Artiodactyla	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000155910	ENSGT00940000153912.A	ENSGT01090000260051.b.a.a.b.b	ENSGT00940000156033 #7	ENSGT00940000159143 #8	ENSGT00940000155509 #9	ENSGT00390000015172 #10	ENSGT01050000244940.a.b #11	ENSGT00940000156754.a.b #13	ENSGT00940000156754.a.a ##13	ENSGT00940000159732 #17	ENSGT00940000159235 #18	ENSGT00940000161199 #19	ENSGT00940000162091 #20	ENSGT00940000161631 #21	ENSGT00950000183185.c.a.b #22	ENSGT00940000156653 #23	ENSGT00940000154368.k #24	ENSGT00940000155748.b #26	ENSGT00390000016042 #32	ENSGT00390000017848 #33	ENSGT00940000156914 #34	ENSGT00390000008264 #35	ENSGT00940000156008 #36	ENSGT01030000234539.b.b.b #37	ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b	ENSGT00930000151028	ENSGT00940000155303	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000153289.a.a.a	ENSGT00390000014618.a
Artiodactyla_a	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000155910	ENSGT00940000153912.A	ENSGT01090000260051.b.a.a.b.b	ENSGT00940000156033 #7	ENSGT00940000159143 #8	ENSGT00940000155509 #9	ENSGT00390000015172 #10	ENSGT01050000244940.a.b #11	ENSGT00940000156754.a.b #13	ENSGT00940000156754.a.a ##13	ENSGT00940000159732 #17	ENSGT00940000159235 #18	ENSGT00940000161199 #19	ENSGT00940000162091 #20	ENSGT00940000161631 #21	ENSGT00950000183185.c.a.b #22	ENSGT00940000156653 #23	ENSGT00940000154368.k #24	ENSGT00940000155748.b #26	ENSGT00390000016042 #32	ENSGT00390000017848 #33	ENSGT00940000156914 #34	ENSGT00390000008264 #35	ENSGT00940000156008 #36	ENSGT01030000234539.b.b.b #37	ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b	ENSGT00930000151028	ENSGT00940000155303	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000153289.a.a.a	ENSGT00390000014618.a
Artiodactyla_b	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000155910	ENSGT00940000153912.A	ENSGT01090000260051.b.a.a.b.b	ENSGT00940000156033 #7	ENSGT00940000159143 #8	ENSGT00940000155509 #9	ENSGT00390000015172 #10	ENSGT01050000244940.a.b #11	ENSGT00940000156754.a.b #13	ENSGT00940000156754.a.a ##13	ENSGT00940000159732 #17	ENSGT00940000159235 #18	ENSGT00940000161199 #19	ENSGT00940000162091 #20	ENSGT00940000161631 #21	ENSGT00950000183185.c.a.b #22	ENSGT00940000156653 #23	ENSGT00940000154368.k #24	ENSGT00940000155748.b #26	ENSGT00390000016042 #32	ENSGT00390000017848 #33	ENSGT00940000156914 #34	ENSGT00390000008264 #35	ENSGT00940000156008 #36	ENSGT01030000234539.b.b.b #37	ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b	ENSGT00930000151028	ENSGT00940000155303	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000153289.a.a.a	ENSGT00390000014618.a
Pecora	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000155910	ENSGT00940000153912.A.e.a	ENSGT01090000260051.b.a.a.b.b	ENSGT00940000156033 #7	ENSGT00940000159143 #8	ENSGT00940000155509 #9	ENSGT00390000015172 #10	ENSGT01050000244940.a.b #11	ENSGT00940000156754.a.b #13	ENSGT00940000156754.a.a ##13	ENSGT00940000159732 #17	ENSGT00940000159235 #18	ENSGT00940000161199 #19	ENSGT00940000162091 #20	ENSGT00940000161631 #21	ENSGT00950000183185.c.a.b #22	ENSGT00940000156653 #23	ENSGT00940000154368.k #24	ENSGT00940000155748.b.g #26	ENSGT00940000155748.b.h.a #30	ENSGT00390000016042 #32	ENSGT00390000017848 #33	ENSGT00940000156914 #34	ENSGT00390000008264 #35	ENSGT00940000156008 #36	ENSGT01030000234539.b.b.b #37	ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b	ENSGT00930000151028	ENSGT00940000155303	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000153289.a.a.a
