Vertebrata DUPLICATION Vertebrata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183176.a #22 Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183176.a #22 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 234 ENSGT00700000104550.a ENSGT00940000158764 ENSGT00940000155581.A ENSGT00950000182863.A.a.b ENSGT00950000183176.a #22 ENSGT00940000159472 #25 ENSGT00390000001562 #26 ENSGT00390000000546 ENSGT00940000154663 ENSGT00940000157601 ENSGT00390000001804 ENSGT00940000154258.a ENSGT00950000182981.a ENSGT01100000263518.A.a.a.a ENSGT01080000257410.C ENSGT00940000160139 Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 268 ENSGT01060000248530.C ENSGT01040000240511.R ENSGT00940000158764 ENSGT00940000155581.A ENSGT00950000182863.A.a.b ENSGT00950000183176.a #22 ENSGT00950000183131.a #23 ENSGT00940000159472 #25 ENSGT00390000001562 #26 ENSGT00390000000546 ENSGT00940000154663 ENSGT00940000157601 ENSGT00390000001804 ENSGT00940000154258.a ENSGT00950000182981.a Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 56 ENSGT00390000018330 ENSGT00940000160950 ENSGT00940000163461.b ENSGT00940000160318 ENSGT00390000013764 ENSGT00940000156358 ENSGT00950000182982.B ENSGT00940000161648 ENSGT00390000013867 ENSGT00950000183202.a.a ENSGT01040000241001 ENSGT00940000158986 ENSGT00700000104550.a ENSGT00940000158764 ENSGT00950000182863.A.a.b ENSGT00950000183176.a #22 ENSGT01070000255540 ENSGT00950000183131.a #23 ENSGT00940000159472 #25 ENSGT00390000001562 #26 ENSGT00390000000546 ENSGT00940000154663 ENSGT00940000157601 ENSGT00390000001804 ENSGT00940000154258.a ENSGT00950000182981.a ENSGT00940000157014 ENSGT00390000011067.A ENSGT00940000158853 ENSGT00390000014941 ENSGT00530000063829.C Amniota ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000159233 ENSGT00390000018330 ENSGT00940000160950 ENSGT00390000013764 ENSGT00940000156358 ENSGT00950000182982.B ENSGT00940000161648 ENSGT00390000013867 ENSGT00950000183202.a.a ENSGT01040000241001 ENSGT00940000158986 ENSGT00700000104550.a ENSGT00940000158764 ENSGT00950000182863.A.a.b ENSGT00950000183176.a #22 ENSGT00940000162922 ENSGT00950000183131.a #23 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19 ENSGT00940000158764 ENSGT00950000182863.A.a.b ENSGT00950000183176.a #22 ENSGT00940000162922 ENSGT00950000183131.a #23 ENSGT00940000159472 #25 ENSGT00390000001562 #26 ENSGT00390000000546 ENSGT00940000154663 ENSGT00940000157601 ENSGT00390000001804 ENSGT00940000154258.a ENSGT00950000182981.a ENSGT00940000157014 ENSGT00390000011067.A ENSGT00940000158853 ENSGT00390000014941 ENSGT00530000063829.C Eutheria ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000163617 ENSGT00940000155225 ENSGT01100000263546.e.a.a.b ENSGT01100000263546.e.b ENSGT01100000263546.e.a.b ENSGT01100000263546.e.a.a.a.b ENSGT01100000263546.d.b.a.b ENSGT00510000049750 ENSGT01100000263546.d.b.a.a.a.b ENSGT01100000263546.d.b.a.a.a.a ENSGT01100000263546.d.b.b ENSGT01100000263546.e.a.a.a.a ENSGT00940000164301 ENSGT00940000160361 ENSGT00950000182863.A.a.b ENSGT00950000183176.a #22 ENSGT00950000183131.a #23 ENSGT00390000013020 #24 ENSGT00940000162922 ENSGT00940000159472 #25 ENSGT00390000001562 #26 ENSGT00390000000546 ENSGT00940000154663 ENSGT00940000157601 ENSGT00390000001804 ENSGT00940000154258.a ENSGT00950000182981.a ENSGT00940000157014 ENSGT00390000011067.A ENSGT00940000158853 ENSGT00390000014941 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000155225 ENSGT01100000263546.e.a.a.b ENSGT01100000263546.e.b ENSGT01100000263546.e.a.b ENSGT01100000263546.e.a.a.a.b ENSGT01010000222653 ENSGT01100000263546.d.b.a.b ENSGT00510000049750 ENSGT01100000263546.d.b.a.a.a.b ENSGT01100000263546.d.b.a.a.a.a ENSGT01100000263546.d.b.b ENSGT01100000263546.e.a.a.a.a ENSGT00940000164301 ENSGT00940000160361 ENSGT00950000182863.A.a.b ENSGT00950000183176.a #22 ENSGT00950000183131.a #23 ENSGT00390000013020 #24 ENSGT00940000162922 ENSGT00940000159472 #25 ENSGT00390000001562 #26 ENSGT00390000000546 ENSGT00940000154663 ENSGT00940000157601 ENSGT00390000001804 ENSGT00940000154258.a ENSGT00950000182981.a ENSGT00940000157014 ENSGT00390000011067.A ENSGT00940000158853 ENSGT00390000014941 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000155225 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ENSGT00940000162922 ENSGT00940000159472 #25 ENSGT00390000001562 #26 ENSGT00390000000546 ENSGT00940000154663 ENSGT00940000157601 ENSGT00390000001804 ENSGT00940000154258.a ENSGT00950000182981.a ENSGT00940000157014 ENSGT00390000011067.A ENSGT00940000158853 ENSGT00390000014941 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00940000156928 ENSGT00490000043329.a.a.a ENSGT00930000151259 ENSGT00940000155225 ENSGT01100000263546.e.a.a.b ENSGT01100000263546.e.b ENSGT01100000263546.e.a.b ENSGT01100000263546.e.a.a.a.b ENSGT00510000049750 ENSGT01100000263546.d.b.a.a.a.b ENSGT01100000263546.d.b.a.a.a.a ENSGT01100000263546.d.b.b ENSGT00940000167211 ENSGT00940000160361 ENSGT00950000182863.A.a.b ENSGT00950000183176.a #22 ENSGT00940000162922 ENSGT00950000183131.a #23 ENSGT00390000013020 #24 ENSGT00940000159472 #25 ENSGT00390000001562 #26 ENSGT00390000000546 ENSGT00940000157601 ENSGT00390000001804 ENSGT00940000154258.a ENSGT00950000182981.a ENSGT00940000157014 ENSGT00390000011067.A ENSGT00390000014941 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MODERN SPECIES 149 ENSJJAG00000021569 ENSJJAG00000000449 Commd7 (ENSJJAG00000010654) ENSJJAG00000000621 Mapre1 (ENSJJAG00000018249) Sun5 (ENSJJAG00000021388) Bpifb2 (ENSJJAG00000017859) ENSJJAG00000019744 Bpifb4 (ENSJJAG00000019678) Bpifa3 (ENSJJAG00000012935) ENSJJAG00000022519 Bpifb1 (ENSJJAG00000023259) Bpifb5 (ENSJJAG00000016027) ENSJJAG00000016210 Snta1 (ENSJJAG00000020267) Cbfa2t2 (ENSJJAG00000012293) #22 Necab3 (ENSJJAG00000020960) #23 1700003F12Rik (ENSJJAG00000010475) #24 E2f1 (ENSJJAG00000022378) #25 Pxmp4 (ENSJJAG00000016829) #26 Zfp341 (ENSJJAG00000020905) Chmp4b (ENSJJAG00000013547) Raly (ENSJJAG00000008473) Eif2s2 (ENSJJAG00000014081) ENSJJAG00000001144 a (ENSJJAG00000018926) ENSJJAG00000022935 Itch (ENSJJAG00000000211) ENSJJAG00000005483 Map1lc3a (ENSJJAG00000010977) Pigu (ENSJJAG00000021314) Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000156928 ENSGT00490000043329.a.a.a ENSGT00940000163617 ENSGT00940000155225 ENSGT01100000263546.e.a.a.b ENSGT01100000263546.e.b 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ENSGT00940000162922 ENSGT00940000159472 #25 ENSGT00390000001562 #26 ENSGT00390000000546 ENSGT00940000154663 ENSGT00940000157601 ENSGT00390000001804 ENSGT00940000154258.a ENSGT00950000182981.a ENSGT00940000157014 ENSGT00390000011067.A ENSGT00940000158853 ENSGT00390000014941 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000157729 ENSGT00390000012419 ENSGT00940000156928 ENSGT00490000043329.a.a.a ENSGT00940000163617 ENSGT00940000155225 ENSGT01100000263546.e.a.a.b ENSGT01100000263546.e.b ENSGT01100000263546.e.a.b ENSGT01100000263546.e.a.a.a.b ENSGT01100000263546.d.b.a.b ENSGT01100000263546.d.b.a.a.a.a ENSGT01100000263546.d.b.b ENSGT00940000160361 ENSGT00950000182863.A.a.b ENSGT00950000183176.a #22 ENSGT00950000183131.a #23 ENSGT00390000013020 #24 ENSGT00940000162922 ENSGT00940000159472 #25 ENSGT00390000001562 #26 ENSGT00390000000546 ENSGT00940000154663 ENSGT00940000157601 ENSGT00390000001804 ENSGT00940000154258.a ENSGT00950000182981.a ENSGT00940000157014 ENSGT00390000011067.A ENSGT00940000158853 ENSGT00390000014941 Mouse lemur DUPLICATION Mouse lemur MODERN SPECIES 9 NOL4L (ENSMICG00000006651) COMMD7 (ENSMICG00000006672) DNMT3B (ENSMICG00000006679) MAPRE1 (ENSMICG00000047719) EFCAB8 (ENSMICG00000036641) SUN5 (ENSMICG00000001971) BPIFB2 (ENSMICG00000001979) BPIFB6 (ENSMICG00000001984) BPIFB3 (ENSMICG00000001990) BPIFB4 (ENSMICG00000026403) BPIFA2 (ENSMICG00000013403) BPIFA1 (ENSMICG00000004348) BPIFB1 (ENSMICG00000004357) CDK5RAP1 (ENSMICG00000004382) SNTA1 (ENSMICG00000004936) ENSMICG00000006895 #22 NECAB3 (ENSMICG00000006906) #23 E2F1 (ENSMICG00000006921) #25 ENSMICG00000028174 #26 ZNF341 (ENSMICG00000047832) ENSMICG00000042802 RALY (ENSMICG00000039074) ENSMICG00000006944 ASIP (ENSMICG00000044506) AHCY (ENSMICG00000003232) ENSMICG00000032740 ENSMICG00000034345 ITCH (ENSMICG00000003238) DYNLRB1 (ENSMICG00000003253) MAP1LC3A (ENSMICG00000028466) PIGU (ENSMICG00000003257) Mouse lemur MODERN SPECIES 4 OLFM4 (ENSMICG00000001798) ENSMICG00000028372 PCDH17 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ENSCCAG00000018006 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 89 DNMT3B (ENSSBOG00000030711) MAPRE1 (ENSSBOG00000026959) EFCAB8 (ENSSBOG00000035195) SUN5 (ENSSBOG00000036230) BPIFB2 (ENSSBOG00000023467) BPIFB6 (ENSSBOG00000015194) BPIFB3 (ENSSBOG00000035285) BPIFB4 (ENSSBOG00000034867) BPIFA2 (ENSSBOG00000031635) ENSSBOG00000035555 BPIFA3 (ENSSBOG00000031059) BPIFA1 (ENSSBOG00000033533) BPIFB1 (ENSSBOG00000023508) CDK5RAP1 (ENSSBOG00000034885) SNTA1 (ENSSBOG00000020201) CBFA2T2 (ENSSBOG00000029834) #22 C20orf144 (ENSSBOG00000026299) #24 ACTL10 (ENSSBOG00000004671) NECAB3 (ENSSBOG00000036045) #23 E2F1 (ENSSBOG00000028962) #25 PXMP4 (ENSSBOG00000005223) #26 ZNF341 (ENSSBOG00000026329) CHMP4B (ENSSBOG00000030524) RALY (ENSSBOG00000001418) ENSSBOG00000020845 ENSSBOG00000035159 AHCY (ENSSBOG00000018930) ITCH (ENSSBOG00000028570) ENSSBOG00000034562 MAP1LC3A (ENSSBOG00000027529) ENSSBOG00000036011 Marmoset MODERN SPECIES 17 ENSCJAG00000015601 EFCAB8 (ENSCJAG00000083357) SUN5 (ENSCJAG00000018611) 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Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155225 ENSGT01100000263546.e.a.a.b ENSGT01100000263546.e.b ENSGT01100000263546.e.a.b ENSGT01100000263546.e.a.a.a.b ENSGT01010000222653 ENSGT01100000263546.d.b.a.b ENSGT01100000263545.a.b.d.a ENSGT01100000263546.d.b.a.a.a.b ENSGT01100000263546.d.b.a.a.a.a ENSGT01100000263546.d.b.b ENSGT01100000263546.e.a.a.a.a ENSGT00940000164301 ENSGT00940000160361 ENSGT00950000182863.A.a.b ENSGT00950000183176.a #22 ENSGT00950000183131.a #23 ENSGT00390000013020 #24 ENSGT00940000162922 ENSGT00940000159472 #25 ENSGT00390000001562 #26 ENSGT00390000000546 ENSGT00940000154663 ENSGT00940000157601 ENSGT00390000001804 ENSGT00940000154258.a ENSGT00950000182981.a ENSGT00940000157014 ENSGT00390000011067.A ENSGT00940000158853 ENSGT00390000014941 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163617 ENSGT00940000155225 ENSGT01100000263546.e.a.a.b ENSGT01100000263546.e.b ENSGT01100000263546.e.a.b ENSGT01100000263546.e.a.a.a.b ENSGT01010000222653 ENSGT01100000263546.d.b.a.b 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ENSGT00390000000546 ENSGT00940000154663 ENSGT00940000157601 ENSGT00390000001804 ENSGT00940000154258.a ENSGT00950000182981.a ENSGT00940000157014 ENSGT00390000011067.A ENSGT00940000158853 ENSGT00390000014941 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000157729 ENSGT00390000012419 ENSGT00940000156928 ENSGT00490000043329.a.a.a.pb ENSGT00940000155225 ENSGT01100000263546.e.a.a.b ENSGT01100000263546.e.b ENSGT01100000263546.e.a.b ENSGT01100000263546.e.a.a.a.b ENSGT01100000263546.d.b.a.b ENSGT01100000263546.d.b.a.a.a.b ENSGT01100000263546.d.b.a.a.a.a ENSGT01100000263546.d.b.b ENSGT00940000160361 ENSGT00950000182863.A.a.b ENSGT00950000183176.a #22 ENSGT00390000013020 #24 ENSGT00940000162922 ENSGT00950000183131.a #23 ENSGT00940000159472 #25 ENSGT00390000001562 #26 ENSGT00390000000546 ENSGT00940000154663 ENSGT00940000157601 ENSGT00390000001804 ENSGT00940000154258.a ENSGT00950000182981.a ENSGT00940000157014 ENSGT00390000011067.A ENSGT00940000158853 ENSGT00390000014941 Microbat MODERN SPECIES 997 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(ENSPVAG00000010292) CHMP4B (ENSPVAG00000010293) Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000155225 ENSGT01100000263546.e.a.a.b ENSGT01100000263546.e.b ENSGT01100000263546.e.a.b ENSGT01100000263546.e.a.a.a.b ENSGT01010000222653 ENSGT01100000263546.d.b.a.b ENSGT00510000049750 ENSGT01100000263546.d.b.a.a.a.b ENSGT01100000263546.d.b.a.a.a.a ENSGT01100000263546.d.b.b ENSGT01100000263546.e.a.a.a.a ENSGT00940000164301 ENSGT00940000160361 ENSGT00950000182863.A.a.b ENSGT00950000183176.a #22 ENSGT00950000183131.a #23 ENSGT00390000013020 #24 ENSGT00940000162922 ENSGT00940000159472 #25 ENSGT00390000001562 #26 ENSGT00390000000546 ENSGT00940000154663 ENSGT00940000157601 ENSGT00390000001804 ENSGT00940000154258.a ENSGT00950000182981.a ENSGT00940000157014 ENSGT00390000011067.A ENSGT00940000158853 ENSGT00390000014941 Suina ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00490000043329.a.a.a.pb ENSGT00930000151259 ENSGT00940000155225 ENSGT01100000263546.e.a.a.b ENSGT01100000263546.e.b ENSGT01100000263546.e.a.b 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ENSGT00390000011067.A ENSGT00940000158853 ENSGT00390000014941 Camelidae ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000155225 ENSGT01100000263546.e.a.a.b ENSGT01100000263546.e.b ENSGT01100000263546.e.a.b ENSGT01100000263546.e.a.a.a.b ENSGT01100000263546.d.b.a.b ENSGT00510000049750 ENSGT01100000263546.d.b.a.a.a.b ENSGT01100000263546.d.b.a.a.a.a ENSGT01100000263546.d.b.b ENSGT01100000263546.e.a.a.a.a ENSGT00940000167211 ENSGT00940000167979 ENSGT00940000160361 ENSGT00950000182863.A.a.b ENSGT00950000183176.a #22 ENSGT00950000183131.a #23 ENSGT00390000013020 #24 ENSGT00940000162922 ENSGT00940000159472 #25 ENSGT00390000001562 #26 ENSGT00390000000546 ENSGT00940000154663 ENSGT00940000157601.h ENSGT00390000001804 ENSGT00940000154258.a ENSGT00950000182981.a ENSGT00940000157014 ENSGT00390000011067.A ENSGT00940000158853 ENSGT00390000014941 Arabian camel MODERN SPECIES 10 DNMT3B (ENSCDRG00005017779) MAPRE1 (ENSCDRG00005019775) EFCAB8 (ENSCDRG00005019793) SUN5 (ENSCDRG00005008823) BPIFB2 (ENSCDRG00005009158) 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(ENSBBBG00000004443) RALY (ENSBBBG00000004441) EIF2S2 (ENSBBBG00000004436) ASIP (ENSBBBG00000018031) AHCY (ENSBBBG00000018017) ENSBBBG00000007314 ENSBBBG00000008776 DYNLRB1 (ENSBBBG00000017935) Yarkand deer MODERN SPECIES 15 BPIFB2 (ENSCHYG00000018354) BPIFB6 (ENSCHYG00000018569) BPIFB3 (ENSCHYG00000018802) BPIFB4 (ENSCHYG00000018989) ENSCHYG00000019160 ENSCHYG00000019207 ENSCHYG00000019281 ENSCHYG00000019367 BPIFA3 (ENSCHYG00000019399) BPIFA1 (ENSCHYG00000019488) BPIFB1 (ENSCHYG00000019627) CDK5RAP1 (ENSCHYG00000019777) ENSCHYG00000020289 ENSCHYG00000020441 SNTA1 (ENSCHYG00000020536) CBFA2T2 (ENSCHYG00000020600) #22 ENSCHYG00000020718 NECAB3 (ENSCHYG00000020779) #23 ENSCHYG00000021007 #24 ACTL10 (ENSCHYG00000021085) E2F1 (ENSCHYG00000021119) #25 PXMP4 (ENSCHYG00000021195) #26 ZNF341 (ENSCHYG00000021267) CHMP4B (ENSCHYG00000021413) RALY (ENSCHYG00000021487) EIF2S2 (ENSCHYG00000021669) ASIP (ENSCHYG00000021759) ENSCHYG00000021816 ITCH (ENSCHYG00000021902) DYNLRB1 (ENSCHYG00000022408) MAP1LC3A (ENSCHYG00000022485) Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183176.a.s.b #22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183176.a.s.b #22 Bovidae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000160091 ENSGT00940000156487 ENSGT00940000160820 ENSGT00390000002319 ENSGT00940000153304.B ENSGT00940000156982 ENSGT00390000004660.C.a.b ENSGT00940000158220 ENSGT00940000156774 ENSGT00390000018691 ENSGT00940000159673 ENSGT00530000063876.b ENSGT00940000156540 ENSGT00940000159098 ENSGT00730000111179.b ENSGT00950000183176.a.s.b #22 ENSGT01030000234620.a.b.a ENSGT00390000006996 ENSGT00940000158836 ENSGT00940000154656 ENSGT00940000156116.C ENSGT00390000012924.b ENSGT00940000154746 ENSGT00390000019941 ENSGT00940000159887 ENSGT00940000157501 ENSGT00940000154813 ENSGT00390000012412 ENSGT00940000156521.b ENSGT00940000158908 ENSGT00390000011163.b Bovinae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000156487 ENSGT00940000160820 ENSGT00390000002319 ENSGT00940000153304.B ENSGT00940000156982 ENSGT00940000153339.b.b ENSGT00390000004660.C.a.b ENSGT00940000158220 ENSGT00940000156774 ENSGT00390000018691 ENSGT00940000159673 ENSGT00530000063876.b ENSGT00940000156540 ENSGT00940000159098 ENSGT00730000111179.b ENSGT00950000183176.a.s.b #22 ENSGT01030000234620.a.b.a ENSGT00390000006996 ENSGT00940000158836 ENSGT00940000154656 ENSGT00940000156116.C ENSGT00390000012924.b ENSGT00940000154746 ENSGT00390000019941 ENSGT00940000159887 ENSGT00940000157501 ENSGT00940000154813 ENSGT00390000012412 ENSGT00940000156521.b ENSGT00940000158908 ENSGT00390000011163.b Bos ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000156487 ENSGT00940000160820 ENSGT00390000002319 ENSGT00940000153304.B ENSGT00940000156982 ENSGT00940000153339.b.b ENSGT00390000004660.C.a.b ENSGT00940000158220 ENSGT00940000156774 ENSGT00390000018691 ENSGT00940000159673 ENSGT00530000063876.b ENSGT00940000156540 ENSGT00940000159098 ENSGT00730000111179.b ENSGT00950000183176.a.s.b #22 ENSGT01030000234620.a.b.a ENSGT00390000006996 ENSGT00940000158836 ENSGT00940000174775 ENSGT00940000154656 ENSGT00940000156116.C ENSGT00390000012924.b ENSGT00940000154746 ENSGT00390000019941 ENSGT00940000159887 ENSGT00940000157501 ENSGT00940000154813 ENSGT00390000012412 ENSGT00940000156521.b ENSGT00940000158908 Bos_b ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000160091 ENSGT00940000156487 ENSGT00940000160820 ENSGT00390000002319 ENSGT00940000153304.B ENSGT00940000156982 ENSGT00390000004660.C.a.b ENSGT00940000158220 ENSGT00940000156774 ENSGT00390000018691 ENSGT00940000159673 ENSGT00530000063876.b ENSGT00940000156540 ENSGT00940000159098 ENSGT00730000111179.b ENSGT00950000183176.a.s.b #22 ENSGT01030000234620.a.b.a ENSGT00390000006996 ENSGT00940000158836 ENSGT00940000174775 ENSGT00940000154656 ENSGT00940000156116.C ENSGT00390000012924.b ENSGT00940000154746 ENSGT00390000019941 ENSGT00940000159887 ENSGT00940000157501 ENSGT00940000154813 ENSGT00390000012412 ENSGT00940000156521.b ENSGT00940000158908 Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 1 SIX4 (ENSBIXG00005009512) MNAT1 (ENSBIXG00005005464) 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ENSGT00940000160091 ENSGT00940000156487 ENSGT00940000160820 ENSGT00390000002319 ENSGT00940000153304.B ENSGT00940000156982 ENSGT00390000004660.C.a.b ENSGT00940000158220 ENSGT00940000156774 ENSGT00390000018691 ENSGT00940000159673 ENSGT00530000063876.b ENSGT00940000156540 ENSGT00940000159098 ENSGT00730000111179.b ENSGT00950000183176.a.s.b #22 ENSGT01030000234620.a.b.a ENSGT00390000006996 ENSGT00940000158836 ENSGT00940000154656 ENSGT00940000156116.C ENSGT00390000012924.b ENSGT00940000154746 ENSGT00390000019941 ENSGT00940000159887 ENSGT00940000157501 ENSGT00940000154813 ENSGT00390000012412 ENSGT00940000156521.b ENSGT00940000158908 ENSGT00390000011163.b Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 23 ENSOARG00020010525 TRMT5 (ENSOARG00020010606) SLC38A6 (ENSOARG00020010682) TMEM30B (ENSOARG00020010869) PRKCH (ENSOARG00020010910) HIF1A (ENSOARG00020011056) SNAPC1 (ENSOARG00020011607) ENSOARG00020011650 SYT16 (ENSOARG00020011691) ENSOARG00020011822 ENSOARG00020011846 KCNH5 (ENSOARG00020011903) 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(ENSCHIG00000017393) ESR2 (ENSCHIG00000011683) ENSCHIG00000026739 MTHFD1 (ENSCHIG00000001482) AKAP5 (ENSCHIG00000011249) ENSCHIG00000023459 ZBTB1 (ENSCHIG00000020242) HSPA2 (ENSCHIG00000010529) PPP1R36 (ENSCHIG00000013318) PLEKHG3 (ENSCHIG00000018176) SPTB (ENSCHIG00000011171) Pecora ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000155225 ENSGT01100000263546.e.a.a.b ENSGT01100000263546.e.b ENSGT01100000263546.e.a.b ENSGT01100000263546.e.a.a.a.b ENSGT01010000222653 ENSGT01100000263546.d.b.a.b.a ENSGT00510000049750 ENSGT01100000263546.d.b.a.a.a.b ENSGT01100000263546.d.b.a.a.a.a ENSGT01100000263546.d.b.b ENSGT01100000263546.e.a.a.a.a ENSGT00940000164301 ENSGT00940000160361 ENSGT00950000182863.A.a.b ENSGT00950000183176.a.t #22 ENSGT00390000013020 #24 ENSGT00940000162922 ENSGT00950000183176.a.s.a #22 ENSGT00950000183131.a #23 ENSGT00940000159472 #25 ENSGT00390000001562 #26 ENSGT00390000000546 ENSGT00940000154663.r.a ENSGT00940000157601 ENSGT00390000001804 ENSGT00940000154258.a ENSGT00950000182981.a ENSGT00940000157014 ENSGT00390000011067.A ENSGT00940000158853 Percora_a ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000155225 ENSGT01100000263546.e.a.a.b ENSGT01100000263546.e.b ENSGT01100000263546.e.a.b ENSGT01100000263546.e.a.a.a.b ENSGT01010000222653 ENSGT01100000263546.d.b.a.b.a ENSGT00510000049750 ENSGT01100000263546.d.b.a.a.a.b ENSGT01100000263546.d.b.a.a.a.a ENSGT01100000263546.d.b.b ENSGT01100000263546.e.a.a.a.a ENSGT00940000164301 ENSGT00940000160361 ENSGT00950000182863.A.a.b ENSGT00950000183176.a.t #22 ENSGT00390000013020 #24 ENSGT00940000162922 ENSGT00950000183176.a.s.a #22 ENSGT00950000183131.a #23 ENSGT00940000159472 #25 ENSGT00390000001562 #26 ENSGT00390000000546 ENSGT00940000154663.r.a ENSGT00940000157601 ENSGT00390000001804 ENSGT00940000154258.a ENSGT00950000182981.a ENSGT00940000157014 ENSGT00390000011067.A ENSGT00940000158853 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183176.a.t #22 Bovinae ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT01100000263546.d.b.a.b.a.a ENSGT01100000263546.d.b.a.b.b 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(ENSMMSG00000011807) DYNLRB1 (ENSMMSG00000011749) MAP1LC3A (ENSMMSG00000011725) Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000163617 ENSGT00940000155225 ENSGT01100000263546.e.a.a.b ENSGT01100000263546.e.b ENSGT01100000263546.e.a.b ENSGT01100000263546.e.a.a.a.b ENSGT01100000263546.d.b.a.b ENSGT00510000049750 ENSGT01100000263546.d.b.a.a.a.b ENSGT01100000263546.d.b.a.a.a.a ENSGT01100000263546.d.b.b ENSGT01100000263546.e.a.a.a.a ENSGT00940000164301 ENSGT00940000160361 ENSGT00950000182863.A.a.b ENSGT00950000183176.a #22 ENSGT00950000183131.a #23 ENSGT00390000013020 #24 ENSGT00940000162922 ENSGT00940000159472 #25 ENSGT00390000001562 #26 ENSGT00390000000546 ENSGT00940000154663 ENSGT00940000157601 ENSGT00390000001804 ENSGT00940000154258.a ENSGT00950000182981.a ENSGT00940000157014 ENSGT00390000011067.A ENSGT00940000158853 ENSGT00390000014941 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES 316 ENSGT00940000164301 ENSGT00940000160361 ENSGT00950000182863.A.a.b ENSGT00950000183176.a #22 ENSGT00950000183131.a #23 ENSGT00390000013020 #24 ENSGT00940000162922 ENSGT00940000159472 #25 ENSGT00390000001562 #26 ENSGT00390000000546 ENSGT00940000154663 ENSGT00940000157601 ENSGT00390000001804 Armadillo MODERN SPECIES 1934 ENSDNOG00000039006 CDK5RAP1 (ENSDNOG00000015236) ENSDNOG00000043650 SNTA1 (ENSDNOG00000040663) CBFA2T2 (ENSDNOG00000007950) #22 NECAB3 (ENSDNOG00000039751) #23 ENSDNOG00000007969 #24 ACTL10 (ENSDNOG00000032070) E2F1 (ENSDNOG00000046733) #25 PXMP4 (ENSDNOG00000007975) #26 ZNF341 (ENSDNOG00000034368) CHMP4B (ENSDNOG00000032154) ENSDNOG00000038139 ENSDNOG00000003227 EIF2S2 (ENSDNOG00000047014) ENSDNOG00000048473 Sloth MODERN SPECIES 7934 CBFA2T2 (ENSCHOG00000006523) #22 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000163617 ENSGT00940000155225 ENSGT01100000263546.e.a.a.b ENSGT01100000263546.e.b ENSGT01100000263546.e.a.b ENSGT01100000263546.e.a.a.a.b ENSGT01100000263546.d.b.a.b ENSGT00510000049750 ENSGT01100000263546.d.b.a.a.a.b ENSGT01100000263546.d.b.a.a.a.a ENSGT01100000263546.d.b.b 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ENSGT00940000162922 ENSGT00940000159472 #25 ENSGT00390000001562 #26 ENSGT00390000000546 ENSGT00940000154663 ENSGT00940000157601 ENSGT00390000001804 ENSGT00940000154258.a ENSGT00950000182981.a ENSGT00940000157014 ENSGT00390000011067.A ENSGT00940000158853 ENSGT00390000014941 Hyrax MODERN SPECIES 7471 CBFA2T2 (ENSPCAG00000015597) #22 NECAB3 (ENSPCAG00000015675) #23 ENSPCAG00000015768 #24 ACTL10 (ENSPCAG00000015815) E2F1 (ENSPCAG00000015826) #25 PXMP4 (ENSPCAG00000015896) #26 Elephant MODERN SPECIES 180 ENSLAFG00000020535 ENSLAFG00000032038 SUN5 (ENSLAFG00000021496) BPIFB2 (ENSLAFG00000008987) BPIFB6 (ENSLAFG00000028326) BPIFB3 (ENSLAFG00000018176) BPIFB4 (ENSLAFG00000002061) ENSLAFG00000000105 ENSLAFG00000003615 BPIFA1 (ENSLAFG00000010265) BPIFB1 (ENSLAFG00000010267) ENSLAFG00000028139 ENSLAFG00000014548 CDK5RAP1 (ENSLAFG00000001172) SNTA1 (ENSLAFG00000027816) CBFA2T2 (ENSLAFG00000018088) #22 NECAB3 (ENSLAFG00000018096) #23 ENSLAFG00000018104 #24 ACTL10 (ENSLAFG00000018108) E2F1 (ENSLAFG00000018114) #25 PXMP4 (ENSLAFG00000004616) #26 ZNF341 (ENSLAFG00000007128) CHMP4B (ENSLAFG00000022958) RALY (ENSLAFG00000000321) EIF2S2 (ENSLAFG00000016639) ASIP (ENSLAFG00000005229) ENSLAFG00000028026 ITCH (ENSLAFG00000011603) DYNLRB1 (ENSLAFG00000029820) MAP1LC3A (ENSLAFG00000027645) PIGU (ENSLAFG00000017870) Marsupialia ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000158327 ENSGT00420000029848.A ENSGT00940000159358 ENSGT00940000157465.a ENSGT00940000158554 ENSGT00390000002781 ENSGT00940000156526.a ENSGT00940000160738 ENSGT00950000183201.b.b.b.a ENSGT00950000182915.a.a.a ENSGT00940000153137.a.b.a ENSGT00940000159708 ENSGT00940000155448 ENSGT00940000158764 ENSGT00950000182863.A.a.b ENSGT00950000183176.a #22 ENSGT00390000013020 #24 ENSGT00940000162922 ENSGT00950000183131.a #23 ENSGT00940000159472 #25 ENSGT00390000001562 #26 ENSGT00390000000546 ENSGT00940000154663 ENSGT00940000155266.x ENSGT00940000157601 ENSGT00390000001804 ENSGT00940000154258.a ENSGT00950000182981.a.g ENSGT00940000157014 ENSGT00390000011067.A ENSGT00940000158853 Opossum MODERN SPECIES ENSMODG00000003922 FLT4 (ENSMODG00000003918) ENSMODG00000003904 TBC1D9B (ENSMODG00000003882) SQSTM1 (ENSMODG00000003806) MGAT4B (ENSMODG00000003778) LTC4S (ENSMODG00000003733) MAML1 (ENSMODG00000003725) ENSMODG00000003708 ENSMODG00000003673 L3MBTL1 (ENSMODG00000003647) SRSF6 (ENSMODG00000003107) ENSMODG00000023076 TOX2 (ENSMODG00000003070) SNTA1 (ENSMODG00000003050) CBFA2T2 (ENSMODG00000003023) #22 NECAB3 (ENSMODG00000002977) #23 ENSMODG00000002993 #24 ENSMODG00000002988 E2F1 (ENSMODG00000002875) #25 PXMP4 (ENSMODG00000002864) #26 ZNF341 (ENSMODG00000002856) CHMP4B (ENSMODG00000002830) ENSMODG00000002836 RALY (ENSMODG00000002819) EIF2S2 (ENSMODG00000002805) ENSMODG00000002765 ASIP (ENSMODG00000002762) AHCY (ENSMODG00000002753) ITCH (ENSMODG00000002732) DYNLRB1 (ENSMODG00000002702) Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000158327 ENSGT00420000029848.A ENSGT00940000159358 ENSGT00940000157465.a ENSGT00940000158554 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Archelosauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003446 ENSGT00940000156028 ENSGT01000000215044 ENSGT00940000153998.a ENSGT00940000162847 ENSGT00960000189441 ENSGT00390000005575 ENSGT00390000004910 ENSGT00940000156202.b ENSGT00940000153251.a ENSGT00940000160950 ENSGT00390000018330 ENSGT00940000159233 ENSGT00940000158764 ENSGT00950000182863.A.a.b ENSGT00950000183176.a #22 ENSGT00940000162922 ENSGT00950000183131.a #23 ENSGT00940000159472 #25 ENSGT00390000001562 #26 ENSGT00390000000546 ENSGT00940000154663 ENSGT00950000182920.b.a.a.c.a.a.a.d ENSGT00940000157601 ENSGT00390000001804 ENSGT00940000154258.a ENSGT00950000182981.a ENSGT00940000157014 ENSGT00390000011067.A ENSGT00940000158853 ENSGT00390000014941 Cryptodira ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000160331 ENSGT00950000182872.f.a.a.b ENSGT00700000104550.a ENSGT00940000158986 ENSGT00950000183202.a.a ENSGT00390000013867 ENSGT00950000182982.B ENSGT00940000156358 ENSGT00390000013764 ENSGT00940000160950 ENSGT00940000160318 ENSGT00390000018330 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ostrich MODERN SPECIES 818 CBFA2T2 (ENSSCUG00000010850) #22 NECAB3 (ENSSCUG00000010854) #23 ACTL10 (ENSSCUG00000010856) ENSSCUG00000010858 #25 PXMP4 (ENSSCUG00000010860) #26 ZNF341 (ENSSCUG00000010869) CHMP4B (ENSSCUG00000010874) ENSSCUG00000010877 ENSSCUG00000010879 RALY (ENSSCUG00000010883) EIF2S2 (ENSSCUG00000010885) ASIP (ENSSCUG00000010886) AHCY (ENSSCUG00000010887) ITCH (ENSSCUG00000010891) DYNLRB1 (ENSSCUG00000010899) MAP1LC3A (ENSSCUG00000010903) Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00950000182872.f.a.a.b ENSGT00700000104550.a ENSGT00940000158986 ENSGT01040000241001 ENSGT00950000183202.a.a ENSGT00390000013867 ENSGT00940000161648 ENSGT00950000182982.B ENSGT00940000156358 ENSGT00390000013764 ENSGT00940000160318 ENSGT00390000018330 ENSGT00940000159233 ENSGT00940000158764 ENSGT00950000182863.A.a.b ENSGT00950000183176.a #22 ENSGT00940000162922 ENSGT00950000183131.a #23 ENSGT00940000159472 #25 ENSGT00390000001562 #26 ENSGT00390000000546 ENSGT00940000154663 ENSGT00940000157601 ENSGT00390000001804 ENSGT00940000154258.a ENSGT00950000182981.a ENSGT00940000157014 ENSGT00390000011067.A ENSGT00940000158853 ENSGT00390000014941 ENSGT00980000199297 tuatara MODERN SPECIES 1490 TOX2 (ENSSPUG00000012752) SNTA1 (ENSSPUG00000012734) CBFA2T2 (ENSSPUG00000012717) #22 ACTL10 (ENSSPUG00000012708) NECAB3 (ENSSPUG00000012690) #23 E2F1 (ENSSPUG00000012675) #25 PXMP4 (ENSSPUG00000012666) #26 ZNF341 (ENSSPUG00000012648) CHMP4B (ENSSPUG00000012632) ENSSPUG00000012622 Episquamata ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000160331 ENSGT00950000182872.f.a.a.b ENSGT00700000104550.a ENSGT00940000158986 ENSGT00950000183202.a.a ENSGT00390000013867 ENSGT00940000161648 ENSGT00950000182982.B ENSGT00940000156358 ENSGT00390000013764 ENSGT00940000160318 ENSGT00390000018330 ENSGT00940000159233 ENSGT00940000158764 ENSGT00950000182863.A.a.b ENSGT00950000183176.a #22 ENSGT00940000162922 ENSGT00950000183131.a #23 ENSGT00940000159472 #25 ENSGT00390000001562 #26 ENSGT00390000000546 ENSGT00940000154663 ENSGT00940000157601 ENSGT00390000001804 ENSGT00940000154258.a ENSGT00950000182981.a ENSGT00940000157014 ENSGT00390000011067.A ENSGT00940000158853 ENSGT00390000014941 ENSGT00980000199297 Laterata ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000160318 ENSGT00390000018330 ENSGT00940000159233 ENSGT00940000158764 ENSGT00950000182863.A.a.b ENSGT00950000183176.a #22 ENSGT00940000162922 ENSGT00950000183131.a #23 ENSGT00940000159472 #25 ENSGT00390000001562 #26 ENSGT00390000000546 ENSGT00940000154663 ENSGT00940000157601 ENSGT00390000001804 ENSGT00940000154258.a ENSGT00950000182981.a ENSGT00940000157014 ENSGT00390000011067.A ENSGT00940000158853 ENSGT00390000014941 ENSGT00980000199297 Common wall lizard MODERN SPECIES 14 ENSPMRG00000017613 ENSPMRG00000017707 ENSPMRG00000018204 ENSPMRG00000018414 ENSPMRG00000018424 SOGA1 (ENSPMRG00000018470) ACSS2 (ENSPMRG00000018560) GSS (ENSPMRG00000018774) ENSPMRG00000019018 TRPC4AP (ENSPMRG00000020462) EDEM2 (ENSPMRG00000020578) ENSPMRG00000020615 ENSPMRG00000020620 TOX2 (ENSPMRG00000020639) SNTA1 (ENSPMRG00000020670) CBFA2T2 (ENSPMRG00000020681) #22 ENSPMRG00000020695 NECAB3 (ENSPMRG00000020712) #23 ACTL10 (ENSPMRG00000020723) ENSPMRG00000020727 ENSPMRG00000020730 E2F1 (ENSPMRG00000020737) #25 PXMP4 (ENSPMRG00000020743) #26 ZNF341 (ENSPMRG00000020759) CHMP4B (ENSPMRG00000020773) ENSPMRG00000020778 RALY (ENSPMRG00000020782) EIF2S2 (ENSPMRG00000020795) ASIP (ENSPMRG00000020805) ENSPMRG00000020811 AHCY (ENSPMRG00000020815) Argentine black and white tegu MODERN SPECIES 28 NDRG3 (ENSSMRG00000002245) RALGAPB (ENSSMRG00000002234) CHD6 (ENSSMRG00000002188) RBL1 (ENSSMRG00000002155) SAMHD1 (ENSSMRG00000002105) ENSSMRG00000002097 SOGA1 (ENSSMRG00000002082) ACSS2 (ENSSMRG00000001992) GSS (ENSSMRG00000001989) ENSSMRG00000001837 ENSSMRG00000001637 TRPC4AP (ENSSMRG00000001628) EDEM2 (ENSSMRG00000001620) TOX2 (ENSSMRG00000001545) SNTA1 (ENSSMRG00000001526) CBFA2T2 (ENSSMRG00000001500) #22 ACTL10 (ENSSMRG00000001490) NECAB3 (ENSSMRG00000001460) #23 E2F1 (ENSSMRG00000001456) #25 PXMP4 (ENSSMRG00000001453) #26 ZNF341 (ENSSMRG00000001447) CHMP4B (ENSSMRG00000001390) ENSSMRG00000001388 ENSSMRG00000001318 RALY (ENSSMRG00000001280) EIF2S2 (ENSSMRG00000001247) ENSSMRG00000001230 ASIP (ENSSMRG00000001224) ENSSMRG00000001217 AHCY (ENSSMRG00000001207) ITCH (ENSSMRG00000001158) Toxicofera ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000160331 ENSGT00950000182872.f.a.a.b ENSGT00700000104550.a ENSGT00940000158986 ENSGT00950000183202.a.a ENSGT00390000013867 ENSGT00940000161648 ENSGT00950000182982.B ENSGT00940000156358 ENSGT00390000013764 ENSGT00940000160318 ENSGT00390000018330 ENSGT00940000159233 ENSGT00940000158764 ENSGT00950000182863.A.a.b ENSGT00950000183176.a #22 ENSGT00940000162922 ENSGT00950000183131.a #23 ENSGT00940000159472 #25 ENSGT00390000001562 #26 ENSGT00390000000546 ENSGT00940000154663 ENSGT00940000157601 ENSGT00390000001804 ENSGT00940000154258.a ENSGT00950000182981.a ENSGT00940000157014 ENSGT00390000011067.A ENSGT00940000158853 ENSGT00390000014941 ENSGT00980000199297 Lizard MODERN SPECIES 3 RBL1 (ENSACAG00000006847) SAMHD1 (ENSACAG00000007007) TLDC2 (ENSACAG00000007093) SOGA1 (ENSACAG00000007120) ENSACAG00000007148 ENSACAG00000007388 ENSACAG00000007497 TRPC4AP (ENSACAG00000008237) ENSACAG00000008338 ENSACAG00000010388 ENSACAG00000036722 ENSACAG00000042806 ENSACAG00000008446 ENSACAG00000043850 SNTA1 (ENSACAG00000008475) CBFA2T2 (ENSACAG00000008567) #22 ENSACAG00000035390 NECAB3 (ENSACAG00000008697) #23 ENSACAG00000002219 ENSACAG00000008761 #25 ENSACAG00000037827 #25 ENSACAG00000042361 PXMP4 (ENSACAG00000008802) #26 ZNF341 (ENSACAG00000008818) CHMP4B (ENSACAG00000008891) ENSACAG00000038084 ENSACAG00000040646 ENSACAG00000037357 ENSACAG00000043994 RALY (ENSACAG00000008983) ENSACAG00000037938 Elapidae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000156477 ENSGT00940000160331 ENSGT00950000182872.f.a.a.b ENSGT00700000104550.a ENSGT00940000158986 ENSGT00950000183202.a.a ENSGT00390000013867 ENSGT00950000182982.B ENSGT00940000156358 ENSGT00390000013764 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ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000156477 ENSGT00940000160331 ENSGT00950000182872.f.a.a.b ENSGT00700000104550.a ENSGT00940000158986 ENSGT00950000183202.a.a ENSGT00390000013867 ENSGT00950000182982.B ENSGT00940000156358 ENSGT00390000013764 ENSGT00940000160318 ENSGT00390000018330 ENSGT00940000159233 ENSGT00940000158764 ENSGT00950000182863.A.a.b.a ENSGT00950000183176.a #22 ENSGT00940000162922 ENSGT00950000183131.a #23 ENSGT00940000159472 #25 ENSGT00390000001562 #26 ENSGT00390000000546 ENSGT00940000154663 ENSGT00940000157601 ENSGT00390000001804 ENSGT00940000154258.a ENSGT00950000182981.a ENSGT00940000157014 ENSGT00390000011067.A ENSGT00940000158853 ENSGT00390000014941 ENSGT00530000063829.C Mainland tiger snake MODERN SPECIES 159 CBFA2T2 (ENSNSUG00000006819) #22 ACTL10 (ENSNSUG00000006816) NECAB3 (ENSNSUG00000006812) #23 E2F1 (ENSNSUG00000006810) #25 PXMP4 (ENSNSUG00000006808) #26 ZNF341 (ENSNSUG00000006805) CHMP4B (ENSNSUG00000006802) ENSNSUG00000006800 ENSNSUG00000006799 EIF2S2 (ENSNSUG00000006794) ASIP (ENSNSUG00000006791) AHCY (ENSNSUG00000006790) ITCH (ENSNSUG00000004770) DYNLRB1 (ENSNSUG00000004757) MAP1LC3A (ENSNSUG00000004753) PIGU (ENSNSUG00000004739) Eastern brown snake MODERN SPECIES 8 NDRG3 (ENSPTXG00000000472) RALGAPB (ENSPTXG00000000412) ENSPTXG00000000404 CHD6 (ENSPTXG00000000268) SAMHD1 (ENSPTXG00000000069) ENSPTXG00000000040 SOGA1 (ENSPTXG00000007847) ACSS2 (ENSPTXG00000007845) GSS (ENSPTXG00000007844) ENSPTXG00000007842 TRPC4AP (ENSPTXG00000007841) EDEM2 (ENSPTXG00000007840) ENSPTXG00000007839 TOX2 (ENSPTXG00000007838) SNTA1 (ENSPTXG00000007837) CBFA2T2 (ENSPTXG00000007823) #22 ACTL10 (ENSPTXG00000007822) NECAB3 (ENSPTXG00000007818) #23 E2F1 (ENSPTXG00000007817) #25 PXMP4 (ENSPTXG00000007816) #26 ZNF341 (ENSPTXG00000007815) CHMP4B (ENSPTXG00000007814) ENSPTXG00000007812 ENSPTXG00000007811 EIF2S2 (ENSPTXG00000007809) ASIP (ENSPTXG00000007806) AHCY (ENSPTXG00000007803) ITCH (ENSPTXG00000007800) DYNLRB1 (ENSPTXG00000007798) MAP1LC3A (ENSPTXG00000007795) PIGU (ENSPTXG00000007794) Blue-lipped sea krait MODERN SPECIES 4784 ENSLLTG00000015481 #22 ENSLLTG00000015479 ##22 Anura ANCESTRAL SPECIES 50 ENSGT00390000013867 ENSGT00950000183202.a.a ENSGT00940000158986 ENSGT00700000104550.a ENSGT00940000158764 ENSGT00940000168101.a ENSGT00950000182863.A.a.b ENSGT00390000018558 ENSGT00950000183176.a #22 ENSGT01070000255540 ENSGT00950000183131.a.c #23 ENSGT00950000183131.a.d #23 ENSGT00940000159472 #25 ENSGT00390000001562 #26 ENSGT00390000000546 ENSGT00940000154663 ENSGT00940000157601 ENSGT00390000001804 ENSGT00940000176173 ENSGT00950000182981.a ENSGT00940000157014 ENSGT00390000011067.A ENSGT00940000158853 ENSGT00390000014941 Leishan spiny toad MODERN SPECIES 3 ENSLLEG00000026819 RAB22A (ENSLLEG00000027003) ENSLLEG00000027127 VAPB (ENSLLEG00000027149) APCDD1L (ENSLLEG00000027178) STX16 (ENSLLEG00000027234) NPEPL1 (ENSLLEG00000027415) ENSLLEG00000027554 ENSLLEG00000027654 ENSLLEG00000027708 GNAS (ENSLLEG00000027778) 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(ENSXETG00000042606) #26 znf341 (ENSXETG00000021426) chmp4b (ENSXETG00000043359) ENSXETG00000045900 raly (ENSXETG00000019514) asip (ENSXETG00000044164) eif2s2 (ENSXETG00000019507) dynlrb1 (ENSXETG00000019475) ahcy (ENSXETG00000019486) map1lc3a (ENSXETG00000019473) pigu (ENSXETG00000019472) tp53inp2 (ENSXETG00000046826) Coelacanth MODERN SPECIES 961 TOX2 (ENSLACG00000012232) ENSLACG00000011487 SNTA1 (ENSLACG00000010986) CBFA2T2 (ENSLACG00000009564) #22 NECAB3 (ENSLACG00000008280) #23 E2F1 (ENSLACG00000006930) #25 PXMP4 (ENSLACG00000006704) #26 ZNF341 (ENSLACG00000006139) CHMP4B (ENSLACG00000005330) ENSLACG00000002082 Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES 62 ENSGT00950000183149.B ENSGT00940000160694 ENSGT00410000025596.a.a ENSGT01030000234597.a.b.b.f ENSGT00950000182970.A.b ENSGT00940000162635 ENSGT00940000156407 ENSGT00390000000732 ENSGT00940000159329 ENSGT00940000160093 ENSGT00940000159925 ENSGT00700000104550.a.j ENSGT00940000158764 ENSGT00940000155581.A ENSGT00950000182863.A.a.b ENSGT00950000183176.a #22 ENSGT00950000183131.a #23 ENSGT00390000000546 ENSGT00390000001562 #26 ENSGT00940000159472 #25 Reedfish MODERN SPECIES 1 lhx4 (ENSECRG00000008106) acbd6 (ENSECRG00000008080) xpr1b (ENSECRG00000008065) stx6 (ENSECRG00000008046) ier5 (ENSECRG00000008036) ENSECRG00000007998 osbp (ENSECRG00000007946) patl1 (ENSECRG00000007912) cebpb (ENSECRG00000007895) peds1 (ENSECRG00000007882) ube2v1 (ENSECRG00000007775) tcf15 (ENSECRG00000007740) itcha (ENSECRG00000007713) VSTM2L (ENSECRG00000007701) ctnnbl1 (ENSECRG00000007678) cbfa2t2 (ENSECRG00000007661) #22 znf341 (ENSECRG00000007631) pxmp4 (ENSECRG00000007618) #26 E2F1 (ENSECRG00000007605) #25 ENSECRG00000007598 SNTA1 (ENSECRG00000007587) tox2 (ENSECRG00000007562) TIMM10B (ENSECRG00000007555) RALGAPB (ENSECRG00000007540) PREX1 (ENSECRG00000007494) kcnq2a (ENSECRG00000007454) chrna4b (ENSECRG00000006928) zgpat (ENSECRG00000006855) arfrp1 (ENSECRG00000006843) TNFRSF6B (ENSECRG00000006833) dtx4a (ENSECRG00000006825) Neopterygii ANCESTRAL SPECIES 44 ENSGT00940000160694.h ENSGT00940000160694.g ENSGT00410000025596.a.a ENSGT01030000234597.a.b.b.f ENSGT00950000182970.A.b ENSGT00940000162635 ENSGT00940000156407 ENSGT00390000000732 ENSGT00940000159329 ENSGT00940000160093 ENSGT00940000159925 ENSGT00700000104550.a.j ENSGT00940000158764 ENSGT00940000155581.A ENSGT00950000182863.A.a.b ENSGT00950000183176.a #22 ENSGT00950000183131.a #23 ENSGT00940000157014 ENSGT00390000000546 ENSGT00390000001562 #26 ENSGT00940000159472 #25 ENSGT01050000244866.D.b.a ENSGT00390000006931 ENSGT00940000159381 ENSGT00390000009748 ENSGT00950000183094.b.a ENSGT01050000244866.B.c.b ENSGT00940000162507.B ENSGT01050000244866.B.c.a ENSGT00940000165533 ENSGT00940000155308 Spotted gar MODERN SPECIES 656 RALGAPB (ENSLOCG00000000654) ENSLOCG00000000690 tox2 (ENSLOCG00000000720) ENSLOCG00000000750 SNTA1 (ENSLOCG00000000786) cbfa2t2 (ENSLOCG00000000816) #22 NECAB3 (ENSLOCG00000000865) #23 itcha (ENSLOCG00000000888) znf341 (ENSLOCG00000000947) 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ENSGT01050000244866.B.c.a ENSGT00940000165533 ENSGT00940000155308.d Osteoglossiformes DUPLICATION Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000155094.a ENSGT00390000006008 ENSGT00950000183149.B.b ENSGT00940000160694.h ENSGT00940000160694.g.a ENSGT00410000025596.a.a ENSGT01030000234597.a.b.b.f.h ENSGT00940000156407 ENSGT00940000160093.a ENSGT00700000104550.a.j.a.a ENSGT00700000104550.a.j.a.b ENSGT00940000158764.e ENSGT00950000182863.A.a.b ENSGT00950000183176.a.a #22 ENSGT00950000183131.a.f #23 ENSGT00940000157014.h ENSGT01050000244866.D.b.a ENSGT00940000159381.b ENSGT00950000183094.b.a.p ENSGT01050000244866.B.c.a ENSGT00940000165533.a ENSGT00940000155308.d ENSGT00940000155230.b.b.b.a ENSGT00940000155458.c.a ENSGT00940000160046 ENSGT00390000016807.b ENSGT00390000000903.b.a ENSGT01010000223084 ENSGT01050000244850.A.b.a.a P. kingsleyae MODERN SPECIES 308 RALGAPB (ENSPKIG00000010870) tox2 (ENSPKIG00000010730) SNTA1 (ENSPKIG00000010628) cbfa2t2 (ENSPKIG00000010565) #22 ITCH 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(ENSSFOG00015019695) ENSSFOG00015019684 myl9b (ENSSFOG00015019678) LPIN3 (ENSSFOG00015019641) Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 228 ENSGT00940000163299.A.b.c.b ENSGT00940000165254.c.b.f ENSGT00940000166720 ENSGT00390000008714.a ENSGT00940000162660.a ENSGT00940000158549 ENSGT00940000155311.C.d ENSGT00940000164248.b.a ENSGT00940000153541.B.f ENSGT00940000161969.k ENSGT00390000016016.B ENSGT00950000182945.b.a.a.a.b.b ENSGT00390000003022 ENSGT00940000155581.A ENSGT00950000183176.a.b #22 ENSGT00950000183131.a.e #23 ENSGT00940000157014.g ENSGT00390000000546 ENSGT00390000001562 #26 ENSGT00940000159472 #25 ENSGT00390000006931 ENSGT00940000159381.a ENSGT00390000009748 ENSGT00950000183094.b.a.o ENSGT01050000244866.B.c.b ENSGT00940000165533.b Asian bonytongue MODERN SPECIES 10 MYLK4 (ENSSFOG00015014044) serpinb1 (ENSSFOG00015031077) ENSSFOG00015014090 ENSSFOG00015028260 maf1b (ENSSFOG00015014127) shrprbck1r (ENSSFOG00015014150) B4GALT3 (ENSSFOG00015014175) bgna (ENSSFOG00015014196) 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(ENSPKIG00000024094) SLC7A5 (ENSPKIG00000024084) ENSPKIG00000024059 #22 ENSPKIG00000024031 #23 itchb (ENSPKIG00000023985) znf341 (ENSPKIG00000023946) pxmp4 (ENSPKIG00000023929) #26 E2F1 (ENSPKIG00000023922) #25 ctnnbl1 (ENSPKIG00000023902) VSTM2L (ENSPKIG00000023894) TTI1 (ENSPKIG00000023886) rprd1b (ENSPKIG00000023874) ENSPKIG00000023856 Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 198 ENSGT00940000156407 ENSGT00940000160093.a ENSGT00700000104550.a.j.b ENSGT00940000158764.g ENSGT00950000182863.A.a.b ENSGT00950000183176.a #22 ENSGT00950000183131.a.f #23 ENSGT00940000157014.f ENSGT00390000001562 #26 ENSGT00940000159381.d ENSGT01050000244866.B.c.a ENSGT00940000165533.c ENSGT00940000155308.d ENSGT00940000159849 ENSGT00940000155458 ENSGT00940000160046 ENSGT00940000165151.b ENSGT00390000016807 ENSGT00390000000903.b.a ENSGT01050000244850.A.b.b ENSGT00940000159178 Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 179 ENSGT00530000063106.A.s.a.b ENSGT00940000160694.g.a ENSGT01030000234597.a.b.b.f ENSGT00940000156407 ENSGT00940000160093.a ENSGT00700000104550.a.j.b ENSGT00940000158764.g ENSGT00940000163999.a ENSGT00950000182863.A.a.b ENSGT00950000183176.a #22 ENSGT00950000183131.a.f #23 ENSGT00940000157014.f ENSGT00390000001562 #26 ENSGT01050000244866.D.b.a ENSGT00940000159381.d ENSGT01050000244866.B.c.a ENSGT00940000165533.c ENSGT00940000155308.d ENSGT00940000159849 ENSGT00940000155458.e.a ENSGT00940000160046 ENSGT00940000165151.b ENSGT00390000016807 ENSGT00390000000903.b.a ENSGT01050000244850.A.b.a.a Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 140 ENSGT00940000160093.a ENSGT00700000104550.a.j.b ENSGT00940000158764.g ENSGT00940000163999.a ENSGT00950000182863.A.a.b ENSGT00950000183176.a #22 ENSGT00950000183131.a.f #23 ENSGT00940000157014.f ENSGT00390000001562 #26 ENSGT01050000244866.D.b.a ENSGT00940000159381.d ENSGT01050000244866.B.c.a ENSGT00940000165533.c ENSGT00940000155308.d ENSGT00940000159849 ENSGT00940000155458.e.a ENSGT00940000160046 ENSGT00940000165151.b ENSGT00390000016807 ENSGT00390000000903.b.a ENSGT01050000244850.A.b.a.a Atlantic herring MODERN SPECIES 21 grm2b (ENSCHAG00000025014) TEX264 (ENSCHAG00000025008) ENSCHAG00000025002 bin2b (ENSCHAG00000024959) stk35l (ENSCHAG00000024947) ENSCHAG00000024935 ENSCHAG00000024931 HELZ2 (ENSCHAG00000024918) STMN3 (ENSCHAG00000024912) arfrp1 (ENSCHAG00000024895) CHRNA4 (ENSCHAG00000024836) KCNQ2 (ENSCHAG00000024632) RALGAPB (ENSCHAG00000024451) tox2 (ENSCHAG00000024410) SNTA1 (ENSCHAG00000024405) cbfa2t2 (ENSCHAG00000024199) #22 NECAB3 (ENSCHAG00000024178) #23 itcha (ENSCHAG00000022207) pxmp4 (ENSCHAG00000022119) #26 tgm5l (ENSCHAG00000022099) VSTM2L (ENSCHAG00000022093) ENSCHAG00000022089 quo (ENSCHAG00000022027) DLGAP4 (ENSCHAG00000022019) ENSCHAG00000022005 CHCHD6 (ENSCHAG00000021993) PLXNA1 (ENSCHAG00000021732) txnrd3 (ENSCHAG00000018885) CHST13 (ENSCHAG00000018788) SLC41A3 (ENSCHAG00000018620) aldh1l1 (ENSCHAG00000016696) Denticle herring MODERN SPECIES 3 ENSDCDG00000016719 ENSDCDG00000016717 ENSDCDG00000016714 tnni1b 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(ENSSGRG00000027634) CDH22 (ENSSGRG00000027703) Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 1018 ENSGT00940000158764.g.e.a.a ENSGT00950000182863.A.a.b.f ENSGT00940000163999.a.q.a.a.a ENSGT00950000183176.a.d #22 Goldfish MODERN SPECIES 46 dctn2 (ENSCARG00000004281) ENSCARG00000004168 igsf8 (ENSCARG00000004141) sp7 (ENSCARG00000004131) ENSCARG00000004113 ENSCARG00000003906 ENSCARG00000003832 STMN3 (ENSCARG00000003822) arfrp1 (ENSCARG00000003800) KCNQ2 (ENSCARG00000003265) RALGAPB (ENSCARG00000003202) ENSCARG00000003176 tox2 (ENSCARG00000003149) ENSCARG00000003132 SNTA1 (ENSCARG00000003112) cbfa2t2 (ENSCARG00000002995) #22 NECAB3 (ENSCARG00000002973) #23 itcha (ENSCARG00000002538) ENSCARG00000002479 snrpb (ENSCARG00000002471) ddx27 (ENSCARG00000002449) ZNFX1 (ENSCARG00000002236) CDH22 (ENSCARG00000002090) ENSCARG00000002039 OCA2 (ENSCARG00000001801) HERC2 (ENSCARG00000001529) nipa2 (ENSCARG00000001511) ENSCARG00000001508 cyfip1 (ENSCARG00000001456) tubgcp5 (ENSCARG00000001370) CHST7 (ENSCARG00000001344) Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000158764.g.e.a.a ENSGT00950000182863.A.a.b.f ENSGT00940000163999.a.q.a.a.a ENSGT00950000183176.a.d #22 ENSGT00950000183131.a.f #23 ENSGT00940000157014.f.e.b ENSGT00940000155154.b.r ENSGT00940000159376.b ENSGT00950000182848.c.b.a.b.b ENSGT00940000160402.g ENSGT00390000010923.a.a ENSGT00950000182978.A.a.b.b.b ENSGT00950000182905.b.d ENSGT00950000182932.C.a ENSGT00940000165387.b.b ENSGT00530000064134.a.b.b ENSGT00880000138014.b.g.b ENSGT00880000138014.b.h ENSGT01100000263545.a.b.d.b.h Common carp reference MODERN SPECIES 10 mars1 (ENSCCRG00000057358) ENSCCRG00000016542 ddit3 (ENSCCRG00000041750) ENSCCRG00000041216 dctn2 (ENSCCRG00000075980) ENSCCRG00000068201 sp7 (ENSCCRG00000009400) ENSCCRG00000068371 ENSCCRG00000081112 ENSCCRG00000000298 ENSCCRG00000054670 ENSCCRG00000065476 tox2 (ENSCCRG00000068710) SNTA1 (ENSCCRG00000080321) ENSCCRG00000075134 cbfa2t2 (ENSCCRG00000013531) #22 NECAB3 (ENSCCRG00000013575) #23 itcha (ENSCCRG00000053905) ddx27 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ENSGT00940000159809 ENSGT00940000156300.i ENSGT00390000008224 ENSGT00730000111186 ENSGT00940000159825.a.b ENSGT00390000017780.f ENSGT00940000165619.b ENSGT00530000063849.B ENSGT00940000155343.a.b ENSGT00950000182852.B.a ENSGT00940000166225 ENSGT00390000000873.a.a ENSGT00940000158764.g ENSGT00950000182863.A.a.b ENSGT00950000183176.a #22 ENSGT00950000183131.a.f #23 ENSGT00940000166000 ENSGT00390000014944.a ENSGT00940000155154.b ENSGT00940000159376 ENSGT00950000182848.c.b.a.b ENSGT00390000010923 ENSGT00940000160402 ENSGT00950000182978.A.a.b.b ENSGT01050000244866.D.b.a ENSGT00390000001562 #26 ENSGT00940000157014.f ENSGT00390000002689 ENSGT00940000161168 ENSGT00390000010463.a.a.a.a Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00950000182810.A.a.a.a ENSGT00940000159809 ENSGT00940000156300.i ENSGT00390000008224 ENSGT00730000111186 ENSGT00940000159825.a.b ENSGT00390000017780.f ENSGT00940000165619.b ENSGT00530000063849.B ENSGT00940000155343.a.b ENSGT00950000182852.B.a ENSGT00940000166225 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ENSGT00390000010923 ENSGT00940000160402 ENSGT00950000182978.A.a.b.b ENSGT01050000244866.D.b.a ENSGT00390000001562 #26 ENSGT00940000157014.f ENSGT00390000002689 ENSGT00940000161168 ENSGT00390000010463.a.a.a.a Seriola ANCESTRAL SPECIES 166 ENSGT00940000155343.a.b ENSGT00950000182852.B.a ENSGT00940000166225 ENSGT00390000000873.a.a ENSGT00940000158764.g ENSGT00950000182863.A.a.b ENSGT00950000183176.a #22 ENSGT00950000183131.a.f #23 ENSGT00940000166000 ENSGT00390000014944.a ENSGT00940000155154.b ENSGT00940000159376 Greater amberjack MODERN SPECIES 311 KCND3 (ENSSDUG00000023622) CTTNBP2NL (ENSSDUG00000023623) wnt2ba (ENSSDUG00000023624) st7l (ENSSDUG00000023625) tox2 (ENSSDUG00000023626) SNTA1 (ENSSDUG00000023627) cbfa2t2 (ENSSDUG00000023628) #22 ENSSDUG00000023629 #23 ENSSDUG00000023630 #23 rbck1 (ENSSDUG00000023631) tbc1d20 (ENSSDUG00000023632) ZNFX1 (ENSSDUG00000023633) CDH22 (ENSSDUG00000023634) Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 3114 KCND3 (ENSSLDG00000008587) CTTNBP2NL 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ENSGT00950000182810.A.a.a.a ENSGT00940000159809 ENSGT00940000156300.i ENSGT00390000008224 ENSGT00730000111186 ENSGT00940000159825.a.b ENSGT00390000017780.f ENSGT00940000165619.b ENSGT00530000063849.B ENSGT00940000155343.a.b ENSGT00950000182852.B.a ENSGT00940000166225 ENSGT00390000000873.a.a ENSGT00940000158764.g ENSGT00950000182863.A.a.b ENSGT00950000183176.a #22 ENSGT00950000183131.a.f #23 ENSGT00940000166000 ENSGT00390000014944.a ENSGT00940000155154.b ENSGT00940000159376 ENSGT00950000182848.c.b.a.b ENSGT00940000160402 ENSGT00390000010923 ENSGT00950000182978.A.a.b.b ENSGT01050000244866.D.b.a ENSGT00390000001562 #26 ENSGT00940000157014.f ENSGT00390000002689 ENSGT00940000161168 ENSGT00390000010463.a.a.a.a Turbot MODERN SPECIES 18 prelid3b (ENSSMAG00000011815) ENSSMAG00000011813 ENSSMAG00000011773 ipo9 (ENSSMAG00000011675) shisa4 (ENSSMAG00000011653) ENSSMAG00000011649 timm17a (ENSSMAG00000011624) ENSSMAG00000011602 INKA2 (ENSSMAG00000011594) KCND3 (ENSSMAG00000011563) CTTNBP2NL 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(ENSCSEG00000019145) tbc1d20 (ENSCSEG00000019138) ZNFX1 (ENSCSEG00000019131) CDH22 (ENSCSEG00000019123) tfap2c (ENSCSEG00000019107) ENSCSEG00000019102 GCNT7 (ENSCSEG00000019096) rtf2 (ENSCSEG00000019087) eya2 (ENSCSEG00000019079) tgm5l (ENSCSEG00000019053) pxmp4 (ENSCSEG00000019042) #26 itcha (ENSCSEG00000019027) bloc1s1 (ENSCSEG00000019018) rdh5 (ENSCSEG00000019014) Eupercaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182810.A.a.a.a ENSGT00940000159809 ENSGT00940000156300.i ENSGT00390000008224 ENSGT00730000111186 ENSGT00940000159825.a.b ENSGT00390000017780.f ENSGT00940000165619.b ENSGT00530000063849.B ENSGT00940000155343.a.b ENSGT00950000182852.B.a ENSGT00940000166225 ENSGT00390000000873.a.a ENSGT00940000158764.g ENSGT00950000182863.A.a.b ENSGT00950000183176.a #22 ENSGT00950000183131.a.f #23 ENSGT00940000166000 ENSGT00390000014944.a ENSGT00940000155154.b ENSGT00940000159376 ENSGT01060000248530.C.d ENSGT00950000182848.c.b.a.b ENSGT00390000010923 ENSGT00940000160402 ENSGT00950000182978.A.a.b.b ENSGT01050000244866.D.b.a ENSGT00390000001562 #26 ENSGT00940000157014.f ENSGT00390000002689 ENSGT00940000161168 Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000159809 ENSGT00940000156300.i ENSGT00390000008224 ENSGT00730000111186 ENSGT00940000159825.a.b ENSGT00390000017780.f ENSGT00940000165619.b ENSGT00390000011581.d ENSGT00530000063849.B ENSGT00940000155343.a.b ENSGT00950000182852.B.a ENSGT00940000166225 ENSGT00390000000873.a.a ENSGT00940000158764.g ENSGT00950000182863.A.a.b ENSGT00950000183176.a #22 ENSGT00950000183131.a.f #23 ENSGT00940000166000 ENSGT00390000014944.a ENSGT00940000154129.gd ENSGT00940000159006.c.a ENSGT00390000010265 ENSGT00940000154360.A.a ENSGT00940000155224.c.a ENSGT00390000016619.b ENSGT00940000155331.B ENSGT00940000161232 ENSGT00390000015021 ENSGT00940000159891 ENSGT00940000174536 ENSGT00940000166256 Fugu MODERN SPECIES 10 GNAS (ENSTRUG00000013102) ipo9 (ENSTRUG00000012941) shisa4 (ENSTRUG00000022506) LMOD1 (ENSTRUG00000012878) ENSTRUG00000012733 timm17a 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ENSGT01060000248530.C.d ENSGT00950000182848.c.b.a.b ENSGT00390000010923 ENSGT00940000160402 ENSGT00950000182978.A.a.b.b ENSGT01050000244866.D.b.a ENSGT00390000001562 #26 ENSGT00940000157014.f ENSGT00390000002689 ENSGT00940000161168 Ballan wrasse MODERN SPECIES 407 ENSLBEG00000023666 CTTNBP2NL (ENSLBEG00000023653) wnt2ba (ENSLBEG00000023633) st7l (ENSLBEG00000023598) tox2 (ENSLBEG00000023573) SNTA1 (ENSLBEG00000023541) cbfa2t2 (ENSLBEG00000023516) #22 NECAB3 (ENSLBEG00000023491) #23 rbck1 (ENSLBEG00000023414) tbc1d20 (ENSLBEG00000023379) ZNFX1 (ENSLBEG00000023342) Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00950000182810.A.a.a.a ENSGT00940000159809 ENSGT00940000156300.i ENSGT00390000008224 ENSGT00730000111186 ENSGT00940000159825.a.b ENSGT00390000017780.f ENSGT00940000165619.b ENSGT00530000063849.B ENSGT00940000155343.a.b ENSGT00950000182852.B.a ENSGT00940000166225 ENSGT00390000000873.a.a ENSGT00940000158764.g ENSGT00950000182863.A.a.b ENSGT00950000183176.a #22 ENSGT00950000183131.a.f #23 ENSGT00940000166000 ENSGT00390000014944.a ENSGT00940000155154.b ENSGT00940000159376 ENSGT01060000248530.C.d ENSGT00950000182848.c.b.a.b ENSGT00390000010923 ENSGT00940000160402 ENSGT00950000182978.A.a.b.b ENSGT01050000244866.D.b.a ENSGT00390000001562 #26 ENSGT00940000157014.f ENSGT00390000002689 ENSGT00940000161168 Perciformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182810.A.a.a.a ENSGT00940000159809 ENSGT00940000156300.i ENSGT00390000008224 ENSGT00730000111186 ENSGT00940000159825.a.b ENSGT00390000017780.f ENSGT00940000165619.b ENSGT00530000063849.B ENSGT00940000155343.a.b ENSGT00950000182852.B.a ENSGT00940000166225 ENSGT00390000000873.a.a ENSGT00940000158764.g ENSGT00950000182863.A.a.b ENSGT00950000183176.a #22 ENSGT00950000183131.a.f #23 ENSGT00940000166000 ENSGT00390000014944.a ENSGT00940000155154.b ENSGT00940000159376 ENSGT00940000163895 ENSGT01060000248530.C.d ENSGT00950000182848.c.b.a.b ENSGT00390000010923 ENSGT00940000160402 ENSGT00950000182978.A.a.b.b ENSGT01050000244866.D.b.a ENSGT00390000001562 #26 ENSGT00940000157014.f ENSGT00390000002689 Cottioidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182810.A.a.a.a ENSGT00940000159809 ENSGT00940000156300.i ENSGT00390000008224 ENSGT00730000111186 ENSGT00940000159825.a.b ENSGT00390000017780.f ENSGT00940000165619.b ENSGT00530000063849.B ENSGT00940000155343.a.b ENSGT00950000182852.B.a ENSGT00940000166225 ENSGT00390000000873.a.a ENSGT00940000158764.g ENSGT00950000182863.A.a.b ENSGT00950000183176.a #22 ENSGT00950000183131.a.f #23 ENSGT00940000166000 ENSGT00390000014944.a ENSGT00940000155154.b ENSGT00940000159376 ENSGT00950000182848.c.b.a.b ENSGT00390000010923 ENSGT00940000160402 ENSGT00950000182978.A.a.b.b ENSGT01050000244866.D.b.a ENSGT00390000001562 #26 ENSGT00940000157014.f ENSGT00390000002689 ENSGT00940000161168 ENSGT00390000010463.a.a.a.a Lumpfish MODERN SPECIES 20 prelid3b (ENSCLMG00005013194) ENSCLMG00005013212 GNAS (ENSCLMG00005013240) ipo9 (ENSCLMG00005013404) shisa4 (ENSCLMG00005000080) LMOD1 (ENSCLMG00005000108) timm17a 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#23 ENSGT00940000166000 ENSGT00390000014944.a ENSGT00940000155154.b ENSGT00940000159376 ENSGT00940000163895 ENSGT01060000248530.C.d ENSGT00950000182848.c.b.a.b ENSGT00390000010923 ENSGT00940000160402 ENSGT00950000182978.A.a.b.b ENSGT01050000244866.D.b.a ENSGT00390000001562 #26 ENSGT00940000157014.f ENSGT00390000002689 Channel bull blenny MODERN SPECIES 19 prelid3b (ENSCGOG00000013223) ENSCGOG00000013226 ENSCGOG00000013273 ipo9 (ENSCGOG00000014708) shisa4 (ENSCGOG00000015365) LMOD1 (ENSCGOG00000015366) timm17a (ENSCGOG00000015367) rap1ab (ENSCGOG00000015372) INKA2 (ENSCGOG00000015546) KCND3 (ENSCGOG00000015548) CTTNBP2NL (ENSCGOG00000015562) wnt2ba (ENSCGOG00000015569) st7l (ENSCGOG00000015612) tox2 (ENSCGOG00000016757) SNTA1 (ENSCGOG00000016765) cbfa2t2 (ENSCGOG00000016835) #22 NECAB3 (ENSCGOG00000017215) #23 rbck1 (ENSCGOG00000017217) tbc1d20 (ENSCGOG00000017221) ZNFX1 (ENSCGOG00000017228) CDH22 (ENSCGOG00000017329) ENSCGOG00000018091 tfap2c (ENSCGOG00000018093) rtf2 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(ENSSLUG00000001012) bloc1s1 (ENSSLUG00000004132) rdh5 (ENSSLUG00000004157) Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182810.A.a.a.a ENSGT00940000159809 ENSGT00940000156300.i ENSGT00390000008224 ENSGT00730000111186 ENSGT00940000159825.a.b ENSGT00390000017780.f ENSGT00940000165619.b ENSGT00530000063849.B ENSGT00940000155343.a.b ENSGT00950000182852.B.a ENSGT00940000166225 ENSGT00390000000873.a.a ENSGT00940000158764.g ENSGT00950000182863.A.a.b ENSGT00950000183176.a #22 ENSGT00950000183131.a.f #23 ENSGT00940000166000 ENSGT00390000014944.a ENSGT00940000155154.b ENSGT00940000159376 ENSGT00950000182848.c.b.a.b ENSGT00390000010923 ENSGT00940000160402 ENSGT00950000182978.A.a.b.b ENSGT01050000244866.D.b.a ENSGT00390000001562 #26 ENSGT00940000157014.f ENSGT00390000002689 ENSGT00940000161168 ENSGT00390000010463.a.a.a.a Gilthead seabream MODERN SPECIES 20 prelid3b (ENSSAUG00010021278) ENSSAUG00010021276 GNAS (ENSSAUG00010020708) ipo9 (ENSSAUG00010019778) shisa4 (ENSSAUG00010019759) LMOD1 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ENSGT00940000160402 ENSGT00950000182978.A.a.b.b ENSGT01050000244866.D.b.a ENSGT00390000001562 #26 ENSGT00940000157014.f ENSGT00390000002689 ENSGT00940000161168 ENSGT00390000010463.a.a.a.a Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00950000182810.A.a.a.a ENSGT00940000159809 ENSGT00940000156300.i ENSGT00390000008224 ENSGT00730000111186 ENSGT00940000159825.a.b ENSGT00390000017780.f ENSGT00940000165619.b ENSGT00530000063849.B ENSGT00940000155343.a.b ENSGT00950000182852.B.a ENSGT00940000166225 ENSGT00390000000873.a.a ENSGT00940000158764.g ENSGT00950000182863.A.a.b ENSGT00950000183176.a #22 ENSGT00950000183131.a.f #23 ENSGT00940000166000 ENSGT00390000014944.a ENSGT00940000155154.b ENSGT00940000159376 ENSGT00950000182848.c.b.a.b ENSGT00390000010923 ENSGT00940000160402 ENSGT00950000182978.A.a.b.b ENSGT01050000244866.D.b.a ENSGT00390000001562 #26 ENSGT00940000157014.f ENSGT00390000002689 ENSGT00940000161168 ENSGT00390000010463.a.a.a.a Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 1 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(ENSOMEG00000016266) ENSOMEG00000016223 Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00950000182810.A.a.a.a ENSGT00940000159809 ENSGT00940000156300.i ENSGT00390000008224 ENSGT00730000111186 ENSGT00940000159825.a.b ENSGT00390000017780.f ENSGT00940000165619.b ENSGT00530000063849.B ENSGT00940000155343.a.b ENSGT00950000182852.B.a ENSGT00940000166225 ENSGT00390000000873.a.a ENSGT00940000158764.g ENSGT00950000182863.A.a.b ENSGT00950000183176.a #22 ENSGT00950000183131.a.f #23 ENSGT00940000166000 ENSGT00390000014944.a ENSGT00940000155154.b ENSGT00940000159376 ENSGT00950000182848.c.b.a.b ENSGT00940000160402 ENSGT00390000010923 ENSGT00950000182978.A.a.b.b ENSGT01050000244866.D.b.a ENSGT00390000001562 #26 ENSGT00940000157014.f ENSGT00390000002689 ENSGT00940000161168 ENSGT01090000260059.a.b.b.a.a.a.a.a.a.b.a.h.a.b.b.b Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 19 prelid3b (ENSORLG00000005656) ENSORLG00000027123 ENSORLG00000005722 ipo9 (ENSORLG00000005758) shisa4 (ENSORLG00000005773) LMOD1 (ENSORLG00000005777) 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(ENSELUG00000014370) rtf2 (ENSELUG00000014386) tfap2c (ENSELUG00000014423) CDH22 (ENSELUG00000014454) ENSELUG00000031016 ZNFX1 (ENSELUG00000014505) ddx27 (ENSELUG00000014535) ENSELUG00000027297 Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183176.a.g #22 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183176.a.g #22 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183176.a.g #22 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183176.a.g #22 Chinook salmon MODERN SPECIES 201 ENSOTSG00005014871 #22 ENSOTSG00005014869 Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000161320.e.a.a ENSGT00390000004215.a.b.a.k.a ENSGT00940000159430.c ENSGT00390000012914.k.b ENSGT01030000234623.a.a.a.a.a.f ENSGT00940000160207.a ENSGT00940000155094.a.d ENSGT00940000158197.c.f ENSGT00940000166655.j ENSGT01030000234597.a.b.b.f.i.a ENSGT00940000156407.b ENSGT00940000160093.a.a ENSGT00700000104550.a.j.b.d.a ENSGT00940000158764.g.a ENSGT00950000182863.A.a.b.g.b ENSGT00950000183176.a.h.a 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ENSGT00940000160402.b ENSGT00390000010923.d ENSGT00950000182848.c.b.a.b.e ENSGT00940000159376.d ENSGT00940000155154.b.t ENSGT00730000111020.b.b.c ENSGT00510000047836.g.a ENSGT00390000016206.n ENSGT01100000263545.a.b.d.b.f ENSGT00940000165387.b.d ENSGT00950000182905.b.a Chinook salmon MODERN SPECIES 11 ENSOTSG00005046136 tcf15 (ENSOTSG00005046135) ENSOTSG00005045723 slc2a10 (ENSOTSG00005045718) tp53rk (ENSOTSG00005045717) SERINC3 (ENSOTSG00005045508) ENSOTSG00005045504 ENSOTSG00005045503 ENSOTSG00005045499 STMN3 (ENSOTSG00005045498) arfrp1 (ENSOTSG00005045496) KCNQ2 (ENSOTSG00005045047) RALGAPB (ENSOTSG00005044947) tox2 (ENSOTSG00005044943) SNTA1 (ENSOTSG00005044938) cbfa2t2 (ENSOTSG00005044919) #22 ENSOTSG00005044917 #23 ENSOTSG00005044913 itcha (ENSOTSG00005040151) tgm5l (ENSOTSG00005040127) eya2 (ENSOTSG00005040122) GCNT7 (ENSOTSG00005040117) rtf2 (ENSOTSG00005040115) tfap2c (ENSOTSG00005040113) ENSOTSG00005040112 CDH22 (ENSOTSG00005040063) ZNFX1 (ENSOTSG00005040048) 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ENSGT00940000155052 ENSGT01070000254033 ENSGT00730000111020.b.b.d ENSGT00940000153725.a.a Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000012914.k.a ENSGT00940000163348 ENSGT01030000234623.a.a.a.a.a.e ENSGT00940000155094.a.c ENSGT00390000006008 ENSGT00940000158197.c.e ENSGT00940000160694.g.a ENSGT01030000234597.a.b.b.f.i.b ENSGT00940000166655.i ENSGT00940000156407.a ENSGT01100000263529.a.a.a.a.b.c.b.g.b ENSGT00940000160093.a.b ENSGT00700000104550.a.j.b.d.b ENSGT00940000158764.g.b ENSGT00950000182863.A.a.b.g.a ENSGT00950000183176.a.h.b #22 ENSGT00950000183131.a.f.m.a #23 ENSGT00940000157014.f.d ENSGT00390000001562 #26 ENSGT00630000089884.B.b.a.b ENSGT00950000182978.A.a.b.b.c ENSGT00390000010923.c ENSGT00940000160402.a ENSGT00950000182848.c.b.a.b.f ENSGT00990000208694 ENSGT00940000159376.c ENSGT00940000155154.b.s ENSGT00550000074997 ENSGT00940000155052 ENSGT01070000254033 ENSGT00730000111020.b.b.d Chinook salmon DUPLICATION Chinook salmon MODERN SPECIES 31 HELZ2 (ENSOTSG00005015887) STMN3 (ENSOTSG00005015967) ENSOTSG00005015968 ENSOTSG00005015969 arfrp1 (ENSOTSG00005015970) ENSOTSG00005015972 CHRNA4 (ENSOTSG00005015974) KCNQ2 (ENSOTSG00005015978) polr3c (ENSOTSG00005015982) ENSOTSG00005015984 ENSOTSG00005015985 dap3 (ENSOTSG00005015992) tox2 (ENSOTSG00005016122) SNTA1 (ENSOTSG00005016124) cbfa2t2 (ENSOTSG00005016127) #22 cbfa2t2 (ENSOTSG00005016129) #22 ENSOTSG00005016272 #23 itcha (ENSOTSG00005016301) pxmp4 (ENSOTSG00005022785) #26 ENSOTSG00005022787 eya2 (ENSOTSG00005022789) ENSOTSG00005022796 rtf2 (ENSOTSG00005022798) GCNT7 (ENSOTSG00005022803) tfap2c (ENSOTSG00005022805) ENSOTSG00005022806 CDH22 (ENSOTSG00005022807) ENSOTSG00005022811 ZNFX1 (ENSOTSG00005022823) ddx27 (ENSOTSG00005022935) snrpb (ENSOTSG00005024089) Chinook salmon MODERN SPECIES 31 stk35l (ENSOTSG00005015886) HELZ2 (ENSOTSG00005015887) STMN3 (ENSOTSG00005015967) ENSOTSG00005015968 ENSOTSG00005015969 arfrp1 (ENSOTSG00005015970) ENSOTSG00005015972 CHRNA4 (ENSOTSG00005015974) KCNQ2 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(ENSOMYG00000022641) ENSOMYG00000022664 ENSOMYG00000022689 ENSOMYG00000072292 Huchen MODERN SPECIES 4544 cbfa2t2 (ENSHHUG00000039107) #22 ENSHHUG00000039137 ##23 Vertebrata ANCESTRAL SPECIES 1147 ENSGT00390000011067.B ENSGT00950000183176.b ##22 Cyclostomata ANCESTRAL SPECIES 1261 ENSGT00390000011067.B ENSGT00950000183176.b ##22 Lamprey DUPLICATION Lamprey MODERN SPECIES 4112 ENSPMAG00000009503 ##22 ENSPMAG00000009505 ##22 Lamprey MODERN SPECIES 4112 ENSPMAG00000009503 ##22 ENSPMAG00000009505 ##22 Hagfish DUPLICATION Hagfish MODERN SPECIES 599 ENSEBUG00000002664 ENSEBUG00000012515 ENSEBUG00000015107 ENSEBUG00000004214 ENSEBUG00000015374 ENSEBUG00000002852 pskh1 (ENSEBUG00000011738) DYNLRB2 (ENSEBUG00000003468) ENSEBUG00000010610 ##22 ENSEBUG00000013150 Hagfish MODERN SPECIES 719 ENSEBUG00000008242 ENSEBUG00000012898 ##22 ENSEBUG00000005468 ENSEBUG00000011496 ENSEBUG00000014245 USH1G (ENSEBUG00000014482) prpsap2 (ENSEBUG00000006471) ENSEBUG00000006295 gng13b (ENSEBUG00000012294) C1QTNF6 (ENSEBUG00000003205) Gnathostomata DUPLICATION Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183176.b.e ##22 Elephant shark MODERN SPECIES 1708 NRSN2 (ENSCMIG00000003280) trib3 (ENSCMIG00000003274) maf1a (ENSCMIG00000003267) RBCK1 (ENSCMIG00000003256) tbc1d20 (ENSCMIG00000003242) CSNK2A1 (ENSCMIG00000003113) tcf15 (ENSCMIG00000003073) SRXN1 (ENSCMIG00000003072) ENSCMIG00000003071 scrt2 (ENSCMIG00000003070) samhd1 (ENSCMIG00000003068) gss (ENSCMIG00000003060) itcha (ENSCMIG00000001505) dynlrb1 (ENSCMIG00000001068) ENSCMIG00000001060 CBFA2T3 (ENSCMIG00000001029) ##22 ENSCMIG00000001010 ENSCMIG00000001008 #23 ENSCMIG00000001003 ##23 E2F1 (ENSCMIG00000000998) #25 ENSCMIG00000000983 #26 hm13 (ENSCMIG00000000838) arhgap46a (ENSCMIG00000000732) Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 165 ENSGT00940000159615 ENSGT00940000163403 ENSGT00940000164556 ENSGT00940000160442 ENSGT00390000007818 ENSGT00940000156329 ENSGT00940000155966 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000160118 ENSGT00940000157000 ENSGT00950000183176.b.e ##22 ENSGT00940000161325 ENSGT00510000047505 ENSGT00940000157787 ENSGT00390000017259 ENSGT00390000012337 ENSGT00940000157348 ENSGT00390000008797 ENSGT00950000182909.b.b.b ENSGT00940000154511.a ENSGT00390000015359 ENSGT00390000002290 Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00390000015057 ENSGT00960000187029 ENSGT00530000063956.b.a ENSGT00940000158102 ENSGT00950000182832.D.a ENSGT00940000159615 ENSGT00940000163403 ENSGT00940000164556 ENSGT00940000160442 ENSGT00390000007818 ENSGT00940000156329 ENSGT00940000155966 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000160118 ENSGT00940000157000 ENSGT00950000183176.b.e ##22 ENSGT00940000161325 ENSGT00510000047505 ENSGT00940000157787 ENSGT00390000017259 ENSGT00390000012337 ENSGT00940000157348 ENSGT00390000008797 ENSGT00950000182909.b.b.b ENSGT00940000154511.a ENSGT00390000015359 ENSGT00390000002290 ENSGT00940000166375 ENSGT00730000111190 ENSGT01100000263484.B.a ENSGT00530000063823.b.a Coelacanth MODERN SPECIES 1952 CBFA2T3 (ENSLACG00000003682) ##22 Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00390000015057 ENSGT00960000187029 ENSGT00530000063956.b.a ENSGT00940000158102 ENSGT00950000182832.D.a ENSGT00940000159615 ENSGT00940000163403 ENSGT00940000164556 ENSGT00940000160442 ENSGT00390000007818 ENSGT00940000156329 ENSGT00940000155966 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000160118 ENSGT00940000157000 ENSGT00950000183176.b.e ##22 ENSGT00940000161325 ENSGT00510000047505 ENSGT00940000157787 ENSGT00390000017259 ENSGT00390000012337 ENSGT00940000157348 ENSGT00390000008797 ENSGT00950000182909.b.b.b ENSGT00940000154511.a ENSGT00390000015359 ENSGT00390000002290 ENSGT00940000161887 ENSGT00940000166375 ENSGT00730000111190 ENSGT01100000263484.B.a Anura ANCESTRAL SPECIES 59 ENSGT00390000007852 ENSGT00940000158841 ENSGT00390000015057 ENSGT00960000187029 ENSGT00530000063956.b.a ENSGT00950000182832.D.a ENSGT00940000159615 ENSGT00940000163403 ENSGT00940000160442 ENSGT00390000007818 ENSGT00940000156329 ENSGT00940000155966 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000160118 ENSGT00940000157000 ENSGT00950000183176.b.e ##22 ENSGT00940000161325 ENSGT00510000047505 ENSGT00940000157787 ENSGT00390000017259 ENSGT00390000012337 ENSGT00940000157348 ENSGT00390000008797 ENSGT00950000182909.b.b.b ENSGT00940000154511.a ENSGT00550000074901 ENSGT00390000005075 ENSGT01010000229522 ENSGT00390000008295.a ENSGT00940000159573 ENSGT00940000160432 Frog MODERN SPECIES 4 spata2l (ENSXETG00000046155) chmp1a (ENSXETG00000019844) dpep1 (ENSXETG00000019843) ENSXETG00000019839 ENSXETG00000041350 cpne7 (ENSXETG00000019836) rpl13 (ENSXETG00000019835) ENSXETG00000048138 ENSXETG00000048579 spg7 (ENSXETG00000019834) ankrd11 (ENSXETG00000011277) slc22a31 (ENSXETG00000011276) ENSXETG00000038947 cdh15 (ENSXETG00000011269) acsf3 (ENSXETG00000011261) cbfa2t3 (ENSXETG00000011259) ##22 pabpn1l (ENSXETG00000011258) trappc2l (ENSXETG00000027081) galns (ENSXETG00000011256) aprt (ENSXETG00000027084) cdt1 (ENSXETG00000011255) piezo1 (ENSXETG00000011253) ctu2 (ENSXETG00000011252) 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(ENSLLEG00000009231) CMTM3 (ENSLLEG00000009113) ENSLLEG00000009082 Amniota ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00390000015057 ENSGT00960000187029 ENSGT00530000063956.b.a ENSGT00940000158102 ENSGT00950000182832.D.a ENSGT00940000159615 ENSGT00940000163403 ENSGT00940000160442 ENSGT00390000007818 ENSGT00980000200525 ENSGT00940000156329 ENSGT00940000155966 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000160118 ENSGT00940000157000 ENSGT00950000183176.b.e ##22 ENSGT00940000161325 ENSGT00510000047505 ENSGT00940000157787 ENSGT00390000017259 ENSGT00390000012337 ENSGT00940000157348 ENSGT00390000008797 ENSGT00950000182909.b.b.b ENSGT00940000154511.a ENSGT00390000015359 ENSGT00390000002290 ENSGT00940000161887 ENSGT00730000111190 ENSGT01100000263484.B.a ENSGT00530000063823.b.a Sauria ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00960000187029 ENSGT00530000063956.b.a ENSGT00940000158102 ENSGT00950000186123 ENSGT00950000182832.D.a ENSGT00940000159615 ENSGT00940000163403 ENSGT00940000160442 ENSGT00390000007818 ENSGT00980000200525 ENSGT00940000156329 ENSGT00940000155966 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000160118 ENSGT00940000157000 ENSGT00950000183176.b.e ##22 ENSGT00940000161325 ENSGT00510000047505 ENSGT00940000157787 ENSGT00390000017259 ENSGT00390000012337 ENSGT00940000157348 ENSGT00390000008797 ENSGT00950000182909.b.b.b ENSGT00940000154511.a ENSGT00390000015359 ENSGT00390000002290 ENSGT00940000161887 ENSGT00730000111190 ENSGT01100000263484.B.a ENSGT00530000063823.b.a Archelosauria ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00390000015057 ENSGT01030000234925 ENSGT00530000063956.b.a ENSGT00940000158102 ENSGT00950000186123 ENSGT00950000182832.D.a ENSGT00940000159615 ENSGT00940000163403 ENSGT00940000160442 ENSGT00390000007818 ENSGT00940000156329 ENSGT00940000155966 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000160118 ENSGT00940000157000 ENSGT00950000183176.b.e ##22 ENSGT00940000161325 ENSGT00510000047505 ENSGT00940000157787 ENSGT00390000017259 ENSGT00390000012337 ENSGT00940000157348 ENSGT00390000008797 ENSGT00950000182909.b.b.b ENSGT00940000154511.a ENSGT00390000015359 ENSGT00390000002290 ENSGT00940000161887 ENSGT00730000111190 ENSGT01100000263484.B.a ENSGT00390000018596.A.a.a Archosauria ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000158841 ENSGT00390000015057 ENSGT00530000063956.b.a ENSGT00940000158102 ENSGT00950000186123 ENSGT00950000182832.D.a ENSGT00940000159615 ENSGT00940000163403 ENSGT00940000160442 ENSGT00390000007818 ENSGT00940000156329 ENSGT00940000155966 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000160118 ENSGT00940000157000 ENSGT00950000183176.b.e ##22 ENSGT00940000161325 ENSGT00510000047505 ENSGT00940000157787 ENSGT00390000017259 ENSGT00390000012337 ENSGT00940000157348 ENSGT00390000008797 ENSGT00950000182909.b.b.b ENSGT00940000154511.a ENSGT00390000015359 ENSGT00390000002290 ENSGT00940000161887 ENSGT00730000111190 ENSGT01100000263484.B.a ENSGT00390000018596.A.a.a Aves ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000158841 ENSGT00390000015057 ENSGT00530000063956.b.a ENSGT00940000158102 ENSGT00950000186123 ENSGT00950000182832.D.a ENSGT00940000159615 ENSGT00940000163403 ENSGT00940000160442 ENSGT00390000007818 ENSGT00940000156329 ENSGT00940000155966 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000160118 ENSGT00940000157000 ENSGT00950000183176.b.e ##22 ENSGT00940000161325 ENSGT00510000047505 ENSGT00940000157787 ENSGT00390000017259 ENSGT00390000012337 ENSGT00940000157348 ENSGT00390000008797 ENSGT00950000182909.b.b.b ENSGT00940000154511.a ENSGT00390000015359 ENSGT00390000002290 ENSGT00940000161887 ENSGT00730000111190 ENSGT00390000018596.A.a.a ENSGT00530000063823.b.a Neognathae ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00390000007852 ENSGT00940000158841 ENSGT00390000015057 ENSGT00530000063956.b.a ENSGT00940000158102 ENSGT00950000182832.D.a ENSGT00940000159615 ENSGT00940000163403 ENSGT00940000160442 ENSGT00390000007818 ENSGT00940000156329 ENSGT00940000155966 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000160118 ENSGT00940000157000 ENSGT00950000183176.b.e ##22 ENSGT00940000161325 ENSGT00510000047505 ENSGT00940000157787 ENSGT00390000017259 ENSGT00390000012337 ENSGT00940000157348 ENSGT00390000008797 ENSGT00950000182909.b.b.b ENSGT00940000154511.a ENSGT00390000015359 ENSGT00390000002290 ENSGT00940000161887 ENSGT00730000111190 ENSGT00390000018596.A.a.a.r ENSGT00530000063823.b.a Neognathae_b ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000007852 ENSGT00940000158841 ENSGT00390000015057 ENSGT00530000063956.b.a ENSGT00940000158102 ENSGT00950000182832.D.a ENSGT00940000159615 ENSGT00940000163403 ENSGT00940000160442 ENSGT00390000007818 ENSGT00940000156329 ENSGT00940000155966 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000160118 ENSGT00940000157000 ENSGT00950000183176.b.e ##22 ENSGT00940000161325 ENSGT00510000047505 ENSGT00940000157787 ENSGT00390000017259 ENSGT00390000012337 ENSGT00940000157348 ENSGT00390000008797 ENSGT00950000182909.b.b.b ENSGT00940000154511.a ENSGT00390000015359 ENSGT00390000002290 ENSGT00940000161887 ENSGT00730000111190 ENSGT00390000018596.A.a.a.r ENSGT00530000063823.b.a Neognathae_c ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00390000007852 ENSGT00940000158841.b ENSGT00390000015057 ENSGT00530000063956.b.a ENSGT00940000158102 ENSGT00950000182832.D.a ENSGT00940000159615 ENSGT00940000163403 ENSGT00940000160442 ENSGT00390000007818 ENSGT00940000156329 ENSGT00940000155966 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000160118 ENSGT00940000157000.h ENSGT00950000183176.b.e ##22 ENSGT00940000161325 ENSGT00510000047505 ENSGT00940000157787 ENSGT00390000017259 ENSGT00390000012337 ENSGT00390000008797 ENSGT00950000182909.b.b.b ENSGT00940000154511.a ENSGT00390000015359 ENSGT00390000002290 ENSGT00940000161887 ENSGT00730000111190 ENSGT00390000018596.A.a.a.r ENSGT00530000063823.b.a ENSGT00530000065415 Golden eagle MODERN SPECIES 25 ENSACCG00020000553 ENSACCG00020000598 VPS9D1 (ENSACCG00020000628) SPATA2L (ENSACCG00020000663) CDK10 (ENSACCG00020000691) CHMP1A (ENSACCG00020000735) DPEP1 (ENSACCG00020000768) ENSACCG00020000807 CPNE7 (ENSACCG00020000841) RPL13 (ENSACCG00020000873) SPG7 (ENSACCG00020001490) ANKRD11 (ENSACCG00020002114) SLC22A31 (ENSACCG00020002138) CDH15 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PABPN1L (ENSFALG00000003319) TRAPPC2L (ENSFALG00000003339) GALNS (ENSFALG00000003353) APRT (ENSFALG00000028372) CDT1 (ENSFALG00000003381) RNF166 (ENSFALG00000003485) MVD (ENSFALG00000003493) CYBA (ENSFALG00000003496) IL17C (ENSFALG00000003501) ZC3H18 (ENSFALG00000006471) ENSFALG00000006487 ENSFALG00000024837 ENSFALG00000027460 BANP (ENSFALG00000006505) ENSFALG00000006527 Passeriformes_g ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00390000007852 ENSGT00940000158841 ENSGT00390000015057 ENSGT00530000063956.b.a ENSGT00940000158102 ENSGT00950000182832.D.a ENSGT00940000159615 ENSGT00940000163403 ENSGT00940000160442 ENSGT00390000007818 ENSGT00940000156329 ENSGT00940000155966 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000160118 ENSGT00940000157000 ENSGT00950000183176.b.e ##22 ENSGT00940000161325 ENSGT00510000047505 ENSGT00940000157787 ENSGT00390000017259 ENSGT00390000012337 ENSGT00390000008797 ENSGT00950000182909.b.b.b ENSGT00390000015359 ENSGT00390000002290 ENSGT00940000161887 ENSGT00730000111190 ENSGT00390000018596.A.a.a.r ENSGT00530000063823.b.a ENSGT00530000065415 ENSGT00390000011116 Medium ground finch DUPLICATION Medium ground finch MODERN SPECIES 76 DEF8 (ENSGFOG00000005196) ENSGFOG00000005182 MC1R (ENSGFOG00000005172) TCF25 (ENSGFOG00000005151) SPIRE2 (ENSGFOG00000005126) FANCA (ENSGFOG00000005012) ZNF276 (ENSGFOG00000004964) CDK10 (ENSGFOG00000004922) CHMP1A (ENSGFOG00000004907) ENSGFOG00000004867 RPL13 (ENSGFOG00000004794) SPG7 (ENSGFOG00000004756) ANKRD11 (ENSGFOG00000004732) ACSF3 (ENSGFOG00000004695) ENSGFOG00000004675 ##22 ENSGFOG00000004668 ##22 PABPN1L (ENSGFOG00000004646) TRAPPC2L (ENSGFOG00000004629) GALNS (ENSGFOG00000004588) APRT (ENSGFOG00000004563) CDT1 (ENSGFOG00000004538) CTU2 (ENSGFOG00000004243) RNF166 (ENSGFOG00000004228) MVD (ENSGFOG00000004198) CYBA (ENSGFOG00000004191) ENSGFOG00000004188 CIDEC (ENSGFOG00000004180) BANP (ENSGFOG00000004170) CA5B (ENSGFOG00000004148) SLC7A5 (ENSGFOG00000004114) KLHDC4 (ENSGFOG00000004090) Medium ground finch MODERN SPECIES 76 GAS8 (ENSGFOG00000005208) DEF8 (ENSGFOG00000005196) ENSGFOG00000005182 MC1R (ENSGFOG00000005172) TCF25 (ENSGFOG00000005151) SPIRE2 (ENSGFOG00000005126) FANCA (ENSGFOG00000005012) ZNF276 (ENSGFOG00000004964) CDK10 (ENSGFOG00000004922) CHMP1A (ENSGFOG00000004907) ENSGFOG00000004867 RPL13 (ENSGFOG00000004794) SPG7 (ENSGFOG00000004756) ANKRD11 (ENSGFOG00000004732) ACSF3 (ENSGFOG00000004695) ENSGFOG00000004675 ##22 ENSGFOG00000004668 ##22 PABPN1L (ENSGFOG00000004646) TRAPPC2L (ENSGFOG00000004629) GALNS (ENSGFOG00000004588) APRT (ENSGFOG00000004563) CDT1 (ENSGFOG00000004538) CTU2 (ENSGFOG00000004243) RNF166 (ENSGFOG00000004228) MVD (ENSGFOG00000004198) CYBA (ENSGFOG00000004191) ENSGFOG00000004188 CIDEC (ENSGFOG00000004180) BANP (ENSGFOG00000004170) CA5B (ENSGFOG00000004148) SLC7A5 (ENSGFOG00000004114) Passeroidea ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00390000007852 ENSGT00940000158841 ENSGT00390000015057 ENSGT00530000063956.b.a ENSGT00940000158102 ENSGT00950000182832.D.a ENSGT00940000159615 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ENSTGUG00000029764 RNF166 (ENSTGUG00000007729) ENSTGUG00000007724 IL17C (ENSTGUG00000007718) ZC3H18 (ENSTGUG00000007717) ENSTGUG00000007712 ZFPM1 (ENSTGUG00000023942) ENSTGUG00000029627 BANP (ENSTGUG00000007690) CA5B (ENSTGUG00000007678) Galloanserae ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000007852 ENSGT00940000158841 ENSGT00390000015057 ENSGT00530000063956.b.a ENSGT00940000158102 ENSGT00950000182832.D.a ENSGT00940000159615 ENSGT00940000163403 ENSGT00940000160442 ENSGT00390000007818 ENSGT00940000156329 ENSGT00940000155966 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000160118 ENSGT00940000157000 ENSGT00950000183176.b.e ##22 ENSGT00940000161325 ENSGT00510000047505 ENSGT00940000157787 ENSGT00390000017259 ENSGT00390000012337 ENSGT00940000157348 ENSGT00390000008797 ENSGT00950000182909.b.b.b ENSGT00390000015359 ENSGT00390000002290 ENSGT00940000161887 ENSGT00730000111190 ENSGT00390000018596.A.a.a.r ENSGT00530000063823.b.a ENSGT00530000065415 Anatidae ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00390000003058.b.a.b ENSGT00390000007852.c ENSGT00940000158841 ENSGT00530000063956.b.a ENSGT00940000158102 ENSGT00950000182832.D.a ENSGT00940000159615 ENSGT00940000163403 ENSGT00940000160442.s.b ENSGT00390000007818 ENSGT00940000156329 ENSGT00940000155966 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000160118 ENSGT00940000157000 ENSGT00950000183176.b.e ##22 ENSGT00940000161325 ENSGT00510000047505 ENSGT00940000157787 ENSGT00390000017259 ENSGT00390000012337 ENSGT00950000182909.b.b.b ENSGT00940000157348 ENSGT00390000008797 ENSGT00390000015359 ENSGT00940000161887 ENSGT00730000111190 ENSGT00390000018596.A.a.a.r ENSGT00530000063823.b.a ENSGT00530000065415 ENSGT00390000011116 Duck MODERN SPECIES 1527 CBFA2T3 (ENSAPLG00000018441) ##22 Pink-footed goose MODERN SPECIES 125 VPS9D1 (ENSABRG00000002042) CDK10 (ENSABRG00000000380) CHMP1A (ENSABRG00000000311) DPEP1 (ENSABRG00000000270) ENSABRG00000000116 CPNE7 (ENSABRG00000000092) RPL13 (ENSABRG00000000089) SPG7 (ENSABRG00000000073) ANKRD11 (ENSABRG00000000065) SLC22A31 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ENSGT00940000157787 ENSGT00390000017259 ENSGT00390000012337 ENSGT00940000157348 ENSGT00390000008797 ENSGT00950000182909.b.b.b ENSGT00390000015359 ENSGT00390000002290 ENSGT00940000161887 ENSGT00730000111190 ENSGT00390000018596.A.a.a.r ENSGT00530000063823.b.a ENSGT00530000065415 Japanese quail MODERN SPECIES 2 FANCA (ENSCJPG00005015064) ZNF276 (ENSCJPG00005015063) VPS9D1 (ENSCJPG00005015062) SPATA2L (ENSCJPG00005015061) CDK10 (ENSCJPG00005015060) CHMP1A (ENSCJPG00005015059) DPEP1 (ENSCJPG00005015058) ENSCJPG00005015057 CPNE7 (ENSCJPG00005015056) RPL13 (ENSCJPG00005015054) SPG7 (ENSCJPG00005015053) ANKRD11 (ENSCJPG00005015051) SLC22A31 (ENSCJPG00005015050) CDH15 (ENSCJPG00005015049) ACSF3 (ENSCJPG00005015048) CBFA2T3 (ENSCJPG00005015032) ##22 PABPN1L (ENSCJPG00005015031) TRAPPC2L (ENSCJPG00005015030) GALNS (ENSCJPG00005015012) APRT (ENSCJPG00005015010) ENSCJPG00005015009 CDT1 (ENSCJPG00005015007) CTU2 (ENSCJPG00005014999) RNF166 (ENSCJPG00005014998) MVD (ENSCJPG00005014997) CYBA (ENSCJPG00005014996) IL17C (ENSCJPG00005014995) ZC3H18 (ENSCJPG00005014938) CIDEC (ENSCJPG00005014937) ZFPM1 (ENSCJPG00005014936) ENSCJPG00005014935 Phasianidae_b ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00390000007852 ENSGT00940000158841 ENSGT00390000015057 ENSGT00530000063956.b.a ENSGT00940000158102 ENSGT00950000182832.D.a ENSGT00940000159615 ENSGT00940000163403 ENSGT00940000160442 ENSGT00390000007818 ENSGT00940000156329 ENSGT00940000155966 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000160118 ENSGT00940000157000 ENSGT00950000183176.b.e ##22 ENSGT00940000161325 ENSGT00510000047505 ENSGT00940000157787 ENSGT00390000017259 ENSGT00390000012337 ENSGT00940000157348 ENSGT00390000008797 ENSGT00950000182909.b.b.b ENSGT00390000015359 ENSGT00390000002290 ENSGT00940000161887 ENSGT00730000111190 ENSGT00390000018596.A.a.a.r ENSGT00530000063823.b.a ENSGT00530000065415 Chicken MODERN SPECIES 2 SPIRE2 (ENSGALG00010008092) FANCA (ENSGALG00010008083) ZNF276 (ENSGALG00010008073) VPS9D1 (ENSGALG00010008062) CDK10 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PABPN1L (ENSMGAG00000007655) ENSMGAG00000017404 ENSMGAG00000007660 ENSMGAG00000018527 ##22 ENSMGAG00000017375 ##22 ENSMGAG00000007880 ENSMGAG00000020935 ENSMGAG00000007898 ENSMGAG00000008007 ENSMGAG00000008062 ENSMGAG00000008042 ENSMGAG00000008027 SPATA2L (ENSMGAG00000008173) CDK10 (ENSMGAG00000008128) CHMP1A (ENSMGAG00000008105) DPEP1 (ENSMGAG00000008081) ENSMGAG00000008195 ENSMGAG00000008218 SPIRE2 (ENSMGAG00000008320) ENSMGAG00000016832 Turkey MODERN SPECIES 4 ENSMGAG00000007612 ENSMGAG00000021464 ENSMGAG00000007624 ENSMGAG00000019295 ENSMGAG00000007832 ENSMGAG00000007845 ENSMGAG00000007878 RNF166 (ENSMGAG00000007804) ENSMGAG00000007721 ENSMGAG00000007782 CDT1 (ENSMGAG00000007702) APRT (ENSMGAG00000007692) PABPN1L (ENSMGAG00000007655) ENSMGAG00000017404 ENSMGAG00000007660 ENSMGAG00000018527 ##22 ENSMGAG00000017375 ##22 ENSMGAG00000007880 ENSMGAG00000020935 ENSMGAG00000007898 ENSMGAG00000008007 ENSMGAG00000008062 ENSMGAG00000008042 ENSMGAG00000008027 SPATA2L (ENSMGAG00000008173) CDK10 (ENSMGAG00000008128) CHMP1A (ENSMGAG00000008105) DPEP1 (ENSMGAG00000008081) ENSMGAG00000008195 ENSMGAG00000008218 SPIRE2 (ENSMGAG00000008320) Australian saltwater crocodile MODERN SPECIES 35 TCF25 (ENSCPRG00005007965) SPIRE2 (ENSCPRG00005007950) FANCA (ENSCPRG00005007925) ZNF276 (ENSCPRG00005007917) VPS9D1 (ENSCPRG00005007862) SPATA2L (ENSCPRG00005007857) CDK10 (ENSCPRG00005007852) ENSCPRG00005007850 CHMP1A (ENSCPRG00005007842) DPEP1 (ENSCPRG00005007831) ENSCPRG00005007793 ANKRD11 (ENSCPRG00005007785) SLC22A31 (ENSCPRG00005007769) CDH15 (ENSCPRG00005007751) ACSF3 (ENSCPRG00005007740) CBFA2T3 (ENSCPRG00005007731) ##22 PABPN1L (ENSCPRG00005007723) TRAPPC2L (ENSCPRG00005007718) GALNS (ENSCPRG00005007702) APRT (ENSCPRG00005007693) CDT1 (ENSCPRG00005007690) PIEZO1 (ENSCPRG00005007114) CTU2 (ENSCPRG00005007019) RNF166 (ENSCPRG00005007009) MVD (ENSCPRG00005006999) CYBA (ENSCPRG00005006986) IL17C (ENSCPRG00005006982) ZC3H18 (ENSCPRG00005006951) ENSCPRG00005006935 CIDEC (ENSCPRG00005006931) ZFPM1 (ENSCPRG00005006922) Cryptodira ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00390000015057 ENSGT01030000234925 ENSGT00530000063956.b.a ENSGT00940000158102 ENSGT00950000186123 ENSGT00950000182832.D.a ENSGT00940000159615 ENSGT00940000163403 ENSGT00940000160442 ENSGT00390000007818 ENSGT00940000156329 ENSGT00940000155966 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000160118 ENSGT00940000157000 ENSGT00950000183176.b.e ##22 ENSGT00940000161325 ENSGT00510000047505 ENSGT00940000157787 ENSGT00390000017259 ENSGT00390000012337 ENSGT00940000157348 ENSGT00390000008797 ENSGT00950000182909.b.b.b ENSGT00940000154511.a ENSGT00390000015359 ENSGT00390000002290 ENSGT00940000161887 ENSGT00730000111190 ENSGT01100000263484.B.a ENSGT00390000018596.A.a.a Chinese turtle MODERN SPECIES 747 ENSPSIG00000000386 CBFA2T3 (ENSPSIG00000003488) ##22 PABPN1L (ENSPSIG00000003404) TRAPPC2L (ENSPSIG00000003328) GALNS (ENSPSIG00000003213) APRT (ENSPSIG00000003164) CDT1 (ENSPSIG00000003130) Testudinoidea ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00390000015057 ENSGT01030000234925 ENSGT00530000063956.b.a ENSGT00940000158102 ENSGT00950000186123 ENSGT00950000182832.D.a ENSGT00940000159615 ENSGT00940000163403 ENSGT00940000160442 ENSGT00390000007818 ENSGT00940000156329 ENSGT00940000155966 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000160118 ENSGT00940000157000 ENSGT00950000183176.b.e ##22 ENSGT00940000161325 ENSGT00510000047505 ENSGT00940000157787 ENSGT00390000017259 ENSGT00390000012337 ENSGT00940000157348 ENSGT00390000008797 ENSGT00950000182909.b.b.b ENSGT00940000154511.a ENSGT00390000015359 ENSGT00390000002290 ENSGT00940000161887.b ENSGT00940000161887.a ENSGT00730000111190 ENSGT01100000263484.B.a Testudinidae ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00390000015057 ENSGT00960000187029 ENSGT00530000063956.b.a ENSGT00940000158102.e ENSGT00950000186123 ENSGT00950000182832.D.a ENSGT00940000159615 ENSGT00940000163403 ENSGT00940000160442 ENSGT00390000007818 ENSGT00940000156329 ENSGT00940000155966 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000160118 ENSGT00940000157000 ENSGT00950000183176.b.e ##22 ENSGT00940000161325 ENSGT00510000047505 ENSGT00940000157787 ENSGT00390000017259 ENSGT00390000012337 ENSGT00940000157348 ENSGT00390000008797 ENSGT00950000182909.b.b.b ENSGT00940000154511.a ENSGT00390000015359 ENSGT00390000002290 ENSGT00940000161887.b ENSGT00940000161887.a ENSGT00730000111190 ENSGT01100000263484.B.a Abingdon island giant tortoise MODERN SPECIES 2466 ZNF276 (ENSCABG00000005569) VPS9D1 (ENSCABG00000005564) SPATA2L (ENSCABG00000005562) ENSCABG00000005559 ENSCABG00000005556 CHMP1A (ENSCABG00000005555) DPEP1 (ENSCABG00000005551) ENSCABG00000005524 CPNE7 (ENSCABG00000005488) RPL13 (ENSCABG00000005483) SPG7 (ENSCABG00000004070) ANKRD11 (ENSCABG00000004001) SLC22A31 (ENSCABG00000003999) CDH15 (ENSCABG00000003996) ACSF3 (ENSCABG00000003994) CBFA2T3 (ENSCABG00000003991) ##22 PABPN1L (ENSCABG00000003987) TRAPPC2L (ENSCABG00000003983) GALNS (ENSCABG00000003976) APRT (ENSCABG00000003974) CDT1 (ENSCABG00000003970) PIEZO1 (ENSCABG00000003533) CTU2 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ENSTMTG00000011881 ENSTMTG00000011465 ENSTMTG00000011412 ENSTMTG00000011379 ENSTMTG00000011357 ENSTMTG00000011342 ENSTMTG00000011313 ENSTMTG00000011270 ENSTMTG00000010740 ##22 ENSTMTG00000010537 ENSTMTG00000010499 ENSTMTG00000010466 ENSTMTG00000010450 ENSTMTG00000010423 ENSTMTG00000009221 ENSTMTG00000009063 ENSTMTG00000009046 ENSTMTG00000009034 ENSTMTG00000009001 ENSTMTG00000008987 ENSTMTG00000008978 ENSTMTG00000008966 ENSTMTG00000008929 ENSTMTG00000008914 Three-toed box turtle MODERN SPECIES 2272 ENSTMTG00000015355 ENSTMTG00000015324 ENSTMTG00000015318 ENSTMTG00000015158 ENSTMTG00000015133 ENSTMTG00000015119 ENSTMTG00000015101 ENSTMTG00000015078 ENSTMTG00000014945 ENSTMTG00000014907 ENSTMTG00000012858 ENSTMTG00000012644 ENSTMTG00000012609 