Fungi/Metazoa group ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061 #22 Bilateria DUPLICATION Bilateria DUPLICATION Bilateria ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.b #22 Chordata ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.b #22 Vertebrata ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.b #22 Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.b #22 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 35 ENSGT00600000084481 ENSGT00940000160082 ENSGT00950000182987.c.a.b.b ENSGT00390000017203 ENSGT00390000014595.a.b ENSGT00940000158029 ENSGT01030000234550.a.a.c.a.a ENSGT00950000183096.a.a.c.a ENSGT00390000004155 ENSGT00530000063751.b ENSGT00940000161216 ENSGT00920000149180 ENSGT00390000014591 ENSGT00940000153571.a ENSGT00820000127055.a #21 ENSGT01090000260061.c.b #22 ENSGT00940000165230 ENSGT00940000165285 ENSGT00390000015205 ENSGT00390000016836.b #26 ENSGT00390000015165 #27 ENSGT01010000222313.A.b.b.b #29 ENSGT00390000012296 #30 ENSGT00390000012340 #28 ENSGT00390000017317 #32 ENSGT00940000161894 #33 ENSGT00940000159212.a 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#10 ENSGT00940000158386 #11 ENSGT00930000151039 #12 ENSGT00940000165249 ENSGT00950000182902.b.b.b ENSGT00940000164941 ENSGT01010000222313.B.b #13 ENSGT00390000015210 #14 ENSGT00940000161117 #15 ENSGT00950000183101.a.a #16 ENSGT00940000153576.c.b #17 ENSGT00940000157119 #18 ENSGT00940000156538 #19 ENSGT00940000157915 #20 ENSGT00820000127055.a #21 ENSGT01090000260061.c.b #22 ENSGT00980000202327 Mammalia ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00940000157112 #7 ENSGT00390000012403 #8 ENSGT00730000111079 #9 ENSGT00940000158112 #10 ENSGT00940000158386 #11 ENSGT00930000151039 #12 ENSGT01010000222313.B.b #13 ENSGT00390000015210 #14 ENSGT00940000161117 #15 ENSGT00950000183101.a.a #16 ENSGT00940000153576.c.b #17 ENSGT00940000157119 #18 ENSGT00940000156538 #19 ENSGT00940000157915 #20 ENSGT00820000127055.a #21 ENSGT01090000260061.c.b #22 ENSGT00940000156758 #23 ENSGT00440000034248 #24 ENSGT00440000038370 #25 ENSGT00390000016836.b #26 ENSGT00390000015165 #27 ENSGT01010000222313.A.b.b.b #29 ENSGT00390000012296 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MODERN SPECIES 15 Rpa1 (ENSMOCG00000013019) #8 Smyd4 (ENSMOCG00000014637) #9 ENSMOCG00000002102 Serpinf1 (ENSMOCG00000013659) #10 Serpinf2 (ENSMOCG00000015426) #11 Wdr81 (ENSMOCG00000014819) #12 ENSMOCG00000004200 #13 Prpf8 (ENSMOCG00000016838) #14 Rilp (ENSMOCG00000022637) #15 Scarf1 (ENSMOCG00000021999) #16 Slc43a2 (ENSMOCG00000006980) #17 Pitpna (ENSMOCG00000014886) #18 Inpp5k (ENSMOCG00000005686) #19 Myo1c (ENSMOCG00000005404) #20 Crk (ENSMOCG00000005876) #21 Ywhae (ENSMOCG00000014128) #22 Doc2b (ENSMOCG00000013519) #23 ENSMOCG00000001677 ENSMOCG00000008254 #23 1700016K19Rik (ENSMOCG00000012261) #25 Rflnb (ENSMOCG00000022116) #26 Vps53 (ENSMOCG00000022829) #27 Tlcd3a (ENSMOCG00000008958) #29 ENSMOCG00000006304 Dbil5 (ENSMOCG00000004108) #31 Gemin4 (ENSMOCG00000016454) #30 Mrm3 (ENSMOCG00000018749) #32 Nxn (ENSMOCG00000014329) #33 Timm22 (ENSMOCG00000021862) #34 Abr (ENSMOCG00000017665) #35 ENSMOCG00000004581 Northern American deer mouse MODERN SPECIES 21 Dph1 (ENSPEMG00000022159) 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DUPLICATION Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 190 Pate10 (ENSJJAG00000008956) ENSJJAG00000008228 #22 ENSJJAG00000007666 ENSJJAG00000000042 Acrv1 (ENSJJAG00000024162) Chek1 (ENSJJAG00000018820) Stt3a (ENSJJAG00000017318) Ei24 (ENSJJAG00000015344) ENSJJAG00000019574 Fez1 (ENSJJAG00000019444) Pknox2 (ENSJJAG00000019019) Tmem218 (ENSJJAG00000018579) Slc37a2 (ENSJJAG00000015861) Hepacam (ENSJJAG00000015662) Robo4 (ENSJJAG00000019076) Robo3 (ENSJJAG00000012565) Msantd2 (ENSJJAG00000022389) Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 146 Smg6 (ENSJJAG00000015367) ENSJJAG00000014311 Hic1 (ENSJJAG00000017367) Ovca2 (ENSJJAG00000017560) Dph1 (ENSJJAG00000020755) Rtn4rl1 (ENSJJAG00000021203) #7 Rpa1 (ENSJJAG00000000876) #8 Serpinf1 (ENSJJAG00000008138) #10 Wdr81 (ENSJJAG00000015048) #12 Prpf8 (ENSJJAG00000021159) #14 ENSJJAG00000001146 #17 ENSJJAG00000010413 #17 Pitpna (ENSJJAG00000011376) #18 Inpp5k (ENSJJAG00000013918) #19 Myo1c (ENSJJAG00000016472) #20 ENSJJAG00000014920 #22 Doc2b 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#23 RPH3AL (ENSCPOG00000001101) #24 ENSCPOG00000036703 #25 RFLNB (ENSCPOG00000009354) #26 VPS53 (ENSCPOG00000009355) #27 TLCD3A (ENSCPOG00000004305) #29 GEMIN4 (ENSCPOG00000004307) #30 ENSCPOG00000019350 #31 MRM3 (ENSCPOG00000026540) #32 NXN (ENSCPOG00000003199) #33 TIMM22 (ENSCPOG00000033413) #34 ABR (ENSCPOG00000005227) #35 BHLHA9 (ENSCPOG00000001935) #36 TRARG1 (ENSCPOG00000025177) #37 GOSR1 (ENSCPOG00000003814) Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153694.A ENSGT00940000157112 #7 ENSGT00390000012403 #8 ENSGT00730000111079 #9 ENSGT00940000158112 #10 ENSGT00940000158386 #11 ENSGT00930000151039 #12 ENSGT01010000222313.B.b #13 ENSGT00390000015210 #14 ENSGT00940000161117 #15 ENSGT00950000183101.a.a #16 ENSGT00940000153576.c.b #17 ENSGT00940000157119 #18 ENSGT00940000156538 #19 ENSGT00940000157915 #20 ENSGT01090000260061.c.b #22 ENSGT00940000156758 #23 ENSGT00440000038370 #25 ENSGT00440000034248 #24 ENSGT00390000016836.b #26 ENSGT00390000015165 #27 ENSGT01010000222313.A.b.b.b #29 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ENSOCUG00000005189 #28 ENSOCUG00000033243 MRM3 (ENSOCUG00000002219) #32 TIMM22 (ENSOCUG00000008033) #34 ABR (ENSOCUG00000005197) #35 BHLHA9 (ENSOCUG00000001780) #36 TRARG1 (ENSOCUG00000022938) #37 GOSR1 (ENSOCUG00000001777) Tree shrew MODERN SPECIES 274 ENSTBEG00000016224 #22 Primates ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000157112 #7 ENSGT00390000012403 #8 ENSGT00730000111079 #9 ENSGT00940000158112 #10 ENSGT00940000158386 #11 ENSGT00930000151039 #12 ENSGT01010000222313.B.b #13 ENSGT00390000015210 #14 ENSGT00940000161117 #15 ENSGT00950000183101.a.a #16 ENSGT00940000153576.c.b #17 ENSGT00940000157119 #18 ENSGT00940000156538 #19 ENSGT00940000157915 #20 ENSGT00820000127055.a #21 ENSGT01090000260061.c.b #22 ENSGT00940000156758 #23 ENSGT00440000034248 #24 ENSGT00440000038370 #25 ENSGT00390000016836.b #26 ENSGT00390000015165 #27 ENSGT01010000222313.A.b.b.b #29 ENSGT00390000012296 #30 ENSGT00940000163490 #31 ENSGT00390000012340 #28 ENSGT00390000017317 #32 ENSGT00940000161894 #33 ENSGT00390000016067 #34 ENSGT00940000153491.b.b.a #35 ENSGT00390000002453 #36 ENSGT00940000160337 #37 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00940000157112 #7 ENSGT00390000012403 #8 ENSGT00730000111079 #9 ENSGT00940000158112 #10 ENSGT00940000158386 #11 ENSGT00930000151039 #12 ENSGT01010000222313.B.b #13 ENSGT00390000015210 #14 ENSGT00940000161117 #15 ENSGT00950000183101.a.a #16 ENSGT00940000153576.c.b #17 ENSGT00940000157119 #18 ENSGT00940000156538 #19 ENSGT00940000157915 #20 ENSGT00820000127055.a #21 ENSGT01090000260061.c.b #22 Tarsier MODERN SPECIES 4913 YWHAE (ENSTSYG00000009089) #22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000157112 #7 ENSGT00390000012403 #8 ENSGT00730000111079 #9 ENSGT00940000158112 #10 ENSGT00940000158386 #11 ENSGT00930000151039 #12 ENSGT01010000222313.B.b #13 ENSGT00390000015210 #14 ENSGT00940000161117 #15 ENSGT00950000183101.a.a #16 ENSGT00940000153576.c.b #17 ENSGT00940000157119 #18 ENSGT00940000156538 #19 ENSGT00940000157915 #20 ENSGT00820000127055.a #21 ENSGT01090000260061.c.b #22 ENSGT00940000160337 #37 ENSGT00390000002453 #36 ENSGT00940000153491.b.b.a #35 ENSGT00390000016067 #34 ENSGT00940000161894 #33 ENSGT00390000017317 #32 ENSGT00390000012340 #28 ENSGT00940000163490 #31 ENSGT00390000012296 #30 ENSGT01010000222313.A.b.b.b #29 ENSGT00390000015165 #27 ENSGT00390000016836.b #26 ENSGT00440000038370 #25 ENSGT00440000034248 #24 ENSGT00940000156758 #23 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 47 ENSGT00940000157112 #7 ENSGT00390000012403 #8 ENSGT00730000111079 #9 ENSGT00940000158112 #10 ENSGT00940000158386 #11 ENSGT00930000151039 #12 ENSGT01010000222313.B.b #13 ENSGT00390000015210 #14 ENSGT00940000161117 #15 ENSGT00950000183101.a.a #16 ENSGT00940000153576.c.b #17 ENSGT00940000157119 #18 ENSGT00940000156538 #19 ENSGT00940000157915 #20 ENSGT00820000127055.a #21 ENSGT01090000260061.c.b #22 ENSGT00940000160337 #37 ENSGT00390000002453 #36 ENSGT00940000153491.b.b.a #35 ENSGT00390000016067 #34 ENSGT00940000161894 #33 ENSGT00390000017317 #32 ENSGT00390000012340 #28 ENSGT00390000012296 #30 ENSGT01010000222313.A.b.b.b #29 ENSGT00390000015165.c #27 ENSGT00390000016836.b #26 ENSGT00440000038370 #25 ENSGT00440000034248 #24 ENSGT00940000156758 #23 ENSGT01030000234586.A.a.b Cebidae ANCESTRAL SPECIES 42 ENSGT00940000157112 #7 ENSGT00390000012403 #8 ENSGT00730000111079 #9 ENSGT00940000158112 #10 ENSGT00940000158386 #11 ENSGT00930000151039 #12 ENSGT01010000222313.B.b #13 ENSGT00390000015210 #14 ENSGT00940000161117 #15 ENSGT00950000183101.a.a #16 ENSGT00940000153576.c.b #17 ENSGT00940000157119 #18 ENSGT00940000156538 #19 ENSGT00940000157915 #20 ENSGT00820000127055.a #21 ENSGT01090000260061.c.b #22 ENSGT00940000160337 #37 ENSGT00940000153491.b.b.a #35 ENSGT00390000016067 #34 ENSGT00940000161894 #33 ENSGT00390000017317 #32 ENSGT00390000012340 #28 ENSGT00390000012296 #30 ENSGT01010000222313.A.b.b.b #29 ENSGT00390000015165.c #27 ENSGT00390000016836.b #26 ENSGT00440000038370 #25 ENSGT00440000034248 #24 ENSGT00940000156758 #23 ENSGT01030000234586.A.a.b ENSGT00940000160875 Marmoset MODERN SPECIES 17 RPA1 (ENSCJAG00000001848) #8 SMYD4 (ENSCJAG00000001865) #9 SERPINF1 (ENSCJAG00000001881) #10 SERPINF2 (ENSCJAG00000001889) #11 WDR81 (ENSCJAG00000001895) #12 PRPF8 (ENSCJAG00000001911) #14 RILP (ENSCJAG00000040878) #15 SCARF1 (ENSCJAG00000002011) #16 SLC43A2 (ENSCJAG00000002031) #17 PITPNA (ENSCJAG00000002044) #18 ENSCJAG00000002060 #19 MYO1C (ENSCJAG00000002077) #20 CRK (ENSCJAG00000002099) #21 ENSCJAG00000063239 ENSCJAG00000069767 YWHAE (ENSCJAG00000002109) #22 ENSCJAG00000081551 ENSCJAG00000079317 ENSCJAG00000070102 ENSCJAG00000086551 TRPV3 (ENSCJAG00000038771) ENSCJAG00000083020 TRPV1 (ENSCJAG00000007063) SHPK (ENSCJAG00000007109) CTNS (ENSCJAG00000007114) TAX1BP3 (ENSCJAG00000007138) EMC6 (ENSCJAG00000007143) P2RX5 (ENSCJAG00000007148) HASPIN (ENSCJAG00000023439) CAMKK1 (ENSCJAG00000011552) P2RX1 (ENSCJAG00000011590) Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES 65 ENSGT00940000157112 #7 ENSGT00390000012403 #8 ENSGT00730000111079 #9 ENSGT00940000158112 #10 ENSGT00940000158386 #11 ENSGT00930000151039 #12 ENSGT01010000222313.B.b #13 ENSGT00390000015210 #14 ENSGT00940000161117 #15 ENSGT00950000183101.a.a #16 ENSGT00940000153576.c.b #17 ENSGT00940000157119 #18 ENSGT00940000156538 #19 ENSGT00940000157915 #20 ENSGT00820000127055.a #21 ENSGT01090000260061.c.b #22 ENSGT00940000160337 #37 ENSGT00940000153491.b.b.a #35 ENSGT00390000016067 #34 ENSGT00940000161894 #33 ENSGT00390000017317 #32 ENSGT00390000012340 #28 ENSGT00390000012296 #30 ENSGT01010000222313.A.b.b.b #29 ENSGT00390000015165.c #27 ENSGT00390000016836.b #26 ENSGT00910000146484 ENSGT00440000034248 #24 ENSGT00940000156758 #23 ENSGT01030000234586.A.a.b ENSGT00940000160875 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 74 RTN4RL1 (ENSSBOG00000033247) #7 RPA1 (ENSSBOG00000030233) #8 SMYD4 (ENSSBOG00000026869) #9 SERPINF1 (ENSSBOG00000022026) #10 SERPINF2 (ENSSBOG00000002359) #11 WDR81 (ENSSBOG00000021169) #12 TLCD2 (ENSSBOG00000022562) #13 PRPF8 (ENSSBOG00000029717) #14 RILP 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PITPNA (ENSCCAG00000028388) #18 INPP5K (ENSCCAG00000030656) #19 MYO1C (ENSCCAG00000034285) #20 CRK (ENSCCAG00000032085) #21 ENSCCAG00000027695 ENSCCAG00000034432 #22 TRARG1 (ENSCCAG00000033358) #37 KDM4A (ENSCCAG00000025432) PTPRF (ENSCCAG00000029349) ENSCCAG00000036988 HYI (ENSCCAG00000027585) SZT2 (ENSCCAG00000029453) MED8 (ENSCCAG00000031645) ELOVL1 (ENSCCAG00000027180) ENSCCAG00000033410 MPL (ENSCCAG00000032993) TIE1 (ENSCCAG00000019700) C1orf210 (ENSCCAG00000029915) TMEM125 (ENSCCAG00000019712) ENSCCAG00000024738 ENSCCAG00000033078 Capuchin MODERN SPECIES 129 TSPAN1 (ENSCCAG00000034126) P3R3URF (ENSCCAG00000022458) PIK3R3 (ENSCCAG00000024208) ENSCCAG00000035429 ENSCCAG00000006015 ENSCCAG00000004296 MAST2 (ENSCCAG00000027633) IPP (ENSCCAG00000023129) ENSCCAG00000024242 TMEM69 (ENSCCAG00000019582) GPBP1L1 (ENSCCAG00000034468) CCDC17 (ENSCCAG00000020473) ENSCCAG00000030061 NASP (ENSCCAG00000013381) ENSCCAG00000024285 ENSCCAG00000022327 #22 ENSCCAG00000036427 MMACHC 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(ENSANAG00000028886) Catarrhini DUPLICATION Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.b.kg #22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.b.kg #22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.b.kg #22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.b.kg #22 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.b.kg #22 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.b.kg #22 Rhesus MODERN SPECIES 7 ENSMMUG00000063397 LHX1 (ENSMMUG00000021668) AATF (ENSMMUG00000021669) ACACA (ENSMMUG00000009349) C16H17orf78 (ENSMMUG00000030090) TADA2A (ENSMMUG00000021911) DUSP14 (ENSMMUG00000002975) SYNRG (ENSMMUG00000002976) DDX52 (ENSMMUG00000002980) HNF1B (ENSMMUG00000003431) ENSMMUG00000061594 ENSMMUG00000058233 HEATR6 (ENSMMUG00000007671) ENSMMUG00000030260 ENSMMUG00000062497 ENSMMUG00000050758 #22 ENSMMUG00000008111 CCL3 (ENSMMUG00000062832) CCL18 (ENSMMUG00000047114) CCL23 (ENSMMUG00000002467) CCL15 (ENSMMUG00000039864) CCL14 (ENSMMUG00000002466) CCL16 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DUPLICATION Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.b.lg.a.a #22 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.b.lg.a.a #22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.b.lg.a.a #22 Orangutan MODERN SPECIES 25 PSPH (ENSPPYG00000017545) NIPSNAP2 (ENSPPYG00000017546) ENSPPYG00000035840 SEPTIN14 (ENSPPYG00000017548) ENSPPYG00000029410 ENSPPYG00000034458 ENSPPYG00000039000 ENSPPYG00000039012 ENSPPYG00000036019 ZNF722 (ENSPPYG00000017541) ZNF727 (ENSPPYG00000034750) ENSPPYG00000040724 ZNF735 (ENSPPYG00000018271) ZNF679 (ENSPPYG00000033769) ZNF736 (ENSPPYG00000030569) ENSPPYG00000038268 #22 ENSPPYG00000031730 ENSPPYG00000033867 ZNF107 (ENSPPYG00000039638) ENSPPYG00000033047 ZNF138 (ENSPPYG00000041455) ENSPPYG00000038616 ENSPPYG00000017531 ENSPPYG00000031909 ENSPPYG00000032228 ENSPPYG00000017530 ENSPPYG00000034940 ENSPPYG00000039689 ENSPPYG00000039398 ENSPPYG00000039599 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.b.lg.a.b #22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.b.lg.a.b #22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.b.lg.a.b #22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.b.lg.a.b #22 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.b.lg.a.b #22 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.b.lg.a.b #22 Crab-eating macaque DUPLICATION Crab-eating macaque MODERN SPECIES 160 ENSMFAG00000051075 ENSMFAG00000048867 #22 ENSMFAG00000008207 Crab-eating macaque MODERN SPECIES 7 LYZL6 (ENSMFAG00000044524) CCL16 (ENSMFAG00000002269) CCL14 (ENSMFAG00000000804) CCL15 (ENSMFAG00000033315) ENSMFAG00000003696 CCL18 (ENSMFAG00000036319) ENSMFAG00000000159 ENSMFAG00000028229 ENSMFAG00000029679 ENSMFAG00000060965 ENSMFAG00000057148 ENSMFAG00000047776 ENSMFAG00000053936 ENSMFAG00000052110 ENSMFAG00000060658 #22 ENSMFAG00000063676 #22 ENSMFAG00000051245 ENSMFAG00000058779 DDX52 (ENSMFAG00000000640) ENSMFAG00000030603 SYNRG (ENSMFAG00000044562) DUSP14 (ENSMFAG00000010455) ENSMFAG00000061442 TADA2A (ENSMFAG00000046352) ACACA (ENSMFAG00000045655) AATF (ENSMFAG00000003108) LHX1 (ENSMFAG00000001746) ENSMFAG00000056392 ENSMFAG00000044208 ENSMFAG00000064927 PIGW (ENSMFAG00000036468) Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.b.lg.a.b #22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.b.lg.a.b #22 Orangutan DUPLICATION Orangutan MODERN SPECIES 8 ENSPPYG00000008192 MMP28 (ENSPPYG00000008193) TAF15 (ENSPPYG00000008194) HEATR9 (ENSPPYG00000008195) ENSPPYG00000031268 RDM1 (ENSPPYG00000008198) LYZL6 (ENSPPYG00000008199) CCL16 (ENSPPYG00000008200) ENSPPYG00000040512 CCL15 (ENSPPYG00000041781) CCL23 (ENSPPYG00000008202) CCL18 (ENSPPYG00000008203) CCL3 (ENSPPYG00000038679) ENSPPYG00000008205 ENSPPYG00000033195 ENSPPYG00000034866 #22 HNF1B (ENSPPYG00000008222) DDX52 (ENSPPYG00000008221) SYNRG (ENSPPYG00000008220) DUSP14 (ENSPPYG00000008219) TADA2A (ENSPPYG00000008218) ACACA (ENSPPYG00000008216) ENSPPYG00000008217 AATF (ENSPPYG00000008215) LHX1 (ENSPPYG00000008214) MRM1 (ENSPPYG00000034525) DHRS11 (ENSPPYG00000008213) ENSPPYG00000030234 ZNHIT3 (ENSPPYG00000008210) MYO19 (ENSPPYG00000008211) ENSPPYG00000008513 Orangutan MODERN SPECIES 155 ENSPPYG00000031149 ENSPPYG00000036364 #22 ENSPPYG00000036040 HEATR6 (ENSPPYG00000008511) Catarrhini DUPLICATION Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00940000153236.b.b.a.b.b.a.b ENSGT00940000153236.b.b.a.b.a.a ENSGT00940000154251.A.a.a.b ENSGT01090000260061.c.b.lg.b.a #22 ENSGT01100000263507.D.a.b.a.b ENSGT00940000157044.j ENSGT00390000001752 ENSGT00940000157044.i.a Cercopithecidae DUPLICATION Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000161752 ENSGT00950000182890.A.a.b.b.b ENSGT00940000153675.a.a.b.e.b ENSGT00940000153104.e.a.a.a.a.b ENSGT00530000064130.d ENSGT00950000183018.a.d ENSGT00390000003115 ENSGT00940000154631.lb.a ENSGT00940000162897 ENSGT00940000158139 ENSGT00440000038159.p.a ENSGT00530000064242.b ENSGT00940000153236.b.b.a.b.b.a.b ENSGT00940000153236.b.b.a.b.a.a ENSGT00940000154251.A.a.a.b ENSGT01090000260061.c.b.lg.b.a.a #22 ENSGT01100000263507.D.a.b.a.b ENSGT00940000157044.j ENSGT00390000001752.ab.a.a ENSGT00940000164280 ENSGT00940000175200 ENSGT00390000001752.`b ENSGT00950000183122.B ENSGT00390000014189 ENSGT00390000006030.d.a.b ENSGT00940000161327 ENSGT00940000154540.a ENSGT00940000153883.b ENSGT00390000008135 ENSGT00510000047059.l ENSGT00940000159212.a Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 156 ENSGT00730000111340.a.b ENSGT01090000260061.c.b.lg.b.a.a #22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 160 ENSGT00730000111340.a.b ENSGT01090000260061.c.b.lg.b.a.a #22 Macaca ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000015821 ENSGT00940000153675.a.a.b.e.b.b ENSGT00940000158139 ENSGT00390000008983.b ENSGT00940000154631.lb.a ENSGT00390000003115 ENSGT00950000183018.a.d ENSGT00530000064130.d ENSGT00940000153104.e.a.a.a.a.b ENSGT00940000153675.a.a.b.e.b.a ENSGT00950000182890.A.a.b.b.b ENSGT00940000161752.d ENSGT00940000153236.b.b.a.b.b.a.b ENSGT00940000153236.b.b.a.b.a.a ENSGT00940000154251.A.a.a.b ENSGT01090000260061.c.b.lg.b.a.a #22 ENSGT00940000164280 ENSGT01030000234556.a.b.a.x ENSGT00910000146915 ENSGT00910000147299 ENSGT00940000157044.j ENSGT00390000001752.ab.a.a ENSGT00390000001752.ab.a.b ENSGT00950000183122.B ENSGT00390000014189 ENSGT00390000006030.d.a.b ENSGT00940000161327 ENSGT00940000154540.a ENSGT00940000153883.b ENSGT00390000008135 ENSGT00510000047059.l Macaca_a ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00530000064242.b ENSGT00440000038159.p.a.e.b.a ENSGT00940000158139 ENSGT00390000008983.b ENSGT00940000154631.lb.a ENSGT00390000003115.e ENSGT00950000183018.a.d ENSGT00530000064130.d ENSGT00940000153104.e.a.a.a.a.b ENSGT00950000182890.A.a.b.b.b ENSGT00940000161752.d ENSGT00390000003115.f ENSGT00940000153236.b.b.a.b.b.a.b ENSGT00940000153236.b.b.a.b.a.a ENSGT00940000154251.A.a.a.b ENSGT01090000260061.c.b.lg.b.a.a #22 ENSGT01100000263507.D.a.a.b.b.a ENSGT00940000164280 ENSGT00910000146915 ENSGT01100000263507.E.b.b.d ENSGT00940000157044.j ENSGT00390000001752.ab.a.a ENSGT00390000001752.ab.a.b ENSGT00950000183122.B ENSGT00940000163505.a.a.a.a.a.a.b.a ENSGT00390000006030.d.a.b ENSGT00940000161327 ENSGT00940000154540.a ENSGT00960000191503.c.a ENSGT00940000153883.b ENSGT00390000008135.ib Crab-eating macaque MODERN SPECIES 13 ENSMFAG00000044932 CCT6A (ENSMFAG00000033952) ENSMFAG00000047517 NIPSNAP2 (ENSMFAG00000044760) ZNF713 (ENSMFAG00000038594) SEPTIN14 (ENSMFAG00000033685) ENSMFAG00000046356 ENSMFAG00000001023 ENSMFAG00000051236 ENSMFAG00000053651 ENSMFAG00000035937 ENSMFAG00000064784 ZNF735 (ENSMFAG00000037962) ZNF679 (ENSMFAG00000002994) ZNF736 (ENSMFAG00000039859) ENSMFAG00000049638 #22 ENSMFAG00000002261 ZNF107 (ENSMFAG00000031156) ENSMFAG00000052580 ENSMFAG00000000747 ENSMFAG00000030765 ENSMFAG00000041082 ENSMFAG00000050454 ENSMFAG00000050748 ENSMFAG00000038812 ENSMFAG00000048686 ENSMFAG00000039768 ENSMFAG00000037750 ENSMFAG00000060357 ASL (ENSMFAG00000046143) ENSMFAG00000047315 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 228 ZNF722 (ENSMNEG00000013468) ZNF679 (ENSMNEG00000028394) ZNF736 (ENSMNEG00000031004) ENSMNEG00000032204 #22 ENSMNEG00000032159 ZNF107 (ENSMNEG00000040288) ENSMNEG00000042553 ENSMNEG00000033960 ENSMNEG00000033983 ENSMNEG00000004826 ENSMNEG00000028377 ENSMNEG00000033664 ENSMNEG00000036733 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 181 ENSGT00730000111340.a.b ENSGT01090000260061.c.b.lg.b.a.a #22 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 227 ENSGT00940000154251.A.a.a.b ENSGT00730000111340.a.b ENSGT01090000260061.c.b.lg.b.a.a #22 ENSGT00390000011666.x.a.e.b ENSGT00940000164280 ENSGT00940000175200 ENSGT00910000148577 ENSGT00910000146915 ENSGT00910000147299 Drill MODERN SPECIES 1710 ZNF736 (ENSMLEG00000037449) ENSMLEG00000028358 ENSMLEG00000027338 #22 ENSMLEG00000031446 ENSMLEG00000035675 Sooty mangabey MODERN SPECIES 316 ZNF736 (ENSCATG00000031671) ENSCATG00000031704 ENSCATG00000042882 #22 ENSCATG00000019370 ENSCATG00000024227 ZNF107 (ENSCATG00000031054) ENSCATG00000034608 ENSCATG00000031642 ENSCATG00000032414 ENSCATG00000032738 ENSCATG00000014967 ENSCATG00000026231 ENSCATG00000034530 ENSCATG00000032766 ENSCATG00000037879 Rhinopithecus DUPLICATION Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 865 ENSGT00940000153236.b.b.a.b.a.a ENSGT00940000154251.A.a.a.b ENSGT01090000260061.c.b.lg.b.a.a.a #22 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 519 ENSRROG00000038123 #22 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1154 ZNF736 (ENSRBIG00000039960) ENSRBIG00000037145 #22 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 1062 ENSGT00730000111340.a.b ENSGT01090000260061.c.b.lg.b.a.a.b #22 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1680 ENSRROG00000029721 ENSRROG00000029099 #22 ENSRROG00000003301 ENSRROG00000032863 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.b.lg.b.a.b #22 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 384 ENSGT00940000165246.a ENSGT01090000260061.c.b.lg.b.a.b #22 ENSGT00940000154397.b.c.a.b.b ENSGT00940000154397.b.c.a.b.a.b ENSGT00940000154397.b.c.b.a.b.d ENSGT00940000165358 ENSGT00950000183183.b.a.y.a.a.a ENSGT00940000164101.a ENSGT00940000162609.a ENSGT00940000164638 ENSGT00940000164205 ENSGT00940000162609.b ENSGT00940000160770.B.b.a ENSGT00960000186612.B.a.b.a.b.a.b Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1971 ZNF841 (ENSRROG00000036907) ZNF616 (ENSRROG00000035628) ENSRROG00000018385 ZNF836 (ENSRROG00000022527) PPP2R1A (ENSRROG00000039119) ZNF610 (ENSRROG00000045802) ZNF528 (ENSRROG00000040325) ENSRROG00000033206 ENSRROG00000044123 ENSRROG00000035465 ZNF808 (ENSRROG00000009467) ZNF701 (ENSRROG00000045288) ENSRROG00000039436 ENSRROG00000030824 ZNF600 (ENSRROG00000037435) ENSRROG00000044423 #22 ZNF468 (ENSRROG00000031174) ZNF28 (ENSRROG00000032344) ZNF888 (ENSRROG00000036532) ZNF816 (ENSRROG00000033377) ENSRROG00000030062 ENSRROG00000003713 ENSRROG00000037022 ZNF160 (ENSRROG00000035317) ZNF415 (ENSRROG00000035150) ZNF347 (ENSRROG00000030294) ZNF665 (ENSRROG00000039874) ENSRROG00000045794 ZNF677 (ENSRROG00000037335) VN1R2 (ENSRROG00000012907) Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1981 ZNF28 (ENSRBIG00000037464) ENSRBIG00000028532 #22 ZNF468 (ENSRBIG00000037148) ENSRBIG00000032168 ZNF888 (ENSRBIG00000041848) ZNF816 (ENSRBIG00000036703) ENSRBIG00000028484 ENSRBIG00000036517 ENSRBIG00000031822 ENSRBIG00000035780 ENSRBIG00000026527 ZNF160 (ENSRBIG00000032121) ZNF415 (ENSRBIG00000036406) ZNF347 (ENSRBIG00000032942) ZNF665 (ENSRBIG00000042059) Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000165518.a ENSGT00940000161752 ENSGT00950000182890.A.a.b.b.b ENSGT00530000064130.d ENSGT00950000183018.a.d ENSGT00390000003115 ENSGT00940000154631 ENSGT00940000162897 ENSGT00940000158139 ENSGT00440000038159.p.a.a.b ENSGT00530000064242.b ENSGT00940000153236.b.b.a.b.b.a.a ENSGT00940000153236.b.b.a.b.b.a.b ENSGT00940000153236.b.b.a.b.a.a ENSGT00940000154251.A.a.a.b ENSGT01090000260061.c.b.lg.b.a #22 ENSGT00940000163252.d ENSGT01100000263507.D.a.a.b.b.b.a ENSGT00940000164280 ENSGT00940000175200 ENSGT01100000263507.D.a.b.a.b ENSGT00940000157044.j ENSGT00390000001752.y.a ENSGT00950000183122.B ENSGT00390000014189 ENSGT00390000006030.d.a.b 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shrew DUPLICATION Common shrew MODERN SPECIES 722 YWHAE (ENSSARG00000012991) #22 Common shrew MODERN SPECIES 4737 ENSSARG00000003727 #22 AS3MT (ENSSARG00000003676) WBP1L (ENSSARG00000003673) Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000157112 #7 ENSGT00390000012403 #8 ENSGT00730000111079 #9 ENSGT00940000158112 #10 ENSGT00940000158386 #11 ENSGT00930000151039 #12 ENSGT01010000222313.B.b #13 ENSGT00390000015210 #14 ENSGT00940000161117 #15 ENSGT00950000183101.a.a #16 ENSGT00940000153576.c.b #17 ENSGT00940000157119 #18 ENSGT00940000156538 #19 ENSGT00940000157915 #20 ENSGT00820000127055.a #21 ENSGT01090000260061.c.b #22 ENSGT00940000156758 #23 ENSGT00440000034248 #24 ENSGT00440000038370 #25 ENSGT00390000016836.b #26 ENSGT00390000015165 #27 ENSGT01010000222313.A.b.b.b #29 ENSGT00900000143173 ENSGT00390000012296 #30 ENSGT00940000163490 #31 ENSGT00390000012340 #28 ENSGT00940000166642 ENSGT00940000179359 ENSGT00390000017317 #32 ENSGT00940000161894 #33 ENSGT00390000016067 #34 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ENSGT00940000156758 #23 ENSGT00440000034248 #24 ENSGT00440000038370 #25 ENSGT00390000016836.b #26 ENSGT00390000015165 #27 ENSGT01010000222313.A.b.b.b #29 ENSGT00390000012296 #30 ENSGT00390000012340 #28 ENSGT00390000017317 #32 ENSGT00940000161894 #33 ENSGT00390000016067 #34 ENSGT00940000153491.b.b.a #35 ENSGT00390000002453 #36 ENSGT00940000160337 #37 ENSGT00390000008688 Vaquita MODERN SPECIES 12 RTN4RL1 (ENSPSNG00000020882) #7 SMYD4 (ENSPSNG00000021186) #9 SERPINF1 (ENSPSNG00000021207) #10 SERPINF2 (ENSPSNG00000021243) #11 WDR81 (ENSPSNG00000021327) #12 TLCD2 (ENSPSNG00000021439) #13 PRPF8 (ENSPSNG00000021481) #14 ENSPSNG00000021531 RILP (ENSPSNG00000021550) #15 SCARF1 (ENSPSNG00000021578) #16 SLC43A2 (ENSPSNG00000021613) #17 PITPNA (ENSPSNG00000021669) #18 INPP5K (ENSPSNG00000021714) #19 MYO1C (ENSPSNG00000021834) #20 CRK (ENSPSNG00000021972) #21 YWHAE (ENSPSNG00000022007) #22 DOC2B (ENSPSNG00000022037) #23 RPH3AL (ENSPSNG00000022061) #24 ENSPSNG00000022073 #25 RFLNB 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ENSGT00940000161894 #33 ENSGT00390000016067 #34 ENSGT00940000153491.b.b.a #35 ENSGT00390000002453 #36 ENSGT00940000160337 #37 ENSGT00390000008688 ENSGT00940000156919 Beluga whale MODERN SPECIES 43 RTN4RL1 (ENSDLEG00000012020) #7 RPA1 (ENSDLEG00000011648) #8 SMYD4 (ENSDLEG00000011576) #9 SERPINF1 (ENSDLEG00000011557) #10 SERPINF2 (ENSDLEG00000011529) #11 WDR81 (ENSDLEG00000011483) #12 TLCD2 (ENSDLEG00000011457) #13 PRPF8 (ENSDLEG00000011389) #14 RILP (ENSDLEG00000011358) #15 SCARF1 (ENSDLEG00000011288) #16 SLC43A2 (ENSDLEG00000011224) #17 ENSDLEG00000011185 #18 INPP5K (ENSDLEG00000011071) #19 MYO1C (ENSDLEG00000011023) #20 CRK (ENSDLEG00000011015) #21 YWHAE (ENSDLEG00000007787) #22 DOC2B (ENSDLEG00000007782) #23 RPH3AL (ENSDLEG00000007777) #24 RFLNB (ENSDLEG00000007769) #26 VPS53 (ENSDLEG00000007623) #27 FAM57A (ENSDLEG00000007586) #29 GEMIN4 (ENSDLEG00000007580) #30 GLOD4 (ENSDLEG00000007561) #28 MRM3 (ENSDLEG00000007546) #32 NXN (ENSDLEG00000007537) #33 TIMM22 (ENSDLEG00000007524) #34 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#33 ENSGT00390000016067 #34 ENSGT01100000264619 ENSGT00940000153491.b.b.a #35 Bovidae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000012403 #8 ENSGT00730000111079 #9 ENSGT00940000158112 #10 ENSGT00940000158386 #11 ENSGT00930000151039 #12 ENSGT01010000222313.B.b #13 ENSGT00390000015210 #14 ENSGT00940000161117 #15 ENSGT00950000183101.a.a #16 ENSGT00940000153576.c.b #17 ENSGT00940000157119.c.a #18 ENSGT00940000156538 #19 ENSGT00940000157915 #20 ENSGT00820000127055.a #21 ENSGT00390000016760.c.a.a.a ENSGT01090000260061.c.b #22 ENSGT00940000156758 #23 ENSGT00440000034248 #24 ENSGT00440000038370 #25 ENSGT00390000016836.b #26 ENSGT00390000015165 #27 ENSGT01010000222313.A.b.b.b #29 ENSGT00900000143173 ENSGT00390000012296 #30 ENSGT00940000163490 #31 ENSGT00390000012340 #28 ENSGT00390000017317 #32 ENSGT00940000161894 #33 ENSGT00390000016067 #34 ENSGT00940000153491.b.b.a #35 ENSGT00390000002453 #36 Bovinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157112 #7 ENSGT00390000012403 #8 ENSGT00730000111079 #9 ENSGT00940000158112 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ENSGT00940000156538 #19 ENSGT00940000157915 #20 ENSGT00820000127055.a #21 ENSGT01090000260061.c.b #22 ENSGT00940000156758 #23 ENSGT00440000034248 #24 ENSGT00440000038370 #25 ENSGT00390000016836.b #26 ENSGT00390000015165 #27 ENSGT01010000222313.A.b.b.b #29 ENSGT00390000012296 #30 ENSGT00940000163490 #31 ENSGT00390000012340 #28 ENSGT00390000017317 #32 ENSGT01100000263480.a.a.b.a.a.a.b.a.a.a.a.a.b.a.a ENSGT00390000016067 #34 ENSGT00940000153491.b.b.a #35 ENSGT00390000002453 #36 ENSGT00940000160337 #37 Bos_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157112 #7 ENSGT00390000012403 #8 ENSGT00730000111079 #9 ENSGT00940000158112 #10 ENSGT00940000158386 #11 ENSGT00930000151039 #12 ENSGT01010000222313.B.b #13 ENSGT00390000015210 #14 ENSGT00940000161117 #15 ENSGT00950000183101.a.a #16 ENSGT00940000153576.c.b #17 ENSGT00940000157119.c.a #18 ENSGT00940000156538 #19 ENSGT00940000157915 #20 ENSGT00820000127055.a #21 ENSGT01090000260061.c.b #22 ENSGT00940000156758 #23 ENSGT00440000034248 #24 ENSGT00440000038370 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#17 ENSGT00950000183101.a.a #16 ENSGT00940000161117 #15 ENSGT00390000015210 #14 ENSGT01010000222313.B.b #13 ENSGT00940000164941 ENSGT00930000151039 #12 ENSGT00940000158386 #11 ENSGT00940000158112 #10 ENSGT00730000111079 #9 ENSGT00390000012403 #8 ENSGT00940000157112.d #7 Neognathae ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00390000008983.b ENSGT00940000162897 ENSGT00940000158139 ENSGT00440000038159.ic ENSGT00940000157044 ENSGT00390000001752 ENSGT00950000183122.B.k ENSGT00390000014189 ENSGT00390000006030.d.a.b ENSGT00940000161327 ENSGT00940000154540.a ENSGT00940000153883.b ENSGT00940000161370 ENSGT00390000005712 ENSGT00820000127055.a #21 ENSGT01090000260061.c.b #22 ENSGT00940000157915 #20 ENSGT00940000156538 #19 ENSGT00940000157119 #18 ENSGT00940000153576.c.b #17 ENSGT00950000183101.a.a #16 ENSGT00940000161117 #15 ENSGT00390000015210 #14 ENSGT01010000222313.B.b #13 ENSGT00940000164941 ENSGT00930000151039 #12 ENSGT00940000158386 #11 ENSGT00940000158112 #10 ENSGT00730000111079 #9 ENSGT00390000012403 #8 ENSGT00940000157112.d #7 Neognathae_b ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00390000008983.b ENSGT00940000162897 ENSGT00940000158139 ENSGT00440000038159.ic ENSGT00940000157044 ENSGT00390000001752 ENSGT00950000183122.B.k ENSGT00390000014189 ENSGT00390000006030.d.a.b ENSGT00940000161327 ENSGT00940000154540.a ENSGT00940000153883.b ENSGT00940000161370 ENSGT00390000005712 ENSGT00820000127055.a #21 ENSGT01090000260061.c.b #22 ENSGT00940000157915 #20 ENSGT00940000156538 #19 ENSGT00940000157119 #18 ENSGT00940000153576.c.b #17 ENSGT00950000183101.a.a #16 ENSGT00940000161117 #15 ENSGT00390000015210 #14 ENSGT01010000222313.B.b #13 ENSGT00940000164941 ENSGT00930000151039 #12 ENSGT00940000158386 #11 ENSGT00940000158112 #10 ENSGT00730000111079 #9 ENSGT00390000012403 #8 ENSGT00940000157112.d #7 Passeriformes ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00390000008983.b ENSGT00940000158139 ENSGT00440000038159.ic ENSGT00940000157044 ENSGT00390000001752 ENSGT00950000183122.B.k.a ENSGT00950000183122.B.k.b ENSGT00390000014189 ENSGT00390000006030.d.a.b ENSGT00940000161327 ENSGT00940000154540.a ENSGT00940000153883.b ENSGT00940000161370 ENSGT00390000005712 ENSGT00820000127055.a #21 ENSGT01090000260061.c.b #22 ENSGT00940000157915 #20 ENSGT00940000156538 #19 ENSGT00940000157119 #18 ENSGT00940000153576.c.b #17 ENSGT00950000183101.a.a #16 ENSGT00940000161117 #15 ENSGT00390000015210 #14 ENSGT01010000222313.B.b #13 ENSGT00940000164941 ENSGT00930000151039 #12 ENSGT00940000158386 #11 ENSGT00940000158112 #10 ENSGT00730000111079 #9 ENSGT00390000012403 #8 ENSGT00940000157112.d #7 Great tit MODERN SPECIES 9 SUMF2 (ENSPMJG00000019010) PHKG1 (ENSPMJG00000019011) CHCHD2 (ENSPMJG00000019012) VKORC1L1 (ENSPMJG00000019013) GUSB (ENSPMJG00000019014) ASL (ENSPMJG00000019015) ENSPMJG00000019016 CRCP (ENSPMJG00000019017) TPST1 (ENSPMJG00000019018) KCTD7 (ENSPMJG00000019019) RABGEF1 (ENSPMJG00000019020) TMEM248 (ENSPMJG00000019021) LRRC75A (ENSPMJG00000019022) NCBP3 (ENSPMJG00000019025) CRK (ENSPMJG00000019026) #21 YWHAE (ENSPMJG00000019027) #22 MYO1C (ENSPMJG00000019028) #20 INPP5K (ENSPMJG00000019029) #19 PITPNA (ENSPMJG00000019030) #18 SLC43A2 (ENSPMJG00000019031) #17 SCARF1 (ENSPMJG00000019033) #16 RILP (ENSPMJG00000019034) #15 PRPF8 (ENSPMJG00000019035) #14 TLCD2 (ENSPMJG00000019036) #13 ENSPMJG00000019037 WDR81 (ENSPMJG00000019038) #12 SERPINF2 (ENSPMJG00000019039) #11 SERPINF1 (ENSPMJG00000019040) #10 SMYD4 (ENSPMJG00000019041) #9 RPA1 (ENSPMJG00000019042) #8 RTN4RL1 (ENSPMJG00000019043) #7 Passeriformes_d ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00390000008983.b ENSGT00940000158139 ENSGT00440000038159.ic ENSGT00940000157044 ENSGT00390000001752 ENSGT00950000183122.B.k.a ENSGT00950000183122.B.k.b ENSGT00390000014189 ENSGT00390000006030.d.a.b ENSGT00940000161327 ENSGT00940000154540.a ENSGT00940000153883.b ENSGT00940000161370 ENSGT00390000005712 ENSGT00820000127055.a #21 ENSGT01090000260061.c.b #22 ENSGT00940000157915 #20 ENSGT00940000156538 #19 ENSGT00940000157119 #18 ENSGT00940000153576.c.b #17 ENSGT00950000183101.a.a #16 ENSGT00940000161117 #15 ENSGT00390000015210 #14 ENSGT01010000222313.B.b #13 ENSGT00940000164941 ENSGT00930000151039 #12 ENSGT00940000158386 #11 ENSGT00940000158112 #10 ENSGT00730000111079 #9 ENSGT00390000012403 #8 ENSGT00940000157112.d #7 Flycatcher MODERN SPECIES 9 ENSFALG00000006781 ENSFALG00000006773 VKORC1L1 (ENSFALG00000028547) ENSFALG00000006748 ENSFALG00000006743 ENSFALG00000006731 CRCP (ENSFALG00000006720) TPST1 (ENSFALG00000006719) KCTD7 (ENSFALG00000006717) RABGEF1 (ENSFALG00000006714) TMEM248 (ENSFALG00000006712) ENSFALG00000015190 LRRC75A (ENSFALG00000024319) ENSFALG00000006704 ENSFALG00000025189 #21 YWHAE (ENSFALG00000026378) #22 MYO1C (ENSFALG00000006676) #20 INPP5K (ENSFALG00000006671) #19 PITPNA (ENSFALG00000025969) #18 SLC43A2 (ENSFALG00000006646) #17 SCARF1 (ENSFALG00000006640) #16 RILP (ENSFALG00000006633) #15 PRPF8 (ENSFALG00000006628) #14 ENSFALG00000023130 ENSFALG00000006618 WDR81 (ENSFALG00000006614) #12 SERPINF2 (ENSFALG00000006609) #11 SERPINF1 (ENSFALG00000006604) #10 SMYD4 (ENSFALG00000006593) #9 RPA1 (ENSFALG00000006575) #8 RTN4RL1 (ENSFALG00000006561) #7 Passeriformes_g ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00390000008983.b ENSGT00940000158139 ENSGT00440000038159.ic ENSGT00940000157044 ENSGT00390000001752 ENSGT00950000183122.B.k.a ENSGT00950000183122.B.k.b ENSGT00390000014189 ENSGT00390000006030.d.a.b ENSGT00940000161327 ENSGT00940000154540.a ENSGT00940000153883.b ENSGT00940000161370 ENSGT00390000005712 ENSGT00820000127055.a #21 ENSGT01090000260061.c.b #22 ENSGT00940000157915 #20 ENSGT00940000156538 #19 ENSGT00940000157119 #18 ENSGT00940000153576.c.b #17 ENSGT00950000183101.a.a #16 ENSGT00940000161117 #15 ENSGT00390000015210 #14 ENSGT01010000222313.B.b #13 ENSGT00940000164941 ENSGT00930000151039 #12 ENSGT00940000158386 #11 ENSGT00940000158112 #10 ENSGT00730000111079 #9 ENSGT00390000012403 #8 ENSGT00940000157112.d #7 Passeroidea ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00390000008983.b ENSGT00940000158139 ENSGT00440000038159.ic 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ENSGT00390000015210 #14 ENSGT01010000222313.B.b #13 ENSGT00940000164941 ENSGT00930000151039 #12 ENSGT00940000158386 #11 ENSGT00940000158112 #10 ENSGT00730000111079 #9 ENSGT00390000012403 #8 ENSGT00940000157112.d #7 Kakapo MODERN SPECIES 58 DDX52 (ENSSHBG00005017631) SYNRG (ENSSHBG00005016859) DUSP14 (ENSSHBG00005016807) TADA2A (ENSSHBG00005016799) ACACA (ENSSHBG00005016113) AATF (ENSSHBG00005016069) LHX1 (ENSSHBG00005016063) MRM1 (ENSSHBG00005016059) DHRS11 (ENSSHBG00005016056) KCTD7 (ENSSHBG00005016052) RABGEF1 (ENSSHBG00005016047) TMEM248 (ENSSHBG00005016043) LRRC75A (ENSSHBG00005016036) NCBP3 (ENSSHBG00005016012) CRK (ENSSHBG00005016007) #21 YWHAE (ENSSHBG00005016004) #22 MYO1C (ENSSHBG00005007594) #20 INPP5K (ENSSHBG00005007074) #19 PITPNA (ENSSHBG00005007032) #18 SLC43A2 (ENSSHBG00005006996) #17 SCARF1 (ENSSHBG00005006967) #16 RILP (ENSSHBG00005006950) #15 PRPF8 (ENSSHBG00005006912) #14 TLCD2 (ENSSHBG00005006869) #13 ENSSHBG00005006845 WDR81 (ENSSHBG00005006808) #12 SERPINF2 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(ENSACCG00020005319) #9 RPA1 (ENSACCG00020005332) #8 Galloanserae ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000162897 ENSGT00940000158139 ENSGT00440000038159.ic ENSGT00940000157044 ENSGT00390000001752 ENSGT00950000183122.B.k ENSGT00950000183122.B.l ENSGT00390000014189 ENSGT00390000006030.d.a.b ENSGT00940000161327 ENSGT00940000154540.a ENSGT00940000153883.b ENSGT00940000161370 ENSGT00390000005712 ENSGT00820000127055.a #21 ENSGT01090000260061.c.b #22 ENSGT00940000157915 #20 ENSGT00940000156538 #19 ENSGT00940000157119 #18 ENSGT00940000153576.c.b #17 ENSGT00950000183101.a.a #16 ENSGT00940000161117 #15 ENSGT00390000015210 #14 ENSGT01010000222313.B.b #13 ENSGT00940000164941 ENSGT00930000151039 #12 ENSGT00940000158386 #11 ENSGT00940000158112 #10 ENSGT00730000111079 #9 ENSGT00390000012403 #8 ENSGT00940000157112.d #7 Anatidae ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000162897 ENSGT00940000158139 ENSGT00440000038159.ic.a ENSGT00940000157044 ENSGT00390000001752 ENSGT00950000183122.B.k ENSGT00950000183122.B.l ENSGT00390000014189 ENSGT00390000006030.d.a.b ENSGT00940000161327 ENSGT00940000154540.a ENSGT00940000153883.b ENSGT00940000161370 ENSGT00390000005712 ENSGT00820000127055.a #21 ENSGT01090000260061.c.b #22 ENSGT00940000157915 #20 ENSGT00940000156538 #19 ENSGT00940000157119 #18 ENSGT00940000153576.c.b #17 ENSGT00950000183101.a.a #16 ENSGT00940000161117 #15 ENSGT00390000015210 #14 ENSGT01010000222313.B.b #13 ENSGT00940000164941 ENSGT00930000151039 #12 ENSGT00940000158386 #11 ENSGT00940000158112 #10 ENSGT00730000111079 #9 ENSGT00390000012403 #8 ENSGT00940000157112.d #7 Duck MODERN SPECIES 11 CCT6B (ENSAPLG00000010870) SUMF2 (ENSAPLG00000011312) ENSAPLG00000019405 ENSAPLG00000012325 VKORC1L1 (ENSAPLG00000019287) GUSB (ENSAPLG00000012409) ENSAPLG00000026020 CRCP (ENSAPLG00000018879) TPST1 (ENSAPLG00000006925) KCTD7 (ENSAPLG00000016810) RABGEF1 (ENSAPLG00000007107) TMEM248 (ENSAPLG00000007316) LRRC75A (ENSAPLG00000007361) NCBP3 (ENSAPLG00000007373) CRK (ENSAPLG00000007541) #21 YWHAE 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ENSGT00940000158386 #11 ENSGT00940000158112 #10 ENSGT00730000111079 #9 ENSGT00390000012403 #8 ENSGT00940000157112.d #7 Phasianidae_b ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000156339 ENSGT00940000162897 ENSGT00940000158139 ENSGT00440000038159.ic ENSGT00940000157044 ENSGT00390000001752 ENSGT00950000183122.B.k ENSGT00390000014189 ENSGT00390000006030.d.a.b ENSGT00940000161327 ENSGT00940000154540.a ENSGT00940000153883.b ENSGT00940000161370 ENSGT00390000005712 ENSGT00820000127055.a #21 ENSGT01090000260061.c.b #22 ENSGT00940000157915 #20 ENSGT00940000156538 #19 ENSGT00940000157119 #18 ENSGT00940000153576.c.b.t #17 ENSGT00950000183101.a.a #16 ENSGT00940000161117 #15 ENSGT00390000015210 #14 ENSGT01010000222313.B.b #13 ENSGT00940000164941 ENSGT00930000151039.a #12 ENSGT00940000158386 #11 ENSGT00940000158112 #10 ENSGT00730000111079 #9 ENSGT00390000012403 #8 ENSGT00940000157112.d #7 Chicken MODERN SPECIES 10 PSPH (ENSGALG00010029649) CCT6A (ENSGALG00010029653) PHKG1 (ENSGALG00010029655) CHCHD2 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ENSGT00730000111079 #9 ENSGT00390000012403 #8 Three-toed box turtle MODERN SPECIES 106 CRK (ENSTMTG00000010782) #21 YWHAE (ENSTMTG00000010767) #22 MYO1C (ENSTMTG00000010619) #20 INPP5K (ENSTMTG00000010549) #19 PITPNA (ENSTMTG00000010485) #18 ENSTMTG00000010462 #17 ENSTMTG00000010455 #17 SCARF1 (ENSTMTG00000010412) #16 ENSTMTG00000010351 #15 PRPF8 (ENSTMTG00000010283) #14 ENSTMTG00000010265 ENSTMTG00000010239 ENSTMTG00000010213 WDR81 (ENSTMTG00000010194) #12 SERPINF2 (ENSTMTG00000010180) #11 SERPINF1 (ENSTMTG00000010163) #10 SMYD4 (ENSTMTG00000010031) #9 painted turtle MODERN SPECIES 1265 CRK (ENSCPBG00000011040) #21 YWHAE (ENSCPBG00000011038) #22 Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT01090000260061.c.b #22 ENSGT00940000157915 #20 ENSGT00940000156538 #19 ENSGT00940000157119 #18 ENSGT00940000153576.c.b #17 ENSGT00950000183101.a.a #16 ENSGT00940000161117 #15 ENSGT00390000015210 #14 ENSGT01010000222313.B.b #13 ENSGT00940000164941 ENSGT00930000151039 #12 ENSGT00940000158386 #11 ENSGT00940000158112 #10 ENSGT00730000111079 #9 ENSGT00390000012403 #8 ENSGT00940000157112 #7 tuatara MODERN SPECIES 1079 ENSSPUG00000008850 SLC47A2 (ENSSPUG00000008589) ALDH3A2 (ENSSPUG00000008545) ULK2 (ENSSPUG00000008183) NLE1 (ENSSPUG00000008129) AKAP10 (ENSSPUG00000008098) ENSSPUG00000008082 SPATA22 (ENSSPUG00000007974) ASPA (ENSSPUG00000007939) TRPV3 (ENSSPUG00000007777) ENSSPUG00000007746 ENSSPUG00000007734 ENSSPUG00000007722 ENSSPUG00000007711 CRK (ENSSPUG00000007698) #21 YWHAE (ENSSPUG00000007685) #22 MYO1C (ENSSPUG00000007626) #20 INPP5K (ENSSPUG00000007597) #19 ENSSPUG00000007580 PITPNA (ENSSPUG00000007575) #18 ENSSPUG00000007561 #17 ENSSPUG00000007548 #17 ENSSPUG00000007541 #17 SCARF1 (ENSSPUG00000007503) #16 RILP (ENSSPUG00000007481) #15 PRPF8 (ENSSPUG00000007463) #14 TLCD2 (ENSSPUG00000007453) #13 ENSSPUG00000007441 ENSSPUG00000007430 WDR81 (ENSSPUG00000007414) #12 SERPINF2 (ENSSPUG00000007353) #11 Episquamata ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT01090000260061.c.b #22 ENSGT00940000157915 #20 ENSGT00940000156538 #19 ENSGT00940000157119 #18 ENSGT00940000153576.c.b #17 ENSGT00950000183101.a.a #16 ENSGT00940000161117 #15 ENSGT00390000015210 #14 ENSGT01010000222313.B.b #13 ENSGT00940000164941 ENSGT00930000151039 #12 ENSGT00940000158386 #11 ENSGT00940000158112 #10 ENSGT00730000111079 #9 ENSGT00390000012403 #8 ENSGT00940000157112 #7 Laterata ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT01090000260061.c.b #22 ENSGT00940000157915 #20 ENSGT00940000156538 #19 ENSGT00940000155101 ENSGT00940000157119 #18 ENSGT00940000153576.c.b #17 ENSGT00950000183101.a.a #16 ENSGT00390000015210 #14 ENSGT01010000222313.B.b #13 ENSGT00940000164941 ENSGT00930000151039 #12 ENSGT00940000158386 #11 ENSGT00940000158112 #10 ENSGT00730000111079 #9 ENSGT00390000012403 #8 ENSGT00940000157112 #7 Common wall lizard MODERN SPECIES 6 MYO18A (ENSPMRG00000022248) PIPOX (ENSPMRG00000022208) SEZ6 (ENSPMRG00000022059) PHF12 (ENSPMRG00000022008) ENSPMRG00000021995 ENSPMRG00000021987 FLOT2 (ENSPMRG00000021864) ERAL1 (ENSPMRG00000021793) ENSPMRG00000021775 FAM222B (ENSPMRG00000021770) TRAF4 (ENSPMRG00000021751) NEK8 (ENSPMRG00000021719) TLCD1 (ENSPMRG00000021701) ##29 ENSPMRG00000021690 CRK (ENSPMRG00000021684) #21 YWHAE (ENSPMRG00000021673) #22 MYO1C (ENSPMRG00000021007) #20 INPP5K (ENSPMRG00000020880) #19 ENSPMRG00000020862 SLC43A2 (ENSPMRG00000020824) #17 SCARF1 (ENSPMRG00000020789) #16 PRPF8 (ENSPMRG00000020662) #14 TLCD2 (ENSPMRG00000020629) #13 ENSPMRG00000020611 WDR81 (ENSPMRG00000020584) #12 SERPINF2 (ENSPMRG00000018050) #11 SERPINF1 (ENSPMRG00000018032) #10 SMYD4 (ENSPMRG00000018012) #9 RPA1 (ENSPMRG00000017869) #8 RTN4RL1 (ENSPMRG00000017823) #7 DPH1 (ENSPMRG00000017805) Argentine black and white tegu MODERN SPECIES 215 CRK (ENSSMRG00000007637) #21 YWHAE (ENSSMRG00000007634) #22 MYO1C (ENSSMRG00000007627) #20 DPH1 (ENSSMRG00000007613) RTN4RL1 (ENSSMRG00000007609) #7 RPA1 (ENSSMRG00000007606) #8 SERPINF1 (ENSSMRG00000007275) #10 SMYD4 (ENSSMRG00000007273) #9 SERPINF2 (ENSSMRG00000007269) #11 WDR81 (ENSSMRG00000007268) #12 ENSSMRG00000007266 TLCD2 (ENSSMRG00000007265) #13 ENSSMRG00000006997 SCARF1 (ENSSMRG00000006988) #16 SLC43A2 (ENSSMRG00000006980) #17 PITPNA (ENSSMRG00000006976) #18 ENSSMRG00000006970 Toxicofera ANCESTRAL SPECIES 43 