Percora_a	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000155910	ENSGT00940000153912.A.e.a	ENSGT01090000260051.b.a.a.b.b	ENSGT00940000156033 #7	ENSGT00940000159143 #8	ENSGT00940000155509 #9	ENSGT00390000015172 #10	ENSGT01050000244940.a.b #11	ENSGT00940000156754.a.b #13	ENSGT00940000156754.a.a ##13	ENSGT00940000159732 #17	ENSGT00940000159235 #18	ENSGT00940000161199 #19	ENSGT00940000162091 #20	ENSGT00940000161631 #21	ENSGT00950000183185.c.a.b #22	ENSGT00940000156653 #23	ENSGT00940000154368.k #24	ENSGT00940000155748.b.g #26	ENSGT00940000155748.b.h.a #30	ENSGT00390000016042 #32	ENSGT00390000017848 #33	ENSGT00940000156914 #34	ENSGT00390000008264 #35	ENSGT00940000156008 #36	ENSGT01030000234539.b.b.b #37	ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b	ENSGT00930000151028	ENSGT00940000155303	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000153289.a.a.a
Bovidae	ANCESTRAL SPECIES	27	ENSGT00940000155910	ENSGT00940000153912.A.e.a	ENSGT01090000260051.b.a.a.b.b	ENSGT00940000156033 #7	ENSGT00940000159143 #8	ENSGT00940000155509 #9	ENSGT00390000015172 #10	ENSGT01050000244940.a.b #11	ENSGT00940000156754.a.b #13	ENSGT00940000156754.a.a ##13	ENSGT00940000159732 #17	ENSGT00940000159235 #18	ENSGT00940000161199 #19	ENSGT00940000162091 #20	ENSGT00940000161631 #21	ENSGT00950000183185.c.a.b #22	ENSGT00940000156653 #23	ENSGT00940000154368.k #24	ENSGT00940000155748.b.g #26	ENSGT00940000155748.b.h.a.b #30	ENSGT00390000016042 #32	ENSGT00390000017848 #33	ENSGT00940000156914 #34	ENSGT00390000008264 #35	ENSGT00940000156008 #36	ENSGT01030000234539.b.b.b #37	ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b	ENSGT00930000151028	ENSGT00940000155303	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000153289.a.a.a
Caprinae	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00940000153912.A.e.a	ENSGT01090000260051.b.a.a.b.b	ENSGT00940000156033 #7	ENSGT00940000159143 #8	ENSGT00940000155509 #9	ENSGT00390000015172 #10	ENSGT01050000244940.a.b #11	ENSGT00940000157251.kb.b	ENSGT00940000156754.a.b #13	ENSGT00940000156754.a.a ##13	ENSGT00940000159732 #17	ENSGT00940000159235 #18	ENSGT00940000161199 #19	ENSGT00940000162091 #20	ENSGT00940000161631 #21	ENSGT00950000183185.c.a.b #22	ENSGT00940000156653 #23	ENSGT00940000154368.k #24	ENSGT00940000155748.b.g #26	ENSGT00940000155748.b.h.a.b.c #30	ENSGT00940000155748.b.h.b #27	ENSGT00940000155748.b.h.a.b.d #31	ENSGT00390000016042 #32	ENSGT00390000017848 #33	ENSGT00940000156914 #34	ENSGT00390000008264 #35	ENSGT00940000156008 #36	ENSGT01030000234539.b.b.b #37	ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b	ENSGT00930000151028	ENSGT00940000155303
Rambouillet Sheep	MODERN SPECIES	17	LRIT1 (ENSOARG00020026303) #7	LRIT2 (ENSOARG00020026301) #8	CDHR1 (ENSOARG00020026297) #9	GPR15LG (ENSOARG00020026294) #10	GHITM (ENSOARG00020026292) #11	ENSOARG00020026284 #12	NRG3 (ENSOARG00020026281) #13	ENSOARG00020026276 #14	ENSOARG00020026269 #15	ENSOARG00020026267 #16	SH2D4B (ENSOARG00020026263) #17	TSPAN14 (ENSOARG00020026261) #18	PRXL2A (ENSOARG00020026259) #19	DYDC2 (ENSOARG00020026258) #20	DYDC1 (ENSOARG00020026256) #21	MAT1A (ENSOARG00020026255) #22	SFTPA1 (ENSOARG00020026254) #23	MBLA (ENSOARG00020026253) #24	ENSOARG00020026250 #25	ENSOARG00020026246 #26	ENSOARG00020026243 #27	ENSOARG00020026241 #28	ENSOARG00020026239 #29	ENSOARG00020026235 #30	ENSOARG00020026232 #31	TMEM254 (ENSOARG00020026230) #32	PLAC9 (ENSOARG00020026228) #33	ANXA11 (ENSOARG00020026223) #34	ZCCHC24 (ENSOARG00020026221) #35	PPIF (ENSOARG00020026220) #36	ZMIZ1 (ENSOARG00020026214) #37
