Vertebrata	DUPLICATION
Vertebrata	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183143.c.a #22
Gnathostomata	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183143.c.a #22
Euteleostomi	ANCESTRAL SPECIES	98			ENSGT00940000156871	ENSGT00940000164250	ENSGT01020000230750	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01070000253990	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000166398	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00930000151526	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873
Sarcopterygii	ANCESTRAL SPECIES	79	ENSGT00940000158425	ENSGT00940000154184.A	ENSGT00940000156871	ENSGT00940000164250	ENSGT01020000230750	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01070000253990	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000166398	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00930000151526	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873
Tetrapoda	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000154184.A	ENSGT00990000211938	ENSGT00940000156871	ENSGT00940000164250	ENSGT01020000230750	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01070000253990	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000166398	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00930000151526	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873
Amniota	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000154184.A	ENSGT00990000211938	ENSGT00940000156871	ENSGT00940000164250	ENSGT01020000230750	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01070000253990	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00940000182586	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00930000151526	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873
Mammalia	ANCESTRAL SPECIES	74	ENSGT00940000158425	ENSGT00940000154184.A	ENSGT00990000211938	ENSGT00940000156871	ENSGT00940000164250	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01100000263656	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00940000182586	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00930000151526	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107
Theria	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000154184.A	ENSGT00990000203589.a.a	ENSGT00940000156871	ENSGT00940000164250	ENSGT00530000065303	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01100000263651	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00940000182586	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00930000151526	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107
Eutheria	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000158425	ENSGT00940000154184.A	ENSGT00990000203589.a.a	ENSGT00940000156871	ENSGT00530000065303	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01100000263651	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00940000182586	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00930000151526	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107
Boreoeutheria	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000153818.a.a	ENSGT00390000010771	ENSGT00510000046406.f.a.b	ENSGT00510000046406.f.a.a	ENSGT00530000065303	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01100000263656	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00940000182586	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00930000151526	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107
Laurasiatheria	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000153818.a.a	ENSGT00390000010771	ENSGT00510000046406.f.a.b	ENSGT00510000046406.f.a.a	ENSGT00530000065303	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01100000263656	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00940000182586	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00930000151526	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107
Eulipotyphla	ANCESTRAL SPECIES	2548																ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000171590
Common shrew	MODERN SPECIES	840																KCTD10 (ENSSARG00000001766) #22
Hedgehog	MODERN SPECIES	6954																KCTD10 (ENSEEUG00000004348) #22	ENSEEUG00000004334
Laurasiatheria_a	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000153818.a.a	ENSGT00390000010771	ENSGT00510000046406.f.a.b	ENSGT00510000046406.f.a.a	ENSGT00530000065303	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01100000263656	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00940000182586	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00930000151526	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107
Laurasiatheria_b	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000153818.a.a	ENSGT00390000010771	ENSGT00510000046406.f.a.b	ENSGT00510000046406.f.a.a	ENSGT00530000065303	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01100000263656	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00940000182586	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00930000151526	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107
Carnivora	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000158101	ENSGT00940000153818.a.a	ENSGT00390000010771	ENSGT00510000046406.f.a.b	ENSGT00510000046406.f.a.a	ENSGT00530000065303	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01100000263656	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00930000151526	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107
Caniformia	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000158101	ENSGT00940000153818.a.a	ENSGT00390000010771	ENSGT00510000046406.f.a.b	ENSGT00510000046406.f.a.a	ENSGT00530000065303	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01100000263656	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00930000151526	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107
Canidae	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00940000158101	ENSGT00940000153818.a.a	ENSGT00390000010771	ENSGT00510000046406.f.a.b	ENSGT00510000046406.f.a.a	ENSGT00530000065303.k	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01100000263656	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405.bc.a	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873
Canis_lupus	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00390000010771	ENSGT00510000046406.f.a.b	ENSGT00510000046406.f.a.a	ENSGT00950000183642	ENSGT00950000183200.A.a.b.b.d	ENSGT00530000065303.k	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01100000263656	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405.bc.a	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873
Dog	MODERN SPECIES	18	OASL (ENSCAFG00845030170)	OASL (ENSCAFG00845030186)	ENSCAFG00845030204	ENSCAFG00845020231	ENSCAFG00845020348	ENSCAFG00845020684	ANKRD13A (ENSCAFG00845020714)	GIT2 (ENSCAFG00845020975)	TCHP (ENSCAFG00845021777)	GLTP (ENSCAFG00845021839)	TRPV4 (ENSCAFG00845022016)	FAM222A (ENSCAFG00845022532)	MVK (ENSCAFG00845022604)	MMAB (ENSCAFG00845022811)	UBE3B (ENSCAFG00845022953)	KCTD10 (ENSCAFG00845023284) #22	MYO1H (ENSCAFG00845023352)	FOXN4 (ENSCAFG00845023510)	ACACB (ENSCAFG00845023823)	UNG (ENSCAFG00845024980)	ENSCAFG00845025088	USP30 (ENSCAFG00845025190)	SVOP (ENSCAFG00845025433)	DAO (ENSCAFG00845025695)	SSH1 (ENSCAFG00845025957)	CORO1C (ENSCAFG00845026453)	SELPLG (ENSCAFG00845026589)	TMEM119 (ENSCAFG00845026643)	ISCU (ENSCAFG00845026711)	SART3 (ENSCAFG00845026929)	FICD (ENSCAFG00845027150)
Dingo	MODERN SPECIES	108	C12orf43 (ENSCAFG00020020834)	OASL (ENSCAFG00020020845)	ENSCAFG00020020855	ENSCAFG00020020857	PIWIL3 (ENSCAFG00020020864)	ENSCAFG00020020894	ANKRD13A (ENSCAFG00020020895)	GIT2 (ENSCAFG00020020942)	TCHP (ENSCAFG00020021691)	GLTP (ENSCAFG00020021694)	TRPV4 (ENSCAFG00020021699)	FAM222A (ENSCAFG00020021705)	MVK (ENSCAFG00020021711)	MMAB (ENSCAFG00020021718)	UBE3B (ENSCAFG00020021763)	KCTD10 (ENSCAFG00020022026) #22	MYO1H (ENSCAFG00020022031)	FOXN4 (ENSCAFG00020022075)	ACACB (ENSCAFG00020022092)	ENSCAFG00020022151	ALKBH2 (ENSCAFG00020022165)	USP30 (ENSCAFG00020022167)	ENSCAFG00020022170	SVOP (ENSCAFG00020022171)	DAO (ENSCAFG00020022183)	SSH1 (ENSCAFG00020022215)	ENSCAFG00020022257	ENSCAFG00020022260	CORO1C (ENSCAFG00020022261)	ENSCAFG00020022264	TMEM119 (ENSCAFG00020022267)
Red fox	MODERN SPECIES	230						ENSVVUG00000001233	ANKRD13A (ENSVVUG00000001265)	GIT2 (ENSVVUG00000001294)	TCHP (ENSVVUG00000001375)	GLTP (ENSVVUG00000001388)	TRPV4 (ENSVVUG00000001579)	FAM222A (ENSVVUG00000004665)	MVK (ENSVVUG00000004670)	MMAB (ENSVVUG00000004684)	UBE3B (ENSVVUG00000004690)	KCTD10 (ENSVVUG00000004733) #22	MYO1H (ENSVVUG00000004746)	FOXN4 (ENSVVUG00000004901)	ACACB (ENSVVUG00000005036)	UNG (ENSVVUG00000008034)	ALKBH2 (ENSVVUG00000008059)	USP30 (ENSVVUG00000008063)	SVOP (ENSVVUG00000008091)	DAO (ENSVVUG00000008105)	SSH1 (ENSVVUG00000008121)	ENSVVUG00000008168	CORO1C (ENSVVUG00000008180)	SELPLG (ENSVVUG00000008196)	ENSVVUG00000008200	ISCU (ENSVVUG00000008203)	SART3 (ENSVVUG00000008216)
Caniformia_b	ANCESTRAL SPECIES	29						ENSGT00530000065303	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01100000263656	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00930000151526	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107
Mustelinae	ANCESTRAL SPECIES	140						ENSGT00530000065303	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01100000263656	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873
American mink	MODERN SPECIES	318						C12orf76 (ENSNVIG00000019473)	ANKRD13A (ENSNVIG00000019431)	GIT2 (ENSNVIG00000019031)	TCHP (ENSNVIG00000018964)	GLTP (ENSNVIG00000018943)	TRPV4 (ENSNVIG00000018802)	FAM222A (ENSNVIG00000018791)	KIME (ENSNVIG00000018721)	MMAB (ENSNVIG00000018681)	UBE3B (ENSNVIG00000018647)	KCTD10 (ENSNVIG00000018631) #22	MYO1H (ENSNVIG00000018551)	FOXN4 (ENSNVIG00000018541)	ACACB (ENSNVIG00000018431)	UNG (ENSNVIG00000018402)	ALKBH2 (ENSNVIG00000018386)	USP30 (ENSNVIG00000018374)	SVOP (ENSNVIG00000018326)	DAO (ENSNVIG00000018298)	SSH1 (ENSNVIG00000018255)	CORO1C (ENSNVIG00000018202)	ENSNVIG00000018190	TMEM119 (ENSNVIG00000018182)	ISCU (ENSNVIG00000018104)	SART3 (ENSNVIG00000018012)	FICD (ENSNVIG00000017996)
Ferret	MODERN SPECIES	453						C12orf76 (ENSMPUG00000003987)	ANKRD13A (ENSMPUG00000003976)	GIT2 (ENSMPUG00000003961)	TCHP (ENSMPUG00000003952)	GLTP (ENSMPUG00000003917)	TRPV4 (ENSMPUG00000003908)	FAM222A (ENSMPUG00000003902)	MVK (ENSMPUG00000003896)	MMAB (ENSMPUG00000003888)	UBE3B (ENSMPUG00000003864)	KCTD10 (ENSMPUG00000003856) #22	MYO1H (ENSMPUG00000003654)	FOXN4 (ENSMPUG00000003606)	ACACB (ENSMPUG00000003545)	UNG (ENSMPUG00000003463)	ENSMPUG00000003459	USP30 (ENSMPUG00000003448)	SVOP (ENSMPUG00000003444)	DAO (ENSMPUG00000003436)	SSH1 (ENSMPUG00000003429)	ENSMPUG00000003421	ENSMPUG00000018416	TMEM119 (ENSMPUG00000003417)	ISCU (ENSMPUG00000003412)	SART3 (ENSMPUG00000003402)	FICD (ENSMPUG00000003398)
Ursidae	ANCESTRAL SPECIES	34					ENSGT00940000156871	ENSGT00530000065303	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01100000263656	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00930000151526	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107
Ursus	ANCESTRAL SPECIES	100					ENSGT00940000156871	ENSGT00530000065303	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01100000263656	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00930000151526	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107
Polar bear	MODERN SPECIES	306						SGSM1 (ENSUMAG00000001327)	C12orf76 (ENSUMAG00000001831)	ANKRD13A (ENSUMAG00000001850)	GIT2 (ENSUMAG00000002013)	TCHP (ENSUMAG00000002054)	GLTP (ENSUMAG00000002073)	TRPV4 (ENSUMAG00000002177)	MVK (ENSUMAG00000002517)	MMAB (ENSUMAG00000002525)	UBE3B (ENSUMAG00000002539)	KCTD10 (ENSUMAG00000002558) #22	ENSUMAG00000002563	ENSUMAG00000002568	ACACB (ENSUMAG00000002844)	UNG (ENSUMAG00000005745)	ALKBH2 (ENSUMAG00000005759)	USP30 (ENSUMAG00000005761)	SVOP (ENSUMAG00000005767)	DAO (ENSUMAG00000005786)	SSH1 (ENSUMAG00000005823)	CORO1C (ENSUMAG00000005828)	ENSUMAG00000005830	TMEM119 (ENSUMAG00000005833)	ISCU (ENSUMAG00000005838)	SART3 (ENSUMAG00000005844)	FICD (ENSUMAG00000005849)
Giant Panda	MODERN SPECIES	3	PISD (ENSAMEG00000007005)	PRR14L (ENSAMEG00000007000)	DEPDC5 (ENSAMEG00000006945)	YWHAH (ENSAMEG00000023877)	SLC5A1 (ENSAMEG00000006897)	ENSAMEG00000003643	ENSAMEG00000026797	GIT2 (ENSAMEG00000005764)	TCHP (ENSAMEG00000005866)	ENSAMEG00000005882	TRPV4 (ENSAMEG00000005900)	FAM222A (ENSAMEG00000024269)	MVK (ENSAMEG00000016630)	MMAB (ENSAMEG00000016623)	UBE3B (ENSAMEG00000016602)	KCTD10 (ENSAMEG00000016597) #22	MYO1H (ENSAMEG00000016558)	FOXN4 (ENSAMEG00000016548)	ENSAMEG00000016533	ENSAMEG00000023811	UNG (ENSAMEG00000016525)	ALKBH2 (ENSAMEG00000016522)	USP30 (ENSAMEG00000016515)	SVOP (ENSAMEG00000016499)	DAO (ENSAMEG00000026748)	SSH1 (ENSAMEG00000016450)	CORO1C (ENSAMEG00000016414)	ENSAMEG00000026536	TMEM119 (ENSAMEG00000019168)	ISCU (ENSAMEG00000016405)	SART3 (ENSAMEG00000016374)
Felidae	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000156366.a.a	ENSGT00940000156366.a.b	ENSGT00940000161301	ENSGT00940000163205	ENSGT00940000162786	ENSGT00530000065303	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01100000263656	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873
Panthera	ANCESTRAL SPECIES	28	ENSGT00940000156366.a.a	ENSGT00940000156366.a.b	ENSGT00940000161301	ENSGT00940000163205	ENSGT00940000162786	ENSGT00530000065303	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01100000263656	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813.r	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873
Panthera_a	ANCESTRAL SPECIES	30	ENSGT00940000156366.a.a	ENSGT00940000156366.a.b	ENSGT00940000161301	ENSGT00940000163205	ENSGT00940000162786	ENSGT00530000065303	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01100000263656	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813.r	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873
leopard	MODERN SPECIES	50	ENSPPRG00000006677	ENSPPRG00000005515	GSTT4 (ENSPPRG00000004852)	ENSPPRG00000004568	ENSPPRG00000004396	C12orf76 (ENSPPRG00000003014)	ANKRD13A (ENSPPRG00000002747)	GIT2 (ENSPPRG00000001349)	TCHP (ENSPPRG00000014966)	GLTP (ENSPPRG00000013292)	TRPV4 (ENSPPRG00000012532)	FAM222A (ENSPPRG00000007868)	MVK (ENSPPRG00000007649)	MMAB (ENSPPRG00000004502)	UBE3B (ENSPPRG00000003702)	KCTD10 (ENSPPRG00000001752) #22	MYO1H (ENSPPRG00000000688)	FOXN4 (ENSPPRG00000023439)	ACACB (ENSPPRG00000020104)	UNG (ENSPPRG00000011218)	ALKBH2 (ENSPPRG00000009996)	USP30 (ENSPPRG00000009766)	SVOP (ENSPPRG00000009417)	DAO (ENSPPRG00000008649)	SSH1 (ENSPPRG00000006674)	ENSPPRG00000005819	CORO1C (ENSPPRG00000005425)	SELPLG (ENSPPRG00000003997)	TMEM119 (ENSPPRG00000015225)	ENSPPRG00000002830	SART3 (ENSPPRG00000001579)
lion	MODERN SPECIES	12	ENSPLOG00000020081	ENSPLOG00000020117	ENSPLOG00000020181	GSTT4 (ENSPLOG00000020241)	ENSPLOG00000020284	C12orf76 (ENSPLOG00000020304)	ANKRD13A (ENSPLOG00000020325)	GIT2 (ENSPLOG00000020542)	TCHP (ENSPLOG00000020697)	GLTP (ENSPLOG00000005077)	TRPV4 (ENSPLOG00000005288)	FAM222A (ENSPLOG00000005603)	ENSPLOG00000005643	ENSPLOG00000005768	UBE3B (ENSPLOG00000005825)	KCTD10 (ENSPLOG00000005955) #22	MYO1H (ENSPLOG00000006041)	FOXN4 (ENSPLOG00000006273)	ACACB (ENSPLOG00000006384)	UNG (ENSPLOG00000006613)	ALKBH2 (ENSPLOG00000006636)	USP30 (ENSPLOG00000006667)	SVOP (ENSPLOG00000006703)	DAO (ENSPLOG00000006804)	SSH1 (ENSPLOG00000006901)	ENSPLOG00000006943	CORO1C (ENSPLOG00000007004)	ENSPLOG00000007081	TMEM119 (ENSPLOG00000007103)	ENSPLOG00000007147	SART3 (ENSPLOG00000007306)
Tiger	MODERN SPECIES	378	ENSPTIG00000006926	ENSPTIG00000007663	ENSPTIG00000008107	GSTT4 (ENSPTIG00000009527)	ENSPTIG00000010388	ENSPTIG00000016270	ENSPTIG00000017521	ANKRD13A (ENSPTIG00000018203)	GIT2 (ENSPTIG00000021033)	TCHP (ENSPTIG00000011064)	ENSPTIG00000011575	TRPV4 (ENSPTIG00000012100)	MVK (ENSPTIG00000018983)	MMAB (ENSPTIG00000006605)	UBE3B (ENSPTIG00000007652)	KCTD10 (ENSPTIG00000011496) #22	MYO1H (ENSPTIG00000013274)	FOXN4 (ENSPTIG00000017812)	ACACB (ENSPTIG00000019181)	UNG (ENSPTIG00000012891)	ALKBH2 (ENSPTIG00000013829)	USP30 (ENSPTIG00000014092)	SVOP (ENSPTIG00000015355)	DAO (ENSPTIG00000016147)	SSH1 (ENSPTIG00000017164)	CORO1C (ENSPTIG00000018914)	SELPLG (ENSPTIG00000020758)	ENSPTIG00000021393	SART3 (ENSPTIG00000021928)	FICD (ENSPTIG00000003544)	CMKLR1 (ENSPTIG00000005406)
Cat	MODERN SPECIES	243	ENSFCAG00000009408	ENSFCAG00000035422	ENSFCAG00000022623	GSTT4 (ENSFCAG00000036794)	ENSFCAG00000022320	C12orf76 (ENSFCAG00000042462)	ANKRD13A (ENSFCAG00000006173)	GIT2 (ENSFCAG00000011505)	TCHP (ENSFCAG00000011503)	GLTP (ENSFCAG00000011500)	TRPV4 (ENSFCAG00000011496)	FAM222A (ENSFCAG00000030447)	MVK (ENSFCAG00000008953)	MMAB (ENSFCAG00000024182)	UBE3B (ENSFCAG00000008951)	KCTD10 (ENSFCAG00000026150) #22	MYO1H (ENSFCAG00000025595)	FOXN4 (ENSFCAG00000003124)	ACACB (ENSFCAG00000008350)	UNG (ENSFCAG00000008349)	ALKBH2 (ENSFCAG00000008348)	USP30 (ENSFCAG00000008347)	SVOP (ENSFCAG00000026089)	DAO (ENSFCAG00000011289)	SSH1 (ENSFCAG00000004336)	CORO1C (ENSFCAG00000031793)	SELPLG (ENSFCAG00000045539)	TMEM119 (ENSFCAG00000041158)	ENSFCAG00000041316	SART3 (ENSFCAG00000014041)	FICD (ENSFCAG00000040222)
Laurasiatheria_c	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000154184.A	ENSGT00990000203589.a.a	ENSGT00940000156871	ENSGT00510000046406.f.a.a	ENSGT00530000065303	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01100000263656	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00940000182586	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873
Chiroptera	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000158101	ENSGT00940000153818.a.a	ENSGT00390000010771	ENSGT00510000046406.f.a.b	ENSGT00510000046406.f.a.a	ENSGT00530000065303	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01100000263656	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873
Megabat	MODERN SPECIES	2405										GLTP (ENSPVAG00000006261)	TRPV4 (ENSPVAG00000006258)	FAM222A (ENSPVAG00000006257)	MVK (ENSPVAG00000006254)	MMAB (ENSPVAG00000006251)	UBE3B (ENSPVAG00000006247)	KCTD10 (ENSPVAG00000006244) #22	MYO1H (ENSPVAG00000006235)
Microchiroptera	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000158101	ENSGT00940000153818.a.a	ENSGT00390000010771	ENSGT00510000046406.f.a.b	ENSGT00510000046406.f.a.a	ENSGT00530000065303	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01100000263656	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873
Microbat	MODERN SPECIES	1166	JAM3 (ENSMLUG00000009693)	NCAPD3 (ENSMLUG00000009710)	VPS26B (ENSMLUG00000009788)	THYN1 (ENSMLUG00000009797)	ACAD8 (ENSMLUG00000009813)	GLB1L3 (ENSMLUG00000003754)	GLB1L2 (ENSMLUG00000003771)	B3GAT1 (ENSMLUG00000003787)	ENSMLUG00000004778	ENSMLUG00000006148	ENSMLUG00000022360	ENSMLUG00000006160	OR6X1 (ENSMLUG00000000675)	ZNF202 (ENSMLUG00000000666)	UBE3B (ENSMLUG00000009400)	KCTD10 (ENSMLUG00000009450) #22	MYO1H (ENSMLUG00000009466)	FOXN4 (ENSMLUG00000025686)	ACACB (ENSMLUG00000006509)	UNG (ENSMLUG00000010755)	ALKBH2 (ENSMLUG00000010708)	USP30 (ENSMLUG00000010674)	SVOP (ENSMLUG00000007194)	DAO (ENSMLUG00000010662)	SSH1 (ENSMLUG00000007935)	CORO1C (ENSMLUG00000012231)	ENSMLUG00000007948	ISCU (ENSMLUG00000007942)	SART3 (ENSMLUG00000007906)	FICD (ENSMLUG00000009866)	WSCD2 (ENSMLUG00000011349)
Greater horseshoe bat	MODERN SPECIES	17	ENSRFEG00010016087	HNF1A (ENSRFEG00010016115)	C12orf43 (ENSRFEG00010016283)	OASL (ENSRFEG00010016367)	ENSRFEG00010016461	C12orf76 (ENSRFEG00010016482)	ANKRD13A (ENSRFEG00010016524)	GIT2 (ENSRFEG00010016603)	ENSRFEG00010016971	GLTP (ENSRFEG00010017175)	TRPV4 (ENSRFEG00010017269)	FAM222A (ENSRFEG00010017617)	MVK (ENSRFEG00010017653)	MMAB (ENSRFEG00010017781)	UBE3B (ENSRFEG00010017914)	KCTD10 (ENSRFEG00010017999) #22	MYO1H (ENSRFEG00010018097)	FOXN4 (ENSRFEG00010018643)	ACACB (ENSRFEG00010018778)	UNG (ENSRFEG00010018810)	ALKBH2 (ENSRFEG00010018834)	USP30 (ENSRFEG00010018866)	SVOP (ENSRFEG00010018928)	DAO (ENSRFEG00010018967)	SSH1 (ENSRFEG00010019052)	CORO1C (ENSRFEG00010019143)	ENSRFEG00010019366	TMEM119 (ENSRFEG00010019386)	ENSRFEG00010019422	SART3 (ENSRFEG00010019603)	FICD (ENSRFEG00010019930)
Equus	ANCESTRAL SPECIES	50	ENSGT00940000154637.m.a.a.b.a.b.a.b	ENSGT00940000154637.m.a.a.b.a.a.a	ENSGT00390000014845.e.b.a.a	ENSGT00940000154637.m.a.a.b.b.a.a	ENSGT00530000065303	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01100000264494	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00940000182586	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873
Horse	MODERN SPECIES	29	PIWIL3 (ENSECAG00000018484)	ENSECAG00000034230	ENSECAG00000032893	ENSECAG00000030081	ENSECAG00000043880	ENSECAG00000018316	ANKRD13A (ENSECAG00000022194)	GIT2 (ENSECAG00000008399)	TCHP (ENSECAG00000022972)	GLTP (ENSECAG00000006004)	TRPV4 (ENSECAG00000011734)	FAM222A (ENSECAG00000036516)	MVK (ENSECAG00000023067)	MMAB (ENSECAG00000000723)	UBE3B (ENSECAG00000008960)	KCTD10 (ENSECAG00000019560) #22	MYO1H (ENSECAG00000004215)	FOXN4 (ENSECAG00000015538)	ACACB (ENSECAG00000015548)	UNG (ENSECAG00000008080)	ALKBH2 (ENSECAG00000015963)	USP30 (ENSECAG00000017723)	SVOP (ENSECAG00000023228)	DAO (ENSECAG00000008398)	SSH1 (ENSECAG00000018197)	CORO1C (ENSECAG00000019147)	SELPLG (ENSECAG00000046831)	TMEM119 (ENSECAG00000000931)	ISCU (ENSECAG00000019879)	SART3 (ENSECAG00000000314)	FICD (ENSECAG00000019014)
Donkey	MODERN SPECIES	28	ENSEASG00005010846	ENSEASG00005024324	ENSEASG00005033628	ENSEASG00005029785	ENSEASG00005027741	ANKRD13A (ENSEASG00005018665)	GIT2 (ENSEASG00005018663)	ENSEASG00005018661	GLTP (ENSEASG00005018660)	TRPV4 (ENSEASG00005018523)	FAM222A (ENSEASG00005018465)	ENSEASG00005029125	ENSEASG00005027830	MMAB (ENSEASG00005018426)	UBE3B (ENSEASG00005018405)	KCTD10 (ENSEASG00005018400) #22	MYO1H (ENSEASG00005018368)	FOXN4 (ENSEASG00005018357)	ACACB (ENSEASG00005014826)	ENSEASG00005014544	ALKBH2 (ENSEASG00005014540)	USP30 (ENSEASG00005014534)	SVOP (ENSEASG00005014529)	DAO (ENSEASG00005036660)	SSH1 (ENSEASG00005014519)	CORO1C (ENSEASG00005014513)	SELPLG (ENSEASG00005026531)	TMEM119 (ENSEASG00005037151)	ENSEASG00005014504	SART3 (ENSEASG00005014500)	FICD (ENSEASG00005033903)
Artiodactyla	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000158866	ENSGT00940000158101	ENSGT00940000153818.a.a	ENSGT00390000010771	ENSGT00510000046406.f.a.b	ENSGT00530000065303	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01090000260322	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873
Suina	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000158866	ENSGT00940000158101	ENSGT00940000153818.a.a	ENSGT00390000010771	ENSGT00510000046406.f.a.b	ENSGT00530000065303	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01090000260322	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873
Chacoan peccary	MODERN SPECIES	812	SPPL3 (ENSCWAG00000013187)	HNF1A (ENSCWAG00000012950)	C12orf43 (ENSCWAG00000012899)	OASL (ENSCWAG00000012666)	ENSCWAG00000012600	C12orf76 (ENSCWAG00000012568)	ANKRD13A (ENSCWAG00000012507)	GIT2 (ENSCWAG00000011894)	ENSCWAG00000011656	GLTP (ENSCWAG00000011567)	TRPV4 (ENSCWAG00000010201)	FAM222A (ENSCWAG00000010105)	MVK (ENSCWAG00000010011)	MMAB (ENSCWAG00000009938)	UBE3B (ENSCWAG00000009786)	KCTD10 (ENSCWAG00000009737) #22	MYO1H (ENSCWAG00000009334)	FOXN4 (ENSCWAG00000009213)	ACACB (ENSCWAG00000008578)	UNG (ENSCWAG00000008412)	ALKBH2 (ENSCWAG00000008371)	USP30 (ENSCWAG00000008307)	SVOP (ENSCWAG00000008112)	DAO (ENSCWAG00000020787)	SSH1 (ENSCWAG00000020769)	CORO1C (ENSCWAG00000020718)	ENSCWAG00000020699	TMEM119 (ENSCWAG00000020696)	ENSCWAG00000020672	SART3 (ENSCWAG00000020630)	FICD (ENSCWAG00000020614)
Pig	MODERN SPECIES	5	ACADS (ENSSSCG00000009916)	SPPL3 (ENSSSCG00000009917)	HNF1A (ENSSSCG00000009919)	C12orf43 (ENSSSCG00000024329)	OASL (ENSSSCG00000009921)	C12orf76 (ENSSSCG00000040422)	ANKRD13A (ENSSSCG00000009924)	GIT2 (ENSSSCG00000009925)	ENSSSCG00000009926	GLTP (ENSSSCG00000039012)	TRPV4 (ENSSSCG00000009929)	FAM222A (ENSSSCG00000009927)	MVK (ENSSSCG00000009931)	MMAB (ENSSSCG00000009932)	UBE3B (ENSSSCG00000009933)	KCTD10 (ENSSSCG00000009934) #22	MYO1H (ENSSSCG00000009935)	ENSSSCG00000009936	ACACB (ENSSSCG00000061436)	UNG (ENSSSCG00000009938)	ALKBH2 (ENSSSCG00000009940)	USP30 (ENSSSCG00000032917)	SVOP (ENSSSCG00000009941)	DAO (ENSSSCG00000009942)	SSH1 (ENSSSCG00000009943)	CORO1C (ENSSSCG00000009944)	ENSSSCG00000027124	ISCU (ENSSSCG00000023380)	SART3 (ENSSSCG00000009946)	FICD (ENSSSCG00000009945)	CMKLR1 (ENSSSCG00000031346)
Artiodactyla_a	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000158866	ENSGT00940000158101	ENSGT00940000153818.a.a	ENSGT00390000010771	ENSGT00510000046406.f.a.b	ENSGT00530000065303	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01090000260322	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873
Camelidae	ANCESTRAL SPECIES	63						ENSGT00530000065303	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01100000264494	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873	ENSGT01020000230438.C
Arabian camel	MODERN SPECIES	25	RITA1 (ENSCDRG00005014093)	DDX54 (ENSCDRG00005013723)	CFAP73 (ENSCDRG00005013686)	RASAL1 (ENSCDRG00005013489)	DTX1 (ENSCDRG00005013422)	C12orf76 (ENSCDRG00005013381)	ANKRD13A (ENSCDRG00005013238)	GIT2 (ENSCDRG00005012466)	ENSCDRG00005012231	GLTP (ENSCDRG00005012133)	TRPV4 (ENSCDRG00005011686)	FAM222A (ENSCDRG00005011610)	MVK (ENSCDRG00005011437)	MMAB (ENSCDRG00005011332)	UBE3B (ENSCDRG00005011184)	KCTD10 (ENSCDRG00005011080) #22	MYO1H (ENSCDRG00005010625)	FOXN4 (ENSCDRG00005010498)	UNG (ENSCDRG00005009548)	ALKBH2 (ENSCDRG00005009452)	USP30 (ENSCDRG00005009258)	SVOP (ENSCDRG00005009024)	ENSCDRG00005021180	DAO (ENSCDRG00005021174)	ENSCDRG00005021169	SSH1 (ENSCDRG00005021159)	CORO1C (ENSCDRG00005021139)	ENSCDRG00005021125	ENSCDRG00005021110	SART3 (ENSCDRG00005021096)	FICD (ENSCDRG00005021092)
Alpaca	MODERN SPECIES	3547																ENSVPAG00000007517 #22
Artiodactyla_b	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000158866	ENSGT00940000158101	ENSGT00940000153818.a.a	ENSGT00390000010771	ENSGT00510000046406.f.a.b	ENSGT00530000065303	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01090000260322	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873
Cetacea	DUPLICATION
Cetacea	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183143.c.a.o #22
Blue whale	MODERN SPECIES	7	WNT8B (ENSBMSG00010020238)	SEC31B (ENSBMSG00010020186)	ENSBMSG00010020139	HIF1AN (ENSBMSG00010020107)	PAX2 (ENSBMSG00010019829)	SLF2 (ENSBMSG00010019778)	SEMA4G (ENSBMSG00010019680)	MRPL43 (ENSBMSG00010019656)	TWNK (ENSBMSG00010019580)	LZTS2 (ENSBMSG00010019532)	PDZD7 (ENSBMSG00010019325)	SFXN3 (ENSBMSG00010019238)	KAZALD1 (ENSBMSG00010019182)	TLX1 (ENSBMSG00010019148)	LBX1 (ENSBMSG00010019122)	ENSBMSG00010019090 #22	BTRC (ENSBMSG00010018955)	POLL (ENSBMSG00010018641)	DPCD (ENSBMSG00010018596)	FBXW4 (ENSBMSG00010018485)	FGF8 (ENSBMSG00010018314)	NPM3 (ENSBMSG00010018271)	OGA (ENSBMSG00010018215)	KCNIP2 (ENSBMSG00010016543)	ARMH3 (ENSBMSG00010016376)	HPS6 (ENSBMSG00010016356)	LDB1 (ENSBMSG00010016310)	PPRC1 (ENSBMSG00010016252)	ENSBMSG00010016224	NOLC1 (ENSBMSG00010016181)	ELOVL3 (ENSBMSG00010016149)
Cetacea	DUPLICATION
Cetacea	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183143.c.a.p.a #22
Odontoceti	DUPLICATION
Odontoceti	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00390000003175.a.a	ENSGT00390000000628.m.a	ENSGT00940000157409	ENSGT00940000157412.b	ENSGT00530000064017.a	ENSGT00940000157186	ENSGT00390000015375	ENSGT00390000004495	ENSGT00940000154078.a.a	ENSGT00950000183002.C	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.a	ENSGT00530000063555.B	ENSGT00940000158698	ENSGT00940000161756	ENSGT00940000159672	ENSGT00950000183143.c.a.p.a.a #22	ENSGT00940000158515	ENSGT00390000014031	ENSGT00390000005029	ENSGT00940000159518	ENSGT00940000158796	ENSGT00390000007726.a.a	ENSGT00940000157798	ENSGT00390000002554	ENSGT00390000001546	ENSGT00390000005639.a.b	ENSGT00950000183137.a	ENSGT00730000111092	ENSGT00960000190004	ENSGT01050000244965.a	ENSGT00940000161801
Odontoceti_a	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00390000003175.a.a	ENSGT00390000000628.m.a	ENSGT00940000157409	ENSGT00940000157412.b	ENSGT00530000064017.a	ENSGT00940000157186	ENSGT00390000015375	ENSGT00390000004495	ENSGT00940000154078.a.a	ENSGT00950000183002.C	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.a	ENSGT00530000063555.B	ENSGT00940000158698	ENSGT00940000161756	ENSGT00940000159672	ENSGT00950000183143.c.a.p.a.a #22	ENSGT00940000158515	ENSGT00390000014031	ENSGT00390000005029	ENSGT00940000159518	ENSGT00940000158796	ENSGT00390000007726.a.a	ENSGT00940000157798	ENSGT00390000002554	ENSGT00390000001546	ENSGT00390000005639.a.b	ENSGT00950000183137.a	ENSGT00730000111092	ENSGT00960000190004	ENSGT01050000244965.a	ENSGT00940000161801
Odontoceti_b	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000160584	ENSGT00390000000628.m.a	ENSGT00940000157409	ENSGT00940000157412.b	ENSGT00530000064017.a	ENSGT00940000157186	ENSGT00390000015375	ENSGT00390000004495	ENSGT00940000154078.a.a	ENSGT00950000183002.C	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.a	ENSGT00530000063555.B	ENSGT00940000158698	ENSGT00940000161756	ENSGT00940000159672	ENSGT00950000183143.c.a.p.a.a #22	ENSGT00940000158515	ENSGT00390000014031	ENSGT00390000005029	ENSGT00940000159518	ENSGT00940000158796	ENSGT00390000007726.a.a	ENSGT00940000157798	ENSGT00390000002554	ENSGT00390000001546	ENSGT00390000005639.a.b	ENSGT00950000183137.a	ENSGT00730000111092	ENSGT00960000190004	ENSGT01050000244965.a	ENSGT00940000161801
Monodontidae	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000154908	ENSGT00940000160584	ENSGT00390000000628.m.a	ENSGT00940000157409	ENSGT00940000157412.b	ENSGT00530000064017.a	ENSGT00940000157186	ENSGT00390000015375	ENSGT00390000004495	ENSGT00940000154078.a.a	ENSGT00950000183002.C	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.a	ENSGT00530000063555.B	ENSGT00940000158698	ENSGT00940000161756	ENSGT00950000183143.c.a.p.a.a #22	ENSGT00940000159672	ENSGT00940000158515	ENSGT00390000014031	ENSGT00390000005029	ENSGT00940000159518	ENSGT00940000158796	ENSGT00390000007726.a.a	ENSGT00940000157798	ENSGT00390000002554	ENSGT00390000001546	ENSGT00390000005639.a.b	ENSGT00950000183137.a	ENSGT00730000111092	ENSGT00960000190004	ENSGT01050000244965.a
Narwhal	MODERN SPECIES	311	NDUFB8 (ENSMMNG00015021899)	HIF1AN (ENSMMNG00015021902)	ENSMMNG00015012209	SLF2 (ENSMMNG00015012230)	SEMA4G (ENSMMNG00015012260)	MRPL43 (ENSMMNG00015012273)	TWNK (ENSMMNG00015012283)	LZTS2 (ENSMMNG00015012307)	PDZD7 (ENSMMNG00015012332)	SFXN3 (ENSMMNG00015012374)	KAZALD1 (ENSMMNG00015012419)	TLX1 (ENSMMNG00015012435)	ENSMMNG00015012448	LBX1 (ENSMMNG00015012454)	BTRC (ENSMMNG00015012491)	ENSMMNG00015012545 #22	POLL (ENSMMNG00015012562)	DPCD (ENSMMNG00015012580)	FBXW4 (ENSMMNG00015012596)	FGF8 (ENSMMNG00015012625)	NPM3 (ENSMMNG00015012666)	OGA (ENSMMNG00015012693)	KCNIP2 (ENSMMNG00015012789)	ARMH3 (ENSMMNG00015012888)	HPS6 (ENSMMNG00015012924)	LDB1 (ENSMMNG00015012934)	PPRC1 (ENSMMNG00015012955)	NOLC1 (ENSMMNG00015012973)	ENSMMNG00015013002	ENSMMNG00015013008	ELOVL3 (ENSMMNG00015013018)
Beluga whale	MODERN SPECIES	65	NDUFB8 (ENSDLEG00000016630)	HIF1AN (ENSDLEG00000016615)	PAX2 (ENSDLEG00000016434)	SLF2 (ENSDLEG00000016409)	SEMA4G (ENSDLEG00000016385)	MRPL43 (ENSDLEG00000016373)	TWNK (ENSDLEG00000016357)	LZTS2 (ENSDLEG00000016343)	ENSDLEG00000016332	ENSDLEG00000016313	SFXN3 (ENSDLEG00000016287)	KAZALD1 (ENSDLEG00000016276)	TLX1 (ENSDLEG00000016266)	ENSDLEG00000016263	LBX1 (ENSDLEG00000016256)	ENSDLEG00000016243 #22	BTRC (ENSDLEG00000014853)	POLL (ENSDLEG00000014662)	DPCD (ENSDLEG00000014637)	FBXW4 (ENSDLEG00000014542)	FGF8 (ENSDLEG00000014445)	NPM3 (ENSDLEG00000014430)	MGEA5 (ENSDLEG00000012761)	KCNIP2 (ENSDLEG00000011996)	ARMH3 (ENSDLEG00000011308)	HPS6 (ENSDLEG00000011254)	LDB1 (ENSDLEG00000011231)	PPRC1 (ENSDLEG00000011163)	ENSDLEG00000011138	NOLC1 (ENSDLEG00000011092)	ENSDLEG00000011076
Vaquita	MODERN SPECIES	7	HIF1AN (ENSPSNG00000012648)	PAX2 (ENSPSNG00000012715)	SLF2 (ENSPSNG00000013212)	SEMA4G (ENSPSNG00000013294)	MRPL43 (ENSPSNG00000013369)	TWNK (ENSPSNG00000013395)	LZTS2 (ENSPSNG00000013492)	ENSPSNG00000013544	ENSPSNG00000013625	SFXN3 (ENSPSNG00000013687)	KAZALD1 (ENSPSNG00000013727)	TLX1 (ENSPSNG00000013783)	ENSPSNG00000013837	LBX1 (ENSPSNG00000013867)	BTRC (ENSPSNG00000013992)	ENSPSNG00000014239 #22	POLL (ENSPSNG00000014325)	DPCD (ENSPSNG00000014573)	FBXW4 (ENSPSNG00000014655)	FGF8 (ENSPSNG00000014763)	NPM3 (ENSPSNG00000015111)	OGA (ENSPSNG00000015199)	KCNIP2 (ENSPSNG00000015521)	ARMH3 (ENSPSNG00000016447)	HPS6 (ENSPSNG00000016490)	LDB1 (ENSPSNG00000016526)	PPRC1 (ENSPSNG00000016660)	NOLC1 (ENSPSNG00000016800)	ELOVL3 (ENSPSNG00000016876)	PITX3 (ENSPSNG00000016915)	GBF1 (ENSPSNG00000017028)
Sperm whale	MODERN SPECIES	12	ENSPCTG00005017035	ENSPCTG00005017133	ERLIN1 (ENSPCTG00005017152)	CHUK (ENSPCTG00005017211)	CWF19L1 (ENSPCTG00005017347)	BLOC1S2 (ENSPCTG00005017426)	SCD (ENSPCTG00005017655)	WNT8B (ENSPCTG00005017722)	SEC31B (ENSPCTG00005017805)	NDUFB8 (ENSPCTG00005017856)	HIF1AN (ENSPCTG00005017931)	PAX2 (ENSPCTG00005017976)	SLF2 (ENSPCTG00005018174)	KAZALD1 (ENSPCTG00005018258)	BTRC (ENSPCTG00005018325)	ENSPCTG00005018571 #22	POLL (ENSPCTG00005018631)	DPCD (ENSPCTG00005018790)	FBXW4 (ENSPCTG00005018820)	ARMH3 (ENSPCTG00005018935)	HPS6 (ENSPCTG00005019039)	LDB1 (ENSPCTG00005019052)	OGA (ENSPCTG00005019093)	NOLC1 (ENSPCTG00005019168)	ENSPCTG00005019221	ACTR1A (ENSPCTG00005019239)	MFSD13A (ENSPCTG00005019320)	CUEDC2 (ENSPCTG00005019392)	FBXL15 (ENSPCTG00005019435)	PSD (ENSPCTG00005019477)	NFKB2 (ENSPCTG00005019685)
Odontoceti	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183143.c.a.p.a.b #22
Odontoceti_a	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183143.c.a.p.a.b #22
Odontoceti_b	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183143.c.a.p.a.b #22
Vaquita	MODERN SPECIES	5	ACADS (ENSPSNG00000006130)	SPPL3 (ENSPSNG00000006088)	HNF1A (ENSPSNG00000006004)	C12orf43 (ENSPSNG00000005939)	OASL (ENSPSNG00000005855)	ENSPSNG00000005814	ANKRD13A (ENSPSNG00000005777)	GIT2 (ENSPSNG00000005636)	ENSPSNG00000005516	GLTP (ENSPSNG00000005473)	TRPV4 (ENSPSNG00000005016)	FAM222A (ENSPSNG00000004838)	MVK (ENSPSNG00000004772)	MMAB (ENSPSNG00000018425)	UBE3B (ENSPSNG00000018353)	ENSPSNG00000018266 #22	MYO1H (ENSPSNG00000017737)	FOXN4 (ENSPSNG00000017645)	ACACB (ENSPSNG00000017568)	UNG (ENSPSNG00000017451)	ALKBH2 (ENSPSNG00000017387)	USP30 (ENSPSNG00000017314)	SVOP (ENSPSNG00000017254)	DAO (ENSPSNG00000017050)	SSH1 (ENSPSNG00000016434)	CORO1C (ENSPSNG00000015996)	ENSPSNG00000015885	TMEM119 (ENSPSNG00000015852)	ENSPSNG00000015689	SART3 (ENSPSNG00000015593)	FICD (ENSPSNG00000015530)
Cetacea	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000158866	ENSGT00940000158101	ENSGT00940000153818.a.a	ENSGT00390000010771	ENSGT00510000046406.f.a.b	ENSGT00530000065303.i	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01090000260322	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a.p.b #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873
Odontoceti	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000158866	ENSGT00940000158101	ENSGT00940000153818.a.a	ENSGT00390000010771	ENSGT00510000046406.f.a.b	ENSGT00530000065303.i	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01090000260322	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a.p.b #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873
Odontoceti_a	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000158866	ENSGT00940000158101	ENSGT00940000153818.a.a	ENSGT00390000010771	ENSGT00510000046406.f.a.b	ENSGT00530000065303.i	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01090000260322	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a.p.b #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873
Odontoceti_b	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000158866	ENSGT00940000158101	ENSGT00940000153818.a.a	ENSGT00390000010771	ENSGT00510000046406.f.a.b	ENSGT00530000065303.i	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01090000260322	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a.p.b #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873
Monodontidae	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000158866	ENSGT00940000158101	ENSGT00940000153818.a.a	ENSGT00390000010771	ENSGT00510000046406.f.a.b	ENSGT00530000065303.i	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01090000260322	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a.p.b #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873
Narwhal	MODERN SPECIES	295	ACADS (ENSMMNG00015010955)	SPPL3 (ENSMMNG00015010916)	HNF1A (ENSMMNG00015010876)	C12orf43 (ENSMMNG00015010845)	OASL (ENSMMNG00015010805)	ENSMMNG00015010767	ANKRD13A (ENSMMNG00015010737)	GIT2 (ENSMMNG00015010560)	ENSMMNG00015010416	GLTP (ENSMMNG00015010388)	TRPV4 (ENSMMNG00015010289)	FAM222A (ENSMMNG00015010257)	MVK (ENSMMNG00015010223)	MMAB (ENSMMNG00015010183)	UBE3B (ENSMMNG00015010156)	ENSMMNG00015010129 #22	MYO1H (ENSMMNG00015010066)	FOXN4 (ENSMMNG00015010046)	ACACB (ENSMMNG00015009996)	UNG (ENSMMNG00015009958)	ALKBH2 (ENSMMNG00015009947)	USP30 (ENSMMNG00015009930)	SVOP (ENSMMNG00015009908)	DAO (ENSMMNG00015009894)	SSH1 (ENSMMNG00015009870)	CORO1C (ENSMMNG00015009843)	ENSMMNG00015009835	TMEM119 (ENSMMNG00015009771)	ISCU (ENSMMNG00015009743)	SART3 (ENSMMNG00015009722)	FICD (ENSMMNG00015009705)
Beluga whale	MODERN SPECIES	60	ENSDLEG00000017389	SPPL3 (ENSDLEG00000017362)	HNF1A (ENSDLEG00000017315)	CUNH12orf43 (ENSDLEG00000017295)	OASL (ENSDLEG00000017275)	ENSDLEG00000017263	ANKRD13A (ENSDLEG00000017213)	GIT2 (ENSDLEG00000017179)	TCHP (ENSDLEG00000017100)	GLTP (ENSDLEG00000017080)	TRPV4 (ENSDLEG00000017046)	FAM222A (ENSDLEG00000017032)	MVK (ENSDLEG00000016965)	MMAB (ENSDLEG00000016955)	UBE3B (ENSDLEG00000016221)	ENSDLEG00000016131 #22	MYO1H (ENSDLEG00000013300)	FOXN4 (ENSDLEG00000021839)	ACACB (ENSDLEG00000020548)	UNG (ENSDLEG00000020278)	ALKBH2 (ENSDLEG00000020269)	USP30 (ENSDLEG00000020224)	ENSDLEG00000020211	DAO (ENSDLEG00000020190)	SSH1 (ENSDLEG00000020185)	CORO1C (ENSDLEG00000020179)	SELPLG (ENSDLEG00000020178)	TMEM119 (ENSDLEG00000020175)	ISCU (ENSDLEG00000020171)	SART3 (ENSDLEG00000020164)	FICD (ENSDLEG00000020163)
Dolphin	MODERN SPECIES	2123																KCTD10 (ENSTTRG00000006406) #22	MYO1H (ENSTTRG00000006401)	FOXN4 (ENSTTRG00000006397)	ACACB (ENSTTRG00000006365)
Sperm whale	MODERN SPECIES	10	TFIP11 (ENSPCTG00005007526)	SRRD (ENSPCTG00005007604)	ENSPCTG00005007640	SEZ6L (ENSPCTG00005007771)	MYO18B (ENSPCTG00005009794)	ENSPCTG00005010111	CRYBB2 (ENSPCTG00005010168)	ENSPCTG00005010236	LHFPL7 (ENSPCTG00005010284)	ENSPCTG00005010391	ANKRD13A (ENSPCTG00005010854)	GIT2 (ENSPCTG00005011018)	TRPV4 (ENSPCTG00005011677)	FAM222A (ENSPCTG00005012639)	UBE3B (ENSPCTG00005012693)	KCTD10 (ENSPCTG00005012804) #22	MYO1H (ENSPCTG00005012919)	FOXN4 (ENSPCTG00005013739)	ACACB (ENSPCTG00005014106)	SVOP (ENSPCTG00005017601)	ENSPCTG00005017637	DAO (ENSPCTG00005017678)	USP30 (ENSPCTG00005017874)	ALKBH2 (ENSPCTG00005017999)	UNG (ENSPCTG00005018028)	SSH1 (ENSPCTG00005018109)	CORO1C (ENSPCTG00005018399)	ENSPCTG00005018621	TMEM119 (ENSPCTG00005018645)	ISCU (ENSPCTG00005018674)	SART3 (ENSPCTG00005018791)
Blue whale	MODERN SPECIES	5	ENSBMSG00010009653	LHFPL7 (ENSBMSG00010009677)	SGSM1 (ENSBMSG00010009748)	ENSBMSG00010009922	ENSBMSG00010009963	ANKRD13A (ENSBMSG00010009986)	ENSBMSG00010010007	GIT2 (ENSBMSG00010010089)	ENSBMSG00010010165	GLTP (ENSBMSG00010010188)	TRPV4 (ENSBMSG00010010296)	FAM222A (ENSBMSG00010010735)	MVK (ENSBMSG00010010772)	MMAB (ENSBMSG00010010819)	UBE3B (ENSBMSG00010010844)	KCTD10 (ENSBMSG00010010873) #22	MYO1H (ENSBMSG00010010921)	FOXN4 (ENSBMSG00010011001)	ACACB (ENSBMSG00010011038)	UNG (ENSBMSG00010011124)	ALKBH2 (ENSBMSG00010011204)	USP30 (ENSBMSG00010011238)	SVOP (ENSBMSG00010011282)	ENSBMSG00010011303	DAO (ENSBMSG00010011330)	SSH1 (ENSBMSG00010011367)	CORO1C (ENSBMSG00010011393)	TMEM119 (ENSBMSG00010011417)	ENSBMSG00010011440	SART3 (ENSBMSG00010011480)	FICD (ENSBMSG00010011504)
Pecora	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000158101	ENSGT00940000153818.a.a	ENSGT00390000010771	ENSGT00510000046406.f.a.b	ENSGT00940000163029	ENSGT00530000065303	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01090000260322	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813.g	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873
Yarkand deer	MODERN SPECIES	28	ACADS (ENSCHYG00000002549)	SPPL3 (ENSCHYG00000002518)	HNF1A (ENSCHYG00000002459)	C12orf43 (ENSCHYG00000002408)	OASL (ENSCHYG00000002386)	ENSCHYG00000002369	C12orf76 (ENSCHYG00000002355)	ENSCHYG00000002340	GIT2 (ENSCHYG00000002140)	ENSCHYG00000002040	GLTP (ENSCHYG00000002008)	TRPV4 (ENSCHYG00000001931)	MVK (ENSCHYG00000001851)	MMAB (ENSCHYG00000001805)	UBE3B (ENSCHYG00000001702)	KCTD10 (ENSCHYG00000001641) #22	MYO1H (ENSCHYG00000001510)	FOXN4 (ENSCHYG00000001471)	ACACB (ENSCHYG00000001428)	ENSCHYG00000001395	UNG (ENSCHYG00000001371)	ALKBH2 (ENSCHYG00000001355)	USP30 (ENSCHYG00000001309)	SVOP (ENSCHYG00000001282)	DAO (ENSCHYG00000001250)	SSH1 (ENSCHYG00000001221)	CORO1C (ENSCHYG00000001168)	ENSCHYG00000001121	ENSCHYG00000001101	SART3 (ENSCHYG00000000951)	FICD (ENSCHYG00000000923)
Percora_a	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000158101	ENSGT00940000153818.a.a	ENSGT00390000010771	ENSGT00510000046406.f.a.b	ENSGT00940000163029	ENSGT00530000065303	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01090000260322	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813.g	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873
Siberian musk deer	MODERN SPECIES	1175	ENSMMSG00000013561	SPPL3 (ENSMMSG00000013539)	HNF1A (ENSMMSG00000013459)	C12orf43 (ENSMMSG00000013415)	C12orf76 (ENSMMSG00000013399)	ENSMMSG00000013391	ANKRD13A (ENSMMSG00000013361)	GIT2 (ENSMMSG00000013172)	ENSMMSG00000013080	GLTP (ENSMMSG00000013040)	TRPV4 (ENSMMSG00000012850)	FAM222A (ENSMMSG00000012822)	MVK (ENSMMSG00000012760)	MMAB (ENSMMSG00000012694)	UBE3B (ENSMMSG00000012639)	KCTD10 (ENSMMSG00000012596) #22	MYO1H (ENSMMSG00000012420)	FOXN4 (ENSMMSG00000012356)	ACACB (ENSMMSG00000011975)	UNG (ENSMMSG00000011876)	ALKBH2 (ENSMMSG00000011853)	USP30 (ENSMMSG00000011821)	SVOP (ENSMMSG00000011752)	DAO (ENSMMSG00000011659)	SSH1 (ENSMMSG00000011622)	CORO1C (ENSMMSG00000011556)	ENSMMSG00000011547	TMEM119 (ENSMMSG00000011536)	ENSMMSG00000011477	SART3 (ENSMMSG00000011380)	FICD (ENSMMSG00000011357)
Bovidae	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000158866	ENSGT00940000158101	ENSGT00940000153818.a.a	ENSGT00390000010771	ENSGT00510000046406.f.a.b	ENSGT00530000065303	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01090000260322	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432.k	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813.g	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873
Bovinae	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000158866	ENSGT00940000158101	ENSGT00940000153818.a.a	ENSGT00390000010771	ENSGT00510000046406.f.a.b	ENSGT00530000065303	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01090000260322	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432.k	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813.g.c	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873
Bos	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000158866	ENSGT00940000158101	ENSGT00940000153818.a.a	ENSGT00390000010771	ENSGT00510000046406.f.a.b	ENSGT00530000065303	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01090000260322	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432.k	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00390000006051.a.b.a.a	ENSGT00940000156488	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813.g.c	ENSGT00900000141107
Bos_a	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000158866	ENSGT00940000158101	ENSGT00940000153818.a.a	ENSGT00390000010771	ENSGT00510000046406.f.a.b	ENSGT00530000065303	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01090000260322	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432.k	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00390000006051.a.b.a.a	ENSGT00940000156488	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000017134	ENSGT00940000166181	ENSGT00390000015813.g.c
Domestic yak	MODERN SPECIES	7	SPPL3 (ENSBGRG00000026421)	HNF1A (ENSBGRG00000026430)	C12orf43 (ENSBGRG00000026435)	ENSBGRG00000026442	C12orf76 (ENSBGRG00000026445)	ANKRD13A (ENSBGRG00000026448)	ENSBGRG00000026453	GIT2 (ENSBGRG00000026463)	ENSBGRG00000026499	GLTP (ENSBGRG00000026519)	TRPV4 (ENSBGRG00000026530)	FAM222A (ENSBGRG00000026553)	MVK (ENSBGRG00000026564)	MMAB (ENSBGRG00000026572)	UBE3B (ENSBGRG00000026580)	KCTD10 (ENSBGRG00000026589) #22	MYO1H (ENSBGRG00000026594)	FOXN4 (ENSBGRG00000026598)	ACACB (ENSBGRG00000026733)	UNG (ENSBGRG00000026811)	ENSBGRG00000026812	ALKBH2 (ENSBGRG00000026813)	USP30 (ENSBGRG00000026814)	ENSBGRG00000026816	SVOP (ENSBGRG00000008549)	DAO (ENSBGRG00000008709)	SSH1 (ENSBGRG00000008960)	ENSBGRG00000009875	CORO1C (ENSBGRG00000009932)	ENSBGRG00000010188	TMEM119 (ENSBGRG00000010204)
Wild yak	MODERN SPECIES	410	ACADS (ENSBMUG00000021446)	SPPL3 (ENSBMUG00000021456)	HNF1A (ENSBMUG00000021502)	C12orf43 (ENSBMUG00000021527)	ENSBMUG00000021534	C12orf76 (ENSBMUG00000021546)	ANKRD13A (ENSBMUG00000021557)	ENSBMUG00000021577	GIT2 (ENSBMUG00000021711)	ENSBMUG00000021734	GLTP (ENSBMUG00000021754)	TRPV4 (ENSBMUG00000021901)	MVK (ENSBMUG00000022031)	MMAB (ENSBMUG00000022072)	UBE3B (ENSBMUG00000022090)	KCTD10 (ENSBMUG00000022109) #22	MYO1H (ENSBMUG00000022149)	FOXN4 (ENSBMUG00000022168)	ACACB (ENSBMUG00000022222)
Bos_b	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000158866	ENSGT00940000158101	ENSGT00940000153818.a.a	ENSGT00390000010771	ENSGT00510000046406.f.a.b	ENSGT00530000065303	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01090000260322	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432.k	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00390000006051.a.b.a.a	ENSGT00940000156488	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813.g.c	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873
Hybrid Bos Indicus	MODERN SPECIES	8	HNF1A (ENSBIXG00005006549)	C12orf43 (ENSBIXG00005028906)	ENSBIXG00005028920	ENSBIXG00005005073	C12orf76 (ENSBIXG00005002181)	ENSBIXG00005028945	ANKRD13A (ENSBIXG00005002115)	GIT2 (ENSBIXG00005029102)	ENSBIXG00005029126	GLTP (ENSBIXG00005007610)	TRPV4 (ENSBIXG00005005220)	FAM222A (ENSBIXG00005001698)	MVK (ENSBIXG00005005272)	ENSBIXG00005030844	UBE3B (ENSBIXG00005030833)	KCTD10 (ENSBIXG00005030825) #22	MYO1H (ENSBIXG00005030807)	FOXN4 (ENSBIXG00005030787)	ENSBIXG00005030776	ACACB (ENSBIXG00005030750)	UNG (ENSBIXG00005030729)	ALKBH2 (ENSBIXG00005030723)	USP30 (ENSBIXG00005030700)	SVOP (ENSBIXG00005030662)	DAO (ENSBIXG00005030642)	SSH1 (ENSBIXG00005030627)	ENSBIXG00005030614	CORO1C (ENSBIXG00005030577)	TMEM119 (ENSBIXG00005030566)	ENSBIXG00005030553	SART3 (ENSBIXG00005030538)
Cow	MODERN SPECIES	8	C17H12orf43 (ENSBTAG00000021796)	OASL (ENSBTAG00000003297)	ENSBTAG00000046887	ENSBTAG00000051177	C12orf76 (ENSBTAG00000032047)	ANKRD13A (ENSBTAG00000014376)	ENSBTAG00000050202	GIT2 (ENSBTAG00000006506)	TCHP (ENSBTAG00000006504)	GLTP (ENSBTAG00000002591)	TRPV4 (ENSBTAG00000000031)	FAM222A (ENSBTAG00000050459)	MVK (ENSBTAG00000005183)	MMAB (ENSBTAG00000005178)	UBE3B (ENSBTAG00000002698)	KCTD10 (ENSBTAG00000002697) #22	MYO1H (ENSBTAG00000002695)	FOXN4 (ENSBTAG00000010847)	ACACB (ENSBTAG00000022058)	ALKBH2 (ENSBTAG00000019846)	USP30 (ENSBTAG00000019845)	SVOP (ENSBTAG00000018833)	DAO (ENSBTAG00000018831)	SSH1 (ENSBTAG00000018825)	CORO1C (ENSBTAG00000007993)	ENSBTAG00000023431	SELPLG (ENSBTAG00000031851)	TMEM119 (ENSBTAG00000031849)	ISCU (ENSBTAG00000011787)	SART3 (ENSBTAG00000031846)	FICD (ENSBTAG00000011771)
American bison	MODERN SPECIES	3351	SPPL3 (ENSBBBG00000012533)	HNF1A (ENSBBBG00000008105)	C12orf43 (ENSBBBG00000012482)	ENSBBBG00000012465	ENSBBBG00000012456	ANKRD13A (ENSBBBG00000012454)	ENSBBBG00000012445	GIT2 (ENSBBBG00000012400)	TCHP (ENSBBBG00000012119)	GLTP (ENSBBBG00000012084)	TRPV4 (ENSBBBG00000007353)	FAM222A (ENSBBBG00000011962)	MVK (ENSBBBG00000011952)	MMAB (ENSBBBG00000011902)	UBE3B (ENSBBBG00000011878)	KCTD10 (ENSBBBG00000011843) #22	MYO1H (ENSBBBG00000011828)	FOXN4 (ENSBBBG00000011774)	ACACB (ENSBBBG00000011758)	UNG (ENSBBBG00000011697)	ALKBH2 (ENSBBBG00000002149)	USP30 (ENSBBBG00000002147)	SVOP (ENSBBBG00000011638)	DAO (ENSBBBG00000011622)	SSH1 (ENSBBBG00000011593)	ENSBBBG00000007543	CORO1C (ENSBBBG00000002117)	TMEM119 (ENSBBBG00000008319)	ENSBBBG00000011481	SART3 (ENSBBBG00000011450)	FICD (ENSBBBG00000011407)
Caprinae	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000153818.a.a	ENSGT00390000010771	ENSGT00510000046406.f.a.b	ENSGT00530000065303	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00950000183087.A.a.a.a.b.b.b.b.a	ENSGT00900000140979.a.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01090000260322	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432.k	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405.wb	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813.g	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873
Rambouillet Sheep	MODERN SPECIES	8	HNF1A (ENSOARG00020022728)	C12orf43 (ENSOARG00020022838)	ENSOARG00020022859	ENSOARG00020022895	C12orf76 (ENSOARG00020022908)	ANKRD13A (ENSOARG00020022934)	ENSOARG00020023006	GIT2 (ENSOARG00020023057)	ENSOARG00020023352	GLTP (ENSOARG00020023410)	TRPV4 (ENSOARG00020023463)	FAM222A (ENSOARG00020023704)	MVK (ENSOARG00020023723)	MMAB (ENSOARG00020003336)	UBE3B (ENSOARG00020003419)	KCTD10 (ENSOARG00020003513) #22	MYO1H (ENSOARG00020003551)	FOXN4 (ENSOARG00020003834)	ACACB (ENSOARG00020003924)	ENSOARG00020004261	ALKBH2 (ENSOARG00020004431)	USP30 (ENSOARG00020004449)	SVOP (ENSOARG00020004494)	DAO (ENSOARG00020004528)	SSH1 (ENSOARG00020004645)	CORO1C (ENSOARG00020004720)	ENSOARG00020004838	TMEM119 (ENSOARG00020004848)	ISCU (ENSOARG00020004864)	SART3 (ENSOARG00020004942)	FICD (ENSOARG00020005278)
Goat	MODERN SPECIES	8	SPPL3 (ENSCHIG00000024733)	HNF1A (ENSCHIG00000018046)	C12orf43 (ENSCHIG00000023049)	ENSCHIG00000017422	C12orf76 (ENSCHIG00000025509)	ENSCHIG00000011449	ANKRD13A (ENSCHIG00000021906)	GIT2 (ENSCHIG00000024454)	ENSCHIG00000018345	GLTP (ENSCHIG00000019730)	TRPV4 (ENSCHIG00000013785)	FAM222A (ENSCHIG00000011144)	MVK (ENSCHIG00000023958)	MMAB (ENSCHIG00000000534)	UBE3B (ENSCHIG00000011616)	KCTD10 (ENSCHIG00000015979) #22	MYO1H (ENSCHIG00000022518)	FOXN4 (ENSCHIG00000024229)	ACACB (ENSCHIG00000020615)	UNG (ENSCHIG00000008245)	ALKBH2 (ENSCHIG00000012352)	USP30 (ENSCHIG00000017429)	SVOP (ENSCHIG00000023191)	DAO (ENSCHIG00000012760)	SSH1 (ENSCHIG00000011891)	CORO1C (ENSCHIG00000022389)	ENSCHIG00000009552	TMEM119 (ENSCHIG00000012744)	ISCU (ENSCHIG00000019834)	SART3 (ENSCHIG00000021385)	FICD (ENSCHIG00000015887)
Euarchontoglires	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000158101	ENSGT00940000153818.a.a	ENSGT00390000010771	ENSGT00510000046406.f.a.b	ENSGT00510000046406.f.a.a	ENSGT00530000065303	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01100000263656	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873
Euarchontoglires_A	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000158101	ENSGT00940000153818.a.a	ENSGT00390000010771	ENSGT00510000046406.f.a.b	ENSGT00510000046406.f.a.a	ENSGT00530000065303	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01100000263656	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873
Glires	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000158101	ENSGT00940000153818.a.a	ENSGT00390000010771	ENSGT00510000046406.f.a.b	ENSGT00510000046406.f.a.a	ENSGT00530000065303	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01100000263656	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873
Lagomorpha	ANCESTRAL SPECIES	35	ENSGT00940000158425	ENSGT00940000154184.A	ENSGT00990000203589.a.a	ENSGT00940000156871	ENSGT00950000183200.A.a.b.b.d	ENSGT00530000065303	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01100000266761	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075
Rabbit	MODERN SPECIES	625													MVK (ENSOCUG00000013967)	MMAB (ENSOCUG00000013958)	UBE3B (ENSOCUG00000013932)	KCTD10 (ENSOCUG00000000475) #22	MYO1H (ENSOCUG00000002125)	FOXN4 (ENSOCUG00000005185)	ACACB (ENSOCUG00000007432)	UNG (ENSOCUG00000003145)	ALKBH2 (ENSOCUG00000021524)	USP30 (ENSOCUG00000004402)
Pika	MODERN SPECIES	3551							ANKRD13A (ENSOPRG00000002589)	GIT2 (ENSOPRG00000002548)	ENSOPRG00000002516	GLTP (ENSOPRG00000002501)	TRPV4 (ENSOPRG00000002461)	FAM222A (ENSOPRG00000002456)	MVK (ENSOPRG00000002433)	MMAB (ENSOPRG00000002401)	UBE3B (ENSOPRG00000002356)	KCTD10 (ENSOPRG00000002337) #22	ENSOPRG00000002330
Rodentia	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000158101	ENSGT00940000153818.a.a	ENSGT00390000010771	ENSGT00510000046406.f.a.b	ENSGT00510000046406.f.a.a	ENSGT00530000065303	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01100000263656	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873
Rodentia_B	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000158101	ENSGT00940000153818.a.a	ENSGT00390000010771	ENSGT00510000046406.f.a.b	ENSGT00510000046406.f.a.a	ENSGT00530000065303	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01100000263651	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873
Myomorpha	ANCESTRAL SPECIES	30	ENSGT00940000158101	ENSGT00940000153818.a.a	ENSGT00390000010771	ENSGT00510000046406.f.a.b	ENSGT00510000046406.f.a.a	ENSGT00530000065303	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01100000264378	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873
Muroidea	ANCESTRAL SPECIES	28	ENSGT00940000158101	ENSGT00940000153818.a.a	ENSGT00390000010771	ENSGT00510000046406.f.a.b	ENSGT00510000046406.f.a.a	ENSGT00530000065303	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01100000264378	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873
Muroidea_A	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000153818.a.a	ENSGT00390000010771	ENSGT00510000046406.f.a.b	ENSGT00510000046406.f.a.a	ENSGT00520000060299	ENSGT00530000065303	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01100000264378	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873
Murinae	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000153818.a.a	ENSGT00390000010771	ENSGT00510000046406.f.a.b	ENSGT00510000046406.f.a.a	ENSGT00520000060299	ENSGT00530000065303	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01100000264378	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873
Mus	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000153818.a.a	ENSGT00390000010771	ENSGT00510000046406.f.a.b	ENSGT00510000046406.f.a.a	ENSGT00520000060299	ENSGT00530000065303	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01100000264306	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873
Mus_A	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00390000010771	ENSGT00510000046406.f.a.b	ENSGT00510000046406.f.a.a	ENSGT00520000060299	ENSGT00860000135768	ENSGT00530000065303	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01100000264306	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873
Mus_B	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000010771	ENSGT00510000046406.f.a.b	ENSGT00510000046406.f.a.a	ENSGT00520000060299	ENSGT00860000135768	ENSGT00530000065303	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01100000264306	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000017134	ENSGT00940000166181	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873
Mus_C	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000010771	ENSGT00510000046406.f.a.b	ENSGT00510000046406.f.a.a	ENSGT00520000060299	ENSGT00860000135768	ENSGT00530000065303	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01100000264306	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000017134	ENSGT00940000166181	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873
Steppe mouse	MODERN SPECIES	3377	Hnf1a (ENSMSIG00000010380)	ENSMSIG00000010364	Oasl1 (ENSMSIG00000010339)	Oasl2 (ENSMSIG00000010319)	ENSMSIG00000010255	ENSMSIG00000010248	ENSMSIG00000010234	Git2 (ENSMSIG00000009586)	ENSMSIG00000009540	Gltp (ENSMSIG00000009509)	Trpv4 (ENSMSIG00000009247)	ENSMSIG00000009226	Mvk (ENSMSIG00000009220)	ENSMSIG00000009181	Ube3b (ENSMSIG00000009095)	Kctd10 (ENSMSIG00000009043) #22	Myo1h (ENSMSIG00000008861)	Foxn4 (ENSMSIG00000008824)	Acacb (ENSMSIG00000008521)	Ung (ENSMSIG00000008468)	Alkbh2 (ENSMSIG00000008408)	Usp30 (ENSMSIG00000008367)	Svop (ENSMSIG00000008307)	Dao (ENSMSIG00000008244)	Ssh1 (ENSMSIG00000008148)	Coro1c (ENSMSIG00000008112)	ENSMSIG00000008097	Tmem119 (ENSMSIG00000008093)	Iscu (ENSMSIG00000008031)	Sart3 (ENSMSIG00000007948)	Ficd (ENSMSIG00000007936)
spretus	MODERN SPECIES	14	Oasl1 (MGP_SPRETEiJ_G0028607)	Oasl2 (MGP_SPRETEiJ_G0028606)	MGP_SPRETEiJ_G0028605	4930519G04Rik (MGP_SPRETEiJ_G0028604)	MGP_SPRETEiJ_G0028603	MGP_SPRETEiJ_G0028602	Ankrd13a (MGP_SPRETEiJ_G0028601)	Git2 (MGP_SPRETEiJ_G0028600)	Tchp (MGP_SPRETEiJ_G0028599)	Gltp (MGP_SPRETEiJ_G0028598)	Trpv4 (MGP_SPRETEiJ_G0028597)	Fam222a (MGP_SPRETEiJ_G0028596)	Mvk (MGP_SPRETEiJ_G0028595)	Mmab (MGP_SPRETEiJ_G0028594)	Ube3b (MGP_SPRETEiJ_G0028593)	Kctd10 (MGP_SPRETEiJ_G0028592) #22	Myo1h (MGP_SPRETEiJ_G0028591)	Foxn4 (MGP_SPRETEiJ_G0028590)	Acacb (MGP_SPRETEiJ_G0028589)	Ung (MGP_SPRETEiJ_G0028588)	Alkbh2 (MGP_SPRETEiJ_G0028587)	Usp30 (MGP_SPRETEiJ_G0028586)	Svop (MGP_SPRETEiJ_G0028585)	Dao (MGP_SPRETEiJ_G0028584)	Ssh1 (MGP_SPRETEiJ_G0028583)	Coro1c (MGP_SPRETEiJ_G0028582)	Selplg (MGP_SPRETEiJ_G0028581)	Tmem119 (MGP_SPRETEiJ_G0028580)	Iscu (MGP_SPRETEiJ_G0028579)	Sart3 (MGP_SPRETEiJ_G0028578)	Ficd (MGP_SPRETEiJ_G0028577)
