG00005029398) ENSEASG00005026895 LONRF3 (ENSEASG00005006109) ENSEASG00005007173 PGRMC1 (ENSEASG00005029757) ENSEASG00005037950 SLC25A5 (ENSEASG00005031452) STEEP1 (ENSEASG00005012866) UBE2A (ENSEASG00005012902) NKRF (ENSEASG00005012904) Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 69 ENSGT00940000160983 ENSGT00950000182988.a.b.b.b ENSGT00940000156128.b ENSGT00940000154895.a.b ENSGT00940000161570 ENSGT00510000047493 ENSGT00940000159922.b ENSGT01060000248594.e.a ENSGT00940000163925 ENSGT00990000203589.a.b.a.b ENSGT00940000159055 ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159971 ENSGT00940000160039 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000159688 #24 ENSGT00390000018873 ENSGT00940000154359.f ENSGT00940000157557 ENSGT00940000155658 ENSGT00940000160896 ENSGT01030000234522.C.b.e.a.b ENSGT00440000033329.b.a.b ENSGT00390000002253 ENSGT00940000163031.b.a ENSGT00940000160619 ENSGT00440000039314.b ENSGT00940000160686 ENSGT00940000154400 ENSGT00390000002197 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 64 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ENSGT00940000159971 ENSGT00940000160039 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000159688 #24 ENSGT00390000018873 ENSGT00940000154359.f ENSGT00940000157557 ENSGT00940000155658 ENSGT00940000160896 ENSGT00440000033329.b.a.b ENSGT00940000160619 ENSGT00440000039314.b ENSGT00940000160686 ENSGT00940000154400 ENSGT00390000002197 ENSGT00940000155075.a.b ENSGT00940000157256 ENSGT00940000158026 Elephant MODERN SPECIES 320 RTL9 (ENSLAFG00000027146) CHRDL1 (ENSLAFG00000018025) PAK3 (ENSLAFG00000005567) CAPN6 (ENSLAFG00000005575) DCX (ENSLAFG00000005582) ENSLAFG00000030843 ALG13 (ENSLAFG00000017925) TRPC5 (ENSLAFG00000017932) RTL4 (ENSLAFG00000025790) LHFPL1 (ENSLAFG00000002339) AMOT (ENSLAFG00000000349) HTR2C (ENSLAFG00000003316) IL13RA2 (ENSLAFG00000013156) LRCH2 (ENSLAFG00000008725) PLS3 (ENSLAFG00000017073) AGTR2 (ENSLAFG00000004752) #22 ENSLAFG00000013875 #24 CT83 (ENSLAFG00000021969) ENSLAFG00000027141 KLHL13 (ENSLAFG00000008122) WDR44 (ENSLAFG00000008093) DOCK11 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ENSGT00940000158469 ENSGT00940000154661.a.a Opossum MODERN SPECIES 627 ENSMODG00000005275 PAK3 (ENSMODG00000005255) CAPN6 (ENSMODG00000005238) ENSMODG00000037776 ENSMODG00000005175 ENSMODG00000005159 ENSMODG00000005054 LHFPL1 (ENSMODG00000005109) AMOT (ENSMODG00000005098) ENSMODG00000025173 ENSMODG00000005047 HTR2C (ENSMODG00000005042) ENSMODG00000005037 LRCH2 (ENSMODG00000005026) PLS3 (ENSMODG00000004940) AGTR2 (ENSMODG00000004897) #22 ENSMODG00000042869 ENSMODG00000004365 #24 ENSMODG00000040103 ENSMODG00000009077 ENSMODG00000009064 ENSMODG00000036377 PCDH19 (ENSMODG00000009008) TNMD (ENSMODG00000008987) ENSMODG00000017489 ENSMODG00000045389 ENSMODG00000017486 ENSMODG00000025187 ENSMODG00000049110 ENSMODG00000017482 ENSMODG00000017480 Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00940000154411.`b.i.e.b.b ENSGT00950000182988.a.b.b.b ENSGT00940000156128.b ENSGT00940000161570 ENSGT00950000183232 ENSGT00510000047493 ENSGT00940000159922.b ENSGT01060000248594.e.a ENSGT00990000203589.a.b.a.b ENSGT00940000159055 ENSGT00390000006939.c ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159971 ENSGT00940000160039 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000159688 #24 ENSGT00940000154359.j ENSGT00940000157557 ENSGT00940000155658 ENSGT00940000160896 ENSGT00940000161713 ENSGT01060000248842 ENSGT00940000160481 ENSGT00390000006915.c.d ENSGT00940000158789 ENSGT00390000008751.b ENSGT00940000161656 ENSGT00940000158469 ENSGT00940000154661.a.a ENSGT00940000164465 Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES 76 ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159971 ENSGT00940000160039 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000159688 #24 ENSGT00940000154359.j ENSGT00940000157557 ENSGT00940000155658 ENSGT00940000160896 ENSGT00940000161713 ENSGT01060000248842 ENSGT00940000160481 ENSGT00390000006915.c.d ENSGT00940000158789 ENSGT00390000008751.b ENSGT00940000161656 ENSGT00940000158469 ENSGT00940000154661.a.a ENSGT00940000164465 Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES 76 ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159971 ENSGT00940000160039 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000159688 #24 ENSGT00940000154359.j ENSGT00940000157557 ENSGT00940000155658 ENSGT00940000160896 ENSGT00940000161713 ENSGT01060000248842 ENSGT00940000160481 ENSGT00390000006915.c.d ENSGT00940000158789 ENSGT00390000008751.b ENSGT00940000161656 ENSGT00940000158469 ENSGT00940000154661.a.a ENSGT00940000164465.g Common wonbat MODERN SPECIES 1214 ENSVURG00010018535 PLS3 (ENSVURG00010018540) AGTR2 (ENSVURG00010018552) #22 ENSVURG00010018558 #24 koala MODERN SPECIES 145 HTR2C (ENSPCIG00000019341) IL13RA2 (ENSPCIG00000036107) LRCH2 (ENSPCIG00000019352) ENSPCIG00000019366 PLS3 (ENSPCIG00000003896) AGTR2 (ENSPCIG00000013834) #22 ENSPCIG00000013702 #24 ENSPCIG00000013675 WDR44 (ENSPCIG00000009561) DOCK11 (ENSPCIG00000020425) IL13RA1 (ENSPCIG00000020422) SLC25A53 (ENSPCIG00000032202) ENSPCIG00000020416 RAB9B (ENSPCIG00000020415) PLP1 (ENSPCIG00000033324) ENSPCIG00000020208 GLA (ENSPCIG00000020196) ENSPCIG00000020194 BTK (ENSPCIG00000020184) ENSPCIG00000037051 ENSPCIG00000020180 Wallaby MODERN SPECIES 12219 AGTR2 (ENSMEUG00000009019) #22 Tasmanian devil MODERN SPECIES 21 ENSSHAG00000025238 ENSSHAG00000006296 ENSSHAG00000004617 CAPN6 (ENSSHAG00000003826) DCX (ENSSHAG00000001659) ENSSHAG00000028383 ENSSHAG00000015788 TRPC5 (ENSSHAG00000015578) LHFPL1 (ENSSHAG00000030416) ENSSHAG00000026695 ENSSHAG00000011754 HTR2C (ENSSHAG00000032229) ENSSHAG00000006634 LRCH2 (ENSSHAG00000029119) PLS3 (ENSSHAG00000008976) AGTR2 (ENSSHAG00000008422) #22 ENSSHAG00000026017 #24 ENSSHAG00000031553 ENSSHAG00000008559 WDR44 (ENSSHAG00000010113) DOCK11 (ENSSHAG00000011126) ENSSHAG00000024227 ENSSHAG00000029461 ENSSHAG00000026352 ENSSHAG00000021421 ENSSHAG00000012886 ENSSHAG00000013184 ENSSHAG00000013439 ENSSHAG00000028349 BTK (ENSSHAG00000013506) TIMM8A (ENSSHAG00000013672) Sauria ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000159334 ENSGT00940000153609.a ENSGT00940000154651 ENSGT00390000000155.a.b ENSGT00390000003197 ENSGT00950000183090.C ENSGT00390000006492 ENSGT00940000159565 ENSGT00940000175781 ENSGT00940000159625 ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159971 ENSGT00940000160039 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT00940000167413 ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000159688 #24 ENSGT00640000091497.a.p ENSGT00940000154359 ENSGT00940000157557 ENSGT00940000155658 ENSGT00940000160896 ENSGT00940000157904 ENSGT00940000158972 ENSGT00940000157245 ENSGT00950000182897.B.a.b.a ENSGT00950000183071.a.b ENSGT01050000244897.a.b.a ENSGT01050000244955.a.b ENSGT00390000013938 ENSGT00950000182865.b.a.b.b.b.b Archelosauria ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000159334 ENSGT00940000153609.a ENSGT00940000154651 ENSGT00390000000155.a.b ENSGT00390000003197 ENSGT00390000006492 ENSGT00940000159565 ENSGT00940000175781 ENSGT00940000159625 ENSGT00960000188821 ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159971 ENSGT00940000160039 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT00940000167413 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ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000159688 #24 ENSGT00940000154359 ENSGT00940000157557 ENSGT00940000155658.x ENSGT00940000155658.y ENSGT00940000160896 ENSGT00940000157904 ENSGT00940000158972 ENSGT00940000157245 ENSGT00950000182897.B.a.b.a ENSGT00950000183071.a.b ENSGT01050000244897.a.b.a ENSGT01050000244955.a.b ENSGT00950000182865.b.a.b.b.b.b ENSGT00940000155028 Acanthophiinae ANCESTRAL SPECIES 45 ENSGT01030000235750 ENSGT00940000159580.g ENSGT00440000037505.b ENSGT00940000164309 ENSGT00510000049291 ENSGT00950000183168.C ENSGT00940000159565 ENSGT00390000003197 ENSGT00940000154651 ENSGT00940000153609.a ENSGT00940000159334 ENSGT00940000159625 ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000160039 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000159688 #24 ENSGT00940000154359 ENSGT00940000157557 ENSGT00940000155658.x ENSGT00940000155658.y ENSGT00940000160896 ENSGT00940000157904 ENSGT00940000158972 ENSGT00940000157245 ENSGT00950000182897.B.a.b.a ENSGT00950000183071.a.b ENSGT01050000244897.a.b.a ENSGT01050000244955.a.b ENSGT00950000182865.b.a.b.b.b.b ENSGT00940000155028 Mainland tiger snake MODERN SPECIES 222 NLGN3 (ENSNSUG00000013132) MED12 (ENSNSUG00000012225) ENSNSUG00000012224 CXorf65 (ENSNSUG00000012223) ENSNSUG00000012222 DLG3 (ENSNSUG00000012221) ENSNSUG00000012220 SLC7A3 (ENSNSUG00000012219) SNX12 (ENSNSUG00000012218) FOXO4 (ENSNSUG00000012217) GDPD2 (ENSNSUG00000012215) HTR2C (ENSNSUG00000012214) ENSNSUG00000012213 ENSNSUG00000012212 PLS3 (ENSNSUG00000012211) AGTR2 (ENSNSUG00000012210) #22 ENSNSUG00000012209 #24 ENSNSUG00000012208 Eastern brown snake MODERN SPECIES 86 NLGN3 (ENSPTXG00000008720) MED12 (ENSPTXG00000008739) ENSPTXG00000008744 CXorf65 (ENSPTXG00000008748) ENSPTXG00000008749 DLG3 (ENSPTXG00000008755) ENSPTXG00000010066 SLC7A3 (ENSPTXG00000010067) SNX12 (ENSPTXG00000010069) FOXO4 (ENSPTXG00000010070) GDPD2 (ENSPTXG00000010071) HTR2C (ENSPTXG00000010073) LRCH2 (ENSPTXG00000010081) ENSPTXG00000010084 PLS3 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ENSGT00940000157904 ENSGT00940000158972 ENSGT00940000157245 ENSGT00950000182897.B.a.b.a.g ENSGT00950000183071.a.b ENSGT01050000244897.a.b.a ENSGT01050000244955.a.b Common wall lizard MODERN SPECIES 419 ENSPMRG00000023472 ENSPMRG00000023478 ENSPMRG00000023487 SLC7A3 (ENSPMRG00000023491) SNX12 (ENSPMRG00000023497) FOXO4 (ENSPMRG00000023501) GDPD2 (ENSPMRG00000023504) ENSPMRG00000023508 HTR2C (ENSPMRG00000023510) LRCH2 (ENSPMRG00000023513) ENSPMRG00000023528 ENSPMRG00000023530 PLS3 (ENSPMRG00000023534) ENSPMRG00000023538 ENSPMRG00000023540 AGTR2 (ENSPMRG00000023542) #22 ENSPMRG00000023543 #24 ENSPMRG00000023546 ENSPMRG00000023549 ENSPMRG00000023550 ENSPMRG00000023552 WDR44 (ENSPMRG00000023553) DOCK11 (ENSPMRG00000023561) ENSPMRG00000023570 ENSPMRG00000023571 ENSPMRG00000023573 ENSPMRG00000023574 STK26 (ENSPMRG00000023575) FRMD7 (ENSPMRG00000023577) RAP2C (ENSPMRG00000023579) ENSPMRG00000023580 Argentine black and white tegu MODERN SPECIES 120 NLGN3 (ENSSMRG00000003840) MED12 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ENSGT01050000244897.a.b.a ENSGT01050000244955.a.b Frog MODERN SPECIES 8 ENSXETG00000046605 cetn1 (ENSXETG00000018443) lpar4 (ENSXETG00000018445) p2ry10 (ENSXETG00000024793) cysltr1 (ENSXETG00000010129) fndc3a (ENSXETG00000010132) taf9b (ENSXETG00000010138) ENSXETG00000045452 htr2c (ENSXETG00000024787) il13ra2 (ENSXETG00000024786) ENSXETG00000033596 lrch2 (ENSXETG00000010141) pls3 (ENSXETG00000003677) ENSXETG00000044340 ENSXETG00000035367 agtr2 (ENSXETG00000024696) #22 ENSXETG00000040095 slc6a14.1 (ENSXETG00000033695) #24 slc6a14.2 (ENSXETG00000003675) #24 ENSXETG00000039084 klhl13 (ENSXETG00000003672) wdr44 (ENSXETG00000003671) dock11 (ENSXETG00000003669) il13ra1 (ENSXETG00000005423) stk26 (ENSXETG00000005418) helz (ENSXETG00000005416) rap2c (ENSXETG00000005415) mbnl3 (ENSXETG00000005409) hs6st2 (ENSXETG00000005408) gpc4 (ENSXETG00000005400) gpc3 (ENSXETG00000032333) Anura ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000157032 ENSGT00940000164733 ENSGT00940000158925 ENSGT01040000240444.A.a.a.a.a ENSGT00950000183202.b ENSGT00950000183115.b.a ENSGT00390000012063 ENSGT00390000003338 ENSGT00390000010170.a.b ENSGT01050000244937.a.a ENSGT00390000011864 ENSGT00940000159528 ENSGT00940000160585 ENSGT00940000173214 ENSGT00950000183097.a.a.b ENSGT01050000244888.b.a.c.a.t #22 ENSGT00940000159160 ENSGT00730000111163 ENSGT00940000161772 ENSGT00940000153655.A.a ENSGT00390000015682 ENSGT00940000158961 ENSGT00390000006051 ENSGT00940000159552 ENSGT00390000016051 ENSGT00940000163575 ENSGT00390000003758 ENSGT00940000166021 ENSGT00940000162467.b ENSGT00390000000693 ENSGT00390000005130 Leishan spiny toad MODERN SPECIES 5 ENSLLEG00000027179 RB1 (ENSLLEG00000026737) ITM2B (ENSLLEG00000026637) MED4 (ENSLLEG00000026463) NUDT15 (ENSLLEG00000026420) SUCLA2 (ENSLLEG00000025699) ENSLLEG00000025598 HTR2A (ENSLLEG00000025580) ENSLLEG00000025566 ENSLLEG00000025547 ESD (ENSLLEG00000025488) LRCH1 (ENSLLEG00000024780) RUBCNL (ENSLLEG00000024599) ENSLLEG00000024408 LCP1 (ENSLLEG00000023900) ENSLLEG00000023843 #22 ENSLLEG00000023808 CPB2 (ENSLLEG00000023678) ZC3H13 (ENSLLEG00000023396) SIAH3 (ENSLLEG00000023320) ENSLLEG00000023261 ENSLLEG00000023114 ENSLLEG00000023095 COG3 (ENSLLEG00000022634) SLC25A30 (ENSLLEG00000022497) TPT1 (ENSLLEG00000022362) KCTD4 (ENSLLEG00000022326) GTF2F2 (ENSLLEG00000021607) ENSLLEG00000021528 GPALPP1 (ENSLLEG00000021140) NUFIP1 (ENSLLEG00000021039) Frog MODERN SPECIES 2 rcbtb2 (ENSXETG00000000559) lpar6 (ENSXETG00000000557) ENSXETG00000049131 rb1 (ENSXETG00000031493) ENSXETG00000048223 itm2b (ENSXETG00000024684) med4 (ENSXETG00000000549) nudt15 (ENSXETG00000039868) sucla2 (ENSXETG00000000548) htr2a (ENSXETG00000032623) esd (ENSXETG00000015425) lrch1 (ENSXETG00000011477) rubcnl (ENSXETG00000038667) lrrc63 (ENSXETG00000038545) lcp1 (ENSXETG00000014954) ENSXETG00000038557 #22 cpb2 (ENSXETG00000026124) zc3h13 (ENSXETG00000014637) ENSXETG00000043129 ttll3 (ENSXETG00000026497) siah3 (ENSXETG00000036871) cog3 (ENSXETG00000014651) slc25a30 (ENSXETG00000047934) tpt1 (ENSXETG00000014661) kctd4 (ENSXETG00000035680) gtf2f2 (ENSXETG00000036901) ENSXETG00000036976 gpalpp1 (ENSXETG00000042639) nufip1 (ENSXETG00000014778) tsc22d1 (ENSXETG00000033932) serp2 (ENSXETG00000038969) Coelacanth MODERN SPECIES 2004 IL13RA2 (ENSLACG00000000260) LRCH2 (ENSLACG00000002033) ENSLACG00000005906 PLS3 (ENSLACG00000007594) zgc:163098 (ENSLACG00000008434) AGTR2 (ENSLACG00000009418) #22 Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES 117 ENSGT00950000182988.a.b.b.b ENSGT00940000156128.b ENSGT00940000161570 ENSGT00940000155097 ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159971 ENSGT01040000240539.a ENSGT00940000160039 ENSGT00940000160658 ENSGT00390000012807 ENSGT00940000158330 ENSGT00730000111263 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT00390000010687.a.b ENSGT00940000159688 #24 ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000159818 ENSGT00940000175287 ENSGT00940000158335 Neopterygii ANCESTRAL SPECIES 130 ENSGT00390000010397.a ENSGT00940000160983 ENSGT00950000182988.a.b.b.b ENSGT00940000156128.b ENSGT00940000161570 ENSGT01030000234518.C.a.b.b ENSGT00940000157557 ENSGT00940000159971 ENSGT01040000240539.a ENSGT00940000160039 ENSGT00390000012807 ENSGT00940000158330 ENSGT00730000111263 ENSGT00950000183097.a.a.a.e.a ENSGT00390000010687.a.b ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000159688 #24 Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 71 ENSGT00940000161206 ENSGT00950000182832.D.b ENSGT00940000162488 ENSGT01050000244948.d ENSGT00950000183107.a.b.b ENSGT00950000182802.D ENSGT00940000156017 ENSGT00390000011425.A ENSGT00940000164351 ENSGT00390000017581.a ENSGT00940000161429 ENSGT00940000159242 ENSGT00390000008591 ENSGT00940000164237 ENSGT00530000063666.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000155920 ENSGT01030000234566.e.b.b.b ENSGT00940000157297 ENSGT00940000159803 ENSGT00940000154103.b ENSGT00530000063529.B ENSGT00940000153902.b.a ENSGT00940000162717 ENSGT00940000153902.b.b ENSGT00390000018389 ENSGT00940000159316 ENSGT00390000014785 ENSGT01090000260082.d.a.a.d ENSGT00940000166318.b ENSGT00940000155107.b.a Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 86 ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00950000182832.D.b ENSGT00940000162488.b.a ENSGT00950000183107.a.b.b ENSGT00950000182802.D ENSGT00940000156017 ENSGT00390000011425.A ENSGT00940000164351 ENSGT00390000017581.a ENSGT00940000161429 ENSGT00940000159242 ENSGT00390000008591 ENSGT00940000164237 ENSGT00530000063666.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000155920 ENSGT01030000234566.e.b.b.b ENSGT00940000157297 ENSGT00940000159803 ENSGT00940000154103.b ENSGT00530000063529.B ENSGT00940000153902.b.a ENSGT00940000162717 ENSGT00940000159316 ENSGT00390000014785 ENSGT01090000260082.d.a.a.d ENSGT00940000166318.b ENSGT00940000154633.jd ENSGT00940000154336 ENSGT00940000153259.a.a.a Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 74 ENSGT01100000263536.A.a.b ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00940000166733 ENSGT00940000162488.b.b ENSGT00950000182802.D ENSGT00940000156017.eb ENSGT00390000011425.A 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ENSGT00940000153902.b.b ENSGT00390000018389 ENSGT01090000260082.d.a.a.c ENSGT00940000155516.v ENSGT00940000160128 ENSGT00950000182972.a.a.a.a.a.e ENSGT00940000166874 ENSGT00940000153404.a ENSGT00940000156381 ENSGT00940000157427.j ENSGT00940000163328.c ENSGT00940000165340 Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT01100000263536.A.a.a ENSGT01100000263536.A.a.b ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00950000182832.D.b ENSGT00940000162488.b.b ENSGT00950000182802.D ENSGT00940000156017.eb ENSGT00940000164351 ENSGT00390000017581.a ENSGT00940000161429 ENSGT00940000159242 ENSGT00390000008591 ENSGT00940000164237 ENSGT00530000063666.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000155920 ENSGT01030000234566.e.b.b.b ENSGT00940000154103.b ENSGT00940000153902.b.b ENSGT00390000018389 ENSGT01090000260082.d.a.a.c ENSGT00940000155516.v ENSGT00940000160128 ENSGT00950000182972.a.a.a.a.a.e ENSGT00940000166874 ENSGT00940000153404.a ENSGT00940000156381 ENSGT00940000157427.j ENSGT00940000163328.c 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APOOL (ENSHCOG00000003483) agtr2 (ENSHCOG00000003490) #22 ENSHCOG00000003496 TENM1 (ENSHCOG00000003560) arhgef9b (ENSHCOG00000003590) asb12b (ENSHCOG00000003608) zc4h2 (ENSHCOG00000003621) msnb (ENSHCOG00000003657) ENSHCOG00000003679 efnb1 (ENSHCOG00000003701) STAG2 (ENSHCOG00000003826) xiap (ENSHCOG00000003864) psmd10 (ENSHCOG00000003872) nxt2 (ENSHCOG00000003893) acsl4a (ENSHCOG00000003957) ENSHCOG00000003965 snx25 (ENSHCOG00000004003) Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT01100000263536.A.a.b ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00940000166733 ENSGT00940000162488.b.b ENSGT00950000182802.D ENSGT00940000156017.eb ENSGT00770000121762 ENSGT00940000164351 ENSGT00390000017581.a ENSGT00940000161429 ENSGT00940000159242 ENSGT00390000008591 ENSGT00940000164237.f ENSGT00530000063666.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000155920 ENSGT01030000234566.e.b.b.b ENSGT00940000154103.b ENSGT00940000153902.b.b ENSGT00390000018389 ENSGT01090000260082.d.a.a.c ENSGT00940000155516.v ENSGT00940000160128 ENSGT00950000182972.a.a.a.a.a.e ENSGT01030000236759 ENSGT00940000166874 ENSGT00940000153404.a ENSGT00940000156381 ENSGT00940000157427.j ENSGT00940000163328.c Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT01100000263536.A.a.a ENSGT01100000263536.A.a.b ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00940000162488.b.b ENSGT00950000182802.D ENSGT00940000156017.eb ENSGT00770000121762 ENSGT00940000164351 ENSGT00390000017581.a ENSGT00940000161429 ENSGT00940000159242 ENSGT00390000008591 ENSGT00940000164237.f ENSGT00530000063666.