ENSGT01090000260061.c.b #22 ENSGT00940000157915 #20 ENSGT00940000156538 #19 ENSGT00940000157119 #18 ENSGT00940000153576.c.b #17 ENSGT00950000183101.a.a #16 ENSGT00940000161117 #15 ENSGT00390000015210 #14 ENSGT01010000222313.B.b #13 ENSGT00940000164941 ENSGT00940000165249 ENSGT00930000151039 #12 ENSGT00940000158386 #11 ENSGT00940000158112 #10 ENSGT00730000111079 #9 ENSGT00390000012403 #8 Elapidae ANCESTRAL SPECIES 44 ENSGT01090000260061.c.b #22 ENSGT00940000157915 #20 ENSGT00940000156538 #19 ENSGT00940000157119 #18 ENSGT00940000153576.c.b #17 ENSGT00950000183101.a.a #16 ENSGT00940000161117 #15 ENSGT00390000015210 #14 ENSGT01010000222313.B.b #13 ENSGT00940000164941 ENSGT00940000165249 ENSGT00930000151039 #12 ENSGT00940000158386 #11 ENSGT00940000158112 #10 ENSGT00730000111079 #9 ENSGT00390000012403 #8 Indian cobra MODERN SPECIES ENSNNAG00000000295 ENSNNAG00000000317 ENSNNAG00000000331 NEK8 (ENSNNAG00000000352) ENSNNAG00000000382 ENSNNAG00000000404 ENSNNAG00000000408 GLOD4 (ENSNNAG00000000418) #28 GEMIN4 (ENSNNAG00000000444) #30 TLCD3A (ENSNNAG00000000461) #29 CRK (ENSNNAG00000000479) #21 YWHAE (ENSNNAG00000000513) #22 MYO1C (ENSNNAG00000000564) #20 INPP5K (ENSNNAG00000000662) #19 PITPNA (ENSNNAG00000000688) #18 SLC43A2 (ENSNNAG00000000715) #17 ENSNNAG00000000728 #16 ENSNNAG00000000737 RILP (ENSNNAG00000000752) #15 PRPF8 (ENSNNAG00000000780) #14 ENSNNAG00000000822 #13 ENSNNAG00000000836 ENSNNAG00000000858 WDR81 (ENSNNAG00000000881) #12 SERPINF2 (ENSNNAG00000000900) #11 SERPINF1 (ENSNNAG00000000910) #10 SMYD4 (ENSNNAG00000000926) #9 Elapidae_a ANCESTRAL SPECIES 104 ENSGT01090000260061.c.b #22 ENSGT00940000157915 #20 ENSGT00940000156538 #19 ENSGT00940000157119 #18 ENSGT00940000153576.c.b #17 ENSGT00950000183101.a.a #16 ENSGT00940000161117 #15 ENSGT00390000015210 #14 ENSGT01010000222313.B.b #13 ENSGT00930000151039 #12 ENSGT00940000158386 #11 ENSGT00940000158112 #10 ENSGT00730000111079 #9 ENSGT00390000012403 #8 ENSGT00940000157112 #7 ENSGT00940000153694.A Acanthophiinae ANCESTRAL SPECIES 102 ENSGT01090000260061.c.b #22 ENSGT00940000157915 #20 ENSGT00940000156538 #19 ENSGT00940000157119 #18 ENSGT00940000153576.c.b #17 ENSGT00950000183101.a.a #16 ENSGT00940000161117 #15 ENSGT00390000015210 #14 ENSGT01010000222313.B.b #13 ENSGT00930000151039 #12 ENSGT00940000158386 #11 ENSGT00940000158112 #10 ENSGT00730000111079 #9 ENSGT00390000012403 #8 ENSGT00940000157112 #7 ENSGT00940000153694.A Eastern brown snake MODERN SPECIES 156 CRK (ENSPTXG00000011611) #21 YWHAE (ENSPTXG00000011610) #22 MYO1C (ENSPTXG00000011608) #20 INPP5K (ENSPTXG00000011607) #19 PITPNA (ENSPTXG00000011605) #18 SLC43A2 (ENSPTXG00000011604) #17 SCARF1 (ENSPTXG00000011587) #16 RILP (ENSPTXG00000011586) #15 PRPF8 (ENSPTXG00000011585) #14 ENSPTXG00000011584 ENSPTXG00000011579 #12 SERPINF2 (ENSPTXG00000011559) #11 SERPINF1 (ENSPTXG00000011549) #10 SMYD4 (ENSPTXG00000011529) #9 RPA1 (ENSPTXG00000011486) #8 RTN4RL1 (ENSPTXG00000011484) #7 DPH1 (ENSPTXG00000011482) Mainland tiger snake MODERN SPECIES 484 CRK (ENSNSUG00000006309) #21 YWHAE (ENSNSUG00000006310) #22 MYO1C (ENSNSUG00000006316) #20 INPP5K (ENSNSUG00000006956) #19 PITPNA (ENSNSUG00000006957) #18 SLC43A2 (ENSNSUG00000006976) #17 SCARF1 (ENSNSUG00000007015) #16 RILP (ENSNSUG00000007016) #15 ENSNSUG00000007017 #14 ENSNSUG00000007018 #14 TLCD2 (ENSNSUG00000007019) #13 WDR81 (ENSNSUG00000007021) #12 ENSNSUG00000007022 #11 Blue-lipped sea krait MODERN SPECIES 8591 CRK (ENSLLTG00000012488) #21 YWHAE (ENSLLTG00000012495) #22 MYO1C (ENSLLTG00000012510) #20 Anura ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00390000007149 ENSGT00940000158363 ENSGT00390000002625 ENSGT00940000159752 ENSGT00390000013187 ENSGT00940000161716 ENSGT00940000167381 ENSGT00390000015354.c.b.b ENSGT00940000159751 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#22 MYO1C (ENSLLEG00000007167) #20 ENSLLEG00000007485 INPP5K (ENSLLEG00000007520) #19 PITPNA (ENSLLEG00000007726) #18 SLC43A2 (ENSLLEG00000007769) #17 SCARF1 (ENSLLEG00000007976) #16 PRPF8 (ENSLLEG00000008055) #14 TLCD2 (ENSLLEG00000009334) #13 ENSLLEG00000009403 ENSLLEG00000009772 ENSLLEG00000009941 ENSLLEG00000009965 WDR81 (ENSLLEG00000009982) #12 SERPINF2 (ENSLLEG00000010083) #11 SERPINF1 (ENSLLEG00000010328) #10 Leishan spiny toad MODERN SPECIES 6 ENSLLEG00000013016 ENSLLEG00000012982 ERGIC2 (ENSLLEG00000012668) ENSLLEG00000011644 TMTC1 (ENSLLEG00000011450) IPO8 (ENSLLEG00000011042) CAPRIN2 (ENSLLEG00000010905) ENSLLEG00000010844 ENSLLEG00000010792 MED7 (ENSLLEG00000010780) ITK (ENSLLEG00000010564) CYFIP2 (ENSLLEG00000010284) NIPAL4 (ENSLLEG00000010219) THG1L (ENSLLEG00000010178) ENSLLEG00000010157 ENSLLEG00000010134 #22 ENSLLEG00000009939 RMND1 (ENSLLEG00000009792) ARMT1 (ENSLLEG00000009748) ENSLLEG00000009727 NDUFA9 (ENSLLEG00000009538) ENSLLEG00000009517 ENSLLEG00000009507 ENSLLEG00000009481 ENSLLEG00000009470 KCNA1 (ENSLLEG00000009448) ENSLLEG00000009430 NTF3 (ENSLLEG00000009399) ENSLLEG00000009336 ENSLLEG00000009245 ENSLLEG00000009234 Leishan spiny toad MODERN SPECIES 8 KLF10 (ENSLLEG00000024337) ENSLLEG00000024365 ENSLLEG00000024399 ATP6V1C1 (ENSLLEG00000024443) ENSLLEG00000024893 FZD6 (ENSLLEG00000005839) CTHRC1 (ENSLLEG00000005889) SLC25A32 (ENSLLEG00000005933) DCAF13 (ENSLLEG00000006016) RIMS2 (ENSLLEG00000006297) DCSTAMP (ENSLLEG00000008220) DPYS (ENSLLEG00000008262) LRP12 (ENSLLEG00000008379) ENSLLEG00000008436 ZFPM2 (ENSLLEG00000008471) ENSLLEG00000008536 #22 ENSLLEG00000008622 ABRA (ENSLLEG00000009001) ANGPT1 (ENSLLEG00000009052) ENSLLEG00000009146 ENSLLEG00000009184 ENSLLEG00000009583 ENSLLEG00000009611 RSPO2 (ENSLLEG00000009655) ENSLLEG00000009865 ENSLLEG00000009842 EIF3E (ENSLLEG00000009926) EMC2 (ENSLLEG00000010245) NIPAL2 (ENSLLEG00000010579) POP1 (ENSLLEG00000010973) RIDA (ENSLLEG00000011164) Frog MODERN SPECIES 2 ift22 (ENSXETG00000012497) col26a1 (ENSXETG00000035357) XB986526 [provisional:hsd3b7] (ENSXETG00000004490) ENSXETG00000046260 orai1 (ENSXETG00000004483) ENSXETG00000043567 myl10 (ENSXETG00000004481) cux1 (ENSXETG00000005476) sh2b2 (ENSXETG00000005475) alkbh4 (ENSXETG00000034559) lrwd1 (ENSXETG00000005472) ENSXETG00000043653 ENSXETG00000047961 nagpa (ENSXETG00000022907) crk (ENSXETG00000022904) #21 ywhae (ENSXETG00000022893) #22 myo1c (ENSXETG00000022882) #20 inpp5k (ENSXETG00000022881) #19 ENSXETG00000045373 pitpna (ENSXETG00000031018) #18 slc43a2 (ENSXETG00000022279) #17 ENSXETG00000042167 ENSXETG00000047615 scarf1 (ENSXETG00000033180) #16 rilp (ENSXETG00000031653) #15 ENSXETG00000047487 prpf8 (ENSXETG00000022259) #14 tlcd2 (ENSXETG00000044649) #13 abhd15 (ENSXETG00000030092) ENSXETG00000033610 atp5pb (ENSXETG00000022255) Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES 289 ENSGT00390000014591 ENSGT00940000157881 ENSGT00940000156538 #19 ENSGT00940000164396 ENSGT00940000157119 #18 ENSGT00940000153576.c.b #17 ENSGT01100000263573.a.b ENSGT00920000149180.b ENSGT00940000153571.a ENSGT00820000127055.a #21 ENSGT01090000260061.c.b #22 ENSGT00940000157915 #20 ENSGT00940000161370 Reedfish MODERN SPECIES 16 SSH2 (ENSECRG00000008971) nsrp1 (ENSECRG00000009004) slc6a4a (ENSECRG00000009027) blmh (ENSECRG00000009064) ncbp3 (ENSECRG00000009103) smtnl (ENSECRG00000009122) slc25a1a (ENSECRG00000009129) tekt1 (ENSECRG00000009141) ENSECRG00000009150 rap1gap2b (ENSECRG00000009169) ENSECRG00000009229 gemin4 (ENSECRG00000009247) #30 LRRC75A (ENSECRG00000009260) ENSECRG00000009268 crk (ENSECRG00000007246) #21 ywhae1 (ENSECRG00000007266) #22 myo1cb (ENSECRG00000007307) #20 ENSECRG00000007346 ENSECRG00000007355 slc43a2b (ENSECRG00000007396) #17 ENSECRG00000007439 pitpnaa (ENSECRG00000007484) #18 inpp5ka (ENSECRG00000007657) #19 nle1 (ENSECRG00000007675) ENSECRG00000007694 tmem199 (ENSECRG00000007704) poldip2 (ENSECRG00000007722) ENSECRG00000007752 tmem97 (ENSECRG00000007766) ift20 (ENSECRG00000007787) tnfaip1 (ENSECRG00000007809) Neopterygii ANCESTRAL SPECIES 268 ENSGT00940000161370 ENSGT00920000149180.b ENSGT00940000153571.a ENSGT00820000127055.a #21 ENSGT01090000260061.c.b #22 ENSGT00940000157915 #20 ENSGT01100000263573.a.b ENSGT00940000153576.c.b #17 ENSGT00940000157119 #18 ENSGT00940000164396 ENSGT00940000156538 #19 ENSGT00940000157881 ENSGT00390000014591 Spotted gar MODERN SPECIES 661 LRRC75A (ENSLOCG00000007159) crk (ENSLOCG00000007144) #21 ywhae1 (ENSLOCG00000007116) #22 myo1cb (ENSLOCG00000007063) #20 ENSLOCG00000007052 slc43a2b (ENSLOCG00000007037) #17 pitpnaa (ENSLOCG00000007016) #18 mybbp1a (ENSLOCG00000006996) ENSLOCG00000006975 ENSLOCG00000006949 ENSLOCG00000006930 ENSLOCG00000006921 tppp2 (ENSLOCG00000006905) ENSLOCG00000006894 ENSLOCG00000006880 ENSLOCG00000006869 TLCD3A (ENSLOCG00000006852) #29 gemin4 (ENSLOCG00000006840) #30 Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 255 ENSGT01010000222313.A.b.b.b.b #29 ENSGT00390000012296 #30 ENSGT00940000165285 ENSGT00940000154495.a.a ENSGT00920000149180.b ENSGT00390000014591 ENSGT00940000153571.a ENSGT00940000161370 ENSGT00820000127055.a.a #21 ENSGT01090000260061.c.b #22 ENSGT00940000157915 #20 ENSGT01100000263573.a.b ENSGT00940000153576.c.b.w #17 ENSGT00940000157119.a #18 ENSGT00940000156538.b #19 ENSGT00950000182894.C ENSGT00510000048837 ENSGT00530000063869.A ENSGT00940000165230.a Osteoglossiformes DUPLICATION Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 677 ENSGT01090000260061.c.b.a #22 ENSGT00940000157915.r #20 Asian bonytongue MODERN SPECIES 17 TSKU (ENSSFOG00015021288) acer3 (ENSSFOG00015021265) ENSSFOG00015021247 MMP1 (ENSSFOG00015021199) mmp30 (ENSSFOG00015021184) acat1 (ENSSFOG00015021173) tmprss2 (ENSSFOG00015021130) ENSSFOG00015021038 PCP4 (ENSSFOG00015021019) ENSSFOG00015021014 ENSSFOG00015021000 rps25 (ENSSFOG00015030390) SLC37A4 (ENSSFOG00015020976) B3GAT1 (ENSSFOG00015031924) ENSSFOG00015020953 ENSSFOG00015020934 #22 myo1cb (ENSSFOG00015020817) #20 ENSSFOG00015028095 aasdhppt (ENSSFOG00015028809) gria4b (ENSSFOG00015020773) mtnr1bb (ENSSFOG00015024650) wls (ENSSFOG00015020722) dr1 (ENSSFOG00015020716) scinla (ENSSFOG00015020694) ccdc18 (ENSSFOG00015029275) mtf2 (ENSSFOG00015020651) dipk1aa (ENSSFOG00015031285) RPL5 (ENSSFOG00015020591) EVI5 (ENSSFOG00015020368) gfi1ab (ENSSFOG00015028337) rpap2 (ENSSFOG00015020266) P. kingsleyae MODERN SPECIES 208 ENSPKIG00000000884 KIRREL3 (ENSPKIG00000000821) ENSPKIG00000000777 smtlb (ENSPKIG00000000662) ETS1 (ENSPKIG00000000540) FLI1 (ENSPKIG00000000505) kcnj1b (ENSPKIG00000024075) KCNJ5 (ENSPKIG00000024064) st3gal4 (ENSPKIG00000024051) il13ra2 (ENSPKIG00000024035) ENSPKIG00000024018 ENSPKIG00000024005 TBX4 (ENSPKIG00000023984) TBX2 (ENSPKIG00000023971) ppm1db (ENSPKIG00000023962) ENSPKIG00000023940 #22 myo1cb (ENSPKIG00000023914) #20 Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 186 ENSGT00990000204384 ENSGT00940000156097.a ENSGT00540000072704 ENSGT00940000159186.b ENSGT00940000157083 ENSGT01090000263084 ENSGT00940000162996.c.a ENSGT00940000162556.C ENSGT00390000012296 #30 ENSGT00940000165285 ENSGT00940000154495.a.a ENSGT00390000014591 ENSGT00940000153571.a.a ENSGT00940000161370 ENSGT00820000127055.a.a.b #21 ENSGT01090000260061.c.b.b #22 ENSGT00940000157915.q #20 ENSGT01100000263573.a.b ENSGT01030000234981.j ENSGT00940000153576.c.b.w.e #17 ENSGT00940000157119.a #18 ENSGT00940000156538.b #19 ENSGT00950000182894.C ENSGT00530000063869.A Asian bonytongue MODERN SPECIES 1 ENSSFOG00015001041 USF1 (ENSSFOG00015000994) ENSSFOG00015029343 ENSSFOG00015015379 ENSSFOG00015028557 ENSSFOG00015000845 ENSSFOG00015025162 ENSSFOG00015032363 gemin4 (ENSSFOG00015015430) #30 dhrs13b.2 (ENSSFOG00015015436) SMTNL2 (ENSSFOG00015015450) tmem199 (ENSSFOG00015015483) poldip2 (ENSSFOG00015015527) LRRC75A (ENSSFOG00015027116) crk (ENSSFOG00015015614) #21 ywhae1 (ENSSFOG00015015638) #22 myo1cb (ENSSFOG00015015705) #20 ENSSFOG00015030302 ENSSFOG00015024350 SLC43A2 (ENSSFOG00015015970) #17 pitpnaa (ENSSFOG00015016034) #18 inpp5ka (ENSSFOG00015016067) #19 tekt1 (ENSSFOG00015016146) ENSSFOG00015016199 ENSSFOG00015000980 GALNT17 (ENSSFOG00015000988) CALN1 (ENSSFOG00015024671) tyw1 (ENSSFOG00015001054) sbds (ENSSFOG00015028625) ENSSFOG00015026389 ENSSFOG00015026282 P. kingsleyae MODERN SPECIES 46 ENSPKIG00000020119 ubash3bb (ENSPKIG00000020168) gkup (ENSPKIG00000020199) ENSPKIG00000020232 usf1 (ENSPKIG00000020259) ENSPKIG00000020288 ENSPKIG00000020540 usp2a (ENSPKIG00000020984) gemin4 (ENSPKIG00000021025) #30 dhrs13b.2 (ENSPKIG00000021049) SMTNL2 (ENSPKIG00000021081) tmem199 (ENSPKIG00000021095) LRRC75A (ENSPKIG00000021120) ENSPKIG00000021137 crk (ENSPKIG00000021142) #21 ywhae1 (ENSPKIG00000021165) #22 myo1cb (ENSPKIG00000021207) #20 ENSPKIG00000021252 ENSPKIG00000021264 SLC43A2 (ENSPKIG00000021292) #17 pitpnaa (ENSPKIG00000021478) #18 inpp5ka (ENSPKIG00000021858) #19 tekt1 (ENSPKIG00000021946) ENSPKIG00000022039 SMCO4 (ENSPKIG00000022063) ENSPKIG00000022082 med17 (ENSPKIG00000022155) ENSPKIG00000022195 ENSPKIG00000022208 ENSPKIG00000022226 HEPH (ENSPKIG00000022257) Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 154 ENSGT00530000063405.b.f ENSGT00960000189385 ENSGT00950000183155.a.a.a.b ENSGT00940000155545.b ENSGT01010000222313.A.b.b.b.a #29 ENSGT00940000154495.a.b ENSGT00820000127055.a.b #21 ENSGT01090000260061.c.b #22 ENSGT00940000157915 #20 ENSGT01100000263573.a.b ENSGT00940000153576.c.b.w #17 ENSGT00940000157119.a #18 ENSGT00940000156538.b #19 ENSGT00950000182894.C ENSGT00510000048837 ENSGT00530000063869.A ENSGT00940000165230.a ENSGT00390000001735 ENSGT00940000157855 ENSGT00940000157430.a.b ENSGT00950000182928.A.a.a ENSGT00530000063841.a ENSGT00950000182928.A.a.b Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 41 ENSGT00940000161289 ENSGT00940000162556.C ENSGT01010000222313.A.b.b.b.b #29 ENSGT00940000155231.a.a ENSGT00390000017207.i.a ENSGT00390000009083.n ENSGT01000000214789 ENSGT00390000012296 #30 ENSGT00940000165285 ENSGT00940000154495.a.a ENSGT00920000149180.b ENSGT00390000014591 ENSGT00940000153571.a ENSGT00940000161370 ENSGT00820000127055.a.a #21 ENSGT01090000260061.c.b #22 ENSGT00940000157915 #20 ENSGT01100000263573.a.b ENSGT00940000153576.c.b.w #17 ENSGT00940000157119.a #18 ENSGT00940000156538.b #19 ENSGT00950000182894.C ENSGT00510000048837 ENSGT00530000063869.A ENSGT00940000165230.a ENSGT00390000001735 ENSGT00940000157855 ENSGT00940000157430.a.b ENSGT00950000182928.A.a.a ENSGT00940000159604 ENSGT00390000008202 Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 98 ENSGT00940000154495.a.a ENSGT00920000149180.b ENSGT00390000014591 ENSGT00940000153571.a ENSGT00940000161370 ENSGT00820000127055.a.a #21 ENSGT01090000260061.c.b #22 ENSGT00940000157915 #20 ENSGT00940000153576.c.b.w #17 ENSGT00940000157119.a #18 ENSGT00940000156538.b #19 ENSGT00950000182894.C ENSGT00530000063869.A ENSGT01080000258083 ENSGT00940000157673 ENSGT00940000164152.a ENSGT01020000230768 ENSGT00940000164682 ENSGT00940000155439.a.b.b ENSGT00940000167797 ENSGT00950000183106.a.a.b ENSGT00950000183063.c.a Cod DUPLICATION Cod MODERN SPECIES 7 ENSGMOG00000032410 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(ENSMMDG00005018982) ENSMMDG00005019006 psmd2 (ENSMMDG00005019038) Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 5 cadm1a (ENSMMDG00005015899) sc5d (ENSMMDG00005015902) plekhb1 (ENSMMDG00005015912) fam168a (ENSMMDG00005015913) ENSMMDG00005015914 ENSMMDG00005015917 ENSMMDG00005015924 TBCEL (ENSMMDG00005015925) ENSMMDG00005015928 TECTA (ENSMMDG00005015931) ENSMMDG00005015939 ENSMMDG00005015943 #29 ENSMMDG00005015946 POLDIP2 (ENSMMDG00005015948) CRK (ENSMMDG00005016019) #21 ywhae2 (ENSMMDG00005016020) #22 gria4b (ENSMMDG00005016022) elmod1 (ENSMMDG00005016024) slc35f2 (ENSMMDG00005016026) CUL5 (ENSMMDG00005016029) CAPN5 (ENSMMDG00005016036) ompb (ENSMMDG00005016043) MYO7A (ENSMMDG00005016059) ENSMMDG00005016072 zw10 (ENSMMDG00005016076) ENSMMDG00005016119 ENSMMDG00005016123 mybbp1a (ENSMMDG00005016132) tbl2 (ENSMMDG00005016154) ENSMMDG00005016158 HEPACAM (ENSMMDG00005016167) Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00540000072704 ENSGT00940000157083 ENSGT00940000162996 ENSGT00530000063405.b.e 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(ENSOMYG00000029155) ankrd13b (ENSOMYG00000029244) GIT1 (ENSOMYG00000029284) ENSOMYG00000029322 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 41 ENSGT00940000160348.u ENSGT00950000182985.a.b.b.a.b ENSGT01030000234613.b.b.g.c ENSGT00530000063405.b.e.e ENSGT00940000161289.m.a.a.b ENSGT00940000161289.m.b ENSGT01010000222313.A.b.b.b.b.c #29 ENSGT00390000012296.i #30 ENSGT00940000165285.e.a ENSGT00940000154495.a.a.f ENSGT00920000149180.b.d ENSGT00390000014591.e ENSGT00940000153571.a.g.a ENSGT00940000161370.a.a ENSGT00820000127055.a.a.e #21 ENSGT01090000260061.c.b.hd.a #22 ENSGT00940000157915.h #20 ENSGT01100000263573.a.b.a ENSGT00940000153576.c.b.w.c.a #17 ENSGT00940000157119.a.g #18 ENSGT00940000156538.b.b #19 ENSGT00510000047961.d.a ENSGT00950000182894.C.f ENSGT00510000048837.c ENSGT00530000063869.A.f ENSGT00940000165230.a.d ENSGT01000000215902.b ENSGT00390000001735.p ENSGT00940000157855.h.a ENSGT00940000157430.a.b.c ENSGT00950000182928.A.a.a.f Chinook salmon MODERN SPECIES 5 ENSOTSG00005019542 spint2 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ENSGT01010000222313.A.b.b.b.b.c #29 ENSGT00390000012296.i #30 ENSGT00940000165285.e.a ENSGT00940000154495.a.a.f.a ENSGT00920000149180.b.d ENSGT00390000014591.e ENSGT00940000153571.a.g.a ENSGT00940000161370.a.a.a ENSGT00820000127055.a.a.e #21 ENSGT01090000260061.c.b.hd.a #22 ENSGT00940000157915.h #20 ENSGT00940000153576.c.b.w.c.a #17 ENSGT00940000153576.c.b.w.d #17 ENSGT00940000157119.a.g #18 ENSGT00940000156538.b.b #19 ENSGT00510000047961.d.a ENSGT00940000180530 ENSGT00510000048837.c ENSGT00530000063869.A.f ENSGT00940000165230.a.d ENSGT01000000215902.b ENSGT00390000001735.p ENSGT00940000157855.h.a ENSGT00940000157430.a.b.c ENSGT00950000182928.A.a.a.f River trout MODERN SPECIES 4 ENSSTUG00000005883 spint2 (ENSSTUG00000005926) ppp1r14ab (ENSSTUG00000005937) ENSSTUG00000005953 tbcela (ENSSTUG00000005975) usp2a (ENSSTUG00000006009) TLCD3A (ENSSTUG00000006271) #29 gemin4 (ENSSTUG00000006284) #30 ENSSTUG00000006289 smtnl (ENSSTUG00000006311) ENSSTUG00000006326 tmem199 (ENSSTUG00000006340) poldip2 (ENSSTUG00000006377) LRRC75A (ENSSTUG00000006968) crk (ENSSTUG00000006975) #21 ENSSTUG00000007005 #22 myo1cb (ENSSTUG00000007134) #20 SLC43A2 (ENSSTUG00000007513) #17 pitpnaa (ENSSTUG00000007700) #18 inpp5ka (ENSSTUG00000007762) #19 ENSSTUG00000007791 ENSSTUG00000007807 FBXO39 (ENSSTUG00000033083) xaf1 (ENSSTUG00000033094) rap1gap2a (ENSSTUG00000033140) ENSSTUG00000033343 blmh (ENSSTUG00000033361) slc6a4a (ENSSTUG00000034123) SSH2 (ENSSTUG00000034170) ankrd13b (ENSSTUG00000034231) GIT1 (ENSSTUG00000034265) Atlantic salmon MODERN SPECIES 28 ENSSSAG00000110456 ENSSSAG00000082790 ENSSSAG00000055370 ENSSSAG00000108051 ENSSSAG00000110658 ENSSSAG00000104904 ENSSSAG00000115449 gemin4 (ENSSSAG00000095835) #30 ENSSSAG00000055828 smtnl (ENSSSAG00000055835) ENSSSAG00000097136 tmem199 (ENSSSAG00000055840) poldip2 (ENSSSAG00000055854) ENSSSAG00000119813 crk (ENSSSAG00000088560) #21 ENSSSAG00000057269 #22 MYO1C (ENSSSAG00000057363) #20 ENSSSAG00000058574 #17 skip (ENSSSAG00000058756) #19 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ENSGT01010000222313.A.b.b.b.b.d #29 ENSGT00390000012296.j #30 ENSGT00940000165285.e.b ENSGT00940000154495.a.a.e ENSGT00920000149180.b.c ENSGT00390000014591.f ENSGT00940000153571.a.g.b ENSGT00940000161370.a.b ENSGT00820000127055.a.a.f #21 ENSGT01090000260061.c.b.hd.b #22 ENSGT00940000157915.g #20 ENSGT01100000263573.a.b.b ENSGT00940000153576.c.b.w.c.b #17 ENSGT00940000157119.a.h #18 ENSGT00940000156538.b.a #19 ENSGT00510000047961.d.b ENSGT00950000182894.C.e ENSGT00510000048837.d ENSGT00530000063869.A.e ENSGT00940000165230.a.c ENSGT01000000215902.a ENSGT00390000001735.o ENSGT00940000157855.g ENSGT00940000154049.b ENSGT00940000157430.a.b.d Salmo ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000160348.v ENSGT00950000182985.a.b.b.a.a ENSGT01030000234613.b.b.g.d ENSGT00530000063405.b.e.f ENSGT00940000161289.m.a ENSGT00940000162556.C ENSGT01010000222313.A.b.b.b.b.d #29 ENSGT00390000012296.j #30 ENSGT00940000165285.e.b ENSGT00940000154495.a.a.f.b ENSGT00920000149180.b.c ENSGT00390000014591.f 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ENSGT00940000157430.a.b.d Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00950000182985.a.b.b.a.a ENSGT01030000234613.b.b.g.d ENSGT00530000063405.b.e.f ENSGT00940000161289.m.a.a.a ENSGT00940000162556.C ENSGT00940000161289.m.a.b ENSGT01010000222313.A.b.b.b.b.d #29 ENSGT00390000012296.j #30 ENSGT00940000165285.e.b ENSGT00940000154495.a.a.e ENSGT00920000149180.b.c ENSGT00390000014591.f ENSGT00940000153571.a.g.b ENSGT00940000161370.a.b ENSGT00820000127055.a.a.f #21 ENSGT01090000260061.c.b.hd.b #22 ENSGT00940000157915.g #20 ENSGT01100000263573.a.b.b ENSGT00940000153576.c.b.w.c.b #17 ENSGT00940000157119.a.h #18 ENSGT00940000156538.b.a #19 ENSGT00510000047961.d.b ENSGT00950000182894.C.e ENSGT00510000048837.d ENSGT00530000063869.A.e ENSGT00940000165230.a.c ENSGT01000000215902.a ENSGT00390000001735.o ENSGT00940000157855.g ENSGT00940000154049.b ENSGT00940000157430.a.b.d Chinook salmon MODERN SPECIES 4 spint2 (ENSOTSG00005019309) ENSOTSG00005019310 ENSOTSG00005019311 tbcela (ENSOTSG00005019312) usp2a 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MODERN SPECIES 3 ENSOMYG00000013619 ENSOMYG00000071149 ENSOMYG00000052060 ENSOMYG00000069267 ENSOMYG00000013600 ENSOMYG00000050316 ENSOMYG00000013581 ENSOMYG00000013575 ENSOMYG00000013433 ENSOMYG00000013280 ENSOMYG00000013232 ENSOMYG00000013216 #29 ENSOMYG00000013208 ENSOMYG00000013188 #21 ENSOMYG00000066390 ENSOMYG00000013174 #22 gria4b (ENSOMYG00000008434) elmod1 (ENSOMYG00000002471) ENSOMYG00000072496 slc35f2 (ENSOMYG00000005785) ENSOMYG00000005684 ompb (ENSOMYG00000005437) CAPN5 (ENSOMYG00000005341) ENSOMYG00000072789 MYO7A (ENSOMYG00000004675) ENSOMYG00000056202 GDPD4 (ENSOMYG00000003888) ENSOMYG00000003825 ENSOMYG00000003794 ENSOMYG00000003707 ENSOMYG00000003572 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 35 ENSGT00940000158657.g ENSGT00500000044966 ENSGT01100000263551.a.a.c ENSGT00940000177774 ENSGT00800000125277 ENSGT00390000006659.db ENSGT00390000000083.b ENSGT00530000063405.b.f.e ENSGT00950000183155.a.a.a.b.c ENSGT00940000155545.b.f ENSGT01010000222313.A.b.b.b.a.e #29 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piranha DUPLICATION Red-bellied piranha MODERN SPECIES 87 ENSPNAG00000006833 sebox (ENSPNAG00000027903) POLDIP2 (ENSPNAG00000027922) LRRC75A (ENSPNAG00000027972) CRK (ENSPNAG00000027996) #21 ywhae2 (ENSPNAG00000028028) #22 ENSPNAG00000028059 SIPA1 (ENSPNAG00000006489) ENSPNAG00000028132 MCC (ENSPNAG00000028222) PPP1CA (ENSPNAG00000028238) MYL2 (ENSPNAG00000004331) rcl1 (ENSPNAG00000028307) gng10 (ENSPNAG00000004335) dnajc25 (ENSPNAG00000006020) ythdc1 (ENSPNAG00000028365) ENSPNAG00000028385 ENSPNAG00000029678 ugt2a1 (ENSPNAG00000029699) ugt2a1 (ENSPNAG00000029704) ENSPNAG00000029719 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 35 tmem97 (ENSPNAG00000010149) ENSPNAG00000010127 ENSPNAG00000010097 appbp2 (ENSPNAG00000001355) MYO18A (ENSPNAG00000009895) pipox (ENSPNAG00000009774) SEZ6 (ENSPNAG00000009752) dhrs13b.1 (ENSPNAG00000009722) gemin4 (ENSPNAG00000009709) #30 dhrs13b.2 (ENSPNAG00000009694) smtnl (ENSPNAG00000009678) tmem199 (ENSPNAG00000009669) poldip2 (ENSPNAG00000001326) LRRC75A 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(ENSCMIG00000013354) #17 ENSCMIG00000013358 SCARF1 (ENSCMIG00000013361) #16 ENSCMIG00000013363 ENSCMIG00000013367 med31 (ENSCMIG00000013373) ENSCMIG00000013386 ENSCMIG00000013402 Cyclostomata DUPLICATION Cyclostomata ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.b.xg #22 Lamprey DUPLICATION Lamprey MODERN SPECIES 1556 ENSPMAG00000006071 pgap4 (ENSPMAG00000006063) YWHAE (ENSPMAG00000006053) #22 Lamprey MODERN SPECIES 822 ENSPMAG00000006598 #22 vmp1 (ENSPMAG00000006629) ENSPMAG00000010014 gdpd1 (ENSPMAG00000006648) Hagfish MODERN SPECIES 1170 ENSEBUG00000015280 ENSEBUG00000013711 ENSEBUG00000016111 ywhae1 (ENSEBUG00000016141) #22 tpst1 (ENSEBUG00000011959) spns1 (ENSEBUG00000002484) ENSEBUG00000016526 SGSM1 (ENSEBUG00000001883) cluha (ENSEBUG00000011360) ENSEBUG00000004557 ENSEBUG00000001486 ENSEBUG00000016077 ENSEBUG00000001452 Cyclostomata ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.b.yg #22 Hagfish MODERN SPECIES 1246 ENSEBUG00000000326 mettl2a (ENSEBUG00000005418) ENSEBUG00000001008 ACAD10 (ENSEBUG00000004737) ENSEBUG00000012795 ENSEBUG00000003659 ENSEBUG00000010378 #22 ENSEBUG00000016821 ENSEBUG00000005586 ENSEBUG00000011387 #21 ENSEBUG00000011547 ENSEBUG00000003795 ENSEBUG00000009401 wnt4 (ENSEBUG00000005567) ENSEBUG00000016290 ENSEBUG00000006284 Bilateria ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.a ##22 Chordata ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.a ##22 Ciona DUPLICATION Ciona DUPLICATION Ciona DUPLICATION Ciona ANCESTRAL SPECIES 180 ENSGT00940000165508 ENSGT00940000156697 ENSGT00940000169059.a ENSGT01090000260061.c.a.a.b ##22 ENSGT01090000260061.c.a.a.a.a ##22 Ciona intestinalis DUPLICATION Ciona intestinalis MODERN SPECIES 6 ENSCING00000011600 ENSCING00000011601 ENSCING00000011603 ENSCING00000018535 ENSCING00000007429 ENSCING00000018799 ENSCING00000007422 ENSCING00000016695 ##22 ENSCING00000007431 ##22 ENSCING00000011595 ENSCING00000011597 ENSCING00000011598 ENSCING00000011599 ENSCING00000009927 ENSCING00000011593 ENSCING00000011594 ##22 ENSCING00000011592 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#34 ENSCSAVG00000008535 ENSCSAVG00000008533 ENSCSAVG00000008445 ENSCSAVG00000008362 ENSCSAVG00000008359 ENSCSAVG00000008356 ENSCSAVG00000008354 ENSCSAVG00000008350 ENSCSAVG00000008339 Ciona savignyi MODERN SPECIES 2 ENSCSAVG00000011739 ENSCSAVG00000011738 ENSCSAVG00000011737 ENSCSAVG00000011736 ENSCSAVG00000011735 ENSCSAVG00000011734 ENSCSAVG00000011733 ENSCSAVG00000011732 ENSCSAVG00000011731 ENSCSAVG00000011730 ENSCSAVG00000011729 ENSCSAVG00000011728 ENSCSAVG00000011727 ENSCSAVG00000011726 ENSCSAVG00000011725 ENSCSAVG00000011724 ##22 ENSCSAVG00000011723 ##22 ENSCSAVG00000011722 ENSCSAVG00000011721 ENSCSAVG00000011720 ENSCSAVG00000011719 ENSCSAVG00000011718 ENSCSAVG00000011717 ENSCSAVG00000011716 ENSCSAVG00000011715 ENSCSAVG00000011714 ENSCSAVG00000011713 ENSCSAVG00000011712 ENSCSAVG00000011711 ENSCSAVG00000011710 ENSCSAVG00000011708 Vertebrata DUPLICATION Vertebrata DUPLICATION Vertebrata ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.a.c.a ##22 Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES 731 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ENSGT00940000154890.a ENSGT01020000230351.C ENSGT00940000155668 ENSGT00940000155045 ENSGT00940000160156 ENSGT00940000156179 ENSGT00940000176156 Spotted gar MODERN SPECIES 661 pigw (ENSLOCG00000017424) MYO19 (ENSLOCG00000003147) znhit3 (ENSLOCG00000003139) ENSLOCG00000003126 ca4a (ENSLOCG00000003098) GUSB (ENSLOCG00000003067) vkorc1l1 (ENSLOCG00000003060) nupr1a (ENSLOCG00000017423) hpda (ENSLOCG00000003037) RNF43 (ENSLOCG00000003019) MTMR4 (ENSLOCG00000003001) HSF5 (ENSLOCG00000002988) supt4h1 (ENSLOCG00000002970) TSPOAP1 (ENSLOCG00000002948) ENSLOCG00000002933 ywhag1 (ENSLOCG00000002919) ##22 hspb1 (ENSLOCG00000002907) SRRM3 (ENSLOCG00000002879) itln3 (ENSLOCG00000002870) ENSLOCG00000002849 MLXIPL (ENSLOCG00000002824) rpain (ENSLOCG00000002804) c1qbp (ENSLOCG00000002779) dhx33 (ENSLOCG00000002764) camkk1a (ENSLOCG00000002745) p2rx1 (ENSLOCG00000002716) ATP2A3 (ENSLOCG00000002683) ZZEF1 (ENSLOCG00000002640) cyb5d2 (ENSLOCG00000002621) ankfy1 (ENSLOCG00000002602) ube2g1a (ENSLOCG00000002581) Osteoglossocephalai DUPLICATION Osteoglossocephalai DUPLICATION Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 952 ENSGT00950000183145.D.h.a ENSGT01090000260061.c.a.c.a.a.a ##22 Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00390000009552 ENSGT00390000013520 ENSGT00940000157382 ENSGT00390000010822 ENSGT00940000167280 ENSGT00940000157044.s ENSGT00390000001752 ENSGT00940000155690.b.a ENSGT00940000158976 ENSGT00530000063474.B.e.b ENSGT00940000154006.b ENSGT00510000048674 ENSGT00390000018559 ENSGT00950000183203.d.d ENSGT00950000183145.D.h.a ENSGT01090000260061.c.a.c.a.a.a ##22 ENSGT00940000155882.a.a.b ENSGT00940000154890.a.b ENSGT00940000155882.a.a.a ENSGT00980000199127 ENSGT00940000162625 ENSGT00940000159210 ENSGT00390000006416 ENSGT00390000018406 ENSGT00940000156747 ENSGT01020000230351.C ENSGT00940000154890.a.a ENSGT00940000174983 ENSGT00940000155668 ENSGT00940000155045 ENSGT00940000160156 P. kingsleyae DUPLICATION P. kingsleyae MODERN SPECIES 28 pigw (ENSPKIG00000016463) 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(ENSMZEG00005008791) or95a1 (ENSMZEG00005008802) or95a1 (ENSMZEG00005008808) diabloa (ENSMZEG00005008819) ENSMZEG00005008825 ENSMZEG00005008838 ENSMZEG00005008841 ENSMZEG00005008848 ENSMZEG00005008854 ENSMZEG00005008859 ENSMZEG00005008864 ENSMZEG00005008871 P. nyererei MODERN SPECIES 899 ca4b (ENSPNYG00000004107) ENSPNYG00000004065 YWHAG (ENSPNYG00000004045) ##22 camkk1b (ENSPNYG00000003999) ENSPNYG00000003977 ENSPNYG00000003939 P4HA3 (ENSPNYG00000003914) diabloa (ENSPNYG00000003873) Midas cichlid MODERN SPECIES 437 DHRS11 (ENSACIG00000008677) DHRS11 (ENSACIG00000008694) ENSACIG00000008707 ENSACIG00000008717 ENSACIG00000008727 ENSACIG00000008736 ENSACIG00000008748 DHRS11 (ENSACIG00000008753) ENSACIG00000008773 DHRS11 (ENSACIG00000008780) DHRS11 (ENSACIG00000008798) DHRS11 (ENSACIG00000008821) DHRS11 (ENSACIG00000008837) DHRS11 (ENSACIG00000008858) ENSACIG00000008879 YWHAG (ENSACIG00000008898) ##22 camkk1b (ENSACIG00000008908) ENSACIG00000008940 ENSACIG00000008961 P4HA3 (ENSACIG00000009033) diabloa (ENSACIG00000009097) ENSACIG00000009145 ENSACIG00000009173 Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000000378.d.a.o.b ENSGT00940000177015 ENSGT00940000153818.a.b.a.b ENSGT00390000010789 ENSGT00940000164527.b ENSGT00940000156751 ENSGT00940000158628 ENSGT00940000159297 ENSGT01010000222313.B.a ##29 ENSGT00940000159645 ENSGT00940000165122 ENSGT00940000165341 ENSGT00840000129887.g.a.d ENSGT00940000155690.b.b ENSGT00950000183203.d.c ENSGT01090000260061.c.a.c.a.a.a ##22 ENSGT00940000154890.a.b ENSGT00940000165592.a ENSGT00510000048072 ENSGT00940000158967 ENSGT00940000165734 ENSGT00390000007237.r.d ENSGT00940000163324.c.b ENSGT00940000163324.c.a.b ENSGT00940000163324.c.a.a ENSGT00390000007237.r.c ENSGT00940000156028.s ENSGT00940000170905 ENSGT00390000006189 ENSGT00940000155956.c ENSGT00390000000002.a.b Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000000378.d.a.o.b ENSGT00940000177015 ENSGT00940000153818.a.b.a.b ENSGT00390000010789 ENSGT00940000164527.b ENSGT00940000156751 ENSGT00940000158628 ENSGT00940000159297 ENSGT01010000222313.B.a ##29 ENSGT00940000159645 ENSGT00940000165122 ENSGT00940000165341 ENSGT00840000129887.g.a.d.d ENSGT00940000155690.b.b ENSGT00950000183203.d.c ENSGT01090000260061.c.a.c.a.a.a ##22 ENSGT00940000154890.a.b ENSGT00940000165592.a ENSGT00510000048072 ENSGT00940000158967 ENSGT00940000165734 ENSGT00390000007237.r.d ENSGT00940000163324.c.b ENSGT00940000163324.c.a.b ENSGT00940000163324.c.a.a ENSGT00390000007237.r.c ENSGT00940000156028.s ENSGT00940000170905 ENSGT00390000006189 ENSGT00940000155956.c ENSGT00390000000002.a.b Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000155585.a ENSGT00390000000378.d.a.o.b ENSGT00940000177015 ENSGT00940000153818.a.b.a.b ENSGT00390000010789 ENSGT00940000164527.b ENSGT00940000156751 ENSGT00940000158628 ENSGT00940000159297 ENSGT01010000222313.B.a ##29 ENSGT00940000159645 ENSGT00940000165122 ENSGT00940000165341 ENSGT00840000129887.g.a.c.a.b.b ENSGT00840000129887.g.a.d.c ENSGT01090000260061.c.a.c.a.a.a ##22 ENSGT00940000154890.a.b ENSGT00940000165592.a ENSGT00510000048072 ENSGT00940000158967 ENSGT00940000165734 ENSGT00390000007237.r.d ENSGT00940000163324.c.b ENSGT00940000163324.c.a.b ENSGT00940000163324.c.a.a ENSGT00390000007237.r.c ENSGT00940000156028.s ENSGT00980000203200 ENSGT00390000006189 ENSGT00940000155956.c ENSGT00390000000002.a.b Mangrove rivulus MODERN SPECIES 36 ENSKMAG00000010274 ENSKMAG00000010247 ENSKMAG00000010225 YWHAG (ENSKMAG00000010210) ##22 camkk1b (ENSKMAG00000010136) ENSKMAG00000009643 ENSKMAG00000009473 P4HA3 (ENSKMAG00000009428) or95a1 (ENSKMAG00000009411) diabloa (ENSKMAG00000009404) ENSKMAG00000009375 ENSKMAG00000009355 ENSKMAG00000009332 ENSKMAG00000009307 diabloa (ENSKMAG00000009294) ENSKMAG00000009279 ENSKMAG00000009257 ENSKMAG00000009229 ilk (ENSKMAG00000009211) Turquoise killifish MODERN SPECIES 1615 DYNLL2A (ENSNFUG00015003555) ENSNFUG00015003561 HNF1BA (ENSNFUG00015003573) SYNRG (ENSNFUG00015003634) ENSNFUG00015000114 DUSP14 (ENSNFUG00015000117) tada2a (ENSNFUG00015000160) TRAF4A (ENSNFUG00015000222) nek8 (ENSNFUG00015000315) TLCD1 (ENSNFUG00015000416) ##29 RAB34A (ENSNFUG00015000437) zgc:174895 (ENSNFUG00015000462) PROCA1 (ENSNFUG00015000465) OLA.5237 (ENSNFUG00015000477) ENSNFUG00015000496 YWHAG1 (ENSNFUG00015000500) ##22 camkk1b (ENSNFUG00015000505) ENSNFUG00015000531 ENSNFUG00015000536 P4HA3 (ENSNFUG00015000581) ENSNFUG00015000593 diabloa (ENSNFUG00015000596) ENSNFUG00015000598 ENSNFUG00015000601 ENSNFUG00015000607 ENSNFUG00015000611 DIABLO (ENSNFUG00015000613) ENSNFUG00015000619 CR954145.1 (ENSNFUG00015000621) RRP8 (ENSNFUG00015000624) ILK (ENSNFUG00015000630) Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000177015 ENSGT00940000153818.a.b.a.b ENSGT00390000010789 ENSGT00940000164527.b ENSGT00940000156751 ENSGT00940000158628 ENSGT00940000159297 ENSGT01010000222313.B.a ##29 ENSGT00940000159645 ENSGT00940000165122 ENSGT00940000165341 ENSGT00840000129887.g.a.d.c ENSGT00840000129887.g.a.d.d 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(ENSLBEG00000025712) diabloa (ENSLBEG00000025686) or91a1 (ENSLBEG00000025663) diabloa (ENSLBEG00000025643) ENSLBEG00000025625 Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000000378.d.a.o.b ENSGT00940000177015 ENSGT00940000153818.a.b.a.b ENSGT00390000010789 ENSGT00940000164527.b ENSGT00940000156751 ENSGT00940000158628 ENSGT00940000159297 ENSGT01010000222313.B.a ##29 ENSGT00940000159645 ENSGT00940000165122 ENSGT00940000165341 ENSGT00840000129887.g.a ENSGT00940000155690.b.b ENSGT00950000183203.d.c ENSGT01090000260061.c.a.c.a.a.a ##22 ENSGT00940000154890.a.b ENSGT00940000165592.a ENSGT00730000113647 ENSGT00510000048072 ENSGT00940000158967 ENSGT00940000165734 ENSGT00940000163324.c.b ENSGT00390000007237.r.d ENSGT00940000163324.c.a.b ENSGT00390000007237.r.c ENSGT00940000156028.s ENSGT00940000170905 ENSGT00390000006189 ENSGT00940000155956.c ENSGT00390000000002.a.b Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000177015 ENSGT00390000000378.d.a.o.b ENSGT00940000153818.a.b.a.b ENSGT00390000010789 ENSGT00940000164527.b ENSGT00940000156751 ENSGT00940000158628 ENSGT00940000159297 ENSGT01010000222313.B.a ##29 ENSGT00940000159645 ENSGT00940000165122 ENSGT00940000165341 ENSGT00840000129887.g.a ENSGT00940000155690.b.b ENSGT00950000183203.d.c ENSGT01090000260061.c.a.c.a.a.a ##22 ENSGT00940000154890.a.b ENSGT00940000165592.a ENSGT00510000048072 ENSGT00940000158967 ENSGT00940000165734 ENSGT00390000007237.r.d ENSGT00940000163324.c.b ENSGT00940000163324.c.a.b ENSGT00390000007237.r.c ENSGT00940000156028.s ENSGT00980000203200 ENSGT00390000006189 ENSGT00940000155956.c ENSGT00390000000002.a.b ENSGT00940000154477.jc.a Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000177015 ENSGT00390000000378.d.a.o.b ENSGT00940000153818.a.b.a.b ENSGT00390000010789 ENSGT00940000164527.b ENSGT00940000156751 ENSGT00940000158628 ENSGT00940000159297 ENSGT01010000222313.B.a ##29 ENSGT00940000159645 ENSGT00940000165122 ENSGT00940000165341 ENSGT00840000129887.g.a ENSGT00940000155690.b.b 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ENSDLAG00005030514 ENSDLAG00005034552 ENSDLAG00005004169 ENSDLAG00005005388 ENSDLAG00005032999 ENSDLAG00005028380 ENSDLAG00005026649 Large yellow croaker MODERN SPECIES 479 ENSLCRG00005015392 psmd8 (ENSLCRG00005015390) nup88 (ENSLCRG00005015388) EHD2 (ENSLCRG00005015386) BICRA (ENSLCRG00005015382) napab (ENSLCRG00005015286) napab (ENSLCRG00005015225) ENSLCRG00005015224 bckdha (ENSLCRG00005015220) rab34a (ENSLCRG00005015211) zgc:174895 (ENSLCRG00005015207) ENSLCRG00005015206 dhrs11b.1 (ENSLCRG00005015205) ca4b (ENSLCRG00005015204) ENSLCRG00005015203 YWHAG (ENSLCRG00005015201) ##22 camkk1b (ENSLCRG00005014877) ENSLCRG00005014869 C2CD3 (ENSLCRG00005014867) P4HA3 (ENSLCRG00005014584) ENSLCRG00005014583 diabloa (ENSLCRG00005014582) ENSLCRG00005014580 ENSLCRG00005014579 ENSLCRG00005014578 ENSLCRG00005014577 ENSLCRG00005014576 ENSLCRG00005014575 ENSLCRG00005014573 ENSLCRG00005014572 ENSLCRG00005014570 Gilthead seabream MODERN SPECIES 11 srsf1a (ENSSAUG00010000759) ENSSAUG00010000756 dynll2a (ENSSAUG00010000753) hnf1ba (ENSSAUG00010000745) SYNRG (ENSSAUG00010000463) dusp14 (ENSSAUG00010000348) tada2a (ENSSAUG00010000317) traf4a (ENSSAUG00010000284) nek8 (ENSSAUG00010000213) tlcd1 (ENSSAUG00010000155) ##29 rab34a (ENSSAUG00010000135) zgc:174895 (ENSSAUG00010000130) ENSSAUG00010000127 dhrs11b.1 (ENSSAUG00010000119) ca4b (ENSSAUG00010000117) YWHAG (ENSSAUG00010000111) ##22 camkk1b (ENSSAUG00010025681) ENSSAUG00010025675 ENSSAUG00010025671 P4HA3 (ENSSAUG00010025642) or95a1 (ENSSAUG00010025639) diabloa (ENSSAUG00010025638) ENSSAUG00010025637 ENSSAUG00010025636 ENSSAUG00010025635 ENSSAUG00010025634 ENSSAUG00010025633 ENSSAUG00010025632 ENSSAUG00010025631 ENSSAUG00010025630 ENSSAUG00010025629 Perciformes ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000000378.d.a.o.b ENSGT00940000177015 ENSGT00940000153818.a.b.a.b ENSGT00390000010789 ENSGT00940000164527.b ENSGT00940000156751 ENSGT00940000158628 ENSGT00940000159297 ENSGT01010000222313.B.a ##29 ENSGT00940000159645 ENSGT00940000165122 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robo2 (ENSCLMG00005006051) Stickleback MODERN SPECIES glod4 (ENSGACG00000010984) #28 BLTP2 (ENSGACG00000011002) aldoca (ENSGACG00000011018) ENSGACG00000011094 dynll2a (ENSGACG00000011096) hnf1ba (ENSGACG00000011101) SYNRG (ENSGACG00000011112) tada2a (ENSGACG00000011119) traf4a (ENSGACG00000011157) nek8 (ENSGACG00000011167) tlcd1 (ENSGACG00000011181) ##29 rab34a (ENSGACG00000011190) ENSGACG00000011223 ca4b (ENSGACG00000011230) ENSGACG00000011249 YWHAG (ENSGACG00000011251) ##22 camkk1b (ENSGACG00000011259) ENSGACG00000011266 ENSGACG00000011279 C2CD3 (ENSGACG00000011281) P4HA3 (ENSGACG00000011291) or95a1 (ENSGACG00000011312) diabloa (ENSGACG00000011316) ENSGACG00000011318 ENSGACG00000011320 ENSGACG00000011322 ENSGACG00000011325 ENSGACG00000011326 diabloa (ENSGACG00000011330) ENSGACG00000011337 ENSGACG00000011342 Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000155585.a ENSGT00390000000378.d.a.o.b ENSGT00940000177015 ENSGT00940000153818.a.b.a.b ENSGT00390000010789 ENSGT00940000164527.b 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ENSGT00940000181974 ENSGT00390000007237.r ENSGT00940000156028.s ENSGT00940000167693 ENSGT00390000006189 Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 351 ENSGT00390000000378.d.a.o.b.e.b ENSGT00940000153818.a.b.a.b.j ENSGT00390000010789.d ENSGT00940000164527.b ENSGT00940000156751.n ENSGT00940000158628.l ENSGT00940000159297.a ENSGT01010000222313.B.a.k ##29 ENSGT00940000159645.c.b ENSGT00940000165122.a.b ENSGT00940000165341.b ENSGT00510000047446.n.b ENSGT00840000129887.g.a.a.b ENSGT00940000155690.b.b.e ENSGT00950000183203.d.c ENSGT01090000260061.c.a.c.a.a.a.g ##22 ENSGT00940000154890.a.b.d ENSGT00940000165592.a.a ENSGT00510000048072 ENSGT00940000158967.r ENSGT00940000165734.o ENSGT00940000163324.h ENSGT00940000181974 ENSGT00390000007237.r.f Huchen MODERN SPECIES 763 ENSHHUG00000018969 hnf1ba (ENSHHUG00000018938) ENSHHUG00000018774 dusp14 (ENSHHUG00000018769) tada2a (ENSHHUG00000018733) traf4a (ENSHHUG00000018707) nek8 (ENSHHUG00000018628) tlcd1 (ENSHHUG00000018625) ##29 rab34a 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ENSGT00510000047446.n.b ENSGT00840000129887.g.a.a.b ENSGT00940000155690.b.b.e ENSGT01090000260061.c.a.c.a.a.a.g ##22 ENSGT00940000154890.a.b.d ENSGT00940000165592.a.a ENSGT00510000048072 ENSGT00940000158967.r ENSGT00940000165734.o ENSGT00940000163324.h ENSGT00940000181974.a ENSGT00390000007237.r.f ENSGT00940000156028.s.g ENSGT00940000167693 ENSGT00390000006189.f ENSGT00940000158902.e ENSGT01020000230351.E.c.g ENSGT00530000063811.A.a.b.d ENSGT00560000077232.B.g.a.e.a Coho salmon MODERN SPECIES 6 ENSOKIG00005043156 SYNRG (ENSOKIG00005043039) dusp14 (ENSOKIG00005043006) ENSOKIG00005042979 tada2a (ENSOKIG00005042558) traf4a (ENSOKIG00005042391) nek8 (ENSOKIG00005042310) TLCD1 (ENSOKIG00005042266) ##29 rab34a (ENSOKIG00005042111) ENSOKIG00005042049 ENSOKIG00005042032 ENSOKIG00005042025 SUPT6H (ENSOKIG00005040793) dhrs11b.1 (ENSOKIG00005040633) ca4b (ENSOKIG00005040613) YWHAG (ENSOKIG00005040588) ##22 camkk1b (ENSOKIG00005040067) ENSOKIG00005039984 ENSOKIG00005039937 P4HA3 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DHX40 (ENSOTSG00005010088) ENSOTSG00005010085 FAM222B (ENSOTSG00005010084) Salmo ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT01000000216432.a ENSGT00390000000378.d.a.o.b.e.b ENSGT00940000153818.a.b.a.b.j ENSGT00390000010789.d ENSGT00940000164527.b.f ENSGT00940000156751.n ENSGT00940000158628.l ENSGT00940000159297.a ENSGT01010000222313.B.a.k ##29 ENSGT00940000159645.c.b ENSGT00940000165122.a.b ENSGT00940000165341.b ENSGT00510000047446.n.b ENSGT00840000129887.g.a.b ENSGT00940000155690.b.b.e ENSGT01090000260061.c.a.c.a.a.a.g ##22 ENSGT00990000212790 ENSGT00940000154890.a.b.d ENSGT00940000165592.a.a ENSGT00510000048072 ENSGT00940000158967.r ENSGT00940000165734.o ENSGT00940000163324.h ENSGT00940000181974 ENSGT00390000007237.r.f ENSGT00940000156028.s.g ENSGT00940000167693 ENSGT00390000006189.f ENSGT00940000158902 ENSGT00530000063811.A.a.b.d ENSGT00560000077232.B.g.a.e.a Atlantic salmon MODERN SPECIES 12 ENSSSAG00000046567 dynll2a (ENSSSAG00000046544) hnf1ba (ENSSSAG00000046470) ENSSSAG00000046269 dusp14 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ENSHHUG00000050055 SUPT6H (ENSHHUG00000049971) ENSHHUG00000049954 ca4b (ENSHHUG00000049929) YWHAG (ENSHHUG00000049917) ##22 camkk1b (ENSHHUG00000049902) Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT01000000216432.b ENSGT00940000153818.a.b.a.b.i ENSGT00390000010789.c ENSGT00940000164527.b.e ENSGT00940000156751.m ENSGT00940000158628.k ENSGT00940000159297.b ENSGT01010000222313.B.a.l ##29 ENSGT00940000159645.c.a ENSGT00940000165122.b ENSGT00940000165122.a.a ENSGT00940000165341.a ENSGT00510000047446.n.a ENSGT00840000129887.g.a.a.a ENSGT00940000155690.b.b.f ENSGT01090000260061.c.a.c.a.a.a.h ##22 ENSGT00940000154890.a.b.c ENSGT01000000215988.b ENSGT00950000183012.B.a.h ENSGT00940000165592.a.b ENSGT00940000163324.g.a ENSGT00390000007237.r.e ENSGT00940000156028.s.h ENSGT00390000006189.e ENSGT00940000161532.b ENSGT01020000230351.E.c.h ENSGT00530000063811.A.a.b.c ENSGT00560000077232.B.g.a.e.b ENSGT00940000156014.d ENSGT00940000159212.a.d ENSGT00510000047059.f Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00390000000378.d.a.o.b.e.a ENSGT01000000216432.b ENSGT00940000153818.a.b.a.b.i ENSGT00390000010789.c ENSGT00940000164527.b.e ENSGT00940000156751.m ENSGT00940000158628.k ENSGT00940000168454 ENSGT01010000222313.B.a.l ##29 ENSGT00940000159645.c.a ENSGT00940000165122.b ENSGT00940000165341.a ENSGT00510000047446.n.a ENSGT00840000129887.g.a.a.a ENSGT00940000155690.b.b.f ENSGT01090000260061.c.a.c.a.a.a.h ##22 ENSGT00940000154890.a.b.c ENSGT01000000215988.b ENSGT00950000183012.B.a.h ENSGT00940000165592.a.b ENSGT00940000158967.q ENSGT00940000163324.g.b ENSGT00940000165734.p ENSGT00940000163324.g.a.b ENSGT00390000007237.r.e ENSGT00940000156028.s.h ENSGT00390000006189.e ENSGT00940000161532.b ENSGT01020000230351.E.c.h ENSGT00530000063811.A.a.b.c ENSGT00560000077232.B.g.a.e.b Rainbow trout MODERN SPECIES 16 dynll2a (ENSOMYG00000016273) ENSOMYG00000016257 hnf1ba (ENSOMYG00000016172) ENSOMYG00000016070 dusp14 (ENSOMYG00000016031) tada2a (ENSOMYG00000015392) traf4a (ENSOMYG00000015225) ENSOMYG00000057123 ENSOMYG00000075267 TLCD1 (ENSOMYG00000015202) ##29 RAB34 (ENSOMYG00000015063) ENSOMYG00000015029 ENSOMYG00000015009 SUPT6H (ENSOMYG00000014654) ca4 (ENSOMYG00000014583) ENSOMYG00000014557 ##22 ENSOMYG00000049664 ENSOMYG00000014511 ENSOMYG00000014494 ENSOMYG00000073085 ENSOMYG00000014445 ENSOMYG00000014430 or95a1 (ENSOMYG00000014425) ENSOMYG00000064353 ENSOMYG00000069294 ENSOMYG00000049470 ENSOMYG00000014412 diabloa (ENSOMYG00000014397) ENSOMYG00000040687 ENSOMYG00000014389 ENSOMYG00000014376 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00940000155585.a.d ENSGT00390000000378.d.a.o.b.e.a ENSGT01000000216432.b ENSGT00940000153818.a.b.a.b.i ENSGT00390000010789.c ENSGT00940000164527.b.e ENSGT00940000156751.m ENSGT00940000158628.k ENSGT01010000222313.B.a.l ##29 ENSGT00940000159645.c.a ENSGT00940000165122.b ENSGT00940000165341.a ENSGT00510000047446.n.a