Goat	MODERN SPECIES	20	CCSER2 (ENSCHIG00000021791)	RGR (ENSCHIG00000024790)	LRIT1 (ENSCHIG00000009908) #7	LRIT2 (ENSCHIG00000000072) #8	CDHR1 (ENSCHIG00000000107) #9	GHITM (ENSCHIG00000000141) #11	ENSCHIG00000000175	ENSCHIG00000000249 #13	ENSCHIG00000000283 ##13	ENSCHIG00000000316	SH2D4B (ENSCHIG00000000351) #17	TSPAN14 (ENSCHIG00000000382) #18	PRXL2A (ENSCHIG00000000416) #19	DYDC2 (ENSCHIG00000000451) #20	DYDC1 (ENSCHIG00000009877) #21	MAT1A (ENSCHIG00000009411) #22	ENSCHIG00000013431 #23	ENSCHIG00000015787 #24	ENSCHIG00000018462 #26	CGN (ENSCHIG00000020824) #30	ENSCHIG00000024354 #27	ENSCHIG00000008740 #31	ENSCHIG00000000069 #32	PLAC9 (ENSCHIG00000000102) #33	ANXA11 (ENSCHIG00000000134) #34	ENSCHIG00000000166	ZCCHC24 (ENSCHIG00000000203) #35	PPIF (ENSCHIG00000000241) #36	ZMIZ1 (ENSCHIG00000000282) #37	ENSCHIG00000000315	POLR3A (ENSCHIG00000000352)
Bovinae	ANCESTRAL SPECIES	30	ENSGT00530000064550.B	ENSGT00940000155910	ENSGT00940000153912.A.e.a	ENSGT01090000260051.b.a.a.b.b	ENSGT00940000156033 #7	ENSGT00940000159143 #8	ENSGT00940000155509 #9	ENSGT00390000015172 #10	ENSGT01050000244940.a.b #11	ENSGT00940000156754.a.b #13	ENSGT00940000159732 #17	ENSGT00940000159235 #18	ENSGT00940000161199 #19	ENSGT00940000162091 #20	ENSGT00940000161631 #21	ENSGT00950000183185.c.a.b #22	ENSGT00940000156653 #23	ENSGT00940000154368.k #24	ENSGT00940000155748.b.g #26	ENSGT00940000155748.b.h.a.b.b #30	ENSGT00940000155748.b.h.b #27	ENSGT00940000155748.b.h.a.b.a #30	ENSGT00390000016042 #32	ENSGT00390000017848 #33	ENSGT00940000156914 #34	ENSGT00390000008264 #35	ENSGT00940000156008 #36	ENSGT01030000234539.b.b.b #37	ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b	ENSGT00930000151028	ENSGT00940000155303
American bison	MODERN SPECIES	2968											SH2D4B (ENSBBBG00000016366) #17	TSPAN14 (ENSBBBG00000016354) #18	PRXL2A (ENSBBBG00000016221) #19	DYDC2 (ENSBBBG00000004021) #20	DYDC1 (ENSBBBG00000004016) #21	MAT1A (ENSBBBG00000016161) #22	ENSBBBG00000016144 #23	ENSBBBG00000016126 #24	ENSBBBG00000016117 #26	ENSBBBG00000016103 #30	ENSBBBG00000003996 #27	ENSBBBG00000016073 ##26	ENSBBBG00000016044 #30	ENSBBBG00000002568	TMEM254 (ENSBBBG00000016012) #32	PLAC9 (ENSBBBG00000015987) #33	ANXA11 (ENSBBBG00000003980) #34	ZCCHC24 (ENSBBBG00000015927) #35	PPIF (ENSBBBG00000015913) #36	ZMIZ1 (ENSBBBG00000015897) #37	RPS24 (ENSBBBG00000015864)
Bos	ANCESTRAL SPECIES	27	ENSGT00530000064550.B	ENSGT00940000155910	ENSGT00940000153912.A.e.a	ENSGT01090000260051.b.a.a.b.b	ENSGT00940000156033 #7	ENSGT00940000159143 #8	ENSGT00940000155509 #9	ENSGT00390000015172 #10	ENSGT01050000244940.a.b #11	ENSGT00940000156754.a.b #13	ENSGT00940000159732 #17	ENSGT00940000159235 #18	ENSGT00940000161199 #19	ENSGT00940000162091 #20	ENSGT00940000161631 #21	ENSGT00950000183185.c.a.b #22	ENSGT00940000156653 #23	ENSGT00940000154368.k #24	ENSGT00940000155748.b.g #26	ENSGT00940000155748.b.h.a.b.b #30	ENSGT00940000155748.b.h.b #27	ENSGT00940000155748.b.h.a.a.b ##26	ENSGT00940000155748.b.h.a.b.a #30	ENSGT00390000016042 #32	ENSGT00390000017848 #33	ENSGT00940000156914 #34	ENSGT00390000008264 #35	ENSGT00940000156008 #36	ENSGT01030000234539.b.b.b #37	ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b	ENSGT00930000151028
Bos_b	ANCESTRAL SPECIES	32	ENSGT00530000064550.B	ENSGT00940000155910	ENSGT00940000153912.A.e.a	ENSGT01090000260051.b.a.a.b.b	ENSGT00940000156033 #7	ENSGT00940000159143 #8	ENSGT00940000155509 #9	ENSGT00390000015172 #10	ENSGT01050000244940.a.b #11	ENSGT00940000156754.a.b #13	ENSGT00940000159732 #17	ENSGT00940000159235 #18	ENSGT00940000161199 #19	ENSGT00940000162091 #20	ENSGT00940000161631 #21	ENSGT00950000183185.c.a.b #22	ENSGT00940000156653 #23	ENSGT00940000154368.k #24	ENSGT00940000155748.b.g #26	ENSGT00940000155748.b.h.a.b.b #30	ENSGT00940000155748.b.h.b #27	ENSGT00940000155748.b.h.a.a.b ##26	ENSGT00940000155748.b.h.a.b.a #30	ENSGT00390000016042 #32	ENSGT00390000017848 #33	ENSGT00940000156914 #34	ENSGT00390000008264 #35	ENSGT00940000156008 #36	ENSGT01030000234539.b.b.b #37	ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b	ENSGT00930000151028