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000155920 ENSGT01030000234566.e.b.b.b ENSGT00940000154103.b ENSGT00940000153902.b.b ENSGT00390000018389 ENSGT01090000260082.d.a.a.c ENSGT00940000155516.v ENSGT00940000160128 ENSGT00950000182972.a.a.a.a.a.e ENSGT01030000236759 ENSGT00940000166874 ENSGT00940000153404.a ENSGT00940000156381 ENSGT00940000157427.j ENSGT00940000163328.c Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT01100000263536.A.a.b 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(ENSFHEG00000014068) Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 46 ENSGT01100000263536.A.a.a ENSGT01100000263536.A.a.b ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00940000162488.b.b ENSGT00950000182802.D ENSGT00940000156017.eb ENSGT00940000164351 ENSGT00390000017581.a ENSGT00940000161429 ENSGT00940000159242 ENSGT00390000008591 ENSGT00940000164237.f ENSGT00940000164237.e.a ENSGT00530000063666.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000155920 ENSGT01030000234566.e.b.b.b.f ENSGT00940000160622.`b.a ENSGT00940000154103.b ENSGT00940000153902.b.b ENSGT00390000018389 ENSGT01090000260082.d.a.a.c ENSGT00940000155516.v ENSGT00940000160128 ENSGT00950000182972.a.a.a.a.a.e.d ENSGT00940000166874 ENSGT00940000153404.a ENSGT00940000156381 ENSGT00940000157427.j ENSGT00940000163328.c Mangrove rivulus MODERN SPECIES 49 p2ry10 (ENSKMAG00000015351) ENSKMAG00000015374 ITM2A (ENSKMAG00000015421) TBX22 (ENSKMAG00000015530) ENSKMAG00000015560 ENSKMAG00000015597 hmgn6 (ENSKMAG00000015625) sh3bgrl 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#22 ENSGT00940000155920 ENSGT01030000234566.e.b.b.b ENSGT00940000154103.b ENSGT00940000153902.b.b ENSGT00390000018389 ENSGT01090000260082.d.a.a.c ENSGT00940000155516.v ENSGT00940000160128 ENSGT00950000182972.a.a.a.a.a.e ENSGT00940000166874.g ENSGT00940000166874.h ENSGT00940000153404.a ENSGT00940000156381 ENSGT00940000157427.j ENSGT00940000163328.c Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000159242 ENSGT00390000008591 ENSGT00940000164237.f ENSGT00530000063666.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000155920 ENSGT01030000234566.e.b.b.b ENSGT00940000154103.b ENSGT00940000153902.b.b ENSGT00390000018389 ENSGT01090000260082.d.a.a.c ENSGT00940000155516.v ENSGT00940000160128 ENSGT00950000182972.a.a.a.a.a.e ENSGT00940000166874.g ENSGT00940000166874.h ENSGT00940000153404.a ENSGT00940000156381 ENSGT00940000157427.j ENSGT00940000163328.c Chinese medaka MODERN SPECIES 26 ENSOSIG00000020786 ENSOSIG00000020783 ENSOSIG00000020782 rps6kal (ENSOSIG00000020571) hdx (ENSOSIG00000020557) 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ENSORLG00000022346 ENSORLG00000008254 ar-alpha (ENSORLG00000008220) efnb1 (ENSORLG00000023841) STAG2 (ENSORLG00000008178) xiap (ENSORLG00000008085) ENSORLG00000028301 psmd10 (ENSORLG00000008068) nxt2 (ENSORLG00000022600) acsl4a (ENSORLG00000008040) Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a ENSGT01100000263536.A.a.b ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00940000162488.b.b ENSGT00980000199388 ENSGT00940000156017.eb ENSGT00940000164351 ENSGT00390000017581.a ENSGT00940000161429 ENSGT00940000159242 ENSGT00390000008591 ENSGT00940000164237.f ENSGT00530000063666.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000155920 ENSGT01030000234566.e.b.b.b ENSGT00940000154103.b ENSGT00940000153902.b.b ENSGT00390000018389 ENSGT01090000260082.d.a.a.c ENSGT00940000155516.v ENSGT00940000160128 ENSGT00950000182972.a.a.a.a.a.e ENSGT00940000166874.g ENSGT00940000166874.h ENSGT00940000153404.a ENSGT00940000156381 ENSGT00940000157427.j ENSGT00940000163328.c Indian medaka MODERN SPECIES 16 LPAR4 (ENSOMEG00000014838) p2ry10 (ENSOMEG00000014818) ENSOMEG00000014809 ITM2A (ENSOMEG00000014792) TBX22 (ENSOMEG00000014761) ENSOMEG00000000367 hmgn7 (ENSOMEG00000014678) sh3bgrl (ENSOMEG00000014658) ENSOMEG00000000905 ENSOMEG00000000363 POU3F4 (ENSOMEG00000014622) rps6kal (ENSOMEG00000014596) hdx (ENSOMEG00000014541) ENSOMEG00000014456 ENSOMEG00000014333 agtr2 (ENSOMEG00000014320) #22 ENSOMEG00000014305 TENM1 (ENSOMEG00000014257) arhgef9b (ENSOMEG00000014060) asb12b (ENSOMEG00000013838) zc4h2 (ENSOMEG00000013819) msnb (ENSOMEG00000000349) ENSOMEG00000013757 efnb1 (ENSOMEG00000013731) STAG2 (ENSOMEG00000013684) xiap (ENSOMEG00000013584) xiap (ENSOMEG00000013484) psmd10 (ENSOMEG00000013461) nxt2 (ENSOMEG00000013420) acsl4a (ENSOMEG00000013384) eif4ebp3l (ENSOMEG00000013335) Javanese ricefish MODERN SPECIES 1 p2ry10 (ENSOJAG00000010405) ENSOJAG00000010409 ITM2A (ENSOJAG00000010416) TBX22 (ENSOJAG00000010463) ENSOJAG00000010481 sh3bgrl (ENSOJAG00000010496) ENSOJAG00000010546 ENSOJAG00000010580 ENSOJAG00000010587 ENSOJAG00000010605 POU3F4 (ENSOJAG00000010612) rps6kal (ENSOJAG00000010862) hdx (ENSOJAG00000014366) ENSOJAG00000014420 ENSOJAG00000014536 agtr2 (ENSOJAG00000014588) #22 ENSOJAG00000014604 TENM1 (ENSOJAG00000014933) arhgef9b (ENSOJAG00000019194) asb12b (ENSOJAG00000019335) zc4h2 (ENSOJAG00000019346) ENSOJAG00000019357 msnb (ENSOJAG00000019560) ENSOJAG00000020721 efnb1 (ENSOJAG00000020749) STAG2 (ENSOJAG00000020843) xiap (ENSOJAG00000021349) ENSOJAG00000021358 psmd10 (ENSOJAG00000021365) nxt2 (ENSOJAG00000021377) acsl4a (ENSOJAG00000021411) Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT01030000235435 ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a ENSGT01100000263536.A.a.b ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000162488.b.b ENSGT00950000182802.D ENSGT00940000156017.eb ENSGT00940000164351 ENSGT00390000017581.a ENSGT00940000161429 ENSGT00940000159242 ENSGT00390000008591 ENSGT00940000164237.f ENSGT00530000063666.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000155920 ENSGT01030000234566.e.b.b.b ENSGT00940000154103.b ENSGT00940000153902.b.b ENSGT00390000018389 ENSGT01090000260082.d.a.a.c ENSGT00940000155516.v ENSGT00940000160128 ENSGT00950000182972.a.a.a.a.a.e ENSGT01030000236759 ENSGT00940000166874 ENSGT00940000153404.a ENSGT00940000156381 ENSGT00940000157427.j ENSGT00940000163328.c Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a ENSGT01100000263536.A.a.b ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00940000162488.b.b ENSGT00950000182802.D ENSGT00940000156017.eb ENSGT00940000164351 ENSGT00390000017581.a ENSGT00940000161429 ENSGT00940000159242 ENSGT00390000008591 ENSGT00940000164237.f ENSGT00530000063666.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000155920 ENSGT01030000234566.e.b.b.b ENSGT00940000154103.b ENSGT00940000153902.b.b ENSGT00390000018389 ENSGT01090000260082.d.a.a.c ENSGT00940000155516.v ENSGT00940000160128 ENSGT00950000182972.a.a.a.a.a.e 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ENSGT01100000263536.A.a.b ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000162488.b.b ENSGT00950000182802.D ENSGT00940000156017.eb ENSGT00940000164351 ENSGT00390000017581.a ENSGT00940000161429 ENSGT00940000159242 ENSGT00390000008591 ENSGT00940000164237.f ENSGT00530000063666.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000155920 ENSGT01030000234566.e.b.b.b ENSGT00940000154103.b ENSGT00940000153902.b.b ENSGT00390000018389 ENSGT01090000260082.d.a.a.c ENSGT00940000155516.v ENSGT00940000160128 ENSGT00950000182972.a.a.a.a.a.e ENSGT00940000166874 ENSGT00940000153404.a ENSGT00940000156381 ENSGT00940000157427.j ENSGT00940000163328.c ENSGT00940000165340 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a ENSGT01100000263536.A.a.b ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00940000162488.b.b ENSGT00950000182802.D ENSGT00940000156017.eb ENSGT00940000164351 ENSGT00390000017581.a ENSGT00940000161429 ENSGT00940000159242 ENSGT00390000008591 ENSGT00940000164237.f 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Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a ENSGT01100000263536.A.a.b ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00940000162488.b.b ENSGT00950000182802.D ENSGT00940000156017.eb ENSGT00940000164351 ENSGT00390000017581.a ENSGT00940000161429 ENSGT00940000159242 ENSGT00390000008591 ENSGT00940000164237.f ENSGT00530000063666.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000155920 ENSGT01030000234566.e.b.b.b ENSGT00940000154103.b ENSGT00940000153902.b.b ENSGT00390000018389 ENSGT01090000260082.d.a.a.c ENSGT00940000155516.v ENSGT00940000160128 ENSGT00950000182972.a.a.a.a.a.e ENSGT00940000166874 ENSGT00940000153404.a ENSGT00940000156381 ENSGT00940000157427.j ENSGT00940000163328.c ENSGT00940000165340 Eastern happy MODERN SPECIES 11 p2ry10 (ENSACLG00000023872) ENSACLG00000023881 ITM2A (ENSACLG00000023891) tbx22 (ENSACLG00000023898) ENSACLG00000023910 ENSACLG00000023943 hmgn6 (ENSACLG00000023964) sh3bgrl (ENSACLG00000023996) ENSACLG00000024014 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ENSGT00390000018389 ENSGT01090000260082.d.a.a.c ENSGT00940000155516.v ENSGT00940000160128 ENSGT00950000182972.a.a.a.a.a.e ENSGT01030000236759 ENSGT00940000166874 ENSGT00940000153404.a ENSGT00940000156381 ENSGT00940000157427.j ENSGT00940000163328.c Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000161206 ENSGT00940000166733 ENSGT00940000162488.b.b ENSGT00950000182802.D ENSGT00940000156017.eb ENSGT00770000121762 ENSGT00940000164351 ENSGT00390000017581.a ENSGT00940000161429 ENSGT00940000159242 ENSGT00390000008591 ENSGT00940000164237.e.b ENSGT00940000164237.e.a ENSGT00940000164237.f ENSGT00530000063666.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000155920 ENSGT01030000234566.e.b.b.b ENSGT00940000154103.b ENSGT00940000153902.b.b ENSGT00390000018389 ENSGT01090000260082.d.a.a.c ENSGT00940000155516.v ENSGT00940000160128 ENSGT00950000182972.a.a.a.a.a.e ENSGT00940000166874 ENSGT00940000153404.a ENSGT00940000156381 ENSGT00940000157427.j ENSGT00940000163328.c ENSGT00940000165340 Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT01030000234579.B.a ENSGT00950000182899.B.b ENSGT00940000155339 ENSGT00550000074964 ENSGT00940000155145 ENSGT00670000099471 ENSGT00940000161397 ENSGT00940000155621 ENSGT00950000183053.B ENSGT00940000157996 ENSGT00390000014020 ENSGT00940000161429 ENSGT00940000159242 ENSGT00940000164237.f ENSGT00530000063666.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000155920 ENSGT01030000234566.e.b.b.b ENSGT00940000154103.b ENSGT00940000153902.b.b ENSGT00390000018389 ENSGT01090000260082.d.a.a.c ENSGT00940000155516.v ENSGT00940000160128 ENSGT00950000182972.a.a.a.a.a.e ENSGT00940000166874 ENSGT00940000153404.a ENSGT00940000156381 ENSGT00940000157427.j ENSGT00940000163328.c ENSGT00940000165340 Tetraodon MODERN SPECIES nkap (ENSTNIG00000015765) zbtb33 (ENSTNIG00000015766) TMEM255A (ENSTNIG00000015767) ATP1B4 (ENSTNIG00000015768) ENSTNIG00000015769 cul4b (ENSTNIG00000015770) mcts1 (ENSTNIG00000000134) c1galt1c1 (ENSTNIG00000000243) clic2 (ENSTNIG00000015771) ENSTNIG00000000701 ocrl (ENSTNIG00000015772) POU3F4 (ENSTNIG00000015773) rps6kal (ENSTNIG00000015774) ENSTNIG00000015775 ENSTNIG00000015776 agtr2 (ENSTNIG00000015777) #22 ENSTNIG00000015778 TENM1 (ENSTNIG00000015779) arhgef9b (ENSTNIG00000015780) asb12b (ENSTNIG00000000074) zc4h2 (ENSTNIG00000015781) msnb (ENSTNIG00000015782) ENSTNIG00000015783 efnb1 (ENSTNIG00000015784) STAG2 (ENSTNIG00000015785) xiap (ENSTNIG00000015786) psmd10 (ENSTNIG00000001147) nxt2 (ENSTNIG00000015787) acsl4a (ENSTNIG00000015788) eif4ebp3l (ENSTNIG00000015789) TENM2 (ENSTNIG00000015790) Fugu MODERN SPECIES 5 TMEM255A (ENSTRUG00000010438) ATP1B4 (ENSTRUG00000010323) lamp2 (ENSTRUG00000010145) cul4b (ENSTRUG00000009785) mcts1 (ENSTRUG00000009679) c1galt1c1 (ENSTRUG00000009661) urp1 (ENSTRUG00000024529) clic2 (ENSTRUG00000009475) ENSTRUG00000009398 ocrl (ENSTRUG00000008986) apln (ENSTRUG00000021840) POU3F4 (ENSTRUG00000008957) rps6kal (ENSTRUG00000008234) ENSTRUG00000029265 APOOL (ENSTRUG00000007376) agtr2 (ENSTRUG00000007325) #22 ENSTRUG00000007266 TENM1 (ENSTRUG00000006641) ENSTRUG00000019751 arhgef9b (ENSTRUG00000006157) asb12b (ENSTRUG00000006010) zc4h2 (ENSTRUG00000032718) ENSTRUG00000005544 ENSTRUG00000005373 efnb1 (ENSTRUG00000026843) STAG2 (ENSTRUG00000004601) xiap (ENSTRUG00000004335) psmd10 (ENSTRUG00000025766) nxt2 (ENSTRUG00000004111) acsl4a (ENSTRUG00000002675) eif4ebp3l (ENSTRUG00000002444) Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000161206 ENSGT00940000166733 ENSGT00940000162488.b.b ENSGT00950000182802.D ENSGT00940000156017.eb ENSGT00770000121762 ENSGT00940000164351 ENSGT00390000017581.a ENSGT00940000161429 ENSGT00940000159242 ENSGT00390000008591 ENSGT00940000164237.f ENSGT00940000164237.e.b ENSGT00940000164237.e.a ENSGT00530000063666.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000155920 ENSGT01030000234566.e.b.b.b ENSGT00940000154103.b ENSGT00940000153902.b.b ENSGT00390000018389 ENSGT01090000260082.d.a.a.c ENSGT00940000155516.v ENSGT00940000160128 ENSGT00950000182972.a.a.a.a.a.e ENSGT00940000166874 ENSGT00940000153404.a ENSGT00940000156381 ENSGT00940000157427.j ENSGT00940000163328.c ENSGT00940000165340 Ballan wrasse MODERN SPECIES 27 p2ry10 (ENSLBEG00000015813) GPR174 (ENSLBEG00000015797) ITM2A (ENSLBEG00000015782) TBX22 (ENSLBEG00000015715) ENSLBEG00000015652 ENSLBEG00000015628 hmgn6 (ENSLBEG00000015609) sh3bgrl (ENSLBEG00000015567) ENSLBEG00000015550 ENSLBEG00000015500 ENSLBEG00000015480 POU3F4 (ENSLBEG00000015462) hdx (ENSLBEG00000015313) ENSLBEG00000015139 apool (ENSLBEG00000015057) agtr2 (ENSLBEG00000015021) #22 SH2D1A (ENSLBEG00000015011) TENM1 (ENSLBEG00000014915) arhgef9b (ENSLBEG00000014843) asb12b (ENSLBEG00000014808) zc4h2 (ENSLBEG00000014777) msnb (ENSLBEG00000014663) ENSLBEG00000014615 efnb1 (ENSLBEG00000014580) STAG2 (ENSLBEG00000014450) xiap (ENSLBEG00000014357) psmd10 (ENSLBEG00000014327) nxt2 (ENSLBEG00000014298) acsl4a (ENSLBEG00000014245) eif4ebp3l (ENSLBEG00000014223) zgc:165573 (ENSLBEG00000014204) Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 13 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ENSGT00940000159242 ENSGT00390000008591 ENSGT00940000164237.f ENSGT00530000063666.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000155920 ENSGT01030000234566.e.b.b.b ENSGT00940000154103.b ENSGT00940000153902.b.b ENSGT00390000018389 ENSGT01090000260082.d.a.a.c ENSGT00940000155516.v ENSGT00940000160128 ENSGT00950000182972.a.a.a.a.a.e ENSGT00940000166874 ENSGT00940000153404.a ENSGT00940000156381 ENSGT00940000157427.j ENSGT00940000163328.c ENSGT00940000165340 Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT01100000263536.A.a.a ENSGT01100000263536.A.a.b ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00950000182832.D.b ENSGT00940000162488.b.b ENSGT00990000211426 ENSGT00940000156017.eb ENSGT00940000164351 ENSGT00390000017581.a ENSGT00940000161429 ENSGT00940000159242 ENSGT00390000008591 ENSGT00940000164237.f ENSGT00530000063666.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000155920 ENSGT01030000234566.e.b.b.b ENSGT00940000154103.b ENSGT00940000153902.b.b ENSGT00390000018389 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ENSSAUG00010018773 ENSSAUG00010019000 POU3F4 (ENSSAUG00010019001) rps6kal (ENSSAUG00010019152) hdx (ENSSAUG00010024425) ENSSAUG00010024429 ENSSAUG00010024477 agtr2 (ENSSAUG00010024478) #22 SH2D1A (ENSSAUG00010024479) TENM1 (ENSSAUG00010024540) arhgef9b (ENSSAUG00010026339) asb12b (ENSSAUG00010026363) zc4h2 (ENSSAUG00010026365) msnb (ENSSAUG00010026391) ENSSAUG00010026531 efnb1 (ENSSAUG00010026532) STAG2 (ENSSAUG00010026568) xiap (ENSSAUG00010026931) psmd10 (ENSSAUG00010026934) nxt2 (ENSSAUG00010026937) acsl4a (ENSSAUG00010026970) eif4ebp3l (ENSSAUG00010027067) ENSSAUG00010027070 Perciformes ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT01100000263536.A.a.b ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00940000166733 ENSGT00940000162488.b.b ENSGT00940000156017.eb ENSGT00940000164351 ENSGT00390000017581.a ENSGT00940000161429 ENSGT00940000159242 ENSGT00390000008591 ENSGT00940000164237.f ENSGT00940000164237.e.b ENSGT00940000164237.e.a ENSGT00530000063666.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000155920 ENSGT01030000234566.e.b.b.b ENSGT00940000154103.b ENSGT00940000153902.b.b ENSGT00390000018389 ENSGT01090000260082.d.a.a.c.f ENSGT00940000155516.v ENSGT00940000160128 ENSGT00950000182972.a.a.a.a.a.e ENSGT00940000166874 ENSGT00940000153404.a ENSGT00940000156381 ENSGT00940000157427.j ENSGT00940000163328.c ENSGT00940000165340 Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT01100000263536.A.a.a ENSGT01100000263536.A.a.b ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00940000162488.b.b ENSGT00940000156017.eb ENSGT00940000164351 ENSGT00390000017581.a ENSGT00940000161429 ENSGT00940000159242 ENSGT00390000008591 ENSGT00940000164237.f ENSGT00940000164237.e.b ENSGT00940000164237.e.a ENSGT00530000063666.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000155920 ENSGT01030000234566.e.b.b.b ENSGT00940000154103.b ENSGT00940000153902.b.b ENSGT00390000018389 ENSGT01090000260082.d.a.a.c.f ENSGT00940000155516.v ENSGT00940000160128 ENSGT00950000182972.a.a.a.a.a.e ENSGT00940000166874 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ENSGT00940000156381 ENSGT00940000157427.j ENSGT00940000163328.c ENSGT00940000165340 Siamese fighting fish MODERN SPECIES 1 p2ry10 (ENSBSLG00000010026) ENSBSLG00000010038 ITM2A (ENSBSLG00000010048) TBX22 (ENSBSLG00000010060) ENSBSLG00000010080 ENSBSLG00000010102 ENSBSLG00000010586 ENSBSLG00000010712 ENSBSLG00000011043 POU3F4 (ENSBSLG00000011060) rps6kal (ENSBSLG00000011086) hdx (ENSBSLG00000011563) ENSBSLG00000011775 ENSBSLG00000012438 APOOL (ENSBSLG00000012448) agtr2 (ENSBSLG00000012458) #22 SH2D1A (ENSBSLG00000012468) TENM1 (ENSBSLG00000012627) ENSBSLG00000016895 asb12b (ENSBSLG00000018132) zc4h2 (ENSBSLG00000018135) ENSBSLG00000018151 ENSBSLG00000018671 efnb1 (ENSBSLG00000018756) STAG2 (ENSBSLG00000018960) xiap (ENSBSLG00000020469) psmd10 (ENSBSLG00000020474) nxt2 (ENSBSLG00000020478) acsl4a (ENSBSLG00000020524) eif4ebp3l (ENSBSLG00000020828) ENSBSLG00000020829 Climbing perch MODERN SPECIES 1 GPR174 (ENSATEG00000019409) ITM2A (ENSATEG00000019420) TBX22 (ENSATEG00000019437) 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ENSGT00940000156381 ENSGT00940000157427.j ENSGT00940000163328.c ENSGT00940000165340 Turbot MODERN SPECIES 4 LPAR4 (ENSSMAG00000011832) P2RY10 (ENSSMAG00000011825) GPR174 (ENSSMAG00000011805) ITM2A (ENSSMAG00000011779) ENSSMAG00000011740 ENSSMAG00000011683 ENSSMAG00000011657 sh3bgrl (ENSSMAG00000011626) ENSSMAG00000011595 ENSSMAG00000011587 POU3F4 (ENSSMAG00000011586) RPS6KA6 (ENSSMAG00000011445) HDX (ENSSMAG00000011383) ENSSMAG00000011322 ENSSMAG00000011271 ENSSMAG00000011264 #22 ENSSMAG00000011256 ENSSMAG00000011172 ENSSMAG00000010813 ENSSMAG00000010786 ENSSMAG00000037547 ENSSMAG00000010747 ENSSMAG00000010690 ENSSMAG00000024783 ENSSMAG00000010444 xiap (ENSSMAG00000010409) psmd10 (ENSSMAG00000010390) nxt2 (ENSSMAG00000010366) acsl4a (ENSSMAG00000010281) ENSSMAG00000010258 ENSSMAG00000031198 Tongue sole MODERN SPECIES 6 p2ry10 (ENSCSEG00000018232) ENSCSEG00000018227 ITM2A (ENSCSEG00000018220) TBX22 (ENSCSEG00000018204) ENSCSEG00000018195 ENSCSEG00000018191 hmgn7 (ENSCSEG00000018183) 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ENSGMOG00000004296 #22 ENSGMOG00000004270 ENSGMOG00000004187 ENSGMOG00000004165 ENSGMOG00000004156 ENSGMOG00000004145 ENSGMOG00000004115 ENSGMOG00000004074 ENSGMOG00000003196 xiap (ENSGMOG00000003181) psmd10 (ENSGMOG00000003170) nxt2 (ENSGMOG00000003163) acsl4a (ENSGMOG00000003130) ENSGMOG00000003122 ENSGMOG00000025642 ENSGMOG00000003000 Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT01100000263536.B.c.b ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a ENSGT01100000263536.A.a.b ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00980000199388 ENSGT00940000156017.eb ENSGT00390000011425.A ENSGT00940000164237 ENSGT00530000063666.a ENSGT00940000164351 ENSGT00940000161429 ENSGT00940000159242 ENSGT00390000008591 ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000155920 ENSGT01030000234566.e.b.b.b ENSGT00940000157297 ENSGT00940000159803 ENSGT00940000160622.