ENSGT00840000129887.g.a.a.a ENSGT00940000155690.b.b.f ENSGT01090000260061.c.a.c.a.a.a.h ##22 ENSGT00940000154890.a.b.c ENSGT01000000215988.b ENSGT00950000183012.B.a.h ENSGT00940000165592.a.b ENSGT00940000158967.q ENSGT00940000163324.g.b ENSGT00940000165734.p ENSGT00940000163324.g.a.b ENSGT00390000007237.r.e ENSGT00940000156028.s.h ENSGT00390000006189.e ENSGT00940000161532.b ENSGT01020000230351.E.c.h ENSGT00530000063811.A.a.b.c ENSGT00560000077232.B.g.a.e.b Coho salmon MODERN SPECIES 9 srsf1a (ENSOKIG00005025452) ENSOKIG00005025470 dynll2a (ENSOKIG00005025486) hnf1ba (ENSOKIG00005025503) SYNRG (ENSOKIG00005025548) dusp14 (ENSOKIG00005025654) tada2a (ENSOKIG00005025705) traf4a (ENSOKIG00005026197) tlcd1 (ENSOKIG00005026210) ##29 rab34a (ENSOKIG00005026222) ENSOKIG00005026442 ENSOKIG00005026480 SUPT6H (ENSOKIG00005026519) ENSOKIG00005027243 ENSOKIG00005027311 YWHAG (ENSOKIG00005027365) ##22 CAMKK1 (ENSOKIG00005027392) ENSOKIG00005027640 P4HA3 (ENSOKIG00005027657) ENSOKIG00005027697 or95a1 (ENSOKIG00005027721) ENSOKIG00005027728 ENSOKIG00005027760 diabloa (ENSOKIG00005027777) ENSOKIG00005004282 ENSOKIG00005004313 ENSOKIG00005004380 P2RX5 (ENSOKIG00005004448) FAM222B (ENSOKIG00005004476) flot2b (ENSOKIG00005004545) GALNT17 (ENSOKIG00005004693) Chinook salmon MODERN SPECIES 5 srsf1a (ENSOTSG00005002433) dynll2a (ENSOTSG00005002430) ENSOTSG00005002424 hnf1ba (ENSOTSG00005002391) SYNRG (ENSOTSG00005002314) dusp14 (ENSOTSG00005002287) tada2a (ENSOTSG00005002068) traf4a (ENSOTSG00005009409) tlcd1 (ENSOTSG00005009408) ##29 rab34a (ENSOTSG00005009314) zgc:174895 (ENSOTSG00005009313) ENSOTSG00005009312 SUPT6H (ENSOTSG00005009309) ENSOTSG00005009308 ca4b (ENSOTSG00005009307) YWHAG (ENSOTSG00005009305) ##22 camkk1b (ENSOTSG00005008367) ENSOTSG00005008353 ENSOTSG00005008351 P4HA3 (ENSOTSG00005008343) ENSOTSG00005008339 ENSOTSG00005008336 diabloa (ENSOTSG00005008335) ENSOTSG00005008334 ENSOTSG00005008330 ENSOTSG00005008329 P2RX5 (ENSOTSG00005008270) FAM222B (ENSOTSG00005008269) flot2b (ENSOTSG00005008263) ENSOTSG00005008254 CALN1 (ENSOTSG00005008251) Salmo ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT01000000216432.b ENSGT00940000153818.a.b.a.b.i ENSGT00390000010789.c ENSGT00940000164527.b.e ENSGT00940000156751.m ENSGT00940000158628.k ENSGT00940000159297.b ENSGT01010000222313.B.a.l ##29 ENSGT00940000159645.d ENSGT00940000159645.c.a ENSGT00940000165122.a.a ENSGT00940000165341.a ENSGT00510000047446.n.a ENSGT00940000177105 ENSGT00940000155690.b.b.f ENSGT01090000260061.c.a.c.a.a.a.h ##22 ENSGT00940000154890.a.b.c ENSGT00950000183012.B.a.h ENSGT00940000165592.a.b ENSGT00940000163324.g.a ENSGT00390000007237.r.e ENSGT00940000170905 ENSGT00940000156028.s.h ENSGT00390000006189.e ENSGT00940000161532.b ENSGT01020000230351.E.c.h ENSGT00530000063811.A.a.b.c ENSGT00560000077232.B.g.a.e.b ENSGT00940000156014.d ENSGT00940000159212.a.d ENSGT00510000047059.f Atlantic salmon MODERN SPECIES 28 hnf1ba (ENSSSAG00000046551) dusp14 (ENSSSAG00000085214) ENSSSAG00000086703 tada2a (ENSSSAG00000045649) traf4 (ENSSSAG00000045610) nek8 (ENSSSAG00000045418) ENSSSAG00000089256 ENSSSAG00000120435 rab34a (ENSSSAG00000110634) zgc:174895 (ENSSSAG00000107605) ENSSSAG00000085755 SUPT6H (ENSSSAG00000040017) ENSSSAG00000039857 ENSSSAG00000039794 ENSSSAG00000094385 ENSSSAG00000113891 ##22 ENSSSAG00000038798 ENSSSAG00000109715 ##29 ENSSSAG00000038676 ENSSSAG00000038359 ENSSSAG00000037934 diabloa (ENSSSAG00000090224) ENSSSAG00000076371 ENSSSAG00000076364 ENSSSAG00000076358 itgae (ENSSSAG00000076346) ENSSSAG00000076337 ENSSSAG00000076335 ENSSSAG00000104063 ENSSSAG00000076084 GALNT17 (ENSSSAG00000076042) River trout MODERN SPECIES 4 dynll2a (ENSSTUG00000035979) ENSSTUG00000035973 hnf1ba (ENSSTUG00000035911) ENSSTUG00000035647 dusp14 (ENSSTUG00000035634) tada2a (ENSSTUG00000035431) traf4a (ENSSTUG00000035352) nek8 (ENSSTUG00000035295) tlcd1 (ENSSTUG00000035284) ##29 rab34a (ENSSTUG00000035216) zgc:174895 (ENSSTUG00000035196) ENSSTUG00000035185 SUPT6H (ENSSTUG00000033839) ENSSTUG00000033741 ca4b (ENSSTUG00000033688) YWHAG (ENSSTUG00000033678) ##22 camkk1b (ENSSTUG00000033635) ENSSTUG00000033631 ENSSTUG00000033622 ENSSTUG00000033591 diabloa (ENSSTUG00000033584) ENSSTUG00000033581 ENSSTUG00000050321 ENSSTUG00000050309 ENSSTUG00000050303 ENSSTUG00000050296 p2rx8 (ENSSTUG00000050293) FAM222B (ENSSTUG00000050291) flot2b (ENSSTUG00000050249) GALNT17 (ENSSTUG00000050238) CALN1 (ENSSTUG00000050233) Northern pike MODERN SPECIES dynll2a (ENSELUG00000021655) ENSELUG00000021664 ENSELUG00000031919 hnf1ba (ENSELUG00000021708) SYNRG (ENSELUG00000021831) dusp14 (ENSELUG00000021870) tada2a (ENSELUG00000022045) traf4a (ENSELUG00000022083) nek8 (ENSELUG00000022112) TLCD1 (ENSELUG00000022119) ##29 rab34a (ENSELUG00000022157) zgc:174895 (ENSELUG00000022182) ENSELUG00000022194 SUPT6H (ENSELUG00000022246) dhrs11b.2 (ENSELUG00000022275) YWHAG (ENSELUG00000022319) ##22 camkk1b (ENSELUG00000022378) ENSELUG00000022398 ENSELUG00000022420 ENSELUG00000000958 P4HA3 (ENSELUG00000022448) ENSELUG00000031616 ENSELUG00000025866 ENSELUG00000022487 ENSELUG00000022559 ENSELUG00000022608 or95a1 (ENSELUG00000022619) ENSELUG00000032697 diabloa (ENSELUG00000022684) ENSELUG00000022698 MECOM (ENSELUG00000022762) Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000010789 ENSGT00940000164527.b ENSGT00940000156751 ENSGT00940000158628 ENSGT00940000168454 ENSGT00960000189469 ENSGT00940000159297 ENSGT01010000222313.B.a ##29 ENSGT00950000182901 ENSGT00940000159645 ENSGT00940000165122 ENSGT00940000165341 ENSGT00840000129887.g.a ENSGT00940000155690.b.b ENSGT00950000183203.d.c ENSGT01090000260061.c.a.c.a.a.a ##22 ENSGT00940000154890.a.b ENSGT00940000165592.a ENSGT00510000048072 ENSGT00940000158967 ENSGT00940000165734 ENSGT00940000163324 ENSGT00390000007237.r ENSGT00940000156028.s ENSGT00940000170905 ENSGT00390000006189 ENSGT00940000155956.c ENSGT00390000000002.a.b ENSGT00940000154477.jc.a ENSGT00940000156324.f.a ENSGT00940000154477.kc Otophysi ANCESTRAL SPECIES 53 ENSGT00940000164527.b ENSGT00940000156751 ENSGT00940000158628 ENSGT00940000168454 ENSGT00960000189469 ENSGT00940000159297 ENSGT01010000222313.B.a ##29 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ENSGT00390000009552 ENSGT00390000013520 ENSGT00940000157382 ENSGT00390000010822 ENSGT00940000167280 ENSGT00940000157044 ENSGT00390000001752 ENSGT00940000155690.b.a ENSGT00940000158976 ENSGT00530000063474.B.e.b ENSGT00940000154006.b ENSGT00510000048674 ENSGT00390000018559 ENSGT00950000183203.d.d ENSGT00950000183145.D.i ENSGT01090000260061.c.a.c.a.a.b ##22 ENSGT00940000155882.a.a ENSGT00960000186914 ENSGT00940000162625 ENSGT00940000159210 ENSGT00390000018406 ENSGT00940000156747 ENSGT01020000230351.C ENSGT00940000154890.a.a ENSGT00940000174983 ENSGT00940000155668.j ENSGT01060000250877 ENSGT00940000155045 ENSGT00940000160156 ENSGT00940000156179 ENSGT00940000176156 Oryzias ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00950000183145.D.i ENSGT01090000260061.c.a.c.a.a.b ##22 ENSGT00940000155882.a.a ENSGT00940000162625 ENSGT00940000159210 ENSGT00390000018406 ENSGT00940000156747 ENSGT01100000263514.A.f.w.b ENSGT00950000183089.c.a.k.b.b.j ENSGT01020000230351.C ENSGT00940000154890.a.a ENSGT00940000174983 ENSGT00940000155668.j ENSGT01060000250877 ENSGT00940000155045 ENSGT00940000160156 ENSGT00940000156179 Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES 160 ENSGT00950000183145.D.i ENSGT01090000260061.c.a.c.a.a.b ##22 ENSGT00940000155882.a.a Javanese ricefish MODERN SPECIES 5 dgat2 (ENSOJAG00000010779) ENSOJAG00000010765 uvrag (ENSOJAG00000010249) wnt11 (ENSOJAG00000010187) ENSOJAG00000010176 PWWP2A (ENSOJAG00000009835) ENSOJAG00000009750 zgc:110540 (ENSOJAG00000009727) ENSOJAG00000009652 ENSOJAG00000009597 ENSOJAG00000009589 ints2 (ENSOJAG00000007280) ENSOJAG00000007156 ENSOJAG00000007132 ENSOJAG00000007119 YWHAG (ENSOJAG00000007090) ##22 ENSOJAG00000007021 ENSOJAG00000006907 hspb1 (ENSOJAG00000006902) ENSOJAG00000006886 ENSOJAG00000006871 ENSOJAG00000006864 pfdn1 (ENSOJAG00000006851) ttc1 (ENSOJAG00000006821) ENSOJAG00000006291 CSF1R (ENSOJAG00000006055) ENSOJAG00000006027 ENSOJAG00000006008 ENSOJAG00000005970 ENSOJAG00000016629 camk2a (ENSOJAG00000016486) Indian medaka MODERN SPECIES 4 ube2g1a (ENSOMEG00000009858) ankfy1 (ENSOMEG00000009995) ENSOMEG00000010022 ZZEF1 (ENSOMEG00000010131) ENSOMEG00000010165 ENSOMEG00000010176 ATP2A3 (ENSOMEG00000010194) camkk1a (ENSOMEG00000010256) p2rx1 (ENSOMEG00000010296) ENSOMEG00000010316 ENSOMEG00000010325 ENSOMEG00000010370 ENSOMEG00000010388 dhx33 (ENSOMEG00000010438) ENSOMEG00000010471 YWHAG (ENSOMEG00000010491) ##22 SPECC1 (ENSOMEG00000010532) ENSOMEG00000010552 adora2b (ENSOMEG00000010566) ENSOMEG00000010582 ncor1 (ENSOMEG00000010603) CENPV (ENSOMEG00000010631) pigl (ENSOMEG00000010656) ENSOMEG00000010669 p2rx5 (ENSOMEG00000010703) ruvbl2 (ENSOMEG00000010777) ftr83 (ENSOMEG00000010804) ftr82 (ENSOMEG00000000262) atp5l (ENSOMEG00000010869) nherf4b (ENSOMEG00000010884) cltca (ENSOMEG00000011028) Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000009724.c ENSGT00940000166102 ENSGT00940000162978.a.a.b ENSGT00940000153556.B ENSGT01020000230351.E.d ENSGT00940000163900 ENSGT00940000157820.a.a ENSGT00940000162439 ENSGT00390000003183 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ENSOSIG00000022004 ENSOSIG00000021997 c1qbp (ENSOSIG00000021992) dhx33 (ENSOSIG00000021988) ENSOSIG00000021976 ENSOSIG00000021975 ENSOSIG00000021972 ENSOSIG00000021969 p2rx1 (ENSOSIG00000021966) camkk1a (ENSOSIG00000021963) ENSOSIG00000021956 ATP2A3 (ENSOSIG00000020170) ZZEF1 (ENSOSIG00000019949) cyb5d2 (ENSOSIG00000019925) Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000009552 ENSGT00390000013520 ENSGT00940000157382 ENSGT00390000010822 ENSGT00940000167280 ENSGT00940000157044 ENSGT00390000001752 ENSGT00940000155690.b.a ENSGT00940000158976 ENSGT00530000063474.B.e.b ENSGT00940000154006.b ENSGT00510000048674 ENSGT00390000018559 ENSGT00950000183203.d.d ENSGT00950000183145.D.i ENSGT01090000260061.c.a.c.a.a.b ##22 ENSGT00940000155882.a.a ENSGT00960000186914 ENSGT00940000162625 ENSGT00940000159210 ENSGT00390000018406 ENSGT00940000156747 ENSGT01020000230351.C ENSGT00940000154890.a.a ENSGT00940000155668.j ENSGT00940000155045 ENSGT00940000160156 ENSGT00940000156179 ENSGT00940000176156 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ENSAPEG00000013231 ENSAPEG00000013272 YWHAG (ENSAPEG00000013287) ##22 hspb1 (ENSAPEG00000013295) ENSAPEG00000013307 ENSAPEG00000013328 c1qbp (ENSAPEG00000013414) dhx33 (ENSAPEG00000013599) p2rx1 (ENSAPEG00000013679) camkk1a (ENSAPEG00000013729) ENSAPEG00000013838 ATP2A3 (ENSAPEG00000013892) ZZEF1 (ENSAPEG00000013980) cyb5d2 (ENSAPEG00000014167) ankfy1 (ENSAPEG00000014177) ube2g1a (ENSAPEG00000014285) spns3 (ENSAPEG00000014311) SPNS2 (ENSAPEG00000014337) Spiny chromis MODERN SPECIES 672 ENSAPOG00000009921 YWHAG (ENSAPOG00000009936) ##22 hspb1 (ENSAPOG00000009968) SRRM3 (ENSAPOG00000000288) ENSAPOG00000010036 c1qbp (ENSAPOG00000010074) dhx33 (ENSAPOG00000010132) p2rx1 (ENSAPOG00000010175) camkk1a (ENSAPOG00000010216) ENSAPOG00000010368 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000009552 ENSGT00390000013520 ENSGT00940000157382 ENSGT00390000010822 ENSGT00940000167280 ENSGT00940000157044 ENSGT00390000001752 ENSGT00940000155690.b.a ENSGT00940000158976 ENSGT00530000063474.B.e.b 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ENSGT00940000154890.a.a ENSGT00940000155668.j ENSGT00940000155045 ENSGT00940000160156 ENSGT00940000156179 ENSGT00940000176156 ENSGT00940000155228 ENSGT00390000005976.a.a.a Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00840000129887.g.b ENSGT00390000013520 ENSGT00940000157382 ENSGT00390000010822 ENSGT00940000167280 ENSGT00940000157044 ENSGT00390000001752 ENSGT00940000155690.b.a ENSGT00940000158976 ENSGT00530000063474.B.e.b ENSGT00940000154006.b ENSGT00940000163549.i.a ENSGT00390000018559 ENSGT00950000183203.d.d ENSGT00950000183145.D.i ENSGT01090000260061.c.a.c.a.a.b ##22 ENSGT00940000155882.a.a ENSGT00960000186914 ENSGT00940000162625 ENSGT00940000159210 ENSGT00390000018406 ENSGT00940000156747 ENSGT01020000230351.C ENSGT00940000154890.a.a ENSGT00940000155668.j ENSGT00940000155045 ENSGT00940000160156 ENSGT00940000153592.B.a ENSGT01030000234555.a.a.a.c.a ENSGT00390000017523 ENSGT00940000155093.b Tetraodon MODERN SPECIES 22 ankfy1 (ENSTNIG00000008565) dhrs11a (ENSTNIG00000008564) pigw (ENSTNIG00000008563) MYO19 (ENSTNIG00000008562) znhit3 (ENSTNIG00000008561) vkorc1l1 (ENSTNIG00000008560) GUSB (ENSTNIG00000008559) ca4a (ENSTNIG00000008558) MTMR4 (ENSTNIG00000008557) hpda (ENSTNIG00000008556) ENSTNIG00000008555 ENSTNIG00000008554 supt4h1 (ENSTNIG00000008553) ENSTNIG00000008552 ENSTNIG00000008551 YWHAG (ENSTNIG00000000725) ##22 hspb1 (ENSTNIG00000008550) SRRM3 (ENSTNIG00000008549) ENSTNIG00000008548 c1qbp (ENSTNIG00000008547) dhx33 (ENSTNIG00000008546) p2rx1 (ENSTNIG00000008545) camkk1a (ENSTNIG00000008544) ATP2A3 (ENSTNIG00000008543) ZZEF1 (ENSTNIG00000008542) cyb5d2 (ENSTNIG00000008541) SPECC1 (ENSTNIG00000008540) adora2b (ENSTNIG00000008539) zswim7 (ENSTNIG00000008538) ncor1 (ENSTNIG00000008537) ENSTNIG00000008536 Fugu MODERN SPECIES 6 ENSTRUG00000032317 pou4f3 (ENSTRUG00000004433) ENSTRUG00000029521 RBM27 (ENSTRUG00000004518) LARS1 (ENSTRUG00000005358) PLAC8L1 (ENSTRUG00000021575) GRXCR2 (ENSTRUG00000006167) kctd16b (ENSTRUG00000006217) yipf5 (ENSTRUG00000006257) ENSTRUG00000028194 ARHGAP26 (ENSTRUG00000006517) ENSTRUG00000032218 supt4h1 (ENSTRUG00000027184) ENSTRUG00000004899 ENSTRUG00000033240 YWHAG (ENSTRUG00000029946) ##22 hspb1 (ENSTRUG00000029481) ENSTRUG00000023773 SRRM3 (ENSTRUG00000026312) ENSTRUG00000029327 ENSTRUG00000019697 c1qbp (ENSTRUG00000032244) dhx33 (ENSTRUG00000003395) p2rx1 (ENSTRUG00000002664) camkk1a (ENSTRUG00000002511) ATP2A3 (ENSTRUG00000002010) ZZEF1 (ENSTRUG00000001469) cyb5d2 (ENSTRUG00000001423) SPECC1 (ENSTRUG00000001159) adora2b (ENSTRUG00000022664) zswim7 (ENSTRUG00000001143) Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00390000009552 ENSGT00390000013520 ENSGT00940000157382 ENSGT00390000010822 ENSGT00940000167280 ENSGT00940000157044 ENSGT00390000001752 ENSGT00940000155690.b.a ENSGT00940000158976 ENSGT00530000063474.B.e.b ENSGT00940000154006.b ENSGT00510000048674 ENSGT00390000018559 ENSGT00950000183203.d.d ENSGT00950000183145.D.i ENSGT01090000260061.c.a.c.a.a.b ##22 ENSGT00940000155882.a.a ENSGT00960000186914 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ENSGT01020000230351.C ENSGT00940000154890.a.a ENSGT00940000155668.j ENSGT00940000155045 ENSGT00940000160156 ENSGT00940000156179 ENSGT00940000155228 ENSGT00390000005976.a.a.a ENSGT00390000005976.a.a.b Perciformes ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00390000013520 ENSGT00940000157382 ENSGT00390000010822 ENSGT00940000167280 ENSGT00940000157044 ENSGT00390000001752 ENSGT00940000155690.b.a ENSGT00940000158976 ENSGT00530000063474.B.e.b ENSGT00940000154006.b ENSGT00510000048674 ENSGT00390000018559 ENSGT00950000183203.d.d ENSGT00950000183145.D.i ENSGT00940000164475 ENSGT01090000260061.c.a.c.a.a.b ##22 ENSGT00940000155882.a.a ENSGT00960000186914 ENSGT00940000162625 ENSGT00940000159210 ENSGT00390000018406 ENSGT00940000156747 ENSGT01020000230351.C ENSGT00940000154890.a.a ENSGT00940000155668.j ENSGT00940000155045 ENSGT00940000160156 ENSGT00940000156179 ENSGT00940000155228 ENSGT00390000005976.a.a.a ENSGT00390000005976.a.a.b Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000013520 ENSGT00940000157382 ENSGT00390000010822 ENSGT00940000167280 ENSGT00940000157044 ENSGT00390000001752 ENSGT00940000155690.b.a ENSGT00940000158976 ENSGT00530000063474.B.e.b ENSGT00940000154006.b ENSGT00510000048674 ENSGT00390000018559 ENSGT00950000183203.d.d ENSGT00950000183145.D.i ENSGT00940000164475 ENSGT01090000260061.c.a.c.a.a.b ##22 ENSGT00940000155882.a.a ENSGT00940000161127 ENSGT00940000159210 ENSGT00390000018406 ENSGT00940000156747 ENSGT01020000230351.C ENSGT00940000154890.a.a ENSGT00940000155668.j ENSGT00940000155045 ENSGT00940000160156 ENSGT00940000156179 ENSGT00940000155228 ENSGT00390000005976.a.a.a ENSGT00390000005976.a.a.b ENSGT00940000153556.B Lumpfish MODERN SPECIES 5 pigw (ENSCLMG00005006819) MYO19 (ENSCLMG00005006826) znhit3 (ENSCLMG00005006895) nupr1a (ENSCLMG00005006896) vkorc1l1 (ENSCLMG00005006897) GUSB (ENSCLMG00005006899) ca4a (ENSCLMG00005006971) MTMR4 (ENSCLMG00005007015) hpda (ENSCLMG00005012571) ENSCLMG00005012575 ENSCLMG00005012577 supt4h1 (ENSCLMG00005012578) TSPOAP1 (ENSCLMG00005012580) ENSCLMG00005012594 ENSCLMG00005012598 YWHAG (ENSCLMG00005012599) ##22 hspb1 (ENSCLMG00005012600) ENSCLMG00005012601 c1qbp (ENSCLMG00005012602) dhx33 (ENSCLMG00005012603) p2rx1 (ENSCLMG00005012604) camkk1a (ENSCLMG00005012605) ATP2A3 (ENSCLMG00005012606) ZZEF1 (ENSCLMG00005014272) cyb5d2 (ENSCLMG00005015627) ankfy1 (ENSCLMG00005015633) ube2g1a (ENSCLMG00005015661) spns3 (ENSCLMG00005015673) SPNS2 (ENSCLMG00005015818) ruvbl2 (ENSCLMG00005015825) ftr83 (ENSCLMG00005016071) Stickleback MODERN SPECIES 7 ENSGACG00000020249 dhrs11a (ENSGACG00000020248) ggnbp2 (ENSGACG00000020247) pigw (ENSGACG00000020246) MYO19 (ENSGACG00000020245) znhit3 (ENSGACG00000020244) nupr1a (ENSGACG00000020243) vkorc1l1 (ENSGACG00000020242) GUSB (ENSGACG00000020241) ca4a (ENSGACG00000020240) MTMR4 (ENSGACG00000020239) hpda (ENSGACG00000020238) supt4h1 (ENSGACG00000020237) ENSGACG00000020236 ENSGACG00000020235 YWHAG (ENSGACG00000020234) ##22 hspb1 (ENSGACG00000020233) ENSGACG00000020232 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ENSGT00940000155228 ENSGT00390000005976.a.a.a ENSGT00390000005976.a.a.b Pike perch MODERN SPECIES 25 MYO19 (ENSSLUG00000006286) znhit3 (ENSSLUG00000006252) nupr1a (ENSSLUG00000006249) vkorc1l1 (ENSSLUG00000006240) ENSSLUG00000006231 ENSSLUG00000006227 GUSB (ENSSLUG00000006165) ca4a (ENSSLUG00000006088) MTMR4 (ENSSLUG00000005776) hpda (ENSSLUG00000005712) ENSSLUG00000005682 ENSSLUG00000005675 supt4h1 (ENSSLUG00000005652) ENSSLUG00000005616 ENSSLUG00000005595 YWHAG (ENSSLUG00000005582) ##22 hspb1 (ENSSLUG00000005571) ENSSLUG00000005561 SRRM3 (ENSSLUG00000005547) ENSSLUG00000005524 c1qbp (ENSSLUG00000005510) dhx33 (ENSSLUG00000005497) p2rx1 (ENSSLUG00000005464) camkk1a (ENSSLUG00000005442) ATP2A3 (ENSSLUG00000003912) ZZEF1 (ENSSLUG00000003643) cyb5d2 (ENSSLUG00000003586) ankfy1 (ENSSLUG00000003223) ube2g1a (ENSSLUG00000003043) spns3 (ENSSLUG00000002607) SPNS2 (ENSSLUG00000002498) Channel bull blenny MODERN SPECIES 5 ggnbp2 (ENSCGOG00000021081) pigw (ENSCGOG00000021079) MYO19 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ENSGT00940000154890.a.a ENSGT00940000155668.j ENSGT00940000155045 ENSGT00940000160156 ENSGT00940000156179 ENSGT00940000155228 ENSGT00390000005976.a.a.a ENSGT00390000005976.a.a.b ENSGT00940000153556.B Large yellow croaker MODERN SPECIES 493 dhrs11a (ENSLCRG00005012254) ggnbp2 (ENSLCRG00005012242) pigw (ENSLCRG00005012237) MYO19 (ENSLCRG00005016615) znhit3 (ENSLCRG00005016611) nupr1a (ENSLCRG00005016610) vkorc1l1 (ENSLCRG00005016608) GUSB (ENSLCRG00005016592) ca4a (ENSLCRG00005016590) MTMR4 (ENSLCRG00005013710) hpda (ENSLCRG00005013542) ENSLCRG00005013537 supt4h1 (ENSLCRG00005013536) ENSLCRG00005013533 ENSLCRG00005013532 YWHAG (ENSLCRG00005013531) ##22 hspb1 (ENSLCRG00005013529) ENSLCRG00005013524 c1qbp (ENSLCRG00005013521) dhx33 (ENSLCRG00005013520) p2rx1 (ENSLCRG00005013516) camkk1a (ENSLCRG00005013515) ATP2A3 (ENSLCRG00005012419) ZZEF1 (ENSLCRG00005012322) cyb5d2 (ENSLCRG00005012316) ankfy1 (ENSLCRG00005012189) ENSLCRG00005012184 ube2g1a (ENSLCRG00005012160) spns3 (ENSLCRG00005012154) SPNS2 (ENSLCRG00005012130) ruvbl2 (ENSLCRG00005011956) European seabass MODERN SPECIES 4 ENSDLAG00005015928 dhrs11a (ENSDLAG00005015822) ggnbp2 (ENSDLAG00005005244) MYO19 (ENSDLAG00005005255) znhit3 (ENSDLAG00005029042) vkorc1l1 (ENSDLAG00005028451) ENSDLAG00005010460 ca4a (ENSDLAG00005033961) hpda (ENSDLAG00005014835) MTMR4 (ENSDLAG00005014914) ENSDLAG00005014809 ENSDLAG00005014800 supt4h1 (ENSDLAG00005034560) ENSDLAG00005014208 ENSDLAG00005014163 YWHAG (ENSDLAG00005026565) ##22 ENSDLAG00005014140 hspb1 (ENSDLAG00005033547) SRRM3 (ENSDLAG00005029670) ENSDLAG00005014002 p2rx1 (ENSDLAG00005013903) camkk1a (ENSDLAG00005013872) ATP2A3 (ENSDLAG00005008964) cyb5d2 (ENSDLAG00005007451) ZZEF1 (ENSDLAG00005007521) ankfy1 (ENSDLAG00005007356) ube2g1a (ENSDLAG00005007318) spns3 (ENSDLAG00005007225) SPNS2 (ENSDLAG00005006555) ruvbl2 (ENSDLAG00005006447) ftr83 (ENSDLAG00005006419) Gilthead seabream MODERN SPECIES 4 pigw (ENSSAUG00010025244) MYO19 (ENSSAUG00010025247) znhit3 (ENSSAUG00010025319) nupr1a (ENSSAUG00010025320) vkorc1l1 (ENSSAUG00010001495) GUSB (ENSSAUG00010001515) GUSB (ENSSAUG00010001569) ca4a (ENSSAUG00010001721) MTMR4 (ENSSAUG00010001783) hpda (ENSSAUG00010002041) ENSSAUG00010002069 ENSSAUG00010002075 supt4h1 (ENSSAUG00010002081) ENSSAUG00010002091 ENSSAUG00010002112 YWHAG (ENSSAUG00010002117) ##22 hspb1 (ENSSAUG00010002121) SRRM3 (ENSSAUG00010002126) ENSSAUG00010002153 c1qbp (ENSSAUG00010002352) dhx33 (ENSSAUG00010002363) p2rx1 (ENSSAUG00010002372) camkk1a (ENSSAUG00010002379) ATP2A3 (ENSSAUG00010002421) ZZEF1 (ENSSAUG00010002682) cyb5d2 (ENSSAUG00010003511) ankfy1 (ENSSAUG00010003524) ube2g1a (ENSSAUG00010003552) spns3 (ENSSAUG00010003638) SPNS2 (ENSSAUG00010004050) ruvbl2 (ENSSAUG00010004060) Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000157382 ENSGT00390000010822 ENSGT00940000167280 ENSGT00940000157044 ENSGT00390000001752 ENSGT00940000155690.b.a ENSGT00940000158976 ENSGT00530000063474.B.e.b ENSGT00940000154006.b ENSGT00510000048674 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ENSGT00940000154890.a.a ENSGT00940000155668.j ENSGT00940000155045 ENSGT00940000160156 ENSGT00940000156179 ENSGT00940000155228 ENSGT00390000005976.a.a.a ENSGT00390000005976.a.a.b Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000009552 ENSGT00390000013520 ENSGT00940000157382 ENSGT00390000010822 ENSGT00940000167280 ENSGT00940000157044 ENSGT00390000001752 ENSGT00940000155690.b.a ENSGT00940000158976 ENSGT00530000063474.B.e.b ENSGT00940000154006.b ENSGT00510000048674 ENSGT00390000018559 ENSGT00950000183203.d.d ENSGT00940000164475 ENSGT01090000260061.c.a.c.a.a.b ##22 ENSGT00940000155882.a.a ENSGT00980000199127 ENSGT00940000162625 ENSGT00940000159210 ENSGT00390000018406 ENSGT00940000156747 ENSGT01020000230351.C ENSGT00940000154890.a.a ENSGT00940000155668.j ENSGT00940000155045 ENSGT00940000160156 ENSGT00940000156179 ENSGT00940000155228 ENSGT00390000005976.a.a.a ENSGT00390000005976.a.a.b Seriola ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000009552 ENSGT00390000013520 ENSGT00940000157382 ENSGT00390000010822 ENSGT00940000167280 ENSGT00940000157044 ENSGT00390000001752 ENSGT00940000155690.b.a ENSGT00940000158976 ENSGT00530000063474.B.e.b ENSGT00940000154006.b ENSGT00510000048674 ENSGT00390000018559 ENSGT00950000183203.d.d ENSGT00940000164475 ENSGT01090000260061.c.a.c.a.a.b ##22 ENSGT00940000155882.a.a ENSGT00940000162625 ENSGT00940000159210 ENSGT00390000018406 ENSGT00940000156747 ENSGT01020000230351.C ENSGT00940000154890.a.a ENSGT00940000155668.j ENSGT00940000155045 ENSGT00940000160156 ENSGT00940000156179 ENSGT00940000155228 ENSGT00390000005976.a.a.a ENSGT00390000005976.a.a.b ENSGT00940000153556.B Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 2973 ggnbp2 (ENSSLDG00000019431) pigw (ENSSLDG00000019468) MYO19 (ENSSLDG00000019480) znhit3 (ENSSLDG00000019511) nupr1a (ENSSLDG00000019522) vkorc1l1 (ENSSLDG00000019538) GUSB (ENSSLDG00000019543) ca4a (ENSSLDG00000019566) MTMR4 (ENSSLDG00000019603) hpda (ENSSLDG00000019737) ENSSLDG00000019787 ENSSLDG00000019806 supt4h1 (ENSSLDG00000019831) ENSSLDG00000019867 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(ENSSDUG00000017798) p2rx1 (ENSSDUG00000017825) camkk1a (ENSSDUG00000017888) ATP2A3 (ENSSDUG00000017936) ZZEF1 (ENSSDUG00000018005) cyb5d2 (ENSSDUG00000018115) ankfy1 (ENSSDUG00000018127) ube2g1a (ENSSDUG00000018171) spns3 (ENSSDUG00000018188) SPNS2 (ENSSDUG00000018219) ruvbl2 (ENSSDUG00000018240) Barramundi perch MODERN SPECIES 94 pigw (ENSLCAG00010018891) MYO19 (ENSLCAG00010018805) znhit3 (ENSLCAG00010018778) nupr1a (ENSLCAG00010018776) vkorc1l1 (ENSLCAG00010018772) GUSB (ENSLCAG00010018683) ca4a (ENSLCAG00010018657) MTMR4 (ENSLCAG00010017953) hpda (ENSLCAG00010017863) ENSLCAG00010017857 ENSLCAG00010017853 supt4h1 (ENSLCAG00010017846) TSPOAP1 (ENSLCAG00010017830) ENSLCAG00010017820 ENSLCAG00010017815 YWHAG (ENSLCAG00010017799) ##22 hspb1 (ENSLCAG00010017792) ENSLCAG00010017789 SRRM3 (ENSLCAG00010017786) ENSLCAG00010017776 c1qbp (ENSLCAG00010017771) dhx33 (ENSLCAG00010017766) p2rx1 (ENSLCAG00010017760) camkk1a (ENSLCAG00010017749) ATP2A3 (ENSLCAG00010017276) ZZEF1 (ENSLCAG00010016985) 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ENSGT01020000230351.C ENSGT00940000154890.a.a ENSGT00940000155668.j ENSGT00940000155045 ENSGT00940000160156 ENSGT00940000156179 ENSGT00940000155228 ENSGT00390000005976.a.a.a ENSGT00390000005976.a.a.b ENSGT00940000153556.B Zig-zag eel MODERN SPECIES 5 ggnbp2 (ENSMAMG00000006520) pigw (ENSMAMG00000006498) znhit3 (ENSMAMG00000006489) nupr1a (ENSMAMG00000006453) vkorc1l1 (ENSMAMG00000028611) ENSMAMG00000006410 ca4a (ENSMAMG00000006393) MTMR4 (ENSMAMG00000006315) hpda (ENSMAMG00000006282) ENSMAMG00000006268 ENSMAMG00000006168 supt4h1 (ENSMAMG00000024582) ENSMAMG00000006087 ENSMAMG00000006074 ENSMAMG00000006053 ENSMAMG00000006048 ##22 hspb1 (ENSMAMG00000025168) ENSMAMG00000005994 c1qbp (ENSMAMG00000005982) ENSMAMG00000005936 p2rx1 (ENSMAMG00000005914) camkk1a (ENSMAMG00000005838) ATP2A3 (ENSMAMG00000005755) ZZEF1 (ENSMAMG00000005641) cyb5d2 (ENSMAMG00000005622) ankfy1 (ENSMAMG00000005565) ube2g1a (ENSMAMG00000005550) spns3 (ENSMAMG00000005520) SPNS2 (ENSMAMG00000005474) ruvbl2 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##22 hspb1 (ENSBSLG00000020771) ENSBSLG00000020772 ENSBSLG00000020773 c1qbp (ENSBSLG00000020775) dhx33 (ENSBSLG00000020779) p2rx1 (ENSBSLG00000020792) camkk1a (ENSBSLG00000020815) ENSBSLG00000020824 ATP2A3 (ENSBSLG00000020850) ZZEF1 (ENSBSLG00000021871) cyb5d2 (ENSBSLG00000022432) ankfy1 (ENSBSLG00000022451) ube2g1a (ENSBSLG00000022583) spns3 (ENSBSLG00000022634) SPNS2 (ENSBSLG00000022986) Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 455 ENSHCOG00000010358 stip1 (ENSHCOG00000010419) rps6ka4 (ENSHCOG00000010506) FLRT1 (ENSHCOG00000010522) zfpl1 (ENSHCOG00000010546) rom1a (ENSHCOG00000010559) frmd8 (ENSHCOG00000010570) ENSHCOG00000010580 ca4a (ENSHCOG00000010648) MTMR4 (ENSHCOG00000010677) hpda (ENSHCOG00000010695) ENSHCOG00000010722 supt4h1 (ENSHCOG00000010739) ENSHCOG00000011006 ENSHCOG00000011053 YWHAG (ENSHCOG00000011071) ##22 hspb1 (ENSHCOG00000011077) ENSHCOG00000011092 ENSHCOG00000011104 c1qbp (ENSHCOG00000011124) dhx33 (ENSHCOG00000011161) p2rx1 (ENSHCOG00000011183) camkk1a 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ENSMMDG00005014702 cltca (ENSMMDG00005013120) ptrh2 (ENSMMDG00005013065) Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 105 ENSGT00390000009552 ENSGT00390000013520 ENSGT00940000157382 ENSGT00390000010822 ENSGT00940000167280 ENSGT00940000157044.o ENSGT00390000001752 ENSGT00940000155690.b.a ENSGT00940000158976 ENSGT00530000063474.B.e.b ENSGT00940000154006.b ENSGT00510000048674 ENSGT00390000018559 ENSGT00950000183203.d.d ENSGT00950000183145.D.h.a ENSGT01090000260061.c.a.c.a.a.b ##22 ENSGT00940000155882.a.a ENSGT00980000199127 ENSGT00940000162625 ENSGT00940000159210 ENSGT00390000006416 ENSGT00390000018406 ENSGT00940000156747 ENSGT01020000230351.C ENSGT00940000154890.a.a ENSGT00940000155668.j ENSGT01060000250877 ENSGT00940000155045 ENSGT00940000160156 ENSGT00940000156179 ENSGT00940000155228 Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 312 ENSGT00390000009552.j ENSGT00390000013520 ENSGT00940000157382 ENSGT00390000010822 ENSGT00940000167280 ENSGT00940000157044.o ENSGT00390000001752.q 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ENSGT01020000230351.C.e ENSGT00940000154890.a.a.c ENSGT00940000155668.j.c.a ENSGT00940000160156 ENSGT00940000156179.c ENSGT00940000155228.f ENSGT00390000005976.a.a.a ENSGT00940000154735.c.f Atlantic salmon MODERN SPECIES 23 ggnbp2 (ENSSSAG00000064606) pigw (ENSSSAG00000064599) myo19 (ENSSSAG00000064331) znhit3 (ENSSSAG00000064315) vkorc1l1 (ENSSSAG00000101858) ENSSSAG00000063558 ca4a (ENSSSAG00000062204) MTMR4 (ENSSSAG00000061898) hpda (ENSSSAG00000062406) ENSSSAG00000062256 ENSSSAG00000063520 supt4h1 (ENSSSAG00000063502) ENSSSAG00000105652 ENSSSAG00000061595 ENSSSAG00000038823 YWHAG (ENSSSAG00000093880) ##22 ENSSSAG00000061449 hspb1 (ENSSSAG00000088803) SRRM3 (ENSSSAG00000090322) rpain (ENSSSAG00000061383) c1qbp (ENSSSAG00000061401) DHX33 (ENSSSAG00000061210) ENSSSAG00000061168 p2rx1 (ENSSSAG00000061104) ENSSSAG00000095623 camkk1a (ENSSSAG00000061029) atp2a3 (ENSSSAG00000020900) cyb5d2 (ENSSSAG00000015825) ankfy1 (ENSSSAG00000015511) ube2g1a (ENSSSAG00000015419) spns3 (ENSSSAG00000015207) River trout MODERN SPECIES 10 MYO19 (ENSSTUG00000021399) znhit3 (ENSSTUG00000021500) nupr1a (ENSSTUG00000021511) vkorc1l1 (ENSSTUG00000021517) GUSB (ENSSTUG00000021537) ca4a (ENSSTUG00000022230) MTMR4 (ENSSTUG00000022258) hpda (ENSSTUG00000022568) ENSSTUG00000023675 ENSSTUG00000023687 supt4h1 (ENSSTUG00000023710) ENSSTUG00000023733 ENSSTUG00000023784 ENSSTUG00000023786 ENSSTUG00000023800 YWHAG (ENSSTUG00000023899) ##22 hspb1 (ENSSTUG00000023907) ENSSTUG00000023922 ENSSTUG00000023923 ENSSTUG00000023946 rpain (ENSSTUG00000024111) c1qbp (ENSSTUG00000024132) dhx33 (ENSSTUG00000024151) p2rx1 (ENSSTUG00000024252) ENSSTUG00000024297 camkk1a (ENSSTUG00000024334) ATP2A3 (ENSSTUG00000024544) ENSSTUG00000026426 cyb5d2 (ENSSTUG00000026434) ankfy1 (ENSSTUG00000026462) ube2g1a (ENSSTUG00000026618) Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 41 ENSGT00390000009552.j ENSGT00390000013520 ENSGT00940000157382 ENSGT00390000010822 ENSGT00940000167280 ENSGT00940000157044.o ENSGT00390000001752.q ENSGT00940000155690.b.a.e ENSGT00940000158976.h.a ENSGT00530000063474.B.e.b ENSGT00940000154006.b.f ENSGT00510000048674 ENSGT00390000018559.h ENSGT00950000183203.d.d.l.b ENSGT00950000183145.D.h.b ENSGT01090000260061.c.a.c.a.a.b.a ##22 ENSGT00980000199127.a ENSGT00940000155882.a.a.c ENSGT00940000167838 ENSGT00390000006416 ENSGT00390000018406.b ENSGT00940000156747.k ENSGT01020000230351.C.e ENSGT00940000154890.a.a.c ENSGT00940000155668.j.c.a ENSGT00940000160156 ENSGT00940000156179.c ENSGT00940000155228.f ENSGT00390000005976.a.a.a ENSGT00940000154735.c.f ENSGT01100000263892.b.b Rainbow trout MODERN SPECIES 1 ENSOMYG00000012284 ca4a (ENSOMYG00000012310) ENSOMYG00000058807 MTMR4 (ENSOMYG00000050775) hpda (ENSOMYG00000012394) ENSOMYG00000012405 ENSOMYG00000068894 ENSOMYG00000012338 supt4h1 (ENSOMYG00000012356) ENSOMYG00000066677 ENSOMYG00000064225 ENSOMYG00000058389 ENSOMYG00000073703 ENSOMYG00000059200 ENSOMYG00000064853 YWHAG (ENSOMYG00000012532) ##22 ENSOMYG00000068171 hspb1 (ENSOMYG00000048428) ENSOMYG00000056928 ENSOMYG00000048882 SRRM3 (ENSOMYG00000071000) C1QBP (ENSOMYG00000012574) rpain (ENSOMYG00000012555) ENSOMYG00000012586 p2rx1 (ENSOMYG00000060599) camkk1a (ENSOMYG00000057855) ENSOMYG00000055996 ENSOMYG00000012654 ATP2A3 (ENSOMYG00000073064) cyb5d2 (ENSOMYG00000012681) ankfy1 (ENSOMYG00000012793) Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 43 ENSGT00390000006633.a.q ENSGT00390000009552.j ENSGT00390000013520 ENSGT00940000157382 ENSGT00390000010822 ENSGT00940000167280 ENSGT00940000157044.o ENSGT00390000001752.q ENSGT00940000155690.b.a.e ENSGT00940000158976.h.a ENSGT00530000063474.B.e.b ENSGT00940000154006.b.f ENSGT00510000048674 ENSGT00390000018559.h ENSGT00950000183145.D.h.b ENSGT01090000260061.c.a.c.a.a.b.a ##22 ENSGT00980000199127.a ENSGT00940000155882.a.a.c ENSGT00940000167838 ENSGT00390000006416 ENSGT00390000018406.b ENSGT00940000156747.k ENSGT01020000230351.C.e ENSGT00940000154890.a.a.c ENSGT00940000155668.j.c.a ENSGT00940000160156 ENSGT00940000156179.c ENSGT00940000155228.f ENSGT00390000005976.a.a.a ENSGT00940000154735.c.f ENSGT00940000157342.c.b.c Coho salmon MODERN SPECIES 20 znhit3 (ENSOKIG00005037678) nupr1a (ENSOKIG00005037652) vkorc1l1 (ENSOKIG00005037628) ENSOKIG00005037621 GUSB (ENSOKIG00005037088) ca4a (ENSOKIG00005037012) MTMR4 (ENSOKIG00005031326) hpda (ENSOKIG00005029330) ENSOKIG00005029203 ENSOKIG00005029168 supt4h1 (ENSOKIG00005029125) ENSOKIG00005029108 ENSOKIG00005029099 ENSOKIG00005029084 ENSOKIG00005029035 YWHAG (ENSOKIG00005029011) ##22 ENSOKIG00005029002 hspb1 (ENSOKIG00005028984) ENSOKIG00005028954 rpain (ENSOKIG00005028939) c1qbp (ENSOKIG00005028920) dhx33 (ENSOKIG00005028861) p2rx1 (ENSOKIG00005028810) camkk1a (ENSOKIG00005028794) ATP2A3 (ENSOKIG00005028180) cyb5d2 (ENSOKIG00005028140) ankfy1 (ENSOKIG00005027816) ube2g1a (ENSOKIG00005027766) spns3 (ENSOKIG00005027568) HNRNPAB (ENSOKIG00005027535) GRIA1 (ENSOKIG00005027322) Chinook salmon MODERN SPECIES 23 zgc:77058 (ENSOTSG00005014660) txndc15 (ENSOTSG00005014662) PCBD2 (ENSOTSG00005014663) ENSOTSG00005014669 pitx1 (ENSOTSG00005014673) HAND1 (ENSOTSG00005014723) SAP30L (ENSOTSG00005014724) ggnbp2 (ENSOTSG00005014725) pigw (ENSOTSG00005014726) MYO19 (ENSOTSG00005014730) znhit3 (ENSOTSG00005014736) vkorc1l1 (ENSOTSG00005014737) GUSB (ENSOTSG00005014740) ENSOTSG00005014766 ENSOTSG00005014771 YWHAG (ENSOTSG00005014773) ##22 ENSOTSG00005014774 slc22a21 (ENSOTSG00005014778) ENSOTSG00005014779 slc22a4 (ENSOTSG00005014781) irf1b (ENSOTSG00005014793) ENSOTSG00005014821 fnip1 (ENSOTSG00005032634) TENM2 (ENSOTSG00005035455) mat2b (ENSOTSG00005035459) eif4ebp3 (ENSOTSG00005035463) ankhd1 (ENSOTSG00005035483) ENSOTSG00005039618 zgc:110540 (ENSOTSG00005039619) hnrnph1l (ENSOTSG00005039622) hbegfb (ENSOTSG00005039688) Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 277 ENSGT00950000183145.D.h.a ENSGT01090000260061.c.a.c.a.a.b.b ##22 ENSGT00980000199127.b ENSGT00940000155882.a.a.d ENSGT00940000162625 ENSGT00940000159210.l ENSGT01010000224314 ENSGT00390000018406.a ENSGT00940000156747.l ENSGT01020000230351.C.f ENSGT00940000154890.a.a.d ENSGT00940000155668.j.c.b ENSGT00940000155045 ENSGT00940000156179.d ENSGT00940000155228.e ENSGT00940000154735.c.e ENSGT01100000263892 Huchen MODERN SPECIES 2413 ENSHHUG00000038382 ENSHHUG00000038376 ENSHHUG00000038375 YWHAG (ENSHHUG00000038341) ##22 ENSHHUG00000038332 hspb1 (ENSHHUG00000038322) Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000161111.a ENSGT00390000006633.a.r ENSGT00390000009552.i ENSGT00940000157044.p ENSGT00390000001752.r ENSGT00940000155690.b.a.f ENSGT00940000158976.h.b ENSGT00940000154006.b.e ENSGT00390000018559.g ENSGT00950000183203.d.d.l.a ENSGT00950000183145.D.h.a ENSGT01090000260061.c.a.c.a.a.b.b ##22 ENSGT00980000199127.b ENSGT00940000155882.a.a.d ENSGT00940000162625.c ENSGT00940000159210.l ENSGT01010000224314 ENSGT00390000018406.a ENSGT00940000156747.l ENSGT01020000230351.C.f ENSGT00940000154890.a.a.d ENSGT00940000155668.j.c.b ENSGT00940000155045 ENSGT00990000212862 ENSGT00940000156179.d ENSGT00940000155228.e ENSGT00940000154735.c.e Salmo ANCESTRAL SPECIES 44 ENSGT00940000161111.a ENSGT00390000006633.a.r ENSGT00390000009552.i ENSGT00940000157044.p ENSGT00390000001752.r ENSGT00940000155690.b.a.f ENSGT00940000158976.h.b ENSGT00940000154006.b.e ENSGT00510000048674.i ENSGT00390000018559.g ENSGT00950000183203.d.d.l.a ENSGT00950000183145.D.h.a ENSGT01090000260061.c.a.c.a.a.b.b ##22 ENSGT00940000155882.a.a.d ENSGT00940000162625.c ENSGT00940000159210.l ENSGT01010000224314 ENSGT00390000018406.a ENSGT01020000230351.C.f ENSGT00940000154890.a.a.d ENSGT00940000155668.j.c.b ENSGT00940000155045 ENSGT00990000212862 ENSGT00940000156179.d ENSGT00940000155228.e ENSGT00940000154735.c.e ENSGT01100000263892.b.a ENSGT00940000157342.c.b.d River trout MODERN SPECIES 6 ENSSTUG00000012478 ENSSTUG00000012569 ENSSTUG00000012586 HAND1 (ENSSTUG00000012604) ENSSTUG00000012613 ggnbp2 (ENSSTUG00000012629) GUSB (ENSSTUG00000012723) vkorc1l1 (ENSSTUG00000013236) ENSSTUG00000013258 MTMR4 (ENSSTUG00000013379) RNF43 (ENSSTUG00000016472) ENSSTUG00000016481 ENSSTUG00000016495 ENSSTUG00000016517 ENSSTUG00000016687 YWHAG (ENSSTUG00000016703) ##22 hspb1 (ENSSTUG00000016717) SRRM3 (ENSSTUG00000016738) ENSSTUG00000016772 ENSSTUG00000017131 c1qbp (ENSSTUG00000017143) p2rx1 (ENSSTUG00000017171) camkk1a (ENSSTUG00000017272) ATP2A3 (ENSSTUG00000017361) ENSSTUG00000017545 ZZEF1 (ENSSTUG00000017555) ENSSTUG00000017628 ankfy1 (ENSSTUG00000017652) ube2g1a (ENSSTUG00000017825) hnrnpabb (ENSSTUG00000017846) ENSSTUG00000001837 Atlantic salmon MODERN SPECIES 4 ENSSSAG00000100062 ENSSSAG00000064552 ENSSSAG00000108420 ENSSSAG00000084076 sp30l (ENSSSAG00000069942) ENSSSAG00000069957 ENSSSAG00000096234 ENSSSAG00000108195 ENSSSAG00000070051 ENSSSAG00000111810 ENSSSAG00000070458 ENSSSAG00000073513 supt4h1 (ENSSSAG00000073514) ENSSSAG00000073527 ENSSSAG00000119650 143g1 (ENSSSAG00000038870) ##22 hspb1 (ENSSSAG00000101076) srrm3 (ENSSSAG00000039179) ENSSSAG00000086270 ENSSSAG00000039257 ENSSSAG00000039636 c1qbp (ENSSSAG00000039711) ENSSSAG00000115502 p2rx1 (ENSSSAG00000039817) camkk1a (ENSSSAG00000040052) ATP2A3 (ENSSSAG00000040294) ZZEF1 (ENSSSAG00000041149) ENSSSAG00000042927 ENSSSAG00000086033 ankfy1 (ENSSSAG00000042993) ube2g1a (ENSSSAG00000043662) Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00530000067117.a ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00390000003354.e ENSGT00950000183073.a.a.b.f.a ENSGT00940000161111.a ENSGT00390000006633.a.r ENSGT00390000009552.i ENSGT00940000157044.p ENSGT00390000001752.r ENSGT00940000155690.b.a.f ENSGT00940000158976.h.b ENSGT00940000154006.b.e ENSGT01060000250101 ENSGT00950000183203.d.d.l.a ENSGT00950000183145.D.h.a ENSGT01090000260061.c.a.c.a.a.b.b ##22 ENSGT00980000199127.b ENSGT00940000155882.a.a.d ENSGT00940000162625.c ENSGT00940000159210.l ENSGT01010000224314 ENSGT00390000018406.a ENSGT00940000156747.l ENSGT01020000230351.C.f ENSGT00940000154890.a.a.d ENSGT00940000155668.j.c.b ENSGT00940000155045 ENSGT00990000212862 ENSGT00940000156179.d ENSGT00940000155228.e ENSGT00940000154735.c.e Rainbow trout MODERN SPECIES 3 ENSOMYG00000009305 ca4a (ENSOMYG00000009115) ENSOMYG00000051523 ENSOMYG00000060697 ENSOMYG00000008948 ENSOMYG00000068552 ENSOMYG00000073587 ENSOMYG00000008674 ENSOMYG00000008666 ENSOMYG00000074898 ENSOMYG00000057251 ENSOMYG00000008554 ENSOMYG00000059436 ENSOMYG00000056126 ENSOMYG00000012450 YWHAG (ENSOMYG00000008503) ##22 ENSOMYG00000008495 hspb1 (ENSOMYG00000008479) ENSOMYG00000069715 SRRM3 (ENSOMYG00000008446) ENSOMYG00000008345 ENSOMYG00000008146 c1qbp (ENSOMYG00000008118) ENSOMYG00000008079 p2rx1 (ENSOMYG00000007959) camkk1a (ENSOMYG00000007760) ATP2A3 (ENSOMYG00000006908) ZZEF1 (ENSOMYG00000004390) ENSOMYG00000034806 ankfy1 (ENSOMYG00000034650) ube2g1a (ENSOMYG00000034520) Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00530000067117.a ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00390000003354.e ENSGT00950000183073.a.a.b.f.a ENSGT00940000161111.a ENSGT00390000006633.a.r ENSGT00390000009552.i ENSGT00940000157044.p ENSGT00390000001752.r ENSGT00940000155690.b.a.f ENSGT00940000158976.h.b ENSGT00940000154006.b.e ENSGT01060000250101 ENSGT00950000183203.d.d.l.a ENSGT00950000183145.D.h.a ENSGT01090000260061.c.a.c.a.a.b.b ##22 ENSGT00980000199127.b ENSGT00940000155882.a.a.d ENSGT00940000162625.c ENSGT00940000159210.l ENSGT01010000224314 ENSGT00390000018406.a ENSGT00940000156747.l ENSGT01020000230351.C.f ENSGT00940000154890.a.a.d ENSGT00940000155668.j.c.b ENSGT00940000155045 ENSGT00990000212862 ENSGT00940000156179.d ENSGT00940000155228.e ENSGT00940000154735.c.e Coho salmon MODERN SPECIES 26 RAB28 (ENSOKIG00005010411) NKX3-2 (ENSOKIG00005010403) ENSOKIG00005010392 COPS6 (ENSOKIG00005010315) HAND1 (ENSOKIG00005010299) SAP30L (ENSOKIG00005010288) GGNBP2 (ENSOKIG00005010255) vkorc1l1 (ENSOKIG00005010236) GUSB (ENSOKIG00005009847) ca4a (ENSOKIG00005009773) MTMR4 (ENSOKIG00005009483) RNF43 (ENSOKIG00005009430) ENSOKIG00005009393 ENSOKIG00005009330 ENSOKIG00005009303 YWHAG (ENSOKIG00005009289) ##22 ENSOKIG00005009271 hspb1 (ENSOKIG00005009254) SRRM3 (ENSOKIG00005009227) ENSOKIG00005009083 ENSOKIG00005009043 c1qbp (ENSOKIG00005009024) DHX33 (ENSOKIG00005008981) p2rx1 (ENSOKIG00005008860) ENSOKIG00005008821 camkk1a (ENSOKIG00005008776) ATP2A3 (ENSOKIG00005008618) ZZEF1 (ENSOKIG00005007501) ENSOKIG00005007455 ankfy1 (ENSOKIG00005007385) ube2g1a (ENSOKIG00005007347) Chinook salmon MODERN SPECIES 33 NKX3-2 (ENSOTSG00005033723) ENSOTSG00005033722 ENSOTSG00005033719 COPS6 (ENSOTSG00005033701) HAND1 (ENSOTSG00005033696) SAP30L (ENSOTSG00005033695) ggnbp2 (ENSOTSG00005033693) vkorc1l1 (ENSOTSG00005033689) GUSB (ENSOTSG00005033286) ca4a (ENSOTSG00005033283) MTMR4 (ENSOTSG00005022167) RNF43 (ENSOTSG00005022137) ENSOTSG00005022136 ENSOTSG00005022132 ENSOTSG00005022131 YWHAG (ENSOTSG00005022130) ##22 ENSOTSG00005022128 hspb1 (ENSOTSG00005022126) SRRM3 (ENSOTSG00005022122) ENSOTSG00005022074 ENSOTSG00005022066 ENSOTSG00005022064 c1qbp (ENSOTSG00005022061) dhx33 (ENSOTSG00005022058) p2rx1 (ENSOTSG00005022050) camkk1a (ENSOTSG00005022048) ATP2A3 (ENSOTSG00005021980) ENSOTSG00005021742 ankfy1 (ENSOTSG00005019906) ube2g1a (ENSOTSG00005019902) hnrnpabb (ENSOTSG00005019894) Northern pike MODERN SPECIES 6 nupr1a (ENSELUG00000019495) vkorc1l1 (ENSELUG00000019523) GUSB (ENSELUG00000019564) ca4a (ENSELUG00000000861) MTMR4 (ENSELUG00000019662) hpda (ENSELUG00000019714) ENSELUG00000019770 ENSELUG00000019733 ENSELUG00000019748 ENSELUG00000019791 supt4h1 (ENSELUG00000019831) ENSELUG00000019930 ENSELUG00000029372 ENSELUG00000034168 ENSELUG00000019966 YWHAG (ENSELUG00000019980) ##22 hspb1 (ENSELUG00000000880) ENSELUG00000020024 SRRM3 (ENSELUG00000030395) ENSELUG00000030474 ENSELUG00000020086 rpain (ENSELUG00000020160) c1qbp (ENSELUG00000020217) dhx33 (ENSELUG00000020257) ENSELUG00000029668 p2rx1 (ENSELUG00000020285) camkk1a (ENSELUG00000020319) ENSELUG00000026241 ENSELUG00000020396 ENSELUG00000033003 ZZEF1 (ENSELUG00000000902) Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 870 ENSGT00950000183145.D.h.b ENSGT01090000260061.c.a.c.a.b ##22 Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 782 ENSGT00950000183145.D.h.b ENSGT01090000260061.c.a.c.a.b ##22 Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 617 ENSGT00950000183145.D.h.b ENSGT01090000260061.c.a.c.a.b ##22 Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00390000009552 ENSGT00390000013520 ENSGT00940000157382 ENSGT00390000010822 ENSGT00940000167280 ENSGT00940000157044 ENSGT00390000001752 ENSGT00940000155690.b.a ENSGT00940000158976 ENSGT00530000063474.B.e.b ENSGT00940000154006.b ENSGT00510000048674 ENSGT00390000018559 ENSGT00950000183203.d.d ENSGT00950000183145.D.h.b ENSGT01090000260061.c.a.c.a.b ##22 ENSGT00950000183145.D.i ENSGT01090000260061.c.a.c.a.a.b ##22 ENSGT00940000155882.a.a ENSGT00980000199127 ENSGT00940000162625 ENSGT00940000159210 ENSGT00390000018406 ENSGT00940000156747 ENSGT01020000230351.C ENSGT00940000154890.a.a ENSGT00940000174983 ENSGT00940000155668.j ENSGT01060000250877 ENSGT00940000155045 ENSGT00940000160156 Cod DUPLICATION Cod MODERN SPECIES 20 ENSGMOG00000014132 DHRS11 (ENSGMOG00000014113) ggnbp2 (ENSGMOG00000014074) pigw (ENSGMOG00000020067) MYO19 (ENSGMOG00000014015) znhit3 (ENSGMOG00000013995) nupr1a (ENSGMOG00000020066) vkorc1l1 (ENSGMOG00000034892) ENSGMOG00000013942 ca4a (ENSGMOG00000013920) ENSGMOG00000013873 ENSGMOG00000013287 supt4h1 (ENSGMOG00000014619) ENSGMOG00000033590 ENSGMOG00000013242 ywhag1 (ENSGMOG00000026114) ##22 ENSGMOG00000009601 ENSGMOG00000026427 fam53c (ENSGMOG00000036282) ENSGMOG00000003044 zmat2 (ENSGMOG00000003032) NUP98 (ENSGMOG00000001450) ENSGMOG00000030352 ENSGMOG00000024147 ENSGMOG00000027141 ENSGMOG00000001539 ENSGMOG00000036509 ENSGMOG00000032086 ENSGMOG00000026503 ENSGMOG00000009596 STIM1 (ENSGMOG00000036378) Cod MODERN SPECIES 7 ENSGMOG00000027748 hnf1ba (ENSGMOG00000016065) ENSGMOG00000023208 dusp14 (ENSGMOG00000020333) tada2a (ENSGMOG00000016136) traf4a (ENSGMOG00000032539) nek8 (ENSGMOG00000016185) TLCD1 (ENSGMOG00000034933) ##29 rab34a (ENSGMOG00000016238) zgc:174895 (ENSGMOG00000035207) ENSGMOG00000032139 ENSGMOG00000034768 SUPT6H (ENSGMOG00000018068) ENSGMOG00000008769 ENSGMOG00000016273 ENSGMOG00000033681 ##22 ENSGMOG00000016303 ENSGMOG00000033784 ENSGMOG00000016334 ENSGMOG00000016376 ENSGMOG00000016446 ENSGMOG00000024010 ENSGMOG00000007160 ENSGMOG00000022628 ENSGMOG00000019871 ENSGMOG00000032853 ENSGMOG00000020346 ENSGMOG00000022610 ENSGMOG00000007161 ENSGMOG00000027720 ENSGMOG00000031829 Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.a.c.a.b ##22 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.a.c.a.b ##22 Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 30 ENSHCOG00000021032 ENSHCOG00000020958 SHKBP1 (ENSHCOG00000020947) ENSHCOG00000020912 ENSHCOG00000020891 ENSHCOG00000020871 ENSHCOG00000020842 ENSHCOG00000020818 traf4a (ENSHCOG00000020733) nek8 (ENSHCOG00000020564) tlcd1 (ENSHCOG00000020536) ##29 rab34a (ENSHCOG00000020527) zgc:174895 (ENSHCOG00000020521) ENSHCOG00000020496 ca4b (ENSHCOG00000020468) YWHAG (ENSHCOG00000020462) ##22 camkk1b (ENSHCOG00000020455) ENSHCOG00000020373 ENSHCOG00000018850 P4HA3 (ENSHCOG00000018832) ENSHCOG00000018816 ENSHCOG00000018807 diabloa (ENSHCOG00000018800) ENSHCOG00000018792 Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00390000013520 ENSGT00940000157382 ENSGT00390000010822 ENSGT00940000167280 ENSGT00940000157044 ENSGT00390000001752 ENSGT00940000155690.b.a ENSGT00940000158976 ENSGT00530000063474.B.e.b ENSGT00940000154006.b ENSGT00510000048674 ENSGT00390000018559 ENSGT00950000183203.d.d ENSGT00950000183145.D.i ENSGT00950000183145.D.h.b ENSGT01090000260061.c.a.c.a.b ##22 ENSGT00940000155882.a.a ENSGT00980000199127.d ENSGT00940000162625 ENSGT00940000159210 ENSGT00390000006416 ENSGT00390000018406 ENSGT00940000156747 ENSGT01020000230351.C ENSGT00940000154890.a.a ENSGT00940000155668.j ENSGT00940000155045 ENSGT00940000160156 ENSGT00940000156179 ENSGT00940000155228 ENSGT00390000005976.a.a.a Otophysi DUPLICATION Otophysi ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT01030000234517.E.c 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ENSGT00950000183145.D.h.b ENSGT01090000260061.c.a.c.a.b.c ##22 ENSGT00940000155882.a.a ENSGT00980000199127.d ENSGT00940000162625 ENSGT00940000159210 ENSGT00390000006416 ENSGT00390000018406 ENSGT00390000010822 ENSGT00940000157382 ENSGT00390000013520 ENSGT00390000009552 ENSGT00840000129887.g.b ENSGT00940000166243 ENSGT00560000077232.B.g.b ENSGT00940000164254.b ENSGT00390000013800 Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 43 ENSGT00940000158557.l ENSGT00390000017839 ENSGT00940000156747 ENSGT00940000167280 ENSGT00940000157044 ENSGT00390000001752 ENSGT00940000155690.b.a.a ENSGT00940000158976 ENSGT00530000063474.B.e.b ENSGT00940000154006.b ENSGT00510000048674 ENSGT00390000018559 ENSGT00950000183203.d.d ENSGT00950000183145.D.i ENSGT00950000183145.D.h.b ENSGT01090000260061.c.a.c.a.b.c ##22 ENSGT00980000199127.d ENSGT00940000162625 ENSGT00940000159210 ENSGT00390000006416 ENSGT00390000018406 ENSGT00390000010822 ENSGT00940000157382 ENSGT00390000013520 ENSGT00390000009552 ENSGT00840000129887.g.b ENSGT00940000166243 ENSGT00560000077232.B.g.b ENSGT00940000164254.b ENSGT00390000013800 ENSGT00530000063811.A.a.a Characoidei ANCESTRAL SPECIES 146 ENSGT00390000001752 ENSGT00940000157044 ENSGT00940000167280 ENSGT00940000156747 ENSGT00940000155690.b.a.a ENSGT00940000158976 ENSGT00530000063474.B.e.b ENSGT00940000154006.b ENSGT00510000048674 ENSGT00390000018559 ENSGT00950000183203.d.d ENSGT00950000183145.D.h.b ENSGT01090000260061.c.a.c.a.b.c ##22 ENSGT00980000199127.d ENSGT00940000162625 ENSGT00940000159210 ENSGT00390000006416 ENSGT00390000018406 ENSGT00390000010822 ENSGT00940000157382 ENSGT00390000013520 ENSGT00390000009552 ENSGT00840000129887.g.b ENSGT00940000166243 ENSGT00560000077232.B.g.b ENSGT00940000164254.b ENSGT00390000013800 ENSGT00530000063811.A.a.a Mexicana tetra MODERN SPECIES 111 RAB35 (ENSAMXG00000040604) rplp0 (ENSAMXG00000032613) GUSB (ENSAMXG00000042392) vkorc1l1 (ENSAMXG00000015856) nupr1a (ENSAMXG00000024841) dhx33 (ENSAMXG00000015875) ca4a (ENSAMXG00000043073) ENSAMXG00000024842 MTMR4 (ENSAMXG00000015899) hpda (ENSAMXG00000015913) ENSAMXG00000015935 ENSAMXG00000030920 supt4h1 (ENSAMXG00000041272) ENSAMXG00000015980 ENSAMXG00000016010 ywhag1 (ENSAMXG00000035383) ##22 hspb1 (ENSAMXG00000016037) ENSAMXG00000031070 SRRM3 (ENSAMXG00000016051) MLXIPL (ENSAMXG00000016067) rpain (ENSAMXG00000016087) c1qbp (ENSAMXG00000016100) znhit3 (ENSAMXG00000042020) MYO19 (ENSAMXG00000016118) pigw (ENSAMXG00000024844) ggnbp2 (ENSAMXG00000016123) SSR4 (ENSAMXG00000032687) dhrs11a (ENSAMXG00000030213) ENSAMXG00000016157 flot2a (ENSAMXG00000016179) tbx16l (ENSAMXG00000033680) Red-bellied piranha MODERN SPECIES 240 ENSPNAG00000009399 supt4h1 (ENSPNAG00000009422) ENSPNAG00000009526 ENSPNAG00000009574 ywhag1 (ENSPNAG00000009594) ##22 ENSPNAG00000009606 hspb1 (ENSPNAG00000004945) SRRM3 (ENSPNAG00000009621) ENSPNAG00000009635 rpain (ENSPNAG00000009665) c1qbp (ENSPNAG00000009689) znhit3 (ENSPNAG00000009703) MYO19 (ENSPNAG00000009723) pigw (ENSPNAG00000009728) ggnbp2 (ENSPNAG00000009772) dhrs11a (ENSPNAG00000009804) ENSPNAG00000009819 flot2a (ENSPNAG00000001344) ENSPNAG00000009914 eral1 (ENSPNAG00000009960) Electric eel MODERN SPECIES 151 CIT (ENSEEEG00000002042) RAB35 (ENSEEEG00000002040) rplp0 (ENSEEEG00000002037) dhx33 (ENSEEEG00000002030) nupr1a (ENSEEEG00000002029) vkorc1l1 (ENSEEEG00000002028) GUSB (ENSEEEG00000002023) ca4a (ENSEEEG00000002021) MTMR4 (ENSEEEG00000000811) hpda (ENSEEEG00000000413) ENSEEEG00000000407 ENSEEEG00000000404 supt4h1 (ENSEEEG00000000394) ENSEEEG00000000257 ENSEEEG00000000182 ywhag1 (ENSEEEG00000000139) ##22 ENSEEEG00000000113 hspb1 (ENSEEEG00000000101) MLXIPL (ENSEEEG00000023773) rpain (ENSEEEG00000023771) c1qbp (ENSEEEG00000023762) znhit3 (ENSEEEG00000023757) MYO19 (ENSEEEG00000023754) pigw (ENSEEEG00000023751) ggnbp2 (ENSEEEG00000023748) dhrs11a (ENSEEEG00000023747) ENSEEEG00000023746 flot2a (ENSEEEG00000023743) ENSEEEG00000023735 eral1 (ENSEEEG00000023729) FAM222B (ENSEEEG00000023725) Channel catfish MODERN SPECIES 20 ca4a (ENSIPUG00000011729) ca4a (ENSIPUG00000011745) mtmr4 (ENSIPUG00000011795) hpda (ENSIPUG00000011930) rnf43 (ENSIPUG00000012016) ENSIPUG00000012036 ENSIPUG00000012053 supt4h1 (ENSIPUG00000012062) ENSIPUG00000012129 zgc:112001 (ENSIPUG00000012267) ENSIPUG00000012287 ENSIPUG00000012304 zgc:112001 (ENSIPUG00000012310) zgc:112001 (ENSIPUG00000012340) ENSIPUG00000012354 ywhag1 (ENSIPUG00000012397) ##22 hspb1 (ENSIPUG00000012429) ENSIPUG00000012445 ENSIPUG00000012451 srrm3 (ENSIPUG00000012467) ENSIPUG00000012479 rpain (ENSIPUG00000012533) c1qbp (ENSIPUG00000012598) znhit3 (ENSIPUG00000012609) myo19 (ENSIPUG00000012625) PIGW (ENSIPUG00000012660) GGNBP2 (ENSIPUG00000012675) dhrs11 (ENSIPUG00000012723) flot2a (ENSIPUG00000013356) tbx6l (ENSIPUG00000013387) eral1 (ENSIPUG00000013409) Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00530000063404.a.m ENSGT01030000234606.a.b.p ENSGT00390000017839 ENSGT00940000156747 ENSGT00940000167280 ENSGT00940000157044 ENSGT00390000001752 ENSGT00940000155690.b.a 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ENSCARG00000056545 ENSCARG00000056517 ENSCARG00000056410 ENSCARG00000056393 ywhag1 (ENSCARG00000056390) ##22 hspb1 (ENSCARG00000056371) ENSCARG00000056344 ENSCARG00000056336 ENSCARG00000055743 rpain (ENSCARG00000055695) c1qbp (ENSCARG00000055665) znhit3 (ENSCARG00000055653) MYO19 (ENSCARG00000054653) pigw (ENSCARG00000054591) ggnbp2 (ENSCARG00000054479) dhrs11a (ENSCARG00000054458) ENSCARG00000054444 srrt (ENSCARG00000052535) prdx4 (ENSCARG00000052043) sat1a.1 (ENSCARG00000051967) Goldfish MODERN SPECIES 44 ENSCARG00000001084 TRAF2 (ENSCARG00000001854) ENSCARG00000001864 RABL6 (ENSCARG00000001866) ENSCARG00000001871 MAPKAP1 (ENSCARG00000001874) ENSCARG00000001890 mvb12ba (ENSCARG00000001907) lmx1ba (ENSCARG00000001912) zbtb43 (ENSCARG00000001917) RALGPS1 (ENSCARG00000002209) ENSCARG00000003140 ENSCARG00000003161 ENSCARG00000003164 ENSCARG00000003167 ywhag1 (ENSCARG00000003174) ##22 hspb1 (ENSCARG00000003177) SRRM3 (ENSCARG00000003184) ENSCARG00000003208 ENSCARG00000003226 c1qbp 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ENSCCRG00000032564 supt4h1 (ENSCCRG00000062668) ENSCCRG00000026968 ENSCCRG00000079192 ywhag1 (ENSCCRG00000055965) ##22 ENSCCRG00000035029 hspb1 (ENSCCRG00000069777) SRRM3 (ENSCCRG00000078835) ENSCCRG00000004896 c1qbp (ENSCCRG00000030531) znhit3 (ENSCCRG00000055115) pigw (ENSCCRG00000059201) ggnbp2 (ENSCCRG00000034572) dhrs11a (ENSCCRG00000034601) ENSCCRG00000035241 ENSCCRG00000035246 ENSCCRG00000035256 ENSCCRG00000057331 srrt (ENSCCRG00000034646) prdx4 (ENSCCRG00000035260) Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00950000183116.b.a.a.a.a.f ENSGT00940000167280.b ENSGT00940000157044.q.b ENSGT00390000001752.d ENSGT00940000155690.b.a.c ENSGT00940000158976.j.b ENSGT00530000063474.B.e.b ENSGT00940000154006.b.c.b ENSGT00390000018559.a ENSGT00950000183203.d.d.o ENSGT00940000154006.b.c.a ENSGT00510000048674 ENSGT00390000018559.b ENSGT00950000183203.d.d.p ENSGT00950000183145.D.h.b.a ENSGT01090000260061.c.a.c.a.b.c.b ##22 ENSGT00940000155882.a.a.l ENSGT00980000199127.d ENSGT00940000162625 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reference MODERN SPECIES 15 dhx33 (ENSCCRG00000072284) nupr1a (ENSCCRG00000062347) ENSCCRG00000005946 vkorc1l1 (ENSCCRG00000079493) ENSCCRG00000032437 ca4a (ENSCCRG00000030049) MTMR4 (ENSCCRG00000030066) ENSCCRG00000008625 hpda (ENSCCRG00000024723) ENSCCRG00000024714 ENSCCRG00000049876 supt4h1 (ENSCCRG00000049874) ENSCCRG00000049864 hspb1 (ENSCCRG00000066100) ENSCCRG00000053391 ywhag1 (ENSCCRG00000067981) ##22 ENSCCRG00000060619 ENSCCRG00000074337 ENSCCRG00000073926 rpain (ENSCCRG00000030523) c1qbp (ENSCCRG00000058149) znhit3 (ENSCCRG00000077670) MYO19 (ENSCCRG00000032677) pigw (ENSCCRG00000032662) ggnbp2 (ENSCCRG00000034598) dhrs11a (ENSCCRG00000055687) ENSCCRG00000034609 srrt (ENSCCRG00000010285) prdx4 (ENSCCRG00000067453) sat1a.2 (ENSCCRG00000021595) apooa (ENSCCRG00000062516) Zebrafish MODERN SPECIES 20 ENSDARG00000110675 nupr1a (ENSDARG00000094300) vkorc1l1 (ENSDARG00000043644) GUSB (ENSDARG00000063126) ca4a (ENSDARG00000043589) CIT (ENSDARG00000089856) RAB35 (ENSDARG00000102078) 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Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 82 ENSGT00550000074975 ENSGT00940000160149 ENSGT00940000153392.b.b ENSGT00940000157641 ENSGT00940000160521 ENSGT01090000260061.c.a.c.a ##22 ENSGT01030000235453 ENSGT00940000155882.a.a ENSGT00940000162625 ENSGT00390000016686 ENSGT00940000164883 ENSGT00390000007848.a ENSGT00940000156847 ENSGT01070000257310 ENSGT00940000165977 ENSGT00940000156438 ENSGT00940000159596 ENSGT00940000154849.a ENSGT01060000250264 ENSGT00940000160764 ENSGT00940000155206 Anura ANCESTRAL SPECIES 78 ENSGT00390000018533 ENSGT00940000159407 ENSGT00940000154164.d ENSGT00940000163807 ENSGT00950000182963.b.a ENSGT00940000158080 ENSGT00940000153392.b.b.d.b.a ENSGT00940000154748.C ENSGT00940000155463 ENSGT00940000164393 ENSGT00390000007662 ENSGT00940000160149 ENSGT00940000153392.b.b.d.a ENSGT00940000157641 ENSGT00940000160521 ENSGT01090000260061.c.a.c.a ##22 ENSGT00940000155882.a.a ENSGT00940000162625 ENSGT00390000001189.b ENSGT00390000016686 ENSGT00940000164883 ENSGT00390000007848.a ENSGT00940000156847 ENSGT00940000165977 ENSGT00940000156438 ENSGT00940000159596 ENSGT00940000154849.a ENSGT00940000160764 ENSGT00940000155206 ENSGT00390000016209 ENSGT00410000025651.A Frog MODERN SPECIES 2 bend2 (ENSXETG00000035686) nhs (ENSXETG00000001112) tubb4b (ENSXETG00000001110) ENSXETG00000044842 ENSXETG00000039975 rbbp7 (ENSXETG00000026983) ENSXETG00000001109 ENSXETG00000041777 polr2j (ENSXETG00000001108) syap1 (ENSXETG00000008966) rasa4 (ENSXETG00000030799) upk3b (ENSXETG00000036878) uap1l1 (ENSXETG00000008968) rad51d (ENSXETG00000008969) ssc4d (ENSXETG00000031843) ywhag (ENSXETG00000008971) ##22 hspb1 (ENSXETG00000008972) ENSXETG00000037033 srrm3 (ENSXETG00000031838) acy3 (ENSXETG00000008975) mdh2 (ENSXETG00000008976) styxl1 (ENSXETG00000008978) tmem120a (ENSXETG00000008980) por (ENSXETG00000008983) rhbdd2 (ENSXETG00000003427) taf15 (ENSXETG00000013477) mmp28 (ENSXETG00000013462) gas2l2 (ENSXETG00000037269) rasl10b (ENSXETG00000040968) ap2b1 (ENSXETG00000013480) pex12 (ENSXETG00000013481) Leishan spiny toad MODERN SPECIES 5 REPS2 (ENSLLEG00000023965) ENSLLEG00000023712 ENSLLEG00000023636 RBBP7 (ENSLLEG00000022690) TXLNG (ENSLLEG00000022539) ENSLLEG00000022400 SYAP1 (ENSLLEG00000022016) ENSLLEG00000021976 ENSLLEG00000021145 ENSLLEG00000021092 ENSLLEG00000021037 ENSLLEG00000020969 DTX2 (ENSLLEG00000020712) ENSLLEG00000020483 ENSLLEG00000020449 YWHAG (ENSLLEG00000020399) ##22 HSPB1 (ENSLLEG00000020346) SRRM3 (ENSLLEG00000019981) ENSLLEG00000019433 ENSLLEG00000019381 ENSLLEG00000019299 ENSLLEG00000019151 MDH2 (ENSLLEG00000018761) ENSLLEG00000018599 TMEM120A (ENSLLEG00000018475) POR (ENSLLEG00000018178) ENSLLEG00000018044 ENSLLEG00000017939 ENSLLEG00000017731 MMP28 (ENSLLEG00000017649) ENSLLEG00000017614 Amniota ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000165137 ENSGT00940000161811 ENSGT00940000159751 ENSGT00940000163742 ENSGT00950000183191.a.b ENSGT00390000005003 ENSGT00390000015354.c.b.b ENSGT00390000006344 ENSGT00940000154248.b ENSGT00550000074975 ENSGT00940000160149 ENSGT00940000153392.b.b.a ENSGT00940000153392.b.b.b ENSGT00940000157641 ENSGT00940000160521 ENSGT01090000260061.c.a.c.a ##22 ENSGT01030000235453 ENSGT00940000155882.a.a ENSGT00900000142991 ENSGT00940000162625 ENSGT00390000016686 ENSGT00390000010113 ENSGT00940000164883 ENSGT00390000007848.a ENSGT00940000156847 ENSGT00390000000699 ENSGT00940000156438 ENSGT00940000159596 ENSGT00390000007830 ENSGT00940000154849.a ENSGT01060000250264 Mammalia ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00940000170602 ENSGT00940000161811 ENSGT00940000159751 ENSGT00940000163742 ENSGT00950000183191.a.b ENSGT00390000005003 ENSGT00390000015354.c.b.b ENSGT00390000006344 ENSGT00940000154248.b ENSGT00550000074975 ENSGT00940000160149 ENSGT00940000153392.b.b.a ENSGT00940000153392.b.b.b ENSGT00940000157641 ENSGT00940000160521 ENSGT01090000260061.c.a.c.a ##22 ENSGT00940000155882.a.a ENSGT00900000142991 ENSGT00940000162625 ENSGT00390000016686 ENSGT00390000010113 ENSGT00390000007848.a ENSGT00940000156847 ENSGT00390000000699 ENSGT00940000156438 ENSGT00940000159596 ENSGT00390000007830 ENSGT00940000154849.a ENSGT01060000250264 ENSGT00940000160764 ENSGT00940000155206 Platypus MODERN SPECIES 8 ENSOANG00000039913 ENSOANG00000047006 MYL10 (ENSOANG00000022693) CUX1 (ENSOANG00000028870) PRKRIP1 (ENSOANG00000046088) ORAI2 (ENSOANG00000049789) ENSOANG00000048842 ENSOANG00000050358 LRWD1 (ENSOANG00000042627) ENSOANG00000020912 ENSOANG00000010016 ENSOANG00000015341 ENSOANG00000004297 DTX2 (ENSOANG00000004296) ENSOANG00000039969 YWHAG (ENSOANG00000044061) ##22 HSPB1 (ENSOANG00000043454) ENSOANG00000045340 ENSOANG00000041397 ENSOANG00000049511 MDH2 (ENSOANG00000001378) STYXL1 (ENSOANG00000040559) ENSOANG00000042315 POR (ENSOANG00000043253) ENSOANG00000036567 TAF15 (ENSOANG00000014273) MMP28 (ENSOANG00000014274) ENSOANG00000045644 ENSOANG00000040830 RASL10B (ENSOANG00000038310) AP2B1 (ENSOANG00000050274) Theria ANCESTRAL SPECIES 43 ENSGT00940000161811 ENSGT00940000159751 ENSGT00940000163742 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ENSGT01100000263482.A.b ENSGT00940000153594.d ENSGT00940000153253.b.a.g ENSGT00940000155974.g ENSGT00940000161467 ENSGT00940000158514 Cow MODERN SPECIES 17 MYL10 (ENSBTAG00000026273) CUX1 (ENSBTAG00000010659) SH2B2 (ENSBTAG00000009691) ENSBTAG00000047266 PRKRIP1 (ENSBTAG00000004106) ORAI2 (ENSBTAG00000012050) ALKBH4 (ENSBTAG00000003617) LRWD1 (ENSBTAG00000014742) POLR2J (ENSBTAG00000005446) ENSBTAG00000005448 UPK3BL1 (ENSBTAG00000020524) UPK3B (ENSBTAG00000021430) DTX2 (ENSBTAG00000001470) ZP3 (ENSBTAG00000014834) SSC4D (ENSBTAG00000003020) YWHAG (ENSBTAG00000004077) ##22 HSPB1 (ENSBTAG00000011969) ENSBTAG00000050791 SRRM3 (ENSBTAG00000007879) MDH2 (ENSBTAG00000009462) STYXL1 (ENSBTAG00000009461) TMEM120A (ENSBTAG00000016139) POR (ENSBTAG00000017082) RHBDD2 (ENSBTAG00000005089) CCL24 (ENSBTAG00000026275) CCL26 (ENSBTAG00000052510) HIP1 (ENSBTAG00000000781) ENSBTAG00000017939 NSUN5 (ENSBTAG00000017941) TRIM50 (ENSBTAG00000005798) FKBP6 (ENSBTAG00000002253) Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 17 SH2B2 (ENSBIXG00005000581) ENSBIXG00005000971 ENSBIXG00005010897 ENSBIXG00005010875 ORAI2 (ENSBIXG00005010862) ALKBH4 (ENSBIXG00005010801) LRWD1 (ENSBIXG00005000945) ENSBIXG00005010770 ENSBIXG00005010730 ENSBIXG00005006318 UPK3B (ENSBIXG00005010658) DTX2 (ENSBIXG00005010564) ENSBIXG00005010462 ENSBIXG00005000733 SSC4D (ENSBIXG00005000868) YWHAG (ENSBIXG00005005698) ##22 ENSBIXG00005010365 HSPB1 (ENSBIXG00005005473) SRRM3 (ENSBIXG00005007426) MDH2 (ENSBIXG00005010300) STYXL1 (ENSBIXG00005010244) TMEM120A (ENSBIXG00005007425) POR (ENSBIXG00005000780) RHBDD2 (ENSBIXG00005010007) CCL24 (ENSBIXG00005000728) CCL26 (ENSBIXG00005009970) HIP1 (ENSBIXG00005009945) ENSBIXG00005009874 NSUN5 (ENSBIXG00005000641) TRIM50 (ENSBIXG00005009839) FKBP6 (ENSBIXG00005009809) Bos_a ANCESTRAL SPECIES 41 ENSGT00940000163742 ENSGT00940000159751 ENSGT00950000183191.a.b ENSGT00510000047245.w.b ENSGT00390000005003.k.a ENSGT00390000015354.c.b.b ENSGT00390000006344 ENSGT00940000154248.b ENSGT00940000164393 ENSGT00940000160149 ENSGT00940000153392.b.b.a ENSGT00940000153392.b.b.b ENSGT00940000157641 ENSGT01030000234567.B.b ENSGT00940000160521 ENSGT01090000260061.c.a.c.a ##22 ENSGT00940000155882.a.a ENSGT00900000142991 ENSGT00940000162625 ENSGT00390000016686.n ENSGT00390000010113 ENSGT00390000007848.a ENSGT00940000156847 ENSGT00390000000699 ENSGT01100000263482.E ENSGT01100000263482.A.b ENSGT00940000153594.d ENSGT00940000153253.b.a.g ENSGT00940000155974 ENSGT00940000161467 ENSGT00940000158514 Domestic yak MODERN SPECIES 18 ENSBGRG00000025960 SH2B2 (ENSBGRG00000025971) ENSBGRG00000025979 PRKRIP1 (ENSBGRG00000025984) ENSBGRG00000026003 ORAI2 (ENSBGRG00000026010) ALKBH4 (ENSBGRG00000026012) LRWD1 (ENSBGRG00000007003) ENSBGRG00000007071 ENSBGRG00000007176 ENSBGRG00000007795 UPK3B (ENSBGRG00000007877) DTX2 (ENSBGRG00000008036) ENSBGRG00000008198 SSC4D (ENSBGRG00000008300) YWHAG (ENSBGRG00000008359) ##22 ENSBGRG00000008398 ENSBGRG00000008438 SRRM3 (ENSBGRG00000008480) MDH2 (ENSBGRG00000008546) STYXL1 (ENSBGRG00000008791) TMEM120A (ENSBGRG00000008998) POR (ENSBGRG00000009108) RHBDD2 (ENSBGRG00000009317) CCL24 (ENSBGRG00000009380) CCL26 (ENSBGRG00000009396) HIP1 (ENSBGRG00000009451) ENSBGRG00000010238 NSUN5 (ENSBGRG00000010301) ENSBGRG00000010437 TRIM50 (ENSBGRG00000010461) Wild yak MODERN SPECIES 514 MYL10 (ENSBMUG00000006336) CUX1 (ENSBMUG00000006645) SH2B2 (ENSBMUG00000007390) ENSBMUG00000007395 PRKRIP1 (ENSBMUG00000007400) ORAI2 (ENSBMUG00000007417) ALKBH4 (ENSBMUG00000007423) LRWD1 (ENSBMUG00000007433) ENSBMUG00000007441 ENSBMUG00000007487 ENSBMUG00000007523 ENSBMUG00000007531 DTX2 (ENSBMUG00000007541) ENSBMUG00000007597 SSC4D (ENSBMUG00000007600) YWHAG (ENSBMUG00000007630) ##22 ENSBMUG00000007646 HSPB1 (ENSBMUG00000007650) MDH2 (ENSBMUG00000007674) STYXL1 (ENSBMUG00000007689) TMEM120A (ENSBMUG00000007707) POR (ENSBMUG00000007740) ENSBMUG00000007762 ENSBMUG00000007768 CCL24 (ENSBMUG00000007774) CCL26 (ENSBMUG00000007777) HIP1 (ENSBMUG00000007836) ENSBMUG00000007879 NSUN5 (ENSBMUG00000007901) TRIM50 (ENSBMUG00000007919) FKBP6 (ENSBMUG00000007971) American bison MODERN SPECIES 3254 MYL10 (ENSBBBG00000010559) CUX1 (ENSBBBG00000011123) SH2B2 (ENSBBBG00000007349) ENSBBBG00000011199 PRKRIP1 (ENSBBBG00000011211) ORAI2 (ENSBBBG00000002043) ALKBH4 (ENSBBBG00000011227) LRWD1 (ENSBBBG00000002049) ENSBBBG00000011251 ENSBBBG00000011289 ENSBBBG00000011301 UPK3B (ENSBBBG00000011306) DTX2 (ENSBBBG00000011314) ENSBBBG00000011326 SSC4D (ENSBBBG00000007590) YWHAG (ENSBBBG00000011348) ##22 HSPB1 (ENSBBBG00000011350) ENSBBBG00000002060 SRRM3 (ENSBBBG00000002063) MDH2 (ENSBBBG00000007350) STYXL1 (ENSBBBG00000007247) TMEM120A (ENSBBBG00000011434) POR (ENSBBBG00000011448) RHBDD2 (ENSBBBG00000011465) CCL24 (ENSBBBG00000011473) ENSBBBG00000007351 CCL26 (ENSBBBG00000011486) HIP1 (ENSBBBG00000002125) ENSBBBG00000011652 NSUN5 (ENSBBBG00000008491) TRIM50 (ENSBBBG00000002156) Caprinae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000161716 ENSGT00940000161811 ENSGT00940000159751 ENSGT00950000183191.a.b ENSGT00390000005003.k.a ENSGT00390000015354.c.b.b ENSGT00390000006344 ENSGT00940000154248.b ENSGT00550000074975 ENSGT00940000160149 ENSGT00940000153392.b.b.a ENSGT00940000153392.b.b.b ENSGT00940000157641 ENSGT01030000234567.B.b ENSGT00940000160521 ENSGT01090000260061.c.a.c.a ##22 ENSGT00940000155882.a.a ENSGT00900000142991 ENSGT00940000162625 ENSGT00390000016686.n ENSGT00390000010113 ENSGT00390000007848.a ENSGT00940000156847 ENSGT00390000000699 ENSGT01100000263482.E ENSGT01100000263482.A.b ENSGT00940000153594.d ENSGT00910000148262 ENSGT00940000153253.b.a.g ENSGT00940000155974 ENSGT00940000161467 Goat MODERN SPECIES 17 COL26A1 (ENSCHIG00000007308) MYL10 (ENSCHIG00000024911) CUX1 (ENSCHIG00000009047) SH2B2 (ENSCHIG00000015376) PRKRIP1 (ENSCHIG00000023221) ORAI2 (ENSCHIG00000010053) ALKBH4 (ENSCHIG00000020179) LRWD1 (ENSCHIG00000020073) ENSCHIG00000009008 ENSCHIG00000026723 ENSCHIG00000014152 UPK3B (ENSCHIG00000026660) DTX2 (ENSCHIG00000013883) ENSCHIG00000021820 SSC4D (ENSCHIG00000026419) YWHAG (ENSCHIG00000025558) ##22 HSPB1 (ENSCHIG00000015975) ENSCHIG00000018001 SRRM3 (ENSCHIG00000014018) MDH2 (ENSCHIG00000024287) STYXL1 (ENSCHIG00000024571) TMEM120A (ENSCHIG00000023234) ENSCHIG00000023666 ENSCHIG00000010141 ENSCHIG00000010097 ENSCHIG00000024978 ENSCHIG00000026436 ENSCHIG00000017633 ENSCHIG00000025047 ENSCHIG00000013479 ENSCHIG00000011766 Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 16 COL26A1 (ENSOARG00020024535) MYL10 (ENSOARG00020024505) CUX1 (ENSOARG00020024286) SH2B2 (ENSOARG00020024254) PRKRIP1 (ENSOARG00020024226) ORAI2 (ENSOARG00020024205) ALKBH4 (ENSOARG00020024193) LRWD1 (ENSOARG00020024131) ENSOARG00020024108 ENSOARG00020024045 ENSOARG00020024015 UPK3B (ENSOARG00020023993) DTX2 (ENSOARG00020023954) ENSOARG00020023895 SSC4D (ENSOARG00020023863) YWHAG (ENSOARG00020023843) ##22 HSPB1 (ENSOARG00020023827) SRRM3 (ENSOARG00020023768) MDH2 (ENSOARG00020023712) STYXL1 (ENSOARG00020023564) TMEM120A (ENSOARG00020023534) POR (ENSOARG00020023488) RHBDD2 (ENSOARG00020023460) CCL24 (ENSOARG00020023433) ENSOARG00020023419 CCL26 (ENSOARG00020023401) HIP1 (ENSOARG00020023068) NSUN5 (ENSOARG00020022737) TRIM50 (ENSOARG00020022634) FKBP6 (ENSOARG00020022533) FZD9 (ENSOARG00020022514) Camelidae ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000161716 ENSGT00940000161811 ENSGT00940000163742 ENSGT00950000183191.a.b ENSGT00390000005003 ENSGT00390000015354.c.b.b ENSGT00390000006344 ENSGT00940000154248.b ENSGT00940000164393 ENSGT00940000160149 ENSGT00940000153392.b.b.a ENSGT00940000153392.b.b.b ENSGT00940000157641 ENSGT01030000234567.B.b ENSGT00940000160521 ENSGT01090000260061.c.a.c.a ##22 ENSGT00900000142991 ENSGT00940000155882.a.a ENSGT00940000167838 ENSGT00390000016686.n ENSGT00390000010113 ENSGT00390000007848.a ENSGT00940000156847 ENSGT00390000000699 ENSGT01100000263482.E ENSGT01100000263482.A.b ENSGT00940000153594.d ENSGT00940000153253.b.a.g ENSGT00940000155974 ENSGT00940000161467 ENSGT00940000158514 Arabian camel MODERN SPECIES 9 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ENSGT00390000013187.c ENSGT00390000013187.d ENSGT00940000161811 ENSGT00940000159751 ENSGT00390000005003 ENSGT00390000015354.c.b.b ENSGT00390000006344 ENSGT00940000154248.b ENSGT00550000074975 ENSGT00940000160149 ENSGT00940000153392.b.b.a ENSGT00940000153392.b.b.b ENSGT00940000157641 ENSGT01030000234567.B.b ENSGT00940000160521 ENSGT01090000260061.c.a.c.a ##22 ENSGT00940000155882.a.a ENSGT00900000142991.a ENSGT00390000016686.n ENSGT00390000010113 ENSGT00390000007848.a ENSGT00940000156847.d ENSGT00390000000699 ENSGT01100000263482.E ENSGT01100000263482.A.b ENSGT00940000153594.d ENSGT00940000153253.b.a.g ENSGT00940000155974 ENSGT00940000161467 ENSGT00940000158514 ENSGT00940000161226 American black bear MODERN SPECIES 272 PRKRIP1 (ENSUAMG00000011286) ORAI2 (ENSUAMG00000011302) ALKBH4 (ENSUAMG00000011304) LRWD1 (ENSUAMG00000011306) ENSUAMG00000011310 ENSUAMG00000011313 ENSUAMG00000011317 UPK3B (ENSUAMG00000011319) DTX2 (ENSUAMG00000011322) ENSUAMG00000011325 SSC4D (ENSUAMG00000011331) YWHAG (ENSUAMG00000011332) ##22 HSPB1 (ENSUAMG00000011333) ENSUAMG00000011334 ENSUAMG00000011337 MDH2 (ENSUAMG00000011338) STYXL1 (ENSUAMG00000011342) ENSUAMG00000011347 Polar bear MODERN SPECIES 213 PLOD3 (ENSUMAG00000011535) ZNHIT1 (ENSUMAG00000012160) ENSUMAG00000012164 IFT22 (ENSUMAG00000012174) MYL10 (ENSUMAG00000012188) CUX1 (ENSUMAG00000012256) PRKRIP1 (ENSUMAG00000012542) ORAI2 (ENSUMAG00000012570) ALKBH4 (ENSUMAG00000012580) LRWD1 (ENSUMAG00000012584) ENSUMAG00000012594 ENSUMAG00000012596 UPK3B (ENSUMAG00000012615) DTX2 (ENSUMAG00000012618) ENSUMAG00000012628 YWHAG (ENSUMAG00000012646) ##22 ENSUMAG00000012652 MDH2 (ENSUMAG00000012661) STYXL1 (ENSUMAG00000012669) TMEM120A (ENSUMAG00000012676) POR (ENSUMAG00000012718) RHBDD2 (ENSUMAG00000012907) CCL24 (ENSUMAG00000012913) CCL26 (ENSUMAG00000012919) HIP1 (ENSUMAG00000013022) NSUN5 (ENSUMAG00000013592) TRIM50 (ENSUMAG00000013606) FKBP6 (ENSUMAG00000013622) BAZ1B (ENSUMAG00000013631) BCL7B (ENSUMAG00000013646) TBL2 (ENSUMAG00000013647) Giant Panda DUPLICATION Giant Panda MODERN SPECIES 1 ENSAMEG00000026629 COL26A1 (ENSAMEG00000001702) MYL10 (ENSAMEG00000015356) CUX1 (ENSAMEG00000015392) SH2B2 (ENSAMEG00000015436) ENSAMEG00000015439 ORAI2 (ENSAMEG00000015450) ALKBH4 (ENSAMEG00000015460) LRWD1 (ENSAMEG00000015465) ENSAMEG00000015480 ENSAMEG00000015484 ENSAMEG00000015525 ENSAMEG00000015529 DTX2 (ENSAMEG00000015530) SSC4D (ENSAMEG00000010834) YWHAG (ENSAMEG00000024455) ##22 HSPB1 (ENSAMEG00000027219) ENSAMEG00000029505 ENSAMEG00000027696 MDH2 (ENSAMEG00000010846) STYXL1 (ENSAMEG00000010870) TMEM120A (ENSAMEG00000010886) POR (ENSAMEG00000010928) RHBDD2 (ENSAMEG00000028969) CCL24 (ENSAMEG00000030777) CCL26 (ENSAMEG00000024924) HIP1 (ENSAMEG00000010991) ENSAMEG00000011093 NSUN5 (ENSAMEG00000011119) TRIM50 (ENSAMEG00000011139) FKBP6 (ENSAMEG00000011153) Giant Panda MODERN SPECIES 893 ENSAMEG00000025786 ##22 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000161811 ENSGT00940000163742 ENSGT00940000159751 ENSGT00950000183191.a.b ENSGT00390000005003 ENSGT00390000015354.c.b.b ENSGT00390000006344 ENSGT00940000154248.b ENSGT00550000074975 ENSGT00940000160149 ENSGT00940000153392.b.b.a ENSGT00940000153392.b.b.b ENSGT00940000157641 ENSGT01030000234567.B.b ENSGT00940000160521 ENSGT01090000260061.c.a.c.a ##22 ENSGT00940000155882.a.a ENSGT00900000142991 ENSGT00940000162625 ENSGT00390000016686.n ENSGT00390000010113 ENSGT00390000007848.a ENSGT00940000156847 ENSGT00390000000699 ENSGT01100000263482.E ENSGT01100000263482.A.b ENSGT00940000153594.d ENSGT00940000153253.b.a.g ENSGT00940000155974 ENSGT00940000161467 ENSGT00940000158514 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00940000161811 ENSGT00940000163742 ENSGT00940000159751 ENSGT00950000183191.a.b ENSGT00390000005003 ENSGT00390000015354.c.b.b ENSGT00390000006344 ENSGT00940000154248.b ENSGT00550000074975 ENSGT00940000160149 ENSGT00940000153392.b.b.a ENSGT00940000153392.b.b.b ENSGT00940000157641 ENSGT01030000234567.B.b ENSGT00940000160521 ENSGT01090000260061.c.a.c.a ##22 ENSGT00940000155882.a.a ENSGT00940000162625 ENSGT00390000016686.n ENSGT00390000010113 ENSGT00390000007848.a ENSGT00940000156847 ENSGT00390000000699 ENSGT00940000168291 ENSGT01100000263482.E ENSGT01100000263482.A.b ENSGT00940000153594.d ENSGT00940000153253.b.a.g ENSGT00940000155974 ENSGT00940000161467 ENSGT00940000158514 Megabat MODERN SPECIES 416 ENSPVAG00000003408 DTX2 (ENSPVAG00000003407) ENSPVAG00000003406 SSC4D (ENSPVAG00000003405) YWHAG (ENSPVAG00000003404) ##22 HSPB1 (ENSPVAG00000003403) SRRM3 (ENSPVAG00000003400) MDH2 (ENSPVAG00000003397) STYXL1 (ENSPVAG00000003396) TMEM120A (ENSPVAG00000003395) POR (ENSPVAG00000003393) Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 39 ENSGT00940000161811 ENSGT00940000163742 ENSGT00940000159751 ENSGT00950000183191.a.b ENSGT00390000005003 ENSGT00390000015354.c.b.b ENSGT00390000006344 ENSGT00940000154248.b ENSGT00550000074975 ENSGT00940000160149 ENSGT00940000153392.b.b.a ENSGT00940000153392.b.b.b ENSGT00940000157641 ENSGT01030000234567.B.b ENSGT00940000160521 ENSGT01090000260061.c.a.c.a ##22 ENSGT00940000155882.a.a ENSGT00940000162625 ENSGT00390000016686.n ENSGT00390000010113 ENSGT00390000007848.a ENSGT00940000156847 ENSGT00390000000699 ENSGT01100000263482.E ENSGT01100000263482.A.b ENSGT00940000153594.d ENSGT00940000153253.b.a.g ENSGT00940000155974 ENSGT00940000161467 ENSGT00940000158514 ENSGT00940000161226 Microbat MODERN SPECIES 982 ENSMLUG00000016879 MYL10 (ENSMLUG00000014418) CUX1 (ENSMLUG00000007264) SH2B2 (ENSMLUG00000007328) PRKRIP1 (ENSMLUG00000006081) ORAI2 (ENSMLUG00000010439) ALKBH4 (ENSMLUG00000010443) LRWD1 (ENSMLUG00000010445) ENSMLUG00000010467 ENSMLUG00000010481 ENSMLUG00000024981 UPK3B (ENSMLUG00000006318) DTX2 (ENSMLUG00000006309) ENSMLUG00000006303 ENSMLUG00000006297 YWHAG (ENSMLUG00000015669) ##22 HSPB1 (ENSMLUG00000015659) ENSMLUG00000015645 MDH2 (ENSMLUG00000017795) STYXL1 (ENSMLUG00000017794) POR (ENSMLUG00000017792) TMEM120A (ENSMLUG00000017793) RHBDD2 (ENSMLUG00000016259) CCL26 (ENSMLUG00000016256) ENSMLUG00000005138 ENSMLUG00000008393 NSUN5 (ENSMLUG00000008380) TRIM50 (ENSMLUG00000005136) FKBP6 (ENSMLUG00000009844) FZD9 (ENSMLUG00000025470) BAZ1B (ENSMLUG00000009860) Equus ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000161716 ENSGT00940000161811 ENSGT00940000159751 ENSGT00950000183191.a.b ENSGT00390000005003 ENSGT00390000015354.c.b.b ENSGT00390000006344 ENSGT00940000154248.b ENSGT00550000074975 ENSGT00940000160149 ENSGT00940000153392.b.b.a ENSGT00940000153392.b.b.b ENSGT00940000157641 ENSGT01030000234567.B.b ENSGT00940000160521 ENSGT01090000260061.c.a.c.a ##22 ENSGT00940000155882.a.a ENSGT00900000142991 ENSGT00940000162625 ENSGT00390000016686.n ENSGT00390000010113 ENSGT00390000007848.a ENSGT00940000156847 ENSGT00390000000699 ENSGT01100000263482.E ENSGT01100000263482.A.b ENSGT00940000153594.d ENSGT00940000153253.b.a.g ENSGT00940000155974 ENSGT00940000161467 ENSGT00940000158514 Donkey MODERN SPECIES 5 IFT22 (ENSEASG00005016903) COL26A1 (ENSEASG00005016899) MYL10 (ENSEASG00005016896) CUX1 (ENSEASG00005016883) SH2B2 (ENSEASG00005016877) ORAI2 (ENSEASG00005016875) ALKBH4 (ENSEASG00005030978) LRWD1 (ENSEASG00005016865) ENSEASG00005029763 ENSEASG00005016860 ENSEASG00005016857 ENSEASG00005016855 DTX2 (ENSEASG00005016853) ENSEASG00005016852 SSC4D (ENSEASG00005016848) YWHAG (ENSEASG00005023788) ##22 HSPB1 (ENSEASG00005016846) ENSEASG00005016843 SRRM3 (ENSEASG00005027819) MDH2 (ENSEASG00005016836) STYXL1 (ENSEASG00005016834) TMEM120A (ENSEASG00005016831) POR (ENSEASG00005016825) RHBDD2 (ENSEASG00005016240) CCL24 (ENSEASG00005030346) CCL26 (ENSEASG00005036959) HIP1 (ENSEASG00005016140) ENSEASG00005016117 NSUN5 (ENSEASG00005016116) TRIM50 (ENSEASG00005016113) FKBP6 (ENSEASG00005016112) Horse MODERN SPECIES 4 FIS1 (ENSECAG00000013191) IFT22 (ENSECAG00000019190) COL26A1 (ENSECAG00000021392) MYL10 (ENSECAG00000022094) CUX1 (ENSECAG00000022645) SH2B2 (ENSECAG00000024201) PRKRIP1 (ENSECAG00000053672) ORAI2 (ENSECAG00000046959) ALKBH4 (ENSECAG00000033173) 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ENSGT00940000158514 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000161811 ENSGT00940000159751 ENSGT00940000163742 ENSGT00950000183191.a.b ENSGT00390000005003 ENSGT00390000015354.c.b.b ENSGT00390000006344 ENSGT00940000154248.b ENSGT00550000074975 ENSGT00940000160149 ENSGT00940000153392.b.b.a ENSGT00940000153392.b.b.b ENSGT00940000157641 ENSGT01030000234567.B.b ENSGT00940000160521 ENSGT01090000260061.c.a.c.a ##22 ENSGT00940000155882.a.a ENSGT00900000142991 ENSGT00940000162625 ENSGT00390000016686.n ENSGT00390000010113 ENSGT00390000007848.a ENSGT00940000156847 ENSGT00390000000699 ENSGT01100000263482.E ENSGT01100000263482.A.b ENSGT00940000153594.d ENSGT00940000153253.b.a.g ENSGT00940000155974 ENSGT00940000161467 ENSGT00940000158514 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000161811 ENSGT00940000159751 ENSGT00940000163742 ENSGT00950000183191.a.b ENSGT00390000005003 ENSGT00390000015354.c.b.b ENSGT00390000006344 ENSGT00940000154248.b ENSGT00550000074975 ENSGT00940000160149 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(ENSHGLG00000002611) ENSHGLG00000002012 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000161811 ENSGT00940000159751 ENSGT00940000163742 ENSGT00950000183191.a.b ENSGT00390000005003 ENSGT00390000015354.c.b.b ENSGT00390000006344 ENSGT00940000154248.b ENSGT00550000074975 ENSGT00940000160149 ENSGT00940000153392.b.b.a ENSGT00940000153392.b.b.b ENSGT00940000157641 ENSGT01030000234567.B.b ENSGT00940000160521 ENSGT01090000260061.c.a.c.a ##22 ENSGT00900000142991 ENSGT00940000155882.a.a ENSGT00940000162625 ENSGT00390000016686.n ENSGT00390000010113 ENSGT00390000007848.a ENSGT00940000156847 ENSGT00390000000699 ENSGT01100000263482.E ENSGT00940000153594.d ENSGT00940000153253.b.a.g ENSGT00940000155974 ENSGT00940000161467 ENSGT00940000158514 ENSGT00940000161226 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT00940000161811 ENSGT00940000159751 ENSGT00940000163742 ENSGT00950000183191.a.b ENSGT00390000005003 ENSGT00390000015354.c.b.b ENSGT00390000006344 ENSGT00940000154248.b ENSGT00550000074975 ENSGT00940000160149 ENSGT00940000153392.b.b.a ENSGT00940000153392.b.b.b ENSGT00940000157641 ENSGT01030000234567.B.b ENSGT00940000160521 ENSGT01090000260061.c.a.c.a ##22 ENSGT00940000155882.a.a ENSGT00900000142991 ENSGT00940000162625 ENSGT00390000016686.n ENSGT00390000010113 ENSGT00390000007848.a ENSGT00940000156847 ENSGT00390000000699 ENSGT01100000263482.E ENSGT00940000153594.d ENSGT00940000153253.b.a.g ENSGT00940000155974 ENSGT00940000161467 ENSGT00940000158514 ENSGT00940000161226 Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 163 COL26A1 (ENSCLAG00000007642) MYL10 (ENSCLAG00000008965) CUX1 (ENSCLAG00000006319) SH2B2 (ENSCLAG00000006116) PRKRIP1 (ENSCLAG00000004919) ORAI2 (ENSCLAG00000006058) ALKBH4 (ENSCLAG00000009920) LRWD1 (ENSCLAG00000011458) ENSCLAG00000005238 ENSCLAG00000008836 ENSCLAG00000005034 UPK3B (ENSCLAG00000004506) DTX2 (ENSCLAG00000014352) ENSCLAG00000015451 SSC4D (ENSCLAG00000004521) YWHAG (ENSCLAG00000006999) ##22 SRRM3 (ENSCLAG00000007682) MDH2 (ENSCLAG00000006393) STYXL1 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ENSMMMG00000010833 HIP1 (ENSMMMG00000010793) ENSMMMG00000010192 NSUN5 (ENSMMMG00000010167) TRIM50 (ENSMMMG00000010149) FZD9 (ENSMMMG00000010138) Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000161716 ENSGT00940000161811 ENSGT00940000159751 ENSGT00950000183191.a.b ENSGT00390000005003 ENSGT00390000015354.c.b.b ENSGT00390000006344 ENSGT00940000154248.b ENSGT00550000074975.y.a ENSGT00940000160149 ENSGT00940000153392.b.b.a ENSGT00940000153392.b.b.b ENSGT00940000157641 ENSGT01030000234567.B.b ENSGT00940000160521 ENSGT01090000260061.c.a.c.a ##22 ENSGT00940000155882.a.a ENSGT00900000142991 ENSGT00940000162625 ENSGT00390000016686.n ENSGT00390000010113 ENSGT00390000007848.a ENSGT00940000156847 ENSGT00390000000699 ENSGT01100000263482.E ENSGT01100000263482.A.b ENSGT00940000153594.d ENSGT00940000153253.b.a.g.i ENSGT00940000155974 ENSGT00940000161467 ENSGT00940000158514 Squirrel MODERN SPECIES 143 IFT22 (ENSSTOG00000012125) COL26A1 (ENSSTOG00000020628) MYL10 (ENSSTOG00000028388) CUX1 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ENSUPAG00010015198 UPK3B (ENSUPAG00010015279) DTX2 (ENSUPAG00010015290) ENSUPAG00010015360 SSC4D (ENSUPAG00010015381) YWHAG (ENSUPAG00010015405) ##22 HSPB1 (ENSUPAG00010015423) ENSUPAG00010015432 SRRM3 (ENSUPAG00010015439) MDH2 (ENSUPAG00010015470) STYXL1 (ENSUPAG00010015506) TMEM120A (ENSUPAG00010015529) POR (ENSUPAG00010015566) RHBDD2 (ENSUPAG00010015620) CCL24 (ENSUPAG00010015638) CCL26 (ENSUPAG00010015644) HIP1 (ENSUPAG00010015650) ENSUPAG00010015708 ENSUPAG00010015715 NSUN5 (ENSUPAG00010015725) TRIM50 (ENSUPAG00010015761) Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 9 ENSSVLG00005019119 ENSSVLG00005019320 SH2B2 (ENSSVLG00005019368) ENSSVLG00005019416 PRKRIP1 (ENSSVLG00005019525) ORAI2 (ENSSVLG00005019598) ALKBH4 (ENSSVLG00005019634) LRWD1 (ENSSVLG00005019713) ENSSVLG00005019755 ENSSVLG00005019845 ENSSVLG00005020097 UPK3B (ENSSVLG00005020248) DTX2 (ENSSVLG00005020370) ENSSVLG00005020463 SSC4D (ENSSVLG00005020658) YWHAG (ENSSVLG00005020755) ##22 HSPB1 (ENSSVLG00005020784) ENSSVLG00005020803 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ENSGT00940000155974 ENSGT00940000161467 ENSGT00940000158514 Kangaroo rat MODERN SPECIES 462 Ift22 (ENSDORG00000008294) Col26a1 (ENSDORG00000004325) Myl10 (ENSDORG00000008118) Cux1 (ENSDORG00000005924) Sh2b2 (ENSDORG00000005927) Prkrip1 (ENSDORG00000005929) Orai2 (ENSDORG00000028267) Alkbh4 (ENSDORG00000005931) Lrwd1 (ENSDORG00000005932) Polr2j (ENSDORG00000005934) Rasa4 (ENSDORG00000005796) ENSDORG00000025640 Dtx2 (ENSDORG00000014423) Zp3 (ENSDORG00000004823) ENSDORG00000004820 Ywhag (ENSDORG00000026427) ##22 Hspb1 (ENSDORG00000013353) ENSDORG00000027991 ENSDORG00000014356 Mdh2 (ENSDORG00000009571) Styxl1 (ENSDORG00000009567) Tmem120a (ENSDORG00000013996) Por (ENSDORG00000013993) Rhbdd2 (ENSDORG00000027016) Hip1 (ENSDORG00000010537) Pom121 (ENSDORG00000010532) Nsun5 (ENSDORG00000010530) Trim50 (ENSDORG00000015388) ENSDORG00000015387 Fzd9 (ENSDORG00000012533) Baz1b (ENSDORG00000012540) Myomorpha ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000161811 ENSGT00940000159751 ENSGT00940000163742 ENSGT00950000183191.a.b ENSGT00390000005003 ENSGT00390000015354.c.b.b ENSGT00390000006344 ENSGT00940000154248.b ENSGT00550000074975 ENSGT00940000160149 ENSGT00940000153392.b.b.a ENSGT00940000153392.b.b.b ENSGT00940000157641 ENSGT01030000234567.B.b ENSGT00940000160521 ENSGT01090000260061.c.a.c.a ##22 ENSGT00940000155882.a.a ENSGT00900000142991 ENSGT00940000162625 ENSGT00390000016686.n ENSGT00390000010113 ENSGT00390000007848.a ENSGT00940000156847 ENSGT00390000000699 ENSGT01100000263482.E ENSGT01100000263482.A.b ENSGT00940000153594.d ENSGT00940000153253.b.a.g ENSGT00940000155974 ENSGT00940000161467 ENSGT00940000158514 Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 130 Znhit1 (ENSJJAG00000015186) Cldn15 (ENSJJAG00000023093) Fis1 (ENSJJAG00000022326) ENSJJAG00000014286 Ift22 (ENSJJAG00000014116) Col26a1 (ENSJJAG00000020129) Myl10 (ENSJJAG00000022286) Sh2b2 (ENSJJAG00000013976) Alkbh4 (ENSJJAG00000022071) Lrwd1 (ENSJJAG00000015564) ENSJJAG00000013854 ENSJJAG00000016841 Upk3b (ENSJJAG00000013885) Dtx2 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ENSGT00950000183191.a.b ENSGT00390000005003 ENSGT00390000015354.c.b.b ENSGT00390000006344 ENSGT00940000154248.b ENSGT00550000074975 ENSGT00940000160149 ENSGT00940000153392.b.b.a ENSGT00940000153392.b.b.b ENSGT00940000157641 ENSGT01030000234567.B.b ENSGT00940000160521 ENSGT01090000260061.c.a.c.a ##22 ENSGT00940000155882.a.a ENSGT00900000142991 ENSGT00940000162625 ENSGT00390000016686.n ENSGT00390000010113 ENSGT00390000007848.a ENSGT00940000156847 ENSGT00960000192995 ENSGT00390000000699 ENSGT01100000263482.E ENSGT01100000263482.A.b ENSGT00940000153594.d ENSGT00940000153253.b.a.g ENSGT00940000155974 ENSGT00940000161467 Mus ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000161716 ENSGT00940000161811 ENSGT00940000159751 ENSGT00950000183191.a.b ENSGT00390000005003 ENSGT00390000015354.c.b.b ENSGT00390000006344 ENSGT00940000154248.b ENSGT00550000074975 ENSGT00940000160149 ENSGT00940000153392.b.b.a ENSGT00940000153392.b.b.b ENSGT00940000157641 ENSGT01030000234567.B.b ENSGT00940000160521 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ENSGT00940000153253.b.a.g ENSGT00940000155974 ENSGT00940000161467 Mus_B ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000161716 ENSGT00940000161811 ENSGT00940000159751 ENSGT00950000183191.a.b ENSGT00390000005003 ENSGT00390000015354.c.b.b ENSGT00390000006344 ENSGT00940000154248.b ENSGT00550000074975 ENSGT00940000160149 ENSGT00940000153392.b.b.a ENSGT00940000153392.b.b.b ENSGT00940000157641 ENSGT01030000234567.B.b ENSGT00940000160521 ENSGT01090000260061.c.a.c.a ##22 ENSGT00940000155882.a.a ENSGT00900000142991 ENSGT00940000162625 ENSGT00390000016686.n ENSGT00390000010113 ENSGT00390000007848.a ENSGT00940000156847 ENSGT00960000192995 ENSGT00390000000699 ENSGT01100000263482.E ENSGT00940000165846 ENSGT00940000153594.d ENSGT00940000153253.b.a.g ENSGT00940000155974 ENSGT00940000161467 Mouse MODERN SPECIES 14 Col26a1 (ENSMUSG00000004415) Myl10 (ENSMUSG00000005474) Cux1 (ENSMUSG00000029705) Sh2b2 (ENSMUSG00000005057) Prkrip1 (ENSMUSG00000039737) Orai2 (ENSMUSG00000039747) Alkbh4 (ENSMUSG00000039754) Lrwd1 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(ENSNGAG00000023155) ENSNGAG00000018360 Upk3b (ENSNGAG00000020529) Dtx2 (ENSNGAG00000023472) ENSNGAG00000011498 Zp3 (ENSNGAG00000003124) ENSNGAG00000023575 ENSNGAG00000024341 Ywhag (ENSNGAG00000022966) ##22 ENSNGAG00000021979 Hspb1 (ENSNGAG00000021729) ENSNGAG00000005825 Mdh2 (ENSNGAG00000001880) ENSNGAG00000013372 ENSNGAG00000022860 Tmem120a (ENSNGAG00000013660) Por (ENSNGAG00000014471) Primates ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000161811 ENSGT00940000159751 ENSGT00940000163742 ENSGT00950000183191.a.b ENSGT00390000005003 ENSGT00390000015354.c.b.b ENSGT00390000006344 ENSGT00940000154248.b ENSGT00550000074975 ENSGT00940000160149 ENSGT00940000153392.b.b.a ENSGT00940000153392.b.b.b ENSGT00940000157641 ENSGT01030000234567.B.b ENSGT00940000160521 ENSGT01090000260061.c.a.c.a ##22 ENSGT00940000155882.a.a ENSGT00940000162625 ENSGT00390000016686.n ENSGT00390000010113 ENSGT00390000007848.a ENSGT00940000156847 ENSGT00390000000699 ENSGT01100000263482.E ENSGT01100000263482.A.b ENSGT00940000153594.d ENSGT00910000148262 ENSGT00940000153253.b.a.g ENSGT00940000155974 ENSGT00940000161467 ENSGT00940000158514 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000161811 ENSGT00940000159751 ENSGT00940000163742 ENSGT00950000183191.a.b ENSGT00390000005003 ENSGT00390000015354.c.b.b ENSGT00390000006344 ENSGT00940000154248.b ENSGT00550000074975 ENSGT00940000160149 ENSGT00940000153392.b.b.a ENSGT00940000153392.b.b.b ENSGT00940000157641 ENSGT01030000234567.B.b ENSGT00940000160521 ENSGT01090000260061.c.a.c.a ##22 ENSGT00940000155882.a.a ENSGT00940000162625 ENSGT00390000016686.n ENSGT00390000010113 ENSGT00390000007848.a ENSGT00940000156847 ENSGT00390000000699 ENSGT01100000263482.E ENSGT01100000263482.A.b ENSGT00940000153594.d ENSGT00910000148262 ENSGT00940000153253.b.a.g ENSGT00940000155974 ENSGT00940000161467 ENSGT00940000158514 Tarsier MODERN SPECIES 7213 RAB20 (ENSTSYG00000029186) COL4A2 (ENSTSYG00000000141) UPK3B (ENSTSYG00000033902) DTX2 (ENSTSYG00000034820) ENSTSYG00000004562 SSC4D (ENSTSYG00000004541) YWHAG (ENSTSYG00000031038) ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000163742 ENSGT00950000183191.a.b ENSGT00390000005003 ENSGT00390000015354.c.b.b ENSGT00390000006344 ENSGT00940000154248.b ENSGT00940000164393 ENSGT00390000002643 ENSGT00550000074975 ENSGT00940000160149 ENSGT00940000153392.b.b.a ENSGT00940000153392.b.b.b ENSGT00940000157641 ENSGT01030000234567.B.b ENSGT00940000160521 ENSGT01090000260061.c.a.c.a ##22 ENSGT00910000147473 ENSGT00940000155882.a.a ENSGT00940000162625 ENSGT00390000016686.n ENSGT00390000010113 ENSGT00390000007848.a ENSGT00940000156847 ENSGT00390000000699 ENSGT01100000263482.E ENSGT01100000263482.A.b ENSGT00940000153594.d ENSGT00910000148262 ENSGT00940000153253.b.a.g ENSGT00940000155974 ENSGT00940000161467 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000159751 ENSGT00950000183191.a.b ENSGT00390000005003 ENSGT00390000015354.c.b.b ENSGT00390000006344 ENSGT00940000154248.b ENSGT00940000164393 ENSGT00390000002643 ENSGT00550000074975 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ENSGT00940000156847 ENSGT00390000000699 ENSGT01100000263482.E ENSGT01100000263482.A.b ENSGT00940000153594.d ENSGT00910000148262 ENSGT00940000153253.b.a.g ENSGT00940000155974 ENSGT00940000161467 ENSGT00940000158514 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000161716 ENSGT00940000161811 ENSGT00940000159751 ENSGT00950000183191.a.b ENSGT00390000005003 ENSGT00390000015354.c.b.b ENSGT00390000006344 ENSGT00940000154248.b ENSGT00550000074975 ENSGT00940000160149 ENSGT00940000153392.b.b.a ENSGT00940000153392.b.b.b ENSGT00940000157641 ENSGT01030000234567.B.b ENSGT00940000160521 ENSGT01090000260061.c.a.c.a ##22 ENSGT00940000155882.a.a.u.a.a ENSGT00940000162625 ENSGT00390000016686.n ENSGT00390000010113 ENSGT00390000007848.a ENSGT00940000156847 ENSGT00390000000699 ENSGT01100000263482.E ENSGT01100000263482.A.b ENSGT00940000153594.d ENSGT00910000148262 ENSGT00940000153253.b.a.g ENSGT00940000155974 ENSGT00940000161467 ENSGT00940000158514 Capuchin MODERN SPECIES 82 MYL10 (ENSCCAG00000020371) 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SPECIES 3 ENSGT00940000161811 ENSGT00940000159751 ENSGT00950000183191.a.b ENSGT00390000005003 ENSGT00910000148683 ENSGT00390000015354.c.b.b ENSGT00390000006344 ENSGT00940000154248.b ENSGT00550000074975 ENSGT00940000160149 ENSGT00940000153392.b.b.a ENSGT00940000153392.b.b.b ENSGT00940000157641 ENSGT01030000234567.B.b ENSGT00940000160521 ENSGT01090000260061.c.a.c.a ##22 ENSGT00940000155882.a.a ENSGT00940000162625 ENSGT00390000016686.n ENSGT00390000010113 ENSGT00390000007848.a ENSGT00940000156847 ENSGT00390000000699 ENSGT01100000263482.E ENSGT00940000165846 ENSGT00940000168291 ENSGT01100000263482.A.b ENSGT00940000153594.d ENSGT00910000148262 ENSGT00940000153253.b.a.g ENSGT00940000155974 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000161811 ENSGT00940000159751 ENSGT00950000183191.a.b ENSGT00390000005003 ENSGT00910000148683 ENSGT00390000015354.c.b.b ENSGT00390000006344 ENSGT00940000154248.b ENSGT00550000074975 ENSGT00940000160149 ENSGT00940000153392.b.b.a ENSGT00940000153392.b.b.b 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SPECIES 194 MYL10 (ENSMNEG00000024220) CUX1 (ENSMNEG00000040279) SH2B2 (ENSMNEG00000010853) PRKRIP1 (ENSMNEG00000030860) ORAI2 (ENSMNEG00000001555) ENSMNEG00000044440 ALKBH4 (ENSMNEG00000035155) LRWD1 (ENSMNEG00000040484) ENSMNEG00000035842 ENSMNEG00000035704 ENSMNEG00000009610 ENSMNEG00000033743 DTX2 (ENSMNEG00000035115) ENSMNEG00000019906 SSC4D (ENSMNEG00000032353) YWHAG (ENSMNEG00000028080) ##22 HSPB1 (ENSMNEG00000015013) Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00940000161716 ENSGT00940000161811 ENSGT00940000159751 ENSGT00950000183191.a.b ENSGT00390000005003 ENSGT00390000015354.c.b.b ENSGT00390000006344 ENSGT00940000154248.b ENSGT00550000074975 ENSGT00940000160149 ENSGT00940000153392.b.b.a ENSGT00940000153392.b.b.b ENSGT00940000157641 ENSGT01030000234567.B.b ENSGT00940000160521 ENSGT01090000260061.c.a.c.a ##22 ENSGT00940000155882.a.a ENSGT00940000162625 ENSGT00390000016686.n ENSGT00390000010113 ENSGT00390000007848.a ENSGT00940000156847 ENSGT00390000000699 ENSGT01100000263482.E 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(ENSCATG00000033703) ENSCATG00000033173 ORAI2 (ENSCATG00000032429) ALKBH4 (ENSCATG00000040957) LRWD1 (ENSCATG00000031283) ENSCATG00000016595 ENSCATG00000041124 ENSCATG00000033062 ENSCATG00000036369 DTX2 (ENSCATG00000012083) ENSCATG00000026904 SSC4D (ENSCATG00000039464) YWHAG (ENSCATG00000038855) ##22 HSPB1 (ENSCATG00000033687) SRRM3 (ENSCATG00000043129) MDH2 (ENSCATG00000037325) STYXL1 (ENSCATG00000039290) TMEM120A (ENSCATG00000040164) POR (ENSCATG00000040584) RHBDD2 (ENSCATG00000034404) CCL24 (ENSCATG00000041170) CCL26 (ENSCATG00000045354) HIP1 (ENSCATG00000034444) ENSCATG00000040581 NSUN5 (ENSCATG00000015253) TRIM50 (ENSCATG00000030497) FKBP6 (ENSCATG00000039896) FZD9 (ENSCATG00000005138) Olive baboon MODERN SPECIES 14 ENSPANG00000043046 CUX1 (ENSPANG00000016879) SH2B2 (ENSPANG00000024962) ENSPANG00000046471 PRKRIP1 (ENSPANG00000005836) ORAI2 (ENSPANG00000040031) ALKBH4 (ENSPANG00000039597) LRWD1 (ENSPANG00000026301) ENSPANG00000037618 ENSPANG00000006303 ENSPANG00000005835 ENSPANG00000046110 ENSPANG00000044109 ENSPANG00000045364 SSC4D (ENSPANG00000010486) YWHAG (ENSPANG00000015907) ##22 ENSPANG00000009241 SRRM3 (ENSPANG00000000776) MDH2 (ENSPANG00000017997) RHBDD2 (ENSPANG00000007149) POR (ENSPANG00000018606) TMEM120A (ENSPANG00000006929) FKBP6 (ENSPANG00000010879) TRIM50 (ENSPANG00000008677) NSUN5 (ENSPANG00000018605) ENSPANG00000006896 HIP1 (ENSPANG00000013801) CCL26 (ENSPANG00000021954) CCL24 (ENSPANG00000022015) FZD9 (ENSPANG00000019358) BAZ1B (ENSPANG00000021193) Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 57 ENSGT00940000159751 ENSGT00950000183191.a.b ENSGT00390000005003 ENSGT00910000148683 ENSGT00390000015354.c.b.b ENSGT00390000006344 ENSGT00940000154248.b ENSGT00940000164393 ENSGT00390000002643 ENSGT00940000160149 ENSGT00940000153392.b.b.a ENSGT00940000153392.b.b.b ENSGT00940000157641 ENSGT01030000234567.B.b ENSGT00940000160521 ENSGT01090000260061.c.a.c.a ##22 ENSGT00910000147473 ENSGT00940000155882.a.a.