Cow	MODERN SPECIES	20	CCSER2 (ENSBTAG00000017611)	RGR (ENSBTAG00000015681)	LRIT1 (ENSBTAG00000003442) #7	LRIT2 (ENSBTAG00000023987) #8	CDHR1 (ENSBTAG00000001231) #9	GPR15LG (ENSBTAG00000050197) #10	GHITM (ENSBTAG00000032829) #11	ENSBTAG00000052588	ENSBTAG00000051629 ##15	NRG3 (ENSBTAG00000009587) #13	SH2D4B (ENSBTAG00000003910) #17	TSPAN14 (ENSBTAG00000003907) #18	PRXL2A (ENSBTAG00000021416) #19	DYDC2 (ENSBTAG00000032862) #20	DYDC1 (ENSBTAG00000032858) #21	MAT1A (ENSBTAG00000005963) #22	SFTPA1 (ENSBTAG00000023032) #23	MBL1 (ENSBTAG00000054761) #24	SFTPD (ENSBTAG00000046421) #26	ENSBTAG00000048082 #30	CL43 (ENSBTAG00000054756) #27	ENSBTAG00000052810 ##26	CL46 (ENSBTAG00000006536) ##26	CGN1 (ENSBTAG00000047317) #30	TMEM254 (ENSBTAG00000001656) #32	PLAC9 (ENSBTAG00000020939) #33	ANXA11 (ENSBTAG00000020940) #34	ZCCHC24 (ENSBTAG00000003877) #35	PPIF (ENSBTAG00000016711) #36	ZMIZ1 (ENSBTAG00000019313) #37	RPS24 (ENSBTAG00000013264)
Bos_a	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00390000015768	ENSGT00940000155910	ENSGT00940000153912.A.e.a	ENSGT01090000260051.b.a.a.b.b	ENSGT00940000156033 #7	ENSGT00940000159143 #8	ENSGT00940000155509 #9	ENSGT00390000015172 #10	ENSGT01050000244940.a.b #11	ENSGT00940000156754.a.b #13	ENSGT00940000159732 #17	ENSGT00940000159235 #18	ENSGT00940000161199 #19	ENSGT00940000162091 #20	ENSGT00940000161631 #21	ENSGT00950000183185.c.a.b #22	ENSGT00940000156653 #23	ENSGT00940000154368.k #24	ENSGT00940000155748.b.g #26	ENSGT00940000155748.b.h.a.b.a #30	ENSGT00390000016042 #32	ENSGT00390000017848 #33	ENSGT00940000156914 #34	ENSGT00390000008264 #35	ENSGT00940000156008 #36	ENSGT01030000234539.b.b.b #37	ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b	ENSGT00930000151028	ENSGT00940000155303	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000153289.a.a.a
Wild yak	MODERN SPECIES	2369																MAT1A (ENSBMUG00000019068) #22	ENSBMUG00000019031 #23	ENSBMUG00000019009 #24	ENSBMUG00000018989 #26
Domestic yak	MODERN SPECIES	19	CCSER2 (ENSBGRG00000026406)	RGR (ENSBGRG00000026377)	LRIT1 (ENSBGRG00000026365) #7	LRIT2 (ENSBGRG00000026359) #8	CDHR1 (ENSBGRG00000026334) #9	ENSBGRG00000026318 #10	GHITM (ENSBGRG00000026306) #11	ENSBGRG00000026300	ENSBGRG00000026297	NRG3 (ENSBGRG00000026267) #13	SH2D4B (ENSBGRG00000026255) #17	TSPAN14 (ENSBGRG00000026210) #18	PRXL2A (ENSBGRG00000026197) #19	DYDC2 (ENSBGRG00000026194) #20	DYDC1 (ENSBGRG00000026188) #21	MAT1A (ENSBGRG00000026171) #22	ENSBGRG00000026156 #23	ENSBGRG00000026148 #24	ENSBGRG00000026101 #30	ENSBGRG00000026078 #32	ENSBGRG00000026065 #33	ANXA11 (ENSBGRG00000026044) #34	ZCCHC24 (ENSBGRG00000026029) #35	PPIF (ENSBGRG00000026020) #36	ZMIZ1 (ENSBGRG00000025955) #37	ENSBGRG00000025877	POLR3A (ENSBGRG00000025792)	DLG5 (ENSBGRG00000025765)	ENSBGRG00000025755	KCNMA1 (ENSBGRG00000021722)	ENSBGRG00000021338
Siberian musk deer	MODERN SPECIES	1227									ENSMMSG00000023292	SH2D4B (ENSMMSG00000023276) #17	ENSMMSG00000023269	TSPAN14 (ENSMMSG00000023222) #18	ENSMMSG00000023200 #19	DYDC2 (ENSMMSG00000023192) #20	DYDC1 (ENSMMSG00000023180) #21	MAT1A (ENSMMSG00000023169) #22	ENSMMSG00000023163 #23	ENSMMSG00000023158 #24	SFTPD (ENSMMSG00000023146) #26	TMEM254 (ENSMMSG00000023136) #32	PLAC9 (ENSMMSG00000023126) #33	ANXA11 (ENSMMSG00000023104) #34	ZCCHC24 (ENSMMSG00000023092) #35	ENSMMSG00000023087	PPIF (ENSMMSG00000023077) #36	ZMIZ1 (ENSMMSG00000023032) #37	ENSMMSG00000023003	POLR3A (ENSMMSG00000022968)	DLG5 (ENSMMSG00000022925)	ENSMMSG00000022915	KCNMA1 (ENSMMSG00000013398)