`b.b ENSGT00530000063529.B ENSGT00940000153902.b.a ENSGT00940000162717 ENSGT00940000159316 ENSGT00390000014785 ENSGT01090000260082.d.a.a.d ENSGT00940000166318.b ENSGT00940000154633.jd ENSGT00940000153259.a.a.a ENSGT00940000155516.u Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 690 ENSGT00950000182832.D.b.fc ENSGT00940000162488.b.a.a ENSGT00950000183107.a.b.b.q.b ENSGT00940000156017.eb.a.a ENSGT00390000011425.A.c ENSGT00940000164237.h ENSGT00530000063666.a.fb ENSGT01050000244888.b.a.c.a.a #22 ENSGT01000000217261 ENSGT01030000234566.e.b.b.b.b ENSGT00940000157297.n.a ENSGT00940000159803.m ENSGT00940000160622.`b.b Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000159183.v.a ENSGT00940000160033.d.c ENSGT00940000154133.B.e ENSGT00990000203619.B.a.b.a ENSGT00940000155902.d.c.a ENSGT00950000183097.a.a.a.f.a.a.a ENSGT00940000155374.g.a ENSGT00940000167119 ENSGT00950000182832.D.b.fc ENSGT00940000162488.b.a.a ENSGT00950000183107.a.b.b.q.b ENSGT00940000156017.eb.a.a ENSGT00390000011425.A.c ENSGT00940000164237.h ENSGT00530000063666.a.fb ENSGT01050000244888.b.a.c.a.a #22 ENSGT01000000217261 ENSGT01030000234566.e.b.b.b.b 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SPECIES 13 ENSGT00940000159183.v.b ENSGT00940000160033.d.d ENSGT00940000154133.B.f ENSGT00990000203619.B.a.b.b ENSGT00940000155902.d.c.b ENSGT00950000183097.a.a.a.f.a.a.b ENSGT00940000161737 ENSGT00950000183031.B ENSGT00950000182832.D.b.gc ENSGT00940000162488.b.a.b ENSGT00950000183107.a.b.b.q.a ENSGT00940000156017.eb.a.b ENSGT00390000011425.A.d ENSGT00940000164237.g ENSGT00530000063666.a.gb ENSGT01050000244888.b.a.c.a.b #22 ENSGT00940000155920.l ENSGT01030000234566.e.b.b.b.a ENSGT00940000157297.n.b ENSGT00940000159803.n ENSGT00940000154103.b.f ENSGT00530000063529.B.a ENSGT00940000153902.b.a.b ENSGT00940000157443.c ENSGT00940000159316.xb.a ENSGT00390000014785 ENSGT01090000260082.d.a.a.d.d ENSGT00940000154336.qd ENSGT00940000153259.a.a.a.d ENSGT00940000155516.u.d ENSGT00940000160157.k Atlantic salmon MODERN SPECIES 4 ENSSSAG00000119766 ENSSSAG00000004828 ccdc61 (ENSSSAG00000004839) ENSSSAG00000004889 ENSSSAG00000005102 ENSSSAG00000007958 rraga (ENSSSAG00000007986) ENSSSAG00000008058 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ENSGT00940000159316.xb.a ENSGT00390000014785 ENSGT01090000260082.d.a.a.d.d ENSGT00940000153259.a.a.a.d ENSGT00940000155516.u.d ENSGT00940000160157.k ENSGT00940000153168.A.h Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000159183.v.b ENSGT00940000160033.d.d ENSGT00940000154133.B.f ENSGT00990000203619.B.a.b.b ENSGT00940000155902.d.c.b ENSGT00950000183097.a.a.a.f.a.a.b ENSGT00940000162863 ENSGT00950000183031.B ENSGT00950000182832.D.b.gc ENSGT00940000162488.b.a.b ENSGT00950000183107.a.b.b.q.a ENSGT00940000156017.eb.a.b ENSGT00390000011425.A.d ENSGT00940000164237.g ENSGT00530000063666.a.gb ENSGT01050000244888.b.a.c.a.b #22 ENSGT00940000155920.l ENSGT01030000234566.e.b.b.b.a ENSGT00940000157297.n.b ENSGT00940000159803.n ENSGT00940000154103.b.f ENSGT00530000063529.B.a ENSGT00940000162717.b ENSGT00940000157443.c ENSGT00940000159316.xb.a ENSGT00390000014785 ENSGT01090000260082.d.a.a.d.d ENSGT00940000153259.a.a.a.d ENSGT00940000155516.u.d ENSGT00940000160157.k ENSGT00940000153168.A.h Chinook salmon MODERN SPECIES 33 QPCTL (ENSOTSG00005012271) ENSOTSG00005012268 ENSOTSG00005012266 ENSOTSG00005012263 ccdc61 (ENSOTSG00005012260) ENSOTSG00005012255 PLS3 (ENSOTSG00005012096) rraga (ENSOTSG00005012090) chmp1b (ENSOTSG00005012087) TENT5D (ENSOTSG00005012086) BRWD3 (ENSOTSG00005009448) sh3bgrl (ENSOTSG00005009441) ENSOTSG00005009440 ENSOTSG00005009267 apool (ENSOTSG00005009261) agtr2 (ENSOTSG00005009260) #22 ENSOTSG00005009258 ENSOTSG00005009257 TENM1 (ENSOTSG00005001397) smarca1 (ENSOTSG00005001182) ENSOTSG00005001142 arhgef9b (ENSOTSG00005001039) amer1 (ENSOTSG00005001140) shisa2a (ENSOTSG00005027737) ZC3H12B (ENSOTSG00005027736) las1l (ENSOTSG00005027734) msna (ENSOTSG00005024574) ENSOTSG00005024567 AR (ENSOTSG00005022912) OPHN1 (ENSOTSG00005022876) yipf6 (ENSOTSG00005022875) Rainbow trout MODERN SPECIES 3 ccdc61 (ENSOMYG00000003992) ENSOMYG00000003945 ENSOMYG00000003928 ENSOMYG00000003740 ENSOMYG00000003338 ENSOMYG00000003271 ENSOMYG00000003212 ENSOMYG00000070732 ENSOMYG00000046780 ENSOMYG00000056162 ENSOMYG00000046683 ENSOMYG00000046589 ENSOMYG00000046585 ENSOMYG00000061248 ENSOMYG00000046525 ENSOMYG00000046480 #22 sh2d1aa (ENSOMYG00000046467) ENSOMYG00000046369 smarca1 (ENSOMYG00000046282) ENSOMYG00000046228 ARHGEF9 (ENSOMYG00000046205) amer1 (ENSOMYG00000077734) ENSOMYG00000046183 shisa2a (ENSOMYG00000046179) ZC3H12B (ENSOMYG00000046170) las1l (ENSOMYG00000046160) msna (ENSOMYG00000046003) ENSOMYG00000045960 ENSOMYG00000061616 ar-alpha (ENSOMYG00000045899) OPHN1 (ENSOMYG00000045852) Northern pike MODERN SPECIES 6 ccdc61 (ENSELUG00000009476) ENSELUG00000009509 ENSELUG00000000351 pls3 (ENSELUG00000009594) CNGA2 (ENSELUG00000009608) ENSELUG00000009623 rraga (ENSELUG00000009655) chmp1b (ENSELUG00000009678) TENT5D (ENSELUG00000026169) BRWD3 (ENSELUG00000009859) ENSELUG00000028905 sh3bgrl (ENSELUG00000009941) ENSELUG00000009993 ENSELUG00000010102 ENSELUG00000033753 agtr2 (ENSELUG00000010162) #22 TENM1 (ENSELUG00000000375) smarca1 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barbel MODERN SPECIES 229 vma21 (ENSSGRG00000021538) npas2 (ENSSGRG00000021536) ENSSGRG00000021535 ENSSGRG00000021292 BRWD3 (ENSSGRG00000019125) CNGA2 (ENSSGRG00000019081) ENSSGRG00000019078 zdhhc15a (ENSSGRG00000019075) ENSSGRG00000019074 NEXMIF (ENSSGRG00000019073) ENSSGRG00000019072 ENSSGRG00000019071 tbx5b (ENSSGRG00000019069) ENSSGRG00000019068 TPCN1 (ENSSGRG00000019067) agtr2 (ENSSGRG00000019066) #22 plp1b (ENSSGRG00000019042) nlgn3b (ENSSGRG00000019040) gria3a (ENSSGRG00000018122) stag2a (ENSSGRG00000015325) acsl4b (ENSSGRG00000015289) fam76b (ENSSGRG00000015192) kat5a (ENSSGRG00000015153) mtmr2 (ENSSGRG00000015123) mtmr2 (ENSSGRG00000015111) gjb1a (ENSSGRG00000015107) gja2 (ENSSGRG00000015105) tbc1d8b (ENSSGRG00000014838) rnf128a (ENSSGRG00000014818) ENSSGRG00000014816 ENSSGRG00000014815 Common carp reference MODERN SPECIES 15 npas2 (ENSCCRG00000026033) ENSCCRG00000026054 apool (ENSCCRG00000026064) ENSCCRG00000026076 ENSCCRG00000082116 chmp1b (ENSCCRG00000031170) 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ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00940000156929 ENSGT00940000156601 ENSGT00940000153249.b.d.b ENSGT00940000153249.b.d.a ENSGT00950000182972.a.a.a.b ENSGT00940000157741 ENSGT00390000016814 ENSGT00940000154659.b ENSGT01080000257342.H ENSGT00950000183196.B ENSGT00940000163015 ENSGT00940000155708 Neopterygii ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000157909 ENSGT01000000214434.A ENSGT00670000098080 ENSGT00940000155714 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000165699.B ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00940000156929 ENSGT00940000156601 ENSGT00940000153249.b.d.b ENSGT00940000153249.b.d.a ENSGT00950000182972.a.a.a.b ENSGT00940000157741 ENSGT00390000016814 ENSGT00940000154659.b ENSGT00940000156699 ENSGT01070000253816.b ENSGT01100000263484.C.b.a ENSGT00940000157005 Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 142 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000157649 ENSGT01060000248594.f ENSGT00950000183097.a.b ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000165699.B ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT00940000182355 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000154674.q.b ENSGT00940000154674.q.a ENSGT00910000144305 ENSGT00940000156929 ENSGT00940000156601 ENSGT00940000153249.b.d.b ENSGT00940000153249.b.d.a ENSGT00950000182972.a.a.a.b ENSGT00940000157741 ENSGT00390000016814 ENSGT01070000253816.b ENSGT00940000156699.i ENSGT00940000156699.j ENSGT00940000154659.b Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00940000160622.ab ENSGT00530000063529.C ENSGT00940000155714 ENSGT00970000197448 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000157649 ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000161292 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ENSGT00940000156601 ENSGT00940000153249.b.d.b ENSGT00390000008686.c.d ENSGT01030000234528.B.b.a.a.b ENSGT00950000183072.a.a.a ENSGT00530000063779.B.b ENSGT00940000158377.b.i.a ENSGT00940000154607.b.a ENSGT00940000154621.a.b.b.a ENSGT00510000048324 ENSGT00940000165167 ENSGT00940000164858 Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000156398 ENSGT00940000156177 ENSGT00940000160993 ENSGT01030000234667.a.a.a.b.a ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000157649 ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000165699.B ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT00940000182355 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000154674.q.b ENSGT00940000156929 ENSGT00940000156601 ENSGT00940000153249.b.d.b ENSGT00390000008686.c.d ENSGT01030000234528.B.b.a.a.b ENSGT00950000183072.a.a.a ENSGT00530000063779.B.b ENSGT00940000154607.b.a ENSGT00940000158377.b.i.a ENSGT00940000154621.a.b.b.a ENSGT00510000048324 ENSGT00940000165167 ENSGT00940000164858 Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000156398 ENSGT00940000156177 ENSGT00940000160993 ENSGT01030000234667.a.a.a.b.a ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000157649 ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000165699.B ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT00940000182355 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000154674.q.b ENSGT00940000156929 ENSGT00940000156601 ENSGT00940000153249.b.d.b ENSGT00390000008686.c.d ENSGT01030000234528.B.b.a.a.b ENSGT00950000183072.a.a.a ENSGT00530000063779.B.b ENSGT00940000158377.b.i.a ENSGT00940000154607.b.a ENSGT00940000154621.a.b.b.a ENSGT00510000048324 ENSGT00940000165167 ENSGT00940000164858 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000156398 ENSGT00940000156177 ENSGT00940000160993 ENSGT01030000234667.a.a.a.b.a ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000157649 ENSGT01060000248594.f 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bdh1 (ENSHCOG00000011587) NCK1 (ENSHCOG00000011576) ENSHCOG00000011571 slc35g2b (ENSHCOG00000011559) slc35g2b (ENSHCOG00000011544) ENSHCOG00000011507 ENSHCOG00000011452 ENSHCOG00000011432 ENSHCOG00000011401 csrnp1b (ENSHCOG00000011387) LIMD2 (ENSHCOG00000011373) map3k22 (ENSHCOG00000011362) Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000156398 ENSGT00940000156177 ENSGT00940000160993 ENSGT01030000234667.a.a.a.b.a ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000157649 ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000165699.B ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT00940000182355 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000154674.q.b ENSGT00940000156929 ENSGT00940000156601 ENSGT00940000153249.b.d.b ENSGT00390000008686.c.d ENSGT01030000234528.B.b.a.a.b ENSGT00950000183072.a.a.a ENSGT00530000063779.B.b ENSGT00940000158377.b.i.a ENSGT00940000154607.b.a.x ENSGT00940000154607.b.a.w ENSGT00940000154621.a.b.b.a ENSGT00510000048324 ENSGT00940000165167 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT01100000263537.b.a.a.b.b ENSGT00940000156398 ENSGT00940000156177 ENSGT00940000160993 ENSGT01030000234667.a.a.a.b.a ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000157649 ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000165699.B ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000154674.q.b ENSGT00940000156929 ENSGT00940000156601 ENSGT00940000153249.b.d.b ENSGT00390000008686.c.d ENSGT01030000234528.B.b.a.a.b ENSGT00950000183072.a.a.a ENSGT00530000063779.B.b ENSGT00940000158377.b.i.a ENSGT00940000154607.b.a.x ENSGT00940000154607.b.a.w ENSGT00940000154621.a.b.b.a ENSGT00510000048324 ENSGT00940000165167 Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000156398 ENSGT00940000156177 ENSGT00940000164635 ENSGT01030000234667.a.a.a.b.a ENSGT00940000160993 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000157649 ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000165699.B ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000154674.q.b ENSGT00940000156929 ENSGT00940000156601 ENSGT00940000153249.b.d.b ENSGT00390000008686.c.d ENSGT01030000234528.B.b.a.a.b ENSGT00950000183072.a.a.a ENSGT00940000158377.b.i.a ENSGT00940000154607.b.a.w ENSGT00940000154607.b.a.x ENSGT00940000154621.a.b.b.a ENSGT00510000048324 ENSGT00940000165167 ENSGT00940000164858 Oryzias ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000156398 ENSGT00940000156177 ENSGT00940000164635 ENSGT01030000234667.a.a.a.b.a ENSGT00940000160993 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000157649 ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000165699.B ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000154674.q.b ENSGT00940000156929 ENSGT00940000156601 ENSGT00940000153249.b.d.b ENSGT00390000008686.c.d ENSGT00950000183072.a.a.a ENSGT00940000158377.b.i.a ENSGT00940000154607.b.a.w ENSGT00940000154621.a.b.b.a ENSGT00510000048324 ENSGT00940000165167 ENSGT00940000164858 ENSGT00940000165361 ENSGT00390000006098 Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000156098.a ENSGT00940000156398 ENSGT00940000156177 ENSGT00940000160993 ENSGT01030000234667.a.a.a.b.a ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000157649 ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000165699.B ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000154674.q.b ENSGT00940000156929 ENSGT00940000156601 ENSGT00940000153249.b.d.b ENSGT00390000008686.c.d ENSGT00950000183072.a.a.a ENSGT00940000158377.b.i.a ENSGT00940000154607.b.a.w ENSGT00940000154621.a.b.b.a ENSGT00510000048324 ENSGT00940000165167 ENSGT00940000164858 ENSGT00390000006098 ENSGT00940000158392.e.b Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 12 KIAA1217 (ENSORLG00000010340) nphp3 (ENSORLG00000010314) uba5 (ENSORLG00000010294) ackr4b (ENSORLG00000010254) acad11 (ENSORLG00000010243) u2surp (ENSORLG00000010235) pcolce2b (ENSORLG00000010197) trpc1 (ENSORLG00000010171) CHST2 (ENSORLG00000010131) SLC9A9 (ENSORLG00000021970) dipk2ab (ENSORLG00000027166) plod2 (ENSORLG00000010111) ENSORLG00000024005 zic4 (ENSORLG00000010055) zic1 (ENSORLG00000010050) AGTR1 (ENSORLG00000010042) ##22 cpb1 (ENSORLG00000010032) gyg1b (ENSORLG00000009975) bdh1 (ENSORLG00000009948) NCK1 (ENSORLG00000009923) slc35g2b (ENSORLG00000009906) ENSORLG00000009893 csrnp1b (ENSORLG00000009885) ENSORLG00000024418 slc22a13b (ENSORLG00000009872) oxsr1b (ENSORLG00000009854) myd88 (ENSORLG00000009788) cry-dash (ENSORLG00000009768) map3k22 (ENSORLG00000009751) DLEC1 (ENSORLG00000009723) plcd1a (ENSORLG00000009694) Chinese medaka MODERN SPECIES 1041 ENSOSIG00000005343 nphp3 (ENSOSIG00000005381) uba5 (ENSOSIG00000005393) acad11 (ENSOSIG00000005803) ackr4b (ENSOSIG00000005816) u2surp (ENSOSIG00000005822) pcolce2b (ENSOSIG00000005888) trpc1 (ENSOSIG00000005961) CHST2 (ENSOSIG00000005963) SLC9A9 (ENSOSIG00000005966) dipk2ab (ENSOSIG00000005976) plod2 (ENSOSIG00000005985) ENSOSIG00000006852 zic4 (ENSOSIG00000006861) zic1 (ENSOSIG00000006864) AGTR1 (ENSOSIG00000006881) ##22 cpb1 (ENSOSIG00000006883) gyg1b (ENSOSIG00000006935) bdh1 (ENSOSIG00000006936) NCK1 (ENSOSIG00000006937) slc35g2b (ENSOSIG00000006938) ENSOSIG00000006939 csrnp1b (ENSOSIG00000006940) LIMD2 (ENSOSIG00000006942) slc22a13b (ENSOSIG00000006943) oxsr1b (ENSOSIG00000006962) myd88 (ENSOSIG00000009510) cry-dash (ENSOSIG00000009512) map3k22 (ENSOSIG00000009513) plcd1a (ENSOSIG00000009516) VILL (ENSOSIG00000009915) Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT01100000263537.b.a.a.b.b ENSGT00940000156177 ENSGT00940000164635 ENSGT01030000234667.a.a.a.b.a ENSGT00940000160993 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000157649 ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000165699.B ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000154674.q.b ENSGT00940000156929 ENSGT00940000156601 ENSGT00940000153249.b.d.b ENSGT00390000008686.c.d ENSGT00950000183072.a.a.a ENSGT00940000158377.b.i.a ENSGT00940000154607.b.a.w ENSGT00940000154621.a.b.b.a ENSGT00510000048324 ENSGT00940000165167 ENSGT00940000164858 ENSGT00940000165361 ENSGT00390000006098 Indian medaka MODERN SPECIES 14 ENSOMEG00000004806 uba5 (ENSOMEG00000004831) ENSOMEG00000004867 ackr4b (ENSOMEG00000004884) acad11 (ENSOMEG00000004902) u2surp (ENSOMEG00000004962) pcolce2b (ENSOMEG00000004994) trpc1 (ENSOMEG00000005043) CHST2 (ENSOMEG00000005071) SLC9A9 (ENSOMEG00000005091) dipk2ab (ENSOMEG00000005108) plod2 (ENSOMEG00000005197) ENSOMEG00000005233 zic4 (ENSOMEG00000005244) zic1 (ENSOMEG00000005271) AGTR1 (ENSOMEG00000005283) ##22 cpb1 (ENSOMEG00000005307) gyg1b (ENSOMEG00000005424) bdh1 (ENSOMEG00000005468) NCK1 (ENSOMEG00000005500) slc35g2b (ENSOMEG00000005515) ENSOMEG00000005575 csrnp1b (ENSOMEG00000005600) LIMD2 (ENSOMEG00000005609) slc22a13b (ENSOMEG00000005640) oxsr1b (ENSOMEG00000005675) myd88 (ENSOMEG00000005693) cry-dash (ENSOMEG00000005737) map3k22 (ENSOMEG00000005798) ENSOMEG00000005873 plcd1a (ENSOMEG00000005925) Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT01100000263537.b.a.a.b.b ENSGT00940000156398 ENSGT00940000156177 ENSGT01030000234667.a.a.a.b.a ENSGT00940000160993 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000157649 ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000165699.B ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000154674.q.b ENSGT00940000156929 ENSGT00940000156601 ENSGT00940000153249.b.d.b ENSGT00390000008686.c.d ENSGT01030000234528.B.b.a.a.b ENSGT00950000183072.a.a.a ENSGT00940000158377.b.i.a ENSGT00940000154607.b.a.w ENSGT00940000154607.b.a.x ENSGT00940000154621.a.b.b.a ENSGT00510000048324 ENSGT00940000165167 ENSGT00940000164858 Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT01100000263537.b.a.a.b.b ENSGT00940000156398 ENSGT00940000156177 ENSGT01030000234667.a.a.a.b.a ENSGT00940000160993 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000157649 ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000165699.B ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000154674.q.b ENSGT00940000156929 ENSGT00940000156601 ENSGT00940000153249.b.d.b ENSGT00390000008686.c.d ENSGT01030000234528.B.b.a.a.b ENSGT00950000183072.a.a.a ENSGT00940000158377.b.i.a ENSGT00940000154607.b.a.w ENSGT00940000154607.b.a.x ENSGT00940000154621.a.b.b.a ENSGT00510000048324 ENSGT00940000165167 ENSGT00940000164858 Mangrove rivulus MODERN SPECIES 7 