Mouse	MODERN SPECIES	14	Hnf1a (ENSMUSG00000029556)	2210016L21Rik (ENSMUSG00000029559)	Oasl1 (ENSMUSG00000041827)	Oasl2 (ENSMUSG00000029561)	4930519G04Rik (ENSMUSG00000029564)	1500011B03Rik (ENSMUSG00000072694)	Ankrd13a (ENSMUSG00000041870)	Git2 (ENSMUSG00000041890)	Tchp (ENSMUSG00000002486)	Gltp (ENSMUSG00000011884)	Trpv4 (ENSMUSG00000014158)	Fam222a (ENSMUSG00000041930)	Mvk (ENSMUSG00000041939)	Mmab (ENSMUSG00000029575)	Ube3b (ENSMUSG00000029577)	Kctd10 (ENSMUSG00000001098) #22	Myo1h (ENSMUSG00000066952)	Foxn4 (ENSMUSG00000042002)	Acacb (ENSMUSG00000042010)	Ung (ENSMUSG00000029591)	Alkbh2 (ENSMUSG00000044339)	Usp30 (ENSMUSG00000029592)	Svop (ENSMUSG00000042078)	Dao (ENSMUSG00000042096)	Ssh1 (ENSMUSG00000042121)	Coro1c (ENSMUSG00000004530)	Selplg (ENSMUSG00000048163)	Tmem119 (ENSMUSG00000054675)	Iscu (ENSMUSG00000025825)	Sart3 (ENSMUSG00000018974)	Ficd (ENSMUSG00000053334)
Ryukyu mouse	MODERN SPECIES	14	Oasl1 (MGP_CAROLIEiJ_G0027609)	Oasl2 (MGP_CAROLIEiJ_G0027608)	MGP_CAROLIEiJ_G0027607	4930519G04Rik (MGP_CAROLIEiJ_G0027606)	MGP_CAROLIEiJ_G0027605	MGP_CAROLIEiJ_G0027604	Ankrd13a (MGP_CAROLIEiJ_G0027603)	Git2 (MGP_CAROLIEiJ_G0027602)	Tchp (MGP_CAROLIEiJ_G0027601)	Gltp (MGP_CAROLIEiJ_G0027600)	Trpv4 (MGP_CAROLIEiJ_G0027599)	Fam222a (MGP_CAROLIEiJ_G0027598)	Mvk (MGP_CAROLIEiJ_G0027597)	Mmab (MGP_CAROLIEiJ_G0027596)	MGP_CAROLIEiJ_G0027595	Kctd10 (MGP_CAROLIEiJ_G0027594) #22	Myo1h (MGP_CAROLIEiJ_G0027593)	Foxn4 (MGP_CAROLIEiJ_G0027592)	Acacb (MGP_CAROLIEiJ_G0027591)	Ung (MGP_CAROLIEiJ_G0027590)	Alkbh2 (MGP_CAROLIEiJ_G0027589)	Usp30 (MGP_CAROLIEiJ_G0027588)	Svop (MGP_CAROLIEiJ_G0027587)	Dao (MGP_CAROLIEiJ_G0027586)	Ssh1 (MGP_CAROLIEiJ_G0027585)	Coro1c (MGP_CAROLIEiJ_G0027584)	Selplg (MGP_CAROLIEiJ_G0027583)	Tmem119 (MGP_CAROLIEiJ_G0027582)	MGP_CAROLIEiJ_G0027581	Sart3 (MGP_CAROLIEiJ_G0027580)	Ficd (MGP_CAROLIEiJ_G0027579)
Shrew mouse	MODERN SPECIES	15	Hnf1a (MGP_PahariEiJ_G0024191)	MGP_PahariEiJ_G0024190	Oasl1 (MGP_PahariEiJ_G0024189)	MGP_PahariEiJ_G0024188	MGP_PahariEiJ_G0024187	MGP_PahariEiJ_G0024186	Ankrd13a (MGP_PahariEiJ_G0024185)	Git2 (MGP_PahariEiJ_G0024184)	Tchp (MGP_PahariEiJ_G0024183)	Gltp (MGP_PahariEiJ_G0024182)	Trpv4 (MGP_PahariEiJ_G0024181)	Fam222a (MGP_PahariEiJ_G0024180)	Mvk (MGP_PahariEiJ_G0024179)	MGP_PahariEiJ_G0024178	Ube3b (MGP_PahariEiJ_G0024177)	Kctd10 (MGP_PahariEiJ_G0024176) #22	Myo1h (MGP_PahariEiJ_G0024175)	Foxn4 (MGP_PahariEiJ_G0024174)	Acacb (MGP_PahariEiJ_G0024173)	Ung (MGP_PahariEiJ_G0024172)	Alkbh2 (MGP_PahariEiJ_G0024171)	Usp30 (MGP_PahariEiJ_G0024170)	Svop (MGP_PahariEiJ_G0024169)	MGP_PahariEiJ_G0024168	Ssh1 (MGP_PahariEiJ_G0024167)	Coro1c (MGP_PahariEiJ_G0024166)	MGP_PahariEiJ_G0024165	Tmem119 (MGP_PahariEiJ_G0024164)	MGP_PahariEiJ_G0024163	Sart3 (MGP_PahariEiJ_G0024162)	Ficd (MGP_PahariEiJ_G0024161)
Rat	MODERN SPECIES	3	C12h12orf43 (ENSRNOG00000001185)	Oasl (ENSRNOG00000001187)	Oasl2 (ENSRNOG00000028814)	LOC691311 (ENSRNOG00000021364)	ENSRNOG00000066080	RGD1560398 (ENSRNOG00000069648)	Ankrd13a (ENSRNOG00000001204)	Git2 (ENSRNOG00000001190)	Tchp (ENSRNOG00000001191)	Gltp (ENSRNOG00000001192)	Trpv4 (ENSRNOG00000001195)	Fam222a (ENSRNOG00000001198)	Mvk (ENSRNOG00000049604)	Mmab (ENSRNOG00000049426)	Ube3b (ENSRNOG00000047219)	Kctd10 (ENSRNOG00000047896) #22	Myo1h (ENSRNOG00000047191)	Foxn4 (ENSRNOG00000000691)	Acacb (ENSRNOG00000000658)	Ung (ENSRNOG00000000692)	Alkbh2 (ENSRNOG00000028584)	Usp30 (ENSRNOG00000028556)	Svop (ENSRNOG00000000693)	Dao (ENSRNOG00000054962)	Ssh1 (ENSRNOG00000000695)	Coro1c (ENSRNOG00000000697)	AABR07036567.1 (ENSRNOG00000020112)	Selplg (ENSRNOG00000000699)	Tmem119 (ENSRNOG00000000700)	Iscu (ENSRNOG00000000701)	Sart3 (ENSRNOG00000000702)
Cricetidae	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000153818.a.a	ENSGT00390000010771	ENSGT00510000046406.f.a.b	ENSGT00510000046406.f.a.a	ENSGT00520000060299	ENSGT00530000065303	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01100000264306	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873
Cricetinae	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000153818.a.a	ENSGT00390000010771	ENSGT00510000046406.f.a.b	ENSGT00510000046406.f.a.a	ENSGT00520000060299	ENSGT00530000065303	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01100000264306	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873
Golden Hamster	MODERN SPECIES	704	Hnf1a (ENSMAUG00000019909)	2210016L21Rik (ENSMAUG00000021072)	ENSMAUG00000018493	ENSMAUG00000000936	ENSMAUG00000012403	ENSMAUG00000008365	ENSMAUG00000014735	Git2 (ENSMAUG00000010532)	ENSMAUG00000012818	Gltp (ENSMAUG00000000222)	Trpv4 (ENSMAUG00000016534)	Fam222a (ENSMAUG00000015503)	Mvk (ENSMAUG00000011969)	Mmab (ENSMAUG00000011390)	Ube3b (ENSMAUG00000020390)	Kctd10 (ENSMAUG00000000200) #22	ENSMAUG00000002109	Myo1h (ENSMAUG00000014848)	Foxn4 (ENSMAUG00000011231)	ENSMAUG00000019057	ENSMAUG00000000167	Ung (ENSMAUG00000011896)	Alkbh2 (ENSMAUG00000009228)	Usp30 (ENSMAUG00000001182)	Svop (ENSMAUG00000014398)	Dao (ENSMAUG00000000506)	Ssh1 (ENSMAUG00000000524)	ENSMAUG00000017903	Selplg (ENSMAUG00000015330)	Tmem119 (ENSMAUG00000014114)	ENSMAUG00000012004
Chinese hamster chok1gshd	MODERN SPECIES	130	Hnf1a (ENSCGRG00001014884)	2210016L21Rik (ENSCGRG00001017554)	Oasl1 (ENSCGRG00001021080)	Oasl2 (ENSCGRG00001017055)	4930519G04Rik (ENSCGRG00001007212)	ENSCGRG00001014625	Ankrd13a (ENSCGRG00001017556)	Git2 (ENSCGRG00001006550)	Tchp (ENSCGRG00001001048)	Gltp (ENSCGRG00001011879)	Trpv4 (ENSCGRG00001019913)	Fam222a (ENSCGRG00001023100)	Mvk (ENSCGRG00001018091)	Mmab (ENSCGRG00001024388)	Ube3b (ENSCGRG00001011610)	Kctd10 (ENSCGRG00001019950) #22	Myo1h (ENSCGRG00001000986)	Foxn4 (ENSCGRG00001001540)	Acacb (ENSCGRG00001012951)	Ung (ENSCGRG00001014464)	Alkbh2 (ENSCGRG00001022310)	Usp30 (ENSCGRG00001023399)	Svop (ENSCGRG00001012441)	Dao (ENSCGRG00001011529)	Ssh1 (ENSCGRG00001021696)	Coro1c (ENSCGRG00001024616)	Selplg (ENSCGRG00001012641)	Tmem119 (ENSCGRG00001001158)	Iscu (ENSCGRG00001017517)	Sart3 (ENSCGRG00001020554)	Ficd (ENSCGRG00001011805)
Cricetidae_B	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000153818.a.a	ENSGT00390000010771	ENSGT00510000046406.f.a.b	ENSGT00510000046406.f.a.a	ENSGT00520000060299	ENSGT00530000065303	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01100000264306	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873
Northern American deer mouse	MODERN SPECIES	15	Hnf1a (ENSPEMG00000015189)	2210016L21Rik (ENSPEMG00000010888)	Oasl1 (ENSPEMG00000016063)	Oasl2 (ENSPEMG00000002563)	4930519G04Rik (ENSPEMG00000011144)	ENSPEMG00000013463	Ankrd13a (ENSPEMG00000001600)	Git2 (ENSPEMG00000007114)	Tchp (ENSPEMG00000016405)	Gltp (ENSPEMG00000028308)	Trpv4 (ENSPEMG00000010457)	Fam222a (ENSPEMG00000008784)	Mvk (ENSPEMG00000006301)	Mmab (ENSPEMG00000012826)	Ube3b (ENSPEMG00000000577)	Kctd10 (ENSPEMG00000012159) #22	Myo1h (ENSPEMG00000013775)	Foxn4 (ENSPEMG00000000758)	Acacb (ENSPEMG00000011484)	ENSPEMG00000016245	Alkbh2 (ENSPEMG00000008584)	Usp30 (ENSPEMG00000016130)	Svop (ENSPEMG00000018703)	Dao (ENSPEMG00000018437)	Ssh1 (ENSPEMG00000015326)	Coro1c (ENSPEMG00000012562)	Selplg (ENSPEMG00000017036)	Tmem119 (ENSPEMG00000025525)	ENSPEMG00000029960	Sart3 (ENSPEMG00000020811)	Ficd (ENSPEMG00000031230)
Prairie vole	MODERN SPECIES	7	Hnf1a (ENSMOCG00000003129)	2210016L21Rik (ENSMOCG00000020970)	Oasl1 (ENSMOCG00000013643)	Oasl2 (ENSMOCG00000019431)	4930519G04Rik (ENSMOCG00000023019)	ENSMOCG00000002202	Ankrd13a (ENSMOCG00000021097)	Git2 (ENSMOCG00000019603)	ENSMOCG00000020137	Gltp (ENSMOCG00000018164)	Trpv4 (ENSMOCG00000014298)	Fam222a (ENSMOCG00000001700)	Mvk (ENSMOCG00000002157)	Mmab (ENSMOCG00000020717)	Ube3b (ENSMOCG00000000411)	Kctd10 (ENSMOCG00000014805) #22	Myo1h (ENSMOCG00000022235)	Foxn4 (ENSMOCG00000020256)	ENSMOCG00000018244	ENSMOCG00000011198	Ung (ENSMOCG00000000431)	Alkbh2 (ENSMOCG00000013405)	Usp30 (ENSMOCG00000012589)	Svop (ENSMOCG00000014762)	Dao (ENSMOCG00000015846)	Ssh1 (ENSMOCG00000004975)	Coro1c (ENSMOCG00000019524)	ENSMOCG00000014634	Tmem119 (ENSMOCG00000020244)	ENSMOCG00000019360	Sart3 (ENSMOCG00000004078)
Upper Galilee mountains blind mole rat	MODERN SPECIES	1466	Crybb2 (ENSNGAG00000001230)	Crybb3 (ENSNGAG00000002089)	ENSNGAG00000014087	Tmem211 (ENSNGAG00000000154)	Sgsm1 (ENSNGAG00000014722)	ENSNGAG00000011606	Ankrd13a (ENSNGAG00000011577)	Git2 (ENSNGAG00000015852)	ENSNGAG00000003932	Gltp (ENSNGAG00000017052)	Trpv4 (ENSNGAG00000016749)	Fam222a (ENSNGAG00000014942)	Mvk (ENSNGAG00000006511)	Mmab (ENSNGAG00000017399)	Ube3b (ENSNGAG00000003847)	Kctd10 (ENSNGAG00000016297) #22	Myo1h (ENSNGAG00000007391)	Foxn4 (ENSNGAG00000015281)	Acacb (ENSNGAG00000019225)	Ung (ENSNGAG00000018945)	Alkbh2 (ENSNGAG00000011661)	Usp30 (ENSNGAG00000012438)	Svop (ENSNGAG00000017854)	Dao (ENSNGAG00000000409)	Ssh1 (ENSNGAG00000013237)	Coro1c (ENSNGAG00000020017)	Selplg (ENSNGAG00000003644)	Tmem119 (ENSNGAG00000010818)	ENSNGAG00000018687	Sart3 (ENSNGAG00000014773)	Ficd (ENSNGAG00000019751)
Lesser Egyptian jerboa	DUPLICATION
Lesser Egyptian jerboa	MODERN SPECIES	109	Acads (ENSJJAG00000020198)	Sppl3 (ENSJJAG00000022924)	Hnf1a (ENSJJAG00000000462)	2210016L21Rik (ENSJJAG00000018859)	Oasl1 (ENSJJAG00000022289)	ENSJJAG00000022337	Ankrd13a (ENSJJAG00000013276)	Git2 (ENSJJAG00000016009)	ENSJJAG00000023867	Gltp (ENSJJAG00000023981)	Trpv4 (ENSJJAG00000015595)	Fam222a (ENSJJAG00000016488)	Mvk (ENSJJAG00000024191)	Mmab (ENSJJAG00000022744)	Ube3b (ENSJJAG00000018342)	ENSJJAG00000013418 #22	Myo1h (ENSJJAG00000022892)	Foxn4 (ENSJJAG00000010809)	Acacb (ENSJJAG00000000256)	ENSJJAG00000016579	Usp30 (ENSJJAG00000020295)	Svop (ENSJJAG00000017537)	Dao (ENSJJAG00000019591)	Ssh1 (ENSJJAG00000012264)	Coro1c (ENSJJAG00000019806)	ENSJJAG00000015496	ENSJJAG00000003636	Sart3 (ENSJJAG00000021869)	Ficd (ENSJJAG00000020622)	Wscd2 (ENSJJAG00000020425)	Sgsm1 (ENSJJAG00000023130)
Lesser Egyptian jerboa	MODERN SPECIES	105									ENSJJAG00000012359	ENSJJAG00000014662	ENSJJAG00000016098	ENSJJAG00000000769	ENSJJAG00000018462	ENSJJAG00000014048	Il1rapl1 (ENSJJAG00000016285)	ENSJJAG00000020571 #22	Nr0b1 (ENSJJAG00000022330)	ENSJJAG00000014702	Tasl (ENSJJAG00000014753)	ENSJJAG00000015331	Tab3 (ENSJJAG00000019643)	ENSJJAG00000022358	ENSJJAG00000005358	ENSJJAG00000022822	ENSJJAG00000024054	Clcn4 (ENSJJAG00000007035)	Mid1 (ENSJJAG00000008283)	Hccs (ENSJJAG00000009600)	ENSJJAG00000010681	Amelx (ENSJJAG00000012298)	ENSJJAG00000003883
Kangaroo rat	MODERN SPECIES	342	ENSDORG00000028706	Mlec (ENSDORG00000026837)	Unc119b (ENSDORG00000023526)	Acads (ENSDORG00000004871)	Sppl3 (ENSDORG00000004872)	Hnf1a (ENSDORG00000007676)	Ankrd13a (ENSDORG00000008865)	Git2 (ENSDORG00000008863)	ENSDORG00000008861	Gltp (ENSDORG00000008704)	Trpv4 (ENSDORG00000006308)	Fam222a (ENSDORG00000024436)	Mvk (ENSDORG00000012797)	Mmab (ENSDORG00000012795)	Ube3b (ENSDORG00000012793)	Kctd10 (ENSDORG00000012791) #22	Myo1h (ENSDORG00000012790)	Acacb (ENSDORG00000012980)	Ung (ENSDORG00000012979)	Alkbh2 (ENSDORG00000012978)	Usp30 (ENSDORG00000012977)	Svop (ENSDORG00000009100)	Dao (ENSDORG00000009099)	Ssh1 (ENSDORG00000000874)	Coro1c (ENSDORG00000013356)	ENSDORG00000014362	Sart3 (ENSDORG00000014360)	Ficd (ENSDORG00000026655)	Wscd2 (ENSDORG00000000235)	Sgsm1 (ENSDORG00000015314)	Crybb3 (ENSDORG00000028727)
Rodentia_A	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000158101	ENSGT00940000153818.a.a	ENSGT00390000010771	ENSGT00510000046406.f.a.b	ENSGT00510000046406.f.a.a	ENSGT00530000065303	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01100000263656	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873
Hystricomorpha	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000156340.a	ENSGT00940000161345	ENSGT00390000015147	ENSGT00940000161808	ENSGT00940000163200	ENSGT00530000065303	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01100000263656	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000159434	ENSGT01020000230438.C	ENSGT00390000008873	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000015813	ENSGT00390000017134	ENSGT00440000039754	ENSGT00940000156488	ENSGT00940000156133	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000159009
Naked mole-rat female	MODERN SPECIES	15	CHCHD10 (ENSHGLG00000037941)	C22orf15 (ENSHGLG00000041140)	VPREB3 (ENSHGLG00000043407)	ENSHGLG00000018817	ENSHGLG00000047620	ANKRD13A (ENSHGLG00000018688)	GIT2 (ENSHGLG00000015609)	ENSHGLG00000014489	GLTP (ENSHGLG00000035359)	TRPV4 (ENSHGLG00000000233)	FAM222A (ENSHGLG00000046243)	ENSHGLG00000034687	MVK (ENSHGLG00000049725)	MMAB (ENSHGLG00000007791)	UBE3B (ENSHGLG00000010291)	KCTD10 (ENSHGLG00000038910) #22	ENSHGLG00000012667	ENSHGLG00000009255	ENSHGLG00000011862	CMKLR1 (ENSHGLG00000044416)	FICD (ENSHGLG00000010944)	SART3 (ENSHGLG00000011579)	ISCU (ENSHGLG00000012770)	TMEM119 (ENSHGLG00000044091)	ENSHGLG00000045973	ENSHGLG00000039515	CORO1C (ENSHGLG00000017773)	SSH1 (ENSHGLG00000017730)	DAO (ENSHGLG00000016640)	ENSHGLG00000038810	SVOP (ENSHGLG00000017833)
Hystricomorpha_a	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000156340.a	ENSGT00390000015147	ENSGT00940000161345	ENSGT00940000161808	ENSGT00940000163200	ENSGT00530000065303	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01100000263656	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000159434	ENSGT01020000230438.C	ENSGT00390000008873	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000015813	ENSGT00390000017134	ENSGT00940000156488	ENSGT00940000156133	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000159009	ENSGT00390000003405.pb
Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000156340.a	ENSGT00390000015147	ENSGT00940000161345	ENSGT00940000161808	ENSGT00940000163200	ENSGT00530000065303	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01100000263656	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000159434	ENSGT01020000230438.C	ENSGT00390000008873	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000015813	ENSGT00390000017134	ENSGT00940000156488	ENSGT00940000156133	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000159009	ENSGT00390000003405.pb
Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	162	SMARCB1 (ENSCLAG00000008073)	MMP11 (ENSCLAG00000009935)	C22orf15 (ENSCLAG00000011415)	CHCHD10 (ENSCLAG00000010445)	VPREB3 (ENSCLAG00000012632)	ZNF70 (ENSCLAG00000017808)	ANKRD13A (ENSCLAG00000011896)	GIT2 (ENSCLAG00000008324)	ENSCLAG00000010742	GLTP (ENSCLAG00000009283)	TRPV4 (ENSCLAG00000010741)	FAM222A (ENSCLAG00000011916)	MVK (ENSCLAG00000012463)	MMAB (ENSCLAG00000016027)	UBE3B (ENSCLAG00000008676)	KCTD10 (ENSCLAG00000012997) #22	MYO1H (ENSCLAG00000012356)	FOXN4 (ENSCLAG00000016537)	WSCD2 (ENSCLAG00000008254)	CMKLR1 (ENSCLAG00000017905)	FICD (ENSCLAG00000013702)	SART3 (ENSCLAG00000011727)	ISCU (ENSCLAG00000013149)	TMEM119 (ENSCLAG00000009874)	CORO1C (ENSCLAG00000011732)	SSH1 (ENSCLAG00000010937)	DAO (ENSCLAG00000013453)	SVOP (ENSCLAG00000014208)	ENSCLAG00000010917	USP30 (ENSCLAG00000008917)	ALKBH2 (ENSCLAG00000011668)
Degu	MODERN SPECIES	120	ENSODEG00000006764	MMP11 (ENSODEG00000008612)	CHCHD10 (ENSODEG00000006934)	VPREB3 (ENSODEG00000006591)	ZNF70 (ENSODEG00000019446)	C12orf76 (ENSODEG00000006686)	ANKRD13A (ENSODEG00000008089)	GIT2 (ENSODEG00000007446)	TCHP (ENSODEG00000009235)	GLTP (ENSODEG00000008564)	TRPV4 (ENSODEG00000007024)	FAM222A (ENSODEG00000006448)	MVK (ENSODEG00000007422)	MMAB (ENSODEG00000007070)	UBE3B (ENSODEG00000007025)	KCTD10 (ENSODEG00000009664) #22	MYO1H (ENSODEG00000006763)	FOXN4 (ENSODEG00000007174)	WSCD2 (ENSODEG00000007251)	FICD (ENSODEG00000006909)	SART3 (ENSODEG00000008547)	ENSODEG00000007790	ENSODEG00000007506	CORO1C (ENSODEG00000007444)	ENSODEG00000019365	SSH1 (ENSODEG00000008770)	DAO (ENSODEG00000006451)	SVOP (ENSODEG00000008018)	USP30 (ENSODEG00000007609)	ALKBH2 (ENSODEG00000007069)	UNG (ENSODEG00000006529)
Guinea pig	MODERN SPECIES	4	SMARCB1 (ENSCPOG00000036261)	MMP11 (ENSCPOG00000003507)	CHCHD10 (ENSCPOG00000014612)	VPREB3 (ENSCPOG00000038412)	ZNF70 (ENSCPOG00000032266)	C12orf76 (ENSCPOG00000030105)	ANKRD13A (ENSCPOG00000012868)	GIT2 (ENSCPOG00000012863)	ENSCPOG00000012857	GLTP (ENSCPOG00000032905)	TRPV4 (ENSCPOG00000021476)	FAM222A (ENSCPOG00000031513)	MVK (ENSCPOG00000027467)	MMAB (ENSCPOG00000011395)	UBE3B (ENSCPOG00000005822)	KCTD10 (ENSCPOG00000031574) #22	MYO1H (ENSCPOG00000014664)	FOXN4 (ENSCPOG00000000942)	WSCD2 (ENSCPOG00000030399)	CMKLR1 (ENSCPOG00000031853)	ENSCPOG00000026220	FICD (ENSCPOG00000031704)	SART3 (ENSCPOG00000010969)	ISCU (ENSCPOG00000010986)	ENSCPOG00000034342	CORO1C (ENSCPOG00000001338)	SSH1 (ENSCPOG00000008158)	DAO (ENSCPOG00000008164)	SVOP (ENSCPOG00000013976)	USP30 (ENSCPOG00000013022)	ALKBH2 (ENSCPOG00000033616)
Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00940000158101	ENSGT00940000153818.a.a	ENSGT00390000010771	ENSGT00510000046406.f.a.b	ENSGT00510000046406.f.a.a	ENSGT00530000065303.a	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01100000263656	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	68						ENSGT00530000065303.a	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01100000263656	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	165						ENSGT00530000065303.a	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01100000263656	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	413						C12orf76 (ENSUPAG00010022600)	ANKRD13A (ENSUPAG00010022596)	GIT2 (ENSUPAG00010022570)	TCHP (ENSUPAG00010022567)	GLTP (ENSUPAG00010022565)	TRPV4 (ENSUPAG00010022545)	FAM222A (ENSUPAG00010022543)	MVK (ENSUPAG00010022540)	MMAB (ENSUPAG00010022535)	UBE3B (ENSUPAG00010022528)	KCTD10 (ENSUPAG00010022519) #22	MYO1H (ENSUPAG00010022490)	FOXN4 (ENSUPAG00010022482)	ACACB (ENSUPAG00010004378)	UNG (ENSUPAG00010004291)	ALKBH2 (ENSUPAG00010004280)	USP30 (ENSUPAG00010004249)	SVOP (ENSUPAG00010004218)	DAO (ENSUPAG00010004179)	SSH1 (ENSUPAG00010004149)	CORO1C (ENSUPAG00010004121)	ENSUPAG00010004118	TMEM119 (ENSUPAG00010004117)	ISCU (ENSUPAG00010004103)	SART3 (ENSUPAG00010004084)	FICD (ENSUPAG00010004078)
Squirrel	MODERN SPECIES	369						C12orf76 (ENSSTOG00000025371)	ANKRD13A (ENSSTOG00000004611)	GIT2 (ENSSTOG00000004553)	ENSSTOG00000020104	GLTP (ENSSTOG00000004484)	TRPV4 (ENSSTOG00000002850)	FAM222A (ENSSTOG00000023653)	MVK (ENSSTOG00000010634)	MMAB (ENSSTOG00000023232)	UBE3B (ENSSTOG00000025653)	KCTD10 (ENSSTOG00000015575) #22	MYO1H (ENSSTOG00000024291)	FOXN4 (ENSSTOG00000028800)	ACACB (ENSSTOG00000004947)	UNG (ENSSTOG00000006894)	ALKBH2 (ENSSTOG00000028697)	USP30 (ENSSTOG00000028726)	SVOP (ENSSTOG00000025881)	DAO (ENSSTOG00000011598)	SSH1 (ENSSTOG00000011590)	CORO1C (ENSSTOG00000011581)	ISCU (ENSSTOG00000002394)	SART3 (ENSSTOG00000002376)	FICD (ENSSTOG00000002374)	WSCD2 (ENSSTOG00000021555)
Alpin marmot	MODERN SPECIES	67	ENSMMMG00000024429	ENSMMMG00000024427	ENSMMMG00000024426	PIWIL3 (ENSMMMG00000024418)	ENSMMMG00000024415	ENSMMMG00000024414	ANKRD13A (ENSMMMG00000024412)	GIT2 (ENSMMMG00000024385)	ENSMMMG00000024380	ENSMMMG00000024378	ENSMMMG00000024375	TRPV4 (ENSMMMG00000024357)	MVK (ENSMMMG00000024356)	MMAB (ENSMMMG00000024355)	UBE3B (ENSMMMG00000024352)	KCTD10 (ENSMMMG00000024350) #22	MYO1H (ENSMMMG00000024346)	FOXN4 (ENSMMMG00000024342)	ACACB (ENSMMMG00000018633)	UNG (ENSMMMG00000018536)	ALKBH2 (ENSMMMG00000018527)	USP30 (ENSMMMG00000018502)	SVOP (ENSMMMG00000018494)	DAO (ENSMMMG00000018456)	SSH1 (ENSMMMG00000018338)	ENSMMMG00000018317	ENSMMMG00000018307	ISCU (ENSMMMG00000018301)	SART3 (ENSMMMG00000018262)	FICD (ENSMMMG00000018257)	CMKLR1 (ENSMMMG00000018251)
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	17	OASL (ENSSVLG00005006906)	ENSSVLG00005006824	ENSSVLG00005006638	ENSSVLG00005006590	ENSSVLG00005006553	ENSSVLG00005006484	GIT2 (ENSSVLG00005006287)	TCHP (ENSSVLG00005006107)	GLTP (ENSSVLG00005006053)	ENSSVLG00005005998	TRPV4 (ENSSVLG00005005812)	FAM222A (ENSSVLG00005005748)	MVK (ENSSVLG00005005596)	ENSSVLG00005005523	UBE3B (ENSSVLG00005005481)	KCTD10 (ENSSVLG00005005431) #22	MYO1H (ENSSVLG00005005207)	FOXN4 (ENSSVLG00005005136)	ACACB (ENSSVLG00005004955)	UNG (ENSSVLG00005004859)	ALKBH2 (ENSSVLG00005004814)	USP30 (ENSSVLG00005004769)	ENSSVLG00005004751	SVOP (ENSSVLG00005004737)	ENSSVLG00005004716	DAO (ENSSVLG00005004678)	SSH1 (ENSSVLG00005004651)	CORO1C (ENSSVLG00005004573)	ENSSVLG00005019245	TMEM119 (ENSSVLG00005019223)	ENSSVLG00005019074
Primates	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00390000010771	ENSGT00510000046406.f.a.b	ENSGT00510000046406.f.a.a	ENSGT00530000065303	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01100000263651	ENSGT00580000082615	ENSGT01100000263656	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873
Strepsirrhini	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00390000010771	ENSGT00510000046406.f.a.b	ENSGT00510000046406.f.a.a	ENSGT00530000065303	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01100000263651	ENSGT00580000082615	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C.h	ENSGT00950000183187.C.g	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000017134	ENSGT00940000166181	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107
Lemuriformes	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000153818.a.a	ENSGT00390000010771.g	ENSGT00510000046406.f.a.b	ENSGT00510000046406.f.a.a	ENSGT00530000065303	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01100000263651	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C.h	ENSGT00950000183187.C.g	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873	ENSGT01020000230438.C
Lemuriformes_a	ANCESTRAL SPECIES	87													ENSGT00950000183187.C.g	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00390000017134	ENSGT00940000166181	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107
Greater bamboo lemur	MODERN SPECIES	53													MVK (ENSPSMG00000003687)	MMAB (ENSPSMG00000003656)	UBE3B (ENSPSMG00000003607)	KCTD10 (ENSPSMG00000003573) #22	MYO1H (ENSPSMG00000003564)	FOXN4 (ENSPSMG00000003550)	ACACB (ENSPSMG00000003358)	UNG (ENSPSMG00000003048)	ALKBH2 (ENSPSMG00000003039)	USP30 (ENSPSMG00000003028)	SVOP (ENSPSMG00000002987)	DAO (ENSPSMG00000002913)	SSH1 (ENSPSMG00000002826)	CORO1C (ENSPSMG00000002748)	TMEM119 (ENSPSMG00000002710)	ENSPSMG00000002698	SART3 (ENSPSMG00000002637)	FICD (ENSPSMG00000002565)	CMKLR1 (ENSPSMG00000002558)
Coquerels sifaka	MODERN SPECIES	446													ENSPCOG00000006724	MMAB (ENSPCOG00000026512)	UBE3B (ENSPCOG00000007767)	KCTD10 (ENSPCOG00000018141) #22	MYO1H (ENSPCOG00000006671)	FOXN4 (ENSPCOG00000019838)	ACACB (ENSPCOG00000027959)	UNG (ENSPCOG00000026100)	ALKBH2 (ENSPCOG00000026329)	USP30 (ENSPCOG00000016582)	SVOP (ENSPCOG00000025251)	ENSPCOG00000004123	GIT2 (ENSPCOG00000016849)	ANKRD13A (ENSPCOG00000010599)	C12orf76 (ENSPCOG00000027357)	OASL (ENSPCOG00000026188)	C12orf43 (ENSPCOG00000025153)	HNF1A (ENSPCOG00000023769)	SPPL3 (ENSPCOG00000018081)
Mouse lemur	MODERN SPECIES	13	C12orf43 (ENSMICG00000008728)	OASL (ENSMICG00000046728)	C12orf76 (ENSMICG00000047429)	ANKRD13A (ENSMICG00000017203)	GIT2 (ENSMICG00000017192)	ENSMICG00000017186	GLTP (ENSMICG00000030371)	TRPV4 (ENSMICG00000014505)	FAM222A (ENSMICG00000035580)	ENSMICG00000031144	MVK (ENSMICG00000017634)	MMAB (ENSMICG00000017633)	ENSMICG00000038066	UBE3B (ENSMICG00000017632)	ENSMICG00000037399	KCTD10 (ENSMICG00000017631) #22	MYO1H (ENSMICG00000029989)	FOXN4 (ENSMICG00000017629)	ACACB (ENSMICG00000043665)	UNG (ENSMICG00000044482)	ENSMICG00000030926	ALKBH2 (ENSMICG00000017626)	USP30 (ENSMICG00000017625)	SVOP (ENSMICG00000017624)	ENSMICG00000033782	DAO (ENSMICG00000035232)	SSH1 (ENSMICG00000000277)	CORO1C (ENSMICG00000037735)	SELPLG (ENSMICG00000044874)	ENSMICG00000032228	ENSMICG00000013067
Bushbaby	MODERN SPECIES	153	SPPL3 (ENSOGAG00000008538)	HNF1A (ENSOGAG00000009071)	C12orf43 (ENSOGAG00000009074)	OASL (ENSOGAG00000009076)	ENSOGAG00000030882	C12orf76 (ENSOGAG00000008048)	ANKRD13A (ENSOGAG00000012287)	GIT2 (ENSOGAG00000012279)	ENSOGAG00000012274	ENSOGAG00000029672	GLTP (ENSOGAG00000015202)	TRPV4 (ENSOGAG00000015196)	MVK (ENSOGAG00000015191)	MMAB (ENSOGAG00000015185)	UBE3B (ENSOGAG00000015177)	KCTD10 (ENSOGAG00000003600) #22	MYO1H (ENSOGAG00000029542)	FOXN4 (ENSOGAG00000007455)	ACACB (ENSOGAG00000007444)	UNG (ENSOGAG00000007441)	ALKBH2 (ENSOGAG00000028772)	USP30 (ENSOGAG00000007436)	SVOP (ENSOGAG00000007434)	DAO (ENSOGAG00000033977)	SSH1 (ENSOGAG00000014046)	CORO1C (ENSOGAG00000000938)	SELPLG (ENSOGAG00000031342)	TMEM119 (ENSOGAG00000029818)	ENSOGAG00000000936	SART3 (ENSOGAG00000000932)	FICD (ENSOGAG00000000930)
Haplorrhini	ANCESTRAL SPECIES	50				ENSGT00530000065303	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01100000263651	ENSGT00580000082615	ENSGT01100000263656	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873
Tarsier	MODERN SPECIES	6975													MVK (ENSTSYG00000012498)	MMAB (ENSTSYG00000012495)	UBE3B (ENSTSYG00000010756)	KCTD10 (ENSTSYG00000010753) #22	MYO1H (ENSTSYG00000030013)
Simiiformes	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000000999	ENSGT00490000044353	ENSGT01050000245332	ENSGT00530000065303	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01100000263651	ENSGT00580000082615	ENSGT01100000263656	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873
Catarrhini	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000000999	ENSGT00490000044353	ENSGT01050000245332	ENSGT00530000065303	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01100000263651	ENSGT00580000082615	ENSGT01100000263656	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873
Hominoidea	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00910000147183	ENSGT00940000159986	ENSGT00390000000999	ENSGT00490000044353	ENSGT01050000245332	ENSGT00530000065303	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01100000263656	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873
Hominidae	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00910000147183	ENSGT00940000159986	ENSGT00390000000999	ENSGT00490000044353	ENSGT01050000245332	ENSGT00530000065303	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01100000263656	ENSGT00940000155182.b.e.a	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873
Homo/Pan/Gorilla group	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00910000147183	ENSGT00940000159986	ENSGT00390000000999	ENSGT00490000044353	ENSGT01050000245332	ENSGT00530000065303	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01100000263656	ENSGT00940000155182.b.e.a	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873
Homo/Pan group	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00910000147183	ENSGT00940000159986	ENSGT00390000000999	ENSGT00490000044353	ENSGT01050000245332	ENSGT00530000065303	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01100000263656	ENSGT00940000155182.b.e.a	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873
Pan	DUPLICATION
Pan	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00950000182950.D	ENSGT00910000147183	ENSGT00940000159986	ENSGT00390000000999	ENSGT00490000044353	ENSGT01050000245332	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01100000263656	ENSGT00940000155182.b.e.a	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a.s #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873
Chimpanzee	MODERN SPECIES	3	ANAPC7 (ENSPTRG00000023371)	ENSPTRG00000046261	ATP2A2 (ENSPTRG00000005437)	IFT81 (ENSPTRG00000005436)	ENSPTRG00000033690	C12H12orf76 (ENSPTRG00000005435)	ANKRD13A (ENSPTRG00000005434)	GIT2 (ENSPTRG00000005433)	TCHP (ENSPTRG00000005432)	GLTP (ENSPTRG00000005431)	TRPV4 (ENSPTRG00000005430)	FAM222A (ENSPTRG00000005429)	MVK (ENSPTRG00000005428)	MMAB (ENSPTRG00000005427)	UBE3B (ENSPTRG00000005425)	ENSPTRG00000050604 #22	MYO1H (ENSPTRG00000005423)	FOXN4 (ENSPTRG00000005421)	ACACB (ENSPTRG00000005420)	UNG (ENSPTRG00000005419)	ALKBH2 (ENSPTRG00000005418)	USP30 (ENSPTRG00000005417)	SVOP (ENSPTRG00000005416)	DAO (ENSPTRG00000005411)	SSH1 (ENSPTRG00000047007)	CORO1C (ENSPTRG00000005408)	SELPLG (ENSPTRG00000005407)	TMEM119 (ENSPTRG00000051328)	ENSPTRG00000040156	SART3 (ENSPTRG00000005404)	FICD (ENSPTRG00000005403)
Bonobo	MODERN SPECIES	3	ANAPC7 (ENSPPAG00000035420)	ENSPPAG00000032578	ATP2A2 (ENSPPAG00000042524)	IFT81 (ENSPPAG00000031123)	ENSPPAG00000034609	ENSPPAG00000036117	ANKRD13A (ENSPPAG00000035872)	GIT2 (ENSPPAG00000006022)	TCHP (ENSPPAG00000038461)	GLTP (ENSPPAG00000029160)	TRPV4 (ENSPPAG00000029843)	FAM222A (ENSPPAG00000031285)	MVK (ENSPPAG00000042351)	MMAB (ENSPPAG00000032476)	UBE3B (ENSPPAG00000029611)	ENSPPAG00000021243 #22	MYO1H (ENSPPAG00000043049)	FOXN4 (ENSPPAG00000038569)	ACACB (ENSPPAG00000033945)	UNG (ENSPPAG00000022353)	ALKBH2 (ENSPPAG00000033974)	USP30 (ENSPPAG00000029209)	SVOP (ENSPPAG00000028321)	ENSPPAG00000029901	SSH1 (ENSPPAG00000030525)	CORO1C (ENSPPAG00000032787)	SELPLG (ENSPPAG00000039506)	TMEM119 (ENSPPAG00000007931)	ISCU (ENSPPAG00000027482)	SART3 (ENSPPAG00000041812)	FICD (ENSPPAG00000031120)
Pan	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183143.c.a.t #22
Bonobo	MODERN SPECIES	337																ENSPPAG00000029894 #22	ENSPPAG00000028183	ENSPPAG00000031961
Chimpanzee	MODERN SPECIES	688																ENSPTRG00000041406 #22	ENSPTRG00000052127	ENSPTRG00000033832
Human	MODERN SPECIES	3	GPN3 (ENSG00000111231)	ARPC3 (ENSG00000111229)	ANAPC7 (ENSG00000196510)	ATP2A2 (ENSG00000174437)	IFT81 (ENSG00000122970)	C12orf76 (ENSG00000174456)	ANKRD13A (ENSG00000076513)	GIT2 (ENSG00000139436)	TCHP (ENSG00000139437)	GLTP (ENSG00000139433)	TRPV4 (ENSG00000111199)	FAM222A (ENSG00000139438)	MVK (ENSG00000110921)	MMAB (ENSG00000139428)	UBE3B (ENSG00000151148)	KCTD10 (ENSG00000110906) #22	MYO1H (ENSG00000174527)	FOXN4 (ENSG00000139445)	ACACB (ENSG00000076555)	UNG (ENSG00000076248)	ALKBH2 (ENSG00000189046)	USP30 (ENSG00000135093)	SVOP (ENSG00000166111)	DAO (ENSG00000110887)	SSH1 (ENSG00000084112)	CORO1C (ENSG00000110880)	SELPLG (ENSG00000110876)	TMEM119 (ENSG00000183160)	ISCU (ENSG00000136003)	SART3 (ENSG00000075856)	FICD (ENSG00000198855)
Gorilla	MODERN SPECIES	3	ANAPC7 (ENSGGOG00000014364)	ENSGGOG00000043027	ATP2A2 (ENSGGOG00000003592)	IFT81 (ENSGGOG00000002168)	ENSGGOG00000005417	ENSGGOG00000025942	ANKRD13A (ENSGGOG00000009482)	GIT2 (ENSGGOG00000009470)	TCHP (ENSGGOG00000010792)	GLTP (ENSGGOG00000043966)	TRPV4 (ENSGGOG00000004623)	FAM222A (ENSGGOG00000000993)	MVK (ENSGGOG00000001642)	MMAB (ENSGGOG00000001641)	UBE3B (ENSGGOG00000001638)	KCTD10 (ENSGGOG00000013947) #22	MYO1H (ENSGGOG00000008306)	FOXN4 (ENSGGOG00000009323)	ACACB (ENSGGOG00000009294)	UNG (ENSGGOG00000022413)	ALKBH2 (ENSGGOG00000009621)	USP30 (ENSGGOG00000009612)	ENSGGOG00000014918	DAO (ENSGGOG00000013247)	SSH1 (ENSGGOG00000000979)	CORO1C (ENSGGOG00000017112)	SELPLG (ENSGGOG00000011384)	TMEM119 (ENSGGOG00000026534)	ENSGGOG00000011579	SART3 (ENSGGOG00000011562)	FICD (ENSGGOG00000011553)
Orangutan	MODERN SPECIES	3	ENSPPYG00000004948	ARPC3 (ENSPPYG00000004947)	ANAPC7 (ENSPPYG00000039967)	ATP2A2 (ENSPPYG00000004946)	IFT81 (ENSPPYG00000004945)	ENSPPYG00000004943	ANKRD13A (ENSPPYG00000004942)	GIT2 (ENSPPYG00000004941)	TCHP (ENSPPYG00000004940)	GLTP (ENSPPYG00000035304)	TRPV4 (ENSPPYG00000004938)	FAM222A (ENSPPYG00000038199)	MVK (ENSPPYG00000004936)	ENSPPYG00000004935	UBE3B (ENSPPYG00000004934)	KCTD10 (ENSPPYG00000037348) #22	MYO1H (ENSPPYG00000035222)	FOXN4 (ENSPPYG00000004931)	ACACB (ENSPPYG00000004930)	UNG (ENSPPYG00000004929)	ALKBH2 (ENSPPYG00000004928)	USP30 (ENSPPYG00000004927)	SVOP (ENSPPYG00000041286)	DAO (ENSPPYG00000004925)	SSH1 (ENSPPYG00000004924)	CORO1C (ENSPPYG00000004923)	ENSPPYG00000004922	TMEM119 (ENSPPYG00000004921)	ISCU (ENSPPYG00000004920)	SART3 (ENSPPYG00000004919)	FICD (ENSPPYG00000038791)
Gibbon	MODERN SPECIES		ENSNLEG00000030264	ANAPC7 (ENSNLEG00000002721)	ENSNLEG00000029890	ATP2A2 (ENSNLEG00000002636)	IFT81 (ENSNLEG00000002605)	ENSNLEG00000002603	ENSNLEG00000002602	ANKRD13A (ENSNLEG00000002504)	GIT2 (ENSNLEG00000002339)	ENSNLEG00000002257	GLTP (ENSNLEG00000002238)	TRPV4 (ENSNLEG00000002222)	MVK (ENSNLEG00000002176)	ENSNLEG00000002073	UBE3B (ENSNLEG00000001706)	KCTD10 (ENSNLEG00000001668) #22	MYO1H (ENSNLEG00000001634)	FOXN4 (ENSNLEG00000001602)	ACACB (ENSNLEG00000001505)	ENSNLEG00000001442	ALKBH2 (ENSNLEG00000028158)	USP30 (ENSNLEG00000001385)	SVOP (ENSNLEG00000006817)	DAO (ENSNLEG00000006814)	SSH1 (ENSNLEG00000006811)	CORO1C (ENSNLEG00000006804)	SELPLG (ENSNLEG00000006802)	ISCU (ENSNLEG00000006797)	SART3 (ENSNLEG00000006767)	FICD (ENSNLEG00000006765)	CMKLR1 (ENSNLEG00000006762)
Cercopithecidae	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000159986	ENSGT00390000000999	ENSGT00490000044353	ENSGT01050000245332	ENSGT00530000065303	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01100000263651	ENSGT00580000082615	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT01000000216272	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107
Cercopithecinae	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000159986	ENSGT00390000000999	ENSGT00490000044353	ENSGT01050000245332	ENSGT00530000065303	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01100000263651	ENSGT00580000082615	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT01000000216272	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107
Cercopithecinae_a	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00910000147183	ENSGT00940000159986	ENSGT00390000000999	ENSGT00490000044353	ENSGT01050000245332	ENSGT00530000065303	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01100000263651	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT01000000216272	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107
Macaca	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00390000018018.tb	ENSGT00950000182950.D	ENSGT00920000150750	ENSGT00940000159986	ENSGT00390000000999	ENSGT00530000065303	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01100000263651	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873
Pig-tailed macaque	MODERN SPECIES	204	ENSMNEG00000029131	ANAPC7 (ENSMNEG00000042508)	ATP2A2 (ENSMNEG00000031586)	ENSMNEG00000036529	IFT81 (ENSMNEG00000035894)	ENSMNEG00000024782	ANKRD13A (ENSMNEG00000032119)	GIT2 (ENSMNEG00000041196)	ENSMNEG00000029596	GLTP (ENSMNEG00000038610)	TRPV4 (ENSMNEG00000044471)	FAM222A (ENSMNEG00000031277)	MVK (ENSMNEG00000042683)	MMAB (ENSMNEG00000045459)	UBE3B (ENSMNEG00000030062)	KCTD10 (ENSMNEG00000012985) #22	MYO1H (ENSMNEG00000043247)	FOXN4 (ENSMNEG00000045187)	ENSMNEG00000010564	ACACB (ENSMNEG00000044783)	FAM177B (ENSMNEG00000034631)	BROX (ENSMNEG00000011074)	ENSMNEG00000035720	MIA3 (ENSMNEG00000031019)	TAF1A (ENSMNEG00000032688)	HHIPL2 (ENSMNEG00000000089)	ENSMNEG00000030688	DUSP10 (ENSMNEG00000029567)	ENSMNEG00000002446	HLX (ENSMNEG00000036814)	MTARC1 (ENSMNEG00000044573)
Macaca_a	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00390000018018.tb	ENSGT00950000182950.D	ENSGT00920000150750	ENSGT00940000159986	ENSGT00390000000999	ENSGT00530000065303	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01100000263651	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873
Rhesus	MODERN SPECIES	2	GPN3 (ENSMMUG00000006494)	ARPC3 (ENSMMUG00000006492)	ANAPC7 (ENSMMUG00000054876)	ATP2A2 (ENSMMUG00000001739)	IFT81 (ENSMMUG00000023032)	ANKRD13A (ENSMMUG00000007678)	GIT2 (ENSMMUG00000010484)	ENSMMUG00000061029	ENSMMUG00000031562	GLTP (ENSMMUG00000058267)	TRPV4 (ENSMMUG00000003942)	FAM222A (ENSMMUG00000060613)	MVK (ENSMMUG00000011663)	MMAB (ENSMMUG00000060209)	UBE3B (ENSMMUG00000019650)	KCTD10 (ENSMMUG00000019649) #22	MYO1H (ENSMMUG00000042728)	FOXN4 (ENSMMUG00000020375)	ACACB (ENSMMUG00000022698)	UNG (ENSMMUG00000006957)	ALKBH2 (ENSMMUG00000062689)	USP30 (ENSMMUG00000039553)	SVOP (ENSMMUG00000015108)	DAO (ENSMMUG00000006893)	SSH1 (ENSMMUG00000015107)	CORO1C (ENSMMUG00000000512)	SELPLG (ENSMMUG00000031572)	TMEM119 (ENSMMUG00000050754)	ISCU (ENSMMUG00000017126)	SART3 (ENSMMUG00000017124)	FICD (ENSMMUG00000017123)
Crab-eating macaque	MODERN SPECIES	2	GPN3 (ENSMFAG00000003083)	ARPC3 (ENSMFAG00000041561)	ANAPC7 (ENSMFAG00000030528)	ENSMFAG00000050727	ATP2A2 (ENSMFAG00000030226)	IFT81 (ENSMFAG00000001327)	ENSMFAG00000030466	ANKRD13A (ENSMFAG00000036762)	GIT2 (ENSMFAG00000038129)	ENSMFAG00000035910	GLTP (ENSMFAG00000007238)	TRPV4 (ENSMFAG00000032093)	MVK (ENSMFAG00000003068)	MMAB (ENSMFAG00000036377)	UBE3B (ENSMFAG00000032022)	KCTD10 (ENSMFAG00000001368) #22	MYO1H (ENSMFAG00000046050)	FOXN4 (ENSMFAG00000031528)	ENSMFAG00000004725	ENSMFAG00000041953	ENSMFAG00000060717	UNG (ENSMFAG00000039615)	ALKBH2 (ENSMFAG00000003561)	USP30 (ENSMFAG00000040319)	ENSMFAG00000048807	SVOP (ENSMFAG00000033712)	DAO (ENSMFAG00000000854)	SSH1 (ENSMFAG00000002904)	SELPLG (ENSMFAG00000030190)	TMEM119 (ENSMFAG00000063201)	CORO1C (ENSMFAG00000044006)
Cercopithecinae_b	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00910000147183	ENSGT00940000159986	ENSGT00390000000999	ENSGT00490000044353	ENSGT01050000245332	ENSGT00530000065303	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01100000263651	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT01000000216272	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107
Olive baboon	MODERN SPECIES	19	GPN3 (ENSPANG00000008884)	ARPC3 (ENSPANG00000024231)	ANAPC7 (ENSPANG00000005345)	ATP2A2 (ENSPANG00000012530)	IFT81 (ENSPANG00000008732)	C12orf76 (ENSPANG00000022858)	ANKRD13A (ENSPANG00000017169)	GIT2 (ENSPANG00000017402)	ENSPANG00000006125	GLTP (ENSPANG00000017668)	TRPV4 (ENSPANG00000019701)	FAM222A (ENSPANG00000034447)	MVK (ENSPANG00000005926)	MMAB (ENSPANG00000016450)	UBE3B (ENSPANG00000006126)	KCTD10 (ENSPANG00000004047) #22	MYO1H (ENSPANG00000005998)	FOXN4 (ENSPANG00000019523)	ACACB (ENSPANG00000016133)	UNG (ENSPANG00000006075)	ALKBH2 (ENSPANG00000021815)	USP30 (ENSPANG00000006076)	SVOP (ENSPANG00000018234)	DAO (ENSPANG00000006127)	SSH1 (ENSPANG00000016134)	ENSPANG00000018235	TMEM119 (ENSPANG00000008243)	ISCU (ENSPANG00000026468)	SART3 (ENSPANG00000024915)	FICD (ENSPANG00000025435)	CMKLR1 (ENSPANG00000012188)
Cercopithecinae_d	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00950000182950.D	ENSGT00910000147183	ENSGT00940000159986	ENSGT00390000000999	ENSGT00490000044353	ENSGT01050000245332	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01100000263651	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT01000000216272	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107
Sooty mangabey	MODERN SPECIES	406	ENSCATG00000034466	ATP2A2 (ENSCATG00000034386)	ENSCATG00000035933	IFT81 (ENSCATG00000043833)	ENSCATG00000018001	ENSCATG00000031038	ANKRD13A (ENSCATG00000041264)	GIT2 (ENSCATG00000030603)	ENSCATG00000041253	GLTP (ENSCATG00000038320)	TRPV4 (ENSCATG00000016857)	FAM222A (ENSCATG00000025405)	MVK (ENSCATG00000009610)	MMAB (ENSCATG00000009276)	UBE3B (ENSCATG00000040656)	KCTD10 (ENSCATG00000032264) #22	MYO1H (ENSCATG00000038608)	FOXN4 (ENSCATG00000044785)	ACACB (ENSCATG00000038648)	ENSCATG00000028907	ALKBH2 (ENSCATG00000017055)	USP30 (ENSCATG00000041949)	SVOP (ENSCATG00000036553)	ENSCATG00000019209	DAO (ENSCATG00000032605)	SSH1 (ENSCATG00000035968)	CORO1C (ENSCATG00000000746)	SELPLG (ENSCATG00000042640)	TMEM119 (ENSCATG00000019459)	ISCU (ENSCATG00000044115)	SART3 (ENSCATG00000041537)
Drill	MODERN SPECIES	1248	ANAPC7 (ENSMLEG00000038272)	ENSMLEG00000043042	ATP2A2 (ENSMLEG00000038965)	IFT81 (ENSMLEG00000042457)	ENSMLEG00000034593	ENSMLEG00000041907	ANKRD13A (ENSMLEG00000037484)	GIT2 (ENSMLEG00000040638)	ENSMLEG00000038876	GLTP (ENSMLEG00000042449)	TRPV4 (ENSMLEG00000036029)	FAM222A (ENSMLEG00000041781)	MVK (ENSMLEG00000029885)	MMAB (ENSMLEG00000031824)	UBE3B (ENSMLEG00000029645)	KCTD10 (ENSMLEG00000027837) #22	ENSMLEG00000032990
Vervet Monkey	MODERN SPECIES	2	GPN3 (ENSCSAG00000002665)	ANAPC7 (ENSCSAG00000002666)	ATP2A2 (ENSCSAG00000002670)	IFT81 (ENSCSAG00000002688)	ENSCSAG00000002701	ANKRD13A (ENSCSAG00000002707)	GIT2 (ENSCSAG00000002715)	ENSCSAG00000002719	ENSCSAG00000002723	GLTP (ENSCSAG00000002726)	TRPV4 (ENSCSAG00000002730)	FAM222A (ENSCSAG00000002733)	MVK (ENSCSAG00000002738)	MMAB (ENSCSAG00000002741)	UBE3B (ENSCSAG00000002746)	KCTD10 (ENSCSAG00000002751) #22	MYO1H (ENSCSAG00000002767)	FOXN4 (ENSCSAG00000002781)	ACACB (ENSCSAG00000002837)	UNG (ENSCSAG00000002850)	ALKBH2 (ENSCSAG00000002853)	USP30 (ENSCSAG00000002855)	SVOP (ENSCSAG00000002859)	DAO (ENSCSAG00000002864)	CORO1C (ENSCSAG00000002869)	SELPLG (ENSCSAG00000002872)	TMEM119 (ENSCSAG00000018943)	ISCU (ENSCSAG00000002876)	SART3 (ENSCSAG00000002880)	FICD (ENSCSAG00000002883)	CMKLR1 (ENSCSAG00000002884)
Rhinopithecus	ANCESTRAL SPECIES	115	ENSGT00940000159986	ENSGT00950000183070.a.b.h.u	ENSGT00390000000999	ENSGT00490000044353	ENSGT00530000065303	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01100000263651	ENSGT00940000155182.b.g	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183120.e.b.a.a.b.b.a.b.b.k.a	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT01000000216272	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873
Golden snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	697	ATP2A2 (ENSRROG00000044524)	ENSRROG00000038691	IFT81 (ENSRROG00000003146)	ENSRROG00000040904	ENSRROG00000038996	ANKRD13A (ENSRROG00000036252)	GIT2 (ENSRROG00000036210)	ENSRROG00000037380	ENSRROG00000035721	TRPV4 (ENSRROG00000037783)	FAM222A (ENSRROG00000032261)	MVK (ENSRROG00000041682)	ENSRROG00000031525	MMAB (ENSRROG00000030329)	UBE3B (ENSRROG00000041392)	KCTD10 (ENSRROG00000035692) #22	MYO1H (ENSRROG00000041848)
Black snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	625	ATP2A2 (ENSRBIG00000035655)	ENSRBIG00000044643	IFT81 (ENSRBIG00000043921)	ENSRBIG00000029839	ENSRBIG00000030983	ANKRD13A (ENSRBIG00000032972)	GIT2 (ENSRBIG00000044798)	ENSRBIG00000016696	ENSRBIG00000030343	TRPV4 (ENSRBIG00000041929)	FAM222A (ENSRBIG00000032889)	MVK (ENSRBIG00000041853)	ENSRBIG00000040001	MMAB (ENSRBIG00000043142)	UBE3B (ENSRBIG00000043274)	KCTD10 (ENSRBIG00000043874) #22	MYO1H (ENSRBIG00000034585)	FOXN4 (ENSRBIG00000006043)	ACACB (ENSRBIG00000041570)	UNG (ENSRBIG00000040272)	ALKBH2 (ENSRBIG00000042275)	USP30 (ENSRBIG00000037750)	SVOP (ENSRBIG00000032661)	ENSRBIG00000007646	DAO (ENSRBIG00000032349)	SSH1 (ENSRBIG00000038990)	CORO1C (ENSRBIG00000029750)	SELPLG (ENSRBIG00000028083)	ISCU (ENSRBIG00000040097)	SART3 (ENSRBIG00000034143)	FICD (ENSRBIG00000033105)
Platyrrhini	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00910000147183	ENSGT00940000159986	ENSGT00390000000999	ENSGT00490000044353	ENSGT01050000245332	ENSGT00530000065303	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01100000263656	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873
Cebidae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00950000182950.D	ENSGT00940000159986	ENSGT00390000000999	ENSGT00490000044353	ENSGT01050000245332	ENSGT00530000065303	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01100000263656	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873
Cebidae_a	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00390000018018	ENSGT00950000182950.D	ENSGT00940000159986	ENSGT00390000000999	ENSGT00490000044353	ENSGT01050000245332	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01100000263656	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873	ENSGT01020000230438.C
Bolivian squirrel monkey	MODERN SPECIES	90	GPN3 (ENSSBOG00000018835)	ANAPC7 (ENSSBOG00000029412)	ATP2A2 (ENSSBOG00000035917)	IFT81 (ENSSBOG00000035096)	ENSSBOG00000022128	ENSSBOG00000026819	ANKRD13A (ENSSBOG00000024338)	GIT2 (ENSSBOG00000030824)	TCHP (ENSSBOG00000031158)	GLTP (ENSSBOG00000031645)	TRPV4 (ENSSBOG00000032479)	FAM222A (ENSSBOG00000035993)	MVK (ENSSBOG00000033485)	MMAB (ENSSBOG00000031585)	UBE3B (ENSSBOG00000021283)	KCTD10 (ENSSBOG00000036073) #22	MYO1H (ENSSBOG00000025728)	FOXN4 (ENSSBOG00000034585)	ACACB (ENSSBOG00000030895)	UNG (ENSSBOG00000027405)	ALKBH2 (ENSSBOG00000035955)	USP30 (ENSSBOG00000020721)	SVOP (ENSSBOG00000030817)	DAO (ENSSBOG00000019648)	SSH1 (ENSSBOG00000036026)	CORO1C (ENSSBOG00000022606)	SELPLG (ENSSBOG00000021697)	ISCU (ENSSBOG00000021034)	SART3 (ENSSBOG00000033093)	FICD (ENSSBOG00000034532)	CMKLR1 (ENSSBOG00000030650)
Capuchin	MODERN SPECIES	8	GPN3 (ENSCCAG00000020449)	ENSCCAG00000027141	ANAPC7 (ENSCCAG00000028880)	ATP2A2 (ENSCCAG00000034051)	IFT81 (ENSCCAG00000028684)	ENSCCAG00000007333	ANKRD13A (ENSCCAG00000037958)	GIT2 (ENSCCAG00000021510)	TCHP (ENSCCAG00000027565)	GLTP (ENSCCAG00000032136)	TRPV4 (ENSCCAG00000025742)	FAM222A (ENSCCAG00000030874)	MVK (ENSCCAG00000019252)	MMAB (ENSCCAG00000023532)	UBE3B (ENSCCAG00000027761)	KCTD10 (ENSCCAG00000016852) #22	MYO1H (ENSCCAG00000025555)	FOXN4 (ENSCCAG00000033436)	ACACB (ENSCCAG00000024948)	UNG (ENSCCAG00000029467)	ALKBH2 (ENSCCAG00000020322)	USP30 (ENSCCAG00000025760)	SVOP (ENSCCAG00000036126)	DAO (ENSCCAG00000014694)	SSH1 (ENSCCAG00000026307)	CORO1C (ENSCCAG00000020867)	SELPLG (ENSCCAG00000024315)	ISCU (ENSCCAG00000037188)	SART3 (ENSCCAG00000023667)	FICD (ENSCCAG00000019637)	CMKLR1 (ENSCCAG00000034028)
Marmoset	MODERN SPECIES	21	ENSCJAG00000086159	ENSCJAG00000077293	ATP2A2 (ENSCJAG00000009429)	IFT81 (ENSCJAG00000009518)	C12orf76 (ENSCJAG00000084530)	ANKRD13A (ENSCJAG00000009560)	GIT2 (ENSCJAG00000009631)	ENSCJAG00000009739	GLTP (ENSCJAG00000045394)	ENSCJAG00000076275	TRPV4 (ENSCJAG00000009767)	FAM222A (ENSCJAG00000063945)	MVK (ENSCJAG00000009849)	MMAB (ENSCJAG00000077406)	UBE3B (ENSCJAG00000009897)	KCTD10 (ENSCJAG00000042982) #22	MYO1H (ENSCJAG00000009995)	FOXN4 (ENSCJAG00000010010)	ACACB (ENSCJAG00000010041)	UNG (ENSCJAG00000010134)	ALKBH2 (ENSCJAG00000010151)	USP30 (ENSCJAG00000010157)	SVOP (ENSCJAG00000015499)	DAO (ENSCJAG00000015484)	SSH1 (ENSCJAG00000015460)	CORO1C (ENSCJAG00000015412)	SELPLG (ENSCJAG00000074914)	TMEM119 (ENSCJAG00000086609)	ENSCJAG00000015374	SART3 (ENSCJAG00000015330)	FICD (ENSCJAG00000015326)
Mas night monkey	MODERN SPECIES	844	ENSANAG00000023486	ANAPC7 (ENSANAG00000037722)	ENSANAG00000020932	ATP2A2 (ENSANAG00000025704)	IFT81 (ENSANAG00000029812)	ENSANAG00000033874	ANKRD13A (ENSANAG00000027221)	GIT2 (ENSANAG00000027209)	ENSANAG00000028609	GLTP (ENSANAG00000015518)	TRPV4 (ENSANAG00000036363)	FAM222A (ENSANAG00000035321)	MVK (ENSANAG00000029956)	MMAB (ENSANAG00000037069)	UBE3B (ENSANAG00000034137)	KCTD10 (ENSANAG00000002073) #22	MYO1H (ENSANAG00000023535)	FOXN4 (ENSANAG00000035296)	ACACB (ENSANAG00000035922)	UNG (ENSANAG00000001719)	ALKBH2 (ENSANAG00000028088)	USP30 (ENSANAG00000020712)	SVOP (ENSANAG00000019294)	DAO (ENSANAG00000022080)	SSH1 (ENSANAG00000022027)	CORO1C (ENSANAG00000008373)	ISCU (ENSANAG00000026058)	SART3 (ENSANAG00000025967)	FICD (ENSANAG00000026246)	CMKLR1 (ENSANAG00000028941)	ENSANAG00000032844
Atlantogenata	ANCESTRAL SPECIES	28					ENSGT00530000065303	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01100000264363	ENSGT01100000264494	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873
Xenarthra	ANCESTRAL SPECIES	335					ENSGT00530000065303	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01100000265807	ENSGT00580000082615	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430
Armadillo	MODERN SPECIES	3856								GIT2 (ENSDNOG00000012062)	ENSDNOG00000015102	ENSDNOG00000015091	TRPV4 (ENSDNOG00000002655)	FAM222A (ENSDNOG00000041266)	MVK (ENSDNOG00000043888)	MMAB (ENSDNOG00000031051)	UBE3B (ENSDNOG00000007628)	KCTD10 (ENSDNOG00000007621) #22	ENSDNOG00000043516
Sloth	MODERN SPECIES	6178																KCTD10 (ENSCHOG00000007211) #22	MYO1H (ENSCHOG00000007164)
Afrotheria	ANCESTRAL SPECIES	61					ENSGT00530000065303	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01100000264363	ENSGT01100000264494	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873	ENSGT01020000230438.C
Tenrec	MODERN SPECIES	1280																KCTD10 (ENSETEG00000009866) #22
Afrotheria_a	ANCESTRAL SPECIES	58					ENSGT00530000065303	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01100000264363	ENSGT01100000264494	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873	ENSGT01020000230438.C
Hyrax	MODERN SPECIES	964														MMAB (ENSPCAG00000005720)	UBE3B (ENSPCAG00000005487)	KCTD10 (ENSPCAG00000005435) #22
Elephant	MODERN SPECIES	527	MAPK1 (ENSLAFG00000010050)	PPM1F (ENSLAFG00000017804)	TOP3B (ENSLAFG00000018671)	ENSLAFG00000018672	ENSLAFG00000030890	C12orf76 (ENSLAFG00000028115)	ANKRD13A (ENSLAFG00000006933)	GIT2 (ENSLAFG00000006931)	ENSLAFG00000006926	GLTP (ENSLAFG00000013411)	TRPV4 (ENSLAFG00000007885)	FAM222A (ENSLAFG00000007539)	MVK (ENSLAFG00000016775)	MMAB (ENSLAFG00000014679)	UBE3B (ENSLAFG00000014668)	KCTD10 (ENSLAFG00000012410) #22	MYO1H (ENSLAFG00000012406)	ENSLAFG00000031464	ACACB (ENSLAFG00000013516)	UNG (ENSLAFG00000013513)	ALKBH2 (ENSLAFG00000013508)	USP30 (ENSLAFG00000013502)	SVOP (ENSLAFG00000006815)	DAO (ENSLAFG00000006810)	SSH1 (ENSLAFG00000030502)	CORO1C (ENSLAFG00000008580)	ENSLAFG00000029844	ISCU (ENSLAFG00000007170)	SART3 (ENSLAFG00000007167)	FICD (ENSLAFG00000007165)	CMKLR1 (ENSLAFG00000018638)
Marsupialia	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000158425	ENSGT00940000154184.A	ENSGT00990000203589.a.a	ENSGT00940000156871	ENSGT00940000164250	ENSGT00530000065303	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01100000263651	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873
Marsupialia_b	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000158425	ENSGT00940000154184.A	ENSGT00990000203589.a.a	ENSGT00940000156871	ENSGT00940000164250	ENSGT00530000065303	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01100000263651	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488.d	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873
Diprotodontia	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000158425	ENSGT00940000154184.A	ENSGT00990000203589.a.a	ENSGT00940000156871	ENSGT00940000164250	ENSGT00530000065303	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01100000263651	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488.d	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873
Diprotodontia_a	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000158425	ENSGT00940000154184.A	ENSGT00990000203589.a.a	ENSGT00940000156871	ENSGT00940000164250	ENSGT00530000065303	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01100000263651	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488.d	ENSGT00440000039754	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873
koala	MODERN SPECIES	126													MVK (ENSPCIG00000002982)	MMAB (ENSPCIG00000031963)	UBE3B (ENSPCIG00000009946)	KCTD10 (ENSPCIG00000009949) #22	MYO1H (ENSPCIG00000035201)	ENSPCIG00000022560	ACACB (ENSPCIG00000013188)	UNG (ENSPCIG00000034505)	ALKBH2 (ENSPCIG00000022555)	ENSPCIG00000022553	USP30 (ENSPCIG00000022544)	SVOP (ENSPCIG00000022538)	DAO (ENSPCIG00000022533)	SSH1 (ENSPCIG00000022526)	CORO1C (ENSPCIG00000022518)	ENSPCIG00000022613	TMEM119 (ENSPCIG00000037285)	ISCU (ENSPCIG00000014105)	SART3 (ENSPCIG00000023889)
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Wallaby	MODERN SPECIES	1967															UBE3B (ENSMEUG00000015194)	KCTD10 (ENSMEUG00000015189) #22
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Common wall lizard	DUPLICATION
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Toxicofera	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000158067.b	ENSGT00940000157699	ENSGT00940000160048	ENSGT00940000154184.A.a	ENSGT00940000156871	ENSGT00940000164250	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01070000253990	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT01030000235326	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873
Elapidae	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00940000158067.b	ENSGT00940000157699	ENSGT00940000160048	ENSGT00940000154184.A.a	ENSGT00940000156871	ENSGT00940000164250	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01070000253990	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT01030000235326	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873
Elapidae_a	ANCESTRAL SPECIES	48	ENSGT00940000158067.b	ENSGT00940000157699	ENSGT00940000160048	ENSGT00940000154184.A.a	ENSGT00940000156871	ENSGT00940000164250	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01070000253990	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT01030000235326	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873
Acanthophiinae	ANCESTRAL SPECIES	46	ENSGT00940000157699	ENSGT00940000160048	ENSGT01010000228002	ENSGT00940000154184.A.a	ENSGT00940000156871	ENSGT00940000164250	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01070000253990	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT01030000235326	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873
Eastern brown snake	MODERN SPECIES	123	ENSPTXG00000019137	GRK3 (ENSPTXG00000019132)	CRYBB2 (ENSPTXG00000019129)	ENSPTXG00000019127	SGSM1 (ENSPTXG00000019123)	ENSPTXG00000019121	ANKRD13A (ENSPTXG00000019120)	GIT2 (ENSPTXG00000019119)	ENSPTXG00000019118	ENSPTXG00000019117	TRPV4 (ENSPTXG00000019116)	FAM222A (ENSPTXG00000019115)	MVK (ENSPTXG00000019114)	MMAB (ENSPTXG00000019113)	UBE3B (ENSPTXG00000019112)	KCTD10 (ENSPTXG00000019111) #22	MYO1H (ENSPTXG00000019109)	FOXN4 (ENSPTXG00000019108)	ACACB (ENSPTXG00000017816)	UNG (ENSPTXG00000017772)	ALKBH2 (ENSPTXG00000017771)	USP30 (ENSPTXG00000017770)	SVOP (ENSPTXG00000017769)	DAO (ENSPTXG00000017768)	SSH1 (ENSPTXG00000017767)	CORO1C (ENSPTXG00000017766)	ENSPTXG00000017765	TMEM119 (ENSPTXG00000017764)	ISCU (ENSPTXG00000017763)	SART3 (ENSPTXG00000017762)	FICD (ENSPTXG00000017760)
Mainland tiger snake	MODERN SPECIES	254	SEZ6L (ENSNSUG00000018632)	MYO18B (ENSNSUG00000018444)	GRK3 (ENSNSUG00000018443)	ENSNSUG00000018416	SGSM1 (ENSNSUG00000018356)	ENSNSUG00000018255	ANKRD13A (ENSNSUG00000018254)	GIT2 (ENSNSUG00000018180)	ENSNSUG00000018179	GLTP (ENSNSUG00000018178)	TRPV4 (ENSNSUG00000018177)	FAM222A (ENSNSUG00000018176)	MVK (ENSNSUG00000018173)	MMAB (ENSNSUG00000018172)	UBE3B (ENSNSUG00000018029)	KCTD10 (ENSNSUG00000018028) #22	MYO1H (ENSNSUG00000018027)	FOXN4 (ENSNSUG00000018026)	ACACB (ENSNSUG00000018025)	ENSNSUG00000018024	UNG (ENSNSUG00000018023)	ALKBH2 (ENSNSUG00000018022)	USP30 (ENSNSUG00000018021)	SVOP (ENSNSUG00000018020)	DAO (ENSNSUG00000018019)	SSH1 (ENSNSUG00000018018)	ENSNSUG00000018017	TMEM119 (ENSNSUG00000018016)	ISCU (ENSNSUG00000018015)	SART3 (ENSNSUG00000018014)	FICD (ENSNSUG00000018013)
Blue-lipped sea krait	MODERN SPECIES	199	ENSLLTG00000018356	GRK3 (ENSLLTG00000018348)	CRYBB2 (ENSLLTG00000018345)	KIAA1671 (ENSLLTG00000018344)	SGSM1 (ENSLLTG00000018334)	ENSLLTG00000018330	ANKRD13A (ENSLLTG00000018329)	GIT2 (ENSLLTG00000018327)	ENSLLTG00000018326	GLTP (ENSLLTG00000018324)	TRPV4 (ENSLLTG00000018323)	FAM222A (ENSLLTG00000018321)	MVK (ENSLLTG00000018320)	MMAB (ENSLLTG00000018319)	UBE3B (ENSLLTG00000018304)	KCTD10 (ENSLLTG00000018295) #22	MYO1H (ENSLLTG00000018292)	FOXN4 (ENSLLTG00000018289)	ACACB (ENSLLTG00000001762)	UNG (ENSLLTG00000001148)	ALKBH2 (ENSLLTG00000001122)	USP30 (ENSLLTG00000001087)	SVOP (ENSLLTG00000001056)	DAO (ENSLLTG00000001037)	SSH1 (ENSLLTG00000000983)	CORO1C (ENSLLTG00000000957)	ENSLLTG00000000953	TMEM119 (ENSLLTG00000000945)	ISCU (ENSLLTG00000000938)	SART3 (ENSLLTG00000000908)	FICD (ENSLLTG00000000895)
Indian cobra	MODERN SPECIES	16	GRK3 (ENSNNAG00000011305)	CRYBB2 (ENSNNAG00000012707)	ENSNNAG00000012735	ENSNNAG00000012794	SGSM1 (ENSNNAG00000012831)	ENSNNAG00000012922	ANKRD13A (ENSNNAG00000013169)	GIT2 (ENSNNAG00000013212)	ENSNNAG00000013237	GLTP (ENSNNAG00000013275)	TRPV4 (ENSNNAG00000013361)	FAM222A (ENSNNAG00000003804)	MVK (ENSNNAG00000003817)	MMAB (ENSNNAG00000003833)	UBE3B (ENSNNAG00000004102)	KCTD10 (ENSNNAG00000006403) #22	MYO1H (ENSNNAG00000006423)	FOXN4 (ENSNNAG00000006523)	ACACB (ENSNNAG00000007254)	UNG (ENSNNAG00000017178)	ALKBH2 (ENSNNAG00000017184)	USP30 (ENSNNAG00000017191)	SVOP (ENSNNAG00000017229)	DAO (ENSNNAG00000017368)	SSH1 (ENSNNAG00000017377)	CORO1C (ENSNNAG00000017394)	ENSNNAG00000017401	TMEM119 (ENSNNAG00000017405)	ISCU (ENSNNAG00000017410)	SART3 (ENSNNAG00000017417)	FICD (ENSNNAG00000017428)
tuatara	MODERN SPECIES	327	ENSSPUG00000008262	LHFPL7 (ENSSPUG00000008272)	SGSM1 (ENSSPUG00000008317)	ENSSPUG00000008553	ENSSPUG00000008567	ENSSPUG00000008572	ENSSPUG00000008576	ENSSPUG00000008583	GIT2 (ENSSPUG00000008597)	ENSSPUG00000008633	GLTP (ENSSPUG00000008646)	TRPV4 (ENSSPUG00000008671)	MVK (ENSSPUG00000008799)	MMAB (ENSSPUG00000008863)	UBE3B (ENSSPUG00000008967)	KCTD10 (ENSSPUG00000009055) #22	ENSSPUG00000009073	FOXN4 (ENSSPUG00000009130)	ACACB (ENSSPUG00000009153)	UNG (ENSSPUG00000009192)	ALKBH2 (ENSSPUG00000009212)	USP30 (ENSSPUG00000009231)	SVOP (ENSSPUG00000009286)	ENSSPUG00000009343	ENSSPUG00000009461	ENSSPUG00000009487	ENSSPUG00000009500	CORO1C (ENSSPUG00000009504)	ENSSPUG00000009516	ISCU (ENSSPUG00000009521)	SART3 (ENSSPUG00000009541)
Archelosauria	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000154184.A	ENSGT00990000211938	ENSGT00940000156871	ENSGT00940000164250	ENSGT01020000230750	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01070000253990	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00940000182586	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00930000151526	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT01030000235326	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107
Cryptodira	ANCESTRAL SPECIES	28	ENSGT00940000160048	ENSGT00940000158425	ENSGT00940000154184.A	ENSGT00940000156871	ENSGT00940000164250	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01070000253990	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00940000182586	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT01030000235326	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873