Yarkand deer	MODERN SPECIES	6	DLG5 (ENSCHYG00000012083)	POLR3A (ENSCHYG00000012420)	ENSCHYG00000012766	ZMIZ1 (ENSCHYG00000012931) #37	PPIF (ENSCHYG00000013395) #36	ZCCHC24 (ENSCHYG00000013440) #35	ANXA11 (ENSCHYG00000013542) #34	PLAC9 (ENSCHYG00000013866) #33	ENSCHYG00000014032 #32	ENSCHYG00000014145 #27	SH2D4B (ENSCHYG00000014276) #17	TSPAN14 (ENSCHYG00000014417) #18	PRXL2A (ENSCHYG00000014641) #19	DYDC2 (ENSCHYG00000014807) #20	DYDC1 (ENSCHYG00000014842) #21	MAT1A (ENSCHYG00000014940) #22	ENSCHYG00000015043 #23	ENSCHYG00000015129 #24	ENSCHYG00000015171 #26	ENSCHYG00000015409	NRG3 (ENSCHYG00000015462) #13	ENSCHYG00000015888 #13	ENSCHYG00000016019	ENSCHYG00000016123 #11	ENSCHYG00000016312 #10	ENSCHYG00000016363 #9	ENSCHYG00000016604 #8	ENSCHYG00000016657 #7	ENSCHYG00000016737	ENSCHYG00000016802	ENSCHYG00000016870
Cetacea	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00390000015768	ENSGT00940000155910	ENSGT00940000153912.A	ENSGT01090000260051.b.a.a.b.b	ENSGT00940000156033 #7	ENSGT00940000159143 #8	ENSGT00940000155509 #9	ENSGT00390000015172 #10	ENSGT01050000244940.a.b #11	ENSGT00940000156754.a.b #13	ENSGT00940000159732 #17	ENSGT00940000159235 #18	ENSGT00940000161199 #19	ENSGT00940000162091 #20	ENSGT00940000161631 #21	ENSGT00950000183185.c.a.b #22	ENSGT00940000156653 #23	ENSGT00940000154368.k #24	ENSGT00940000155748.b #26	ENSGT00390000016042 #32	ENSGT00390000017848 #33	ENSGT00940000156914 #34	ENSGT00940000153524.b.a.b	ENSGT00390000008264 #35	ENSGT00940000156008 #36	ENSGT01030000234539.b.b.b #37	ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b	ENSGT00930000151028	ENSGT00940000155303	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000153289.a.a.a
Blue whale	MODERN SPECIES	7	GRID1 (ENSBMSG00010022455)	CCSER2 (ENSBMSG00010022458)	RGR (ENSBMSG00010022461)	LRIT1 (ENSBMSG00010022463) #7	LRIT2 (ENSBMSG00010022464) #8	CDHR1 (ENSBMSG00010022466) #9	ENSBMSG00010022467 #10	ENSBMSG00010022468 #11	ENSBMSG00010022469	NRG3 (ENSBMSG00010022472) #13	SH2D4B (ENSBMSG00010022475) #17	TSPAN14 (ENSBMSG00010022479) #18	PRXL2A (ENSBMSG00010022482) #19	DYDC2 (ENSBMSG00010022483) #20	DYDC1 (ENSBMSG00010022484) #21	MAT1A (ENSBMSG00010022487) #22	ENSBMSG00010022490 #23	SFTPD (ENSBMSG00010022493) #26	TMEM254 (ENSBMSG00010022495) #32	PLAC9 (ENSBMSG00010022496) #33	ANXA11 (ENSBMSG00010022498) #34	ENSBMSG00010022499	ZCCHC24 (ENSBMSG00010022501) #35	PPIF (ENSBMSG00010022502) #36	ZMIZ1 (ENSBMSG00010022504) #37	ENSBMSG00010022505	POLR3A (ENSBMSG00010022509)	DLG5 (ENSBMSG00010022512)	KCNMA1 (ENSBMSG00010022513)	LRMDA (ENSBMSG00010012642)	ZNF503 (ENSBMSG00010012691)
Odontoceti	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00390000015768	ENSGT00940000155910	ENSGT00940000153912.A	ENSGT01090000260051.b.a.a.b.b	ENSGT00940000156033 #7	ENSGT00940000159143 #8	ENSGT00940000155509 #9	ENSGT00390000015172 #10	ENSGT01050000244940.a.b #11	ENSGT00940000156754.a.b #13	ENSGT00940000159732 #17	ENSGT00940000159235 #18	ENSGT00940000161199 #19	ENSGT00940000162091 #20	ENSGT00940000161631 #21	ENSGT00950000183185.c.a.b #22	ENSGT00940000156653 #23	ENSGT00940000154368.k #24	ENSGT00940000155748.b #26	ENSGT00390000016042 #32	ENSGT00390000017848 #33	ENSGT00940000156914 #34	ENSGT00940000153524.b.a.b	ENSGT00390000008264 #35	ENSGT00940000156008 #36	ENSGT01030000234539.b.b.b #37	ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b	ENSGT00930000151028	ENSGT00940000155303	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000153289.a.a.a
