Vertebrata DUPLICATION Vertebrata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183215.c.b #22 Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000163885 ENSGT00940000165937 ENSGT01060000248589.D ENSGT00390000012569.a ENSGT00940000165091 ENSGT00390000010799 ENSGT00940000153511.a ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a ENSGT00950000182852.A.b ENSGT00940000157193 ENSGT00390000004660.C.a.b ENSGT00390000002053 ENSGT00950000183034.B ENSGT00390000004173 #33 ENSGT00940000164027 ENSGT00950000183215.c.b #22 ENSGT00940000164496 ENSGT00950000182978.B ENSGT01090000260093.b ENSGT00950000183182.a.a ENSGT00390000010045 ENSGT00530000063770.c.a ENSGT00940000157151 ENSGT00940000156592 ENSGT00940000154347.b.b ENSGT00940000156213 ENSGT00940000158264.b ENSGT00530000063698.b ENSGT00940000157833 ENSGT00940000155019.a.a ENSGT01000000214440.A.a.b.a Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 195 ENSGT00950000182852.A.b ENSGT00940000157193 ENSGT00390000004660.C.a.b ENSGT00390000002053 ENSGT00950000183034.B ENSGT00390000004173 #33 ENSGT00940000164027 ENSGT00390000005972 #21 ENSGT00950000183215.c.b #22 ENSGT00940000164496 ENSGT00950000182978.B ENSGT01090000260093.b ENSGT00950000183182.a.a ENSGT00390000010045 ENSGT00530000063770.c.a ENSGT00940000156115 ENSGT00910000144179.b.b ENSGT00410000025651.B ENSGT00940000157999 Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 315 ENSGT00950000183215.c.b #22 ENSGT01060000248589.D ENSGT00390000012569.a ENSGT00940000165091 ENSGT00940000153511.a ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a ENSGT00950000182852.A.b ENSGT00940000157193 ENSGT00390000004660.C.a.b ENSGT00390000002053 ENSGT00940000154531 ENSGT00950000183034.B ENSGT00390000004173 #33 Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 228 ENSGT00950000183215.c.b #22 ENSGT00390000012569.a ENSGT00940000165091 ENSGT00940000153511.a ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a ENSGT00950000182852.A.b ENSGT00940000157193 ENSGT00390000002053 ENSGT00950000183034.B Amniota ANCESTRAL SPECIES 35 ENSGT00940000158233 #10 ENSGT00940000159501 #11 ENSGT00390000004116 #12 ENSGT00730000111080.b #13 ENSGT00940000155017 #14 ENSGT00940000156598 #15 ENSGT00390000017845 #16 ENSGT00730000111390 #17 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c #18 ENSGT00940000157118.c.a #19 ENSGT00940000159312 #20 ENSGT00940000164027 ENSGT00390000005972 #21 ENSGT00950000183215.c.b #22 ENSGT00940000161438 #24 ENSGT01030000234597.a.a #25 ENSGT00390000005233.a #26 ENSGT00940000161960 #27 ENSGT00940000156072 #28 ENSGT00940000156529 #29 ENSGT00940000158412 #30 ENSGT00950000183056.A.a #31 ENSGT00530000067301 #32 ENSGT00390000004173 #33 ENSGT00940000159599 #35 ENSGT00620000087993.a.b #37 ENSGT00940000157260 ENSGT00520000055567.b ENSGT00940000157740 Mammalia ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000158233 #10 ENSGT00940000159501 #11 ENSGT00390000004116 #12 ENSGT00730000111080.b #13 ENSGT00940000155017 #14 ENSGT00940000156598 #15 ENSGT00390000017845 #16 ENSGT00730000111390 #17 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c #18 ENSGT00940000157118.c.a #19 ENSGT00940000159312 #20 ENSGT00940000164027 ENSGT00390000005972 #21 ENSGT00950000183215.c.b #22 ENSGT00940000161438 #24 ENSGT01030000234597.a.a #25 ENSGT00390000005233.a #26 ENSGT00940000161960 #27 ENSGT00940000156072 #28 ENSGT00940000156529 #29 ENSGT00940000158412 #30 ENSGT00950000183056.A.a #31 ENSGT00530000067301 #32 ENSGT00390000004173 #33 ENSGT01070000253847 ENSGT00940000159599 #35 ENSGT00940000161879 #36 ENSGT00620000087993.a.b #37 ENSGT00940000157260 Theria ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000158233 #10 ENSGT00940000159501 #11 ENSGT00390000004116 #12 ENSGT00730000111080.b #13 ENSGT00940000155017 #14 ENSGT00940000156598 #15 ENSGT00390000017845 #16 ENSGT00730000111390 #17 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c #18 ENSGT00940000157118.c.a #19 ENSGT00940000159312 #20 ENSGT00940000164027 ENSGT00390000005972 #21 ENSGT00950000183215.c.b #22 ENSGT00390000003280 #23 ENSGT00940000161438 #24 ENSGT01030000234597.a.a #25 ENSGT00390000005233.a #26 ENSGT00940000161960 #27 ENSGT00940000156072 #28 ENSGT00940000156529 #29 ENSGT00940000158412 #30 ENSGT00950000183056.A.a #31 ENSGT00530000067301 #32 ENSGT00390000004173 #33 ENSGT01070000253847 ENSGT00940000159599 #35 ENSGT00940000161879 #36 ENSGT00720000109135 Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011598 #9 ENSGT00940000158233 #10 ENSGT00940000159501 #11 ENSGT00390000004116 #12 ENSGT00730000111080.b #13 ENSGT00940000155017 #14 ENSGT00940000156598 #15 ENSGT00390000017845 #16 ENSGT00730000111390 #17 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c #18 ENSGT00940000157118.c.a #19 ENSGT00940000159312 #20 ENSGT00390000005972 #21 ENSGT00950000183215.c.b #22 ENSGT00390000003280 #23 ENSGT00940000161438 #24 ENSGT01030000234597.a.a #25 ENSGT00390000005233.a #26 ENSGT00940000161960 #27 ENSGT00940000156072 #28 ENSGT00940000156529 #29 ENSGT00940000158412 #30 ENSGT00950000183056.A.a #31 ENSGT00530000067301 #32 ENSGT00390000004173 #33 ENSGT01070000253847 ENSGT00940000159599 #35 ENSGT00940000161879 #36 ENSGT00720000109135 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011598 #9 ENSGT00940000158233 #10 ENSGT00940000159501 #11 ENSGT00390000004116 #12 ENSGT00730000111080.b #13 ENSGT00940000155017 #14 ENSGT00940000156598 #15 ENSGT00390000017845 #16 ENSGT00730000111390 #17 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c #18 ENSGT00940000157118.c.a #19 ENSGT00940000159312 #20 ENSGT00390000005972 #21 ENSGT00950000183215.c.b #22 ENSGT00390000003280 #23 ENSGT00940000161438 #24 ENSGT01030000234597.a.a #25 ENSGT00390000005233.a #26 ENSGT00940000161960 #27 ENSGT00940000156072 #28 ENSGT00940000156529 #29 ENSGT00940000158412 #30 ENSGT00950000183056.A.a #31 ENSGT00530000067301 #32 ENSGT00390000004173 #33 ENSGT01070000253847 ENSGT00940000159599 #35 ENSGT00940000161879 #36 ENSGT00720000109135 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011598 #9 ENSGT00940000158233 #10 ENSGT00940000159501 #11 ENSGT00390000004116 #12 ENSGT00730000111080.b #13 ENSGT00940000155017 #14 ENSGT00940000156598 #15 ENSGT00390000017845 #16 ENSGT00730000111390 #17 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c #18 ENSGT00940000157118.c.a #19 ENSGT00940000159312 #20 ENSGT00390000005972 #21 ENSGT00950000183215.c.b #22 ENSGT00390000003280 #23 ENSGT00940000161438 #24 ENSGT01030000234597.a.a #25 ENSGT00390000005233.a #26 ENSGT00940000161960 #27 ENSGT00940000156072 #28 ENSGT00940000156529 #29 ENSGT00940000158412 #30 ENSGT00950000183056.A.a #31 ENSGT00530000067301 #32 ENSGT00390000004173 #33 ENSGT01070000253847 ENSGT00940000159599 #35 ENSGT00940000161879 #36 ENSGT00720000109135 Primates ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000011598 #9 ENSGT00940000158233 #10 ENSGT00940000159501 #11 ENSGT00390000004116 #12 ENSGT00730000111080.b #13 ENSGT00940000155017 #14 ENSGT00940000156598 #15 ENSGT00390000017845 #16 ENSGT00730000111390 #17 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c #18 ENSGT00940000157118.c.a #19 ENSGT00940000159312 #20 ENSGT00390000005972 #21 ENSGT00950000183215.c.b #22 ENSGT00390000003280 #23 ENSGT00940000161438 #24 ENSGT01030000234597.a.a #25 ENSGT00390000005233.a #26 ENSGT00940000161960 #27 ENSGT00940000156072 #28 ENSGT00940000156529 #29 ENSGT00940000158412 #30 ENSGT00950000183056.A.a #31 ENSGT00530000067301 #32 ENSGT00390000004173 #33 ENSGT01070000253847 ENSGT00940000159599 #35 ENSGT00940000161879 #36 ENSGT00720000109135 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000011598 #9 ENSGT00940000158233 #10 ENSGT00940000159501 #11 ENSGT00390000004116 #12 ENSGT00730000111080.b #13 ENSGT00940000155017 #14 ENSGT00940000156598 #15 ENSGT00390000017845 #16 ENSGT00730000111390 #17 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c #18 ENSGT00940000157118.c.a #19 ENSGT00940000159312 #20 ENSGT00390000005972 #21 ENSGT00950000183215.c.b #22 ENSGT00390000003280 #23 ENSGT00940000161438 #24 ENSGT01030000234597.a.a #25 ENSGT00390000005233.a #26 ENSGT00940000161960 #27 ENSGT00940000156072 #28 ENSGT00940000156529 #29 ENSGT00940000158412 #30 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Equus ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000158233 #10 ENSGT00940000159501 #11 ENSGT00390000004116 #12 ENSGT00730000111080.b #13 ENSGT00940000155017 #14 ENSGT00940000156598 #15 ENSGT00390000017845.g.a #16 ENSGT00390000017845.g.b #16 ENSGT00730000111390 #17 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c #18 ENSGT00940000157118.c.a #19 ENSGT00940000159312 #20 ENSGT00390000005972 #21 ENSGT00950000183215.c.b #22 ENSGT00390000003280 #23 ENSGT00940000161438 #24 ENSGT01030000234597.a.a #25 ENSGT00390000005233.a #26 ENSGT00940000161960 #27 ENSGT00940000156072 #28 ENSGT00940000156529 #29 ENSGT00940000158412 #30 ENSGT00950000183056.A.a #31 ENSGT00530000067301 #32 ENSGT00390000004173 #33 ENSGT00940000159599 #35 ENSGT01070000253847 ENSGT00940000161879 #36 ENSGT00720000109135 Horse MODERN SPECIES 11 NIPAL3 (ENSECAG00000022826) #10 RCAN3 (ENSECAG00000020134) #11 NCMAP (ENSECAG00000042902) #12 SRRM1 (ENSECAG00000026981) #13 CLIC4 (ENSECAG00000016168) #14 RUNX3 (ENSECAG00000014360) #15 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(ENSMMNG00015018918) CRB2 (ENSMMNG00015018867) STRBP (ENSMMNG00015018777) RABGAP1 (ENSMMNG00015018694) ZBTB26 (ENSMMNG00015018669) ZBTB6 (ENSMMNG00015018659) RC3H2 (ENSMMNG00015018607) PDCL (ENSMMNG00015018554) PTGS1 (ENSMMNG00015018448) MRRF (ENSMMNG00015018364) RBM18 (ENSMMNG00015018256) LHX6 (ENSMMNG00015018081) MORN5 (ENSMMNG00015017987) NDUFA8 (ENSMMNG00015017957) TTLL11 (ENSMMNG00015017872) Sperm whale MODERN SPECIES 20 HSPA5 (ENSPCTG00005011897) RABEPK (ENSPCTG00005011943) PPP6C (ENSPCTG00005012010) SCAI (ENSPCTG00005012153) GOLGA1 (ENSPCTG00005012337) ARPC5L (ENSPCTG00005012408) RPL35 (ENSPCTG00005012446) OLFML2A (ENSPCTG00005012507) NR6A1 (ENSPCTG00005012676) NR5A1 (ENSPCTG00005013087) ENSPCTG00005013273 PSMB7 (ENSPCTG00005013513) LHX2 (ENSPCTG00005013579) DENND1A (ENSPCTG00005013710) ENSPCTG00005014157 ENSPCTG00005014200 #22 CRB2 (ENSPCTG00005014259) STRBP (ENSPCTG00005014427) RABGAP1 (ENSPCTG00005014497) ZBTB26 (ENSPCTG00005014658) ZBTB6 (ENSPCTG00005014671) RC3H2 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(ENSBMSG00010001760) MRRF (ENSBMSG00010001690) RBM18 (ENSBMSG00010001663) Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00950000183215.c.b #22 ENSGT00390000003280 #23 ENSGT00940000161438 #24 ENSGT01030000234597.a.a #25 ENSGT00390000005233.a #26 ENSGT00940000161960 #27 ENSGT00940000156072 #28 ENSGT00940000156529 #29 Common shrew MODERN SPECIES 1364 MTFR1L (ENSSARG00000011026) #22 AUNIP (ENSSARG00000011043) #23 ENSSARG00000011053 #24 STMN1 (ENSSARG00000011057) #25 PAFAH2 (ENSSARG00000011062) #26 EXTL1 (ENSSARG00000011101) #27 ENSSARG00000011120 #28 TRIM63 (ENSSARG00000011127) #29 Hedgehog MODERN SPECIES 1933 MTFR1L (ENSEEUG00000007728) #22 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000158233 #10 ENSGT00940000159501 #11 ENSGT00390000004116 #12 ENSGT00730000111080.b #13 ENSGT00940000155017 #14 ENSGT00940000156598 #15 ENSGT00390000017845.c #16 ENSGT00390000017845.d #16 ENSGT00730000111390 #17 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c #18 ENSGT00940000157118.c.a #19 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SPECIES 2239 STPG1 (ENSDNOG00000032430) #9 NIPAL3 (ENSDNOG00000014003) #10 RCAN3 (ENSDNOG00000011357) #11 NCMAP (ENSDNOG00000000914) #12 SRRM1 (ENSDNOG00000049141) #13 ENSDNOG00000042215 #14 RUNX3 (ENSDNOG00000043493) #15 SYF2 (ENSDNOG00000047605) #16 ENSDNOG00000035528 #17 TMEM50A (ENSDNOG00000036245) ENSDNOG00000017485 MACO1 (ENSDNOG00000005372) #18 LDLRAP1 (ENSDNOG00000025498) #19 MAN1C1 (ENSDNOG00000046261) #20 SELENON (ENSDNOG00000015062) #21 MTFR1L (ENSDNOG00000015087) #22 AUNIP (ENSDNOG00000044053) #23 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000158233 #10 ENSGT00940000159501 #11 ENSGT00390000004116 #12 ENSGT00730000111080.b #13 ENSGT00940000155017 #14 ENSGT00940000156598 #15 ENSGT00390000017845.c #16 ENSGT00390000017845.d #16 ENSGT00730000111390 #17 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c #18 ENSGT00940000157118.c.a #19 ENSGT00940000159312 #20 ENSGT00390000005972 #21 ENSGT00950000183215.c.b #22 ENSGT00390000003280 #23 ENSGT00940000161438 #24 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ENSGT00940000161879 #36 ENSGT00720000109135 ENSGT00620000087993.a.b #37 ENSGT00940000157260 ENSGT00520000055567.b Elephant MODERN SPECIES 332 NIPAL3 (ENSLAFG00000012374) #10 RCAN3 (ENSLAFG00000017638) #11 NCMAP (ENSLAFG00000014893) #12 SRRM1 (ENSLAFG00000013830) #13 CLIC4 (ENSLAFG00000017470) #14 RUNX3 (ENSLAFG00000008382) #15 ENSLAFG00000023150 #16 ENSLAFG00000030814 #16 RSRP1 (ENSLAFG00000022865) #17 TMEM50A (ENSLAFG00000014756) ENSLAFG00000014759 MACO1 (ENSLAFG00000001213) #18 LDLRAP1 (ENSLAFG00000001214) #19 MAN1C1 (ENSLAFG00000004643) #20 SELENON (ENSLAFG00000021561) #21 MTFR1L (ENSLAFG00000002306) #22 AUNIP (ENSLAFG00000022386) #23 PAQR7 (ENSLAFG00000000368) #24 ENSLAFG00000006089 #25 PAFAH2 (ENSLAFG00000008618) #26 EXTL1 (ENSLAFG00000002438) #27 SLC30A2 (ENSLAFG00000002439) #28 TRIM63 (ENSLAFG00000002440) #29 PDIK1L (ENSLAFG00000002444) #30 ZNF593 (ENSLAFG00000022048) #33 CNKSR1 (ENSLAFG00000002445) #35 CATSPER4 (ENSLAFG00000008447) #36 ENSLAFG00000027598 CEP85 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#18 ENSGT00940000157118.c.a #19 ENSGT00940000159312 #20 ENSGT00960000188019 ENSGT00950000183215.c.b #22 Pink-footed goose MODERN SPECIES 73 RCAN3 (ENSABRG00000012217) #11 NCMAP (ENSABRG00000012194) #12 SRRM1 (ENSABRG00000012156) #13 CLIC4 (ENSABRG00000012147) #14 RUNX3 (ENSABRG00000012142) #15 SYF2 (ENSABRG00000012134) #16 RSRP1 (ENSABRG00000012129) #17 TMEM50A (ENSABRG00000012117) ENSABRG00000012095 MACO1 (ENSABRG00000012082) #18 LDLRAP1 (ENSABRG00000012068) #19 ENSABRG00000012066 MAN1C1 (ENSABRG00000012053) #20 ENSABRG00000012040 ENSABRG00000012037 MTFR1L (ENSABRG00000012032) #22 Duck MODERN SPECIES 15 STPG1 (ENSAPLG00000003159) #9 NIPAL3 (ENSAPLG00000002628) #10 RCAN3 (ENSAPLG00000002545) #11 NCMAP (ENSAPLG00000002541) #12 SRRM1 (ENSAPLG00000002066) #13 CLIC4 (ENSAPLG00000019742) #14 RUNX3 (ENSAPLG00000016439) #15 SYF2 (ENSAPLG00000016435) #16 RSRP1 (ENSAPLG00000023561) #17 TMEM50A (ENSAPLG00000016434) ENSAPLG00000016375 MACO1 (ENSAPLG00000016308) #18 LDLRAP1 (ENSAPLG00000016262) #19 MAN1C1 (ENSAPLG00000016115) #20 ENSAPLG00000025313 MTFR1L (ENSAPLG00000016018) #22 Phasianidae ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000157833 ENSGT00940000155019.a.a ENSGT00940000156139.ab ENSGT00390000004116 #12 ENSGT00730000111080.b #13 ENSGT00940000155017 #14 ENSGT00940000156598.l #15 ENSGT00390000017845 #16 ENSGT00730000111390 #17 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c #18 ENSGT00940000157118.c.a #19 ENSGT00940000159312 #20 ENSGT00940000164027 ENSGT00950000183215.c.b #22 ENSGT00940000164873 ENSGT00390000002144 ENSGT00410000025596.a.b ENSGT00940000156761 ENSGT00940000167209 ENSGT00940000160504 ENSGT00940000160992 ENSGT00940000161085 ENSGT00940000157034 ENSGT00940000157669 ENSGT00940000155543 ENSGT00940000157582 ENSGT00950000183168.B.a ENSGT00940000160073 ENSGT00940000163923.e Phasianidae_b ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000157833 ENSGT00940000155019.a.a ENSGT00940000156139.ab ENSGT00390000004116 #12 ENSGT00730000111080.b #13 ENSGT00940000155017 #14 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Testudinidae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000158233 #10 ENSGT00940000159501 #11 ENSGT00390000004116 #12 ENSGT00730000111080.b #13 ENSGT00940000155017 #14 ENSGT00940000156598.l #15 ENSGT00390000017845 #16 ENSGT00730000111390 #17 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c #18 ENSGT00940000157118.c.a #19 ENSGT00940000159312 #20 ENSGT00940000164027 ENSGT00390000005972 #21 ENSGT00950000183215.c.b #22 ENSGT00960000189517 ENSGT00940000161438 #24 ENSGT01030000234597.a.a #25 ENSGT00390000005233.a #26 ENSGT00940000163960 ENSGT00940000156072 #28 ENSGT00940000156529 #29 ENSGT00940000158412 #30 ENSGT00950000183056.A.a #31 ENSGT00390000004173 #33 ENSGT00940000159599.e #35 ENSGT00940000159599.f #35 ENSGT00390000006975.b ENSGT00620000087993.a.b #37 ENSGT00940000157260 Goode s thornscrub tortoise MODERN SPECIES 12 STPG1 (ENSGEVG00005021179) #9 NIPAL3 (ENSGEVG00005021180) #10 RCAN3 (ENSGEVG00005021183) #11 ENSGEVG00005021184 SRRM1 (ENSGEVG00005021189) #13 CLIC4 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ENSGT00510000050935 ENSGT00940000160188 Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 52 ENSGT00940000165937 ENSGT00940000157330 ENSGT01060000248589.D ENSGT00950000182852.A.b ENSGT00940000157193 ENSGT00390000004660.C.a.b ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a ENSGT00390000010799 ENSGT00940000165091.d ENSGT00390000002053 ENSGT00950000183034.B ENSGT00390000004173 #33 ENSGT00940000164027 ENSGT00940000155187.A ENSGT00940000181185 ENSGT00950000183215.c.b #22 ENSGT00950000183092.b.b ENSGT00940000175159 ENSGT00510000050935 ENSGT00940000160188 ENSGT00940000158591.g.b ENSGT00390000003365.b ENSGT01060000248564.a.a.a.b ENSGT00940000156096.e.a ENSGT00390000011376 ENSGT00950000183034.C.a.b ENSGT00390000012242 ENSGT01010000222287.B.b.a.a.b.b ENSGT00940000153511.b.q ENSGT00950000182856.a.b.a ENSGT00530000063775.a.a Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT01030000234620.a.a.a.a.a.b ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a ENSGT00390000010799 ENSGT00940000165091.d ENSGT00390000002053 ENSGT00950000183034.B ENSGT00390000004173 #33 ENSGT00940000164027 ENSGT00940000155187.A ENSGT00940000181185 ENSGT00950000183215.c.b #22 ENSGT00950000183092.b.b ENSGT00940000175159 ENSGT00510000050935 ENSGT00940000160188 ENSGT00940000158591.g.b ENSGT00390000003365.b ENSGT01060000248564.a.a.a.b ENSGT00940000156096.e.a ENSGT00390000011376 ENSGT00950000183034.C.a.b ENSGT00390000012242 ENSGT00940000153511.b.q ENSGT00950000182856.a.b.a ENSGT00530000063775.a.a ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b.b Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000173691 ENSGT00530000063583.a.a.a ENSGT00940000165081.a ENSGT00940000154225.b ENSGT00940000154482.b.b.a.c ENSGT01030000234620.a.a.a.a.a.b ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a ENSGT00390000010799 ENSGT00940000165091.d ENSGT00390000002053 ENSGT00950000183034.B ENSGT00390000004173 #33 ENSGT00940000164027 ENSGT00940000155187.A ENSGT00940000181185 ENSGT00950000183215.c.b #22 ENSGT00950000183092.b.b ENSGT00940000175159 ENSGT00510000050935 ENSGT00940000160188 ENSGT00940000158591.g.b ENSGT00390000003365.b 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tail seahorse MODERN SPECIES 176 ENSHCOG00000016837 mtfr1l (ENSHCOG00000016849) #22 ENSHCOG00000016867 chrm5a (ENSHCOG00000016895) zgc:194887 (ENSHCOG00000016905) ENSHCOG00000016926 THBS1 (ENSHCOG00000017007) ENSHCOG00000017014 SLC10A1 (ENSHCOG00000017036) MAX (ENSHCOG00000017056) RAB15 (ENSHCOG00000017086) GPX2 (ENSHCOG00000017160) SIPA1L1 (ENSHCOG00000017212) RGS6 (ENSHCOG00000017288) ifi27.7 (ENSHCOG00000017347) ENSHCOG00000017371 ZDHHC14 (ENSHCOG00000017423) Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000173691 ENSGT00530000063583.a.a.a ENSGT00940000165081.a ENSGT00940000154225.b ENSGT00940000154482.b.b.a.c ENSGT01030000234620.a.a.a.a.a.b ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a ENSGT00390000010799 ENSGT00940000165091.d ENSGT00390000002053 ENSGT00950000183034.B ENSGT00390000004173 #33 ENSGT00940000164027 ENSGT00940000155187.A ENSGT00940000181185 ENSGT00950000183215.c.b #22 ENSGT00950000183092.b.b ENSGT00940000175159 ENSGT00510000050935 ENSGT00940000160188 ENSGT00940000158591.g.b 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ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b.b Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000173691 ENSGT00530000063583.a.a.a ENSGT00940000165081.a ENSGT00940000154225.b ENSGT00940000154482.b.b.a.c ENSGT01030000234620.a.a.a.a.a.b ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a ENSGT00390000010799 ENSGT00940000165091.d ENSGT00390000002053 ENSGT00950000183034.B ENSGT00390000004173 #33 ENSGT00940000164027 ENSGT00940000155187.A ENSGT00940000181185 ENSGT00950000183215.c.b #22 ENSGT00950000183092.b.b ENSGT00940000175159 ENSGT00510000050935 ENSGT00940000160188 ENSGT00940000158591.g.b ENSGT00390000003365.b ENSGT01060000248564.a.a.a.b ENSGT00940000156096.e.a ENSGT00390000011376 ENSGT00950000183034.C.a.b ENSGT00390000012242 ENSGT00940000153511.b.q ENSGT00950000182856.a.b.a ENSGT00530000063775.a.a ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b.b Carangaria ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000153724.B ENSGT00940000173691 ENSGT00530000063583.a.a.a ENSGT00940000165081.a ENSGT00940000154225.b ENSGT00940000154482.b.b.a.c ENSGT01030000234620.a.a.a.a.a.b ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a ENSGT00390000010799 ENSGT00940000165091.d ENSGT00390000002053 ENSGT00950000183034.B ENSGT00390000004173 #33 ENSGT00940000164027 ENSGT00940000155187.A ENSGT00950000183215.c.b #22 ENSGT00950000183092.b.b ENSGT00940000175159 ENSGT00510000050935 ENSGT00940000160188 ENSGT00940000158591.g.b ENSGT00390000003365.b ENSGT01060000248564.a.a.a.b ENSGT00940000156096.e.a ENSGT00390000011376 ENSGT00950000183034.C.a.b ENSGT00390000012242 ENSGT00940000153511.b.q ENSGT00950000182856.a.b.a ENSGT00530000063775.a.a ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b.b Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000159694.a ENSGT00940000153724.B ENSGT00530000063583.a.a.a ENSGT00940000165081.a ENSGT00940000154225.b ENSGT00940000154482.b.b.a.c ENSGT01030000234620.a.a.a.a.a.b ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a ENSGT00390000010799.j ENSGT00940000165091.d ENSGT00390000002053 ENSGT00950000183034.B ENSGT00390000004173 #33 ENSGT00940000164027 ENSGT00940000155187.A ENSGT00950000183215.c.b #22 ENSGT00950000183092.b.b ENSGT00940000175159 ENSGT00510000050935 ENSGT00940000160188 ENSGT00940000158591.g.b ENSGT00390000003365.b ENSGT01060000248564.a.a.a.b ENSGT00940000156096.e.a ENSGT00390000011376 ENSGT00950000183034.C.a.b ENSGT00390000012242 ENSGT00940000153511.b.q ENSGT00950000182856.a.b.a ENSGT00530000063775.a.a ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b.b Seriola ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000159694.a ENSGT00940000153724.B ENSGT00530000063583.a.a.a ENSGT00940000165081.a ENSGT00940000154225.b ENSGT00940000154482.b.b.a.c ENSGT01030000234620.a.a.a.a.a.b ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a ENSGT00390000010799.j ENSGT00940000165091.d ENSGT00390000002053 ENSGT00950000183034.B ENSGT00390000004173 #33 ENSGT00940000164027 ENSGT00940000155187.A ENSGT00950000183215.c.b #22 ENSGT00950000183092.b.b ENSGT00510000050935.i ENSGT00940000160188 ENSGT00940000158591.g.b ENSGT00390000003365.b ENSGT01060000248564.a.a.a.b ENSGT00940000156096.e.a ENSGT00390000011376 ENSGT00950000183034.C.a.b ENSGT00390000012242 ENSGT00940000153511.b.q ENSGT00950000182856.a.b.a ENSGT00530000063775.a.a ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b.b ENSGT00530000063503.a.b.g.b Greater amberjack MODERN SPECIES 62 ENSSDUG00000016837 WDR25 (ENSSDUG00000016932) WARS1 (ENSSDUG00000016951) ENSSDUG00000016971 DLK1 (ENSSDUG00000017000) DIO3 (ENSSDUG00000017068) PPP2R5C (ENSSDUG00000017083) ENSSDUG00000017167 rpl13a (ENSSDUG00000017181) atp5if1b (ENSSDUG00000017228) zmpste24 (ENSSDUG00000017236) ENSSDUG00000017269 znf593 (ENSSDUG00000017282) #33 selenon (ENSSDUG00000017295) ENSSDUG00000017332 mtfr1l (ENSSDUG00000017357) #22 STAC (ENSSDUG00000017400) ENSSDUG00000017427 ENSSDUG00000017441 tonsl (ENSSDUG00000017456) GABRR1 (ENSSDUG00000017556) PM20D2 (ENSSDUG00000017574) CNR1 (ENSSDUG00000017598) akirin2 (ENSSDUG00000017605) orc3 (ENSSDUG00000017628) znf292a (ENSSDUG00000017666) cga (ENSSDUG00000017698) syncripl (ENSSDUG00000017716) SNX14 (ENSSDUG00000017749) nt5e (ENSSDUG00000017875) HTR1B (ENSSDUG00000017921) Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 3229 rpl13a (ENSSLDG00000002561) atp5if1b (ENSSLDG00000002635) zmpste24 (ENSSLDG00000002813) ENSSLDG00000002867 znf593 (ENSSLDG00000002876) #33 selenon (ENSSLDG00000002892) ENSSLDG00000002955 mtfr1l (ENSSLDG00000002984) #22 STAC (ENSSLDG00000003023) nkl.4 (ENSSLDG00000003061) tonsl (ENSSLDG00000003128) GABRR1 (ENSSLDG00000003164) PM20D2 (ENSSLDG00000003219) CNR1 (ENSSLDG00000003271) akirin2 (ENSSLDG00000003291) orc3 (ENSSLDG00000003341) znf292a (ENSSLDG00000003371) cga (ENSSLDG00000003479) syncripl (ENSSLDG00000003502) SNX14 (ENSSLDG00000003610) nt5e (ENSSLDG00000003971) HTR1B (ENSSLDG00000004018) ENSSLDG00000004047 Barramundi perch MODERN SPECIES 99 WARS1 (ENSLCAG00010020818) WDR25 (ENSLCAG00010020825) ENSLCAG00010020828 DLK1 (ENSLCAG00010020832) ENSLCAG00010020834 ENSLCAG00010020840 ENSLCAG00010020870 ENSLCAG00010020972 rpl13a (ENSLCAG00010020979) atp5if1b (ENSLCAG00010020989) zmpste24 (ENSLCAG00010021000) ENSLCAG00010021007 znf593 (ENSLCAG00010021012) #33 selenon (ENSLCAG00010021014) ENSLCAG00010021022 mtfr1l (ENSLCAG00010021030) #22 STAC (ENSLCAG00010021038) ENSLCAG00010021051 ENSLCAG00010021052 tonsl (ENSLCAG00010021056) ENSLCAG00010021075 PM20D2 (ENSLCAG00010021084) CNR1 (ENSLCAG00010021085) akirin2 (ENSLCAG00010021092) orc3 (ENSLCAG00010021136) znf292a (ENSLCAG00010021211) cga (ENSLCAG00010021214) syncripl (ENSLCAG00010021236) SNX14 (ENSLCAG00010021286) nt5e (ENSLCAG00010021363) HTR1B (ENSLCAG00010021370) Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000153724.B ENSGT00940000173691 ENSGT00530000063583.a.a.a ENSGT00940000165081.a ENSGT00940000154225.b ENSGT00940000154482.b.b.a.c ENSGT01030000234620.a.a.a.a.a.b ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a ENSGT00390000010799 ENSGT00940000165091.d ENSGT00390000002053 ENSGT00950000183034.B ENSGT00390000004173 #33 ENSGT00940000164027 ENSGT00940000155187.A ENSGT00950000183215.c.b #22 ENSGT00950000183092.b.b ENSGT00510000050935 ENSGT00940000160188 ENSGT00940000158591.g.b ENSGT00390000003365.b ENSGT01060000248564.a.a.a.b ENSGT00940000156096.e.a ENSGT00390000011376 ENSGT00950000183034.C.a.b ENSGT00390000012242 ENSGT00940000153511.b.q ENSGT00950000182856.a.b.a ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b.b ENSGT00530000063503.a.b.g.b ENSGT00940000156078.c Turbot MODERN SPECIES 8 ENSSMAG00000033014 ENSSMAG00000023034 DLK1 (ENSSMAG00000033742) ENSSMAG00000020042 ENSSMAG00000027293 ENSSMAG00000020053 ENSSMAG00000020077 rpl13a (ENSSMAG00000020078) atp5if1b (ENSSMAG00000031300) zmpste24 (ENSSMAG00000020099) ENSSMAG00000027549 ENSSMAG00000025060 znf593 (ENSSMAG00000020125) #33 selenon (ENSSMAG00000020131) ENSSMAG00000036432 mtfr1l (ENSSMAG00000020161) #22 ENSSMAG00000020164 ENSSMAG00000020206 ENSSMAG00000020192 ENSSMAG00000020232 CNR1 (ENSSMAG00000020235) ENSSMAG00000020247 orc3 (ENSSMAG00000020236) znf292a (ENSSMAG00000020252) ENSSMAG00000034135 cga (ENSSMAG00000020254) SYNCRIP (ENSSMAG00000020337) ENSSMAG00000020339 ENSSMAG00000020391 ENSSMAG00000020402 colec11 (ENSSMAG00000020438) Tongue sole MODERN SPECIES id3 (ENSCSEG00000002710) ENSCSEG00000002705 ENSCSEG00000002690 DLK1 (ENSCSEG00000002681) ENSCSEG00000002676 ENSCSEG00000002673 PPP2R5C (ENSCSEG00000002653) ENSCSEG00000002649 rpl13a (ENSCSEG00000002640) atp5if1b (ENSCSEG00000002634) zmpste24 (ENSCSEG00000002631) znf593 (ENSCSEG00000002614) #33 ENSCSEG00000002598 selenon (ENSCSEG00000002587) ENSCSEG00000002568 mtfr1l (ENSCSEG00000002560) #22 STAC (ENSCSEG00000002540) nkl.2 (ENSCSEG00000002527) tonsl (ENSCSEG00000002520) ENSCSEG00000002508 CNR1 (ENSCSEG00000002506) akirin2 (ENSCSEG00000002500) orc3 (ENSCSEG00000002490) znf292a (ENSCSEG00000002480) cga (ENSCSEG00000002474) syncripl (ENSCSEG00000002468) SNX14 (ENSCSEG00000002420) HTR1B (ENSCSEG00000002415) ENSCSEG00000002405 myo6b (ENSCSEG00000002380) colec11 (ENSCSEG00000002376) Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000153724.B ENSGT00530000063583.a.a.a ENSGT00940000165081.a ENSGT00940000154225.b ENSGT00940000154482.b.b.a.c ENSGT01030000234620.a.a.a.a.a.b ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a ENSGT00390000010799 ENSGT00940000165091.d ENSGT00390000002053 ENSGT00950000183034.B ENSGT00390000004173 #33 ENSGT00940000164027 ENSGT00940000155187.A ENSGT00940000181185 ENSGT00950000183215.c.b #22 ENSGT00950000183092.b.b ENSGT00510000050935 ENSGT00940000160188 ENSGT00940000158591.g.b ENSGT00390000003365.b ENSGT01060000248564.a.a.a.b ENSGT00940000156096.e.a ENSGT00390000011376 ENSGT00950000183034.C.a.b ENSGT00390000012242 ENSGT00940000153511.b.q ENSGT00950000182856.a.b.a ENSGT00530000063775.a.a ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b.b ENSGT00530000063503.a.b.g.b Zig-zag eel MODERN SPECIES 14 SLC25A29 (ENSMAMG00000026464) WARS1 (ENSMAMG00000007146) WDR25 (ENSMAMG00000007198) ENSMAMG00000007217 DLK1 (ENSMAMG00000007281) ENSMAMG00000007356 ENSMAMG00000007372 ENSMAMG00000007420 rpl13a (ENSMAMG00000007425) atp5if1b (ENSMAMG00000007444) zmpste24 (ENSMAMG00000007453) ENSMAMG00000007479 znf593 (ENSMAMG00000007484) #33 selenon (ENSMAMG00000007500) ENSMAMG00000028484 mtfr1l (ENSMAMG00000007548) #22 ENSMAMG00000007577 ENSMAMG00000028279 ENSMAMG00000007619 ENSMAMG00000007668 ENSMAMG00000007708 CNR1 (ENSMAMG00000027709) ENSMAMG00000007821 orc3 (ENSMAMG00000007798) ENSMAMG00000024627 ENSMAMG00000026472 cga (ENSMAMG00000007884) SYNCRIP (ENSMAMG00000007903) ENSMAMG00000007940 HTR1B (ENSMAMG00000007784) ENSMAMG00000025443 Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000153724.B ENSGT00530000063583.a.a.a ENSGT00940000165081.a ENSGT00940000154225.b ENSGT00940000154482.b.b.a.c ENSGT01030000234620.a.a.a.a.a.b ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a ENSGT00390000010799 ENSGT00940000165091.d ENSGT00390000002053 ENSGT00950000183034.B ENSGT00390000004173 #33 ENSGT00940000164027 ENSGT00940000155187.A ENSGT00940000181185 ENSGT00950000183215.c.b #22 ENSGT00950000183092.b.b ENSGT00510000050935 ENSGT00940000160188 ENSGT00940000158591.g.b ENSGT00390000003365.b ENSGT01060000248564.a.a.a.b ENSGT00940000156096.e.a ENSGT00390000011376 ENSGT00950000183034.C.a.b ENSGT00390000012242 ENSGT00940000153511.b.q ENSGT00950000182856.a.b.a ENSGT00530000063775.a.a ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b.b ENSGT00530000063503.a.b.g.b Climbing perch MODERN SPECIES 13 WARS1 (ENSATEG00000012465) WDR25 (ENSATEG00000012498) ENSATEG00000012519 DLK1 (ENSATEG00000029944) ENSATEG00000012730 ENSATEG00000012752 ENSATEG00000012808 rpl13a (ENSATEG00000012828) atp5if1b (ENSATEG00000012846) zmpste24 (ENSATEG00000012851) ENSATEG00000012869 znf593 (ENSATEG00000028135) #33 selenon (ENSATEG00000012886) ENSATEG00000026067 ENSATEG00000027605 mtfr1l (ENSATEG00000012947) #22 ENSATEG00000012978 ENSATEG00000013013 ENSATEG00000013023 ENSATEG00000013035 ENSATEG00000013101 ENSATEG00000013140 CNR1 (ENSATEG00000013176) ENSATEG00000013188 orc3 (ENSATEG00000013212) ENSATEG00000030171 ENSATEG00000025822 ENSATEG00000028442 cga (ENSATEG00000013322) SYNCRIP (ENSATEG00000013885) ENSATEG00000013946 Siamese fighting fish MODERN SPECIES 12 SLC25A29 (ENSBSLG00000018754) WARS1 (ENSBSLG00000018279) WDR25 (ENSBSLG00000018228) ENSBSLG00000018213 DLK1 (ENSBSLG00000018193) ENSBSLG00000018164 ENSBSLG00000017575 ENSBSLG00000017547 rpl13a (ENSBSLG00000017423) atp5if1b (ENSBSLG00000017414) zmpste24 (ENSBSLG00000017321) ENSBSLG00000017296 znf593 (ENSBSLG00000017290) #33 selenon (ENSBSLG00000017153) ENSBSLG00000017117 mtfr1l (ENSBSLG00000017070) #22 STAC (ENSBSLG00000017029) ENSBSLG00000016852 ENSBSLG00000016819 tonsl (ENSBSLG00000026531) GABRR1 (ENSBSLG00000026528) PM20D2 (ENSBSLG00000026526) CNR1 (ENSBSLG00000026525) akirin2 (ENSBSLG00000026524) orc3 (ENSBSLG00000026523) ENSBSLG00000026520 ENSBSLG00000026519 cga (ENSBSLG00000026518) SYNCRIP (ENSBSLG00000026517) ENSBSLG00000026428 NT5E (ENSBSLG00000026405) Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000153724.B ENSGT00530000063583.a.a.a ENSGT00940000165081.a ENSGT00940000154225.b ENSGT00940000154482.b.b.a.c ENSGT01030000234620.a.a.a.a.a.b ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a ENSGT00390000010799 ENSGT00940000165091.d ENSGT00390000002053 ENSGT00950000183034.B ENSGT00390000004173 #33 ENSGT00940000164027 ENSGT00940000155187.A ENSGT00940000181185 ENSGT00950000183215.c.b #22 ENSGT00950000183092.b.b ENSGT00940000175159 ENSGT00510000050935 ENSGT00940000160188 ENSGT00940000158591.g.b ENSGT00390000003365.b ENSGT01060000248564.a.a.a.b ENSGT00940000156096.e.a ENSGT00390000011376 ENSGT00950000183034.C.a.b ENSGT00390000012242 ENSGT00940000153511.b.q ENSGT00950000182856.a.b.a ENSGT00530000063775.a.a ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b.b Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000153724.B ENSGT00530000063583.a.a.a ENSGT00940000165081.a ENSGT00940000154225.b ENSGT00940000154482.b.b.a.c ENSGT01030000234620.a.a.a.a.a.b ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a ENSGT00390000010799 ENSGT00940000165091.d ENSGT00390000002053 ENSGT00950000183034.B ENSGT00390000004173 #33 ENSGT00940000164027 ENSGT00940000155187.A ENSGT00940000181185 ENSGT00950000183215.c.b #22 ENSGT00950000183092.b.b ENSGT00940000175159 ENSGT00510000050935 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ENSGT00940000164027 ENSGT00940000155187.A ENSGT00950000183215.c.b #22 ENSGT00950000183092.b.b ENSGT00510000050935 ENSGT00940000160188 ENSGT00940000158591.g.b ENSGT00390000003365.b ENSGT01060000248564.a.a.a.b ENSGT00940000156096.e.a ENSGT00390000011376 ENSGT00950000183034.C.a.b ENSGT00390000012242 ENSGT00940000153511.b.q ENSGT00950000182856.a.b.a ENSGT00530000063775.a.a ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b.b ENSGT00530000063503.a.b.g.b Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000157766.b.a ENSGT00940000153724.B ENSGT00530000063583.a.a.a ENSGT00940000165081.a ENSGT00940000154225.b ENSGT00940000154482.b.b.a.c ENSGT01030000234620.a.a.a.a.a.b ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a ENSGT00390000010799.h ENSGT00940000165091.d ENSGT00390000002053 ENSGT00950000183034.B ENSGT00390000004173 #33 ENSGT00940000164027 ENSGT00940000155187.A ENSGT00950000183215.c.b #22 ENSGT00950000183092.b.b ENSGT00510000050935 ENSGT00940000160188 ENSGT00940000158591.g.b ENSGT00390000003365.b ENSGT01060000248564.a.a.a.b ENSGT00940000156096.e.a ENSGT00390000011376 ENSGT00950000183034.C.a.b ENSGT00390000012242 ENSGT00940000153511.b.q ENSGT00950000182856.a.b.a ENSGT00530000063775.a.a ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b.b ENSGT00530000063503.a.b.g.b Pike perch MODERN SPECIES 110 WARS1 (ENSSLUG00000025300) WDR25 (ENSSLUG00000025302) ENSSLUG00000025306 DLK1 (ENSSLUG00000025312) ENSSLUG00000025315 ENSSLUG00000025334 ENSSLUG00000011627 rpl13a (ENSSLUG00000011699) ENSSLUG00000011714 atp5if1b (ENSSLUG00000011722) zmpste24 (ENSSLUG00000011745) RLF (ENSSLUG00000011838) znf593 (ENSSLUG00000011841) #33 selenon (ENSSLUG00000011845) ENSSLUG00000011849 mtfr1l (ENSSLUG00000011854) #22 STAC (ENSSLUG00000011861) reep5 (ENSSLUG00000011875) chd1 (ENSSLUG00000012190) syk (ENSSLUG00000019466) auh (ENSSLUG00000019504) nfil3 (ENSSLUG00000019507) ROR2 (ENSSLUG00000019517) ENSSLUG00000019549 sptlc1 (ENSSLUG00000019559) chsy3 (ENSSLUG00000019593) megf10 (ENSSLUG00000019603) SLC27A3 (ENSSLUG00000019623) prrc1 (ENSSLUG00000019669) lmnb1 (ENSSLUG00000019679) slc27a6 (ENSSLUG00000019709) Channel bull blenny MODERN SPECIES 14 soul3 (ENSCGOG00000017637) SLC25A29 (ENSCGOG00000017638) WARS1 (ENSCGOG00000017649) WDR25 (ENSCGOG00000017996) ENSCGOG00000017998 DLK1 (ENSCGOG00000018022) ENSCGOG00000018083 ENSCGOG00000021179 rpl13a (ENSCGOG00000021189) atp5if1b (ENSCGOG00000021222) zmpste24 (ENSCGOG00000021229) ENSCGOG00000021265 znf593 (ENSCGOG00000021267) #33 selenon (ENSCGOG00000021268) ENSCGOG00000021278 mtfr1l (ENSCGOG00000021280) #22 STAC (ENSCGOG00000021284) nkl.4 (ENSCGOG00000021287) tonsl (ENSCGOG00000021291) GABRR1 (ENSCGOG00000021380) PM20D2 (ENSCGOG00000021403) CNR1 (ENSCGOG00000021407) akirin2 (ENSCGOG00000021732) orc3 (ENSCGOG00000021416) ENSCGOG00000021764 ENSCGOG00000021765 ENSCGOG00000021767 cga (ENSCGOG00000021768) syncripl (ENSCGOG00000021780) SNX14 (ENSCGOG00000022079) nt5e (ENSCGOG00000022171) Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000157766.b.a ENSGT00940000153724.B ENSGT00530000063583.a.a.a ENSGT00940000165081.a ENSGT00940000154225.b ENSGT00940000154482.b.b.a.c ENSGT01030000234620.a.a.a.a.a.b ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a ENSGT00390000010799.h ENSGT00940000165091.d ENSGT00390000002053 ENSGT00950000183034.B ENSGT00390000004173 #33 ENSGT00940000164027 ENSGT00940000155187.A ENSGT00950000183215.c.b #22 ENSGT00950000183092.b.b ENSGT00510000050935 ENSGT00940000160188 ENSGT00940000158591.g.b ENSGT00390000003365.b ENSGT01060000248564.a.a.a.b ENSGT00940000156096.e.a ENSGT00390000011376 ENSGT00950000183034.C.a.b ENSGT00390000012242 ENSGT00940000153511.b.q ENSGT00950000182856.a.b.a ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b.b ENSGT00530000063503.a.b.g.b ENSGT00940000168150.a Lumpfish MODERN SPECIES 14 ENSCLMG00005016940 DLK1 (ENSCLMG00005016937) ENSCLMG00005016936 ENSCLMG00005016934 ENSCLMG00005011442 ENSCLMG00005011394 rpl13a (ENSCLMG00005011384) ENSCLMG00005010271 ENSCLMG00005010251 atp5if1b (ENSCLMG00005010246) zmpste24 (ENSCLMG00005010237) ENSCLMG00005010232 znf593 (ENSCLMG00005010229) #33 selenon (ENSCLMG00005010223) ENSCLMG00005010218 mtfr1l (ENSCLMG00005010214) #22 STAC (ENSCLMG00005010203) nkl.4 (ENSCLMG00005010197) tonsl (ENSCLMG00005010170) GABRR1 (ENSCLMG00005021657) PM20D2 (ENSCLMG00005021626) CNR1 (ENSCLMG00005021624) AKIRIN2 (ENSCLMG00005021622) orc3 (ENSCLMG00005021601) ENSCLMG00005021596 ENSCLMG00005021594 cga (ENSCLMG00005021590) syncripl (ENSCLMG00005021544) SNX14 (ENSCLMG00005021516) ENSCLMG00005021512 HTR1B (ENSCLMG00005021511) Stickleback MODERN SPECIES 15 ENSGACG00000009448 SLC25A29 (ENSGACG00000009441) WARS1 (ENSGACG00000009413) WDR25 (ENSGACG00000009406) ENSGACG00000009402 ENSGACG00000009397 ENSGACG00000009386 ENSGACG00000009379 rpl13a (ENSGACG00000009310) atp5if1b (ENSGACG00000009305) zmpste24 (ENSGACG00000009297) ENSGACG00000009288 znf593 (ENSGACG00000009279) #33 selenon (ENSGACG00000009262) ENSGACG00000009254 mtfr1l (ENSGACG00000009245) #22 STAC (ENSGACG00000009232) nkl.4 (ENSGACG00000009229) tonsl (ENSGACG00000009209) GABRR1 (ENSGACG00000009199) PM20D2 (ENSGACG00000009194) CNR1 (ENSGACG00000009189) akirin2 (ENSGACG00000009179) znf292a (ENSGACG00000009170) cga (ENSGACG00000009153) syncripl (ENSGACG00000009124) SNX14 (ENSGACG00000009094) HTR1B (ENSGACG00000009090) ENSGACG00000009087 ENSGACG00000009073 colec11 (ENSGACG00000009068) Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000153724.B ENSGT00530000063583.a.a.a ENSGT00940000165081.a ENSGT00940000154225.b ENSGT00940000154482.b.b.a.c ENSGT01030000234620.a.a.a.a.a.b ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a ENSGT00390000010799 ENSGT00940000165091.d ENSGT00390000002053 ENSGT00950000183034.B ENSGT00390000004173 #33 ENSGT00940000164027 ENSGT00940000155187.A ENSGT00940000181185 ENSGT00950000183215.c.b #22 ENSGT00950000183092.b.b ENSGT00940000175159 ENSGT00510000050935 ENSGT00940000160188 ENSGT00940000158591.g.b ENSGT00390000003365.b ENSGT01060000248564.a.a.a.b ENSGT00940000156096.e.a ENSGT00390000011376 ENSGT00950000183034.C.a.b ENSGT00390000012242 ENSGT00940000153511.b.q ENSGT00950000182856.a.b.a ENSGT00530000063775.a.a ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b.b Gilthead seabream MODERN SPECIES 7 SLC25A29 (ENSSAUG00010001530) WARS1 (ENSSAUG00010001699) WDR25 (ENSSAUG00010002609) ENSSAUG00010002623 DLK1 (ENSSAUG00010002633) DIO3 (ENSSAUG00010002642) ENSSAUG00010002713 ENSSAUG00010003108 rpl13a (ENSSAUG00010003114) atp5if1b (ENSSAUG00010003151) zmpste24 (ENSSAUG00010003156) RLF (ENSSAUG00010003171) znf593 (ENSSAUG00010003179) #33 selenon (ENSSAUG00010003190) ENSSAUG00010003204 mtfr1l (ENSSAUG00010003211) #22 ENSSAUG00010003214 STAC (ENSSAUG00010003217) ENSSAUG00010003227 nkl.4 (ENSSAUG00010003231) tonsl (ENSSAUG00010003245) GABRR1 (ENSSAUG00010003331) PM20D2 (ENSSAUG00010003462) CNR1 (ENSSAUG00010003476) akirin2 (ENSSAUG00010003480) orc3 (ENSSAUG00010003509) znf292a (ENSSAUG00010003577) cga (ENSSAUG00010003582) VASH1 (ENSSAUG00010003587) ENSSAUG00010003588 LRRC74A (ENSSAUG00010003589) Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000153724.B ENSGT00530000063583.a.a.a ENSGT00940000165081.a ENSGT00940000154225.b ENSGT00940000154482.b.b.a.c ENSGT01030000234620.a.a.a.a.a.b ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a ENSGT00390000010799 ENSGT00940000165091.d ENSGT00390000002053 ENSGT00950000183034.B ENSGT00390000004173 #33 ENSGT00940000164027 ENSGT00940000155187.A ENSGT00940000181185 ENSGT00950000183215.c.b #22 ENSGT00950000183092.b.b ENSGT00940000175159 ENSGT00510000050935 ENSGT00940000160188 ENSGT00940000158591.g.b ENSGT00390000003365.b ENSGT01060000248564.a.a.a.b ENSGT00940000156096.e.a ENSGT00390000011376 ENSGT00950000183034.C.a.b ENSGT00390000012242 ENSGT00940000153511.b.q ENSGT00950000182856.a.b.a ENSGT00530000063775.a.a ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b.b European seabass MODERN SPECIES 2 WARS1 (ENSDLAG00005000841) ENSDLAG00005028675 ENSDLAG00005027047 DLK1 (ENSDLAG00005000813) ENSDLAG00005000807 ENSDLAG00005031733 ENSDLAG00005027762 rpl13a (ENSDLAG00005032540) rpl13a (ENSDLAG00005000624) atp5if1b (ENSDLAG00005032619) zmpste24 (ENSDLAG00005000613) ENSDLAG00005034680 selenon (ENSDLAG00005032126) ENSDLAG00005029402 ENSDLAG00005034464 mtfr1l (ENSDLAG00005028385) #22 ENSDLAG00005000545 ENSDLAG00005000539 ENSDLAG00005000512 ENSDLAG00005003436 ENSDLAG00005028699 ENSDLAG00005032849 ENSDLAG00005032399 ENSDLAG00005031600 GABRR1 (ENSDLAG00005000470) PM20D2 (ENSDLAG00005034721) CNR1 (ENSDLAG00005032092) orc3 (ENSDLAG00005000399) znf292a (ENSDLAG00005000374) cga (ENSDLAG00005000366) SYNCRIP (ENSDLAG00005000325) Large yellow croaker MODERN SPECIES 495 WARS1 (ENSLCRG00005011513) WDR25 (ENSLCRG00005011564) ENSLCRG00005011569 DLK1 (ENSLCRG00005011574) ENSLCRG00005011577 ENSLCRG00005011578 ENSLCRG00005011593 ENSLCRG00005011809 rpl13a (ENSLCRG00005011811) atp5if1b (ENSLCRG00005011833) zmpste24 (ENSLCRG00005011835) ENSLCRG00005011837 znf593 (ENSLCRG00005011840) #33 selenon (ENSLCRG00005011842) ENSLCRG00005011856 mtfr1l (ENSLCRG00005011857) #22 STAC (ENSLCRG00005011858) ENSLCRG00005011862 nkl.4 (ENSLCRG00005011866) ENSLCRG00005011871 tonsl (ENSLCRG00005011874) GABRR1 (ENSLCRG00005011886) PM20D2 (ENSLCRG00005011927) CNR1 (ENSLCRG00005011929) akirin2 (ENSLCRG00005011935) orc3 (ENSLCRG00005011979) znf292a (ENSLCRG00005012511) cga (ENSLCRG00005012512) syncripl (ENSLCRG00005012514) SNX14 (ENSLCRG00005012664) nt5e (ENSLCRG00005012675) Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000153724.B ENSGT00530000063583.a.a.a ENSGT00940000165081.a ENSGT00940000154225.b ENSGT00940000154482.b.b.a.c ENSGT01030000234620.a.a.a.a.a.b ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a ENSGT00390000010799 ENSGT00940000165091.d ENSGT00390000002053 ENSGT00950000183034.B ENSGT00390000004173 #33 ENSGT00940000164027 ENSGT00940000155187.A ENSGT00940000181185 ENSGT00950000183215.c.b #22 ENSGT00950000183092.b.b ENSGT00940000175159 ENSGT00510000050935 ENSGT00940000160188 ENSGT00940000158591.g.b ENSGT00390000003365.b ENSGT01060000248564.a.a.a.b ENSGT00940000156096.e.a ENSGT00390000011376 ENSGT00950000183034.C.a.b ENSGT00390000012242 ENSGT00940000153511.b.q 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WARS1 (ENSTNIG00000017279) ENSTNIG00000017280 ENSTNIG00000017281 DLK1 (ENSTNIG00000017282) DIO3 (ENSTNIG00000017283) ENSTNIG00000017284 rpl13a (ENSTNIG00000017285) zmpste24 (ENSTNIG00000017286) ENSTNIG00000017287 znf593 (ENSTNIG00000017288) #33 selenon (ENSTNIG00000017289) ENSTNIG00000017290 mtfr1l (ENSTNIG00000017291) #22 STAC (ENSTNIG00000017292) ENSTNIG00000001275 tonsl (ENSTNIG00000017293) GABRR1 (ENSTNIG00000017294) PM20D2 (ENSTNIG00000017295) CNR1 (ENSTNIG00000017296) akirin2 (ENSTNIG00000017297) orc3 (ENSTNIG00000002054) znf292a (ENSTNIG00000017298) syncripl (ENSTNIG00000017299) SNX14 (ENSTNIG00000017300) ENSTNIG00000017301 myo6b (ENSTNIG00000017302) colec11 (ENSTNIG00000017303) sox11a (ENSTNIG00000017304) Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000153724.B ENSGT00940000173691 ENSGT00530000063583.a.a.a ENSGT00940000165081.a ENSGT00940000154225.b ENSGT00940000154482.b.b.a.c ENSGT01030000234620.a.a.a.a.a.b ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a ENSGT00390000010799 ENSGT00940000165091.d 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ENSGT00940000154482.b.b.a.c ENSGT01030000234620.a.a.a.a.a.b ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a ENSGT00390000010799 ENSGT00940000165091.d ENSGT00390000002053 ENSGT00950000183034.B ENSGT00390000004173 #33 ENSGT00940000164027 ENSGT00940000155187.A ENSGT00950000183215.c.b #22 ENSGT00950000183092.b.b ENSGT00510000050935 ENSGT00940000160188 ENSGT00940000158591.g.b ENSGT01060000248564.a.a.a.b ENSGT00940000156096.e.a ENSGT00390000011376 ENSGT00950000183034.C.a.b ENSGT00390000012242 ENSGT00940000153511.b.q ENSGT00950000182856.a.b.a ENSGT00530000063775.a.a ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b.b ENSGT00530000063503.a.b.g.b ENSGT00940000156078.c Orange clownfish MODERN SPECIES 9 WDR25 (ENSAPEG00000018501) ENSAPEG00000018512 DLK1 (ENSAPEG00000018555) DIO3 (ENSAPEG00000018645) ENSAPEG00000018657 ENSAPEG00000018666 PPP2R5C (ENSAPEG00000018686) ENSAPEG00000018751 rpl13a (ENSAPEG00000018777) atp5if1b (ENSAPEG00000018820) zmpste24 (ENSAPEG00000018830) ENSAPEG00000018882 znf593 (ENSAPEG00000018888) #33 selenon 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(ENSSPAG00000022320) zmpste24 (ENSSPAG00000022314) ENSSPAG00000022305 znf593 (ENSSPAG00000022301) #33 selenon (ENSSPAG00000022285) ENSSPAG00000022275 mtfr1l (ENSSPAG00000022261) #22 STAC (ENSSPAG00000022240) Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000157766.b.a ENSGT00940000153724.B ENSGT00530000063583.a.a.a ENSGT00940000165081.a ENSGT00940000154225.b ENSGT00940000154482.b.b.a.c ENSGT01030000234620.a.a.a.a.a.b ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a ENSGT00390000010799 ENSGT00940000165091.d ENSGT00390000002053 ENSGT00950000183034.B ENSGT00390000004173 #33 ENSGT00940000164027 ENSGT00940000155187.A ENSGT00950000183215.c.b #22 ENSGT00950000183092.b.b ENSGT00510000050935.m ENSGT00940000175159 ENSGT00510000050935.n ENSGT00940000160188 ENSGT00940000158591.g.b ENSGT00390000003365.b ENSGT01060000248564.a.a.a.b ENSGT00940000156096.e.a ENSGT00390000011376 ENSGT00950000183034.C.a.b ENSGT00390000012242 ENSGT00940000153511.b.q ENSGT00950000182856.a.b.a ENSGT00530000063775.a.a Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL 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(ENSNFUG00015008479) ENSNFUG00015008487 ZNF593 (ENSNFUG00015008490) #33 ENSNFUG00015008511 ENSNFUG00015008518 mtfr1l (ENSNFUG00015008519) #22 STAC (ENSNFUG00015008525) nkl.4 (ENSNFUG00015008528) tonsl (ENSNFUG00015008533) ENSNFUG00015008594 PM20D2 (ENSNFUG00015008656) ENSNFUG00015008715 CNR1 (ENSNFUG00015008716) akirin2 (ENSNFUG00015008723) orc3 (ENSNFUG00015008746) znf292a (ENSNFUG00015008837) cga (ENSNFUG00015008843) SYNCRIPL (ENSNFUG00015008875) SNX14 (ENSNFUG00015009489) HTR1B (ENSNFUG00015009723) ENSNFUG00015009735 Oryzias ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000153724.B ENSGT00940000173691 ENSGT00530000063583.a.a.a ENSGT00940000165081.a ENSGT00940000154225.b ENSGT00940000154482.b.b.a.c ENSGT01030000234620.a.a.a.a.a.b ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a ENSGT00390000010799 ENSGT00940000165091.d ENSGT00390000002053 ENSGT00950000183034.B ENSGT00390000004173 #33 ENSGT00940000164027 ENSGT00940000155187.A ENSGT00950000183215.c.b #22 ENSGT00950000183092.b.b ENSGT00510000050935 ENSGT00940000160188 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ENSGT00390000002053 ENSGT00950000183034.B ENSGT00390000004173 #33 ENSGT00940000164027 ENSGT00940000155187.A ENSGT00950000183215.c.b #22 ENSGT00950000183092.b.b ENSGT00510000050935 ENSGT00940000160188 ENSGT00940000158591.g.b ENSGT00390000003365.b ENSGT01060000248564.a.a.a.b ENSGT00940000156096.e.a ENSGT00390000011376 ENSGT00950000183034.C.a.b ENSGT00390000012242 ENSGT00940000153511.b.q ENSGT00950000182856.a.b.a ENSGT00530000063775.a.a ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b.b ENSGT00530000063503.a.b.g.b Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 14 SLC25A29 (ENSORLG00000025078) WARS1 (ENSORLG00000014524) WDR25 (ENSORLG00000014527) ENSORLG00000027872 DLK1 (ENSORLG00000025954) ENSORLG00000027130 PPP2R5C (ENSORLG00000014576) ENSORLG00000014581 rpl13a (ENSORLG00000014599) atp5if1b (ENSORLG00000014607) zmpste24 (ENSORLG00000014621) ENSORLG00000014636 znf593 (ENSORLG00000014641) #33 selenon (ENSORLG00000014649) ENSORLG00000014654 mtfr1l (ENSORLG00000014664) #22 STAC (ENSORLG00000014686) ENSORLG00000022450 tonsl (ENSORLG00000014714) ENSORLG00000014740 ENSORLG00000014750 HTR1B (ENSORLG00000014940) AKIRIN2 (ENSORLG00000029748) orc3 (ENSORLG00000014787) znf292a (ENSORLG00000014801) cga (ENSORLG00000022598) syncripl (ENSORLG00000014840) SNX14 (ENSORLG00000014899) nt5e (ENSORLG00000014932) ENSORLG00000030609 myo6b (ENSORLG00000014977) Chinese medaka MODERN SPECIES 671 rpl13a (ENSOSIG00000018574) atp5if1b (ENSOSIG00000018580) zmpste24 (ENSOSIG00000018585) ENSOSIG00000018593 znf593 (ENSOSIG00000018594) #33 selenon (ENSOSIG00000018597) mtfr1l (ENSOSIG00000018602) #22 ENSOSIG00000018607 STAC (ENSOSIG00000018608) ENSOSIG00000018614 GABRR1 (ENSOSIG00000018637) PM20D2 (ENSOSIG00000018732) CNR1 (ENSOSIG00000018733) akirin2 (ENSOSIG00000018736) orc3 (ENSOSIG00000018743) znf292a (ENSOSIG00000018749) cga (ENSOSIG00000018751) syncripl (ENSOSIG00000018766) SNX14 (ENSOSIG00000018848) nt5e (ENSOSIG00000020015) HTR1B (ENSOSIG00000020026) ENSOSIG00000020034 Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 14 PPP2R5C 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(ENSGMOG00000025825) zmpste24 (ENSGMOG00000010767) ENSGMOG00000024833 znf593 (ENSGMOG00000010720) #33 selenon (ENSGMOG00000010703) ENSGMOG00000027134 mtfr1l (ENSGMOG00000010661) #22 ENSGMOG00000030741 ENSGMOG00000010613 ENSGMOG00000013969 ENSGMOG00000010595 ENSGMOG00000010589 orc3 (ENSGMOG00000010505) znf292a (ENSGMOG00000035404) cga (ENSGMOG00000010447) SYNCRIP (ENSGMOG00000010432) ENSGMOG00000010401 NT5E (ENSGMOG00000010380) HTR1B (ENSGMOG00000020373) ENSGMOG00000010359 MYO6 (ENSGMOG00000010314) colec11 (ENSGMOG00000016181) Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 72 ENSGT00390000018360.b ENSGT00950000183094.a.n ENSGT00940000154716.gc.b ENSGT01030000234515.a.b.a.a.e ENSGT00940000154947.k ENSGT00390000012569.a ENSGT00940000153511.a ENSGT00390000010799 ENSGT00940000165091.d ENSGT00390000002053 ENSGT00950000183034.B ENSGT00390000004173 #33 ENSGT00940000164027 ENSGT00940000155187.A ENSGT00940000181185 ENSGT00950000183215.c.b #22 ENSGT00950000183092.b.b ENSGT00940000175159 ENSGT00510000050935 ENSGT00940000160188 ENSGT00940000158591.g.b ENSGT00390000003365.b ENSGT01060000248564.a.a.a.b ENSGT00940000156096.e.a ENSGT00390000011376 ENSGT00950000183034.C.a.b ENSGT00390000012242 ENSGT01010000222287.B.b.a.a.b.b ENSGT00940000153511.b.q ENSGT00950000182856.a.b.a ENSGT00530000063775.a.a.a Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 333 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a.c ENSGT00940000153511.a.nb.a ENSGT00390000010799.d ENSGT00940000165091.d.a ENSGT00390000002053.f ENSGT00950000183034.B.p ENSGT00390000004173 #33 ENSGT00940000164027 ENSGT00940000155187.A ENSGT00940000181185.b ENSGT00950000183215.c.b.h #22 ENSGT00940000181185.a ENSGT00950000183215.c.b.g #22 ENSGT00950000183092.b.b.f ENSGT00510000050935.q.a ENSGT00510000050935.q.b ENSGT00940000158591.g.b.e ENSGT01060000248564.a.a.a.b.b ENSGT00940000156096.e.a.d ENSGT00390000011376.c ENSGT00950000183034.C.a.b.e ENSGT00390000012242.a.b ENSGT00940000153511.b.q.d ENSGT00530000063775.a.a.a ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b.b.a ENSGT00530000063503.a.b.g.b.c ENSGT00940000156078.c.e ENSGT00940000159468.g Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT01060000248589.D.u.b ENSGT01060000248589.D.u.a ENSGT00950000182852.A.b.e ENSGT00940000157193.e ENSGT00390000004660.C.a.b ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a.c ENSGT00940000153511.a.nb.a ENSGT00390000010799.d ENSGT00940000165091.d.a ENSGT00390000002053.f ENSGT00950000183034.B.p ENSGT00390000004173 #33 ENSGT00940000164027 ENSGT00940000155187.A.c.b ENSGT00940000181185.a ENSGT00950000183215.c.b.g #22 ENSGT00950000183092.b.b.f ENSGT00510000050935.q.a ENSGT00510000050935.q.b ENSGT00940000158591.g.b.e ENSGT01060000248564.a.a.a.b.b ENSGT00940000156096.e.a.d ENSGT00390000011376.c ENSGT00950000183034.C.a.b.e ENSGT00390000012242.a.b ENSGT01010000222287.B.b.a.a.b.b.a ENSGT00940000153511.b.q.d ENSGT00530000063775.a.a.a ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b.b.a ENSGT00530000063503.a.b.g.b.c ENSGT00940000156078.c.e Salmo ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT01060000248589.D.u.b ENSGT01060000248589.D.u.a ENSGT00950000182852.A.b.e ENSGT00940000157193.e ENSGT00390000004660.C.a.b ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a.c ENSGT00940000153511.a.nb.a ENSGT00390000010799.d ENSGT00940000165091.d.a ENSGT00390000002053.f ENSGT00950000183034.B.p ENSGT00390000004173 #33 ENSGT00940000164027 ENSGT00940000155187.A.c.b ENSGT00940000181185.a ENSGT00950000183215.c.b.g #22 ENSGT00950000183092.b.b.f ENSGT00510000050935.q.a ENSGT00940000158591.g.b.e ENSGT01060000248564.a.a.a.b.b ENSGT00940000156096.e.a.d ENSGT00390000011376.c ENSGT00950000183034.C.a.b.e ENSGT00390000012242.a.b ENSGT00940000165278.e ENSGT00940000153511.b.q.d ENSGT00530000063775.a.a.a ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b.b.a ENSGT00530000063503.a.b.g.b.c ENSGT00940000156078.c.e ENSGT00940000159468.g Atlantic salmon MODERN SPECIES ENSSSAG00000103575 kdm1a (ENSSSAG00000008598) tmem30b (ENSSSAG00000100813) ENSSSAG00000113451 ENSSSAG00000008676 rpl13a (ENSSSAG00000008822) atp5if1b (ENSSSAG00000008979) ENSSSAG00000082248 zmpste24 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ENSGT00390000004254 ENSGT01030000234513.A.a.a.a.b.c.b ENSGT01030000234513.A.a.a.a.a.e ENSGT00940000158484 ENSGT00940000157491 ENSGT00940000158000 ENSGT00940000153592.A.b ENSGT01030000235292 ENSGT00390000005606 ENSGT00940000157913.b.a ENSGT01010000222313.A.a ENSGT00940000153798.A.a Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 53 ENSGT00940000154289.B.e.a ENSGT00940000160084.g ENSGT00940000154906.C.d ENSGT00940000153968.a.a.f ENSGT00940000156635 ENSGT00940000166901 ENSGT00390000007694 ENSGT00390000015361 ENSGT00530000063557.b ENSGT00940000155483.f ENSGT00940000163420 ENSGT00390000006619 ENSGT00390000004173 #33 ENSGT00940000164027 ENSGT00940000155187.A ENSGT00950000183215.c.b #22 ENSGT00950000183092.b.b ENSGT00940000154524.b ENSGT00940000154239.b ENSGT00390000004254 ENSGT01030000234513.A.a.a.a.b.c.b ENSGT01030000234513.A.a.a.a.a.e ENSGT00940000158484 ENSGT00940000157491 ENSGT00940000158000 ENSGT00940000153592.A.b ENSGT01030000235292 ENSGT00390000005606 ENSGT00940000157913.b.a ENSGT01010000222313.A.a 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#22 ENSGT00950000183092.b.b ENSGT01060000249972 ENSGT00940000160188 Atlantic herring MODERN SPECIES 5 ENSCHAG00000018276 ENSCHAG00000018268 ENSCHAG00000018259 ENSCHAG00000018250 ENSCHAG00000017868 rpl13a (ENSCHAG00000017737) atp5if1b (ENSCHAG00000017730) ENSCHAG00000017697 ENSCHAG00000017664 zmpste24 (ENSCHAG00000017558) ENSCHAG00000017512 RLF (ENSCHAG00000017504) znf593 (ENSCHAG00000017473) #33 selenon (ENSCHAG00000017419) ENSCHAG00000017400 mtfr1l (ENSCHAG00000017382) #22 STAC (ENSCHAG00000017302) ENSCHAG00000017279 ENSCHAG00000017246 nkl.4 (ENSCHAG00000017239) tonsl (ENSCHAG00000016424) klf11b (ENSCHAG00000016390) grhl1 (ENSCHAG00000015880) ywhaqb (ENSCHAG00000015822) adam17a (ENSCHAG00000013963) iah1 (ENSCHAG00000013918) itgb1bp1 (ENSCHAG00000013894) asap2a (ENSCHAG00000011321) MBOAT2 (ENSCHAG00000011085) KIDINS220 (ENSCHAG00000010596) id2a (ENSCHAG00000010550) Denticle herring MODERN SPECIES ENSDCDG00000004755 ENSDCDG00000004753 qkia (ENSDCDG00000004748) pacrg (ENSDCDG00000004742) LUZP1 (ENSDCDG00000004733) kdm1a (ENSDCDG00000004700) tmem30b (ENSDCDG00000004687) ENSDCDG00000004681 HNRNPR (ENSDCDG00000004660) rpl13a (ENSDCDG00000004641) zmpste24 (ENSDCDG00000004619) RLF (ENSDCDG00000004603) znf593 (ENSDCDG00000004595) #33 selenon (ENSDCDG00000004591) ENSDCDG00000004588 mtfr1l (ENSDCDG00000004582) #22 STAC (ENSDCDG00000004569) ENSDCDG00000004560 ENSDCDG00000004555 ENSDCDG00000004551 lbh (ENSDCDG00000004547) ENSDCDG00000004544 lclat1 (ENSDCDG00000004540) slc30a10 (ENSDCDG00000004536) ENSDCDG00000004534 iars2 (ENSDCDG00000004155) qrsl1 (ENSDCDG00000003951) rtn4ip1 (ENSDCDG00000003929) ENSDCDG00000003731 ENSDCDG00000003730 ENSDCDG00000003727 Spotted gar MODERN SPECIES 672 ENSLOCG00000004573 PTAFR (ENSLOCG00000018282) dnajc8 (ENSLOCG00000004544) tmem30b (ENSLOCG00000004514) kdm1a (ENSLOCG00000004475) LUZP1 (ENSLOCG00000004433) ENSLOCG00000018281 hnrnpr (ENSLOCG00000004400) rpl13a (ENSLOCG00000004388) ENSLOCG00000004377 zmpste24 (ENSLOCG00000004363) RLF 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(ENSECRG00000016225) ENSECRG00000016283 ENSECRG00000016337 ENSECRG00000016355 ENSECRG00000016379 ENSECRG00000016421 ENSECRG00000016532 ENSECRG00000016621 ccn2b (ENSECRG00000016795) trnau1apa (ENSECRG00000016820) stx12 (ENSECRG00000016865) ENSECRG00000016931 sh3bgrl3 (ENSECRG00000017114) CEP85 (ENSECRG00000017136) #37 Elephant shark MODERN SPECIES 1521 dnajc8 (ENSCMIG00000016318) atp5if1b (ENSCMIG00000016328) rpl13a (ENSCMIG00000016337) hnrnpr (ENSCMIG00000016404) ENSCMIG00000016460 ENSCMIG00000016461 kdm1a (ENSCMIG00000016497) tmem30b (ENSCMIG00000016543) zmpste24 (ENSCMIG00000016550) ENSCMIG00000016566 RLF (ENSCMIG00000016571) znf593 (ENSCMIG00000016576) #33 selenon (ENSCMIG00000016579) ENSCMIG00000016581 ENSCMIG00000016583 mtfr1l (ENSCMIG00000016585) #22 si:ch211-195b13.1 (ENSCMIG00000016619) ENSCMIG00000016764 xkr8.3 (ENSCMIG00000016847) smpdl3b (ENSCMIG00000016850) rpa2 (ENSCMIG00000016855) ENSCMIG00000016859 ENSCMIG00000016863 ptprub (ENSCMIG00000016880) mecr (ENSCMIG00000016925) ENSCMIG00000016931 srsf4 (ENSCMIG00000016933) ENSCMIG00000016937 ENSCMIG00000016945 EPB41 (ENSCMIG00000017073) ccn2b (ENSCMIG00000017312) Cyclostomata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183215.c.b #22 Lamprey MODERN SPECIES 497 ENSPMAG00000004631 ENSPMAG00000004623 #22 Hagfish MODERN SPECIES 568 ENSEBUG00000000765 ENSEBUG00000013258 ENSEBUG00000012625 ENSEBUG00000010845 ENSEBUG00000012069 ENSEBUG00000006781 ENSEBUG00000012283 ENSEBUG00000012922 #22 pde7a (ENSEBUG00000000343) Vertebrata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183215.c.a ##22 Gnathostomata DUPLICATION Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES 177 ENSGT00940000161124 ENSGT00940000157314.A ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00940000167949 ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00940000164948 ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 178 ENSGT00940000157314.A ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00940000167949 ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00940000164948 ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318 ENSGT00940000156674 Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 163 ENSGT00940000161124 ENSGT00940000157314.A ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00940000167949 ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00940000164948 ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00650000094590 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318 ENSGT00940000156674 Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000160412 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ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00650000094590 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.v ENSGT00940000156674 ENSGT00390000013823.b.c.a.b ENSGT00390000013823.b.c.a.a Sauria ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00530000064150 ENSGT00530000063484.a.m ENSGT00530000063484.a.n ENSGT00940000158448 ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00940000157314.A ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00940000167949 ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00940000164948 ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00650000094590 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00680000101596 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.v ENSGT00940000156674 ENSGT00390000013823.b.d Archelosauria ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00530000064150 ENSGT00530000063484.a.m ENSGT00530000063484.a.n ENSGT00940000158448 ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00940000157314.A ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00940000167949 ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00940000164948 ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00650000094590 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00680000101596 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a.b ENSGT00390000018318.v ENSGT00940000156674 ENSGT00390000013823.b.d Cryptodira ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000160412 ENSGT00530000064150 ENSGT00530000063484.a.m ENSGT00530000063484.a.n ENSGT00940000158448 ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00940000157314.A ENSGT00940000160083 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ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a.b ENSGT00950000182978.A.a.a.a.b ENSGT00390000018318.u.b.b ENSGT00940000156674.n ENSGT00390000013823.b.d.f.a Emydidae ANCESTRAL SPECIES 46 ENSGT00950000182963.a.a ENSGT00940000160412 ENSGT00530000064150 ENSGT00530000063484.a.m ENSGT00530000063484.a.n ENSGT00940000158448 ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00940000157314.A ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00680000101596 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a.b ENSGT00950000182978.A.a.a.a.b ENSGT00390000018318.u.b.b ENSGT00940000156674.n ENSGT00390000013823.b.d.f.b painted turtle MODERN SPECIES 12 CCDC28A (ENSCPBG00000017201) NHSL1 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ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00680000101596 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a.b ENSGT00390000018318.u.b.b ENSGT00940000156674.n ENSGT00390000013823.b.d.f.b ENSGT00940000156674.m Goode s thornscrub tortoise MODERN SPECIES 17 NHSL1 (ENSGEVG00005007994) ENSGEVG00005007932 ARFGEF3 (ENSGEVG00005007723) ENSGEVG00005007670 ENSGEVG00005007635 TNFAIP3 (ENSGEVG00005007607) OLIG3 (ENSGEVG00005007591) ENSGEVG00005007546 IL22RA2 (ENSGEVG00005007496) IL20RA (ENSGEVG00005007442) SLC35D3 (ENSGEVG00005007413) PEX7 (ENSGEVG00005007361) MAP3K5 (ENSGEVG00005005197) MAP7 (ENSGEVG00005004461) BCLAF1 (ENSGEVG00005004317) MTFR2 (ENSGEVG00005004278) ##22 PDE7B (ENSGEVG00005004167) AHI1 (ENSGEVG00005004094) MYB (ENSGEVG00005004048) HBS1L (ENSGEVG00005004019) ALDH8A1 (ENSGEVG00005004008) ENSGEVG00005003999 SGK1 (ENSGEVG00005003985) 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ground finch MODERN SPECIES 19 NHSL1 (ENSGFOG00000000232) ARFGEF3 (ENSGFOG00000000107) ENSGFOG00000000069 ENSGFOG00000000067 TNFAIP3 (ENSGFOG00000000065) OLIG3 (ENSGFOG00000000063) ENSGFOG00000000060 IL22RA2 (ENSGFOG00000000056) IL20RA (ENSGFOG00000000052) SLC35D3 (ENSGFOG00000000049) PEX7 (ENSGFOG00000000046) MAP3K5 (ENSGFOG00000010728) MAP7 (ENSGFOG00000010697) ENSGFOG00000010691 BCLAF1 (ENSGFOG00000010684) MTFR2 (ENSGFOG00000010676) ##22 PDE7B (ENSGFOG00000010661) SF3B5 (ENSGFOG00000010657) STX11 (ENSGFOG00000010650) UTRN (ENSGFOG00000010557) EPM2A (ENSGFOG00000010537) FBXO30 (ENSGFOG00000010534) SHPRH (ENSGFOG00000010511) GRM1 (ENSGFOG00000010494) RAB32 (ENSGFOG00000010487) STXBP5 (ENSGFOG00000009605) ENSGFOG00000009544 SASH1 (ENSGFOG00000009483) UST (ENSGFOG00000009469) TAB2 (ENSGFOG00000009460) ZC3H12D (ENSGFOG00000009167) Flycatcher MODERN SPECIES 21 NHSL1 (ENSFALG00000012835) ARFGEF3 (ENSFALG00000012840) ENSFALG00000027131 ENSFALG00000028881 TNFAIP3 (ENSFALG00000012857) OLIG3 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(ENSAPLG00000012664) ENSAPLG00000012545 BCLAF1 (ENSAPLG00000007570) MTFR2 (ENSAPLG00000007596) ##22 PDE7B (ENSAPLG00000007602) ENSAPLG00000029770 ENSAPLG00000007676 MYB (ENSAPLG00000007728) HBS1L (ENSAPLG00000007791) ALDH8A1 (ENSAPLG00000007873) SGK1 (ENSAPLG00000007896) SLC2A12 (ENSAPLG00000007989) TBPL1 (ENSAPLG00000007996) TCF21 (ENSAPLG00000008024) EYA4 (ENSAPLG00000008029) RPS12 (ENSAPLG00000008543) SLC18B1 (ENSAPLG00000008600) ENSAPLG00000008745 ENSAPLG00000008759 African ostrich MODERN SPECIES 1073 NHSL1 (ENSSCUG00000014431) ARFGEF3 (ENSSCUG00000014402) ENSSCUG00000014396 ENSSCUG00000014395 TNFAIP3 (ENSSCUG00000014392) OLIG3 (ENSSCUG00000014391) IFNGR1 (ENSSCUG00000014389) IL22RA2 (ENSSCUG00000014388) IL20RA (ENSSCUG00000014385) SLC35D3 (ENSSCUG00000014382) PEX7 (ENSSCUG00000014381) MAP3K5 (ENSSCUG00000014363) MAP7 (ENSSCUG00000014349) ENSSCUG00000014345 BCLAF1 (ENSSCUG00000014341) MTFR2 (ENSSCUG00000014339) ##22 PDE7B (ENSSCUG00000014336) AHI1 (ENSSCUG00000014329) MYB 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ENSGT00940000160412 ENSGT00530000064150 ENSGT00530000063484.a.m ENSGT00530000063484.a.n ENSGT00940000158448 ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000157314.A ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00940000167949 ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00680000101596 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.v ENSGT00940000156674 ENSGT00390000013823.b.d ENSGT00950000182934.a.b Episquamata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182963.a.a ENSGT00940000160412 ENSGT00530000064150 ENSGT00530000063484.a.m ENSGT00530000063484.a.n ENSGT00940000158448 ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000157314.A ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00940000167949 ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00680000101596 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.v ENSGT00940000156674 ENSGT00390000013823.b.d ENSGT00950000182934.a.b Toxicofera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182963.a.a ENSGT00940000160412 ENSGT00530000064150 ENSGT00530000063484.a.m ENSGT00530000063484.a.n ENSGT00940000158448 ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000157314.A ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00940000167949 ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00680000101596 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.v ENSGT00940000156674 ENSGT00390000013823.b.d ENSGT00950000182934.a.b Elapidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182963.a.a ENSGT00940000160412 ENSGT00530000064150 ENSGT00530000063484.a.m ENSGT00530000063484.a.n ENSGT00940000158448 ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000157314.A ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00940000167949 ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00680000101596 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.v ENSGT00940000156674 ENSGT00390000013823.b.d ENSGT00950000182934.a.b Indian cobra MODERN SPECIES NHSL1 (ENSNNAG00000001792) HEBP2 (ENSNNAG00000001818) ARFGEF3 (ENSNNAG00000001883) PERP (ENSNNAG00000002038) ENSNNAG00000002044 TNFAIP3 (ENSNNAG00000002057) OLIG3 (ENSNNAG00000002072) ENSNNAG00000002084 IL20RA 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ENSGT00680000101596 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.v ENSGT00940000156674 ENSGT00940000173986 ENSGT00390000013823.b.d.l Mainland tiger snake MODERN SPECIES 14 ARFGEF3 (ENSNSUG00000009900) ENSNSUG00000009899 ENSNSUG00000009896 TNFAIP3 (ENSNSUG00000009847) OLIG3 (ENSNSUG00000009846) ENSNSUG00000009845 ENSNSUG00000009844 SLC35D3 (ENSNSUG00000009843) PEX7 (ENSNSUG00000009842) ENSNSUG00000009841 ENSNSUG00000009840 ENSNSUG00000009839 MAP7 (ENSNSUG00000009838) ENSNSUG00000009837 BCLAF1 (ENSNSUG00000009836) MTFR2 (ENSNSUG00000009835) ##22 PDE7B (ENSNSUG00000009834) ENSNSUG00000009833 AHI1 (ENSNSUG00000009832) MYB (ENSNSUG00000009410) ENSNSUG00000009409 HBS1L (ENSNSUG00000007992) ALDH8A1 (ENSNSUG00000007986) ENSNSUG00000007973 SGK1 (ENSNSUG00000007972) SLC2A12 (ENSNSUG00000007970) TBPL1 (ENSNSUG00000007969) TCF21 (ENSNSUG00000007968) EYA4 (ENSNSUG00000007953) RPS12 (ENSNSUG00000007948) ENSNSUG00000007947 Lizard MODERN SPECIES 814 ARFGEF3 (ENSACAG00000016819) ENSACAG00000039582 ENSACAG00000038729 ENSACAG00000016852 ENSACAG00000044884 ENSACAG00000035269 TNFAIP3 (ENSACAG00000016855) ENSACAG00000028387 ENSACAG00000028065 SLC35D3 (ENSACAG00000016914) PEX7 (ENSACAG00000016918) MAP3K5 (ENSACAG00000016923) MAP7 (ENSACAG00000016994) BCLAF1 (ENSACAG00000017011) ENSACAG00000034620 ENSACAG00000017033 ##22 PDE7B (ENSACAG00000017035) ENSACAG00000035045 ENSACAG00000042528 AHI1 (ENSACAG00000009806) MYB (ENSACAG00000009861) ENSACAG00000040508 HBS1L (ENSACAG00000010120) ALDH8A1 (ENSACAG00000010204) SGK1 (ENSACAG00000010226) SLC2A12 (ENSACAG00000010313) TCF21 (ENSACAG00000010325) EYA4 (ENSACAG00000010346) ENSACAG00000042105 ENSACAG00000010479 SLC18B1 (ENSACAG00000010502) Laterata ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00950000182963.a.a ENSGT00940000160412 ENSGT00530000064150 ENSGT00530000063484.a.m ENSGT00530000063484.a.n ENSGT00940000158448 ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000157314.A ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00940000167949 ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.v ENSGT00940000173986 ENSGT00390000018318.u.b.a.a ENSGT00940000156674 ENSGT00390000013823.b.d Common wall lizard MODERN SPECIES 11 ARFGEF3 (ENSPMRG00000004701) ENSPMRG00000004685 ENSPMRG00000004677 TNFAIP3 (ENSPMRG00000004670) OLIG3 (ENSPMRG00000004665) ENSPMRG00000004656 IL20RA (ENSPMRG00000004637) SLC35D3 (ENSPMRG00000004628) PEX7 (ENSPMRG00000004619) MAP3K5 (ENSPMRG00000004592) ENSPMRG00000004584 ENSPMRG00000004581 MAP7 (ENSPMRG00000004562) ENSPMRG00000004544 BCLAF1 (ENSPMRG00000004526) MTFR2 (ENSPMRG00000004501) ##22 ENSPMRG00000004495 PDE7B (ENSPMRG00000004470) ENSPMRG00000004408 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(ENSSMRG00000001971) EYA4 (ENSSMRG00000002159) RPS12 (ENSSMRG00000002196) ENSSMRG00000002204 ENSSMRG00000002207 ENSSMRG00000002275 TAAR1 (ENSSMRG00000002339) Mammalia ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000160412 ENSGT00740000116829 ENSGT00530000064150 ENSGT00530000063484.a ENSGT00940000158448 ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00940000157314.A ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00940000164948 ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00650000094590 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.v ENSGT00940000156674 ENSGT00390000013823.b.c.a.b ENSGT00390000013823.b.c.a.a Theria ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00950000182963.a.a ENSGT00940000160412 ENSGT00740000116829 ENSGT00530000064150 ENSGT00530000063484.a ENSGT00940000158448 ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00940000157314.A ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00650000094590 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.v ENSGT00940000156674 ENSGT00390000013823.b.c.b ENSGT00390000013823.b.c.a.a Marsupialia ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00950000182963.a.a ENSGT00940000160412 ENSGT00740000116829 ENSGT00530000064150 ENSGT00530000063484.a ENSGT00940000158448 ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00940000157314.A ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00650000094590 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.v ENSGT00390000018318.u.b.b ENSGT00940000156674 ENSGT00390000013823.b.c.b Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00950000182963.a.a ENSGT00940000160412 ENSGT00740000116829 ENSGT00530000064150 ENSGT00530000063484.a ENSGT00940000158448 ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00940000157314.A ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.v ENSGT00940000156674 ENSGT00390000013823.b.c.b ENSGT00390000013823.b.c.a.a ENSGT00950000182934.a.b Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00950000182963.a.a ENSGT00940000160412 ENSGT00740000116829 ENSGT00530000064150 ENSGT00530000063484.a ENSGT00940000158448 ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00940000157314.A ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.u.a ENSGT00390000018318.u.b.b ENSGT00940000156674 ENSGT00390000013823.b.c.b ENSGT00390000013823.b.c.a.a Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00940000157314.A ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 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ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.v ENSGT00940000156674 ENSGT00390000013823.b.c.a.b ENSGT00390000013823.b.c.b Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000160412 ENSGT00740000116829 ENSGT01030000236221 ENSGT00530000064150 ENSGT00530000063484.a ENSGT00940000158448 ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00940000157314.A ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00650000094590 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.u.a ENSGT00390000018318.u.b.b ENSGT00940000156674 ENSGT00390000013823.b.c.a.b Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000160412 ENSGT00740000116829 ENSGT01030000236221 ENSGT00530000064150 ENSGT00530000063484.a ENSGT00940000158448 ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00940000157314.A ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00650000094590 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.u.a ENSGT00940000156674 ENSGT00390000013823.b.c.a.b ENSGT00390000013823.b.c.b Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000160412 ENSGT00740000116829 ENSGT01030000236221 ENSGT00530000064150 ENSGT00530000063484.a ENSGT00940000158448 ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00940000157314.A ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 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SPECIES 18 ENSGT00940000160412 ENSGT00740000116829 ENSGT00540000070023.c.b.a.a.b ENSGT00530000064150 ENSGT00530000063484.a ENSGT00940000158448 ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00940000157314.A ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00650000094590 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00950000182925.D.a.a.b.a.k.b ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.u.a ENSGT00390000018318.u.b.b ENSGT00940000156674 Pig MODERN SPECIES SMIM28 (ENSSSCG00000048346) ENSSSCG00000004151 ARFGEF3 (ENSSSCG00000022968) PERP (ENSSSCG00000038420) TNFAIP3 (ENSSSCG00000004154) OLIG3 (ENSSSCG00000004155) IFNGR1 (ENSSSCG00000004156) IL22RA2 (ENSSSCG00000004158) IL20RA (ENSSSCG00000004157) SLC35D3 (ENSSSCG00000004159) PEX7 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ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.u.a ENSGT00940000156674 ENSGT00390000013823.b.c.a.b Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00950000182963.a.a ENSGT00940000160412 ENSGT00740000116829 ENSGT00530000064150 ENSGT00530000063484.a ENSGT00940000158448 ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00940000157314.A ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00650000094590 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00950000182925.D.a.a.b.a.k.b ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.u.a ENSGT00940000156674 ENSGT00390000013823.b.c.a.b Cetacea ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00950000182963.a.a ENSGT00940000160412 ENSGT00740000116829 ENSGT00530000064150 ENSGT00530000063484.a ENSGT00940000158448 ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00940000157314.A ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00650000094590 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00950000182925.D.a.a.b.a.k.b ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.u.a ENSGT00940000156674 ENSGT00390000013823.b.c.a.b Odontoceti ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00950000182963.a.a ENSGT00940000160412 ENSGT00740000116829 ENSGT00530000064150 ENSGT00530000063484.a ENSGT00940000158448 ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00940000157314.A ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00650000094590 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00950000182925.D.a.a.b.a.k.b ENSGT00940000155726.fb.b ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.u.a ENSGT00940000156674 ENSGT00390000013823.b.c.a.b Sperm whale MODERN SPECIES 1 SMIM28 (ENSPCTG00005002515) ARFGEF3 (ENSPCTG00005002543) PERP (ENSPCTG00005002611) TNFAIP3 (ENSPCTG00005002628) ENSPCTG00005002647 OLIG3 (ENSPCTG00005002654) ENSPCTG00005002660 IFNGR1 (ENSPCTG00005002669) IL22RA2 (ENSPCTG00005002687) IL20RA (ENSPCTG00005002725) SLC35D3 (ENSPCTG00005002777) PEX7 (ENSPCTG00005002794) MAP3K5 (ENSPCTG00005002829) MAP7 (ENSPCTG00005002901) BCLAF1 (ENSPCTG00005003186) MTFR2 (ENSPCTG00005003247) ##22 PDE7B (ENSPCTG00005003278) AHI1 (ENSPCTG00005003350) MYB (ENSPCTG00005003582) HBS1L (ENSPCTG00005004840) ALDH8A1 (ENSPCTG00005005236) ENSPCTG00005005368 SGK1 (ENSPCTG00005005434) ENSPCTG00005005970 SLC2A12 (ENSPCTG00005005980) TBPL1 (ENSPCTG00005006014) TCF21 (ENSPCTG00005006049) EYA4 (ENSPCTG00005006207) ENSPCTG00005007873 SLC18B1 (ENSPCTG00005007922) VNN2 (ENSPCTG00005007984) Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00950000182963.a.a ENSGT00940000160412 ENSGT00740000116829 ENSGT00530000064150 ENSGT00530000063484.a ENSGT00940000158448 ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00940000157314.A ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00650000094590 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00950000182925.D.a.a.b.a.k.b ENSGT00940000155726.fb.b ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.u.a ENSGT00940000156674 ENSGT00390000013823.b.c.a.b Dolphin MODERN SPECIES 1876 IL20RA (ENSTTRG00000002552) SLC35D3 (ENSTTRG00000002550) PEX7 (ENSTTRG00000002549) MAP3K5 (ENSTTRG00000002547) MAP7 (ENSTTRG00000002544) BCLAF1 (ENSTTRG00000002543) MTFR2 (ENSTTRG00000002539) ##22 PDE7B (ENSTTRG00000002534) Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00950000182963.a.a ENSGT00940000160412 ENSGT00740000116829 ENSGT00530000064150 ENSGT00530000063484.a ENSGT00940000158448 ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00940000157314.A ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00650000094590 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00950000182925.D.a.a.b.a.k.b ENSGT00940000155726.fb.b ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.u.a ENSGT00940000156674 ENSGT00390000013823.b.c.a.b Monodontidae ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00950000182963.a.a ENSGT00940000160412 ENSGT00740000116829 ENSGT00530000064150 ENSGT00530000063484.a ENSGT00940000158448 ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00940000157314.A ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00650000094590 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00950000182925.D.a.a.b.a.k.b ENSGT00940000155726.fb.b ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.u.a ENSGT00940000156674 ENSGT01010000229148 Narwhal MODERN SPECIES 301 NHSL1 (ENSMMNG00015004748) HEBP2 (ENSMMNG00015004744) SMIM28 (ENSMMNG00015004741) ARFGEF3 (ENSMMNG00015004736) PERP (ENSMMNG00015004729) TNFAIP3 (ENSMMNG00015004725) OLIG3 (ENSMMNG00015004722) IFNGR1 (ENSMMNG00015004717) IL22RA2 (ENSMMNG00015004714) IL20RA (ENSMMNG00015004702) SLC35D3 (ENSMMNG00015004697) PEX7 (ENSMMNG00015004689) MAP3K5 (ENSMMNG00015004650) MAP7 (ENSMMNG00015004576) BCLAF1 (ENSMMNG00015004416) MTFR2 (ENSMMNG00015004365) ##22 PDE7B (ENSMMNG00015004337) ENSMMNG00015004316 AHI1 (ENSMMNG00015004289) MYB (ENSMMNG00015003868) HBS1L (ENSMMNG00015003506) ALDH8A1 (ENSMMNG00015003422) ENSMMNG00015003395 SGK1 (ENSMMNG00015003296) SLC2A12 (ENSMMNG00015003231) TBPL1 (ENSMMNG00015003201) TCF21 (ENSMMNG00015003187) EYA4 (ENSMMNG00015002681) ENSMMNG00015002434 SLC18B1 (ENSMMNG00015002413) ENSMMNG00015002397 Beluga whale MODERN SPECIES 80 CCDC28A (ENSDLEG00000018902) NHSL1 (ENSDLEG00000018878) HEBP2 (ENSDLEG00000018869) ARFGEF3 (ENSDLEG00000018824) PERP (ENSDLEG00000018815) TNFAIP3 (ENSDLEG00000018805) OLIG3 (ENSDLEG00000018800) IFNGR1 (ENSDLEG00000018795) IL22RA2 (ENSDLEG00000018776) IL20RA (ENSDLEG00000018765) SLC35D3 (ENSDLEG00000018760) PEX7 (ENSDLEG00000018737) MAP3K5 (ENSDLEG00000018645) MAP7 (ENSDLEG00000018586) BCLAF1 (ENSDLEG00000018552) MTFR2 (ENSDLEG00000018530) ##22 PDE7B (ENSDLEG00000018501) ENSDLEG00000018489 AHI1 (ENSDLEG00000018476) MYB (ENSDLEG00000017828) HBS1L (ENSDLEG00000017719) ENSDLEG00000017705 ALDH8A1 (ENSDLEG00000017684) ENSDLEG00000017675 SGK1 (ENSDLEG00000017395) SLC2A12 (ENSDLEG00000017341) TBPL1 (ENSDLEG00000017321) TCF21 (ENSDLEG00000017308) EYA4 (ENSDLEG00000017258) ENSDLEG00000017198 SLC18B1 (ENSDLEG00000017166) Vaquita MODERN SPECIES 3 NHSL1 (ENSPSNG00000016929) HEBP2 (ENSPSNG00000017128) SMIM28 (ENSPSNG00000017175) ARFGEF3 (ENSPSNG00000017246) PERP (ENSPSNG00000017580) TNFAIP3 (ENSPSNG00000017627) OLIG3 (ENSPSNG00000017695) IFNGR1 (ENSPSNG00000017711) IL22RA2 (ENSPSNG00000017736) IL20RA (ENSPSNG00000017854) SLC35D3 (ENSPSNG00000018001) PEX7 (ENSPSNG00000018022) MAP3K5 (ENSPSNG00000018088) MAP7 (ENSPSNG00000018187) BCLAF1 (ENSPSNG00000018438) MTFR2 (ENSPSNG00000018668) ##22 PDE7B (ENSPSNG00000018778) AHI1 (ENSPSNG00000018997) ENSPSNG00000019108 MYB (ENSPSNG00000019358) HBS1L (ENSPSNG00000020502) ALDH8A1 (ENSPSNG00000020689) ENSPSNG00000020833 SGK1 (ENSPSNG00000020913) SLC2A12 (ENSPSNG00000021095) TBPL1 (ENSPSNG00000021116) TCF21 (ENSPSNG00000021150) EYA4 (ENSPSNG00000021358) ENSPSNG00000021786 SLC18B1 (ENSPSNG00000004354) VNN2 (ENSPSNG00000004504) Blue whale MODERN SPECIES 3 HEBP2 (ENSBMSG00010011427) SMIM28 (ENSBMSG00010011435) ARFGEF3 (ENSBMSG00010011454) PERP (ENSBMSG00010012999) ENSBMSG00010013004 TNFAIP3 (ENSBMSG00010013017) OLIG3 (ENSBMSG00010013026) IFNGR1 (ENSBMSG00010013033) IL22RA2 (ENSBMSG00010013041) IL20RA (ENSBMSG00010013064) SLC35D3 (ENSBMSG00010013086) PEX7 (ENSBMSG00010013106) MAP3K5 (ENSBMSG00010013140) MAP7 (ENSBMSG00010013240) BCLAF1 (ENSBMSG00010013436) MTFR2 (ENSBMSG00010013499) ##22 PDE7B (ENSBMSG00010013521) AHI1 (ENSBMSG00010013573) MYB (ENSBMSG00010013716) HBS1L (ENSBMSG00010015846) ALDH8A1 (ENSBMSG00010016072) ENSBMSG00010016201 SGK1 (ENSBMSG00010016242) SLC2A12 (ENSBMSG00010016353) TBPL1 (ENSBMSG00010016385) TCF21 (ENSBMSG00010016420) ENSBMSG00010016433 EYA4 (ENSBMSG00010016581) RPS12 (ENSBMSG00010019087) SLC18B1 (ENSBMSG00010019139) VNN2 (ENSBMSG00010019272) Pecora ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00950000182963.a.a ENSGT00940000160412 ENSGT00740000116829 ENSGT00530000064150 ENSGT00530000063484.a ENSGT00940000158448 ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00940000157314.A ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00960000191152 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00950000182925.D.a.a.b.a.k.b ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.u.a ENSGT00940000156674 ENSGT00390000013823.b.c.a.b Percora_a ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00950000182963.a.a ENSGT00940000160412 ENSGT00740000116829 ENSGT00530000064150 ENSGT00530000063484.a ENSGT00940000158448 ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00940000157314.A ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00960000191152 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00950000182925.D.a.a.b.a.k.b ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.u.a ENSGT00940000156674 ENSGT00390000013823.b.c.a.b Bovidae ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00950000182963.a.a ENSGT00940000160412 ENSGT00740000116829 ENSGT00530000064150 ENSGT00530000063484.a ENSGT00940000158448 ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00940000157314.A ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00960000191152 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00950000182925.D.a.a.b.a.k.b ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.u.a ENSGT00940000156674 ENSGT00390000013823.b.c.a.b Bovinae ANCESTRAL SPECIES 35 ENSGT00950000182963.a.a ENSGT00940000160412 ENSGT00740000116829 ENSGT00530000064150 ENSGT00530000063484.a.k.a ENSGT00940000158448 ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00940000157314.A ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00960000191152 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00950000182925.D.a.a.b.a.k.b ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.u.a ENSGT00940000156674 ENSGT00390000013823.b.c.a.b Bos ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000160412 ENSGT00740000116829 ENSGT00530000064150 ENSGT00530000063484.a.l ENSGT00530000063484.a.k.a ENSGT00940000158448 ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00940000157314.A ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00950000182925.D.a.a.b.a.k.b ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.u.a ENSGT00940000156674 ENSGT00390000013823.b.c.a.b ENSGT00390000013823.b.c.b Bos_b ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00950000182963.a.a ENSGT00940000160412 ENSGT00740000116829 ENSGT00530000064150 ENSGT00530000063484.a.l ENSGT00940000158448 ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00940000157314.A ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00390000008432.l ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00950000185181 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.v ENSGT00940000156674 ENSGT00390000013823.b.c.a.b Cow MODERN SPECIES 28 CCDC28A (ENSBTAG00000015516) NHSL1 (ENSBTAG00000000245) HEBP2 (ENSBTAG00000000243) ARFGEF3 (ENSBTAG00000017370) PERP (ENSBTAG00000020097) TNFAIP3 (ENSBTAG00000000436) OLIG3 (ENSBTAG00000008749) IFNGR1 (ENSBTAG00000012544) IL22RA2 (ENSBTAG00000017000) IL20RA (ENSBTAG00000015638) SLC35D3 (ENSBTAG00000016793) PEX7 (ENSBTAG00000016791) MAP3K5 (ENSBTAG00000009065) MAP7 (ENSBTAG00000001598) BCLAF1 (ENSBTAG00000007802) MTFR2 (ENSBTAG00000007799) ##22 PDE7B (ENSBTAG00000015888) ENSBTAG00000046495 AHI1 (ENSBTAG00000017958) MYB (ENSBTAG00000012074) HBS1L (ENSBTAG00000020174) ALDH8A1 (ENSBTAG00000007975) ENSBTAG00000050964 SGK1 (ENSBTAG00000004269) SLC2A12 (ENSBTAG00000019002) TBPL1 (ENSBTAG00000035370) TCF21 (ENSBTAG00000021827) EYA4 (ENSBTAG00000021970) RPS12 (ENSBTAG00000001360) SLC18B1 (ENSBTAG00000015242) VNN2 (ENSBTAG00000016357) Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 28 NHSL1 (ENSBIXG00005004480) ENSBIXG00005004489 SMIM28 (ENSBIXG00005004498) ARFGEF3 (ENSBIXG00005026451) ENSBIXG00005026496 TNFAIP3 (ENSBIXG00005004535) OLIG3 (ENSBIXG00005004539) IFNGR1 (ENSBIXG00005026601) IL22RA2 (ENSBIXG00005026622) IL20RA (ENSBIXG00005026689) SLC35D3 (ENSBIXG00005026714) PEX7 (ENSBIXG00005026748) MAP3K5 (ENSBIXG00005026792) MAP7 (ENSBIXG00005004633) BCLAF1 (ENSBIXG00005027187) MTFR2 (ENSBIXG00005027208) ##22 ENSBIXG00005007583 PDE7B (ENSBIXG00005005610) ENSBIXG00005027379 AHI1 (ENSBIXG00005027513) MYB (ENSBIXG00005004779) HBS1L (ENSBIXG00005028064) ALDH8A1 (ENSBIXG00005028188) ENSBIXG00005028211 SGK1 (ENSBIXG00005028436) SLC2A12 (ENSBIXG00005004915) TBPL1 (ENSBIXG00005004933) ENSBIXG00005002400 EYA4 (ENSBIXG00005002280) ENSBIXG00005028931 ENSBIXG00005028939 Bos_a ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00950000182963.a.a ENSGT00940000160412 ENSGT00740000116829 ENSGT00530000064150 ENSGT00530000063484.a.k.a ENSGT00940000158448 ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00940000157314.A ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00950000182925.D.a.a.b.a.k.b ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.u.a ENSGT00940000156674 ENSGT00390000013823.b.c.a.b ENSGT00390000013823.b.c.b Wild yak MODERN SPECIES 1062 IFNGR1 (ENSBMUG00000012052) IL22RA2 (ENSBMUG00000012067) IL20RA (ENSBMUG00000012085) SLC35D3 (ENSBMUG00000012102) PEX7 (ENSBMUG00000012113) MAP3K5 (ENSBMUG00000012132) MAP7 (ENSBMUG00000012203) BCLAF1 (ENSBMUG00000012296) MTFR2 (ENSBMUG00000012345) ##22 PDE7B (ENSBMUG00000012382) AHI1 (ENSBMUG00000012435) MYB (ENSBMUG00000012863) HBS1L (ENSBMUG00000013294) ALDH8A1 (ENSBMUG00000013397) ENSBMUG00000013415 Domestic yak MODERN SPECIES 1 SMIM28 (ENSBGRG00000013484) ARFGEF3 (ENSBGRG00000013577) ENSBGRG00000014011 ENSBGRG00000014065 TNFAIP3 (ENSBGRG00000014104) OLIG3 (ENSBGRG00000014179) ENSBGRG00000014200 IFNGR1 (ENSBGRG00000014225) IL22RA2 (ENSBGRG00000014306) IL20RA (ENSBGRG00000014447) SLC35D3 (ENSBGRG00000014577) PEX7 (ENSBGRG00000014624) MAP3K5 (ENSBGRG00000014827) MAP7 (ENSBGRG00000015070) BCLAF1 (ENSBGRG00000015909) MTFR2 (ENSBGRG00000016366) ##22 PDE7B (ENSBGRG00000016432) ENSBGRG00000016837 ENSBGRG00000016866 AHI1 (ENSBGRG00000016896) ENSBGRG00000017011 MYB (ENSBGRG00000017062) HBS1L (ENSBGRG00000017504) ALDH8A1 (ENSBGRG00000018084) ENSBGRG00000018439 ENSBGRG00000018453 SGK1 (ENSBGRG00000018550) SLC2A12 (ENSBGRG00000018914) TBPL1 (ENSBGRG00000019080) TCF21 (ENSBGRG00000019152) ENSBGRG00000019187 American bison MODERN SPECIES 3117 NHSL1 (ENSBBBG00000011588) HEBP2 (ENSBBBG00000002116) SMIM28 (ENSBBBG00000011538) ARFGEF3 (ENSBBBG00000011534) ENSBBBG00000011504 TNFAIP3 (ENSBBBG00000011487) OLIG3 (ENSBBBG00000002099) IFNGR1 (ENSBBBG00000007970) IL22RA2 (ENSBBBG00000002090) IL20RA (ENSBBBG00000011411) SLC35D3 (ENSBBBG00000006758) PEX7 (ENSBBBG00000025472) MAP3K5 (ENSBBBG00000025426) MAP7 (ENSBBBG00000025344) BCLAF1 (ENSBBBG00000025127) MTFR2 (ENSBBBG00000007818) ##22 PDE7B (ENSBBBG00000006552) ENSBBBG00000024765 ENSBBBG00000006505 MYB (ENSBBBG00000000167) HBS1L (ENSBBBG00000024102) ALDH8A1 (ENSBBBG00000000303) ENSBBBG00000023839 SGK1 (ENSBBBG00000023807) SLC2A12 (ENSBBBG00000023678) TBPL1 (ENSBBBG00000023665) TCF21 (ENSBBBG00000023645) EYA4 (ENSBBBG00000023613) ENSBBBG00000000395 SLC18B1 (ENSBBBG00000000426) VNN2 (ENSBBBG00000000486) Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182963.a.a ENSGT00940000160412 ENSGT00740000116829 ENSGT00530000064150 ENSGT00530000063484.a ENSGT00940000158448 ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00940000157314.A ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00950000182925.D.a.a.b.a.k.b ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.u.b.a.b.a.b ENSGT00940000156674 ENSGT00390000013823.b.c.a.b ENSGT00390000013823.b.c.b Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 24 CCDC28A (ENSOARG00020008233) NHSL1 (ENSOARG00020008019) HEBP2 (ENSOARG00020007983) SMIM28 (ENSOARG00020007936) ARFGEF3 (ENSOARG00020007298) PERP (ENSOARG00020007239) TNFAIP3 (ENSOARG00020023915) OLIG3 (ENSOARG00020023905) IL22RA2 (ENSOARG00020023864) IFNGR1 (ENSOARG00020023838) SLC35D3 (ENSOARG00020023727) PEX7 (ENSOARG00020023693) MAP3K5 (ENSOARG00020023530) MAP7 (ENSOARG00020022779) BCLAF1 (ENSOARG00020022544) MTFR2 (ENSOARG00020022505) ##22 PDE7B (ENSOARG00020022379) AHI1 (ENSOARG00020022315) MYB (ENSOARG00020021881) ENSOARG00020021772 ENSOARG00020021719 ENSOARG00020021449 ALDH8A1 (ENSOARG00020021383) ENSOARG00020021323 SGK1 (ENSOARG00020020794) SLC2A12 (ENSOARG00020020681) TBPL1 (ENSOARG00020020634) TCF21 (ENSOARG00020020602) EYA4 (ENSOARG00020020157) RPS12 (ENSOARG00020020036) SLC18B1 (ENSOARG00020019835) Goat MODERN SPECIES 28 CCDC28A (ENSCHIG00000018840) NHSL1 (ENSCHIG00000016534) HEBP2 (ENSCHIG00000023213) ARFGEF3 (ENSCHIG00000026696) PERP (ENSCHIG00000015047) TNFAIP3 (ENSCHIG00000021461) OLIG3 (ENSCHIG00000010551) IFNGR1 (ENSCHIG00000013778) IL22RA2 (ENSCHIG00000026489) IL20RA (ENSCHIG00000016224) SLC35D3 (ENSCHIG00000008530) PEX7 (ENSCHIG00000011508) MAP3K5 (ENSCHIG00000024066) MAP7 (ENSCHIG00000008356) BCLAF1 (ENSCHIG00000000525) MTFR2 (ENSCHIG00000010590) ##22 PDE7B (ENSCHIG00000026148) AHI1 (ENSCHIG00000025335) MYB (ENSCHIG00000009914) HBS1L (ENSCHIG00000010299) ALDH8A1 (ENSCHIG00000023305) ENSCHIG00000003168 ENSCHIG00000007546 SGK1 (ENSCHIG00000010215) SLC2A12 (ENSCHIG00000017082) TBPL1 (ENSCHIG00000006206) TCF21 (ENSCHIG00000015635) EYA4 (ENSCHIG00000021889) ENSCHIG00000015149 SLC18B1 (ENSCHIG00000020241) VNN2 (ENSCHIG00000024247) Siberian musk deer MODERN SPECIES 59 NHSL1 (ENSMMSG00000001822) HEBP2 (ENSMMSG00000001795) SMIM28 (ENSMMSG00000001785) ARFGEF3 (ENSMMSG00000001733) PERP (ENSMMSG00000001712) TNFAIP3 (ENSMMSG00000001684) OLIG3 (ENSMMSG00000001673) IFNGR1 (ENSMMSG00000001659) IL22RA2 (ENSMMSG00000001633) IL20RA (ENSMMSG00000001560) SLC35D3 (ENSMMSG00000001541) PEX7 (ENSMMSG00000001524) MAP3K5 (ENSMMSG00000001444) MAP7 (ENSMMSG00000000545) BCLAF1 (ENSMMSG00000000221) MTFR2 (ENSMMSG00000000176) ##22 PDE7B (ENSMMSG00000000115) Yarkand deer MODERN SPECIES 18 ENSCHYG00000026481 NHSL1 (ENSCHYG00000026431) ENSCHYG00000026400 ARFGEF3 (ENSCHYG00000026237) PERP (ENSCHYG00000026194) TNFAIP3 (ENSCHYG00000026166) OLIG3 (ENSCHYG00000026133) IFNGR1 (ENSCHYG00000026112) IL22RA2 (ENSCHYG00000026095) IL20RA (ENSCHYG00000026016) SLC35D3 (ENSCHYG00000026002) PEX7 (ENSCHYG00000025953) MAP3K5 (ENSCHYG00000025879) MAP7 (ENSCHYG00000025635) BCLAF1 (ENSCHYG00000025304) MTFR2 (ENSCHYG00000025255) ##22 PDE7B (ENSCHYG00000025119) ENSCHYG00000025071 AHI1 (ENSCHYG00000025009) MYB (ENSCHYG00000024610) HBS1L (ENSCHYG00000024451) ALDH8A1 (ENSCHYG00000024259) ENSCHYG00000024232 ENSCHYG00000024196 SGK1 (ENSCHYG00000023724) SLC2A12 (ENSCHYG00000023610) TBPL1 (ENSCHYG00000023559) TCF21 (ENSCHYG00000023525) ENSCHYG00000023506 EYA4 (ENSCHYG00000023090) ENSCHYG00000022935 Camelidae ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00940000160412 ENSGT00740000116829 ENSGT01030000236221 ENSGT00530000064150 ENSGT00530000063484.a ENSGT00940000158448 ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00940000157314.A ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00950000182925.D.a.a.b.a.k.b ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.v ENSGT00940000156674 ENSGT00390000013823.b.c.a.b ENSGT00390000013823.b.c.b Arabian camel MODERN SPECIES 34 NHSL1 (ENSCDRG00005013989) HEBP2 (ENSCDRG00005014162) SMIM28 (ENSCDRG00005014197) ARFGEF3 (ENSCDRG00005014224) PERP (ENSCDRG00005014505) TNFAIP3 (ENSCDRG00005014565) OLIG3 (ENSCDRG00005014653) IFNGR1 (ENSCDRG00005014662) IL22RA2 (ENSCDRG00005014705) IL20RA (ENSCDRG00005014767) SLC35D3 (ENSCDRG00005015088) PEX7 (ENSCDRG00005015169) MAP3K5 (ENSCDRG00005015332) MAP7 (ENSCDRG00005015545) BCLAF1 (ENSCDRG00005017775) MTFR2 (ENSCDRG00005018327) ##22 PDE7B (ENSCDRG00005018377) AHI1 (ENSCDRG00005018511) MYB (ENSCDRG00005018759) HBS1L (ENSCDRG00005021331) ALDH8A1 (ENSCDRG00005021478) ENSCDRG00005021481 SGK1 (ENSCDRG00005021488) SLC2A12 (ENSCDRG00005021503) TBPL1 (ENSCDRG00005021546) TCF21 (ENSCDRG00005021553) EYA4 (ENSCDRG00005021570) ENSCDRG00005021622 ENSCDRG00005021625 SLC18B1 (ENSCDRG00005021633) VNN2 (ENSCDRG00005021638) Alpaca MODERN SPECIES 558 ENSVPAG00000003936 IL20RA (ENSVPAG00000003935) SLC35D3 (ENSVPAG00000003934) PEX7 (ENSVPAG00000003933) MAP3K5 (ENSVPAG00000003929) MAP7 (ENSVPAG00000003926) BCLAF1 (ENSVPAG00000003924) MTFR2 (ENSVPAG00000003922) ##22 PDE7B (ENSVPAG00000003920) AHI1 (ENSVPAG00000003915) Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000160412 ENSGT00740000116829 ENSGT01030000236221 ENSGT00530000064150 ENSGT00530000063484.a ENSGT00940000158448 ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00940000157314.A ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00650000094590 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.u.a ENSGT00940000156674 ENSGT00390000013823.b.c.a.b ENSGT00390000013823.b.c.b Carnivora ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000160412 ENSGT00740000116829 ENSGT01030000236221 ENSGT00530000064150 ENSGT00530000063484.a ENSGT00940000158448 ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00940000157314.A ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.u.a ENSGT00940000156674 ENSGT00390000013823.b.c.a.b ENSGT00390000013823.b.c.b ENSGT00390000013823.b.c.a.a Caniformia ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000160412 ENSGT00740000116829 ENSGT01030000236221 ENSGT00530000064150 ENSGT00530000063484.a ENSGT00940000158448 ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00940000157314.A ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.v ENSGT00940000156674 ENSGT00390000013823.b.c.b ENSGT00390000013823.b.c.a.a ENSGT00950000182934.a.b Canidae ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00990000204448 ENSGT00950000182963.a.a ENSGT00940000160412 ENSGT00530000064150 ENSGT00530000063484.a ENSGT00940000158448 ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00940000157314.A ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712.g.a ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.u.a ENSGT00940000156674 ENSGT00390000013823.b.c.b ENSGT00390000013823.b.c.a.a ENSGT00940000162730 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000160412 ENSGT00530000064150 ENSGT00530000063484.a ENSGT00940000158448 ENSGT00940000160850 ENSGT00940000154746.f ENSGT00390000007084.c.b.x.a.b ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00940000157314.A ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712.g.a ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.u.a ENSGT00940000156674 ENSGT00390000013823.b.c.b ENSGT00390000013823.b.c.a.a.e ENSGT00940000153886.a.b.i.b Dingo MODERN SPECIES 125 PERP (ENSCAFG00020022860) TNFAIP3 (ENSCAFG00020022788) OLIG3 (ENSCAFG00020022780) ENSCAFG00020022773 ENSCAFG00020022772 IFNGR1 (ENSCAFG00020022770) ENSCAFG00020022769 IL22RA2 (ENSCAFG00020022749) IL20RA (ENSCAFG00020022742) SLC35D3 (ENSCAFG00020022738) PEX7 (ENSCAFG00020022697) ENSCAFG00020022693 MAP3K5 (ENSCAFG00020022645) MAP7 (ENSCAFG00020022565) BCLAF1 (ENSCAFG00020022554) MTFR2 (ENSCAFG00020022551) ##22 PDE7B (ENSCAFG00020022549) AHI1 (ENSCAFG00020022540) MYB (ENSCAFG00020021933) HBS1L (ENSCAFG00020021904) ALDH8A1 (ENSCAFG00020021903) SGK1 (ENSCAFG00020021876) ENSCAFG00020021874 SLC2A12 (ENSCAFG00020021868) ENSCAFG00020021865 TCF21 (ENSCAFG00020021862) EYA4 (ENSCAFG00020021829) ENSCAFG00020021815 RPS12 (ENSCAFG00020021808) SLC18B1 (ENSCAFG00020021806) ENSCAFG00020021802 Dog MODERN SPECIES ARFGEF3 (ENSCAFG00845006884) PERP 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ANCESTRAL SPECIES 45 ENSGT00500000044870.a ENSGT00950000182963.a.a ENSGT00940000160412 ENSGT00530000064150 ENSGT00530000063484.a ENSGT00940000158448 ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00940000157314.A ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00390000008294.e.a.a.b ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.v ENSGT00940000156674 ENSGT00390000013823.b.c.b ENSGT00390000013823.b.c.a.a American black bear MODERN SPECIES 695 BCLAF1 (ENSUAMG00000006413) MTFR2 (ENSUAMG00000006416) ##22 ENSUAMG00000006419 ENSUAMG00000006421 Polar bear MODERN SPECIES 172 CCDC28A (ENSUMAG00000023778) NHSL1 (ENSUMAG00000023785) HEBP2 (ENSUMAG00000023790) ARFGEF3 (ENSUMAG00000023799) PERP 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ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00960000191483 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.u.b.a.b.a.b ENSGT00940000156674 ENSGT00390000013823.b.c.b ENSGT00390000013823.b.c.a.a Ferret MODERN SPECIES 166 HEBP2 (ENSMPUG00000014882) ENSMPUG00000018880 ARFGEF3 (ENSMPUG00000014874) PERP (ENSMPUG00000014873) TNFAIP3 (ENSMPUG00000014869) OLIG3 (ENSMPUG00000018873) IFNGR1 (ENSMPUG00000014867) IL22RA2 (ENSMPUG00000014865) ENSMPUG00000014851 ENSMPUG00000014848 SLC35D3 (ENSMPUG00000014847) PEX7 (ENSMPUG00000014844) MAP3K5 (ENSMPUG00000014837) MAP7 (ENSMPUG00000014832) BCLAF1 (ENSMPUG00000014831) ENSMPUG00000014828 ##22 PDE7B (ENSMPUG00000014824) AHI1 (ENSMPUG00000014816) MYB (ENSMPUG00000014814) HBS1L (ENSMPUG00000014810) ALDH8A1 (ENSMPUG00000014807) SGK1 (ENSMPUG00000014805) SLC2A12 (ENSMPUG00000014803) TBPL1 (ENSMPUG00000014801) TCF21 (ENSMPUG00000014798) ENSMPUG00000014795 ENSMPUG00000014791 EYA4 (ENSMPUG00000014787) ENSMPUG00000018871 ENSMPUG00000014785 ENSMPUG00000014771 American mink MODERN SPECIES 74 HEBP2 (ENSNVIG00000019332) ENSNVIG00000019309 ARFGEF3 (ENSNVIG00000019245) PERP (ENSNVIG00000019220) TNFAIP3 (ENSNVIG00000019197) OLIG3 (ENSNVIG00000019187) ENSNVIG00000019175 IFNGR1 (ENSNVIG00000019165) IL22RA2 (ENSNVIG00000019145) IL20RA (ENSNVIG00000019125) SLC35D3 (ENSNVIG00000019115) PEX7 (ENSNVIG00000019108) MAP3K5 (ENSNVIG00000019047) MAP7 (ENSNVIG00000019008) BCLAF1 (ENSNVIG00000018905) ENSNVIG00000018887 ##22 PDE7B (ENSNVIG00000018838) AHI1 (ENSNVIG00000018672) MYB (ENSNVIG00000018282) HBS1L (ENSNVIG00000018178) ALDH8A1 (ENSNVIG00000018134) SGK1 (ENSNVIG00000017967) SLC2A12 (ENSNVIG00000017918) TBPL1 (ENSNVIG00000017887) TCF21 (ENSNVIG00000017869) ENSNVIG00000017856 EYA4 (ENSNVIG00000017341) RPS12 (ENSNVIG00000017281) SLC18B1 (ENSNVIG00000017254) ENSNVIG00000017237 VNN1 (ENSNVIG00000017213) Felidae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000160412 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ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.u.a ENSGT00940000156674 ENSGT00390000013823.b.c.a.b ENSGT00390000013823.b.c.b ENSGT00390000013823.b.c.a.a Tiger MODERN SPECIES 531 CCDC28A (ENSPTIG00000016053) NHSL1 (ENSPTIG00000016469) HEBP2 (ENSPTIG00000017165) SMIM28 (ENSPTIG00000018314) ARFGEF3 (ENSPTIG00000018636) PERP (ENSPTIG00000020244) TNFAIP3 (ENSPTIG00000020430) ENSPTIG00000007628 IL22RA2 (ENSPTIG00000008359) IL20RA (ENSPTIG00000008630) SLC35D3 (ENSPTIG00000009793) PEX7 (ENSPTIG00000009999) MAP3K5 (ENSPTIG00000010843) MAP7 (ENSPTIG00000013943) BCLAF1 (ENSPTIG00000019385) MTFR2 (ENSPTIG00000020220) ##22 PDE7B (ENSPTIG00000020531) Panthera_a ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000160412 ENSGT00740000116829 ENSGT00530000064150 ENSGT00530000063484.a ENSGT00940000167705 ENSGT00940000158448 ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00940000157314.A ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.u.a ENSGT00940000156674 ENSGT00390000013823.b.c.b ENSGT00390000013823.b.c.a.a ENSGT00950000182934.a.b lion MODERN SPECIES 5 NHSL1 (ENSPLOG00000015317) HEBP2 (ENSPLOG00000015180) SMIM28 (ENSPLOG00000015131) ARFGEF3 (ENSPLOG00000014795) PERP (ENSPLOG00000014727) TNFAIP3 (ENSPLOG00000014623) OLIG3 (ENSPLOG00000014588) IFNGR1 (ENSPLOG00000014560) IL22RA2 (ENSPLOG00000014459) IL20RA (ENSPLOG00000014290) SLC35D3 (ENSPLOG00000014233) PEX7 (ENSPLOG00000014121) MAP3K5 (ENSPLOG00000013624) MAP7 (ENSPLOG00000012805) BCLAF1 (ENSPLOG00000012177) MTFR2 (ENSPLOG00000012074) ##22 PDE7B (ENSPLOG00000011814) ENSPLOG00000011744 AHI1 (ENSPLOG00000011612) MYB (ENSPLOG00000011318) HBS1L (ENSPLOG00000011065) ALDH8A1 (ENSPLOG00000010852) SGK1 (ENSPLOG00000022564) SLC2A12 (ENSPLOG00000022554) TBPL1 (ENSPLOG00000022547) TCF21 (ENSPLOG00000022539) EYA4 (ENSPLOG00000022457) RPS12 (ENSPLOG00000022370) SLC18B1 (ENSPLOG00000022341) ENSPLOG00000022323 ENSPLOG00000022310 leopard MODERN SPECIES 82 HEBP2 (ENSPPRG00000011018) SMIM28 (ENSPPRG00000010627) ARFGEF3 (ENSPPRG00000010225) PERP (ENSPPRG00000010138) ENSPPRG00000010132 TNFAIP3 (ENSPPRG00000009354) OLIG3 (ENSPPRG00000021908) ENSPPRG00000004790 IL22RA2 (ENSPPRG00000003819) IL20RA (ENSPPRG00000003633) SLC35D3 (ENSPPRG00000002355) PEX7 (ENSPPRG00000002196) MAP3K5 (ENSPPRG00000001889) MAP7 (ENSPPRG00000001492) BCLAF1 (ENSPPRG00000023156) MTFR2 (ENSPPRG00000023744) ##22 PDE7B (ENSPPRG00000024077) AHI1 (ENSPPRG00000024365) ENSPPRG00000014606 ENSPPRG00000014074 MYB (ENSPPRG00000012353) HBS1L (ENSPPRG00000005285) ALDH8A1 (ENSPPRG00000002155) SGK1 (ENSPPRG00000000691) SLC2A12 (ENSPPRG00000023028) TBPL1 (ENSPPRG00000023235) TCF21 (ENSPPRG00000023375) EYA4 (ENSPPRG00000023698) ENSPPRG00000006554 SLC18B1 (ENSPPRG00000006306) ENSPPRG00000005772 Cat MODERN SPECIES 236 HEBP2 (ENSFCAG00000039511) SMIM28 (ENSFCAG00000046377) ARFGEF3 (ENSFCAG00000013904) PERP (ENSFCAG00000028929) ENSFCAG00000039174 TNFAIP3 (ENSFCAG00000008135) OLIG3 (ENSFCAG00000030246) IFNGR1 (ENSFCAG00000030336) IL22RA2 (ENSFCAG00000021984) IL20RA (ENSFCAG00000029581) SLC35D3 (ENSFCAG00000007846) PEX7 (ENSFCAG00000029046) MAP3K5 (ENSFCAG00000008186) MAP7 (ENSFCAG00000008185) BCLAF1 (ENSFCAG00000027614) MTFR2 (ENSFCAG00000030038) ##22 PDE7B (ENSFCAG00000029239) ENSFCAG00000050931 ENSFCAG00000033467 AHI1 (ENSFCAG00000001813) MYB (ENSFCAG00000001812) HBS1L (ENSFCAG00000001810) ALDH8A1 (ENSFCAG00000001809) SGK1 (ENSFCAG00000013874) SLC2A12 (ENSFCAG00000013872) TBPL1 (ENSFCAG00000035311) TCF21 (ENSFCAG00000031261) EYA4 (ENSFCAG00000011142) ENSFCAG00000034865 SLC18B1 (ENSFCAG00000011135) VNN1 (ENSFCAG00000043054) Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00950000182963.a.a ENSGT00940000160412 ENSGT00740000116829 ENSGT00530000064150 ENSGT00530000063484.a ENSGT00940000158448 ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00940000157314.A ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00650000094590 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.u.a ENSGT00940000156674 ENSGT00390000013823.b.c.a.b ENSGT00390000013823.b.c.b Equus ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00950000182963.a.a ENSGT00940000160412 ENSGT00740000116829 ENSGT00530000064150 ENSGT00530000063484.a ENSGT00940000158448 ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00940000157314.A ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00650000094590 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.u.b.a.b.a.b ENSGT00940000156674 ENSGT00390000013823.b.c.a.b ENSGT00390000013823.b.c.b Horse MODERN SPECIES 1 HEBP2 (ENSECAG00000012705) SMIM28 (ENSECAG00000042188) ENSECAG00000052359 ARFGEF3 (ENSECAG00000011074) PERP (ENSECAG00000010262) TNFAIP3 (ENSECAG00000009626) OLIG3 (ENSECAG00000009598) IFNGR1 (ENSECAG00000009347) IL22RA2 (ENSECAG00000008817) IL20RA (ENSECAG00000007642) SLC35D3 (ENSECAG00000007507) PEX7 (ENSECAG00000007461) MAP3K5 (ENSECAG00000024860) MAP7 (ENSECAG00000024302) BCLAF1 (ENSECAG00000023692) MTFR2 (ENSECAG00000038834) ##22 PDE7B (ENSECAG00000020846) AHI1 (ENSECAG00000019646) MYB (ENSECAG00000009918) HBS1L (ENSECAG00000004470) ALDH8A1 (ENSECAG00000021674) ENSECAG00000029781 SGK1 (ENSECAG00000020431) SLC2A12 (ENSECAG00000020239) TBPL1 (ENSECAG00000019486) TCF21 (ENSECAG00000019197) ENSECAG00000051625 ENSECAG00000058049 EYA4 (ENSECAG00000009316) ENSECAG00000001599 SLC18B1 (ENSECAG00000023651) Donkey MODERN SPECIES 13 ENSEASG00005028125 HEBP2 (ENSEASG00005034494) SMIM28 (ENSEASG00005028436) ARFGEF3 (ENSEASG00005011767) ENSEASG00005034498 TNFAIP3 (ENSEASG00005011724) OLIG3 (ENSEASG00005011723) IFNGR1 (ENSEASG00005011722) IL22RA2 (ENSEASG00005011721) IL20RA (ENSEASG00005028860) SLC35D3 (ENSEASG00005030411) PEX7 (ENSEASG00005011713) MAP3K5 (ENSEASG00005011455) MAP7 (ENSEASG00005011215) BCLAF1 (ENSEASG00005011177) MTFR2 (ENSEASG00005011169) ##22 PDE7B (ENSEASG00005011165) AHI1 (ENSEASG00005011162) MYB (ENSEASG00005011157) ENSEASG00005031142 HBS1L (ENSEASG00005011148) ALDH8A1 (ENSEASG00005011139) SGK1 (ENSEASG00005011126) SLC2A12 (ENSEASG00005011123) ENSEASG00005011118 TCF21 (ENSEASG00005011116) EYA4 (ENSEASG00005011112) RPS12 (ENSEASG00005011103) SLC18B1 (ENSEASG00005011101) VNN2 (ENSEASG00005011098) ENSEASG00005011096 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00950000182963.a.a ENSGT00940000160412 ENSGT00740000116829 ENSGT00530000064150 ENSGT00530000063484.a ENSGT00940000158448 ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00940000157314.A ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.u.a ENSGT00940000156674 ENSGT00390000013823.b.c.a.b ENSGT00390000013823.b.c.b ENSGT00390000013823.b.c.a.a Megabat MODERN SPECIES 2269 MAP7 (ENSPVAG00000007234) BCLAF1 (ENSPVAG00000007233) MTFR2 (ENSPVAG00000007232) ##22 PDE7B (ENSPVAG00000007231) Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00950000182963.a.a ENSGT00940000160412 ENSGT00740000116829 ENSGT00530000064150 ENSGT00530000063484.a ENSGT00940000158448 ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00940000157314.A ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.u.a ENSGT00940000156674 ENSGT00390000013823.b.c.a.b ENSGT00390000013823.b.c.b ENSGT00390000013823.b.c.a.a Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 21 SMIM28 (ENSRFEG00010004786) ARFGEF3 (ENSRFEG00010004768) PERP (ENSRFEG00010004754) TNFAIP3 (ENSRFEG00010004741) OLIG3 (ENSRFEG00010004731) IFNGR1 (ENSRFEG00010004717) IL22RA2 (ENSRFEG00010004706) IL20RA (ENSRFEG00010004692) ENSRFEG00010004684 SLC35D3 (ENSRFEG00010004673) PEX7 (ENSRFEG00010004663) ENSRFEG00010004658 MAP3K5 (ENSRFEG00010004611) MAP7 (ENSRFEG00010004535) BCLAF1 (ENSRFEG00010004398) MTFR2 (ENSRFEG00010004336) ##22 PDE7B (ENSRFEG00010004294) ENSRFEG00010004274 AHI1 (ENSRFEG00010004178) MYB (ENSRFEG00010004034) HBS1L (ENSRFEG00010003918) ALDH8A1 (ENSRFEG00010003820) SGK1 (ENSRFEG00010003588) SLC2A12 (ENSRFEG00010003467) TBPL1 (ENSRFEG00010003438) TCF21 (ENSRFEG00010003415) EYA4 (ENSRFEG00010003348) ENSRFEG00010003233 SLC18B1 (ENSRFEG00010003181) VNN2 (ENSRFEG00010003139) VNN1 (ENSRFEG00010003067) Microbat MODERN SPECIES 948 CCDC28A (ENSMLUG00000003625) NHSL1 (ENSMLUG00000015321) HEBP2 (ENSMLUG00000015318) ARFGEF3 (ENSMLUG00000001476) PERP (ENSMLUG00000001473) TNFAIP3 (ENSMLUG00000011543) OLIG3 (ENSMLUG00000026705) IFNGR1 (ENSMLUG00000008601) IL22RA2 (ENSMLUG00000011981) IL20RA (ENSMLUG00000027725) SLC35D3 (ENSMLUG00000007099) PEX7 (ENSMLUG00000007080) MAP3K5 (ENSMLUG00000007043) MAP7 (ENSMLUG00000007011) BCLAF1 (ENSMLUG00000002343) MTFR2 (ENSMLUG00000002331) ##22 PDE7B (ENSMLUG00000002323) AHI1 (ENSMLUG00000002136) MYB (ENSMLUG00000002125) ENSMLUG00000025301 HBS1L (ENSMLUG00000010618) ALDH8A1 (ENSMLUG00000010607) SGK1 (ENSMLUG00000016791) SLC2A12 (ENSMLUG00000016784) TBPL1 (ENSMLUG00000002050) TCF21 (ENSMLUG00000009194) EYA4 (ENSMLUG00000017308) RPS12 (ENSMLUG00000001137) SLC18B1 (ENSMLUG00000005809) VNN2 (ENSMLUG00000004860) ENSMLUG00000005696 Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 Common shrew MODERN SPECIES 3288 ENSSARG00000009288 ##22 Hedgehog MODERN SPECIES 4315 MTFR2 (ENSEEUG00000002310) ##22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000160412 ENSGT00740000116829 ENSGT01030000236221 ENSGT00530000064150 ENSGT00530000063484.a ENSGT00940000158448 ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00940000157314.A ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00650000094590 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.u.a ENSGT00390000018318.u.b.b ENSGT00940000156674 ENSGT00390000013823.b.c.a.b Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000160412 ENSGT00740000116829 ENSGT01030000236221 ENSGT00530000064150 ENSGT00530000063484.a ENSGT00940000158448 ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00940000157314.A ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00650000094590 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.u.a ENSGT00390000018318.u.b.b ENSGT00940000156674 ENSGT00390000013823.b.c.a.b Glires ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000160412 ENSGT00740000116829 ENSGT01030000236221 ENSGT00530000064150 ENSGT00530000063484.a ENSGT00940000158448 ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00940000157314.A ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00650000094590 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.u.a ENSGT00390000018318.u.b.b ENSGT00940000156674 ENSGT00390000013823.b.c.a.b Rodentia ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000160412 ENSGT00740000116829 ENSGT01030000236221 ENSGT00530000064150 ENSGT00530000063484.a ENSGT00940000158448 ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00940000157314.A ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00650000094590 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.u.a ENSGT00390000018318.u.b.b ENSGT00940000156674 ENSGT00390000013823.b.c.a.b Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00500000044870.a ENSGT00950000182963.a.a ENSGT00940000160412 ENSGT00530000064150 ENSGT00530000063484.a ENSGT00940000158448 ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00940000157314.A ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00650000094590 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.u.a ENSGT00390000018318.u.b.b ENSGT00940000156674 ENSGT00390000013823.b.c.b Myomorpha ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00500000044870.a ENSGT00950000182963.a.a ENSGT00940000160412 ENSGT00530000064150 ENSGT00530000063484.a ENSGT00940000158448 ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00940000157314.A ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00650000094590 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.u.a ENSGT00390000018318.u.b.b ENSGT00940000156674 ENSGT00390000013823.b.c.b Muroidea ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00500000044870.a ENSGT00950000182963.a.a ENSGT00940000160412 ENSGT00530000064150 ENSGT00530000063484.a ENSGT00940000158448 ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00940000157314.A ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00650000094590 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.u.a ENSGT00390000018318.u.b.b ENSGT00940000156674 ENSGT00390000013823.b.c.b Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00950000182963.a.a ENSGT00940000160412 ENSGT00530000064150 ENSGT00940000160886.p.a.a.b ENSGT00530000063484.a ENSGT00940000158448 ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00940000157314.A ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00650000094590 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00950000183442 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.u.a ENSGT00390000018318.u.b.b ENSGT00940000156674 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00950000182963.a.a ENSGT00940000160412 ENSGT00530000064150 ENSGT00940000160886.p.a.a.b ENSGT00530000063484.a ENSGT00940000158448 ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00940000157314.A ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248.pc ENSGT00650000094590 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00950000183442 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.u.b.b ENSGT00940000156674 ENSGT00390000013823.b.c.b Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00500000044870.a ENSGT00950000182963.a.a ENSGT00940000160412 ENSGT00530000064150 ENSGT00530000063484.a ENSGT00940000158448 ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00940000157314.A ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248.pc ENSGT00650000094590 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00950000183442 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.u.b.a.b.a.b ENSGT00390000018318.u.b.b ENSGT00940000156674 Prairie vole MODERN SPECIES 354 Nhsl1 (ENSMOCG00000021012) Hebp2 (ENSMOCG00000011108) Arfgef3 (ENSMOCG00000009174) Perp (ENSMOCG00000012264) Tnfaip3 (ENSMOCG00000006328) Olig3 (ENSMOCG00000001779) ENSMOCG00000018866 Ifngr1 (ENSMOCG00000003677) Il22ra2 (ENSMOCG00000006128) Il20ra (ENSMOCG00000022279) Slc35d3 (ENSMOCG00000018328) Pex7 (ENSMOCG00000016916) Map3k5 (ENSMOCG00000019021) Map7 (ENSMOCG00000010774) Bclaf1 (ENSMOCG00000005885) Mtfr2 (ENSMOCG00000004425) ##22 ENSMOCG00000006744 Pde7b (ENSMOCG00000018081) Ahi1 (ENSMOCG00000019913) ENSMOCG00000016189 ENSMOCG00000014988 ENSMOCG00000020414 Hbs1l (ENSMOCG00000023038) Aldh8a1 (ENSMOCG00000013932) 1700020N01Rik (ENSMOCG00000017055) Sgk1 (ENSMOCG00000008011) Slc2a12 (ENSMOCG00000001440) Tbpl1 (ENSMOCG00000022781) Tcf21 (ENSMOCG00000016422) Eya4 (ENSMOCG00000021008) ENSMOCG00000000324 Northern American deer mouse MODERN SPECIES 7 Arfgef3 (ENSPEMG00000006396) ENSPEMG00000016223 ENSPEMG00000031383 Perp (ENSPEMG00000015920) Tnfaip3 (ENSPEMG00000000880) Olig3 (ENSPEMG00000008406) ENSPEMG00000026149 Ifngr1 (ENSPEMG00000007579) Il22ra2 (ENSPEMG00000027600) Il20ra (ENSPEMG00000020460) Slc35d3 (ENSPEMG00000029399) Pex7 (ENSPEMG00000021366) Map3k5 (ENSPEMG00000015212) Map7 (ENSPEMG00000006441) ENSPEMG00000029424 Mtfr2 (ENSPEMG00000017505) ##22 Pde7b (ENSPEMG00000013435) ENSPEMG00000010391 Ahi1 (ENSPEMG00000007907) Myb (ENSPEMG00000000233) ENSPEMG00000024833 Hbs1l (ENSPEMG00000014369) Aldh8a1 (ENSPEMG00000013721) 1700020N01Rik (ENSPEMG00000011791) Sgk1 (ENSPEMG00000009727) Slc2a12 (ENSPEMG00000006268) Tbpl1 (ENSPEMG00000004800) Tcf21 (ENSPEMG00000003503) ENSPEMG00000025529 ENSPEMG00000025804 Eya4 (ENSPEMG00000018298) Cricetinae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00950000182963.a.a ENSGT00940000160412 ENSGT00530000064150 ENSGT00940000160886.p.a.a.b ENSGT00530000063484.a ENSGT00940000158448 ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00940000157314.A ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248.pc ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00950000183442 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.u.b.b ENSGT00940000156674 ENSGT00390000013823.b.c.b ENSGT00390000013823.b.c.a.a Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 1 Nhsl1 (ENSCGRG00001021948) Hebp2 (ENSCGRG00001020023) Arfgef3 (ENSCGRG00001019486) Gm4922 (ENSCGRG00001006023) Perp (ENSCGRG00001020200) Tnfaip3 (ENSCGRG00001019749) Olig3 (ENSCGRG00001006525) Ifngr1 (ENSCGRG00001021869) Il22ra2 (ENSCGRG00001020957) Il20ra (ENSCGRG00001020064) Slc35d3 (ENSCGRG00001006411) PEX7 (ENSCGRG00001004544) Map3k5 (ENSCGRG00001009680) Map7 (ENSCGRG00001024812) ENSCGRG00001024620 Mtfr2 (ENSCGRG00001024312) ##22 Pde7b (ENSCGRG00001021298) Ahi1 (ENSCGRG00001019676) Myb (ENSCGRG00001018869) Hbs1l (ENSCGRG00001024531) Aldh8a1 (ENSCGRG00001023246) 1700020N01Rik (ENSCGRG00001006553) Sgk1 (ENSCGRG00001022228) ENSCGRG00001005727 Lin28b (ENSCGRG00001024078) Bves (ENSCGRG00001023624) Popdc3 (ENSCGRG00001024360) Prep (ENSCGRG00001023843) Prdm1 (ENSCGRG00001023291) Atg5 (ENSCGRG00001022743) Ccdc70 (ENSCGRG00001005698) Golden Hamster MODERN SPECIES 621 Ect2l (ENSMAUG00000010748) Ccdc28a (ENSMAUG00000012356) Nhsl1 (ENSMAUG00000017101) Hebp2 (ENSMAUG00000022054) Arfgef3 (ENSMAUG00000015376) Perp (ENSMAUG00000020965) Tnfaip3 (ENSMAUG00000019454) Olig3 (ENSMAUG00000007734) Ifngr1 (ENSMAUG00000004899) Il22ra2 (ENSMAUG00000009499) Il20ra (ENSMAUG00000009539) Slc35d3 (ENSMAUG00000019497) Pex7 (ENSMAUG00000011551) Map3k5 (ENSMAUG00000017994) Bclaf1 (ENSMAUG00000020380) Mtfr2 (ENSMAUG00000020722) ##22 Pde7b (ENSMAUG00000015483) Ahi1 (ENSMAUG00000009566) Myb (ENSMAUG00000009411) Hbs1l (ENSMAUG00000001077) Aldh8a1 (ENSMAUG00000013904) 1700020N01Rik (ENSMAUG00000021945) Sgk1 (ENSMAUG00000009469) Slc2a12 (ENSMAUG00000008238) Tbpl1 (ENSMAUG00000003205) Tcf21 (ENSMAUG00000020633) Eya4 (ENSMAUG00000020805) ENSMAUG00000016653 Slc18b1 (ENSMAUG00000021274) Taar1 (ENSMAUG00000007196) Taar2 (ENSMAUG00000017522) Murinae ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00950000182963.a.a ENSGT00940000160412 ENSGT00530000064150 ENSGT00940000160886.p.a.a.b ENSGT00530000063484.a ENSGT00940000158448 ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00940000157314.A ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT01050000248461 ENSGT00950000183442 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT01050000248247 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.u.a.b ENSGT00940000156674 Mus ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000160412 ENSGT00530000064150 ENSGT00940000160886.p.a.a.b ENSGT00530000063484.a ENSGT00940000158448 ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00940000157314.A ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00900000143307 ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274 ENSGT00650000094590 ENSGT00940000156799 ENSGT00950000183442 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT01050000248247 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.u.a.b ENSGT00940000156674 Mus_A ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00530000064150 ENSGT00940000160886.p.a.a.b ENSGT00530000063484.a ENSGT00940000158448 ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00900000143457 ENSGT00940000157314.A ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00900000143307 ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274 ENSGT00650000094590 ENSGT00940000156799 