ENSKMAG00000012381 nphp3 (ENSKMAG00000012309) uba5 (ENSKMAG00000012251) ackr4b (ENSKMAG00000012223) acad11 (ENSKMAG00000012184) u2surp (ENSKMAG00000012083) pcolce2b (ENSKMAG00000012021) trpc1 (ENSKMAG00000011936) CHST2 (ENSKMAG00000011898) SLC9A9 (ENSKMAG00000011867) dipk2ab (ENSKMAG00000011842) plod2 (ENSKMAG00000011768) ENSKMAG00000011727 ENSKMAG00000011705 zic1 (ENSKMAG00000011689) AGTR1 (ENSKMAG00000011672) ##22 cpb1 (ENSKMAG00000011653) gyg1b (ENSKMAG00000011607) bdh1 (ENSKMAG00000011581) NCK1 (ENSKMAG00000011568) slc35g2b (ENSKMAG00000011557) ENSKMAG00000011537 ENSKMAG00000011520 csrnp1b (ENSKMAG00000011508) ENSKMAG00000011478 slc22a13b (ENSKMAG00000011447) ENSKMAG00000011428 slc22a13b (ENSKMAG00000011396) slc22a13b (ENSKMAG00000011363) slc22a13b (ENSKMAG00000011331) slc22a13b (ENSKMAG00000011296) Turquoise killifish MODERN SPECIES 1617 pcolce2b (ENSNFUG00015010794) TRPC1 (ENSNFUG00015010853) CHST2 (ENSNFUG00015010924) SLC9A9 (ENSNFUG00015010934) C3ORF58 (ENSNFUG00015010966) nmt2 (ENSNFUG00015010976) ENSNFUG00015010991 ENSNFUG00015010996 ENSNFUG00015010998 ENSNFUG00015011003 PLOD2 (ENSNFUG00015011496) PLSCR1 (ENSNFUG00015020096) zic4 (ENSNFUG00015020101) ZIC1 (ENSNFUG00015020105) ENSNFUG00015020110 AGTR1B (ENSNFUG00015020112) ##22 CPB1 (ENSNFUG00015020115) BDH1 (ENSNFUG00015020121) NCK1B (ENSNFUG00015020134) SLC35G2B (ENSNFUG00015020136) Nfu_g_1_011289 (ENSNFUG00015020140) ENSNFUG00015020147 CSRNP1B (ENSNFUG00015020157) ENSNFUG00015020164 slc22a13b (ENSNFUG00015020169) SLC22A13 (ENSNFUG00015020181) OXSR1B (ENSNFUG00015020223) MYD88 (ENSNFUG00015021092) CRY-DASH (ENSNFUG00015021097) Nfu_g_1_011407 (ENSNFUG00015021106) ENSNFUG00015021119 Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT01100000263537.b.a.a.b.b ENSGT00940000156398 ENSGT00940000156177 ENSGT01030000234667.a.a.a.b.a ENSGT00940000160993 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000157649 ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b 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ENSAPOG00000014869 Bicolor damselfish MODERN SPECIES 2104 AGTR1 (ENSSPAG00000021246) ##22 cpb1 (ENSSPAG00000021254) gyg1b (ENSSPAG00000021267) bdh1 (ENSSPAG00000021287) NCK1 (ENSSPAG00000021296) slc35g2b (ENSSPAG00000021315) Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT01100000263537.b.a.a.b.b ENSGT00940000156398 ENSGT00940000156177 ENSGT00940000160993 ENSGT01030000234667.a.a.a.b.a ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000157649 ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000165699.B ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000154674.q.b ENSGT00940000156929 ENSGT00940000156601 ENSGT00940000153249.b.d.b ENSGT00390000008686.c.d ENSGT01030000234528.B.b.a.a.b ENSGT00950000183072.a.a.a ENSGT00530000063779.B.b ENSGT00940000158377.b.i.a ENSGT00940000154607.b.a.x ENSGT00940000154607.b.a.w ENSGT00940000154621.a.b.b.a ENSGT00510000048324 ENSGT00940000165167 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT01100000263537.b.a.a.b.b ENSGT00940000156398 ENSGT00940000156177 ENSGT01030000234667.a.a.a.b.a ENSGT00940000160993 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000157649 ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000165699.B ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000154674.q.b ENSGT00940000156929 ENSGT00940000156601 ENSGT00940000153249.b.d.b ENSGT00390000008686.c.d ENSGT01030000234528.B.b.a.a.b ENSGT00950000183072.a.a.a ENSGT00530000063779.B.b ENSGT00940000158377.b.i.a ENSGT00940000154607.b.a.x ENSGT00940000154607.b.a.w ENSGT00940000154621.a.b.b.a ENSGT00510000048324 ENSGT00940000165167 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT01100000263537.b.a.a.b.b ENSGT00940000156398 ENSGT00940000156177 ENSGT01030000234667.a.a.a.b.a ENSGT00940000160993 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000157649 ENSGT01060000248594.f 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ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000165699.B ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000154674.q.b ENSGT00940000156929 ENSGT00940000156601 ENSGT00940000153249.b.d.b ENSGT00390000008686.c.d ENSGT01030000234528.B.b.a.a.b ENSGT00950000183072.a.a.a ENSGT00940000158377.b.i.a ENSGT00940000154607.b.a.x ENSGT00940000154607.b.a.w ENSGT00940000154621.a.b.b.a ENSGT00510000048324 ENSGT00940000165167 ENSGT00940000164858 Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000156098.a ENSGT01100000263537.b.a.a.b.b ENSGT00940000156398 ENSGT00940000156177 ENSGT01030000234667.a.a.a.b.a ENSGT00940000160993 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000157649 ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000161292 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000165699.B ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000154674.q.b ENSGT00940000156929 ENSGT00940000156601 ENSGT00940000153249.b.d.b 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19 ENSGT01100000263537.b.a.a.b.b ENSGT00940000156398 ENSGT00940000156177 ENSGT00940000160993 ENSGT01030000234667.a.a.a.b.a ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000157649 ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000165699.B ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000154674.q.b ENSGT00940000156929 ENSGT00940000156601 ENSGT00940000153249.b.d.b ENSGT00390000008686.c.d ENSGT01030000234528.B.b.a.a.b ENSGT00950000183072.a.a.a ENSGT00940000158377.b.i.a ENSGT00940000154607.b.a.x ENSGT00940000154607.b.a.w ENSGT00940000154621.a.b.b.a ENSGT00510000048324 ENSGT00940000165167 ENSGT00940000164858 Ballan wrasse MODERN SPECIES 757 AGTR1 (ENSLBEG00000019531) ##22 cpb1 (ENSLBEG00000019569) gyg1b (ENSLBEG00000019712) bdh1 (ENSLBEG00000019762) NCK1 (ENSLBEG00000019775) slc35g2b (ENSLBEG00000019799) ENSLBEG00000019814 ENSLBEG00000019854 csrnp1b (ENSLBEG00000019878) Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT01100000263537.b.a.a.b.b ENSGT00940000156398 ENSGT00940000156177 ENSGT00940000160993 ENSGT01030000234667.a.a.a.b.a ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000157649 ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000165699.B ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000154674.q.b ENSGT00940000156929 ENSGT00940000156601 ENSGT00940000153249.b.d.b ENSGT00390000008686.c.d ENSGT01030000234528.B.b.a.a.b ENSGT00950000183072.a.a.a ENSGT00940000158377.b.i.a ENSGT00940000154607.b.a.x ENSGT00940000154607.b.a.w ENSGT00940000154621.a.b.b.a ENSGT00510000048324 ENSGT00940000165167 ENSGT00940000164858 Perciformes ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT01100000263537.b.a.a.b.b ENSGT00940000156398 ENSGT00940000156177 ENSGT00940000160993 ENSGT01030000234667.a.a.a.b.a ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000157649 ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000161292 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Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT01100000263537.b.a.a.b.b ENSGT00940000156398 ENSGT00940000156177 ENSGT00940000160993 ENSGT01030000234667.a.a.a.b.a ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000157649 ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000165699.B ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000154674.q.b ENSGT00940000156929 ENSGT00940000156601 ENSGT00940000153249.b.d.b ENSGT00390000008686.c.d ENSGT01030000234528.B.b.a.a.b ENSGT00950000183072.a.a.a ENSGT00940000158377.b.i.a ENSGT00940000154607.b.a.x ENSGT00940000154607.b.a.w ENSGT00940000154621.a.b.b.a ENSGT00510000048324 ENSGT00940000165167 ENSGT00940000164858 Channel bull blenny MODERN SPECIES 12 ENSCGOG00000023250 nphp3 (ENSCGOG00000023209) uba5 (ENSCGOG00000023152) ackr4b (ENSCGOG00000023143) acad11 (ENSCGOG00000023054) u2surp (ENSCGOG00000022700) pcolce2b (ENSCGOG00000022663) trpc1 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amberjack MODERN SPECIES 2777 plod2 (ENSSLDG00000015111) ENSSLDG00000015069 zic4 (ENSSLDG00000015055) zic1 (ENSSLDG00000015044) AGTR1 (ENSSLDG00000015034) ##22 cpb1 (ENSSLDG00000015016) gyg1b (ENSSLDG00000014997) bdh1 (ENSSLDG00000014967) NCK1 (ENSSLDG00000014945) slc35g2b (ENSSLDG00000014934) ENSSLDG00000014921 ENSSLDG00000014817 csrnp1b (ENSSLDG00000014777) ENSSLDG00000014762 slc22a13b (ENSSLDG00000014743) oxsr1b (ENSSLDG00000014715) myd88 (ENSSLDG00000014687) cry-dash (ENSSLDG00000014646) map3k22 (ENSSLDG00000014577) ENSSLDG00000014533 Greater amberjack MODERN SPECIES 217 ENSSDUG00000006491 nphp3 (ENSSDUG00000006427) uba5 (ENSSDUG00000006405) ackr4b (ENSSDUG00000006395) acad11 (ENSSDUG00000006341) u2surp (ENSSDUG00000006136) pcolce2b (ENSSDUG00000005953) trpc1 (ENSSDUG00000005892) CHST2 (ENSSDUG00000005866) SLC9A9 (ENSSDUG00000005834) dipk2ab (ENSSDUG00000005818) plod2 (ENSSDUG00000005733) ENSSDUG00000005712 zic4 (ENSSDUG00000005702) zic1 (ENSSDUG00000005680) AGTR1 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ENSGT01030000234626.C ENSGT00390000006098 ENSGT00940000158392.e.b.d Salmoninae_a DUPLICATION Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 252 ENSGT01030000234558.A.a.b.n ENSGT00940000165699.B ENSGT00940000154200.B.q ENSGT00940000160269.g.b ENSGT01050000244888.b.a.c.b.c ##22 Salmo ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000161902.a.b.a ENSGT00940000155268 ENSGT00950000182878.b.a.k ENSGT00940000157063.a.a.c.a ENSGT00940000154977 ENSGT00940000156908.b ENSGT00390000011717 ENSGT00940000156130.a.a.c.a ENSGT00940000159124 ENSGT00940000158635.c.c.a ENSGT00520000055625.b.ab ENSGT01030000234558.A.a.b.n ENSGT00940000165699.B ENSGT00940000154200.B.q ENSGT00940000160269.g.b ENSGT01050000244888.b.a.c.b.c ##22 River trout MODERN SPECIES 11 ENSSTUG00000020570 ENSSTUG00000020566 ube2wa (ENSSTUG00000020486) ENSSTUG00000020474 JPH1 (ENSSTUG00000020472) gdap1 (ENSSTUG00000020458) pi15a (ENSSTUG00000020450) dipk2ab (ENSSTUG00000020440) ENSSTUG00000020415 ENSSTUG00000020412 ENSSTUG00000020405 ENSSTUG00000020392 ENSSTUG00000020380 zic4 (ENSSTUG00000020356) zic1 (ENSSTUG00000020341) AGTR1 (ENSSTUG00000020334) ##22 bdh1 (ENSSTUG00000020256) ENSSTUG00000020236 Atlantic salmon MODERN SPECIES 10 ENSSSAG00000121215 JPH1 (ENSSSAG00000100444) ENSSSAG00000085608 pi15a (ENSSSAG00000094265) dipk2ab (ENSSSAG00000097283) ENSSSAG00000106170 ENSSSAG00000091584 ENSSSAG00000122230 ENSSSAG00000102478 plod2 (ENSSSAG00000055301) ENSSSAG00000044978 ENSSSAG00000044847 zic4 (ENSSSAG00000044903) zic1 (ENSSSAG00000044953) ENSSSAG00000088397 AGTR1 (ENSSSAG00000066734) ##22 gyg1b (ENSSSAG00000045396) bdh1 (ENSSSAG00000097728) ENSSSAG00000085614 slc35g2b (ENSSSAG00000109757) ENSSSAG00000075501 ENSSSAG00000054598 ENSSSAG00000121424 slc22a13b (ENSSSAG00000116575) cry-dash (ENSSSAG00000045219) acaa1 (ENSSSAG00000121911) ENSSSAG00000045522 ENSSSAG00000085672 plcd1a (ENSSSAG00000111220) ENSSSAG00000083683 gars (ENSSSAG00000045811) Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 125 ENSGT01050000244888.b.a.c.b.c ##22 ENSGT00940000154674.q.b.f ENSGT00940000156929 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(ENSOKIG00005050908) cry-dash (ENSOKIG00005050871) ENSOKIG00005050852 acaa1 (ENSOKIG00005050841) ENSOKIG00005050798 plcd1a (ENSOKIG00005049333) ENSOKIG00005048422 ENSOKIG00005048248 Chinook salmon MODERN SPECIES 7 tspy (ENSOTSG00005006625) sema3ga (ENSOTSG00005006621) ENSOTSG00005006606 ENSOTSG00005006571 apex2 (ENSOTSG00005006565) zgc:162200 (ENSOTSG00005006564) rap1gapa (ENSOTSG00005006547) ENSOTSG00005006538 mxra8b (ENSOTSG00005006537) DVL1 (ENSOTSG00005006536) tnfrsf9a (ENSOTSG00005006535) ENSOTSG00005006533 uts2a (ENSOTSG00005006532) ENSOTSG00005006530 CAMTA1 (ENSOTSG00005006528) AGTR1 (ENSOTSG00005006526) ##22 gyg1b (ENSOTSG00005006525) bdh1 (ENSOTSG00005006524) ENSOTSG00005006523 ENSOTSG00005028583 dnajc11a (ENSOTSG00005028560) ENSOTSG00005028559 ENSOTSG00005028558 ENSOTSG00005028545 ENSOTSG00005028162 mfsd4ab (ENSOTSG00005028156) lemd1 (ENSOTSG00005028149) PM20D1 (ENSOTSG00005028148) NFASC (ENSOTSG00005019091) slc16a7 (ENSOTSG00005019063) TAFA1 (ENSOTSG00005019061) Rainbow trout MODERN SPECIES 2 dipk2ab (ENSOMYG00000030273) ENSOMYG00000060992 ENSOMYG00000048485 plod2 (ENSOMYG00000062424) ENSOMYG00000053402 ENSOMYG00000059996 ENSOMYG00000070705 zic4 (ENSOMYG00000033046) zic1 (ENSOMYG00000033075) ENSOMYG00000050097 ENSOMYG00000032970 ENSOMYG00000048418 ENSOMYG00000033010 mix23 (ENSOMYG00000033022) ENSOMYG00000033028 ENSOMYG00000032843 ##22 gyg1b (ENSOMYG00000032717) bdh1 (ENSOMYG00000032666) ENSOMYG00000070920 ENSOMYG00000032653 slc35g2b (ENSOMYG00000032638) ENSOMYG00000051533 ENSOMYG00000076255 ENSOMYG00000032644 ENSOMYG00000048009 SLC22A13 (ENSOMYG00000032606) ENSOMYG00000069127 cry-dash (ENSOMYG00000032594) acaa1 (ENSOMYG00000032320) ENSOMYG00000050640 plcd1a (ENSOMYG00000032160) Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00940000156118.d.b.d ENSGT00940000161902.a.b.a ENSGT00940000155268 ENSGT00950000182878.b.a.k ENSGT00940000157063.a.a.d.a ENSGT00940000154977 ENSGT00940000156908.b ENSGT00390000011717 ENSGT00940000156130.a.a.c.a ENSGT00940000159124 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ENSGT00940000154674.q.b.e ENSGT00940000156601.t.b ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a.a.a.c ENSGT00940000158377.b.i.a ENSGT00510000048324 ENSGT00940000164858 ENSGT00940000158392.e.b.c ENSGT00940000160253 ENSGT00530000063629.b.c ENSGT00940000156360.c ENSGT00940000160089 ENSGT00940000159338 ENSGT00940000156402.B Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 171 ENSGT01050000244888.b.a.c.b.d ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00390000005979.a ENSGT00940000158377.b.i.a ENSGT00510000048324 ENSGT00940000164858 ENSGT00940000158392.e.b.c ENSGT00940000160253 ENSGT00530000063629.b.c ENSGT00940000156360.c ENSGT00940000160089 ENSGT00940000159338 ENSGT00940000156402.B ENSGT00940000157080 ENSGT00940000157313 ENSGT00390000017542 Chinook salmon MODERN SPECIES 21 alg14 (ENSOTSG00005003490) TLCD4 (ENSOTSG00005003488) ENSOTSG00005003487 ENSOTSG00005003485 plppr5b (ENSOTSG00005003484) ENSOTSG00005003481 ENSOTSG00005003480 ENSOTSG00005003478 rpl7 (ENSOTSG00005003349) dipk2ab (ENSOTSG00005003347) plod2 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ENSOMYG00000065795 Salmo ANCESTRAL SPECIES 67 ENSGT01090000260093.a.c ENSGT00950000182978.A.a.b.a.c.b.a.b ENSGT00940000160438.d.a ENSGT00940000156118.d.b.c ENSGT00940000161902.a.b.b ENSGT00390000008325.b.b ENSGT00950000182878.b.a.l ENSGT00940000157063.a.a.c.b ENSGT00940000156908.a ENSGT00940000158635.c.c.b ENSGT00940000156473.f.a ENSGT00520000055625.b.`b ENSGT01030000234558.A.a.b.m.a ENSGT00940000154200.B.r ENSGT00940000160269.g.a ENSGT01050000244888.b.a.c.b.d ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000154674.q.b ENSGT00940000156929 ENSGT00940000156601.u.a ENSGT00390000008686.c.d ENSGT00950000183072.a.a.a.d ENSGT00530000063779.B.b ENSGT00940000154607.b.a.s.b ENSGT00940000165167 ENSGT01030000234626.C ENSGT00390000006098 ENSGT00940000158392.e.b.d ENSGT00940000153759.a.a.g ENSGT00940000158548 ENSGT00640000091497.a River trout MODERN SPECIES 36 ENSSTUG00000010696 SBSPON (ENSSTUG00000010688) rpl7 (ENSSTUG00000043928) rdh10a (ENSSTUG00000043900) ENSSTUG00000043898 ube2wa (ENSSTUG00000043860) 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ENSGT00940000157975 ENSGT01030000234629.D ENSGT00390000005140.b.b ENSGT00940000160622.ab ENSGT00390000010687.a.a.e ENSGT00940000157649 ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000161292 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000165699.B ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269.f ENSGT01050000244888.b.a.c.b.e ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000154674.q.b ENSGT00940000155265.a.h ENSGT00940000159537 ENSGT00390000013463 ENSGT00940000164582.a Atlantic herring MODERN SPECIES 8 sh3glb1a (ENSCHAG00000025487) nrros (ENSCHAG00000025548) fbxo45 (ENSCHAG00000025550) fam168b (ENSCHAG00000025555) ENSCHAG00000025564 u2surp (ENSCHAG00000025638) pcolce2b (ENSCHAG00000025676) trpc1 (ENSCHAG00000025709) CHST2 (ENSCHAG00000025745) dipk2ab (ENSCHAG00000025751) plod2 (ENSCHAG00000025876) ENSCHAG00000027111 ENSCHAG00000027114 zic4 (ENSCHAG00000027118) zic1 (ENSCHAG00000027120) AGTR1 (ENSCHAG00000027123) ##22 cpb1 (ENSCHAG00000027124) cpb1 (ENSCHAG00000027127) cpb1 (ENSCHAG00000027132) gyg1b 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ENSGT00940000153498.B.a ENSGT00940000154811.B.a.a.b ENSGT00940000156350.h ENSGT00940000157002 ENSGT00940000157649 ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000161292 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000165699.B ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269.f ENSGT01050000244888.b.a.c.b.e ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000154674.q.b ENSGT00940000156929 ENSGT00940000156601.s ENSGT00940000153249.b.d.b ENSGT00950000182972.a.a.a.b.k.a ENSGT00390000008527 ENSGT00940000178206 ENSGT00930000150950.a ENSGT00940000157252.m.b ENSGT00940000155002.b.e.a ENSGT00940000158085.b.a ENSGT00940000154453.a.b.b.e.a ENSGT01090000260098.B.b ENSGT00940000161191.A.b Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 55 ENSGT00810000125439.A ENSGT00940000156105.k.a ENSGT00390000005508.b ENSGT00940000153498.B.a ENSGT00940000154811.B.a.a.b ENSGT00940000156350.h ENSGT00940000157002 ENSGT00940000157649 ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000161292 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000165699.B ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269.f ENSGT01050000244888.b.a.c.b.e ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000154674.q.b ENSGT00940000156929 ENSGT00940000156601.s ENSGT00940000153249.b.d.b ENSGT00950000182972.a.a.a.b.k.a ENSGT00390000008527 ENSGT00940000178206 ENSGT00930000150950.a ENSGT00940000157252.m.b ENSGT00940000155002.b.e.a ENSGT00940000158085.b.a ENSGT00940000154453.a.b.b.e.a ENSGT01090000260098.B.b ENSGT00940000161191.A.b Characoidei ANCESTRAL SPECIES 46 ENSGT00810000125439.A ENSGT00940000156105.k.a ENSGT00390000005508.b ENSGT00940000153498.B.a ENSGT00940000154811.B.a.a.b ENSGT00940000156350.h ENSGT00940000157002 ENSGT00940000157649 ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000161292 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000165699.B ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269.f ENSGT01050000244888.b.a.c.b.e ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000154674.q.b ENSGT00940000156929 ENSGT00940000156601.s ENSGT00940000153249.b.d.b ENSGT00390000008527 ENSGT00940000178206 ENSGT00930000150950.a ENSGT00940000157252.m.b ENSGT00940000155002.b.e.a ENSGT00940000158085.b.a ENSGT00940000154453.a.b.b.e.a ENSGT01090000260098.B.b ENSGT00940000161191.A.b ENSGT00940000157866 Mexicana tetra MODERN SPECIES 1 dipk2ab (ENSAMXG00000036418) plod2 (ENSAMXG00000033850) ENSAMXG00000010955 zic4 (ENSAMXG00000031851) zic1 (ENSAMXG00000010931) AGTR1 (ENSAMXG00000025004) ##22 cpb1 (ENSAMXG00000010920) gyg1b (ENSAMXG00000039979) bdh1 (ENSAMXG00000033523) NCK1 (ENSAMXG00000010892) slc35g2b (ENSAMXG00000025002) idi1 (ENSAMXG00000034930) ENSAMXG00000033699 wdr37 (ENSAMXG00000018880) ADARB2 (ENSAMXG00000040561) PFKP (ENSAMXG00000018923) klf6a (ENSAMXG00000037722) CCNY (ENSAMXG00000018937) ENSAMXG00000018944 fzd8a (ENSAMXG00000042656) sugct (ENSAMXG00000035823) Red-bellied