Chinese turtle	MODERN SPECIES	1320													ENSPSIG00000000758	MVK (ENSPSIG00000004674)	UBE3B (ENSPSIG00000004899)	KCTD10 (ENSPSIG00000005203) #22	MYO1H (ENSPSIG00000005256)	ENSPSIG00000004731	FOXN4 (ENSPSIG00000004744)	ACACB (ENSPSIG00000004813)	UNG (ENSPSIG00000006190)	ALKBH2 (ENSPSIG00000006219)	USP30 (ENSPSIG00000006276)	ENSPSIG00000006717	ENSPSIG00000006782	DAO (ENSPSIG00000006798)
Testudinoidea	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00940000158425	ENSGT00940000154184.A	ENSGT00960000189129	ENSGT00940000156871	ENSGT00940000164250	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01070000253990	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00940000182586	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00940000163343	ENSGT01030000235326	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107
Testudinidae	ANCESTRAL SPECIES	32	ENSGT00940000160048	ENSGT00940000158425	ENSGT00940000154184.A	ENSGT00960000189129	ENSGT00940000156871	ENSGT00940000164250	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01070000253990	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00940000163343	ENSGT01030000235326	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107
Goode s thornscrub tortoise	MODERN SPECIES	4	GRK3 (ENSGEVG00005012354)	CRYBB2 (ENSGEVG00005012418)	CRYBB3 (ENSGEVG00005012608)	ENSGEVG00005012660	SGSM1 (ENSGEVG00005012705)	ENSGEVG00005013184	ANKRD13A (ENSGEVG00005013546)	GIT2 (ENSGEVG00005013595)	ENSGEVG00005013691	GLTP (ENSGEVG00005013725)	TRPV4 (ENSGEVG00005013749)	FAM222A (ENSGEVG00005013881)	MVK (ENSGEVG00005013904)	MMAB (ENSGEVG00005013934)	UBE3B (ENSGEVG00005013968)	KCTD10 (ENSGEVG00005014015) #22	MYO1H (ENSGEVG00005014056)	FOXN4 (ENSGEVG00005014484)	ACACB (ENSGEVG00005015458)	UNG (ENSGEVG00005019856)	ALKBH2 (ENSGEVG00005019860)	USP30 (ENSGEVG00005019866)	SVOP (ENSGEVG00005019876)	ENSGEVG00005019889	SSH1 (ENSGEVG00005019895)	CORO1C (ENSGEVG00005019908)	ZBED2 (ENSGEVG00005019912)	ENSGEVG00005019915	TMEM119 (ENSGEVG00005019918)	ISCU (ENSGEVG00005019926)	SART3 (ENSGEVG00005019931)
Abingdon island giant tortoise	MODERN SPECIES	2324						ENSCABG00000022081	ANKRD13A (ENSCABG00000022082)	GIT2 (ENSCABG00000000202)	ENSCABG00000000309	GLTP (ENSCABG00000000364)	TRPV4 (ENSCABG00000000374)	FAM222A (ENSCABG00000000414)	MVK (ENSCABG00000000438)	MMAB (ENSCABG00000000466)	UBE3B (ENSCABG00000000574)	KCTD10 (ENSCABG00000000589) #22	MYO1H (ENSCABG00000000597)	FOXN4 (ENSCABG00000000608)	ENSCABG00000000618	ENSCABG00000000631	UNG (ENSCABG00000000635)	ALKBH2 (ENSCABG00000000641)	USP30 (ENSCABG00000000647)	SVOP (ENSCABG00000000654)	DAO (ENSCABG00000000666)	SSH1 (ENSCABG00000000766)	CORO1C (ENSCABG00000000872)	ZBED2 (ENSCABG00000000877)	ENSCABG00000000878	TMEM119 (ENSCABG00000000882)	ISCU (ENSCABG00000000884)
Emydidae	ANCESTRAL SPECIES	37	ENSGT00940000158425	ENSGT00940000154184.A	ENSGT00960000189129	ENSGT00940000156871	ENSGT00940000164250	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01070000253990	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00940000182586	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00940000163343	ENSGT01030000235326	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107
Three-toed box turtle	MODERN SPECIES	109	CRYBB3 (ENSTMTG00000015332)	ENSTMTG00000015345	ENSTMTG00000015361	SGSM1 (ENSTMTG00000015387)	ENSTMTG00000015534	ENSTMTG00000015556	ANKRD13A (ENSTMTG00000015738)	GIT2 (ENSTMTG00000015777)	ENSTMTG00000015882	GLTP (ENSTMTG00000015904)	TRPV4 (ENSTMTG00000015925)	FAM222A (ENSTMTG00000015972)	MVK (ENSTMTG00000015986)	MMAB (ENSTMTG00000016005)	UBE3B (ENSTMTG00000016032)	KCTD10 (ENSTMTG00000016086) #22	MYO1H (ENSTMTG00000016102)	FOXN4 (ENSTMTG00000016170)	ACACB (ENSTMTG00000016805)	UNG (ENSTMTG00000021932)	ALKBH2 (ENSTMTG00000021934)	USP30 (ENSTMTG00000021940)	SVOP (ENSTMTG00000021949)	DAO (ENSTMTG00000021954)	SSH1 (ENSTMTG00000021960)	CORO1C (ENSTMTG00000021966)	ZBED2 (ENSTMTG00000021973)	ENSTMTG00000021975	TMEM119 (ENSTMTG00000021979)	SART3 (ENSTMTG00000021985)	FICD (ENSTMTG00000022006)
painted turtle	MODERN SPECIES	2406	ENSCPBG00000021581	ENSCPBG00000021579	ENSCPBG00000021578	SGSM1 (ENSCPBG00000021575)	ENSCPBG00000021572	ANKRD13A (ENSCPBG00000021568)	GIT2 (ENSCPBG00000021563)	ENSCPBG00000021561	GLTP (ENSCPBG00000021559)	TRPV4 (ENSCPBG00000021542)	FAM222A (ENSCPBG00000021539)	ENSCPBG00000021536	ENSCPBG00000021533	MMAB (ENSCPBG00000021529)	UBE3B (ENSCPBG00000021527)	KCTD10 (ENSCPBG00000021524) #22	MYO1H (ENSCPBG00000021522)	FOXN4 (ENSCPBG00000021520)	ACACB (ENSCPBG00000008093)	UNG (ENSCPBG00000006835)	ALKBH2 (ENSCPBG00000006832)	USP30 (ENSCPBG00000006824)	SVOP (ENSCPBG00000006813)	DAO (ENSCPBG00000006802)	SSH1 (ENSCPBG00000006788)	ZBED2 (ENSCPBG00000006777)	CORO1C (ENSCPBG00000006748)	TMEM119 (ENSCPBG00000006725)	ISCU (ENSCPBG00000006718)	SART3 (ENSCPBG00000006699)	FICD (ENSCPBG00000006689)
Archosauria	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000158425	ENSGT00940000154184.A	ENSGT00990000211938	ENSGT00940000156871	ENSGT00940000164250	ENSGT01020000230750	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01100000263656	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00930000151526	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT01030000235326	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107
Australian saltwater crocodile	MODERN SPECIES	40	CDK2AP1 (ENSCPRG00005017247)	MTRFR (ENSCPRG00005017244)	MPHOSPH9 (ENSCPRG00005017209)	PITPNM2 (ENSCPRG00005017186)	ARL6IP4 (ENSCPRG00005017177)	OGFOD2 (ENSCPRG00005017172)	ENSCPRG00005017166	ABCB9 (ENSCPRG00005017161)	VPS37B (ENSCPRG00005017158)	HIP1R (ENSCPRG00005016802)	CCDC62 (ENSCPRG00005016649)	FAM222A (ENSCPRG00005016647)	MVK (ENSCPRG00005016641)	MMAB (ENSCPRG00005016630)	UBE3B (ENSCPRG00005016619)	KCTD10 (ENSCPRG00005016612) #22	MYO1H (ENSCPRG00005016606)	FOXN4 (ENSCPRG00005016595)	ACACB (ENSCPRG00005015840)	UNG (ENSCPRG00005015626)	ALKBH2 (ENSCPRG00005015623)	USP30 (ENSCPRG00005015620)	SVOP (ENSCPRG00005015613)	DAO (ENSCPRG00005015607)	SSH1 (ENSCPRG00005015592)	CORO1C (ENSCPRG00005015584)	TMEM119 (ENSCPRG00005015580)	ISCU (ENSCPRG00005015579)	SART3 (ENSCPRG00005015574)	FICD (ENSCPRG00005015570)	CMKLR1 (ENSCPRG00005015568)
Aves	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000158425	ENSGT00940000154184.A	ENSGT00990000211938	ENSGT00940000156871	ENSGT00940000164250	ENSGT01020000230750	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01030000235484	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00930000151526	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT01030000235326	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107
African ostrich	MODERN SPECIES	891													MVK (ENSSCUG00000012839)	MMAB (ENSSCUG00000012849)	UBE3B (ENSSCUG00000012854)	KCTD10 (ENSSCUG00000012864) #22	MYO1H (ENSSCUG00000012868)	FOXN4 (ENSSCUG00000012873)	ACACB (ENSSCUG00000013060)	UNG (ENSSCUG00000013306)	ALKBH2 (ENSSCUG00000013310)	USP30 (ENSSCUG00000013315)	SVOP (ENSSCUG00000013318)	DAO (ENSSCUG00000013321)	SSH1 (ENSSCUG00000013322)	CORO1C (ENSSCUG00000013325)	SART3 (ENSSCUG00000013351)	FICD (ENSSCUG00000013367)	CMKLR1 (ENSSCUG00000013371)
Neognathae	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000158425	ENSGT00940000154184.A	ENSGT00990000211938	ENSGT00940000156871	ENSGT00940000164250	ENSGT01020000230750	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01030000235484	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00930000151526	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT01030000235326	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107
Galloanserae	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000160048	ENSGT00940000158425	ENSGT00940000154184.A	ENSGT00940000156871	ENSGT00940000164250	ENSGT01020000230750	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01030000235484	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT01030000235326	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873
Anatidae	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00940000157699	ENSGT00940000160048	ENSGT00940000158425	ENSGT00940000154184.A	ENSGT00940000156871	ENSGT00940000164250	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01030000235484	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873	ENSGT01020000230438.C
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Duck	MODERN SPECIES	7	GRK3 (ENSAPLG00000010529)	CRYBB2 (ENSAPLG00000010294)	ENSAPLG00000018309	ENSAPLG00000018339	SGSM1 (ENSAPLG00000009722)	ENSAPLG00000007491	ANKRD13A (ENSAPLG00000007138)	GIT2 (ENSAPLG00000006006)	ENSAPLG00000005875	GLTP (ENSAPLG00000027969)	TRPV4 (ENSAPLG00000005295)	FAM222A (ENSAPLG00000019911)	MVK (ENSAPLG00000005266)	MMAB (ENSAPLG00000005263)	UBE3B (ENSAPLG00000004427)	KCTD10 (ENSAPLG00000028654) #22	MYO1H (ENSAPLG00000003020)	FOXN4 (ENSAPLG00000002586)	ACACB (ENSAPLG00000015224)	UNG (ENSAPLG00000015120)	ALKBH2 (ENSAPLG00000015118)	USP30 (ENSAPLG00000015086)	SVOP (ENSAPLG00000004265)	DAO (ENSAPLG00000018816)	SSH1 (ENSAPLG00000005232)	TMEM119 (ENSAPLG00000022467)	ISCU (ENSAPLG00000006183)	SART3 (ENSAPLG00000006205)	FICD (ENSAPLG00000002137)	CMKLR1 (ENSAPLG00000002139)	ENSAPLG00000021891
Phasianidae	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000160048	ENSGT00940000158425	ENSGT00940000154184.A	ENSGT00940000156871	ENSGT00940000164250	ENSGT01020000230750	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01030000235484	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT01030000235326	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873
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Turkey	MODERN SPECIES	8	ENSMGAG00000008439	ENSMGAG00000018067	ENSMGAG00000008461	ENSMGAG00000008453	ENSMGAG00000022760	ENSMGAG00000008538	ENSMGAG00000008537	ENSMGAG00000008591	ENSMGAG00000008651	ENSMGAG00000008574	ENSMGAG00000008583	ENSMGAG00000008625	MVK (ENSMGAG00000006312)	MMAB (ENSMGAG00000006293)	UBE3B (ENSMGAG00000006245)	KCTD10 (ENSMGAG00000006233) #22	MYO1H (ENSMGAG00000006137)	FOXN4 (ENSMGAG00000006116)	UNG (ENSMGAG00000005991)	ALKBH2 (ENSMGAG00000005978)	USP30 (ENSMGAG00000005958)	SVOP (ENSMGAG00000005923)	DAO (ENSMGAG00000005897)	SSH1 (ENSMGAG00000005877)	CORO1C (ENSMGAG00000005787)	ENSMGAG00000018442	TMEM119 (ENSMGAG00000005784)	ISCU (ENSMGAG00000018993)	SART3 (ENSMGAG00000005746)	FICD (ENSMGAG00000005737)	CMKLR1 (ENSMGAG00000015475)
Chicken	MODERN SPECIES	6	CRYBB3 (ENSGALG00010021174)	KIAA1671 (ENSGALG00010021167)	SGSM1 (ENSGALG00010021141)	ENSGALG00010021834	ENSGALG00010021823	ANKRD13A (ENSGALG00010021810)	GIT2 (ENSGALG00010021783)	ENSGALG00010021769	GLTP (ENSGALG00010021041)	TRPV4 (ENSGALG00010020674)	FAM222A (ENSGALG00010021764)	MVK (ENSGALG00010021727)	MMAB (ENSGALG00010021715)	ENSGALG00010026684	UBE3B (ENSGALG00010021595)	KCTD10 (ENSGALG00010021580) #22	MYO1H (ENSGALG00010021559)	FOXN4 (ENSGALG00010021500)	ACACB (ENSGALG00010021490)	UNG (ENSGALG00010021483)	ALKBH2 (ENSGALG00010021476)	USP30 (ENSGALG00010021458)	SVOP (ENSGALG00010022628)	DAO (ENSGALG00010022614)	SSH1 (ENSGALG00010022559)	TMEM119 (ENSGALG00010022533)	ISCU (ENSGALG00010022525)	CORO1C (ENSGALG00010022497)	SART3 (ENSGALG00010022467)	FICD (ENSGALG00010022441)	CMKLR1 (ENSGALG00010022421)
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Passeriformes_g	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000160048	ENSGT00940000158425	ENSGT00940000154184.A	ENSGT00940000156871	ENSGT00940000164250	ENSGT01020000230750	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01030000235484	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT01030000235326	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873
Passeroidea	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000160048	ENSGT00940000158425	ENSGT00940000154184.A	ENSGT00940000156871	ENSGT00940000164250	ENSGT01020000230750	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01030000235484	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT01030000235326	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873
Common canary	MODERN SPECIES	18	CRYBB2 (ENSSCAG00000005664)	CRYBB3 (ENSSCAG00000005670)	KIAA1671 (ENSSCAG00000005677)	SGSM1 (ENSSCAG00000005694)	ENSSCAG00000005739	ENSSCAG00000005918	ANKRD13A (ENSSCAG00000005923)	GIT2 (ENSSCAG00000005937)	ENSSCAG00000005957	GLTP (ENSSCAG00000005960)	TRPV4 (ENSSCAG00000006006)	FAM222A (ENSSCAG00000006271)	MVK (ENSSCAG00000006276)	MMAB (ENSSCAG00000006293)	UBE3B (ENSSCAG00000006304)	KCTD10 (ENSSCAG00000006321) #22	MYO1H (ENSSCAG00000006330)	FOXN4 (ENSSCAG00000006350)	ACACB (ENSSCAG00000006443)	ALKBH2 (ENSSCAG00000006904)	USP30 (ENSSCAG00000006907)	SVOP (ENSSCAG00000006948)	DAO (ENSSCAG00000007148)	SSH1 (ENSSCAG00000007153)	CORO1C (ENSSCAG00000007162)	TMEM119 (ENSSCAG00000007169)	ISCU (ENSSCAG00000007177)	ENSSCAG00000007187	FICD (ENSSCAG00000007193)	CMKLR1 (ENSSCAG00000007198)	WSCD2 (ENSSCAG00000007204)
Zebra finch	MODERN SPECIES	6	GRK3 (ENSTGUG00000007559)	CRYBB2 (ENSTGUG00000007542)	CRYBB3 (ENSTGUG00000028127)	KIAA1671 (ENSTGUG00000024957)	SGSM1 (ENSTGUG00000007521)	ENSTGUG00000007504	ANKRD13A (ENSTGUG00000007473)	GIT2 (ENSTGUG00000007438)	ENSTGUG00000007435	GLTP (ENSTGUG00000007421)	TRPV4 (ENSTGUG00000007398)	FAM222A (ENSTGUG00000027719)	MVK (ENSTGUG00000007371)	MMAB (ENSTGUG00000007359)	UBE3B (ENSTGUG00000007321)	KCTD10 (ENSTGUG00000007316) #22	MYO1H (ENSTGUG00000007247)	FOXN4 (ENSTGUG00000007235)	ACACB (ENSTGUG00000007071)	UNG (ENSTGUG00000007069)	ALKBH2 (ENSTGUG00000007068)	USP30 (ENSTGUG00000007057)	SVOP (ENSTGUG00000007030)	DAO (ENSTGUG00000007011)	SSH1 (ENSTGUG00000006998)	CORO1C (ENSTGUG00000006956)	ENSTGUG00000020580	TMEM119 (ENSTGUG00000006954)	ISCU (ENSTGUG00000006939)	SART3 (ENSTGUG00000006905)	FICD (ENSTGUG00000023805)
Medium ground finch	MODERN SPECIES	65												FAM222A (ENSGFOG00000010298)	MVK (ENSGFOG00000010261)	MMAB (ENSGFOG00000010249)	UBE3B (ENSGFOG00000010228)	KCTD10 (ENSGFOG00000010218) #22	MYO1H (ENSGFOG00000010200)	FOXN4 (ENSGFOG00000010185)	ACACB (ENSGFOG00000009687)	UNG (ENSGFOG00000009651)	ALKBH2 (ENSGFOG00000009637)	USP30 (ENSGFOG00000009621)	SVOP (ENSGFOG00000009602)	DAO (ENSGFOG00000009558)	SSH1 (ENSGFOG00000009536)	CORO1C (ENSGFOG00000009527)	TMEM119 (ENSGFOG00000009521)	SART3 (ENSGFOG00000009387)	FICD (ENSGFOG00000009356)	CMKLR1 (ENSGFOG00000009348)	WSCD2 (ENSGFOG00000009343)
Flycatcher	MODERN SPECIES	6	CRYBB2 (ENSFALG00000008627)	CRYBB3 (ENSFALG00000008638)	KIAA1671 (ENSFALG00000008641)	SGSM1 (ENSFALG00000008643)	ENSFALG00000008657	ENSFALG00000028453	ANKRD13A (ENSFALG00000008673)	GIT2 (ENSFALG00000008693)	ENSFALG00000026179	GLTP (ENSFALG00000008709)	TRPV4 (ENSFALG00000008717)	FAM222A (ENSFALG00000008729)	MVK (ENSFALG00000008730)	MMAB (ENSFALG00000008651)	UBE3B (ENSFALG00000008734)	KCTD10 (ENSFALG00000028590) #22	MYO1H (ENSFALG00000008743)	FOXN4 (ENSFALG00000008767)	ACACB (ENSFALG00000008802)	UNG (ENSFALG00000008843)	ALKBH2 (ENSFALG00000008845)	USP30 (ENSFALG00000008848)	SVOP (ENSFALG00000008855)	DAO (ENSFALG00000008856)	SSH1 (ENSFALG00000008860)	CORO1C (ENSFALG00000008863)	TMEM119 (ENSFALG00000008871)	ISCU (ENSFALG00000024300)	ENSFALG00000008894	FICD (ENSFALG00000008911)	WSCD2 (ENSFALG00000008913)
Neognathae_c	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000158425	ENSGT00940000154184.A	ENSGT00990000211938	ENSGT00940000156871	ENSGT00940000164250	ENSGT01020000230750	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01030000235484	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT01030000235326	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873
Kakapo	MODERN SPECIES	3	CRYBB3 (ENSSHBG00005008290)	ENSSHBG00005008306	ENSSHBG00005008321	SGSM1 (ENSSHBG00005008401)	ENSSHBG00005008605	ENSSHBG00005008632	ANKRD13A (ENSSHBG00005008647)	GIT2 (ENSSHBG00005008968)	ENSSHBG00005016078	GLTP (ENSSHBG00005000634)	TRPV4 (ENSSHBG00005000637)	FAM222A (ENSSHBG00005000638)	MVK (ENSSHBG00005005547)	MMAB (ENSSHBG00005005574)	UBE3B (ENSSHBG00005005715)	KCTD10 (ENSSHBG00005006131) #22	MYO1H (ENSSHBG00005006183)	FOXN4 (ENSSHBG00005006248)	ACACB (ENSSHBG00005006324)	UNG (ENSSHBG00005006447)	ALKBH2 (ENSSHBG00005006463)	USP30 (ENSSHBG00005006489)	SVOP (ENSSHBG00005006520)	DAO (ENSSHBG00005006570)	SSH1 (ENSSHBG00005006682)	CORO1C (ENSSHBG00005007615)	ENSSHBG00005007629	TMEM119 (ENSSHBG00005007637)	ISCU (ENSSHBG00005007646)	SART3 (ENSSHBG00005007662)	FICD (ENSSHBG00005007694)
Golden eagle	MODERN SPECIES	25	CRYBB2 (ENSACCG00020010533)	CRYBB3 (ENSACCG00020010549)	ENSACCG00020010584	SGSM1 (ENSACCG00020010665)	ENSACCG00020010739	ENSACCG00020010757	ANKRD13A (ENSACCG00020010775)	GIT2 (ENSACCG00020010828)	ENSACCG00020010873	GLTP (ENSACCG00020010900)	TRPV4 (ENSACCG00020010933)	FAM222A (ENSACCG00020010975)	MVK (ENSACCG00020010986)	MMAB (ENSACCG00020011010)	UBE3B (ENSACCG00020011026)	KCTD10 (ENSACCG00020000357) #22	MYO1H (ENSACCG00020000400)	FOXN4 (ENSACCG00020000441)	ACACB (ENSACCG00020001508)	UNG (ENSACCG00020003065)	ALKBH2 (ENSACCG00020003078)	USP30 (ENSACCG00020003097)	SVOP (ENSACCG00020003238)	DAO (ENSACCG00020003460)	SSH1 (ENSACCG00020003483)	CORO1C (ENSACCG00020003525)	ENSACCG00020003559	TMEM119 (ENSACCG00020003575)	ISCU (ENSACCG00020003597)	SART3 (ENSACCG00020003624)	FICD (ENSACCG00020003661)
Anura	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00990000203589.a.a	ENSGT00940000156871	ENSGT00940000164250	ENSGT01020000230750	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01070000253990	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000153446.a.b.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000166398	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873	ENSGT00940000157433
Frog	MODERN SPECIES		tmem211 (ENSXETG00000031027)	sgsm1 (ENSXETG00000018672)	slc6a4l (ENSXETG00000018650)	ENSXETG00000039821	ankrd13a (ENSXETG00000018665)	git2 (ENSXETG00000018638)	tchp (ENSXETG00000018633)	gltp (ENSXETG00000018625)	ENSXETG00000043358	trpv4 (ENSXETG00000018609)	fam222a (ENSXETG00000018606)	mvk (ENSXETG00000018603)	mmab (ENSXETG00000040875)	aldh3b1 (ENSXETG00000018597)	ube3b (ENSXETG00000018590)	kctd10 (ENSXETG00000018588) #22	myo1h (ENSXETG00000018580)	foxn4 (ENSXETG00000018573)	ENSXETG00000038798	ENSXETG00000044235	acacb (ENSXETG00000022294)	ung (ENSXETG00000022298)	alkbh2 (ENSXETG00000036179)	usp30 (ENSXETG00000022301)	svop (ENSXETG00000022304)	dao (ENSXETG00000022308)	ssh1 (ENSXETG00000022310)	coro1c (ENSXETG00000022312)	tmem119 (ENSXETG00000042242)	iscu (ENSXETG00000027428)	sart3 (ENSXETG00000017645)
Leishan spiny toad	MODERN SPECIES		ENSLLEG00000003451	ENSLLEG00000000016	GIT2 (ENSLLEG00000000073)	ENSLLEG00000000243	ENSLLEG00000000288	GLTP (ENSLLEG00000000324)	ENSLLEG00000000380	TRPV4 (ENSLLEG00000000405)	ENSLLEG00000000502	ENSLLEG00000000507	FAM222A (ENSLLEG00000000521)	MVK (ENSLLEG00000000538)	MMAB (ENSLLEG00000000568)	ENSLLEG00000000643	UBE3B (ENSLLEG00000000833)	KCTD10 (ENSLLEG00000000887) #22	MYO1H (ENSLLEG00000000986)	ENSLLEG00000001062	FOXN4 (ENSLLEG00000001080)	ACACB (ENSLLEG00000001151)	ENSLLEG00000001601	ALKBH2 (ENSLLEG00000001658)	USP30 (ENSLLEG00000001682)	SVOP (ENSLLEG00000001751)	DAO (ENSLLEG00000001851)	SSH1 (ENSLLEG00000001873)	CORO1C (ENSLLEG00000001897)	TMEM119 (ENSLLEG00000001936)	ENSLLEG00000001948	SART3 (ENSLLEG00000001973)	FICD (ENSLLEG00000002010)
Coelacanth	MODERN SPECIES	1275												FAM222A (ENSLACG00000001908)	MVK (ENSLACG00000022614)	MMAB (ENSLACG00000009178)	UBE3B (ENSLACG00000009345)	KCTD10 (ENSLACG00000009858) #22	MYO1H (ENSLACG00000010226)	FOXN4 (ENSLACG00000011453)	ACACB (ENSLACG00000011626)	UNG (ENSLACG00000012496)	ALKBH2 (ENSLACG00000012552)	USP30 (ENSLACG00000012641)
Actinopterygii	ANCESTRAL SPECIES	51	ENSGT00390000018351	ENSGT00940000163530	ENSGT00940000156871	ENSGT00940000164250	ENSGT01020000230750	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01100000265807	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000166398	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00930000151526	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT01030000234989	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813	ENSGT00900000141107
Reedfish	MODERN SPECIES	9	srsf9 (ENSECRG00000018987)	gatc (ENSECRG00000018969)	triap1 (ENSECRG00000018949)	SGSM1 (ENSECRG00000018860)	slc6a4b (ENSECRG00000018685)	ankrd13a (ENSECRG00000018611)	git2a (ENSECRG00000018456)	gltpa (ENSECRG00000018386)	tchp (ENSECRG00000018338)	trpv4 (ENSECRG00000018296)	fam222aa (ENSECRG00000018269)	mvk (ENSECRG00000018235)	ENSECRG00000018193	mmab (ENSECRG00000018154)	ube3b (ENSECRG00000018075)	kctd10 (ENSECRG00000018009) #22	MYO1H (ENSECRG00000017851)	foxn4 (ENSECRG00000017741)	ACACB (ENSECRG00000017468)	UNG (ENSECRG00000017377)	alkbh2 (ENSECRG00000017355)	usp30 (ENSECRG00000017311)	SVOP (ENSECRG00000017098)	DAO (ENSECRG00000016551)	DAO (ENSECRG00000016473)	SSH1 (ENSECRG00000016416)	coro1ca (ENSECRG00000016362)	ENSECRG00000016348	ENSECRG00000016335	ENSECRG00000016321	iscub (ENSECRG00000016307)
Neopterygii	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00390000018351	ENSGT00940000163530	ENSGT00940000156871	ENSGT00940000164250	ENSGT01020000230750	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383	ENSGT01070000253909	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000166398	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00930000151526	ENSGT00940000156430	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133	ENSGT00940000156488	ENSGT01030000234989	ENSGT00390000017134	ENSGT00940000166908	ENSGT00390000015813
Spotted gar	MODERN SPECIES	659	ENSLOCG00000018145	srsf9 (ENSLOCG00000004044)	gatc (ENSLOCG00000004056)	triap1 (ENSLOCG00000004071)	SGSM1 (ENSLOCG00000004081)	slc6a4b (ENSLOCG00000004125)	ankrd13a (ENSLOCG00000004140)	git2a (ENSLOCG00000004167)	tchp (ENSLOCG00000004221)	gltpa (ENSLOCG00000004248)	trpv4 (ENSLOCG00000004262)	fam222aa (ENSLOCG00000004291)	mvk (ENSLOCG00000004323)	mmab (ENSLOCG00000004341)	ube3b (ENSLOCG00000004355)	kctd10 (ENSLOCG00000004391) #22	MYO1H (ENSLOCG00000004399)	foxn4 (ENSLOCG00000004428)	ACACB (ENSLOCG00000004439)	UNG (ENSLOCG00000004484)	alkbh2 (ENSLOCG00000004502)	usp30 (ENSLOCG00000004518)	SVOP (ENSLOCG00000004555)	dao.2 (ENSLOCG00000004565)	SSH1 (ENSLOCG00000004601)	coro1ca (ENSLOCG00000004623)	selplg (ENSLOCG00000004647)	TMEM119 (ENSLOCG00000004681)	ENSLOCG00000018146	iscub (ENSLOCG00000004690)	sart3 (ENSLOCG00000004710)
Osteoglossocephalai	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00390000018351	ENSGT00940000163530	ENSGT00940000156871	ENSGT00940000164250	ENSGT01020000230750	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383.a	ENSGT01070000253867	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B.a	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000166398	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430.a	ENSGT00940000158984	ENSGT00930000151526	ENSGT00940000156430.b	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133.a.a	ENSGT00940000156488.a.b	ENSGT01030000234989	ENSGT00940000156133.b	ENSGT00940000156488.b
Osteoglossiformes	ANCESTRAL SPECIES	47	ENSGT00390000018351	ENSGT00940000163530.j	ENSGT00940000156871	ENSGT00940000164250	ENSGT01020000230750	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383.a	ENSGT01070000253867	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B.a	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000166398	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430.a	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000003405	ENSGT00940000159009	ENSGT00550000075075	ENSGT00940000155403.a	ENSGT00390000018635.d	ENSGT00940000156133.a.a	ENSGT00940000156488.a.a.h	ENSGT00390000017134.a	ENSGT00940000166908	ENSGT00900000141107	ENSGT00390000008873	ENSGT01020000230438.C.g
P. kingsleyae	MODERN SPECIES	281	gatc (ENSPKIG00000024856)	triap1 (ENSPKIG00000024861)	SGSM1 (ENSPKIG00000024877)	slc6a4b (ENSPKIG00000024899)	ENSPKIG00000024909	ankrd13a (ENSPKIG00000024915)	ENSPKIG00000024930	ENSPKIG00000024941	gltpa (ENSPKIG00000024961)	trpv4 (ENSPKIG00000024969)	FAM222A (ENSPKIG00000024978)	mvk (ENSPKIG00000024989)	mmab (ENSPKIG00000025003)	ENSPKIG00000025015	ube3b (ENSPKIG00000025027)	kctd10 (ENSPKIG00000025041) #22	MYO1H (ENSPKIG00000025053)	foxn4 (ENSPKIG00000025067)	ACACB (ENSPKIG00000025081)	ENSPKIG00000025098	unga (ENSPKIG00000025102)	alkbh2 (ENSPKIG00000025109)	usp30 (ENSPKIG00000025113)	SVOP (ENSPKIG00000025126)	dao.2 (ENSPKIG00000025144)	SSH1 (ENSPKIG00000025155)	ENSPKIG00000025169	CORO1C (ENSPKIG00000025179)	ENSPKIG00000025194	ENSPKIG00000025198	sart3 (ENSPKIG00000025203)
Asian bonytongue	MODERN SPECIES	10	DNAH10 (ENSSFOG00015002188)	SRSF9 (ENSSFOG00015002476)	gatc (ENSSFOG00015002508)	SGSM1 (ENSSFOG00015002541)	slc6a4b (ENSSFOG00015002689)	ankrd13a (ENSSFOG00015002757)	git2a (ENSSFOG00015002827)	ENSSFOG00015002942	gltpa (ENSSFOG00015002948)	trpv4 (ENSSFOG00015002987)	fam222aa (ENSSFOG00015027425)	mvk (ENSSFOG00015003097)	mmab (ENSSFOG00015003159)	ENSSFOG00015003187	ube3b (ENSSFOG00015003210)	kctd10 (ENSSFOG00015003345) #22	MYO1H (ENSSFOG00015003385)	foxn4 (ENSSFOG00015003492)	ACACB (ENSSFOG00015003534)	unga (ENSSFOG00015003654)	alkbh2 (ENSSFOG00015003695)	usp30 (ENSSFOG00015003704)	SVOP (ENSSFOG00015003766)	dao.2 (ENSSFOG00015003835)	SSH1 (ENSSFOG00015003889)	CORO1C (ENSSFOG00015003910)	ENSSFOG00015003961	ENSSFOG00015033297	sart3 (ENSSFOG00015004012)	ficd (ENSSFOG00015004113)	CMKLR1 (ENSSFOG00015004129)
Clupeocephala	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000163900	ENSGT00390000018351	ENSGT00940000156871.o	ENSGT00940000164250	ENSGT01020000230750	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383.a	ENSGT01070000253909	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B.a	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000166398	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430.a	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00930000151526	ENSGT00940000156430.b	ENSGT00940000155403.b	ENSGT00940000156133.a.b	ENSGT00940000156488.a.a	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813.b.b	ENSGT01020000230438.C.f.b	ENSGT00390000014107.a.a	ENSGT00600000084860.B	ENSGT00940000162536	ENSGT00390000009387
Otomorpha	ANCESTRAL SPECIES	133	ENSGT00940000162007	ENSGT00390000018351	ENSGT00940000156871.o	ENSGT00940000164250	ENSGT01020000230750	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383.a	ENSGT01070000253909	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B.a	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000166398	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430.a	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049
Otophysi	ANCESTRAL SPECIES	67	ENSGT00940000162007	ENSGT00390000018351	ENSGT00940000156871.o	ENSGT00940000164250	ENSGT01020000230750	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383.a	ENSGT01070000253909	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B.a	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000166398	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430.a	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049
Characiphysae	ANCESTRAL SPECIES	239														ENSGT00940000166398	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430.a.a	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049
Channel catfish	MODERN SPECIES	14	pdlim5 (ENSIPUG00000023626)	EGFLAM (ENSIPUG00000023628)	slc1a3a (ENSIPUG00000000944)	lmbrd2a (ENSIPUG00000000959)	ENSIPUG00000000979	spef2 (ENSIPUG00000001003)	lifra (ENSIPUG00000001153)	ENSIPUG00000001183	GAK (ENSIPUG00000001211)	ugt2b5 (ENSIPUG00000001375)	tal2 (ENSIPUG00000002366)	ENSIPUG00000002371	ENSIPUG00000002392	ENSIPUG00000002429	ube3b (ENSIPUG00000002442)	KCTD10 (ENSIPUG00000002491) #22	MYO1H (ENSIPUG00000002523)	foxn4 (ENSIPUG00000002562)	ACACB (ENSIPUG00000002595)	ENSIPUG00000002690	ENSIPUG00000003111	MVK (ENSIPUG00000003127)	mmab (ENSIPUG00000003143)	ENSIPUG00000003154	ENSIPUG00000003182
Characiphysae_b	ANCESTRAL SPECIES	260														ENSGT00940000166398	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430.a.b	ENSGT00940000156430.a.a	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049
Characoidei	ANCESTRAL SPECIES	377														ENSGT00940000166398	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430.a.a	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049
Red-bellied piranha	MODERN SPECIES	911												ENSPNAG00000015842	ENSPNAG00000015843	ENSPNAG00000015862	ube3b (ENSPNAG00000015940)	kctd10 (ENSPNAG00000015966) #22	MYO1H (ENSPNAG00000016051)	foxn4 (ENSPNAG00000016157)	ACACB (ENSPNAG00000016321)
Mexicana tetra	MODERN SPECIES	196														ENSAMXG00000034498	ube3b (ENSAMXG00000043942)	kctd10 (ENSAMXG00000040336) #22	MYO1H (ENSAMXG00000006820)
Electric eel	MODERN SPECIES	1314															ube3b (ENSEEEG00000010733)	kctd10 (ENSEEEG00000010721) #22	ENSEEEG00000010719
Cyprinoidei	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000162007	ENSGT00390000018351	ENSGT00940000156871.o	ENSGT00940000164250	ENSGT01020000230750	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383.a	ENSGT01070000253909	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B.a	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000166398	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430.a	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00900000141033.a	ENSGT00940000161917	ENSGT00940000165775.a	ENSGT00940000154929.C	ENSGT00940000154929.A.b	ENSGT00940000159834	ENSGT00940000154389.b.r	ENSGT00950000183078.b.b	ENSGT00390000016767	ENSGT00390000004796	ENSGT00940000159487	ENSGT00390000002024
Cyprininae	DUPLICATION
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Goldfish	DUPLICATION
Goldfish	MODERN SPECIES	23	ENSCARG00000020430	fUBL (ENSCARG00000020429)	fUBL (ENSCARG00000020427)	ENSCARG00000020420	gatc (ENSCARG00000020415)	ENSCARG00000019932	slc6a4b (ENSCARG00000019721)	ankrd13a (ENSCARG00000019619)	git2a (ENSCARG00000018194)	gltpa (ENSCARG00000018149)	ENSCARG00000018146	trpv4 (ENSCARG00000015602)	fam222aa (ENSCARG00000015542)	ENSCARG00000015513	ube3b (ENSCARG00000015327)	kctd10 (ENSCARG00000015277) #22	MYO1H (ENSCARG00000015060)	foxn4 (ENSCARG00000015034)	RUSC2 (ENSCARG00000012128)	ENSCARG00000012119	ENSCARG00000012112	HIRA (ENSCARG00000011185)	ENSCARG00000011151	ascc2 (ENSCARG00000011076)	zdhhc8b (ENSCARG00000011039)	ENSCARG00000011032	HIRA (ENSCARG00000009648)	ENSCARG00000009583	ascc2 (ENSCARG00000009460)	ENSCARG00000009437	ENSCARG00000009426
Goldfish	MODERN SPECIES	23	ENSCARG00000021493	ENSCARG00000021497	ENSCARG00000021501	ENSCARG00000021509	ENSCARG00000021514	gatc (ENSCARG00000021519)	ENSCARG00000021562	slc6a4b (ENSCARG00000022013)	ankrd13a (ENSCARG00000022207)	git2a (ENSCARG00000022390)	gltpa (ENSCARG00000024476)	trpv4 (ENSCARG00000024671)	fam222aa (ENSCARG00000030460)	mvk (ENSCARG00000030469)	ube3b (ENSCARG00000030545)	kctd10 (ENSCARG00000030651) #22	foxn4 (ENSCARG00000031153)	RUSC2 (ENSCARG00000036584)	ENSCARG00000036664	ENSCARG00000036690	EIF4A1 (ENSCARG00000036703)	senp3a (ENSCARG00000036735)	plscr3a (ENSCARG00000036971)	phf23a (ENSCARG00000036987)	atp6v1aa (ENSCARG00000037026)	zdhhc23a (ENSCARG00000037327)	ENSCARG00000037347	znf703 (ENSCARG00000037387)	tia1l (ENSCARG00000037415)	dgcr8 (ENSCARG00000037754)	trmt2a (ENSCARG00000039562)
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	42	ENSGT00940000162007.hb.b	ENSGT00390000018351.a	ENSGT00940000162007.ib	ENSGT00390000018351.b.b	ENSGT00940000156871.o.b	ENSGT00940000164250.b	ENSGT00950000182928.A.b.o	ENSGT00940000156383.a.f	ENSGT01070000253909.b	ENSGT00940000155182.b.`b	ENSGT00940000158615.f	ENSGT00530000063811.B.a.b	ENSGT00950000183187.C.f	ENSGT00390000008432.j	ENSGT00940000156548.b	ENSGT00950000183143.c.a.a #22	ENSGT00940000156430.a.d	ENSGT00940000158984.g.a	ENSGT00940000155049.cb	ENSGT00900000141033.a.c	ENSGT00940000161917.g.a	ENSGT00940000165775.a.w	ENSGT00940000159834.k	ENSGT00940000154389.b.r	ENSGT00950000183078.b.b.g	ENSGT00390000016767.k.b	ENSGT00390000004796.b	ENSGT00390000002024.h	ENSGT00940000156044.g
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	229	pxmp2 (ENSSGRG00000030284)	ENSSGRG00000030285	gatc (ENSSGRG00000030287)	SGSM1 (ENSSGRG00000030291)	slc6a4b (ENSSGRG00000030296)	ankrd13a (ENSSGRG00000030297)	git2a (ENSSGRG00000030365)	tchp (ENSSGRG00000032088)	gltpa (ENSSGRG00000032089)	trpv4 (ENSSGRG00000032093)	fam222aa (ENSSGRG00000032317)	fam222aa (ENSSGRG00000032318)	mvk (ENSSGRG00000032319)	mmab (ENSSGRG00000032321)	ube3b (ENSSGRG00000032349)	kctd10 (ENSSGRG00000032931) #22	MYO1H (ENSSGRG00000032941)	foxn4 (ENSSGRG00000032946)	ACACB (ENSSGRG00000032961)	RUSC2 (ENSSGRG00000033878)	ENSSGRG00000033884	ENSSGRG00000033899	ranbp1 (ENSSGRG00000034039)	golga3 (ENSSGRG00000034042)	ankle2 (ENSSGRG00000034564)	pgam5 (ENSSGRG00000034567)	bri3bp (ENSSGRG00000034568)	bri3bp (ENSSGRG00000034569)	aacs (ENSSGRG00000034572)	ENSSGRG00000034614
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Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	312	ENSGT00940000161539.i	ENSGT00940000162007.hb.a	ENSGT00390000018351.b.a	ENSGT00940000156871.o.a	ENSGT00940000164250.a	ENSGT01020000230750	ENSGT00950000182928.A.b.p	ENSGT00940000156383.a.e	ENSGT01070000253909.a.a	ENSGT00940000155182.b.ab	ENSGT00940000158615.e	ENSGT00530000063811.B.a.a	ENSGT00950000183187.C.e	ENSGT00390000008432.i	ENSGT00940000156548.a	ENSGT00950000183143.c.a.b #22	ENSGT00940000156430.a.c	ENSGT00940000158984.g.b	ENSGT00940000155049.bb	ENSGT00900000141033.a.d	ENSGT00940000161917.g.b
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00940000161539.i	ENSGT00940000162007.hb.a	ENSGT00390000018351.b.a	ENSGT00940000156871.o.a	ENSGT00940000164250.a	ENSGT01020000230750	ENSGT00950000182928.A.b.p	ENSGT00940000156383.a.e	ENSGT01070000253909.a.a	ENSGT00940000155182.b.ab	ENSGT00940000158615.e	ENSGT00530000063811.B.a.a	ENSGT00950000183187.C.e	ENSGT00390000008432.i	ENSGT00940000156548.a	ENSGT00950000183143.c.a.b #22	ENSGT00940000156430.a.c	ENSGT00940000158984.g.b	ENSGT00940000155049.bb	ENSGT00900000141033.a.d	ENSGT00940000161917.g.b	ENSGT00940000165775.a.x	ENSGT00940000154929.C	ENSGT00940000154929.A.b	ENSGT00940000159834.l	ENSGT00940000154389.b.q	ENSGT00950000183078.b.b.h	ENSGT00390000016767.k.a	ENSGT00390000004796.a	ENSGT00940000159487	ENSGT00390000002024.g
Common carp reference	MODERN SPECIES	7	ENSCCRG00000035128	gatc (ENSCCRG00000037983)	ENSCCRG00000069046	slc6a4b (ENSCCRG00000034251)	ENSCCRG00000053853	ankrd13a (ENSCCRG00000034957)	ENSCCRG00000061557	git2a (ENSCCRG00000037153)	tchp (ENSCCRG00000037191)	gltpa (ENSCCRG00000082115)	trpv4 (ENSCCRG00000001658)	fam222aa (ENSCCRG00000071064)	mvk (ENSCCRG00000002111)	mmab (ENSCCRG00000051143)	ube3b (ENSCCRG00000051109)	kctd10 (ENSCCRG00000072714) #22	MYO1H (ENSCCRG00000050868)	foxn4 (ENSCCRG00000060761)	ACACB (ENSCCRG00000006517)	RUSC2 (ENSCCRG00000015357)	ENSCCRG00000017228	ENSCCRG00000015361	ATOSB (ENSCCRG00000015369)	ENSCCRG00000017628	golga3 (ENSCCRG00000016748)	ankle2 (ENSCCRG00000063019)	pgam5 (ENSCCRG00000079084)	poli (ENSCCRG00000022993)	bri3bp (ENSCCRG00000064889)	aacs (ENSCCRG00000073357)	TMEM132C (ENSCCRG00000051248)
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Goldfish	MODERN SPECIES	1771	pxmp2 (ENSCARG00000048952)	ENSCARG00000048980	ENSCARG00000049005	gatc (ENSCARG00000049027)	SGSM1 (ENSCARG00000049299)	slc6a4b (ENSCARG00000054346)	ankrd13a (ENSCARG00000054695)	git2a (ENSCARG00000055710)	tchp (ENSCARG00000056291)	gltpa (ENSCARG00000056310)	trpv4 (ENSCARG00000056533)	fam222aa (ENSCARG00000060000)	mvk (ENSCARG00000060017)	mmab (ENSCARG00000060081)	ube3b (ENSCARG00000060241)	kctd10 (ENSCARG00000050368) #22	MYO1H (ENSCARG00000050516)	foxn4 (ENSCARG00000051032)	ACACB (ENSCARG00000051819)	RUSC2 (ENSCARG00000065116)	ENSCARG00000065127	cebpd (ENSCARG00000065144)
Zebrafish	MODERN SPECIES	20	isg15 (ENSDARG00000086374)	gatc (ENSDARG00000056855)	SGSM1 (ENSDARG00000028857)	slc6a4b (ENSDARG00000057017)	ENSDARG00000095754	ankrd13a (ENSDARG00000061901)	git2a (ENSDARG00000061915)	tchp (ENSDARG00000035605)	gltpa (ENSDARG00000061921)	trpv4 (ENSDARG00000061941)	fam222aa (ENSDARG00000090797)	mvk (ENSDARG00000004130)	mmab (ENSDARG00000068344)	ENSDARG00000035606	ube3b (ENSDARG00000061960)	kctd10 (ENSDARG00000017115) #22	MYO1H (ENSDARG00000061968)	foxn4 (ENSDARG00000010591)	ACACB (ENSDARG00000061994)	ENSDARG00000095288	ENSDARG00000062040	ENSDARG00000017391	ENSDARG00000068650	ranbp1 (ENSDARG00000014817)	golga3 (ENSDARG00000062511)	ankle2 (ENSDARG00000035607)	pgam5 (ENSDARG00000035608)	poli (ENSDARG00000029250)	bri3bp (ENSDARG00000010108)	aacs (ENSDARG00000012468)	TMEM132C (ENSDARG00000062538)
Clupeiformes	DUPLICATION
Clupeiformes	ANCESTRAL SPECIES	197		ENSGT00390000018351	ENSGT00940000156871.o	ENSGT00940000164250	ENSGT01020000230750	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383.b.c	ENSGT01070000253909	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B.a	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000166398	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a.c #22	ENSGT00940000156430.a	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000016407	ENSGT00940000158982	ENSGT00390000018619	ENSGT00940000157242.a.a	ENSGT00530000067979	ENSGT00940000167385	ENSGT00940000166272	ENSGT00940000164944	ENSGT00940000166263	ENSGT00940000158491.a	ENSGT00940000153352.A	ENSGT00940000166675
Atlantic herring	MODERN SPECIES	23	ENSCHAG00000026072	ENSCHAG00000026074	ENSCHAG00000026077	TOP3B (ENSCHAG00000026088)	ppm1f (ENSCHAG00000026097)	mapk1 (ENSCHAG00000026107)	ypel1 (ENSCHAG00000026209)	ppil2 (ENSCHAG00000026220)	bri3bp (ENSCHAG00000026286)	aacs (ENSCHAG00000026295)	TMEM132C (ENSCHAG00000026336)	ENSCHAG00000026341	HIRA (ENSCHAG00000026348)	GAK (ENSCHAG00000026455)	ENSCHAG00000026987	kctd10 (ENSCHAG00000026991) #22	MYO1H (ENSCHAG00000027006)	foxn4 (ENSCHAG00000027053)	ACACB (ENSCHAG00000027473)	SKIC3 (ENSCHAG00000027845)	ENSCHAG00000027852	arsk (ENSCHAG00000027853)	nfu1 (ENSCHAG00000027854)	dnase2 (ENSCHAG00000027856)	stambpb (ENSCHAG00000027857)	ENSCHAG00000027858	ccn1l2 (ENSCHAG00000027859)	ENSCHAG00000000233	slc2a11b (ENSCHAG00000000277)	ENSCHAG00000000455	slc2a11b (ENSCHAG00000000598)
Denticle herring	MODERN SPECIES	2	gltpa (ENSDCDG00000013703)	tchp (ENSDCDG00000013710)	ENSDCDG00000014030	ankrd13a (ENSDCDG00000021088)	slc6a4b (ENSDCDG00000021566)	ENSDCDG00000024071	gatc (ENSDCDG00000024575)	wscd2 (ENSDCDG00000024576)	cmklr1 (ENSDCDG00000024580)	trpv4 (ENSDCDG00000024631)	fam222aa (ENSDCDG00000027188)	mvk (ENSDCDG00000027191)	mmab (ENSDCDG00000014516)	ENSDCDG00000014538	ube3b (ENSDCDG00000015260)	kctd10 (ENSDCDG00000015331) #22	foxn4 (ENSDCDG00000015337)	SKIC3 (ENSDCDG00000015426)	arsk (ENSDCDG00000015510)	nol6 (ENSDCDG00000015592)	aqp3a (ENSDCDG00000015998)	ENSDCDG00000016004	wdr54 (ENSDCDG00000016013)	rhobtb4 (ENSDCDG00000016062)	ENSDCDG00000016455	rtkna (ENSDCDG00000016465)	rmnd1 (ENSDCDG00000016505)	smn1 (ENSDCDG00000016567)	hspb11 (ENSDCDG00000016576)	mccc2 (ENSDCDG00000016627)	ENSDCDG00000016652
Clupeiformes	ANCESTRAL SPECIES	354													ENSGT00940000164626.b.b.c.a	ENSGT00940000155882.a.b.b	ENSGT00730000110943.B.d.b	ENSGT00950000183143.c.a.d #22	ENSGT00940000156430.b	ENSGT00940000155403.b	ENSGT00940000156133.a.b	ENSGT00940000156488.a.a	ENSGT01030000234989	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813.b.b	ENSGT00390000014107.a.a	ENSGT00600000084860.B	ENSGT00940000155826
Atlantic herring	MODERN SPECIES	3	ENSCHAG00000004106	ENSCHAG00000004255	ENSCHAG00000004307	ENSCHAG00000004352	ENSCHAG00000004703	ENSCHAG00000006150	ENSCHAG00000007958	ENSCHAG00000007979	ENSCHAG00000008006	ENSCHAG00000008143	ENSCHAG00000011333	ENSCHAG00000019269	ENSCHAG00000019283	hspb15 (ENSCHAG00000019294)	SUSD2 (ENSCHAG00000019298)	KCTD10 (ENSCHAG00000019473) #22	MYO1H (ENSCHAG00000019527)	UNG (ENSCHAG00000019834)	ENSCHAG00000019955	SSH1 (ENSCHAG00000020210)	ENSCHAG00000020265	ENSCHAG00000020535	rnf185 (ENSCHAG00000020553)	WSCD2 (ENSCHAG00000020564)	iscub (ENSCHAG00000020597)	tmem119b (ENSCHAG00000020619)	ENSCHAG00000020623	ENSCHAG00000020659	LZTS3 (ENSCHAG00000020669)	ENSCHAG00000020678	ENSCHAG00000020691
Denticle herring	MODERN SPECIES	13	ENSDCDG00000003706	ENSDCDG00000003708	ENSDCDG00000003827	stoml2 (ENSDCDG00000009758)	sec31a (ENSDCDG00000011197)	enoph1 (ENSDCDG00000021267)	hnrnpdl (ENSDCDG00000021270)	ENSDCDG00000021323	ENSDCDG00000021464	ENSDCDG00000026977	ENSDCDG00000028327	ENSDCDG00000028436	hspb15 (ENSDCDG00000028449)	SUSD2 (ENSDCDG00000028457)	ENSDCDG00000028483	KCTD10 (ENSDCDG00000028488) #22	MYO1H (ENSDCDG00000028532)	UNG (ENSDCDG00000029668)	ENSDCDG00000029743	SSH1 (ENSDCDG00000029748)	CORO1C (ENSDCDG00000029957)	ENSDCDG00000030327	TMEM119 (ENSDCDG00000030329)	iscub (ENSDCDG00000030330)	rnf185 (ENSDCDG00000030332)	ENSDCDG00000030337	YTHDC2 (ENSDCDG00000030349)	avp (ENSDCDG00000030510)	FASTKD5 (ENSDCDG00000030523)	LZTS3 (ENSDCDG00000030526)	ENSDCDG00000030532
Euteleosteomorpha	ANCESTRAL SPECIES	50		ENSGT00390000018351	ENSGT00940000156871.o	ENSGT00940000164250	ENSGT01020000230750	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383.a	ENSGT01070000253909	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B.a	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000166398	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430.a	ENSGT00940000158984	ENSGT00930000151526	ENSGT00940000156430.b	ENSGT00940000155403.b	ENSGT00940000156133.a.b	ENSGT00940000156488.a.a	ENSGT01030000234989.a	ENSGT00940000156133.b	ENSGT00940000156488.b	ENSGT00390000017134	ENSGT00390000015813.b.b	ENSGT01020000230438.C.f.b	ENSGT00390000014107.a.a	ENSGT00600000084860.B
Acanthomorphata	ANCESTRAL SPECIES	29		ENSGT00390000018351	ENSGT00940000156871.o	ENSGT00940000164250	ENSGT01020000230750	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383.a	ENSGT01070000253867	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B.a	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000166398	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00930000151526	ENSGT00940000156430.a	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000010194	ENSGT01020000230351.A	ENSGT00390000002626	ENSGT00950000182923.C.a	ENSGT00940000158190	ENSGT00940000161922	ENSGT00940000160448	ENSGT00500000045140.a.b	ENSGT00940000164243	ENSGT00840000129953	ENSGT00530000063509.B
Euacanthomorphacea	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000162007	ENSGT00390000018351	ENSGT00940000156871.o	ENSGT00940000164250	ENSGT01020000230750	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383.a	ENSGT01070000253867	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B.a	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000166398	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00930000151526	ENSGT00940000156430.a	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000010194	ENSGT01020000230351.A	ENSGT00390000002626	ENSGT00950000182923.C.a	ENSGT00940000158190	ENSGT00940000161922	ENSGT00940000160448	ENSGT00500000045140.a.b	ENSGT00940000164243	ENSGT00840000129953	ENSGT00530000063509.B
Percomorphaceae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000162007	ENSGT00390000018351	ENSGT00940000156871.o	ENSGT00940000164250	ENSGT01020000230750	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383.a	ENSGT01070000253867	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B.a	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000166398	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00930000151526	ENSGT00940000156430.a	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000010194	ENSGT01020000230351.A	ENSGT00390000002626	ENSGT00950000182923.C.a	ENSGT00940000158190	ENSGT00940000161922	ENSGT00940000160448	ENSGT00500000045140.a.b	ENSGT00940000164243	ENSGT00840000129953	ENSGT00530000063509.B
Percomorphaceae_B	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000162007	ENSGT00390000018351	ENSGT00940000156871.o	ENSGT00940000164250	ENSGT01020000230750	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383.a	ENSGT01070000253867	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B.a	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000166398	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00930000151526	ENSGT00940000156430.a	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000010194	ENSGT01020000230351.A	ENSGT00390000002626	ENSGT00950000182923.C.a	ENSGT00940000158190	ENSGT00940000161922	ENSGT00940000160448	ENSGT00500000045140.a.b	ENSGT00940000164243	ENSGT00840000129953	ENSGT00530000063509.B
Percomorphaceae_C	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000162007	ENSGT00390000018351	ENSGT00940000156871.o	ENSGT00940000164250	ENSGT01020000230750	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383.a	ENSGT01070000253867	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B.a	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000166398	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00930000151526	ENSGT00940000156430.a	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000010194	ENSGT01020000230351.A	ENSGT00390000002626	ENSGT00950000182923.C.a	ENSGT00940000158190	ENSGT00940000161922	ENSGT00940000160448	ENSGT00500000045140.a.b	ENSGT00940000164243	ENSGT00840000129953	ENSGT00530000063509.B
Percomorphaceae_D	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000162007	ENSGT00390000018351	ENSGT00940000156871.o	ENSGT00940000164250	ENSGT01020000230750	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383.a	ENSGT01070000253867	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B.a	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000166398	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00930000151526	ENSGT00940000156430.a	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000010194	ENSGT01020000230351.A	ENSGT00390000002626	ENSGT00950000182923.C.a	ENSGT00940000158190	ENSGT00940000161922	ENSGT00940000160448	ENSGT00500000045140.a.b	ENSGT00940000164243	ENSGT00840000129953	ENSGT00530000063509.B
Anabantaria	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT01030000235866	ENSGT00940000162007	ENSGT00390000018351	ENSGT00940000156871.o	ENSGT00940000164250	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383.a	ENSGT01070000253867	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B.a	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000166398	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00930000151526	ENSGT00940000156430.a	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000010194	ENSGT01020000230351.A	ENSGT00390000002626	ENSGT00950000182923.C.a	ENSGT00940000158190	ENSGT00940000161922	ENSGT00940000160448	ENSGT00500000045140.a.b	ENSGT00940000164243	ENSGT00840000129953	ENSGT00530000063509.B
Zig-zag eel	MODERN SPECIES	23	pxmp2 (ENSMAMG00000026320)	ENSMAMG00000027718	GATC (ENSMAMG00000028097)	ENSMAMG00000015759	slc6a4b (ENSMAMG00000015721)	ankrd13a (ENSMAMG00000015672)	git2a (ENSMAMG00000015537)	ENSMAMG00000015513	gltpa (ENSMAMG00000015498)	trpv4 (ENSMAMG00000015429)	fam222aa (ENSMAMG00000025083)	mvk (ENSMAMG00000015380)	mmab (ENSMAMG00000015352)	ENSMAMG00000015313	ube3b (ENSMAMG00000015229)	kctd10 (ENSMAMG00000015197) #22	ENSMAMG00000024755	ENSMAMG00000026086	foxn4 (ENSMAMG00000015121)	ACACB (ENSMAMG00000015014)	pole (ENSMAMG00000014886)	p2rx2 (ENSMAMG00000014724)	pes (ENSMAMG00000014668)	gal3st1a (ENSMAMG00000014656)	lztr1 (ENSMAMG00000014604)	cldn26 (ENSMAMG00000014598)	ENSMAMG00000014550	si:dkey-98f17.5 (ENSMAMG00000014528)	ENSMAMG00000014478	ENSMAMG00000014397	ENSMAMG00000014363
Anabantoidei	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT01030000235866	ENSGT00940000162007	ENSGT00390000018351	ENSGT00940000156871.o	ENSGT00940000164250	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383.a	ENSGT01070000253867	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B.a	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000166398	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430.a	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000010194	ENSGT01020000230351.A	ENSGT00390000002626	ENSGT00950000182923.C.a	ENSGT00940000158190	ENSGT00940000161922	ENSGT00940000160448	ENSGT00500000045140.a.b	ENSGT00940000164243	ENSGT00840000129953	ENSGT00530000063509.B	ENSGT00940000153883.a
Climbing perch	MODERN SPECIES	22	pxmp2 (ENSATEG00000009359)	ENSATEG00000028494	gatc (ENSATEG00000009237)	ENSATEG00000009159	slc6a4b (ENSATEG00000009112)	ankrd13a (ENSATEG00000009073)	git2a (ENSATEG00000008986)	ENSATEG00000008966	gltpa (ENSATEG00000027452)	trpv4 (ENSATEG00000008800)	fam222aa (ENSATEG00000008755)	mvk (ENSATEG00000008567)	mmab (ENSATEG00000008524)	ENSATEG00000008488	ube3b (ENSATEG00000008293)	kctd10 (ENSATEG00000008240) #22	MYO1H (ENSATEG00000008139)	foxn4 (ENSATEG00000008094)	ACACB (ENSATEG00000007878)	pole (ENSATEG00000007700)	p2rx2 (ENSATEG00000007493)	pes (ENSATEG00000007439)	gal3st1a (ENSATEG00000007420)	lztr1 (ENSATEG00000007335)	cldn26 (ENSATEG00000007317)	ENSATEG00000007241	si:dkey-98f17.5 (ENSATEG00000007188)	ENSATEG00000007107	ENSATEG00000007000	ENSATEG00000006987	ENSATEG00000006983
Siamese fighting fish	MODERN SPECIES	20	ENSBSLG00000001864	gatc (ENSBSLG00000001860)	SGSM1 (ENSBSLG00000001828)	slc6a4b (ENSBSLG00000001767)	ENSBSLG00000001737	ankrd13a (ENSBSLG00000020534)	git2a (ENSBSLG00000016548)	ENSBSLG00000016494	gltpa (ENSBSLG00000016492)	trpv4 (ENSBSLG00000016329)	fam222aa (ENSBSLG00000016313)	mvk (ENSBSLG00000016307)	mmab (ENSBSLG00000016292)	ENSBSLG00000016112	ube3b (ENSBSLG00000016039)	kctd10 (ENSBSLG00000016028) #22	MYO1H (ENSBSLG00000015663)	foxn4 (ENSBSLG00000015607)	ACACB (ENSBSLG00000014937)	pole (ENSBSLG00000014762)	p2rx2 (ENSBSLG00000014729)	ENSBSLG00000014630	gal3st1a (ENSBSLG00000014626)	lztr1 (ENSBSLG00000014446)	cldn26 (ENSBSLG00000014431)	AIFM3 (ENSBSLG00000014180)	si:dkey-98f17.5 (ENSBSLG00000014038)	slc2a11b (ENSBSLG00000013404)	rbm19 (ENSBSLG00000013268)	plbd2 (ENSBSLG00000013120)	ENSBSLG00000012481
Carangaria	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000162007	ENSGT00390000018351	ENSGT00940000156871.o	ENSGT00940000164250	ENSGT01020000230750	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383.a	ENSGT01070000253867	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B.a	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000166398	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430.a	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000010194	ENSGT01020000230351.A	ENSGT00390000002626	ENSGT00950000182923.C.a	ENSGT00940000158190	ENSGT00940000161922	ENSGT00940000160448	ENSGT00500000045140.a.b	ENSGT00940000164243	ENSGT00840000129953	ENSGT00530000063509.B	ENSGT00940000153883.a
Carangaria_A	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000162007	ENSGT00390000018351	ENSGT00940000156871.o	ENSGT00940000164250	ENSGT01020000230750	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383.a	ENSGT01070000253867	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B.a	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000166398	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430.a	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000010194	ENSGT01020000230351.A	ENSGT00390000002626	ENSGT00950000182923.C.a	ENSGT00940000158190	ENSGT00940000161922	ENSGT00940000160448	ENSGT00500000045140.a.b	ENSGT00940000164243	ENSGT00840000129953	ENSGT00530000063509.B	ENSGT00940000153883.a
Seriola	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000161539	ENSGT00940000162007	ENSGT00390000018351	ENSGT00940000156871.o	ENSGT00940000164250	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383.a	ENSGT01070000253867	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B.a	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000166398	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430.a	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000010194	ENSGT01020000230351.A	ENSGT00390000002626	ENSGT00950000182923.C.a	ENSGT00940000158190	ENSGT00940000161922	ENSGT00940000160448	ENSGT00500000045140.a.b	ENSGT00940000164243	ENSGT00840000129953	ENSGT00530000063509.B	ENSGT00940000153883.a
Yellowtail amberjack	MODERN SPECIES	2916	ENSSLDG00000025148	ENSSLDG00000025155	gatc (ENSSLDG00000025159)	SGSM1 (ENSSLDG00000025163)	slc6a4b (ENSSLDG00000025194)	ankrd13a (ENSSLDG00000025204)	git2a (ENSSLDG00000025233)	tchp (ENSSLDG00000025264)	gltpa (ENSSLDG00000025273)	trpv4 (ENSSLDG00000025274)	fam222aa (ENSSLDG00000025277)	mvk (ENSSLDG00000025279)	mmab (ENSSLDG00000025291)	ENSSLDG00000025292	ube3b (ENSSLDG00000025297)	kctd10 (ENSSLDG00000025309) #22	MYO1H (ENSSLDG00000025312)	foxn4 (ENSSLDG00000025321)	ACACB (ENSSLDG00000025326)	pole (ENSSLDG00000025342)	p2rx2 (ENSSLDG00000025360)	pes (ENSSLDG00000025373)	gal3st1a (ENSSLDG00000025377)	lztr1 (ENSSLDG00000025379)	cldn26 (ENSSLDG00000025383)	AIFM3 (ENSSLDG00000025386)	si:dkey-98f17.5 (ENSSLDG00000025395)	slc2a11b (ENSSLDG00000025402)	rbm19 (ENSSLDG00000025413)	plbd2 (ENSSLDG00000000113)	ENSSLDG00000000338
Greater amberjack	MODERN SPECIES	6	ENSSDUG00000012175	ENSSDUG00000012191	gatc (ENSSDUG00000012206)	SGSM1 (ENSSDUG00000012219)	slc6a4b (ENSSDUG00000012324)	ankrd13a (ENSSDUG00000012347)	git2a (ENSSDUG00000012418)	ENSSDUG00000012520	gltpa (ENSSDUG00000012553)	trpv4 (ENSSDUG00000012578)	fam222aa (ENSSDUG00000012615)	mvk (ENSSDUG00000012645)	mmab (ENSSDUG00000012684)	ENSSDUG00000012658	ube3b (ENSSDUG00000012732)	kctd10 (ENSSDUG00000012849) #22	MYO1H (ENSSDUG00000012879)	foxn4 (ENSSDUG00000012939)	ACACB (ENSSDUG00000012966)	pole (ENSSDUG00000013088)	p2rx2 (ENSSDUG00000013179)	pes (ENSSDUG00000013213)	gal3st1a (ENSSDUG00000013317)	lztr1 (ENSSDUG00000013328)	cldn26 (ENSSDUG00000013411)	AIFM3 (ENSSDUG00000013416)	si:dkey-98f17.5 (ENSSDUG00000013457)	slc2a11b (ENSSDUG00000013513)	rbm19 (ENSSDUG00000013544)	plbd2 (ENSSDUG00000013583)	ENSSDUG00000013608
Barramundi perch	MODERN SPECIES	95	pxmp2 (ENSLCAG00010028229)	ENSLCAG00010028227	SGSM1 (ENSLCAG00010028226)	slc6a4b (ENSLCAG00010028225)	ENSLCAG00010028224	ankrd13a (ENSLCAG00010028223)	git2a (ENSLCAG00010028222)	ENSLCAG00010028221	gltpa (ENSLCAG00010028220)	trpv4 (ENSLCAG00010028219)	fam222aa (ENSLCAG00010028218)	mvk (ENSLCAG00010028217)	mmab (ENSLCAG00010028216)	ENSLCAG00010028215	ube3b (ENSLCAG00010028214)	kctd10 (ENSLCAG00010028213) #22	MYO1H (ENSLCAG00010028212)	foxn4 (ENSLCAG00010028211)	ACACB (ENSLCAG00010028210)	pole (ENSLCAG00010028209)	p2rx2 (ENSLCAG00010028208)	pes (ENSLCAG00010028207)	gal3st1a (ENSLCAG00010028206)	lztr1 (ENSLCAG00010028205)	cldn26 (ENSLCAG00010028204)	AIFM3 (ENSLCAG00010028203)	si:dkey-98f17.5 (ENSLCAG00010028202)	slc2a11b (ENSLCAG00010028201)	rbm19 (ENSLCAG00010028200)	ENSLCAG00010028199	morc2 (ENSLCAG00010028198)
Pleuronectoidei	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000161539	ENSGT00940000162007	ENSGT00390000018351	ENSGT00940000156871.o	ENSGT00940000164250	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383.a	ENSGT01070000253867	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B.a	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000166398	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430.a	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000010194	ENSGT01020000230351.A	ENSGT00390000002626	ENSGT00950000182923.C.a	ENSGT00940000158190	ENSGT00940000161922	ENSGT00940000160448	ENSGT00500000045140.a.b	ENSGT00940000164243	ENSGT00840000129953	ENSGT00530000063509.B	ENSGT00940000153883.a
Tongue sole	DUPLICATION
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Eupercaria	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000162007	ENSGT00390000018351	ENSGT00940000156871.o	ENSGT00940000164250	ENSGT01020000230750	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383.a	ENSGT01070000253867	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B.a	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000166398	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430.a	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000010194	ENSGT01020000230351.A	ENSGT00390000002626	ENSGT00950000182923.C.a	ENSGT00940000158190	ENSGT00940000161922	ENSGT00940000160448	ENSGT00500000045140.a.b	ENSGT00940000164243	ENSGT00840000129953	ENSGT00530000063509.B	ENSGT00940000153883.a
Tetraodontidae	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000161539	ENSGT00940000162007	ENSGT00390000018351	ENSGT00940000156871.o	ENSGT00940000164250	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383.a	ENSGT01070000253867.a	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B.a	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000166398	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430.a	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000010194	ENSGT01020000230351.A	ENSGT00390000002626	ENSGT00950000182923.C.a	ENSGT00940000158190	ENSGT00940000161922	ENSGT00940000160448	ENSGT00500000045140.a.b	ENSGT00940000164243	ENSGT00840000129953	ENSGT00530000063509.B	ENSGT00940000153883.a
Tetraodon	MODERN SPECIES	3	pxmp2 (ENSTNIG00000015877)	ENSTNIG00000015878	gatc (ENSTNIG00000015879)	SGSM1 (ENSTNIG00000015880)	slc6a4b (ENSTNIG00000015881)	ankrd13a (ENSTNIG00000015882)	git2a (ENSTNIG00000015883)	ENSTNIG00000015884	gltpa (ENSTNIG00000015885)	trpv4 (ENSTNIG00000015886)	fam222aa (ENSTNIG00000015887)	mvk (ENSTNIG00000015888)	mmab (ENSTNIG00000015889)	ENSTNIG00000015890	ube3b (ENSTNIG00000015891)	kctd10 (ENSTNIG00000015892) #22	MYO1H (ENSTNIG00000015893)	foxn4 (ENSTNIG00000015894)	ACACB (ENSTNIG00000015895)	pole (ENSTNIG00000015896)	p2rx2 (ENSTNIG00000015897)	pes (ENSTNIG00000015898)	gal3st1a (ENSTNIG00000015899)	lztr1 (ENSTNIG00000015900)	AIFM3 (ENSTNIG00000015901)	slc2a11b (ENSTNIG00000015902)	rbm19 (ENSTNIG00000015903)	plbd2 (ENSTNIG00000015904)	morc2 (ENSTNIG00000015905)	ENSTNIG00000015906	SLC8B1 (ENSTNIG00000001107)