ENSGT00950000183442 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT01050000248247 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.u.a.b ENSGT00390000018318.u.b.b Mus_B ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00530000064150 ENSGT00940000160886.p.a.a.b ENSGT00530000063484.a ENSGT00940000158448 ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00900000143457 ENSGT00940000157314.A ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00900000143307 ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274 ENSGT00650000094590 ENSGT00940000156799 ENSGT00950000183442 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT01050000248247 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.u.a.b ENSGT00940000156674 Mouse MODERN SPECIES 1 Nhsl1 (ENSMUSG00000039835) Hebp2 (ENSMUSG00000019853) Arfgef3 (ENSMUSG00000019852) Gm4922 (ENSMUSG00000044624) Perp (ENSMUSG00000019851) Tnfaip3 (ENSMUSG00000019850) Olig3 (ENSMUSG00000045591) Ifngr1 (ENSMUSG00000020009) Il22ra2 (ENSMUSG00000039760) Il20ra (ENSMUSG00000020007) Slc35d3 (ENSMUSG00000050473) Pex7 (ENSMUSG00000020003) Map3k5 (ENSMUSG00000071369) Map7 (ENSMUSG00000019996) Bclaf1 (ENSMUSG00000037608) Mtfr2 (ENSMUSG00000019992) ##22 Pde7b (ENSMUSG00000019990) Ahi1 (ENSMUSG00000019986) Myb (ENSMUSG00000019982) Hbs1l (ENSMUSG00000019977) Aldh8a1 (ENSMUSG00000037542) 1700020N01Rik (ENSMUSG00000050844) Sgk1 (ENSMUSG00000019970) Semp2l2b (ENSMUSG00000069712) Raet1e (ENSMUSG00000053219) H60b (ENSMUSG00000075297) Raet1d (ENSMUSG00000078452) Slc2a12 (ENSMUSG00000037490) Tbpl1 (ENSMUSG00000071359) Gm56675 (ENSMUSG00000118528) Tcf21 (ENSMUSG00000045680) Mus_C ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00530000064150 ENSGT00940000160886.p.a.a.b ENSGT00530000063484.a ENSGT00940000158448 ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00900000143457 ENSGT00940000157314.A ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00900000143307 ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274 ENSGT00650000094590 ENSGT00940000156799 ENSGT00950000183442 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.u.a.b ENSGT00940000156674 ENSGT00390000013823.b.c.b spretus MODERN SPECIES 1 Arfgef3 (MGP_SPRETEiJ_G0015951) Gm4922 (MGP_SPRETEiJ_G0015952) Perp (MGP_SPRETEiJ_G0015953) Tnfaip3 (MGP_SPRETEiJ_G0015954) Olig3 (MGP_SPRETEiJ_G0015955) MGP_SPRETEiJ_G0015956 Il22ra2 (MGP_SPRETEiJ_G0015957) MGP_SPRETEiJ_G0015958 Il20ra (MGP_SPRETEiJ_G0015959) Slc35d3 (MGP_SPRETEiJ_G0015960) Pex7 (MGP_SPRETEiJ_G0015961) Map3k5 (MGP_SPRETEiJ_G0015962) Map7 (MGP_SPRETEiJ_G0015963) MGP_SPRETEiJ_G0015964 Bclaf1 (MGP_SPRETEiJ_G0015965) MGP_SPRETEiJ_G0015966 ##22 Pde7b (MGP_SPRETEiJ_G0015967) MGP_SPRETEiJ_G0015968 Myb (MGP_SPRETEiJ_G0015969) Hbs1l (MGP_SPRETEiJ_G0015970) MGP_SPRETEiJ_G0015971 Aldh8a1 (MGP_SPRETEiJ_G0015972) 1700020N01Rik (MGP_SPRETEiJ_G0015973) Sgk1 (MGP_SPRETEiJ_G0015974) Slc2a12 (MGP_SPRETEiJ_G0015975) Tbpl1 (MGP_SPRETEiJ_G0015976) Tcf21 (MGP_SPRETEiJ_G0015977) Eya4 (MGP_SPRETEiJ_G0015979) MGP_SPRETEiJ_G0015980 Slc18b1 (MGP_SPRETEiJ_G0015981) Vnn3 (MGP_SPRETEiJ_G0015982) Steppe mouse DUPLICATION Steppe mouse MODERN SPECIES 3412 F2rl1 (ENSMSIG00000011086) S100z (ENSMSIG00000011096) Crhbp (ENSMSIG00000011120) Aggf1 (ENSMSIG00000011146) ENSMSIG00000011178 Pde8b (ENSMSIG00000011209) ENSMSIG00000011421 Otp (ENSMSIG00000011481) ENSMSIG00000011491 Ap3b1 (ENSMSIG00000011521) Scamp1 (ENSMSIG00000011596) Lhfpl2 (ENSMSIG00000011618) Arsb (ENSMSIG00000011652) Dmgdh (ENSMSIG00000011670) Bhmt2 (ENSMSIG00000011736) ENSMSIG00000011793 ##22 Jmy (ENSMSIG00000011806) ENSMSIG00000011824 ENSMSIG00000011858 ENSMSIG00000011865 Homer1 (ENSMSIG00000011873) Tent2 (ENSMSIG00000012117) Cmya5 (ENSMSIG00000012218) Mtx3 (ENSMSIG00000012405) Thbs4 (ENSMSIG00000012423) Serinc5 (ENSMSIG00000012451) Spz1 (ENSMSIG00000012499) Zfyve16 (ENSMSIG00000012506) ENSMSIG00000012548 Ankrd34b (ENSMSIG00000012559) Dhfr (ENSMSIG00000012568) Steppe mouse MODERN SPECIES 2959 Sgk1 (ENSMSIG00000029394) ENSMSIG00000029448 ENSMSIG00000029449 1700020N01Rik (ENSMSIG00000029452) ENSMSIG00000029461 ENSMSIG00000029462 Aldh8a1 (ENSMSIG00000029466) Hbs1l (ENSMSIG00000029472) Myb (ENSMSIG00000029496) Ahi1 (ENSMSIG00000029513) Pde7b (ENSMSIG00000029540) ENSMSIG00000029555 ##22 Ryukyu mouse MODERN SPECIES 1 Arfgef3 (MGP_CAROLIEiJ_G0015143) Gm4922 (MGP_CAROLIEiJ_G0015144) Perp (MGP_CAROLIEiJ_G0015145) Tnfaip3 (MGP_CAROLIEiJ_G0015146) Olig3 (MGP_CAROLIEiJ_G0015147) Ifngr1 (MGP_CAROLIEiJ_G0015148) Il22ra2 (MGP_CAROLIEiJ_G0015149) MGP_CAROLIEiJ_G0015150 Il20ra (MGP_CAROLIEiJ_G0015151) Slc35d3 (MGP_CAROLIEiJ_G0015152) Pex7 (MGP_CAROLIEiJ_G0015153) Map3k5 (MGP_CAROLIEiJ_G0015154) Map7 (MGP_CAROLIEiJ_G0015155) MGP_CAROLIEiJ_G0015156 Bclaf1 (MGP_CAROLIEiJ_G0015157) Mtfr2 (MGP_CAROLIEiJ_G0015158) ##22 Pde7b (MGP_CAROLIEiJ_G0015159) Ahi1 (MGP_CAROLIEiJ_G0015160) Myb (MGP_CAROLIEiJ_G0015161) Hbs1l (MGP_CAROLIEiJ_G0015162) MGP_CAROLIEiJ_G0015163 Aldh8a1 (MGP_CAROLIEiJ_G0015164) 1700020N01Rik (MGP_CAROLIEiJ_G0015165) Sgk1 (MGP_CAROLIEiJ_G0015166) Slc2a12 (MGP_CAROLIEiJ_G0015167) Tbpl1 (MGP_CAROLIEiJ_G0015168) Tcf21 (MGP_CAROLIEiJ_G0015169) Eya4 (MGP_CAROLIEiJ_G0015170) Rps12 (MGP_CAROLIEiJ_G0015171) Slc18b1 (MGP_CAROLIEiJ_G0015172) Vnn3 (MGP_CAROLIEiJ_G0015173) Shrew mouse MODERN SPECIES 13 Gm4922 (MGP_PahariEiJ_G0023763) Perp (MGP_PahariEiJ_G0023764) Tnfaip3 (MGP_PahariEiJ_G0023765) MGP_PahariEiJ_G0023766 Olig3 (MGP_PahariEiJ_G0023767) Ifngr1 (MGP_PahariEiJ_G0023768) Il22ra2 (MGP_PahariEiJ_G0023769) MGP_PahariEiJ_G0023770 Il20ra (MGP_PahariEiJ_G0023771) Slc35d3 (MGP_PahariEiJ_G0023772) Pex7 (MGP_PahariEiJ_G0023773) Map3k5 (MGP_PahariEiJ_G0023774) Map7 (MGP_PahariEiJ_G0023775) MGP_PahariEiJ_G0023776 MGP_PahariEiJ_G0023777 Mtfr2 (MGP_PahariEiJ_G0023778) ##22 Pde7b (MGP_PahariEiJ_G0023779) Ahi1 (MGP_PahariEiJ_G0023780) Myb (MGP_PahariEiJ_G0023781) Hbs1l (MGP_PahariEiJ_G0023782) MGP_PahariEiJ_G0023783 Aldh8a1 (MGP_PahariEiJ_G0023784) 1700020N01Rik (MGP_PahariEiJ_G0023785) Sgk1 (MGP_PahariEiJ_G0023786) Slc2a12 (MGP_PahariEiJ_G0023787) Tbpl1 (MGP_PahariEiJ_G0023788) Tcf21 (MGP_PahariEiJ_G0023789) Eya4 (MGP_PahariEiJ_G0023790) MGP_PahariEiJ_G0023791 Slc18b1 (MGP_PahariEiJ_G0023792) Vnn3 (MGP_PahariEiJ_G0023793) Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 1789 ENSNGAG00000000988 Hebp2 (ENSNGAG00000003578) Arfgef3 (ENSNGAG00000010293) Perp (ENSNGAG00000017566) ENSNGAG00000018978 Olig3 (ENSNGAG00000018786) Ifngr1 (ENSNGAG00000010028) Il22ra2 (ENSNGAG00000000838) ENSNGAG00000012948 Il20ra (ENSNGAG00000005056) Slc35d3 (ENSNGAG00000015318) Pex7 (ENSNGAG00000018527) Map3k5 (ENSNGAG00000000561) Map7 (ENSNGAG00000019743) Bclaf1 (ENSNGAG00000016813) Mtfr2 (ENSNGAG00000001241) ##22 Pde7b (ENSNGAG00000010650) Ahi1 (ENSNGAG00000017747) Myb (ENSNGAG00000006199) Hbs1l (ENSNGAG00000015184) Aldh8a1 (ENSNGAG00000009983) Sgk1 (ENSNGAG00000017569) Slc2a12 (ENSNGAG00000015437) Tbpl1 (ENSNGAG00000002735) Tcf21 (ENSNGAG00000010530) Eya4 (ENSNGAG00000014955) ENSNGAG00000008061 ENSNGAG00000017824 Slc18b1 (ENSNGAG00000001177) Vnn1 (ENSNGAG00000000525) Taar1 (ENSNGAG00000016686) Kangaroo rat MODERN SPECIES 416 Nhsl1 (ENSDORG00000028836) Hebp2 (ENSDORG00000008127) Arfgef3 (ENSDORG00000000555) Perp (ENSDORG00000026815) ENSDORG00000002537 Olig3 (ENSDORG00000013033) Ifngr1 (ENSDORG00000003816) Il22ra2 (ENSDORG00000003815) Il20ra (ENSDORG00000006038) Slc35d3 (ENSDORG00000006037) Pex7 (ENSDORG00000006036) ENSDORG00000001559 Map7 (ENSDORG00000011587) ENSDORG00000026911 Bclaf1 (ENSDORG00000015144) Mtfr2 (ENSDORG00000011726) ##22 Pde7b (ENSDORG00000011723) Ahi1 (ENSDORG00000005963) Myb (ENSDORG00000005960) Hbs1l (ENSDORG00000005958) Aldh8a1 (ENSDORG00000012210) Sgk1 (ENSDORG00000006576) Slc2a12 (ENSDORG00000001098) Tbpl1 (ENSDORG00000026809) Tcf21 (ENSDORG00000028001) Eya4 (ENSDORG00000009832) ENSDORG00000016670 Slc18b1 (ENSDORG00000016669) Vnn3 (ENSDORG00000006399) Vnn1 (ENSDORG00000013713) Taar1 (ENSDORG00000014650) Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000160412 ENSGT00740000116829 ENSGT01030000236221 ENSGT00530000064150 ENSGT00530000063484.a ENSGT00940000158448 ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00940000157314.A ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00650000094590 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.u.a ENSGT00390000018318.u.b.b ENSGT00940000156674 ENSGT00390000013823.b.c.a.b Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES 39 ENSGT00500000044870.a ENSGT00950000182963.a.a.b ENSGT00940000160412 ENSGT00530000064150 ENSGT00530000063484.a ENSGT00940000158448 ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00940000157314.A ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00500000044870.a ENSGT00950000182963.a.a.b ENSGT00940000160412 ENSGT00530000064150 ENSGT00530000063484.a ENSGT00940000158448 ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00940000157314.A ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00530000063558.B ENSGT00940000157993 ENSGT00390000004172 ENSGT01090000260082.d.b.i ENSGT00940000160610 ENSGT00940000154531 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00500000044870.a ENSGT00950000182963.a.a.b ENSGT00940000160412 ENSGT00530000064150 ENSGT00530000063484.a ENSGT00940000158448 ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00940000157314.A ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00530000063558.B ENSGT00940000157993 ENSGT00390000004172 ENSGT01090000260082.d.b.i ENSGT00940000160610 ENSGT00940000154531 Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 146 SLC35D3 (ENSCLAG00000003234) PEX7 (ENSCLAG00000003272) MAP3K5 (ENSCLAG00000007503) ENSCLAG00000012716 ENSCLAG00000003926 BCLAF1 (ENSCLAG00000004401) MTFR2 (ENSCLAG00000005292) ##22 PDE7B (ENSCLAG00000007039) AHI1 (ENSCLAG00000003003) MYB (ENSCLAG00000005675) HBS1L (ENSCLAG00000004937) ALDH8A1 (ENSCLAG00000005380) SGK1 (ENSCLAG00000006128) SLC2A12 (ENSCLAG00000002848) TBPL1 (ENSCLAG00000003071) TCF21 (ENSCLAG00000003324) ENSCLAG00000006768 FNDC1 (ENSCLAG00000007668) TAGAP (ENSCLAG00000002626) RSPH3 (ENSCLAG00000002659) ENSCLAG00000002792 EZR (ENSCLAG00000003081) Degu MODERN SPECIES 65 ENSODEG00000009708 ARFGEF3 (ENSODEG00000008382) ENSODEG00000008459 TNFAIP3 (ENSODEG00000008925) ENSODEG00000019565 OLIG3 (ENSODEG00000019534) ENSODEG00000019506 ENSODEG00000008408 IL22RA2 (ENSODEG00000007775) IL20RA (ENSODEG00000006756) SLC35D3 (ENSODEG00000006620) ENSODEG00000008240 ENSODEG00000008040 MAP7 (ENSODEG00000008448) ENSODEG00000006806 MTFR2 (ENSODEG00000006976) ##22 PDE7B (ENSODEG00000007023) ENSODEG00000007137 ENSODEG00000006953 ENSODEG00000019597 ENSODEG00000008684 HBS1L (ENSODEG00000008959) ALDH8A1 (ENSODEG00000007514) ENSODEG00000006585 SLC2A12 (ENSODEG00000007816) ENSODEG00000006582 TCF21 (ENSODEG00000007820) ENSODEG00000019436 FNDC1 (ENSODEG00000007591) ENSODEG00000009689 TAGAP (ENSODEG00000007094) Guinea pig MODERN SPECIES 41 OLIG3 (ENSCPOG00000007516) IFNGR1 (ENSCPOG00000012963) IL22RA2 (ENSCPOG00000025110) IL20RA (ENSCPOG00000037107) SLC35D3 (ENSCPOG00000010798) PEX7 (ENSCPOG00000007704) MAP3K5 (ENSCPOG00000004244) MAP7 (ENSCPOG00000004237) BCLAF1 (ENSCPOG00000008088) MTFR2 (ENSCPOG00000008084) ##22 PDE7B (ENSCPOG00000035879) ENSCPOG00000030097 MYB (ENSCPOG00000014607) HBS1L (ENSCPOG00000007015) ALDH8A1 (ENSCPOG00000007012) SGK1 (ENSCPOG00000001494) SLC2A12 (ENSCPOG00000001493) TBPL1 (ENSCPOG00000011899) TCF21 (ENSCPOG00000024201) FNDC1 (ENSCPOG00000006443) TAGAP (ENSCPOG00000006603) RSPH3 (ENSCPOG00000014634) EZR (ENSCPOG00000004306) SYTL3 (ENSCPOG00000004299) DYNLT1 (ENSCPOG00000004297) Naked mole-rat female DUPLICATION Naked mole-rat female MODERN SPECIES PERP (ENSHGLG00000017932) ENSHGLG00000037648 ENSHGLG00000005679 OLIG3 (ENSHGLG00000020086) ENSHGLG00000047576 IL22RA2 (ENSHGLG00000001748) ENSHGLG00000036039 IL20RA (ENSHGLG00000002408) ENSHGLG00000038313 SLC35D3 (ENSHGLG00000000195) PEX7 (ENSHGLG00000000229) ENSHGLG00000035518 MAP3K5 (ENSHGLG00000000842) MAP7 (ENSHGLG00000000995) BCLAF1 (ENSHGLG00000001879) ENSHGLG00000000549 ##22 PDE7B (ENSHGLG00000048791) ENSHGLG00000002954 AHI1 (ENSHGLG00000003261) MYB (ENSHGLG00000000878) HBS1L (ENSHGLG00000000516) ALDH8A1 (ENSHGLG00000000876) SGK1 (ENSHGLG00000000909) ENSHGLG00000019010 SLC2A12 (ENSHGLG00000000953) ENSHGLG00000046831 TCF21 (ENSHGLG00000035092) ENSHGLG00000040407 ENSHGLG00000032159 ENSHGLG00000003172 ENSHGLG00000035822 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 30 ENSHGLG00000030453 ENSHGLG00000042127 ENSHGLG00000048903 ENSHGLG00000011588 ENSHGLG00000041057 ENSHGLG00000037582 ENSHGLG00000000069 ENSHGLG00000007721 ENSHGLG00000020219 ENSHGLG00000009665 ENSHGLG00000005824 HRCT1 (ENSHGLG00000038952) ENSHGLG00000020655 ENSHGLG00000034288 ENSHGLG00000050096 ENSHGLG00000041527 ##22 ENSHGLG00000000367 ENSHGLG00000048384 ENSHGLG00000049908 ENSHGLG00000037586 ENSHGLG00000002744 ENSHGLG00000008605 ENSHGLG00000050160 ENSHGLG00000048343 ENSHGLG00000006340 ENSHGLG00000019873 ENSHGLG00000045536 ENSHGLG00000036624 ENSHGLG00000043996 ENSHGLG00000046651 ENSHGLG00000021201 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000160412 ENSGT00740000116829 ENSGT01030000236221 ENSGT00530000064150 ENSGT00530000063484.a ENSGT00940000158448 ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00940000157314.A ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00650000094590 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.u.b.a.a ENSGT00940000156674 ENSGT00390000013823.b.c.a.b ENSGT00390000013823.b.c.b Eurasian red squirrel DUPLICATION Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 13 ENSSVLG00005001588 LRRC63 (ENSSVLG00005001547) LCP1 (ENSSVLG00005001488) CPB2 (ENSSVLG00005001440) ZC3H13 (ENSSVLG00005001347) SIAH3 (ENSSVLG00005001312) CBY2 (ENSSVLG00005001296) ENSSVLG00005001222 SLC25A30 (ENSSVLG00005001187) ENSSVLG00005001160 ENSSVLG00005001144 ENSSVLG00005001090 KCTD4 (ENSSVLG00005001062) ENSSVLG00005001046 ENSSVLG00005001028 ENSSVLG00005001012 ##22 ENSSVLG00005000987 NUFIP1 (ENSSVLG00005000955) TSC22D1 (ENSSVLG00005000900) SERP2 (ENSSVLG00005000867) LACC1 (ENSSVLG00005000824) CCDC122 (ENSSVLG00005000800) ENOX1 (ENSSVLG00005000776) DNAJC15 (ENSSVLG00005000749) EPSTI1 (ENSSVLG00005000671) FAM216B (ENSSVLG00005000610) ENSSVLG00005000585 TNFSF11 (ENSSVLG00005000540) AKAP11 (ENSSVLG00005000468) DGKH (ENSSVLG00005000391) VWA8 (ENSSVLG00005004690) Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 16 OLIG3 (ENSSVLG00005020760) IFNGR1 (ENSSVLG00005020792) IL22RA2 (ENSSVLG00005020977) IL20RA (ENSSVLG00005021081) SLC35D3 (ENSSVLG00005021290) PEX7 (ENSSVLG00005006033) MAP3K5 (ENSSVLG00005006091) ENSSVLG00005006276 ENSSVLG00005006372 ENSSVLG00005006470 ENSSVLG00005006489 ENSSVLG00005006502 ENSSVLG00005006526 ENSSVLG00005006545 ENSSVLG00005006663 ENSSVLG00005006924 ##22 PDE7B (ENSSVLG00005007033) AHI1 (ENSSVLG00005007162) MYB (ENSSVLG00005007375) ENSSVLG00005007995 ENSSVLG00005008038 ALDH8A1 (ENSSVLG00005008086) ENSSVLG00005008214 SGK1 (ENSSVLG00005008322) SLC2A12 (ENSSVLG00005008629) TBPL1 (ENSSVLG00005008655) TCF21 (ENSSVLG00005008705) ENSSVLG00005008727 EYA4 (ENSSVLG00005009017) ENSSVLG00005010015 SLC18B1 (ENSSVLG00005010095) Marmotini ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00990000204448 ENSGT00950000182963.a.a ENSGT00940000160412 ENSGT00530000064150 ENSGT00530000063484.a ENSGT00940000158448 ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00940000157314.A ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000163252.d ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.u.b.a.b.a.b ENSGT00940000156674 ENSGT00390000013823.b.c.a.b ENSGT00390000013823.b.c.a.a Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 59 ENSGT00990000204448 ENSGT00950000182963.a.a ENSGT00940000160412 ENSGT00530000064150 ENSGT00530000063484.a ENSGT00940000158448 ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00940000157314.A ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000163252.d ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.u.b.a.a ENSGT00940000156674 ENSGT00390000013823.b.c.a.b ENSGT00390000013823.b.c.a.a Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 94 ENSUPAG00010003303 NHSL1 (ENSUPAG00010003289) HEBP2 (ENSUPAG00010003272) ARFGEF3 (ENSUPAG00010003182) PERP (ENSUPAG00010003162) TNFAIP3 (ENSUPAG00010003126) OLIG3 (ENSUPAG00010003123) IFNGR1 (ENSUPAG00010003115) IL22RA2 (ENSUPAG00010003105) IL20RA (ENSUPAG00010003082) SLC35D3 (ENSUPAG00010003080) PEX7 (ENSUPAG00010003051) MAP3K5 (ENSUPAG00010002902) MAP7 (ENSUPAG00010002836) BCLAF1 (ENSUPAG00010002788) MTFR2 (ENSUPAG00010002758) ##22 ENSUPAG00010002749 PDE7B (ENSUPAG00010002707) AHI1 (ENSUPAG00010002656) MYB (ENSUPAG00010002637) ENSUPAG00010002482 ENSUPAG00010002240 SLC2A12 (ENSUPAG00010002225) TBPL1 (ENSUPAG00010002221) ENSUPAG00010002212 Squirrel MODERN SPECIES 160 CCDC28A (ENSSTOG00000021039) NHSL1 (ENSSTOG00000002362) HEBP2 (ENSSTOG00000020811) ARFGEF3 (ENSSTOG00000028835) PERP (ENSSTOG00000024446) TNFAIP3 (ENSSTOG00000007860) OLIG3 (ENSSTOG00000020214) IFNGR1 (ENSSTOG00000023671) IL22RA2 (ENSSTOG00000012313) IL20RA (ENSSTOG00000016256) SLC35D3 (ENSSTOG00000025129) PEX7 (ENSSTOG00000025283) MAP3K5 (ENSSTOG00000009007) MAP7 (ENSSTOG00000008977) BCLAF1 (ENSSTOG00000013977) MTFR2 (ENSSTOG00000013967) ##22 ENSSTOG00000021413 PDE7B (ENSSTOG00000020095) AHI1 (ENSSTOG00000007607) MYB (ENSSTOG00000007581) HBS1L (ENSSTOG00000007551) ALDH8A1 (ENSSTOG00000007535) SGK1 (ENSSTOG00000028424) SLC2A12 (ENSSTOG00000027759) TBPL1 (ENSSTOG00000006786) TCF21 (ENSSTOG00000023733) EYA4 (ENSSTOG00000005069) ENSSTOG00000031770 SLC18B1 (ENSSTOG00000009373) ENSSTOG00000009354 VNN1 (ENSSTOG00000007336) Alpin marmot MODERN SPECIES 2 ECT2L (ENSMMMG00000000082) CCDC28A (ENSMMMG00000000049) NHSL1 (ENSMMMG00000000011) HEBP2 (ENSMMMG00000019485) ARFGEF3 (ENSMMMG00000019413) PERP (ENSMMMG00000019402) TNFAIP3 (ENSMMMG00000019379) OLIG3 (ENSMMMG00000019365) IFNGR1 (ENSMMMG00000019328) IL22RA2 (ENSMMMG00000019318) IL20RA (ENSMMMG00000019314) PEX7 (ENSMMMG00000019290) MAP3K5 (ENSMMMG00000019235) MAP7 (ENSMMMG00000019204) BCLAF1 (ENSMMMG00000019134) MTFR2 (ENSMMMG00000019120) ##22 ENSMMMG00000019117 PDE7B (ENSMMMG00000019089) AHI1 (ENSMMMG00000019073) MYB (ENSMMMG00000019066) HBS1L (ENSMMMG00000019006) ALDH8A1 (ENSMMMG00000019004) ENSMMMG00000018939 SGK1 (ENSMMMG00000018673) SLC2A12 (ENSMMMG00000018652) TBPL1 (ENSMMMG00000018642) TCF21 (ENSMMMG00000018609) EYA4 (ENSMMMG00000018511) ENSMMMG00000018382 SLC18B1 (ENSMMMG00000018367) ENSMMMG00000018365 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00950000182963.a.a ENSGT00940000160412 ENSGT00740000116829 ENSGT00530000064150 ENSGT00530000063484.a ENSGT00940000158448 ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00940000157314.A ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.u.a ENSGT00940000156674 ENSGT00390000013823.b.c.a.b ENSGT00950000182934.a.b ENSGT00940000161475 Rabbit MODERN SPECIES 3 NHSL1 (ENSOCUG00000013429) HEBP2 (ENSOCUG00000013425) SMIM28 (ENSOCUG00000038063) ARFGEF3 (ENSOCUG00000004754) ENSOCUG00000004238 TNFAIP3 (ENSOCUG00000002310) OLIG3 (ENSOCUG00000017289) IFNGR1 (ENSOCUG00000013254) IL22RA2 (ENSOCUG00000022021) IL20RA (ENSOCUG00000015696) SLC35D3 (ENSOCUG00000005418) PEX7 (ENSOCUG00000005413) MAP3K5 (ENSOCUG00000015434) MAP7 (ENSOCUG00000025456) BCLAF1 (ENSOCUG00000016363) MTFR2 (ENSOCUG00000023560) ##22 PDE7B (ENSOCUG00000016632) AHI1 (ENSOCUG00000011645) MYB (ENSOCUG00000011633) ENSOCUG00000011619 ALDH8A1 (ENSOCUG00000011613) SGK1 (ENSOCUG00000014367) SLC2A12 (ENSOCUG00000007095) ENSOCUG00000007091 TCF21 (ENSOCUG00000017761) ENSOCUG00000034819 EYA4 (ENSOCUG00000000635) ENSOCUG00000001606 SLC18B1 (ENSOCUG00000001601) ENSOCUG00000002119 TAAR1 (ENSOCUG00000017485) Pika MODERN SPECIES 3373 MTFR2 (ENSOPRG00000001751) ##22 PDE7B (ENSOPRG00000001717) Tree shrew MODERN SPECIES 9045 BCLAF1 (ENSTBEG00000014886) MTFR2 (ENSTBEG00000014424) ##22 PDE7B (ENSTBEG00000014277) Primates ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000160412 ENSGT00740000116829 ENSGT01030000236221 ENSGT00530000064150 ENSGT00530000063484.a ENSGT00940000158448 ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00940000157314.A ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.u.a ENSGT00940000156674 ENSGT00390000013823.b.c.a.b ENSGT00390000013823.b.c.b ENSGT00390000013823.b.c.a.a Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00950000182963.a.a ENSGT00940000160412 ENSGT00740000116829 ENSGT00530000064150 ENSGT00530000063484.a ENSGT00940000158448 ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00940000157314.A ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.u.b.b ENSGT00940000156674 ENSGT00390000013823.b.c.a.b ENSGT00390000013823.b.c.b ENSGT00390000013823.b.c.a.a Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00950000182963.a.a ENSGT00940000160412 ENSGT00740000116829 ENSGT00530000064150 ENSGT00530000063484.a ENSGT00940000158448 ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00940000157314.A ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.u.b.b ENSGT00940000156674 ENSGT00390000013823.b.c.a.b ENSGT00390000013823.b.c.b ENSGT00390000013823.b.c.a.a Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00950000182963.a.a ENSGT00940000160412 ENSGT00740000116829 ENSGT00530000064150 ENSGT00530000063484.a.a ENSGT00940000158448 ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00940000157314.A ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.u.a ENSGT00940000156674 ENSGT00390000013823.b.c.a.b ENSGT00390000013823.b.c.b ENSGT00390000013823.b.c.a.a Coquerels sifaka MODERN SPECIES 1046 OLIG3 (ENSPCOG00000005063) IFNGR1 (ENSPCOG00000001037) IL22RA2 (ENSPCOG00000016305) IL20RA (ENSPCOG00000028358) SLC35D3 (ENSPCOG00000021808) ENSPCOG00000027911 MAP3K5 (ENSPCOG00000019678) MAP7 (ENSPCOG00000024639) BCLAF1 (ENSPCOG00000014683) MTFR2 (ENSPCOG00000004724) ##22 PDE7B (ENSPCOG00000027152) ENSPCOG00000018117 MYB (ENSPCOG00000018217) ENSPCOG00000020390 ALDH8A1 (ENSPCOG00000028699) ENSPCOG00000000608 ENSPCOG00000006925 SGK1 (ENSPCOG00000021583) SLC2A12 (ENSPCOG00000024120) TBPL1 (ENSPCOG00000015682) TCF21 (ENSPCOG00000028439) EYA4 (ENSPCOG00000019086) ENSPCOG00000018473 SLC18B1 (ENSPCOG00000024834) VNN2 (ENSPCOG00000014249) Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 1107 MAP7 (ENSPSMG00000012847) BCLAF1 (ENSPSMG00000012569) MTFR2 (ENSPSMG00000012407) ##22 PDE7B (ENSPSMG00000012399) AHI1 (ENSPSMG00000012348) MYB (ENSPSMG00000011509) HBS1L (ENSPSMG00000010745) ALDH8A1 (ENSPSMG00000010552) ENSPSMG00000010526 ENSPSMG00000010518 ENSPSMG00000010511 SGK1 (ENSPSMG00000010165) SLC2A12 (ENSPSMG00000009995) TBPL1 (ENSPSMG00000009985) TCF21 (ENSPSMG00000009967) ENSPSMG00000009962 EYA4 (ENSPSMG00000009715) RPS12 (ENSPSMG00000009418) Mouse lemur MODERN SPECIES 28 HEBP2 (ENSMICG00000032428) SMIM28 (ENSMICG00000046075) ARFGEF3 (ENSMICG00000013986) PERP (ENSMICG00000047745) TNFAIP3 (ENSMICG00000013965) ENSMICG00000041427 ENSMICG00000027650 ENSMICG00000044585 IL22RA2 (ENSMICG00000004960) IL20RA (ENSMICG00000004953) SLC35D3 (ENSMICG00000046861) PEX7 (ENSMICG00000004938) MAP3K5 (ENSMICG00000004915) MAP7 (ENSMICG00000004905) BCLAF1 (ENSMICG00000004946) MTFR2 (ENSMICG00000004940) ##22 PDE7B (ENSMICG00000032302) AHI1 (ENSMICG00000005541) MYB (ENSMICG00000005531) ENSMICG00000001533 ALDH8A1 (ENSMICG00000001527) SGK1 (ENSMICG00000007886) SLC2A12 (ENSMICG00000026712) TBPL1 (ENSMICG00000015740) TCF21 (ENSMICG00000029994) EYA4 (ENSMICG00000007846) RPS12 (ENSMICG00000043038) SLC18B1 (ENSMICG00000037158) VNN2 (ENSMICG00000005236) VNN1 (ENSMICG00000005229) TAAR2 (ENSMICG00000003235) Bushbaby MODERN SPECIES 157 HEBP2 (ENSOGAG00000005010) ARFGEF3 (ENSOGAG00000016978) PERP (ENSOGAG00000011669) TNFAIP3 (ENSOGAG00000011667) OLIG3 (ENSOGAG00000011977) ENSOGAG00000032882 IFNGR1 (ENSOGAG00000006564) IL22RA2 (ENSOGAG00000006556) IL20RA (ENSOGAG00000006549) SLC35D3 (ENSOGAG00000006548) PEX7 (ENSOGAG00000000560) ENSOGAG00000030613 MAP3K5 (ENSOGAG00000000556) MAP7 (ENSOGAG00000009726) BCLAF1 (ENSOGAG00000009724) MTFR2 (ENSOGAG00000009721) ##22 ENSOGAG00000025397 ENSOGAG00000024127 PDE7B (ENSOGAG00000009717) ENSOGAG00000030360 AHI1 (ENSOGAG00000011323) MYB (ENSOGAG00000000056) HBS1L (ENSOGAG00000012604) ALDH8A1 (ENSOGAG00000012602) ENSOGAG00000028801 ENSOGAG00000029912 SGK1 (ENSOGAG00000008732) SLC2A12 (ENSOGAG00000034406) TBPL1 (ENSOGAG00000006622) TCF21 (ENSOGAG00000034073) EYA4 (ENSOGAG00000006398) Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000160412 ENSGT00740000116829 ENSGT01030000236221 ENSGT00530000064150 ENSGT00530000063484.a ENSGT00940000158448 ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00940000157314.A ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.u.a ENSGT00940000156674 ENSGT00390000013823.b.c.a.b ENSGT00390000013823.b.c.b ENSGT00390000013823.b.c.a.a Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00740000116829 ENSGT01030000236221 ENSGT00530000064150 ENSGT00530000063484.a ENSGT00940000158448 ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00940000157314.A ENSGT00910000146884 ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.u.a ENSGT00940000156674 ENSGT00390000013823.b.c.a.b ENSGT00390000013823.b.c.b ENSGT00390000013823.b.c.a.a Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00530000064150 ENSGT00530000063484.a.c ENSGT00940000158448 ENSGT00940000153876.B.i ENSGT00940000154296.jb.b ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00940000157314.A ENSGT00910000146884 ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00950000183163.a.b.c ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.u.a ENSGT00940000156674 ENSGT00390000013823.b.c.a.b ENSGT00390000013823.b.c.b ENSGT00390000013823.b.c.a.a Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00530000064150 ENSGT00530000063484.a.c ENSGT00940000158448 ENSGT00940000153876.B.i ENSGT00940000154296.jb.b ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00940000157314.A ENSGT00910000146884 ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00950000183163.a.b.c ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.u.a ENSGT00940000156674 ENSGT00390000013823.b.c.a.b ENSGT00390000013823.b.c.b ENSGT00390000013823.b.c.a.a Hominidae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00530000064150 ENSGT00530000063484.a.c ENSGT00940000158448 ENSGT00940000153876.B.i ENSGT00940000154296.jb.b ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00940000157314.A ENSGT00910000146884 ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00950000183163.a.b.c ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.u.a ENSGT00940000156674 ENSGT00390000013823.b.c.a.b ENSGT00390000013823.b.c.b ENSGT00390000013823.b.c.a.a Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00530000064150 ENSGT00530000063484.a.c ENSGT00940000158448 ENSGT00940000153876.B.i ENSGT00940000154296.jb.b ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00940000157314.A ENSGT00910000146884 ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00950000183163.a.b.c ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.u.b.b ENSGT00940000156674 ENSGT00390000013823.b.c.a.b ENSGT00390000013823.b.c.b ENSGT00390000013823.b.c.a.a Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00530000064150 ENSGT00530000063484.a.c ENSGT00940000158448 ENSGT00940000153876.B.i ENSGT00940000154296.jb.b ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00940000157314.A ENSGT00910000146884 ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00950000183163.a.b.c ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 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SPECIES 19 PERP (ENSPTRG00000050751) TNFAIP3 (ENSPTRG00000018644) ENSPTRG00000047083 ENSPTRG00000044157 OLIG3 (ENSPTRG00000018643) IFNGR1 (ENSPTRG00000018642) IL22RA2 (ENSPTRG00000018641) IL20RA (ENSPTRG00000018640) ENSPTRG00000047595 SLC35D3 (ENSPTRG00000018639) PEX7 (ENSPTRG00000018638) MAP3K5 (ENSPTRG00000024326) ENSPTRG00000049539 MAP7 (ENSPTRG00000018636) BCLAF1 (ENSPTRG00000018635) MTFR2 (ENSPTRG00000018634) ##22 PDE7B (ENSPTRG00000018633) AHI1 (ENSPTRG00000018632) MYB (ENSPTRG00000018631) HBS1L (ENSPTRG00000018630) ALDH8A1 (ENSPTRG00000018629) ENSPTRG00000052017 SGK1 (ENSPTRG00000018626) SLC2A12 (ENSPTRG00000018625) TBPL1 (ENSPTRG00000018624) TCF21 (ENSPTRG00000018622) EYA4 (ENSPTRG00000018619) RPS12 (ENSPTRG00000018618) SLC18B1 (ENSPTRG00000018616) VNN2 (ENSPTRG00000018615) VNN3 (ENSPTRG00000018614) Bonobo MODERN SPECIES 19 ARFGEF3 (ENSPPAG00000036773) PERP (ENSPPAG00000039047) TNFAIP3 (ENSPPAG00000034373) ENSPPAG00000035158 ENSPPAG00000043546 OLIG3 (ENSPPAG00000020831) IFNGR1 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ENSPPYG00000017020 SLC18B1 (ENSPPYG00000017019) VNN2 (ENSPPYG00000017018) ENSPPYG00000029683 Gibbon MODERN SPECIES 18 ARFGEF3 (ENSNLEG00000014937) PERP (ENSNLEG00000027370) TNFAIP3 (ENSNLEG00000014913) ENSNLEG00000035766 ENSNLEG00000030456 OLIG3 (ENSNLEG00000019305) IFNGR1 (ENSNLEG00000035902) IL22RA2 (ENSNLEG00000014887) IL20RA (ENSNLEG00000014884) ENSNLEG00000027846 SLC35D3 (ENSNLEG00000014882) PEX7 (ENSNLEG00000014868) MAP3K5 (ENSNLEG00000014849) MAP7 (ENSNLEG00000014807) BCLAF1 (ENSNLEG00000014796) MTFR2 (ENSNLEG00000014793) ##22 PDE7B (ENSNLEG00000014787) AHI1 (ENSNLEG00000014767) MYB (ENSNLEG00000014751) HBS1L (ENSNLEG00000014721) ALDH8A1 (ENSNLEG00000014713) ENSNLEG00000032917 ENSNLEG00000033209 SGK1 (ENSNLEG00000014679) SLC2A12 (ENSNLEG00000014667) TBPL1 (ENSNLEG00000014649) TCF21 (ENSNLEG00000031050) EYA4 (ENSNLEG00000014613) ENSNLEG00000014611 SLC18B1 (ENSNLEG00000014588) ENSNLEG00000032485 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00530000064150 ENSGT00530000063484.a.c 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(ENSPANG00000018173) IL22RA2 (ENSPANG00000000356) ENSPANG00000039384 IL20RA (ENSPANG00000017634) ENSPANG00000033937 SLC35D3 (ENSPANG00000005133) PEX7 (ENSPANG00000023965) MAP3K5 (ENSPANG00000015068) MAP7 (ENSPANG00000016952) ENSPANG00000047396 BCLAF1 (ENSPANG00000022182) MTFR2 (ENSPANG00000014438) ##22 PDE7B (ENSPANG00000015851) AHI1 (ENSPANG00000008061) ENSPANG00000033626 MYB (ENSPANG00000018932) HBS1L (ENSPANG00000007075) ALDH8A1 (ENSPANG00000022180) ENSPANG00000047724 SGK1 (ENSPANG00000010260) SLC2A12 (ENSPANG00000022519) TBPL1 (ENSPANG00000020089) ENSPANG00000041421 TCF21 (ENSPANG00000037480) ENSPANG00000040940 ENSPANG00000050946 EYA4 (ENSPANG00000013262) Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 73 ENSGT00530000064150 ENSGT00530000063484.a.c ENSGT00940000158448 ENSGT00940000153876.B.i ENSGT00940000154296.jb.b ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00940000157314.A ENSGT00910000146884 ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00950000183163.a.b.c ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.v ENSGT00940000156674 ENSGT00390000013823.b.c.a.b ENSGT00390000013823.b.c.b ENSGT00390000013823.b.c.a.a Sooty mangabey MODERN SPECIES 324 ARFGEF3 (ENSCATG00000039507) ENSCATG00000042163 TNFAIP3 (ENSCATG00000041434) ENSCATG00000044693 ENSCATG00000041894 OLIG3 (ENSCATG00000015711) IFNGR1 (ENSCATG00000037440) IL22RA2 (ENSCATG00000031043) IL20RA (ENSCATG00000037479) ENSCATG00000043504 SLC35D3 (ENSCATG00000029391) PEX7 (ENSCATG00000030986) MAP3K5 (ENSCATG00000017514) MAP7 (ENSCATG00000041354) BCLAF1 (ENSCATG00000018862) MTFR2 (ENSCATG00000029871) ##22 PDE7B (ENSCATG00000039515) AHI1 (ENSCATG00000017191) ENSCATG00000039064 MYB (ENSCATG00000029830) HBS1L (ENSCATG00000043042) ALDH8A1 (ENSCATG00000045306) ENSCATG00000043694 SGK1 (ENSCATG00000044319) SLC2A12 (ENSCATG00000010423) TBPL1 (ENSCATG00000045200) TCF21 (ENSCATG00000037198) EYA4 (ENSCATG00000043182) ENSCATG00000036985 SLC18B1 (ENSCATG00000035898) VNN2 (ENSCATG00000012186) Drill MODERN SPECIES 733 SMIM28 (ENSMLEG00000030662) ARFGEF3 (ENSMLEG00000030098) PERP (ENSMLEG00000038902) TNFAIP3 (ENSMLEG00000024974) ENSMLEG00000038362 ENSMLEG00000032539 IFNGR1 (ENSMLEG00000029276) IL22RA2 (ENSMLEG00000034712) IL20RA (ENSMLEG00000036693) ENSMLEG00000029751 SLC35D3 (ENSMLEG00000041255) PEX7 (ENSMLEG00000030496) MAP3K5 (ENSMLEG00000044142) MAP7 (ENSMLEG00000041309) BCLAF1 (ENSMLEG00000029438) MTFR2 (ENSMLEG00000025670) ##22 PDE7B (ENSMLEG00000038045) Macaca ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00530000064150 ENSGT00530000063484.a.c ENSGT00940000158448 ENSGT00940000153876.B.i ENSGT00940000154296.jb.b ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00940000157314.A ENSGT00910000146884 ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00950000183163.a.b.c ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00390000002732.n.s.a ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.u.a ENSGT00940000156674 ENSGT00390000013823.b.c.a.b ENSGT00390000013823.b.c.b Macaca_a ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00950000182963.a.a ENSGT00940000160412 ENSGT00740000116829 ENSGT00530000064150 ENSGT00530000063484.a.c ENSGT00940000158448 ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00940000157314.A ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00950000183163.a.b.c ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00390000002732.n.s.a ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT01100000263539.b.a.a.a.a.a.b.a.a.a.a.b ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.u.a ENSGT00940000156674 ENSGT00390000013823.b.c.a.b Crab-eating macaque MODERN SPECIES 14 ENSMFAG00000047571 TNFAIP3 (ENSMFAG00000000326) ENSMFAG00000039282 ENSMFAG00000051130 OLIG3 (ENSMFAG00000027435) ENSMFAG00000054860 IFNGR1 (ENSMFAG00000003984) IL22RA2 (ENSMFAG00000030047) ENSMFAG00000053800 IL20RA (ENSMFAG00000030911) SLC35D3 (ENSMFAG00000036990) PEX7 (ENSMFAG00000036835) MAP3K5 (ENSMFAG00000040944) MAP7 (ENSMFAG00000042781) BCLAF1 (ENSMFAG00000039754) MTFR2 (ENSMFAG00000038742) ##22 PDE7B (ENSMFAG00000032923) ENSMFAG00000065391 ENSMFAG00000007648 AHI1 (ENSMFAG00000033411) MYB (ENSMFAG00000036535) HBS1L (ENSMFAG00000003766) ALDH8A1 (ENSMFAG00000037548) ENSMFAG00000055793 SGK1 (ENSMFAG00000037310) SLC2A12 (ENSMFAG00000002658) TBPL1 (ENSMFAG00000040137) TCF21 (ENSMFAG00000060473) EYA4 (ENSMFAG00000037522) ENSMFAG00000042652 SLC18B1 (ENSMFAG00000040844) Rhesus MODERN SPECIES 14 HEBP2 (ENSMMUG00000000122) SMIM28 (ENSMMUG00000059337) ARFGEF3 (ENSMMUG00000019927) PERP (ENSMMUG00000049387) TNFAIP3 (ENSMMUG00000008869) OLIG3 (ENSMMUG00000047350) IFNGR1 (ENSMMUG00000062426) IL22RA2 (ENSMMUG00000013562) ENSMMUG00000062792 IL20RA (ENSMMUG00000013566) SLC35D3 (ENSMMUG00000055984) PEX7 (ENSMMUG00000016382) MAP3K5 (ENSMMUG00000016376) MAP7 (ENSMMUG00000016373) BCLAF1 (ENSMMUG00000003710) MTFR2 (ENSMMUG00000003709) ##22 PDE7B (ENSMMUG00000003708) ENSMMUG00000053328 ENSMMUG00000044284 AHI1 (ENSMMUG00000009368) MYB (ENSMMUG00000018166) HBS1L (ENSMMUG00000004802) ENSMMUG00000061139 ENSMMUG00000053927 SGK1 (ENSMMUG00000008140) ENSMMUG00000061787 SLC2A12 (ENSMMUG00000022921) TBPL1 (ENSMMUG00000022920) TCF21 (ENSMMUG00000064455) EYA4 (ENSMMUG00000005745) RPS12 (ENSMMUG00000013237) Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 342 ARFGEF3 (ENSMNEG00000037585) PERP (ENSMNEG00000038554) TNFAIP3 (ENSMNEG00000036248) ENSMNEG00000037249 ENSMNEG00000042980 OLIG3 (ENSMNEG00000019943) IFNGR1 (ENSMNEG00000042601) IL22RA2 (ENSMNEG00000032299) IL20RA (ENSMNEG00000042534) ENSMNEG00000038998 SLC35D3 (ENSMNEG00000023233) PEX7 (ENSMNEG00000043251) MAP3K5 (ENSMNEG00000043079) MAP7 (ENSMNEG00000042032) BCLAF1 (ENSMNEG00000035970) MTFR2 (ENSMNEG00000039364) ##22 PDE7B (ENSMNEG00000040328) AHI1 (ENSMNEG00000010215) MYB (ENSMNEG00000042074) HBS1L (ENSMNEG00000043942) ALDH8A1 (ENSMNEG00000044833) ENSMNEG00000041599 SGK1 (ENSMNEG00000031699) SLC2A12 (ENSMNEG00000040633) TBPL1 (ENSMNEG00000027053) TCF21 (ENSMNEG00000008781) EYA4 (ENSMNEG00000045456) ENSMNEG00000040181 SLC18B1 (ENSMNEG00000034054) VNN2 (ENSMNEG00000035056) ENSMNEG00000038694 Vervet Monkey MODERN SPECIES 4 HEBP2 (ENSCSAG00000017008) SMIM28 (ENSCSAG00000017006) ARFGEF3 (ENSCSAG00000016997) PERP (ENSCSAG00000016948) TNFAIP3 (ENSCSAG00000016944) ENSCSAG00000016938 OLIG3 (ENSCSAG00000000185) IFNGR1 (ENSCSAG00000016936) IL22RA2 (ENSCSAG00000016931) IL20RA (ENSCSAG00000016925) SLC35D3 (ENSCSAG00000016900) PEX7 (ENSCSAG00000016896) MAP3K5 (ENSCSAG00000016892) MAP7 (ENSCSAG00000016880) BCLAF1 (ENSCSAG00000016867) MTFR2 (ENSCSAG00000016854) ##22 PDE7B (ENSCSAG00000016849) AHI1 (ENSCSAG00000016829) ENSCSAG00000016818 MYB (ENSCSAG00000016815) HBS1L (ENSCSAG00000016791) ALDH8A1 (ENSCSAG00000016740) ENSCSAG00000016735 SGK1 (ENSCSAG00000016730) SLC2A12 (ENSCSAG00000016714) TBPL1 (ENSCSAG00000016709) TCF21 (ENSCSAG00000016705) EYA4 (ENSCSAG00000016701) ENSCSAG00000016696 SLC18B1 (ENSCSAG00000016693) VNN2 (ENSCSAG00000016687) Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 92 ENSGT00530000063484.a.c ENSGT00940000158448 ENSGT00940000154900.e.d.b ENSGT00940000153876.B.i ENSGT00940000154296.jb.b ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00940000157314.A ENSGT00910000146884 ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00950000183163.a.b.c ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.u.a ENSGT00390000018318.u.b.b ENSGT00940000156674 ENSGT00390000013823.b.c.a.b ENSGT00390000013823.b.c.b Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2152 TNFAIP3 (ENSRROG00000041571) ENSRROG00000041456 ENSRROG00000041568 ENSRROG00000036262 OLIG3 (ENSRROG00000019602) IFNGR1 (ENSRROG00000035100) IL22RA2 (ENSRROG00000002783) IL20RA (ENSRROG00000007730) ENSRROG00000038139 SLC35D3 (ENSRROG00000035626) PEX7 (ENSRROG00000036829) MAP3K5 (ENSRROG00000031252) ENSRROG00000013913 MAP7 (ENSRROG00000017668) BCLAF1 (ENSRROG00000040259) MTFR2 (ENSRROG00000034463) ##22 PDE7B (ENSRROG00000044535) Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2496 ENSRBIG00000032034 BCLAF1 (ENSRBIG00000029072) MTFR2 (ENSRBIG00000028360) ##22 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000160412 ENSGT00740000116829 ENSGT00530000064150 ENSGT00530000063484.a ENSGT00940000158448 ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00940000157314.A ENSGT00910000146884 ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00390000005830.u ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.u.b.b ENSGT00940000156674 ENSGT00390000013823.b.c.b ENSGT00390000013823.b.c.a.a Cebidae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000160412 ENSGT00740000116829 ENSGT00530000064150 ENSGT00530000063484.a ENSGT00940000158448 ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00940000157314.A ENSGT00910000146884 ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00390000005830.u ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.u.a ENSGT00940000156674 ENSGT00390000013823.b.c.b ENSGT00390000013823.b.c.a.a Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000160412 ENSGT00740000116829 ENSGT00530000064150 ENSGT00530000063484.a ENSGT00940000158448 ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00940000157314.A ENSGT00910000146884 ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00390000005830.u ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00390000014722.d ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.u.a ENSGT00940000156674 ENSGT00390000013823.b.c.b Capuchin MODERN SPECIES 65 SMIM28 (ENSCCAG00000022535) ARFGEF3 (ENSCCAG00000022363) PERP (ENSCCAG00000024325) TNFAIP3 (ENSCCAG00000026453) ENSCCAG00000022443 OLIG3 (ENSCCAG00000032329) IFNGR1 (ENSCCAG00000028495) IL22RA2 (ENSCCAG00000028239) IL20RA (ENSCCAG00000028945) ENSCCAG00000024812 SLC35D3 (ENSCCAG00000034349) PEX7 (ENSCCAG00000037288) MAP3K5 (ENSCCAG00000019841) MAP7 (ENSCCAG00000021966) BCLAF1 (ENSCCAG00000032457) MTFR2 (ENSCCAG00000027036) ##22 PDE7B (ENSCCAG00000036216) Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 91 IL20RA (ENSSBOG00000030873) SLC35D3 (ENSSBOG00000028578) PEX7 (ENSSBOG00000029138) MAP3K5 (ENSSBOG00000031833) MAP7 (ENSSBOG00000035407) ENSSBOG00000000077 BCLAF1 (ENSSBOG00000033973) MTFR2 (ENSSBOG00000019957) ##22 PDE7B (ENSSBOG00000027341) AHI1 (ENSSBOG00000035373) MYB (ENSSBOG00000028999) ENSSBOG00000033605 ENSSBOG00000019696 ALDH8A1 (ENSSBOG00000003193) SGK1 (ENSSBOG00000033468) SLC2A12 (ENSSBOG00000023577) TBPL1 (ENSSBOG00000022803) TCF21 (ENSSBOG00000034676) ENSSBOG00000024565 EYA4 (ENSSBOG00000029920) ENSSBOG00000023133 SLC18B1 (ENSSBOG00000030940) ENSSBOG00000029580 Marmoset MODERN SPECIES 16 OLIG3 (ENSCJAG00000019011) ENSCJAG00000085578 ENSCJAG00000084731 ENSCJAG00000076925 IFNGR1 (ENSCJAG00000069510) IL22RA2 (ENSCJAG00000018991) IL20RA (ENSCJAG00000018982) ENSCJAG00000078995 SLC35D3 (ENSCJAG00000008524) PEX7 (ENSCJAG00000008514) ENSCJAG00000078792 MAP3K5 (ENSCJAG00000008383) MAP7 (ENSCJAG00000008294) ENSCJAG00000071860 BCLAF1 (ENSCJAG00000008200) MTFR2 (ENSCJAG00000008189) ##22 PDE7B (ENSCJAG00000008164) ENSCJAG00000070725 ENSCJAG00000074971 AHI1 (ENSCJAG00000008068) ENSCJAG00000071466 MYB (ENSCJAG00000007798) ENSCJAG00000080967 HBS1L (ENSCJAG00000007678) ALDH8A1 (ENSCJAG00000007652) ENSCJAG00000082917 SGK1 (ENSCJAG00000002727) SLC2A12 (ENSCJAG00000038249) TBPL1 (ENSCJAG00000002794) TCF21 (ENSCJAG00000058563) ENSCJAG00000078241 Mas night monkey MODERN SPECIES 506 SMIM28 (ENSANAG00000033494) ARFGEF3 (ENSANAG00000034514) ENSANAG00000019730 PERP (ENSANAG00000036824) TNFAIP3 (ENSANAG00000029324) ENSANAG00000000023 OLIG3 (ENSANAG00000019677) IFNGR1 (ENSANAG00000022563) IL22RA2 (ENSANAG00000034970) IL20RA (ENSANAG00000032920) SLC35D3 (ENSANAG00000021760) PEX7 (ENSANAG00000022204) MAP3K5 (ENSANAG00000037690) MAP7 (ENSANAG00000022874) BCLAF1 (ENSANAG00000035003) MTFR2 (ENSANAG00000023880) ##22 PDE7B (ENSANAG00000033089) AHI1 (ENSANAG00000028946) MYB (ENSANAG00000026941) ENSANAG00000030478 HBS1L (ENSANAG00000038076) ALDH8A1 (ENSANAG00000026843) SGK1 (ENSANAG00000036955) SLC2A12 (ENSANAG00000026241) TBPL1 (ENSANAG00000033371) TCF21 (ENSANAG00000021568) EYA4 (ENSANAG00000023112) RPS12 (ENSANAG00000030986) SLC18B1 (ENSANAG00000026852) ENSANAG00000024271 ENSANAG00000029064 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 51 ENSGT00950000182963.a.a ENSGT00940000160412 ENSGT00740000116829 ENSGT00530000064150 ENSGT00530000063484.a ENSGT00940000158448 ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00940000157314.A ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.v ENSGT00940000156674 ENSGT00390000013823.b.c.a.b ENSGT00390000013823.b.c.b ENSGT00390000013823.b.c.a.a Xenarthra ANCESTRAL SPECIES 439 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00940000157314.A ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 Armadillo MODERN SPECIES 2554 OLIG3 (ENSDNOG00000042405) ENSDNOG00000033108 ENSDNOG00000047511 ENSDNOG00000049724 IL22RA2 (ENSDNOG00000035934) IL20RA (ENSDNOG00000034429) SLC35D3 (ENSDNOG00000036032) PEX7 (ENSDNOG00000039698) MAP3K5 (ENSDNOG00000019294) MAP7 (ENSDNOG00000013217) BCLAF1 (ENSDNOG00000019473) ENSDNOG00000032576 ##22 PDE7B (ENSDNOG00000041927) AHI1 (ENSDNOG00000003425) Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 55 ENSGT00500000044870.a ENSGT00950000182963.a.a ENSGT00940000160412 ENSGT00530000064150 ENSGT00530000063484.a ENSGT00940000158448 ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00940000157314.A ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.u.b.b ENSGT00940000156674 ENSGT00390000013823.b.c.b ENSGT00390000013823.b.c.a.a ENSGT00950000182934.a.b Tenrec MODERN SPECIES 4180 ENSETEG00000015870 ##22 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 51 ENSGT00500000044870.a ENSGT00950000182963.a.a ENSGT00940000160412 ENSGT00530000064150 ENSGT00530000063484.a ENSGT00940000158448 ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000161124 ENSGT00940000157314.A ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.u.b.b ENSGT00940000156674 ENSGT00390000013823.b.c.b ENSGT00390000013823.b.c.a.a ENSGT00950000182934.a.b Hyrax MODERN SPECIES 10521 MTFR2 (ENSPCAG00000004959) ##22 Elephant MODERN SPECIES 1 HEBP2 (ENSLAFG00000013501) ARFGEF3 (ENSLAFG00000001882) PERP (ENSLAFG00000000047) TNFAIP3 (ENSLAFG00000011428) OLIG3 (ENSLAFG00000005655) IFNGR1 (ENSLAFG00000029501) IL22RA2 (ENSLAFG00000001324) ENSLAFG00000007603 SLC35D3 (ENSLAFG00000016308) PEX7 (ENSLAFG00000007598) ENSLAFG00000032335 MAP3K5 (ENSLAFG00000000588) MAP7 (ENSLAFG00000004444) ENSLAFG00000032469 BCLAF1 (ENSLAFG00000015982) MTFR2 (ENSLAFG00000031342) ##22 PDE7B (ENSLAFG00000018738) AHI1 (ENSLAFG00000017402) MYB (ENSLAFG00000018350) HBS1L (ENSLAFG00000007835) ALDH8A1 (ENSLAFG00000007832) SGK1 (ENSLAFG00000012698) SLC2A12 (ENSLAFG00000014066) TBPL1 (ENSLAFG00000014064) TCF21 (ENSLAFG00000009507) EYA4 (ENSLAFG00000012196) RPS12 (ENSLAFG00000007933) SLC18B1 (ENSLAFG00000001053) ENSLAFG00000026575 ENSLAFG00000017269 TAAR1 (ENSLAFG00000008959) Platypus MODERN SPECIES 11 HEBP2 (ENSOANG00000049313) SMIM28 (ENSOANG00000036691) ARFGEF3 (ENSOANG00000014799) PERP (ENSOANG00000047720) TNFAIP3 (ENSOANG00000014797) OLIG3 (ENSOANG00000014796) ENSOANG00000050067 ENSOANG00000005256 IL20RA (ENSOANG00000005257) SLC35D3 (ENSOANG00000005259) PEX7 (ENSOANG00000011627) MAP3K5 (ENSOANG00000009449) MAP7 (ENSOANG00000009448) BCLAF1 (ENSOANG00000009444) ENSOANG00000009443 MTFR2 (ENSOANG00000009442) ##22 PDE7B (ENSOANG00000009441) AHI1 (ENSOANG00000031640) MYB (ENSOANG00000002777) HBS1L (ENSOANG00000002684) ALDH8A1 (ENSOANG00000051194) SGK1 (ENSOANG00000013095) SLC2A12 (ENSOANG00000013096) TBPL1 (ENSOANG00000013097) TCF21 (ENSOANG00000013098) EYA4 (ENSOANG00000001885) RPS12 (ENSOANG00000001886) SLC18B1 (ENSOANG00000022303) VNN1 (ENSOANG00000005318) TAAR2 (ENSOANG00000005321) ENSOANG00000040179 Anura ANCESTRAL SPECIES 40 ENSGT00500000044870.a ENSGT00950000182963.a.a ENSGT00940000160412 ENSGT00530000064150 ENSGT00530000063484.a ENSGT00940000158448 ENSGT00940000160850 ENSGT00510000048929 ENSGT00940000157314.A ENSGT00940000160083 ENSGT00940000157264 ENSGT00940000159155 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00940000167949.a ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000164496 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318 ENSGT00940000156674 ENSGT00390000013823.b.a ENSGT00950000182934.a.b Frog MODERN SPECIES 5 ENSXETG00000031627 pln (ENSXETG00000043179) cep85l (ENSXETG00000012874) ##37 ENSXETG00000041871 ENSXETG00000035493 ENSXETG00000045413 mcm9 (ENSXETG00000012868) asf1a (ENSXETG00000035875) ankrd60 (ENSXETG00000037038) fam184a (ENSXETG00000022616) ENSXETG00000043468 man1a1 (ENSXETG00000022600) ENSXETG00000036917 gja1 (ENSXETG00000044635) ENSXETG00000040434 mtfr2 (ENSXETG00000017718) ##22 pde7b (ENSXETG00000017719) ahi1 (ENSXETG00000003723) myb (ENSXETG00000003725) hbs1l (ENSXETG00000003726) aldh8a1 (ENSXETG00000003727) sgk1 (ENSXETG00000000124) slc2a12 (ENSXETG00000000118) tbpl1 (ENSXETG00000000116) tcf21 (ENSXETG00000000114) ENSXETG00000038619 eya4 (ENSXETG00000000110) rps12 (ENSXETG00000000109) slc18b1 (ENSXETG00000000108) vnn2 (ENSXETG00000039983) taar1 (ENSXETG00000039183) Leishan spiny toad MODERN SPECIES 7 ENSLLEG00000025653 ENSLLEG00000025754 ENSLLEG00000025771 ENSLLEG00000025779 ENSLLEG00000025827 ENSLLEG00000026040 SLC35D3 (ENSLLEG00000026167) ENSLLEG00000026200 PEX7 (ENSLLEG00000026217) ENSLLEG00000026340 ENSLLEG00000026365 MAP3K5 (ENSLLEG00000026418) MAP7 (ENSLLEG00000026922) ENSLLEG00000027316 BCLAF1 (ENSLLEG00000027482) MTFR2 (ENSLLEG00000027567) ##22 ENSLLEG00000027680 ENSLLEG00000027702 MYB (ENSLLEG00000027735) ENSLLEG00000027841 ALDH8A1 (ENSLLEG00000027952) ENSLLEG00000005050 TBPL1 (ENSLLEG00000005117) ENSLLEG00000005130 ENSLLEG00000005139 ERO1B (ENSLLEG00000005181) GPR137B (ENSLLEG00000005265) ENSLLEG00000005311 ENSLLEG00000005316 ENSLLEG00000005328 NID1 (ENSLLEG00000005380) Coelacanth MODERN SPECIES 1782 MAP7 (ENSLACG00000001292) BCLAF1 (ENSLACG00000006728) armc1l (ENSLACG00000008097) ENSLACG00000022165 ##22 PDE7B (ENSLACG00000009480) Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES 69 ENSGT01090000260082.d.b ENSGT00390000004172 ENSGT00940000157993 ENSGT00530000063558.B ENSGT00390000011877 ENSGT00390000013931 ENSGT01030000234626.B ENSGT00550000074878 ENSGT00940000157723 ENSGT00390000004348 ENSGT00950000182985.b.a ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00940000167949 ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00940000164948 ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318 ENSGT00940000156674 ENSGT00940000171557 ENSGT00940000159157 ENSGT00560000077266.a Neopterygii ANCESTRAL SPECIES 88 ENSGT00940000155086.A ENSGT00530000063558.B ENSGT00390000011877 ENSGT00390000013931 ENSGT01030000234626.B ENSGT00550000074878 ENSGT00940000157723 ENSGT00390000004348 ENSGT00950000182985.b.a ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00940000167949 ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00940000164948 ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318 ENSGT00940000156674 ENSGT00940000165353 ENSGT00940000159157 ENSGT00560000077266.a Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 183 ENSGT00530000063558.B ENSGT00390000011877 ENSGT00390000013931 ENSGT01030000234626.B ENSGT00550000074878 ENSGT00940000157723 ENSGT00390000004348 ENSGT00950000182985.b.a ENSGT00950000182941.a.a.a.a ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00940000164948 ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318 ENSGT00940000165353 ENSGT00940000159157 ENSGT00560000077266.a ENSGT00950000182802.C ENSGT00950000183107.a.a Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 140 ENSGT00940000155086.B ENSGT00940000166976 ENSGT00530000063558.B ENSGT00390000011877 ENSGT00390000013931 ENSGT01030000234626.B ENSGT00550000074878 ENSGT00940000157723 ENSGT00390000004348 ENSGT00950000182985.b.a ENSGT00950000182941.a.a.a.a ENSGT00940000164948 ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156248 ENSGT00650000094590 ENSGT01080000257573 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318 ENSGT00940000171557 ENSGT00940000165353 ENSGT00940000159157 Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 320 ENSGT00940000164948 ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318 ENSGT00940000171557 ENSGT00940000165353 ENSGT00940000159157 ENSGT00560000077266.a ENSGT01040000240523 ENSGT00950000183107.a.a Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 185 ENSGT00940000164948 ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156248.c ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318 ENSGT00940000157260.t ENSGT00940000159157 ENSGT00560000077266.a ENSGT01040000240523 ENSGT00950000183107.a.a Denticle herring DUPLICATION Denticle herring MODERN SPECIES 5 lbr (ENSDCDG00000020381) enah (ENSDCDG00000020363) srp9 (ENSDCDG00000020362) ephx1 (ENSDCDG00000020359) slc5a6a (ENSDCDG00000019560) rpl7l1 (ENSDCDG00000019527) NCOA1 (ENSDCDG00000019520) nus1 (ENSDCDG00000019516) ENSDCDG00000019512 ginm1 (ENSDCDG00000019509) katna1 (ENSDCDG00000019507) ENSDCDG00000011719 ENSDCDG00000011718 ENSDCDG00000011716 armc1l (ENSDCDG00000011712) mtfr2 (ENSDCDG00000011709) ##22 ENSDCDG00000011669 ENSDCDG00000011667 srp9 (ENSDCDG00000011664) ephx1 (ENSDCDG00000011653) slc5a6a (ENSDCDG00000011643) rpl7l1 (ENSDCDG00000011624) NCOA1 (ENSDCDG00000010773) nus1 (ENSDCDG00000010703) ENSDCDG00000010690 ginm1 (ENSDCDG00000010672) katna1 (ENSDCDG00000010536) ENSDCDG00000010510 ENSDCDG00000010503 ENSDCDG00000010492 armc1l (ENSDCDG00000010419) Denticle herring MODERN SPECIES 5 ENSDCDG00000011669 ENSDCDG00000011667 srp9 (ENSDCDG00000011664) ephx1 (ENSDCDG00000011653) slc5a6a (ENSDCDG00000011643) rpl7l1 (ENSDCDG00000011624) NCOA1 (ENSDCDG00000010773) nus1 (ENSDCDG00000010703) ENSDCDG00000010690 ginm1 (ENSDCDG00000010672) katna1 (ENSDCDG00000010536) ENSDCDG00000010510 ENSDCDG00000010503 ENSDCDG00000010492 armc1l (ENSDCDG00000010419) mtfr2 (ENSDCDG00000010395) ##22 myb (ENSDCDG00000010198) hbs1l (ENSDCDG00000010112) SLC35F1 (ENSDCDG00000010046) ENSDCDG00000010024 si:dkeyp-114g9.1 (ENSDCDG00000010008) ENSDCDG00000009984 ##37 Atlantic herring MODERN SPECIES 6 ENSCHAG00000018805 CAPN3 (ENSCHAG00000018819) CAPN3 (ENSCHAG00000019187) nrbp1 (ENSCHAG00000019332) ENSCHAG00000019581 ##18 ENSCHAG00000019587 ENSCHAG00000019616 rhag (ENSCHAG00000019679) ENSCHAG00000019951 ENSCHAG00000019969 ENSCHAG00000019981 ENSCHAG00000020021 ENSCHAG00000020032 ENSCHAG00000020057 armc1l (ENSCHAG00000020093) mtfr2 (ENSCHAG00000020102) ##22 PDE7B (ENSCHAG00000020119) myb (ENSCHAG00000020460) hbs1l (ENSCHAG00000020630) aldh8a1 (ENSCHAG00000022413) ENSCHAG00000022437 SGK1 (ENSCHAG00000022452) slc2a12 (ENSCHAG00000022555) tbpl1 (ENSCHAG00000022560) tcf21 (ENSCHAG00000022568) eya4 (ENSCHAG00000022588) rps12 (ENSCHAG00000022894) ENSCHAG00000022901 ENSCHAG00000022904 sh3bgrl2 (ENSCHAG00000022916) LCA5 (ENSCHAG00000022924) Otophysi ANCESTRAL SPECIES 178 ENSGT00950000183038.a.b.a.h ENSGT00390000010523.d ENSGT00940000164745.i.a ENSGT00950000183167.a.b.b.b ENSGT00940000156832 ENSGT00940000156211.b ENSGT00390000009842 ENSGT00390000012948.b ENSGT00940000164771.b ENSGT00390000013978.d ENSGT01030000235094 ENSGT00950000183178.a ENSGT00390000002174.a ENSGT01100000263547.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000164948 ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000156248 ENSGT01080000257573 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318 ENSGT00940000165353 ENSGT00940000159157 ENSGT00560000077266.a ENSGT01040000240523 ENSGT00950000183107.a.a Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 159 ENSGT00940000156211.b ENSGT00390000009842 ENSGT00390000012948.b ENSGT00940000164771.b ENSGT00390000013978.d ENSGT01030000235094 ENSGT00950000183178.a ENSGT00390000002174.a ENSGT01100000263547.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000164948 ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318 ENSGT00940000166598 ENSGT00940000157260.t ENSGT00940000159157 ENSGT00560000077266.a ENSGT01040000240523 ENSGT00950000183107.a.a Channel catfish MODERN SPECIES 6 rprm3 (ENSIPUG00000011547) zgc:56699 (ENSIPUG00000011498) letmd1 (ENSIPUG00000011472) cd63 (ENSIPUG00000011407) ENSIPUG00000011391 mylk2 (ENSIPUG00000011370) tpx2 (ENSIPUG00000011232) trappc6b (ENSIPUG00000011166) plagx (ENSIPUG00000011159) PAN2 (ENSIPUG00000011065) ENSIPUG00000011048 ORMDL2 (ENSIPUG00000011026) nemp1 (ENSIPUG00000011012) ENSIPUG00000010976 armc1l (ENSIPUG00000010926) mtfr2 (ENSIPUG00000010892) ##22 myb (ENSIPUG00000010846) hbs1l (ENSIPUG00000010748) aldh8a1 (ENSIPUG00000010718) SGK1 (ENSIPUG00000010684) slc2a12 (ENSIPUG00000010652) tbpl1 (ENSIPUG00000010601) tcf21 (ENSIPUG00000010589) eya4 (ENSIPUG00000010471) rps12 (ENSIPUG00000010390) zgc:153284 (ENSIPUG00000010347) sh3bgrl2 (ENSIPUG00000010327) lca5 (ENSIPUG00000010297) hmgn3 (ENSIPUG00000010282) phip (ENSIPUG00000010181) ENSIPUG00000010135 Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 35 ENSGT00940000156832 ENSGT00940000156211.b ENSGT00390000009842 ENSGT00390000012948.b ENSGT00940000164771.b ENSGT00390000013978.d ENSGT01030000235094 ENSGT00950000183178.a ENSGT00390000002174.a ENSGT01100000263547.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000164948 ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318 ENSGT00940000165353 ENSGT00940000159157 ENSGT00560000077266.a ENSGT01040000240523 ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00530000065281 Characoidei ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000156832 ENSGT00940000156211.b ENSGT00390000009842 ENSGT00390000012948.b ENSGT00940000164771.b ENSGT00390000013978.d ENSGT01030000235094 ENSGT00950000183178.a ENSGT00390000002174.a ENSGT01100000263547.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000164948 ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318 ENSGT00940000165353 ENSGT00940000159157 ENSGT00560000077266.a ENSGT01040000240523 ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00530000065281 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 683 sh2b1 (ENSPNAG00000018309) pitpnbl (ENSPNAG00000018353) cabp5b (ENSPNAG00000006420) ENSPNAG00000018415 SEZ6L2 (ENSPNAG00000018429) kctd13 (ENSPNAG00000005017) hirip3 (ENSPNAG00000018496) zgc:112038 (ENSPNAG00000018511) ENSPNAG00000018608 cdipt (ENSPNAG00000018634) ENSPNAG00000018645 nlk1 (ENSPNAG00000018687) tlcd3ba (ENSPNAG00000018696) ENSPNAG00000018717 armc1l (ENSPNAG00000018742) mtfr2 (ENSPNAG00000005333) ##22 Mexicana tetra MODERN SPECIES 6 rprm3 (ENSAMXG00000042213) zgc:56699 (ENSAMXG00000038346) letmd1 (ENSAMXG00000029546) cd63 (ENSAMXG00000037489) ENSAMXG00000042604 tpx2 (ENSAMXG00000005456) trappc6b (ENSAMXG00000034566) plagx (ENSAMXG00000025935) PAN2 (ENSAMXG00000005418) ENSAMXG00000041004 ormdl2 (ENSAMXG00000034523) nemp1 (ENSAMXG00000035957) nemp1 (ENSAMXG00000005407) ENSAMXG00000005394 armc1l (ENSAMXG00000004220) mtfr2 (ENSAMXG00000004238) ##22 myb (ENSAMXG00000004244) hbs1l (ENSAMXG00000004260) eya4 (ENSAMXG00000004355) rps12 (ENSAMXG00000035998) ENSAMXG00000039895 sh3bgrl2 (ENSAMXG00000037764) LCA5 (ENSAMXG00000039992) hmgn3 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ENSGT00390000018318.r.b ENSGT00940000171557 ENSGT00560000077266.a.a ENSGT01040000240523.b ENSGT00950000183107.a.a.f ENSGT00530000065281.a Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000010523.d.b ENSGT00940000164745.i.a.a ENSGT00950000183167.a.b.b.b.f ENSGT00940000156832.db ENSGT00940000156211.b.h ENSGT00390000009842.h ENSGT00390000012948.b.w ENSGT00940000164771.b.c ENSGT00390000013978.d.a ENSGT01030000235094.a ENSGT00950000183178.a.w ENSGT00390000002174.a.h ENSGT00390000004585.f ENSGT01100000263547.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000164948.c ENSGT00950000183215.c.a.a.i ##22 ENSGT00940000156248.b ENSGT01080000257573 ENSGT00940000156274.k ENSGT00940000156799.a ENSGT00940000155726.mb ENSGT00940000159614.a ENSGT00940000155712.i ENSGT00940000160174.h ENSGT00950000182978.A.a.a.c ENSGT00390000018318.r.b ENSGT00940000171557 ENSGT00560000077266.a.a ENSGT01040000240523.a ENSGT00950000183107.a.a.f ENSGT00530000065281.a Golden-line barbel MODERN SPECIES 28 armc1l (ENSSGRG00000025453) mtfr2 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SPECIES 16 ENSGT00520000055570.B.l ENSGT00940000171406 ENSGT00530000064185 ENSGT00940000155936.a.b ENSGT00940000155678 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000161165 ENSGT00390000007551 ENSGT00940000157463.b ENSGT01010000229923 ENSGT00390000001965 ENSGT00390000004348 ENSGT00950000182985.b.a ENSGT00950000182941.a.a.a.a ENSGT00940000164948 ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00940000163520.A.a.a.a.a.a.a.g.a.b.b ENSGT00970000193390.c.a.a.b ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318 ENSGT00940000157260.s ENSGT00940000166622 ENSGT00940000159157 Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000153433.B.a.a ENSGT00410000025698.a ENSGT00940000157219.e ENSGT00520000055570.B.l ENSGT00940000155936.a.b ENSGT00940000155678 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000161165 ENSGT00390000007551 ENSGT00940000157463.b ENSGT00390000001965 ENSGT00390000004348 ENSGT00950000182985.b.a ENSGT00950000182941.a.a.a.a ENSGT00940000164948 ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712.l ENSGT00940000155712.k ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318 ENSGT00940000157260.s ENSGT00940000166622 ENSGT00940000159157 ENSGT00560000077266.a Tetraodon MODERN SPECIES 5 si:ch73-21k16.4 (ENSTNIG00000016304) LPIN1 (ENSTNIG00000016305) GNPAT (ENSTNIG00000016306) ENSTNIG00000000786 ENSTNIG00000016307 itsn2a (ENSTNIG00000016308) DDX1 (ENSTNIG00000016309) nbas (ENSTNIG00000016310) lratd1 (ENSTNIG00000001205) ENSTNIG00000016311 sec63 (ENSTNIG00000016312) iyd (ENSTNIG00000016313) ppp1r14c (ENSTNIG00000016314) ENSTNIG00000016315 armc1l (ENSTNIG00000016316) mtfr2 (ENSTNIG00000016317) ##22 PDE7B (ENSTNIG00000016318) myb (ENSTNIG00000016319) hbs1l (ENSTNIG00000016320) aldh8a1 (ENSTNIG00000016321) SGK1 (ENSTNIG00000016322) 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ENSTRUG00000019648 ENSTRUG00000005039 sh3bgrl2 (ENSTRUG00000022881) ENSTRUG00000021948 Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00520000055570.B.l ENSGT00940000171406 ENSGT00530000064185 ENSGT00940000155936.a.b ENSGT00940000155678 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000161165 ENSGT00390000007551 ENSGT00940000157463.b ENSGT01010000229923 ENSGT00390000001965 ENSGT00390000004348 ENSGT00950000182985.b.a ENSGT00950000182941.a.a.a.a ENSGT00940000164948 ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00940000163520.A.a.a.a.a.a.a.g.a.b.b ENSGT00970000193390.c.a.a.b ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318 ENSGT00940000157260.s ENSGT00940000166622 ENSGT00940000159157 Ballan wrasse MODERN SPECIES 121 ENSLBEG00000003550 tmem63a (ENSLBEG00000003473) mrps18a (ENSLBEG00000003391) rsph9 (ENSLBEG00000003432) vegfab (ENSLBEG00000003354) naga (ENSLBEG00000003326) ENSLBEG00000003295 wdr26b (ENSLBEG00000003265) fez2b (ENSLBEG00000003220) ppp1r14c (ENSLBEG00000003174) ENSLBEG00000003050 armc1l (ENSLBEG00000002980) mtfr2 (ENSLBEG00000002959) ##22 PDE7B (ENSLBEG00000002915) myb (ENSLBEG00000002889) hbs1l (ENSLBEG00000002784) aldh8a1 (ENSLBEG00000002728) SGK1 (ENSLBEG00000002663) slc2a12 (ENSLBEG00000002615) tbpl1 (ENSLBEG00000002554) tcf21 (ENSLBEG00000002535) eya4 (ENSLBEG00000002488) rps12 (ENSLBEG00000002426) ENSLBEG00000002373 ENSLBEG00000002356 sh3bgrl2 (ENSLBEG00000002334) ENSLBEG00000002318 fam167ab (ENSLBEG00000002269) Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00520000055570.B.l ENSGT00940000171406 ENSGT00530000064185 ENSGT00940000155936.a.b ENSGT00940000155678 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000161165 ENSGT00390000007551 ENSGT00940000157463.b ENSGT01010000229923 ENSGT00390000001965 ENSGT00390000004348 ENSGT00950000182985.b.a ENSGT00950000182941.a.a.a.a ENSGT00940000164948 ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 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ENSGT00940000157260.s ENSGT00940000166622 ENSGT00940000159157 Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00520000055570.B.l ENSGT00940000171406 ENSGT00530000064185 ENSGT00940000155936.a.b ENSGT00940000155678 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000161165 ENSGT00390000007551 ENSGT00940000157463.b ENSGT01010000229923 ENSGT00390000001965 ENSGT00390000004348 ENSGT00950000182985.b.a ENSGT00950000182941.a.a.a.a ENSGT00940000164948 ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00940000163520.A.a.a.a.a.a.a.g.a.b.b ENSGT00970000193390.c.a.a.b ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318 ENSGT00940000157260.s ENSGT00940000166622 ENSGT00940000159157 Pike perch MODERN SPECIES 4 si:ch73-21k16.4 (ENSSLUG00000018140) LPIN1 (ENSSLUG00000018121) ENSSLUG00000018085 ENSSLUG00000018077 itsn2a (ENSSLUG00000017134) DDX1 (ENSSLUG00000016917) nbas (ENSSLUG00000014187) 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SPECIES 18 mixl1 (ENSGACG00000011351) lin9 (ENSGACG00000011327) ENSGACG00000011324 parp1 (ENSGACG00000011280) itsn2a (ENSGACG00000011256) DDX1 (ENSGACG00000011162) nbas (ENSGACG00000011136) lratd1 (ENSGACG00000011134) MTLN (ENSGACG00000011129) ENSGACG00000011123 sec63 (ENSGACG00000011115) iyd (ENSGACG00000011113) ppp1r14c (ENSGACG00000011108) ENSGACG00000011098 armc1l (ENSGACG00000011079) mtfr2 (ENSGACG00000011073) ##22 PDE7B (ENSGACG00000011060) myb (ENSGACG00000011054) hbs1l (ENSGACG00000011035) aldh8a1 (ENSGACG00000011008) SGK1 (ENSGACG00000010973) slc2a12 (ENSGACG00000010968) tbpl1 (ENSGACG00000010959) tcf21 (ENSGACG00000010957) ENSGACG00000010950 eya4 (ENSGACG00000010932) rps12 (ENSGACG00000010916) ENSGACG00000010912 ENSGACG00000010905 sh3bgrl2 (ENSGACG00000010894) ENSGACG00000010887 Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00410000025698.a ENSGT00940000157219.e ENSGT00520000055570.B.l ENSGT00530000064185 ENSGT00940000155936.a.b ENSGT00940000155678 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000161165 ENSGT00390000007551 ENSGT00940000157463.b ENSGT00390000001965 ENSGT00390000004348 ENSGT00950000182985.b.a ENSGT00950000182941.a.a.a.a ENSGT00940000164948 ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00940000163520.A.a.a.a.a.a.a.g.a.b.b ENSGT00970000193390.c.a.a.b ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318 ENSGT00940000157260.s ENSGT00940000166622 ENSGT00940000159157 Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00410000025698.a ENSGT00940000157219.e ENSGT00520000055570.B.l ENSGT00530000064185 ENSGT00940000155936.a.b ENSGT00940000155678 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000161165 ENSGT00390000007551 ENSGT00940000157463.b ENSGT00390000001965 ENSGT00390000004348 ENSGT00950000182985.b.a ENSGT00950000182941.a.a.a.a ENSGT00940000164948 ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156248 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ENSGT00940000159157 ENSGT00560000077266.a Climbing perch MODERN SPECIES 15 si:ch73-21k16.4 (ENSATEG00000003701) ENSATEG00000003757 ENSATEG00000028510 ENSATEG00000029757 DDX1 (ENSATEG00000003965) nbas (ENSATEG00000004094) lratd1 (ENSATEG00000004217) ENSATEG00000004228 ENSATEG00000028701 ENSATEG00000029724 sec63 (ENSATEG00000004251) ENSATEG00000004277 ENSATEG00000026982 ENSATEG00000004334 armc1l (ENSATEG00000004348) mtfr2 (ENSATEG00000004387) ##22 ENSATEG00000004395 myb (ENSATEG00000004447) hbs1l (ENSATEG00000004459) aldh8a1 (ENSATEG00000004552) SGK1 (ENSATEG00000004646) slc2a12 (ENSATEG00000004712) tbpl1 (ENSATEG00000004722) tcf21 (ENSATEG00000004746) ENSATEG00000004751 eya4 (ENSATEG00000004763) rps12 (ENSATEG00000004850) ENSATEG00000026850 ENSATEG00000004901 ENSATEG00000005031 sh3bgrl2 (ENSATEG00000005083) Siamese fighting fish MODERN SPECIES 13 eya4 (ENSBSLG00000024236) tcf21 (ENSBSLG00000024175) tbpl1 (ENSBSLG00000024172) slc2a12 (ENSBSLG00000024164) DDX1 (ENSBSLG00000024072) nbas 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ENSGT00530000064185 ENSGT00940000155936.a.b ENSGT00940000155678 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000161165 ENSGT00390000007551 ENSGT00940000157463.b ENSGT00390000001965 ENSGT00390000004348 ENSGT00950000182985.b.a ENSGT00950000182941.a.a.a.a ENSGT00940000164948 ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00940000163520.A.a.a.a.a.a.a.g.a.b.b ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318.d ENSGT00940000157260.s ENSGT00940000166622 ENSGT00940000159157 ENSGT00560000077266.a Greater amberjack MODERN SPECIES 10 si:ch73-21k16.4 (ENSSDUG00000011998) LPIN1 (ENSSDUG00000012032) ENSSDUG00000012152 ENSSDUG00000012233 itsn2a (ENSSDUG00000012253) DDX1 (ENSSDUG00000012334) nbas (ENSSDUG00000012449) lratd1 (ENSSDUG00000012611) MTLN (ENSSDUG00000012621) ENSSDUG00000012637 sec63 (ENSSDUG00000012649) iyd (ENSSDUG00000012760) ppp1r14c (ENSSDUG00000012796) 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ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00970000193390.c.a.a.b ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318 ENSGT00940000171557 ENSGT00940000166622 ENSGT00940000159157 ENSGT00560000077266.a Turbot MODERN SPECIES 12 esrrgb (ENSSMAG00000009541) si:ch73-21k16.4 (ENSSMAG00000009585) ENSSMAG00000009604 ENSSMAG00000009893 ENSSMAG00000009911 DDX1 (ENSSMAG00000010094) nbas (ENSSMAG00000010197) lratd1 (ENSSMAG00000010341) ENSSMAG00000010354 ENSSMAG00000010361 sec63 (ENSSMAG00000010393) ENSSMAG00000010471 ENSSMAG00000037515 ENSSMAG00000010495 armc1l (ENSSMAG00000010515) mtfr2 (ENSSMAG00000010526) ##22 ENSSMAG00000010546 myb (ENSSMAG00000010585) hbs1l (ENSSMAG00000010621) aldh8a1 (ENSSMAG00000010687) SGK1 (ENSSMAG00000010714) slc2a12 (ENSSMAG00000010765) tbpl1 (ENSSMAG00000010781) tcf21 (ENSSMAG00000036326) ENSSMAG00000025921 ENSSMAG00000010818 eya4 (ENSSMAG00000010837) rps12 (ENSSMAG00000011021) ENSSMAG00000011069 ENSSMAG00000011076 sh3bgrl2 (ENSSMAG00000011107) Tongue sole MODERN SPECIES 17 esrrgb (ENSCSEG00000002536) si:ch73-21k16.4 (ENSCSEG00000002545) LPIN1 (ENSCSEG00000002548) ENSCSEG00000002557 itsn2a (ENSCSEG00000002594) DDX1 (ENSCSEG00000002630) nbas (ENSCSEG00000002658) ENSCSEG00000002682 lratd1 (ENSCSEG00000002687) MTLN (ENSCSEG00000002691) sec63 (ENSCSEG00000002702) iyd (ENSCSEG00000002719) ppp1r14c (ENSCSEG00000002723) ENSCSEG00000002738 armc1l (ENSCSEG00000002744) mtfr2 (ENSCSEG00000002748) ##22 PDE7B (ENSCSEG00000002754) myb (ENSCSEG00000002762) hbs1l (ENSCSEG00000002794) aldh8a1 (ENSCSEG00000002843) EPM2A (ENSCSEG00000002851) ENSCSEG00000002854 fbxo30b (ENSCSEG00000002881) GRM1 (ENSCSEG00000002884) rab32a (ENSCSEG00000002895) ENSCSEG00000002897 stxbp5a (ENSCSEG00000002905) SAMD5 (ENSCSEG00000002921) sash1a (ENSCSEG00000002925) usta (ENSCSEG00000002936) ENSCSEG00000002943 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000157219.e ENSGT00520000055570.B.l ENSGT00940000171406 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Poecilia ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00410000025698.a ENSGT00940000157219.e ENSGT00520000055570.B.l ENSGT00940000164632.b.b ENSGT00940000155936.a.b ENSGT00940000155678 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000161165 ENSGT00390000007551 ENSGT00940000157463.b ENSGT00390000001965 ENSGT00390000004348 ENSGT00950000182985.b.a ENSGT00950000182941.a.a.a.a ENSGT00940000164948 ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00970000193390.c.a.a.b ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318 ENSGT00940000157260.s ENSGT00940000166622 ENSGT00940000159157 ENSGT00560000077266.a NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00410000025698.a ENSGT00940000157219.e ENSGT00520000055570.B.l ENSGT00940000164632.b.b ENSGT00940000155936.a.b ENSGT00940000155678 ENSGT00390000012474.o ENSGT00940000161165 ENSGT00390000007551 ENSGT00940000157463.b ENSGT00390000001965 ENSGT00390000004348 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ENSGT00410000025698.a ENSGT00940000157219.e ENSGT00520000055570.B.l ENSGT00940000164632.b.b ENSGT00940000155936.a.b ENSGT00940000155678 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000161165 ENSGT00390000007551 ENSGT00940000157463.b ENSGT00390000001965 ENSGT00390000004348 ENSGT00950000182985.b.a ENSGT00950000182941.a.a.a.a.c ENSGT00940000164948 ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318 ENSGT00940000157260.s ENSGT00940000166622 ENSGT00940000159157 ENSGT00560000077266.a ENSGT00940000159097 Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00410000025698.a ENSGT00940000157219.e ENSGT00520000055570.B.l ENSGT00940000164632.b.b ENSGT00940000155936.a.b ENSGT00940000155678 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000161165 ENSGT00390000007551 ENSGT00940000157463.b ENSGT00390000001965 ENSGT00390000004348 ENSGT00950000182985.b.a ENSGT00950000182941.a.a.a.a.c ENSGT00940000164948 ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318 ENSGT00940000157260.s ENSGT00940000166622 ENSGT00940000159157 ENSGT00560000077266.a ENSGT00940000159097 Indian medaka MODERN SPECIES 22 lratd1 (ENSOMEG00000017488) MTLN (ENSOMEG00000000654) ENSOMEG00000017469 sec63 (ENSOMEG00000000436) iyd (ENSOMEG00000017325) ENSOMEG00000017313 ENSOMEG00000017297 aldh16a1 (ENSOMEG00000017260) ENSOMEG00000017211 ENSOMEG00000017137 ENSOMEG00000017119 ENSOMEG00000017110 eci1 (ENSOMEG00000017097) ENSOMEG00000017061 armc1l (ENSOMEG00000016864) mtfr2 (ENSOMEG00000016843) ##22 PDE7B (ENSOMEG00000016823) myb (ENSOMEG00000016773) hbs1l (ENSOMEG00000016715) aldh8a1 (ENSOMEG00000016670) SGK1 (ENSOMEG00000016641) slc2a12 (ENSOMEG00000016577) tbpl1 (ENSOMEG00000016557) tcf21 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fam167ab (ENSOJAG00000020112) Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000153433.B.a.a ENSGT00410000025698.a ENSGT00940000157219.e ENSGT00520000055570.B.l ENSGT00940000155936.a.b ENSGT00940000155678 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000161165 ENSGT00390000007551 ENSGT00940000157463.b ENSGT00390000001965 ENSGT00390000004348 ENSGT00950000182985.b.a ENSGT00950000182941.a.a.a.a.c ENSGT00940000164948 ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318 ENSGT00940000176295 ENSGT00940000166622 ENSGT00940000159157 ENSGT00560000077266.a ENSGT00940000159097 Chinese medaka MODERN SPECIES 796 fez2b (ENSOSIG00000016042) esrrgb (ENSOSIG00000016050) si:ch73-21k16.4 (ENSOSIG00000016052) ENSOSIG00000016059 ENSOSIG00000016085 ENSOSIG00000016363 nbas (ENSOSIG00000016458) lratd1 (ENSOSIG00000017350) MTLN (ENSOSIG00000017351) 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(ENSORLG00000016588) ##22 PDE7B (ENSORLG00000016583) myb (ENSORLG00000016573) hbs1l (ENSORLG00000016559) aldh8a1 (ENSORLG00000016537) SGK1 (ENSORLG00000016520) slc2a12 (ENSORLG00000016511) tbpl1 (ENSORLG00000029396) tcf21 (ENSORLG00000021964) rps12 (ENSORLG00000016460) eya4 (ENSORLG00000016484) ENSORLG00000023653 ENSORLG00000016446 sh3bgrl2 (ENSORLG00000027955) ENSORLG00000016430 fam167ab (ENSORLG00000016424) Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000157219.e ENSGT00520000055570.B.l ENSGT00940000171406 ENSGT00940000164632.b.b ENSGT00940000155936.a.b ENSGT00940000155678 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000161165 ENSGT00390000007551 ENSGT00940000157463.b ENSGT00390000001965 ENSGT00390000004348 ENSGT00950000182985.b.a ENSGT00950000182941.a.a.a.a ENSGT00940000164948 ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156248 ENSGT00730000111130 ENSGT00390000018525.b ENSGT01080000257573 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT01030000234583.a.a.c.b.b ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318 ENSGT00940000171557 Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000157219.e ENSGT00520000055570.B.l ENSGT00940000171406 ENSGT00940000164632.b.b ENSGT00940000155936.a.b ENSGT00940000155678 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000161165 ENSGT00390000007551 ENSGT00940000157463.b ENSGT00390000001965 ENSGT00390000004348 ENSGT00950000182985.b.a ENSGT00950000182941.a.a.a.a ENSGT00940000164948 ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156248 ENSGT00730000111130 ENSGT00390000018525.b ENSGT01080000257573 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT01030000234583.a.a.c.b.b ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318 ENSGT00940000159157 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000157219.e ENSGT00520000055570.B.l.g ENSGT00940000171406 ENSGT00940000164632.b.b ENSGT00940000155936.a.b ENSGT00940000155678 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000161165 ENSGT00390000007551 ENSGT00940000157463.b ENSGT00390000001965 ENSGT00390000004348 ENSGT00950000182985.b.a ENSGT00950000182941.a.a.a.a ENSGT00940000164948 ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT01030000234583.a.a.c.b.b ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318 ENSGT00940000166622.m.b ENSGT00940000171557 ENSGT00940000157260.s ENSGT00940000166622.m.a Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000157219.e ENSGT00520000055570.B.l.g ENSGT00940000171406 ENSGT00940000164632.b.b ENSGT00940000155936.a.b ENSGT00940000155678 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000161165 ENSGT00390000007551 ENSGT00940000157463.b ENSGT00390000001965 ENSGT00390000004348 ENSGT00950000182985.b.a ENSGT00950000182941.a.a.a.a ENSGT00940000164948 ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT01030000234583.a.a.c.b.b ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318 ENSGT00940000166622.m.b ENSGT00940000171557 ENSGT00940000157260.s ENSGT00940000166622.m.a Lyretail cichlid MODERN SPECIES 338 ENSNBRG00000020954 si:ch73-21k16.4 (ENSNBRG00000020932) LPIN1 (ENSNBRG00000020896) ENSNBRG00000020809 ENSNBRG00000020764 ENSNBRG00000020742 DDX1 (ENSNBRG00000020677) nbas (ENSNBRG00000020581) lratd1 (ENSNBRG00000020564) MTLN (ENSNBRG00000020560) ENSNBRG00000020552 sec63 (ENSNBRG00000020473) iyd (ENSNBRG00000020462) ppp1r14c (ENSNBRG00000020456) armc1l (ENSNBRG00000020437) mtfr2 (ENSNBRG00000020420) ##22 PDE7B (ENSNBRG00000020393) myb (ENSNBRG00000020190) hbs1l (ENSNBRG00000020095) aldh8a1 (ENSNBRG00000020070) SGK1 (ENSNBRG00000020051) slc2a12 (ENSNBRG00000020024) tbpl1 (ENSNBRG00000020010) tcf21 (ENSNBRG00000020002) eya4 (ENSNBRG00000019962) ENSNBRG00000019923 ENSNBRG00000019887 ENSNBRG00000019870 ENSNBRG00000019852 sh3bgrl2 (ENSNBRG00000019843) ENSNBRG00000019828 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000157219.e ENSGT00520000055570.B.l.g ENSGT00940000171406 ENSGT00940000164632.b.b ENSGT00940000155936.a.b ENSGT00940000155678 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000161165 ENSGT00390000007551 ENSGT00940000157463.b ENSGT00390000001965 ENSGT00390000004348 ENSGT00950000182985.b.a ENSGT00950000182941.a.a.a.a ENSGT00940000164948 ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274.m ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT01030000234583.a.a.c.b.b ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318 ENSGT00940000166622.m.b ENSGT00940000171557 ENSGT00940000166622.n ENSGT00940000157260.s Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 276 LPIN1 (ENSHBUG00000014389) ENSHBUG00000014327 ENSHBUG00000014163 ENSHBUG00000014158 ENSHBUG00000014114 DDX1 (ENSHBUG00000014069) nbas (ENSHBUG00000014019) lratd1 (ENSHBUG00000013710) MTLN (ENSHBUG00000013695) ENSHBUG00000013675 sec63 (ENSHBUG00000013656) iyd (ENSHBUG00000013642) ppp1r14c (ENSHBUG00000013633) ENSHBUG00000013625 armc1l (ENSHBUG00000013581) mtfr2 (ENSHBUG00000013560) ##22 PDE7B (ENSHBUG00000013545) myb (ENSHBUG00000013437) hbs1l (ENSHBUG00000013424) aldh8a1 (ENSHBUG00000013404) SGK1 (ENSHBUG00000013374) slc2a12 (ENSHBUG00000013283) tbpl1 (ENSHBUG00000013274) tcf21 (ENSHBUG00000013252) eya4 (ENSHBUG00000013228) rps12 (ENSHBUG00000013168) ENSHBUG00000013129 ENSHBUG00000013114 ENSHBUG00000013097 ENSHBUG00000013092 sh3bgrl2 (ENSHBUG00000013062) Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000157219.e ENSGT00520000055570.B.l.g ENSGT00940000171406 ENSGT00940000164632.b.b ENSGT00940000155936.a.b ENSGT00940000155678 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000161165 ENSGT00390000007551 ENSGT00940000157463.b ENSGT00390000001965 ENSGT00390000004348 ENSGT00950000182985.b.a ENSGT00950000182941.a.a.a.a ENSGT00940000164948 ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274.m ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT01030000234583.a.a.c.b.b ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318 ENSGT00940000157260.s ENSGT00940000166622.m.a ENSGT00950000183145.A.b.a.s.a ENSGT00940000163299.B.b.b.g.b Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000157219.e ENSGT00520000055570.B.l.g ENSGT00940000171406 ENSGT00940000164632.b.b ENSGT00940000155936.a.b ENSGT00940000155678 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000161165 ENSGT00390000007551 ENSGT00940000157463.b ENSGT00390000001965 ENSGT00390000004348 ENSGT00950000182985.b.a ENSGT00950000182941.a.a.a.a ENSGT00940000164948 ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274.m ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318 ENSGT00950000183145.A.b.a.s.b ENSGT00940000157260.s ENSGT00940000166622.m.a ENSGT00950000183145.A.b.a.s.a ENSGT00940000163299.B.b.b.g.b Zebra mbuna MODERN SPECIES 1097 LPIN1 (ENSMZEG00005015060) ENSMZEG00005015111 ENSMZEG00005015169 ENSMZEG00005015176 ENSMZEG00005015185 DDX1 (ENSMZEG00005015207) nbas (ENSMZEG00005015265) lratd1 (ENSMZEG00005015338) MTLN (ENSMZEG00005015349) ENSMZEG00005015353 sec63 (ENSMZEG00005015369) iyd (ENSMZEG00005015400) ppp1r14c (ENSMZEG00005015409) ENSMZEG00005015434 armc1l (ENSMZEG00005015470) mtfr2 (ENSMZEG00005015488) ##22 ENSMZEG00005015495 PDE7B (ENSMZEG00005015508) myb (ENSMZEG00005015531) hbs1l (ENSMZEG00005015575) aldh8a1 (ENSMZEG00005015598) SGK1 (ENSMZEG00005015609) slc2a12 (ENSMZEG00005015652) tbpl1 (ENSMZEG00005015661) ptk2bb (ENSMZEG00005015713) CHRNA2 (ENSMZEG00005015764) ENSMZEG00005016044 nme6 (ENSMZEG00005016052) eif2b4 (ENSMZEG00005016074) atraid (ENSMZEG00005016085) snx17 (ENSMZEG00005016097) Eastern happy MODERN SPECIES 6 ENSACLG00000008767 ENSACLG00000008775 ENSACLG00000008778 ENSACLG00000008784 ENSACLG00000008834 DDX1 (ENSACLG00000008850) nbas (ENSACLG00000008921) lratd1 (ENSACLG00000009785) MTLN (ENSACLG00000009786) ENSACLG00000009788 sec63 (ENSACLG00000009789) iyd (ENSACLG00000009842) ppp1r14c (ENSACLG00000009853) ENSACLG00000009863 armc1l (ENSACLG00000009933) mtfr2 (ENSACLG00000009948) ##22 PDE7B (ENSACLG00000010402) myb (ENSACLG00000010427) hbs1l (ENSACLG00000010469) aldh8a1 (ENSACLG00000010545) ENSACLG00000010561 SGK1 (ENSACLG00000010577) slc2a12 (ENSACLG00000010666) tbpl1 (ENSACLG00000010680) tcf21 (ENSACLG00000010780) eya4 (ENSACLG00000010790) rps12 (ENSACLG00000011016) ENSACLG00000011113 ENSACLG00000011117 ENSACLG00000011123 ENSACLG00000011149 P. nyererei MODERN SPECIES 456 si:ch73-21k16.4 (ENSPNYG00000014144) LPIN1 (ENSPNYG00000014077) ENSPNYG00000014030 ENSPNYG00000013999 ENSPNYG00000013957 DDX1 (ENSPNYG00000013839) nbas (ENSPNYG00000013714) lratd1 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ENSGT00940000156975.n.a ENSGT00530000063834.e.b ENSGT01030000234626.A.b ENSGT00950000182848.d.e ENSGT00940000160562 ENSGT00940000156406.b ENSGT00940000166083.e.b ENSGT00520000055570.B.l ENSGT00940000171406 ENSGT01060000251035 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000161165.j ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00950000182985.b.a.g ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000156248.e.b.a ENSGT01080000257573.b.b ENSGT00940000156799 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174.e ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318 ENSGT00940000171557 ENSGT00940000159157 ENSGT01070000253766.C.o.a.g.a ENSGT00390000014037.c.g ENSGT00450000040279 ENSGT00940000161092.c ENSGT00940000154242.a.d Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 247 ENSGT00950000183215.c.a.a ##22 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174.e ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318 ENSGT00940000171557 ENSGT00940000159157 Coho salmon MODERN SPECIES 13 eif2b4 (ENSOKIG00005041038) 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ENSOMYG00000062619 ENSOMYG00000063382 mtfr2 (ENSOMYG00000028410) ##22 myb (ENSOMYG00000061659) ENSOMYG00000065177 aldh8a1 (ENSOMYG00000025589) ENSOMYG00000062827 ENSOMYG00000053078 ENSOMYG00000039735 ENSOMYG00000049685 tcf21 (ENSOMYG00000075719) eya4 (ENSOMYG00000063960) ENSOMYG00000069660 ENSOMYG00000066355 sh3bgrl2 (ENSOMYG00000048234) ENSOMYG00000049293 XKR6 (ENSOMYG00000031089) tdh (ENSOMYG00000076726) Huchen MODERN SPECIES 5231 mtfr2 (ENSHHUG00000025459) ##22 Northern pike MODERN SPECIES 17 clic5b (ENSELUG00000007750) ENSELUG00000025146 runx2b (ENSELUG00000007656) ENSELUG00000007505 ENSELUG00000007344 itsn2a (ENSELUG00000007309) iyd (ENSELUG00000007281) sec63 (ENSELUG00000007214) lratd1 (ENSELUG00000025774) ENSELUG00000033088 nbas (ENSELUG00000007088) DDX1 (ENSELUG00000006743) ppp1r14c (ENSELUG00000030754) ENSELUG00000006639 armc1l (ENSELUG00000006566) mtfr2 (ENSELUG00000006523) ##22 myb (ENSELUG00000006491) hbs1l (ENSELUG00000006444) aldh8a1 (ENSELUG00000006417) 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SPECIES foxi2 (ENSSFOG00015026749) drc1 (ENSSFOG00015018560) OTOF (ENSSFOG00015018253) sod2 (ENSSFOG00015018195) wtap (ENSSFOG00015032191) acat2 (ENSSFOG00015018150) tcp1 (ENSSFOG00015018108) ENSSFOG00015018085 PLEKHG1 (ENSSFOG00015024237) iyd (ENSSFOG00015018043) ppp1r14c (ENSSFOG00015018031) ENSSFOG00015018022 MAP7 (ENSSFOG00015017910) BCLAF1 (ENSSFOG00015017853) armc1l (ENSSFOG00015017825) mtfr2 (ENSSFOG00015017810) ##22 MYB (ENSSFOG00015017613) hbs1l (ENSSFOG00015017544) aldh8a1 (ENSSFOG00015033318) sgk1 (ENSSFOG00015017351) slc2a12 (ENSSFOG00015017339) tbpl1 (ENSSFOG00015017311) tcf21 (ENSSFOG00015024810) eya4 (ENSSFOG00015017200) rps12 (ENSSFOG00015017146) ENSSFOG00015024872 sh3bgrl2 (ENSSFOG00015030166) LCA5 (ENSSFOG00015030512) HMGN3 (ENSSFOG00015017064) PHIP (ENSSFOG00015016980) ENSSFOG00015031240 P. kingsleyae MODERN SPECIES 82 fzd3a (ENSPKIG00000022575) OTOF (ENSPKIG00000022619) FNDC1 (ENSPKIG00000022686) sod2 (ENSPKIG00000022722) wtap (ENSPKIG00000022748) wtap 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ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00860000135574 ENSGT00980000203407 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ##22 ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a ENSGT00940000154473.a ENSGT00390000005213 ENSGT00390000003849 ENSGT00390000010499 ENSGT00940000157709 ENSGT00390000002854 ENSGT00940000153776.a.a ENSGT01090000260080.b.b ENSGT00940000162447 ENSGT00940000158260 ENSGT00550000074850 ENSGT00390000015084.d Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000159497 ENSGT00940000158863 ENSGT00940000153886.a.b.d ENSGT00940000153649.A ENSGT00940000159947 ENSGT00940000156304 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00860000135574 ENSGT00980000203407 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ##22 ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a ENSGT00940000154473.a ENSGT00390000005213 ENSGT00390000003849 ENSGT00390000010499 ENSGT00940000157709 ENSGT00390000002854 ENSGT00940000153776.a.a ENSGT01090000260080.b.b ENSGT00940000162447 ENSGT00940000158260 ENSGT00550000074850.q ENSGT00390000015084.d Common wonbat DUPLICATION Common wonbat MODERN SPECIES 1048 ENSVURG00010020574 ENSVURG00010020590 ENSVURG00010020602 ENSVURG00010020610 ENSVURG00010020622 ENSVURG00010020638 ENSVURG00010020643 ENSVURG00010020644 ENSVURG00010020648 ENSVURG00010020650 ENSVURG00010020661 ENSVURG00010020665 ENSVURG00010020671 ENSVURG00010020676 ENSVURG00010020685 ENSVURG00010020690 ##22 ENSVURG00010020699 ENSVURG00010020708 ENSVURG00010020714 ENSVURG00010020748 ENSVURG00010020753 ENSVURG00010020755 ENSVURG00010020761 ENSVURG00010020762 ENSVURG00010020766 ENSVURG00010020775 ENSVURG00010020782 ENSVURG00010020794 ENSVURG00010020805 ENSVURG00010020809 ENSVURG00010020816 Common wonbat MODERN SPECIES 1048 ENSVURG00010006806 ENSVURG00010007085 ENSVURG00010014124 ENSVURG00010014136 ENSVURG00010014170 ENSVURG00010014259 ENSVURG00010014266 ENSVURG00010014274 ENSVURG00010014281 ENSVURG00010014297 ENSVURG00010014323 ENSVURG00010014331 ENSVURG00010014354 ENSVURG00010014368 ENSVURG00010014407 ENSVURG00010014418 ##22 ENSVURG00010014443 ENSVURG00010014494 ENSVURG00010014504 ENSVURG00010014515 ENSVURG00010014521 ENSVURG00010014527 ENSVURG00010014545 ENSVURG00010014554 ENSVURG00010014572 ENSVURG00010014605 ENSVURG00010014661 ENSVURG00010014831 ENSVURG00010014846 ENSVURG00010014865 ENSVURG00010014880 koala MODERN SPECIES 94 CLVS1 (ENSPCIG00000000028) ASPH (ENSPCIG00000000029) NKAIN3 (ENSPCIG00000000031) GGH (ENSPCIG00000000034) TTPA (ENSPCIG00000017630) YTHDF3 (ENSPCIG00000017629) ENSPCIG00000031204 ENSPCIG00000020477 ENSPCIG00000014101 CYP7B1 (ENSPCIG00000033238) ARMC1 (ENSPCIG00000014338) MTFR1 (ENSPCIG00000014351) ##22 PDE7A (ENSPCIG00000014359) DNAJC5B (ENSPCIG00000014369) TRIM55 (ENSPCIG00000026705) CRH (ENSPCIG00000026701) RRS1 (ENSPCIG00000026695) ADHFE1 (ENSPCIG00000026692) VXN (ENSPCIG00000032494) MYBL1 (ENSPCIG00000026686) VCPIP1 (ENSPCIG00000033756) SGK3 (ENSPCIG00000026664) MCMDC2 (ENSPCIG00000026659) TCF24 (ENSPCIG00000026642) ENSPCIG00000026640 ENSPCIG00000026636 ENSPCIG00000026631 Wallaby MODERN SPECIES 14498 MTFR1 (ENSMEUG00000005173) ##22 Tasmanian devil MODERN SPECIES TOX (ENSSHAG00000007522) CA8 (ENSSHAG00000007782) ENSSHAG00000021182 ENSSHAG00000004796 CHD7 (ENSSHAG00000011522) CLVS1 (ENSSHAG00000006016) ASPH (ENSSHAG00000000974) NKAIN3 (ENSSHAG00000031817) TTPA (ENSSHAG00000032102) GGH (ENSSHAG00000010843) YTHDF3 (ENSSHAG00000009482) ENSSHAG00000025212 ENSSHAG00000020524 ENSSHAG00000025575 ARMC1 (ENSSHAG00000015467) MTFR1 (ENSSHAG00000027884) ##22 PDE7A (ENSSHAG00000014928) DNAJC5B (ENSSHAG00000013754) TRIM55 (ENSSHAG00000013270) CRH (ENSSHAG00000026029) RRS1 (ENSSHAG00000023196) ADHFE1 (ENSSHAG00000011658) VXN (ENSSHAG00000011189) VCPIP1 (ENSSHAG00000010559) SGK3 (ENSSHAG00000008146) MCMDC2 (ENSSHAG00000007791) TCF24 (ENSSHAG00000024487) PPP1R42 (ENSSHAG00000006842) COPS5 (ENSSHAG00000022566) CSPP1 (ENSSHAG00000004470) ARFGEF1 (ENSSHAG00000000921) Eutheria ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000155059 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000158863 ENSGT00940000153886.a.b ENSGT00960000189175 ENSGT00940000153649.A ENSGT00940000159947 ENSGT00940000156304 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ##22 ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a ENSGT00940000154473.a ENSGT00390000005213 ENSGT00390000003849 ENSGT00390000010499 ENSGT00940000157709 ENSGT00860000135506 ENSGT00390000002854 ENSGT00940000153776.a.a ENSGT01090000260080.b.b ENSGT00940000162447 ENSGT00940000158260 ENSGT00550000074850 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000158863 ENSGT00940000153886.a.b ENSGT00960000189175 ENSGT00940000153649.A ENSGT00940000159947 ENSGT00940000156304 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00860000135574 ENSGT00910000147681 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ##22 ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a ENSGT00940000154473.a ENSGT00390000005213 ENSGT00390000003849 ENSGT00390000010499 ENSGT00940000157709 ENSGT00860000135506 ENSGT00390000002854 ENSGT00940000153776.a.a ENSGT01090000260080.b.b ENSGT00940000162447 ENSGT00940000158260 ENSGT00550000074850 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000158863 ENSGT00940000153886.a.b ENSGT00960000189175 ENSGT00940000153649.A ENSGT00940000159947 ENSGT00940000156304 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00860000135574 ENSGT00910000147681 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ##22 ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a ENSGT00940000154473.a ENSGT00390000005213 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ENSGT00940000159947 ENSGT00940000156304 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00940000153141.B.b ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ##22 ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a ENSGT00940000154473.a ENSGT00390000005213 ENSGT00390000003849 ENSGT00390000010499 ENSGT00940000157709 ENSGT00390000002854 ENSGT00940000153776.a.a ENSGT01090000260080.b.b ENSGT00940000162447 ENSGT00940000158260 ENSGT00550000074850 ENSGT00390000015084.d Giant Panda MODERN SPECIES 19 TOX (ENSAMEG00000005857) CA8 (ENSAMEG00000005842) RAB2A (ENSAMEG00000005810) CHD7 (ENSAMEG00000005699) CLVS1 (ENSAMEG00000005687) ASPH (ENSAMEG00000005680) ENSAMEG00000029572 NKAIN3 (ENSAMEG00000015503) GGH (ENSAMEG00000018121) TTPA (ENSAMEG00000024127) YTHDF3 (ENSAMEG00000018113) ENSAMEG00000024582 CYP7B1 (ENSAMEG00000012256) ENSAMEG00000025290 ARMC1 (ENSAMEG00000012275) MTFR1 (ENSAMEG00000012281) ##22 PDE7A (ENSAMEG00000012296) DNAJC5B 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ENSGT00550000074850 ENSGT00390000015084.d American black bear MODERN SPECIES 6389 MTFR1 (ENSUAMG00000000786) ##22 PDE7A (ENSUAMG00000000361) Polar bear DUPLICATION Polar bear MODERN SPECIES 296 NSMAF (ENSUMAG00000009846) ENSUMAG00000009852 TOX (ENSUMAG00000009857) CA8 (ENSUMAG00000009870) RAB2A (ENSUMAG00000009877) CHD7 (ENSUMAG00000010436) CLVS1 (ENSUMAG00000014042) ASPH (ENSUMAG00000014054) NKAIN3 (ENSUMAG00000014091) GGH (ENSUMAG00000014093) TTPA (ENSUMAG00000014098) YTHDF3 (ENSUMAG00000014104) CYP7B1 (ENSUMAG00000014112) ARMC1 (ENSUMAG00000014116) ENSUMAG00000014117 ##22 MTFR1 (ENSUMAG00000014119) ##22 PDE7A (ENSUMAG00000014127) DNAJC5B (ENSUMAG00000014199) TRIM55 (ENSUMAG00000014201) ADHFE1 (ENSUMAG00000014211) VXN (ENSUMAG00000014266) MYBL1 (ENSUMAG00000014273) VCPIP1 (ENSUMAG00000014329) SGK3 (ENSUMAG00000014334) MCMDC2 (ENSUMAG00000014337) PPP1R42 (ENSUMAG00000014349) COPS5 (ENSUMAG00000014356) CSPP1 (ENSUMAG00000014367) Polar bear MODERN SPECIES 296 SDCBP (ENSUMAG00000009840) NSMAF (ENSUMAG00000009846) ENSUMAG00000009852 TOX (ENSUMAG00000009857) CA8 (ENSUMAG00000009870) RAB2A (ENSUMAG00000009877) CHD7 (ENSUMAG00000010436) CLVS1 (ENSUMAG00000014042) ASPH (ENSUMAG00000014054) NKAIN3 (ENSUMAG00000014091) GGH (ENSUMAG00000014093) TTPA (ENSUMAG00000014098) YTHDF3 (ENSUMAG00000014104) CYP7B1 (ENSUMAG00000014112) ARMC1 (ENSUMAG00000014116) ENSUMAG00000014117 ##22 MTFR1 (ENSUMAG00000014119) ##22 PDE7A (ENSUMAG00000014127) DNAJC5B (ENSUMAG00000014199) TRIM55 (ENSUMAG00000014201) ADHFE1 (ENSUMAG00000014211) VXN (ENSUMAG00000014266) MYBL1 (ENSUMAG00000014273) VCPIP1 (ENSUMAG00000014329) SGK3 (ENSUMAG00000014334) MCMDC2 (ENSUMAG00000014337) PPP1R42 (ENSUMAG00000014349) COPS5 (ENSUMAG00000014356) CSPP1 (ENSUMAG00000014367) Mustelinae ANCESTRAL SPECIES 147 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00390000012818.o.a.a.a.a ENSGT00940000153141.B.b ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ##22 ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a ENSGT00940000154473.a ENSGT00390000005213 ENSGT00390000003849 ENSGT00390000010499 ENSGT00940000157709 ENSGT00390000002854 ENSGT00940000153776.a.a ENSGT01090000260080.b.b ENSGT00940000162447 ENSGT00940000158260 ENSGT00550000074850 ENSGT00390000015084.d Ferret MODERN SPECIES 338 ENSMPUG00000009821 ENSMPUG00000009825 GGH (ENSMPUG00000009830) TTPA (ENSMPUG00000009834) YTHDF3 (ENSMPUG00000009857) ENSMPUG00000018623 CYP7B1 (ENSMPUG00000009863) ARMC1 (ENSMPUG00000009870) MTFR1 (ENSMPUG00000009909) ##22 PDE7A (ENSMPUG00000009915) DNAJC5B (ENSMPUG00000009928) TRIM55 (ENSMPUG00000009932) CRH (ENSMPUG00000018624) ENSMPUG00000009937 ENSMPUG00000009947 RRS1 (ENSMPUG00000018626) ADHFE1 (ENSMPUG00000009954) VXN (ENSMPUG00000009963) ENSMPUG00000009976 VCPIP1 (ENSMPUG00000009980) SGK3 (ENSMPUG00000009983) MCMDC2 (ENSMPUG00000010115) ENSMPUG00000010161 ENSMPUG00000010168 American mink DUPLICATION American mink MODERN SPECIES 190 CYP7B1 (ENSNVIG00000023956) ARMC1 (ENSNVIG00000023953) ENSNVIG00000023952 ##22 ENSNVIG00000023951 ##22 ENSNVIG00000023950 PDE7A (ENSNVIG00000023943) DNAJC5B (ENSNVIG00000023941) TRIM55 (ENSNVIG00000023936) CRH (ENSNVIG00000023934) RRS1 (ENSNVIG00000023931) ADHFE1 (ENSNVIG00000023925) VXN (ENSNVIG00000023920) MYBL1 (ENSNVIG00000023910) VCPIP1 (ENSNVIG00000023909) SGK3 (ENSNVIG00000023899) MCMDC2 (ENSNVIG00000023889) TCF24 (ENSNVIG00000023883) PPP1R42 (ENSNVIG00000023882) ENSNVIG00000023880 American mink MODERN SPECIES 190 CYP7B1 (ENSNVIG00000023956) ARMC1 (ENSNVIG00000023953) ENSNVIG00000023952 ##22 ENSNVIG00000023951 ##22 ENSNVIG00000023950 PDE7A (ENSNVIG00000023943) DNAJC5B (ENSNVIG00000023941) TRIM55 (ENSNVIG00000023936) CRH (ENSNVIG00000023934) RRS1 (ENSNVIG00000023931) ADHFE1 (ENSNVIG00000023925) VXN (ENSNVIG00000023920) MYBL1 (ENSNVIG00000023910) VCPIP1 (ENSNVIG00000023909) SGK3 (ENSNVIG00000023899) MCMDC2 (ENSNVIG00000023889) TCF24 (ENSNVIG00000023883) PPP1R42 (ENSNVIG00000023882) Canidae DUPLICATION Canidae DUPLICATION Canidae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000014781 ENSGT00390000014594 ENSGT00940000159391 ENSGT00940000154149.b.a ENSGT00940000154499 ENSGT00530000063646.a ENSGT00390000001254 ENSGT00940000155635 ENSGT00950000185732 ENSGT00940000154614 ENSGT00530000063751.a ENSGT00990000204652 ENSGT00730000111014 ENSGT00390000012568 ENSGT00940000156236 ENSGT00950000183215.c.a.b.g.a ##22 ENSGT00390000010743.a ENSGT01030000234606.b ENSGT00940000163634 ENSGT00940000154386.ob.c.b.b.h.d.a ENSGT00940000159228 ENSGT00940000159902 ENSGT01030000234614.B.b ENSGT00390000005554 ENSGT00950000183081.a.a.a ENSGT00940000153838.b ENSGT00950000182888.a.a.b ENSGT00950000182951.B ENSGT00940000154079.a ENSGT00940000155091 ENSGT00390000011962.c Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000014781 ENSGT00390000014594 ENSGT00940000159391 ENSGT00940000154149.b.a ENSGT00940000154499 ENSGT00530000063646.a ENSGT00390000001254 ENSGT00940000155635 ENSGT00950000185732 ENSGT00940000154614 ENSGT00530000063751.a ENSGT00990000204652 ENSGT00730000111014 ENSGT00390000012568 ENSGT00940000156236 ENSGT00950000183215.c.a.b.g.a ##22 ENSGT00390000010743.a ENSGT01030000234606.b ENSGT00940000163634 ENSGT00940000154386.ob.c.b.b.h.d.a ENSGT00940000159228 ENSGT00940000159902 ENSGT01030000234614.B.b ENSGT00390000005554 ENSGT00950000183081.a.a.a ENSGT00940000153838.b ENSGT00950000182888.a.a.b ENSGT00950000182951.B ENSGT00940000154079.a ENSGT00940000155091 ENSGT00390000011962.c Dingo MODERN SPECIES 271 TSEN15 (ENSCAFG00020015550) C1orf21 (ENSCAFG00020015562) EDEM3 (ENSCAFG00020015575) NIBAN1 (ENSCAFG00020015627) RNF2 (ENSCAFG00020015632) TRMT1L (ENSCAFG00020015640) SWT1 (ENSCAFG00020015648) IVNS1ABP (ENSCAFG00020015690) ENSCAFG00020015702 HMCN1 (ENSCAFG00020015729) ENSCAFG00020015808 ENSCAFG00020015812 TPR (ENSCAFG00020015836) ODR4 (ENSCAFG00020016537) PDC (ENSCAFG00020016540) ENSCAFG00020016541 ##22 PTGS2 (ENSCAFG00020016543) PLA2G4A (ENSCAFG00020016556) ENSCAFG00020016560 ENSCAFG00020016562 FAM163A 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(ENSVVUG00000012639) FAM20B (ENSVVUG00000012653) RALGPS2 (ENSVVUG00000012679) Canidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183215.c.a.b.g.b ##22 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183215.c.a.b.g.b ##22 Dingo MODERN SPECIES 30 CA8 (ENSCAFG00020015844) ENSCAFG00020015847 ENSCAFG00020015849 CHD7 (ENSCAFG00020015856) ENSCAFG00020015876 CLVS1 (ENSCAFG00020015881) ASPH (ENSCAFG00020015893) NKAIN3 (ENSCAFG00020015973) GGH (ENSCAFG00020015977) TTPA (ENSCAFG00020015981) YTHDF3 (ENSCAFG00020015995) ENSCAFG00020015998 BHLHE22 (ENSCAFG00020016004) CYP7B1 (ENSCAFG00020016006) ARMC1 (ENSCAFG00020016019) ENSCAFG00020016022 ##22 MTFR1 (ENSCAFG00020016024) ##22 PDE7A (ENSCAFG00020016027) DNAJC5B (ENSCAFG00020016038) TRIM55 (ENSCAFG00020016040) ENSCAFG00020016044 ENSCAFG00020016049 ADHFE1 (ENSCAFG00020016051) VXN (ENSCAFG00020016059) MYBL1 (ENSCAFG00020016060) VCPIP1 (ENSCAFG00020016103) SGK3 (ENSCAFG00020016107) MCMDC2 (ENSCAFG00020016131) PPP1R42 (ENSCAFG00020016139) COPS5 (ENSCAFG00020016144) CSPP1 (ENSCAFG00020016152) Canidae ANCESTRAL SPECIES 42 ENSGT00940000155059 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000158863 ENSGT00940000153886.a.b ENSGT00940000153649.A ENSGT00940000159947 ENSGT00940000156304 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00860000135574 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b.h ##22 ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a ENSGT00940000154473.a ENSGT00390000005213 ENSGT00390000003849 ENSGT00390000010499 ENSGT00940000157709 ENSGT00390000002854 ENSGT00940000153776.a.a ENSGT01090000260080.b.b ENSGT00940000162447 ENSGT00940000158260 ENSGT00550000074850 ENSGT00390000015084.d Red fox MODERN SPECIES 3 CA8 (ENSVVUG00000018041) ENSVVUG00000018049 RAB2A (ENSVVUG00000018053) CHD7 (ENSVVUG00000018063) CLVS1 (ENSVVUG00000018126) ASPH (ENSVVUG00000018144) ENSVVUG00000018274 ENSVVUG00000018297 NKAIN3 (ENSVVUG00000018339) GGH (ENSVVUG00000018346) TTPA (ENSVVUG00000018379) YTHDF3 (ENSVVUG00000018384) ENSVVUG00000018389 CYP7B1 (ENSVVUG00000018408) ARMC1 (ENSVVUG00000018413) MTFR1 (ENSVVUG00000018419) ##22 PDE7A (ENSVVUG00000018435) DNAJC5B (ENSVVUG00000018444) TRIM55 (ENSVVUG00000018449) RRS1 (ENSVVUG00000018452) ADHFE1 (ENSVVUG00000018455) VXN (ENSVVUG00000018463) ENSVVUG00000018467 MYBL1 (ENSVVUG00000018480) VCPIP1 (ENSVVUG00000018589) SGK3 (ENSVVUG00000018590) MCMDC2 (ENSVVUG00000018599) PPP1R42 (ENSVVUG00000018635) COPS5 (ENSVVUG00000018644) CSPP1 (ENSVVUG00000018649) ARFGEF1 (ENSVVUG00000018676) Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00940000158863 ENSGT01090000260040.a.a.b.dc.a ENSGT00940000153886.a.b.i.a ENSGT00940000153649.A ENSGT00390000008624.i ENSGT00940000159947 ENSGT00940000156304 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00860000135574 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b.h ##22 ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a ENSGT00940000154473.a ENSGT00390000005213 ENSGT00390000003849 ENSGT00390000010499 ENSGT00940000157709 ENSGT00390000002854 ENSGT00940000153776.a.a ENSGT01090000260080.b.b ENSGT00940000162447 ENSGT00940000158260 ENSGT00550000074850 ENSGT00390000015084.d Dog MODERN SPECIES 21 CA8 (ENSCAFG00845028447) ENSCAFG00845028495 RAB2A (ENSCAFG00845028560) CHD7 (ENSCAFG00845028771) ENSCAFG00845029025 CLVS1 (ENSCAFG00845029038) ASPH (ENSCAFG00845029184) NKAIN3 (ENSCAFG00845029711) GGH (ENSCAFG00845029791) TTPA (ENSCAFG00845029838) YTHDF3 (ENSCAFG00845029858) ENSCAFG00845029970 BHLHE22 (ENSCAFG00845029985) CYP7B1 (ENSCAFG00845017776) ARMC1 (ENSCAFG00845017839) MTFR1 (ENSCAFG00845018020) ##22 PDE7A (ENSCAFG00845018315) DNAJC5B (ENSCAFG00845018466) TRIM55 (ENSCAFG00845018610) CRH (ENSCAFG00845018776) RRS1 (ENSCAFG00845018810) ADHFE1 (ENSCAFG00845018929) MYBL1 (ENSCAFG00845019346) VCPIP1 (ENSCAFG00845019565) SGK3 (ENSCAFG00845019652) MCMDC2 (ENSCAFG00845020001) TCF24 (ENSCAFG00845020289) TCF24 (ENSCAFG00845020351) COPS5 (ENSCAFG00845020562) CSPP1 (ENSCAFG00845020821) ARFGEF1 (ENSCAFG00845022092) Dingo MODERN SPECIES 30 ENSCAFG00020015847 ENSCAFG00020015849 CHD7 (ENSCAFG00020015856) ENSCAFG00020015876 CLVS1 (ENSCAFG00020015881) ASPH (ENSCAFG00020015893) NKAIN3 (ENSCAFG00020015973) GGH (ENSCAFG00020015977) TTPA (ENSCAFG00020015981) YTHDF3 (ENSCAFG00020015995) ENSCAFG00020015998 BHLHE22 (ENSCAFG00020016004) CYP7B1 (ENSCAFG00020016006) ARMC1 (ENSCAFG00020016019) ENSCAFG00020016022 ##22 MTFR1 (ENSCAFG00020016024) ##22 PDE7A (ENSCAFG00020016027) DNAJC5B (ENSCAFG00020016038) TRIM55 (ENSCAFG00020016040) ENSCAFG00020016044 ENSCAFG00020016049 ADHFE1 (ENSCAFG00020016051) VXN (ENSCAFG00020016059) MYBL1 (ENSCAFG00020016060) VCPIP1 (ENSCAFG00020016103) SGK3 (ENSCAFG00020016107) MCMDC2 (ENSCAFG00020016131) PPP1R42 (ENSCAFG00020016139) COPS5 (ENSCAFG00020016144) CSPP1 (ENSCAFG00020016152) ARFGEF1 (ENSCAFG00020016265) Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000158863 ENSGT00940000153886.a.b ENSGT00960000189175 ENSGT00940000153649.A ENSGT00940000159947 ENSGT00940000156304 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00860000135574 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ##22 ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a ENSGT00940000154473.a ENSGT00390000005213 ENSGT00390000003849 ENSGT00390000010499 ENSGT00940000157709 ENSGT00860000135506 ENSGT00390000002854 ENSGT00940000153776.a.a ENSGT01090000260080.b.b ENSGT00940000162447 ENSGT00940000158260 ENSGT00550000074850 Equus ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000158863 ENSGT00940000153886.a.b ENSGT00960000189175 ENSGT00940000153649.A ENSGT00940000159947 ENSGT00940000156304 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00860000135574 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ##22 ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a ENSGT00940000154473.a ENSGT00390000005213 ENSGT00390000003849 ENSGT00390000010499 ENSGT00940000157709 ENSGT00390000002854 ENSGT00940000153776.a.a ENSGT01090000260080.b.b ENSGT00940000162447 ENSGT00940000158260 ENSGT00550000074850 ENSGT00390000015084.d Donkey MODERN SPECIES 3 ENSEASG00005016264 CA8 (ENSEASG00005016262) RAB2A (ENSEASG00005016261) ENSEASG00005025791 CHD7 (ENSEASG00005016258) CLVS1 (ENSEASG00005016256) ASPH (ENSEASG00005029180) NKAIN3 (ENSEASG00005016237) GGH (ENSEASG00005016231) TTPA (ENSEASG00005031026) YTHDF3 (ENSEASG00005016224) ENSEASG00005026428 ENSEASG00005026720 CYP7B1 (ENSEASG00005033874) ARMC1 (ENSEASG00005001743) MTFR1 (ENSEASG00005001735) ##22 PDE7A (ENSEASG00005001725) DNAJC5B (ENSEASG00005001709) TRIM55 (ENSEASG00005001701) CRH (ENSEASG00005027049) RRS1 (ENSEASG00005001691) ADHFE1 (ENSEASG00005001684) VXN (ENSEASG00005026057) MYBL1 (ENSEASG00005001342) VCPIP1 (ENSEASG00005001311) SGK3 (ENSEASG00005001304) MCMDC2 (ENSEASG00005001284) TCF24 (ENSEASG00005029980) PPP1R42 (ENSEASG00005001251) COPS5 (ENSEASG00005001239) CSPP1 (ENSEASG00005001209) Horse MODERN SPECIES 30 ENSECAG00000040466 CA8 (ENSECAG00000018004) ENSECAG00000056437 RAB2A (ENSECAG00000012124) CHD7 (ENSECAG00000001445) CLVS1 (ENSECAG00000000059) ASPH (ENSECAG00000021447) NKAIN3 (ENSECAG00000020663) GGH (ENSECAG00000014903) TTPA (ENSECAG00000045564) YTHDF3 (ENSECAG00000011093) BHLHE22 (ENSECAG00000039010) CYP7B1 (ENSECAG00000007540) ENSECAG00000054918 ARMC1 (ENSECAG00000022099) MTFR1 (ENSECAG00000018466) ##22 ENSECAG00000048660 PDE7A (ENSECAG00000017565) DNAJC5B (ENSECAG00000016455) TRIM55 (ENSECAG00000014370) CRH (ENSECAG00000047445) RRS1 (ENSECAG00000004492) ADHFE1 (ENSECAG00000000795) VXN (ENSECAG00000000693) MYBL1 (ENSECAG00000015959) VCPIP1 (ENSECAG00000015559) SGK3 (ENSECAG00000021200) MCMDC2 (ENSECAG00000053323) TCF24 (ENSECAG00000038988) PPP1R42 (ENSECAG00000017878) COPS5 (ENSECAG00000013916) Chiroptera ANCESTRAL SPECIES 42 ENSGT00940000154502 ENSGT00940000155059 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000158863 ENSGT00940000153886.a.b ENSGT00940000153649.A ENSGT00940000159947 ENSGT00940000156304 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ##22 ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a.c ENSGT00940000154473.a ENSGT00390000005213 ENSGT00390000003849 ENSGT00390000010499 ENSGT00940000157709 ENSGT00860000135506 ENSGT00390000002854 ENSGT00940000153776.a.a ENSGT01090000260080.b.b ENSGT00940000162447 ENSGT00940000158260 ENSGT00550000074850 Megabat MODERN SPECIES 1933 MTFR1 (ENSPVAG00000014193) ##22 PDE7A (ENSPVAG00000014194) Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 41 ENSGT00940000154502 ENSGT00940000155059 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000158863 ENSGT00940000153886.a.b ENSGT00940000153649.A ENSGT00940000159947 ENSGT00940000156304 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ##22 ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a.c ENSGT00940000154473.a ENSGT00390000005213 ENSGT00390000003849 ENSGT00390000010499 ENSGT00940000157709 ENSGT00390000002854 ENSGT00940000153776.a.a ENSGT01090000260080.b.b ENSGT00940000162447 ENSGT00940000158260 ENSGT00550000074850 ENSGT00390000015084.d Microbat MODERN SPECIES 1014 ENSMLUG00000013421 GGH (ENSMLUG00000007310) TTPA (ENSMLUG00000007670) YTHDF3 (ENSMLUG00000006541) ENSMLUG00000002156 CYP7B1 (ENSMLUG00000017179) ARMC1 (ENSMLUG00000014037) MTFR1 (ENSMLUG00000016066) ##22 PDE7A (ENSMLUG00000016073) DNAJC5B (ENSMLUG00000010163) ENSMLUG00000010188 CRH (ENSMLUG00000017632) ADHFE1 (ENSMLUG00000003145) VXN (ENSMLUG00000003160) MYBL1 (ENSMLUG00000003166) VCPIP1 (ENSMLUG00000022995) SGK3 (ENSMLUG00000014939) MCMDC2 (ENSMLUG00000024440) PPP1R42 (ENSMLUG00000007370) ENSMLUG00000025828 COPS5 (ENSMLUG00000011697) CSPP1 (ENSMLUG00000011710) ARFGEF1 (ENSMLUG00000011755) Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 5 ENSRFEG00010007105 ENSRFEG00010007072 CHD7 (ENSRFEG00010006927) ENSRFEG00010006898 CLVS1 (ENSRFEG00010006823) ASPH (ENSRFEG00010006293) NKAIN3 (ENSRFEG00010006061) GGH (ENSRFEG00010006024) TTPA (ENSRFEG00010005978) YTHDF3 (ENSRFEG00010005932) ENSRFEG00010005859 ENSRFEG00010005831 BHLHE22 (ENSRFEG00010005813) CYP7B1 (ENSRFEG00010005796) ARMC1 (ENSRFEG00010005774) MTFR1 (ENSRFEG00010005711) ##22 PDE7A (ENSRFEG00010005521) DNAJC5B (ENSRFEG00010005419) TRIM55 (ENSRFEG00010005379) CRH (ENSRFEG00010005344) RRS1 (ENSRFEG00010005333) ADHFE1 (ENSRFEG00010005297) VXN (ENSRFEG00010013433) MYBL1 (ENSRFEG00010013303) VCPIP1 (ENSRFEG00010013254) SGK3 (ENSRFEG00010012754) MCMDC2 (ENSRFEG00010012236) TCF24 (ENSRFEG00010012183) PPP1R42 (ENSRFEG00010012011) ENSRFEG00010011807 CSPP1 (ENSRFEG00010011374) Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000158863 ENSGT00940000153886.a.b ENSGT00960000189175 ENSGT00940000153649.A ENSGT00940000159947 ENSGT00940000156304 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00860000135574 ENSGT00910000147681 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ##22 ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a ENSGT00940000154473.a ENSGT00390000005213 ENSGT00390000003849 ENSGT00390000010499 ENSGT00940000157709 ENSGT00860000135506 ENSGT00390000002854 ENSGT00940000153776.a.a ENSGT01090000260080.b.b ENSGT00940000162447 ENSGT00940000158260 ENSGT00550000074850 Suina ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000158863 ENSGT00940000153886.a.b ENSGT00960000189175 ENSGT00940000153649.A ENSGT00940000159947 ENSGT00940000156304 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00910000147681 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ##22 ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a ENSGT00940000154473.a ENSGT00390000005213 ENSGT00390000003849 ENSGT00390000010499 ENSGT00940000157709 ENSGT00390000002854 ENSGT00940000153776.a.a ENSGT01090000260080.b.b ENSGT00940000162447 ENSGT00940000158260 ENSGT00550000074850 ENSGT00390000015084.d Pig MODERN SPECIES 12 TOX (ENSSSCG00000006235) CA8 (ENSSSCG00000006233) RAB2A (ENSSSCG00000006232) CHD7 (ENSSSCG00000006231) CLVS1 (ENSSSCG00000006230) ASPH (ENSSSCG00000025087) NKAIN3 (ENSSSCG00000059747) GGH (ENSSSCG00000037637) TTPA (ENSSSCG00000058048) ENSSSCG00000050933 YTHDF3 (ENSSSCG00000033144) ENSSSCG00000063449 BHLHE22 (ENSSSCG00000059145) CYP7B1 (ENSSSCG00000022092) ARMC1 (ENSSSCG00000006220) MTFR1 (ENSSSCG00000006219) ##22 ENSSSCG00000035826 PDE7A (ENSSSCG00000006218) DNAJC5B (ENSSSCG00000006217) TRIM55 (ENSSSCG00000006216) CRH (ENSSSCG00000006215) RRS1 (ENSSSCG00000006214) ADHFE1 (ENSSSCG00000006213) VXN (ENSSSCG00000023848) MYBL1 (ENSSSCG00000027872) VCPIP1 (ENSSSCG00000006209) SGK3 (ENSSSCG00000006206) ENSSSCG00000006205 TCF24 (ENSSSCG00000049935) PPP1R42 (ENSSSCG00000006204) COPS5 (ENSSSCG00000006203) Chacoan peccary MODERN SPECIES 840 RAB2A (ENSCWAG00000009724) ENSCWAG00000009840 ENSCWAG00000009900 ENSCWAG00000010023 CLVS1 (ENSCWAG00000010069) ASPH (ENSCWAG00000010208) NKAIN3 (ENSCWAG00000011268) GGH (ENSCWAG00000011330) TTPA (ENSCWAG00000011411) YTHDF3 (ENSCWAG00000011547) ENSCWAG00000011664 BHLHE22 (ENSCWAG00000011698) CYP7B1 (ENSCWAG00000011713) ARMC1 (ENSCWAG00000011746) ENSCWAG00000011813 MTFR1 (ENSCWAG00000011862) ##22 PDE7A (ENSCWAG00000011971) ENSCWAG00000012388 DNAJC5B (ENSCWAG00000012408) TRIM55 (ENSCWAG00000012488) CRH (ENSCWAG00000013107) RRS1 (ENSCWAG00000013121) ADHFE1 (ENSCWAG00000013150) VXN (ENSCWAG00000013388) MYBL1 (ENSCWAG00000013728) VCPIP1 (ENSCWAG00000014215) SGK3 (ENSCWAG00000014271) MCMDC2 (ENSCWAG00000014440) TCF24 (ENSCWAG00000014809) PPP1R42 (ENSCWAG00000014841) COPS5 (ENSCWAG00000014912) Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000158863 ENSGT00940000153886.a.b ENSGT00960000189175 ENSGT00940000153649.A ENSGT00940000159947 ENSGT00940000156304 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00860000135574 ENSGT00910000147681 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ##22 ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a ENSGT00940000154473.a ENSGT00390000005213 ENSGT00390000003849 ENSGT00390000010499 ENSGT00940000157709 ENSGT00860000135506 ENSGT00390000002854 ENSGT00940000153776.a.a ENSGT01090000260080.b.b ENSGT00940000162447 ENSGT00940000158260 ENSGT00550000074850 Camelidae ANCESTRAL SPECIES 77 ENSGT00940000155059 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000158863 ENSGT00940000153886.a.b ENSGT00940000153649.A ENSGT00940000159947 ENSGT00940000156304 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00910000147681 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ##22 ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a ENSGT00940000154473.a ENSGT00390000005213 ENSGT00390000003849 ENSGT00390000010499 ENSGT00940000157709 ENSGT00390000002854 ENSGT00940000153776.a.a ENSGT01090000260080.b.b ENSGT00940000162447 ENSGT00940000158260 ENSGT00550000074850 ENSGT00390000015084.d.f Alpaca MODERN SPECIES 3345 ARMC1 (ENSVPAG00000004186) MTFR1 (ENSVPAG00000004187) ##22 PDE7A (ENSVPAG00000004188) DNAJC5B (ENSVPAG00000004189) TRIM55 (ENSVPAG00000004190) CRH (ENSVPAG00000004191) ADHFE1 (ENSVPAG00000004192) ENSVPAG00000004193 MYBL1 (ENSVPAG00000004194) VCPIP1 (ENSVPAG00000004195) SGK3 (ENSVPAG00000004196) MCMDC2 (ENSVPAG00000004198) PPP1R42 (ENSVPAG00000004200) COPS5 (ENSVPAG00000004201) CSPP1 (ENSVPAG00000004204) ARFGEF1 (ENSVPAG00000004205) CPA6 (ENSVPAG00000004206) Arabian camel MODERN SPECIES 21 CA8 (ENSCDRG00005020483) RAB2A (ENSCDRG00005020500) CHD7 (ENSCDRG00005020522) CLVS1 (ENSCDRG00005020550) ASPH (ENSCDRG00005020568) NKAIN3 (ENSCDRG00005020651) GGH (ENSCDRG00005020657) TTPA (ENSCDRG00005020665) ENSCDRG00005020671 YTHDF3 (ENSCDRG00005020678) ENSCDRG00005020699 ENSCDRG00005020705 CYP7B1 (ENSCDRG00005020713) ENSCDRG00005020716 ARMC1 (ENSCDRG00005020720) MTFR1 (ENSCDRG00005020730) ##22 PDE7A (ENSCDRG00005020748) DNAJC5B (ENSCDRG00005020764) TRIM55 (ENSCDRG00005020793) CRH (ENSCDRG00005020833) RRS1 (ENSCDRG00005020834) ADHFE1 (ENSCDRG00005020841) VXN (ENSCDRG00005020864) MYBL1 (ENSCDRG00005020892) VCPIP1 (ENSCDRG00005020916) SGK3 (ENSCDRG00005020926) MCMDC2 (ENSCDRG00005020934) TCF24 (ENSCDRG00005020969) PPP1R42 (ENSCDRG00005020972) COPS5 (ENSCDRG00005020975) CSPP1 (ENSCDRG00005020990) Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000158863 ENSGT00940000153886.a.b ENSGT00960000189175 ENSGT00940000153649.A ENSGT00940000159947 ENSGT00940000156304 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00860000135574 ENSGT00910000147681 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ##22 ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a ENSGT00940000154473.a ENSGT00390000005213 ENSGT00390000003849 ENSGT00390000010499 ENSGT00940000157709 ENSGT00860000135506 ENSGT00390000002854 ENSGT00940000153776.a.a ENSGT01090000260080.b.b ENSGT00940000162447 ENSGT00940000158260 ENSGT00550000074850 Cetacea ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000153886.a.b ENSGT00960000189175 ENSGT00940000153649.A ENSGT00940000159947 ENSGT00940000156304 ENSGT00940000166547 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00910000147681 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ENSGT00390000014100 ENSGT00940000168359 ENSGT00950000183215.c.a.b ##22 ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a ENSGT00940000154473.a ENSGT00390000005213 ENSGT00390000003849 ENSGT00390000010499 ENSGT00940000157709 ENSGT00860000135506 ENSGT00390000002854 ENSGT00940000153776.a.a ENSGT01090000260080.b.b ENSGT00940000162447 ENSGT00940000158260 ENSGT00550000074850 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000153886.a.b.p ENSGT00940000153649.A ENSGT00940000154706.gb ENSGT00940000159947 ENSGT00940000156304 ENSGT00940000166547 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00910000147681 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ENSGT00390000014100 ENSGT00940000168359 ENSGT00950000183215.c.a.b ##22 ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a ENSGT00940000154473.a ENSGT00390000005213 ENSGT00390000003849 ENSGT00390000010499 ENSGT00940000157709 ENSGT00860000135506 ENSGT00390000002854 ENSGT00940000153776.a.a ENSGT01090000260080.b.b ENSGT00940000162447 ENSGT00940000158260 ENSGT00550000074850 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00960000189175 ENSGT00940000153886.a.b.p ENSGT00940000153649.A ENSGT00940000154706.gb ENSGT00940000159947 ENSGT00940000156304 ENSGT00940000166547 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00910000147681 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ##22 ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a ENSGT00940000154473.a ENSGT00390000005213 ENSGT00390000003849 ENSGT00390000010499 ENSGT00940000157709 ENSGT00860000135506 ENSGT00390000002854 ENSGT00940000153776.a.a ENSGT01090000260080.b.b ENSGT00940000162447 ENSGT00940000158260 ENSGT00550000074850 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00960000189175 ENSGT00940000153886.a.b.p ENSGT00940000153649.A ENSGT00940000154706.gb ENSGT00940000159947 ENSGT00940000156304 ENSGT00940000166547 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00910000147681 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ##22 ENSGT00940000157658 ENSGT00390000017669.b ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a ENSGT00940000154473.a ENSGT00390000005213 ENSGT00390000003849 ENSGT00390000010499 ENSGT00940000157709 ENSGT00390000002854 ENSGT00940000153776.a.a ENSGT01090000260080.b.b ENSGT00940000162447 ENSGT00940000158260 ENSGT00550000074850 Monodontidae ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00960000189175 ENSGT00940000153886.a.b.p ENSGT00940000153649.A ENSGT00940000154706.gb ENSGT00940000159947 ENSGT00940000156304 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00940000162252.a.b.a ENSGT00910000147681 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ##22 ENSGT00940000157658 ENSGT00390000017669.b ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a ENSGT00940000154473.a ENSGT00390000005213 ENSGT00390000003849 ENSGT00390000010499 ENSGT00940000157709 ENSGT00390000002854 ENSGT00940000153776.a.a ENSGT01090000260080.b.b ENSGT00940000162447 ENSGT00940000158260 ENSGT00550000074850 Narwhal MODERN SPECIES 300 RAB2A (ENSMMNG00015014666) ENSMMNG00015014634 ENSMMNG00015014606 ENSMMNG00015014583 CLVS1 (ENSMMNG00015014569) ASPH (ENSMMNG00015014513) NKAIN3 (ENSMMNG00015014482) GGH (ENSMMNG00015014466) TTPA (ENSMMNG00015014455) YTHDF3 (ENSMMNG00015014419) ENSMMNG00015014408 ENSMMNG00015014395 BHLHE22 (ENSMMNG00015014386) CYP7B1 (ENSMMNG00015014371) ARMC1 (ENSMMNG00015014356) MTFR1 (ENSMMNG00015014325) ##22 ENSMMNG00015014303 PDE7A (ENSMMNG00015014265) DNAJC5B (ENSMMNG00015014239) TRIM55 (ENSMMNG00015014189) RRS1 (ENSMMNG00015014163) ADHFE1 (ENSMMNG00015014130) VXN (ENSMMNG00015014102) MYBL1 (ENSMMNG00015014075) VCPIP1 (ENSMMNG00015014042) SGK3 (ENSMMNG00015014018) MCMDC2 (ENSMMNG00015013975) TCF24 (ENSMMNG00015003942) PPP1R42 (ENSMMNG00015003922) COPS5 (ENSMMNG00015003896) ENSMMNG00015003870 Beluga whale MODERN SPECIES 47 CHD7 (ENSDLEG00000014252) CLVS1 (ENSDLEG00000014225) ASPH (ENSDLEG00000013927) NKAIN3 (ENSDLEG00000013867) GGH (ENSDLEG00000013842) TTPA (ENSDLEG00000013829) YTHDF3 (ENSDLEG00000013813) ENSDLEG00000013804 ENSDLEG00000013798 ENSDLEG00000013782 ENSDLEG00000013768 BHLHE22 (ENSDLEG00000013759) ENSDLEG00000013748 CYP7B1 (ENSDLEG00000013719) ARMC1 (ENSDLEG00000013690) MTFR1 (ENSDLEG00000013658) ##22 ENSDLEG00000013648 DNAJC5B (ENSDLEG00000013633) PDE7A (ENSDLEG00000013570) TRIM55 (ENSDLEG00000013551) CRH (ENSDLEG00000013545) RRS1 (ENSDLEG00000014102) ADHFE1 (ENSDLEG00000014067) CUNH8orf46 (ENSDLEG00000014052) MYBL1 (ENSDLEG00000013961) VCPIP1 (ENSDLEG00000013944) SGK3 (ENSDLEG00000013898) MCMDC2 (ENSDLEG00000013877) TCF24 (ENSDLEG00000013861) PPP1R42 (ENSDLEG00000013815) ENSDLEG00000013805 Vaquita MODERN SPECIES 8 ENSPSNG00000014232 ENSPSNG00000014444 ENSPSNG00000014695 ENSPSNG00000014838 CLVS1 (ENSPSNG00000015072) ASPH (ENSPSNG00000015174) ENSPSNG00000015230 NKAIN3 (ENSPSNG00000015534) GGH (ENSPSNG00000015614) TTPA (ENSPSNG00000015656) YTHDF3 (ENSPSNG00000015736) ENSPSNG00000015879 BHLHE22 (ENSPSNG00000015901) CYP7B1 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SGK3 (ENSBMSG00010019860) MCMDC2 (ENSBMSG00010019741) TCF24 (ENSBMSG00010019697) PPP1R42 (ENSBMSG00010019585) COPS5 (ENSBMSG00010019531) ENSBMSG00010019494 Pecora ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000158863 ENSGT00940000153886.a.b ENSGT00960000189175 ENSGT00940000153649.A ENSGT00940000159947 ENSGT00940000156304 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00860000135574 ENSGT00910000147681 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ##22 ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a ENSGT00940000154473.a ENSGT00390000005213 ENSGT00390000003849 ENSGT00390000010499 ENSGT00940000157709 ENSGT00390000002854 ENSGT00940000153776.a.a ENSGT01090000260080.b.b ENSGT00940000162447 ENSGT00940000158260 ENSGT00550000074850 ENSGT00390000015084.d.e Yarkand deer MODERN SPECIES 13 RAB2A (ENSCHYG00000025151) CHD7 (ENSCHYG00000025292) CLVS1 (ENSCHYG00000025501) ASPH (ENSCHYG00000025689) NKAIN3 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ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ##22 ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a ENSGT00940000154473.a ENSGT00390000005213 ENSGT00390000003849 ENSGT00390000010499 ENSGT00940000157709 ENSGT00390000002854 ENSGT00940000153776.a.a ENSGT01090000260080.b.b ENSGT00940000162447 ENSGT00940000158260 ENSGT00550000074850 ENSGT00390000015084.d.e Siberian musk deer DUPLICATION Siberian musk deer DUPLICATION Siberian musk deer MODERN SPECIES 1166 OGDHL (ENSMMSG00000017262) PARG (ENSMMSG00000017152) TIMM23B (ENSMMSG00000017106) ENSMMSG00000017087 ENSMMSG00000017072 ENSMMSG00000012008 ZFAND4 (ENSMMSG00000011735) MARCHF8 (ENSMMSG00000011687) ALOX5 (ENSMMSG00000011637) OR13A1 (ENSMMSG00000011620) ENSMMSG00000011614 ENSMMSG00000011592 