Euteleostomi	DUPLICATION
Euteleostomi	ANCESTRAL SPECIES	74											ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000006950	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607	ENSGT00940000155230	ENSGT00940000156220	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00940000166801	ENSGT00530000063698.a.b	ENSGT00940000158264.a	ENSGT00940000158929	ENSGT00940000157124
Sarcopterygii	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00400000022086.a	ENSGT00530000063835.b	ENSGT00940000160814 #7	ENSGT00940000156781 #8	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000006950	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607	ENSGT00940000155230	ENSGT00940000156220	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00940000166801	ENSGT00530000063698.a.b	ENSGT00940000158264.a	ENSGT00940000158929	ENSGT00940000157124
Tetrapoda	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00400000022086.a	ENSGT00530000063835.b	ENSGT00940000160814 #7	ENSGT00940000156781 #8	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000006950	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607	ENSGT00940000155230	ENSGT00940000156220	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00940000166801	ENSGT00530000063698.a.b	ENSGT00940000158264.a	ENSGT00940000158929	ENSGT00940000157124
Amniota	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00530000063835.b	ENSGT00940000160814 #7	ENSGT00940000156781 #8	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT00390000008413	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.c.a	ENSGT00940000153607.d	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00940000166801
Mammalia	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000160814 #7	ENSGT00940000156781 #8	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00510000047245 #10	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT00390000008413	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.c.a	ENSGT00940000153607.d	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00940000166801
Theria	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000160814 #7	ENSGT00940000156781 #8	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00510000047245 #10	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT00390000008413	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.c.a	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00940000166801	ENSGT00530000063698.a.b
Eutheria	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000156781 #8	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00510000047245 #10	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT00390000008413	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00940000157209.jb #17	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.c.a	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00530000063698.a.b	ENSGT00940000158264.a
Boreoeutheria	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000156781 #8	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00510000047245 #10	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT00390000008413	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00940000157209.jb #17	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.c.a	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230	ENSGT00900000143817	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00530000063698.a.b
Euarchontoglires	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000156781 #8	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00510000047245 #10	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT00390000008413	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00940000157209.jb #17	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.c.a	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230	ENSGT00900000143817	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00530000063698.a.b
Primates	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00940000156781 #8	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00510000047245 #10	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT00390000008413	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00940000157209.jb #17	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.c.a	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230	ENSGT00900000143817	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00530000063698.a.b
Strepsirrhini	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000156781 #8	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00510000047245 #10	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT00390000008413	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00940000157209.jb #17	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.c.a	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00530000063698.a.b	ENSGT00940000158264.a