Fugu	MODERN SPECIES	13	pxmp2 (ENSTRUG00000029975)	ENSTRUG00000029256	gatc (ENSTRUG00000032655)	SGSM1 (ENSTRUG00000014620)	slc6a4b (ENSTRUG00000014701)	ankrd13a (ENSTRUG00000014829)	git2a (ENSTRUG00000014889)	ENSTRUG00000014974	gltpa (ENSTRUG00000015019)	trpv4 (ENSTRUG00000015050)	fam222aa (ENSTRUG00000015120)	mvk (ENSTRUG00000015131)	mmab (ENSTRUG00000021106)	ENSTRUG00000015166	ube3b (ENSTRUG00000015209)	kctd10 (ENSTRUG00000024501) #22	foxn4 (ENSTRUG00000015456)	ACACB (ENSTRUG00000015479)	pole (ENSTRUG00000022287)	p2rx2 (ENSTRUG00000015846)	pes (ENSTRUG00000015909)	gal3st1a (ENSTRUG00000015949)	lztr1 (ENSTRUG00000015961)	cldn26 (ENSTRUG00000016007)	AIFM3 (ENSTRUG00000016011)	si:dkey-98f17.5 (ENSTRUG00000021287)	slc2a11b (ENSTRUG00000023513)	rbm19 (ENSTRUG00000016032)	plbd2 (ENSTRUG00000016148)	ENSTRUG00000020282	morc2 (ENSTRUG00000016176)
Eupecaria_A	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT01030000235866	ENSGT00390000018351	ENSGT00940000156871.o	ENSGT00940000164250	ENSGT01020000230750	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383.a	ENSGT01070000253867	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B.a	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000166398	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430.a	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000010194	ENSGT01020000230351.A	ENSGT00390000002626	ENSGT00950000182923.C.a	ENSGT00940000158190	ENSGT00940000161922	ENSGT00940000160448	ENSGT00500000045140.a.b	ENSGT00940000164243	ENSGT00840000129953	ENSGT00530000063509.B	ENSGT00940000153883.a
Ballan wrasse	MODERN SPECIES	347										trpv4 (ENSLBEG00000011640)	fam222aa (ENSLBEG00000011671)	mvk (ENSLBEG00000011685)	mmab (ENSLBEG00000011702)	ENSLBEG00000011721	ube3b (ENSLBEG00000011781)	kctd10 (ENSLBEG00000011900) #22	MYO1H (ENSLBEG00000011933)	foxn4 (ENSLBEG00000012023)	ACACB (ENSLBEG00000012088)	pole (ENSLBEG00000012234)	p2rx2 (ENSLBEG00000012343)	pes (ENSLBEG00000012366)	gal3st1a (ENSLBEG00000012394)	lztr1 (ENSLBEG00000012459)	cldn26 (ENSLBEG00000012558)	AIFM3 (ENSLBEG00000012629)	si:dkey-98f17.5 (ENSLBEG00000012756)	slc2a11b (ENSLBEG00000012798)	rbm19 (ENSLBEG00000012897)	plbd2 (ENSLBEG00000013169)	ENSLBEG00000013204
Eupecaria_B	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT01030000235866	ENSGT00390000018351	ENSGT00940000156871.o	ENSGT00940000164250	ENSGT01020000230750	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383.a	ENSGT01070000253867	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B.a	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000166398	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430.a	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000010194	ENSGT01020000230351.A	ENSGT00390000002626	ENSGT00950000182923.C.a	ENSGT00940000158190	ENSGT00940000161922	ENSGT00940000160448	ENSGT00500000045140.a.b	ENSGT00940000164243	ENSGT00840000129953	ENSGT00530000063509.B	ENSGT00940000153883.a
Perciformes	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000161539	ENSGT00390000018351	ENSGT00940000156871.o	ENSGT00940000164250	ENSGT01020000230750	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383.a	ENSGT01070000253867	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B.a	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000166398	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430.a	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000010194	ENSGT01020000230351.A	ENSGT00390000002626	ENSGT00950000182923.C.a	ENSGT00940000158190	ENSGT00940000161922	ENSGT00940000160448	ENSGT00500000045140.a.b	ENSGT00940000164243	ENSGT00840000129953	ENSGT00530000063509.B	ENSGT00940000153883.a
Perciformes_a	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000161539	ENSGT00390000018351	ENSGT00940000156871.o	ENSGT00940000164250	ENSGT01020000230750	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383.a	ENSGT01070000253867	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B.a	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000166398	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430.a	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000010194	ENSGT01020000230351.A	ENSGT00390000002626	ENSGT00950000182923.C.a	ENSGT00940000158190	ENSGT00940000161922	ENSGT00940000160448	ENSGT00500000045140.a.b	ENSGT00940000164243	ENSGT00840000129953	ENSGT00530000063509.B	ENSGT00940000153883.a
Channel bull blenny	MODERN SPECIES	23	ENSCGOG00000021625	gatc (ENSCGOG00000021624)	SGSM1 (ENSCGOG00000021414)	slc6a4b (ENSCGOG00000021406)	ENSCGOG00000021404	ankrd13a (ENSCGOG00000021373)	git2a (ENSCGOG00000020853)	ENSCGOG00000020780	gltpa (ENSCGOG00000020777)	trpv4 (ENSCGOG00000019343)	fam222aa (ENSCGOG00000019290)	mvk (ENSCGOG00000019289)	mmab (ENSCGOG00000019272)	ENSCGOG00000019091	ube3b (ENSCGOG00000018827)	kctd10 (ENSCGOG00000018814) #22	ENSCGOG00000018810	ENSCGOG00000018809	foxn4 (ENSCGOG00000018791)	ACACB (ENSCGOG00000018600)	pole (ENSCGOG00000018371)	p2rx2 (ENSCGOG00000018339)	pes (ENSCGOG00000018212)	gal3st1a (ENSCGOG00000018204)	lztr1 (ENSCGOG00000017425)	cldn26 (ENSCGOG00000017407)	AIFM3 (ENSCGOG00000017402)	si:dkey-98f17.5 (ENSCGOG00000017393)	slc2a11b (ENSCGOG00000017289)	rbm19 (ENSCGOG00000016480)	ENSCGOG00000016451
Pike perch	MODERN SPECIES	23	pxmp2 (ENSSLUG00000026090)	gatc (ENSSLUG00000026088)	SGSM1 (ENSSLUG00000026083)	slc6a4b (ENSSLUG00000026081)	ENSSLUG00000026078	ankrd13a (ENSSLUG00000026075)	git2a (ENSSLUG00000026061)	ENSSLUG00000026032	gltpa (ENSSLUG00000026030)	trpv4 (ENSSLUG00000026002)	fam222aa (ENSSLUG00000025977)	mvk (ENSSLUG00000025975)	mmab (ENSSLUG00000025972)	ENSSLUG00000025970	ube3b (ENSSLUG00000025969)	kctd10 (ENSSLUG00000025967) #22	MYO1H (ENSSLUG00000025965)	foxn4 (ENSSLUG00000025960)	ACACB (ENSSLUG00000025524)	p2rx2 (ENSSLUG00000025085)	pes (ENSSLUG00000025077)	gal3st1a (ENSSLUG00000025065)	lztr1 (ENSSLUG00000025008)	cldn26 (ENSSLUG00000024991)	AIFM3 (ENSSLUG00000024989)	si:dkey-98f17.5 (ENSSLUG00000024984)	slc2a11b (ENSSLUG00000024981)	slc2a11b (ENSSLUG00000024975)	rbm19 (ENSSLUG00000024967)	plbd2 (ENSSLUG00000024899)	ENSSLUG00000024882
Cottioidei	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00390000003405.h	ENSGT00940000161539	ENSGT00390000018351	ENSGT00940000156871.o	ENSGT00940000164250	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383.a	ENSGT01070000253867	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B.a	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000166398	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430.a	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000010194	ENSGT01020000230351.A	ENSGT00390000002626	ENSGT00950000182923.C.a	ENSGT00940000158190	ENSGT00940000161922	ENSGT00940000160448	ENSGT00500000045140.a.b	ENSGT00940000164243	ENSGT00840000129953	ENSGT00530000063509.B	ENSGT00940000153883.a
Lumpfish	MODERN SPECIES	24	pxmp2 (ENSCLMG00005003572)	gatc (ENSCLMG00005003583)	SGSM1 (ENSCLMG00005003586)	ENSCLMG00005003591	slc6a4b (ENSCLMG00005003593)	ankrd13a (ENSCLMG00005003597)	git2a (ENSCLMG00005003614)	ENSCLMG00005006316	gltpa (ENSCLMG00005006322)	trpv4 (ENSCLMG00005006352)	fam222aa (ENSCLMG00005006354)	mvk (ENSCLMG00005006357)	mmab (ENSCLMG00005006361)	ENSCLMG00005006370	ube3b (ENSCLMG00005006725)	kctd10 (ENSCLMG00005006764) #22	foxn4 (ENSCLMG00005006782)	ACACB (ENSCLMG00005006800)	pole (ENSCLMG00005008146)	p2rx2 (ENSCLMG00005008374)	pes (ENSCLMG00005008375)	gal3st1a (ENSCLMG00005008376)	lztr1 (ENSCLMG00005008377)	cldn26 (ENSCLMG00005008416)	AIFM3 (ENSCLMG00005008429)	si:dkey-98f17.5 (ENSCLMG00005008469)	slc2a11b (ENSCLMG00005008470)	rbm19 (ENSCLMG00005008769)	ENSCLMG00005010776	morc2 (ENSCLMG00005010789)	ENSCLMG00005013567
Stickleback	MODERN SPECIES	12	unga (ENSGACG00000008939)	pxmp2 (ENSGACG00000008963)	ENSGACG00000008971	gatc (ENSGACG00000008973)	SGSM1 (ENSGACG00000008977)	slc6a4b (ENSGACG00000009001)	ankrd13a (ENSGACG00000009085)	git2a (ENSGACG00000009100)	ENSGACG00000009114	gltpa (ENSGACG00000009126)	trpv4 (ENSGACG00000009136)	fam222aa (ENSGACG00000009146)	mvk (ENSGACG00000009149)	ENSGACG00000009157	ube3b (ENSGACG00000009166)	kctd10 (ENSGACG00000009196) #22	MYO1H (ENSGACG00000009207)	foxn4 (ENSGACG00000009215)	ACACB (ENSGACG00000009222)	pole (ENSGACG00000009265)	p2rx2 (ENSGACG00000009294)	pes (ENSGACG00000009302)	gal3st1a (ENSGACG00000009328)	lztr1 (ENSGACG00000009334)	cldn26 (ENSGACG00000009352)	AIFM3 (ENSGACG00000009355)	si:dkey-98f17.5 (ENSGACG00000009399)	slc2a11b (ENSGACG00000009410)	rbm19 (ENSGACG00000009462)	plbd2 (ENSGACG00000009498)	ENSGACG00000009510
Eupecaria_C	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000161539	ENSGT00940000162007	ENSGT00390000018351	ENSGT00940000156871.o	ENSGT00940000164250	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383.a	ENSGT01070000253867	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B.a	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000166398	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430.a	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000010194	ENSGT01020000230351.A	ENSGT00390000002626	ENSGT00950000182923.C.a	ENSGT00940000158190	ENSGT00940000161922	ENSGT00940000160448	ENSGT00500000045140.a.b	ENSGT00940000164243	ENSGT00840000129953	ENSGT00530000063509.B	ENSGT00940000153883.a
Gilthead seabream	MODERN SPECIES	19	ENSSAUG00010020050	ENSSAUG00010020052	gatc (ENSSAUG00010020053)	SGSM1 (ENSSAUG00010020112)	slc6a4b (ENSSAUG00010020330)	ankrd13a (ENSSAUG00010020417)	git2a (ENSSAUG00010020552)	ENSSAUG00010022053	gltpa (ENSSAUG00010022055)	trpv4 (ENSSAUG00010022072)	fam222aa (ENSSAUG00010023908)	mvk (ENSSAUG00010023909)	mmab (ENSSAUG00010023910)	ENSSAUG00010023911	ube3b (ENSSAUG00010023912)	kctd10 (ENSSAUG00010023918) #22	MYO1H (ENSSAUG00010023925)	foxn4 (ENSSAUG00010023945)	ACACB (ENSSAUG00010023958)	pole (ENSSAUG00010024160)	p2rx2 (ENSSAUG00010024167)	pes (ENSSAUG00010024171)	gal3st1a (ENSSAUG00010024172)	lztr1 (ENSSAUG00010024175)	cldn26 (ENSSAUG00010024182)	AIFM3 (ENSSAUG00010024186)	si:dkey-98f17.5 (ENSSAUG00010024192)	slc2a11b (ENSSAUG00010024199)	rbm19 (ENSSAUG00010024249)	ENSSAUG00010024539	morc2 (ENSSAUG00010024542)
Eupercaria_incertae_sedis	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT01030000235866	ENSGT00940000163900	ENSGT00390000018351	ENSGT00940000156871.o	ENSGT00940000164250	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383.a	ENSGT01070000253867	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B.a	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000166398	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430.a	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000010194	ENSGT01020000230351.A	ENSGT00390000002626	ENSGT00950000182923.C.a	ENSGT00940000158190	ENSGT00940000161922	ENSGT00940000160448	ENSGT00500000045140.a.b	ENSGT00940000164243	ENSGT00840000129953	ENSGT00530000063509.B	ENSGT00940000153883.a
European seabass	MODERN SPECIES	13	ENSDLAG00005032425	ENSDLAG00005028514	gatc (ENSDLAG00005031249)	ENSDLAG00005015836	slc6a4b (ENSDLAG00005018799)	ankrd13a (ENSDLAG00005019019)	git2a (ENSDLAG00005019800)	ENSDLAG00005022511	gltpa (ENSDLAG00005022523)	trpv4 (ENSDLAG00005022585)	fam222aa (ENSDLAG00005023669)	mvk (ENSDLAG00005023670)	mmab (ENSDLAG00005023675)	ENSDLAG00005023688	ube3b (ENSDLAG00005023696)	kctd10 (ENSDLAG00005001229) #22	MYO1H (ENSDLAG00005001424)	foxn4 (ENSDLAG00005026761)	ACACB (ENSDLAG00005003039)	pole (ENSDLAG00005015952)	p2rx2 (ENSDLAG00005016148)	pes (ENSDLAG00005016204)	gal3st1a (ENSDLAG00005031141)	lztr1 (ENSDLAG00005016299)	cldn26 (ENSDLAG00005030777)	ENSDLAG00005016715	si:dkey-98f17.5 (ENSDLAG00005016944)	ENSDLAG00005017050	ENSDLAG00005017158	ENSDLAG00005017341	ENSDLAG00005017582
Large yellow croaker	MODERN SPECIES	2	ENSLCRG00005016225	gatc (ENSLCRG00005016223)	SGSM1 (ENSLCRG00005015101)	slc6a4b (ENSLCRG00005015084)	ankrd13a (ENSLCRG00005014952)	git2a (ENSLCRG00005014731)	ENSLCRG00005014719	gltpa (ENSLCRG00005014718)	trpv4 (ENSLCRG00005014410)	fam222aa (ENSLCRG00005014403)	ENSLCRG00005014401	mvk (ENSLCRG00005014399)	mmab (ENSLCRG00005014253)	ENSLCRG00005014064	ube3b (ENSLCRG00005014047)	kctd10 (ENSLCRG00005014042) #22	foxn4 (ENSLCRG00005014039)	ACACB (ENSLCRG00005005930)	pole (ENSLCRG00005005867)	p2rx2 (ENSLCRG00005005855)	ENSLCRG00005005853	pes (ENSLCRG00005005816)	gal3st1a (ENSLCRG00005005812)	lztr1 (ENSLCRG00005005623)	cldn26 (ENSLCRG00005005616)	AIFM3 (ENSLCRG00005004698)	si:dkey-98f17.5 (ENSLCRG00005004675)	slc2a11b (ENSLCRG00005004652)	rbm19 (ENSLCRG00005004612)	plbd2 (ENSLCRG00005004589)	ENSLCRG00005004586
Ovalentaria	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000162007	ENSGT00390000018351	ENSGT00940000156871.o	ENSGT00940000164250	ENSGT01020000230750	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383.a	ENSGT01070000253867	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B.a	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000166398	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430.a	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000010194	ENSGT01020000230351.A	ENSGT00390000002626	ENSGT00950000182923.C.a	ENSGT00940000158190	ENSGT00940000161922	ENSGT00940000160448	ENSGT00500000045140.a.b	ENSGT00940000164243	ENSGT00840000129953	ENSGT00530000063509.B	ENSGT00940000153883.a
Ovalentaria_B	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000162007	ENSGT00390000018351	ENSGT00940000156871.o	ENSGT00940000164250	ENSGT01020000230750	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383.a	ENSGT01070000253867	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B.a	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000166398	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430.a	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000010194	ENSGT01020000230351.A	ENSGT00390000002626	ENSGT00950000182923.C.a	ENSGT00940000158190	ENSGT00940000161922	ENSGT00940000160448	ENSGT00500000045140.a.b	ENSGT00940000164243	ENSGT00840000129953	ENSGT00530000063509.B	ENSGT00940000153883.a
Pomacentridae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT01030000235866	ENSGT00390000018351	ENSGT00940000156871.o	ENSGT00940000164250	ENSGT01020000230750	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383.a	ENSGT01070000253867	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B.a	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000166398	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430.a	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000010194	ENSGT01020000230351.A	ENSGT00390000002626	ENSGT00950000182923.C.a	ENSGT00940000158190	ENSGT00940000161922	ENSGT00940000160448	ENSGT00500000045140.a.b	ENSGT00940000164243	ENSGT00840000129953	ENSGT00530000063509.B	ENSGT00940000153883.a
Pomacentridae_A	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT01030000235866	ENSGT00390000018351	ENSGT00940000156871.o	ENSGT00940000164250	ENSGT01020000230750	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383.a	ENSGT01070000253867	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B.a	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000166398	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430.a	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000010194	ENSGT01020000230351.A	ENSGT00390000002626	ENSGT00950000182923.C.a	ENSGT00940000158190	ENSGT00940000161922	ENSGT00940000160448	ENSGT00500000045140.a.b	ENSGT00940000164243	ENSGT00840000129953	ENSGT00530000063509.B	ENSGT00940000153883.a
Amphiprion	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT01030000235866	ENSGT00390000018351	ENSGT00940000156871.o	ENSGT00940000164250	ENSGT01020000230750	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383.a	ENSGT01070000253867	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B.a	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000166398	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430.a	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000010194	ENSGT01020000230351.A	ENSGT00390000002626	ENSGT00950000182923.C.a	ENSGT00940000158190	ENSGT00940000161922	ENSGT00940000160448	ENSGT00500000045140.a.b	ENSGT00940000164243	ENSGT00840000129953	ENSGT00530000063509.B	ENSGT00940000153883.a
Orange clownfish	MODERN SPECIES	19	ENSAPEG00000023423	gatc (ENSAPEG00000023411)	SGSM1 (ENSAPEG00000023369)	slc6a4b (ENSAPEG00000023355)	ankrd13a (ENSAPEG00000023308)	git2a (ENSAPEG00000023273)	ENSAPEG00000023239	gltpa (ENSAPEG00000023224)	trpv4 (ENSAPEG00000023174)	fam222aa (ENSAPEG00000023169)	ENSAPEG00000023141	mvk (ENSAPEG00000023137)	mmab (ENSAPEG00000023126)	ENSAPEG00000023113	ube3b (ENSAPEG00000023031)	kctd10 (ENSAPEG00000023007) #22	ENSAPEG00000022997	MYO1H (ENSAPEG00000022967)	foxn4 (ENSAPEG00000022957)	ACACB (ENSAPEG00000022865)	pole (ENSAPEG00000022806)	p2rx2 (ENSAPEG00000022730)	pes (ENSAPEG00000022652)	gal3st1a (ENSAPEG00000022636)	lztr1 (ENSAPEG00000022557)	cldn26 (ENSAPEG00000022540)	AIFM3 (ENSAPEG00000022510)	si:dkey-98f17.5 (ENSAPEG00000022447)	slc2a11b (ENSAPEG00000022421)	rbm19 (ENSAPEG00000022381)	plbd2 (ENSAPEG00000022353)
Clown anemonefish	MODERN SPECIES	826			SGSM1 (ENSAOCG00000010165)	slc6a4b (ENSAOCG00000010102)	ENSAOCG00000010073	ankrd13a (ENSAOCG00000010052)	git2a (ENSAOCG00000009989)	ENSAOCG00000009902	gltpa (ENSAOCG00000009776)	trpv4 (ENSAOCG00000009763)	fam222aa (ENSAOCG00000009701)	mvk (ENSAOCG00000009667)	mmab (ENSAOCG00000009596)	ENSAOCG00000009578	ube3b (ENSAOCG00000009545)	kctd10 (ENSAOCG00000009446) #22	MYO1H (ENSAOCG00000002607)	foxn4 (ENSAOCG00000009340)	ACACB (ENSAOCG00000009298)	pole (ENSAOCG00000009127)	ENSAOCG00000000551	p2rx2 (ENSAOCG00000009043)	pes (ENSAOCG00000008883)	gal3st1a (ENSAOCG00000008823)	lztr1 (ENSAOCG00000000515)	cldn26 (ENSAOCG00000008716)	AIFM3 (ENSAOCG00000008705)	si:dkey-98f17.5 (ENSAOCG00000008661)	slc2a11b (ENSAOCG00000008605)	rbm19 (ENSAOCG00000008554)	plbd2 (ENSAOCG00000008473)
Spiny chromis	MODERN SPECIES	14	unga (ENSAPOG00000007636)	ENSAPOG00000007669	pxmp2 (ENSAPOG00000007696)	SGSM1 (ENSAPOG00000007856)	slc6a4b (ENSAPOG00000007929)	ankrd13a (ENSAPOG00000007995)	ENSAPOG00000008013	git2a (ENSAPOG00000008155)	gltpa (ENSAPOG00000008203)	trpv4 (ENSAPOG00000008283)	fam222aa (ENSAPOG00000008295)	mvk (ENSAPOG00000008431)	mmab (ENSAPOG00000008470)	ENSAPOG00000008512	ube3b (ENSAPOG00000008632)	kctd10 (ENSAPOG00000008667) #22	MYO1H (ENSAPOG00000009369)	foxn4 (ENSAPOG00000000270)	ACACB (ENSAPOG00000009683)	pole (ENSAPOG00000009938)	p2rx2 (ENSAPOG00000009980)	pes (ENSAPOG00000010054)	gal3st1a (ENSAPOG00000010081)	cldn26 (ENSAPOG00000010088)	lztr1 (ENSAPOG00000010176)	AIFM3 (ENSAPOG00000010307)	si:dkey-98f17.5 (ENSAPOG00000010378)	slc2a11b (ENSAPOG00000010481)	rbm19 (ENSAPOG00000010507)	plbd2 (ENSAPOG00000010544)	ENSAPOG00000010563
Bicolor damselfish	MODERN SPECIES	491												mvk (ENSSPAG00000019633)	mmab (ENSSPAG00000019588)	ENSSPAG00000019558	ube3b (ENSSPAG00000019463)	kctd10 (ENSSPAG00000019422) #22	MYO1H (ENSSPAG00000019359)	foxn4 (ENSSPAG00000019332)	ACACB (ENSSPAG00000019194)	pole (ENSSPAG00000019095)	p2rx2 (ENSSPAG00000019000)	pes (ENSSPAG00000018970)	gal3st1a (ENSSPAG00000018959)	lztr1 (ENSSPAG00000018894)	cldn26 (ENSSPAG00000018881)	AIFM3 (ENSSPAG00000018834)	si:dkey-98f17.5 (ENSSPAG00000018800)	slc2a11b (ENSSPAG00000018746)	rbm19 (ENSSPAG00000018685)	plbd2 (ENSSPAG00000018567)	ENSSPAG00000018524
Cichlidae	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000162007	ENSGT00390000018351	ENSGT00940000156871.o	ENSGT00940000164250	ENSGT01020000230750	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383.a	ENSGT01070000253867	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B.a	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000166398	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430.a	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000010194	ENSGT01020000230351.A	ENSGT00390000002626	ENSGT00950000182923.C.a	ENSGT00940000158190	ENSGT00940000161922	ENSGT00940000160448	ENSGT00500000045140.a.b	ENSGT00940000164243	ENSGT00840000129953	ENSGT00530000063509.B	ENSGT00940000153883.a
Pseudocrenilabrinae	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000162007.p	ENSGT00390000018351	ENSGT00940000156871.o	ENSGT00940000164250	ENSGT01020000230750	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383.a	ENSGT01070000253867	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B.a	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000166398	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430.a	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000010194	ENSGT01020000230351.A	ENSGT00390000002626	ENSGT00950000182923.C.a	ENSGT00940000158190	ENSGT00940000161922	ENSGT00940000160448	ENSGT00500000045140.a.b	ENSGT00940000164243	ENSGT00840000129953	ENSGT00530000063509.B	ENSGT00940000153883.a
Pseudocrenilabrinae_A	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000162007.p	ENSGT00390000018351	ENSGT00940000156871.o	ENSGT00940000164250	ENSGT01020000230750	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383.a	ENSGT01070000253867	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B.a	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000166398	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430.a	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000010194	ENSGT01020000230351.A	ENSGT00390000002626	ENSGT00950000182923.C.a	ENSGT00940000158190	ENSGT00940000161922	ENSGT00940000160448	ENSGT00500000045140.a.b	ENSGT00940000164243	ENSGT00840000129953	ENSGT00530000063509.B	ENSGT00940000153883.a
Haplochromini	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000162007.o.a	ENSGT00390000018351	ENSGT00940000156871.o	ENSGT00940000164250	ENSGT01020000230750	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383.a	ENSGT01070000253867	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B.a	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000166398	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430.a	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000010194	ENSGT01020000230351.A	ENSGT00390000002626	ENSGT00950000182923.C.a	ENSGT00940000158190	ENSGT00940000161922	ENSGT00940000160448	ENSGT00500000045140.a.b	ENSGT00940000164243	ENSGT00840000129953	ENSGT00530000063509.B	ENSGT00940000153883.a
Haplochromini_A	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000162007.p	ENSGT00390000018351	ENSGT00940000156871.o	ENSGT00940000164250	ENSGT01020000230750	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383.a	ENSGT01070000253867	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B.a	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000166398	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430.a	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000010194	ENSGT01020000230351.A	ENSGT00390000002626	ENSGT00950000182923.C.a	ENSGT00940000158190	ENSGT00940000161922	ENSGT00940000160448	ENSGT00500000045140.a.b	ENSGT00940000164243	ENSGT00840000129953	ENSGT00530000063509.B	ENSGT00940000153883.a
Haplochromini_B	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000162007.p	ENSGT00390000018351	ENSGT00940000156871.o	ENSGT00940000164250	ENSGT01020000230750	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383.a	ENSGT01070000253867	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B.a	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000166398	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430.a	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000010194	ENSGT01020000230351.A	ENSGT00390000002626	ENSGT00950000182923.C.a	ENSGT00940000158190	ENSGT00940000161922	ENSGT00940000160448	ENSGT00500000045140.a.b	ENSGT00940000164243	ENSGT00840000129953	ENSGT00530000063509.B	ENSGT00940000153883.a
Eastern happy	MODERN SPECIES	3	gatc (ENSACLG00000026251)	SGSM1 (ENSACLG00000026302)	ENSACLG00000026433	slc6a4b (ENSACLG00000026438)	ankrd13a (ENSACLG00000026482)	ENSACLG00000026505	git2a (ENSACLG00000026515)	ENSACLG00000026598	gltpa (ENSACLG00000026619)	trpv4 (ENSACLG00000026642)	fam222aa (ENSACLG00000026673)	mvk (ENSACLG00000026684)	mmab (ENSACLG00000026717)	ENSACLG00000026700	ube3b (ENSACLG00000026725)	kctd10 (ENSACLG00000026824) #22	MYO1H (ENSACLG00000000183)	foxn4 (ENSACLG00000000292)	ACACB (ENSACLG00000000321)	pole (ENSACLG00000000578)	p2rx2 (ENSACLG00000000735)	pes (ENSACLG00000000815)	gal3st1a (ENSACLG00000000854)	lztr1 (ENSACLG00000000986)	cldn26 (ENSACLG00000001160)	AIFM3 (ENSACLG00000001182)	si:dkey-98f17.5 (ENSACLG00000001308)	slc2a11b (ENSACLG00000001363)	rbm19 (ENSACLG00000001399)	plbd2 (ENSACLG00000001449)	ENSACLG00000001466
Zebra mbuna	MODERN SPECIES	1094	ENSMZEG00005016065	gatc (ENSMZEG00005016072)	SGSM1 (ENSMZEG00005016078)	slc6a4b (ENSMZEG00005016107)	ENSMZEG00005016118	ankrd13a (ENSMZEG00005016134)	git2a (ENSMZEG00005016177)	ENSMZEG00005016233	gltpa (ENSMZEG00005016249)	trpv4 (ENSMZEG00005016260)	fam222aa (ENSMZEG00005016273)	mvk (ENSMZEG00005016278)	mmab (ENSMZEG00005016287)	ENSMZEG00005016291	ube3b (ENSMZEG00005016320)	kctd10 (ENSMZEG00005016346) #22	MYO1H (ENSMZEG00005016361)	foxn4 (ENSMZEG00005016379)	ACACB (ENSMZEG00005016396)	pole (ENSMZEG00005016436)	p2rx2 (ENSMZEG00005016500)	ENSMZEG00005016529	gal3st1a (ENSMZEG00005016534)	lztr1 (ENSMZEG00005016541)	cldn26 (ENSMZEG00005016551)	AIFM3 (ENSMZEG00005016558)	si:dkey-98f17.5 (ENSMZEG00005016572)	slc2a11b (ENSMZEG00005016592)	rbm19 (ENSMZEG00005016607)	plbd2 (ENSMZEG00005016629)	ENSMZEG00005016638
P. nyererei	MODERN SPECIES	301	ENSPNYG00000016009	gatc (ENSPNYG00000016015)	SGSM1 (ENSPNYG00000016029)	slc6a4b (ENSPNYG00000016077)	ENSPNYG00000016108	ankrd13a (ENSPNYG00000016126)	git2a (ENSPNYG00000016188)	tchp (ENSPNYG00000016256)	gltpa (ENSPNYG00000016349)	trpv4 (ENSPNYG00000016374)	fam222aa (ENSPNYG00000016411)	mvk (ENSPNYG00000016422)	mmab (ENSPNYG00000016430)	ENSPNYG00000016441	ube3b (ENSPNYG00000016480)	kctd10 (ENSPNYG00000016562) #22	MYO1H (ENSPNYG00000016587)	foxn4 (ENSPNYG00000016670)	ACACB (ENSPNYG00000016723)	pole (ENSPNYG00000016820)	p2rx2 (ENSPNYG00000016898)	ENSPNYG00000016947	gal3st1a (ENSPNYG00000017140)	lztr1 (ENSPNYG00000017150)	cldn26 (ENSPNYG00000017209)	AIFM3 (ENSPNYG00000017221)	si:dkey-98f17.5 (ENSPNYG00000017266)	slc2a11b (ENSPNYG00000017331)	rbm19 (ENSPNYG00000017434)	plbd2 (ENSPNYG00000017669)	ENSPNYG00000017686
Burton s mouthbrooder	MODERN SPECIES	551	ENSHBUG00000006773	gatc (ENSHBUG00000006827)	SGSM1 (ENSHBUG00000006891)	slc6a4b (ENSHBUG00000006955)	ENSHBUG00000006979	ankrd13a (ENSHBUG00000007076)	git2a (ENSHBUG00000007178)	ENSHBUG00000007201	gltpa (ENSHBUG00000007225)	trpv4 (ENSHBUG00000007289)	fam222aa (ENSHBUG00000007306)	mvk (ENSHBUG00000007341)	ENSHBUG00000007380	mmab (ENSHBUG00000007368)	ube3b (ENSHBUG00000007477)	kctd10 (ENSHBUG00000000769) #22	MYO1H (ENSHBUG00000007591)	foxn4 (ENSHBUG00000007602)	ACACB (ENSHBUG00000007752)	pole (ENSHBUG00000007900)	p2rx2 (ENSHBUG00000007963)	pes (ENSHBUG00000008000)	gal3st1a (ENSHBUG00000008012)	lztr1 (ENSHBUG00000008144)	cldn26 (ENSHBUG00000008170)	AIFM3 (ENSHBUG00000008281)	si:dkey-98f17.5 (ENSHBUG00000008331)	slc2a11b (ENSHBUG00000008353)	rbm19 (ENSHBUG00000009047)	ENSHBUG00000009092	morc2 (ENSHBUG00000009325)
Lyretail cichlid	MODERN SPECIES	296	pxmp2 (ENSNBRG00000007839)	gatc (ENSNBRG00000007810)	SGSM1 (ENSNBRG00000007726)	slc6a4b (ENSNBRG00000007683)	ENSNBRG00000007669	ankrd13a (ENSNBRG00000007636)	git2a (ENSNBRG00000007577)	ENSNBRG00000007501	gltpa (ENSNBRG00000007472)	trpv4 (ENSNBRG00000007413)	fam222aa (ENSNBRG00000007385)	mvk (ENSNBRG00000007355)	mmab (ENSNBRG00000007331)	ENSNBRG00000007279	ube3b (ENSNBRG00000007190)	kctd10 (ENSNBRG00000007162) #22	MYO1H (ENSNBRG00000006888)	foxn4 (ENSNBRG00000006829)	ACACB (ENSNBRG00000006682)	pole (ENSNBRG00000006528)	p2rx2 (ENSNBRG00000006363)	pes (ENSNBRG00000006301)	gal3st1a (ENSNBRG00000006293)	lztr1 (ENSNBRG00000006234)	cldn26 (ENSNBRG00000006211)	AIFM3 (ENSNBRG00000006155)	si:dkey-98f17.5 (ENSNBRG00000006068)	slc2a11b (ENSNBRG00000005987)	rbm19 (ENSNBRG00000005913)	plbd2 (ENSNBRG00000005895)	ENSNBRG00000005889
Nile tilapia	MODERN SPECIES	3	ENSONIG00000028519	ENSONIG00000028326	gatc (ENSONIG00000033269)	SGSM1 (ENSONIG00000013445)	slc6a4b (ENSONIG00000013452)	ankrd13a (ENSONIG00000013466)	git2a (ENSONIG00000013468)	gltpa (ENSONIG00000013471)	trpv4 (ENSONIG00000013473)	ENSONIG00000013470	fam222aa (ENSONIG00000036086)	mvk (ENSONIG00000013483)	mmab (ENSONIG00000037683)	ENSONIG00000013485	ube3b (ENSONIG00000013487)	kctd10 (ENSONIG00000042772) #22	MYO1H (ENSONIG00000013496)	foxn4 (ENSONIG00000013504)	ACACB (ENSONIG00000013510)	pole (ENSONIG00000013522)	p2rx2 (ENSONIG00000013535)	pes (ENSONIG00000013543)	gal3st1a (ENSONIG00000013552)	lztr1 (ENSONIG00000013553)	cldn26 (ENSONIG00000032748)	AIFM3 (ENSONIG00000013559)	si:dkey-98f17.5 (ENSONIG00000013568)	slc2a11b (ENSONIG00000013569)	rbm19 (ENSONIG00000013576)	plbd2 (ENSONIG00000013585)	ENSONIG00000013588
Midas cichlid	MODERN SPECIES	744	ENSACIG00000016749	gatc (ENSACIG00000016853)	SGSM1 (ENSACIG00000016869)	slc6a4b (ENSACIG00000016926)	ENSACIG00000016963	ankrd13a (ENSACIG00000016972)	git2a (ENSACIG00000016999)	ENSACIG00000017037	gltpa (ENSACIG00000017082)	trpv4 (ENSACIG00000017098)	fam222aa (ENSACIG00000017116)	mvk (ENSACIG00000017137)	mmab (ENSACIG00000017198)	ENSACIG00000017216	ube3b (ENSACIG00000017238)	kctd10 (ENSACIG00000017281) #22	MYO1H (ENSACIG00000017300)	foxn4 (ENSACIG00000017338)	ACACB (ENSACIG00000017362)	pole (ENSACIG00000017455)	ENSACIG00000017521	p2rx2 (ENSACIG00000017544)	pes (ENSACIG00000017610)	gal3st1a (ENSACIG00000017639)	lztr1 (ENSACIG00000017649)	cldn26 (ENSACIG00000017682)	AIFM3 (ENSACIG00000017688)	si:dkey-98f17.5 (ENSACIG00000017719)	slc2a11b (ENSACIG00000017753)	rbm19 (ENSACIG00000017780)	plbd2 (ENSACIG00000017813)
Atherinomorphae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000163900	ENSGT00390000018351	ENSGT00940000156871.o	ENSGT00940000164250	ENSGT01020000230750	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383.a	ENSGT01070000253867	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B.a	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000166398	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430.a	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000010194	ENSGT01020000230351.A	ENSGT00390000002626	ENSGT00950000182923.C.a	ENSGT00940000158190	ENSGT00940000161922	ENSGT00940000160448	ENSGT00500000045140.a.b	ENSGT00940000164243.i	ENSGT00940000164243.j	ENSGT00840000129953	ENSGT00530000063509.B
Cyprinodontiformes	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000162007	ENSGT00390000018351	ENSGT00940000156871.o	ENSGT00940000164250	ENSGT01020000230750	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383.a	ENSGT01070000253867	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B.a	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000166398	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430.a	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000010194	ENSGT01020000230351.A	ENSGT00390000002626	ENSGT00950000182923.C.a	ENSGT00940000158190	ENSGT00940000161922	ENSGT00940000160448	ENSGT00500000045140.a.b	ENSGT00940000164243.i	ENSGT00940000164243.j	ENSGT00840000129953	ENSGT00530000063509.B
Aplocheiloidei	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00940000162007	ENSGT00390000018351	ENSGT00940000156871.o	ENSGT00940000164250	ENSGT01020000230750	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383.a	ENSGT01100000265160	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B.a	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000166398	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430.a	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000010194	ENSGT01020000230351.A	ENSGT00390000002626	ENSGT00950000182923.C.a	ENSGT00940000158190	ENSGT00940000161922	ENSGT00940000160448	ENSGT00500000045140.a.b	ENSGT00940000164243.i	ENSGT00940000164243.j	ENSGT00840000129953	ENSGT00530000063509.B
Mangrove rivulus	MODERN SPECIES	26	pxmp2 (ENSKMAG00000016536)	ENSKMAG00000016517	gatc (ENSKMAG00000016476)	SGSM1 (ENSKMAG00000016393)	slc6a4b (ENSKMAG00000016348)	ankrd13a (ENSKMAG00000016283)	git2a (ENSKMAG00000016140)	ENSKMAG00000016082	gltpa (ENSKMAG00000016068)	trpv4 (ENSKMAG00000015990)	fam222aa (ENSKMAG00000015934)	mvk (ENSKMAG00000015900)	mmab (ENSKMAG00000015881)	ENSKMAG00000015846	ube3b (ENSKMAG00000015733)	kctd10 (ENSKMAG00000015703) #22	MYO1H (ENSKMAG00000015612)	foxn4 (ENSKMAG00000015563)	ACACB (ENSKMAG00000015466)	ENSKMAG00000015411	ENSKMAG00000015382	p2rx2 (ENSKMAG00000015359)	pes (ENSKMAG00000015285)	gal3st1a (ENSKMAG00000015260)	lztr1 (ENSKMAG00000015195)	cldn26 (ENSKMAG00000015171)	AIFM3 (ENSKMAG00000015053)	si:dkey-98f17.5 (ENSKMAG00000014997)	slc2a11b (ENSKMAG00000014945)	slc2a11b (ENSKMAG00000014912)	rbm19 (ENSKMAG00000014807)
Turquoise killifish	MODERN SPECIES	1627	SVOP (ENSNFUG00015014328)	usp30 (ENSNFUG00015014182)	alkbh2 (ENSNFUG00015014144)	UNGA (ENSNFUG00015014137)	PXMP2 (ENSNFUG00015014118)	gatc (ENSNFUG00015014076)	SGSM1 (ENSNFUG00015025363)	slc6a4b (ENSNFUG00015025356)	ENSNFUG00015025352	ankrd13a (ENSNFUG00015025347)	ENSNFUG00015025333	GLTPA (ENSNFUG00015025327)	trpv4 (ENSNFUG00015025325)	fam222aa (ENSNFUG00015025321)	mvk (ENSNFUG00015025319)	kctd10 (ENSNFUG00015025309) #22	foxn4 (ENSNFUG00015025307)	ACACB (ENSNFUG00015024426)	p2rx2 (ENSNFUG00015024119)	PES (ENSNFUG00015024106)	gal3st1a (ENSNFUG00015024098)	LZTR1 (ENSNFUG00015023966)	cldn26 (ENSNFUG00015023933)	ENSNFUG00015023930	si:dkey-98f17.5 (ENSNFUG00015023870)	slc2a11b (ENSNFUG00015023838)	slc2a11b (ENSNFUG00015023729)	plbd2 (ENSNFUG00015023646)	ENSNFUG00015023637	morc2 (ENSNFUG00015023400)	OLA.8803 (ENSNFUG00015023379)
Cyprinodontoidei	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000018351	ENSGT00940000156871.o	ENSGT00940000164250	ENSGT01100000263553.a.b.b.b	ENSGT01020000230750	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383.a	ENSGT01070000253867	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B.a	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000166398	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430.a	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000010194	ENSGT01020000230351.A	ENSGT00390000002626	ENSGT00950000182923.C.a	ENSGT00940000158190	ENSGT00940000161922	ENSGT00940000160448	ENSGT00500000045140.a.b	ENSGT00940000164243.i	ENSGT00940000164243.j	ENSGT00840000129953	ENSGT00530000063509.B
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Mummichog	MODERN SPECIES	2204	gatc (ENSFHEG00000014992)	SGSM1 (ENSFHEG00000014979)	slc6a4b (ENSFHEG00000014888)	ENSFHEG00000014852	ENSFHEG00000014844	ankrd13a (ENSFHEG00000014831)	git2a (ENSFHEG00000014740)	ENSFHEG00000014598	gltpa (ENSFHEG00000014578)	trpv4 (ENSFHEG00000014524)	fam222aa (ENSFHEG00000013624)	ENSFHEG00000013605	mmab (ENSFHEG00000000318)	ENSFHEG00000013583	ube3b (ENSFHEG00000000315)	kctd10 (ENSFHEG00000013475) #22	ENSFHEG00000013455	ENSFHEG00000013410	foxn4 (ENSFHEG00000013376)	ACACB (ENSFHEG00000013208)	pole (ENSFHEG00000013067)	p2rx2 (ENSFHEG00000012950)	pes (ENSFHEG00000000287)	gal3st1a (ENSFHEG00000012906)	lztr1 (ENSFHEG00000012890)	cldn26 (ENSFHEG00000012823)	AIFM3 (ENSFHEG00000012805)	si:dkey-98f17.5 (ENSFHEG00000012744)	slc2a11b (ENSFHEG00000012703)	slc2a11b (ENSFHEG00000000280)	rbm19 (ENSFHEG00000012578)
Poeciliinae	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000162007	ENSGT00390000018351	ENSGT00940000156871.o	ENSGT00940000164250	ENSGT01100000263553.a.b.b.b	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383.a	ENSGT01070000253867	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B.a	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000166398	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430.a	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000010194	ENSGT01020000230351.A	ENSGT00390000002626	ENSGT00950000182923.C.a	ENSGT00940000158190	ENSGT00940000161922	ENSGT00940000160448	ENSGT00500000045140.a.b	ENSGT00940000164243.i	ENSGT00940000164243.j	ENSGT00840000129953	ENSGT00530000063509.B
Poecilia	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000163900	ENSGT00390000018351	ENSGT00940000156871.o	ENSGT00940000164250	ENSGT01100000263553.a.b.b.b	ENSGT00950000182928.A.b	ENSGT00940000156383.a	ENSGT01070000253867	ENSGT00940000155182.b	ENSGT00940000158615	ENSGT00530000063811.B.a	ENSGT00950000183187.C	ENSGT00390000008432	ENSGT00940000166398	ENSGT00940000156548	ENSGT00950000183143.c.a #22	ENSGT00940000156430.a	ENSGT00940000158984	ENSGT00940000155049	ENSGT00390000010194	ENSGT01020000230351.A	ENSGT00390000002626	ENSGT00950000182923.C.a	ENSGT00940000158190	ENSGT00940000161922	ENSGT00940000160448	ENSGT00500000045140.a.b	ENSGT00940000164243.i	ENSGT00940000164243.j	ENSGT00840000129953	ENSGT00530000063509.B
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Sailfin molly	MODERN SPECIES	104							git2a (ENSPLAG00000004410)	ENSPLAG00000004382	gltpa (ENSPLAG00000004375)	trpv4 (ENSPLAG00000004349)	fam222aa (ENSPLAG00000004323)	mvk (ENSPLAG00000004319)	mmab (ENSPLAG00000004298)	ENSPLAG00000004291	ube3b (ENSPLAG00000004257)	kctd10 (ENSPLAG00000004173) #22	MYO1H (ENSPLAG00000004155)	foxn4 (ENSPLAG00000004110)	ACACB (ENSPLAG00000004093)	pole (ENSPLAG00000004016)	p2rx2 (ENSPLAG00000003908)	pes (ENSPLAG00000003811)	gal3st1a (ENSPLAG00000003772)	lztr1 (ENSPLAG00000003760)	cldn26 (ENSPLAG00000000066)	AIFM3 (ENSPLAG00000003740)	si:dkey-98f17.5 (ENSPLAG00000003709)	slc2a11b (ENSPLAG00000003689)	slc2a11b (ENSPLAG00000003664)	rbm19 (ENSPLAG00000000059)	plbd2 (ENSPLAG00000003572)
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Tiger tail seahorse	MODERN SPECIES	89	gatc (ENSHCOG00000009209)	ENSHCOG00000009100	SGSM1 (ENSHCOG00000009083)	slc6a4b (ENSHCOG00000009028)	ENSHCOG00000008997	ankrd13a (ENSHCOG00000008985)	git2a (ENSHCOG00000008926)	ENSHCOG00000008792	gltpa (ENSHCOG00000008776)	trpv4 (ENSHCOG00000008688)	fam222aa (ENSHCOG00000008652)	mvk (ENSHCOG00000008630)	mmab (ENSHCOG00000000281)	ENSHCOG00000008367	ube3b (ENSHCOG00000008356)	kctd10 (ENSHCOG00000008309) #22	ENSHCOG00000008287	ENSHCOG00000008257	foxn4 (ENSHCOG00000008217)	ACACB (ENSHCOG00000008190)	ENSHCOG00000008092	pole (ENSHCOG00000008062)
Pinecone sodierfish	MODERN SPECIES	23	pxmp2 (ENSMMDG00005017968)	ENSMMDG00005017965	gatc (ENSMMDG00005017962)	SGSM1 (ENSMMDG00005017899)	slc6a4b (ENSMMDG00005017886)	ankrd13a (ENSMMDG00005017861)	git2a (ENSMMDG00005017636)	tchp (ENSMMDG00005017620)	gltpa (ENSMMDG00005017615)	trpv4 (ENSMMDG00005017605)	fam222aa (ENSMMDG00005017597)	mvk (ENSMMDG00005017592)	mmab (ENSMMDG00005017581)	ENSMMDG00005017398	ube3b (ENSMMDG00005016904)	kctd10 (ENSMMDG00005016868) #22	MYO1H (ENSMMDG00005015517)	foxn4 (ENSMMDG00005015470)	ACACB (ENSMMDG00005014232)	pole (ENSMMDG00005013689)	p2rx2 (ENSMMDG00005013666)	pes (ENSMMDG00005013661)	gal3st1a (ENSMMDG00005013657)	lztr1 (ENSMMDG00005012762)	cldn26 (ENSMMDG00005012747)	AIFM3 (ENSMMDG00005012624)	si:dkey-98f17.5 (ENSMMDG00005012601)	slc2a11b (ENSMMDG00005012511)	rbm19 (ENSMMDG00005012492)	plbd2 (ENSMMDG00005012459)	ENSMMDG00005012446
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Salmoninae	DUPLICATION
Salmoninae	DUPLICATION
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	73	ENSGT00940000156871.p.d	ENSGT00940000163530.k.a	ENSGT00940000156839.j.a.a.a	ENSGT00940000160711.h.b	ENSGT00390000006265.b.c.f	ENSGT00950000183101.b.b.a	ENSGT00390000014052.b	ENSGT00390000009869.e	ENSGT00940000159368.a.c	ENSGT00940000155845.t.c	ENSGT00420000029890.c	ENSGT00940000155735.r.a	ENSGT00940000155882.a.b.b.a	ENSGT00940000156599.g.a	ENSGT00940000160709.ab.a.a	ENSGT00950000183143.c.a.i.a #22	ENSGT00940000156430.b	ENSGT00940000158984.x.a	ENSGT00940000155403.b.c	ENSGT00940000156133.a.b.c	ENSGT00940000156488.a.a.c	ENSGT00390000017134.e	ENSGT00390000015813.b.b.g.a	ENSGT01020000230438.C.f.b	ENSGT00390000014107.a.a.s	ENSGT00600000084860.B.b	ENSGT00940000162536	ENSGT00390000009387.f	ENSGT00940000163130	ENSGT00390000017655.p	ENSGT00940000162972
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Chinook salmon	MODERN SPECIES	12	git2b (ENSOTSG00005037644)	ENSOTSG00005037265	triap1 (ENSOTSG00005037252)	srsf9 (ENSOTSG00005037251)	RTN4R (ENSOTSG00005037250)	ENSOTSG00005036845	SCARF2 (ENSOTSG00005036839)	zmat5 (ENSOTSG00005036838)	CABP7 (ENSOTSG00005036836)	tescb (ENSOTSG00005036835)	m17 (ENSOTSG00005036832)	ENSOTSG00005036829	hspb15 (ENSOTSG00005036827)	GALNT9 (ENSOTSG00005036821)	ENSOTSG00005036820	kctd10 (ENSOTSG00005036819) #22	ENSOTSG00005036758	FOXN4 (ENSOTSG00005036752)	ENSOTSG00005036681	SSH1 (ENSOTSG00005036680)	ENSOTSG00005036590	tmem119b (ENSOTSG00005036589)	iscub (ENSOTSG00005036588)	CMKLR1 (ENSOTSG00005036587)	rnf185 (ENSOTSG00005036586)	ENSOTSG00005036585	ENSOTSG00005036584	TSSK1B (ENSOTSG00005036583)	ess2 (ENSOTSG00005036574)	dgcr2 (ENSOTSG00005036559)	car15 (ENSOTSG00005036558)
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River trout	MODERN SPECIES	15	triap1 (ENSSTUG00000048728)	srsf9 (ENSSTUG00000048729)	RTN4R (ENSSTUG00000048738)	ENSSTUG00000048757	ENSSTUG00000048891	SCARF2 (ENSSTUG00000048893)	uqcr10 (ENSSTUG00000048901)	zmat5 (ENSSTUG00000048903)	CABP7 (ENSSTUG00000048909)	tescb (ENSSTUG00000048919)	m17 (ENSSTUG00000048926)	ENSSTUG00000048929	hspb15 (ENSSTUG00000048935)	GALNT9 (ENSSTUG00000048940)	ENSSTUG00000048964	kctd10 (ENSSTUG00000048978) #22	MYO1H (ENSSTUG00000049012)	FOXN4 (ENSSTUG00000049280)	ENSSTUG00000049288	SSH1 (ENSSTUG00000049309)	ENSSTUG00000049445	ENSSTUG00000049566	ISCU (ENSSTUG00000049568)	CMKLR1 (ENSSTUG00000049572)	rnf185 (ENSSTUG00000049577)	ENSSTUG00000049581	ENSSTUG00000049585	ess2 (ENSSTUG00000049587)	ENSSTUG00000049590	dgcr2 (ENSSTUG00000049595)	car15 (ENSSTUG00000049605)
Atlantic salmon	MODERN SPECIES		ENSSSAG00000003903	ENSSSAG00000004530	srsf9 (ENSSSAG00000004540)	ENSSSAG00000004563	ENSSSAG00000004638	ENSSSAG00000005397	UQCR10 (ENSSSAG00000121536)	zmat5 (ENSSSAG00000005421)	CABP7 (ENSSSAG00000005442)	tescb (ENSSSAG00000097089)	m17 (ENSSSAG00000090891)	ENSSSAG00000088504	HSPB1 (ENSSSAG00000005477)	ENSSSAG00000005501	ENSSSAG00000005560	KCTD10 (ENSSSAG00000005570) #22	ENSSSAG00000005650	FOXN4 (ENSSSAG00000005861)	ENSSSAG00000005876	SSH1 (ENSSSAG00000099714)	cor1c (ENSSSAG00000005930)	ENSSSAG00000006039	ISCU (ENSSSAG00000006059)	CML1 (ENSSSAG00000006091)	RN185 (ENSSSAG00000006099)	ENSSSAG00000103197	ENSSSAG00000117508	ess2 (ENSSSAG00000079668)	ENSSSAG00000006248	dgcr2 (ENSSSAG00000006275)	car15 (ENSSSAG00000006378)
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000160711.h.a	ENSGT00390000006265.b.c.e	ENSGT00950000183101.b.b.b	ENSGT00390000014052.a	ENSGT00390000009869.f	ENSGT00940000159368.a.d	ENSGT00940000155845.t.d	ENSGT00420000029890.d	ENSGT00940000155735.r.b	ENSGT00940000155882.a.b.b.b	ENSGT00730000110943.B.d.b	ENSGT00940000156599.g.b	ENSGT00940000160709.ab.a.b	ENSGT00390000006114	ENSGT00940000166058	ENSGT00950000183143.c.a.i.b #22	ENSGT00940000171590.a.b	ENSGT00940000158984.x.b	ENSGT00940000155403.b.d	ENSGT00940000156133.a.b.d	ENSGT00940000156488.a.a.d	ENSGT01030000234989.a	ENSGT00390000017134.f	ENSGT00390000015813.b.b.g.b	ENSGT00390000014107.a.a.t	ENSGT00600000084860.B.a	ENSGT00390000009387.e	ENSGT00940000162226	ENSGT00390000017655.o	ENSGT00940000154575.a.b.e	ENSGT00940000158903.mb.a
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00940000160711.h.a	ENSGT00390000006265.b.c.e	ENSGT00950000183101.b.b.b	ENSGT00390000014052.a	ENSGT00390000009869.f	ENSGT00940000159368.a.d	ENSGT00940000155845.t.d	ENSGT00420000029890.d	ENSGT00940000155735.r.b	ENSGT00940000155882.a.b.b.b	ENSGT00730000110943.B.d.b	ENSGT00940000156599.g.b	ENSGT00940000160709.ab.a.b	ENSGT00390000006114	ENSGT00940000166058	ENSGT00950000183143.c.a.i.b #22	ENSGT00940000158984.x.b	ENSGT00940000155403.b.d	ENSGT00940000156133.a.b.d	ENSGT00940000156488.a.a.d	ENSGT01030000234989.a	ENSGT00990000203805.d	ENSGT00390000017134.f	ENSGT00390000015813.b.b.g.b	ENSGT00390000014107.a.a.t	ENSGT00600000084860.B.a	ENSGT00390000009387.e	ENSGT00940000162226	ENSGT00390000017655.o	ENSGT00940000154575.a.b.e	ENSGT00940000158903.mb.a
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000160711.h.a	ENSGT00390000006265.b.c.e	ENSGT00950000183101.b.b.b	ENSGT00390000014052.a	ENSGT00390000009869.f	ENSGT00940000159368.a.d	ENSGT00940000155845.t.d	ENSGT00420000029890.d	ENSGT00940000155735.r.b	ENSGT00940000155882.a.b.b.b	ENSGT00730000110943.B.d.b	ENSGT00940000156599.g.b	ENSGT00940000160709.ab.a.b	ENSGT00390000006114	ENSGT00940000166058	ENSGT00950000183143.c.a.i.b #22	ENSGT00940000156430.b.h	ENSGT00940000158984.x.b	ENSGT00940000155403.b.d	ENSGT00940000156133.a.b.d	ENSGT00940000156488.a.a.d	ENSGT01030000234989.a	ENSGT00990000203805.d	ENSGT00390000017134.f	ENSGT00390000015813.b.b.g.b	ENSGT00390000014107.a.a.t	ENSGT00600000084860.B.a	ENSGT00390000009387.e	ENSGT00940000162226	ENSGT00390000017655.o	ENSGT00940000154575.a.b.e
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	4	ENSSSAG00000080013	ENSSSAG00000120649	zmat5 (ENSSSAG00000080002)	ENSSSAG00000100827	m17 (ENSSSAG00000086976)	tescb (ENSSSAG00000094208)	ENSSSAG00000090746	ENSSSAG00000106720	ENSSSAG00000112402	ENSSSAG00000079945	ENSSSAG00000079924	ENSSSAG00000079914	ENSSSAG00000111935	foxred1 (ENSSSAG00000079816)	ENSSSAG00000079794	ENSSSAG00000079786 #22	ENSSSAG00000079776	ENSSSAG00000079760	ENSSSAG00000079738	ENSSSAG00000079699	ENSSSAG00000108399	ENSSSAG00000079689	ENSSSAG00000079682	ENSSSAG00000094165	ess2 (ENSSSAG00000006149)	TSSK2 (ENSSSAG00000106957)	dgcr2 (ENSSSAG00000079659)	setd1ba (ENSSSAG00000079647)	RHOF (ENSSSAG00000079642)	tmem120b (ENSSSAG00000079547)	orai1b (ENSSSAG00000087746)
River trout	MODERN SPECIES	6	ENSSTUG00000005316	ENSSTUG00000004956	SCARF2 (ENSSTUG00000004919)	uqcr10 (ENSSTUG00000004911)	zmat5 (ENSSTUG00000004882)	CABP7 (ENSSTUG00000004872)	tescb (ENSSTUG00000004853)	m17 (ENSSTUG00000004844)	ENSSTUG00000004832	ENSSTUG00000004818	SUSD2 (ENSSTUG00000004535)	GALNT9 (ENSSTUG00000004491)	ENSSTUG00000004461	foxred1 (ENSSTUG00000003447)	cry5 (ENSSTUG00000003353)	kctd10 (ENSSTUG00000003289) #22	ENSSTUG00000003270	FOXN4 (ENSSTUG00000003233)	SSH1 (ENSSTUG00000003062)	ENSSTUG00000002297	ENSSTUG00000002084	ENSSTUG00000001886	iscub (ENSSTUG00000035888)	rnf185 (ENSSTUG00000035868)	ENSSTUG00000035859	ess2 (ENSSTUG00000035801)	TSSK2 (ENSSTUG00000035788)	dgcr2 (ENSSTUG00000035719)	setd1ba (ENSSTUG00000035659)	rhof (ENSSTUG00000035640)	tmem120b (ENSSTUG00000035040)
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Coho salmon	MODERN SPECIES	26	ENSOKIG00005001193	SCARF2 (ENSOKIG00005001285)	uqcr10 (ENSOKIG00005001292)	zmat5 (ENSOKIG00005001298)	CABP7 (ENSOKIG00005001302)	tescb (ENSOKIG00005001307)	m17 (ENSOKIG00005001317)	ENSOKIG00005001319	ENSOKIG00005001325	ENSOKIG00005001338	GALNT9 (ENSOKIG00005001365)	ENSOKIG00005001372	ENSOKIG00005001375	foxred1 (ENSOKIG00005001411)	cry5 (ENSOKIG00005001528)	KCTD10 (ENSOKIG00005001537) #22	ENSOKIG00005001544	FOXN4 (ENSOKIG00005001551)	ENSOKIG00005001569	SSH1 (ENSOKIG00005001606)	CORO1C (ENSOKIG00005001673)	ENSOKIG00005001925	TMEM119 (ENSOKIG00005001931)	iscub (ENSOKIG00005001937)	ESS2 (ENSOKIG00005001985)	ENSOKIG00005002071	TSSK2 (ENSOKIG00005002097)	dgcr2 (ENSOKIG00005002147)	setd1ba (ENSOKIG00005002303)	rhof (ENSOKIG00005002388)	tmem120b (ENSOKIG00005002518)
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Rainbow trout	MODERN SPECIES	3	ENSOMYG00000033804	ENSOMYG00000033813	ENSOMYG00000033830	ENSOMYG00000014704	tescb (ENSOMYG00000033844)	ENSOMYG00000033862	m17 (ENSOMYG00000033868)	ENSOMYG00000033874	ENSOMYG00000033886	ENSOMYG00000033932	ENSOMYG00000073679	ENSOMYG00000034275	ENSOMYG00000034285	ENSOMYG00000034336	ENSOMYG00000034621	ENSOMYG00000034634 #22	ENSOMYG00000053228	ENSOMYG00000034653	SSH1 (ENSOMYG00000034679)	ENSOMYG00000034793	ENSOMYG00000035723	ENSOMYG00000035726	iscua (ENSOMYG00000035740)	ENSOMYG00000035761	ENSOMYG00000069059	ess2 (ENSOMYG00000035821)	TSSK2 (ENSOMYG00000035850)	dgcr2 (ENSOMYG00000035877)	setd1ba (ENSOMYG00000035931)	rhof (ENSOMYG00000035973)	tmem120b (ENSOMYG00000036219)
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Salmoninae	DUPLICATION
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Salmo	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000002374	ENSGT00940000157487	ENSGT01090000260294.a	ENSGT00940000156871.o.f	ENSGT00940000164250.c	ENSGT00950000182928.A.b.s	ENSGT00940000156383.a.c	ENSGT01070000253909	ENSGT00940000155182.b.z	ENSGT00940000158615.d	ENSGT00530000063811.B.a.d	ENSGT00950000183187.C.b	ENSGT00990000210642	ENSGT00940000166398	ENSGT00940000156548.e	ENSGT00950000183143.c.a.j.a #22	ENSGT00940000156430.a.t	ENSGT00940000158984.w.a	ENSGT00940000155049.eb	ENSGT01020000230351.A.h	ENSGT00390000002626.n	ENSGT00950000182923.C.a.c	ENSGT00940000161922.f	ENSGT00940000160448.l	ENSGT00940000164243.c	ENSGT00940000165954.b	ENSGT00800000124190.j	ENSGT00390000000560.b.a	ENSGT00940000160404.b	ENSGT00940000160570.c	ENSGT00940000153246.b
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River trout	MODERN SPECIES	19	ENSSTUG00000013277	SGSM1 (ENSSTUG00000013338)	ENSSTUG00000014338	slc6a4b (ENSSTUG00000014340)	ankrd13a (ENSSTUG00000014378)	git2a (ENSSTUG00000014522)	tchp (ENSSTUG00000018428)	ENSSTUG00000018463	gltpa (ENSSTUG00000018479)	trpv4 (ENSSTUG00000018591)	fam222aa (ENSSTUG00000022448)	mvk (ENSSTUG00000022453)	ENSSTUG00000022489	ENSSTUG00000022533	ube3b (ENSSTUG00000022659)	kctd10 (ENSSTUG00000022922) #22	MYO1H (ENSSTUG00000022955)	foxn4 (ENSSTUG00000023093)	ACACB (ENSSTUG00000023375)	ENSSTUG00000028773	p2rx2 (ENSSTUG00000028840)	pes (ENSSTUG00000028858)	gal3st1a (ENSSTUG00000028908)	cldn26 (ENSSTUG00000028911)	AIFM3 (ENSSTUG00000028929)	slc2a11b (ENSSTUG00000029355)	gstt2 (ENSSTUG00000029436)	chek2 (ENSSTUG00000029492)	entr1 (ENSSTUG00000029654)	ENSSTUG00000029661	snapc4 (ENSSTUG00000029663)
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Chinook salmon	DUPLICATION
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Chinook salmon	MODERN SPECIES	28	hnrnpk (ENSOTSG00005044730)	zgc:136564 (ENSOTSG00005044728)	ENSOTSG00005044727	SGSM1 (ENSOTSG00005044609)	slc6a4b (ENSOTSG00005044555)	ankrd13a (ENSOTSG00005044547)	git2a (ENSOTSG00005043819)	tchp (ENSOTSG00005043777)	gltpa (ENSOTSG00005043774)	trpv4 (ENSOTSG00005040263)	fam222aa (ENSOTSG00005040251)	mvk (ENSOTSG00005040250)	mmab (ENSOTSG00005040249)	ENSOTSG00005040248	ube3b (ENSOTSG00005040191)	kctd10 (ENSOTSG00005040187) #22	MYO1H (ENSOTSG00005040186)	foxn4 (ENSOTSG00005040170)	ACACB (ENSOTSG00005030530)	p2rx2 (ENSOTSG00005030424)	pes (ENSOTSG00005030371)	gal3st1a (ENSOTSG00005030369)	cldn26 (ENSOTSG00005030368)	AIFM3 (ENSOTSG00005030360)	slc2a11b (ENSOTSG00005030324)	gstt2 (ENSOTSG00005030323)	chek2 (ENSOTSG00005030291)	entr1 (ENSOTSG00005030287)	ENSOTSG00005030285	CARD9 (ENSOTSG00005030282)	ENSOTSG00005030280
Coho salmon	MODERN SPECIES	22	zgc:136564 (ENSOKIG00005019608)	ENSOKIG00005019597	ENSOKIG00005019583	SGSM1 (ENSOKIG00005017770)	slc6a4b (ENSOKIG00005016096)	ankrd13a (ENSOKIG00005015907)	git2a (ENSOKIG00005010120)	tchp (ENSOKIG00005009719)	gltpa (ENSOKIG00005009698)	trpv4 (ENSOKIG00005009059)	fam222aa (ENSOKIG00005008985)	mvk (ENSOKIG00005008935)	mmab (ENSOKIG00005008887)	ENSOKIG00005008813	ube3b (ENSOKIG00005008649)	kctd10 (ENSOKIG00005008538) #22	MYO1H (ENSOKIG00005008294)	foxn4 (ENSOKIG00005008178)	ACACB (ENSOKIG00005006430)	p2rx2 (ENSOKIG00005006108)	pes (ENSOKIG00005006041)	gal3st1a (ENSOKIG00005006001)	cldn26 (ENSOKIG00005005992)	ENSOKIG00005005988	AIFM3 (ENSOKIG00005005870)	slc2a11b (ENSOKIG00005005833)	ENSOKIG00005005817	chek2 (ENSOKIG00005005766)	entr1 (ENSOKIG00005005742)	snapc4 (ENSOKIG00005005686)	CARD9 (ENSOKIG00005005656)
Huchen	MODERN SPECIES	285												mvk (ENSHHUG00000043849)	ENSHHUG00000043831	ENSHHUG00000043821	ube3b (ENSHHUG00000043818)	kctd10 (ENSHHUG00000043812) #22	ENSHHUG00000043809	MYO1H (ENSHHUG00000043805)	foxn4 (ENSHHUG00000043794)	ACACB (ENSHHUG00000042553)	ENSHHUG00000042525	ENSHHUG00000042523	p2rx2 (ENSHHUG00000042519)	pes (ENSHHUG00000042512)	gal3st1a (ENSHHUG00000042509)	cldn26 (ENSHHUG00000042502)	AIFM3 (ENSHHUG00000042490)	ENSHHUG00000042487	slc2a11b (ENSHHUG00000042469)	gstt2 (ENSHHUG00000042462)	chek2 (ENSHHUG00000042422)
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Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000155181.c.a.e	ENSGT00390000016025.a	ENSGT00940000153434.c.a.a	ENSGT00940000157487	ENSGT01090000260294.b	ENSGT00940000156871.o.e	ENSGT00940000164250.d	ENSGT00950000182928.A.b.t	ENSGT00940000156383.a.d	ENSGT00940000155182.b.y	ENSGT00940000158615.c	ENSGT00530000063811.B.a.c	ENSGT00950000183187.C.a	ENSGT00390000008432.e.a	ENSGT00940000156548.f	ENSGT00950000183143.c.a.j.b #22	ENSGT00940000156430.a.s	ENSGT00940000158984.w.b	ENSGT00940000155049.db	ENSGT00390000010194	ENSGT01020000230351.A.g	ENSGT00390000002626.m	ENSGT00950000182923.C.a.d	ENSGT00940000158190	ENSGT00940000161922.e	ENSGT00940000160448.k	ENSGT00500000045140.a.b	ENSGT00940000164243.d	ENSGT00940000165954.a	ENSGT00800000124190.i	ENSGT00390000000560.b.b.b
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000155181.c.a.e	ENSGT00390000016025.a	ENSGT00940000153434.c.a.a	ENSGT00940000157487	ENSGT01090000260294.b	ENSGT00940000156871.o.e	ENSGT00940000164250.d	ENSGT00950000182928.A.b.t	ENSGT00940000156383.a.d	ENSGT00940000155182.b.y	ENSGT00940000158615.c	ENSGT00530000063811.B.a.c	ENSGT00950000183187.C.a	ENSGT00390000008432.e.a	ENSGT00940000156548.f	ENSGT00950000183143.c.a.j.b #22	ENSGT00940000156430.a.s	ENSGT00940000158984.w.b	ENSGT00940000155049.db	ENSGT00390000010194	ENSGT01020000230351.A.g	ENSGT00390000002626.m	ENSGT00950000182923.C.a.d	ENSGT00940000158190	ENSGT00940000161922.e	ENSGT00940000160448.k	ENSGT00500000045140.a.b	ENSGT00940000164243.d	ENSGT00940000165954.a	ENSGT00800000124190.i	ENSGT00390000000560.b.b.b
Chinook salmon	MODERN SPECIES	3	SLC28A3 (ENSOTSG00005041342)	hnrnpk (ENSOTSG00005041590)	ENSOTSG00005041593	ENSOTSG00005041594	ENSOTSG00005032551	slc6a4b (ENSOTSG00005032650)	ankrd13a (ENSOTSG00005036694)	git2a (ENSOTSG00005036784)	gltpa (ENSOTSG00005037391)	trpv4 (ENSOTSG00005037452)	fam222aa (ENSOTSG00005042710)	ENSOTSG00005042711	ENSOTSG00005042712	mmab (ENSOTSG00005042713)	ube3b (ENSOTSG00005042714)	kctd10 (ENSOTSG00005042726) #22	MYO1H (ENSOTSG00005042732)	foxn4 (ENSOTSG00005042909)	ACACB (ENSOTSG00005042933)	pole (ENSOTSG00005046043)	p2rx2 (ENSOTSG00005046499)	pes (ENSOTSG00005046501)	gal3st1a (ENSOTSG00005046508)	lztr1 (ENSOTSG00005046510)	AIFM3 (ENSOTSG00005046581)	si:dkey-98f17.5 (ENSOTSG00005046592)	slc2a11b (ENSOTSG00005046594)	gstt2 (ENSOTSG00005046595)	chek2 (ENSOTSG00005046599)	ENSOTSG00005046601	snapc4 (ENSOTSG00005046602)
Coho salmon	MODERN SPECIES	28	hnrnpk (ENSOKIG00005033255)	ENSOKIG00005033313	ENSOKIG00005033332	ENSOKIG00005033345	ENSOKIG00005033548	slc6a4b (ENSOKIG00005036918)	ankrd13a (ENSOKIG00005037469)	ENSOKIG00005037625	git2a (ENSOKIG00005037858)	gltpa (ENSOKIG00005041679)	trpv4 (ENSOKIG00005041809)	fam222aa (ENSOKIG00005044671)	mvk (ENSOKIG00005044681)	mmab (ENSOKIG00005044723)	ube3b (ENSOKIG00005044759)	kctd10 (ENSOKIG00005044817) #22	ENSOKIG00005044824	foxn4 (ENSOKIG00005044827)	ACACB (ENSOKIG00005045124)	pole (ENSOKIG00005047293)	p2rx2 (ENSOKIG00005047418)	pes (ENSOKIG00005047552)	gal3st1a (ENSOKIG00005047746)	lztr1 (ENSOKIG00005047763)	cldn26 (ENSOKIG00005047844)	AIFM3 (ENSOKIG00005047868)	si:dkey-98f17.5 (ENSOKIG00005047944)	slc2a11b (ENSOKIG00005047956)	gstt2 (ENSOKIG00005047990)	chek2 (ENSOKIG00005048005)	ENSOKIG00005048042
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Northern pike	DUPLICATION
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Northern pike	MODERN SPECIES	12	zgc:136564 (ENSELUG00000002827)	KIF27 (ENSELUG00000001218)	ENSELUG00000024729	SGSM1 (ENSELUG00000002879)	tlr22 (ENSELUG00000002846)	slc6a4b (ENSELUG00000002939)	ankrd13a (ENSELUG00000002956)	git2a (ENSELUG00000002981)	tchp (ENSELUG00000003035)	gltpa (ENSELUG00000003047)	trpv4 (ENSELUG00000003057)	fam222aa (ENSELUG00000003068)	mvk (ENSELUG00000001228)	mmab (ENSELUG00000003088)	ube3b (ENSELUG00000003105)	kctd10 (ENSELUG00000000101) #22	MYO1H (ENSELUG00000003132)	foxn4 (ENSELUG00000003146)	ACACB (ENSELUG00000003177)	pole (ENSELUG00000003209)	p2rx2 (ENSELUG00000003239)	pes (ENSELUG00000003253)	gal3st1a (ENSELUG00000003263)	lztr1 (ENSELUG00000003298)	cldn26 (ENSELUG00000003313)	AIFM3 (ENSELUG00000003338)	si:dkey-98f17.5 (ENSELUG00000003365)	slc2a11b (ENSELUG00000003390)	gstt2 (ENSELUG00000003405)	chek2 (ENSELUG00000003419)	entr1 (ENSELUG00000003431)
Elephant shark	MODERN SPECIES	1576	wscd2 (ENSCMIG00000014328)	gstt2 (ENSCMIG00000014330)	chek2 (ENSCMIG00000014332)	ENSCMIG00000014336	ENSCMIG00000014338	slc7a4 (ENSCMIG00000014339)	dgcr6 (ENSCMIG00000014340)	ENSCMIG00000014342	ENSCMIG00000014343	ENSCMIG00000014344	asphd2 (ENSCMIG00000014347)	SEZ6L (ENSCMIG00000014376)	MYO18B (ENSCMIG00000014434)	crybb1 (ENSCMIG00000014442)	si:dkey-174n20.1 (ENSCMIG00000014452)	kctd10 (ENSCMIG00000014473) #22	SGSM1 (ENSCMIG00000014492)	usp30 (ENSCMIG00000014531)	alkbh2 (ENSCMIG00000014534)	UNG (ENSCMIG00000014535)	MYO1H (ENSCMIG00000014542)	foxn4 (ENSCMIG00000014557)	ENSCMIG00000014563	ACACB (ENSCMIG00000014792)	ube3b (ENSCMIG00000015368)	mmab (ENSCMIG00000015377)	mvk (ENSCMIG00000015383)	ENSCMIG00000015388	fam222aa (ENSCMIG00000015389)	trpv4 (ENSCMIG00000015398)	gltpa (ENSCMIG00000015423)
Cyclostomata	ANCESTRAL SPECIES	175														ENSGT00390000007149	ENSGT00390000003413	ENSGT00950000183143.c.a #22
Lamprey	MODERN SPECIES	1058														tmem97 (ENSPMAG00000003525)	ift20 (ENSPMAG00000003532)	kctd10 (ENSPMAG00000003538) #22