`b.b ENSGT00940000162625 ENSGT00390000016686.n.h.a ENSGT00390000010113 ENSGT00390000007848.a ENSGT00940000156847 ENSGT00390000000699 ENSGT01100000263482.E ENSGT01100000263482.A.b ENSGT00940000153594.d ENSGT00940000153253.b.a.g ENSGT00940000155974 ENSGT00940000161467 ENSGT00940000158514 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2632 CUX1 (ENSRROG00000044945) SH2B2 (ENSRROG00000011013) PRKRIP1 (ENSRROG00000043589) ENSRROG00000039093 ORAI2 (ENSRROG00000030748) ALKBH4 (ENSRROG00000045199) LRWD1 (ENSRROG00000042471) ENSRROG00000035578 ENSRROG00000037205 ENSRROG00000029286 ENSRROG00000028897 UPK3B (ENSRROG00000031265) DTX2 (ENSRROG00000026439) ENSRROG00000005604 SSC4D (ENSRROG00000040414) YWHAG (ENSRROG00000034757) ##22 ENSRROG00000044238 ENSRROG00000039764 SRRM3 (ENSRROG00000034980) ENSRROG00000030684 STYXL1 (ENSRROG00000041332) TMEM120A (ENSRROG00000034774) POR (ENSRROG00000040500) ENSRROG00000004708 CCL24 (ENSRROG00000044114) CCL26 (ENSRROG00000035529) HIP1 (ENSRROG00000043117) ENSRROG00000044906 NSUN5 (ENSRROG00000041917) TRIM50 (ENSRROG00000036480) FKBP6 (ENSRROG00000029764) Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00950000183191.a.b ENSGT00390000005003 ENSGT00910000148683 ENSGT00390000015354.c.b.b ENSGT00390000006344 ENSGT00940000154248.b ENSGT00940000164393 ENSGT00390000002643 ENSGT00550000074975 ENSGT00940000160149 ENSGT00940000153392.b.b.a ENSGT00940000153392.b.b.b ENSGT00940000157641 ENSGT01030000234567.B.b ENSGT00940000160521 ENSGT01090000260061.c.a.c.a ##22 ENSGT00940000155882.a.a ENSGT00940000162625 ENSGT00390000016686.n ENSGT00390000010113 ENSGT00390000007848.a ENSGT00940000156847 ENSGT00390000000699 ENSGT01100000263482.E ENSGT01100000263482.A.b ENSGT00940000153594.d ENSGT00940000154303.C.g ENSGT00940000153253.b.a.g ENSGT00940000155974.i.a ENSGT00940000167700 ENSGT00940000155974.j Hominidae ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00950000183191.a.b ENSGT00390000005003 ENSGT00910000148683 ENSGT00390000015354.c.b.b ENSGT00390000006344 ENSGT00940000154248.b ENSGT00940000164393 ENSGT00390000002643 ENSGT00550000074975 ENSGT00940000160149 ENSGT00940000153392.b.b.a ENSGT00940000153392.b.b.b ENSGT00940000157641 ENSGT01030000234567.B.b ENSGT00940000160521 ENSGT01090000260061.c.a.c.a ##22 ENSGT00940000155882.a.a ENSGT00940000162625 ENSGT00390000016686.n ENSGT00390000010113 ENSGT00390000007848.a ENSGT00940000156847 ENSGT00390000000699 ENSGT01100000263482.E ENSGT01100000263482.A.b ENSGT00940000153594.d ENSGT00910000146651.b Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00940000157641.t.a ENSGT00900000141074.e.a.b.a.a.b ENSGT00940000153392.b.b.b ENSGT00940000157641.t.b ENSGT01030000234567.B.b ENSGT00940000160521 ENSGT01090000260061.c.a.c.a ##22 ENSGT00940000155882.a.a ENSGT00940000162625 ENSGT00390000016686.n ENSGT00390000010113 ENSGT00390000007848.a ENSGT00940000156847 ENSGT00390000000699 ENSGT00940000168291 ENSGT00390000006208.a.a Gorilla MODERN SPECIES 20 ENSGGOG00000016975 ENSGGOG00000040701 ENSGGOG00000038097 PRKRIP1 (ENSGGOG00000007726) ORAI2 (ENSGGOG00000016045) ALKBH4 (ENSGGOG00000000694) LRWD1 (ENSGGOG00000023543) ENSGGOG00000004519 ENSGGOG00000038950 ENSGGOG00000003930 ENSGGOG00000005457 ENSGGOG00000005455 ENSGGOG00000044035 ENSGGOG00000005450 SSC4D (ENSGGOG00000005447) YWHAG (ENSGGOG00000024098) ##22 HSPB1 (ENSGGOG00000002700) ENSGGOG00000036497 MDH2 (ENSGGOG00000011790) STYXL1 (ENSGGOG00000014256) TMEM120A (ENSGGOG00000026408) ENSGGOG00000041192 POR (ENSGGOG00000005876) RHBDD2 (ENSGGOG00000016935) ENSGGOG00000004845 HIP1 (ENSGGOG00000016310) ENSGGOG00000041636 POM121C (ENSGGOG00000011716) ENSGGOG00000043878 NSUN5 (ENSGGOG00000011730) ENSGGOG00000015742 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000157641.t.a ENSGT00900000141074.e.a.b.a.a.b ENSGT00940000153392.b.b.b ENSGT00940000157641.t.b ENSGT01030000234567.B.b.i ENSGT00940000160521 ENSGT01090000260061.c.a.c.a ##22 ENSGT00940000155882.a.a ENSGT00940000162625 ENSGT00390000016686.n ENSGT00390000010113 ENSGT00390000007848.a ENSGT00940000156847 ENSGT00390000000699 ENSGT01100000263482.E ENSGT01100000263482.A.b ENSGT00940000153594.d.j ENSGT00940000154173.A.a.c.a.b.a.a.a.a.b.a.b ENSGT00390000006208.a.a ENSGT00940000157317 ENSGT00940000162266 ENSGT00940000160014 Pan ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00910000147808 ENSGT00940000155057 ENSGT00390000011648.a ENSGT00390000007283 ENSGT00390000001969.b ENSGT00940000156909 ENSGT00390000012875 ENSGT00530000063534.a ENSGT00940000157946 ENSGT00940000153392.b.b.b ENSGT00940000157641.t.b ENSGT00940000157641.t.a ENSGT00900000141074.e.a.b.a.a.b ENSGT01030000234567.B.b.i ENSGT00940000160521 ENSGT01090000260061.c.a.c.a ##22 Chimpanzee MODERN SPECIES 20 ENSPTRG00000044849 ENSPTRG00000052674 ENSPTRG00000043322 ENSPTRG00000050917 ENSPTRG00000028444 ENSPTRG00000045503 ENSPTRG00000045418 ENSPTRG00000028525 ENSPTRG00000028524 ENSPTRG00000019325 ENSPTRG00000045976 DTX2 (ENSPTRG00000019326) ZP3 (ENSPTRG00000019323) SSC4D (ENSPTRG00000019322) ENSPTRG00000049175 YWHAG (ENSPTRG00000019320) ##22 HSPB1 (ENSPTRG00000019319) SRRM3 (ENSPTRG00000019317) ENSPTRG00000048369 MDH2 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ENSGT00950000183191.a.b ENSGT00390000005003 ENSGT00390000015354.c.b.b ENSGT00390000006344 ENSGT00940000154248.b ENSGT00550000074975 ENSGT00940000160149 ENSGT00940000153392.b.b.a ENSGT00940000153392.b.b.b ENSGT00940000157641 ENSGT01030000234567.B.b ENSGT00940000160521 ENSGT01090000260061.c.a.c.a ##22 ENSGT00940000155882.a.a ENSGT00940000162625 ENSGT00390000016686.n ENSGT00390000010113 ENSGT00390000007848.a ENSGT00940000156847 ENSGT00390000000699 Elephant MODERN SPECIES 403 ENSLAFG00000005922 MYL10 (ENSLAFG00000031784) CUX1 (ENSLAFG00000002555) SH2B2 (ENSLAFG00000002557) PRKRIP1 (ENSLAFG00000004916) ORAI2 (ENSLAFG00000004919) ALKBH4 (ENSLAFG00000004920) LRWD1 (ENSLAFG00000006779) ENSLAFG00000021507 ENSLAFG00000027014 ENSLAFG00000025691 UPK3B (ENSLAFG00000022980) DTX2 (ENSLAFG00000022906) ENSLAFG00000012464 SSC4D (ENSLAFG00000012462) YWHAG (ENSLAFG00000012457) ##22 ENSLAFG00000032744 MDH2 (ENSLAFG00000005253) STYXL1 (ENSLAFG00000000884) TMEM120A (ENSLAFG00000000883) POR (ENSLAFG00000000882) RHBDD2 (ENSLAFG00000000553) FAM20C (ENSLAFG00000015758) PDGFA (ENSLAFG00000011919) PRKAR1B (ENSLAFG00000022863) ENSLAFG00000015992 SUN1 (ENSLAFG00000015996) GET4 (ENSLAFG00000016008) ADAP1 (ENSLAFG00000016012) COX19 (ENSLAFG00000004895) CYP2W1 (ENSLAFG00000006885) Hyrax MODERN SPECIES 5345 ENSPCAG00000013497 SSC4D (ENSPCAG00000013444) YWHAG (ENSPCAG00000013421) ##22 Tenrec MODERN SPECIES 12606 YWHAG (ENSETEG00000007484) ##22 Sauria ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00390000013187 ENSGT00940000170602 ENSGT00940000159751 ENSGT00940000163742 ENSGT00950000183191.a.b ENSGT00390000005003 ENSGT00390000015354.c.b.b ENSGT00390000006344 ENSGT00940000154248.b ENSGT00550000074975 ENSGT00940000160149 ENSGT00940000153392.b.b.a ENSGT00940000153392.b.b.b ENSGT00940000157641 ENSGT00940000160521 ENSGT01090000260061.c.a.c.a ##22 ENSGT01030000235453 ENSGT00940000155882.a.a ENSGT00900000142991 ENSGT00940000162625 ENSGT00390000016686 ENSGT00390000010113 ENSGT00940000164883 ENSGT00390000007848.a ENSGT00940000156847 ENSGT00390000000699 ENSGT00960000191068 ENSGT00940000165977 ENSGT00940000156438 ENSGT00940000159596 ENSGT00390000007830 Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES 103 ENSGT00940000153392.b.b.a ENSGT00940000153392.b.b.b ENSGT00940000157641 ENSGT00940000160521 ENSGT01090000260061.c.a.c.a ##22 ENSGT00940000155882.a.a ENSGT01030000235453 ENSGT00940000162625 ENSGT00390000016686 ENSGT00390000010113 ENSGT00940000164883 ENSGT00390000007848.a ENSGT00940000156847 ENSGT00390000000699 ENSGT00960000191068 ENSGT00940000156438 ENSGT00940000159596 ENSGT00960000189835 ENSGT00940000154849.a ENSGT00940000160764 tuatara MODERN SPECIES 1203 MIS12 (ENSSPUG00000007157) CAMKK1 (ENSSPUG00000007039) P2RX1 (ENSSPUG00000007002) ATP2A3 (ENSSPUG00000006983) ZZEF1 (ENSSPUG00000006713) CYB5D2 (ENSSPUG00000006646) ANKFY1 (ENSSPUG00000006623) UBE2G1 (ENSSPUG00000006609) SPNS3 (ENSSPUG00000006553) SPNS2 (ENSSPUG00000006466) MYBBP1A (ENSSPUG00000006417) EIF4H (ENSSPUG00000006402) UPK3B (ENSSPUG00000006384) DTX2 (ENSSPUG00000006368) SSC4D (ENSSPUG00000006350) YWHAG (ENSSPUG00000006341) ##22 HSPB1 (ENSSPUG00000006322) SRRM3 (ENSSPUG00000006285) MDH2 (ENSSPUG00000006263) STYXL1 (ENSSPUG00000006150) TMEM120A (ENSSPUG00000006102) POR (ENSSPUG00000006093) RHBDD2 (ENSSPUG00000006085) TAF15 (ENSSPUG00000006042) MMP28 (ENSSPUG00000006018) RASL10B (ENSSPUG00000005974) ENSSPUG00000005963 AP2B1 (ENSSPUG00000005938) PEX12 (ENSSPUG00000005914) ENSSPUG00000005879 UNC45B (ENSSPUG00000005839) Episquamata ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00530000063743.b ENSGT00390000015063 ENSGT00390000006416 ENSGT00390000018665 ENSGT00530000063156.a.b ENSGT00940000156747 ENSGT00390000018406 ENSGT00940000154890.a ENSGT01020000230351.C ENSGT00940000155668 ENSGT00940000155045 ENSGT00940000153392.b.b.a ENSGT00940000153392.b.b.b ENSGT00940000157641 ENSGT00940000160521 ENSGT01090000260061.c.a.c.a ##22 ENSGT00940000155882.a.a ENSGT01030000235453 ENSGT00940000162625 ENSGT00940000156265.x.b.a.a.a.b ENSGT00390000016686 ENSGT00940000164883 ENSGT00390000007848.a ENSGT00940000156847 ENSGT00390000000699 ENSGT00960000191068 ENSGT00940000156438 ENSGT00940000159596 ENSGT00960000189835 ENSGT00940000154849.a ENSGT00940000160764 Laterata ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00390000013187 ENSGT00530000063743.b ENSGT00390000015063 ENSGT00390000006416 ENSGT00390000018665 ENSGT00530000063156.a.b ENSGT00940000156747 ENSGT00390000018406 ENSGT00940000154890.a ENSGT01020000230351.C ENSGT00940000155668 ENSGT00940000153392.b.b.a ENSGT00940000153392.b.b.b ENSGT00940000157641 ENSGT00940000160521 ENSGT01090000260061.c.a.c.a ##22 ENSGT00940000155882.a.a ENSGT01030000235453 ENSGT00940000162625 ENSGT00940000156265.x.b.a.a.a.b ENSGT00390000016686 ENSGT00390000010113 ENSGT00390000007848.a ENSGT00940000156847 ENSGT00390000000699 Common wall lizard MODERN SPECIES 6 NUP88 (ENSPMRG00000016474) ENSPMRG00000016830 MIS12 (ENSPMRG00000016833) DERL2 (ENSPMRG00000016840) DHX33 (ENSPMRG00000016862) C1QBP (ENSPMRG00000016881) CAMKK1 (ENSPMRG00000016892) P2RX1 (ENSPMRG00000016916) ATP2A3 (ENSPMRG00000017017) ENSPMRG00000017620 ENSPMRG00000017629 UPK3B (ENSPMRG00000017647) DTX2 (ENSPMRG00000017658) ENSPMRG00000017665 ENSPMRG00000017670 YWHAG (ENSPMRG00000017676) ##22 ENSPMRG00000017686 HSPB1 (ENSPMRG00000017688) ENSPMRG00000017723 ENSPMRG00000017732 ENSPMRG00000017737 MDH2 (ENSPMRG00000017750) STYXL1 (ENSPMRG00000017774) TMEM120A (ENSPMRG00000017797) POR (ENSPMRG00000017929) RHBDD2 (ENSPMRG00000018356) PEX12 (ENSPMRG00000018371) AP2B1 (ENSPMRG00000018527) RASL10B (ENSPMRG00000018960) ENSPMRG00000018970 MMP28 (ENSPMRG00000018993) Argentine black and white tegu DUPLICATION Argentine black and white tegu MODERN SPECIES 1 ENSSMRG00000023354 ALYREF (ENSSMRG00000023353) ANAPC11 (ENSSMRG00000023352) NPB (ENSSMRG00000023351) PCYT2 (ENSSMRG00000023350) SIRT7 (ENSSMRG00000023349) MAFG (ENSSMRG00000023348) ENSSMRG00000023347 MYADML2 (ENSSMRG00000023346) NOTUM (ENSSMRG00000023345) ASPSCR1 (ENSSMRG00000023343) CENPX (ENSSMRG00000023342) LRRC45 (ENSSMRG00000023341) RAC3 (ENSSMRG00000023340) DCXR (ENSSMRG00000023339) ENSSMRG00000023338 ##22 RFNG (ENSSMRG00000023337) GPS1 (ENSSMRG00000023336) DUS1L (ENSSMRG00000023335) FASN (ENSSMRG00000023334) ENSSMRG00000023333 SLC16A3 (ENSSMRG00000023332) CSNK1D (ENSSMRG00000023331) UTP18 (ENSSMRG00000023330) MBTD1 (ENSSMRG00000023329) NME2 (ENSSMRG00000023328) NME1 (ENSSMRG00000023327) ENSSMRG00000023326 SPAG9 (ENSSMRG00000023325) TOB1 (ENSSMRG00000023324) WFIKKN2 (ENSSMRG00000023323) Argentine black and white tegu MODERN SPECIES 203 TAF15 (ENSSMRG00000003254) ENSSMRG00000003262 ENSSMRG00000003264 UPK3B (ENSSMRG00000003267) DTX2 (ENSSMRG00000003270) SSC4D (ENSSMRG00000003277) ENSSMRG00000003287 ##22 HSPB1 (ENSSMRG00000003288) ENSSMRG00000003289 SRRM3 (ENSSMRG00000003300) ENSSMRG00000003341 MDH2 (ENSSMRG00000003346) ENSSMRG00000003350 TMEM120A (ENSSMRG00000003359) Toxicofera ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00530000063743.b ENSGT00390000015063 ENSGT00390000006416 ENSGT00390000018665 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##22 HSPB1 (ENSGALG00010029612) ENSGALG00010029785 SRRM3 (ENSGALG00010029613) MDH2 (ENSGALG00010029614) ENSGALG00010029615 TMEM120A (ENSGALG00010029616) POR (ENSGALG00010029617) ENSGALG00010029619 ENSGALG00010029620 TAF15 (ENSGALG00010029621) MMP28 (ENSGALG00010029622) ENSGALG00010029623 RASL10B (ENSGALG00010029624) AP2B1 (ENSGALG00010029626) PEX12 (ENSGALG00010029627) Japanese quail MODERN SPECIES 10 ENSCJPG00005009325 ENSCJPG00005009326 CUX1 (ENSCJPG00005009330) SH2B2 (ENSCJPG00005009791) PRKRIP1 (ENSCJPG00005009793) ORAI2 (ENSCJPG00005009795) ALKBH4 (ENSCJPG00005009796) LRWD1 (ENSCJPG00005009797) ENSCJPG00005009798 ENSCJPG00005009799 ENSCJPG00005009800 UPK3B (ENSCJPG00005009801) DTX2 (ENSCJPG00005009802) ENSCJPG00005009804 SSC4D (ENSCJPG00005009805) YWHAG (ENSCJPG00005009811) ##22 HSPB1 (ENSCJPG00005009812) SRRM3 (ENSCJPG00005009813) MDH2 (ENSCJPG00005009814) ENSCJPG00005009815 TMEM120A (ENSCJPG00005009816) POR (ENSCJPG00005009821) ENSCJPG00005009827 TAF15 (ENSCJPG00005009893) MMP28 (ENSCJPG00005009900) ENSCJPG00005009902 RASL10B (ENSCJPG00005009905) AP2B1 (ENSCJPG00005009912) PEX12 (ENSCJPG00005009914) UNC45B (ENSCJPG00005009918) ENSCJPG00005009920 Anatidae ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000161716 ENSGT00940000167381 ENSGT00940000159751 ENSGT00940000163742 ENSGT00950000183191.a.b ENSGT00390000005003 ENSGT00390000015354.c.b.b ENSGT00390000006344 ENSGT00940000154248.b ENSGT00550000074975 ENSGT00940000160149 ENSGT00940000153392.b.b.a ENSGT00940000153392.b.b.b ENSGT00940000157641 ENSGT00940000160521 ENSGT01090000260061.c.a.c.a ##22 ENSGT01030000235453 ENSGT00940000155882.a.a ENSGT00940000162625 ENSGT00390000016686 ENSGT00940000164883 ENSGT00390000007848.a ENSGT00940000156847 ENSGT00390000000699 ENSGT00940000156438 ENSGT00940000159596 ENSGT00940000154849.a ENSGT00940000160764 ENSGT00940000155206 ENSGT00390000016209 ENSGT00410000025651.A.a Pink-footed goose MODERN SPECIES 38 ENSABRG00000000810 CUX1 (ENSABRG00000000863) ENSABRG00000001096 ENSABRG00000001146 SH2B2 (ENSABRG00000001156) PRKRIP1 (ENSABRG00000001187) ORAI2 (ENSABRG00000001202) ALKBH4 (ENSABRG00000001235) LRWD1 (ENSABRG00000001249) ENSABRG00000001302 ENSABRG00000001359 ENSABRG00000001450 UPK3B (ENSABRG00000001470) DTX2 (ENSABRG00000001492) SSC4D (ENSABRG00000001586) YWHAG (ENSABRG00000001641) ##22 ENSABRG00000001693 HSPB1 (ENSABRG00000001700) SRRM3 (ENSABRG00000001730) MDH2 (ENSABRG00000001842) ENSABRG00000001887 TMEM120A (ENSABRG00000001955) POR (ENSABRG00000002005) RHBDD2 (ENSABRG00000002103) TAF15 (ENSABRG00000002253) MMP28 (ENSABRG00000002268) ENSABRG00000002276 RASL10B (ENSABRG00000002299) AP2B1 (ENSABRG00000002319) PEX12 (ENSABRG00000002398) ENSABRG00000002424 Duck MODERN SPECIES 11 NUP88 (ENSAPLG00000015794) RABEP1 (ENSAPLG00000016012) IFT22 (ENSAPLG00000020497) COL26A1 (ENSAPLG00000000582) ENSAPLG00000000709 ENSAPLG00000001296 CUX1 (ENSAPLG00000002588) ENSAPLG00000028994 ENSAPLG00000003744 LRWD1 (ENSAPLG00000003533) SH2B2 (ENSAPLG00000028018) PRKRIP1 (ENSAPLG00000026029) ORAI2 (ENSAPLG00000003488) ALKBH4 (ENSAPLG00000003499) ENSAPLG00000003804 YWHAG (ENSAPLG00000004442) ##22 SRRM3 (ENSAPLG00000004545) MDH2 (ENSAPLG00000004591) TMEM120A (ENSAPLG00000005153) POR (ENSAPLG00000005585) TAF15 (ENSAPLG00000006217) RHBDD2 (ENSAPLG00000025011) MMP28 (ENSAPLG00000006470) ENSAPLG00000023918 ENSAPLG00000030046 AP2B1 (ENSAPLG00000006779) RAD51D (ENSAPLG00000008196) RFFL (ENSAPLG00000008748) LIG3 (ENSAPLG00000008964) TMEM132E (ENSAPLG00000009524) ENSAPLG00000021360 Cyclostomata ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.a.c.a ##22 Hagfish MODERN SPECIES 299 ENSEBUG00000007231 ENSEBUG00000014998 tyw5 (ENSEBUG00000006382) ENSEBUG00000014800 ENSEBUG00000013741 ENSEBUG00000008118 ENSEBUG00000013293 elovl6l (ENSEBUG00000014607) ENSEBUG00000011354 ywhag1 (ENSEBUG00000010992) ##22 ENSEBUG00000015129 ENSEBUG00000009894 slc1a2b (ENSEBUG00000000820) Vertebrata ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES 591 ENSGT00940000159687 ENSGT00940000160353 ENSGT00500000044989 ENSGT00390000016559 ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 Elephant shark MODERN SPECIES 1711 ENSCMIG00000006262 ppm1f (ENSCMIG00000006260) TOP3B (ENSCMIG00000006257) rab35b (ENSCMIG00000006253) GCN1 (ENSCMIG00000005130) ENSCMIG00000004811 ENSCMIG00000004791 rab36 (ENSCMIG00000004775) GNAZ (ENSCMIG00000004773) RSPH14 (ENSCMIG00000004770) DEPDC5 (ENSCMIG00000004677) YWHAH (ENSCMIG00000004606) ##22 slc5a1 (ENSCMIG00000004517) Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 351 ENSGT00390000016559 ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 ENSGT00520000055626.a ENSGT00940000154388 ENSGT00390000013484 ENSGT00940000154110.a ENSGT00940000166668 ENSGT00390000012071 ENSGT00940000153340.B ENSGT00940000159296 Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00390000016559 ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 ENSGT00520000055626.a ENSGT00940000154388 ENSGT00390000013484 ENSGT00940000154110.a ENSGT00940000166668 ENSGT00390000012071 ENSGT00940000153340.B ENSGT00940000159296 ENSGT00940000162372 ENSGT00940000155307.b ENSGT01030000234517.E ENSGT00940000157442 ENSGT00940000158557 ENSGT00940000153612.B Neopterygii ANCESTRAL SPECIES 340 ENSGT00390000016559 ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 ENSGT00520000055626.a ENSGT00390000013484 ENSGT00940000154110.a ENSGT00940000166668 ENSGT00390000012071 ENSGT00940000159296 Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 562 ENSGT00390000016559 ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 47 ENSGT00940000159687 ENSGT00390000016559 ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 ENSGT00680000100126.i ENSGT00940000162631 ENSGT00940000166787 ENSGT00940000153340.B ENSGT00940000157856 ENSGT00390000014879.c.a.a.a ENSGT00940000156185 ENSGT00390000006707 ENSGT00390000011206.a ENSGT00390000006867 ENSGT00390000001280.b ENSGT00940000154779.a.b.a ENSGT00390000014909 ENSGT00940000166216 Asian bonytongue MODERN SPECIES 21 SSH1 (ENSSFOG00015015810) ENSSFOG00015015832 FOXN4 (ENSSFOG00015015852) rfx3 (ENSSFOG00015029856) glis3 (ENSSFOG00015015922) zgc:56235 (ENSSFOG00015015933) SLC25A1 (ENSSFOG00015015942) pi4kaa (ENSSFOG00015015982) hic2 (ENSSFOG00015016070) UBE2L5 (ENSSFOG00015016080) sdf2l1 (ENSSFOG00015032321) sppl3 (ENSSFOG00015031011) GNAZ (ENSSFOG00015028594) rab36 (ENSSFOG00015016156) DEPDC5 (ENSSFOG00015016202) ywhah (ENSSFOG00015016274) ##22 slc5a1 (ENSSFOG00015016283) RNF208 (ENSSFOG00015028895) nt5c2l1 (ENSSFOG00015016324) slc2a11l (ENSSFOG00015016375) drg1 (ENSSFOG00015016405) STARD7 (ENSSFOG00015031749) slc20a1b (ENSSFOG00015016452) gmcl1 (ENSSFOG00015016487) fam136a (ENSSFOG00015025273) pcyox1 (ENSSFOG00015016539) DTWD2 (ENSSFOG00015032604) snx24 (ENSSFOG00015016591) loxa (ENSSFOG00015025004) GGCX (ENSSFOG00015016692) ska1 (ENSSFOG00015026613) P. kingsleyae MODERN SPECIES 2 dpm2 (ENSPKIG00000021474) eeig1b (ENSPKIG00000021496) slc25a25b (ENSPKIG00000021548) uap1l1 (ENSPKIG00000021613) zdhhc12b (ENSPKIG00000021757) ENSPKIG00000021680 SFRP1 (ENSPKIG00000021780) ENSPKIG00000021792 tcimb (ENSPKIG00000021807) ENSPKIG00000021825 ENSPKIG00000021868 ENSPKIG00000021937 ENSPKIG00000021949 rab36 (ENSPKIG00000021975) DEPDC5 (ENSPKIG00000022014) ywhah (ENSPKIG00000022072) ##22 slc5a1 (ENSPKIG00000022197) RNF208 (ENSPKIG00000022439) nt5c2l1 (ENSPKIG00000022472) slc2a11l (ENSPKIG00000022531) drg1 (ENSPKIG00000022572) STARD7 (ENSPKIG00000022629) SLC20A1 (ENSPKIG00000022658) gmcl1 (ENSPKIG00000022681) fam136a (ENSPKIG00000022708) pcyox1 (ENSPKIG00000022738) DTWD2 (ENSPKIG00000022765) snx24 (ENSPKIG00000022799) loxa (ENSPKIG00000022841) GGCX (ENSPKIG00000022863) ska1 (ENSPKIG00000022897) Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 102 ENSGT00940000156185 ENSGT00390000006707 ENSGT00390000011206.a ENSGT00390000014879.c.a.a.a ENSGT00940000157856 ENSGT00940000153340.B ENSGT00950000182904.a.b.a ENSGT00910000144252.d.b ENSGT00940000166216 ENSGT00940000166787 ENSGT00940000162631 ENSGT00940000158101 ENSGT00940000160353 ENSGT00940000159687 ENSGT00390000016559 ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 ENSGT00680000100126 ENSGT00940000154822.b ENSGT00900000141033.b.a ENSGT00940000165675 ENSGT00940000165775.b ENSGT00900000141033.a ENSGT00940000161917 ENSGT00940000165775.a ENSGT00940000154929.C ENSGT00940000154929.A ENSGT01030000234614.A ENSGT00910000144278 ENSGT01030000234821.B ENSGT00390000002865 Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 123 ENSGT00940000156185 ENSGT00390000006707 ENSGT00390000011206.a ENSGT00390000014879.c.a.a.a ENSGT00940000157856 ENSGT00940000153340.B ENSGT00950000182904.a.b.a ENSGT00910000144252.d.b ENSGT00940000166216 ENSGT00940000166787 ENSGT00940000162631 ENSGT00940000158101 ENSGT00940000160353 ENSGT00940000159687 ENSGT00390000016559 ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 ENSGT00680000100126 ENSGT00940000154822.b ENSGT00900000141033.b.a ENSGT00940000165675 ENSGT00940000154929.A ENSGT01030000234614.A ENSGT00910000144278 ENSGT01030000234821.B ENSGT00390000002865 ENSGT00940000155307.a.b.b ENSGT00940000154885.A.e.a ENSGT00940000166554.a.b ENSGT00940000154909.a.b ENSGT00950000182864.a.b.b.a.a.a.b Otophysi ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000156185 ENSGT00390000006707 ENSGT00390000011206.a ENSGT00390000014879.c.a.a.a ENSGT00940000157856 ENSGT00940000153340.B ENSGT00950000182904.a.b.a ENSGT00910000144252.d.b ENSGT00940000166216 ENSGT00940000166787 ENSGT00940000162631 ENSGT00940000158101 ENSGT00940000160353 ENSGT00940000159687 ENSGT00390000016559 ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 ENSGT00680000100126 ENSGT00940000154822.b ENSGT00900000141033.b.a ENSGT00940000165675 ENSGT00940000154929.A ENSGT01030000234614.A ENSGT00910000144278 ENSGT01030000234821.B ENSGT00390000002865 ENSGT00940000155307.a.b.b ENSGT00940000154885.A.e.a ENSGT00940000166554.a.b ENSGT00940000154909.a.b ENSGT00950000182864.a.b.b.a.a.a.b Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 40 ENSGT00940000156185 ENSGT00390000006707 ENSGT00390000011206.a ENSGT00390000014879.c.a.a.a ENSGT00940000157856 ENSGT00940000153340.B ENSGT00950000182904.a.b.a ENSGT00910000144252.d.b ENSGT00940000166216 ENSGT00940000166787 ENSGT00940000162631 ENSGT00940000158101 ENSGT00940000160353 ENSGT00940000159687 ENSGT00390000016559 ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 ENSGT00680000100126 ENSGT00940000154822.b ENSGT00900000141033.b.a ENSGT00940000165675 ENSGT00940000154929.A ENSGT01030000234614.A ENSGT00910000144278 ENSGT01030000234821.B ENSGT00390000002865 ENSGT00940000155307.a.b.b ENSGT00940000154885.A.e.a ENSGT00940000166554.a.b ENSGT00940000154909.a.b ENSGT00950000182864.a.b.b.a.a.a.b Channel catfish MODERN SPECIES 7 gmcl1 (ENSIPUG00000022914) fam136a (ENSIPUG00000022905) pcyox1 (ENSIPUG00000022901) slc20a1 (ENSIPUG00000022892) stard7 (ENSIPUG00000022862) DRG1 (ENSIPUG00000022849) KCNN2 (ENSIPUG00000022842) smarcad1b (ENSIPUG00000022817) ska1 (ENSIPUG00000022812) slc2a11l (ENSIPUG00000022796) nt5dc4 (ENSIPUG00000022750) Sppl3 (ENSIPUG00000022726) Gnaz (ENSIPUG00000022723) rab36 (ENSIPUG00000022673) DEPDC5 (ENSIPUG00000022568) YWHAG (ENSIPUG00000022557) ##22 SLC5A1 (ENSIPUG00000022509) RNF208 (ENSIPUG00000022500) fam166b (ENSIPUG00000022489) ENSIPUG00000022482 ENSIPUG00000022441 unc13b (ENSIPUG00000022204) stoml2 (ENSIPUG00000022167) pigo (ENSIPUG00000022150) ENSIPUG00000022141 phf24 (ENSIPUG00000022125) prkab1a (ENSIPUG00000022093) PLA2G1B (ENSIPUG00000022084) ENSIPUG00000022080 ENSIPUG00000022075 ENSIPUG00000022072 Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00940000156185 ENSGT00390000006707 ENSGT00390000011206.a ENSGT00390000014879.c.a.a.a ENSGT00940000157856 ENSGT00940000153340.B ENSGT00950000182904.a.b.a ENSGT00910000144252.d.b ENSGT00940000166216 ENSGT00940000166787 ENSGT00940000162631 ENSGT00940000158101 ENSGT00940000160353 ENSGT00940000159687 ENSGT00390000016559 ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 ENSGT00680000100126 ENSGT00940000154822.b ENSGT00900000141033.b.a ENSGT00940000165675 ENSGT00940000154929.A ENSGT01030000234614.A ENSGT00910000144278 ENSGT01030000234821.B ENSGT00390000002865 ENSGT00940000155307.a.b.b ENSGT00940000154885.A.e.a ENSGT00940000166554.a.b ENSGT00940000154909.a.b ENSGT00950000182864.a.b.b.a.a.a.b Characoidei ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00940000156185 ENSGT00390000006707 ENSGT00390000011206.a ENSGT00390000014879.c.a.a.a ENSGT00940000157856 ENSGT00940000153340.B ENSGT00950000182904.a.b.a ENSGT00910000144252.d.b ENSGT00940000166216 ENSGT00940000166787 ENSGT00940000162631 ENSGT00940000158101 ENSGT00940000160353 ENSGT00940000159687 ENSGT00390000016559 ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 ENSGT00680000100126 ENSGT00940000154822.b ENSGT00900000141033.b.a ENSGT00940000165675 ENSGT00940000165775.b ENSGT01030000234614.A ENSGT00910000144278 ENSGT01030000234821.B ENSGT00390000002865 ENSGT00940000155307.a.b.b ENSGT00940000154885.A.e.a ENSGT00940000166554.a.b.e.a ENSGT00940000154909.a.b ENSGT00950000182864.a.b.b.a.a.a.b Mexicana tetra MODERN SPECIES 12 pcyox1 (ENSAMXG00000031156) slc20a1b (ENSAMXG00000019185) STARD7 (ENSAMXG00000041522) ENSAMXG00000038811 ENSAMXG00000043452 ENSAMXG00000042853 KCNN2 (ENSAMXG00000019146) smarcad1b (ENSAMXG00000019130) ska1 (ENSAMXG00000017079) slc2a11l (ENSAMXG00000041300) nt5c2l1 (ENSAMXG00000017138) sppl3 (ENSAMXG00000017209) GNAZ (ENSAMXG00000017245) rab36 (ENSAMXG00000017266) DEPDC5 (ENSAMXG00000017289) ywhah (ENSAMXG00000035345) ##22 slc5a1 (ENSAMXG00000017336) slc5a1 (ENSAMXG00000017367) RNF208 (ENSAMXG00000030392) fam166b (ENSAMXG00000017390) ENSAMXG00000029323 ENSAMXG00000017413 ENSAMXG00000017447 stoml2 (ENSAMXG00000033373) PIGO (ENSAMXG00000017497) ccl19b (ENSAMXG00000033973) ENSAMXG00000037443 ENSAMXG00000038908 PHF24 (ENSAMXG00000042286) prkab1a (ENSAMXG00000034470) PLA2G1B (ENSAMXG00000000310) Red-bellied piranha MODERN SPECIES 49 il6st (ENSPNAG00000021433) ENSPNAG00000021495 ddx4 (ENSPNAG00000003686) slc38a9 (ENSPNAG00000021563) ENSPNAG00000021581 ENSPNAG00000021622 fut10 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(ENSEEEG00000015737) GNAZ (ENSEEEG00000015736) rab36 (ENSEEEG00000015734) DEPDC5 (ENSEEEG00000015720) ywhah (ENSEEEG00000015706) ##22 slc5a1 (ENSEEEG00000015693) RNF208 (ENSEEEG00000015691) fam166b (ENSEEEG00000015690) ENSEEEG00000015689 ENSEEEG00000015687 UNC13B (ENSEEEG00000015672) stoml2 (ENSEEEG00000015641) PIGO (ENSEEEG00000015638) ccl19b (ENSEEEG00000015636) Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 48 ENSGT00390000002865 ENSGT01030000234821.B ENSGT00910000144278 ENSGT00390000014879.c.a.a.a ENSGT00940000157856 ENSGT00940000153340.B ENSGT00950000182904.a.b.a ENSGT00910000144252.d.b ENSGT00940000166216 ENSGT00940000166787 ENSGT00940000162631 ENSGT00940000158101 ENSGT00940000160353 ENSGT00940000159687 ENSGT00390000016559 ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 ENSGT00680000100126 ENSGT00750000118757 ENSGT00940000154822.b ENSGT00900000141033.b.a ENSGT00940000165675 ENSGT00940000154929.A.a ENSGT01030000234614.A Cyprininae DUPLICATION Cyprininae DUPLICATION Cyprininae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.a.c.b.a.a ##22 Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 51 ENSGT00390000002865.c ENSGT01030000234821.B.a ENSGT00910000144278.c ENSGT00390000014879.c.a.a.a.b ENSGT00940000157856.b ENSGT00940000153340.B.cb ENSGT00950000182904.a.b.a.b ENSGT00910000144252.d.b.a.a ENSGT00940000166216.b ENSGT00940000166787 ENSGT00940000162631.d ENSGT00940000158101.c ENSGT00940000160353.g ENSGT00940000159687.e ENSGT00390000016559.x ENSGT01090000260061.c.a.c.b.a.a ##22 ENSGT00940000155844.q ENSGT00680000100126.e ENSGT00940000165675.e ENSGT00940000154929.A.a.a ENSGT01030000234614.A.j ENSGT00390000011206.a.h ENSGT00390000006707 ENSGT00940000156185.a ENSGT00390000014909.d ENSGT00390000001280.b.k ENSGT00940000156185.b ENSGT00390000014909.c ENSGT00390000001280.b.l ENSGT00940000154779.a.b.a ENSGT00940000156009.A.d.g Golden-line barbel MODERN SPECIES 535 ENSSGRG00000022865 prkab1a (ENSSGRG00000022866) PHF24 (ENSSGRG00000022870) ENSSGRG00000022871 ccl19b (ENSSGRG00000022872) PIGO (ENSSGRG00000022873) slc20a1b (ENSSGRG00000022907) ENSSGRG00000023134 drg1 (ENSSGRG00000023138) ENSSGRG00000023252 nt5c2l1 (ENSSGRG00000023308) sppl3 (ENSSGRG00000024251) GNAZ (ENSSGRG00000024252) rab36 (ENSSGRG00000024253) DEPDC5 (ENSSGRG00000024254) ywhah (ENSSGRG00000024256) ##22 slc5a1 (ENSSGRG00000024268) slc5a1 (ENSSGRG00000024271) RNF208 (ENSSGRG00000024335) fam166b (ENSSGRG00000024337) ENSSGRG00000024339 ENSSGRG00000024342 ENSSGRG00000024541 Goldfish MODERN SPECIES 28 ENSCARG00000019242 PHF24 (ENSCARG00000019230) ccl19b (ENSCARG00000019215) PIGO (ENSCARG00000019204) slc20a1b (ENSCARG00000019142) ENSCARG00000018993 drg1 (ENSCARG00000018962) KCNN2 (ENSCARG00000018956) smarcad1b (ENSCARG00000018889) ska1 (ENSCARG00000018874) slc2a11l (ENSCARG00000018854) nt5c2l1 (ENSCARG00000016610) sppl3 (ENSCARG00000016480) GNAZ (ENSCARG00000016465) DEPDC5 (ENSCARG00000016029) ywhah (ENSCARG00000015969) ##22 RNF208 (ENSCARG00000015965) ENSCARG00000015805 UNC13B (ENSCARG00000012277) stoml2 (ENSCARG00000012069) pcyox1 (ENSCARG00000012058) fam136a (ENSCARG00000012047) gmcl1 (ENSCARG00000012001) GGCX (ENSCARG00000010902) snx24 (ENSCARG00000010847) loxa (ENSCARG00000010843) mpx (ENSCARG00000008440) ENSCARG00000008330 mat2aa (ENSCARG00000008181) ENSCARG00000008167 slc35e4 (ENSCARG00000008160) Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 100 ENSGT00390000014879.c.a.a.a.b ENSGT00940000157856.b ENSGT00940000153340.B.cb ENSGT00390000014879.c.a.a.a.a.b ENSGT00940000157856.a ENSGT00940000153340.B.bb ENSGT00950000182904.a.b.a ENSGT00910000144252.d.b.a.a ENSGT00940000166216.b ENSGT00940000166787 ENSGT00940000162631.d ENSGT00940000158101.c ENSGT00940000160353.g ENSGT00940000159687.e ENSGT00390000016559.x ENSGT01090000260061.c.a.c.b.a.b ##22 ENSGT00940000155844.q ENSGT00680000100126.e ENSGT00940000165675.e ENSGT00940000154929.A.a.a ENSGT01030000234614.A.j ENSGT00390000011206.a.h ENSGT00900000141033.b.a ENSGT00940000165675.f ENSGT00940000154929.A.a.b ENSGT01030000234614.A.i ENSGT00390000011206.a.g ENSGT00390000006707 ENSGT00940000156185.a ENSGT00390000014909.d ENSGT00390000001280.b.k Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.a.c.b.a.b ##22 Golden-line barbel MODERN SPECIES 826 GNAZ (ENSSGRG00000022382) rab36 (ENSSGRG00000022383) DEPDC5 (ENSSGRG00000022402) ywhah (ENSSGRG00000024003) ##22 RNF208 (ENSSGRG00000024006) fam166b (ENSSGRG00000024007) ENSSGRG00000024008 ENSSGRG00000024024 UNC13B (ENSSGRG00000024996) stoml2 (ENSSGRG00000025648) pcyox1 (ENSSGRG00000025657) fam136a (ENSSGRG00000025661) gmcl1 (ENSSGRG00000025663) GGCX (ENSSGRG00000025701) snx24 (ENSSGRG00000026503) loxa (ENSSGRG00000026511) mpx (ENSSGRG00000026515) mat2aa (ENSSGRG00000026828) ENSSGRG00000026896 Goldfish MODERN SPECIES 1 paqr3b (ENSCARG00000019903) antxr2b (ENSCARG00000019926) ENSCARG00000020221 rasgef1bb (ENSCARG00000020248) ENSCARG00000020454 snx18b (ENSCARG00000020460) ARL15 (ENSCARG00000020467) ENSCARG00000020479 ndufa8 (ENSCARG00000020484) si:ch211-243g18.2 (ENSCARG00000020512) ENSCARG00000020524 RABGAP1 (ENSCARG00000020595) GNAZ (ENSCARG00000001740) rab36 (ENSCARG00000001745) DEPDC5 (ENSCARG00000001994) ywhah (ENSCARG00000004776) ##22 slc5a1 (ENSCARG00000004816) slc5a1 (ENSCARG00000005191) RNF208 (ENSCARG00000005254) fam166b (ENSCARG00000005258) ENSCARG00000005262 ENSCARG00000005295 UNC13B (ENSCARG00000005673) stoml2 (ENSCARG00000005817) pcyox1 (ENSCARG00000005876) fam136a (ENSCARG00000005884) gmcl1 (ENSCARG00000005905) snx24 (ENSCARG00000005996) loxa (ENSCARG00000006014) ENSCARG00000006029 mpx (ENSCARG00000006147) Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 1380 ENSGT00390000016559.w.b ENSGT01090000260061.c.a.c.b.b ##22 Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 1042 ENSGT00390000016559.w.b ENSGT01090000260061.c.a.c.b.b ##22 Common carp reference MODERN SPECIES 32 ccl19b (ENSCCRG00000019122) ENSCCRG00000019110 slc20a1b (ENSCCRG00000019082) ENSCCRG00000019056 drg1 (ENSCCRG00000070468) ENSCCRG00000008041 smarcad1b (ENSCCRG00000038419) ska1 (ENSCCRG00000038372) slc2a11l (ENSCCRG00000005371) nt5c2l1 (ENSCCRG00000005326) sppl3 (ENSCCRG00000020779) ENSCCRG00000069554 ENSCCRG00000038955 rab36 (ENSCCRG00000061264) ENSCCRG00000021297 ywhah (ENSCCRG00000031456) ##22 ENSCCRG00000068902 ENSCCRG00000042368 ENSCCRG00000009690 stoml2 (ENSCCRG00000079512) pcyox1 (ENSCCRG00000006643) fam136a (ENSCCRG00000071479) gmcl1 (ENSCCRG00000010989) ENSCCRG00000006690 snx24 (ENSCCRG00000006671) loxa (ENSCCRG00000006668) mpx (ENSCCRG00000012370) mat2aa (ENSCCRG00000078152) ENSCCRG00000051490 ENSCCRG00000053014 ENSCCRG00000075076 Zebrafish MODERN SPECIES 1 ccl19b (ENSDARG00000039351) PIGO (ENSDARG00000011743) ENSDARG00000095294 slc20a1b (ENSDARG00000010641) STARD7 (ENSDARG00000074858) drg1 (ENSDARG00000039345) KCNN2 (ENSDARG00000014939) smarcad1b (ENSDARG00000073721) ska1 (ENSDARG00000039354) slc2a11l (ENSDARG00000062873) nt5c2l1 (ENSDARG00000034852) GNAZ (ENSDARG00000099844) sppl3 (ENSDARG00000025220) rab36 (ENSDARG00000014058) DEPDC5 (ENSDARG00000078105) ywhah (ENSDARG00000005560) ##22 slc5a1 (ENSDARG00000013871) RNF208 (ENSDARG00000078056) ENSDARG00000093444 fam166b (ENSDARG00000100292) ENSDARG00000104450 UNC13B (ENSDARG00000099113) stoml2 (ENSDARG00000103135) ENSDARG00000105041 chsy3 (ENSDARG00000069472) ENSDARG00000078922 isoc1 (ENSDARG00000060069) slc27a6 (ENSDARG00000046053) ENSDARG00000046054 FBN2 (ENSDARG00000051896) slc12a2 (ENSDARG00000104573) Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 199 ENSGT00940000156185 ENSGT00390000006707 ENSGT00390000011206.a ENSGT00390000014879.c.a.a.a ENSGT00940000157856 ENSGT00940000153340.B ENSGT00950000182904.a.b.a ENSGT00910000144252.d.b ENSGT00940000166216 ENSGT00940000166787 ENSGT00940000162631 ENSGT00940000158101 ENSGT00940000160353 ENSGT00940000159687 ENSGT00390000016559 ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 ENSGT00680000100126 ENSGT00940000154822.b ENSGT00900000141033.a ENSGT00940000161917 ENSGT00900000141033.b.a ENSGT00940000165675 ENSGT00940000154929.A ENSGT01030000234614.A Denticle herring MODERN SPECIES 13 pcyox1 (ENSDCDG00000001519) ENSDCDG00000001520 slc20a1b (ENSDCDG00000001523) STARD7 (ENSDCDG00000001529) drg1 (ENSDCDG00000001546) KCNN2 (ENSDCDG00000001548) smarcad1b (ENSDCDG00000001560) ska1 (ENSDCDG00000001603) slc2a11l (ENSDCDG00000001609) slc2a11l (ENSDCDG00000001613) nt5c2l1 (ENSDCDG00000001632) sppl3 (ENSDCDG00000001688) GNAZ (ENSDCDG00000001693) rab36 (ENSDCDG00000001694) DEPDC5 (ENSDCDG00000001774) ywhah (ENSDCDG00000003436) ##22 slc5a1 (ENSDCDG00000003533) RNF208 (ENSDCDG00000003696) fam166b (ENSDCDG00000003700) ENSDCDG00000003702 ENSDCDG00000003703 ENSDCDG00000003706 ENSDCDG00000003708 ENSDCDG00000003827 stoml2 (ENSDCDG00000009758) sec31a (ENSDCDG00000011197) enoph1 (ENSDCDG00000021267) hnrnpdl (ENSDCDG00000021270) ENSDCDG00000021323 ENSDCDG00000021464 ENSDCDG00000026977 Atlantic herring MODERN SPECIES 3 surf2 (ENSCHAG00000012159) pcyox1 (ENSCHAG00000012204) slc20a1b (ENSCHAG00000012219) ENSCHAG00000012273 drg1 (ENSCHAG00000012433) KCNN2 (ENSCHAG00000012476) smarcad1b (ENSCHAG00000012615) sppl3 (ENSCHAG00000012874) ska1 (ENSCHAG00000012983) slc2a11l (ENSCHAG00000012998) CYC1 (ENSCHAG00000013130) nt5c2l1 (ENSCHAG00000013154) GNAZ (ENSCHAG00000013313) rab36 (ENSCHAG00000013326) DEPDC5 (ENSCHAG00000013405) ywhah (ENSCHAG00000013902) ##22 slc5a1 (ENSCHAG00000013934) RNF208 (ENSCHAG00000015736) fam166b (ENSCHAG00000015772) ENSCHAG00000015782 ENSCHAG00000015864 UNC13B (ENSCHAG00000017948) stoml2 (ENSCHAG00000020613) ENSCHAG00000020714 DEPDC1B (ENSCHAG00000020741) ELOVL7 (ENSCHAG00000020797) ZSWIM6 (ENSCHAG00000020814) KIF2A (ENSCHAG00000021079) PITPNM2 (ENSCHAG00000021390) ENSCHAG00000021656 ENSCHAG00000022123 Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 50 ENSGT00940000156185 ENSGT00390000006707 ENSGT00390000011206.a ENSGT00390000014879.c.a.a.a ENSGT00940000157856 ENSGT00940000153340.B ENSGT00950000182904.a.b.a ENSGT00910000144252.d.b ENSGT00940000166216 ENSGT00940000166787 ENSGT00940000162631 ENSGT00940000158101 ENSGT00940000160353 ENSGT00940000159687 ENSGT00390000016559 ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 ENSGT00680000100126 ENSGT00940000154822.b ENSGT00900000141033.b.a ENSGT00940000165675 ENSGT00940000154929.A ENSGT01030000234614.A.l ENSGT00910000144278 ENSGT01030000234821.B ENSGT00390000002865 ENSGT00940000155307.a.b.b ENSGT00940000154885.A.e.a ENSGT00940000155648.A.a ENSGT00940000166554.a.b ENSGT00940000154909.a.b Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000156185 ENSGT00390000006707 ENSGT00390000011206.a ENSGT00390000014879.c.a.a.a ENSGT00940000157856 ENSGT00940000153340.B ENSGT00950000182904.a.b.a ENSGT00910000144252.d.b ENSGT00940000166216 ENSGT00940000166787 ENSGT00940000162631 ENSGT00940000158101 ENSGT00940000160353 ENSGT00940000159687 ENSGT00390000016559 ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 ENSGT00680000100126 ENSGT00940000154822.b ENSGT00900000141033.b.a ENSGT00940000165675 ENSGT00940000154929.A ENSGT01030000234614.A.l ENSGT00910000144278 ENSGT01030000234821.B ENSGT00390000002865 ENSGT00940000155307.a.b.b.c ENSGT00940000155307.a.b.b.d ENSGT00940000154885.A.e.a ENSGT00940000155648.A.a ENSGT00940000154909.a.b Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000156185.f ENSGT00390000006707.f ENSGT00390000011206.a.i.b ENSGT00390000011206.a.i.a ENSGT00390000014879.c.a.a.a.d ENSGT00940000157856.d ENSGT00940000153340.B.db ENSGT00950000182904.a.b.a.f ENSGT00910000144252.d.b ENSGT00940000166216 ENSGT00940000162631.e ENSGT00940000158101.f ENSGT00940000160353.c.a ENSGT00940000159687 ENSGT00390000016559 ENSGT01090000260061.c.a.c.b.c ##22 ENSGT00940000155844.m ENSGT00680000100126.g ENSGT00940000154822.b.c ENSGT00900000141033.b.a.c ENSGT00940000171384.b ENSGT00940000165675.z ENSGT00940000154929.A ENSGT01030000234614.A.l.c ENSGT00910000144278 ENSGT01030000234821.B.c ENSGT00390000002865.e ENSGT00940000155307.a.b.b.c ENSGT01020000232096 ENSGT00940000155648.A.a.c ENSGT00940000154909.a.b.d Huchen MODERN SPECIES 862 ENSHHUG00000003644 gmcl1 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ENSGT00940000165675.z ENSGT00940000154929.A.c ENSGT01030000234614.A.l.c ENSGT00910000144278 ENSGT01030000234821.B.c ENSGT00390000002865.e ENSGT00940000155307.a.b.b.c ENSGT01020000232096 ENSGT00940000155648.A.a.c ENSGT00940000154909.a.b.d Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00390000001280.b.m ENSGT00390000014909.e ENSGT00940000156185.f ENSGT00390000006707.f ENSGT00390000011206.a.i.a ENSGT00390000014879.c.a.a.a.d ENSGT00940000157856.d ENSGT00940000153340.B.db ENSGT00950000182904.a.b.a.f ENSGT00940000166216 ENSGT00940000162631.e ENSGT00940000158101.f ENSGT00940000160353.c.a ENSGT00940000159687.c ENSGT00390000016559 ENSGT01090000260061.c.a.c.b.c ##22 ENSGT00940000155844.m ENSGT00680000100126.g ENSGT00940000154822.b.c ENSGT00900000141033.b.a.c ENSGT00940000171384.b ENSGT00940000165675.z ENSGT00940000154929.A.c ENSGT01030000234614.A.l.c ENSGT00910000144278 ENSGT01030000234821.B.c ENSGT00390000002865.e ENSGT00940000155307.a.b.b.c ENSGT01020000232096 ENSGT00940000155648.A.a.c ENSGT00940000154909.a.b.d Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000001280.b.m ENSGT00390000014909.e ENSGT00940000156185.f ENSGT00390000006707.f ENSGT00390000011206.a.i.a ENSGT00390000014879.c.a.a.a.d ENSGT00940000157856.d ENSGT00940000153340.B.db ENSGT00950000182904.a.b.a.f ENSGT00940000166216 ENSGT00940000162631.e ENSGT00940000158101.f ENSGT00940000160353.c.a ENSGT00940000159687.c ENSGT00390000016559 ENSGT01090000260061.c.a.c.b.c ##22 ENSGT00940000155844.m ENSGT00680000100126.g ENSGT00940000154822.b.c ENSGT00900000141033.b.a.c ENSGT00940000165675.z ENSGT00940000154929.A.c ENSGT01030000234614.A.l.c ENSGT00910000144278 ENSGT01030000234821.B.c ENSGT00390000002865.e ENSGT00940000155307.a.b.b.c ENSGT01020000232096 ENSGT00940000155648.A.a.c ENSGT00940000154909.a.b.d ENSGT00950000182864.a.b.b.a.a.a.d Chinook salmon MODERN SPECIES 12 ENSOTSG00005026437 ENSOTSG00005026433 gmcl1 (ENSOTSG00005026427) fam136a (ENSOTSG00005026426) pcyox1 (ENSOTSG00005026425) slc20a1b (ENSOTSG00005026424) 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ENSGT00940000154909.a.b.d River trout MODERN SPECIES 15 snx24 (ENSSTUG00000007001) ENSSTUG00000007010 ENSSTUG00000007033 gmcl1 (ENSSTUG00000007080) fam136a (ENSSTUG00000007090) pcyox1 (ENSSTUG00000007099) slc20a1b (ENSSTUG00000007127) STARD7 (ENSSTUG00000007805) drg1 (ENSSTUG00000007933) KCNN2 (ENSSTUG00000007959) ska1 (ENSSTUG00000007972) nt5c2l1 (ENSSTUG00000007997) sppl3 (ENSSTUG00000008148) GNAZ (ENSSTUG00000008218) DEPDC5 (ENSSTUG00000008263) ywhah (ENSSTUG00000008617) ##22 slc5a1 (ENSSTUG00000008635) RNF208 (ENSSTUG00000009053) fam166b (ENSSTUG00000009066) ENSSTUG00000009084 ENSSTUG00000009160 ENSSTUG00000010362 stoml2 (ENSSTUG00000012384) PIGO (ENSSTUG00000012888) ccl19b (ENSSTUG00000012914) PHF24 (ENSSTUG00000012928) prkab1a (ENSSTUG00000012956) ENSSTUG00000012984 LRRTM4 (ENSSTUG00000012988) ppp2r2ab (ENSSTUG00000013002) bnip3lb (ENSSTUG00000013406) Atlantic