Vertebrata DUPLICATION Vertebrata ANCESTRAL SPECIES ENSGT01050000244888.b.a #22 Gnathostomata DUPLICATION Gnathostomata DUPLICATION Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00390000008820.f ENSGT00940000159568 ENSGT00390000012178 ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159971 ENSGT00940000160039 ENSGT00730000110943.C ENSGT00940000160658 ENSGT00390000012807 ENSGT00940000158330 ENSGT00730000111263 ENSGT00390000016972 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT00390000010687.a.b ENSGT00940000159688 #23 ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000157557 #27 ENSGT01030000234518.C.a.b.b ENSGT00950000182897.B.a.b.a ENSGT00950000183071.a.b ENSGT01050000244897.a.b.a ENSGT01050000244955.a.b ENSGT00390000013938 ENSGT00390000004360.a.b.a.a.a ENSGT00950000182865.b.a.b.b.b.b ENSGT00940000155028 ENSGT00390000015476 ENSGT00590000083134.b ENSGT00940000155266 ENSGT00390000016655.a.b ENSGT00510000047104 Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00950000182988.a.b.b.b ENSGT00940000156128.b ENSGT00940000161570 ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159971 ENSGT00940000160039 ENSGT00940000160658 ENSGT00390000012807 ENSGT00940000158330 ENSGT00730000111263 ENSGT00390000016972 ENSGT00390000003006 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT00390000010687.a.b ENSGT00940000159688 #23 ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000159818 ENSGT01100000263543 ENSGT00940000161569 ENSGT00940000175287 ENSGT00940000158335 ENSGT00940000154359 #26 ENSGT00940000157557 #27 ENSGT00940000155658 #28 ENSGT00940000160896 #29 ENSGT00940000157904 ENSGT00940000158972 ENSGT00940000157245 ENSGT00950000182897.B.a.b.a ENSGT00950000183071.a.b ENSGT01050000244897.a.b.a Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000161206 ENSGT00950000183115.b.b ENSGT01100000263536.A.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT01050000245003 ENSGT01100000263536.B.c.b ENSGT00940000163592 ENSGT00940000155097 ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159971 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ENSGT00940000157904 ENSGT00940000158972 ENSGT00940000157245 ENSGT00950000182897.B.a.b.a ENSGT00950000183071.a.b ENSGT01050000244897.a.b.a ENSGT01050000244955.a.b ENSGT00390000013938 ENSGT00950000182865.b.a.b.b.b.b ENSGT00940000155028 Mammalia ANCESTRAL SPECIES 44 ENSGT00940000162488 ENSGT00950000182832.D.b ENSGT00940000161206 ENSGT00950000183115.b.b ENSGT01030000234518.D ENSGT01100000263536.A.a.a.b ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT01050000245003 ENSGT01100000263536.B.c.b ENSGT00940000163592 ENSGT00940000155097 ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159971 ENSGT00940000160039 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000159688 #23 ENSGT00940000154359 #26 ENSGT00940000157557 #27 ENSGT00940000155658 #28 ENSGT00940000160896 #29 ENSGT00940000157904 ENSGT00940000158972 ENSGT00940000157245 ENSGT00950000182897.B.a.b.a ENSGT00950000183071.a.b ENSGT01050000244897.a.b.a ENSGT01050000244955.a.b ENSGT00390000013938 ENSGT00950000182865.b.a.b.b.b.b ENSGT00940000155028 Theria ANCESTRAL SPECIES 54 ENSGT00390000010397.a ENSGT00940000160983 ENSGT00950000182988.a.b.b.b ENSGT00940000156128.b ENSGT00940000161570 ENSGT00950000183232 ENSGT00510000047493 ENSGT00940000159922.b ENSGT01060000248594.e.a ENSGT00990000203589.a.b.a.b ENSGT00940000159055 ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159971 ENSGT00940000160039 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000159688 #23 ENSGT00940000154359 #26 ENSGT00940000157557 #27 ENSGT00940000155658 #28 ENSGT00940000160896 #29 Eutheria ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000160983 ENSGT00950000182988.a.b.b.b ENSGT00940000156128.b ENSGT00940000161570 ENSGT00950000183232 ENSGT00510000047493 ENSGT00940000159922.b ENSGT01060000248594.e.a ENSGT00940000163925 ENSGT00990000203589.a.b.a.b ENSGT00940000159055 ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159971 ENSGT00940000160039 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000159688 #23 ENSGT00940000154359.f #26 ENSGT00940000157557 #27 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ENSGT01030000234522.C.b.e.a.b #30 ENSGT00440000033329.b.a.b #31 ENSGT00390000002253 ENSGT00940000163031.b.a #32 ENSGT00940000160619 #33 ENSGT00440000039314.b #34 ENSGT00940000160686 #35 ENSGT00940000154400.b #36 ENSGT00390000002197 #37 ENSGT00940000155075.a.b Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00950000182988.a.b.b.b ENSGT00940000156128.b ENSGT00940000161570 ENSGT00950000183232 ENSGT00510000047493 ENSGT00940000159922.b ENSGT01060000248594.e.a ENSGT00390000018248 ENSGT00940000163925 ENSGT00990000203589.a.b.a.b ENSGT00940000159055 ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159971 ENSGT00940000160039 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000159688 #23 ENSGT00390000018873 #24 ENSGT00940000154359.f #26 ENSGT00940000157557 #27 ENSGT00940000155658 #28 ENSGT00940000160896 #29 ENSGT01030000234522.C.b.e.a.b #30 ENSGT00440000033329.b.a.b #31 ENSGT00940000163031.b.a #32 ENSGT00940000160619 #33 ENSGT00440000039314.b #34 ENSGT00940000160686 #35 ENSGT00940000154400.b #36 ENSGT00390000002197 #37 ENSGT00940000155075.a.b.`b Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000160983 ENSGT00950000182988.a.b.b.b ENSGT00940000156128.b ENSGT00940000161570 ENSGT00950000183232 ENSGT00940000159922.b ENSGT00390000018248 ENSGT01060000248594.e.a ENSGT00990000203589.a.b.a.b ENSGT00940000159055 ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159971 ENSGT00940000160039 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT00390000010165.i.b.b.a #21 ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000159688 #23 ENSGT00390000018873 #24 ENSGT00940000154359.f #26 ENSGT00940000157557 #27 ENSGT00940000155658 #28 ENSGT00940000160896 #29 ENSGT01030000234522.C.b.e.a.b #30 ENSGT00440000033329.b.a.b #31 ENSGT00940000163031.b.a #32 ENSGT00940000160619 #33 ENSGT00440000039314.b #34 ENSGT00940000160686 #35 ENSGT00940000154400.b #36 ENSGT00390000002197 #37 ENSGT00940000155075.a.b.`b Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES 65 ENSGT00940000160983 ENSGT00950000182988.a.b.b.b ENSGT00940000156128.b ENSGT00940000161570 ENSGT00950000183232 ENSGT00940000159922.b ENSGT00390000018248 ENSGT01060000248594.e.a ENSGT00990000203589.a.b.a.b ENSGT00940000159055 ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159971 ENSGT00940000160039 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT00390000010165.i.b.b.a #21 ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000159688 #23 ENSGT00390000018873 #24 ENSGT00940000154359.f #26 ENSGT00940000157557 #27 ENSGT00940000155658 #28 ENSGT00940000160896 #29 ENSGT01030000234522.C.b.e.a.b #30 ENSGT00440000033329.b.a.b #31 ENSGT00940000163031.b.a #32 ENSGT00940000160619 #33 ENSGT00440000039314.b #34 ENSGT00940000160686 #35 ENSGT00940000154400.b #36 ENSGT00390000002197 #37 ENSGT00940000155075.a.b.`b Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES 107 ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000159688 #23 ENSGT00390000018873 #24 ENSGT00940000154359.f #26 ENSGT00940000157557 #27 ENSGT00940000155658 #28 ENSGT00940000160896 #29 ENSGT01030000234522.C.b.e.a.b #30 ENSGT00440000033329.b.a.b #31 ENSGT00940000163031.b.a #32 ENSGT00940000160619 #33 ENSGT00440000039314.b #34 ENSGT00940000160686 #35 ENSGT00940000154400.b #36 ENSGT00390000002197 #37 ENSGT00940000155075.a.b.`b Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 241 ENSCLAG00000017619 #21 AGTR2 (ENSCLAG00000017599) #22 ENSCLAG00000008811 #23 ENSCLAG00000004474 #24 ENSCLAG00000008615 #25 KLHL13 (ENSCLAG00000007440) #26 WDR44 (ENSCLAG00000002582) #27 DOCK11 (ENSCLAG00000006793) #28 IL13RA1 (ENSCLAG00000006075) #29 ENSCLAG00000017563 #30 LONRF3 (ENSCLAG00000003297) #31 ENSCLAG00000002989 #32 PGRMC1 (ENSCLAG00000002952) #33 ENSCLAG00000002233 #34 SLC25A43 (ENSCLAG00000002149) #35 SLC25A5 (ENSCLAG00000004099) #36 STEEP1 (ENSCLAG00000003523) #37 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 31 LHFPL1 (ENSHGLG00000013759) ENSHGLG00000012297 ENSHGLG00000013791 ENSHGLG00000035431 ENSHGLG00000035102 ENSHGLG00000001226 ENSHGLG00000041493 ENSHGLG00000001151 ENSHGLG00000001104 LRCH2 (ENSHGLG00000001011) ENSHGLG00000028563 ENSHGLG00000039724 ENSHGLG00000000853 ENSHGLG00000019727 #21 ENSHGLG00000044858 ENSHGLG00000040362 #22 ENSHGLG00000043063 ENSHGLG00000001647 #23 ENSHGLG00000051011 ENSHGLG00000042774 ENSHGLG00000002833 ENSHGLG00000002893 KLHL13 (ENSHGLG00000003690) #26 ENSHGLG00000046500 ENSHGLG00000003366 #27 ENSHGLG00000033083 DOCK11 (ENSHGLG00000000806) #28 IL13RA1 (ENSHGLG00000001323) #29 ZCCHC12 (ENSHGLG00000036218) #30 LONRF3 (ENSHGLG00000002169) #31 ENSHGLG00000011436 #32 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00950000182988.a.b.b.b ENSGT00940000156128.b ENSGT00940000161570 ENSGT00950000183232 ENSGT00510000047493 ENSGT00940000159922.b ENSGT00390000018248 ENSGT01060000248594.e.a ENSGT00940000163925 ENSGT00990000203589.a.b.a.b ENSGT00940000159055 ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159971 ENSGT00940000160039 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000159688 #23 ENSGT00940000154359.f #26 ENSGT00940000157557 #27 ENSGT00940000155658 #28 ENSGT00940000160896 #29 ENSGT01030000234522.C.b.e.a.b.a #30 ENSGT00440000033329.b.a.b #31 ENSGT00940000163031.b.a #32 ENSGT00940000160619 #33 ENSGT00440000039314.b #34 ENSGT00940000160686 #35 ENSGT00940000154400.b #36 ENSGT00390000002197.t #37 ENSGT00940000155075.a.b.`b ENSGT00940000157256 Marmotini ANCESTRAL SPECIES 63 ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000159688 #23 ENSGT00940000154359.f #26 ENSGT00940000157557 #27 ENSGT00940000155658 #28 ENSGT00940000160896 #29 ENSGT01030000234522.C.b.e.a.b.a #30 ENSGT00440000033329.b.a.b #31 ENSGT00940000160619 #33 ENSGT00440000039314.b #34 ENSGT00940000160686 #35 ENSGT00940000154400.b #36 ENSGT00390000002197.t #37 ENSGT00940000155075.a.b.`b ENSGT00940000157256 ENSGT00940000158026 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 78 ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000159688 #23 ENSGT00390000007430.r ENSGT00940000154359.f #26 ENSGT00940000157557 #27 ENSGT00940000155658 #28 ENSGT00940000160896 #29 ENSGT01030000234522.C.b.e.a.b.a #30 ENSGT00440000033329.b.a.b #31 ENSGT00940000163031.b.a #32 ENSGT00940000160619 #33 ENSGT00440000039314.b #34 ENSGT00940000160686 #35 ENSGT00940000154400.b #36 ENSGT00390000002197.t #37 ENSGT00940000155075.a.b.`b Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 785 AGTR2 (ENSUPAG00010005469) #22 ENSUPAG00010005475 #23 Squirrel MODERN SPECIES 79 GARIN1B (ENSSTOG00000026261) GARIN1A (ENSSTOG00000008506) HILPDA (ENSSTOG00000029766) IMPDH1 (ENSSTOG00000002177) PRRT4 (ENSSTOG00000023582) RBM28 (ENSSTOG00000002169) LEP (ENSSTOG00000027970) LRRC4 (ENSSTOG00000021081) SND1 (ENSSTOG00000002140) PAX4 (ENSSTOG00000002127) FSCN3 (ENSSTOG00000002115) ARF5 (ENSSTOG00000002104) GCC1 (ENSSTOG00000002099) ZNF800 (ENSSTOG00000023294) GRM8 (ENSSTOG00000006490) AGTR2 (ENSSTOG00000012524) #22 ENSSTOG00000007147 #23 ENSSTOG00000029519 KLHL13 (ENSSTOG00000012035) #26 WDR44 (ENSSTOG00000007251) #27 DOCK11 (ENSSTOG00000007295) #28 IL13RA1 (ENSSTOG00000024422) #29 ENSSTOG00000022238 #30 LONRF3 (ENSSTOG00000015024) #31 PGRMC1 (ENSSTOG00000024047) #33 SLC25A43 (ENSSTOG00000004872) #35 ENSSTOG00000020438 #36 STEEP1 (ENSSTOG00000011579) #37 UBE2A (ENSSTOG00000011583) NKRF (ENSSTOG00000020483) SEPTIN6 (ENSSTOG00000011593) Alpin marmot MODERN SPECIES 54 AGTR2 (ENSMMMG00000007695) #22 ENSMMMG00000007671 #23 ENSMMMG00000007666 KLHL13 (ENSMMMG00000007467) #26 WDR44 (ENSMMMG00000007422) #27 DOCK11 (ENSMMMG00000007293) #28 IL13RA1 (ENSMMMG00000007276) #29 ENSMMMG00000007268 #30 ENSMMMG00000007240 #31 ENSMMMG00000007229 #33 ENSMMMG00000007220 #34 SLC25A43 (ENSMMMG00000007207) #35 SLC25A5 (ENSMMMG00000007201) #36 ENSMMMG00000007184 #37 UBE2A (ENSMMMG00000007093) NKRF (ENSMMMG00000007091) Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 156 AMOT (ENSSVLG00005013525) ENSSVLG00005019330 ENSSVLG00005019275 ENSSVLG00005019228 ENSSVLG00005019177 ENSSVLG00005019126 ENSSVLG00005019077 HTR2C (ENSSVLG00005018984) ENSSVLG00005018928 IL13RA2 (ENSSVLG00005018862) LRCH2 (ENSSVLG00005018464) ENSSVLG00005018369 ENSSVLG00005018340 PLS3 (ENSSVLG00005018046) ENSSVLG00005017980 AGTR2 (ENSSVLG00005017968) #22 ENSSVLG00005017948 ##21 ENSSVLG00005017904 SLC6A14 (ENSSVLG00005017746) CT83 (ENSSVLG00005017691) #24 ENSSVLG00005017648 KLHL13 (ENSSVLG00005017370) #26 WDR44 (ENSSVLG00005017220) #27 DOCK11 (ENSSVLG00005016279) #28 IL13RA1 (ENSSVLG00005016116) #29 ENSSVLG00005016098 #30 ENSSVLG00005016082 LONRF3 (ENSSVLG00005015856) #31 ENSSVLG00005015710 #32 PGRMC1 (ENSSVLG00005015662) #33 ENSSVLG00005015613 #34 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00950000182988.a.b.b.b ENSGT00940000156128.b ENSGT00940000161570 ENSGT00950000183232 ENSGT00510000047493 ENSGT00940000159922.b ENSGT01060000248594.e.a ENSGT00390000018248 ENSGT00940000163925 ENSGT00990000203589.a.b.a.b ENSGT00940000159055 ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159971 ENSGT00940000160039 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000159688 #23 ENSGT00940000154359.f #26 ENSGT00940000157557 #27 ENSGT00940000155658 #28 ENSGT00940000160896 #29 ENSGT01030000234522.C.b.e.a.b #30 ENSGT00440000033329.b.a.b #31 ENSGT00390000002253 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#23 ENSGT00860000135780 ENSGT00940000154359.f #26 ENSGT00940000157557 #27 ENSGT00940000155993.d.b ENSGT00940000155993.d.a.b ENSGT00940000155658 #28 ENSGT00940000160896 #29 ENSGT01030000234522.C.b.e.a.b.c #30 ENSGT00440000033329.b.a.b #31 ENSGT00940000170289 ENSGT00940000163031.b.a #32 ENSGT00940000160619 #33 ENSGT00440000039314.b #34 ENSGT00940000160686 #35 Mouse MODERN SPECIES 37 Ndufb11 (ENSMUSG00000031059) Rbm10 (ENSMUSG00000031060) Uba1 (ENSMUSG00000001924) Cdk16 (ENSMUSG00000031065) Usp11 (ENSMUSG00000031066) Araf (ENSMUSG00000001127) Syn1 (ENSMUSG00000037217) Timp1 (ENSMUSG00000001131) Cfp (ENSMUSG00000001128) Elk1 (ENSMUSG00000009406) Uxt (ENSMUSG00000001134) Zfp182 (ENSMUSG00000054737) Spaca5 (ENSMUSG00000037167) Zfp300 (ENSMUSG00000031079) Ssxa1 (ENSMUSG00000062814) Agtr2 (ENSMUSG00000068122) #22 Slc6a14 (ENSMUSG00000031089) #23 Gm28269 (ENSMUSG00000101818) Klhl13 (ENSMUSG00000036782) #26 Wdr44 (ENSMUSG00000036769) #27 Tesl1 (ENSMUSG00000068113) Gm5934 (ENSMUSG00000084063) 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#35 spretus MODERN SPECIES 19 Rbm10 (MGP_SPRETEiJ_G0034113) Uba1 (MGP_SPRETEiJ_G0034114) Cdk16 (MGP_SPRETEiJ_G0034115) Usp11 (MGP_SPRETEiJ_G0034116) Araf (MGP_SPRETEiJ_G0034117) Syn1 (MGP_SPRETEiJ_G0034118) Timp1 (MGP_SPRETEiJ_G0034119) Cfp (MGP_SPRETEiJ_G0034120) Elk1 (MGP_SPRETEiJ_G0034121) Uxt (MGP_SPRETEiJ_G0034122) Zfp182 (MGP_SPRETEiJ_G0034123) Spaca5 (MGP_SPRETEiJ_G0034124) Zfp300 (MGP_SPRETEiJ_G0034125) MGP_SPRETEiJ_G0034126 MGP_SPRETEiJ_G0034127 Agtr2 (MGP_SPRETEiJ_G0034128) #22 Slc6a14 (MGP_SPRETEiJ_G0034129) #23 Gm28269 (MGP_SPRETEiJ_G0034130) Klhl13 (MGP_SPRETEiJ_G0034131) #26 MGP_SPRETEiJ_G0034132 MGP_SPRETEiJ_G0034133 #27 Tesl1 (MGP_SPRETEiJ_G0034134) MGP_SPRETEiJ_G0034135 Dock11 (MGP_SPRETEiJ_G0034136) #28 Il13ra1 (MGP_SPRETEiJ_G0034137) #29 Zcchc12 (MGP_SPRETEiJ_G0034138) #30 Lonrf3 (MGP_SPRETEiJ_G0034139) #31 MGP_SPRETEiJ_G0034140 Gm14569 (MGP_SPRETEiJ_G0034141) #32 Pgrmc1 (MGP_SPRETEiJ_G0034142) #33 Akap17b (MGP_SPRETEiJ_G0034143) #34 Steppe mouse MODERN SPECIES 1994 Agtr2 (ENSMSIG00000002524) #22 Ryukyu mouse MODERN SPECIES 19 Rbm10 (MGP_CAROLIEiJ_G0032963) Uba1 (MGP_CAROLIEiJ_G0032964) Cdk16 (MGP_CAROLIEiJ_G0032965) Usp11 (MGP_CAROLIEiJ_G0032966) Araf (MGP_CAROLIEiJ_G0032967) Syn1 (MGP_CAROLIEiJ_G0032968) Timp1 (MGP_CAROLIEiJ_G0032969) Cfp (MGP_CAROLIEiJ_G0032970) Elk1 (MGP_CAROLIEiJ_G0032971) Uxt (MGP_CAROLIEiJ_G0032972) Zfp182 (MGP_CAROLIEiJ_G0032973) Spaca5 (MGP_CAROLIEiJ_G0032974) Zfp300 (MGP_CAROLIEiJ_G0032975) Ssxa1 (MGP_CAROLIEiJ_G0032976) MGP_CAROLIEiJ_G0032977 Agtr2 (MGP_CAROLIEiJ_G0032978) #22 Slc6a14 (MGP_CAROLIEiJ_G0032979) #23 Gm28269 (MGP_CAROLIEiJ_G0032980) Klhl13 (MGP_CAROLIEiJ_G0032981) #26 Wdr44 (MGP_CAROLIEiJ_G0032982) #27 Dock11 (MGP_CAROLIEiJ_G0032983) #28 Il13ra1 (MGP_CAROLIEiJ_G0032984) #29 Zcchc12 (MGP_CAROLIEiJ_G0032985) #30 Lonrf3 (MGP_CAROLIEiJ_G0032986) #31 MGP_CAROLIEiJ_G0032987 Gm14569 (MGP_CAROLIEiJ_G0032988) #32 Pgrmc1 (MGP_CAROLIEiJ_G0032989) #33 Akap17b (MGP_CAROLIEiJ_G0032990) #34 Slc25a43 (MGP_CAROLIEiJ_G0032991) #35 Slc25a5 (MGP_CAROLIEiJ_G0032992) #36 Steep1 (MGP_CAROLIEiJ_G0032993) #37 Shrew mouse MODERN SPECIES 23 Ndufb11 (MGP_PahariEiJ_G0031505) Rbm10 (MGP_PahariEiJ_G0031506) Uba1 (MGP_PahariEiJ_G0031507) Cdk16 (MGP_PahariEiJ_G0031508) Usp11 (MGP_PahariEiJ_G0031509) Araf (MGP_PahariEiJ_G0031510) Syn1 (MGP_PahariEiJ_G0031511) Timp1 (MGP_PahariEiJ_G0031512) Cfp (MGP_PahariEiJ_G0031513) Elk1 (MGP_PahariEiJ_G0031514) Uxt (MGP_PahariEiJ_G0031515) Zfp182 (MGP_PahariEiJ_G0031516) Spaca5 (MGP_PahariEiJ_G0031517) Zfp300 (MGP_PahariEiJ_G0031518) Ssxa1 (MGP_PahariEiJ_G0031519) Agtr2 (MGP_PahariEiJ_G0031520) #22 Slc6a14 (MGP_PahariEiJ_G0031521) #23 MGP_PahariEiJ_G0031522 Klhl13 (MGP_PahariEiJ_G0031523) #26 Wdr44 (MGP_PahariEiJ_G0031524) #27 Tesl1 (MGP_PahariEiJ_G0031525) MGP_PahariEiJ_G0031526 MGP_PahariEiJ_G0031527 #28 Il13ra1 (MGP_PahariEiJ_G0031528) #29 Zcchc12 (MGP_PahariEiJ_G0031529) #30 Lonrf3 (MGP_PahariEiJ_G0031530) #31 MGP_PahariEiJ_G0031531 Gm14569 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Zcchc12 (ENSRNOG00000013162) #30 Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 1607 Agtr2 (ENSNGAG00000008929) #22 Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 69 Dcx (ENSJJAG00000015630) A730046J19Rik (ENSJJAG00000010844) Glt28d2 (ENSJJAG00000013741) Trpc5 (ENSJJAG00000024433) Lhfpl1 (ENSJJAG00000015318) ENSJJAG00000012278 ENSJJAG00000018212 ENSJJAG00000017574 ENSJJAG00000020933 Htr2c (ENSJJAG00000024036) ENSJJAG00000023972 ENSJJAG00000011564 Il13ra2 (ENSJJAG00000022912) Lrch2 (ENSJJAG00000009205) Pls3 (ENSJJAG00000022405) Agtr2 (ENSJJAG00000011582) #22 Vps45 (ENSJJAG00000019652) Otud7b (ENSJJAG00000023034) Mtmr11 (ENSJJAG00000013193) Sf3b4 (ENSJJAG00000022500) Sv2a (ENSJJAG00000019928) Bola1 (ENSJJAG00000018323) ENSJJAG00000014139 ENSJJAG00000020529 Hjv (ENSJJAG00000012429) Txnip (ENSJJAG00000013701) ENSJJAG00000019638 Ankrd34a (ENSJJAG00000011251) Lix1l (ENSJJAG00000017071) ENSJJAG00000009488 Pex11b (ENSJJAG00000003343) Kangaroo rat MODERN SPECIES 366 Cnot11 (ENSDORG00000004481) Rnf149 (ENSDORG00000007032) Creg2 (ENSDORG00000026419) Rfx8 (ENSDORG00000027680) Map4k4 (ENSDORG00000011322) Il1r2 (ENSDORG00000001386) Il1r1 (ENSDORG00000008123) Il1rl2 (ENSDORG00000008125) Il1rl1 (ENSDORG00000000310) Il18r1 (ENSDORG00000009793) Il18rap (ENSDORG00000009798) Slc9a4 (ENSDORG00000009801) Slc9a2 (ENSDORG00000007378) Mfsd9 (ENSDORG00000007380) Tmem182 (ENSDORG00000001502) Agtr2 (ENSDORG00000029423) #22 Slc6a14 (ENSDORG00000026053) #23 Klhl13 (ENSDORG00000008906) #26 Wdr44 (ENSDORG00000006076) #27 Dock11 (ENSDORG00000012146) #28 Il13ra1 (ENSDORG00000012156) #29 Lonrf3 (ENSDORG00000007891) #31 Pgrmc1 (ENSDORG00000016710) #33 Akap17b (ENSDORG00000016711) #34 Slc25a43 (ENSDORG00000027768) #35 Slc25a5 (ENSDORG00000016192) #36 ENSDORG00000026192 #37 Ube2a (ENSDORG00000000749) Nkrf (ENSDORG00000024123) Septin6 (ENSDORG00000026632) Sowahd (ENSDORG00000004901) Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES 53 ENSGT00390000010397.a ENSGT00730000110943.A.d ENSGT00940000160983 ENSGT00950000182988.a.b.b.b ENSGT00940000156128.b ENSGT00940000161570 ENSGT00940000166730 ENSGT01060000248594.e.a ENSGT00390000018248 ENSGT00990000203589.a.b.a.b ENSGT00940000159055 ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159971 ENSGT00940000160039 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00390000018873 #24 ENSGT00940000154359.f #26 ENSGT00940000157557 #27 ENSGT00940000155658 #28 ENSGT00940000160896 #29 ENSGT01030000234522.C.b.e.a.b #30 ENSGT00440000033329.b.a.b #31 ENSGT00390000002253 ENSGT00940000164744 ENSGT00940000160619 #33 ENSGT00440000039314.b #34 ENSGT00940000160686 #35 ENSGT00940000154400.b #36 ENSGT00390000002197 #37 ENSGT00940000155075.a.b Rabbit MODERN SPECIES 1401 RTL4 (ENSOCUG00000005364) ENSOCUG00000027921 #36 LHFPL1 (ENSOCUG00000013710) AMOT (ENSOCUG00000004881) ENSOCUG00000036470 ENSOCUG00000013331 ENSOCUG00000031433 ENSOCUG00000021705 ENSOCUG00000032360 HTR2C (ENSOCUG00000015900) IL13RA2 (ENSOCUG00000014747) LRCH2 (ENSOCUG00000016267) ENSOCUG00000026035 PLS3 (ENSOCUG00000006041) ENSOCUG00000021665 ##21 AGTR2 (ENSOCUG00000012363) #22 SLC6A14 (ENSOCUG00000015028) ENSOCUG00000036103 #24 KLHL13 (ENSOCUG00000001993) #26 WDR44 (ENSOCUG00000013619) #27 DOCK11 (ENSOCUG00000013642) #28 IL13RA1 (ENSOCUG00000013687) #29 ENSOCUG00000016135 #30 ENSOCUG00000030538 #31 LONRF3 (ENSOCUG00000012990) #31 ENSOCUG00000021455 ENSOCUG00000015860 PGRMC1 (ENSOCUG00000010280) #33 ENSOCUG00000022039 #34 SLC25A43 (ENSOCUG00000013248) #35 ENSOCUG00000013268 #36 Primates ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00950000183232 ENSGT00510000047493 ENSGT00940000159922.b ENSGT01060000248594.e.a ENSGT00390000018248 ENSGT00940000163925 ENSGT00990000203589.a.b.a.b ENSGT00940000159055 ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159971 ENSGT00940000160039 ENSGT00990000204264 ENSGT00940000165469 ENSGT00990000205098 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000159688 #23 ENSGT00390000018873 #24 ENSGT00940000154359.f #26 ENSGT00940000157557 #27 ENSGT00940000155658 #28 ENSGT00940000160896 #29 ENSGT01030000234522.C.b.e.a.b #30 ENSGT00440000033329.b.a.b #31 ENSGT00390000002253 ENSGT00940000163031.b.a #32 ENSGT00940000160619 #33 ENSGT00440000039314.b #34 ENSGT00940000160686 #35 ENSGT00940000154400.b #36 ENSGT00390000002197 #37 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000161570 ENSGT00950000183232 ENSGT00940000159922.b ENSGT01060000248594.e.a ENSGT00390000018248 ENSGT00940000163925 ENSGT00990000203589.a.b.a.b ENSGT00940000159055 ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159971 ENSGT00940000160039 ENSGT00990000204264 ENSGT00940000165469 ENSGT00990000205098 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000159688 #23 ENSGT00390000018873 #24 ENSGT00940000154359.f #26 ENSGT00940000157557 #27 ENSGT00940000155658 #28 ENSGT00940000160896 #29 ENSGT01030000234522.C.b.e.a.b #30 ENSGT00440000033329.b.a.b #31 ENSGT00390000002253 ENSGT00940000163031.b.a #32 ENSGT00940000160619 #33 ENSGT00440000039314.b #34 ENSGT00940000160686 #35 ENSGT00940000154400.a.b ##36 ENSGT00940000154400.b #36 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000156128.b ENSGT00940000161570 ENSGT00950000183232 ENSGT00940000159922.b ENSGT01060000248594.e.a ENSGT00390000018248 ENSGT00940000163925 ENSGT00990000203589.a.b.a.b ENSGT00940000159055 ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159971 ENSGT00940000160039 ENSGT00990000204264 ENSGT00990000205098 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00390000018873 #24 ENSGT00940000154359.f #26 ENSGT00940000157557 #27 ENSGT00940000155658 #28 ENSGT00940000160896 #29 ENSGT01030000234522.C.b.e.a.b.f #30 ENSGT00440000033329.b.a.b #31 ENSGT00390000002253.a ENSGT00940000163031.b.a #32 ENSGT00940000160619 #33 ENSGT00440000039314.b #34 ENSGT00940000160686 #35 ENSGT00940000154400.a.b ##36 ENSGT00390000002197.p #37 ENSGT00940000155075.a.b Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00910000147631 ENSGT00940000161570 ENSGT00950000183232 ENSGT00940000159922.b ENSGT01060000248594.e.a ENSGT00390000018248 ENSGT00940000163925 ENSGT00990000203589.a.b.a.b ENSGT00940000159055 ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159971 ENSGT00940000160039 ENSGT00940000162929.l ENSGT00950000183340 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00390000018873.c #24 ENSGT00390000018873.d #24 ENSGT00940000154359.f #26 ENSGT00940000157557 #27 ENSGT00940000155658.bb.a #28 ENSGT00940000160896 #29 ENSGT01030000234522.C.b.e.a.b.f #30 ENSGT00440000033329.b.a.b #31 ENSGT00390000002253.a ENSGT00940000163031.b.a #32 ENSGT00940000160619 #33 ENSGT00440000039314.b #34 ENSGT00940000160686 #35 ENSGT00940000154400.a.b ##36 ENSGT00390000002197.p #37 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00910000147631 ENSGT00940000161570 ENSGT00950000183232 ENSGT00940000159922.b ENSGT01060000248594.e.a ENSGT00390000018248 ENSGT00940000163925 ENSGT00990000203589.a.b.a.b ENSGT00940000159055 ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159971 ENSGT00940000160039 ENSGT00940000162929.l ENSGT00950000183340 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00390000018873.c #24 ENSGT00390000018873.d #24 ENSGT00940000154359.f #26 ENSGT00940000157557 #27 ENSGT00940000155658.bb.a #28 ENSGT00940000160896 #29 ENSGT01030000234522.C.b.e.a.b.f #30 ENSGT00440000033329.b.a.b #31 ENSGT00390000002253.a ENSGT00940000163031.b.a #32 ENSGT00940000160619 #33 ENSGT00440000039314.b #34 ENSGT00940000160686 #35 ENSGT00940000154400.b #36 ENSGT00390000002197.p #37 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 694 AGTR2 (ENSRBIG00000031065) #22 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1855 AGTR2 (ENSRROG00000015641) #22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000161570 ENSGT00950000183232 ENSGT00940000159922.b ENSGT00390000017282.r.a.b ENSGT01060000248594.e.a ENSGT00390000018248 ENSGT00940000163925 ENSGT00990000203589.a.b.a.b ENSGT00940000159055 ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159971 ENSGT00940000160039 ENSGT00940000162929.l ENSGT00950000183340 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00390000018873.c #24 ENSGT00390000018873.d #24 ENSGT00940000154359.f #26 ENSGT00940000157557 #27 ENSGT00940000155658.bb.a #28 ENSGT00940000160896 #29 ENSGT01030000234522.C.b.e.a.b.f #30 ENSGT00440000033329.b.a.b #31 ENSGT00390000002253.a ENSGT00940000163031.b.a #32 ENSGT00940000160619 #33 ENSGT00440000039314.b #34 ENSGT00940000160686 #35 ENSGT00940000154400.b #36 ENSGT00940000154400.a.b ##36 Vervet Monkey MODERN SPECIES 193 AGTR2 (ENSCSAG00000019502) #22 SLC6A14 (ENSCSAG00000018276) ENSCSAG00000018271 #24 KLHL13 (ENSCSAG00000018270) #26 WDR44 (ENSCSAG00000018269) #27 PLS3 (ENSCSAG00000018267) Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000161570 ENSGT00950000183232 ENSGT00940000159922.b ENSGT00390000017282.r.a.b ENSGT01060000248594.e.a ENSGT00390000018248 ENSGT00940000163925 ENSGT00990000203589.a.b.a.b ENSGT00940000159055 ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159971 ENSGT00940000160039 ENSGT00940000162929.l ENSGT00950000183340 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00390000018873.c #24 ENSGT00940000154359.f #26 ENSGT00940000157557 #27 ENSGT00940000155658.bb.a #28 ENSGT00940000160896 #29 ENSGT01030000234522.C.b.e.a.b.f #30 ENSGT00440000033329.b.a.b #31 ENSGT00950000185370 ENSGT00940000160619 #33 ENSGT00440000039314.b #34 ENSGT00940000160686 #35 ENSGT00940000154400.b #36 ENSGT00390000002197.p #37 ENSGT00940000155075.a.b ENSGT00940000157256 Macaca ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000161570 ENSGT00950000183232 ENSGT00940000159922.b ENSGT00390000017282.r.a.b ENSGT01060000248594.e.a ENSGT00390000018248 ENSGT00940000163925 ENSGT00990000203589.a.b.a.b ENSGT00940000159055 ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159971 ENSGT00940000160039 ENSGT00940000162929.l ENSGT00950000183340 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00390000018873.c #24 ENSGT00940000154359.f #26 ENSGT00940000157557 #27 ENSGT00940000155658.bb.a #28 ENSGT00940000160896 #29 ENSGT01030000234522.C.b.e.a.b.f #30 ENSGT00440000033329.b.a.b #31 ENSGT00950000185370 ENSGT00940000160619 #33 ENSGT00530000064130.c.a.b ENSGT00940000160686 #35 ENSGT00940000154400.b #36 ENSGT00390000002197.p #37 ENSGT00940000155075.a.b ENSGT00940000157256 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 419 AGTR2 (ENSMNEG00000027643) #22 SLC6A14 (ENSMNEG00000043764) CT83 (ENSMNEG00000034180) #24 KLHL13 (ENSMNEG00000029163) #26 WDR44 (ENSMNEG00000028012) #27 DOCK11 (ENSMNEG00000034085) #28 IL13RA1 (ENSMNEG00000038953) #29 ZCCHC12 (ENSMNEG00000026384) #30 LONRF3 (ENSMNEG00000045507) #31 CT47C1 (ENSMNEG00000043721) KIAA1210 (ENSMNEG00000041033) #32 PGRMC1 (ENSMNEG00000035406) #33 SLC25A43 (ENSMNEG00000040923) #35 ENSMNEG00000038553 #36 STEEP1 (ENSMNEG00000030076) #37 UBE2A (ENSMNEG00000035208) Macaca_a ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00950000182988.a.b.b.b ENSGT00940000156128.b ENSGT00940000161570 ENSGT00940000159922.b ENSGT01060000248594.e.a ENSGT00390000018248 ENSGT00940000163925 ENSGT00990000203589.a.b.a.b ENSGT00940000159055 ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159971 ENSGT00940000160039 ENSGT00990000204264 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT00940000156297.p.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00390000018873.c #24 ENSGT00390000018873.d #24 ENSGT00940000154359.f #26 ENSGT00940000157557 #27 ENSGT00940000155658.bb.a #28 ENSGT00940000160896 #29 ENSGT01030000234522.C.b.e.a.b.f #30 ENSGT00440000033329.b.a.b #31 ENSGT00950000185370 ENSGT00940000160619 #33 ENSGT00530000064130.c.a.b ENSGT00940000160686 #35 ENSGT00940000154400.b #36 ENSGT00940000155075.a.b ENSGT00940000157256 Rhesus MODERN SPECIES 327 CAPN6 (ENSMMUG00000015308) DCX (ENSMMUG00000015312) ALG13 (ENSMMUG00000010421) TRPC5 (ENSMMUG00000010424) TRPC5OS (ENSMMUG00000064574) RTL4 (ENSMMUG00000059768) LHFPL1 (ENSMMUG00000000903) AMOT (ENSMMUG00000007688) HTR2C (ENSMMUG00000009607) IL13RA2 (ENSMMUG00000022224) LRCH2 (ENSMMUG00000017323) ENSMMUG00000060939 ENSMMUG00000007515 PLS3 (ENSMMUG00000006377) ENSMMUG00000019688 AGTR2 (ENSMMUG00000055906) #22 SLC6A14 (ENSMMUG00000057063) CT83 (ENSMMUG00000020849) #24 ENSMMUG00000032363 #24 ENSMMUG00000017109 KLHL13 (ENSMMUG00000002293) #26 WDR44 (ENSMMUG00000011497) #27 DOCK11 (ENSMMUG00000011498) #28 IL13RA1 (ENSMMUG00000053844) #29 ZCCHC12 (ENSMMUG00000017574) #30 LONRF3 (ENSMMUG00000016431) #31 CT47C1 (ENSMMUG00000019534) KIAA1210 (ENSMMUG00000019533) #32 PGRMC1 (ENSMMUG00000014466) #33 SLC25A43 (ENSMMUG00000020282) #35 UBE2A (ENSMMUG00000022667) Crab-eating macaque MODERN SPECIES 175 TRPC5 (ENSMFAG00000003102) TRPC5OS (ENSMFAG00000047357) ENSMFAG00000055408 RTL4 (ENSMFAG00000064863) ENSMFAG00000047521 LHFPL1 (ENSMFAG00000003226) AMOT (ENSMFAG00000032269) ENSMFAG00000032031 ENSMFAG00000049831 HTR2C (ENSMFAG00000064910) IL13RA2 (ENSMFAG00000003923) ENSMFAG00000048522 LUZP4 (ENSMFAG00000042600) PLS3 (ENSMFAG00000031185) ENSMFAG00000045515 AGTR2 (ENSMFAG00000008335) #22 ENSMFAG00000049076 ENSMFAG00000056981 ENSMFAG00000062982 SLC6A14 (ENSMFAG00000035389) CT83 (ENSMFAG00000052975) #24 ENSMFAG00000000247 #24 ENSMFAG00000065339 ENSMFAG00000055250 ENSMFAG00000057933 ENSMFAG00000059238 ENSMFAG00000052835 ENSMFAG00000024766 ENSMFAG00000049555 ENSMFAG00000065173 KLHL13 (ENSMFAG00000043732) #26 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00940000161570 ENSGT00950000183232 ENSGT00940000159922.b ENSGT00390000017282.r.a.b ENSGT01060000248594.e.a ENSGT00390000018248 ENSGT00940000163925 ENSGT00990000203589.a.b.a.b ENSGT00940000159055 ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159971 ENSGT00940000160039 ENSGT00990000204264 ENSGT00950000183340 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00390000018873.c #24 ENSGT00940000154359.f #26 ENSGT00940000157557 #27 ENSGT00940000155658.bb.a #28 ENSGT00940000160896 #29 ENSGT01030000234522.C.b.e.a.b.f #30 ENSGT00440000033329.b.a.b #31 ENSGT00390000002253.a ENSGT00940000163031.b.a #32 ENSGT00940000160619 #33 ENSGT00440000039314.b #34 ENSGT00940000160686 #35 ENSGT00940000154400.a.b ##36 ENSGT00390000002197.p #37 ENSGT00940000155075.a.b Olive baboon MODERN SPECIES 792 AMOT (ENSPANG00000021026) LHFPL1 (ENSPANG00000004576) RTL4 (ENSPANG00000044292) TRPC5OS (ENSPANG00000049143) TRPC5 (ENSPANG00000012213) ENSPANG00000044568 ENSPANG00000043135 ENSPANG00000051365 HTR2C (ENSPANG00000010092) IL13RA2 (ENSPANG00000012467) ENSPANG00000017967 LRCH2 (ENSPANG00000015253) ENSPANG00000024419 PLS3 (ENSPANG00000018366) ENSPANG00000044711 AGTR2 (ENSPANG00000022415) #22 SLC6A14 (ENSPANG00000002929) CT83 (ENSPANG00000025705) #24 ENSPANG00000037716 #24 ENSPANG00000043465 ENSPANG00000038296 KLHL13 (ENSPANG00000006811) #26 ENSPANG00000044557 ENSPANG00000046605 ENSPANG00000049849 WDR44 (ENSPANG00000012048) #27 DOCK11 (ENSPANG00000024417) #28 IL13RA1 (ENSPANG00000018627) #29 ZCCHC12 (ENSPANG00000033496) #30 LONRF3 (ENSPANG00000015252) #31 CT47C1 (ENSPANG00000039371) Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 89 ENSGT00940000156128.b ENSGT00910000147631 ENSGT00940000161570 ENSGT00950000183232 ENSGT00940000159922.b ENSGT00390000017282.r.a.b ENSGT01060000248594.e.a ENSGT00990000203589.a.b.a.b ENSGT00940000159055 ENSGT00940000164104.b ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159971 ENSGT00940000160039 ENSGT00950000183340 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00390000018873.c #24 ENSGT00940000154359.f #26 ENSGT00940000157557 #27 ENSGT00940000155658.bb.a #28 ENSGT00940000160896 #29 ENSGT01030000234522.C.b.e.a.b.f #30 ENSGT00440000033329.b.a.b #31 ENSGT00390000002253.a ENSGT00940000163031.b.a #32 ENSGT00940000160619 #33 ENSGT00940000160686 #35 ENSGT00940000154400.a.b ##36 ENSGT00390000002197.p #37 ENSGT00940000155075.a.b ENSGT00940000157256 Sooty mangabey MODERN SPECIES 283 ENSCATG00000039884 SERTM2 (ENSCATG00000013352) ALG13 (ENSCATG00000032824) TRPC5 (ENSCATG00000029734) LHFPL1 (ENSCATG00000041033) AMOT (ENSCATG00000035828) ENSCATG00000028931 ENSCATG00000043275 ENSCATG00000038904 HTR2C (ENSCATG00000031908) IL13RA2 (ENSCATG00000037283) LRCH2 (ENSCATG00000037702) LUZP4 (ENSCATG00000012199) PLS3 (ENSCATG00000038506) ENSCATG00000045172 AGTR2 (ENSCATG00000020256) #22 SLC6A14 (ENSCATG00000038946) CT83 (ENSCATG00000034454) #24 KLHL13 (ENSCATG00000040977) #26 WDR44 (ENSCATG00000044289) #27 DOCK11 (ENSCATG00000038401) #28 ENSCATG00000009670 ENSCATG00000040411 IL13RA1 (ENSCATG00000034378) #29 ZCCHC12 (ENSCATG00000006188) #30 LONRF3 (ENSCATG00000040361) #31 CT47C1 (ENSCATG00000038614) KIAA1210 (ENSCATG00000015100) #32 ENSCATG00000040418 PGRMC1 (ENSCATG00000039960) #33 SLC25A43 (ENSCATG00000045150) #35 Drill MODERN SPECIES 633 AGTR2 (ENSMLEG00000019955) #22 SLC6A14 (ENSMLEG00000036629) CT83 (ENSMLEG00000044123) #24 ENSMLEG00000042967 KLHL13 (ENSMLEG00000023263) #26 WDR44 (ENSMLEG00000043429) #27 DOCK11 (ENSMLEG00000013685) #28 IL13RA1 (ENSMLEG00000042144) #29 ZCCHC12 (ENSMLEG00000017941) #30 LONRF3 (ENSMLEG00000030948) #31 CT47C1 (ENSMLEG00000042244) KIAA1210 (ENSMLEG00000041621) #32 ENSMLEG00000036214 PGRMC1 (ENSMLEG00000031520) #33 SLC25A43 (ENSMLEG00000033832) #35 SLC25A5 (ENSMLEG00000031806) ##36 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000161570 ENSGT00950000183232 ENSGT00390000015797.d.m.a ENSGT00940000159922.b ENSGT01060000248594.e.a ENSGT00390000018248 ENSGT00940000163925 ENSGT00990000203589.a.b.a.b ENSGT00940000159055 ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159971 ENSGT00940000160039 ENSGT00940000162929.l ENSGT00950000183340 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00390000018873.c #24 ENSGT00390000018873.d #24 ENSGT00940000154359.f #26 ENSGT00940000157557 #27 ENSGT00940000155658.bb.a #28 ENSGT00940000160896 #29 ENSGT01030000234522.C.b.e.a.b.f #30 ENSGT00940000164191.b ENSGT00440000033329.b.a.b #31 ENSGT00390000002253.a ENSGT00940000163031.b.a #32 ENSGT00940000160619 #33 ENSGT00530000064130.c.a.b ENSGT00940000160686 #35 ENSGT00940000154400.a.b ##36 Hominidae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000161570 ENSGT00950000183232 ENSGT00390000015797.d.m.a 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AGTR2 (ENSPPYG00000020654) #22 SLC6A14 (ENSPPYG00000020656) CT83 (ENSPPYG00000020657) #24 ENSPPYG00000031592 #24 KLHL13 (ENSPPYG00000020658) #26 WDR44 (ENSPPYG00000020659) #27 DOCK11 (ENSPPYG00000020660) #28 IL13RA1 (ENSPPYG00000020661) #29 ZCCHC12 (ENSPPYG00000020662) #30 LONRF3 (ENSPPYG00000020663) #31 CT47C1 (ENSPPYG00000020664) KIAA1210 (ENSPPYG00000020665) #32 PGRMC1 (ENSPPYG00000020666) #33 SLC25A43 (ENSPPYG00000035637) #35 ENSPPYG00000033592 SLC25A5 (ENSPPYG00000020669) ##36 Gibbon MODERN SPECIES 449 ENSNLEG00000028689 ALG13 (ENSNLEG00000014546) TRPC5 (ENSNLEG00000014606) RTL4 (ENSNLEG00000014618) LHFPL1 (ENSNLEG00000014619) AMOT (ENSNLEG00000014625) ENSNLEG00000027151 HTR2C (ENSNLEG00000030638) ENSNLEG00000033896 IL13RA2 (ENSNLEG00000014640) LRCH2 (ENSNLEG00000014656) ENSNLEG00000028889 ENSNLEG00000033339 PLS3 (ENSNLEG00000014671) ENSNLEG00000028901 AGTR2 (ENSNLEG00000032737) #22 SLC6A14 (ENSNLEG00000014716) ENSNLEG00000014732 #24 ENSNLEG00000034861 #24 KLHL13 (ENSNLEG00000014736) #26 WDR44 (ENSNLEG00000014755) #27 DOCK11 (ENSNLEG00000014789) #28 IL13RA1 (ENSNLEG00000014814) #29 ENSNLEG00000033569 #30 ENSNLEG00000030944 ENSNLEG00000014827 #31 ENSNLEG00000034815 KIAA1210 (ENSNLEG00000014834) #32 PGRMC1 (ENSNLEG00000014842) #33 SLC25A43 (ENSNLEG00000028599) #35 SLC25A5 (ENSNLEG00000014852) ##36 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 41 ENSGT00940000156128.b ENSGT00940000161570.a ENSGT00950000183232 ENSGT00940000159922.b ENSGT01060000248594.e.a ENSGT00390000018248 ENSGT00990000203589.a.b.a.b ENSGT00940000159055 ENSGT00940000158041.c.b ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159971 ENSGT00940000160039 ENSGT00990000204264 ENSGT00940000165469 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00390000018873 #24 ENSGT00940000154359.f #26 ENSGT00550000074618.a.a.j.a ENSGT00940000157557 #27 ENSGT00940000155658 #28 ENSGT00940000160896 #29 ENSGT01030000234522.C.b.e.a.b.f #30 ENSGT00440000033329.b.a.b #31 ENSGT00390000002253.a ENSGT00940000163031.b.a #32 ENSGT00940000160619 #33 ENSGT00530000064130.c.a ENSGT00940000160686 #35 ENSGT00940000154400.a.b ##36 ENSGT00390000002197.p #37 Cebidae ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00950000182988.a.b.b.b ENSGT00940000156128.b ENSGT00940000161570.a ENSGT00950000183232 ENSGT00940000159922.b ENSGT01060000248594.e.a ENSGT00390000018248 ENSGT00990000203589.a.b.a.b ENSGT00940000159055 ENSGT00940000158041.c.b ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159971 ENSGT00940000160039 ENSGT00990000204264 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00390000018873.a #24 ENSGT00940000154359.f #26 ENSGT00550000074618.a.a.j.a ENSGT00940000157557 #27 ENSGT00940000155658 #28 ENSGT00940000160896 #29 ENSGT01030000234522.C.b.e.a.b.f #30 ENSGT00440000033329.b.a.b #31 ENSGT00390000002253.a ENSGT00940000163031.b.a #32 ENSGT00940000160619 #33 ENSGT00530000064130.c.a ENSGT00940000160686 #35 ENSGT00940000154400.a.b.b ##36 ENSGT00390000002197.p #37 Marmoset MODERN SPECIES 78 ENSCJAG00000073196 ALG13 (ENSCJAG00000007056) TRPC5 (ENSCJAG00000007053) TRPC5OS (ENSCJAG00000046018) LHFPL1 (ENSCJAG00000070219) AMOT (ENSCJAG00000007004) ENSCJAG00000023432 ENSCJAG00000066287 ENSCJAG00000076352 #21 HTR2C (ENSCJAG00000006967) IL13RA2 (ENSCJAG00000006949) ENSCJAG00000070981 ENSCJAG00000001968 ENSCJAG00000077783 PLS3 (ENSCJAG00000001982) AGTR2 (ENSCJAG00000002516) #22 SLC6A14 (ENSCJAG00000043509) ENSCJAG00000002485 #24 ENSCJAG00000074258 ENSCJAG00000078021 ENSCJAG00000053773 #24 ENSCJAG00000083115 KLHL13 (ENSCJAG00000002447) #26 WDR44 (ENSCJAG00000002408) #27 DOCK11 (ENSCJAG00000002281) #28 ENSCJAG00000064943 ENSCJAG00000086389 IL13RA1 (ENSCJAG00000040932) #29 ZCCHC12 (ENSCJAG00000039059) #30 LONRF3 (ENSCJAG00000005189) #31 ENSCJAG00000064726 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES 67 ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00390000018873.a #24 ENSGT00940000154359.f #26 ENSGT00550000074618.a.a.j.a ENSGT00940000157557 #27 ENSGT00940000155658 #28 ENSGT00940000160896 #29 ENSGT00440000033329.b.a.b #31 ENSGT00390000002253.a ENSGT00950000185370 ENSGT00940000160619 #33 ENSGT00530000064130.c.a ENSGT00940000160686 #35 ENSGT00940000154400.a.b.b ##36 ENSGT00390000002197.p #37 ENSGT00940000155075.a.b.v.b Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 85 AGTR2 (ENSSBOG00000015085) #22 ENSSBOG00000034479 SLC6A14 (ENSSBOG00000025912) CT83 (ENSSBOG00000028750) #24 KLHL13 (ENSSBOG00000001403) #26 ENSSBOG00000023834 WDR44 (ENSSBOG00000035467) #27 DOCK11 (ENSSBOG00000018795) #28 IL13RA1 (ENSSBOG00000014267) #29 LONRF3 (ENSSBOG00000026750) #31 CT47C1 (ENSSBOG00000028868) PGRMC1 (ENSSBOG00000020615) #33 ENSSBOG00000030322 SLC25A43 (ENSSBOG00000019634) #35 STEEP1 (ENSSBOG00000024579) #37 UBE2A (ENSSBOG00000032134) Capuchin MODERN SPECIES 861 AGTR2 (ENSCCAG00000031674) #22 Mas night monkey MODERN SPECIES 928 AGTR2 (ENSANAG00000015473) #22 SLC6A14 (ENSANAG00000026701) ENSANAG00000035121 ENSANAG00000020579 KLHL13 (ENSANAG00000034243) #26 ENSANAG00000023743 WDR44 (ENSANAG00000025934) #27 DOCK11 (ENSANAG00000030286) #28 IL13RA1 (ENSANAG00000002047) #29 LONRF3 (ENSANAG00000020507) #31 CT47C1 (ENSANAG00000027186) KIAA1210 (ENSANAG00000036561) #32 PGRMC1 (ENSANAG00000035662) #33 ENSANAG00000023853 SLC25A43 (ENSANAG00000017265) #35 SLC25A5 (ENSANAG00000028035) ##36 Tarsier MODERN SPECIES 3890 AGTR2 (ENSTSYG00000007517) #22 SLC6A14 (ENSTSYG00000014708) #23 CT83 (ENSTSYG00000014709) #24 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000159688 #23 ENSGT00390000018873 #24 ENSGT00940000154359.f #26 ENSGT00940000157557 #27 ENSGT00940000155658 #28 ENSGT00940000160896 #29 ENSGT01030000234522.C.b.e.a.b.g #30 ENSGT00440000033329.b.a.b #31 ENSGT00940000163031.b.a #32 ENSGT00940000160619 #33 ENSGT00440000039314.b #34 ENSGT00940000160686 #35 ENSGT00940000154400.b #36 ENSGT00390000002197 #37 ENSGT00940000155075.a.b Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES 79 ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000159688 #23 ENSGT00390000018873 #24 ENSGT00940000154359.f #26 ENSGT00940000157557 #27 ENSGT00940000155658 #28 ENSGT00940000160896 #29 ENSGT01030000234522.C.b.e.a.b.g #30 ENSGT00440000033329.b.a.b #31 ENSGT00940000160619 #33 ENSGT00940000160686 #35 ENSGT00940000154400.b #36 ENSGT00390000002197 #37 ENSGT00940000155075.a.b ENSGT00940000157256 ENSGT00940000158026 Mouse lemur MODERN SPECIES 169 ENSMICG00000041850 IL13RA2 (ENSMICG00000032540) LRCH2 (ENSMICG00000047056) ENSMICG00000032868 ENSMICG00000042645 ENSMICG00000046847 ENSMICG00000001553 ENSMICG00000047685 ENSMICG00000028066 ENSMICG00000030188 ENSMICG00000027684 ENSMICG00000042624 ENSMICG00000038657 XIAP (ENSMICG00000004339) STAG2 (ENSMICG00000033289) AGTR2 (ENSMICG00000044784) #22 ENSMICG00000037304 #23 CT83 (ENSMICG00000029868) #24 ENSMICG00000026999 KLHL13 (ENSMICG00000035307) #26 ENSMICG00000034601 WDR44 (ENSMICG00000000877) #27 DOCK11 (ENSMICG00000011698) #28 ENSMICG00000031264 IL13RA1 (ENSMICG00000046669) #29 ENSMICG00000041498 #30 LONRF3 (ENSMICG00000004246) #31 PGRMC1 (ENSMICG00000004265) #33 SLC25A43 (ENSMICG00000043952) #35 ENSMICG00000035994 ENSMICG00000030606 Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 Coquerels sifaka MODERN SPECIES 580 ENSPCOG00000013043 ENSPCOG00000021221 AGTR2 (ENSPCOG00000025934) #22 ENSPCOG00000019015 SLC6A14 (ENSPCOG00000015850) CT83 (ENSPCOG00000010682) #24 Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 1367 ENSPSMG00000016145 ENSPSMG00000016135 AGTR2 (ENSPSMG00000016131) #22 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000161570 ENSGT00950000183232 ENSGT00510000047493 ENSGT00940000159922.b ENSGT01060000248594.e.a ENSGT00390000018248 ENSGT00940000163925 ENSGT00990000203589.a.b.a.b ENSGT00940000159055 ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159971 ENSGT00940000160039 ENSGT00990000204264 ENSGT00990000205098 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000159688 #23 ENSGT00390000018873 #24 ENSGT00940000154359.f #26 ENSGT00940000157557 #27 ENSGT00940000155658 #28 ENSGT00940000160896 #29 ENSGT00440000033329.b.a.b #31 ENSGT00390000002253 ENSGT00950000185370 ENSGT00940000163031.b.a #32 ENSGT00940000160619 #33 ENSGT00440000039314.b #34 ENSGT00940000160686 #35 ENSGT00940000154400.b #36 ENSGT00390000002197 #37 Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 Hedgehog MODERN SPECIES 10618 AGTR2 (ENSEEUG00000012908) #22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000156128.b ENSGT00940000161570 ENSGT00950000183232 ENSGT00510000047493 ENSGT00940000159922.b ENSGT01060000248594.e.a ENSGT00390000018248 ENSGT00940000163925 ENSGT00990000203589.a.b.a.b ENSGT00940000159055 ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159971 ENSGT00940000160039 ENSGT00990000205098 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000159688 #23 ENSGT00390000018873 #24 ENSGT00940000154359.f #26 ENSGT00940000157557 #27 ENSGT00940000155658 #28 ENSGT00940000160896 #29 ENSGT01030000234522.C.b.e.a.b.i #30 ENSGT00440000033329.b.a.b #31 ENSGT00940000163031.b.a #32 ENSGT00950000185370 ENSGT00940000160619 #33 ENSGT00440000039314.b #34 ENSGT00940000160686 #35 ENSGT00940000154400.b #36 ENSGT00390000002197 #37 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000155075.a.b ENSGT00390000002197 #37 ENSGT00940000154400.b #36 ENSGT00940000160686 #35 ENSGT00440000039314.b #34 ENSGT00940000160619 #33 ENSGT00950000185370 ENSGT00440000033329.b.a.b #31 ENSGT01030000234522.C.b.e.a.b.i #30 ENSGT00940000160896 #29 ENSGT00940000155658 #28 ENSGT00940000157557 #27 ENSGT00940000154359.f #26 ENSGT00390000018873 #24 ENSGT00940000159688 #23 ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT00990000205098 ENSGT00940000160039 ENSGT00940000159971 ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159055 ENSGT00990000203589.a.b.a.b ENSGT00940000163925 ENSGT01060000248594.e.a ENSGT00390000018248 ENSGT00940000159922.b ENSGT00510000047493 ENSGT00950000183232 ENSGT00940000161570 ENSGT00940000156128.b Suina ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000002197 #37 ENSGT00940000154400.b #36 ENSGT00940000160686 #35 ENSGT00440000039314.b 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#35 ENSCDRG00005011276 #34 PGRMC1 (ENSCDRG00005011247) #33 ENSCDRG00005011180 ENSCDRG00005011124 LONRF3 (ENSCDRG00005010727) #31 ENSCDRG00005010706 #30 IL13RA1 (ENSCDRG00005010522) #29 DOCK11 (ENSCDRG00005009656) #28 WDR44 (ENSCDRG00005009484) #27 KLHL13 (ENSCDRG00005009107) #26 ENSCDRG00005009043 CT83 (ENSCDRG00005008988) #24 ENSCDRG00005008836 #23 AGTR2 (ENSCDRG00005008814) #22 PLS3 (ENSCDRG00005008407) LRCH2 (ENSCDRG00005008234) IL13RA2 (ENSCDRG00005008060) HTR2C (ENSCDRG00005007965) ENSCDRG00005007907 ENSCDRG00005007889 ENSCDRG00005007838 AMOT (ENSCDRG00005007728) LHFPL1 (ENSCDRG00005007705) RTL4 (ENSCDRG00005007694) TRPC5 (ENSCDRG00005007632) ENSCDRG00005007576 ENSCDRG00005007494 ENSCDRG00005007416 TCEAL1 (ENSCDRG00005007397) Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000154400.b #36 ENSGT00940000160686 #35 ENSGT00440000039314.b #34 ENSGT00940000160619 #33 ENSGT00950000185370 ENSGT00940000155145 ENSGT00390000002253 ENSGT00440000033329.b.a.b #31 ENSGT01030000234522.C.b.e.a.b.i 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bison MODERN SPECIES 3360 ENSBBBG00000017763 AGTR2 (ENSBBBG00000017747) #22 PNPLA4 (ENSBBBG00000017745) ANOS1 (ENSBBBG00000017715) ENSBBBG00000017691 GPR143 (ENSBBBG00000004346) ENSBBBG00000008006 ENSBBBG00000004335 ENSBBBG00000007432 ENSBBBG00000017461 Caprinae ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT00940000155658 #28 ENSGT00940000157557 #27 ENSGT00940000154359.f #26 ENSGT00390000018873 #24 ENSGT00940000159688 #23 ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000159818 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT00940000160039 ENSGT00940000159971 ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159055 ENSGT00990000203589.a.b.a.b ENSGT01060000248594.e.a ENSGT00940000159922.b ENSGT00510000047493.m ENSGT00950000183232 ENSGT00940000161570 ENSGT00940000156128.b ENSGT00950000182988.a.b.b.b ENSGT00950000185157 Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 205 IGSF1 (ENSOARG00020020748) ENSOARG00020021060 ARHGAP36 (ENSOARG00020021118) ENOX2 (ENSOARG00020021894) ENSOARG00020022292 ENSOARG00020022310 DOCK11 (ENSOARG00020022385) #28 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ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00950000183232 ENSGT00510000047493 ENSGT00940000159922.b ENSGT01060000248594.e.a ENSGT00390000018248 ENSGT00940000163925 ENSGT00990000203589.a.b.a.b ENSGT00940000159055 ENSGT00550000075035.o.b ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000157540.A.k.b ENSGT00940000159971 ENSGT00940000160039 ENSGT00990000205098 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000159688 #23 ENSGT00390000018873 #24 ENSGT00940000154359.f #26 ENSGT00940000157557 #27 ENSGT00940000155658 #28 ENSGT00940000160896 #29 ENSGT01030000234522.C.b.e.a.b.i #30 ENSGT00440000033329.b.a.b #31 ENSGT00940000163031.b.a #32 ENSGT00390000003197.i.a.y.b ENSGT00940000164744 ENSGT00940000160619 #33 ENSGT00440000039314.b #34 ENSGT00940000160686 #35 ENSGT00940000154400.b #36 Canidae ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00940000159922.b ENSGT01060000248594.e.a ENSGT00390000018248 ENSGT00940000163925 ENSGT00990000203589.a.b.a.b ENSGT00940000159055 ENSGT00550000075035.o.b ENSGT00390000005254.i.b.j 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ENSGT00940000159688 #23 ENSGT00390000018873 #24 ENSGT00390000000571.a ENSGT00940000156221.b ENSGT00940000154359.f #26 ENSGT00390000006621.p.b ENSGT00940000157557 #27 ENSGT00940000155658 #28 ENSGT00940000160896 #29 ENSGT01030000234522.C.b.e.a.b.i #30 ENSGT00440000033329.b.a.b #31 ENSGT00940000163031.b.a #32 ENSGT00390000003197.i.a.y.b ENSGT00940000160619 #33 ENSGT00440000039314.b #34 Dog MODERN SPECIES 144 AMOT (ENSCAFG00845023646) ENSCAFG00845023745 ENSCAFG00845015589 ENSCAFG00845015615 ENSCAFG00845015637 ENSCAFG00845015656 ENSCAFG00845015677 ENSCAFG00845015701 HTR2C (ENSCAFG00845015792) ENSCAFG00845015960 IL13RA2 (ENSCAFG00845016176) LRCH2 (ENSCAFG00845016493) ENSCAFG00845016662 PLS3 (ENSCAFG00845017128) ENSCAFG00845017579 AGTR2 (ENSCAFG00845017623) #22 SLC6A14 (ENSCAFG00845017665) #23 ENSCAFG00845017849 #24 ENSCAFG00845017892 ENSCAFG00845017940 KLHL13 (ENSCAFG00845018113) #26 ENSCAFG00845018585 WDR44 (ENSCAFG00845018713) #27 DOCK11 (ENSCAFG00845018981) #28 ENSCAFG00845019196 IL13RA1 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(ENSMPUG00000001555) #37 Ursidae ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00950000183232 ENSGT00510000047493 ENSGT00940000159922.b ENSGT00390000018248 ENSGT01060000248594.e.a ENSGT00940000163925 ENSGT00990000203589.a.b.a.b ENSGT00940000159055 ENSGT00550000075035.o.b ENSGT00940000157540.A.k.b ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159971 ENSGT00940000160039 ENSGT00990000205098 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000159688 #23 ENSGT00390000018873 #24 ENSGT00940000154359.f #26 ENSGT00940000157557 #27 ENSGT00940000155658 #28 ENSGT00940000160896 #29 ENSGT01030000234522.C.b.e.a.b.i #30 ENSGT00440000033329.b.a.b #31 ENSGT00940000163031.b.a #32 ENSGT00390000003197.i.a.y.b ENSGT00940000160619.n #33 ENSGT00440000039314.b #34 ENSGT00940000160686 #35 ENSGT00940000154400.b #36 ENSGT00390000002197 #37 Ursus ANCESTRAL SPECIES 189 ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000159688 #23 ENSGT00390000018873 #24 ENSGT00940000154359.f #26 ENSGT00940000157557 #27 ENSGT00940000155658 #28 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ENSGT01030000234522.C.b.e.a.b.i #30 ENSGT00440000033329.b.a.b #31 ENSGT00940000160619 #33 ENSGT00440000039314.b #34 ENSGT00940000160686 #35 ENSGT00940000154400.b #36 ENSGT00390000002197 #37 ENSGT00940000155075.a.b ENSGT00940000157256 Tiger MODERN SPECIES 256 AGTR2 (ENSPTIG00000009635) #22 ENSPTIG00000007756 #23 CT83 (ENSPTIG00000008031) #24 DYRK1B (ENSPTIG00000008058) FBL (ENSPTIG00000008381) ENSPTIG00000008725 PSMC4 (ENSPTIG00000009877) ENSPTIG00000010398 ENSPTIG00000010530 ENSPTIG00000010643 ENSPTIG00000010806 AKT2 (ENSPTIG00000010966) C19orf47 (ENSPTIG00000011865) PLD3 (ENSPTIG00000011966) HIPK4 (ENSPTIG00000012551) ENSPTIG00000012781 Panthera_a ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00510000047493 ENSGT00940000159922.b ENSGT01060000248594.e.a ENSGT00390000018248 ENSGT00940000163925 ENSGT00990000203589.a.b.a.b ENSGT00940000159055 ENSGT00960000186788 ENSGT00440000033468.c.b ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000157540.A.k.b ENSGT00940000159971 ENSGT00940000160039 ENSGT01020000230624.a 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#30 ENSGT00440000033329.b.a.b #31 ENSGT00950000185370 ENSGT00940000160619 #33 ENSGT00440000039314.b #34 ENSGT00940000160686 #35 ENSGT00940000154400.b #36 ENSGT00390000002197 #37 ENSGT00940000155075.a.b Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00390000010397.a ENSGT00730000110943.A.d ENSGT00940000160983 ENSGT00950000182988.a.b.b.b ENSGT00940000156128.b ENSGT00940000154895.a.b ENSGT00390000018248 ENSGT01060000248594.e.a ENSGT00940000163925 ENSGT00990000203589.a.b.a.b ENSGT00940000159055 ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159971 ENSGT00940000160039 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000159688 #23 ENSGT00390000018873 #24 ENSGT00940000154359.f #26 ENSGT00940000157557 #27 ENSGT00940000155658 #28 ENSGT00940000160896 #29 ENSGT01030000234522.C.b.e.a.b.i #30 ENSGT00440000033329.b.a.b #31 ENSGT00950000185370 ENSGT00940000160619 #33 ENSGT00440000039314.b #34 ENSGT00940000160686 #35 ENSGT00940000154400.b #36 ENSGT00390000002197 #37 ENSGT00940000155075.a.b Microbat MODERN SPECIES 939 CAPN6 (ENSMLUG00000005892) ENSMLUG00000005902 ENSMLUG00000028647 ALG13 (ENSMLUG00000006264) TRPC5 (ENSMLUG00000003191) RTL4 (ENSMLUG00000016922) LHFPL1 (ENSMLUG00000009118) AMOT (ENSMLUG00000003647) ENSMLUG00000028246 ENSMLUG00000030503 HTR2C (ENSMLUG00000000264) IL13RA2 (ENSMLUG00000010477) ENSMLUG00000025585 LRCH2 (ENSMLUG00000001866) PLS3 (ENSMLUG00000005398) AGTR2 (ENSMLUG00000004283) #22 ENSMLUG00000005842 #23 ENSMLUG00000005847 #24 ENSMLUG00000028410 ENSMLUG00000009996 KLHL13 (ENSMLUG00000027393) #26 WDR44 (ENSMLUG00000013400) #27 DOCK11 (ENSMLUG00000017040) #28 IL13RA1 (ENSMLUG00000017055) #29 ENSMLUG00000014630 #30 LONRF3 (ENSMLUG00000009240) #31 ENSMLUG00000028852 ENSMLUG00000001892 PGRMC1 (ENSMLUG00000000278) #33 ENSMLUG00000029168 SLC25A43 (ENSMLUG00000015726) #35 Megabat MODERN SPECIES 4392 AGTR2 (ENSPVAG00000011251) #22 Equus ANCESTRAL SPECIES 39 ENSGT00940000156128.b ENSGT00940000161570 ENSGT00950000183232 ENSGT00510000047493 ENSGT00940000159922.b ENSGT00390000018248 ENSGT01060000248594.e.a ENSGT00940000163925 ENSGT00990000203589.a.b.a.b ENSGT00940000159055 ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159971 ENSGT00940000160039 ENSGT00940000165469 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000159688 #23 ENSGT00390000018873 #24 ENSGT00940000154359.f #26 ENSGT00940000157557 #27 ENSGT00940000155658 #28 ENSGT00940000160896 #29 ENSGT01030000234522.C.b.e.a.b.i #30 ENSGT00440000033329.b.a.b #31 ENSGT00950000185370 ENSGT00940000160619 #33 ENSGT00440000039314.b #34 ENSGT00940000154400.b #36 ENSGT00390000002197 #37 ENSGT00940000155075.a.b ENSGT00940000157256 Horse MODERN SPECIES 480 ENSECAG00000053523 ENSECAG00000039392 ENSECAG00000056183 ALG13 (ENSECAG00000022134) TRPC5 (ENSECAG00000023439) TRPC5OS (ENSECAG00000056999) RTL4 (ENSECAG00000003482) LHFPL1 (ENSECAG00000015524) AMOT (ENSECAG00000015878) ENSECAG00000051999 HTR2C (ENSECAG00000021540) IL13RA2 (ENSECAG00000024016) LRCH2 (ENSECAG00000000625) ENSECAG00000031884 PLS3 (ENSECAG00000013135) AGTR2 (ENSECAG00000018905) #22 SLC6A14 (ENSECAG00000021061) #23 CT83 (ENSECAG00000007887) #24 ENSECAG00000057751 KLHL13 (ENSECAG00000008237) #26 WDR44 (ENSECAG00000012077) #27 DOCK11 (ENSECAG00000020337) #28 ENSECAG00000057731 IL13RA1 (ENSECAG00000019115) #29 ZCCHC12 (ENSECAG00000003626) #30 ENSECAG00000047780 LONRF3 (ENSECAG00000024139) #31 ENSECAG00000055470 KIAA1210 (ENSECAG00000009081) PGRMC1 (ENSECAG00000039508) #33 AKAP17B (ENSECAG00000003863) #34 Donkey MODERN SPECIES 36 PAK3 (ENSEASG00005008209) CAPN6 (ENSEASG00005008193) SERTM2 (ENSEASG00005030037) ENSEASG00005038348 ENSEASG00005038576 TRPC5OS (ENSEASG00005032981) TRPC5 (ENSEASG00005019621) RTL4 (ENSEASG00005019628) LHFPL1 (ENSEASG00005019629) AMOT (ENSEASG00005019632) HTR2C (ENSEASG00005020350) IL13RA2 (ENSEASG00005020346) LRCH2 (ENSEASG00005017932) ENSEASG00005038083 PLS3 (ENSEASG00005012825) AGTR2 (ENSEASG00005029442) #22 ENSEASG00005019583 #23 CT83 (ENSEASG00005032681) #24 KLHL13 (ENSEASG00005016421) #26 WDR44 (ENSEASG00005016476) #27 DOCK11 (ENSEASG00005010428) #28 IL13RA1 (ENSEASG00005029398) #29 ENSEASG00005026895 #30 LONRF3 (ENSEASG00005006109) #31 ENSEASG00005007173 PGRMC1 (ENSEASG00005029757) #33 ENSEASG00005037950 #34 SLC25A5 (ENSEASG00005031452) #36 STEEP1 (ENSEASG00005012866) #37 UBE2A (ENSEASG00005012902) NKRF (ENSEASG00005012904) Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 69 ENSGT00940000160983 ENSGT00950000182988.a.b.b.b ENSGT00940000156128.b ENSGT00940000154895.a.b ENSGT00940000161570 ENSGT00510000047493 ENSGT00940000159922.b ENSGT01060000248594.e.a ENSGT00940000163925 ENSGT00990000203589.a.b.a.b ENSGT00940000159055 ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159971 ENSGT00940000160039 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000159688 #23 ENSGT00390000018873 #24 ENSGT00940000154359.f #26 ENSGT00940000157557 #27 ENSGT00940000155658 #28 ENSGT00940000160896 #29 ENSGT01030000234522.C.b.e.a.b #30 ENSGT00440000033329.b.a.b #31 ENSGT00390000002253 ENSGT00940000163031.b.a #32 ENSGT00940000160619 #33 ENSGT00440000039314.b #34 ENSGT00940000160686 #35 ENSGT00940000154400 #36 ENSGT00390000002197 #37 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 64 ENSGT00730000110943.A.d ENSGT00940000160983 ENSGT00950000182988.a.b.b.b ENSGT00940000156128.b ENSGT00940000161570 ENSGT00510000047493 ENSGT00940000159922.b ENSGT01060000248594.e.a ENSGT00940000163925 ENSGT00990000203589.a.b.a.b ENSGT00940000159055 ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159971 ENSGT00940000160039 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000159688 #23 ENSGT00390000018873 #24 ENSGT00940000154359.f #26 ENSGT00940000157557 #27 ENSGT00940000155658 #28 ENSGT00940000160896 #29 ENSGT00440000033329.b.a.b #31 ENSGT00940000160619 #33 ENSGT00440000039314.b #34 ENSGT00940000160686 #35 ENSGT00940000154400 #36 ENSGT00390000002197 #37 ENSGT00940000155075.a.b ENSGT00940000157256 ENSGT00940000158026 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 60 ENSGT00730000110943.A.d ENSGT00940000160983 ENSGT00950000182988.a.b.b.b ENSGT00940000156128.b ENSGT00940000161570 ENSGT00510000047493 ENSGT00940000159922.b ENSGT01060000248594.e.a ENSGT00940000163925 ENSGT00990000203589.a.b.a.b ENSGT00940000159055 ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159971 ENSGT00940000160039 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000159688 #23 ENSGT00390000018873 #24 ENSGT00940000154359.f #26 ENSGT00940000157557 #27 ENSGT00940000155658 #28 ENSGT00940000160896 #29 ENSGT00440000033329.b.a.b #31 ENSGT00940000160619 #33 ENSGT00440000039314.b #34 ENSGT00940000160686 #35 ENSGT00940000154400 #36 ENSGT00390000002197 #37 ENSGT00940000155075.a.b ENSGT00940000157256 ENSGT00940000158026 Elephant MODERN SPECIES 320 RTL9 (ENSLAFG00000027146) CHRDL1 (ENSLAFG00000018025) PAK3 (ENSLAFG00000005567) CAPN6 (ENSLAFG00000005575) DCX (ENSLAFG00000005582) ENSLAFG00000030843 ALG13 (ENSLAFG00000017925) TRPC5 (ENSLAFG00000017932) RTL4 (ENSLAFG00000025790) LHFPL1 (ENSLAFG00000002339) AMOT (ENSLAFG00000000349) HTR2C (ENSLAFG00000003316) IL13RA2 (ENSLAFG00000013156) LRCH2 (ENSLAFG00000008725) PLS3 (ENSLAFG00000017073) AGTR2 (ENSLAFG00000004752) #22 ENSLAFG00000013875 #23 CT83 (ENSLAFG00000021969) #24 ENSLAFG00000027141 KLHL13 (ENSLAFG00000008122) #26 WDR44 (ENSLAFG00000008093) #27 DOCK11 (ENSLAFG00000002510) #28 IL13RA1 (ENSLAFG00000006708) #29 LONRF3 (ENSLAFG00000020846) #31 ENSLAFG00000025839 #33 ENSLAFG00000031823 #34 ENSLAFG00000020744 #34 SLC25A43 (ENSLAFG00000029086) #35 SLC25A5 (ENSLAFG00000029398) #36 STEEP1 (ENSLAFG00000017745) #37 UBE2A (ENSLAFG00000006533) Hyrax MODERN SPECIES 8441 AGTR2 (ENSPCAG00000001268) #22 Marsupialia ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00940000154411.