Hagfish	MODERN SPECIES	680		ENSEBUG00000016917	ENSEBUG00000011572	ENSEBUG00000013088	ENSEBUG00000002156	ENSEBUG00000008772	ENSEBUG00000000717	ENSEBUG00000002995	ENSEBUG00000009206	ENSEBUG00000016908	ENSEBUG00000001829	ENSEBUG00000002920	ENSEBUG00000000322	ENSEBUG00000016996	ift20 (ENSEBUG00000016655)	kctd10 (ENSEBUG00000013678) #22	ENSEBUG00000001865	USP32 (ENSEBUG00000016737)	ENSEBUG00000006359	ENSEBUG00000013899	ENSEBUG00000003369	ENSEBUG00000013058	ENSEBUG00000015185	ENSEBUG00000000897	ENSEBUG00000000990	ENSEBUG00000008355	ccdc47 (ENSEBUG00000002946)	ENSEBUG00000000724	ENSEBUG00000013907	ENSEBUG00000009192	ENSEBUG00000016714
Vertebrata	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183143.c.b ##22
Gnathostomata	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183143.c.b ##22
Euteleostomi	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183143.c.b ##22
Sarcopterygii	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183143.c.b ##22
Tetrapoda	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183143.c.b ##22
Amniota	ANCESTRAL SPECIES	90								ENSGT00390000014991	ENSGT00530000063743.a	ENSGT00940000159895	ENSGT00930000151040	ENSGT00940000180015	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00940000153883.a	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00940000154169.A	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525	ENSGT00940000159632	ENSGT00390000016049	ENSGT00390000008969	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00950000182987.c.a.a
Sauria	ANCESTRAL SPECIES	187																ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676
Lepidosauria	ANCESTRAL SPECIES	74	ENSGT00940000167265	ENSGT00680000101584	ENSGT00390000015278	ENSGT01050000244827.D.a	ENSGT00730000113150	ENSGT00940000165613	ENSGT00940000159195.s	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000160675.f	ENSGT00940000160492	ENSGT00940000159252.b.b	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000159632	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000159991.A	ENSGT00940000154169.A	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525	ENSGT00390000008969	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00970000194055	ENSGT00820000127055.a	ENSGT00950000182987.c.a.a	ENSGT00930000151040	ENSGT00940000160732	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000160691	ENSGT00940000160628
Episquamata	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00390000015278	ENSGT01050000244827.D.a	ENSGT00940000159195.t	ENSGT00390000001948	ENSGT00730000113150	ENSGT00940000165613	ENSGT00940000159195.s.b	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000160675.f	ENSGT00940000160492	ENSGT00940000161676	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000159632	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000169830	ENSGT00940000153883.a	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00940000159991.A	ENSGT00940000154169.A	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525	ENSGT00390000008969	ENSGT00960000190159	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00970000194055	ENSGT00820000127055.a	ENSGT00950000182987.c.a.a	ENSGT00930000151040	ENSGT00940000160732
Laterata	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00390000015278	ENSGT01050000244827.D.a	ENSGT00940000159195.t	ENSGT00390000001948	ENSGT00730000113150	ENSGT00940000165613	ENSGT00940000159195.s.a.a	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000160675.f	ENSGT00940000160492	ENSGT00940000161676	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000159632	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000169830	ENSGT00940000153883.a	ENSGT00940000159991.A	ENSGT00940000154169.A	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525	ENSGT00390000008969	ENSGT00960000190159	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00970000194055	ENSGT00820000127055.a	ENSGT00950000182987.c.a.a	ENSGT00930000151040	ENSGT00940000160732	ENSGT00940000161514
Common wall lizard	MODERN SPECIES	4	THOC6 (ENSPMRG00000013872)	ENSPMRG00000013866	ENSPMRG00000013859	ENSPMRG00000013853	ENSPMRG00000013848	ENSPMRG00000013835	ZG16 (ENSPMRG00000013828)	DOC2A (ENSPMRG00000013817)	INO80E (ENSPMRG00000013811)	HIRIP3 (ENSPMRG00000013807)	ENSPMRG00000013806	SEZ6L2 (ENSPMRG00000013792)	ENSPMRG00000013782	PAGR1 (ENSPMRG00000013780)	KIF22 (ENSPMRG00000013684)	KCTD13 (ENSPMRG00000013639) ##22	ENSPMRG00000013628	CDIPT (ENSPMRG00000013620)	ENSPMRG00000013612	MAZ (ENSPMRG00000013601)	MVP (ENSPMRG00000013586)	TLCD3B (ENSPMRG00000013574)	ENSPMRG00000013567	ENSPMRG00000013564	ALDOA (ENSPMRG00000013553)	PPP4C (ENSPMRG00000013545)	TBX6 (ENSPMRG00000013541)	YPEL3 (ENSPMRG00000013534)	ENSPMRG00000013526	GDPD3 (ENSPMRG00000013521)	MAPK3 (ENSPMRG00000013485)
Argentine black and white tegu	MODERN SPECIES	38	ENSSMRG00000000282	ENSSMRG00000000817	THOC6 (ENSSMRG00000000828)	ENSSMRG00000000858	ENSSMRG00000000862	ENSSMRG00000000877	ENSSMRG00000000885	ENSSMRG00000000903	DOC2A (ENSSMRG00000000955)	INO80E (ENSSMRG00000000977)	ENSSMRG00000001013	SEZ6L2 (ENSSMRG00000001029)	ENSSMRG00000001085	PAGR1 (ENSSMRG00000001090)	KIF22 (ENSSMRG00000001093)	KCTD13 (ENSSMRG00000001099) ##22	ENSSMRG00000001111	ENSSMRG00000001124	ENSSMRG00000001141	ENSSMRG00000001144	CDIPT (ENSSMRG00000001162)	ENSSMRG00000001171	MAZ (ENSSMRG00000001250)	MVP (ENSSMRG00000001268)	ENSSMRG00000002345	TLCD3B (ENSSMRG00000002353)	ENSSMRG00000002355	ENSSMRG00000002357	ALDOA (ENSSMRG00000002361)	PPP4C (ENSSMRG00000002397)	TBX6 (ENSSMRG00000002403)
Toxicofera	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT01050000244827.D.a	ENSGT00940000159195.t	ENSGT00390000001948	ENSGT00730000113150	ENSGT00940000165613	ENSGT00940000159195.s.a.a	ENSGT00940000159195.s.b	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000160675.f	ENSGT00940000160492	ENSGT00940000161676	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000159632	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000169830	ENSGT00940000153883.a	ENSGT00940000159991.B.a	ENSGT00940000159991.A	ENSGT00940000154169.A	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525	ENSGT00390000008969	ENSGT00960000190159	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00970000194055	ENSGT00820000127055.a	ENSGT00950000182987.c.a.a	ENSGT00930000151040	ENSGT00940000160732
Elapidae	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00390000015278	ENSGT01050000244827.D.a	ENSGT00940000159195.t	ENSGT00390000001948	ENSGT00730000113150	ENSGT00940000165613	ENSGT00940000159195.s.b	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000160675.f	ENSGT00940000160492.g	ENSGT00940000161676	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000159632	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000169830.a	ENSGT00940000153883.a	ENSGT00940000159991.B.a	ENSGT00940000159991.A.c	ENSGT00940000154169.A	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525.p.a	ENSGT00390000008969	ENSGT00960000190159	ENSGT01010000222313.A.b.b.a.e	ENSGT00970000194055	ENSGT00820000127055.a.t	ENSGT00950000182987.c.a.a	ENSGT00930000151040.i.b	ENSGT00940000160732
Indian cobra	MODERN SPECIES	337	ENSNNAG00000012605	THOC6 (ENSNNAG00000011928)	ENSNNAG00000011826	ENSNNAG00000011805	ENSNNAG00000011711	ZG16 (ENSNNAG00000011666)	ENSNNAG00000011653	ENSNNAG00000011627	ENSNNAG00000011575	ENSNNAG00000011543	DUSP14 (ENSNNAG00000011516)	SEZ6L2 (ENSNNAG00000010269)	ENSNNAG00000010146	ENSNNAG00000010126	KIF22 (ENSNNAG00000010025)	KCTD13 (ENSNNAG00000009989) ##22	ENSNNAG00000009962	ENSNNAG00000009935	TAOK2 (ENSNNAG00000009193)	CDIPT (ENSNNAG00000009106)	ENSNNAG00000009090	ENSNNAG00000009032	MVP (ENSNNAG00000008139)	ENSNNAG00000008021	ENSNNAG00000007991	ALDOA (ENSNNAG00000007949)	ENSNNAG00000007917	TBX6 (ENSNNAG00000007891)	YPEL3 (ENSNNAG00000007855)	GDPD3 (ENSNNAG00000007804)	ENSNNAG00000007716
Elapidae_a	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT01050000244827.D.a	ENSGT00940000159195.t	ENSGT00390000001948	ENSGT00730000113150	ENSGT00940000165613	ENSGT00940000159195.s.b	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000160675.f	ENSGT00940000160492.g	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000159252.b.b	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000159632	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000169830.a	ENSGT00940000153883.a	ENSGT00940000159991.B.a	ENSGT00940000159991.A.c	ENSGT00940000154169.A	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525.q	ENSGT00940000158525.p.a	ENSGT00390000008969	ENSGT00960000190159	ENSGT01010000222313.A.b.b.a.e	ENSGT00970000194055	ENSGT00820000127055.a.t	ENSGT00950000182987.c.a.a	ENSGT00930000151040.i.b
Acanthophiinae	DUPLICATION
Acanthophiinae	ANCESTRAL SPECIES	31	ENSGT00390000015278	ENSGT01050000244827.D.a	ENSGT00940000159195.t	ENSGT00390000001948	ENSGT00730000113150	ENSGT00940000165613	ENSGT00940000159195.s.b	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000160675.f	ENSGT00940000160492.g	ENSGT00940000161676	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000159632	ENSGT00950000183143.c.b.a ##22	ENSGT00940000169830.a	ENSGT00940000153883.a	ENSGT00940000159991.B.a	ENSGT00940000159991.A.c	ENSGT00940000154169.A	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525.q	ENSGT00940000158525.p.a	ENSGT00390000008969	ENSGT00960000190159	ENSGT01010000222313.A.b.b.a.e	ENSGT00970000194055	ENSGT00820000127055.a.t	ENSGT00950000182987.c.a.a	ENSGT00930000151040.i.b
Mainland tiger snake	MODERN SPECIES	173	ENSNSUG00000019252	ENSNSUG00000019253	ENSNSUG00000019254	ENSNSUG00000019255	ENSNSUG00000019256	ZG16 (ENSNSUG00000019257)	ENSNSUG00000019258	INO80E (ENSNSUG00000019259)	HIRIP3 (ENSNSUG00000019260)	ENSNSUG00000019261	ENSNSUG00000019262	ENSNSUG00000019263	ENSNSUG00000019264	PAGR1 (ENSNSUG00000019265)	KIF22 (ENSNSUG00000019266)	ENSNSUG00000019267 ##22	ENSNSUG00000019268	ENSNSUG00000019269	TAOK2 (ENSNSUG00000019270)	CDIPT (ENSNSUG00000019519)	ENSNSUG00000019520	ENSNSUG00000019521	MVP (ENSNSUG00000019522)	ENSNSUG00000019523	TLCD3B (ENSNSUG00000019524)	ENSNSUG00000019525	ENSNSUG00000019526	ALDOA (ENSNSUG00000019527)	ENSNSUG00000019528	TBX6 (ENSNSUG00000019529)	YPEL3 (ENSNSUG00000019530)
Eastern brown snake	MODERN SPECIES	53	THOC6 (ENSPTXG00000008832)	ENSPTXG00000008831	ENSPTXG00000008830	ENSPTXG00000008815	ENSPTXG00000008813	ZG16 (ENSPTXG00000008812)	ENSPTXG00000008810	ENSPTXG00000008808	ENSPTXG00000008807	ENSPTXG00000008797	ENSPTXG00000008794	SEZ6L2 (ENSPTXG00000008789)	ENSPTXG00000008788	PAGR1 (ENSPTXG00000008786)	KIF22 (ENSPTXG00000008785)	ENSPTXG00000008783 ##22	ENSPTXG00000008782	ENSPTXG00000008781	ENSPTXG00000008780	CDIPT (ENSPTXG00000008778)	ENSPTXG00000008777	ENSPTXG00000008776	MVP (ENSPTXG00000008774)	ENSPTXG00000008772	ENSPTXG00000008771	ENSPTXG00000008770	ALDOA (ENSPTXG00000008768)	TBX6 (ENSPTXG00000008767)	YPEL3 (ENSPTXG00000008766)	GDPD3 (ENSPTXG00000014691)	MAPK3 (ENSPTXG00000014690)
Acanthophiinae	ANCESTRAL SPECIES	273																ENSGT00950000183143.c.b.b ##22	ENSGT00940000159991.A.d
Mainland tiger snake	MODERN SPECIES	342														ENSNSUG00000001282	ENSNSUG00000001285	ENSNSUG00000001289 ##22	ENSNSUG00000001308	ENSNSUG00000001311
Eastern brown snake	MODERN SPECIES	244																ENSPTXG00000013672 ##22	ENSPTXG00000013673
Blue-lipped sea krait	MODERN SPECIES	6984													LEMD3 (ENSLLTG00000013623)	PAGR1 (ENSLLTG00000013628)	KIF22 (ENSLLTG00000013630)	KCTD13 (ENSLLTG00000013635) ##22
Lizard	MODERN SPECIES	893												ENSACAG00000014033	ENSACAG00000014305	ENSACAG00000035935	ENSACAG00000014338	ENSACAG00000014374 ##22	ENSACAG00000043460	ENSACAG00000039978	ENSACAG00000037007	ENSACAG00000014439	ENSACAG00000014661	ENSACAG00000014648	ENSACAG00000014698	ENSACAG00000041954	ENSACAG00000014742	TLCD3B (ENSACAG00000014874)	ENSACAG00000014912	ALDOA (ENSACAG00000014919)	ENSACAG00000038083	PPP4C (ENSACAG00000014977)	TBX6 (ENSACAG00000015031)
tuatara	MODERN SPECIES	27	ENSSPUG00000010937	ENSSPUG00000010928	ENSSPUG00000010915	ENSSPUG00000010896	ENSSPUG00000010885	THOC6 (ENSSPUG00000010877)	ENSSPUG00000010866	ZG16 (ENSSPUG00000010860)	ENSSPUG00000010857	INO80E (ENSSPUG00000010843)	HIRIP3 (ENSSPUG00000010835)	DUSP14 (ENSSPUG00000010827)	SEZ6L2 (ENSSPUG00000010805)	ENSSPUG00000010790	KIF22 (ENSSPUG00000010731)	KCTD13 (ENSSPUG00000010708) ##22	ENSSPUG00000010677	CDIPT (ENSSPUG00000010658)	PRRT2 (ENSSPUG00000010636)	MAZ (ENSSPUG00000010618)	MVP (ENSSPUG00000010594)	ENSSPUG00000010565	ENSSPUG00000010540	PPP4C (ENSSPUG00000010527)	TBX6 (ENSSPUG00000010517)	YPEL3 (ENSSPUG00000010496)	GDPD3 (ENSSPUG00000010472)	MAPK3 (ENSSPUG00000010281)	ENSSPUG00000010244	ENSSPUG00000010232	CORO1A (ENSSPUG00000010220)
Archelosauria	ANCESTRAL SPECIES	42												ENSGT00940000159632	ENSGT00940000158525	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000154169.A	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00940000160675.f	ENSGT00390000014062	ENSGT00390000011918	ENSGT00940000159141	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00950000182987.c.a.a	ENSGT00940000180015	ENSGT00930000151040	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160759	ENSGT00520000055626.b	ENSGT00940000161032	ENSGT00940000157457
Cryptodira	ANCESTRAL SPECIES	106												ENSGT00940000159632	ENSGT00940000158525	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000154169.A	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00940000160675.f	ENSGT00390000014062	ENSGT00390000011918	ENSGT00940000159141
Testudinoidea	ANCESTRAL SPECIES	77											ENSGT00390000008969.n	ENSGT00940000159632	ENSGT00940000158525	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000154169.A	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00940000160675.f	ENSGT00390000014062	ENSGT00390000011918	ENSGT00940000159141
Testudinidae	ANCESTRAL SPECIES	117																ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000160675.f	ENSGT00390000014062	ENSGT00390000011918	ENSGT00940000159141
Abingdon island giant tortoise	MODERN SPECIES	347																KCTD13 (ENSCABG00000007248) ##22	ASPHD1 (ENSCABG00000007245)	SEZ6L2 (ENSCABG00000007230)	ENSCABG00000007227	ENSCABG00000007224	ENSCABG00000007217	PAGR1 (ENSCABG00000007212)	ENSCABG00000007211
Goode s thornscrub tortoise	MODERN SPECIES	183																KCTD13 (ENSGEVG00005015761) ##22	ENSGEVG00005015795	SEZ6L2 (ENSGEVG00005015835)	PAGR1 (ENSGEVG00005016123)	DUSP14 (ENSGEVG00005016198)	ENSGEVG00005016243	INO80E (ENSGEVG00005016265)	ENSGEVG00005016300	ENSGEVG00005016339	ENSGEVG00005016364	ENSGEVG00005016476	ENSGEVG00005016629	ENSGEVG00005016646	ZG16 (ENSGEVG00005016660)	ENSGEVG00005016691	CASP14 (ENSGEVG00005016703)
Emydidae	ANCESTRAL SPECIES	126										ENSGT00390000008969.n	ENSGT00940000159632	ENSGT00940000158525.r	ENSGT00940000158525.s	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000154169.A	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00940000160675.f	ENSGT00940000171898
Three-toed box turtle	MODERN SPECIES	2136																KCTD13 (ENSTMTG00000020304) ##22
painted turtle	MODERN SPECIES	1140										ENSCPBG00000012775	KIF22 (ENSCPBG00000012773)	ENSCPBG00000012770	ENSCPBG00000012768	ENSCPBG00000012766	CDIPT (ENSCPBG00000012764)	KCTD13 (ENSCPBG00000012737) ##22	ASPHD1 (ENSCPBG00000012734)	SEZ6L2 (ENSCPBG00000012672)	ENSCPBG00000012666	ENSCPBG00000012664	PPP4C (ENSCPBG00000012661)	YPEL3 (ENSCPBG00000012655)	MAPK3 (ENSCPBG00000012650)	CORO1A (ENSCPBG00000012644)	ENSCPBG00000012641	ENSCPBG00000012639	SGF29 (ENSCPBG00000012638)	ENSCPBG00000012637	CLN3 (ENSCPBG00000012616)	ENSCPBG00000012407	ENSCPBG00000012394
Chinese turtle	MODERN SPECIES	1938														CDIPT (ENSPSIG00000007200)	ENSPSIG00000000676	KCTD13 (ENSPSIG00000006317) ##22
Mammalia	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00510000047760	ENSGT00940000160628	ENSGT00940000160691	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160732	ENSGT00930000151040	ENSGT00950000182987.c.a.a	ENSGT00980000198830	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00940000153883.a	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00940000154169.A	ENSGT00390000008969	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525	ENSGT00940000159632	ENSGT00940000159195	ENSGT00390000014957	ENSGT00390000012483	ENSGT00940000159805	ENSGT00940000159038.d	ENSGT00940000161794	ENSGT00940000162332
Platypus	MODERN SPECIES	11	ENSOANG00000042768	CORO1A (ENSOANG00000043537)	MAPK3 (ENSOANG00000005892)	GDPD3 (ENSOANG00000005893)	ENSOANG00000044085	TBX6 (ENSOANG00000006061)	PPP4C (ENSOANG00000008136)	ALDOA (ENSOANG00000008135)	ENSOANG00000036075	TLCD3B (ENSOANG00000050540)	ENSOANG00000010036	INO80E (ENSOANG00000010035)	ENSOANG00000045262	TAOK2 (ENSOANG00000010506)	TMEM219 (ENSOANG00000020765)	KCTD13 (ENSOANG00000048238) ##22	ASPHD1 (ENSOANG00000042516)	SEZ6L2 (ENSOANG00000007346)	CDIPT (ENSOANG00000007171)	MVP (ENSOANG00000007170)	ENSOANG00000044563	ENSOANG00000050865	ENSOANG00000037313	MAZ (ENSOANG00000046199)	KIF22 (ENSOANG00000004107)	ENSOANG00000010006	ENSOANG00000038192	ENSOANG00000029631	ENSOANG00000032022	ENSOANG00000029589	CD2BP2 (ENSOANG00000013817)
Theria	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000160628	ENSGT00940000160691	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160732	ENSGT00930000151040	ENSGT00950000182987.c.a.a	ENSGT01030000234914	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00390000002780	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00940000153883.a	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00940000154169.A	ENSGT00390000008969	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525	ENSGT00940000159632	ENSGT00940000159195	ENSGT00390000014957	ENSGT00390000002761	ENSGT00390000017626	ENSGT00390000012483	ENSGT00940000159805	ENSGT00940000159038.d
Eutheria	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00510000047760	ENSGT00940000160691	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160732	ENSGT00930000151040	ENSGT00950000182987.c.a.a	ENSGT01030000234914	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00390000002780	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00940000153883.a	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00490000043964	ENSGT00940000154169.A	ENSGT00390000008969	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525	ENSGT00940000159632	ENSGT00940000159195	ENSGT00390000014957	ENSGT00390000002761	ENSGT00390000017626	ENSGT00390000012483	ENSGT00940000166735
Atlantogenata	ANCESTRAL SPECIES	29	ENSGT00940000160628	ENSGT00940000160691	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160732	ENSGT00930000151040	ENSGT00950000182987.c.a.a	ENSGT01000000214789	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00390000002780	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00940000153883.a	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00490000043964	ENSGT00940000154169.A	ENSGT00390000008969	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000159632	ENSGT00940000159195	ENSGT00390000014957	ENSGT00390000002761	ENSGT00390000017626	ENSGT00390000012483	ENSGT00940000166735	ENSGT00940000159805
Xenarthra	ANCESTRAL SPECIES	3																ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00490000043964	ENSGT00940000154169.A	ENSGT00390000008969	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000159632	ENSGT00940000159195	ENSGT00390000014957	ENSGT00390000002761	ENSGT00390000017626	ENSGT00390000012483	ENSGT00940000166735	ENSGT00940000159805
Sloth	MODERN SPECIES	6197																ENSCHOG00000003554 ##22
Armadillo	MODERN SPECIES	3994													KCNN4 (ENSDNOG00000044059)	ENSDNOG00000044820	ENSDNOG00000042221	KCTD13 (ENSDNOG00000024321) ##22	ASPHD1 (ENSDNOG00000025039)	SEZ6L2 (ENSDNOG00000006890)	ENSDNOG00000025916	CDIPT (ENSDNOG00000043327)	MVP (ENSDNOG00000040061)	PAGR1 (ENSDNOG00000048009)	PRRT2 (ENSDNOG00000045777)	KIF22 (ENSDNOG00000025062)	ZG16 (ENSDNOG00000025094)	C16orf54 (ENSDNOG00000005217)	QPRT (ENSDNOG00000007102)	ENSDNOG00000046199	CD2BP2 (ENSDNOG00000005462)	ENSDNOG00000041755	TBC1D10B (ENSDNOG00000048187)
Afrotheria	ANCESTRAL SPECIES	28	ENSGT00510000047760	ENSGT00940000160628	ENSGT00940000160691	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160732	ENSGT00930000151040	ENSGT00950000182987.c.a.a	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00390000002780	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00940000153883.a	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00940000154169.A	ENSGT00390000008969	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000159632	ENSGT00940000159195	ENSGT00390000014957	ENSGT00390000002761	ENSGT00390000017626	ENSGT00390000012483	ENSGT00940000159805	ENSGT00940000159038.d	ENSGT00940000161794
Tenrec	MODERN SPECIES	6804																KCTD13 (ENSETEG00000018817) ##22	ASPHD1 (ENSETEG00000018815)	ENSETEG00000018810
Afrotheria_a	ANCESTRAL SPECIES	28	ENSGT00510000047760	ENSGT00940000160628	ENSGT00940000160691	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160732	ENSGT00930000151040	ENSGT00950000182987.c.a.a	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00390000002780	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00940000153883.a	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00940000154169.A	ENSGT00390000008969	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000159632	ENSGT00940000159195	ENSGT00390000014957	ENSGT00390000002761	ENSGT00390000017626	ENSGT00390000012483	ENSGT00940000159805	ENSGT00940000159038.d	ENSGT00940000161794
Elephant	MODERN SPECIES	503	CORO1A (ENSLAFG00000029519)	MAPK3 (ENSLAFG00000017904)	GDPD3 (ENSLAFG00000017897)	YPEL3 (ENSLAFG00000017893)	TBX6 (ENSLAFG00000017884)	PPP4C (ENSLAFG00000017878)	ALDOA (ENSLAFG00000017873)	TLCD3B (ENSLAFG00000017867)	C16orf92 (ENSLAFG00000032500)	DOC2A (ENSLAFG00000004734)	INO80E (ENSLAFG00000004631)	HIRIP3 (ENSLAFG00000022825)	TAOK2 (ENSLAFG00000026148)	TMEM219 (ENSLAFG00000006395)	ENSLAFG00000005520	KCTD13 (ENSLAFG00000018058) ##22	ASPHD1 (ENSLAFG00000029524)	SEZ6L2 (ENSLAFG00000022407)	CDIPT (ENSLAFG00000026396)	PAGR1 (ENSLAFG00000032212)	PRRT2 (ENSLAFG00000025630)	KIF22 (ENSLAFG00000008064)	ZG16 (ENSLAFG00000020976)	C16orf54 (ENSLAFG00000008060)	QPRT (ENSLAFG00000010134)	SPN (ENSLAFG00000010131)	CD2BP2 (ENSLAFG00000008812)	TBC1D10B (ENSLAFG00000008815)	MYL11 (ENSLAFG00000008820)	SEPTIN1 (ENSLAFG00000027789)	ZNF48 (ENSLAFG00000008821)
Hyrax	MODERN SPECIES	496																KCTD13 (ENSPCAG00000005897) ##22	ASPHD1 (ENSPCAG00000005847)	SEZ6L2 (ENSPCAG00000005732)	CDIPT (ENSPCAG00000005669)
Boreoeutheria	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000160628	ENSGT00940000160691	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160732	ENSGT00930000151040	ENSGT00950000182987.c.a.a	ENSGT01030000234914	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00390000002780	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00940000153883.a	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00490000043964	ENSGT00940000154169.A	ENSGT00390000008969	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000169143	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525	ENSGT00940000159632	ENSGT00940000159195	ENSGT00390000014957	ENSGT00390000002761	ENSGT00390000017626	ENSGT00390000012483
Euarchontoglires	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000160628	ENSGT00940000160691	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160732	ENSGT00930000151040	ENSGT00950000182987.c.a.a	ENSGT01030000234914	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00390000002780	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00940000153883.a	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00490000043964	ENSGT00940000154169.A	ENSGT00390000008969	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000169143	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525	ENSGT00940000159632	ENSGT00940000159195	ENSGT00390000014957	ENSGT00390000002761	ENSGT00390000017626	ENSGT00390000012483
Primates	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000160628	ENSGT00940000160691	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160732	ENSGT00930000151040	ENSGT00950000182987.c.a.a	ENSGT01040000240645	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00390000002780	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00940000153883.a	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00490000043964	ENSGT00940000154169.A	ENSGT00390000008969	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525	ENSGT00940000159632	ENSGT00940000159195	ENSGT00390000014957	ENSGT00390000002761	ENSGT00390000017626	ENSGT00390000012483	ENSGT00940000159805
Strepsirrhini	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00510000047760	ENSGT00940000160628	ENSGT00940000160691	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160732	ENSGT00930000151040	ENSGT00950000182987.c.a.a	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00390000002780	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00940000153883.a	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00490000043964	ENSGT00940000154169.A	ENSGT00390000008969	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525	ENSGT00940000159632	ENSGT00940000159195	ENSGT00390000014957	ENSGT00390000002761	ENSGT00390000017626	ENSGT00390000012483	ENSGT00940000159805
Lemuriformes	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00510000047760	ENSGT00940000160628	ENSGT00940000160691	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160732	ENSGT00930000151040	ENSGT00950000182987.c.a.a	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00390000002780	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00940000153883.a	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00490000043964	ENSGT00940000154169.A	ENSGT00390000008969	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525	ENSGT00940000159632	ENSGT00940000159195	ENSGT00390000014957	ENSGT00390000002761	ENSGT00390000017626	ENSGT00390000012483	ENSGT00940000159805
Mouse lemur	MODERN SPECIES	8	ENSMICG00000037709	CORO1A (ENSMICG00000047781)	MAPK3 (ENSMICG00000009154)	GDPD3 (ENSMICG00000009150)	YPEL3 (ENSMICG00000031208)	TBX6 (ENSMICG00000009134)	PPP4C (ENSMICG00000009129)	ALDOA (ENSMICG00000009122)	C16orf92 (ENSMICG00000009112)	TLCD3B (ENSMICG00000038237)	DOC2A (ENSMICG00000037303)	INO80E (ENSMICG00000031360)	HIRIP3 (ENSMICG00000036066)	TAOK2 (ENSMICG00000009090)	ENSMICG00000009088	KCTD13 (ENSMICG00000045744) ##22	ASPHD1 (ENSMICG00000010244)	SEZ6L2 (ENSMICG00000010229)	CDIPT (ENSMICG00000010224)	MVP (ENSMICG00000010206)	PAGR1 (ENSMICG00000047735)	PRRT2 (ENSMICG00000027346)	MAZ (ENSMICG00000030392)	KIF22 (ENSMICG00000010183)	ZG16 (ENSMICG00000037619)	C16orf54 (ENSMICG00000029914)	QPRT (ENSMICG00000027088)	CD2BP2 (ENSMICG00000011801)	TBC1D10B (ENSMICG00000036323)	MYL11 (ENSMICG00000030453)	SEPTIN1 (ENSMICG00000011817)
Lemuriformes_a	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00510000047760	ENSGT00940000160628	ENSGT00940000160691	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160732	ENSGT00930000151040	ENSGT00950000182987.c.a.a	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00390000002780	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00940000153883.a	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00490000043964	ENSGT00940000154169.A	ENSGT00390000008969	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525	ENSGT00940000159632	ENSGT00940000159195	ENSGT00390000014957	ENSGT00390000002761	ENSGT00390000017626	ENSGT00390000012483	ENSGT00940000159805
Coquerels sifaka	MODERN SPECIES	812	ENSPCOG00000015225	ENSPCOG00000021295	CORO1A (ENSPCOG00000023961)	MAPK3 (ENSPCOG00000015414)	GDPD3 (ENSPCOG00000010214)	YPEL3 (ENSPCOG00000019682)	TBX6 (ENSPCOG00000026028)	PPP4C (ENSPCOG00000013681)	ALDOA (ENSPCOG00000024732)	TLCD3B (ENSPCOG00000011288)	DOC2A (ENSPCOG00000015884)	INO80E (ENSPCOG00000019034)	ENSPCOG00000026438	TAOK2 (ENSPCOG00000020345)	TMEM219 (ENSPCOG00000014351)	KCTD13 (ENSPCOG00000025325) ##22	ASPHD1 (ENSPCOG00000022108)	SEZ6L2 (ENSPCOG00000022354)	CDIPT (ENSPCOG00000001754)	MVP (ENSPCOG00000007547)	PAGR1 (ENSPCOG00000016016)	PRRT2 (ENSPCOG00000019481)	MAZ (ENSPCOG00000022370)	KIF22 (ENSPCOG00000019305)	ENSPCOG00000013145	QPRT (ENSPCOG00000015695)	CD2BP2 (ENSPCOG00000016720)	TBC1D10B (ENSPCOG00000021899)	MYL11 (ENSPCOG00000016427)	SEPTIN1 (ENSPCOG00000028121)	ZNF48 (ENSPCOG00000016727)
Greater bamboo lemur	MODERN SPECIES	1213	MAPK3 (ENSPSMG00000020818)	GDPD3 (ENSPSMG00000020758)	YPEL3 (ENSPSMG00000020746)	TBX6 (ENSPSMG00000020725)	PPP4C (ENSPSMG00000020714)	ALDOA (ENSPSMG00000020482)	TLCD3B (ENSPSMG00000020275)	ENSPSMG00000020261	ENSPSMG00000020255	INO80E (ENSPSMG00000020234)	ENSPSMG00000020190	TAOK2 (ENSPSMG00000020173)	TMEM219 (ENSPSMG00000020109)	ENSPSMG00000020097	ENSPSMG00000020089	KCTD13 (ENSPSMG00000020085) ##22	ASPHD1 (ENSPSMG00000020082)	SEZ6L2 (ENSPSMG00000019903)	ENSPSMG00000019510	CDIPT (ENSPSMG00000019498)
Bushbaby	MODERN SPECIES	211	ENSOGAG00000033666	CORO1A (ENSOGAG00000002942)	MAPK3 (ENSOGAG00000027841)	GDPD3 (ENSOGAG00000011663)	YPEL3 (ENSOGAG00000011660)	TBX6 (ENSOGAG00000011659)	PPP4C (ENSOGAG00000011657)	ALDOA (ENSOGAG00000011655)	TLCD3B (ENSOGAG00000003730)	C16orf92 (ENSOGAG00000003727)	DOC2A (ENSOGAG00000011651)	INO80E (ENSOGAG00000011649)	HIRIP3 (ENSOGAG00000011646)	TAOK2 (ENSOGAG00000029089)	TMEM219 (ENSOGAG00000011922)	KCTD13 (ENSOGAG00000010532) ##22	ASPHD1 (ENSOGAG00000032117)	SEZ6L2 (ENSOGAG00000010521)	CDIPT (ENSOGAG00000010517)	MVP (ENSOGAG00000010511)	PAGR1 (ENSOGAG00000010507)	PRRT2 (ENSOGAG00000031501)	MAZ (ENSOGAG00000033940)	KIF22 (ENSOGAG00000000266)	ZG16 (ENSOGAG00000032023)	C16orf54 (ENSOGAG00000034744)	QPRT (ENSOGAG00000030327)	SPN (ENSOGAG00000027322)	CD2BP2 (ENSOGAG00000016716)	TBC1D10B (ENSOGAG00000025723)	MYL11 (ENSOGAG00000032901)
Haplorrhini	ANCESTRAL SPECIES	30	ENSGT00940000160628	ENSGT00940000160691	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160732	ENSGT00930000151040	ENSGT00950000182987.c.a.a	ENSGT01040000240645	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00390000002780	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00940000153883.a	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00490000043964	ENSGT00940000154169.A	ENSGT00390000008969	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525	ENSGT00940000159632	ENSGT00940000159195	ENSGT00390000014957	ENSGT00390000002761	ENSGT00390000017626	ENSGT00390000012483	ENSGT00940000159805
Tarsier	MODERN SPECIES	6840	ENSTSYG00000025554	MAPK3 (ENSTSYG00000005769)	GDPD3 (ENSTSYG00000005758)	YPEL3 (ENSTSYG00000028159)	TBX6 (ENSTSYG00000030769)	PPP4C (ENSTSYG00000004533)	ALDOA (ENSTSYG00000004505)	ENSTSYG00000025998	FAM57B (ENSTSYG00000033577)	C16orf92 (ENSTSYG00000003859)	DOC2A (ENSTSYG00000027221)	INO80E (ENSTSYG00000027247)	ENSTSYG00000004257	TAOK2 (ENSTSYG00000036147)	TMEM219 (ENSTSYG00000000592)	KCTD13 (ENSTSYG00000037437) ##22	ASPHD1 (ENSTSYG00000032377)	SEZ6L2 (ENSTSYG00000007795)	CDIPT (ENSTSYG00000007764)	MVP (ENSTSYG00000004093)	PAGR1 (ENSTSYG00000008812)	PRRT2 (ENSTSYG00000008777)	MAZ (ENSTSYG00000026702)
Simiiformes	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000160628	ENSGT00940000160691	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160732	ENSGT00930000151040	ENSGT00950000182987.c.a.a	ENSGT01040000240645	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00390000002780	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00940000153883.a	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00490000043964	ENSGT00940000154169.A	ENSGT00390000008969	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525	ENSGT00940000159632	ENSGT00940000159195	ENSGT00390000014957	ENSGT00390000002761	ENSGT00390000017626	ENSGT00390000012483	ENSGT00940000159805
Platyrrhini	ANCESTRAL SPECIES	35	ENSGT00940000160628	ENSGT00940000160691	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160732	ENSGT00930000151040	ENSGT00950000182987.c.a.a.u.a.a	ENSGT01040000240645	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00390000002780	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00940000153883.a	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676.b	ENSGT00940000160492	ENSGT00940000154169.A	ENSGT00390000008969	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525	ENSGT00940000159632.k.a	ENSGT00940000159195	ENSGT00390000014957	ENSGT00390000002761	ENSGT00390000017626	ENSGT00390000012483	ENSGT00940000159805	ENSGT00940000159038.d
Cebidae	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000160628	ENSGT00940000160691	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160732	ENSGT00930000151040	ENSGT00950000182987.c.a.a.u.a.a	ENSGT01040000240645	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00390000002780	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00940000153883.a	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676.b	ENSGT00940000160492	ENSGT00940000154169.A	ENSGT00390000008969	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525	ENSGT00940000159632.l	ENSGT00940000159195	ENSGT00390000014957	ENSGT00390000002761	ENSGT00390000017626	ENSGT00390000012483	ENSGT00940000159805	ENSGT00940000159038.d
Cebidae_a	ANCESTRAL SPECIES	57	ENSGT00940000160628	ENSGT00940000160691	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160732	ENSGT00930000151040	ENSGT00950000182987.c.a.a.u.a.a	ENSGT01040000240645	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00390000002780	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00940000153883.a	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676.b	ENSGT00940000160492	ENSGT00940000154169.A	ENSGT00390000008969	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525	ENSGT00940000159632.l	ENSGT00940000159195	ENSGT00390000002761	ENSGT00390000017626	ENSGT00390000012483	ENSGT00940000159805	ENSGT00940000159038.d	ENSGT00940000161794
Capuchin	MODERN SPECIES	723	ENSCCAG00000029885	CORO1A (ENSCCAG00000022003)	MAPK3 (ENSCCAG00000036517)	GDPD3 (ENSCCAG00000027572)	YPEL3 (ENSCCAG00000014313)	TBX6 (ENSCCAG00000026338)	PPP4C (ENSCCAG00000029620)	ENSCCAG00000035059	TLCD3B (ENSCCAG00000029616)	C16orf92 (ENSCCAG00000037624)	DOC2A (ENSCCAG00000020909)	INO80E (ENSCCAG00000019890)	HIRIP3 (ENSCCAG00000026626)	TAOK2 (ENSCCAG00000029609)	TMEM219 (ENSCCAG00000021041)	KCTD13 (ENSCCAG00000026195) ##22	ASPHD1 (ENSCCAG00000025422)	SEZ6L2 (ENSCCAG00000026494)	CDIPT (ENSCCAG00000029533)	ENSCCAG00000033828	PAGR1 (ENSCCAG00000033539)	PRRT2 (ENSCCAG00000020597)	ENSCCAG00000037524	KIF22 (ENSCCAG00000031496)	ZG16 (ENSCCAG00000037387)	QPRT (ENSCCAG00000023194)	CD2BP2 (ENSCCAG00000028241)	TBC1D10B (ENSCCAG00000023363)	MYLPF (ENSCCAG00000025574)	SEPTIN1 (ENSCCAG00000030164)
Bolivian squirrel monkey	MODERN SPECIES	78	CORO1A (ENSSBOG00000030883)	MAPK3 (ENSSBOG00000030575)	GDPD3 (ENSSBOG00000017088)	YPEL3 (ENSSBOG00000019067)	TBX6 (ENSSBOG00000028392)	PPP4C (ENSSBOG00000030388)	ENSSBOG00000003826	ENSSBOG00000035437	TLCD3B (ENSSBOG00000024038)	C16orf92 (ENSSBOG00000024582)	DOC2A (ENSSBOG00000023541)	INO80E (ENSSBOG00000030838)	HIRIP3 (ENSSBOG00000036226)	TAOK2 (ENSSBOG00000030008)	TMEM219 (ENSSBOG00000028430)	KCTD13 (ENSSBOG00000026442) ##22	ASPHD1 (ENSSBOG00000022080)	SEZ6L2 (ENSSBOG00000034774)	CDIPT (ENSSBOG00000011472)	MVP (ENSSBOG00000022115)	PAGR1 (ENSSBOG00000029228)	PRRT2 (ENSSBOG00000030463)	ENSSBOG00000020791	ENSSBOG00000026016	ZG16 (ENSSBOG00000031291)	QPRT (ENSSBOG00000025402)	SPN (ENSSBOG00000015489)	CD2BP2 (ENSSBOG00000033872)	TBC1D10B (ENSSBOG00000025233)	MYL11 (ENSSBOG00000033120)	SEPTIN1 (ENSSBOG00000021733)
Marmoset	MODERN SPECIES	3	CORO1A (ENSCJAG00000006672)	MAPK3 (ENSCJAG00000006770)	GDPD3 (ENSCJAG00000006809)	YPEL3 (ENSCJAG00000006829)	TBX6 (ENSCJAG00000035904)	PPP4C (ENSCJAG00000006846)	ENSCJAG00000006874	ENSCJAG00000041508	TLCD3B (ENSCJAG00000085791)	C16orf92 (ENSCJAG00000006902)	DOC2A (ENSCJAG00000006908)	INO80E (ENSCJAG00000006954)	HIRIP3 (ENSCJAG00000006978)	TAOK2 (ENSCJAG00000006995)	TMEM219 (ENSCJAG00000007082)	KCTD13 (ENSCJAG00000007098) ##22	ENSCJAG00000087331	SEZ6L2 (ENSCJAG00000007113)	CDIPT (ENSCJAG00000045120)	MVP (ENSCJAG00000007166)	PAGR1 (ENSCJAG00000007182)	PRRT2 (ENSCJAG00000007186)	ENSCJAG00000007189	ENSCJAG00000007193	ZG16 (ENSCJAG00000007220)	C16orf54 (ENSCJAG00000038222)	QPRT (ENSCJAG00000007227)	SPN (ENSCJAG00000081281)	CD2BP2 (ENSCJAG00000007235)	TBC1D10B (ENSCJAG00000007260)	MYL11 (ENSCJAG00000002571)
Mas night monkey	MODERN SPECIES	624	ENSANAG00000023547	MAPK3 (ENSANAG00000037745)	GDPD3 (ENSANAG00000026502)	YPEL3 (ENSANAG00000026920)	TBX6 (ENSANAG00000021181)	PPP4C (ENSANAG00000029233)	ENSANAG00000031251	ENSANAG00000032668	TLCD3B (ENSANAG00000032244)	C16orf92 (ENSANAG00000035410)	DOC2A (ENSANAG00000037504)	INO80E (ENSANAG00000036566)	HIRIP3 (ENSANAG00000021474)	TAOK2 (ENSANAG00000020284)	TMEM219 (ENSANAG00000033491)	KCTD13 (ENSANAG00000023943) ##22	ENSANAG00000032189	SEZ6L2 (ENSANAG00000030298)	CDIPT (ENSANAG00000026144)	MVP (ENSANAG00000025785)	PAGR1 (ENSANAG00000030147)	PRRT2 (ENSANAG00000022678)	ENSANAG00000036195	ENSANAG00000022334	ZG16 (ENSANAG00000026906)	QPRT (ENSANAG00000029571)	SPN (ENSANAG00000027731)	CD2BP2 (ENSANAG00000031706)	TBC1D10B (ENSANAG00000027798)	MYL11 (ENSANAG00000029928)	SEPTIN1 (ENSANAG00000029084)
Catarrhini	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000160691	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160732	ENSGT00930000151040	ENSGT00950000182987.c.a.a	ENSGT01040000240645	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00390000002780	ENSGT00940000159141	ENSGT00910000148024	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00940000153883.a	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00490000043964	ENSGT00940000154169.A	ENSGT00390000008969	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525	ENSGT00940000159632	ENSGT00940000159195	ENSGT00390000014957	ENSGT00390000002761	ENSGT00390000017626	ENSGT00390000012483	ENSGT00940000159805
Cercopithecidae	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000160691	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160732	ENSGT00930000151040	ENSGT00950000182987.c.a.a	ENSGT01040000240645	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00390000002780	ENSGT00940000159141	ENSGT00910000148024	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00940000153883.a.b	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00490000043964	ENSGT00940000154169.A	ENSGT00390000008969	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525	ENSGT00940000159632	ENSGT00940000159195	ENSGT00390000014957	ENSGT00390000002761	ENSGT00390000017626	ENSGT00390000012483	ENSGT00940000159805
Rhinopithecus	ANCESTRAL SPECIES	66	ENSGT00940000160628	ENSGT00940000160691	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160732	ENSGT00930000151040.g	ENSGT00950000182987.c.a.a.x	ENSGT01040000240645	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00390000002780	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00940000153883.a.b	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00490000043964	ENSGT00940000154169.A	ENSGT00390000008969	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525	ENSGT00940000159632	ENSGT00940000159195	ENSGT00390000002761	ENSGT00390000012483	ENSGT00940000159805	ENSGT00940000159038.d	ENSGT00940000161794
Black snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	472									C16orf92 (ENSRBIG00000028784)	TLCD3B (ENSRBIG00000030256)	DOC2A (ENSRBIG00000043273)	INO80E (ENSRBIG00000037079)	HIRIP3 (ENSRBIG00000044734)	TAOK2 (ENSRBIG00000040093)	ENSRBIG00000038715	KCTD13 (ENSRBIG00000038323) ##22	ASPHD1 (ENSRBIG00000033286)	ENSRBIG00000010762	RNF138 (ENSRBIG00000032879)	MEP1B (ENSRBIG00000031696)	GAREM1 (ENSRBIG00000038312)	ENSRBIG00000022271	ENSRBIG00000040503	CCDC178 (ENSRBIG00000044038)	ASXL3 (ENSRBIG00000029166)	NOL4 (ENSRBIG00000029317)	DTNA (ENSRBIG00000041085)	MAPRE2 (ENSRBIG00000032237)	ZNF397 (ENSRBIG00000028427)	ZSCAN30 (ENSRBIG00000005296)	ENSRBIG00000038714
Golden snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	754	CORO1A (ENSRROG00000041990)	MAPK3 (ENSRROG00000039711)	GDPD3 (ENSRROG00000038363)	YPEL3 (ENSRROG00000006739)	TBX6 (ENSRROG00000031276)	ENSRROG00000033437	ENSRROG00000032617	ENSRROG00000040687	TLCD3B (ENSRROG00000021952)	C16orf92 (ENSRROG00000034755)	DOC2A (ENSRROG00000038003)	INO80E (ENSRROG00000035493)	HIRIP3 (ENSRROG00000029428)	TAOK2 (ENSRROG00000045336)	ENSRROG00000029167	KCTD13 (ENSRROG00000043681) ##22	ASPHD1 (ENSRROG00000031532)	SEZ6L2 (ENSRROG00000039201)	ENSRROG00000033663	CDIPT (ENSRROG00000029737)	MVP (ENSRROG00000032290)	PAGR1 (ENSRROG00000025694)	PRRT2 (ENSRROG00000043414)	ENSRROG00000026952	KIF22 (ENSRROG00000041229)	ZG16 (ENSRROG00000043737)	QPRT (ENSRROG00000027988)	CD2BP2 (ENSRROG00000014438)	TBC1D10B (ENSRROG00000036690)	MYL11 (ENSRROG00000044636)	SEPTIN1 (ENSRROG00000038708)
Cercopithecinae	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000160691	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160732	ENSGT00930000151040	ENSGT00950000182987.c.a.a	ENSGT01040000240645	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00390000002780	ENSGT00940000159141	ENSGT00910000148024	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00940000153883.a.b	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00490000043964	ENSGT00940000154169.A	ENSGT00390000008969	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525	ENSGT00940000159632	ENSGT00940000159195	ENSGT00390000014957	ENSGT00390000002761	ENSGT00390000017626	ENSGT00390000012483	ENSGT00940000159805
Vervet Monkey	MODERN SPECIES	24	ENSCSAG00000006200	CORO1A (ENSCSAG00000006195)	MAPK3 (ENSCSAG00000006190)	GDPD3 (ENSCSAG00000006187)	YPEL3 (ENSCSAG00000006177)	TBX6 (ENSCSAG00000006175)	PPP4C (ENSCSAG00000006170)	ALDOA (ENSCSAG00000006167)	TLCD3B (ENSCSAG00000006160)	C16orf92 (ENSCSAG00000006159)	DOC2A (ENSCSAG00000006155)	INO80E (ENSCSAG00000006149)	HIRIP3 (ENSCSAG00000006145)	ENSCSAG00000006141	TMEM219 (ENSCSAG00000006136)	KCTD13 (ENSCSAG00000006133) ##22	SEZ6L2 (ENSCSAG00000006130)	ASPHD1 (ENSCSAG00000006126)	ENSCSAG00000006124	MVP (ENSCSAG00000006120)	PAGR1 (ENSCSAG00000006114)	PRRT2 (ENSCSAG00000006112)	ENSCSAG00000006110	KIF22 (ENSCSAG00000006106)	ZG16 (ENSCSAG00000006102)	C16orf54 (ENSCSAG00000018858)	QPRT (ENSCSAG00000006096)	SPN (ENSCSAG00000006094)	CD2BP2 (ENSCSAG00000006089)	TBC1D10B (ENSCSAG00000006075)	MYL11 (ENSCSAG00000006069)
Cercopithecinae_a	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000160691	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160732	ENSGT00930000151040	ENSGT00950000182987.c.a.a	ENSGT01040000240645	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00390000002780	ENSGT00940000159141	ENSGT00910000148024	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00940000153883.a.b	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00490000043964	ENSGT00940000154169.A	ENSGT00390000008969	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525	ENSGT00940000159632	ENSGT00940000159195	ENSGT00390000014957	ENSGT00390000002761	ENSGT00390000017626	ENSGT00390000012483	ENSGT00940000159805
Macaca	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000160628	ENSGT00940000160691	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160732	ENSGT00930000151040	ENSGT00950000182987.c.a.a	ENSGT01040000240645	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00390000002780	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00940000153883.a.b	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00490000043964	ENSGT00940000154169.A	ENSGT00390000008969	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525	ENSGT00940000159632	ENSGT00940000159195	ENSGT00390000014957	ENSGT00390000002761	ENSGT00390000017626	ENSGT00390000012483	ENSGT00940000159805
Pig-tailed macaque	MODERN SPECIES	583	CORO1A (ENSMNEG00000035433)	MAPK3 (ENSMNEG00000031920)	GDPD3 (ENSMNEG00000012099)	YPEL3 (ENSMNEG00000032402)	TBX6 (ENSMNEG00000045471)	PPP4C (ENSMNEG00000044113)	ENSMNEG00000036503	ENSMNEG00000032142	TLCD3B (ENSMNEG00000029181)	C16orf92 (ENSMNEG00000041187)	DOC2A (ENSMNEG00000026173)	INO80E (ENSMNEG00000029595)	HIRIP3 (ENSMNEG00000037137)	TAOK2 (ENSMNEG00000041309)	ENSMNEG00000039853	KCTD13 (ENSMNEG00000029225) ##22	ASPHD1 (ENSMNEG00000021537)	SEZ6L2 (ENSMNEG00000042648)	CDIPT (ENSMNEG00000040456)	MVP (ENSMNEG00000039450)	PAGR1 (ENSMNEG00000045428)	PRRT2 (ENSMNEG00000039672)	MAZ (ENSMNEG00000037329)	KIF22 (ENSMNEG00000045069)	ZG16 (ENSMNEG00000026503)	C16orf54 (ENSMNEG00000040219)	QPRT (ENSMNEG00000039707)	SPN (ENSMNEG00000008727)	CD2BP2 (ENSMNEG00000044094)	TBC1D10B (ENSMNEG00000039368)	MYL11 (ENSMNEG00000040711)
Macaca_a	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000164316	ENSGT00510000047760.y.a	ENSGT00940000160628	ENSGT00940000160691	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160732	ENSGT00930000151040	ENSGT00950000182987.c.a.a	ENSGT01040000240645	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00390000002780	ENSGT00940000159141	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00940000153883.a.b	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT01050000245554.A.a.a	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00490000043964	ENSGT00940000154169.A	ENSGT00390000008969	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525	ENSGT00940000159632	ENSGT00940000159195	ENSGT00390000014957	ENSGT00390000002761	ENSGT00390000017626	ENSGT00390000012483
Rhesus	MODERN SPECIES	12	CORO1A (ENSMMUG00000007329)	MAPK3 (ENSMMUG00000017758)	GDPD3 (ENSMMUG00000029164)	YPEL3 (ENSMMUG00000000980)	TBX6 (ENSMMUG00000000981)	PPP4C (ENSMMUG00000000982)	ALDOA (ENSMMUG00000000983)	ENSMMUG00000060657	TLCD3B (ENSMMUG00000037707)	C6H16orf92 (ENSMMUG00000012245)	DOC2A (ENSMMUG00000020277)	HIRIP3 (ENSMMUG00000020275)	INO80E (ENSMMUG00000020276)	TAOK2 (ENSMMUG00000020274)	TMEM219 (ENSMMUG00000020273)	KCTD13 (ENSMMUG00000057762) ##22	ENSMMUG00000051976	ASPHD1 (ENSMMUG00000018992)	SEZ6L2 (ENSMMUG00000018986)	CDIPT (ENSMMUG00000018985)	MVP (ENSMMUG00000016422)	PAGR1 (ENSMMUG00000061749)	PRRT2 (ENSMMUG00000009683)	MAZ (ENSMMUG00000019826)	KIF22 (ENSMMUG00000009684)	ZG16 (ENSMMUG00000057819)	C20H16orf54 (ENSMMUG00000021210)	QPRT (ENSMMUG00000042891)	SPN (ENSMMUG00000016143)	CD2BP2 (ENSMMUG00000021844)	TBC1D10B (ENSMMUG00000021845)
Crab-eating macaque	MODERN SPECIES	12	ENSMFAG00000059690	ENSMFAG00000046351	CORO1A (ENSMFAG00000030805)	MAPK3 (ENSMFAG00000042040)	GDPD3 (ENSMFAG00000031264)	ENSMFAG00000003117	TBX6 (ENSMFAG00000001085)	PPP4C (ENSMFAG00000041016)	ENSMFAG00000031476	TLCD3B (ENSMFAG00000064979)	C16orf92 (ENSMFAG00000034119)	DOC2A (ENSMFAG00000031217)	INO80E (ENSMFAG00000037830)	TAOK2 (ENSMFAG00000030440)	TMEM219 (ENSMFAG00000000244)	KCTD13 (ENSMFAG00000041130) ##22	ENSMFAG00000049904	ASPHD1 (ENSMFAG00000042406)	SEZ6L2 (ENSMFAG00000043800)	ENSMFAG00000055855	CDIPT (ENSMFAG00000004028)	MVP (ENSMFAG00000032090)	PAGR1 (ENSMFAG00000057632)	PRRT2 (ENSMFAG00000032833)	ENSMFAG00000040127	KIF22 (ENSMFAG00000034567)	SPN (ENSMFAG00000042820)	DCTPP1 (ENSMFAG00000002505)	CD2BP2 (ENSMFAG00000038725)	TBC1D10B (ENSMFAG00000053026)	MYL11 (ENSMFAG00000039997)
Cercopithecinae_b	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000160691	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160732	ENSGT00930000151040	ENSGT00950000182987.c.a.a	ENSGT01040000240645	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00390000002780	ENSGT00940000159141	ENSGT00910000148024	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00940000153883.a.b	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00940000154169.A	ENSGT00390000008969	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525	ENSGT00940000159632	ENSGT00940000159195	ENSGT00390000014957	ENSGT00390000002761	ENSGT00390000017626	ENSGT00390000012483	ENSGT00940000159805	ENSGT00940000159038.d
Olive baboon	MODERN SPECIES	9	ENSPANG00000011067	ENSPANG00000033570	CORO1A (ENSPANG00000011152)	MAPK3 (ENSPANG00000004872)	GDPD3 (ENSPANG00000011153)	ENSPANG00000016127	TBX6 (ENSPANG00000000556)	PPP4C (ENSPANG00000006187)	TLCD3B (ENSPANG00000016292)	C16orf92 (ENSPANG00000016291)	DOC2A (ENSPANG00000016303)	INO80E (ENSPANG00000032529)	HIRIP3 (ENSPANG00000016337)	TAOK2 (ENSPANG00000016360)	TMEM219 (ENSPANG00000016358)	KCTD13 (ENSPANG00000016356) ##22	ASPHD1 (ENSPANG00000016355)	SEZ6L2 (ENSPANG00000016354)	CDIPT (ENSPANG00000016353)	MVP (ENSPANG00000016369)	PAGR1 (ENSPANG00000016367)	PRRT2 (ENSPANG00000016382)	ENSPANG00000039532	MAZ (ENSPANG00000046240)	KIF22 (ENSPANG00000016493)	ZG16 (ENSPANG00000016491)	C16orf54 (ENSPANG00000042382)	QPRT (ENSPANG00000030759)	SPN (ENSPANG00000047150)	CD2BP2 (ENSPANG00000041870)	TBC1D10B (ENSPANG00000016515)
Cercopithecinae_d	ANCESTRAL SPECIES	63	ENSGT00940000160628	ENSGT00940000160691	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160732	ENSGT00930000151040	ENSGT00950000182987.c.a.a	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00390000002780	ENSGT00940000159141	ENSGT00910000148024	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00940000153883.a.b	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00940000154169.A	ENSGT00390000008969	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525	ENSGT00940000159632	ENSGT00940000159195	ENSGT00390000014957	ENSGT00390000002761	ENSGT00390000017626	ENSGT00390000012483	ENSGT00940000159805	ENSGT00940000159038.d
Sooty mangabey	MODERN SPECIES	100	ENSCATG00000037738	CORO1A (ENSCATG00000037744)	MAPK3 (ENSCATG00000029901)	GDPD3 (ENSCATG00000037818)	YPEL3 (ENSCATG00000038922)	TBX6 (ENSCATG00000002220)	PPP4C (ENSCATG00000043928)	ENSCATG00000034359	TLCD3B (ENSCATG00000035490)	C16orf92 (ENSCATG00000037291)	DOC2A (ENSCATG00000042629)	INO80E (ENSCATG00000031454)	HIRIP3 (ENSCATG00000033284)	TAOK2 (ENSCATG00000022747)	ENSCATG00000032992	KCTD13 (ENSCATG00000035254) ##22	ASPHD1 (ENSCATG00000034154)	SEZ6L2 (ENSCATG00000023404)	CDIPT (ENSCATG00000012902)	MVP (ENSCATG00000036298)	PAGR1 (ENSCATG00000037521)	PRRT2 (ENSCATG00000042985)	MAZ (ENSCATG00000033033)	KIF22 (ENSCATG00000034257)	ZG16 (ENSCATG00000038499)	QPRT (ENSCATG00000033402)	SPN (ENSCATG00000028578)	CD2BP2 (ENSCATG00000039709)	TBC1D10B (ENSCATG00000015685)	MYL11 (ENSCATG00000044024)	SEPTIN1 (ENSCATG00000037250)
Drill	MODERN SPECIES	853	CORO1A (ENSMLEG00000043873)	MAPK3 (ENSMLEG00000034806)	GDPD3 (ENSMLEG00000032435)	YPEL3 (ENSMLEG00000025543)	TBX6 (ENSMLEG00000034289)	PPP4C (ENSMLEG00000039779)	ALDOA (ENSMLEG00000029895)	TLCD3B (ENSMLEG00000044438)	C16orf92 (ENSMLEG00000032028)	DOC2A (ENSMLEG00000009074)	INO80E (ENSMLEG00000028070)	ENSMLEG00000042878	HIRIP3 (ENSMLEG00000039261)	TAOK2 (ENSMLEG00000028289)	ENSMLEG00000043792	KCTD13 (ENSMLEG00000029358) ##22	ASPHD1 (ENSMLEG00000043039)	SEZ6L2 (ENSMLEG00000044234)	CDIPT (ENSMLEG00000028202)	MVP (ENSMLEG00000036661)	PAGR1 (ENSMLEG00000043558)	PRRT2 (ENSMLEG00000037542)	ENSMLEG00000036147	KIF22 (ENSMLEG00000042834)	ZG16 (ENSMLEG00000010383)	C16orf54 (ENSMLEG00000016617)	QPRT (ENSMLEG00000037078)	SPN (ENSMLEG00000030348)	CD2BP2 (ENSMLEG00000040691)	TBC1D10B (ENSMLEG00000036140)	MYL11 (ENSMLEG00000038386)
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Bonobo	MODERN SPECIES	7	ENSPPAG00000040016	CORO1A (ENSPPAG00000031716)	MAPK3 (ENSPPAG00000038057)	GDPD3 (ENSPPAG00000034592)	YPEL3 (ENSPPAG00000030320)	TBX6 (ENSPPAG00000028657)	PPP4C (ENSPPAG00000034067)	ENSPPAG00000039660	TLCD3B (ENSPPAG00000043659)	ENSPPAG00000036946	DOC2A (ENSPPAG00000032448)	INO80E (ENSPPAG00000043512)	HIRIP3 (ENSPPAG00000006667)	TAOK2 (ENSPPAG00000039887)	TMEM219 (ENSPPAG00000027480)	ENSPPAG00000025945 ##22	ASPHD1 (ENSPPAG00000035046)	SEZ6L2 (ENSPPAG00000032004)	CDIPT (ENSPPAG00000040218)	MVP (ENSPPAG00000036492)	PAGR1 (ENSPPAG00000029230)	PRRT2 (ENSPPAG00000041908)	ENSPPAG00000041571	KIF22 (ENSPPAG00000032354)	ZG16 (ENSPPAG00000031258)	C16orf54 (ENSPPAG00000007164)	QPRT (ENSPPAG00000038641)	SPN (ENSPPAG00000000724)	CD19 (ENSPPAG00000028921)	RABEP2 (ENSPPAG00000035259)	ATP2A1 (ENSPPAG00000036775)
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Tree shrew	MODERN SPECIES	4005														TNS4 (ENSTBEG00000009138)	ENSTBEG00000008847	KCTD13 (ENSTBEG00000008644) ##22	CDIPT (ENSTBEG00000008330)	MVP (ENSTBEG00000007045)	PAGR1 (ENSTBEG00000006823)	PRRT2 (ENSTBEG00000006503)	KIF22 (ENSTBEG00000005505)	ZG16 (ENSTBEG00000005199)
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Lagomorpha	ANCESTRAL SPECIES	92	ENSGT00940000160628	ENSGT00940000160691	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160732	ENSGT00930000151040	ENSGT00950000182987.c.a.a	ENSGT01040000240645	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00390000002780	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00940000153883.a	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00490000043964	ENSGT00940000154169.A	ENSGT00390000008969	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000161103
Rabbit	MODERN SPECIES	17	ENSOCUG00000007562	CORO1A (ENSOCUG00000002253)	MAPK3 (ENSOCUG00000013716)	GDPD3 (ENSOCUG00000022883)	YPEL3 (ENSOCUG00000023899)	TBX6 (ENSOCUG00000026026)	PPP4C (ENSOCUG00000006335)	ALDOA (ENSOCUG00000006329)	ENSOCUG00000037898	ENSOCUG00000025093	DOC2A (ENSOCUG00000027142)	INO80E (ENSOCUG00000006323)	HIRIP3 (ENSOCUG00000014134)	TAOK2 (ENSOCUG00000021218)	ENSOCUG00000006318	KCTD13 (ENSOCUG00000017636) ##22	ENSOCUG00000024192	SEZ6L2 (ENSOCUG00000000901)	ENSOCUG00000024358	MVP (ENSOCUG00000008668)	PAGR1 (ENSOCUG00000012887)	ENSOCUG00000012883	ENSOCUG00000027492	ENSOCUG00000038513	ENSOCUG00000033251	GSG1L (ENSOCUG00000021880)	KATNIP (ENSOCUG00000016566)	GTF3C1 (ENSOCUG00000015692)	ENSOCUG00000031900	ENSOCUG00000000329	ENSOCUG00000001500
Pika	MODERN SPECIES	3099		ENSOPRG00000009852	CORO1A (ENSOPRG00000009837)	MAPK3 (ENSOPRG00000009817)	GDPD3 (ENSOPRG00000009797)	TBX6 (ENSOPRG00000009784)	PPP4C (ENSOPRG00000009773)	ALDOA (ENSOPRG00000009760)	TLCD3B (ENSOPRG00000009748)	C16orf92 (ENSOPRG00000009734)	DOC2A (ENSOPRG00000009712)	INO80E (ENSOPRG00000009692)	ENSOPRG00000009661	TAOK2 (ENSOPRG00000009634)	TMEM219 (ENSOPRG00000009621)	KCTD13 (ENSOPRG00000009596) ##22	ASPHD1 (ENSOPRG00000009580)	SEZ6L2 (ENSOPRG00000009542)	ENSOPRG00000019194	CDIPT (ENSOPRG00000009531)	MVP (ENSOPRG00000009511)	PAGR1 (ENSOPRG00000009506)	PRRT2 (ENSOPRG00000009498)
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Rodentia_B	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000160628	ENSGT00940000160691	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160732	ENSGT00930000151040	ENSGT00950000182987.c.a.a	ENSGT00980000198830	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00390000002780	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00940000153883.a	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00490000043964	ENSGT00940000154169.A	ENSGT00390000008969	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000169143	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525	ENSGT00940000159632	ENSGT00940000159195	ENSGT00390000014957	ENSGT00390000002761	ENSGT00390000017626	ENSGT00390000012483
Myomorpha	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000160628	ENSGT00940000160691	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160732	ENSGT00930000151040	ENSGT00950000182987.c.a.a	ENSGT00980000198830	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00390000002780	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00940000153883.a	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00490000043964	ENSGT00940000154169.A	ENSGT00390000008969	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000169143	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525	ENSGT00940000159632	ENSGT00940000159195	ENSGT00390000014957	ENSGT00390000002761	ENSGT00390000017626	ENSGT00390000012483
Muroidea	ANCESTRAL SPECIES	33	ENSGT00940000160628	ENSGT00940000160691	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160732	ENSGT00930000151040	ENSGT00950000182987.c.a.a	ENSGT00980000198830	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00390000002780	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00940000153883.a	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00490000043964	ENSGT00940000154169.A	ENSGT00390000008969	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000169143	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525	ENSGT00940000159632	ENSGT00940000159195	ENSGT00390000014957	ENSGT00390000002761	ENSGT00390000017626	ENSGT00390000012483
Muroidea_A	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000160628	ENSGT00940000160691	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160732	ENSGT00930000151040	ENSGT00950000182987.c.a.a.o.b	ENSGT00980000198830	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00390000002780	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00940000153883.a	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00490000043964	ENSGT00940000154169.A	ENSGT00390000008969	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000169143	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525	ENSGT00940000159632	ENSGT00940000159195	ENSGT00390000014957	ENSGT00390000002761	ENSGT00390000017626	ENSGT00390000012483
Cricetidae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000160628	ENSGT00940000160691	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160732	ENSGT00930000151040	ENSGT00950000182987.c.a.a.o.b	ENSGT00980000198830	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00390000002780	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00940000153883.a	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00490000043964	ENSGT00940000154169.A	ENSGT00390000008969	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525	ENSGT00940000159632	ENSGT00940000159195.r	ENSGT00390000014957	ENSGT00390000002761	ENSGT00390000017626	ENSGT00390000012483	ENSGT00940000159805
