Amniota ANCESTRAL SPECIES 39 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00940000164972 ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00940000153981.B ENSGT00940000160262 ENSGT00940000161202.b ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 Mammalia ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000155018 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 Theria ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00940000159550 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000159550 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000168628 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00390000012030.a ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000168628 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00390000012030.a ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000168628 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00390000012030.a ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000168628 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00390000012030.a ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00390000012030.a ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000168963 #25 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 Pika MODERN SPECIES 1179 THRAP3 (ENSOPRG00000001637) #22 ENSOPRG00000018323 #23 ENSOPRG00000001654 #24 ENSOPRG00000001677 #25 STK40 (ENSOPRG00000001683) #26 LSM10 (ENSOPRG00000001699) #27 OSCP1 (ENSOPRG00000001704) #28 MRPS15 (ENSOPRG00000001726) #29 CSF3R (ENSOPRG00000001738) #30 Rabbit MODERN SPECIES 437 TFAP2E (ENSOCUG00000013190) PSMB2 (ENSOCUG00000013198) C1orf216 (ENSOCUG00000009123) CLSPN (ENSOCUG00000017387) AGO4 (ENSOCUG00000004076) ENSOCUG00000008679 AGO1 (ENSOCUG00000023116) AGO3 (ENSOCUG00000006255) ENSOCUG00000035817 ENSOCUG00000027798 TEKT2 (ENSOCUG00000029722) ADPRS (ENSOCUG00000011038) COL8A2 (ENSOCUG00000011042) TRAPPC3 (ENSOCUG00000011044) MAP7D1 (ENSOCUG00000001551) THRAP3 (ENSOCUG00000005323) #22 ENSOCUG00000003260 #24 ENSOCUG00000002287 STK40 (ENSOCUG00000005325) #26 OSCP1 (ENSOCUG00000005337) #28 MRPS15 (ENSOCUG00000005675) #29 CSF3R (ENSOCUG00000011231) #30 GRIK3 (ENSOCUG00000005581) ZC3H12A (ENSOCUG00000010856) MEAF6 (ENSOCUG00000010862) SNIP1 (ENSOCUG00000010867) DNALI1 (ENSOCUG00000010871) GNL2 (ENSOCUG00000010877) ENSOCUG00000010888 ENSOCUG00000021550 CDCA8 (ENSOCUG00000017043) Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157613 ENSGT00940000168628 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157613 ENSGT00940000168628 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 Kangaroo rat MODERN SPECIES 499 Zmym4 (ENSDORG00000010296) ENSDORG00000028012 ENSDORG00000029801 Ncdn (ENSDORG00000004799) Tfap2e (ENSDORG00000004800) Psmb2 (ENSDORG00000027956) 5730409E04Rik (ENSDORG00000027526) Clspn (ENSDORG00000011179) Ago4 (ENSDORG00000008933) Ago1 (ENSDORG00000008494) Ago3 (ENSDORG00000009414) Tekt2 (ENSDORG00000001077) Adprs (ENSDORG00000001078) Col8a2 (ENSDORG00000025675) Trappc3 (ENSDORG00000030245) Thrap3 (ENSDORG00000013216) #22 Eva1b (ENSDORG00000027599) Stk40 (ENSDORG00000008423) #26 Lsm10 (ENSDORG00000007579) #27 Oscp1 (ENSDORG00000007580) #28 ENSDORG00000007581 #29 Csf3r (ENSDORG00000007582) #30 Grik3 (ENSDORG00000012002) Myomorpha ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000157613 ENSGT00940000168628 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 117 Zmym4 (ENSJJAG00000011913) AU040320 (ENSJJAG00000023709) Ncdn (ENSJJAG00000012057) Tfap2e (ENSJJAG00000023486) ENSJJAG00000015159 5730409E04Rik (ENSJJAG00000009869) Clspn (ENSJJAG00000023223) ENSJJAG00000003401 Ago1 (ENSJJAG00000019449) Ago3 (ENSJJAG00000017436) Tekt2 (ENSJJAG00000012392) Adprs (ENSJJAG00000001557) Col8a2 (ENSJJAG00000010113) Trappc3 (ENSJJAG00000021017) Map7d1 (ENSJJAG00000018805) ENSJJAG00000024064 #22 ENSJJAG00000013087 #24 Eva1b (ENSJJAG00000000205) Stk40 (ENSJJAG00000013773) #26 Oscp1 (ENSJJAG00000023834) #28 Mrps15 (ENSJJAG00000022198) #29 Csf3r (ENSJJAG00000017669) #30 Grik3 (ENSJJAG00000017762) Zc3h12a (ENSJJAG00000004252) ENSJJAG00000013630 ENSJJAG00000000604 Snip1 (ENSJJAG00000023710) Dnali1 (ENSJJAG00000002274) Gnl2 (ENSJJAG00000010798) Rspo1 (ENSJJAG00000001617) Cdca8 (ENSJJAG00000020145) Muroidea ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000157613 ENSGT00940000168628 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000157613 ENSGT00940000168628 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 Murinae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000159550 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 Rat MODERN SPECIES 15 Zmym4 (ENSRNOG00000012397) LOC100294508 (ENSRNOG00000012204) Ncdn (ENSRNOG00000011751) Tfap2e (ENSRNOG00000027595) Psmb2 (ENSRNOG00000011463) RGD1563072 (ENSRNOG00000021609) Clspn (ENSRNOG00000011332) Ago4 (ENSRNOG00000025596) Ago1 (ENSRNOG00000055915) Ago3 (ENSRNOG00000034269) Tekt2 (ENSRNOG00000011033) Adprs (ENSRNOG00000010849) Col8a2 (ENSRNOG00000010841) Trappc3 (ENSRNOG00000010550) Map7d1 (ENSRNOG00000010237) Thrap3 (ENSRNOG00000009977) #22 Sh3d21 (ENSRNOG00000024566) #24 Eva1b (ENSRNOG00000024818) Stk40 (ENSRNOG00000025679) #26 Lsm10 (ENSRNOG00000068296) #27 Oscp1 (ENSRNOG00000026978) #28 Mrps15 (ENSRNOG00000008279) #29 Csf3r (ENSRNOG00000008759) #30 ENSRNOG00000063670 Grik3 (ENSRNOG00000008992) Zc3h12a (ENSRNOG00000009131) Meaf6 (ENSRNOG00000009309) Snip1 (ENSRNOG00000024889) Dnali1 (ENSRNOG00000024957) Gnl2 (ENSRNOG00000009430) Rspo1 (ENSRNOG00000009656) Mus ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000159550 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 Shrew mouse MODERN SPECIES 19 Zmym4 (MGP_PahariEiJ_G0028817) AU040320 (MGP_PahariEiJ_G0028816) Ncdn (MGP_PahariEiJ_G0028815) Tfap2e (MGP_PahariEiJ_G0028814) Psmb2 (MGP_PahariEiJ_G0028813) 5730409E04Rik (MGP_PahariEiJ_G0028812) Clspn (MGP_PahariEiJ_G0028811) Ago4 (MGP_PahariEiJ_G0028810) Ago1 (MGP_PahariEiJ_G0028809) Ago3 (MGP_PahariEiJ_G0028808) Tekt2 (MGP_PahariEiJ_G0028807) Adprs (MGP_PahariEiJ_G0028806) Col8a2 (MGP_PahariEiJ_G0028805) Trappc3 (MGP_PahariEiJ_G0028804) Map7d1 (MGP_PahariEiJ_G0028803) MGP_PahariEiJ_G0028802 #22 MGP_PahariEiJ_G0028801 #24 Eva1b (MGP_PahariEiJ_G0028800) Stk40 (MGP_PahariEiJ_G0028799) #26 Lsm10 (MGP_PahariEiJ_G0028798) #27 Oscp1 (MGP_PahariEiJ_G0028797) #28 Mrps15 (MGP_PahariEiJ_G0028796) #29 Csf3r (MGP_PahariEiJ_G0028795) #30 Grik3 (MGP_PahariEiJ_G0028794) Zc3h12a (MGP_PahariEiJ_G0028793) Meaf6 (MGP_PahariEiJ_G0028792) Snip1 (MGP_PahariEiJ_G0028791) Dnali1 (MGP_PahariEiJ_G0028790) Gnl2 (MGP_PahariEiJ_G0028789) Rspo1 (MGP_PahariEiJ_G0028788) MGP_PahariEiJ_G0028787 Mus_A DUPLICATION Mus_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183163.a.a.e #22 Mus_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183163.a.a.e #22 Mus_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183163.a.a.e #22 Steppe mouse MODERN SPECIES 2249 ENSMSIG00000009627 #22 ENSMSIG00000009559 Mus_A ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000159550 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a.f #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 Mus_B ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000159550 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a.f #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 Mouse MODERN SPECIES 13 Zmym4 (ENSMUSG00000042446) AU040320 (ENSMUSG00000028830) Ncdn (ENSMUSG00000028833) Tfap2e (ENSMUSG00000042477) Psmb2 (ENSMUSG00000028837) 5730409E04Rik (ENSMUSG00000073755) Clspn (ENSMUSG00000042489) Ago4 (ENSMUSG00000042500) Ago1 (ENSMUSG00000041530) Ago3 (ENSMUSG00000028842) Tekt2 (ENSMUSG00000028845) Adprs (ENSMUSG00000042558) Col8a2 (ENSMUSG00000056174) Trappc3 (ENSMUSG00000028847) Map7d1 (ENSMUSG00000028849) Thrap3 (ENSMUSG00000043962) #22 Sh3d21 (ENSMUSG00000073758) #24 Eva1b (ENSMUSG00000050212) Stk40 (ENSMUSG00000042608) #26 Lsm10 (ENSMUSG00000050188) #27 Oscp1 (ENSMUSG00000042616) #28 Mrps15 (ENSMUSG00000028861) #29 Csf3r (ENSMUSG00000028859) #30 Grik3 (ENSMUSG00000001985) Zc3h12a (ENSMUSG00000042677) Meaf6 (ENSMUSG00000028863) Snip1 (ENSMUSG00000050213) Dnali1 (ENSMUSG00000042707) Gnl2 (ENSMUSG00000028869) Rspo1 (ENSMUSG00000028871) 9930104L06Rik (ENSMUSG00000044730) Mus_C ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000159550 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a.f #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 spretus MODERN SPECIES 13 Zmym4 (MGP_SPRETEiJ_G0027465) AU040320 (MGP_SPRETEiJ_G0027464) Ncdn (MGP_SPRETEiJ_G0027463) Tfap2e (MGP_SPRETEiJ_G0027462) Psmb2 (MGP_SPRETEiJ_G0027461) 5730409E04Rik (MGP_SPRETEiJ_G0027460) Clspn (MGP_SPRETEiJ_G0027459) Ago4 (MGP_SPRETEiJ_G0027458) Ago1 (MGP_SPRETEiJ_G0027457) Ago3 (MGP_SPRETEiJ_G0027456) Tekt2 (MGP_SPRETEiJ_G0027455) Adprs (MGP_SPRETEiJ_G0027454) Col8a2 (MGP_SPRETEiJ_G0027453) Trappc3 (MGP_SPRETEiJ_G0027452) Map7d1 (MGP_SPRETEiJ_G0027451) Thrap3 (MGP_SPRETEiJ_G0027450) #22 Sh3d21 (MGP_SPRETEiJ_G0027449) #24 Eva1b (MGP_SPRETEiJ_G0027448) Stk40 (MGP_SPRETEiJ_G0027447) #26 Lsm10 (MGP_SPRETEiJ_G0027446) #27 Oscp1 (MGP_SPRETEiJ_G0027445) #28 Mrps15 (MGP_SPRETEiJ_G0027444) #29 Csf3r (MGP_SPRETEiJ_G0027443) #30 Grik3 (MGP_SPRETEiJ_G0027442) Zc3h12a (MGP_SPRETEiJ_G0027441) Meaf6 (MGP_SPRETEiJ_G0027440) Snip1 (MGP_SPRETEiJ_G0027439) Dnali1 (MGP_SPRETEiJ_G0027438) Gnl2 (MGP_SPRETEiJ_G0027437) Rspo1 (MGP_SPRETEiJ_G0027436) Cdca8 (MGP_SPRETEiJ_G0027435) Steppe mouse MODERN SPECIES 3362 Ncdn (ENSMSIG00000016728) Tfap2e (ENSMSIG00000016711) Psmb2 (ENSMSIG00000016704) ENSMSIG00000016700 5730409E04Rik (ENSMSIG00000016696) ENSMSIG00000016695 Clspn (ENSMSIG00000016630) Ago4 (ENSMSIG00000016601) Ago1 (ENSMSIG00000016559) Ago3 (ENSMSIG00000016468) Tekt2 (ENSMSIG00000016431) Adprs (ENSMSIG00000016412) Col8a2 (ENSMSIG00000016393) Trappc3 (ENSMSIG00000016379) Map7d1 (ENSMSIG00000016217) Thrap3 (ENSMSIG00000016164) #22 Sh3d21 (ENSMSIG00000016082) #24 Eva1b (ENSMSIG00000016045) Stk40 (ENSMSIG00000016008) #26 Lsm10 (ENSMSIG00000016001) #27 Oscp1 (ENSMSIG00000015894) #28 Mrps15 (ENSMSIG00000015874) #29 Csf3r (ENSMSIG00000015810) #30 Grik3 (ENSMSIG00000015725) Zc3h12a (ENSMSIG00000015699) Meaf6 (ENSMSIG00000015611) Snip1 (ENSMSIG00000015594) ENSMSIG00000015561 Gnl2 (ENSMSIG00000015516) Rspo1 (ENSMSIG00000015498) 9930104L06Rik (ENSMSIG00000015482) Ryukyu mouse MODERN SPECIES 13 Zmym4 (MGP_CAROLIEiJ_G0026486) AU040320 (MGP_CAROLIEiJ_G0026485) Ncdn (MGP_CAROLIEiJ_G0026484) Tfap2e (MGP_CAROLIEiJ_G0026483) Psmb2 (MGP_CAROLIEiJ_G0026482) 5730409E04Rik (MGP_CAROLIEiJ_G0026481) MGP_CAROLIEiJ_G0026480 Ago4 (MGP_CAROLIEiJ_G0026479) Ago1 (MGP_CAROLIEiJ_G0026478) Ago3 (MGP_CAROLIEiJ_G0026477) Tekt2 (MGP_CAROLIEiJ_G0026476) Adprs (MGP_CAROLIEiJ_G0026475) Col8a2 (MGP_CAROLIEiJ_G0026474) Trappc3 (MGP_CAROLIEiJ_G0026473) Map7d1 (MGP_CAROLIEiJ_G0026472) MGP_CAROLIEiJ_G0026471 #22 Sh3d21 (MGP_CAROLIEiJ_G0026470) #24 Eva1b (MGP_CAROLIEiJ_G0026469) Stk40 (MGP_CAROLIEiJ_G0026468) #26 Lsm10 (MGP_CAROLIEiJ_G0026467) #27 Oscp1 (MGP_CAROLIEiJ_G0026466) #28 Mrps15 (MGP_CAROLIEiJ_G0026465) #29 Csf3r (MGP_CAROLIEiJ_G0026464) #30 Grik3 (MGP_CAROLIEiJ_G0026463) Zc3h12a (MGP_CAROLIEiJ_G0026462) Meaf6 (MGP_CAROLIEiJ_G0026461) Snip1 (MGP_CAROLIEiJ_G0026460) Dnali1 (MGP_CAROLIEiJ_G0026459) Gnl2 (MGP_CAROLIEiJ_G0026458) Rspo1 (MGP_CAROLIEiJ_G0026457) Cdca8 (MGP_CAROLIEiJ_G0026456) Cricetidae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000157613 ENSGT00940000168628 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000159550 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b.e #26 ENSGT00950000182986.b.f #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 Golden Hamster MODERN SPECIES 783 5730409E04Rik (ENSMAUG00000019105) Clspn (ENSMAUG00000016563) Ago4 (ENSMAUG00000021743) Ago1 (ENSMAUG00000015189) Ago3 (ENSMAUG00000010128) Tekt2 (ENSMAUG00000011830) Adprs (ENSMAUG00000017195) Col8a2 (ENSMAUG00000000665) Trappc3 (ENSMAUG00000019950) ENSMAUG00000016543 Thrap3 (ENSMAUG00000019723) #22 Sh3d21 (ENSMAUG00000014506) #24 Eva1b (ENSMAUG00000010494) Stk40 (ENSMAUG00000014659) #26 Oscp1 (ENSMAUG00000004945) #28 Mrps15 (ENSMAUG00000021202) #29 Csf3r (ENSMAUG00000001404) #30 Grik3 (ENSMAUG00000018300) Zc3h12a (ENSMAUG00000012893) Meaf6 (ENSMAUG00000009391) Snip1 (ENSMAUG00000015995) Dnali1 (ENSMAUG00000008689) Gnl2 (ENSMAUG00000018529) Rspo1 (ENSMAUG00000017138) 9930104L06Rik (ENSMAUG00000001306) Cdca8 (ENSMAUG00000001752) Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 111 Ncdn (ENSCGRG00001016309) Tfap2e (ENSCGRG00001004504) Psmb2 (ENSCGRG00001009469) ENSCGRG00001003912 5730409E04Rik (ENSCGRG00001001609) Clspn (ENSCGRG00001014483) Ago4 (ENSCGRG00001002701) Ago1 (ENSCGRG00001022708) Ago3 (ENSCGRG00001024614) Tekt2 (ENSCGRG00001021518) Adprs (ENSCGRG00001023363) Col8a2 (ENSCGRG00001019144) ENSCGRG00001020476 Trappc3 (ENSCGRG00001020776) Map7d1 (ENSCGRG00001022850) Thrap3 (ENSCGRG00001003105) #22 Sh3d21 (ENSCGRG00001013521) #24 Eva1b (ENSCGRG00001016486) ENSCGRG00001000587 #26 ENSCGRG00001004317 #27 Oscp1 (ENSCGRG00001012967) #28 Mrps15 (ENSCGRG00001019050) #29 Csf3r (ENSCGRG00001021810) #30 Grik3 (ENSCGRG00001012192) Zc3h12a (ENSCGRG00001015497) Meaf6 (ENSCGRG00001006760) Snip1 (ENSCGRG00001010414) Dnali1 (ENSCGRG00001012511) Gnl2 (ENSCGRG00001016733) Rspo1 (ENSCGRG00001017490) 9930104L06Rik (ENSCGRG00001024913) Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000157613 ENSGT00940000168628 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 Northern American deer mouse DUPLICATION Northern American deer mouse MODERN SPECIES 11 Zmym4 (ENSPEMG00000022163) AU040320 (ENSPEMG00000004246) Ncdn (ENSPEMG00000013918) Tfap2e (ENSPEMG00000023893) Psmb2 (ENSPEMG00000001295) 5730409E04Rik (ENSPEMG00000029022) Clspn (ENSPEMG00000024140) ENSPEMG00000022651 Ago1 (ENSPEMG00000023313) Ago3 (ENSPEMG00000024271) Tekt2 (ENSPEMG00000007126) Adprs (ENSPEMG00000015344) Col8a2 (ENSPEMG00000030728) Trappc3 (ENSPEMG00000017774) Map7d1 (ENSPEMG00000018714) Thrap3 (ENSPEMG00000023512) #22 Sh3d21 (ENSPEMG00000022518) #24 Eva1b (ENSPEMG00000017056) Stk40 (ENSPEMG00000010968) #26 Lsm10 (ENSPEMG00000029690) #27 Oscp1 (ENSPEMG00000021248) #28 Mrps15 (ENSPEMG00000022897) #29 Csf3r (ENSPEMG00000021902) #30 Grik3 (ENSPEMG00000020816) Zc3h12a (ENSPEMG00000024080) Meaf6 (ENSPEMG00000023877) Snip1 (ENSPEMG00000021090) Dnali1 (ENSPEMG00000020987) Gnl2 (ENSPEMG00000021234) Rspo1 (ENSPEMG00000021279) 9930104L06Rik (ENSPEMG00000022126) Northern American deer mouse MODERN SPECIES 20 Tmed3 (ENSPEMG00000019885) Ankrd34c (ENSPEMG00000020141) Rasgrf1 (ENSPEMG00000019313) Ctsh (ENSPEMG00000019736) Morf4l1 (ENSPEMG00000019429) Adamts7 (ENSPEMG00000017976) Tbc1d2b (ENSPEMG00000000960) Zic1 (ENSPEMG00000019412) Zic4 (ENSPEMG00000026607) Plscr5 (ENSPEMG00000019462) Plscr1 (ENSPEMG00000019486) Plscr2 (ENSPEMG00000019567) 1700057G04Rik (ENSPEMG00000019593) Plscr4 (ENSPEMG00000019619) Plod2 (ENSPEMG00000023460) ENSPEMG00000019304 #22 Dipk2a (ENSPEMG00000019631) Slc9a9 (ENSPEMG00000019907) Chst2 (ENSPEMG00000019658) U2surp (ENSPEMG00000020825) Paqr9 (ENSPEMG00000021256) Pcolce2 (ENSPEMG00000021235) Trpc1 (ENSPEMG00000021151) Pls1 (ENSPEMG00000023583) Atr (ENSPEMG00000022407) Xrn1 (ENSPEMG00000020610) ENSPEMG00000028629 Gk5 (ENSPEMG00000021213) Tfdp2 (ENSPEMG00000020459) ENSPEMG00000025894 ENSPEMG00000020541 Prairie vole DUPLICATION Prairie vole MODERN SPECIES ENSMOCG00000022665 Sp4 (ENSMOCG00000016482) Dnah11 (ENSMOCG00000015979) Cdca7l (ENSMOCG00000017529) Rapgef5 (ENSMOCG00000008682) ENSMOCG00000001797 Ptprn2 (ENSMOCG00000015064) Ncapg2 (ENSMOCG00000022899) Esyt2 (ENSMOCG00000000676) Dync2i1 (ENSMOCG00000017481) Vipr2 (ENSMOCG00000018122) ENSMOCG00000016119 ENSMOCG00000008994 ENSMOCG00000002030 ENSMOCG00000016167 ENSMOCG00000006712 #22 Ighm (ENSMOCG00000021689) ENSMOCG00000020403 Tmem121 (ENSMOCG00000008761) ENSMOCG00000009709 Tedc1 (ENSMOCG00000018454) ENSMOCG00000009725 ENSMOCG00000006199 Mta1 (ENSMOCG00000019316) Tex22 (ENSMOCG00000003772) Pacs2 (ENSMOCG00000002425) Btbd6 (ENSMOCG00000021298) Brf1 (ENSMOCG00000017813) Nudt14 (ENSMOCG00000005584) Jag2 (ENSMOCG00000022935) Gpr132 (ENSMOCG00000013396) Prairie vole DUPLICATION Prairie vole MODERN SPECIES 1 ENSMOCG00000003001 ENSMOCG00000010938 Ncdn (ENSMOCG00000002663) Tfap2e (ENSMOCG00000008257) ENSMOCG00000003664 5730409E04Rik (ENSMOCG00000007468) Clspn (ENSMOCG00000018907) Ago4 (ENSMOCG00000005772) Ago1 (ENSMOCG00000000537) Ago3 (ENSMOCG00000020568) Tekt2 (ENSMOCG00000017440) Adprs (ENSMOCG00000019508) Col8a2 (ENSMOCG00000012957) Trappc3 (ENSMOCG00000013847) Map7d1 (ENSMOCG00000019568) ENSMOCG00000005500 #22 ENSMOCG00000015795 Eva1b (ENSMOCG00000017606) Stk40 (ENSMOCG00000019033) #26 Lsm10 (ENSMOCG00000021943) #27 Oscp1 (ENSMOCG00000001484) #28 Mrps15 (ENSMOCG00000004474) #29 Csf3r (ENSMOCG00000015592) #30 Grik3 (ENSMOCG00000009075) ENSMOCG00000009417 Zc3h12a (ENSMOCG00000001899) Meaf6 (ENSMOCG00000019012) Snip1 (ENSMOCG00000008716) Dnali1 (ENSMOCG00000003328) Gnl2 (ENSMOCG00000016365) Rspo1 (ENSMOCG00000022465) Prairie vole MODERN SPECIES 83 Vamp8 (ENSMOCG00000004037) Ggcx (ENSMOCG00000017281) ENSMOCG00000011611 Sh2d6 (ENSMOCG00000015508) Capg (ENSMOCG00000005806) Elmod3 (ENSMOCG00000015870) ENSMOCG00000002524 ENSMOCG00000000675 Retsat (ENSMOCG00000021447) ENSMOCG00000000091 Tcf7l1 (ENSMOCG00000012953) Kcmf1 (ENSMOCG00000003279) ENSMOCG00000012602 Dnah6 (ENSMOCG00000002417) Suclg1 (ENSMOCG00000021421) ENSMOCG00000004435 #22 ENSMOCG00000016382 Lrrtm1 (ENSMOCG00000015921) ENSMOCG00000019395 Reg3b (ENSMOCG00000000127) Reg2 (ENSMOCG00000019434) Reg3g (ENSMOCG00000000838) ENSMOCG00000003469 ENSMOCG00000015470 Lrrtm4 (ENSMOCG00000008317) ENSMOCG00000000151 Gcfc2 (ENSMOCG00000017779) ENSMOCG00000018596 Eva1a (ENSMOCG00000012884) Tacr1 (ENSMOCG00000006018) Pole4 (ENSMOCG00000016768) Upper Galilee mountains blind mole rat DUPLICATION Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 775 ENSNGAG00000013255 ENSNGAG00000019339 Ncdn (ENSNGAG00000016923) Tfap2e (ENSNGAG00000020679) Psmb2 (ENSNGAG00000002741) 5730409E04Rik (ENSNGAG00000004304) Clspn (ENSNGAG00000017502) Ago4 (ENSNGAG00000020544) Ago1 (ENSNGAG00000017448) Ago3 (ENSNGAG00000012607) Tekt2 (ENSNGAG00000015353) Adprs (ENSNGAG00000015743) Col8a2 (ENSNGAG00000017271) Trappc3 (ENSNGAG00000017785) Map7d1 (ENSNGAG00000019773) Thrap3 (ENSNGAG00000010876) #22 Sh3d21 (ENSNGAG00000013731) #24 Eva1b (ENSNGAG00000021220) Stk40 (ENSNGAG00000021449) #26 Lsm10 (ENSNGAG00000015011) #27 Oscp1 (ENSNGAG00000015958) #28 Mrps15 (ENSNGAG00000018718) #29 Csf3r (ENSNGAG00000020143) #30 Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 928 ENSNGAG00000011241 Hecw2 (ENSNGAG00000013883) ENSNGAG00000000961 ENSNGAG00000022114 Slc39a10 (ENSNGAG00000011173) ENSNGAG00000016764 ENSNGAG00000021690 #22 Tmeff2 (ENSNGAG00000018754) Cavin2 (ENSNGAG00000023002) Nabp1 (ENSNGAG00000006505) ENSNGAG00000018958 Myo1b (ENSNGAG00000023056) Stat4 (ENSNGAG00000021305) Stat1 (ENSNGAG00000021916) Gls (ENSNGAG00000022784) Nab1 (ENSNGAG00000005980) Nemp2 (ENSNGAG00000021036) Mfsd6 (ENSNGAG00000017357) Inpp1 (ENSNGAG00000013999) Hibch (ENSNGAG00000014329) 1700019D03Rik (ENSNGAG00000010148) Mstn (ENSNGAG00000009589) Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000159550 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000159550 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256.f ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 Marmotini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000159550 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256.f ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000159550 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256.f ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 120 ZMYM4 (ENSUPAG00010000592) KIAA0319L (ENSUPAG00010000550) NCDN (ENSUPAG00010000503) TFAP2E (ENSUPAG00010000482) PSMB2 (ENSUPAG00010000458) C1orf216 (ENSUPAG00010000447) CLSPN (ENSUPAG00010000278) AGO4 (ENSUPAG00010000240) AGO1 (ENSUPAG00010000213) AGO3 (ENSUPAG00010000133) TEKT2 (ENSUPAG00010000079) ADPRS (ENSUPAG00010000029) COL8A2 (ENSUPAG00010017659) TRAPPC3 (ENSUPAG00010017653) MAP7D1 (ENSUPAG00010017568) THRAP3 (ENSUPAG00010017531) #22 SH3D21 (ENSUPAG00010017516) #24 EVA1B (ENSUPAG00010017508) STK40 (ENSUPAG00010017491) #26 ENSUPAG00010017484 #27 OSCP1 (ENSUPAG00010017454) #28 MRPS15 (ENSUPAG00010017437) #29 CSF3R (ENSUPAG00010017417) #30 GRIK3 (ENSUPAG00010017396) ZC3H12A (ENSUPAG00010017379) MEAF6 (ENSUPAG00010017344) SNIP1 (ENSUPAG00010017338) DNALI1 (ENSUPAG00010017332) ENSUPAG00010017290 RSPO1 (ENSUPAG00010017283) C1orf109 (ENSUPAG00010017276) Squirrel MODERN SPECIES 74 ENSSTOG00000022215 NCDN (ENSSTOG00000025477) TFAP2E (ENSSTOG00000001781) PSMB2 (ENSSTOG00000001795) ENSSTOG00000025789 C1orf216 (ENSSTOG00000000870) CLSPN (ENSSTOG00000021294) AGO4 (ENSSTOG00000004725) AGO1 (ENSSTOG00000010857) AGO3 (ENSSTOG00000025904) TEKT2 (ENSSTOG00000010245) ADPRS (ENSSTOG00000010251) COL8A2 (ENSSTOG00000023344) TRAPPC3 (ENSSTOG00000010270) MAP7D1 (ENSSTOG00000010274) THRAP3 (ENSSTOG00000000602) #22 EVA1B (ENSSTOG00000023164) STK40 (ENSSTOG00000027085) #26 LSM10 (ENSSTOG00000000606) #27 OSCP1 (ENSSTOG00000000607) #28 MRPS15 (ENSSTOG00000000608) #29 CSF3R (ENSSTOG00000000615) #30 GRIK3 (ENSSTOG00000010632) ZC3H12A (ENSSTOG00000026842) MEAF6 (ENSSTOG00000005166) SNIP1 (ENSSTOG00000025511) DNALI1 (ENSSTOG00000005196) GNL2 (ENSSTOG00000005217) RSPO1 (ENSSTOG00000005254) C1orf109 (ENSSTOG00000000834) CDCA8 (ENSSTOG00000000833) Alpin marmot MODERN SPECIES 15 ZMYM4 (ENSMMMG00000007967) KIAA0319L (ENSMMMG00000007937) NCDN (ENSMMMG00000007929) TFAP2E (ENSMMMG00000007915) PSMB2 (ENSMMMG00000007906) C1orf216 (ENSMMMG00000007900) CLSPN (ENSMMMG00000007847) AGO4 (ENSMMMG00000007806) AGO1 (ENSMMMG00000007780) AGO3 (ENSMMMG00000007745) TEKT2 (ENSMMMG00000007715) ADPRS (ENSMMMG00000007700) COL8A2 (ENSMMMG00000007686) TRAPPC3 (ENSMMMG00000007674) MAP7D1 (ENSMMMG00000006325) THRAP3 (ENSMMMG00000006271) #22 SH3D21 (ENSMMMG00000006222) #24 EVA1B (ENSMMMG00000006211) STK40 (ENSMMMG00000006181) #26 LSM10 (ENSMMMG00000006179) #27 ENSMMMG00000006174 #28 MRPS15 (ENSMMMG00000006160) #29 CSF3R (ENSMMMG00000006145) #30 ENSMMMG00000006132 GRIK3 (ENSMMMG00000006114) ZC3H12A (ENSMMMG00000006073) SNIP1 (ENSMMMG00000006068) DNALI1 (ENSMMMG00000006059) GNL2 (ENSMMMG00000006031) RSPO1 (ENSMMMG00000006021) C1orf109 (ENSMMMG00000006007) Eurasian red squirrel MODERN SPECIES ZMYM4 (ENSSVLG00005001206) KIAA0319L (ENSSVLG00005001304) NCDN (ENSSVLG00005001362) TFAP2E (ENSSVLG00005001387) PSMB2 (ENSSVLG00005001408) C1orf216 (ENSSVLG00005001422) CLSPN (ENSSVLG00005001487) AGO4 (ENSSVLG00005001696) AGO1 (ENSSVLG00005001765) AGO3 (ENSSVLG00005001834) TEKT2 (ENSSVLG00005001949) ADPRS (ENSSVLG00005001975) COL8A2 (ENSSVLG00005001986) TRAPPC3 (ENSSVLG00005002006) MAP7D1 (ENSSVLG00005002056) THRAP3 (ENSSVLG00005002113) #22 ENSSVLG00005002147 ENSSVLG00005002157 #24 EVA1B (ENSSVLG00005002184) STK40 (ENSSVLG00005002214) #26 LSM10 (ENSSVLG00005002235) #27 OSCP1 (ENSSVLG00005002261) #28 MRPS15 (ENSSVLG00005002313) #29 CSF3R (ENSSVLG00005002340) #30 GRIK3 (ENSSVLG00005002397) ZC3H12A (ENSSVLG00005002445) MEAF6 (ENSSVLG00005002483) SNIP1 (ENSSVLG00005002539) DNALI1 (ENSSVLG00005002552) GNL2 (ENSSVLG00005002574) RSPO1 (ENSSVLG00005002610) Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000159550 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 26 KIAA0319L (ENSHGLG00000010433) NCDN (ENSHGLG00000012088) TFAP2E (ENSHGLG00000035632) PSMB2 (ENSHGLG00000039477) C1orf216 (ENSHGLG00000013004) ENSHGLG00000039952 CLSPN (ENSHGLG00000013282) AGO4 (ENSHGLG00000010241) AGO1 (ENSHGLG00000011540) AGO3 (ENSHGLG00000012538) TEKT2 (ENSHGLG00000019203) ADPRS (ENSHGLG00000018720) ENSHGLG00000033231 ENSHGLG00000013854 MAP7D1 (ENSHGLG00000014101) THRAP3 (ENSHGLG00000019374) #22 ENSHGLG00000011928 ENSHGLG00000035766 STK40 (ENSHGLG00000010896) #26 ENSHGLG00000011625 #27 OSCP1 (ENSHGLG00000011822) #28 ENSHGLG00000047064 #29 ENSHGLG00000044262 CSF3R (ENSHGLG00000010743) #30 GRIK3 (ENSHGLG00000011776) ENSHGLG00000046483 ZC3H12A (ENSHGLG00000012808) MEAF6 (ENSHGLG00000013675) SNIP1 (ENSHGLG00000045104) DNALI1 (ENSHGLG00000012722) GNL2 (ENSHGLG00000013728) Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000159550 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 Guinea pig MODERN SPECIES 25 KIAA0319L (ENSCPOG00000008350) NCDN (ENSCPOG00000023962) TFAP2E (ENSCPOG00000024445) PSMB2 (ENSCPOG00000036531) C1orf216 (ENSCPOG00000031562) ENSCPOG00000011544 AGO4 (ENSCPOG00000011557) AGO1 (ENSCPOG00000011568) AGO3 (ENSCPOG00000030524) TEKT2 (ENSCPOG00000006152) ADPRS (ENSCPOG00000031369) COL8A2 (ENSCPOG00000039740) TRAPPC3 (ENSCPOG00000038851) MAP7D1 (ENSCPOG00000000559) ENSCPOG00000037255 THRAP3 (ENSCPOG00000015742) #22 EVA1B (ENSCPOG00000020754) STK40 (ENSCPOG00000027226) #26 LSM10 (ENSCPOG00000039302) #27 OSCP1 (ENSCPOG00000010874) #28 MRPS15 (ENSCPOG00000010877) #29 CSF3R (ENSCPOG00000010879) #30 GRIK3 (ENSCPOG00000025605) ZC3H12A (ENSCPOG00000011081) MEAF6 (ENSCPOG00000025988) SNIP1 (ENSCPOG00000011083) DNALI1 (ENSCPOG00000011086) GNL2 (ENSCPOG00000026804) RSPO1 (ENSCPOG00000038977) C1orf109 (ENSCPOG00000001227) CDCA8 (ENSCPOG00000001228) Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000159550 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 159 ZMYM4 (ENSCLAG00000009236) KIAA0319L (ENSCLAG00000012151) NCDN (ENSCLAG00000008627) TFAP2E (ENSCLAG00000014043) PSMB2 (ENSCLAG00000011404) C1orf216 (ENSCLAG00000014133) CLSPN (ENSCLAG00000009173) AGO4 (ENSCLAG00000012097) AGO1 (ENSCLAG00000011507) AGO3 (ENSCLAG00000013184) TEKT2 (ENSCLAG00000011534) ADPRS (ENSCLAG00000013083) COL8A2 (ENSCLAG00000007777) TRAPPC3 (ENSCLAG00000007951) MAP7D1 (ENSCLAG00000011145) THRAP3 (ENSCLAG00000013043) #22 ENSCLAG00000014941 #24 EVA1B (ENSCLAG00000012665) STK40 (ENSCLAG00000008274) #26 LSM10 (ENSCLAG00000008633) #27 OSCP1 (ENSCLAG00000008808) #28 MRPS15 (ENSCLAG00000015562) #29 CSF3R (ENSCLAG00000013775) #30 GRIK3 (ENSCLAG00000012617) ZC3H12A (ENSCLAG00000008722) MEAF6 (ENSCLAG00000011410) SNIP1 (ENSCLAG00000014140) DNALI1 (ENSCLAG00000014051) GNL2 (ENSCLAG00000012504) RSPO1 (ENSCLAG00000016364) C1orf109 (ENSCLAG00000008471) Degu DUPLICATION Degu MODERN SPECIES 171 TFAP2E (ENSODEG00000004925) PSMB2 (ENSODEG00000006435) ENSODEG00000019417 CLSPN (ENSODEG00000006133) AGO4 (ENSODEG00000006355) ENSODEG00000007754 AGO1 (ENSODEG00000005321) AGO3 (ENSODEG00000005161) ENSODEG00000019305 ENSODEG00000006322 TEKT2 (ENSODEG00000007150) ADPRS (ENSODEG00000006213) ENSODEG00000006340 ENSODEG00000007410 MAP7D1 (ENSODEG00000005198) ENSODEG00000006090 #22 SH3D21 (ENSODEG00000005155) #24 EVA1B (ENSODEG00000006459) STK40 (ENSODEG00000005380) #26 LSM10 (ENSODEG00000019161) #27 OSCP1 (ENSODEG00000005227) #28 MRPS15 (ENSODEG00000005390) #29 CSF3R (ENSODEG00000006285) #30 GRIK3 (ENSODEG00000005952) ENSODEG00000019238 ZC3H12A (ENSODEG00000005643) ENSODEG00000007741 SNIP1 (ENSODEG00000005648) DNALI1 (ENSODEG00000006719) ENSODEG00000005679 RSPO1 (ENSODEG00000005377) Degu MODERN SPECIES 137 FARSB (ENSODEG00000005451) ENSODEG00000019468 MOGAT1 (ENSODEG00000007108) ACSL3 (ENSODEG00000005596) ENSODEG00000005263 SCG2 (ENSODEG00000005187) ENSODEG00000005931 ENSODEG00000005677 ENSODEG00000005654 MRPL44 (ENSODEG00000006415) SERPINE2 (ENSODEG00000005496) FAM124B (ENSODEG00000005053) CUL3 (ENSODEG00000006176) CCDC195 (ENSODEG00000005812) DOCK10 (ENSODEG00000005671) ENSODEG00000006184 #22 NYAP2 (ENSODEG00000006251) IRS1 (ENSODEG00000006768) RHBDD1 (ENSODEG00000006375) COL4A4 (ENSODEG00000006651) ENSODEG00000006320 ENSODEG00000004929 TM4SF20 (ENSODEG00000004688) ENSODEG00000006150 ENSODEG00000005117 ENSODEG00000005883 SLC19A3 (ENSODEG00000005319) ENSODEG00000005323 DAW1 (ENSODEG00000006316) SPHKAP (ENSODEG00000005853) Degu MODERN SPECIES 50 RGS18 (ENSODEG00000013926) RGS21 (ENSODEG00000009295) RGS1 (ENSODEG00000009482) RGS13 (ENSODEG00000009567) RGS2 (ENSODEG00000010209) ENSODEG00000011024 RO60 (ENSODEG00000010468) GLRX2 (ENSODEG00000010878) CDC73 (ENSODEG00000010481) B3GALT2 (ENSODEG00000011536) ENSODEG00000011003 ENSODEG00000019692 ENSODEG00000019716 ENSODEG00000010768 #22 KCNT2 (ENSODEG00000009673) ENSODEG00000010026 ENSODEG00000010990 ZBTB41 (ENSODEG00000013022) ENSODEG00000011989 DENND1B (ENSODEG00000010445) C1orf53 (ENSODEG00000010198) LHX9 (ENSODEG00000010844) NEK7 (ENSODEG00000011591) ENSODEG00000012489 ENSODEG00000019948 ATP6V1G3 (ENSODEG00000011992) PTPRC (ENSODEG00000009940) ENSODEG00000010173 ENSODEG00000010467 Tree shrew MODERN SPECIES 1734 THRAP3 (ENSTBEG00000016264) #22 ENSTBEG00000016377 #24 STK40 (ENSTBEG00000016464) #26 LSM10 (ENSTBEG00000016674) #27 OSCP1 (ENSTBEG00000016688) #28 Primates ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00390000012030.a ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729.e ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00390000012030.a ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 Bushbaby MODERN SPECIES 140 KIAA0319L (ENSOGAG00000002092) NCDN (ENSOGAG00000034366) TFAP2E (ENSOGAG00000029197) PSMB2 (ENSOGAG00000002097) C1orf216 (ENSOGAG00000004230) CLSPN (ENSOGAG00000004231) ENSOGAG00000032752 ENSOGAG00000004233 AGO1 (ENSOGAG00000010279) AGO3 (ENSOGAG00000010290) TEKT2 (ENSOGAG00000032145) ADPRS (ENSOGAG00000026312) COL8A2 (ENSOGAG00000034217) TRAPPC3 (ENSOGAG00000029810) MAP7D1 (ENSOGAG00000013476) THRAP3 (ENSOGAG00000002648) #22 ENSOGAG00000028592 #24 EVA1B (ENSOGAG00000025550) STK40 (ENSOGAG00000002651) #26 LSM10 (ENSOGAG00000002653) #27 OSCP1 (ENSOGAG00000002654) #28 ENSOGAG00000002656 #29 CSF3R (ENSOGAG00000002660) #30 GRIK3 (ENSOGAG00000002138) ZC3H12A (ENSOGAG00000030940) MEAF6 (ENSOGAG00000006773) SNIP1 (ENSOGAG00000008634) DNALI1 (ENSOGAG00000008639) GNL2 (ENSOGAG00000008643) RSPO1 (ENSOGAG00000008648) C1orf109 (ENSOGAG00000008650) Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729.e ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00390000012030.a ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES 58 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729.e ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00390000012030.a ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 Coquerels sifaka MODERN SPECIES 257 KIAA0319L (ENSPCOG00000025777) NCDN (ENSPCOG00000023262) TFAP2E (ENSPCOG00000017621) PSMB2 (ENSPCOG00000024983) ENSPCOG00000007974 CLSPN (ENSPCOG00000017966) AGO4 (ENSPCOG00000015935) AGO1 (ENSPCOG00000022061) AGO3 (ENSPCOG00000028390) TEKT2 (ENSPCOG00000026680) ADPRS (ENSPCOG00000015295) COL8A2 (ENSPCOG00000018858) TRAPPC3 (ENSPCOG00000021901) MAP7D1 (ENSPCOG00000024366) ENSPCOG00000028655 THRAP3 (ENSPCOG00000027521) #22 SH3D21 (ENSPCOG00000013355) #24 EVA1B (ENSPCOG00000022411) STK40 (ENSPCOG00000024517) #26 OSCP1 (ENSPCOG00000021088) #28 MRPS15 (ENSPCOG00000014731) #29 CSF3R (ENSPCOG00000019162) #30 GRIK3 (ENSPCOG00000025879) Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 1104 AGO4 (ENSPSMG00000008413) AGO1 (ENSPSMG00000008155) AGO3 (ENSPSMG00000007852) ENSPSMG00000007627 TEKT2 (ENSPSMG00000007624) ADPRS (ENSPSMG00000007612) COL8A2 (ENSPSMG00000007598) TRAPPC3 (ENSPSMG00000007582) MAP7D1 (ENSPSMG00000007504) THRAP3 (ENSPSMG00000007350) #22 SH3D21 (ENSPSMG00000007326) #24 EVA1B (ENSPSMG00000007322) STK40 (ENSPSMG00000007309) #26 LSM10 (ENSPSMG00000007286) #27 OSCP1 (ENSPSMG00000007256) #28 MRPS15 (ENSPSMG00000007209) #29 CSF3R (ENSPSMG00000007169) #30 GRIK3 (ENSPSMG00000007001) Mouse lemur DUPLICATION Mouse lemur MODERN SPECIES 11 KIAA0319L (ENSMICG00000006428) ENSMICG00000035693 NCDN (ENSMICG00000006440) TFAP2E (ENSMICG00000046802) PSMB2 (ENSMICG00000006460) CLSPN (ENSMICG00000005691) AGO4 (ENSMICG00000033507) ENSMICG00000044276 AGO1 (ENSMICG00000016147) AGO3 (ENSMICG00000016158) TEKT2 (ENSMICG00000016171) ADPRS (ENSMICG00000016186) COL8A2 (ENSMICG00000033642) TRAPPC3 (ENSMICG00000016250) MAP7D1 (ENSMICG00000016257) THRAP3 (ENSMICG00000007920) #22 SH3D21 (ENSMICG00000027388) #24 EVA1B (ENSMICG00000044326) STK40 (ENSMICG00000007931) #26 OSCP1 (ENSMICG00000007944) #28 MRPS15 (ENSMICG00000047526) #29 CSF3R (ENSMICG00000007970) #30 