`b.i.e.b.b ENSGT00950000182988.a.b.b.b ENSGT00940000156128.b ENSGT00940000161570 ENSGT00950000183232 ENSGT00510000047493 ENSGT00940000159922.b ENSGT01060000248594.e.a ENSGT00990000203589.a.b.a.b ENSGT00940000159055 ENSGT00390000006939.c ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159971 ENSGT00940000160039 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000159688 #23 ENSGT00940000156164.f ENSGT00940000154359 #26 ENSGT00940000157557 #27 ENSGT00940000155658 #28 ENSGT00940000160896 #29 ENSGT00940000161713 ENSGT01060000248842 ENSGT00940000160481 ENSGT00390000006915.c.d ENSGT00940000158789 ENSGT00390000008751.b ENSGT00940000161656 ENSGT00940000158469 ENSGT00940000154661.a.a Opossum MODERN SPECIES 627 ENSMODG00000005275 PAK3 (ENSMODG00000005255) CAPN6 (ENSMODG00000005238) ENSMODG00000037776 ENSMODG00000005175 ENSMODG00000005159 ENSMODG00000005054 LHFPL1 (ENSMODG00000005109) AMOT (ENSMODG00000005098) ENSMODG00000025173 ENSMODG00000005047 HTR2C (ENSMODG00000005042) ENSMODG00000005037 LRCH2 (ENSMODG00000005026) PLS3 (ENSMODG00000004940) AGTR2 (ENSMODG00000004897) #22 ENSMODG00000042869 ENSMODG00000004365 #23 ENSMODG00000040103 ENSMODG00000009077 ENSMODG00000009064 ENSMODG00000036377 PCDH19 (ENSMODG00000009008) TNMD (ENSMODG00000008987) ENSMODG00000017489 ENSMODG00000045389 ENSMODG00000017486 ENSMODG00000025187 ENSMODG00000049110 ENSMODG00000017482 ENSMODG00000017480 Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00940000154411.`b.i.e.b.b ENSGT00950000182988.a.b.b.b ENSGT00940000156128.b ENSGT00940000161570 ENSGT00950000183232 ENSGT00510000047493 ENSGT00940000159922.b ENSGT01060000248594.e.a ENSGT00990000203589.a.b.a.b ENSGT00940000159055 ENSGT00390000006939.c ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159971 ENSGT00940000160039 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000159688 #23 ENSGT00940000154359.j #26 ENSGT00940000157557 #27 ENSGT00940000155658 #28 ENSGT00940000160896 #29 ENSGT00940000161713 ENSGT01060000248842 ENSGT00940000160481 ENSGT00390000006915.c.d ENSGT00940000158789 ENSGT00390000008751.b ENSGT00940000161656 ENSGT00940000158469 ENSGT00940000154661.a.a ENSGT00940000164465 Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES 76 ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159971 ENSGT00940000160039 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000159688 #23 ENSGT00940000154359.j #26 ENSGT00940000157557 #27 ENSGT00940000155658 #28 ENSGT00940000160896 #29 ENSGT00940000161713 ENSGT01060000248842 ENSGT00940000160481 ENSGT00390000006915.c.d ENSGT00940000158789 ENSGT00390000008751.b ENSGT00940000161656 ENSGT00940000158469 ENSGT00940000154661.a.a ENSGT00940000164465 Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES 76 ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159971 ENSGT00940000160039 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000159688 #23 ENSGT00940000154359.j #26 ENSGT00940000157557 #27 ENSGT00940000155658 #28 ENSGT00940000160896 #29 ENSGT00940000161713 ENSGT01060000248842 ENSGT00940000160481 ENSGT00390000006915.c.d ENSGT00940000158789 ENSGT00390000008751.b ENSGT00940000161656 ENSGT00940000158469 ENSGT00940000154661.a.a ENSGT00940000164465.g Common wonbat MODERN SPECIES 1214 ENSVURG00010018535 PLS3 (ENSVURG00010018540) AGTR2 (ENSVURG00010018552) #22 ENSVURG00010018558 #23 koala MODERN SPECIES 145 HTR2C (ENSPCIG00000019341) IL13RA2 (ENSPCIG00000036107) LRCH2 (ENSPCIG00000019352) ENSPCIG00000019366 PLS3 (ENSPCIG00000003896) AGTR2 (ENSPCIG00000013834) #22 ENSPCIG00000013702 #23 ENSPCIG00000013675 #26 WDR44 (ENSPCIG00000009561) #27 DOCK11 (ENSPCIG00000020425) #28 IL13RA1 (ENSPCIG00000020422) #29 SLC25A53 (ENSPCIG00000032202) ENSPCIG00000020416 RAB9B (ENSPCIG00000020415) PLP1 (ENSPCIG00000033324) ENSPCIG00000020208 GLA (ENSPCIG00000020196) ENSPCIG00000020194 BTK (ENSPCIG00000020184) ENSPCIG00000037051 ENSPCIG00000020180 Wallaby MODERN SPECIES 12219 AGTR2 (ENSMEUG00000009019) #22 Tasmanian devil MODERN SPECIES 21 ENSSHAG00000025238 ENSSHAG00000006296 ENSSHAG00000004617 CAPN6 (ENSSHAG00000003826) DCX (ENSSHAG00000001659) ENSSHAG00000028383 ENSSHAG00000015788 TRPC5 (ENSSHAG00000015578) LHFPL1 (ENSSHAG00000030416) ENSSHAG00000026695 ENSSHAG00000011754 HTR2C (ENSSHAG00000032229) ENSSHAG00000006634 LRCH2 (ENSSHAG00000029119) PLS3 (ENSSHAG00000008976) AGTR2 (ENSSHAG00000008422) #22 ENSSHAG00000026017 #23 ENSSHAG00000031553 ENSSHAG00000008559 #26 WDR44 (ENSSHAG00000010113) #27 DOCK11 (ENSSHAG00000011126) #28 ENSSHAG00000024227 #29 ENSSHAG00000029461 ENSSHAG00000026352 ENSSHAG00000021421 ENSSHAG00000012886 ENSSHAG00000013184 ENSSHAG00000013439 ENSSHAG00000028349 BTK (ENSSHAG00000013506) TIMM8A (ENSSHAG00000013672) Sauria ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000159334 ENSGT00940000153609.a ENSGT00940000154651 ENSGT00390000000155.a.b ENSGT00390000003197 ENSGT00950000183090.C ENSGT00390000006492 ENSGT00940000159565 ENSGT00940000175781 ENSGT00940000159625 ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159971 ENSGT00940000160039 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT00940000167413 ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000159688 #23 ENSGT00640000091497.a.p ENSGT00940000154359 #26 ENSGT00940000157557 #27 ENSGT00940000155658 #28 ENSGT00940000160896 #29 ENSGT00940000157904 ENSGT00940000158972 ENSGT00940000157245 ENSGT00950000182897.B.a.b.a ENSGT00950000183071.a.b ENSGT01050000244897.a.b.a ENSGT01050000244955.a.b ENSGT00390000013938 ENSGT00950000182865.b.a.b.b.b.b Archelosauria ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000159334 ENSGT00940000153609.a ENSGT00940000154651 ENSGT00390000000155.a.b ENSGT00390000003197 ENSGT00390000006492 ENSGT00940000159565 ENSGT00940000175781 ENSGT00940000159625 ENSGT00960000188821 ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159971 ENSGT00940000160039 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT00940000167413 ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000159688 #23 ENSGT00640000091497.a.p ENSGT00940000154359 #26 ENSGT00940000157557 #27 ENSGT00940000155658 #28 ENSGT00940000160896 #29 ENSGT00940000157904 ENSGT00940000158972 ENSGT00940000157245 ENSGT00950000182897.B.a.b.a ENSGT00950000183071.a.b ENSGT01050000244897.a.b.a ENSGT01050000244955.a.b ENSGT00390000013938 ENSGT00950000182865.b.a.b.b.b.b Archosauria ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000159334 ENSGT00940000153609.a ENSGT00940000154651 ENSGT00390000000155.a.b ENSGT00390000003197 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#23 ENSGT00640000091497.a.p ENSGT00940000154359 #26 ENSGT00940000157557 #27 ENSGT00940000155658 #28 ENSGT00940000160896 #29 ENSGT00940000157904 ENSGT00940000158972 ENSGT00940000157245 ENSGT00950000182897.B.a.b.a ENSGT00950000183071.a.b ENSGT01050000244897.a.b.a ENSGT01050000244955.a.b ENSGT00950000182865.b.a.b.b.b.b ENSGT00940000155028 Neognathae ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00440000037505.b ENSGT00940000159334 ENSGT00940000153609.a ENSGT00940000154651 ENSGT00390000000155.a.b ENSGT00390000003197 ENSGT00390000006492 ENSGT00940000159565 ENSGT00960000188821 ENSGT00940000159625 ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159971 ENSGT00940000160039 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT00940000167413 ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000159688 #23 ENSGT00640000091497.a.p ENSGT00940000154359 #26 ENSGT00940000157557 #27 ENSGT00940000155658 #28 ENSGT00940000160896 #29 ENSGT00940000157904 ENSGT00940000158972 ENSGT00940000157245 ENSGT00950000182897.B.a.b.a ENSGT00950000183071.a.b 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giant tortoise MODERN SPECIES 474 HTR2C (ENSCABG00000009704) IL13RA2 (ENSCABG00000009702) LRCH2 (ENSCABG00000009701) PLS3 (ENSCABG00000009675) ENSCABG00000009669 ENSCABG00000009666 AGTR2 (ENSCABG00000009663) #22 ENSCABG00000009660 #23 ENSCABG00000009657 #26 WDR44 (ENSCABG00000009656) #27 DOCK11 (ENSCABG00000009646) #28 IL13RA1 (ENSCABG00000009622) #29 STK26 (ENSCABG00000009605) FRMD7 (ENSCABG00000009600) RAP2C (ENSCABG00000009599) MBNL3 (ENSCABG00000009598) HS6ST2 (ENSCABG00000009597) ENSCABG00000009596 Chinese turtle MODERN SPECIES 2039 AGTR2 (ENSPSIG00000001063) #22 ENSPSIG00000012275 #23 ENSPSIG00000012199 #26 WDR44 (ENSPSIG00000009873) #27 DOCK11 (ENSPSIG00000007194) #28 IL13RA1 (ENSPSIG00000005888) #29 ENSPSIG00000001055 STK26 (ENSPSIG00000005183) FRMD7 (ENSPSIG00000005005) ENSPSIG00000004945 RAP2C (ENSPSIG00000004845) MBNL3 (ENSPSIG00000017914) ENSPSIG00000001052 ENSPSIG00000001044 GPC4 (ENSPSIG00000017845) GPC3 (ENSPSIG00000017593) Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES 30 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med4 (ENSXETG00000000549) nudt15 (ENSXETG00000039868) sucla2 (ENSXETG00000000548) htr2a (ENSXETG00000032623) esd (ENSXETG00000015425) lrch1 (ENSXETG00000011477) rubcnl (ENSXETG00000038667) lrrc63 (ENSXETG00000038545) lcp1 (ENSXETG00000014954) ENSXETG00000038557 #22 cpb2 (ENSXETG00000026124) zc3h13 (ENSXETG00000014637) ENSXETG00000043129 ttll3 (ENSXETG00000026497) siah3 (ENSXETG00000036871) cog3 (ENSXETG00000014651) slc25a30 (ENSXETG00000047934) tpt1 (ENSXETG00000014661) kctd4 (ENSXETG00000035680) gtf2f2 (ENSXETG00000036901) ENSXETG00000036976 gpalpp1 (ENSXETG00000042639) nufip1 (ENSXETG00000014778) tsc22d1 (ENSXETG00000033932) serp2 (ENSXETG00000038969) Coelacanth MODERN SPECIES 2004 IL13RA2 (ENSLACG00000000260) LRCH2 (ENSLACG00000002033) ENSLACG00000005906 PLS3 (ENSLACG00000007594) zgc:163098 (ENSLACG00000008434) AGTR2 (ENSLACG00000009418) #22 Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES 117 ENSGT00950000182988.a.b.b.b ENSGT00940000156128.b ENSGT00940000161570 ENSGT00940000155097 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SPECIES 1 ENSGT01100000263536.A.a.a ENSGT01100000263536.A.a.b ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00950000182832.D.b ENSGT00940000162488.b.b ENSGT00950000182802.D ENSGT00940000156017.eb ENSGT00940000164351 ENSGT00390000017581.a ENSGT00940000161429 ENSGT00940000159242 ENSGT00390000008591 ENSGT00940000164237 ENSGT00530000063666.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000155920 ENSGT01030000234566.e.b.b.b ENSGT00940000154103.b ENSGT00940000153902.b.b ENSGT00390000018389 ENSGT01090000260082.d.a.a.c ENSGT00940000155516.v ENSGT00940000160128 ENSGT00950000182972.a.a.a.a.a.e ENSGT00940000166874 ENSGT00940000153404.a ENSGT00940000156381 ENSGT00940000157427.j ENSGT00940000163328.c ENSGT00940000165340 Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT01100000263536.A.a.a ENSGT01100000263536.A.a.b ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00950000182832.D.b ENSGT00940000162488.b.b ENSGT00950000182802.D ENSGT00940000156017.eb ENSGT00940000164351 ENSGT00390000017581.a ENSGT00940000161429 ENSGT00940000159242 ENSGT00390000008591 ENSGT00940000164237 ENSGT00530000063666.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000155920 ENSGT01030000234566.e.b.b.b ENSGT00940000154103.b ENSGT00940000153902.b.b ENSGT00390000018389 ENSGT01090000260082.d.a.a.c ENSGT00940000155516.v ENSGT00940000160128 ENSGT00950000182972.a.a.a.a.a.e ENSGT00940000166874 ENSGT00940000153404.a ENSGT00940000156381 ENSGT00940000157427.j ENSGT00940000163328.c ENSGT00940000165340 Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 1 p2ry10 (ENSMMDG00005018304) ENSMMDG00005018307 ITM2A (ENSMMDG00005018320) TBX22 (ENSMMDG00005018321) ENSMMDG00005018332 TENT5D (ENSMMDG00005018387) ENSMMDG00005018390 sh3bgrl (ENSMMDG00005018393) ENSMMDG00005018399 ENSMMDG00005018401 POU3F4 (ENSMMDG00005018402) rps6kal (ENSMMDG00005018506) hdx (ENSMMDG00005023170) ENSMMDG00005023172 ENSMMDG00005023177 agtr2 (ENSMMDG00005004247) #22 SH2D1A (ENSMMDG00005004272) TENM1 (ENSMMDG00005004446) arhgef9b (ENSMMDG00005005406) asb12b 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ENSGT00940000164237.f ENSGT00530000063666.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000155920 ENSGT01030000234566.e.b.b.b ENSGT00940000154103.b ENSGT00940000153902.b.b ENSGT00390000018389 ENSGT01090000260082.d.a.a.c ENSGT00940000155516.v ENSGT00940000160128 ENSGT00950000182972.a.a.a.a.a.e ENSGT01030000236759 ENSGT00940000166874 ENSGT00940000153404.a ENSGT00940000156381 ENSGT00940000157427.j ENSGT00940000163328.c Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT01100000263536.A.a.b ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00950000182832.D.b.c ENSGT00940000162488.b.b ENSGT00950000182802.D ENSGT00940000156017.eb ENSGT00770000121762 ENSGT00940000164351 ENSGT00390000017581.a ENSGT00940000161429 ENSGT00940000159242 ENSGT00390000008591 ENSGT00940000164237.f ENSGT00530000063666.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000155920 ENSGT01030000234566.e.b.b.b ENSGT00940000154103.b ENSGT00940000153902.b.b ENSGT00390000018389 ENSGT01090000260082.d.a.a.c ENSGT00940000155516.v ENSGT00940000160128 ENSGT00950000182972.a.a.a.a.a.e ENSGT01030000236759 ENSGT00940000166874 ENSGT00940000153404.a ENSGT00940000156381 ENSGT00940000157427.j ENSGT00940000163328.c Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT01100000263536.A.a.b ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00950000182832.D.b.c ENSGT00940000162488.b.b ENSGT00950000182802.D ENSGT00940000156017.eb ENSGT00770000121762 ENSGT00940000164351 ENSGT00390000017581.a ENSGT00940000161429 ENSGT00940000159242 ENSGT00390000008591 ENSGT00940000164237.f ENSGT00530000063666.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000155920 ENSGT01030000234566.e.b.b.b ENSGT00940000154103.b ENSGT00940000153902.b.b ENSGT00390000018389 ENSGT01090000260082.d.a.a.c ENSGT00940000155516.v ENSGT00940000160128 ENSGT00950000182972.a.a.a.a.a.e ENSGT01030000236759 ENSGT00940000166874 ENSGT00940000153404.a ENSGT00940000156381 ENSGT00940000157427.j ENSGT00940000163328.c Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT01100000263536.A.a.b ENSGT00950000183115.b.b 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ENSCVAG00000016533 Mummichog MODERN SPECIES 2236 LPAR4 (ENSFHEG00000015289) p2ry10 (ENSFHEG00000015284) ENSFHEG00000015272 ITM2A (ENSFHEG00000015267) TBX22 (ENSFHEG00000015245) TENT5D (ENSFHEG00000015095) hmgn6 (ENSFHEG00000015073) sh3bgrl (ENSFHEG00000015052) ENSFHEG00000015018 ENSFHEG00000014917 POU3F4 (ENSFHEG00000014912) rps6kal (ENSFHEG00000014893) hdx (ENSFHEG00000014758) ENSFHEG00000014732 APOOL (ENSFHEG00000014110) agtr2 (ENSFHEG00000014089) #22 ENSFHEG00000014085 TENM1 (ENSFHEG00000014068) Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 46 ENSGT01100000263536.A.a.a ENSGT01100000263536.A.a.b ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00940000162488.b.b ENSGT00950000182802.D ENSGT00940000156017.eb ENSGT00940000164351 ENSGT00390000017581.a ENSGT00940000161429 ENSGT00940000159242 ENSGT00390000008591 ENSGT00940000164237.f ENSGT00940000164237.e.a ENSGT00530000063666.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000155920 ENSGT01030000234566.e.b.b.b.f ENSGT00940000160622.`b.a 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ENSGT00940000155920 ENSGT01030000234566.e.b.b.b ENSGT00940000154103.b ENSGT00940000153902.b.b ENSGT00390000018389 ENSGT01090000260082.d.a.a.c ENSGT00940000155516.v ENSGT00940000160128 ENSGT00950000182972.a.a.a.a.a.e ENSGT00940000166874.g ENSGT00940000166874.h ENSGT00940000153404.a ENSGT00940000156381 ENSGT00940000157427.j ENSGT00940000163328.c Chinese medaka MODERN SPECIES 26 ENSOSIG00000020786 ENSOSIG00000020783 ENSOSIG00000020782 rps6kal (ENSOSIG00000020571) hdx (ENSOSIG00000020557) ENSOSIG00000020556 ENSOSIG00000020554 ENSOSIG00000020551 agtr2 (ENSOSIG00000020545) #22 ENSOSIG00000020544 TENM1 (ENSOSIG00000014198) ENSOSIG00000014136 ENSOSIG00000013615 asb12b (ENSOSIG00000013588) zc4h2 (ENSOSIG00000013582) msnb (ENSOSIG00000012816) ENSOSIG00000012607 efnb1 (ENSOSIG00000012604) STAG2 (ENSOSIG00000008738) xiap (ENSOSIG00000008717) ENSOSIG00000008716 ENSOSIG00000008715 psmd10 (ENSOSIG00000008714) nxt2 (ENSOSIG00000008713) Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 1 st3gal5 (ENSORLG00000008671) 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ENSGT00940000153902.b.b ENSGT00390000018389 ENSGT01090000260082.d.a.a.c ENSGT00940000155516.v ENSGT00940000160128 ENSGT00950000182972.a.a.a.a.a.e ENSGT00940000166874 ENSGT00940000153404.a ENSGT00940000156381 ENSGT00940000157427.j ENSGT00940000163328.c ENSGT00940000165340 Eastern happy MODERN SPECIES 11 p2ry10 (ENSACLG00000023872) ENSACLG00000023881 ITM2A (ENSACLG00000023891) tbx22 (ENSACLG00000023898) ENSACLG00000023910 ENSACLG00000023943 hmgn6 (ENSACLG00000023964) sh3bgrl (ENSACLG00000023996) ENSACLG00000024014 ENSACLG00000024021 ENSACLG00000024028 rps6kal (ENSACLG00000024045) hdx (ENSACLG00000024104) ENSACLG00000024114 APOOL (ENSACLG00000024162) agtr2 (ENSACLG00000024172) #22 SH2D1A (ENSACLG00000024348) TENM1 (ENSACLG00000024383) arhgef9b (ENSACLG00000024474) asb12b (ENSACLG00000024634) zc4h2 (ENSACLG00000024645) msnb (ENSACLG00000024676) ENSACLG00000024776 efnb1 (ENSACLG00000024802) STAG2 (ENSACLG00000024953) xiap (ENSACLG00000025018) psmd10 (ENSACLG00000025060) nxt2 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Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT01100000263536.A.a.a ENSGT01100000263536.A.a.b ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00940000162488.b.b ENSGT00950000182802.D ENSGT00940000156017.eb ENSGT00940000164351 ENSGT00390000017581.a ENSGT00940000161429 ENSGT00940000159242 ENSGT00390000008591 ENSGT00940000164237.f ENSGT00940000164237.e.a ENSGT00530000063666.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000155920 ENSGT01030000234566.e.b.b.b.c ENSGT00940000154103.b ENSGT00940000153902.b.b ENSGT00390000018389 ENSGT01090000260082.d.a.a.c ENSGT00940000155516.v ENSGT00940000160128 ENSGT00950000182972.a.a.a.a.a.e ENSGT01030000236759 ENSGT00940000166874 ENSGT00940000153404.a ENSGT00940000156381 ENSGT00940000157427.j ENSGT00940000163328.c Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT01100000263536.A.a.a ENSGT01100000263536.A.a.b ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00950000182832.D.b ENSGT00940000162488.b.b ENSGT00950000182802.D ENSGT00940000156017.eb ENSGT00940000164351 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(ENSSPAG00000014139) ENSSPAG00000014113 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000161206 ENSGT00940000166733 ENSGT00940000162488.b.b ENSGT00950000182802.D ENSGT00940000156017.eb ENSGT00770000121762 ENSGT00940000164351 ENSGT00390000017581.a ENSGT00940000161429 ENSGT00940000159242 ENSGT00390000008591 ENSGT00940000164237.f ENSGT00940000164237.e.b ENSGT00940000164237.e.a ENSGT00530000063666.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000155920 ENSGT01030000234566.e.b.b.b ENSGT00940000154103.b ENSGT00940000153902.b.b ENSGT00390000018389 ENSGT01090000260082.d.a.a.c ENSGT00940000155516.v ENSGT00940000160128 ENSGT00950000182972.a.a.a.a.a.e ENSGT01030000236759 ENSGT00940000166874 ENSGT00940000153404.a ENSGT00940000156381 ENSGT00940000157427.j ENSGT00940000163328.c Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000161206 ENSGT00940000166733 ENSGT00940000162488.b.b ENSGT00950000182802.D ENSGT00940000156017.eb ENSGT00770000121762 ENSGT00940000164351 ENSGT00390000017581.a ENSGT00940000161429 ENSGT00940000159242 ENSGT00390000008591 ENSGT00940000164237.e.b ENSGT00940000164237.e.a ENSGT00940000164237.f ENSGT00530000063666.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000155920 ENSGT01030000234566.e.b.b.b ENSGT00940000154103.b ENSGT00940000153902.b.b ENSGT00390000018389 ENSGT01090000260082.d.a.a.c ENSGT00940000155516.v ENSGT00940000160128 ENSGT00950000182972.a.a.a.a.a.e ENSGT00940000166874 ENSGT00940000153404.a ENSGT00940000156381 ENSGT00940000157427.j ENSGT00940000163328.c ENSGT00940000165340 Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT01030000234579.B.a ENSGT00950000182899.B.b ENSGT00940000155339 ENSGT00550000074964 ENSGT00940000155145 ENSGT00670000099471 ENSGT00940000161397 ENSGT00940000155621 ENSGT00950000183053.B ENSGT00940000157996 ENSGT00390000014020 ENSGT00940000161429 ENSGT00940000159242 ENSGT00940000164237.f ENSGT00530000063666.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000155920 ENSGT01030000234566.e.b.b.b ENSGT00940000154103.b ENSGT00940000153902.b.b ENSGT00390000018389 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(ENSLBEG00000015313) ENSLBEG00000015139 apool (ENSLBEG00000015057) agtr2 (ENSLBEG00000015021) #22 SH2D1A (ENSLBEG00000015011) TENM1 (ENSLBEG00000014915) arhgef9b (ENSLBEG00000014843) asb12b (ENSLBEG00000014808) zc4h2 (ENSLBEG00000014777) msnb (ENSLBEG00000014663) ENSLBEG00000014615 efnb1 (ENSLBEG00000014580) STAG2 (ENSLBEG00000014450) xiap (ENSLBEG00000014357) psmd10 (ENSLBEG00000014327) nxt2 (ENSLBEG00000014298) acsl4a (ENSLBEG00000014245) eif4ebp3l (ENSLBEG00000014223) zgc:165573 (ENSLBEG00000014204) Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT01100000263536.A.a.b ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00940000166733 ENSGT00940000162488.b.b ENSGT00940000156017.eb ENSGT00940000164351 ENSGT00390000017581.a ENSGT00940000161429 ENSGT00940000159242 ENSGT00390000008591 ENSGT00940000164237.f ENSGT00940000164237.e.b ENSGT00940000164237.e.a ENSGT00530000063666.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000155920 ENSGT01030000234566.e.b.b.b ENSGT00940000154103.b ENSGT00940000153902.b.b ENSGT00390000018389 ENSGT01090000260082.d.a.a.c ENSGT00940000155516.v ENSGT00940000160128 ENSGT00950000182972.a.a.a.a.a.e ENSGT00940000166874 ENSGT00940000153404.a ENSGT00940000156381 ENSGT00940000157427.j ENSGT00940000163328.c ENSGT00940000165340 Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a ENSGT01100000263536.A.a.b ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00950000182832.D.b ENSGT00940000162488.b.b ENSGT00940000156017.eb ENSGT00940000164351 ENSGT00390000017581.a ENSGT00940000161429 ENSGT00940000159242 ENSGT00390000008591 ENSGT00940000164237.f ENSGT00530000063666.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000155920 ENSGT01030000234566.e.b.b.b ENSGT00940000154103.b ENSGT00940000153902.b.b ENSGT00390000018389 ENSGT01090000260082.d.a.a.c ENSGT00940000155516.v ENSGT00940000160128 ENSGT00950000182972.a.a.a.a.a.e ENSGT00940000166874 ENSGT00940000153404.a ENSGT00940000156381 ENSGT00940000157427.j ENSGT00940000163328.c ENSGT00940000165340 Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT01100000263536.A.a.a ENSGT01100000263536.A.a.b ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00950000182832.D.b ENSGT00940000162488.b.b ENSGT00990000211426 ENSGT00940000156017.eb ENSGT00940000164351 ENSGT00390000017581.a ENSGT00940000161429 ENSGT00940000159242 ENSGT00390000008591 ENSGT00940000164237.f ENSGT00530000063666.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000155920 ENSGT01030000234566.e.b.b.b ENSGT00940000154103.b ENSGT00940000153902.b.b ENSGT00390000018389 ENSGT01090000260082.d.a.a.c ENSGT00940000155516.v ENSGT00940000160128 ENSGT00950000182972.a.a.a.a.a.e ENSGT00940000166874 ENSGT00940000153404.a ENSGT00940000156381 ENSGT00940000157427.j ENSGT00940000163328.c ENSGT00940000165340 European seabass MODERN SPECIES 12 P2RY10 (ENSDLAG00005020837) ENSDLAG00005020816 ITM2A (ENSDLAG00005020811) TBX22 (ENSDLAG00005020808) ENSDLAG00005020801 ENSDLAG00005020795 ENSDLAG00005034448 SH3BGRL (ENSDLAG00005020788) ENSDLAG00005020627 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ENSGT00940000156017.eb ENSGT00940000164351 ENSGT00390000017581.a ENSGT00940000161429 ENSGT00940000159242 ENSGT00390000008591 ENSGT00940000164237.f ENSGT00940000164237.e.b ENSGT00940000164237.e.a ENSGT00530000063666.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000155920 ENSGT01030000234566.e.b.b.b ENSGT00940000154103.b ENSGT00940000153902.b.b ENSGT00390000018389 ENSGT01090000260082.d.a.a.c.f ENSGT00940000155516.v ENSGT00940000160128 ENSGT00950000182972.a.a.a.a.a.e ENSGT00940000166874 ENSGT00940000153404.a ENSGT00940000156381 ENSGT00940000157427.j ENSGT00940000163328.c ENSGT00940000165340 Stickleback MODERN SPECIES 3 ENSGACG00000018578 LPAR4 (ENSGACG00000018574) p2ry10 (ENSGACG00000018572) ENSGACG00000018571 ITM2A (ENSGACG00000018559) TENT5D (ENSGACG00000018558) ENSGACG00000018556 sh3bgrl (ENSGACG00000018552) ENSGACG00000018550 ENSGACG00000018548 POU3F4 (ENSGACG00000018547) rps6kal (ENSGACG00000018545) hdx (ENSGACG00000018543) ENSGACG00000018542 ENSGACG00000018541 agtr2 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ENSCLMG00005016097 ENSCLMG00005016100 ENSCLMG00005016102 efnb1 (ENSCLMG00005016164) STAG2 (ENSCLMG00005016256) xiap (ENSCLMG00005020442) psmd10 (ENSCLMG00005020443) nxt2 (ENSCLMG00005020444) acsl4a (ENSCLMG00005020452) Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a ENSGT01100000263536.A.a.b ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00940000166733 ENSGT00940000162488.b.b ENSGT00940000156017.eb ENSGT00940000164351 ENSGT00390000017581.a ENSGT00940000161429 ENSGT00940000159242 ENSGT00390000008591 ENSGT00940000164237.f ENSGT00530000063666.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000155920 ENSGT01030000234566.e.b.b.b ENSGT00940000154103.b ENSGT00940000153902.b.b ENSGT00390000018389 ENSGT01090000260082.d.a.a.c.f ENSGT00940000155516.v ENSGT00940000160128 ENSGT00950000182972.a.a.a.a.a.e ENSGT00940000166874 ENSGT00940000153404.a ENSGT00940000156381 ENSGT00940000157427.j ENSGT00940000163328.c ENSGT00940000165340 Channel bull blenny MODERN SPECIES 1 p2ry10 (ENSCGOG00000004205) ENSCGOG00000004202 ITM2A (ENSCGOG00000004199) TBX22 (ENSCGOG00000004171) ENSCGOG00000004160 ENSCGOG00000004156 sh3bgrl (ENSCGOG00000004120) ENSCGOG00000004075 ENSCGOG00000024607 POU3F4 (ENSCGOG00000024606) rps6kal (ENSCGOG00000024323) hdx (ENSCGOG00000024241) ENSCGOG00000024236 ENSCGOG00000024235 ENSCGOG00000024234 agtr2 (ENSCGOG00000024232) #22 SH2D1A (ENSCGOG00000024231) TENM1 (ENSCGOG00000024209) arhgef9b (ENSCGOG00000024171) asb12b (ENSCGOG00000024169) zc4h2 (ENSCGOG00000024167) msnb (ENSCGOG00000024166) ENSCGOG00000024160 efnb1 (ENSCGOG00000024158) STAG2 (ENSCGOG00000023306) xiap (ENSCGOG00000023214) psmd10 (ENSCGOG00000023212) nxt2 (ENSCGOG00000023203) acsl4a (ENSCGOG00000023113) eif4ebp3l (ENSCGOG00000023108) ENSCGOG00000023106 Pike perch MODERN SPECIES 52 p2ry10 (ENSSLUG00000025597) ENSSLUG00000025594 ITM2A (ENSSLUG00000025592) TBX22 (ENSSLUG00000025589) ENSSLUG00000025585 ENSSLUG00000025579 sh3bgrl (ENSSLUG00000025576) ENSSLUG00000025575 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ENSGT00940000156381 ENSGT00940000157427.j ENSGT00940000163328.c ENSGT00940000165340 Zig-zag eel MODERN SPECIES 1 LPAR4 (ENSMAMG00000014774) P2RY10 (ENSMAMG00000014768) ENSMAMG00000014756 ITM2A (ENSMAMG00000014746) TBX22 (ENSMAMG00000014706) ENSMAMG00000014671 TENT5D (ENSMAMG00000014540) SH3BGRL (ENSMAMG00000014484) ENSMAMG00000014395 ENSMAMG00000014380 POU3F4 (ENSMAMG00000014367) RPS6KA6 (ENSMAMG00000014284) HDX (ENSMAMG00000014266) ENSMAMG00000014209 APOOL (ENSMAMG00000024696) ENSMAMG00000014181 #22 ENSMAMG00000024395 ENSMAMG00000014063 ENSMAMG00000013917 ENSMAMG00000013889 ENSMAMG00000013866 ENSMAMG00000013829 ENSMAMG00000013798 ENSMAMG00000013781 ENSMAMG00000013643 xiap (ENSMAMG00000013628) psmd10 (ENSMAMG00000013619) nxt2 (ENSMAMG00000013603) acsl4a (ENSMAMG00000013555) ENSMAMG00000013532 ENSMAMG00000013522 Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT01100000263536.A.a.b ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00950000182832.D.b ENSGT00940000162488.b.b ENSGT00940000156017.eb ENSGT00940000164351 ENSGT00390000017581.a ENSGT00940000161429 ENSGT00940000159242 ENSGT00390000008591 ENSGT00940000164237.f ENSGT00940000164237.e.b ENSGT00940000164237.e.a ENSGT00530000063666.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000155920 ENSGT01030000234566.e.b.b.b ENSGT00940000154103.b ENSGT00940000153902.b.b ENSGT00390000018389 ENSGT01090000260082.d.a.a.c ENSGT00940000155516.v ENSGT00940000160128 ENSGT00950000182972.a.a.a.a.a.e ENSGT00940000166874 ENSGT00940000153404.a ENSGT00940000156381 ENSGT00940000157427.j ENSGT00940000163328.c ENSGT00940000165340 Siamese fighting fish MODERN SPECIES 1 p2ry10 (ENSBSLG00000010026) ENSBSLG00000010038 ITM2A (ENSBSLG00000010048) TBX22 (ENSBSLG00000010060) ENSBSLG00000010080 ENSBSLG00000010102 ENSBSLG00000010586 ENSBSLG00000010712 ENSBSLG00000011043 POU3F4 (ENSBSLG00000011060) rps6kal (ENSBSLG00000011086) hdx (ENSBSLG00000011563) ENSBSLG00000011775 ENSBSLG00000012438 APOOL (ENSBSLG00000012448) agtr2 (ENSBSLG00000012458) #22 SH2D1A 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Barramundi perch MODERN SPECIES 63 p2ry10 (ENSLCAG00010001745) ENSLCAG00010001747 ITM2A (ENSLCAG00010001749) TBX22 (ENSLCAG00010001754) ENSLCAG00010001762 ENSLCAG00010001767 sh3bgrl (ENSLCAG00010001775) ENSLCAG00010001779 ENSLCAG00010001784 POU3F4 (ENSLCAG00010001788) rps6kal (ENSLCAG00010001927) hdx (ENSLCAG00010002274) ENSLCAG00010002282 ENSLCAG00010002297 ENSLCAG00010002300 agtr2 (ENSLCAG00010002306) #22 SH2D1A (ENSLCAG00010002309) TENM1 (ENSLCAG00010002628) ENSLCAG00010004106 asb12b (ENSLCAG00010004140) zc4h2 (ENSLCAG00010004142) msnb (ENSLCAG00010004150) ENSLCAG00010004166 efnb1 (ENSLCAG00010004181) STAG2 (ENSLCAG00010004269) xiap (ENSLCAG00010004694) psmd10 (ENSLCAG00010004699) nxt2 (ENSLCAG00010004705) acsl4a (ENSLCAG00010004724) eif4ebp3l (ENSLCAG00010004787) ENSLCAG00010004790 Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00950000182832.D.b ENSGT00940000162488.b.b ENSGT00980000199388 ENSGT00940000156017.eb ENSGT00940000164351 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ENSSMAG00000010813 ENSSMAG00000010786 ENSSMAG00000037547 ENSSMAG00000010747 ENSSMAG00000010690 ENSSMAG00000024783 ENSSMAG00000010444 xiap (ENSSMAG00000010409) psmd10 (ENSSMAG00000010390) nxt2 (ENSSMAG00000010366) acsl4a (ENSSMAG00000010281) ENSSMAG00000010258 ENSSMAG00000031198 Tongue sole MODERN SPECIES 6 p2ry10 (ENSCSEG00000018232) ENSCSEG00000018227 ITM2A (ENSCSEG00000018220) TBX22 (ENSCSEG00000018204) ENSCSEG00000018195 ENSCSEG00000018191 hmgn7 (ENSCSEG00000018183) sh3bgrl (ENSCSEG00000018177) ENSCSEG00000018174 POU3F4 (ENSCSEG00000018166) rps6kal (ENSCSEG00000018120) hdx (ENSCSEG00000018099) ENSCSEG00000018062 ENSCSEG00000018052 ENSCSEG00000018036 agtr2 (ENSCSEG00000018029) #22 SH2D1A (ENSCSEG00000018016) TENM1 (ENSCSEG00000017985) arhgef9b (ENSCSEG00000017892) asb12b (ENSCSEG00000017888) fgfr2 (ENSCSEG00000017754) wdr11 (ENSCSEG00000017666) PLPP4 (ENSCSEG00000017646) FLOT1 (ENSCSEG00000017640) ENSCSEG00000017636 vsir (ENSCSEG00000017616) cdh23 (ENSCSEG00000017540) eif3s6ip 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Rainbow trout MODERN SPECIES 1 ENSOMYG00000061040 ENSOMYG00000002324 ENSOMYG00000002340 ENSOMYG00000002607 ENSOMYG00000002657 ENSOMYG00000002693 ENSOMYG00000002755 ENSOMYG00000002776 ENSOMYG00000003430 ENSOMYG00000070451 ENSOMYG00000004610 ENSOMYG00000069079 ENSOMYG00000004774 ENSOMYG00000004843 ENSOMYG00000077112 ENSOMYG00000060315 #22 ENSOMYG00000005420 smarca1 (ENSOMYG00000006770) ENSOMYG00000007202 ENSOMYG00000065810 ENSOMYG00000010152 amer1 (ENSOMYG00000010155) asb12a (ENSOMYG00000010188) mtmr8 (ENSOMYG00000008389) ZC3H12B (ENSOMYG00000010201) msna (ENSOMYG00000010701) ENSOMYG00000074842 fdx1b (ENSOMYG00000013576) ENSOMYG00000013596 ENSOMYG00000013622 ENSOMYG00000013632 Salmo ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000159183.v.a ENSGT00940000160033.d.c ENSGT00940000154133.B.e ENSGT00990000203619.B.a.b.a ENSGT00940000155902.d.c.a ENSGT00950000183097.a.a.a.f.a.a.a ENSGT00940000155374.g.a ENSGT00940000167119 ENSGT00950000182832.D.b.fc ENSGT00940000162488.b.a.a ENSGT00950000183107.a.b.b.q.b 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MODERN SPECIES 104 ENSHHUG00000020713 ccdc61 (ENSHHUG00000020700) CYSLTR2 (ENSHHUG00000020696) ENSHHUG00000020617 pls3 (ENSHHUG00000019584) CNGA2 (ENSHHUG00000019376) ENSHHUG00000019337 rraga (ENSHHUG00000019315) chmp1b (ENSHHUG00000019183) TENT5D (ENSHHUG00000019177) ENSHHUG00000018982 sh3bgrl (ENSHHUG00000018931) ENSHHUG00000018917 ENSHHUG00000018894 apool (ENSHHUG00000018887) agtr2 (ENSHHUG00000018882) #22 ENSHHUG00000018879 TENM1 (ENSHHUG00000017982) smarca1 (ENSHHUG00000017787) ENSHHUG00000017768 ENSHHUG00000017683 amer1 (ENSHHUG00000017678) asb12a (ENSHHUG00000017663) mtmr8 (ENSHHUG00000017600) ZC3H12B (ENSHHUG00000017594) msna (ENSHHUG00000015857) fdx1b (ENSHHUG00000015847) ENSHHUG00000015825 ENSHHUG00000015823 AR (ENSHHUG00000015325) OPHN1 (ENSHHUG00000015299) Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT00940000160033.d.c ENSGT00940000154133.B.e ENSGT00990000203619.B.a.b.a ENSGT00940000155902.d.c.a ENSGT00950000183097.a.a.a.f.a.a.a ENSGT00940000155374.g.a ENSGT00940000161737 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ENSGT00530000063529.B.a ENSGT00940000153902.b.a.b ENSGT00940000157443.c ENSGT00940000159316.xb.a ENSGT00390000014785 ENSGT01090000260082.d.a.a.d.d ENSGT00940000154336.qd ENSGT00940000153259.a.a.a.d ENSGT00940000155516.u.d ENSGT00940000160157.k Atlantic salmon MODERN SPECIES 4 ENSSSAG00000119766 ENSSSAG00000004828 ccdc61 (ENSSSAG00000004839) ENSSSAG00000004889 ENSSSAG00000005102 ENSSSAG00000007958 rraga (ENSSSAG00000007986) ENSSSAG00000008058 ENSSSAG00000008096 ENSSSAG00000008163 ENSSSAG00000084290 ENSSSAG00000009395 ENSSSAG00000009423 ENSSSAG00000009440 ENSSSAG00000101359 ENSSSAG00000009461 #22 sh2d1aa (ENSSSAG00000117384) ENSSSAG00000009842 smarca1 (ENSSSAG00000054210) ENSSSAG00000061847 amer1 (ENSSSAG00000062015) asb12a (ENSSSAG00000064122) shisa2a (ENSSSAG00000082270) ENSSSAG00000064131 msna (ENSSSAG00000064191) las1l (ENSSSAG00000064124) ENSSSAG00000088132 ENSSSAG00000068330 AR (ENSSSAG00000068362) OPHN1 (ENSSSAG00000068742) yipf6 (ENSSSAG00000094250) River trout MODERN SPECIES 6 ENSSTUG00000019282 ENSSTUG00000019296 ccdc61 (ENSSTUG00000019310) ENSSTUG00000019364 ATRX (ENSSTUG00000019370) PLS3 (ENSSTUG00000019482) nup62l (ENSSTUG00000021905) rraga (ENSSTUG00000021952) chmp1b (ENSSTUG00000021989) TENT5D (ENSSTUG00000022443) BRWD3 (ENSSTUG00000022462) sh3bgrl (ENSSTUG00000023208) ENSSTUG00000023305 ENSSTUG00000023313 apool (ENSSTUG00000023431) agtr2 (ENSSTUG00000023443) #22 sh2d1aa (ENSSTUG00000023451) TENM1 (ENSSTUG00000023466) smarca1 (ENSSTUG00000023581) ENSSTUG00000023870 ARHGEF9 (ENSSTUG00000023916) amer1 (ENSSTUG00000024872) asb12a (ENSSTUG00000024880) ENSSTUG00000024883 shisa2a (ENSSTUG00000024888) ZC3H12B (ENSSTUG00000024895) las1l (ENSSTUG00000024915) msna (ENSSTUG00000024984) ENSSTUG00000028290 ENSSTUG00000028322 AR (ENSSTUG00000028332) Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000159183.v.b ENSGT00940000160033.d.d ENSGT00940000154133.B.f ENSGT00990000203619.B.a.b.b ENSGT00940000155902.d.c.b ENSGT00950000183097.a.a.a.f.a.a.b ENSGT00940000162863 ENSGT00950000183031.B ENSGT00950000182832.D.b.gc ENSGT00940000162488.b.a.b ENSGT00950000183107.a.b.b.q.a ENSGT00940000156017.eb.a.b ENSGT00390000011425.A.d ENSGT00940000164237.g ENSGT00530000063666.a.gb ENSGT01050000244888.b.a.c.a.b #22 ENSGT00940000155920.l ENSGT01030000234566.e.b.b.b.a ENSGT00940000157297.n.b ENSGT00940000159803.n ENSGT00940000154103.b.f ENSGT00530000063529.B.a ENSGT00940000162717.b ENSGT00940000157443.c ENSGT00940000159316.xb.a ENSGT00390000014785 ENSGT01090000260082.d.a.a.d.d ENSGT00940000153259.a.a.a.d ENSGT00940000155516.u.d ENSGT00940000160157.k ENSGT00940000153168.A.h Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000159183.v.b ENSGT00940000160033.d.d ENSGT00940000154133.B.f ENSGT00990000203619.B.a.b.b ENSGT00940000155902.d.c.b ENSGT00950000183097.a.a.a.f.a.a.b ENSGT00940000162863 ENSGT00950000183031.B ENSGT00950000182832.D.b.gc ENSGT00940000162488.b.a.b ENSGT00950000183107.a.b.b.q.a ENSGT00940000156017.eb.a.b ENSGT00390000011425.A.d ENSGT00940000164237.g ENSGT00530000063666.a.gb ENSGT01050000244888.b.a.c.a.b #22 ENSGT00940000155920.l ENSGT01030000234566.e.b.b.b.a ENSGT00940000157297.n.b ENSGT00940000159803.n ENSGT00940000154103.b.f ENSGT00530000063529.B.a ENSGT00940000162717.b ENSGT00940000157443.c ENSGT00940000159316.xb.a ENSGT00390000014785 ENSGT01090000260082.d.a.a.d.d ENSGT00940000153259.a.a.a.d ENSGT00940000155516.u.d ENSGT00940000160157.k ENSGT00940000153168.A.h Chinook salmon MODERN SPECIES 33 QPCTL (ENSOTSG00005012271) ENSOTSG00005012268 ENSOTSG00005012266 ENSOTSG00005012263 ccdc61 (ENSOTSG00005012260) ENSOTSG00005012255 PLS3 (ENSOTSG00005012096) rraga (ENSOTSG00005012090) chmp1b (ENSOTSG00005012087) TENT5D (ENSOTSG00005012086) BRWD3 (ENSOTSG00005009448) sh3bgrl (ENSOTSG00005009441) ENSOTSG00005009440 ENSOTSG00005009267 apool (ENSOTSG00005009261) agtr2 (ENSOTSG00005009260) #22 ENSOTSG00005009258 ENSOTSG00005009257 TENM1 (ENSOTSG00005001397) smarca1 (ENSOTSG00005001182) ENSOTSG00005001142 arhgef9b (ENSOTSG00005001039) amer1 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DUPLICATION Mexicana tetra MODERN SPECIES 16 ENSAMXG00000026472 ITM2A (ENSAMXG00000013634) TBX22 (ENSAMXG00000013612) ENSAMXG00000037196 TENT5D (ENSAMXG00000013579) hmgn6 (ENSAMXG00000031290) sh3bgrl (ENSAMXG00000034050) ENSAMXG00000013508 ENSAMXG00000043922 POU3F4 (ENSAMXG00000026471) rps6kal (ENSAMXG00000013462) hdx (ENSAMXG00000013448) ENSAMXG00000029522 ENSAMXG00000030447 APOOL (ENSAMXG00000013423) AGTR2 (ENSAMXG00000026470) #22 SH2D1A (ENSAMXG00000035894) TENM1 (ENSAMXG00000013379) ENSAMXG00000013315 asb12b (ENSAMXG00000013297) ZC4H2 (ENSAMXG00000033369) msnb (ENSAMXG00000013264) ENSAMXG00000013256 EFNB1 (ENSAMXG00000013251) ENSAMXG00000042586 ENSAMXG00000034165 ENSAMXG00000013245 GJB1 (ENSAMXG00000042506) ENSAMXG00000032395 VMA21 (ENSAMXG00000035610) ENSAMXG00000037994 Mexicana tetra MODERN SPECIES 18 uprt (ENSAMXG00000037352) NEXMIF (ENSAMXG00000007091) ENSAMXG00000038905 prps1a (ENSAMXG00000032486) tbx5b (ENSAMXG00000038165) CFAP73 (ENSAMXG00000043844) IQCD (ENSAMXG00000036602) 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AGTR2 (ENSPNAG00000012191) #22 SH2D1A (ENSPNAG00000012204) TENM1 (ENSPNAG00000005132) Red-bellied piranha MODERN SPECIES 973 agtr2 (ENSPNAG00000000364) #22 efnb1 (ENSPNAG00000000361) Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 180 ENSGT00940000156017 ENSGT00390000011425.A ENSGT00390000017581.a ENSGT00940000161429.a ENSGT00940000159242.l ENSGT00390000008591 ENSGT00940000164237 ENSGT00530000063666.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a #22 ENSGT00940000155920.y.a ENSGT01030000234566.e.b.b.b ENSGT00940000157297 ENSGT00940000159803.g ENSGT00940000154103.b ENSGT00530000063529.B ENSGT00940000153902.b.a ENSGT00940000162717 ENSGT00390000018389.d ENSGT00940000159316.