Cricetinae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000160628	ENSGT00940000160691	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160732	ENSGT00930000151040	ENSGT00950000182987.c.a.a.o.b	ENSGT00980000198830	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00390000002780	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00940000153883.a	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00490000043964	ENSGT00940000154169.A	ENSGT00390000008969	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525	ENSGT00940000159632	ENSGT00940000159195.r	ENSGT00390000014957	ENSGT00390000002761	ENSGT00390000017626	ENSGT00390000012483	ENSGT00940000159805
Golden Hamster	MODERN SPECIES	617	Coro1a (ENSMAUG00000013014)	Mapk3 (ENSMAUG00000012073)	Gdpd3 (ENSMAUG00000010571)	Ypel3 (ENSMAUG00000011044)	Tbx6 (ENSMAUG00000012819)	Ppp4c (ENSMAUG00000010287)	ENSMAUG00000010797	Aldoa (ENSMAUG00000011360)	Tlcd3b (ENSMAUG00000010468)	4930451I11Rik (ENSMAUG00000010675)	Doc2a (ENSMAUG00000010658)	Ino80e (ENSMAUG00000009807)	Hirip3 (ENSMAUG00000009501)	Taok2 (ENSMAUG00000011006)	Tmem219 (ENSMAUG00000010715)	Kctd13 (ENSMAUG00000009840) ##22	ENSMAUG00000010959	Sez6l2 (ENSMAUG00000010538)	Cdiptos (ENSMAUG00000010404)	Cdipt (ENSMAUG00000009471)	Mvp (ENSMAUG00000009864)	ENSMAUG00000009518	ENSMAUG00000009171	Maz (ENSMAUG00000011903)	Kif22 (ENSMAUG00000010234)	AI467606 (ENSMAUG00000010308)	Qprt (ENSMAUG00000012329)	Spn (ENSMAUG00000009348)	Cd2bp2 (ENSMAUG00000010155)	Tbc1d10b (ENSMAUG00000009825)	Mylpf (ENSMAUG00000010599)
Chinese hamster chok1gshd	MODERN SPECIES	401	Coro1a (ENSCGRG00001024348)	Mapk3 (ENSCGRG00001014672)	Gdpd3 (ENSCGRG00001021910)	YPEL (ENSCGRG00001014821)	Tbx6 (ENSCGRG00001000407)	Ppp4c (ENSCGRG00001009040)	ENSCGRG00001000522	Aldoa (ENSCGRG00001017072)	Tlcd3b (ENSCGRG00001000487)	4930451I11Rik (ENSCGRG00001019334)	Doc2a (ENSCGRG00001000827)	Ino80e (ENSCGRG00001014232)	Hirip3 (ENSCGRG00001016861)	Taok2 (ENSCGRG00001019830)	Tmem219 (ENSCGRG00001018087)	Kctd13 (ENSCGRG00001021389) ##22	Asphd1 (ENSCGRG00001022098)	Sez6l2 (ENSCGRG00001005969)	Cdiptos (ENSCGRG00001018424)	Cdipt (ENSCGRG00001021676)	Mvp (ENSCGRG00001015253)	ENSCGRG00001017938	Prrt2 (ENSCGRG00001000118)	Maz (ENSCGRG00001008879)	Kif22 (ENSCGRG00001021149)	Zg16 (ENSCGRG00001002097)	ENSCGRG00001008405	AI467606 (ENSCGRG00001000817)	Qprt (ENSCGRG00001013484)	Spn (ENSCGRG00001011052)	Cd2bp2 (ENSCGRG00001016440)
Cricetidae_B	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000160628	ENSGT00940000160691	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160732	ENSGT00930000151040	ENSGT00950000182987.c.a.a.o.b	ENSGT00980000198830	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00390000002780	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00940000153883.a	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00490000043964	ENSGT00940000154169.A	ENSGT00390000008969	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525	ENSGT00940000159632	ENSGT00940000159195.r	ENSGT00390000014957	ENSGT00390000002761	ENSGT00390000017626	ENSGT00390000012483	ENSGT00940000159805
Northern American deer mouse	MODERN SPECIES		Coro1a (ENSPEMG00000015899)	Mapk3 (ENSPEMG00000001609)	Gdpd3 (ENSPEMG00000007576)	Ypel3 (ENSPEMG00000027115)	Tbx6 (ENSPEMG00000016486)	Ppp4c (ENSPEMG00000009035)	ENSPEMG00000017223	Aldoa (ENSPEMG00000017418)	Tlcd3b (ENSPEMG00000014620)	4930451I11Rik (ENSPEMG00000009118)	Doc2a (ENSPEMG00000013377)	Ino80e (ENSPEMG00000026695)	Hirip3 (ENSPEMG00000014990)	Taok2 (ENSPEMG00000001354)	Tmem219 (ENSPEMG00000015824)	Kctd13 (ENSPEMG00000012834) ##22	Asphd1 (ENSPEMG00000004098)	Sez6l2 (ENSPEMG00000024014)	Cdiptos (ENSPEMG00000012204)	Cdipt (ENSPEMG00000025978)	Mvp (ENSPEMG00000000532)	ENSPEMG00000029303	Prrt2 (ENSPEMG00000000471)	Maz (ENSPEMG00000008318)	Kif22 (ENSPEMG00000016249)	Zg16 (ENSPEMG00000016579)	AI467606 (ENSPEMG00000028290)	Qprt (ENSPEMG00000007099)	Spn (ENSPEMG00000017446)	Cd2bp2 (ENSPEMG00000010579)	ENSPEMG00000017179
Prairie vole	MODERN SPECIES	16	Coro1a (ENSMOCG00000011536)	Mapk3 (ENSMOCG00000017980)	Gdpd3 (ENSMOCG00000016293)	Ypel3 (ENSMOCG00000003598)	Tbx6 (ENSMOCG00000001950)	Ppp4c (ENSMOCG00000014013)	ENSMOCG00000016362	Aldoa (ENSMOCG00000014497)	Tlcd3b (ENSMOCG00000018269)	4930451I11Rik (ENSMOCG00000014477)	Doc2a (ENSMOCG00000014246)	Ino80e (ENSMOCG00000017242)	Hirip3 (ENSMOCG00000010862)	Taok2 (ENSMOCG00000018671)	ENSMOCG00000022224	Kctd13 (ENSMOCG00000016983) ##22	ENSMOCG00000018070	Sez6l2 (ENSMOCG00000021047)	Cdiptos (ENSMOCG00000013585)	Cdipt (ENSMOCG00000009507)	Mvp (ENSMOCG00000021967)	ENSMOCG00000009267	ENSMOCG00000011254	Maz (ENSMOCG00000003611)	Kif22 (ENSMOCG00000013483)	ENSMOCG00000003889	AI467606 (ENSMOCG00000009138)	Qprt (ENSMOCG00000010558)	Spn (ENSMOCG00000011587)	Cd2bp2 (ENSMOCG00000013402)	Tbc1d10b (ENSMOCG00000010623)
Murinae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000160628	ENSGT00940000160691	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160732	ENSGT00930000151040	ENSGT00950000182987.c.a.a.o.b	ENSGT00980000198830	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00390000002780	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00940000153883.a	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00490000043964	ENSGT00940000154169.A	ENSGT00390000008969	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000169143	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525	ENSGT00940000159632	ENSGT00940000159195	ENSGT00390000014957	ENSGT00390000002761	ENSGT00390000017626	ENSGT00390000012483
Mus	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000160628	ENSGT00940000160691	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160732	ENSGT00930000151040	ENSGT00950000182987.c.a.a.o.b.g	ENSGT00980000198830	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00390000002780	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00940000153883.a	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00490000043964	ENSGT00940000154169.A	ENSGT00390000008969	ENSGT00390000016049.c	ENSGT00940000169143	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525	ENSGT00940000159632	ENSGT00940000159195	ENSGT00390000014957	ENSGT00390000002761	ENSGT00390000017626	ENSGT00390000012483
Mus_A	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000160628	ENSGT00940000160691	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160732	ENSGT00930000151040	ENSGT00950000182987.c.a.a.o.b.g	ENSGT00980000198830	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00390000002780	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00940000153883.a	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00490000043964	ENSGT00940000154169.A	ENSGT00390000008969	ENSGT00390000016049.c	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525	ENSGT00940000159632	ENSGT00940000159195	ENSGT00390000014957	ENSGT00390000002761	ENSGT00390000017626	ENSGT00390000012483	ENSGT00940000159805
Mus_B	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000160628	ENSGT00940000160691	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160732	ENSGT00930000151040	ENSGT00950000182987.c.a.a.o.b.g	ENSGT00980000198830	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00390000002780	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00940000153883.a	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00490000043964	ENSGT00940000154169.A	ENSGT00390000008969	ENSGT00390000016049.c	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525	ENSGT00940000159632	ENSGT00940000159195	ENSGT00390000014957	ENSGT00390000002761	ENSGT00390000017626	ENSGT00390000012483	ENSGT00940000159805
Mus_C	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000160628	ENSGT00940000160691	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160732	ENSGT00930000151040	ENSGT00950000182987.c.a.a.o.b.g	ENSGT00980000198830	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00390000002780	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00940000153883.a	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00490000043964	ENSGT00940000154169.A	ENSGT00390000008969	ENSGT00390000016049.c	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525	ENSGT00940000159632	ENSGT00940000159195	ENSGT00390000014957	ENSGT00390000002761	ENSGT00390000017626	ENSGT00390000012483	ENSGT00940000159805
spretus	MODERN SPECIES	16	MGP_SPRETEiJ_G0031573	Coro1a (MGP_SPRETEiJ_G0031574)	Mapk3 (MGP_SPRETEiJ_G0031575)	Gdpd3 (MGP_SPRETEiJ_G0031576)	Ypel3 (MGP_SPRETEiJ_G0031577)	Tbx6 (MGP_SPRETEiJ_G0031578)	Ppp4c (MGP_SPRETEiJ_G0031579)	Aldoa (MGP_SPRETEiJ_G0031580)	Tlcd3b (MGP_SPRETEiJ_G0031581)	4930451I11Rik (MGP_SPRETEiJ_G0031582)	Doc2a (MGP_SPRETEiJ_G0031583)	Ino80e (MGP_SPRETEiJ_G0031584)	Hirip3 (MGP_SPRETEiJ_G0031585)	Taok2 (MGP_SPRETEiJ_G0031586)	Tmem219 (MGP_SPRETEiJ_G0031587)	Kctd13 (MGP_SPRETEiJ_G0031588) ##22	Asphd1 (MGP_SPRETEiJ_G0031589)	Sez6l2 (MGP_SPRETEiJ_G0031590)	MGP_SPRETEiJ_G0031591	Mvp (MGP_SPRETEiJ_G0031592)	MGP_SPRETEiJ_G0031593	MGP_SPRETEiJ_G0031594	MGP_SPRETEiJ_G0031595	Prrt2 (MGP_SPRETEiJ_G0031596)	Maz (MGP_SPRETEiJ_G0031597)	Kif22 (MGP_SPRETEiJ_G0031598)	Zg16 (MGP_SPRETEiJ_G0031599)	AI467606 (MGP_SPRETEiJ_G0031600)	Qprt (MGP_SPRETEiJ_G0031601)	Spn (MGP_SPRETEiJ_G0031602)	Cd2bp2 (MGP_SPRETEiJ_G0031603)
Steppe mouse	MODERN SPECIES	2217						Ppp4c (ENSMSIG00000027409)	Aldoa (ENSMSIG00000027423)	ENSMSIG00000027451	Tlcd3b (ENSMSIG00000027456)	4930451I11Rik (ENSMSIG00000027476)	Doc2a (ENSMSIG00000027491)	Ino80e (ENSMSIG00000027512)	ENSMSIG00000027583	Taok2 (ENSMSIG00000027591)	Tmem219 (ENSMSIG00000027626)	Kctd13 (ENSMSIG00000027672) ##22	Asphd1 (ENSMSIG00000027678)	Sez6l2 (ENSMSIG00000000124)	Cdiptos (ENSMSIG00000000294)	Cdipt (ENSMSIG00000000358)	Mvp (ENSMSIG00000000502)	ENSMSIG00000000563	Prrt2 (ENSMSIG00000000591)	Maz (ENSMSIG00000000614)
Mouse	MODERN SPECIES	16	Coro1a (ENSMUSG00000030707)	Mapk3 (ENSMUSG00000063065)	Gdpd3 (ENSMUSG00000030703)	Ypel3 (ENSMUSG00000042675)	Tbx6 (ENSMUSG00000030699)	Ppp4c (ENSMUSG00000030697)	Aldoa (ENSMUSG00000030695)	Tlcd3b (ENSMUSG00000058966)	Aldoa (ENSMUSG00000114515)	4930451I11Rik (ENSMUSG00000045989)	Doc2a (ENSMUSG00000052301)	Ino80e (ENSMUSG00000030689)	Hirip3 (ENSMUSG00000042606)	Taok2 (ENSMUSG00000059981)	Tmem219 (ENSMUSG00000060538)	Kctd13 (ENSMUSG00000030685) ##22	Asphd1 (ENSMUSG00000046378)	Sez6l2 (ENSMUSG00000030683)	Cdiptos (ENSMUSG00000097075)	Cdipt (ENSMUSG00000030682)	Mvp (ENSMUSG00000030681)	Pagr1a (ENSMUSG00000030680)	Gm42742 (ENSMUSG00000107068)	Prrt2 (ENSMUSG00000045114)	Maz (ENSMUSG00000030678)	Kif22 (ENSMUSG00000030677)	Zg16 (ENSMUSG00000049350)	AI467606 (ENSMUSG00000045165)	Qprt (ENSMUSG00000030674)	Spn (ENSMUSG00000051457)	Cd2bp2 (ENSMUSG00000042502)
Ryukyu mouse	MODERN SPECIES	16	Bola2 (MGP_CAROLIEiJ_G0030459)	Coro1a (MGP_CAROLIEiJ_G0030460)	Mapk3 (MGP_CAROLIEiJ_G0030461)	Gdpd3 (MGP_CAROLIEiJ_G0030462)	Ypel3 (MGP_CAROLIEiJ_G0030463)	Tbx6 (MGP_CAROLIEiJ_G0030464)	Ppp4c (MGP_CAROLIEiJ_G0030465)	Aldoa (MGP_CAROLIEiJ_G0030466)	Tlcd3b (MGP_CAROLIEiJ_G0030467)	4930451I11Rik (MGP_CAROLIEiJ_G0030468)	MGP_CAROLIEiJ_G0030469	MGP_CAROLIEiJ_G0030470	Hirip3 (MGP_CAROLIEiJ_G0030471)	Taok2 (MGP_CAROLIEiJ_G0030472)	Tmem219 (MGP_CAROLIEiJ_G0030473)	Kctd13 (MGP_CAROLIEiJ_G0030474) ##22	Asphd1 (MGP_CAROLIEiJ_G0030475)	Sez6l2 (MGP_CAROLIEiJ_G0030476)	Cdipt (MGP_CAROLIEiJ_G0030477)	Mvp (MGP_CAROLIEiJ_G0030478)	MGP_CAROLIEiJ_G0030479	MGP_CAROLIEiJ_G0030480	MGP_CAROLIEiJ_G0030481	Prrt2 (MGP_CAROLIEiJ_G0030482)	Maz (MGP_CAROLIEiJ_G0030483)	MGP_CAROLIEiJ_G0030484	Zg16 (MGP_CAROLIEiJ_G0030485)	AI467606 (MGP_CAROLIEiJ_G0030486)	Qprt (MGP_CAROLIEiJ_G0030487)	Spn (MGP_CAROLIEiJ_G0030488)	MGP_CAROLIEiJ_G0030489
Shrew mouse	MODERN SPECIES		Bola2 (MGP_PahariEiJ_G0013669)	Coro1a (MGP_PahariEiJ_G0013670)	Mapk3 (MGP_PahariEiJ_G0013671)	Gdpd3 (MGP_PahariEiJ_G0013672)	Ypel3 (MGP_PahariEiJ_G0013673)	Tbx6 (MGP_PahariEiJ_G0013674)	Ppp4c (MGP_PahariEiJ_G0013675)	Aldoa (MGP_PahariEiJ_G0013676)	Tlcd3b (MGP_PahariEiJ_G0013677)	4930451I11Rik (MGP_PahariEiJ_G0013678)	Doc2a (MGP_PahariEiJ_G0013679)	MGP_PahariEiJ_G0013680	MGP_PahariEiJ_G0013681	Taok2 (MGP_PahariEiJ_G0013682)	Tmem219 (MGP_PahariEiJ_G0013683)	Kctd13 (MGP_PahariEiJ_G0013684) ##22	Asphd1 (MGP_PahariEiJ_G0013685)	Sez6l2 (MGP_PahariEiJ_G0013686)	Cdipt (MGP_PahariEiJ_G0013687)	Mvp (MGP_PahariEiJ_G0013688)	MGP_PahariEiJ_G0013689	MGP_PahariEiJ_G0013691	MGP_PahariEiJ_G0013690	Prrt2 (MGP_PahariEiJ_G0013692)	Maz (MGP_PahariEiJ_G0013693)	MGP_PahariEiJ_G0013694	Zg16 (MGP_PahariEiJ_G0013695)	AI467606 (MGP_PahariEiJ_G0013696)	Qprt (MGP_PahariEiJ_G0013697)	Spn (MGP_PahariEiJ_G0013698)	Cd2bp2 (MGP_PahariEiJ_G0013699)
Rat	MODERN SPECIES		Coro1a (ENSRNOG00000019430)	ENSRNOG00000067742	Gdpd3 (ENSRNOG00000019685)	Mapk3 (ENSRNOG00000053583)	Ypel3 (ENSRNOG00000019721)	Tbx6 (ENSRNOG00000019771)	Ppp4c (ENSRNOG00000019813)	Aldoa (ENSRNOG00000052802)	LOC103691235 (ENSRNOG00000067655)	Tlcd3b (ENSRNOG00000019914)	Doc2a (ENSRNOG00000019920)	Ino80e (ENSRNOG00000019960)	Hirip3 (ENSRNOG00000029061)	Taok2 (ENSRNOG00000019964)	Tmem219 (ENSRNOG00000020000)	Kctd13 (ENSRNOG00000020010) ##22	Asphd1 (ENSRNOG00000027213)	Sez6l2 (ENSRNOG00000027098)	Cdiptos (ENSRNOG00000057003)	Cdipt (ENSRNOG00000024144)	Mvp (ENSRNOG00000020182)	Prrt2 (ENSRNOG00000029366)	Maz (ENSRNOG00000055082)	Kif22 (ENSRNOG00000020281)	Zg16 (ENSRNOG00000016857)	C1h16orf54 (ENSRNOG00000016978)	Qprt (ENSRNOG00000016980)	Spn (ENSRNOG00000036711)	Cd2bp2 (ENSRNOG00000017201)	Tbc1d10b (ENSRNOG00000017349)	Myl11 (ENSRNOG00000017645)
Upper Galilee mountains blind mole rat	MODERN SPECIES	1849	Mapk3 (ENSNGAG00000002514)	Gdpd3 (ENSNGAG00000009285)	Ypel3 (ENSNGAG00000018590)	Tbx6 (ENSNGAG00000020808)	Ppp4c (ENSNGAG00000011899)	ENSNGAG00000005523	Aldoa (ENSNGAG00000011234)	ENSNGAG00000023510	Tlcd3b (ENSNGAG00000012669)	4930451I11Rik (ENSNGAG00000022713)	Doc2a (ENSNGAG00000002410)	Ino80e (ENSNGAG00000023457)	Hirip3 (ENSNGAG00000020213)	ENSNGAG00000014761	Tmem219 (ENSNGAG00000022763)	Kctd13 (ENSNGAG00000020414) ##22	ENSNGAG00000011859	Sez6l2 (ENSNGAG00000007314)	ENSNGAG00000019209	Cdipt (ENSNGAG00000011715)	Mvp (ENSNGAG00000012766)	ENSNGAG00000005646	Prrt2 (ENSNGAG00000011127)	ENSNGAG00000023335	Kif22 (ENSNGAG00000004121)	Zg16 (ENSNGAG00000011148)	Qprt (ENSNGAG00000023419)	Cd2bp2 (ENSNGAG00000023200)	Tbc1d10b (ENSNGAG00000014846)	Mylpf (ENSNGAG00000008358)	Septin1 (ENSNGAG00000021368)
Lesser Egyptian jerboa	MODERN SPECIES	185	Mapk3 (ENSJJAG00000010908)	Gdpd3 (ENSJJAG00000011102)	Ypel3 (ENSJJAG00000018230)	Tbx6 (ENSJJAG00000020553)	Ppp4c (ENSJJAG00000000212)	ENSJJAG00000004376	ENSJJAG00000018094	Aldoa (ENSJJAG00000019462)	Tlcd3b (ENSJJAG00000020551)	4930451I11Rik (ENSJJAG00000013068)	Doc2a (ENSJJAG00000013934)	Ino80e (ENSJJAG00000016296)	Hirip3 (ENSJJAG00000017473)	ENSJJAG00000011563	Tmem219 (ENSJJAG00000022947)	Kctd13 (ENSJJAG00000000837) ##22	ENSJJAG00000004574	Sez6l2 (ENSJJAG00000008955)	Cdiptos (ENSJJAG00000009064)	Cdipt (ENSJJAG00000011186)	Mvp (ENSJJAG00000015211)	ENSJJAG00000016682	ENSJJAG00000019430	Maz (ENSJJAG00000020922)	Kif22 (ENSJJAG00000022618)	Zg16 (ENSJJAG00000012850)
Kangaroo rat	MODERN SPECIES	333	ENSDORG00000026227	Coro1a (ENSDORG00000007427)	Mapk3 (ENSDORG00000003370)	Gdpd3 (ENSDORG00000003368)	Ypel3 (ENSDORG00000023793)	Tbx6 (ENSDORG00000003367)	Ppp4c (ENSDORG00000003366)	ENSDORG00000003364	Aldoa (ENSDORG00000024800)	Tlcd3b (ENSDORG00000006792)	Doc2a (ENSDORG00000003070)	Ino80e (ENSDORG00000003067)	ENSDORG00000003064	ENSDORG00000025179	Tmem219 (ENSDORG00000027172)	Kctd13 (ENSDORG00000008174) ##22	ENSDORG00000025818	Sez6l2 (ENSDORG00000008203)	Cdiptos (ENSDORG00000026800)	Cdipt (ENSDORG00000008201)	Mvp (ENSDORG00000007996)	ENSDORG00000007994	ENSDORG00000029380	Kif22 (ENSDORG00000007991)	ENSDORG00000029287	Zg16 (ENSDORG00000002397)	AI467606 (ENSDORG00000027654)	Qprt (ENSDORG00000011148)	ENSDORG00000011432	Cd2bp2 (ENSDORG00000026209)	Tbc1d10b (ENSDORG00000011435)
Rodentia_A	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000160628	ENSGT00940000160691	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160732	ENSGT00930000151040	ENSGT00950000182987.c.a.a	ENSGT01030000234914	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00390000002780	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00940000153883.a	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00490000043964	ENSGT00940000154169.A	ENSGT00390000008969	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525	ENSGT00940000159632	ENSGT00940000159195	ENSGT00390000014957	ENSGT00390000002761	ENSGT00390000017626	ENSGT00390000012483	ENSGT00940000166735
Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000160628	ENSGT00940000160691	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160732	ENSGT00930000151040	ENSGT00950000182987.c.a.a	ENSGT00980000198830	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00390000002780	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00940000153883.a	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00490000043964	ENSGT00940000154169.A	ENSGT00390000008969	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525	ENSGT00940000159632	ENSGT00940000159195	ENSGT00390000014957	ENSGT00390000002761	ENSGT00390000017626	ENSGT00390000012483	ENSGT00940000166735
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000160628	ENSGT00940000160691	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160732	ENSGT00930000151040	ENSGT00950000182987.c.a.a	ENSGT00980000198830	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00390000002780	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00940000153883.a	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00490000043964	ENSGT00940000154169.A	ENSGT00390000008969	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525	ENSGT00940000159632	ENSGT00940000159195	ENSGT00390000014957	ENSGT00390000002761	ENSGT00390000017626	ENSGT00390000012483	ENSGT00940000159805
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000160628	ENSGT00940000160691	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160732	ENSGT00930000151040	ENSGT00950000182987.c.a.a	ENSGT00980000198830	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00390000002780	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00940000153883.a	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00490000043964	ENSGT00940000154169.A	ENSGT00390000008969	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525	ENSGT00940000159632	ENSGT00940000159195	ENSGT00390000014957	ENSGT00390000002761	ENSGT00390000017626	ENSGT00390000012483	ENSGT00940000159805
Squirrel	MODERN SPECIES	101	CORO1A (ENSSTOG00000008284)	MAPK3 (ENSSTOG00000000878)	GDPD3 (ENSSTOG00000000872)	YPEL3 (ENSSTOG00000020976)	TBX6 (ENSSTOG00000000869)	PPP4C (ENSSTOG00000027743)	ALDOA (ENSSTOG00000000865)	ENSSTOG00000031253	TLCD3B (ENSSTOG00000015004)	C16orf92 (ENSSTOG00000015001)	DOC2A (ENSSTOG00000001550)	INO80E (ENSSTOG00000001543)	HIRIP3 (ENSSTOG00000019703)	TAOK2 (ENSSTOG00000014982)	TMEM219 (ENSSTOG00000002548)	KCTD13 (ENSSTOG00000028496) ##22	ASPHD1 (ENSSTOG00000001511)	SEZ6L2 (ENSSTOG00000001490)	ENSSTOG00000030825	CDIPT (ENSSTOG00000001488)	MVP (ENSSTOG00000001480)	PAGR1 (ENSSTOG00000001478)	PRRT2 (ENSSTOG00000001475)	ENSSTOG00000027842	KIF22 (ENSSTOG00000001463)	ZG16 (ENSSTOG00000001461)	C16orf54 (ENSSTOG00000028325)	QPRT (ENSSTOG00000014904)	CD2BP2 (ENSSTOG00000015800)	TBC1D10B (ENSSTOG00000027313)	SEPTIN1 (ENSSTOG00000002782)
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	809	MAPK3 (ENSUPAG00010009760)	GDPD3 (ENSUPAG00010009745)	CORO1A (ENSUPAG00010009707)	YPEL3 (ENSUPAG00010009692)	TBX6 (ENSUPAG00010009680)	PPP4C (ENSUPAG00010009666)	ALDOA (ENSUPAG00010009653)	ENSUPAG00010009647	TLCD3B (ENSUPAG00010009630)	C16orf92 (ENSUPAG00010009627)	DOC2A (ENSUPAG00010009621)	INO80E (ENSUPAG00010009549)	HIRIP3 (ENSUPAG00010009538)	ENSUPAG00010009508	TMEM219 (ENSUPAG00010009469)	KCTD13 (ENSUPAG00010009460) ##22	ASPHD1 (ENSUPAG00010009447)	SEZ6L2 (ENSUPAG00010009379)	ENSUPAG00010009370	CDIPT (ENSUPAG00010009363)
Alpin marmot	MODERN SPECIES	28	CORO1A (ENSMMMG00000023723)	MAPK3 (ENSMMMG00000023724)	GDPD3 (ENSMMMG00000023725)	YPEL3 (ENSMMMG00000023726)	TBX6 (ENSMMMG00000023727)	PPP4C (ENSMMMG00000023728)	ALDOA (ENSMMMG00000023729)	ENSMMMG00000023731	TLCD3B (ENSMMMG00000023732)	C16orf92 (ENSMMMG00000023734)	DOC2A (ENSMMMG00000023735)	INO80E (ENSMMMG00000023736)	HIRIP3 (ENSMMMG00000023737)	ENSMMMG00000023738	TMEM219 (ENSMMMG00000023739)	KCTD13 (ENSMMMG00000023741) ##22	ASPHD1 (ENSMMMG00000023742)	SEZ6L2 (ENSMMMG00000023743)	ENSMMMG00000023749	CDIPT (ENSMMMG00000023754)	MVP (ENSMMMG00000023756)	PAGR1 (ENSMMMG00000023782)	PRRT2 (ENSMMMG00000023784)	ENSMMMG00000023787	KIF22 (ENSMMMG00000023790)	ZG16 (ENSMMMG00000023791)	C16orf54 (ENSMMMG00000023793)	QPRT (ENSMMMG00000023794)	ENSMMMG00000023796	CD2BP2 (ENSMMMG00000023797)	TBC1D10B (ENSMMMG00000023799)
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	9	CORO1A (ENSSVLG00005022040)	GDPD3 (ENSSVLG00005022589)	YPEL3 (ENSSVLG00005022679)	PPP4C (ENSSVLG00005022845)	ALDOA (ENSSVLG00005022910)	ENSSVLG00005023020	TLCD3B (ENSSVLG00005023107)	C16orf92 (ENSSVLG00005023167)	DOC2A (ENSSVLG00005023203)	INO80E (ENSSVLG00005023270)	HIRIP3 (ENSSVLG00005023447)	TAOK2 (ENSSVLG00005023522)	TMEM219 (ENSSVLG00005023589)	ENSSVLG00005023621	ENSSVLG00005023665	KCTD13 (ENSSVLG00005023703) ##22	ENSSVLG00005023727	SEZ6L2 (ENSSVLG00005023786)	ENSSVLG00005023928	ENSSVLG00005023953	MVP (ENSSVLG00005024023)	PAGR1 (ENSSVLG00005024039)	PRRT2 (ENSSVLG00005024065)	MAZ (ENSSVLG00005024135)	KIF22 (ENSSVLG00005024240)	ZG16 (ENSSVLG00005024275)	C16orf54 (ENSSVLG00005024307)	ENSSVLG00005024313	QPRT (ENSSVLG00005024324)	SPN (ENSSVLG00005024364)	ENSSVLG00005024376
Hystricomorpha	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000160628	ENSGT00940000160691	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160732	ENSGT00930000151040	ENSGT00950000182987.c.a.a	ENSGT01030000234914	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00390000002780	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00940000153883.a	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00490000043964	ENSGT00940000154169.A	ENSGT00390000008969	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525	ENSGT00940000159632	ENSGT00940000159195	ENSGT00390000014957	ENSGT00390000002761	ENSGT00390000017626	ENSGT00390000012483	ENSGT00940000159805
Naked mole-rat female	MODERN SPECIES	15	MAPK3 (ENSHGLG00000012077)	GDPD3 (ENSHGLG00000014961)	YPEL3 (ENSHGLG00000046181)	TBX6 (ENSHGLG00000012853)	PPP4C (ENSHGLG00000010803)	ENSHGLG00000012856	ENSHGLG00000009641	FAM57B (ENSHGLG00000010019)	ENSHGLG00000011015	DOC2A (ENSHGLG00000013063)	INO80E (ENSHGLG00000018286)	HIRIP3 (ENSHGLG00000009590)	TAOK2 (ENSHGLG00000010247)	ENSHGLG00000033956	TMEM219 (ENSHGLG00000012585)	KCTD13 (ENSHGLG00000049521) ##22	ASPHD1 (ENSHGLG00000011101)	SEZ6L2 (ENSHGLG00000018156)	ENSHGLG00000016825	CDIPT (ENSHGLG00000016919)	MVP (ENSHGLG00000019034)	PAGR1 (ENSHGLG00000014329)	PRRT2 (ENSHGLG00000017723)	ENSHGLG00000018743	KIF22 (ENSHGLG00000006818)	ZG16 (ENSHGLG00000036562)	ENSHGLG00000039629	QPRT (ENSHGLG00000040784)	SPN (ENSHGLG00000043525)	CD2BP2 (ENSHGLG00000040276)	ENSHGLG00000006622
Hystricomorpha_a	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000160628	ENSGT00940000160691	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160732	ENSGT00930000151040	ENSGT00950000182987.c.a.a	ENSGT01030000234914	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00390000002780	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00940000153883.a	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00490000043964	ENSGT00940000154169.A	ENSGT00390000008969	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525	ENSGT00940000159632	ENSGT00940000159195	ENSGT00390000014957	ENSGT00390000002761	ENSGT00390000017626	ENSGT00390000012483	ENSGT00940000159805
Guinea pig	MODERN SPECIES	4	ENSCPOG00000032964	MAPK3 (ENSCPOG00000003253)	GDPD3 (ENSCPOG00000026890)	YPEL3 (ENSCPOG00000003249)	TBX6 (ENSCPOG00000021165)	PPP4C (ENSCPOG00000003938)	ALDOA (ENSCPOG00000007434)	ENSCPOG00000031164	TLCD3B (ENSCPOG00000004220)	C16orf92 (ENSCPOG00000010422)	DOC2A (ENSCPOG00000020613)	INO80E (ENSCPOG00000011974)	HIRIP3 (ENSCPOG00000024308)	TAOK2 (ENSCPOG00000013241)	TMEM219 (ENSCPOG00000025186)	KCTD13 (ENSCPOG00000013817) ##22	ASPHD1 (ENSCPOG00000013815)	SEZ6L2 (ENSCPOG00000024588)	CDIPT (ENSCPOG00000037085)	MVP (ENSCPOG00000007374)	PAGR1 (ENSCPOG00000001508)	PRRT2 (ENSCPOG00000001510)	MAZ (ENSCPOG00000019886)	KIF22 (ENSCPOG00000002475)	ZG16 (ENSCPOG00000030346)	C16orf54 (ENSCPOG00000039383)	QPRT (ENSCPOG00000024975)	SPN (ENSCPOG00000020724)	CD2BP2 (ENSCPOG00000040493)	MYL11 (ENSCPOG00000003087)	SEPTIN1 (ENSCPOG00000003088)
Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES	43	ENSGT00940000160628	ENSGT00940000160691	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160732	ENSGT00930000151040	ENSGT00950000182987.c.a.a	ENSGT01030000234914	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00390000002780	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00940000153883.a	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00490000043964	ENSGT00940000154169.A	ENSGT00390000008969	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525	ENSGT00940000159632	ENSGT00940000159195	ENSGT00390000014957	ENSGT00390000002761	ENSGT00390000012483	ENSGT00940000159805	ENSGT00940000159038.d
Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	200	ENSCLAG00000014934	MAPK3 (ENSCLAG00000013110)	GDPD3 (ENSCLAG00000015259)	YPEL3 (ENSCLAG00000010065)	TBX6 (ENSCLAG00000012212)	PPP4C (ENSCLAG00000011141)	ALDOA (ENSCLAG00000009637)	ENSCLAG00000010262	TLCD3B (ENSCLAG00000009554)	C16orf92 (ENSCLAG00000012422)	DOC2A (ENSCLAG00000009593)	INO80E (ENSCLAG00000010213)	HIRIP3 (ENSCLAG00000014160)	TAOK2 (ENSCLAG00000014095)	TMEM219 (ENSCLAG00000010263)	KCTD13 (ENSCLAG00000011163) ##22	ASPHD1 (ENSCLAG00000010796)	SEZ6L2 (ENSCLAG00000012459)	ENSCLAG00000012134	CDIPT (ENSCLAG00000009525)	MVP (ENSCLAG00000011381)	PAGR1 (ENSCLAG00000009746)	ENSCLAG00000010098	ENSCLAG00000010257	KIF22 (ENSCLAG00000011845)	ZG16 (ENSCLAG00000015106)	C16orf54 (ENSCLAG00000011187)	QPRT (ENSCLAG00000011259)	CD2BP2 (ENSCLAG00000011745)	TBC1D10B (ENSCLAG00000012337)	MYL11 (ENSCLAG00000010249)
Degu	MODERN SPECIES	42	ENSODEG00000015136	CORO1A (ENSODEG00000013864)	MAPK3 (ENSODEG00000014228)	GDPD3 (ENSODEG00000014393)	YPEL3 (ENSODEG00000014110)	TBX6 (ENSODEG00000013201)	PPP4C (ENSODEG00000013527)	ENSODEG00000014918	ENSODEG00000015824	TLCD3B (ENSODEG00000013182)	DOC2A (ENSODEG00000013649)	INO80E (ENSODEG00000014791)	HIRIP3 (ENSODEG00000014857)	ENSODEG00000014199	TMEM219 (ENSODEG00000014299)	KCTD13 (ENSODEG00000014567) ##22	ENSODEG00000014256	SEZ6L2 (ENSODEG00000013638)	ENSODEG00000013931	CDIPT (ENSODEG00000013659)	MVP (ENSODEG00000015812)	ENSODEG00000014140	ENSODEG00000014201	ENSODEG00000014451	KIF22 (ENSODEG00000014003)	ZG16 (ENSODEG00000014795)	QPRT (ENSODEG00000014102)	ENSODEG00000014610	TBC1D10B (ENSODEG00000014268)	MYL11 (ENSODEG00000015211)	SEPTIN1 (ENSODEG00000014531)
Laurasiatheria	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000160628	ENSGT00940000160691	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160732	ENSGT00930000151040	ENSGT00950000182987.c.a.a	ENSGT01030000234914	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00390000002780	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00940000153883.a	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00490000043964	ENSGT00940000154169.A	ENSGT00390000008969	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000169143	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525	ENSGT00940000159632	ENSGT00940000159195	ENSGT00390000014957	ENSGT00390000002761	ENSGT00390000017626	ENSGT00390000012483
Laurasiatheria_a	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000160628	ENSGT00940000160691	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160732	ENSGT00930000151040	ENSGT00950000182987.c.a.a	ENSGT01030000234914	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00390000002780	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00940000153883.a	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00490000043964	ENSGT00940000154169.A	ENSGT00390000008969	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000169143	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525	ENSGT00940000159632	ENSGT00940000159195	ENSGT00390000014957	ENSGT00390000002761	ENSGT00390000017626	ENSGT00390000012483
Artiodactyla	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000160628	ENSGT00940000160691	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160732	ENSGT00930000151040	ENSGT00950000182987.c.a.a	ENSGT01030000234914	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00390000002780	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00940000153883.a	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00490000043964	ENSGT00940000154169.A	ENSGT00390000008969	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525	ENSGT00940000159632	ENSGT00940000159195	ENSGT00390000014957	ENSGT00390000002761	ENSGT00390000017626	ENSGT00390000012483	ENSGT00940000166735
Suina	ANCESTRAL SPECIES	31	ENSGT00940000160628	ENSGT00940000160691	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160732	ENSGT00930000151040	ENSGT00950000182987.c.a.a	ENSGT01040000240645	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00390000002780	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00940000153883.a	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00490000043964	ENSGT00940000154169.A	ENSGT00390000008969	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525	ENSGT00940000159632	ENSGT00940000159195	ENSGT00390000014957	ENSGT00390000002761	ENSGT00390000017626	ENSGT00390000012483	ENSGT00940000159805
Chacoan peccary	MODERN SPECIES	842	ENSCWAG00000018260	CORO1A (ENSCWAG00000018306)	MAPK3 (ENSCWAG00000018419)	GDPD3 (ENSCWAG00000018753)	YPEL3 (ENSCWAG00000018821)	TBX6 (ENSCWAG00000018878)	PPP4C (ENSCWAG00000018937)	ALDOA (ENSCWAG00000018974)	ENSCWAG00000019037	TLCD3B (ENSCWAG00000009156)	DOC2A (ENSCWAG00000009295)	INO80E (ENSCWAG00000009445)	HIRIP3 (ENSCWAG00000009502)	TAOK2 (ENSCWAG00000009549)	TMEM219 (ENSCWAG00000009642)	KCTD13 (ENSCWAG00000009682) ##22	ASPHD1 (ENSCWAG00000009709)	SEZ6L2 (ENSCWAG00000009818)	ENSCWAG00000011169	CDIPT (ENSCWAG00000011230)	MVP (ENSCWAG00000011362)	PAGR1 (ENSCWAG00000011416)	PRRT2 (ENSCWAG00000011455)	MAZ (ENSCWAG00000011571)
Pig	MODERN SPECIES	11	CORO1A (ENSSSCG00000038055)	MAPK3 (ENSSSCG00000040682)	GDPD3 (ENSSSCG00000021811)	YPEL3 (ENSSSCG00000035430)	TBX6 (ENSSSCG00000034774)	PPP4C (ENSSSCG00000036817)	ALDOA (ENSSSCG00000032556)	ENSSSCG00000046707	TLCD3B (ENSSSCG00000037193)	C16orf92 (ENSSSCG00000037075)	DOC2A (ENSSSCG00000034635)	INO80E (ENSSSCG00000032921)	HIRIP3 (ENSSSCG00000030122)	TAOK2 (ENSSSCG00000031967)	TMEM219 (ENSSSCG00000052107)	KCTD13 (ENSSSCG00000040888) ##22	ENSSSCG00000040342	SEZ6L2 (ENSSSCG00000029186)	ENSSSCG00000034445	CDIPT (ENSSSCG00000027629)	MVP (ENSSSCG00000027946)	PAGR1 (ENSSSCG00000054721)	PRRT2 (ENSSSCG00000027970)	MAZ (ENSSSCG00000025321)	KIF22 (ENSSSCG00000029509)	ENSSSCG00000029752	QPRT (ENSSSCG00000027454)	SPN (ENSSSCG00000035256)	CD2BP2 (ENSSSCG00000007791)	TBC1D10B (ENSSSCG00000007798)	MYL11 (ENSSSCG00000007799)
Artiodactyla_a	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000160628	ENSGT00940000160691	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160732	ENSGT00930000151040	ENSGT00950000182987.c.a.a	ENSGT01030000234914	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00390000002780	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00940000153883.a	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00490000043964	ENSGT00940000154169.A.k	ENSGT00390000008969	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525	ENSGT00940000159632	ENSGT00940000159195	ENSGT00390000014957	ENSGT00390000002761	ENSGT00390000017626	ENSGT00390000012483	ENSGT00940000166735
Camelidae	ANCESTRAL SPECIES	30	ENSGT00940000160628	ENSGT00940000160691	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160732	ENSGT00930000151040	ENSGT00950000182987.c.a.a.c	ENSGT01030000234914	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00390000002780	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00940000153883.a	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00490000043964	ENSGT00940000154169.A.k	ENSGT00390000008969	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525	ENSGT00940000159632	ENSGT00390000002761	ENSGT00390000014957	ENSGT00390000017626	ENSGT00390000012483	ENSGT00940000159805	ENSGT00940000159038.d
Arabian camel	MODERN SPECIES	9	CORO1A (ENSCDRG00005008664)	MAPK3 (ENSCDRG00005008768)	GDPD3 (ENSCDRG00005009233)	YPEL3 (ENSCDRG00005009420)	TBX6 (ENSCDRG00005009554)	PPP4C (ENSCDRG00005009689)	ENSCDRG00005009835	ENSCDRG00005010074	TLCD3B (ENSCDRG00005010204)	C16orf92 (ENSCDRG00005010309)	DOC2A (ENSCDRG00005010374)	INO80E (ENSCDRG00005010432)	HIRIP3 (ENSCDRG00005010524)	TAOK2 (ENSCDRG00005010569)	TMEM219 (ENSCDRG00005010796)	KCTD13 (ENSCDRG00005010832) ##22	ASPHD1 (ENSCDRG00005010917)	SEZ6L2 (ENSCDRG00005010996)	ENSCDRG00005011654	CDIPT (ENSCDRG00005011707)	MVP (ENSCDRG00005011911)	PAGR1 (ENSCDRG00005011855)	PRRT2 (ENSCDRG00005012023)	MAZ (ENSCDRG00005012130)	KIF22 (ENSCDRG00005012198)	QPRT (ENSCDRG00005012250)	C16orf54 (ENSCDRG00005012308)	ENSCDRG00005012341	CD2BP2 (ENSCDRG00005012394)	TBC1D10B (ENSCDRG00005012492)	MYL11 (ENSCDRG00005012665)
Alpaca	MODERN SPECIES	3323																KCTD13 (ENSVPAG00000007796) ##22	CDIPT (ENSVPAG00000007794)
Artiodactyla_b	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000160628	ENSGT00940000160691	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160732	ENSGT00930000151040	ENSGT00950000182987.c.a.a	ENSGT01030000234914	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00390000002780	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00940000153883.a	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00490000043964	ENSGT00940000154169.A.k	ENSGT00390000008969	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525	ENSGT00940000159632	ENSGT00940000159195	ENSGT00390000014957	ENSGT00390000002761	ENSGT00390000017626	ENSGT00390000012483	ENSGT00940000166735
Pecora	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000160628	ENSGT00940000160691	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160732	ENSGT00930000151040	ENSGT00950000182987.c.a.a	ENSGT01030000234914	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00390000002780	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00940000153883.a	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00490000043964	ENSGT00940000154169.A.k	ENSGT00390000008969	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525	ENSGT00940000159632	ENSGT00940000159195	ENSGT00390000014957	ENSGT00390000002761	ENSGT00390000017626	ENSGT00390000012483	ENSGT00940000166735
Yarkand deer	MODERN SPECIES	1	ENSCHYG00000004899	CORO1A (ENSCHYG00000004912)	ENSCHYG00000004982	GDPD3 (ENSCHYG00000005244)	ENSCHYG00000005280	TBX6 (ENSCHYG00000005354)	PPP4C (ENSCHYG00000005439)	ALDOA (ENSCHYG00000005501)	ENSCHYG00000005562	TLCD3B (ENSCHYG00000005602)	DOC2A (ENSCHYG00000005707)	INO80E (ENSCHYG00000005758)	HIRIP3 (ENSCHYG00000005824)	TAOK2 (ENSCHYG00000005911)	TMEM219 (ENSCHYG00000006036)	KCTD13 (ENSCHYG00000006061) ##22	ASPHD1 (ENSCHYG00000006122)	SEZ6L2 (ENSCHYG00000006235)	ENSCHYG00000007306	ENSCHYG00000007346	MVP (ENSCHYG00000007459)	PAGR1 (ENSCHYG00000007540)	PRRT2 (ENSCHYG00000007561)	MAZ (ENSCHYG00000007598)	KIF22 (ENSCHYG00000007666)	ZG16 (ENSCHYG00000007726)	ENSCHYG00000007771	QPRT (ENSCHYG00000007791)	ENSCHYG00000007836	CD2BP2 (ENSCHYG00000007863)	TBC1D10B (ENSCHYG00000007925)
Percora_a	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160732	ENSGT00930000151040	ENSGT00950000182987.c.a.a	ENSGT01030000234914	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00390000002780	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00940000153883.a.h	ENSGT00960000190903	ENSGT00940000153883.a.g	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00490000043964	ENSGT00940000154169.A.k	ENSGT00390000008969	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525	ENSGT00940000159632	ENSGT00940000159195	ENSGT00390000014957	ENSGT00390000002761	ENSGT00390000017626	ENSGT00390000012483	ENSGT00940000166735
Bovidae	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160732	ENSGT00930000151040	ENSGT00950000182987.c.a.a	ENSGT01030000234914	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00390000002780	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000159991.A	ENSGT00940000153883.a.h	ENSGT00960000190903	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00940000153883.a.g.a	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00490000043964	ENSGT00940000154169.A.k	ENSGT00390000008969	ENSGT01010000229505	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525	ENSGT00940000159632	ENSGT00940000159195	ENSGT00390000014957	ENSGT00390000002761	ENSGT00390000017626	ENSGT00390000012483
Caprinae	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000160628	ENSGT00940000160691	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160732	ENSGT00930000151040	ENSGT00950000182987.c.a.a	ENSGT01040000240645	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00390000002780	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00940000153883.a.g.a	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00490000043964	ENSGT00940000154169.A.k	ENSGT00390000008969	ENSGT01010000229505	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525	ENSGT00940000159632	ENSGT00940000159195	ENSGT00390000014957	ENSGT00390000002761	ENSGT00390000017626	ENSGT00390000012483
Rambouillet Sheep	MODERN SPECIES	16	CORO1A (ENSOARG00020014834)	MAPK3 (ENSOARG00020015005)	GDPD3 (ENSOARG00020015512)	YPEL3 (ENSOARG00020015578)	TBX6 (ENSOARG00020015766)	PPP4C (ENSOARG00020015863)	ALDOA (ENSOARG00020015962)	ENSOARG00020016212	TLCD3B (ENSOARG00020016400)	C16orf92 (ENSOARG00020016496)	DOC2A (ENSOARG00020016538)	INO80E (ENSOARG00020016658)	ENSOARG00020016749	TAOK2 (ENSOARG00020016784)	TMEM219 (ENSOARG00020016957)	KCTD13 (ENSOARG00020016990) ##22	ENSOARG00020017044	SEZ6L2 (ENSOARG00020017133)	ENSOARG00020019032	CDIPT (ENSOARG00020019082)	MVP (ENSOARG00020019254)	ENSOARG00020019335	PAGR1 (ENSOARG00020019360)	PRRT2 (ENSOARG00020019397)	MAZ (ENSOARG00020019489)	KIF22 (ENSOARG00020019776)	ZG16 (ENSOARG00020019832)	C16orf54 (ENSOARG00020019890)	QPRT (ENSOARG00020019913)	ENSOARG00020019988	ENSOARG00020020033
Goat	MODERN SPECIES	17	ENSCHIG00000021042	CORO1A (ENSCHIG00000021644)	ENSCHIG00000024393	MAPK3 (ENSCHIG00000016099)	GDPD3 (ENSCHIG00000014168)	YPEL3 (ENSCHIG00000022021)	TBX6 (ENSCHIG00000013310)	PPP4C (ENSCHIG00000022306)	ALDOA (ENSCHIG00000013515)	TLCD3B (ENSCHIG00000015596)	DOC2A (ENSCHIG00000012920)	INO80E (ENSCHIG00000017542)	HIRIP3 (ENSCHIG00000011597)	TAOK2 (ENSCHIG00000015173)	ENSCHIG00000017434	KCTD13 (ENSCHIG00000023558) ##22	ASPHD1 (ENSCHIG00000012171)	SEZ6L2 (ENSCHIG00000024594)	ENSCHIG00000014846	CDIPT (ENSCHIG00000019243)	MVP (ENSCHIG00000007963)	PAGR1 (ENSCHIG00000012427)	PRRT2 (ENSCHIG00000021578)	MAZ (ENSCHIG00000020711)	KIF22 (ENSCHIG00000025605)	ZG16 (ENSCHIG00000009261)	C16orf54 (ENSCHIG00000011474)	QPRT (ENSCHIG00000020454)	ENSCHIG00000007607	CD2BP2 (ENSCHIG00000011361)	TBC1D10B (ENSCHIG00000015189)
Bovinae	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160732	ENSGT00930000151040	ENSGT00950000182987.c.a.a	ENSGT01030000234914	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00390000002780	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000159991.A	ENSGT00940000153883.a.h	ENSGT00960000190903	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00940000153883.a.g.a	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00490000043964	ENSGT00940000154169.A.k	ENSGT00390000008969	ENSGT01010000229505	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525	ENSGT00940000159632	ENSGT00940000159195	ENSGT00390000014957	ENSGT00390000002761	ENSGT00390000017626	ENSGT00390000012483
Bos	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160732	ENSGT00930000151040	ENSGT00950000182987.c.a.a	ENSGT01030000234914	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00390000002780	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00960000190903	ENSGT00940000159991.A	ENSGT00940000153883.a.h	ENSGT00940000153883.a.g.a	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00490000043964	ENSGT00940000154169.A.k	ENSGT00390000008969	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525	ENSGT00940000159632	ENSGT00940000159195	ENSGT00390000014957	ENSGT00390000002761	ENSGT00390000017626	ENSGT00390000012483	ENSGT00940000166735
Bos_a	DUPLICATION
Bos_a	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183143.c.b.e ##22
Wild yak	MODERN SPECIES	390	ENSBMUG00000022261	DDX51 (ENSBMUG00000022246)	NOC4L (ENSBMUG00000022227)	GALNT9 (ENSBMUG00000022210)	ENSBMUG00000022194	ENSBMUG00000022172	ENSBMUG00000022134	P2RX2 (ENSBMUG00000022115)	POLE (ENSBMUG00000022021)	ENSBMUG00000021926	PXMP2 (ENSBMUG00000021909)	ENSBMUG00000021881	ANKLE2 (ENSBMUG00000021872)	GOLGA3 (ENSBMUG00000021840)	CHFR (ENSBMUG00000021793)	ENSBMUG00000021779 ##22	ANHX (ENSBMUG00000021767)	ENSBMUG00000021755	MBD3L1 (ENSBMUG00000021747)	ENSBMUG00000021738
Domestic yak	MODERN SPECIES	5															ENSBGRG00000003677	ENSBGRG00000003709 ##22	ENSBGRG00000003741	CDC73 (ENSBGRG00000003804)	B3GALT2 (ENSBGRG00000004165)	ENSBGRG00000004178	RO60 (ENSBGRG00000004224)	UCHL5 (ENSBGRG00000004334)	RGS2 (ENSBGRG00000004414)	RGS13 (ENSBGRG00000004475)	RGS1 (ENSBGRG00000004500)	RGS21 (ENSBGRG00000004592)	RGS18 (ENSBGRG00000004619)	BRINP3 (ENSBGRG00000004695)	ENSBGRG00000004786	KCTD3 (ENSBGRG00000004811)	USH2A (ENSBGRG00000004859)
Bos_a	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160732	ENSGT00930000151040	ENSGT00950000182987.c.a.a	ENSGT01030000234914	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00390000002780	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00960000190903	ENSGT00940000153883.a.h	ENSGT00940000153883.a.g.a	ENSGT00950000183143.c.b.f ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00490000043964	ENSGT00940000154169.A.k	ENSGT00390000008969	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525	ENSGT00940000159632	ENSGT00940000159195	ENSGT00390000014957	ENSGT00390000002761	ENSGT00390000017626	ENSGT00390000012483	ENSGT00940000166735
Domestic yak	MODERN SPECIES	18	GDPD3 (ENSBGRG00000007022)	YPEL3 (ENSBGRG00000026426)	TBX6 (ENSBGRG00000026416)	PPP4C (ENSBGRG00000026402)	ALDOA (ENSBGRG00000026388)	ENSBGRG00000026366	TLCD3B (ENSBGRG00000026353)	C16orf92 (ENSBGRG00000026350)	DOC2A (ENSBGRG00000026342)	INO80E (ENSBGRG00000026322)	ENSBGRG00000026303	ENSBGRG00000026312	ENSBGRG00000026292	ENSBGRG00000026279	TMEM219 (ENSBGRG00000026270)	ENSBGRG00000026268 ##22	ENSBGRG00000026266	SEZ6L2 (ENSBGRG00000026170)	ENSBGRG00000026126	CDIPT (ENSBGRG00000026100)	MVP (ENSBGRG00000026091)	PAGR1 (ENSBGRG00000026080)	ENSBGRG00000026074	MAZ (ENSBGRG00000026026)	KIF22 (ENSBGRG00000026007)	ZG16 (ENSBGRG00000025995)	C16orf54 (ENSBGRG00000025989)	QPRT (ENSBGRG00000025977)	ENSBGRG00000025972	CD2BP2 (ENSBGRG00000025962)	TBC1D10B (ENSBGRG00000025949)
Wild yak	MODERN SPECIES	2937																ENSBMUG00000008161 ##22
Bos_b	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160732	ENSGT00930000151040	ENSGT00950000182987.c.a.a	ENSGT01030000234914	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00390000002780	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00960000190903	ENSGT00940000159991.A	ENSGT00940000153883.a.h	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00490000043964	ENSGT00940000154169.A.k	ENSGT00390000008969	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525	ENSGT00940000159632	ENSGT00940000159195	ENSGT00390000014957	ENSGT00390000002761	ENSGT00390000017626	ENSGT00390000012483	ENSGT00940000166735
Cow	MODERN SPECIES	17	MAPK3 (ENSBTAG00000016156)	GDPD3 (ENSBTAG00000016155)	YPEL3 (ENSBTAG00000009047)	TBX6 (ENSBTAG00000009046)	PPP4C (ENSBTAG00000012928)	ALDOA (ENSBTAG00000012927)	ENSBTAG00000050743	TLCD3B (ENSBTAG00000005033)	C16orf92 (ENSBTAG00000048797)	DOC2A (ENSBTAG00000005031)	INO80E (ENSBTAG00000005030)	HIRIP3 (ENSBTAG00000005028)	TAOK2 (ENSBTAG00000017422)	TMEM219 (ENSBTAG00000021785)	ENSBTAG00000045841	KCTD13 (ENSBTAG00000015982) ##22	ASPHD1 (ENSBTAG00000026319)	SEZ6L2 (ENSBTAG00000007955)	ENSBTAG00000053919	CDIPT (ENSBTAG00000007954)	MVP (ENSBTAG00000007952)	PAGR1 (ENSBTAG00000010904)	PRRT2 (ENSBTAG00000046752)	MAZ (ENSBTAG00000052323)	KIF22 (ENSBTAG00000013669)	C25H16orf54 (ENSBTAG00000047448)	QPRT (ENSBTAG00000018082)	SPN (ENSBTAG00000026326)	CD2BP2 (ENSBTAG00000015486)	TBC1D10B (ENSBTAG00000031852)	MYL11 (ENSBTAG00000021218)
Hybrid Bos Indicus	MODERN SPECIES	17	GDPD3 (ENSBIXG00005004061)	YPEL3 (ENSBIXG00005023785)	TBX6 (ENSBIXG00005023824)	PPP4C (ENSBIXG00005023913)	ENSBIXG00005024001	ALDOA (ENSBIXG00005024298)	ENSBIXG00005024098	TLCD3B (ENSBIXG00005004161)	C16orf92 (ENSBIXG00005024400)	DOC2A (ENSBIXG00005024529)	INO80E (ENSBIXG00005024595)	HIRIP3 (ENSBIXG00005024623)	TAOK2 (ENSBIXG00005024739)	ENSBIXG00005024787	ENSBIXG00005024851	KCTD13 (ENSBIXG00005004247) ##22	ASPHD1 (ENSBIXG00005024886)	SEZ6L2 (ENSBIXG00005004257)	ENSBIXG00005025020	CDIPT (ENSBIXG00005005770)	MVP (ENSBIXG00005025152)	PRRT2 (ENSBIXG00005025292)	MAZ (ENSBIXG00005025347)	KIF22 (ENSBIXG00005025420)	ZG16 (ENSBIXG00005025441)	C16orf54 (ENSBIXG00005025449)	QPRT (ENSBIXG00005025472)	ENSBIXG00005025475	CD2BP2 (ENSBIXG00005006859)	ENSBIXG00005025515	TBC1D10B (ENSBIXG00005025594)
American bison	MODERN SPECIES	3004	MAPK3 (ENSBBBG00000004374)	GDPD3 (ENSBBBG00000017667)	YPEL3 (ENSBBBG00000017652)	TBX6 (ENSBBBG00000017619)	PPP4C (ENSBBBG00000007310)	ALDOA (ENSBBBG00000006898)	ENSBBBG00000017481	TLCD3B (ENSBBBG00000017450)	C16orf92 (ENSBBBG00000017414)	DOC2A (ENSBBBG00000007500)	INO80E (ENSBBBG00000017333)	ENSBBBG00000004280	TAOK2 (ENSBBBG00000017262)	TMEM219 (ENSBBBG00000017148)	ENSBBBG00000017126	KCTD13 (ENSBBBG00000004232) ##22	ENSBBBG00000007665	SEZ6L2 (ENSBBBG00000017087)	ENSBBBG00000004151	CDIPT (ENSBBBG00000016770)	MVP (ENSBBBG00000016717)	ENSBBBG00000016697	PAGR1 (ENSBBBG00000016687)	PRRT2 (ENSBBBG00000004129)	ENSBBBG00000016655	KIF22 (ENSBBBG00000016646)	ZG16 (ENSBBBG00000016609)	QPRT (ENSBBBG00000016600)	ENSBBBG00000008554	CD2BP2 (ENSBBBG00000000736)	TBC1D10B (ENSBBBG00000016582)
Siberian musk deer	MODERN SPECIES	211	ENSMMSG00000010315	MAPK3 (ENSMMSG00000010351)	GDPD3 (ENSMMSG00000010686)	YPEL3 (ENSMMSG00000010772)	TBX6 (ENSMMSG00000010877)	PPP4C (ENSMMSG00000010933)	ALDOA (ENSMMSG00000010977)	ENSMMSG00000011125	TLCD3B (ENSMMSG00000011182)	DOC2A (ENSMMSG00000011260)	INO80E (ENSMMSG00000011322)	HIRIP3 (ENSMMSG00000011607)	TAOK2 (ENSMMSG00000011667)	ENSMMSG00000011779	ENSMMSG00000011814	KCTD13 (ENSMMSG00000011851) ##22	ENSMMSG00000011869	SEZ6L2 (ENSMMSG00000011966)	ENSMMSG00000013137	CDIPT (ENSMMSG00000013159)	MVP (ENSMMSG00000013254)	PAGR1 (ENSMMSG00000013279)	PRRT2 (ENSMMSG00000013295)	MAZ (ENSMMSG00000013334)	KIF22 (ENSMMSG00000013367)	ZG16 (ENSMMSG00000013449)	C16orf54 (ENSMMSG00000013472)	QPRT (ENSMMSG00000013484)	ENSMMSG00000013505	CD2BP2 (ENSMMSG00000013518)	ENSMMSG00000013535
Cetacea	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000160628	ENSGT00940000160691	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160732	ENSGT00930000151040	ENSGT00950000182987.c.a.a	ENSGT01030000234914	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00390000002780	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00940000153883.a	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00490000043964	ENSGT00940000154169.A.k	ENSGT00390000008969	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525	ENSGT00940000159632	ENSGT00940000159195	ENSGT00390000014957	ENSGT00390000002761	ENSGT00390000017626	ENSGT00390000012483	ENSGT00940000159805
Odontoceti	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000160628	ENSGT00940000160691	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160732	ENSGT00930000151040	ENSGT00950000182987.c.a.a	ENSGT01030000234914	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00390000002780	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00940000153883.a	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00490000043964	ENSGT00940000154169.A.k	ENSGT00390000008969	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525	ENSGT00940000159632	ENSGT00940000159195	ENSGT00390000014957	ENSGT00390000002761	ENSGT00390000017626	ENSGT00390000012483	ENSGT00940000159805
Odontoceti_a	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000160628	ENSGT00940000160691	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160732	ENSGT00930000151040	ENSGT00950000182987.c.a.a	ENSGT01030000234914	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00390000002780	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00940000153883.a	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00490000043964	ENSGT00940000154169.A.k	ENSGT00390000008969	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525	ENSGT00940000159632	ENSGT00940000159195	ENSGT00390000014957	ENSGT00390000002761	ENSGT00390000017626	ENSGT00390000012483	ENSGT00940000159805
Odontoceti_b	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000160628	ENSGT00940000160691	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160732	ENSGT00930000151040	ENSGT00950000182987.c.a.a	ENSGT01030000234914	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00390000002780	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00940000153883.a	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00490000043964	ENSGT00940000154169.A.k	ENSGT00390000008969	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525	ENSGT00940000159632	ENSGT00940000159195	ENSGT00390000014957	ENSGT00390000002761	ENSGT00390000017626	ENSGT00390000012483	ENSGT00940000159805
Monodontidae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000160628	ENSGT00940000160691	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160732	ENSGT00930000151040	ENSGT00950000182987.c.a.a	ENSGT01030000234914	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00390000002780	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00940000153883.a	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00490000043964	ENSGT00940000154169.A.k	ENSGT00390000008969	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525	ENSGT00940000159632	ENSGT00940000159195	ENSGT00390000014957	ENSGT00390000002761	ENSGT00390000017626	ENSGT00390000012483	ENSGT00940000159805
Beluga whale	MODERN SPECIES	48	CORO1A (ENSDLEG00000014272)	MAPK3 (ENSDLEG00000014296)	GDPD3 (ENSDLEG00000014329)	YPEL3 (ENSDLEG00000014367)	TBX6 (ENSDLEG00000014394)	PPP4C (ENSDLEG00000014432)	ALDOA (ENSDLEG00000014475)	ENSDLEG00000014514	FAM57B (ENSDLEG00000014523)	DOC2A (ENSDLEG00000014533)	INO80E (ENSDLEG00000014548)	ENSDLEG00000014570	ENSDLEG00000014594	ENSDLEG00000014627	TMEM219 (ENSDLEG00000014646)	KCTD13 (ENSDLEG00000014654) ##22	ASPHD1 (ENSDLEG00000014666)	SEZ6L2 (ENSDLEG00000014687)	ENSDLEG00000014717	CDIPT (ENSDLEG00000014722)	MVP (ENSDLEG00000014748)	PAGR1 (ENSDLEG00000014738)	PRRT2 (ENSDLEG00000014781)	MAZ (ENSDLEG00000014799)	KIF22 (ENSDLEG00000014879)	ZG16 (ENSDLEG00000014967)	CUNH16orf54 (ENSDLEG00000013743)	QPRT (ENSDLEG00000013755)	SPN (ENSDLEG00000013772)	CD2BP2 (ENSDLEG00000013784)	TBC1D10B (ENSDLEG00000013802)
Narwhal	MODERN SPECIES	299	CORO1A (ENSMMNG00015013059)	MAPK3 (ENSMMNG00015013090)	GDPD3 (ENSMMNG00015013196)	YPEL3 (ENSMMNG00015004884)	TBX6 (ENSMMNG00015004891)	PPP4C (ENSMMNG00015004897)	ALDOA (ENSMMNG00015004910)	ENSMMNG00015004928	TLCD3B (ENSMMNG00015004939)	C16orf92 (ENSMMNG00015004947)	DOC2A (ENSMMNG00015004953)	INO80E (ENSMMNG00015004971)	ENSMMNG00015004992	TAOK2 (ENSMMNG00015005021)	TMEM219 (ENSMMNG00015005067)	KCTD13 (ENSMMNG00015005076) ##22	ENSMMNG00015005085	SEZ6L2 (ENSMMNG00015005145)	ENSMMNG00015005335	ENSMMNG00015005360	MVP (ENSMMNG00015005400)	PAGR1 (ENSMMNG00015005383)	PRRT2 (ENSMMNG00015005426)	MAZ (ENSMMNG00015005459)	KIF22 (ENSMMNG00015005491)	ZG16 (ENSMMNG00015005503)	C16orf54 (ENSMMNG00015005530)	QPRT (ENSMMNG00015005541)	ENSMMNG00015005562	CD2BP2 (ENSMMNG00015005576)	TBC1D10B (ENSMMNG00015005606)
Vaquita	MODERN SPECIES	6	ENSPSNG00000010574	CORO1A (ENSPSNG00000010607)	MAPK3 (ENSPSNG00000010736)	GDPD3 (ENSPSNG00000011073)	YPEL3 (ENSPSNG00000011251)	TBX6 (ENSPSNG00000011456)	PPP4C (ENSPSNG00000011539)	ALDOA (ENSPSNG00000011670)	ENSPSNG00000011917	TLCD3B (ENSPSNG00000012032)	DOC2A (ENSPSNG00000012226)	ENSPSNG00000012335	HIRIP3 (ENSPSNG00000012376)	TAOK2 (ENSPSNG00000012446)	ENSPSNG00000012661	KCTD13 (ENSPSNG00000012725) ##22	ASPHD1 (ENSPSNG00000012764)	SEZ6L2 (ENSPSNG00000012925)	ENSPSNG00000014118	ENSPSNG00000014165	MVP (ENSPSNG00000014322)	PRRT2 (ENSPSNG00000014421)	MAZ (ENSPSNG00000014597)	KIF22 (ENSPSNG00000015034)	ZG16 (ENSPSNG00000015126)	C16orf54 (ENSPSNG00000015190)	QPRT (ENSPSNG00000015229)	SPN (ENSPSNG00000015358)	CD2BP2 (ENSPSNG00000015375)	TBC1D10B (ENSPSNG00000015441)	MYL11 (ENSPSNG00000015500)
Dolphin	MODERN SPECIES	2592	ENSTTRG00000005544	ENSTTRG00000005543	CORO1A (ENSTTRG00000005541)	MAPK3 (ENSTTRG00000005540)	GDPD3 (ENSTTRG00000005538)	YPEL3 (ENSTTRG00000005536)	TBX6 (ENSTTRG00000005534)	PPP4C (ENSTTRG00000005532)	ALDOA (ENSTTRG00000005529)	TLCD3B (ENSTTRG00000005526)	C16orf92 (ENSTTRG00000005523)	DOC2A (ENSTTRG00000005520)	INO80E (ENSTTRG00000005517)	HIRIP3 (ENSTTRG00000005509)	TMEM219 (ENSTTRG00000005506)	KCTD13 (ENSTTRG00000005501) ##22	ASPHD1 (ENSTTRG00000005491)	SEZ6L2 (ENSTTRG00000005479)	ENSTTRG00000005471	ENSTTRG00000005465	MVP (ENSTTRG00000005451)	PAGR1 (ENSTTRG00000005446)	PRRT2 (ENSTTRG00000005437)	MAZ (ENSTTRG00000005420)	KIF22 (ENSTTRG00000005405)	ZG16 (ENSTTRG00000005397)	CUNH16orf54 (ENSTTRG00000005381)	ENSTTRG00000005369	SPN (ENSTTRG00000005346)
Sperm whale	MODERN SPECIES	5	NSMCE1 (ENSPCTG00005009591)	IL4R (ENSPCTG00005009629)	IL21R (ENSPCTG00005009724)	GSG1L (ENSPCTG00005009763)	KATNIP (ENSPCTG00005009827)	ENSPCTG00005010063	XPO6 (ENSPCTG00005010098)	ENSPCTG00005010170	FAM57B (ENSPCTG00005010213)	C16orf92 (ENSPCTG00005010315)	DOC2A (ENSPCTG00005010387)	INO80E (ENSPCTG00005010520)	HIRIP3 (ENSPCTG00005010595)	TAOK2 (ENSPCTG00005010647)	TMEM219 (ENSPCTG00005010777)	KCTD13 (ENSPCTG00005010803) ##22	ENSPCTG00005010842	SEZ6L2 (ENSPCTG00005010970)	ENSPCTG00005012038	CDIPT (ENSPCTG00005012065)	MVP (ENSPCTG00005012171)	ENSPCTG00005012342	SEPHS2 (ENSPCTG00005012362)	DCTPP1 (ENSPCTG00005012386)	ZNF771 (ENSPCTG00005012435)	ZNF689 (ENSPCTG00005012482)	ENSPCTG00005012533	PRR14 (ENSPCTG00005012573)	FBRS (ENSPCTG00005012624)	SRCAP (ENSPCTG00005012924)	TMEM265 (ENSPCTG00005014100)
Blue whale	MODERN SPECIES	6	CORO1A (ENSBMSG00010013551)	MAPK3 (ENSBMSG00010013605)	GDPD3 (ENSBMSG00010013676)	YPEL3 (ENSBMSG00010013724)	TBX6 (ENSBMSG00010013747)	PPP4C (ENSBMSG00010013782)	ALDOA (ENSBMSG00010013821)	ENSBMSG00010013936	TLCD3B (ENSBMSG00010014032)	C16orf92 (ENSBMSG00010014108)	DOC2A (ENSBMSG00010014154)	INO80E (ENSBMSG00010014208)	HIRIP3 (ENSBMSG00010014277)	TAOK2 (ENSBMSG00010014320)	ENSBMSG00010014521	KCTD13 (ENSBMSG00010014564) ##22	ENSBMSG00010014610	SEZ6L2 (ENSBMSG00010014772)	ENSBMSG00010015524	ENSBMSG00010015564	MVP (ENSBMSG00010015732)	PAGR1 (ENSBMSG00010015793)	PRRT2 (ENSBMSG00010015819)	MAZ (ENSBMSG00010015893)	KIF22 (ENSBMSG00010016035)	ZG16 (ENSBMSG00010016057)	C16orf54 (ENSBMSG00010016078)	QPRT (ENSBMSG00010016095)	SPN (ENSBMSG00010016139)	CD2BP2 (ENSBMSG00010016148)	TBC1D10B (ENSBMSG00010016186)
Laurasiatheria_b	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000160628	ENSGT00940000160691	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160732	ENSGT00930000151040	ENSGT00950000182987.c.a.a	ENSGT01030000234914	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00390000002780	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00940000153883.a	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00490000043964	ENSGT00940000154169.A	ENSGT00390000008969	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000169143	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525	ENSGT00940000159632	ENSGT00940000159195	ENSGT00390000014957	ENSGT00390000002761	ENSGT00390000017626	ENSGT00390000012483
Carnivora	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000160628	ENSGT00940000160691	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160732	ENSGT00930000151040	ENSGT00950000182987.c.a.a	ENSGT01030000234914	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00390000002780	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00940000153883.a	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00490000043964	ENSGT00940000154169.A	ENSGT00390000008969	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000169143	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525	ENSGT00940000159632	ENSGT00940000159195	ENSGT00390000014957	ENSGT00390000002761	ENSGT00390000017626	ENSGT00390000012483