GRIK3 (ENSMICG00000016437) ZC3H12A (ENSMICG00000004790) MEAF6 (ENSMICG00000030115) SNIP1 (ENSMICG00000044466) DNALI1 (ENSMICG00000011878) ENSMICG00000011884 RSPO1 (ENSMICG00000011909) C1orf109 (ENSMICG00000030638) ENSMICG00000045747 Mouse lemur MODERN SPECIES 169 ENSMICG00000035221 ENSMICG00000026518 ENSMICG00000041675 ENSMICG00000037213 ENSMICG00000015146 PPP2R3B (ENSMICG00000030474) GTPBP6 (ENSMICG00000044435) PLCXD1 (ENSMICG00000045160) SHOX (ENSMICG00000014601) ENSMICG00000004731 ENSMICG00000033357 ENSMICG00000027916 ENSMICG00000042557 TMEM47 (ENSMICG00000044159) ENSMICG00000042840 ENSMICG00000042555 #22 ENSMICG00000032834 DMD (ENSMICG00000028112) ENSMICG00000047999 TAB3 (ENSMICG00000032994) ENSMICG00000031852 ENSMICG00000005238 ENSMICG00000034710 NR0B1 (ENSMICG00000047871) ENSMICG00000032961 ENSMICG00000013694 IL1RAPL1 (ENSMICG00000009756) ENSMICG00000043208 ENSMICG00000036346 ENSMICG00000030568 ENSMICG00000029119 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00390000012030.a ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 Tarsier DUPLICATION Tarsier MODERN SPECIES 4773 TEKT2 (ENSTSYG00000000204) ADPRHL2 (ENSTSYG00000011188) COL8A2 (ENSTSYG00000035637) TRAPPC3 (ENSTSYG00000000393) MAP7D1 (ENSTSYG00000001484) THRAP3 (ENSTSYG00000012214) #22 SH3D21 (ENSTSYG00000035793) #24 STK40 (ENSTSYG00000005872) #26 OSCP1 (ENSTSYG00000010954) #28 CSF3R (ENSTSYG00000007230) #30 GRIK3 (ENSTSYG00000000594) Tarsier MODERN SPECIES 3795 ENSTSYG00000011370 #22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00390000012030.a ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00390000012030.a ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257.t ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00390000012030.a ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257.t ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 Hominidae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00390000012030.a ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257.t ENSGT00940000156553 ENSGT00950000182891.a.a.b.a.a.a.b.a.b.a ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00390000012030.a ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257.t ENSGT00940000156553 ENSGT00950000182891.a.a.b.a.a.a.b.a.b.a ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 Gorilla MODERN SPECIES KIAA0319L (ENSGGOG00000012068) NCDN (ENSGGOG00000009754) TFAP2E (ENSGGOG00000009762) PSMB2 (ENSGGOG00000009771) C1orf216 (ENSGGOG00000043887) CLSPN (ENSGGOG00000005981) AGO4 (ENSGGOG00000036532) AGO1 (ENSGGOG00000003316) AGO3 (ENSGGOG00000036711) ENSGGOG00000043836 TEKT2 (ENSGGOG00000003766) ADPRS (ENSGGOG00000003770) COL8A2 (ENSGGOG00000003772) TRAPPC3 (ENSGGOG00000004752) MAP7D1 (ENSGGOG00000003219) THRAP3 (ENSGGOG00000006917) #22 SH3D21 (ENSGGOG00000006931) #24 EVA1B (ENSGGOG00000006937) STK40 (ENSGGOG00000011597) #26 LSM10 (ENSGGOG00000003556) #27 OSCP1 (ENSGGOG00000007041) #28 MRPS15 (ENSGGOG00000013565) #29 CSF3R (ENSGGOG00000013573) #30 GRIK3 (ENSGGOG00000011315) ZC3H12A (ENSGGOG00000009268) MEAF6 (ENSGGOG00000017191) SNIP1 (ENSGGOG00000022697) ENSGGOG00000042544 DNALI1 (ENSGGOG00000007698) GNL2 (ENSGGOG00000007704) RSPO1 (ENSGGOG00000007712) Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000159550 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257.t ENSGT00940000156553 ENSGT00950000182891.a.a.b.a.a.a.b.a.b.a ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 Human MODERN SPECIES ZMYM4 (ENSG00000146463) KIAA0319L (ENSG00000142687) NCDN (ENSG00000020129) TFAP2E (ENSG00000116819) PSMB2 (ENSG00000126067) C1orf216 (ENSG00000142686) CLSPN (ENSG00000092853) AGO4 (ENSG00000134698) AGO1 (ENSG00000092847) AGO3 (ENSG00000126070) TEKT2 (ENSG00000092850) ADPRS (ENSG00000116863) COL8A2 (ENSG00000171812) TRAPPC3 (ENSG00000054116) MAP7D1 (ENSG00000116871) THRAP3 (ENSG00000054118) #22 SH3D21 (ENSG00000214193) #24 EVA1B (ENSG00000142694) STK40 (ENSG00000196182) #26 LSM10 (ENSG00000181817) #27 OSCP1 (ENSG00000116885) #28 MRPS15 (ENSG00000116898) #29 CSF3R (ENSG00000119535) #30 GRIK3 (ENSG00000163873) ZC3H12A (ENSG00000163874) MEAF6 (ENSG00000163875) SNIP1 (ENSG00000163877) DNALI1 (ENSG00000163879) GNL2 (ENSG00000134697) RSPO1 (ENSG00000169218) C1orf109 (ENSG00000116922) Pan ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000159550 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257.t ENSGT00940000156553 ENSGT00950000182891.a.a.b.a.a.a.b.a.b.a ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 Bonobo MODERN SPECIES ENSPPAG00000043691 KIAA0319L (ENSPPAG00000033357) NCDN (ENSPPAG00000040334) TFAP2E (ENSPPAG00000039587) PSMB2 (ENSPPAG00000043554) C1orf216 (ENSPPAG00000004841) CLSPN (ENSPPAG00000029163) AGO4 (ENSPPAG00000031752) AGO1 (ENSPPAG00000034838) AGO3 (ENSPPAG00000031959) TEKT2 (ENSPPAG00000032256) ADPRS (ENSPPAG00000041931) COL8A2 (ENSPPAG00000031750) TRAPPC3 (ENSPPAG00000041117) MAP7D1 (ENSPPAG00000039211) THRAP3 (ENSPPAG00000028961) #22 SH3D21 (ENSPPAG00000028393) #24 EVA1B (ENSPPAG00000028458) STK40 (ENSPPAG00000038002) #26 LSM10 (ENSPPAG00000023465) #27 OSCP1 (ENSPPAG00000032111) #28 MRPS15 (ENSPPAG00000025884) #29 CSF3R (ENSPPAG00000037401) #30 GRIK3 (ENSPPAG00000029669) ZC3H12A (ENSPPAG00000041054) MEAF6 (ENSPPAG00000028352) SNIP1 (ENSPPAG00000039865) ENSPPAG00000001093 DNALI1 (ENSPPAG00000032274) GNL2 (ENSPPAG00000001559) RSPO1 (ENSPPAG00000042330) Chimpanzee MODERN SPECIES ZMYM4 (ENSPTRG00000000519) KIAA0319L (ENSPTRG00000000521) NCDN (ENSPTRG00000000522) TFAP2E (ENSPTRG00000000523) PSMB2 (ENSPTRG00000000524) C1H1orf216 (ENSPTRG00000052130) CLSPN (ENSPTRG00000000526) AGO4 (ENSPTRG00000000527) AGO1 (ENSPTRG00000000528) AGO3 (ENSPTRG00000000529) TEKT2 (ENSPTRG00000024371) ADPRS (ENSPTRG00000000531) COL8A2 (ENSPTRG00000000532) TRAPPC3 (ENSPTRG00000000533) MAP7D1 (ENSPTRG00000000534) THRAP3 (ENSPTRG00000000535) #22 SH3D21 (ENSPTRG00000034515) #24 EVA1B (ENSPTRG00000000537) STK40 (ENSPTRG00000000538) #26 LSM10 (ENSPTRG00000000539) #27 OSCP1 (ENSPTRG00000000540) #28 MRPS15 (ENSPTRG00000000541) #29 CSF3R (ENSPTRG00000000542) #30 GRIK3 (ENSPTRG00000000543) ZC3H12A (ENSPTRG00000000544) MEAF6 (ENSPTRG00000047980) SNIP1 (ENSPTRG00000000547) ENSPTRG00000045895 DNALI1 (ENSPTRG00000000548) GNL2 (ENSPTRG00000000549) RSPO1 (ENSPTRG00000000550) Orangutan MODERN SPECIES KIAA0319L (ENSPPYG00000001558) NCDN (ENSPPYG00000001557) TFAP2E (ENSPPYG00000001556) PSMB2 (ENSPPYG00000001555) C1orf216 (ENSPPYG00000001554) CLSPN (ENSPPYG00000001553) AGO4 (ENSPPYG00000001552) AGO1 (ENSPPYG00000001551) AGO3 (ENSPPYG00000001550) ENSPPYG00000040273 TEKT2 (ENSPPYG00000001549) ADPRS (ENSPPYG00000001548) COL8A2 (ENSPPYG00000001547) TRAPPC3 (ENSPPYG00000001546) MAP7D1 (ENSPPYG00000001545) THRAP3 (ENSPPYG00000001544) #22 SH3D21 (ENSPPYG00000001543) #24 EVA1B (ENSPPYG00000030005) STK40 (ENSPPYG00000001540) #26 LSM10 (ENSPPYG00000001539) #27 OSCP1 (ENSPPYG00000001538) #28 MRPS15 (ENSPPYG00000001537) #29 CSF3R (ENSPPYG00000001536) #30 GRIK3 (ENSPPYG00000001535) ZC3H12A (ENSPPYG00000001534) MEAF6 (ENSPPYG00000034713) SNIP1 (ENSPPYG00000001532) ENSPPYG00000001531 DNALI1 (ENSPPYG00000001530) GNL2 (ENSPPYG00000001529) RSPO1 (ENSPPYG00000001528) Gibbon MODERN SPECIES 2 ENSNLEG00000031618 KIAA0319L (ENSNLEG00000011001) NCDN (ENSNLEG00000011043) TFAP2E (ENSNLEG00000011088) PSMB2 (ENSNLEG00000034792) C1orf216 (ENSNLEG00000035826) CLSPN (ENSNLEG00000011110) AGO4 (ENSNLEG00000011125) AGO1 (ENSNLEG00000011181) AGO3 (ENSNLEG00000027092) TEKT2 (ENSNLEG00000011235) ADPRS (ENSNLEG00000011265) ENSNLEG00000011300 TRAPPC3 (ENSNLEG00000031818) ENSNLEG00000011317 THRAP3 (ENSNLEG00000011359) #22 SH3D21 (ENSNLEG00000011391) #24 EVA1B (ENSNLEG00000030121) STK40 (ENSNLEG00000011406) #26 LSM10 (ENSNLEG00000033754) #27 OSCP1 (ENSNLEG00000011442) #28 MRPS15 (ENSNLEG00000030022) #29 CSF3R (ENSNLEG00000011482) #30 GRIK3 (ENSNLEG00000011524) ZC3H12A (ENSNLEG00000011545) MEAF6 (ENSNLEG00000011546) SNIP1 (ENSNLEG00000011577) DNALI1 (ENSNLEG00000011584) GNL2 (ENSNLEG00000011599) RSPO1 (ENSNLEG00000011628) ENSNLEG00000031719 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00390000012030.a ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257.t ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00390000015109 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00390000012030.a ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 880 ENSRROG00000033752 NCDN (ENSRROG00000042808) TFAP2E (ENSRROG00000042239) PSMB2 (ENSRROG00000029102) C1orf216 (ENSRROG00000023698) CLSPN (ENSRROG00000030857) AGO4 (ENSRROG00000035783) AGO1 (ENSRROG00000044469) AGO3 (ENSRROG00000042180) ENSRROG00000027570 TEKT2 (ENSRROG00000039414) ADPRS (ENSRROG00000030199) COL8A2 (ENSRROG00000030627) TRAPPC3 (ENSRROG00000034420) MAP7D1 (ENSRROG00000045698) THRAP3 (ENSRROG00000028592) #22 SH3D21 (ENSRROG00000042801) #24 EVA1B (ENSRROG00000034651) STK40 (ENSRROG00000025639) #26 LSM10 (ENSRROG00000011414) #27 OSCP1 (ENSRROG00000032439) #28 MRPS15 (ENSRROG00000045410) #29 CSF3R (ENSRROG00000040755) #30 IQCF3 (ENSRROG00000035667) IQCF2 (ENSRROG00000042169) IQCF5 (ENSRROG00000011279) IQCF1 (ENSRROG00000037019) Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 766 ENSRBIG00000041273 NCDN (ENSRBIG00000023812) TFAP2E (ENSRBIG00000038962) PSMB2 (ENSRBIG00000034620) C1orf216 (ENSRBIG00000010891) CLSPN (ENSRBIG00000030748) AGO4 (ENSRBIG00000040185) AGO1 (ENSRBIG00000032611) AGO3 (ENSRBIG00000043774) ENSRBIG00000006280 TEKT2 (ENSRBIG00000044673) ADPRS (ENSRBIG00000004132) COL8A2 (ENSRBIG00000043182) TRAPPC3 (ENSRBIG00000043692) MAP7D1 (ENSRBIG00000032601) THRAP3 (ENSRBIG00000031284) #22 SH3D21 (ENSRBIG00000031442) #24 EVA1B (ENSRBIG00000035344) STK40 (ENSRBIG00000036383) #26 LSM10 (ENSRBIG00000001561) #27 OSCP1 (ENSRBIG00000032588) #28 MRPS15 (ENSRBIG00000038467) #29 CSF3R (ENSRBIG00000036474) #30 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00390000012030.a ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737.d #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257.t ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 Vervet Monkey MODERN SPECIES 12 NCDN (ENSCSAG00000001085) TFAP2E (ENSCSAG00000001086) PSMB2 (ENSCSAG00000001087) C1orf216 (ENSCSAG00000000132) ENSCSAG00000001088 ENSCSAG00000001089 AGO4 (ENSCSAG00000001090) AGO1 (ENSCSAG00000001091) AGO3 (ENSCSAG00000001092) ENSCSAG00000000133 TEKT2 (ENSCSAG00000001093) ADPRS (ENSCSAG00000001094) COL8A2 (ENSCSAG00000001095) TRAPPC3 (ENSCSAG00000001096) MAP7D1 (ENSCSAG00000001097) THRAP3 (ENSCSAG00000001098) #22 SH3D21 (ENSCSAG00000001100) #24 EVA1B (ENSCSAG00000001099) STK40 (ENSCSAG00000001101) #26 LSM10 (ENSCSAG00000000134) #27 OSCP1 (ENSCSAG00000001102) #28 MRPS15 (ENSCSAG00000001103) #29 CSF3R (ENSCSAG00000001104) #30 GRIK3 (ENSCSAG00000001105) ZC3H12A (ENSCSAG00000001106) MEAF6 (ENSCSAG00000001107) SNIP1 (ENSCSAG00000001108) DNALI1 (ENSCSAG00000001109) GNL2 (ENSCSAG00000001110) RSPO1 (ENSCSAG00000001111) C1orf109 (ENSCSAG00000001112) Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729.d ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00390000012030.a ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737.d #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257.t ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729.d ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00390000012030.a ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737.c #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257.t ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729.c.b ENSGT00940000158729.c.a ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737.d #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257.t ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 Rhesus MODERN SPECIES NCDN (ENSMMUG00000019812) TFAP2E (ENSMMUG00000019815) PSMB2 (ENSMMUG00000013090) C1H1orf216 (ENSMMUG00000059270) CLSPN (ENSMMUG00000010961) ENSMMUG00000053265 ENSMMUG00000050423 AGO4 (ENSMMUG00000003343) AGO1 (ENSMMUG00000006251) AGO3 (ENSMMUG00000006252) TEKT2 (ENSMMUG00000012028) ADPRS (ENSMMUG00000050632) COL8A2 (ENSMMUG00000012031) TRAPPC3 (ENSMMUG00000022499) MAP7D1 (ENSMMUG00000022500) THRAP3 (ENSMMUG00000014622) #22 SH3D21 (ENSMMUG00000011688) #24 EVA1B (ENSMMUG00000057604) STK40 (ENSMMUG00000016212) #26 LSM10 (ENSMMUG00000017338) #27 OSCP1 (ENSMMUG00000020432) #28 MRPS15 (ENSMMUG00000020433) #29 CSF3R (ENSMMUG00000020434) #30 ENSMMUG00000053885 GRIK3 (ENSMMUG00000009679) ZC3H12A (ENSMMUG00000010323) MEAF6 (ENSMMUG00000010328) SNIP1 (ENSMMUG00000059855) DNALI1 (ENSMMUG00000008418) GNL2 (ENSMMUG00000008419) RSPO1 (ENSMMUG00000008420) Crab-eating macaque MODERN SPECIES KIAA0319L (ENSMFAG00000003546) TFAP2E (ENSMFAG00000036191) NCDN (ENSMFAG00000038902) PSMB2 (ENSMFAG00000002319) C1orf216 (ENSMFAG00000005466) CLSPN (ENSMFAG00000021652) ENSMFAG00000050764 ENSMFAG00000035543 ENSMFAG00000055085 AGO1 (ENSMFAG00000002846) ENSMFAG00000004521 TEKT2 (ENSMFAG00000003542) ADPRS (ENSMFAG00000034318) COL8A2 (ENSMFAG00000048490) TRAPPC3 (ENSMFAG00000038169) THRAP3 (ENSMFAG00000040144) #22 SH3D21 (ENSMFAG00000036528) #24 EVA1B (ENSMFAG00000053220) STK40 (ENSMFAG00000000703) #26 LSM10 (ENSMFAG00000061237) #27 OSCP1 (ENSMFAG00000043477) #28 ENSMFAG00000038082 #29 CSF3R (ENSMFAG00000032558) #30 GRIK3 (ENSMFAG00000002477) ENSMFAG00000052566 ZC3H12A (ENSMFAG00000032647) SNIP1 (ENSMFAG00000040288) DNALI1 (ENSMFAG00000038046) GNL2 (ENSMFAG00000039033) RSPO1 (ENSMFAG00000043851) C1orf109 (ENSMFAG00000063901) Pig-tailed macaque DUPLICATION Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 217 ENSMNEG00000042114 NCDN (ENSMNEG00000036209) TFAP2E (ENSMNEG00000026563) PSMB2 (ENSMNEG00000042680) C1orf216 (ENSMNEG00000011640) CLSPN (ENSMNEG00000031665) AGO4 (ENSMNEG00000037723) AGO1 (ENSMNEG00000028881) AGO3 (ENSMNEG00000039518) ENSMNEG00000022567 TEKT2 (ENSMNEG00000034182) ADPRS (ENSMNEG00000038272) COL8A2 (ENSMNEG00000043231) TRAPPC3 (ENSMNEG00000014589) MAP7D1 (ENSMNEG00000035413) THRAP3 (ENSMNEG00000018987) #22 SH3D21 (ENSMNEG00000043158) #24 EVA1B (ENSMNEG00000041849) STK40 (ENSMNEG00000038686) #26 LSM10 (ENSMNEG00000020023) #27 OSCP1 (ENSMNEG00000043487) #28 MRPS15 (ENSMNEG00000042543) #29 CSF3R (ENSMNEG00000033813) #30 GRIK3 (ENSMNEG00000035057) ZC3H12A (ENSMNEG00000040453) MEAF6 (ENSMNEG00000034129) SNIP1 (ENSMNEG00000004331) DNALI1 (ENSMNEG00000035462) GNL2 (ENSMNEG00000043438) RSPO1 (ENSMNEG00000034664) C1orf109 (ENSMNEG00000039182) Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 467 RBMS3 (ENSMNEG00000035839) TGFBR2 (ENSMNEG00000041064) GADL1 (ENSMNEG00000040498) ENSMNEG00000042630 #22 STT3B (ENSMNEG00000043111) OSBPL10 (ENSMNEG00000028144) GPD1L (ENSMNEG00000036490) ENSMNEG00000030537 CMTM8 (ENSMNEG00000042143) CMTM7 (ENSMNEG00000045324) CMTM6 (ENSMNEG00000035614) DYNC1LI1 (ENSMNEG00000031282) ENSMNEG00000030223 CNOT10 (ENSMNEG00000039743) TRIM71 (ENSMNEG00000030331) CCR4 (ENSMNEG00000015017) GLB1 (ENSMNEG00000035974) CRTAP (ENSMNEG00000041104) SUSD5 (ENSMNEG00000041063) Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729.d ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00390000012030.a ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737.d #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257.t ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 Olive baboon MODERN SPECIES NCDN (ENSPANG00000017888) TFAP2E (ENSPANG00000004801) PSMB2 (ENSPANG00000007342) ENSPANG00000047679 C1orf216 (ENSPANG00000023261) CLSPN (ENSPANG00000023877) AGO4 (ENSPANG00000007232) AGO1 (ENSPANG00000009060) AGO3 (ENSPANG00000007682) ENSPANG00000032150 TEKT2 (ENSPANG00000010534) ADPRS (ENSPANG00000010533) COL8A2 (ENSPANG00000011822) TRAPPC3 (ENSPANG00000013869) MAP7D1 (ENSPANG00000006397) THRAP3 (ENSPANG00000010532) #22 SH3D21 (ENSPANG00000019295) #24 EVA1B (ENSPANG00000023876) STK40 (ENSPANG00000026394) #26 LSM10 (ENSPANG00000023172) #27 OSCP1 (ENSPANG00000009801) #28 ENSPANG00000009486 #29 CSF3R (ENSPANG00000004799) #30 ENSPANG00000002642 GRIK3 (ENSPANG00000005822) ZC3H12A (ENSPANG00000011821) MEAF6 (ENSPANG00000023016) SNIP1 (ENSPANG00000016943) DNALI1 (ENSPANG00000025521) GNL2 (ENSPANG00000025285) RSPO1 (ENSPANG00000016776) Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729.d ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00390000012030.a ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737.d #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00950000185476 ENSGT00390000015257.t ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 Drill MODERN SPECIES 996 AGO4 (ENSMLEG00000039490) AGO1 (ENSMLEG00000038388) AGO3 (ENSMLEG00000027912) ENSMLEG00000006923 TEKT2 (ENSMLEG00000019450) ADPRS (ENSMLEG00000040472) COL8A2 (ENSMLEG00000044213) TRAPPC3 (ENSMLEG00000030351) MAP7D1 (ENSMLEG00000038403) THRAP3 (ENSMLEG00000028924) #22 SH3D21 (ENSMLEG00000021402) #24 STK40 (ENSMLEG00000029415) #26 LSM10 (ENSMLEG00000025150) #27 OSCP1 (ENSMLEG00000018880) #28 ENSMLEG00000040975 #29 CSF3R (ENSMLEG00000039105) #30 GRIK3 (ENSMLEG00000031025) ZC3H12A (ENSMLEG00000034570) ENSMLEG00000021493 Sooty mangabey DUPLICATION Sooty mangabey MODERN SPECIES 227 KIAA0319L (ENSCATG00000043672) NCDN (ENSCATG00000043234) TFAP2E (ENSCATG00000032602) PSMB2 (ENSCATG00000038881) C1orf216 (ENSCATG00000006919) CLSPN (ENSCATG00000044080) AGO4 (ENSCATG00000043421) AGO1 (ENSCATG00000031521) AGO3 (ENSCATG00000029748) ENSCATG00000005617 TEKT2 (ENSCATG00000042764) ADPRS (ENSCATG00000042745) COL8A2 (ENSCATG00000032341) TRAPPC3 (ENSCATG00000041647) MAP7D1 (ENSCATG00000038724) THRAP3 (ENSCATG00000038343) #22 SH3D21 (ENSCATG00000044150) #24 EVA1B (ENSCATG00000039327) STK40 (ENSCATG00000039453) #26 LSM10 (ENSCATG00000006589) #27 OSCP1 (ENSCATG00000038966) #28 ENSCATG00000044771 #29 CSF3R (ENSCATG00000038990) #30 GRIK3 (ENSCATG00000038812) ZC3H12A (ENSCATG00000037700) ENSCATG00000006010 ENSCATG00000037164 SNIP1 (ENSCATG00000039335) DNALI1 (ENSCATG00000037101) GNL2 (ENSCATG00000026503) RSPO1 (ENSCATG00000037142) Sooty mangabey MODERN SPECIES 458 ENSCATG00000035101 #22 STT3B (ENSCATG00000034285) OSBPL10 (ENSCATG00000038263) GPD1L (ENSCATG00000038775) CMTM8 (ENSCATG00000033422) CMTM7 (ENSCATG00000014394) ENSCATG00000030998 DYNC1LI1 (ENSCATG00000041634) ENSCATG00000039673 ENSCATG00000000280 ENSCATG00000032297 CNOT10 (ENSCATG00000034330) TRIM71 (ENSCATG00000039860) CCR4 (ENSCATG00000006477) GLB1 (ENSCATG00000030809) ENSCATG00000008562 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000159550 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536.k.a ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364.i #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 Cebidae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000159550 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536.k.a ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364.i #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 Marmoset MODERN SPECIES 19 ZMYM4 (ENSCJAG00000001447) KIAA0319L (ENSCJAG00000001486) NCDN (ENSCJAG00000001525) TFAP2E (ENSCJAG00000001531) PSMB2 (ENSCJAG00000038344) C1orf216 (ENSCJAG00000044395) CLSPN (ENSCJAG00000001559) AGO4 (ENSCJAG00000001610) AGO1 (ENSCJAG00000032023) AGO3 (ENSCJAG00000031580) TEKT2 (ENSCJAG00000001705) ADPRS (ENSCJAG00000001719) COL8A2 (ENSCJAG00000046041) TRAPPC3 (ENSCJAG00000001734) MAP7D1 (ENSCJAG00000001746) THRAP3 (ENSCJAG00000001754) #22 SH3D21 (ENSCJAG00000001796) #24 EVA1B (ENSCJAG00000001807) STK40 (ENSCJAG00000001818) #26 LSM10 (ENSCJAG00000044880) #27 OSCP1 (ENSCJAG00000001826) #28 MRPS15 (ENSCJAG00000001852) #29 CSF3R (ENSCJAG00000001860) #30 GRIK3 (ENSCJAG00000001873) ZC3H12A (ENSCJAG00000056482) MEAF6 (ENSCJAG00000001927) SNIP1 (ENSCJAG00000001963) DNALI1 (ENSCJAG00000057297) ENSCJAG00000001998 C1orf109 (ENSCJAG00000062886) CDCA8 (ENSCJAG00000002008) Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000159550 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536.k.a ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364.i #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553.r ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 Capuchin MODERN SPECIES 277 TFAP2E (ENSCCAG00000014473) ENSCCAG00000025604 ENSCCAG00000020290 C1orf216 (ENSCCAG00000032404) ENSCCAG00000032336 CLSPN (ENSCCAG00000020740) ENSCCAG00000007055 AGO4 (ENSCCAG00000001397) AGO1 (ENSCCAG00000011823) AGO3 (ENSCCAG00000034189) TEKT2 (ENSCCAG00000034337) ADPRS (ENSCCAG00000029534) COL8A2 (ENSCCAG00000034498) TRAPPC3 (ENSCCAG00000016538) MAP7D1 (ENSCCAG00000023770) THRAP3 (ENSCCAG00000028401) #22 SH3D21 (ENSCCAG00000027849) #24 EVA1B (ENSCCAG00000025930) STK40 (ENSCCAG00000035718) #26 ENSCCAG00000037064 CEP63 (ENSCCAG00000027864) KY (ENSCCAG00000017585) EPHB1 (ENSCCAG00000024853) PPP2R3A (ENSCCAG00000034294) MSL2 (ENSCCAG00000018654) ENSCCAG00000036817 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 135 ENSSBOG00000024972 ZMYM4 (ENSSBOG00000033026) KIAA0319L (ENSSBOG00000030468) NCDN (ENSSBOG00000036150) TFAP2E (ENSSBOG00000035566) ENSSBOG00000035339 CLSPN (ENSSBOG00000034344) AGO4 (ENSSBOG00000026529) AGO1 (ENSSBOG00000020867) AGO3 (ENSSBOG00000029981) TEKT2 (ENSSBOG00000022674) ADPRS (ENSSBOG00000028837) COL8A2 (ENSSBOG00000027384) TRAPPC3 (ENSSBOG00000033429) MAP7D1 (ENSSBOG00000032444) THRAP3 (ENSSBOG00000029130) #22 SH3D21 (ENSSBOG00000032808) #24 EVA1B (ENSSBOG00000023166) STK40 (ENSSBOG00000030732) #26 ENSSBOG00000036413 #27 OSCP1 (ENSSBOG00000014944) #28 MRPS15 (ENSSBOG00000034679) #29 CSF3R (ENSSBOG00000029331) #30 ENSSBOG00000025138 ENSSBOG00000032606 GRIK3 (ENSSBOG00000034275) ZC3H12A (ENSSBOG00000028357) MEAF6 (ENSSBOG00000033011) Mas night monkey DUPLICATION Mas night monkey DUPLICATION Mas night monkey MODERN SPECIES 957 KIAA0319L (ENSANAG00000030578) NCDN (ENSANAG00000030003) TFAP2E (ENSANAG00000033962) PSMB2 (ENSANAG00000034782) C1orf216 (ENSANAG00000017316) CLSPN (ENSANAG00000037355) AGO4 (ENSANAG00000031428) AGO1 (ENSANAG00000037711) AGO3 (ENSANAG00000037735) TEKT2 (ENSANAG00000027050) ADPRS (ENSANAG00000027244) COL8A2 (ENSANAG00000030537) TRAPPC3 (ENSANAG00000029327) MAP7D1 (ENSANAG00000015395) ENSANAG00000032677 ENSANAG00000024479 #22 SH3D21 (ENSANAG00000028854) #24 EVA1B (ENSANAG00000029581) STK40 (ENSANAG00000026859) #26 ENSANAG00000018759 #27 OSCP1 (ENSANAG00000026578) #28 MRPS15 (ENSANAG00000024978) #29 CSF3R (ENSANAG00000031691) #30 ENSANAG00000029021 GRIK3 (ENSANAG00000037814) ZC3H12A (ENSANAG00000009908) ENSANAG00000028024 SNIP1 (ENSANAG00000019123) DNALI1 (ENSANAG00000014001) GNL2 (ENSANAG00000023449) RSPO1 (ENSANAG00000027107) Mas night monkey MODERN SPECIES 1333 HNRNPA3 (ENSANAG00000002931) MTX2 (ENSANAG00000022501) ENSANAG00000031061 HOXD1 (ENSANAG00000019775) HOXD3 (ENSANAG00000026428) HOXD4 (ENSANAG00000028028) HOXD8 (ENSANAG00000026980) HOXD9 (ENSANAG00000024699) HOXD10 (ENSANAG00000025381) HOXD11 (ENSANAG00000029678) HOXD12 (ENSANAG00000008919) HOXD13 (ENSANAG00000029500) EVX2 (ENSANAG00000031929) LNPK (ENSANAG00000019161) ENSANAG00000021797 ENSANAG00000023367 #22 ENSANAG00000033889 ENSANAG00000037338 ENSANAG00000011341 Mas night monkey MODERN SPECIES 1061 NGLY1 (ENSANAG00000021060) OXSM (ENSANAG00000031063) LRRC3B (ENSANAG00000019390) NEK10 (ENSANAG00000020680) SLC4A7 (ENSANAG00000033803) EOMES (ENSANAG00000033599) ENSANAG00000028605 CMC1 (ENSANAG00000033017) AZI2 (ENSANAG00000032294) ZCWPW2 (ENSANAG00000026346) ENSANAG00000019465 RBMS3 (ENSANAG00000021899) ENSANAG00000029841 TGFBR2 (ENSANAG00000026606) GADL1 (ENSANAG00000007534) ENSANAG00000030952 #22 STT3B (ENSANAG00000033353) OSBPL10 (ENSANAG00000028037) GPD1L (ENSANAG00000014659) CMTM8 (ENSANAG00000028101) ENSANAG00000027747 ENSANAG00000026200 ENSANAG00000029265 DYNC1LI1 (ENSANAG00000036308) ENSANAG00000019325 CNOT10 (ENSANAG00000033966) TRIM71 (ENSANAG00000022657) CCR4 (ENSANAG00000017606) GLB1 (ENSANAG00000028634) TMPPE (ENSANAG00000020099) CRTAP (ENSANAG00000037231) Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000168628 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00390000012030.a ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000168963 #25 ENSGT00990000210150 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000168628 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00390000012030.a ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00390000012030.a ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 Suina ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000159550 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 Pig MODERN SPECIES 14 ENSSSCG00000062913 NCDN (ENSSSCG00000031786) TFAP2E (ENSSSCG00000040097) PSMB2 (ENSSSCG00000035914) ENSSSCG00000037699 C1orf216 (ENSSSCG00000037600) CLSPN (ENSSSCG00000003628) AGO3 (ENSSSCG00000003630) ENSSSCG00000055207 ENSSSCG00000003632 TEKT2 (ENSSSCG00000003633) ADPRS (ENSSSCG00000003634) COL8A2 (ENSSSCG00000033641) TRAPPC3 (ENSSSCG00000037213) MAP7D1 (ENSSSCG00000003637) THRAP3 (ENSSSCG00000029954) #22 ENSSSCG00000028892 #24 EVA1B (ENSSSCG00000033892) STK40 (ENSSSCG00000036832) #26 LSM10 (ENSSSCG00000038916) #27 OSCP1 (ENSSSCG00000036709) #28 MRPS15 (ENSSSCG00000034647) #29 CSF3R (ENSSSCG00000025795) #30 GRIK3 (ENSSSCG00000003640) ZC3H12A (ENSSSCG00000037815) MEAF6 (ENSSSCG00000034611) SNIP1 (ENSSSCG00000029991) DNALI1 (ENSSSCG00000058884) GNL2 (ENSSSCG00000031631) RSPO1 (ENSSSCG00000032240) C1orf109 (ENSSSCG00000039905) Chacoan peccary MODERN SPECIES 39 NCDN (ENSCWAG00000009618) TFAP2E (ENSCWAG00000009465) PSMB2 (ENSCWAG00000009415) C1orf216 (ENSCWAG00000009403) CLSPN (ENSCWAG00000009253) ENSCWAG00000009201 AGO4 (ENSCWAG00000009127) AGO1 (ENSCWAG00000009026) ENSCWAG00000008976 ENSCWAG00000008735 TEKT2 (ENSCWAG00000008694) ADPRS (ENSCWAG00000008618) COL8A2 (ENSCWAG00000008567) TRAPPC3 (ENSCWAG00000008474) MAP7D1 (ENSCWAG00000008245) THRAP3 (ENSCWAG00000008133) #22 ENSCWAG00000008017 EVA1B (ENSCWAG00000007937) STK40 (ENSCWAG00000007890) #26 LSM10 (ENSCWAG00000007870) #27 OSCP1 (ENSCWAG00000007749) #28 MRPS15 (ENSCWAG00000007709) #29 CSF3R (ENSCWAG00000007434) #30 GRIK3 (ENSCWAG00000007280) ENSCWAG00000007239 MEAF6 (ENSCWAG00000007151) SNIP1 (ENSCWAG00000007114) DNALI1 (ENSCWAG00000007051) GNL2 (ENSCWAG00000007009) RSPO1 (ENSCWAG00000006919) C1orf109 (ENSCWAG00000006887) Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00390000012030.a ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00390000012030.a ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 Cetacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00390000012030.a ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00990000210150 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737.g #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00390000012030.a ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00990000210150 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737.g #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00390000012030.a ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00990000210150 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737.g #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 Dolphin MODERN SPECIES 740 CLSPN (ENSTTRG00000015081) AGO4 (ENSTTRG00000015086) AGO1 (ENSTTRG00000015088) AGO3 (ENSTTRG00000015092) TEKT2 (ENSTTRG00000015093) ADPRS (ENSTTRG00000015096) COL8A2 (ENSTTRG00000015097) TRAPPC3 (ENSTTRG00000015098) MAP7D1 (ENSTTRG00000015100) THRAP3 (ENSTTRG00000015101) #22 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00390000012030.a ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00990000210150 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737.g #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000154717.ib ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 Vaquita MODERN SPECIES KIAA0319L (ENSPSNG00000014729) NCDN (ENSPSNG00000014884) TFAP2E (ENSPSNG00000015021) PSMB2 (ENSPSNG00000015130) C1orf216 (ENSPSNG00000015213) CLSPN (ENSPSNG00000015267) AGO4 (ENSPSNG00000015400) AGO1 (ENSPSNG00000015633) AGO3 (ENSPSNG00000015767) ENSPSNG00000015925 TEKT2 (ENSPSNG00000016008) ADPRS (ENSPSNG00000016066) COL8A2 (ENSPSNG00000016120) TRAPPC3 (ENSPSNG00000016166) MAP7D1 (ENSPSNG00000016291) THRAP3 (ENSPSNG00000016451) #22 ENSPSNG00000016520 EVA1B (ENSPSNG00000016616) STK40 (ENSPSNG00000016665) #26 LSM10 (ENSPSNG00000016792) #27 OSCP1 (ENSPSNG00000016833) #28 ENSPSNG00000017018 #29 CSF3R (ENSPSNG00000017067) #30 GRIK3 (ENSPSNG00000017499) ENSPSNG00000017843 ZC3H12A (ENSPSNG00000017941) MEAF6 (ENSPSNG00000018028) SNIP1 (ENSPSNG00000018177) DNALI1 (ENSPSNG00000018223) GNL2 (ENSPSNG00000018313) RSPO1 (ENSPSNG00000018411) Monodontidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00390000012030.a ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00990000210150 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737.g #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000154717.ib ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 Narwhal MODERN SPECIES 304 KIAA0319L (ENSMMNG00015009434) NCDN (ENSMMNG00015009414) TFAP2E (ENSMMNG00015009400) PSMB2 (ENSMMNG00015009386) C1orf216 (ENSMMNG00015009379) CLSPN (ENSMMNG00015009362) AGO1 (ENSMMNG00015009304) AGO4 (ENSMMNG00015009235) ENSMMNG00015009200 ENSMMNG00015009194 TEKT2 (ENSMMNG00015009187) ADPRS (ENSMMNG00015009176) COL8A2 (ENSMMNG00015009172) TRAPPC3 (ENSMMNG00015009162) MAP7D1 (ENSMMNG00015009143) THRAP3 (ENSMMNG00015009123) #22 ENSMMNG00015009102 EVA1B (ENSMMNG00015009093) STK40 (ENSMMNG00015009085) #26 LSM10 (ENSMMNG00015009078) #27 OSCP1 (ENSMMNG00015009023) #28 MRPS15 (ENSMMNG00015009004) #29 CSF3R (ENSMMNG00015008991) #30 GRIK3 (ENSMMNG00015008981) ZC3H12A (ENSMMNG00015008939) MEAF6 (ENSMMNG00015008912) SNIP1 (ENSMMNG00015008842) DNALI1 (ENSMMNG00015008824) GNL2 (ENSMMNG00015008807) RSPO1 (ENSMMNG00015008781) C1orf109 (ENSMMNG00015008763) Beluga whale MODERN SPECIES 74 ZMYM4 (ENSDLEG00000020543) KIAA0319L (ENSDLEG00000020588) NCDN (ENSDLEG00000020601) TFAP2E (ENSDLEG00000020609) PSMB2 (ENSDLEG00000020616) CUNH1orf216 (ENSDLEG00000020623) CLSPN (ENSDLEG00000020638) AGO4 (ENSDLEG00000020706) AGO1 (ENSDLEG00000020718) AGO3 (ENSDLEG00000020726) ENSDLEG00000020733 TEKT2 (ENSDLEG00000020737) COL8A2 (ENSDLEG00000020743) TRAPPC3 (ENSDLEG00000020746) MAP7D1 (ENSDLEG00000020755) THRAP3 (ENSDLEG00000020766) #22 ENSDLEG00000020772 EVA1B (ENSDLEG00000020774) STK40 (ENSDLEG00000020778) #26 LSM10 (ENSDLEG00000020785) #27 OSCP1 (ENSDLEG00000020789) #28 ENSDLEG00000020797 #29 CSF3R (ENSDLEG00000020804) #30 GRIK3 (ENSDLEG00000020811) ENSDLEG00000020819 ZC3H12A (ENSDLEG00000020831) MEAF6 (ENSDLEG00000020839) SNIP1 (ENSDLEG00000020851) DNALI1 (ENSDLEG00000020862) GNL2 (ENSDLEG00000007944) RSPO1 (ENSDLEG00000007971) Sperm whale MODERN SPECIES 540 THRAP3 (ENSPCTG00005012128) #22 Blue whale MODERN SPECIES KIAA0319L (ENSBMSG00010000897) NCDN (ENSBMSG00010000921) TFAP2E (ENSBMSG00010000953) PSMB2 (ENSBMSG00010000988) C1orf216 (ENSBMSG00010001008) CLSPN (ENSBMSG00010001054) AGO4 (ENSBMSG00010001125) AGO1 (ENSBMSG00010001153) AGO3 (ENSBMSG00010001203) ENSBMSG00010001236 TEKT2 (ENSBMSG00010001253) ADPRS (ENSBMSG00010001262) COL8A2 (ENSBMSG00010001272) TRAPPC3 (ENSBMSG00010001294) MAP7D1 (ENSBMSG00010001348) THRAP3 (ENSBMSG00010001398) #22 EVA1B (ENSBMSG00010001412) STK40 (ENSBMSG00010001425) #26 ENSBMSG00010001447 #27 OSCP1 (ENSBMSG00010001473) #28 MRPS15 (ENSBMSG00010001557) #29 CSF3R (ENSBMSG00010001575) #30 GRIK3 (ENSBMSG00010001634) ZC3H12A (ENSBMSG00010001681) ENSBMSG00010001718 SNIP1 (ENSBMSG00010001754) DNALI1 (ENSBMSG00010001767) GNL2 (ENSBMSG00010001802) RSPO1 (ENSBMSG00010001901) C1orf109 (ENSBMSG00010001923) CDCA8 (ENSBMSG00010001930) Pecora ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00390000012030.a ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 Yarkand deer MODERN SPECIES 12 TFAP2E (ENSCHYG00000027065) PSMB2 (ENSCHYG00000027060) C1orf216 (ENSCHYG00000027059) CLSPN (ENSCHYG00000027053) ENSCHYG00000027052 AGO4 (ENSCHYG00000027041) ENSCHYG00000027036 AGO3 (ENSCHYG00000027029) ENSCHYG00000027026 TEKT2 (ENSCHYG00000027024) ADPRS (ENSCHYG00000027021) COL8A2 (ENSCHYG00000027017) TRAPPC3 (ENSCHYG00000027012) MAP7D1 (ENSCHYG00000027002) ENSCHYG00000026996 THRAP3 (ENSCHYG00000026991) #22 SH3D21 (ENSCHYG00000026983) #24 EVA1B (ENSCHYG00000026978) STK40 (ENSCHYG00000026974) #26 LSM10 (ENSCHYG00000026972) #27 OSCP1 (ENSCHYG00000026967) #28 MRPS15 (ENSCHYG00000026961) #29 CSF3R (ENSCHYG00000026959) #30 GRIK3 (ENSCHYG00000026942) ENSCHYG00000026936 ZC3H12A (ENSCHYG00000026932) SNIP1 (ENSCHYG00000026912) DNALI1 (ENSCHYG00000026895) GNL2 (ENSCHYG00000026865) RSPO1 (ENSCHYG00000026851) C1orf109 (ENSCHYG00000026846) Percora_a ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00390000012030.a ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 Bovidae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00390000012030.a ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 Bovinae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00390000012030.a ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 Bos ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00390000012030.a ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 Bos_b ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00390000012030.a ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 22 KIAA0319L (ENSBIXG00005026746) TFAP2E (ENSBIXG00005026820) PSMB2 (ENSBIXG00005026844) C1orf216 (ENSBIXG00005026857) CLSPN (ENSBIXG00005004592) ENSBIXG00005026903 ENSBIXG00005026911 AGO1 (ENSBIXG00005026944) ENSBIXG00005026966 AGO3 (ENSBIXG00005027246) ENSBIXG00005005614 TEKT2 (ENSBIXG00005027402) COL8A2 (ENSBIXG00005027444) TRAPPC3 (ENSBIXG00005007591) MAP7D1 (ENSBIXG00005027608) THRAP3 (ENSBIXG00005027648) #22 ENSBIXG00005004754 #24 EVA1B (ENSBIXG00005027691) STK40 (ENSBIXG00005027735) #26 LSM10 (ENSBIXG00005027748) #27 OSCP1 (ENSBIXG00005027790) #28 MRPS15 (ENSBIXG00005027828) #29 CSF3R (ENSBIXG00005027869) #30 GRIK3 (ENSBIXG00005027987) ZC3H12A (ENSBIXG00005028023) SNIP1 (ENSBIXG00005028139) DNALI1 (ENSBIXG00005028180) GNL2 (ENSBIXG00005028205) RSPO1 (ENSBIXG00005028242) C1orf109 (ENSBIXG00005028256) CDCA8 (ENSBIXG00005007599) Cow MODERN SPECIES 22 KIAA0319L (ENSBTAG00000016694) NCDN (ENSBTAG00000016696) TFAP2E (ENSBTAG00000001959) PSMB2 (ENSBTAG00000002377) C3H1orf216 (ENSBTAG00000038292) CLSPN (ENSBTAG00000002826) AGO4 (ENSBTAG00000015220) AGO1 (ENSBTAG00000012253) AGO3 (ENSBTAG00000018324) ENSBTAG00000055249 TEKT2 (ENSBTAG00000021714) ADPRS (ENSBTAG00000021715) COL8A2 (ENSBTAG00000010175) TRAPPC3 (ENSBTAG00000005732) MAP7D1 (ENSBTAG00000030301) THRAP3 (ENSBTAG00000024095) #22 SH3D21 (ENSBTAG00000038617) #24 EVA1B (ENSBTAG00000014358) STK40 (ENSBTAG00000015969) #26 LSM10 (ENSBTAG00000024096) #27 OSCP1 (ENSBTAG00000007994) #28 MRPS15 (ENSBTAG00000024097) #29 CSF3R (ENSBTAG00000013334) #30 GRIK3 (ENSBTAG00000009269) ZC3H12A (ENSBTAG00000011316) MEAF6 (ENSBTAG00000010506) SNIP1 (ENSBTAG00000016852) DNALI1 (ENSBTAG00000002583) GNL2 (ENSBTAG00000003849) RSPO1 (ENSBTAG00000003837) C3H1orf109 (ENSBTAG00000014325) Bos_a ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00390000012030.a ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 ENSGT00390000011115 Wild yak MODERN SPECIES 504 TFAP2E (ENSBMUG00000021558) PSMB2 (ENSBMUG00000021571) ENSBMUG00000021576 C1orf216 (ENSBMUG00000021588) CLSPN (ENSBMUG00000021706) AGO4 (ENSBMUG00000021730) AGO1 (ENSBMUG00000021749) AGO3 (ENSBMUG00000021761) ENSBMUG00000021797 ENSBMUG00000021805 TEKT2 (ENSBMUG00000021822) ADPRS (ENSBMUG00000021835) COL8A2 (ENSBMUG00000021845) TRAPPC3 (ENSBMUG00000021877) MAP7D1 (ENSBMUG00000021965) THRAP3 (ENSBMUG00000022036) #22 SH3D21 (ENSBMUG00000022061) #24 EVA1B (ENSBMUG00000022076) STK40 (ENSBMUG00000022119) #26 LSM10 (ENSBMUG00000022140) #27 NPHP4 (ENSBMUG00000000118) KCNAB2 (ENSBMUG00000000324) CHD5 (ENSBMUG00000000423) RPL22 (ENSBMUG00000000473) RNF207 (ENSBMUG00000000544) ICMT (ENSBMUG00000000568) GPR153 (ENSBMUG00000000578) ACOT7 (ENSBMUG00000000671) ENSBMUG00000000699 ENSBMUG00000000714 ENSBMUG00000000737 Domestic yak MODERN SPECIES 22 TFAP2E (ENSBGRG00000010881) PSMB2 (ENSBGRG00000010708) C1orf216 (ENSBGRG00000010647) CLSPN (ENSBGRG00000010482) ENSBGRG00000010448 AGO1 (ENSBGRG00000010203) ENSBGRG00000010165 AGO4 (ENSBGRG00000009562) ENSBGRG00000009506 TEKT2 (ENSBGRG00000009332) ADPRS (ENSBGRG00000009212) COL8A2 (ENSBGRG00000009153) TRAPPC3 (ENSBGRG00000009085) MAP7D1 (ENSBGRG00000008399) ENSBGRG00000008330 THRAP3 (ENSBGRG00000008220) #22 SH3D21 (ENSBGRG00000008077) #24 ENSBGRG00000008041 STK40 (ENSBGRG00000007897) #26 LSM10 (ENSBGRG00000007878) #27 OSCP1 (ENSBGRG00000007695) #28 CSF3R (ENSBGRG00000007254) #30 ENSBGRG00000007155 GRIK3 (ENSBGRG00000006888) ZC3H12A (ENSBGRG00000006725) SNIP1 (ENSBGRG00000006583) DNALI1 (ENSBGRG00000006531) GNL2 (ENSBGRG00000006437) RSPO1 (ENSBGRG00000006342) C1orf109 (ENSBGRG00000006278) CDCA8 (ENSBGRG00000006243) American bison MODERN SPECIES 3081 KIAA0319L (ENSBBBG00000008471) NCDN (ENSBBBG00000021563) ENSBBBG00000021575 PSMB2 (ENSBBBG00000021588) C1orf216 (ENSBBBG00000021593) CLSPN (ENSBBBG00000021717) AGO4 (ENSBBBG00000021763) AGO1 (ENSBBBG00000021806) AGO3 (ENSBBBG00000008372) ENSBBBG00000007681 TEKT2 (ENSBBBG00000021903) ADPRS (ENSBBBG00000021910) COL8A2 (ENSBBBG00000021919) TRAPPC3 (ENSBBBG00000021943) MAP7D1 (ENSBBBG00000022091) THRAP3 (ENSBBBG00000022137) #22 ENSBBBG00000022154 #24 EVA1B (ENSBBBG00000007200) STK40 (ENSBBBG00000022179) #26 LSM10 (ENSBBBG00000022186) #27 OSCP1 (ENSBBBG00000022249) #28 MRPS15 (ENSBBBG00000022276) #29 CSF3R (ENSBBBG00000005872) #30 GRIK3 (ENSBBBG00000022330) Caprinae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00390000012030.a ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737.j #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 Goat MODERN SPECIES 22 KIAA0319L (ENSCHIG00000020470) ENSCHIG00000016571 NCDN (ENSCHIG00000026559) TFAP2E (ENSCHIG00000021809) PSMB2 (ENSCHIG00000016929) C1orf216 (ENSCHIG00000008904) CLSPN (ENSCHIG00000023309) AGO4 (ENSCHIG00000026564) ENSCHIG00000011848 AGO3 (ENSCHIG00000011536) TEKT2 (ENSCHIG00000026732) ADPRS (ENSCHIG00000011636) COL8A2 (ENSCHIG00000023849) TRAPPC3 (ENSCHIG00000015948) MAP7D1 (ENSCHIG00000003118) THRAP3 (ENSCHIG00000022784) #22 ENSCHIG00000018156 #24 EVA1B (ENSCHIG00000011422) STK40 (ENSCHIG00000020883) #26 LSM10 (ENSCHIG00000009398) #27 OSCP1 (ENSCHIG00000012198) #28 ENSCHIG00000016923 #29 CSF3R (ENSCHIG00000006768) #30 GRIK3 (ENSCHIG00000021730) ZC3H12A (ENSCHIG00000021957) MEAF6 (ENSCHIG00000002979) SNIP1 (ENSCHIG00000013452) DNALI1 (ENSCHIG00000007466) GNL2 (ENSCHIG00000015731) RSPO1 (ENSCHIG00000023675) C1orf109 (ENSCHIG00000011969) Rambouillet Sheep MODERN SPECIES KIAA0319L (ENSOARG00020010426) NCDN (ENSOARG00020010602) TFAP2E (ENSOARG00020010658) PSMB2 (ENSOARG00020010787) C1orf216 (ENSOARG00020010859) CLSPN (ENSOARG00020010932) AGO4 (ENSOARG00020012103) AGO1 (ENSOARG00020012325) AGO3 (ENSOARG00020012702) ENSOARG00020012933 TEKT2 (ENSOARG00020012976) ADPRS (ENSOARG00020013078) COL8A2 (ENSOARG00020013134) TRAPPC3 (ENSOARG00020013190) MAP7D1 (ENSOARG00020013418) THRAP3 (ENSOARG00020013606) #22 ENSOARG00020013812 #24 EVA1B (ENSOARG00020014434) STK40 (ENSOARG00020014470) #26 LSM10 (ENSOARG00020014526) #27 OSCP1 (ENSOARG00020014556) #28 MRPS15 (ENSOARG00020014966) #29 CSF3R (ENSOARG00020015107) #30 GRIK3 (ENSOARG00020015177) ZC3H12A (ENSOARG00020015441) MEAF6 (ENSOARG00020015561) SNIP1 (ENSOARG00020015736) DNALI1 (ENSOARG00020015777) GNL2 (ENSOARG00020015915) RSPO1 (ENSOARG00020016022) C1orf109 (ENSOARG00020016199) Siberian musk deer MODERN SPECIES 4 KIAA0319L (ENSMMSG00000009718) NCDN (ENSMMSG00000009667) TFAP2E (ENSMMSG00000009625) PSMB2 (ENSMMSG00000009599) C1orf216 (ENSMMSG00000009587) CLSPN (ENSMMSG00000009515) AGO4 (ENSMMSG00000009404) AGO1 (ENSMMSG00000009238) AGO3 (ENSMMSG00000009092) ENSMMSG00000009060 TEKT2 (ENSMMSG00000008997) ADPRS (ENSMMSG00000008967) COL8A2 (ENSMMSG00000008947) TRAPPC3 (ENSMMSG00000008867) MAP7D1 (ENSMMSG00000008733) THRAP3 (ENSMMSG00000008671) #22 SH3D21 (ENSMMSG00000008627) #24 EVA1B (ENSMMSG00000008604) STK40 (ENSMMSG00000008536) #26 LSM10 (ENSMMSG00000008521) #27 OSCP1 (ENSMMSG00000008440) #28 MRPS15 (ENSMMSG00000008409) #29 CSF3R (ENSMMSG00000008372) #30 GRIK3 (ENSMMSG00000008231) ZC3H12A (ENSMMSG00000008185) MEAF6 (ENSMMSG00000008080) ENSMMSG00000008041 DNALI1 (ENSMMSG00000007981) GNL2 (ENSMMSG00000007948) RSPO1 (ENSMMSG00000007885) C1orf109 (ENSMMSG00000007865) Camelidae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000156221 ENSGT00940000159550 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00640000091536 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00390000012030.a ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 Arabian camel MODERN SPECIES 4 SFPQ (ENSCDRG00005021228) ZMYM4 (ENSCDRG00005021241) KIAA0319L (ENSCDRG00005021261) NCDN (ENSCDRG00005021273) PSMB2 (ENSCDRG00005021286) CLSPN (ENSCDRG00005021303) AGO4 (ENSCDRG00005021335) AGO1 (ENSCDRG00005006649) AGO3 (ENSCDRG00005006758) ENSCDRG00005006892 TEKT2 (ENSCDRG00005007020) ADPRS (ENSCDRG00005007072) COL8A2 (ENSCDRG00005007112) TRAPPC3 (ENSCDRG00005007149) MAP7D1 (ENSCDRG00005007249) THRAP3 (ENSCDRG00005008001) #22 ENSCDRG00005008118 #24 EVA1B (ENSCDRG00005008175) STK40 (ENSCDRG00005008254) #26 LSM10 (ENSCDRG00005008343) #27 OSCP1 (ENSCDRG00005008387) #28 MRPS15 (ENSCDRG00005008579) #29 CSF3R (ENSCDRG00005008687) #30 GRIK3 (ENSCDRG00005008818) ZC3H12A (ENSCDRG00005008948) MEAF6 (ENSCDRG00005009070) SNIP1 (ENSCDRG00005009364) DNALI1 (ENSCDRG00005009434) GNL2 (ENSCDRG00005009550) RSPO1 (ENSCDRG00005009641) C1orf109 (ENSCDRG00005009761) Alpaca MODERN SPECIES 5398 THRAP3 (ENSVPAG00000004656) #22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157613 ENSGT00940000168628 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 Carnivora ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000157613 ENSGT00940000168628 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 Felidae ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000157613 ENSGT00910000144152.b.b.b ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00550000074698.k.a.b.a.a.a ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 Panthera ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000157613 ENSGT00910000144152.b.b.b ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00550000074698.k.a.b.a.a.a ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 Panthera_a ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000157613 ENSGT00910000144152.b.b.b ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00550000074698.k.a.b.a.a.a ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 lion MODERN SPECIES 8 KIAA0319L (ENSPLOG00000022058) NCDN (ENSPLOG00000022040) TFAP2E (ENSPLOG00000022025) PSMB2 (ENSPLOG00000022003) C1orf216 (ENSPLOG00000021988) ENSPLOG00000021982 CLSPN (ENSPLOG00000021959) AGO1 (ENSPLOG00000021894) AGO4 (ENSPLOG00000021693) ENSPLOG00000021615 TEKT2 (ENSPLOG00000021579) ADPRS (ENSPLOG00000021546) COL8A2 (ENSPLOG00000021527) TRAPPC3 (ENSPLOG00000021495) MAP7D1 (ENSPLOG00000021300) THRAP3 (ENSPLOG00000021215) #22 ENSPLOG00000021161 EVA1B (ENSPLOG00000021132) STK40 (ENSPLOG00000021083) #26 ENSPLOG00000021048 #27 OSCP1 (ENSPLOG00000020969) #28 MRPS15 (ENSPLOG00000020901) #29 CSF3R (ENSPLOG00000020805) #30 GRIK3 (ENSPLOG00000020707) ZC3H12A (ENSPLOG00000020649) MEAF6 (ENSPLOG00000020523) SNIP1 (ENSPLOG00000020485) DNALI1 (ENSPLOG00000020424) GNL2 (ENSPLOG00000020381) RSPO1 (ENSPLOG00000020291) C1orf109 (ENSPLOG00000020230) leopard MODERN SPECIES 130 KIAA0319L (ENSPPRG00000012492) ENSPPRG00000011950 NCDN (ENSPPRG00000010663) TFAP2E (ENSPPRG00000010109) PSMB2 (ENSPPRG00000009440) C1orf216 (ENSPPRG00000015355) CLSPN (ENSPPRG00000008963) AGO4 (ENSPPRG00000006520) AGO1 (ENSPPRG00000006475) AGO3 (ENSPPRG00000005934) TEKT2 (ENSPPRG00000005344) ADPRS (ENSPPRG00000004988) COL8A2 (ENSPPRG00000004825) TRAPPC3 (ENSPPRG00000004660) MAP7D1 (ENSPPRG00000003580) THRAP3 (ENSPPRG00000001735) #22 SH3D21 (ENSPPRG00000001082) #24 EVA1B (ENSPPRG00000023067) STK40 (ENSPPRG00000023089) #26 LSM10 (ENSPPRG00000014619) #27 OSCP1 (ENSPPRG00000024092) #28 MRPS15 (ENSPPRG00000024277) #29 CSF3R (ENSPPRG00000024429) #30 ENSPPRG00000019275 GRIK3 (ENSPPRG00000017558) ZC3H12A (ENSPPRG00000014359) MEAF6 (ENSPPRG00000012769) SNIP1 (ENSPPRG00000011313) DNALI1 (ENSPPRG00000010993) GNL2 (ENSPPRG00000010528) RSPO1 (ENSPPRG00000009901) Tiger MODERN SPECIES 383 ZMYM4 (ENSPTIG00000008677) KIAA0319L (ENSPTIG00000011048) NCDN (ENSPTIG00000012074) TFAP2E (ENSPTIG00000014612) PSMB2 (ENSPTIG00000015407) C1orf216 (ENSPTIG00000003921) CLSPN (ENSPTIG00000016555) AGO4 (ENSPTIG00000020262) AGO1 (ENSPTIG00000020991) AGO3 (ENSPTIG00000001029) TEKT2 (ENSPTIG00000009996) ADPRS (ENSPTIG00000010575) COL8A2 (ENSPTIG00000011151) TRAPPC3 (ENSPTIG00000011666) MAP7D1 (ENSPTIG00000012934) THRAP3 (ENSPTIG00000016888) #22 SH3D21 (ENSPTIG00000017828) #24 ENSPTIG00000020226 #25 STK40 (ENSPTIG00000020622) #26 LSM10 (ENSPTIG00000004613) #27 OSCP1 (ENSPTIG00000021848) #28 MRPS15 (ENSPTIG00000022020) #29 CSF3R (ENSPTIG00000002473) #30 ENSPTIG00000009786 GRIK3 (ENSPTIG00000010943) ZC3H12A (ENSPTIG00000012943) MEAF6 (ENSPTIG00000013885) SNIP1 (ENSPTIG00000014216) DNALI1 (ENSPTIG00000014464) GNL2 (ENSPTIG00000015095) RSPO1 (ENSPTIG00000015434) Cat MODERN SPECIES 239 KIAA0319L (ENSFCAG00000013873) ENSFCAG00000038220 NCDN (ENSFCAG00000013876) TFAP2E (ENSFCAG00000013878) PSMB2 (ENSFCAG00000030845) CC1H1orf216 (ENSFCAG00000013881) CLSPN (ENSFCAG00000013882) AGO4 (ENSFCAG00000006218) AGO1 (ENSFCAG00000000746) AGO3 (ENSFCAG00000000747) TEKT2 (ENSFCAG00000012461) ADPRS (ENSFCAG00000012465) COL8A2 (ENSFCAG00000042990) TRAPPC3 (ENSFCAG00000043644) MAP7D1 (ENSFCAG00000012469) THRAP3 (ENSFCAG00000014127) #22 SH3D21 (ENSFCAG00000051592) #24 EVA1B (ENSFCAG00000026800) STK40 (ENSFCAG00000005262) #26 LSM10 (ENSFCAG00000047113) #27 OSCP1 (ENSFCAG00000005258) #28 MRPS15 (ENSFCAG00000005265) #29 CSF3R (ENSFCAG00000013269) #30 ENSFCAG00000029626 GRIK3 (ENSFCAG00000005150) ZC3H12A (ENSFCAG00000008757) MEAF6 (ENSFCAG00000038230) SNIP1 (ENSFCAG00000008758) DNALI1 (ENSFCAG00000008759) GNL2 (ENSFCAG00000008760) RSPO1 (ENSFCAG00000008761) Caniformia ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000157613 ENSGT00940000168628 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 Canidae ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000159550 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000156221.a ENSGT00940000159550 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738.k ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 Dog MODERN SPECIES 6 ZMYM6 (ENSCAFG00845015247) ZMYM1 (ENSCAFG00845015149) ENSCAFG00845015011 ZMYM4 (ENSCAFG00845014825) KIAA0319L (ENSCAFG00845014738) NCDN (ENSCAFG00845014699) TFAP2E (ENSCAFG00845014665) PSMB2 (ENSCAFG00845014631) C15H1orf216 (ENSCAFG00845014608) CLSPN (ENSCAFG00845014565) AGO1 (ENSCAFG00845030992) AGO3 (ENSCAFG00845030956) ADPRHL2 (ENSCAFG00845030916) COL8A2 (ENSCAFG00845030898) TRAPPC3 (ENSCAFG00845030892) THRAP3 (ENSCAFG00845030875) #22 ENSCAFG00845030851 ENSCAFG00845030827 #24 ENSCAFG00845030799 STK40 (ENSCAFG00845030786) #26 LSM10 (ENSCAFG00845030776) #27 OSCP1 (ENSCAFG00845030771) #28 ENSCAFG00845030768 #29 CSF3R (ENSCAFG00845030757) #30 GRIK3 (ENSCAFG00845030735) ZC3H12A (ENSCAFG00845030728) MEAF6 (ENSCAFG00845030711) SNIP1 (ENSCAFG00845030697) DNALI1 (ENSCAFG00845030680) GNL2 (ENSCAFG00845030665) RSPO1 (ENSCAFG00845030653) Dingo MODERN SPECIES 344 ENSCAFG00020010702 ZMYM4 (ENSCAFG00020009999) KIAA0319L (ENSCAFG00020009949) NCDN (ENSCAFG00020009945) TFAP2E (ENSCAFG00020009931) PSMB2 (ENSCAFG00020009927) ENSCAFG00020009913 ENSCAFG00020009910 AGO1 (ENSCAFG00020009251) AGO3 (ENSCAFG00020009051) TEKT2 (ENSCAFG00020009035) ADPRS (ENSCAFG00020009028) COL8A2 (ENSCAFG00020009026) TRAPPC3 (ENSCAFG00020009022) MAP7D1 (ENSCAFG00020009006) THRAP3 (ENSCAFG00020008982) #22 ENSCAFG00020008975 SH3D21 (ENSCAFG00020008955) #24 STK40 (ENSCAFG00020008930) #26 LSM10 (ENSCAFG00020008920) #27 OSCP1 (ENSCAFG00020008914) #28 MRPS15 (ENSCAFG00020008912) #29 CSF3R (ENSCAFG00020008854) #30 ENSCAFG00020008853 GRIK3 (ENSCAFG00020008653) ZC3H12A (ENSCAFG00020008620) MEAF6 (ENSCAFG00020008613) ENSCAFG00020008608 