ENSTMTG00000012562 ENSTMTG00000012544 ENSTMTG00000012396 ##22 ENSTMTG00000012298 ENSTMTG00000012275 ENSTMTG00000012249 ENSTMTG00000012234 ENSTMTG00000012206 ENSTMTG00000011027 ENSTMTG00000010792 ENSTMTG00000010773 ENSTMTG00000010754 ENSTMTG00000010709 ENSTMTG00000010692 ENSTMTG00000010674 ENSTMTG00000010649 ENSTMTG00000010595 ENSTMTG00000010531 painted turtle DUPLICATION painted turtle MODERN SPECIES 708 ANKRD11 (ENSCPBG00000023386) SLC22A31 (ENSCPBG00000023394) CDH15 (ENSCPBG00000023399) ACSF3 (ENSCPBG00000023427) CBFA2T3 (ENSCPBG00000023435) ##22 ENSCPBG00000023439 ##22 PABPN1L (ENSCPBG00000023441) TRAPPC2L (ENSCPBG00000023442) GALNS (ENSCPBG00000023444) APRT (ENSCPBG00000023446) CDT1 (ENSCPBG00000023447) PIEZO1 (ENSCPBG00000023456) CTU2 (ENSCPBG00000023471) RNF166 (ENSCPBG00000023472) SNAI3 (ENSCPBG00000023474) ENSCPBG00000023476 MVD (ENSCPBG00000023478) CYBA (ENSCPBG00000023484) IL17C (ENSCPBG00000023486) ZC3H18 (ENSCPBG00000023488) painted turtle MODERN SPECIES 708 ANKRD11 (ENSCPBG00000023386) SLC22A31 (ENSCPBG00000023394) CDH15 (ENSCPBG00000023399) ACSF3 (ENSCPBG00000023427) CBFA2T3 (ENSCPBG00000023435) ##22 ENSCPBG00000023439 ##22 PABPN1L (ENSCPBG00000023441) TRAPPC2L (ENSCPBG00000023442) GALNS 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ENSGT00940000154511.a ENSGT00390000015359 ENSGT00390000002290 ENSGT00940000166375 ENSGT00730000111190 ENSGT00960000190114 ENSGT01100000263484.B.a Common wall lizard MODERN SPECIES 16 KIAA0513 (ENSPMRG00000011129) SPATA2L (ENSPMRG00000011122) CDK10 (ENSPMRG00000011113) ENSPMRG00000011110 CHMP1A (ENSPMRG00000011106) DPEP1 (ENSPMRG00000011102) ENSPMRG00000011089 CPNE7 (ENSPMRG00000011078) RPL13 (ENSPMRG00000011066) SPG7 (ENSPMRG00000011056) ENSPMRG00000011051 ANKRD11 (ENSPMRG00000011041) SLC22A31 (ENSPMRG00000011030) CDH15 (ENSPMRG00000011023) ACSF3 (ENSPMRG00000011014) CBFA2T3 (ENSPMRG00000010990) ##22 PABPN1L (ENSPMRG00000010979) TRAPPC2L (ENSPMRG00000010973) GALNS (ENSPMRG00000010964) APRT (ENSPMRG00000010959) CDT1 (ENSPMRG00000010950) ENSPMRG00000010945 PIEZO1 (ENSPMRG00000010137) CTU2 (ENSPMRG00000009965) RNF166 (ENSPMRG00000009949) SNAI3 (ENSPMRG00000009942) MVD (ENSPMRG00000009934) CYBA (ENSPMRG00000009927) ENSPMRG00000009923 ZC3H18 (ENSPMRG00000009914) ENSPMRG00000009908 Argentine black and white tegu MODERN SPECIES 51 ENSSMRG00000006779 ZFPM1 (ENSSMRG00000006793) ENSSMRG00000006805 ENSSMRG00000006808 ENSSMRG00000006810 ENSSMRG00000006815 CYBA (ENSSMRG00000006816) MVD (ENSSMRG00000006817) SNAI3 (ENSSMRG00000006819) RNF166 (ENSSMRG00000006820) CTU2 (ENSSMRG00000006821) PIEZO1 (ENSSMRG00000006841) SLC22A31 (ENSSMRG00000006876) CDH15 (ENSSMRG00000006887) ACSF3 (ENSSMRG00000006898) CBFA2T3 (ENSSMRG00000006920) ##22 PABPN1L (ENSSMRG00000006941) TRAPPC2L (ENSSMRG00000006943) GALNS (ENSSMRG00000006944) APRT (ENSSMRG00000006956) CDT1 (ENSSMRG00000007029) ANKRD11 (ENSSMRG00000007052) SPG7 (ENSSMRG00000007056) RPL13 (ENSSMRG00000007063) CPNE7 (ENSSMRG00000007068) ENSSMRG00000007082 ENSSMRG00000007086 DPEP1 (ENSSMRG00000007089) CHMP1A (ENSSMRG00000007095) SPATA2L (ENSSMRG00000007100) ENSSMRG00000007103 Toxicofera ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00390000015057 ENSGT00530000063956.b.a ENSGT00940000158102 ENSGT00950000186123 ENSGT00950000182832.D.a ENSGT00940000159615 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ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000158841.e ENSGT00390000015057 ENSGT00530000063956.b.a ENSGT00940000158102 ENSGT00950000182832.D.a ENSGT00940000159615 ENSGT00940000163403 ENSGT00940000160442 ENSGT00390000007818 ENSGT00980000200525 ENSGT00940000156329 ENSGT00940000155966.s ENSGT00940000162670 ENSGT00940000160118 ENSGT00940000157000.l ENSGT00950000183176.b.e.i.a ##22 ENSGT00940000161325 ENSGT00510000047505 ENSGT00940000157787 ENSGT00390000017259 ENSGT00390000012337 ENSGT00940000157348 ENSGT00390000008797 ENSGT00950000182909.b.b.b ENSGT00940000154511.a ENSGT00390000015359 ENSGT00390000002290 ENSGT00940000166375 ENSGT00730000111190 ENSGT00960000190114 ENSGT01100000263484.B.a Elapidae_a ANCESTRAL SPECIES 56 ENSGT00940000158841.e ENSGT00940000158841.f ENSGT00390000015057 ENSGT00530000063956.b.a ENSGT00940000158102 ENSGT00950000182832.D.a ENSGT00940000159615 ENSGT00940000163403 ENSGT00940000160442 ENSGT00390000007818 ENSGT00940000156329 ENSGT00940000155966.s ENSGT00940000162670 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Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00390000015057 ENSGT00960000187029 ENSGT00530000063956.b.a ENSGT00940000158102 ENSGT00950000182832.D.a ENSGT00940000159615 ENSGT00940000163403.j ENSGT00940000163403.i ENSGT00940000160442 ENSGT00390000007818 ENSGT00940000156329 ENSGT00940000155966 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000160118 ENSGT00940000157000 ENSGT00950000183176.b.e ##22 ENSGT00940000161325 ENSGT00510000047505 ENSGT00940000157787 ENSGT00390000017259 ENSGT00390000012337 ENSGT00940000157348 ENSGT00390000008797 ENSGT00950000182909.b.b.b ENSGT00940000154511.a ENSGT00390000015359 ENSGT00390000002290 ENSGT00940000161887 ENSGT00730000111190 ENSGT01100000263484.B.a ENSGT00530000063823.b.a Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00390000015057 ENSGT00960000187029 ENSGT00530000063956.b.a ENSGT00940000158102 ENSGT00950000182832.D.a ENSGT00940000159615 ENSGT00940000163403.j ENSGT00940000163403.i ENSGT00940000160442 ENSGT00390000007818 ENSGT00940000156329 ENSGT00940000155966 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000160118 ENSGT00940000157000 ENSGT00950000183176.b.e ##22 ENSGT00940000161325 ENSGT00510000047505 ENSGT00940000157787 ENSGT00390000017259 ENSGT00390000012337 ENSGT00940000157348 ENSGT00390000008797 ENSGT00950000182909.b.b.b ENSGT00940000154511.a ENSGT00390000015359 ENSGT00390000002290 ENSGT00940000161887 ENSGT00730000111190 ENSGT01100000263484.B.a ENSGT00530000063823.b.a Common wonbat MODERN SPECIES 312 ZNF276 (ENSVURG00010020658) VPS9D1 (ENSVURG00010020668) ENSVURG00010020678 SPATA2L (ENSVURG00010020681) CDK10 (ENSVURG00010020687) CHMP1A (ENSVURG00010020697) DPEP1 (ENSVURG00010020700) ENSVURG00010020705 CPNE7 (ENSVURG00010020710) ENSVURG00010020720 SPG7 (ENSVURG00010020737) ANKRD11 (ENSVURG00010020745) SLC22A31 (ENSVURG00010020754) CDH15 (ENSVURG00010020758) ACSF3 (ENSVURG00010020768) CBFA2T3 (ENSVURG00010020779) ##22 ENSVURG00010020790 TRAPPC2L (ENSVURG00010020795) GALNS (ENSVURG00010020797) APRT (ENSVURG00010020808) ENSVURG00010020812 PIEZO1 (ENSVURG00010020822) CTU2 (ENSVURG00010020832) ENSVURG00010020837 ENSVURG00010020838 SNAI3 (ENSVURG00010020840) MVD (ENSVURG00010020842) CYBA (ENSVURG00010020848) ENSVURG00010020849 ZC3H18 (ENSVURG00010020855) ENSVURG00010020863 koala MODERN SPECIES 34 ZNF276 (ENSPCIG00000024719) VPS9D1 (ENSPCIG00000024722) ENSPCIG00000036683 ENSPCIG00000024726 CDK10 (ENSPCIG00000024731) CHMP1A (ENSPCIG00000024737) DPEP1 (ENSPCIG00000024739) ENSPCIG00000024742 ENSPCIG00000035926 CPNE7 (ENSPCIG00000022629) SPG7 (ENSPCIG00000024753) ANKRD11 (ENSPCIG00000016771) ENSPCIG00000016774 CDH15 (ENSPCIG00000016775) ACSF3 (ENSPCIG00000014646) CBFA2T3 (ENSPCIG00000007037) ##22 ENSPCIG00000007038 TRAPPC2L (ENSPCIG00000007039) GALNS (ENSPCIG00000007040) ENSPCIG00000007043 PIEZO1 (ENSPCIG00000007075) CTU2 (ENSPCIG00000007465) RNF166 (ENSPCIG00000030690) SNAI3 (ENSPCIG00000007471) MVD (ENSPCIG00000007474) CYBA (ENSPCIG00000007476) IL17C (ENSPCIG00000007478) ZC3H18 (ENSPCIG00000007482) ENSPCIG00000007498 ENSPCIG00000007500 ENSPCIG00000007505 Wallaby MODERN SPECIES 3541 ENSMEUG00000002083 ##22 Tasmanian devil MODERN SPECIES 1 ZNF276 (ENSSHAG00000006045) VPS9D1 (ENSSHAG00000005671) ENSSHAG00000005431 SPATA2L (ENSSHAG00000020909) CDK10 (ENSSHAG00000005046) CHMP1A (ENSSHAG00000004486) DPEP1 (ENSSHAG00000003173) ENSSHAG00000000678 CPNE7 (ENSSHAG00000015959) RPL13 (ENSSHAG00000020515) SPG7 (ENSSHAG00000015455) ANKRD11 (ENSSHAG00000014307) ENSSHAG00000014110 CDH15 (ENSSHAG00000014046) ACSF3 (ENSSHAG00000012810) CBFA2T3 (ENSSHAG00000010129) ##22 ENSSHAG00000010001 TRAPPC2L (ENSSHAG00000025346) GALNS (ENSSHAG00000009521) ENSSHAG00000022499 CDT1 (ENSSHAG00000000481) PIEZO1 (ENSSHAG00000007529) CTU2 (ENSSHAG00000007366) ENSSHAG00000007244 SNAI3 (ENSSHAG00000006702) MVD (ENSSHAG00000005976) CYBA (ENSSHAG00000005777) ENSSHAG00000005664 ENSSHAG00000003741 ENSSHAG00000001804 BANP (ENSSHAG00000002473) Eutheria ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00390000015057 ENSGT00530000063956.b.a ENSGT00940000158102 ENSGT00390000014546 ENSGT00950000182832.D.a 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ENSGT00390000012337 ENSGT00940000157348 ENSGT00390000008797 ENSGT00950000182909.b.b.b ENSGT00940000154511.a ENSGT00390000015359 ENSGT00390000002290 ENSGT00940000161887 ENSGT00730000111190 ENSGT01100000263484.B.a ENSGT00530000063823.b.a Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000007852 ENSGT00940000158841 ENSGT00390000015057 ENSGT00530000063956.b.a ENSGT00940000158102 ENSGT00390000014546 ENSGT00950000182832.D.a ENSGT00940000159615 ENSGT00940000160442 ENSGT00390000007818 ENSGT00940000156329 ENSGT00940000155966 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000160118 ENSGT00940000157000 ENSGT00950000183176.b.e ##22 ENSGT00940000161325 ENSGT00510000047505 ENSGT00940000157787 ENSGT00390000017259 ENSGT00390000012337 ENSGT00940000157348 ENSGT00390000008797 ENSGT00950000182909.b.b.b ENSGT00940000154511.a ENSGT00390000015359 ENSGT00390000002290 ENSGT00940000161887 ENSGT00730000111190 ENSGT01100000263484.B.a ENSGT00530000063823.b.a Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000007852 ENSGT00940000158841 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ENSGT00530000063823.b.a Equus ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00390000003058.b.a.b ENSGT00390000007852 ENSGT00940000158841 ENSGT00390000015057 ENSGT00530000063956.b.a ENSGT00940000158102 ENSGT00390000014546 ENSGT00950000182832.D.a ENSGT00940000159615 ENSGT00940000160442 ENSGT00390000007818 ENSGT00940000156329 ENSGT00940000155966 ENSGT00940000160118 ENSGT00940000157000 ENSGT00950000183176.b.e ##22 ENSGT00940000161325 ENSGT00510000047505 ENSGT00940000157787 ENSGT00390000017259 ENSGT00390000012337 ENSGT00940000157348 ENSGT00390000008797 ENSGT00950000182909.b.b.b ENSGT00940000154511.a ENSGT00390000015359 ENSGT00390000002290 ENSGT00940000161887 ENSGT00730000111190 ENSGT01100000263484.B.a ENSGT00530000063823.b.a Horse MODERN SPECIES 22 TCF25 (ENSECAG00000018986) SPIRE2 (ENSECAG00000011856) FANCA (ENSECAG00000024214) ZNF276 (ENSECAG00000019563) VPS9D1 (ENSECAG00000012538) SPATA2L (ENSECAG00000012197) CDK10 (ENSECAG00000024995) CHMP1A (ENSECAG00000033210) DPEP1 (ENSECAG00000022966) CPNE7 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(ENSRFEG00010014910) ENSRFEG00010014665 ZFPM1 (ENSRFEG00010014593) Megabat MODERN SPECIES 5299 CBFA2T3 (ENSPVAG00000002712) ##22 PABPN1L (ENSPVAG00000002716) TRAPPC2L (ENSPVAG00000002718) GALNS (ENSPVAG00000002723) APRT (ENSPVAG00000002727) CDT1 (ENSPVAG00000002731) Carnivora ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000007852 ENSGT00940000158841 ENSGT00390000015057 ENSGT00530000063956.b.a ENSGT00940000158102 ENSGT00390000014546 ENSGT00950000182832.D.a ENSGT00940000159615 ENSGT00940000160442 ENSGT00390000007818 ENSGT00940000156329 ENSGT00940000155966 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000160118 ENSGT00940000157000 ENSGT00950000183176.b.e ##22 ENSGT00940000161325 ENSGT00510000047505 ENSGT00940000157787 ENSGT00390000017259 ENSGT00390000012337 ENSGT00940000157348 ENSGT00390000008797 ENSGT00950000182909.b.b.b ENSGT00940000154511.a ENSGT00390000015359 ENSGT00390000002290 ENSGT00940000161887 ENSGT00730000111190 ENSGT00530000063823.b.a ENSGT00530000065415 Felidae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000007852 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lion MODERN SPECIES 15 VPS9D1 (ENSPLOG00000011815) SPATA2L (ENSPLOG00000011717) CDK10 (ENSPLOG00000011467) SPATA33 (ENSPLOG00000011398) CHMP1A (ENSPLOG00000011262) DPEP1 (ENSPLOG00000011157) CPNE7 (ENSPLOG00000010878) RPL13 (ENSPLOG00000010753) SPG7 (ENSPLOG00000010152) ANKRD11 (ENSPLOG00000009987) ENSPLOG00000009890 ENSPLOG00000009869 SLC22A31 (ENSPLOG00000009830) CDH15 (ENSPLOG00000009712) ACSF3 (ENSPLOG00000009585) CBFA2T3 (ENSPLOG00000009563) ##22 PABPN1L (ENSPLOG00000009491) TRAPPC2L (ENSPLOG00000009396) GALNS (ENSPLOG00000009345) APRT (ENSPLOG00000009279) CDT1 (ENSPLOG00000008900) ENSPLOG00000008656 CTU2 (ENSPLOG00000008529) RNF166 (ENSPLOG00000008414) SNAI3 (ENSPLOG00000008309) MVD (ENSPLOG00000008247) CYBA (ENSPLOG00000008197) IL17C (ENSPLOG00000008172) ZC3H18 (ENSPLOG00000008137) BANP (ENSPLOG00000007791) CA5A (ENSPLOG00000007724) leopard MODERN SPECIES 60 FANCA (ENSPPRG00000012181) ZNF276 (ENSPPRG00000008094) SPATA2L (ENSPPRG00000006617) CDK10 (ENSPPRG00000005773) SPATA33 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ENSGT00530000063956.b.a ENSGT00940000158102 ENSGT00390000014546 ENSGT00950000182832.D.a ENSGT00940000159615 ENSGT00940000160442 ENSGT00390000007818.e.a ENSGT00940000156329 ENSGT00940000155966 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000160118 ENSGT00940000157000 ENSGT00950000183176.b.e ##22 ENSGT00940000161325 ENSGT00510000047505 ENSGT00940000157787 ENSGT00390000017259 ENSGT00390000012337 ENSGT00940000157348 ENSGT00390000008797 ENSGT00950000182909.b.b.b.f ENSGT00940000154511.a ENSGT00390000015359 ENSGT00390000002290 ENSGT00940000161887 ENSGT00730000111190 ENSGT00530000063823.b.a ENSGT00530000065415 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000007852 ENSGT00940000158841 ENSGT00390000015057 ENSGT00530000063956.b.a ENSGT00940000158102 ENSGT00390000014546 ENSGT00950000182832.D.a ENSGT00940000159615 ENSGT00940000160442 ENSGT00390000007818.e.a ENSGT00940000156329 ENSGT00940000155966.o ENSGT00940000162670 ENSGT00940000160118 ENSGT00940000157000 ENSGT00950000183176.b.e ##22 ENSGT00940000161325 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SPECIES 296 TCF25 (ENSMMNG00015018167) SPIRE2 (ENSMMNG00015018215) FANCA (ENSMMNG00015018287) ZNF276 (ENSMMNG00015018696) VPS9D1 (ENSMMNG00015018789) ENSMMNG00015018925 CDK10 (ENSMMNG00015000039) SPATA33 (ENSMMNG00015000110) CHMP1A (ENSMMNG00015000139) DPEP1 (ENSMMNG00015000186) RPL13 (ENSMMNG00015000239) SPG7 (ENSMMNG00015000288) SLC22A31 (ENSMMNG00015000365) CDH15 (ENSMMNG00015000391) ACSF3 (ENSMMNG00015000443) CBFA2T3 (ENSMMNG00015000500) ##22 PABPN1L (ENSMMNG00015000557) TRAPPC2L (ENSMMNG00015000621) GALNS (ENSMMNG00015000663) APRT (ENSMMNG00015000690) CDT1 (ENSMMNG00015000724) PIEZO1 (ENSMMNG00015000785) CTU2 (ENSMMNG00015000879) ENSMMNG00015000928 SNAI3 (ENSMMNG00015000980) MVD (ENSMMNG00015001001) CYBA (ENSMMNG00015001037) IL17C (ENSMMNG00015001065) ZC3H18 (ENSMMNG00015001109) ZFPM1 (ENSMMNG00015001163) BANP (ENSMMNG00015001362) Beluga whale MODERN SPECIES 12 FANCA (ENSDLEG00000002221) ZNF276 (ENSDLEG00000002305) VPS9D1 (ENSDLEG00000002337) SPATA2L (ENSDLEG00000002403) CDK10 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(ENSBMSG00010020243) TRAPPC2L (ENSBMSG00010020167) GALNS (ENSBMSG00010020134) APRT (ENSBMSG00010020108) CDT1 (ENSBMSG00010020082) CTU2 (ENSBMSG00010019409) RNF166 (ENSBMSG00010019316) SNAI3 (ENSBMSG00010019290) MVD (ENSBMSG00010019271) CYBA (ENSBMSG00010019240) IL17C (ENSBMSG00010019217) ZC3H18 (ENSBMSG00010019187) ENSBMSG00010019135 ZFPM1 (ENSBMSG00010019106) BANP (ENSBMSG00010018677) Pecora ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000007852 ENSGT00940000158841 ENSGT00390000015057 ENSGT00530000063956.b.a ENSGT00940000158102 ENSGT00390000014546 ENSGT00950000182832.D.a ENSGT00940000159615 ENSGT00940000160442 ENSGT00390000007818.e.a ENSGT00940000156329 ENSGT00940000155966 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000160118 ENSGT00940000157000 ENSGT00950000183176.b.e ##22 ENSGT00940000161325 ENSGT00510000047505 ENSGT00940000157787 ENSGT00390000017259 ENSGT00390000012337 ENSGT00940000157348 ENSGT00390000008797 ENSGT00950000182909.b.b.b ENSGT00940000154511.a ENSGT00390000015359 ENSGT00390000002290 ENSGT00940000161887 ENSGT00730000111190 ENSGT01100000263484.B.a ENSGT00530000063823.b.a Yarkand deer MODERN SPECIES 27 SPIRE2 (ENSCHYG00000001206) FANCA (ENSCHYG00000001109) VPS9D1 (ENSCHYG00000001021) ZNF276 (ENSCHYG00000000947) SPATA2L (ENSCHYG00000000928) CDK10 (ENSCHYG00000000898) CHMP1A (ENSCHYG00000000869) DPEP1 (ENSCHYG00000000853) CPNE7 (ENSCHYG00000000789) ENSCHYG00000000757 SPG7 (ENSCHYG00000000517) ANKRD11 (ENSCHYG00000000357) SLC22A31 (ENSCHYG00000000292) CDH15 (ENSCHYG00000000273) ACSF3 (ENSCHYG00000000245) CBFA2T3 (ENSCHYG00000000207) ##22 ENSCHYG00000000170 TRAPPC2L (ENSCHYG00000000144) GALNS (ENSCHYG00000000089) CDT1 (ENSCHYG00000000044) PIEZO1 (ENSCHYG00000003236) CTU2 (ENSCHYG00000003155) RNF166 (ENSCHYG00000003134) SNAI3 (ENSCHYG00000003114) MVD (ENSCHYG00000003094) IL17C (ENSCHYG00000003083) CYBA (ENSCHYG00000003064) ZC3H18 (ENSCHYG00000003027) ZFPM1 (ENSCHYG00000002961) ZNF469 (ENSCHYG00000002944) BANP (ENSCHYG00000002777) Percora_a ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000007852 ENSGT00940000158841 ENSGT00390000015057 ENSGT00530000063956.b.a ENSGT00940000158102 ENSGT00390000014546 ENSGT00950000182832.D.a ENSGT00940000159615 ENSGT00940000160442 ENSGT00390000007818.e.a ENSGT00940000156329 ENSGT00940000155966 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000160118 ENSGT00940000157000 ENSGT00950000183176.b.e ##22 ENSGT00940000161325 ENSGT00510000047505 ENSGT00940000157787 ENSGT00390000017259 ENSGT00390000012337 ENSGT00940000157348 ENSGT00390000008797 ENSGT00950000182909.b.b.b ENSGT00940000154511.a ENSGT00390000015359 ENSGT00390000002290 ENSGT00940000161887 ENSGT00730000111190 ENSGT01100000263484.B.a ENSGT00530000063823.b.a Bovidae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000007852 ENSGT00940000158841 ENSGT00390000015057 ENSGT00530000063956.b.a ENSGT00940000158102 ENSGT00390000014546 ENSGT00950000182832.D.a ENSGT00940000159615 ENSGT00940000160442 ENSGT00390000007818.e.a ENSGT00940000156329 ENSGT00940000155966 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000160118 ENSGT00940000157000 ENSGT00950000183176.b.e ##22 ENSGT00940000161325 ENSGT00510000047505 ENSGT00940000157787 ENSGT00390000017259 ENSGT00390000012337 ENSGT00940000157348 ENSGT00390000008797 ENSGT00950000182909.b.b.b ENSGT00940000154511.a ENSGT00390000015359 ENSGT00390000002290 ENSGT00940000161887 ENSGT00730000111190 ENSGT01100000263484.B.a ENSGT00530000063823.b.a Bovinae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000007852 ENSGT00940000158841 ENSGT00390000015057 ENSGT00530000063956.b.a ENSGT00940000158102 ENSGT00390000014546 ENSGT00950000182832.D.a ENSGT00940000159615 ENSGT00940000160442 ENSGT00390000007818.e.a ENSGT00940000156329 ENSGT00940000155966 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000160118 ENSGT00940000157000 ENSGT00950000183176.b.e ##22 ENSGT00940000161325 ENSGT00510000047505 ENSGT00940000157787 ENSGT00390000017259 ENSGT00390000012337 ENSGT00940000157348 ENSGT00390000008797 ENSGT00950000182909.b.b.b ENSGT00940000154511.a ENSGT00390000015359 ENSGT00390000002290 ENSGT00940000161887 ENSGT00730000111190 ENSGT01100000263484.B.a ENSGT00530000063823.b.a Bos ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000007852 ENSGT00940000158841 ENSGT00390000015057 ENSGT00530000063956.b.a ENSGT00940000158102 ENSGT00390000014546 ENSGT00950000182832.D.a ENSGT00940000159615 ENSGT00940000160442 ENSGT00390000007818.e.a ENSGT00940000156329 ENSGT00940000155966 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000160118 ENSGT00940000157000 ENSGT00950000183176.b.e ##22 ENSGT00940000161325 ENSGT00510000047505 ENSGT00940000157787 ENSGT00390000017259 ENSGT00390000012337 ENSGT00940000157348 ENSGT00390000008797 ENSGT00950000182909.b.b.b ENSGT00940000154511.a ENSGT00390000015359 ENSGT00390000002290 ENSGT00940000161887 ENSGT00730000111190 ENSGT01100000263484.B.a ENSGT00530000063823.b.a Bos_a ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00390000007852 ENSGT00940000158841 ENSGT00390000015057 ENSGT00530000063956.b.a ENSGT00940000158102 ENSGT00390000014546 ENSGT00950000182832.D.a ENSGT00940000159615 ENSGT00940000160442 ENSGT00390000007818.e.a ENSGT00940000156329 ENSGT00940000155966 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000160118 ENSGT00940000157000 ENSGT00950000183176.b.e ##22 ENSGT00940000161325 ENSGT00510000047505 ENSGT00940000157787 ENSGT00390000017259 ENSGT00390000012337 ENSGT00940000157348 ENSGT00390000008797 ENSGT00950000182909.b.b.b ENSGT00940000154511.a ENSGT00390000015359 ENSGT00390000002290 ENSGT00940000161887 ENSGT00730000111190 ENSGT01100000263484.B.a ENSGT00530000063823.b.a Domestic yak MODERN SPECIES 12 SPIRE2 (ENSBGRG00000025749) FANCA (ENSBGRG00000026229) VPS9D1 (ENSBGRG00000026719) SPATA2L (ENSBGRG00000026749) CDK10 (ENSBGRG00000026766) ENSBGRG00000026801 CHMP1A (ENSBGRG00000026824) DPEP1 (ENSBGRG00000026852) CPNE7 (ENSBGRG00000026854) ENSBGRG00000026855 SPG7 (ENSBGRG00000026859) ANKRD11 (ENSBGRG00000026866) ENSBGRG00000026870 CDH15 (ENSBGRG00000026871) ACSF3 (ENSBGRG00000026875) CBFA2T3 (ENSBGRG00000026878) ##22 ENSBGRG00000026880 TRAPPC2L (ENSBGRG00000026882) ENSBGRG00000026885 GALNS (ENSBGRG00000026887) APRT (ENSBGRG00000026889) CDT1 (ENSBGRG00000026890) PIEZO1 (ENSBGRG00000026892) CTU2 (ENSBGRG00000026899) ENSBGRG00000026904 SNAI3 (ENSBGRG00000026905) MVD (ENSBGRG00000026907) CYBA (ENSBGRG00000026909) IL17C (ENSBGRG00000026910) ZC3H18 (ENSBGRG00000026911) ENSBGRG00000026913 Wild yak MODERN SPECIES 488 FANCA (ENSBMUG00000011777) ZNF276 (ENSBMUG00000011836) VPS9D1 (ENSBMUG00000012041) SPATA2L (ENSBMUG00000012376) CDK10 (ENSBMUG00000012383) ENSBMUG00000012395 ENSBMUG00000012413 DPEP1 (ENSBMUG00000012426) CPNE7 (ENSBMUG00000012611) RPL13 (ENSBMUG00000012686) SPG7 (ENSBMUG00000012712) ANKRD11 (ENSBMUG00000012807) SLC22A31 (ENSBMUG00000012847) CDH15 (ENSBMUG00000012874) ACSF3 (ENSBMUG00000012901) CBFA2T3 (ENSBMUG00000013034) ##22 PABPN1L (ENSBMUG00000013084) TRAPPC2L (ENSBMUG00000013133) GALNS (ENSBMUG00000013165) ENSBMUG00000013182 CDT1 (ENSBMUG00000013216) ENSBMUG00000013286 ENSBMUG00000013338 CTU2 (ENSBMUG00000013372) RNF166 (ENSBMUG00000013384) SNAI3 (ENSBMUG00000013406) MVD (ENSBMUG00000013426) CYBA (ENSBMUG00000013440) IL17C (ENSBMUG00000013455) ZC3H18 (ENSBMUG00000013519) ENSBMUG00000013540 Bos_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007852 ENSGT00940000158841 ENSGT00390000015057 ENSGT00530000063956.b.a ENSGT00940000158102 ENSGT00390000014546 ENSGT00950000182832.D.a ENSGT00940000159615 ENSGT00940000160442 ENSGT00390000007818.e.a ENSGT00940000156329 ENSGT00940000155966 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000160118 ENSGT00940000157000 ENSGT00950000183176.b.e ##22 ENSGT00940000161325 ENSGT00510000047505 ENSGT00940000157787 ENSGT00390000017259 ENSGT00390000012337 ENSGT00940000157348 ENSGT00390000008797 ENSGT00950000182909.b.b.b ENSGT00940000154511.a ENSGT00390000015359 ENSGT00390000002290 ENSGT00940000161887 ENSGT00730000111190 ENSGT01100000263484.B.a ENSGT00530000063823.b.a Cow MODERN SPECIES 9 FANCA (ENSBTAG00000001906) ZNF276 (ENSBTAG00000001904) VPS9D1 (ENSBTAG00000021165) SPATA2L (ENSBTAG00000033334) CDK10 (ENSBTAG00000033333) SPATA33 (ENSBTAG00000052192) CHMP1A (ENSBTAG00000033331) DPEP1 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(ENSBBBG00000003922) APRT (ENSBBBG00000015695) CDT1 (ENSBBBG00000015673) ENSBBBG00000003908 CTU2 (ENSBBBG00000015652) RNF166 (ENSBBBG00000015638) SNAI3 (ENSBBBG00000003436) MVD (ENSBBBG00000003446) CYBA (ENSBBBG00000003459) IL17C (ENSBBBG00000003473) ENSBBBG00000003897 ENSBBBG00000003895 ENSBBBG00000015589 Caprinae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000007852 ENSGT00940000158841 ENSGT00390000015057 ENSGT00530000063956.b.a ENSGT00940000158102 ENSGT00390000014546 ENSGT00950000182832.D.a ENSGT00940000159615 ENSGT00940000160442 ENSGT00390000007818.e.a ENSGT00940000156329 ENSGT00940000155966 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000160118 ENSGT00940000157000 ENSGT00950000183176.b.e ##22 ENSGT00940000161325 ENSGT00510000047505 ENSGT00940000157787 ENSGT00390000017259 ENSGT00390000012337 ENSGT00940000157348 ENSGT00390000008797 ENSGT00950000182909.b.b.b ENSGT00940000154511.a ENSGT00390000015359 ENSGT00390000002290 ENSGT00940000161887 ENSGT00730000111190.i ENSGT00530000063823.b.a ENSGT00390000011116 Goat MODERN SPECIES 9 SPIRE2 (ENSCHIG00000019449) FANCA (ENSCHIG00000003612) ZNF276 (ENSCHIG00000017992) VPS9D1 (ENSCHIG00000025705) SPATA2L (ENSCHIG00000017204) CDK10 (ENSCHIG00000009612) CHMP1A (ENSCHIG00000025480) DPEP1 (ENSCHIG00000013192) CPNE7 (ENSCHIG00000021800) ENSCHIG00000001441 SPG7 (ENSCHIG00000015886) ENSCHIG00000014177 SLC22A31 (ENSCHIG00000011227) CDH15 (ENSCHIG00000019029) ACSF3 (ENSCHIG00000012787) CBFA2T3 (ENSCHIG00000024719) ##22 PABPN1L (ENSCHIG00000013987) TRAPPC2L (ENSCHIG00000022896) GALNS (ENSCHIG00000014398) APRT (ENSCHIG00000018530) CDT1 (ENSCHIG00000012478) PIEZO1 (ENSCHIG00000021797) CTU2 (ENSCHIG00000014854) RNF166 (ENSCHIG00000026588) SNAI3 (ENSCHIG00000018087) MVD (ENSCHIG00000019348) CYBA (ENSCHIG00000014395) IL17C (ENSCHIG00000023815) ENSCHIG00000026768 ENSCHIG00000019746 ZFPM1 (ENSCHIG00000010239) Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 5 TUBB3 (ENSOARG00020003541) MC1R (ENSOARG00020003524) TCF25 (ENSOARG00020003444) ZNF276 (ENSOARG00020003180) SPATA2L 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ENSGT00940000157787 ENSGT00390000017259 ENSGT00390000012337 ENSGT00940000157348 ENSGT00390000008797 ENSGT00950000182909.b.b.b ENSGT00940000154511.a ENSGT00390000015359 ENSGT00390000002290 ENSGT00940000161887 ENSGT00730000111190 ENSGT00530000063823.b.a ENSGT00530000065415 Arabian camel MODERN SPECIES 13 FANCA (ENSCDRG00005019227) ZNF276 (ENSCDRG00005019848) VPS9D1 (ENSCDRG00005019863) SPATA2L (ENSCDRG00005019883) CDK10 (ENSCDRG00005019898) CHMP1A (ENSCDRG00005019955) DPEP1 (ENSCDRG00005019995) ENSCDRG00005020022 ENSCDRG00005020032 ENSCDRG00005020054 ENSCDRG00005020079 ANKRD11 (ENSCDRG00005020124) SLC22A31 (ENSCDRG00005020212) CDH15 (ENSCDRG00005020247) ACSF3 (ENSCDRG00005020347) CBFA2T3 (ENSCDRG00005020363) ##22 PABPN1L (ENSCDRG00005020384) TRAPPC2L (ENSCDRG00005020411) GALNS (ENSCDRG00005020434) APRT (ENSCDRG00005020463) CDT1 (ENSCDRG00005020480) ENSCDRG00005020494 CTU2 (ENSCDRG00005020514) RNF166 (ENSCDRG00005020545) SNAI3 (ENSCDRG00005020562) MVD (ENSCDRG00005020571) CYBA (ENSCDRG00005020585) IL17C (ENSCDRG00005020593) ZC3H18 (ENSCDRG00005020605) ZFPM1 (ENSCDRG00005020620) ZNF469 (ENSCDRG00005020636) Suina ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00390000005563 ENSGT00390000003058.b.a.b ENSGT00390000007852 ENSGT00940000158841 ENSGT00390000015057 ENSGT00530000063956.b.a ENSGT00940000158102 ENSGT00950000182832.D.a ENSGT00940000159615 ENSGT00940000160442 ENSGT00390000007818 ENSGT00940000156329 ENSGT00940000155966 ENSGT00940000160118 ENSGT00940000157000 ENSGT00950000183176.b.e ##22 ENSGT00940000161325 ENSGT00510000047505 ENSGT00940000157787 ENSGT00390000017259 ENSGT00390000012337 ENSGT00940000157348 ENSGT00390000008797 ENSGT00950000182909.b.b.b ENSGT00940000154511.a ENSGT00390000015359 ENSGT00390000002290 ENSGT00940000161887 ENSGT00730000111190 ENSGT00530000063823.b.a ENSGT00530000065415 Pig MODERN SPECIES 14 SPIRE2 (ENSSSCG00000002635) FANCA (ENSSSCG00000024687) ZNF276 (ENSSSCG00000029228) VPS9D1 (ENSSSCG00000022310) SPATA2L (ENSSSCG00000029339) CDK10 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SPECIES ENSGT00950000183176.b.e ##22 Common shrew MODERN SPECIES 6784 ENSSARG00000002151 ##22 Hedgehog MODERN SPECIES 2727 ENSEEUG00000013428 ##22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000015057 ENSGT00530000063956.b.a ENSGT00940000158102 ENSGT00390000014546 ENSGT00950000182832.D.a ENSGT00940000159615 ENSGT00940000163403 ENSGT00940000160442 ENSGT00390000007818 ENSGT00980000200525 ENSGT00940000156329 ENSGT00940000155966 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000160118 ENSGT00940000157000 ENSGT00950000183176.b.e ##22 ENSGT00940000161325 ENSGT00510000047505.d ENSGT00940000157787 ENSGT00390000017259 ENSGT00390000012337 ENSGT00940000157348 ENSGT00390000008797 ENSGT00950000182909.b.b.b ENSGT00940000154511.a ENSGT00390000015359 ENSGT00390000002290 ENSGT00940000161887 ENSGT00730000111190 ENSGT01100000263484.B.a ENSGT00530000063823.b.a Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000015057 ENSGT00530000063956.b.a ENSGT00940000158102 ENSGT00390000014546 ENSGT00950000182832.D.a ENSGT00940000159615 ENSGT00940000163403 ENSGT00940000160442 ENSGT00390000007818 ENSGT00980000200525 ENSGT00940000156329 ENSGT00940000155966 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000160118 ENSGT00940000157000 ENSGT00950000183176.b.e ##22 ENSGT00940000161325 ENSGT00510000047505.d ENSGT00940000157787 ENSGT00390000017259 ENSGT00390000012337 ENSGT00940000157348 ENSGT00390000008797 ENSGT00950000182909.b.b.b ENSGT00940000154511.a ENSGT00390000015359 ENSGT00390000002290 ENSGT00940000161887 ENSGT00730000111190 ENSGT01100000263484.B.a ENSGT00530000063823.b.a Glires ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000015057 ENSGT00530000063956.b.a ENSGT00940000158102 ENSGT00390000014546 ENSGT00950000182832.D.a ENSGT00940000159615 ENSGT00940000163403 ENSGT00940000160442 ENSGT00390000007818 ENSGT00980000200525 ENSGT00940000156329 ENSGT00940000155966 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000160118 ENSGT00940000157000 ENSGT00950000183176.b.e ##22 ENSGT00940000161325 ENSGT00510000047505.d ENSGT00940000157787 ENSGT00390000017259 ENSGT00390000012337 ENSGT00940000157348 ENSGT00390000008797 ENSGT00950000182909.b.b.b ENSGT00940000154511.a ENSGT00390000015359 ENSGT00390000002290 ENSGT00940000161887 ENSGT00730000111190 ENSGT01100000263484.B.a ENSGT00530000063823.b.a Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES 354 ENSGT00950000183176.b.e ##22 ENSGT00940000161325 ENSGT00940000165912 ENSGT00940000157787 ENSGT00390000017259 Pika MODERN SPECIES 4529 ENSOPRG00000005611 ##22 PABPN1L (ENSOPRG00000005597) ENSOPRG00000005587 GALNS (ENSOPRG00000005546) ENSOPRG00000005530 Rodentia ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000015057 ENSGT00530000063956.b.a ENSGT00940000158102 ENSGT00390000014546 ENSGT00950000182832.D.a ENSGT00940000159615 ENSGT00940000163403 ENSGT00940000160442 ENSGT00390000007818 ENSGT00980000200525 ENSGT00940000156329 ENSGT00940000155966 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000160118 ENSGT00940000157000 ENSGT00950000183176.b.e ##22 ENSGT00940000161325 ENSGT00510000047505.d ENSGT00940000157787 ENSGT00390000017259 ENSGT00390000012337 ENSGT00940000157348 ENSGT00390000008797 ENSGT00950000182909.b.b.b ENSGT00940000154511.a ENSGT00390000015359 ENSGT00390000002290 ENSGT00940000161887 ENSGT00730000111190 ENSGT01100000263484.B.a ENSGT00530000063823.b.a Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000015057 ENSGT00530000063956.b.a ENSGT00940000158102 ENSGT00390000014546 ENSGT00950000182832.D.a ENSGT00940000159615 ENSGT00940000163403 ENSGT00940000160442 ENSGT00390000007818 ENSGT00980000200525 ENSGT00940000156329 ENSGT00940000155966 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000160118 ENSGT00940000157000 ENSGT00950000183176.b.e ##22 ENSGT00940000161325 ENSGT00510000047505.d ENSGT00940000157787 ENSGT00390000017259 ENSGT00390000012337 ENSGT00940000157348 ENSGT00390000008797 ENSGT00950000182909.b.b.b ENSGT00940000154511.a ENSGT00390000015359 ENSGT00390000002290 ENSGT00940000161887 ENSGT00730000111190 ENSGT00530000063823.b.a ENSGT00530000065415 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000158841 ENSGT00390000015057 ENSGT00530000063956.b.a ENSGT00940000158102 ENSGT00390000014546 ENSGT00950000182832.D.a ENSGT00940000159615 ENSGT00940000160442 ENSGT00390000007818 ENSGT00980000200525 ENSGT00940000156329 ENSGT00940000155966 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000160118 ENSGT00940000157000 ENSGT00950000183176.b.e ##22 ENSGT00940000161325 ENSGT00510000047505.d ENSGT00940000157787 ENSGT00390000017259 ENSGT00390000012337 ENSGT00940000157348 ENSGT00390000008797 ENSGT00950000182909.b.b.b ENSGT00940000154511.a ENSGT00390000015359 ENSGT00390000002290 ENSGT00940000161887.f ENSGT00730000111190 ENSGT00530000063823.b.a ENSGT00530000065415 Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 8 ZNF276 (ENSSVLG00005018741) VPS9D1 (ENSSVLG00005018934) SPATA2L (ENSSVLG00005019298) CDK10 (ENSSVLG00005019348) SPATA33 (ENSSVLG00005019508) CHMP1A (ENSSVLG00005019640) DPEP1 (ENSSVLG00005019718) CPNE7 (ENSSVLG00005019880) RPL13 (ENSSVLG00005020235) ENSSVLG00005020309 SPG7 (ENSSVLG00005020448) ANKRD11 (ENSSVLG00005021411) SLC22A31 (ENSSVLG00005021491) CDH15 (ENSSVLG00005021588) ACSF3 (ENSSVLG00005021795) CBFA2T3 (ENSSVLG00005021892) ##22 PABPN1L (ENSSVLG00005022098) TRAPPC2L (ENSSVLG00005022327) GALNS (ENSSVLG00005022395) APRT (ENSSVLG00005022428) CDT1 (ENSSVLG00005022481) CTU2 (ENSSVLG00005024007) RNF166 (ENSSVLG00005024047) SNAI3 (ENSSVLG00005024096) MVD (ENSSVLG00005024123) CYBA (ENSSVLG00005024171) IL17C (ENSSVLG00005024189) ZC3H18 (ENSSVLG00005024223) ZFPM1 (ENSSVLG00005024272) BANP (ENSSVLG00005024587) CA5A (ENSSVLG00005024653) Marmotini ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00390000007852 ENSGT00940000158841 ENSGT00390000015057 ENSGT00530000063956.b.a ENSGT00940000158102 ENSGT00390000014546 ENSGT00950000182832.D.a ENSGT00940000159615 ENSGT00940000160442 ENSGT00390000007818 ENSGT00940000156329 ENSGT00940000155966 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000160118 ENSGT00940000157000 ENSGT00950000183176.b.e ##22 ENSGT00940000161325 ENSGT00510000047505.d.i ENSGT00940000157787 ENSGT00390000017259 ENSGT00390000012337 ENSGT00940000157348 ENSGT00390000008797 ENSGT00950000182909.b.b.b ENSGT00940000154511.a ENSGT00390000015359 ENSGT00390000002290 ENSGT00940000161887.f ENSGT00730000111190 ENSGT00530000063823.b.a ENSGT00530000065415 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 64 ENSGT00390000007852 ENSGT00940000158841 ENSGT00390000015057 ENSGT00530000063956.b.a ENSGT00940000158102 ENSGT00390000014546 ENSGT00950000182832.D.a ENSGT00940000159615 ENSGT00940000160442 ENSGT00390000007818 ENSGT00940000156329 ENSGT00940000155966.k ENSGT00940000162670 ENSGT00940000160118 ENSGT00940000157000 ENSGT00950000183176.b.e ##22 ENSGT00940000161325 ENSGT00510000047505.d.i ENSGT00940000157787 ENSGT00390000017259 ENSGT00390000012337 ENSGT00940000157348 ENSGT00390000008797 ENSGT00950000182909.b.b.b ENSGT00940000154511.a ENSGT00390000015359 ENSGT00390000002290 ENSGT00940000161887.f ENSGT00730000111190 ENSGT00530000063823.b.a ENSGT00530000065415 Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 254 FANCA (ENSUPAG00010016155) ZNF276 (ENSUPAG00010016143) VPS9D1 (ENSUPAG00010016108) SPATA2L (ENSUPAG00010016102) CDK10 (ENSUPAG00010016080) SPATA33 (ENSUPAG00010016075) CHMP1A (ENSUPAG00010016059) DPEP1 (ENSUPAG00010016045) CPNE7 (ENSUPAG00010016021) RPL13 (ENSUPAG00010016011) SPG7 (ENSUPAG00010015952) ANKRD11 (ENSUPAG00010015938) SLC22A31 (ENSUPAG00010015933) CDH15 (ENSUPAG00010015916) ACSF3 (ENSUPAG00010015909) CBFA2T3 (ENSUPAG00010015810) ##22 PABPN1L (ENSUPAG00010015748) ENSUPAG00010015728 GALNS (ENSUPAG00010015693) APRT (ENSUPAG00010015685) CDT1 (ENSUPAG00010015658) ENSUPAG00010015536 CTU2 (ENSUPAG00010015526) RNF166 (ENSUPAG00010015514) SNAI3 (ENSUPAG00010015507) MVD (ENSUPAG00010015487) CYBA (ENSUPAG00010015480) IL17C (ENSUPAG00010015474) ZC3H18 (ENSUPAG00010015235) ZFPM1 (ENSUPAG00010015217) ENSUPAG00010015213 Squirrel MODERN SPECIES 241 SPIRE2 (ENSSTOG00000008062) FANCA (ENSSTOG00000013992) ZNF276 (ENSSTOG00000013982) VPS9D1 (ENSSTOG00000020938) SPATA2L (ENSSTOG00000020942) CDK10 (ENSSTOG00000020862) ENSSTOG00000011971 CHMP1A (ENSSTOG00000023813) DPEP1 (ENSSTOG00000011941) CPNE7 (ENSSTOG00000019772) RPL13 (ENSSTOG00000011963) SPG7 (ENSSTOG00000014682) ENSSTOG00000028622 CDH15 (ENSSTOG00000015320) ACSF3 (ENSSTOG00000027519) CBFA2T3 (ENSSTOG00000021485) ##22 PABPN1L (ENSSTOG00000020814) TRAPPC2L (ENSSTOG00000007271) GALNS (ENSSTOG00000025556) APRT (ENSSTOG00000010846) CDT1 (ENSSTOG00000027593) PIEZO1 (ENSSTOG00000004005) CTU2 (ENSSTOG00000003978) RNF166 (ENSSTOG00000003956) SNAI3 (ENSSTOG00000021205) MVD (ENSSTOG00000016332) CYBA (ENSSTOG00000020835) IL17C (ENSSTOG00000022407) ZC3H18 (ENSSTOG00000022431) ZFPM1 (ENSSTOG00000027139) BANP (ENSSTOG00000009245) Alpin marmot MODERN SPECIES 43 VPS9D1 (ENSMMMG00000008522) SPATA2L (ENSMMMG00000009267) CDK10 (ENSMMMG00000009277) ENSMMMG00000009305 ENSMMMG00000009322 CHMP1A (ENSMMMG00000009328) DPEP1 (ENSMMMG00000009340) ENSMMMG00000009365 RPL13 (ENSMMMG00000009384) SPG7 (ENSMMMG00000009398) ENSMMMG00000009488 ENSMMMG00000009531 SLC22A31 (ENSMMMG00000009538) CDH15 (ENSMMMG00000009550) ACSF3 (ENSMMMG00000009572) ENSMMMG00000009585 ##22 PABPN1L (ENSMMMG00000009594) ENSMMMG00000009629 GALNS (ENSMMMG00000009650) APRT (ENSMMMG00000009691) CDT1 (ENSMMMG00000009699) CTU2 (ENSMMMG00000010375) RNF166 (ENSMMMG00000010714) SNAI3 (ENSMMMG00000010735) MVD (ENSMMMG00000010755) CYBA (ENSMMMG00000010774) IL17C (ENSMMMG00000010778) ZC3H18 (ENSMMMG00000010787) ENSMMMG00000011032 BANP (ENSMMMG00000011037) CA5A (ENSMMMG00000011084) Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES 59 ENSGT00940000158841 ENSGT00390000015057 ENSGT00530000063956.b.a ENSGT00940000158102 ENSGT00390000014546 ENSGT00950000182832.D.a ENSGT00940000159615 ENSGT00940000163403 ENSGT00940000160442 ENSGT00390000007818 ENSGT00940000156329 ENSGT00940000155966 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000160118 ENSGT00940000157000 ENSGT00950000183176.b.e ##22 ENSGT00940000161325 ENSGT00510000047505.d ENSGT00940000157787 ENSGT00390000017259 ENSGT00390000012337 ENSGT00940000157348 ENSGT00390000008797 ENSGT00950000182909.b.b.b ENSGT00940000154511.a ENSGT00390000015359 ENSGT00390000002290 ENSGT00940000161887 ENSGT00730000111190 ENSGT00530000063823.b.a ENSGT00390000011116 Naked mole-rat female DUPLICATION Naked mole-rat female MODERN SPECIES 26 ZNF276 (ENSHGLG00000011227) VPS9D1 (ENSHGLG00000009627) SPATA2L (ENSHGLG00000010915) CDK10 (ENSHGLG00000038945) ENSHGLG00000013125 CHMP1A (ENSHGLG00000036077) DPEP1 (ENSHGLG00000012033) ENSHGLG00000042723 RPL13 (ENSHGLG00000010880) SPG7 (ENSHGLG00000012312) ENSHGLG00000045549 ENSHGLG00000050558 ENSHGLG00000037687 ENSHGLG00000044301 ENSHGLG00000038565 ##22 ENSHGLG00000032090 ##22 PABPN1L (ENSHGLG00000043697) TRAPPC2L (ENSHGLG00000010329) GALNS (ENSHGLG00000011517) ENSHGLG00000036618 ENSHGLG00000036225 CTU2 (ENSHGLG00000015988) RNF166 (ENSHGLG00000014545) SNAI3 (ENSHGLG00000018681) ENSHGLG00000043954 CYBA (ENSHGLG00000050710) IL17C (ENSHGLG00000037937) ENSHGLG00000013309 ENSHGLG00000040718 ENSHGLG00000038403 BANP (ENSHGLG00000009601) Naked mole-rat female MODERN SPECIES 26 FANCA (ENSHGLG00000010551) ZNF276 (ENSHGLG00000011227) VPS9D1 (ENSHGLG00000009627) SPATA2L (ENSHGLG00000010915) CDK10 (ENSHGLG00000038945) ENSHGLG00000013125 CHMP1A (ENSHGLG00000036077) DPEP1 (ENSHGLG00000012033) ENSHGLG00000042723 RPL13 (ENSHGLG00000010880) SPG7 (ENSHGLG00000012312) ENSHGLG00000045549 ENSHGLG00000050558 ENSHGLG00000037687 ENSHGLG00000044301 ENSHGLG00000038565 ##22 ENSHGLG00000032090 ##22 PABPN1L (ENSHGLG00000043697) TRAPPC2L (ENSHGLG00000010329) GALNS (ENSHGLG00000011517) ENSHGLG00000036618 ENSHGLG00000036225 CTU2 (ENSHGLG00000015988) RNF166 (ENSHGLG00000014545) SNAI3 (ENSHGLG00000018681) ENSHGLG00000043954 CYBA (ENSHGLG00000050710) IL17C (ENSHGLG00000037937) ENSHGLG00000013309 ENSHGLG00000040718 ENSHGLG00000038403 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES 64 ENSGT00940000158841 ENSGT00390000015057 ENSGT00530000063956.b.a ENSGT00940000158102 ENSGT00390000014546 ENSGT00950000182832.D.a ENSGT00940000159615 ENSGT00940000163403 ENSGT00940000160442 ENSGT00390000007818 ENSGT00940000156329 ENSGT00940000155966 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000160118 ENSGT00940000157000 ENSGT00950000183176.b.e ##22 ENSGT00940000161325 ENSGT00510000047505.d ENSGT00940000157787 ENSGT00390000017259 ENSGT00390000012337 ENSGT00940000157348 ENSGT00390000008797 ENSGT00950000182909.b.b.b ENSGT00940000154511.a ENSGT00390000015359 ENSGT00390000002290 ENSGT00940000161887 ENSGT00730000111190 ENSGT00530000063823.b.a ENSGT00390000011116 Guinea pig MODERN SPECIES 270 CBFA2T3 (ENSCPOG00000023105) ##22 PABPN1L (ENSCPOG00000025951) TRAPPC2L (ENSCPOG00000002742) GALNS (ENSCPOG00000021208) APRT (ENSCPOG00000026373) CDT1 (ENSCPOG00000023857) PIEZO1 (ENSCPOG00000008804) CTU2 (ENSCPOG00000008782) RNF166 (ENSCPOG00000001798) SNAI3 (ENSCPOG00000031579) MVD (ENSCPOG00000020861) CYBA (ENSCPOG00000001019) IL17C (ENSCPOG00000033964) ZC3H18 (ENSCPOG00000031675) ZFPM1 (ENSCPOG00000024281) Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES 82 ENSGT00940000158841 ENSGT00390000015057 ENSGT00530000063956.b.a ENSGT00940000158102 ENSGT00390000014546 ENSGT00950000182832.D.a ENSGT00940000159615 ENSGT00940000163403 ENSGT00940000160442 ENSGT00390000007818 ENSGT00940000156329 ENSGT00940000155966 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000160118 ENSGT00940000157000 ENSGT00950000183176.b.e ##22 ENSGT00940000161325 ENSGT00510000047505.d ENSGT00940000157787 ENSGT00390000017259 ENSGT00390000012337 ENSGT00940000157348 ENSGT00390000008797 ENSGT00950000182909.b.b.b ENSGT00940000154511.a ENSGT00390000015359 ENSGT00390000002290 ENSGT00940000161887 ENSGT00730000111190 ENSGT00530000063823.b.a ENSGT00390000011116 Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 248 SPIRE2 (ENSCLAG00000000871) FANCA (ENSCLAG00000000722) ZNF276 (ENSCLAG00000001566) VPS9D1 (ENSCLAG00000001120) SPATA2L (ENSCLAG00000002771) CDK10 (ENSCLAG00000002701) CHMP1A (ENSCLAG00000002472) DPEP1 (ENSCLAG00000002340) CPNE7 (ENSCLAG00000001931) RPL13 (ENSCLAG00000003801) SPG7 (ENSCLAG00000001470) ANKRD11 (ENSCLAG00000001054) ENSCLAG00000001462 CDH15 (ENSCLAG00000001258) ACSF3 (ENSCLAG00000002959) CBFA2T3 (ENSCLAG00000000863) ##22 PABPN1L (ENSCLAG00000000704) TRAPPC2L (ENSCLAG00000000646) GALNS (ENSCLAG00000002856) APRT (ENSCLAG00000002341) CDT1 (ENSCLAG00000002254) PIEZO1 (ENSCLAG00000001688) ENSCLAG00000000894 RNF166 (ENSCLAG00000000806) SNAI3 (ENSCLAG00000000729) MVD (ENSCLAG00000000836) CYBA (ENSCLAG00000000711) IL17C (ENSCLAG00000000670) ZC3H18 (ENSCLAG00000000600) ENSCLAG00000001012 BANP (ENSCLAG00000000895) Degu MODERN SPECIES 256 VPS9D1 (ENSODEG00000004436) SPATA2L (ENSODEG00000004672) CDK10 (ENSODEG00000004698) ENSODEG00000004794 CHMP1A (ENSODEG00000004817) DPEP1 (ENSODEG00000004853) ENSODEG00000004875 CPNE7 (ENSODEG00000004085) ENSODEG00000004235 SPG7 (ENSODEG00000004303) ENSODEG00000019057 ANKRD11 (ENSODEG00000004490) CDH15 (ENSODEG00000004669) ACSF3 (ENSODEG00000004369) ENSODEG00000004407 CBFA2T3 (ENSODEG00000004615) ##22 PABPN1L (ENSODEG00000004649) ENSODEG00000004673 GALNS (ENSODEG00000004721) ENSODEG00000004857 CDT1 (ENSODEG00000004905) PIEZO1 (ENSODEG00000005089) CTU2 (ENSODEG00000004093) RNF166 (ENSODEG00000004145) SNAI3 (ENSODEG00000004154) MVD (ENSODEG00000004168) CYBA (ENSODEG00000004204) IL17C (ENSODEG00000004311) ZC3H18 (ENSODEG00000004401) ZFPM1 (ENSODEG00000004547) ENSODEG00000004574 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00390000007852 ENSGT00940000158841 ENSGT00390000015057 ENSGT00530000063956.b.a ENSGT00940000158102 ENSGT00390000014546 ENSGT00950000182832.D.a ENSGT00940000159615 ENSGT00940000163403 ENSGT00940000160442 ENSGT00390000007818 ENSGT00940000156329 ENSGT00940000155966 ENSGT00940000160118 ENSGT00940000157000 ENSGT00950000183176.b.e ##22 ENSGT00940000161325 ENSGT00510000047505.d ENSGT00940000157787 ENSGT00390000017259 ENSGT00390000012337 ENSGT00940000157348 ENSGT00390000008797 ENSGT00950000182909.b.b.b ENSGT00940000154511.a ENSGT00390000015359 ENSGT00390000002290 ENSGT00940000161887 ENSGT00730000111190 ENSGT01100000263484.B.a ENSGT00530000063823.b.a Kangaroo rat MODERN SPECIES 533 ENSDORG00000029115 Fanca (ENSDORG00000012259) ENSDORG00000012257 Vps9d1 (ENSDORG00000014825) Cdk10 (ENSDORG00000015084) ENSDORG00000027254 Chmp1a (ENSDORG00000023731) Dpep1 (ENSDORG00000008048) Sult5a1 (ENSDORG00000025066) Cpne7 (ENSDORG00000005124) Rpl13 (ENSDORG00000028330) Spg7 (ENSDORG00000005698) ENSDORG00000023552 Cdh15 (ENSDORG00000025114) Acsf3 (ENSDORG00000012903) Cbfa2t3 (ENSDORG00000015966) ##22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00390000007852 ENSGT00940000158841 ENSGT00390000015057 ENSGT00530000063956.b.a ENSGT00940000158102 ENSGT00390000014546 ENSGT00950000182832.D.a ENSGT00940000159615 ENSGT00940000163403 ENSGT00940000160442 ENSGT00390000007818 ENSGT00940000156329 ENSGT00940000155966 ENSGT00940000160118 ENSGT00940000157000 ENSGT00950000183176.b.e ##22 ENSGT00940000161325 ENSGT00510000047505.d ENSGT00940000157787 ENSGT00390000017259 ENSGT00390000012337 ENSGT00940000157348 ENSGT00390000008797 ENSGT00950000182909.b.b.b ENSGT00940000154511.a ENSGT00390000015359 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ENSGT00950000183176.b.e ##22 ENSGT00940000161325 ENSGT00510000047505.d ENSGT00940000157787 ENSGT00390000017259 ENSGT00390000012337 ENSGT00940000157348 ENSGT00390000008797 ENSGT00950000182909.b.b.b ENSGT00940000154511.a ENSGT00390000015359 ENSGT00390000002290 ENSGT00940000161887 ENSGT00730000111190 ENSGT01100000263484.B.a ENSGT00530000063823.b.a Northern American deer mouse MODERN SPECIES 18 Fanca (ENSPEMG00000017722) ENSPEMG00000025161 Spata2l (ENSPEMG00000027370) Cdk10 (ENSPEMG00000012841) ENSPEMG00000018787 Chmp1a (ENSPEMG00000013566) Dpep1 (ENSPEMG00000012103) Sult5a1 (ENSPEMG00000007963) Cpne7 (ENSPEMG00000013758) Rpl13 (ENSPEMG00000010342) Spg7 (ENSPEMG00000016642) ENSPEMG00000027773 Ankrd11 (ENSPEMG00000015479) Cdh15 (ENSPEMG00000018346) Acsf3 (ENSPEMG00000014608) Cbfa2t3 (ENSPEMG00000008145) ##22 Pabpn1l (ENSPEMG00000016624) Trappc2l (ENSPEMG00000026189) Galns (ENSPEMG00000018911) Aprt (ENSPEMG00000007366) Cdt1 (ENSPEMG00000010002) Ctu2 (ENSPEMG00000016552) Rnf166 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ENSGT00940000155966 ENSGT00940000160118 ENSGT00940000157000 ENSGT00950000183176.b.e ##22 ENSGT00940000161325 ENSGT00510000047505.d ENSGT00940000157787 ENSGT00390000017259 ENSGT00390000012337 ENSGT00940000157348 ENSGT00390000008797 ENSGT00950000182909.b.b.b ENSGT00940000154511.a ENSGT00390000015359 ENSGT00390000002290 ENSGT00940000161887 ENSGT00730000111190 ENSGT01100000263484.B.a ENSGT00530000063823.b.a spretus MODERN SPECIES 17 Fanca (MGP_SPRETEiJ_G0032804) Zfp276 (MGP_SPRETEiJ_G0032803) Vps9d1 (MGP_SPRETEiJ_G0032802) Spata2l (MGP_SPRETEiJ_G0032801) MGP_SPRETEiJ_G0032800 MGP_SPRETEiJ_G0032799 Chmp1a (MGP_SPRETEiJ_G0032798) Dpep1 (MGP_SPRETEiJ_G0032797) Sult5a1 (MGP_SPRETEiJ_G0032796) Cpne7 (MGP_SPRETEiJ_G0032795) MGP_SPRETEiJ_G0032794 Spg7 (MGP_SPRETEiJ_G0032793) Ankrd11 (MGP_SPRETEiJ_G0032792) Cdh15 (MGP_SPRETEiJ_G0032791) Acsf3 (MGP_SPRETEiJ_G0032790) Cbfa2t3 (MGP_SPRETEiJ_G0032789) ##22 Pabpn1l (MGP_SPRETEiJ_G0032788) Trappc2l (MGP_SPRETEiJ_G0032787) Galns (MGP_SPRETEiJ_G0032786) 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(MGP_PahariEiJ_G0023259) Cyba (MGP_PahariEiJ_G0023258) Il17c (MGP_PahariEiJ_G0023257) Zc3h18 (MGP_PahariEiJ_G0023256) Trhr2 (MGP_PahariEiJ_G0023255) Zfpm1 (MGP_PahariEiJ_G0023254) Rat MODERN SPECIES 10 Fanca (ENSRNOG00000016706) Zfp276 (ENSRNOG00000016631) Vps9d1 (ENSRNOG00000028904) Spata2L (ENSRNOG00000016167) Cdk10 (ENSRNOG00000016088) Spata33 (ENSRNOG00000038239) Chmp1a (ENSRNOG00000016001) Dpep1 (ENSRNOG00000015880) Sult5a1 (ENSRNOG00000015695) Cpne7 (ENSRNOG00000015397) Rpl13 (ENSRNOG00000015335) Spg7 (ENSRNOG00000015150) Ankrd11 (ENSRNOG00000027906) Cdh15 (ENSRNOG00000027954) Acsf3 (ENSRNOG00000015077) Cbfa2t3 (ENSRNOG00000014723) ##22 Pabpn1l (ENSRNOG00000029558) Trappc2l (ENSRNOG00000014581) Galns (ENSRNOG00000014461) Aprt (ENSRNOG00000014405) Cdt1 (ENSRNOG00000013970) Piezo1 (ENSRNOG00000056786) Ctu2 (ENSRNOG00000051531) Rnf166 (ENSRNOG00000013777) Snai3 (ENSRNOG00000013586) Mvd (ENSRNOG00000013376) Cyba (ENSRNOG00000013014) Il17c (ENSRNOG00000013007) Zc3h18 (ENSRNOG00000028501) Mlnr (ENSRNOG00000012789) Zfpm1 (ENSRNOG00000043077) Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 1108 Sult5a1 (ENSNGAG00000022110) Cpne7 (ENSNGAG00000023423) Rpl13 (ENSNGAG00000018467) Spg7 (ENSNGAG00000020726) ENSNGAG00000024166 ENSNGAG00000008560 Ankrd11 (ENSNGAG00000015118) Cdh15 (ENSNGAG00000016069) Acsf3 (ENSNGAG00000022957) Cbfa2t3 (ENSNGAG00000016320) ##22 Pabpn1l (ENSNGAG00000023992) ENSNGAG00000024083 Galns (ENSNGAG00000022107) ENSNGAG00000016112 Cdt1 (ENSNGAG00000022315) Piezo1 (ENSNGAG00000017101) Ctu2 (ENSNGAG00000023366) Rnf166 (ENSNGAG00000021980) Snai3 (ENSNGAG00000023039) Mvd (ENSNGAG00000023194) Cyba (ENSNGAG00000009875) Il17c (ENSNGAG00000013943) Zc3h18 (ENSNGAG00000011518) Trhr2 (ENSNGAG00000021694) Zfpm1 (ENSNGAG00000015027) Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 127 Cpne7 (ENSJJAG00000000879) Rpl13 (ENSJJAG00000014012) Spg7 (ENSJJAG00000008061) ENSJJAG00000015097 Cdh15 (ENSJJAG00000005187) Acsf3 (ENSJJAG00000016704) Cbfa2t3 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ENSGT00390000015359 ENSGT00390000002290 ENSGT00940000161887 ENSGT00730000111190 ENSGT00530000063823.b.a ENSGT00530000065415 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000158841 ENSGT00390000015057 ENSGT00530000063956.b.a ENSGT00940000158102 ENSGT00390000014546 ENSGT00950000182832.D.a ENSGT00940000159615 ENSGT00940000160442 ENSGT00390000007818 ENSGT00940000156329 ENSGT00940000155966 ENSGT00940000162638.A ENSGT00940000162670 ENSGT00940000160118 ENSGT00940000157000 ENSGT00950000183176.b.e ##22 ENSGT00940000161325 ENSGT00510000047505.c.b ENSGT00940000157787 ENSGT00390000017259 ENSGT00390000012337 ENSGT00940000157348 ENSGT00390000008797 ENSGT00950000182909.b.b.b ENSGT00940000154511.a ENSGT00390000015359 ENSGT00390000002290 ENSGT00940000161887 ENSGT00730000111190 ENSGT00530000063823.b.a ENSGT00530000065415 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000158841 ENSGT00390000015057 ENSGT00530000063956.b.a ENSGT00940000158102 ENSGT00390000014546 ENSGT00950000182832.D.a ENSGT00940000159615 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19 ENSGT00940000158841 ENSGT00390000015057 ENSGT00530000063956.b.a ENSGT00940000158102 ENSGT00390000014546 ENSGT00950000182832.D.a ENSGT00940000159615 ENSGT00940000160442 ENSGT00390000007818.gb ENSGT00940000156329 ENSGT00940000155966 ENSGT00940000162638.A ENSGT00940000162670 ENSGT00940000160118 ENSGT00940000157000 ENSGT00950000183176.b.e ##22 ENSGT00940000161325 ENSGT00510000047505.c.b ENSGT00910000147699 ENSGT00940000157787 ENSGT00390000017259 ENSGT00390000012337 ENSGT00410000028565 ENSGT00940000157348 ENSGT00390000008797 ENSGT00950000182909.b.b.b ENSGT00550000076317 ENSGT00940000154511.a ENSGT00390000015359 ENSGT00390000002290 ENSGT00940000161887 Bonobo MODERN SPECIES 7 ZNF276 (ENSPPAG00000030560) VPS9D1 (ENSPPAG00000043316) SPATA2L (ENSPPAG00000027459) CDK10 (ENSPPAG00000028904) SPATA33 (ENSPPAG00000037171) CHMP1A (ENSPPAG00000031215) DPEP1 (ENSPPAG00000031919) CPNE7 (ENSPPAG00000032990) ENSPPAG00000029415 SPG7 (ENSPPAG00000030811) ANKRD11 (ENSPPAG00000031546) ZNF778 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ENSGT00940000161325 ENSGT00510000047505.c.b ENSGT00910000147699 ENSGT00940000157787 ENSGT00390000017259 ENSGT00390000012337 ENSGT00410000028565 ENSGT00940000157348 ENSGT00390000008797 ENSGT00950000182909.b.b.b ENSGT00940000154511.a ENSGT00390000015359 ENSGT00390000002290 ENSGT00940000161887 ENSGT00730000111190 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000158841 ENSGT00390000015057 ENSGT00530000063956.b.a ENSGT00940000158102 ENSGT00390000014546 ENSGT00950000182832.D.a ENSGT00940000159615 ENSGT00940000160442 ENSGT00390000007818 ENSGT00940000156329 ENSGT00940000155966 ENSGT00940000162638.A.e ENSGT00940000162670 ENSGT00940000160118 ENSGT00940000157000 ENSGT00950000183176.b.e ##22 ENSGT00940000161325 ENSGT00510000047505.c.b ENSGT00910000147699 ENSGT00940000157787 ENSGT00390000017259 ENSGT00390000012337 ENSGT00410000028565 ENSGT00940000157348 ENSGT00390000008797 ENSGT00950000182909.b.b.b ENSGT00940000154511.a ENSGT00390000015359 ENSGT00390000002290 ENSGT00940000161887 ENSGT00730000111190 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000158841 ENSGT00390000015057 ENSGT00530000063956.b.a ENSGT00940000158102 ENSGT00390000014546 ENSGT00950000182832.D.a ENSGT00940000159615 ENSGT00940000160442 ENSGT00390000007818.z ENSGT00940000156329 ENSGT00940000155966 ENSGT00940000162638.A.e ENSGT00940000162670 ENSGT00940000160118 ENSGT00940000157000 ENSGT00950000183176.b.e ##22 ENSGT00940000161325 ENSGT00510000047505.c.b ENSGT00910000147699 ENSGT00940000157787 ENSGT00390000017259 ENSGT00390000012337 ENSGT00410000028565 ENSGT00940000157348 ENSGT00390000008797 ENSGT00950000182909.b.b.b ENSGT00940000154511.a ENSGT00390000015359 ENSGT00390000002290 ENSGT00940000161887 ENSGT00730000111190 Macaca ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000158841 ENSGT00390000015057 ENSGT00530000063956.b.a ENSGT00940000158102 ENSGT00390000014546 ENSGT00950000182832.D.a ENSGT00940000159615 ENSGT00940000160442 ENSGT00390000007818.z ENSGT00940000156329 ENSGT00940000155966 ENSGT00940000162638.A.e 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ENSGT00940000154511.a ENSGT00390000015359 ENSGT00390000002290 ENSGT00940000161887 ENSGT00730000111190 ENSGT00530000063823.b.a ENSGT00530000065415 Capuchin MODERN SPECIES 508 VPS9D1 (ENSCCAG00000035171) SPATA2L (ENSCCAG00000032657) CDK10 (ENSCCAG00000028810) SPATA33 (ENSCCAG00000022579) CHMP1A (ENSCCAG00000035528) DPEP1 (ENSCCAG00000030093) CPNE7 (ENSCCAG00000020943) RPL13 (ENSCCAG00000024248) SPG7 (ENSCCAG00000023609) ENSCCAG00000035392 ANKRD11 (ENSCCAG00000013589) ZNF778 (ENSCCAG00000036765) SLC22A31 (ENSCCAG00000032645) CDH15 (ENSCCAG00000033494) ENSCCAG00000028000 ENSCCAG00000035478 ##22 PABPN1L (ENSCCAG00000027631) TRAPPC2L (ENSCCAG00000027684) GALNS (ENSCCAG00000035940) APRT (ENSCCAG00000032131) CDT1 (ENSCCAG00000023387) PIEZO1 (ENSCCAG00000035159) CTU2 (ENSCCAG00000030905) RNF166 (ENSCCAG00000037660) SNAI3 (ENSCCAG00000037651) Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 48 ENSSBOG00000018570 ##22 PABPN1L (ENSSBOG00000018410) TRAPPC2L (ENSSBOG00000027294) GALNS (ENSSBOG00000028431) 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SPECIES 7336 CBFA2T3 (ENSTSYG00000032240) ##22 TRAPPC2L (ENSTSYG00000012868) GALNS (ENSTSYG00000034707) APRT (ENSTSYG00000031872) CDT1 (ENSTSYG00000036284) PIEZO1 (ENSTSYG00000027348) CTU2 (ENSTSYG00000013726) RNF166 (ENSTSYG00000031472) SNAI3 (ENSTSYG00000025594) MVD (ENSTSYG00000031262) CYBA (ENSTSYG00000036710) IL17C (ENSTSYG00000034277) ZC3H18 (ENSTSYG00000036966) Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00390000007852 ENSGT00940000158841 ENSGT00390000015057 ENSGT00530000063956.b.a ENSGT00940000158102 ENSGT00390000014546 ENSGT00950000182832.D.a ENSGT00940000159615 ENSGT00940000160442 ENSGT00390000007818 ENSGT00940000156329 ENSGT00940000155966 ENSGT00940000162638.A ENSGT00940000160118 ENSGT00940000157000 ENSGT00950000183176.b.e ##22 ENSGT00940000161325 ENSGT00510000047505.c.a ENSGT00940000157787 ENSGT00390000017259 ENSGT00390000012337 ENSGT00940000157348 ENSGT00390000008797 ENSGT00950000182909.b.b.b ENSGT00940000154511.a ENSGT00390000015359 ENSGT00390000002290 ENSGT00940000161887 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ENSGT00940000161887 ENSGT00730000111190 ENSGT00530000063823.b.a ENSGT00530000065415 Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 175 ZNF276 (ENSPSMG00000010649) ENSPSMG00000010629 VPS9D1 (ENSPSMG00000010618) ENSPSMG00000010606 CDK10 (ENSPSMG00000010584) SPATA33 (ENSPSMG00000010508) CHMP1A (ENSPSMG00000010501) DPEP1 (ENSPSMG00000010475) CPNE7 (ENSPSMG00000010425) RPL13 (ENSPSMG00000010359) SPG7 (ENSPSMG00000010197) ANKRD11 (ENSPSMG00000010017) ZNF778 (ENSPSMG00000009944) CDH15 (ENSPSMG00000009911) ACSF3 (ENSPSMG00000009839) CBFA2T3 (ENSPSMG00000009813) ##22 PABPN1L (ENSPSMG00000009791) ENSPSMG00000009771 GALNS (ENSPSMG00000009716) APRT (ENSPSMG00000009665) CDT1 (ENSPSMG00000009647) ENSPSMG00000009632 ENSPSMG00000009627 CTU2 (ENSPSMG00000009614) RNF166 (ENSPSMG00000009591) SNAI3 (ENSPSMG00000009571) MVD (ENSPSMG00000009568) ENSPSMG00000009551 IL17C (ENSPSMG00000009542) ZC3H18 (ENSPSMG00000009510) ENSPSMG00000009376 Coquerels sifaka DUPLICATION Coquerels sifaka MODERN SPECIES 714 CBFA2T3 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(ENSLAFG00000007196) CYBA (ENSLAFG00000005109) ZC3H18 (ENSLAFG00000015674) ZFPM1 (ENSLAFG00000013561) ENSLAFG00000030575 BANP (ENSLAFG00000005122) Hyrax MODERN SPECIES 5105 CBFA2T3 (ENSPCAG00000002849) ##22 ENSPCAG00000002797 TRAPPC2L (ENSPCAG00000002785) GALNS (ENSPCAG00000002742) APRT (ENSPCAG00000002719) CDT1 (ENSPCAG00000002664) Tenrec DUPLICATION Tenrec DUPLICATION Tenrec MODERN SPECIES 8870 ENSETEG00000018434 ##22 ENSETEG00000018428 ##22 Tenrec MODERN SPECIES 8870 ENSETEG00000018434 ##22 ENSETEG00000018428 ##22 Tenrec MODERN SPECIES 8869 ENSETEG00000005559 ##22 Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000159841 ENSGT00970000193520 ENSGT00950000182838.B.a.a ENSGT00940000159421 ENSGT00390000005939.b ENSGT00940000159615 ENSGT00940000163403 ENSGT00940000159903 ENSGT00500000044924 ENSGT00390000007453 ENSGT00940000156329 ENSGT00940000155966 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000160118 ENSGT00940000157000 ENSGT00950000183176.b.e ##22 ENSGT00940000161325 ENSGT00510000047505 ENSGT00940000157787 ENSGT00390000017259 ENSGT00390000012337 ENSGT00940000157348 ENSGT00390000008797 ENSGT00950000182909.b.b.b ENSGT00940000154511.a ENSGT00940000157175 ENSGT00940000154848.b ENSGT00390000017697.b ENSGT00940000159836 ENSGT00940000165234 ENSGT00940000160687 Reedfish MODERN SPECIES 17 ap1g1 (ENSECRG00000012404) ENSECRG00000012373 ATXN1L (ENSECRG00000012354) dpep1 (ENSECRG00000012295) sult5a1 (ENSECRG00000012232) dhodh (ENSECRG00000012205) ist1 (ENSECRG00000012169) SPG7 (ENSECRG00000012127) ENSECRG00000012107 ANKRD11 (ENSECRG00000012092) SLC22A31 (ENSECRG00000012073) cdh15 (ENSECRG00000012049) ACSF3 (ENSECRG00000012022) ENSECRG00000012003 ENSECRG00000011994 CBFA2T3 (ENSECRG00000011929) ##22 pabpn1l (ENSECRG00000011882) ENSECRG00000011867 trappc2l (ENSECRG00000011858) galns (ENSECRG00000011836) CDT1 (ENSECRG00000011815) aprt (ENSECRG00000011787) ENSECRG00000011774 ENSECRG00000011758 ENSECRG00000011743 ENSECRG00000011729 PIEZO1 (ENSECRG00000011668) ctu2 (ENSECRG00000011586) 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SPECIES 43 ap1g1 (ENSPKIG00000009139) ZNF821 (ENSPKIG00000009084) ATXN1L (ENSPKIG00000009066) ist1 (ENSPKIG00000009049) ENSPKIG00000009030 ENSPKIG00000009010 ENSPKIG00000009000 sult5a1 (ENSPKIG00000008973) dpep1 (ENSPKIG00000008937) SLC22A31 (ENSPKIG00000008907) ENSPKIG00000008883 ANKRD11 (ENSPKIG00000008776) SPG7 (ENSPKIG00000008639) cdh15 (ENSPKIG00000008586) ACSF3 (ENSPKIG00000008534) CBFA2T3 (ENSPKIG00000008424) ##22 trappc2l (ENSPKIG00000008361) pabpn1l (ENSPKIG00000008340) galns (ENSPKIG00000008276) aprt (ENSPKIG00000008216) CDT1 (ENSPKIG00000008196) PIEZO1 (ENSPKIG00000007997) ctu2 (ENSPKIG00000007920) RNF166 (ENSPKIG00000007890) SNAI3 (ENSPKIG00000007872) cdh1 (ENSPKIG00000007678) ciao2b (ENSPKIG00000007575) rrad (ENSPKIG00000007552) pdp2 (ENSPKIG00000007531) ca7 (ENSPKIG00000007497) nae1 (ENSPKIG00000007379) Asian bonytongue MODERN SPECIES 2 USP10 (ENSSFOG00015015209) marveld3 (ENSSFOG00015026837) PHLPP2 (ENSSFOG00015015313) ap1g1 (ENSSFOG00015015385) ZNF821 (ENSSFOG00015015463) ATXN1L (ENSSFOG00015015480) ist1 (ENSSFOG00015027420) ENSSFOG00015029714 sult5a1 (ENSSFOG00015015533) dpep1 (ENSSFOG00015015547) SLC22A31 (ENSSFOG00015026577) ANKRD11 (ENSSFOG00015015598) SPG7 (ENSSFOG00015026066) cdh15 (ENSSFOG00015015646) ACSF3 (ENSSFOG00015015713) CBFA2T3 (ENSSFOG00015015761) ##22 pabpn1l (ENSSFOG00015025999) trappc2l (ENSSFOG00015029365) galns (ENSSFOG00015015865) aprt (ENSSFOG00015033142) CDT1 (ENSSFOG00015026416) PIEZO1 (ENSSFOG00015015938) ctu2 (ENSSFOG00015016029) RNF166 (ENSSFOG00015027693) SNAI3 (ENSSFOG00015016115) ENSSFOG00015016129 ENSSFOG00015016189 ENSSFOG00015016272 rrad (ENSSFOG00015016448) pdp2 (ENSSFOG00015016484) ca7 (ENSSFOG00015016490) Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183176.b.e.t ##22 P. kingsleyae MODERN SPECIES 328 ENSPKIG00000024087 USP10 (ENSPKIG00000024052) ap1g1 (ENSPKIG00000023973) ist1 (ENSPKIG00000023933) dhodh (ENSPKIG00000023908) ANKRD11 (ENSPKIG00000023875) CBFA2T3 (ENSPKIG00000023828) ##22 RNF166 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SPECIES 68 ENSGT00390000007453 ENSGT00940000168098 ENSGT00500000044924 ENSGT00940000159903 ENSGT01020000230389.a.b ENSGT00940000163403 ENSGT00940000159615 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000155966 ENSGT00940000156329 ENSGT00940000160118 ENSGT00940000157000 ENSGT00950000183176.b.e ##22 ENSGT00940000161325 ENSGT00510000047505 ENSGT00940000157787 ENSGT00390000017259 ENSGT00390000012337 ENSGT00940000157348 ENSGT00390000008797 ENSGT00950000182909.b.b.b ENSGT00940000154511.a ENSGT00940000154848.b ENSGT00390000017697.b ENSGT00940000159836 ENSGT00940000165234 ENSGT00940000159757 ENSGT00550000074901 Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 78 ENSGT00390000007453 ENSGT00500000044924 ENSGT00940000159903 ENSGT00940000161671 ENSGT00940000160876.b ENSGT01020000230389.a.b ENSGT00940000163403 ENSGT00940000159615 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000155966 ENSGT00940000156329 ENSGT00940000160118 ENSGT00940000157000 ENSGT00950000183176.b.e ##22 ENSGT00940000161325 ENSGT00510000047505 ENSGT00940000157787 ENSGT00390000017259 ENSGT00390000012337 ENSGT00940000157348 ENSGT00390000008797 ENSGT00950000182909.b.b.b ENSGT00390000017697.b ENSGT00940000154511.a ENSGT00940000154848.b ENSGT00940000159836 ENSGT00940000165234 ENSGT00940000159757 ENSGT00550000074901 Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 91 ENSGT00390000004417.b ENSGT00940000155010.a.a ENSGT00940000156563.a ENSGT00940000163421.a.d ENSGT00940000156938.e ENSGT00390000007453 ENSGT00500000044924 ENSGT00940000162823.C.b ENSGT00940000163403 ENSGT00940000159615 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000155966 ENSGT00940000156329 ENSGT00940000160118 ENSGT00940000157000 ENSGT00950000183176.b.e ##22 ENSGT00940000161325 ENSGT00510000047505 ENSGT00940000157787 ENSGT00390000017259 ENSGT00390000012337 ENSGT00940000157348 ENSGT00390000008797 ENSGT00950000182909.b.b.b ENSGT00940000154511.a ENSGT00690000103052 ENSGT00940000154848.b ENSGT00940000156519.o ENSGT00950000182971.A ENSGT00390000015893 ENSGT00390000015857 Atlantic herring MODERN SPECIES 22 MATCAP1 (ENSCHAG00000019336) GABARAPL2 (ENSCHAG00000019341) NQO2 (ENSCHAG00000019397) ENSCHAG00000019676 ENSCHAG00000019751 ist1 (ENSCHAG00000019762) dhodh (ENSCHAG00000019823) ENSCHAG00000019988 sult5a1 (ENSCHAG00000019992) dpep1 (ENSCHAG00000020006) SLC22A31 (ENSCHAG00000020045) ANKRD11 (ENSCHAG00000020059) SPG7 (ENSCHAG00000020225) cdh15 (ENSCHAG00000021955) ACSF3 (ENSCHAG00000022016) CBFA2T3 (ENSCHAG00000022304) ##22 trappc2l (ENSCHAG00000022318) galns (ENSCHAG00000022371) aprt (ENSCHAG00000022607) CDT1 (ENSCHAG00000022614) PIEZO1 (ENSCHAG00000022740) ctu2 (ENSCHAG00000023544) RNF166 (ENSCHAG00000023602) SNAI3 (ENSCHAG00000023607) ENSCHAG00000023677 ENSCHAG00000025187 ENSCHAG00000025201 zdhhc7 (ENSCHAG00000025305) nip7 (ENSCHAG00000025309) cog8 (ENSCHAG00000025312) NOB1 (ENSCHAG00000025319) Denticle herring MODERN SPECIES 7 ENSDCDG00000031868 nadsyn1 (ENSDCDG00000031887) tpcn2 (ENSDCDG00000031902) ENSDCDG00000022293 ccnd1 (ENSDCDG00000022299) ENSDCDG00000022301 lto1 (ENSDCDG00000022303) fgf19 (ENSDCDG00000022305) fgf4 (ENSDCDG00000022308) fgf3 (ENSDCDG00000022315) zgc:153993 (ENSDCDG00000022398) ano1a (ENSDCDG00000022511) FADD (ENSDCDG00000026252) pacsin3 (ENSDCDG00000026254) ACSF3 (ENSDCDG00000026303) CBFA2T3 (ENSDCDG00000026480) ##22 PABPN1L (ENSDCDG00000026482) trappc2l (ENSDCDG00000026484) galns (ENSDCDG00000026497) tnni2b.2 (ENSDCDG00000026548) tnni2b.1 (ENSDCDG00000026551) ENSDCDG00000026552 ENSDCDG00000026554 ENSDCDG00000026556 tnnt3b (ENSDCDG00000026571) myod1 (ENSDCDG00000026580) OTOG (ENSDCDG00000026583) ABCC8 (ENSDCDG00000026610) ENSDCDG00000026869 chrna5 (ENSDCDG00000026872) ENSDCDG00000026877 Otophysi ANCESTRAL SPECIES 155 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000155966 ENSGT00940000156329 ENSGT00940000160118 ENSGT00940000157000 ENSGT00950000183176.b.e ##22 ENSGT00940000161325 ENSGT00510000047505 ENSGT00940000157787 ENSGT00390000017259 ENSGT00390000012337 ENSGT00940000157348 ENSGT00390000008797 ENSGT00950000182909.b.b.b ENSGT00390000017697.b ENSGT00940000154511.a ENSGT00940000154848.b ENSGT00940000159836 ENSGT00940000165234 ENSGT00940000159757 ENSGT00550000074901 Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000165300.b.a.a.a ENSGT00940000159757 ENSGT00940000165234 ENSGT00940000159836 ENSGT00940000154848.b ENSGT00940000154511.a ENSGT00390000017697.b ENSGT00940000156038.a.a ENSGT00940000157042.c.b ENSGT00940000155710.b ENSGT00940000162670 ENSGT00940000155966 ENSGT00940000156329 ENSGT00940000160118 ENSGT00940000157000 ENSGT00950000183176.b.e ##22 ENSGT00940000161325 ENSGT00510000047505 ENSGT00940000157787 ENSGT00390000017259 ENSGT00390000012337 ENSGT00940000157348 ENSGT00390000008797 ENSGT00950000182909.b.b.b Channel catfish MODERN SPECIES 19 apba2 (ENSIPUG00000023407) sord (ENSIPUG00000023442) ENSIPUG00000023466 ca7 (ENSIPUG00000023469) ENSIPUG00000023479 RRAD (ENSIPUG00000023484) FAM96B (ENSIPUG00000023490) ENSIPUG00000023500 LOXL4 (ENSIPUG00000023503) ATL2 (ENSIPUG00000023517) SLC22A31 (ENSIPUG00000023532) ankrd11 (ENSIPUG00000023534) spg7 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ENSGT00940000157348 ENSGT00390000008797 ENSGT00950000182909.b.b.b ENSGT00940000154511.a Electric eel MODERN SPECIES 108 mphosph10 (ENSEEEG00000018436) mcee (ENSEEEG00000018489) APBA2 (ENSEEEG00000018492) sord (ENSEEEG00000018497) ca7 (ENSEEEG00000018563) rrad (ENSEEEG00000018685) ciao2b (ENSEEEG00000018689) ENSEEEG00000018701 LOXL4 (ENSEEEG00000018713) ATL2 (ENSEEEG00000018850) SLC22A31 (ENSEEEG00000019391) ANKRD11 (ENSEEEG00000019392) SPG7 (ENSEEEG00000019401) cdh15 (ENSEEEG00000019546) ACSF3 (ENSEEEG00000019554) CBFA2T3 (ENSEEEG00000019560) ##22 pabpn1l (ENSEEEG00000019570) trappc2l (ENSEEEG00000019573) galns (ENSEEEG00000019581) aprt (ENSEEEG00000019582) CDT1 (ENSEEEG00000019584) PIEZO1 (ENSEEEG00000019596) ctu2 (ENSEEEG00000019678) RNF166 (ENSEEEG00000019690) SNAI3 (ENSEEEG00000019692) cdh1 (ENSEEEG00000019697) Characoidei ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000163916 ENSGT00940000165300.a ENSGT00940000159757 ENSGT00940000165234 ENSGT00940000159836 ENSGT00940000154848.b 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ENSCARG00000068469 pde5ab (ENSCARG00000068694) ENSCARG00000068853 mad2l1 (ENSCARG00000005849) camk2d1 (ENSCARG00000005922) spink4 (ENSCARG00000006313) mttp (ENSCARG00000006403) ENSCARG00000008192 xpa (ENSCARG00000008200) pla2g12a (ENSCARG00000008282) Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 110 ENSGT00940000160974.b.d.p ENSGT00940000159464.a ENSGT00940000158707.a.a.u ENSGT00940000160309.e.b.f ENSGT00390000004215.a.b.b.c.a.b.a.c.g ENSGT00390000004417.b.a ENSGT00940000163421.a.d.g ENSGT00940000159615.c ENSGT00390000013574.d ENSGT00390000007453.g.a.b ENSGT00940000162670.l ENSGT00940000155966.cb ENSGT00940000156329.f ENSGT00940000160118.e ENSGT00940000157000.o ENSGT00950000183176.b.e.u ##22 ENSGT00940000161325.n ENSGT00510000047505.h ENSGT00940000157787.b ENSGT00390000017259.s.b ENSGT00390000012337.l ENSGT00940000157348.r ENSGT00390000008797.b ENSGT00950000182909.b.b.b.i ENSGT00940000154848.b.j.a Golden-line barbel DUPLICATION Golden-line barbel MODERN SPECIES 281 ENSSGRG00000008599 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Zebrafish MODERN SPECIES 22 MATCAP1 (ENSDARG00000059529) nqo1 (ENSDARG00000010250) zgc:194679 (ENSDARG00000073723) ENSDARG00000051892 dpep1 (ENSDARG00000068181) sult5a1 (ENSDARG00000007769) ENSDARG00000051890 ENSDARG00000100098 dhodh (ENSDARG00000051889) ist1 (ENSDARG00000051888) SLC22A31 (ENSDARG00000078882) ANKRD11 (ENSDARG00000051886) SPG7 (ENSDARG00000068187) cdh15 (ENSDARG00000068191) ACSF3 (ENSDARG00000059503) CBFA2T3 (ENSDARG00000079012) ##22 pabpn1l (ENSDARG00000087996) trappc2l (ENSDARG00000111785) galns (ENSDARG00000051853) aprt (ENSDARG00000003519) CDT1 (ENSDARG00000051854) PIEZO1 (ENSDARG00000076870) ctu2 (ENSDARG00000051851) RNF166 (ENSDARG00000089538) ENSDARG00000035796 snai3 (ENSDARG00000031243) tpcn2 (ENSDARG00000100420) ccnd1 (ENSDARG00000101637) lto1 (ENSDARG00000104287) fgf19 (ENSDARG00000098663) fgf4 (ENSDARG00000105230) Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000158943.c ENSGT00940000153941.b ENSGT00390000011359 ENSGT00390000007453 ENSGT00940000168098 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ENSGT00940000158943.c.c ENSGT00940000153941.b.d ENSGT00390000011359.o ENSGT00390000007453.f ENSGT00500000044924.b ENSGT00940000162823.C.b ENSGT00940000163403.c ENSGT00940000159615.l ENSGT00940000162670.m ENSGT00940000155966.gb.a.b ENSGT00940000156329.d ENSGT00940000160118.g ENSGT00940000157000.n ENSGT00950000183176.b.e.w.a ##22 ENSGT00940000161325.o ENSGT00510000047505.j ENSGT00940000157787.f ENSGT00390000017259.bb.b ENSGT00390000012337.e ENSGT00940000157348.s.a ENSGT00390000008797.c ENSGT00950000182909.b.b.b.r ENSGT00950000182909.b.b.b.q.b ENSGT00940000154511.a.g.b ENSGT00940000154848.b.c.a.b.a ENSGT00390000017697.b.eb.b.a ENSGT00940000159836.b ENSGT00940000165234 ENSGT00940000159757.m River trout DUPLICATION River trout MODERN SPECIES 21 terb2 (ENSSTUG00000043328) sord (ENSSTUG00000043335) APBA2 (ENSSTUG00000043474) mcee (ENSSTUG00000044828) mphosph10 (ENSSTUG00000044879) ist1 (ENSSTUG00000045295) dhodh (ENSSTUG00000045359) ENSSTUG00000045410 sult5a1 (ENSSTUG00000045414) dpep1 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Rainbow trout DUPLICATION Rainbow trout MODERN SPECIES 27 ENSOMYG00000029390 dhodh (ENSOMYG00000029214) ENSOMYG00000029192 sult5a1 (ENSOMYG00000029128) ENSOMYG00000029054 ENSOMYG00000049632 ENSOMYG00000029006 SLC22A31 (ENSOMYG00000028926) ENSOMYG00000068148 ENSOMYG00000053462 ANKRD11 (ENSOMYG00000021548) SPG7 (ENSOMYG00000020459) cdh15 (ENSOMYG00000020290) ACSF3 (ENSOMYG00000020259) ENSOMYG00000066633 CBFA2T3 (ENSOMYG00000020152) ##22 PABPN1L (ENSOMYG00000020123) trappc2l (ENSOMYG00000020110) galns (ENSOMYG00000019989) aprt (ENSOMYG00000019959) CDT1 (ENSOMYG00000019951) PIEZO1 (ENSOMYG00000019759) ctu2 (ENSOMYG00000019324) RNF166 (ENSOMYG00000064303) ENSOMYG00000048797 ENSOMYG00000019206 ENSOMYG00000015527 ciao2b (ENSOMYG00000019191) rrad (ENSOMYG00000015257) ENSOMYG00000015246 ca7 (ENSOMYG00000015221) Rainbow trout MODERN SPECIES 18 sord (ENSOMYG00000042629) ENSOMYG00000042207 mcee (ENSOMYG00000042122) mphosph10 (ENSOMYG00000042099) ist1 (ENSOMYG00000049934) dhodh (ENSOMYG00000042076) ENSOMYG00000042061 sult5a1 (ENSOMYG00000042052) dpep1 (ENSOMYG00000042022) SLC22A31 (ENSOMYG00000042005) ANKRD11 (ENSOMYG00000041973) SPG7 (ENSOMYG00000041652) cdh15 (ENSOMYG00000041577) ACSF3 (ENSOMYG00000041503) ENSOMYG00000063445 CBFA2T3 (ENSOMYG00000041484) ##22 PABPN1L (ENSOMYG00000041475) trappc2l (ENSOMYG00000041458) galns (ENSOMYG00000041454) aprt (ENSOMYG00000041443) CDT1 (ENSOMYG00000041432) PIEZO1 (ENSOMYG00000041383) ctu2 (ENSOMYG00000041336) RNF166 (ENSOMYG00000054129) ENSOMYG00000041324 ENSOMYG00000038855 ciao2b (ENSOMYG00000038177) lto1 (ENSOMYG00000038146) ENSOMYG00000038167 ENSOMYG00000066369 tpcn2 (ENSOMYG00000038011) Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012336 ENSGT00550000074781.u.a ENSGT00940000158943.c.c ENSGT00940000153941.b.d ENSGT00390000011359.o ENSGT00390000007453.f ENSGT00500000044924.a ENSGT00940000159903 ENSGT00940000163403.c.a ENSGT00940000159615.l ENSGT00940000162670.m ENSGT00940000155966.gb.a.b ENSGT00940000156329.d ENSGT00940000160118.g ENSGT00940000157000.n ENSGT00950000183176.b.e.w.a ##22 ENSGT00940000161325.p.a ENSGT00950000183176.b.e.x ##22 ENSGT00940000161325.o ENSGT00510000047505.j ENSGT00940000157787.f ENSGT00390000017259.bb.b ENSGT00390000012337.e ENSGT00940000157348.s.b.b ENSGT00390000008797.c ENSGT00950000182909.b.b.b.q.b ENSGT00950000182909.b.b.b.q.a.b ENSGT00940000154511.a.g.b ENSGT00940000154848.b.c.a.b.a ENSGT00390000017697.b.db ENSGT00940000154848.b.c.a.b.b Coho salmon MODERN SPECIES 22 sord (ENSOKIG00005018753) APBA2 (ENSOKIG00005016807) mcee (ENSOKIG00005016720) mphosph10 (ENSOKIG00005016706) ENSOKIG00005016666 dhodh (ENSOKIG00005016614) ENSOKIG00005016603 sult5a1 (ENSOKIG00005016592) ENSOKIG00005016590 DPEP1 (ENSOKIG00005016462) SLC22A31 (ENSOKIG00005016449) ANKRD11 (ENSOKIG00005016404) SPG7 (ENSOKIG00005015473) cdh15 (ENSOKIG00005015045) ACSF3 (ENSOKIG00005015004) CBFA2T3 (ENSOKIG00005014998) ##22 PABPN1L (ENSOKIG00005014985) trappc2l (ENSOKIG00005014931) galns (ENSOKIG00005014862) aprt (ENSOKIG00005014830) CDT1 (ENSOKIG00005014823) PIEZO1 (ENSOKIG00005014562) ctu2 (ENSOKIG00005014421) RNF166 (ENSOKIG00005014407) ENSOKIG00005014402 ciao2b (ENSOKIG00005014377) ENSOKIG00005010939 rrad (ENSOKIG00005010785) ENSOKIG00005010771 ca7 (ENSOKIG00005010755) nae1 (ENSOKIG00005010631) Chinook salmon MODERN SPECIES 28 TJP1 (ENSOTSG00005006472) sord (ENSOTSG00005006446) APBA2 (ENSOTSG00005005682) mcee (ENSOTSG00005005678) mphosph10 (ENSOTSG00005005677) ist1 (ENSOTSG00005005675) dhodh (ENSOTSG00005005662) sult5a1 (ENSOTSG00005005659) sult5a1 (ENSOTSG00005005657) SLC22A31 (ENSOTSG00005005656) dpep1 (ENSOTSG00005005651) ANKRD11 (ENSOTSG00005005648) SPG7 (ENSOTSG00005004860) cdh15 (ENSOTSG00005004851) ACSF3 (ENSOTSG00005004850) CBFA2T3 (ENSOTSG00005004847) ##22 ENSOTSG00005004845 ##22 PABPN1L (ENSOTSG00005004843) trappc2l (ENSOTSG00005004791) galns (ENSOTSG00005004620) aprt (ENSOTSG00005004616) CDT1 (ENSOTSG00005004615) PIEZO1 (ENSOTSG00005004271) RNF166 (ENSOTSG00005004261) ENSOTSG00005004259 ctu2 (ENSOTSG00005002557) ENSOTSG00005002544 RNF166 (ENSOTSG00005002542) ENSOTSG00005002538 ENSOTSG00005000741 ciao2b (ENSOTSG00005000718) Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183176.b.e.w.b.a ##22 Huchen MODERN SPECIES 922 SPG7 (ENSHHUG00000028401) cdh15 (ENSHHUG00000028395) ENSHHUG00000028394 ACSF3 (ENSHHUG00000028365) ENSHHUG00000028358 ##22 CBFA2T3 (ENSHHUG00000028328) ##22 PABPN1L (ENSHHUG00000028326) trappc2l (ENSHHUG00000028296) galns (ENSHHUG00000028278) CDT1 (ENSHHUG00000028269) PIEZO1 (ENSHHUG00000027951) ctu2 (ENSHHUG00000027903) RNF166 (ENSHHUG00000027899) ENSHHUG00000027895 ENSHHUG00000027303 ciao2b (ENSHHUG00000027227) fgf19 (ENSHHUG00000027218) lto1 (ENSHHUG00000027210) ccnd1 (ENSHHUG00000027197) Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 76 ENSGT00940000155164.a.b.a ENSGT00550000074781.u.b ENSGT00940000158943.c.d ENSGT00940000153941.b.c ENSGT00390000011359.p ENSGT00390000007453.e ENSGT00500000044924.b ENSGT00940000162823.C.b ENSGT00940000163403.d ENSGT00940000159615.k ENSGT00940000162670.n ENSGT00940000155966.gb.a.a ENSGT00940000156329.c ENSGT00940000160118.h ENSGT00940000157000.m ENSGT00950000183176.b.e.w.b.a ##22 ENSGT00940000161325.p.b ENSGT00510000047505.i ENSGT00940000157787.e ENSGT00390000017259.bb.a ENSGT00390000012337.f ENSGT00940000157348.t ENSGT00390000008797.d ENSGT00950000182909.b.b.b.q.a.a ENSGT00940000154511.a.g.a ENSGT00940000154848.b.c.b ENSGT00390000017697.b.eb.a.b ENSGT00940000166897.c ENSGT00940000157816.a.b.d ENSGT00940000159763.p.a ENSGT00390000010152.a Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00940000155164.a.b.a ENSGT00550000074781.u.b ENSGT00940000158943.c.d ENSGT00940000153941.b.c ENSGT00390000011359.p ENSGT00390000007453.e ENSGT00500000044924.b ENSGT00940000162823.C.b ENSGT00940000163403.d ENSGT00940000159615.k ENSGT00940000162670.n ENSGT00940000155966.gb.b ENSGT00940000156329.c ENSGT00940000160118.h ENSGT00940000157000.m ENSGT00950000183176.b.e.w.b.a ##22 ENSGT00940000161325.p.b ENSGT00510000047505.i ENSGT00940000157787.e ENSGT00390000017259.bb.a ENSGT00390000012337.f ENSGT00940000157348.t ENSGT00390000008797.d ENSGT00950000182909.b.b.b.r ENSGT00950000182909.b.b.b.q.a.a ENSGT00940000154511.a.g.a ENSGT00940000154848.b.c.b ENSGT00390000017697.b.eb.a.b ENSGT00940000166897.c ENSGT00940000157816.a.b.d ENSGT00940000159763.p.a Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00940000155164.a.b.a ENSGT00550000074781.u.b ENSGT00940000158943.c.d ENSGT00940000153941.b.c ENSGT00390000011359.p ENSGT00390000007453.e ENSGT00500000044924.b ENSGT00940000162823.C.b ENSGT00940000163403.d ENSGT00940000159615.k ENSGT00940000162670.n ENSGT00940000155966.gb.a.a ENSGT00940000156329.c ENSGT00940000160118.h ENSGT00940000157000.m ENSGT00950000183176.b.e.w.b.a ##22 ENSGT00940000161325.p.b ENSGT00510000047505.i ENSGT00940000157787.e ENSGT00390000017259.bb.a ENSGT00390000012337.f ENSGT00940000157348.t ENSGT00390000008797.d ENSGT00950000182909.b.b.b.q.a.a ENSGT00940000154511.a.g.a 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(ENSOKIG00005015062) SPG7 (ENSOKIG00005014317) cdh15 (ENSOKIG00005014179) ACSF3 (ENSOKIG00005013666) CBFA2T3 (ENSOKIG00005013581) ##22 PABPN1L (ENSOKIG00005013564) trappc2l (ENSOKIG00005013531) galns (ENSOKIG00005013489) aprt (ENSOKIG00005013478) CDT1 (ENSOKIG00005013468) PIEZO1 (ENSOKIG00005012256) ctu2 (ENSOKIG00005012143) RNF166 (ENSOKIG00005012129) ENSOKIG00005012121 ENSOKIG00005011040 CIAO2B (ENSOKIG00005010965) lto1 (ENSOKIG00005010951) CCND1 (ENSOKIG00005010929) tpcn2 (ENSOKIG00005010826) dhcr7 (ENSOKIG00005010778) Salmo ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00530000063335.A.pb.a ENSGT00940000155164.a.b.a ENSGT00550000074781.u.b ENSGT00940000158943.c.d ENSGT00940000153941.b.c ENSGT00390000011359.p ENSGT00390000007453.e ENSGT00500000044924.a ENSGT00940000163403.d ENSGT00940000159615.k ENSGT00940000162670.n ENSGT00940000155966.gb.a.a ENSGT00940000156329.c ENSGT00940000160118.h ENSGT00940000157000.m ENSGT00950000183176.b.e.w.b.a ##22 ENSGT00940000161325.p.b ENSGT00510000047505.i ENSGT00940000157787.e ENSGT00390000017259.bb.a ENSGT00390000012337.f ENSGT00940000157348.t ENSGT00390000008797.d ENSGT00950000182909.b.b.b.q.a.a ENSGT00940000154511.a.g.a ENSGT00940000154848.b.c.b ENSGT00390000017697.b.eb.b.b ENSGT00940000166897.c ENSGT00940000157816.a.b.d ENSGT00940000159763.p.a ENSGT00390000010152.a Atlantic salmon MODERN SPECIES 2 ENSSSAG00000074535 sord (ENSSSAG00000074503) ENSSSAG00000073464 mphosph10 (ENSSSAG00000073294) mcee (ENSSSAG00000053296) ist1 (ENSSSAG00000073269) dhodh (ENSSSAG00000073250) ENSSSAG00000114046 sult5a1 (ENSSSAG00000073243) dpep1 (ENSSSAG00000073232) SLC22A31 (ENSSSAG00000073225) ENSSSAG00000073160 SPG7 (ENSSSAG00000072817) cdh15 (ENSSSAG00000072707) ACSF3 (ENSSSAG00000072585) CBFA2T3 (ENSSSAG00000109906) ##22 trappc2l (ENSSSAG00000072525) PABPN1L (ENSSSAG00000072555) galns (ENSSSAG00000072515) aprt (ENSSSAG00000111408) CDT1 (ENSSSAG00000072506) PIEZO1 (ENSSSAG00000072401) ctu2 (ENSSSAG00000072330) RNF166 (ENSSSAG00000072323) ENSSSAG00000066114 ENSSSAG00000072016 ENSSSAG00000071996 lto1 (ENSSSAG00000071982) ENSSSAG00000108373 tpcn2 (ENSSSAG00000070595) ENSSSAG00000102017 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 80 ENSGT00940000159615.l ENSGT00940000162670.m ENSGT00940000155966.gb.b ENSGT00940000155966.gb.a.b ENSGT00940000156329.d ENSGT00940000160118.g ENSGT00940000157000.n ENSGT00950000183176.b.e.w.b.b ##22 ENSGT00940000161325.o ENSGT00510000047505.j ENSGT00940000157787.f ENSGT00390000017259.bb.b ENSGT00390000012337.e ENSGT00940000157348.s.b.b ENSGT00390000008797.c ENSGT00950000182909.b.b.b.q.b ENSGT00940000154511.a.g.b ENSGT00940000154848.b.c.a.b.a ENSGT00390000017697.b.eb.b ENSGT00390000017697.b.eb.a.a ENSGT00940000154848.b.c.a.b.b ENSGT00390000017697.b.db ENSGT00940000159836.b Huchen MODERN SPECIES 1580 SPG7 (ENSHHUG00000051137) cdh15 (ENSHHUG00000051161) ACSF3 (ENSHHUG00000051185) CBFA2T3 (ENSHHUG00000051205) ##22 PABPN1L (ENSHHUG00000051243) trappc2l (ENSHHUG00000051249) galns (ENSHHUG00000051304) aprt (ENSHHUG00000051329) CDT1 (ENSHHUG00000051330) Salmoninae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183176.b.e.x ##22 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 47 ENSGT00940000159615.l ENSGT00940000162670.m ENSGT00940000155966.gb.a.b ENSGT00940000156329.d ENSGT00940000160118.g ENSGT00940000157000.n ENSGT00950000183176.b.e.w.a ##22 ENSGT00940000161325.p.a ENSGT00950000183176.b.e.x ##22 ENSGT00940000161325.o ENSGT00510000047505.j ENSGT00940000157787.f ENSGT00390000017259.bb.b ENSGT00390000012337.e ENSGT00940000157348.s.b.b ENSGT00390000008797.c ENSGT00950000182909.b.b.b.q.b ENSGT00940000154511.a.g.b ENSGT00940000154848.b.c.a.b.a ENSGT00390000017697.b.db ENSGT00940000154848.b.c.a.b.b ENSGT00390000017697.b.eb.b ENSGT00940000159836.b ENSGT00940000165234 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 445 ENSGT00950000183176.b.e.x ##22 ENSGT00940000161325.o Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000158943.c.c ENSGT00940000153941.b.d ENSGT00390000011359.o ENSGT00390000007453.f ENSGT00500000044924.a ENSGT00940000159903 ENSGT00940000163403.c.a ENSGT00940000159615.l ENSGT00940000162670.m ENSGT00940000155966.gb.a.b ENSGT00940000156329.d ENSGT00940000160118.g ENSGT00940000157000.n ENSGT00950000183176.b.e.w.a ##22 ENSGT00940000161325.p.a ENSGT00950000183176.b.e.x ##22 ENSGT00940000161325.o ENSGT00510000047505.j ENSGT00940000157787.f ENSGT00390000017259.bb.b ENSGT00390000012337.e ENSGT00940000157348.s.b.b ENSGT00390000008797.c ENSGT00950000182909.b.b.b.q.b ENSGT00950000182909.b.b.b.q.a.b ENSGT00940000154511.a.g.b ENSGT00940000154848.b.c.a.b.a ENSGT00390000017697.b.db ENSGT00940000154848.b.c.a.b.b ENSGT00940000159836.b ENSGT00940000165234 Chinook salmon MODERN SPECIES 28 sord (ENSOTSG00005006446) APBA2 (ENSOTSG00005005682) mcee (ENSOTSG00005005678) mphosph10 (ENSOTSG00005005677) ist1 (ENSOTSG00005005675) dhodh (ENSOTSG00005005662) sult5a1 (ENSOTSG00005005659) sult5a1 (ENSOTSG00005005657) SLC22A31 (ENSOTSG00005005656) dpep1 (ENSOTSG00005005651) ANKRD11 (ENSOTSG00005005648) SPG7 (ENSOTSG00005004860) cdh15 (ENSOTSG00005004851) ACSF3 (ENSOTSG00005004850) CBFA2T3 (ENSOTSG00005004847) ##22 ENSOTSG00005004845 ##22 PABPN1L (ENSOTSG00005004843) trappc2l (ENSOTSG00005004791) galns (ENSOTSG00005004620) aprt (ENSOTSG00005004616) CDT1 (ENSOTSG00005004615) PIEZO1 (ENSOTSG00005004271) RNF166 (ENSOTSG00005004261) ENSOTSG00005004259 ctu2 (ENSOTSG00005002557) ENSOTSG00005002544 RNF166 (ENSOTSG00005002542) ENSOTSG00005002538 ENSOTSG00005000741 ciao2b (ENSOTSG00005000718) ENSOTSG00005000709 Northern pike MODERN SPECIES 1 terb2 (ENSELUG00000017770) sord (ENSELUG00000017847) APBA2 (ENSELUG00000017912) mcee (ENSELUG00000017936) mphosph10 (ENSELUG00000017942) ist1 (ENSELUG00000017983) dhodh (ENSELUG00000018016) ENSELUG00000018053 sult5a1 (ENSELUG00000001375) dpep1 (ENSELUG00000018110) SLC22A31 (ENSELUG00000018139) ANKRD11 (ENSELUG00000000753) SPG7 (ENSELUG00000000761) cdh15 (ENSELUG00000018220) ACSF3 (ENSELUG00000018266) CBFA2T3 (ENSELUG00000000775) ##22 PABPN1L (ENSELUG00000018385) trappc2l (ENSELUG00000018489) galns (ENSELUG00000018586) aprt (ENSELUG00000028541) CDT1 (ENSELUG00000018509) PIEZO1 (ENSELUG00000018690) ctu2 (ENSELUG00000018711) RNF166 (ENSELUG00000034401) ENSELUG00000018742 cdh1 (ENSELUG00000018753) ciao2b (ENSELUG00000018766) rrad (ENSELUG00000026901) ENSELUG00000009882 ca7 (ENSELUG00000025690) nae1 (ENSELUG00000009810) Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 68 ENSGT00940000158943.c ENSGT00940000153941.b ENSGT00390000011359 ENSGT00390000007453 ENSGT00940000168098 ENSGT00500000044924 ENSGT00940000159903 ENSGT00940000162823.C.b ENSGT00940000163403 ENSGT00940000159615 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000155966 ENSGT00940000156329 ENSGT00940000160118 ENSGT00940000157000 ENSGT00950000183176.b.e ##22 ENSGT00940000157787 ENSGT00940000175054 ENSGT00940000160432 ENSGT00940000162264 ENSGT00940000159573 ENSGT00390000008295.a ENSGT00550000074901 ENSGT00940000159757 ENSGT00940000165234 ENSGT00940000159836 ENSGT00940000157981.a.a.a ENSGT00940000153665.b.a.a ENSGT00940000154490.a.b ENSGT00940000156459.k ENSGT00690000101915.i.b Cod MODERN SPECIES 5 ENSGMOG00000014900 ENSGMOG00000014942 ENSGMOG00000014993 crybgx (ENSGMOG00000015010) ENSGMOG00000015022 dis3l (ENSGMOG00000003012) ENSGMOG00000011768 ENSGMOG00000004096 ENSGMOG00000004071 ENSGMOG00000004049 ENSGMOG00000035369 ENSGMOG00000035938 ENSGMOG00000001565 cdh15 (ENSGMOG00000001534) ACSF3 (ENSGMOG00000001508) CBFA2T3 (ENSGMOG00000001484) ##22 PABPN1L (ENSGMOG00000001475) trappc2l (ENSGMOG00000001406) galns (ENSGMOG00000001371) cmtm3 (ENSGMOG00000001358) dync1li2 (ENSGMOG00000001336) nae1 (ENSGMOG00000001307) ENSGMOG00000033842 ca7 (ENSGMOG00000001295) ENSGMOG00000001257 rrad (ENSGMOG00000001251) ENSGMOG00000032564 ENSGMOG00000028160 nsun3 (ENSGMOG00000028910) ENSGMOG00000002500 arl6 (ENSGMOG00000036908) Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000158943.c ENSGT00940000153941.b ENSGT00390000011359 ENSGT00390000007453 ENSGT00940000168098 ENSGT00500000044924 ENSGT00940000159903 ENSGT01020000230389.a.b ENSGT00940000163403 ENSGT00940000159615 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000155966 ENSGT00940000156329 ENSGT00940000160118 ENSGT00940000157000 ENSGT00950000183176.b.e ##22 ENSGT00940000157787 ENSGT00940000162264 ENSGT00940000160432 ENSGT00940000159573 ENSGT00390000008295.a ENSGT00550000074901 ENSGT00940000159757 ENSGT00940000165234 ENSGT00940000159836 ENSGT00940000157981.a.a.a ENSGT00940000153665.b.a.a ENSGT00940000154490.a.b ENSGT00940000156459.k ENSGT00690000101915.i.b ENSGT00940000161074.b Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 17 terb2 (ENSMMDG00005006979) sord (ENSMMDG00005006969) APBA2 (ENSMMDG00005006967) mcee (ENSMMDG00005006965) mphosph10 (ENSMMDG00005006955) ist1 (ENSMMDG00005006952) dhodh (ENSMMDG00005006943) ENSMMDG00005006883 sult5a1 (ENSMMDG00005006838) dpep1 (ENSMMDG00005006836) SLC22A31 (ENSMMDG00005006831) ANKRD11 (ENSMMDG00005006780) SPG7 (ENSMMDG00005005518) cdh15 (ENSMMDG00005005445) ACSF3 (ENSMMDG00005005280) CBFA2T3 (ENSMMDG00005003611) ##22 PABPN1L (ENSMMDG00005003570) trappc2l (ENSMMDG00005003550) galns (ENSMMDG00005003469) ENSMMDG00005003457 cmtm3 (ENSMMDG00005003454) cmtm4 (ENSMMDG00005003452) dync1li2 (ENSMMDG00005003437) nae1 (ENSMMDG00005003374) ca7 (ENSMMDG00005003344) rrad (ENSMMDG00005003339) atp5mc3b (ENSMMDG00005003232) nsun3 (ENSMMDG00005003224) EPHA6 (ENSMMDG00005003198) arl6 (ENSMMDG00005003179) SLC5A7 (ENSMMDG00005003171) Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00950000182841.b.a.b.a.a ENSGT00940000153941.b ENSGT00390000011359 ENSGT00390000007453 ENSGT00940000168098 ENSGT00500000044924 ENSGT00940000159903 ENSGT00940000162823.C.b ENSGT00940000163403 ENSGT00940000159615 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000155966 ENSGT00940000156329 ENSGT00940000160118 ENSGT00940000157000 ENSGT00950000183176.b.e ##22 ENSGT00940000157787 ENSGT00940000162264 ENSGT00940000160432 ENSGT00940000159573 ENSGT00390000008295.a ENSGT00730000112371 ENSGT00550000074901 ENSGT00940000159757 ENSGT00940000165234 ENSGT00940000159836 ENSGT00940000157981.a.a.a ENSGT00940000153665.b.a.a ENSGT00940000154490.a.b ENSGT00940000156459.k ENSGT00690000101915.i.b Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 256 zdhhc13 (ENSHCOG00000005101) mpped2a (ENSHCOG00000005088) ENSHCOG00000005065 ENSHCOG00000000830 NR2E3 (ENSHCOG00000000127) dhodh (ENSHCOG00000004903) ENSHCOG00000004872 dpep1 (ENSHCOG00000004863) sult5a1 (ENSHCOG00000004854) SLC22A31 (ENSHCOG00000004838) ENSHCOG00000004814 ANKRD11 (ENSHCOG00000004805) SPG7 (ENSHCOG00000004772) cdh15 (ENSHCOG00000004721) ACSF3 (ENSHCOG00000004671) CBFA2T3 (ENSHCOG00000004595) ##22 PABPN1L (ENSHCOG00000004151) trappc2l (ENSHCOG00000004141) galns (ENSHCOG00000004126) cmtm3 (ENSHCOG00000004082) ENSHCOG00000004076 cmtm4 (ENSHCOG00000004065) dync1li2 (ENSHCOG00000004056) ENSHCOG00000004046 nae1 (ENSHCOG00000004030) ca7 (ENSHCOG00000003982) ENSHCOG00000003865 rrad (ENSHCOG00000003823) nsun3 (ENSHCOG00000003817) atp5mc3b (ENSHCOG00000003797) ENSHCOG00000003791 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 12 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ENSGT00940000157000 ENSGT00950000183176.b.e ##22 ENSGT00940000161325 ENSGT00510000047505 ENSGT00940000157787 ENSGT00940000162264 