ENSMMSG00000011562 ENSMMSG00000011543 ENSMMSG00000011523 ENSMMSG00000011513 ##22 ENSMMSG00000011486 ENSMMSG00000011468 DEPP1 (ENSMMSG00000011461) RASSF4 (ENSMMSG00000011454) TMEM72 (ENSMMSG00000011429) CXCL12 (ENSMMSG00000024231) 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ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000153886.a.b ENSGT00960000189175 ENSGT00940000153649.A ENSGT00940000159947 ENSGT00940000156304 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00860000135574 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b.k ##22 ENSGT00940000157658.l ENSGT00950000183215.c.a.b.l ##22 ENSGT00940000157658.k ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a ENSGT00940000154473.a ENSGT00390000005213 ENSGT00390000003849 ENSGT00390000010499 ENSGT00940000157709 ENSGT00390000002854 ENSGT00940000153776.a.a ENSGT01090000260080.b.b ENSGT00940000162447 ENSGT00940000158260 ENSGT00550000074850.e ENSGT00390000015084.d.e Bos ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000158863 ENSGT00940000153886.a.b ENSGT00960000189175 ENSGT00940000153649.A ENSGT00940000159947 ENSGT00940000156304 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00860000135574 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b.l ##22 ENSGT00950000183215.c.a.b.k ##22 ENSGT00940000157658.l ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a ENSGT00940000154473.a ENSGT00390000005213 ENSGT00390000003849 ENSGT00390000010499 ENSGT00940000157709 ENSGT00390000002854 ENSGT00940000153776.a.a ENSGT01090000260080.b.b ENSGT00940000162447 ENSGT00940000158260 ENSGT00550000074850.e Bos_b ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000155059 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000158863 ENSGT00940000153886.a.b ENSGT00940000153649.A ENSGT00940000159947 ENSGT00940000156304 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00860000135574 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b.l ##22 ENSGT00940000157658.l ENSGT00940000157658.k ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a ENSGT00940000154473.a ENSGT00390000005213 ENSGT00390000003849 ENSGT00390000010499 ENSGT00940000157709 ENSGT00390000002854 ENSGT00940000153776.a.a ENSGT01090000260080.b.b ENSGT00940000162447 ENSGT00940000158260 ENSGT00550000074850.e Cow MODERN SPECIES 5 TOX (ENSBTAG00000004954) ENSBTAG00000054521 CA8 (ENSBTAG00000017529) RAB2A (ENSBTAG00000000948) CHD7 (ENSBTAG00000021841) CLVS1 (ENSBTAG00000043978) ASPH (ENSBTAG00000026283) NKAIN3 (ENSBTAG00000054400) GGH (ENSBTAG00000007534) TTPA (ENSBTAG00000022471) YTHDF3 (ENSBTAG00000018557) ENSBTAG00000055090 CYP7B1 (ENSBTAG00000001299) BHLHE22 (ENSBTAG00000033173) ARMC1 (ENSBTAG00000015901) MTFR1 (ENSBTAG00000008629) ##22 PDE7A (ENSBTAG00000011614) ENSBTAG00000055026 DNAJC5B (ENSBTAG00000015229) TRIM55 (ENSBTAG00000021009) CRH (ENSBTAG00000033128) RRS1 (ENSBTAG00000016716) ADHFE1 (ENSBTAG00000004476) VXN (ENSBTAG00000002192) MYBL1 (ENSBTAG00000011981) VCPIP1 (ENSBTAG00000006695) SGK3 (ENSBTAG00000013284) MCMDC2 (ENSBTAG00000000620) TCF24 (ENSBTAG00000050513) PPP1R42 (ENSBTAG00000011205) COPS5 (ENSBTAG00000002784) Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 5 RAB2A (ENSBIXG00005022188) CHD7 (ENSBIXG00005022086) CLVS1 (ENSBIXG00005022041) ASPH (ENSBIXG00005003705) ENSBIXG00005021840 NKAIN3 (ENSBIXG00005021820) ENSBIXG00005003675 GGH (ENSBIXG00005007361) TTPA (ENSBIXG00005021749) YTHDF3 (ENSBIXG00005021673) ENSBIXG00005021413 CYP7B1 (ENSBIXG00005021356) BHLHE22 (ENSBIXG00005021284) ENSBIXG00005021269 ARMC1 (ENSBIXG00005007368) MTFR1 (ENSBIXG00005021188) ##22 PDE7A (ENSBIXG00005021100) ENSBIXG00005020934 DNAJC5B (ENSBIXG00005020911) TRIM55 (ENSBIXG00005020887) CRH (ENSBIXG00005020841) RRS1 (ENSBIXG00005020829) ADHFE1 (ENSBIXG00005020812) VXN (ENSBIXG00005003510) MYBL1 (ENSBIXG00005003490) VCPIP1 (ENSBIXG00005020575) SGK3 (ENSBIXG00005020529) MCMDC2 (ENSBIXG00005020358) TCF24 (ENSBIXG00005020310) PPP1R42 (ENSBIXG00005020289) COPS5 (ENSBIXG00005003382) Bos_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183215.c.a.b.l ##22 Domestic yak MODERN SPECIES 24 ENSBGRG00000003482 GYS2 (ENSBGRG00000003443) SPX (ENSBGRG00000003414) GOLT1B (ENSBGRG00000003380) RECQL (ENSBGRG00000003337) PYROXD1 (ENSBGRG00000003299) ENSBGRG00000003285 SLCO1A2 (ENSBGRG00000003238) ENSBGRG00000003165 SLCO1C1 (ENSBGRG00000003132) PDE3A (ENSBGRG00000003042) ENSBGRG00000003028 ENSBGRG00000003019 AEBP2 (ENSBGRG00000002969) PLEKHA5 (ENSBGRG00000002854) ENSBGRG00000002822 ##22 CAPZA3 (ENSBGRG00000002812) PLCZ1 (ENSBGRG00000002779) PIK3C2G (ENSBGRG00000002479) RERGL (ENSBGRG00000002431) ENSBGRG00000002424 ENSBGRG00000002415 LMO3 (ENSBGRG00000002364) ENSBGRG00000002348 ENSBGRG00000002345 MGST1 (ENSBGRG00000002333) SLC15A5 (ENSBGRG00000002300) ENSBGRG00000002292 ENSBGRG00000002283 DERA (ENSBGRG00000002244) STRAP (ENSBGRG00000002181) American bison MODERN SPECIES 2892 SDC2 (ENSBBBG00000003987) PTDSS1 (ENSBBBG00000016024) MTERF3 (ENSBBBG00000016006) ENSBBBG00000003981 GDF6 (ENSBBBG00000008331) ENSBBBG00000002575 ##22 CFAP418 (ENSBBBG00000015959) PLEKHF2 (ENSBBBG00000015951) NDUFAF6 (ENSBBBG00000007034) TP53INP1 (ENSBBBG00000015906) CCNE2 (ENSBBBG00000003954) INTS8 (ENSBBBG00000003945) DPY19L4 (ENSBBBG00000007456) ESRP1 (ENSBBBG00000015792) VIRMA (ENSBBBG00000015671) RAD54B (ENSBBBG00000015642) GEM (ENSBBBG00000003433) CDH17 (ENSBBBG00000003449) PDP1 (ENSBBBG00000015585) TMEM67 (ENSBBBG00000015579) ENSBBBG00000015527 Caprinae ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000158863 ENSGT00940000153886.a.b ENSGT00940000153649.A ENSGT00940000159947 ENSGT00940000156304 ENSGT00940000161484 ENSGT00960000187139 ENSGT00390000014547.c.k.a ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00860000135574 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ENSGT00390000014100.j ENSGT00950000183215.c.a.b ##22 ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a ENSGT00940000154473.a ENSGT00390000005213 ENSGT00390000003849 ENSGT00390000010499 ENSGT00940000157709 ENSGT00390000002854 ENSGT00940000153776.a.a ENSGT01090000260080.b.b ENSGT00940000162447 ENSGT00940000158260 ENSGT00550000074850 ENSGT00390000015084.d.f Goat MODERN SPECIES 5 ENSCHIG00000007833 RAB2A (ENSCHIG00000020374) CHD7 (ENSCHIG00000011729) ENSCHIG00000008362 CLVS1 (ENSCHIG00000012139) ASPH (ENSCHIG00000027073) ENSCHIG00000004443 NKAIN3 (ENSCHIG00000012560) GGH (ENSCHIG00000009898) TTPA (ENSCHIG00000026720) YTHDF3 (ENSCHIG00000026460) ENSCHIG00000024644 BHLHE22 (ENSCHIG00000010726) CYP7B1 (ENSCHIG00000012833) ENSCHIG00000012456 MTFR1 (ENSCHIG00000022918) ##22 ENSCHIG00000012015 PDE7A (ENSCHIG00000016873) ENSCHIG00000022187 DNAJC5B (ENSCHIG00000023758) TRIM55 (ENSCHIG00000014432) CRH (ENSCHIG00000010353) RRS1 (ENSCHIG00000009141) ADHFE1 (ENSCHIG00000017994) VXN (ENSCHIG00000010815) MYBL1 (ENSCHIG00000022375) VCPIP1 (ENSCHIG00000010272) SGK3 (ENSCHIG00000021932) MCMDC2 (ENSCHIG00000022620) PPP1R42 (ENSCHIG00000010584) COPS5 (ENSCHIG00000020229) Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 25 RAB2A (ENSOARG00020025690) CHD7 (ENSOARG00020025706) ENSOARG00020025727 CLVS1 (ENSOARG00020025743) ASPH (ENSOARG00020025751) NKAIN3 (ENSOARG00020025781) ENSOARG00020025786 ENSOARG00020025790 ENSOARG00020025792 GGH (ENSOARG00020025795) TTPA (ENSOARG00020025797) YTHDF3 (ENSOARG00020025799) ENSOARG00020025808 BHLHE22 (ENSOARG00020025812) ARMC1 (ENSOARG00020025817) MTFR1 (ENSOARG00020025827) ##22 ENSOARG00020025835 PDE7A (ENSOARG00020025840) DNAJC5B (ENSOARG00020025861) TRIM55 (ENSOARG00020025874) CRH (ENSOARG00020025933) ADHFE1 (ENSOARG00020025938) VXN (ENSOARG00020025949) MYBL1 (ENSOARG00020025967) VCPIP1 (ENSOARG00020025981) SGK3 (ENSOARG00020025987) MCMDC2 (ENSOARG00020025994) TCF24 (ENSOARG00020026013) PPP1R42 (ENSOARG00020026014) COPS5 (ENSOARG00020026018) CSPP1 (ENSOARG00020006099) Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000158863 ENSGT00940000153886.a.b.f ENSGT00940000153649.A ENSGT00940000159947 ENSGT00940000156304 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00860000135574 ENSGT00910000147681 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ##22 ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a ENSGT00940000154473.a ENSGT00390000005213 ENSGT00390000003849 ENSGT00390000010499 ENSGT00940000157709 ENSGT00390000002854 ENSGT00940000153776.a.a ENSGT01090000260080.b.b ENSGT00940000162447 ENSGT00940000158260 ENSGT00550000074850 ENSGT00390000015084.d Primates ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000158863 ENSGT00940000153886.a.b.f ENSGT00940000153649.A ENSGT00940000159947 ENSGT00940000156304 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00860000135574 ENSGT00910000147681 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ##22 ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a ENSGT00940000154473.a ENSGT00390000005213 ENSGT00390000003849 ENSGT00390000010499 ENSGT00940000157709 ENSGT00390000002854 ENSGT00940000153776.a.a ENSGT01090000260080.b.b ENSGT00940000162447 ENSGT00940000158260 ENSGT00550000074850 ENSGT00390000015084.d Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000155059 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000158863 ENSGT00940000153886.a.b.f ENSGT00940000153649.A ENSGT00940000159947 ENSGT00940000156304 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00860000135574 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ##22 ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a ENSGT00940000154473.a ENSGT00390000005213 ENSGT00390000003849 ENSGT00390000010499 ENSGT00940000157709 ENSGT00390000002854 ENSGT00940000153776.a.a ENSGT01090000260080.b.b ENSGT00940000162447 ENSGT00940000158260 ENSGT00550000074850 ENSGT00390000015084.d Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000155059 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000158863 ENSGT00940000153886.a.b.f ENSGT00940000153649.A ENSGT00940000159947 ENSGT00940000156304 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00860000135574 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ##22 ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a ENSGT00940000154473.a ENSGT00390000005213 ENSGT00390000003849 ENSGT00390000010499 ENSGT00940000157709 ENSGT00390000002854 ENSGT00940000153776.a.a ENSGT01090000260080.b.b ENSGT00940000162447 ENSGT00940000158260 ENSGT00550000074850 ENSGT00390000015084.d Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES 68 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00860000135574 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ##22 ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a ENSGT00940000154473.a ENSGT00390000005213 ENSGT00390000003849 ENSGT00390000010499 ENSGT00940000157709 ENSGT00390000002854 ENSGT00940000153776.a.a ENSGT01090000260080.b.b ENSGT00940000162447 ENSGT00940000158260 ENSGT00550000074850 ENSGT00390000015084.d Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 445 NKAIN3 (ENSPSMG00000025456) ENSPSMG00000025458 GGH (ENSPSMG00000025462) TTPA (ENSPSMG00000025463) YTHDF3 (ENSPSMG00000025470) ENSPSMG00000025473 BHLHE22 (ENSPSMG00000025477) CYP7B1 (ENSPSMG00000025483) ARMC1 (ENSPSMG00000025494) MTFR1 (ENSPSMG00000025498) ##22 PDE7A (ENSPSMG00000025531) DNAJC5B (ENSPSMG00000025539) TRIM55 (ENSPSMG00000000157) CRH (ENSPSMG00000000193) RRS1 (ENSPSMG00000000222) ADHFE1 (ENSPSMG00000000270) VXN (ENSPSMG00000000317) MYBL1 (ENSPSMG00000000451) VCPIP1 (ENSPSMG00000000556) SGK3 (ENSPSMG00000000750) MCMDC2 (ENSPSMG00000001043) TCF24 (ENSPSMG00000001057) ENSPSMG00000001097 COPS5 (ENSPSMG00000001151) CSPP1 (ENSPSMG00000001230) Coquerels sifaka MODERN SPECIES 927 ARMC1 (ENSPCOG00000025990) MTFR1 (ENSPCOG00000023689) ##22 PDE7A (ENSPCOG00000028393) DNAJC5B (ENSPCOG00000021321) TRIM55 (ENSPCOG00000016111) ADHFE1 (ENSPCOG00000028805) VXN (ENSPCOG00000027580) MYBL1 (ENSPCOG00000007372) VCPIP1 (ENSPCOG00000026640) SGK3 (ENSPCOG00000024667) MCMDC2 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(ENSMICG00000011048) ARFGEF1 (ENSMICG00000011062) Bushbaby MODERN SPECIES 228 BHLHE22 (ENSOGAG00000034883) CYP7B1 (ENSOGAG00000016306) ARMC1 (ENSOGAG00000011721) MTFR1 (ENSOGAG00000007717) ##22 PDE7A (ENSOGAG00000007720) DNAJC5B (ENSOGAG00000001082) TRIM55 (ENSOGAG00000001083) CRH (ENSOGAG00000030179) RRS1 (ENSOGAG00000001085) ADHFE1 (ENSOGAG00000001086) VXN (ENSOGAG00000008697) ENSOGAG00000031090 MYBL1 (ENSOGAG00000004344) VCPIP1 (ENSOGAG00000012360) SGK3 (ENSOGAG00000012362) MCMDC2 (ENSOGAG00000012369) PPP1R42 (ENSOGAG00000012380) ENSOGAG00000027429 COPS5 (ENSOGAG00000012387) Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000158863 ENSGT00940000153886.a.b.f ENSGT00940000153649.A ENSGT00940000159947 ENSGT00940000156304 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00860000135574 ENSGT00910000147681 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ##22 ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a ENSGT00940000154473.a ENSGT00390000005213 ENSGT00390000003849 ENSGT00390000010499 ENSGT00940000157709 ENSGT00390000002854 ENSGT00940000153776.a.a ENSGT01090000260080.b.b ENSGT00940000162447 ENSGT00940000158260 ENSGT00550000074850 ENSGT00390000015084.d Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000158863 ENSGT00940000153886.a.b.f ENSGT00940000153649.A ENSGT00940000159947 ENSGT00940000156304 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00860000135574 ENSGT00910000147681 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ##22 ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a ENSGT00940000154473.a ENSGT00390000005213 ENSGT00390000003849 ENSGT00390000010499 ENSGT00940000157709 ENSGT00390000002854 ENSGT00940000153776.a.a ENSGT01090000260080.b.b ENSGT00940000162447 ENSGT00940000158260 ENSGT00910000146934 ENSGT00550000074850 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000158863 ENSGT00910000147170 ENSGT00940000153886.a.b.f ENSGT00940000153649.A ENSGT00940000159947 ENSGT00940000156304 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00860000135574 ENSGT00910000147681 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ##22 ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a ENSGT00940000154473.a ENSGT00390000005213 ENSGT00390000003849 ENSGT00390000010499 ENSGT00940000157709 ENSGT00390000002854 ENSGT00940000163244.d.b.a.b.b.a.b ENSGT00390000009693.m.a ENSGT00940000153776.a.a ENSGT00990000204339 ENSGT01090000260080.b.b ENSGT00940000162447 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00910000147347 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000158863 ENSGT00910000147170 ENSGT00940000153886.a.b.f ENSGT00940000153649.A ENSGT00940000159947 ENSGT00940000156304 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ENSGT00390000014100.c ENSGT00950000183215.c.a.b ##22 ENSGT00940000157658 ENSGT00910000148230 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a ENSGT00940000154473.a ENSGT00390000005213 ENSGT00390000003849 ENSGT00390000010499 ENSGT00940000157709 ENSGT00390000002854 ENSGT00940000163244.d.b.a.b.b.a.b ENSGT00390000009693.m.a ENSGT00940000153776.a.a ENSGT00990000204339 ENSGT01090000260080.b.b Hominidae ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00910000147347 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000158863 ENSGT00910000147170 ENSGT00940000153886.a.b.f ENSGT00940000153649.A ENSGT00940000159947 ENSGT00940000156304 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ENSGT00390000014100.c ENSGT00950000183215.c.a.b ##22 ENSGT00940000157658 ENSGT00910000148230 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a ENSGT00940000154473.a ENSGT00390000005213 ENSGT00390000003849 ENSGT00390000010499 ENSGT00940000157709 ENSGT00390000002854 ENSGT00940000163244.d.b.a.b.b.a.b ENSGT00390000009693.m.a ENSGT00940000153776.a.a ENSGT01090000260080.b.b ENSGT00940000162447 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000153886.a.b.f ENSGT00940000153649.A ENSGT00900000143563.d ENSGT00390000016650.g.b ENSGT00940000153052.c.a.b ENSGT00940000159947 ENSGT00940000156304 ENSGT00940000157752.b ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ENSGT00390000014100.c ENSGT00950000183215.c.a.b ##22 ENSGT00940000157658 ENSGT00910000148230 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a ENSGT00940000154473.a ENSGT00390000005213 ENSGT00390000003849 ENSGT00390000010499 ENSGT00940000157709 ENSGT00390000002854 ENSGT00940000163244.d.b.a.b.b.a.b ENSGT00390000009693.m.a ENSGT00940000153776.a.a ENSGT01090000260080.b.b ENSGT00940000162447 Gorilla MODERN SPECIES 21 ENSGGOG00000041942 ENSGGOG00000023384 ENSGGOG00000028098 CLVS1 (ENSGGOG00000007625) ASPH 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ENSGT00940000153141.B.b ENSGT00390000014100.c ENSGT00950000183215.c.a.b ##22 ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a ENSGT00940000154473.a ENSGT00390000005213 ENSGT00390000003849 ENSGT00390000010499 ENSGT00940000157709 ENSGT00390000002854 ENSGT00940000163244.d.b.a.b.b.a.b ENSGT00390000009693.m.a ENSGT00940000153776.a.a ENSGT01090000260080.b.b ENSGT00940000162447 ENSGT00940000158260 Pan ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000153649.A ENSGT00390000016650.g.b ENSGT00940000153052.c.a.b ENSGT00940000159947 ENSGT00940000156304 ENSGT00940000157752.b ENSGT00940000161484 ENSGT00940000154795.c ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00860000135574 ENSGT00910000147681 ENSGT00940000153141.B.b ENSGT00390000014100.c ENSGT00950000183215.c.a.b ##22 ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a ENSGT00940000154473.a ENSGT00390000005213 ENSGT00390000003849 ENSGT00390000010499 ENSGT00940000157709 ENSGT00390000002854 ENSGT00940000163244.d.b.a.b.b.a.b ENSGT00390000009693.m.a ENSGT00940000153776.a.a ENSGT01090000260080.b.b ENSGT00940000162447 ENSGT00940000158260 Chimpanzee MODERN SPECIES 21 CLVS1 (ENSPTRG00000020288) ENSPTRG00000052386 ASPH (ENSPTRG00000020289) ENSPTRG00000042694 NKAIN3 (ENSPTRG00000020292) ENSPTRG00000046745 ENSPTRG00000043036 GGH (ENSPTRG00000020293) TTPA (ENSPTRG00000020294) YTHDF3 (ENSPTRG00000049135) ENSPTRG00000048438 ENSPTRG00000050724 ENSPTRG00000022575 CYP7B1 (ENSPTRG00000020297) ARMC1 (ENSPTRG00000020298) MTFR1 (ENSPTRG00000020299) ##22 PDE7A (ENSPTRG00000030991) DNAJC5B (ENSPTRG00000020301) TRIM55 (ENSPTRG00000020302) CRH (ENSPTRG00000020304) RRS1 (ENSPTRG00000030988) ADHFE1 (ENSPTRG00000045798) VXN (ENSPTRG00000045591) MYBL1 (ENSPTRG00000020308) VCPIP1 (ENSPTRG00000020309) C8H8orf44 (ENSPTRG00000020310) ENSPTRG00000052460 SGK3 (ENSPTRG00000020312) MCMDC2 (ENSPTRG00000020313) TCF24 (ENSPTRG00000043956) PPP1R42 (ENSPTRG00000020316) Bonobo MODERN SPECIES 21 ENSPPAG00000028711 ASPH (ENSPPAG00000036467) ENSPPAG00000029474 NKAIN3 (ENSPPAG00000034556) ENSPPAG00000035311 ENSPPAG00000032702 GGH (ENSPPAG00000036800) TTPA (ENSPPAG00000039436) ENSPPAG00000001547 YTHDF3 (ENSPPAG00000043483) ENSPPAG00000041014 ENSPPAG00000032241 ENSPPAG00000032908 CYP7B1 (ENSPPAG00000038686) ARMC1 (ENSPPAG00000041437) MTFR1 (ENSPPAG00000030706) ##22 PDE7A (ENSPPAG00000037038) DNAJC5B (ENSPPAG00000042664) TRIM55 (ENSPPAG00000028998) CRH (ENSPPAG00000020093) RRS1 (ENSPPAG00000024378) ADHFE1 (ENSPPAG00000043914) VXN (ENSPPAG00000042638) MYBL1 (ENSPPAG00000031091) VCPIP1 (ENSPPAG00000028693) ENSPPAG00000041765 ENSPPAG00000039360 SGK3 (ENSPPAG00000037172) ENSPPAG00000033423 ENSPPAG00000034583 ENSPPAG00000036430 Human MODERN SPECIES 20 SDCBP (ENSG00000137575) NSMAF (ENSG00000035681) TOX (ENSG00000198846) CA8 (ENSG00000178538) RAB2A (ENSG00000104388) CHD7 (ENSG00000171316) CLVS1 (ENSG00000177182) ASPH (ENSG00000198363) NKAIN3 (ENSG00000185942) GGH (ENSG00000137563) TTPA (ENSG00000137561) YTHDF3 (ENSG00000185728) BHLHE22 (ENSG00000180828) CYP7B1 (ENSG00000172817) ARMC1 (ENSG00000104442) MTFR1 (ENSG00000066855) ##22 PDE7A (ENSG00000205268) DNAJC5B (ENSG00000147570) TRIM55 (ENSG00000147573) CRH (ENSG00000147571) RRS1 (ENSG00000179041) ENSG00000285655 ADHFE1 (ENSG00000147576) VXN (ENSG00000169085) MYBL1 (ENSG00000185697) VCPIP1 (ENSG00000175073) C8orf44-SGK3 (ENSG00000288602) SGK3 (ENSG00000104205) MCMDC2 (ENSG00000178460) TCF24 (ENSG00000261787) PPP1R42 (ENSG00000178125) Orangutan MODERN SPECIES 21 CA8 (ENSPPYG00000018615) RAB2A (ENSPPYG00000018617) CHD7 (ENSPPYG00000018618) ENSPPYG00000036142 ENSPPYG00000039758 CLVS1 (ENSPPYG00000018621) ASPH (ENSPPYG00000018622) NKAIN3 (ENSPPYG00000018623) GGH (ENSPPYG00000018624) TTPA (ENSPPYG00000040852) YTHDF3 (ENSPPYG00000018626) ENSPPYG00000018628 CYP7B1 (ENSPPYG00000018629) ENSPPYG00000030990 ARMC1 (ENSPPYG00000018630) MTFR1 (ENSPPYG00000018631) ##22 PDE7A (ENSPPYG00000018632) DNAJC5B (ENSPPYG00000018634) TRIM55 (ENSPPYG00000018635) CRH (ENSPPYG00000018636) RRS1 (ENSPPYG00000018637) ADHFE1 (ENSPPYG00000018638) VXN (ENSPPYG00000018639) MYBL1 (ENSPPYG00000018640) VCPIP1 (ENSPPYG00000018641) ENSPPYG00000018642 SGK3 (ENSPPYG00000018644) MCMDC2 (ENSPPYG00000018645) TCF24 (ENSPPYG00000032491) ENSPPYG00000018647 COPS5 (ENSPPYG00000018648) Gibbon MODERN SPECIES 6 MATN2 (ENSNLEG00000003768) RPL30 (ENSNLEG00000029825) ENSNLEG00000029861 ENSNLEG00000031246 ENSNLEG00000033181 NKAIN3 (ENSNLEG00000003847) GGH (ENSNLEG00000003849) TTPA (ENSNLEG00000003861) YTHDF3 (ENSNLEG00000003872) ENSNLEG00000033907 ENSNLEG00000028285 ENSNLEG00000029731 ENSNLEG00000034961 CYP7B1 (ENSNLEG00000003905) ARMC1 (ENSNLEG00000003916) MTFR1 (ENSNLEG00000003936) ##22 PDE7A (ENSNLEG00000003962) ENSNLEG00000028763 DNAJC5B (ENSNLEG00000010568) TRIM55 (ENSNLEG00000010586) CRH (ENSNLEG00000034419) RRS1 (ENSNLEG00000027730) ADHFE1 (ENSNLEG00000010666) VXN (ENSNLEG00000010728) VCPIP1 (ENSNLEG00000010732) ENSNLEG00000029586 SGK3 (ENSNLEG00000010743) ENSNLEG00000031156 MCMDC2 (ENSNLEG00000010822) TCF24 (ENSNLEG00000010898) ENSNLEG00000010902 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000155059.f.a.b ENSGT00940000159497 ENSGT00940000158863 ENSGT00910000147170 ENSGT00940000153886.a.b.f ENSGT00940000153649.A ENSGT00940000159947 ENSGT00940000156304 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ##22 ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a ENSGT00940000154473.a ENSGT00390000005213 ENSGT00390000003849 ENSGT00390000010499 ENSGT00940000157709 ENSGT00390000002854 ENSGT00940000163244.d.b.a.b.b.a.b ENSGT00390000009693.m.a ENSGT00940000153776.a.a ENSGT00990000204339 ENSGT01090000260080.b.b ENSGT00940000162447 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 186 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ##22 ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a ENSGT00940000154473.a ENSGT00950000182878.b.a.c.a.b.l.b ENSGT00390000005213 ENSGT00390000003849 ENSGT00390000010499 ENSGT00940000157709 ENSGT00940000155309.f ENSGT00940000154445.e.a ENSGT00390000002854 ENSGT00940000163244.d.b.a.b.b.a.b ENSGT00390000009693.m.a ENSGT00940000153776.a.a Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1612 ARMC1 (ENSRROG00000028852) MTFR1 (ENSRROG00000037841) ##22 PDE7A (ENSRROG00000042395) DNAJC5B (ENSRROG00000029357) TRIM55 (ENSRROG00000042603) CRH (ENSRROG00000027040) ENSRROG00000036665 RRS1 (ENSRROG00000013472) ADHFE1 (ENSRROG00000041512) VXN (ENSRROG00000032222) MYBL1 (ENSRROG00000043732) VCPIP1 (ENSRROG00000040394) ENSRROG00000026408 ENSRROG00000041218 ENSRROG00000026443 SGK3 (ENSRROG00000044810) MCMDC2 (ENSRROG00000032568) Black snub-nosed monkey DUPLICATION Black snub-nosed monkey DUPLICATION Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1856 AGTR1 (ENSRBIG00000041468) CPB1 (ENSRBIG00000032988) CPA3 (ENSRBIG00000031558) 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THNSL1 (ENSRBIG00000031482) ENKUR (ENSRBIG00000033429) GPR158 (ENSRBIG00000032195) MYO3A (ENSRBIG00000028265) GAD2 (ENSRBIG00000044008) ENSRBIG00000039073 ENSRBIG00000032223 CYP7B1 (ENSRBIG00000031298) ARMC1 (ENSRBIG00000039049) ENSRBIG00000035487 ##22 ENSRBIG00000032704 ##22 PDE7A (ENSRBIG00000039600) DNAJC5B (ENSRBIG00000039171) TRIM55 (ENSRBIG00000028261) CRH (ENSRBIG00000005039) ENSRBIG00000035415 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000155059.f.a.b ENSGT00940000159497 ENSGT00940000158863 ENSGT00910000147170 ENSGT00940000153886.a.b.f ENSGT00940000153649.A ENSGT00940000159947 ENSGT00940000156304 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ##22 ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a ENSGT00940000154473.a ENSGT00390000005213 ENSGT00390000003849 ENSGT00390000010499 ENSGT00940000157709 ENSGT00390000002854 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ENSGT00940000159294 ENSGT00910000148230 ENSGT00940000154004.a ENSGT00940000154473.a ENSGT00390000005213 ENSGT00390000003849 ENSGT00390000010499 ENSGT00940000157709 ENSGT00390000002854 ENSGT00940000168383 ENSGT00390000009693.m.a ENSGT00940000153776.a.a ENSGT01090000260080.b.b ENSGT00990000204339 Drill MODERN SPECIES 1339 ENSMLEG00000032680 ENSMLEG00000026807 ENSMLEG00000027352 CYP7B1 (ENSMLEG00000032171) ENSMLEG00000037500 MTFR1 (ENSMLEG00000038829) ##22 PDE7A (ENSMLEG00000034626) DNAJC5B (ENSMLEG00000042312) Sooty mangabey MODERN SPECIES 647 RAB2A (ENSCATG00000028334) CHD7 (ENSCATG00000020229) CLVS1 (ENSCATG00000030286) ASPH (ENSCATG00000037051) NKAIN3 (ENSCATG00000040480) ENSCATG00000031297 GGH (ENSCATG00000031907) ENSCATG00000020757 TTPA (ENSCATG00000037149) YTHDF3 (ENSCATG00000038669) ENSCATG00000036275 ENSCATG00000016419 ENSCATG00000016486 CYP7B1 (ENSCATG00000037154) ARMC1 (ENSCATG00000037424) MTFR1 (ENSCATG00000038587) ##22 PDE7A (ENSCATG00000042309) ENSCATG00000043678 DNAJC5B 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(ENSPANG00000015219) SGK3 (ENSPANG00000024618) MCMDC2 (ENSPANG00000009323) TCF24 (ENSPANG00000017721) PPP1R42 (ENSPANG00000024380) COPS5 (ENSPANG00000008028) CSPP1 (ENSPANG00000009322) Macaca ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00510000048041.p ENSGT00940000153886.a.b.f ENSGT00940000153649.A ENSGT00940000159947 ENSGT00940000156304 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00860000135574 ENSGT00910000148180 ENSGT00910000147681 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ##22 ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00910000148230 ENSGT00940000154004.a ENSGT00940000154473.a ENSGT00390000005213 ENSGT00390000003849 ENSGT00390000010499 ENSGT00940000157709 ENSGT00390000002854 ENSGT00940000163244.d.b.a.b.b.a.b ENSGT00940000153776.a.a ENSGT00990000204339 ENSGT01090000260080.b.b ENSGT00940000162447 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 580 ENSMNEG00000044279 RAB2A (ENSMNEG00000037175) CHD7 (ENSMNEG00000040978) 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ENSGT00940000158777 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ##22 ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00910000148230 ENSGT00940000154004.a ENSGT00940000154473.a ENSGT00390000005213 ENSGT00390000003849 ENSGT00390000010499 ENSGT00940000157709 ENSGT00390000002854 ENSGT00940000153776.a.a ENSGT01090000260080.b.b ENSGT00940000162447 ENSGT00940000158260 ENSGT00550000074850.l Rhesus MODERN SPECIES 18 ENSMMUG00000017297 TOX (ENSMMUG00000010971) CA8 (ENSMMUG00000006437) ENSMMUG00000037723 RAB2A (ENSMMUG00000017038) CHD7 (ENSMMUG00000011584) CLVS1 (ENSMMUG00000008774) ASPH (ENSMMUG00000008777) NKAIN3 (ENSMMUG00000009144) GGH (ENSMMUG00000055148) TTPA (ENSMMUG00000054577) YTHDF3 (ENSMMUG00000006729) BHLHE22 (ENSMMUG00000038208) CYP7B1 (ENSMMUG00000004411) ARMC1 (ENSMMUG00000028974) MTFR1 (ENSMMUG00000011263) ##22 PDE7A (ENSMMUG00000011262) DNAJC5B (ENSMMUG00000021585) ENSMMUG00000058626 TRIM55 (ENSMMUG00000021586) CRH (ENSMMUG00000021587) 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(ENSOCUG00000008165) ##22 PDE7A (ENSOCUG00000008175) ENSOCUG00000038559 ENSOCUG00000024415 DNAJC5B (ENSOCUG00000007514) TRIM55 (ENSOCUG00000005522) CRH (ENSOCUG00000023819) RRS1 (ENSOCUG00000013490) ADHFE1 (ENSOCUG00000008341) VXN (ENSOCUG00000000345) MYBL1 (ENSOCUG00000015184) VCPIP1 (ENSOCUG00000015198) SGK3 (ENSOCUG00000011573) MCMDC2 (ENSOCUG00000011583) TCF24 (ENSOCUG00000034630) PPP1R42 (ENSOCUG00000014096) Pika MODERN SPECIES 2312 MTFR1 (ENSOPRG00000013955) ##22 PDE7A (ENSOPRG00000013970) ENSOPRG00000014002 TRIM55 (ENSOPRG00000014012) CRH (ENSOPRG00000014039) Rodentia ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000155059 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000158863 ENSGT00940000153886.a.b.f ENSGT00940000153649.A ENSGT00940000159947 ENSGT00940000156304 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00860000135574 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ##22 ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a ENSGT00940000154473.a ENSGT00390000005213 ENSGT00390000003849 ENSGT00390000010499 ENSGT00940000157709 ENSGT00390000002854 ENSGT00940000153776.a.a ENSGT01090000260080.b.b ENSGT00940000162447 ENSGT00940000158260 ENSGT00550000074850 ENSGT00390000015084.d Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000155059 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000158863 ENSGT00940000153886.a.b.f ENSGT00940000153649.A ENSGT00940000159947 ENSGT00940000156304 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00860000135574 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ##22 ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a ENSGT00940000154473.a ENSGT00390000005213 ENSGT00390000003849 ENSGT00390000010499 ENSGT00940000157709 ENSGT00390000002854 ENSGT00940000153776.a.a ENSGT01090000260080.b.b ENSGT00940000162447 ENSGT00940000158260 ENSGT00550000074850 ENSGT00390000015084.d Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000154502 ENSGT00940000155059 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000158863 ENSGT00940000153886.a.b.f ENSGT00940000153649.A ENSGT00940000159947 ENSGT00940000156304 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ##22 ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a ENSGT00940000173737 ENSGT00390000003849 ENSGT00390000010499 ENSGT00940000157709 ENSGT00390000002854 ENSGT00940000153776.a.a ENSGT01090000260080.b.b ENSGT00940000162447 ENSGT00940000158260 ENSGT00550000074850 ENSGT00390000015084.d ENSGT00940000157108 Naked mole-rat female DUPLICATION Naked mole-rat female MODERN SPECIES 13 ASPH (ENSHGLG00000009811) ENSHGLG00000035266 ENSHGLG00000039677 NKAIN3 (ENSHGLG00000005384) ENSHGLG00000014967 ENSHGLG00000018653 TTPA (ENSHGLG00000044950) YTHDF3 (ENSHGLG00000009954) ENSHGLG00000005832 ENSHGLG00000040702 BHLHE22 (ENSHGLG00000040700) ENSHGLG00000017552 ENSHGLG00000017154 ENSHGLG00000015615 ARMC1 (ENSHGLG00000035403) ENSHGLG00000016607 ##22 PDE7A (ENSHGLG00000015990) ENSHGLG00000040101 DNAJC5B (ENSHGLG00000016338) TRIM55 (ENSHGLG00000017441) CRH (ENSHGLG00000017473) ADHFE1 (ENSHGLG00000043416) VXN (ENSHGLG00000049988) MYBL1 (ENSHGLG00000015635) ENSHGLG00000047713 VCPIP1 (ENSHGLG00000012964) ENSHGLG00000047192 SGK3 (ENSHGLG00000015703) MCMDC2 (ENSHGLG00000012730) ENSHGLG00000047166 ENSHGLG00000034628 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 24 CCDC89 (ENSHGLG00000037872) CREBZF (ENSHGLG00000003083) ENSHGLG00000003233 ENSHGLG00000003500 ENSHGLG00000037235 DLG2 (ENSHGLG00000004449) ENSHGLG00000042096 ENSHGLG00000046380 ENSHGLG00000043756 ENSHGLG00000014010 ANKRD42 (ENSHGLG00000007952) ENSHGLG00000002410 PCF11 (ENSHGLG00000002473) ENSHGLG00000002759 DDIAS (ENSHGLG00000050869) ENSHGLG00000046609 ##22 PRCP (ENSHGLG00000036425) ENSHGLG00000045251 ENSHGLG00000032876 ENSHGLG00000048309 ENSHGLG00000046901 ENSHGLG00000018145 ENSHGLG00000045517 ENSHGLG00000044687 ENSHGLG00000004145 ENSHGLG00000004806 NARS2 (ENSHGLG00000003746) ENSHGLG00000003188 GAB2 (ENSHGLG00000002641) USP35 (ENSHGLG00000019526) KCTD21 (ENSHGLG00000032398) Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000154502 ENSGT00940000155059 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000158863 ENSGT00940000153886.a.b.f ENSGT00940000153649.A ENSGT00940000159947 ENSGT00940000156304 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ##22 ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a ENSGT00940000173737 ENSGT00390000003849 ENSGT00390000010499 ENSGT00940000157709 ENSGT00390000002854 ENSGT00940000153776.a.a ENSGT01090000260080.b.b ENSGT00940000162447 ENSGT00940000158260 ENSGT00550000074850 ENSGT00390000015084.d ENSGT00940000157108 Guinea pig MODERN SPECIES ENSCPOG00000007782 ENSCPOG00000032558 PDE12 (ENSCPOG00000001620) ENSCPOG00000010334 DENND6A (ENSCPOG00000033336) SLMAP (ENSCPOG00000027044) FLNB (ENSCPOG00000010528) DNASE1L3 (ENSCPOG00000038516) NKAIN3 (ENSCPOG00000011548) GGH (ENSCPOG00000007679) TTPA (ENSCPOG00000034140) YTHDF3 (ENSCPOG00000002961) ENSCPOG00000004652 CYP7B1 (ENSCPOG00000038333) ARMC1 (ENSCPOG00000033885) MTFR1 (ENSCPOG00000014987) ##22 PDE7A (ENSCPOG00000009675) DNAJC5B (ENSCPOG00000003404) TRIM55 (ENSCPOG00000001635) CRH (ENSCPOG00000037117) RRS1 (ENSCPOG00000000647) ADHFE1 (ENSCPOG00000000648) VXN (ENSCPOG00000031365) MYBL1 (ENSCPOG00000007578) VCPIP1 (ENSCPOG00000010498) SGK3 (ENSCPOG00000007486) MCMDC2 (ENSCPOG00000007493) TCF24 (ENSCPOG00000014534) COPS5 (ENSCPOG00000011793) ENSCPOG00000030067 ENSCPOG00000008950 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000158863 ENSGT00940000153886.a.b.f ENSGT00940000153649.A ENSGT00940000159947 ENSGT00940000156304 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 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DUPLICATION Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 16 ZNF76 (ENSSVLG00005008484) DEF6 (ENSSVLG00005008458) ENSSVLG00005008450 PPARD (ENSSVLG00005008351) FANCE (ENSSVLG00005008269) RPL10A (ENSSVLG00005008232) TEAD3 (ENSSVLG00005008177) TULP1 (ENSSVLG00005007903) FKBP5 (ENSSVLG00005007720) ARMC12 (ENSSVLG00005007605) CLPSL2 (ENSSVLG00005007579) ENSSVLG00005007555 CLPS (ENSSVLG00005007519) LHFPL5 (ENSSVLG00005007493) ENSSVLG00005007332 ENSSVLG00005007292 ##22 ENSSVLG00005007274 SLC26A8 (ENSSVLG00005007071) ENSSVLG00005006939 MAPK13 (ENSSVLG00005006787) BRPF3 (ENSSVLG00005006666) BNIP5 (ENSSVLG00005006367) PXT1 (ENSSVLG00005006244) KCTD20 (ENSSVLG00005006146) STK38 (ENSSVLG00005006116) SRSF3 (ENSSVLG00005006090) CDKN1A (ENSSVLG00005006061) RAB44 (ENSSVLG00005005971) CPNE5 (ENSSVLG00005005838) PPIL1 (ENSSVLG00005005795) C6orf89 (ENSSVLG00005005762) Eurasian red squirrel DUPLICATION Eurasian red squirrel MODERN SPECIES RAB2A (ENSSVLG00005012184) CHD7 (ENSSVLG00005012393) CLVS1 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ENSGT00910000144305 ENSGT00940000154674 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000157819 ENSGT01050000244888.b.a.c.b.h ENSGT00940000153421.a.b ENSGT01030000234598.a.b ENSGT00940000155789 ENSGT00390000015332 Shrew mouse MODERN SPECIES 17 Slc7a12 (MGP_PahariEiJ_G0026299) MGP_PahariEiJ_G0026300 MGP_PahariEiJ_G0026301 Car13 (MGP_PahariEiJ_G0026302) MGP_PahariEiJ_G0026303 Car3 (MGP_PahariEiJ_G0026304) Car2 (MGP_PahariEiJ_G0026305) Sirpd (MGP_PahariEiJ_G0026306) MGP_PahariEiJ_G0026307 MGP_PahariEiJ_G0026308 Ythdf3 (MGP_PahariEiJ_G0026310) MGP_PahariEiJ_G0026311 Bhlhe22 (MGP_PahariEiJ_G0026312) Cyp7b1 (MGP_PahariEiJ_G0026313) Armc1 (MGP_PahariEiJ_G0026314) Mtfr1 (MGP_PahariEiJ_G0026315) ##22 Pde7a (MGP_PahariEiJ_G0026316) Dnajc5b (MGP_PahariEiJ_G0026317) MGP_PahariEiJ_G0026318 Trim55 (MGP_PahariEiJ_G0026319) Crh (MGP_PahariEiJ_G0026320) Cp (MGP_PahariEiJ_G0026321) Hps3 (MGP_PahariEiJ_G0026322) Hltf (MGP_PahariEiJ_G0026323) Gyg (MGP_PahariEiJ_G0026324) Cpa3 (MGP_PahariEiJ_G0026325) Cpb1 (MGP_PahariEiJ_G0026326) Agtr1b (MGP_PahariEiJ_G0026327) Tbl1xr1 (MGP_PahariEiJ_G0026328) Naaladl2 (MGP_PahariEiJ_G0026329) Nlgn1 (MGP_PahariEiJ_G0026330) Mus_A ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000157414 ENSGT00940000157353 ENSGT00390000015564.y ENSGT00940000160659 ENSGT00940000161270 ENSGT00940000159435 ENSGT00940000160385 ENSGT00960000186656.a.a.a.a.a.b.db.b ENSGT00960000186656.a.a.a.a.a.b.db.a.a ENSGT00960000186656.a.a.a.a.a.b.db.a.b ENSGT00940000158777 ENSGT00770000121214 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ##22 ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a ENSGT00940000154473.a ENSGT00940000155866 ENSGT00390000015458 ENSGT00910000144305 ENSGT00940000154674 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000157819 ENSGT01050000244888.b.a.c.b.h ENSGT00940000153421.a.b ENSGT01030000234598.a.b ENSGT00940000155789 ENSGT00390000015332 Ryukyu mouse MODERN SPECIES 12 Lrrcc1 (MGP_CAROLIEiJ_G0024852) E2f5 (MGP_CAROLIEiJ_G0024853) Rbis (MGP_CAROLIEiJ_G0024854) Car13 (MGP_CAROLIEiJ_G0024855) Car3 (MGP_CAROLIEiJ_G0024857) Car2 (MGP_CAROLIEiJ_G0024858) Sirpd (MGP_CAROLIEiJ_G0024859) MGP_CAROLIEiJ_G0024860 MGP_CAROLIEiJ_G0024861 Ythdf3 (MGP_CAROLIEiJ_G0024863) MGP_CAROLIEiJ_G0024864 Cypt12 (MGP_CAROLIEiJ_G0024865) Bhlhe22 (MGP_CAROLIEiJ_G0024866) Cyp7b1 (MGP_CAROLIEiJ_G0024867) Armc1 (MGP_CAROLIEiJ_G0024868) Mtfr1 (MGP_CAROLIEiJ_G0024869) ##22 Pde7a (MGP_CAROLIEiJ_G0024870) Dnajc5b (MGP_CAROLIEiJ_G0024871) MGP_CAROLIEiJ_G0024872 MGP_CAROLIEiJ_G0024873 Trim55 (MGP_CAROLIEiJ_G0024874) Crh (MGP_CAROLIEiJ_G0024875) Cp (MGP_CAROLIEiJ_G0024876) Hps3 (MGP_CAROLIEiJ_G0024877) Hltf (MGP_CAROLIEiJ_G0024878) Gyg (MGP_CAROLIEiJ_G0024879) Cpa3 (MGP_CAROLIEiJ_G0024880) Cpb1 (MGP_CAROLIEiJ_G0024881) Agtr1b (MGP_CAROLIEiJ_G0024882) Tbl1xr1 (MGP_CAROLIEiJ_G0024883) Naaladl2 (MGP_CAROLIEiJ_G0024884) Mus_B ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000157414 ENSGT00940000157353 ENSGT00390000015564.y ENSGT00940000160659 ENSGT00940000161270 ENSGT00940000159435 ENSGT00940000160385 ENSGT00960000186656.a.a.a.a.a.b.db.b ENSGT00960000186656.a.a.a.a.a.b.db.a.a.b ENSGT00960000186656.a.a.a.a.a.b.db.a.b ENSGT00940000158777 ENSGT00770000121214 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ##22 ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a ENSGT00940000154473.a ENSGT00940000155866 ENSGT00390000015458 ENSGT00910000144305 ENSGT00940000154674 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000157819 ENSGT01050000244888.b.a.c.b.h ENSGT00940000153421.a.b ENSGT01030000234598.a.b ENSGT00940000155789 ENSGT00390000015332 Mouse MODERN SPECIES 12 Rbis (ENSMUSG00000078784) Car13 (ENSMUSG00000027555) Car1 (ENSMUSG00000027556) Car3 (ENSMUSG00000027559) Car2 (ENSMUSG00000027562) Sirpd (ENSMUSG00000078783) Sirpb1a (ENSMUSG00000095788) Sirpb1b (ENSMUSG00000095028) Sirpb1c (ENSMUSG00000074677) Gm5150 (ENSMUSG00000078780) Ythdf3 (ENSMUSG00000047213) Cypt12 (ENSMUSG00000027564) Bhlhe22 (ENSMUSG00000025128) Cyp7b1 (ENSMUSG00000039519) Armc1 (ENSMUSG00000027599) Mtfr1 (ENSMUSG00000027601) ##22 Pde7a (ENSMUSG00000069094) Dnajc5b (ENSMUSG00000027606) Trim55 (ENSMUSG00000060913) Crh (ENSMUSG00000049796) Cp (ENSMUSG00000003617) Hps3 (ENSMUSG00000027615) Hltf (ENSMUSG00000002428) Gyg (ENSMUSG00000019528) Cpa3 (ENSMUSG00000001865) Cpb1 (ENSMUSG00000011463) Agtr1b (ENSMUSG00000054988) Tbl1xr1 (ENSMUSG00000027630) Naaladl2 (ENSMUSG00000102758) Nlgn1 (ENSMUSG00000063887) Spata16 (ENSMUSG00000039335) Mus_C ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000163578.d ENSGT00940000157414 ENSGT00940000157353 ENSGT00390000015564.y ENSGT00940000160659 ENSGT00940000159435 ENSGT00940000160385 ENSGT00960000186656.a.a.a.a.a.b.db.b ENSGT00960000186656.a.a.a.a.a.b.db.a.a.b ENSGT00960000186656.a.a.a.a.a.b.db.a.b ENSGT00940000158777 ENSGT00770000121214 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ##22 ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00860000135717 ENSGT00940000154004.a ENSGT00940000154473.a ENSGT00940000155866 ENSGT00390000015458 ENSGT00910000144305 ENSGT00940000154674 ENSGT00940000161551 ENSGT00940000157819 ENSGT01050000244888.b.a.c.b.h ENSGT00940000153421.a.b ENSGT01030000234598.a.b ENSGT00940000155789 spretus MODERN SPECIES 12 Lrrcc1 (MGP_SPRETEiJ_G0025782) E2f5 (MGP_SPRETEiJ_G0025783) Rbis (MGP_SPRETEiJ_G0025784) Car13 (MGP_SPRETEiJ_G0025785) Car3 (MGP_SPRETEiJ_G0025787) Car2 (MGP_SPRETEiJ_G0025788) Sirpd (MGP_SPRETEiJ_G0025789) MGP_SPRETEiJ_G0025792 MGP_SPRETEiJ_G0025791 MGP_SPRETEiJ_G0025793 Ythdf3 (MGP_SPRETEiJ_G0025794) Cypt12 (MGP_SPRETEiJ_G0025795) Bhlhe22 (MGP_SPRETEiJ_G0025796) Cyp7b1 (MGP_SPRETEiJ_G0025797) Armc1 (MGP_SPRETEiJ_G0025799) Mtfr1 (MGP_SPRETEiJ_G0025800) ##22 Pde7a (MGP_SPRETEiJ_G0025801) Dnajc5b (MGP_SPRETEiJ_G0025802) MGP_SPRETEiJ_G0025803 Trim55 (MGP_SPRETEiJ_G0025804) Crh (MGP_SPRETEiJ_G0025805) MGP_SPRETEiJ_G0025806 Cp (MGP_SPRETEiJ_G0025807) Hps3 (MGP_SPRETEiJ_G0025808) Hltf (MGP_SPRETEiJ_G0025809) Gyg (MGP_SPRETEiJ_G0025810) Cpb1 (MGP_SPRETEiJ_G0025811) Cpa3 (MGP_SPRETEiJ_G0025812) Agtr1b (MGP_SPRETEiJ_G0025813) Tbl1xr1 (MGP_SPRETEiJ_G0025814) MGP_SPRETEiJ_G0025815 Steppe mouse DUPLICATION Steppe mouse MODERN SPECIES 2671 Armc1 (ENSMSIG00000002295) Mtfr1 (ENSMSIG00000002320) ##22 Pde7a (ENSMSIG00000002359) Dnajc5b (ENSMSIG00000002498) ENSMSIG00000002586 Trim55 (ENSMSIG00000002601) Crh (ENSMSIG00000002653) Steppe mouse MODERN SPECIES 2568 Ugp2 (ENSMSIG00000014630) ENSMSIG00000014612 Vps54 (ENSMSIG00000014517) ENSMSIG00000014505 ##22 Peli1 (ENSMSIG00000014472) Lgalsl (ENSMSIG00000014448) Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000154502 ENSGT00940000155059 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000158863 ENSGT00940000153886.a.b ENSGT00940000153649.A ENSGT00940000159947 ENSGT00940000156304 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ##22 ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a ENSGT00940000154473.a ENSGT00390000005213 ENSGT00390000003849 ENSGT00390000010499 ENSGT00940000157709 ENSGT00860000135506 ENSGT00390000002854 ENSGT00940000153776.a.a ENSGT01090000260080.b.b ENSGT00940000162447 ENSGT00940000158260 ENSGT00550000074850 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000154502 ENSGT00940000155059 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000158863 ENSGT00940000153886.a.b ENSGT00940000153649.A ENSGT00940000159947 ENSGT00940000156304 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ##22 ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a ENSGT00940000154473.a ENSGT00390000005213 ENSGT00390000003849 ENSGT00390000010499 ENSGT00940000157709 ENSGT00860000135506 ENSGT00390000002854 ENSGT00940000153776.a.a ENSGT01090000260080.b.b ENSGT00940000158260 ENSGT00550000074850 ENSGT00390000015084.d Tenrec MODERN SPECIES 5045 MTFR1 (ENSETEG00000019153) ##22 PDE7A (ENSETEG00000019155) Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000154502 ENSGT00940000155059 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000158863 ENSGT00940000153886.a.b ENSGT00940000153649.A ENSGT00940000159947 ENSGT00940000156304 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ##22 ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a ENSGT00940000154473.a ENSGT00390000005213 ENSGT00390000003849 ENSGT00390000010499 ENSGT00940000157709 ENSGT00860000135506 ENSGT00390000002854 ENSGT00940000153776.a.a ENSGT01090000260080.b.b ENSGT00940000158260 ENSGT00550000074850 ENSGT00390000015084.d Hyrax MODERN SPECIES 8634 MTFR1 (ENSPCAG00000006231) ##22 Elephant MODERN SPECIES 567 SDCBP (ENSLAFG00000010757) NSMAF (ENSLAFG00000014883) TOX (ENSLAFG00000008007) CA8 (ENSLAFG00000022921) RAB2A (ENSLAFG00000015567) CHD7 (ENSLAFG00000000403) CLVS1 (ENSLAFG00000013282) ASPH (ENSLAFG00000013283) NKAIN3 (ENSLAFG00000017210) GGH (ENSLAFG00000011543) TTPA (ENSLAFG00000008681) YTHDF3 (ENSLAFG00000016052) ENSLAFG00000031948 CYP7B1 (ENSLAFG00000012756) ARMC1 (ENSLAFG00000007039) MTFR1 (ENSLAFG00000012850) ##22 PDE7A (ENSLAFG00000012855) DNAJC5B (ENSLAFG00000013696) TRIM55 (ENSLAFG00000001277) CRH (ENSLAFG00000000557) RRS1 (ENSLAFG00000015405) ADHFE1 (ENSLAFG00000007123) VXN (ENSLAFG00000004817) MYBL1 (ENSLAFG00000004821) VCPIP1 (ENSLAFG00000004826) SGK3 (ENSLAFG00000012586) MCMDC2 (ENSLAFG00000012589) PPP1R42 (ENSLAFG00000030620) COPS5 (ENSLAFG00000015398) ENSLAFG00000011549 ARFGEF1 (ENSLAFG00000011559) Xenarthra ANCESTRAL SPECIES 1479 ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ##22 ENSGT00940000157658 Sloth MODERN SPECIES 5177 MTFR1 (ENSCHOG00000006664) ##22 PDE7A (ENSCHOG00000006676) Armadillo DUPLICATION Armadillo MODERN SPECIES 4386 ASB13 (ENSDNOG00000001915) ENSDNOG00000041402 ##22 TASOR2 (ENSDNOG00000019088) GDI2 (ENSDNOG00000019091) Armadillo MODERN SPECIES 4477 ARMC1 (ENSDNOG00000009056) ENSDNOG00000018221 ##22 PDE7A (ENSDNOG00000038222) Platypus MODERN SPECIES 18 SDCBP (ENSOANG00000005034) NSMAF (ENSOANG00000005036) TOX (ENSOANG00000005038) CA8 (ENSOANG00000005040) RAB2A (ENSOANG00000041731) CHD7 (ENSOANG00000005042) CLVS1 (ENSOANG00000005044) ASPH (ENSOANG00000005045) NKAIN3 (ENSOANG00000005046) GGH (ENSOANG00000005049) TTPA (ENSOANG00000049899) YTHDF3 (ENSOANG00000005053) ENSOANG00000040949 ENSOANG00000005056 ARMC1 (ENSOANG00000039345) MTFR1 (ENSOANG00000002298) ##22 PDE7A (ENSOANG00000002300) DNAJC5B (ENSOANG00000002302) TRIM55 (ENSOANG00000002304) ENSOANG00000002306 ADHFE1 (ENSOANG00000002307) ENSOANG00000044853 MYBL1 (ENSOANG00000002308) VCPIP1 (ENSOANG00000002311) SGK3 (ENSOANG00000002312) MCMDC2 (ENSOANG00000002316) TCF24 (ENSOANG00000002317) PPP1R42 (ENSOANG00000002318) COPS5 (ENSOANG00000048237) ENSOANG00000002320 ARFGEF1 (ENSOANG00000002324) Sauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155059 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000158863 ENSGT00940000153886.a.b ENSGT00960000189175 ENSGT00940000153649.A ENSGT00940000159947 ENSGT00940000156304 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ##22 ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a ENSGT00940000154473.a ENSGT00390000005213 ENSGT00390000003849 ENSGT00390000010499 ENSGT00940000157709 ENSGT00390000002854 ENSGT00940000153776.a.a ENSGT01090000260080.b.b ENSGT00940000162447 ENSGT00940000158260 ENSGT00550000074850 ENSGT00390000015084.d Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000154502 ENSGT00940000155059 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000158863 ENSGT00940000153886.a.b ENSGT00940000153649.A ENSGT00940000159947 ENSGT00940000156304 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ##22 ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a ENSGT00940000154473.a ENSGT00390000005213 ENSGT00390000003849 ENSGT00390000010499 ENSGT00940000157709 ENSGT00390000002854 ENSGT00940000153776.a.a ENSGT01090000260080.b.b ENSGT00940000162447 ENSGT00940000158260 ENSGT00550000074850 ENSGT00390000015084.d Episquamata ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000155059 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000158863 ENSGT00940000153886.a.b ENSGT00940000153649.A ENSGT00940000159947 ENSGT00940000156304 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00390000010318 ENSGT00940000158777 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ##22 ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a ENSGT00940000154473.a ENSGT00390000005213 ENSGT00390000003849 ENSGT00390000010499 ENSGT00940000157709 ENSGT00390000002854 ENSGT00940000153776.a.a ENSGT01090000260080.b.b ENSGT00940000162447 ENSGT00940000158260 ENSGT00550000074850 ENSGT00390000015084.d Laterata ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000155059 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000158863 ENSGT00940000153886.a.b ENSGT00940000153649.A ENSGT00940000159947 ENSGT00940000156304 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00390000010318 ENSGT00940000158777 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ##22 ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a ENSGT00940000154473.a ENSGT00390000005213 ENSGT00390000003849 ENSGT00390000010499 ENSGT00940000157709 ENSGT00390000002854 ENSGT00940000153776.a.a ENSGT01090000260080.b.b ENSGT00940000162447 ENSGT00940000158260 ENSGT00550000074850 ENSGT00390000015084.d Common wall lizard MODERN SPECIES 15 ENSPMRG00000007552 ENSPMRG00000007540 ENSPMRG00000007535 NKAIN3 (ENSPMRG00000007529) GGH (ENSPMRG00000007511) ENSPMRG00000007494 TTPA (ENSPMRG00000007485) RNF4 (ENSPMRG00000007477) YTHDF3 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(ENSSMRG00000011774) ##22 PDE7A (ENSSMRG00000011768) DNAJC5B (ENSSMRG00000011765) TRIM55 (ENSSMRG00000011763) CRH (ENSSMRG00000011762) RRS1 (ENSSMRG00000011753) ADHFE1 (ENSSMRG00000011752) VXN (ENSSMRG00000011751) MYBL1 (ENSSMRG00000011750) VCPIP1 (ENSSMRG00000011748) SGK3 (ENSSMRG00000011741) MCMDC2 (ENSSMRG00000011738) TCF24 (ENSSMRG00000011705) PPP1R42 (ENSSMRG00000011609) COPS5 (ENSSMRG00000011607) ENSSMRG00000011606 Toxicofera ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000155059 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000158863 ENSGT00940000153886.a.b ENSGT00940000153649.A ENSGT00940000159947 ENSGT00940000156304 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00390000010318 ENSGT00940000158777 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ##22 ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a ENSGT00940000154473.a ENSGT00390000005213 ENSGT00390000003849 ENSGT00390000010499 ENSGT00940000157709 ENSGT00390000002854 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(ENSSPUG00000000191) VCPIP1 (ENSSPUG00000000263) SGK3 (ENSSPUG00000000277) MCMDC2 (ENSSPUG00000000284) PPP1R42 (ENSSPUG00000000312) COPS5 (ENSSPUG00000000363) ENSSPUG00000000374 ENSSPUG00000000438 ARFGEF1 (ENSSPUG00000000514) Archelosauria ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000158863 ENSGT00940000153886.a.b ENSGT00960000189175 ENSGT00940000153649.A.ib ENSGT00940000159947 ENSGT00940000156304 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00960000189659 ENSGT00940000158777 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ##22 ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a ENSGT00940000154473.a ENSGT00390000005213 ENSGT00390000003849 ENSGT00390000010499 ENSGT00940000157709 ENSGT00390000002854 ENSGT00940000153776.a.a ENSGT01090000260080.b.b ENSGT00940000162447 ENSGT00940000158260 ENSGT00550000074850 ENSGT00390000015084.d Archosauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155059 ENSGT00940000159497 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ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a ENSGT00940000154473.a ENSGT00390000005213 ENSGT00390000003849 ENSGT00390000010499 ENSGT00940000157709 ENSGT00390000002854 ENSGT00940000153776.a.a ENSGT01090000260080.b.b ENSGT00940000162447 ENSGT00940000158260 ENSGT00550000074850 ENSGT00390000015084.d Neognathae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155059 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000158863 ENSGT00940000153886.a.b ENSGT00940000153649.A.ib ENSGT00940000159947 ENSGT00940000156304 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00960000189659 ENSGT00940000158777 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ##22 ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a ENSGT00940000154473.a ENSGT00390000005213 ENSGT00390000003849 ENSGT00390000010499 ENSGT00940000157709 ENSGT00390000002854 ENSGT00940000153776.a.a ENSGT01090000260080.b.b ENSGT00940000162447 ENSGT00940000158260 ENSGT00550000074850 ENSGT00390000015084.d Galloanserae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154502 ENSGT00940000155059 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000158863 ENSGT00940000153886.a.b ENSGT00940000153649.A.ib ENSGT00940000159947 ENSGT00940000156304 ENSGT00940000161484.b ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ##22 ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a ENSGT00940000154473.a ENSGT00390000005213 ENSGT00390000003849 ENSGT00390000010499 ENSGT00940000157709 ENSGT00390000002854 ENSGT00940000153776.a.a ENSGT01090000260080.b.b ENSGT00940000162447 ENSGT00940000158260 ENSGT00550000074850 ENSGT00390000015084.d Anatidae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000154502 ENSGT00940000155059 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000158863 ENSGT00940000153886.a.b ENSGT00940000153649.A.ib ENSGT00940000159947 ENSGT00940000156304 ENSGT00940000161484.b ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ##22 ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a ENSGT00940000154473.a ENSGT00390000005213 ENSGT00390000003849 ENSGT00390000010499.b ENSGT00940000157709 ENSGT00390000002854 ENSGT00940000153776.a.a ENSGT01090000260080.b.b ENSGT00940000162447 ENSGT00940000158260 ENSGT00550000074850 ENSGT00390000015084.d Duck MODERN SPECIES 10 ENSAPLG00000019251 CA8 (ENSAPLG00000005583) RAB2A (ENSAPLG00000005615) CHD7 (ENSAPLG00000005873) CLVS1 (ENSAPLG00000006781) ASPH (ENSAPLG00000006796) NKAIN3 (ENSAPLG00000024234) ENSAPLG00000021204 GGH (ENSAPLG00000010846) TTPA (ENSAPLG00000025244) YTHDF3 (ENSAPLG00000011329) ENSAPLG00000030747 ENSAPLG00000029880 CYP7B1 (ENSAPLG00000011556) ARMC1 (ENSAPLG00000013027) MTFR1 (ENSAPLG00000002927) ##22 ENSAPLG00000022620 ENSAPLG00000031190 DNAJC5B (ENSAPLG00000013934) TRIM55 (ENSAPLG00000013946) CRH (ENSAPLG00000020533) ADHFE1 (ENSAPLG00000014301) VXN (ENSAPLG00000020243) MYBL1 (ENSAPLG00000014596) VCPIP1 (ENSAPLG00000014936) SGK3 (ENSAPLG00000015056) MCMDC2 (ENSAPLG00000015951) TCF24 (ENSAPLG00000022840) PPP1R42 (ENSAPLG00000015979) COPS5 (ENSAPLG00000016013) ENSAPLG00000016218 Pink-footed goose MODERN SPECIES 62 SDCBP (ENSABRG00000005737) NSMAF (ENSABRG00000005742) TOX (ENSABRG00000005797) CA8 (ENSABRG00000005857) RAB2A (ENSABRG00000005879) CHD7 (ENSABRG00000006196) CLVS1 (ENSABRG00000011678) ASPH (ENSABRG00000011700) ENSABRG00000011824 GGH (ENSABRG00000011841) TTPA (ENSABRG00000011863) YTHDF3 (ENSABRG00000011878) ENSABRG00000011926 CYP7B1 (ENSABRG00000011931) ARMC1 (ENSABRG00000011982) MTFR1 (ENSABRG00000012005) ##22 PDE7A (ENSABRG00000012018) Phasianidae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000154502 ENSGT00940000155059 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000158863 ENSGT00940000153886.a.b ENSGT00940000153649.A.ib ENSGT00940000159947 ENSGT00940000156304 ENSGT00940000161484.b ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ##22 ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a ENSGT00940000154473.a ENSGT00390000005213 ENSGT00390000003849 ENSGT00390000010499 ENSGT00940000157709 ENSGT00390000002854 ENSGT00940000153776.a.a ENSGT01090000260080.b.b ENSGT00940000162447 ENSGT00940000158260 ENSGT00550000074850 ENSGT00390000015084.d Japanese quail MODERN SPECIES 11 SDCBP (ENSCJPG00005010425) NSMAF (ENSCJPG00005010426) TOX (ENSCJPG00005010427) CA8 (ENSCJPG00005010429) RAB2A (ENSCJPG00005010430) CHD7 (ENSCJPG00005010431) CLVS1 (ENSCJPG00005011531) ASPH (ENSCJPG00005011534) NKAIN3 (ENSCJPG00005011554) GGH (ENSCJPG00005011561) TTPA (ENSCJPG00005011581) YTHDF3 (ENSCJPG00005011583) BHLHE22 (ENSCJPG00005011601) CYP7B1 (ENSCJPG00005011602) ARMC1 (ENSCJPG00005011615) MTFR1 (ENSCJPG00005011616) ##22 PDE7A (ENSCJPG00005011623) DNAJC5B (ENSCJPG00005011625) TRIM55 (ENSCJPG00005011647) CRH (ENSCJPG00005011650) RRS1 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SPECIES 11 SDCBP (ENSGALG00010002916) NSMAF (ENSGALG00010002983) TOX (ENSGALG00010003042) CA8 (ENSGALG00010002685) RAB2A (ENSGALG00010002760) CHD7 (ENSGALG00010002626) CLVS1 (ENSGALG00010003877) ASPH (ENSGALG00010003960) NKAIN3 (ENSGALG00010004006) GGH (ENSGALG00010003063) TTPA (ENSGALG00010003074) YTHDF3 (ENSGALG00010003103) ENSGALG00010004014 CYP7B1 (ENSGALG00010003006) ARMC1 (ENSGALG00010003121) MTFR1 (ENSGALG00010003154) ##22 PDE7A (ENSGALG00010004047) DNAJC5B (ENSGALG00010004050) ENSGALG00010004579 TRIM55 (ENSGALG00010004122) CRH (ENSGALG00010004133) RRS1 (ENSGALG00010004591) ADHFE1 (ENSGALG00010002884) VXN (ENSGALG00010002890) MYBL1 (ENSGALG00010002911) VCPIP1 (ENSGALG00010002920) SGK3 (ENSGALG00010004072) MCMDC2 (ENSGALG00010004128) TCF24 (ENSGALG00010004143) PPP1R42 (ENSGALG00010004145) COPS5 (ENSGALG00010004154) Turkey MODERN SPECIES 22 ENSMGAG00000011271 TCF24 (ENSMGAG00000018157) ENSMGAG00000011243 ENSMGAG00000011263 VCPIP1 (ENSMGAG00000011238) ENSMGAG00000011226 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ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ##22 ENSGT00940000157658 ENSGT00940000154473.a ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a ENSGT00390000005213 ENSGT00390000003849 ENSGT00940000157709 ENSGT00390000002854 ENSGT00940000153776.a.a ENSGT01090000260080.b.b ENSGT00940000162447 ENSGT00940000158260 ENSGT00550000074850 ENSGT00390000015084.d ENSGT00940000157108 Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 40 ENSGT00960000189659 ENSGT00940000158777 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ENSGT00390000014100.k.a ENSGT00390000014100.k.b ENSGT00950000183215.c.a.b ##22 ENSGT00940000157658 ENSGT00940000154004.a.e.a ENSGT00940000154473.a ENSGT00940000154004.a.e.b ENSGT00390000005213 ENSGT00940000159294 ENSGT00390000003849 ENSGT00940000157709 ENSGT00390000002854 ENSGT00940000153776.a.a ENSGT01090000260080.b.b ENSGT00940000162447 ENSGT00940000158260 ENSGT00550000074850 ENSGT00390000015084.c.a Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00940000160779 ENSGT00940000159458 ENSGT00940000158378 ENSGT00940000157596 ENSGT00940000160838 ENSGT00940000164978.b ENSGT00940000153322.B.d.b ENSGT00940000159385 ENSGT00390000017765.b ENSGT00940000158777 ENSGT01060000251044 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ENSGT00390000014100.k.a ENSGT00390000014100.k.b ENSGT00950000183215.c.a.b ##22 ENSGT00940000157658 ENSGT00940000154004.a.e.b ENSGT00940000154473.a ENSGT00390000005213 ENSGT00940000157709.i ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a.e.a ENSGT00390000003849 ENSGT00940000157709.j ENSGT00390000002854 ENSGT00940000177201 ENSGT00390000015084.c.b ENSGT00940000153776.a.a ENSGT01090000260080.b.b ENSGT00940000162447 Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000002395 ENSGT00940000167274 ENSGT00390000001504 ENSGT00940000158713 ENSGT00940000165120 ENSGT00940000160085 ENSGT00940000154103.a ENSGT00940000176911 ENSGT00940000154936 ENSGT00940000159385.a.a ENSGT00390000017765.b ENSGT00940000158777 ENSGT01060000251044 ENSGT00940000162962 ENSGT00390000014100.k.b ENSGT00950000183215.c.a.b ##22 ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a.e.b ENSGT00940000154473.a ENSGT00390000005213 ENSGT00940000157709.i ENSGT00940000153776.a.a ENSGT01090000260080.b.b ENSGT00940000162447 ENSGT00940000158260 ENSGT00550000074850 ENSGT00980000202398 ENSGT00390000015084.c.a ENSGT00940000157108 ENSGT00940000159307 Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 47 ENSGT00940000163955 ENSGT00390000002395 ENSGT00940000167274 ENSGT00390000001504 ENSGT00940000158713 ENSGT00940000165120 ENSGT00940000160085 ENSGT00940000154103.a ENSGT00940000154936 ENSGT00940000159385.b ENSGT00390000017765.b ENSGT00940000158777 ENSGT01060000251044 ENSGT00940000162962 ENSGT00390000014100.k.b ENSGT00950000183215.c.a.b ##22 Denticle herring MODERN SPECIES 11 pdx1 (ENSDCDG00000024070) urad (ENSDCDG00000024072) ENSDCDG00000024074 pan3 (ENSDCDG00000024102) flt1 (ENSDCDG00000025035) ENSDCDG00000025040 ENSDCDG00000025041 TMPRSS7 (ENSDCDG00000025043) ENSDCDG00000025049 c1qtnf9 (ENSDCDG00000025056) TAGLN3 (ENSDCDG00000025062) tagln3b (ENSDCDG00000025064) ythdf3 (ENSDCDG00000025067) bhlhe22 (ENSDCDG00000025071) armc1 (ENSDCDG00000025074) mtfr1 (ENSDCDG00000025077) ##22 pde7a (ENSDCDG00000025086) DNAJC5B (ENSDCDG00000025096) crhb (ENSDCDG00000025097) rrs1 (ENSDCDG00000025098) MYBL1 (ENSDCDG00000025100) sgk3 (ENSDCDG00000025111) TCF24 (ENSDCDG00000025428) ppp1r42 (ENSDCDG00000025431) chrnd (ENSDCDG00000025509) camk2n2 (ENSDCDG00000026634) KLHL24 (ENSDCDG00000026635) SH3KBP1 (ENSDCDG00000026636) MAP3K15 (ENSDCDG00000026641) ccl20b (ENSDCDG00000026716) tfr1b (ENSDCDG00000026723) Atlantic herring MODERN SPECIES 8 lnx2a (ENSCHAG00000015948) pan3 (ENSCHAG00000015966) flt1 (ENSCHAG00000016175) ENSCHAG00000016931 ENSCHAG00000016990 ENSCHAG00000017010 ENSCHAG00000017035 c1qtnf9 (ENSCHAG00000017323) ENSCHAG00000017366 tagln3a (ENSCHAG00000017372) tagln3b (ENSCHAG00000017391) ythdf3 (ENSCHAG00000017393) ENSCHAG00000017403 bhlhe22 (ENSCHAG00000017425) armc1 (ENSCHAG00000017432) mtfr1 (ENSCHAG00000017442) ##22 pde7a (ENSCHAG00000017472) MYBL1 (ENSCHAG00000018235) rrs1 (ENSCHAG00000018273) crhb (ENSCHAG00000018294) TCF24 (ENSCHAG00000018318) ppp1r42 (ENSCHAG00000018335) cops5 (ENSCHAG00000018362) ENSCHAG00000018488 ARFGEF1 (ENSCHAG00000018516) CPA6 (ENSCHAG00000019550) PREX2 (ENSCHAG00000019631) zgc:162928 (ENSCHAG00000020625) GOLT1B (ENSCHAG00000020637) sulf1 (ENSCHAG00000020657) SLCO5A1 (ENSCHAG00000021232) Otophysi ANCESTRAL SPECIES 47 ENSGT00390000001844.a.a ENSGT00940000159227 ENSGT00940000157145 ENSGT01030000234614.B.a.b ENSGT00940000166938 ENSGT00950000183163.b ENSGT00950000182941.b.b.b.b ENSGT00390000008256.sd ENSGT00980000201894 ENSGT00390000008256.rd.a ENSGT00940000159370.d ENSGT00530000063174.a.k ENSGT00940000158777 ENSGT00940000162962 ENSGT00390000014100.k.b ENSGT00950000183215.c.a.b ##22 ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154473.a ENSGT00940000154004.a.e.b ENSGT00940000154473.b.a.a ENSGT00390000005213 ENSGT00940000157709.i ENSGT00940000153776.a.a ENSGT01090000260080.b.b ENSGT00940000162447 ENSGT00940000158260 ENSGT00550000074850 ENSGT00390000017600 ENSGT00940000175299 ENSGT00940000158224 Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00390000001844.a.a ENSGT00940000159227 ENSGT00940000157145 ENSGT01030000234614.B.a.b ENSGT00940000166938 ENSGT00950000183163.b ENSGT00950000182941.b.b.b.b ENSGT00390000008256.sd ENSGT00980000201894 ENSGT00390000008256.rd.b ENSGT00940000159370.d ENSGT00530000063174.a.k ENSGT00940000158777 ENSGT00940000162962 ENSGT00390000014100.k.b ENSGT00950000183215.c.a.b ##22 ENSGT00940000153141.B.b ENSGT00390000014100.k.a ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a.e.b ENSGT00940000154473.a ENSGT00940000154473.b.a.a ENSGT00390000005213 ENSGT00940000157709.i ENSGT00940000153776.a.a ENSGT01090000260080.b.b ENSGT00940000162447 ENSGT00940000158260 ENSGT00550000074850 ENSGT00390000017600 Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 52 ENSGT00390000001844.a.a ENSGT00940000159227 ENSGT00940000157145 ENSGT01030000234614.B.a.b ENSGT00940000166938 ENSGT00950000183163.b ENSGT00950000182941.b.b.b.b ENSGT00390000008256.sd ENSGT00980000201894 ENSGT00390000008256.rd.b ENSGT00940000159370.d ENSGT00530000063174.a.k ENSGT00940000158777 ENSGT00940000162962 ENSGT00390000014100.k.b ENSGT00950000183215.c.a.b ##22 Characoidei ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000166463 ENSGT00390000001844.a.a ENSGT00940000159227 ENSGT00940000157145 ENSGT01030000234614.B.a.b ENSGT00940000166938 ENSGT00950000183163.b ENSGT00950000182941.b.b.b.b ENSGT00390000008256.sd ENSGT00980000201894 ENSGT00940000159370.d ENSGT00530000063174.a.k ENSGT00940000158777 ENSGT00940000162962 ENSGT00390000014100.k.b ENSGT00950000183215.c.a.b ##22 ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a.e.b ENSGT00940000154473.b.a.a ENSGT00390000005213 ENSGT00940000157709.i ENSGT00940000153776.a.a ENSGT01090000260080.b.b ENSGT00940000162447 ENSGT00940000158260 ENSGT00550000074850 ENSGT00390000017600 ENSGT00940000158224 ENSGT00940000159542 ENSGT00390000001846 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 8 chodl (ENSPNAG00000021045) lyz (ENSPNAG00000021068) ENSPNAG00000021084 zgc:112408 (ENSPNAG00000021112) ENSPNAG00000021132 zgc:112982 (ENSPNAG00000021161) ENSPNAG00000021173 ENSPNAG00000021193 eif1axb (ENSPNAG00000021235) ENSPNAG00000021247 rps6ka3b (ENSPNAG00000021313) pdha1b (ENSPNAG00000021432) ythdf3 (ENSPNAG00000021457) bhlhe22 (ENSPNAG00000006245) armc1 (ENSPNAG00000021521) mtfr1 (ENSPNAG00000021553) ##22 pde7a (ENSPNAG00000021598) DNAJC5B (ENSPNAG00000021634) trim55b (ENSPNAG00000021676) ENSPNAG00000021695 rrs1 (ENSPNAG00000021707) MYBL1 (ENSPNAG00000021760) sgk3 (ENSPNAG00000003699) MCMDC2 (ENSPNAG00000021908) TCF24 (ENSPNAG00000021920) ppp1r42 (ENSPNAG00000021938) cops5 (ENSPNAG00000021972) pign (ENSPNAG00000022001) hnf4g (ENSPNAG00000022047) ZFHX4 (ENSPNAG00000022085) pex2 (ENSPNAG00000022101) Mexicana tetra MODERN SPECIES 18 lyz (ENSAMXG00000014017) ENSAMXG00000042503 ENSAMXG00000039498 zgc:112408 (ENSAMXG00000013983) ENSAMXG00000013967 ENSAMXG00000013954 ENSAMXG00000013940 eif1axb (ENSAMXG00000032495) ENSAMXG00000040423 rps6ka3b (ENSAMXG00000013900) ENSAMXG00000030935 pdha1b (ENSAMXG00000013896) ythdf3 (ENSAMXG00000030366) bhlhe22 (ENSAMXG00000026338) armc1 (ENSAMXG00000041843) mtfr1 (ENSAMXG00000032269) ##22 ENSAMXG00000029419 pde7a (ENSAMXG00000034112) DNAJC5B (ENSAMXG00000037384) trim55b (ENSAMXG00000013789) ENSAMXG00000032945 rrs1 (ENSAMXG00000037893) MYBL1 (ENSAMXG00000013759) sgk3 (ENSAMXG00000013716) MCMDC2 (ENSAMXG00000013691) TCF24 (ENSAMXG00000013680) ppp1r42 (ENSAMXG00000013664) cops5 (ENSAMXG00000032825) pign (ENSAMXG00000013631) ENSAMXG00000033860 hnf4g (ENSAMXG00000013618) Electric eel MODERN SPECIES 78 sat1b (ENSEEEG00000013700) apoob (ENSEEEG00000013698) ENSEEEG00000013696 chodl (ENSEEEG00000013695) ENSEEEG00000013694 zgc:112408 (ENSEEEG00000013673) ENSEEEG00000013663 zgc:112982 (ENSEEEG00000013662) ENSEEEG00000013658 eif1axb (ENSEEEG00000013657) ENSEEEG00000013655 rps6ka3b (ENSEEEG00000010781) ythdf3 (ENSEEEG00000010656) bhlhe22 (ENSEEEG00000010653) armc1 (ENSEEEG00000010651) mtfr1 (ENSEEEG00000010649) ##22 pde7a (ENSEEEG00000010552) DNAJC5B (ENSEEEG00000010541) trim55b (ENSEEEG00000010535) crhb (ENSEEEG00000010533) MYBL1 (ENSEEEG00000010531) sgk3 (ENSEEEG00000009946) MCMDC2 (ENSEEEG00000009906) TCF24 (ENSEEEG00000009903) ppp1r42 (ENSEEEG00000009900) cops5 (ENSEEEG00000009892) pign (ENSEEEG00000009128) ENSEEEG00000009094 hnf4g (ENSEEEG00000009091) ENSEEEG00000009090 ZFHX4 (ENSEEEG00000009089) Channel catfish MODERN SPECIES 15 CNTNAP2 (ENSIPUG00000013587) apoob (ENSIPUG00000013681) si:rp71-1f1.4 (ENSIPUG00000013702) c23h11orf65 (ENSIPUG00000013713) Chodl (ENSIPUG00000013733) zgc:112408 (ENSIPUG00000013770) ENSIPUG00000013799 ENSIPUG00000013837 map7d2 (ENSIPUG00000013874) ENSIPUG00000013916 RPS6KA3 (ENSIPUG00000013955) pdha1b (ENSIPUG00000014101) YTHDF1 (ENSIPUG00000014157) bhlhe22 (ENSIPUG00000014202) armc1 (ENSIPUG00000014207) mtfr1 (ENSIPUG00000014219) ##22 pde7a (ENSIPUG00000014264) DNAJC5B (ENSIPUG00000014336) trim55 (ENSIPUG00000014351) ENSIPUG00000014385 rrs1 (ENSIPUG00000014412) mybl1 (ENSIPUG00000014428) sgk3 (ENSIPUG00000014487) MCMDC2 (ENSIPUG00000014555) TCF24 (ENSIPUG00000014579) ppp1r42 (ENSIPUG00000014588) cops5 (ENSIPUG00000014614) pign (ENSIPUG00000014655) GPR141 (ENSIPUG00000014693) hnf4g (ENSIPUG00000014701) ZFHX4 (ENSIPUG00000014739) Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000159227 ENSGT00940000157145 ENSGT00940000153832 ENSGT01030000234614.B.a.b ENSGT00940000166938 ENSGT00950000183163.b ENSGT00950000182941.b.b.b.b ENSGT00390000008256.sd.a.a ENSGT00980000201894 ENSGT00390000008256.sd.a.b ENSGT00940000159370.d ENSGT00530000063174.a.k ENSGT00940000158777 ENSGT00940000162962 ENSGT00390000014100.k.b ENSGT00950000183215.c.a.b ##22 ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154473.a ENSGT00940000154004.a.e.b Cyprininae DUPLICATION Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 237 ENSGT00940000159227 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ENSGT00390000008256.rd.a ENSGT00940000166443.d.b ENSGT00940000159370.d.d ENSGT00530000063174.a.k.a.a ENSGT00940000158777.r ENSGT00940000162962.b ENSGT00390000014100.k.b.c ENSGT00950000183215.c.a.b.db ##22 ENSGT00940000157658.hb ENSGT00940000159294.d ENSGT00940000154473.a.a.a ENSGT00940000154004.a.e.b.f ENSGT00940000154473.a.b ENSGT00940000156040.e.c ENSGT01030000234646.B.a.b.c.b ENSGT00940000163831.e.b ENSGT00940000153716.A.k.b ENSGT00730000111111.n ENSGT00940000158055.f ENSGT00530000063529.A.i.b ENSGT00940000156371.c.a.b.k.a ENSGT00940000156371.d ENSGT00940000162182.f Golden-line barbel MODERN SPECIES 84 hgd (ENSSGRG00000052378) ENSSGRG00000052403 chodl (ENSSGRG00000052405) lyz (ENSSGRG00000052409) zgc:112408 (ENSSGRG00000052413) ENSSGRG00000052414 zgc:112982 (ENSSGRG00000052415) ENSSGRG00000052417 eif1axb (ENSSGRG00000052419) ENSSGRG00000052497 rps6ka3b (ENSSGRG00000052513) pdha1b (ENSSGRG00000053038) ythdf3 (ENSSGRG00000053039) bhlhe22 (ENSSGRG00000053041) armc1 (ENSSGRG00000053042) 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ENSGT00940000166938.a ENSGT00950000183163.b.i ENSGT00950000182941.b.b.b.b.a.a ENSGT00390000008256.sd.a.a ENSGT00940000159370.d.c ENSGT00530000063174.a.k.b ENSGT00940000158777.q ENSGT00940000162962.a ENSGT00390000014100.k.b.d ENSGT00950000183215.c.a.b.eb ##22 ENSGT00940000157658.ib ENSGT00940000159294.c ENSGT00940000154473.a.a.b ENSGT00940000154004.a.e.b.e ENSGT00940000156040.e.d ENSGT01030000234646.B.a.b.c.a ENSGT00940000163831.e.a ENSGT00940000153716.A.k.a ENSGT00730000111111.o ENSGT00940000158055.e ENSGT00530000063529.A.i.a ENSGT00940000156371.c.a.b.k.b ENSGT00940000162182.e ENSGT00940000156202.b ENSGT00940000171984.c Common carp reference MODERN SPECIES 14 pola1 (ENSCCRG00000025848) arxa (ENSCCRG00000014710) hgd (ENSCCRG00000048424) ndufb4 (ENSCCRG00000081842) chodl (ENSCCRG00000048479) ENSCCRG00000062456 zgc:112408 (ENSCCRG00000059313) ENSCCRG00000008420 zgc:112982 (ENSCCRG00000008429) MAP7D2 (ENSCCRG00000073438) eif1axb (ENSCCRG00000008453) rps6ka3b (ENSCCRG00000021404) pdha1b 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ENSGT00390000006738.b.c River trout MODERN SPECIES 36 usp12a (ENSSTUG00000043826) rpl21 (ENSSTUG00000043884) gtf3ab (ENSSTUG00000043892) lnx2a (ENSSTUG00000043910) pdx1 (ENSSTUG00000043933) flt1 (ENSSTUG00000043943) pan3 (ENSSTUG00000044065) SPATA13 (ENSSTUG00000044436) c1qtnf9 (ENSSTUG00000044470) ENSSTUG00000044476 TAGLN3 (ENSSTUG00000044482) tagln3b (ENSSTUG00000044497) ythdf3 (ENSSTUG00000044512) bhlhe22 (ENSSTUG00000044524) armc1 (ENSSTUG00000044528) mtfr1 (ENSSTUG00000044545) ##22 pde7a (ENSSTUG00000044560) ENSSTUG00000044735 trim55b (ENSSTUG00000044744) crhb (ENSSTUG00000044761) ENSSTUG00000006627 rrs1 (ENSSTUG00000006632) MYBL1 (ENSSTUG00000006640) sgk3 (ENSSTUG00000006670) MCMDC2 (ENSSTUG00000006880) TCF24 (ENSSTUG00000006929) ppp1r42 (ENSSTUG00000006943) cops5 (ENSSTUG00000006961) ARFGEF1 (ENSSTUG00000007164) CPA6 (ENSSTUG00000012345) ENSSTUG00000012434 Atlantic salmon MODERN SPECIES 21 usp12 (ENSSSAG00000060005) gtf3ab (ENSSSAG00000060244) pdx1 (ENSSSAG00000095952) LNX2 (ENSSSAG00000060315) FLT3 (ENSSSAG00000060395) PAN3 (ENSSSAG00000060444) FLT1 (ENSSSAG00000065213) ENSSSAG00000056540 c1qtnf9 (ENSSSAG00000056526) ENSSSAG00000115980 tagln3b (ENSSSAG00000115887) ythdf3 (ENSSSAG00000056509) ENSSSAG00000056506 bhlhe22 (ENSSSAG00000084019) armc1 (ENSSSAG00000102374) mtfr1 (ENSSSAG00000080783) ##22 pde7a (ENSSSAG00000080765) trim55b (ENSSSAG00000080754) crhb (ENSSSAG00000118338) ENSSSAG00000080736 sgk3 (ENSSSAG00000080624) TCF24 (ENSSSAG00000090187) MCMDC2 (ENSSSAG00000103500) ppp1r42 (ENSSSAG00000080592) CSN5 (ENSSSAG00000080584) ENSSSAG00000101204 ENSSSAG00000080581 ARFGEF1 (ENSSSAG00000080482) cpa6 (ENSSSAG00000080450) ENSSSAG00000080443 ENSSSAG00000080439 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000155647.cb ENSGT00940000158381.e ENSGT00940000163955.v.a ENSGT00940000160575 ENSGT00390000001504.f ENSGT00940000158713.c ENSGT00940000154103.a.g ENSGT00940000176911 ENSGT00940000154936.c.a ENSGT00940000159385.f.b ENSGT00390000017765.b.c ENSGT00940000158777.o ENSGT01010000227996 ENSGT00940000162962.c.a ENSGT00390000014100.k.b.a ENSGT00950000183215.c.a.b.fb ##22 ENSGT00940000157658.cb.a ENSGT00940000159294.f.b.b ENSGT00940000154004.a.e.b.c ENSGT00940000154473.a.e.a ENSGT00390000005213.f ENSGT00940000157709.i.h ENSGT00940000153776.a.a.k ENSGT01090000260080.b.b ENSGT00940000162447.c ENSGT00550000074850.z ENSGT00940000157108.v.a ENSGT00940000159307.d ENSGT00530000064112.b.a.a.b ENSGT00940000166207.k.b ENSGT00390000006738.b.c Rainbow trout MODERN SPECIES 6 usp12a (ENSOMYG00000012558) rl21 (ENSOMYG00000012541) gtf3ab (ENSOMYG00000012526) lnx2a (ENSOMYG00000012512) pdx1 (ENSOMYG00000012510) ENSOMYG00000062335 PAN3 (ENSOMYG00000011351) FLT1 (ENSOMYG00000011130) ENSOMYG00000011054 ENSOMYG00000011019 tagln3b (ENSOMYG00000011016) ythdf3 (ENSOMYG00000010993) ENSOMYG00000058181 bhlhe22 (ENSOMYG00000003766) armc1 (ENSOMYG00000003815) mtfr1 (ENSOMYG00000003834) ##22 pde7a (ENSOMYG00000003923) DNAJC5B (ENSOMYG00000004011) trim55b (ENSOMYG00000004025) crhb (ENSOMYG00000004052) rrs1 (ENSOMYG00000073017) MYBL1 (ENSOMYG00000004144) ENSOMYG00000072294 ENSOMYG00000051918 sgk3 (ENSOMYG00000004328) MCMDC2 (ENSOMYG00000004365) TCF24 (ENSOMYG00000004386) COPS5 (ENSOMYG00000004465) ARFGEF1 (ENSOMYG00000008003) ENSOMYG00000065874 CPA6 (ENSOMYG00000012412) Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000155647.cb ENSGT00940000158381.e ENSGT00940000163955.v.a ENSGT00940000160575 ENSGT00390000001504.f ENSGT00940000158713.c ENSGT00940000154103.a.g ENSGT00940000176911 ENSGT00940000154936.c.a ENSGT00940000159385.f.b ENSGT00390000017765.b.c ENSGT00940000158777.o ENSGT01010000227996 ENSGT00940000162962.c.a ENSGT00390000014100.k.b.a ENSGT00950000183215.c.a.b.fb ##22 ENSGT00940000157658.cb.a ENSGT00940000159294.f.b.b ENSGT00940000154004.a.e.b.c ENSGT00940000154473.a.e.a ENSGT00390000005213.f ENSGT00940000157709.i.h ENSGT00940000153776.a.a.k ENSGT01090000260080.b.b ENSGT00940000162447.c ENSGT00550000074850.z ENSGT00940000157108.v.a ENSGT00940000159307.d ENSGT00530000064112.b.a.a.b ENSGT00940000166207.k.b ENSGT00390000006738.b.c Coho salmon MODERN SPECIES 2 lnx2a (ENSOKIG00005008419) pdx1 (ENSOKIG00005008402) FLT3 (ENSOKIG00005008384) PAN3 (ENSOKIG00005007837) FLT1 (ENSOKIG00005007728) ENSOKIG00005007717 SPATA13 (ENSOKIG00005007613) c1qtnf9 (ENSOKIG00005007570) ENSOKIG00005007540 tagln3b (ENSOKIG00005007532) ythdf3 (ENSOKIG00005007522) ENSOKIG00005007499 ENSOKIG00005007487 bhlhe22 (ENSOKIG00005007480) armc1 (ENSOKIG00005007459) mtfr1 (ENSOKIG00005007440) ##22 pde7a (ENSOKIG00005007319) DNAJC5B (ENSOKIG00005007289) trim55b (ENSOKIG00005007278) crhb (ENSOKIG00005007273) rrs1 (ENSOKIG00005007259) MYBL1 (ENSOKIG00005007235) sgk3 (ENSOKIG00005007073) MCMDC2 (ENSOKIG00005006996) TCF24 (ENSOKIG00005006979) cops5 (ENSOKIG00005006920) ARFGEF1 (ENSOKIG00005006186) CPA6 (ENSOKIG00005006025) RNF31 (ENSOKIG00005005748) ENSOKIG00005005690 emc9 (ENSOKIG00005005674) Chinook salmon DUPLICATION Chinook salmon MODERN SPECIES 21 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(ENSOTSG00005031388) ARMC2 (ENSOTSG00005031385) foxo3b (ENSOTSG00005031383) ENSOTSG00005031382 snx3 (ENSOTSG00005031379) nr2e1 (ENSOTSG00005031378) OSTM1 (ENSOTSG00005031375) armc1 (ENSOTSG00005031374) mtfr1 (ENSOTSG00005031372) ##22 pde7a (ENSOTSG00005031369) DNAJC5B (ENSOTSG00005031365) trim55b (ENSOTSG00005031363) crhb (ENSOTSG00005031361) rrs1 (ENSOTSG00005031360) MYBL1 (ENSOTSG00005031359) sgk3 (ENSOTSG00005031262) MCMDC2 (ENSOTSG00005031257) TCF24 (ENSOTSG00005031255) cops5 (ENSOTSG00005031248) ARFGEF1 (ENSOTSG00005028301) CPA6 (ENSOTSG00005028262) RNF31 (ENSOTSG00005028259) irf9 (ENSOTSG00005028258) emc9 (ENSOTSG00005028256) Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 149 ENSGT00940000155647.cb ENSGT00940000158381.e ENSGT00940000163955.v.a ENSGT00940000160575 ENSGT00390000001504.f ENSGT00940000158713.c ENSGT00940000154103.a.g ENSGT00940000154936.c.a ENSGT00940000176911 ENSGT00940000159385.f.b ENSGT00390000017765.b.c ENSGT00940000158777.o ENSGT01060000251044 ENSGT00940000162962.c.b 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ENSGT00940000157658.cb.b ENSGT00940000159294.f.b.a ENSGT00940000159294.e ENSGT00940000154004.a.e.b.d ENSGT00940000154473.a.e.b ENSGT00390000005213.e ENSGT00940000157709.i.g ENSGT00940000153776.a.a.l ENSGT00940000162447.d ENSGT00940000158260.e ENSGT00550000074850.y ENSGT00980000202398 ENSGT00390000015084.c.a ENSGT00940000157108.v.b ENSGT00940000159307.c Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00940000163955.v.b ENSGT00390000002395.f ENSGT00940000167274 ENSGT00390000001504.e ENSGT00940000158713.d ENSGT00940000165120 ENSGT00940000160085 ENSGT00940000154103.a.h ENSGT00940000154936.c.b ENSGT00940000159385.f.a ENSGT00390000017765.b.d ENSGT00940000158777.p ENSGT00950000184906.C ENSGT00940000162962.c.b ENSGT00390000014100.k.b.b ENSGT00950000183215.c.a.b.gb ##22 ENSGT00940000157658.cb.b ENSGT00940000159294.f.b.a ENSGT00940000154004.a.e.b.d ENSGT00940000154473.a.e.b ENSGT00390000005213.e ENSGT00940000157709.i.g ENSGT00940000153776.a.a.l ENSGT00940000162447.d ENSGT00940000158260.e ENSGT00550000074850.y ENSGT00980000202398 ENSGT00390000015084.c.a ENSGT00940000157108.v.b ENSGT00940000159307.c ENSGT00530000064112.b.a.a.a Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000163955.v.b ENSGT00390000002395.f ENSGT00940000167274 ENSGT00390000001504.e ENSGT00940000158713.d ENSGT00940000165120 ENSGT00940000160085 ENSGT00940000154103.a.h ENSGT00940000154936.c.b ENSGT00940000159385.f.a ENSGT00390000017765.b.d ENSGT00940000158777.p ENSGT00950000184906.C ENSGT00940000162962.c.b ENSGT00390000014100.k.b.b ENSGT00950000183215.c.a.b.gb ##22 ENSGT00940000157658.cb.b ENSGT00940000159294.f.b.a ENSGT00940000154004.a.e.b.d ENSGT00940000154473.a.e.b ENSGT00390000005213.e ENSGT00940000157709.i.g ENSGT00940000153776.a.a.l ENSGT00940000162447.d ENSGT00940000158260.e ENSGT00550000074850.y ENSGT00980000202398 ENSGT00390000015084.c.a ENSGT00940000157108.v.b ENSGT00940000159307.c ENSGT00530000064112.b.a.a.a Chinook salmon DUPLICATION Chinook salmon MODERN SPECIES 7 pan3 (ENSOTSG00005002167) 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TCF24 (ENSOMYG00000034933) ppp1r42 (ENSOMYG00000034918) csn5 (ENSOMYG00000034873) ENSOMYG00000034837 ENSOMYG00000050500 ARFGEF1 (ENSOMYG00000033710) CPA6 (ENSOMYG00000033394) ENSOMYG00000033347 Salmo ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000003643 ENSGT00940000163955.v.b ENSGT00390000002395 ENSGT00940000167274 ENSGT00390000001504.e ENSGT00940000158713.d ENSGT00940000165120 ENSGT00940000160085 ENSGT00940000154103.a.h ENSGT00940000154936.c.b ENSGT00940000159385.f.a ENSGT00390000017765.b.d ENSGT00940000158777.p ENSGT00940000162962.c.b ENSGT00390000014100.k.b.b ENSGT00950000183215.c.a.b.gb ##22 ENSGT00940000157658.cb.b ENSGT00940000159294.e ENSGT00940000154004.a.e.b.d ENSGT00940000154473.a.e.b ENSGT00390000005213.e ENSGT00940000157709.i.g ENSGT00940000153776.a.a.l ENSGT00940000162447.d ENSGT00940000158260.e ENSGT00550000074850.y ENSGT00980000202398 ENSGT00390000015084.c.a ENSGT00940000157108.v.b ENSGT00940000159307.c ENSGT00530000064112.b.a.a.a Atlantic salmon MODERN SPECIES 10 si:ch211-140b10.6 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Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000163955 ENSGT00390000002395 ENSGT00940000167274 ENSGT00390000001504 ENSGT00940000158713 ENSGT00940000165120 ENSGT00940000160085 ENSGT00940000154103.a ENSGT00940000154936 ENSGT00940000176911 ENSGT00940000159385 ENSGT00390000017765.b ENSGT00940000158777 ENSGT00940000162962 ENSGT00390000014100.k.b ENSGT00950000183215.c.a.b ##22 ENSGT00940000157658 ENSGT00940000154004.a.e.b ENSGT00940000154473.a ENSGT00390000005213 ENSGT00940000157709.i ENSGT00940000153776.a.a ENSGT01090000260080.b.b ENSGT00940000162447 ENSGT00940000158260 ENSGT00550000074850 ENSGT00390000015084.c.a ENSGT00940000157108 ENSGT00940000159307 ENSGT00940000155894 ENSGT00390000005870 Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000163955 ENSGT00390000002395 ENSGT00940000167274 ENSGT00390000001504 ENSGT00940000158713 ENSGT00940000165120 ENSGT00940000160085 ENSGT00940000154103.a ENSGT00940000154936 ENSGT00940000176911 ENSGT00940000159385 ENSGT00390000017765.b 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perch MODERN SPECIES 11 si:ch211-140b10.6 (ENSATEG00000028994) pdx1 (ENSATEG00000010719) urad (ENSATEG00000027814) ENSATEG00000010746 pan3 (ENSATEG00000010812) flt1 (ENSATEG00000010898) ENSATEG00000026354 ENSATEG00000030180 ENSATEG00000011139 c1qtnf9 (ENSATEG00000026859) ENSATEG00000011168 tagln3b (ENSATEG00000011456) ythdf3 (ENSATEG00000026605) bhlhe22 (ENSATEG00000011525) armc1 (ENSATEG00000011533) mtfr1 (ENSATEG00000011587) ##22 pde7a (ENSATEG00000011609) trim55b (ENSATEG00000011663) crhb (ENSATEG00000011692) rrs1 (ENSATEG00000011743) ENSATEG00000025570 MYBL1 (ENSATEG00000011764) sgk3 (ENSATEG00000011776) MCMDC2 (ENSATEG00000011845) TCF24 (ENSATEG00000027430) ppp1r42 (ENSATEG00000011905) cops5 (ENSATEG00000011952) ARFGEF1 (ENSATEG00000011997) CPA6 (ENSATEG00000012107) PREX2 (ENSATEG00000012260) zgc:162928 (ENSATEG00000012457) Siamese fighting fish MODERN SPECIES 15 si:ch211-140b10.6 (ENSBSLG00000000923) pdx1 (ENSBSLG00000000920) urad (ENSBSLG00000000918) ENSBSLG00000000911 pan3 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