`c.a ENSGT00390000014785 ENSGT01090000260082.d.a.a.d ENSGT00940000166318.b ENSGT00940000153259.a.a.a ENSGT00940000155516 P. kingsleyae MODERN SPECIES 295 ENSPKIG00000022456 sh3bgrl (ENSPKIG00000022441) ENSPKIG00000022427 ENSPKIG00000022407 POU3F4 (ENSPKIG00000022395) rps6kal (ENSPKIG00000022340) hdx (ENSPKIG00000022290) ENSPKIG00000022202 APOOL 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ENSECRG00000015735 GABRA3 (ENSECRG00000015831) ENSECRG00000016123 Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES 338 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00940000153981.B ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000157909 ENSGT01000000214434.A ENSGT00670000098080 ENSGT00940000155714 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000154435 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00940000153981.B ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT00940000165445 ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942 #25 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ENSGT01030000234528.B.b.a.a.b ENSGT00950000183072.a.a.a ENSGT00530000063779.B.b ENSGT00940000158377.b.i.a ENSGT00940000154607.b.a.x ENSGT00940000154607.b.a.w ENSGT00940000154621.a.b.b.a ENSGT00510000048324 ENSGT00940000165167 Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000156398 ENSGT00940000156177 ENSGT00940000164635 ENSGT01030000234667.a.a.a.b.a ENSGT00940000160993 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000157649 ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000165699.B ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000154674.q.b ENSGT00940000156929 ENSGT00940000156601 ENSGT00940000153249.b.d.b ENSGT00390000008686.c.d ENSGT01030000234528.B.b.a.a.b ENSGT00950000183072.a.a.a ENSGT00940000158377.b.i.a ENSGT00940000154607.b.a.w ENSGT00940000154607.b.a.x ENSGT00940000154621.a.b.b.a ENSGT00510000048324 ENSGT00940000165167 ENSGT00940000164858 Oryzias ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000156398 ENSGT00940000156177 ENSGT00940000164635 ENSGT01030000234667.a.a.a.b.a ENSGT00940000160993 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000157649 ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000165699.B ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000154674.q.b ENSGT00940000156929 ENSGT00940000156601 ENSGT00940000153249.b.d.b ENSGT00390000008686.c.d ENSGT00950000183072.a.a.a ENSGT00940000158377.b.i.a ENSGT00940000154607.b.a.w ENSGT00940000154621.a.b.b.a ENSGT00510000048324 ENSGT00940000165167 ENSGT00940000164858 ENSGT00940000165361 ENSGT00390000006098 Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000156098.a ENSGT00940000156398 ENSGT00940000156177 ENSGT00940000160993 ENSGT01030000234667.a.a.a.b.a ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000157649 ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b 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ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000154674.q.b ENSGT00940000156929 ENSGT00940000156601 ENSGT00940000153249.b.d.b ENSGT00390000008686.c.d ENSGT01030000234528.B.b.a.a.b ENSGT00950000183072.a.a.a ENSGT00940000158377.b.i.a ENSGT00940000154607.b.a.w ENSGT00940000154607.b.a.x ENSGT00940000154621.a.b.b.a ENSGT00510000048324 ENSGT00940000165167 ENSGT00940000164858 Mangrove rivulus MODERN SPECIES 7 ENSKMAG00000012381 nphp3 (ENSKMAG00000012309) uba5 (ENSKMAG00000012251) ackr4b (ENSKMAG00000012223) acad11 (ENSKMAG00000012184) u2surp (ENSKMAG00000012083) pcolce2b (ENSKMAG00000012021) trpc1 (ENSKMAG00000011936) CHST2 (ENSKMAG00000011898) SLC9A9 (ENSKMAG00000011867) dipk2ab (ENSKMAG00000011842) plod2 (ENSKMAG00000011768) ENSKMAG00000011727 ENSKMAG00000011705 zic1 (ENSKMAG00000011689) AGTR1 (ENSKMAG00000011672) ##22 cpb1 (ENSKMAG00000011653) gyg1b (ENSKMAG00000011607) bdh1 (ENSKMAG00000011581) NCK1 (ENSKMAG00000011568) slc35g2b (ENSKMAG00000011557) ENSKMAG00000011537 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(ENSNFUG00015021092) CRY-DASH (ENSNFUG00015021097) Nfu_g_1_011407 (ENSNFUG00015021106) ENSNFUG00015021119 Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT01100000263537.b.a.a.b.b ENSGT00940000156398 ENSGT00940000156177 ENSGT01030000234667.a.a.a.b.a ENSGT00940000160993 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000157649 ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000165699.B ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000154674.q.b ENSGT00940000156929 ENSGT00940000156601 ENSGT00940000153249.b.d.b ENSGT00390000008686.c.d ENSGT01030000234528.B.b.a.a.b ENSGT00950000183072.a.a.a ENSGT00940000158377.b.i.a ENSGT00940000154607.b.a.w ENSGT00940000154607.b.a.x.p ENSGT00940000154607.b.a.x.o ENSGT00940000154621.a.b.b.a ENSGT00510000048324 ENSGT00940000165167 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT01100000263537.b.a.a.b.b ENSGT00940000156398 ENSGT00940000156177 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DUPLICATION Spiny chromis MODERN SPECIES 3542 AGTR1 (ENSAPOG00000007721) ##22 cpb1 (ENSAPOG00000007704) Spiny chromis MODERN SPECIES 1113 AGTR1 (ENSAPOG00000014635) ##22 cpb1 (ENSAPOG00000014766) gyg1b (ENSAPOG00000014777) bdh1 (ENSAPOG00000014787) NCK1 (ENSAPOG00000000410) slc35g2b (ENSAPOG00000014805) ENSAPOG00000014814 ENSAPOG00000014831 csrnp1b (ENSAPOG00000014839) LIMD2 (ENSAPOG00000014848) ENSAPOG00000014869 Bicolor damselfish MODERN SPECIES 2104 AGTR1 (ENSSPAG00000021246) ##22 cpb1 (ENSSPAG00000021254) gyg1b (ENSSPAG00000021267) bdh1 (ENSSPAG00000021287) NCK1 (ENSSPAG00000021296) slc35g2b (ENSSPAG00000021315) Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT01100000263537.b.a.a.b.b ENSGT00940000156398 ENSGT00940000156177 ENSGT00940000160993 ENSGT01030000234667.a.a.a.b.a ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000157649 ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000165699.B ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 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ENSGT00940000165167 ENSGT00940000164858 Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT01100000263537.b.a.a.b.b ENSGT00940000156398 ENSGT00940000156177 ENSGT00940000160993 ENSGT01030000234667.a.a.a.b.a ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000157649 ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000165699.B ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000154674.q.b ENSGT00940000156929 ENSGT00940000156601 ENSGT00940000153249.b.d.b ENSGT00390000008686.c.d ENSGT00950000183072.a.a.a ENSGT00940000158377.b.i.a ENSGT00940000154607.b.a.w ENSGT00940000154621.a.b.b.a ENSGT00510000048324 ENSGT00940000165167 ENSGT00940000164858 ENSGT00940000165361 ENSGT00940000158392.e.b Lumpfish MODERN SPECIES 12 ENSCLMG00005022236 nphp3 (ENSCLMG00005008747) uba5 (ENSCLMG00005008750) acad11 (ENSCLMG00005008776) ackr4b (ENSCLMG00005009762) u2surp (ENSCLMG00005009769) pcolce2b (ENSCLMG00005011776) 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ENSGT00940000153249.b.d.b ENSGT00390000008686.c.d ENSGT01030000234528.B.b.a.a.b ENSGT00950000183072.a.a.a ENSGT00940000158377.b.i.a ENSGT00940000154607.b.a.x ENSGT00940000154607.b.a.w ENSGT00940000154621.a.b.b.a ENSGT00510000048324 ENSGT00940000165167 ENSGT00940000164858 Channel bull blenny MODERN SPECIES 12 ENSCGOG00000023250 nphp3 (ENSCGOG00000023209) uba5 (ENSCGOG00000023152) ackr4b (ENSCGOG00000023143) acad11 (ENSCGOG00000023054) u2surp (ENSCGOG00000022700) pcolce2b (ENSCGOG00000022663) trpc1 (ENSCGOG00000022576) CHST2 (ENSCGOG00000022571) SLC9A9 (ENSCGOG00000022565) dipk2ab (ENSCGOG00000022562) plod2 (ENSCGOG00000020724) ENSCGOG00000020605 zic4 (ENSCGOG00000020604) zic1 (ENSCGOG00000020600) AGTR1 (ENSCGOG00000020598) ##22 cpb1 (ENSCGOG00000020513) gyg1b (ENSCGOG00000020497) bdh1 (ENSCGOG00000020495) NCK1 (ENSCGOG00000020490) slc35g2b (ENSCGOG00000020489) ENSCGOG00000020486 ENSCGOG00000020108 csrnp1b (ENSCGOG00000020095) ENSCGOG00000020093 slc22a13b (ENSCGOG00000020087) slc22a13b 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myd88 (ENSCSEG00000017825) cry-dash (ENSCSEG00000017812) map3k22 (ENSCSEG00000017795) Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT01100000263537.b.a.a.b.b ENSGT00940000156398 ENSGT00940000156177 ENSGT00940000160993 ENSGT01030000234667.a.a.a.b.a ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000157649 ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000165699.B ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000154674.q.b ENSGT00940000156929 ENSGT00940000156601 ENSGT00940000153249.b.d.b ENSGT00390000008686.c.d ENSGT01030000234528.B.b.a.a.b ENSGT00950000183072.a.a.a ENSGT00530000063779.B.b ENSGT00940000158377.b.i.a ENSGT00940000154607.b.a.w ENSGT00940000154621.a.b.b.a ENSGT00510000048324 ENSGT00940000165167 ENSGT00940000164858 Barramundi perch MODERN SPECIES 47 CEP120 (ENSLCAG00010007992) nphp3 (ENSLCAG00010008052) uba5 (ENSLCAG00010008144) acad11 (ENSLCAG00010008341) ackr4b 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ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000165699.B ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000154674.q.b ENSGT00940000156929 ENSGT00940000156601 ENSGT00940000153249.b.d.b ENSGT00390000008686.c.d ENSGT01030000234528.B.b.a.a.b ENSGT00950000183072.a.a.a ENSGT00530000063779.B.b ENSGT00940000158377.b.i.a ENSGT00940000154607.b.a.w ENSGT00940000154621.a.b.b.a ENSGT00510000048324.e ENSGT00940000165167 ENSGT00940000164858 Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 2777 plod2 (ENSSLDG00000015111) ENSSLDG00000015069 zic4 (ENSSLDG00000015055) zic1 (ENSSLDG00000015044) AGTR1 (ENSSLDG00000015034) ##22 cpb1 (ENSSLDG00000015016) gyg1b (ENSSLDG00000014997) bdh1 (ENSSLDG00000014967) NCK1 (ENSSLDG00000014945) slc35g2b (ENSSLDG00000014934) ENSSLDG00000014921 ENSSLDG00000014817 csrnp1b (ENSSLDG00000014777) ENSSLDG00000014762 slc22a13b (ENSSLDG00000014743) oxsr1b (ENSSLDG00000014715) myd88 (ENSSLDG00000014687) cry-dash (ENSSLDG00000014646) map3k22 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ENSGT00940000158635.c.d ENSGT00940000156473.f.a ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b.m.a ENSGT01030000234558.A.a.b.n ENSGT00940000165699.B ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269.g.b ENSGT00940000160269.g.a ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000154674.q.b ENSGT00940000156929 ENSGT00940000156601.u ENSGT00940000153249.b.d.b ENSGT00390000008686.c.d ENSGT00950000183072.a.a.a.d ENSGT00530000063779.B.b ENSGT00940000154607.b.a.s.a.a ENSGT00940000165167 ENSGT01030000234626.C ENSGT00390000006098 ENSGT00940000158392.e.b.d Salmoninae_a DUPLICATION Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 252 ENSGT01030000234558.A.a.b.n ENSGT00940000165699.B ENSGT00940000154200.B.q ENSGT00940000160269.g.b ENSGT01050000244888.b.a.c.b.c ##22 Salmo ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000161902.a.b.a ENSGT00940000155268 ENSGT00950000182878.b.a.k ENSGT00940000157063.a.a.c.a ENSGT00940000154977 ENSGT00940000156908.b ENSGT00390000011717 ENSGT00940000156130.a.a.c.a ENSGT00940000159124 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ENSGT00940000154674.q.b ENSGT00940000156929 ENSGT00940000156601.u.a ENSGT00390000008686.c.d ENSGT00950000183072.a.a.a.d ENSGT00530000063779.B.b ENSGT00940000154607.b.a.s.b ENSGT00940000165167 ENSGT01030000234626.C ENSGT00390000006098 ENSGT00940000158392.e.b.d ENSGT00940000153759.a.a.g ENSGT00940000158548 ENSGT00640000091497.a River trout MODERN SPECIES 36 ENSSTUG00000010696 SBSPON (ENSSTUG00000010688) rpl7 (ENSSTUG00000043928) rdh10a (ENSSTUG00000043900) ENSSTUG00000043898 ube2wa (ENSSTUG00000043860) elocb (ENSSTUG00000043851) pi15a (ENSSTUG00000043840) CRISPLD1 (ENSSTUG00000043822) dipk2ab (ENSSTUG00000043819) ENSSTUG00000043794 plod2 (ENSSTUG00000034042) ENSSTUG00000033773 zic4 (ENSSTUG00000033753) zic1 (ENSSTUG00000033742) AGTR1 (ENSSTUG00000033667) ##22 ENSSTUG00000033661 gyg1b (ENSSTUG00000033514) ENSSTUG00000033480 slc35g2b (ENSSTUG00000033466) ENSSTUG00000033245 csrnp1b (ENSSTUG00000033232) LIMD2 (ENSSTUG00000033227) myd88 (ENSSTUG00000033212) map3k22 (ENSSTUG00000033168) 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pi15a (ENSELUG00000004219) CRISPLD1 (ENSELUG00000004202) ENSELUG00000025936 ENSELUG00000028930 ENSELUG00000030642 dipk2ab (ENSELUG00000004166) dipk2ab (ENSELUG00000032198) ENSELUG00000030052 plod2 (ENSELUG00000004131) ENSELUG00000004042 zic4 (ENSELUG00000004026) zic1 (ENSELUG00000004018) AGTR1 (ENSELUG00000004016) ##22 ENSELUG00000030036 cpb1 (ENSELUG00000004007) gyg1b (ENSELUG00000003979) bdh1 (ENSELUG00000003958) NCK1 (ENSELUG00000003948) slc35g2b (ENSELUG00000003938) ENSELUG00000003931 csrnp1b (ENSELUG00000003916) ENSELUG00000003901 slc22a13b (ENSELUG00000003892) oxsr1b (ENSELUG00000003874) myd88 (ENSELUG00000003867) cry-dash (ENSELUG00000003858) map3k22 (ENSELUG00000003835) acaa1 (ENSELUG00000003809) Otomorpha DUPLICATION Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 74 ENSGT00940000157975 ENSGT01030000234629.D ENSGT00390000005140.b.b ENSGT00940000160622.ab ENSGT00530000063529.C ENSGT00940000155714 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000157649 ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000161292 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000165699.B ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269.f ENSGT01050000244888.b.a.c.b.e ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000154674.q.b ENSGT00940000156929 ENSGT00940000156601.s ENSGT00940000153249.b.d.b ENSGT00950000182972.a.a.a.b.l ENSGT00390000008527 ENSGT00940000178206 ENSGT00930000150950.a ENSGT00940000157252.m.b ENSGT00940000155002.b.e.a ENSGT00940000158085.b.a Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 51 ENSGT00400000023530.b ENSGT00940000155667.b.a ENSGT00940000157975 ENSGT01030000234629.D ENSGT00390000005140.b.b ENSGT00940000160622.ab ENSGT00390000010687.a.a.e ENSGT00940000157649 ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000161292 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000165699.B ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269.f ENSGT01050000244888.b.a.c.b.e ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000154674.q.b ENSGT00940000155265.a.h ENSGT00940000159537 ENSGT00390000013463 ENSGT00940000164582.a Atlantic herring MODERN SPECIES 8 sh3glb1a (ENSCHAG00000025487) nrros (ENSCHAG00000025548) fbxo45 (ENSCHAG00000025550) fam168b (ENSCHAG00000025555) ENSCHAG00000025564 u2surp (ENSCHAG00000025638) pcolce2b (ENSCHAG00000025676) trpc1 (ENSCHAG00000025709) CHST2 (ENSCHAG00000025745) dipk2ab (ENSCHAG00000025751) plod2 (ENSCHAG00000025876) ENSCHAG00000027111 ENSCHAG00000027114 zic4 (ENSCHAG00000027118) zic1 (ENSCHAG00000027120) AGTR1 (ENSCHAG00000027123) ##22 cpb1 (ENSCHAG00000027124) cpb1 (ENSCHAG00000027127) cpb1 (ENSCHAG00000027132) gyg1b (ENSCHAG00000027144) GPT (ENSCHAG00000027178) foxh1 (ENSCHAG00000027457) oplah (ENSCHAG00000027464) ENSCHAG00000027493 ENSCHAG00000027498 ENSCHAG00000027499 maf1b (ENSCHAG00000002375) ENSCHAG00000002603 bambia (ENSCHAG00000002683) waca (ENSCHAG00000002743) mpp7a (ENSCHAG00000004312) Denticle herring MODERN SPECIES 11 sh3glb1a (ENSDCDG00000014340) ENSDCDG00000014564 nrros (ENSDCDG00000014566) fbxo45 (ENSDCDG00000014570) fam168b (ENSDCDG00000014575) ENSDCDG00000014608 U2SURP (ENSDCDG00000015910) pcolce2b (ENSDCDG00000015930) trpc1 (ENSDCDG00000015968) CHST2 (ENSDCDG00000015996) dipk2ab (ENSDCDG00000016000) plod2 (ENSDCDG00000016314) ENSDCDG00000026149 zic4 (ENSDCDG00000026155) zic1 (ENSDCDG00000026159) AGTR1 (ENSDCDG00000026162) ##22 cpb1 (ENSDCDG00000026164) gyg1b (ENSDCDG00000026167) GPT (ENSDCDG00000026198) foxh1 (ENSDCDG00000027701) oplah (ENSDCDG00000027712) shrprbck1r (ENSDCDG00000027765) maf1b (ENSDCDG00000027777) vipr2 (ENSDCDG00000027796) zmynd11 (ENSDCDG00000027835) DIP2C (ENSDCDG00000028293) larp4b (ENSDCDG00000034031) STAG1 (ENSDCDG00000034082) msl2b (ENSDCDG00000034482) tnfsf10 (ENSDCDG00000034484) nceh1b.1 (ENSDCDG00000034487) Otophysi ANCESTRAL SPECIES 175 ENSGT00940000157951 ENSGT00940000156105.k.a ENSGT00390000005508.b ENSGT00940000153498.B.a ENSGT00940000154811.B.a.a.b ENSGT00940000156350.h ENSGT00940000157002 ENSGT00940000157649 ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000161292 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000165699.B ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269.f ENSGT01050000244888.b.a.c.b.e ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000154674.q.b ENSGT00940000156929 ENSGT00940000156601.s ENSGT00940000153249.b.d.b ENSGT00390000008527 ENSGT00940000178206 ENSGT00930000150950.a ENSGT00940000157252.m.b ENSGT00940000155002.b.e.a ENSGT00940000158085.b.a ENSGT00940000154453.a.b.b.e.a ENSGT01090000260098.B.b ENSGT00940000161191.A.a.a Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 52 ENSGT00940000157951 ENSGT00940000156105.k.a ENSGT00390000005508.b ENSGT00940000153498.B.a ENSGT00940000154811.B.a.a.b ENSGT00940000156350.h ENSGT00940000157002 ENSGT00940000157649 ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000161292 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000165699.B ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269.f ENSGT01050000244888.b.a.c.b.e ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000154674.q.b ENSGT00940000156929 ENSGT00940000156601.s ENSGT00940000153249.b.d.b ENSGT00950000182972.a.a.a.b.k.a ENSGT00390000008527 ENSGT00940000178206 ENSGT00930000150950.a ENSGT00940000157252.m.b ENSGT00940000155002.b.e.a ENSGT00940000158085.b.a ENSGT00940000154453.a.b.b.e.a ENSGT01090000260098.B.b ENSGT00940000161191.A.b Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 55 ENSGT00810000125439.A ENSGT00940000156105.k.a ENSGT00390000005508.b ENSGT00940000153498.B.a ENSGT00940000154811.B.a.a.b ENSGT00940000156350.h ENSGT00940000157002 ENSGT00940000157649 ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000161292 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000165699.B ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269.f ENSGT01050000244888.b.a.c.b.e ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000154674.q.b ENSGT00940000156929 ENSGT00940000156601.s ENSGT00940000153249.b.d.b ENSGT00950000182972.a.a.a.b.k.a ENSGT00390000008527 ENSGT00940000178206 ENSGT00930000150950.a ENSGT00940000157252.m.b ENSGT00940000155002.b.e.a ENSGT00940000158085.b.a ENSGT00940000154453.a.b.b.e.a ENSGT01090000260098.B.b ENSGT00940000161191.A.b Characoidei ANCESTRAL SPECIES 46 ENSGT00810000125439.A ENSGT00940000156105.k.a ENSGT00390000005508.b ENSGT00940000153498.B.a ENSGT00940000154811.B.a.a.b ENSGT00940000156350.h ENSGT00940000157002 ENSGT00940000157649 ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000161292 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000165699.B ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269.f ENSGT01050000244888.b.a.c.b.e ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000154674.q.b ENSGT00940000156929 ENSGT00940000156601.s ENSGT00940000153249.b.d.b ENSGT00390000008527 ENSGT00940000178206 ENSGT00930000150950.a ENSGT00940000157252.m.b ENSGT00940000155002.b.e.a ENSGT00940000158085.b.a ENSGT00940000154453.a.b.b.e.a ENSGT01090000260098.B.b ENSGT00940000161191.A.b ENSGT00940000157866 Mexicana tetra MODERN SPECIES 1 dipk2ab (ENSAMXG00000036418) plod2 (ENSAMXG00000033850) ENSAMXG00000010955 zic4 (ENSAMXG00000031851) zic1 (ENSAMXG00000010931) AGTR1 (ENSAMXG00000025004) ##22 cpb1 (ENSAMXG00000010920) gyg1b (ENSAMXG00000039979) bdh1 (ENSAMXG00000033523) NCK1 (ENSAMXG00000010892) slc35g2b (ENSAMXG00000025002) idi1 (ENSAMXG00000034930) ENSAMXG00000033699 wdr37 (ENSAMXG00000018880) ADARB2 (ENSAMXG00000040561) PFKP (ENSAMXG00000018923) klf6a (ENSAMXG00000037722) CCNY (ENSAMXG00000018937) ENSAMXG00000018944 fzd8a (ENSAMXG00000042656) sugct (ENSAMXG00000035823) Red-bellied piranha MODERN SPECIES 4 ENSPNAG00000029861 pdss1 (ENSPNAG00000029883) ENSPNAG00000029897 abi1a (ENSPNAG00000029906) acbd5a (ENSPNAG00000029918) mastl (ENSPNAG00000005654) pcolce2b (ENSPNAG00000004686) trpc1 (ENSPNAG00000029958) CHST2 (ENSPNAG00000029965) ENSPNAG00000029971 dipk2ab (ENSPNAG00000029980) plod2 (ENSPNAG00000030000) ENSPNAG00000030005 zic4 (ENSPNAG00000030011) zic1 (ENSPNAG00000030015) AGTR1 (ENSPNAG00000030018) ##22 cpb1 (ENSPNAG00000006587) gyg1b (ENSPNAG00000030032) bdh1 (ENSPNAG00000030037) NCK1 (ENSPNAG00000004692) slc35g2b (ENSPNAG00000030039) idi1 (ENSPNAG00000030043) wdr37 (ENSPNAG00000030060) ADARB2 (ENSPNAG00000030072) ENSPNAG00000030076 PFKP 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ENSGT00390000010652.D.a.b ENSGT00940000161872 ENSGT00940000157166.d ENSGT00940000157050.i.a ENSGT00940000164804.a ENSGT00940000164492.a.a ENSGT00940000158959.b.b ENSGT00940000160269.e ENSGT01050000244888.b.a.c.b.f ##22 ENSGT00940000154674.q.a ENSGT00910000144305 ENSGT00940000156601.s.a ENSGT00940000153249.b.d.b ENSGT00950000182972.a.a.a.b.l ENSGT00940000157741 ENSGT00940000154982.d ENSGT00940000156313.c.b ENSGT01030000234633.B.a.d ENSGT00950000183154.b.a.a.b ENSGT00940000154920.bb.a ENSGT00530000063668.A.c ENSGT00950000183074.A.a.b ENSGT00940000157171 ENSGT00390000015525.b Atlantic herring MODERN SPECIES 17 kcnn1a (ENSCHAG00000017288) ENSCHAG00000017257 ENSCHAG00000017254 angptl4 (ENSCHAG00000017237) ndufs7 (ENSCHAG00000017228) ENSCHAG00000017156 MED26 (ENSCHAG00000017137) crtc1a (ENSCHAG00000017119) ENSCHAG00000017093 MAST3 (ENSCHAG00000017066) pik3r2 (ENSCHAG00000015117) ifi30 (ENSCHAG00000015040) mpv17l2 (ENSCHAG00000015031) ENSCHAG00000014472 rab3aa (ENSCHAG00000014417) AGTR1 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tnika (ENSCARG00000024912) slc2a2 (ENSCARG00000035482) Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 580 ENSGT00390000010652.D.a.b.b ENSGT00940000161872.f ENSGT00940000157166.d.f ENSGT00940000157050.i.a.b ENSGT00940000164804.a.a ENSGT00940000160620.a ENSGT00940000164492.a.a.b ENSGT00940000158959.b.b.a ENSGT01050000244888.b.a.c.b.f.b ##22 ENSGT00940000154674.q.a.a ENSGT00910000144305.a ENSGT00940000156601.r.a ENSGT00940000153249.b.d.b.t ENSGT00950000182972.a.a.a.b.k.a.a ENSGT00940000157741.i ENSGT00390000016814.d.b ENSGT00940000156699.j.a ENSGT00940000154659.b.d Goldfish MODERN SPECIES 11 ENSCARG00000000589 sap130b (ENSCARG00000000809) mllt1b (ENSCARG00000001206) ENSCARG00000001211 rab6bb (ENSCARG00000001218) aire (ENSCARG00000001228) crtc1a (ENSCARG00000001267) ENSCARG00000001282 MAST3 (ENSCARG00000001314) pik3r2 (ENSCARG00000001443) ifi30 (ENSCARG00000001681) mpv17l2 (ENSCARG00000001687) ENSCARG00000001691 ENSCARG00000001722 rab3aa (ENSCARG00000001849) AGTR1 (ENSCARG00000001855) ##22 gyg1a 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fndc3ba (ENSPKIG00000021061) GHSR (ENSPKIG00000021028) pld1a (ENSPKIG00000020932) tnika (ENSPKIG00000020782) Asian bonytongue MODERN SPECIES 18 ENSSFOG00015029937 nadkb (ENSSFOG00015030602) gpr160 (ENSSFOG00015010516) u2surp (ENSSFOG00015010470) PCOLCE2 (ENSSFOG00015010419) pls1 (ENSSFOG00015010344) CHST2 (ENSSFOG00015010324) dipk2aa (ENSSFOG00015010308) ENSSFOG00015010299 plod2 (ENSSFOG00015010084) si:ch211-71m22.1 (ENSSFOG00015010038) ENSSFOG00015024668 zic4 (ENSSFOG00015009983) ZIC1 (ENSSFOG00015009971) ENSSFOG00015031549 AGTR1 (ENSSFOG00015009966) ##22 gyg1a (ENSSFOG00015009894) HLTF (ENSSFOG00015009816) bdh1 (ENSSFOG00015031023) NCK1 (ENSSFOG00015009771) slc35g2a (ENSSFOG00015028575) ENSSFOG00015009648 pccb (ENSSFOG00015009544) MSL2 (ENSSFOG00015009527) TNFSF10 (ENSSFOG00015027159) nceh1a (ENSSFOG00015033076) PPP2R3A (ENSSFOG00015009424) fndc3ba (ENSSFOG00015009292) ghsra (ENSSFOG00015030756) pld1a (ENSSFOG00015009068) tnika (ENSSFOG00015008965) Spotted gar MODERN SPECIES 652 xrn1 (ENSLOCG00000007944) ATR (ENSLOCG00000007924) pls1 (ENSLOCG00000007909) trpc1 (ENSLOCG00000007889) pcolce2b (ENSLOCG00000007866) u2surp (ENSLOCG00000007828) chst2a (ENSLOCG00000017407) ENSLOCG00000007817 SLC9A9 (ENSLOCG00000007796) dipk2aa (ENSLOCG00000007771) plod2 (ENSLOCG00000007750) ENSLOCG00000007741 si:ch211-71m22.1 (ENSLOCG00000007730) zic4 (ENSLOCG00000007717) zic1 (ENSLOCG00000007706) AGTR1 (ENSLOCG00000017406) ##22 cpb1 (ENSLOCG00000007688) gyg1b (ENSLOCG00000007672) HLTF (ENSLOCG00000007640) bdh1 (ENSLOCG00000007627) NCK1 (ENSLOCG00000007610) slc35g2a (ENSLOCG00000017405) STAG1 (ENSLOCG00000007568) pccb (ENSLOCG00000007550) msl2a (ENSLOCG00000007537) PPP2R3A (ENSLOCG00000007518) nceh1b.1 (ENSLOCG00000007501) tnfsf10 (ENSLOCG00000007485) ghsra (ENSLOCG00000007476) ENSLOCG00000007456 ENSLOCG00000007447 Reedfish MODERN SPECIES 10 TFDP2 (ENSECRG00000014401) ENSECRG00000014447 pls1 (ENSECRG00000014473) trpc1 (ENSECRG00000014535) pcolce2b (ENSECRG00000014562) u2surp (ENSECRG00000014625) chst2a (ENSECRG00000014684) CHST2 (ENSECRG00000014726) dipk2aa (ENSECRG00000014866) ENSECRG00000014894 plod2 (ENSECRG00000014947) PLSCR1 (ENSECRG00000015050) ENSECRG00000015112 zic4 (ENSECRG00000015234) zic1 (ENSECRG00000015318) AGTR1 (ENSECRG00000015345) ##22 cpb1 (ENSECRG00000015379) HLTF (ENSECRG00000015441) gyg1b (ENSECRG00000015561) bdh1 (ENSECRG00000015587) NCK1 (ENSECRG00000015624) slc35g2a (ENSECRG00000006303) STAG1 (ENSECRG00000006334) pccb (ENSECRG00000006376) msl2a (ENSECRG00000006410) PPP2R3A (ENSECRG00000006423) ENSECRG00000006437 nceh1b.1 (ENSECRG00000006444) tnfsf10 (ENSECRG00000006455) ghsra (ENSECRG00000006465) fndc3ba (ENSECRG00000006480) Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000157909 ENSGT01000000214434.A ENSGT00670000098080 ENSGT00940000155714 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000154435 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00940000153981.B ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT00940000165445 ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942 #25 ENSGT00940000153664.B ENSGT00940000160465 Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT01000000214434.A ENSGT00670000098080 ENSGT00940000155714 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000154435 ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT00940000165445 ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942 #25 ENSGT00940000153664.B Amniota ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00670000098080 ENSGT00940000155714 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000154435 ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT00940000165445 ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942 #25 ENSGT00940000153664.B Sauria ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00670000098080 ENSGT00940000155714 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000154435 ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551.c ENSGT00940000161551.d ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT00940000165445 ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942 #25 Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00670000098080 ENSGT00940000155714 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000154435 ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 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ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942 #25 Laterata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155714 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334.c ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000154435.y.b ENSGT00940000154435.y.a.a ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819.a ENSGT00940000161551.c ENSGT00940000161551.d ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866.lb.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT00940000165445 ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942 #25 Argentine black and white tegu MODERN SPECIES 19 ENSSMRG00000016414 PAQR9 (ENSSMRG00000016416) U2SURP (ENSSMRG00000016420) CHST2 (ENSSMRG00000017568) SLC9A9 (ENSSMRG00000017575) ENSSMRG00000017620 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(ENSPMRG00000008901) CP (ENSPMRG00000008918) TM4SF18 (ENSPMRG00000008925) TM4SF1 (ENSPMRG00000008930) ENSPMRG00000008939 TM4SF4 (ENSPMRG00000008954) COMMD2 (ENSPMRG00000008966) ANKUB1 (ENSPMRG00000008977) RNF13 (ENSPMRG00000008983) #25 PFN2 (ENSPMRG00000008990) Toxicofera ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000155714 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334.c ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000154435.y.b ENSGT00940000154435.y.a.a ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551.c ENSGT00940000161551.d ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT00940000165445 ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942 #25 Elapidae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000155714 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334.c ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000154435.y.b.c.a ENSGT00940000154435.y.a.a ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551.c ENSGT00940000161551.d ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT00940000165445 ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942 #25 ENSGT00940000153664.B Elapidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155714 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334.c ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000154435.y.b.c.a ENSGT00940000154435.y.a.a ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551.c ENSGT00940000161551.d ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT00940000165445 ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942 #25 ENSGT00940000153664.B Acanthophiinae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000155714 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334.c ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000154435.y.b.c.a ENSGT00940000154435.y.a.a ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551.c ENSGT00940000161551.d ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT00940000165445 ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942 #25 ENSGT00940000153664.B Mainland tiger snake MODERN SPECIES PLS1 (ENSNSUG00000018160) TRPC1 (ENSNSUG00000018161) PCOLCE2 (ENSNSUG00000018162) PAQR9 (ENSNSUG00000018174) U2SURP (ENSNSUG00000018175) CHST2 (ENSNSUG00000018357) SLC9A9 (ENSNSUG00000018359) DIPK2A (ENSNSUG00000018360) PLOD2 (ENSNSUG00000018362) ENSNSUG00000018363 ENSNSUG00000018364 ENSNSUG00000018365 PLSCR5 (ENSNSUG00000018370) ZIC4 (ENSNSUG00000018371) ZIC1 (ENSNSUG00000018372) AGTR1 (ENSNSUG00000018373) ##22 CPB1 (ENSNSUG00000018374) CPA3 (ENSNSUG00000018375) GYG1 (ENSNSUG00000018376) HLTF (ENSNSUG00000018377) ENSNSUG00000018480 HPS3 (ENSNSUG00000018481) CP (ENSNSUG00000018482) TM4SF18 (ENSNSUG00000018483) ENSNSUG00000018484 TM4SF4 (ENSNSUG00000018485) WWTR1 (ENSNSUG00000018486) COMMD2 (ENSNSUG00000018488) ANKUB1 (ENSNSUG00000018489) RNF13 (ENSNSUG00000018490) #25 ENSNSUG00000018491 Eastern brown snake MODERN SPECIES 16 TRPC1 (ENSPTXG00000004571) PCOLCE2 (ENSPTXG00000004573) PAQR9 (ENSPTXG00000004575) U2SURP (ENSPTXG00000004578) CHST2 (ENSPTXG00000004582) SLC9A9 (ENSPTXG00000004584) DIPK2A (ENSPTXG00000004588) ENSPTXG00000004590 PLOD2 (ENSPTXG00000004593) ENSPTXG00000004599 ENSPTXG00000004601 PLSCR5 (ENSPTXG00000004603) ZIC4 (ENSPTXG00000004613) ENSPTXG00000004615 ZIC1 (ENSPTXG00000004617) AGTR1 (ENSPTXG00000004618) ##22 CPB1 (ENSPTXG00000004621) ENSPTXG00000004622 ENSPTXG00000004624 GYG1 (ENSPTXG00000004625) HLTF (ENSPTXG00000004626) HPS3 (ENSPTXG00000004674) CP (ENSPTXG00000004839) TM4SF18 (ENSPTXG00000004840) ENSPTXG00000004842 TM4SF4 (ENSPTXG00000004843) WWTR1 (ENSPTXG00000004844) COMMD2 (ENSPTXG00000004845) ANKUB1 (ENSPTXG00000004846) RNF13 (ENSPTXG00000004847) #25 ENSPTXG00000004848 Blue-lipped sea krait MODERN SPECIES 1205 AGTR1 (ENSLLTG00000018177) ##22 Indian cobra MODERN SPECIES 3 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#25 Archelosauria ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00670000098080 ENSGT00940000155714 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000154435 ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551.d ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00950000182825.B ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942 #25 ENSGT00940000153664.B Cryptodira ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00670000098080 ENSGT00940000155714 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000154435 ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551.d ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT01040000240444.A.b.a.b.gb ENSGT01040000240444.A.b.a.a ENSGT01040000240444.A.b.b ENSGT00950000182825.B ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 Testudinoidea ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00670000098080 ENSGT00940000155714 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000154435 ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551.d ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT01040000240444.A.b.a.a.a ENSGT00950000182825.B ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942 #25 Emydidae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00670000098080 ENSGT00940000155714 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000154435 ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551.d ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT01040000240444.A.b.a.a.a ENSGT00950000182825.B ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942 #25 Three-toed box turtle MODERN SPECIES 32 XRN1 (ENSTMTG00000019913) ATR (ENSTMTG00000019972) PLS1 (ENSTMTG00000020021) TRPC1 (ENSTMTG00000020038) PCOLCE2 (ENSTMTG00000020055) PAQR9 (ENSTMTG00000020066) U2SURP (ENSTMTG00000020082) CHST2 (ENSTMTG00000020129) SLC9A9 (ENSTMTG00000020136) DIPK2A (ENSTMTG00000020145) PLOD2 (ENSTMTG00000020153) PLSCR1 (ENSTMTG00000020194) PLSCR5 (ENSTMTG00000020211) ZIC4 (ENSTMTG00000020239) ZIC1 (ENSTMTG00000020249) AGTR1 (ENSTMTG00000020257) ##22 CPB1 (ENSTMTG00000020261) CPA3 (ENSTMTG00000020271) GYG1 (ENSTMTG00000020282) HLTF (ENSTMTG00000020293) ENSTMTG00000020332 ENSTMTG00000020335 HPS3 (ENSTMTG00000020345) CP (ENSTMTG00000020367) TM4SF18 (ENSTMTG00000020386) TM4SF1 (ENSTMTG00000002658) TM4SF4 (ENSTMTG00000002664) WWTR1 (ENSTMTG00000002668) COMMD2 (ENSTMTG00000002672) ANKUB1 (ENSTMTG00000002677) RNF13 (ENSTMTG00000002681) #25 painted turtle MODERN SPECIES 768 GK5 (ENSCPBG00000002311) ATR (ENSCPBG00000008903) PLS1 (ENSCPBG00000008914) TRPC1 (ENSCPBG00000008916) PCOLCE2 (ENSCPBG00000008919) PAQR9 (ENSCPBG00000008921) U2SURP (ENSCPBG00000008969) CHST2 (ENSCPBG00000011801) SLC9A9 (ENSCPBG00000011803) DIPK2A (ENSCPBG00000011813) PLOD2 (ENSCPBG00000011834) PLSCR1 (ENSCPBG00000011847) PLSCR5 (ENSCPBG00000011856) ZIC4 (ENSCPBG00000011864) ZIC1 (ENSCPBG00000011867) AGTR1 (ENSCPBG00000011883) ##22 CPB1 (ENSCPBG00000011887) CPA3 (ENSCPBG00000011893) GYG1 (ENSCPBG00000011895) Testudinidae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00670000098080 ENSGT00940000155714 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000154435 ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551.d ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT01040000240444.A.b.a.a.a ENSGT00950000182825.B ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942 #25 Goode s thornscrub tortoise MODERN SPECIES 23 ATR (ENSGEVG00005008879) ENSGEVG00005008824 PLS1 (ENSGEVG00005008792) TRPC1 (ENSGEVG00005008765) PCOLCE2 (ENSGEVG00005008665) PAQR9 (ENSGEVG00005008620) U2SURP (ENSGEVG00005007971) CHST2 (ENSGEVG00005007797) SLC9A9 (ENSGEVG00005007763) DIPK2A (ENSGEVG00005007746) PLOD2 (ENSGEVG00005006208) PLSCR1 (ENSGEVG00005005744) PLSCR5 (ENSGEVG00005011532) ZIC4 (ENSGEVG00005011456) ZIC1 (ENSGEVG00005011414) AGTR1 (ENSGEVG00005011402) ##22 CPB1 (ENSGEVG00005011227) CPA3 (ENSGEVG00005011172) GYG1 (ENSGEVG00005011136) HLTF (ENSGEVG00005011026) ENSGEVG00005010957 ENSGEVG00005010818 HPS3 (ENSGEVG00005010757) CP (ENSGEVG00005010164) TM4SF18 (ENSGEVG00005009967) TM4SF1 (ENSGEVG00005009813) TM4SF4 (ENSGEVG00005009637) WWTR1 (ENSGEVG00005009594) COMMD2 (ENSGEVG00005009577) ANKUB1 (ENSGEVG00005009465) RNF13 (ENSGEVG00005009339) #25 Abingdon island giant tortoise MODERN SPECIES 2347 AGTR1 (ENSCABG00000019592) ##22 CPB1 (ENSCABG00000019594) CPA3 (ENSCABG00000019596) GYG1 (ENSCABG00000019599) HLTF (ENSCABG00000019643) ENSCABG00000019794 ENSCABG00000019797 HPS3 (ENSCABG00000019804) CP (ENSCABG00000019807) TM4SF18 (ENSCABG00000019839) TM4SF1 (ENSCABG00000019844) TM4SF4 (ENSCABG00000019851) WWTR1 (ENSCABG00000019874) COMMD2 (ENSCABG00000019884) ANKUB1 (ENSCABG00000019887) RNF13 (ENSCABG00000019891) #25 Chinese turtle MODERN SPECIES 523 AGTR1 (ENSPSIG00000000825) ##22 CPB1 (ENSPSIG00000011660) CPA3 (ENSPSIG00000012200) GYG1 (ENSPSIG00000014501) HLTF (ENSPSIG00000014558) ENSPSIG00000014661 HPS3 (ENSPSIG00000014704) CP (ENSPSIG00000015628) TM4SF18 (ENSPSIG00000017172) TM4SF1 (ENSPSIG00000017177) TM4SF4 (ENSPSIG00000017198) WWTR1 (ENSPSIG00000017220) COMMD2 (ENSPSIG00000005159) ANKUB1 (ENSPSIG00000005189) RNF13 (ENSPSIG00000005312) #25 PFN2 (ENSPSIG00000005498) Archosauria ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00670000098080 ENSGT00940000155714 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ENSGT00940000157819 ENSGT00940000163773 ENSGT00940000159265 ENSGT00940000159409 ENSGT00940000156929 ENSGT00510000046981 ENSGT00390000004757 ENSGT00940000156389.a ENSGT00940000158154 ENSGT00940000161593 ENSGT01030000234960.a ENSGT00940000156442 ENSGT00390000018718 ENSGT00940000155941.A ENSGT00940000162953 Neognathae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00670000098080 ENSGT00940000155714 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000154435 ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000163773 ENSGT00940000159265 ENSGT00940000159409 ENSGT00940000156929 ENSGT00510000046981 ENSGT00390000004757 ENSGT00940000156389.a ENSGT00940000158154 ENSGT00940000161593 ENSGT01030000234960.a ENSGT00940000156442 ENSGT00390000018718 ENSGT00940000155941.A ENSGT00940000162953 Neognathae_b ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00670000098080 ENSGT00940000155714 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000154435 ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000163773 ENSGT00940000159265 ENSGT00940000159409 ENSGT00940000156929 ENSGT00510000046981 ENSGT00390000004757 ENSGT00940000156389.a ENSGT00940000158154 ENSGT00940000161593 ENSGT01030000234960.a ENSGT00940000156442 ENSGT00390000018718 ENSGT00940000155941.A ENSGT00940000162953 Passeriformes ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00670000098080 ENSGT00940000155714 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000154435 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Kakapo MODERN SPECIES 25 ATR (ENSSHBG00005019112) PLS1 (ENSSHBG00005019135) TRPC1 (ENSSHBG00005006476) PCOLCE2 (ENSSHBG00005006524) PAQR9 (ENSSHBG00005006552) U2SURP (ENSSHBG00005006721) CHST2 (ENSSHBG00005008417) SLC9A9 (ENSSHBG00005008423) DIPK2A (ENSSHBG00005008426) ENSSHBG00005008431 PLOD2 (ENSSHBG00005008619) PLSCR1 (ENSSHBG00005016174) PLSCR5 (ENSSHBG00005016186) ZIC4 (ENSSHBG00005016193) ZIC1 (ENSSHBG00005016200) AGTR1 (ENSSHBG00005016206) ##22 CPB1 (ENSSHBG00005016213) ENSSHBG00005016226 ENSSHBG00005016240 MELTF (ENSSHBG00005016246) DLG1 (ENSSHBG00005016540) BDH1 (ENSSHBG00005019926) APOD (ENSSHBG00005019929) ENSSHBG00005019930 ACAP2 (ENSSHBG00005019933) XXYLT1 (ENSSHBG00005019935) FAM43A (ENSSHBG00005019937) LSG1 (ENSSHBG00005019941) ATP13A3 (ENSSHBG00005019946) ENSSHBG00005019954 LRRC15 (ENSSHBG00005019956) Golden eagle MODERN SPECIES 1 ATR (ENSACCG00020004424) PLS1 (ENSACCG00020004378) TRPC1 (ENSACCG00020004359) PCOLCE2 (ENSACCG00020004338) PAQR9 (ENSACCG00020004315) U2SURP 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ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000163773 ENSGT00940000159265 ENSGT00940000159409 ENSGT00940000156929 ENSGT00510000046981 ENSGT00390000004757 ENSGT00940000156389.a ENSGT00940000158154 ENSGT00940000161593 ENSGT00940000156442 ENSGT00940000155941.A ENSGT00940000162953 ENSGT00940000161771 ENSGT00940000164427.a.b.f Phasianidae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00670000098080 ENSGT00940000155714 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000154435 ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00390000003197 ENSGT00390000006492 ENSGT01070000254044 ENSGT00940000163773 ENSGT00940000159265 ENSGT00940000159409 ENSGT00940000156929 ENSGT00510000046981 ENSGT00390000004757 ENSGT00940000156389.a ENSGT00940000158154 ENSGT00940000161593 ENSGT00940000156442 ENSGT00940000155941.A Phasianidae_b ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00670000098080 ENSGT00940000155714 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000154435 ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT01070000254044 ENSGT00940000163773 ENSGT00940000159265 ENSGT00940000159409 ENSGT00940000156929 ENSGT00510000046981 ENSGT00390000004757 ENSGT00940000156389.a ENSGT00940000158154 ENSGT00940000161593 ENSGT00940000156442 ENSGT00940000155941.A ENSGT00940000162953 ENSGT00940000161771 Turkey MODERN SPECIES 2 ENSMGAG00000019977 ENSMGAG00000007079 ENSMGAG00000007050 ENSMGAG00000022300 ENSMGAG00000022647 ENSMGAG00000007045 ENSMGAG00000006951 ENSMGAG00000007020 ENSMGAG00000006975 ENSMGAG00000006997 ENSMGAG00000006928 ENSMGAG00000021046 ENSMGAG00000016846 ENSMGAG00000006732 ENSMGAG00000006730 AGTR1 (ENSMGAG00000016025) ##22 ENSMGAG00000006671 ENSMGAG00000018648 ENSMGAG00000022223 ENSMGAG00000021202 ENSMGAG00000021213 ENSMGAG00000006667 ENSMGAG00000006650 ENSMGAG00000006583 ENSMGAG00000006579 ENSMGAG00000021305 ENSMGAG00000017341 ENSMGAG00000006549 PAQR9 (ENSMGAG00000019037) ENSMGAG00000006438 ENSMGAG00000006503 Chicken MODERN SPECIES 38 ATR (ENSGALG00010015749) PLS1 (ENSGALG00010015774) TRPC1 (ENSGALG00010015788) PCOLCE2 (ENSGALG00010015809) PAQR9 (ENSGALG00010015814) U2SURP (ENSGALG00010015839) CHST2 (ENSGALG00010015858) SLC9A9 (ENSGALG00010015887) C9H3orf58 (ENSGALG00010015963) PLOD2 (ENSGALG00010016915) PLSCR1 (ENSGALG00010016973) PLSCR5 (ENSGALG00010016979) ENSGALG00010018616 ZIC4 (ENSGALG00010016996) ZIC1 (ENSGALG00010017016) AGTR1 (ENSGALG00010017056) ##22 NCBP2 (ENSGALG00010017122) CPB1 (ENSGALG00010017144) ENSGALG00010018633 PIGZ (ENSGALG00010017154) MELTF (ENSGALG00010017240) DLG1 (ENSGALG00010017343) BDH1A 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(ENSCJPG00005012479) LSG1 (ENSCJPG00005012480) ATP13A3 (ENSCJPG00005012483) Anatidae ANCESTRAL SPECIES 40 ENSGT00670000098080 ENSGT00940000155714 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000154435 ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT01070000254044 ENSGT00950000183090.C Pink-footed goose MODERN SPECIES 403 AGTR1 (ENSABRG00000014751) ##22 CPB1 (ENSABRG00000014753) ENSABRG00000014757 ENSABRG00000014764 African ostrich MODERN SPECIES 1075 GK5 (ENSSCUG00000014571) XRN1 (ENSSCUG00000014591) ATR (ENSSCUG00000014616) PLS1 (ENSSCUG00000014649) TRPC1 (ENSSCUG00000014651) PCOLCE2 (ENSSCUG00000014659) U2SURP (ENSSCUG00000014671) ENSSCUG00000014689 SLC9A9 (ENSSCUG00000014692) DIPK2A (ENSSCUG00000014695) PLOD2 (ENSSCUG00000014760) PLSCR1 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(ENSMODG00000021249) ENSMODG00000021250 ZIC1 (ENSMODG00000021251) AGTR1 (ENSMODG00000024750) ##22 ENSMODG00000024751 CPB1 (ENSMODG00000021255) CPA3 (ENSMODG00000021256) GYG1 (ENSMODG00000021257) HLTF (ENSMODG00000021258) HPS3 (ENSMODG00000021259) CP (ENSMODG00000021261) ENSMODG00000021262 TM4SF18 (ENSMODG00000021263) ENSMODG00000021264 TM4SF4 (ENSMODG00000021265) WWTR1 (ENSMODG00000021266) COMMD2 (ENSMODG00000021267) ANKUB1 (ENSMODG00000024756) RNF13 (ENSMODG00000021268) #25 Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000155714 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947.i ENSGT00940000154435 ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00950000182987.c.a.a.b ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b.k.b ENSGT01030000234590.A.b.b.l ENSGT01030000234590.A.b.b.k.a ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000155714 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947.i ENSGT00940000154435 ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00950000182987.c.a.a.b ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b.k.b ENSGT01030000234590.A.b.b.l ENSGT01030000234590.A.b.b.k.a ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000155714 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947.i ENSGT00940000154435 ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00950000182987.c.a.a.b ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b.k.b ENSGT01030000234590.A.b.b.l ENSGT01030000234590.A.b.b.k.a ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 koala MODERN SPECIES 9 DIPK2A (ENSPCIG00000037438) ENSPCIG00000018428 ENSPCIG00000007920 ENSPCIG00000029198 ENSPCIG00000013897 PLOD2 (ENSPCIG00000018522) PLSCR4 (ENSPCIG00000018533) PLSCR1 (ENSPCIG00000018535) PLSCR5 (ENSPCIG00000018538) ENSPCIG00000032139 ENSPCIG00000023048 ENSPCIG00000023047 ZIC1 (ENSPCIG00000023051) ENSPCIG00000034512 AGTR1 (ENSPCIG00000023054) ##22 ENSPCIG00000023055 CPB1 (ENSPCIG00000005481) CPA3 (ENSPCIG00000005490) GYG1 (ENSPCIG00000005496) HLTF (ENSPCIG00000005506) HPS3 (ENSPCIG00000005526) CP (ENSPCIG00000005553) ENSPCIG00000005652 TM4SF18 (ENSPCIG00000005774) TM4SF1 (ENSPCIG00000004115) ENSPCIG00000005778 ENSPCIG00000005781 ENSPCIG00000005790 WWTR1 (ENSPCIG00000005795) ENSPCIG00000034817 Common wonbat MODERN SPECIES 1046 PAQR9 (ENSVURG00010010423) U2SURP (ENSVURG00010010436) CHST2 (ENSVURG00010010449) SLC9A9 (ENSVURG00010010469) ENSVURG00010010488 DIPK2A (ENSVURG00010010492) ENSVURG00010010499 ENSVURG00010010517 ENSVURG00010010530 PLOD2 (ENSVURG00010010570) PLSCR4 (ENSVURG00010010620) PLSCR1 (ENSVURG00010010637) PLSCR5 (ENSVURG00010010651) ZIC4 (ENSVURG00010010689) ZIC1 (ENSVURG00010010744) AGTR1 (ENSVURG00010010772) ##22 ENSVURG00010010778 CPB1 (ENSVURG00010010818) CPA3 (ENSVURG00010010849) GYG1 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ENSSHAG00000018942 WWTR1 (ENSSHAG00000025546) COMMD2 (ENSSHAG00000027397) ANKUB1 (ENSSHAG00000024566) Eutheria ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164931 ENSGT00940000154435 ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h #25 ENSGT00940000153664.B ENSGT00940000160465 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 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ENSGT00940000153664.B Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164931 ENSGT00940000154435.j ENSGT00940000154435.i ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT00940000165295 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h #25 ENSGT00940000153664.B Suina ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164931 ENSGT00940000154435.i ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT00940000165295 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h #25 ENSGT00940000153664.B ENSGT00940000160465 Chacoan peccary MODERN SPECIES 944 PAQR9 (ENSCWAG00000014421) U2SURP (ENSCWAG00000014436) CHST2 (ENSCWAG00000014501) SLC9A9 (ENSCWAG00000014518) DIPK2A (ENSCWAG00000014557) ENSCWAG00000014638 PLOD2 (ENSCWAG00000014675) PLSCR4 (ENSCWAG00000015062) ENSCWAG00000015102 ENSCWAG00000015142 PLSCR1 (ENSCWAG00000015196) PLSCR5 (ENSCWAG00000015309) ZIC4 (ENSCWAG00000015380) ZIC1 (ENSCWAG00000015486) ENSCWAG00000015525 AGTR1 (ENSCWAG00000015548) ##22 CPB1 (ENSCWAG00000015586) GYG1 (ENSCWAG00000015683) HLTF (ENSCWAG00000015763) HPS3 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ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h #25 ENSGT00940000153664.B Pecora ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164931 ENSGT00940000154435.j.b.b ENSGT00940000154435.j.b.a ENSGT00940000154435.i ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT00940000165295 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h #25 ENSGT00940000153664.B Percora_a ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164931 ENSGT00940000154435.j.b.b ENSGT00940000154435.i ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT00940000165295 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h #25 ENSGT00940000153664.B Bovidae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164931 ENSGT00940000154435.j.b.b ENSGT00940000154435.i ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT00940000165295 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h #25 ENSGT00940000153664.B Caprinae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164931 ENSGT00940000154435.i ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h #25 ENSGT00940000153664.B ENSGT00940000160465 Goat MODERN SPECIES PCOLCE2 (ENSCHIG00000024199) PAQR9 (ENSCHIG00000009825) U2SURP (ENSCHIG00000023892) CHST2 (ENSCHIG00000010707) SLC9A9 (ENSCHIG00000013168) DIPK2A (ENSCHIG00000018908) PLOD2 (ENSCHIG00000018266) PLSCR4 (ENSCHIG00000022873) ENSCHIG00000010958 PLSCR1 (ENSCHIG00000025945) PLSCR5 (ENSCHIG00000013997) ZIC4 (ENSCHIG00000023352) ZIC1 (ENSCHIG00000027149) ENSCHIG00000014985 ENSCHIG00000014987 AGTR1 (ENSCHIG00000011470) ##22 CPB1 (ENSCHIG00000006800) CPA3 (ENSCHIG00000011174) GYG1 (ENSCHIG00000017330) HLTF (ENSCHIG00000024059) HPS3 (ENSCHIG00000022630) CP (ENSCHIG00000014080) ENSCHIG00000026820 ENSCHIG00000010914 TM4SF18 (ENSCHIG00000019127) TM4SF1 (ENSCHIG00000015148) TM4SF4 (ENSCHIG00000008247) WWTR1 (ENSCHIG00000017264) COMMD2 (ENSCHIG00000013298) ENSCHIG00000019445 RNF13 (ENSCHIG00000007199) #25 Rambouillet Sheep MODERN SPECIES PCOLCE2 (ENSOARG00020006072) PAQR9 (ENSOARG00020006055) U2SURP (ENSOARG00020005741) CHST2 (ENSOARG00020005718) SLC9A9 (ENSOARG00020005671) DIPK2A (ENSOARG00020005642) PLOD2 (ENSOARG00020005484) PLSCR4 (ENSOARG00020005420) ENSOARG00020005372 PLSCR1 (ENSOARG00020005334) PLSCR5 (ENSOARG00020005312) ENSOARG00020006040 ENSOARG00020006026 ZIC1 (ENSOARG00020005847) ENSOARG00020005798 AGTR1 (ENSOARG00020005782) ##22 CPB1 (ENSOARG00020005735) CPA3 (ENSOARG00020005710) GYG1 (ENSOARG00020005658) HLTF (ENSOARG00020005489) HPS3 (ENSOARG00020005359) CP (ENSOARG00020005238) TM4SF18 (ENSOARG00020005177) TM4SF1 (ENSOARG00020005149) ENSOARG00020005129 TM4SF4 (ENSOARG00020005107) WWTR1 (ENSOARG00020005085) COMMD2 (ENSOARG00020005061) ANKUB1 (ENSOARG00020005010) RNF13 (ENSOARG00020004953) #25 PFN2 (ENSOARG00020004872) Bovinae ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000157649 ENSGT00940000153096.b.c.b.b.a.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164931 ENSGT00940000154435.j.b.b ENSGT00940000154435.i ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT00940000165295 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h #25 ENSGT00940000153664.B Bos ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000157649 ENSGT00940000153096.b.c.b.b.a.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164931 ENSGT00940000154435.j.b.b ENSGT00940000154435.i ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT00940000165295 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h #25 ENSGT00940000153664.B Bos_a ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000157649 ENSGT00940000153096.b.c.b.b.a.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164931 ENSGT00940000154435.j.b.b ENSGT00940000154435.i ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT00940000165295 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h #25 ENSGT00940000153664.B Domestic yak MODERN SPECIES ENSBGRG00000000169 PLOD2 (ENSBGRG00000020444) ENSBGRG00000020343 ENSBGRG00000020292 ENSBGRG00000020218 ENSBGRG00000020190 ENSBGRG00000020009 ENSBGRG00000019984 PLSCR5 (ENSBGRG00000019884) ENSBGRG00000019852 ZIC4 (ENSBGRG00000019768) ENSBGRG00000019710 ZIC1 (ENSBGRG00000019684) ENSBGRG00000019633 ENSBGRG00000019617 AGTR1 (ENSBGRG00000019592) ##22 CPB1 (ENSBGRG00000019337) CPA3 (ENSBGRG00000019241) GYG1 (ENSBGRG00000019043) HLTF (ENSBGRG00000018610) CP (ENSBGRG00000017687) HPS3 (ENSBGRG00000017021) ENSBGRG00000016824 TM4SF18 (ENSBGRG00000016700) TM4SF1 (ENSBGRG00000016631) TM4SF4 (ENSBGRG00000016533) WWTR1 (ENSBGRG00000016273) ANKUB1 (ENSBGRG00000016179) RNF13 (ENSBGRG00000015971) #25 PFN2 (ENSBGRG00000015699) ENSBGRG00000015674 Wild yak MODERN SPECIES 1415 AGTR1 (ENSBMUG00000022155) ##22 CPB1 (ENSBMUG00000022173) CPA3 (ENSBMUG00000022187) GYG1 (ENSBMUG00000022224) HLTF (ENSBMUG00000022266) HPS3 (ENSBMUG00000022328) CP (ENSBMUG00000022371) ENSBMUG00000022411 TM4SF18 (ENSBMUG00000022444) Bos_b ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000157649 ENSGT00940000153096.b.c.b.b.a.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164931 ENSGT00940000154435.j.b.b ENSGT00940000154435.i ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT00940000165295 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h #25 ENSGT00940000153664.B Cow MODERN SPECIES U2SURP (ENSBTAG00000009154) CHST2 (ENSBTAG00000011584) ENSBTAG00000054067 SLC9A9 (ENSBTAG00000031178) DIPK2A (ENSBTAG00000007933) ENSBTAG00000049240 PLOD2 (ENSBTAG00000007331) PLSCR4 (ENSBTAG00000011986) PLSCR1 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ENSMMSG00000018368 TM4SF4 (ENSMMSG00000018332) WWTR1 (ENSMMSG00000018305) ENSMMSG00000018286 ANKUB1 (ENSMMSG00000018220) Yarkand deer MODERN SPECIES 10 ENSCHYG00000012307 ENSCHYG00000012238 ENSCHYG00000012154 ENSCHYG00000012097 ENSCHYG00000011997 PLSCR5 (ENSCHYG00000011921) ZIC1 (ENSCHYG00000011861) ZIC4 (ENSCHYG00000011790) ENSCHYG00000011684 AGTR1 (ENSCHYG00000011650) ##22 CPB1 (ENSCHYG00000011567) CPA3 (ENSCHYG00000011461) ENSCHYG00000011392 HLTF (ENSCHYG00000011129) HPS3 (ENSCHYG00000010601) CP (ENSCHYG00000010330) ENSCHYG00000010218 ENSCHYG00000010188 TM4SF18 (ENSCHYG00000010146) TM4SF1 (ENSCHYG00000009987) TM4SF4 (ENSCHYG00000009908) WWTR1 (ENSCHYG00000009838) COMMD2 (ENSCHYG00000009780) ANKUB1 (ENSCHYG00000009675) RNF13 (ENSCHYG00000009540) #25 Cetacea ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT00930000151314.f ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164931 ENSGT00940000154435.j.b.b ENSGT00940000154435.j.b.a ENSGT00940000154435.i ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT00940000165295 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00950000182878.b.a.c.a.a.b.o.a.a.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h #25 Blue whale MODERN SPECIES 15 ENSBMSG00010003096 SLC9A9 (ENSBMSG00010003106) DIPK2A (ENSBMSG00010003121) ENSBMSG00010003130 ENSBMSG00010003139 ENSBMSG00010003145 PLOD2 (ENSBMSG00010003166) PLSCR4 (ENSBMSG00010003190) ENSBMSG00010003203 ENSBMSG00010000039 ENSBMSG00010000055 ENSBMSG00010000106 PLSCR5 (ENSBMSG00010000196) ZIC4 (ENSBMSG00010000237) ZIC1 (ENSBMSG00010000272) AGTR1 (ENSBMSG00010000298) ##22 CPB1 (ENSBMSG00010000351) ENSBMSG00010000417 GYG1 (ENSBMSG00010000477) HLTF (ENSBMSG00010000559) HPS3 (ENSBMSG00010000610) CP (ENSBMSG00010000666) TM4SF18 (ENSBMSG00010000702) TM4SF1 (ENSBMSG00010000724) TM4SF4 (ENSBMSG00010000748) WWTR1 (ENSBMSG00010000762) ENSBMSG00010000786 COMMD2 (ENSBMSG00010000804) ENSBMSG00010000822 ANKUB1 (ENSBMSG00010000838) RNF13 (ENSBMSG00010000861) #25 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT00930000151314.f ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000154435.i ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT00940000165295 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00950000182878.b.a.c.a.a.b.o.a.a.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h #25 Sperm whale MODERN SPECIES PAQR9 (ENSPCTG00005000109) U2SURP (ENSPCTG00005000108) CHST2 (ENSPCTG00005000107) SLC9A9 (ENSPCTG00005000106) DIPK2A (ENSPCTG00005000105) ENSPCTG00005000104 PLOD2 (ENSPCTG00005000102) PLSCR4 (ENSPCTG00005000101) ENSPCTG00005000100 ENSPCTG00005000099 ENSPCTG00005000098 ENSPCTG00005000097 PLSCR5 (ENSPCTG00005000096) ENSPCTG00005000095 ZIC1 (ENSPCTG00005000094) AGTR1 (ENSPCTG00005000093) ##22 ENSPCTG00005000092 GYG1 (ENSPCTG00005000091) HLTF (ENSPCTG00005000090) HPS3 (ENSPCTG00005000089) CP (ENSPCTG00005000088) ENSPCTG00005000087 TM4SF18 (ENSPCTG00005000086) TM4SF1 (ENSPCTG00005000085) TM4SF4 (ENSPCTG00005000084) WWTR1 (ENSPCTG00005000083) COMMD2 (ENSPCTG00005000082) ANKUB1 (ENSPCTG00005000081) RNF13 (ENSPCTG00005000079) #25 PFN2 (ENSPCTG00005000078) TSC22D2 (ENSPCTG00005000077) Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 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ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00950000182878.b.a.c.a.a.b.o.a.a.b.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h #25 ENSGT00940000153664.B Monodontidae ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT00930000151314.f ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000154435.i ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00950000182878.b.a.c.a.a.b.o.a.a.b.