ENSGT00940000160432 ENSGT00940000159573 ENSGT00390000008295.a ENSGT00730000112371 ENSGT00550000074901 ENSGT00940000159757 ENSGT00940000165234 ENSGT00940000159836 ENSGT00940000157981.a.a.a ENSGT00940000153665.b.a.a ENSGT00940000154490.a.b Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00950000182841.b.a.b.a.a ENSGT00940000153941.b ENSGT00390000011359 ENSGT00390000007453 ENSGT00940000168098 ENSGT00500000044924 ENSGT00940000159903 ENSGT01020000230389.a.b ENSGT00940000163403 ENSGT00940000159615 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000155966 ENSGT00940000156329 ENSGT00940000160118 ENSGT00940000157000 ENSGT00950000183176.b.e ##22 ENSGT00940000161325 ENSGT00510000047505 ENSGT00940000157787 ENSGT00940000162264 ENSGT00940000160432 ENSGT00940000159573 ENSGT00390000008295.a ENSGT00730000112371 ENSGT00550000074901 ENSGT00940000159757 ENSGT00940000165234 ENSGT00940000159836 ENSGT00940000157981.a.a.a ENSGT00940000153665.b.a.a ENSGT00940000154490.a.b Oryzias ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00550000074828.a ENSGT00950000182841.b.a.b.a.a ENSGT00940000153941.b ENSGT00390000011359 ENSGT00390000007453 ENSGT00500000044924 ENSGT00940000159903 ENSGT01020000230389.a.b ENSGT00940000163403 ENSGT00940000159615 ENSGT00940000162670.t ENSGT00940000155966 ENSGT00940000156329 ENSGT00940000160118 ENSGT00940000157000 ENSGT00950000183176.b.e ##22 ENSGT00940000161325 ENSGT00510000047505 ENSGT00940000157787 ENSGT00940000160432 ENSGT00940000159573 ENSGT00390000008295.a ENSGT00730000112371 ENSGT00550000074901 ENSGT00940000159757 ENSGT00940000165234 ENSGT00940000159836 ENSGT00940000157981.a.a.a ENSGT00940000153665.b.a.a ENSGT00940000154490.a.b ENSGT00940000156459.k Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00550000074828.a ENSGT00950000182841.b.a.b.a.a ENSGT00940000153941.b ENSGT00390000011359 ENSGT00390000007453 ENSGT00500000044924 ENSGT00940000161671 ENSGT01020000230389.a.b ENSGT00940000163403 ENSGT00940000159615 ENSGT00940000162670.t ENSGT00940000155966 ENSGT00940000156329 ENSGT00940000160118 ENSGT00940000157000 ENSGT00950000183176.b.e ##22 ENSGT00940000161325 ENSGT00510000047505 ENSGT00940000157787 ENSGT00940000160432 ENSGT00940000159573 ENSGT00390000008295.a ENSGT00730000112371 ENSGT00550000074901 ENSGT00940000159757 ENSGT00940000165234 ENSGT00940000159836 ENSGT00940000157981.a.a.a ENSGT00940000153665.b.a.a ENSGT00940000154490.a.b ENSGT00940000156459.k Chinese medaka MODERN SPECIES 72 lin7c (ENSOSIG00000010762) rplp2l (ENSOSIG00000010761) ENSOSIG00000010759 mcee (ENSOSIG00000010758) mphosph10 (ENSOSIG00000010150) ist1 (ENSOSIG00000010130) dhodh (ENSOSIG00000009691) ENSOSIG00000009687 ENSOSIG00000009686 dpep1 (ENSOSIG00000009650) SLC22A31 (ENSOSIG00000009643) ANKRD11 (ENSOSIG00000009586) SPG7 (ENSOSIG00000006899) cdh15 (ENSOSIG00000006874) ACSF3 (ENSOSIG00000006824) CBFA2T3 (ENSOSIG00000006821) ##22 PABPN1L (ENSOSIG00000006820) trappc2l 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nae1 (ENSORLG00000005429) ca7 (ENSORLG00000028995) ENSORLG00000027526 ENSORLG00000005424 rrad (ENSORLG00000024517) ENSORLG00000026953 nsun3 (ENSORLG00000005378) ENSORLG00000005357 Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000153222.a.b.b.b.a ENSGT00950000182841.b.a.b.a.a ENSGT00940000153941.b ENSGT00390000011359 ENSGT00390000007453 ENSGT00500000044924 ENSGT00940000159903 ENSGT01020000230389.a.b ENSGT00940000163403 ENSGT00940000159615 ENSGT00940000162670.t ENSGT00940000155966 ENSGT00940000156329 ENSGT00940000160118 ENSGT00940000157000 ENSGT00950000183176.b.e ##22 ENSGT00940000161325 ENSGT00510000047505 ENSGT00940000157787 ENSGT00940000160432 ENSGT00940000159573 ENSGT00390000008295.a ENSGT00730000112371 ENSGT00550000074901 ENSGT00940000159757 ENSGT00940000165234 ENSGT00940000159836 ENSGT00940000157981.a.a.a ENSGT00940000153665.b.a.a ENSGT00940000154490.a.b ENSGT00940000156459.k Javanese ricefish DUPLICATION Javanese ricefish DUPLICATION Javanese ricefish MODERN SPECIES 17 mphosph10 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(ENSTNIG00000009418) cmtm3 (ENSTNIG00000009419) cmtm4 (ENSTNIG00000009420) dync1li2 (ENSTNIG00000009421) ENSTNIG00000009422 nae1 (ENSTNIG00000009423) ca7 (ENSTNIG00000009424) ENSTNIG00000009425 rrad (ENSTNIG00000009426) atp5mc3b (ENSTNIG00000009427) nsun3 (ENSTNIG00000009428) ENSTNIG00000009429 arl6 (ENSTNIG00000009430) Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00550000074828.a ENSGT00950000182841.b.a.b.a.a ENSGT00940000153941.b ENSGT00390000011359 ENSGT00390000007453 ENSGT00940000178658 ENSGT00500000044924 ENSGT01020000230389.a.b ENSGT00940000163403 ENSGT00940000159615 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000155966 ENSGT00940000156329 ENSGT00940000160118 ENSGT00940000157000 ENSGT00950000183176.b.e ##22 ENSGT00940000161325 ENSGT00510000047505 ENSGT00940000157787 ENSGT00940000162264 ENSGT00940000160432 ENSGT00940000159573 ENSGT00390000008295.a ENSGT00730000112371 ENSGT00550000074901 ENSGT00940000159757 ENSGT00940000165234 ENSGT00940000159836 ENSGT00940000157981.a.a.a ENSGT00940000153665.b.a.a ENSGT00940000154490.a.b Ballan wrasse MODERN SPECIES 462 CBFA2T3 (ENSLBEG00000011666) ##22 trappc2l (ENSLBEG00000011621) PABPN1L (ENSLBEG00000011647) galns (ENSLBEG00000011579) CKLF (ENSLBEG00000011555) cmtm3 (ENSLBEG00000011528) cmtm4 (ENSLBEG00000011506) dync1li2 (ENSLBEG00000011486) ENSLBEG00000011466 nae1 (ENSLBEG00000011347) ca7 (ENSLBEG00000011260) ENSLBEG00000011196 rrad (ENSLBEG00000011162) atp5mc3b (ENSLBEG00000011134) nsun3 (ENSLBEG00000011096) ENSLBEG00000011062 Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00550000074828.a ENSGT00950000182841.b.a.b.a.a ENSGT00940000153941.b ENSGT00390000011359 ENSGT00390000007453 ENSGT00940000178658 ENSGT00500000044924 ENSGT01020000230389.a.b ENSGT00940000163403 ENSGT00940000159615 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000155966 ENSGT00940000156329 ENSGT00940000160118 ENSGT00940000157000 ENSGT00950000183176.b.e ##22 ENSGT00940000161325 ENSGT00510000047505 ENSGT00940000157787 ENSGT00940000162264 ENSGT00940000160432 ENSGT00940000159573 ENSGT00390000008295.a ENSGT00730000112371 ENSGT00550000074901 ENSGT00940000159757 ENSGT00940000165234 ENSGT00940000159836 ENSGT00940000157981.a.a.a ENSGT00940000153665.b.a.a ENSGT00940000154490.a.b Perciformes ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00550000074828.a ENSGT00950000182841.b.a.b.a.a ENSGT00940000153941.b ENSGT00390000011359 ENSGT00390000007453 ENSGT00940000178658 ENSGT00500000044924 ENSGT01020000230389.a.b ENSGT00940000163403 ENSGT00940000159615 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000155966 ENSGT00940000156329 ENSGT00940000160118 ENSGT00940000157000 ENSGT00950000183176.b.e ##22 ENSGT00940000161325 ENSGT00510000047505 ENSGT00940000157787 ENSGT00940000162264 ENSGT00940000160432 ENSGT00940000159573 ENSGT00390000008295.a ENSGT00730000112371 ENSGT00550000074901 ENSGT00940000159757 ENSGT00940000165234 ENSGT00940000159836 ENSGT00940000157981.a.a.a ENSGT00940000153665.b.a.a ENSGT00940000154490.a.b Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00550000074828.a ENSGT00950000182841.b.a.b.a.a ENSGT00940000153941.b ENSGT00390000011359 ENSGT00390000007453 ENSGT00940000178658 ENSGT00500000044924 ENSGT01020000230389.a.b ENSGT00940000163403 ENSGT00940000159615 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000155966 ENSGT00940000156329 ENSGT00940000160118 ENSGT00940000157000 ENSGT00950000183176.b.e ##22 ENSGT00940000161325 ENSGT00510000047505 ENSGT00940000157787 ENSGT00940000162264 ENSGT00940000160432 ENSGT00940000159573 ENSGT00390000008295.a ENSGT00730000112371 ENSGT00550000074901 ENSGT00940000159757 ENSGT00940000165234 ENSGT00940000159836 ENSGT00940000157981.a.a.a ENSGT00940000153665.b.a.a ENSGT00940000154490.a.b Pike perch MODERN SPECIES 44 rplp2l (ENSSLUG00000008127) FTH1 (ENSSLUG00000008122) mcee (ENSSLUG00000008116) mphosph10 (ENSSLUG00000007775) ist1 (ENSSLUG00000007721) ENSSLUG00000007710 dhodh (ENSSLUG00000007690) ENSSLUG00000007681 sult5a1 (ENSSLUG00000007678) dpep1 (ENSSLUG00000007645) SLC22A31 (ENSSLUG00000007628) ANKRD11 (ENSSLUG00000007520) SPG7 (ENSSLUG00000006937) cdh15 (ENSSLUG00000006861) ACSF3 (ENSSLUG00000006846) CBFA2T3 (ENSSLUG00000006715) ##22 PABPN1L (ENSSLUG00000006679) trappc2l (ENSSLUG00000006637) galns (ENSSLUG00000006586) ENSSLUG00000006570 cmtm3 (ENSSLUG00000006576) cmtm4 (ENSSLUG00000006566) dync1li2 (ENSSLUG00000006538) ENSSLUG00000006516 nae1 (ENSSLUG00000006431) ca7 (ENSSLUG00000006405) rrad (ENSSLUG00000006400) ENSSLUG00000006384 nsun3 (ENSSLUG00000006264) EPHA6 (ENSSLUG00000006222) arl6 (ENSSLUG00000006214) Channel bull blenny MODERN SPECIES 17 ENSCGOG00000000498 mcee (ENSCGOG00000000460) mphosph10 (ENSCGOG00000022206) ist1 (ENSCGOG00000022195) dhodh (ENSCGOG00000022193) ENSCGOG00000022192 sult5a1 (ENSCGOG00000022191) ENSCGOG00000022190 dpep1 (ENSCGOG00000022168) SLC22A31 (ENSCGOG00000022167) ANKRD11 (ENSCGOG00000022149) ENSCGOG00000022142 SPG7 (ENSCGOG00000021725) cdh15 (ENSCGOG00000021700) ACSF3 (ENSCGOG00000021699) CBFA2T3 (ENSCGOG00000021697) ##22 PABPN1L (ENSCGOG00000021695) trappc2l (ENSCGOG00000021672) galns (ENSCGOG00000021649) CKLF (ENSCGOG00000021644) cmtm3 (ENSCGOG00000021642) cmtm4 (ENSCGOG00000021641) dync1li2 (ENSCGOG00000021392) ENSCGOG00000021386 nae1 (ENSCGOG00000020359) ca7 (ENSCGOG00000020254) ENSCGOG00000020250 rrad (ENSCGOG00000020245) atp5mc3b (ENSCGOG00000020241) nsun3 (ENSCGOG00000020236) ENSCGOG00000020217 Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00550000074828.a ENSGT00950000182841.b.a.b.a.a ENSGT00940000153941.b ENSGT00390000011359 ENSGT00390000007453 ENSGT00940000168098 ENSGT00500000044924 ENSGT01020000230389.a.b ENSGT00940000163403 ENSGT00940000159615 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000155966 ENSGT00940000156329 ENSGT00940000160118 ENSGT00940000157000 ENSGT00950000183176.b.e ##22 ENSGT00940000161325 ENSGT00510000047505 ENSGT00940000157787 ENSGT00940000162264 ENSGT00940000160432 ENSGT00940000159573 ENSGT00390000008295.a ENSGT00730000112371 ENSGT00550000074901 ENSGT00940000159757 ENSGT00940000165234 ENSGT00940000159836 ENSGT00940000157981.a.a.a ENSGT00940000153665.b.a.a ENSGT00940000154490.a.b Lumpfish MODERN SPECIES 18 rplp2l (ENSCLMG00005002101) FTH1 (ENSCLMG00005002100) mcee (ENSCLMG00005002097) mphosph10 (ENSCLMG00005002069) ist1 (ENSCLMG00005002061) dhodh (ENSCLMG00005002053) ENSCLMG00005002041 sult5a1 (ENSCLMG00005002019) dpep1 (ENSCLMG00005002015) SLC22A31 (ENSCLMG00005002014) ENSCLMG00005002012 SPG7 (ENSCLMG00005000903) cdh15 (ENSCLMG00005000890) ACSF3 (ENSCLMG00005000886) ENSCLMG00005000883 CBFA2T3 (ENSCLMG00005000791) ##22 PABPN1L (ENSCLMG00005000789) trappc2l (ENSCLMG00005000781) galns (ENSCLMG00005000729) CKLF (ENSCLMG00005000725) cmtm3 (ENSCLMG00005000724) cmtm4 (ENSCLMG00005000723) dync1li2 (ENSCLMG00005000715) ENSCLMG00005000706 nae1 (ENSCLMG00005000674) ca7 (ENSCLMG00005000592) rrad (ENSCLMG00005000584) ENSCLMG00005000550 nsun3 (ENSCLMG00005000546) EPHA6 (ENSCLMG00005000538) arl6 (ENSCLMG00005000532) Stickleback MODERN SPECIES 1 lin7c (ENSGACG00000015500) rplp2l (ENSGACG00000015499) FTH1 (ENSGACG00000015484) mcee (ENSGACG00000015483) mphosph10 (ENSGACG00000015478) ist1 (ENSGACG00000015470) ENSGACG00000015469 dhodh (ENSGACG00000015466) sult5a1 (ENSGACG00000015459) dpep1 (ENSGACG00000015454) SLC22A31 (ENSGACG00000015452) ANKRD11 (ENSGACG00000015450) SPG7 (ENSGACG00000015447) cdh15 (ENSGACG00000015445) ACSF3 (ENSGACG00000015439) CBFA2T3 (ENSGACG00000015432) ##22 PABPN1L (ENSGACG00000015428) galns (ENSGACG00000015424) ENSGACG00000015423 cmtm3 (ENSGACG00000015421) cmtm4 (ENSGACG00000015419) dync1li2 (ENSGACG00000015417) ENSGACG00000015415 nae1 (ENSGACG00000015403) ca7 (ENSGACG00000015396) ENSGACG00000015392 rrad (ENSGACG00000015391) atp5mc3b (ENSGACG00000015390) nsun3 (ENSGACG00000015388) EPHA6 (ENSGACG00000015384) arl6 (ENSGACG00000015382) Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000153222.a.b.b.b.a ENSGT00550000074828.a ENSGT00950000182841.b.a.b.a.a ENSGT00940000153941.b ENSGT00390000011359 ENSGT00390000007453 ENSGT00500000044924 ENSGT01020000230389.a.b ENSGT00940000163403 ENSGT00940000159615 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000155966 ENSGT00940000156329 ENSGT00940000160118 ENSGT00940000157000 ENSGT00950000183176.b.e ##22 ENSGT00940000161325 ENSGT00510000047505 ENSGT00940000157787 ENSGT00940000160432 ENSGT00940000162264 ENSGT00940000159573 ENSGT00390000008295.a ENSGT00550000074901 ENSGT00940000159757 ENSGT00940000165234 ENSGT00940000159836 ENSGT00940000157981.a.a.a ENSGT00940000153665.b.a.a ENSGT00940000154490.a.b ENSGT00940000156459.k Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000153222.a.b.b.b.a ENSGT00550000074828.a ENSGT00950000182841.b.a.b.a.a ENSGT00940000153941.b ENSGT00390000011359 ENSGT00390000007453 ENSGT00500000044924 ENSGT01020000230389.a.b ENSGT00940000163403 ENSGT00940000159615 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000155966 ENSGT00940000156329 ENSGT00940000160118 ENSGT00940000157000 ENSGT00950000183176.b.e ##22 ENSGT00940000161325 ENSGT00510000047505 ENSGT00940000157787 ENSGT00940000162264 ENSGT00940000159573 ENSGT00390000008295.a ENSGT00550000074901 ENSGT00940000159757 ENSGT00940000165234 ENSGT00940000159836 ENSGT00940000157981.a.a.a ENSGT00940000153665.b.a.a ENSGT00940000154490.a.b ENSGT00940000156459.k ENSGT00690000101915.i.b European seabass MODERN SPECIES 18 lin7c (ENSDLAG00005031763) ENSDLAG00005022166 ENSDLAG00005022170 ENSDLAG00005032560 ENSDLAG00005022187 ist1 (ENSDLAG00005030321) dhodh (ENSDLAG00005022215) ENSDLAG00005022256 sult5a1 (ENSDLAG00005022257) dpep1 (ENSDLAG00005022269) SLC22A31 (ENSDLAG00005022297) ENSDLAG00005022306 SPG7 (ENSDLAG00005022348) cdh15 (ENSDLAG00005022924) ACSF3 (ENSDLAG00005022953) CBFA2T3 (ENSDLAG00005022964) ##22 PABPN1L (ENSDLAG00005030086) trappc2l (ENSDLAG00005023033) galns (ENSDLAG00005022981) cmtm4 (ENSDLAG00005023070) dync1li2 (ENSDLAG00005023102) nae1 (ENSDLAG00005023414) ca7 (ENSDLAG00005023838) ENSDLAG00005027449 ENSDLAG00005023851 nsun3 (ENSDLAG00005023914) ENSDLAG00005023919 arl6 (ENSDLAG00005031921) ENSDLAG00005023951 kctd12.2 (ENSDLAG00005023959) ENSDLAG00005023975 Large yellow croaker MODERN SPECIES 480 lin7c (ENSLCRG00005007644) rplp2l (ENSLCRG00005007641) ENSLCRG00005007638 mcee (ENSLCRG00005007636) mphosph10 (ENSLCRG00005007626) ist1 (ENSLCRG00005007616) dhodh (ENSLCRG00005007579) ENSLCRG00005007575 sult5a1 (ENSLCRG00005007571) dpep1 (ENSLCRG00005007467) SLC22A31 (ENSLCRG00005007465) ANKRD11 (ENSLCRG00005007136) SPG7 (ENSLCRG00005005091) cdh15 (ENSLCRG00005004877) ACSF3 (ENSLCRG00005004855) CBFA2T3 (ENSLCRG00005004847) ##22 galns (ENSLCRG00005004837) CKLF (ENSLCRG00005004834) cmtm4 (ENSLCRG00005004829) dync1li2 (ENSLCRG00005004320) nae1 (ENSLCRG00005002830) ca7 (ENSLCRG00005002779) ENSLCRG00005002769 rrad (ENSLCRG00005002763) atp5mc3b (ENSLCRG00005002618) nsun3 (ENSLCRG00005002611) ENSLCRG00005002578 arl6 (ENSLCRG00005002566) SLC5A7 (ENSLCRG00005002560) kctd12.2 (ENSLCRG00005002557) lmo7b (ENSLCRG00005002529) Gilthead seabream MODERN SPECIES 18 rplp2l (ENSSAUG00010002322) ENSSAUG00010002318 mcee (ENSSAUG00010002300) mphosph10 (ENSSAUG00010002283) ist1 (ENSSAUG00010002268) dhodh (ENSSAUG00010002205) ENSSAUG00010002182 sult5a1 (ENSSAUG00010002173) dpep1 (ENSSAUG00010002165) SLC22A31 (ENSSAUG00010002159) ANKRD11 (ENSSAUG00010002127) SPG7 (ENSSAUG00010001951) cdh15 (ENSSAUG00010001919) ACSF3 (ENSSAUG00010001908) ENSSAUG00010001904 CBFA2T3 (ENSSAUG00010001896) ##22 PABPN1L (ENSSAUG00010001890) trappc2l (ENSSAUG00010001882) galns (ENSSAUG00010001751) cmtm3 (ENSSAUG00010001713) CKLF (ENSSAUG00010001707) cmtm4 (ENSSAUG00010001697) dync1li2 (ENSSAUG00010001080) nae1 (ENSSAUG00010001019) ca7 (ENSSAUG00010001008) ENSSAUG00010001007 rrad (ENSSAUG00010001005) atp5mc3b (ENSSAUG00010001003) nsun3 (ENSSAUG00010001002) ENSSAUG00010000991 arl6 (ENSSAUG00010000983) Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00950000182841.b.a.b.a.a ENSGT00940000153941.b ENSGT00390000011359 ENSGT00390000007453 ENSGT00940000178658 ENSGT00500000044924 ENSGT00940000159903 ENSGT01020000230389.a.b ENSGT00940000163403 ENSGT00940000159615 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000155966 ENSGT00940000156329 ENSGT00940000160118 ENSGT00940000157000 ENSGT00950000183176.b.e ##22 ENSGT00940000161325 ENSGT00510000047505 ENSGT00940000157787 ENSGT00940000162264 ENSGT00940000160432 ENSGT00940000159573 ENSGT00390000008295.a ENSGT00730000112371 ENSGT00550000074901 ENSGT00940000159757 ENSGT00940000165234 ENSGT00940000159836 ENSGT00940000157981.a.a.a ENSGT00940000153665.b.a.a ENSGT00940000154490.a.b Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00950000182841.b.a.b.a.a ENSGT00940000153941.b ENSGT00390000011359 ENSGT00390000007453 ENSGT00940000168098 ENSGT00500000044924 ENSGT00940000159903 ENSGT01020000230389.a.b ENSGT00940000163403 ENSGT00940000159615 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000155966 ENSGT00940000156329 ENSGT00940000160118 ENSGT00940000157000 ENSGT00950000183176.b.e ##22 ENSGT00940000161325 ENSGT00510000047505 ENSGT00940000157787 ENSGT00940000162264 ENSGT00940000160432 ENSGT00940000159573 ENSGT00390000008295.a ENSGT00550000074901 ENSGT00940000159757 ENSGT00940000165234 ENSGT00940000159836 ENSGT00940000157981.a.a.a ENSGT00940000153665.b.a.a ENSGT00940000154490.a.b ENSGT00940000156459.k Zig-zag eel MODERN SPECIES 17 ENSMAMG00000001544 ENSMAMG00000028600 ENSMAMG00000001575 ENSMAMG00000001587 ist1 (ENSMAMG00000024849) ENSMAMG00000028558 dhodh (ENSMAMG00000001638) HPR (ENSMAMG00000025366) sult5a1 (ENSMAMG00000001721) dpep1 (ENSMAMG00000001775) SLC22A31 (ENSMAMG00000001803) ENSMAMG00000001834 SPG7 (ENSMAMG00000001883) cdh15 (ENSMAMG00000001904) ACSF3 (ENSMAMG00000001946) CBFA2T3 (ENSMAMG00000001967) ##22 PABPN1L (ENSMAMG00000002051) trappc2l (ENSMAMG00000027635) galns (ENSMAMG00000002110) cmtm4 (ENSMAMG00000002169) dync1li2 (ENSMAMG00000002195) ENSMAMG00000027175 nae1 (ENSMAMG00000002260) ca7 (ENSMAMG00000002369) ENSMAMG00000024967 ENSMAMG00000002570 rrad (ENSMAMG00000002621) ENSMAMG00000002628 nsun3 (ENSMAMG00000026492) ENSMAMG00000002649 arl6 (ENSMAMG00000027051) Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000153222.a.b.b.b.a ENSGT00550000074828.a ENSGT00950000182841.b.a.b.a.a ENSGT00940000153941.b ENSGT00390000011359 ENSGT00390000007453 ENSGT00500000044924 ENSGT01020000230389.a.b ENSGT00940000163403 ENSGT00940000159615 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000155966 ENSGT00940000156329 ENSGT00940000160118 ENSGT00940000157000 ENSGT00950000183176.b.e ##22 ENSGT00940000161325 ENSGT00510000047505 ENSGT00940000157787 ENSGT00940000162264 ENSGT00940000160432 ENSGT00940000159573 ENSGT00390000008295.a ENSGT00550000074901 ENSGT00940000159757 ENSGT00940000159836 ENSGT00940000157981.a.a.a ENSGT00940000153665.b.a.a ENSGT00940000154490.a.b ENSGT00940000156459.k ENSGT00690000101915.i.b Siamese fighting fish MODERN SPECIES 14 lin7c (ENSBSLG00000023819) ENSBSLG00000023828 FTH1 (ENSBSLG00000023831) mcee (ENSBSLG00000023849) mphosph10 (ENSBSLG00000023904) ist1 (ENSBSLG00000023982) dhodh (ENSBSLG00000024005) ENSBSLG00000024019 sult5a1 (ENSBSLG00000024025) dpep1 (ENSBSLG00000024047) SLC22A31 (ENSBSLG00000024061) ANKRD11 (ENSBSLG00000024089) SPG7 (ENSBSLG00000024121) cdh15 (ENSBSLG00000024197) ACSF3 (ENSBSLG00000024221) CBFA2T3 (ENSBSLG00000000522) ##22 PABPN1L (ENSBSLG00000000563) trappc2l (ENSBSLG00000000595) galns (ENSBSLG00000000660) ENSBSLG00000000755 cmtm3 (ENSBSLG00000000760) cmtm4 (ENSBSLG00000000765) dync1li2 (ENSBSLG00000000780) nae1 (ENSBSLG00000000837) ca7 (ENSBSLG00000000910) rrad (ENSBSLG00000001198) atp5mc3b (ENSBSLG00000001237) nsun3 (ENSBSLG00000001265) arl6 (ENSBSLG00000001341) SLC5A7 (ENSBSLG00000001361) ENSBSLG00000001393 Climbing perch MODERN SPECIES 16 ENSATEG00000011083 ENSATEG00000011089 ENSATEG00000028147 ENSATEG00000011131 ist1 (ENSATEG00000011140) dhodh (ENSATEG00000011177) ENSATEG00000011210 sult5a1 (ENSATEG00000011268) dpep1 (ENSATEG00000011300) SLC22A31 (ENSATEG00000011338) ENSATEG00000029423 ENSATEG00000011370 SPG7 (ENSATEG00000011391) cdh15 (ENSATEG00000011487) ACSF3 (ENSATEG00000011508) CBFA2T3 (ENSATEG00000011579) ##22 PABPN1L (ENSATEG00000011646) trappc2l (ENSATEG00000011671) galns (ENSATEG00000011700) CKLF (ENSATEG00000011745) cmtm3 (ENSATEG00000011761) cmtm4 (ENSATEG00000011783) dync1li2 (ENSATEG00000011795) nae1 (ENSATEG00000011863) ca7 (ENSATEG00000011959) rrad (ENSATEG00000012125) ENSATEG00000012129 nsun3 (ENSATEG00000012137) ENSATEG00000012142 arl6 (ENSATEG00000012204) ENSATEG00000012228 Carangaria ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00550000074828.a ENSGT00950000182841.b.a.b.a.a ENSGT00940000153941.b ENSGT00390000011359 ENSGT00390000007453 ENSGT00940000178658 ENSGT00500000044924 ENSGT01020000230389.a.b ENSGT00940000163403 ENSGT00940000159615 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000155966 ENSGT00940000156329 ENSGT00940000160118 ENSGT00940000157000 ENSGT00950000183176.b.e ##22 ENSGT00940000161325 ENSGT00510000047505 ENSGT00940000157787 ENSGT00940000162264 ENSGT00940000160432 ENSGT00940000159573 ENSGT00390000008295.a ENSGT00730000112371 ENSGT00550000074901 ENSGT00940000159757 ENSGT00940000165234 ENSGT00940000159836 ENSGT00940000157981.a.a.a ENSGT00940000153665.b.a.a ENSGT00940000154490.a.b Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000153222.a.b.b.b.a ENSGT00550000074828.a ENSGT00950000182841.b.a.b.a.a ENSGT00940000153941.b ENSGT00390000011359 ENSGT00390000007453 ENSGT00500000044924 ENSGT01020000230389.a.b ENSGT00940000163403 ENSGT00940000159615 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000155966 ENSGT00940000156329 ENSGT00940000160118 ENSGT00940000157000 ENSGT00950000183176.b.e ##22 ENSGT00940000161325 ENSGT00510000047505 ENSGT00940000157787 ENSGT00940000162264 ENSGT00940000160432 ENSGT00940000159573 ENSGT00390000008295.a ENSGT00730000112371 ENSGT00550000074901 ENSGT00940000159757 ENSGT00940000165234 ENSGT00940000159836 ENSGT00940000157981.a.a.a ENSGT00940000153665.b.a.a ENSGT00940000154490.a.b Seriola ANCESTRAL SPECIES 52 ENSGT00940000153222.a.b.b.b.a ENSGT00550000074828.a ENSGT00950000182841.b.a.b.a.a ENSGT00940000153941.b ENSGT00390000011359 ENSGT00390000007453 ENSGT00500000044924 ENSGT01020000230389.a.b ENSGT00940000163403 ENSGT00940000159615 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000155966 ENSGT00940000156329 ENSGT00940000160118 ENSGT00940000157000 ENSGT00950000183176.b.e ##22 ENSGT00940000161325 ENSGT00510000047505 ENSGT00940000157787 ENSGT00940000162264 ENSGT00940000160432 ENSGT00940000159573 ENSGT00390000008295.a ENSGT00730000112371 ENSGT00550000074901 ENSGT00940000159757 ENSGT00940000165234 ENSGT00940000159836 ENSGT00940000157981.a.a.a ENSGT00940000153665.b.a.a ENSGT00940000154490.a.b Greater amberjack MODERN SPECIES 233 rplp2l (ENSSDUG00000007436) ENSSDUG00000007415 mcee (ENSSDUG00000007405) mphosph10 (ENSSDUG00000007381) ist1 (ENSSDUG00000007365) ENSSDUG00000007359 ENSSDUG00000007352 dhodh (ENSSDUG00000007317) sult5a1 (ENSSDUG00000007303) dpep1 (ENSSDUG00000007274) SLC22A31 (ENSSDUG00000007258) ANKRD11 (ENSSDUG00000007209) SPG7 (ENSSDUG00000007147) cdh15 (ENSSDUG00000007113) ACSF3 (ENSSDUG00000007083) CBFA2T3 (ENSSDUG00000007029) ##22 PABPN1L (ENSSDUG00000006986) trappc2l (ENSSDUG00000007001) galns (ENSSDUG00000006961) CKLF (ENSSDUG00000006956) cmtm3 (ENSSDUG00000006947) cmtm4 (ENSSDUG00000006932) dync1li2 (ENSSDUG00000006867) ENSSDUG00000006857 nae1 (ENSSDUG00000006813) ca7 (ENSSDUG00000006788) ENSSDUG00000006744 rrad (ENSSDUG00000006708) atp5mc3b (ENSSDUG00000006694) nsun3 (ENSSDUG00000006683) EPHA6 (ENSSDUG00000006670) Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 3074 rplp2l (ENSSLDG00000021441) ENSSLDG00000021450 mcee (ENSSLDG00000021467) mphosph10 (ENSSLDG00000021481) ist1 (ENSSLDG00000021497) dhodh (ENSSLDG00000021516) ENSSLDG00000021545 ENSSLDG00000021555 sult5a1 (ENSSLDG00000021569) dpep1 (ENSSLDG00000021578) SLC22A31 (ENSSLDG00000021603) ANKRD11 (ENSSLDG00000021617) SPG7 (ENSSLDG00000021642) cdh15 (ENSSLDG00000021758) ACSF3 (ENSSLDG00000021795) CBFA2T3 (ENSSLDG00000021818) ##22 trappc2l (ENSSLDG00000021857) PABPN1L (ENSSLDG00000021845) galns (ENSSLDG00000021875) CKLF (ENSSLDG00000000093) cmtm3 (ENSSLDG00000000153) cmtm4 (ENSSLDG00000000188) dync1li2 (ENSSLDG00000000227) ENSSLDG00000000303 nae1 (ENSSLDG00000000326) ca7 (ENSSLDG00000000431) ENSSLDG00000000443 rrad (ENSSLDG00000000511) atp5mc3b (ENSSLDG00000000535) nsun3 (ENSSLDG00000000551) ENSSLDG00000000560 Barramundi perch MODERN SPECIES 243 SLC22A31 (ENSLCAG00010006178) ANKRD11 (ENSLCAG00010006160) SPG7 (ENSLCAG00010005785) cdh15 (ENSLCAG00010005731) ACSF3 (ENSLCAG00010005728) CBFA2T3 (ENSLCAG00010005721) ##22 PABPN1L (ENSLCAG00010005716) trappc2l (ENSLCAG00010005686) galns (ENSLCAG00010005543) ENSLCAG00010005521 cmtm3 (ENSLCAG00010005516) cmtm4 (ENSLCAG00010005502) dync1li2 (ENSLCAG00010005465) nae1 (ENSLCAG00010005089) ca7 (ENSLCAG00010005006) ENSLCAG00010004998 rrad (ENSLCAG00010004994) atp5mc3b (ENSLCAG00010004984) nsun3 (ENSLCAG00010004979) EPHA6 (ENSLCAG00010004917) arl6 (ENSLCAG00010004891) Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000153222.a.b.b.b.a ENSGT00550000074828.a ENSGT00950000182841.b.a.b.a.a ENSGT00940000153941.b ENSGT00390000011359 ENSGT00390000007453 ENSGT00940000178658 ENSGT00500000044924 ENSGT00940000159615 ENSGT00940000163403 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000155966 ENSGT00940000156329 ENSGT00940000160118 ENSGT00940000157000 ENSGT00950000183176.b.e ##22 ENSGT00940000161325 ENSGT00510000047505 ENSGT00940000157787 ENSGT00940000162264 ENSGT00940000160432 ENSGT00940000159573 ENSGT00390000008295.a ENSGT00730000112371 ENSGT00550000074901 ENSGT00940000159757 ENSGT00940000165234 ENSGT00940000159836 ENSGT00940000157981.a.a.a ENSGT00940000153665.b.a.a ENSGT00940000154490.a.b Turbot MODERN SPECIES 17 lin7c (ENSSMAG00000024571) ENSSMAG00000024542 ENSSMAG00000025209 ENSSMAG00000021363 ENSSMAG00000021362 ist1 (ENSSMAG00000021361) ENSSMAG00000021359 sult5a1 (ENSSMAG00000021356) SLC22A31 (ENSSMAG00000021354) ANKRD11 (ENSSMAG00000021353) ENSSMAG00000021355 SPG7 (ENSSMAG00000033690) SPG7 (ENSSMAG00000021352) cdh15 (ENSSMAG00000021351) ACSF3 (ENSSMAG00000021350) CBFA2T3 (ENSSMAG00000021349) ##22 PABPN1L (ENSSMAG00000021348) trappc2l (ENSSMAG00000021347) galns (ENSSMAG00000021346) ENSSMAG00000021345 cmtm3 (ENSSMAG00000032348) cmtm4 (ENSSMAG00000021343) dync1li2 (ENSSMAG00000021342) ENSSMAG00000035978 nae1 (ENSSMAG00000021340) ca7 (ENSSMAG00000021339) ENSSMAG00000021338 rrad (ENSSMAG00000021337) ENSSMAG00000035812 nsun3 (ENSSMAG00000021335) ENSSMAG00000021334 Tongue sole MODERN SPECIES 15 ENSCSEG00000001355 rplp2l (ENSCSEG00000001350) lin7c (ENSCSEG00000001340) bdnf (ENSCSEG00000001337) ENSCSEG00000001334 ENSCSEG00000001271 mettl15 (ENSCSEG00000001264) lgr4 (ENSCSEG00000001253) mybpc3 (ENSCSEG00000001236) spi1b (ENSCSEG00000001226) slc39a13 (ENSCSEG00000001215) ENSCSEG00000001204 SPG7 (ENSCSEG00000001177) cdh15 (ENSCSEG00000001171) ACSF3 (ENSCSEG00000001161) CBFA2T3 (ENSCSEG00000001154) ##22 pabpn1l (ENSCSEG00000001142) trappc2l (ENSCSEG00000001136) galns (ENSCSEG00000001134) ENSCSEG00000001131 cmtm3 (ENSCSEG00000001124) cmtm4 (ENSCSEG00000001121) dync1li2 (ENSCSEG00000001106) ENSCSEG00000001102 nae1 (ENSCSEG00000001082) NHS (ENSCSEG00000001077) ENSCSEG00000001072 ace2 (ENSCSEG00000001064) zgc:113276 (ENSCSEG00000001060) ENSCSEG00000001056 vegfd (ENSCSEG00000001052) Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00940000162251 ENSGT00940000162619 ENSGT00390000011730 ENSGT00940000158140 ENSGT00940000164598 ENSGT00390000002407.d ENSGT00390000006738.a ENSGT00390000007838 ENSGT00700000104539.b.a ENSGT00970000197463 ENSGT00390000010285.d ENSGT00390000010606 ENSGT00940000158322 ENSGT00390000010285.c ENSGT00390000017350 ENSGT00950000183176.b.f ##22 Elephant shark MODERN SPECIES 1584 nudcd1 (ENSCMIG00000012977) trhrb (ENSCMIG00000012986) TMEM74 (ENSCMIG00000012994) emc2 (ENSCMIG00000012998) eif3e (ENSCMIG00000013017) RSPO2 (ENSCMIG00000013028) angpt1 (ENSCMIG00000013033) zfpm2a (ENSCMIG00000013052) ENSCMIG00000013056 oxr1b (ENSCMIG00000013085) ABRA (ENSCMIG00000013169) TMEM67 (ENSCMIG00000013182) rbm12bb (ENSCMIG00000013216) cibar1 (ENSCMIG00000013219) TRIQK (ENSCMIG00000013222) runx1t1 (ENSCMIG00000013255) ##22 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00390000007597 ENSGT00940000164400 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000159511 ENSGT00390000002833 ENSGT00530000063647.A.b ENSGT00390000008778 ENSGT00940000156966 ENSGT00940000157830 ENSGT00940000157655 ENSGT00940000156368.b ENSGT00390000010606 ENSGT00940000158322 ENSGT00390000010285.c ENSGT00390000017350 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT00940000164066 ENSGT00390000003680.b ENSGT00950000183131.b.a ##23 ENSGT00390000007813 ENSGT00950000183108.b.a.b ENSGT00940000153801.b ENSGT00390000000521 ENSGT00390000006658.a.b ENSGT00940000164654 ENSGT00940000156113 ENSGT00940000157532 ENSGT00390000001688 ENSGT00940000154824 ENSGT00940000154968 ENSGT00950000182992.a.b.b Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00390000007597 ENSGT00940000164400 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000159511 ENSGT00390000002833 ENSGT00530000063647.A.b ENSGT00390000008778 ENSGT00940000156966 ENSGT00940000157830 ENSGT00940000157655 ENSGT00940000156368.b ENSGT00390000010606 ENSGT00940000158322 ENSGT00390000010285.c ENSGT00390000017350 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT00940000164066 ENSGT00390000003680.b ENSGT00950000183131.b.a ##23 ENSGT00390000007813 ENSGT00950000183108.b.a.b ENSGT00940000153801.b ENSGT00390000000521 ENSGT00390000006658.a.b ENSGT00940000164654 ENSGT00940000156113 ENSGT00940000157532 ENSGT00390000001688 ENSGT00940000154824.a ENSGT00940000154968 ENSGT00950000182992.a.b.b Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000007597 ENSGT00940000164400 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000159511 ENSGT00390000002833 ENSGT00530000063647.A.b ENSGT00390000008778 ENSGT00940000156966 ENSGT00940000157830 ENSGT00940000157655 ENSGT00940000156368.b ENSGT00390000010606 ENSGT00940000158322 ENSGT00390000010285.c ENSGT00390000017350 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT01100000263544.c.b ENSGT00940000164066 ENSGT00390000003680.b ENSGT00950000183131.b.a ##23 ENSGT00390000007813 ENSGT00950000183108.b.a.b ENSGT00940000153801.b ENSGT00390000000521 ENSGT00390000006658.a.b ENSGT00940000164654 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ENSGT00940000157830 ENSGT00940000157655 ENSGT00940000156368.b ENSGT00390000010606 ENSGT00940000158322 ENSGT00390000010285.c ENSGT00390000017350 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT01100000263544.c.b ENSGT00940000164463 ENSGT00390000012840 ENSGT00390000003680.b ENSGT00530000068397 ENSGT00950000183131.b.a ##23 ENSGT00390000007813 ENSGT00950000183108.b.a.b ENSGT00940000153801.b ENSGT00390000000521 ENSGT00390000006658.a.b ENSGT00940000164654 ENSGT00940000156113 ENSGT00940000157532 ENSGT00940000154824.a Archelosauria ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000164400 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00950000185308 ENSGT00940000159511 ENSGT00390000002833 ENSGT00530000063647.A.b ENSGT00390000008778 ENSGT00940000156966 ENSGT00940000157830 ENSGT00940000157655 ENSGT00940000156368.b ENSGT00390000010606 ENSGT00940000158322 ENSGT00390000010285.c ENSGT00390000017350 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT01100000263544.c.b ENSGT00940000164463 ENSGT00390000012840 ENSGT00390000003680.b ENSGT00530000068397 ENSGT00950000183131.b.a ##23 ENSGT00390000007813 ENSGT00950000183108.b.a.b ENSGT00940000153801.b ENSGT00390000000521 ENSGT00390000006658.a.b ENSGT00940000164654 ENSGT00940000156113 ENSGT00940000157532 ENSGT00940000154824.a Archosauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164400 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00950000185308 ENSGT00940000159511 ENSGT00390000002833 ENSGT00530000063647.A.b ENSGT00390000008778 ENSGT00940000156966 ENSGT00940000157830 ENSGT00940000157655 ENSGT00940000156368.b ENSGT00390000010606 ENSGT00940000158322 ENSGT00390000010285.c ENSGT00390000017350 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT01100000263544.c.b ENSGT00940000164463 ENSGT00390000012840 ENSGT00390000003680.b ENSGT00530000068397 ENSGT00950000183131.b.a ##23 ENSGT00390000007813 ENSGT00950000183108.b.a.b ENSGT00940000153801.b ENSGT00390000000521 ENSGT00390000006658.a.b ENSGT00940000164654 ENSGT00940000156113 ENSGT00940000157532 ENSGT00940000154824.a Aves ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000164400 ENSGT00530000063023.A.b 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ENSGT00940000154824.a ENSGT00940000154968 Anatidae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000164400 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00950000185308 ENSGT00940000159511 ENSGT00390000002833 ENSGT00530000063647.A.b ENSGT00390000008778 ENSGT00940000156966 ENSGT00940000157830 ENSGT00940000157655 ENSGT00940000156368.b ENSGT00390000010606 ENSGT00940000158322 ENSGT00390000010285.c ENSGT00390000017350 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT01100000263544.c.b ENSGT00390000012840 ENSGT00390000003680.b ENSGT00530000068397 ENSGT00950000183131.b.a ##23 ENSGT00390000007813 ENSGT00950000183108.b.a.b ENSGT00940000153801.b ENSGT00390000000521 ENSGT00390000006658.a.b ENSGT00940000164654 ENSGT00940000156113 ENSGT00940000157532 ENSGT00940000154824.a ENSGT00940000154968 Duck MODERN SPECIES 10 INTS8 (ENSAPLG00000007030) ENSAPLG00000006639 DPY19L4 (ENSAPLG00000006172) ESRP1 (ENSAPLG00000013868) VIRMA (ENSAPLG00000014267) ENSAPLG00000014357 RAD54B (ENSAPLG00000014366) FSBP (ENSAPLG00000014488) GEM (ENSAPLG00000014490) CDH17 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SPECIES 3 ENSGT00940000164400 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00950000185308 ENSGT00940000159511 ENSGT00390000002833 ENSGT00530000063647.A.b ENSGT00390000008778 ENSGT00940000156966 ENSGT00940000157830 ENSGT00940000157655 ENSGT00940000156368.b ENSGT00390000010606 ENSGT00940000158322 ENSGT00390000010285.c ENSGT00390000017350 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT01100000263544.c.b ENSGT00390000012840 ENSGT00390000003680.b ENSGT00530000068397 ENSGT00950000183131.b.a ##23 ENSGT00390000007813 ENSGT00950000183108.b.a.b ENSGT00940000153801.b ENSGT00390000000521 ENSGT00390000006658.a.b ENSGT00940000164654 ENSGT00940000156113 ENSGT00940000157532 ENSGT00940000154824.a ENSGT00940000154968 Passeriformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164400 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00950000185308 ENSGT00940000159511 ENSGT00390000002833 ENSGT00530000063647.A.b ENSGT00390000008778 ENSGT00940000156966 ENSGT00940000157830 ENSGT00940000157655 ENSGT00940000156368.b ENSGT00390000010606 ENSGT00940000158322 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Testudinidae ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000164400 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00950000185308 ENSGT00940000159511 ENSGT00390000002833 ENSGT00530000063647.A.b ENSGT00390000008778 ENSGT00940000156966 ENSGT00940000157830 ENSGT00940000157655 ENSGT00940000156368.b ENSGT00390000010606 ENSGT00940000158322 ENSGT00390000010285.c ENSGT00390000017350 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT01100000263544.c.b ENSGT00940000164463 ENSGT00390000012840 ENSGT00390000003680.b ENSGT00530000068397 ENSGT00950000183131.b.a ##23 ENSGT00390000007813 ENSGT00950000183108.b.a.b ENSGT00940000153801.b ENSGT00390000000521 ENSGT00390000006658.a.b ENSGT00940000164654.e ENSGT00390000010554.f ENSGT00940000157532 ENSGT00940000154824.a Abingdon island giant tortoise MODERN SPECIES 2318 RUNX1T1 (ENSCABG00000017841) ##22 ENSCABG00000017848 ENSCABG00000017849 ENSCABG00000017850 OTUD6B (ENSCABG00000017852) PIP4P2 (ENSCABG00000017855) Goode s thornscrub tortoise MODERN SPECIES 11 ENSGEVG00005003178 DPY19L4 (ENSGEVG00005003147) 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ENSGT00940000156368.b ENSGT00390000010606 ENSGT00940000158322 ENSGT00390000010285.c ENSGT00390000017350 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT01100000263544.c.b ENSGT00940000164463 ENSGT00390000012840 ENSGT00390000003680.b ENSGT00530000068397 ENSGT00950000183131.b.a ##23 ENSGT00390000007813 ENSGT00950000183108.b.a.b ENSGT00940000153801.b ENSGT00390000000521 ENSGT00390000006658.a.b ENSGT00940000164654.e ENSGT00940000156113 ENSGT00940000157532 ENSGT00940000154824.a painted turtle MODERN SPECIES 703 DPY19L4 (ENSCPBG00000006094) ENSCPBG00000006083 ESRP1 (ENSCPBG00000006007) VIRMA (ENSCPBG00000003435) ENSCPBG00000003239 FSBP (ENSCPBG00000003228) RAD54B (ENSCPBG00000003204) GEM (ENSCPBG00000003189) CDH17 (ENSCPBG00000003123) PDP1 (ENSCPBG00000003104) TMEM67 (ENSCPBG00000003074) RBM12B (ENSCPBG00000003061) CIBAR1 (ENSCPBG00000003035) TRIQK (ENSCPBG00000003013) ENSCPBG00000002997 RUNX1T1 (ENSCPBG00000002973) ##22 SLC26A7 (ENSCPBG00000002908) ENSCPBG00000002878 OTUD6B (ENSCPBG00000002864) PIP4P2 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ENSGT00940000156113 ENSGT00940000157532 ENSGT00940000154824.a Laterata ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000164400 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00950000185308 ENSGT00940000159511 ENSGT00390000002833 ENSGT00530000063647.A.b ENSGT00390000008778 ENSGT00940000156966 ENSGT00940000157830 ENSGT00940000157655 ENSGT00940000156368.b ENSGT00390000010606.ab ENSGT00940000158322 ENSGT00390000010285.c ENSGT01030000234950 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT01100000263544.c.b ENSGT00940000164463 ENSGT00390000012840 ENSGT00390000003680.b ENSGT00530000068397 ENSGT00950000183131.b.a ##23 ENSGT00390000007813 ENSGT00950000183108.b.a.b ENSGT00940000153801.b ENSGT00390000000521 ENSGT00390000006658.a.b ENSGT00940000164654 ENSGT00940000156113 ENSGT00940000157532 ENSGT00940000154824.a Common wall lizard MODERN SPECIES 15 ENSPMRG00000021636 DPY19L4 (ENSPMRG00000006294) ENSPMRG00000006427 ESRP1 (ENSPMRG00000006436) VIRMA (ENSPMRG00000006450) ENSPMRG00000006470 FSBP (ENSPMRG00000006480) RAD54B (ENSPMRG00000006504) GEM 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SPECIES 7 ENSGT00940000156934 ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000159511 ENSGT00390000002833 ENSGT00530000063647.A.b ENSGT00390000008778 ENSGT00940000156966 ENSGT00940000157830 ENSGT00940000157655 ENSGT00940000156368.b ENSGT00390000010606 ENSGT00940000158322 ENSGT00390000010285.c ENSGT00390000017350 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT01100000263544.c.b ENSGT00940000164463 ENSGT00390000012840 ENSGT00390000003680.b ENSGT00530000068397 ENSGT00950000183131.b.a ##23 ENSGT00390000007813 ENSGT00950000183108.b.a.b ENSGT00940000153801.b ENSGT00390000000521 ENSGT00390000006658.a.b ENSGT00940000164654 ENSGT00940000156113 ENSGT00940000157532 ENSGT00390000001688 Marsupialia ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000156934 ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000159511 ENSGT00390000002833 ENSGT00530000063647.A.b ENSGT00390000008778 ENSGT00940000156966 ENSGT00940000157830 ENSGT00940000157655 ENSGT00940000156368.b ENSGT00390000010606 ENSGT00940000158322 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ENSGT00390000000521 ENSGT00390000006658.a.b ENSGT00940000156113 ENSGT00940000157532 ENSGT00390000001688 ENSGT00940000154824.a Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000159511 ENSGT00390000002833 ENSGT00530000063647.A.b ENSGT00390000008778 ENSGT00940000156966 ENSGT00940000157830 ENSGT00940000157655 ENSGT00940000156368.b ENSGT00390000010606 ENSGT00940000158322 ENSGT00390000010285.c.ec.b ENSGT00390000010285.c.dc ENSGT00390000017350 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT01100000263544.c.b ENSGT00940000154960 ENSGT00390000012840 ENSGT00390000003680.b ENSGT00530000068397 ENSGT00950000183131.b.a ##23 ENSGT00390000007813 Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES 35 ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000159511 ENSGT00390000002833 ENSGT00530000063647.A.b ENSGT00390000008778 ENSGT00940000156966 ENSGT00940000157830 ENSGT00940000157655 ENSGT00940000156368.b ENSGT00390000010606 ENSGT00940000158322 ENSGT00390000010285.c.ec.b ENSGT00390000010285.c.dc ENSGT00390000017350 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT01100000263544.c.b ENSGT00940000154960 ENSGT00390000012840 ENSGT00390000003680.b ENSGT00530000068397 ENSGT00950000183131.b.a ##23 ENSGT00390000007813 koala MODERN SPECIES 232 CDH17 (ENSPCIG00000016712) PDP1 (ENSPCIG00000033924) TMEM67 (ENSPCIG00000037233) RBM12B (ENSPCIG00000008556) ENSPCIG00000023335 ENSPCIG00000030292 TRIQK (ENSPCIG00000033155) ENSPCIG00000015858 RUNX1T1 (ENSPCIG00000011101) ##22 ENSPCIG00000011113 SLC26A7 (ENSPCIG00000007617) ENSPCIG00000034942 OTUD6B (ENSPCIG00000007606) PIP4P2 (ENSPCIG00000007601) C8orf88 (ENSPCIG00000007595) NECAB1 (ENSPCIG00000033118) ##23 TMEM64 (ENSPCIG00000024149) Common wonbat MODERN SPECIES 742 INTS8 (ENSVURG00010017948) DPY19L4 (ENSVURG00010017977) ESRP1 (ENSVURG00010018002) VIRMA (ENSVURG00010018015) RAD54B (ENSVURG00010000097) ENSVURG00010000114 FSBP (ENSVURG00010000131) GEM (ENSVURG00010000154) CDH17 (ENSVURG00010000194) PDP1 (ENSVURG00010000524) TMEM67 (ENSVURG00010000550) RBM12B (ENSVURG00010000630) ENSVURG00010000638 ENSVURG00010000651 TRIQK (ENSVURG00010000677) RUNX1T1 (ENSVURG00010000776) ##22 SLC26A7 (ENSVURG00010000974) ENSVURG00010000989 ENSVURG00010001005 OTUD6B (ENSVURG00010001022) PIP4P2 (ENSVURG00010001038) C8orf88 (ENSVURG00010001051) ENSVURG00010001058 ##23 ENSVURG00010001080 ENSVURG00010001089 Wallaby MODERN SPECIES 314 RUNX1T1 (ENSMEUG00000011036) ##22 Tasmanian devil MODERN SPECIES TP53INP1 (ENSSHAG00000028179) CCNE2 (ENSSHAG00000017844) INTS8 (ENSSHAG00000017754) DPY19L4 (ENSSHAG00000017668) ESRP1 (ENSSHAG00000030981) VIRMA (ENSSHAG00000017298) RAD54B (ENSSHAG00000017038) GEM (ENSSHAG00000016768) CDH17 (ENSSHAG00000016528) PDP1 (ENSSHAG00000016028) TMEM67 (ENSSHAG00000015417) RBM12B (ENSSHAG00000015335) CIBAR1 (ENSSHAG00000015216) ENSSHAG00000000609 ENSSHAG00000012866 RUNX1T1 (ENSSHAG00000008351) ##22 ENSSHAG00000020462 SLC26A7 (ENSSHAG00000014607) OTUD6B (ENSSHAG00000013420) PIP4P2 (ENSSHAG00000012741) C8orf88 (ENSSHAG00000030494) NECAB1 (ENSSHAG00000012037) ##23 TMEM64 (ENSSHAG00000028654) CALB1 (ENSSHAG00000025646) DECR1 (ENSSHAG00000003375) NBN (ENSSHAG00000001663) OSGIN2 (ENSSHAG00000000911) RIPK2 (ENSSHAG00000014513) ENSSHAG00000022369 MMP16 (ENSSHAG00000003247) ENSSHAG00000011704 Opossum MODERN SPECIES 2 INTS8 (ENSMODG00000007099) DPY19L4 (ENSMODG00000007155) ESRP1 (ENSMODG00000007268) VIRMA (ENSMODG00000007320) FSBP (ENSMODG00000007330) RAD54B (ENSMODG00000007343) GEM (ENSMODG00000007348) CDH17 (ENSMODG00000007386) PDP1 (ENSMODG00000039514) TMEM67 (ENSMODG00000007431) RBM12B (ENSMODG00000007436) ENSMODG00000007447 ENSMODG00000046414 ENSMODG00000028668 TRIQK (ENSMODG00000024567) RUNX1T1 (ENSMODG00000007500) ##22 ENSMODG00000040659 ENSMODG00000029086 SLC26A7 (ENSMODG00000007528) ENSMODG00000024575 ENSMODG00000007537 ENSMODG00000007551 PIP4P2 (ENSMODG00000007561) C8orf88 (ENSMODG00000047666) NECAB1 (ENSMODG00000007570) ##23 TMEM64 (ENSMODG00000007607) ENSMODG00000047647 ENSMODG00000007612 CALB1 (ENSMODG00000007628) DECR1 (ENSMODG00000007644) ENSMODG00000007677 Eutheria ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00530000063829.A ENSGT00940000156934 ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000159511 ENSGT00390000002833 ENSGT00390000008778 ENSGT00940000156966 ENSGT00940000157830 ENSGT00940000157655 ENSGT00940000156368.b ENSGT00390000010606 ENSGT00940000158322 ENSGT00390000010285.c ENSGT00390000017350 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT01100000263544.c.b ENSGT00940000164066 ENSGT00390000012840 ENSGT00390000003680.b ENSGT00530000068397 ENSGT00950000183131.b.a ##23 ENSGT00390000007813 ENSGT00950000183108.b.a.b ENSGT00940000153801.b ENSGT00390000000521 ENSGT00390000006658.a.b ENSGT00940000156113 ENSGT00940000157532 ENSGT00390000001688 ENSGT00940000154824.a Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000159511 ENSGT00390000002833 ENSGT00390000008778 ENSGT00940000156966 ENSGT00940000157830 ENSGT00940000157655 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ENSGT01060000249136 ENSGT00390000000521 ENSGT00390000006658.a.b ENSGT00940000156113 ENSGT01000000215502 ENSGT00940000157532 ENSGT00390000001688 Caprinae ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00530000063829.A ENSGT00940000156934 ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000159511 ENSGT00390000002833 ENSGT00940000156966 ENSGT00940000157830 ENSGT00940000157655 ENSGT00940000156368.b ENSGT00390000010606 ENSGT00940000158322 ENSGT00390000010285.c ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.h.a.a ENSGT00390000017350 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT01100000263544.c.b ENSGT00940000164066 ENSGT00940000164463 ENSGT00390000012840 ENSGT00390000003680.b ENSGT00530000068397 ENSGT00390000007813 ENSGT00950000183108.b.a.b ENSGT00940000153801.b ENSGT00390000000521 ENSGT00390000006658.a.b ENSGT00940000156113 ENSGT01000000215502 ENSGT00940000157532 ENSGT00390000001688 Goat MODERN SPECIES 5 DPY19L4 (ENSCHIG00000020474) ESRP1 (ENSCHIG00000014128) ENSCHIG00000019947 VIRMA (ENSCHIG00000015977) RAD54B 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ENSGT00950000183108.b.a.b ENSGT00940000153801.b ENSGT01060000249136 ENSGT00390000000521 ENSGT00390000006658.a.b ENSGT00940000156113 ENSGT01000000215502 ENSGT00940000157532 ENSGT00390000001688 Bos ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000156934 ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000159511.l ENSGT00390000002833 ENSGT00940000156966 ENSGT00390000008778 ENSGT00940000157830 ENSGT00940000157655 ENSGT00940000156368.b ENSGT00390000010606 ENSGT00940000158322 ENSGT00390000010285.c.fb.