salmon MODERN SPECIES ENSSSAG00000092165 ENSSSAG00000000230 gmcl1 (ENSSSAG00000000262) fam136a (ENSSSAG00000121870) 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ENSGT01030000234614.A.l.d ENSGT00390000002865.f ENSGT01030000234821.B.d ENSGT00940000155307.a.b.b.d ENSGT00940000154885.A.e.a ENSGT00940000155648.A.a.d ENSGT00940000154909.a.b.c ENSGT00950000182864.a.b.b.a.a.a.c Salmo ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000156185.e ENSGT00390000006707.e ENSGT00390000011206.a.i.b ENSGT00390000014879.c.a.a.a.c ENSGT00940000157856.c ENSGT00940000153340.B.eb ENSGT00950000182904.a.b.a.e ENSGT00910000144252.d.b ENSGT01060000252579 ENSGT01030000234969 ENSGT00940000166787 ENSGT00940000162631.f ENSGT00940000158101.e ENSGT00940000160353.c.b ENSGT00940000159687 ENSGT01090000260061.c.a.c.b.d ##22 ENSGT00940000155844.n ENSGT00680000100126.h ENSGT00940000154822.b.d ENSGT00900000141033.b.a.d ENSGT00940000165675.y ENSGT00940000154929.A.d ENSGT01030000234614.A.l.d ENSGT00390000002865.f ENSGT01030000234821.B.d ENSGT00940000155307.a.b.b.d ENSGT00940000154885.A.e.a ENSGT00940000155648.A.a.d ENSGT00940000154909.a.b.c ENSGT00950000182864.a.b.b.a.a.a.c ENSGT00390000013415.a.b.jb.d Atlantic salmon MODERN SPECIES 2 F136A (ENSSSAG00000047978) pcyox1 (ENSSSAG00000121293) slc20a1b (ENSSSAG00000047373) ENSSSAG00000047350 drg1 (ENSSSAG00000047226) ENSSSAG00000093269 smarcad1b (ENSSSAG00000046322) ENSSSAG00000096229 ENSSSAG00000046278 slc2a11l (ENSSSAG00000046211) nt5c2l1 (ENSSSAG00000045618) sppl3 (ENSSSAG00000045426) ENSSSAG00000087342 ENSSSAG00000045407 rab36 (ENSSSAG00000045372) ywhah (ENSSSAG00000087252) ##22 slc5a1 (ENSSSAG00000096485) ENSSSAG00000112941 ENSSSAG00000044174 fam166b (ENSSSAG00000044180) ENSSSAG00000044171 ENSSSAG00000042981 ENSSSAG00000038613 ENSSSAG00000034608 ENSSSAG00000089208 ENSSSAG00000033714 ENSSSAG00000033609 ENSSSAG00000033491 ENSSSAG00000033446 ENSSSAG00000120202 ENSSSAG00000033400 River trout MODERN SPECIES 3 fam136a (ENSSTUG00000006364) ENSSTUG00000006352 pcyox1 (ENSSTUG00000006349) slc20a1b (ENSSTUG00000006195) ENSSTUG00000006173 ENSSTUG00000006138 drg1 (ENSSTUG00000006089) KCNN2 (ENSSTUG00000006066) smarcad1b (ENSSTUG00000005593) 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(ENSOKIG00005047521) bnip3lb (ENSOKIG00005047507) Chinook salmon MODERN SPECIES 26 mpx (ENSOTSG00005037118) loxa (ENSOTSG00005037114) GGCX (ENSOTSG00005037089) gmcl1 (ENSOTSG00005037064) FAM136A (ENSOTSG00005037062) pcyox1 (ENSOTSG00005037060) slc20a1b (ENSOTSG00005036696) ENSOTSG00005036693 drg1 (ENSOTSG00005036692) KCNN2 (ENSOTSG00005036690) smarcad1b (ENSOTSG00005036685) ENSOTSG00005036683 slc2a11l (ENSOTSG00005036682) nt5c2l1 (ENSOTSG00005035366) sppl3 (ENSOTSG00005035351) ywhah (ENSOTSG00005035350) ##22 slc5a1 (ENSOTSG00005033892) RNF208 (ENSOTSG00005033888) fam166b (ENSOTSG00005033887) ENSOTSG00005033886 ENSOTSG00005033047 ENSOTSG00005032127 stoml2 (ENSOTSG00005031064) PHF24 (ENSOTSG00005031052) ENSOTSG00005031050 prkab1a (ENSOTSG00005031048) ENSOTSG00005031046 ENSOTSG00005031044 ENSOTSG00005031043 LRRTM4 (ENSOTSG00005031039) ppp2r2ab (ENSOTSG00005031036) Rainbow trout MODERN SPECIES 364 pcyox1 (ENSOMYG00000058237) slc20a1b (ENSOMYG00000046445) ENSOMYG00000046432 ENSOMYG00000050731 ENSOMYG00000046414 drg1 (ENSOMYG00000046387) ENSOMYG00000046380 ENSOMYG00000053594 smarcad1b (ENSOMYG00000046354) ENSOMYG00000046341 ENSOMYG00000058478 slc2a11l (ENSOMYG00000046339) nt5c2l1 (ENSOMYG00000046215) sppl3 (ENSOMYG00000046147) ENSOMYG00000046141 ywhah (ENSOMYG00000046135) ##22 slc5a1 (ENSOMYG00000045379) ENSOMYG00000045280 fam166b (ENSOMYG00000045278) ENSOMYG00000045274 ENSOMYG00000045173 ENSOMYG00000044745 ENSOMYG00000044558 ENSOMYG00000065780 ENSOMYG00000044531 ENSOMYG00000057771 ENSOMYG00000044527 prkab1a (ENSOMYG00000044509) ENSOMYG00000044495 ENSOMYG00000044490 ENSOMYG00000054193 Huchen MODERN SPECIES 71 GGCX (ENSHHUG00000034432) ENSHHUG00000034472 ENSHHUG00000034476 fam136a (ENSHHUG00000034487) pcyox1 (ENSHHUG00000034498) slc20a1b (ENSHHUG00000034509) ENSHHUG00000034549 drg1 (ENSHHUG00000034577) KCNN2 (ENSHHUG00000034600) smarcad1b (ENSHHUG00000034610) ENSHHUG00000034634 slc2a11l (ENSHHUG00000034637) nt5c2l1 (ENSHHUG00000034645) sppl3 (ENSHHUG00000034696) GNAZ (ENSHHUG00000034700) ywhah (ENSHHUG00000034703) ##22 slc5a1 (ENSHHUG00000034713) RNF208 (ENSHHUG00000034952) fam166b (ENSHHUG00000034956) ENSHHUG00000034962 ENSHHUG00000034972 ENSHHUG00000035049 stoml2 (ENSHHUG00000035421) ENSHHUG00000035463 PHF24 (ENSHHUG00000035469) ccl19b (ENSHHUG00000035477) prkab1a (ENSHHUG00000035485) PLA2G1B (ENSHHUG00000035507) LRRTM4 (ENSHHUG00000035519) Northern pike MODERN SPECIES 13 GGCX (ENSELUG00000019443) gmcl1 (ENSELUG00000019379) fam136a (ENSELUG00000025891) pcyox1 (ENSELUG00000019341) slc20a1b (ENSELUG00000019330) STARD7 (ENSELUG00000019310) drg1 (ENSELUG00000019289) KCNN2 (ENSELUG00000019249) smarcad1b (ENSELUG00000019154) slc2a11l (ENSELUG00000019023) nt5c2l1 (ENSELUG00000018958) sppl3 (ENSELUG00000018945) GNAZ (ENSELUG00000018929) rab36 (ENSELUG00000018921) DEPDC5 (ENSELUG00000018800) ywhah (ENSELUG00000018622) ##22 slc5a1 (ENSELUG00000018612) RNF208 (ENSELUG00000018565) fam166b (ENSELUG00000018555) ENSELUG00000018540 ENSELUG00000000790 UNC13B (ENSELUG00000000780) stoml2 (ENSELUG00000000765) PIGO (ENSELUG00000000756) ccl19 (ENSELUG00000018143) PHF24 (ENSELUG00000000728) prkab1a (ENSELUG00000000727) ENSELUG00000017998 LRRTM4 (ENSELUG00000017980) ENSELUG00000025645 ppp2r2ab (ENSELUG00000017926) Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00940000156009.A.d ENSGT00940000154779.a.b.a ENSGT00390000001280.b ENSGT00390000014909 ENSGT00940000156185 ENSGT00390000006707 ENSGT00390000011206.a ENSGT00390000014879.c.a.a.a ENSGT00940000157856 ENSGT00940000153340.B ENSGT00950000182904.a.b.a ENSGT00940000166787 ENSGT00940000162631 ENSGT00940000158101 ENSGT00940000160353 ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 ENSGT00680000100126 ENSGT00940000154822.b ENSGT00900000141033.b.a ENSGT01000000214704 ENSGT00940000153372.A.e.a.a ENSGT00940000157400 ENSGT00940000158907.c ENSGT00390000004624.a.a ENSGT00940000166240 ENSGT00940000173711 ENSGT00530000063460.A.b ENSGT00390000005102 ENSGT00940000156471.a ENSGT00510000047107.B.c Cod MODERN SPECIES 17 ENSGMOG00000023822 gmcl1 (ENSGMOG00000014628) ENSGMOG00000014596 snx24 (ENSGMOG00000014576) loxa (ENSGMOG00000014551) ENSGMOG00000026523 ENSGMOG00000015803 slc20a1b (ENSGMOG00000015827) ENSGMOG00000015864 drg1 (ENSGMOG00000015885) ENSGMOG00000019038 slc2a11l (ENSGMOG00000015922) nt5c2l1 (ENSGMOG00000016119) sppl3 (ENSGMOG00000016150) ENSGMOG00000030134 ywhah (ENSGMOG00000020322) ##22 slc5a1 (ENSGMOG00000016186) ENSGMOG00000004420 fam166b (ENSGMOG00000016231) ENSGMOG00000030612 ENSGMOG00000033371 ENSGMOG00000016349 rai14 (ENSGMOG00000016362) fgf10a (ENSGMOG00000028286) nnt (ENSGMOG00000016424) ENSGMOG00000015564 ENSGMOG00000028443 ENSGMOG00000036730 ENSGMOG00000025799 ENSGMOG00000024295 ENSGMOG00000027914 Spotted gar MODERN SPECIES 632 ywhah (ENSLOCG00000017297) ##22 Reedfish MODERN SPECIES 9 crybb2 (ENSECRG00000020380) ENSECRG00000020417 rnf10 (ENSECRG00000020459) pop5 (ENSECRG00000020483) cabp1a (ENSECRG00000020513) mlec (ENSECRG00000020532) unc119.1 (ENSECRG00000020550) acads (ENSECRG00000020579) sppl3 (ENSECRG00000020606) hnf1a (ENSECRG00000020662) C12orf43 (ENSECRG00000020741) rab36 (ENSECRG00000020759) rsph14 (ENSECRG00000020787) GNAZ (ENSECRG00000020801) DEPDC5 (ENSECRG00000020839) ywhah (ENSECRG00000020960) ##22 slc5a1 (ENSECRG00000020976) slc5a1 (ENSECRG00000021070) ENSECRG00000021514 sxph (ENSECRG00000021528) pisd (ENSECRG00000021563) SFI1 (ENSECRG00000021593) EIF4ENIF1 (ENSECRG00000021633) drg1 (ENSECRG00000021671) PATZ1 (ENSECRG00000021712) ENSECRG00000021736 TMEM233 (ENSECRG00000021749) prkab1b (ENSECRG00000017651) CIT (ENSECRG00000017742) BICDL1 (ENSECRG00000017873) rab35b (ENSECRG00000018004) Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 225 ENSGT00390000014107.a.a ENSGT00940000159133 ENSGT00390000017774 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000153340.B ENSGT00390000012071 ENSGT00940000166668 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000013484 ENSGT00940000154388 ENSGT00520000055626.a ENSGT00390000016559 ENSGT00390000013263 ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 ENSGT00940000160353 ENSGT00940000159687 ENSGT00500000044989 Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000153818.a.b.b ENSGT00390000010771 ENSGT00390000014107.a.a ENSGT00940000159133 ENSGT00390000017774 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000153340.B ENSGT00390000012071 ENSGT00940000166668 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000013484 ENSGT00940000154388 ENSGT00520000055626.a ENSGT00390000016559 ENSGT00390000013263 ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 ENSGT00940000160353 ENSGT00500000044989 ENSGT00940000159687 ENSGT00940000153491.b.a ##35 ENSGT00940000153592.B.b.b ENSGT01030000234555.a.a.a.c.b ENSGT00390000004906 ENSGT00390000000571 ENSGT00610000086153 ENSGT00940000164235 ENSGT00940000154601 ENSGT00940000155794 ENSGT00390000006044 ENSGT00730000111140 Anura ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000158866 ENSGT00940000158101 ENSGT00940000153818.a.b.b ENSGT00390000010771 ENSGT00390000014107.a.a ENSGT00940000159133 ENSGT00390000017774 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000153340.B ENSGT00390000012071 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000013484 ENSGT00940000154388 ENSGT00520000055626.a ENSGT00390000016559 ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 ENSGT00500000044989.b ENSGT00940000160353 ENSGT00500000044989.a ENSGT00940000159687 ENSGT00940000153491.b.a ##35 ENSGT00940000153592.B.b.b ENSGT01030000234555.a.a.a.c.b ENSGT00390000004906 ENSGT00390000000571 ENSGT00610000086153 ENSGT00940000164235 ENSGT00940000154601 ENSGT00940000155794 ENSGT00390000006044 Leishan spiny toad MODERN SPECIES ENSLLEG00000004115 C12orf43 (ENSLLEG00000004103) RNF185 (ENSLLEG00000004096) ENSLLEG00000004093 LIMK2 (ENSLLEG00000004078) ENSLLEG00000004069 PATZ1 (ENSLLEG00000004063) DRG1 (ENSLLEG00000004049) EIF4ENIF1 (ENSLLEG00000004009) ENSLLEG00000003994 PISD (ENSLLEG00000003953) ENSLLEG00000003902 ENSLLEG00000003882 ENSLLEG00000003872 DEPDC5 (ENSLLEG00000003053) YWHAH (ENSLLEG00000002777) ##22 SLC5A1 (ENSLLEG00000001709) 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ENSGT00940000159133 ENSGT00390000017774 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000153340.B ENSGT00390000012071 ENSGT00940000166668 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000013484 ENSGT00940000154388 ENSGT00520000055626.a ENSGT00390000016559 ENSGT00390000013263 ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 ENSGT00940000160353 ENSGT00500000044989 ENSGT00940000159687 ENSGT00940000153491.b.a ##35 ENSGT00940000153592.B.b.b ENSGT01030000234555.a.a.a.c.b ENSGT00390000004906 ENSGT00390000000571 ENSGT00610000086153 ENSGT00940000164235 ENSGT00940000154601 ENSGT00940000155794 ENSGT00390000006044 ENSGT00390000007249 Archelosauria ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000158101 ENSGT00940000153818.a.a ENSGT00390000010771 ENSGT00390000014107.a.a ENSGT00940000159133 ENSGT00390000017774 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000153340.B ENSGT00390000012071 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000013484 ENSGT00940000154388 ENSGT00520000055626.a ENSGT00390000016559 ENSGT00390000013263 ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 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ENSGT00940000155794 ENSGT00390000006044 Aves ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000158101 ENSGT00940000153818.a.a ENSGT00390000010771 ENSGT00390000014107.a.a ENSGT00940000159133 ENSGT00390000017774 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000153340.B ENSGT00390000012071 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000013484 ENSGT00940000154388 ENSGT00520000055626.a ENSGT00390000016559 ENSGT00390000013263 ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 ENSGT00940000160353 ENSGT00500000044989 ENSGT00940000159687 ENSGT00950000185801 ENSGT00940000153491.b.a ##35 ENSGT00940000153592.B.b.b ENSGT01030000234555.a.a.a.c.b ENSGT00390000004906 ENSGT00390000000571 ENSGT00610000086153 ENSGT00940000164235 ENSGT00940000154601 ENSGT00940000155794 ENSGT00390000006044 Neognathae ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000158101 ENSGT00940000153818.a.a ENSGT00390000010771 ENSGT00390000014107.a.a ENSGT00940000159133 ENSGT00390000017774 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000153340.B ENSGT00390000012071 ENSGT00940000154110.a 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ENSGT01030000234555.a.a.a.c.b ENSGT00390000004906 ENSGT00390000000571 ENSGT00610000086153 ENSGT00940000164235 ENSGT00940000154601 ENSGT00940000155794 ENSGT00390000006044 Passeriformes ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000158101 ENSGT00940000153818.a.a ENSGT00390000010771 ENSGT00390000014107.a.a ENSGT00940000159133 ENSGT00390000017774 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000153340.B ENSGT00390000012071 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000013484 ENSGT00940000154388 ENSGT00520000055626.a ENSGT00390000016559 ENSGT00390000013263 ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 ENSGT00940000160353 ENSGT00500000044989 ENSGT00940000159687 ENSGT00950000185801 ENSGT00940000153491.b.a ##35 ENSGT00940000153592.B.b.b ENSGT01030000234555.a.a.a.c.b ENSGT00390000004906 ENSGT00390000000571 ENSGT00610000086153 ENSGT00940000164235 ENSGT00940000154601 ENSGT00940000155794 ENSGT00390000006044 Great tit MODERN SPECIES 6 ACADS (ENSPMJG00000018009) SPPL3 (ENSPMJG00000018010) HNF1A (ENSPMJG00000018011) C12orf43 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(ENSFALG00000007346) ##35 SPECC1L (ENSFALG00000007320) ADORA2A (ENSFALG00000023310) UPB1 (ENSFALG00000007311) GUCD1 (ENSFALG00000007310) SNRPD3 (ENSFALG00000007303) ENSFALG00000007298 ENSFALG00000007297 ENSFALG00000007296 ENSFALG00000007277 ENSFALG00000025673 Passeriformes_g ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000158101 ENSGT00940000153818.a.a ENSGT00390000010771 ENSGT00390000014107.a.a ENSGT00940000159133 ENSGT00390000017774 ENSGT00940000159296.o ENSGT00940000153340.B ENSGT00390000012071 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000013484 ENSGT00940000154388 ENSGT00520000055626.a ENSGT00390000016559 ENSGT00390000013263 ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 ENSGT00940000160353 ENSGT00500000044989 ENSGT00940000159687 ENSGT00950000185801 ENSGT00940000153491.b.a ##35 ENSGT00940000153592.B.b.b ENSGT01030000234555.a.a.a.c.b ENSGT00390000004906 ENSGT00390000000571 ENSGT00610000086153 ENSGT00940000164235 ENSGT00940000154601 ENSGT00940000155794 ENSGT00390000006044 Passeroidea ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000153818.a.a ENSGT00390000010771 ENSGT00390000014107.a.a ENSGT00940000159133 ENSGT00390000017774 ENSGT00940000159296.o ENSGT00940000159296.p ENSGT00940000153340.B ENSGT00390000012071 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000013484 ENSGT00940000154388 ENSGT00520000055626.a ENSGT00390000016559 ENSGT00390000013263 ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 ENSGT00940000160353 ENSGT00500000044989 ENSGT00940000159687 ENSGT00940000153491.b.a ##35 ENSGT00940000153592.B.b.b ENSGT01030000234555.a.a.a.c.b ENSGT00390000004906 ENSGT00390000000571 ENSGT00610000086153 ENSGT00940000164235 ENSGT00940000154601 ENSGT00940000155794 ENSGT00390000006044 ENSGT00730000111140 Common canary MODERN SPECIES 18 SPPL3 (ENSSCAG00000003907) HNF1A (ENSSCAG00000003899) C12orf43 (ENSSCAG00000003891) RNF185 (ENSSCAG00000003885) LIMK2 (ENSSCAG00000003867) PIK3IP1 (ENSSCAG00000003864) PATZ1 (ENSSCAG00000003861) DRG1 (ENSSCAG00000003856) EIF4ENIF1 (ENSSCAG00000003852) SFI1 (ENSSCAG00000003812) PISD (ENSSCAG00000003792) ENSSCAG00000003782 ENSSCAG00000003775 DEPDC5 (ENSSCAG00000003749) ENSSCAG00000003742 YWHAH (ENSSCAG00000003741) ##22 SLC5A1 (ENSSCAG00000003734) GNAZ (ENSSCAG00000003724) RSPH14 (ENSSCAG00000003717) RAB36 (ENSSCAG00000003713) BCR (ENSSCAG00000003704) ##35 SPECC1L (ENSSCAG00000003679) ADORA2A (ENSSCAG00000003668) UPB1 (ENSSCAG00000003663) GUCD1 (ENSSCAG00000003653) SNRPD3 (ENSSCAG00000003650) ENSSCAG00000003634 ENSSCAG00000003628 ENSSCAG00000003615 SMPD4 (ENSSCAG00000003599) MED15 (ENSSCAG00000003581) Zebra finch MODERN SPECIES 6 SPPL3 (ENSTGUG00000009651) HNF1A (ENSTGUG00000009673) C12orf43 (ENSTGUG00000009701) RNF185 (ENSTGUG00000009710) LIMK2 (ENSTGUG00000009721) PIK3IP1 (ENSTGUG00000021045) PATZ1 (ENSTGUG00000009749) DRG1 (ENSTGUG00000009759) EIF4ENIF1 (ENSTGUG00000009790) SFI1 (ENSTGUG00000009821) PISD (ENSTGUG00000009829) ENSTGUG00000009830 ENSTGUG00000025574 DEPDC5 (ENSTGUG00000009850) ENSTGUG00000009899 YWHAH (ENSTGUG00000009902) ##22 SLC5A1 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ENSGT00940000159296 ENSGT00940000153340.B ENSGT00390000012071 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000013484 ENSGT00940000154388 ENSGT00520000055626.a ENSGT00390000016559 ENSGT00390000013263 ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 ENSGT00940000160353 ENSGT00500000044989 ENSGT00940000159687 ENSGT00940000153491.b.a ##35 ENSGT00940000153592.B.b.b ENSGT01030000234555.a.a.a.c.b ENSGT00390000004906 ENSGT00390000000571 ENSGT00610000086153 ENSGT00940000164235 ENSGT00940000154601 ENSGT00940000155794 ENSGT00390000006044 ENSGT00730000111140 Kakapo MODERN SPECIES 3 ACADS (ENSSHBG00005010599) SPPL3 (ENSSHBG00005010566) HNF1A (ENSSHBG00005010507) C12orf43 (ENSSHBG00005010470) RNF185 (ENSSHBG00005010428) LIMK2 (ENSSHBG00005019978) PIK3IP1 (ENSSHBG00005019977) PATZ1 (ENSSHBG00005019975) DRG1 (ENSSHBG00005019974) EIF4ENIF1 (ENSSHBG00005019971) ENSSHBG00005019970 PISD (ENSSHBG00005019969) ENSSHBG00005019968 ENSSHBG00005019967 DEPDC5 (ENSSHBG00005017883) YWHAH (ENSSHBG00005017564) ##22 SLC5A1 (ENSSHBG00005017210) GNAZ (ENSSHBG00005017169) RSPH14 (ENSSHBG00005017147) BCR (ENSSHBG00005015994) ##35 SPECC1L (ENSSHBG00005015880) ADORA2A (ENSSHBG00005015856) UPB1 (ENSSHBG00005015851) GUCD1 (ENSSHBG00005015850) SNRPD3 (ENSSHBG00005015845) ENSSHBG00005015840 ENSSHBG00005015837 ENSSHBG00005015831 GGT5 (ENSSHBG00005015826) SMPD4 (ENSSHBG00005015822) MED15 (ENSSHBG00005015813) Golden eagle MODERN SPECIES 25 SPPL3 (ENSACCG00020007484) HNF1A (ENSACCG00020007465) C12orf43 (ENSACCG00020007455) RNF185 (ENSACCG00020007442) LIMK2 (ENSACCG00020007422) PIK3IP1 (ENSACCG00020007404) PATZ1 (ENSACCG00020007374) DRG1 (ENSACCG00020007351) EIF4ENIF1 (ENSACCG00020007310) SFI1 (ENSACCG00020007260) PISD (ENSACCG00020007237) ENSACCG00020007218 ENSACCG00020007204 DEPDC5 (ENSACCG00020007035) ENSACCG00020006677 YWHAH (ENSACCG00020006667) ##22 SLC5A1 (ENSACCG00020006653) GNAZ (ENSACCG00020006633) RSPH14 (ENSACCG00020006618) RAB36 (ENSACCG00020006592) BCR (ENSACCG00020006007) ##35 SPECC1L (ENSACCG00020005251) ADORA2A (ENSACCG00020005242) UPB1 (ENSACCG00020005232) GUCD1 (ENSACCG00020005224) SNRPD3 (ENSACCG00020005211) ENSACCG00020005203 ENSACCG00020005183 GGT5 (ENSACCG00020005171) ENSACCG00020005160 SMPD4 (ENSACCG00020005148) Galloanserae ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000158866 ENSGT00940000158101 ENSGT00940000153818.a.a ENSGT00390000010771 ENSGT00390000014107.a.a ENSGT00940000159133 ENSGT00390000017774 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000153340.B ENSGT00390000012071 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000013484 ENSGT00940000154388 ENSGT00520000055626.a ENSGT00390000016559 ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 ENSGT00940000160353 ENSGT00500000044989 ENSGT00940000159687 ENSGT00950000185801 ENSGT00940000153491.b.a ##35 ENSGT00940000153592.B.b.b ENSGT01030000234555.a.a.a.c.b ENSGT00390000004906 ENSGT00390000000571 ENSGT00610000086153 ENSGT00940000164235 ENSGT00940000154601 ENSGT00940000155794 ENSGT00390000006044 Phasianidae ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000158866 ENSGT00940000158101 ENSGT00940000153818.a.a ENSGT00390000010771 ENSGT00390000014107.a.a ENSGT00940000159133 ENSGT00390000017774 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000153340.B ENSGT00390000012071 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000013484 ENSGT00940000154388 ENSGT00520000055626.a ENSGT00390000016559 ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 ENSGT00940000160353 ENSGT00500000044989 ENSGT00940000159687 ENSGT00940000153491.b.a ##35 ENSGT00950000185801 ENSGT00940000153592.B.b.b ENSGT01030000234555.a.a.a.c.b ENSGT00390000004906 ENSGT00390000000571 ENSGT00610000086153 ENSGT00940000164235 ENSGT00940000154601 ENSGT00940000155794 ENSGT00390000006044 Japanese quail MODERN SPECIES 6 HNF1A (ENSCJPG00005013300) ENSCJPG00005013298 RNF185 (ENSCJPG00005013294) LIMK2 (ENSCJPG00005013291) PIK3IP1 (ENSCJPG00005013285) PATZ1 (ENSCJPG00005013283) DRG1 (ENSCJPG00005013279) EIF4ENIF1 (ENSCJPG00005013151) PISD (ENSCJPG00005013150) ENSCJPG00005013149 ENSCJPG00005013148 SGF29 (ENSCJPG00005013145) ENSCJPG00005013144 ENSCJPG00005013143 DEPDC5 (ENSCJPG00005011177) YWHAH (ENSCJPG00005011165) ##22 SLC5A1 (ENSCJPG00005011164) GNAZ (ENSCJPG00005011163) RSPH14 (ENSCJPG00005011162) RAB36 (ENSCJPG00005011160) ENSCJPG00005011159 BCR (ENSCJPG00005009635) ##35 SPECC1L (ENSCJPG00005009519) ADORA2A (ENSCJPG00005009518) UPB1 (ENSCJPG00005009517) GUCD1 (ENSCJPG00005009515) SNRPD3 (ENSCJPG00005009514) ENSCJPG00005009513 ENSCJPG00005009512 GGT5 (ENSCJPG00005009511) SMPD4 (ENSCJPG00005008967) Phasianidae_b ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000158866 ENSGT00940000158101 ENSGT00940000153818.a.a ENSGT00390000010771 ENSGT00390000014107.a.a ENSGT00940000159133 ENSGT00390000017774 ENSGT00940000159296.q ENSGT00940000153340.B ENSGT00390000012071 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000013484 ENSGT00940000154388 ENSGT00520000055626.a ENSGT00390000016559 ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 ENSGT00940000160353 ENSGT00500000044989 ENSGT00940000159687 ENSGT00940000153491.b.a ##35 ENSGT00940000153592.B.b.b 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ANCESTRAL SPECIES 56 ENSGT00940000158866 ENSGT00940000158101 ENSGT00940000153818.a.a ENSGT00390000010771 ENSGT00390000014107.a.a ENSGT00940000159133 ENSGT00390000017774 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000153340.B ENSGT00390000012071 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000013484 ENSGT00520000055626.a ENSGT00390000016559 ENSGT00390000013263 ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 ENSGT00940000160353 ENSGT00500000044989 ENSGT00940000159687 ENSGT00940000153491.b.a ##35 ENSGT00940000153592.B.b.b ENSGT01030000234555.a.a.a.c.b ENSGT00390000004906 ENSGT00390000000571 ENSGT00610000086153 ENSGT00940000164235 ENSGT00940000154601 ENSGT00940000155794 Platypus MODERN SPECIES 11 SRL (ENSOANG00000038313) SPPL3 (ENSOANG00000041881) HNF1A (ENSOANG00000014646) ENSOANG00000014647 ENSOANG00000047116 LIMK2 (ENSOANG00000014650) PIK3IP1 (ENSOANG00000050884) PATZ1 (ENSOANG00000014654) DRG1 (ENSOANG00000014655) EIF4ENIF1 (ENSOANG00000014657) ENSOANG00000010678 PISD (ENSOANG00000010677) ENSOANG00000039161 DEPDC5 (ENSOANG00000011371) ENSOANG00000006862 YWHAH (ENSOANG00000003572) ##22 ENSOANG00000003573 ENSOANG00000002165 GNAZ (ENSOANG00000005379) ENSOANG00000040321 RAB36 (ENSOANG00000000325) BCR (ENSOANG00000012981) ##35 SPECC1L (ENSOANG00000048595) ADORA2A (ENSOANG00000014280) UPB1 (ENSOANG00000015173) ENSOANG00000028743 ENSOANG00000002463 ENSOANG00000002462 ENSOANG00000041314 ENSOANG00000002631 ENSOANG00000050975 Theria ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000161655 ENSGT00940000154284.b ENSGT00940000156855 ENSGT00940000161662 ENSGT00390000014107.a.a ENSGT00940000159133 ENSGT00390000017774 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000153340.B ENSGT00390000012071 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000013484 ENSGT00520000055626.a ENSGT00390000016559 ENSGT00390000013263 ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 ENSGT00940000160846 ENSGT00940000160353 ENSGT00500000044989 ENSGT00940000159687 ENSGT00940000153491.b.a ##35 ENSGT00940000153592.B.b.b ENSGT01030000234555.a.a.a.c.b ENSGT00390000004906 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ENSGT00940000154179.z.a.a.a ENSGT00940000153474.b.d Suina ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000161655 ENSGT00940000154284.b ENSGT00940000156855 ENSGT00940000161662 ENSGT00390000014107.a.a ENSGT00940000159133 ENSGT00390000017774 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000153340.B ENSGT00390000012071 ENSGT00940000169485 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000013484 ENSGT00520000055626.a ENSGT00390000016559 ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 ENSGT00940000160846 ENSGT00940000153520.c.a ENSGT00940000153474.a.a ENSGT00940000156298 ENSGT00940000163781 ENSGT00940000161054 ENSGT01030000234531.A.b.b.a ENSGT00940000154179.z.a.a.a ENSGT00940000153120.k.a.b.b ENSGT00940000153120.k.a.a ENSGT00940000162558 ENSGT00940000163371.b.b ENSGT00940000163531 ENSGT00940000160353 Pig MODERN SPECIES 5 ENSSSCG00000063554 SELENOM (ENSSSCG00000029781) INPP5J (ENSSSCG00000030345) PLA2G3 (ENSSSCG00000010023) RNF185 (ENSSSCG00000058877) LIMK2 (ENSSSCG00000010025) PIK3IP1 (ENSSSCG00000010026) PATZ1 (ENSSSCG00000010027) DRG1 (ENSSSCG00000010029) EIF4ENIF1 (ENSSSCG00000010030) ENSSSCG00000035290 SFI1 (ENSSSCG00000010031) PISD (ENSSSCG00000010032) PRR14L (ENSSSCG00000010033) DEPDC5 (ENSSSCG00000010034) YWHAH (ENSSSCG00000010035) ##22 ENSSSCG00000042192 SLC5A1 (ENSSSCG00000010036) SLC5A4 (ENSSSCG00000010039) ENSSSCG00000035443 ENSSSCG00000040522 ENSSSCG00000031037 ENSSSCG00000041880 ENSSSCG00000032042 ENSSSCG00000039180 ENSSSCG00000048391 ENSSSCG00000025508 ZNF280B (ENSSSCG00000033879) ENSSSCG00000034651 PRAME (ENSSSCG00000036408) ENSSSCG00000039192 Chacoan peccary MODERN SPECIES 812 ENSCWAG00000010799 SMTN (ENSCWAG00000010665) SELENOM (ENSCWAG00000010607) INPP5J (ENSCWAG00000010371) PLA2G3 (ENSCWAG00000010309) RNF185 (ENSCWAG00000010223) LIMK2 (ENSCWAG00000010000) PIK3IP1 (ENSCWAG00000009936) PATZ1 (ENSCWAG00000009802) DRG1 (ENSCWAG00000009748) EIF4ENIF1 (ENSCWAG00000008972) ENSCWAG00000008866 PISD (ENSCWAG00000008784) PRR14L (ENSCWAG00000008723) DEPDC5 (ENSCWAG00000008416) YWHAH (ENSCWAG00000008325) ##22 SLC5A1 (ENSCWAG00000008102) SLC5A4 (ENSCWAG00000007942) ENSCWAG00000007887 ENSCWAG00000007838 ENSCWAG00000010675 ENSCWAG00000010480 ENSCWAG00000010436 PRAME (ENSCWAG00000010406) ENSCWAG00000010378 ENSCWAG00000010259 ENSCWAG00000010093 ENSCWAG00000010014 ENSCWAG00000009997 ENSCWAG00000009964 ENSCWAG00000009895 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000154284.b ENSGT00940000156855 ENSGT00940000161662 ENSGT00390000014107.a.a ENSGT00940000159133 ENSGT00390000017774 ENSGT00940000159296 ENSGT00540000073696 ENSGT00940000153340.B ENSGT00390000012071 ENSGT00940000169485 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000013484 ENSGT00520000055626.a ENSGT00390000016559 ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 ENSGT00940000160846 ENSGT00940000153520.d.b.b ENSGT00940000163531 ENSGT00940000160353 ENSGT00500000044989 ENSGT00940000159687 ENSGT01000000215173 ENSGT00940000153491.b.a ##35 ENSGT00940000153592.B.b.b ENSGT01030000234555.a.a.a.c.b ENSGT00390000004906 ENSGT00390000000571 ENSGT00610000086153 ENSGT00940000162815 Camelidae ANCESTRAL SPECIES 63 ENSGT00940000161655 ENSGT00940000154284.b ENSGT00940000156855 ENSGT00940000161662 ENSGT00390000014107.a.a ENSGT00940000159133 ENSGT00390000017774 ENSGT00940000159296 ENSGT00540000073696 ENSGT00940000153340.B ENSGT00390000012071 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000013484 ENSGT00520000055626.a ENSGT00390000016559 ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 Alpaca MODERN SPECIES 4798 YWHAH (ENSVPAG00000009460) ##22 Arabian camel MODERN SPECIES 25 SELENOM (ENSCDRG00005012427) ENSCDRG00005012387 ENSCDRG00005012322 PLA2G3 (ENSCDRG00005012238) RNF185 (ENSCDRG00005012101) LIMK2 (ENSCDRG00005011800) PIK3IP1 (ENSCDRG00005011735) PATZ1 (ENSCDRG00005011451) ENSCDRG00005011424 DRG1 (ENSCDRG00005011363) EIF4ENIF1 (ENSCDRG00005010980) SFI1 (ENSCDRG00005010311) PISD (ENSCDRG00005010080) PRR14L (ENSCDRG00005009975) DEPDC5 (ENSCDRG00005009136) YWHAH (ENSCDRG00005009047) ##22 SLC5A1 (ENSCDRG00005022135) ENSCDRG00005022131 ENSCDRG00005022129 ENSCDRG00005022128 ENSCDRG00005022127 ENSCDRG00005022125 ENSCDRG00005022124 ENSCDRG00005022123 ENSCDRG00005022122 ENSCDRG00005022121 ENSCDRG00005022119 ENSCDRG00005022118 ENSCDRG00005022116 ZNF280B (ENSCDRG00005022115) ENSCDRG00005022113 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000161655 ENSGT00940000154284.b ENSGT00940000156855 ENSGT00940000161662 ENSGT00390000014107.a.a ENSGT00940000159133 ENSGT00390000017774 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000153340.B ENSGT00390000012071 ENSGT00940000169485 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000013484 ENSGT00520000055626.a ENSGT00390000016559 ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 ENSGT00940000160846 ENSGT00940000153520.d.b.b ENSGT00940000163531 ENSGT00940000160353 ENSGT00500000044989 ENSGT00940000159687 ENSGT01000000215173 ENSGT00940000153491.b.a ##35 ENSGT00940000153592.B.b.b ENSGT01030000234555.a.a.a.c.b ENSGT00390000004906 ENSGT00390000000571 ENSGT00610000086153 ENSGT00940000162815 Pecora ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000161655 ENSGT00940000154284.b ENSGT00940000156855 ENSGT00940000161662 ENSGT00390000014107.a.a ENSGT00940000159133 ENSGT00390000017774 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000153340.B ENSGT00390000012071 ENSGT00940000169485 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000013484 ENSGT00520000055626.a ENSGT00390000016559 ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 ENSGT00940000160846 ENSGT00940000153474.b.d.g.a.b.b ENSGT00940000153474.b.d.g.a.b.a ENSGT00940000153520.d.b.a.a.a.b ENSGT00940000153474.b.d.g.b.a ENSGT00940000156298.m.b ENSGT00940000153474.b.d.g.b.b.b.a.a ENSGT00940000161517.D ENSGT00940000161054 ENSGT01030000234531.A.b.b.a ENSGT00940000154179.`b ENSGT00940000153120.k.a.b.b.w ENSGT00940000153120.k.a.a.d ENSGT00940000153120.k.a.b.b.x Yarkand deer MODERN SPECIES 28 SMTN (ENSCHYG00000002588) SELENOM (ENSCHYG00000002527) INPP5J (ENSCHYG00000002332) PLA2G3 (ENSCHYG00000002281) RNF185 (ENSCHYG00000002252) LIMK2 (ENSCHYG00000002141) PIK3IP1 (ENSCHYG00000002073) PATZ1 (ENSCHYG00000002021) DRG1 (ENSCHYG00000001979) EIF4ENIF1 (ENSCHYG00000001918) SFI1 (ENSCHYG00000001710) PISD (ENSCHYG00000001611) PRR14L (ENSCHYG00000001542) ENSCHYG00000001513 DEPDC5 (ENSCHYG00000001350) YWHAH (ENSCHYG00000001271) ##22 SLC5A1 (ENSCHYG00000001245) SLC5A4 (ENSCHYG00000001217) ENSCHYG00000001199 ENSCHYG00000001174 ENSCHYG00000001156 ENSCHYG00000001146 ENSCHYG00000001131 ENSCHYG00000001118 ZNF280B (ENSCHYG00000001098) PRAME (ENSCHYG00000001038) ENSCHYG00000001020 ENSCHYG00000001003 ENSCHYG00000000997 ZNF70 (ENSCHYG00000000990) VPREB3 (ENSCHYG00000000976) Percora_a ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000161655 ENSGT00940000154284.b ENSGT00940000156855 ENSGT00940000161662 ENSGT00390000014107.a.a ENSGT00940000159133 ENSGT00390000017774 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000153340.B ENSGT00390000012071 ENSGT00940000169485 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000013484 ENSGT00520000055626.a ENSGT00390000016559 ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 ENSGT00940000160846 ENSGT00940000153474.b.d.g.a.b.b ENSGT00940000153520.d.b.a.a.a.b ENSGT00940000153474.b.d.g.b.b.a ENSGT00940000156298.n ENSGT00940000153474.b.d.g.b.b.b.a.b ENSGT00940000156298.m.a ENSGT00940000153474.b.d.g.b.b.b.a.a ENSGT00940000161517.D ENSGT00940000153474.b.d.g.b.a ENSGT00940000154293.C ENSGT00940000153474.b.d.g.a.a ENSGT00940000156298.m.b ENSGT00940000153474.b.d.g.a.b.a Bovidae ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00390000017082 ENSGT00940000161655 ENSGT00940000154284.b ENSGT00940000156855 ENSGT00940000161662 ENSGT00390000014107.a.a ENSGT00940000159133 ENSGT00390000017774 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000153340.B.c ENSGT00390000012071 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000013484 ENSGT00520000055626.a ENSGT00390000016559 ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 ENSGT00940000160846 ENSGT00940000153474.b.d.g.a.b.b ENSGT00940000161054.u.a ENSGT00940000161054.v ENSGT01030000234531.A.b.b.a.i.a ENSGT00940000153474.b.d.g.a.b.a ENSGT00940000153520.d.b.a.a.a.b.f ENSGT00940000154293.C ENSGT00940000153474.b.d.g.a.a ENSGT00940000156298.m.b ENSGT00940000153474.b.d.g.b.b.b.a.a.d ENSGT00940000161517.D ENSGT00940000153474.b.d.g.b.b.a ENSGT00940000156298.n Bovinae ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000161655 ENSGT00940000154284.b ENSGT00940000156855 ENSGT00940000161662 ENSGT00390000014107.a.a ENSGT00940000159133 ENSGT00390000017774 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000153340.B.c ENSGT00390000012071 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000010316.w.d ENSGT00390000013484 ENSGT00520000055626.a ENSGT00390000016559 ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 ENSGT00940000160846 ENSGT00940000153474.b.d.g.a.b.b ENSGT00940000153520.d.b.a.a.a.b.e.b ENSGT00940000153474.b.d.g.b.a ENSGT00940000154293.C ENSGT00940000153474.b.d.g.a.a ENSGT00940000156298.m.b ENSGT00940000153474.b.d.g.b.b.b.a.a.d.a.b.a ENSGT00940000156298.m.a.b.b ENSGT00940000153474.b.d.g.b.b.b.a.a.d.a.a ENSGT00940000161517.D ENSGT00940000153474.b.d.g.b.b.b.a.a.d.a.b.b ENSGT00940000156298.n ENSGT00940000156298.m.a.b.a Bos ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000161655 ENSGT00940000154284.b ENSGT00940000156855 ENSGT00940000161662 ENSGT00390000014107.a.a ENSGT00940000159133 ENSGT00390000017774 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000153340.B.c ENSGT00390000012071 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000010316.w.d ENSGT00390000013484 ENSGT00520000055626.a ENSGT00390000016559 ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 ENSGT00940000160846 ENSGT00940000153474.b.d.g.a.b.b ENSGT00940000153520.d.b.a.a.a.b.f ENSGT00940000153474.b.d.g.b.a ENSGT00940000153474.b.d.g.a.a ENSGT00940000156298.m.a.b.a ENSGT00940000153474.b.d.g.b.b.b.a.b ENSGT00940000153474.b.d.g.a.b.a ENSGT00940000161054.u.a ENSGT00940000161054.v.a ENSGT01030000234531.A.b.b.a.i.a.b ENSGT00940000153474.b.d.h ENSGT00940000154179.`b.m.a ENSGT00940000154179.`b.m.b Bos_a ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000161655 ENSGT00940000154284.b ENSGT00940000156855 ENSGT00940000161662 ENSGT00390000014107.a.a ENSGT00940000159133 ENSGT00390000017774 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000153340.B.c ENSGT00390000012071 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000010316.w.d ENSGT00390000013484 ENSGT00520000055626.a ENSGT00390000016559 ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 ENSGT00940000160846 ENSGT00940000153474.b.d.g.a.b.b ENSGT00940000153520.d.b.a.a.a.b.f ENSGT00940000153474.b.d.g.b.a ENSGT00940000154179.`b.n ENSGT00940000153474.b.d.g.b.b.b.a.a.c ENSGT00940000153474.b.d.g.a.b.a ENSGT00940000161054.u.a ENSGT00940000161054.v.a ENSGT01030000234531.A.b.b.a.i.a.b ENSGT00940000153474.b.d.h ENSGT00940000154179.`b.m.a ENSGT00940000154179.`b.m.b ENSGT00940000153120.k.a.b.b.w Domestic yak MODERN SPECIES 7 SMTN (ENSBGRG00000025006) SELENOM (ENSBGRG00000025055) INPP5J (ENSBGRG00000025069) PLA2G3 (ENSBGRG00000025211) RNF185 (ENSBGRG00000007764) LIMK2 (ENSBGRG00000007932) PIK3IP1 (ENSBGRG00000008520) PATZ1 (ENSBGRG00000008657) ENSBGRG00000008848 EIF4ENIF1 (ENSBGRG00000008974) SFI1 (ENSBGRG00000009211) ENSBGRG00000010224 PISD (ENSBGRG00000010261) PRR14L (ENSBGRG00000010522) DEPDC5 (ENSBGRG00000010853) YWHAH (ENSBGRG00000019376) ##22 SLC5A1 (ENSBGRG00000019426) SLC5A4 (ENSBGRG00000019793) ENSBGRG00000020007 ENSBGRG00000020175 ENSBGRG00000020224 ENSBGRG00000020250 ENSBGRG00000020289 ENSBGRG00000020340 ENSBGRG00000020379 ENSBGRG00000020415 ENSBGRG00000020428 ENSBGRG00000020460 ENSBGRG00000020481 ENSBGRG00000020488 ENSBGRG00000020500 Wild yak MODERN SPECIES 2260 ENSBMUG00000024324 SMTN (ENSBMUG00000024308) SELENOM (ENSBMUG00000024265) INPP5J (ENSBMUG00000024242) PLA2G3 (ENSBMUG00000024238) ENSBMUG00000024211 LIMK2 (ENSBMUG00000024175) PIK3IP1 (ENSBMUG00000024154) PATZ1 (ENSBMUG00000024127) ENSBMUG00000024092 EIF4ENIF1 (ENSBMUG00000024062) SFI1 (ENSBMUG00000023988) PISD (ENSBMUG00000023797) PRR14L (ENSBMUG00000023776) DEPDC5 (ENSBMUG00000023241) YWHAH (ENSBMUG00000021989) ##22 SLC5A1 (ENSBMUG00000021979) SLC5A4 (ENSBMUG00000021945) ENSBMUG00000021933 ENSBMUG00000021924 Bos_b ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000153998.b ENSGT00390000017082 ENSGT00940000161655 ENSGT00940000154284.b ENSGT00940000156855 ENSGT00940000161662 ENSGT00390000014107.a.a ENSGT00940000159133 ENSGT00390000017774 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000153340.B.c ENSGT00390000012071 ENSGT00940000154110.a ENSGT00520000055626.a ENSGT00390000016559 ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 ENSGT00940000160846 ENSGT00940000153520.d.b.a.a.a.b.e.a ENSGT00940000153474.b.d.g.a.b.a.d ENSGT00940000153520.d.b.a.a.a.b.f ENSGT00940000153474.b.d.g.b.b.b.a.a.d.a.b.a.b.a.b ENSGT00940000153520.d.b.a.a.a.b.e.b ENSGT00940000153474.b.d.g.b.a ENSGT00940000153474.b.d.g.a.a.a ENSGT00940000156298.m.a.b.a ENSGT00940000153474.b.d.g.b.b.b.a.b.c ENSGT00940000153474.b.d.g.b.b.b.a.a.d.b ENSGT00940000153474.b.d.g.b.b.b.a.b.d ENSGT00940000153474.b.d.g.a.b.a.c ENSGT00940000161054.u.a Cow MODERN SPECIES 8 MORC2 (ENSBTAG00000009963) SMTN (ENSBTAG00000003100) ENSBTAG00000055010 SELENOM (ENSBTAG00000031279) INPP5J (ENSBTAG00000017023) PLA2G3 (ENSBTAG00000011962) RNF185 (ENSBTAG00000002828) LIMK2 (ENSBTAG00000010662) PIK3IP1 (ENSBTAG00000010667) PATZ1 (ENSBTAG00000005478) DRG1 (ENSBTAG00000008990) EIF4ENIF1 (ENSBTAG00000008991) SFI1 (ENSBTAG00000008996) PRR14L (ENSBTAG00000009006) DEPDC5 (ENSBTAG00000001295) YWHAH (ENSBTAG00000031134) ##22 SLC5A1 (ENSBTAG00000012851) SLC5A4 (ENSBTAG00000008117) ENSBTAG00000050653 ENSBTAG00000053220 ENSBTAG00000046584 ENSBTAG00000039237 ENSBTAG00000050373 ENSBTAG00000050496 ENSBTAG00000047529 ENSBTAG00000052689 ENSBTAG00000054609 ENSBTAG00000053980 ENSBTAG00000048321 ENSBTAG00000047986 ENSBTAG00000052233 Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 8 MORC2 (ENSBIXG00005000221) ENSBIXG00005008628 SMTN (ENSBIXG00005000257) SELENOM (ENSBIXG00005006764) INPP5J (ENSBIXG00005008864) PLA2G3 (ENSBIXG00005008890) RNF185 (ENSBIXG00005008922) LIMK2 (ENSBIXG00005005793) PIK3IP1 (ENSBIXG00005008992) PATZ1 (ENSBIXG00005009061) DRG1 (ENSBIXG00005009099) EIF4ENIF1 (ENSBIXG00005000405) SFI1 (ENSBIXG00005009221) PRR14L (ENSBIXG00005009283) DEPDC5 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(ENSBMSG00010011330) ENSBMSG00010011303 SVOP (ENSBMSG00010011282) USP30 (ENSBMSG00010011238) Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000154284.b ENSGT00940000156855 ENSGT00940000161662 ENSGT00390000014107.a.a ENSGT00940000159133 ENSGT00390000017774 ENSGT00940000159296 ENSGT00540000073696 ENSGT00940000153340.B ENSGT00390000012071 ENSGT00940000154110.a ENSGT00940000171945 ENSGT00390000013484 ENSGT00520000055626.a ENSGT00390000016559 ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 ENSGT00940000160846 ENSGT00940000153520.d.b.b ENSGT00940000156298.p ENSGT00940000153520.c.c ENSGT00940000161640 ENSGT00940000153474.b.d ENSGT00940000156298.o.a ENSGT00940000162204 ENSGT00940000163781 ENSGT00940000161054 ENSGT01030000234531.A.b.b.a ENSGT00940000154179.`b ENSGT00940000153120.k.a.b.b.z.b.a ENSGT00940000153120.k.a.b.a.a.a Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00390000017082 ENSGT00940000161655 ENSGT00940000154284.b ENSGT00940000156855 ENSGT00940000161662 ENSGT00390000014107.a.a ENSGT00940000159133 ENSGT00390000017774 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000153340.B ENSGT00390000012071 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000013484 ENSGT00520000055626.a ENSGT00390000016559 ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 ENSGT00940000160846 ENSGT00940000156298.p ENSGT00940000153520.c.c ENSGT00940000161640 ENSGT00940000153474.b.d ENSGT00940000161517.D ENSGT00940000153520.d.b.a.a.a.a.d ENSGT00940000153474.b.c.b ENSGT00940000156298.o.a ENSGT00940000162204 ENSGT00940000163781 ENSGT00940000161054 ENSGT01030000234531.A.b.b.a ENSGT00940000154179.z.b Equus ANCESTRAL SPECIES 50 ENSGT00390000017082 ENSGT00940000161655 ENSGT00940000154284.b ENSGT00940000156855 ENSGT00940000161662 ENSGT00390000014107.a.a ENSGT00940000159133 ENSGT00390000017774 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000153340.B.i ENSGT00390000012071 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000013484 ENSGT00520000055626.a ENSGT00390000016559 ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 ENSGT00940000160846 ENSGT00940000156298.p.g.b ENSGT00940000153520.c.c ENSGT00940000161640.e.b Donkey MODERN SPECIES 28 ENSEASG00005010378 SMTN (ENSEASG00005010385) SELENOM (ENSEASG00005029402) INPP5J (ENSEASG00005010404) PLA2G3 (ENSEASG00005010433) RNF185 (ENSEASG00005010439) LIMK2 (ENSEASG00005010443) PIK3IP1 (ENSEASG00005010450) PATZ1 (ENSEASG00005010455) ENSEASG00005033297 EIF4ENIF1 (ENSEASG00005010461) SFI1 (ENSEASG00005010467) ENSEASG00005026689 PRR14L (ENSEASG00005010474) DEPDC5 (ENSEASG00005010528) YWHAH (ENSEASG00005026873) ##22 SLC5A1 (ENSEASG00005011466) ENSEASG00005012762 ENSEASG00005025295 ENSEASG00005033153 ENSEASG00005038758 ENSEASG00005028195 ENSEASG00005025020 ENSEASG00005035723 ENSEASG00005031278 ENSEASG00005035850 ENSEASG00005034784 ENSEASG00005026438 ENSEASG00005029041 ENSEASG00005029176 ENSEASG00005025688 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000161655 ENSGT00390000017082 ENSGT00940000154284.b ENSGT00940000156855 ENSGT00940000161662 ENSGT00390000014107.a.a ENSGT00940000159133 ENSGT00390000017774 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000153340.B ENSGT00390000012071 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000013484 ENSGT00520000055626.a ENSGT00390000016559 ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 ENSGT00940000160846 ENSGT00940000156298.o.a.d.a.b ENSGT00940000162204 ENSGT00940000163781 ENSGT00940000161054 ENSGT01030000234531.A.b.b.a ENSGT00940000153934.a.b ENSGT00940000154179.`b ENSGT00940000153120.k.a.a ENSGT00940000153934.a.a ENSGT00940000153120.k.a.b.b.z.a ENSGT00940000153120.k.a.b.a.a.b ENSGT00940000163531 ENSGT00500000044989 Megabat MODERN SPECIES 422 YWHAH (ENSPVAG00000017244) ##22 SLC5A1 (ENSPVAG00000017245) Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000161655 ENSGT00390000017082 ENSGT00940000154284.b ENSGT00940000156855 ENSGT00940000161662 ENSGT00390000014107.a.a ENSGT00940000159133 ENSGT00390000017774 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000153340.B ENSGT00390000012071 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000013484 ENSGT00520000055626.a ENSGT00390000016559 ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 ENSGT00940000160846 ENSGT00940000156298.o.a.d.a.b ENSGT00940000162204 ENSGT00940000163781 ENSGT00940000161054 ENSGT01030000234531.A.b.b.a ENSGT00940000153934.a.b ENSGT00940000154179.`b ENSGT00940000153120.k.a.a ENSGT00940000153934.a.a ENSGT00940000153120.k.a.b.b.z.a ENSGT00940000153120.k.a.b.a.a.b ENSGT00940000163531 ENSGT00500000044989 Microbat MODERN SPECIES 1443 ENSMLUG00000001325 YWHAH (ENSMLUG00000001358) ##22 SLC5A1 (ENSMLUG00000000838) SLC5A4 (ENSMLUG00000000851) ENSMLUG00000023936 ENSMLUG00000027903 ENSMLUG00000016304 ENSMLUG00000030004 ENSMLUG00000026525 ENSMLUG00000025952 ENSMLUG00000027636 ENSMLUG00000009210 ENSMLUG00000023577 ENSMLUG00000026448 ENSMLUG00000025074 ENSMLUG00000027437 ENSMLUG00000029684 Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 17 SMTN (ENSRFEG00010009101) ENSRFEG00010009360 SELENOM (ENSRFEG00010009382) INPP5J (ENSRFEG00010009450) PLA2G3 (ENSRFEG00010009643) RNF185 (ENSRFEG00010009674) LIMK2 (ENSRFEG00010009760) PIK3IP1 (ENSRFEG00010009828) PATZ1 (ENSRFEG00010009908) DRG1 (ENSRFEG00010010113) EIF4ENIF1 (ENSRFEG00010010182) PISD (ENSRFEG00010011060) PRR14L (ENSRFEG00010011153) DEPDC5 (ENSRFEG00010011229) ENSRFEG00010011706 YWHAH (ENSRFEG00010011741) ##22 SLC5A1 (ENSRFEG00010011797) SLC5A4 (ENSRFEG00010011975) ENSRFEG00010013648 ENSRFEG00010013820 ENSRFEG00010013845 ENSRFEG00010013875 ENSRFEG00010014008 ENSRFEG00010014076 ENSRFEG00010014104 ENSRFEG00010014120 ENSRFEG00010014145 ENSRFEG00010014180 ENSRFEG00010014229 ENSRFEG00010014274 ENSRFEG00010014322 Carnivora ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000154284.b ENSGT00940000156855 ENSGT00940000161662 ENSGT00390000014107.a.a ENSGT00940000159133 ENSGT00390000017774 ENSGT00940000159296 ENSGT00540000073696 ENSGT00940000153340.B ENSGT00390000012071 ENSGT00940000154110.a ENSGT00940000171945 ENSGT00390000013484 ENSGT00520000055626.a ENSGT00390000016559 ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 ENSGT00940000160846 ENSGT00940000153520.d.b.b ENSGT00940000162204 ENSGT00940000161054 ENSGT01030000234531.A.b.b.a ENSGT00940000154179.