Sperm whale	MODERN SPECIES	12	GRID1 (ENSPCTG00005007265)	CCSER2 (ENSPCTG00005007133)	RGR (ENSPCTG00005006808)	LRIT1 (ENSPCTG00005006744) #7	LRIT2 (ENSPCTG00005006723) #8	CDHR1 (ENSPCTG00005006669) #9	GPR15LG (ENSPCTG00005006634) #10	GHITM (ENSPCTG00005006615) #11	NRG3 (ENSPCTG00005006486) #13	ENSPCTG00005006456	SH2D4B (ENSPCTG00005006438) #17	PRXL2A (ENSPCTG00005006403) #19	TSPAN14 (ENSPCTG00005006388) #18	DYDC2 (ENSPCTG00005006371) #20	DYDC1 (ENSPCTG00005006354) #21	MAT1A (ENSPCTG00005006306) #22	ENSPCTG00005006277 #23	MBL2 (ENSPCTG00005006245) #24	SFTPD (ENSPCTG00005006186) #26	TMEM254 (ENSPCTG00005006162) #32	ENSPCTG00005006115 #34	ENSPCTG00005006100 #36	ZMIZ1 (ENSPCTG00005006080) #37	RPS24 (ENSPCTG00005005966)	POLR3A (ENSPCTG00005005766)	ENSPCTG00005005355	KCNMA1 (ENSPCTG00005004698)	ENSPCTG00005004484	ENSPCTG00005004478	ENSPCTG00005004441	LRMDA (ENSPCTG00005004419)
Odontoceti_a	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00390000015768	ENSGT00940000155910	ENSGT00940000153912.A	ENSGT01090000260051.b.a.a.b.b	ENSGT00940000156033 #7	ENSGT00940000159143 #8	ENSGT00940000155509 #9	ENSGT00390000015172 #10	ENSGT01050000244940.a.b #11	ENSGT00940000156754.a.b #13	ENSGT00940000159732 #17	ENSGT00940000159235 #18	ENSGT00940000161199 #19	ENSGT00940000162091 #20	ENSGT00940000161631 #21	ENSGT00950000183185.c.a.b #22	ENSGT00940000156653 #23	ENSGT00940000154368.k #24	ENSGT00940000155748.b #26	ENSGT00390000016042 #32	ENSGT00390000017848 #33	ENSGT00940000156914 #34	ENSGT00940000153524.b.a.b	ENSGT00390000008264 #35	ENSGT00940000156008 #36	ENSGT01030000234539.b.b.b #37	ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b	ENSGT00930000151028	ENSGT00940000155303	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000153289.a.a.a
Odontoceti_b	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00390000015768	ENSGT00940000155910	ENSGT00940000153912.A	ENSGT01090000260051.b.a.a.b.b	ENSGT00940000156033 #7	ENSGT00940000159143 #8	ENSGT00940000155509 #9	ENSGT00390000015172 #10	ENSGT01050000244940.a.b #11	ENSGT00940000156754.a.b #13	ENSGT00940000159732 #17	ENSGT00940000159235 #18	ENSGT00940000161199 #19	ENSGT00940000162091 #20	ENSGT00940000161631 #21	ENSGT00950000183185.c.a.b #22	ENSGT00940000156653 #23	ENSGT00940000154368.k #24	ENSGT00940000155748.b #26	ENSGT00390000016042 #32	ENSGT00390000017848 #33	ENSGT00940000156914 #34	ENSGT00940000153524.b.a.b	ENSGT00390000008264 #35	ENSGT00940000156008 #36	ENSGT01030000234539.b.b.b #37	ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b	ENSGT00930000151028	ENSGT00940000155303	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000153289.a.a.a
Monodontidae	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00390000015768	ENSGT00940000155910	ENSGT00940000153912.A	ENSGT01090000260051.b.a.a.b.b	ENSGT00940000156033 #7	ENSGT00940000159143 #8	ENSGT00940000155509 #9	ENSGT00390000015172 #10	ENSGT01050000244940.a.b #11	ENSGT00940000156754.a.b #13	ENSGT00940000159732 #17	ENSGT00940000159235 #18	ENSGT00940000161199 #19	ENSGT00940000162091 #20	ENSGT00940000161631 #21	ENSGT00950000183185.c.a.b #22	ENSGT00940000156653 #23	ENSGT00940000154368.k #24	ENSGT00940000155748.b #26	ENSGT00390000016042 #32	ENSGT00390000017848 #33	ENSGT00940000156914 #34	ENSGT00940000153524.b.a.b	ENSGT00390000008264 #35	ENSGT00940000156008 #36	ENSGT01030000234539.b.b.b #37	ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b	ENSGT00930000151028	ENSGT00940000155303	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000153289.a.a.a