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h #25 ENSGT00940000153664.B Beluga whale MODERN SPECIES 18 TRPC1 (ENSDLEG00000002901) PCOLCE2 (ENSDLEG00000002981) PAQR9 (ENSDLEG00000003008) U2SURP (ENSDLEG00000003020) CHST2 (ENSDLEG00000003050) ENSDLEG00000003055 SLC9A9 (ENSDLEG00000003069) CUNH3orf58 (ENSDLEG00000003079) ENSDLEG00000003088 PLOD2 (ENSDLEG00000003108) PLSCR4 (ENSDLEG00000003147) PLSCR1 (ENSDLEG00000003167) PLSCR5 (ENSDLEG00000003194) ZIC4 (ENSDLEG00000003202) ZIC1 (ENSDLEG00000003218) AGTR1 (ENSDLEG00000003225) ##22 CPB1 (ENSDLEG00000003229) CPA3 (ENSDLEG00000003258) GYG1 (ENSDLEG00000003273) HLTF (ENSDLEG00000003285) HPS3 (ENSDLEG00000003349) CP (ENSDLEG00000003394) TM4SF18 (ENSDLEG00000003412) TM4SF1 (ENSDLEG00000003421) TM4SF4 (ENSDLEG00000003442) WWTR1 (ENSDLEG00000003450) ENSDLEG00000003452 COMMD2 (ENSDLEG00000003458) ENSDLEG00000003463 RNF13 (ENSDLEG00000003470) #25 PFN2 (ENSDLEG00000003480) Narwhal MODERN SPECIES 297 TRPC1 (ENSMMNG00015000693) PCOLCE2 (ENSMMNG00015000650) PAQR9 (ENSMMNG00015000630) U2SURP (ENSMMNG00015000545) CHST2 (ENSMMNG00015000510) ENSMMNG00015000492 SLC9A9 (ENSMMNG00015000475) DIPK2A (ENSMMNG00015000433) ENSMMNG00015000418 PLOD2 (ENSMMNG00015000282) PLSCR4 (ENSMMNG00015000172) PLSCR1 (ENSMMNG00015000121) PLSCR5 (ENSMMNG00015000062) ZIC4 (ENSMMNG00015004437) ZIC1 (ENSMMNG00015004415) AGTR1 (ENSMMNG00015004396) ##22 CPB1 (ENSMMNG00015004361) CPA3 (ENSMMNG00015004348) GYG1 (ENSMMNG00015004320) HLTF (ENSMMNG00015004292) HPS3 (ENSMMNG00015004246) CP (ENSMMNG00015004203) TM4SF18 (ENSMMNG00015004182) TM4SF1 (ENSMMNG00015004167) TM4SF4 (ENSMMNG00015004152) WWTR1 (ENSMMNG00015004139) COMMD2 (ENSMMNG00015004117) ANKUB1 (ENSMMNG00015004099) RNF13 (ENSMMNG00015004067) #25 PFN2 (ENSMMNG00015004026) TSC22D2 (ENSMMNG00015003998) Vaquita MODERN SPECIES 15 PCOLCE2 (ENSPSNG00000009157) PAQR9 (ENSPSNG00000009187) ENSPSNG00000009448 CHST2 (ENSPSNG00000011325) ENSPSNG00000011340 SLC9A9 (ENSPSNG00000011399) DIPK2A (ENSPSNG00000011433) ENSPSNG00000011500 PLOD2 (ENSPSNG00000011568) PLSCR4 (ENSPSNG00000011690) PLSCR1 (ENSPSNG00000011787) PLSCR5 (ENSPSNG00000011945) ENSPSNG00000012040 ZIC4 (ENSPSNG00000012068) ZIC1 (ENSPSNG00000012231) AGTR1 (ENSPSNG00000012278) ##22 CPB1 (ENSPSNG00000012386) CPA3 (ENSPSNG00000012509) GYG1 (ENSPSNG00000012650) HLTF (ENSPSNG00000012734) HPS3 (ENSPSNG00000012878) CP (ENSPSNG00000013223) TM4SF18 (ENSPSNG00000013475) TM4SF1 (ENSPSNG00000013533) TM4SF4 (ENSPSNG00000013608) WWTR1 (ENSPSNG00000013698) ENSPSNG00000013752 ENSPSNG00000013786 COMMD2 (ENSPSNG00000013838) ANKUB1 (ENSPSNG00000013900) RNF13 (ENSPSNG00000014075) #25 Dolphin MODERN SPECIES 841 ENSTTRG00000009495 ##22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164931 ENSGT00940000154435 ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT00940000165295 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h #25 ENSGT00940000153664.B Carnivora ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00950000185592 ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164931 ENSGT00940000154435 ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT00940000165295 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h #25 ENSGT00940000153664.B Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00950000185592 ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164931 ENSGT00940000154435 ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT00940000165295 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h #25 ENSGT00940000153664.B Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00950000185592 ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164931 ENSGT00940000154435 ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT00940000165295 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h #25 ENSGT00940000153664.B Ursidae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00950000185592 ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164931 ENSGT00940000154435 ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT00940000165295 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00940000154942.h #25 ENSGT00940000153664.B ENSGT00940000160465 Ursus ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00950000185592 ENSGT00940000161947 ENSGT00530000063516.a.a.d ENSGT00940000164931 ENSGT00940000154435 ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT00940000165295 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT00940000167707 ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00940000154942.h #25 ENSGT00940000153664.B Polar bear MODERN SPECIES 112 PAQR9 (ENSUMAG00000012908) SLC9A9 (ENSUMAG00000012650) DIPK2A (ENSUMAG00000012620) ENSUMAG00000012607 PLOD2 (ENSUMAG00000012593) ENSUMAG00000012591 PLSCR4 (ENSUMAG00000012588) ENSUMAG00000012575 ENSUMAG00000012573 ENSUMAG00000012556 PLSCR1 (ENSUMAG00000012545) PLSCR5 (ENSUMAG00000012531) ENSUMAG00000012515 ZIC4 (ENSUMAG00000012491) ZIC1 (ENSUMAG00000012488) AGTR1 (ENSUMAG00000012460) ##22 CPB1 (ENSUMAG00000012435) CPA3 (ENSUMAG00000012432) GYG1 (ENSUMAG00000012408) HLTF (ENSUMAG00000012391) HPS3 (ENSUMAG00000012373) CP (ENSUMAG00000012358) ENSUMAG00000012344 TM4SF18 (ENSUMAG00000012340) TM4SF1 (ENSUMAG00000012335) ENSUMAG00000012330 TM4SF4 (ENSUMAG00000012321) WWTR1 (ENSUMAG00000012315) COMMD2 (ENSUMAG00000012304) RNF13 (ENSUMAG00000012297) #25 ENSUMAG00000012295 American black bear MODERN SPECIES 5491 AGTR1 (ENSUAMG00000012044) ##22 CPB1 (ENSUAMG00000012040) CPA3 (ENSUAMG00000012037) Giant Panda MODERN SPECIES 16 TRPC1 (ENSAMEG00000012683) PCOLCE2 (ENSAMEG00000012725) PAQR9 (ENSAMEG00000012752) U2SURP (ENSAMEG00000012757) CHST2 (ENSAMEG00000024314) SLC9A9 (ENSAMEG00000012796) DIPK2A (ENSAMEG00000012804) PLOD2 (ENSAMEG00000013650) ENSAMEG00000013629 ENSAMEG00000026607 PLSCR1 (ENSAMEG00000002079) PLSCR5 (ENSAMEG00000002120) ZIC4 (ENSAMEG00000002144) ZIC1 (ENSAMEG00000002149) ENSAMEG00000023619 AGTR1 (ENSAMEG00000019288) ##22 CPA3 (ENSAMEG00000010873) GYG1 (ENSAMEG00000010890) HLTF (ENSAMEG00000010901) HPS3 (ENSAMEG00000010955) CP (ENSAMEG00000010966) ENSAMEG00000011036 TM4SF18 (ENSAMEG00000011045) TM4SF1 (ENSAMEG00000011052) TM4SF4 (ENSAMEG00000010395) WWTR1 (ENSAMEG00000010414) RNF13 (ENSAMEG00000010433) #25 ENSAMEG00000024490 Mustelinae ANCESTRAL SPECIES 59 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164931 ENSGT00940000154435 ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674.m ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT00940000165295.a ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h #25 ENSGT00940000153664.B American mink MODERN SPECIES 61 ZIC4 (ENSNVIG00000014149) ZIC1 (ENSNVIG00000014135) AGTR1 (ENSNVIG00000014110) ##22 CPB1 (ENSNVIG00000014069) CBPA3 (ENSNVIG00000014040) GYG1 (ENSNVIG00000013975) HLTF (ENSNVIG00000013881) HPS3 (ENSNVIG00000013838) CP (ENSNVIG00000013804) ENSNVIG00000013745 T4S18 (ENSNVIG00000013708) TM4SF1 (ENSNVIG00000013694) TM4SF4 (ENSNVIG00000013679) WWTR1 (ENSNVIG00000013656) COMD2 (ENSNVIG00000013648) ANKUB1 (ENSNVIG00000013634) ENSNVIG00000013623 #25 ENSNVIG00000013617 #25 Ferret MODERN SPECIES 207 U2SURP (ENSMPUG00000011855) CHST2 (ENSMPUG00000019342) SLC9A9 (ENSMPUG00000011846) DIPK2A (ENSMPUG00000011840) ENSMPUG00000011834 PLOD2 (ENSMPUG00000011826) PLSCR4 (ENSMPUG00000011821) ENSMPUG00000011813 PLSCR1 (ENSMPUG00000011806) ENSMPUG00000011801 PLSCR5 (ENSMPUG00000011793) ENSMPUG00000011771 ZIC4 (ENSMPUG00000011767) ZIC1 (ENSMPUG00000011764) ENSMPUG00000011741 AGTR1 (ENSMPUG00000019341) ##22 Canidae ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164931 ENSGT00940000154435 ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT00940000165295 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h #25 ENSGT00940000153664.B Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164931 ENSGT00940000154435 ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT00940000165295 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965.e ENSGT00390000007965.f ENSGT00940000154942.h #25 Dingo MODERN SPECIES 80 PAQR9 (ENSCAFG00020010463) U2SURP (ENSCAFG00020010497) CHST2 (ENSCAFG00020011451) SLC9A9 (ENSCAFG00020011470) DIPK2A (ENSCAFG00020011532) ENSCAFG00020011537 ENSCAFG00020011539 PLOD2 (ENSCAFG00020011739) PLSCR4 (ENSCAFG00020018835) ENSCAFG00020018841 PLSCR1 (ENSCAFG00020018849) PLSCR5 (ENSCAFG00020018852) ENSCAFG00020018869 ZIC4 (ENSCAFG00020018878) ZIC1 (ENSCAFG00020018881) AGTR1 (ENSCAFG00020018902) ##22 CPB1 (ENSCAFG00020018903) CPA3 (ENSCAFG00020018916) GYG1 (ENSCAFG00020018942) HLTF (ENSCAFG00020018945) HPS3 (ENSCAFG00020018969) CP (ENSCAFG00020019195) ENSCAFG00020020267 TM4SF18 (ENSCAFG00020020286) TM4SF1 (ENSCAFG00020020288) ENSCAFG00020020293 Dog MODERN SPECIES 15 U2SURP (ENSCAFG00845029146) CHST2 (ENSCAFG00845029239) SLC9A9 (ENSCAFG00845029260) DIPK2A (ENSCAFG00845019923) ENSCAFG00845019990 ENSCAFG00845020135 ENSCAFG00845020319 PLOD2 (ENSCAFG00845020429) PLSCR4 (ENSCAFG00845020987) ENSCAFG00845021095 PLSCR1 (ENSCAFG00845021201) PLSCR5 (ENSCAFG00845021401) ENSCAFG00845021640 ZIC4 (ENSCAFG00845021719) ZIC1 (ENSCAFG00845021895) AGTR1 (ENSCAFG00845022234) ##22 CPB1 (ENSCAFG00845022322) GYG1 (ENSCAFG00845022687) HLTF (ENSCAFG00845022829) HPS3 (ENSCAFG00845023096) CP (ENSCAFG00845023529) ENSCAFG00845023786 TM4SF18 (ENSCAFG00845023913) TM4SF1 (ENSCAFG00845023992) TM4SF4 (ENSCAFG00845024070) WWTR1 (ENSCAFG00845024146) COMMD2 (ENSCAFG00845024239) RNF13 (ENSCAFG00845024329) #25 ENSCAFG00845024431 ENSCAFG00845024489 ENSCAFG00845024587 Red fox MODERN SPECIES 116 ENSVVUG00000012328 PLSCR1 (ENSVVUG00000012320) PLSCR5 (ENSVVUG00000012305) ENSVVUG00000012281 ZIC4 (ENSVVUG00000012278) ZIC1 (ENSVVUG00000012273) ENSVVUG00000012264 ENSVVUG00000012257 AGTR1 (ENSVVUG00000012243) ##22 CPB1 (ENSVVUG00000012236) CPA3 (ENSVVUG00000012233) GYG1 (ENSVVUG00000012194) HLTF (ENSVVUG00000012173) HPS3 (ENSVVUG00000012125) CP (ENSVVUG00000012074) ENSVVUG00000011311 TM4SF18 (ENSVVUG00000011274) ENSVVUG00000011270 TM4SF1 (ENSVVUG00000011257) TM4SF4 (ENSVVUG00000011230) WWTR1 (ENSVVUG00000011160) COMMD2 (ENSVVUG00000011132) RNF13 (ENSVVUG00000011109) #25 PFN2 (ENSVVUG00000011099) Felidae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00950000185592 ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164931 ENSGT00940000154435.e ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT00940000165295 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h.c #25 ENSGT00940000153664.B Panthera ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00950000185592 ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164931 ENSGT00940000154435.e ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT00940000165295 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h.c #25 ENSGT00940000153664.B Panthera_a ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00950000185592 ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164931 ENSGT00940000154435.e ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT00940000165295 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h.c #25 ENSGT00940000153664.B leopard MODERN SPECIES 5 ATR (ENSPPRG00000003180) PLS1 (ENSPPRG00000002354) TRPC1 (ENSPPRG00000000533) PCOLCE2 (ENSPPRG00000000105) PAQR9 (ENSPPRG00000015091) U2SURP (ENSPPRG00000022258) SLC9A9 (ENSPPRG00000013496) DIPK2A (ENSPPRG00000012546) PLOD2 (ENSPPRG00000012277) PLSCR4 (ENSPPRG00000011790) ENSPPRG00000010848 ENSPPRG00000010322 PLSCR5 (ENSPPRG00000009681) ZIC4 (ENSPPRG00000008986) ZIC1 (ENSPPRG00000008236) AGTR1 (ENSPPRG00000014998) ##22 CPB1 (ENSPPRG00000007735) CPA3 (ENSPPRG00000007497) GYG1 (ENSPPRG00000007281) HLTF (ENSPPRG00000006271) HPS3 (ENSPPRG00000002181) CP (ENSPPRG00000001396) ENSPPRG00000000858 TM4SF18 (ENSPPRG00000000537) TM4SF1 (ENSPPRG00000000353) TM4SF4 (ENSPPRG00000000272) WWTR1 (ENSPPRG00000000145) COMMD2 (ENSPPRG00000022715) ANKUB1 (ENSPPRG00000022868) ENSPPRG00000023096 #25 PFN2 (ENSPPRG00000023714) lion MODERN SPECIES 9 PCOLCE2 (ENSPLOG00000015762) PAQR9 (ENSPLOG00000015819) U2SURP (ENSPLOG00000015841) CHST2 (ENSPLOG00000015901) SLC9A9 (ENSPLOG00000015913) DIPK2A (ENSPLOG00000015954) PLOD2 (ENSPLOG00000016066) ENSPLOG00000016613 PLSCR4 (ENSPLOG00000016649) ENSPLOG00000016771 ENSPLOG00000016871 PLSCR5 (ENSPLOG00000017085) ZIC4 (ENSPLOG00000017156) ZIC1 (ENSPLOG00000017247) ENSPLOG00000017298 AGTR1 (ENSPLOG00000017325) ##22 CPB1 (ENSPLOG00000017370) CPA3 (ENSPLOG00000017467) GYG1 (ENSPLOG00000017649) HLTF (ENSPLOG00000017862) HPS3 (ENSPLOG00000018200) CP (ENSPLOG00000018504) ENSPLOG00000018666 TM4SF18 (ENSPLOG00000018906) TM4SF1 (ENSPLOG00000018995) TM4SF4 (ENSPLOG00000019054) WWTR1 (ENSPLOG00000019091) COMMD2 (ENSPLOG00000019117) ANKUB1 (ENSPLOG00000019147) RNF13 (ENSPLOG00000019225) #25 PFN2 (ENSPLOG00000019319) Tiger MODERN SPECIES 242 ATR (ENSPTIG00000018572) PLS1 (ENSPTIG00000014589) TRPC1 (ENSPTIG00000009946) PCOLCE2 (ENSPTIG00000009436) U2SURP (ENSPTIG00000001167) CHST2 (ENSPTIG00000005139) SLC9A9 (ENSPTIG00000020998) ENSPTIG00000020674 PLOD2 (ENSPTIG00000018891) PLSCR4 (ENSPTIG00000017081) ENSPTIG00000016702 ENSPTIG00000015040 PLSCR5 (ENSPTIG00000014021) ZIC4 (ENSPTIG00000012876) ZIC1 (ENSPTIG00000012490) AGTR1 (ENSPTIG00000011825) ##22 CPB1 (ENSPTIG00000011527) CPA3 (ENSPTIG00000010908) GYG1 (ENSPTIG00000007857) HLTF (ENSPTIG00000020394) HPS3 (ENSPTIG00000017916) CP (ENSPTIG00000016162) ENSPTIG00000013550 TM4SF18 (ENSPTIG00000013093) TM4SF1 (ENSPTIG00000012525) TM4SF4 (ENSPTIG00000012425) WWTR1 (ENSPTIG00000010780) COMMD2 (ENSPTIG00000010520) ANKUB1 (ENSPTIG00000008912) RNF13 (ENSPTIG00000007326) #25 PFN2 (ENSPTIG00000006381) Cat MODERN SPECIES 240 PCOLCE2 (ENSFCAG00000001007) PAQR9 (ENSFCAG00000024035) CHST2 (ENSFCAG00000022945) U2SURP (ENSFCAG00000012186) SLC9A9 (ENSFCAG00000009297) DIPK2A (ENSFCAG00000023927) ENSFCAG00000033064 PLOD2 (ENSFCAG00000023549) ENSFCAG00000053114 PLSCR4 (ENSFCAG00000045073) ENSFCAG00000037637 ENSFCAG00000027005 PLSCR5 (ENSFCAG00000024711) ZIC4 (ENSFCAG00000007059) ZIC1 (ENSFCAG00000007061) AGTR1 (ENSFCAG00000000717) ##22 CPB1 (ENSFCAG00000000222) CPA3 (ENSFCAG00000022469) GYG1 (ENSFCAG00000007859) HPS3 (ENSFCAG00000003222) CP (ENSFCAG00000003223) CPHL1 (ENSFCAG00000036951) TM4SF18 (ENSFCAG00000001287) TM4SF1 (ENSFCAG00000013771) TM4SF4 (ENSFCAG00000040290) WWTR1 (ENSFCAG00000039437) COMMD2 (ENSFCAG00000042364) ANKUB1 (ENSFCAG00000008571) ENSFCAG00000023659 RNF13 (ENSFCAG00000010281) #25 PFN2 (ENSFCAG00000041725) Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000155714 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000154435 ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT00940000165295 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h #25 ENSGT00940000153664.B Equus ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000154435 ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT00940000166511 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT00940000165295 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h #25 ENSGT00940000153664.B Donkey MODERN SPECIES 13 PLS1 (ENSEASG00005000633) TRPC1 (ENSEASG00005000262) PCOLCE2 (ENSEASG00005000245) PAQR9 (ENSEASG00005000232) U2SURP (ENSEASG00005000213) CHST2 (ENSEASG00005024234) SLC9A9 (ENSEASG00005000191) DIPK2A (ENSEASG00005000184) PLOD2 (ENSEASG00005000164) PLSCR4 (ENSEASG00005000022) PLSCR1 (ENSEASG00005030899) PLSCR5 (ENSEASG00005021862) ZIC4 (ENSEASG00005031952) ZIC1 (ENSEASG00005021859) ENSEASG00005021856 AGTR1 (ENSEASG00005024073) ##22 CPB1 (ENSEASG00005021850) CPA3 (ENSEASG00005021848) GYG1 (ENSEASG00005021841) HLTF (ENSEASG00005021834) HPS3 (ENSEASG00005021830) CP (ENSEASG00005021826) ENSEASG00005021553 TM4SF18 (ENSEASG00005021427) TM4SF1 (ENSEASG00005021423) TM4SF4 (ENSEASG00005021420) WWTR1 (ENSEASG00005021415) COMMD2 (ENSEASG00005021413) ANKUB1 (ENSEASG00005038130) RNF13 (ENSEASG00005021404) #25 PFN2 (ENSEASG00005021401) Horse MODERN SPECIES 7 TRPC1 (ENSECAG00000018048) PCOLCE2 (ENSECAG00000020485) PAQR9 (ENSECAG00000021863) U2SURP (ENSECAG00000022460) CHST2 (ENSECAG00000000982) SLC9A9 (ENSECAG00000006450) DIPK2A (ENSECAG00000009060) ENSECAG00000054798 PLOD2 (ENSECAG00000009297) PLSCR4 (ENSECAG00000060330) PLSCR1 (ENSECAG00000017295) PLSCR5 (ENSECAG00000019663) ZIC4 (ENSECAG00000020070) ZIC1 (ENSECAG00000020355) ENSECAG00000053335 AGTR1 (ENSECAG00000001279) ##22 CPB1 (ENSECAG00000021384) CPA3 (ENSECAG00000033607) GYG1 (ENSECAG00000023192) HLTF (ENSECAG00000024277) HPS3 (ENSECAG00000008073) CP (ENSECAG00000012064) CPHL1 (ENSECAG00000040185) TM4SF18 (ENSECAG00000018664) TM4SF1 (ENSECAG00000019071) TM4SF4 (ENSECAG00000020823) WWTR1 (ENSECAG00000021613) COMMD2 (ENSECAG00000022864) ANKUB1 (ENSECAG00000023137) RNF13 (ENSECAG00000023263) #25 PFN2 (ENSECAG00000024742) Chiroptera ANCESTRAL SPECIES 68 ENSGT00940000155714 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000154435 ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT00940000165295 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h #25 ENSGT00940000153664.B Megabat MODERN SPECIES 1108 AGTR1 (ENSPVAG00000014281) ##22 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000155714 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000154435 ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT00940000165295 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h #25 ENSGT00940000153664.B Microbat MODERN SPECIES 987 ENSMLUG00000001038 PLSCR4 (ENSMLUG00000003563) PLSCR1 (ENSMLUG00000008749) PLSCR5 (ENSMLUG00000006403) ENSMLUG00000006618 ENSMLUG00000029495 ENSMLUG00000028293 ZIC4 (ENSMLUG00000012518) ZIC1 (ENSMLUG00000003411) ENSMLUG00000024034 ENSMLUG00000029616 ENSMLUG00000026078 AGTR1 (ENSMLUG00000001873) ##22 CPB1 (ENSMLUG00000007825) CPA3 (ENSMLUG00000007858) GYG1 (ENSMLUG00000006382) HLTF (ENSMLUG00000014077) ENSMLUG00000022401 HPS3 (ENSMLUG00000014082) CP (ENSMLUG00000001678) ENSMLUG00000023415 TM4SF18 (ENSMLUG00000004313) TM4SF1 (ENSMLUG00000010993) TM4SF4 (ENSMLUG00000017180) WWTR1 (ENSMLUG00000002531) COMMD2 (ENSMLUG00000014878) ANKUB1 (ENSMLUG00000006410) RNF13 (ENSMLUG00000008391) #25 Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 11 PAQR9 (ENSRFEG00010005166) U2SURP (ENSRFEG00010005180) ENSRFEG00010005199 CHST2 (ENSRFEG00010005206) SLC9A9 (ENSRFEG00010005221) DIPK2A (ENSRFEG00010005250) ENSRFEG00010005260 PLOD2 (ENSRFEG00010005288) PLSCR4 (ENSRFEG00010005346) ENSRFEG00010005376 PLSCR1 (ENSRFEG00010005408) PLSCR5 (ENSRFEG00010005460) ZIC4 (ENSRFEG00010005534) ZIC1 (ENSRFEG00010005593) ENSRFEG00010005605 AGTR1 (ENSRFEG00010005628) ##22 CPB1 (ENSRFEG00010005647) CPA3 (ENSRFEG00010005703) ENSRFEG00010005735 GYG1 (ENSRFEG00010005772) HLTF (ENSRFEG00010005836) HPS3 (ENSRFEG00010006011) CP (ENSRFEG00010006210) ENSRFEG00010006508 TM4SF18 (ENSRFEG00010007025) TM4SF1 (ENSRFEG00010007070) TM4SF4 (ENSRFEG00010007100) WWTR1 (ENSRFEG00010007131) COMMD2 (ENSRFEG00010007155) ANKUB1 (ENSRFEG00010007185) RNF13 (ENSRFEG00010007291) #25 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164931 ENSGT00940000154435 ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT00940000165295 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h #25 ENSGT00940000153664.B Primates ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164931 ENSGT00940000154435.p ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT00940000165295 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h #25 ENSGT00940000153664.B Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164931 ENSGT00940000154435.o.a ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT00940000165295 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h #25 ENSGT00940000153664.B Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164931 ENSGT00940000154435.o.a ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT00940000165295 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h #25 ENSGT00940000153664.B Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES 77 ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164931 ENSGT00940000154435.o.b ENSGT00940000154435.o.a ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h #25 ENSGT00940000153664.B ENSGT00940000160465 Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 1425 AGTR1 (ENSPSMG00000007773) ##22 CPB1 (ENSPSMG00000007764) CPA3 (ENSPSMG00000007756) GYG1 (ENSPSMG00000007740) HLTF (ENSPSMG00000007621) HPS3 (ENSPSMG00000007483) CP (ENSPSMG00000007442) ENSPSMG00000007390 ENSPSMG00000007379 TM4SF18 (ENSPSMG00000007374) TM4SF1 (ENSPSMG00000007359) TM4SF4 (ENSPSMG00000007321) WWTR1 (ENSPSMG00000007316) COMMD2 (ENSPSMG00000007296) ANKUB1 (ENSPSMG00000007279) RNF13 (ENSPSMG00000007264) #25 Coquerels sifaka MODERN SPECIES 274 ZIC4 (ENSPCOG00000012436) ZIC1 (ENSPCOG00000017619) ENSPCOG00000023791 AGTR1 (ENSPCOG00000021803) ##22 CPB1 (ENSPCOG00000021086) CPA3 (ENSPCOG00000017041) GYG1 (ENSPCOG00000023589) HLTF (ENSPCOG00000021668) HPS3 (ENSPCOG00000021848) CP (ENSPCOG00000017783) TM4SF18 (ENSPCOG00000028412) TM4SF1 (ENSPCOG00000000568) TM4SF4 (ENSPCOG00000025191) WWTR1 (ENSPCOG00000022186) COMMD2 (ENSPCOG00000022761) ANKUB1 (ENSPCOG00000021560) ENSPCOG00000016179 RNF13 (ENSPCOG00000020296) #25 PFN2 (ENSPCOG00000027668) Mouse lemur MODERN SPECIES PCOLCE2 (ENSMICG00000048890) PAQR9 (ENSMICG00000049417) U2SURP (ENSMICG00000049294) CHST2 (ENSMICG00000048867) ENSMICG00000049556 SLC9A9 (ENSMICG00000049232) DIPK2A (ENSMICG00000048950) ENSMICG00000049299 PLOD2 (ENSMICG00000049252) PLSCR4 (ENSMICG00000048916) ENSMICG00000049069 PLSCR1 (ENSMICG00000049018) PLSCR5 (ENSMICG00000049484) ZIC4 (ENSMICG00000049129) ZIC1 (ENSMICG00000049488) AGTR1 (ENSMICG00000049373) ##22 CPB1 (ENSMICG00000048946) CPA3 (ENSMICG00000049222) GYG1 (ENSMICG00000048915) HLTF (ENSMICG00000049468) HPS3 (ENSMICG00000049042) CP (ENSMICG00000049345) ENSMICG00000049080 TM4SF18 (ENSMICG00000049421) TM4SF1 (ENSMICG00000048949) TM4SF4 (ENSMICG00000048927) WWTR1 (ENSMICG00000049363) COMMD2 (ENSMICG00000049525) ANKUB1 (ENSMICG00000049041) RNF13 (ENSMICG00000049394) #25 PFN2 (ENSMICG00000049089) Bushbaby MODERN SPECIES 147 PAQR9 (ENSOGAG00000003917) U2SURP (ENSOGAG00000004335) CHST2 (ENSOGAG00000027881) SLC9A9 (ENSOGAG00000004342) DIPK2A (ENSOGAG00000011489) ENSOGAG00000024209 PLOD2 (ENSOGAG00000009905) ENSOGAG00000034254 PLSCR4 (ENSOGAG00000009912) ENSOGAG00000031786 PLSCR1 (ENSOGAG00000017010) PLSCR5 (ENSOGAG00000011154) ZIC4 (ENSOGAG00000007463) ZIC1 (ENSOGAG00000007465) ENSOGAG00000032175 AGTR1 (ENSOGAG00000008654) ##22 CPB1 (ENSOGAG00000008314) CPA3 (ENSOGAG00000008318) ENSOGAG00000030851 GYG1 (ENSOGAG00000008323) HLTF (ENSOGAG00000008324) HPS3 (ENSOGAG00000008334) CP (ENSOGAG00000008337) TM4SF18 (ENSOGAG00000007424) TM4SF1 (ENSOGAG00000007426) ENSOGAG00000031766 TM4SF4 (ENSOGAG00000001441) WWTR1 (ENSOGAG00000029861) Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164931 ENSGT00940000154435.p ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT00940000165295 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h #25 ENSGT00940000153664.B.k.a Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164931 ENSGT00940000164933 ENSGT00940000154435.p ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674.i.a ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT00940000165295 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h #25 ENSGT00940000153664.B.k.a Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164931 ENSGT00940000164933 ENSGT00940000154435.p ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674.i.a.a ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT00940000165295 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h.q.a #25 ENSGT00940000153664.B.k.a Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164933 ENSGT00940000154435.p ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674.i.a.a ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h.q.a #25 ENSGT00940000153664.B.k.a ENSGT00940000160465 Hominidae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT00910000147832 ENSGT00390000013230 ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164933 ENSGT00940000154435.p ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674.i.a.a ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h.q.a #25 ENSGT00940000153664.B.k.a ENSGT00940000160465 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT00910000147832 ENSGT00390000013230 ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164933 ENSGT00940000154435.p ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674.i.a.a ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h.q.a #25 ENSGT00940000153664.B.k.a ENSGT00940000160465 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT00910000147832 ENSGT00390000013230 ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164933 ENSGT00940000154435.p ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674.i.a.a ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h.q.a #25 ENSGT00940000153664.B.l ENSGT00940000160465 Pan ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00390000001347.vb.a.b.a.c.b ENSGT00520000055625.b ENSGT00910000147832 ENSGT00390000013230 ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164933 ENSGT00940000154435.p ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674.i.a.a ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT00940000153311.a.b.a.fb.b ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h.q.a #25 ENSGT00940000153664.B.k.a Bonobo MODERN SPECIES 16 PCOLCE2 (ENSPPAG00000029354) PAQR9 (ENSPPAG00000009521) ENSPPAG00000027945 SLC9A9 (ENSPPAG00000040325) ENSPPAG00000029017 DIPK2A (ENSPPAG00000032010) ENSPPAG00000002254 ENSPPAG00000005549 PLOD2 (ENSPPAG00000039540) PLSCR4 (ENSPPAG00000031934) ENSPPAG00000026009 PLSCR1 (ENSPPAG00000037351) PLSCR5 (ENSPPAG00000034907) ZIC4 (ENSPPAG00000037404) ZIC1 (ENSPPAG00000035757) AGTR1 (ENSPPAG00000035987) ##22 CPB1 (ENSPPAG00000037959) CPA3 (ENSPPAG00000042270) GYG1 (ENSPPAG00000033397) HLTF (ENSPPAG00000030858) HPS3 (ENSPPAG00000028047) CP (ENSPPAG00000034310) TM4SF18 (ENSPPAG00000039245) TM4SF1 (ENSPPAG00000027801) ENSPPAG00000036140 TM4SF4 (ENSPPAG00000040081) WWTR1 (ENSPPAG00000038967) COMMD2 (ENSPPAG00000039238) ANKUB1 (ENSPPAG00000025963) RNF13 (ENSPPAG00000036941) #25 ENSPPAG00000027828 Chimpanzee MODERN SPECIES 16 U2SURP (ENSPTRG00000015489) CHST2 (ENSPTRG00000043559) SLC9A9 (ENSPTRG00000015491) ENSPTRG00000046723 DIPK2A (ENSPTRG00000015492) ENSPTRG00000051252 ENSPTRG00000049155 PLOD2 (ENSPTRG00000015494) PLSCR4 (ENSPTRG00000015497) PLSCR2 (ENSPTRG00000015498) PLSCR1 (ENSPTRG00000015499) PLSCR5 (ENSPTRG00000041967) ENSPTRG00000050021 ZIC4 (ENSPTRG00000015500) ZIC1 (ENSPTRG00000044837) AGTR1 (ENSPTRG00000015503) ##22 CPB1 (ENSPTRG00000015505) CPA3 (ENSPTRG00000015507) GYG1 (ENSPTRG00000015509) HLTF (ENSPTRG00000015511) HPS3 (ENSPTRG00000015512) CP (ENSPTRG00000015513) TM4SF18 (ENSPTRG00000015515) TM4SF1 (ENSPTRG00000015516) ENSPTRG00000050621 TM4SF4 (ENSPTRG00000015517) WWTR1 (ENSPTRG00000015519) COMMD2 (ENSPTRG00000015520) ANKUB1 (ENSPTRG00000030099) RNF13 (ENSPTRG00000015521) #25 PFN2 (ENSPTRG00000015524) Human MODERN SPECIES 15 PLS1 (ENSG00000120756) TRPC1 (ENSG00000144935) PCOLCE2 (ENSG00000163710) PAQR9 (ENSG00000188582) U2SURP (ENSG00000163714) CHST2 (ENSG00000175040) SLC9A9 (ENSG00000181804) DIPK2A (ENSG00000181744) PLOD2 (ENSG00000152952) PLSCR4 (ENSG00000114698) PLSCR2 (ENSG00000163746) PLSCR1 (ENSG00000188313) PLSCR5 (ENSG00000231213) ZIC4 (ENSG00000174963) ZIC1 (ENSG00000152977) AGTR1 (ENSG00000144891) ##22 CPB1 (ENSG00000153002) CPA3 (ENSG00000163751) GYG1 (ENSG00000163754) HLTF (ENSG00000071794) HPS3 (ENSG00000163755) CP (ENSG00000047457) TM4SF18 (ENSG00000163762) TM4SF1 (ENSG00000169908) TM4SF4 (ENSG00000169903) WWTR1 (ENSG00000018408) COMMD2 (ENSG00000114744) ANKUB1 (ENSG00000206199) RNF13 (ENSG00000082996) #25 PFN2 (ENSG00000070087) TSC22D2 (ENSG00000196428) Gorilla MODERN SPECIES 16 U2SURP (ENSGGOG00000005563) CHST2 (ENSGGOG00000010984) SLC9A9 (ENSGGOG00000034866) ENSGGOG00000042026 DIPK2A (ENSGGOG00000015140) ENSGGOG00000042601 ENSGGOG00000026282 ENSGGOG00000042473 PLOD2 (ENSGGOG00000014284) PLSCR4 (ENSGGOG00000006475) ENSGGOG00000004864 PLSCR1 (ENSGGOG00000010136) PLSCR5 (ENSGGOG00000027798) ZIC4 (ENSGGOG00000042345) ZIC1 (ENSGGOG00000001101) AGTR1 (ENSGGOG00000001326) ##22 CPB1 (ENSGGOG00000005316) CPA3 (ENSGGOG00000026314) ENSGGOG00000027497 GYG1 (ENSGGOG00000008980) HLTF (ENSGGOG00000001261) HPS3 (ENSGGOG00000016590) CP (ENSGGOG00000009531) TM4SF18 (ENSGGOG00000002355) TM4SF1 (ENSGGOG00000003605) TM4SF4 (ENSGGOG00000001835) WWTR1 (ENSGGOG00000000214) COMMD2 (ENSGGOG00000003255) ANKUB1 (ENSGGOG00000011489) RNF13 (ENSGGOG00000007103) #25 ENSGGOG00000007109 Orangutan MODERN SPECIES 16 PAQR9 (ENSPPYG00000014177) U2SURP (ENSPPYG00000014178) CHST2 (ENSPPYG00000014179) SLC9A9 (ENSPPYG00000014180) ENSPPYG00000039260 DIPK2A (ENSPPYG00000014182) ENSPPYG00000034648 ENSPPYG00000014183 PLOD2 (ENSPPYG00000029800) PLSCR4 (ENSPPYG00000014185) ENSPPYG00000014186 PLSCR1 (ENSPPYG00000014187) PLSCR5 (ENSPPYG00000032802) ZIC4 (ENSPPYG00000014188) ZIC1 (ENSPPYG00000014189) AGTR1 (ENSPPYG00000014190) ##22 CPB1 (ENSPPYG00000014191) CPA3 (ENSPPYG00000014192) GYG1 (ENSPPYG00000025899) HLTF (ENSPPYG00000014193) HPS3 (ENSPPYG00000014194) CP (ENSPPYG00000014195) TM4SF18 (ENSPPYG00000014196) TM4SF1 (ENSPPYG00000014197) TM4SF4 (ENSPPYG00000014198) WWTR1 (ENSPPYG00000014199) COMMD2 (ENSPPYG00000014200) ANKUB1 (ENSPPYG00000014201) RNF13 (ENSPPYG00000014202) #25 PFN2 (ENSPPYG00000031333) TSC22D2 (ENSPPYG00000014204) Gibbon MODERN SPECIES 1 ENSNLEG00000031581 NELL2 (ENSNLEG00000017926) DBX2 (ENSNLEG00000017924) ANO6 (ENSNLEG00000017920) ARID2 (ENSNLEG00000017919) SCAF11 (ENSNLEG00000017918) SLC38A1 (ENSNLEG00000029941) SLC38A2 (ENSNLEG00000017915) ENSNLEG00000017914 ENSNLEG00000033869 SLC38A4 (ENSNLEG00000017911) PLSCR1 (ENSNLEG00000002292) PLSCR5 (ENSNLEG00000002352) ENSNLEG00000002375 ZIC1 (ENSNLEG00000002407) AGTR1 (ENSNLEG00000002416) ##22 CPB1 (ENSNLEG00000002424) CPA3 (ENSNLEG00000002507) GYG1 (ENSNLEG00000002557) HLTF (ENSNLEG00000002612) HPS3 (ENSNLEG00000002759) CP (ENSNLEG00000002866) ENSNLEG00000003021 TM4SF1 (ENSNLEG00000003038) TM4SF4 (ENSNLEG00000003053) WWTR1 (ENSNLEG00000003066) COMMD2 (ENSNLEG00000029867) ANKUB1 (ENSNLEG00000003124) RNF13 (ENSNLEG00000003149) #25 ENSNLEG00000028509 ENSNLEG00000031859 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 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ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674.i.a.a ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT00940000165295 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h.q.a #25 ENSGT00940000153664.B.l Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164931 ENSGT00940000164933 ENSGT00940000154435.p ENSGT00940000161728 ENSGT00390000004380.m.b ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674.i.a.a ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT00940000165295 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h.q.a #25 ENSGT00940000153664.B.k.a Macaca ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT00390000015224.c.b.a ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164931 ENSGT00940000164933 ENSGT00940000154435.p ENSGT00940000161728 ENSGT00390000004380.m.b ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674.i.a.a ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00990000203720.a.b.a.b.b ENSGT00940000155866 ENSGT00940000165295 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h.q.a #25 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 443 PCOLCE2 (ENSMNEG00000039023) PAQR9 (ENSMNEG00000001542) U2SURP 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(ENSMFAG00000060529) ENSMFAG00000046298 ENSMFAG00000044185 TM4SF4 (ENSMFAG00000062270) WWTR1 (ENSMFAG00000031777) ENSMFAG00000062927 COMMD2 (ENSMFAG00000064614) Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164933 ENSGT00940000164931 ENSGT00940000154435.p ENSGT00940000161728 ENSGT00390000004380.m.b ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674.i.a.a ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h.q.a #25 ENSGT00940000153664.B.k.a ENSGT00940000160465 Olive baboon MODERN SPECIES 11 ENSPANG00000039164 ENSPANG00000038918 DIPK2A (ENSPANG00000017827) ENSPANG00000015415 ENSPANG00000048643 ENSPANG00000048692 PLOD2 (ENSPANG00000020900) PLSCR4 (ENSPANG00000019530) ENSPANG00000043123 ENSPANG00000039550 PLSCR1 (ENSPANG00000018880) PLSCR5 (ENSPANG00000023164) ENSPANG00000033699 ZIC4 (ENSPANG00000024745) ZIC1 (ENSPANG00000005804) AGTR1 (ENSPANG00000002853) ##22 CPB1 (ENSPANG00000015081) CPA3 (ENSPANG00000023231) ENSPANG00000025217 HLTF (ENSPANG00000009264) HPS3 (ENSPANG00000017455) CP (ENSPANG00000019531) TM4SF18 (ENSPANG00000026217) TM4SF1 (ENSPANG00000039765) TM4SF4 (ENSPANG00000009384) WWTR1 (ENSPANG00000006008) COMMD2 (ENSPANG00000025218) ANKUB1 (ENSPANG00000013122) ENSPANG00000041361 RNF13 (ENSPANG00000021037) #25 ENSPANG00000009265 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 81 ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164933 ENSGT00940000154435.p ENSGT00940000161728 ENSGT00390000004380.m.a.a.a.a ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674.i.a.a ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT00910000146673 ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h.q.a #25 ENSGT00940000153664.B.k.a ENSGT00940000160465 Drill MODERN SPECIES 341 AGTR1 (ENSMLEG00000036265) ##22 CPB1 (ENSMLEG00000021063) CPA3 (ENSMLEG00000037447) GYG1 (ENSMLEG00000029835) HLTF (ENSMLEG00000029059) ENSMLEG00000023583 ENSMLEG00000028026 HPS3 (ENSMLEG00000040824) CP (ENSMLEG00000027209) TM4SF18 (ENSMLEG00000037034) ENSMLEG00000019692 TM4SF4 (ENSMLEG00000039948) WWTR1 (ENSMLEG00000036019) COMMD2 (ENSMLEG00000043537) ANKUB1 (ENSMLEG00000042185) RNF13 (ENSMLEG00000042049) #25 Sooty mangabey MODERN SPECIES 120 IPO7 (ENSCATG00000042452) ZNF143 (ENSCATG00000035571) ENSCATG00000029419 WEE1 (ENSCATG00000033804) ENSCATG00000022086 SWAP70 (ENSCATG00000040545) SBF2 (ENSCATG00000039616) PLOD2 (ENSCATG00000041420) PLSCR4 (ENSCATG00000037688) PLSCR2 (ENSCATG00000036287) PLSCR1 (ENSCATG00000045303) PLSCR5 (ENSCATG00000030014) ENSCATG00000012480 ZIC4 (ENSCATG00000030079) ZIC1 (ENSCATG00000042962) AGTR1 (ENSCATG00000042957) ##22 CPB1 (ENSCATG00000036137) CPA3 (ENSCATG00000033057) GYG1 (ENSCATG00000041913) HLTF (ENSCATG00000043955) ENSCATG00000041142 Vervet Monkey MODERN SPECIES 6 PLS1 (ENSCSAG00000011290) TRPC1 (ENSCSAG00000011302) PCOLCE2 (ENSCSAG00000011308) PAQR9 (ENSCSAG00000018908) U2SURP (ENSCSAG00000011321) CHST2 (ENSCSAG00000018906) SLC9A9 (ENSCSAG00000011341) DIPK2A (ENSCSAG00000011348) PLOD2 (ENSCSAG00000011365) PLSCR4 (ENSCSAG00000011376) PLSCR2 (ENSCSAG00000011381) PLSCR1 (ENSCSAG00000011390) PLSCR5 (ENSCSAG00000011398) ZIC4 (ENSCSAG00000011405) ZIC1 (ENSCSAG00000011409) AGTR1 (ENSCSAG00000011417) ##22 CPB1 (ENSCSAG00000011424) CPA3 (ENSCSAG00000011433) GYG1 (ENSCSAG00000011436) HLTF (ENSCSAG00000011449) ENSCSAG00000018904 HPS3 (ENSCSAG00000011461) CP (ENSCSAG00000011475) TM4SF18 (ENSCSAG00000011485) TM4SF1 (ENSCSAG00000011494) TM4SF4 (ENSCSAG00000011499) WWTR1 (ENSCSAG00000011508) COMMD2 (ENSCSAG00000011515) ANKUB1 (ENSCSAG00000011527) RNF13 (ENSCSAG00000011538) #25 ENSCSAG00000011544 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 348 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674.i.a.a ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT00910000146673 ENSGT00940000153311.a.b.a.fb.b ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h.q.a #25 ENSGT00940000153664.B.k.b Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1832 ENSRROG00000041420 AGTR1 (ENSRROG00000031154) ##22 CPB1 (ENSRROG00000032160) CPA3 (ENSRROG00000031917) GYG1 (ENSRROG00000035996) HLTF (ENSRROG00000028898) HPS3 (ENSRROG00000009620) CP (ENSRROG00000042142) Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1856 AGTR1 (ENSRBIG00000041468) ##22 CPB1 (ENSRBIG00000032988) CPA3 (ENSRBIG00000031558) GYG1 (ENSRBIG00000041646) HLTF (ENSRBIG00000015981) HPS3 (ENSRBIG00000024625) ENSRBIG00000030284 CP (ENSRBIG00000040705) TM4SF18 (ENSRBIG00000034512) ENSRBIG00000040640 ENSRBIG00000041143 TM4SF4 (ENSRBIG00000031572) WWTR1 (ENSRBIG00000032755) COMMD2 (ENSRBIG00000031068) ANKUB1 (ENSRBIG00000031588) RNF13 (ENSRBIG00000040404) #25 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164931 ENSGT00940000164933.a ENSGT00940000154435.p ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674.i.a ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT00940000165295 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h #25 ENSGT00940000153664.B.k.a Cebidae ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164931 ENSGT00940000164933.a ENSGT00940000154435.p ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674.i.a ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT00940000165295 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h #25 ENSGT00940000153664.B.k.b Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164931 ENSGT00940000164933.a ENSGT00940000154435.p ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674.i.a ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT00940000165295 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h #25 ENSGT00940000153664.B.k.b Capuchin MODERN SPECIES 30 PAQR9 (ENSCCAG00000029369) U2SURP (ENSCCAG00000032530) CHST2 (ENSCCAG00000020600) SLC9A9 (ENSCCAG00000034947) DIPK2A (ENSCCAG00000020146) PLOD2 (ENSCCAG00000025733) PLSCR4 (ENSCCAG00000022476) ENSCCAG00000024980 PLSCR2 (ENSCCAG00000021427) PLSCR1 (ENSCCAG00000033563) PLSCR5 (ENSCCAG00000026895) ENSCCAG00000034914 ZIC4 (ENSCCAG00000020073) ZIC1 (ENSCCAG00000006506) ENSCCAG00000020167 AGTR1 (ENSCCAG00000037143) ##22 CPB1 (ENSCCAG00000030852) CPA3 (ENSCCAG00000020019) GYG1 (ENSCCAG00000010480) HLTF (ENSCCAG00000026957) HPS3 (ENSCCAG00000025547) CP (ENSCCAG00000029381) TM4SF18 (ENSCCAG00000024188) TM4SF1 (ENSCCAG00000033032) TM4SF4 (ENSCCAG00000028225) WWTR1 (ENSCCAG00000033257) COMMD2 (ENSCCAG00000030153) ENSCCAG00000024462 ANKUB1 (ENSCCAG00000032570) ENSCCAG00000020698 SLC38A5 (ENSCCAG00000032976) Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 54 ACAD11 (ENSSBOG00000033693) UBA5 (ENSSBOG00000020398) NPHP3 (ENSSBOG00000034548) TMEM108 (ENSSBOG00000011724) BFSP2 (ENSSBOG00000028849) ENSSBOG00000018329 TOPBP1 (ENSSBOG00000024009) TF (ENSSBOG00000031489) SRPRB (ENSSBOG00000015129) RAB6B (ENSSBOG00000032178) ENSSBOG00000022800 SLCO2A1 (ENSSBOG00000005126) ENSSBOG00000025080 ZIC4 (ENSSBOG00000033853) ZIC1 (ENSSBOG00000036128) AGTR1 (ENSSBOG00000028954) ##22 CPB1 (ENSSBOG00000028899) CPA3 (ENSSBOG00000035859) GYG1 (ENSSBOG00000035071) HLTF (ENSSBOG00000035436) HPS3 (ENSSBOG00000029336) CP (ENSSBOG00000020804) ENSSBOG00000030239 TM4SF18 (ENSSBOG00000030715) TM4SF1 (ENSSBOG00000013839) TM4SF4 (ENSSBOG00000023962) WWTR1 (ENSSBOG00000022386) ENSSBOG00000021576 ANKUB1 (ENSSBOG00000019018) RNF13 (ENSSBOG00000023866) #25 PFN2 (ENSSBOG00000035879) Marmoset MODERN SPECIES 8 PAQR9 (ENSCJAG00000040620) U2SURP (ENSCJAG00000001639) ENSCJAG00000052027 SLC9A9 (ENSCJAG00000001617) DIPK2A (ENSCJAG00000001605) ENSCJAG00000078272 PLOD2 (ENSCJAG00000001578) PLSCR4 (ENSCJAG00000041138) ENSCJAG00000067351 PLSCR1 (ENSCJAG00000001542) PLSCR5 (ENSCJAG00000001534) ZIC4 (ENSCJAG00000001529) ZIC1 (ENSCJAG00000047544) ENSCJAG00000080507 ENSCJAG00000053621 AGTR1 (ENSCJAG00000001517) ##22 CPB1 (ENSCJAG00000001510) CPA3 (ENSCJAG00000001501) GYG1 (ENSCJAG00000001467) HLTF (ENSCJAG00000001426) HPS3 (ENSCJAG00000001358) CP (ENSCJAG00000001377) ENSCJAG00000062521 TM4SF18 (ENSCJAG00000045324) TM4SF1 (ENSCJAG00000074093) TM4SF4 (ENSCJAG00000083212) WWTR1 (ENSCJAG00000001336) COMMD2 (ENSCJAG00000001327) ANKUB1 (ENSCJAG00000001315) RNF13 (ENSCJAG00000001297) #25 ENSCJAG00000001271 Mas night monkey MODERN SPECIES 401 TRPC1 (ENSANAG00000020387) PCOLCE2 (ENSANAG00000033412) U2SURP (ENSANAG00000035774) CHST2 (ENSANAG00000015893) SLC9A9 (ENSANAG00000020698) DIPK2A (ENSANAG00000037040) PLOD2 (ENSANAG00000030377) PLSCR4 (ENSANAG00000003079) ENSANAG00000030475 PLSCR1 (ENSANAG00000014304) PLSCR5 (ENSANAG00000027235) ZIC4 (ENSANAG00000036933) ZIC1 (ENSANAG00000032455) ENSANAG00000028319 ENSANAG00000029069 AGTR1 (ENSANAG00000022846) ##22 CPB1 (ENSANAG00000036172) CPA3 (ENSANAG00000035981) GYG1 (ENSANAG00000036809) HLTF (ENSANAG00000036474) HPS3 (ENSANAG00000019165) CP (ENSANAG00000030125) ENSANAG00000023000 ENSANAG00000021775 TM4SF18 (ENSANAG00000001190) TM4SF1 (ENSANAG00000029637) ENSANAG00000021676 TM4SF4 (ENSANAG00000038134) WWTR1 (ENSANAG00000029620) COMMD2 (ENSANAG00000023648) ANKUB1 (ENSANAG00000037045) Tarsier MODERN SPECIES 7068 AGTR1 (ENSTSYG00000013739) ##22 ENSTSYG00000029085 CPB1 (ENSTSYG00000008691) CPA3 (ENSTSYG00000008726) GYG1 (ENSTSYG00000014643) HLTF (ENSTSYG00000014645) HPS3 (ENSTSYG00000007054) CP (ENSTSYG00000007058) TM4SF18 (ENSTSYG00000008564) TM4SF1 (ENSTSYG00000001599) ENSTSYG00000027277 GPR68 (ENSTSYG00000030742) CCDC88C (ENSTSYG00000030602) PPP4R3A (ENSTSYG00000010333) CATSPERB (ENSTSYG00000006430) TC2N (ENSTSYG00000014187) Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164931 ENSGT00940000154435 ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h #25 ENSGT00940000153664.B ENSGT00940000160465 Glires ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164931 ENSGT00940000154435 ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h #25 ENSGT00940000153664.B ENSGT00940000160465 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000155714 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164931 ENSGT00940000154435.n ENSGT00940000154435.m.a ENSGT00940000161728 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674.c ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h #25 ENSGT00940000153664.B ENSGT00940000160465 Rabbit MODERN SPECIES 5 U2SURP (ENSOCUG00000012121) CHST2 (ENSOCUG00000012132) SLC9A9 (ENSOCUG00000009911) DIPK2A (ENSOCUG00000012616) ENSOCUG00000038414 PLOD2 (ENSOCUG00000001461) PLSCR4 (ENSOCUG00000015564) ENSOCUG00000023944 ENSOCUG00000029550 ENSOCUG00000012892 PLSCR5 (ENSOCUG00000002500) ENSOCUG00000037397 ZIC4 (ENSOCUG00000010959) ENSOCUG00000021417 ENSOCUG00000026392 AGTR1 (ENSOCUG00000025557) ##22 CPB1 (ENSOCUG00000003084) CPA3 (ENSOCUG00000032097) ENSOCUG00000007320 ENSOCUG00000003516 HLTF (ENSOCUG00000003520) HPS3 (ENSOCUG00000003526) CP (ENSOCUG00000003535) TM4SF18 (ENSOCUG00000003542) ENSOCUG00000003545 TM4SF1 (ENSOCUG00000027275) ENSOCUG00000022512 TM4SF4 (ENSOCUG00000013741) WWTR1 (ENSOCUG00000013750) COMMD2 (ENSOCUG00000002638) ANKUB1 (ENSOCUG00000002642) Rodentia ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000154435.l ENSGT00940000164931 ENSGT00940000154435.k ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h #25 ENSGT00940000153664.B ENSGT00940000160465 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000154435.l ENSGT00940000154435.k ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h #25 ENSGT00940000153664.B ENSGT00940000160465 Kangaroo rat MODERN SPECIES 443 ENSDORG00000025570 ENSDORG00000029879 ENSDORG00000023219 Gk5 (ENSDORG00000023582) Xrn1 (ENSDORG00000013833) Atr (ENSDORG00000000389) Pls1 (ENSDORG00000009841) Trpc1 (ENSDORG00000013958) Pcolce2 (ENSDORG00000013959) ENSDORG00000005201 Slc9a9 (ENSDORG00000011135) ENSDORG00000028495 Plod2 (ENSDORG00000003217) 1700057G04Rik (ENSDORG00000014306) Plscr5 (ENSDORG00000028115) ENSDORG00000024749 ##22 Cpb1 (ENSDORG00000001786) Cpa3 (ENSDORG00000001789) Gyg (ENSDORG00000016120) Hltf (ENSDORG00000016121) Hps3 (ENSDORG00000001208) Cp (ENSDORG00000001212) Tm4sf1 (ENSDORG00000000505) Tm4sf4 (ENSDORG00000029592) Commd2 (ENSDORG00000006954) ENSDORG00000014273 ENSDORG00000014274 #25 ENSDORG00000026457 Eif2a (ENSDORG00000012408) Selenot (ENSDORG00000024406) Siah2 (ENSDORG00000023835) Myomorpha ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00900000143480 ENSGT00940000155866 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h #25 ENSGT00940000153664.B Muroidea DUPLICATION Muroidea ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT01050000244888.b.a.c.b.g ##22 ENSGT00390000001014 ENSGT00940000157153 ENSGT00940000159059 ENSGT00390000010872 ENSGT00940000162937.b ENSGT00940000162527 ENSGT00940000162303.b ENSGT00440000033640 ENSGT00940000156211.b ENSGT01000000215059 ENSGT00390000008538 ENSGT00940000154573 ENSGT00940000154931.d ENSGT00940000154519.g.b ENSGT00940000156563 Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 960 Agtr1a (ENSNGAG00000001950) ##22 Uqcrfs1 (ENSNGAG00000001109) Dusp22 (ENSNGAG00000021364) Irf4 (ENSNGAG00000020771) ENSNGAG00000019248 ENSNGAG00000017632 Foxq1 (ENSNGAG00000011384) Foxf2 (ENSNGAG00000011181) ENSNGAG00000007865 Gmds (ENSNGAG00000021851) Mylk4 (ENSNGAG00000016589) Wrnip1 (ENSNGAG00000022017) ENSNGAG00000007869 ENSNGAG00000020541 ENSNGAG00000018961 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00950000182818.A.f.a.a.b ENSGT00950000182818.A.f.b.b.a.b ENSGT00950000182818.A.f.a.a.a.b.b.a 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ENSMAUG00000009659 ENSMAUG00000009345 ENSMAUG00000009098 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00950000182818.A.f.a.a.b ENSGT00950000182818.A.f.b.b.a.b ENSGT00950000182818.A.f.a.a.a.b.b.a ENSGT00950000182818.A.f.a.a.a.b.b.b ENSGT00950000182818.A.f.a.a.a.b.a.b ENSGT00950000182818.A.f.a.a.a.b.a.a ENSGT00950000182818.A.f.b.b.a.a.b ENSGT00950000182818.A.f.b.b.a.a.a ENSGT00950000182818.A.f.b.b.b ENSGT00950000182818.A.f.b.a.b.b ENSGT00950000182818.A.f.b.a.b.a ENSGT00940000161470 ENSGT00940000155952 ENSGT00940000155115.a.a ENSGT01030000234564.a.a.a.a.a ENSGT01050000244888.b.a.c.b.g ##22 ENSGT00390000001014 ENSGT00940000157153 ENSGT00940000159059 ENSGT00390000010872 ENSGT00860000135685 ENSGT00940000162937.b ENSGT00940000162527 ENSGT00940000162303.b ENSGT00440000033640 ENSGT00940000156211.b ENSGT00390000008538 ENSGT01000000215059 ENSGT00940000154573 ENSGT00940000154931.d ENSGT00940000154519.g.b.a.d Northern American deer mouse MODERN SPECIES 18 Prl2b1 (ENSPEMG00000020341) Prl7a1 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ENSGT00950000182818.A.f.b.a.b.b ENSGT00940000161470 ENSGT00940000155952 ENSGT00940000155115.a.a ENSGT01030000234564.a.a.a.a.a ENSGT01050000244888.b.a.c.b.g ##22 ENSGT00390000001014 ENSGT00940000157153 ENSGT00940000159059 ENSGT00390000010872 ENSGT00860000135627 ENSGT00860000135685 ENSGT00940000162937.b ENSGT00940000162527 ENSGT00940000162303.b ENSGT00440000033640 ENSGT00940000156211.b ENSGT00390000008538 ENSGT01000000215059 ENSGT00940000154573.k.a ENSGT00940000154573.k.b Mus_A ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00950000182818.A.f.a.a.b.a.a.b ENSGT00950000182818.A.f.a.a.b.b ENSGT00950000182818.A.f.a.a.a.a ENSGT00950000182818.A.f.a.a.a.b.b.a ENSGT00950000182818.A.f.a.a.a.b.b.b ENSGT00950000182818.A.f.a.a.a.b.a.b ENSGT00950000182818.A.f.a.a.a.b.a.a ENSGT00950000182818.A.f.b.b.a.a.b ENSGT00950000182818.A.f.b.b.a.a.a ENSGT00950000182818.A.f.b.b.b ENSGT00950000182818.A.f.b.a.b.b ENSGT00940000161470 ENSGT00940000155952 ENSGT00940000155115.a.a ENSGT01030000234564.a.a.a.a.a ENSGT01050000244888.b.a.c.b.g ##22 ENSGT00390000001014 ENSGT00940000157153 ENSGT00940000159059 ENSGT00390000010872 ENSGT00860000135627 ENSGT00860000135685 ENSGT00940000162937.b ENSGT00940000162527 ENSGT00940000162303.b ENSGT00440000033640 ENSGT00940000156211.b ENSGT00390000008538 ENSGT01000000215059 ENSGT00940000154573.k.a ENSGT00940000154573.k.b Mus_B ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00950000182818.A.f.a.a.b.a.a.b ENSGT00950000182818.A.f.a.a.b.b ENSGT00950000182818.A.f.a.a.a.a ENSGT00950000182818.A.f.a.a.a.b.b.a ENSGT00950000182818.A.f.a.a.a.b.b.b ENSGT00950000182818.A.f.a.a.a.b.a.b ENSGT00950000182818.A.f.a.a.a.b.a.a ENSGT00950000182818.A.f.b.b.a.a.b ENSGT00950000182818.A.f.b.b.a.a.a.c ENSGT00950000182818.A.f.b.b.b ENSGT00950000182818.A.f.b.a.b.b ENSGT00940000161470 ENSGT00940000155952 ENSGT00940000155115.a.a ENSGT01030000234564.a.a.a.a.a ENSGT01050000244888.b.a.c.b.g ##22 ENSGT00390000001014 ENSGT00940000157153 ENSGT00940000159059 ENSGT00390000010872 ENSGT00860000135627 ENSGT00860000135685 ENSGT00940000162937.b ENSGT00940000162527 ENSGT00940000162303.b ENSGT00440000033640 ENSGT00940000156211.b ENSGT00390000008538 ENSGT01000000215059 ENSGT00940000154573.k.a ENSGT00940000154573.l Mouse MODERN SPECIES 4 Prl8a9 (ENSMUSG00000006490) Prl8a1 (ENSMUSG00000019756) Prl7b1 (ENSMUSG00000021347) Prl7a1 (ENSMUSG00000006488) Prl7a2 (ENSMUSG00000046899) Prl7d1 (ENSMUSG00000021348) Prl7c1 (ENSMUSG00000060738) Prl2a1 (ENSMUSG00000022886) Prl2c1 (ENSMUSG00000062551) Prl4a1 (ENSMUSG00000005891) Prl5a1 (ENSMUSG00000017064) Sox4 (ENSMUSG00000076431) Cdkal1 (ENSMUSG00000006191) E2f3 (ENSMUSG00000016477) Mboat1 (ENSMUSG00000038732) Agtr1a (ENSMUSG00000049115) ##22 Uqcrfs1 (ENSMUSG00000038462) Dusp22 (ENSMUSG00000069255) Irf4 (ENSMUSG00000021356) Exoc2 (ENSMUSG00000021357) Hus1b (ENSMUSG00000076430) Foxq1 (ENSMUSG00000038415) Foxf2 (ENSMUSG00000038402) Foxc1 (ENSMUSG00000050295) Gmds (ENSMUSG00000038372) Mylk4 (ENSMUSG00000044951) Wrnip1 (ENSMUSG00000021400) Serpinb1a (ENSMUSG00000044734) Serpinb1c (ENSMUSG00000079049) Serpinb6b (ENSMUSG00000042842) Serpinb9 (ENSMUSG00000045827) Mus_C ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00950000182818.A.f.a.a.b.a.a.b ENSGT00950000182818.A.f.a.a.b.b ENSGT00950000182818.A.f.a.a.a.a ENSGT00950000182818.A.f.a.a.a.b.b.a ENSGT00950000182818.A.f.a.a.a.b.b.b ENSGT00950000182818.A.f.a.a.a.b.a.b ENSGT00950000182818.A.f.a.a.a.b.a.a ENSGT00950000182818.A.f.b.b.a.a.b ENSGT00950000182818.A.f.b.b.a.a.a.c ENSGT00950000182818.A.f.b.b.b ENSGT00950000182818.A.f.b.a.b.b ENSGT00940000161470 ENSGT00940000155952 ENSGT00940000155115.a.a ENSGT01030000234564.a.a.a.a.a ENSGT01050000244888.b.a.c.b.g ##22 ENSGT00390000001014 ENSGT00940000157153 ENSGT00940000159059 ENSGT00390000010872 ENSGT00860000135627 ENSGT00860000135685 ENSGT00940000162937.b ENSGT00940000162527 ENSGT00940000162303.b ENSGT00440000033640 ENSGT00940000156211.b ENSGT00390000008538 ENSGT01000000215059 ENSGT00940000154573.k.a ENSGT00940000154573.l spretus MODERN SPECIES 4 Prl7a2 (MGP_SPRETEiJ_G0019244) Prl7d1 (MGP_SPRETEiJ_G0019245) Prl7c1 (MGP_SPRETEiJ_G0019246) Prl2a1 (MGP_SPRETEiJ_G0019247) MGP_SPRETEiJ_G0019248 MGP_SPRETEiJ_G0019251 MGP_SPRETEiJ_G0019250 MGP_SPRETEiJ_G0019249 Prl4a1 (MGP_SPRETEiJ_G0019252) MGP_SPRETEiJ_G0019253 Prl5a1 (MGP_SPRETEiJ_G0019254) Sox4 (MGP_SPRETEiJ_G0019255) Cdkal1 (MGP_SPRETEiJ_G0019256) E2f3 (MGP_SPRETEiJ_G0019257) Mboat1 (MGP_SPRETEiJ_G0019258) Agtr1a (MGP_SPRETEiJ_G0019259) ##22 Uqcrfs1 (MGP_SPRETEiJ_G0019260) Dusp22 (MGP_SPRETEiJ_G0019261) Irf4 (MGP_SPRETEiJ_G0019262) Exoc2 (MGP_SPRETEiJ_G0019263) Hus1b (MGP_SPRETEiJ_G0019264) MGP_SPRETEiJ_G0019265 MGP_SPRETEiJ_G0019266 Foxq1 (MGP_SPRETEiJ_G0019267) Foxf2 (MGP_SPRETEiJ_G0019268) Foxc1 (MGP_SPRETEiJ_G0019269) Gmds (MGP_SPRETEiJ_G0019270) MGP_SPRETEiJ_G0019271 Wrnip1 (MGP_SPRETEiJ_G0019272) MGP_SPRETEiJ_G0019273 MGP_SPRETEiJ_G0019274 Steppe mouse MODERN SPECIES 3125 Sox4 (ENSMSIG00000003950) ENSMSIG00000003925 Cdkal1 (ENSMSIG00000003744) E2f3 (ENSMSIG00000003621) Mboat1 (ENSMSIG00000003528) Agtr1a (ENSMSIG00000003511) ##22 ENSMSIG00000003491 ENSMSIG00000003474 Ryukyu mouse MODERN SPECIES 4 Prl7a2 (MGP_CAROLIEiJ_G0018375) Prl7d1 (MGP_CAROLIEiJ_G0018376) Prl7c1 (MGP_CAROLIEiJ_G0018377) Prl2a1 (MGP_CAROLIEiJ_G0018378) MGP_CAROLIEiJ_G0018379 MGP_CAROLIEiJ_G0018382 MGP_CAROLIEiJ_G0018380 MGP_CAROLIEiJ_G0018381 MGP_CAROLIEiJ_G0018383 Prl4a1 (MGP_CAROLIEiJ_G0018384) Prl5a1 (MGP_CAROLIEiJ_G0018385) Sox4 (MGP_CAROLIEiJ_G0018386) Cdkal1 (MGP_CAROLIEiJ_G0018387) E2f3 (MGP_CAROLIEiJ_G0018388) Mboat1 (MGP_CAROLIEiJ_G0018389) Agtr1a (MGP_CAROLIEiJ_G0018390) ##22 Uqcrfs1 (MGP_CAROLIEiJ_G0018391) Dusp22 (MGP_CAROLIEiJ_G0018392) Irf4 (MGP_CAROLIEiJ_G0018393) Exoc2 (MGP_CAROLIEiJ_G0018394) Hus1b (MGP_CAROLIEiJ_G0018395) MGP_CAROLIEiJ_G0018396 MGP_CAROLIEiJ_G0018397 Foxq1 (MGP_CAROLIEiJ_G0018398) Foxf2 (MGP_CAROLIEiJ_G0018399) Foxc1 (MGP_CAROLIEiJ_G0018400) Gmds (MGP_CAROLIEiJ_G0018401) MGP_CAROLIEiJ_G0018402 Wrnip1 (MGP_CAROLIEiJ_G0018403) MGP_CAROLIEiJ_G0018404 Serpinb1a (MGP_CAROLIEiJ_G0018405) Shrew mouse MODERN SPECIES 7 MGP_PahariEiJ_G0019440 Prl7a2 (MGP_PahariEiJ_G0019441) Prl7d1 (MGP_PahariEiJ_G0019442) Prl7c1 (MGP_PahariEiJ_G0019443) Prl2a1 (MGP_PahariEiJ_G0019444) MGP_PahariEiJ_G0019445 MGP_PahariEiJ_G0019448 MGP_PahariEiJ_G0019446 MGP_PahariEiJ_G0019447 Prl4a1 (MGP_PahariEiJ_G0019449) Prl5a1 (MGP_PahariEiJ_G0019450) Sox4 (MGP_PahariEiJ_G0019451) Cdkal1 (MGP_PahariEiJ_G0019452) E2f3 (MGP_PahariEiJ_G0019453) Mboat1 (MGP_PahariEiJ_G0019454) Agtr1a (MGP_PahariEiJ_G0019455) ##22 Uqcrfs1 (MGP_PahariEiJ_G0019456) Dusp22 (MGP_PahariEiJ_G0019457) Irf4 (MGP_PahariEiJ_G0019458) Exoc2 (MGP_PahariEiJ_G0019459) Hus1b (MGP_PahariEiJ_G0019460) MGP_PahariEiJ_G0019461 Foxq1 (MGP_PahariEiJ_G0019462) Foxf2 (MGP_PahariEiJ_G0019463) Foxc1 (MGP_PahariEiJ_G0019464) Gmds (MGP_PahariEiJ_G0019465) MGP_PahariEiJ_G0019466 Wrnip1 (MGP_PahariEiJ_G0019467) MGP_PahariEiJ_G0019468 Serpinb1a (MGP_PahariEiJ_G0019469) MGP_PahariEiJ_G0019470 Rat MODERN SPECIES 8 Prl7a3 (ENSRNOG00000016616) Prl7d1 (ENSRNOG00000016510) Prl7c1 (ENSRNOG00000047649) Prl2a1 (ENSRNOG00000016463) Prl2c1 (ENSRNOG00000039058) Prl4a1 (ENSRNOG00000016436) Prl5a1 (ENSRNOG00000016307) Prl5a2 (ENSRNOG00000039075) Sox4 (ENSRNOG00000065643) ENSRNOG00000065771 Cdkal1 (ENSRNOG00000018381) RGD1561310 (ENSRNOG00000062739) ENSRNOG00000062512 E2f3 (ENSRNOG00000029273) Mboat1 (ENSRNOG00000027125) Agtr1a (ENSRNOG00000018346) ##22 ENSRNOG00000070855 Uqcrfs1 (ENSRNOG00000018281) Dusp22 (ENSRNOG00000056376) Irf4 (ENSRNOG00000061070) Exoc2 (ENSRNOG00000060266) Foxq1 (ENSRNOG00000062314) Foxf2 (ENSRNOG00000063796) Foxc1 (ENSRNOG00000070919) Gmds (ENSRNOG00000017605) Mylk4 (ENSRNOG00000070083) ENSRNOG00000063699 Wrnip1 (ENSRNOG00000017040) Serpinb1a (ENSRNOG00000016581) Serpinb6b (ENSRNOG00000016420) Serpinb9 (ENSRNOG00000033772) Muroidea ANCESTRAL SPECIES 44 ENSGT01050000244888.b.a.c.b.h ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00900000143480 ENSGT00940000155866 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h #25 ENSGT00940000153664.B Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 1415 Hhip (ENSNGAG00000016947) ENSNGAG00000014163 Agtr1b (ENSNGAG00000018677) ##22 Cpb1 (ENSNGAG00000011572) Cpa3 (ENSNGAG00000007285) ENSNGAG00000020600 Hltf (ENSNGAG00000018333) Hps3 (ENSNGAG00000019595) Cp (ENSNGAG00000022941) ENSNGAG00000022257 Tm4sf1 (ENSNGAG00000021173) Tm4sf4 (ENSNGAG00000007462) Wwtr1 (ENSNGAG00000017893) Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000155708 ENSGT00940000163015 ENSGT00940000182224 ENSGT00950000183196.B ENSGT00940000155015 ENSGT00390000016029 ENSGT00940000157005 ENSGT01100000263484.C.b.a ENSGT01070000253816.b ENSGT00940000156699 ENSGT00940000156299 ENSGT00390000015332 ENSGT00940000155789 ENSGT01030000234598.a.b ENSGT00940000153421.a.b ENSGT01050000244888.b.a.c.b.h ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00900000143480 ENSGT00940000155866 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000154509.xc.a ENSGT00390000003738.a.b ENSGT00940000155708 ENSGT00950000183196.B ENSGT00940000155015 ENSGT00390000016029 ENSGT00940000157005 ENSGT01100000263484.C.b.a ENSGT01070000253816.b ENSGT00940000156699 ENSGT00940000156299 ENSGT00390000015332 ENSGT00940000155789 ENSGT01030000234598.a.b ENSGT00940000153421.a.b ENSGT01050000244888.b.a.c.b.h ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00900000143480 ENSGT00940000155866 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES 55 ENSGT00940000154509.xc.a ENSGT00390000003738.a.b ENSGT00940000155708 ENSGT00950000183196.B ENSGT00940000155015 ENSGT00390000016029 ENSGT00940000157005 ENSGT01100000263484.C.b.a ENSGT01070000253816.b ENSGT00940000156699 ENSGT00940000156299 ENSGT00390000015332 ENSGT00940000155789 ENSGT01030000234598.a.b ENSGT00940000153421.a.b ENSGT01050000244888.b.a.c.b.h ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 Prairie vole DUPLICATION Prairie vole MODERN SPECIES Fat4 (ENSMOCG00000018552) Ankrd50 (ENSMOCG00000004523) Slc2a2 (ENSMOCG00000016334) Tnik (ENSMOCG00000002021) Pld1 (ENSMOCG00000019861) Tmem212 (ENSMOCG00000014617) Fndc3b (ENSMOCG00000018057) Ghsr (ENSMOCG00000010453) Tnfsf10 (ENSMOCG00000001683) Nceh1 (ENSMOCG00000021848) Ect2 (ENSMOCG00000016900) Spata16 (ENSMOCG00000014167) Nlgn1 (ENSMOCG00000006420) Tbl1xr1 (ENSMOCG00000022629) ENSMOCG00000006252 ENSMOCG00000007296 ##22 Cpb1 (ENSMOCG00000020527) Cpa3 (ENSMOCG00000020637) Gyg (ENSMOCG00000013677) Hltf (ENSMOCG00000019747) Hps3 (ENSMOCG00000010766) Cp (ENSMOCG00000016138) ENSMOCG00000019158 ENSMOCG00000017600 Lamb1 (ENSMOCG00000014282) Dld (ENSMOCG00000021009) Slc26a3 (ENSMOCG00000019595) Cbll1 (ENSMOCG00000016689) Slc26a4 (ENSMOCG00000022260) Bcap29 (ENSMOCG00000002261) Dus4l (ENSMOCG00000019344) Prairie vole MODERN SPECIES 3 ENSMOCG00000010680 Prl2b1 (ENSMOCG00000020413) Prl7a1 (ENSMOCG00000002066) Prl7a2 (ENSMOCG00000006151) Prl7d1 (ENSMOCG00000017698) Prl7c1 (ENSMOCG00000020212) Prl2a1 (ENSMOCG00000006918) ENSMOCG00000019145 Prl4a1 (ENSMOCG00000000622) Prl5a1 (ENSMOCG00000018200) Sox4 (ENSMOCG00000004505) ENSMOCG00000002429 Cdkal1 (ENSMOCG00000022160) E2f3 (ENSMOCG00000022923) Mboat1 (ENSMOCG00000004726) ENSMOCG00000019499 ##22 Uqcrfs1 (ENSMOCG00000014738) ENSMOCG00000007870 Irf4 (ENSMOCG00000017633) Exoc2 (ENSMOCG00000022998) Hus1b (ENSMOCG00000002316) ENSMOCG00000000826 Foxq1 (ENSMOCG00000005340) Foxf2 (ENSMOCG00000010276) ENSMOCG00000002929 Foxc1 (ENSMOCG00000006436) Gmds (ENSMOCG00000018203) Mylk4 (ENSMOCG00000014428) ENSMOCG00000019965 Wrnip1 (ENSMOCG00000002819) ENSMOCG00000021377 Northern American deer mouse MODERN SPECIES 19 Il2 (ENSPEMG00000006965) Adad1 (ENSPEMG00000013728) Bltp1 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ENSGT00390000014100 ENSGT00940000153141.B.b ENSGT00940000162962 ENSGT00770000121214 Mus_A ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000003738.a.b ENSGT00940000155708 ENSGT00940000182224 ENSGT00950000183196.B ENSGT00940000155015.b ENSGT00390000016029 ENSGT00940000157005 ENSGT01100000263484.C.b.a ENSGT01070000253816.b ENSGT00940000156699 ENSGT00940000156299 ENSGT00390000015332 ENSGT00940000155789 ENSGT01030000234598.a.b ENSGT00940000153421.a.b ENSGT01050000244888.b.a.c.b.h ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT00940000154473.a ENSGT00940000154004.a ENSGT00940000159294 ENSGT00940000157658 ENSGT00950000183215.c.a.b ENSGT00390000014100 ENSGT00940000153141.B.b ENSGT00940000162962 ENSGT00770000121214 Mus_B ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000003738.a.b ENSGT00940000155708 ENSGT00940000182224 ENSGT00950000183196.B ENSGT00940000155015.b ENSGT00390000016029 ENSGT00940000157005 ENSGT01100000263484.C.b.a ENSGT01070000253816.b ENSGT00940000156699 ENSGT00940000156299 ENSGT00390000015332 ENSGT00940000155789 ENSGT01030000234598.a.b ENSGT00940000153421.a.b ENSGT01050000244888.b.a.c.b.h ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT00940000154473.a ENSGT00940000154004.a ENSGT00940000159294 ENSGT00940000157658 ENSGT00950000183215.c.a.b ENSGT00390000014100 ENSGT00940000153141.B.b ENSGT00940000162962 ENSGT00770000121214 Mouse MODERN SPECIES 12 Rpl22l1 (ENSMUSG00000039221) Eif5a2 (ENSMUSG00000050192) Slc2a2 (ENSMUSG00000027690) Tnik (ENSMUSG00000027692) Pld1 (ENSMUSG00000027695) Tmem212 (ENSMUSG00000043164) Fndc3b (ENSMUSG00000039286) Ghsr (ENSMUSG00000051136) Tnfsf10 (ENSMUSG00000039304) Nceh1 (ENSMUSG00000027698) Ect2 (ENSMUSG00000027699) Spata16 (ENSMUSG00000039335) Nlgn1 (ENSMUSG00000063887) Naaladl2 (ENSMUSG00000102758) Tbl1xr1 (ENSMUSG00000027630) Agtr1b (ENSMUSG00000054988) ##22 Cpb1 (ENSMUSG00000011463) Cpa3 (ENSMUSG00000001865) Gyg (ENSMUSG00000019528) Hltf (ENSMUSG00000002428) Hps3 (ENSMUSG00000027615) Cp (ENSMUSG00000003617) Crh (ENSMUSG00000049796) Trim55 (ENSMUSG00000060913) Dnajc5b (ENSMUSG00000027606) Pde7a (ENSMUSG00000069094) Mtfr1 (ENSMUSG00000027601) Armc1 (ENSMUSG00000027599) Cyp7b1 (ENSMUSG00000039519) Bhlhe22 (ENSMUSG00000025128) Cypt12 (ENSMUSG00000027564) Mus_C ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000003738.a.b ENSGT00940000155708 ENSGT00940000182224 ENSGT00950000183196.B ENSGT00940000155015.b ENSGT00390000016029 ENSGT00940000157005 ENSGT01100000263484.C.b.a ENSGT01070000253816.b ENSGT00940000156699 ENSGT00940000156299 ENSGT00390000015332 ENSGT00940000155789 ENSGT01030000234598.a.b ENSGT00940000153421.a.b ENSGT01050000244888.b.a.c.b.h ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT00940000154473.a ENSGT00940000154004.a ENSGT00860000135717 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000157658 ENSGT00950000183215.c.a.b ENSGT00390000014100 ENSGT00940000153141.B.b ENSGT00940000162962 Steppe mouse MODERN SPECIES 774 Agtr1b (ENSMSIG00000002747) ##22 spretus MODERN SPECIES 12 Slc2a2 (MGP_SPRETEiJ_G0025828) Tnik (MGP_SPRETEiJ_G0025827) MGP_SPRETEiJ_G0025826 Pld1 (MGP_SPRETEiJ_G0025825) Tmem212 (MGP_SPRETEiJ_G0025824) Fndc3b (MGP_SPRETEiJ_G0025823) Ghsr (MGP_SPRETEiJ_G0025822) Tnfsf10 (MGP_SPRETEiJ_G0025821) Nceh1 (MGP_SPRETEiJ_G0025820) Ect2 (MGP_SPRETEiJ_G0025819) Spata16 (MGP_SPRETEiJ_G0025818) Nlgn1 (MGP_SPRETEiJ_G0025817) MGP_SPRETEiJ_G0025816 MGP_SPRETEiJ_G0025815 Tbl1xr1 (MGP_SPRETEiJ_G0025814) Agtr1b (MGP_SPRETEiJ_G0025813) ##22 Cpa3 (MGP_SPRETEiJ_G0025812) Cpb1 (MGP_SPRETEiJ_G0025811) Gyg (MGP_SPRETEiJ_G0025810) Hltf (MGP_SPRETEiJ_G0025809) Hps3 (MGP_SPRETEiJ_G0025808) Cp (MGP_SPRETEiJ_G0025807) MGP_SPRETEiJ_G0025806 Crh (MGP_SPRETEiJ_G0025805) Trim55 (MGP_SPRETEiJ_G0025804) MGP_SPRETEiJ_G0025803 Dnajc5b (MGP_SPRETEiJ_G0025802) Pde7a (MGP_SPRETEiJ_G0025801) Mtfr1 (MGP_SPRETEiJ_G0025800) Armc1 (MGP_SPRETEiJ_G0025799) Cyp7b1 (MGP_SPRETEiJ_G0025797) Ryukyu mouse MODERN SPECIES 12 Rpl22l1 (MGP_CAROLIEiJ_G0024897) Eif5a2 (MGP_CAROLIEiJ_G0024896) Slc2a2 (MGP_CAROLIEiJ_G0024895) Tnik (MGP_CAROLIEiJ_G0024894) Pld1 (MGP_CAROLIEiJ_G0024893) Tmem212 (MGP_CAROLIEiJ_G0024892) Fndc3b (MGP_CAROLIEiJ_G0024891) Ghsr (MGP_CAROLIEiJ_G0024890) Tnfsf10 (MGP_CAROLIEiJ_G0024889) Nceh1 (MGP_CAROLIEiJ_G0024888) MGP_CAROLIEiJ_G0024887 Spata16 (MGP_CAROLIEiJ_G0024886) Nlgn1 (MGP_CAROLIEiJ_G0024885) Naaladl2 (MGP_CAROLIEiJ_G0024884) Tbl1xr1 (MGP_CAROLIEiJ_G0024883) Agtr1b (MGP_CAROLIEiJ_G0024882) ##22 Cpb1 (MGP_CAROLIEiJ_G0024881) Cpa3 (MGP_CAROLIEiJ_G0024880) Gyg (MGP_CAROLIEiJ_G0024879) Hltf (MGP_CAROLIEiJ_G0024878) Hps3 (MGP_CAROLIEiJ_G0024877) Cp (MGP_CAROLIEiJ_G0024876) Crh (MGP_CAROLIEiJ_G0024875) Trim55 (MGP_CAROLIEiJ_G0024874) MGP_CAROLIEiJ_G0024873 MGP_CAROLIEiJ_G0024872 Dnajc5b (MGP_CAROLIEiJ_G0024871) Pde7a (MGP_CAROLIEiJ_G0024870) Mtfr1 (MGP_CAROLIEiJ_G0024869) Armc1 (MGP_CAROLIEiJ_G0024868) Cyp7b1 (MGP_CAROLIEiJ_G0024867) Shrew mouse MODERN SPECIES 17 Rpl22l1 (MGP_PahariEiJ_G0026342) Eif5a2 (MGP_PahariEiJ_G0026341) MGP_PahariEiJ_G0026340 Tnik (MGP_PahariEiJ_G0026339) Pld1 (MGP_PahariEiJ_G0026338) Tmem212 (MGP_PahariEiJ_G0026337) Fndc3b (MGP_PahariEiJ_G0026336) Ghsr (MGP_PahariEiJ_G0026335) Tnfsf10 (MGP_PahariEiJ_G0026334) Nceh1 (MGP_PahariEiJ_G0026333) Ect2 (MGP_PahariEiJ_G0026332) Spata16 (MGP_PahariEiJ_G0026331) Nlgn1 (MGP_PahariEiJ_G0026330) Naaladl2 (MGP_PahariEiJ_G0026329) Tbl1xr1 (MGP_PahariEiJ_G0026328) Agtr1b (MGP_PahariEiJ_G0026327) ##22 Cpb1 (MGP_PahariEiJ_G0026326) Cpa3 (MGP_PahariEiJ_G0026325) Gyg (MGP_PahariEiJ_G0026324) Hltf (MGP_PahariEiJ_G0026323) Hps3 (MGP_PahariEiJ_G0026322) Cp (MGP_PahariEiJ_G0026321) Crh (MGP_PahariEiJ_G0026320) Trim55 (MGP_PahariEiJ_G0026319) MGP_PahariEiJ_G0026318 Dnajc5b (MGP_PahariEiJ_G0026317) Pde7a (MGP_PahariEiJ_G0026316) Mtfr1 (MGP_PahariEiJ_G0026315) Armc1 (MGP_PahariEiJ_G0026314) Cyp7b1 (MGP_PahariEiJ_G0026313) Bhlhe22 (MGP_PahariEiJ_G0026312) Rat MODERN SPECIES 11 Tnik (ENSRNOG00000012422) Pld1 (ENSRNOG00000028156) Tmem212 (ENSRNOG00000012608) Fndc3b (ENSRNOG00000024089) Ghsr (ENSRNOG00000024119) Tnfsf10 (ENSRNOG00000067968) Nceh1 (ENSRNOG00000013313) Ect2 (ENSRNOG00000024365) Spata16 (ENSRNOG00000024521) Nlgn1 (ENSRNOG00000032576) ENSRNOG00000033028 Naaladl2 (ENSRNOG00000065021) Tbl1xr1 (ENSRNOG00000011216) LOC120100784 (ENSRNOG00000031378) ENSRNOG00000070560 Agtr1b (ENSRNOG00000010640) ##22 Cpb1 (ENSRNOG00000030904) Cpa3 (ENSRNOG00000011181) Gyg1 (ENSRNOG00000011146) Hltf (ENSRNOG00000000082) Hps3 (ENSRNOG00000031406) Cp (ENSRNOG00000011913) ENSRNOG00000069706 ENSRNOG00000064644 Crh (ENSRNOG00000012703) Trim55 (ENSRNOG00000012723) Dnajc5b (ENSRNOG00000012851) AABR07009572.1 (ENSRNOG00000013038) Pde7a (ENSRNOG00000013048) Mtfr1 (ENSRNOG00000021359) Armc1 (ENSRNOG00000013253) Lesser Egyptian jerboa DUPLICATION Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 103 ENSJJAG00000017891 ENSJJAG00000017330 1700057G04Rik (ENSJJAG00000020060) ENSJJAG00000020283 ENSJJAG00000020887 Plscr5 (ENSJJAG00000000244) ENSJJAG00000000877 ENSJJAG00000004591 ENSJJAG00000005647 ENSJJAG00000008994 Zic4 (ENSJJAG00000011859) Zic1 (ENSJJAG00000012204) ENSJJAG00000020121 ENSJJAG00000020634 ENSJJAG00000020950 ENSJJAG00000013602 ##22 ENSJJAG00000000074 ENSJJAG00000000322 Uqcrfs1 (ENSJJAG00000000535) Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 57 Asic5 (ENSJJAG00000012586) Tdo2 (ENSJJAG00000016645) Ctso (ENSJJAG00000019382) Pdgfc (ENSJJAG00000019722) Glrb (ENSJJAG00000020669) Gria2 (ENSJJAG00000014639) Gask1b (ENSJJAG00000018888) Tmem144 (ENSJJAG00000016125) Rxfp1 (ENSJJAG00000021550) Etfdh (ENSJJAG00000018038) Ppid (ENSJJAG00000011315) Fnip2 (ENSJJAG00000024272) ENSJJAG00000021691 Rapgef2 (ENSJJAG00000010275) Fstl5 (ENSJJAG00000016998) ENSJJAG00000009812 ##22 Cpb1 (ENSJJAG00000011113) Cpa3 (ENSJJAG00000010020) Gyg (ENSJJAG00000007942) Hltf (ENSJJAG00000020192) Hps3 (ENSJJAG00000024425) ENSJJAG00000018946 Cp (ENSJJAG00000010698) Tm4sf1 (ENSJJAG00000003150) Tm4sf4 (ENSJJAG00000007164) ENSJJAG00000003580 Commd2 (ENSJJAG00000021539) ENSJJAG00000011296 Rnf13 (ENSJJAG00000012385) #25 Pfn2 (ENSJJAG00000018684) ENSJJAG00000013003 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000154435.l ENSGT00940000164931 ENSGT00940000154435.k ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h #25 ENSGT00940000153664.B ENSGT00940000160465 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164931 ENSGT00940000154435.k.g.a ENSGT00940000154435.k.h ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489.f ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h #25 ENSGT00940000153664.B ENSGT00940000160465 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 27 ENSHGLG00000040890 ENSHGLG00000038284 ENSHGLG00000019213 ENSHGLG00000019244 ENSHGLG00000021419 ENSHGLG00000049780 ENSHGLG00000042807 ENSHGLG00000040188 ENSHGLG00000043888 ENSHGLG00000048208 ENSHGLG00000017414 ENSHGLG00000032818 ENSHGLG00000011081 ENSHGLG00000002472 ENSHGLG00000035002 ENSHGLG00000046384 ##22 CPB1 (ENSHGLG00000011884) CPA3 (ENSHGLG00000012134) GYG1 (ENSHGLG00000012311) ENSHGLG00000040634 ENSHGLG00000035118 ENSHGLG00000011754 HLTF (ENSHGLG00000012503) HPS3 (ENSHGLG00000012977) CP (ENSHGLG00000014064) ENSHGLG00000020937 TM4SF18 (ENSHGLG00000046931) TM4SF1 (ENSHGLG00000017433) TM4SF4 (ENSHGLG00000017445) ENSHGLG00000039194 WWTR1 (ENSHGLG00000017284) Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164931 ENSGT00940000154435.k.g.a ENSGT00940000154435.k.g.b ENSGT00940000154435.k.h ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489.f ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h #25 ENSGT00940000153664.B ENSGT00940000160465 Guinea pig MODERN SPECIES 8 PCOLCE2 (ENSCPOG00000009999) PAQR9 (ENSCPOG00000021386) U2SURP (ENSCPOG00000011656) CHST2 (ENSCPOG00000026369) SLC9A9 (ENSCPOG00000000663) DIPK2A (ENSCPOG00000009308) ENSCPOG00000026394 PLOD2 (ENSCPOG00000014514) PLSCR4 (ENSCPOG00000009496) ENSCPOG00000007099 ENSCPOG00000030970 ENSCPOG00000030500 ENSCPOG00000030198 PLSCR5 (ENSCPOG00000015238) ZIC4 (ENSCPOG00000010981) AGTR1 (ENSCPOG00000007610) ##22 CPB1 (ENSCPOG00000001475) CPA3 (ENSCPOG00000001479) GYG1 (ENSCPOG00000001482) HLTF (ENSCPOG00000001238) HPS3 (ENSCPOG00000013007) CP (ENSCPOG00000013015) TM4SF18 (ENSCPOG00000030709) TM4SF1 (ENSCPOG00000036320) TM4SF4 (ENSCPOG00000010562) WWTR1 (ENSCPOG00000037193) COMMD2 (ENSCPOG00000031805) ENSCPOG00000024921 RNF13 (ENSCPOG00000000517) #25 PFN2 (ENSCPOG00000034416) TSC22D2 (ENSCPOG00000001481) Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES 45 ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164931 ENSGT00940000154435.k.g.a ENSGT00940000154435.k.g.b ENSGT00940000154435.k.h ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00940000159061 ENSGT00940000154688.b ENSGT00940000156041 ENSGT00390000013367 ENSGT00950000183118.B ENSGT00940000159578 ENSGT00530000063553.b.b ENSGT00940000154837.f ENSGT00940000158682 ENSGT00940000155881 ENSGT00940000153510.b Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 181 ENSCLAG00000008261 PPM1K (ENSCLAG00000008179) ENSCLAG00000008144 PIGY (ENSCLAG00000007742) HERC3 (ENSCLAG00000007432) FAM13A (ENSCLAG00000007217) PLOD2 (ENSCLAG00000008696) PLSCR4 (ENSCLAG00000008577) ENSCLAG00000008432 ENSCLAG00000008210 ENSCLAG00000007786 ENSCLAG00000007606 PLSCR5 (ENSCLAG00000007297) ZIC4 (ENSCLAG00000007107) ZIC1 (ENSCLAG00000006845) AGTR1 (ENSCLAG00000004411) ##22 CPB1 (ENSCLAG00000004152) CPA3 (ENSCLAG00000004064) GYG1 (ENSCLAG00000003920) HLTF (ENSCLAG00000003408) ENSCLAG00000003230 GPT2 (ENSCLAG00000003182) ENSCLAG00000002868 NETO2 (ENSCLAG00000008739) ITFG1 (ENSCLAG00000007967) PHKB (ENSCLAG00000007130) ABCC12 (ENSCLAG00000006887) LONP2 (ENSCLAG00000006722) SIAH1 (ENSCLAG00000006639) N4BP1 (ENSCLAG00000006600) LIN54 (ENSCLAG00000006502) Degu MODERN SPECIES 69 DIPK2A (ENSODEG00000008791) ENSODEG00000008615 ENSODEG00000008712 ENSODEG00000008324 PLOD2 (ENSODEG00000009443) PLSCR4 (ENSODEG00000009888) ENSODEG00000008158 ENSODEG00000009747 PLSCR5 (ENSODEG00000009189) ZIC4 (ENSODEG00000008678) ZIC1 (ENSODEG00000008223) ENSODEG00000007847 ENSODEG00000013165 ENSODEG00000013852 ENSODEG00000019589 AGTR1 (ENSODEG00000019590) ##22 CPB1 (ENSODEG00000011062) CPA3 (ENSODEG00000008292) ENSODEG00000009053 HLTF (ENSODEG00000009415) GPT2 (ENSODEG00000008090) ENSODEG00000007831 NETO2 (ENSODEG00000008553) ENSODEG00000008342 ITFG1 (ENSODEG00000007883) PHKB (ENSODEG00000008822) ABCC12 (ENSODEG00000010786) ENSODEG00000009232 ENSODEG00000007971 SIAH1 (ENSODEG00000010400) N4BP1 (ENSODEG00000009642) Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000154435.l ENSGT00940000154435.k ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00390000016906 ENSGT00390000011127 ENSGT01030000234621.C.b ENSGT00390000011700 ENSGT00530000063813.a ENSGT00530000063813.b Marmotini ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000154435.l ENSGT00940000154435.k ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00390000016906 ENSGT00390000011127 ENSGT01030000234621.C.b ENSGT00390000011700 ENSGT00530000063813.a ENSGT00530000063813.b Alpin marmot MODERN SPECIES 19 U2SURP (ENSMMMG00000017089) CHST2 (ENSMMMG00000017088) SLC9A9 (ENSMMMG00000017071) ENSMMMG00000017056 ENSMMMG00000017052 ENSMMMG00000017044 ENSMMMG00000017033 PLOD2 (ENSMMMG00000017004) PLSCR4 (ENSMMMG00000016989) ENSMMMG00000016973 ENSMMMG00000016964 ENSMMMG00000016886 PLSCR5 (ENSMMMG00000016875) ZIC4 (ENSMMMG00000016860) ZIC1 (ENSMMMG00000016851) AGTR1 (ENSMMMG00000016843) ##22 CPB1 (ENSMMMG00000016838) CPA3 (ENSMMMG00000016829) GYG1 (ENSMMMG00000016824) HLTF (ENSMMMG00000016808) HPS3 (ENSMMMG00000016598) CP (ENSMMMG00000016360) TM4SF18 (ENSMMMG00000016299) TM4SF1 (ENSMMMG00000016291) TM4SF4 (ENSMMMG00000016284) IL12A (ENSMMMG00000016274) SCHIP1 (ENSMMMG00000016272) ENSMMMG00000016266 ENSMMMG00000016261 MFSD1 (ENSMMMG00000016249) RARRES1 (ENSMMMG00000016234) Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 46 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000154435.l ENSGT00940000154435.k ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00390000016906 ENSGT00390000011127 ENSGT01030000234621.C.b ENSGT00390000011700 ENSGT00530000063813.a ENSGT00530000063813.b Squirrel MODERN SPECIES 119 DIPK2A (ENSSTOG00000015680) PLOD2 (ENSSTOG00000025550) PLSCR4 (ENSSTOG00000006004) ENSSTOG00000033689 ENSSTOG00000002373 PLSCR5 (ENSSTOG00000008096) ZIC4 (ENSSTOG00000015977) ZIC1 (ENSSTOG00000000952) AGTR1 (ENSSTOG00000025945) ##22 CPB1 (ENSSTOG00000008344) CPA3 (ENSSTOG00000008364) GYG1 (ENSSTOG00000001687) HLTF (ENSSTOG00000001694) HPS3 (ENSSTOG00000015620) CP (ENSSTOG00000015628) ENSSTOG00000002890 TM4SF18 (ENSSTOG00000026073) TM4SF1 (ENSSTOG00000025707) TM4SF4 (ENSSTOG00000010877) IL12A (ENSSTOG00000014615) ENSSTOG00000014607 ENSSTOG00000026854 MFSD1 (ENSSTOG00000010188) RARRES1 (ENSSTOG00000010175) Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 337 AGTR1 (ENSUPAG00010001088) ##22 CPB1 (ENSUPAG00010001070) CPA3 (ENSUPAG00010001046) GYG1 (ENSUPAG00010001020) HLTF (ENSUPAG00010000994) HPS3 (ENSUPAG00010000943) CP (ENSUPAG00010000478) TM4SF18 (ENSUPAG00010000462) TM4SF1 (ENSUPAG00010000443) TM4SF4 (ENSUPAG00010000438) IL12A (ENSUPAG00010000415) ENSUPAG00010000392 Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 1 PCOLCE2 (ENSSVLG00005009992) PAQR9 (ENSSVLG00005010124) U2SURP (ENSSVLG00005010214) CHST2 (ENSSVLG00005011831) SLC9A9 (ENSSVLG00005011865) DIPK2A (ENSSVLG00005011903) ENSSVLG00005011980 PLOD2 (ENSSVLG00005012138) PLSCR4 (ENSSVLG00005012337) ENSSVLG00005012558 PLSCR1 (ENSSVLG00005012636) PLSCR5 (ENSSVLG00005012728) ZIC4 (ENSSVLG00005012907) ZIC1 (ENSSVLG00005013067) ENSSVLG00005013147 AGTR1 (ENSSVLG00005013217) ##22 CPB1 (ENSSVLG00005013271) CPA3 (ENSSVLG00005013362) GYG1 (ENSSVLG00005013712) HLTF (ENSSVLG00005013865) HPS3 (ENSSVLG00005014027) CP (ENSSVLG00005014272) TM4SF18 (ENSSVLG00005014461) TM4SF1 (ENSSVLG00005014530) TM4SF4 (ENSSVLG00005014565) IL12A (ENSSVLG00005014635) ENSSVLG00005014764 ENSSVLG00005015250 ENSSVLG00005015377 MFSD1 (ENSSVLG00005015449) RARRES1 (ENSSVLG00005015785) Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 45 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00940000162334 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164931 ENSGT00940000154435 ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.g.a ##25 ENSGT00940000154942.h #25 ENSGT00940000153664.B Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 59 ENSGT00940000155714 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164931 ENSGT00940000154435 ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h #25 ENSGT00940000153664.B ENSGT00940000160465 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 57 ENSGT00940000155714 ENSGT00950000183097.a.b ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000157649 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000161947 ENSGT00940000164931 ENSGT00940000154435 ENSGT00940000161728 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h #25 ENSGT00940000153664.B ENSGT00940000160465 Elephant MODERN SPECIES 383 PLS1 (ENSLAFG00000008746) TRPC1 (ENSLAFG00000004282) PCOLCE2 (ENSLAFG00000004287) U2SURP (ENSLAFG00000002566) CHST2 (ENSLAFG00000001355) SLC9A9 (ENSLAFG00000000863) DIPK2A (ENSLAFG00000004615) ENSLAFG00000003009 PLOD2 (ENSLAFG00000001931) PLSCR4 (ENSLAFG00000013908) ENSLAFG00000027441 PLSCR1 (ENSLAFG00000016401) PLSCR5 (ENSLAFG00000026690) ZIC4 (ENSLAFG00000010922) ZIC1 (ENSLAFG00000030632) AGTR1 (ENSLAFG00000004852) ##22 CPB1 (ENSLAFG00000004854) CPA3 (ENSLAFG00000004858) GYG1 (ENSLAFG00000006512) HLTF (ENSLAFG00000006515) HPS3 (ENSLAFG00000000998) CP (ENSLAFG00000001000) TM4SF18 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ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157819 ENSGT00940000161551.a ENSGT00940000154674 ENSGT00910000144305 ENSGT00390000015458 ENSGT00940000155866 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.b ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT00940000165445 ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00950000183086.a.a.b ENSGT00940000154369 ENSGT01030000234629.B Frog MODERN SPECIES 5 ENSXETG00000022137 u2surp (ENSXETG00000022133) chst2 (ENSXETG00000022131) ENSXETG00000048586 ENSXETG00000044419 slc9a9 (ENSXETG00000001625) ENSXETG00000049327 dipk2a (ENSXETG00000001626) plod2 (ENSXETG00000001628) ENSXETG00000045404 plscr1 (ENSXETG00000015514) plscr2 (ENSXETG00000001630) plscr5 (ENSXETG00000034906) zic4 (ENSXETG00000015475) zic1 (ENSXETG00000015467) agtr1 (ENSXETG00000034925) ##22 cpb1 (ENSXETG00000016077) ENSXETG00000033023 cpa3 (ENSXETG00000016076) ENSXETG00000048131 gyg1 (ENSXETG00000016072) hltf (ENSXETG00000029917) hps3 (ENSXETG00000016060) cp 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MODERN SPECIES 1814 AGTR1 (ENSLACG00000006082) ##22 CPB1 (ENSLACG00000006288) GYG1 (ENSLACG00000007155) HLTF (ENSLACG00000007872) ENSLACG00000022462 HPS3 (ENSLACG00000009184) CP (ENSLACG00000009522) Elephant shark MODERN SPECIES 1580 GPR171 (ENSCMIG00000010842) MED12L (ENSCMIG00000010782) clrn1 (ENSCMIG00000010765) MINDY4B (ENSCMIG00000010760) ENSCMIG00000010757 selenot1a (ENSCMIG00000010756) eif2a (ENSCMIG00000010744) SERP1 (ENSCMIG00000010739) ENSCMIG00000010737 ENSCMIG00000010736 pfn2a (ENSCMIG00000010733) rnf13 (ENSCMIG00000010730) #25 ENSCMIG00000010727 #25 ENSCMIG00000010723 #25 ANKUB1 (ENSCMIG00000010717) AGTR1 (ENSCMIG00000010710) ##22 cpb1 (ENSCMIG00000010697) ENSCMIG00000010685 HLTF (ENSCMIG00000010663) ENSCMIG00000010652 hps3 (ENSCMIG00000010651) cp (ENSCMIG00000010615) ENSCMIG00000010571 tm4sf4 (ENSCMIG00000010566) wwtr1 (ENSCMIG00000010561) commd2 (ENSCMIG00000010557) ENSCMIG00000010545 NMUR1 (ENSCMIG00000010531) EPHB3 (ENSCMIG00000010455) ENSCMIG00000010432 ENSCMIG00000010427 Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES ENSGT01050000244888.b.a.d ##22 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES ENSGT01050000244888.b.a.d ##22 Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT01050000244888.b.a.d ##22 Neopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT01050000244888.b.a.d ##22 Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES ENSGT01050000244888.b.a.d ##22 Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES ENSGT01050000244888.b.a.d ##22 Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT01050000244888.b.a.d ##22 Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES ENSGT01050000244888.b.a.d ##22 Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT01050000244888.b.a.d ##22 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01050000244888.b.a.d ##22 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT01050000244888.b.a.d ##22 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT01050000244888.b.a.d ##22 Eupercaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT01050000244888.b.a.d ##22 Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01050000244888.b.a.d ##22 Fugu MODERN SPECIES 20 capn1 (ENSTRUG00000008157) pnp5a (ENSTRUG00000008618) 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ENSGT00940000153576.c.a ENSGT00940000158505 ENSGT00940000157622 ENSGT00440000039859 ENSGT01020000230351.B ENSGT00940000157117 ENSGT00940000171312 ENSGT00940000154184.B ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 ENSGT00940000161412 ENSGT01100000263572.b ENSGT01100000263498.a.b.b.b ENSGT01100000263572.a.a.a.a.b ENSGT01100000263503.D ENSGT01100000263503.C ENSGT01100000263572.a.a.b.a.a ENSGT01100000263498.a.b.a.a.a.a ENSGT01100000263498.a.b.a.a.a.b ENSGT01100000263496.C.a.b Cryptodira ANCESTRAL SPECIES 57 ENSGT00940000153668.B ENSGT00940000161443.b ENSGT00940000161443.a ENSGT00940000159681 ENSGT00940000165322 ENSGT00940000154495.b.b ENSGT00390000003068 ENSGT00940000153576.c.a ENSGT00940000158505 ENSGT00940000157622 ENSGT00440000039859.g ENSGT01020000230351.B ENSGT00940000157117 ENSGT00940000171312 ENSGT01030000234639.A.b.c.a.a.a.b ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 ENSGT00940000161412 ENSGT01100000263572.b ENSGT01100000263498.a.b.b.b ENSGT01100000263572.a.a.a.a.b ENSGT01100000263503.C 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MODERN SPECIES 953 APLNR (ENSAPLG00000022393) ##22 Phasianidae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000001774 ENSGT00940000156001 ENSGT00940000153668.B ENSGT00940000161443 ENSGT00940000159681 ENSGT00940000165322 ENSGT00940000154495.b.b ENSGT00390000003068 ENSGT00940000158505 ENSGT00940000157622 ENSGT00440000039859 ENSGT01020000230351.B ENSGT00940000157117 ENSGT00940000171312 ENSGT00940000154184.B ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 ENSGT00940000161412 ENSGT00730000111073.j ENSGT00730000111073.i ENSGT00940000155073 ENSGT00940000159763 ENSGT00940000157816 ENSGT00390000009426 ENSGT00940000160601 ENSGT00940000158825 ENSGT00940000161128 ENSGT00940000157182 ENSGT00390000002105 ENSGT01050000244900.a.a.b ENSGT00940000158565 ENSGT01030000235608 Phasianidae_b ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000001774 ENSGT00940000156001 ENSGT00940000153668.B ENSGT00940000161443 ENSGT00940000159681 ENSGT00940000165322 ENSGT00940000154495.b.b ENSGT00390000003068 ENSGT00940000157112.c ENSGT00940000157622 ENSGT00440000039859 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(ENSPMJG00000006557) ENSPMJG00000006561 ENSPMJG00000006563 B4GALNT4 (ENSPMJG00000006564) PKP3 (ENSPMJG00000006569) SIGIRR (ENSPMJG00000006570) Passeriformes_d ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000163832 ENSGT00390000003751.a ENSGT00390000001774 ENSGT00940000156001 ENSGT00940000153668.B ENSGT00940000161443 ENSGT00940000159681 ENSGT00940000165322 ENSGT00390000003068 ENSGT00940000158505 ENSGT00940000157622 ENSGT00440000039859 ENSGT00940000171312 ENSGT00940000157117 ENSGT01020000230351.B ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 ENSGT00940000161412 ENSGT00730000111073.j ENSGT00730000111073.i ENSGT00390000001738 ENSGT00940000160208 ENSGT00390000014700.b.a.a ENSGT00940000159464 ENSGT00390000001802 ENSGT00960000189786 ENSGT00390000006297 ENSGT00950000182857.a.a.b.b ENSGT01010000222725 ENSGT00950000182857.a.a.b.a ENSGT01050000244857.A.a.b ENSGT00940000159515 Flycatcher MODERN SPECIES 24 CTNND1 (ENSFALG00000011034) TMX2 (ENSFALG00000011092) MED19 (ENSFALG00000011101) ZDHHC5 (ENSFALG00000011114) CLP1 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ENSGT00940000161412 ENSGT00730000111073.j ENSGT00730000111073.i ENSGT00390000001738 ENSGT00940000160208 ENSGT00390000014700.b.a.a ENSGT00940000159464 ENSGT00390000001802 ENSGT00960000189786 ENSGT00390000006297 ENSGT00950000182857.a.a.b.b ENSGT01010000222725 ENSGT00950000182857.a.a.b.a ENSGT01050000244857.A.a.b ENSGT00940000159515 Passeroidea ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000156045 ENSGT00940000163832 ENSGT00390000003751.a ENSGT00390000001774 ENSGT00940000156001 ENSGT00940000153668.B ENSGT00940000161443 ENSGT00940000159681 ENSGT00940000165322 ENSGT00390000003068 ENSGT00940000158505 ENSGT00940000157622 ENSGT00940000171312 ENSGT00940000157117 ENSGT01020000230351.B ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 ENSGT00940000161412 ENSGT00730000111073.j ENSGT00730000111073.i ENSGT00390000001738 ENSGT00940000160208 ENSGT00390000014700.b.a.a ENSGT00940000159464 ENSGT00390000001802 ENSGT00960000189786 ENSGT00390000006297 ENSGT00950000182857.a.a.b.b ENSGT01010000222725 ENSGT00950000182857.a.a.b.a ENSGT01050000244857.A.a.b ENSGT00940000159515 Zebra finch MODERN SPECIES 27 CTNND1 (ENSTGUG00000007067) ENSTGUG00000024436 TMX2 (ENSTGUG00000007042) MED19 (ENSTGUG00000007039) ZDHHC5 (ENSTGUG00000007007) CLP1 (ENSTGUG00000007002) YPEL4 (ENSTGUG00000023978) ENSTGUG00000019046 ENSTGUG00000006999 TIMM10 (ENSTGUG00000024064) RTN4RL2 (ENSTGUG00000019089) SLC43A3 (ENSTGUG00000016253) ENSTGUG00000029689 SSRP1 (ENSTGUG00000006961) P2RX3 (ENSTGUG00000027517) APLNR (ENSTGUG00000025156) ##22 LRRC55 (ENSTGUG00000026552) ENSTGUG00000006928 ENSTGUG00000006913 VPS51 (ENSTGUG00000006901) BET1L (ENSTGUG00000025632) SIRT3 (ENSTGUG00000006886) PSMD13 (ENSTGUG00000006851) ENSTGUG00000006849 PGGHG (ENSTGUG00000006825) IFITM5 (ENSTGUG00000006845) ENSTGUG00000023359 ENSTGUG00000029566 B4GALNT4 (ENSTGUG00000006890) PKP3 (ENSTGUG00000006785) SIGIRR (ENSTGUG00000006773) Common canary MODERN SPECIES 3 SLC43A3 (ENSSCAG00000008545) ENSSCAG00000008540 SSRP1 (ENSSCAG00000008533) P2RX3 (ENSSCAG00000008526) APLNR (ENSSCAG00000008524) ##22 ENSSCAG00000008519 ENSSCAG00000008510 VPS51 (ENSSCAG00000008482) ENSSCAG00000008476 RIC8A (ENSSCAG00000008472) SIRT3 (ENSSCAG00000008469) PSMD13 (ENSSCAG00000008464) ENSSCAG00000008458 PGGHG (ENSSCAG00000008452) ENSSCAG00000008449 ENSSCAG00000008446 ENSSCAG00000008439 B4GALNT4 (ENSSCAG00000008433) PKP3 (ENSSCAG00000008424) SIGIRR (ENSSCAG00000008414) Neognathae_c ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000156045 ENSGT00940000163832 ENSGT00390000003751.a ENSGT00390000001774 ENSGT00940000156001 ENSGT00940000153668.B ENSGT00940000161443 ENSGT00940000159681 ENSGT00940000165322 ENSGT00940000158505 ENSGT00940000157622 ENSGT00440000039859 ENSGT01020000230351.B ENSGT00940000157117 ENSGT00940000171312 ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 ENSGT00940000161412 ENSGT00940000159520.h.q.a ENSGT00730000111073.j ENSGT00730000111073.i ENSGT00390000001738 ENSGT00940000160208 ENSGT00390000014700.b.a.a ENSGT00940000159464 ENSGT00390000001802 ENSGT00960000187780 ENSGT00390000006297 ENSGT00950000182857.a.a.b.b ENSGT01010000222725 ENSGT00950000182857.a.a.b.a ENSGT01050000244857.A.a.b Golden eagle DUPLICATION Golden eagle MODERN SPECIES 7 MPEG1 (ENSACCG00020010513) DTX4 (ENSACCG00020010501) CNTF (ENSACCG00020010486) ZFP91 (ENSACCG00020010472) LPXN (ENSACCG00020010460) CTNND1 (ENSACCG00020010447) ENSACCG00020010419 TMX2 (ENSACCG00020010408) MED19 (ENSACCG00020010395) ZDHHC5 (ENSACCG00020010381) CLP1 (ENSACCG00020010365) YPEL4 (ENSACCG00020010358) ENSACCG00020010346 ##22 LRRC55 (ENSACCG00020010337) ENSACCG00020010329 ENSACCG00020010321 ENSACCG00020010315 ENSACCG00020010296 ENSACCG00020010277 VPS51 (ENSACCG00020010253) ENSACCG00020010240 RIC8A (ENSACCG00020010227) SIRT3 (ENSACCG00020010213) PSMD13 (ENSACCG00020010195) PGGHG (ENSACCG00020010175) IFITM5 (ENSACCG00020010147) ENSACCG00020010144 ENSACCG00020010137 Golden eagle MODERN SPECIES 82 SLC43A3 (ENSACCG00020016160) ENSACCG00020016170 P2RX3 (ENSACCG00020016182) SSRP1 (ENSACCG00020016195) ENSACCG00020016220 ENSACCG00020016230 ##22 Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES 53 ENSGT00940000156001 ENSGT00940000153668.B ENSGT00940000161443 ENSGT00940000159681 ENSGT00940000165322 ENSGT00940000154495.b.b ENSGT00940000162276 ENSGT00390000003068 ENSGT00940000153576.c.a ENSGT00940000158505 ENSGT00940000157622 ENSGT01020000230351.B ENSGT00940000157117 ENSGT00940000171312 ENSGT00940000154184.B ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 ENSGT00940000161412 ENSGT01100000263572.b ENSGT01100000263503.A ENSGT01100000263498.a.b.b.b ENSGT01100000263572.a.a.a.a.b.k ENSGT00940000154333 ENSGT01100000263572.a.a.a.a.b.l ENSGT01100000263572.a.a.b.a.a ENSGT01100000263503.E ENSGT00950000182718.A ENSGT01100000263499.a.a ENSGT01100000263572.a.b.b ENSGT01100000263498.a.b.a.a.a.a ENSGT01100000263503.C ENSGT01100000263496.C.a.a Episquamata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000156001 ENSGT00940000153668.B ENSGT00940000161443 ENSGT00940000159681 ENSGT00940000165322 ENSGT00940000154495.b.b ENSGT00940000162276 ENSGT00390000003068 ENSGT00940000153576.c.a ENSGT00960000189416 ENSGT00940000158505 ENSGT00940000157622 ENSGT01020000230351.B ENSGT00940000157117 ENSGT00940000154184.B ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 ENSGT00940000161412 ENSGT01100000263572.b ENSGT00940000163951.c.a ENSGT00940000163951.c.b ENSGT01030000234639.A.b.c.h ENSGT00940000155484 ENSGT00940000161626 ENSGT00950000182928.A.a.b ENSGT00940000160322 ENSGT00940000158691.j ENSGT00390000005096 ENSGT00950000183133.f.g.a.a ENSGT00950000183133.f.g.a.b ENSGT00510000048856.C ENSGT00390000005767.a Laterata ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000001774 ENSGT00940000156001 ENSGT00940000153668.B ENSGT00940000161443 ENSGT00940000159681 ENSGT00940000165322 ENSGT00940000162276 ENSGT00390000003068 ENSGT00940000153576.c.a ENSGT00960000189416 ENSGT00940000158505 ENSGT00940000157622 ENSGT01020000230351.B ENSGT00940000157117 ENSGT00940000154184.B ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 ENSGT00940000161412 ENSGT01100000263572.b ENSGT01100000263503.A ENSGT01100000263498.a.b.b.b.d ENSGT01100000263572.a.a.a.a.b.k ENSGT00940000154333 ENSGT01100000263572.a.a.a.a.b.l ENSGT01100000263503.E.b.b ENSGT01100000263503.E.a ENSGT00950000182718.A ENSGT01100000263499.a.a.a ENSGT01100000263499.a.a.b ENSGT01100000263503.C ENSGT01100000263572.a.a.b.a.a ENSGT01100000263496.C.a.a Common wall lizard MODERN SPECIES CLP1 (ENSPMRG00000001338) YPEL4 (ENSPMRG00000001349) SERPING1 (ENSPMRG00000001368) ENSPMRG00000001395 ENSPMRG00000001402 TIMM10 (ENSPMRG00000001417) SLC43A1 (ENSPMRG00000001429) ENSPMRG00000001514 ENSPMRG00000001608 RTN4RL2 (ENSPMRG00000001617) SLC43A3 (ENSPMRG00000001630) P2RX3 (ENSPMRG00000001656) ENSPMRG00000001668 SSRP1 (ENSPMRG00000001699) TNKS1BP1 (ENSPMRG00000001827) APLNR (ENSPMRG00000001837) ##22 LRRC55 (ENSPMRG00000001843) ENSPMRG00000001848 ENSPMRG00000001858 ENSPMRG00000001865 ENSPMRG00000001870 ENSPMRG00000001876 ENSPMRG00000001883 ENSPMRG00000001886 ENSPMRG00000001892 ENSPMRG00000001901 ENSPMRG00000001914 OR5AR1 (ENSPMRG00000001919) ENSPMRG00000001925 ENSPMRG00000001936 ENSPMRG00000001943 Argentine black and white tegu MODERN SPECIES 40 ZDHHC5 (ENSSMRG00000000956) CLP1 (ENSSMRG00000000948) YPEL4 (ENSSMRG00000000937) SERPING1 (ENSSMRG00000000881) ENSSMRG00000000868 ENSSMRG00000000861 TIMM10 (ENSSMRG00000000859) SLC43A1 (ENSSMRG00000000848) ENSSMRG00000000371 ENSSMRG00000000339 RTN4RL2 (ENSSMRG00000000329) SLC43A3 (ENSSMRG00000000157) P2RX3 (ENSSMRG00000000024) SSRP1 (ENSSMRG00000013632) TNKS1BP1 (ENSSMRG00000013631) APLNR (ENSSMRG00000013629) ##22 LRRC55 (ENSSMRG00000013628) ENSSMRG00000013604 ENSSMRG00000013603 ENSSMRG00000013602 ENSSMRG00000013601 ENSSMRG00000013600 ENSSMRG00000013599 ENSSMRG00000013598 ENSSMRG00000013597 ENSSMRG00000013596 ENSSMRG00000013595 ENSSMRG00000013594 ENSSMRG00000013592 ENSSMRG00000013591 OR9G1 (ENSSMRG00000013590) Toxicofera ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000001774 ENSGT00940000156001 ENSGT00940000153668.B ENSGT00940000161443 ENSGT00940000159681 ENSGT00940000165322 ENSGT00940000162276 ENSGT00390000003068 ENSGT00940000153576.c.a ENSGT00960000189416 ENSGT00940000158505 ENSGT00940000157622 ENSGT01020000230351.B ENSGT00940000157117 ENSGT00940000154184.B ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 ENSGT00940000161412 ENSGT01100000263503.A ENSGT01100000263572.b ENSGT01100000263498.a.b.b.b ENSGT01100000263572.a.a.a.a.b.k ENSGT00940000154333 ENSGT01100000263572.a.a.a.a.b.l ENSGT00950000182718.A ENSGT01100000263499.a.a.a ENSGT01100000263499.a.a.b ENSGT01100000263572.a.b.b ENSGT01100000263503.D ENSGT01100000263503.C ENSGT01100000263572.a.a.b.a.a Lizard DUPLICATION Lizard MODERN SPECIES 330 ENSACAG00000009901 ##22 Lizard MODERN SPECIES ZDHHC5 (ENSACAG00000007070) CLP1 (ENSACAG00000007139) YPEL4 (ENSACAG00000007151) SERPING1 (ENSACAG00000007154) ENSACAG00000007191 ENSACAG00000007205 TIMM10 (ENSACAG00000007211) SLC43A1 (ENSACAG00000007213) ENSACAG00000042368 ENSACAG00000042917 RTN4RL2 (ENSACAG00000007277) SLC43A3 (ENSACAG00000007301) P2RX3 (ENSACAG00000007329) SSRP1 (ENSACAG00000007488) TNKS1BP1 (ENSACAG00000007585) ENSACAG00000007589 ##22 LRRC55 (ENSACAG00000007590) OR5AR1 (ENSACAG00000007600) OR9G1 (ENSACAG00000038812) ENSACAG00000035047 ENSACAG00000026836 ENSACAG00000022740 ENSACAG00000023190 ENSACAG00000037950 ENSACAG00000027878 ENSACAG00000007614 ENSACAG00000037530 ENSACAG00000023376 ENSACAG00000041016 ENSACAG00000037461 ENSACAG00000020941 Elapidae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000161443 ENSGT00940000159681 ENSGT00940000165322 ENSGT00940000154495.b.b ENSGT00940000162276 ENSGT00390000003068 ENSGT00940000153576.c.a ENSGT00960000189416.a.b ENSGT00960000189416.a.a.a ENSGT00940000158505 ENSGT00940000157622 ENSGT01020000230351.B ENSGT00940000157117 ENSGT00940000171312 ENSGT00940000154184.B ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 ENSGT00940000161412 ENSGT01100000263503.A ENSGT01100000263572.b.j ENSGT01100000263498.a.b.b.b.a.b ENSGT01100000263498.a.b.b.b.a.a.a.a ENSGT01100000263498.a.b.b.b.a.a.b ENSGT01100000263498.a.b.b.b.b ENSGT00940000154333 ENSGT01100000263572.a.a.a.a.b.l ENSGT00950000182718.A ENSGT01100000263499.a.a.a.c ENSGT01100000263499.a.a.a.d ENSGT01100000263499.a.a.b ENSGT01100000263572.a.b.b Indian cobra MODERN SPECIES SERPING1 (ENSNNAG00000001036) ENSNNAG00000000998 ENSNNAG00000000982 TIMM10 (ENSNNAG00000000965) SLC43A1 (ENSNNAG00000000944) ENSNNAG00000000787 ENSNNAG00000000732 ENSNNAG00000000725 ENSNNAG00000000721 ENSNNAG00000000713 RTN4RL2 (ENSNNAG00000000701) SLC43A3 (ENSNNAG00000000680) P2RX3 (ENSNNAG00000000657) SSRP1 (ENSNNAG00000000617) ENSNNAG00000000597 APLNR (ENSNNAG00000000586) ##22 LRRC55 (ENSNNAG00000000578) ENSNNAG00000000565 ENSNNAG00000000543 ENSNNAG00000000534 ENSNNAG00000000520 ENSNNAG00000000508 ENSNNAG00000000499 ENSNNAG00000000492 OR9G1 (ENSNNAG00000000481) OR5AR1 (ENSNNAG00000000475) ENSNNAG00000000386 ENSNNAG00000000310 ENSNNAG00000000303 ENSNNAG00000015971 ENSNNAG00000015959 Elapidae_a ANCESTRAL SPECIES 65 ENSGT00940000161443 ENSGT00940000159681 ENSGT00940000165322 ENSGT00940000154495.b.b ENSGT00940000162276 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ENSGT00960000189416.a.a.a ENSGT00940000158505 ENSGT00940000157622 ENSGT01020000230351.B ENSGT00940000157117 ENSGT00940000171312 ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 ENSGT00940000161412 ENSGT01100000263503.A ENSGT01100000263572.b.j ENSGT01100000263498.a.b.b.b.a.b ENSGT01100000263498.a.b.b.b.a.a.a.a ENSGT01100000263498.a.b.b.b.a.a.b ENSGT01100000263494.a.b.b.b.h ENSGT01100000263572.a.a.a.a.b.l ENSGT00950000182718.A ENSGT01100000263499.a.a.a.c ENSGT01100000263499.a.a.a.d ENSGT01100000263499.a.a.b ENSGT01100000263572.a.b.b ENSGT01100000263572.b.i.a ENSGT01100000263503.C Mainland tiger snake MODERN SPECIES 204 ZDHHC5 (ENSNSUG00000016978) CLP1 (ENSNSUG00000017008) YPEL4 (ENSNSUG00000017010) SERPING1 (ENSNSUG00000017012) ENSNSUG00000017013 ENSNSUG00000017014 ENSNSUG00000017015 ENSNSUG00000017016 ENSNSUG00000017018 ENSNSUG00000017019 RTN4RL2 (ENSNSUG00000017020) SLC43A3 (ENSNSUG00000017021) P2RX3 (ENSNSUG00000017022) SSRP1 (ENSNSUG00000017023) ENSNSUG00000017024 APLNR (ENSNSUG00000017025) ##22 LRRC55 (ENSNSUG00000017026) ENSNSUG00000017027 ENSNSUG00000017028 ENSNSUG00000017029 ENSNSUG00000017030 ENSNSUG00000017031 Eastern brown snake MODERN SPECIES 126 ZDHHC5 (ENSPTXG00000009523) CLP1 (ENSPTXG00000009521) YPEL4 (ENSPTXG00000009520) SERPING1 (ENSPTXG00000009519) ENSPTXG00000009518 ENSPTXG00000009515 TIMM10 (ENSPTXG00000011195) SLC43A1 (ENSPTXG00000011194) ENSPTXG00000011115 ENSPTXG00000011114 RTN4RL2 (ENSPTXG00000011113) SLC43A3 (ENSPTXG00000011112) P2RX3 (ENSPTXG00000011111) SSRP1 (ENSPTXG00000011110) ENSPTXG00000011109 APLNR (ENSPTXG00000011108) ##22 LRRC55 (ENSPTXG00000011107) ENSPTXG00000011106 ENSPTXG00000011105 ENSPTXG00000011104 ENSPTXG00000011103 ENSPTXG00000011102 ENSPTXG00000011101 OR5AR1 (ENSPTXG00000011099) ENSPTXG00000011098 ENSPTXG00000011097 ENSPTXG00000011096 OR5F1 (ENSPTXG00000011095) ENSPTXG00000011093 ENSPTXG00000011092 ENSPTXG00000011091 Mammalia ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000001774 ENSGT00940000156001 ENSGT00940000153668.B ENSGT00940000161443 ENSGT00940000159681 ENSGT00940000161981 ENSGT00940000162276 ENSGT00390000003068 ENSGT00940000153576.c.a ENSGT00940000158505 ENSGT00940000157622 ENSGT00440000039859 ENSGT01020000230351.B ENSGT00940000157117 ENSGT00940000154184.B ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 ENSGT00940000161412 ENSGT01100000263503.A ENSGT01100000263498.a.b.b ENSGT00940000163951 ENSGT00940000156870 ENSGT00390000000972 ENSGT00390000003450 ENSGT00940000160201 ENSGT00390000000020.b ENSGT00940000161832.a ENSGT00940000154479.a ENSGT00390000017480 ENSGT00940000158775 ENSGT00390000014065 ENSGT00940000158970 Theria ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000001774 ENSGT00940000156001 ENSGT00940000153668.B ENSGT00940000161443 ENSGT00940000159681 ENSGT00940000161981 ENSGT00940000162276 ENSGT00390000003068 ENSGT00940000153576.c.a ENSGT00940000158505 ENSGT00940000157622 ENSGT00440000039859 ENSGT01020000230351.B ENSGT00940000157117 ENSGT00940000154184.B ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 ENSGT00940000161412 ENSGT01100000263498.a.b.b ENSGT00950000182990.a.a.a.a ENSGT01100000263503.A.a ENSGT01100000263503.A.b ENSGT00940000154333.b.a ENSGT01090000260044.A.a.a ENSGT01100000263494.a.b.b.b ENSGT00940000154333.b.b ENSGT01100000263572.a.a.a.a.b ENSGT01100000263494.a.a.b ENSGT01100000263503.E.c.a.b ENSGT01100000263503.E.c.a.a.a ENSGT01100000263503.E.c.b ENSGT01100000263503.E.d.b Marsupialia ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000161443 ENSGT00940000159681 ENSGT00940000154420.C.i.q.b ENSGT00940000161981 ENSGT00940000162276 ENSGT00390000003068 ENSGT00940000153576.c.a ENSGT00940000158505 ENSGT00940000157622 ENSGT00440000039859.f ENSGT00440000039859.e.a ENSGT00440000039859.e.b ENSGT01020000230351.B ENSGT00940000157117 ENSGT00940000154184.B ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 ENSGT00940000161412 ENSGT01100000263498.a.b.b.d.b ENSGT01100000263498.a.b.b.c.a ENSGT00950000182990.a.a.a.a ENSGT01100000263503.A.a ENSGT01100000263503.A.b.d.b ENSGT01100000263498.a.b.b.c.b ENSGT00940000154333.b.b.c ENSGT01100000263494.a.b.b.b.a ENSGT00940000154333.b.b.d ENSGT01100000263494.a.b.b.b.b ENSGT01090000260044.A.a.a.h ENSGT01100000263572.a.a.a.a.b ENSGT01100000263494.a.a.b.a.a ENSGT01100000263494.a.a.b.b Opossum MODERN SPECIES 4 ENSMODG00000020107 YPEL4 (ENSMODG00000020105) ENSMODG00000020104 ENSMODG00000042932 ENSMODG00000040168 ENSMODG00000020103 TIMM10 (ENSMODG00000020102) SLC43A1 (ENSMODG00000020101) SLC43A3 (ENSMODG00000020100) ENSMODG00000025543 ENSMODG00000020096 ENSMODG00000025542 P2RX3 (ENSMODG00000020094) SSRP1 (ENSMODG00000020088) ENSMODG00000020085 APLNR (ENSMODG00000020083) ##22 LRRC55 (ENSMODG00000020081) ENSMODG00000020080 ENSMODG00000020073 ENSMODG00000024286 ENSMODG00000020077 ENSMODG00000020074 ENSMODG00000041508 ENSMODG00000050518 ENSMODG00000046988 ENSMODG00000024292 ENSMODG00000037737 ENSMODG00000020068 ENSMODG00000020067 ENSMODG00000020066 ENSMODG00000020065 Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000161443 ENSGT00940000159681 ENSGT00940000154420.C.i.q.b ENSGT00940000161981 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(ENSPCIG00000027209) APLNR (ENSPCIG00000008143) ##22 LRRC55 (ENSPCIG00000035266) ENSPCIG00000031978 ENSPCIG00000006906 ENSPCIG00000024825 ENSPCIG00000014564 ENSPCIG00000006909 ENSPCIG00000033304 ENSPCIG00000006898 ENSPCIG00000006899 ENSPCIG00000006897 ENSPCIG00000035329 ENSPCIG00000006896 ENSPCIG00000006894 OR5AP2 (ENSPCIG00000006887) ENSPCIG00000008590 Common wonbat MODERN SPECIES 919 YPEL4 (ENSVURG00010005935) SERPING1 (ENSVURG00010005914) ENSVURG00010005912 UBE2L6 (ENSVURG00010005896) ENSVURG00010005885 TIMM10 (ENSVURG00010005877) SLC43A1 (ENSVURG00010005853) RTN4RL2 (ENSVURG00010005841) SLC43A3 (ENSVURG00010005822) ENSVURG00010005798 ENSVURG00010005786 ENSVURG00010005767 P2RX3 (ENSVURG00010005750) SSRP1 (ENSVURG00010005734) ENSVURG00010005707 APLNR (ENSVURG00010005694) ##22 LRRC55 (ENSVURG00010005686) ENSVURG00010005682 Tasmanian devil MODERN SPECIES 5 TMX2 (ENSSHAG00000015811) MED19 (ENSSHAG00000015779) ZDHHC5 (ENSSHAG00000015739) YPEL4 (ENSSHAG00000027981) ENSSHAG00000031016 UBE2L6 (ENSSHAG00000031901) SMTNL1 (ENSSHAG00000015405) TIMM10 (ENSSHAG00000031044) SLC43A1 (ENSSHAG00000015227) RTN4RL2 (ENSSHAG00000015163) ENSSHAG00000029459 ENSSHAG00000014702 P2RX3 (ENSSHAG00000014527) SSRP1 (ENSSHAG00000014448) ENSSHAG00000014355 APLNR (ENSSHAG00000024286) ##22 LRRC55 (ENSSHAG00000026612) ENSSHAG00000026520 ENSSHAG00000022930 ENSSHAG00000022222 ENSSHAG00000031298 ENSSHAG00000031201 ENSSHAG00000024782 ENSSHAG00000027402 ENSSHAG00000032084 ENSSHAG00000012131 ENSSHAG00000022302 ENSSHAG00000024491 ENSSHAG00000027122 ENSSHAG00000021018 ENSSHAG00000029184 Eutheria ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000156001 ENSGT00940000153668.B ENSGT00940000161443 ENSGT00940000159681 ENSGT00940000161981 ENSGT00940000162276 ENSGT00390000003068 ENSGT00940000153576.c.a ENSGT00940000158505 ENSGT00940000157622 ENSGT00440000039859.d ENSGT00440000039859.c ENSGT01020000230351.B ENSGT00940000157117 ENSGT00940000154184.B ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 ENSGT00940000161412 ENSGT01100000263498.a.b.b.f ENSGT01100000263498.a.b.b.e ENSGT00950000182990.a.a.a.a ENSGT01100000263503.A.a.b ENSGT01100000263503.A.a.a ENSGT01100000263503.A.b.b ENSGT01100000263503.A.b.a ENSGT00940000154333.b.a ENSGT01100000263494.a.b.b.b.c.b ENSGT00940000154333.b.b.b ENSGT01090000260044.A.a.a ENSGT01100000263494.a.b.b.b.c.a ENSGT00940000154333.b.b.a ENSGT01100000263572.a.a.a.a.b Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 72 ENSGT00940000156001 ENSGT00940000153668.B ENSGT00940000161443 ENSGT00940000159681 ENSGT00940000161981 ENSGT00940000162276 ENSGT00390000003068 ENSGT00940000153576.c.a ENSGT00940000158505 ENSGT00940000157622 ENSGT00440000039859.d ENSGT00440000039859.c ENSGT01020000230351.B ENSGT00940000157117 ENSGT00940000154184.B ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 ENSGT00940000161412 ENSGT01100000263498.a.b.b.f ENSGT01100000263498.a.b.b.e ENSGT00950000182990.a.a.a.a ENSGT01100000263503.A.a.b ENSGT01100000263503.A.a.a ENSGT01100000263503.A.b.b ENSGT01100000263503.A.b.a ENSGT01100000263494.a.b.b.b.c.b ENSGT00940000154333.b.b.b ENSGT01090000260044.A.a.a ENSGT00940000154333.b.a ENSGT01100000263494.a.b.b.b.c.a ENSGT00940000154333.b.b.a ENSGT01100000263572.a.a.a.a.b Xenarthra ANCESTRAL SPECIES 43 ENSGT00940000156001 ENSGT00940000153668.B ENSGT00940000161443 ENSGT00940000159681 ENSGT00940000161981 ENSGT00940000162276 ENSGT00390000003068 ENSGT00940000153576.c.a ENSGT00940000158505 ENSGT00940000157622 ENSGT00440000039859.d ENSGT00440000039859.c ENSGT01020000230351.B ENSGT00940000157117 ENSGT00940000154184.B ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 ENSGT00940000161412 ENSGT01100000263498.a.b.b.f ENSGT01100000263498.a.b.b.e ENSGT00950000182990.a.a.a.a ENSGT01100000263494.a.b.b.b.c.b ENSGT00940000154333.b.b.b Armadillo MODERN SPECIES 2799 ZDHHC5 (ENSDNOG00000048325) CLP1 (ENSDNOG00000042415) YPEL4 (ENSDNOG00000032698) SERPING1 (ENSDNOG00000009061) UBE2L6 (ENSDNOG00000036700) SMTNL1 (ENSDNOG00000045573) TIMM10 (ENSDNOG00000034455) SLC43A1 (ENSDNOG00000007395) RTN4RL2 (ENSDNOG00000031133) SLC43A3 (ENSDNOG00000017282) PRG2 (ENSDNOG00000001894) PRG3 (ENSDNOG00000038092) P2RX3 (ENSDNOG00000003606) SSRP1 (ENSDNOG00000003595) TNKS1BP1 (ENSDNOG00000034658) APLNR (ENSDNOG00000006063) ##22 LRRC55 (ENSDNOG00000001445) ENSDNOG00000035354 ENSDNOG00000046591 ENSDNOG00000042482 ENSDNOG00000040319 ENSDNOG00000044428 ENSDNOG00000036656 ENSDNOG00000047911 ENSDNOG00000039214 ENSDNOG00000019188 ENSDNOG00000032903 OR9G4 (ENSDNOG00000039408) ENSDNOG00000048182 ENSDNOG00000048377 ENSDNOG00000030921 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 131 ENSGT00390000001774 ENSGT00940000156001 ENSGT00940000153668.B ENSGT00940000161443 ENSGT00940000159681 ENSGT00940000161981 ENSGT00940000162276 ENSGT00390000003068 ENSGT00940000153576.c.a ENSGT00940000158505 ENSGT00940000157622 ENSGT00440000039859.c ENSGT01020000230351.B ENSGT00940000157117 ENSGT00940000154184.B ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 ENSGT00940000161412 Tenrec MODERN SPECIES 14414 APLNR (ENSETEG00000016925) ##22 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 134 ENSGT00390000001774 ENSGT00940000156001 ENSGT00940000153668.B ENSGT00940000161443 ENSGT00940000159681 ENSGT00940000161981 ENSGT00940000162276 ENSGT00390000003068 ENSGT00940000153576.c.a ENSGT00940000158505 ENSGT00940000157622 ENSGT00440000039859.c ENSGT01020000230351.B ENSGT00940000157117 ENSGT00940000154184.B ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 ENSGT00940000161412 Elephant MODERN SPECIES 38 TMX2 (ENSLAFG00000020712) MED19 (ENSLAFG00000014917) ZDHHC5 (ENSLAFG00000014912) CLP1 (ENSLAFG00000014907) YPEL4 (ENSLAFG00000013734) SERPING1 (ENSLAFG00000001662) UBE2L6 (ENSLAFG00000012121) SMTNL1 (ENSLAFG00000020495) TIMM10 (ENSLAFG00000027886) SLC43A1 (ENSLAFG00000012117) SLC43A3 (ENSLAFG00000004064) PRG3 (ENSLAFG00000004061) P2RX3 (ENSLAFG00000004060) SSRP1 (ENSLAFG00000004058) TNKS1BP1 (ENSLAFG00000031330) APLNR (ENSLAFG00000008878) ##22 LRRC55 (ENSLAFG00000016731) ENSLAFG00000030611 ENSLAFG00000026756 ENSLAFG00000025879 ENSLAFG00000028111 ENSLAFG00000028779 ENSLAFG00000026455 ENSLAFG00000030618 ENSLAFG00000030565 ENSLAFG00000020733 ENSLAFG00000027010 ENSLAFG00000000041 ENSLAFG00000030395 ENSLAFG00000032736 ENSLAFG00000028386 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000156001 ENSGT00940000153668.B ENSGT00940000161443 ENSGT00940000159681 ENSGT00940000161981 ENSGT00940000162276 ENSGT00390000003068 ENSGT00940000153576.c.a ENSGT00940000158505 ENSGT00940000157622 ENSGT00440000039859.d ENSGT00440000039859.c ENSGT01020000230351.B ENSGT00940000157117 ENSGT00940000154184.B ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 ENSGT00940000161412 ENSGT01100000263498.a.b.b.f ENSGT01100000263498.a.b.b.e ENSGT00950000182990.a.a.a.a ENSGT01100000263503.A.a.b ENSGT01100000263503.A.a.a ENSGT01100000263503.A.b.b ENSGT01100000263503.A.b.a ENSGT00940000154333.b.a ENSGT01100000263494.a.b.b.b.c.b ENSGT00940000154333.b.b.a ENSGT01090000260044.A.a.a ENSGT01100000263572.a.a.a.a.b ENSGT01100000263494.a.a.b ENSGT01100000263503.E.c.a.b Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000156001 ENSGT00940000153668.B ENSGT00940000161443 ENSGT00940000159681 ENSGT00940000161981 ENSGT00940000162276 ENSGT00390000003068 ENSGT00940000153576.c.a ENSGT00940000158505 ENSGT00940000157622 ENSGT00440000039859.d ENSGT00440000039859.c ENSGT01020000230351.B ENSGT00940000157117 ENSGT00940000154184.B ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 ENSGT00940000161412 ENSGT01100000263498.a.b.b.f.o ENSGT01100000263498.a.b.b.f.p ENSGT01100000263498.a.b.b.e ENSGT00950000182990.a.a.a.a ENSGT01100000263503.A.a.b ENSGT01100000263503.A.a.a ENSGT01100000263503.A.b.b ENSGT01100000263503.A.b.a ENSGT00940000154333.b.a ENSGT01100000263494.a.b.b.b.c.b ENSGT00940000154333.b.b.b ENSGT01100000263494.a.b.b.b.c.a ENSGT00940000154333.b.b.a ENSGT01090000260044.A.a.a Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000156001 ENSGT00940000153668.B ENSGT00940000161443 ENSGT00940000159681 ENSGT00940000161981 ENSGT00940000162276 ENSGT00390000003068 ENSGT00940000153576.c.a ENSGT00940000158505 ENSGT00940000157622 ENSGT00440000039859.d ENSGT00440000039859.c ENSGT01020000230351.B ENSGT00940000157117 ENSGT00940000154184.B ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 ENSGT00940000161412 ENSGT01100000263498.a.b.b.f.o ENSGT01100000263498.a.b.b.e ENSGT00950000182990.a.a.a.a ENSGT01100000263503.A.a.b ENSGT01100000263503.A.a.a ENSGT01100000263503.A.b.b ENSGT01100000263503.A.b.a ENSGT00940000154333.b.a ENSGT01100000263494.a.b.b.b.c.b ENSGT00940000154333.b.b.b ENSGT00940000154333.b.b.a ENSGT01090000260044.A.a.a ENSGT01100000263572.a.a.a.a.b ENSGT01100000263494.a.a.b Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000156001 ENSGT00940000153668.B ENSGT00940000161443 ENSGT00940000159681 ENSGT00940000161981 ENSGT00940000162276 ENSGT00390000003068 ENSGT00940000153576.c.a ENSGT00940000158505 ENSGT00940000157622 ENSGT00440000039859.d ENSGT00440000039859.c ENSGT01020000230351.B ENSGT00940000157117 ENSGT00940000154184.B ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 ENSGT00940000161412 ENSGT01100000263498.a.b.b.e ENSGT00950000182990.a.a.a.a ENSGT01100000263503.A.a.b ENSGT01100000263503.A.b.a ENSGT01100000263494.a.b.b.b.c.b ENSGT00940000154333.b.b.a ENSGT01100000263572.a.a.a.a.b ENSGT01100000263494.a.a.b ENSGT01100000263503.E.c.a.b ENSGT01100000263503.E.c.b ENSGT01100000263503.E.d.b ENSGT01100000263503.E.d.a.a.a ENSGT01100000263503.E.d.a.a.b.a.a ENSGT01100000263503.E.d.a.a.b.a.b Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000156001 ENSGT00940000153668.B ENSGT00940000161443 ENSGT00940000159681 ENSGT00940000161981 ENSGT00940000162276 ENSGT00390000003068 ENSGT00940000153576.c.a ENSGT00940000158505 ENSGT00940000157622 ENSGT00440000039859.d ENSGT00440000039859.c ENSGT01020000230351.B ENSGT00940000157117 ENSGT00940000154184.B ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 ENSGT00940000161412 ENSGT01100000263498.a.b.b.e.i ENSGT00950000182990.a.a.a.a ENSGT01100000263503.A.a.b ENSGT01100000263498.a.b.b.e.j ENSGT01100000263503.A.b.a ENSGT01100000263494.a.b.b.b.c.b ENSGT00940000154333.b.b.a ENSGT01100000263572.a.a.a.a.b ENSGT01100000263494.a.a.b ENSGT01100000263503.E.c.a.a.b ENSGT01100000263503.E.c.a.b ENSGT01100000263503.E.c.b ENSGT01100000263503.E.d.b ENSGT01100000263503.E.d.a.a.a.b Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000156001 ENSGT00940000153668.B.a ENSGT00940000161443 ENSGT00940000159681 ENSGT00940000161981 ENSGT00940000162276 ENSGT00390000003068 ENSGT00940000153576.c.a ENSGT00940000158505 ENSGT00940000157622 ENSGT00440000039859.d ENSGT00440000039859.c ENSGT01020000230351.B ENSGT00940000157117 ENSGT00940000154184.B ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 ENSGT00940000161412 ENSGT01100000263498.a.b.b.e.i ENSGT00940000154333.b.b.a ENSGT01100000263572.a.a.a.a.b ENSGT01100000263503.E.c.a.b ENSGT01100000263503.E.c.b ENSGT01100000263503.E.d.a.a.a.b ENSGT01100000263503.E.d.a.a.b.a.a ENSGT01100000263503.E.d.a.a.b.a.b ENSGT01100000263503.E.d.a.a.b.b ENSGT00950000182718.A.a.a.b.b ENSGT00950000182718.A.a.b.b.b.b ENSGT00950000182718.A.a.b.a.b ENSGT00950000182718.A.a.b.a.a.c.a.b.g ENSGT01100000263503.B.c.j Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000156001 