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.h.a.a ENSGT00390000017350 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT01100000263544.c.b ENSGT00940000164066 ENSGT00390000012840 ENSGT00390000003680.b ENSGT00530000068397 ENSGT00950000182995.e.a.a.a.fb.b ENSGT00390000007813 ENSGT00950000183108.b.a.b ENSGT00940000153801.b ENSGT00390000000521 ENSGT00390000006658.a.b ENSGT00940000156113 ENSGT01000000215502 ENSGT00940000157532 ENSGT00390000001688 Bos_b ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00530000063829.A ENSGT00940000156934 ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000159511.l ENSGT00390000002833.c ENSGT00940000156966 ENSGT00390000008778 ENSGT00940000157830 ENSGT00940000157655 ENSGT00940000156368.b ENSGT00390000010606 ENSGT00940000158322 ENSGT00390000010285.c.fb.a ENSGT00390000017350 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT01100000263544.c.b ENSGT00940000164066 ENSGT00390000003680.b ENSGT00530000068397 ENSGT00950000182995.e.a.a.a.fb.b ENSGT00390000007813 ENSGT00950000183108.b.a.b ENSGT00940000153801.b ENSGT00390000000521 ENSGT00390000006658.a.b ENSGT00940000156113 ENSGT01000000215502 ENSGT00940000157532 ENSGT00390000001688 ENSGT00960000189807 Cow MODERN SPECIES 5 TP53INP1 (ENSBTAG00000055158) CCNE2 (ENSBTAG00000004906) INTS8 (ENSBTAG00000004902) DPY19L4 (ENSBTAG00000013621) ESRP1 (ENSBTAG00000021838) VIRMA (ENSBTAG00000003789) RAD54B (ENSBTAG00000000632) FSBP (ENSBTAG00000024984) GEM (ENSBTAG00000007596) CDH17 (ENSBTAG00000021964) PDP1 (ENSBTAG00000000199) TMEM67 (ENSBTAG00000044190) RBM12B 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(ENSCHYG00000010352) ENSCHYG00000010442 CALB1 (ENSCHYG00000010474) DECR1 (ENSCHYG00000010587) NBN (ENSCHYG00000010824) OSGIN2 (ENSCHYG00000010943) RIPK2 (ENSCHYG00000011078) ENSCHYG00000011356 MMP16 (ENSCHYG00000011395) ENSCHYG00000011463 CNBD1 (ENSCHYG00000011498) Camelidae ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00530000063829.A ENSGT00940000156934 ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000159511 ENSGT00390000002833 ENSGT00390000008778 ENSGT00940000156966 ENSGT00940000157830 ENSGT00940000157655 ENSGT00940000156368.b ENSGT00390000010606 ENSGT00940000158322 ENSGT00390000010285.c ENSGT01030000234950 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT01100000263544.c.b ENSGT00940000164066 ENSGT00390000012840 ENSGT00390000003680.b ENSGT00530000068397 ENSGT00950000183131.b.a ##23 ENSGT00390000007813 Arabian camel MODERN SPECIES 17 CCNE2 (ENSCDRG00005021183) INTS8 (ENSCDRG00005021172) DPY19L4 (ENSCDRG00005021160) ENSCDRG00005021153 ESRP1 (ENSCDRG00005021141) VIRMA (ENSCDRG00005021115) RAD54B (ENSCDRG00005021104) GEM (ENSCDRG00005021094) CDH17 (ENSCDRG00005021084) PDP1 (ENSCDRG00005021075) TMEM67 (ENSCDRG00005021066) RBM12B (ENSCDRG00005021057) CIBAR1 (ENSCDRG00005021047) ENSCDRG00005021030 ENSCDRG00005021023 RUNX1T1 (ENSCDRG00005020987) ##22 SLC26A7 (ENSCDRG00005020955) LRRC69 (ENSCDRG00005020925) OTUD6B (ENSCDRG00005020904) PIP4P2 (ENSCDRG00005020889) C8orf88 (ENSCDRG00005020886) ENSCDRG00005020885 NECAB1 (ENSCDRG00005020870) ##23 ENSCDRG00005020857 ENSCDRG00005020848 Alpaca MODERN SPECIES 2743 RUNX1T1 (ENSVPAG00000009494) ##22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000156934 ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000159511 ENSGT00390000002833 ENSGT00390000008778 ENSGT00940000156966 ENSGT00940000157830 ENSGT00940000157655 ENSGT00940000156368.b ENSGT00390000010606 ENSGT00940000158322 ENSGT00390000010285.c ENSGT00390000017350 ENSGT00510000055281 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT01100000263544.c.b ENSGT00940000164066 ENSGT00390000012840 ENSGT00390000003680.b ENSGT00530000068397 ENSGT00910000147407 ENSGT00950000183131.b.a ##23 ENSGT00390000007813 ENSGT00950000183108.b.a.b ENSGT00940000153801.b ENSGT01060000249136 ENSGT00390000000521 ENSGT00390000006658.a.b ENSGT00940000156113 ENSGT00940000157532 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000156934 ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000159511 ENSGT00390000002833 ENSGT00940000156966 ENSGT00390000008778 ENSGT00940000157830 ENSGT00940000157655 ENSGT00940000156368.b ENSGT00390000010606 ENSGT00940000158322 ENSGT00390000010285.c ENSGT00390000017350 ENSGT00510000055281 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT01100000263544.c.b ENSGT00940000164066 ENSGT00390000012840 ENSGT00390000003680.b ENSGT00530000068397 ENSGT00910000147407 ENSGT00950000183131.b.a ##23 ENSGT00390000007813 ENSGT00950000183108.b.a.b ENSGT00940000153801.b ENSGT00390000000521 ENSGT00390000006658.a.b ENSGT00940000156113 ENSGT00940000157532 ENSGT00390000001688 Equus ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00510000048688 ENSGT00530000063829.A ENSGT00940000156934 ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000159511 ENSGT00390000002833 ENSGT00940000156966 ENSGT00940000157830 ENSGT00940000157655 ENSGT00940000156368.b ENSGT00390000010606 ENSGT00940000158322 ENSGT00390000010285.c ENSGT00390000017350 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT01100000263544.c.b ENSGT00390000012840 ENSGT00390000003680.b ENSGT00530000068397 ENSGT00910000147407 ENSGT00950000183131.b.a ##23 ENSGT00390000007813 ENSGT00950000183108.b.a.b ENSGT00940000153801.b ENSGT00390000000521 ENSGT00390000006658.a.b ENSGT00940000156113 ENSGT00390000014654 ENSGT00940000163032 ENSGT00940000155633.D Donkey MODERN SPECIES 3 MBP (ENSEASG00005002078) ZNF236 (ENSEASG00005002084) ZNF516 (ENSEASG00005002101) TSHZ1 (ENSEASG00005002107) PTGR3 (ENSEASG00005032876) ENSEASG00005023898 ENSEASG00005036048 ENSEASG00005016242 CDH17 (ENSEASG00005016247) PDP1 (ENSEASG00005031219) TMEM67 (ENSEASG00005016269) RBM12B (ENSEASG00005016297) ENSEASG00005016300 ENSEASG00005031386 TRIQK (ENSEASG00005025608) RUNX1T1 (ENSEASG00005016311) ##22 SLC26A7 (ENSEASG00005014030) OTUD6B (ENSEASG00005014036) PIP4P2 (ENSEASG00005014038) C8orf88 (ENSEASG00005036654) ENSEASG00005026399 NECAB1 (ENSEASG00005014047) ##23 TMEM64 (ENSEASG00005014049) CALB1 (ENSEASG00005014050) ENSEASG00005014053 ENSEASG00005014055 NBN (ENSEASG00005014058) OSGIN2 (ENSEASG00005028467) ENSEASG00005014064 ENSEASG00005027435 ENSEASG00005030668 Horse MODERN SPECIES 30 ENSECAG00000052620 ESRP1 (ENSECAG00000000784) VIRMA (ENSECAG00000012879) ENSECAG00000049378 RAD54B (ENSECAG00000021949) ENSECAG00000004316 ENSECAG00000059478 GEM (ENSECAG00000018531) CDH17 (ENSECAG00000017615) ENSECAG00000045038 PDP1 (ENSECAG00000016359) TMEM67 (ENSECAG00000019054) RBM12B (ENSECAG00000017870) CIBAR1 (ENSECAG00000007382) TRIQK (ENSECAG00000035852) RUNX1T1 (ENSECAG00000000178) ##22 SLC26A7 (ENSECAG00000003602) ENSECAG00000059759 OTUD6B (ENSECAG00000018205) PIP4P2 (ENSECAG00000012004) ENSECAG00000029843 C8orf88 (ENSECAG00000050360) NECAB1 (ENSECAG00000009384) ##23 TMEM64 (ENSECAG00000008174) CALB1 (ENSECAG00000000058) ENSECAG00000056912 DECR1 (ENSECAG00000022113) ENSECAG00000037667 OSGIN2 (ENSECAG00000013560) NBN (ENSECAG00000013889) RIPK2 (ENSECAG00000023011) Chiroptera ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000156934 ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000159511 ENSGT00390000002833 ENSGT00940000156966 ENSGT00390000008778 ENSGT00940000157830 ENSGT00940000157655 ENSGT00940000156368.b ENSGT00390000010606 ENSGT00940000158322 ENSGT00390000010285.c ENSGT00390000017350 ENSGT00510000055281 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT01100000263544.c.b ENSGT00940000164066 ENSGT00390000012840 Megabat MODERN SPECIES 4978 RUNX1T1 (ENSPVAG00000008458) ##22 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000156934 ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000159511 ENSGT00390000002833 ENSGT00940000156966 ENSGT00390000008778 ENSGT00940000157830 ENSGT00940000157655 ENSGT00940000156368.b ENSGT00390000010606 ENSGT00940000158322 ENSGT00390000010285.c ENSGT00390000017350 ENSGT00510000055281 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT01100000263544.c.b ENSGT00940000164066 ENSGT00390000012840 Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 5 ESRP1 (ENSRFEG00010012180) ENSRFEG00010012079 VIRMA (ENSRFEG00010011950) ENSRFEG00010011909 RAD54B (ENSRFEG00010011469) GEM (ENSRFEG00010011387) CDH17 (ENSRFEG00010011194) PDP1 (ENSRFEG00010010990) ENSRFEG00010010832 ENSRFEG00010010784 RBM12B (ENSRFEG00010010756) ENSRFEG00010010711 ENSRFEG00010010471 TRIQK (ENSRFEG00010010363) ENSRFEG00010010330 RUNX1T1 (ENSRFEG00010014288) ##22 SLC26A7 (ENSRFEG00010013718) ENSRFEG00010013686 ENSRFEG00010013608 LRRC69 (ENSRFEG00010013404) ENSRFEG00010013177 ENSRFEG00010013158 SPIDR (ENSRFEG00010013063) CEBPD (ENSRFEG00010013042) PRKDC (ENSRFEG00010012932) MCM4 (ENSRFEG00010012774) ENSRFEG00010012735 ENSRFEG00010012650 CLXN (ENSRFEG00010012494) ENSRFEG00010012447 PPDPFL (ENSRFEG00010012401) Microbat MODERN SPECIES 1050 RUNX1T1 (ENSMLUG00000004595) ##22 SLC26A7 (ENSMLUG00000003742) ENSMLUG00000023522 OTUD6B (ENSMLUG00000016954) SNTG1 (ENSMLUG00000011379) PCMTD1 (ENSMLUG00000002277) MYC (ENSMLUG00000026933) ENSMLUG00000027632 ENSMLUG00000029252 ENSMLUG00000026948 ENSMLUG00000008520 CYRIB (ENSMLUG00000011305) ASAP1 (ENSMLUG00000009025) ADCY8 (ENSMLUG00000012194) ENSMLUG00000022216 ENSMLUG00000015388 Carnivora ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000156934 ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000159511 ENSGT00390000002833 ENSGT00390000008778 ENSGT00940000156966 ENSGT00940000157830 ENSGT00940000157655 ENSGT00940000156368.b ENSGT00390000010606 ENSGT00940000158322 ENSGT00390000010285.c ENSGT00390000017350 ENSGT00510000055281 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT01100000263544.c.b ENSGT00940000164066 ENSGT00390000012840 ENSGT00390000003680.b ENSGT00530000068397 ENSGT00950000183131.b.a ##23 ENSGT00390000007813 ENSGT00950000183108.b.a.b ENSGT00940000153801.b ENSGT01060000249136 ENSGT00390000000521 ENSGT00390000006658.a.b ENSGT00940000156113 ENSGT00940000157532 ENSGT00390000001688 Felidae ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00530000063829.A ENSGT00940000156934 ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000159511 ENSGT00390000002833 ENSGT00940000156966 ENSGT00940000157830 ENSGT00940000157655 ENSGT00940000156368.b ENSGT00390000010606 ENSGT00940000158322 ENSGT00390000010285.c ENSGT00390000017350 ENSGT00510000055281 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT01100000263544.c.b ENSGT00940000164066 ENSGT00390000012840 ENSGT00390000003680.b ENSGT00530000068397 ENSGT00390000000571.b.b ENSGT00950000183131.b.a ##23 ENSGT00390000007813 ENSGT00950000183108.b.a.b ENSGT00940000153801.b ENSGT00390000000521 ENSGT00390000006658.a.b ENSGT00940000156113 ENSGT00940000157532 ENSGT00390000001688 Panthera ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00530000063829.A ENSGT00940000156934 ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000159511 ENSGT00390000002833 ENSGT00940000156966 ENSGT00940000157830 ENSGT00940000157655 ENSGT00940000156368.b ENSGT00390000010606 ENSGT00940000158322 ENSGT00390000010285.c ENSGT00390000017350 ENSGT00510000055281 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT01100000263544.c.b ENSGT00940000164066 ENSGT00390000012840 ENSGT00390000003680.b ENSGT00530000068397 ENSGT00390000000571.b.b ENSGT00950000183131.b.a ##23 ENSGT00390000007813 ENSGT00950000183108.b.a.b ENSGT00940000153801.b ENSGT00390000000521 ENSGT00390000006658.a.b ENSGT00940000156113 ENSGT00940000157532 ENSGT00390000001688 Tiger DUPLICATION Tiger MODERN SPECIES 175 RAD54B (ENSPTIG00000012670) ENSPTIG00000013371 GEM (ENSPTIG00000016878) CDH17 (ENSPTIG00000017434) PDP1 (ENSPTIG00000018605) TMEM67 (ENSPTIG00000019697) RBM12B (ENSPTIG00000020071) CIBAR1 (ENSPTIG00000021531) TRIQK (ENSPTIG00000009851) ENSPTIG00000007336 ENSPTIG00000013341 ##22 ENSPTIG00000014067 ##22 ENSPTIG00000014905 CPEB4 (ENSPTIG00000015408) ENSPTIG00000017876 STC2 (ENSPTIG00000020657) NKX2-5 (ENSPTIG00000021046) BNIP1 (ENSPTIG00000021237) 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ENSGT00390000010285.c ENSGT00390000017350 ENSGT00510000055281 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT01100000263544.c.b ENSGT00940000164066 ENSGT00390000012840 ENSGT00390000003680.b ENSGT00530000068397 ENSGT00390000000571.b.b ENSGT00950000183131.b.a ##23 ENSGT00390000007813 ENSGT00950000183108.b.a.b ENSGT00940000153801.b ENSGT00390000000521 ENSGT00390000006658.a.b ENSGT00940000156113 ENSGT00940000157532 ENSGT00390000001688 lion MODERN SPECIES 509 CCNE2 (ENSPLOG00000000448) INTS8 (ENSPLOG00000000486) DPY19L4 (ENSPLOG00000000568) ESRP1 (ENSPLOG00000000760) VIRMA (ENSPLOG00000000910) RAD54B (ENSPLOG00000001032) ENSPLOG00000001069 GEM (ENSPLOG00000001086) CDH17 (ENSPLOG00000001126) PDP1 (ENSPLOG00000001174) TMEM67 (ENSPLOG00000001214) RBM12B (ENSPLOG00000001285) CIBAR1 (ENSPLOG00000001331) TRIQK (ENSPLOG00000001363) ENSPLOG00000001380 RUNX1T1 (ENSPLOG00000001456) ##22 ENSPLOG00000001568 SLC26A7 (ENSPLOG00000001595) LRRC69 (ENSPLOG00000001643) OTUD6B (ENSPLOG00000001677) PIP4P2 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TM55A (ENSNVIG00000002974) C8orf88 (ENSNVIG00000002953) ENSNVIG00000002940 ##23 Ursidae ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000156934 ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000159511 ENSGT00510000046985.i ENSGT00390000002833 ENSGT00390000008778 ENSGT00940000156966 ENSGT00940000157830 ENSGT00940000157655 ENSGT00940000156368.b ENSGT00390000010606 ENSGT00940000158322 ENSGT00390000010285.c ENSGT00390000017350 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT01100000263544.c.b ENSGT00940000164066 ENSGT00390000012840 ENSGT00390000003680.b ENSGT00530000068397 ENSGT00950000183131.b.a ##23 ENSGT00390000007813 ENSGT00950000183108.b.a.b ENSGT00940000153801.b ENSGT00390000000521 ENSGT00390000006658.a.b ENSGT00940000156113 ENSGT00940000157532 ENSGT00390000001688 ENSGT00940000154824.a Ursus ANCESTRAL SPECIES 84 ENSGT00940000156934 ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000159511 ENSGT00510000046985.i ENSGT00390000002833 ENSGT00390000008778 ENSGT00940000156966 ENSGT00940000157830 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(ENSAMEG00000024938) NECAB1 (ENSAMEG00000014928) ##23 ENSAMEG00000014935 CALB1 (ENSAMEG00000014944) DECR1 (ENSAMEG00000014999) NBN (ENSAMEG00000015005) OSGIN2 (ENSAMEG00000015063) RIPK2 (ENSAMEG00000015077) MMP16 (ENSAMEG00000017143) CNBD1 (ENSAMEG00000017142) Canidae ANCESTRAL SPECIES 42 ENSGT00530000063829.A ENSGT00940000156934 ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000159511 ENSGT00390000002833 ENSGT00940000156966 ENSGT00390000008778 ENSGT00940000157830 ENSGT00940000157655 ENSGT00940000156368.b ENSGT00390000010606 ENSGT00940000158322 ENSGT00390000010285.c ENSGT00390000017350 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT01100000263544.c.b ENSGT00940000164066 ENSGT00390000012840 ENSGT00390000003680.b ENSGT00530000068397 ENSGT00950000183131.b.a ##23 ENSGT00390000007813 ENSGT00950000183108.b.a.b ENSGT00940000153801.b ENSGT00390000000521 ENSGT00390000006658.a.b ENSGT00940000156113 ENSGT00940000157532 ENSGT00390000001688 ENSGT00940000154824.a Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00530000063829.A ENSGT00940000156934 ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000159511 ENSGT00390000002833 ENSGT00940000156966 ENSGT00390000008778 ENSGT00940000157830 ENSGT00940000157655 ENSGT00940000156368.b ENSGT00390000010606 ENSGT00940000158322 ENSGT00390000010285.c ENSGT00390000017350 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT01100000263544.c.b ENSGT00940000164066 ENSGT00390000012840 ENSGT00390000003680.b ENSGT00530000068397 ENSGT00950000183131.b.a ##23 ENSGT00390000007813 ENSGT00950000183108.b.a.b ENSGT00940000153801.b ENSGT00390000000521 ENSGT00390000006658.a.b ENSGT00940000156113 ENSGT00940000157532 ENSGT00390000001688 ENSGT00940000154824.a Dog MODERN SPECIES 21 NDUFAF6 (ENSCAFG00845016345) TP53INP1 (ENSCAFG00845016236) CCNE2 (ENSCAFG00845016153) INTS8 (ENSCAFG00845016039) DPY19L4 (ENSCAFG00845015605) ESRP1 (ENSCAFG00845015323) VIRMA (ENSCAFG00845015063) RAD54B (ENSCAFG00845014874) GEM (ENSCAFG00845014817) CDH17 (ENSCAFG00845014632) PDP1 (ENSCAFG00845014567) TMEM67 (ENSCAFG00845014512) RBM12B (ENSCAFG00845014482) CIBAR1 (ENSCAFG00845014459) ENSCAFG00845021945 RUNX1T1 (ENSCAFG00845021248) ##22 ENSCAFG00845020927 SLC26A7 (ENSCAFG00845020813) LRRC69 (ENSCAFG00845020675) OTUD6B (ENSCAFG00845020571) ENSCAFG00845020431 C8orf88 (ENSCAFG00845020369) NECAB1 (ENSCAFG00845020193) ##23 TMEM64 (ENSCAFG00845019978) CALB1 (ENSCAFG00845019845) DECR1 (ENSCAFG00845019648) NBN (ENSCAFG00845019442) OSGIN2 (ENSCAFG00845019231) RIPK2 (ENSCAFG00845018948) ENSCAFG00845018832 MMP16 (ENSCAFG00845018720) Dingo MODERN SPECIES 293 TP53INP1 (ENSCAFG00020009749) CCNE2 (ENSCAFG00020009760) INTS8 (ENSCAFG00020009921) DPY19L4 (ENSCAFG00020010847) ESRP1 (ENSCAFG00020010882) VIRMA (ENSCAFG00020011073) RAD54B (ENSCAFG00020012084) FSBP (ENSCAFG00020012090) GEM (ENSCAFG00020012092) CDH17 (ENSCAFG00020012112) PDP1 (ENSCAFG00020012132) TMEM67 (ENSCAFG00020012146) RBM12B (ENSCAFG00020012203) CIBAR1 (ENSCAFG00020012209) TRIQK (ENSCAFG00020012222) RUNX1T1 (ENSCAFG00020012225) ##22 SLC26A7 (ENSCAFG00020012231) LRRC69 (ENSCAFG00020012261) OTUD6B (ENSCAFG00020012272) PIP4P2 (ENSCAFG00020012274) C8orf88 (ENSCAFG00020012277) NECAB1 (ENSCAFG00020012286) ##23 CALB1 (ENSCAFG00020012291) DECR1 (ENSCAFG00020012300) NBN (ENSCAFG00020012307) OSGIN2 (ENSCAFG00020012317) ENSCAFG00020012323 ENSCAFG00020012331 MMP16 (ENSCAFG00020012348) CNBD1 (ENSCAFG00020012371) CNGB3 (ENSCAFG00020012387) Red fox MODERN SPECIES 3 TP53INP1 (ENSVVUG00000003119) CCNE2 (ENSVVUG00000003111) INTS8 (ENSVVUG00000003083) DPY19L4 (ENSVVUG00000003044) ESRP1 (ENSVVUG00000002900) VIRMA (ENSVVUG00000002835) ENSVVUG00000002830 FSBP (ENSVVUG00000002829) GEM (ENSVVUG00000002821) CDH17 (ENSVVUG00000002787) PDP1 (ENSVVUG00000002781) TMEM67 (ENSVVUG00000002722) RBM12B (ENSVVUG00000002694) ENSVVUG00000002691 TRIQK (ENSVVUG00000002665) RUNX1T1 (ENSVVUG00000002591) ##22 ENSVVUG00000002542 SLC26A7 (ENSVVUG00000002425) LRRC69 (ENSVVUG00000002394) OTUD6B (ENSVVUG00000002386) PIP4P2 (ENSVVUG00000002368) C8orf88 (ENSVVUG00000002350) ENSVVUG00000002332 ##23 ENSVVUG00000002246 CALB1 (ENSVVUG00000002228) ENSVVUG00000002146 NBN (ENSVVUG00000002057) OSGIN2 (ENSVVUG00000002034) RIPK2 (ENSVVUG00000002006) ENSVVUG00000001968 MMP16 (ENSVVUG00000001923) Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183176.b.f ##22 Hedgehog MODERN SPECIES 8789 RUNX1T1 (ENSEEUG00000004013) ##22 Common shrew MODERN SPECIES 6677 RUNX1T1 (ENSSARG00000009755) ##22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000159511 ENSGT00390000002833 ENSGT00390000008778 ENSGT00940000156966 ENSGT00940000157830 ENSGT00940000157655 ENSGT00940000156368.b ENSGT00390000010606 ENSGT00940000158322 ENSGT00390000010285.c ENSGT01030000234950 ENSGT00510000055281 ENSGT00390000017350 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT01100000263544.c.b ENSGT00940000164066 ENSGT00390000012840 ENSGT00390000003680.b ENSGT00910000147407 ENSGT00530000068397 ENSGT00950000183131.b.a ##23 ENSGT00390000007813 ENSGT00950000183108.b.a.b ENSGT00940000153801.b ENSGT01060000249136 ENSGT00390000000521 ENSGT00390000006658.a.b ENSGT00940000156113 ENSGT00940000157532 Primates ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000159511 ENSGT00390000002833 ENSGT00390000008778 ENSGT00940000156966 ENSGT00940000157830 ENSGT00940000157655 ENSGT00940000156368.b ENSGT00390000010606 ENSGT00940000158322 ENSGT00390000010285.c ENSGT01030000234950 ENSGT00510000055281 ENSGT00390000017350 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT01100000263544.c.b ENSGT00940000164066 ENSGT00390000012840 ENSGT00390000003680.b ENSGT00910000147407 ENSGT00530000068397 ENSGT00950000183131.b.a ##23 ENSGT00390000007813 ENSGT00950000183108.b.a.b ENSGT00940000153801.b ENSGT01060000249136 ENSGT00390000000521 ENSGT00390000006658.a.b ENSGT00940000156113 ENSGT00940000157532 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000156934 ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000159511 ENSGT00390000002833 ENSGT00390000008778 ENSGT00940000156966 ENSGT00940000157830 ENSGT00940000157655 ENSGT00940000156368.b ENSGT00390000010606 ENSGT00940000158322 ENSGT00390000010285.c ENSGT00390000017350 ENSGT00510000055281 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT01100000263544.c.b ENSGT00940000164066 ENSGT00390000012840 ENSGT00390000003680.b ENSGT00530000068397 ENSGT00910000147407 ENSGT00950000183131.b.a ##23 ENSGT00390000007813 ENSGT00950000183108.b.a.b ENSGT00940000153801.b ENSGT00390000000521 ENSGT00390000006658.a.b ENSGT00940000156113 ENSGT00940000157532 ENSGT00390000001688 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000156934 ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000159511 ENSGT00390000002833 ENSGT00390000008778 ENSGT00940000156966 ENSGT00940000157830 ENSGT00940000157655 ENSGT00940000156368.b ENSGT00390000010606 ENSGT00940000158322 ENSGT00390000010285.c ENSGT00510000055281 ENSGT00390000017350 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT01100000263544.c.b ENSGT00940000164066 ENSGT00390000012840 ENSGT00390000003680.b ENSGT00530000068397 ENSGT00910000147407 ENSGT00950000183131.b.a ##23 ENSGT00390000007813 ENSGT00950000183108.b.a.b ENSGT00940000153801.b ENSGT00390000000521 ENSGT00390000006658.a.b ENSGT00940000156113 ENSGT00940000157532 ENSGT00390000009546.b Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000159511 ENSGT00390000002833 ENSGT00390000008778 ENSGT00940000156966 ENSGT00940000157830 ENSGT00940000157655 ENSGT00390000008294.e.a ENSGT00940000156368.b ENSGT00390000010606 ENSGT00940000158322 ENSGT00390000010285.c ENSGT00510000055281 ENSGT00390000017350 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT01100000263544.c.b ENSGT00940000164066 ENSGT00390000012840 ENSGT00390000003680.b ENSGT00530000068397 ENSGT00910000147407 ENSGT00950000183131.b.a ##23 ENSGT00390000007813 ENSGT00950000183108.b.a.b ENSGT00940000153801.b ENSGT00390000000521 ENSGT00390000006658.a.b ENSGT00940000156113 ENSGT00910000147562 ENSGT00940000157532 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000159511 ENSGT00390000002833 ENSGT00940000156966 ENSGT00390000008778 ENSGT00940000157830 ENSGT00940000157655 ENSGT00390000008294.e.a.r ENSGT00940000156368.b ENSGT00390000010606 ENSGT00940000158322 ENSGT00390000010285.c.`c.a ENSGT00390000017350 ENSGT00510000055281 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT01100000263544.c.b ENSGT00940000164066 ENSGT00390000012840 ENSGT00390000003680.b ENSGT00530000068397 ENSGT00950000183131.b.a ##23 ENSGT00390000007813 ENSGT00950000183108.b.a.b ENSGT00940000153801.b ENSGT00390000000521 ENSGT00390000006658.a.b ENSGT00940000156113 ENSGT00910000147562 ENSGT00940000157532 ENSGT00390000009546.b Hominidae ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000159511 ENSGT00390000002833 ENSGT00940000156966 ENSGT00390000008778 ENSGT00940000157830 ENSGT00940000157655 ENSGT00390000008294.e.a.r ENSGT00940000156368.b ENSGT00390000010606 ENSGT00940000158322 ENSGT00390000010285.c.`c.a ENSGT00510000055281 ENSGT00390000017350 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT01100000263544.c.b ENSGT00940000164066 ENSGT00390000012840 ENSGT00390000003680.b ENSGT00530000068397 ENSGT00950000183131.b.a ##23 ENSGT00390000007813 ENSGT00950000183108.b.a.b ENSGT00940000153801.b ENSGT00390000000521 ENSGT00390000006658.a.b ENSGT00940000156113 ENSGT00910000147562 ENSGT00940000157532 ENSGT00390000009546.b Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000159511 ENSGT00390000002833 ENSGT00940000156966 ENSGT00390000008778 ENSGT00940000157830 ENSGT00940000157655 ENSGT00390000008294.e.a.r ENSGT00940000156368.b ENSGT00390000010606 ENSGT00940000158322 ENSGT00910000148603 ENSGT00390000010285.c.`c.a ENSGT00510000055281 ENSGT00390000017350 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT01100000263544.c.b ENSGT00940000164066 ENSGT00390000012840 ENSGT00390000003680.b ENSGT00530000068397 ENSGT00950000183131.b.a ##23 ENSGT00390000007813 ENSGT00950000183108.b.a.b ENSGT00940000153801.b ENSGT00390000000521 ENSGT00390000006658.a.b ENSGT00940000156113 ENSGT00910000147562 ENSGT00940000157532 ENSGT00390000009546.b Gorilla MODERN SPECIES 21 INTS8 (ENSGGOG00000005424) DPY19L4 (ENSGGOG00000014179) ESRP1 (ENSGGOG00000003627) VIRMA (ENSGGOG00000006855) RAD54B (ENSGGOG00000023516) GEM (ENSGGOG00000013020) CDH17 (ENSGGOG00000012331) ENSGGOG00000036876 PDP1 (ENSGGOG00000027042) TMEM67 (ENSGGOG00000027426) RBM12B (ENSGGOG00000011909) ENSGGOG00000022248 CIBAR1 (ENSGGOG00000006452) ENSGGOG00000025746 TRIQK (ENSGGOG00000041672) RUNX1T1 (ENSGGOG00000002874) ##22 SLC26A7 (ENSGGOG00000006440) LRRC69 (ENSGGOG00000010204) OTUD6B (ENSGGOG00000015833) PIP4P2 (ENSGGOG00000017181) C8orf88 (ENSGGOG00000036457) NECAB1 (ENSGGOG00000000011) ##23 TMEM64 (ENSGGOG00000023552) CALB1 (ENSGGOG00000004938) DECR1 (ENSGGOG00000002614) NBN (ENSGGOG00000027731) OSGIN2 (ENSGGOG00000003696) RIPK2 (ENSGGOG00000010840) ENSGGOG00000042581 MMP16 (ENSGGOG00000027756) ENSGGOG00000042950 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000159511 ENSGT00390000002833 ENSGT00940000156966 ENSGT00390000008778 ENSGT00940000157830 ENSGT00940000157655 ENSGT00390000008294.e.a.r ENSGT00940000156368.b ENSGT00390000010606 ENSGT00940000158322 ENSGT00910000148603 ENSGT00390000010285.c.`c.a ENSGT00390000017350 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT01100000263544.c.b ENSGT00940000164066 ENSGT00390000012840 ENSGT00390000003680.b ENSGT00530000068397 ENSGT00950000183131.b.a ##23 ENSGT00390000007813 ENSGT00950000183108.b.a.b ENSGT00940000153801.b ENSGT00390000000521 ENSGT00390000006658.a.b ENSGT00940000156113 ENSGT00910000147562 ENSGT00940000157532 ENSGT00390000009546.b Human MODERN SPECIES 20 NDUFAF6 (ENSG00000156170) CCNE2 (ENSG00000175305) INTS8 (ENSG00000164941) DPY19L4 (ENSG00000156162) ESRP1 (ENSG00000104413) VIRMA (ENSG00000164944) FSBP (ENSG00000265817) RAD54B (ENSG00000197275) GEM (ENSG00000164949) CDH17 (ENSG00000079112) PDP1 (ENSG00000164951) TMEM67 (ENSG00000164953) RBM12B (ENSG00000183808) CIBAR1 (ENSG00000188343) TRIQK (ENSG00000205133) RUNX1T1 (ENSG00000079102) ##22 SLC26A7 (ENSG00000147606) LRRC69 (ENSG00000214954) OTUD6B (ENSG00000155100) PIP4P2 (ENSG00000155099) C8orf88 (ENSG00000253250) NECAB1 (ENSG00000123119) ##23 TMEM64 (ENSG00000180694) CALB1 (ENSG00000104327) DECR1 (ENSG00000104325) NBN (ENSG00000104320) OSGIN2 (ENSG00000164823) RIPK2 (ENSG00000104312) MMP16 (ENSG00000156103) DCAF4L2 (ENSG00000176566) CNBD1 (ENSG00000176571) Pan ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000156934 ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000159511 ENSGT00390000002833 ENSGT00940000156966 ENSGT00940000157830 ENSGT00940000157655 ENSGT00390000008294.e.a.r ENSGT00940000156368.b ENSGT00390000010606 ENSGT00940000158322 ENSGT00910000148603 ENSGT00390000010285.c.`c.a ENSGT00390000017350 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT01100000263544.c.b ENSGT00940000164066 ENSGT00390000012840 ENSGT00390000003680.b ENSGT00530000068397 ENSGT00950000183131.b.a ##23 ENSGT00390000007813 ENSGT00950000183108.b.a.b ENSGT00940000153801.b ENSGT00390000000521 ENSGT00390000006658.a.b ENSGT00940000156113 ENSGT00910000147562 ENSGT00940000157532 ENSGT00910000147912 Chimpanzee MODERN SPECIES 21 INTS8 (ENSPTRG00000020432) DPY19L4 (ENSPTRG00000020431) ESRP1 (ENSPTRG00000020430) VIRMA (ENSPTRG00000020428) RAD54B (ENSPTRG00000020427) GEM (ENSPTRG00000020426) CDH17 (ENSPTRG00000020425) ENSPTRG00000049145 PDP1 (ENSPTRG00000020424) ENSPTRG00000050680 TMEM67 (ENSPTRG00000020422) RBM12B (ENSPTRG00000020420) ENSPTRG00000050149 ENSPTRG00000044420 TRIQK (ENSPTRG00000049470) RUNX1T1 (ENSPTRG00000020416) ##22 SLC26A7 (ENSPTRG00000033891) LRRC69 (ENSPTRG00000020414) OTUD6B (ENSPTRG00000020413) PIP4P2 (ENSPTRG00000020412) C8H8orf88 (ENSPTRG00000046842) NECAB1 (ENSPTRG00000020411) ##23 TMEM64 (ENSPTRG00000020410) CALB1 (ENSPTRG00000020409) DECR1 (ENSPTRG00000020408) NBN (ENSPTRG00000020407) OSGIN2 (ENSPTRG00000020406) RIPK2 (ENSPTRG00000020405) ENSPTRG00000043455 MMP16 (ENSPTRG00000020403) ENSPTRG00000052318 Bonobo MODERN SPECIES 21 CCNE2 (ENSPPAG00000028603) INTS8 (ENSPPAG00000033161) DPY19L4 (ENSPPAG00000039378) ESRP1 (ENSPPAG00000037294) VIRMA (ENSPPAG00000032721) RAD54B (ENSPPAG00000029572) GEM (ENSPPAG00000024586) CDH17 (ENSPPAG00000036344) ENSPPAG00000035912 PDP1 (ENSPPAG00000026907) ENSPPAG00000012789 TMEM67 (ENSPPAG00000029467) ENSPPAG00000042794 CIBAR1 (ENSPPAG00000042855) TRIQK (ENSPPAG00000002158) RUNX1T1 (ENSPPAG00000031370) ##22 SLC26A7 (ENSPPAG00000013458) LRRC69 (ENSPPAG00000006380) OTUD6B (ENSPPAG00000039145) PIP4P2 (ENSPPAG00000034867) C8orf88 (ENSPPAG00000022982) ENSPPAG00000041684 ##23 TMEM64 (ENSPPAG00000032620) CALB1 (ENSPPAG00000042566) DECR1 (ENSPPAG00000036153) NBN (ENSPPAG00000019456) OSGIN2 (ENSPPAG00000030450) RIPK2 (ENSPPAG00000044025) ENSPPAG00000035897 MMP16 (ENSPPAG00000010941) ENSPPAG00000029533 Orangutan MODERN SPECIES 21 TP53INP1 (ENSPPYG00000040092) CCNE2 (ENSPPYG00000018757) INTS8 (ENSPPYG00000018756) DPY19L4 (ENSPPYG00000018755) ESRP1 (ENSPPYG00000018753) ENSPPYG00000037538 VIRMA (ENSPPYG00000018751) RAD54B (ENSPPYG00000018750) GEM (ENSPPYG00000018749) CDH17 (ENSPPYG00000018748) PDP1 (ENSPPYG00000018747) TMEM67 (ENSPPYG00000018746) RBM12B (ENSPPYG00000018745) CIBAR1 (ENSPPYG00000018744) TRIQK (ENSPPYG00000018743) RUNX1T1 (ENSPPYG00000018741) ##22 SLC26A7 (ENSPPYG00000018740) LRRC69 (ENSPPYG00000018739) OTUD6B (ENSPPYG00000018738) PIP4P2 (ENSPPYG00000018737) C8orf88 (ENSPPYG00000034958) NECAB1 (ENSPPYG00000018736) ##23 TMEM64 (ENSPPYG00000018735) CALB1 (ENSPPYG00000018734) DECR1 (ENSPPYG00000018733) NBN (ENSPPYG00000018732) OSGIN2 (ENSPPYG00000018731) RIPK2 (ENSPPYG00000018730) MMP16 (ENSPPYG00000018729) DCAF4L2 (ENSPPYG00000018728) CNBD1 (ENSPPYG00000018727) Gibbon MODERN SPECIES 6 CCNE2 (ENSNLEG00000003483) INTS8 (ENSNLEG00000003354) DPY19L4 (ENSNLEG00000003347) ESRP1 (ENSNLEG00000003241) VIRMA (ENSNLEG00000003151) RAD54B (ENSNLEG00000003062) GEM (ENSNLEG00000003045) CDH17 (ENSNLEG00000002974) PDP1 (ENSNLEG00000002967) ENSNLEG00000033649 TMEM67 (ENSNLEG00000002783) RBM12B (ENSNLEG00000032050) ENSNLEG00000002773 TRIQK (ENSNLEG00000002765) ENSNLEG00000027770 RUNX1T1 (ENSNLEG00000002658) ##22 SLC26A7 (ENSNLEG00000002502) ENSNLEG00000002467 OTUD6B (ENSNLEG00000002420) PIP4P2 (ENSNLEG00000002397) C8orf88 (ENSNLEG00000002396) NECAB1 (ENSNLEG00000002344) ##23 TMEM64 (ENSNLEG00000002330) CALB1 (ENSNLEG00000002245) DECR1 (ENSNLEG00000029920) NBN (ENSNLEG00000002033) ENSNLEG00000002024 RIPK2 (ENSNLEG00000001895) ENSNLEG00000032270 MMP16 (ENSNLEG00000027127) DCAF4L2 (ENSNLEG00000019002) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000159511 ENSGT00390000002833 ENSGT00390000008778 ENSGT00940000156966 ENSGT00940000157830 ENSGT00940000157655 ENSGT00390000008294.e.a ENSGT00940000156368.b ENSGT00390000010606 ENSGT00940000158322 ENSGT00390000010285.c ENSGT00390000017350 ENSGT00510000055281 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT01100000263544.c.b ENSGT00940000164066 ENSGT00390000012840 ENSGT00390000003680.b ENSGT00530000068397 ENSGT00910000147407 ENSGT00950000183131.b.a ##23 ENSGT00390000007813 ENSGT00950000183108.b.a.b ENSGT00940000153801.b ENSGT00390000000521 ENSGT00390000006658.a.b ENSGT00940000156113 ENSGT00910000147562 ENSGT00940000157532 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000159511 ENSGT00390000002833 ENSGT00390000008778 ENSGT00940000156966 ENSGT00940000157830 ENSGT00940000157655 ENSGT00390000008294.e.a ENSGT00940000156368.b ENSGT00390000010606 ENSGT00940000158322 ENSGT00390000010285.c ENSGT00390000017350 ENSGT00510000055281 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT01100000263544.c.b ENSGT00940000164066 ENSGT00390000012840 ENSGT00390000003680.b ENSGT00530000068397 ENSGT00910000147407 ENSGT00950000183131.b.a ##23 ENSGT00390000007813 ENSGT00950000183108.b.a.b ENSGT00940000153801.b ENSGT00390000000521 ENSGT00390000006658.a.b ENSGT00940000156113 ENSGT00910000147562 ENSGT00940000157532 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000156934 ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000159511 ENSGT00390000002833 ENSGT00940000156966 ENSGT00940000157830 ENSGT00940000157655 ENSGT00390000008294.e.a ENSGT00940000156368.b ENSGT00390000010606 ENSGT00940000158322 ENSGT00390000010285.c ENSGT00390000017350 ENSGT00510000055281 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT01100000263544.c.b ENSGT00940000164066 ENSGT00390000012840 ENSGT00390000003680.b ENSGT00530000068397 ENSGT00910000147407 ENSGT00950000183131.b.a ##23 ENSGT00390000007813 ENSGT00950000183108.b.a.b ENSGT00940000153801.b ENSGT00390000000521 ENSGT00390000006658.a.b ENSGT00940000156113 ENSGT00910000147562 ENSGT00940000157532 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00530000063829.A ENSGT00940000156934 ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000159511 ENSGT00390000002833 ENSGT00940000156966 ENSGT00940000157830 ENSGT00940000157655 ENSGT00390000008294.e.a ENSGT00940000156368.b ENSGT00390000010606 ENSGT00940000158322 ENSGT00390000010285.c ENSGT00390000017350 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT01100000263544.c.b ENSGT00390000012840 ENSGT00390000003680.b ENSGT00530000068397 ENSGT00910000147407 ENSGT00950000183131.b.a ##23 ENSGT00390000007813 ENSGT00950000183108.b.a.b ENSGT00940000153801.b ENSGT00390000000521 ENSGT00390000006658.a.b ENSGT00940000156113 ENSGT00940000157532 ENSGT00390000001688 ENSGT00940000154824.a Olive baboon MODERN SPECIES 18 VIRMA (ENSPANG00000017809) ENSPANG00000002488 RAD54B (ENSPANG00000019566) ENSPANG00000043038 GEM (ENSPANG00000017240) CDH17 (ENSPANG00000017130) PDP1 (ENSPANG00000011147) TMEM67 (ENSPANG00000009489) RBM12B (ENSPANG00000035535) CIBAR1 (ENSPANG00000024158) ENSPANG00000051317 TRIQK (ENSPANG00000029780) ENSPANG00000038084 ENSPANG00000050255 ENSPANG00000041246 RUNX1T1 (ENSPANG00000004755) ##22 SLC26A7 (ENSPANG00000010066) ENSPANG00000051009 ENSPANG00000051163 OTUD6B (ENSPANG00000022969) PIP4P2 (ENSPANG00000005208) C8orf88 (ENSPANG00000045847) ENSPANG00000040997 NECAB1 (ENSPANG00000016561) ##23 TMEM64 (ENSPANG00000009061) ENSPANG00000043211 ENSPANG00000040984 ENSPANG00000047622 CALB1 (ENSPANG00000016822) DECR1 (ENSPANG00000016824) NBN (ENSPANG00000011020) Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 92 ENSGT00530000063829.A ENSGT00940000156934 ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000159511 ENSGT00390000002833 ENSGT00940000156966 ENSGT00940000157830 ENSGT00940000157655 ENSGT00390000008294.e.a ENSGT00940000156368.b ENSGT00390000010606 ENSGT00940000158322 ENSGT00390000010285.c ENSGT00390000017350 ENSGT00950000183176.b.f ##22 Drill MODERN SPECIES 744 TP53INP1 (ENSMLEG00000033824) CCNE2 (ENSMLEG00000031183) INTS8 (ENSMLEG00000036088) DPY19L4 (ENSMLEG00000041642) ESRP1 (ENSMLEG00000015475) VIRMA (ENSMLEG00000033647) RAD54B (ENSMLEG00000006946) GEM (ENSMLEG00000030970) CDH17 (ENSMLEG00000025852) ENSMLEG00000026827 PDP1 (ENSMLEG00000039161) TMEM67 (ENSMLEG00000035574) RBM12B (ENSMLEG00000037288) ENSMLEG00000043029 TRIQK (ENSMLEG00000030472) RUNX1T1 (ENSMLEG00000034551) ##22 Sooty mangabey MODERN SPECIES 658 CCNE2 (ENSCATG00000045094) INTS8 (ENSCATG00000035060) DPY19L4 (ENSCATG00000017771) ESRP1 (ENSCATG00000038739) VIRMA (ENSCATG00000043446) RAD54B (ENSCATG00000030661) ENSCATG00000043242 GEM (ENSCATG00000032814) CDH17 (ENSCATG00000032530) ENSCATG00000039742 PDP1 (ENSCATG00000026851) TMEM67 (ENSCATG00000038457) RBM12B (ENSCATG00000030769) CIBAR1 (ENSCATG00000012539) TRIQK (ENSCATG00000031074) RUNX1T1 (ENSCATG00000016868) ##22 Macaca ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00530000063829.A ENSGT00940000156934 ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000159511 ENSGT00390000002833 ENSGT00940000156966 ENSGT00940000157830 ENSGT00940000157655 ENSGT00940000156368.b ENSGT00390000010606 ENSGT00940000158322 ENSGT00390000010285.c ENSGT00390000017350 ENSGT00510000055281 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT01100000263544.c.b ENSGT00940000164066 ENSGT00390000012840 ENSGT00390000003680.b ENSGT00530000068397 ENSGT00910000147407 ENSGT00950000183131.b.a ##23 ENSGT00390000007813 ENSGT00950000183108.b.a.b ENSGT00940000153801.b ENSGT00390000000521 ENSGT00390000006658.a.b ENSGT00940000156113 ENSGT00910000147562 ENSGT00940000157532 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00510000048688 ENSGT00530000063829.A ENSGT00940000156934 ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000159511 ENSGT00390000002833 ENSGT00390000008778 ENSGT00940000156966 ENSGT00940000157830 ENSGT00940000157655 ENSGT00940000156368.b ENSGT00390000010606 ENSGT00940000158322 ENSGT00390000010285.c ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT01100000263544.c.b ENSGT00390000012840 ENSGT00390000003680.b ENSGT00530000068397 ENSGT00950000183131.b.a ##23 ENSGT00390000007813 ENSGT00950000183108.b.a.b ENSGT00940000153801.b ENSGT00390000000521 ENSGT00390000006658.a.b ENSGT00940000156113 ENSGT00940000157532 ENSGT00390000009546.b ENSGT00390000001688 ENSGT00530000062932.c.a.a.a.b.a.d Rhesus MODERN SPECIES 18 CCNE2 (ENSMMUG00000005358) INTS8 (ENSMMUG00000005356) DPY19L4 (ENSMMUG00000021113) ESRP1 (ENSMMUG00000021112) VIRMA (ENSMMUG00000012981) ENSMMUG00000061159 FSBP (ENSMMUG00000052407) RAD54B (ENSMMUG00000005659) GEM (ENSMMUG00000062934) CDH17 (ENSMMUG00000020010) ENSMMUG00000047716 PDP1 (ENSMMUG00000004568) TMEM67 (ENSMMUG00000005561) RBM12B (ENSMMUG00000005558) CIBAR1 (ENSMMUG00000005557) RUNX1T1 (ENSMMUG00000023115) ##22 SLC26A7 (ENSMMUG00000019481) OTUD6B (ENSMMUG00000013396) PIP4P2 (ENSMMUG00000051364) C8H8orf88 (ENSMMUG00000049102) NECAB1 (ENSMMUG00000013392) ##23 TMEM64 (ENSMMUG00000004011) ENSMMUG00000061241 CALB1 (ENSMMUG00000006664) DECR1 (ENSMMUG00000006663) NBN (ENSMMUG00000014519) OSGIN2 (ENSMMUG00000014518) RIPK2 (ENSMMUG00000020725) ENSMMUG00000051248 ENSMMUG00000058939 ENSMMUG00000055409 Crab-eating macaque MODERN SPECIES 18 ENSMFAG00000061242 ENSMFAG00000063260 DPY19L4 (ENSMFAG00000001092) ESRP1 (ENSMFAG00000031577) VIRMA (ENSMFAG00000041706) RAD54B (ENSMFAG00000031629) 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ENSGT00940000156113 ENSGT00940000157532 ENSGT00390000001688 Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES 46 ENSGT00940000156934 ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000159511 ENSGT00390000002833 ENSGT00940000156966 ENSGT00940000157830 ENSGT00940000157655 ENSGT00940000156368.b ENSGT00390000010606 ENSGT00940000158322 ENSGT00390000010285.c ENSGT00390000017350 ENSGT00510000055281 ENSGT01030000234950 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT01100000263544.c.b ENSGT00940000164066 ENSGT00390000012840 ENSGT00390000003680.b ENSGT00530000068397 ENSGT00950000183131.b.a ##23 ENSGT00390000007813 ENSGT00950000183108.b.a.b ENSGT00940000153801.b ENSGT01060000249136 ENSGT00390000000521 ENSGT00390000006658.a.b ENSGT00940000156113 ENSGT00940000157532 ENSGT00390000001688 Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 27 TP53INP1 (ENSPSMG00000018946) CCNE2 (ENSPSMG00000018924) INTS8 (ENSPSMG00000018853) DPY19L4 (ENSPSMG00000018792) ESRP1 (ENSPSMG00000018737) ENSPSMG00000018677 RAD54B (ENSPSMG00000018667) GEM 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ENSPCOG00000023268 ENSPCOG00000001922 OSGIN2 (ENSPCOG00000016333) RIPK2 (ENSPCOG00000024471) ENSPCOG00000016166 ENSPCOG00000018604 Mouse lemur MODERN SPECIES 31 TP53INP1 (ENSMICG00000047023) CCNE2 (ENSMICG00000015598) INTS8 (ENSMICG00000015571) DPY19L4 (ENSMICG00000034944) ESRP1 (ENSMICG00000008757) VIRMA (ENSMICG00000002218) FSBP (ENSMICG00000035643) RAD54B (ENSMICG00000000754) GEM (ENSMICG00000043148) CDH17 (ENSMICG00000015201) PDP1 (ENSMICG00000015194) TMEM67 (ENSMICG00000015167) RBM12B (ENSMICG00000036969) CIBAR1 (ENSMICG00000006797) TRIQK (ENSMICG00000046319) RUNX1T1 (ENSMICG00000015825) ##22 SLC26A7 (ENSMICG00000012285) LRRC69 (ENSMICG00000027375) ENSMICG00000012278 PIP4P2 (ENSMICG00000012276) C8orf88 (ENSMICG00000041689) NECAB1 (ENSMICG00000034070) ##23 TMEM64 (ENSMICG00000028722) CALB1 (ENSMICG00000010459) DECR1 (ENSMICG00000010454) NBN (ENSMICG00000010449) OSGIN2 (ENSMICG00000033226) ENSMICG00000045235 RIPK2 (ENSMICG00000007408) ENSMICG00000041489 ENSMICG00000036676 Bushbaby MODERN SPECIES 119 DPY19L4 (ENSOGAG00000001710) ESRP1 (ENSOGAG00000000917) ENSOGAG00000025900 VIRMA (ENSOGAG00000013555) RAD54B (ENSOGAG00000007854) FSBP (ENSOGAG00000007859) GEM (ENSOGAG00000007849) CDH17 (ENSOGAG00000002985) PDP1 (ENSOGAG00000002984) TMEM67 (ENSOGAG00000002980) RBM12B (ENSOGAG00000002979) CIBAR1 (ENSOGAG00000002972) ENSOGAG00000029864 ENSOGAG00000027889 TRIQK (ENSOGAG00000009459) RUNX1T1 (ENSOGAG00000012411) ##22 ENSOGAG00000015022 SLC26A7 (ENSOGAG00000005224) OTUD6B (ENSOGAG00000011298) PIP4P2 (ENSOGAG00000011296) NECAB1 (ENSOGAG00000008481) ##23 TMEM64 (ENSOGAG00000008478) CALB1 (ENSOGAG00000002418) DECR1 (ENSOGAG00000002417) ENSOGAG00000002416 OSGIN2 (ENSOGAG00000024574) RIPK2 (ENSOGAG00000012627) ENSOGAG00000030962 MMP16 (ENSOGAG00000002718) ENSOGAG00000024480 CNGB3 (ENSOGAG00000012116) Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00530000063829.A ENSGT00940000156934 ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000159511 ENSGT00390000002833 ENSGT00390000008778 ENSGT00940000156966 ENSGT00940000157830 ENSGT00940000157655 ENSGT00940000156368.b ENSGT00390000010606 ENSGT00940000158322 ENSGT00390000010285.c ENSGT00390000017350 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT01100000263544.c.b ENSGT00940000164066 ENSGT00390000012840 ENSGT00390000003680.b ENSGT00530000068397 ENSGT00950000183131.b.a ##23 ENSGT00390000007813 ENSGT00950000183108.b.a.b ENSGT00940000153801.b ENSGT00390000000521 ENSGT00390000006658.a.b ENSGT00940000156113 ENSGT00940000157532 ENSGT00390000001688 ENSGT00940000154824.a Tree shrew MODERN SPECIES 2704 RUNX1T1 (ENSTBEG00000010312) ##22 SLC26A7 (ENSTBEG00000017419) OTUD6B (ENSTBEG00000017070) PIP4P2 (ENSTBEG00000016767) Glires ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00530000063829.A ENSGT00940000156934 ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000159511 ENSGT00390000002833 ENSGT00940000156966 ENSGT00390000008778 ENSGT00940000157830 ENSGT00940000157655 ENSGT00940000156368.b