`b ENSGT00940000153120.k.a.b.b.z.b.a ENSGT00940000162558.g.a.b.a ENSGT00940000153120.k.a.b.a.b.a.b ENSGT00940000154179.z.b ENSGT00940000162558.g.b ENSGT00940000153120.k.a.a.i ENSGT00940000162558.g.a.b.b.b ENSGT00940000153120.k.a.a.j Caniformia ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000154284.b ENSGT00940000156855 ENSGT00940000161662 ENSGT00390000014107.a.a ENSGT00940000159133 ENSGT00390000017774 ENSGT00940000159296 ENSGT00540000073696 ENSGT00940000153340.B ENSGT00390000012071 ENSGT00940000154110.a ENSGT00940000171945 ENSGT00390000013484 ENSGT00520000055626.a ENSGT00390000016559 ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 ENSGT00940000160846 ENSGT00940000162204 ENSGT00940000161054 ENSGT01030000234531.A.b.b.a ENSGT00940000154179.`b ENSGT00940000154179.z.b ENSGT00940000162558.g.b ENSGT00940000153120.k.a.a.i.c.b ENSGT00940000162558.h ENSGT00940000153934.a.a ENSGT00940000153120.k.a.a.j ENSGT00940000162558.g.a.b.b.b ENSGT00940000153120.k.a.a.i.c.a ENSGT00940000162558.g.a.b.b.a Canidae ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00390000017082 ENSGT00940000161655 ENSGT00940000154284.b ENSGT00940000156855 ENSGT00940000161662 ENSGT00390000014107.a.a ENSGT00940000159133 ENSGT00390000017774 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000153340.B ENSGT00390000012071 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000013484 ENSGT00520000055626.a ENSGT00390000016559 ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 ENSGT00940000160846 ENSGT00940000153474.a.a.b.b Red fox MODERN SPECIES 215 SMTN (ENSVVUG00000002448) SELENOM (ENSVVUG00000002426) INPP5J (ENSVVUG00000002420) PLA2G3 (ENSVVUG00000002387) RNF185 (ENSVVUG00000002360) LIMK2 (ENSVVUG00000002341) PIK3IP1 (ENSVVUG00000002329) PATZ1 (ENSVVUG00000002321) DRG1 (ENSVVUG00000001548) EIF4ENIF1 (ENSVVUG00000001441) SFI1 (ENSVVUG00000001395) PISD (ENSVVUG00000001372) PRR14L (ENSVVUG00000001346) DEPDC5 (ENSVVUG00000029088) ENSVVUG00000029084 YWHAH (ENSVVUG00000029083) ##22 SLC5A1 (ENSVVUG00000029081) SLC5A4 (ENSVVUG00000029080) ENSVVUG00000029079 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000161655 ENSGT00390000017082 ENSGT00940000154284.b ENSGT00940000156855 ENSGT00940000161662 ENSGT00390000014107.a.a ENSGT00940000159133 ENSGT00390000017774 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000153340.B ENSGT00390000012071 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000013484 ENSGT00520000055626.a ENSGT00390000016559 ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 ENSGT00940000160846 ENSGT00940000153474.b.c.a.a.a.a.a.b.b.a.b ENSGT00940000153474.a.b.a.a.c.a.a.a.a.b.b ENSGT00940000156298.o.b.a.b.a.b.a ENSGT00940000161517.D ENSGT00940000153474.a.b.b.c.a ENSGT00940000153520.d.a.a.b.b.a ENSGT00940000153474.b.c.a.a.a.a.a.a.b.a.b.a.b.a.a.a ENSGT00940000153474.b.c.a.a.a.a.a.a.b.a.b.b.a.b Dingo MODERN SPECIES 108 SMTN (ENSCAFG00020001247) ENSCAFG00020001274 SELENOM (ENSCAFG00020001277) INPP5J (ENSCAFG00020001294) PLA2G3 (ENSCAFG00020001374) RNF185 (ENSCAFG00020001389) LIMK2 (ENSCAFG00020001398) PIK3IP1 (ENSCAFG00020001418) PATZ1 (ENSCAFG00020001433) DRG1 (ENSCAFG00020001457) EIF4ENIF1 (ENSCAFG00020001521) SFI1 (ENSCAFG00020001569) PISD (ENSCAFG00020001632) ENSCAFG00020001650 DEPDC5 (ENSCAFG00020001921) YWHAH (ENSCAFG00020003733) ##22 SLC5A1 (ENSCAFG00020003745) SLC5A4 (ENSCAFG00020003771) ENSCAFG00020003781 ENSCAFG00020003789 ENSCAFG00020003793 ENSCAFG00020003799 ENSCAFG00020003800 ENSCAFG00020003801 ENSCAFG00020003802 ENSCAFG00020003803 ENSCAFG00020003805 ENSCAFG00020003806 ENSCAFG00020003810 ENSCAFG00020003818 ENSCAFG00020003820 Dog MODERN SPECIES 18 MORC2 (ENSCAFG00845021336) SMTN (ENSCAFG00845021764) ENSCAFG00845022051 SELENOM (ENSCAFG00845022084) INPP5J (ENSCAFG00845022129) PLA2G3 (ENSCAFG00845022232) RNF185 (ENSCAFG00845022335) PIK3IP1 (ENSCAFG00845022796) PATZ1 (ENSCAFG00845022934) DRG1 (ENSCAFG00845023038) EIF4ENIF1 (ENSCAFG00845023147) SFI1 (ENSCAFG00845023768) PISD (ENSCAFG00845024889) PRR14L (ENSCAFG00845025084) DEPDC5 (ENSCAFG00845025431) YWHAH (ENSCAFG00845027045) ##22 ENSCAFG00845027122 SLC5A1 (ENSCAFG00845027277) SLC5A4 (ENSCAFG00845027749) ENSCAFG00845027857 ENSCAFG00845027871 ENSCAFG00845027889 ENSCAFG00845027914 ENSCAFG00845027943 ENSCAFG00845027972 ENSCAFG00845028019 ENSCAFG00845028039 ENSCAFG00845028089 ENSCAFG00845028172 ENSCAFG00845028230 ENSCAFG00845028278 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00940000154284.b ENSGT00940000156855 ENSGT00940000161662 ENSGT00390000014107.a.a ENSGT00940000159133 ENSGT00390000017774 ENSGT00940000159296 ENSGT00540000073696 ENSGT00940000153340.B ENSGT00390000012071 ENSGT00940000154110.a ENSGT00940000171945 ENSGT00390000013484 ENSGT00520000055626.a ENSGT00390000016559 ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 ENSGT00940000160846 Mustelinae ANCESTRAL SPECIES 76 ENSGT00940000161655 ENSGT00940000154284.b ENSGT00940000156855 ENSGT00940000161662 ENSGT00390000014107.a.a ENSGT00940000159133 ENSGT00390000017774 ENSGT00940000159296 ENSGT00540000073696 ENSGT00940000153340.B ENSGT00390000012071 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000013484 ENSGT00520000055626.a ENSGT00390000016559 ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 ENSGT00940000160846 American mink MODERN SPECIES 121 SELENOM (ENSNVIG00000001429) INPP5J (ENSNVIG00000001295) PLA2G3 (ENSNVIG00000001273) RN185 (ENSNVIG00000001214) LIMK2 (ENSNVIG00000001130) PIK3IP1 (ENSNVIG00000001054) ENSNVIG00000001025 PATZ1 (ENSNVIG00000000974) ENSNVIG00000000965 DRG1 (ENSNVIG00000000954) EIF4ENIF1 (ENSNVIG00000000860) SFI1 (ENSNVIG00000000057) PISD (ENSNVIG00000021994) PRR14L (ENSNVIG00000021973) DEPDC5 (ENSNVIG00000020981) YWHAH (ENSNVIG00000020963) ##22 SLC5A1 (ENSNVIG00000020933) Ferret MODERN SPECIES 283 OSBP2 (ENSMPUG00000012878) MORC2 (ENSMPUG00000012872) SMTN (ENSMPUG00000012866) SELENOM (ENSMPUG00000012848) PLA2G3 (ENSMPUG00000012845) INPP5J (ENSMPUG00000012832) LIMK2 (ENSMPUG00000012826) PIK3IP1 (ENSMPUG00000012824) PATZ1 (ENSMPUG00000012814) DRG1 (ENSMPUG00000012810) EIF4ENIF1 (ENSMPUG00000012801) SFI1 (ENSMPUG00000012788) PISD (ENSMPUG00000012782) PRR14L (ENSMPUG00000012770) DEPDC5 (ENSMPUG00000012757) YWHAH (ENSMPUG00000012755) ##22 SLC5A1 (ENSMPUG00000012749) SLC5A4 (ENSMPUG00000012665) ENSMPUG00000012661 ENSMPUG00000012658 ENSMPUG00000012655 ENSMPUG00000012653 Ursidae ANCESTRAL SPECIES 48 ENSGT00940000161655 ENSGT00940000154284.b.qb ENSGT00940000156855 ENSGT00940000161662 ENSGT00390000014107.a.a ENSGT00940000159133 ENSGT00390000017774 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000153340.B ENSGT00390000012071 ENSGT00940000154110.a ENSGT00940000171945 ENSGT00390000013484 ENSGT00520000055626.a ENSGT00390000016559.d ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 ENSGT00940000160846 Giant Panda MODERN SPECIES 3 SMTN (ENSAMEG00000007241) SELENOM (ENSAMEG00000024537) INPP5J (ENSAMEG00000007209) PLA2G3 (ENSAMEG00000007198) RNF185 (ENSAMEG00000007180) LIMK2 (ENSAMEG00000007100) PIK3IP1 (ENSAMEG00000007084) PATZ1 (ENSAMEG00000007074) DRG1 (ENSAMEG00000007040) EIF4ENIF1 (ENSAMEG00000007030) ENSAMEG00000027088 SFI1 (ENSAMEG00000007023) PISD (ENSAMEG00000007005) PRR14L (ENSAMEG00000007000) DEPDC5 (ENSAMEG00000006945) YWHAH (ENSAMEG00000023877) ##22 SLC5A1 (ENSAMEG00000006897) ENSAMEG00000003643 ENSAMEG00000026797 GIT2 (ENSAMEG00000005764) TCHP (ENSAMEG00000005866) ENSAMEG00000005882 TRPV4 (ENSAMEG00000005900) FAM222A (ENSAMEG00000024269) MVK (ENSAMEG00000016630) MMAB (ENSAMEG00000016623) UBE3B (ENSAMEG00000016602) KCTD10 (ENSAMEG00000016597) MYO1H (ENSAMEG00000016558) FOXN4 (ENSAMEG00000016548) ENSAMEG00000016533 Ursus ANCESTRAL SPECIES 80 ENSGT00940000161655 ENSGT00940000154284.b.qb ENSGT00940000156855 ENSGT00940000161662 ENSGT00390000014107.a.a ENSGT00940000159133 ENSGT00390000017774 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000153340.B ENSGT00390000012071 ENSGT00940000154110.a ENSGT00940000171945 ENSGT00390000013484 ENSGT00520000055626.a ENSGT00390000016559.d ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 ENSGT00940000160846 American black bear MODERN SPECIES 3885 DEPDC5 (ENSUAMG00000018865) YWHAH (ENSUAMG00000018864) ##22 Polar bear MODERN SPECIES 428 SMTN (ENSUMAG00000016143) SELENOM (ENSUMAG00000016111) INPP5J (ENSUMAG00000016037) PLA2G3 (ENSUMAG00000015999) RNF185 (ENSUMAG00000015988) PIK3IP1 (ENSUMAG00000015979) LIMK2 (ENSUMAG00000015954) PATZ1 (ENSUMAG00000015943) DRG1 (ENSUMAG00000015937) EIF4ENIF1 (ENSUMAG00000015927) SFI1 (ENSUMAG00000015887) ENSUMAG00000015874 PISD (ENSUMAG00000015868) ENSUMAG00000015861 DEPDC5 (ENSUMAG00000015792) YWHAH (ENSUMAG00000015772) ##22 SLC5A1 (ENSUMAG00000015760) SLC5A4 (ENSUMAG00000015749) ENSUMAG00000015739 Felidae ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT01030000238049 ENSGT00940000161655 ENSGT00940000154284.b ENSGT00940000156855 ENSGT00940000161662 ENSGT00390000014107.a.a ENSGT00940000159133 ENSGT00390000017774 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000153340.B ENSGT00390000012071 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000013484 ENSGT00520000055626.a ENSGT00390000016559 ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 ENSGT00940000160846 ENSGT00940000153520.d.b.b ENSGT00940000153474.a.a.a.a.b.b.b ENSGT00940000153520.c.d.a.b ENSGT00940000163781 ENSGT00940000161054 ENSGT01030000234531.A.b.b.a ENSGT00940000154179.`b ENSGT00940000153120.k.a.b.b.z.b.a ENSGT00940000162558.g.a.b.a ENSGT00940000153120.k.a.a.i.b ENSGT00940000162558.g.a.b.b.a ENSGT00940000153307.c.a.n.d.a.b ENSGT00940000163371.b.b Panthera ANCESTRAL SPECIES 35 ENSGT01030000238049 ENSGT00940000161655 ENSGT00940000154284.b ENSGT00940000156855 ENSGT00940000161662 ENSGT00390000014107.a.a ENSGT00940000159133 ENSGT00390000017774 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000153340.B ENSGT00390000012071 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000013484 ENSGT00520000055626.a ENSGT00390000016559 ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 ENSGT00940000160846 ENSGT00940000153520.d.b.b ENSGT00940000153474.a.a.a.a.b.a ENSGT00940000154293.C ENSGT00940000153474.b.d.a.b ENSGT00940000161517.D ENSGT00940000153520.d.a.b.e.c.a.b ENSGT00940000153474.a.b.a.b.b ENSGT00950000183200.A.a.b.b.d.a ENSGT00390000017663 ENSGT00390000006265.b ENSGT00940000160711 ENSGT00940000153380.D ENSGT00940000158044.a Panthera_a ANCESTRAL SPECIES 43 ENSGT01030000238049 ENSGT00940000161655 ENSGT00940000154284.b ENSGT00940000156855 ENSGT00940000161662 ENSGT00390000014107.a.a ENSGT00940000159133 ENSGT00390000017774 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000153340.B ENSGT00390000012071 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000013484 ENSGT00520000055626.a ENSGT00390000016559 ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 ENSGT00940000160846 ENSGT00940000153520.d.b.b ENSGT00940000153474.a.a.a.a.b.a lion MODERN SPECIES 12 MORC2 (ENSPLOG00000007723) ENSPLOG00000021772 SMTN (ENSPLOG00000021713) SELENOM (ENSPLOG00000021685) INPP5J (ENSPLOG00000021505) PLA2G3 (ENSPLOG00000021412) LIMK2 (ENSPLOG00000021310) PIK3IP1 (ENSPLOG00000021232) PATZ1 (ENSPLOG00000021199) DRG1 (ENSPLOG00000021152) EIF4ENIF1 (ENSPLOG00000021071) SFI1 (ENSPLOG00000021011) PISD (ENSPLOG00000020934) PRR14L (ENSPLOG00000020889) DEPDC5 (ENSPLOG00000020763) YWHAH (ENSPLOG00000020701) ##22 SLC5A1 (ENSPLOG00000020605) SLC5A4 (ENSPLOG00000020553) IGLV5-52 (ENSPLOG00000020540) ENSPLOG00000020443 ENSPLOG00000020418 ENSPLOG00000020330 RTN4R (ENSPLOG00000020294) CCDC188 (ENSPLOG00000020243) ZDHHC8 (ENSPLOG00000020202) RANBP1 (ENSPLOG00000020134) TRMT2A (ENSPLOG00000019989) DGCR8 (ENSPLOG00000019913) TANGO2 (ENSPLOG00000019874) ARVCF (ENSPLOG00000019377) COMT (ENSPLOG00000019271) leopard MODERN SPECIES 106 MORC2 (ENSPPRG00000009902) SMTN (ENSPPRG00000007604) SELENOM (ENSPPRG00000004814) INPP5J (ENSPPRG00000004336) PLA2G3 (ENSPPRG00000002952) RNF185 (ENSPPRG00000002643) LIMK2 (ENSPPRG00000002342) PIK3IP1 (ENSPPRG00000002104) PATZ1 (ENSPPRG00000001573) DRG1 (ENSPPRG00000000938) EIF4ENIF1 (ENSPPRG00000000659) SFI1 (ENSPPRG00000024657) PISD (ENSPPRG00000009356) PRR14L (ENSPPRG00000008897) DEPDC5 (ENSPPRG00000008352) YWHAH (ENSPPRG00000002757) ##22 SLC5A1 (ENSPPRG00000002585) SLC5A4 (ENSPPRG00000001251) ENSPPRG00000000650 Tiger MODERN SPECIES 171 OSBP2 (ENSPTIG00000013404) MORC2 (ENSPTIG00000017244) SMTN (ENSPTIG00000004467) SELENOM (ENSPTIG00000019866) INPP5J (ENSPTIG00000021441) RNF185 (ENSPTIG00000022076) LIMK2 (ENSPTIG00000000020) PIK3IP1 (ENSPTIG00000005501) PATZ1 (ENSPTIG00000007937) DRG1 (ENSPTIG00000008664) EIF4ENIF1 (ENSPTIG00000009657) SFI1 (ENSPTIG00000018165) PISD (ENSPTIG00000013935) PRR14L (ENSPTIG00000015665) DEPDC5 (ENSPTIG00000017537) YWHAH (ENSPTIG00000017611) ##22 SLC5A1 (ENSPTIG00000017762) SLC5A4 (ENSPTIG00000019721) ENSPTIG00000020947 ENSPTIG00000021143 ENSPTIG00000021269 ENSPTIG00000004562 ENSPTIG00000021620 ENSPTIG00000021662 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000156855 ENSGT00940000161662 ENSGT00390000014107.a.a ENSGT00940000159133 ENSGT00390000017774 ENSGT00940000159296 ENSGT00540000073696 ENSGT00940000153340.B ENSGT00390000012071 ENSGT00940000169485 ENSGT00940000154110.a ENSGT00940000171945 ENSGT00390000013484 ENSGT00520000055626.a ENSGT00390000016559 ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 ENSGT00940000160846 ENSGT00940000161054 ENSGT00940000165289 ENSGT01030000234531.A.b.b.a ENSGT00940000153120.k.a.a ENSGT00940000162558 ENSGT00940000153120.k.a.b.b ENSGT00940000153120.k.a.b.a ENSGT00940000153934.a.a ENSGT00940000161640 ENSGT00940000153520.c ENSGT00940000156298 ENSGT00940000161517.D ENSGT00940000153520.d.b.a.a.a.a.d Primates ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000154284.b ENSGT00940000156855 ENSGT00940000161662 ENSGT00390000014107.a.a ENSGT00940000159133 ENSGT00390000017774 ENSGT00940000159296 ENSGT00540000073696 ENSGT00940000153340.B ENSGT00390000012071 ENSGT00940000169485 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000013484 ENSGT00520000055626.a ENSGT00390000016559 ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 ENSGT00940000160846 ENSGT00940000153520.d.b.a.a.a.a.d.c.a ENSGT00940000153474.a.b ENSGT00940000162204 ENSGT00940000163781 ENSGT00940000161054 ENSGT00940000165289 ENSGT01030000234531.A.b.b.a ENSGT00940000162558.n ENSGT00940000153120.k.a.b.a ENSGT00940000154179 ENSGT00940000153120.k.a.a ENSGT00940000153120.k.a.b.b ENSGT00940000153307.c.a Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 42 ENSGT00940000154284.b ENSGT00940000156855 ENSGT00940000161662 ENSGT00390000014107.a.a ENSGT00940000159133 ENSGT00390000017774 ENSGT00940000159296 ENSGT00540000073696 ENSGT00940000153340.B ENSGT00390000012071 ENSGT00940000169485 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000013484 ENSGT00520000055626.a ENSGT00390000016559 ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 ENSGT00940000160846 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00940000154284.b ENSGT00940000156855 ENSGT00940000161662 ENSGT00390000014107.a.a ENSGT00940000159133 ENSGT00390000017774 ENSGT00940000159296 ENSGT00540000073696 ENSGT00940000153340.B ENSGT00390000012071 ENSGT00940000169485 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000013484 ENSGT00520000055626.a ENSGT00390000016559 ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 ENSGT00940000160846 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 40 ENSGT00940000161655 ENSGT00940000154284.b ENSGT00940000156855 ENSGT00940000161662 ENSGT00390000014107.a.a ENSGT00940000159133 ENSGT00390000017774 ENSGT00940000159296 ENSGT00540000073696 ENSGT00940000153340.B ENSGT00390000012071 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000013484 ENSGT00520000055626.a ENSGT00390000016559 ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 ENSGT00940000160846 Mas night monkey MODERN SPECIES 280 ENSANAG00000031366 ##22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT00940000161655 ENSGT00940000154284.b ENSGT00940000156855 ENSGT00940000161662 ENSGT00390000014107.a.a ENSGT00940000159133 ENSGT00390000017774 ENSGT00940000159296 ENSGT00540000073696 ENSGT00940000153340.B ENSGT00390000012071 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000013484 ENSGT00520000055626.a ENSGT00390000016559 ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 Marmoset MODERN SPECIES ENSCJAG00000061186 SELENOM (ENSCJAG00000010769) INPP5J (ENSCJAG00000010779) PLA2G3 (ENSCJAG00000010853) RNF185 (ENSCJAG00000010869) LIMK2 (ENSCJAG00000010908) PIK3IP1 (ENSCJAG00000010973) ENSCJAG00000080208 PATZ1 (ENSCJAG00000010978) DRG1 (ENSCJAG00000011009) EIF4ENIF1 (ENSCJAG00000011034) SFI1 (ENSCJAG00000011107) PISD (ENSCJAG00000011154) PRR14L (ENSCJAG00000011163) DEPDC5 (ENSCJAG00000011169) YWHAH (ENSCJAG00000055488) ##22 SLC5A1 (ENSCJAG00000011369) ENSCJAG00000004900 MLC1 (ENSCJAG00000003866) SYN3 (ENSCJAG00000006266) TIMP3 (ENSCJAG00000044183) FBXO7 (ENSCJAG00000006238) BPIFC (ENSCJAG00000006209) RTCB (ENSCJAG00000006128) SLC5A4 (ENSCJAG00000044264) ENSCJAG00000078413 LARGE1 (ENSCJAG00000000968) ENSCJAG00000022754 ISX (ENSCJAG00000071825) HMGXB4 (ENSCJAG00000000537) TOM1 (ENSCJAG00000000519) Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES 43 ENSGT00940000161655 ENSGT00940000154284.b ENSGT00940000156855 ENSGT00940000161662 ENSGT00390000014107.a.a ENSGT00940000159133 ENSGT00390000017774 ENSGT00940000159296 ENSGT00540000073696 ENSGT00940000153340.B.s.a ENSGT00390000012071 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000013484 ENSGT00520000055626.a ENSGT00390000016559 ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 Capuchin MODERN SPECIES 1085 ENSCCAG00000026693 ##22 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 280 ENSSBOG00000025375 DEPDC5 (ENSSBOG00000022689) YWHAH (ENSSBOG00000024158) ##22 SLC5A1 (ENSSBOG00000029749) SLC5A4 (ENSSBOG00000021753) Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000154284.b ENSGT00940000156855 ENSGT00940000161662 ENSGT00390000014107.a.a ENSGT00940000159133 ENSGT00390000017774 ENSGT00940000159296 ENSGT00540000073696 ENSGT00940000153340.B ENSGT00390000012071 ENSGT00940000169485 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000013484 ENSGT00520000055626.a ENSGT00390000016559 ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 ENSGT00940000160846 ENSGT00940000164457.B ENSGT00940000155911 ENSGT01100000263545.a.b.c.a ENSGT00390000006670 ENSGT00940000155415 ENSGT00940000159601 ENSGT00940000158497 ENSGT00940000154892.e ENSGT00940000161702 ENSGT00390000012436 ENSGT00940000156865 ENSGT00390000017673.b ENSGT01050000244824.G Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000161655 ENSGT00940000154284.b ENSGT00940000156855 ENSGT00940000161662 ENSGT00390000014107.a.a ENSGT00940000159133 ENSGT00390000017774 ENSGT00940000159296 ENSGT00540000073696 ENSGT00940000153340.B ENSGT00390000012071 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000013484 ENSGT00520000055626.a ENSGT00390000016559 ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 ENSGT00520000056310.B ENSGT00940000160846 ENSGT00940000164457.B ENSGT00940000155911 ENSGT01100000263545.a.b.c.a ENSGT00390000006670 ENSGT00940000155415 ENSGT00940000159601 ENSGT00940000158497 ENSGT00940000154892.e ENSGT00940000161702 ENSGT00390000012436 ENSGT00940000156865 ENSGT00390000017673.b Hominidae ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000161655 ENSGT00940000154284.b ENSGT00940000156855 ENSGT00940000161662 ENSGT00390000014107.a.a ENSGT00940000159133 ENSGT00390000017774 ENSGT00940000159296 ENSGT00540000073696 ENSGT00940000153340.B ENSGT00390000012071 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000013484 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(ENSGGOG00000039162) ENSGGOG00000011678 Orangutan MODERN SPECIES 13 ENSPPYG00000011724 SELENOM (ENSPPYG00000011726) INPP5J (ENSPPYG00000011727) PLA2G3 (ENSPPYG00000011728) RNF185 (ENSPPYG00000011729) LIMK2 (ENSPPYG00000011730) PIK3IP1 (ENSPPYG00000011731) PATZ1 (ENSPPYG00000011732) ENSPPYG00000012007 DRG1 (ENSPPYG00000029949) EIF4ENIF1 (ENSPPYG00000011736) SFI1 (ENSPPYG00000011737) PISD (ENSPPYG00000011738) PRR14L (ENSPPYG00000011739) DEPDC5 (ENSPPYG00000011740) YWHAH (ENSPPYG00000011743) ##22 SLC5A1 (ENSPPYG00000011744) ENSPPYG00000041096 ENSPPYG00000041426 RFPL2 (ENSPPYG00000038393) ENSPPYG00000039152 SLC5A4 (ENSPPYG00000011746) ENSPPYG00000012003 ENSPPYG00000011749 ENSPPYG00000036647 RTCB (ENSPPYG00000011752) BPIFC (ENSPPYG00000011753) FBXO7 (ENSPPYG00000011755) SYN3 (ENSPPYG00000011756) TIMP3 (ENSPPYG00000031652) ENSPPYG00000031824 Gibbon MODERN SPECIES 22 ENSNLEG00000004205 INPP5J (ENSNLEG00000004208) PLA2G3 (ENSNLEG00000004269) RNF185 (ENSNLEG00000004273) LIMK2 (ENSNLEG00000004325) PIK3IP1 (ENSNLEG00000004354) ENSNLEG00000034191 ENSNLEG00000004385 ENSNLEG00000018920 DRG1 (ENSNLEG00000027001) EIF4ENIF1 (ENSNLEG00000004391) SFI1 (ENSNLEG00000004495) PISD (ENSNLEG00000004556) PRR14L (ENSNLEG00000004585) DEPDC5 (ENSNLEG00000004589) YWHAH (ENSNLEG00000004782) ##22 ENSNLEG00000036276 SLC5A1 (ENSNLEG00000004788) ENSNLEG00000018922 RFPL2 (ENSNLEG00000004795) ENSNLEG00000004807 SYN3 (ENSNLEG00000004854) TIMP3 (ENSNLEG00000004812) FBXO7 (ENSNLEG00000004862) BPIFC (ENSNLEG00000004931) RTCB (ENSNLEG00000004960) ENSNLEG00000034955 RAB33B (ENSNLEG00000032616) SETD7 (ENSNLEG00000033550) ENSNLEG00000027961 ENSNLEG00000028291 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000154284.b ENSGT00940000156855 ENSGT00940000161662 ENSGT00390000014107.a.a ENSGT00940000159133 ENSGT00390000017774 ENSGT00940000159296 ENSGT00540000073696 ENSGT00940000153340.B.l ENSGT00390000012071 ENSGT00940000169485 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000013484 ENSGT00520000055626.a ENSGT00390000016559 ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 ENSGT00520000056310.B ENSGT00940000163408.a.b.c ENSGT00940000160846 ENSGT00940000164457.B ENSGT00940000155911 ENSGT01100000263545.a.b.c.a ENSGT00390000006670 ENSGT00940000155415 ENSGT00940000159601 ENSGT00940000158497 ENSGT00940000154892.e ENSGT00940000161702 ENSGT00390000012436 ENSGT00940000156865 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 199 ENSGT00940000161655 ENSGT00940000154284.b ENSGT00940000156855 ENSGT00940000161662 ENSGT00390000014107.a.a ENSGT00940000159133 ENSGT00390000017774 ENSGT00940000159296 ENSGT00540000073696 ENSGT00940000153340.B.l ENSGT00390000012071 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000013484 ENSGT00520000055626.a ENSGT00390000016559 ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 902 SMTN (ENSRROG00000039184) SELENOM (ENSRROG00000030666) INPP5J (ENSRROG00000032322) PLA2G3 (ENSRROG00000045058) RNF185 (ENSRROG00000032288) LIMK2 (ENSRROG00000044097) PIK3IP1 (ENSRROG00000037909) PATZ1 (ENSRROG00000037155) ENSRROG00000043730 DRG1 (ENSRROG00000040766) EIF4ENIF1 (ENSRROG00000029827) SFI1 (ENSRROG00000027646) PISD (ENSRROG00000034540) PRR14L (ENSRROG00000003134) DEPDC5 (ENSRROG00000044858) YWHAH (ENSRROG00000042743) ##22 SLC5A1 (ENSRROG00000030351) Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 267 SMTN (ENSRBIG00000018955) SELENOM (ENSRBIG00000032525) INPP5J (ENSRBIG00000037708) PLA2G3 (ENSRBIG00000039906) RNF185 (ENSRBIG00000029318) LIMK2 (ENSRBIG00000036343) PIK3IP1 (ENSRBIG00000031187) PATZ1 (ENSRBIG00000044231) ENSRBIG00000007331 DRG1 (ENSRBIG00000019207) EIF4ENIF1 (ENSRBIG00000034744) SFI1 (ENSRBIG00000034088) PISD (ENSRBIG00000038486) PRR14L (ENSRBIG00000032355) DEPDC5 (ENSRBIG00000032031) YWHAH (ENSRBIG00000005431) ##22 SLC5A1 (ENSRBIG00000034965) Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000154284.b ENSGT00940000156855 ENSGT00940000161662 ENSGT00390000014107.a.a ENSGT00940000159133 ENSGT00390000017774 ENSGT00940000159296 ENSGT00540000073696 ENSGT00940000153340.B.l ENSGT00390000012071 ENSGT00940000169485 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000013484 ENSGT00520000055626.a ENSGT00390000016559 ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 ENSGT00520000056310.B ENSGT00940000163408.a.b.c ENSGT00940000160846 ENSGT00940000164457.B ENSGT00940000155911 ENSGT01100000263545.a.b.c.a ENSGT00390000006670 ENSGT00940000155415 ENSGT00940000159601 ENSGT00940000158497 ENSGT00940000154892.e ENSGT00940000161702 ENSGT00390000012436 ENSGT00940000156865 Vervet Monkey MODERN SPECIES 10 MORC2 (ENSCSAG00000008882) SMTN (ENSCSAG00000008847) INPP5J (ENSCSAG00000008805) PLA2G3 (ENSCSAG00000008789) RNF185 (ENSCSAG00000008775) LIMK2 (ENSCSAG00000008761) PIK3IP1 (ENSCSAG00000008749) PATZ1 (ENSCSAG00000008746) DRG1 (ENSCSAG00000008731) EIF4ENIF1 (ENSCSAG00000008717) SFI1 (ENSCSAG00000008672) PISD (ENSCSAG00000008655) PRR14L (ENSCSAG00000008590) DEPDC5 (ENSCSAG00000008572) ENSCSAG00000008512 YWHAH (ENSCSAG00000008504) ##22 SLC5A1 (ENSCSAG00000008499) ENSCSAG00000008488 SLC5A4 (ENSCSAG00000008464) ENSCSAG00000008359 RTCB (ENSCSAG00000008351) BPIFC (ENSCSAG00000008309) FBXO7 (ENSCSAG00000008283) SYN3 (ENSCSAG00000008254) TIMP3 (ENSCSAG00000008241) LARGE1 (ENSCSAG00000008233) ISX (ENSCSAG00000008226) HMGXB4 (ENSCSAG00000008220) TOM1 (ENSCSAG00000008210) HMOX1 (ENSCSAG00000008200) MCM5 (ENSCSAG00000008193) Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000156855 ENSGT00940000161662 ENSGT00390000014107.a.a ENSGT00940000159133 ENSGT00390000017774 ENSGT00940000159296 ENSGT00540000073696 ENSGT00940000153340.B.l ENSGT00390000012071 ENSGT00940000169485 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000013484 ENSGT00520000055626.a ENSGT00390000016559 ENSGT00390000011748.q.f ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 ENSGT00520000056310.B ENSGT00940000163408.a.b.c ENSGT00940000160846 ENSGT00940000164457.B ENSGT00940000155911 ENSGT01100000263545.a.b.c.a ENSGT00390000006670 ENSGT00940000155415 ENSGT00940000159601 ENSGT00940000158497 ENSGT00940000154892.e ENSGT00940000161702 ENSGT00390000012436 ENSGT00940000156865 Macaca ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000156855 ENSGT00940000161662 ENSGT00390000014107.a.a ENSGT00940000159133 ENSGT00390000017774 ENSGT00940000159296 ENSGT00540000073696 ENSGT00940000153340.B.l ENSGT00390000012071 ENSGT00940000169485 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000013484 ENSGT00520000055626.a ENSGT00390000016559 ENSGT00390000011748.q.f ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 ENSGT00940000163408.a.b.c ENSGT00940000160846 ENSGT00940000164457.B ENSGT00940000155911 ENSGT01100000263545.a.b.c.a ENSGT00390000006670 ENSGT00940000155415 ENSGT00940000159601 ENSGT00940000158497 ENSGT00940000161702 ENSGT00390000012436 ENSGT00940000156865 ENSGT00390000017673.b ENSGT01050000244824.G Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 133 SMTN (ENSMNEG00000040236) INPP5J (ENSMNEG00000005244) PLA2G3 (ENSMNEG00000044339) RNF185 (ENSMNEG00000042463) LIMK2 (ENSMNEG00000036488) PIK3IP1 (ENSMNEG00000039643) PATZ1 (ENSMNEG00000037588) ENSMNEG00000033998 DRG1 (ENSMNEG00000040598) ENSMNEG00000028937 SFI1 (ENSMNEG00000039859) PISD (ENSMNEG00000033961) PRR14L (ENSMNEG00000041158) ENSMNEG00000042353 DEPDC5 (ENSMNEG00000035239) YWHAH (ENSMNEG00000039733) ##22 SLC5A1 (ENSMNEG00000041838) Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000154284.b ENSGT00940000156855 ENSGT00940000161662 ENSGT00390000014107.a.a ENSGT00940000159133 ENSGT00390000017774 ENSGT00940000159296 ENSGT00540000073696 ENSGT00940000153340.B.l ENSGT00390000012071 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000013484 ENSGT00520000055626.a ENSGT00390000016559 ENSGT00390000011748.q.f ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 ENSGT00520000056310.B ENSGT00940000163408.a.b.c ENSGT00940000160846 ENSGT00940000164457.B ENSGT00940000155911 ENSGT01100000263545.a.b.c.a ENSGT00390000006670 ENSGT00940000155415 ENSGT00940000159601 ENSGT00940000158497 ENSGT00940000154892.e ENSGT00940000161702 ENSGT00390000012436 ENSGT00940000156865 Olive baboon MODERN SPECIES 7 TUG1 (ENSPANG00000045070) ENSPANG00000037314 SMTN (ENSPANG00000017602) SELENOM (ENSPANG00000034547) INPP5J (ENSPANG00000018617) PLA2G3 (ENSPANG00000024406) RNF185 (ENSPANG00000015145) LIMK2 (ENSPANG00000004086) PIK3IP1 (ENSPANG00000012703) PATZ1 (ENSPANG00000006821) EIF4ENIF1 (ENSPANG00000012702) SFI1 (ENSPANG00000025532) PISD (ENSPANG00000015908) PRR14L (ENSPANG00000015910) DEPDC5 (ENSPANG00000035305) YWHAH (ENSPANG00000041028) ##22 SLC5A1 (ENSPANG00000004876) RFPL1 (ENSPANG00000005139) SLC5A4 (ENSPANG00000026319) RTCB (ENSPANG00000016035) BPIFC (ENSPANG00000016603) FBXO7 (ENSPANG00000026268) TIMP3 (ENSPANG00000026318) SYN3 (ENSPANG00000022751) LARGE1 (ENSPANG00000004083) ENSPANG00000032474 ISX (ENSPANG00000037623) HMGXB4 (ENSPANG00000021766) TOM1 (ENSPANG00000015906) HMOX1 (ENSPANG00000041525) MCM5 (ENSPANG00000007031) Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000154284.b ENSGT00940000156855 ENSGT00940000161662 ENSGT00390000014107.a.a ENSGT00940000159133 ENSGT00390000017774 ENSGT00940000159296 ENSGT00540000073696 ENSGT00940000153340.B.l ENSGT00390000012071 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000013484 ENSGT00520000055626.a ENSGT00390000016559 ENSGT00390000011748.q.f ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 ENSGT00520000056310.B ENSGT00940000163408.a.b.c ENSGT00940000160846 ENSGT00940000164457.B ENSGT00940000155911 ENSGT01100000263545.a.b.c.a ENSGT00390000006670 ENSGT00940000155415 ENSGT00940000159601 ENSGT00940000158497 ENSGT00940000154892.e.b ENSGT00940000161702 ENSGT00390000012436 ENSGT00940000156865 Sooty mangabey MODERN SPECIES 474 SMTN (ENSCATG00000039549) SELENOM (ENSCATG00000041974) INPP5J (ENSCATG00000044969) PLA2G3 (ENSCATG00000044450) RNF185 (ENSCATG00000045195) LIMK2 (ENSCATG00000029540) PIK3IP1 (ENSCATG00000041200) PATZ1 (ENSCATG00000006101) ENSCATG00000036598 DRG1 (ENSCATG00000037529) EIF4ENIF1 (ENSCATG00000026186) SFI1 (ENSCATG00000032409) PISD (ENSCATG00000034064) PRR14L (ENSCATG00000035758) DEPDC5 (ENSCATG00000033620) YWHAH (ENSCATG00000042690) ##22 SLC5A1 (ENSCATG00000043278) ENSCATG00000035648 ENSCATG00000036907 SLC5A4 (ENSCATG00000040639) ENSCATG00000043014 RTCB (ENSCATG00000033424) FBXO7 (ENSCATG00000039724) BPIFC (ENSCATG00000032658) SYN3 (ENSCATG00000044956) TIMP3 (ENSCATG00000042645) ENSCATG00000041580 LARGE1 (ENSCATG00000044223) ENSCATG00000000038 ISX (ENSCATG00000029244) HMGXB4 (ENSCATG00000033136) Drill MODERN SPECIES 751 SELENOM (ENSMLEG00000041548) INPP5J (ENSMLEG00000034838) PLA2G3 (ENSMLEG00000039497) RNF185 (ENSMLEG00000029013) LIMK2 (ENSMLEG00000040393) PIK3IP1 (ENSMLEG00000038993) PATZ1 (ENSMLEG00000030938) ENSMLEG00000041400 DRG1 (ENSMLEG00000001628) EIF4ENIF1 (ENSMLEG00000029191) SFI1 (ENSMLEG00000030532) PISD (ENSMLEG00000041553) PRR14L (ENSMLEG00000020061) ENSMLEG00000030906 DEPDC5 (ENSMLEG00000026900) YWHAH (ENSMLEG00000035520) ##22 SLC5A1 (ENSMLEG00000032294) ENSMLEG00000040675 SLC5A4 (ENSMLEG00000028205) 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ENSGT00940000153520.d.b.b ENSGT00940000153934.a.b ENSGT00940000163781 ENSGT00940000161054 ENSGT01030000234531.A.b.b.a ENSGT00940000154179 ENSGT00940000153120.k.a.a ENSGT00940000162558 ENSGT00940000153307.d.b ENSGT00940000163531 ENSGT00940000160353 ENSGT00500000044989 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 51 ENSGT00940000161640 ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 ENSGT00940000160846.d ENSGT00390000016559 ENSGT00520000055626.a ENSGT00390000013484 ENSGT00940000154110.a ENSGT00940000169485 ENSGT00390000012071 ENSGT00940000153340.B.z ENSGT00940000159296 ENSGT00390000017774 ENSGT00940000159133 ENSGT00390000014107.a.a ENSGT00940000161662 ENSGT00940000156855 Marmotini ANCESTRAL SPECIES 80 ENSGT00940000153474.a.b.e.b ENSGT00940000156298.w.a ENSGT00940000156298.w.b ENSGT00940000161640.k ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 ENSGT00390000004757.s.a ENSGT00940000160846.d ENSGT00390000016559 ENSGT00520000055626.a ENSGT00390000013484 ENSGT00940000154110.a ENSGT00940000169485 ENSGT00390000012071 ENSGT00940000153340.B.z.a ENSGT00940000159296 ENSGT00390000017774 ENSGT00940000159133 ENSGT00390000014107.a.a ENSGT00940000161662 Alpin marmot MODERN SPECIES 98 ENSMMMG00000017901 ENSMMMG00000017896 ENSMMMG00000017892 ENSMMMG00000017887 ENSMMMG00000017882 ENSMMMG00000017875 ENSMMMG00000017869 ENSMMMG00000017868 ENSMMMG00000017866 ENSMMMG00000017865 ENSMMMG00000017862 ENSMMMG00000017854 ENSMMMG00000017851 ENSMMMG00000017842 ENSMMMG00000017840 YWHAH (ENSMMMG00000017836) ##22 ENSMMMG00000017810 ENSMMMG00000017777 ENSMMMG00000017772 SLC5A4 (ENSMMMG00000017755) DEPDC5 (ENSMMMG00000014911) PRR14L (ENSMMMG00000014871) PISD (ENSMMMG00000014791) SFI1 (ENSMMMG00000014758) ENSMMMG00000014748 EIF4ENIF1 (ENSMMMG00000014620) DRG1 (ENSMMMG00000014603) PATZ1 (ENSMMMG00000014512) PIK3IP1 (ENSMMMG00000014491) LIMK2 (ENSMMMG00000014389) RNF185 (ENSMMMG00000014365) Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 134 ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 ENSGT00390000004757.s.a 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ENSSVLG00005015702 ENSSVLG00005015668 ENSSVLG00005015610 ENSSVLG00005015597 ENSSVLG00005015508 ENSSVLG00005015482 ENSSVLG00005015454 ENSSVLG00005015394 ENSSVLG00005015368 ENSSVLG00005015244 YWHAH (ENSSVLG00005015202) ##22 SLC5A1 (ENSSVLG00005014942) ENSSVLG00005014768 ENSSVLG00005014557 ENSSVLG00005014505 DEPDC5 (ENSSVLG00005014165) PRR14L (ENSSVLG00005013651) ENSSVLG00005013578 PISD (ENSSVLG00005013477) ENSSVLG00005013121 ENSSVLG00005013045 SFI1 (ENSSVLG00005011756) ENSSVLG00005010969 ENSSVLG00005010889 DRG1 (ENSSVLG00005010798) PATZ1 (ENSSVLG00005010670) Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT01000000220689 ENSGT00940000161655 ENSGT00940000154284.b ENSGT00940000156855 ENSGT00940000161662 ENSGT00390000014107.a.a.f ENSGT00940000159133 ENSGT00390000017774 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000153340.B ENSGT00390000012071 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000013484 ENSGT00520000055626.a ENSGT00390000016559 ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 ENSGT00940000160846.c ENSGT00940000160846.d ENSGT00940000153520.d.b.b ENSGT00940000154293.A ENSGT00940000156298 ENSGT00940000153934.a.a ENSGT00940000153934.a.b ENSGT00940000163781 ENSGT00940000161054 ENSGT00940000165289 ENSGT01030000234531.A.b.b.a ENSGT00940000154179 ENSGT00940000153120.k.a.a ENSGT00940000162558.i Naked mole-rat female DUPLICATION Naked mole-rat female MODERN SPECIES 31 ASMTL (ENSHGLG00000000257) ENSHGLG00000036691 ENSHGLG00000035502 ENSHGLG00000043703 ENSHGLG00000032025 SHOX (ENSHGLG00000000231) ENSHGLG00000047934 ENSHGLG00000032885 ENSHGLG00000040468 ENSHGLG00000041453 ENSHGLG00000049109 ENSHGLG00000038472 ENSHGLG00000046562 ENSHGLG00000047819 ENSHGLG00000032080 ENSHGLG00000037448 ##22 ENSHGLG00000039759 ENSHGLG00000000777 PRPS2 (ENSHGLG00000001149) ENSHGLG00000005664 ENSHGLG00000039291 FRMPD4 (ENSHGLG00000001133) MSL3 (ENSHGLG00000000202) AMELX (ENSHGLG00000009327) ARHGAP6 (ENSHGLG00000001753) HCCS (ENSHGLG00000041389) ENSHGLG00000047727 MID1 (ENSHGLG00000001434) ENSHGLG00000000190 ENSHGLG00000038732 ENSHGLG00000001411 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 15 SMTN (ENSHGLG00000013571) SELENOM (ENSHGLG00000014125) INPP5J (ENSHGLG00000006736) PLA2G3 (ENSHGLG00000008744) RNF185 (ENSHGLG00000047693) LIMK2 (ENSHGLG00000018102) PIK3IP1 (ENSHGLG00000018249) ENSHGLG00000049525 ENSHGLG00000015589 DRG1 (ENSHGLG00000015167) EIF4ENIF1 (ENSHGLG00000015208) SFI1 (ENSHGLG00000018152) PISD (ENSHGLG00000018039) PRR14L (ENSHGLG00000019117) DEPDC5 (ENSHGLG00000015809) YWHAH (ENSHGLG00000011659) ##22 ENSHGLG00000041152 ENSHGLG00000034693 SLC5A1 (ENSHGLG00000006105) ENSHGLG00000007896 ENSHGLG00000038297 ENSHGLG00000050703 ENSHGLG00000039020 ENSHGLG00000036936 ENSHGLG00000034686 ENSHGLG00000044436 ENSHGLG00000033598 ENSHGLG00000036235 PRAME (ENSHGLG00000010699) ENSHGLG00000045068 ENSHGLG00000010950 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000153998.b ENSGT00940000161655 ENSGT00940000154284.b ENSGT00940000156855 ENSGT00940000161662 ENSGT00390000014107.a.a.f ENSGT00940000159133 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ENSGT00940000153520.d.b.b ENSGT00940000153934.a.b ENSGT00940000163781 ENSGT00940000161054 ENSGT01030000234531.A.b.a ENSGT00940000162558.j ENSGT00940000163531 ENSGT00940000160353 ENSGT00500000044989 ENSGT00940000159687 ENSGT00940000153491.b.a ##35 ENSGT00940000153592.B.b.b Degu DUPLICATION Degu MODERN SPECIES 271 SELENOM (ENSODEG00000003856) INPP5J (ENSODEG00000003778) PLA2G3 (ENSODEG00000003732) ENSODEG00000018944 RNF185 (ENSODEG00000003704) LIMK2 (ENSODEG00000003660) PIK3IP1 (ENSODEG00000003614) PATZ1 (ENSODEG00000003589) ENSODEG00000003560 ENSODEG00000003534 ENSODEG00000003511 ENSODEG00000003485 SFI1 (ENSODEG00000003157) PISD (ENSODEG00000002874) DEPDC5 (ENSODEG00000002525) ENSODEG00000004097 ##22 SLC5A1 (ENSODEG00000004082) SLC5A4 (ENSODEG00000004033) ENSODEG00000004008 ENSODEG00000004000 ENSODEG00000003992 Degu MODERN SPECIES 61 SRSF7 (ENSODEG00000010029) GEMIN6 (ENSODEG00000011245) DHX57 (ENSODEG00000011626) ENSODEG00000009626 ARHGEF33 (ENSODEG00000010871) ENSODEG00000011783 SOS1 (ENSODEG00000012567) CDKL4 (ENSODEG00000010265) MAP4K3 (ENSODEG00000011426) TMEM178A (ENSODEG00000010204) ENSODEG00000010561 ENSODEG00000019855 SLC8A1 (ENSODEG00000010025) ENSODEG00000009978 ENSODEG00000019775 ENSODEG00000010136 ##22 ENSODEG00000019723 ENSODEG00000010490 PKDCC (ENSODEG00000014354) EML4 (ENSODEG00000011507) COX7A2L (ENSODEG00000011433) ENSODEG00000011166 KCNG3 (ENSODEG00000014536) ENSODEG00000012097 ENSODEG00000011091 ENSODEG00000019803 HAAO (ENSODEG00000010886) ENSODEG00000012111 ENSODEG00000010547 PLEKHH2 (ENSODEG00000012982) DYNC2LI1 (ENSODEG00000011054) Long-tailed chinchilla DUPLICATION Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 70 ENSCLAG00000017413 ##22 Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 162 MORC2 (ENSCLAG00000016717) SMTN (ENSCLAG00000007037) SELENOM (ENSCLAG00000010856) INPP5J (ENSCLAG00000008189) PLA2G3 (ENSCLAG00000009961) RNF185 (ENSCLAG00000006888) LIMK2 (ENSCLAG00000006899) PIK3IP1 (ENSCLAG00000010296) PATZ1 (ENSCLAG00000017053) DRG1 (ENSCLAG00000010837) 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(ENSCPOG00000012375) PLA2G3 (ENSCPOG00000012383) RNF185 (ENSCPOG00000034711) LIMK2 (ENSCPOG00000002696) PIK3IP1 (ENSCPOG00000006014) PATZ1 (ENSCPOG00000010787) DRG1 (ENSCPOG00000010791) EIF4ENIF1 (ENSCPOG00000010795) SFI1 (ENSCPOG00000012348) PISD (ENSCPOG00000035163) PRR14L (ENSCPOG00000030128) DEPDC5 (ENSCPOG00000005990) YWHAH (ENSCPOG00000039908) ##22 SLC5A1 (ENSCPOG00000007281) SLC5A4 (ENSCPOG00000007292) ENSCPOG00000015096 ENSCPOG00000014172 ENSCPOG00000002239 ENSCPOG00000035429 ENSCPOG00000033868 ENSCPOG00000024036 ZNF280B (ENSCPOG00000009452) ENSCPOG00000023605 ENSCPOG00000038947 ENSCPOG00000037423 ENSCPOG00000033114 ENSCPOG00000034912 ENSCPOG00000031212 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000161655 ENSGT00940000154284.b ENSGT00940000156855 ENSGT00940000161662 ENSGT00390000014107.a.a ENSGT00940000159133 ENSGT00390000017774 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000153340.B ENSGT00390000012071 ENSGT00940000154110.a ENSGT00940000171945 ENSGT00390000013484 ENSGT00520000055626.a ENSGT00390000016559 ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 ENSGT00940000160846.c ENSGT00940000160846.d ENSGT00940000161054 ENSGT00940000163200 ENSGT00940000161808 ENSGT00390000015147 ENSGT00940000161345 ENSGT00940000156340.a ENSGT00440000038585 ENSGT00530000063156.a.a.b ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000155608 ENSGT00940000162786 ENSGT00940000161301 Kangaroo rat MODERN SPECIES 342 ENSDORG00000024343 ENSDORG00000029884 ENSDORG00000001110 Smtn (ENSDORG00000001475) Selenom (ENSDORG00000001485) Inpp5j (ENSDORG00000012302) Rnf185 (ENSDORG00000008744) Limk2 (ENSDORG00000016012) Pik3ip1 (ENSDORG00000025088) Patz1 (ENSDORG00000023834) Drg1 (ENSDORG00000025618) Eif4enif1 (ENSDORG00000000183) Sfi1 (ENSDORG00000007807) Pisd (ENSDORG00000007814) ENSDORG00000025092 Ywhah (ENSDORG00000023737) ##22 Slc5a1 (ENSDORG00000010759) Slc5a4a (ENSDORG00000006662) ENSDORG00000025619 Vpreb3 (ENSDORG00000009165) Chchd10 (ENSDORG00000002673) Mmp11 (ENSDORG00000002674) Smarcb1 (ENSDORG00000002679) Derl3 (ENSDORG00000026998) ENSDORG00000000257 Mif (ENSDORG00000028642) Gstt4 (ENSDORG00000025436) Gstt1 (ENSDORG00000007140) Gstt3 (ENSDORG00000029140) Ddt (ENSDORG00000007138) Cabin1 (ENSDORG00000000073) Myomorpha ANCESTRAL SPECIES 47 ENSGT00940000161655 ENSGT00940000154284.b ENSGT00940000156855 ENSGT00940000161662 ENSGT00390000014107.a.a ENSGT00940000159133 ENSGT00390000017774 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000153340.B ENSGT00390000012071 ENSGT00940000154110.a ENSGT00940000171945 ENSGT00390000013484 ENSGT00520000055626.a ENSGT00390000016559 ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 ENSGT00940000160846.c ENSGT00940000160846.d ENSGT00940000161054 ENSGT00940000163531 ENSGT00940000163200 ENSGT00940000161808 ENSGT00390000015147 ENSGT00940000161345 ENSGT00940000156340.a ENSGT00440000038585 ENSGT00530000063156.a.a.b ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000155608 ENSGT00940000162786 Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 143 ENSJJAG00000010768 Elac1 (ENSJJAG00000010672) Smad4 (ENSJJAG00000008893) Mex3c (ENSJJAG00000005241) ENSJJAG00000001355 ENSJJAG00000000847 ENSJJAG00000013702 Dcc (ENSJJAG00000005791) ENSJJAG00000022704 Vmn2r118 (ENSJJAG00000007013) ENSJJAG00000022934 ENSJJAG00000022536 ENSJJAG00000010074 ENSJJAG00000009767 ##22 ENSJJAG00000009435 Acp5 (ENSJJAG00000002644) Elof1 (ENSJJAG00000001405) Cnn1 (ENSJJAG00000001001) ENSJJAG00000000325 Zfp653 (ENSJJAG00000000128) Elavl3 (ENSJJAG00000023513) Prkcsh (ENSJJAG00000021556) ENSJJAG00000020511 Rgl3 (ENSJJAG00000012550) Epor (ENSJJAG00000005085) Swsap1 (ENSJJAG00000004050) Plppr2 (ENSJJAG00000001171) Ccdc159 (ENSJJAG00000000427) Tmem205 (ENSJJAG00000000261) Muroidea ANCESTRAL SPECIES 39 ENSGT00940000161655 ENSGT00940000154284.b ENSGT00940000156855 ENSGT00940000161662 ENSGT00390000014107.a.a ENSGT00940000159133 ENSGT00390000017774 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000153340.B ENSGT00390000012071 ENSGT00940000154110.a ENSGT00940000171945 ENSGT00390000013484 ENSGT00520000055626.a ENSGT00390000016559 ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 ENSGT00940000160846.c ENSGT00940000160846.d ENSGT00940000161054 ENSGT00940000163531 ENSGT00940000163200 ENSGT00940000161808 ENSGT00390000015147 ENSGT00940000161345 ENSGT00940000156340.a ENSGT00440000038585 ENSGT00530000063156.a.a.b ENSGT00940000161061.b ENSGT00940000155608 ENSGT00940000162786 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000161655 ENSGT00940000154284.b ENSGT00940000156855 ENSGT00940000161662 ENSGT00390000014107.a.a ENSGT00940000159133 ENSGT00390000017774 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000153340.B ENSGT00390000012071 ENSGT00940000154110.a ENSGT00940000171945 ENSGT00390000013484 ENSGT00520000055626.a ENSGT00390000016559 ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00390000000377 ENSGT00940000162861 ENSGT00530000063371.A ENSGT00390000008738 ENSGT00390000013284 ENSGT00940000158858 ENSGT00940000159880 ENSGT00950000183167.a.b.a ENSGT00940000157429 ENSGT00390000005342 ENSGT00390000013043 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000167396 ENSGT00940000161655 ENSGT00940000154284.b ENSGT00940000156855 ENSGT00940000161662 ENSGT00390000014107.a.a ENSGT00940000159133 ENSGT00390000017774 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000153340.B ENSGT00390000012071 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000013484 ENSGT00520000055626.a ENSGT00390000016559 ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00390000000377 ENSGT00940000162861 ENSGT00530000063371.A ENSGT00390000008738 ENSGT00390000013284 ENSGT00940000158858 ENSGT00940000159880 ENSGT00950000183167.a.b.a ENSGT00940000157429 ENSGT00390000005342 ENSGT00390000013043 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000153998.b.i ENSGT00940000161655 ENSGT00940000154284.b ENSGT00940000156855 ENSGT00940000161662 ENSGT00390000014107.a.a ENSGT00940000159133 ENSGT00390000017774 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000153340.B ENSGT00390000012071 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ENSGT00940000157429 ENSGT00390000005342 ENSGT00390000013043 Northern American deer mouse DUPLICATION Northern American deer mouse MODERN SPECIES 1 ENSPEMG00000028066 Smtn (ENSPEMG00000002692) Selenom (ENSPEMG00000000604) Inpp5j (ENSPEMG00000014450) Pla2g3 (ENSPEMG00000012793) Rnf185 (ENSPEMG00000030279) Limk2 (ENSPEMG00000018901) Pik3ip1 (ENSPEMG00000015103) Patz1 (ENSPEMG00000005321) Drg1 (ENSPEMG00000007303) Eif4enif1 (ENSPEMG00000001947) Sfi1 (ENSPEMG00000026201) Pisd (ENSPEMG00000009121) ENSPEMG00000011362 Depdc5 (ENSPEMG00000017938) ENSPEMG00000024597 ##22 Slc5a1 (ENSPEMG00000018099) ENSPEMG00000030935 Spon2 (ENSPEMG00000012059) Ctbp1 (ENSPEMG00000018643) Maea (ENSPEMG00000009131) Uvssa (ENSPEMG00000010756) Nkx1-1 (ENSPEMG00000016893) Fam53a (ENSPEMG00000008959) Slbp (ENSPEMG00000018369) Tmem129 (ENSPEMG00000000690) Tacc3 (ENSPEMG00000012388) Fgfr3 (ENSPEMG00000006894) Letm1 (ENSPEMG00000000609) Nsd2 (ENSPEMG00000017277) Nelfa (ENSPEMG00000016134) Northern American deer mouse MODERN SPECIES 10 ENSPEMG00000005583 Atp9b (ENSPEMG00000023034) Nfatc1 (ENSPEMG00000022364) Ctdp1 (ENSPEMG00000022491) Kcng2 (ENSPEMG00000026971) Slc66a2 (ENSPEMG00000021424) Hsbp1l1 (ENSPEMG00000028002) Txnl4a (ENSPEMG00000021776) Rbfa (ENSPEMG00000021588) Adnp2 (ENSPEMG00000023970) Pard6g (ENSPEMG00000025457) ENSPEMG00000006471 Setbp1 (ENSPEMG00000021869) ENSPEMG00000022112 Slc14a1 (ENSPEMG00000008835) ENSPEMG00000028869 ##22 Siglec15 (ENSPEMG00000024146) Epg5 (ENSPEMG00000022153) Pstpip2 (ENSPEMG00000022379) Atp5a1 (ENSPEMG00000022004) Haus1 (ENSPEMG00000021388) 8030462N17Rik (ENSPEMG00000010341) ENSPEMG00000029031 Loxhd1 (ENSPEMG00000022919) St8sia5 (ENSPEMG00000022119) Pias2 (ENSPEMG00000022220) Katnal2 (ENSPEMG00000021096) Hdhd2 (ENSPEMG00000020912) ENSPEMG00000026193 Skor2 (ENSPEMG00000022190) Smad2 (ENSPEMG00000020383) Prairie vole MODERN SPECIES 89 Morc2a (ENSMOCG00000019690) ENSMOCG00000002196 Selenom (ENSMOCG00000012710) Inpp5j (ENSMOCG00000016640) Pla2g3 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ENSGT00390000013284 ENSGT00940000158858 ENSGT00940000159880 ENSGT00950000183167.a.b.a ENSGT00940000157429 ENSGT00390000005342 Mus_A ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000158595 ENSGT01000000214622.a.a.b ENSGT00950000183172.C ENSGT00390000005572 ENSGT00940000155320 ENSGT00390000010130 ENSGT00390000005743 ENSGT00390000004208 ENSGT00940000158876 ENSGT00530000063883 ENSGT00940000154644.n ENSGT00940000154920 ENSGT00390000013484 ENSGT00520000055626.a ENSGT00390000016559 ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00390000000377 ENSGT00940000162861 ENSGT00530000063371.A ENSGT00860000135700 ENSGT00390000008738 ENSGT00390000013284 ENSGT00940000158858 ENSGT00940000159880 ENSGT00950000183167.a.b.a ENSGT00940000157429 ENSGT00390000005342 Ryukyu mouse MODERN SPECIES 14 Zfp512 (MGP_CAROLIEiJ_G0027093) MGP_CAROLIEiJ_G0027094 Gpn1 (MGP_CAROLIEiJ_G0027095) Supt7l (MGP_CAROLIEiJ_G0027096) Slc4a1ap (MGP_CAROLIEiJ_G0027097) 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ENSGT00940000157429 ENSGT00390000005342 Steppe mouse MODERN SPECIES 3132 Depdc5 (ENSMSIG00000019758) Ywhah (ENSMSIG00000020077) ##22 Slc5a1 (ENSMSIG00000020102) Spon2 (ENSMSIG00000020130) ENSMSIG00000020152 Maea (ENSMSIG00000020294) Uvssa (ENSMSIG00000020327) Nkx1-1 (ENSMSIG00000020362) Fam53a (ENSMSIG00000020370) ENSMSIG00000020391 Slbp (ENSMSIG00000020394) Tmem129 (ENSMSIG00000020453) ENSMSIG00000020463 Fgfr3 (ENSMSIG00000020478) Letm1 (ENSMSIG00000020902) Nsd2 (ENSMSIG00000020943) Nelfa (ENSMSIG00000021131) spretus MODERN SPECIES 14 Zfp512 (MGP_SPRETEiJ_G0028089) Ccdc121 (MGP_SPRETEiJ_G0028090) Gpn1 (MGP_SPRETEiJ_G0028091) Supt7l (MGP_SPRETEiJ_G0028092) Slc4a1ap (MGP_SPRETEiJ_G0028093) MGP_SPRETEiJ_G0028094 Rbks (MGP_SPRETEiJ_G0028095) Babam2 (MGP_SPRETEiJ_G0028096) Fosl2 (MGP_SPRETEiJ_G0028097) Plb1 (MGP_SPRETEiJ_G0028098) Ppp1cb (MGP_SPRETEiJ_G0028099) Yes1 (MGP_SPRETEiJ_G0028100) Pisd (MGP_SPRETEiJ_G0028101) MGP_SPRETEiJ_G0028102 Depdc5 (MGP_SPRETEiJ_G0028103) Ywhah (MGP_SPRETEiJ_G0028104) ##22 Slc5a1 (MGP_SPRETEiJ_G0028105) Spon2 (MGP_SPRETEiJ_G0028106) Ctbp1 (MGP_SPRETEiJ_G0028107) Maea (MGP_SPRETEiJ_G0028108) Uvssa (MGP_SPRETEiJ_G0028109) Nkx1-1 (MGP_SPRETEiJ_G0028110) Fam53a (MGP_SPRETEiJ_G0028111) MGP_SPRETEiJ_G0028112 Slbp (MGP_SPRETEiJ_G0028113) Tmem129 (MGP_SPRETEiJ_G0028114) Tacc3 (MGP_SPRETEiJ_G0028115) Fgfr3 (MGP_SPRETEiJ_G0028116) Letm1 (MGP_SPRETEiJ_G0028117) Nsd2 (MGP_SPRETEiJ_G0028118) Nelfa (MGP_SPRETEiJ_G0028119) Shrew mouse MODERN SPECIES 4 Smtn (MGP_PahariEiJ_G0016877) MGP_PahariEiJ_G0016878 Inpp5j (MGP_PahariEiJ_G0016879) Pla2g3 (MGP_PahariEiJ_G0016880) Rnf185 (MGP_PahariEiJ_G0016881) Limk2 (MGP_PahariEiJ_G0016882) Pik3ip1 (MGP_PahariEiJ_G0016883) Patz1 (MGP_PahariEiJ_G0016884) MGP_PahariEiJ_G0016885 Eif4enif1 (MGP_PahariEiJ_G0016886) Sfi1 (MGP_PahariEiJ_G0016887) MGP_PahariEiJ_G0016888 Pisd (MGP_PahariEiJ_G0016889) Prr14l (MGP_PahariEiJ_G0016890) Depdc5 (MGP_PahariEiJ_G0016891) Ywhah (MGP_PahariEiJ_G0016892) ##22 Slc5a1 (MGP_PahariEiJ_G0016893) Spon2 (MGP_PahariEiJ_G0016894) Ctbp1 (MGP_PahariEiJ_G0016895) Maea (MGP_PahariEiJ_G0016896) Uvssa (MGP_PahariEiJ_G0016897) Nkx1-1 (MGP_PahariEiJ_G0016898) Fam53a (MGP_PahariEiJ_G0016899) MGP_PahariEiJ_G0016900 Slbp (MGP_PahariEiJ_G0016901) Tmem129 (MGP_PahariEiJ_G0016902) MGP_PahariEiJ_G0016903 Fgfr3 (MGP_PahariEiJ_G0016904) MGP_PahariEiJ_G0016905 Nsd2 (MGP_PahariEiJ_G0016906) Nelfa (MGP_PahariEiJ_G0016907) Rat MODERN SPECIES 5 Selenom (ENSRNOG00000061231) Inpp5j (ENSRNOG00000019361) Pla2g3 (ENSRNOG00000025121) ENSRNOG00000064182 Rnf185 (ENSRNOG00000019325) Limk2 (ENSRNOG00000019000) Pik3ip1 (ENSRNOG00000018859) Patz1 (ENSRNOG00000018709) Drg1 (ENSRNOG00000018590) Eif4enif1 (ENSRNOG00000018475) Sfi1 (ENSRNOG00000018412) Pisd (ENSRNOG00000018319) Prr14l (ENSRNOG00000048891) LOC100361879 (ENSRNOG00000045749) Depdc5 (ENSRNOG00000018144) Ywhah (ENSRNOG00000055471) ##22 Slc5a1 (ENSRNOG00000017775) Spon2 (ENSRNOG00000006033) Ctbp1 (ENSRNOG00000005428) Maea (ENSRNOG00000005397) Uvssa (ENSRNOG00000005122) Nkx1-1 (ENSRNOG00000005113) Fam53a (ENSRNOG00000017548) Slbp (ENSRNOG00000037162) Tmem129 (ENSRNOG00000017329) Tacc3 (ENSRNOG00000017259) Fgfr3 (ENSRNOG00000016818) Letm1 (ENSRNOG00000016427) Nsd2 (ENSRNOG00000038140) Nelfa (ENSRNOG00000015474) RGD1560394 (ENSRNOG00000065022) Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 1127 Osbp2 (ENSNGAG00000006206) ENSNGAG00000017090 Smtn (ENSNGAG00000000214) Selenom (ENSNGAG00000002659) Inpp5j (ENSNGAG00000012771) Pla2g3 (ENSNGAG00000010285) Rnf185 (ENSNGAG00000011285) Limk2 (ENSNGAG00000019859) Pik3ip1 (ENSNGAG00000007708) Patz1 (ENSNGAG00000010268) Drg1 (ENSNGAG00000003869) Eif4enif1 (ENSNGAG00000017244) Sfi1 (ENSNGAG00000003322) Pisd (ENSNGAG00000011375) Depdc5 (ENSNGAG00000015721) Ywhah (ENSNGAG00000010622) ##22 Slc5a1 (ENSNGAG00000020941) Slc5a4a (ENSNGAG00000011928) Zfp280b (ENSNGAG00000020638) Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 62 ENSGT00940000153998.b ENSGT00940000161655 ENSGT00940000154284.b ENSGT00940000156855 ENSGT00940000161662 ENSGT00390000014107.a.a ENSGT00940000159133 ENSGT00390000017774 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000153340.B ENSGT00390000012071 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000013484 ENSGT00520000055626.a ENSGT00390000016559 ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 ENSGT00940000160846 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES 1033 ENSGT00520000055626.a ENSGT00390000016559 ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 ENSGT00940000160846 Sloth MODERN SPECIES 13701 YWHAH (ENSCHOG00000002161) ##22 Armadillo MODERN SPECIES 3615 KCNH8 (ENSDNOG00000017660) PRR14L (ENSDNOG00000014560) ENSDNOG00000048054 ENSDNOG00000012365 YWHAH (ENSDNOG00000036843) ##22 SLC5A1 (ENSDNOG00000033111) SLC5A4 (ENSDNOG00000047134) ENSDNOG00000039470 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 49 ENSGT00940000153998.b ENSGT00940000161655 ENSGT00940000154284.b ENSGT00940000156855 ENSGT00940000161662 ENSGT00390000014107.a.a ENSGT00940000159133 ENSGT00390000017774 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000153340.B ENSGT00390000012071 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000013484 ENSGT00520000055626.a ENSGT00390000016559 ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 ENSGT00940000160846 ENSGT00940000163531 ENSGT00940000160353 ENSGT00500000044989 ENSGT00940000159687 ENSGT00940000153491.b.a ##35 ENSGT00940000153592.B.b.b ENSGT01030000234555.a.a.a.c.b ENSGT00390000004906 ENSGT00390000000571 ENSGT00610000086153 ENSGT00940000162815 ENSGT00940000154601 ENSGT00940000155794 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 49 ENSGT00940000153998.b ENSGT00940000161655 ENSGT00940000154284.b ENSGT00940000156855 ENSGT00940000161662 ENSGT00390000014107.a.a ENSGT00940000159133 ENSGT00390000017774 ENSGT00940000159296 ENSGT00940000153340.B ENSGT00390000012071 ENSGT00940000154110.a ENSGT00390000013484 ENSGT00520000055626.a ENSGT00390000016559 ENSGT01090000260061.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000155844 ENSGT00940000160846 ENSGT00940000163531 ENSGT00940000160353 ENSGT00500000044989 ENSGT00940000159687 ENSGT00940000153491.b.a ##35 ENSGT00940000153592.B.b.b ENSGT01030000234555.a.a.a.c.b ENSGT00390000004906 ENSGT00390000000571 ENSGT00610000086153 ENSGT00940000162815 ENSGT00940000154601 ENSGT00940000155794 Hyrax MODERN SPECIES 184 DEPDC5 (ENSPCAG00000004694) YWHAH (ENSPCAG00000004956) ##22 Tenrec MODERN SPECIES 306 DEPDC5 (ENSETEG00000001687) YWHAH (ENSETEG00000001696) ##22 Coelacanth MODERN SPECIES 231 UPB1 (ENSLACG00000015292) ADORA2A (ENSLACG00000015554) SPECC1L (ENSLACG00000015765) BCR (ENSLACG00000016178) ##35 LIMK2 (ENSLACG00000016577) RNF185 (ENSLACG00000016682) PIK3IP1 (ENSLACG00000016745) PATZ1 (ENSLACG00000016839) DRG1 (ENSLACG00000016884) EIF4ENIF1 (ENSLACG00000016906) ENSLACG00000017027 PISD (ENSLACG00000017068) sxph (ENSLACG00000017168) DEPDC5 (ENSLACG00000017261) ENSLACG00000017378 YWHAH (ENSLACG00000017413) ##22 SLC5A1 (ENSLACG00000017475) RSPH14 (ENSLACG00000017537) GNAZ (ENSLACG00000017616) RAB36 (ENSLACG00000017799) ENSLACG00000017851 ENSLACG00000017887 C12orf43 (ENSLACG00000017895) hnf1ba (ENSLACG00000017915) SPPL3 (ENSLACG00000017976) ACADS (ENSLACG00000018055) UNC119B (ENSLACG00000018079) MLEC (ENSLACG00000018098) CABP1 (ENSLACG00000018116) POP5 (ENSLACG00000018188) RNF10 (ENSLACG00000018192) Vertebrata ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.a.d ##22 Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.a.d ##22 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.a.d ##22 Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.a.d ##22 Neopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.a.d ##22 Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.a.d ##22 Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.a.d ##22 Otomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.a.d ##22 Otophysi ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.a.d ##22 Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.a.d ##22 Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 563 ENSGT00990000210500 ENSGT00940000163010.v.b ENSGT00940000155788.l.b ENSGT00390000003465.b.b.a ENSGT01090000260040.b.b.a.f ENSGT00940000160311.a.b.b.b ENSGT00940000158703 ENSGT01090000260061.c.a.d ##22 ENSGT00940000160311.a.b.a ENSGT00940000166830 ENSGT00940000154697.a.a.a.b.b ENSGT00390000008918.k.b ENSGT00940000162035.f ENSGT00950000183151.b.y.a ENSGT00940000159821 ENSGT00390000015641.q ENSGT00940000160858.d ENSGT00390000002381.a.d ENSGT01090000261128 Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 487 ENSGT00990000210500 ENSGT00940000163010.v.b ENSGT00940000155788.l.b ENSGT00390000003465.b.b.a.b ENSGT01090000260061.c.a.d ##22 ENSGT00940000160311.a.b.a ENSGT00940000166830 ENSGT00940000154697.a.a.a.b.b ENSGT00940000164643 ENSGT00940000162035.f ENSGT00950000183151.b.y.a ENSGT00940000159821 ENSGT00390000015641.q ENSGT00940000160858.d ENSGT00390000002381.a.d ENSGT01090000261128 Golden-line barbel MODERN SPECIES 445 slc25a32a (ENSSGRG00000023413) cthrc1a (ENSSGRG00000023416) mc5ra (ENSSGRG00000023417) rnmt (ENSSGRG00000023418) fam210aa (ENSSGRG00000023419) LDLRAD4 (ENSSGRG00000023420) seh1l (ENSSGRG00000023428) ENSSGRG00000023433 ENSSGRG00000023435 ptpn2b (ENSSGRG00000023440) psmg2 (ENSSGRG00000023499) ncaldb (ENSSGRG00000023505) grhl2b (ENSSGRG00000023511) znf706 (ENSSGRG00000023540) ENSSGRG00000023545 ##22 pabpc1b (ENSSGRG00000023565) ENSSGRG00000024789 spag1a (ENSSGRG00000024792) ENSSGRG00000024795 ENSSGRG00000024796 ENSSGRG00000024797 adck5 (ENSSGRG00000024807) ENSSGRG00000024882 Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 127 ENSGT01030000234510.a.a.b ENSGT01030000234510.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000156554.a ENSGT00390000000724.c.b.c ENSGT00510000048187 ENSGT00940000153393.A ENSGT00940000154686.b ENSGT00390000000781 ENSGT00940000162435 ENSGT00940000158862 ENSGT00940000155788.k ENSGT00390000003465.b.b.b ENSGT01090000260040.a.a.a ENSGT01090000260040.b.b.a.d ENSGT01090000260061.c.a.d ##22 ENSGT00940000160311.a.a ENSGT00940000158703 ENSGT00940000154697.a.a.a.a ENSGT00940000154697.b ENSGT00530000063692.a ENSGT00500000044936 ENSGT00940000154684 ENSGT00940000160530 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000159321 ENSGT00390000017478 ENSGT00420000029792.qb.a ENSGT00940000158008 ENSGT00940000153446.a.a.x ENSGT00940000153446.a.a.w.a Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.a.d ##22 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.a.d ##22 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 714 ENSGT01090000260061.c.a.d ##22 ENSGT00940000160311.a.a.b Salmo ANCESTRAL SPECIES 616 ENSGT01090000260061.c.a.d ##22 ENSGT00940000160311.a.a.b River trout MODERN SPECIES 439 fbxo32 (ENSSTUG00000026611) ENSSTUG00000026674 elovl4a (ENSSTUG00000026696) SOGA3 (ENSSTUG00000026706) SOGA3 (ENSSTUG00000026731) ENSSTUG00000026739 rpl30 (ENSSTUG00000026756) fbxo43 (ENSSTUG00000026764) ENSSTUG00000026773 ENSSTUG00000026781 ENSSTUG00000026799 fbxo43 (ENSSTUG00000026804) rpl30 (ENSSTUG00000026826) ENSSTUG00000026835 pabpc1a (ENSSTUG00000026847) ENSSTUG00000027223 ##22 ENSSTUG00000027233 RNF19A (ENSSTUG00000027288) ENSSTUG00000027345 ENSSTUG00000027349 ENSSTUG00000027357 rida (ENSSTUG00000027374) POP1 (ENSSTUG00000027386) NIPAL2 (ENSSTUG00000027461) NIPAL2 (ENSSTUG00000027469) POP1 (ENSSTUG00000027478) rida (ENSSTUG00000027504) ENSSTUG00000027513 ENSSTUG00000027523 ENSSTUG00000027527 ENSSTUG00000027545 Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.a.d ##22 Euacanthomorphacea DUPLICATION Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.a.d.a ##22 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.a.d.a ##22 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.a.d.a ##22 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.a.d.a ##22 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.a.d.a ##22 Carangaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.a.d.a ##22 Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.a.d.a ##22 Seriola ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.a.d.a ##22 Yellowtail amberjack DUPLICATION Yellowtail amberjack DUPLICATION Yellowtail amberjack DUPLICATION Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 1408 ENSSLDG00000011454 ##22 Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 1461 ENSSLDG00000000351 ##22 Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 638 ENSSLDG00000005794 ##22 Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 806 ENSSLDG00000009431 ##22 Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.a.d.a ##22 Tongue sole MODERN SPECIES 10 bckdk (ENSCSEG00000016496) orai2 (ENSCSEG00000016488) USP28 (ENSCSEG00000016461) HTR3A (ENSCSEG00000016449) zbtb16a (ENSCSEG00000016440) ncam1a (ENSCSEG00000015969) cadm1a (ENSCSEG00000015889) sc5d (ENSCSEG00000015866) plekhb1 (ENSCSEG00000015863) ENSCSEG00000015849 TECTA (ENSCSEG00000015826) ENSCSEG00000015810 ENSCSEG00000015801 #29 ENSCSEG00000015789 CRK (ENSCSEG00000015777) #21 ENSCSEG00000015677 ##22 gria4b (ENSCSEG00000015575) elmod1 (ENSCSEG00000015527) slc35f2 (ENSCSEG00000015491) CUL5 (ENSCSEG00000015456) ompb (ENSCSEG00000015444) CAPN5 (ENSCSEG00000015427) MYO7A (ENSCSEG00000015251) ENSCSEG00000015202 ENSCSEG00000015230 ENSCSEG00000015171 FCHSD2 (ENSCSEG00000015081) foxred1 (ENSCSEG00000015059) kcnj1b (ENSCSEG00000015056) ENSCSEG00000015046 rabep1 (ENSCSEG00000015015) Euacanthomorphacea DUPLICATION Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00940000155721.b.b ENSGT01030000234510.a.a.b ENSGT01030000234510.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000156554.a ENSGT00390000000724.c.b.c ENSGT00510000048187 ENSGT00940000153393.A ENSGT00940000154686.b ENSGT00390000000781 ENSGT00940000162435 ENSGT00940000158862 ENSGT00940000155788.k ENSGT00390000003465.b.b.b ENSGT01090000260040.a.a.a ENSGT01090000260040.b.b.a.d ENSGT01090000260061.c.a.d.b.a ##22 ENSGT00940000160311.a.a ENSGT00940000158703 ENSGT00940000154697.a.a.a.a ENSGT00940000154697.b ENSGT00530000063692.a ENSGT00500000044936 ENSGT00940000154684 ENSGT00940000160530 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000159321 ENSGT00390000017478 ENSGT00420000029792.qb.a ENSGT00940000158008 ENSGT00940000153446.a.a.w.a ENSGT00940000154181.b.a Percomorphaceae DUPLICATION Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012690.a ENSGT00940000155721.b.b ENSGT01030000234510.a.a.b ENSGT01030000234510.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000156554.a ENSGT00390000000724.c.b.c ENSGT00510000048187 ENSGT00940000153393.A ENSGT00940000154686.b ENSGT00390000000781 ENSGT00940000162435 ENSGT00940000158862 ENSGT00940000155788.k ENSGT00390000003465.b.b.b ENSGT01090000260040.b.b.a.c.b ENSGT01090000260061.c.a.d.b.a.a ##22 ENSGT00940000160311.a.a ENSGT00940000158703 ENSGT00940000154697.a.a.a.a ENSGT00940000154697.b ENSGT00530000063692.a ENSGT00500000044936 ENSGT00940000154684 ENSGT00940000160530 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000159321 ENSGT00390000017478 ENSGT00420000029792.qb.a ENSGT00940000158008 ENSGT00940000153446.a.a.w.a ENSGT00940000154181.b.a Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 480 ncalda (ENSHCOG00000013434) ENSHCOG00000013467 ##22 pabpc1a (ENSHCOG00000013502) rnf19a (ENSHCOG00000013534) ENSHCOG00000013540 FBXO43 (ENSHCOG00000013550) ENSHCOG00000013646 VPS13B (ENSHCOG00000013804) osr2 (ENSHCOG00000013823) KCNS2 (ENSHCOG00000013836) NIPAL2 (ENSHCOG00000013854) POP1 (ENSHCOG00000013888) ENSHCOG00000013907 ENSHCOG00000013917 ubr5 (ENSHCOG00000014022) azin1a (ENSHCOG00000014039) atp6v1c1a (ENSHCOG00000014045) Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.a.d.b.a.a ##22 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.a.d.b.a.a ##22 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.a.d.b.a.a ##22 Carangaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.a.d.b.a.a ##22 Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00940000155488.m.b ENSGT00390000001296 ENSGT00390000012690.a ENSGT00940000155721.b.b ENSGT01030000234510.a.a.b ENSGT01030000234510.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000156554.a ENSGT00390000000724.c.b.c ENSGT00510000048187 ENSGT00940000153393.A ENSGT00940000154686.b ENSGT00390000000781 ENSGT00940000162435 ENSGT00940000158862 ENSGT00940000155788.k ENSGT01090000260061.c.a.d.b.a.a ##22 ENSGT00940000160311.a.a.d ENSGT00940000158703 ENSGT00940000154697.a.a.a.a ENSGT00940000154697.b ENSGT00530000063692.a ENSGT00500000044936 ENSGT00940000154684 ENSGT00940000160530 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000159321 ENSGT00390000017478 ENSGT00420000029792.qb.a ENSGT00940000158008 ENSGT00940000153446.a.a.w.a ENSGT00940000154181.b.a Turbot MODERN SPECIES zgc:77056 (ENSSMAG00000013445) tmem42a (ENSSMAG00000036827) zdhhc3a (ENSSMAG00000013466) mc2r (ENSSMAG00000013506) mc5rb (ENSSMAG00000013523) fam210ab (ENSSMAG00000013530) ldlrad4b (ENSSMAG00000024611) ENSSMAG00000022451 CEP192 (ENSSMAG00000010573) SEH1L (ENSSMAG00000010604) ptpn2a (ENSSMAG00000010638) cep76 (ENSSMAG00000010648) id4 (ENSSMAG00000035497) ncalda (ENSSMAG00000028156) GRHL2 (ENSSMAG00000010755) ENSSMAG00000025081 ##22 ENSSMAG00000010803 RNF19A (ENSSMAG00000010882) ENSSMAG00000011020 ENSSMAG00000029794 FBXO43 (ENSSMAG00000011089) ENSSMAG00000011117 VPS13B (ENSSMAG00000011345) OSR2 (ENSSMAG00000011794) KCNS2 (ENSSMAG00000010538) NIPAL2 (ENSSMAG00000010528) POP1 (ENSSMAG00000010467) RIDA (ENSSMAG00000010449) MATN2 (ENSSMAG00000010420) LAPTM4B (ENSSMAG00000010374) ENSSMAG00000010329 Tongue sole MODERN SPECIES 4 RIMS2 (ENSCSEG00000013619) dcaf13 (ENSCSEG00000013595) slc25a32b (ENSCSEG00000013575) CTHRC1 (ENSCSEG00000013553) fzd6 (ENSCSEG00000013537) klhl32 (ENSCSEG00000013512) mms22l (ENSCSEG00000013481) ldlrad4b (ENSCSEG00000013462) ENSCSEG00000013450 seh1l (ENSCSEG00000013427) ptpn2a (ENSCSEG00000013419) cep76 (ENSCSEG00000013384) id4 (ENSCSEG00000013378) ncalda (ENSCSEG00000013364) grhl2a (ENSCSEG00000013351) ENSCSEG00000013338 ##22 pabpc1a (ENSCSEG00000013324) rnf19a (ENSCSEG00000013313) ENSCSEG00000013303 ENSCSEG00000013298 ENSCSEG00000013266 fam210ab (ENSCSEG00000013259) mc5rb (ENSCSEG00000013252) mc2r (ENSCSEG00000013247) zdhhc3a (ENSCSEG00000013228) ENSCSEG00000013214 ENSCSEG00000012987 stt3b (ENSCSEG00000012945) ENSCSEG00000012931 popdc3 (ENSCSEG00000012927) bves (ENSCSEG00000012920) Eupercaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.a.d.b.a.a ##22 Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00390000001296 ENSGT00390000012690.a ENSGT00940000155721.b.b ENSGT01030000234510.a.a.b ENSGT01030000234510.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000156554.a ENSGT00390000000724.c.b.c ENSGT00510000048187 ENSGT00940000153393.A ENSGT00940000154686.b ENSGT00390000000781 ENSGT00940000162435 ENSGT00940000158862 ENSGT00940000155788.k ENSGT00390000003465.b.b.b ENSGT01090000260061.c.a.d.b.a.a ##22 ENSGT00940000160311.a.a ENSGT00940000158703 ENSGT00940000154697.a.a.a.a ENSGT00940000154697.b ENSGT00530000063692.a ENSGT00500000044936 ENSGT00940000154684 ENSGT00940000160530 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000159321 ENSGT00390000017478 ENSGT00420000029792.qb.a ENSGT00390000004263.a.d.a ENSGT00390000003058.b.a.a.a.b ENSGT00940000158819 Fugu MODERN SPECIES 19 mc5r (ENSTRUG00000012727) zdhhc3a (ENSTRUG00000013064) mc2r (ENSTRUG00000012951) fam210ab (ENSTRUG00000021010) ldlrad4b (ENSTRUG00000012667) ENSTRUG00000030393 ENSTRUG00000027748 ENSTRUG00000030051 seh1l (ENSTRUG00000022150) ptpn2 (ENSTRUG00000012316) cep76 (ENSTRUG00000012223) id4 (ENSTRUG00000025562) ncalda (ENSTRUG00000024736) ENSTRUG00000011936 ZNF706 (ENSTRUG00000011931) ENSTRUG00000011774 ##22 ENSTRUG00000011577 rnf19a (ENSTRUG00000011384) ENSTRUG00000019678 ENSTRUG00000011262 FBXO43 (ENSTRUG00000020193) ENSTRUG00000011182 VPS13B (ENSTRUG00000011132) osr2 (ENSTRUG00000011070) KCNS2 (ENSTRUG00000011051) NIPAL2 (ENSTRUG00000023606) POP1 (ENSTRUG00000010856) rida (ENSTRUG00000010847) MATN2 (ENSTRUG00000010697) LAPTM4B (ENSTRUG00000010627) ENSTRUG00000010517 Tetraodon MODERN SPECIES 23 mc5rb (ENSTNIG00000013316) fam210ab (ENSTNIG00000013315) ldlrad4b (ENSTNIG00000000459) ENSTNIG00000013314 seh1l (ENSTNIG00000013313) ptpn2a (ENSTNIG00000013312) ENSTNIG00000013311 ncalda (ENSTNIG00000013310) GRHL2 (ENSTNIG00000013309) ENSTNIG00000013308 ##22 pabpc1a (ENSTNIG00000013307) rnf19a (ENSTNIG00000013306) ENSTNIG00000013305 FBXO43 (ENSTNIG00000013304) VPS13B (ENSTNIG00000013303) ENSTNIG00000001089 ENSTNIG00000001594 ENSTNIG00000013302 osr2 (ENSTNIG00000013301) ENSTNIG00000013300 KCNS2 (ENSTNIG00000013299) NIPAL2 (ENSTNIG00000013298) POP1 (ENSTNIG00000013297) MATN2 (ENSTNIG00000013295) ENSTNIG00000013294 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.a.d.b.a.a ##22 Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000001296 ENSGT00390000012690.a ENSGT00940000155721.b.b ENSGT01030000234510.a.a.b ENSGT01030000234510.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000156554.a ENSGT00390000000724.c.b.c ENSGT00510000048187 ENSGT00940000153393.A ENSGT00940000154686.b ENSGT00390000000781 ENSGT00940000162435 ENSGT00940000158862 ENSGT00940000155788.k ENSGT00390000003465.b.b.b ENSGT01090000260061.c.a.d.b.a.a ##22 ENSGT01090000260040.b.b.a.c.b ENSGT00940000160311.a.a ENSGT00940000158703 ENSGT00940000154697.a.a.a.a ENSGT00940000154697.b ENSGT00530000063692.a ENSGT00500000044936 ENSGT00940000154684 ENSGT00940000160530 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000159321 ENSGT00390000017478 ENSGT00420000029792.qb.a ENSGT00940000158008 ENSGT00940000153446.a.a.w.a Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00390000001296 ENSGT00390000012690.a ENSGT00940000155721.b.b ENSGT01030000234510.a.a.b ENSGT01030000234510.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000156554.a ENSGT00390000000724.c.b.c ENSGT00510000048187.db ENSGT00940000153393.A ENSGT00940000154686.b ENSGT00390000000781 ENSGT00940000162435 ENSGT00940000158862 ENSGT00940000155788.k ENSGT00390000003465.b.b.b ENSGT01090000260061.c.a.d.b.a.a ##22 ENSGT00940000160311.a.a ENSGT00940000158703 ENSGT00940000154697.a.a.a.a ENSGT00940000154697.b ENSGT00530000063692.a ENSGT00500000044936 ENSGT00940000154684 ENSGT00940000160530 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000159321 ENSGT00390000017478 ENSGT00420000029792.qb.a ENSGT00940000158008 ENSGT00940000153446.a.a.w.a ENSGT00940000154181.b.a Bicolor damselfish DUPLICATION Bicolor damselfish MODERN SPECIES 254 zgc:77056 (ENSSPAG00000013125) tmem42a (ENSSPAG00000013135) zdhhc3a (ENSSPAG00000013149) mc2r (ENSSPAG00000013183) mc5rb (ENSSPAG00000013278) fam210ab (ENSSPAG00000014230) 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COQ8A (ENSSPAG00000018609) ENSSPAG00000018599 ##22 TATDN3 (ENSSPAG00000018577) fuca2 (ENSSPAG00000018545) Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00390000012690.a ENSGT00940000155721.b.b ENSGT01030000234510.a.a.b ENSGT01030000234510.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000156554.a ENSGT00390000000724.c.b.c ENSGT00510000048187.eb ENSGT00510000048187.db ENSGT00940000153393.A ENSGT00940000154686.b ENSGT00390000000781.c ENSGT00940000162435 ENSGT00940000158862 ENSGT00940000155788.k ENSGT00390000003465.b.b.b ENSGT01090000260061.c.a.d.b.a.a ##22 ENSGT00940000160311.a.a ENSGT00940000158703 ENSGT00940000154697.a.a.a.a ENSGT00940000154697.b ENSGT00530000063692.a ENSGT00500000044936 ENSGT00940000154684 ENSGT00940000160530 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000159321 ENSGT00390000017478 ENSGT00420000029792.qb.a ENSGT00940000158008 ENSGT00940000153446.a.a.w.a ENSGT00940000154181.b.a Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 109 ENSGT00390000012690.a ENSGT00940000155721.b.b ENSGT01030000234510.a.a.b ENSGT01030000234510.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000156554.a ENSGT00390000000724.c.b.c ENSGT00510000048187.eb ENSGT00510000048187.db ENSGT00940000153393.A ENSGT00940000154686.b ENSGT00390000000781.c ENSGT00940000162435 ENSGT00940000158862 ENSGT00940000155788.k ENSGT00390000003465.b.b.b ENSGT01090000260061.c.a.d.b.a.a ##22 ENSGT00940000160311.a.a ENSGT00940000158703 ENSGT00940000154697.a.a.a.a ENSGT00940000154697.b ENSGT00530000063692.a ENSGT00500000044936 ENSGT00940000154684 ENSGT00940000160530 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000159321 ENSGT00390000017478 ENSGT00420000029792.qb.a ENSGT00940000158008 ENSGT00940000153446.a.a.w.a ENSGT00940000154181.b.a Orange clownfish MODERN SPECIES 21 zdhhc3a (ENSAPEG00000006474) mc2r (ENSAPEG00000006499) mc5rb (ENSAPEG00000006527) ENSAPEG00000006549 fam210ab (ENSAPEG00000006559) ldlrad4b (ENSAPEG00000006574) ENSAPEG00000006607 ENSAPEG00000006621 seh1l (ENSAPEG00000006662) ptpn2a (ENSAPEG00000006677) cep76 (ENSAPEG00000006733) id4 (ENSAPEG00000006776) ncalda (ENSAPEG00000006812) ENSAPEG00000006832 ZNF706 (ENSAPEG00000006927) ENSAPEG00000006949 ##22 pabpc1a (ENSAPEG00000006963) rnf19a (ENSAPEG00000007034) ENSAPEG00000007079 ENSAPEG00000007113 FBXO43 (ENSAPEG00000007154) ENSAPEG00000007220 VPS13B (ENSAPEG00000007328) ENSAPEG00000007540 osr2 (ENSAPEG00000007554) KCNS2 (ENSAPEG00000007565) NIPAL2 (ENSAPEG00000007576) POP1 (ENSAPEG00000007607) rida (ENSAPEG00000007659) MATN2 (ENSAPEG00000007695) LAPTM4B (ENSAPEG00000007833) Clown anemonefish MODERN SPECIES 999 ENSAOCG00000011885 ENSAOCG00000011872 ENSAOCG00000011752 ncalda (ENSAOCG00000011730) ENSAOCG00000011708 ZNF706 (ENSAOCG00000011688) ENSAOCG00000011675 ##22 pabpc1a (ENSAOCG00000011656) rnf19a (ENSAOCG00000011632) ENSAOCG00000011582 FBXO43 (ENSAOCG00000011555) ENSAOCG00000000719 VPS13B (ENSAOCG00000011440) osr2 (ENSAOCG00000000699) KCNS2 (ENSAOCG00000011007) NIPAL2 (ENSAOCG00000010998) POP1 (ENSAOCG00000010991) rida (ENSAOCG00000000693) MATN2 (ENSAOCG00000010914) LAPTM4B (ENSAOCG00000010616) ENSAOCG00000010593 ENSAOCG00000010576 Spiny chromis MODERN SPECIES 1533 ENSAPOG00000014797 crygm3 (ENSAPOG00000014815) ENSAPOG00000014835 crygs4 (ENSAPOG00000000415) crygs3 (ENSAPOG00000014894) grhl2a (ENSAPOG00000014966) ZNF706 (ENSAPOG00000014979) ENSAPOG00000015008 ##22 pabpc1a (ENSAPOG00000015105) ENSAPOG00000015120 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.a.d.b.a.b ##22 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.a.d.b.a.b ##22 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.a.d.b.a.b ##22 Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.a.d.b.a.b ##22 Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000154030.a.b ENSGT00390000013670 ENSGT00940000157701 ENSGT00940000156464 ENSGT00940000156714.a ENSGT01030000234564.a.a.a.a.b.a ENSGT00940000155623 ENSGT00390000003990 ENSGT00940000155699.a.b ENSGT00510000048685.g.b ENSGT00390000013762.b.b ENSGT00940000158830 ENSGT00510000048466 ENSGT00940000155982.e.a ENSGT00940000157612 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ENSGT00940000159551 ENSGT00390000001205.b ENSGT00940000153887.A ENSGT00940000157826.d Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000154030.a.b ENSGT00390000013670 ENSGT00940000157701 ENSGT00940000156464 ENSGT00940000156714.a ENSGT01030000234564.a.a.a.a.b.a ENSGT00940000155623 ENSGT00390000003990 ENSGT00940000155699.a.b ENSGT00510000048685.g.b ENSGT00390000013762.b.b ENSGT00940000158830 ENSGT00510000048466 ENSGT00940000155982.e.a ENSGT00940000157612 ENSGT01090000260061.c.a.d.b.a.b ##22 ENSGT00940000155443.c ENSGT00390000008069 ENSGT00390000007594 ENSGT00940000164602 ENSGT00940000166410 ENSGT00940000158100 ENSGT00390000003967.a ENSGT00940000162008 ENSGT00390000014780 ENSGT00950000183032.B.b.a ENSGT00420000029802 ENSGT00940000159551 ENSGT00390000001205.b ENSGT00940000153887.A ENSGT00940000157826.c.a.b Clown anemonefish MODERN SPECIES 623 rnf144aa (ENSAOCG00000010367) ENSAOCG00000010360 id2a (ENSAOCG00000010346) KIDINS220 (ENSAOCG00000010304) MBOAT2 (ENSAOCG00000010155) asap2a 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ENSGT00390000018415 ENSGT00940000162740.k.a ENSGT00940000163010 ENSGT00940000155788.l.d ENSGT00390000003465.b.b.a ENSGT01090000260061.c.a.d.b.b ##22 ENSGT00940000160311.a.b ENSGT00760000119766 ENSGT00390000005869.a ENSGT00870000136537 ENSGT00950000182940.b.a.b.a.b ENSGT00940000155176.o.b ENSGT00940000166429 ENSGT00940000154996.a.a.b ENSGT00390000017503 ENSGT00940000158438.m ENSGT01030000234534.B.a.a.b ENSGT00940000160839 ENSGT00950000183051.a.a.b ENSGT00920000149172 ENSGT00940000156446 Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00390000013305.a.b ENSGT00940000154181.b.b ENSGT00940000153446.a.a.w.b ENSGT00390000012138.a.b.d ENSGT00420000029792.qb.b ENSGT00940000154984.A ENSGT00390000008918 ENSGT00940000154697.a.a.a.b ENSGT00940000166830 ENSGT00940000154686.a ENSGT00390000018415 ENSGT00940000162740.k.a ENSGT00940000163010 ENSGT00940000155788.l.d ENSGT00390000003465.b.b.a ENSGT01090000260061.c.a.d.b.b ##22 ENSGT00940000160311.a.b ENSGT00760000119766 ENSGT00390000005869.a ENSGT00870000136537 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sf3b4 (ENSAPOG00000017647) SV2A (ENSAPOG00000017639) CTSS (ENSAPOG00000017560) ENSAPOG00000017388 lingo4a (ENSAPOG00000017358) vps72a (ENSAPOG00000017347) SYNGAP1 (ENSAPOG00000017311) ENSAPOG00000017254 ENSAPOG00000017243 tshz1 (ENSAPOG00000017234) CSMD3 (ENSAPOG00000017193) trps1 (ENSAPOG00000016785) Bicolor damselfish MODERN SPECIES 270 rrm2b (ENSSPAG00000019642) mtdha (ENSSPAG00000019620) laptm4b (ENSSPAG00000019600) rpl30 (ENSSPAG00000019581) RIDA (ENSSPAG00000019562) ENSSPAG00000019554 stk3 (ENSSPAG00000019513) spag1a (ENSSPAG00000019495) ENSSPAG00000019460 ptpn2b (ENSSPAG00000019443) psmg2 (ENSSPAG00000019435) zgc:136493 (ENSSPAG00000019423) ncaldb (ENSSPAG00000019414) grhl2b (ENSSPAG00000019357) znf706 (ENSSPAG00000019343) ENSSPAG00000019330 ##22 pabpc1b (ENSSPAG00000019265) ENSSPAG00000019238 LIX1L (ENSSPAG00000019225) sf3b4 (ENSSPAG00000019219) SV2A (ENSSPAG00000019190) CTSS (ENSSPAG00000019023) ctss1 (ENSSPAG00000018989) lingo4a (ENSSPAG00000018979) vps72a (ENSSPAG00000018964) ENSSPAG00000018927 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.a.d.b.b ##22 Eupercaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.a.d.b.b ##22 Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.a.d.b.b ##22 Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.a.d.b.b ##22 Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.a.d.b.b ##22 Gilthead seabream MODERN SPECIES 17 rrm2b (ENSSAUG00010003345) ENSSAUG00010003335 laptm4b (ENSSAUG00010003329) rpl30 (ENSSAUG00010003324) RIDA (ENSSAUG00010003313) stk3 (ENSSAUG00010001936) polr2k (ENSSAUG00010001883) spag1a (ENSSAUG00010001881) ENSSAUG00010001854 ptpn2b (ENSSAUG00010001838) psmg2 (ENSSAUG00010001825) zgc:136493 (ENSSAUG00010001808) ncaldb (ENSSAUG00010001792) grhl2b (ENSSAUG00010001680) znf706 (ENSSAUG00010001636) ENSSAUG00010001626 ##22 pabpc1b (ENSSAUG00010001450) ENSSAUG00010001418 ENSSAUG00010001411 LIX1L (ENSSAUG00010001405) sf3b4 (ENSSAUG00010001398) SV2A (ENSSAUG00010001240) ENSSAUG00010017292 ENSSAUG00010017290 vps72a (ENSSAUG00010017287) SYNGAP1 (ENSSAUG00010016670) RXFP4 (ENSSAUG00010016653) znf516 (ENSSAUG00010016652) tshz1 (ENSSAUG00010016651) CSMD3 (ENSSAUG00010016627) trps1 (ENSSAUG00010016602) Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 2 rnf19a (ENSMMDG00005006477) ptpn2b (ENSMMDG00005006471) psmg2 (ENSMMDG00005006468) zgc:136493 (ENSMMDG00005006449) zgc:136493 (ENSMMDG00005006444) ENSMMDG00005006439 zgc:136493 (ENSMMDG00005006435) ENSMMDG00005006219 ENSMMDG00005005833 zgc:136493 (ENSMMDG00005005718) ENSMMDG00005005576 zgc:136493 (ENSMMDG00005005572) ncaldb (ENSMMDG00005005568) grhl2b (ENSMMDG00005005562) znf706 (ENSMMDG00005005559) ENSMMDG00005005557 ##22 pabpc1b (ENSMMDG00005005388) ENSMMDG00005005345 LIX1L (ENSMMDG00005005334) sf3b4 (ENSMMDG00005005330) SV2A (ENSMMDG00005005325) ENSMMDG00005005316 ctss1 (ENSMMDG00005004164) lingo4a (ENSMMDG00005004108) vps72a (ENSMMDG00005004101) SYNGAP1 (ENSMMDG00005004075) ENSMMDG00005004053 znf516 (ENSMMDG00005004049) tshz1 (ENSMMDG00005004041) CSMD3 (ENSMMDG00005003424) trps1 (ENSMMDG00005003403) Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.a.d ##22 Coelacanth MODERN SPECIES 1675 ENSLACG00000010467 ##22 ADAM17 (ENSLACG00000009394) IAH1 (ENSLACG00000022480) CPSF3 (ENSLACG00000008308) ITGB1BP1 (ENSLACG00000008015) ASAP2 (ENSLACG00000006201) E2F6 (ENSLACG00000003098) Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.a.d ##22 Amniota ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.a.d ##22 Mammalia ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.a.d ##22 Theria ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.a.d ##22 Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.a.d ##22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.a.d ##22 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.a.d ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.a.d ##22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.a.d ##22 Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.a.d ##22 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.a.d ##22 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.a.d ##22 Ursidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.a.d ##22 Giant Panda MODERN SPECIES 1743 ENSAMEG00000028208 ##22 Canidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.a.d ##22 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.a.d ##22 Dog MODERN SPECIES 11 ENSCAFG00845003317 ENSCAFG00845003242 CCDC7 (ENSCAFG00845003160) ENSCAFG00845003110 ITGB1 (ENSCAFG00845002947) NRP1 (ENSCAFG00845002787) ENSCAFG00845002703 PARD3 (ENSCAFG00845002370) CUL2 (ENSCAFG00845002080) CREM (ENSCAFG00845001664) ENSCAFG00845001537 ENSCAFG00845001523 CCNY (ENSCAFG00845001450) GJD4 (ENSCAFG00845001376) FZD8 (ENSCAFG00845001355) ENSCAFG00845001346 ##22 ENSCAFG00845001333 ENSCAFG00845001305 ENSCAFG00845001295 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.a.d ##22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.a.d ##22 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.a.d ##22 Cetacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.a.d ##22 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.a.d ##22 Sperm whale MODERN SPECIES ENSPCTG00005000025 ENSPCTG00005000026 ENSPCTG00005000027 ENSPCTG00005000028 ENSPCTG00005000029 ENSPCTG00005000030 ENSPCTG00005000031 ENSPCTG00005000032 ENSPCTG00005000033 ENSPCTG00005000034 ENSPCTG00005000035 ENSPCTG00005000036 ENSPCTG00005000037 ENSPCTG00005000038 ENSPCTG00005000039 ENSPCTG00005000040 ##22 ENSPCTG00005000041 ENSPCTG00005000042 ENSPCTG00005000043 ENSPCTG00005000044 ENSPCTG00005000045 ENSPCTG00005000046 ENSPCTG00005000047 ENSPCTG00005000048 ENSPCTG00005000049 ENSPCTG00005000050 STRIT1 (ENSPCTG00005000051) MME (ENSPCTG00005000052) ENSPCTG00005000053 GPR149 (ENSPCTG00005000054) DHX36 (ENSPCTG00005000055) Blue whale MODERN SPECIES 15 MINDY4B (ENSBMSG00010001173) CLRN1 (ENSBMSG00010001209) MED12L (ENSBMSG00010001333) GPR171 (ENSBMSG00010001712) P2RY14 (ENSBMSG00010001724) GPR87 (ENSBMSG00010001735) P2RY13 (ENSBMSG00010001751) P2RY12 (ENSBMSG00010001766) IGSF10 (ENSBMSG00010001778) SUCNR1 (ENSBMSG00010001801) ENSBMSG00010001822 MBNL1 (ENSBMSG00010001872) ENSBMSG00010002061 P2RY1 (ENSBMSG00010002069) RAP2B (ENSBMSG00010002082) ENSBMSG00010002101 ##22 ARHGEF26 (ENSBMSG00010002131) DHX36 (ENSBMSG00010002188) GPR149 (ENSBMSG00010002240) ENSBMSG00010002266 ENSBMSG00010002280 MME (ENSBMSG00010002306) STRIT1 (ENSBMSG00010002387) PLCH1 (ENSBMSG00010002496) ENSBMSG00010003115 C3orf33 (ENSBMSG00010003125) SLC33A1 (ENSBMSG00010003142) GMPS (ENSBMSG00010003175) ENSBMSG00010003213 ENSBMSG00010003257 KCNAB1 (ENSBMSG00010003309) Cyclostomata ANCESTRAL SPECIES 498 ENSGT00390000016559 ENSGT01090000260061.c.a.d ##22 Lamprey DUPLICATION Lamprey MODERN SPECIES 4094 ywhag1 (ENSPMAG00000009989) ##22 Lamprey MODERN SPECIES 586 ENSPMAG00000005263 ENSPMAG00000005289 ENSPMAG00000005294 DEPDC5 (ENSPMAG00000005297) ENSPMAG00000005339 ##22 ENSPMAG00000005353 slc5a1 (ENSPMAG00000005357) Hagfish DUPLICATION Hagfish MODERN SPECIES 277 ugp2a (ENSEBUG00000003810) gng2 (ENSEBUG00000007886) ENSEBUG00000003618 ENSEBUG00000012184 ero1b (ENSEBUG00000003191) ENSEBUG00000015397 eif4a3 (ENSEBUG00000003713) ENSEBUG00000011972 ENSEBUG00000007341 bhlhe22 (ENSEBUG00000008856) ENSEBUG00000016048 ENSEBUG00000007955 hpca (ENSEBUG00000005350) ENSEBUG00000008268 ##22 ENSEBUG00000003621 ENSEBUG00000001170 ENSEBUG00000003908 rxraa (ENSEBUG00000004555) alad (ENSEBUG00000011332) ENSEBUG00000005241 ENSEBUG00000004740 ENSEBUG00000005499 ENSEBUG00000011971 ENSEBUG00000003826 ENSEBUG00000001383 ENSEBUG00000016540 ENSEBUG00000016483 ENSEBUG00000005665 ENSEBUG00000011451 Hagfish MODERN SPECIES 397 ENSEBUG00000009092 ENSEBUG00000004513 ENSEBUG00000015650 ##22 ENSEBUG00000011898 Hagfish MODERN SPECIES 753 ENSEBUG00000014898 ENSEBUG00000002017 slc6a4b (ENSEBUG00000006154) ENSEBUG00000015292 ENSEBUG00000002813 ENSEBUG00000005145 ENSEBUG00000007033 cops4 (ENSEBUG00000015315) ENSEBUG00000014502 ENSEBUG00000012116 DEPDC5 (ENSEBUG00000006279) ENSEBUG00000016726 ##22 Ecdysozoa ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.c.a ##22 Fruitfly MODERN SPECIES 19 CG12321 (FBgn0038577) MED17 (FBgn0038578) CG14313 (FBgn0038579) Ssdp (FBgn0011481) CG7985 (FBgn0028499) CG44158 (FBgn0265041) CG14314 (FBgn0038581) CG7183 (FBgn0038583) CG7988 (FBgn0038582) mTerf5 (FBgn0038584) Non3 (FBgn0038585) CG7168 (FBgn0038586) Mdh2 (FBgn0262559) repo (FBgn0011701) CG7156 (FBgn0038588) 14-3-3epsilon (FBgn0020238) ##22 CG12320 (FBgn0038590) CG18598 (FBgn0038589) Ada2a (FBgn0263738) Polr2D (FBgn0263757) moi (FBgn0261019) Tgs1 (FBgn0266195) CG18599 (FBgn0038592) Vps39 (FBgn0038593) eIF1A (FBgn0026250) CG7142 (FBgn0038595) CG14312 (FBgn0038596) CG8064 (FBgn0038597) CG7131 (FBgn0038598) l(3)05822 (FBgn0010877) Dlc90F (FBgn0024432) Bilateria ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.d ##22 Chordata ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.d ##22 Ciona ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.d ##22 Ciona intestinalis DUPLICATION Ciona intestinalis MODERN SPECIES 7 ENSCING00000016102 ENSCING00000008620 ENSCING00000008618 ENSCING00000021124 ENSCING00000020336 ENSCING00000023670 ENSCING00000008616 ENSCING00000008615 ENSCING00000023856 ##22 ENSCING00000008609 ##22 ENSCING00000018614 ENSCING00000018421 ENSCING00000008608 thbsbi (ENSCING00000008607) ENSCING00000018759 ENSCING00000023663 ENSCING00000024173 ENSCING00000015272 ENSCING00000008605 ENSCING00000018578 ENSCING00000008604 ENSCING00000020687 ENSCING00000008603 ENSCING00000018754 Ciona intestinalis MODERN SPECIES 7 ENSCING00000016102 ENSCING00000008620 ENSCING00000008618 ENSCING00000021124 ENSCING00000020336 ENSCING00000023670 ENSCING00000008616 ENSCING00000008615 ENSCING00000023856 ##22 ENSCING00000008609 ##22 ENSCING00000018614 ENSCING00000018421 ENSCING00000008608 thbsbi (ENSCING00000008607) ENSCING00000018759 ENSCING00000023663 ENSCING00000024173 ENSCING00000015272 ENSCING00000008605 ENSCING00000018578 ENSCING00000008604 ENSCING00000020687 ENSCING00000008603 ENSCING00000018754 ENSCING00000015264 Ciona savignyi MODERN SPECIES 2 ENSCSAVG00000011707 ENSCSAVG00000011708 ENSCSAVG00000011710 ENSCSAVG00000011711 ENSCSAVG00000011712 ENSCSAVG00000011713 ENSCSAVG00000011714 ENSCSAVG00000011715 ENSCSAVG00000011716 ENSCSAVG00000011717 ENSCSAVG00000011718 ENSCSAVG00000011719 ENSCSAVG00000011720 ENSCSAVG00000011721 ENSCSAVG00000011722 ENSCSAVG00000011723 ##22 ENSCSAVG00000011724 ##22 ENSCSAVG00000011725 ENSCSAVG00000011726 ENSCSAVG00000011727 ENSCSAVG00000011728 ENSCSAVG00000011729 ENSCSAVG00000011730 ENSCSAVG00000011731 ENSCSAVG00000011732 ENSCSAVG00000011733 ENSCSAVG00000011734 ENSCSAVG00000011735 ENSCSAVG00000011736 ENSCSAVG00000011737 ENSCSAVG00000011738 Vertebrata ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.d ##22 Cyclostomata ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.d ##22 Hagfish MODERN SPECIES 632 ENSEBUG00000006414 ENSEBUG00000014428 ENSEBUG00000013367 ENSEBUG00000007288 ##22 ENSEBUG00000011503 ENSEBUG00000004195 ENSEBUG00000012608 ENSEBUG00000014093 ENSEBUG00000014807 Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.d ##22 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.d ##22 Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.d ##22 Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.d ##22 Amniota ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.d ##22 Mammalia ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.d ##22 Theria ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.d ##22 Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.d ##22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.d ##22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.d ##22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.d ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.d ##22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.d ##22 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.d ##22 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.d ##22 Marmotini ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260061.d ##22 Alpin marmot MODERN SPECIES 283 ENSMMMG00000008006 ENSMMMG00000008019 ##22 Yeast DUPLICATION Yeast MODERN SPECIES 3 TVP23 (YDR084C) AFR1 (YDR085C) SSS1 (YDR086C) RRP1 (YDR087C) SLU7 (YDR088C) VTC5 (YDR089W) YDR090C RLI1 (YDR091C) UBC13 (YDR092W) DNF2 (YDR093W) YDR094W YDR095C GIS1 (YDR096W) MSH6 (YDR097C) GRX3 (YDR098C) BMH2 (YDR099W) #22 TVP15 (YDR100W) ARX1 (YDR101C) YDR102C STE5 (YDR103W) SPO71 (YDR104C) TMS1 (YDR105C) ARP10 (YDR106W) TMN2 (YDR107C) TRS85 (YDR108W) YDR109C FOB1 (YDR110W) ALT2 (YDR111C) IRC2 (YDR112W) PDS1 (YDR113C) YDR114C Yeast MODERN SPECIES 6 PAB1 (YER165W) YER165C-A DNF1 (YER166W) BCK2 (YER167W) CCA1 (YER168C) RPH1 (YER169W) ADK2 (YER170W) RAD3 (YER171W) BRR2 (YER172C) YER172C-A RAD24 (YER173W) GRX4 (YER174C) TMT1 (YER175C) YER175W-A ECM32 (YER176W) BMH1 (YER177W) #22 PDA1 (YER178W) DMC1 (YER179W) ISC10 (YER180C) SLO1 (YER180C-A) YER181C FMP10 (YER182W) FAU1 (YER183C) TOG1 (YER184C) PUG1 (YER185W) YER186C YER187W YER188W YER188C-A YER189W YRF1-2 (YER190W)