ENSGT00940000153668.B.a ENSGT00940000161443 ENSGT00940000159681 ENSGT00940000161981 ENSGT00940000162276 ENSGT00390000003068 ENSGT00940000153576.c.a ENSGT00940000158505 ENSGT00940000157622 ENSGT00440000039859.d ENSGT00440000039859.c ENSGT01020000230351.B ENSGT00940000157117 ENSGT00940000154184.B ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 ENSGT00940000161412 ENSGT01100000263498.a.b.b.e.i ENSGT00940000154333.b.b.a ENSGT01100000263572.a.a.a.a.b ENSGT01100000263503.E.c.a.b ENSGT01100000263503.E.c.b ENSGT01100000263503.E.d.a.a.a.b ENSGT01100000263503.E.d.a.a.b.a.a ENSGT01100000263503.E.d.a.a.b.b ENSGT00950000182718.A.a.a.b.b ENSGT00950000182718.A.a.b.b.b.b ENSGT00950000182718.A.a.b.a.b ENSGT00950000182718.A.a.b.a.a.c.a.b.g ENSGT01100000263503.B.c.j ENSGT00940000153301.a.b Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000156001 ENSGT00940000153668.B.a ENSGT00940000161443 ENSGT00940000159681 ENSGT00940000161981 ENSGT00940000162276 ENSGT00390000003068 ENSGT00940000153576.c.a ENSGT00940000158505 ENSGT00940000157622 ENSGT00440000039859.d ENSGT00440000039859.c ENSGT01020000230351.B ENSGT00940000157117 ENSGT00940000154184.B ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 ENSGT00940000161412 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 42 ZDHHC5 (ENSSBOG00000031798) ENSSBOG00000032517 YPEL4 (ENSSBOG00000027197) SERPING1 (ENSSBOG00000021710) UBE2L6 (ENSSBOG00000021889) SMTNL1 (ENSSBOG00000023278) TIMM10 (ENSSBOG00000026077) SLC43A1 (ENSSBOG00000001567) ENSSBOG00000031706 SLC43A3 (ENSSBOG00000029377) PRG2 (ENSSBOG00000005769) PRG3 (ENSSBOG00000000056) P2RX3 (ENSSBOG00000031619) SSRP1 (ENSSBOG00000033077) TNKS1BP1 (ENSSBOG00000021776) APLNR (ENSSBOG00000032955) ##22 LRRC55 (ENSSBOG00000000761) OR5AP2 (ENSSBOG00000035528) OR5M3 (ENSSBOG00000027095) OR8U1 (ENSSBOG00000031043) ENSSBOG00000023881 ENSSBOG00000032894 ENSSBOG00000027704 OR8K3 (ENSSBOG00000018853) ENSSBOG00000032962 ENSSBOG00000033210 OR5D16 (ENSSBOG00000018520) ENSSBOG00000023336 OR4S2 (ENSSBOG00000019085) ENSSBOG00000032803 OR4C5 (ENSSBOG00000030577) Capuchin MODERN SPECIES 253 CLP1 (ENSCCAG00000031957) YPEL4 (ENSCCAG00000021044) ENSCCAG00000020681 SERPING1 (ENSCCAG00000030702) UBE2L6 (ENSCCAG00000036933) SMTNL1 (ENSCCAG00000015514) TIMM10 (ENSCCAG00000026853) SLC43A1 (ENSCCAG00000020635) RTN4RL2 (ENSCCAG00000026479) SLC43A3 (ENSCCAG00000031801) PRG2 (ENSCCAG00000019787) PRG3 (ENSCCAG00000022015) P2RX3 (ENSCCAG00000023880) SSRP1 (ENSCCAG00000029669) TNKS1BP1 (ENSCCAG00000037526) APLNR (ENSCCAG00000014940) ##22 LRRC55 (ENSCCAG00000034284) Mas night monkey MODERN SPECIES 335 CLP1 (ENSANAG00000034935) YPEL4 (ENSANAG00000016132) ENSANAG00000024778 SERPING1 (ENSANAG00000026312) UBE2L6 (ENSANAG00000032291) SMTNL1 (ENSANAG00000001637) TIMM10 (ENSANAG00000027477) SLC43A1 (ENSANAG00000029105) RTN4RL2 (ENSANAG00000037630) SLC43A3 (ENSANAG00000038258) PRG2 (ENSANAG00000026586) PRG3 (ENSANAG00000026629) P2RX3 (ENSANAG00000034918) SSRP1 (ENSANAG00000037729) TNKS1BP1 (ENSANAG00000025236) APLNR (ENSANAG00000008918) ##22 LRRC55 (ENSANAG00000019996) Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000153668.B ENSGT00940000161443 ENSGT00940000159681 ENSGT00910000147383 ENSGT00940000161981 ENSGT00940000162276 ENSGT00390000003068 ENSGT00940000153576.c.a ENSGT00940000158505 ENSGT00940000157622 ENSGT00440000039859.d ENSGT00440000039859.c ENSGT01020000230351.B ENSGT00940000157117 ENSGT00940000154184.B ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 ENSGT00940000161412 ENSGT01100000263498.a.b.b.e.i ENSGT00950000182990.a.a.a.a ENSGT01100000263503.A.a.b ENSGT01100000263498.a.b.b.e.j ENSGT01100000263503.A.b.a ENSGT01100000263494.a.b.b.b.c.b ENSGT00940000154333.b.b.a ENSGT01100000263572.a.a.a.a.b ENSGT01100000263494.a.a.b ENSGT01100000263503.E.c.a.a.b ENSGT01100000263503.E.c.a.b ENSGT01100000263503.E.c.b ENSGT01100000263503.E.d.b ENSGT01100000263503.E.d.a.a.a.b Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000153668.B ENSGT00940000161443 ENSGT00940000159681 ENSGT00910000147383 ENSGT00940000161981 ENSGT00940000162276 ENSGT00390000003068 ENSGT00940000153576.c.a ENSGT00940000158505 ENSGT00940000157622 ENSGT00440000039859.d ENSGT00440000039859.c ENSGT01020000230351.B ENSGT00940000157117 ENSGT00940000154184.B ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 ENSGT00940000161412 ENSGT01100000263498.a.b.b.e.i ENSGT01100000263498.a.b.b.e.j ENSGT01100000263503.A.b.a ENSGT01100000263494.a.b.b.b.c.b ENSGT00940000154333.b.b.a ENSGT01100000263572.a.a.a.a.b ENSGT01100000263494.a.a.b ENSGT01100000263503.E.c.a.b ENSGT01100000263503.E.c.b ENSGT01100000263503.E.d.b ENSGT01100000263503.E.d.a.a.a.b ENSGT01100000263503.E.d.a.a.b.a.b ENSGT01100000263503.E.d.a.a.b.b ENSGT00950000182718.A.a.a.a Hominidae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000153668.B ENSGT00940000161443 ENSGT00940000159681 ENSGT00910000147383 ENSGT00940000161981 ENSGT00940000162276 ENSGT00390000003068 ENSGT00940000153576.c.a ENSGT00940000158505 ENSGT00940000157622 ENSGT00440000039859.d ENSGT00440000039859.c ENSGT01020000230351.B ENSGT00940000157117 ENSGT00940000154184.B 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ENSGT00940000154333.b.b.a ENSGT01100000263572.a.a.a.a.b ENSGT01100000263494.a.a.b ENSGT01100000263503.E.c.a.a.b ENSGT01100000263503.E.c.a.b.z ENSGT01100000263503.E.c.a.b.y ENSGT01100000263503.E.c.b ENSGT01100000263503.E.d.b ENSGT01100000263503.E.d.a.a.a.b ENSGT01100000263503.E.d.a.a.b.a.b Gorilla MODERN SPECIES 2 CLP1 (ENSGGOG00000023006) YPEL (ENSGGOG00000028295) SERPING1 (ENSGGOG00000015654) ENSGGOG00000028424 UBE2L6 (ENSGGOG00000005243) SMTNL1 (ENSGGOG00000005239) TIMM10 (ENSGGOG00000012434) SLC43A1 (ENSGGOG00000009527) RTN4RL2 (ENSGGOG00000009525) SLC43A3 (ENSGGOG00000009818) PRG2 (ENSGGOG00000002031) PRG3 (ENSGGOG00000004044) P2RX3 (ENSGGOG00000012379) SSRP1 (ENSGGOG00000012359) TNKS1BP1 (ENSGGOG00000012345) APLNR (ENSGGOG00000027955) ##22 LRRC55 (ENSGGOG00000008305) OR5AK3P (ENSGGOG00000016262) OR9G4 (ENSGGOG00000010244) OR9G1 (ENSGGOG00000027225) ENSGGOG00000026519 OR5AR1 (ENSGGOG00000025189) OR5AP2 (ENSGGOG00000028237) ENSGGOG00000023888 OR5M1 (ENSGGOG00000040942) OR5M10 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ENSGT00940000161443 ENSGT00940000159681 ENSGT00910000147383 ENSGT00940000161981 ENSGT00940000162276 ENSGT00390000003068 ENSGT00940000153576.c.a ENSGT00940000158505 ENSGT00940000157622 ENSGT00440000039859.d ENSGT00440000039859.c ENSGT01020000230351.B ENSGT00940000157117 ENSGT00940000154184.B ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 ENSGT00940000161412 ENSGT01100000263498.a.b.b.e.i ENSGT01100000263498.a.b.b.e.j ENSGT01100000263503.A.b.a ENSGT01100000263494.a.b.b.b.c.b ENSGT00940000154333.b.b.a ENSGT01100000263572.a.a.a.a.b ENSGT01100000263494.a.a.b ENSGT01100000263503.E.c.a.b.z ENSGT01100000263503.E.c.a.b.y ENSGT01100000263503.E.c.b ENSGT01100000263503.E.d.b ENSGT01100000263503.E.d.a.a.a.b ENSGT01100000263503.E.d.a.a.a.a.b ENSGT01100000263503.E.d.a.a.a.a.a Bonobo MODERN SPECIES 16 ENSPPAG00000008889 ENSPPAG00000031281 GMPS (ENSPPAG00000042787) SLC33A1 (ENSPPAG00000028834) C3orf33 (ENSPPAG00000040302) PLCH1 (ENSPPAG00000015015) ENSPPAG00000037955 STRIT1 (ENSPPAG00000028301) MME (ENSPPAG00000019817) SLC43A3 (ENSPPAG00000028764) PRG2 (ENSPPAG00000005293) PRG3 (ENSPPAG00000039813) P2RX3 (ENSPPAG00000037750) SSRP1 (ENSPPAG00000039088) TNKS1BP1 (ENSPPAG00000039200) APLNR (ENSPPAG00000007352) ##22 LRRC55 (ENSPPAG00000030647) OR5AK2 (ENSPPAG00000006294) OR5AK3P (ENSPPAG00000008152) ENSPPAG00000033428 ENSPPAG00000026788 GPR149 (ENSPPAG00000031139) DHX36 (ENSPPAG00000020323) ARHGEF26 (ENSPPAG00000040872) RAP2B (ENSPPAG00000026674) ENSPPAG00000035243 P2RY1 (ENSPPAG00000025414) MBNL1 (ENSPPAG00000031243) SUCNR1 (ENSPPAG00000034729) AADAC (ENSPPAG00000034214) AADACL2 (ENSPPAG00000028166) Chimpanzee MODERN SPECIES 2 CLP1 (ENSPTRG00000047318) YPEL4 (ENSPTRG00000003664) SERPING1 (ENSPTRG00000046666) ENSPTRG00000044437 UBE2L6 (ENSPTRG00000003661) SMTNL1 (ENSPTRG00000034232) TIMM10 (ENSPTRG00000003659) SLC43A1 (ENSPTRG00000052064) RTN4RL2 (ENSPTRG00000003657) SLC43A3 (ENSPTRG00000003656) PRG2 (ENSPTRG00000003655) PRG3 (ENSPTRG00000029958) P2RX3 (ENSPTRG00000003654) SSRP1 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(ENSG00000172457) OR9G1 (ENSG00000174914) OR5AR1 (ENSG00000172459) OR5AP2 (ENSG00000172464) OR5M1 (ENSG00000255012) OR5M10 (ENSG00000254834) OR5M11 (ENSG00000255223) OR5M8 (ENSG00000181371) OR5M3 (ENSG00000174937) OR5M9 (ENSG00000150269) ENSG00000284732 Orangutan MODERN SPECIES 2 ZDHHC5 (ENSPPYG00000003265) CLP1 (ENSPPYG00000003266) YPEL4 (ENSPPYG00000003267) SERPING1 (ENSPPYG00000003268) UBE2L6 (ENSPPYG00000003270) SMTNL1 (ENSPPYG00000003271) TIMM10 (ENSPPYG00000003272) SLC43A1 (ENSPPYG00000003273) RTN4RL2 (ENSPPYG00000033138) SLC43A3 (ENSPPYG00000003274) PRG2 (ENSPPYG00000003275) PRG3 (ENSPPYG00000003276) P2RX3 (ENSPPYG00000003277) SSRP1 (ENSPPYG00000003278) TNKS1BP1 (ENSPPYG00000003279) APLNR (ENSPPYG00000003280) ##22 LRRC55 (ENSPPYG00000003281) ENSPPYG00000039690 OR5AK2 (ENSPPYG00000040191) OR5AK3P (ENSPPYG00000041668) OR4C3 (ENSPPYG00000003290) OR4X2 (ENSPPYG00000003292) PTPRJ (ENSPPYG00000040803) NUP160 (ENSPPYG00000003293) FNBP4 (ENSPPYG00000003294) AGBL2 (ENSPPYG00000003295) MTCH2 (ENSPPYG00000003296) ENSPPYG00000038525 FAM180B (ENSPPYG00000040243) NDUFS3 (ENSPPYG00000003299) KBTBD4 (ENSPPYG00000003300) Gibbon MODERN SPECIES 19 ENSNLEG00000012809 YPEL4 (ENSNLEG00000012804) SERPING1 (ENSNLEG00000012799) ENSNLEG00000033478 UBE2L6 (ENSNLEG00000033588) SMTNL1 (ENSNLEG00000012785) TIMM10 (ENSNLEG00000012782) SLC43A1 (ENSNLEG00000012774) RTN4RL2 (ENSNLEG00000012766) SLC43A3 (ENSNLEG00000012636) PRG2 (ENSNLEG00000026666) PRG3 (ENSNLEG00000012630) P2RX3 (ENSNLEG00000012607) SSRP1 (ENSNLEG00000012584) TNKS1BP1 (ENSNLEG00000012565) APLNR (ENSNLEG00000012562) ##22 LRRC55 (ENSNLEG00000012559) OR5AK3P (ENSNLEG00000019331) ENSNLEG00000028752 OR9G4 (ENSNLEG00000019330) OR5AR1 (ENSNLEG00000019329) OR5M11 (ENSNLEG00000019325) ENSNLEG00000036145 ENSNLEG00000033888 OR5M8 (ENSNLEG00000019324) ENSNLEG00000036266 ENSNLEG00000034254 OR5M9 (ENSNLEG00000019323) ENSNLEG00000012557 ENSNLEG00000012554 ENSNLEG00000012552 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153668.B 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ENSGT00940000157622 ENSGT00440000039859.d ENSGT00440000039859.c ENSGT01020000230351.B ENSGT00940000157117 ENSGT00940000154184.B ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 ENSGT00940000161412 ENSGT01100000263498.a.b.b.e.i ENSGT00950000182990.a.a.a.a ENSGT01100000263494.a.b.b.b.c.b ENSGT00940000154333.b.b.a ENSGT01100000263572.a.a.a.a.b ENSGT01100000263494.a.a.b ENSGT01100000263503.E.c.a.b ENSGT01100000263503.E.d.a.b ENSGT01100000263503.E.d.a.a.b.b ENSGT00950000182718.A.a.a.b.b.c ENSGT00950000182718.A.a.b.b.b.b ENSGT00950000182718.A.a.b.a.b ENSGT00950000182718.A.a.b.a.a.c.a.b.g ENSGT01100000263503.B.c.g Vervet Monkey MODERN SPECIES ZDHHC5 (ENSCSAG00000005998) CLP1 (ENSCSAG00000005994) YPEL4 (ENSCSAG00000005991) SERPING1 (ENSCSAG00000005989) UBE2L6 (ENSCSAG00000005985) SMTNL1 (ENSCSAG00000005982) TIMM10 (ENSCSAG00000005976) SLC43A1 (ENSCSAG00000005973) RTN4RL2 (ENSCSAG00000005968) SLC43A3 (ENSCSAG00000005965) PRG2 (ENSCSAG00000005958) PRG3 (ENSCSAG00000005957) P2RX3 (ENSCSAG00000005954) SSRP1 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ENSGT00940000153668.B ENSGT00940000161443 ENSGT00940000159681 ENSGT00910000147383 ENSGT00940000161981 ENSGT00940000162276 ENSGT00390000003068 ENSGT00940000153576.c.a ENSGT00940000158505 ENSGT00940000157622 ENSGT00440000039859.d ENSGT00440000039859.c ENSGT01020000230351.B ENSGT00940000157117 ENSGT00940000154184.B ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 ENSGT00940000161412 ENSGT00950000182990.a.a.a.a ENSGT01100000263494.a.b.b.b.c.b ENSGT01100000263494.a.a.b ENSGT01100000263503.E.d.a.a.b.a.a ENSGT01100000263503.E.d.a.a.b.b ENSGT00950000182718.A.a.b.b.b.b ENSGT00950000182718.A.a.b.a.b ENSGT01100000263503.C.cb ENSGT01100000263496.B ENSGT00940000161123 ENSGT00940000155775.j Sooty mangabey MODERN SPECIES 333 CLP1 (ENSCATG00000044628) YPEL4 (ENSCATG00000033472) SERPING1 (ENSCATG00000009657) ENSCATG00000010273 UBE2L6 (ENSCATG00000013517) SMTNL1 (ENSCATG00000009203) TIMM10 (ENSCATG00000030369) SLC43A1 (ENSCATG00000036597) RTN4RL2 (ENSCATG00000029746) SLC43A3 (ENSCATG00000031268) PRG2 (ENSCATG00000039658) PRG3 (ENSCATG00000011827) P2RX3 (ENSCATG00000028693) SSRP1 (ENSCATG00000041377) TNKS1BP1 (ENSCATG00000037546) APLNR (ENSCATG00000019437) ##22 LRRC55 (ENSCATG00000010960) ENSCATG00000013388 OR9G4 (ENSCATG00000019474) ENSCATG00000019867 ENSCATG00000031014 OR5M9 (ENSCATG00000020470) OR8J1 (ENSCATG00000014575) OR8K1 (ENSCATG00000018484) ENSCATG00000029525 ENSCATG00000018722 OR5I1 (ENSCATG00000016816) OR4S2 (ENSCATG00000018258) ENSCATG00000039191 OR4A8 (ENSCATG00000000891) Drill MODERN SPECIES 1280 ENSMLEG00000043496 CLP1 (ENSMLEG00000043556) YPEL4 (ENSMLEG00000038814) SERPING1 (ENSMLEG00000042045) UBE2L6 (ENSMLEG00000026248) SMTNL1 (ENSMLEG00000039653) TIMM10 (ENSMLEG00000039006) SLC43A1 (ENSMLEG00000033063) RTN4RL2 (ENSMLEG00000042469) SLC43A3 (ENSMLEG00000039856) PRG2 (ENSMLEG00000016545) PRG3 (ENSMLEG00000036798) P2RX3 (ENSMLEG00000041148) SSRP1 (ENSMLEG00000041800) TNKS1BP1 (ENSMLEG00000040944) APLNR (ENSMLEG00000002797) ##22 LRRC55 (ENSMLEG00000040052) ENSMLEG00000032571 OR9G4 (ENSMLEG00000000951) OR5AP2 (ENSMLEG00000039138) ENSMLEG00000029910 OR5M9 (ENSMLEG00000027744) OR8K1 (ENSMLEG00000007703) Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 171 ENSGT00940000153668.B ENSGT00940000161443 ENSGT00940000159681 ENSGT00910000147383 ENSGT00940000161981 ENSGT00940000162276 ENSGT00390000003068 ENSGT00940000153576.c.a ENSGT00940000158505 ENSGT00940000157622 ENSGT00440000039859.d ENSGT00440000039859.c ENSGT01020000230351.B ENSGT00940000157117 ENSGT00940000154184.B ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 ENSGT00940000161412 ENSGT01100000263498.a.b.b.e.j ENSGT00950000182990.a.a.a.a ENSGT01100000263503.A.a.b ENSGT01100000263494.a.b.b.b.c.b ENSGT00950000182718.A.a.b.a.b ENSGT00940000161123 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1528 YPEL4 (ENSRBIG00000040318) SERPING1 (ENSRBIG00000028629) ENSRBIG00000019402 ENSRBIG00000022294 UBE2L6 (ENSRBIG00000031493) SMTNL1 (ENSRBIG00000001369) TIMM10 (ENSRBIG00000038432) SLC43A1 (ENSRBIG00000041888) RTN4RL2 (ENSRBIG00000029726) SLC43A3 (ENSRBIG00000031449) PRG2 (ENSRBIG00000031800) PRG3 (ENSRBIG00000043716) P2RX3 (ENSRBIG00000035211) SSRP1 (ENSRBIG00000033951) TNKS1BP1 (ENSRBIG00000037955) APLNR (ENSRBIG00000001282) ##22 LRRC55 (ENSRBIG00000031677) OR5AK3P (ENSRBIG00000042622) ENSRBIG00000037831 ENSRBIG00000029124 OR9G4 (ENSRBIG00000044998) OR8K1 (ENSRBIG00000025428) OR4S2 (ENSRBIG00000017494) Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2853 ENSRROG00000024165 UBE2L6 (ENSRROG00000029059) SMTNL1 (ENSRROG00000030998) TIMM10 (ENSRROG00000040851) SLC43A1 (ENSRROG00000035253) RTN4RL2 (ENSRROG00000038840) SLC43A3 (ENSRROG00000038533) PRG2 (ENSRROG00000038395) PRG3 (ENSRROG00000036176) P2RX3 (ENSRROG00000039082) SSRP1 (ENSRROG00000034838) TNKS1BP1 (ENSRROG00000010396) APLNR (ENSRROG00000027016) ##22 LRRC55 (ENSRROG00000031890) ENSRROG00000043546 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000156001 ENSGT00940000153668.B ENSGT00940000161443 ENSGT00940000159681 ENSGT00940000161981 ENSGT00940000162276 ENSGT00390000003068 ENSGT00940000153576.c.a ENSGT00940000158505 ENSGT00940000157622 ENSGT00440000039859.d ENSGT00440000039859.c ENSGT01020000230351.B ENSGT00940000157117 ENSGT00940000154184.B ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 ENSGT00940000161412 ENSGT01100000263498.a.b.b.f.o ENSGT01100000263498.a.b.b.e ENSGT00950000182990.a.a.a.a ENSGT01100000263503.A.a.a ENSGT01100000263503.A.b.b ENSGT01100000263503.A.b.a ENSGT00940000154333.b.a ENSGT01100000263494.a.b.b.b.c.b ENSGT00940000154333.b.b.b ENSGT00940000154333.b.b.a ENSGT01090000260044.A.a.a ENSGT01100000263572.a.a.a.a.b ENSGT01100000263494.a.a.b ENSGT01100000263503.E.c.a.a.b Bushbaby MODERN SPECIES 324 CLP1 (ENSOGAG00000004508) YPEL4 (ENSOGAG00000004507) SERPING1 (ENSOGAG00000004505) UBE2L6 (ENSOGAG00000004503) SMTNL1 (ENSOGAG00000024484) ENSOGAG00000029980 TIMM10 (ENSOGAG00000025080) SLC43A1 (ENSOGAG00000015830) RTN4RL2 (ENSOGAG00000015828) SLC43A3 (ENSOGAG00000030654) PRG2 (ENSOGAG00000014753) ENSOGAG00000002685 P2RX3 (ENSOGAG00000014742) SSRP1 (ENSOGAG00000014738) TNKS1BP1 (ENSOGAG00000034200) APLNR (ENSOGAG00000001814) ##22 LRRC55 (ENSOGAG00000002476) ENSOGAG00000026503 ENSOGAG00000029559 ENSOGAG00000030714 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000156001 ENSGT00940000153668.B ENSGT00940000161443 ENSGT00940000159681 ENSGT00940000161981 ENSGT00940000162276 ENSGT00390000003068 ENSGT00940000153576.c.a ENSGT00940000158505 ENSGT00940000157622 ENSGT00440000039859.d ENSGT00440000039859.c ENSGT01020000230351.B ENSGT00940000157117 ENSGT00940000154184.B ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 ENSGT00940000161412 ENSGT01100000263498.a.b.b.e ENSGT00950000182990.a.a.a.a ENSGT01100000263503.A.a.a Mouse lemur MODERN SPECIES 27 MED19 (ENSMICG00000004907) ZDHHC5 (ENSMICG00000004899) CLP1 (ENSMICG00000004895) YPEL4 (ENSMICG00000030565) SERPING1 (ENSMICG00000031150) UBE2L6 (ENSMICG00000034110) SMTNL1 (ENSMICG00000032273) TIMM10 (ENSMICG00000028118) SLC43A1 (ENSMICG00000004875) RTN4RL2 (ENSMICG00000030732) SLC43A3 (ENSMICG00000004860) PRG3 (ENSMICG00000040085) P2RX3 (ENSMICG00000042170) SSRP1 (ENSMICG00000004836) TNKS1BP1 (ENSMICG00000004828) APLNR (ENSMICG00000004827) ##22 LRRC55 (ENSMICG00000030806) ENSMICG00000005818 ENSMICG00000044836 ENSMICG00000045429 ENSMICG00000043695 ENSMICG00000015266 OR5M3 (ENSMICG00000041855) ENSMICG00000041685 ENSMICG00000045131 OR5T2 (ENSMICG00000007784) ENSMICG00000047830 ENSMICG00000028603 ENSMICG00000044406 ENSMICG00000045883 ENSMICG00000043929 Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000156001 ENSGT00940000153668.B ENSGT00940000161443 ENSGT00940000159681 ENSGT00940000161981 ENSGT00940000162276 ENSGT00390000003068 ENSGT00940000153576.c.a ENSGT00940000158505 ENSGT00940000157622 ENSGT00440000039859.d ENSGT00440000039859.c ENSGT01020000230351.B ENSGT00940000157117 ENSGT00940000154184.B ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 ENSGT00940000161412 ENSGT01100000263498.a.b.b.e ENSGT00950000182990.a.a.a.a ENSGT01100000263503.A.a.a Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 623 ZDHHC5 (ENSPSMG00000006246) CLP1 (ENSPSMG00000006258) YPEL4 (ENSPSMG00000006287) SERPING1 (ENSPSMG00000006347) UBE2L6 (ENSPSMG00000006356) SMTNL1 (ENSPSMG00000006364) TIMM10 (ENSPSMG00000006373) SLC43A1 (ENSPSMG00000006392) RTN4RL2 (ENSPSMG00000006409) SLC43A3 (ENSPSMG00000006464) PRG2 (ENSPSMG00000006524) PRG3 (ENSPSMG00000006532) P2RX3 (ENSPSMG00000006539) SSRP1 (ENSPSMG00000006582) TNKS1BP1 (ENSPSMG00000006662) APLNR (ENSPSMG00000006688) ##22 LRRC55 (ENSPSMG00000006691) ENSPSMG00000006699 ENSPSMG00000006716 ENSPSMG00000006720 Coquerels sifaka MODERN SPECIES 292 ZDHHC5 (ENSPCOG00000024126) CLP1 (ENSPCOG00000000360) YPEL4 (ENSPCOG00000016654) SERPING1 (ENSPCOG00000021404) UBE2L6 (ENSPCOG00000025269) SMTNL1 (ENSPCOG00000024781) TIMM10 (ENSPCOG00000018636) SLC43A1 (ENSPCOG00000028114) RTN4RL2 (ENSPCOG00000015209) SLC43A3 (ENSPCOG00000027857) PRG2 (ENSPCOG00000023605) ENSPCOG00000022015 P2RX3 (ENSPCOG00000025770) SSRP1 (ENSPCOG00000023166) TNKS1BP1 (ENSPCOG00000020048) APLNR (ENSPCOG00000007875) ##22 LRRC55 (ENSPCOG00000018064) ENSPCOG00000026835 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000156001 ENSGT00940000153668.B ENSGT00940000161443 ENSGT00940000159681 ENSGT00940000161981 ENSGT00940000162276 ENSGT00390000003068 ENSGT00940000153576.c.a ENSGT00940000158505 ENSGT00940000157622 ENSGT00440000039859.d ENSGT00440000039859.c ENSGT01020000230351.B ENSGT00940000157117 ENSGT00940000154184.B ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 ENSGT00940000161412 ENSGT01100000263498.a.b.b.f.p ENSGT01100000263498.a.b.b.e ENSGT00950000182990.a.a.a.a ENSGT01100000263503.A.a.b ENSGT01100000263503.A.a.a ENSGT01100000263503.A.b.b ENSGT00940000154333.b.a ENSGT01100000263494.a.b.b.b.c.b ENSGT00940000154333.b.b.b ENSGT01100000263494.a.b.b.b.c.a ENSGT00940000154333.b.b.a ENSGT01090000260044.A.a.a ENSGT01100000263572.a.a.a.a.b ENSGT01100000263494.a.a.b Tree shrew MODERN SPECIES 6530 APLNR (ENSTBEG00000008300) ##22 LRRC55 (ENSTBEG00000008407) Glires ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000156001 ENSGT00940000153668.B ENSGT00940000161443 ENSGT00940000159681 ENSGT00940000161981 ENSGT00940000162276 ENSGT00390000003068 ENSGT00940000153576.c.a ENSGT00940000158505 ENSGT00940000157622 ENSGT00440000039859.d ENSGT00440000039859.c ENSGT01020000230351.B ENSGT00940000157117 ENSGT00940000154184.B ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 ENSGT00940000161412 ENSGT01100000263498.a.b.b.f.o ENSGT01100000263498.a.b.b.f.p ENSGT01100000263498.a.b.b.e ENSGT00950000182990.a.a.a.a ENSGT01100000263503.A.a.b ENSGT01100000263503.A.a.a ENSGT01100000263503.A.b.b ENSGT00940000154333.b.a ENSGT01100000263494.a.b.b.b.c.b ENSGT00940000154333.b.b.b ENSGT01100000263494.a.b.b.b.c.a ENSGT00940000154333.b.b.a ENSGT01090000260044.A.a.a ENSGT01100000263572.a.a.a.a.b Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000156001 ENSGT00940000153668.B ENSGT00940000161443 ENSGT00940000159681 ENSGT00940000161981 ENSGT00940000162276 ENSGT00390000003068 ENSGT00940000153576.c.a ENSGT00940000158505 ENSGT00940000157622 ENSGT00440000039859.d ENSGT00440000039859.c ENSGT01020000230351.B ENSGT00940000157117 ENSGT00940000154184.B ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 ENSGT00940000161412 ENSGT01100000263498.a.b.b.f.o ENSGT01100000263498.a.b.b.f.p ENSGT00950000182990.a.a.a.a ENSGT01100000263503.A.a.b ENSGT01100000263503.A.a.a ENSGT01100000263503.A.b.b ENSGT01100000263498.a.b.b.e ENSGT00940000154333.b.a ENSGT01100000263494.a.b.b.b.c.b ENSGT01100000263494.a.b.b.b.c.a ENSGT00940000154333.b.b.a ENSGT01100000263572.a.a.a.a.b ENSGT01100000263494.a.a.b ENSGT01100000263503.E.c.a.b Rabbit MODERN SPECIES ZDHHC5 (ENSOCUG00000007047) CLP1 (ENSOCUG00000007045) YPEL4 (ENSOCUG00000000191) SERPING1 (ENSOCUG00000026479) UBE2L6 (ENSOCUG00000021867) SMTNL1 (ENSOCUG00000027228) TIMM10 (ENSOCUG00000001338) SLC43A1 (ENSOCUG00000026004) ENSOCUG00000025809 SLC43A3 (ENSOCUG00000012561) ENSOCUG00000008297 PRG3 (ENSOCUG00000003089) P2RX3 (ENSOCUG00000003082) SSRP1 (ENSOCUG00000029504) TNKS1BP1 (ENSOCUG00000024188) APLNR (ENSOCUG00000003078) ##22 LRRC55 (ENSOCUG00000000448) ENSOCUG00000022555 ENSOCUG00000027710 ENSOCUG00000027838 ENSOCUG00000023413 ENSOCUG00000005361 ENSOCUG00000021057 ENSOCUG00000024865 ENSOCUG00000036810 OR9G4 (ENSOCUG00000007748) ENSOCUG00000035086 ENSOCUG00000022251 ENSOCUG00000026116 ENSOCUG00000033439 ENSOCUG00000026010 Rodentia ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000153668.B ENSGT00940000161443 ENSGT00860000136158 ENSGT00940000159681 ENSGT00940000161981 ENSGT00940000162276 ENSGT00390000003068 ENSGT00940000153576.c.a ENSGT00940000158505 ENSGT00940000157622 ENSGT00440000039859.d ENSGT00440000039859.c ENSGT01020000230351.B ENSGT00940000157117 ENSGT00940000154184.B ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 ENSGT00940000161412 ENSGT01100000263498.a.b.b.f.o ENSGT01100000263498.a.b.b.f.p ENSGT01100000263498.a.b.b.e ENSGT00950000182990.a.a.a.a ENSGT01100000263503.A.a.b ENSGT01100000263503.A.a.a ENSGT01100000263503.A.b.b ENSGT00940000154333.b.a ENSGT01100000263494.a.b.b.b.c.b ENSGT00940000154333.b.b.b ENSGT01100000263494.a.b.b.b.c.a ENSGT00940000154333.b.b.a ENSGT01090000260044.A.a.a ENSGT01100000263572.a.a.a.a.b Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000153668.B ENSGT00940000161443 ENSGT00860000136158 ENSGT00940000159681 ENSGT00940000161981 ENSGT00940000162276 ENSGT00390000003068 ENSGT00940000153576.c.a ENSGT00940000158505 ENSGT00940000157622 ENSGT00440000039859.d ENSGT00440000039859.c ENSGT01020000230351.B ENSGT00940000157117 ENSGT00940000154184.B ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 ENSGT00940000161412 ENSGT01100000263498.a.b.b.f.p.c ENSGT01100000263498.a.b.b.f.p.d ENSGT01100000263498.a.b.b.e ENSGT00950000182990.a.a.a.a ENSGT01100000263503.A.a.b ENSGT01100000263503.A.a.a ENSGT01100000263503.A.b.b ENSGT00940000154333.b.a ENSGT01100000263494.a.b.b.b.c.b ENSGT00940000154333.b.b.b ENSGT01100000263494.a.b.b.b.c.a ENSGT01090000260044.A.a.a ENSGT00940000154333.b.b.a ENSGT01100000263572.a.a.a.a.b Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00390000001774 ENSGT00940000156001 ENSGT00940000153668.B ENSGT00940000161443 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ENSGT00940000157117 ENSGT00940000154184.B ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 ENSGT00940000161412 ENSGT01100000263498.a.b.b.f.p.d.a ENSGT01100000263498.a.b.b.e.o ENSGT01100000263498.a.b.b.e.p ENSGT00950000182990.a.a.a.a ENSGT01100000263503.A.a.b ENSGT01100000263503.A.b.b ENSGT00940000154333.b.a ENSGT01100000263494.a.b.b.b.c.b ENSGT00940000154333.b.b.b ENSGT00940000154333.b.b.a ENSGT01100000263494.a.b.b.b.c.a ENSGT01090000260044.A.a.a ENSGT01100000263572.a.a.a.a.b ENSGT01100000263494.a.a.b Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES 64 ENSGT00390000001774 ENSGT00940000156001 ENSGT00940000153668.B ENSGT00940000161443 ENSGT00940000159681 ENSGT00940000161981 ENSGT00940000162276 ENSGT00390000003068 ENSGT00940000153576.c.a ENSGT00940000158505 ENSGT00440000039859.d ENSGT00440000039859.c ENSGT01020000230351.B ENSGT00940000157117 ENSGT00940000154184.B ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 ENSGT00940000161412 ENSGT01100000263498.a.b.b.f.p.d.a ENSGT01100000263498.a.b.b.e.p ENSGT00950000182990.a.a.a.a ENSGT01100000263503.A.a.b ENSGT01100000263494.a.b.b.b.c.b ENSGT00940000154333.b.b.b ENSGT00940000154333.b.b.a ENSGT01100000263494.a.b.b.b.c.a ENSGT01090000260044.A.a.a ENSGT01100000263572.a.a.a.a.b ENSGT01100000263494.a.a.b ENSGT01100000263503.E.c.a.b ENSGT01100000263503.E.c.a.a.b ENSGT01100000263503.E.c.a.a.a Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 218 MED19 (ENSCLAG00000009229) ZDHHC5 (ENSCLAG00000012355) CLP1 (ENSCLAG00000004094) YPEL4 (ENSCLAG00000003918) SERPING1 (ENSCLAG00000003856) UBE2L6 (ENSCLAG00000003829) SMTNL1 (ENSCLAG00000003774) TIMM10 (ENSCLAG00000003637) SLC43A1 (ENSCLAG00000003566) ENSCLAG00000003529 ENSCLAG00000003333 PRG3 (ENSCLAG00000003306) P2RX3 (ENSCLAG00000003198) SSRP1 (ENSCLAG00000002884) TNKS1BP1 (ENSCLAG00000002740) APLNR (ENSCLAG00000017677) ##22 LRRC55 (ENSCLAG00000012284) ENSCLAG00000017869 ENSCLAG00000010042 ENSCLAG00000009552 ENSCLAG00000009406 OR9G4 (ENSCLAG00000017531) ENSCLAG00000017574 ENSCLAG00000017532 ENSCLAG00000017564 ENSCLAG00000017520 OR5AR1 (ENSCLAG00000017501) OR5AP2 (ENSCLAG00000017509) ENSCLAG00000017494 ENSCLAG00000017526 ENSCLAG00000017547 Degu MODERN SPECIES 280 TMX2 (ENSODEG00000012761) MED19 (ENSODEG00000011834) ZDHHC5 (ENSODEG00000012260) CLP1 (ENSODEG00000011410) YPEL4 (ENSODEG00000012760) SERPING1 (ENSODEG00000012532) UBE2L6 (ENSODEG00000012571) ENSODEG00000011687 TIMM10 (ENSODEG00000011959) SLC43A1 (ENSODEG00000011176) RTN4RL2 (ENSODEG00000011666) PRG2 (ENSODEG00000010946) PRG3 (ENSODEG00000011441) P2RX3 (ENSODEG00000011096) TNKS1BP1 (ENSODEG00000012516) APLNR (ENSODEG00000011407) ##22 LRRC55 (ENSODEG00000011776) ENSODEG00000011283 OR5AP2 (ENSODEG00000011501) ENSODEG00000019842 ENSODEG00000013613 OR5M8 (ENSODEG00000019856) ENSODEG00000012614 OR5M3 (ENSODEG00000019824) ENSODEG00000019778 ENSODEG00000011343 OR8K1 (ENSODEG00000010994) OR8K3 (ENSODEG00000010697) OR5J2 (ENSODEG00000019808) Guinea pig MODERN SPECIES 86 ZDHHC5 (ENSCPOG00000026877) CLP1 (ENSCPOG00000012554) YPEL4 (ENSCPOG00000039075) SERPING1 (ENSCPOG00000025775) UBE2L6 (ENSCPOG00000005451) SMTNL1 (ENSCPOG00000038068) TIMM10 (ENSCPOG00000036926) SLC43A1 (ENSCPOG00000006049) RTN4RL2 (ENSCPOG00000022760) ENSCPOG00000022081 ENSCPOG00000000481 ENSCPOG00000036700 P2RX3 (ENSCPOG00000019432) SSRP1 (ENSCPOG00000000480) TNKS1BP1 (ENSCPOG00000036559) APLNR (ENSCPOG00000000324) ##22 LRRC55 (ENSCPOG00000038334) ENSCPOG00000023171 ENSCPOG00000037113 ENSCPOG00000038493 ENSCPOG00000034134 ENSCPOG00000039192 ENSCPOG00000026789 OR8U3 (ENSCPOG00000022397) ENSCPOG00000020045 OR5M3 (ENSCPOG00000035449) OR5M8 (ENSCPOG00000000956) ENSCPOG00000023435 ENSCPOG00000025916 ENSCPOG00000030237 ENSCPOG00000037095 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 45 ENSGT00940000153668.B ENSGT00940000161443 ENSGT00860000136158 ENSGT00940000159681 ENSGT00940000161981 ENSGT00940000162276 ENSGT00390000003068 ENSGT00940000153576.c.a ENSGT00940000158505 ENSGT00940000157622 ENSGT00440000039859.d ENSGT00440000039859.c ENSGT01020000230351.B ENSGT00940000157117 ENSGT00940000154184.B 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ENSSVLG00005017755 ENSSVLG00005017777 ENSSVLG00005017803 ENSSVLG00005004832 OR9G4 (ENSSVLG00005004873) ENSSVLG00005004892 ENSSVLG00005004919 ENSSVLG00005004957 ENSSVLG00005004967 ENSSVLG00005004986 OR5AR1 (ENSSVLG00005005009) OR5AP2 (ENSSVLG00005005016) Marmotini ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000153668.B ENSGT00940000161443 ENSGT00860000136158 ENSGT00940000159681 ENSGT00940000161981 ENSGT00940000162276 ENSGT00390000003068 ENSGT00940000153576.c.a ENSGT00940000158505 ENSGT00940000157622 ENSGT00440000039859.d ENSGT00440000039859.c ENSGT01020000230351.B ENSGT00940000157117 ENSGT00940000154184.B ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 ENSGT00940000161412 ENSGT01100000263498.a.b.b.f.p.c ENSGT01100000263498.a.b.b.f.p.d ENSGT01100000263498.a.b.b.e.q.b ENSGT01100000263498.a.b.b.e.q.a ENSGT01100000263498.a.b.b.e.r ENSGT00950000182990.a.a.a.a ENSGT01100000263503.A.a.b ENSGT01100000263503.A.a.a ENSGT01100000263503.A.b.b ENSGT00940000154333.b.a ENSGT01100000263494.a.b.b.b.c.b ENSGT00940000154333.b.b.b ENSGT01100000263494.a.b.b.b.c.a.g.a ENSGT00940000154333.b.b.a Alpin marmot MODERN SPECIES 3 YPEL4 (ENSMMMG00000017710) SERPING1 (ENSMMMG00000017679) ENSMMMG00000017673 SMTNL1 (ENSMMMG00000017662) TIMM10 (ENSMMMG00000017656) SLC43A1 (ENSMMMG00000017592) ENSMMMG00000017589 ENSMMMG00000017566 SLC43A3 (ENSMMMG00000017516) PRG2 (ENSMMMG00000017513) PRG3 (ENSMMMG00000017511) P2RX3 (ENSMMMG00000017459) SSRP1 (ENSMMMG00000017423) ENSMMMG00000017420 ENSMMMG00000017412 APLNR (ENSMMMG00000017409) ##22 LRRC55 (ENSMMMG00000017406) ENSMMMG00000017380 ENSMMMG00000017375 ENSMMMG00000017371 ENSMMMG00000017370 ENSMMMG00000017366 ENSMMMG00000017351 ENSMMMG00000017346 ENSMMMG00000017342 ENSMMMG00000017341 OR9G4 (ENSMMMG00000017339) ENSMMMG00000017333 ENSMMMG00000017332 ENSMMMG00000017330 ENSMMMG00000017326 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000153668.B ENSGT00940000161443 ENSGT00860000136158 ENSGT00940000159681 ENSGT00940000161981 ENSGT00940000162276 ENSGT00390000003068 ENSGT00940000153576.c.a ENSGT00940000158505 ENSGT00940000157622 ENSGT00440000039859.d ENSGT00440000039859.c ENSGT01020000230351.B ENSGT00940000157117 ENSGT00940000154184.B ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 ENSGT00940000161412 ENSGT01100000263498.a.b.b.f.p.c ENSGT01100000263498.a.b.b.e.q.b ENSGT01100000263498.a.b.b.e.q.a ENSGT01100000263498.a.b.b.e.r ENSGT00950000182990.a.a.a.a ENSGT01100000263503.A.a.b ENSGT01100000263503.A.a.a ENSGT01100000263503.A.b.b ENSGT00940000154333.b.a ENSGT01100000263494.a.b.b.b.c.b ENSGT00940000154333.b.b.b ENSGT01090000260044.A.a.a ENSGT01100000263494.a.b.b.b.c.a.g.a ENSGT01100000263494.a.b.b.b.c.a.g.b Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 336 ZDHHC5 (ENSUPAG00010020072) CLP1 (ENSUPAG00010020084) YPEL4 (ENSUPAG00010020089) SERPING1 (ENSUPAG00010020096) ENSUPAG00010020108 SMTNL1 (ENSUPAG00010020111) TIMM10 (ENSUPAG00010020116) SLC43A1 (ENSUPAG00010020123) RTN4RL2 (ENSUPAG00010020147) SLC43A3 (ENSUPAG00010020150) PRG2 (ENSUPAG00010020161) PRG3 (ENSUPAG00010000054) P2RX3 (ENSUPAG00010000073) SSRP1 (ENSUPAG00010000217) TNKS1BP1 (ENSUPAG00010000244) APLNR (ENSUPAG00010000262) ##22 LRRC55 (ENSUPAG00010000269) ENSUPAG00010000284 ENSUPAG00010000292 ENSUPAG00010000308 ENSUPAG00010000331 OR9G4 (ENSUPAG00010000344) ENSUPAG00010000351 ENSUPAG00010000377 ENSUPAG00010000384 ENSUPAG00010000387 Squirrel MODERN SPECIES 181 CLP1 (ENSSTOG00000029257) YPEL4 (ENSSTOG00000022772) ENSSTOG00000033598 SERPING1 (ENSSTOG00000009696) UBE2L6 (ENSSTOG00000009692) SMTNL1 (ENSSTOG00000028520) TIMM10 (ENSSTOG00000028033) SLC43A1 (ENSSTOG00000008586) RTN4RL2 (ENSSTOG00000020266) ENSSTOG00000008574 PRG2 (ENSSTOG00000008561) PRG3 (ENSSTOG00000026632) P2RX3 (ENSSTOG00000008540) SSRP1 (ENSSTOG00000008508) TNKS1BP1 (ENSSTOG00000021580) APLNR (ENSSTOG00000021177) ##22 LRRC55 (ENSSTOG00000004092) ENSSTOG00000025152 ENSSTOG00000029154 ENSSTOG00000034403 ENSSTOG00000028143 ENSSTOG00000025178 ENSSTOG00000024631 ENSSTOG00000024726 ENSSTOG00000003427 ENSSTOG00000027816 ENSSTOG00000021062 ENSSTOG00000022101 ENSSTOG00000027443 ENSSTOG00000034731 ENSSTOG00000027371 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000153668.B ENSGT00940000161443 ENSGT00860000136158 ENSGT00940000159681 ENSGT00940000161981 ENSGT00940000162276 ENSGT00390000003068 ENSGT00940000153576.c.a ENSGT00940000158505 ENSGT00940000157622 ENSGT00440000039859.d ENSGT00440000039859.c ENSGT01020000230351.B ENSGT00940000157117 ENSGT00940000154184.B ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 ENSGT00940000161412 ENSGT01100000263498.a.b.b.f.o ENSGT01100000263498.a.b.b.f.p ENSGT01100000263498.a.b.b.e ENSGT00950000182990.a.a.a.a ENSGT01100000263503.A.a.b ENSGT01100000263503.A.a.a ENSGT01100000263503.A.b.b ENSGT00940000154333.b.a ENSGT00940000154333.b.b.b ENSGT00940000154333.b.b.a ENSGT01100000263494.a.b.b.b.c.a ENSGT01090000260044.A.a.a ENSGT01100000263572.a.a.a.a.b ENSGT01100000263494.a.a.b Kangaroo rat MODERN SPECIES 436 Med19 (ENSDORG00000014687) Zdhhc5 (ENSDORG00000014686) Ypel4 (ENSDORG00000025120) Serping1 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ENSGT00950000182990.a.a.a.a ENSGT01100000263503.A.a.b.f ENSGT01100000263503.A.a.b.e.a.b ENSGT01100000263503.A.a.b.e.b ENSGT01100000263503.A.a.a ENSGT01100000263494.a.b.b.b.c.b ENSGT01100000263503.A.b.b ENSGT00940000154333.b.a ENSGT00940000154333.b.b.b Northern American deer mouse MODERN SPECIES 17 Clp1 (ENSPEMG00000011213) Ypel4 (ENSPEMG00000025687) ENSPEMG00000016890 Serping1 (ENSPEMG00000011193) Ube2l6 (ENSPEMG00000024104) Smtnl1 (ENSPEMG00000024035) Timm10 (ENSPEMG00000028146) Slc43a1 (ENSPEMG00000017276) Rtn4rl2 (ENSPEMG00000016619) Slc43a3 (ENSPEMG00000009796) Prg2 (ENSPEMG00000006364) Prg3 (ENSPEMG00000015070) P2rx3 (ENSPEMG00000012958) Ssrp1 (ENSPEMG00000013852) Tnks1bp1 (ENSPEMG00000018733) Aplnr (ENSPEMG00000009295) ##22 Lrrc55 (ENSPEMG00000027210) ENSPEMG00000031367 ENSPEMG00000031038 ENSPEMG00000030531 Or5ak23 (ENSPEMG00000028989) Or5ak24 (ENSPEMG00000028996) Or5ak25 (ENSPEMG00000025590) ENSPEMG00000030844 ENSPEMG00000026906 Fads2b (ENSPEMG00000011181) ENSPEMG00000030890 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(ENSCAFG00020000809) UBE2L6 (ENSCAFG00020000807) SMTNL1 (ENSCAFG00020000753) TIMM10 (ENSCAFG00020000744) SLC43A1 (ENSCAFG00020000733) RTN4RL2 (ENSCAFG00020000714) SLC43A3 (ENSCAFG00020000707) ENSCAFG00020000701 PRG3 (ENSCAFG00020000657) P2RX3 (ENSCAFG00020000557) SSRP1 (ENSCAFG00020000476) TNKS1BP1 (ENSCAFG00020000464) APLNR (ENSCAFG00020000452) ##22 LRRC55 (ENSCAFG00020000438) ENSCAFG00020000427 ENSCAFG00020000416 ENSCAFG00020000399 ENSCAFG00020000392 ENSCAFG00020000367 ENSCAFG00020000342 ENSCAFG00020000327 ENSCAFG00020000313 ENSCAFG00020000308 OR9G1 (ENSCAFG00020000306) ENSCAFG00020000302 ENSCAFG00020000276 OR5AR1 (ENSCAFG00020000257) OR5AP2 (ENSCAFG00020000127) Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00390000001774 ENSGT00940000156001 ENSGT00940000153668.B ENSGT00940000161443 ENSGT00940000159681 ENSGT00940000161981 ENSGT00940000162276 ENSGT00390000003068 ENSGT00940000153576.c.a ENSGT00940000158505 ENSGT00940000157622 ENSGT00440000039859.d ENSGT01020000230351.B ENSGT00940000157117 ENSGT00940000154184.B ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 ENSGT00940000161412 ENSGT01100000263498.a.b.b.f ENSGT00950000182990.a.a.a.a ENSGT01100000263503.A.a.b.g ENSGT01100000263503.A.a.b.h ENSGT01100000263503.A.a.a ENSGT01100000263503.A.b.b ENSGT01100000263503.A.b.a ENSGT00940000154333.b.a ENSGT01100000263494.a.b.b.b.c.b ENSGT00940000154333.b.b.b ENSGT00940000154333.b.b.a ENSGT01090000260044.A.a.a ENSGT01100000263572.a.a.a.a.b ENSGT01100000263494.a.a.b Mustelinae ANCESTRAL SPECIES 54 ENSGT00390000001774 ENSGT00940000156001 ENSGT00940000153668.B ENSGT00940000161443 ENSGT00940000159681 ENSGT00940000161981 ENSGT00940000162276 ENSGT00390000003068.q ENSGT00940000153576.c.a ENSGT00940000158505 ENSGT00940000157622 ENSGT00440000039859.d ENSGT01020000230351.B ENSGT00940000157117 ENSGT00940000154184.B ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 ENSGT00940000161412 ENSGT01100000263498.a.b.b.f ENSGT00950000182990.a.a.a.a ENSGT01100000263503.A.a.b.g ENSGT01100000263503.A.a.b.h ENSGT01100000263503.A.a.a ENSGT01100000263503.A.b.b ENSGT01100000263503.A.b.a ENSGT00940000154333.b.a ENSGT01100000263494.a.b.b.b.c.b ENSGT00940000154333.b.b.b ENSGT00940000154333.b.b.a ENSGT01090000260044.A.a.a ENSGT01100000263572.a.a.a.a.b ENSGT01100000263494.a.a.b American mink MODERN SPECIES 325 ZDHHC5 (ENSNVIG00000016488) CLP1 (ENSNVIG00000016367) YPEL4 (ENSNVIG00000016300) SERPING1 (ENSNVIG00000016178) UBE2L6 (ENSNVIG00000016152) SMTNL1 (ENSNVIG00000016008) TIM10 (ENSNVIG00000015927) LAT3 (ENSNVIG00000015712) RTN4RL2 (ENSNVIG00000015654) SLC43A3 (ENSNVIG00000015344) PRG2 (ENSNVIG00000015190) P2RX3 (ENSNVIG00000015027) SSRP1 (ENSNVIG00000014957) ENSNVIG00000014927 ENSNVIG00000014866 APLNR (ENSNVIG00000014836) ##22 LRRC55 (ENSNVIG00000014798) ENSNVIG00000014771 ENSNVIG00000014753 ENSNVIG00000014652 Ferret MODERN SPECIES 413 MED19 (ENSMPUG00000000276) ZDHHC5 (ENSMPUG00000000273) CLP1 (ENSMPUG00000000268) SERPING1 (ENSMPUG00000000265) UBE2L6 (ENSMPUG00000000263) SMTNL1 (ENSMPUG00000000256) ENSMPUG00000000253 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ENSGT00950000182990.a.a.a.a ENSGT01100000263503.A.a.b.g ENSGT01100000263503.A.a.b.h ENSGT01100000263503.A.a.a ENSGT01100000263503.A.b.b ENSGT01100000263503.A.b.a ENSGT00940000154333.b.a ENSGT01100000263494.a.b.b.b.c.b ENSGT00940000154333.b.b.b ENSGT00940000154333.b.b.a ENSGT01100000263572.a.a.a.a.b ENSGT01100000263494.a.a.b ENSGT01100000263503.E.c.a.b Ursus ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00390000001774 ENSGT00940000156001 ENSGT00940000153668.B ENSGT00940000161443 ENSGT00940000159681 ENSGT00940000161981 ENSGT00940000162276 ENSGT00390000003068 ENSGT00940000153576.c.a ENSGT00940000158505 ENSGT00940000157622 ENSGT00440000039859.d ENSGT01020000230351.B ENSGT00940000157117 ENSGT00940000154184.B ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 ENSGT00940000161412 ENSGT01100000263498.a.b.b.f ENSGT00950000182990.a.a.a.a ENSGT01100000263503.A.a.b.g ENSGT01100000263503.A.a.b.h ENSGT01100000263503.A.a.a.e ENSGT01100000263503.A.b.b ENSGT01100000263503.A.b.a ENSGT00940000154333.b.a ENSGT01100000263494.a.b.b.b.c.b 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(ENSUMAG00000018258) ENSUMAG00000018253 ENSUMAG00000018250 APLNR (ENSUMAG00000018245) ##22 LRRC55 (ENSUMAG00000018241) ENSUMAG00000018237 ENSUMAG00000018226 ENSUMAG00000018221 ENSUMAG00000018212 ENSUMAG00000018204 ENSUMAG00000018194 ENSUMAG00000018191 ENSUMAG00000018186 ENSUMAG00000018182 OR9G4 (ENSUMAG00000018177) OR5AR1 (ENSUMAG00000018175) OR5AP2 (ENSUMAG00000018171) ENSUMAG00000018169 ENSUMAG00000018165 Giant Panda MODERN SPECIES 7 TMX2 (ENSAMEG00000014600) MED19 (ENSAMEG00000014583) ZDHHC5 (ENSAMEG00000014553) CLP1 (ENSAMEG00000014551) YPEL4 (ENSAMEG00000026365) SERPING1 (ENSAMEG00000014526) UBE2L6 (ENSAMEG00000014519) SMTNL1 (ENSAMEG00000014518) TIMM10 (ENSAMEG00000014516) SLC43A1 (ENSAMEG00000014486) RTN4RL2 (ENSAMEG00000025003) SLC43A3 (ENSAMEG00000014457) PRG2 (ENSAMEG00000014444) P2RX3 (ENSAMEG00000014384) ENSAMEG00000014330 APLNR (ENSAMEG00000020025) ##22 LRRC55 (ENSAMEG00000026148) ENSAMEG00000030364 ENSAMEG00000027195 ENSAMEG00000014258 ENSAMEG00000027244 ENSAMEG00000027556 ENSAMEG00000020018 ENSAMEG00000020016 OR9G4 (ENSAMEG00000020015) ENSAMEG00000020012 ENSAMEG00000028213 ENSAMEG00000030164 OR5AR1 (ENSAMEG00000001614) OR5AP2 (ENSAMEG00000018545) ENSAMEG00000018542 Felidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000001774 ENSGT00940000156001 ENSGT00940000153668.B ENSGT00940000161443 ENSGT00940000159681 ENSGT00940000161981 ENSGT00940000162276 ENSGT00390000003068 ENSGT00940000153576.c.a ENSGT00940000158505 ENSGT00940000157622 ENSGT00440000039859.c ENSGT01020000230351.B ENSGT00940000157117 ENSGT00940000154184.B ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 ENSGT00940000161412 ENSGT01100000263498.a.b.b.f ENSGT01100000263498.a.b.b.e ENSGT00950000182990.a.a.a.a.k.a ENSGT01100000263503.A.a.a ENSGT01100000263503.A.a.b.j ENSGT01100000263503.A.a.b.i ENSGT00950000182990.a.a.a.a.k.b ENSGT01100000263503.A.b.b ENSGT01100000263503.A.b.a ENSGT00940000154333.b.a ENSGT01100000263494.a.b.b.b.c.b ENSGT00940000154333.b.b.b ENSGT00940000154333.b.b.a ENSGT01090000260044.A.a.a Panthera ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00390000001774 ENSGT00940000156001 ENSGT00940000153668.B ENSGT00940000161443 ENSGT00940000159681 ENSGT00940000161981 ENSGT00940000162276 ENSGT00390000003068 ENSGT00940000153576.c.a ENSGT00940000158505 ENSGT00940000157622 ENSGT00440000039859.c ENSGT01020000230351.B ENSGT00940000157117 ENSGT00940000154184.B ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 ENSGT00940000161412 ENSGT01100000263498.a.b.b.f ENSGT01100000263498.a.b.b.e ENSGT00950000182990.a.a.a.a.k.a Panthera_a ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00390000001774 ENSGT00940000156001 ENSGT00940000153668.B ENSGT00940000161443 ENSGT00940000159681 ENSGT00940000161981 ENSGT00940000162276 ENSGT00390000003068 ENSGT00940000153576.c.a ENSGT00940000158505 ENSGT00940000157622 ENSGT00440000039859.c ENSGT01020000230351.B ENSGT00940000157117 ENSGT00940000154184.B ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 ENSGT00940000161412 leopard MODERN SPECIES 64 MED19 (ENSPPRG00000005092) ZDHHC5 (ENSPPRG00000005592) CLP1 (ENSPPRG00000006135) YPEL4 (ENSPPRG00000006761) SERPING1 (ENSPPRG00000008240) UBE2L6 (ENSPPRG00000008637) SMTNL1 (ENSPPRG00000009441) TIMM10 (ENSPPRG00000009625) ENSPPRG00000019896 SLC43A1 (ENSPPRG00000010464) ENSPPRG00000010859 SLC43A3 (ENSPPRG00000012705) P2RX3 (ENSPPRG00000014554) SSRP1 (ENSPPRG00000014894) TNKS1BP1 (ENSPPRG00000018588) APLNR (ENSPPRG00000020279) ##22 LRRC55 (ENSPPRG00000020088) lion MODERN SPECIES 10 ZDHHC5 (ENSPLOG00000010619) CLP1 (ENSPLOG00000010568) YPEL4 (ENSPLOG00000010534) SERPING1 (ENSPLOG00000010433) UBE2L6 (ENSPLOG00000010389) SMTNL1 (ENSPLOG00000010290) TIMM10 (ENSPLOG00000010253) SLC43A1 (ENSPLOG00000010181) RTN4RL2 (ENSPLOG00000010150) SLC43A3 (ENSPLOG00000010098) PRG3 (ENSPLOG00000010060) P2RX3 (ENSPLOG00000009956) SSRP1 (ENSPLOG00000009914) ENSPLOG00000009888 ENSPLOG00000009854 APLNR (ENSPLOG00000009836) ##22 LRRC55 (ENSPLOG00000009818) ENSPLOG00000009778 ENSPLOG00000009752 ENSPLOG00000009745 OR4C12 (ENSPLOG00000009739) OR4C5 (ENSPLOG00000009713) OR4C3 (ENSPLOG00000009694) ENSPLOG00000009688 ENSPLOG00000009675 OR4S1 (ENSPLOG00000009662) OR4X1 (ENSPLOG00000009647) OR4X2 (ENSPLOG00000009630) ENSPLOG00000009618 OR4B1 (ENSPLOG00000009601) PTPRJ (ENSPLOG00000008520) Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000156001 ENSGT00940000153668.B ENSGT00940000161443 ENSGT00940000159681 ENSGT00940000161981 ENSGT00940000162276 ENSGT00390000003068 ENSGT00940000153576.c.a ENSGT00940000158505 ENSGT00940000157622 ENSGT00440000039859.d ENSGT00440000039859.c ENSGT01020000230351.B ENSGT00940000157117 ENSGT00940000154184.B ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 ENSGT00940000161412 ENSGT01100000263498.a.b.b.f ENSGT01100000263498.a.b.b.e ENSGT00950000182990.a.a.a.a ENSGT01100000263503.A.a.b ENSGT01100000263503.A.a.a ENSGT01100000263503.A.b.b ENSGT00940000154333.b.b.b ENSGT00940000154333.b.b.a ENSGT01100000263503.A.b.a ENSGT00940000154333.b.a ENSGT01090000260044.A.a.a ENSGT01100000263572.a.a.a.a.b ENSGT01100000263494.a.a.b ENSGT01100000263503.E.c.a.a.a Equus ANCESTRAL SPECIES 64 ENSGT00440000039859.c.h.a.a.b ENSGT00440000039859.d.d ENSGT00440000039859.c.g.b.b ENSGT00940000157622.c.a ENSGT00440000039859.d.c.a.a.a ENSGT00440000039859.c.g.b.a.a ENSGT00440000039859.c.h.a.a.a ENSGT01020000230351.B ENSGT00940000157117 ENSGT00940000154184.B ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 ENSGT00940000161412 ENSGT01100000263498.a.b.b.f ENSGT01100000263498.a.b.b.e ENSGT00950000182990.a.a.a.a.i.b ENSGT00950000182990.a.a.a.a.i.a ENSGT01100000263503.A.a.b ENSGT01100000263503.A.a.a ENSGT01100000263503.A.b.b ENSGT00940000154333.b.b.b ENSGT00940000154333.b.b.a ENSGT01100000263503.A.b.a ENSGT01100000263494.a.b.b.b.c.b ENSGT01100000263494.a.a.b.eb ENSGT01100000263503.E.c.a.b.s ENSGT01100000263503.E.c.a.a.a Horse MODERN SPECIES 3 ENSECAG00000050731 ENSECAG00000039998 ENSECAG00000038011 ENSECAG00000006678 ENSECAG00000006504 ENSECAG00000036673 ENSECAG00000028885 ENSECAG00000044666 ENSECAG00000050689 ENSECAG00000050281 ENSECAG00000039574 ENSECAG00000045854 P2RX3 (ENSECAG00000016640) SSRP1 (ENSECAG00000056385) TNKS1BP1 (ENSECAG00000015938) APLNR (ENSECAG00000004658) ##22 LRRC55 (ENSECAG00000015698) OR5AK35 (ENSECAG00000004181) ENSECAG00000014839 ENSECAG00000013095 ENSECAG00000013249 ENSECAG00000034109 ENSECAG00000046092 OR5AP1 (ENSECAG00000003217) OR5M10 (ENSECAG00000002683) OR5M13E (ENSECAG00000042411) OR5M11 (ENSECAG00000002259) OR5M8B (ENSECAG00000002053) OR5M3 (ENSECAG00000001795) OR8U3 (ENSECAG00000000882) ENSECAG00000054529 Donkey MODERN SPECIES 8 ENSEASG00005028798 ENSEASG00005035469 ENSEASG00005023560 ENSEASG00005032541 ENSEASG00005027275 ENSEASG00005026709 ENSEASG00005037526 ENSEASG00005034314 ENSEASG00005036716 ENSEASG00005021425 ENSEASG00005037434 ENSEASG00005038328 P2RX3 (ENSEASG00005003892) SSRP1 (ENSEASG00005003883) TNKS1BP1 (ENSEASG00005003879) APLNR (ENSEASG00005003872) ##22 LRRC55 (ENSEASG00005003868) ENSEASG00005037313 ENSEASG00005037331 ENSEASG00005038636 ENSEASG00005031013 ENSEASG00005037894 ENSEASG00005025785 ENSEASG00005025650 ENSEASG00005029739 ENSEASG00005020435 ENSEASG00005024392 OR5M11 (ENSEASG00005012351) OR5M8 (ENSEASG00005034539) ENSEASG00005027089 ENSEASG00005038520 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES 56 ENSGT00390000001774 ENSGT00940000156001 ENSGT00940000153668.B ENSGT00940000161443 ENSGT00940000159681 ENSGT00940000161981 ENSGT00940000162276 ENSGT00390000003068 ENSGT00940000153576.c.a ENSGT00940000158505 ENSGT00940000157622 ENSGT00440000039859.c ENSGT01020000230351.B ENSGT00940000157117 ENSGT00940000154184.B ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 ENSGT00940000161412 ENSGT01100000263498.a.b.b.f ENSGT01100000263498.a.b.b.e ENSGT00950000182990.a.a.a.a ENSGT01100000263503.A.a.b ENSGT01100000263503.A.a.a ENSGT01100000263503.A.b.a ENSGT00940000154333.b.a ENSGT00940000154333.b.b.b ENSGT01100000263572.a.a.a.a.b ENSGT01100000263494.a.a.b ENSGT01100000263503.E.c.a.b ENSGT01100000263503.E.c.a.a.a ENSGT01100000263503.E.c.b ENSGT01100000263503.E.d.b Megabat MODERN SPECIES 2735 TNKS1BP1 (ENSPVAG00000016415) APLNR (ENSPVAG00000016413) ##22 LRRC55 (ENSPVAG00000016412) Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00390000001774 ENSGT00940000156001 ENSGT00940000153668.B ENSGT00940000161443 ENSGT00940000159681 ENSGT00940000161981 ENSGT00940000162276 ENSGT00390000003068 ENSGT00940000153576.c.a ENSGT00940000158505 ENSGT00940000157622 ENSGT00440000039859.c ENSGT01020000230351.B ENSGT00940000157117 ENSGT00940000154184.B ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 ENSGT00940000161412 ENSGT01100000263498.a.b.b.f ENSGT01100000263498.a.b.b.e ENSGT00950000182990.a.a.a.a ENSGT01100000263503.A.a.b ENSGT01100000263503.A.a.a ENSGT01100000263503.A.b.a ENSGT00940000154333.b.a ENSGT00940000154333.b.b.b ENSGT01100000263572.a.a.a.a.b ENSGT01100000263494.a.a.b ENSGT01100000263503.E.c.a.b ENSGT01100000263503.E.c.a.a.a ENSGT01100000263503.E.c.b ENSGT01100000263503.E.d.b Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 2 MED19 (ENSRFEG00010003875) ZDHHC5 (ENSRFEG00010003891) ENSRFEG00010003915 CLP1 (ENSRFEG00010003931) YPEL4 (ENSRFEG00010003943) SERPING1 (ENSRFEG00010003977) UBE2L6 (ENSRFEG00010004016) ENSRFEG00010004002 ENSRFEG00010004036 SLC43A1 (ENSRFEG00010004069) RTN4RL2 (ENSRFEG00010004085) PRG3 (ENSRFEG00010004154) P2RX3 (ENSRFEG00010006795) SSRP1 (ENSRFEG00010006947) TNKS1BP1 (ENSRFEG00010006992) APLNR (ENSRFEG00010007039) ##22 LRRC55 (ENSRFEG00010007060) ENSRFEG00010007095 ENSRFEG00010007134 ENSRFEG00010007159 ENSRFEG00010007199 ENSRFEG00010007506 OR5AR1 (ENSRFEG00010007515) OR5AP2 (ENSRFEG00010007524) ENSRFEG00010007540 ENSRFEG00010007548 ENSRFEG00010007562 OR5M11 (ENSRFEG00010007575) ENSRFEG00010007587 OR5M9 (ENSRFEG00010007602) OR8U3 (ENSRFEG00010007664) Microbat MODERN SPECIES 1034 ZDHHC5 (ENSMLUG00000007907) CLP1 (ENSMLUG00000007904) ENSMLUG00000005093 SERPING1 (ENSMLUG00000007895) UBE2L6 (ENSMLUG00000007888) SMTNL1 (ENSMLUG00000026744) TIMM10 (ENSMLUG00000007883) SLC43A1 (ENSMLUG00000007845) RTN4RL2 (ENSMLUG00000030642) SLC43A3 (ENSMLUG00000007822) ENSMLUG00000011315 ENSMLUG00000007210 P2RX3 (ENSMLUG00000007190) SSRP1 (ENSMLUG00000007168) TNKS1BP1 (ENSMLUG00000007136) APLNR (ENSMLUG00000007132) ##22 ENSMLUG00000029488 LRRC55 (ENSMLUG00000007127) ENSMLUG00000023090 ENSMLUG00000025449 ENSMLUG00000024004 ENSMLUG00000003155 ENSMLUG00000022447 ENSMLUG00000023715 ENSMLUG00000030384 ENSMLUG00000027741 OR5AR1 (ENSMLUG00000000573) OR5AP2 (ENSMLUG00000000568) ENSMLUG00000023746 ENSMLUG00000022458 OR5M11 (ENSMLUG00000027402) Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000156001 ENSGT00940000153668.B ENSGT00940000161443 ENSGT00940000159681 ENSGT00940000161981 ENSGT00940000162276 ENSGT00390000003068 ENSGT00940000153576.c.a ENSGT00940000158505 ENSGT00940000157622 ENSGT00440000039859.d ENSGT00440000039859.c ENSGT01020000230351.B ENSGT00940000157117 ENSGT00940000154184.B ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 ENSGT00940000161412 ENSGT01100000263498.a.b.b.f ENSGT01100000263498.a.b.b.e ENSGT00950000182990.a.a.a.a ENSGT01100000263503.A.a.b ENSGT01100000263503.A.a.a ENSGT01100000263503.A.b.b ENSGT00940000154333.b.a ENSGT01100000263494.a.b.b.b.c.a ENSGT00940000154333.b.b.b ENSGT00940000154333.b.b.a ENSGT01090000260044.A.a.a ENSGT01100000263572.a.a.a.a.b ENSGT01100000263494.a.a.b ENSGT01100000263503.E.c.a.b Suina ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000153668.B ENSGT00940000161443 ENSGT00940000159681 ENSGT00940000161981 ENSGT00940000162276 ENSGT00390000003068 ENSGT00940000153576.c.a ENSGT00940000158505 ENSGT00940000157622 ENSGT00440000039859.d ENSGT00440000039859.c ENSGT01020000230351.B ENSGT00940000157117 ENSGT00940000154184.B.g ENSGT00940000154184.B.h ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 ENSGT00940000161412 ENSGT01100000263498.a.b.b.f ENSGT01100000263498.a.b.b.e ENSGT01100000263503.A.a.b ENSGT01100000263503.A.a.a ENSGT01100000263503.A.b.b ENSGT01100000263503.A.b.a ENSGT01100000263494.a.b.b.b.c.b Chacoan peccary MODERN SPECIES 919 TMX2 (ENSCWAG00000006258) MED19 (ENSCWAG00000006308) ZDHHC5 (ENSCWAG00000006356) CLP1 (ENSCWAG00000006439) YPEL4 (ENSCWAG00000006475) SERPING1 (ENSCWAG00000006515) UBE2L6 (ENSCWAG00000006566) TIMM10 (ENSCWAG00000006590) SLC43A1 (ENSCWAG00000006612) RTN4RL2 (ENSCWAG00000006682) SLC43A3 (ENSCWAG00000006738) ENSCWAG00000006831 P2RX3 (ENSCWAG00000006897) SSRP1 (ENSCWAG00000007006) TNKS1BP1 (ENSCWAG00000007040) APLNR (ENSCWAG00000007072) ##22 LRRC55 (ENSCWAG00000007083) ENSCWAG00000007110 ENSCWAG00000007175 ENSCWAG00000007186 ENSCWAG00000007191 ENSCWAG00000007206 OR4C12 (ENSCWAG00000007217) OR4C6 (ENSCWAG00000007227) ENSCWAG00000007235 OR4S2 (ENSCWAG00000007243) ENSCWAG00000007250 ENSCWAG00000007274 OR4C45 (ENSCWAG00000007287) ENSCWAG00000007296 ENSCWAG00000007310 Pig MODERN SPECIES 146 ENSSSCG00000028527 APLNR (ENSSSCG00000038869) ##22 LRRC55 (ENSSSCG00000039445) ENSSSCG00000042917 ENSSSCG00000052024 ENSSSCG00000062386 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000156001 ENSGT00940000153668.B ENSGT00940000161443 ENSGT00940000159681 ENSGT00940000161981 ENSGT00940000162276 ENSGT00390000003068 ENSGT00940000153576.c.a ENSGT00940000158505 ENSGT00940000157622 ENSGT00440000039859.d ENSGT00440000039859.c ENSGT01020000230351.B ENSGT00940000157117 ENSGT00940000154184.B ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 ENSGT00940000161412 ENSGT01100000263498.a.b.b.f ENSGT01100000263498.a.b.b.e ENSGT00950000182990.a.a.a.a ENSGT01100000263503.A.a.b ENSGT01100000263503.A.b.b ENSGT00940000154333.b.a ENSGT01100000263494.a.b.b.b.c.a ENSGT00940000154333.b.b.b ENSGT01090000260044.A.a.a