ENSGT00390000010606 ENSGT00940000158322 ENSGT00390000010285.c ENSGT00390000017350 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT01100000263544.c.b ENSGT00940000164066 ENSGT00390000012840 ENSGT00390000003680.b ENSGT00530000068397 ENSGT00950000183131.b.a ##23 ENSGT00390000007813 ENSGT00950000183108.b.a.b ENSGT00940000153801.b ENSGT00390000000521 ENSGT00390000006658.a.b ENSGT00940000156113 ENSGT00940000157532 ENSGT00390000001688 ENSGT00940000154824.a Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES 638 ENSGT00390000017350 ENSGT00950000183176.b.f ##22 Rabbit MODERN SPECIES 14 CCNE2 (ENSOCUG00000005398) INTS8 (ENSOCUG00000005386) DPY19L4 (ENSOCUG00000001317) ESRP1 (ENSOCUG00000001316) VIRMA (ENSOCUG00000016495) RAD54B (ENSOCUG00000016478) GEM (ENSOCUG00000001030) CDH17 (ENSOCUG00000001029) PDP1 (ENSOCUG00000003939) TMEM67 (ENSOCUG00000010390) RBM12B (ENSOCUG00000010353) CIBAR1 (ENSOCUG00000010331) ENSOCUG00000039147 TRIQK (ENSOCUG00000034527) ENSOCUG00000022069 RUNX1T1 (ENSOCUG00000003754) ##22 ENSOCUG00000027627 SLC26A7 (ENSOCUG00000012527) LRRC69 (ENSOCUG00000028994) OTUD6B (ENSOCUG00000000218) ENSOCUG00000000723 ENSOCUG00000030280 ENSOCUG00000023574 NECAB1 (ENSOCUG00000001277) ##23 ENSOCUG00000006890 ENSOCUG00000021479 ENSOCUG00000006341 ENSOCUG00000006333 NBN (ENSOCUG00000009935) OSGIN2 (ENSOCUG00000009931) ENSOCUG00000030509 Pika MODERN SPECIES 4222 RUNX1T1 (ENSOPRG00000004193) ##22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00530000063829.A ENSGT00940000156934 ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000159511 ENSGT00390000002833 ENSGT00940000156966 ENSGT00390000008778 ENSGT00940000157830 ENSGT00940000157655 ENSGT00940000156368.b ENSGT00390000010606 ENSGT00940000158322 ENSGT00390000010285.c ENSGT00390000017350 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT01100000263544.c.b ENSGT00940000164066 ENSGT00390000012840 ENSGT00390000003680.b ENSGT00530000068397 ENSGT00950000183131.b.a ##23 ENSGT00390000007813 ENSGT00950000183108.b.a.b ENSGT00940000153801.b ENSGT00390000000521 ENSGT00390000006658.a.b ENSGT00940000156113 ENSGT00940000157532 ENSGT00390000001688 ENSGT00940000154824.a Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00530000063829.A ENSGT00940000156934 ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000159511 ENSGT00390000002833 ENSGT00940000156966 ENSGT00390000008778 ENSGT00940000157830 ENSGT00940000157655 ENSGT00940000156368.b ENSGT00390000010606 ENSGT00940000158322 ENSGT00390000010285.c ENSGT00390000017350 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT01100000263544.c.b ENSGT00940000164066 ENSGT00390000012840 ENSGT00390000003680.b ENSGT00530000068397 ENSGT00950000183131.b.a ##23 ENSGT00390000007813 ENSGT00950000183108.b.a.b ENSGT00940000153801.b ENSGT00390000000521 ENSGT00390000006658.a.b ENSGT00940000156113 ENSGT00940000157532 ENSGT00390000001688 ENSGT00940000154824.a Kangaroo rat MODERN SPECIES 336 Trp53inp1 (ENSDORG00000023784) Ccne2 (ENSDORG00000014957) Ints8 (ENSDORG00000014954) Dpy19l4 (ENSDORG00000004016) Esrp1 (ENSDORG00000011987) ENSDORG00000024142 Virma (ENSDORG00000002324) Rad54b (ENSDORG00000002492) Fsbp (ENSDORG00000024906) Gem (ENSDORG00000003903) Pdp1 (ENSDORG00000015533) Tmem67 (ENSDORG00000004149) ENSDORG00000024034 Cibar1 (ENSDORG00000028815) Triqk (ENSDORG00000028174) Runx1t1 (ENSDORG00000013545) ##22 ENSDORG00000024490 Slc26a7 (ENSDORG00000014243) Otud6b (ENSDORG00000005619) Pip4p2 (ENSDORG00000025689) Gm11837 (ENSDORG00000027568) Necab1 (ENSDORG00000006622) ##23 Tmem64 (ENSDORG00000029629) Calb1 (ENSDORG00000013359) Decr1 (ENSDORG00000013357) Osgin2 (ENSDORG00000025748) Ripk2 (ENSDORG00000002598) Mmp16 (ENSDORG00000000461) Cngb3 (ENSDORG00000008524) ENSDORG00000028023 Cpne3 (ENSDORG00000000949) Myomorpha ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00530000063829.A ENSGT00940000156934 ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000159511 ENSGT00390000002833 ENSGT00940000156966 ENSGT00390000008778 ENSGT00940000157830 ENSGT00940000157655 ENSGT00940000156368.b ENSGT00390000010606 ENSGT00940000158322 ENSGT00390000010285.c ENSGT00390000017350 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT01100000263544.c.b ENSGT00940000164066 ENSGT00390000012840 ENSGT00390000003680.b ENSGT00530000068397 ENSGT00950000183131.b.a ##23 ENSGT00390000007813 ENSGT00950000183108.b.a.b ENSGT00940000153801.b ENSGT00390000000521 ENSGT00390000006658.a.b ENSGT00940000156113 ENSGT00940000157532 ENSGT00390000001688 ENSGT00940000154824.a Muroidea ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00530000063829.A ENSGT00940000156934 ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000159511 ENSGT00390000002833 ENSGT00940000156966 ENSGT00390000008778 ENSGT00940000157830 ENSGT00940000157655 ENSGT00940000156368.b ENSGT00390000010606 ENSGT00940000158322 ENSGT00390000010285.c ENSGT00390000017350 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT01100000263544.c.b ENSGT00940000164066 ENSGT00390000012840 ENSGT00390000003680.b ENSGT00530000068397 ENSGT00950000183131.b.a ##23 ENSGT00390000007813 ENSGT00950000183108.b.a.b ENSGT00940000153801.b ENSGT00390000000521 ENSGT00390000006658.a.b ENSGT00940000156113 ENSGT00940000157532 ENSGT00390000001688 ENSGT00940000154824.a Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00530000063829.A ENSGT00940000156934 ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000159511 ENSGT00390000002833 ENSGT00940000156966 ENSGT00390000008778 ENSGT00940000157830 ENSGT00940000157655 ENSGT00940000156368.b ENSGT00390000010606 ENSGT00940000158322 ENSGT00390000010285.c ENSGT00390000017350 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT01100000263544.c.b ENSGT00940000164066 ENSGT00390000012840 ENSGT00390000003680.b ENSGT00530000068397 ENSGT00950000183131.b.a ##23 ENSGT00390000007813 ENSGT00950000183108.b.a.b ENSGT00940000153801.b ENSGT00390000000521 ENSGT00390000006658.a.b ENSGT00940000156113 ENSGT00940000157532 ENSGT00390000001688 ENSGT00940000154824.a Cricetidae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00530000063829.A ENSGT00940000156934 ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000159511 ENSGT00390000002833 ENSGT00940000156966 ENSGT00390000008778 ENSGT00940000157830 ENSGT00940000157655 ENSGT00940000156368.b ENSGT00390000010606 ENSGT00940000158322 ENSGT00390000010285.c ENSGT00390000017350 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT01100000263544.c.b ENSGT00940000164066 ENSGT00390000012840 ENSGT00390000003680.b ENSGT00530000068397 ENSGT00950000183131.b.a ##23 ENSGT00390000007813 ENSGT00950000183108.b.a.b ENSGT00940000153801.b ENSGT00390000000521 ENSGT00390000006658.a.b ENSGT00940000156113 ENSGT00940000157532 ENSGT00390000001688 ENSGT00940000154824.a Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES 50 ENSGT00530000063829.A ENSGT00940000156934 ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000159511 ENSGT00390000002833 ENSGT00940000156966 ENSGT00390000008778 ENSGT00940000157830 ENSGT00940000157655 ENSGT00940000156368.b ENSGT00390000010606 ENSGT00940000158322 ENSGT00390000010285.c ENSGT00390000017350 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT01100000263544.c.b ENSGT00940000164066 ENSGT00390000012840 ENSGT00390000003680.b ENSGT00530000068397 ENSGT00950000183131.b.a ##23 ENSGT00390000007813 ENSGT00950000183108.b.a.b ENSGT00940000153801.b ENSGT00390000000521 ENSGT00390000006658.a.b ENSGT00940000156113 ENSGT00940000157532 ENSGT00390000001688 ENSGT00940000154824.a Northern American deer mouse DUPLICATION Northern American deer mouse MODERN SPECIES 11 Dpy19l4 (ENSPEMG00000002369) Esrp1 (ENSPEMG00000020410) Virma (ENSPEMG00000002167) Rad54b (ENSPEMG00000012133) Gem (ENSPEMG00000012652) ENSPEMG00000013625 Cdh17 (ENSPEMG00000018197) Pdp1 (ENSPEMG00000028541) Tmem67 (ENSPEMG00000017838) ENSPEMG00000008279 Cibar1 (ENSPEMG00000010608) ENSPEMG00000030089 ENSPEMG00000028954 ENSPEMG00000028937 Triqk (ENSPEMG00000025632) ENSPEMG00000017685 ##22 ENSPEMG00000000556 Slc26a7 (ENSPEMG00000011690) ENSPEMG00000011651 Otud6b (ENSPEMG00000004107) ENSPEMG00000027425 Pip4p2 (ENSPEMG00000029418) Gm11837 (ENSPEMG00000015295) Necab1 (ENSPEMG00000014048) ##23 Tmem64 (ENSPEMG00000006681) ENSPEMG00000007388 Calb1 (ENSPEMG00000015493) Decr1 (ENSPEMG00000002922) Nbn (ENSPEMG00000001045) Osgin2 (ENSPEMG00000009452) Ripk2 (ENSPEMG00000018444) Northern American deer mouse MODERN SPECIES 14 Crb3 (ENSPEMG00000021919) Dennd1c (ENSPEMG00000023860) Tubb4a (ENSPEMG00000028633) Tnfsf9 (ENSPEMG00000020989) Cd70 (ENSPEMG00000015587) ENSPEMG00000011159 ENSPEMG00000015087 Tnfsf14 (ENSPEMG00000000292) ENSPEMG00000001526 Gpr108 (ENSPEMG00000030315) Trip10 (ENSPEMG00000017394) ENSPEMG00000031058 Vav1 (ENSPEMG00000015943) Adgre1 (ENSPEMG00000013357) ENSPEMG00000008525 ENSPEMG00000028855 ##22 ENSPEMG00000030002 2610008E11Rik (ENSPEMG00000029764) ENSPEMG00000008518 ENSPEMG00000008828 Or7a36 (ENSPEMG00000011041) ENSPEMG00000009495 ENSPEMG00000015450 Ccdc105 (ENSPEMG00000008931) Casp14 (ENSPEMG00000003806) Or1i2 (ENSPEMG00000002732) Syde1 (ENSPEMG00000017967) Ilvbl (ENSPEMG00000016636) Or10b1 (ENSPEMG00000031391) Notch3 (ENSPEMG00000003368) ENSPEMG00000026978 Prairie vole MODERN SPECIES 355 Trp53inp1 (ENSMOCG00000021132) Ccne2 (ENSMOCG00000001638) Ints8 (ENSMOCG00000017112) Dpy19l4 (ENSMOCG00000007197) Esrp1 (ENSMOCG00000013567) Virma (ENSMOCG00000015388) Rad54b (ENSMOCG00000020035) Fsbp (ENSMOCG00000008704) Gem (ENSMOCG00000006722) Cdh17 (ENSMOCG00000010844) Pdp1 (ENSMOCG00000014340) Tmem67 (ENSMOCG00000011860) ENSMOCG00000005603 Cibar1 (ENSMOCG00000011538) Triqk (ENSMOCG00000007927) Runx1t1 (ENSMOCG00000017694) ##22 Slc26a7 (ENSMOCG00000009692) Lrrc69 (ENSMOCG00000015447) Otud6b (ENSMOCG00000003127) Pip4p2 (ENSMOCG00000010645) Gm11837 (ENSMOCG00000020310) Necab1 (ENSMOCG00000016012) ##23 Tmem64 (ENSMOCG00000013491) Calb1 (ENSMOCG00000019024) ENSMOCG00000020786 Decr1 (ENSMOCG00000015275) Nbn (ENSMOCG00000006817) Osgin2 (ENSMOCG00000006201) Ripk2 (ENSMOCG00000008336) ENSMOCG00000009257 Mmp16 (ENSMOCG00000021490) Cricetinae ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00530000063829.A ENSGT00940000156934 ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000159511 ENSGT00390000002833 ENSGT00390000008778 ENSGT00940000156966 ENSGT00940000157830 ENSGT00940000157655 ENSGT00940000156368.b ENSGT00390000010606 ENSGT00940000158322 ENSGT00390000010285.c ENSGT00390000017350 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT01100000263544.c.b ENSGT00940000164066 ENSGT00390000012840 ENSGT00390000003680.b ENSGT00530000068397 ENSGT00950000183131.b.a ##23 ENSGT00390000007813 ENSGT00950000183108.b.a.b ENSGT00940000153801.b ENSGT00390000000521 ENSGT00390000006658.a.b ENSGT00940000156113 ENSGT00940000157532 ENSGT00940000154824.a ENSGT00940000154968 Golden Hamster MODERN SPECIES 625 Runx1t1 (ENSMAUG00000018463) ##22 Slc26a7 (ENSMAUG00000012657) ENSMAUG00000010763 Otud6b (ENSMAUG00000007981) Pip4p2 (ENSMAUG00000014691) Gm11837 (ENSMAUG00000004822) Necab1 (ENSMAUG00000019959) ##23 Tmem64 (ENSMAUG00000021648) Calb1 (ENSMAUG00000009816) Decr1 (ENSMAUG00000018588) Nbn (ENSMAUG00000021633) Osgin2 (ENSMAUG00000009459) Ripk2 (ENSMAUG00000008933) ENSMAUG00000010464 Mmp16 (ENSMAUG00000004025) Cngb3 (ENSMAUG00000019078) Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 136 Cdh17 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ENSGT00940000154824.a Mus_A ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00530000063829.A ENSGT00940000156934 ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000159511 ENSGT00390000002833 ENSGT00940000156966 ENSGT00390000008778 ENSGT00940000157830 ENSGT00940000157655 ENSGT00940000156368.b ENSGT00390000010606 ENSGT00940000158322 ENSGT00390000010285.c ENSGT00390000017350 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT01100000263544.c.b ENSGT00940000164066 ENSGT00390000012840 ENSGT00390000003680.b ENSGT00530000068397 ENSGT00950000183131.b.a ##23 ENSGT00390000007813 ENSGT00950000183108.b.a.b ENSGT00940000153801.b ENSGT00390000000521 ENSGT00390000006658.a.b ENSGT00940000156113 ENSGT00940000157532 ENSGT00390000001688 ENSGT00940000154824.a Mus_B ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00530000063829.A ENSGT00940000156934 ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000159511 ENSGT00390000002833 ENSGT00940000156966 ENSGT00390000008778 ENSGT00940000157830 ENSGT00940000157655 ENSGT00940000156368.b ENSGT00390000010606 ENSGT00940000158322.d ENSGT00390000010285.c ENSGT00390000017350 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT01100000263544.c.b ENSGT00940000164066 ENSGT00390000012840 ENSGT00390000003680.b ENSGT00530000068397 ENSGT00950000183131.b.a ##23 ENSGT00390000007813 ENSGT00950000183108.b.a.b ENSGT00940000153801.b ENSGT00390000000521 ENSGT00390000006658.a.b ENSGT00940000156113 ENSGT00940000157532 ENSGT00390000001688 ENSGT00940000154824.a Mouse MODERN SPECIES 13 Ccne2 (ENSMUSG00000028212) Ints8 (ENSMUSG00000040738) Dpy19l4 (ENSMUSG00000045205) Esrp1 (ENSMUSG00000040728) Virma (ENSMUSG00000040720) Rad54b (ENSMUSG00000078773) Fsbp (ENSMUSG00000094595) Gem (ENSMUSG00000028214) Cdh17 (ENSMUSG00000028217) Pdp1 (ENSMUSG00000049225) Tmem67 (ENSMUSG00000049488) Rbm12b2 (ENSMUSG00000052137) Rbm12b1 (ENSMUSG00000046667) Cibar1 (ENSMUSG00000028218) Triqk (ENSMUSG00000055963) Runx1t1 (ENSMUSG00000006586) ##22 Slc26a7 (ENSMUSG00000040569) Lrrc69 (ENSMUSG00000023151) Otud6b (ENSMUSG00000040550) Pip4p2 (ENSMUSG00000028221) Gm11837 (ENSMUSG00000086587) Necab1 (ENSMUSG00000040536) ##23 Tmem64 (ENSMUSG00000043252) Calb1 (ENSMUSG00000028222) Decr1 (ENSMUSG00000028223) Nbn (ENSMUSG00000028224) Osgin2 (ENSMUSG00000041153) Ripk2 (ENSMUSG00000041135) Mmp16 (ENSMUSG00000028226) Cnbd1 (ENSMUSG00000073991) Cngb3 (ENSMUSG00000056494) Mus_C ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00510000048688 ENSGT00530000063829.A ENSGT00940000156934 ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000159511 ENSGT00390000002833 ENSGT00940000156966 ENSGT00390000008778 ENSGT00940000157830 ENSGT00940000157655 ENSGT00940000156368.b ENSGT00390000010606 ENSGT00940000158322.d ENSGT00390000010285.c ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT01100000263544.c.b ENSGT00940000164066 ENSGT00390000012840 ENSGT00390000003680.b ENSGT00530000068397 ENSGT00950000183131.b.a ##23 ENSGT00390000007813 ENSGT00950000183108.b.a.b ENSGT00940000153801.b ENSGT00390000000521 ENSGT00390000006658.a.b ENSGT00940000156113 ENSGT00940000157532 ENSGT00390000001688 ENSGT00940000154824.a spretus MODERN SPECIES 13 Ccne2 (MGP_SPRETEiJ_G0026753) Ints8 (MGP_SPRETEiJ_G0026754) Dpy19l4 (MGP_SPRETEiJ_G0026755) Esrp1 (MGP_SPRETEiJ_G0026756) Virma (MGP_SPRETEiJ_G0026757) Rad54b (MGP_SPRETEiJ_G0026758) Fsbp (MGP_SPRETEiJ_G0026759) Gem (MGP_SPRETEiJ_G0026760) Cdh17 (MGP_SPRETEiJ_G0026761) Pdp1 (MGP_SPRETEiJ_G0026762) MGP_SPRETEiJ_G0026763 Tmem67 (MGP_SPRETEiJ_G0026764) MGP_SPRETEiJ_G0026765 MGP_SPRETEiJ_G0026766 Cibar1 (MGP_SPRETEiJ_G0026767) Runx1t1 (MGP_SPRETEiJ_G0026768) ##22 Slc26a7 (MGP_SPRETEiJ_G0026769) Lrrc69 (MGP_SPRETEiJ_G0026770) MGP_SPRETEiJ_G0026771 Pip4p2 (MGP_SPRETEiJ_G0026772) Necab1 (MGP_SPRETEiJ_G0026773) ##23 Tmem64 (MGP_SPRETEiJ_G0026774) Calb1 (MGP_SPRETEiJ_G0026775) Decr1 (MGP_SPRETEiJ_G0026776) Nbn (MGP_SPRETEiJ_G0026777) Osgin2 (MGP_SPRETEiJ_G0026778) Ripk2 (MGP_SPRETEiJ_G0026779) Mmp16 (MGP_SPRETEiJ_G0026780) MGP_SPRETEiJ_G0026781 Cngb3 (MGP_SPRETEiJ_G0026782) Cpne3 (MGP_SPRETEiJ_G0026783) Steppe mouse MODERN SPECIES 2894 Runx1t1 (ENSMSIG00000000727) ##22 Slc26a7 (ENSMSIG00000000568) ENSMSIG00000000556 ENSMSIG00000000540 Lrrc69 (ENSMSIG00000000468) ENSMSIG00000000407 Pip4p2 (ENSMSIG00000000344) Gm11837 (ENSMSIG00000000315) Necab1 (ENSMSIG00000000161) ##23 Ryukyu mouse MODERN SPECIES 13 Ndufaf6 (MGP_CAROLIEiJ_G0025803) Trp53inp1 (MGP_CAROLIEiJ_G0025804) Ccne2 (MGP_CAROLIEiJ_G0025805) Ints8 (MGP_CAROLIEiJ_G0025806) Dpy19l4 (MGP_CAROLIEiJ_G0025807) Esrp1 (MGP_CAROLIEiJ_G0025808) Virma (MGP_CAROLIEiJ_G0025809) Rad54b (MGP_CAROLIEiJ_G0025810) Fsbp (MGP_CAROLIEiJ_G0025811) Gem (MGP_CAROLIEiJ_G0025812) Cdh17 (MGP_CAROLIEiJ_G0025813) Pdp1 (MGP_CAROLIEiJ_G0025814) Tmem67 (MGP_CAROLIEiJ_G0025815) Cibar1 (MGP_CAROLIEiJ_G0025816) Triqk (MGP_CAROLIEiJ_G0025818) Runx1t1 (MGP_CAROLIEiJ_G0025819) ##22 Slc26a7 (MGP_CAROLIEiJ_G0025820) Lrrc69 (MGP_CAROLIEiJ_G0025821) Otud6b (MGP_CAROLIEiJ_G0025822) Pip4p2 (MGP_CAROLIEiJ_G0025823) Necab1 (MGP_CAROLIEiJ_G0025824) ##23 Tmem64 (MGP_CAROLIEiJ_G0025825) Calb1 (MGP_CAROLIEiJ_G0025826) Decr1 (MGP_CAROLIEiJ_G0025827) Nbn (MGP_CAROLIEiJ_G0025828) Osgin2 (MGP_CAROLIEiJ_G0025829) Ripk2 (MGP_CAROLIEiJ_G0025830) Mmp16 (MGP_CAROLIEiJ_G0025831) MGP_CAROLIEiJ_G0025832 Cngb3 (MGP_CAROLIEiJ_G0025833) Cpne3 (MGP_CAROLIEiJ_G0025834) Shrew mouse MODERN SPECIES 14 Trp53inp1 (MGP_PahariEiJ_G0023927) Ccne2 (MGP_PahariEiJ_G0023928) Ints8 (MGP_PahariEiJ_G0023929) Dpy19l4 (MGP_PahariEiJ_G0023930) Esrp1 (MGP_PahariEiJ_G0023931) Virma (MGP_PahariEiJ_G0023932) Rad54b (MGP_PahariEiJ_G0023933) Fsbp (MGP_PahariEiJ_G0023934) Gem (MGP_PahariEiJ_G0023935) Cdh17 (MGP_PahariEiJ_G0023936) Pdp1 (MGP_PahariEiJ_G0023937) MGP_PahariEiJ_G0023938 Tmem67 (MGP_PahariEiJ_G0023939) Cibar1 (MGP_PahariEiJ_G0023940) Triqk (MGP_PahariEiJ_G0023941) Runx1t1 (MGP_PahariEiJ_G0023942) ##22 Slc26a7 (MGP_PahariEiJ_G0023943) Lrrc69 (MGP_PahariEiJ_G0023944) Otud6b (MGP_PahariEiJ_G0023945) Pip4p2 (MGP_PahariEiJ_G0023946) Necab1 (MGP_PahariEiJ_G0023947) ##23 Tmem64 (MGP_PahariEiJ_G0023948) Calb1 (MGP_PahariEiJ_G0023949) Decr1 (MGP_PahariEiJ_G0023950) Nbn (MGP_PahariEiJ_G0023951) Osgin2 (MGP_PahariEiJ_G0023952) Ripk2 (MGP_PahariEiJ_G0023953) Mmp16 (MGP_PahariEiJ_G0023954) MGP_PahariEiJ_G0023955 Cngb3 (MGP_PahariEiJ_G0023956) Cpne3 (MGP_PahariEiJ_G0023957) Rat MODERN SPECIES 15 LOC103692302 (ENSRNOG00000063229) RGD1559441 (ENSRNOG00000067162) LOC103692301 (ENSRNOG00000070765) ENSRNOG00000070727 ENSRNOG00000062635 Virma (ENSRNOG00000014664) Fsbp (ENSRNOG00000039949) Gem (ENSRNOG00000015160) Cdh17 (ENSRNOG00000015562) Pdp1 (ENSRNOG00000016180) Tmem67 (ENSRNOG00000016187) LOC120102832 (ENSRNOG00000055292) Rbm12b (ENSRNOG00000016330) Cibar1 (ENSRNOG00000016338) Triqk (ENSRNOG00000039924) Runx1t1 (ENSRNOG00000005673) ##22 Slc26a7 (ENSRNOG00000006096) Lrrc69 (ENSRNOG00000006498) Otud6b (ENSRNOG00000006636) Pip4p2 (ENSRNOG00000006697) Necab1 (ENSRNOG00000007256) Necab1 (ENSRNOG00000066027) ##23 Tmem64 (ENSRNOG00000007426) Calb1 (ENSRNOG00000007456) Decr1 (ENSRNOG00000008236) Nbn (ENSRNOG00000008580) Osgin2 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ENSGT00390000012840 ENSGT00390000003680.b ENSGT00530000068397 ENSGT00950000183131.b.a ##23 ENSGT00390000007813 ENSGT00950000183108.b.a.b ENSGT00940000153801.b ENSGT00390000000521 ENSGT00390000006658.a.b ENSGT00940000156113 ENSGT00940000157532 ENSGT00390000001688 ENSGT00940000154824.a Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00530000063829.A ENSGT00940000156934 ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000159511 ENSGT00390000002833 ENSGT00390000008778 ENSGT00940000156966 ENSGT00940000157830 ENSGT00940000157655 ENSGT00940000156368.b ENSGT00390000010606 ENSGT00940000158322 ENSGT00390000010285.c ENSGT00390000017350 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT01100000263544.c.b ENSGT00940000164066 ENSGT00390000012840 ENSGT00390000003680.b ENSGT00530000068397 ENSGT00950000183131.b.a ##23 ENSGT00390000007813 ENSGT00950000183108.b.a.b ENSGT00940000153801.b ENSGT00390000000521.i ENSGT00390000006658.a.b ENSGT00940000156113 ENSGT00940000157532 ENSGT00390000001688 ENSGT00940000154824.a Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00530000063829.A ENSGT00940000156934 ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000159511 ENSGT00390000002833 ENSGT00390000008778 ENSGT00940000156966 ENSGT00940000157830 ENSGT00940000157655 ENSGT00940000156368.b ENSGT00390000010606 ENSGT00940000158322 ENSGT00390000010285.c ENSGT00390000017350 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT01100000263544.c.b ENSGT00940000164066 ENSGT00390000012840 ENSGT00390000003680.b ENSGT00950000183131.b.a ##23 ENSGT00390000007813 ENSGT00950000183108.b.a.b ENSGT00940000153801.b ENSGT00390000000521.i ENSGT00390000006658.a.b ENSGT00940000156113 ENSGT00940000157532 ENSGT00390000001688 ENSGT00940000154824.a ENSGT00940000154968 Guinea pig MODERN SPECIES NDUFAF6 (ENSCPOG00000010701) TP53INP1 (ENSCPOG00000037283) ENSCPOG00000013401 INTS8 (ENSCPOG00000013395) DPY19L4 (ENSCPOG00000013388) ESRP1 (ENSCPOG00000012197) VIRMA (ENSCPOG00000009333) RAD54B (ENSCPOG00000011643) FSBP (ENSCPOG00000009332) GEM (ENSCPOG00000009714) CDH17 (ENSCPOG00000006582) TMEM67 (ENSCPOG00000007816) RBM12B (ENSCPOG00000007815) CIBAR1 (ENSCPOG00000007802) TRIQK (ENSCPOG00000031688) RUNX1T1 (ENSCPOG00000026546) ##22 SLC26A7 (ENSCPOG00000002686) LRRC69 (ENSCPOG00000021324) OTUD6B (ENSCPOG00000013595) PIP4P2 (ENSCPOG00000034702) NECAB1 (ENSCPOG00000000501) ##23 TMEM64 (ENSCPOG00000034769) CALB1 (ENSCPOG00000000619) DECR1 (ENSCPOG00000036075) NBN (ENSCPOG00000013698) OSGIN2 (ENSCPOG00000013694) RIPK2 (ENSCPOG00000006415) MMP16 (ENSCPOG00000002700) CNGB3 (ENSCPOG00000012943) CPNE3 (ENSCPOG00000014415) ENSCPOG00000014411 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00530000063829.A ENSGT00940000156934 ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000159511 ENSGT00390000002833 ENSGT00390000008778 ENSGT00940000156966 ENSGT00940000157830 ENSGT00940000157655 ENSGT00940000156368.b ENSGT00390000010606 ENSGT00940000158322 ENSGT00390000010285.c ENSGT00390000017350 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT01100000263544.c.b ENSGT00940000164066 ENSGT00390000012840 ENSGT00390000003680.b ENSGT00950000183131.b.a ##23 ENSGT00390000007813 ENSGT00950000183108.b.a.b ENSGT00940000153801.b ENSGT00390000000521.i ENSGT00390000006658.a.b ENSGT00940000156113 ENSGT00940000157532 ENSGT00390000001688 ENSGT00940000154824.a ENSGT00940000154968 Degu MODERN SPECIES 175 ESRP1 (ENSODEG00000002165) ENSODEG00000002361 VIRMA (ENSODEG00000002449) ENSODEG00000018816 ENSODEG00000002650 ENSODEG00000018878 ENSODEG00000018916 GEM (ENSODEG00000004933) ENSODEG00000004970 CDH17 (ENSODEG00000004993) PDP1 (ENSODEG00000005061) TMEM67 (ENSODEG00000005116) RBM12B (ENSODEG00000019204) CIBAR1 (ENSODEG00000005214) TRIQK (ENSODEG00000005257) RUNX1T1 (ENSODEG00000005303) ##22 SLC26A7 (ENSODEG00000005374) LRRC69 (ENSODEG00000005436) ENSODEG00000005466 PIP4P2 (ENSODEG00000005487) NECAB1 (ENSODEG00000005532) ##23 TMEM64 (ENSODEG00000005595) ENSODEG00000005609 Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 124 CCNE2 (ENSCLAG00000006670) INTS8 (ENSCLAG00000006242) DPY19L4 (ENSCLAG00000008110) ENSCLAG00000007117 ESRP1 (ENSCLAG00000015531) VIRMA (ENSCLAG00000013204) FSBP (ENSCLAG00000013136) RAD54B (ENSCLAG00000010476) GEM (ENSCLAG00000010140) CDH17 (ENSCLAG00000014507) PDP1 (ENSCLAG00000013964) TMEM67 (ENSCLAG00000006451) RBM12B (ENSCLAG00000017617) CIBAR1 (ENSCLAG00000005013) TRIQK (ENSCLAG00000004830) RUNX1T1 (ENSCLAG00000006551) ##22 SLC26A7 (ENSCLAG00000004673) ENSCLAG00000004203 OTUD6B (ENSCLAG00000010851) PIP4P2 (ENSCLAG00000010164) NECAB1 (ENSCLAG00000010008) ##23 ENSCLAG00000011366 CALB1 (ENSCLAG00000009767) DECR1 (ENSCLAG00000009666) NBN (ENSCLAG00000008958) OSGIN2 (ENSCLAG00000007112) RIPK2 (ENSCLAG00000006724) MMP16 (ENSCLAG00000006099) CNBD1 (ENSCLAG00000007926) CNGB3 (ENSCLAG00000007201) CPNE3 (ENSCLAG00000006089) Naked mole-rat female DUPLICATION Naked mole-rat female MODERN SPECIES 13 ENSHGLG00000042399 ENSHGLG00000035172 VIRMA (ENSHGLG00000006573) ENSHGLG00000032542 ENSHGLG00000039726 FSBP (ENSHGLG00000044850) GEM (ENSHGLG00000006576) 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ENSHGLG00000013763 S100A4 (ENSHGLG00000016459) S100A3 (ENSHGLG00000033057) ENSHGLG00000009571 S100A14 (ENSHGLG00000008860) S100A1 (ENSHGLG00000044434) CHTOP (ENSHGLG00000010389) ENSHGLG00000042410 SNAPIN (ENSHGLG00000043471) ILF2 (ENSHGLG00000004134) NPR1 (ENSHGLG00000009046) ENSHGLG00000041750 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000156934 ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000159511 ENSGT00390000002833 ENSGT00390000008778 ENSGT00940000156966 ENSGT00940000157830 ENSGT00940000157655 ENSGT00940000156368.b ENSGT00390000010606 ENSGT00940000158322 ENSGT00390000010285.c ENSGT01030000234950 ENSGT00390000017350 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT01100000263544.c.b ENSGT00940000164066 ENSGT00390000012840 ENSGT00390000003680.b ENSGT00530000068397 ENSGT00950000183131.b.a ##23 ENSGT00390000007813 ENSGT00950000183108.b.a.b ENSGT00940000153801.b ENSGT00390000000521 ENSGT00390000006658.a.b ENSGT00940000156113 ENSGT00940000157532 ENSGT00390000001688 ENSGT00940000154824.a Marmotini ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00530000063829.A ENSGT00940000156934 ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000159511 ENSGT00390000002833 ENSGT00390000008778 ENSGT00940000156966 ENSGT00940000157830 ENSGT00940000157655 ENSGT00940000156368.b ENSGT00390000010606 ENSGT00940000158322 ENSGT00390000010285.c ENSGT00390000017350 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT01100000263544.c.b ENSGT00940000164066 ENSGT00390000012840 ENSGT00390000003680.b ENSGT00530000068397 ENSGT00950000183131.b.a ##23 ENSGT00390000007813 ENSGT00950000183108.b.a.b ENSGT00940000153801.b ENSGT00390000000521 ENSGT00390000006658.a.b ENSGT00940000156113 ENSGT00940000157532 ENSGT00390000001688 ENSGT00940000154824.a Alpin marmot MODERN SPECIES 16 CCNE2 (ENSMMMG00000008373) INTS8 (ENSMMMG00000007978) DPY19L4 (ENSMMMG00000007948) ESRP1 (ENSMMMG00000007808) ENSMMMG00000007791 VIRMA (ENSMMMG00000007702) FSBP (ENSMMMG00000007694) RAD54B (ENSMMMG00000007647) GEM (ENSMMMG00000007618) CDH17 (ENSMMMG00000007567) PDP1 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ENSGT00390000003680.b ENSGT00530000068397 ENSGT00950000183131.b.a ##23 ENSGT00390000007813 ENSGT00950000183108.b.a.b ENSGT00940000153801.b ENSGT00390000000521 ENSGT00390000006658.a.b ENSGT00940000156113 ENSGT00940000157532 ENSGT00390000001688 ENSGT00940000154824.a Squirrel MODERN SPECIES 144 TP53INP1 (ENSSTOG00000004462) CCNE2 (ENSSTOG00000004435) INTS8 (ENSSTOG00000004379) DPY19L4 (ENSSTOG00000014342) ESRP1 (ENSSTOG00000014330) VIRMA (ENSSTOG00000010804) FSBP (ENSSTOG00000010801) RAD54B (ENSSTOG00000010791) GEM (ENSSTOG00000010786) CDH17 (ENSSTOG00000002021) PDP1 (ENSSTOG00000028703) TMEM67 (ENSSTOG00000010296) RBM12B (ENSSTOG00000027445) CIBAR1 (ENSSTOG00000010284) TRIQK (ENSSTOG00000002731) RUNX1T1 (ENSSTOG00000002287) ##22 SLC26A7 (ENSSTOG00000000314) ENSSTOG00000024759 OTUD6B (ENSSTOG00000002954) PIP4P2 (ENSSTOG00000034343) C8orf88 (ENSSTOG00000023014) NECAB1 (ENSSTOG00000001216) ##23 TMEM64 (ENSSTOG00000001213) CALB1 (ENSSTOG00000009162) DECR1 (ENSSTOG00000009147) ENSSTOG00000024562 NBN (ENSSTOG00000015180) OSGIN2 (ENSSTOG00000015176) RIPK2 (ENSSTOG00000015168) MMP16 (ENSSTOG00000002129) CNGB3 (ENSSTOG00000004002) Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 1 TP53INP1 (ENSUPAG00010013560) CCNE2 (ENSUPAG00010013567) INTS8 (ENSUPAG00010013609) DPY19L4 (ENSUPAG00010013851) ESRP1 (ENSUPAG00010013887) VIRMA (ENSUPAG00010013956) RAD54B (ENSUPAG00010013994) FSBP (ENSUPAG00010014019) GEM (ENSUPAG00010014039) CDH17 (ENSUPAG00010014050) PDP1 (ENSUPAG00010014089) TMEM67 (ENSUPAG00010014102) RBM12B (ENSUPAG00010014125) CIBAR1 (ENSUPAG00010014134) ENSUPAG00010014163 RUNX1T1 (ENSUPAG00010014181) ##22 SLC26A7 (ENSUPAG00010015342) LRRC69 (ENSUPAG00010015366) OTUD6B (ENSUPAG00010015394) PIP4P2 (ENSUPAG00010015417) C8orf88 (ENSUPAG00010015437) NECAB1 (ENSUPAG00010015448) ##23 TMEM64 (ENSUPAG00010015486) CALB1 (ENSUPAG00010015495) DECR1 (ENSUPAG00010015525) NBN (ENSUPAG00010015538) OSGIN2 (ENSUPAG00010015561) RIPK2 (ENSUPAG00010015578) MMP16 (ENSUPAG00010015590) CNBD1 (ENSUPAG00010015603) CNGB3 (ENSUPAG00010015625) Eurasian red squirrel DUPLICATION Eurasian red squirrel MODERN SPECIES TP53INP1 (ENSSVLG00005001805) ENSSVLG00005001753 INTS8 (ENSSVLG00005001719) DPY19L4 (ENSSVLG00005001687) ESRP1 (ENSSVLG00005001584) VIRMA (ENSSVLG00005001519) RAD54B (ENSSVLG00005001462) GEM (ENSSVLG00005001435) CDH17 (ENSSVLG00005001288) PDP1 (ENSSVLG00005001123) TMEM67 (ENSSVLG00005001049) RBM12B (ENSSVLG00005001004) CIBAR1 (ENSSVLG00005000981) ENSSVLG00005000951 ENSSVLG00005000943 ENSSVLG00005000855 ##22 SLC26A7 (ENSSVLG00005000726) LRRC69 (ENSSVLG00005000650) ENSSVLG00005000592 PIP4P2 (ENSSVLG00005000545) C8orf88 (ENSSVLG00005000519) NECAB1 (ENSSVLG00005000494) ##23 TMEM64 (ENSSVLG00005000474) CALB1 (ENSSVLG00005000460) DECR1 (ENSSVLG00005000424) ENSSVLG00005000384 OSGIN2 (ENSSVLG00005000353) RIPK2 (ENSSVLG00005000327) MMP16 (ENSSVLG00005000299) CNBD1 (ENSSVLG00005000279) CNGB3 (ENSSVLG00005000250) Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 3 TP53BP2 (ENSSVLG00005015950) FBXO28 (ENSSVLG00005015889) ENSSVLG00005015831 ENSSVLG00005015789 DEGS1 (ENSSVLG00005015737) NVL (ENSSVLG00005014283) CNIH4 (ENSSVLG00005013000) WDR26 (ENSSVLG00005012677) CNIH3 (ENSSVLG00005012576) ENSSVLG00005012453 ENSSVLG00005012320 ENSSVLG00005012197 LBR (ENSSVLG00005012135) ENSSVLG00005011796 ENSSVLG00005011720 ENSSVLG00005011663 ##22 ENSSVLG00005011588 BOP1 (ENSSVLG00005011521) ENAH (ENSSVLG00005011282) SRP9 (ENSSVLG00005011178) EPHX1 (ENSSVLG00005011131) TMEM63A (ENSSVLG00005011067) ENSSVLG00005010994 PYCR2 (ENSSVLG00005010901) ENSSVLG00005010786 SDE2 (ENSSVLG00005010717) ENSSVLG00005010668 ACBD3 (ENSSVLG00005010595) MIXL1 (ENSSVLG00005010553) ENSSVLG00005010350 ENSSVLG00005010227 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00530000063829.A ENSGT00940000156934 ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000159511 ENSGT00390000002833 ENSGT00390000008778 ENSGT00940000156966 ENSGT00940000157830 ENSGT00940000157655 ENSGT00940000156368.b ENSGT00390000010606 ENSGT00940000158322 ENSGT00390000010285.c ENSGT00390000017350 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT01100000263544.c.b ENSGT00940000164066 ENSGT00390000012840 ENSGT00390000003680.b ENSGT00530000068397 ENSGT00950000183131.b.a ##23 ENSGT00390000007813 ENSGT00950000183108.b.a.b ENSGT00940000153801.b ENSGT00390000000521 ENSGT00390000006658.a.b ENSGT00940000156113 ENSGT00940000157532 ENSGT00390000001688 ENSGT00940000154824.a Xenarthra ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000156934 ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000159511 ENSGT00390000002833 ENSGT00940000156966 ENSGT00390000008778 ENSGT00940000157830 ENSGT00940000157655 ENSGT00940000156368.b ENSGT00390000010606 ENSGT00470000042499 ENSGT00940000158322 ENSGT00390000010285.c ENSGT00390000017350 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT01100000263544.c.b ENSGT00940000164066 ENSGT00390000012840 ENSGT00390000003680.b ENSGT00530000068397 ENSGT00950000183131.b.a ##23 ENSGT00390000007813 ENSGT00950000183108.b.a.b ENSGT00940000153801.b ENSGT00390000000521 ENSGT00390000006658.a.b ENSGT00940000156113 ENSGT00940000157532 ENSGT00940000154968 ENSGT00950000182992.a.b.b Armadillo MODERN SPECIES 3295 DPY19L4 (ENSDNOG00000018518) ESRP1 (ENSDNOG00000015648) VIRMA (ENSDNOG00000000495) RAD54B (ENSDNOG00000015535) FSBP (ENSDNOG00000037552) ENSDNOG00000034384 GEM (ENSDNOG00000025046) CDH17 (ENSDNOG00000030738) PDP1 (ENSDNOG00000047624) TMEM67 (ENSDNOG00000013892) ENSDNOG00000046867 ENSDNOG00000041087 RBM12B (ENSDNOG00000041608) CIBAR1 (ENSDNOG00000013822) TRIQK (ENSDNOG00000019786) RUNX1T1 (ENSDNOG00000030709) ##22 ENSDNOG00000047390 SLC26A7 (ENSDNOG00000015538) LRRC69 (ENSDNOG00000024272) ENSDNOG00000032119 PIP4P2 (ENSDNOG00000019478) C8orf88 (ENSDNOG00000042167) NECAB1 (ENSDNOG00000016197) ##23 ENSDNOG00000018952 TMEM64 (ENSDNOG00000004256) ENSDNOG00000039191 CALB1 (ENSDNOG00000044661) DECR1 (ENSDNOG00000043391) NBN (ENSDNOG00000010843) OSGIN2 (ENSDNOG00000039511) RIPK2 (ENSDNOG00000038605) Sloth MODERN SPECIES 7938 RUNX1T1 (ENSCHOG00000000273) ##22 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00530000063829.A ENSGT00940000156934 ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000159511 ENSGT00390000002833 ENSGT00390000008778 ENSGT00940000156966 ENSGT00940000157830 ENSGT00940000157655 ENSGT00940000156368.b ENSGT00390000010606 ENSGT00940000158322 ENSGT00390000010285.c ENSGT00390000017350 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT01100000263544.c.b ENSGT00390000012840 ENSGT00390000003680.b ENSGT00950000183131.b.a ##23 ENSGT00390000007813 ENSGT00950000183108.b.a.b ENSGT00940000153801.b ENSGT00390000000521 ENSGT00390000006658.a.b ENSGT00940000156113 ENSGT00940000157532 ENSGT00390000001688 ENSGT00940000154824.a ENSGT00940000154968 ENSGT00950000182992.a.b.b Tenrec MODERN SPECIES 8078 RUNX1T1 (ENSETEG00000014837) ##22 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00530000063829.A ENSGT00940000156934 ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000159511 ENSGT00390000002833 ENSGT00390000008778 ENSGT00940000156966 ENSGT00940000157830 ENSGT00940000157655 ENSGT00940000156368.b ENSGT00390000010606 ENSGT00940000158322 ENSGT00390000010285.c ENSGT00390000017350 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT01100000263544.c.b ENSGT00390000012840 ENSGT00390000003680.b ENSGT00950000183131.b.a ##23 ENSGT00390000007813 ENSGT00950000183108.b.a.b ENSGT00940000153801.b ENSGT00390000000521 ENSGT00390000006658.a.b ENSGT00940000156113 ENSGT00940000157532 ENSGT00390000001688 ENSGT00940000154824.a ENSGT00940000154968 ENSGT00950000182992.a.b.b Elephant MODERN SPECIES 567 TP53INP1 (ENSLAFG00000001509) CCNE2 (ENSLAFG00000001507) INTS8 (ENSLAFG00000001503) DPY19L4 (ENSLAFG00000001500) ESRP1 (ENSLAFG00000001498) VIRMA (ENSLAFG00000015325) FSBP (ENSLAFG00000015324) RAD54B (ENSLAFG00000015315) GEM (ENSLAFG00000003096) CDH17 (ENSLAFG00000007754) PDP1 (ENSLAFG00000010019) TMEM67 (ENSLAFG00000003950) RBM12B (ENSLAFG00000029949) CIBAR1 (ENSLAFG00000003954) TRIQK (ENSLAFG00000017857) RUNX1T1 (ENSLAFG00000005779) ##22 SLC26A7 (ENSLAFG00000016880) ENSLAFG00000020788 OTUD6B (ENSLAFG00000011002) PIP4P2 (ENSLAFG00000010999) NECAB1 (ENSLAFG00000002467) ##23 TMEM64 (ENSLAFG00000032281) CALB1 (ENSLAFG00000007269) DECR1 (ENSLAFG00000007265) ENSLAFG00000017473 OSGIN2 (ENSLAFG00000001821) RIPK2 (ENSLAFG00000004949) MMP16 (ENSLAFG00000009808) ENSLAFG00000005635 CNGB3 (ENSLAFG00000003362) CPNE3 (ENSLAFG00000012140) Hyrax MODERN SPECIES 7480 RUNX1T1 (ENSPCAG00000009770) ##22 Platypus MODERN SPECIES 15 ENSOANG00000043957 CCNE2 (ENSOANG00000043394) INTS8 (ENSOANG00000002217) ENSOANG00000002218 DPY19L4 (ENSOANG00000002219) ESRP1 (ENSOANG00000004746) VIRMA (ENSOANG00000011351) RAD54B (ENSOANG00000011348) GEM (ENSOANG00000046330) CDH17 (ENSOANG00000006257) PDP1 (ENSOANG00000007880) TMEM67 (ENSOANG00000049606) ENSOANG00000015735 CIBAR1 (ENSOANG00000050166) ENSOANG00000045975 RUNX1T1 (ENSOANG00000001913) ##22 SLC26A7 (ENSOANG00000041035) ENSOANG00000029483 OTUD6B (ENSOANG00000048050) PIP4P2 (ENSOANG00000049096) C8orf88 (ENSOANG00000050923) NECAB1 (ENSOANG00000042291) ##23 TMEM64 (ENSOANG00000049337) CALB1 (ENSOANG00000011998) DECR1 (ENSOANG00000011997) NBN (ENSOANG00000001316) OSGIN2 (ENSOANG00000004602) RIPK2 (ENSOANG00000048765) MMP16 (ENSOANG00000002138) ENSOANG00000049646 CNGB3 (ENSOANG00000011593) Anura ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000158322.g.a ENSGT00940000158322.h ENSGT00390000010285.c ENSGT01030000234950 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT01100000263544.c.b ENSGT00940000164066 ENSGT00390000012840 ENSGT00390000003680.b ENSGT00950000183131.b.a ##23 ENSGT00390000007813 ENSGT00950000183108.b.a.b ENSGT00940000153801.b ENSGT00390000000521 ENSGT00390000006658.a.b ENSGT00940000153331.b ENSGT00940000164654 ENSGT00940000156113 ENSGT01050000244818 ENSGT00940000157532 Frog MODERN SPECIES 6 esrp1 (ENSXETG00000014667) cibar1 (ENSXETG00000014666) virma (ENSXETG00000014668) ENSXETG00000015384 FSBP (ENSXETG00000048890) rad54b (ENSXETG00000025924) gem (ENSXETG00000014678) cdh17 (ENSXETG00000014682) ENSXETG00000039850 pdp1 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(ENSLLEG00000014666) ##22 ENSLLEG00000014992 SLC26A7 (ENSLLEG00000015030) LRRC69 (ENSLLEG00000015212) ENSLLEG00000015602 ENSLLEG00000015746 PIP4P2 (ENSLLEG00000015788) ENSLLEG00000015947 NECAB1 (ENSLLEG00000016057) ##23 ENSLLEG00000016264 ENSLLEG00000016311 ENSLLEG00000016335 TMEM64 (ENSLLEG00000016349) CALB1 (ENSLLEG00000016422) DECR1 (ENSLLEG00000016572) ENSLLEG00000016849 Coelacanth MODERN SPECIES 1147 RUNX1T1 (ENSLACG00000006839) ##22 Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000159511 ENSGT00390000002833 ENSGT00530000063647.A.b.a ENSGT00390000008778 ENSGT00940000156966 ENSGT00940000157830.d ENSGT00940000157655 ENSGT00940000156368.b ENSGT00390000010606 ENSGT00940000158322.j ENSGT00940000158322.i ENSGT00390000010285.c ENSGT00390000017350 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT00940000164463 ENSGT00390000012840 ENSGT00390000003680.b ENSGT00950000183131.b.a ##23 ENSGT00390000007813 ENSGT00940000157781 ENSGT00950000182991.A.a.c.a.b ENSGT00950000183108.b.a.b ENSGT00940000153801.b ENSGT00390000000521 ENSGT00390000006658.a.b ENSGT00390000014274 ENSGT00390000015769.A ENSGT00940000155589 ENSGT00400000022250 Reedfish MODERN SPECIES 4 ENSECRG00000021313 ENSECRG00000021217 has2 (ENSECRG00000021206) cibar1 (ENSECRG00000021173) cibar1 (ENSECRG00000021124) triqk (ENSECRG00000021093) runx1t1 (ENSECRG00000021028) ##22 ENSECRG00000020979 otud6b (ENSECRG00000020952) pip4p2 (ENSECRG00000020936) necab1 (ENSECRG00000020899) ##23 tmem64 (ENSECRG00000020865) upp1 (ENSECRG00000020840) pnp4b (ENSECRG00000020825) CALB1 (ENSECRG00000020809) decr1 (ENSECRG00000020768) ENSECRG00000020752 ENSECRG00000020736 FSBP (ENSECRG00000020721) RAD54B (ENSECRG00000020690) gem (ENSECRG00000020673) cdh17 (ENSECRG00000020580) Neopterygii ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000164859 ENSGT00390000011137 ENSGT00940000159511 ENSGT00390000002833 ENSGT00530000063647.A.b.a ENSGT00390000008778 ENSGT00940000156966 ENSGT00940000157830.d ENSGT00940000157655 ENSGT00940000156368.b ENSGT00390000010606 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ENSGT01050000244814.a.a.b.b.b.a.a.d.b ENSGT00940000160023 ENSGT00510000047559 ENSGT00940000159209 ENSGT00940000155689 ENSGT00940000170761 ENSGT00950000183094.b.b Cod MODERN SPECIES 14 ENSGMOG00000015594 ENSGMOG00000024288 azin1b (ENSGMOG00000015534) ENSGMOG00000015516 ENSGMOG00000023527 spire1a (ENSGMOG00000015465) klhl38a (ENSGMOG00000015458) ENSGMOG00000022404 fam91a1 (ENSGMOG00000004452) lratd2a (ENSGMOG00000004433) ENSGMOG00000036896 ENSGMOG00000029694 cibar1 (ENSGMOG00000004412) ENSGMOG00000035498 triqk (ENSGMOG00000031842) runx1t1 (ENSGMOG00000002931) ##22 ENSGMOG00000002904 otud6b (ENSGMOG00000002883) ENSGMOG00000002868 ENSGMOG00000002823 ENSGMOG00000022164 ENSGMOG00000003577 ENSGMOG00000003554 ENSGMOG00000003542 ENSGMOG00000003522 ENSGMOG00000032098 ENSGMOG00000032392 RAPGEF5 (ENSGMOG00000006739) ENSGMOG00000028765 ENSGMOG00000032131 TOMM7 (ENSGMOG00000031331) Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000170872 ENSGT00940000165758 ENSGT00510000047245 ENSGT00500000044921.a 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ENSGT01030000234787 ENSGT00390000003058.b.a.a.a.a ENSGT00940000157647.c ENSGT00390000009543 ENSGT00940000159198.g ENSGT00950000182986.a.b.b ENSGT00390000010285.c ENSGT00390000017350 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT00390000012840 ENSGT00940000154337.a.b ENSGT00940000154995 ENSGT00940000154107.b ENSGT00940000160242.b ENSGT00940000158230.b.b ENSGT00940000155620.q ENSGT01050000244814.a.a.b.b.b.a.a.d.b ENSGT00940000160023 ENSGT00510000047559 ENSGT00940000159209 ENSGT00940000155689 ENSGT00940000170761 ENSGT00950000183094.b.b ENSGT00940000157125 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000164175.b.b ENSGT00940000165758 ENSGT00510000047245 ENSGT00500000044921.a ENSGT00530000063631.a.k ENSGT00950000182995.e.b.`b ENSGT00390000004263.a.d.b ENSGT01030000234787 ENSGT00390000003058.b.a.a.a.a ENSGT00940000157647.c ENSGT00390000009543 ENSGT00940000159198.g ENSGT00950000182986.a.b.b ENSGT00390000010285.c ENSGT00390000017350 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT00390000012840 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ENSGT01030000234787 ENSGT00390000003058.b.a.a.a.a ENSGT00940000157647.c ENSGT00390000009543 ENSGT00940000159198.g ENSGT00950000182986.a.b.b ENSGT00390000010285.c ENSGT00390000017350 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT00390000012840 ENSGT00940000154337.a.b ENSGT00940000154995 ENSGT00940000154107.b ENSGT00940000160242.b ENSGT00940000158230.b.b ENSGT00940000155620.q ENSGT01050000244814.a.a.b.b.b.a.a.d.b ENSGT00940000160023 ENSGT00510000047559 ENSGT00940000159209 ENSGT00940000155689 ENSGT00940000170761 ENSGT00950000183094.b.b ENSGT00940000157125 P. nyererei MODERN SPECIES 323 ENSPNYG00000010959 ENSPNYG00000010950 snrpd1 (ENSPNYG00000010941) ggcta (ENSPNYG00000010921) adnp2b (ENSPNYG00000010918) azin1b (ENSPNYG00000010912) ATP6V1C1 (ENSPNYG00000010871) ENSPNYG00000010856 spire1a (ENSPNYG00000010820) klhl38a (ENSPNYG00000010808) fam91a1 (ENSPNYG00000010766) lratd2a (ENSPNYG00000010751) TRIB1 (ENSPNYG00000010744) cibar1 (ENSPNYG00000010722) triqk (ENSPNYG00000010706) runx1t1 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ENSGT01050000244814.a.a.b.b.b.a.a.d.b ENSGT00940000160023 ENSGT00510000047559 ENSGT00940000159209 ENSGT00940000155689 ENSGT00940000170761 ENSGT00950000183094.b.b ENSGT00940000157125 Eastern happy MODERN SPECIES 13 ENSACLG00000017138 ankib1a (ENSACLG00000017157) snrpd1 (ENSACLG00000017406) ggcta (ENSACLG00000017417) adnp2b (ENSACLG00000017453) azin1b (ENSACLG00000017457) ATP6V1C1 (ENSACLG00000017479) ENSACLG00000017527 spire1a (ENSACLG00000017550) klhl38a (ENSACLG00000017725) fam91a1 (ENSACLG00000017738) lratd2a (ENSACLG00000017847) TRIB1 (ENSACLG00000017865) cibar1 (ENSACLG00000017875) triqk (ENSACLG00000017940) runx1t1 (ENSACLG00000017970) ##22 ENSACLG00000018022 otud6b (ENSACLG00000018028) RAB5A (ENSACLG00000018066) kat2b (ENSACLG00000018091) ENSACLG00000018207 ZNF385D (ENSACLG00000018233) rab25a (ENSACLG00000018262) UBQLN4 (ENSACLG00000018287) lim2.4 (ENSACLG00000018324) TINAGL1 (ENSACLG00000018345) cfap300 (ENSACLG00000018413) KCNQ4 (ENSACLG00000018427) nfyc (ENSACLG00000018486) 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ENSTNIG00000000830 osbpl3a (ENSTNIG00000009202) ENSTNIG00000000262 ENSTNIG00000009203 jazf1a (ENSTNIG00000009204) tax1bp1a (ENSTNIG00000009205) hibadha (ENSTNIG00000009206) Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000170872 ENSGT00940000165758 ENSGT00510000047245 ENSGT00500000044921.a ENSGT00530000063631.a.k ENSGT00950000182995.e.b.`b ENSGT00390000004263.a.d.b ENSGT01030000234787 ENSGT00390000003058.b.a.a.a.a ENSGT00940000157647.c ENSGT00390000009543 ENSGT00940000159198.g ENSGT00950000182986.a.b.b ENSGT00390000010285.c ENSGT00390000017350 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT00940000164463 ENSGT00390000012840 ENSGT00940000154337.a.b ENSGT00940000154995 ENSGT00940000154107.b ENSGT00940000160242.b ENSGT00940000158230.b.b ENSGT00940000155620.q ENSGT01050000244814.a.a.b.b.b.a.a.d.b ENSGT00940000160023 ENSGT00510000047559 ENSGT00940000159209 ENSGT00940000155689 ENSGT00940000170761 ENSGT00950000183094.b.b Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000170872 ENSGT00940000165758 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(ENSSAUG00010005959) ENSSAUG00010005974 spire1a (ENSSAUG00010005981) klhl38a (ENSSAUG00010006457) fam91a1 (ENSSAUG00010006512) lratd2a (ENSSAUG00010008954) TRIB1 (ENSSAUG00010008959) cibar1 (ENSSAUG00010008960) ENSSAUG00010008961 runx1t1 (ENSSAUG00010008971) ##22 ENSSAUG00010009037 otud6b (ENSSAUG00010009048) RAB5A (ENSSAUG00010009052) kat2b (ENSSAUG00010009062) ENSSAUG00010009067 ZNF385D (ENSSAUG00010009072) rab25a (ENSSAUG00010009077) UBQLN4 (ENSSAUG00010009085) LIM2 (ENSSAUG00010009090) tinagl1 (ENSSAUG00010009103) cfap300 (ENSSAUG00010009123) KCNQ4 (ENSSAUG00010009139) nfyc (ENSSAUG00010009601) ENSSAUG00010009647 RPRD1A (ENSSAUG00010000139) Perciformes ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000164175.b ENSGT00940000165758 ENSGT00510000047245 ENSGT00500000044921.a ENSGT00530000063631.a.k ENSGT00950000182995.e.b.