piranha MODERN SPECIES 4 ENSPNAG00000029861 pdss1 (ENSPNAG00000029883) ENSPNAG00000029897 abi1a (ENSPNAG00000029906) acbd5a (ENSPNAG00000029918) mastl (ENSPNAG00000005654) pcolce2b (ENSPNAG00000004686) trpc1 (ENSPNAG00000029958) CHST2 (ENSPNAG00000029965) ENSPNAG00000029971 dipk2ab (ENSPNAG00000029980) plod2 (ENSPNAG00000030000) ENSPNAG00000030005 zic4 (ENSPNAG00000030011) zic1 (ENSPNAG00000030015) AGTR1 (ENSPNAG00000030018) ##22 cpb1 (ENSPNAG00000006587) gyg1b (ENSPNAG00000030032) bdh1 (ENSPNAG00000030037) NCK1 (ENSPNAG00000004692) slc35g2b (ENSPNAG00000030039) idi1 (ENSPNAG00000030043) wdr37 (ENSPNAG00000030060) ADARB2 (ENSPNAG00000030072) ENSPNAG00000030076 PFKP (ENSPNAG00000030086) klf6a (ENSPNAG00000030095) CCNY (ENSPNAG00000030098) ENSPNAG00000030100 fzd8a (ENSPNAG00000030105) sugct (ENSPNAG00000007695) Electric eel MODERN SPECIES 404 AGTR1 (ENSEEEG00000018414) ##22 cpb1 (ENSEEEG00000018415) gyg1b (ENSEEEG00000018417) bdh1 (ENSEEEG00000018448) NCK1 (ENSEEEG00000018452) ENSEEEG00000018455 slc35g2b (ENSEEEG00000018456) idi1 (ENSEEEG00000018459) wdr37 (ENSEEEG00000018466) ENSEEEG00000018479 ntrk3a (ENSEEEG00000018484) ENSEEEG00000018493 Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000156105.k.a ENSGT00390000005508.b ENSGT00940000153498.B.a ENSGT00940000154811.B.a.a.b ENSGT00940000156350.h ENSGT00940000157002 ENSGT00940000157649 ENSGT01060000248594.f ENSGT00950000182866.D.d.b.bb.b.a ENSGT00940000161292 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000165699.B ENSGT00940000154200.B.t ENSGT00940000160269.f ENSGT01050000244888.b.a.c.b.e ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161191.A.a.a ENSGT01090000260098.B.b ENSGT00940000154453.a.b.b.e.a ENSGT00940000158085.b.a ENSGT00940000155002.b.e.a ENSGT00940000157252.m.b ENSGT00930000150950.a ENSGT00390000008527 ENSGT00940000156929 ENSGT00940000154674.q.b ENSGT00940000157866 ENSGT00940000157116.f.a ENSGT00940000155105 ENSGT00390000018596.A.b Cyprininae DUPLICATION Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 600 ENSGT01030000234558.A.a.b.g.b ENSGT00940000154200.B.t.b ENSGT00940000165699.B.d ENSGT00940000154200.B.t.a.b ENSGT00940000160269.f.b ENSGT01050000244888.b.a.c.b.e.a ##22 ENSGT00940000157819.p ENSGT00940000161191.A.a.a ENSGT01090000260098.B.b.c ENSGT00940000154453.a.b.b.e.a.c ENSGT00940000158085.b.a.a.a.a ENSGT00940000155002.b.e.a.c.b ENSGT00940000157252.m.b.a.a ENSGT00930000150950.a.f ENSGT01090000260098.B.b.d ENSGT00940000154453.a.b.b.e.a.d ENSGT00940000158085.b.a.b Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 166 ENSGT00940000156105.k.a.b ENSGT00390000005508.b ENSGT00940000153498.B.a.n ENSGT00940000154811.B.a.a.b.e.a ENSGT00940000156350.h.a.a ENSGT00940000157002.d ENSGT00940000157649.i.a ENSGT01060000248594.f.d ENSGT00950000182866.D.d.b.bb.b.a.b.b ENSGT00940000161292.u.b ENSGT00520000055625.b.l.a ENSGT01030000234558.A.a.b.g.b ENSGT00940000154200.B.t.b ENSGT00940000154200.B.t.a.b ENSGT00940000160269.f.b ENSGT01050000244888.b.a.c.b.e.a ##22 ENSGT00940000157819.p ENSGT00940000161191.A.a.a ENSGT01090000260098.B.b.d ENSGT00940000154453.a.b.b.e.a.d ENSGT00940000158085.b.a.a.a.b ENSGT00940000155002.b.e.a.c.a ENSGT00940000157252.m.b.a.b.a ENSGT00930000150950.a.e ENSGT00390000008527 ENSGT00940000153249.b.d.b.s.a ENSGT00940000156601.s.d ENSGT00940000156929.d ENSGT00940000153249.b.d.b.s.b ENSGT00940000156601.s.c ENSGT00940000156929.c.b Golden-line barbel MODERN SPECIES 2714 AGTR1 (ENSSGRG00000011583) ##22 ENSSGRG00000011582 Common carp reference MODERN SPECIES 40 trpc1 (ENSCCRG00000031641) ENSCCRG00000052933 ENSCCRG00000016954 ENSCCRG00000081742 ENSCCRG00000006150 ENSCCRG00000069416 ENSCCRG00000017382 dipk2ab (ENSCCRG00000057972) ENSCCRG00000057039 ENSCCRG00000053427 plod2 (ENSCCRG00000002279) ENSCCRG00000061822 ENSCCRG00000072439 zic1 (ENSCCRG00000037371) zic4 (ENSCCRG00000066417) AGTR1 (ENSCCRG00000014634) ##22 cpb1 (ENSCCRG00000014639) ENSCCRG00000076198 ENSCCRG00000014803 klf6a (ENSCCRG00000019179) PFKP (ENSCCRG00000031710) ENSCCRG00000070265 ENSCCRG00000062913 ADARB2 (ENSCCRG00000069259) wdr37 (ENSCCRG00000079698) idi1 (ENSCCRG00000060401) slc35g2b (ENSCCRG00000080856) bdh1 (ENSCCRG00000082785) gyg1b (ENSCCRG00000015526) sugct (ENSCCRG00000061515) inhbaa (ENSCCRG00000072678) Goldfish MODERN SPECIES 16 CPA6 (ENSCARG00000047273) PREX2 (ENSCARG00000043714) zgc:162928 (ENSCARG00000043383) sulf1 (ENSCARG00000042336) SLCO5A1 (ENSCARG00000042248) csrnp1b (ENSCARG00000042231) LIMD2 (ENSCARG00000042222) slc22a13b (ENSCARG00000042191) OXSR1 (ENSCARG00000042093) plod2 (ENSCARG00000026664) ENSCARG00000026283 ENSCARG00000026264 zic4 (ENSCARG00000026258) zic1 (ENSCARG00000026254) ENSCARG00000026251 AGTR1 (ENSCARG00000026248) ##22 cpb1 (ENSCARG00000026176) fzd8a (ENSCARG00000026141) ENSCARG00000026135 CCNY (ENSCARG00000042518) klf6a (ENSCARG00000042452) napga (ENSCARG00000040848) ENSCARG00000040591 ralaa (ENSCARG00000040544) ENSCARG00000040528 ENSCARG00000040506 itgb1a (ENSCARG00000036505) nrp1a (ENSCARG00000032106) ENSCARG00000031933 ENSCARG00000021576 CUL2 (ENSCARG00000021204) Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 432 ENSGT00940000156105.k.a.a ENSGT00940000153498.B.a ENSGT00940000154811.A.p ENSGT00940000154811.B.a.a.b.e.b ENSGT00940000156350.h.b 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plod2 (ENSDARG00000011821) ENSDARG00000077468 zic4 (ENSDARG00000031307) zic1 (ENSDARG00000015567) AGTR1 (ENSDARG00000045443) ##22 cpb1 (ENSDARG00000045442) fzd8a (ENSDARG00000045444) ENSDARG00000116895 CCNY (ENSDARG00000063677) klf6a (ENSDARG00000029072) PFKP (ENSDARG00000028000) ADARB2 (ENSDARG00000071823) wdr37 (ENSDARG00000074611) idi1 (ENSDARG00000019976) slc35g2b (ENSDARG00000045447) NCK1 (ENSDARG00000075369) bdh1 (ENSDARG00000059388) gyg1b (ENSDARG00000059391) sugct (ENSDARG00000102341) inhbaa (ENSDARG00000012671) Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000174859 ENSGT00940000164521.f ENSGT00910000144227 #21 ENSGT00940000159478.e ENSGT00940000154539.a.b ENSGT00390000000259.k.a ENSGT00390000010652.D.a.b ENSGT00940000161872 ENSGT00940000157166.d ENSGT00940000157050.i.a ENSGT00940000164804.a ENSGT00940000160620 ENSGT00940000164492.a.a ENSGT00940000158959.b.b ENSGT00940000160269.e ENSGT01050000244888.b.a.c.b.f ##22 ENSGT00940000154674.q.a ENSGT00910000144305 ENSGT00940000156601.r 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ENSGT00940000161872.f ENSGT00940000157166.d.f ENSGT00940000157050.i.a.b ENSGT00940000164804.a.a ENSGT00940000160620.a ENSGT00940000164492.a.a.b ENSGT00940000158959.b.b.a ENSGT01050000244888.b.a.c.b.f.b ##22 ENSGT00940000154674.q.a.a ENSGT00910000144305.a ENSGT00940000156601.r.a ENSGT00940000153249.b.d.b.t ENSGT00950000182972.a.a.a.b.k.a.a ENSGT00940000157741.i ENSGT00390000016814.d.b ENSGT00940000156699.j.a ENSGT00940000154659.b.d ENSGT00940000157005.s.b ENSGT01100000263484.C.b.a.a.b.a ENSGT00940000155015.g.b.b ENSGT00950000183196.B.h.a ENSGT00940000155708.d ENSGT00940000155893.b.b Common carp reference MODERN SPECIES 21 ENSCCRG00000036019 kcnn1a (ENSCCRG00000024743) insl3 (ENSCCRG00000032925) ENSCCRG00000032943 rps28 (ENSCCRG00000072994) #21 angptl4 (ENSCCRG00000033209) ENSCCRG00000064930 ENSCCRG00000033220 crtc1a (ENSCCRG00000068743) ENSCCRG00000068341 MAST3 (ENSCCRG00000064186) pik3r2 (ENSCCRG00000015337) mpv17l2 (ENSCCRG00000018993) ENSCCRG00000034816 rab3aa (ENSCCRG00000034805) 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(ENSDARG00000056228) tnika (ENSDARG00000056218) slc2a2 (ENSDARG00000056196) Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 157 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT01060000248594.f.a ENSGT00950000183097.a.b ENSGT00940000161292.a ENSGT00940000161292.b ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b.f ENSGT00940000165699.A ENSGT00940000165699.B.b ENSGT00940000154200.B.p ENSGT00940000160269.d ENSGT00940000182355 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000154674.q.a ENSGT00910000144305 ENSGT00940000156929 ENSGT00940000156601.p ENSGT00940000153249.b.d.b ENSGT00950000182972.a.a.a.b.m ENSGT00940000157741 ENSGT00390000016814 ENSGT01070000253816.b.e ENSGT00940000156699.j ENSGT00940000154659.b.b ENSGT00940000157005 ENSGT01100000263484.C.b.a.b ENSGT00940000155015.g.b ENSGT00950000183196.B.i P. kingsleyae MODERN SPECIES 205 ATR (ENSPKIG00000021904) u2surp (ENSPKIG00000021859) PCOLCE2 (ENSPKIG00000021811) ENSPKIG00000021769 pls1 (ENSPKIG00000021730) CHST2 (ENSPKIG00000021712) ENSPKIG00000021703 dipk2aa (ENSPKIG00000021688) plod2 (ENSPKIG00000021658) si:ch211-71m22.1 (ENSPKIG00000021642) zic4 (ENSPKIG00000021631) ZIC1 (ENSPKIG00000021609) ENSPKIG00000021588 AGTR1 (ENSPKIG00000021582) ##22 gyg1a (ENSPKIG00000021566) HLTF (ENSPKIG00000021535) bdh1 (ENSPKIG00000021518) NCK1 (ENSPKIG00000021501) slc35g2a (ENSPKIG00000021484) STAG1 (ENSPKIG00000021392) pccb (ENSPKIG00000021332) MSL2 (ENSPKIG00000021313) ENSPKIG00000021294 nceh1a (ENSPKIG00000021276) PPP2R3A (ENSPKIG00000021182) fndc3ba (ENSPKIG00000021061) GHSR (ENSPKIG00000021028) pld1a (ENSPKIG00000020932) tnika (ENSPKIG00000020782) Asian bonytongue MODERN SPECIES 18 ENSSFOG00015029937 nadkb (ENSSFOG00015030602) gpr160 (ENSSFOG00015010516) u2surp (ENSSFOG00015010470) PCOLCE2 (ENSSFOG00015010419) pls1 (ENSSFOG00015010344) CHST2 (ENSSFOG00015010324) dipk2aa (ENSSFOG00015010308) ENSSFOG00015010299 plod2 (ENSSFOG00015010084) si:ch211-71m22.1 (ENSSFOG00015010038) ENSSFOG00015024668 zic4 (ENSSFOG00015009983) ZIC1 (ENSSFOG00015009971) ENSSFOG00015031549 AGTR1 (ENSSFOG00015009966) ##22 gyg1a (ENSSFOG00015009894) HLTF (ENSSFOG00015009816) bdh1 (ENSSFOG00015031023) NCK1 (ENSSFOG00015009771) slc35g2a (ENSSFOG00015028575) ENSSFOG00015009648 pccb (ENSSFOG00015009544) MSL2 (ENSSFOG00015009527) TNFSF10 (ENSSFOG00015027159) nceh1a (ENSSFOG00015033076) PPP2R3A (ENSSFOG00015009424) fndc3ba (ENSSFOG00015009292) ghsra (ENSSFOG00015030756) pld1a (ENSSFOG00015009068) tnika (ENSSFOG00015008965) Spotted gar MODERN SPECIES 652 xrn1 (ENSLOCG00000007944) ATR (ENSLOCG00000007924) pls1 (ENSLOCG00000007909) trpc1 (ENSLOCG00000007889) pcolce2b (ENSLOCG00000007866) u2surp (ENSLOCG00000007828) chst2a (ENSLOCG00000017407) ENSLOCG00000007817 SLC9A9 (ENSLOCG00000007796) dipk2aa (ENSLOCG00000007771) plod2 (ENSLOCG00000007750) ENSLOCG00000007741 si:ch211-71m22.1 (ENSLOCG00000007730) zic4 (ENSLOCG00000007717) zic1 (ENSLOCG00000007706) AGTR1 (ENSLOCG00000017406) ##22 cpb1 (ENSLOCG00000007688) gyg1b (ENSLOCG00000007672) HLTF (ENSLOCG00000007640) 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PPP2R3A (ENSECRG00000006423) ENSECRG00000006437 nceh1b.1 (ENSECRG00000006444) tnfsf10 (ENSECRG00000006455) ghsra (ENSECRG00000006465) fndc3ba (ENSECRG00000006480) Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000157909 ENSGT01000000214434.A ENSGT00670000098080 ENSGT00940000155714 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000154435 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00940000153981.B ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT00940000165445 ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942 ENSGT00940000153664.B ENSGT00940000160465 Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT01000000214434.A ENSGT00670000098080 ENSGT00940000155714 ENSGT00950000183097.a.b 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ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942 Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00670000098080 ENSGT00940000155714 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000154435 ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551.c ENSGT00940000161551.d ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT00940000165445 ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942 Episquamata ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000155714 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334.c ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b 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ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000154435 ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551.d ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT01040000240444.A.b.a.a.a ENSGT00950000182825.B ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942 Emydidae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00670000098080 ENSGT00940000155714 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000154435 ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 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ENSPSIG00000014661 HPS3 (ENSPSIG00000014704) CP (ENSPSIG00000015628) TM4SF18 (ENSPSIG00000017172) TM4SF1 (ENSPSIG00000017177) TM4SF4 (ENSPSIG00000017198) WWTR1 (ENSPSIG00000017220) COMMD2 (ENSPSIG00000005159) ANKUB1 (ENSPSIG00000005189) RNF13 (ENSPSIG00000005312) PFN2 (ENSPSIG00000005498) Archosauria ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00670000098080 ENSGT00940000155714 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000154435 ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000163773 ENSGT00940000159265 ENSGT00940000159409 ENSGT00940000156929 ENSGT00510000046981 ENSGT00390000004757 ENSGT00940000156389.a ENSGT00940000158154 ENSGT00940000161593 ENSGT01030000234960.a ENSGT00940000156442 ENSGT00390000018718 ENSGT00940000155941.A ENSGT00940000162953 Aves ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00670000098080 ENSGT00940000155714 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000154435 ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000163773 ENSGT00940000159265 ENSGT00940000159409 ENSGT00940000156929 ENSGT00510000046981 ENSGT00390000004757 ENSGT00940000156389.a ENSGT00940000158154 ENSGT00940000161593 ENSGT01030000234960.a ENSGT00940000156442 ENSGT00390000018718 ENSGT00940000155941.A ENSGT00940000162953 Neognathae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00670000098080 ENSGT00940000155714 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000154435 ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000163773 ENSGT00940000159265 ENSGT00940000159409 ENSGT00940000156929 ENSGT00510000046981 ENSGT00390000004757 ENSGT00940000156389.a ENSGT00940000158154 ENSGT00940000161593 ENSGT01030000234960.a ENSGT00940000156442 ENSGT00390000018718 ENSGT00940000155941.A ENSGT00940000162953 Neognathae_b ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00670000098080 ENSGT00940000155714 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000154435 ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000163773 ENSGT00940000159265 ENSGT00940000159409 ENSGT00940000156929 ENSGT00510000046981 ENSGT00390000004757 ENSGT00940000156389.a ENSGT00940000158154 ENSGT00940000161593 ENSGT01030000234960.a ENSGT00940000156442 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ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h ENSGT00940000153664.B ENSGT00940000160465 Goat MODERN SPECIES PCOLCE2 (ENSCHIG00000024199) PAQR9 (ENSCHIG00000009825) U2SURP (ENSCHIG00000023892) CHST2 (ENSCHIG00000010707) SLC9A9 (ENSCHIG00000013168) DIPK2A (ENSCHIG00000018908) PLOD2 (ENSCHIG00000018266) PLSCR4 (ENSCHIG00000022873) ENSCHIG00000010958 PLSCR1 (ENSCHIG00000025945) PLSCR5 (ENSCHIG00000013997) ZIC4 (ENSCHIG00000023352) ZIC1 (ENSCHIG00000027149) ENSCHIG00000014985 ENSCHIG00000014987 AGTR1 (ENSCHIG00000011470) ##22 CPB1 (ENSCHIG00000006800) CPA3 (ENSCHIG00000011174) GYG1 (ENSCHIG00000017330) HLTF (ENSCHIG00000024059) HPS3 (ENSCHIG00000022630) CP (ENSCHIG00000014080) ENSCHIG00000026820 ENSCHIG00000010914 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PFN2 (ENSOARG00020004872) Bovinae ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000157649 ENSGT00940000153096.b.c.b.b.a.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164931 ENSGT00940000154435.j.b.b ENSGT00940000154435.i ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT00940000165295 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h ENSGT00940000153664.B Bos ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000157649 ENSGT00940000153096.b.c.b.b.a.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164931 ENSGT00940000154435.j.b.b ENSGT00940000154435.i ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT00940000165295 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h ENSGT00940000153664.B Bos_a ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000157649 ENSGT00940000153096.b.c.b.b.a.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164931 ENSGT00940000154435.j.b.b ENSGT00940000154435.i ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 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yak MODERN SPECIES 1415 AGTR1 (ENSBMUG00000022155) ##22 CPB1 (ENSBMUG00000022173) CPA3 (ENSBMUG00000022187) GYG1 (ENSBMUG00000022224) HLTF (ENSBMUG00000022266) HPS3 (ENSBMUG00000022328) CP (ENSBMUG00000022371) ENSBMUG00000022411 TM4SF18 (ENSBMUG00000022444) Bos_b ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000157649 ENSGT00940000153096.b.c.b.b.a.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164931 ENSGT00940000154435.j.b.b ENSGT00940000154435.i ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT00940000165295 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h ENSGT00940000153664.B Cow MODERN SPECIES U2SURP (ENSBTAG00000009154) CHST2 (ENSBTAG00000011584) ENSBTAG00000054067 SLC9A9 (ENSBTAG00000031178) DIPK2A (ENSBTAG00000007933) ENSBTAG00000049240 PLOD2 (ENSBTAG00000007331) PLSCR4 (ENSBTAG00000011986) PLSCR1 (ENSBTAG00000031306) ENSBTAG00000054268 PLSCR2 (ENSBTAG00000022227) PLSCR5 (ENSBTAG00000005522) ENSBTAG00000053400 ZIC4 (ENSBTAG00000014749) ZIC1 (ENSBTAG00000014751) AGTR1 (ENSBTAG00000045633) ##22 CPB1 (ENSBTAG00000000456) CPA3 (ENSBTAG00000015008) GYG1 (ENSBTAG00000001721) HLTF (ENSBTAG00000019704) HPS3 (ENSBTAG00000002395) CP (ENSBTAG00000012164) TM4SF18 (ENSBTAG00000019960) TM4SF1 (ENSBTAG00000015163) TM4SF4 (ENSBTAG00000001893) WWTR1 (ENSBTAG00000007814) COMMD2 (ENSBTAG00000005068) ANKUB1 (ENSBTAG00000031346) RNF13 (ENSBTAG00000011147) PFN2 (ENSBTAG00000011150) TSC22D2 (ENSBTAG00000018402) Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES PCOLCE2 (ENSBIXG00005029362) ENSBIXG00005029331 PAQR9 (ENSBIXG00005029326) U2SURP (ENSBIXG00005029299) CHST2 (ENSBIXG00005029274) SLC9A9 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ZIC1 (ENSBBBG00000017580) ENSBBBG00000017587 ENSBBBG00000007463 AGTR1 (ENSBBBG00000007578) ##22 CPB1 (ENSBBBG00000017637) CPA3 (ENSBBBG00000017648) GYG1 (ENSBBBG00000017706) HLTF (ENSBBBG00000017803) HPS3 (ENSBBBG00000004398) CP (ENSBBBG00000017904) ENSBBBG00000017945 TM4SF18 (ENSBBBG00000017957) TM4SF1 (ENSBBBG00000017968) TM4SF4 (ENSBBBG00000017984) WWTR1 (ENSBBBG00000017998) COMMD2 (ENSBBBG00000008831) ANKUB1 (ENSBBBG00000018020) RNF13 (ENSBBBG00000004437) PFN2 (ENSBBBG00000018048) Siberian musk deer MODERN SPECIES 1183 PCOLCE2 (ENSMMSG00000005995) PAQR9 (ENSMMSG00000005982) U2SURP (ENSMMSG00000005820) CHST2 (ENSMMSG00000005775) SLC9A9 (ENSMMSG00000005673) DIPK2A (ENSMMSG00000005617) PLOD2 (ENSMMSG00000005367) PLSCR4 (ENSMMSG00000005249) ENSMMSG00000005202 ENSMMSG00000005158 PLSCR1 (ENSMMSG00000005107) PLSCR5 (ENSMMSG00000005079) ZIC4 (ENSMMSG00000005028) ZIC1 (ENSMMSG00000004996) ENSMMSG00000004963 AGTR1 (ENSMMSG00000004940) ##22 CPB1 (ENSMMSG00000004897) CPA3 (ENSMMSG00000004845) GYG1 (ENSMMSG00000018873) HLTF (ENSMMSG00000018794) HPS3 (ENSMMSG00000018734) CP (ENSMMSG00000018621) ENSMMSG00000018490 ENSMMSG00000018466 TM4SF18 (ENSMMSG00000018445) TM4SF1 (ENSMMSG00000018414) ENSMMSG00000018368 TM4SF4 (ENSMMSG00000018332) WWTR1 (ENSMMSG00000018305) ENSMMSG00000018286 ANKUB1 (ENSMMSG00000018220) Yarkand deer MODERN SPECIES 10 ENSCHYG00000012307 ENSCHYG00000012238 ENSCHYG00000012154 ENSCHYG00000012097 ENSCHYG00000011997 PLSCR5 (ENSCHYG00000011921) ZIC1 (ENSCHYG00000011861) ZIC4 (ENSCHYG00000011790) ENSCHYG00000011684 AGTR1 (ENSCHYG00000011650) ##22 CPB1 (ENSCHYG00000011567) CPA3 (ENSCHYG00000011461) ENSCHYG00000011392 HLTF (ENSCHYG00000011129) HPS3 (ENSCHYG00000010601) CP (ENSCHYG00000010330) ENSCHYG00000010218 ENSCHYG00000010188 TM4SF18 (ENSCHYG00000010146) TM4SF1 (ENSCHYG00000009987) TM4SF4 (ENSCHYG00000009908) WWTR1 (ENSCHYG00000009838) COMMD2 (ENSCHYG00000009780) ANKUB1 (ENSCHYG00000009675) RNF13 (ENSCHYG00000009540) Cetacea ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT00930000151314.f ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164931 ENSGT00940000154435.j.b.b ENSGT00940000154435.j.b.a ENSGT00940000154435.i ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT00940000165295 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00950000182878.b.a.c.a.a.b.o.a.a.