ENSGT01100000263572.a.a.a.a.b ENSGT01100000263494.a.a.b ENSGT01100000263503.E.c.a.b ENSGT01100000263503.E.c.a.a.b ENSGT01100000263503.E.c.a.a.a Camelidae ANCESTRAL SPECIES 74 ENSGT00940000156001 ENSGT00940000153668.B ENSGT00940000161443 ENSGT00940000159681 ENSGT00940000161981 ENSGT00940000162276 ENSGT00390000003068 ENSGT00940000153576.c.a ENSGT00940000158505 ENSGT00940000157622 ENSGT00440000039859.d ENSGT00440000039859.c ENSGT01020000230351.B ENSGT00940000157117 ENSGT00940000154184.B ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 ENSGT00940000161412 ENSGT01100000263498.a.b.b.f ENSGT01100000263498.a.b.b.e ENSGT01100000263503.A.a.b ENSGT01100000263494.a.b.b.b.c.b ENSGT00940000154333.b.b.a ENSGT01100000263572.a.a.a.a.b.c ENSGT01100000263494.a.a.b ENSGT01100000263503.E.c.a.b ENSGT01100000263503.E.c.a.a.a ENSGT01100000263503.E.c.b ENSGT01100000263503.E.d.b.d ENSGT01100000263503.E.d.a.a.b.a.a ENSGT00950000182718.A.b.b ENSGT00950000182718.A.a.a.a Arabian camel MODERN SPECIES 1 CLP1 (ENSCDRG00005001548) YPEL4 (ENSCDRG00005001567) SERPING1 (ENSCDRG00005001598) UBE2L6 (ENSCDRG00005001613) SMTNL1 (ENSCDRG00005001634) TIMM10 (ENSCDRG00005001655) SLC43A1 (ENSCDRG00005001678) ENSCDRG00005001707 SLC43A3 (ENSCDRG00005001781) ENSCDRG00005002068 PRG2 (ENSCDRG00005002080) ENSCDRG00005002097 P2RX3 (ENSCDRG00005002123) SSRP1 (ENSCDRG00005002163) TNKS1BP1 (ENSCDRG00005002203) APLNR (ENSCDRG00005002219) ##22 LRRC55 (ENSCDRG00005002226) ENSCDRG00005002234 ENSCDRG00005002243 ENSCDRG00005002259 ENSCDRG00005002272 OR9G4 (ENSCDRG00005002287) OR9G1 (ENSCDRG00005002296) ENSCDRG00005002304 OR5AP2 (ENSCDRG00005002310) ENSCDRG00005002321 ENSCDRG00005002335 ENSCDRG00005002348 ENSCDRG00005002373 OR5M11 (ENSCDRG00005002384) ENSCDRG00005002396 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000156001 ENSGT00940000153668.B ENSGT00940000161443 ENSGT00940000159681 ENSGT00940000161981 ENSGT00940000162276 ENSGT00390000003068 ENSGT00940000153576.c.a ENSGT00940000158505 ENSGT00940000157622 ENSGT00440000039859.d ENSGT00440000039859.c ENSGT01020000230351.B ENSGT00940000157117 ENSGT00940000154184.B ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 ENSGT00940000161412 ENSGT01100000263498.a.b.b.f ENSGT01100000263498.a.b.b.e ENSGT00950000182990.a.a.a.a ENSGT01100000263503.A.a.b ENSGT01100000263503.A.b.b ENSGT00940000154333.b.a ENSGT01100000263494.a.b.b.b.c.a ENSGT00940000154333.b.b.b ENSGT01090000260044.A.a.a ENSGT01100000263572.a.a.a.a.b ENSGT01100000263494.a.a.b ENSGT01100000263503.E.c.a.b ENSGT01100000263503.E.c.a.a.b ENSGT01100000263503.E.c.a.a.a Pecora ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000156001 ENSGT00940000153668.B ENSGT00940000161443 ENSGT00940000159681 ENSGT00940000161981 ENSGT00940000162276 ENSGT00390000003068 ENSGT00940000153576.c.a ENSGT00940000158505 ENSGT00940000157622 ENSGT00440000039859.c.o ENSGT00440000039859.c.p ENSGT01020000230351.B ENSGT00940000157117 ENSGT00940000154184.B ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 ENSGT00940000161412 ENSGT01100000263498.a.b.b.f.j ENSGT01100000263498.a.b.b.f.i.a ENSGT01100000263498.a.b.b.e ENSGT00950000182990.a.a.a.a ENSGT01100000263503.A.a.b ENSGT01100000263503.A.b.b ENSGT00940000154333.b.a ENSGT01100000263494.a.b.b.b.c.a ENSGT00940000154333.b.b.b ENSGT01090000260044.A.a.a ENSGT01100000263572.a.a.a.a.b ENSGT01100000263494.a.a.b ENSGT01100000263503.E.c.a.b.x ENSGT01100000263503.E.c.a.a.a.n Percora_a ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000156001 ENSGT00940000153668.B ENSGT00940000161443 ENSGT00940000159681 ENSGT00940000161981 ENSGT00940000162276 ENSGT00390000003068 ENSGT00940000153576.c.a ENSGT00940000158505 ENSGT00940000157622 ENSGT00440000039859.c.o.a ENSGT00440000039859.c.p ENSGT01020000230351.B ENSGT00940000157117.c ENSGT00940000154184.B ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 ENSGT00940000161412 ENSGT01100000263498.a.b.b.f.j ENSGT01100000263498.a.b.b.f.i.a ENSGT01100000263498.a.b.b.e.cb ENSGT01100000263496.D.b.b.a.a.b.a.a.d ENSGT00940000154261.q.b.a.b.d ENSGT00940000154970.e.a.b ENSGT00940000159605.o.b.a ENSGT00940000154261.q.a.a.a.d ENSGT00940000159605.o.b.b.b.e.a ENSGT00940000154261.q.a.a.a.c ENSGT00940000162374.p ENSGT00940000154261.q.a.a.b ENSGT00940000162374.o ENSGT00940000160829 Bovidae ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000153668.B ENSGT00940000161443 ENSGT00940000159681 ENSGT00940000161981 ENSGT00940000162276 ENSGT00390000003068 ENSGT00940000153576.c.a ENSGT00940000158505 ENSGT00940000157622 ENSGT00440000039859.c.o.a ENSGT00440000039859.c.o.b ENSGT00440000039859.c.p ENSGT01020000230351.B ENSGT00940000157117.c ENSGT00940000154184.B ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 ENSGT00940000161412 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ENSGT01100000263494.a.a.b.u ENSGT01100000263503.E.c.a.b.x Bos_b ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000161443 ENSGT00940000159681 ENSGT00940000161981 ENSGT00940000162276 ENSGT00390000003068 ENSGT00940000153576.c.a ENSGT00940000158505 ENSGT00940000157622 ENSGT00440000039859.c.o.a ENSGT00440000039859.c.o.b ENSGT00440000039859.c.p.b ENSGT00440000039859.c.p.a.b ENSGT01020000230351.B ENSGT00940000157117.c ENSGT00940000154184.B ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 ENSGT00940000161412 ENSGT01100000263498.a.b.b.f.j.c ENSGT01100000263498.a.b.b.f.j.d ENSGT01100000263498.a.b.b.f.i.a ENSGT01100000263498.a.b.b.e.cb ENSGT01100000263498.a.b.b.e.bb ENSGT01100000263498.a.b.b.f.i.b ENSGT00960000191881 ENSGT00950000182990.a.a.a.a.c.a ENSGT01100000263503.A.a.b.m ENSGT01100000263503.A.a.b.n ENSGT01100000263503.A.b.b ENSGT00940000154333.b.a ENSGT01100000263494.a.b.b.b.c.a.c.a ENSGT00940000154333.b.b.b Cow MODERN SPECIES 6 SERPING1 (ENSBTAG00000016267) UBE2L6 (ENSBTAG00000012989) SMTNL1 (ENSBTAG00000027524) TIMM10 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ENSGT01100000263503.E.c.a.b.x ENSGT01100000263503.E.c.a.a.a.n ENSGT01100000263503.E.c.b ENSGT01100000263503.E.d.a.a.b.a.b.c ENSGT01100000263503.E.d.a.a.b.b.k.d ENSGT00950000182718.A.b.b Goat MODERN SPECIES 6 ZDHHC5 (ENSCHIG00000016801) CLP1 (ENSCHIG00000023497) YPEL4 (ENSCHIG00000005124) SERPING1 (ENSCHIG00000019405) UBE2L6 (ENSCHIG00000014930) SMTNL1 (ENSCHIG00000003345) ENSCHIG00000026208 SLC43A1 (ENSCHIG00000019588) RTN4RL2 (ENSCHIG00000024464) SLC43A3 (ENSCHIG00000025279) ENSCHIG00000017206 ENSCHIG00000025766 P2RX3 (ENSCHIG00000024883) SSRP1 (ENSCHIG00000011670) TNKS1BP1 (ENSCHIG00000008865) APLNR (ENSCHIG00000023743) ##22 LRRC55 (ENSCHIG00000010200) ENSCHIG00000008843 ENSCHIG00000009111 ENSCHIG00000011557 ENSCHIG00000023672 ENSCHIG00000008046 ENSCHIG00000013539 ENSCHIG00000013635 OR5AR1 (ENSCHIG00000003529) OR5AP2 (ENSCHIG00000003672) ENSCHIG00000002363 OR5M11 (ENSCHIG00000009682) OR5M3 (ENSCHIG00000008423) ENSCHIG00000017861 ENSCHIG00000009379 Siberian musk deer MODERN SPECIES 118 MED19 (ENSMMSG00000011903) ZDHHC5 (ENSMMSG00000000030) CLP1 (ENSMMSG00000000053) YPEL4 (ENSMMSG00000000069) SERPING1 (ENSMMSG00000000093) UBE2L6 (ENSMMSG00000000140) SMTNL1 (ENSMMSG00000000152) TIMM10 (ENSMMSG00000000183) SLC43A1 (ENSMMSG00000000200) RTN4RL2 (ENSMMSG00000000215) ENSMMSG00000000234 ENSMMSG00000000254 P2RX3 (ENSMMSG00000000287) ENSMMSG00000000338 TNKS1BP1 (ENSMMSG00000000371) APLNR (ENSMMSG00000000395) ##22 LRRC55 (ENSMMSG00000000399) ENSMMSG00000000416 ENSMMSG00000000429 ENSMMSG00000000446 ENSMMSG00000000458 ENSMMSG00000000489 ENSMMSG00000000556 ENSMMSG00000000565 ENSMMSG00000000573 ENSMMSG00000000580 ENSMMSG00000000591 ENSMMSG00000000600 ENSMMSG00000000615 ENSMMSG00000000624 ENSMMSG00000000628 Cetacea ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000156001 ENSGT00940000153668.B ENSGT00940000161443 ENSGT00940000159681 ENSGT00940000161981 ENSGT00940000162276 ENSGT00390000003068 ENSGT00940000153576.c.a ENSGT00940000158505 ENSGT00940000157622 ENSGT00440000039859.d 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ENSBMSG00010005794 ENSBMSG00010005745 ENSBMSG00010022048 ENSBMSG00010022047 ENSBMSG00010022045 ENSBMSG00010022043 ENSBMSG00010022042 ENSBMSG00010022041 ENSBMSG00010022036 ENSBMSG00010022034 OR4B1 (ENSBMSG00010022033) Odontoceti ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000156001 ENSGT00940000153668.B ENSGT00940000161443 ENSGT00940000159681 ENSGT00940000161981 ENSGT00940000162276 ENSGT00390000003068 ENSGT00940000153576.c.a ENSGT00940000158505 ENSGT00940000157622 ENSGT00440000039859.d ENSGT00440000039859.c ENSGT01020000230351.B ENSGT00940000157117 ENSGT00940000154184.B ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 ENSGT00940000161412 ENSGT00940000155395 ENSGT00940000156870 ENSGT00390000000972 ENSGT00390000003450 ENSGT00940000160201 ENSGT00390000000020.b ENSGT00940000161832.a ENSGT00940000154479.a ENSGT00390000017480 ENSGT00940000158775 ENSGT00390000014065 ENSGT00940000158970 ENSGT00390000016785 ENSGT01020000230346.E Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000156001 ENSGT00940000153668.B ENSGT00940000161443 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SLC43A3 (ENSPSNG00000014958) PRG2 (ENSPSNG00000014726) PRG3 (ENSPSNG00000014488) P2RX3 (ENSPSNG00000014188) SSRP1 (ENSPSNG00000014073) TNKS1BP1 (ENSPSNG00000013998) APLNR (ENSPSNG00000013960) ##22 LRRC55 (ENSPSNG00000013862) ENSPSNG00000012905 PTPRJ (ENSPSNG00000012615) NUP160 (ENSPSNG00000012237) FNBP4 (ENSPSNG00000012146) AGBL2 (ENSPSNG00000012052) MTCH2 (ENSPSNG00000011989) ENSPSNG00000011949 FAM180B (ENSPSNG00000011919) NDUFS3 (ENSPSNG00000011780) KBTBD4 (ENSPSNG00000011651) PTPMT1 (ENSPSNG00000011591) CELF1 (ENSPSNG00000011349) RAPSN (ENSPSNG00000010989) PSMC3 (ENSPSNG00000010889) Dolphin MODERN SPECIES 6176 APLNR (ENSTTRG00000015255) ##22 Sperm whale MODERN SPECIES 7 LRP4 (ENSPCTG00005019305) ENSPCTG00005019663 NR1H3 (ENSPCTG00005019704) ENSPCTG00005019900 CELF1 (ENSPCTG00005020176) NDUFS3 (ENSPCTG00005020272) FAM180B (ENSPCTG00005020314) ENSPCTG00005020333 ENSPCTG00005020351 AGBL2 (ENSPCTG00005020384) FNBP4 (ENSPCTG00005020443) NUP160 (ENSPCTG00005020494) PTPRJ (ENSPCTG00005020731) OR8K5 (ENSPCTG00005021273) ENSPCTG00005021353 APLNR (ENSPCTG00005021748) ##22 LRRC55 (ENSPCTG00005021755) UBE2L6 (ENSPCTG00005021768) SERPING1 (ENSPCTG00005021786) YPEL4 (ENSPCTG00005021807) CLP1 (ENSPCTG00005021820) ZDHHC5 (ENSPCTG00005021830) MED19 (ENSPCTG00005021852) TMX2 (ENSPCTG00005021876) SELENOH (ENSPCTG00005021896) BTBD18 (ENSPCTG00005021901) CTNND1 (ENSPCTG00005021925) ENSPCTG00005021986 OR10Q1 (ENSPCTG00005022004) LPXN (ENSPCTG00005004373) CNTF (ENSPCTG00005004440) Coelacanth MODERN SPECIES 732 UNC93B1 (ENSLACG00000000145) cryba1l2 (ENSLACG00000002101) crybb1l2 (ENSLACG00000003067) ENSLACG00000003417 ENSLACG00000003864 ENSLACG00000022355 APLNR (ENSLACG00000005190) ##22 ENSLACG00000006110 ENSLACG00000006624 ENSLACG00000006688 CORO1B (ENSLACG00000007741) ENSLACG00000008259 ANKRD13D (ENSLACG00000008964) PPP1CA (ENSLACG00000009376) RAD9A (ENSLACG00000009659) POLD4 (ENSLACG00000010841) ENSLACG00000011413 ENSLACG00000011590 MRPL18 (ENSLACG00000012028) ENSLACG00000012450 KDM2A (ENSLACG00000012832) GRK2 (ENSLACG00000013299) Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 Neopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 252 ENSGT00510000047881 ENSGT00940000158446 ENSGT00940000160394.a.a ENSGT00390000007640.b.b ENSGT00940000156152.e.a.b ENSGT00940000159848.a ENSGT00940000156124.c.a.b ENSGT00940000160630 ENSGT00940000164059 ENSGT00930000151062 ENSGT00940000159837 ENSGT00940000160226.j ENSGT00940000153571.b ENSGT00730000111696.b ENSGT00990000203615.a.a.a.a ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 ENSGT00940000153899.b.b ENSGT01020000230346.E ENSGT00390000000020.b ENSGT00390000003450 ENSGT00390000000972 ENSGT00940000161051.a.a.b.b.b.a Asian bonytongue MODERN SPECIES 22 c1qtnf4 (ENSSFOG00015025161) pacsin3 (ENSSFOG00015019453) ambra1a (ENSSFOG00015019495) CHRM4 (ENSSFOG00015019529) mdkb (ENSSFOG00015019534) DGKZ (ENSSFOG00015019562) creb3l1 (ENSSFOG00015019727) phf21aa (ENSSFOG00015019755) zgc:110699 (ENSSFOG00015029583) atg13 (ENSSFOG00015019823) ENSSFOG00015019940 SYT13 (ENSSFOG00015024876) fbxo3 (ENSSFOG00015019965) ENSSFOG00015019991 ENSSFOG00015027821 aplnr2 (ENSSFOG00015025805) ##22 tmem17 (ENSSFOG00015020031) psmc3 (ENSSFOG00015020046) mtch2 (ENSSFOG00015020075) fnbp4 (ENSSFOG00015020087) nup160 (ENSSFOG00015020108) npsn (ENSSFOG00015020194) arfgap2 (ENSSFOG00015020216) ENSSFOG00015020264 large2 (ENSSFOG00015020290) thraa (ENSSFOG00015024188) DHX8 (ENSSFOG00015024187) etv4 (ENSSFOG00015024186) ENSSFOG00015029737 meox1 (ENSSFOG00015024185) SOST (ENSSFOG00015028325) P. kingsleyae MODERN SPECIES 16 ambra1a (ENSPKIG00000012478) CHRM4 (ENSPKIG00000012549) mdkb (ENSPKIG00000012563) DGKZ (ENSPKIG00000012653) ENSPKIG00000012837 creb3l1 (ENSPKIG00000012854) phf21aa (ENSPKIG00000012884) zgc:110699 (ENSPKIG00000012910) atg13 (ENSPKIG00000012989) ENSPKIG00000013122 SYT13 (ENSPKIG00000013155) ENSPKIG00000013179 fbxo3 (ENSPKIG00000013214) ENSPKIG00000013256 ENSPKIG00000013288 aplnr2 (ENSPKIG00000013312) ##22 tmem17 (ENSPKIG00000013336) psmc3 (ENSPKIG00000013380) mtch2 (ENSPKIG00000013448) fnbp4 (ENSPKIG00000013476) nup160 (ENSPKIG00000013522) coq9 (ENSPKIG00000013593) exoc3l1 (ENSPKIG00000013668) septin15 (ENSPKIG00000013804) islr2 (ENSPKIG00000013860) ENSPKIG00000013876 cyp11a1.1 (ENSPKIG00000013911) stoml1 (ENSPKIG00000013950) nr2e3 (ENSPKIG00000013983) ENSPKIG00000014042 ENSPKIG00000014056 Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 243 ENSGT00390000007640.b.a ENSGT00940000156152.e.b ENSGT00940000156152.e.a.a ENSGT00940000159848 ENSGT00940000156124.c.a ENSGT00940000166946 ENSGT00940000154348.c.b.a.b ENSGT00390000007055 ENSGT01030000234629.E.b ENSGT00940000160630 ENSGT00940000164059 ENSGT00930000151062 ENSGT00940000160226 ENSGT00940000153571.b ENSGT00730000111696.a ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 261 ENSGT00940000160394.a ENSGT00390000007640.b.a ENSGT00940000156152.e.a.a ENSGT00940000159848 ENSGT00940000156124.c.a ENSGT00940000166946 ENSGT00940000154348.c.b.a.b ENSGT00390000007055 ENSGT01030000234629.E.b ENSGT00940000160630 ENSGT00940000164059 ENSGT00930000151062 ENSGT00940000160226 ENSGT00940000153571.b ENSGT00730000111696.a ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 Otophysi ANCESTRAL SPECIES 62 ENSGT00940000160394.a ENSGT00390000007640.b.a ENSGT00940000156152.e.a.a ENSGT00940000159848 ENSGT00940000156124.c.a ENSGT00940000166946 ENSGT00940000154348.c.b.a.b ENSGT00390000007055 ENSGT01030000234629.E.b ENSGT00940000160630 ENSGT00940000164059 ENSGT00930000151062 ENSGT00940000160226 ENSGT00940000153571.b ENSGT00730000111696.a ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 ENSGT01020000230346.E ENSGT00390000000020.b ENSGT00940000154856.A.a.c.a.a ENSGT00940000154856.A.a.c.a.b.a.b ENSGT00940000163716.c.a.a.b ENSGT00940000161832.a ENSGT00390000017480 ENSGT00390000014065 ENSGT00940000158970 ENSGT00420000029858 ENSGT00940000156370 ENSGT00730000111020.a ENSGT00940000166619 ENSGT00940000153837.a.b ENSGT00940000156469.b Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000160394.a ENSGT00390000007640.b.a ENSGT00940000156152.e.a.a ENSGT00940000159848 ENSGT00940000156124.c.a ENSGT00940000166946 ENSGT00940000154348.c.b.a.b ENSGT00390000007055 ENSGT01030000234629.E.b ENSGT00940000160630 ENSGT00940000164059 ENSGT00930000151062 ENSGT00940000160226.g ENSGT00940000153571.b ENSGT00730000111696.a ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 ENSGT01020000230346.E ENSGT00390000000020.b ENSGT00940000154856.A.a.c.a.a ENSGT00940000161051.a.a.b.b.a ENSGT00940000163716.c.a.a.b ENSGT00940000154856.A.a.c.a.b.a.b ENSGT00940000161832.a ENSGT00390000017480 ENSGT00390000014065 ENSGT00940000158970 ENSGT00420000029858 ENSGT00940000156370 ENSGT00730000111020.a ENSGT00940000166619 ENSGT00940000153837.a.b Channel catfish MODERN SPECIES 19 mdk (ENSIPUG00000001143) DGKZ (ENSIPUG00000001160) creb3l1 (ENSIPUG00000001219) phf21aa (ENSIPUG00000001251) ENSIPUG00000001262 zgc:110699 (ENSIPUG00000001274) atg13 (ENSIPUG00000001289) ENSIPUG00000001334 arhgap1 (ENSIPUG00000001355) sema4e (ENSIPUG00000001466) f2 (ENSIPUG00000002533) znf408 (ENSIPUG00000002563) syt13 (ENSIPUG00000002574) fbxo3 (ENSIPUG00000002597) cd59 (ENSIPUG00000002641) aplnr2 (ENSIPUG00000002662) ##22 Psmc3 (ENSIPUG00000002665) mtch2 (ENSIPUG00000002703) ENSIPUG00000002810 ENSIPUG00000002816 ENSIPUG00000002822 mfng (ENSIPUG00000002831) SULT3A1 (ENSIPUG00000002834) MAN2B1 (ENSIPUG00000002847) trmt1 (ENSIPUG00000002899) slc8a1a (ENSIPUG00000002955) tmem178a (ENSIPUG00000002995) ENSIPUG00000003011 ugt1b2 (ENSIPUG00000003020) ENSIPUG00000003035 stx10 (ENSIPUG00000003070) Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00940000160394.a ENSGT00390000007640.b.a ENSGT00940000156152.e.a.a ENSGT00940000159848 ENSGT00940000156124.c.a ENSGT00940000166946 ENSGT00940000154348.c.b.a.b ENSGT00390000007055 ENSGT01030000234629.E.b ENSGT00940000160630 ENSGT00940000164059 ENSGT00930000151062 ENSGT00940000160226.g ENSGT00940000153571.b ENSGT00730000111696.a ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 ENSGT01020000230346.E ENSGT00390000000020.b ENSGT00940000154856.A.a.c.a.a.e ENSGT00940000163716.c.a.a.b.bb ENSGT00940000161832.a ENSGT00390000017480 ENSGT00390000014065 ENSGT00940000158970 ENSGT00420000029858 ENSGT00940000156370 ENSGT00730000111020.a ENSGT00940000166619 ENSGT00940000153837.a.b ENSGT00940000156469.b ENSGT00940000160021 Electric eel MODERN SPECIES 683 syt13 (ENSEEEG00000013585) fbxo3 (ENSEEEG00000013584) cd59 (ENSEEEG00000013582) aplnr2 (ENSEEEG00000013581) ##22 psmc3 (ENSEEEG00000013580) mtch2 (ENSEEEG00000013578) c6ast1 (ENSEEEG00000013575) dnaja2a (ENSEEEG00000013573) cdca9 (ENSEEEG00000013572) gpt2 (ENSEEEG00000013513) zgc:92818 (ENSEEEG00000013499) mylk3 (ENSEEEG00000013493) orc6 (ENSEEEG00000013490) vps35 (ENSEEEG00000013488) hrh3 (ENSEEEG00000013473) Characoidei ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00390000007640.b.a ENSGT00940000156152.e.a.a ENSGT00940000159848 ENSGT00940000156124.c.a ENSGT00940000166946 ENSGT00940000154348.c.b.a.b ENSGT00390000007055 ENSGT01030000234629.E.b ENSGT00940000160630 ENSGT00940000164059 ENSGT00930000151062 ENSGT00940000160226.g ENSGT00940000153571.b ENSGT00730000111696.a ENSGT00950000183116.b.a.a.b.a.b.d ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 ENSGT01020000230346.E ENSGT00390000000020.b ENSGT00940000154856.A.a.c.a.a.f ENSGT00940000161051.a.a.b.b.a ENSGT00940000154856.A.a.c.a.a.e ENSGT00940000163716.c.a.a.b.cb ENSGT00940000154856.A.a.c.a.b.a.b ENSGT00940000161832.a ENSGT00390000017480 ENSGT00390000014065 ENSGT00940000158970 ENSGT00420000029858 ENSGT00940000156370 ENSGT00730000111020.a ENSGT00940000166619 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 547 cd59 (ENSPNAG00000007124) ENSPNAG00000024572 psmc3 (ENSPNAG00000024546) aplnr2 (ENSPNAG00000024511) ##22 mtch2 (ENSPNAG00000024499) ENSPNAG00000024475 SLC12A4 (ENSPNAG00000007123) SLC6A2 (ENSPNAG00000024430) lpcat2 (ENSPNAG00000024356) mmp2 (ENSPNAG00000006306) irx6a (ENSPNAG00000024284) Mexicana tetra MODERN SPECIES 33 ENSAMXG00000035733 ENSAMXG00000043904 creb3l1 (ENSAMXG00000035815) phf21aa (ENSAMXG00000021466) zgc:110699 (ENSAMXG00000030692) harbi1 (ENSAMXG00000021383) atg13 (ENSAMXG00000021375) ENSAMXG00000021369 arhgap1 (ENSAMXG00000021366) f2 (ENSAMXG00000021260) znf408 (ENSAMXG00000032642) syt13 (ENSAMXG00000039565) fbxo3 (ENSAMXG00000031303) cd59 (ENSAMXG00000031797) ENSAMXG00000029219 aplnr2 (ENSAMXG00000043579) ##22 psmc3 (ENSAMXG00000030799) mtch2 (ENSAMXG00000042983) c6ast1 (ENSAMXG00000029889) npsn (ENSAMXG00000021040) ENSAMXG00000029532 c6ast1 (ENSAMXG00000037710) ENSAMXG00000042761 ENSAMXG00000020828 ENSAMXG00000020723 ENSAMXG00000042170 c6ast3 (ENSAMXG00000020667) c1qtnf4 (ENSAMXG00000042152) ndufs3 (ENSAMXG00000039139) ptpmt1 (ENSAMXG00000032591) celf1 (ENSAMXG00000020576) Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000160394.a ENSGT00390000007640.b.a ENSGT00940000156152.e.a.a ENSGT00940000159848 ENSGT00940000156124.c.a ENSGT00940000166946 ENSGT00940000154348.c.b.a.b ENSGT00390000007055 ENSGT01030000234629.E.b ENSGT00940000160630 ENSGT00940000164059.d ENSGT00930000151062 ENSGT00940000160226 ENSGT00940000153571.b ENSGT00730000111696.a ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 ENSGT01020000230346.E ENSGT00390000000020.b ENSGT00940000154856.A.a.c.a.a ENSGT00940000161051.a.a.b.b.a ENSGT00940000154856.A.a.c.a.b.a.b.i ENSGT00940000163716.c.a.a.b ENSGT00940000161832.a ENSGT00390000017480 ENSGT00390000014065 ENSGT00940000158970 ENSGT00420000029858 ENSGT00940000156370 ENSGT00730000111020.a ENSGT00940000166619 ENSGT00940000153837.a.b Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000158446.x ENSGT00390000016223.o.a ENSGT00940000160394.a.d ENSGT00390000007640.b.a.b ENSGT00940000156152.e.a.a.b ENSGT00940000159848.d ENSGT00940000156124.c.a.d ENSGT00940000166946.a ENSGT00940000154348.c.b.a.b ENSGT00390000007055.g ENSGT00940000160630.g.b ENSGT00930000151062.h ENSGT00940000160226.e ENSGT00940000153571.b.h ENSGT00730000111696.a.i ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 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ENSGT00390000014065.d ENSGT00940000158970.c.b ENSGT00420000029858.f ENSGT00940000156370.q ENSGT00730000111020.a.h ENSGT00940000166619.a Golden-line barbel DUPLICATION Golden-line barbel MODERN SPECIES 507 SLC8B1 (ENSSGRG00000042914) SNX1 (ENSSGRG00000042081) acp2 (ENSSGRG00000042055) ambra1a (ENSSGRG00000042051) CHRM4 (ENSSGRG00000042046) mdka (ENSSGRG00000042043) DGKZ (ENSSGRG00000041904) zgc:110699 (ENSSGRG00000041883) atg13 (ENSSGRG00000041610) ENSSGRG00000041598 f2 (ENSSGRG00000041567) znf408 (ENSSGRG00000041565) syt13 (ENSSGRG00000041563) fbxo3 (ENSSGRG00000041443) cd59 (ENSSGRG00000041437) aplnr2 (ENSSGRG00000041436) ##22 psmc3 (ENSSGRG00000041285) mtch2 (ENSSGRG00000040716) npsn (ENSSGRG00000040708) c6ast3 (ENSSGRG00000040707) ENSSGRG00000040686 c1qtnf4 (ENSSGRG00000040683) ndufs3 (ENSSGRG00000040673) ptpmt1 (ENSSGRG00000040658) celf1 (ENSSGRG00000040650) nudt19 (ENSSGRG00000040648) SLC7A9 (ENSSGRG00000040647) zgc:165481 (ENSSGRG00000040644) SYMPK (ENSSGRG00000040642) cep89 (ENSSGRG00000040637) rhpn2 (ENSSGRG00000040252) Golden-line barbel MODERN SPECIES 708 CHRM4 (ENSSGRG00000051548) mdka (ENSSGRG00000051547) ENSSGRG00000051546 DGKZ (ENSSGRG00000051476) creb3l1 (ENSSGRG00000051462) phf21aa (ENSSGRG00000051461) zgc:110699 (ENSSGRG00000051460) atg13 (ENSSGRG00000051289) ENSSGRG00000051287 arhgap1 (ENSSGRG00000051285) f2 (ENSSGRG00000051279) ENSSGRG00000051278 syt13 (ENSSGRG00000051277) fbxo3 (ENSSGRG00000051276) cd59 (ENSSGRG00000051275) aplnr2 (ENSSGRG00000051274) ##22 psmc3 (ENSSGRG00000051273) mtch2 (ENSSGRG00000051231) npsn (ENSSGRG00000051152) c6ast3 (ENSSGRG00000051149) c6ast3 (ENSSGRG00000051148) c1qtnf4 (ENSSGRG00000051147) ndufs3 (ENSSGRG00000051140) ptpmt1 (ENSSGRG00000051136) celf1 (ENSSGRG00000051134) nudt19 (ENSSGRG00000051133) SLC7A9 (ENSSGRG00000051130) Common carp reference MODERN SPECIES CHRM4 (ENSCCRG00000075300) mdka (ENSCCRG00000041763) DGKZ (ENSCCRG00000045328) creb3l1 (ENSCCRG00000016787) phf21aa (ENSCCRG00000010347) zgc:110699 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ENSGT00390000003443 ENSGT00940000153377.C ENSGT00950000182956.b.b.a.b ENSGT00950000182931.B.a.a.g ENSGT00390000001536 ENSGT00940000154795 ENSGT00530000063554.a ENSGT01030000234592.A.b.b.a.b.b.b ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 ENSGT00940000160061 ENSGT00950000183194.a.a ENSGT00950000183194.b ENSGT00390000006791 ENSGT01020000230394.e.a.a.a.a.a ENSGT00940000157810 ENSGT00940000158319 ENSGT00940000177234 ENSGT00940000157255.c.a ENSGT00940000165903 ENSGT00940000164657 ENSGT00950000182818.B.b ENSGT00950000183093.A.a ENSGT00810000125439.B.c.b ENSGT01100000263537.b.a.b Ballan wrasse MODERN SPECIES 246 pus7 (ENSLBEG00000011849) zgc:172339 (ENSLBEG00000011901) aplnr2 (ENSLBEG00000011908) ##22 hdac10 (ENSLBEG00000011985) parvb (ENSLBEG00000012232) parvg (ENSLBEG00000012301) SHISAL1 (ENSLBEG00000012346) plxnb2b (ENSLBEG00000012494) TUBGCP6 (ENSLBEG00000012650) appl2 (ENSLBEG00000012708) ENSLBEG00000012790 NUAK1 (ENSLBEG00000012814) ENSLBEG00000012849 szl (ENSLBEG00000012889) prl2 (ENSLBEG00000012937) ENSLBEG00000013023 NELL2 (ENSLBEG00000013108) TMEM117 (ENSLBEG00000013219) Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000156361.A.b ENSGT00940000156642.b ENSGT00940000158861.A ENSGT00940000157097.g ENSGT00390000013709.b ENSGT00940000159852.b ENSGT00940000164990.c ENSGT00390000003443 ENSGT00940000153377.C ENSGT00950000182956.b.b.a.b ENSGT00950000182931.B.a.a.g ENSGT00390000001536 ENSGT00940000154795 ENSGT00530000063554.a ENSGT01030000234592.A.b.b.a.b.b.b ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 ENSGT00940000160061 ENSGT00950000183194.a.a ENSGT00950000183194.b ENSGT00390000006791 ENSGT01020000230394.e.a.a.a.a.a ENSGT00940000157810 ENSGT00940000158319 ENSGT00940000177234 ENSGT00940000157255.c.a ENSGT00940000165903 ENSGT00940000164657 ENSGT00950000182818.B.b ENSGT00950000183093.A.a ENSGT00810000125439.B.c.b ENSGT01100000263537.b.a.b Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000156361.A.b ENSGT00940000156642.b ENSGT00940000158861.A ENSGT00940000157097.g ENSGT00390000013709.b ENSGT00940000159852.b ENSGT00940000164990.c ENSGT00390000003443 ENSGT00940000153377.C ENSGT00950000182956.b.b.a.b ENSGT00950000182931.B.a.a.g ENSGT00390000001536 ENSGT00940000154795 ENSGT00530000063554.a ENSGT01030000234592.A.b.b.a.b.b.b ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 ENSGT00940000160061 ENSGT00950000183194.a.a ENSGT00950000183194.b ENSGT00390000006791 ENSGT01020000230394.e.a.a.a.a.a ENSGT00940000157810 ENSGT00940000158319 ENSGT00940000177234 ENSGT00940000157255.c.a ENSGT00940000165903 ENSGT00940000164657 ENSGT00950000182818.B.b ENSGT00950000183093.A.a ENSGT00810000125439.B.c.b ENSGT01100000263537.b.a.b Gilthead seabream MODERN SPECIES 22 ENSSAUG00010026827 fbln1 (ENSSAUG00010026766) WNT7B (ENSSAUG00010026747) pparab (ENSSAUG00010026739) yars2 (ENSSAUG00010026737) cdkn1bb (ENSSAUG00010026734) ENSSAUG00010026707 mrps35 (ENSSAUG00010026700) ENSSAUG00010026698 ENSSAUG00010026668 DENND2A (ENSSAUG00010026619) ADCK2 (ENSSAUG00010026615) ENSSAUG00010026530 pus7 (ENSSAUG00010026487) zgc:172339 (ENSSAUG00010026485) aplnr2 (ENSSAUG00010026484) ##22 hdac10 (ENSSAUG00010026471) parvb (ENSSAUG00010026441) parvg (ENSSAUG00010026439) SHISAL1 (ENSSAUG00010026435) plxnb2b (ENSSAUG00010025990) TUBGCP6 (ENSSAUG00010025930) appl2 (ENSSAUG00010025467) NUAK1 (ENSSAUG00010025463) ENSSAUG00010025448 szl (ENSSAUG00010025443) prl2 (ENSSAUG00010025441) ENSSAUG00010025439 NELL2 (ENSSAUG00010024772) ENSSAUG00010024750 TMEM117 (ENSSAUG00010024749) Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000156361.A.b ENSGT00940000156642.b ENSGT00940000158861.A ENSGT00940000157097.g ENSGT00390000013709.b ENSGT00940000159852.b ENSGT00940000164990.c ENSGT00390000003443 ENSGT00940000153377.C ENSGT00950000182956.b.b.a.b ENSGT00950000182931.B.a.a.g ENSGT00390000001536 ENSGT00940000154795 ENSGT00530000063554.a ENSGT01030000234592.A.b.b.a.b.b.b ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 ENSGT00940000160061 ENSGT00950000183194.a.a ENSGT00950000183194.b ENSGT00390000006791 ENSGT01020000230394.e.a.a.a.a.a ENSGT00940000157810 ENSGT00940000158319 ENSGT00940000177234 ENSGT00940000157255.c.a ENSGT00940000165903 ENSGT00940000164657 ENSGT00950000182818.B.b ENSGT00950000183093.A.a ENSGT00810000125439.B.c.b ENSGT01100000263537.b.a.b Large yellow croaker MODERN SPECIES 492 ENSLCRG00005010995 fbln1 (ENSLCRG00005011007) WNT7B (ENSLCRG00005011021) pparab (ENSLCRG00005011024) yars2 (ENSLCRG00005011026) cdkn1bb (ENSLCRG00005011028) ENSLCRG00005011031 mrps35 (ENSLCRG00005011036) ENSLCRG00005011038 ENSLCRG00005011042 DENND2A (ENSLCRG00005011306) ADCK2 (ENSLCRG00005011334) ENSLCRG00005011357 pus7 (ENSLCRG00005012376) zgc:172339 (ENSLCRG00005012387) aplnr2 (ENSLCRG00005012388) ##22 hdac10 (ENSLCRG00005012390) parvb (ENSLCRG00005012409) parvg (ENSLCRG00005012488) SHISAL1 (ENSLCRG00005012490) plxnb2b (ENSLCRG00005012544) TUBGCP6 (ENSLCRG00005016205) appl2 (ENSLCRG00005016251) NUAK1 (ENSLCRG00005016912) ENSLCRG00005016915 szl (ENSLCRG00005017017) prl2 (ENSLCRG00005017019) ENSLCRG00005017021 NELL2 (ENSLCRG00005017029) TMEM117 (ENSLCRG00005018681) twf1a (ENSLCRG00005018687) Perciformes ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000156361.A.b ENSGT00940000156642.b ENSGT00940000158861.A ENSGT00940000157097.g ENSGT00390000013709.b ENSGT00940000159852.b ENSGT00940000164990.c ENSGT00390000003443 ENSGT00940000153377.C ENSGT00950000182956.b.b.a.b ENSGT00950000182931.B.a.a.g ENSGT00390000001536 ENSGT00940000154795 ENSGT00530000063554.a ENSGT01030000234592.A.b.b.a.b.b.b ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 ENSGT00940000160061 ENSGT00950000183194.a.a ENSGT00950000183194.b ENSGT00390000006791 ENSGT01020000230394.e.a.a.a.a.a ENSGT00940000157810 ENSGT00940000158319 ENSGT00940000157255.c.a ENSGT00940000165903 ENSGT00940000164657 ENSGT00950000182818.B.b ENSGT00950000183093.A.a ENSGT00810000125439.B.c.b ENSGT01100000263537.b.a.b ENSGT00390000013052 Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000156361.A.b ENSGT00940000156642.b ENSGT00940000158861.A ENSGT00940000157097.g ENSGT00390000013709.b ENSGT00940000159852.b ENSGT00940000164990.c ENSGT00390000003443 ENSGT00940000153377.C ENSGT00950000182956.b.b.a.b ENSGT00950000182931.B.a.a.g ENSGT00390000001536 ENSGT00940000154795 ENSGT00530000063554.a ENSGT01030000234592.A.b.b.a.b.b.b ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 ENSGT00940000160061 ENSGT00950000183194.a.a ENSGT00950000183194.b ENSGT00390000006791 ENSGT01020000230394.e.a.a.a.a.a ENSGT00940000157810 ENSGT00940000158319 ENSGT00940000157255.c.a ENSGT00940000165903 ENSGT00940000164657 ENSGT00950000182818.B.b ENSGT00950000183093.A.a ENSGT00810000125439.B.c.b ENSGT01100000263537.b.a.b ENSGT00390000013052 Pike perch MODERN SPECIES 6 ENSSLUG00000014627 fbln1 (ENSSLUG00000014196) WNT7B (ENSSLUG00000014101) pparab (ENSSLUG00000014089) yars2 (ENSSLUG00000014085) cdkn1bb (ENSSLUG00000014080) ENSSLUG00000014073 mrps35 (ENSSLUG00000014066) ENSSLUG00000014056 ENSSLUG00000013925 DENND2A (ENSSLUG00000013886) ADCK2 (ENSSLUG00000013866) ENSSLUG00000013827 pus7 (ENSSLUG00000012759) zgc:172339 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ENSGT00950000182956.b.b.a.b ENSGT00950000182931.B.a.a.g ENSGT00390000001536 ENSGT00940000154795 ENSGT00530000063554.a ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 ENSGT00940000160061 ENSGT00950000183194.a.a ENSGT00950000183194.b ENSGT00390000006791 ENSGT01020000230394.e.a.a.a.a.a ENSGT00940000157810 ENSGT00940000158319 ENSGT00940000177234 ENSGT00940000157255.c.a ENSGT00940000165903 ENSGT00940000164657 ENSGT00950000182818.B.b ENSGT00950000183093.A.a ENSGT00810000125439.B.c.b ENSGT00390000013052 Fugu MODERN SPECIES 21 AKR1D1 (ENSTRUG00000016401) ENSTRUG00000016412 fbln1 (ENSTRUG00000016430) WNT7B (ENSTRUG00000016453) pparab (ENSTRUG00000016463) yars2 (ENSTRUG00000016475) cdkn1bb (ENSTRUG00000024873) ENSTRUG00000016483 mrps35 (ENSTRUG00000016486) ENSTRUG00000021058 TEAD4 (ENSTRUG00000016489) DENND2A (ENSTRUG00000016500) ADCK2 (ENSTRUG00000016512) ENSTRUG00000016517 pus7 (ENSTRUG00000016532) aplnr2 (ENSTRUG00000016544) ##22 hdac10 (ENSTRUG00000016566) parvg (ENSTRUG00000016590) SHISAL1 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ENSTNIG00000015977 szl (ENSTNIG00000015978) prl2 (ENSTNIG00000001813) ENSTNIG00000015979 NELL2 (ENSTNIG00000015980) TMEM117 (ENSTNIG00000015981) twf1a (ENSTNIG00000015982) Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000156361.A.b ENSGT00940000156642.b ENSGT00940000158861.A ENSGT00940000157097.g ENSGT00390000013709.b ENSGT00940000159852.b ENSGT00940000164990.c ENSGT00390000003443 ENSGT00940000153377.C ENSGT00950000182956.b.b.a.b ENSGT00950000182931.B.a.a.g ENSGT00390000001536 ENSGT00940000154795 ENSGT00530000063554.a ENSGT01030000234592.A.b.b.a.b.b.b ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 ENSGT00940000160061 ENSGT00950000183194.a.a ENSGT00950000183194.b ENSGT00390000006791 ENSGT01020000230394.e.a.a.a.a.a ENSGT00940000157810 ENSGT00940000158319 ENSGT00610000087444 ENSGT00940000157255.c.a ENSGT00940000165903 ENSGT00940000164657 ENSGT00950000182818.B.b ENSGT00950000183093.A.a ENSGT00810000125439.B.c.b ENSGT01100000263537.b.a.b Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000156361.A.b ENSGT00940000156642.b ENSGT00940000158861.A ENSGT00940000157097.g ENSGT00390000013709.b ENSGT00940000159852.b ENSGT00940000164990.c ENSGT00390000003443 ENSGT00940000153377.C ENSGT00950000182956.b.b.a.b ENSGT00950000182931.B.a.a.g ENSGT00390000001536 ENSGT00940000154795 ENSGT00530000063554.a ENSGT01030000234592.A.b.b.a.b.b.b ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 ENSGT00940000160061 ENSGT00950000183194.a.a ENSGT00950000183194.b ENSGT00390000006791 ENSGT01020000230394.e.a.a.a.a.a ENSGT00940000157810 ENSGT00940000158319 ENSGT00610000087444 ENSGT00940000157255.c.a ENSGT00940000165903 ENSGT00940000164657 ENSGT00950000183093.A.a ENSGT00810000125439.B.c.b ENSGT00390000013052 ENSGT01100000263537.b.a.b Zig-zag eel MODERN SPECIES 20 ENSMAMG00000023139 fbln1 (ENSMAMG00000023141) WNT7B (ENSMAMG00000023142) pparab (ENSMAMG00000023143) yars2 (ENSMAMG00000023144) cdkn1bb (ENSMAMG00000023145) ENSMAMG00000023146 ENSMAMG00000023147 ENSMAMG00000023148 ENSMAMG00000023149 ENSMAMG00000023150 ENSMAMG00000023151 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ENSGT00730000111696.a.b ENSGT01020000230346.E.b ENSGT00390000000020.b.x ENSGT00940000161051.a.a.b.b.b.a.o Salmo ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00940000160394.a.e ENSGT00390000007640.b.b.n.a.b ENSGT00940000156152.e.a.a.d ENSGT00940000159848.e.b ENSGT00940000156124.c.a.e.a ENSGT00940000166946.c ENSGT00940000154348.c.b.a.b ENSGT00390000007055.n.a ENSGT00940000160630.f ENSGT00940000164059.e ENSGT00930000151062.k ENSGT00940000159837.e.a ENSGT00940000160226.d ENSGT00940000153571.b.a ENSGT00730000111696.a.a ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 ENSGT01020000230346.E.a ENSGT00390000000020.b.y ENSGT00940000154856.A.a.c.a.a.l ENSGT00940000154856.A.a.c.a.b.a.b.b ENSGT00940000161051.a.a.b.b.b.a.p ENSGT00940000154856.A.a.c.a.a.k ENSGT00940000163716.c.a.a.b ENSGT00390000002105.e ENSGT00940000157182.g.b.a ENSGT01090000260003.a.a.a.a ENSGT00940000161128.e.a ENSGT00940000158825.c.a ENSGT00940000160601 ENSGT00940000166897.d ENSGT00940000157816.a.b.c Atlantic salmon MODERN SPECIES 18 ambra1a (ENSSSAG00000009870) CHRM4 (ENSSSAG00000111835) MDK (ENSSSAG00000015295) DGKZ (ENSSSAG00000015434) creb3l1 (ENSSSAG00000032234) phf21aa (ENSSSAG00000033080) harbi1 (ENSSSAG00000079577) atg13 (ENSSSAG00000041473) arhgap1 (ENSSSAG00000041564) ENSSSAG00000085852 f2 (ENSSSAG00000041686) ENSSSAG00000083929 ENSSSAG00000041993 fbxo3 (ENSSSAG00000100816) cd59 (ENSSSAG00000042007) aplnr2 (ENSSSAG00000042495) ##22 ENSSSAG00000042508 mtch2 (ENSSSAG00000043064) ENSSSAG00000033317 lce (ENSSSAG00000112923) ENSSSAG00000084746 hce2 (ENSSSAG00000043141) ENSSSAG00000043164 ENSSSAG00000103946 ano1a (ENSSSAG00000043408) BAX (ENSSSAG00000053164) fgf3 (ENSSSAG00000109242) fgf4 (ENSSSAG00000053180) lto1 (ENSSSAG00000053185) ccnd1 (ENSSSAG00000082383) tpcn2 (ENSSSAG00000053215) River trout MODERN SPECIES 21 pacsin3 (ENSSTUG00000010035) acp2 (ENSSTUG00000009962) ambra1a (ENSSTUG00000009841) CHRM4 (ENSSTUG00000009805) MDK (ENSSTUG00000009795) DGKZ (ENSSTUG00000009277) creb3l1 (ENSSTUG00000009242) phf21aa (ENSSTUG00000008605) 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ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 ENSGT01020000230346.E.a ENSGT00390000000020.b.y ENSGT00940000163716.c.a.b ENSGT00940000163716.c.a.a.b.z ENSGT00390000002105.e ENSGT00940000157182.g.b.a ENSGT01090000260003.a.a.a.a ENSGT00940000161128.e.a ENSGT00940000158825.c.a ENSGT00940000160601 ENSGT00940000166897.d ENSGT00940000157816.a.b.c ENSGT00940000159763.p.b ENSGT00390000010152.b ENSGT00390000000417.a.b.l Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016223.h.a.a ENSGT00940000160394.a.e ENSGT00390000007640.b.b.n.a.b ENSGT00940000156152.e.a.a.d ENSGT00940000159848.e.b ENSGT00940000156124.c.a.f ENSGT00940000166946.c ENSGT00390000007055.n.a ENSGT00940000160630.f ENSGT00940000164059.e ENSGT00930000151062.k ENSGT00940000159837.e.a ENSGT00940000160226.d ENSGT00940000153571.b.a ENSGT00730000111696.a.a ENSGT01050000244888.b.b.a.a ##22 ENSGT01020000230346.E.a ENSGT00390000000020.b.y ENSGT00940000163716.c.a.b ENSGT00940000163716.c.a.a.b.y ENSGT00940000163716.c.a.a.b.z ENSGT00390000002105.e 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ENSGT00940000153998.b ENSGT00940000153883.a ENSGT00940000154495.b.b ENSGT00940000156855 ENSGT00940000161662 ENSGT01020000230351.A ENSGT00390000010194 ENSGT00950000185268 ENSGT00940000161539 Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 138 ENSGT00390000014845 ENSGT00940000157987 ENSGT00730000112955 ENSGT00390000005772 ENSGT00530000063370.b ENSGT00730000111291 ENSGT01050000244888.b.b.a.b ##22 ENSGT00940000154540.b ENSGT00940000153998.b ENSGT00940000153883.a ENSGT00940000161655 ENSGT00940000154284.b ENSGT00940000156855 ENSGT00940000161662 ENSGT01020000230351.A ENSGT00390000010194 ENSGT00950000185268 ENSGT00940000161539 ENSGT00390000002626 ENSGT00950000182923.C ENSGT01030000234567.A.b ENSGT00390000004019 Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 48 ENSGT00390000005772 ENSGT00530000063370.b ENSGT00730000111291 ENSGT01050000244888.b.b.a.b ##22 ENSGT00940000154540.b ENSGT00940000153998.b ENSGT00940000161655 ENSGT00940000154284.b ENSGT00940000156855 ENSGT00940000161662 ENSGT01020000230351.A ENSGT00390000010194 ENSGT00950000185268 ENSGT00940000161539 ENSGT00390000002626 ENSGT00950000182923.C ENSGT01030000234567.A.b ENSGT00390000004019 ENSGT00940000160650 Amniota ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000157386 ENSGT00730000111077 ENSGT00390000013684 ENSGT00940000171034 ENSGT00940000159671 ENSGT00940000160650 ENSGT00390000004019 ENSGT01030000234567.A.b ENSGT00950000182923.C ENSGT00390000002626 ENSGT00530000063370.b ENSGT00730000111291 ENSGT00940000163638 ENSGT00390000011578 ENSGT00940000157987 ENSGT01050000244888.b.b.a.b ##22 ENSGT00940000153998.b ENSGT00940000161655 ENSGT00940000154284.b ENSGT00940000156855 ENSGT00940000161662 ENSGT01020000230351.A ENSGT00390000010194 ENSGT00950000185268 ENSGT00940000161539 Mammalia ANCESTRAL SPECIES 35 ENSGT00940000157386 ENSGT00730000111077 ENSGT00390000013684 ENSGT00940000171034 ENSGT00940000159671 ENSGT00940000160650 ENSGT00390000004019 ENSGT00940000162077 ENSGT00950000182923.C ENSGT00390000002626 ENSGT00530000063370.b ENSGT00730000111291 ENSGT00940000163638 ENSGT00390000011578 ENSGT00940000157987 ENSGT01050000244888.b.b.a.b ##22 ENSGT00940000153998.b ENSGT00940000161655 ENSGT00940000154284.b ENSGT00940000156855 ENSGT00940000161662 ENSGT00940000157468.a.b ENSGT00940000153876.B ENSGT00390000003682 ENSGT00910000144226 ENSGT00530000063869.B ENSGT00950000183174.A ENSGT00390000018566 ENSGT00390000003209 ENSGT00940000161891 ENSGT00940000154089.b Theria ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00730000111077 ENSGT00390000013684 ENSGT00940000171034 ENSGT00940000159671 ENSGT00940000160650 ENSGT00390000004019 ENSGT00940000162077 ENSGT00940000162471 ENSGT00950000182923.C ENSGT00390000002626 ENSGT00530000063370.b ENSGT00730000111291 ENSGT00940000163638 ENSGT00390000011578 ENSGT00940000157987 ENSGT01050000244888.b.b.a.b ##22 ENSGT00940000153998.b ENSGT00940000161655 ENSGT00940000154284.b ENSGT00940000156855 ENSGT00940000161662 ENSGT00390000014107.a.a ENSGT00940000159133 ENSGT00390000017774 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000153340.B ENSGT00390000012071 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ENSCPBG00000007488 ENSCPBG00000007485 ENSCPBG00000007482 ENSCPBG00000007480 ##22 ENSCPBG00000007477 MORC2 (ENSCPBG00000007473) SMTN (ENSCPBG00000007432) SELENOM (ENSCPBG00000007421) INPP5J (ENSCPBG00000007417) PLA2G3 (ENSCPBG00000007408) ENSCPBG00000007403 ENSCPBG00000007398 POLE (ENSCPBG00000007382) ENSCPBG00000007368 PXMP2 (ENSCPBG00000007366) ENSCPBG00000007316 Testudinidae ANCESTRAL SPECIES 40 ENSGT00950000183018.a.c ENSGT00390000013777 ENSGT00940000161893 ENSGT00940000155991 ENSGT00940000165465 ENSGT00940000162366 ENSGT00940000154849.b ENSGT00940000154191 ENSGT00390000013711 ENSGT00940000161542 ENSGT00940000160943.p ENSGT00940000158715 ENSGT00940000153110.D ENSGT00550000075100 ENSGT01030000235175.b.b.a ENSGT01050000244888.b.b.a.b ##22 ENSGT00940000153998.b ENSGT00940000161655 ENSGT00940000154284.b ENSGT00960000189450 ENSGT00940000156855 ENSGT00940000161662 ENSGT00510000046406.f.b.a.a.a.a ENSGT00510000046406.f.b.a.a.a.b ENSGT00940000162007 ENSGT01020000230351.A ENSGT00390000010194 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ENSGT00940000154284.b ENSGT00960000189450 ENSGT00940000156855 ENSGT00940000161662 ENSGT01020000230351.A ENSGT00390000010194 ENSGT00830000128447.b ENSGT00940000160448 ENSGT00940000153899.b.a ENSGT01020000230351.F ENSGT00940000154297.B ENSGT00940000154637 ENSGT00390000017663 Neognathae ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT01050000244888.b.b.a.b ##22 ENSGT00940000153998.b ENSGT00940000161655 ENSGT00940000154284.b ENSGT00960000189450 ENSGT00940000156855 ENSGT00940000161662 ENSGT01020000230351.A ENSGT00390000010194 ENSGT00830000128447.b ENSGT00940000160448 ENSGT00940000153899.b.a ENSGT01020000230351.F ENSGT00940000154297.B ENSGT00940000154637 ENSGT00390000017663 Galloanserae ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00390000007971 ENSGT01050000244888.b.b.a.b ##22 ENSGT00940000153998.b ENSGT00940000161655 ENSGT00940000154284.b ENSGT00940000156855 ENSGT00940000161662 ENSGT01020000230351.A ENSGT00390000010194 ENSGT00830000128447.b ENSGT00940000160448 ENSGT00940000153899.b.a ENSGT01020000230351.F ENSGT00940000154297.B ENSGT00940000154637 ENSGT00390000017663 ENSGT00950000183101.b Anatidae ANCESTRAL SPECIES 66 ENSGT00390000007971 ENSGT01050000244888.b.b.a.b ##22 ENSGT00940000153998.b ENSGT00940000161655 ENSGT00940000156855 ENSGT00940000161662 ENSGT01020000230351.A ENSGT00390000010194 ENSGT00940000160448 ENSGT00940000153899.b.a ENSGT01020000230351.F ENSGT00940000154297.B ENSGT00940000154637 ENSGT00390000017663 ENSGT00950000183101.b ENSGT00390000006265.b ENSGT00940000160711 Pink-footed goose MODERN SPECIES 462 ENSABRG00000008107 ENSABRG00000008119 ##22 MORC2 (ENSABRG00000008124) SMTN (ENSABRG00000008164) SELENOM (ENSABRG00000008243) Duck MODERN SPECIES 7 SNRNP35 (ENSAPLG00000015654) RILPL2 (ENSAPLG00000015655) RILPL1 (ENSAPLG00000025541) TMED2 (ENSAPLG00000015561) DDX55 (ENSAPLG00000015032) EIF2B1 (ENSAPLG00000014771) GTF2H3 (ENSAPLG00000014734) TCTN2 (ENSAPLG00000014650) ATP6V0A2 (ENSAPLG00000014518) DNAH10 (ENSAPLG00000014113) CCDC92 (ENSAPLG00000014106) RFLNA (ENSAPLG00000013994) NCOR2 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ENSGT00830000128447.b ENSGT00940000160448 ENSGT00940000153899.b.a ENSGT01020000230351.F ENSGT00940000154297.B ENSGT00940000154637 ENSGT00390000017663 ENSGT00950000183101.b Phasianidae_b ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000158557 ENSGT00940000157442 ENSGT01030000234517.E ENSGT00940000155307.b ENSGT00940000162372 ENSGT00390000015428 ENSGT00940000160605 ENSGT00730000111247 ENSGT00910000144281 ENSGT00940000155735 ENSGT00940000157251 ENSGT00940000159876 ENSGT00940000153110.D ENSGT00550000075100 ENSGT00390000007971 ENSGT01050000244888.b.b.a.b ##22 ENSGT00940000153998.b ENSGT00940000161655 ENSGT00940000154284.b ENSGT00940000156855 ENSGT00940000161662 ENSGT01020000230351.A ENSGT00390000010194 ENSGT00830000128447.b ENSGT00940000160448 ENSGT00940000153899.b.a ENSGT01020000230351.F ENSGT00940000154297.B ENSGT00940000154637 ENSGT00390000017663 ENSGT00950000183101.b Chicken MODERN SPECIES 6 RAB35 (ENSGALG00010020845) BICDL1 (ENSGALG00010020865) CIT (ENSGALG00010020981) PRKAB1 (ENSGALG00010023322) 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ENSCJPG00005014557 VSIG10 (ENSCJPG00005014564) ENSCJPG00005014565 DDX54 (ENSCJPG00005014566) ENSCJPG00005014567 ENSCJPG00005014568 ##22 MORC2 (ENSCJPG00005014569) SMTN (ENSCJPG00005014570) SELENOM (ENSCJPG00005014571) INPP5J (ENSCJPG00005014572) PLA2G3 (ENSCJPG00005014573) P2RX2 (ENSCJPG00005014574) POLE (ENSCJPG00005014575) ENSCJPG00005014593 ENSCJPG00005014594 AIFM3 (ENSCJPG00005014595) ENSCJPG00005014596 P2RX6 (ENSCJPG00005014597) LRRC74B (ENSCJPG00005014598) SLC7A4 (ENSCJPG00005014599) ENSCJPG00005014600 Neognathae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT01050000244888.b.b.a.b ##22 Neognathae_c ANCESTRAL SPECIES ENSGT01050000244888.b.b.a.b ##22 Golden eagle MODERN SPECIES 45 MAST1 (ENSACCG00020012900) GCDH (ENSACCG00020012495) FARSA (ENSACCG00020012442) CALR (ENSACCG00020012401) ENSACCG00020012367 ENSACCG00020012344 ENSACCG00020012313 NFIX (ENSACCG00020012251) ACP5 (ENSACCG00020012114) ELOF1 (ENSACCG00020011902) CNN1 (ENSACCG00020011842) ECSIT (ENSACCG00020014443) ZNF653 (ENSACCG00020014427) ELAVL3 (ENSACCG00020014411) ENSACCG00020014373 ENSACCG00020014355 ##22 Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00390000006208.b ENSGT00940000157386 ENSGT00730000111077 ENSGT00390000013684 ENSGT00940000171034 ENSGT00940000159671 ENSGT00940000160650 ENSGT00390000004019 ENSGT01030000234567.A.b ENSGT00950000182923.C ENSGT00390000002626 ENSGT00530000063370.b ENSGT00730000111291 ENSGT00940000163638 ENSGT00940000157987 ENSGT01050000244888.b.b.a.b ##22 ENSGT00940000153998.b ENSGT00940000154495.b.a.b ENSGT00960000189450 ENSGT00940000156855 ENSGT00940000161662 ENSGT00510000046406.f.b.a.a.a.b ENSGT00940000162007 ENSGT01020000230351.A ENSGT00390000010194 ENSGT00940000161539 ENSGT00940000160711 ENSGT00390000006265.b ENSGT00950000183101.b ENSGT00390000017663 ENSGT00940000154637 Episquamata ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000161542 ENSGT00730000111077 ENSGT00390000013684 ENSGT00940000171034 ENSGT00940000159671 ENSGT00940000160650 ENSGT00390000004019 ENSGT01030000234567.A.b ENSGT00950000182923.C ENSGT00390000002626 ENSGT00530000063370.b ENSGT00730000111291 ENSGT00940000163638 ENSGT00940000157987 ENSGT00940000161909 ENSGT01050000244888.b.b.a.b ##22 ENSGT00940000153998.b ENSGT00940000154495.b.a.b ENSGT00960000189450 ENSGT00940000156855 ENSGT00940000161662 ENSGT00510000046406.f.b.b ENSGT00940000162007 ENSGT01020000230351.A ENSGT00390000010194 ENSGT00940000161539 ENSGT00940000160711 ENSGT00390000006265.b ENSGT00950000183101.b ENSGT00390000017663 ENSGT00940000154637 Laterata ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000154191 ENSGT00390000013711 ENSGT00940000161542 ENSGT00730000111077 ENSGT00390000013684 ENSGT00940000159671 ENSGT00940000160650 ENSGT00390000004019 ENSGT00950000182923.C ENSGT00390000002626 ENSGT00530000063370.b ENSGT00730000111291 ENSGT00940000163638 ENSGT00940000157987 ENSGT00940000161909 ENSGT01050000244888.b.b.a.b ##22 ENSGT00940000153998.b ENSGT00960000189450 ENSGT00940000156855 ENSGT00940000161662 ENSGT00510000046406.f.b.b ENSGT00940000162007 ENSGT01020000230351.A ENSGT00390000010194 ENSGT00940000161539 ENSGT00940000160711 ENSGT00390000006265.b ENSGT00950000183101.b ENSGT00390000017663 ENSGT00940000154637 ENSGT00940000154297.B Common wall lizard MODERN SPECIES 7 RHBDD3 (ENSPMRG00000023720) SF3A1 (ENSPMRG00000023723) CCDC157 (ENSPMRG00000023727) RNF215 (ENSPMRG00000023730) SEC14L2 (ENSPMRG00000023732) MTFP1 (ENSPMRG00000023735) PES1 (ENSPMRG00000023737) TCN2 (ENSPMRG00000023740) SLC35E4 (ENSPMRG00000023743) ENSPMRG00000015330 DUSP21 (ENSPMRG00000015334) OSBP2 (ENSPMRG00000015377) ENSPMRG00000015457 LSM8 (ENSPMRG00000015458) ENSPMRG00000015463 ENSPMRG00000015464 ##22 MORC2 (ENSPMRG00000015489) ENSPMRG00000015537 ENSPMRG00000015553 SELENOM (ENSPMRG00000015581) INPP5J (ENSPMRG00000015591) PLA2G3 (ENSPMRG00000015620) ENSPMRG00000015647 P2RX2 (ENSPMRG00000015686) POLE (ENSPMRG00000015970) PXMP2 (ENSPMRG00000016641) RTN4R (ENSPMRG00000016653) ENSPMRG00000016686 ENSPMRG00000016806 SCARF2 (ENSPMRG00000016809) ENSPMRG00000016814 Argentine black and white tegu MODERN SPECIES 41 RHBDD3 (ENSSMRG00000018105) EMID1 (ENSSMRG00000018106) SF3A1 (ENSSMRG00000018107) CCDC157 (ENSSMRG00000018111) RNF215 (ENSSMRG00000018112) SEC14L2 (ENSSMRG00000018113) MTFP1 (ENSSMRG00000018114) GAL3ST1 (ENSSMRG00000018116) PES1 (ENSSMRG00000018118) TCN2 (ENSSMRG00000018120) SLC35E4 (ENSSMRG00000018121) ENSSMRG00000018122 DUSP21 (ENSSMRG00000018123) OSBP2 (ENSSMRG00000018126) ENSSMRG00000018129 ENSSMRG00000018130 ##22 MORC2 (ENSSMRG00000018131) ARL6IP4 (ENSSMRG00000018133) PITPNM2 (ENSSMRG00000018134) MPHOSPH9 (ENSSMRG00000018521) MTRFR (ENSSMRG00000018523) ENSSMRG00000018525 SBNO1 (ENSSMRG00000018526) ENSSMRG00000018530 RILPL2 (ENSSMRG00000018531) SNRNP35 (ENSSMRG00000018532) RILPL1 (ENSSMRG00000018533) TMED2 (ENSSMRG00000018535) DDX55 (ENSSMRG00000018536) ENSSMRG00000018549 EIF2B1 (ENSSMRG00000018551) Toxicofera ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000013711 ENSGT00730000111077 ENSGT00390000013684 ENSGT00940000171034 ENSGT00940000159671 ENSGT00940000160650 ENSGT00390000004019 ENSGT01030000234567.A.b ENSGT00950000182923.C ENSGT00390000002626 ENSGT00530000063370.b ENSGT00730000111291 ENSGT00940000163638 ENSGT00940000157987 ENSGT00940000161909 ENSGT01050000244888.b.b.a.b ##22 ENSGT00940000153998.b ENSGT00940000154495.b.b ENSGT00940000154284.b ENSGT00940000156855 ENSGT00940000161662 ENSGT00510000046406.f.b.b ENSGT00940000162007 ENSGT01020000230351.A ENSGT00390000010194 ENSGT00940000160711 ENSGT00390000006265.b ENSGT00950000183101.b ENSGT00390000017663 ENSGT00940000154637 ENSGT00940000173122 Elapidae ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00390000013711 ENSGT00730000111077 ENSGT00390000013684 ENSGT00940000171034 ENSGT00940000159671 ENSGT00940000160650 ENSGT00390000004019 ENSGT00950000182923.C ENSGT00390000002626 ENSGT00530000063370.b ENSGT00730000111291 ENSGT00940000163638 ENSGT00940000157987.b ENSGT00940000157987.a ENSGT00940000161909 ENSGT01050000244888.b.b.a.b ##22 ENSGT00940000153998.b ENSGT00940000154495.b.a.b ENSGT00940000154284.b ENSGT00940000156855 ENSGT00940000161662 ENSGT00510000046406.f.b.b ENSGT00940000162007 ENSGT01020000230351.A ENSGT00390000010194 ENSGT00430000031027.a ENSGT00940000154642 ENSGT00950000182881.a.b.a.a ENSGT00570000079101.b ENSGT00390000013143 ENSGT00960000189785 Indian cobra MODERN SPECIES 16 RHBDD3 (ENSNNAG00000016971) SF3A1 (ENSNNAG00000016911) ENSNNAG00000016895 RNF215 (ENSNNAG00000016873) ENSNNAG00000016863 SEC14L2 (ENSNNAG00000016858) MTFP1 (ENSNNAG00000016849) GAL3ST1 (ENSNNAG00000016837) PES1 (ENSNNAG00000016723) TCN2 (ENSNNAG00000016711) SLC35E4 (ENSNNAG00000016708) ENSNNAG00000016687 DUSP21 (ENSNNAG00000016679) OSBP2 (ENSNNAG00000016553) ENSNNAG00000016529 ENSNNAG00000016523 ##22 ENSNNAG00000016509 SELENOM (ENSNNAG00000016501) ENSNNAG00000016497 PLA2G3 (ENSNNAG00000016481) ENSNNAG00000016100 ENSNNAG00000016069 ENSNNAG00000016059 ENSNNAG00000016050 ENSNNAG00000016039 ENSNNAG00000016030 CCDC92 (ENSNNAG00000016021) DNAH10 (ENSNNAG00000015200) ATP6V0A2 (ENSNNAG00000014968) TCTN2 (ENSNNAG00000014874) GTF2H3 (ENSNNAG00000014837) Elapidae_a ANCESTRAL SPECIES 67 ENSGT00940000154191.d ENSGT00390000013711 ENSGT00730000111077 ENSGT00390000013684 ENSGT00940000171034 ENSGT00940000159671 ENSGT00940000160650 ENSGT00390000004019 ENSGT00950000182923.C ENSGT00390000002626 ENSGT00530000063370.b ENSGT00730000111291 ENSGT00940000163638 ENSGT00940000157987.a ENSGT00940000161909 ENSGT01050000244888.b.b.a.b ##22 ENSGT00940000153998.b ENSGT00940000154495.b.a.b ENSGT00940000154284.b ENSGT00940000156855 ENSGT00940000161662 ENSGT00510000046406.f.b.b ENSGT00940000162007 ENSGT01020000230351.A ENSGT00390000010194 ENSGT00430000031027.a ENSGT00940000154642 ENSGT00950000182881.a.b.a.a ENSGT00570000079101.b ENSGT00390000013143 ENSGT00960000189785 Acanthophiinae ANCESTRAL SPECIES 65 ENSGT00390000013711 ENSGT00730000111077 ENSGT00390000013684 ENSGT00940000171034 ENSGT00940000159671 ENSGT00940000160650 ENSGT00390000004019 ENSGT00950000182923.C ENSGT00390000002626 ENSGT00530000063370.b ENSGT00730000111291 ENSGT00940000163638 ENSGT00940000157987.a ENSGT00940000161909 ENSGT00940000157987.b ENSGT01050000244888.b.b.a.b ##22 ENSGT00940000153998.b ENSGT00940000154495.b.a.b ENSGT00940000154284.b ENSGT00940000156855 ENSGT00940000161662 ENSGT00510000046406.f.b.b ENSGT00940000162007 ENSGT01020000230351.A ENSGT00390000010194 ENSGT00430000031027.a ENSGT00940000154642 ENSGT00950000182881.a.b.a.a ENSGT00570000079101.b ENSGT00390000013143 ENSGT00960000189785 Mainland tiger snake MODERN SPECIES 383 OSBP2 (ENSNSUG00000015744) ENSNSUG00000015743 ##22 MORC2 (ENSNSUG00000015648) ENSNSUG00000015643 SELENOM (ENSNSUG00000015642) INPP5J (ENSNSUG00000015554) PLA2G3 (ENSNSUG00000015549) ENSNSUG00000015548 ENSNSUG00000015547 ISG15 (ENSNSUG00000015546) P2RX2 (ENSNSUG00000015539) ENSNSUG00000015538 ENSNSUG00000015537 CCDC92 (ENSNSUG00000015536) Eastern