SNIP1 (ENSCAFG00020008599) DNALI1 (ENSCAFG00020008587) GNL2 (ENSCAFG00020008050) Red fox MODERN SPECIES 9 KIAA0319L (ENSVVUG00000000742) NCDN (ENSVVUG00000000730) PSMB2 (ENSVVUG00000000594) CUNH1orf216 (ENSVVUG00000000576) ENSVVUG00000000567 ENSVVUG00000000502 ENSVVUG00000000479 ENSVVUG00000000465 AGO1 (ENSVVUG00000000405) AGO3 (ENSVVUG00000000362) ENSVVUG00000000300 ADPRS (ENSVVUG00000000243) COL8A2 (ENSVVUG00000000223) TRAPPC3 (ENSVVUG00000000193) MAP7D1 (ENSVVUG00000000164) THRAP3 (ENSVVUG00000000118) #22 SH3D21 (ENSVVUG00000023237) #24 ENSVVUG00000023229 #25 STK40 (ENSVVUG00000023215) #26 LSM10 (ENSVVUG00000023209) #27 OSCP1 (ENSVVUG00000023202) #28 MRPS15 (ENSVVUG00000023194) #29 CSF3R (ENSVVUG00000023189) #30 GRIK3 (ENSVVUG00000023178) ZC3H12A (ENSVVUG00000023171) MEAF6 (ENSVVUG00000023163) SNIP1 (ENSVVUG00000023160) DNALI1 (ENSVVUG00000023159) GNL2 (ENSVVUG00000023157) RSPO1 (ENSVVUG00000023149) CUNH1orf109 (ENSVVUG00000023148) Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000157613 ENSGT00940000168628 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 Mustelinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000159550 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 American mink MODERN SPECIES 99 SFPQ (ENSNVIG00000011654) ZMYM4 (ENSNVIG00000011677) KIAA0319L (ENSNVIG00000011748) NCDN (ENSNVIG00000011790) TFAP2E (ENSNVIG00000011827) PSMB2 (ENSNVIG00000011855) CA216 (ENSNVIG00000011868) CLSPN (ENSNVIG00000011881) AGO1 (ENSNVIG00000012004) ENSNVIG00000012133 TEKT2 (ENSNVIG00000012158) ADPRS (ENSNVIG00000012218) COL8A2 (ENSNVIG00000012227) TPPC3 (ENSNVIG00000012239) MAP7D1 (ENSNVIG00000012295) THRAP3 (ENSNVIG00000012429) #22 ENSNVIG00000012530 #24 EVA1B (ENSNVIG00000012547) STK40 (ENSNVIG00000012562) #26 LSM10 (ENSNVIG00000012589) #27 OSCP1 (ENSNVIG00000012600) #28 ENSNVIG00000012683 #29 CSF3R (ENSNVIG00000012698) #30 GRIK3 (ENSNVIG00000012775) ZC3H12A (ENSNVIG00000012804) MEAF6 (ENSNVIG00000012809) SNIP1 (ENSNVIG00000012822) DNALI1 (ENSNVIG00000012831) GNL2 (ENSNVIG00000012836) RSPO1 (ENSNVIG00000012862) C1orf109 (ENSNVIG00000012887) Ferret MODERN SPECIES 167 KIAA0319L (ENSMPUG00000014917) NCDN (ENSMPUG00000014913) TFAP2E (ENSMPUG00000014894) PSMB2 (ENSMPUG00000014891) C1orf216 (ENSMPUG00000018596) CLSPN (ENSMPUG00000014881) AGO4 (ENSMPUG00000014876) AGO1 (ENSMPUG00000014872) ENSMPUG00000014871 TEKT2 (ENSMPUG00000014823) ADPRS (ENSMPUG00000014821) COL8A2 (ENSMPUG00000014818) TRAPPC3 (ENSMPUG00000014815) ENSMPUG00000018594 MAP7D1 (ENSMPUG00000014812) THRAP3 (ENSMPUG00000014809) #22 ENSMPUG00000014783 #24 EVA1B (ENSMPUG00000014781) STK40 (ENSMPUG00000014777) #26 LSM10 (ENSMPUG00000018593) #27 OSCP1 (ENSMPUG00000014774) #28 CSF3R (ENSMPUG00000014768) #30 GRIK3 (ENSMPUG00000014760) ZC3H12A (ENSMPUG00000014758) MEAF6 (ENSMPUG00000014722) SNIP1 (ENSMPUG00000014718) DNALI1 (ENSMPUG00000014714) GNL2 (ENSMPUG00000014709) RSPO1 (ENSMPUG00000014706) C1orf109 (ENSMPUG00000014702) CDCA8 (ENSMPUG00000014699) Ursidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157613 ENSGT00940000168628 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536.f ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 Ursus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157613 ENSGT00940000168628 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536.f ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808.a #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 Polar bear MODERN SPECIES 189 NCDN (ENSUMAG00000007557) TFAP2E (ENSUMAG00000007555) PSMB2 (ENSUMAG00000007547) C1orf216 (ENSUMAG00000007539) ENSUMAG00000007536 ENSUMAG00000007529 AGO4 (ENSUMAG00000006297) AGO1 (ENSUMAG00000002480) ENSUMAG00000002065 ENSUMAG00000002033 TEKT2 (ENSUMAG00000002004) ADPRS (ENSUMAG00000001988) COL8A2 (ENSUMAG00000001984) TRAPPC3 (ENSUMAG00000001979) MAP7D1 (ENSUMAG00000001773) THRAP3 (ENSUMAG00000001744) #22 ENSUMAG00000001726 #24 STK40 (ENSUMAG00000001453) #26 LSM10 (ENSUMAG00000001438) #27 ENSUMAG00000001369 #28 MRPS15 (ENSUMAG00000001358) #29 CSF3R (ENSUMAG00000001333) #30 GRIK3 (ENSUMAG00000001150) ZC3H12A (ENSUMAG00000001122) MEAF6 (ENSUMAG00000001101) SNIP1 (ENSUMAG00000001093) DNALI1 (ENSUMAG00000001085) GNL2 (ENSUMAG00000000413) RSPO1 (ENSUMAG00000000320) C1orf109 (ENSUMAG00000000310) CDCA8 (ENSUMAG00000000303) American black bear MODERN SPECIES 2000 THRAP3 (ENSUAMG00000015685) #22 ENSUAMG00000015686 #24 EVA1B (ENSUAMG00000015687) STK40 (ENSUAMG00000015688) #26 Giant Panda DUPLICATION Giant Panda DUPLICATION Giant Panda MODERN SPECIES 11 KIAA0319L (ENSAMEG00000000737) NCDN (ENSAMEG00000000724) TFAP2E (ENSAMEG00000028474) PSMB2 (ENSAMEG00000000715) C1orf216 (ENSAMEG00000018544) CLSPN (ENSAMEG00000000679) AGO4 (ENSAMEG00000000573) AGO1 (ENSAMEG00000000504) AGO3 (ENSAMEG00000000497) TEKT2 (ENSAMEG00000000473) ADPRS (ENSAMEG00000025564) COL8A2 (ENSAMEG00000000461) TRAPPC3 (ENSAMEG00000000457) MAP7D1 (ENSAMEG00000000412) ENSAMEG00000024644 #22 ENSAMEG00000028122 #22 ENSAMEG00000001385 #24 EVA1B (ENSAMEG00000031396) STK40 (ENSAMEG00000001415) #26 LSM10 (ENSAMEG00000019854) #27 OSCP1 (ENSAMEG00000001437) #28 MRPS15 (ENSAMEG00000001463) #29 CSF3R (ENSAMEG00000001480) #30 GRIK3 (ENSAMEG00000001517) ZC3H12A (ENSAMEG00000000991) MEAF6 (ENSAMEG00000027272) SNIP1 (ENSAMEG00000001009) DNALI1 (ENSAMEG00000001019) GNL2 (ENSAMEG00000001032) RSPO1 (ENSAMEG00000027319) C1orf109 (ENSAMEG00000001077) Giant Panda MODERN SPECIES 11 ZMYM4 (ENSAMEG00000000760) KIAA0319L (ENSAMEG00000000737) NCDN (ENSAMEG00000000724) TFAP2E (ENSAMEG00000028474) PSMB2 (ENSAMEG00000000715) C1orf216 (ENSAMEG00000018544) CLSPN (ENSAMEG00000000679) AGO4 (ENSAMEG00000000573) AGO1 (ENSAMEG00000000504) AGO3 (ENSAMEG00000000497) TEKT2 (ENSAMEG00000000473) ADPRS (ENSAMEG00000025564) COL8A2 (ENSAMEG00000000461) TRAPPC3 (ENSAMEG00000000457) MAP7D1 (ENSAMEG00000000412) ENSAMEG00000024644 #22 ENSAMEG00000028122 #22 ENSAMEG00000001385 #24 EVA1B (ENSAMEG00000031396) STK40 (ENSAMEG00000001415) #26 LSM10 (ENSAMEG00000019854) #27 OSCP1 (ENSAMEG00000001437) #28 MRPS15 (ENSAMEG00000001463) #29 CSF3R (ENSAMEG00000001480) #30 GRIK3 (ENSAMEG00000001517) ZC3H12A (ENSAMEG00000000991) MEAF6 (ENSAMEG00000027272) SNIP1 (ENSAMEG00000001009) DNALI1 (ENSAMEG00000001019) GNL2 (ENSAMEG00000001032) RSPO1 (ENSAMEG00000027319) Giant Panda MODERN SPECIES 687 ENSAMEG00000028730 #22 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000159550 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 Equus ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000159550 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT01030000238136 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000171437 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 Horse MODERN SPECIES 11 ZMYM4 (ENSECAG00000008800) NCDN (ENSECAG00000008891) KIAA0319L (ENSECAG00000012927) TFAP2E (ENSECAG00000003027) PSMB2 (ENSECAG00000021615) C2H1orf216 (ENSECAG00000005102) CLSPN (ENSECAG00000009472) AGO4 (ENSECAG00000023972) AGO1 (ENSECAG00000024353) AGO3 (ENSECAG00000051188) TEKT2 (ENSECAG00000017670) ADPRS (ENSECAG00000013445) COL8A2 (ENSECAG00000012799) TRAPPC3 (ENSECAG00000012569) MAP7D1 (ENSECAG00000001581) THRAP3 (ENSECAG00000021207) #22 SH3D21 (ENSECAG00000020556) #24 STK40 (ENSECAG00000015678) #26 LSM10 (ENSECAG00000005071) #27 OSCP1 (ENSECAG00000008850) #28 MRPS15 (ENSECAG00000000933) #29 CSF3R (ENSECAG00000013457) #30 ENSECAG00000040086 GRIK3 (ENSECAG00000010275) ENSECAG00000032155 ZC3H12A (ENSECAG00000009562) MEAF6 (ENSECAG00000022449) SNIP1 (ENSECAG00000021869) DNALI1 (ENSECAG00000018337) GNL2 (ENSECAG00000008068) RSPO1 (ENSECAG00000022683) Donkey MODERN SPECIES 25 ZMYM4 (ENSEASG00005012020) KIAA0319L (ENSEASG00005012027) NCDN (ENSEASG00005012034) TFAP2E (ENSEASG00005012037) PSMB2 (ENSEASG00005012040) C1orf216 (ENSEASG00005029553) CLSPN (ENSEASG00005012055) AGO4 (ENSEASG00005012079) AGO1 (ENSEASG00005012086) AGO3 (ENSEASG00005012089) TEKT2 (ENSEASG00005012098) ADPRS (ENSEASG00005012163) COL8A2 (ENSEASG00005012168) TRAPPC3 (ENSEASG00005038259) MAP7D1 (ENSEASG00005012176) THRAP3 (ENSEASG00005012182) #22 ENSEASG00005012187 #24 EVA1B (ENSEASG00005012191) STK40 (ENSEASG00005012192) #26 LSM10 (ENSEASG00005031673) #27 OSCP1 (ENSEASG00005012195) #28 MRPS15 (ENSEASG00005032042) #29 CSF3R (ENSEASG00005012209) #30 ENSEASG00005012213 GRIK3 (ENSEASG00005012214) ENSEASG00005012219 MEAF6 (ENSEASG00005012221) SNIP1 (ENSEASG00005012223) DNALI1 (ENSEASG00005024722) GNL2 (ENSEASG00005012227) RSPO1 (ENSEASG00005012231) Chiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000159550 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 Megabat MODERN SPECIES 1190 THRAP3 (ENSPVAG00000008632) #22 ENSPVAG00000008635 #24 ENSPVAG00000008637 #24 EVA1B (ENSPVAG00000008639) STK40 (ENSPVAG00000008642) #26 LSM10 (ENSPVAG00000008644) #27 OSCP1 (ENSPVAG00000008646) #28 MRPS15 (ENSPVAG00000008648) #29 CSF3R (ENSPVAG00000008650) #30 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000159550 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 27 ZMYM4 (ENSRFEG00010001311) KIAA0319L (ENSRFEG00010001380) NCDN (ENSRFEG00010001441) TFAP2E (ENSRFEG00010001481) ENSRFEG00010001507 C1orf216 (ENSRFEG00010001522) CLSPN (ENSRFEG00010001591) AGO4 (ENSRFEG00010001742) AGO1 (ENSRFEG00010001802) AGO3 (ENSRFEG00010001891) TEKT2 (ENSRFEG00010001943) ADPRS (ENSRFEG00010001958) COL8A2 (ENSRFEG00010001979) TRAPPC3 (ENSRFEG00010002008) MAP7D1 (ENSRFEG00010002111) THRAP3 (ENSRFEG00010002289) #22 ENSRFEG00010002356 EVA1B (ENSRFEG00010002372) STK40 (ENSRFEG00010002403) #26 LSM10 (ENSRFEG00010002437) #27 OSCP1 (ENSRFEG00010002458) #28 MRPS15 (ENSRFEG00010002496) #29 CSF3R (ENSRFEG00010002521) #30 ENSRFEG00010002566 GRIK3 (ENSRFEG00010002581) ZC3H12A (ENSRFEG00010002614) MEAF6 (ENSRFEG00010002688) SNIP1 (ENSRFEG00010002767) DNALI1 (ENSRFEG00010002793) GNL2 (ENSRFEG00010002826) RSPO1 (ENSRFEG00010002896) Microbat MODERN SPECIES 1068 ENSMLUG00000026401 KIAA0319L (ENSMLUG00000004024) NCDN (ENSMLUG00000009374) TFAP2E (ENSMLUG00000009852) PSMB2 (ENSMLUG00000009862) C1orf216 (ENSMLUG00000017091) CLSPN (ENSMLUG00000017093) AGO4 (ENSMLUG00000017102) AGO1 (ENSMLUG00000009628) AGO3 (ENSMLUG00000009668) TEKT2 (ENSMLUG00000011491) ADPRS (ENSMLUG00000027862) COL8A2 (ENSMLUG00000011023) TRAPPC3 (ENSMLUG00000002140) MAP7D1 (ENSMLUG00000012362) THRAP3 (ENSMLUG00000006447) #22 ENSMLUG00000006453 #24 ENSMLUG00000006458 EVA1B (ENSMLUG00000024745) STK40 (ENSMLUG00000006463) #26 LSM10 (ENSMLUG00000023895) #27 OSCP1 (ENSMLUG00000006472) #28 MRPS15 (ENSMLUG00000006475) #29 CSF3R (ENSMLUG00000006479) #30 Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183163.a.a #22 Common shrew MODERN SPECIES 9836 THRAP3 (ENSSARG00000006424) #22 Hedgehog MODERN SPECIES 3679 THRAP3 (ENSEEUG00000004939) #22 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000159550 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00940000159550 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 Armadillo MODERN SPECIES 2908 ZMYM4 (ENSDNOG00000017647) KIAA0319L (ENSDNOG00000017653) NCDN (ENSDNOG00000017658) TFAP2E (ENSDNOG00000036871) PSMB2 (ENSDNOG00000017663) C1orf216 (ENSDNOG00000017576) CLSPN (ENSDNOG00000015628) AGO4 (ENSDNOG00000015674) AGO1 (ENSDNOG00000008077) AGO3 (ENSDNOG00000008106) TEKT2 (ENSDNOG00000040733) ADPRS (ENSDNOG00000025495) COL8A2 (ENSDNOG00000043920) TRAPPC3 (ENSDNOG00000039424) MAP7D1 (ENSDNOG00000005516) THRAP3 (ENSDNOG00000031470) #22 SH3D21 (ENSDNOG00000023808) #24 EVA1B (ENSDNOG00000010513) ENSDNOG00000023624 STK40 (ENSDNOG00000041875) #26 LSM10 (ENSDNOG00000036662) #27 OSCP1 (ENSDNOG00000040997) #28 MRPS15 (ENSDNOG00000046736) #29 CSF3R (ENSDNOG00000018916) #30 GRIK3 (ENSDNOG00000008042) ZC3H12A (ENSDNOG00000035006) MEAF6 (ENSDNOG00000038956) ENSDNOG00000014381 DNALI1 (ENSDNOG00000031070) ENSDNOG00000016466 RSPO1 (ENSDNOG00000049599) Sloth MODERN SPECIES 3423 THRAP3 (ENSCHOG00000008973) #22 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000159550 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 Tenrec MODERN SPECIES 3357 THRAP3 (ENSETEG00000003542) #22 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000156221 ENSGT00940000159550 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 Elephant MODERN SPECIES 332 ZMYM4 (ENSLAFG00000007332) KIAA0319L (ENSLAFG00000007339) NCDN (ENSLAFG00000007345) TFAP2E (ENSLAFG00000029444) PSMB2 (ENSLAFG00000007353) C1orf216 (ENSLAFG00000027891) CLSPN (ENSLAFG00000007905) AGO4 (ENSLAFG00000010394) AGO1 (ENSLAFG00000010835) AGO3 (ENSLAFG00000002744) TEKT2 (ENSLAFG00000017273) ADPRS (ENSLAFG00000017280) ENSLAFG00000030120 TRAPPC3 (ENSLAFG00000009853) MAP7D1 (ENSLAFG00000009850) THRAP3 (ENSLAFG00000009587) #22 ENSLAFG00000028055 #24 ENSLAFG00000000070 #24 EVA1B (ENSLAFG00000008194) STK40 (ENSLAFG00000009594) #26 LSM10 (ENSLAFG00000009600) #27 OSCP1 (ENSLAFG00000021988) #28 MRPS15 (ENSLAFG00000011450) #29 CSF3R (ENSLAFG00000014447) #30 GRIK3 (ENSLAFG00000015216) ENSLAFG00000030279 RSPO1 (ENSLAFG00000006813) ZC3H12A (ENSLAFG00000018720) MEAF6 (ENSLAFG00000018721) SNIP1 (ENSLAFG00000030689) DNALI1 (ENSLAFG00000018722) Hyrax MODERN SPECIES 11665 THRAP3 (ENSPCAG00000008951) #22 ENSPCAG00000008924 #24 Marsupialia ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000159550 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a.i ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 ENSGT00390000011115 Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000159550 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a.i ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 ENSGT00390000011115 Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000159550 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a.i ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 ENSGT00390000011115 Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000159550 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536.a ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a.i ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 ENSGT00390000011115 koala MODERN SPECIES 14 ENSPCIG00000005735 KIAA0319L (ENSPCIG00000000705) NCDN (ENSPCIG00000000687) TFAP2E (ENSPCIG00000000674) PSMB2 (ENSPCIG00000000656) ENSPCIG00000000636 CLSPN (ENSPCIG00000000623) AGO4 (ENSPCIG00000000092) AGO1 (ENSPCIG00000000172) AGO3 (ENSPCIG00000000198) TEKT2 (ENSPCIG00000000226) ADPRS (ENSPCIG00000000248) COL8A2 (ENSPCIG00000000274) TRAPPC3 (ENSPCIG00000000307) MAP7D1 (ENSPCIG00000024807) THRAP3 (ENSPCIG00000024805) #22 EVA1B (ENSPCIG00000014860) STK40 (ENSPCIG00000014864) #26 LSM10 (ENSPCIG00000014865) #27 OSCP1 (ENSPCIG00000014866) #28 ENSPCIG00000014874 #30 GRIK3 (ENSPCIG00000014898) ZC3H12A (ENSPCIG00000035700) ENSPCIG00000036821 SNIP1 (ENSPCIG00000000204) DNALI1 (ENSPCIG00000000162) GNL2 (ENSPCIG00000000135) RSPO1 (ENSPCIG00000025743) C1orf109 (ENSPCIG00000025741) CDCA8 (ENSPCIG00000025739) ENSPCIG00000031448 Common wonbat MODERN SPECIES 1014 ENSVURG00010004017 SFPQ (ENSVURG00010003967) ZMYM4 (ENSVURG00010003887) KIAA0319L (ENSVURG00010003844) NCDN (ENSVURG00010003829) TFAP2E (ENSVURG00010003800) ENSVURG00010003776 C1orf216 (ENSVURG00010003767) CLSPN (ENSVURG00010003394) AGO1 (ENSVURG00010003341) AGO4 (ENSVURG00010003234) TEKT2 (ENSVURG00010003190) ADPRS (ENSVURG00010003186) COL8A2 (ENSVURG00010003181) MAP7D1 (ENSVURG00010003157) THRAP3 (ENSVURG00010003132) #22 ENSVURG00010003118 STK40 (ENSVURG00010003108) #26 LSM10 (ENSVURG00010003089) #27 OSCP1 (ENSVURG00010003056) #28 MRPS15 (ENSVURG00010003030) #29 CSF3R (ENSVURG00010003017) #30 ENSVURG00010002992 GRIK3 (ENSVURG00010002934) ZC3H12A (ENSVURG00010002872) MEAF6 (ENSVURG00010002849) SNIP1 (ENSVURG00010002829) DNALI1 (ENSVURG00010002806) GNL2 (ENSVURG00010002781) RSPO1 (ENSVURG00010002763) C1orf109 (ENSVURG00010002753) Wallaby MODERN SPECIES 4792 ENSMEUG00000015508 #22 Tasmanian devil MODERN SPECIES 2 ZMYM4 (ENSSHAG00000016398) KIAA0319L (ENSSHAG00000016681) NCDN (ENSSHAG00000016854) TFAP2E (ENSSHAG00000016887) PSMB2 (ENSSHAG00000021782) ENSSHAG00000030808 CLSPN (ENSSHAG00000017175) ENSSHAG00000017320 AGO1 (ENSSHAG00000017468) AGO3 (ENSSHAG00000029487) TEKT2 (ENSSHAG00000005473) ADPRS (ENSSHAG00000029452) COL8A2 (ENSSHAG00000017647) ENSSHAG00000023429 MAP7D1 (ENSSHAG00000017810) THRAP3 (ENSSHAG00000017932) #22 EVA1B (ENSSHAG00000017973) STK40 (ENSSHAG00000017985) #26 OSCP1 (ENSSHAG00000021302) #28 LSM10 (ENSSHAG00000022746) #27 MRPS15 (ENSSHAG00000018120) #29 ENSSHAG00000018138 #30 GRIK3 (ENSSHAG00000025082) ZC3H12A (ENSSHAG00000021632) MEAF6 (ENSSHAG00000011910) ENSSHAG00000012118 DNALI1 (ENSSHAG00000012158) GNL2 (ENSSHAG00000012267) RSPO1 (ENSSHAG00000012546) C1orf109 (ENSSHAG00000013153) CDCA8 (ENSSHAG00000028910) Opossum DUPLICATION Opossum DUPLICATION Opossum MODERN SPECIES 3 ENSMODG00000047620 KIAA0319L (ENSMODG00000017916) NCDN (ENSMODG00000017906) TFAP2E (ENSMODG00000017904) ENSMODG00000017902 ENSMODG00000017899 CLSPN (ENSMODG00000017895) AGO4 (ENSMODG00000017888) AGO1 (ENSMODG00000023335) AGO3 (ENSMODG00000017869) TEKT2 (ENSMODG00000017883) ADPRS (ENSMODG00000017880) COL8A2 (ENSMODG00000047645) TRAPPC3 (ENSMODG00000017848) ENSMODG00000048565 ENSMODG00000017834 #22 ENSMODG00000050671 #22 EVA1B (ENSMODG00000017827) STK40 (ENSMODG00000017824) #26 LSM10 (ENSMODG00000023328) #27 OSCP1 (ENSMODG00000017817) #28 MRPS15 (ENSMODG00000017813) #29 CSF3R (ENSMODG00000017810) #30 GRIK3 (ENSMODG00000017802) ZC3H12A (ENSMODG00000017794) ENSMODG00000017787 SNIP1 (ENSMODG00000017778) DNALI1 (ENSMODG00000047771) GNL2 (ENSMODG00000017773) RSPO1 (ENSMODG00000023326) C1orf109 (ENSMODG00000017765) Opossum MODERN SPECIES 3 KIAA0319L (ENSMODG00000017916) NCDN (ENSMODG00000017906) TFAP2E (ENSMODG00000017904) ENSMODG00000017902 ENSMODG00000017899 CLSPN (ENSMODG00000017895) AGO4 (ENSMODG00000017888) AGO1 (ENSMODG00000023335) AGO3 (ENSMODG00000017869) TEKT2 (ENSMODG00000017883) ADPRS (ENSMODG00000017880) COL8A2 (ENSMODG00000047645) TRAPPC3 (ENSMODG00000017848) ENSMODG00000048565 ENSMODG00000017834 #22 ENSMODG00000050671 #22 EVA1B (ENSMODG00000017827) STK40 (ENSMODG00000017824) #26 LSM10 (ENSMODG00000023328) #27 OSCP1 (ENSMODG00000017817) #28 MRPS15 (ENSMODG00000017813) #29 CSF3R (ENSMODG00000017810) #30 GRIK3 (ENSMODG00000017802) ZC3H12A (ENSMODG00000017794) ENSMODG00000017787 SNIP1 (ENSMODG00000017778) DNALI1 (ENSMODG00000047771) GNL2 (ENSMODG00000017773) RSPO1 (ENSMODG00000023326) C1orf109 (ENSMODG00000017765) CDCA8 (ENSMODG00000017762) Opossum MODERN SPECIES DSTN (ENSMODG00000005428) BFSP1 (ENSMODG00000005413) PCSK2 (ENSMODG00000005404) OTOR (ENSMODG00000005398) SNRPB2 (ENSMODG00000005392) ENSMODG00000005375 ENSMODG00000046291 FLRT3 (ENSMODG00000005288) ENSMODG00000005277 SEL1L2 (ENSMODG00000005222) ENSMODG00000005203 ENSMODG00000005209 NDUFAF5 (ENSMODG00000005082) ESF1 (ENSMODG00000005066) ENSMODG00000005052 ##22 ENSMODG00000038816 #22 TASP1 (ENSMODG00000005044) ENSMODG00000023134 ISM1 (ENSMODG00000005022) SPTLC3 (ENSMODG00000005015) BTBD3 (ENSMODG00000004924) ENSMODG00000047165 JAG1 (ENSMODG00000004910) MKKS (ENSMODG00000004860) SNAP25 (ENSMODG00000004799) ANKEF1 (ENSMODG00000004764) ENSMODG00000049357 ENSMODG00000041990 PAK5 (ENSMODG00000004734) LAMP5 (ENSMODG00000004711) PLCB4 (ENSMODG00000004697) Platypus MODERN SPECIES 7 ZMYM4 (ENSOANG00000010569) ENSOANG00000049345 ENSOANG00000010567 NCDN (ENSOANG00000047629) TFAP2E (ENSOANG00000013427) PSMB2 (ENSOANG00000013424) ENSOANG00000002084 AGO4 (ENSOANG00000002082) AGO1 (ENSOANG00000002080) AGO3 (ENSOANG00000002078) TEKT2 (ENSOANG00000002075) ADPRS (ENSOANG00000038562) ENSOANG00000050098 TRAPPC3 (ENSOANG00000002072) MAP7D1 (ENSOANG00000036062) THRAP3 (ENSOANG00000002070) #22 EVA1B (ENSOANG00000038945) STK40 (ENSOANG00000002067) #26 ENSOANG00000042771 #27 OSCP1 (ENSOANG00000002064) #28 MRPS15 (ENSOANG00000042130) #29 ENSOANG00000002062 #30 GRIK3 (ENSOANG00000002061) ZC3H12A (ENSOANG00000002060) MEAF6 (ENSOANG00000002059) SNIP1 (ENSOANG00000036482) DNALI1 (ENSOANG00000002058) GNL2 (ENSOANG00000002057) RSPO1 (ENSOANG00000002054) ENSOANG00000002053 CDCA8 (ENSOANG00000002052) Sauria ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00940000164972 ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00940000161202.b ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00940000164972 ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00990000210150 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00940000166129 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 Episquamata ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00950000182995.e.a.a.b ENSGT00390000002919 ENSGT00940000165766 ENSGT00940000155824.C ENSGT00940000155272 ENSGT00940000177851 ENSGT00940000158790 ENSGT00940000154788 ENSGT00940000161351 ENSGT00390000017767.b.b ENSGT00940000161166 ENSGT00390000015159.a.a ENSGT00390000015214 ENSGT00940000178962 ENSGT00940000158613 ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00990000210150 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00940000166129 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 Laterata ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT00940000158451 ENSGT00940000154576 ENSGT00950000182995.e.a.a.b ENSGT00390000002919 ENSGT00940000155824.C ENSGT00940000155272 ENSGT00940000177851 ENSGT00940000158790 ENSGT00940000154788 ENSGT00940000161351 ENSGT00390000017767.b.b ENSGT00940000161166 ENSGT00390000015159.a.a ENSGT00390000015214 ENSGT00940000158613 ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000165828 ENSGT00940000161371 ENSGT00940000163547 ENSGT00940000159693 ENSGT00940000161163 ENSGT00940000154301 ENSGT00730000111349 ENSGT00390000018895.b ENSGT00940000155718 ENSGT00940000154383 ENSGT00940000162194 ENSGT00940000160103 ENSGT00940000161782 ENSGT00940000155722 Common wall lizard MODERN SPECIES 16 RNF19B (ENSPMRG00000017320) AK2 (ENSPMRG00000017305) AZIN2 (ENSPMRG00000017278) NDUFS5 (ENSPMRG00000017266) MACF1 (ENSPMRG00000011150) ENSPMRG00000009879 ENSPMRG00000009872 PPIE (ENSPMRG00000009863) PABPC4 (ENSPMRG00000009846) HEYL (ENSPMRG00000009840) NT5C1A (ENSPMRG00000009834) HPCAL4 (ENSPMRG00000009826) ENSPMRG00000009813 TRIT1 (ENSPMRG00000009777) ENSPMRG00000009749 THRAP3 (ENSPMRG00000009720) #22 ENSPMRG00000009697 #24 ENSPMRG00000009683 EIF3I (ENSPMRG00000009668) ENSPMRG00000009648 FAM167B (ENSPMRG00000009642) LCK (ENSPMRG00000009632) HDAC1 (ENSPMRG00000009621) MARCKSL1 (ENSPMRG00000009613) TMEM39B (ENSPMRG00000009596) KHDRBS1 (ENSPMRG00000009579) PTP4A2 (ENSPMRG00000009551) ENSPMRG00000009480 ADGRB2 (ENSPMRG00000008643) ENSPMRG00000008401 PEF1 (ENSPMRG00000008383) Argentine black and white tegu MODERN SPECIES 82 AK2 (ENSSMRG00000015914) AZIN2 (ENSSMRG00000015912) NDUFS5 (ENSSMRG00000015911) ENSSMRG00000013690 MACF1 (ENSSMRG00000012094) ENSSMRG00000012085 ENSSMRG00000012080 PPIE (ENSSMRG00000012079) PABPC4 (ENSSMRG00000012076) NT5C1A (ENSSMRG00000012074) HPCAL4 (ENSSMRG00000012072) ENSSMRG00000012070 ENSSMRG00000012068 ENSSMRG00000012067 MYCL (ENSSMRG00000012064) THRAP3 (ENSSMRG00000012062) #22 ENSSMRG00000012059 #24 DCDC2B (ENSSMRG00000012055) ENSSMRG00000012039 EIF3I (ENSSMRG00000012035) ENSSMRG00000012034 FAM167B (ENSSMRG00000012033) LCK (ENSSMRG00000011981) MARCKSL1 (ENSSMRG00000011980) HDAC1 (ENSSMRG00000011979) ENSSMRG00000011976 TMEM39B (ENSSMRG00000011975) KHDRBS1 (ENSSMRG00000011971) PTP4A2 (ENSSMRG00000011968) ENSSMRG00000011964 ADGRB2 (ENSSMRG00000011919) Toxicofera ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00940000158451 ENSGT00940000154576 ENSGT00950000182995.e.a.a.b ENSGT00390000002919 ENSGT00940000165766 ENSGT00940000155824.C ENSGT00940000155272 ENSGT00940000158790 ENSGT00940000154788 ENSGT00390000017767.b.b ENSGT00940000161166 ENSGT00390000015159.a.a ENSGT00390000015214 ENSGT00940000178962 ENSGT00940000158613 ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00990000210150 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 Elapidae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000158451 ENSGT00940000154576 ENSGT00950000182995.e.a.a.b ENSGT00390000002919 ENSGT00940000165766 ENSGT00940000155824.C ENSGT00940000155272 ENSGT00940000158790 ENSGT00940000154788 ENSGT00390000017767.b.b ENSGT00940000161166 ENSGT00390000015159.a.a ENSGT00390000015214 ENSGT00940000178962 ENSGT00940000158613 ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000159442 ENSGT00390000017974 ENSGT00950000183031.A.a.a.je.a ENSGT00940000165372 ENSGT00390000005813 ENSGT00950000183028.a.b ENSGT00530000063402.a ENSGT00940000157291 ENSGT00390000015364.b ENSGT00390000008551 Elapidae_a ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000004700.a ENSGT00940000158451 ENSGT00940000154576 ENSGT00950000182995.e.a.a.b ENSGT00390000002919 ENSGT00940000165766 ENSGT00940000155824.C ENSGT00940000155272 ENSGT00940000158790 ENSGT00940000154788 ENSGT00390000017767.b.b ENSGT00940000161166 ENSGT00390000015159.a.a ENSGT00390000015214.g ENSGT00940000158613 ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000159442 ENSGT00390000017974 ENSGT00950000183031.A.a.a.je.a ENSGT00940000165372 ENSGT00390000005813 ENSGT00950000183028.a.b ENSGT00530000063402.a ENSGT00940000157291.b ENSGT00940000157291.a ENSGT00390000015364.b Acanthophiinae ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00390000004700.a ENSGT00940000158451 ENSGT00940000154576 ENSGT00950000182995.e.a.a.b ENSGT00390000002919 ENSGT00940000165766 ENSGT00940000155824.C ENSGT00940000155272 ENSGT00940000158790 ENSGT00940000154788 ENSGT00390000017767.b.b ENSGT00940000161166 ENSGT00390000015159.a.a ENSGT00390000015214.g ENSGT00940000158613 ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000159442 ENSGT00390000017974 ENSGT00950000183031.A.a.a.je.a ENSGT00940000165372 ENSGT00390000005813 ENSGT00950000183028.a.b ENSGT00530000063402.a ENSGT00940000157291.a ENSGT00390000015364.b ENSGT00390000008551 Mainland tiger snake MODERN SPECIES 56 AK2 (ENSNSUG00000012143) AZIN2 (ENSNSUG00000012144) NDUFS5 (ENSNSUG00000012150) ENSNSUG00000012151 ENSNSUG00000012152 ENSNSUG00000012154 ENSNSUG00000012161 ENSNSUG00000012163 PPIE (ENSNSUG00000012164) PABPC4 (ENSNSUG00000012165) NT5C1A (ENSNSUG00000012236) HPCAL4 (ENSNSUG00000012237) ENSNSUG00000012239 TRIT1 (ENSNSUG00000012240) MYCL (ENSNSUG00000012241) THRAP3 (ENSNSUG00000012242) #22 EVA1B (ENSNSUG00000012243) STK40 (ENSNSUG00000012244) #26 LSM10 (ENSNSUG00000012245) #27 OSCP1 (ENSNSUG00000012246) #28 MRPS15 (ENSNSUG00000012248) #29 MYCBP (ENSNSUG00000012250) RHBDL2 (ENSNSUG00000012251) ENSNSUG00000012252 UTP11 (ENSNSUG00000000010) FHL3 (ENSNSUG00000000073) SF3A3 (ENSNSUG00000000087) MTF1 (ENSNSUG00000000129) YRDC (ENSNSUG00000000168) C1orf109 (ENSNSUG00000000229) Eastern brown snake MODERN SPECIES 19 RNF19B (ENSPTXG00000000389) AK2 (ENSPTXG00000000403) AZIN2 (ENSPTXG00000000420) NDUFS5 (ENSPTXG00000000796) MACF1 (ENSPTXG00000001801) ENSPTXG00000018937 PPIE (ENSPTXG00000018938) PABPC4 (ENSPTXG00000018939) NT5C1A (ENSPTXG00000018941) HPCAL4 (ENSPTXG00000018942) ENSPTXG00000018943 ENSPTXG00000018944 ENSPTXG00000018945 ENSPTXG00000018946 MYCL (ENSPTXG00000018947) THRAP3 (ENSPTXG00000018948) #22 EVA1B (ENSPTXG00000018949) STK40 (ENSPTXG00000018950) #26 LSM10 (ENSPTXG00000018951) #27 OSCP1 (ENSPTXG00000018952) #28 MRPS15 (ENSPTXG00000018953) #29 RHBDL2 (ENSPTXG00000018954) MYCBP (ENSPTXG00000018955) RRAGC (ENSPTXG00000018956) ENSPTXG00000018957 UTP11 (ENSPTXG00000018958) FHL3 (ENSPTXG00000018959) SF3A3 (ENSPTXG00000018960) MTF1 (ENSPTXG00000018961) YRDC (ENSPTXG00000018962) C1orf109 (ENSPTXG00000018963) Blue-lipped sea krait MODERN SPECIES 10289 THRAP3 (ENSLLTG00000008517) #22 Indian cobra MODERN SPECIES 11 FNDC5 (ENSNNAG00000017239) ENSNNAG00000017227 RNF19B (ENSNNAG00000017199) AK2 (ENSNNAG00000017179) AZIN2 (ENSNNAG00000017171) NDUFS5 (ENSNNAG00000017166) ENSNNAG00000004759 PPIE (ENSNNAG00000004727) PABPC4 (ENSNNAG00000004677) NT5C1A (ENSNNAG00000004580) ENSNNAG00000004491 ENSNNAG00000004455 ENSNNAG00000004445 ENSNNAG00000004432 MYCL (ENSNNAG00000004422) THRAP3 (ENSNNAG00000004370) #22 EVA1B (ENSNNAG00000004341) STK40 (ENSNNAG00000004259) #26 LSM10 (ENSNNAG00000004232) #27 OSCP1 (ENSNNAG00000004190) #28 MRPS15 (ENSNNAG00000004174) #29 ENSNNAG00000004155 RHBDL2 (ENSNNAG00000004066) MYCBP (ENSNNAG00000004022) ENSNNAG00000003998 ENSNNAG00000003972 UTP11 (ENSNNAG00000003931) FHL3 (ENSNNAG00000003897) SF3A3 (ENSNNAG00000003723) MTF1 (ENSNNAG00000003689) YRDC (ENSNNAG00000003668) Lizard MODERN SPECIES 1093 azin2 (ENSACAG00000003415) NDUFS5 (ENSACAG00000040066) ENSACAG00000036031 ENSACAG00000003326 ENSACAG00000002949 ENSACAG00000002816 ENSACAG00000002688 PABPC4 (ENSACAG00000002544) NT5C1A (ENSACAG00000002502) HPCAL4 (ENSACAG00000002443) ENSACAG00000002404 ENSACAG00000002280 ENSACAG00000025431 ENSACAG00000002180 #22 ENSACAG00000045385 ENSACAG00000002145 tuatara MODERN SPECIES 1024 ENSSPUG00000000939 TRAPPC3 (ENSSPUG00000000968) ENSSPUG00000000984 ENSSPUG00000001000 ENSSPUG00000001075 THRAP3 (ENSSPUG00000001120) #22 EVA1B (ENSSPUG00000001155) STK40 (ENSSPUG00000001174) #26 OSCP1 (ENSSPUG00000001212) #28 ENSSPUG00000001378 MRPS15 (ENSSPUG00000001388) #29 ENSSPUG00000001395 #30 ENSSPUG00000001404 #30 ENSSPUG00000001413 Archelosauria ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00940000164972 ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00940000161202.b ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 Archosauria ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000155018 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 ENSGT00390000011115 Aves ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00940000155018 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 ENSGT00390000011115 Neognathae ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000155018 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 ENSGT00390000011115 Neognathae_b ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000155018 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 ENSGT00390000011115 Passeriformes ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000155018 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 ENSGT00390000011115 Passeriformes_d ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000155018 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 ENSGT00390000011115 Passeriformes_g ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000165614 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00940000164552.f.a ENSGT00390000015364.b Passeroidea ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000165614 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 ENSGT00390000011115 Zebra finch MODERN SPECIES 16 KIAA0319L (ENSTGUG00000001687) NCDN (ENSTGUG00000001681) TFAP2E (ENSTGUG00000001672) PSMB2 (ENSTGUG00000001663) C1orf216 (ENSTGUG00000029067) CLSPN (ENSTGUG00000001651) AGO4 (ENSTGUG00000024123) ENSTGUG00000021564 AGO1 (ENSTGUG00000001631) AGO3 (ENSTGUG00000014986) TEKT2 (ENSTGUG00000001625) ADPRS (ENSTGUG00000001622) COL8A2 (ENSTGUG00000001619) TRAPPC3 (ENSTGUG00000001616) MAP7D1 (ENSTGUG00000020289) THRAP3 (ENSTGUG00000001606) #22 EVA1B (ENSTGUG00000025865) STK40 (ENSTGUG00000001603) #26 LSM10 (ENSTGUG00000022736) #27 OSCP1 (ENSTGUG00000001590) #28 MRPS15 (ENSTGUG00000024895) #29 CSF3R (ENSTGUG00000001588) #30 GRIK3 (ENSTGUG00000001569) ZC3H12A (ENSTGUG00000026131) MEAF6 (ENSTGUG00000001560) SNIP1 (ENSTGUG00000001544) DNALI1 (ENSTGUG00000001557) GNL2 (ENSTGUG00000001547) RSPO1 (ENSTGUG00000001536) ENSTGUG00000019470 ENSTGUG00000022284 Common canary MODERN SPECIES 49 NCDN (ENSSCAG00000015432) TFAP2E (ENSSCAG00000015421) PSMB2 (ENSSCAG00000015418) C1orf216 (ENSSCAG00000015416) CLSPN (ENSSCAG00000015411) ENSSCAG00000015409 ENSSCAG00000015404 ENSSCAG00000015403 ENSSCAG00000015399 AGO3 (ENSSCAG00000015396) TEKT2 (ENSSCAG00000015389) ADPRS (ENSSCAG00000015386) COL8A2 (ENSSCAG00000015381) TRAPPC3 (ENSSCAG00000015380) MAP7D1 (ENSSCAG00000015376) THRAP3 (ENSSCAG00000015371) #22 EVA1B (ENSSCAG00000015366) STK40 (ENSSCAG00000015361) #26 OSCP1 (ENSSCAG00000015356) #28 MRPS15 (ENSSCAG00000015349) #29 CSF3R (ENSSCAG00000015342) #30 ENSSCAG00000015339 ENSSCAG00000015337 GRIK3 (ENSSCAG00000015246) ZC3H12A (ENSSCAG00000015215) MEAF6 (ENSSCAG00000015214) DNALI1 (ENSSCAG00000015210) GNL2 (ENSSCAG00000015204) RSPO1 (ENSSCAG00000015200) ENSSCAG00000015197 CDCA8 (ENSSCAG00000015192) Medium ground finch MODERN SPECIES 181 TMEM35B (ENSGFOG00000013433) SFPQ (ENSGFOG00000013419) ZMYM4 (ENSGFOG00000013027) KIAA0319L (ENSGFOG00000012978) NCDN (ENSGFOG00000012974) TFAP2E (ENSGFOG00000012972) PSMB2 (ENSGFOG00000012966) CLSPN (ENSGFOG00000012960) AGO4 (ENSGFOG00000012950) AGO1 (ENSGFOG00000012946) AGO3 (ENSGFOG00000012927) TEKT2 (ENSGFOG00000012924) ADPRS (ENSGFOG00000012920) ENSGFOG00000012918 TRAPPC3 (ENSGFOG00000012915) THRAP3 (ENSGFOG00000012887) #22 STK40 (ENSGFOG00000012876) #26 LSM10 (ENSGFOG00000012872) #27 OSCP1 (ENSGFOG00000012865) #28 MRPS15 (ENSGFOG00000012856) #29 CSF3R (ENSGFOG00000012850) #30 Flycatcher MODERN SPECIES 15 ZMYM4 (ENSFALG00000000734) ENSFALG00000024613 KIAA0319L (ENSFALG00000000740) NCDN (ENSFALG00000000742) TFAP2E (ENSFALG00000027366) PSMB2 (ENSFALG00000024999) C1orf216 (ENSFALG00000014273) CLSPN (ENSFALG00000000773) AGO1 (ENSFALG00000000790) ADPRS (ENSFALG00000028684) ENSFALG00000023448 TRAPPC3 (ENSFALG00000000832) ENSFALG00000000835 ENSFALG00000000824 MAP7D1 (ENSFALG00000000837) THRAP3 (ENSFALG00000000840) #22 ENSFALG00000028751 STK40 (ENSFALG00000000846) #26 LSM10 (ENSFALG00000028374) #27 OSCP1 (ENSFALG00000000855) #28 MRPS15 (ENSFALG00000000866) #29 CSF3R (ENSFALG00000000875) #30 GRIK3 (ENSFALG00000000886) ZC3H12A (ENSFALG00000000890) MEAF6 (ENSFALG00000000895) SNIP1 (ENSFALG00000000898) DNALI1 (ENSFALG00000000901) GNL2 (ENSFALG00000000909) RSPO1 (ENSFALG00000029044) ENSFALG00000023058 CDCA8 (ENSFALG00000000920) Great tit MODERN SPECIES 15 KIAA0319L (ENSPMJG00000006673) NCDN (ENSPMJG00000006675) TFAP2E (ENSPMJG00000006676) PSMB2 (ENSPMJG00000006678) C1orf216 (ENSPMJG00000006680) CLSPN (ENSPMJG00000006682) AGO4 (ENSPMJG00000006688) ENSPMJG00000006707 ENSPMJG00000006708 AGO3 (ENSPMJG00000006709) TEKT2 (ENSPMJG00000006712) ADPRS (ENSPMJG00000006718) COL8A2 (ENSPMJG00000006720) TRAPPC3 (ENSPMJG00000006723) MAP7D1 (ENSPMJG00000006724) THRAP3 (ENSPMJG00000006749) #22 EVA1B (ENSPMJG00000006755) STK40 (ENSPMJG00000006758) #26 LSM10 (ENSPMJG00000006760) #27 OSCP1 (ENSPMJG00000006764) #28 MRPS15 (ENSPMJG00000006766) #29 CSF3R (ENSPMJG00000006768) #30 GRIK3 (ENSPMJG00000006831) ZC3H12A (ENSPMJG00000006834) MEAF6 (ENSPMJG00000006841) SNIP1 (ENSPMJG00000006845) DNALI1 (ENSPMJG00000006847) ENSPMJG00000006852 RSPO1 (ENSPMJG00000006854) ENSPMJG00000006855 CDCA8 (ENSPMJG00000006856) Neognathae_c ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT01080000259115 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 ENSGT00390000011115 Kakapo MODERN SPECIES 6 ENSSHBG00005010707 KIAA0319L (ENSSHBG00005005834) NCDN (ENSSHBG00005005408) TFAP2E (ENSSHBG00005005377) PSMB2 (ENSSHBG00005000735) C1orf216 (ENSSHBG00005000717) CLSPN (ENSSHBG00005000707) AGO4 (ENSSHBG00005019185) AGO1 (ENSSHBG00005017278) AGO3 (ENSSHBG00005017167) TEKT2 (ENSSHBG00005017157) ADPRS (ENSSHBG00005017149) COL8A2 (ENSSHBG00005017145) TRAPPC3 (ENSSHBG00005017143) MAP7D1 (ENSSHBG00005017141) THRAP3 (ENSSHBG00005017133) #22 EVA1B (ENSSHBG00005017124) STK40 (ENSSHBG00005017111) #26 LSM10 (ENSSHBG00005017106) #27 OSCP1 (ENSSHBG00005017104) #28 MRPS15 (ENSSHBG00005017100) #29 CSF3R (ENSSHBG00005017091) #30 GRIK3 (ENSSHBG00005017083) ENSSHBG00005017076 MEAF6 (ENSSHBG00005017069) SNIP1 (ENSSHBG00005017055) DNALI1 (ENSSHBG00005017051) GNL2 (ENSSHBG00005017044) RSPO1 (ENSSHBG00005017035) C1orf109 (ENSSHBG00005017031) CDCA8 (ENSSHBG00005017023) Golden eagle MODERN SPECIES 7 ENSACCG00020007509 ENSACCG00020007498 KIAA0319L (ENSACCG00020007466) NCDN (ENSACCG00020007449) TFAP2E (ENSACCG00020007424) PSMB2 (ENSACCG00020007392) CLSPN (ENSACCG00020007318) AGO4 (ENSACCG00020007268) AGO1 (ENSACCG00020007246) AGO3 (ENSACCG00020007221) TEKT2 (ENSACCG00020007198) ADPRS (ENSACCG00020007187) COL8A2 (ENSACCG00020007180) TRAPPC3 (ENSACCG00020007167) MAP7D1 (ENSACCG00020007137) THRAP3 (ENSACCG00020007064) #22 EVA1B (ENSACCG00020007041) STK40 (ENSACCG00020007023) #26 LSM10 (ENSACCG00020007012) #27 OSCP1 (ENSACCG00020016654) #28 MRPS15 (ENSACCG00020016648) #29 CSF3R (ENSACCG00020016644) #30 GRIK3 (ENSACCG00020016533) ZC3H12A (ENSACCG00020016403) MEAF6 (ENSACCG00020016352) SNIP1 (ENSACCG00020016338) DNALI1 (ENSACCG00020016330) GNL2 (ENSACCG00020016319) RSPO1 (ENSACCG00020016309) ENSACCG00020016301 CDCA8 (ENSACCG00020016289) Galloanserae ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000165614 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 ENSGT00390000011115 Anatidae ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT01030000238234 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 ENSGT00390000011115 ENSGT00940000164552 ENSGT00390000016054.b Pink-footed goose MODERN SPECIES 73 ENSABRG00000020825 ZMYM4 (ENSABRG00000020832) ENSABRG00000020838 KIAA0319L (ENSABRG00000020845) NCDN (ENSABRG00000020848) TFAP2E (ENSABRG00000020852) PSMB2 (ENSABRG00000020856) C1orf216 (ENSABRG00000020859) CLSPN (ENSABRG00000020864) AGO3 (ENSABRG00000020889) TEKT2 (ENSABRG00000020906) ADPRS (ENSABRG00000020915) COL8A2 (ENSABRG00000020919) TRAPPC3 (ENSABRG00000020920) MAP7D1 (ENSABRG00000020951) THRAP3 (ENSABRG00000021040) #22 STK40 (ENSABRG00000021045) #26 OSCP1 (ENSABRG00000021050) #28 CSF3R (ENSABRG00000021053) #30 GRIK3 (ENSABRG00000021061) ZC3H12A (ENSABRG00000021065) MEAF6 (ENSABRG00000021072) SNIP1 (ENSABRG00000021080) DNALI1 (ENSABRG00000021085) GNL2 (ENSABRG00000021088) RSPO1 (ENSABRG00000021097) C1orf109 (ENSABRG00000021103) CDCA8 (ENSABRG00000021106) ENSABRG00000021121 MANEAL (ENSABRG00000021131) YRDC (ENSABRG00000021137) Duck MODERN SPECIES 15 TMEM35B (ENSAPLG00000017324) ENSAPLG00000003643 ZMYM4 (ENSAPLG00000002899) ENSAPLG00000018446 KIAA0319L (ENSAPLG00000009379) NCDN (ENSAPLG00000009984) TFAP2E (ENSAPLG00000010002) PSMB2 (ENSAPLG00000010006) CLSPN (ENSAPLG00000011178) AGO4 (ENSAPLG00000010882) AGO1 (ENSAPLG00000010440) AGO3 (ENSAPLG00000009642) TEKT2 (ENSAPLG00000009574) ADPRS (ENSAPLG00000009421) COL8A2 (ENSAPLG00000025608) THRAP3 (ENSAPLG00000009009) #22 EVA1B (ENSAPLG00000025602) STK40 (ENSAPLG00000008561) #26 GRIK3 (ENSAPLG00000007300) ZC3H12A (ENSAPLG00000024542) MEAF6 (ENSAPLG00000007127) DNALI1 (ENSAPLG00000006770) GNL2 (ENSAPLG00000006508) RSPO1 (ENSAPLG00000006500) C1orf109 (ENSAPLG00000024192) CDCA8 (ENSAPLG00000003470) ENSAPLG00000016384 MANEAL (ENSAPLG00000024518) YRDC (ENSAPLG00000025208) MTF1 (ENSAPLG00000016056) INPP5B (ENSAPLG00000015547) Phasianidae ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000165614 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 ENSGT00940000164552 Japanese quail MODERN SPECIES 15 KIAA0319L (ENSCJPG00005017087) NCDN (ENSCJPG00005017086) ENSCJPG00005017085 ENSCJPG00005017083 PSMB2 (ENSCJPG00005017082) C1orf216 (ENSCJPG00005017080) CLSPN (ENSCJPG00005017068) AGO4 (ENSCJPG00005017064) AGO1 (ENSCJPG00005017061) AGO3 (ENSCJPG00005017055) TEKT2 (ENSCJPG00005017051) ADPRS (ENSCJPG00005017049) COL8A2 (ENSCJPG00005017048) TRAPPC3 (ENSCJPG00005017040) MAP7D1 (ENSCJPG00005017036) THRAP3 (ENSCJPG00005017025) #22 EVA1B (ENSCJPG00005017024) STK40 (ENSCJPG00005017020) #26 LSM10 (ENSCJPG00005017018) #27 OSCP1 (ENSCJPG00005016941) #28 CSF3R (ENSCJPG00005016940) #30 GRIK3 (ENSCJPG00005016444) ZC3H12A (ENSCJPG00005016443) MEAF6 (ENSCJPG00005016442) SNIP1 (ENSCJPG00005016441) DNALI1 (ENSCJPG00005016440) GNL2 (ENSCJPG00005016439) RSPO1 (ENSCJPG00005016438) C1orf109 (ENSCJPG00005016437) MANEAL (ENSCJPG00005016436) ENSCJPG00005016367 Phasianidae_b ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000159550 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 ENSGT00940000164552 Turkey DUPLICATION Turkey MODERN SPECIES 17 ENSMGAG00000019449 ENSMGAG00000021640 DNALI1 (ENSMGAG00000003325) ENSMGAG00000003267 RSPO1 (ENSMGAG00000003245) ENSMGAG00000003330 ENSMGAG00000003361 ENSMGAG00000003371 ENSMGAG00000003413 CSF3R (ENSMGAG00000003526) #30 ENSMGAG00000003573 #28 ENSMGAG00000003562 #29 ENSMGAG00000015707 #27 ENSMGAG00000003614 #26 ENSMGAG00000018617 ENSMGAG00000003640 #22 ENSMGAG00000021587 #22 ENSMGAG00000003386 ENSMGAG00000003713 ENSMGAG00000021309 ENSMGAG00000003732 TEKT2 (ENSMGAG00000003750) AGO1 (ENSMGAG00000003822) ENSMGAG00000019105 ENSMGAG00000003851 ENSMGAG00000018964 ENSMGAG00000003920 ENSMGAG00000003986 ENSMGAG00000004014 ENSMGAG00000004027 ENSMGAG00000004047 Turkey MODERN SPECIES 17 ENSMGAG00000021640 DNALI1 (ENSMGAG00000003325) ENSMGAG00000003267 RSPO1 (ENSMGAG00000003245) ENSMGAG00000003330 ENSMGAG00000003361 ENSMGAG00000003371 ENSMGAG00000003413 CSF3R (ENSMGAG00000003526) #30 ENSMGAG00000003573 #28 ENSMGAG00000003562 #29 ENSMGAG00000015707 #27 ENSMGAG00000003614 #26 ENSMGAG00000018617 ENSMGAG00000003640 #22 ENSMGAG00000021587 #22 ENSMGAG00000003386 ENSMGAG00000003713 ENSMGAG00000021309 ENSMGAG00000003732 TEKT2 (ENSMGAG00000003750) AGO1 (ENSMGAG00000003822) ENSMGAG00000019105 ENSMGAG00000003851 ENSMGAG00000018964 ENSMGAG00000003920 ENSMGAG00000003986 ENSMGAG00000004014 ENSMGAG00000004027 ENSMGAG00000004047 ZMYM4 (ENSMGAG00000004092) Chicken MODERN SPECIES 15 IFI27L2 (ENSGALG00010013837) KIAA0319L (ENSGALG00010013772) NCDN (ENSGALG00010013719) TFAP2E (ENSGALG00010013698) PSMB2 (ENSGALG00010015046) C1orf216 (ENSGALG00010015032) CLSPN (ENSGALG00010015027) AGO4 (ENSGALG00010015009) AGO1 (ENSGALG00010014990) AGO3 (ENSGALG00010014949) TEKT2 (ENSGALG00010014905) ADPRHL2 (ENSGALG00010018267) COL8A2 (ENSGALG00010014897) TRAPPC3 (ENSGALG00010014859) MAP7D1 (ENSGALG00010014806) THRAP3 (ENSGALG00010014795) #22 EVA1B (ENSGALG00010014780) STK40 (ENSGALG00010014762) #26 LSM10 (ENSGALG00010014745) #27 OSCP1 (ENSGALG00010018258) #28 MRPS15 (ENSGALG00010014729) #29 CSF3R (ENSGALG00010014690) #30 GRIK3 (ENSGALG00010016578) ZC3H12A (ENSGALG00010016458) MEAF6 (ENSGALG00010016677) SNIP1 (ENSGALG00010016613) DNALI1 (ENSGALG00010016611) GNL2 (ENSGALG00010016600) RSPO1 (ENSGALG00010013311) C1orf109 (ENSGALG00010013103) ENSGALG00010013302 African ostrich MODERN SPECIES 893 THRAP3 (ENSSCUG00000013426) #22 STK40 (ENSSCUG00000013432) #26 OSCP1 (ENSSCUG00000013435) #28 MRPS15 (ENSSCUG00000013438) #29 GRIK3 (ENSSCUG00000013440) ENSSCUG00000013445 MEAF6 (ENSSCUG00000013449) SNIP1 (ENSSCUG00000013451) GNL2 (ENSSCUG00000013452) RSPO1 (ENSSCUG00000013457) Australian saltwater crocodile MODERN SPECIES 58 ENSCPRG00005002419 MAP7D1 (ENSCPRG00005002420) THRAP3 (ENSCPRG00005002448) #22 STK40 (ENSCPRG00005002499) #26 LSM10 (ENSCPRG00005002502) #27 OSCP1 (ENSCPRG00005002504) #28 MRPS15 (ENSCPRG00005002507) #29 ENSCPRG00005002521 #30 GRIK3 (ENSCPRG00005002528) ZC3H12A (ENSCPRG00005002535) MEAF6 (ENSCPRG00005002540) SNIP1 (ENSCPRG00005002543) DNALI1 (ENSCPRG00005002547) GNL2 (ENSCPRG00005002554) RSPO1 (ENSCPRG00005002591) CDCA8 (ENSCPRG00005002599) C1orf109 (ENSCPRG00005002620) ENSCPRG00005002634 Cryptodira ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00940000164972 ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000160627 #24 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00940000161202.b ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 Testudinoidea ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00940000164972 ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00990000210150 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00940000161202.b ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 Testudinidae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00940000164972 ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00940000161202.b ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 Goode s thornscrub tortoise MODERN SPECIES 12 NCDN (ENSGEVG00005006175) TFAP2E (ENSGEVG00005006139) PSMB2 (ENSGEVG00005006128) C1orf216 (ENSGEVG00005006043) CLSPN (ENSGEVG00005005870) AGO4 (ENSGEVG00005005791) AGO1 (ENSGEVG00005005703) AGO3 (ENSGEVG00005005639) TEKT2 (ENSGEVG00005005594) ADPRS (ENSGEVG00005005570) ENSGEVG00005005550 ENSGEVG00005005522 TRAPPC3 (ENSGEVG00005005507) ENSGEVG00005005474 MAP7D1 (ENSGEVG00005005319) THRAP3 (ENSGEVG00005005253) #22 ENSGEVG00005005227 EVA1B (ENSGEVG00005005210) STK40 (ENSGEVG00005005164) #26 LSM10 (ENSGEVG00005005145) #27 OSCP1 (ENSGEVG00005005115) #28 ENSGEVG00005005085 MRPS15 (ENSGEVG00005005058) #29 CSF3R (ENSGEVG00005005019) #30 GRIK3 (ENSGEVG00005004662) ZC3H12A (ENSGEVG00005004569) MEAF6 (ENSGEVG00005004388) SNIP1 (ENSGEVG00005004359) DNALI1 (ENSGEVG00005004338) GNL2 (ENSGEVG00005004309) RSPO1 (ENSGEVG00005004280) Abingdon island giant tortoise MODERN SPECIES 2577 NCDN (ENSCABG00000007342) TFAP2E (ENSCABG00000007343) PSMB2 (ENSCABG00000007345) C1orf216 (ENSCABG00000007347) CLSPN (ENSCABG00000007352) AGO4 (ENSCABG00000007476) AGO1 (ENSCABG00000013412) ENSCABG00000015096 AGO3 (ENSCABG00000015112) TEKT2 (ENSCABG00000015179) ADPRS (ENSCABG00000015185) COL8A2 (ENSCABG00000015187) TRAPPC3 (ENSCABG00000015191) ENSCABG00000015195 MAP7D1 (ENSCABG00000015201) THRAP3 (ENSCABG00000015214) #22 EVA1B (ENSCABG00000015223) STK40 (ENSCABG00000015228) #26 LSM10 (ENSCABG00000015234) #27 OSCP1 (ENSCABG00000015236) #28 ENSCABG00000015238 MRPS15 (ENSCABG00000015239) #29 CSF3R (ENSCABG00000015240) #30 Emydidae ANCESTRAL SPECIES 39 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00940000164972 ENSGT00950000182941.a.a.b ENSGT00950000183163.a.a #22 ENSGT00990000210150 ENSGT00940000154096.b.b.b.b.a ENSGT00950000182986.b #26 ENSGT00510000048364 #27 ENSGT00390000004808 #28 ENSGT00940000161202.b ENSGT00390000001737 #29 ENSGT00940000158915 #30 ENSGT00940000159465 ENSGT00940000155107.a.a ENSGT00390000015257 ENSGT00940000156553 ENSGT00390000003012 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 Three-toed box turtle MODERN SPECIES 111 NCDN (ENSTMTG00000006282) TFAP2E (ENSTMTG00000006307) PSMB2 (ENSTMTG00000006329) C1orf216 (ENSTMTG00000006346) CLSPN (ENSTMTG00000006379) AGO4 (ENSTMTG00000006524) AGO1 (ENSTMTG00000006686) AGO3 (ENSTMTG00000008722) TEKT2 (ENSTMTG00000009035) ADPRS (ENSTMTG00000009056) ENSTMTG00000009071 ENSTMTG00000009081 TRAPPC3 (ENSTMTG00000009095) ENSTMTG00000009113 MAP7D1 (ENSTMTG00000009142) THRAP3 (ENSTMTG00000009191) #22 ENSTMTG00000009216 EVA1B (ENSTMTG00000009227) STK40 (ENSTMTG00000009239) #26 LSM10 (ENSTMTG00000009262) #27 OSCP1 (ENSTMTG00000009274) #28 ENSTMTG00000009300 MRPS15 (ENSTMTG00000009309) #29 ENSTMTG00000009333 #30 GRIK3 (ENSTMTG00000009387) ZC3H12A (ENSTMTG00000009698) MEAF6 (ENSTMTG00000009714) SNIP1 (ENSTMTG00000009743) DNALI1 (ENSTMTG00000009756) GNL2 (ENSTMTG00000009773) RSPO1 (ENSTMTG00000009804) painted turtle MODERN SPECIES 6 KIAA0319L (ENSCPBG00000018629) NCDN (ENSCPBG00000018626) TFAP2E (ENSCPBG00000018622) PSMB2 (ENSCPBG00000018619) C1orf216 (ENSCPBG00000018616) CLSPN (ENSCPBG00000018609) AGO4 (ENSCPBG00000018602) AGO1 (ENSCPBG00000018594) AGO3 (ENSCPBG00000018583) TEKT2 (ENSCPBG00000018573) ADPRS (ENSCPBG00000018548) COL8A2 (ENSCPBG00000018546) TRAPPC3 (ENSCPBG00000018543) ENSCPBG00000018540 MAP7D1 (ENSCPBG00000018535) THRAP3 (ENSCPBG00000018530) #22 EVA1B (ENSCPBG00000018526) STK40 (ENSCPBG00000018522) #26 OSCP1 (ENSCPBG00000018516) #28 ENSCPBG00000018513 MRPS15 (ENSCPBG00000018508) #29 ENSCPBG00000018503 #30 GRIK3 (ENSCPBG00000018496) ZC3H12A (ENSCPBG00000018492) MEAF6 (ENSCPBG00000018490) SNIP1 (ENSCPBG00000018488) DNALI1 (ENSCPBG00000018486) GNL2 (ENSCPBG00000018483) RSPO1 (ENSCPBG00000018476) C1orf109 (ENSCPBG00000018470) CDCA8 (ENSCPBG00000018466) Chinese turtle MODERN SPECIES 1959 TEKT2 (ENSPSIG00000010645) ADPRS (ENSPSIG00000010591) COL8A2 (ENSPSIG00000010582) TRAPPC3 (ENSPSIG00000010573) ENSPSIG00000010432 ENSPSIG00000010418 THRAP3 (ENSPSIG00000010296) #22 ENSPSIG00000010281 #24 EVA1B (ENSPSIG00000010264) STK40 (ENSPSIG00000009955) #26 LSM10 (ENSPSIG00000000590) #27 OSCP1 (ENSPSIG00000009947) #28 MRPS15 (ENSPSIG00000009916) #29 CSF3R (ENSPSIG00000009762) #30 GRIK3 (ENSPSIG00000009454) ZC3H12A (ENSPSIG00000009198) MEAF6 (ENSPSIG00000009138) SNIP1 (ENSPSIG00000009136) DNALI1 (ENSPSIG00000008823) GNL2 (ENSPSIG00000007800) ENSPSIG00000000588 RSPO1 (ENSPSIG00000007793)