Bushbaby	MODERN SPECIES	127	GATA6 (ENSOGAG00000034042) #7	MIB1 (ENSOGAG00000014282) #8	ABHD3 (ENSOGAG00000007835) #9	SNRPD1 (ENSOGAG00000007833) #10	ENSOGAG00000007829 #11	GREB1L (ENSOGAG00000012915) #12	ROCK1 (ENSOGAG00000012135) #13	USP14 (ENSOGAG00000000466) #14	THOC1 (ENSOGAG00000000470) #15	COLEC12 (ENSOGAG00000003364) #16	CETN1 (ENSOGAG00000026660) #17	CLUL1 (ENSOGAG00000003367) #18	TYMS (ENSOGAG00000024349) #19	ENOSF1 (ENSOGAG00000003371) #20	YES1 (ENSOGAG00000003375) #21	ADCYAP1 (ENSOGAG00000029548) #22	ENSOGAG00000012452 #23	ENSOGAG00000009095 #24
Lemuriformes	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00940000156781 #8	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00510000047245 #10	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT00390000008413	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00940000157209.jb #17	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.c.a	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00530000063698.a.b	ENSGT00940000158264.a
Lemuriformes_a	ANCESTRAL SPECIES	32	ENSGT00940000156781 #8	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00510000047245 #10	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT00390000008413	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00940000157209.jb #17	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.c.a	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00530000063698.a.b	ENSGT00940000158264.a
Greater bamboo lemur	MODERN SPECIES	694	SNRPD1 (ENSPSMG00000023812) #10	ENSPSMG00000023808	ESCO1 (ENSPSMG00000023801) #11	GREB1L (ENSPSMG00000023783) #12	ENSPSMG00000023754	ROCK1 (ENSPSMG00000023740) #13	USP14 (ENSPSMG00000023661) #14	THOC1 (ENSPSMG00000023556) #15	ENSPSMG00000023514	COLEC12 (ENSPSMG00000023506) #16	CETN1 (ENSPSMG00000023484) #17	CLUL1 (ENSPSMG00000023475) #18	TYMS (ENSPSMG00000023465) #19	ENOSF1 (ENSPSMG00000023425) #20	YES1 (ENSPSMG00000023337) #21	ADCYAP1 (ENSPSMG00000023309) #22	ENSPSMG00000023306	METTL4 (ENSPSMG00000023291)	NDC80 (ENSPSMG00000023277)
Coquerels sifaka	MODERN SPECIES	522	ABHD3 (ENSPCOG00000006103) #9	ENSPCOG00000022556	SNRPD1 (ENSPCOG00000013327) #10	ESCO1 (ENSPCOG00000009253) #11	GREB1L (ENSPCOG00000001696) #12	ENSPCOG00000000059	ENSPCOG00000023741	ROCK1 (ENSPCOG00000015163) #13	USP14 (ENSPCOG00000025457) #14	THOC1 (ENSPCOG00000009234) #15	COLEC12 (ENSPCOG00000026722) #16	CLUL1 (ENSPCOG00000026641) #18	TYMS (ENSPCOG00000023949) #19	ENOSF1 (ENSPCOG00000016574) #20	ENSPCOG00000002353 #21	ADCYAP1 (ENSPCOG00000011810) #22	METTL4 (ENSPCOG00000020273)	NDC80 (ENSPCOG00000024438)	SMCHD1 (ENSPCOG00000028124)	EMILIN2 (ENSPCOG00000023410)	LPIN2 (ENSPCOG00000027455)	MYOM1 (ENSPCOG00000019999)	MYL12A (ENSPCOG00000018571)	MYL12B (ENSPCOG00000028244)	TGIF1 (ENSPCOG00000013428)	DLGAP1 (ENSPCOG00000025011)	AKAIN1 (ENSPCOG00000003655)	ZBTB14 (ENSPCOG00000027135)	EPB41L3 (ENSPCOG00000007637)	ENSPCOG00000014927	TMEM200C (ENSPCOG00000020142)
Mouse lemur	MODERN SPECIES	10	GATA6 (ENSMICG00000044131) #7	MIB1 (ENSMICG00000007890) #8	ABHD3 (ENSMICG00000002109) #9	ENSMICG00000034736	SNRPD1 (ENSMICG00000044066) #10	ESCO1 (ENSMICG00000008993) #11	GREB1L (ENSMICG00000013562) #12	ROCK1 (ENSMICG00000014892) #13	USP14 (ENSMICG00000009020) #14	THOC1 (ENSMICG00000027200) #15	COLEC12 (ENSMICG00000004528) #16	CLUL1 (ENSMICG00000017333) #18	TYMS (ENSMICG00000014830) #19	ENOSF1 (ENSMICG00000014847) #20	YES1 (ENSMICG00000028620) #21	ADCYAP1 (ENSMICG00000030488) #22	ENSMICG00000033941	ENSMICG00000033758	ENSMICG00000029575	METTL4 (ENSMICG00000037155)	NDC80 (ENSMICG00000008378)	SMCHD1 (ENSMICG00000012555)	ENSMICG00000036843	EMILIN2 (ENSMICG00000017574)	LPIN2 (ENSMICG00000017575)	MYOM1 (ENSMICG00000017883)	MYL12A (ENSMICG00000037011)	MYL12B (ENSMICG00000027780)	TGIF1 (ENSMICG00000029611)	DLGAP1 (ENSMICG00000001909)	AKAIN1 (ENSMICG00000034961)
Haplorrhini	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00940000156781 #8	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00510000047245 #10	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT00390000008413	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00940000157209.jb #17	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.c.a	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230	ENSGT00900000143817	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00530000063698.a.b
Tarsier	MODERN SPECIES	6935												CLUL1 (ENSTSYG00000011737) #18	TYMS (ENSTSYG00000011744) #19	ENOSF1 (ENSTSYG00000011746) #20	YES1 (ENSTSYG00000003065) #21	ADCYAP1 (ENSTSYG00000028914) #22	ENSTSYG00000026408
Simiiformes	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00940000156781 #8	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00510000047245 #10	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT00390000008413	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00940000157209.jb #17	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00940000165544	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.c.a	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230.fd	ENSGT00900000143817	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047