Narwhal	MODERN SPECIES	311	WAPL (ENSMMNG00015013353)	GRID1 (ENSMMNG00015013323)	CCSER2 (ENSMMNG00015013293)	RGR (ENSMMNG00015013252)	LRIT1 (ENSMMNG00015013227) #7	LRIT2 (ENSMMNG00015013216) #8	CDHR1 (ENSMMNG00015013199) #9	GPR15LG (ENSMMNG00015013188) #10	GHITM (ENSMMNG00015013177) #11	NRG3 (ENSMMNG00015013141) #13	SH2D4B (ENSMMNG00015013109) #17	TSPAN14 (ENSMMNG00015013074) #18	PRXL2A (ENSMMNG00015013046) #19	DYDC2 (ENSMMNG00015013037) #20	DYDC1 (ENSMMNG00015013023) #21	MAT1A (ENSMMNG00015013003) #22	ENSMMNG00015012993 #23	ENSMMNG00015012984 #24	SFTPD (ENSMMNG00015012972) #26	TMEM254 (ENSMMNG00015012964) #32	PLAC9 (ENSMMNG00015012952) #33	ENSMMNG00015012941	ANXA11 (ENSMMNG00015012925) #34	ENSMMNG00015012913	ZCCHC24 (ENSMMNG00015012905) #35	PPIF (ENSMMNG00015012885) #36	ZMIZ1 (ENSMMNG00015012852) #37	ENSMMNG00015012806	POLR3A (ENSMMNG00015012741)	DLG5 (ENSMMNG00015012641)	KCNMA1 (ENSMMNG00015011966)
Beluga whale	MODERN SPECIES	65	WAPL (ENSDLEG00000012059)	ENSDLEG00000012096	GRID1 (ENSDLEG00000012126)	CCSER2 (ENSDLEG00000012429)	RGR (ENSDLEG00000012476)	LRIT1 (ENSDLEG00000007931) #7	LRIT2 (ENSDLEG00000007947) #8	CDHR1 (ENSDLEG00000007970) #9	GHITM (ENSDLEG00000007990) #11	ENSDLEG00000008022 #13	SH2D4B (ENSDLEG00000008032) #17	TSPAN14 (ENSDLEG00000008056) #18	FAM213A (ENSDLEG00000008086) #19	DYDC2 (ENSDLEG00000008134) #20	DYDC1 (ENSDLEG00000008165) #21	MAT1A (ENSDLEG00000008206) #22	ENSDLEG00000008253 #23	ENSDLEG00000008274 #24	SFTPD (ENSDLEG00000008308) #26	TMEM254 (ENSDLEG00000008376) #32	ENSDLEG00000008405 #33	ANXA11 (ENSDLEG00000008446) #34	ENSDLEG00000008507	ENSDLEG00000008547	ZCCHC24 (ENSDLEG00000008566)	PPIF (ENSDLEG00000008590) #36	ZMIZ1 (ENSDLEG00000008643) #37	RPS24 (ENSDLEG00000008847)	POLR3A (ENSDLEG00000008899)	DLG5 (ENSDLEG00000009115)	ENSDLEG00000009359
Vaquita	MODERN SPECIES	7	OPN4 (ENSPSNG00000009696)	WAPL (ENSPSNG00000022637)	GRID1 (ENSPSNG00000022635)	CCSER2 (ENSPSNG00000022634)	RGR (ENSPSNG00000022633)	LRIT1 (ENSPSNG00000022632) #7	LRIT2 (ENSPSNG00000022631) #8	CDHR1 (ENSPSNG00000022630) #9	GPR15LG (ENSPSNG00000022629) #10	GHITM (ENSPSNG00000022628) #11	NRG3 (ENSPSNG00000022624) #13	SH2D4B (ENSPSNG00000022622) #17	TSPAN14 (ENSPSNG00000022619) #18	PRXL2A (ENSPSNG00000022616) #19	ENSPSNG00000022615 #20	MAT1A (ENSPSNG00000022614) #22	ENSPSNG00000022612 #23	ENSPSNG00000022611 #24	SFTPD (ENSPSNG00000022610) #26	TMEM254 (ENSPSNG00000022609) #32	PLAC9 (ENSPSNG00000022608) #33	ANXA11 (ENSPSNG00000022607) #34	ENSPSNG00000022606	ZCCHC24 (ENSPSNG00000022605) #35	PPIF (ENSPSNG00000022602) #36	ZMIZ1 (ENSPSNG00000022601) #37	ENSPSNG00000022599	POLR3A (ENSPSNG00000022598)	DLG5 (ENSPSNG00000022596)	KCNMA1 (ENSPSNG00000021619)	ENSPSNG00000019239
Camelidae	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000015768	ENSGT00940000155910	ENSGT00940000153912.A	ENSGT01090000260051.b.a.a.b.b	ENSGT00940000156033 #7	ENSGT00940000159143 #8	ENSGT00940000155509 #9	ENSGT00390000015172 #10	ENSGT01050000244940.a.b #11	ENSGT00940000156754.a.b #13	ENSGT00940000159732 #17	ENSGT00940000159235 #18	ENSGT00940000161199 #19	ENSGT00940000162091 #20	ENSGT00940000161631 #21	ENSGT00950000183185.c.a.b #22	ENSGT00940000156653 #23	ENSGT00940000154368.k #24	ENSGT00940000155748.b #26	ENSGT00390000016042 #32	ENSGT00390000017848 #33	ENSGT00940000156914 #34	ENSGT00390000008264 #35	ENSGT00940000156008 #36	ENSGT00390000000153.l.b.c.a	ENSGT00930000151028	ENSGT00940000155303	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000153289.a.a.a	ENSGT00390000014618.a	ENSGT00390000004409