Caniformia	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000160628	ENSGT00940000160691	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160732	ENSGT00930000151040	ENSGT00950000182987.c.a.a	ENSGT01030000234914	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00390000002780	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00940000153883.a	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00490000043964	ENSGT00940000154169.A	ENSGT00390000008969	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525	ENSGT00940000159632	ENSGT00940000159195	ENSGT00390000014957	ENSGT00390000002761	ENSGT00390000017626	ENSGT00390000012483	ENSGT00940000159805
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Canis_lupus	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000160691.n.b	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160732	ENSGT00930000151040	ENSGT00950000182987.c.a.a.i.a.a	ENSGT01030000234914	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00390000002780	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00940000159991.A	ENSGT00940000153883.a	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00490000043964	ENSGT00940000154169.A	ENSGT00390000008969	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525	ENSGT00940000159632	ENSGT00940000159195	ENSGT00390000014957	ENSGT00390000002761	ENSGT00390000017626	ENSGT00390000012483	ENSGT00940000159805
Dog	MODERN SPECIES	34	ENSCAFG00845002114	CORO1A (ENSCAFG00845002083)	MAPK3 (ENSCAFG00845002016)	GDPD3 (ENSCAFG00845001933)	YPEL3 (ENSCAFG00845001845)	TBX6 (ENSCAFG00845001769)	PPP4C (ENSCAFG00845001731)	ALDOA (ENSCAFG00845001653)	ENSCAFG00845001614	TLCD3B (ENSCAFG00845001590)	ENSCAFG00845001498	DOC2A (ENSCAFG00845001469)	INO80E (ENSCAFG00845001349)	HIRIP3 (ENSCAFG00845001245)	TAOK2 (ENSCAFG00845001150)	KCTD13 (ENSCAFG00845001068) ##22	ASPHD1 (ENSCAFG00845001044)	SEZ6L2 (ENSCAFG00845000986)	ENSCAFG00845000930	CDIPT (ENSCAFG00845000887)	MVP (ENSCAFG00845000844)	PAGR1 (ENSCAFG00845000827)	PRRT2 (ENSCAFG00845000791)	MAZ (ENSCAFG00845000703)	KIF22 (ENSCAFG00845000629)	ZG16 (ENSCAFG00845014477)	C16orf54 (ENSCAFG00845014456)	ENSCAFG00845014366	ENSCAFG00845014354	CD2BP2 (ENSCAFG00845014325)	TBC1D10B (ENSCAFG00845014298)
Dingo	MODERN SPECIES	172	CORO1A (ENSCAFG00020017604)	ENSCAFG00020017614	GDPD3 (ENSCAFG00020017650)	YPEL3 (ENSCAFG00020017655)	TBX6 (ENSCAFG00020017660)	PPP4C (ENSCAFG00020017664)	ENSCAFG00020017668	ENSCAFG00020017672	TLCD3B (ENSCAFG00020017673)	C16orf92 (ENSCAFG00020017676)	DOC2A (ENSCAFG00020017677)	INO80E (ENSCAFG00020017683)	HIRIP3 (ENSCAFG00020017687)	ENSCAFG00020017689	TMEM219 (ENSCAFG00020017695)	KCTD13 (ENSCAFG00020017698) ##22	ENSCAFG00020017700	SEZ6L2 (ENSCAFG00020017701)	ENSCAFG00020017724	CDIPT (ENSCAFG00020017727)	MVP (ENSCAFG00020017730)	PAGR1 (ENSCAFG00020017743)	ENSCAFG00020017747	MAZ (ENSCAFG00020017751)	KIF22 (ENSCAFG00020017756)	ZG16 (ENSCAFG00020017780)	C16orf54 (ENSCAFG00020017783)	QPRT (ENSCAFG00020017784)	ENSCAFG00020017791	CD2BP2 (ENSCAFG00020017794)	TBC1D10B (ENSCAFG00020017798)
Red fox	MODERN SPECIES	85	ENSVVUG00000025994	CORO1A (ENSVVUG00000025995)	ENSVVUG00000026001	GDPD3 (ENSVVUG00000026004)	YPEL3 (ENSVVUG00000026009)	TBX6 (ENSVVUG00000026010)	PPP4C (ENSVVUG00000026011)	ENSVVUG00000026016	ENSVVUG00000026046	TLCD3B (ENSVVUG00000026048)	C16orf92 (ENSVVUG00000026049)	DOC2A (ENSVVUG00000026050)	INO80E (ENSVVUG00000026051)	HIRIP3 (ENSVVUG00000026052)	TAOK2 (ENSVVUG00000026056)	KCTD13 (ENSVVUG00000026070) ##22	ASPHD1 (ENSVVUG00000026071)	SEZ6L2 (ENSVVUG00000026073)	ENSVVUG00000026083	CDIPT (ENSVVUG00000026088)	MVP (ENSVVUG00000026093)	PAGR1 (ENSVVUG00000026095)	PRRT2 (ENSVVUG00000026096)	ENSVVUG00000026097	KIF22 (ENSVVUG00000026100)	ZG16 (ENSVVUG00000026103)	CUNH16orf54 (ENSVVUG00000026104)	QPRT (ENSVVUG00000026105)	ENSVVUG00000026107	CD2BP2 (ENSVVUG00000026108)	TBC1D10B (ENSVVUG00000026110)
Caniformia_b	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000160628	ENSGT00940000160691	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160732	ENSGT00930000151040	ENSGT00950000182987.c.a.a	ENSGT01030000234914	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00390000002780	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00940000153883.a	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00490000043964	ENSGT00940000154169.A	ENSGT00390000008969	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525	ENSGT00940000159632	ENSGT00940000159195	ENSGT00390000014957	ENSGT00390000002761	ENSGT00390000017626	ENSGT00390000012483	ENSGT00940000159805
Mustelinae	ANCESTRAL SPECIES	52	ENSGT00940000160628	ENSGT00940000160691	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160732	ENSGT00930000151040	ENSGT00950000182987.c.a.a	ENSGT01030000234914	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00390000002780	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00940000153883.a	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00490000043964	ENSGT00940000154169.A	ENSGT00390000008969	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525	ENSGT00940000159632	ENSGT00940000159195	ENSGT00390000014957	ENSGT00390000002761	ENSGT00390000017626	ENSGT00390000012483	ENSGT00940000159805
American mink	MODERN SPECIES	391	CORO1A (ENSNVIG00000000987)	MAPK3 (ENSNVIG00000000806)	GDPD3 (ENSNVIG00000000754)	YPEL3 (ENSNVIG00000000694)	TBX6 (ENSNVIG00000000662)	PPP4C (ENSNVIG00000000577)	ALDOA (ENSNVIG00000000386)	ENSNVIG00000000272	TLCD3B (ENSNVIG00000000212)	C16orf92 (ENSNVIG00000000197)	DOC2A (ENSNVIG00000025032)	INO80E (ENSNVIG00000025031)	HIRIP3 (ENSNVIG00000025030)	TAOK2 (ENSNVIG00000025029)	TMEM219 (ENSNVIG00000025028)	KCTD13 (ENSNVIG00000025027) ##22	ASPHD1 (ENSNVIG00000025026)	SEZ6L2 (ENSNVIG00000025025)	ENSNVIG00000025024	CDIPT (ENSNVIG00000025023)	MVP (ENSNVIG00000025022)	PAGR1 (ENSNVIG00000025021)	PRRT2 (ENSNVIG00000025020)	ENSNVIG00000025019	KIF22 (ENSNVIG00000025018)	ENSNVIG00000025017	ZG16 (ENSNVIG00000025016)	CP054 (ENSNVIG00000025015)	QPRT (ENSNVIG00000025014)	CD2BP2 (ENSNVIG00000025013)	TBC1D10B (ENSNVIG00000025012)
Ferret	MODERN SPECIES	349	CORO1A (ENSMPUG00000012662)	MAPK3 (ENSMPUG00000012636)	GDPD3 (ENSMPUG00000012608)	YPEL3 (ENSMPUG00000012595)	TBX6 (ENSMPUG00000012586)	PPP4C (ENSMPUG00000012567)	ALDOA (ENSMPUG00000012563)	ENSMPUG00000012556	TLCD3B (ENSMPUG00000012551)	DOC2A (ENSMPUG00000012544)	INO80E (ENSMPUG00000012526)	HIRIP3 (ENSMPUG00000012514)	ENSMPUG00000012512	TMEM219 (ENSMPUG00000012504)	ASPHD1 (ENSMPUG00000012495)	KCTD13 (ENSMPUG00000012492) ##22	SEZ6L2 (ENSMPUG00000012487)	CDIPT (ENSMPUG00000012466)	MVP (ENSMPUG00000012462)	PRRT2 (ENSMPUG00000012455)	KIF22 (ENSMPUG00000012450)	ZG16 (ENSMPUG00000012446)	ENSMPUG00000012439	C16orf54 (ENSMPUG00000020020)	QPRT (ENSMPUG00000012437)	ENSMPUG00000012432	CD2BP2 (ENSMPUG00000012393)	ENSMPUG00000012390	MYL11 (ENSMPUG00000012370)	TBC1D10B (ENSMPUG00000012336)	ZNF48 (ENSMPUG00000012333)
Ursidae	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000160628	ENSGT00940000160691	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160732	ENSGT00930000151040	ENSGT00950000182987.c.a.a.g.b	ENSGT01030000234914	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00390000002780	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00940000153883.a	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00490000043964	ENSGT00940000154169.A	ENSGT00390000008969	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525	ENSGT00940000159632	ENSGT00940000159195	ENSGT00390000014957	ENSGT00390000002761	ENSGT00390000017626	ENSGT00390000012483	ENSGT00940000159805
Ursus	ANCESTRAL SPECIES	48	ENSGT00940000160628	ENSGT00940000160691	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160732	ENSGT00930000151040	ENSGT00950000182987.c.a.a.g.b	ENSGT01030000234914	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00390000002780	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000159991.A	ENSGT00940000153883.a	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00490000043964	ENSGT00940000154169.A	ENSGT00950000185847	ENSGT00390000008969	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525	ENSGT00940000159632	ENSGT00940000159195.i	ENSGT00390000002761	ENSGT00390000017626	ENSGT00390000012483	ENSGT00940000159805
Polar bear	MODERN SPECIES	120	CORO1A (ENSUMAG00000010996)	MAPK3 (ENSUMAG00000011005)	GDPD3 (ENSUMAG00000011011)	YPEL3 (ENSUMAG00000011030)	TBX6 (ENSUMAG00000011037)	PPP4C (ENSUMAG00000011044)	ALDOA (ENSUMAG00000011051)	ENSUMAG00000011059	ENSUMAG00000011069	C16orf92 (ENSUMAG00000011072)	DOC2A (ENSUMAG00000011079)	INO80E (ENSUMAG00000011094)	HIRIP3 (ENSUMAG00000011097)	ENSUMAG00000011099	TMEM219 (ENSUMAG00000011109)	KCTD13 (ENSUMAG00000011113) ##22	ENSUMAG00000011120	SEZ6L2 (ENSUMAG00000011126)	ENSUMAG00000011138	CDIPT (ENSUMAG00000011146)	ENSUMAG00000011152	ENSUMAG00000011153	PAGR1 (ENSUMAG00000011158)	PRRT2 (ENSUMAG00000011163)	ENSUMAG00000011165	KIF22 (ENSUMAG00000011184)	ZG16 (ENSUMAG00000011302)	ENSUMAG00000011312	ENSUMAG00000011319	CD2BP2 (ENSUMAG00000011324)	TBC1D10B (ENSUMAG00000011334)
American black bear	MODERN SPECIES	2027		MAPK3 (ENSUAMG00000024157)	GDPD3 (ENSUAMG00000024155)	ENSUAMG00000024154	TBX6 (ENSUAMG00000024153)	PPP4C (ENSUAMG00000024151)	ALDOA (ENSUAMG00000024150)	ENSUAMG00000024149	TLCD3B (ENSUAMG00000024148)	C16orf92 (ENSUAMG00000024147)	DOC2A (ENSUAMG00000024144)	INO80E (ENSUAMG00000024140)	HIRIP3 (ENSUAMG00000024137)	ENSUAMG00000024132	TMEM219 (ENSUAMG00000024130)	KCTD13 (ENSUAMG00000024127) ##22	ASPHD1 (ENSUAMG00000024125)	SEZ6L2 (ENSUAMG00000024120)	ENSUAMG00000024113	CDIPT (ENSUAMG00000024109)
Giant Panda	MODERN SPECIES	1	CORO1A (ENSAMEG00000015314)	MAPK3 (ENSAMEG00000015300)	GDPD3 (ENSAMEG00000015282)	YPEL3 (ENSAMEG00000015270)	TBX6 (ENSAMEG00000015253)	PPP4C (ENSAMEG00000015223)	ENSAMEG00000015188	ENSAMEG00000023789	TLCD3B (ENSAMEG00000015171)	C16orf92 (ENSAMEG00000015169)	DOC2A (ENSAMEG00000015138)	INO80E (ENSAMEG00000015128)	HIRIP3 (ENSAMEG00000015116)	TAOK2 (ENSAMEG00000015061)	TMEM219 (ENSAMEG00000015058)	KCTD13 (ENSAMEG00000015032) ##22	ASPHD1 (ENSAMEG00000015026)	SEZ6L2 (ENSAMEG00000014966)	ENSAMEG00000029561	MVP (ENSAMEG00000014878)	PAGR1 (ENSAMEG00000014873)	PRRT2 (ENSAMEG00000027610)	MAZ (ENSAMEG00000014864)	ENSAMEG00000014946	KIF22 (ENSAMEG00000014825)	ENSAMEG00000026751	C16orf54 (ENSAMEG00000026308)	ENSAMEG00000008034	ENSAMEG00000008033	ENSAMEG00000008021	TBC1D10B (ENSAMEG00000024960)
Felidae	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000160628	ENSGT00940000160691	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160732	ENSGT00930000151040	ENSGT00950000182987.c.a.a	ENSGT01030000234914	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00390000002780	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00940000153883.a	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00490000043964	ENSGT00940000154169.A	ENSGT00390000008969	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000169143	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525.c.b	ENSGT00940000159632	ENSGT00940000159195	ENSGT00390000014957	ENSGT00390000002761	ENSGT00390000017626	ENSGT00390000012483
Panthera	ANCESTRAL SPECIES	43	ENSGT00940000160628	ENSGT00940000160691	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160732	ENSGT00930000151040	ENSGT00950000182987.c.a.a	ENSGT01030000234914	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00390000002780	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00940000153883.a	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00490000043964	ENSGT00940000154169.A	ENSGT00390000008969	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000169143	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525.c.b	ENSGT00940000159632	ENSGT00940000159195.g	ENSGT00940000159195.h	ENSGT00390000014957	ENSGT00390000002761	ENSGT00390000012483
Tiger	MODERN SPECIES	425	CORO1A (ENSPTIG00000018198)	MAPK3 (ENSPTIG00000019078)	GDPD3 (ENSPTIG00000002002)	YPEL3 (ENSPTIG00000005775)	TBX6 (ENSPTIG00000007485)	PPP4C (ENSPTIG00000008173)	ALDOA (ENSPTIG00000009459)	ENSPTIG00000011899	TLCD3B (ENSPTIG00000012476)	C16orf92 (ENSPTIG00000012553)	DOC2A (ENSPTIG00000012622)	INO80E (ENSPTIG00000013860)	ENSPTIG00000014367	TAOK2 (ENSPTIG00000015382)	TMEM219 (ENSPTIG00000017151)	KCTD13 (ENSPTIG00000017716) ##22	ASPHD1 (ENSPTIG00000018002)	SEZ6L2 (ENSPTIG00000019648)	ENSPTIG00000002629	CDIPT (ENSPTIG00000005088)	ENSPTIG00000006840	PAGR1 (ENSPTIG00000007029)	PRRT2 (ENSPTIG00000007264)	ENSPTIG00000007866	KIF22 (ENSPTIG00000008280)	ZG16 (ENSPTIG00000008659)
Panthera_a	ANCESTRAL SPECIES	45	ENSGT00940000160691	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160732	ENSGT00930000151040	ENSGT00950000182987.c.a.a	ENSGT01040000240645	ENSGT01030000234914	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00390000002780	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00940000153883.a	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00490000043964	ENSGT00940000154169.A	ENSGT00390000008969	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000169143	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525.c.b	ENSGT00940000159632	ENSGT00940000159195.g	ENSGT00940000159195.h	ENSGT00390000014957	ENSGT00390000002761	ENSGT00390000012483
leopard	MODERN SPECIES	192								ENSPPRG00000006432	TLCD3B (ENSPPRG00000006414)	C16orf92 (ENSPPRG00000006308)	DOC2A (ENSPPRG00000006109)	INO80E (ENSPPRG00000006002)	ENSPPRG00000005492	TAOK2 (ENSPPRG00000003976)	TMEM219 (ENSPPRG00000002515)	KCTD13 (ENSPPRG00000002003) ##22	ASPHD1 (ENSPPRG00000001822)	SEZ6L2 (ENSPPRG00000001716)	ENSPPRG00000001209	CDIPT (ENSPPRG00000001081)	ENSPPRG00000021006	ENSPPRG00000020829	PAGR1 (ENSPPRG00000020339)	ENSPPRG00000019802	PRRT2 (ENSPPRG00000019704)	ENSPPRG00000016750	ENSPPRG00000011596	ENSPPRG00000011505	ENSPPRG00000011160	ENSPPRG00000010950	C16orf54 (ENSPPRG00000018112)
lion	MODERN SPECIES	75	CORO1A (ENSPLOG00000014875)	MAPK3 (ENSPLOG00000014972)	GDPD3 (ENSPLOG00000015232)	YPEL3 (ENSPLOG00000015342)	TBX6 (ENSPLOG00000015432)	PPP4C (ENSPLOG00000015562)	ALDOA (ENSPLOG00000015632)	ENSPLOG00000015749	TLCD3B (ENSPLOG00000015844)	ENSPLOG00000015919	DOC2A (ENSPLOG00000015984)	INO80E (ENSPLOG00000016075)	HIRIP3 (ENSPLOG00000016133)	TAOK2 (ENSPLOG00000016199)	TMEM219 (ENSPLOG00000016249)	KCTD13 (ENSPLOG00000016299) ##22	ENSPLOG00000016363	SEZ6L2 (ENSPLOG00000016500)	ENSPLOG00000017214	CDIPT (ENSPLOG00000017275)	MVP (ENSPLOG00000017472)	PAGR1 (ENSPLOG00000017513)	PRRT2 (ENSPLOG00000017550)	MAZ (ENSPLOG00000017663)	KIF22 (ENSPLOG00000017821)
Cat	MODERN SPECIES	247	CORO1A (ENSFCAG00000001301)	MAPK3 (ENSFCAG00000014173)	GDPD3 (ENSFCAG00000030438)	YPEL3 (ENSFCAG00000031006)	TBX6 (ENSFCAG00000014172)	PPP4C (ENSFCAG00000014171)	ALDOA (ENSFCAG00000014170)	ENSFCAG00000044299	TLCD3B (ENSFCAG00000014169)	CE3H16orf92 (ENSFCAG00000045204)	DOC2A (ENSFCAG00000014167)	INO80E (ENSFCAG00000014166)	HIRIP3 (ENSFCAG00000014165)	TAOK2 (ENSFCAG00000014164)	TMEM219 (ENSFCAG00000014163)	KCTD13 (ENSFCAG00000025598) ##22	ASPHD1 (ENSFCAG00000014161)	SEZ6L2 (ENSFCAG00000014159)	ENSFCAG00000036459	CDIPT (ENSFCAG00000014157)	MVP (ENSFCAG00000014153)	PAGR1 (ENSFCAG00000028241)	PRRT2 (ENSFCAG00000031694)	MAZ (ENSFCAG00000014146)	KIF22 (ENSFCAG00000014143)	ENSFCAG00000014141	QPRT (ENSFCAG00000024436)	CE3H16orf54 (ENSFCAG00000012539)	ENSFCAG00000052292	CD2BP2 (ENSFCAG00000010216)	TBC1D10B (ENSFCAG00000030318)
Laurasiatheria_c	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000160628	ENSGT00940000160691	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160732	ENSGT00930000151040	ENSGT00950000182987.c.a.a	ENSGT01030000234914	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00390000002780	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00940000153883.a	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00490000043964	ENSGT00940000154169.A	ENSGT00390000008969	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525	ENSGT00940000159632	ENSGT00940000159195	ENSGT00390000014957	ENSGT00390000002761	ENSGT00390000017626	ENSGT00390000012483	ENSGT00940000159805
Equus	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000160628	ENSGT00940000160691	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160732	ENSGT00930000151040	ENSGT00950000182987.c.a.a	ENSGT01100000266225	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00390000002780	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00940000153883.a	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00490000043964	ENSGT00940000154169.A	ENSGT00390000008969	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525	ENSGT00940000159632	ENSGT00940000159195	ENSGT00390000014957	ENSGT00390000002761	ENSGT00390000017626	ENSGT00390000012483	ENSGT00940000159805	ENSGT00940000159038.d
Donkey	MODERN SPECIES	5	CORO1A (ENSEASG00005014707)	MAPK3 (ENSEASG00005014689)	GDPD3 (ENSEASG00005014679)	YPEL3 (ENSEASG00005035580)	TBX6 (ENSEASG00005014665)	PPP4C (ENSEASG00005014647)	ALDOA (ENSEASG00005014632)	ENSEASG00005031029	TLCD3B (ENSEASG00005014626)	C16orf92 (ENSEASG00005032097)	DOC2A (ENSEASG00005014621)	INO80E (ENSEASG00005014612)	HIRIP3 (ENSEASG00005025789)	TAOK2 (ENSEASG00005014139)	TMEM219 (ENSEASG00005014067)	KCTD13 (ENSEASG00005036091) ##22	ASPHD1 (ENSEASG00005014060)	SEZ6L2 (ENSEASG00005013352)	ENSEASG00005029173	CDIPT (ENSEASG00005013251)	MVP (ENSEASG00005013194)	PRRT2 (ENSEASG00005027256)	MAZ (ENSEASG00005013172)	KIF22 (ENSEASG00005013164)	ZG16 (ENSEASG00005038280)	C16orf54 (ENSEASG00005027324)	ENSEASG00005013160	ENSEASG00005013159	ENSEASG00005013156	ENSEASG00005013155	SEPTIN1 (ENSEASG00005013153)
Horse	MODERN SPECIES	4	ENSECAG00000037409	CORO1A (ENSECAG00000024788)	MAPK3 (ENSECAG00000014460)	GDPD3 (ENSECAG00000006934)	YPEL3 (ENSECAG00000024038)	TBX6 (ENSECAG00000022374)	PPP4C (ENSECAG00000022179)	ALDOA (ENSECAG00000003121)	ENSECAG00000041760	TLCD3B (ENSECAG00000023852)	DOC2A (ENSECAG00000018403)	INO80E (ENSECAG00000015015)	HIRIP3 (ENSECAG00000014983)	TAOK2 (ENSECAG00000021114)	TMEM219 (ENSECAG00000018940)	KCTD13 (ENSECAG00000012915) ##22	ASPHD1 (ENSECAG00000012414)	SEZ6L2 (ENSECAG00000017305)	CDIPT (ENSECAG00000012107)	ENSECAG00000030133	MVP (ENSECAG00000025091)	PRRT2 (ENSECAG00000024472)	MAZ (ENSECAG00000024341)	KIF22 (ENSECAG00000014452)	ZG16 (ENSECAG00000013812)	C13H16orf54 (ENSECAG00000003481)	QPRT (ENSECAG00000009002)	ENSECAG00000038252	CD2BP2 (ENSECAG00000006737)	TBC1D10B (ENSECAG00000022918)	MYL11 (ENSECAG00000017437)
Chiroptera	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000160628	ENSGT00940000160691	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160732	ENSGT00930000151040	ENSGT00950000182987.c.a.a	ENSGT01030000234914	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00390000002780	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00940000153883.a	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00490000043964	ENSGT00940000154169.A	ENSGT00390000008969	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525	ENSGT00940000159632	ENSGT00940000159195	ENSGT00390000014957	ENSGT00390000002761	ENSGT00390000017626	ENSGT00390000012483	ENSGT00940000159805
Megabat	MODERN SPECIES	3085																KCTD13 (ENSPVAG00000017225) ##22	ASPHD1 (ENSPVAG00000017222)	SEZ6L2 (ENSPVAG00000017219)	CDIPT (ENSPVAG00000017216)	MVP (ENSPVAG00000017213)	PAGR1 (ENSPVAG00000017212)	PRRT2 (ENSPVAG00000017210)	MAZ (ENSPVAG00000017209)	KIF22 (ENSPVAG00000017206)	C16orf54 (ENSPVAG00000017203)	QPRT (ENSPVAG00000017202)	SPN (ENSPVAG00000017198)
Microchiroptera	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000160628	ENSGT00940000160691	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160732	ENSGT00930000151040	ENSGT00950000182987.c.a.a	ENSGT01030000234914	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00390000002780	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00940000153883.a	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00490000043964	ENSGT00940000154169.A	ENSGT00390000008969	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525	ENSGT00940000159632	ENSGT00940000159195	ENSGT00390000014957	ENSGT00390000002761	ENSGT00390000017626	ENSGT00390000012483	ENSGT00940000159805
Greater horseshoe bat	MODERN SPECIES	47	IL27 (ENSRFEG00010018956)	NUPR1 (ENSRFEG00010018921)	ENSRFEG00010018897	ENSRFEG00010018844	TBX6 (ENSRFEG00010018705)	PPP4C (ENSRFEG00010018661)	ALDOA (ENSRFEG00010018577)	ENSRFEG00010018470	TLCD3B (ENSRFEG00010018426)	C16orf92 (ENSRFEG00010018382)	DOC2A (ENSRFEG00010018357)	INO80E (ENSRFEG00010018261)	HIRIP3 (ENSRFEG00010018177)	TAOK2 (ENSRFEG00010018090)	TMEM219 (ENSRFEG00010018040)	KCTD13 (ENSRFEG00010018010) ##22	ASPHD1 (ENSRFEG00010017985)	SEZ6L2 (ENSRFEG00010016853)	ENSRFEG00010016804	CDIPT (ENSRFEG00010016556)	MVP (ENSRFEG00010016532)	PAGR1 (ENSRFEG00010016496)	PRRT2 (ENSRFEG00010016286)	MAZ (ENSRFEG00010015986)	KIF22 (ENSRFEG00010015889)	ZG16 (ENSRFEG00010015844)	C16orf54 (ENSRFEG00010015822)	QPRT (ENSRFEG00010015773)	ENSRFEG00010015758	CD2BP2 (ENSRFEG00010015706)	TBC1D10B (ENSRFEG00010015670)
Microbat	MODERN SPECIES	1414	ENSMLUG00000024827	ENSMLUG00000003449	CORO1A (ENSMLUG00000003444)	MAPK3 (ENSMLUG00000011284)	GDPD3 (ENSMLUG00000011272)	YPEL3 (ENSMLUG00000011260)	TBX6 (ENSMLUG00000011244)	PPP4C (ENSMLUG00000011226)	ALDOA (ENSMLUG00000011210)	TLCD3B (ENSMLUG00000008914)	ENSMLUG00000024406	DOC2A (ENSMLUG00000008889)	INO80E (ENSMLUG00000008865)	HIRIP3 (ENSMLUG00000008835)	TAOK2 (ENSMLUG00000008795)	KCTD13 (ENSMLUG00000012928) ##22	ASPHD1 (ENSMLUG00000012924)	SEZ6L2 (ENSMLUG00000012916)	CDIPT (ENSMLUG00000012907)	MVP (ENSMLUG00000012898)	PAGR1 (ENSMLUG00000012895)	PRRT2 (ENSMLUG00000012891)	ENSMLUG00000005155	ENSMLUG00000023790	C16orf54 (ENSMLUG00000025578)
Eulipotyphla	ANCESTRAL SPECIES	1091																ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676
Hedgehog	MODERN SPECIES	6979																KCTD13 (ENSEEUG00000012557) ##22	ASPHD1 (ENSEEUG00000012522)
Common shrew	MODERN SPECIES	5444																KCTD13 (ENSSARG00000005866) ##22	ASPHD1 (ENSSARG00000005850)
Marsupialia	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000160628	ENSGT00940000160691	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160732	ENSGT00930000151040	ENSGT00950000182987.c.a.a.a	ENSGT01030000234914	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00390000002780	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00940000153883.a	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00940000154169.A	ENSGT00960000191655	ENSGT00390000008969	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525	ENSGT00940000159632	ENSGT00940000159195	ENSGT00390000014957	ENSGT00810000125541	ENSGT00940000155289.C.a.a.a.a	ENSGT00390000005678	ENSGT00950000182846.b.r
Opossum	MODERN SPECIES	5	ENSMODG00000015658	CORO1A (ENSMODG00000015665)	MAPK3 (ENSMODG00000015670)	GDPD3 (ENSMODG00000015674)	YPEL3 (ENSMODG00000015679)	TBX6 (ENSMODG00000015682)	PPP4C (ENSMODG00000015692)	ENSMODG00000015696	ENSMODG00000047272	TLCD3B (ENSMODG00000015702)	DOC2A (ENSMODG00000022950)	INO80E (ENSMODG00000015706)	ENSMODG00000015709	TAOK2 (ENSMODG00000015713)	TMEM219 (ENSMODG00000015717)	KCTD13 (ENSMODG00000015721) ##22	ENSMODG00000015723	SEZ6L2 (ENSMODG00000015748)	CDIPT (ENSMODG00000015751)	ENSMODG00000044402	MVP (ENSMODG00000015756)	PAGR1 (ENSMODG00000015762)	KIF22 (ENSMODG00000015765)	ENSMODG00000015768	C16orf54 (ENSMODG00000022949)	CCNF (ENSMODG00000015778)	ENSMODG00000015781	ENSMODG00000015843	RNPS1 (ENSMODG00000015891)	ECI1 (ENSMODG00000015892)	DNASE1L2 (ENSMODG00000015903)
Marsupialia_b	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000160691	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160732	ENSGT00930000151040.c	ENSGT00930000151040.d	ENSGT00950000182987.c.a.a.a	ENSGT01030000234914	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00390000002780	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00940000153883.a	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00960000191655	ENSGT00940000154169.A	ENSGT00390000008969	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525	ENSGT00940000159632	ENSGT00940000159195	ENSGT00390000014957	ENSGT00810000125541.g	ENSGT00940000155289.C.a.a.a.a	ENSGT00940000155289.C.a.b	ENSGT00730000111029
Diprotodontia	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000160628	ENSGT00940000160691	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160732	ENSGT00930000151040.c	ENSGT00950000182987.c.a.a.a	ENSGT01030000234914	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00390000002780	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00940000153883.a	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00960000191655	ENSGT00940000154169.A	ENSGT00390000008969	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525	ENSGT00940000159632	ENSGT00940000159195	ENSGT00390000014957	ENSGT00810000125541.g	ENSGT00940000155289.C.a.a.a.a	ENSGT00940000155289.C.a.b	ENSGT00730000111029
Diprotodontia_a	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00510000047760	ENSGT00940000160628	ENSGT00940000160691	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000161514	ENSGT00940000160732	ENSGT00930000151040.c	ENSGT00950000182987.c.a.a.a.c	ENSGT01030000234914	ENSGT01010000222313.A.b.b.a	ENSGT00940000159141	ENSGT00390000011918	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000159991.B	ENSGT00940000153883.a	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00960000191655	ENSGT00940000154169.A	ENSGT00390000008969	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525	ENSGT00940000159632	ENSGT00940000159195	ENSGT00390000014957	ENSGT00810000125541.g	ENSGT00940000155289.C.a.a.a.a	ENSGT00940000155289.C.a.b	ENSGT00730000111029	ENSGT00390000005678
Common wonbat	MODERN SPECIES	1009	ENSVURG00010008527	CORO1A (ENSVURG00010008536)	MAPK3 (ENSVURG00010008563)	GDPD3 (ENSVURG00010008680)	YPEL3 (ENSVURG00010008690)	TBX6 (ENSVURG00010008746)	ENSVURG00010008770	ENSVURG00010008790	ENSVURG00010008812	TLCD3B (ENSVURG00010008823)	DOC2A (ENSVURG00010008834)	INO80E (ENSVURG00010008877)	ENSVURG00010008886	TAOK2 (ENSVURG00010008905)	TMEM219 (ENSVURG00010008951)	KCTD13 (ENSVURG00010008984) ##22	ASPHD1 (ENSVURG00010008994)	SEZ6L2 (ENSVURG00010009016)	ENSVURG00010009103	CDIPT (ENSVURG00010009112)	MVP (ENSVURG00010009147)	ENSVURG00010009160	MAZ (ENSVURG00010009170)	KIF22 (ENSVURG00010009196)	ZG16 (ENSVURG00010009203)	ENSVURG00010009213	CCNF (ENSVURG00010009221)	ENSVURG00010009296	ENSVURG00010009573	ENSVURG00010009579	RNPS1 (ENSVURG00010009617)
koala	MODERN SPECIES	116	ENSPCIG00000025198	CORO1A (ENSPCIG00000025196)	MAPK3 (ENSPCIG00000025195)	GDPD3 (ENSPCIG00000025194)	YPEL3 (ENSPCIG00000025193)	TBX6 (ENSPCIG00000025192)	PPP4C (ENSPCIG00000025191)	ENSPCIG00000025190	ENSPCIG00000025189	TLCD3B (ENSPCIG00000025188)	DOC2A (ENSPCIG00000025172)	INO80E (ENSPCIG00000025149)	ENSPCIG00000025167	TAOK2 (ENSPCIG00000025140)	TMEM219 (ENSPCIG00000036916)	KCTD13 (ENSPCIG00000025136) ##22	ASPHD1 (ENSPCIG00000025134)	SEZ6L2 (ENSPCIG00000025132)	CDIPT (ENSPCIG00000025130)	ENSPCIG00000031008	MVP (ENSPCIG00000025128)	ENSPCIG00000033291	ENSPCIG00000032624	MAZ (ENSPCIG00000025125)	KIF22 (ENSPCIG00000025123)	ZG16 (ENSPCIG00000025122)	C16orf54 (ENSPCIG00000025120)	CCNF (ENSPCIG00000025031)	ENSPCIG00000035113	ENSPCIG00000025023	ENSPCIG00000036753
Wallaby	MODERN SPECIES	1759																ENSMEUG00000014997 ##22	ENSMEUG00000014992	SEZ6L2 (ENSMEUG00000014980)	ENSMEUG00000014976	CDIPT (ENSMEUG00000014967)	MVP (ENSMEUG00000014942)
Tasmanian devil	MODERN SPECIES		NUPR1 (ENSSHAG00000028845)	ENSSHAG00000027944	ENSSHAG00000020620	CORO1A (ENSSHAG00000030444)	MAPK3 (ENSSHAG00000031471)	GDPD3 (ENSSHAG00000010907)	TBX6 (ENSSHAG00000020905)	YPEL3 (ENSSHAG00000025213)	PPP4C (ENSSHAG00000025146)	ENSSHAG00000010672	TLCD3B (ENSSHAG00000010545)	DOC2A (ENSSHAG00000010368)	ENSSHAG00000022181	INO80E (ENSSHAG00000010296)	ENSSHAG00000010269	KCTD13 (ENSSHAG00000029655) ##22	ENSSHAG00000009922	ASPHD1 (ENSSHAG00000023014)	ENSSHAG00000023930	ENSSHAG00000025537	ENSSHAG00000026452	ENSSHAG00000009673	KIF22 (ENSSHAG00000028177)	MVP (ENSSHAG00000029858)	ENSSHAG00000031775	ENSSHAG00000027210	ENSSHAG00000008660	ENSSHAG00000005525	ENSSHAG00000021880	ENSSHAG00000003424	ENSSHAG00000022732
Coelacanth	MODERN SPECIES	3732																KCTD13 (ENSLACG00000000381) ##22	ENSLACG00000002181
Actinopterygii	ANCESTRAL SPECIES	252														ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000169830	ENSGT00940000154169.A.h	ENSGT00390000008969	ENSGT00940000161103	ENSGT00940000158525	ENSGT00940000159632	ENSGT00390000016049	ENSGT00950000182987.c.a.a	ENSGT00930000151040	ENSGT00940000160732	ENSGT00390000017900	ENSGT00390000006265.a	ENSGT00940000160506
Neopterygii	ANCESTRAL SPECIES	339										ENSGT00530000064242.a	ENSGT00390000015229	ENSGT00390000007119	ENSGT00390000005976.b	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00940000159991.A	ENSGT00940000154169.A.h
Osteoglossocephalai	ANCESTRAL SPECIES	207											ENSGT00940000164396	ENSGT00940000160506.b	ENSGT00940000159252.b.b	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000163009.b.a.a.b.a	ENSGT00940000163852	ENSGT00940000163009.b.a.a.b.b	ENSGT00940000157290	ENSGT00940000159991.A	ENSGT00940000154169.A.h	ENSGT00940000158525.u	ENSGT00940000165613	ENSGT01010000222313.A.b.b.a.a.b	ENSGT00950000183191.a.a	ENSGT00940000157795.g.b	ENSGT00390000005976.b	ENSGT00390000007119	ENSGT00390000015229
Osteoglossiformes	ANCESTRAL SPECIES	184							ENSGT00950000182987.c.a.a.mb	ENSGT00390000003249	ENSGT00390000017405	ENSGT00940000160759.b	ENSGT00940000161514.e	ENSGT00940000164396.a	ENSGT00940000160506.b	ENSGT00940000159252.b.b	ENSGT00940000160492	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000163852	ENSGT00940000163009.b.a.a.b.b	ENSGT00940000159991.A	ENSGT00940000154169.A.h	ENSGT00940000158525.u	ENSGT00940000165613	ENSGT01010000222313.A.b.b.a.a.b	ENSGT01000000214789	ENSGT00390000008969	ENSGT00390000016049	ENSGT00940000159632	ENSGT00390000007119	ENSGT00390000015229	ENSGT00530000064242.a
P. kingsleyae	MODERN SPECIES	459						zgc:100868 (ENSPKIG00000015808)	zgc:100868 (ENSPKIG00000016712)	ALDOA (ENSPKIG00000016732)	cln3 (ENSPKIG00000016764)	nudt9 (ENSPKIG00000016818)	gdpd3a (ENSPKIG00000016862)	ypel3 (ENSPKIG00000016900)	pitpnbl (ENSPKIG00000016922)	ENSPKIG00000016943	SEZ6L2 (ENSPKIG00000016975)	kctd13 (ENSPKIG00000017050) ##22	hirip3 (ENSPKIG00000017127)	ENSPKIG00000017526	ENSPKIG00000018042	cdipt (ENSPKIG00000018156)	ENSPKIG00000018202	nlk1 (ENSPKIG00000018252)	tlcd3ba (ENSPKIG00000018285)	mvp (ENSPKIG00000018322)	pagr1 (ENSPKIG00000018363)	kif22 (ENSPKIG00000018408)	sgf29 (ENSPKIG00000018503)	DOC2A (ENSPKIG00000018583)	ENSPKIG00000018633	ENSPKIG00000018648	ENSPKIG00000018666
Asian bonytongue	MODERN SPECIES	23	hsd17b14 (ENSSFOG00015029443)	ENSSFOG00015004441	ENSSFOG00015004265	PPFIA3 (ENSSFOG00015004126)	nucb1 (ENSSFOG00015004072)	ALDOA (ENSSFOG00015004063)	cln3 (ENSSFOG00015004024)	nudt9 (ENSSFOG00015025893)	MAPK3 (ENSSFOG00015027162)	GDPD3 (ENSSFOG00015003682)	ypel3 (ENSSFOG00015003651)	pitpnbl (ENSSFOG00015003623)	cabp5b (ENSSFOG00015003598)	ENSSFOG00015003582	SEZ6L2 (ENSSFOG00015003559)	kctd13 (ENSSFOG00015003462) ##22	hirip3 (ENSSFOG00015003453)	ENSSFOG00015003381	zgc:100868 (ENSSFOG00015002092)	ENSSFOG00015001686	cdipt (ENSSFOG00015028092)	ENSSFOG00015027475	nlk1 (ENSSFOG00015001490)	ENSSFOG00015029907	mvp (ENSSFOG00015001397)	pagr1 (ENSSFOG00015032776)	ENSSFOG00015001379	ENSSFOG00015024336	ENSSFOG00015027498	ENSSFOG00015001294	sgf29 (ENSSFOG00015001254)
Clupeocephala	ANCESTRAL SPECIES	183											ENSGT00940000164396	ENSGT00940000160506.b	ENSGT00940000159252.b.b	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000163852.c.a.b.a.a	ENSGT00940000163160.b	ENSGT00940000163852.c.b	ENSGT00940000163009.b.a.a.b.b	ENSGT00940000157290	ENSGT00940000163009.b.b	ENSGT00940000163852.c.a.b.b	ENSGT00940000159991.A.a	ENSGT00940000154169.A.h	ENSGT00940000158525.u	ENSGT00940000165613	ENSGT01000000214789	ENSGT00390000008969	ENSGT00940000161103.a
Otomorpha	ANCESTRAL SPECIES	313												ENSGT00940000164396	ENSGT00940000160506.b	ENSGT00940000159252.b.b	ENSGT00940000160492	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000163852.c.a.b.a.a.g	ENSGT00940000159991.A.a	ENSGT00940000154169.A.h	ENSGT00940000158525.u	ENSGT00940000165613	ENSGT01010000222313.A.b.b.a.a.b.a	ENSGT00390000008969	ENSGT00940000161103.a	ENSGT00940000154308.A.a.a.a	ENSGT00940000159141.j.a	ENSGT00530000064242.a	ENSGT00390000015229	ENSGT00390000007119	ENSGT00390000005976.b
Clupeiformes	ANCESTRAL SPECIES	287														ENSGT00940000159252.b.b	ENSGT00940000160492	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000163852.c.a.b.a.a.g.b	ENSGT00940000163852.c.a.b.a.a.g.a	ENSGT00940000159991.A.a	ENSGT00940000154169.A.h	ENSGT00940000158525.u	ENSGT00940000165613	ENSGT01010000222313.A.b.b.a.a.b.a	ENSGT00390000008969	ENSGT00940000161103.a	ENSGT00950000185235	ENSGT00390000015229	ENSGT00390000007119	ENSGT00390000005976.b	ENSGT00950000183191.a.a.e.b
Atlantic herring	MODERN SPECIES	15	ENSCHAG00000005110	ENSCHAG00000005342	ENSCHAG00000005370	ENSCHAG00000005375	ENSCHAG00000005395	ENSCHAG00000005423	ENSCHAG00000005453	dhps (ENSCHAG00000006250)	ENSCHAG00000006566	ENSCHAG00000006615	ENSCHAG00000006635	ENSCHAG00000006718	ENSCHAG00000006764	ENSCHAG00000007146	ENSCHAG00000007285	kctd13 (ENSCHAG00000009040) ##22	hirip3 (ENSCHAG00000009067)	ENSCHAG00000009144	ENSCHAG00000009152	ENSCHAG00000009184	ENSCHAG00000009308	ENSCHAG00000009576	ENSCHAG00000009604	nlk1 (ENSCHAG00000009646)	mvp (ENSCHAG00000009698)	ENSCHAG00000010021	ENSCHAG00000010030	ENSCHAG00000010036	sgf29 (ENSCHAG00000010057)	ENSCHAG00000010102	spns1 (ENSCHAG00000010122)
Denticle herring	MODERN SPECIES	17	rcn3 (ENSDCDG00000005197)	pax10 (ENSDCDG00000005194)	ENSDCDG00000005192	tspan4b (ENSDCDG00000005191)	ENSDCDG00000005188	ENSDCDG00000005178	ENSDCDG00000005170	thoc6 (ENSDCDG00000005157)	ENSDCDG00000005143	rnf25 (ENSDCDG00000005140)	tescb (ENSDCDG00000005137)	ENSDCDG00000005130	ENSDCDG00000005124	ENSDCDG00000005119	SEZ6L2 (ENSDCDG00000004939)	kctd13 (ENSDCDG00000004928) ##22	hirip3 (ENSDCDG00000004917)	ENSDCDG00000004740	ENSDCDG00000004718	ENSDCDG00000003252	cdipt (ENSDCDG00000022913)	MAZ (ENSDCDG00000022912)	nlk1 (ENSDCDG00000022811)	tlcd3ba (ENSDCDG00000022809)	mvp (ENSDCDG00000022409)	ENSDCDG00000022393	ENSDCDG00000022389	grip2a (ENSDCDG00000020265)	ssuh2rs1 (ENSDCDG00000020185)	ENSDCDG00000020179	ENSDCDG00000020174
Otophysi	ANCESTRAL SPECIES	46	ENSGT00390000008969	ENSGT00940000161103.a	ENSGT00940000154308.A.a.a.a	ENSGT00940000159141.j.a	ENSGT00530000064242.a	ENSGT00390000015229	ENSGT00390000007119	ENSGT00390000005976.b	ENSGT00940000157795.g.b	ENSGT00950000183191.a.a.f	ENSGT00940000154813.e.a.b	ENSGT00940000164396	ENSGT00940000160506.b	ENSGT00940000159252.b.b	ENSGT00940000160492	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000154169.A.h	ENSGT00940000158525.u	ENSGT00940000165613	ENSGT01010000222313.A.b.b.a.a.b.a	ENSGT00990000204783	ENSGT00940000177150	ENSGT00960000187164	ENSGT00940000158922.d	ENSGT00950000183046.a.b.l	ENSGT00940000157900	ENSGT00940000154268.k.a	ENSGT00940000154376.a.a	ENSGT00950000182883.a.a.a	ENSGT00730000110974.a
Characiphysae	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000161265.e.a.a	ENSGT00390000008969	ENSGT00940000161103.a	ENSGT00940000174861	ENSGT00940000159141.j.a	ENSGT00530000064242.a	ENSGT00390000015229	ENSGT00390000007119	ENSGT00390000005976.b	ENSGT00940000157795.g.b	ENSGT00950000183191.a.a.f	ENSGT00940000164396	ENSGT00940000160506.b	ENSGT00940000159252.b.b	ENSGT00940000160492	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000163160.b.e.a	ENSGT00940000159991.A.a	ENSGT00940000154169.A.h	ENSGT00940000158525.u	ENSGT00940000165613	ENSGT01010000222313.A.b.b.a.a.b.a	ENSGT00990000204783	ENSGT00940000177150	ENSGT00960000187164	ENSGT00940000158922.d	ENSGT00950000183046.a.b.l	ENSGT00940000157900	ENSGT00940000154268.k.a	ENSGT00940000154376.a.a
Channel catfish	MODERN SPECIES	11	ENSIPUG00000002029	ENSIPUG00000001968	ENSIPUG00000001963	DOC2A (ENSIPUG00000001924)	nupr1 (ENSIPUG00000001913)	sgf29 (ENSIPUG00000001851)	nfatc2ip (ENSIPUG00000001830)	spns1 (ENSIPUG00000001804)	atxn2l (ENSIPUG00000001761)	sh2b1 (ENSIPUG00000001741)	ENSIPUG00000001726	pitpnbl (ENSIPUG00000001633)	cabp5b (ENSIPUG00000001604)	ENSIPUG00000001583	sez6 (ENSIPUG00000001550)	Kctd10 (ENSIPUG00000001513) ##22	hirip3 (ENSIPUG00000001493)	ENSIPUG00000001484	ENSIPUG00000001473	ENSIPUG00000001464	ENSIPUG00000001455	ENSIPUG00000001439	ENSIPUG00000001422	ENSIPUG00000001387	ENSIPUG00000001371	Cdipt (ENSIPUG00000001351)	Maz (ENSIPUG00000001307)	nlk.2 (ENSIPUG00000001284)	fam57b (ENSIPUG00000001260)	ENSIPUG00000001253	ENSIPUG00000001250
Characiphysae_b	ANCESTRAL SPECIES	30	ENSGT00940000161265.e.a.a	ENSGT00390000008969	ENSGT00940000161103.a	ENSGT00940000174861	ENSGT00940000159141.j.a	ENSGT00530000064242.a	ENSGT00390000015229	ENSGT00390000007119	ENSGT00390000005976.b	ENSGT00940000157795.g.b	ENSGT00950000183191.a.a.f	ENSGT00940000164396	ENSGT00940000160506.b	ENSGT00940000159252.b.b	ENSGT00940000160492	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000163160.b.e.a	ENSGT00940000159991.A.a	ENSGT00940000154169.A.h	ENSGT00940000158525.u	ENSGT00940000165613	ENSGT01010000222313.A.b.b.a.a.b.a	ENSGT00990000204783	ENSGT00940000177150	ENSGT00960000187164	ENSGT00940000158922.d	ENSGT00950000183046.a.b.l	ENSGT00940000157900	ENSGT00940000154268.k.a	ENSGT00940000154376.a.a
Electric eel	MODERN SPECIES	26	ENSEEEG00000003807	mvp (ENSEEEG00000002941)	ENSEEEG00000002879	ENSEEEG00000002878	ENSEEEG00000002876	ENSEEEG00000002875	nupr1b (ENSEEEG00000002874)	sgf29 (ENSEEEG00000002871)	nfatc2ip (ENSEEEG00000002869)	spns1 (ENSEEEG00000002863)	atxn2l (ENSEEEG00000002857)	sh2b1 (ENSEEEG00000002856)	pitpnbl (ENSEEEG00000002853)	ENSEEEG00000002850	SEZ6L2 (ENSEEEG00000002847)	kctd13 (ENSEEEG00000002845) ##22	hirip3 (ENSEEEG00000002844)	ENSEEEG00000002044	ENSEEEG00000002034	cdipt (ENSEEEG00000002032)	ENSEEEG00000002031	nlk1 (ENSEEEG00000001941)	tlcd3ba (ENSEEEG00000001936)	ENSEEEG00000001935	ENSEEEG00000001934	RUNDC3A (ENSEEEG00000001933)	FAM117A (ENSEEEG00000001932)	slc35b1 (ENSEEEG00000001929)	ndufa4a (ENSEEEG00000001922)	spop (ENSEEEG00000001915)	NXPH3 (ENSEEEG00000001914)
Characoidei	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00940000161265.e.a.a	ENSGT00390000008969	ENSGT00940000161103.a	ENSGT00940000174861	ENSGT00940000159141.j.a	ENSGT00530000064242.a	ENSGT00390000015229	ENSGT00390000007119	ENSGT00390000005976.b	ENSGT00940000157795.g.b	ENSGT00950000183191.a.a.f	ENSGT00940000164396	ENSGT00940000160506.b	ENSGT00940000159252.b.b	ENSGT00940000160492	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000163160.b.e.a	ENSGT00940000159991.A.a	ENSGT00940000154169.A.h	ENSGT00940000158525.u	ENSGT00940000165613	ENSGT01010000222313.A.b.b.a.a.b.a	ENSGT00990000204783	ENSGT00940000177150	ENSGT00960000187164	ENSGT00940000158922.d	ENSGT00950000183046.a.b.l	ENSGT00940000157900	ENSGT00940000154268.k.a	ENSGT00940000154376.a.a
Red-bellied piranha	MODERN SPECIES	683											sh2b1 (ENSPNAG00000018309)	pitpnbl (ENSPNAG00000018353)	cabp5b (ENSPNAG00000006420)	ENSPNAG00000018415	SEZ6L2 (ENSPNAG00000018429)	kctd13 (ENSPNAG00000005017) ##22	hirip3 (ENSPNAG00000018496)	zgc:112038 (ENSPNAG00000018511)	ENSPNAG00000018608	cdipt (ENSPNAG00000018634)	ENSPNAG00000018645	nlk1 (ENSPNAG00000018687)	tlcd3ba (ENSPNAG00000018696)	ENSPNAG00000018717	armc1l (ENSPNAG00000018742)	mtfr2 (ENSPNAG00000005333)
Mexicana tetra	MODERN SPECIES	143	ENSAMXG00000032552	ENSAMXG00000003448	ENSAMXG00000029620	ENSAMXG00000040820	nupr1b (ENSAMXG00000042734)	sgf29 (ENSAMXG00000003395)	nfatc2ip (ENSAMXG00000003379)	spns1 (ENSAMXG00000003359)	atxn2l (ENSAMXG00000003332)	sh2b1 (ENSAMXG00000003306)	pitpnbl (ENSAMXG00000003272)	ENSAMXG00000033294	cabp5b (ENSAMXG00000043720)	ASPHD2 (ENSAMXG00000003221)	SEZ6L2 (ENSAMXG00000003204)	kctd13 (ENSAMXG00000034347) ##22	hirip3 (ENSAMXG00000043296)	ENSAMXG00000042663	ENSAMXG00000003079	cdipt (ENSAMXG00000036809)	ENSAMXG00000003053	nlk1 (ENSAMXG00000003011)	tlcd3ba (ENSAMXG00000003007)	ENSAMXG00000033835	ENSAMXG00000039178	ENSAMXG00000033731	RUNDC3A (ENSAMXG00000036561)	ENSAMXG00000042845
Cyprinoidei	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000161725.h	ENSGT00990000213837	ENSGT00940000154308.A.a.a.a	ENSGT00940000159141.j.a	ENSGT00530000064242.a	ENSGT00390000015229	ENSGT00390000007119	ENSGT00390000005976.b	ENSGT00940000157795.g.b	ENSGT00950000183191.a.a.f	ENSGT00940000154813.e.a.b	ENSGT00940000164396	ENSGT00940000160506.b	ENSGT00940000159252.b.b	ENSGT00940000160492	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00390000014062	ENSGT00390000013260.C.g	ENSGT00940000160874	ENSGT00410000026495.C.b	ENSGT00390000014771.b.a	ENSGT00390000002810	ENSGT00940000160286	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.b.a.b	ENSGT00940000177692	ENSGT00390000013719	ENSGT00950000182917.a.b.b	ENSGT00940000164506.b.b	ENSGT00940000160257	ENSGT00940000167287	ENSGT00940000160315.i
Cyprininae	DUPLICATION
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	269	ENSGT01100000263533.a	ENSGT00940000161725.h.a	ENSGT00940000154308.A.a.a.a	ENSGT00940000159141.j.a.b	ENSGT00530000064242.a.c	ENSGT00390000015229.bb	ENSGT00390000007119.b	ENSGT00390000005976.b.d	ENSGT00940000157795.g.b.a	ENSGT00950000183191.a.a.f.a.b	ENSGT00940000154813.e.a.b	ENSGT00940000164396.c.a	ENSGT00940000160506.b.b	ENSGT00940000159252.b.b.d	ENSGT00940000160492.b	ENSGT00950000183143.c.b.g ##22	ENSGT00390000014062.d	ENSGT00390000010523.c.a.h	ENSGT01090000259987.b.b.a.a.a.a.d	ENSGT00950000182984.b.a.a.c.a.d	ENSGT01050000244842.a.b.b.b.j	ENSGT00940000157020.g.a.d	ENSGT00940000157579.a.c	ENSGT00940000154578.A.c.b.d.l	ENSGT00390000014069.b.l	ENSGT00940000158253.db.a	ENSGT00940000166349.n	ENSGT00940000157423.a.a.c	ENSGT00390000010440.g.a	ENSGT00730000110974.a.d	ENSGT00950000182883.a.a.a.d
Goldfish	MODERN SPECIES	22	ENSCARG00000017008	ENSCARG00000017019	ENSCARG00000017027	DOC2A (ENSCARG00000017058)	nupr1b (ENSCARG00000017117)	sgf29 (ENSCARG00000017126)	nfatc2ip (ENSCARG00000017168)	spns1 (ENSCARG00000017187)	atxn2l (ENSCARG00000017283)	sh2b1 (ENSCARG00000017371)	ENSCARG00000017392	pitpnbl (ENSCARG00000017414)	cabp5b (ENSCARG00000017528)	ASPHD2 (ENSCARG00000017548)	ENSCARG00000017573	kctd13 (ENSCARG00000017803) ##22	hirip3 (ENSCARG00000017817)	rprml (ENSCARG00000017824)	itgb3a (ENSCARG00000017844)	mettl2a (ENSCARG00000017995)	tlk2 (ENSCARG00000018108)	MRC2 (ENSCARG00000018238)	rnd2 (ENSCARG00000018465)	vat1 (ENSCARG00000018475)	ENSCARG00000018487	tmub2 (ENSCARG00000018495)	atxn7l3a (ENSCARG00000018502)	ubtf (ENSCARG00000018560)	slc4a1a (ENSCARG00000019139)	ENSCARG00000019181	NGFR (ENSCARG00000000128)
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	113	ENSGT01100000263533.a	ENSGT00940000161725.h.a	ENSGT01100000263505.b.b.a.a.a.b	ENSGT00940000159141.j.a.b	ENSGT00530000064242.a.c	ENSGT00390000015229.bb	ENSGT00390000007119.a	ENSGT00390000005976.b.d	ENSGT00940000157795.g.b.a	ENSGT00950000183191.a.a.f.a.b	ENSGT00940000154813.e.a.b	ENSGT00940000164396.c.a	ENSGT00940000160506.b.b	ENSGT00940000159252.b.b.d	ENSGT00940000160492.b	ENSGT00950000183143.c.b.g ##22	ENSGT00390000014062.d	ENSGT00390000010523.c.a.h	ENSGT01090000259987.b.b.a.a.a.a.c.b	ENSGT00940000156059.o	ENSGT00950000182984.b.a.a.c.a.d	ENSGT01050000244842.a.b.b.b.j	ENSGT00940000157020.g.a.d	ENSGT00940000157579.a.c	ENSGT00940000154578.A.c.b.d.l	ENSGT00940000160773.h	ENSGT00390000014069.b.l	ENSGT00940000158253.db.a	ENSGT00940000166349.n	ENSGT00940000157423.a.a.c	ENSGT00390000010440.g.a
Common carp reference	MODERN SPECIES	3	mvp (ENSCCRG00000063252)	ENSCCRG00000043521	ENSCCRG00000035137	ENSCCRG00000035159	ENSCCRG00000068744	sgf29 (ENSCCRG00000074953)	nupr1b (ENSCCRG00000063606)	spns1 (ENSCCRG00000072982)	atxn2l (ENSCCRG00000051049)	sh2b1 (ENSCCRG00000080788)	ENSCCRG00000055032	pitpnbl (ENSCCRG00000051068)	cabp5b (ENSCCRG00000009560)	ENSCCRG00000009567	ENSCCRG00000051107	kctd13 (ENSCCRG00000051112) ##22	hirip3 (ENSCCRG00000051117)	rprml (ENSCCRG00000058144)	itgb3a (ENSCCRG00000049656)	mettl2a (ENSCCRG00000008201)	tlk2 (ENSCCRG00000066124)	MRC2 (ENSCCRG00000011390)	rnd2 (ENSCCRG00000024725)	vat1 (ENSCCRG00000066633)	ENSCCRG00000061047	asb16 (ENSCCRG00000008740)	tmub2 (ENSCCRG00000080193)	atxn7l3a (ENSCCRG00000008754)	ubtf (ENSCCRG00000008775)	slc4a1a (ENSCCRG00000077482)	selenow2a (ENSCCRG00000067963)
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	450	ENSSGRG00000045185	zgc:66474 (ENSSGRG00000045183)	ENSSGRG00000045180	DOC2A (ENSSGRG00000045179)	ENSSGRG00000045177	sgf29 (ENSSGRG00000045153)	nfatc2ip (ENSSGRG00000045151)	spns1 (ENSSGRG00000044540)	atxn2l (ENSSGRG00000044524)	sh2b1 (ENSSGRG00000044522)	ENSSGRG00000044520	pitpnbl (ENSSGRG00000044517)	cabp5b (ENSSGRG00000044515)	ENSSGRG00000044513	SEZ6L2 (ENSSGRG00000043869)	kctd13 (ENSSGRG00000043855) ##22	hirip3 (ENSSGRG00000043853)	rprml (ENSSGRG00000043851)	ENSSGRG00000043850	tlk2 (ENSSGRG00000042590)	MRC2 (ENSSGRG00000042445)	rnd2 (ENSSGRG00000042441)	vat1 (ENSSGRG00000042440)
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00940000157416.e	ENSGT00950000183070.a.b.b.b	ENSGT00390000008969.l	ENSGT00940000161103.a.d	ENSGT00940000159141.j.a.a	ENSGT00530000064242.a.d	ENSGT00390000015229.cb	ENSGT00390000007119.a	ENSGT00390000005976.b.c	ENSGT00940000157795.g.b.b	ENSGT00950000183191.a.a.f.a.a	ENSGT00940000164396.c.b	ENSGT00940000160506.b.a	ENSGT00940000159252.b.b.c	ENSGT00940000160492.a	ENSGT00950000183143.c.b.h ##22	ENSGT00390000014062.c	ENSGT00390000010523.c.a.g	ENSGT01090000259987.b.b.a.a.a.a.c.a	ENSGT00940000156059.p	ENSGT00950000182984.b.a.a.c.a.c	ENSGT01050000244842.a.b.b.b.i	ENSGT00940000157020.g.a.c	ENSGT00940000157579.a.d	ENSGT00940000154578.A.c.b.d.k	ENSGT00940000160773	ENSGT00390000014069.b.k	ENSGT00940000158253.db.b	ENSGT00940000166349.m	ENSGT00940000157423.a.a.d	ENSGT00940000177451.b
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00950000183070.a.b.b.b	ENSGT00390000008969.l	ENSGT00940000161103.a.d	ENSGT01100000263491.a.b.b.c.a.a.b	ENSGT00940000154308.A.a.a.a	ENSGT00940000159141.j.a.a	ENSGT00530000064242.a.d	ENSGT00390000015229.cb	ENSGT00390000005976.b.c	ENSGT00940000157795.g.b.b	ENSGT00950000183191.a.a.f.a.a	ENSGT00940000164396.c.b	ENSGT00940000160506.b.a	ENSGT00940000159252.b.b.c	ENSGT00940000160492.a	ENSGT00950000183143.c.b.h ##22	ENSGT00390000014062.c	ENSGT00390000010523.c.a.g	ENSGT01090000259987.b.b.a.a.a.a.c.a	ENSGT00940000156059.p	ENSGT00950000182984.b.a.a.c.a.c	ENSGT01050000244842.a.b.b.b.i	ENSGT00940000157020.g.a.c	ENSGT00940000157579.a.d	ENSGT00940000154578.A.c.b.d.k	ENSGT00940000160773.g	ENSGT00390000014069.b.k	ENSGT00940000158253.db.b	ENSGT00940000166349.m	ENSGT00940000157423.a.a.d	ENSGT00940000177451.b
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	26	ENSSGRG00000031372	ENSSGRG00000031370	ENSSGRG00000031369	ENSSGRG00000031365	DOC2A (ENSSGRG00000031364)	nupr1b (ENSSGRG00000031362)	sgf29 (ENSSGRG00000031354)	spns1 (ENSSGRG00000031309)	atxn2l (ENSSGRG00000031301)	sh2b1 (ENSSGRG00000031300)	ENSSGRG00000031299	pitpnbl (ENSSGRG00000031287)	cabp5b (ENSSGRG00000031286)	ENSSGRG00000031285	SEZ6L2 (ENSSGRG00000031057)	kctd13 (ENSSGRG00000031049) ##22	ENSSGRG00000031048	zgc:163079 (ENSSGRG00000031047)	rprml (ENSSGRG00000031046)	ENSSGRG00000031045	mettl2a (ENSSGRG00000030579)	tlk2 (ENSSGRG00000029224)	MRC2 (ENSSGRG00000028697)	rnd2 (ENSSGRG00000028683)	vat1 (ENSSGRG00000028682)	ENSSGRG00000028681	asb16 (ENSSGRG00000028680)	tmub2 (ENSSGRG00000028679)	atxn7l3a (ENSSGRG00000028678)	ubtf (ENSSGRG00000026806)	slc4a1a (ENSSGRG00000025296)
Goldfish	MODERN SPECIES	20	zgc:66474 (ENSCARG00000024483)	ENSCARG00000024477	ENSCARG00000024472	DOC2A (ENSCARG00000024127)	nupr1b (ENSCARG00000024111)	sgf29 (ENSCARG00000024053)	nfatc2ip (ENSCARG00000024035)	spns1 (ENSCARG00000023935)	atxn2l (ENSCARG00000023750)	sh2b1 (ENSCARG00000023710)	ENSCARG00000023699	pitpnbl (ENSCARG00000023645)	cabp5b (ENSCARG00000023625)	ASPHD2 (ENSCARG00000023619)	SEZ6L2 (ENSCARG00000023567)	kctd13 (ENSCARG00000023527) ##22	hirip3 (ENSCARG00000023502)	rprml (ENSCARG00000023497)	itgb3a (ENSCARG00000020529)	mettl2a (ENSCARG00000020135)	tlk2 (ENSCARG00000019314)	MRC2 (ENSCARG00000016205)	ENSCARG00000016088	rnd2 (ENSCARG00000016068)	vat1 (ENSCARG00000016057)	ENSCARG00000016050	asb16 (ENSCARG00000016042)	tmub2 (ENSCARG00000016031)	atxn7l3a (ENSCARG00000015976)	ubtf (ENSCARG00000015828)	slc4a1a (ENSCARG00000015560)
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Euacanthomorphacea	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000156054.c.a	ENSGT00940000157282	ENSGT00940000159737.d	ENSGT00940000163334.d	ENSGT00440000038032	ENSGT00390000004681.a.b	ENSGT00390000014585	ENSGT00940000156518.B	ENSGT00940000166693	ENSGT00940000159327.u.a	ENSGT00940000178126	ENSGT00940000160506.b	ENSGT00940000159252.b.b	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00390000014062	ENSGT00390000014771.b.a	ENSGT00390000002810	ENSGT00940000160286	ENSGT00940000158125.b	ENSGT00940000163157.b	ENSGT00940000159110.a	ENSGT00940000155653.a	ENSGT00560000077365	ENSGT00390000018612.a.a	ENSGT00390000004452	ENSGT00390000007101.d.a	ENSGT00940000153909.a	ENSGT00940000156748	ENSGT01030000234586.A.a.a.b
Percomorphaceae	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000157282	ENSGT00940000159737.d	ENSGT00940000163334.d	ENSGT00940000177484	ENSGT00440000038032	ENSGT00390000004681.a.b	ENSGT00390000014585	ENSGT00940000156518.B	ENSGT00940000166693	ENSGT00940000159327.u.a	ENSGT00940000178126	ENSGT00940000160506.b	ENSGT00940000159252.b.b	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00390000014062	ENSGT00390000014771.b.a	ENSGT00390000002810	ENSGT00940000160286	ENSGT00940000158125.b	ENSGT00940000163157.b	ENSGT00940000159110.a	ENSGT00940000155653.a	ENSGT00560000077365	ENSGT00390000018612.a.a	ENSGT00390000004452	ENSGT00390000007101.d.a	ENSGT00940000153909.a	ENSGT00940000156748	ENSGT01030000234586.A.a.a.b
Percomorphaceae_B	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.b	ENSGT01100000263485.a.a.b.a.a.b.b	ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.b	ENSGT00940000163847.b	ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.b.b	ENSGT01100000263566.b.b.b.a	ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b	ENSGT01100000263566.b.b.c.a.a.a	ENSGT01090000259993.A.b.j	ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a	ENSGT01090000259993.A.b.i.a.b	ENSGT00940000160506.b	ENSGT00940000159252.b.b	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT01000000219961	ENSGT00390000014062	ENSGT00390000014771.b.a	ENSGT00390000002810	ENSGT00940000160286	ENSGT00940000158125.b	ENSGT00940000163157.b	ENSGT00940000159110.a	ENSGT00940000155653.a	ENSGT00560000077365	ENSGT00390000018612.a.a	ENSGT00390000004452	ENSGT00390000007101.d.a	ENSGT00940000153909.a	ENSGT00940000156748
Percomorphaceae_C	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT01020000230358.h.d.b.b.h.a.a	ENSGT01100000263485.a.a.a.b.a.a.a	ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.a.b.b.b.a.b	ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.b	ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.a.b	ENSGT01050000244936	ENSGT01090000259993.A.b.i.b	ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.b	ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.a.b.b.b.a.a.a	ENSGT00940000163849.i.a.a.b.a.a	ENSGT01090000259993.A.b.i.a.b	ENSGT00940000160506.b	ENSGT00940000159252.b.b	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT01000000219961	ENSGT00390000014062	ENSGT00390000014771.b.a	ENSGT00390000002810	ENSGT00940000160286	ENSGT00940000158125.b	ENSGT00940000163157.b	ENSGT00940000159110.a	ENSGT00940000155653.a	ENSGT00560000077365	ENSGT00390000018612.a.a	ENSGT00390000004452	ENSGT00390000007101.d.a	ENSGT00940000153909.a	ENSGT00940000156748
Percomorphaceae_D	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT01100000263566.b.b.b.b	ENSGT01090000259993.B.c.b.b.e.a	ENSGT01050000244936	ENSGT01090000259993.A.b.i.b	ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.b	ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.b	ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.a.b.a.b	ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a	ENSGT01100000263566.b.b.a.b	ENSGT01020000230358.h.d.b.b.h.a.b	ENSGT01090000259993.A.b.i.a.b	ENSGT00940000160506.b	ENSGT00940000159252.b.b	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT01000000219961	ENSGT00390000014062	ENSGT00390000014771.b.a	ENSGT00390000002810	ENSGT00940000160286	ENSGT00940000158125.b	ENSGT00940000163157.b	ENSGT00940000159110.a	ENSGT00940000155653.a	ENSGT00560000077365	ENSGT00390000018612.a.a	ENSGT00390000004452	ENSGT00390000007101.d.a	ENSGT00940000153909.a	ENSGT00940000156748
Carangaria	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT01090000259993.D.b.d	ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.a	ENSGT01100000263485.a.a.b.a.b.a.a.a	ENSGT01100000263485.a.b.b.b.b	ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.a.a	ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.a.b.b.a.b	ENSGT01100000263485.a.a.b.a.a.a.a.b	ENSGT01100000263485.a.a.a.b.a.a.b.b.a.b	ENSGT01100000263485.a.a.b.a.a.b.b.a	ENSGT01090000259993.A.b.i.a.a	ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.a.a.a	ENSGT01090000259993.A.b.i.a.b	ENSGT00940000160506.b	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT01000000219961	ENSGT00390000014062	ENSGT00390000014771.b.a	ENSGT00390000002810	ENSGT00940000160286	ENSGT00940000158125.b	ENSGT00940000163157.b	ENSGT00940000159110.a	ENSGT00940000155653.a	ENSGT00560000077365	ENSGT00390000018612.a.a	ENSGT00390000004452	ENSGT00390000007101.d.a	ENSGT00940000153909.a	ENSGT00940000156748
Pleuronectoidei	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000156054.c.a	ENSGT00940000157282	ENSGT00940000159737.d	ENSGT00940000163334.d.t	ENSGT00390000004681.a.b	ENSGT00390000014585	ENSGT00940000156518.B	ENSGT00900000141021.b.b.e	ENSGT00940000159327.u.a	ENSGT00940000163371.b	ENSGT01100000263566.b.a	ENSGT00940000160506.b	ENSGT00940000159252.b.b	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00390000014062	ENSGT00390000014771.b.a	ENSGT00390000002810	ENSGT00940000160286	ENSGT00940000158125.b	ENSGT00940000163157.b	ENSGT00940000159110.a	ENSGT00940000155653.a	ENSGT00560000077365	ENSGT00390000018612.a.a	ENSGT00390000004452	ENSGT00390000007101.d.a	ENSGT00940000153909.a	ENSGT00940000156748	ENSGT01030000234586.A.a.a.b
Turbot	MODERN SPECIES	10	ENSSMAG00000010801	ENSSMAG00000010767	ENSSMAG00000010762	ENSSMAG00000037722	ENSSMAG00000010758	ENSSMAG00000023159	ENSSMAG00000036124	ENSSMAG00000035564	ENSSMAG00000029804	ENSSMAG00000010727	ENSSMAG00000024005	ENSSMAG00000037533	ENSSMAG00000010685	ENSSMAG00000010670	ENSSMAG00000010659	ENSSMAG00000010650 ##22	ENSSMAG00000010641	antkmt (ENSSMAG00000029225)	ENSSMAG00000010566	nme4 (ENSSMAG00000010381)	eps8l1a (ENSSMAG00000010360)	ENSSMAG00000010297	slc17a7a (ENSSMAG00000010243)	zgc:55558 (ENSSMAG00000010231)	pold1 (ENSSMAG00000010177)	gys1 (ENSSMAG00000010135)	aspdh (ENSSMAG00000010102)	tmem86b (ENSSMAG00000023587)	ENSSMAG00000010092	ENSSMAG00000010053	KCNJ18 (ENSSMAG00000010049)
Tongue sole	MODERN SPECIES	8	gtf2f1 (ENSCSEG00000013361)	GFUS (ENSCSEG00000013379)	alkbh7 (ENSCSEG00000013396)	CACNA1A (ENSCSEG00000013404)	ENSCSEG00000013443	NACC1 (ENSCSEG00000013451)	ENSCSEG00000013467	ENSCSEG00000013477	ENSCSEG00000013484	ENSCSEG00000013490	ENSCSEG00000013495	ENSCSEG00000013503	cabp5b (ENSCSEG00000013514)	ENSCSEG00000013528	SEZ6L2 (ENSCSEG00000013538)	kctd13 (ENSCSEG00000013574) ##22	hirip3 (ENSCSEG00000013587)	antkmt (ENSCSEG00000013597)	xpo6 (ENSCSEG00000013622)	nme4 (ENSCSEG00000013668)	eps8l1a (ENSCSEG00000013687)	ENSCSEG00000013715	slc17a7a (ENSCSEG00000013728)	zgc:55558 (ENSCSEG00000013739)	pold1 (ENSCSEG00000013752)	gys1 (ENSCSEG00000013807)	aspdh (ENSCSEG00000013820)	tmem86b (ENSCSEG00000013827)	hspbp1 (ENSCSEG00000013837)	tufm (ENSCSEG00000013841)	ENSCSEG00000013868
Carangaria_A	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00390000004681.a.b	ENSGT00390000014585	ENSGT00940000156518.B	ENSGT00940000166693	ENSGT00900000141021.b.b.e	ENSGT00940000159327.u.a	ENSGT01030000234901	ENSGT01100000263485.a.b.a.b.a	ENSGT01090000259993.D.b.d	ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.a	ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b	ENSGT01050000244936	ENSGT00940000160506.b	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT01000000219961	ENSGT00390000014062	ENSGT00390000014771.b.a	ENSGT00390000002810	ENSGT00940000160286	ENSGT00940000158125.b	ENSGT00940000163157.b	ENSGT00940000159110.a	ENSGT00940000155653.a	ENSGT00560000077365	ENSGT00390000018612.a.a	ENSGT00390000004452	ENSGT00390000007101.d.a	ENSGT00940000153909.a	ENSGT00940000156748
Barramundi perch	MODERN SPECIES	41	ENSLCAG00010018859	ENSLCAG00010018864	ENSLCAG00010018867	ENSLCAG00010018871	ENSLCAG00010018872	ENSLCAG00010018875	ENSLCAG00010018879	ENSLCAG00010018882	ENSLCAG00010018886	ENSLCAG00010018889	ENSLCAG00010018892	ENSLCAG00010018903	cabp5b (ENSLCAG00010018907)	ENSLCAG00010018912	SEZ6L2 (ENSLCAG00010018933)	kctd13 (ENSLCAG00010018992) ##22	ENSLCAG00010018995	ENSLCAG00010018997	antkmt (ENSLCAG00010018999)	xpo6 (ENSLCAG00010019011)	nme4 (ENSLCAG00010019128)	eps8l1a (ENSLCAG00010019136)	ENSLCAG00010019140	slc17a7a (ENSLCAG00010019196)	zgc:55558 (ENSLCAG00010019375)	pold1 (ENSLCAG00010000286)	gys1 (ENSLCAG00010000455)	hspbp1 (ENSLCAG00010000553)	tmem86b (ENSLCAG00010000571)	tufm (ENSLCAG00010000578)	KCNJ18 (ENSLCAG00010000586)