brown snake MODERN SPECIES 206 GAS2L1 (ENSPTXG00000017245) ENSPTXG00000017243 ENSPTXG00000017238 SF3A1 (ENSPTXG00000017232) ENSPTXG00000017229 RNF215 (ENSPTXG00000017225) SEC14L2 (ENSPTXG00000017199) MTFP1 (ENSPTXG00000017189) GAL3ST1 (ENSPTXG00000017185) PES1 (ENSPTXG00000017178) TCN2 (ENSPTXG00000017173) SLC35E4 (ENSPTXG00000017169) DUSP21 (ENSPTXG00000017168) ENSPTXG00000017164 ENSPTXG00000017160 ENSPTXG00000017156 ##22 MORC2 (ENSPTXG00000016385) ENSPTXG00000016359 SELENOM (ENSPTXG00000016357) ENSPTXG00000016348 PLA2G3 (ENSPTXG00000016335) ENSPTXG00000016332 Blue-lipped sea krait MODERN SPECIES 10966 ENSLLTG00000006287 ##22 tuatara MODERN SPECIES 262 OSBP2 (ENSSPUG00000006940) ENSSPUG00000006978 ENSSPUG00000006987 ENSSPUG00000006992 ENSSPUG00000007004 ##22 MORC2 (ENSSPUG00000007020) SMTN (ENSSPUG00000007048) SELENOM (ENSSPUG00000007082) ENSSPUG00000007301 ENSSPUG00000007383 P2RX2 (ENSSPUG00000007946) POLE (ENSSPUG00000007979) PXMP2 (ENSSPUG00000008039) Anura ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT01090000260024.A.a.b.a.b.a.a ENSGT01060000248581.B.b ENSGT01030000234606.a.b.d ENSGT00940000160962 ENSGT00390000006103 ENSGT00940000158452 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(ENSLLEG00000017121) ENSLLEG00000017094 ENSLLEG00000016864 ENSLLEG00000014871 PXMP2 (ENSLLEG00000014755) PES1 (ENSLLEG00000014644) ENSLLEG00000014623 Frog MODERN SPECIES ENSXETG00000043687 ENSXETG00000001739 ENSXETG00000038334 ENSXETG00000047680 ENSXETG00000031185 ENSXETG00000049016 slc39a2 (ENSXETG00000001746) mettl17 (ENSXETG00000001747) parp2 (ENSXETG00000001748) tep1 (ENSXETG00000001751) hnrnpc (ENSXETG00000016162) pex2 (ENSXETG00000016160) ENSXETG00000047054 ENSXETG00000016158 znf219 (ENSXETG00000035438) ENSXETG00000040464 ##22 ENSXETG00000038641 morc2 (ENSXETG00000016156) smtn (ENSXETG00000016155) ENSXETG00000043855 ENSXETG00000016154 pla2g3 (ENSXETG00000016153) P2RX2 (ENSXETG00000016152) pole (ENSXETG00000016151) ENSXETG00000047324 pxmp2 (ENSXETG00000024780) pes1 (ENSXETG00000030097) gal3st1 (ENSXETG00000038299) zp3.2 (ENSXETG00000016148) mtfp1 (ENSXETG00000016147) sec14l3 (ENSXETG00000016146) Coelacanth MODERN SPECIES 282 ENSLACG00000011965 ENSLACG00000014234 ENSLACG00000015935 dgcr6 (ENSLACG00000016307) SLC7A4 (ENSLACG00000016390) ENSLACG00000016512 ENSLACG00000016582 CCDC117 (ENSLACG00000016617) ENSLACG00000016683 osbp2b (ENSLACG00000016791) mzt2b (ENSLACG00000017149) LZTR1 (ENSLACG00000017170) AIFM3 (ENSLACG00000017350) si:dkey-98f17.5 (ENSLACG00000017433) slc2a11b (ENSLACG00000017550) aplnra (ENSLACG00000017753) ##22 ENSLACG00000017793 ENSLACG00000017831 MORC2 (ENSLACG00000017848) ENSLACG00000017933 ENSLACG00000018095 INPP5J (ENSLACG00000018176) ENSLACG00000018216 ENSLACG00000018284 Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES 121 ENSGT00940000154849.b ENSGT00940000154191 ENSGT00390000013711 ENSGT00940000161542 ENSGT00940000160943 ENSGT00940000158715 ENSGT00390000017663 ENSGT00940000154637 ENSGT00390000013684 ENSGT00730000111077 ENSGT00940000157386 ENSGT01050000244888.b.b.a.b ##22 ENSGT00940000154540.b ENSGT00940000153998.b ENSGT00940000153883.a ENSGT00940000161655 ENSGT00940000154284.b ENSGT00940000177369 ENSGT00940000156855 ENSGT00940000165179 ENSGT00940000157468.a.b ENSGT00940000153876.B ENSGT00940000177505 ENSGT00390000003682 ENSGT00910000144226 ENSGT00530000063869.B ENSGT00950000183174.A Neopterygii ANCESTRAL SPECIES 154 ENSGT00730000112955 ENSGT00940000157987 ENSGT00940000165465 ENSGT00940000155991 ENSGT00940000154849.b ENSGT00940000154191 ENSGT00390000013711 ENSGT00940000161542 ENSGT00940000160943 ENSGT00940000158715 ENSGT00390000017663 ENSGT00940000154637 ENSGT00390000013684 ENSGT00730000111077 ENSGT00940000157386.a ENSGT01050000244888.b.b.a.b ##22 ENSGT00940000154540.b ENSGT00940000153998.b ENSGT00940000153883.a ENSGT00530000063509.B ENSGT00940000161536 ENSGT00840000129953 Osteoglossocephalai DUPLICATION Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 187 ENSGT00940000153892.B ENSGT00940000158699 ENSGT00940000156664.c ENSGT00950000183160.B ENSGT00390000016776 ENSGT00940000159022 ENSGT00390000016836.a ENSGT00430000031027.a ENSGT00940000160943 ENSGT00940000158715 ENSGT00390000017663 ENSGT00940000154637 ENSGT00390000013684 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ENSGT00940000160943 ENSGT00940000158715 ENSGT00390000017663 ENSGT00940000154637 ENSGT00940000171034 ENSGT00390000013684 ENSGT00730000111077 ENSGT00940000157386.a ENSGT00940000178234 ENSGT01050000244888.b.b.a.b.c ##22 ENSGT00530000063474.B.e.a ENSGT00940000154575.a.a ENSGT00940000158903.lb ENSGT00390000015354.d.a.a ENSGT00940000154717.pc.b ENSGT00390000012719.b.b ENSGT00390000018674 ENSGT00940000154601.h.b ENSGT00940000164235.a ENSGT00940000155794.h ENSGT00940000159252.b.a ENSGT00940000158555.a.a ENSGT00390000016504 ENSGT01030000235079 ENSGT00390000007349.b Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT01030000234627.a.b.a.b.a ENSGT00940000159783 ENSGT00940000156664.d ENSGT00940000154764 ENSGT00940000159022 ENSGT00390000016836.a ENSGT00430000031027.a ENSGT00940000160943 ENSGT00940000158715 ENSGT00390000017663 ENSGT00940000154637 ENSGT00390000013684 ENSGT00730000111077 ENSGT00940000157386.a ENSGT00940000178234 ENSGT01050000244888.b.b.a.b.c ##22 ENSGT00530000063474.B.e.a 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(ENSOKIG00005029580) hnf1a (ENSOKIG00005029605) zgc:162025 (ENSOKIG00005029679) Chinook salmon MODERN SPECIES 3 ENSOTSG00005047275 fzd10 (ENSOTSG00005047276) RIMBP2 (ENSOTSG00005047277) ADGRD1 (ENSOTSG00005047279) ulk1a (ENSOTSG00005047286) EP400 (ENSOTSG00005047287) ncor2 (ENSOTSG00005047291) rflna (ENSOTSG00005047305) ccdc92 (ENSOTSG00005047306) DTX1 (ENSOTSG00005047311) RASAL1 (ENSOTSG00005029585) dgcr6 (ENSOTSG00005029633) slc7a4 (ENSOTSG00005029634) sf3a1 (ENSOTSG00005029638) TBC1D10A (ENSOTSG00005029879) aplnra (ENSOTSG00005030705) ##22 hpdb (ENSOTSG00005030710) RHOF (ENSOTSG00005030763) ORAI1 (ENSOTSG00005030765) kdm2ba (ENSOTSG00005030768) rnf34a (ENSOTSG00005030773) anapc5 (ENSOTSG00005030776) ENSOTSG00005030779 ENSOTSG00005030790 ggt5a (ENSOTSG00005030791) asphd2 (ENSOTSG00005030792) cabp1a (ENSOTSG00005030793) mlec (ENSOTSG00005030794) unc119.1 (ENSOTSG00005030796) zgc:162025 (ENSOTSG00005030798) hnf1a (ENSOTSG00005030801) Rainbow trout MODERN SPECIES 2 ENSOMYG00000011145 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ENSGT00390000009488 ENSGT00940000155477 ENSGT00940000164321.c Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000163762.b ENSGT00940000156611 ENSGT00390000016543.c ENSGT00940000165688 ENSGT00390000003282.A ENSGT00390000014879.c.a.a.b ENSGT00940000160943 ENSGT00940000158715 ENSGT00390000017663 ENSGT00940000154637 ENSGT00940000171034 ENSGT00390000013684 ENSGT00730000111077 ENSGT00940000157386.a ENSGT00940000178234 ENSGT01050000244888.b.b.a.b.c ##22 ENSGT00530000063474.B.e.a ENSGT00940000154575.a.a ENSGT00940000158903.lb ENSGT00390000015354.d.a.a ENSGT00940000154717.pc.b ENSGT00390000012719.b.b ENSGT00500000044987 ENSGT00390000002096 ENSGT00940000159904 ENSGT00940000154442 ENSGT00390000006780 ENSGT00940000158323.h ENSGT00390000009488 ENSGT00940000155477 ENSGT00940000164321.c Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000157955.d.b ENSGT00940000155945.i.b ENSGT00940000163762.b ENSGT00940000156611 ENSGT00390000016543.c ENSGT00940000165688 ENSGT00390000003282.A ENSGT00390000014879.c.a.a.b 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11 ENSGT00940000155945.i.b ENSGT00940000163762.b ENSGT00940000156611 ENSGT00390000016543.c ENSGT00940000165688 ENSGT00390000003282.A ENSGT00390000014879.c.a.a.b ENSGT00940000160943 ENSGT00940000158715 ENSGT00390000017663 ENSGT00940000154637 ENSGT00940000171034 ENSGT00390000013684 ENSGT00730000111077 ENSGT00940000157386.a ENSGT01050000244888.b.b.a.b.c ##22 ENSGT00530000063474.B.e.a ENSGT00940000154575.a.a ENSGT00390000015354.d.a.a ENSGT00940000154717.pc.b ENSGT00390000012719.b.b ENSGT00500000044987 ENSGT00390000002096 ENSGT00940000159904 ENSGT00940000154442 ENSGT00390000006780 ENSGT00940000158323.h ENSGT00390000009488 ENSGT00940000155477 ENSGT00940000164321.c ENSGT00730000111133 Lumpfish MODERN SPECIES 24 ENSCLMG00005018664 gapvd1 (ENSCLMG00005018748) AJM1 (ENSCLMG00005018760) syn1 (ENSCLMG00005018764) vgll4l (ENSCLMG00005018770) slc20a1a (ENSCLMG00005018774) ENSCLMG00005019003 DTX1 (ENSCLMG00005019004) RASAL1 (ENSCLMG00005019008) dgcr6 (ENSCLMG00005019022) slc7a4 (ENSCLMG00005019023) 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ENSGT00390000009488 ENSGT00940000155477 ENSGT00940000164321.c Large yellow croaker MODERN SPECIES 2 lmx1bb (ENSLCRG00005005322) mvb12bb (ENSLCRG00005005321) ENSLCRG00005005307 gapvd1 (ENSLCRG00005005297) AJM1 (ENSLCRG00005005292) syn1 (ENSLCRG00005005289) vgll4l (ENSLCRG00005005287) slc20a1a (ENSLCRG00005005226) DTX1 (ENSLCRG00005005198) RASAL1 (ENSLCRG00005005145) dgcr6 (ENSLCRG00005005142) slc7a4 (ENSLCRG00005005141) ENSLCRG00005005140 sf3a1 (ENSLCRG00005005107) TBC1D10A (ENSLCRG00005005105) aplnra (ENSLCRG00005005104) ##22 hpdb (ENSLCRG00005005089) ENSLCRG00005005086 RHOF (ENSLCRG00005005083) ORAI1 (ENSLCRG00005005082) rnf34a (ENSLCRG00005005080) kdm2ba (ENSLCRG00005005077) ENSLCRG00005005076 carnmt1 (ENSLCRG00005005074) trpm6 (ENSLCRG00005005014) rorb (ENSLCRG00005004267) MFSD3 (ENSLCRG00005004259) anxa1a (ENSLCRG00005004253) ENSLCRG00005004248 cyp1d1 (ENSLCRG00005004247) ENSLCRG00005004245 European seabass MODERN SPECIES 13 zbtb34 (ENSDLAG00005032480) lmx1bb (ENSDLAG00005025877) 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ENSGT00940000165688 ENSGT00390000016543.c ENSGT00940000156611 ENSGT00940000163762.b ENSGT00940000155945.i.b ENSGT00940000157955.d.b Sheepshead minnow MODERN SPECIES 504 lsm1 (ENSCVAG00000003871) ENSCVAG00000003881 star (ENSCVAG00000003901) ELMOD3 (ENSCVAG00000003919) ENSCVAG00000003939 pold2 (ENSCVAG00000003972) nono (ENSCVAG00000003978) NPC1L1 (ENSCVAG00000004405) RICTOR (ENSCVAG00000000129) ENSCVAG00000004485 slc7a4 (ENSCVAG00000000133) ENSCVAG00000004513 ENSCVAG00000004515 sf3a1 (ENSCVAG00000004560) TBC1D10A (ENSCVAG00000004574) aplnra (ENSCVAG00000004588) ##22 hpdb (ENSCVAG00000000139) ORAI1 (ENSCVAG00000004630) kdm2ba (ENSCVAG00000004636) rnf34a (ENSCVAG00000004686) dgcr6 (ENSCVAG00000004702) RASAL1 (ENSCVAG00000004775) Mummichog MODERN SPECIES 2230 TBC1D10A (ENSFHEG00000001774) aplnra (ENSFHEG00000001765) ##22 hpdb (ENSFHEG00000001756) ORAI1 (ENSFHEG00000001748) kdm2ba (ENSFHEG00000001744) rnf34a (ENSFHEG00000001736) dgcr6 (ENSFHEG00000001731) RASAL1 (ENSFHEG00000001720) DTX1 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ENSGT00940000158323.h.e ENSGT00390000009488 ENSGT00940000155477 ENSGT00940000164321.c Chinese medaka MODERN SPECIES 474 gapvd1 (ENSOSIG00000015380) AJM1 (ENSOSIG00000015382) syn1 (ENSOSIG00000015386) vgll4l (ENSOSIG00000015390) slc20a1a (ENSOSIG00000015391) DTX1 (ENSOSIG00000015394) ENSOSIG00000015398 RASAL1 (ENSOSIG00000015400) dgcr6 (ENSOSIG00000015401) slc7a4 (ENSOSIG00000015402) sf3a1 (ENSOSIG00000015405) TBC1D10A (ENSOSIG00000015508) aplnra (ENSOSIG00000015547) ##22 hpdb (ENSOSIG00000015554) ORAI1 (ENSOSIG00000015569) kdm2ba (ENSOSIG00000015570) rnf34a (ENSOSIG00000015573) ENSOSIG00000015576 RICTOR (ENSOSIG00000015578) NPC1L1 (ENSOSIG00000015600) nono (ENSOSIG00000015679) pold2 (ENSOSIG00000015684) AEBP1 (ENSOSIG00000015711) lsm1 (ENSOSIG00000016068) bag4 (ENSOSIG00000016071) carnmt1 (ENSOSIG00000016073) trpm6 (ENSOSIG00000016094) rorb (ENSOSIG00000016625) Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 23 mvb12bb (ENSORLG00000013275) ENSORLG00000025327 ENSORLG00000013269 gapvd1 (ENSORLG00000013237) AJM1 (ENSORLG00000029723) syn1 (ENSORLG00000013182) vgll4l (ENSORLG00000027678) slc20a1a (ENSORLG00000013173) DTX1 (ENSORLG00000013147) RASAL1 (ENSORLG00000013128) dgcr6 (ENSORLG00000013085) slc7a4 (ENSORLG00000013067) CCDC157 (ENSORLG00000028856) sf3a1 (ENSORLG00000013050) TBC1D10A (ENSORLG00000013033) aplnra (ENSORLG00000013006) ##22 hpdb (ENSORLG00000012993) ENSORLG00000030273 ORAI1 (ENSORLG00000023602) kdm2ba (ENSORLG00000012943) rnf34a (ENSORLG00000012926) ENSORLG00000012912 RICTOR (ENSORLG00000012899) NPC1L1 (ENSORLG00000012854) nono (ENSORLG00000012801) pold2 (ENSORLG00000012796) ENSORLG00000012761 ENSORLG00000028139 ELMOD3 (ENSORLG00000012726) star (ENSORLG00000012688) ENSORLG00000012670 Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 189 ENSGT00940000158930 ENSGT00950000183166.a.b ENSGT00550000074856.c.b ENSGT00390000008325.a ENSGT00950000182843.a.b ENSGT00550000074798.a.b ENSGT00940000158664 ENSGT00940000160943 ENSGT00940000158715 ENSGT00390000017663 ENSGT00940000154637 ENSGT00940000171034 ENSGT00390000013684 ENSGT00730000111077 ENSGT00940000157386.a ENSGT01050000244888.b.b.a.b.c ##22 ENSGT00940000162972.e.b ENSGT00530000063474.B.e.a ENSGT00940000154575.a.a Otophysi ANCESTRAL SPECIES 322 ENSGT00530000063255.C ENSGT00940000160571 ENSGT00520000055570.A.b ENSGT00940000161915 ENSGT00940000161605 ENSGT00940000169964 ENSGT00940000159904 ENSGT00950000182787.E.d.e.b ENSGT00940000161682 ENSGT00940000157386.a ENSGT01050000244888.b.b.a.b.c ##22 ENSGT00940000162972.e.b ENSGT00530000063474.B.e.a ENSGT00940000154575.a.a Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 96 ENSGT00530000063255.C ENSGT00940000160571 ENSGT00520000055570.A.b ENSGT00940000161915 ENSGT00940000161605 ENSGT00940000169964 ENSGT00940000159904 ENSGT00950000182787.E.d.e.b ENSGT00940000161682 ENSGT00940000157386.a ENSGT01050000244888.b.b.a.b.c ##22 ENSGT00940000162972.e.b ENSGT00530000063474.B.e.a ENSGT00940000154575.a.a ENSGT01100000263475.f.a.f.b.a ENSGT00940000161861 ENSGT00950000183200.A.a.b.b ENSGT01030000234627.a.b.a.b.a ENSGT00950000183203.c.b ENSGT00940000159783.g.a ENSGT00940000156664.d ENSGT00940000154764 ENSGT00940000159022 ENSGT00390000016836.a ENSGT00430000031027.a ENSGT00990000209961 Channel catfish MODERN SPECIES 24 ENSIPUG00000005198 ncor2 (ENSIPUG00000004773) EP400 (ENSIPUG00000004570) ulk1a (ENSIPUG00000004487) ADGRD1 (ENSIPUG00000004394) RIMBP2 (ENSIPUG00000004325) stx2 (ENSIPUG00000004281) gpat2 (ENSIPUG00000004176) adra2b (ENSIPUG00000004154) Dusp2 (ENSIPUG00000004137) izumo1 (ENSIPUG00000004120) npc1l1 (ENSIPUG00000004087) gck (ENSIPUG00000004068) Myl7 (ENSIPUG00000004044) TBC1D10A (ENSIPUG00000004024) aplnr (ENSIPUG00000004015) ##22 ENSIPUG00000004010 ENSIPUG00000003997 ENSIPUG00000003992 MR1 (ENSIPUG00000003966) fzd10 (ENSIPUG00000003951) ENSIPUG00000003912 ENSIPUG00000003903 ccn1l2 (ENSIPUG00000003879) ENSIPUG00000003771 stambp (ENSIPUG00000003740) ENSIPUG00000003728 tcf7l1b (ENSIPUG00000003707) ube2d4 (ENSIPUG00000003650) dbnlb (ENSIPUG00000003577) ENSIPUG00000003539 Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 104 ENSGT00530000063255.C ENSGT00940000160571 ENSGT00520000055570.A.b ENSGT00940000161915 ENSGT00940000161605 ENSGT00940000169964 ENSGT00940000159904 ENSGT00950000182787.E.d.e.b ENSGT00940000161682 ENSGT00940000157386.a ENSGT01050000244888.b.b.a.b.c ##22 ENSGT00940000162972.e.b ENSGT00530000063474.B.e.a ENSGT00940000154575.a.a ENSGT01100000263475.f.a.f.b.a ENSGT00940000161861 ENSGT00950000183200.A.a.b.b ENSGT01030000234627.a.b.a.b.a ENSGT00950000183203.c.b ENSGT00940000159783.g.a ENSGT00940000156664.d ENSGT00940000154764 ENSGT00940000159022 ENSGT00390000016836.a ENSGT00430000031027.a ENSGT00990000209961 Characoidei ANCESTRAL SPECIES 143 ENSGT00530000063255.C ENSGT00940000160571 ENSGT00520000055570.A.b ENSGT00940000161915 ENSGT00940000161605 ENSGT00940000169964 ENSGT00940000159904 ENSGT00950000182787.E.d.e.b ENSGT00940000161682 ENSGT00940000157386.a ENSGT01050000244888.b.b.a.b.c ##22 ENSGT00940000162972.e.b ENSGT00530000063474.B.e.a ENSGT00940000154575.a.a ENSGT01100000263475.f.a.f.b.a ENSGT00940000161861 ENSGT00950000183200.A.a.b.b ENSGT01030000234627.a.b.a.b.a ENSGT00950000183203.c.b ENSGT00940000159783.g.a ENSGT00940000156664.d ENSGT00940000154764 ENSGT00940000159022 ENSGT00390000016836.a ENSGT00430000031027.a ENSGT00990000209961 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 435 myl7 (ENSPNAG00000012637) TBC1D10A (ENSPNAG00000012675) aplnra (ENSPNAG00000012694) ##22 ENSPNAG00000002370 hpdb (ENSPNAG00000012797) ENSPNAG00000002411 ENSPNAG00000012859 ENSPNAG00000012876 ENSPNAG00000005549 ENSPNAG00000012906 fzd10 (ENSPNAG00000012924) piwil1 (ENSPNAG00000012989) ENSPNAG00000013021 Mexicana tetra MODERN SPECIES 21 ENSAMXG00000040491 bcl2l16 (ENSAMXG00000030617) ENSAMXG00000040542 fgf17 (ENSAMXG00000042469) ADGRD2 (ENSAMXG00000005477) nr5a1a (ENSAMXG00000005494) nr6a1a (ENSAMXG00000039712) adra2b (ENSAMXG00000037029) dusp2 (ENSAMXG00000043215) ENSAMXG00000036421 NPC1L1 (ENSAMXG00000009702) YKT6 (ENSAMXG00000038981) gck 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ENSSGRG00000021840 GBGT1 (ENSSGRG00000021842) Common carp reference MODERN SPECIES 23 arpc5la (ENSCCRG00000076754) ENSCCRG00000019851 olfml2a (ENSCCRG00000079545) pop5 (ENSCCRG00000065097) rnf10 (ENSCCRG00000019888) zgc:152830 (ENSCCRG00000020052) fahd2a (ENSCCRG00000080892) gpat2 (ENSCCRG00000047238) adra2b (ENSCCRG00000069849) dusp2 (ENSCCRG00000042641) ENSCCRG00000034529 ENSCCRG00000001772 gck (ENSCCRG00000007721) myl7 (ENSCCRG00000011546) ENSCCRG00000015587 aplnra (ENSCCRG00000072102) ##22 ORAI1 (ENSCCRG00000057249) kdm2ba (ENSCCRG00000015568) rnf34a (ENSCCRG00000009228) ENSCCRG00000003199 ggt1a (ENSCCRG00000074914) ggt5a (ENSCCRG00000003077) asphd2 (ENSCCRG00000003051) cabp1a (ENSCCRG00000006907) mlec (ENSCCRG00000006929) unc119.1 (ENSCCRG00000012390) ENSCCRG00000030982 ENSCCRG00000074464 ENSCCRG00000054320 ENSCCRG00000004957 pla2g1b (ENSCCRG00000056583) Zebrafish MODERN SPECIES 23 arpc5la (ENSDARG00000041720) ENSDARG00000094519 olfml2a (ENSDARG00000005648) pop5 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ENSGT00390000013684 ENSGT00730000111077 ENSGT00940000157386.a ENSGT01050000244888.b.b.a.b.c ##22 ENSGT00390000017655.l ENSGT00530000063474.B.e.a ENSGT00940000158903.lb ENSGT00390000007848.b.f ENSGT00940000159285 ENSGT00390000015354.d.a.a.b ENSGT00390000015354.d.b ENSGT00940000154717.pc.b ENSGT00390000012719.b.b ENSGT00390000018674 ENSGT00940000164235.a ENSGT00940000154601.h.b ENSGT00940000155794.h ENSGT00940000159252.b.a ENSGT00940000158555.a.a Asian bonytongue MODERN SPECIES 8 ADGRD1 (ENSSFOG00015003241) MMP17 (ENSSFOG00015003279) ULK1 (ENSSFOG00015003349) pus1 (ENSSFOG00015003463) EP400 (ENSSFOG00015028922) MMP17 (ENSSFOG00015003568) ncor2 (ENSSFOG00015003639) rflna (ENSSFOG00015004330) ccdc92 (ENSSFOG00015031905) DTX1 (ENSSFOG00015004377) RASAL1 (ENSSFOG00015004403) dgcr6 (ENSSFOG00015030468) slc7a4 (ENSSFOG00015004515) sf3a1 (ENSSFOG00015004579) TBC1D10A (ENSSFOG00015015112) aplnra (ENSSFOG00015004660) ##22 DGCR2 (ENSSFOG00015004700) hpdb (ENSSFOG00015004763) SETD1B 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ENSGT00940000155968.d.a ENSGT00940000156522.c.b ENSGT01070000253744.b.a.a.b ENSGT00940000157176.b ENSGT00940000167013 ENSGT00940000158782.d.b ENSGT00390000016468 ENSGT00530000064873.a ENSGT00390000011937.g.a ENSGT00940000157386.b ENSGT01050000244888.b.b.a.b.d ##22 ENSGT00390000013929 ENSGT00950000182881.a.b.a.a.b ENSGT00940000154191.k.b ENSGT00940000166850 ENSGT00730000111291 ENSGT00940000154495.b.b.b ENSGT00940000156855.d ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.a ENSGT00940000164890.a ENSGT00940000156009.A.d ENSGT00940000154779.a.b.a ENSGT00390000001280.b ENSGT00390000014909 ENSGT00940000156185 ENSGT00390000006707 Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 439 ENSGT00390000011937.g.a ENSGT01050000244888.b.b.a.b.d ##22 ENSGT00970000197293 Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000158555.a.b ENSGT01030000234574.B.c.b.b.n ENSGT00940000165511.b ENSGT00390000002288 ENSGT00940000164214.k.b ENSGT00940000156575 ENSGT00940000155968.d.a ENSGT00940000156522.c.b ENSGT00940000157176.b ENSGT00940000167013 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ENSGT00940000156185 ENSGT00390000006707 ENSGT00390000011206.a Tiger tail seahorse DUPLICATION Tiger tail seahorse DUPLICATION Tiger tail seahorse DUPLICATION Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 438 CDH13 (ENSHCOG00000006110) mlycd (ENSHCOG00000006121) ENSHCOG00000006155 hsbp1a (ENSHCOG00000006165) ENSHCOG00000006178 kcng4a (ENSHCOG00000006230) wfdc1 (ENSHCOG00000006247) wfdc1 (ENSHCOG00000006262) DYRK4 (ENSHCOG00000006294) ndufa9a (ENSHCOG00000006298) ENSHCOG00000006310 ##22 aplnrb (ENSHCOG00000006319) ##22 GALNT8 (ENSHCOG00000006469) ADA2 (ENSHCOG00000006476) ENSHCOG00000006487 ENSHCOG00000006525 atp6v1e1a (ENSHCOG00000006551) bcl2l13 (ENSHCOG00000006562) ENSHCOG00000006569 wee2 (ENSHCOG00000006594) dennd11 (ENSHCOG00000006620) agk (ENSHCOG00000006637) nup205 (ENSHCOG00000006664) ENSHCOG00000006682 fgd4a (ENSHCOG00000006710) BICD1 (ENSHCOG00000006751) slc23a4 (ENSHCOG00000006779) Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 282 ENSHCOG00000001854 ENSHCOG00000001869 patl1 (ENSHCOG00000001898) 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(ENSHCOG00000009437) loxa (ENSHCOG00000009407) Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT01030000234574.B.c.b.b.n ENSGT00940000165511.b ENSGT00940000159649 ENSGT00390000002288 ENSGT00940000164214.k.b ENSGT00940000156575 ENSGT00940000155968.d.a ENSGT00940000156522.c.b ENSGT00940000157176.b ENSGT00940000167013 ENSGT00940000158782.d.b ENSGT00390000016468 ENSGT00530000064873.a ENSGT00390000011937.g.a ENSGT00940000157386.b ENSGT01050000244888.b.b.a.b.d ##22 ENSGT00390000013929 ENSGT00950000182881.a.b.a.a.b ENSGT00940000166850 ENSGT00730000111291 ENSGT00940000154495.b.b.b ENSGT00940000156855.d ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.b ENSGT00940000164890.a ENSGT00940000156009.A.d ENSGT00940000154779.a.b.a ENSGT00390000001280.b ENSGT00390000014909 ENSGT00940000156185 ENSGT00390000006707 ENSGT00390000011206.a Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000165511.b ENSGT00940000169772.A ENSGT00940000159649 ENSGT00390000002288 ENSGT00940000164214.k.b ENSGT00940000156575 ENSGT00940000155968.d.a 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ENSGT01050000244888.b.b.a.b.d ##22 ENSGT00390000013929 ENSGT00950000182881.a.b.a.a.b ENSGT00940000166850 ENSGT00730000111291 ENSGT00940000154495.b.b.b ENSGT00940000156855.d ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.b ENSGT00940000164890.a ENSGT00940000156009.A.d ENSGT00940000154779.a.b.a ENSGT00390000001280.b ENSGT00390000014909 ENSGT00940000156185 ENSGT00390000006707 ENSGT00390000011206.a Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT01030000234574.B.c.b.b.n ENSGT00940000165511.b ENSGT00940000169772.C ENSGT00390000002288 ENSGT00940000164214.k.b ENSGT00940000156575 ENSGT00940000155968.d.a ENSGT00940000156522.c.b ENSGT00940000157176.b ENSGT00940000167013 ENSGT00940000158782.d.b ENSGT00390000016468 ENSGT00530000064873.a ENSGT00390000011937.g.a ENSGT00940000157386.b ENSGT01050000244888.b.b.a.b.d ##22 ENSGT00390000013929 ENSGT00950000182881.a.b.a.a.b ENSGT00940000166850 ENSGT00730000111291 ENSGT00940000154495.b.b.b ENSGT00940000156855.d ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.b ENSGT00940000164890.a ENSGT00940000156009.A.d ENSGT00940000154779.a.b.a ENSGT00390000001280.b ENSGT00390000014909 ENSGT00940000156185 ENSGT00390000006707 ENSGT00390000011206.a Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000162972 ENSGT00390000017655 ENSGT00390000009387 ENSGT00940000165511.b ENSGT00390000002288 ENSGT00940000164214.k.b ENSGT00940000156575 ENSGT00940000155968.d.a ENSGT00940000156522.c.b ENSGT00940000157176.b ENSGT00940000167013 ENSGT00940000158782.d.b ENSGT00390000016468 ENSGT00390000011937.g.a ENSGT00940000157386.b ENSGT01050000244888.b.b.a.b.d ##22 ENSGT00390000013929 ENSGT00950000182881.a.b.a.a.b ENSGT00940000166850 ENSGT00730000111291 ENSGT00940000154495.b.b.b ENSGT00940000156855.d ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.b ENSGT00940000164890.a ENSGT00940000156009.A.d ENSGT00940000154779.a.b.a ENSGT00390000001280.b ENSGT00390000014909 ENSGT00940000156185 ENSGT00390000006707 ENSGT00390000011206.a Tetraodon MODERN SPECIES 19 car15 (ENSTNIG00000001696) dgcr2 (ENSTNIG00000009092) ess2 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ENSGT00940000157386.b ENSGT01050000244888.b.b.a.b.d ##22 ENSGT00390000013929 ENSGT00950000182881.a.b.a.a.b ENSGT00940000166850 ENSGT00730000111291 ENSGT00940000154495.b.b.b ENSGT00940000156855.d ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.b ENSGT00940000164890.a ENSGT00940000156009.A.d ENSGT00940000154779.a.b.a ENSGT00390000001280.b ENSGT00390000014909 ENSGT00940000156185 ENSGT00390000006707 ENSGT00390000011206.a Channel bull blenny MODERN SPECIES 3 ENSCGOG00000001263 ENSCGOG00000001273 ENSCGOG00000001278 brf2 (ENSCGOG00000001287) prlhr2b (ENSCGOG00000001291) anxa4 (ENSCGOG00000001341) AAK1 (ENSCGOG00000001516) ANTXR1 (ENSCGOG00000001523) bmp1b (ENSCGOG00000001562) trim69 (ENSCGOG00000002477) kcnip3b (ENSCGOG00000002507) ENSCGOG00000003275 prnpb (ENSCGOG00000003277) PPTC7 (ENSCGOG00000003279) TBC1D10A (ENSCGOG00000003284) aplnrb (ENSCGOG00000003297) ##22 ENSCGOG00000003299 ENSCGOG00000003373 ENSCGOG00000005768 slc35e4 (ENSCGOG00000005987) INPP5J (ENSCGOG00000005989) MAT2A (ENSCGOG00000006002) mpx 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pcyox1 (ENSSLUG00000022204) Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000158555.a.b ENSGT01030000234574.B.c.b.b.n ENSGT00940000165511.b ENSGT00390000002288 ENSGT00940000164214.k.b ENSGT00940000156575 ENSGT00940000155968.d.a ENSGT00940000156522.c.b ENSGT00940000157176.b ENSGT00940000167013 ENSGT00940000158782.d.b ENSGT00390000016468 ENSGT00530000064873.a ENSGT00390000011937.g.a ENSGT00940000157386.b ENSGT01050000244888.b.b.a.b.d ##22 ENSGT00390000013929 ENSGT00950000182881.a.b.a.a.b ENSGT00940000166850 ENSGT00730000111291 ENSGT00940000154495.b.b.b ENSGT00940000156855.d ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.b ENSGT00940000164890.a ENSGT00940000156009.A.d ENSGT00940000154779.a.b.a ENSGT00390000001280.b ENSGT00390000014909 ENSGT00940000156185 ENSGT00390000006707 ENSGT00390000011206.a Stickleback MODERN SPECIES 13 gpat4 (ENSGACG00000017057) ENSGACG00000017061 ENSGACG00000017066 ENSGACG00000017067 brf2 (ENSGACG00000017068) prlhr2b (ENSGACG00000017069) anxa4 (ENSGACG00000017070) AAK1 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(ENSCLMG00005017181) aplnrb (ENSCLMG00005017465) ##22 ENSCLMG00005017466 ENSCLMG00005017469 ENSCLMG00005017899 slc35e4 (ENSCLMG00005017900) ENSCLMG00005017902 INPP5J (ENSCLMG00005017903) MAT2A (ENSCLMG00005017915) ENSCLMG00005017937 mpx (ENSCLMG00005017951) loxa (ENSCLMG00005017966) snx24 (ENSCLMG00005017967) GGCX (ENSCLMG00005017972) gmcl1 (ENSCLMG00005018038) fam136a (ENSCLMG00005018315) pcyox1 (ENSCLMG00005018318) Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT01030000234574.B.c.b.b.n ENSGT00940000165511.b ENSGT00940000169772.C ENSGT00390000002288 ENSGT00940000164214.k.b ENSGT00940000156575 ENSGT00940000155968.d.a ENSGT00940000156522.c.b ENSGT00940000157176.b ENSGT00940000167013 ENSGT00940000158782.d.b ENSGT00390000016468 ENSGT00530000064873.a ENSGT00390000011937.g.a ENSGT00940000157386.b ENSGT01050000244888.b.b.a.b.d ##22 ENSGT00390000013929 ENSGT00950000182881.a.b.a.a.b ENSGT00940000166850 ENSGT00730000111291 ENSGT00940000154495.b.b.b ENSGT00940000156855.d ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.b ENSGT00940000164890.a ENSGT00940000156009.A.d ENSGT00940000154779.a.b.a ENSGT00390000001280.b ENSGT00390000014909 ENSGT00940000156185 ENSGT00390000006707 ENSGT00390000011206.a Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000158555.a.b ENSGT00940000165511.b ENSGT00940000169772.C ENSGT00390000002288 ENSGT00940000164214.k.b ENSGT00940000156575 ENSGT00940000155968.d.a ENSGT00940000156522.c.b ENSGT00940000157176.b ENSGT00940000167013 ENSGT00940000158782.d.b ENSGT00390000016468 ENSGT00530000064873.a ENSGT00390000011937.g.a ENSGT00940000157386.b ENSGT01050000244888.b.b.a.b.d ##22 ENSGT00390000013929 ENSGT00950000182881.a.b.a.a.b ENSGT00940000166850 ENSGT00730000111291 ENSGT00940000154495.b.b.b ENSGT00940000156855.d ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.b ENSGT00940000164890.a ENSGT00940000156009.A.d ENSGT00940000154779.a.b.a ENSGT00390000001280.b ENSGT00390000014909 ENSGT00940000156185 ENSGT00390000006707 ENSGT00390000011206.a Zig-zag eel MODERN SPECIES 3 ENSMAMG00000010821 cabp1b (ENSMAMG00000010806) ENSMAMG00000010795 brf2 (ENSMAMG00000010791) prlhr2b (ENSMAMG00000010766) anxa4 (ENSMAMG00000010729) AAK1 (ENSMAMG00000010719) ANTXR1 (ENSMAMG00000010645) bmp1b (ENSMAMG00000010607) trim69 (ENSMAMG00000010581) ENSMAMG00000010559 ENSMAMG00000010554 ENSMAMG00000010528 ENSMAMG00000010512 ENSMAMG00000010505 aplnrb (ENSMAMG00000010450) ##22 ENSMAMG00000010440 ENSMAMG00000010404 ENSMAMG00000010292 slc35e4 (ENSMAMG00000025828) ENSMAMG00000010239 ENSMAMG00000010232 ENSMAMG00000025123 mpx (ENSMAMG00000010201) loxa (ENSMAMG00000010183) snx24 (ENSMAMG00000010145) ENSMAMG00000010088 gmcl1 (ENSMAMG00000010048) fam136a (ENSMAMG00000009971) pcyox1 (ENSMAMG00000009960) slc20a1b (ENSMAMG00000009934) Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000158555.a.b ENSGT00940000165511.b ENSGT00940000169772.C ENSGT00390000002288 ENSGT00940000164214.k.b ENSGT00940000156575 ENSGT00940000155968.d.a ENSGT00940000156522.c.b ENSGT00940000157176.b ENSGT00940000167013 ENSGT00940000158782.d.b ENSGT00390000016468 ENSGT00530000064873.a ENSGT00390000011937.g.a ENSGT00940000157386.b ENSGT01050000244888.b.b.a.b.d ##22 ENSGT00390000013929 ENSGT00950000182881.a.b.a.a.b ENSGT00940000166850 ENSGT00730000111291 ENSGT00940000154495.b.b.b ENSGT00940000156855.d ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.b ENSGT00940000164890.a ENSGT00940000156009.A.d ENSGT00940000154779.a.b.a ENSGT00390000001280.b ENSGT00390000014909 ENSGT00940000156185 ENSGT00390000006707 ENSGT00390000011206.a Siamese fighting fish MODERN SPECIES 3 GGT5 (ENSBSLG00000020523) ENSBSLG00000020516 cabp1b (ENSBSLG00000020510) ENSBSLG00000020506 brf2 (ENSBSLG00000020502) prlhr2b (ENSBSLG00000020500) anxa4 (ENSBSLG00000020290) AAK1 (ENSBSLG00000020254) ANTXR1 (ENSBSLG00000020159) trim69 (ENSBSLG00000019873) kcnip3b (ENSBSLG00000019736) ENSBSLG00000019734 prnpb (ENSBSLG00000019731) PPTC7 (ENSBSLG00000019729) TBC1D10A (ENSBSLG00000019719) aplnrb (ENSBSLG00000019713) ##22 ENSBSLG00000019706 ENSBSLG00000018984 ENSBSLG00000018843 slc35e4 (ENSBSLG00000018824) ENSBSLG00000018801 INPP5J (ENSBSLG00000018718) MAT2A (ENSBSLG00000018657) mpx (ENSBSLG00000018347) loxa (ENSBSLG00000018299) snx24 (ENSBSLG00000018269) GGCX (ENSBSLG00000017978) gmcl1 (ENSBSLG00000017842) fam136a (ENSBSLG00000017813) pcyox1 (ENSBSLG00000017799) slc20a1b (ENSBSLG00000017608) Climbing perch MODERN SPECIES 13 cabp1b (ENSATEG00000016082) ENSATEG00000016114 ENSATEG00000030194 brf2 (ENSATEG00000016133) prlhr2b (ENSATEG00000016150) anxa4 (ENSATEG00000016173) AAK1 (ENSATEG00000016218) ANTXR1 (ENSATEG00000016282) bmp1b (ENSATEG00000016438) trim69 (ENSATEG00000016483) ENSATEG00000016522 ENSATEG00000016547 ENSATEG00000026233 ENSATEG00000016578 ENSATEG00000016610 aplnrb (ENSATEG00000016645) ##22 ENSATEG00000016667 ENSATEG00000016677 ENSATEG00000016761 slc35e4 (ENSATEG00000029805) ENSATEG00000016996 ENSATEG00000017009 ENSATEG00000017051 ENSATEG00000028313 mpx (ENSATEG00000017086) loxa (ENSATEG00000017109) snx24 (ENSATEG00000029765) ENSATEG00000017194 gmcl1 (ENSATEG00000017256) fam136a (ENSATEG00000029151) pcyox1 (ENSATEG00000017322) Carangaria ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000158555.a.b ENSGT01030000234574.B.c.b.b.n ENSGT00940000165511.b ENSGT00390000002288 ENSGT00940000164214.k.b ENSGT00940000156575 ENSGT00940000155968.d.a ENSGT00940000156522.c.b ENSGT00940000157176.b ENSGT00940000167013 ENSGT00940000158782.d.b ENSGT00390000016468 ENSGT00530000064873.a ENSGT00390000011937.g.a ENSGT00940000157386.b ENSGT01050000244888.b.b.a.b.d ##22 ENSGT00390000013929 ENSGT00950000182881.a.b.a.a.b ENSGT00940000166850 ENSGT00730000111291 ENSGT00940000154495.b.b.b ENSGT00940000156855.d ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.b ENSGT00940000164890.a ENSGT00940000156009.A.d ENSGT00940000154779.a.b.a ENSGT00390000001280.b ENSGT00390000014909 ENSGT00940000156185 ENSGT00390000006707 ENSGT00390000011206.a Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000155794.g ENSGT00940000158555.a.b ENSGT00940000165511.b ENSGT00390000002288 ENSGT00940000164214.k.b ENSGT00940000156575 ENSGT00940000155968.d.a ENSGT00940000156522.c.b ENSGT00940000157176.b ENSGT00940000167013 ENSGT00940000158782.d.b ENSGT00390000016468 ENSGT00530000064873.a ENSGT00390000011937.g.a ENSGT00940000157386.b ENSGT01050000244888.b.b.a.b.d ##22 ENSGT00390000013929 ENSGT00950000182881.a.b.a.a.b ENSGT00940000166850 ENSGT00730000111291 ENSGT00940000154495.b.b.b.f ENSGT00940000156855.d ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.b ENSGT00940000156009.A.d ENSGT00940000154779.a.b.a ENSGT00390000001280.b ENSGT00390000014909 ENSGT00940000156185 ENSGT00390000006707 ENSGT00390000011206.a ENSGT00390000014879.c.a.a.a Turbot MODERN SPECIES 7 ENSSMAG00000001084 cabp1b (ENSSMAG00000001054) ENSSMAG00000001044 brf2 (ENSSMAG00000023469) prlhr2b (ENSSMAG00000001023) anxa4 (ENSSMAG00000000996) AAK1 (ENSSMAG00000000981) ANTXR1 (ENSSMAG00000000923) bmp1b (ENSSMAG00000000838) trim69 (ENSSMAG00000000814) ENSSMAG00000032911 ENSSMAG00000000765 ENSSMAG00000020518 ENSSMAG00000020516 ENSSMAG00000020512 aplnrb (ENSSMAG00000035529) ##22 ENSSMAG00000020507 ENSSMAG00000020490 ENSSMAG00000020462 slc35e4 (ENSSMAG00000020459) ENSSMAG00000020458 ENSSMAG00000020448 ENSSMAG00000020436 mpx (ENSSMAG00000020424) loxa (ENSSMAG00000020416) snx24 (ENSSMAG00000020379) ENSSMAG00000020385 gmcl1 (ENSSMAG00000020368) fam136a (ENSSMAG00000020365) pcyox1 (ENSSMAG00000020363) slc20a1b (ENSSMAG00000020358) Tongue sole MODERN SPECIES 5 ENSCSEG00000001542 GGT5 (ENSCSEG00000001549) cabp1b (ENSCSEG00000001553) ENSCSEG00000001560 ENSCSEG00000001564 prlhr2b (ENSCSEG00000001566) anxa4 (ENSCSEG00000001569) AAK1 (ENSCSEG00000001577) ANTXR1 (ENSCSEG00000001586) bmp1b (ENSCSEG00000001620) trim69 (ENSCSEG00000001662) prnpb (ENSCSEG00000001666) kcnip3b (ENSCSEG00000001671) PPTC7 (ENSCSEG00000001681) TBC1D10A (ENSCSEG00000001686) aplnrb (ENSCSEG00000001695) ##22 ENSCSEG00000001701 ENSCSEG00000001709 ENSCSEG00000001730 slc35e4 (ENSCSEG00000001734) ENSCSEG00000001737 INPP5J (ENSCSEG00000001743) MAT2A (ENSCSEG00000001757) mpx (ENSCSEG00000001760) loxa (ENSCSEG00000001764) snx24 (ENSCSEG00000001768) GGCX (ENSCSEG00000001781) gmcl1 (ENSCSEG00000001798) fam136a (ENSCSEG00000001808) pcyox1 (ENSCSEG00000001815) Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000158555.a.b ENSGT01030000234574.B.c.b.b.n ENSGT00940000165511.b ENSGT00390000002288 ENSGT00940000164214.k.b ENSGT00940000156575 ENSGT00940000155968.d.a ENSGT00940000156522.c.b ENSGT00940000157176.b ENSGT00940000167013 ENSGT00940000158782.d.b ENSGT00390000016468 ENSGT00530000064873.a ENSGT00390000011937.g.a ENSGT00940000157386.b ENSGT01050000244888.b.b.a.b.d ##22 ENSGT00390000013929 ENSGT00950000182881.a.b.a.a.b ENSGT00940000166850 ENSGT00730000111291 ENSGT00940000154495.b.b.b ENSGT00940000156855.d ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.b ENSGT00940000164890.a ENSGT00940000156009.A.d ENSGT00940000154779.a.b.a ENSGT00390000001280.b ENSGT00390000014909 ENSGT00940000156185 ENSGT00390000006707 ENSGT00390000011206.a Seriola ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000158555.a.b ENSGT01030000234574.B.c.b.b.n ENSGT00940000165511.b ENSGT00390000002288 ENSGT00940000164214.k.b ENSGT00940000156575 ENSGT00940000155968.d.a ENSGT00940000156522.c.b ENSGT00940000157176.b ENSGT00940000167013 ENSGT00940000158782.d.b ENSGT00390000016468 ENSGT00530000064873.a ENSGT00390000011937.g.a ENSGT00940000157386.b ENSGT01050000244888.b.b.a.b.d ##22 ENSGT00390000013929 ENSGT00950000182881.a.b.a.a.b ENSGT00940000166850 ENSGT00730000111291 ENSGT00940000154495.b.b.b ENSGT00940000156855.d ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.b ENSGT00940000177137 ENSGT00940000156009.A.d ENSGT00940000154779.a.b.a ENSGT00390000001280.b ENSGT00390000014909 ENSGT00940000156185 ENSGT00390000006707 ENSGT00390000011206.a Greater amberjack MODERN SPECIES 138 cabp1b (ENSSDUG00000017924) gpat4 (ENSSDUG00000017830) ENSSDUG00000017813 brf2 (ENSSDUG00000017801) prlhr2b (ENSSDUG00000017771) anxa4 (ENSSDUG00000017725) AAK1 (ENSSDUG00000017687) ANTXR1 (ENSSDUG00000017651) bmp1b (ENSSDUG00000017600) trim69 (ENSSDUG00000017568) kcnip3b (ENSSDUG00000017538) ENSSDUG00000017528 prnpb (ENSSDUG00000017523) PPTC7 (ENSSDUG00000017509) TBC1D10A (ENSSDUG00000017488) aplnrb (ENSSDUG00000017477) ##22 ENSSDUG00000017463 ENSSDUG00000017409 ENSSDUG00000017266 slc35e4 (ENSSDUG00000017242) ENSSDUG00000017226 INPP5J (ENSSDUG00000017189) MAT2A (ENSSDUG00000017156) mpx (ENSSDUG00000017130) loxa (ENSSDUG00000017113) snx24 (ENSSDUG00000017103) GGCX (ENSSDUG00000017057) gmcl1 (ENSSDUG00000017005) fam136a (ENSSDUG00000016998) pcyox1 (ENSSDUG00000016983) slc20a1b (ENSSDUG00000016944) Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 2737 cabp1b (ENSSLDG00000015811) gpat4 (ENSSLDG00000015846) ENSSLDG00000015883 brf2 (ENSSLDG00000015898) prlhr2b (ENSSLDG00000015915) anxa4 (ENSSLDG00000015933) AAK1 (ENSSLDG00000015969) ANTXR1 (ENSSLDG00000016013) bmp1b (ENSSLDG00000016052) trim69 (ENSSLDG00000016080) kcnip3b (ENSSLDG00000016101) ENSSLDG00000016120 prnpb (ENSSLDG00000016127) PPTC7 (ENSSLDG00000016137) TBC1D10A (ENSSLDG00000016162) aplnrb (ENSSLDG00000016185) ##22 ENSSLDG00000016215 ENSSLDG00000016266 ENSSLDG00000016391 slc35e4 (ENSSLDG00000016611) ENSSLDG00000016623 INPP5J (ENSSLDG00000016645) MAT2A (ENSSLDG00000016684) ENSSLDG00000016706 mpx (ENSSLDG00000016725) Barramundi perch MODERN SPECIES 218 cabp1b (ENSLCAG00010006106) gpat4 (ENSLCAG00010006023) ENSLCAG00010006002 brf2 (ENSLCAG00010005999) prlhr2b (ENSLCAG00010005994) anxa4 (ENSLCAG00010005918) AAK1 (ENSLCAG00010005905) ANTXR1 (ENSLCAG00010005894) bmp1b (ENSLCAG00010005567) trim69 (ENSLCAG00010005506) kcnip3b (ENSLCAG00010005496) ENSLCAG00010005491 prnpb (ENSLCAG00010005490) PPTC7 (ENSLCAG00010005479) TBC1D10A (ENSLCAG00010005474) aplnrb (ENSLCAG00010005472) ##22 ENSLCAG00010005469 ENSLCAG00010005467 ENSLCAG00010004962 ENSLCAG00010004760 slc35e4 (ENSLCAG00010004745) ENSLCAG00010004742 INPP5J (ENSLCAG00010004738) MAT2A (ENSLCAG00010004730) ENSLCAG00010004725 mpx (ENSLCAG00010004717) loxa (ENSLCAG00010004714) snx24 (ENSLCAG00010004711) GGCX (ENSLCAG00010004692) gmcl1 (ENSLCAG00010004684) Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00390000002288 ENSGT00940000164214.k.b ENSGT00940000158663.d ENSGT00940000156575 ENSGT00940000155968.d.a ENSGT00940000156522.c.b ENSGT01070000253744.b.a.a.b ENSGT00940000157176.b ENSGT00940000167013 ENSGT00390000004965.b ENSGT00940000158782.d.b ENSGT00390000016468 ENSGT00530000064873.a ENSGT00390000011937.g.a ENSGT00940000157386.b ENSGT01050000244888.b.b.a.b.d ##22 ENSGT00390000013929 ENSGT00950000182881.a.b.a.a.b ENSGT00940000154191.k.b ENSGT00940000166850 ENSGT00730000111291 ENSGT00940000154495.b.b.b ENSGT00940000156855.d ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.a ENSGT00940000164890.a ENSGT00940000156009.A.d ENSGT00940000154779.a.b.a ENSGT00390000001280.b ENSGT00390000014909 ENSGT00940000156185 ENSGT00390000006707 Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 722 ENSGT00390000011937.g.a.d ENSGT00940000157386.b.d ENSGT01050000244888.b.b.a.b.d.c ##22 ENSGT00940000178234 ENSGT00390000013929.g ENSGT00950000182881.a.b.a.a.b.c ENSGT00940000166850.a ENSGT00730000111291.a ENSGT00940000154495.b.b.b.c ENSGT00940000156855.d.b ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.a.c Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000159649 ENSGT00390000002288 ENSGT00940000164214.k.b.d ENSGT00940000156575.o ENSGT00940000155968.d.a.e ENSGT00940000156522.c.b.c ENSGT01070000253744.b.a.a.b.a ENSGT00940000157176.b.d ENSGT00940000167013.i ENSGT00390000004965.b ENSGT00940000158782.d.b.g ENSGT00390000016468.b ENSGT00530000064873.a.a ENSGT00390000011937.g.a.d ENSGT00940000157386.b.d ENSGT01050000244888.b.b.a.b.d.c ##22 ENSGT00940000178234 ENSGT00390000013929.g ENSGT00950000182881.a.b.a.a.b.c ENSGT00940000166850.a ENSGT00730000111291.a ENSGT00940000154495.b.b.b.c ENSGT00940000156855.d.b ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.a.c ENSGT00940000164890.a.a ENSGT00940000156009.A.d.s.a ENSGT00940000154779.a.b.a.g ENSGT00390000001280.b.m ENSGT00390000014909.f.b ENSGT00940000156185.f ENSGT00390000006707.f Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00390000002288 ENSGT00940000164214.k.b.d ENSGT00940000156575.o ENSGT00940000155968.d.a.e ENSGT00940000156522.c.b.c ENSGT01070000253744.b.a.a.b.a ENSGT00940000157176.b.d ENSGT00940000167013.i ENSGT00390000004965.b ENSGT00940000158782.d.b.g ENSGT00390000016468.b ENSGT00390000016468.a ENSGT00530000064873.a.a ENSGT00390000011937.g.a.d ENSGT00940000157386.b.d ENSGT01050000244888.b.b.a.b.d.c ##22 ENSGT00390000013929.g ENSGT00950000182881.a.b.a.a.b.c ENSGT00940000166850.a ENSGT00730000111291.a ENSGT00940000154495.b.b.b.c ENSGT00940000156855.d.b ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.a.c ENSGT00940000164890.a.a ENSGT00940000156009.A.d.s.a ENSGT00940000154779.a.b.a.g ENSGT00390000001280.b.m ENSGT00390000014909.e ENSGT00940000156185.f ENSGT00390000006707.f ENSGT00390000011206.a.i.a Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000002288 ENSGT00940000164214.k.b.d ENSGT00940000156575.o ENSGT00940000155968.d.a.e ENSGT00940000156522.c.b.c ENSGT01070000253744.b.a.a.b.a ENSGT00940000157176.b.d ENSGT00940000167013.i ENSGT00390000004965.b ENSGT00940000158782.d.b.g ENSGT00390000016468.b ENSGT00390000016468.a ENSGT00530000064873.a.a ENSGT00390000011937.g.a.d ENSGT00940000157386.b.d ENSGT01050000244888.b.b.a.b.d.c ##22 ENSGT00390000013929.g ENSGT00950000182881.a.b.a.a.b.c ENSGT00940000166850.a ENSGT00730000111291.a ENSGT00940000154495.b.b.b.c ENSGT00940000156855.d.b ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.a.c ENSGT00940000164890.a.a ENSGT00940000156009.A.d.s.a ENSGT00940000154779.a.b.a.g ENSGT00390000001280.b.m ENSGT00390000014909.e ENSGT00940000156185.f ENSGT00390000006707.f ENSGT00390000011206.a.i.a Coho salmon MODERN SPECIES 15 ENSOKIG00005010740 brf2 (ENSOKIG00005010749) prlhr2b (ENSOKIG00005010756) anxa4 (ENSOKIG00005010782) AAK1 (ENSOKIG00005010880) ANTXR1 (ENSOKIG00005010957) npffr1l1 (ENSOKIG00005011255) trim69 (ENSOKIG00005011271) pcna (ENSOKIG00005011301) kcnip3b (ENSOKIG00005011379) ENSOKIG00005011650 ENSOKIG00005011665 prnpb (ENSOKIG00005011670) PPTC7 (ENSOKIG00005011676) TBC1D10A (ENSOKIG00005011702) aplnrb (ENSOKIG00005011739) ##22 ENSOKIG00005011754 ENSOKIG00005011801 ENSOKIG00005012138 slc35e4 (ENSOKIG00005012345) ENSOKIG00005012350 mat2aa (ENSOKIG00005012367) ENSOKIG00005012640 mpx (ENSOKIG00005012668) loxa (ENSOKIG00005012885) snx24 (ENSOKIG00005012890) ENSOKIG00005012909 gmcl1 (ENSOKIG00005012952) fam136a (ENSOKIG00005013000) pcyox1 (ENSOKIG00005013009) slc20a1b (ENSOKIG00005013015) Chinook salmon MODERN SPECIES 12 prlhr2b (ENSOTSG00005028517) anxa4 (ENSOTSG00005028495) ENSOTSG00005028483 ANTXR1 (ENSOTSG00005028477) npffr1l1 (ENSOTSG00005028475) bmp1b (ENSOTSG00005028444) trim69 (ENSOTSG00005028441) pcna (ENSOTSG00005028438) kcnip3b (ENSOTSG00005028415) ENSOTSG00005028414 ENSOTSG00005028413 prnpb (ENSOTSG00005028412) PPTC7 (ENSOTSG00005028411) TBC1D10A (ENSOTSG00005028408) ENSOTSG00005028404 aplnrb (ENSOTSG00005028403) ##22 ENSOTSG00005028400 ENSOTSG00005027853 ENSOTSG00005027756 slc35e4 (ENSOTSG00005027754) ENSOTSG00005027751 INPP5J (ENSOTSG00005027714) mat2aa (ENSOTSG00005027708) ENSOTSG00005027706 mpx (ENSOTSG00005026447) loxa (ENSOTSG00005026442) snx24 (ENSOTSG00005026441) ENSOTSG00005026437 ENSOTSG00005026433 gmcl1 (ENSOTSG00005026427) fam136a (ENSOTSG00005026426) Rainbow trout MODERN SPECIES 26 AAK1 (ENSOMYG00000028074) ENSOMYG00000072613 ANTXR1 (ENSOMYG00000027989) npffr1l1 (ENSOMYG00000027915) trim69 (ENSOMYG00000027897) pcna (ENSOMYG00000059791) ENSOMYG00000027800 ENSOMYG00000027775 ENSOMYG00000058231 ENSOMYG00000027762 ENSOMYG00000048106 ENSOMYG00000058199 ENSOMYG00000027715 ENSOMYG00000055792 ENSOMYG00000074789 aplnrb (ENSOMYG00000027696) ##22 ENSOMYG00000027689 ENSOMYG00000022694 ENSOMYG00000021898 slc35e4 (ENSOMYG00000021859) ENSOMYG00000021850 ENSOMYG00000021826 mat2aa (ENSOMYG00000021720) ENSOMYG00000021658 ENSOMYG00000072457 mpx (ENSOMYG00000021593) loxa (ENSOMYG00000021524) snx24 (ENSOMYG00000021510) ENSOMYG00000021489 ENSOMYG00000066090 gmcl1 (ENSOMYG00000021462) Salmo ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157079.b.z.a ENSGT00940000165511.b.c ENSGT00390000002288 ENSGT00940000164214.k.b.d ENSGT00940000156575.o ENSGT00940000155968.d.a.e ENSGT00940000156522.c.b.c ENSGT01070000253744.b.a.a.b.a ENSGT00940000167013.i ENSGT00390000004965.b ENSGT00940000158782.d.b.g ENSGT00390000016468.b ENSGT00530000064873.a.a ENSGT00390000011937.g.a.d ENSGT00940000157386.b.d ENSGT01050000244888.b.b.a.b.d.c ##22 ENSGT00940000178234 ENSGT00390000013929.g ENSGT00950000182881.a.b.a.a.b.c ENSGT00940000166850.a ENSGT00730000111291.a ENSGT00940000154495.b.b.b.c ENSGT00940000156855.d.b ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.a.c ENSGT00940000164890.a.a ENSGT00940000156009.A.d.s.a ENSGT00940000154779.a.b.a.g ENSGT00390000001280.b.m ENSGT00390000014909.f.b ENSGT00940000156185.f ENSGT00390000006707.f River trout MODERN SPECIES 15 ENSSTUG00000004083 ENSSTUG00000004097 brf2 (ENSSTUG00000004125) prlhr2b (ENSSTUG00000004141) anxa4 (ENSSTUG00000004205) AAK1 (ENSSTUG00000004526) ANTXR1 (ENSSTUG00000004660) npffr1l1 (ENSSTUG00000005176) trim69 (ENSSTUG00000005200) pcna (ENSSTUG00000005225) kcnip3b (ENSSTUG00000005275) ENSSTUG00000005837 prnpb (ENSSTUG00000005842) PPTC7 (ENSSTUG00000005847) TBC1D10A (ENSSTUG00000005868) aplnrb (ENSSTUG00000005935) ##22 ENSSTUG00000005944 ENSSTUG00000005952 ENSSTUG00000005976 ENSSTUG00000006542 slc35e4 (ENSSTUG00000006557) ENSSTUG00000006564 INPP5J (ENSSTUG00000006584) mat2aa (ENSSTUG00000006674) ENSSTUG00000006722 mpx (ENSSTUG00000006763) loxa (ENSSTUG00000006986) snx24 (ENSSTUG00000007001) ENSSTUG00000007010 ENSSTUG00000007033 gmcl1 (ENSSTUG00000007080) Atlantic salmon MODERN SPECIES brf2 (ENSSSAG00000008580) prlhr2b (ENSSSAG00000118342) anxa4 (ENSSSAG00000008599) AAK1 (ENSSSAG00000008656) ANTXR1 (ENSSSAG00000008845) npffr1l1 (ENSSSAG00000009363) ENSSSAG00000088928 trim69 (ENSSSAG00000009437) pcna (ENSSSAG00000009453) ENSSSAG00000058432 ENSSSAG00000114857 ENSSSAG00000010124 ENSSSAG00000108905 ENSSSAG00000111316 ENSSSAG00000116417 aplnrb (ENSSSAG00000092566) ##22 ENSSSAG00000011041 ENSSSAG00000011563 ENSSSAG00000082446 slc35e4 (ENSSSAG00000098144) ENSSSAG00000015635 ENSSSAG00000015646 mat2aa (ENSSSAG00000015758) ENSSSAG00000019139 mpx (ENSSSAG00000000157) loxa (ENSSSAG00000094401) snx24 (ENSSSAG00000000202) ENSSSAG00000092165 ENSSSAG00000000230 gmcl1 (ENSSSAG00000000262) fam136a (ENSSSAG00000121870) Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 241 ENSGT00940000158782.d.b.h ENSGT00390000016468.a ENSGT00530000064873.a.b ENSGT00390000011937.g.a.c ENSGT00940000157386.b.c ENSGT01050000244888.b.b.a.b.d.d ##22 ENSGT00390000013929.h ENSGT00950000182881.a.b.a.a.b.d ENSGT00940000154191.k.b ENSGT00940000166850.b ENSGT00730000111291.b ENSGT00940000154495.b.b.b.d ENSGT00940000156855.d.a ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.a.d ENSGT00940000164890.a.b ENSGT00940000156009.A.d.s.b ENSGT00940000154779.a.b.a.h ENSGT00390000001280.b.n ENSGT00390000014909.f.a ENSGT00940000156185.e ENSGT00390000006707.e Huchen MODERN SPECIES 71 ENSHHUG00000033965 pcna (ENSHHUG00000034015) kcnip3b 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ENSGT00950000182881.a.b.a.a.b.d ENSGT00940000154191.k.b ENSGT00940000166850.b ENSGT00730000111291.b ENSGT00940000154495.b.b.b.d ENSGT00940000156855.d.a ENSGT00950000183185.c.a.a.bb.a.a.d ENSGT00940000164890.a.b ENSGT00940000156009.A.d.s.b ENSGT00940000154779.a.b.a.h ENSGT00390000001280.b.n ENSGT00390000014909.f.a ENSGT00940000156185.e ENSGT00390000006707.e Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000163701.b.a.a.a.b.a.b ENSGT00940000163701.b.a.a.a.b.a.a ENSGT00940000163701.b.a.a.a.b.b ENSGT00940000166282.B ENSGT00940000160629.a.b ENSGT00940000166176.h ENSGT00940000158048.d.e ENSGT00940000165390.b.c.a.d ENSGT00940000165390.b.c.a.c ENSGT00990000212312 ENSGT00940000158782.d.b.h ENSGT01000000221771 ENSGT00530000064873.a.b ENSGT00390000011937.g.a.c ENSGT00940000157386.b.c ENSGT01050000244888.b.b.a.b.d.d ##22 ENSGT00390000013929.h ENSGT00950000182881.a.b.a.a.b.d ENSGT00940000154191.k.b ENSGT00940000166850.b ENSGT00730000111291.b ENSGT00940000154495.b.b.b.d ENSGT00940000156855.d.a 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ENSSGRG00000026900 ENSSGRG00000026902 ENSSGRG00000026928 ENSSGRG00000027471 ENSSGRG00000027478 sub1a (ENSSGRG00000027522) DHX29 (ENSSGRG00000027524) mtrex (ENSSGRG00000027542) PLPP1 (ENSSGRG00000027739) CSGALNACT1 (ENSSGRG00000027748) hvcn1 (ENSSGRG00000027752) PPTC7 (ENSSGRG00000027753) TBC1D10A (ENSSGRG00000027754) aplnrb (ENSSGRG00000027765) ##22 ENSSGRG00000027767 GOLPH3 (ENSSGRG00000027769) isl1b (ENSSGRG00000027776) ITGA1 (ENSSGRG00000027777) ENSSGRG00000028023 Common carp reference MODERN SPECIES 24 ENSCCRG00000051133 ENSCCRG00000048812 ENSCCRG00000073813 ENSCCRG00000037700 sub1a (ENSCCRG00000068368) ENSCCRG00000054942 ENSCCRG00000060938 DHX29 (ENSCCRG00000014204) mtrex (ENSCCRG00000062739) PLPP1 (ENSCCRG00000010311) ENSCCRG00000076110 hvcn1 (ENSCCRG00000010323) ENSCCRG00000058831 ENSCCRG00000058047 ENSCCRG00000050238 aplnrb (ENSCCRG00000068715) ##22 ENSCCRG00000066680 ENSCCRG00000059700 ENSCCRG00000064762 isl1b (ENSCCRG00000010389) ITGA1 (ENSCCRG00000050154) ITGA2 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ENSCARG00000012383 ENSCARG00000012401 plpp5 (ENSCARG00000012427) Zebrafish MODERN SPECIES 1 zgc:173443 (ENSDARG00000034403) sub1a (ENSDARG00000053446) ENSDARG00000089569 ENSDARG00000094312 ENSDARG00000115315 DHX29 (ENSDARG00000040326) mtrex (ENSDARG00000013457) PLPP1 (ENSDARG00000053381) CSGALNACT1 (ENSDARG00000040535) hvcn1 (ENSDARG00000040338) ENSDARG00000078447 PPTC7 (ENSDARG00000052658) ENSDARG00000074732 ENSDARG00000052656 ENSDARG00000060096 aplnrb (ENSDARG00000036670) ##22 pmaip1 (ENSDARG00000089307) GOLPH3 (ENSDARG00000044225) isl1b (ENSDARG00000021055) ENSDARG00000093621 ITGA1 (ENSDARG00000074316) ENSDARG00000069390 ENSDARG00000086838 ITGA2 (ENSDARG00000062974) MOCS2 (ENSDARG00000077202) fstb (ENSDARG00000057992) ARL15 (ENSDARG00000057995) snx18b (ENSDARG00000044246) ENSDARG00000075600 rasgef1bb (ENSDARG00000044251) ENSDARG00000092269 Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 182 ENSGT00940000156240 ENSGT00940000154089.b ENSGT00940000156812 ENSGT00940000157386.b 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ptgs1 (ENSDCDG00000000457) Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 455 ENSGT00940000157386.b ENSGT01050000244888.b.b.a.b.d ##22 ENSGT00390000013929 ENSGT00950000182881.a.b.a.a.b ENSGT00940000156855.d ENSGT00730000111291 ENSGT00940000154191.k.b Asian bonytongue MODERN SPECIES 21 smpd4 (ENSSFOG00015006764) TMEM132C (ENSSFOG00015006851) ENSSFOG00015006919 RIMBP2 (ENSSFOG00015000669) ENSSFOG00015000743 ENSSFOG00015032178 ENSSFOG00015030311 sfswap (ENSSFOG00015000766) MMP17 (ENSSFOG00015000784) noc4l (ENSSFOG00015000842) ENSSFOG00015029597 ENSSFOG00015015173 ENSSFOG00015015149 ENSSFOG00015025365 TBC1D10A (ENSSFOG00015033261) ENSSFOG00015015096 ##22 ENSSFOG00015015076 ENSSFOG00015015022 mpx (ENSSFOG00015014987) mpx (ENSSFOG00015027164) ENSSFOG00015027527 mpx (ENSSFOG00015031834) mpx (ENSSFOG00015032671) ENSSFOG00015022924 ENSSFOG00015022988 INPP5J (ENSSFOG00015023011) ENSSFOG00015023019 slc35e4 (ENSSFOG00015029706) ENSSFOG00015003293 ENSSFOG00015000311 ENSSFOG00015003400 P. kingsleyae MODERN SPECIES 653 ENSPKIG00000017786 ENSPKIG00000017767 TBC1D10A (ENSPKIG00000017735) aplnrb (ENSPKIG00000017716) ##22 ENSPKIG00000017701 noc4l (ENSPKIG00000017628) ENSPKIG00000017598 ##22 ENSPKIG00000017490 ENSPKIG00000017464 ENSPKIG00000017412 ENSPKIG00000017363 Spotted gar MODERN SPECIES 659 ENSLOCG00000008033 ENSLOCG00000008042 osbp2b (ENSLOCG00000008057) ap1b1 (ENSLOCG00000008079) ENSLOCG00000008106 ewsr1b (ENSLOCG00000008118) ENSLOCG00000008145 ENSLOCG00000008161 DTX1 (ENSLOCG00000008172) RASAL1 (ENSLOCG00000008183) dgcr6 (ENSLOCG00000008215) slc7a4 (ENSLOCG00000008226) CCDC157 (ENSLOCG00000008237) sf3a1 (ENSLOCG00000008251) TBC1D10A (ENSLOCG00000008261) aplnra (ENSLOCG00000018158) ##22 ENSLOCG00000008272 morc2 (ENSLOCG00000008283) plbd2 (ENSLOCG00000008313) lhx5 (ENSLOCG00000008328) rbm19 (ENSLOCG00000008341) mzt2b (ENSLOCG00000008364) zgc:193801 (ENSLOCG00000008374) NEFH (ENSLOCG00000008382) thoc5 (ENSLOCG00000008401) ENSLOCG00000008423 SLC8B1 (ENSLOCG00000008436) TPCN1 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