Arabian camel	MODERN SPECIES	2	RGR (ENSCDRG00005010360)	LRIT1 (ENSCDRG00005010255) #7	LRIT2 (ENSCDRG00005010151) #8	CDHR1 (ENSCDRG00005008037) #9	GPR15LG (ENSCDRG00005007900) #10	GHITM (ENSCDRG00005007844) #11	ENSCDRG00005007837	ENSCDRG00005007794	ENSCDRG00005007739 #13	ENSCDRG00005007698	SH2D4B (ENSCDRG00005007650) #17	ENSCDRG00005007349 #18	ENSCDRG00005007240 #19	ENSCDRG00005007182 #20	DYDC1 (ENSCDRG00005007116) #21	MAT1A (ENSCDRG00005007061) #22	ENSCDRG00005007005 #23	ENSCDRG00005006976 #24	SFTPD (ENSCDRG00005006926) #26	TMEM254 (ENSCDRG00005006878) #32	ENSCDRG00005006822 #33	ANXA11 (ENSCDRG00005006778) #34	ZCCHC24 (ENSCDRG00005006751) #35	PPIF (ENSCDRG00005006732) #36	RPS24 (ENSCDRG00005022258)	ENSCDRG00005022257	ENSCDRG00005022255	DLG5 (ENSCDRG00005022253)	KCNMA1 (ENSCDRG00005019550)	LRMDA (ENSCDRG00005018525)	ZNF503 (ENSCDRG00005018488)
Alpaca	MODERN SPECIES	1120																MAT1A (ENSVPAG00000002966) #22
Suina	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00390000015768	ENSGT00940000155910	ENSGT00940000153912.A	ENSGT01090000260051.b.a.a.b.b	ENSGT00940000156033 #7	ENSGT00940000159143 #8	ENSGT00940000155509 #9	ENSGT00390000015172 #10	ENSGT01050000244940.a.b #11	ENSGT00940000156754.a.b #13	ENSGT00940000159732 #17	ENSGT00940000159235 #18	ENSGT00940000161199 #19	ENSGT00940000162091 #20	ENSGT00940000161631 #21	ENSGT00950000183185.c.a.b #22	ENSGT00940000156653 #23	ENSGT00940000154368.k #24	ENSGT00940000155748.b #26	ENSGT00390000016042 #32	ENSGT00390000017848 #33	ENSGT00940000156914 #34	ENSGT00390000008264 #35	ENSGT00940000156008 #36	ENSGT01030000234539.b.b.b #37	ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b	ENSGT00930000151028	ENSGT00940000155303	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000153289.a.a.a	ENSGT00390000014618.a
Chacoan peccary	MODERN SPECIES	975	GRID1 (ENSCWAG00000015223)	CCSER2 (ENSCWAG00000015355)	RGR (ENSCWAG00000015482)	LRIT1 (ENSCWAG00000015793) #7	LRIT2 (ENSCWAG00000015831) #8	CDHR1 (ENSCWAG00000015860) #9	GPR15LG (ENSCWAG00000015937) #10	GHITM (ENSCWAG00000015973) #11	NRG3 (ENSCWAG00000015993) #13	ENSCWAG00000016174	SH2D4B (ENSCWAG00000016213) #17	TSPAN14 (ENSCWAG00000016283) #18	PRXL2A (ENSCWAG00000016536) #19	DYDC2 (ENSCWAG00000016627) #20	DYDC1 (ENSCWAG00000016654) #21	MAT1A (ENSCWAG00000016704) #22	ENSCWAG00000016771 #23	ENSCWAG00000016806 #24	SFTPD (ENSCWAG00000016854) #26	ENSCWAG00000016901	TMEM254 (ENSCWAG00000016918) #32	PLAC9 (ENSCWAG00000016948) #33	ANXA11 (ENSCWAG00000016962) #34	ZCCHC24 (ENSCWAG00000017002) #35	PPIF (ENSCWAG00000017029) #36	ZMIZ1 (ENSCWAG00000017058) #37	ENSCWAG00000017213	POLR3A (ENSCWAG00000017336)	DLG5 (ENSCWAG00000017488)	KCNMA1 (ENSCWAG00000018002)	LRMDA (ENSCWAG00000021618)
Pig	MODERN SPECIES	5	LRIT1 (ENSSSCG00000034402) #7	LRIT2 (ENSSSCG00000010347) #8	CDHR1 (ENSSSCG00000010348) #9	GPR15LG (ENSSSCG00000024634) #10	GHITM (ENSSSCG00000010345) #11	ENSSSCG00000049810	NRG3 (ENSSSCG00000010344) #13	ENSSSCG00000051331 ##16	ENSSSCG00000010343	SH2D4B (ENSSSCG00000010342) #17	TSPAN14 (ENSSSCG00000010341) #18	PRXL2A (ENSSSCG00000010340) #19	DYDC2 (ENSSSCG00000010339) #20	ENSSSCG00000045226	DYDC1 (ENSSSCG00000061214) #21	MAT1A (ENSSSCG00000010337) #22	SFTPA1 (ENSSSCG00000010336) #23	SFTPD (ENSSSCG00000010334) #26	MBL1 (ENSSSCG00000055445) #24	TMEM254 (ENSSSCG00000024300) #32	PLAC9 (ENSSSCG00000010332) #33	ANXA11 (ENSSSCG00000010331) #34	ZCCHC24 (ENSSSCG00000033074) #35	PPIF (ENSSSCG00000010330) #36	ZMIZ1 (ENSSSCG00000010329) #37	ENSSSCG00000039544	POLR3A (ENSSSCG00000010327)	DLG5 (ENSSSCG00000026268)	ENSSSCG00000048875	KCNMA1 (ENSSSCG00000010325)	ENSSSCG00000043656