`b ENSGT00390000004263.a.d.b ENSGT01030000234787 ENSGT00390000003058.b.a.a.a.a ENSGT00940000157647.c ENSGT00390000009543 ENSGT00940000159198.g ENSGT00950000182986.a.b.b ENSGT00390000010285.c ENSGT00390000017350 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT00940000161019 ENSGT00390000012840 ENSGT00940000154337.a.b ENSGT00940000154995 ENSGT00940000154107.b ENSGT00940000160242.b ENSGT00940000158230.b.b ENSGT00940000155620.q ENSGT01050000244814.a.a.b.b.b.a.a.d.b ENSGT00940000160023 ENSGT00510000047559 ENSGT00940000159209 ENSGT00940000155689 ENSGT00940000170761 ENSGT00950000183094.b.b Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000164175.b ENSGT00940000165758 ENSGT00510000047245 ENSGT00500000044921.a ENSGT00530000063631.a.k ENSGT00950000182995.e.b.`b ENSGT00390000004263.a.d.b ENSGT01030000234787 ENSGT00390000003058.b.a.a.a.a ENSGT00940000157647.c ENSGT00390000009543 ENSGT00940000159198.g ENSGT00950000182986.a.b.b ENSGT00390000010285.c ENSGT01030000234950 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT00940000161019 ENSGT00390000012840 ENSGT00940000154337.a.b ENSGT00940000154995 ENSGT00940000154107.b ENSGT00940000160242.b ENSGT00940000158230.b.b ENSGT00940000155620.q ENSGT01050000244814.a.a.b.b.b.a.a.d.b ENSGT00940000160023 ENSGT00510000047559 ENSGT00940000159209 ENSGT00940000155689 ENSGT00940000170761 ENSGT00950000183094.b.b Channel bull blenny MODERN SPECIES 2 ENSCGOG00000004071 ankib1a (ENSCGOG00000023945) snrpd1 (ENSCGOG00000023934) ggcta (ENSCGOG00000023933) adnp2b (ENSCGOG00000023932) azin1b (ENSCGOG00000023931) ATP6V1C1 (ENSCGOG00000023860) ENSCGOG00000023849 spire1a (ENSCGOG00000023833) klhl38a (ENSCGOG00000023822) fam91a1 (ENSCGOG00000023633) lratd2a (ENSCGOG00000023615) TRIB1 (ENSCGOG00000023614) cibar1 (ENSCGOG00000023610) ENSCGOG00000023604 runx1t1 (ENSCGOG00000023558) ##22 ENSCGOG00000023553 otud6b (ENSCGOG00000023552) RAB5A (ENSCGOG00000023540) kat2b (ENSCGOG00000023382) ENSCGOG00000023369 ZNF385D (ENSCGOG00000023368) rab25a (ENSCGOG00000023367) UBQLN4 (ENSCGOG00000023348) LIM2 (ENSCGOG00000023346) TINAGL1 (ENSCGOG00000023343) cfap300 (ENSCGOG00000023333) KCNQ4 (ENSCGOG00000023303) nfyc (ENSCGOG00000023296) ENSCGOG00000023288 RPRD1A (ENSCGOG00000023284) Pike perch MODERN SPECIES 41 cibar1 (ENSSLUG00000010406) ENSSLUG00000010405 ENSSLUG00000010402 runx1t1 (ENSSLUG00000010101) ##22 ENSSLUG00000010079 otud6b (ENSSLUG00000010073) RAB5A (ENSSLUG00000010063) kat2b (ENSSLUG00000009183) ENSSLUG00000009098 ZNF385D (ENSSLUG00000009085) rab25a (ENSSLUG00000009075) UBQLN4 (ENSSLUG00000009055) lim2.4 (ENSSLUG00000009042) TINAGL1 (ENSSLUG00000007965) cfap300 (ENSSLUG00000007927) KCNQ4 (ENSSLUG00000007900) nfyc (ENSSLUG00000007788) ENSSLUG00000007770 RPRD1A (ENSSLUG00000007758) Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000164175.b ENSGT00940000165758 ENSGT00510000047245 ENSGT00500000044921.a ENSGT00530000063631.a.k ENSGT00950000182995.e.b.`b ENSGT00390000004263.a.d.b ENSGT01030000234787 ENSGT00390000003058.b.a.a.a.a ENSGT00940000157647.c ENSGT00390000009543 ENSGT00940000159198.g ENSGT00950000182986.a.b.b ENSGT00390000010285.c ENSGT00390000017350 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT00940000161019 ENSGT00390000012840 ENSGT00940000154337.a.b ENSGT00940000154995 ENSGT00940000154107.b ENSGT00940000160242.b ENSGT00940000158230.b.b ENSGT00940000155620.q ENSGT01050000244814.a.a.b.b.b.a.a.d.b ENSGT00940000160023 ENSGT00510000047559 ENSGT00940000159209 ENSGT00940000155689 ENSGT00940000170761 ENSGT00950000183094.b.b Lumpfish MODERN SPECIES 2 ENSCLMG00005001410 ankib1a (ENSCLMG00005001446) snrpd1 (ENSCLMG00005001478) ggcta (ENSCLMG00005001500) adnp2b (ENSCLMG00005001518) azin1b (ENSCLMG00005001531) ATP6V1C1 (ENSCLMG00005001565) ENSCLMG00005001685 spire1a (ENSCLMG00005001728) klhl38a (ENSCLMG00005001760) fam91a1 (ENSCLMG00005001778) lratd2a (ENSCLMG00005001802) TRIB1 (ENSCLMG00005001804) cibar1 (ENSCLMG00005001806) triqk (ENSCLMG00005001808) runx1t1 (ENSCLMG00005001825) ##22 ENSCLMG00005002564 otud6b (ENSCLMG00005002565) RAB5A (ENSCLMG00005002566) kat2b (ENSCLMG00005002571) ENSCLMG00005002593 ZNF385D (ENSCLMG00005002596) rab25a (ENSCLMG00005002601) UBQLN4 (ENSCLMG00005002604) LIM2 (ENSCLMG00005002607) ENSCLMG00005002608 TINAGL1 (ENSCLMG00005002619) cfap300 (ENSCLMG00005003216) imp4 (ENSCLMG00005003227) KCNQ4 (ENSCLMG00005003246) nfyc (ENSCLMG00005003265) Stickleback MODERN SPECIES 9 mapk15 (ENSGACG00000005266) grinaa (ENSGACG00000005238) ENSGACG00000005237 ENSGACG00000005235 ankib1a (ENSGACG00000005220) snrpd1 (ENSGACG00000005201) ggcta (ENSGACG00000005197) adnp2b (ENSGACG00000005193) azin1b (ENSGACG00000005185) ATP6V1C1 (ENSGACG00000005164) spire1a (ENSGACG00000005147) klhl38a (ENSGACG00000005128) fam91a1 (ENSGACG00000005113) TRIB1 (ENSGACG00000005101) cibar1 (ENSGACG00000005082) runx1t1 (ENSGACG00000005059) ##22 ENSGACG00000005052 otud6b (ENSGACG00000005002) RAB5A (ENSGACG00000004997) kat2b (ENSGACG00000004986) ENSGACG00000004980 ZNF385D (ENSGACG00000004976) rab25a (ENSGACG00000004965) UBQLN4 (ENSGACG00000004959) LIM2 (ENSGACG00000004952) TINAGL1 (ENSGACG00000004892) cfap300 (ENSGACG00000004879) KCNQ4 (ENSGACG00000004872) nfyc (ENSGACG00000004846) ENSGACG00000004837 RPRD1A (ENSGACG00000004817) Ballan wrasse MODERN SPECIES 539 runx1t1 (ENSLBEG00000002616) ##22 ENSLBEG00000002570 ENSLBEG00000002543 RAB5A (ENSLBEG00000002516) kat2b (ENSLBEG00000002439) ENSLBEG00000002405 ZNF385D (ENSLBEG00000002390) rab25a (ENSLBEG00000002367) UBQLN4 (ENSLBEG00000002320) LIM2 (ENSLBEG00000002300) TINAGL1 (ENSLBEG00000002245) cfap300 (ENSLBEG00000002224) KCNQ4 (ENSLBEG00000002107) nfyc (ENSLBEG00000001936) Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000164175.b ENSGT00940000165758 ENSGT00510000047245 ENSGT00500000044921.a ENSGT00530000063631.a.k ENSGT00950000182995.e.b.`b ENSGT00390000004263.a.d.b ENSGT01030000234787 ENSGT00390000003058.b.a.a.a.a ENSGT00940000157647.c ENSGT00390000009543 ENSGT00940000159198.g ENSGT00950000182986.a.b.b ENSGT00390000010285.c ENSGT00390000017350 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT00940000164463 ENSGT00390000012840 ENSGT00940000154337.a.b ENSGT00940000154995 ENSGT00940000154107.b ENSGT00940000160242.b ENSGT00940000158230.b.b ENSGT00940000155620.q ENSGT01050000244814.a.a.b.b.b.a.a.d.b ENSGT00940000160023 ENSGT00510000047559 ENSGT00940000159209 ENSGT00940000155689 ENSGT00940000170761 ENSGT00950000183094.b.b Carangaria ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000164175.b ENSGT00940000165758 ENSGT00510000047245 ENSGT00500000044921.a ENSGT00530000063631.a.k ENSGT00950000182995.e.b.`b ENSGT00390000004263.a.d.b ENSGT01030000234787 ENSGT00390000003058.b.a.a.a.a ENSGT00940000157647.c ENSGT00390000009543 ENSGT00940000159198.g ENSGT00950000182986.a.b.b ENSGT00390000010285.c ENSGT00390000017350 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT00940000164463 ENSGT00390000012840 ENSGT00940000154337.a.b ENSGT00940000154995 ENSGT00940000154107.b ENSGT00940000160242.b ENSGT00940000158230.b.b ENSGT00940000155620.q ENSGT01050000244814.a.a.b.b.b.a.a.d.b ENSGT00940000160023 ENSGT00510000047559 ENSGT00940000159209 ENSGT00940000155689 ENSGT00940000170761 ENSGT00950000183094.b.b Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000164175.b ENSGT00940000165758 ENSGT00510000047245 ENSGT00500000044921.a ENSGT00530000063631.a.k ENSGT00950000182995.e.b.`b ENSGT00390000004263.a.d.b ENSGT01030000234787 ENSGT00390000003058.b.a.a.a.a ENSGT00940000157647.c ENSGT00390000009543 ENSGT00940000159198.g ENSGT00950000182986.a.b.b ENSGT00390000010285.c ENSGT01030000234950 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT00940000164463 ENSGT00390000012840 ENSGT00940000154337.a.b ENSGT00940000154995 ENSGT00940000154107.b ENSGT00940000160242.b ENSGT00940000158230.b.b ENSGT00940000155620.q ENSGT01050000244814.a.a.b.b.b.a.a.d.b ENSGT00940000160023 ENSGT00510000047559 ENSGT00940000159209 ENSGT00940000155689 ENSGT00940000170761 ENSGT00950000183094.b.b Seriola ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000164175.b ENSGT00940000165758 ENSGT00510000047245 ENSGT00500000044921.a ENSGT00530000063631.a.k ENSGT00950000182995.e.b.`b ENSGT00390000004263.a.d.b ENSGT01030000234787 ENSGT00390000003058.b.a.a.a.a ENSGT00940000157647.c ENSGT00390000009543 ENSGT00940000159198.g ENSGT00950000182986.a.b.b ENSGT00390000010285.c ENSGT01030000234950 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT00940000181982 ENSGT00390000012840 ENSGT00940000154337.a.b ENSGT00940000154995 ENSGT00940000154107.b ENSGT00940000160242.b ENSGT00940000158230.b.b ENSGT00940000155620.q ENSGT01050000244814.a.a.b.b.b.a.a.d.b ENSGT00940000160023 ENSGT00510000047559 ENSGT00940000159209 ENSGT00940000155689 ENSGT00940000170761 ENSGT00950000183094.b.b Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 2890 ENSSLDG00000012445 ankib1a (ENSSLDG00000011965) snrpd1 (ENSSLDG00000011858) ggcta (ENSSLDG00000011833) adnp2b (ENSSLDG00000011825) azin1b (ENSSLDG00000011808) ATP6V1C1 (ENSSLDG00000011761) ENSSLDG00000011748 spire1a (ENSSLDG00000011546) klhl38a (ENSSLDG00000011472) fam91a1 (ENSSLDG00000011415) lratd2a (ENSSLDG00000011397) TRIB1 (ENSSLDG00000011384) cibar1 (ENSSLDG00000011251) ENSSLDG00000011209 runx1t1 (ENSSLDG00000011172) ##22 ENSSLDG00000011146 otud6b (ENSSLDG00000011101) RAB5A (ENSSLDG00000011069) kat2b (ENSSLDG00000010977) ENSSLDG00000010937 ZNF385D (ENSSLDG00000010909) rab25a (ENSSLDG00000010880) UBQLN4 (ENSSLDG00000010839) lim2.4 (ENSSLDG00000010807) TINAGL1 (ENSSLDG00000010762) cfap300 (ENSSLDG00000010739) KCNQ4 (ENSSLDG00000010705) nfyc (ENSSLDG00000010606) ENSSLDG00000010572 RPRD1A (ENSSLDG00000010537) Greater amberjack MODERN SPECIES 48 ENSSDUG00000010631 ankib1a (ENSSDUG00000010560) snrpd1 (ENSSDUG00000010521) ggcta (ENSSDUG00000010492) adnp2b (ENSSDUG00000010479) azin1b (ENSSDUG00000010460) ATP6V1C1 (ENSSDUG00000010405) ENSSDUG00000010387 spire1a (ENSSDUG00000010221) klhl38a (ENSSDUG00000010166) fam91a1 (ENSSDUG00000010053) lratd2a (ENSSDUG00000010026) TRIB1 (ENSSDUG00000010011) cibar1 (ENSSDUG00000009987) ENSSDUG00000009978 runx1t1 (ENSSDUG00000009928) ##22 ENSSDUG00000009886 otud6b (ENSSDUG00000009860) RAB5A (ENSSDUG00000009835) kat2b (ENSSDUG00000009787) ENSSDUG00000009765 ZNF385D (ENSSDUG00000009750) rab25a (ENSSDUG00000009735) UBQLN4 (ENSSDUG00000009691) lim2.4 (ENSSDUG00000009670) TINAGL1 (ENSSDUG00000009649) cfap300 (ENSSDUG00000009628) ENSSDUG00000009618 KCNQ4 (ENSSDUG00000009542) nfyc (ENSSDUG00000009492) ENSSDUG00000009470 Barramundi perch MODERN SPECIES 427 klhl38a (ENSLCAG00010006349) fam91a1 (ENSLCAG00010006280) lratd2a (ENSLCAG00010006232) ENSLCAG00010006226 cibar1 (ENSLCAG00010006220) ENSLCAG00010006218 runx1t1 (ENSLCAG00010006125) ##22 ENSLCAG00010006096 ENSLCAG00010006092 ENSLCAG00010006037 Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000164175.b ENSGT00940000165758 ENSGT00510000047245 ENSGT00500000044921.a ENSGT00530000063631.a.k ENSGT00950000182995.e.b.`b ENSGT00390000004263.a.d.b ENSGT01030000234787 ENSGT00390000003058.b.a.a.a.a ENSGT00940000157647.c ENSGT00390000009543 ENSGT00940000159198.g ENSGT00950000182986.a.b.b ENSGT00390000010285.c ENSGT00390000017350 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT00390000012840 ENSGT00940000154337.a.b ENSGT00940000154995 ENSGT00940000154107.b ENSGT00940000160242.b ENSGT00940000158230.b.b ENSGT00940000155620.q ENSGT01050000244814.a.a.b.b.b.a.a.d.b ENSGT00940000160023 ENSGT00510000047559 ENSGT00940000159209 ENSGT00940000155689 ENSGT00940000170761 ENSGT00950000183094.b.b ENSGT00940000157125 Turbot MODERN SPECIES 14 ENSSMAG00000034677 ENSSMAG00000008675 ENSSMAG00000008765 ENSSMAG00000008769 ENSSMAG00000008777 azin1b (ENSSMAG00000008784) ENSSMAG00000008804 ENSSMAG00000008838 spire1a (ENSSMAG00000008849) klhl38a (ENSSMAG00000008942) fam91a1 (ENSSMAG00000008966) lratd2a (ENSSMAG00000009009) ENSSMAG00000021701 cibar1 (ENSSMAG00000009032) ENSSMAG00000028041 runx1t1 (ENSSMAG00000009153) ##22 otud6b (ENSSMAG00000009196) RAB5A (ENSSMAG00000009229) ENSSMAG00000009616 ENSSMAG00000009694 ZNF385D (ENSSMAG00000009709) ENSSMAG00000035677 ENSSMAG00000009738 ENSSMAG00000009791 ENSSMAG00000009811 ENSSMAG00000009852 ENSSMAG00000009872 ENSSMAG00000009905 ENSSMAG00000009961 ENSSMAG00000010001 ubp1 (ENSSMAG00000010036) Tongue sole MODERN SPECIES 9 fam83hb (ENSCSEG00000018065) ankib1a (ENSCSEG00000018085) snrpd1 (ENSCSEG00000018141) ggcta (ENSCSEG00000018149) adnp2b (ENSCSEG00000018160) azin1b (ENSCSEG00000018171) ATP6V1C1 (ENSCSEG00000018200) ENSCSEG00000018243 spire1a (ENSCSEG00000018257) klhl38a (ENSCSEG00000018272) fam91a1 (ENSCSEG00000018287) lratd2a (ENSCSEG00000018347) TRIB1 (ENSCSEG00000018355) cibar1 (ENSCSEG00000018357) triqk (ENSCSEG00000018367) runx1t1 (ENSCSEG00000018387) ##22 otud6b (ENSCSEG00000018406) ENSCSEG00000018420 pex11b (ENSCSEG00000018423) ilf2 (ENSCSEG00000018437) ENSCSEG00000018517 ENSCSEG00000018537 ENSCSEG00000018543 ENSCSEG00000018547 ARHGEF2 (ENSCSEG00000018555) ENSCSEG00000018569 ENSCSEG00000018591 ssr2 (ENSCSEG00000018614) ENSCSEG00000018630 ANKMY2 (ENSCSEG00000018633) tspan13b (ENSCSEG00000018642) Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000164175.b ENSGT00940000165758 ENSGT00510000047245 ENSGT00500000044921.a ENSGT00530000063631.a.k ENSGT00950000182995.e.b.`b ENSGT00390000004263.a.d.b ENSGT01030000234787 ENSGT00390000003058.b.a.a.a.a ENSGT00940000157647.c ENSGT00390000009543 ENSGT00940000159198.g ENSGT00950000182986.a.b.b ENSGT00390000010285.c ENSGT00390000017350 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT00940000164463 ENSGT00390000012840 ENSGT00940000154337.a.b ENSGT00940000154995 ENSGT00940000154107.b ENSGT00940000160242.b ENSGT00940000158230.b.b ENSGT00940000155620.q ENSGT01050000244814.a.a.b.b.b.a.a.d.b ENSGT00940000160023 ENSGT00510000047559 ENSGT00940000159209 ENSGT00940000155689 ENSGT00940000170761 ENSGT00950000183094.b.b Zig-zag eel MODERN SPECIES 2 ENSMAMG00000013023 ENSMAMG00000012983 ENSMAMG00000012971 ENSMAMG00000012966 ENSMAMG00000024389 azin1b (ENSMAMG00000012944) ENSMAMG00000012882 ENSMAMG00000012867 spire1a (ENSMAMG00000012814) klhl38a (ENSMAMG00000012793) fam91a1 (ENSMAMG00000012723) lratd2a (ENSMAMG00000012706) ENSMAMG00000012697 cibar1 (ENSMAMG00000012674) triqk (ENSMAMG00000012671) runx1t1 (ENSMAMG00000012649) ##22 ENSMAMG00000012594 otud6b (ENSMAMG00000012583) RAB5A (ENSMAMG00000012573) KAT2B (ENSMAMG00000012530) ENSMAMG00000012524 ZNF385D (ENSMAMG00000012483) ENSMAMG00000012471 ENSMAMG00000012446 ENSMAMG00000012425 ENSMAMG00000012384 ENSMAMG00000012366 ENSMAMG00000012339 ENSMAMG00000012280 ENSMAMG00000012247 fkbp9 (ENSMAMG00000012223) Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000164175.b ENSGT00940000165758 ENSGT00510000047245 ENSGT00500000044921.a ENSGT00530000063631.a.k ENSGT00950000182995.e.b.`b ENSGT00390000004263.a.d.b ENSGT01030000234787 ENSGT00390000003058.b.a.a.a.a ENSGT00940000157647.c ENSGT00390000009543 ENSGT00940000159198.g ENSGT00950000182986.a.b.b ENSGT00390000010285.c ENSGT00390000017350 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT00940000164463 ENSGT00390000012840 ENSGT00940000154337.a.b ENSGT00940000154995 ENSGT00940000154107.b ENSGT00940000160242.b ENSGT00940000158230.b.b ENSGT00940000155620.q ENSGT01050000244814.a.a.b.b.b.a.a.d.b ENSGT00940000160023 ENSGT00510000047559 ENSGT00940000159209 ENSGT00940000155689 ENSGT00940000170761 ENSGT00950000183094.b.b Siamese fighting fish MODERN SPECIES 2 fam83hb (ENSBSLG00000013483) ENSBSLG00000013467 ankib1a (ENSBSLG00000013227) snrpd1 (ENSBSLG00000012386) ggcta (ENSBSLG00000012379) adnp2b (ENSBSLG00000012371) azin1b (ENSBSLG00000012363) ATP6V1C1 (ENSBSLG00000012246) ENSBSLG00000012223 spire1a (ENSBSLG00000012175) fam91a1 (ENSBSLG00000010874) lratd2a (ENSBSLG00000010697) TRIB1 (ENSBSLG00000010679) cibar1 (ENSBSLG00000010613) triqk (ENSBSLG00000010252) runx1t1 (ENSBSLG00000009107) ##22 otud6b (ENSBSLG00000008994) RAB5A (ENSBSLG00000008904) kat2b (ENSBSLG00000008678) ENSBSLG00000008658 ZNF385D (ENSBSLG00000008655) rab25a (ENSBSLG00000008617) UBQLN4 (ENSBSLG00000008535) LIM2 (ENSBSLG00000008519) TINAGL1 (ENSBSLG00000008337) cfap300 (ENSBSLG00000025795) KCNQ4 (ENSBSLG00000025742) nfyc (ENSBSLG00000025658) RPRD1A (ENSBSLG00000025634) fkbp9 (ENSBSLG00000025558) crtap (ENSBSLG00000025539) Climbing perch MODERN SPECIES 2 ENSATEG00000014325 ENSATEG00000014344 ENSATEG00000014399 ENSATEG00000014422 ENSATEG00000026876 azin1b (ENSATEG00000014436) ENSATEG00000014449 ENSATEG00000014476 spire1a (ENSATEG00000014493) klhl38a (ENSATEG00000014558) fam91a1 (ENSATEG00000014575) lratd2a (ENSATEG00000014651) ENSATEG00000014664 cibar1 (ENSATEG00000014669) triqk (ENSATEG00000014685) runx1t1 (ENSATEG00000014697) ##22 ENSATEG00000014729 otud6b (ENSATEG00000014744) RAB5A (ENSATEG00000014748) ENSATEG00000014763 ENSATEG00000014815 ZNF385D (ENSATEG00000014843) ENSATEG00000014851 ENSATEG00000014859 ENSATEG00000025250 ENSATEG00000014922 ENSATEG00000014937 ENSATEG00000015023 ENSATEG00000015095 ENSATEG00000015157 ENSATEG00000015171 Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 112 ENSGT00940000154984.A ENSGT00420000029792.qb.b ENSGT00390000012138.a.b.c.a ENSGT00940000153446.a.a.w.b ENSGT00940000154181.b.b ENSGT00390000013305.a.b ENSGT00950000182995.e.b.`b ENSGT01030000234787 ENSGT00390000003058.b.a.a.a.a ENSGT00940000157647.c ENSGT00390000009543 ENSGT00940000159198.g ENSGT00950000182986.a.b.b ENSGT00390000010285.c ENSGT00390000017350 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT00390000012840 ENSGT00390000003680.b ENSGT00950000183131.b.a ##23 ENSGT00390000007813 ENSGT00390000014242.k ENSGT00390000013934 ENSGT00390000008115 ENSGT01100000263533.b.b.b.a.a.a.a.c.b ENSGT00940000164972 ENSGT00940000161110.a.b ENSGT00940000166312.b.a ENSGT00940000164318 ENSGT01030000234513.A.a.a.a.b.d.a ENSGT00940000155722 ENSGT00390000009435 Salmoninae DUPLICATION Salmoninae DUPLICATION Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183176.b.f.m.a.a ##22 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183176.b.f.m.a.a ##22 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183176.b.f.m.a.a ##22 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183176.b.f.m.a.a ##22 Chinook salmon MODERN SPECIES 18 OSBPL6 (ENSOTSG00005044574) prkra (ENSOTSG00005044570) ENSOTSG00005044569 ENSOTSG00005044552 CMKLR2 (ENSOTSG00005044548) ENSOTSG00005044546 INO80D (ENSOTSG00005044544) STK24 (ENSOTSG00005044523) DOCK9 (ENSOTSG00005017228) FARP1 (ENSOTSG00005017102) ENSOTSG00005017094 ENSOTSG00005017093 ENSOTSG00005017091 ENSOTSG00005017089 ENSOTSG00005017086 ENSOTSG00005017085 ##22 CNTNAP5 (ENSOTSG00005017074) ENSOTSG00005017073 ENSOTSG00005017072 ENSOTSG00005017071 SH3BP4 (ENSOTSG00005017069) ARL4C (ENSOTSG00005017067) ARL4C (ENSOTSG00005017066) ENSOTSG00005016858 arhgap15 (ENSOTSG00005016855) zeb2a (ENSOTSG00005016854) ENSOTSG00005016853 ENSOTSG00005016852 acvr2aa (ENSOTSG00005016807) ENSOTSG00005016802 epc2 (ENSOTSG00005016572) Huchen MODERN SPECIES 6481 runx1t1 (ENSHHUG00000002637) ##22 ENSHHUG00000002650 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 1014 ENSGT00950000182986.a.b.b.l.b ENSGT00390000010285.c ENSGT00950000183176.b.f.m.a.b ##22 ENSGT00950000183176.b.f.m.b ##22 ENSGT00940000164463 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00440000035378.c.b ENSGT00940000153269.b.b.n ENSGT01030000234510.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000156554.b.d ENSGT00390000000724.c.b.d ENSGT00390000003465.b.b.a ENSGT00940000154697.a.a.a.b ENSGT00940000154984.A.g ENSGT00390000012138.a.b.c.a.b ENSGT00940000154181.b.b ENSGT01030000234787 ENSGT00390000003058.b.a.a.a.a.e ENSGT00390000009543.p ENSGT00950000182986.a.b.b.l.a.b ENSGT00390000010285.c ENSGT00950000183176.b.f.m.a.b ##22 ENSGT00940000164066 ENSGT00390000003680.b.g.a ENSGT00950000183131.b.a ##23 ENSGT00390000007813.h ENSGT00390000013934 ENSGT00390000008115.n Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 87 ENSGT00940000155788.l ENSGT00940000160311.a.b ENSGT00940000158703 ENSGT00940000164643.a.a ENSGT00940000154984.A.h.b.b.a ENSGT00420000029792.qb.b ENSGT00390000012138.a.b.c.a.a.a.a ENSGT00390000013305.a.b ENSGT00950000182995.e.b.`b ENSGT00390000003058.b.a.a.a.a.f ENSGT00940000157647.c ENSGT00390000009543.o ENSGT00940000159198.g.k.b ENSGT00950000182986.a.b.b.k ENSGT00390000017350 ENSGT00950000183176.b.f.m.a.b ##22 ENSGT00950000183176.b.f.n ##22 ENSGT00390000012840 ENSGT00390000003680.b.g.b ENSGT00390000007813.g ENSGT00390000014242.k ENSGT00390000008115.m ENSGT01100000263533.b.b.b.a.a.a.a.c.b.b ENSGT00940000164972.h.a ENSGT01100000265367 ENSGT00940000155722 ENSGT00390000009435 ENSGT01090000260070.B.j.a ENSGT00940000159513.j ENSGT00440000035378.c.a ENSGT00940000154994.b Rainbow trout MODERN SPECIES 24 psmg2 (ENSOMYG00000032486) ptpn2b (ENSOMYG00000032559) seh1l (ENSOMYG00000032961) fam210aa (ENSOMYG00000032979) rnmt (ENSOMYG00000054773) ENSOMYG00000003442 ENSOMYG00000053312 ENSOMYG00000033070 ENSOMYG00000064383 klhl38a (ENSOMYG00000033101) fam91a1 (ENSOMYG00000033172) ENSOMYG00000075396 lratd2a (ENSOMYG00000033205) ENSOMYG00000037171 triqk (ENSOMYG00000075945) runx1t1 (ENSOMYG00000074359) ##22 ENSOMYG00000076503 otud6b (ENSOMYG00000034094) PIP4P2 (ENSOMYG00000076356) tmem64 (ENSOMYG00000056093) ENSOMYG00000061187 ENSOMYG00000066131 tdp2b (ENSOMYG00000008522) ENSOMYG00000007296 ENSOMYG00000055727 ENSOMYG00000061117 angpt2b (ENSOMYG00000068292) ENSOMYG00000049663 ENSOMYG00000075909 ENSOMYG00000073642 ENSOMYG00000052787 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 775 ENSGT00390000010285.c 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ENSGT00950000183176.b.f.m.b ##22 ENSGT00940000164463 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 430 ENSGT00950000183176.b.f.m.b ##22 ENSGT00940000164463 ENSGT00390000003680.b.h.a Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183176.b.f.m.b ##22 Rainbow trout MODERN SPECIES 9 ENSOMYG00000006912 stk3 (ENSOMYG00000006983) ENSOMYG00000054613 ENSOMYG00000070922 rpl30 (ENSOMYG00000007025) mtdha (ENSOMYG00000064459) ENSOMYG00000007074 spire1a (ENSOMYG00000007193) fam91a1 (ENSOMYG00000056174) ENSOMYG00000055811 lratd2a (ENSOMYG00000006719) ENSOMYG00000062661 cibar1 (ENSOMYG00000006794) ENSOMYG00000051846 ENSOMYG00000070062 runx1t1 (ENSOMYG00000049231) ##22 ENSOMYG00000048347 LRRC69 (ENSOMYG00000064758) pip4p2 (ENSOMYG00000070808) NECAB1 (ENSOMYG00000076168) ##23 tmem64 (ENSOMYG00000030894) ENSOMYG00000007370 ENSOMYG00000034129 ENSOMYG00000069461 angpt2b (ENSOMYG00000069799) ENSOMYG00000067116 ENSOMYG00000058116 ENSOMYG00000070958 ENSOMYG00000070759 ENSOMYG00000059535 gjb9b (ENSOMYG00000064515) Salmo ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000003465.b.b.a ENSGT00940000154697.a.a.a.b ENSGT00390000008918 ENSGT00940000154984.A.h.a ENSGT00940000154984.A.g ENSGT00390000012138.a.b.c.a.b ENSGT00940000154181.b.b ENSGT01030000234787 ENSGT00390000003058.b.a.a.a.a.e ENSGT00390000009543.p ENSGT00940000159198.g ENSGT00950000182986.a.b.b.k ENSGT00390000017350 ENSGT00950000182986.a.b.b.l.b ENSGT00390000010285.c ENSGT00950000183176.b.f.m.b ##22 ENSGT00940000164463 ENSGT00390000003680.b.h.a ENSGT00950000183131.b.a ##23 ENSGT00390000007813.h ENSGT00390000013934 ENSGT00390000008115.n ENSGT00940000164972.g.a.b ENSGT00940000161110.a.b.g.b ENSGT00940000161110.a.b.h ENSGT00940000166312.b.a ENSGT01030000234513.A.a.a.a.b.d.a ENSGT00940000155722.g ENSGT00390000009435 ENSGT01090000260070.B.i.a ENSGT00940000159513.j River trout MODERN SPECIES 27 runx1t1 (ENSSTUG00000022454) ##22 ENSSTUG00000022444 pip4p2 (ENSSTUG00000022410) tmem64 (ENSSTUG00000022391) ENSSTUG00000022382 acot13 (ENSSTUG00000022361) zgc:111986 (ENSSTUG00000022324) ENSSTUG00000022317 ENSSTUG00000022268 ENSSTUG00000022254 gjb9b (ENSSTUG00000022250) pef1 (ENSSTUG00000022227) gja4 (ENSSTUG00000022220) ENSSTUG00000022206 ENSSTUG00000022182 yars1 (ENSSTUG00000022122) Atlantic salmon MODERN SPECIES 19 ENSSSAG00000065969 LDLRAD4 (ENSSSAG00000102457) ZN706 (ENSSSAG00000065979) ENSSSAG00000096146 stk3 (ENSSSAG00000041996) rpl30 (ENSSSAG00000066053) mtdha (ENSSSAG00000066076) ENSSSAG00000095437 ENSSSAG00000066016 ENSSSAG00000099100 fam91a1 (ENSSSAG00000084387) ENSSSAG00000117940 ENSSSAG00000116859 cibar1 (ENSSSAG00000066097) ENSSSAG00000096451 runx1t1 (ENSSSAG00000089484) ##22 ENSSSAG00000066155 ENSSSAG00000090991 pip4p2 (ENSSSAG00000040160) NECAB1 (ENSSSAG00000086143) ##23 tmem64 (ENSSSAG00000090737) acot13 (ENSSSAG00000066179) ENSSSAG00000109128 ENSSSAG00000100163 ENSSSAG00000040438 ENSSSAG00000109935 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 280 ENSGT01030000234787 ENSGT00390000003058.b.a.a.a.a.e ENSGT00390000009543 ENSGT00950000182986.a.b.b.k 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ENSGT00390000007813.g ENSGT00390000014242.k ENSGT00390000008115.m ENSGT01100000263533.b.b.b.a.a.a.a.c.b.b ENSGT00940000164972.h ENSGT00940000161110.a.b.g.a ENSGT00940000164972.g.a ENSGT00940000161110.a.b.h ENSGT00940000166312.b.a ENSGT01030000234513.A.a.a.a.b.d.a ENSGT00940000155722 ENSGT00390000009435 ENSGT01090000260070.B.j Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 87 ENSGT00940000160311.a.b ENSGT00940000158703 ENSGT00940000164643.a.a ENSGT00940000154984.A.h.b.b.a ENSGT00420000029792.qb.b ENSGT00390000012138.a.b.c.a.a.a.a ENSGT00390000013305.a.b ENSGT00950000182995.e.b.`b ENSGT00390000003058.b.a.a.a.a.f ENSGT00940000157647.c ENSGT00390000009543.o ENSGT00940000159198.g.k.b ENSGT00950000182986.a.b.b.k ENSGT00390000017350 ENSGT00950000183176.b.f.m.a.b ##22 ENSGT00950000183176.b.f.n ##22 ENSGT00390000012840 ENSGT00390000003680.b.g.b ENSGT00390000007813.g ENSGT00390000014242.k ENSGT00390000008115.m ENSGT01100000263533.b.b.b.a.a.a.a.c.b.b ENSGT00940000164972.h.a ENSGT01100000265367 ENSGT00940000155722 ENSGT00390000009435 ENSGT01090000260070.B.j.a ENSGT00940000159513.j ENSGT00440000035378.c.a ENSGT00940000154994.b ENSGT00940000166437.e Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 100 ENSGT00940000155788.l ENSGT00940000160311.a.b ENSGT00940000153773.b ENSGT00940000158703 ENSGT00940000164643.a.a ENSGT00940000154984.A.h.b.b.a ENSGT00420000029792.qb.b ENSGT00390000012138.a.b.c.a.a.a.a ENSGT00390000013305.a.b ENSGT00950000182995.e.b.`b ENSGT00390000003058.b.a.a.a.a.f ENSGT00940000157647.c ENSGT00390000009543.o ENSGT00940000159198.g.k.b ENSGT00950000182986.a.b.b.k ENSGT00950000183176.b.f.n ##22 ENSGT00390000012840 ENSGT00390000003680.b.g.b ENSGT00390000007813.g ENSGT00390000014242.k ENSGT00390000008115.m ENSGT01100000263533.b.b.b.a.a.a.a.c.b.b ENSGT00940000164972.h.a ENSGT00940000161110.a.b.g.a ENSGT00940000155722 ENSGT00390000009435 ENSGT01090000260070.B.j.a ENSGT00940000159513.j ENSGT00440000035378.c.a ENSGT00940000154994.b ENSGT00940000166437.e Chinook salmon MODERN SPECIES 29 ENSOTSG00005020474 CNGA3 (ENSOTSG00005020476) ENSOTSG00005020477 ENSOTSG00005020479 ENSOTSG00005020481 ENSOTSG00005020483 ENSOTSG00005020490 si:dkey-51e6.1 (ENSOTSG00005020649) si:dkey-97o5.1 (ENSOTSG00005020650) scyl3 (ENSOTSG00005020653) ENSOTSG00005020660 ENSOTSG00005020665 kyat3.2 (ENSOTSG00005020669) pkn2b (ENSOTSG00005020874) chst12a (ENSOTSG00005031446) ENSOTSG00005031447 ##22 ENSOTSG00005031449 SLC35D1 (ENSOTSG00005031460) ENSOTSG00005031473 ENSOTSG00005031474 RS1 (ENSOTSG00005031475) Coho salmon MODERN SPECIES 5 ENSOKIG00005007754 STK3 (ENSOKIG00005007669) ENSOKIG00005007649 RIDA (ENSOKIG00005007585) rpl30 (ENSOKIG00005007569) rrm2b (ENSOKIG00005007526) azin1b (ENSOKIG00005007443) spire1a (ENSOKIG00005007331) klhl38a (ENSOKIG00005007308) fam91a1 (ENSOKIG00005006928) lratd2a (ENSOKIG00005006899) TRIB1 (ENSOKIG00005006882) ENSOKIG00005006862 ENSOKIG00005006845 ENSOKIG00005006836 runx1t1 (ENSOKIG00005006631) ##22 otud6b (ENSOKIG00005006607) PIP4P2 (ENSOKIG00005006590) tmem64 (ENSOKIG00005006579) ENSOKIG00005006558 zgc:111986 (ENSOKIG00005006539) ENSOKIG00005006531 angpt2b (ENSOKIG00005006462) ENSOKIG00005006454 ENSOKIG00005005901 pef1 (ENSOKIG00005005818) smim12 (ENSOKIG00005005808) gja4 (ENSOKIG00005005803) ENSOKIG00005005798 dlgap3 (ENSOKIG00005005763) fuca1.2 (ENSOKIG00005005749) Salmo ANCESTRAL SPECIES 270 ENSGT00950000183176.b.f.n ##22 ENSGT00390000012840 ENSGT00390000003680.b.g.b ENSGT00390000007813.g ENSGT00390000014242.k ENSGT00390000008115.m ENSGT00940000164972.g.a.a ENSGT00940000161110.a.b.g.a Atlantic salmon MODERN SPECIES 5 ENSSSAG00000093074 ENSSSAG00000091050 ENSSSAG00000111569 ENSSSAG00000115063 rrm2b (ENSSSAG00000098746) azin1b (ENSSSAG00000042061) spire1a (ENSSSAG00000041867) klhl38a (ENSSSAG00000088235) ENSSSAG00000090890 fam91a1 (ENSSSAG00000041723) lratd2a (ENSSSAG00000102747) ENSSSAG00000096037 triqk (ENSSSAG00000097303) otud6b (ENSSSAG00000100428) ENSSSAG00000052862 RUNX1T1 (ENSSSAG00000010232) ##22 PIP4P2 (ENSSSAG00000066143) tmem64 (ENSSSAG00000090308) ENSSSAG00000112736 ENSSSAG00000118092 angpt2b (ENSSSAG00000086730) ENSSSAG00000118805 ENSSSAG00000105880 ENSSSAG00000039685 pef1 (ENSSSAG00000039627) smim12 (ENSSSAG00000092642) gja4 (ENSSSAG00000095274) dlgap3 (ENSSSAG00000039326) ENSSSAG00000115433 ENSSSAG00000099431 fuca1.2 (ENSSSAG00000055028) River trout MODERN SPECIES 29 stk3 (ENSSTUG00000035946) ENSSTUG00000035984 rnf19a (ENSSTUG00000035999) pabpc1b (ENSSTUG00000036060) grhl2b (ENSSTUG00000036430) NCALD (ENSSTUG00000036557) ENSSTUG00000036564 ENSSTUG00000036573 psmg2 (ENSSTUG00000036584) ptpn2b (ENSSTUG00000036595) seh1l (ENSSTUG00000036619) fam210aa (ENSSTUG00000036818) rnmt (ENSSTUG00000036823) ENSSTUG00000036843 ENSSTUG00000036845 runx1t1 (ENSSTUG00000037460) ##22 ENSSTUG00000037659 otud6b (ENSSTUG00000037671) pip4p2 (ENSSTUG00000037692) tmem64 (ENSSTUG00000037727) ENSSTUG00000037730 tdp2b (ENSSTUG00000037734) zgc:111986 (ENSSTUG00000037742) ENSSTUG00000037764 ENSSTUG00000037774 angpt2b (ENSSTUG00000037787) ENSSTUG00000037861 ENSSTUG00000037889 ENSSTUG00000037893 ENSSTUG00000037901 ENSSTUG00000037913 Northern pike MODERN SPECIES 9 yars1 (ENSELUG00000017171) ENSELUG00000017134 ENSELUG00000000640 rbbp4 (ENSELUG00000017073) rims3 (ENSELUG00000017025) smap2 (ENSELUG00000017011) ENSELUG00000032187 ENSELUG00000016982 FKBP14 (ENSELUG00000016947) klhl38a (ENSELUG00000016921) fam91a1 (ENSELUG00000016894) lratd2a (ENSELUG00000016790) TRIB1 (ENSELUG00000016780) cibar1 (ENSELUG00000016762) triqk (ENSELUG00000016719) runx1t1 (ENSELUG00000016688) ##22 ENSELUG00000034648 ENSELUG00000016652 pip4p2 (ENSELUG00000016538) necab1 (ENSELUG00000016505) ##23 tmem64 (ENSELUG00000016459) tdp2b (ENSELUG00000016449) acot13 (ENSELUG00000016423) zgc:111986 (ENSELUG00000016413) ENSELUG00000030468 ENSELUG00000033458 ENSELUG00000016397 angpt2b (ENSELUG00000016379) ENSELUG00000027871 ENSELUG00000028634 ENSELUG00000016320 Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 197 ENSGT00940000154181.b.b ENSGT00390000013305.a.b ENSGT00950000182995.e.b.`b ENSGT00390000004263.a.d.b ENSGT01030000234787 ENSGT00390000003058.b.a.a.a.a ENSGT00940000157647.c ENSGT00390000009543 ENSGT00940000159198.g ENSGT00950000182986.a.b.b ENSGT00390000010285.c ENSGT00390000017350 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT00940000164463 ENSGT00390000012840 ENSGT00390000003680.b ENSGT00950000183131.b.a ##23 ENSGT00390000007813 ENSGT00390000014242.k ENSGT00390000013934 ENSGT00390000008115 ENSGT00940000153270.a ENSGT00530000068834 ENSGT00940000153717.a.a ENSGT00940000165898 ENSGT01030000234597.a.b.b.e.b ENSGT00940000157068.c ENSGT00940000177780 Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 58 ENSGT00940000154984.A ENSGT00420000029792.qb.a.n ENSGT00390000012138.a.b.d ENSGT00940000153446.a.a.w.b ENSGT00940000154181.b.b ENSGT00390000013305.a.b ENSGT00950000182995.e.b.`b ENSGT00390000004263.a.d.b ENSGT00390000003058.b.a.a.a.a ENSGT00940000157647.c ENSGT00390000009543 ENSGT00940000159198.g ENSGT00950000182986.a.b.b ENSGT00390000010285.c ENSGT01030000234950 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT00980000199767 ENSGT00390000012840 ENSGT00390000003680.b ENSGT00950000183131.b.a ##23 ENSGT00390000007813 ENSGT00390000014242.k ENSGT00390000013934 ENSGT00390000008115 ENSGT00940000153270.a ENSGT00940000153717.a.a ENSGT00940000165898 ENSGT01030000234597.a.b.b.e.b ENSGT00940000157068.c ENSGT00940000157988 ENSGT00940000155294 Atlantic herring MODERN SPECIES 10 stk3 (ENSCHAG00000009925) rida (ENSCHAG00000009857) rpl30 (ENSCHAG00000009819) laptm4b (ENSCHAG00000009800) mtdha (ENSCHAG00000009785) rrm2b (ENSCHAG00000008513) azin1b (ENSCHAG00000008432) atp6v1c1b (ENSCHAG00000008212) spire1a (ENSCHAG00000008106) klhl38a (ENSCHAG00000008084) fam91a1 (ENSCHAG00000007774) lratd2a (ENSCHAG00000007738) TRIB1 (ENSCHAG00000007726) cibar1 (ENSCHAG00000007574) ENSCHAG00000007544 runx1t1 (ENSCHAG00000007293) ##22 ENSCHAG00000007243 otud6b (ENSCHAG00000007229) pip4p2 (ENSCHAG00000007186) ENSCHAG00000006900 ENSCHAG00000006841 osbpl3a (ENSCHAG00000006377) ENSCHAG00000006280 cbx3a (ENSCHAG00000006118) snx10a (ENSCHAG00000006049) hoxa1a (ENSCHAG00000006006) ENSCHAG00000005986 evx1 (ENSCHAG00000005937) ASTE1 (ENSCHAG00000005883) matn1 (ENSCHAG00000005773) hibadha (ENSCHAG00000005661) Denticle herring MODERN SPECIES 12 ENSDCDG00000025897 vps45 (ENSDCDG00000025870) plekho1a (ENSDCDG00000025866) anp32e (ENSDCDG00000025863) cart4 (ENSDCDG00000025860) jtb (ENSDCDG00000025858) azin1b (ENSDCDG00000025856) ATP6V1C1 (ENSDCDG00000025817) spire1a (ENSDCDG00000023935) klhl38a (ENSDCDG00000023913) fam91a1 (ENSDCDG00000023896) lratd2a (ENSDCDG00000023893) TRIB1 (ENSDCDG00000023890) cibar1 (ENSDCDG00000023881) ENSDCDG00000023878 runx1t1 (ENSDCDG00000031642) ##22 otud6b (ENSDCDG00000031604) pip4p2 (ENSDCDG00000031599) necab1 (ENSDCDG00000031589) ##23 tmem64 (ENSDCDG00000031570) tdp2b (ENSDCDG00000031565) acot13 (ENSDCDG00000031562) zgc:111986 (ENSDCDG00000031560) ENSDCDG00000031558 gmnn (ENSDCDG00000031554) ripor2 (ENSDCDG00000031505) si:dkeyp-120h9.1 (ENSDCDG00000031496) stmn2b (ENSDCDG00000031493) hey1 (ENSDCDG00000031489) zbtb10 (ENSDCDG00000031487) tpd52 (ENSDCDG00000031486) Otophysi ANCESTRAL SPECIES 140 ENSGT00940000154984.A ENSGT00420000029792.qb.a ENSGT00390000012138.a.b.d ENSGT00940000153446.a.a.w.b ENSGT00940000154181.b.b ENSGT00390000013305.a.b ENSGT00950000182995.e.b.`b ENSGT00940000178526 ENSGT00390000003058.b.a.a.a.a ENSGT00940000157647.c ENSGT00390000009543 ENSGT00940000159198.g ENSGT00950000182986.a.b.b ENSGT00390000010285.c ENSGT00390000017350 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT00940000164463 ENSGT00390000012840 Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 51 ENSGT00390000012138.a.b.d ENSGT00940000153446.a.a.w.b ENSGT00940000154181.b.b ENSGT00390000013305.a.b ENSGT00950000182995.e.b.`b ENSGT00390000004263.a.d.a.h ENSGT00940000178526 ENSGT01030000234787 ENSGT00390000003058.b.a.a.a.a ENSGT00940000157647.c ENSGT00390000009543 ENSGT00940000159198.g ENSGT00950000182986.a.b.b ENSGT00390000010285.c ENSGT00390000017350 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT00940000164463 ENSGT00390000012840 ENSGT00940000166582 ENSGT00940000156221 ENSGT00940000160103 ENSGT00940000158302.d.b ENSGT00940000161290 ENSGT00940000158387 ENSGT00940000156923 ENSGT00950000182883.a.b.a ENSGT00940000155427.b ENSGT00390000003680.b ENSGT00950000183131.b.a ##23 ENSGT00390000007813 ENSGT00390000014242.k Channel catfish MODERN SPECIES 3 thrb (ENSIPUG00000011865) rarb (ENSIPUG00000011940) TOP2B (ENSIPUG00000012089) ngly1 (ENSIPUG00000012265) adnp2b (ENSIPUG00000012367) txnl4a (ENSIPUG00000012382) atp6v1c1b (ENSIPUG00000012415) ENSIPUG00000012463 spire1a (ENSIPUG00000012501) klhl38a (ENSIPUG00000012729) fam91a1 (ENSIPUG00000012746) lratd2a (ENSIPUG00000012820) Trib1 (ENSIPUG00000012834) fam92a1 (ENSIPUG00000012853) triqk (ENSIPUG00000012879) runx1t1 (ENSIPUG00000012904) ##22 lrrc69 (ENSIPUG00000012931) otud6b (ENSIPUG00000012953) zmym4 (ENSIPUG00000013026) SFPQ (ENSIPUG00000013076) ADGRB2 (ENSIPUG00000013160) ENSIPUG00000013254 ENSIPUG00000013258 ENSIPUG00000013267 col9a2 (ENSIPUG00000013295) smap2 (ENSIPUG00000013352) phf14 (ENSIPUG00000013425) nxph1 (ENSIPUG00000013532) thsd7aa (ENSIPUG00000013547) tmem55a (ENSIPUG00000013609) necab1 (ENSIPUG00000013641) ##23 Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000012138.a.b.d ENSGT00940000153446.a.a.w.b ENSGT00940000154181.b.b ENSGT00390000013305.a.b ENSGT00950000182995.e.b.`b ENSGT00390000004263.a.d.a.h ENSGT00940000178526 ENSGT01030000234787 ENSGT00390000003058.b.a.a.a.a ENSGT00940000157647.c ENSGT00390000009543 ENSGT00940000159198.g ENSGT00950000182986.a.b.b ENSGT00390000010285.c ENSGT00390000017350 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT00940000164463 ENSGT00390000012840 ENSGT00940000166582 ENSGT00940000156221 ENSGT00940000160103 ENSGT00940000158302.d.b ENSGT00940000161290 ENSGT00940000158387 ENSGT00940000156923 ENSGT00950000182883.a.b.a ENSGT00940000155427.b ENSGT00390000003680.b ENSGT00950000183131.b.a ##23 ENSGT00390000007813 ENSGT00390000014242.k Characoidei ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00420000029792.qb.a ENSGT00390000012138.a.b.d ENSGT00940000153446.a.a.w.b ENSGT00940000154181.b.b ENSGT00390000013305.a.b ENSGT00950000182995.e.b.`b ENSGT00390000004263.a.d.a.h ENSGT01030000234787 ENSGT00390000003058.b.a.a.a.a ENSGT00940000157647.c ENSGT00390000009543 ENSGT00940000159198.g ENSGT00950000182986.a.b.b ENSGT00390000010285.c ENSGT00390000017350 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT00940000164463 ENSGT00390000012840 ENSGT00940000166582 ENSGT00940000156221 ENSGT00940000160103 ENSGT00940000161290 ENSGT00940000158387 ENSGT00940000156923 ENSGT00950000182883.a.b.a ENSGT00940000155427.b ENSGT00390000003680.b ENSGT00950000183131.b.a ##23 ENSGT00390000007813 ENSGT00390000014242.k ENSGT00390000016199.b Red-bellied piranha MODERN SPECIES 1 ENSPNAG00000011524 rpl30 (ENSPNAG00000011570) laptm4b (ENSPNAG00000001815) mtdha (ENSPNAG00000001826) rrm2b (ENSPNAG00000011635) azin1b (ENSPNAG00000011650) atp6v1c1b (ENSPNAG00000011686) ENSPNAG00000011691 spire1a (ENSPNAG00000001932) klhl38a (ENSPNAG00000005712) fam91a1 (ENSPNAG00000011907) lratd2a (ENSPNAG00000011922) TRIB1 (ENSPNAG00000011931) cibar1 (ENSPNAG00000011941) triqk (ENSPNAG00000011951) runx1t1 (ENSPNAG00000011982) ##22 ENSPNAG00000005131 ENSPNAG00000002057 otud6b (ENSPNAG00000012027) zmym4.2 (ENSPNAG00000012109) ENSPNAG00000012129 sfpq (ENSPNAG00000002128) ADGRB2 (ENSPNAG00000012254) col9a2 (ENSPNAG00000012328) smap2 (ENSPNAG00000012352) phf14 (ENSPNAG00000012397) Mexicana tetra MODERN SPECIES 15 rida (ENSAMXG00000031748) rpl30 (ENSAMXG00000037627) laptm4b (ENSAMXG00000034415) mtdha (ENSAMXG00000036674) rrm2b (ENSAMXG00000031469) azin1b (ENSAMXG00000011357) atp6v1c1b (ENSAMXG00000011365) ENSAMXG00000011376 spire1a (ENSAMXG00000011397) klhl38a (ENSAMXG00000041010) fam91a1 (ENSAMXG00000011430) lratd2a (ENSAMXG00000031778) TRIB1 (ENSAMXG00000043443) cibar1 (ENSAMXG00000011452) triqk (ENSAMXG00000031056) runx1t1 (ENSAMXG00000011474) ##22 ENSAMXG00000044068 otud6b (ENSAMXG00000011487) ENSAMXG00000011497 zmym4.2 (ENSAMXG00000011511) sfpq (ENSAMXG00000011538) ENSAMXG00000042350 sox4a (ENSAMXG00000025426) ENSAMXG00000039034 nrsn1l (ENSAMXG00000043834) lpcat1 (ENSAMXG00000011948) mrpl36 (ENSAMXG00000036656) ndufs6 (ENSAMXG00000041388) irx4b (ENSAMXG00000035483) e2f3 (ENSAMXG00000036295) srfbp1 (ENSAMXG00000040976) Electric eel MODERN SPECIES 54 pbdc1 (ENSEEEG00000008400) xpo7 (ENSEEEG00000008408) ENSEEEG00000008551 GFRA2 (ENSEEEG00000008553) TLE3 (ENSEEEG00000008577) paqr5b (ENSEEEG00000008824) glceb (ENSEEEG00000008839) CORO2B (ENSEEEG00000008840) anp32a (ENSEEEG00000008862) klhl38a (ENSEEEG00000008864) fam91a1 (ENSEEEG00000008865) lratd2a (ENSEEEG00000008869) TRIB1 (ENSEEEG00000008870) cibar1 (ENSEEEG00000008871) triqk (ENSEEEG00000008872) runx1t1 (ENSEEEG00000008874) ##22 ENSEEEG00000008909 otud6b (ENSEEEG00000008912) zmym4.2 (ENSEEEG00000008913) sfpq (ENSEEEG00000008914) smpd2a (ENSEEEG00000008916) ENSEEEG00000008917 arl6ip5b (ENSEEEG00000008919) srsf6a (ENSEEEG00000008920) L3MBTL1 (ENSEEEG00000008921) sgk2a (ENSEEEG00000008927) mybl2a (ENSEEEG00000008975) adtrp1 (ENSEEEG00000008976) zgc:171857 (ENSEEEG00000008977) WNT7A (ENSEEEG00000008978) FBLN2 (ENSEEEG00000008980) Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000154984.A ENSGT00420000029792.qb.a ENSGT00390000012138.a.b.d ENSGT00940000153446.a.a.w.b ENSGT00940000154181.b.b ENSGT00390000013305.a.b ENSGT00950000182995.e.b.`b ENSGT00940000178526 ENSGT00390000003058.b.a.a.a.a ENSGT00940000157647.c ENSGT00390000009543 ENSGT00940000159198.g ENSGT00950000182986.a.b.b ENSGT00390000010285.c ENSGT00390000017350 ENSGT00950000183176.b.f ##22 ENSGT00940000164463 ENSGT00980000199767 ENSGT00390000012840 ENSGT00550000075032 ENSGT00940000155994 ENSGT00940000162490 ENSGT00390000013383 ENSGT00940000163607 ENSGT00940000157173 ENSGT00940000171718 ENSGT00950000183084.b.a.a.b.e.a ENSGT00950000183084.b.a.a.a ENSGT00940000157473.b.a ENSGT00940000155783 ENSGT00390000000916 Cyprininae DUPLICATION Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 51 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ENSGT00390000013383.u.b ENSGT00940000163607.a ENSGT00940000157173.a ENSGT00940000155783.i.a ENSGT00390000000916.i ENSGT00450000040303.r ENSGT01030000234543.F.f.b ENSGT00940000159104.c.d ENSGT00940000158587.c.b.j ENSGT00950000182872.f.a.b.p.e ENSGT01030000234863.b.a Common carp reference MODERN SPECIES 31 stk3 (ENSCCRG00000058673) rida (ENSCCRG00000060151) rpl30 (ENSCCRG00000054990) laptm4b (ENSCCRG00000005969) mtdha (ENSCCRG00000005979) rrm2b (ENSCCRG00000006143) azin1b (ENSCCRG00000007380) atp6v1c1b (ENSCCRG00000006410) ENSCCRG00000006381 spire1a (ENSCCRG00000042431) ENSCCRG00000042421 fam91a1 (ENSCCRG00000049964) ENSCCRG00000020372 cibar1 (ENSCCRG00000020373) ENSCCRG00000074327 runx1t1 (ENSCCRG00000004819) ##22 ENSCCRG00000050815 pex1 (ENSCCRG00000050804) elmo1 (ENSCCRG00000005021) rp9 (ENSCCRG00000048663) si:dkey-184p18.2 (ENSCCRG00000079262) poc1bl (ENSCCRG00000048657) ENSCCRG00000004723 gabbr2 (ENSCCRG00000058382) elp2 (ENSCCRG00000009307) abitram (ENSCCRG00000009316) ctnnal1 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SPECIES 369 ENSGT00390000017767.b.b.a.d ENSGT00940000154984.A.a ENSGT00420000029792.qb.a.k.b ENSGT00940000154181.b.b.a ENSGT00390000013305.a.b.c.b ENSGT00950000182995.e.b.`b.f ENSGT00390000004263.a.d.a.c.a ENSGT00940000178526.b ENSGT00390000003058.b.a.a.a.a.a ENSGT00940000157647.c ENSGT00390000009543.n ENSGT00940000159198.g.cb ENSGT00950000182986.a.b.b.m ENSGT00390000010285.c.jc ENSGT00390000017350 ENSGT00950000183176.b.f.p ##22 ENSGT00980000199767 ENSGT00390000012840 ENSGT00550000075032.b ENSGT00940000155994.o.a ENSGT00940000162490.a ENSGT00390000013383.u.a ENSGT00940000163607.b ENSGT00940000157173.b ENSGT00940000155783.i.b ENSGT00390000000916.j ENSGT00450000040303.q ENSGT01030000234543.F.f.a ENSGT00940000159104.c.c ENSGT00940000158587.c.b.i ENSGT00950000182872.f.a.b.p.f Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000017767.b.b.a.c.a ENSGT00940000154984.A.a ENSGT00940000153446.a.a.w.b.a ENSGT00940000154181.b.b.a ENSGT00390000013305.a.b.c.b ENSGT00950000182995.e.b.`b.f 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kingsleyae MODERN SPECIES 204 si:ch211-269k10.5 (ENSPKIG00000019714) PTDSS1 (ENSPKIG00000019663) PLEKHG4B (ENSPKIG00000019567) NKD2 (ENSPKIG00000019524) trip13 (ENSPKIG00000019468) brd9 (ENSPKIG00000019374) ZDHHC11 (ENSPKIG00000019317) TPPP (ENSPKIG00000019267) cep72 (ENSPKIG00000019222) ENSPKIG00000019166 ccdc12 (ENSPKIG00000019130) NBEAL2 (ENSPKIG00000018965) ENSPKIG00000018908 ENSPKIG00000018775 rbm12bb (ENSPKIG00000018719) ENSPKIG00000018692 ##22 ENSPKIG00000018645 upp1 (ENSPKIG00000018600) zgc:111986 (ENSPKIG00000018571) stmn2a (ENSPKIG00000018549) HEY1 (ENSPKIG00000018533) znf704 (ENSPKIG00000018510) ENSPKIG00000018426 ENSPKIG00000018400 ENSPKIG00000018376 fam8a1b (ENSPKIG00000018357) ATXN1 (ENSPKIG00000018323) GMPR (ENSPKIG00000018264) mylipa (ENSPKIG00000018221) dtnbp1a (ENSPKIG00000018159) JARID2 (ENSPKIG00000017990) Asian bonytongue MODERN SPECIES 9 PTDSS1 (ENSSFOG00015000952) si:ch211-269k10.5 (ENSSFOG00015001023) PLEKHG4B (ENSSFOG00015001043) NKD2 (ENSSFOG00015001063) 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