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h Blue whale MODERN SPECIES 15 ENSBMSG00010003096 SLC9A9 (ENSBMSG00010003106) DIPK2A (ENSBMSG00010003121) ENSBMSG00010003130 ENSBMSG00010003139 ENSBMSG00010003145 PLOD2 (ENSBMSG00010003166) PLSCR4 (ENSBMSG00010003190) ENSBMSG00010003203 ENSBMSG00010000039 ENSBMSG00010000055 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ENSGT00940000155866 ENSGT00940000165295 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00950000182878.b.a.c.a.a.b.o.a.a.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h Sperm whale MODERN SPECIES PAQR9 (ENSPCTG00005000109) U2SURP (ENSPCTG00005000108) CHST2 (ENSPCTG00005000107) SLC9A9 (ENSPCTG00005000106) DIPK2A (ENSPCTG00005000105) ENSPCTG00005000104 PLOD2 (ENSPCTG00005000102) PLSCR4 (ENSPCTG00005000101) ENSPCTG00005000100 ENSPCTG00005000099 ENSPCTG00005000098 ENSPCTG00005000097 PLSCR5 (ENSPCTG00005000096) ENSPCTG00005000095 ZIC1 (ENSPCTG00005000094) AGTR1 (ENSPCTG00005000093) ##22 ENSPCTG00005000092 GYG1 (ENSPCTG00005000091) HLTF (ENSPCTG00005000090) HPS3 (ENSPCTG00005000089) CP (ENSPCTG00005000088) ENSPCTG00005000087 TM4SF18 (ENSPCTG00005000086) TM4SF1 (ENSPCTG00005000085) TM4SF4 (ENSPCTG00005000084) WWTR1 (ENSPCTG00005000083) COMMD2 (ENSPCTG00005000082) ANKUB1 (ENSPCTG00005000081) RNF13 (ENSPCTG00005000079) PFN2 (ENSPCTG00005000078) TSC22D2 (ENSPCTG00005000077) Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT00930000151314.f ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000154435.i ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00950000182878.b.a.c.a.a.b.o.a.a.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h ENSGT01030000236357 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00950000183010.a.b.a.a.a.a.b ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT00930000151314.f ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000154435.i ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00950000182878.b.a.c.a.a.b.o.a.a.b.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h ENSGT00940000153664.B Monodontidae ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT00930000151314.f ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000154435.i ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00950000182878.b.a.c.a.a.b.o.a.a.b.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h ENSGT00940000153664.B Beluga whale MODERN SPECIES 18 TRPC1 (ENSDLEG00000002901) PCOLCE2 (ENSDLEG00000002981) PAQR9 (ENSDLEG00000003008) U2SURP (ENSDLEG00000003020) CHST2 (ENSDLEG00000003050) ENSDLEG00000003055 SLC9A9 (ENSDLEG00000003069) CUNH3orf58 (ENSDLEG00000003079) ENSDLEG00000003088 PLOD2 (ENSDLEG00000003108) PLSCR4 (ENSDLEG00000003147) PLSCR1 (ENSDLEG00000003167) PLSCR5 (ENSDLEG00000003194) ZIC4 (ENSDLEG00000003202) ZIC1 (ENSDLEG00000003218) AGTR1 (ENSDLEG00000003225) ##22 CPB1 (ENSDLEG00000003229) CPA3 (ENSDLEG00000003258) GYG1 (ENSDLEG00000003273) HLTF (ENSDLEG00000003285) HPS3 (ENSDLEG00000003349) CP (ENSDLEG00000003394) TM4SF18 (ENSDLEG00000003412) TM4SF1 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PFN2 (ENSMMNG00015004026) TSC22D2 (ENSMMNG00015003998) Vaquita MODERN SPECIES 15 PCOLCE2 (ENSPSNG00000009157) PAQR9 (ENSPSNG00000009187) ENSPSNG00000009448 CHST2 (ENSPSNG00000011325) ENSPSNG00000011340 SLC9A9 (ENSPSNG00000011399) DIPK2A (ENSPSNG00000011433) ENSPSNG00000011500 PLOD2 (ENSPSNG00000011568) PLSCR4 (ENSPSNG00000011690) PLSCR1 (ENSPSNG00000011787) PLSCR5 (ENSPSNG00000011945) ENSPSNG00000012040 ZIC4 (ENSPSNG00000012068) ZIC1 (ENSPSNG00000012231) AGTR1 (ENSPSNG00000012278) ##22 CPB1 (ENSPSNG00000012386) CPA3 (ENSPSNG00000012509) GYG1 (ENSPSNG00000012650) HLTF (ENSPSNG00000012734) HPS3 (ENSPSNG00000012878) CP (ENSPSNG00000013223) TM4SF18 (ENSPSNG00000013475) TM4SF1 (ENSPSNG00000013533) TM4SF4 (ENSPSNG00000013608) WWTR1 (ENSPSNG00000013698) ENSPSNG00000013752 ENSPSNG00000013786 COMMD2 (ENSPSNG00000013838) ANKUB1 (ENSPSNG00000013900) RNF13 (ENSPSNG00000014075) Dolphin MODERN SPECIES 841 ENSTTRG00000009495 ##22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00950000183097.a.b 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ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h ENSGT00940000153664.B Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00950000185592 ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164931 ENSGT00940000154435 ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT00940000165295 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h ENSGT00940000153664.B Ursidae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00950000185592 ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164931 ENSGT00940000154435 ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT00940000165295 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00940000154942.h ENSGT00940000153664.B ENSGT00940000160465 Ursus ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00950000185592 ENSGT00940000161947 ENSGT00530000063516.a.a.d ENSGT00940000164931 ENSGT00940000154435 ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT00940000165295 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT00940000167707 ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00940000154942.h ENSGT00940000153664.B Polar bear MODERN SPECIES 112 PAQR9 (ENSUMAG00000012908) SLC9A9 (ENSUMAG00000012650) DIPK2A (ENSUMAG00000012620) ENSUMAG00000012607 PLOD2 (ENSUMAG00000012593) ENSUMAG00000012591 PLSCR4 (ENSUMAG00000012588) ENSUMAG00000012575 ENSUMAG00000012573 ENSUMAG00000012556 PLSCR1 (ENSUMAG00000012545) PLSCR5 (ENSUMAG00000012531) ENSUMAG00000012515 ZIC4 (ENSUMAG00000012491) ZIC1 (ENSUMAG00000012488) AGTR1 (ENSUMAG00000012460) ##22 CPB1 (ENSUMAG00000012435) CPA3 (ENSUMAG00000012432) GYG1 (ENSUMAG00000012408) HLTF (ENSUMAG00000012391) HPS3 (ENSUMAG00000012373) CP (ENSUMAG00000012358) ENSUMAG00000012344 TM4SF18 (ENSUMAG00000012340) TM4SF1 (ENSUMAG00000012335) ENSUMAG00000012330 TM4SF4 (ENSUMAG00000012321) WWTR1 (ENSUMAG00000012315) COMMD2 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ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164931 ENSGT00940000154435 ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674.m ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT00940000165295.a ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h ENSGT00940000153664.B American mink MODERN SPECIES 61 ZIC4 (ENSNVIG00000014149) ZIC1 (ENSNVIG00000014135) AGTR1 (ENSNVIG00000014110) ##22 CPB1 (ENSNVIG00000014069) CBPA3 (ENSNVIG00000014040) GYG1 (ENSNVIG00000013975) HLTF (ENSNVIG00000013881) HPS3 (ENSNVIG00000013838) CP (ENSNVIG00000013804) ENSNVIG00000013745 T4S18 (ENSNVIG00000013708) TM4SF1 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ENSGT00390000007965.f ENSGT00940000154942.h Dingo MODERN SPECIES 80 PAQR9 (ENSCAFG00020010463) U2SURP (ENSCAFG00020010497) CHST2 (ENSCAFG00020011451) SLC9A9 (ENSCAFG00020011470) DIPK2A (ENSCAFG00020011532) ENSCAFG00020011537 ENSCAFG00020011539 PLOD2 (ENSCAFG00020011739) PLSCR4 (ENSCAFG00020018835) ENSCAFG00020018841 PLSCR1 (ENSCAFG00020018849) PLSCR5 (ENSCAFG00020018852) ENSCAFG00020018869 ZIC4 (ENSCAFG00020018878) ZIC1 (ENSCAFG00020018881) AGTR1 (ENSCAFG00020018902) ##22 CPB1 (ENSCAFG00020018903) CPA3 (ENSCAFG00020018916) GYG1 (ENSCAFG00020018942) HLTF (ENSCAFG00020018945) HPS3 (ENSCAFG00020018969) CP (ENSCAFG00020019195) ENSCAFG00020020267 TM4SF18 (ENSCAFG00020020286) TM4SF1 (ENSCAFG00020020288) ENSCAFG00020020293 Dog MODERN SPECIES 15 U2SURP (ENSCAFG00845029146) CHST2 (ENSCAFG00845029239) SLC9A9 (ENSCAFG00845029260) DIPK2A (ENSCAFG00845019923) ENSCAFG00845019990 ENSCAFG00845020135 ENSCAFG00845020319 PLOD2 (ENSCAFG00845020429) PLSCR4 (ENSCAFG00845020987) ENSCAFG00845021095 PLSCR1 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(ENSVVUG00000011257) TM4SF4 (ENSVVUG00000011230) WWTR1 (ENSVVUG00000011160) COMMD2 (ENSVVUG00000011132) RNF13 (ENSVVUG00000011109) PFN2 (ENSVVUG00000011099) Felidae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00950000185592 ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164931 ENSGT00940000154435.e ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT00940000165295 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h.c ENSGT00940000153664.B Panthera ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00950000185592 ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164931 ENSGT00940000154435.e ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT00940000165295 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h.c ENSGT00940000153664.B Panthera_a ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00950000185592 ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164931 ENSGT00940000154435.e ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT00940000165295 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h.c ENSGT00940000153664.B leopard MODERN SPECIES 5 ATR (ENSPPRG00000003180) PLS1 (ENSPPRG00000002354) TRPC1 (ENSPPRG00000000533) PCOLCE2 (ENSPPRG00000000105) PAQR9 (ENSPPRG00000015091) U2SURP (ENSPPRG00000022258) SLC9A9 (ENSPPRG00000013496) DIPK2A (ENSPPRG00000012546) PLOD2 (ENSPPRG00000012277) PLSCR4 (ENSPPRG00000011790) ENSPPRG00000010848 ENSPPRG00000010322 PLSCR5 (ENSPPRG00000009681) ZIC4 (ENSPPRG00000008986) ZIC1 (ENSPPRG00000008236) AGTR1 (ENSPPRG00000014998) ##22 CPB1 (ENSPPRG00000007735) CPA3 (ENSPPRG00000007497) GYG1 (ENSPPRG00000007281) HLTF (ENSPPRG00000006271) HPS3 (ENSPPRG00000002181) CP (ENSPPRG00000001396) ENSPPRG00000000858 TM4SF18 (ENSPPRG00000000537) TM4SF1 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(ENSPLOG00000019319) Tiger MODERN SPECIES 242 ATR (ENSPTIG00000018572) PLS1 (ENSPTIG00000014589) TRPC1 (ENSPTIG00000009946) PCOLCE2 (ENSPTIG00000009436) U2SURP (ENSPTIG00000001167) CHST2 (ENSPTIG00000005139) SLC9A9 (ENSPTIG00000020998) ENSPTIG00000020674 PLOD2 (ENSPTIG00000018891) PLSCR4 (ENSPTIG00000017081) ENSPTIG00000016702 ENSPTIG00000015040 PLSCR5 (ENSPTIG00000014021) ZIC4 (ENSPTIG00000012876) ZIC1 (ENSPTIG00000012490) AGTR1 (ENSPTIG00000011825) ##22 CPB1 (ENSPTIG00000011527) CPA3 (ENSPTIG00000010908) GYG1 (ENSPTIG00000007857) HLTF (ENSPTIG00000020394) HPS3 (ENSPTIG00000017916) CP (ENSPTIG00000016162) ENSPTIG00000013550 TM4SF18 (ENSPTIG00000013093) TM4SF1 (ENSPTIG00000012525) TM4SF4 (ENSPTIG00000012425) WWTR1 (ENSPTIG00000010780) COMMD2 (ENSPTIG00000010520) ANKUB1 (ENSPTIG00000008912) RNF13 (ENSPTIG00000007326) PFN2 (ENSPTIG00000006381) Cat MODERN SPECIES 240 PCOLCE2 (ENSFCAG00000001007) PAQR9 (ENSFCAG00000024035) CHST2 (ENSFCAG00000022945) U2SURP (ENSFCAG00000012186) SLC9A9 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ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT00940000165295 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h ENSGT00940000153664.B Equus ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000154435 ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT00940000166511 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT00940000165295 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h ENSGT00940000153664.B Donkey MODERN SPECIES 13 PLS1 (ENSEASG00005000633) TRPC1 (ENSEASG00005000262) PCOLCE2 (ENSEASG00005000245) PAQR9 (ENSEASG00005000232) U2SURP (ENSEASG00005000213) CHST2 (ENSEASG00005024234) SLC9A9 (ENSEASG00005000191) DIPK2A (ENSEASG00005000184) PLOD2 (ENSEASG00005000164) PLSCR4 (ENSEASG00005000022) PLSCR1 (ENSEASG00005030899) PLSCR5 (ENSEASG00005021862) ZIC4 (ENSEASG00005031952) ZIC1 (ENSEASG00005021859) ENSEASG00005021856 AGTR1 (ENSEASG00005024073) ##22 CPB1 (ENSEASG00005021850) CPA3 (ENSEASG00005021848) GYG1 (ENSEASG00005021841) HLTF (ENSEASG00005021834) HPS3 (ENSEASG00005021830) CP (ENSEASG00005021826) ENSEASG00005021553 TM4SF18 (ENSEASG00005021427) TM4SF1 (ENSEASG00005021423) TM4SF4 (ENSEASG00005021420) WWTR1 (ENSEASG00005021415) COMMD2 (ENSEASG00005021413) ANKUB1 (ENSEASG00005038130) RNF13 (ENSEASG00005021404) PFN2 (ENSEASG00005021401) Horse MODERN SPECIES 7 TRPC1 (ENSECAG00000018048) PCOLCE2 (ENSECAG00000020485) PAQR9 (ENSECAG00000021863) U2SURP (ENSECAG00000022460) CHST2 (ENSECAG00000000982) SLC9A9 (ENSECAG00000006450) DIPK2A (ENSECAG00000009060) ENSECAG00000054798 PLOD2 (ENSECAG00000009297) PLSCR4 (ENSECAG00000060330) PLSCR1 (ENSECAG00000017295) PLSCR5 (ENSECAG00000019663) ZIC4 (ENSECAG00000020070) ZIC1 (ENSECAG00000020355) ENSECAG00000053335 AGTR1 (ENSECAG00000001279) ##22 CPB1 (ENSECAG00000021384) CPA3 (ENSECAG00000033607) GYG1 (ENSECAG00000023192) HLTF (ENSECAG00000024277) HPS3 (ENSECAG00000008073) CP (ENSECAG00000012064) CPHL1 (ENSECAG00000040185) TM4SF18 (ENSECAG00000018664) TM4SF1 (ENSECAG00000019071) TM4SF4 (ENSECAG00000020823) WWTR1 (ENSECAG00000021613) COMMD2 (ENSECAG00000022864) ANKUB1 (ENSECAG00000023137) RNF13 (ENSECAG00000023263) PFN2 (ENSECAG00000024742) Chiroptera ANCESTRAL SPECIES 68 ENSGT00940000155714 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000154435 ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT00940000165295 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h ENSGT00940000153664.B Megabat MODERN SPECIES 1108 AGTR1 (ENSPVAG00000014281) ##22 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000155714 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000154435 ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT00940000165295 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h ENSGT00940000153664.B Microbat MODERN SPECIES 987 ENSMLUG00000001038 PLSCR4 (ENSMLUG00000003563) PLSCR1 (ENSMLUG00000008749) PLSCR5 (ENSMLUG00000006403) ENSMLUG00000006618 ENSMLUG00000029495 ENSMLUG00000028293 ZIC4 (ENSMLUG00000012518) ZIC1 (ENSMLUG00000003411) ENSMLUG00000024034 ENSMLUG00000029616 ENSMLUG00000026078 AGTR1 (ENSMLUG00000001873) ##22 CPB1 (ENSMLUG00000007825) CPA3 (ENSMLUG00000007858) GYG1 (ENSMLUG00000006382) HLTF (ENSMLUG00000014077) ENSMLUG00000022401 HPS3 (ENSMLUG00000014082) CP (ENSMLUG00000001678) ENSMLUG00000023415 TM4SF18 (ENSMLUG00000004313) TM4SF1 (ENSMLUG00000010993) TM4SF4 (ENSMLUG00000017180) WWTR1 (ENSMLUG00000002531) COMMD2 (ENSMLUG00000014878) ANKUB1 (ENSMLUG00000006410) RNF13 (ENSMLUG00000008391) Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 11 PAQR9 (ENSRFEG00010005166) U2SURP (ENSRFEG00010005180) ENSRFEG00010005199 CHST2 (ENSRFEG00010005206) SLC9A9 (ENSRFEG00010005221) DIPK2A (ENSRFEG00010005250) ENSRFEG00010005260 PLOD2 (ENSRFEG00010005288) PLSCR4 (ENSRFEG00010005346) ENSRFEG00010005376 PLSCR1 (ENSRFEG00010005408) PLSCR5 (ENSRFEG00010005460) ZIC4 (ENSRFEG00010005534) ZIC1 (ENSRFEG00010005593) ENSRFEG00010005605 AGTR1 (ENSRFEG00010005628) ##22 CPB1 (ENSRFEG00010005647) CPA3 (ENSRFEG00010005703) ENSRFEG00010005735 GYG1 (ENSRFEG00010005772) HLTF (ENSRFEG00010005836) HPS3 (ENSRFEG00010006011) CP (ENSRFEG00010006210) ENSRFEG00010006508 TM4SF18 (ENSRFEG00010007025) TM4SF1 (ENSRFEG00010007070) TM4SF4 (ENSRFEG00010007100) WWTR1 (ENSRFEG00010007131) COMMD2 (ENSRFEG00010007155) ANKUB1 (ENSRFEG00010007185) RNF13 (ENSRFEG00010007291) Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164931 ENSGT00940000154435 ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT00940000165295 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h ENSGT00940000153664.B Primates ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164931 ENSGT00940000154435.p ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT00940000165295 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h ENSGT00940000153664.B Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164931 ENSGT00940000154435.o.a ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT00940000165295 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h ENSGT00940000153664.B Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164931 ENSGT00940000154435.o.a ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT00940000165295 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h ENSGT00940000153664.B Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES 77 ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164931 ENSGT00940000154435.o.b ENSGT00940000154435.o.a ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h ENSGT00940000153664.B ENSGT00940000160465 Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 1425 AGTR1 (ENSPSMG00000007773) ##22 CPB1 (ENSPSMG00000007764) CPA3 (ENSPSMG00000007756) GYG1 (ENSPSMG00000007740) HLTF (ENSPSMG00000007621) HPS3 (ENSPSMG00000007483) CP (ENSPSMG00000007442) ENSPSMG00000007390 ENSPSMG00000007379 TM4SF18 (ENSPSMG00000007374) TM4SF1 (ENSPSMG00000007359) TM4SF4 (ENSPSMG00000007321) WWTR1 (ENSPSMG00000007316) COMMD2 (ENSPSMG00000007296) ANKUB1 (ENSPSMG00000007279) RNF13 (ENSPSMG00000007264) Coquerels sifaka MODERN SPECIES 274 ZIC4 (ENSPCOG00000012436) ZIC1 (ENSPCOG00000017619) 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WWTR1 (ENSOGAG00000029861) Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164931 ENSGT00940000154435.p ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT00940000165295 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h ENSGT00940000153664.B.k.a Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164931 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ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT00910000147832 ENSGT00390000013230 ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164933 ENSGT00940000154435.p ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674.i.a.a ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h.q.a ENSGT00940000153664.B.k.a ENSGT00940000160465 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT00910000147832 ENSGT00390000013230 ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164933 ENSGT00940000154435.p 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WWTR1 (ENSMFAG00000031777) ENSMFAG00000062927 COMMD2 (ENSMFAG00000064614) Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164933 ENSGT00940000164931 ENSGT00940000154435.p ENSGT00940000161728 ENSGT00390000004380.m.b ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674.i.a.a ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h.q.a ENSGT00940000153664.B.k.a ENSGT00940000160465 Olive baboon MODERN SPECIES 11 ENSPANG00000039164 ENSPANG00000038918 DIPK2A (ENSPANG00000017827) ENSPANG00000015415 ENSPANG00000048643 ENSPANG00000048692 PLOD2 (ENSPANG00000020900) PLSCR4 (ENSPANG00000019530) ENSPANG00000043123 ENSPANG00000039550 PLSCR1 (ENSPANG00000018880) PLSCR5 (ENSPANG00000023164) ENSPANG00000033699 ZIC4 (ENSPANG00000024745) ZIC1 (ENSPANG00000005804) AGTR1 (ENSPANG00000002853) ##22 CPB1 (ENSPANG00000015081) CPA3 (ENSPANG00000023231) ENSPANG00000025217 HLTF (ENSPANG00000009264) HPS3 (ENSPANG00000017455) CP (ENSPANG00000019531) TM4SF18 (ENSPANG00000026217) TM4SF1 (ENSPANG00000039765) TM4SF4 (ENSPANG00000009384) WWTR1 (ENSPANG00000006008) COMMD2 (ENSPANG00000025218) ANKUB1 (ENSPANG00000013122) ENSPANG00000041361 RNF13 (ENSPANG00000021037) ENSPANG00000009265 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 81 ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164933 ENSGT00940000154435.p ENSGT00940000161728 ENSGT00390000004380.m.a.a.a.a ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674.i.a.a ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT00910000146673 ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h.q.a ENSGT00940000153664.B.k.a ENSGT00940000160465 Drill MODERN SPECIES 341 AGTR1 (ENSMLEG00000036265) ##22 CPB1 (ENSMLEG00000021063) CPA3 (ENSMLEG00000037447) GYG1 (ENSMLEG00000029835) HLTF (ENSMLEG00000029059) ENSMLEG00000023583 ENSMLEG00000028026 HPS3 (ENSMLEG00000040824) CP (ENSMLEG00000027209) TM4SF18 (ENSMLEG00000037034) ENSMLEG00000019692 TM4SF4 (ENSMLEG00000039948) WWTR1 (ENSMLEG00000036019) COMMD2 (ENSMLEG00000043537) ANKUB1 (ENSMLEG00000042185) RNF13 (ENSMLEG00000042049) Sooty mangabey MODERN SPECIES 120 IPO7 (ENSCATG00000042452) ZNF143 (ENSCATG00000035571) ENSCATG00000029419 WEE1 (ENSCATG00000033804) ENSCATG00000022086 SWAP70 (ENSCATG00000040545) SBF2 (ENSCATG00000039616) PLOD2 (ENSCATG00000041420) PLSCR4 (ENSCATG00000037688) PLSCR2 (ENSCATG00000036287) PLSCR1 (ENSCATG00000045303) PLSCR5 (ENSCATG00000030014) ENSCATG00000012480 ZIC4 (ENSCATG00000030079) ZIC1 (ENSCATG00000042962) AGTR1 (ENSCATG00000042957) ##22 CPB1 (ENSCATG00000036137) CPA3 (ENSCATG00000033057) GYG1 (ENSCATG00000041913) HLTF (ENSCATG00000043955) ENSCATG00000041142 Vervet Monkey MODERN SPECIES 6 PLS1 (ENSCSAG00000011290) TRPC1 (ENSCSAG00000011302) PCOLCE2 (ENSCSAG00000011308) PAQR9 (ENSCSAG00000018908) U2SURP (ENSCSAG00000011321) CHST2 (ENSCSAG00000018906) SLC9A9 (ENSCSAG00000011341) DIPK2A (ENSCSAG00000011348) PLOD2 (ENSCSAG00000011365) PLSCR4 (ENSCSAG00000011376) PLSCR2 (ENSCSAG00000011381) PLSCR1 (ENSCSAG00000011390) PLSCR5 (ENSCSAG00000011398) ZIC4 (ENSCSAG00000011405) ZIC1 (ENSCSAG00000011409) AGTR1 (ENSCSAG00000011417) ##22 CPB1 (ENSCSAG00000011424) CPA3 (ENSCSAG00000011433) GYG1 (ENSCSAG00000011436) HLTF (ENSCSAG00000011449) ENSCSAG00000018904 HPS3 (ENSCSAG00000011461) CP (ENSCSAG00000011475) TM4SF18 (ENSCSAG00000011485) TM4SF1 (ENSCSAG00000011494) TM4SF4 (ENSCSAG00000011499) WWTR1 (ENSCSAG00000011508) COMMD2 (ENSCSAG00000011515) ANKUB1 (ENSCSAG00000011527) RNF13 (ENSCSAG00000011538) ENSCSAG00000011544 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 348 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674.i.a.a ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT00910000146673 ENSGT00940000153311.a.b.a.fb.b ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h.q.a ENSGT00940000153664.B.k.b Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1832 ENSRROG00000041420 AGTR1 (ENSRROG00000031154) ##22 CPB1 (ENSRROG00000032160) CPA3 (ENSRROG00000031917) GYG1 (ENSRROG00000035996) HLTF (ENSRROG00000028898) HPS3 (ENSRROG00000009620) CP (ENSRROG00000042142) Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1856 AGTR1 (ENSRBIG00000041468) ##22 CPB1 (ENSRBIG00000032988) CPA3 (ENSRBIG00000031558) GYG1 (ENSRBIG00000041646) HLTF (ENSRBIG00000015981) HPS3 (ENSRBIG00000024625) ENSRBIG00000030284 CP (ENSRBIG00000040705) TM4SF18 (ENSRBIG00000034512) ENSRBIG00000040640 ENSRBIG00000041143 TM4SF4 (ENSRBIG00000031572) WWTR1 (ENSRBIG00000032755) COMMD2 (ENSRBIG00000031068) ANKUB1 (ENSRBIG00000031588) RNF13 (ENSRBIG00000040404) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164931 ENSGT00940000164933.a ENSGT00940000154435.p ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674.i.a ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT00940000165295 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h ENSGT00940000153664.B.k.a Cebidae ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164931 ENSGT00940000164933.a ENSGT00940000154435.p ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674.i.a ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT00940000165295 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h ENSGT00940000153664.B.k.b Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164931 ENSGT00940000164933.a ENSGT00940000154435.p ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674.i.a ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT00940000165295 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h ENSGT00940000153664.B.k.b Capuchin MODERN SPECIES 30 PAQR9 (ENSCCAG00000029369) U2SURP (ENSCCAG00000032530) CHST2 (ENSCCAG00000020600) SLC9A9 (ENSCCAG00000034947) DIPK2A (ENSCCAG00000020146) PLOD2 (ENSCCAG00000025733) PLSCR4 (ENSCCAG00000022476) ENSCCAG00000024980 PLSCR2 (ENSCCAG00000021427) PLSCR1 (ENSCCAG00000033563) PLSCR5 (ENSCCAG00000026895) ENSCCAG00000034914 ZIC4 (ENSCCAG00000020073) ZIC1 (ENSCCAG00000006506) ENSCCAG00000020167 AGTR1 (ENSCCAG00000037143) ##22 CPB1 (ENSCCAG00000030852) CPA3 (ENSCCAG00000020019) GYG1 (ENSCCAG00000010480) HLTF (ENSCCAG00000026957) HPS3 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PCOLCE2 (ENSANAG00000033412) U2SURP (ENSANAG00000035774) CHST2 (ENSANAG00000015893) SLC9A9 (ENSANAG00000020698) DIPK2A (ENSANAG00000037040) PLOD2 (ENSANAG00000030377) PLSCR4 (ENSANAG00000003079) ENSANAG00000030475 PLSCR1 (ENSANAG00000014304) PLSCR5 (ENSANAG00000027235) ZIC4 (ENSANAG00000036933) ZIC1 (ENSANAG00000032455) ENSANAG00000028319 ENSANAG00000029069 AGTR1 (ENSANAG00000022846) ##22 CPB1 (ENSANAG00000036172) CPA3 (ENSANAG00000035981) GYG1 (ENSANAG00000036809) HLTF (ENSANAG00000036474) HPS3 (ENSANAG00000019165) CP (ENSANAG00000030125) ENSANAG00000023000 ENSANAG00000021775 TM4SF18 (ENSANAG00000001190) TM4SF1 (ENSANAG00000029637) ENSANAG00000021676 TM4SF4 (ENSANAG00000038134) WWTR1 (ENSANAG00000029620) COMMD2 (ENSANAG00000023648) ANKUB1 (ENSANAG00000037045) Tarsier MODERN SPECIES 7068 AGTR1 (ENSTSYG00000013739) ##22 ENSTSYG00000029085 CPB1 (ENSTSYG00000008691) CPA3 (ENSTSYG00000008726) GYG1 (ENSTSYG00000014643) HLTF (ENSTSYG00000014645) HPS3 (ENSTSYG00000007054) CP (ENSTSYG00000007058) TM4SF18 (ENSTSYG00000008564) TM4SF1 (ENSTSYG00000001599) ENSTSYG00000027277 GPR68 (ENSTSYG00000030742) CCDC88C (ENSTSYG00000030602) PPP4R3A (ENSTSYG00000010333) CATSPERB (ENSTSYG00000006430) TC2N (ENSTSYG00000014187) Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164931 ENSGT00940000154435 ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h ENSGT00940000153664.B ENSGT00940000160465 Glires ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164931 ENSGT00940000154435 ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h ENSGT00940000153664.B ENSGT00940000160465 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000155714 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164931 ENSGT00940000154435.n ENSGT00940000154435.m.a ENSGT00940000161728 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674.c ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h ENSGT00940000153664.B ENSGT00940000160465 Rabbit MODERN SPECIES 5 U2SURP (ENSOCUG00000012121) CHST2 (ENSOCUG00000012132) SLC9A9 (ENSOCUG00000009911) DIPK2A (ENSOCUG00000012616) ENSOCUG00000038414 PLOD2 (ENSOCUG00000001461) PLSCR4 (ENSOCUG00000015564) ENSOCUG00000023944 ENSOCUG00000029550 ENSOCUG00000012892 PLSCR5 (ENSOCUG00000002500) ENSOCUG00000037397 ZIC4 (ENSOCUG00000010959) ENSOCUG00000021417 ENSOCUG00000026392 AGTR1 (ENSOCUG00000025557) ##22 CPB1 (ENSOCUG00000003084) CPA3 (ENSOCUG00000032097) ENSOCUG00000007320 ENSOCUG00000003516 HLTF (ENSOCUG00000003520) HPS3 (ENSOCUG00000003526) CP (ENSOCUG00000003535) TM4SF18 (ENSOCUG00000003542) ENSOCUG00000003545 TM4SF1 (ENSOCUG00000027275) ENSOCUG00000022512 TM4SF4 (ENSOCUG00000013741) WWTR1 (ENSOCUG00000013750) COMMD2 (ENSOCUG00000002638) ANKUB1 (ENSOCUG00000002642) Rodentia ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000154435.l ENSGT00940000164931 ENSGT00940000154435.k ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h ENSGT00940000153664.B ENSGT00940000160465 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000154435.l ENSGT00940000154435.k ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h ENSGT00940000153664.B ENSGT00940000160465 Kangaroo rat MODERN SPECIES 443 ENSDORG00000025570 ENSDORG00000029879 ENSDORG00000023219 Gk5 (ENSDORG00000023582) Xrn1 (ENSDORG00000013833) Atr (ENSDORG00000000389) Pls1 (ENSDORG00000009841) Trpc1 (ENSDORG00000013958) Pcolce2 (ENSDORG00000013959) ENSDORG00000005201 Slc9a9 (ENSDORG00000011135) ENSDORG00000028495 Plod2 (ENSDORG00000003217) 1700057G04Rik (ENSDORG00000014306) Plscr5 (ENSDORG00000028115) ENSDORG00000024749 ##22 Cpb1 (ENSDORG00000001786) Cpa3 (ENSDORG00000001789) Gyg (ENSDORG00000016120) Hltf (ENSDORG00000016121) Hps3 (ENSDORG00000001208) Cp (ENSDORG00000001212) Tm4sf1 (ENSDORG00000000505) Tm4sf4 (ENSDORG00000029592) Commd2 (ENSDORG00000006954) ENSDORG00000014273 ENSDORG00000014274 ENSDORG00000026457 Eif2a (ENSDORG00000012408) Selenot (ENSDORG00000024406) Siah2 (ENSDORG00000023835) Myomorpha ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00900000143480 ENSGT00940000155866 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h ENSGT00940000153664.B Muroidea DUPLICATION Muroidea ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT01050000244888.b.a.c.b.g ##22 ENSGT00390000001014 ENSGT00940000157153 ENSGT00940000159059 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ENSCGRG00001000139 ENSCGRG00001009851 Golden Hamster MODERN SPECIES 623 ENSMAUG00000002270 Prl3a1 (ENSMAUG00000001809) ENSMAUG00000001287 Prl2b1 (ENSMAUG00000001042) Prl7a2 (ENSMAUG00000000812) Prl7d1 (ENSMAUG00000000638) Prl2a1 (ENSMAUG00000000491) ENSMAUG00000000360 Prl4a1 (ENSMAUG00000018200) Prl5a1 (ENSMAUG00000018024) Sox4 (ENSMAUG00000001434) Cdkal1 (ENSMAUG00000020796) E2f3 (ENSMAUG00000019714) ENSMAUG00000018470 Mboat1 (ENSMAUG00000017913) Agtr1a (ENSMAUG00000017279) ##22 Uqcrfs1 (ENSMAUG00000016767) Dusp22 (ENSMAUG00000016397) Irf4 (ENSMAUG00000015575) Exoc2 (ENSMAUG00000015195) ENSMAUG00000014057 ENSMAUG00000013208 Foxq1 (ENSMAUG00000018519) Foxf2 (ENSMAUG00000012470) Foxc1 (ENSMAUG00000018460) Gmds (ENSMAUG00000011976) Mylk4 (ENSMAUG00000011053) Wrnip1 (ENSMAUG00000009914) ENSMAUG00000009659 ENSMAUG00000009345 ENSMAUG00000009098 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00950000182818.A.f.a.a.b ENSGT00950000182818.A.f.b.b.a.b ENSGT00950000182818.A.f.a.a.a.b.b.a 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Prl5a1 (ENSPEMG00000022650) ENSPEMG00000026740 Sox4 (ENSPEMG00000013688) Cdkal1 (ENSPEMG00000009808) E2f3 (ENSPEMG00000011070) Mboat1 (ENSPEMG00000028788) Agtr1a (ENSPEMG00000029887) ##22 Uqcrfs1 (ENSPEMG00000012221) Dusp22 (ENSPEMG00000012769) Irf4 (ENSPEMG00000012922) Exoc2 (ENSPEMG00000014307) Hus1b (ENSPEMG00000013275) ENSPEMG00000023016 Foxq1 (ENSPEMG00000029927) Foxf2 (ENSPEMG00000017102) Foxc1 (ENSPEMG00000025795) Gmds (ENSPEMG00000018701) ENSPEMG00000000084 Wrnip1 (ENSPEMG00000000543) ENSPEMG00000030799 ENSPEMG00000003771 ENSPEMG00000024282 Murinae ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00950000182818.A.f.a.a.b.a.a.b ENSGT00950000182818.A.f.a.a.a.a ENSGT00950000182818.A.f.a.a.a.b.b.a ENSGT00950000182818.A.f.a.a.a.b.b.b ENSGT00950000182818.A.f.a.a.a.b.a.b ENSGT00950000182818.A.f.a.a.a.b.a.a ENSGT00950000182818.A.f.b.b.a.a.b ENSGT00950000182818.A.f.b.b.a.a.a ENSGT00950000182818.A.f.b.b.b ENSGT00950000182818.A.f.b.a.b.b ENSGT00950000182818.A.f.b.a.b.a ENSGT00940000161470 ENSGT00940000155952 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ENSGT00940000156211.b ENSGT00390000008538 ENSGT01000000215059 ENSGT00940000154573.k.a ENSGT00940000154573.k.b Mus_B ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00950000182818.A.f.a.a.b.a.a.b ENSGT00950000182818.A.f.a.a.b.b ENSGT00950000182818.A.f.a.a.a.a ENSGT00950000182818.A.f.a.a.a.b.b.a ENSGT00950000182818.A.f.a.a.a.b.b.b ENSGT00950000182818.A.f.a.a.a.b.a.b ENSGT00950000182818.A.f.a.a.a.b.a.a ENSGT00950000182818.A.f.b.b.a.a.b ENSGT00950000182818.A.f.b.b.a.a.a.c ENSGT00950000182818.A.f.b.b.b ENSGT00950000182818.A.f.b.a.b.b ENSGT00940000161470 ENSGT00940000155952 ENSGT00940000155115.a.a ENSGT01030000234564.a.a.a.a.a ENSGT01050000244888.b.a.c.b.g ##22 ENSGT00390000001014 ENSGT00940000157153 ENSGT00940000159059 ENSGT00390000010872 ENSGT00860000135627 ENSGT00860000135685 ENSGT00940000162937.b ENSGT00940000162527 ENSGT00940000162303.b ENSGT00440000033640 ENSGT00940000156211.b ENSGT00390000008538 ENSGT01000000215059 ENSGT00940000154573.k.a ENSGT00940000154573.l Mouse MODERN SPECIES 4 Prl8a9 (ENSMUSG00000006490) Prl8a1 (ENSMUSG00000019756) Prl7b1 (ENSMUSG00000021347) Prl7a1 (ENSMUSG00000006488) Prl7a2 (ENSMUSG00000046899) Prl7d1 (ENSMUSG00000021348) Prl7c1 (ENSMUSG00000060738) Prl2a1 (ENSMUSG00000022886) Prl2c1 (ENSMUSG00000062551) Prl4a1 (ENSMUSG00000005891) Prl5a1 (ENSMUSG00000017064) Sox4 (ENSMUSG00000076431) Cdkal1 (ENSMUSG00000006191) E2f3 (ENSMUSG00000016477) Mboat1 (ENSMUSG00000038732) Agtr1a (ENSMUSG00000049115) ##22 Uqcrfs1 (ENSMUSG00000038462) Dusp22 (ENSMUSG00000069255) Irf4 (ENSMUSG00000021356) Exoc2 (ENSMUSG00000021357) Hus1b (ENSMUSG00000076430) Foxq1 (ENSMUSG00000038415) Foxf2 (ENSMUSG00000038402) Foxc1 (ENSMUSG00000050295) Gmds (ENSMUSG00000038372) Mylk4 (ENSMUSG00000044951) Wrnip1 (ENSMUSG00000021400) Serpinb1a (ENSMUSG00000044734) Serpinb1c (ENSMUSG00000079049) Serpinb6b (ENSMUSG00000042842) Serpinb9 (ENSMUSG00000045827) Mus_C ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00950000182818.A.f.a.a.b.a.a.b ENSGT00950000182818.A.f.a.a.b.b ENSGT00950000182818.A.f.a.a.a.a ENSGT00950000182818.A.f.a.a.a.b.b.a ENSGT00950000182818.A.f.a.a.a.b.b.b ENSGT00950000182818.A.f.a.a.a.b.a.b ENSGT00950000182818.A.f.a.a.a.b.a.a ENSGT00950000182818.A.f.b.b.a.a.b ENSGT00950000182818.A.f.b.b.a.a.a.c ENSGT00950000182818.A.f.b.b.b ENSGT00950000182818.A.f.b.a.b.b ENSGT00940000161470 ENSGT00940000155952 ENSGT00940000155115.a.a ENSGT01030000234564.a.a.a.a.a ENSGT01050000244888.b.a.c.b.g ##22 ENSGT00390000001014 ENSGT00940000157153 ENSGT00940000159059 ENSGT00390000010872 ENSGT00860000135627 ENSGT00860000135685 ENSGT00940000162937.b ENSGT00940000162527 ENSGT00940000162303.b ENSGT00440000033640 ENSGT00940000156211.b ENSGT00390000008538 ENSGT01000000215059 ENSGT00940000154573.k.a ENSGT00940000154573.l spretus MODERN SPECIES 4 Prl7a2 (MGP_SPRETEiJ_G0019244) Prl7d1 (MGP_SPRETEiJ_G0019245) Prl7c1 (MGP_SPRETEiJ_G0019246) Prl2a1 (MGP_SPRETEiJ_G0019247) MGP_SPRETEiJ_G0019248 MGP_SPRETEiJ_G0019251 MGP_SPRETEiJ_G0019250 MGP_SPRETEiJ_G0019249 Prl4a1 (MGP_SPRETEiJ_G0019252) MGP_SPRETEiJ_G0019253 Prl5a1 (MGP_SPRETEiJ_G0019254) Sox4 (MGP_SPRETEiJ_G0019255) Cdkal1 (MGP_SPRETEiJ_G0019256) E2f3 (MGP_SPRETEiJ_G0019257) Mboat1 (MGP_SPRETEiJ_G0019258) Agtr1a (MGP_SPRETEiJ_G0019259) ##22 Uqcrfs1 (MGP_SPRETEiJ_G0019260) Dusp22 (MGP_SPRETEiJ_G0019261) Irf4 (MGP_SPRETEiJ_G0019262) Exoc2 (MGP_SPRETEiJ_G0019263) Hus1b (MGP_SPRETEiJ_G0019264) MGP_SPRETEiJ_G0019265 MGP_SPRETEiJ_G0019266 Foxq1 (MGP_SPRETEiJ_G0019267) Foxf2 (MGP_SPRETEiJ_G0019268) Foxc1 (MGP_SPRETEiJ_G0019269) Gmds (MGP_SPRETEiJ_G0019270) MGP_SPRETEiJ_G0019271 Wrnip1 (MGP_SPRETEiJ_G0019272) MGP_SPRETEiJ_G0019273 MGP_SPRETEiJ_G0019274 Steppe mouse MODERN SPECIES 3125 Sox4 (ENSMSIG00000003950) ENSMSIG00000003925 Cdkal1 (ENSMSIG00000003744) E2f3 (ENSMSIG00000003621) Mboat1 (ENSMSIG00000003528) Agtr1a (ENSMSIG00000003511) ##22 ENSMSIG00000003491 ENSMSIG00000003474 Ryukyu mouse MODERN SPECIES 4 Prl7a2 (MGP_CAROLIEiJ_G0018375) Prl7d1 (MGP_CAROLIEiJ_G0018376) Prl7c1 (MGP_CAROLIEiJ_G0018377) Prl2a1 (MGP_CAROLIEiJ_G0018378) MGP_CAROLIEiJ_G0018379 MGP_CAROLIEiJ_G0018382 MGP_CAROLIEiJ_G0018380 MGP_CAROLIEiJ_G0018381 MGP_CAROLIEiJ_G0018383 Prl4a1 (MGP_CAROLIEiJ_G0018384) Prl5a1 (MGP_CAROLIEiJ_G0018385) Sox4 (MGP_CAROLIEiJ_G0018386) Cdkal1 (MGP_CAROLIEiJ_G0018387) E2f3 (MGP_CAROLIEiJ_G0018388) Mboat1 (MGP_CAROLIEiJ_G0018389) Agtr1a (MGP_CAROLIEiJ_G0018390) ##22 Uqcrfs1 (MGP_CAROLIEiJ_G0018391) Dusp22 (MGP_CAROLIEiJ_G0018392) Irf4 (MGP_CAROLIEiJ_G0018393) Exoc2 (MGP_CAROLIEiJ_G0018394) Hus1b (MGP_CAROLIEiJ_G0018395) MGP_CAROLIEiJ_G0018396 MGP_CAROLIEiJ_G0018397 Foxq1 (MGP_CAROLIEiJ_G0018398) Foxf2 (MGP_CAROLIEiJ_G0018399) Foxc1 (MGP_CAROLIEiJ_G0018400) Gmds (MGP_CAROLIEiJ_G0018401) MGP_CAROLIEiJ_G0018402 Wrnip1 (MGP_CAROLIEiJ_G0018403) MGP_CAROLIEiJ_G0018404 Serpinb1a (MGP_CAROLIEiJ_G0018405) Shrew mouse MODERN SPECIES 7 MGP_PahariEiJ_G0019440 Prl7a2 (MGP_PahariEiJ_G0019441) Prl7d1 (MGP_PahariEiJ_G0019442) Prl7c1 (MGP_PahariEiJ_G0019443) Prl2a1 (MGP_PahariEiJ_G0019444) MGP_PahariEiJ_G0019445 MGP_PahariEiJ_G0019448 MGP_PahariEiJ_G0019446 MGP_PahariEiJ_G0019447 Prl4a1 (MGP_PahariEiJ_G0019449) Prl5a1 (MGP_PahariEiJ_G0019450) Sox4 (MGP_PahariEiJ_G0019451) Cdkal1 (MGP_PahariEiJ_G0019452) E2f3 (MGP_PahariEiJ_G0019453) Mboat1 (MGP_PahariEiJ_G0019454) Agtr1a (MGP_PahariEiJ_G0019455) ##22 Uqcrfs1 (MGP_PahariEiJ_G0019456) Dusp22 (MGP_PahariEiJ_G0019457) Irf4 (MGP_PahariEiJ_G0019458) Exoc2 (MGP_PahariEiJ_G0019459) Hus1b (MGP_PahariEiJ_G0019460) MGP_PahariEiJ_G0019461 Foxq1 (MGP_PahariEiJ_G0019462) Foxf2 (MGP_PahariEiJ_G0019463) Foxc1 (MGP_PahariEiJ_G0019464) Gmds (MGP_PahariEiJ_G0019465) MGP_PahariEiJ_G0019466 Wrnip1 (MGP_PahariEiJ_G0019467) MGP_PahariEiJ_G0019468 Serpinb1a (MGP_PahariEiJ_G0019469) MGP_PahariEiJ_G0019470 Rat MODERN SPECIES 8 Prl7a3 (ENSRNOG00000016616) Prl7d1 (ENSRNOG00000016510) Prl7c1 (ENSRNOG00000047649) Prl2a1 (ENSRNOG00000016463) Prl2c1 (ENSRNOG00000039058) Prl4a1 (ENSRNOG00000016436) Prl5a1 (ENSRNOG00000016307) Prl5a2 (ENSRNOG00000039075) Sox4 (ENSRNOG00000065643) ENSRNOG00000065771 Cdkal1 (ENSRNOG00000018381) RGD1561310 (ENSRNOG00000062739) ENSRNOG00000062512 E2f3 (ENSRNOG00000029273) Mboat1 (ENSRNOG00000027125) Agtr1a (ENSRNOG00000018346) ##22 ENSRNOG00000070855 Uqcrfs1 (ENSRNOG00000018281) Dusp22 (ENSRNOG00000056376) Irf4 (ENSRNOG00000061070) Exoc2 (ENSRNOG00000060266) Foxq1 (ENSRNOG00000062314) Foxf2 (ENSRNOG00000063796) Foxc1 (ENSRNOG00000070919) Gmds (ENSRNOG00000017605) Mylk4 (ENSRNOG00000070083) ENSRNOG00000063699 Wrnip1 (ENSRNOG00000017040) Serpinb1a (ENSRNOG00000016581) Serpinb6b (ENSRNOG00000016420) Serpinb9 (ENSRNOG00000033772) Muroidea ANCESTRAL SPECIES 44 ENSGT01050000244888.b.a.c.b.h ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00900000143480 ENSGT00940000155866 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h ENSGT00940000153664.B Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 1415 Hhip (ENSNGAG00000016947) ENSNGAG00000014163 Agtr1b (ENSNGAG00000018677) ##22 Cpb1 (ENSNGAG00000011572) Cpa3 (ENSNGAG00000007285) ENSNGAG00000020600 Hltf (ENSNGAG00000018333) Hps3 (ENSNGAG00000019595) Cp (ENSNGAG00000022941) ENSNGAG00000022257 Tm4sf1 (ENSNGAG00000021173) Tm4sf4 (ENSNGAG00000007462) Wwtr1 (ENSNGAG00000017893) Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000155708 ENSGT00940000163015 ENSGT00940000182224 ENSGT00950000183196.B ENSGT00940000155015 ENSGT00390000016029 ENSGT00940000157005 ENSGT01100000263484.C.b.a ENSGT01070000253816.b ENSGT00940000156699 ENSGT00940000156299 ENSGT00390000015332 ENSGT00940000155789 ENSGT01030000234598.a.b ENSGT00940000153421.a.b ENSGT01050000244888.b.a.c.b.h ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00900000143480 ENSGT00940000155866 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000154509.xc.a ENSGT00390000003738.a.b ENSGT00940000155708 ENSGT00950000183196.B ENSGT00940000155015 ENSGT00390000016029 ENSGT00940000157005 ENSGT01100000263484.C.b.a ENSGT01070000253816.b ENSGT00940000156699 ENSGT00940000156299 ENSGT00390000015332 ENSGT00940000155789 ENSGT01030000234598.a.b ENSGT00940000153421.a.b ENSGT01050000244888.b.a.c.b.h ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00900000143480 ENSGT00940000155866 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES 55 ENSGT00940000154509.xc.a ENSGT00390000003738.a.b ENSGT00940000155708 ENSGT00950000183196.B ENSGT00940000155015 ENSGT00390000016029 ENSGT00940000157005 ENSGT01100000263484.C.b.a ENSGT01070000253816.b ENSGT00940000156699 ENSGT00940000156299 ENSGT00390000015332 ENSGT00940000155789 ENSGT01030000234598.a.b ENSGT00940000153421.a.b ENSGT01050000244888.b.a.c.b.h ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 Prairie vole DUPLICATION Prairie vole MODERN SPECIES Fat4 (ENSMOCG00000018552) Ankrd50 (ENSMOCG00000004523) Slc2a2 (ENSMOCG00000016334) Tnik (ENSMOCG00000002021) Pld1 (ENSMOCG00000019861) Tmem212 (ENSMOCG00000014617) Fndc3b (ENSMOCG00000018057) Ghsr (ENSMOCG00000010453) Tnfsf10 (ENSMOCG00000001683) Nceh1 (ENSMOCG00000021848) Ect2 (ENSMOCG00000016900) Spata16 (ENSMOCG00000014167) Nlgn1 (ENSMOCG00000006420) Tbl1xr1 (ENSMOCG00000022629) ENSMOCG00000006252 ENSMOCG00000007296 ##22 Cpb1 (ENSMOCG00000020527) Cpa3 (ENSMOCG00000020637) Gyg (ENSMOCG00000013677) Hltf (ENSMOCG00000019747) Hps3 (ENSMOCG00000010766) Cp (ENSMOCG00000016138) ENSMOCG00000019158 ENSMOCG00000017600 Lamb1 (ENSMOCG00000014282) Dld (ENSMOCG00000021009) Slc26a3 (ENSMOCG00000019595) Cbll1 (ENSMOCG00000016689) Slc26a4 (ENSMOCG00000022260) Bcap29 (ENSMOCG00000002261) Dus4l (ENSMOCG00000019344) Prairie vole MODERN SPECIES 3 ENSMOCG00000010680 Prl2b1 (ENSMOCG00000020413) Prl7a1 (ENSMOCG00000002066) Prl7a2 (ENSMOCG00000006151) Prl7d1 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ENSPEMG00000030574 ENSPEMG00000023072 ENSPEMG00000023778 ENSPEMG00000022198 Agtr1b (ENSPEMG00000026806) ##22 Cpb1 (ENSPEMG00000015871) Cpa3 (ENSPEMG00000000978) Gyg (ENSPEMG00000016029) Hltf (ENSPEMG00000016172) Hps3 (ENSPEMG00000006862) Cp (ENSPEMG00000013146) ENSPEMG00000026230 ENSPEMG00000025409 ENSPEMG00000013052 ENSPEMG00000008579 ENSPEMG00000025311 Anxa5 (ENSPEMG00000015439) ENSPEMG00000026454 ENSPEMG00000001402 Qrfpr (ENSPEMG00000000133) Cricetinae ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000154509.xc.a ENSGT00390000003738.a.b ENSGT00940000155708 ENSGT00950000183196.B ENSGT00940000155015 ENSGT00390000016029 ENSGT00940000157005 ENSGT01100000263484.C.b.a ENSGT01070000253816.b ENSGT00940000156699 ENSGT00940000156299 ENSGT00390000015332 ENSGT00940000155789 ENSGT01030000234598.a.b ENSGT00940000153421.a.b ENSGT01050000244888.b.a.c.b.h ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00900000143480 ENSGT00940000155866 ENSGT00940000160763 ENSGT00940000160217 ENSGT01100000263494.a.a.a.a.a.d.b.c ENSGT01100000263494.a.a.a.a.a.d.a ENSGT01100000263494.a.a.a.a.a.c.a ENSGT01100000263494.a.a.a.a.a.c.b ENSGT01040000240406.B ENSGT01050000244815.A.c.b.a.a.a.b Golden Hamster MODERN SPECIES 710 ENSMAUG00000015462 Agtr1b (ENSMAUG00000011096) ##22 Cpb1 (ENSMAUG00000012497) Gyg (ENSMAUG00000016848) Hltf (ENSMAUG00000009077) Hps3 (ENSMAUG00000000348) ENSMAUG00000017442 ENSMAUG00000018266 ENSMAUG00000010960 Tespa1 (ENSMAUG00000014405) Neurod4 (ENSMAUG00000016755) ENSMAUG00000019566 ENSMAUG00000012633 ENSMAUG00000017152 ENSMAUG00000000737 Or6c65 (ENSMAUG00000017066) Or6c214 (ENSMAUG00000019350) Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 352 Tnik (ENSCGRG00001021152) Pld1 (ENSCGRG00001023076) Tmem212 (ENSCGRG00001018197) Fndc3b (ENSCGRG00001016574) Ghsr (ENSCGRG00001022780) Tnfsf10 (ENSCGRG00001006321) Nceh1 (ENSCGRG00001007699) Ect2 (ENSCGRG00001011775) Spata16 (ENSCGRG00001013349) Nlgn1 (ENSCGRG00001012016) Naaladl2 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(MGP_CAROLIEiJ_G0024895) Tnik (MGP_CAROLIEiJ_G0024894) Pld1 (MGP_CAROLIEiJ_G0024893) Tmem212 (MGP_CAROLIEiJ_G0024892) Fndc3b (MGP_CAROLIEiJ_G0024891) Ghsr (MGP_CAROLIEiJ_G0024890) Tnfsf10 (MGP_CAROLIEiJ_G0024889) Nceh1 (MGP_CAROLIEiJ_G0024888) MGP_CAROLIEiJ_G0024887 Spata16 (MGP_CAROLIEiJ_G0024886) Nlgn1 (MGP_CAROLIEiJ_G0024885) Naaladl2 (MGP_CAROLIEiJ_G0024884) Tbl1xr1 (MGP_CAROLIEiJ_G0024883) Agtr1b (MGP_CAROLIEiJ_G0024882) ##22 Cpb1 (MGP_CAROLIEiJ_G0024881) Cpa3 (MGP_CAROLIEiJ_G0024880) Gyg (MGP_CAROLIEiJ_G0024879) Hltf (MGP_CAROLIEiJ_G0024878) Hps3 (MGP_CAROLIEiJ_G0024877) Cp (MGP_CAROLIEiJ_G0024876) Crh (MGP_CAROLIEiJ_G0024875) Trim55 (MGP_CAROLIEiJ_G0024874) MGP_CAROLIEiJ_G0024873 MGP_CAROLIEiJ_G0024872 Dnajc5b (MGP_CAROLIEiJ_G0024871) Pde7a (MGP_CAROLIEiJ_G0024870) Mtfr1 (MGP_CAROLIEiJ_G0024869) Armc1 (MGP_CAROLIEiJ_G0024868) Cyp7b1 (MGP_CAROLIEiJ_G0024867) Shrew mouse MODERN SPECIES 17 Rpl22l1 (MGP_PahariEiJ_G0026342) Eif5a2 (MGP_PahariEiJ_G0026341) MGP_PahariEiJ_G0026340 Tnik (MGP_PahariEiJ_G0026339) Pld1 (MGP_PahariEiJ_G0026338) Tmem212 (MGP_PahariEiJ_G0026337) Fndc3b (MGP_PahariEiJ_G0026336) Ghsr (MGP_PahariEiJ_G0026335) Tnfsf10 (MGP_PahariEiJ_G0026334) Nceh1 (MGP_PahariEiJ_G0026333) Ect2 (MGP_PahariEiJ_G0026332) Spata16 (MGP_PahariEiJ_G0026331) Nlgn1 (MGP_PahariEiJ_G0026330) Naaladl2 (MGP_PahariEiJ_G0026329) Tbl1xr1 (MGP_PahariEiJ_G0026328) Agtr1b (MGP_PahariEiJ_G0026327) ##22 Cpb1 (MGP_PahariEiJ_G0026326) Cpa3 (MGP_PahariEiJ_G0026325) Gyg (MGP_PahariEiJ_G0026324) Hltf (MGP_PahariEiJ_G0026323) Hps3 (MGP_PahariEiJ_G0026322) Cp (MGP_PahariEiJ_G0026321) Crh (MGP_PahariEiJ_G0026320) Trim55 (MGP_PahariEiJ_G0026319) MGP_PahariEiJ_G0026318 Dnajc5b (MGP_PahariEiJ_G0026317) Pde7a (MGP_PahariEiJ_G0026316) Mtfr1 (MGP_PahariEiJ_G0026315) Armc1 (MGP_PahariEiJ_G0026314) Cyp7b1 (MGP_PahariEiJ_G0026313) Bhlhe22 (MGP_PahariEiJ_G0026312) Rat MODERN SPECIES 11 Tnik (ENSRNOG00000012422) Pld1 (ENSRNOG00000028156) Tmem212 (ENSRNOG00000012608) Fndc3b (ENSRNOG00000024089) Ghsr 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(ENSJJAG00000012385) Pfn2 (ENSJJAG00000018684) ENSJJAG00000013003 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000154435.l ENSGT00940000164931 ENSGT00940000154435.k ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h ENSGT00940000153664.B ENSGT00940000160465 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164931 ENSGT00940000154435.k.g.a ENSGT00940000154435.k.h ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489.f ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h ENSGT00940000153664.B ENSGT00940000160465 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 27 ENSHGLG00000040890 ENSHGLG00000038284 ENSHGLG00000019213 ENSHGLG00000019244 ENSHGLG00000021419 ENSHGLG00000049780 ENSHGLG00000042807 ENSHGLG00000040188 ENSHGLG00000043888 ENSHGLG00000048208 ENSHGLG00000017414 ENSHGLG00000032818 ENSHGLG00000011081 ENSHGLG00000002472 ENSHGLG00000035002 ENSHGLG00000046384 ##22 CPB1 (ENSHGLG00000011884) CPA3 (ENSHGLG00000012134) GYG1 (ENSHGLG00000012311) ENSHGLG00000040634 ENSHGLG00000035118 ENSHGLG00000011754 HLTF (ENSHGLG00000012503) HPS3 (ENSHGLG00000012977) CP (ENSHGLG00000014064) ENSHGLG00000020937 TM4SF18 (ENSHGLG00000046931) TM4SF1 (ENSHGLG00000017433) TM4SF4 (ENSHGLG00000017445) ENSHGLG00000039194 WWTR1 (ENSHGLG00000017284) Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164931 ENSGT00940000154435.k.g.a ENSGT00940000154435.k.g.b ENSGT00940000154435.k.h ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489.f ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h ENSGT00940000153664.B ENSGT00940000160465 Guinea pig MODERN SPECIES 8 PCOLCE2 (ENSCPOG00000009999) PAQR9 (ENSCPOG00000021386) U2SURP (ENSCPOG00000011656) CHST2 (ENSCPOG00000026369) SLC9A9 (ENSCPOG00000000663) DIPK2A (ENSCPOG00000009308) ENSCPOG00000026394 PLOD2 (ENSCPOG00000014514) PLSCR4 (ENSCPOG00000009496) ENSCPOG00000007099 ENSCPOG00000030970 ENSCPOG00000030500 ENSCPOG00000030198 PLSCR5 (ENSCPOG00000015238) ZIC4 (ENSCPOG00000010981) AGTR1 (ENSCPOG00000007610) ##22 CPB1 (ENSCPOG00000001475) CPA3 (ENSCPOG00000001479) GYG1 (ENSCPOG00000001482) HLTF (ENSCPOG00000001238) HPS3 (ENSCPOG00000013007) CP (ENSCPOG00000013015) TM4SF18 (ENSCPOG00000030709) TM4SF1 (ENSCPOG00000036320) TM4SF4 (ENSCPOG00000010562) WWTR1 (ENSCPOG00000037193) COMMD2 (ENSCPOG00000031805) ENSCPOG00000024921 RNF13 (ENSCPOG00000000517) PFN2 (ENSCPOG00000034416) TSC22D2 (ENSCPOG00000001481) Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES 45 ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164931 ENSGT00940000154435.k.g.a ENSGT00940000154435.k.g.b ENSGT00940000154435.k.h ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00940000159061 ENSGT00940000154688.b ENSGT00940000156041 ENSGT00390000013367 ENSGT00950000183118.B ENSGT00940000159578 ENSGT00530000063553.b.b ENSGT00940000154837.f ENSGT00940000158682 ENSGT00940000155881 ENSGT00940000153510.b Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 181 ENSCLAG00000008261 PPM1K (ENSCLAG00000008179) ENSCLAG00000008144 PIGY (ENSCLAG00000007742) HERC3 (ENSCLAG00000007432) FAM13A (ENSCLAG00000007217) PLOD2 (ENSCLAG00000008696) PLSCR4 (ENSCLAG00000008577) ENSCLAG00000008432 ENSCLAG00000008210 ENSCLAG00000007786 ENSCLAG00000007606 PLSCR5 (ENSCLAG00000007297) ZIC4 (ENSCLAG00000007107) ZIC1 (ENSCLAG00000006845) AGTR1 (ENSCLAG00000004411) ##22 CPB1 (ENSCLAG00000004152) CPA3 (ENSCLAG00000004064) GYG1 (ENSCLAG00000003920) HLTF (ENSCLAG00000003408) ENSCLAG00000003230 GPT2 (ENSCLAG00000003182) ENSCLAG00000002868 NETO2 (ENSCLAG00000008739) ITFG1 (ENSCLAG00000007967) PHKB (ENSCLAG00000007130) ABCC12 (ENSCLAG00000006887) LONP2 (ENSCLAG00000006722) SIAH1 (ENSCLAG00000006639) N4BP1 (ENSCLAG00000006600) LIN54 (ENSCLAG00000006502) Degu MODERN SPECIES 69 DIPK2A (ENSODEG00000008791) ENSODEG00000008615 ENSODEG00000008712 ENSODEG00000008324 PLOD2 (ENSODEG00000009443) PLSCR4 (ENSODEG00000009888) ENSODEG00000008158 ENSODEG00000009747 PLSCR5 (ENSODEG00000009189) ZIC4 (ENSODEG00000008678) ZIC1 (ENSODEG00000008223) ENSODEG00000007847 ENSODEG00000013165 ENSODEG00000013852 ENSODEG00000019589 AGTR1 (ENSODEG00000019590) ##22 CPB1 (ENSODEG00000011062) CPA3 (ENSODEG00000008292) ENSODEG00000009053 HLTF (ENSODEG00000009415) GPT2 (ENSODEG00000008090) ENSODEG00000007831 NETO2 (ENSODEG00000008553) ENSODEG00000008342 ITFG1 (ENSODEG00000007883) PHKB (ENSODEG00000008822) ABCC12 (ENSODEG00000010786) ENSODEG00000009232 ENSODEG00000007971 SIAH1 (ENSODEG00000010400) N4BP1 (ENSODEG00000009642) Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000154435.l ENSGT00940000154435.k ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00390000016906 ENSGT00390000011127 ENSGT01030000234621.C.b ENSGT00390000011700 ENSGT00530000063813.a ENSGT00530000063813.b Marmotini ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000154435.l ENSGT00940000154435.k ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00390000016906 ENSGT00390000011127 ENSGT01030000234621.C.b ENSGT00390000011700 ENSGT00530000063813.a ENSGT00530000063813.b Alpin marmot MODERN SPECIES 19 U2SURP (ENSMMMG00000017089) CHST2 (ENSMMMG00000017088) SLC9A9 (ENSMMMG00000017071) ENSMMMG00000017056 ENSMMMG00000017052 ENSMMMG00000017044 ENSMMMG00000017033 PLOD2 (ENSMMMG00000017004) PLSCR4 (ENSMMMG00000016989) ENSMMMG00000016973 ENSMMMG00000016964 ENSMMMG00000016886 PLSCR5 (ENSMMMG00000016875) ZIC4 (ENSMMMG00000016860) ZIC1 (ENSMMMG00000016851) AGTR1 (ENSMMMG00000016843) ##22 CPB1 (ENSMMMG00000016838) CPA3 (ENSMMMG00000016829) GYG1 (ENSMMMG00000016824) HLTF (ENSMMMG00000016808) HPS3 (ENSMMMG00000016598) CP (ENSMMMG00000016360) TM4SF18 (ENSMMMG00000016299) TM4SF1 (ENSMMMG00000016291) TM4SF4 (ENSMMMG00000016284) IL12A (ENSMMMG00000016274) SCHIP1 (ENSMMMG00000016272) ENSMMMG00000016266 ENSMMMG00000016261 MFSD1 (ENSMMMG00000016249) RARRES1 (ENSMMMG00000016234) Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 46 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000154435.l ENSGT00940000154435.k ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00390000016906 ENSGT00390000011127 ENSGT01030000234621.C.b ENSGT00390000011700 ENSGT00530000063813.a ENSGT00530000063813.b Squirrel MODERN SPECIES 119 DIPK2A (ENSSTOG00000015680) PLOD2 (ENSSTOG00000025550) PLSCR4 (ENSSTOG00000006004) ENSSTOG00000033689 ENSSTOG00000002373 PLSCR5 (ENSSTOG00000008096) ZIC4 (ENSSTOG00000015977) ZIC1 (ENSSTOG00000000952) AGTR1 (ENSSTOG00000025945) ##22 CPB1 (ENSSTOG00000008344) CPA3 (ENSSTOG00000008364) GYG1 (ENSSTOG00000001687) HLTF (ENSSTOG00000001694) HPS3 (ENSSTOG00000015620) CP (ENSSTOG00000015628) ENSSTOG00000002890 TM4SF18 (ENSSTOG00000026073) TM4SF1 (ENSSTOG00000025707) TM4SF4 (ENSSTOG00000010877) IL12A (ENSSTOG00000014615) ENSSTOG00000014607 ENSSTOG00000026854 MFSD1 (ENSSTOG00000010188) RARRES1 (ENSSTOG00000010175) Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 337 AGTR1 (ENSUPAG00010001088) ##22 CPB1 (ENSUPAG00010001070) CPA3 (ENSUPAG00010001046) GYG1 (ENSUPAG00010001020) HLTF (ENSUPAG00010000994) HPS3 (ENSUPAG00010000943) CP (ENSUPAG00010000478) TM4SF18 (ENSUPAG00010000462) TM4SF1 (ENSUPAG00010000443) TM4SF4 (ENSUPAG00010000438) IL12A (ENSUPAG00010000415) ENSUPAG00010000392 Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 1 PCOLCE2 (ENSSVLG00005009992) PAQR9 (ENSSVLG00005010124) U2SURP (ENSSVLG00005010214) CHST2 (ENSSVLG00005011831) SLC9A9 (ENSSVLG00005011865) DIPK2A (ENSSVLG00005011903) ENSSVLG00005011980 PLOD2 (ENSSVLG00005012138) PLSCR4 (ENSSVLG00005012337) ENSSVLG00005012558 PLSCR1 (ENSSVLG00005012636) PLSCR5 (ENSSVLG00005012728) ZIC4 (ENSSVLG00005012907) ZIC1 (ENSSVLG00005013067) ENSSVLG00005013147 AGTR1 (ENSSVLG00005013217) ##22 CPB1 (ENSSVLG00005013271) CPA3 (ENSSVLG00005013362) GYG1 (ENSSVLG00005013712) HLTF (ENSSVLG00005013865) HPS3 (ENSSVLG00005014027) CP (ENSSVLG00005014272) TM4SF18 (ENSSVLG00005014461) TM4SF1 (ENSSVLG00005014530) TM4SF4 (ENSSVLG00005014565) IL12A (ENSSVLG00005014635) ENSSVLG00005014764 ENSSVLG00005015250 ENSSVLG00005015377 MFSD1 (ENSSVLG00005015449) RARRES1 (ENSSVLG00005015785) Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 45 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164931 ENSGT00940000154435 ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.g.a ENSGT00940000154942.h ENSGT00940000153664.B Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 59 ENSGT00940000155714 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164931 ENSGT00940000154435 ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h ENSGT00940000153664.B ENSGT00940000160465 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 57 ENSGT00940000155714 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164931 ENSGT00940000154435 ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h ENSGT00940000153664.B ENSGT00940000160465 Elephant MODERN SPECIES 383 PLS1 (ENSLAFG00000008746) TRPC1 (ENSLAFG00000004282) PCOLCE2 (ENSLAFG00000004287) U2SURP (ENSLAFG00000002566) CHST2 (ENSLAFG00000001355) SLC9A9 (ENSLAFG00000000863) DIPK2A (ENSLAFG00000004615) ENSLAFG00000003009 PLOD2 (ENSLAFG00000001931) PLSCR4 (ENSLAFG00000013908) ENSLAFG00000027441 PLSCR1 (ENSLAFG00000016401) PLSCR5 (ENSLAFG00000026690) ZIC4 (ENSLAFG00000010922) ZIC1 (ENSLAFG00000030632) AGTR1 (ENSLAFG00000004852) ##22 CPB1 (ENSLAFG00000004854) CPA3 (ENSLAFG00000004858) GYG1 (ENSLAFG00000006512) HLTF (ENSLAFG00000006515) HPS3 (ENSLAFG00000000998) CP (ENSLAFG00000001000) TM4SF18 (ENSLAFG00000005653) TM4SF1 (ENSLAFG00000022490) TM4SF4 (ENSLAFG00000000089) WWTR1 (ENSLAFG00000007925) COMMD2 (ENSLAFG00000007449) ENSLAFG00000007453 RNF13 (ENSLAFG00000023196) PFN2 (ENSLAFG00000013974) ENSLAFG00000027167 Hyrax MODERN SPECIES 3359 AGTR1 (ENSPCAG00000006135) ##22 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES 668 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b Sloth MODERN SPECIES 11631 AGTR1 (ENSCHOG00000004336) ##22 Armadillo MODERN SPECIES 1742 AGTR1 (ENSDNOG00000018776) ##22 CPB1 (ENSDNOG00000016362) CPA3 (ENSDNOG00000025855) GYG1 (ENSDNOG00000015492) HLTF (ENSDNOG00000015496) HPS3 (ENSDNOG00000006163) CP (ENSDNOG00000006185) TM4SF18 (ENSDNOG00000016778) Platypus MODERN SPECIES ENSOANG00000003648 ATR (ENSOANG00000003647) PLS1 (ENSOANG00000003646) TRPC1 (ENSOANG00000003645) PCOLCE2 (ENSOANG00000050644) PAQR9 (ENSOANG00000003643) U2SURP (ENSOANG00000003644) CHST2 (ENSOANG00000038278) SLC9A9 (ENSOANG00000011733) DIPK2A (ENSOANG00000038588) PLOD2 (ENSOANG00000001812) PLSCR1 (ENSOANG00000012076) PLSCR5 (ENSOANG00000003869) ZIC4 (ENSOANG00000007364) ZIC1 (ENSOANG00000039158) AGTR1 (ENSOANG00000000457) ##22 CPB1 (ENSOANG00000009290) GYG1 (ENSOANG00000020607) HLTF (ENSOANG00000000614) HPS3 (ENSOANG00000000609) CP (ENSOANG00000000613) ENSOANG00000020605 TM4SF18 (ENSOANG00000039083) TM4SF1 (ENSOANG00000000611) TM4SF4 (ENSOANG00000012381) WWTR1 (ENSOANG00000047643) COMMD2 (ENSOANG00000009074) ANKUB1 (ENSOANG00000030635) RNF13 (ENSOANG00000044928) PFN2 (ENSOANG00000005189) TSC22D2 (ENSOANG00000048020) Anura ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00670000098080 ENSGT00940000155714 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649.w ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000154435 ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551.a ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT00940000165445 ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00950000183086.a.a.b ENSGT00940000154369 ENSGT01030000234629.B Frog MODERN SPECIES 5 ENSXETG00000022137 u2surp (ENSXETG00000022133) chst2 (ENSXETG00000022131) ENSXETG00000048586 ENSXETG00000044419 slc9a9 (ENSXETG00000001625) ENSXETG00000049327 dipk2a (ENSXETG00000001626) plod2 (ENSXETG00000001628) ENSXETG00000045404 plscr1 (ENSXETG00000015514) plscr2 (ENSXETG00000001630) plscr5 (ENSXETG00000034906) zic4 (ENSXETG00000015475) zic1 (ENSXETG00000015467) agtr1 (ENSXETG00000034925) ##22 cpb1 (ENSXETG00000016077) ENSXETG00000033023 cpa3 (ENSXETG00000016076) ENSXETG00000048131 gyg1 (ENSXETG00000016072) hltf (ENSXETG00000029917) hps3 (ENSXETG00000016060) cp (ENSXETG00000031159) tm4sf18 (ENSXETG00000036355) tm4sf1 (ENSXETG00000016042) XB5764007 [provisional:ggt1] (ENSXETG00000033992) XB5965330 [provisional] (ENSXETG00000016019) wwtr1 (ENSXETG00000016011) commd2 (ENSXETG00000043998) clstn2 (ENSXETG00000020738) Leishan spiny toad MODERN SPECIES 7 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ENSEBUG00000011298 ENSEBUG00000015995 ENSEBUG00000015163 #22 ENSEBUG00000013603 Lamprey MODERN SPECIES 1006 ENSPMAG00000005739 AGTR1 (ENSPMAG00000005736) #22