Seriola	ANCESTRAL SPECIES	57										ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.a.b.a.b	ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.a.a.a.a.a.a.a	ENSGT01090000259993.A.b.i.a.b	ENSGT00940000160506.b	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00390000014062	ENSGT00390000014771.b.a	ENSGT00390000002810	ENSGT00940000160286	ENSGT00940000158125.b	ENSGT00940000163157.b	ENSGT00940000159110.a	ENSGT00940000155653.a	ENSGT00560000077365	ENSGT00390000018612.a.a	ENSGT00390000004452	ENSGT00390000007101.d.a	ENSGT00940000153909.a	ENSGT00940000156748	ENSGT01030000234586.A.a.a.b
Yellowtail amberjack	MODERN SPECIES	3261	ENSSLDG00000006954	ENSSLDG00000006944	ENSSLDG00000006933	ENSSLDG00000006909	ENSSLDG00000006898	ENSSLDG00000006892	ENSSLDG00000006882	ENSSLDG00000006876	ENSSLDG00000006867	ENSSLDG00000006860	ENSSLDG00000006850	ENSSLDG00000006835	cabp5b (ENSSLDG00000006809)	ENSSLDG00000006787	SEZ6L2 (ENSSLDG00000006763)	kctd13 (ENSSLDG00000006720) ##22	hirip3 (ENSSLDG00000006690)	antkmt (ENSSLDG00000006675)	xpo6 (ENSSLDG00000006580)	nme4 (ENSSLDG00000006542)	eps8l1a (ENSSLDG00000006521)	ENSSLDG00000006469
Greater amberjack	MODERN SPECIES	89				ENSSDUG00000017635	ENSSDUG00000017631	ENSSDUG00000017621	ENSSDUG00000017614	ENSSDUG00000017599	ENSSDUG00000017596	ENSSDUG00000017592	ENSSDUG00000017585	ENSSDUG00000017576	cabp5b (ENSSDUG00000017565)	ENSSDUG00000017555	SEZ6L2 (ENSSDUG00000017473)	kctd13 (ENSSDUG00000017440) ##22	hirip3 (ENSSDUG00000017417)	antkmt (ENSSDUG00000017396)	xpo6 (ENSSDUG00000017294)	nme4 (ENSSDUG00000017260)	eps8l1a (ENSSDUG00000017245)	ENSSDUG00000017208	slc17a7a (ENSSDUG00000017180)	zgc:55558 (ENSSDUG00000017164)	pold1 (ENSSDUG00000017052)	gys1 (ENSSDUG00000017012)	aspdh (ENSSDUG00000016990)	tmem86b (ENSSDUG00000016980)	hspbp1 (ENSSDUG00000016953)	tufm (ENSSDUG00000016896)	ENSSDUG00000016846
Anabantaria	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.a.b.a.b	ENSGT01090000259993.A.b.j	ENSGT01100000263566.b.a	ENSGT01100000263485.a.a.a.b.a.a.a	ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.a.b.b.b.a.b	ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.b	ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.a.b.a.b	ENSGT01100000263566.b.b.c.b	ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a	ENSGT01100000263566.b.b.a.b	ENSGT01020000230358.h.d.b.b.h.a.b	ENSGT01090000259993.A.b.i.a.b	ENSGT00940000160506.b	ENSGT00940000159252.b.b	ENSGT00940000160492	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00390000014062	ENSGT00390000014771.b.a	ENSGT00390000002810	ENSGT00940000160286	ENSGT00940000158125.b	ENSGT00940000163157.b	ENSGT00940000159110.a	ENSGT00940000155653.a	ENSGT00560000077365	ENSGT00390000018612.a.a	ENSGT00390000004452	ENSGT00390000007101.d.a	ENSGT00940000153909.a	ENSGT00940000156748	ENSGT01030000234586.A.a.a.b
Anabantoidei	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT01090000259993.D.b.d	ENSGT00940000177227.b	ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.a.b.a.b	ENSGT01090000259993.A.b.j	ENSGT00940000163849.i.a.a.b.b	ENSGT01100000263485.a.a.a.b.a.a.a	ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.a.b.b.b.a.b	ENSGT01090000259993.B.c.b.b.e.b.b	ENSGT01020000230358.h.d.b.a.c.b	ENSGT01100000263485.a.b.a.a.a.b.d.f	ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.b	ENSGT00940000160506.b	ENSGT00940000159252.b.b	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00390000014062	ENSGT00390000014771.b.a	ENSGT00390000002810	ENSGT00940000160286	ENSGT00940000158125.b	ENSGT00940000163157.b	ENSGT00940000159110.a	ENSGT00940000155653.a	ENSGT00560000077365	ENSGT00390000018612.a.a	ENSGT00390000004452	ENSGT00390000007101.d.a	ENSGT00940000153909.a	ENSGT00940000156748	ENSGT01030000234586.A.a.a.b
Siamese fighting fish	DUPLICATION
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Siamese fighting fish	MODERN SPECIES	19	ENSBSLG00000018501	ENSBSLG00000018494	ENSBSLG00000018483	ENSBSLG00000018475	ENSBSLG00000018469	ENSBSLG00000018462	ENSBSLG00000018449	ENSBSLG00000018439	ENSBSLG00000018436	ENSBSLG00000018435	ENSBSLG00000018431	ENSBSLG00000018403	ENSBSLG00000018395	ASPHD2 (ENSBSLG00000018390)	SEZ6L2 (ENSBSLG00000017056)	kctd13 (ENSBSLG00000016947) ##22	hirip3 (ENSBSLG00000016923)	antkmt (ENSBSLG00000016723)	xpo6 (ENSBSLG00000015510)	nme4 (ENSBSLG00000015496)	eps8l1a (ENSBSLG00000015442)	ENSBSLG00000015388	slc17a7a (ENSBSLG00000013720)	zgc:55558 (ENSBSLG00000013658)	pold1 (ENSBSLG00000013285)	gys1 (ENSBSLG00000012086)	aspdh (ENSBSLG00000012021)	tmem86b (ENSBSLG00000012007)	hspbp1 (ENSBSLG00000011973)	tufm (ENSBSLG00000011868)	KCNJ12 (ENSBSLG00000011824)
Climbing perch	MODERN SPECIES	21	ENSATEG00000026809	ENSATEG00000001633	ENSATEG00000001664	ENSATEG00000026092	ENSATEG00000001735	ENSATEG00000001771	ENSATEG00000029564	ENSATEG00000029943	ENSATEG00000027270	ENSATEG00000028892	ENSATEG00000001820	ENSATEG00000001827	ENSATEG00000001910	ENSATEG00000001938	ENSATEG00000001991	ENSATEG00000002102 ##22	hirip3 (ENSATEG00000002111)	antkmt (ENSATEG00000002261)	ENSATEG00000002273	nme4 (ENSATEG00000002395)	eps8l1a (ENSATEG00000002583)	ENSATEG00000002591	slc17a7a (ENSATEG00000002647)	zgc:55558 (ENSATEG00000002682)	pold1 (ENSATEG00000002687)	gys1 (ENSATEG00000002788)	aspdh (ENSATEG00000026199)	tmem86b (ENSATEG00000002876)	ENSATEG00000002893	ENSATEG00000002905	ENSATEG00000002913
Zig-zag eel	MODERN SPECIES	22	ENSMAMG00000024978	ENSMAMG00000026841	ENSMAMG00000028142	ENSMAMG00000000956	ENSMAMG00000028285	ENSMAMG00000000560	ENSMAMG00000001036	ENSMAMG00000028434	ENSMAMG00000000451	ENSMAMG00000025082	ENSMAMG00000026259	ENSMAMG00000001089	ENSMAMG00000001097	ENSMAMG00000001104	ENSMAMG00000001134	ENSMAMG00000001223 ##22	hirip3 (ENSMAMG00000001268)	antkmt (ENSMAMG00000001300)	ENSMAMG00000001351	nme4 (ENSMAMG00000001519)	eps8l1a (ENSMAMG00000001589)	ENSMAMG00000001617	slc17a7a (ENSMAMG00000001662)	zgc:55558 (ENSMAMG00000025989)	pold1 (ENSMAMG00000001747)	gys1 (ENSMAMG00000001811)	aspdh (ENSMAMG00000001860)	tmem86b (ENSMAMG00000001891)	ENSMAMG00000001916	ENSMAMG00000002053	KCNJ18 (ENSMAMG00000002065)
Eupercaria	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT01100000263566.b.a	ENSGT01020000230358.h.d.b.b.h.a.a	ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.b	ENSGT01100000263485.a.b.b.a.a	ENSGT01100000263931	ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.a.a.a	ENSGT01100000263485.a.b.a.a.a.b.c.b	ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.b	ENSGT01020000230358.h.d.b.b.h.a.b	ENSGT00940000163849.j	ENSGT01020000230358.h.d.b.a.c.b	ENSGT01090000259993.A.b.i.a.b	ENSGT00940000160506.b	ENSGT00940000159252.b.b	ENSGT00940000160492	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00390000014062	ENSGT00390000014771.b.a	ENSGT00390000002810	ENSGT00940000160286	ENSGT00940000158125.b	ENSGT00940000163157.b	ENSGT00940000159110.a	ENSGT00940000155653.a	ENSGT00560000077365	ENSGT00390000018612.a.a	ENSGT00390000004452	ENSGT00390000007101.d.a	ENSGT00940000153909.a	ENSGT00940000156748	ENSGT01030000234586.A.a.a.b
Tetraodontidae	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000157282	ENSGT00940000159737.d	ENSGT00940000163334.d.t	ENSGT00390000004681.a.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00390000014585	ENSGT00940000156518.B.i	ENSGT00940000166693	ENSGT00940000159327.u.a	ENSGT00940000163371.b	ENSGT01100000263566.b.a	ENSGT01020000230358.h.d.b.b.h.a.a	ENSGT00940000163849.i.b.b	ENSGT00940000160506.b	ENSGT00940000160492	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00390000014771.b.a	ENSGT00390000002810	ENSGT00940000160286	ENSGT00940000158125.b	ENSGT00940000163157.b	ENSGT00940000159110.a	ENSGT00940000155653.a	ENSGT00560000077365	ENSGT00390000018612.a.a	ENSGT00390000004452	ENSGT00390000007101.d.a	ENSGT00940000153909.a	ENSGT00940000156748.db	ENSGT01030000234586.A.a.a.b	ENSGT00390000006617
Fugu	MODERN SPECIES	17	ENSTRUG00000030593	ENSTRUG00000027255	ENSTRUG00000029517	ENSTRUG00000023516	ENSTRUG00000032247	ENSTRUG00000032796	ENSTRUG00000030231	ENSTRUG00000033194	ENSTRUG00000033012	ENSTRUG00000000530	ENSTRUG00000025998	ENSTRUG00000032055	ENSTRUG00000026531	cabp5b (ENSTRUG00000003005)	SEZ6L2 (ENSTRUG00000003228)	kctd13 (ENSTRUG00000004194) ##22	antkmt (ENSTRUG00000004662)	xpo6 (ENSTRUG00000004696)	nme4 (ENSTRUG00000005236)	eps8l1a (ENSTRUG00000005442)	ENSTRUG00000005532	slc17a7a (ENSTRUG00000006463)	zgc:55558 (ENSTRUG00000006628)	pold1 (ENSTRUG00000006759)	gys1 (ENSTRUG00000007451)	aspdh (ENSTRUG00000008112)	tmem86b (ENSTRUG00000019614)	hspbp1 (ENSTRUG00000008160)	tufm (ENSTRUG00000008300)	KCNJ18 (ENSTRUG00000008462)	tmem11 (ENSTRUG00000008507)
Eupecaria_A	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000177453	ENSGT01100000263566.b.a	ENSGT00940000163849.i.b.b	ENSGT01100000263485.a.b.a.b.a	ENSGT00940000163849.i.a.b	ENSGT01090000259993.D.b.d	ENSGT01100000263485.a.b.b.a.a.j.b.a	ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.a	ENSGT00940000163847.b	ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.b.b	ENSGT01020000230358.h.d.b.a.c.b	ENSGT01090000259993.A.b.i.a.b	ENSGT00940000160506.b	ENSGT00940000159252.b.b	ENSGT00940000160492	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00390000014062	ENSGT00390000014771.b.a	ENSGT00390000002810	ENSGT00940000160286	ENSGT00940000158125.b	ENSGT00940000163157.b	ENSGT00940000159110.a	ENSGT00940000155653.a	ENSGT00560000077365	ENSGT00390000018612.a.a	ENSGT00390000004452	ENSGT00390000007101.d.a	ENSGT00940000153909.a	ENSGT00940000156748	ENSGT01030000234586.A.a.a.b
Ballan wrasse	MODERN SPECIES	483																kctd13 (ENSLBEG00000022923) ##22	ENSLBEG00000022943	antkmt (ENSLBEG00000022983)	xpo6 (ENSLBEG00000023039)	nme4 (ENSLBEG00000023159)	eps8l1a (ENSLBEG00000023219)	ENSLBEG00000023268	pold1 (ENSLBEG00000023381)	SLC17A7 (ENSLBEG00000023479)	zgc:55558 (ENSLBEG00000023534)	gys1 (ENSLBEG00000023578)	aspdh (ENSLBEG00000023642)	tmem86b (ENSLBEG00000023679)	hspbp1 (ENSLBEG00000023696)	tufm (ENSLBEG00000023735)	ENSLBEG00000023771
Eupecaria_B	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT01100000263485.a.b.a.a.a.a.b	ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.a.b.b.b.a.a.b	ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.a.a.a	ENSGT01090000259993.A.b.i.a.a.b	ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.a.b.b	ENSGT01090000259993.D.b.d	ENSGT01100000263566.b.a	ENSGT00940000163849.i.b.b	ENSGT01100000263485.a.b.a.b.a.k	ENSGT01100000263485.a.b.b.a.a.j.b.a	ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.a	ENSGT01050000244936	ENSGT00940000160506.b	ENSGT00940000159252.b.b	ENSGT00940000160492	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00390000014062	ENSGT00390000014771.b.a	ENSGT00390000002810	ENSGT00940000160286	ENSGT00940000158125.b	ENSGT00940000163157.b	ENSGT00940000159110.a	ENSGT00940000155653.a	ENSGT00560000077365	ENSGT00390000018612.a.a	ENSGT00390000004452	ENSGT00390000007101.d.a	ENSGT00940000153909.a	ENSGT00940000156748	ENSGT01030000234586.A.a.a.b
Eupecaria_C	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT01100000263485.a.b.b.a.a.j.b.a.b.a.b.b.a	ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.b	ENSGT01090000259993.A.b.i.a.a.b	ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.a.b.b	ENSGT01090000259993.D.b.d	ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.a.b	ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.b	ENSGT01100000263485.a.b.a.a.a.a.b	ENSGT01100000263485.a.b.b.a.a.j.b.a.b.b	ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.a	ENSGT01100000263485.a.b.b.a.a.j.b.a.b.a.b.b.b	ENSGT01090000259993.A.b.i.a.b	ENSGT00940000160506.b	ENSGT00940000159252.b.b	ENSGT00940000160492	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00390000014062	ENSGT00390000014771.b.a	ENSGT00390000002810	ENSGT00940000160286	ENSGT00940000158125.b	ENSGT00940000163157.b	ENSGT00940000159110.a	ENSGT00940000155653.a	ENSGT00560000077365	ENSGT00390000018612.a.a	ENSGT00390000004452	ENSGT00390000007101.d.a	ENSGT00940000153909.a	ENSGT00940000156748	ENSGT01030000234586.A.a.a.b
Eupercaria_incertae_sedis	ANCESTRAL SPECIES	35												ENSGT01090000259993.A.b.i.b	ENSGT00940000160506.b	ENSGT00940000159252.b.b	ENSGT00940000160492	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00390000014062	ENSGT00390000002810	ENSGT00940000160286	ENSGT00940000158125.b	ENSGT00940000163157.b	ENSGT00940000159110.a	ENSGT00940000155653.a	ENSGT00560000077365	ENSGT00390000018612.a.a	ENSGT00390000004452	ENSGT00390000007101.d.a	ENSGT00940000153909.a	ENSGT00940000156748	ENSGT01030000234586.A.a.a.b	ENSGT00940000155286.m.b
European seabass	MODERN SPECIES	21	ENSDLAG00005021921	ddx5 (ENSDLAG00005021958)	smurf2 (ENSDLAG00005022129)	kpna2 (ENSDLAG00005022285)	ENSDLAG00005022359	grb2b (ENSDLAG00005022404)	ENSDLAG00005022410	ENSDLAG00005022414	ntn1b (ENSDLAG00005022442)	ENSDLAG00005022458	ENSDLAG00005022462	ENSDLAG00005022477	ENSDLAG00005022485	ENSDLAG00005022496	ENSDLAG00005022509	ENSDLAG00005022713 ##22	ENSDLAG00005022726	eps8l1a (ENSDLAG00005022929)	ENSDLAG00005022935	slc17a7a (ENSDLAG00005022968)	zgc:55558 (ENSDLAG00005030311)	pold1 (ENSDLAG00005023332)	gys1 (ENSDLAG00005023480)	ENSDLAG00005031127	tmem86b (ENSDLAG00005023510)	ENSDLAG00005023516	ENSDLAG00005033708	ENSDLAG00005026864	NATD1 (ENSDLAG00005035103)	TMEM11 (ENSDLAG00005029286)	ENSDLAG00005023548
Large yellow croaker	MODERN SPECIES	483	ENSLCRG00005000616	ENSLCRG00005000613	ENSLCRG00005000610	ENSLCRG00005000608	ENSLCRG00005000606	ENSLCRG00005000602	ENSLCRG00005000601	ENSLCRG00005000598	ENSLCRG00005000592	ENSLCRG00005000590	ENSLCRG00005016433	ENSLCRG00005016431	cabp5b (ENSLCRG00005016429)	ASPHD2 (ENSLCRG00005016427)	SEZ6L2 (ENSLCRG00005016145)	kctd13 (ENSLCRG00005016141) ##22	hirip3 (ENSLCRG00005016139)	xpo6 (ENSLCRG00005015877)	nme4 (ENSLCRG00005015872)	eps8l1a (ENSLCRG00005015867)	ENSLCRG00005015865	slc17a7a (ENSLCRG00005014571)	zgc:55558 (ENSLCRG00005014562)	pold1 (ENSLCRG00005014529)	gys1 (ENSLCRG00005014485)	aspdh (ENSLCRG00005014482)	tmem86b (ENSLCRG00005014480)	hspbp1 (ENSLCRG00005014479)	tufm (ENSLCRG00005014430)	ENSLCRG00005014427	ENSLCRG00005014423
Gilthead seabream	MODERN SPECIES	15	ENSSAUG00010017334	ENSSAUG00010017333	ENSSAUG00010017332	ENSSAUG00010017331	ENSSAUG00010017330	ENSSAUG00010017329	ENSSAUG00010017328	ENSSAUG00010017327	ENSSAUG00010017326	ENSSAUG00010017325	ENSSAUG00010017324	ENSSAUG00010017323	cabp5b (ENSSAUG00010017322)	ASPHD2 (ENSSAUG00010017321)	SEZ6L2 (ENSSAUG00010016065)	kctd13 (ENSSAUG00010016045) ##22	ENSSAUG00010016043	antkmt (ENSSAUG00010016042)	xpo6 (ENSSAUG00010014987)	nme4 (ENSSAUG00010014972)	eps8l1a (ENSSAUG00010014970)	ENSSAUG00010014966	slc17a7a (ENSSAUG00010013485)	zgc:55558 (ENSSAUG00010013455)	pold1 (ENSSAUG00010012637)	gys1 (ENSSAUG00010012554)	aspdh (ENSSAUG00010012547)	tmem86b (ENSSAUG00010012546)	hspbp1 (ENSSAUG00010012543)	tufm (ENSSAUG00010012317)	KCNJ18 (ENSSAUG00010012314)
Perciformes	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000163371.b	ENSGT00940000161491	ENSGT01020000230358.h.d.b.b.h.a.a	ENSGT01100000263485.a.a.b.a.a.a.b	ENSGT01100000263485.a.a.a.b.a.a.a	ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.b	ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.a.b.b.b.a.a.a	ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.a.a.b	ENSGT00940000163533	ENSGT01090000259993.D.b.d	ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.b	ENSGT01050000244936	ENSGT00940000160506.b	ENSGT00940000159252.b.b	ENSGT00940000160492	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00390000014062	ENSGT00390000014771.b.a	ENSGT00390000002810	ENSGT00940000160286	ENSGT00940000158125.b	ENSGT00940000163157.b	ENSGT00940000159110.a	ENSGT00940000155653.a	ENSGT00560000077365	ENSGT00390000018612.a.a	ENSGT00390000004452	ENSGT00390000007101.d.a	ENSGT00940000153909.a	ENSGT00940000156748	ENSGT01030000234586.A.a.a.b
Cottioidei	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000155025.B.j	ENSGT00940000156054.c.a	ENSGT00940000157282	ENSGT00940000159737.d	ENSGT00940000163334.d.t	ENSGT00440000038032	ENSGT00390000004681.a.b	ENSGT00390000014585	ENSGT00940000156518.B	ENSGT00900000141021.b.b.e	ENSGT00940000159327.u.a	ENSGT00940000163371.b	ENSGT00940000160506.b	ENSGT00940000159252.b.b	ENSGT00940000160492	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00390000014062	ENSGT00390000014771.b.a	ENSGT00390000002810	ENSGT00940000160286	ENSGT00940000158125.b	ENSGT00940000163157.b	ENSGT00940000159110.a	ENSGT00940000155653.a	ENSGT00560000077365	ENSGT00390000018612.a.a	ENSGT00390000004452	ENSGT00390000007101.d.a	ENSGT00940000153909.a	ENSGT00940000156748	ENSGT01030000234586.A.a.a.b
Lumpfish	MODERN SPECIES	23	ENSCLMG00005009813	ENSCLMG00005009812	ENSCLMG00005009811	ENSCLMG00005009805	ENSCLMG00005009804	ENSCLMG00005009803	ENSCLMG00005009802	ENSCLMG00005009801	ENSCLMG00005009800	ENSCLMG00005009799	ENSCLMG00005009798	ENSCLMG00005009797	cabp5b (ENSCLMG00005009796)	ENSCLMG00005009795	SEZ6L2 (ENSCLMG00005009794)	kctd13 (ENSCLMG00005009793) ##22	hirip3 (ENSCLMG00005009791)	antkmt (ENSCLMG00005009790)	xpo6 (ENSCLMG00005009027)	nme4 (ENSCLMG00005008278)	eps8l1a (ENSCLMG00005008273)	ENSCLMG00005008270	slc17a7a (ENSCLMG00005008266)	zgc:55558 (ENSCLMG00005008265)	pold1 (ENSCLMG00005007102)	gys1 (ENSCLMG00005007023)	aspdh (ENSCLMG00005007017)	tmem86b (ENSCLMG00005007016)	hspbp1 (ENSCLMG00005007013)	tufm (ENSCLMG00005006811)	ENSCLMG00005006803
Stickleback	MODERN SPECIES	10	ENSGACG00000012779	ENSGACG00000012781	ENSGACG00000012783	ENSGACG00000012790	ENSGACG00000012792	ENSGACG00000012794	ENSGACG00000012797	ENSGACG00000012799	ENSGACG00000012804	ENSGACG00000012806	ENSGACG00000012809	ENSGACG00000012812	ENSGACG00000012814	ENSGACG00000012818	SEZ6L2 (ENSGACG00000012825)	kctd13 (ENSGACG00000012838) ##22	hirip3 (ENSGACG00000012844)	antkmt (ENSGACG00000012848)	ENSGACG00000012850	ENSGACG00000012852	nme4 (ENSGACG00000012855)	eps8l1a (ENSGACG00000012872)	ENSGACG00000012881	slc17a7a (ENSGACG00000012885)	zgc:55558 (ENSGACG00000012896)	pold1 (ENSGACG00000012911)	gys1 (ENSGACG00000012936)	aspdh (ENSGACG00000012942)	tmem86b (ENSGACG00000012950)	hspbp1 (ENSGACG00000012953)	tufm (ENSGACG00000012961)
Perciformes_a	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00440000038032	ENSGT00390000004681.a.b	ENSGT00390000014585	ENSGT00940000156518.B	ENSGT00940000166693	ENSGT00940000159327.u.a	ENSGT00940000163371.b	ENSGT00940000161491	ENSGT01020000230358.h.d.b.b.h.a.a	ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.a.a.b	ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.b.o.a.b	ENSGT01050000244936	ENSGT00940000160506.b	ENSGT00940000159252.b.b	ENSGT00940000160492	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00390000014062	ENSGT00390000014771.b.a	ENSGT00390000002810	ENSGT00940000160286	ENSGT00940000158125.b	ENSGT00940000163157.b	ENSGT00940000159110.a	ENSGT00940000155653.a	ENSGT00560000077365	ENSGT00390000018612.a.a	ENSGT00390000004452	ENSGT00390000007101.d.a	ENSGT00940000153909.a	ENSGT00940000156748	ENSGT01030000234586.A.a.a.b
Channel bull blenny	MODERN SPECIES	22	ENSCGOG00000015111	ENSCGOG00000015112	ENSCGOG00000015114	ENSCGOG00000003857	ENSCGOG00000003862	ENSCGOG00000003870	ENSCGOG00000003873	ENSCGOG00000003880	ENSCGOG00000003882	ENSCGOG00000003885	ENSCGOG00000003890	ENSCGOG00000003895	cabp5b (ENSCGOG00000003900)	ASPHD2 (ENSCGOG00000003907)	SEZ6L2 (ENSCGOG00000003949)	kctd13 (ENSCGOG00000004979) ##22	hirip3 (ENSCGOG00000004989)	antkmt (ENSCGOG00000005036)	xpo6 (ENSCGOG00000005055)	nme4 (ENSCGOG00000005826)	eps8l1a (ENSCGOG00000005948)	ENSCGOG00000005955	slc17a7a (ENSCGOG00000005971)	zgc:55558 (ENSCGOG00000006221)	pold1 (ENSCGOG00000006275)	gys1 (ENSCGOG00000006655)	aspdh (ENSCGOG00000008781)	tmem86b (ENSCGOG00000008795)	hspbp1 (ENSCGOG00000008801)	tufm (ENSCGOG00000008932)	ENSCGOG00000009170
Pike perch	MODERN SPECIES	38	ENSSLUG00000010578	ENSSLUG00000010571	ENSSLUG00000010564	ENSSLUG00000010557	ENSSLUG00000010553	ENSSLUG00000010548	ENSSLUG00000010546	ENSSLUG00000010541	ENSSLUG00000010537	ENSSLUG00000010533	ENSSLUG00000010521	ENSSLUG00000010497	cabp5b (ENSSLUG00000010476)	ASPHD2 (ENSSLUG00000010461)	SEZ6L2 (ENSSLUG00000010334)	kctd13 (ENSSLUG00000010312) ##22	hirip3 (ENSSLUG00000010260)	antkmt (ENSSLUG00000010248)	xpo6 (ENSSLUG00000009383)	nme4 (ENSSLUG00000009337)	eps8l1a (ENSSLUG00000009333)	ENSSLUG00000009321	slc17a7a (ENSSLUG00000005346)	zgc:55558 (ENSSLUG00000004975)	pold1 (ENSSLUG00000004188)	gys1 (ENSSLUG00000004027)	aspdh (ENSSLUG00000003987)	tmem86b (ENSSLUG00000003983)	hspbp1 (ENSSLUG00000003980)	tufm (ENSSLUG00000003934)	KCNJ18 (ENSSLUG00000003921)
Ovalentaria	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b	ENSGT01100000263566.b.b.b.a	ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.b.b	ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.a	ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.b.a.b.b.a	ENSGT01100000263485.a.a.b.a.b.a.a.b.a.a.b	ENSGT01090000259993.D.b.d	ENSGT01020000230358.h.d.b.a.c.b	ENSGT01100000263566.b.b.c.a.a.b.d.b	ENSGT01100000263485.a.b.b.a.a	ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.d	ENSGT01090000259993.A.b.i.a.b.g.a	ENSGT00940000160506.b	ENSGT00940000159252.b.b	ENSGT00940000160492	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT01000000219961	ENSGT00390000014062	ENSGT00390000014771.b.a	ENSGT00390000002810	ENSGT00940000160286	ENSGT00940000158125.b	ENSGT00940000163157.b	ENSGT00940000159110.a	ENSGT00940000155653.a	ENSGT00560000077365	ENSGT00390000018612.a.a	ENSGT00390000004452	ENSGT00390000007101.d.a	ENSGT00940000153909.a	ENSGT00940000156748
Atherinomorphae	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.b.a.a.b	ENSGT01090000259993.A.b.j	ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.c.a	ENSGT01090000259993.A.b.i.a.a	ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a.e.b.a	ENSGT00940000163849.i.a.a.b	ENSGT01030000234536	ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a.e.b.b	ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.b.a.b	ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.a.b	ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.b.a.a.a	ENSGT00940000163847.b	ENSGT00940000160506.b	ENSGT00940000159252.b.b	ENSGT00940000160492	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT01000000219961	ENSGT00390000014062	ENSGT00390000014771.b.a	ENSGT00390000002810	ENSGT00940000160286	ENSGT00940000158125.b	ENSGT00940000163157.b	ENSGT00940000159110.a	ENSGT00940000155653.a	ENSGT00560000077365	ENSGT00390000018612.a.a	ENSGT00390000004452	ENSGT00390000007101.d.a	ENSGT00940000153909.a	ENSGT00940000156748
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Guppy	MODERN SPECIES	460	ENSPREG00000000654	ENSPREG00000000646	ENSPREG00000000632	ENSPREG00000000576	ENSPREG00000000562	ENSPREG00000000554	ENSPREG00000016814	ENSPREG00000016802	ENSPREG00000016798	ENSPREG00000016787	ENSPREG00000016780	cabp5b (ENSPREG00000016767)	ENSPREG00000016723	ASPHD2 (ENSPREG00000016698)	SEZ6L2 (ENSPREG00000016679)	kctd13 (ENSPREG00000016649) ##22	hirip3 (ENSPREG00000016543)	antkmt (ENSPREG00000016486)	xpo6 (ENSPREG00000016421)	nme4 (ENSPREG00000016410)	eps8l1a (ENSPREG00000016362)	ENSPREG00000016342	ENSPREG00000016301	b9d1 (ENSPREG00000016266)	EPN2 (ENSPREG00000016226)	grapa (ENSPREG00000016211)	ENSPREG00000016191	SPHK1 (ENSPREG00000016154)	ENSPREG00000016064	ENSPREG00000016045	CYGB (ENSPREG00000016035)
Platyfish	MODERN SPECIES	7	ENSXMAG00000022844	ENSXMAG00000024750	ENSXMAG00000026214	ENSXMAG00000028491	ENSXMAG00000024289	ENSXMAG00000025947	ENSXMAG00000025581	ENSXMAG00000025489	ENSXMAG00000021411	ENSXMAG00000027203	ENSXMAG00000026421	ENSXMAG00000011557	cabp5b (ENSXMAG00000011565)	ENSXMAG00000011567	SEZ6L2 (ENSXMAG00000011571)	kctd13 (ENSXMAG00000011606) ##22	hirip3 (ENSXMAG00000011617)	antkmt (ENSXMAG00000011622)	xpo6 (ENSXMAG00000011630)	nme4 (ENSXMAG00000011650)	eps8l1a (ENSXMAG00000011657)	ENSXMAG00000011663	slc17a7a (ENSXMAG00000011681)	zgc:55558 (ENSXMAG00000011691)	pold1 (ENSXMAG00000011702)	gys1 (ENSXMAG00000011787)	aspdh (ENSXMAG00000011818)	tmem86b (ENSXMAG00000027194)	hspbp1 (ENSXMAG00000011831)	tufm (ENSXMAG00000011848)	ENSXMAG00000019673
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Mummichog	MODERN SPECIES	2491												ENSFHEG00000021435	cabp5b (ENSFHEG00000021325)	ENSFHEG00000021279	SEZ6L2 (ENSFHEG00000000762)	kctd13 (ENSFHEG00000021259) ##22	hirip3 (ENSFHEG00000021223)	antkmt (ENSFHEG00000000523)	xpo6 (ENSFHEG00000021190)	nme4 (ENSFHEG00000021063)	eps8l1a (ENSFHEG00000021056)	ENSFHEG00000021008	slc17a7a (ENSFHEG00000020886)	zgc:55558 (ENSFHEG00000020836)	pold1 (ENSFHEG00000020825)	gys1 (ENSFHEG00000020804)	aspdh (ENSFHEG00000020744)	tmem86b (ENSFHEG00000020697)	hspbp1 (ENSFHEG00000020670)	tufm (ENSFHEG00000020646)	ENSFHEG00000020609
Oryzias	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000155025.B.j.a	ENSGT00940000155025.B.j.b	ENSGT00940000156054.c.a	ENSGT00940000157282	ENSGT00940000159737.d	ENSGT00440000038032	ENSGT00390000014585	ENSGT00940000156518.B	ENSGT00940000166693	ENSGT00940000159327.u.a	ENSGT00940000163160.b.a.a.i.b	ENSGT00940000163160.b.a.a.i.a.a.a	ENSGT00940000160506.b	ENSGT00940000159252.b.b	ENSGT00940000160492	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT01000000219961	ENSGT00390000014062	ENSGT00390000014771.b.a	ENSGT00390000002810	ENSGT00940000160286	ENSGT00940000158125.b	ENSGT00940000163157.b	ENSGT00940000159110.a	ENSGT00940000155653.a	ENSGT00560000077365	ENSGT00390000018612.a.a	ENSGT00390000004452	ENSGT00390000007101.d.a	ENSGT00940000153909.a	ENSGT00940000156748
Oryzias_b	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000155025.B.j.a	ENSGT00940000155025.B.j.b	ENSGT00940000156054.c.a	ENSGT00940000157282	ENSGT00940000159737.d	ENSGT00440000038032	ENSGT00390000014585	ENSGT00940000156518.B	ENSGT00940000166693	ENSGT00940000159327.u.a	ENSGT00940000163160.b.a.a.i.b	ENSGT00940000163160.b.a.a.i.a.a.a	ENSGT00940000160506.b	ENSGT00940000159252.b.b	ENSGT00940000160492	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT01000000219961	ENSGT00390000014062	ENSGT00390000014771.b.a	ENSGT00390000002810	ENSGT00940000160286	ENSGT00940000158125.b	ENSGT00940000163157.b	ENSGT00940000159110.a	ENSGT00940000155653.a	ENSGT00560000077365	ENSGT00390000018612.a.a	ENSGT00390000004452	ENSGT00390000007101.d.a	ENSGT00940000153909.a	ENSGT00940000156748
Indian medaka	MODERN SPECIES	9	ENSOMEG00000015736	ENSOMEG00000015751	sgsm3 (ENSOMEG00000015879)	ELFN2 (ENSOMEG00000015970)	gtf2f1 (ENSOMEG00000016050)	alkbh7 (ENSOMEG00000016001)	ENSOMEG00000016074	CACNA1A (ENSOMEG00000016125)	ENSOMEG00000016144	NACC1 (ENSOMEG00000016184)	ENSOMEG00000016207	ENSOMEG00000016221	cabp5b (ENSOMEG00000016249)	ENSOMEG00000016280	SEZ6L2 (ENSOMEG00000016338)	kctd13 (ENSOMEG00000016366) ##22	hirip3 (ENSOMEG00000016398)	antkmt (ENSOMEG00000016419)	xpo6 (ENSOMEG00000016505)	eps8l1a (ENSOMEG00000016537)	nme4 (ENSOMEG00000016556)	ENSOMEG00000016616	slc17a7a (ENSOMEG00000016669)	zgc:55558 (ENSOMEG00000016685)	pold1 (ENSOMEG00000016731)	gys1 (ENSOMEG00000016807)	aspdh (ENSOMEG00000016841)	hspbp1 (ENSOMEG00000016890)	tufm (ENSOMEG00000016958)	ENSOMEG00000016976	ENSOMEG00000000425
Javanese ricefish	MODERN SPECIES	22	gtpbp1 (ENSOJAG00000013434)	sgsm3 (ENSOJAG00000013390)	ELFN2 (ENSOJAG00000013371)	gtf2f1 (ENSOJAG00000013318)	alkbh7 (ENSOJAG00000013314)	CACNA1A (ENSOJAG00000010675)	ENSOJAG00000010549	NACC1 (ENSOJAG00000010514)	ENSOJAG00000010499	ENSOJAG00000010489	ENSOJAG00000010467	ENSOJAG00000010460	cabp5b (ENSOJAG00000010449)	ASPHD2 (ENSOJAG00000010439)	SEZ6L2 (ENSOJAG00000009383)	kctd13 (ENSOJAG00000009232) ##22	ENSOJAG00000009210	ENSOJAG00000009172	antkmt (ENSOJAG00000009154)	xpo6 (ENSOJAG00000008945)	nme4 (ENSOJAG00000008914)	eps8l1a (ENSOJAG00000008902)	ENSOJAG00000008488	slc17a7a (ENSOJAG00000007627)	zgc:55558 (ENSOJAG00000007499)	gys1 (ENSOJAG00000007074)	aspdh (ENSOJAG00000006993)	tmem86b (ENSOJAG00000006978)	hspbp1 (ENSOJAG00000006954)	tufm (ENSOJAG00000006746)	ENSOJAG00000006716
Oryzias_a	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000155025.B.j.a	ENSGT00940000155025.B.j.b.a.a	ENSGT00940000156054.c.a	ENSGT00940000157282	ENSGT00940000159737.d	ENSGT00440000038032	ENSGT00390000014585	ENSGT00940000156518.B	ENSGT00940000166693	ENSGT00940000159327.u.a	ENSGT00940000163160.b.a.a.i.b	ENSGT00940000163160.b.a.a.i.a.a.a	ENSGT00940000160506.b	ENSGT00940000159252.b.b	ENSGT00940000160492	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00390000014062	ENSGT00390000014771.b.a	ENSGT00390000002810	ENSGT00940000160286	ENSGT00940000158125.b	ENSGT00940000163157.b	ENSGT00940000159110.a	ENSGT00940000155653.a	ENSGT00560000077365	ENSGT00390000018612.a.a	ENSGT00390000004452	ENSGT00390000007101.d.a	ENSGT00940000153909.a	ENSGT00940000156748	ENSGT01030000234586.A.a.a.b
Chinese medaka	MODERN SPECIES	989	ENSOSIG00000010526	ENSOSIG00000010524	gtpbp1 (ENSOSIG00000009847)	sgsm3 (ENSOSIG00000009831)	ELFN2 (ENSOSIG00000009816)	gtf2f1 (ENSOSIG00000009814)	alkbh7 (ENSOSIG00000009812)	CACNA1A (ENSOSIG00000007618)	ENSOSIG00000007562	NACC1 (ENSOSIG00000007560)	ENSOSIG00000007558	ENSOSIG00000007555	cabp5b (ENSOSIG00000007553)	ENSOSIG00000007552	SEZ6L2 (ENSOSIG00000005509)	kctd13 (ENSOSIG00000005493) ##22	ENSOSIG00000005491	antkmt (ENSOSIG00000005488)	xpo6 (ENSOSIG00000005417)	nme4 (ENSOSIG00000005409)	eps8l1a (ENSOSIG00000005406)	ENSOSIG00000005401	slc17a7a (ENSOSIG00000005226)	zgc:55558 (ENSOSIG00000005221)	pold1 (ENSOSIG00000005194)	gys1 (ENSOSIG00000005081)	aspdh (ENSOSIG00000005069)	tmem86b (ENSOSIG00000005067)	KCNJ12 (ENSOSIG00000020976)	ENSOSIG00000020974	dhrs7b (ENSOSIG00000020973)
Japanese Medaka HdrR	MODERN SPECIES	22	ENSORLG00000022630	sgsm3 (ENSORLG00000010788)	gtpbp1 (ENSORLG00000010742)	ELFN2 (ENSORLG00000010805)	gtf2f1 (ENSORLG00000018776)	alkbh7 (ENSORLG00000018765)	CACNA1A (ENSORLG00000011019)	ENSORLG00000011036	NACC1 (ENSORLG00000011048)	ENSORLG00000024991	ENSORLG00000029191	ENSORLG00000026595	ENSORLG00000011058	ENSORLG00000011076	SEZ6L2 (ENSORLG00000011147)	kctd13 (ENSORLG00000011184) ##22	hirip3 (ENSORLG00000011191)	antkmt (ENSORLG00000026042)	xpo6 (ENSORLG00000011231)	nme4 (ENSORLG00000011239)	eps8l1a (ENSORLG00000011245)	ENSORLG00000011253	slc17a7a (ENSORLG00000011296)	zgc:55558 (ENSORLG00000024443)	pold1 (ENSORLG00000011359)	gys1 (ENSORLG00000011434)	aspdh (ENSORLG00000011451)	tmem86b (ENSORLG00000011461)	hspbp1 (ENSORLG00000011480)	tufm (ENSORLG00000011497)	ENSORLG00000011503
Ovalentaria_B	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT01100000263485.a.b.b.a.a	ENSGT01020000230358.h.d.b.b.h.a.a.l	ENSGT01090000259993.A.b.i.a.b.h	ENSGT01090000259993.A.b.i.a.b.g.b	ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.d	ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.a.b	ENSGT00940000163847.b	ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.b.a.a.b	ENSGT01100000263566.b.b.b.a	ENSGT01090000259993.A.b.i.a.b.g.a	ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a.e.b.b	ENSGT00940000160506.b	ENSGT00940000159252.b.b	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00390000014062	ENSGT00390000014771.b.a	ENSGT00390000002810	ENSGT00940000160286	ENSGT00940000158125.b	ENSGT00940000163157.b	ENSGT00940000159110.a	ENSGT00940000155653.a	ENSGT00560000077365	ENSGT00390000018612.a.a	ENSGT00390000004452	ENSGT00390000007101.d.a	ENSGT00940000153909.a	ENSGT00940000156748	ENSGT01030000234586.A.a.a.b
Pomacentridae	ANCESTRAL SPECIES	47									ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.a.b.b.c	ENSGT00940000163849.i.a.a.b.e.a	ENSGT01090000259993.B.c.b.b.e.b.b	ENSGT00940000160506.b	ENSGT00940000159252.b.b	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00390000014062	ENSGT00390000014771.b.a	ENSGT00390000002810	ENSGT00940000160286	ENSGT00940000158125.b	ENSGT00940000163157.b	ENSGT00940000159110.a	ENSGT00940000155653.a	ENSGT00560000077365	ENSGT00390000018612.a.a	ENSGT00390000004452	ENSGT00390000007101.d.a	ENSGT00940000153909.a	ENSGT00940000156748	ENSGT01030000234586.A.a.a.b
Pomacentridae_A	ANCESTRAL SPECIES	54												ENSGT00940000160506.b	ENSGT00940000159252.b.b	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00390000014062	ENSGT00390000014771.b.a	ENSGT00390000002810	ENSGT00940000160286	ENSGT00940000158125.b	ENSGT00940000163157.b	ENSGT00940000159110.a	ENSGT00940000155653.a	ENSGT00560000077365	ENSGT00390000018612.a.a	ENSGT00390000004452	ENSGT00390000007101.d.a	ENSGT00940000153909.a	ENSGT00940000156748	ENSGT01030000234586.A.a.a.b
Amphiprion	ANCESTRAL SPECIES	69											ENSGT00940000160560.b.f.a.b.b	ENSGT00940000160506.b	ENSGT00940000159252.b.b	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00390000014062	ENSGT00390000014771.b.a	ENSGT00390000002810	ENSGT00940000160286	ENSGT00940000158125.b	ENSGT00940000163157.b	ENSGT00940000159110.a	ENSGT00950000182857.a.b.eb	ENSGT00940000155653.a	ENSGT00560000077365	ENSGT00390000018612.a.a	ENSGT00390000004452.i	ENSGT00390000007101.d.a.u	ENSGT00940000153909.a	ENSGT00940000156748
Clown anemonefish	MODERN SPECIES	1813										ENSAOCG00000018234	ENSAOCG00000001305	cabp5b (ENSAOCG00000018327)	ENSAOCG00000018350	ENSAOCG00000018363	SEZ6L2 (ENSAOCG00000018390)	kctd13 (ENSAOCG00000018424) ##22	hirip3 (ENSAOCG00000018436)	antkmt (ENSAOCG00000018443)	xpo6 (ENSAOCG00000001326)	nme4 (ENSAOCG00000018585)	eps8l1a (ENSAOCG00000018647)	ENSAOCG00000018706	slc17a7a (ENSAOCG00000018768)
Orange clownfish	MODERN SPECIES	5	ENSAPEG00000016717	ENSAPEG00000016713	ENSAPEG00000016702	ENSAPEG00000016690	ENSAPEG00000016684	ENSAPEG00000016671	ENSAPEG00000016659	ENSAPEG00000016630	ENSAPEG00000016624	ENSAPEG00000016609	ENSAPEG00000016545	ENSAPEG00000016510	ENSAPEG00000016503	ENSAPEG00000016500	ENSAPEG00000016474	kctd13 (ENSAPEG00000016435) ##22	ENSAPEG00000016420	hirip3 (ENSAPEG00000016413)	antkmt (ENSAPEG00000016405)	xpo6 (ENSAPEG00000016304)	nme4 (ENSAPEG00000016293)	eps8l1a (ENSAPEG00000016249)	ENSAPEG00000016187	slc17a7a (ENSAPEG00000016129)	ENSAPEG00000016022	zgc:55558 (ENSAPEG00000016011)	pold1 (ENSAPEG00000015926)	gys1 (ENSAPEG00000015845)	aspdh (ENSAPEG00000015804)	tmem86b (ENSAPEG00000015800)	hspbp1 (ENSAPEG00000015794)
Spiny chromis	MODERN SPECIES	778													cabp5b (ENSAPOG00000012573)	ENSAPOG00000012612	SEZ6L2 (ENSAPOG00000012635)	kctd13 (ENSAPOG00000012649) ##22	ENSAPOG00000012680	antkmt (ENSAPOG00000012725)	xpo6 (ENSAPOG00000012873)	nme4 (ENSAPOG00000012893)	eps8l1a (ENSAPOG00000012953)	ENSAPOG00000013028	slc17a7a (ENSAPOG00000013098)	zgc:55558 (ENSAPOG00000013106)	pold1 (ENSAPOG00000013225)	gys1 (ENSAPOG00000013295)	aspdh (ENSAPOG00000013320)	tmem86b (ENSAPOG00000000364)	hspbp1 (ENSAPOG00000013358)	tufm (ENSAPOG00000013385)	ENSAPOG00000013391
Bicolor damselfish	MODERN SPECIES	279					ENSSPAG00000009150	ENSSPAG00000009170	ENSSPAG00000009183	ENSSPAG00000009187	ENSSPAG00000009199	ENSSPAG00000009210	ENSSPAG00000009240	ENSSPAG00000009258	cabp5b (ENSSPAG00000009272)	ENSSPAG00000009284	SEZ6L2 (ENSSPAG00000009300)	kctd13 (ENSSPAG00000009375) ##22	antkmt (ENSSPAG00000009411)	xpo6 (ENSSPAG00000009469)	nme4 (ENSSPAG00000009575)	eps8l1a (ENSSPAG00000009589)	ENSSPAG00000009612	slc17a7a (ENSSPAG00000009662)	zgc:55558 (ENSSPAG00000009689)	pold1 (ENSSPAG00000009720)	gys1 (ENSSPAG00000009815)	aspdh (ENSSPAG00000009868)	hspbp1 (ENSSPAG00000009901)	tmem86b (ENSSPAG00000009925)	tufm (ENSSPAG00000009936)	ENSSPAG00000009981	natd1 (ENSSPAG00000009988)
Cichlidae	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.b.a.a.a	ENSGT01090000259993.B.c.b.b.e.b.b	ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.d.b.a.b	ENSGT01100000263485.a.b.b.a.a	ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.d.b.b.a.a	ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.a.b	ENSGT00940000163847.b	ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.b.a.a.b	ENSGT01100000263566.b.b.b.a	ENSGT01090000259993.A.b.i.a.b.g.a	ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a.e.b.b	ENSGT00940000160506.b	ENSGT00940000159252.b.b	ENSGT00940000161676	ENSGT00940000160492	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00390000014062	ENSGT00390000014771.b.a	ENSGT00390000002810	ENSGT00940000160286	ENSGT00940000158125.b	ENSGT00940000163157.b	ENSGT00940000159110.a	ENSGT00940000155653.a	ENSGT00560000077365	ENSGT00390000018612.a.a	ENSGT00390000004452	ENSGT00390000007101.d.a	ENSGT00940000153909.a	ENSGT00940000156748	ENSGT01030000234586.A.a.a.b
Midas cichlid	MODERN SPECIES	1292				ENSACIG00000008329	ENSACIG00000008320	ENSACIG00000008309	ENSACIG00000008297	ENSACIG00000008293	ENSACIG00000008283	ENSACIG00000008281	ENSACIG00000008258	ENSACIG00000008253	cabp5b (ENSACIG00000008234)	ENSACIG00000008225	ENSACIG00000008168	kctd13 (ENSACIG00000008145) ##22	ENSACIG00000008117	antkmt (ENSACIG00000008101)	xpo6 (ENSACIG00000008055)	nme4 (ENSACIG00000008012)	eps8l1a (ENSACIG00000007977)	ENSACIG00000007954	slc17a7a (ENSACIG00000007925)	zgc:55558 (ENSACIG00000007608)	pold1 (ENSACIG00000007546)	gys1 (ENSACIG00000007513)	aspdh (ENSACIG00000007446)	tmem86b (ENSACIG00000007432)	hspbp1 (ENSACIG00000007409)	tufm (ENSACIG00000007388)	KCNJ18 (ENSACIG00000007381)
Pseudocrenilabrinae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT01100000263485.a.a.b.a.a.a.a.b	ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.b.a.b.b.b	ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.b.l	ENSGT01100000263485.a.a.b.a.b.b.b.a	ENSGT01100000263485.a.a.b.a.b.b.b.b	ENSGT01090000259993.A.b.i.b	ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.b.a.a.a	ENSGT01090000259993.B.c.b.b.e.a.e.a	ENSGT00940000163847.b	ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.b.a.a.b.a.a	ENSGT01100000263566.b.b.b.a	ENSGT01090000259993.A.b.i.a.b.g.a.a.a	ENSGT00940000160506.b	ENSGT00940000159252.b.b	ENSGT00940000160492	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00390000014062.f	ENSGT00390000014771.b.a	ENSGT00390000002810	ENSGT00940000160286	ENSGT00940000158125.b	ENSGT00940000163157.b	ENSGT00940000159110.a	ENSGT00940000155653.a	ENSGT00560000077365	ENSGT00390000018612.a.a	ENSGT00390000004452	ENSGT00390000007101.d.a	ENSGT00940000153909.a	ENSGT00940000156748	ENSGT01030000234586.A.a.a.b
Pseudocrenilabrinae_A	ANCESTRAL SPECIES	36	ENSGT01090000259993.B.c.b.b.e.b.b	ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.p.a.a.a.a.b	ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.a	ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.b.a.b.b.a	ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.a.a.b	ENSGT01090000259993.B.d	ENSGT01100000263485.a.a.b.a.a.a.a.b	ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.b.a.b.b.b	ENSGT01100000263485.a.a.b.a.b.b.b.a	ENSGT01100000263485.a.a.b.a.b.b.b.b	ENSGT01100000263485.a.a.b.a.b.a.a.a	ENSGT01090000259993.A.b.i.a.b.g.a.a.a	ENSGT00940000160506.b	ENSGT00980000198701	ENSGT00940000160492	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00390000014062.f	ENSGT00390000014771.b.a	ENSGT00390000002810	ENSGT00940000160286	ENSGT00940000158125.b	ENSGT00940000163157.b	ENSGT00940000159110.a	ENSGT00940000155653.a	ENSGT00560000077365	ENSGT00390000018612.a.a	ENSGT00390000004452	ENSGT00390000007101.d.a	ENSGT00940000153909.a	ENSGT00940000156748	ENSGT01030000234586.A.a.a.b
Haplochromini	ANCESTRAL SPECIES	37	ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.d.b.b.a.b.a.b.a.b	ENSGT01090000259993.A.b.i.a.a.g.b.a	ENSGT01100000263485.a.a.b.a.a.a.a.b	ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.b.a.b.b.b	ENSGT01100000263485.a.a.b.a.b.b.b.a	ENSGT01100000263485.a.a.b.a.b.b.b.b	ENSGT01100000263485.a.a.b.a.b.a.a.a	ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.d.b.b.a.a.b.b.b	ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.d.b.b.a.b.a.a.a.b.b.b.a	ENSGT01090000259993.A.b.i.a.b.g.a.a.b	ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.d.b.b.a.b.a.b.a.a.a	ENSGT01090000259993.A.b.i.a.b.g.a.a.a	ENSGT00940000160506.b	ENSGT00980000198701	ENSGT00940000160492	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00390000014062.f	ENSGT00390000014771.b.a	ENSGT00390000002810	ENSGT00940000160286	ENSGT00940000158125.b	ENSGT00940000163157.b	ENSGT00940000159110.a	ENSGT00940000155653.a	ENSGT00560000077365	ENSGT00390000018612.a.a	ENSGT00390000004452	ENSGT00390000007101.d.a	ENSGT00940000153909.a	ENSGT00940000156748	ENSGT01030000234586.A.a.a.b
Burton s mouthbrooder	MODERN SPECIES	715	ENSHBUG00000019805	ENSHBUG00000019797	ENSHBUG00000000590	ENSHBUG00000019763	ENSHBUG00000019746	ENSHBUG00000019738	ENSHBUG00000019732	ENSHBUG00000019722	ENSHBUG00000019697	ENSHBUG00000019681	ENSHBUG00000019659	ENSHBUG00000019650	cabp5b (ENSHBUG00000019637)	ENSHBUG00000019602	SEZ6L2 (ENSHBUG00000019566)	kctd13 (ENSHBUG00000000817) ##22	antkmt (ENSHBUG00000019536)	xpo6 (ENSHBUG00000019504)	nme4 (ENSHBUG00000019333)	eps8l1a (ENSHBUG00000019318)	ENSHBUG00000019292	pold1 (ENSHBUG00000019230)	slc17a7a (ENSHBUG00000019189)	zgc:55558 (ENSHBUG00000019131)	gys1 (ENSHBUG00000019127)	aspdh (ENSHBUG00000019092)	tmem86b (ENSHBUG00000019080)	hspbp1 (ENSHBUG00000019058)	tufm (ENSHBUG00000019031)	ENSHBUG00000018991	natd1 (ENSHBUG00000018987)
Haplochromini_A	ANCESTRAL SPECIES	37								ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.d.b.b.b.b.a	ENSGT01090000259993.B.c.b.b.e.a.e.a	ENSGT00940000163533	ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.d.b.b.a.b.a.b.a.a.a.a	ENSGT01090000259993.A.b.i.a.b.g.a.a.a	ENSGT00940000160506.b	ENSGT00980000198701	ENSGT00940000160492	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00390000014062.f	ENSGT00390000014771.b.a	ENSGT00390000002810	ENSGT00940000160286	ENSGT00940000158125.b	ENSGT00940000163157.b	ENSGT00940000159110.a	ENSGT00940000155653.a	ENSGT00560000077365	ENSGT00390000018612.a.a	ENSGT00390000004452	ENSGT00390000007101.d.a	ENSGT00940000153909.a	ENSGT00940000156748	ENSGT01030000234586.A.a.a.b
P. nyererei	MODERN SPECIES	718					ENSPNYG00000007966	ENSPNYG00000007985	ENSPNYG00000007991	ENSPNYG00000008003	ENSPNYG00000008020	ENSPNYG00000008036	ENSPNYG00000008057	ENSPNYG00000008072	cabp5b (ENSPNYG00000008084)	ENSPNYG00000008103	SEZ6L2 (ENSPNYG00000008134)	kctd13 (ENSPNYG00000008177) ##22	hirip3 (ENSPNYG00000008223)	antkmt (ENSPNYG00000008325)	xpo6 (ENSPNYG00000008375)	nme4 (ENSPNYG00000008479)	eps8l1a (ENSPNYG00000008512)	ENSPNYG00000008577	slc17a7a (ENSPNYG00000008610)	zgc:55558 (ENSPNYG00000008645)	pold1 (ENSPNYG00000008683)	gys1 (ENSPNYG00000008755)	aspdh (ENSPNYG00000008818)	tmem86b (ENSPNYG00000008876)	hspbp1 (ENSPNYG00000008841)	tufm (ENSPNYG00000008905)	KCNJ18 (ENSPNYG00000008920)
Haplochromini_B	ANCESTRAL SPECIES	41	ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.b.l.b	ENSGT01090000259993.C.a	ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.a.a.b.a	ENSGT01090000259993.B.d	ENSGT01100000263485.a.a.b.a.b.b.b.a	ENSGT01100000263485.a.a.b.a.b.b.b.b	ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.d.b.b.a.b.a.a.b.b	ENSGT01100000263485.a.a.b.a.b.a.a.a	ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.d.b.b.a.a.b.b.b	ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.d.b.a.a.b.b	ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.d.b.b.a.b.a.b.a.b	ENSGT01090000259993.A.b.i.a.a.g.b.a	ENSGT00940000160506.b	ENSGT00980000198701	ENSGT00940000160492	ENSGT00950000183143.c.b ##22	ENSGT00390000014062.f	ENSGT00390000014771.b.a	ENSGT00390000002810	ENSGT00940000160286	ENSGT00940000158125.b	ENSGT00940000163157.b	ENSGT00940000159110.a	ENSGT00940000155653.a	ENSGT00560000077365	ENSGT00390000018612.a.a	ENSGT00390000004452	ENSGT00390000007101.d.a	ENSGT00940000153909.a	ENSGT00940000156748	ENSGT01030000234586.A.a.a.b
Zebra mbuna	MODERN SPECIES	1107	ENSMZEG00005010388	ENSMZEG00005010396	ENSMZEG00005010406	ENSMZEG00005010414	ENSMZEG00005010431	ENSMZEG00005010439	ENSMZEG00005010452	ENSMZEG00005010467	ENSMZEG00005010473	ENSMZEG00005010484	ENSMZEG00005010489	ENSMZEG00005010498	cabp5b (ENSMZEG00005010511)	ENSMZEG00005010528	SEZ6L2 (ENSMZEG00005010543)	kctd13 (ENSMZEG00005010567) ##22	ENSMZEG00005010582	antkmt (ENSMZEG00005010591)	xpo6 (ENSMZEG00005010620)	nme4 (ENSMZEG00005010670)	eps8l1a (ENSMZEG00005010685)	ENSMZEG00005010704	slc17a7a (ENSMZEG00005010741)	zgc:55558 (ENSMZEG00005010805)	pold1 (ENSMZEG00005010775)	gys1 (ENSMZEG00005010817)	aspdh (ENSMZEG00005010838)	tmem86b (ENSMZEG00005010853)	hspbp1 (ENSMZEG00005010848)	tufm (ENSMZEG00005010857)	KCNJ18 (ENSMZEG00005010861)
Eastern happy	MODERN SPECIES	16	ENSACLG00000006541	ENSACLG00000006551	ENSACLG00000006556	ENSACLG00000006561	ENSACLG00000006565	ENSACLG00000006577	ENSACLG00000006591	ENSACLG00000006598	ENSACLG00000006609	ENSACLG00000006617	ENSACLG00000006620	ENSACLG00000006624	cabp5b (ENSACLG00000006627)	ENSACLG00000006639	SEZ6L2 (ENSACLG00000006653)	kctd13 (ENSACLG00000006668) ##22	ENSACLG00000006680	antkmt (ENSACLG00000006692)	xpo6 (ENSACLG00000007048)	nme4 (ENSACLG00000007095)	eps8l1a (ENSACLG00000007101)	ENSACLG00000007117	slc17a7a (ENSACLG00000007163)	zgc:55558 (ENSACLG00000007314)	pold1 (ENSACLG00000007207)	gys1 (ENSACLG00000007332)	aspdh (ENSACLG00000007365)	tmem86b (ENSACLG00000007370)	hspbp1 (ENSACLG00000007380)	tufm (ENSACLG00000007403)	ENSACLG00000007411
Lyretail cichlid	MODERN SPECIES	563	ENSNBRG00000007871	ENSNBRG00000007859	ENSNBRG00000007848	ENSNBRG00000007822	ENSNBRG00000007804	ENSNBRG00000007801	ENSNBRG00000007791	ENSNBRG00000007779	ENSNBRG00000007760	ENSNBRG00000007745	ENSNBRG00000007722	ENSNBRG00000007707	cabp5b (ENSNBRG00000007668)	ENSNBRG00000007640	SEZ6L2 (ENSNBRG00000007585)	kctd13 (ENSNBRG00000007556) ##22	hirip3 (ENSNBRG00000007429)	antkmt (ENSNBRG00000007354)	xpo6 (ENSNBRG00000007275)	nme4 (ENSNBRG00000007255)	eps8l1a (ENSNBRG00000007164)	ENSNBRG00000007124	slc17a7a (ENSNBRG00000007081)	zgc:55558 (ENSNBRG00000006780)	pold1 (ENSNBRG00000006694)	gys1 (ENSNBRG00000006629)	ENSNBRG00000006611	aspdh (ENSNBRG00000006605)	tmem86b (ENSNBRG00000006573)	hspbp1 (ENSNBRG00000006545)	tufm (ENSNBRG00000006466)
Nile tilapia	DUPLICATION
Nile tilapia	DUPLICATION
Nile tilapia	DUPLICATION
Nile tilapia	DUPLICATION
Nile tilapia	MODERN SPECIES	149																kctd13 (ENSONIG00000036590) ##22
Nile tilapia	MODERN SPECIES	16	b9d1 (ENSONIG00000015756)	EPN2 (ENSONIG00000015758)	grapa (ENSONIG00000015760)	ENSONIG00000030128	SPHK1 (ENSONIG00000027390)	ENSONIG00000019447	ENSONIG00000035861	cygb1 (ENSONIG00000038093)	PRPSAP1 (ENSONIG00000039326)	rasd4 (ENSONIG00000032392)	ENSONIG00000031423	MGAT5B (ENSONIG00000019444)	ENSONIG00000031513	sec14l1 (ENSONIG00000019441)	nptx1l (ENSONIG00000019439)	kctd13 (ENSONIG00000034303) ##22	pecam1a (ENSONIG00000019437)	PPP1R27 (ENSONIG00000019436)	mcrip1 (ENSONIG00000031724)	alyref (ENSONIG00000019434)	ARHGDIA (ENSONIG00000036385)	cdr2l (ENSONIG00000019431)	RECQL5 (ENSONIG00000019427)	ENSONIG00000019425	xylt2 (ENSONIG00000019421)	ENSONIG00000019418	NHERF1 (ENSONIG00000019417)	atp2a1 (ENSONIG00000019415)	rabep2 (ENSONIG00000019414)	ENSONIG00000019412	nudt9 (ENSONIG00000019410)
Nile tilapia	DUPLICATION
Nile tilapia	MODERN SPECIES	134															kctd13 (ENSONIG00000034068) ##22	kctd13 (ENSONIG00000029300) ##22	ENSONIG00000038964
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Tiger tail seahorse	MODERN SPECIES	373	gtf2f1 (ENSHCOG00000005324)	alkbh7 (ENSHCOG00000005305)	CACNA1A (ENSHCOG00000005284)	NACC1 (ENSHCOG00000005198)	ENSHCOG00000005170	ENSHCOG00000005155	ENSHCOG00000005133	ENSHCOG00000005130	ENSHCOG00000005127	ENSHCOG00000005116	ENSHCOG00000005109	ENSHCOG00000005097	cabp5b (ENSHCOG00000005091)	ENSHCOG00000005078	SEZ6L2 (ENSHCOG00000005057)	kctd13 (ENSHCOG00000005019) ##22	hirip3 (ENSHCOG00000005013)	antkmt (ENSHCOG00000005008)	xpo6 (ENSHCOG00000004987)	nme4 (ENSHCOG00000004895)	eps8l1a (ENSHCOG00000004881)	ENSHCOG00000004828	slc17a7a (ENSHCOG00000004787)	zgc:55558 (ENSHCOG00000004774)	ENSHCOG00000004753	TOP3A (ENSHCOG00000004737)	smcr8a (ENSHCOG00000004709)	bud31 (ENSHCOG00000004703)	pdap1b (ENSHCOG00000004693)	shmt1 (ENSHCOG00000004683)	shmt1 (ENSHCOG00000004644)
Pinecone sodierfish	MODERN SPECIES	22	ENSMMDG00005005628	prl (ENSMMDG00005005630)	ENSMMDG00005005633	ENSMMDG00005005640	ENSMMDG00005005749	pih1d1 (ENSMMDG00005009877)	tnnt1 (ENSMMDG00005009881)	syt5a (ENSMMDG00005009885)	fthl31 (ENSMMDG00005009892)	aldh16a1 (ENSMMDG00005009914)	ENSMMDG00005009940	ENSMMDG00005009946	cabp5b (ENSMMDG00005009948)	ENSMMDG00005009950	SEZ6L2 (ENSMMDG00005009954)	kctd13 (ENSMMDG00005009962) ##22	hirip3 (ENSMMDG00005009968)	antkmt (ENSMMDG00005009971)	xpo6 (ENSMMDG00005009995)	nme4 (ENSMMDG00005010758)	eps8l1a (ENSMMDG00005010816)	ENSMMDG00005010854	slc17a7a (ENSMMDG00005010859)	zgc:55558 (ENSMMDG00005010862)	pold1 (ENSMMDG00005010865)	gys1 (ENSMMDG00005010887)	aspdh (ENSMMDG00005011110)	tmem86b (ENSMMDG00005011114)	hspbp1 (ENSMMDG00005011117)	tufm (ENSMMDG00005011123)	KCNJ18 (ENSMMDG00005011153)
Cod	MODERN SPECIES	11	NT5C3B (ENSGMOG00000000085)	KLHL11 (ENSGMOG00000000084)	ACLY (ENSGMOG00000000077)	ENSGMOG00000036389	odad4 (ENSGMOG00000000068)	dnajc7 (ENSGMOG00000000061)	nkiras2 (ENSGMOG00000036484)	ENSGMOG00000029425	ENSGMOG00000036189	alkbh7 (ENSGMOG00000003247)	ENSGMOG00000007660	ENSGMOG00000007685	ENSGMOG00000014239	ENSGMOG00000036868	ENSGMOG00000014267	ENSGMOG00000014310 ##22	hirip3 (ENSGMOG00000027084)	antkmt (ENSGMOG00000028047)	ENSGMOG00000022702	nme4 (ENSGMOG00000014375)	eps8l1a (ENSGMOG00000014384)	ENSGMOG00000014409	slc17a7a (ENSGMOG00000014431)	zgc:55558 (ENSGMOG00000014457)	pold1 (ENSGMOG00000014471)	gys1 (ENSGMOG00000014524)	aspdh (ENSGMOG00000010931)	tmem86b (ENSGMOG00000014559)	ENSGMOG00000013105	ENSGMOG00000023969	ENSGMOG00000027297
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Salmoninae	DUPLICATION
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Salmo	ANCESTRAL SPECIES	64		ENSGT00940000166981.e.a	ENSGT00940000160609.f.e	ENSGT00940000164511.C.k.b.b	ENSGT00950000182818.A.o.a	ENSGT00940000162682.B.b	ENSGT00940000157917.a.a.b.b	ENSGT00530000064085.d.b	ENSGT00390000008812.b.b.b.b	ENSGT00530000063301.a.a.c.b.a.b	ENSGT00940000158951.f.c	ENSGT00940000165079.b.b	ENSGT00940000163377.a.b.b.a.b	ENSGT00940000159252.b.b.b	ENSGT00940000160492.f	ENSGT00950000183143.c.b.m ##22	ENSGT00390000002810.l	ENSGT00550000074873.ob.a.a.b.b	ENSGT01030000234629.E.a.b.c	ENSGT00940000153496.a.a.r.a	ENSGT00390000007652.c	ENSGT00390000003337.f.b	ENSGT00390000006617.f	ENSGT01030000234586.A.a.a.b.h	ENSGT00940000180096.a	ENSGT00940000154700.f	ENSGT00950000182838.A.a.a.k.b	ENSGT00940000167194.b	ENSGT00940000160972.a	ENSGT00940000158268.b.a	ENSGT00440000037417.B.a.e.a
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Huchen	MODERN SPECIES	2800																kctd13 (ENSHHUG00000009290) ##22	hirip3 (ENSHHUG00000009240)	antkmt (ENSHHUG00000009221)	xpo6 (ENSHHUG00000008616)	ENSHHUG00000008599
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Atlantic salmon	MODERN SPECIES	22	ENSSSAG00000001259	ENSSSAG00000098477	GRXCR1 (ENSSSAG00000001276)	ENSSSAG00000109586	ENSSSAG00000100623	shisa3 (ENSSSAG00000001285)	BEND4 (ENSSSAG00000001295)	ENSSSAG00000110525	ENSSSAG00000001311	sfxn5b (ENSSSAG00000001324)	ENSSSAG00000001355	ENSSSAG00000100128	ENSSSAG00000001416	ENSSSAG00000001424	sez6l2 (ENSSSAG00000001491)	ENSSSAG00000001746 ##22	hirip3 (ENSSSAG00000001751)	fam173a (ENSSSAG00000001756)	ENSSSAG00000001798	nme4 (ENSSSAG00000002048)	ccdc137 (ENSSSAG00000002067)	ENSSSAG00000117067	ENSSSAG00000002078	ENSSSAG00000002099	ENSSSAG00000002113	ENSSSAG00000035106	ENSSSAG00000102967	spsb3a (ENSSSAG00000002130)	ENSSSAG00000100412	ENSSSAG00000096951	mrps34 (ENSSSAG00000002136)
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	33					ENSGT00940000159219.b.c	ENSGT00940000157110.y.b	ENSGT00940000161360.a.b	ENSGT00390000014963.f	ENSGT00940000158783.a.b.o	ENSGT01030000234641.a.a.a.d	ENSGT00510000047420.i	ENSGT00940000160491.d.b.d	ENSGT00940000164396	ENSGT00940000159252.b.b.a	ENSGT00940000160492.e	ENSGT00950000183143.c.b.n ##22	ENSGT00390000014062	ENSGT00390000014771.b.a	ENSGT00390000002810.k	ENSGT00940000160286.hb	ENSGT00390000004169	ENSGT00950000182961.a.a.d	ENSGT00390000012605	ENSGT00390000006009.a.a.b.d	ENSGT00550000074873.ob.a.a.b.a	ENSGT01030000234629.E.a.b.d	ENSGT00390000008964	ENSGT00940000161283	ENSGT00940000153496.a.a.q	ENSGT00390000007652.d	ENSGT00390000003337.f.a
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	49			ENSGT00940000161833.b.b	ENSGT00390000008346.e	ENSGT00940000159219.b.c	ENSGT00940000157110.y.b	ENSGT00940000161360.a.b	ENSGT00390000014963.f	ENSGT00940000158783.a.b.o	ENSGT01030000234641.a.a.a.d	ENSGT00510000047420.i	ENSGT00940000160491.d.b.d	ENSGT00940000164396	ENSGT00940000159252.b.b.a	ENSGT00940000160492.e	ENSGT00950000183143.c.b.n ##22	ENSGT00390000014062	ENSGT00390000014771.b.a	ENSGT00390000002810.k	ENSGT00940000160286.hb	ENSGT00390000004169	ENSGT00950000182961.a.a.d	ENSGT00390000012605	ENSGT00390000006009.a.a.b.d	ENSGT00550000074873.ob.a.a.b.a	ENSGT01030000234629.E.a.b.d	ENSGT00390000008964	ENSGT00940000161283	ENSGT00940000153496.a.a.q	ENSGT00390000007652.d	ENSGT00390000003337.f.a
Chinook salmon	DUPLICATION
Chinook salmon	MODERN SPECIES	33	SAP30L (ENSOTSG00005033695)	HAND1 (ENSOTSG00005033696)	COPS6 (ENSOTSG00005033701)	ENSOTSG00005033719	ENSOTSG00005033722	NKX3-2 (ENSOTSG00005033723)	slc30a9 (ENSOTSG00005033724)	GRXCR1 (ENSOTSG00005033726)	ENSOTSG00005033727	sfxn5b (ENSOTSG00005033729)	smyd5 (ENSOTSG00005033743)	ENSOTSG00005033788	pitpnbl (ENSOTSG00005033790)	ASPHD2 (ENSOTSG00005033795)	SEZ6L2 (ENSOTSG00005033807)	kctd13 (ENSOTSG00005033865) ##22	hirip3 (ENSOTSG00005033866)	antkmt (ENSOTSG00005033867)	xpo6 (ENSOTSG00005033869)	nme4 (ENSOTSG00005034244)	ccdc137 (ENSOTSG00005034247)	GPRC5C (ENSOTSG00005034251)	amdhd2 (ENSOTSG00005034259)	nog2 (ENSOTSG00005034294)	ATP6V0C (ENSOTSG00005034295)	spsb3a (ENSOTSG00005030605)	mrps34 (ENSOTSG00005030606)	nme3 (ENSOTSG00005030608)	mapk8ip3 (ENSOTSG00005030621)	jpt2 (ENSOTSG00005031524)	CRAMP1 (ENSOTSG00005031526)
Chinook salmon	MODERN SPECIES	2924	slc6a11a (ENSOTSG00005028061)	PMP22 (ENSOTSG00005028062)	ENSOTSG00005028064	CDC42EP4 (ENSOTSG00005028065)	SDK2 (ENSOTSG00005028068)	ENSOTSG00005028130	shisa3 (ENSOTSG00005028131)	BEND4 (ENSOTSG00005028132)	ENSOTSG00005028134	sfxn5b (ENSOTSG00005028135)	smyd5 (ENSOTSG00005028146)	ENSOTSG00005028212	pitpnbl (ENSOTSG00005028214)	ASPHD2 (ENSOTSG00005028215)	SEZ6L2 (ENSOTSG00005028219)	kctd13 (ENSOTSG00005028222) ##22	hirip3 (ENSOTSG00005028224)	antkmt (ENSOTSG00005028225)	xpo6 (ENSOTSG00005028226)	nme4 (ENSOTSG00005029591)	ccdc137 (ENSOTSG00005029593)	GPRC5C (ENSOTSG00005029595)	amdhd2 (ENSOTSG00005029597)	nog2 (ENSOTSG00005029626)	ATP6V0C (ENSOTSG00005029627)	spsb3a (ENSOTSG00005029635)	mrps34 (ENSOTSG00005029636)	nme3 (ENSOTSG00005029637)	mapk8ip3 (ENSOTSG00005029643)	jpt2 (ENSOTSG00005029954)	CRAMP1 (ENSOTSG00005029955)
Coho salmon	MODERN SPECIES	26	COPS6 (ENSOKIG00005010315)	ENSOKIG00005010392	NKX3-2 (ENSOKIG00005010403)	RAB28 (ENSOKIG00005010411)	slc30a9 (ENSOKIG00005010432)	GRXCR1 (ENSOKIG00005010443)	ATP8A1 (ENSOKIG00005010468)	shisa3 (ENSOKIG00005010635)	ENSOKIG00005010639	ENSOKIG00005010657	sfxn5b (ENSOKIG00005010700)	ENSOKIG00005010883	pitpnbl (ENSOKIG00005010893)	ENSOKIG00005010924	SEZ6L2 (ENSOKIG00005010980)	kctd13 (ENSOKIG00005011221) ##22	ENSOKIG00005011231	hirip3 (ENSOKIG00005011236)	antkmt (ENSOKIG00005011245)	xpo6 (ENSOKIG00005011283)	nme4 (ENSOKIG00005012349)	ccdc137 (ENSOKIG00005012364)	GPRC5C (ENSOKIG00005012368)	amdhd2 (ENSOKIG00005012381)	ENSOKIG00005026218	ATP6V0C (ENSOKIG00005026233)	ENSOKIG00005026273	spsb3a (ENSOKIG00005026283)	mrps34 (ENSOKIG00005026293)	nme3 (ENSOKIG00005026313)	mapk8ip3 (ENSOKIG00005026395)
Rainbow trout	MODERN SPECIES	3	ENSOMYG00000011460	ENSOMYG00000077732	ENSOMYG00000011742	shisa3 (ENSOMYG00000017881)	ENSOMYG00000017891	ENSOMYG00000017937	sfxn5b (ENSOMYG00000017959)	ENSOMYG00000018007	ENSOMYG00000063958	ENSOMYG00000018110	ENSOMYG00000018127	ENSOMYG00000018153	ENSOMYG00000069055	ENSOMYG00000018203	ENSOMYG00000052203	ENSOMYG00000018839 ##22	hirip3 (ENSOMYG00000018846)	antkmt (ENSOMYG00000018851)	ENSOMYG00000018956	nme4 (ENSOMYG00000019542)	ENSOMYG00000019548	ENSOMYG00000019555	ENSOMYG00000019633	ENSOMYG00000019676	ENSOMYG00000019687	spsb3a (ENSOMYG00000019705)	mrps34 (ENSOMYG00000019712)	nme3 (ENSOMYG00000019726)	mapk8ip3 (ENSOMYG00000019947)	jpt2 (ENSOMYG00000023087)	ENSOMYG00000023101
Huchen	MODERN SPECIES	765									ENSHHUG00000019983	sfxn5b (ENSHHUG00000019978)	smyd5 (ENSHHUG00000019941)	ENSHHUG00000019836	pitpnbl (ENSHHUG00000019706)	ENSHHUG00000019693	ENSHHUG00000019544	kctd13 (ENSHHUG00000019537) ##22
Northern pike	MODERN SPECIES	10	spsb3a (ENSELUG00000009455)	ATP6V0C (ENSELUG00000009437)	ENSELUG00000022963	ENSELUG00000033910	nog2 (ENSELUG00000009426)	amdhd2 (ENSELUG00000009397)	ENSELUG00000025997	CAPN15 (ENSELUG00000009318)	GPRC5C (ENSELUG00000009299)	ccdc137 (ENSELUG00000009272)	ENSELUG00000009242	nme4 (ENSELUG00000029985)	xpo6 (ENSELUG00000009159)	antkmt (ENSELUG00000009029)	ENSELUG00000009004	kctd13 (ENSELUG00000008989) ##22	ENSELUG00000008967	ENSELUG00000025165	pitpnbl (ENSELUG00000008928)	cabp5b (ENSELUG00000008887)	ENSELUG00000033545	ENSELUG00000008722	cdipt (ENSELUG00000024256)	ENSELUG00000024246	nlk1 (ENSELUG00000024221)	TLCD3B (ENSELUG00000024181)	mvp (ENSELUG00000024149)	ENSELUG00000024031	ENSELUG00000027254	ENSELUG00000024006	ENSELUG00000023980
Reedfish	MODERN SPECIES	3	ENSECRG00000015872	ENSECRG00000014912	ENSECRG00000021954	ENSECRG00000021969	ENSECRG00000021984	ENSECRG00000021991	ENSECRG00000022001	sgf29 (ENSECRG00000022009)	ENSECRG00000022017	DOC2A (ENSECRG00000022027)	ENSECRG00000022037	adprh (ENSECRG00000022045)	sult1st1 (ENSECRG00000022056)	ENSECRG00000022074	SEZ6L2 (ENSECRG00000022085)	kctd13 (ENSECRG00000022105) ##22	nlk1 (ENSECRG00000022124)	ENSECRG00000022151	HIRIP3 (ENSECRG00000022192)	ENSECRG00000022203	cdipt (ENSECRG00000022211)	ENSECRG00000022223	MAZ (ENSECRG00000022228)	kif22 (ENSECRG00000022240)	PAGR1 (ENSECRG00000022252)	ENSECRG00000022257	ENSECRG00000022265	ENSECRG00000022279	ENSECRG00000022307	ENSECRG00000022336	ENSECRG00000022364