Platyrrhini	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00940000160814 #7	ENSGT00940000156781 #8	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00510000047245 #10	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT01030000234517.A.e #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232.a #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00940000157209.jb #17	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786.w #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00940000165544	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.c.a	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230.fd.a	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a.f	ENSGT00940000157047.i	ENSGT00530000063698.a.b
Cebidae	ANCESTRAL SPECIES	28	ENSGT00940000160814 #7	ENSGT00940000156781 #8	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00510000047245 #10	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT01030000234517.A.e #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232.a #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00940000157209.jb #17	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786.w #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00940000165544	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.c.a	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230.fd.a	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a.f	ENSGT00940000157047.i	ENSGT00530000063698.a.b
Marmoset	MODERN SPECIES	4	MIB1 (ENSCJAG00000020532) #8	ABHD3 (ENSCJAG00000020529) #9	SNRPD1 (ENSCJAG00000063007) #10	ENSCJAG00000078350	ESCO1 (ENSCJAG00000020517) #11	GREB1L (ENSCJAG00000020496) #12	ROCK1 (ENSCJAG00000020477) #13	USP14 (ENSCJAG00000020464) #14	THOC1 (ENSCJAG00000020450) #15	COLEC12 (ENSCJAG00000000146) #16	CETN1 (ENSCJAG00000081806) #17	CLUL1 (ENSCJAG00000000140) #18	TYMS (ENSCJAG00000000125) #19	ENOSF1 (ENSCJAG00000000111) #20	YES1 (ENSCJAG00000000099) #21	ADCYAP1 (ENSCJAG00000045833) #22	ENSCJAG00000045947	ENSCJAG00000062931	METTL4 (ENSCJAG00000000092)	NDC80 (ENSCJAG00000000078)	ENSCJAG00000000071	ENSCJAG00000043001	ENSCJAG00000053051	ENSCJAG00000070355	EMILIN2 (ENSCJAG00000012955)	LPIN2 (ENSCJAG00000012946)	MYOM1 (ENSCJAG00000012917)	ENSCJAG00000012890	MYL12B (ENSCJAG00000080160)	ENSCJAG00000040414	ENSCJAG00000012865
Cebidae_a	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00400000022086.a	ENSGT00940000160814 #7	ENSGT00940000156781 #8	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00510000047245 #10	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT01030000234517.A.e #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232.a #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786.w #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00940000165544	ENSGT00390000016237	ENSGT00530000063169.b.b	ENSGT00390000010218.e.b	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.c.a	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230.fd.a	ENSGT00910000148299	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638
Bolivian squirrel monkey	MODERN SPECIES	53	MIB1 (ENSSBOG00000035880) #8	ABHD3 (ENSSBOG00000034125) #9	SNRPD1 (ENSSBOG00000020998) #10	ESCO1 (ENSSBOG00000028562) #11	GREB1L (ENSSBOG00000027051) #12	ENSSBOG00000022635	ENSSBOG00000034569 #13	USP14 (ENSSBOG00000029264) #14	ENSSBOG00000016556 #15	ENSSBOG00000026973	COLEC12 (ENSSBOG00000030126) #16	CLUL1 (ENSSBOG00000035239) #18	TYMS (ENSSBOG00000021422) #19	ENOSF1 (ENSSBOG00000035498) #20	YES1 (ENSSBOG00000034837) #21	ADCYAP1 (ENSSBOG00000028158) #22	ENSSBOG00000025141	METTL4 (ENSSBOG00000033623)	NDC80 (ENSSBOG00000035772)	SMCHD1 (ENSSBOG00000030266)	EMILIN2 (ENSSBOG00000029862)	LPIN2 (ENSSBOG00000026923)	MYOM1 (ENSSBOG00000036143)	MYL12A (ENSSBOG00000019169)	ENSSBOG00000022177	TGIF1 (ENSSBOG00000036056)	DLGAP1 (ENSSBOG00000031193)	ENSSBOG00000031178	ENSSBOG00000035366	AKAIN1 (ENSSBOG00000031954)	ZBTB14 (ENSSBOG00000034371)
Capuchin	MODERN SPECIES	12	ABHD3 (ENSCCAG00000022913) #9	ENSCCAG00000003133	ENSCCAG00000006504	SNRPD1 (ENSCCAG00000032658) #10	ENSCCAG00000034500 #11	GREB1L (ENSCCAG00000020057) #12	ENSCCAG00000018730	ROCK1 (ENSCCAG00000022582) #13	USP14 (ENSCCAG00000031810) #14	THOC1 (ENSCCAG00000025766) #15	COLEC12 (ENSCCAG00000022094) #16	CLUL1 (ENSCCAG00000029554) #18	TYMS (ENSCCAG00000035741) #19	ENOSF1 (ENSCCAG00000034159) #20	YES1 (ENSCCAG00000036987) #21	ADCYAP1 (ENSCCAG00000019487) #22
Mas night monkey	MODERN SPECIES	752	GATA6 (ENSANAG00000029224) #7	ENSANAG00000024462	MIB1 (ENSANAG00000026407) #8	ABHD3 (ENSANAG00000034649) #9	SNRPD1 (ENSANAG00000025641) #10	ESCO1 (ENSANAG00000035894) #11	GREB1L (ENSANAG00000023089) #12	ROCK1 (ENSANAG00000033862) #13	USP14 (ENSANAG00000025200) #14	ENSANAG00000033200 #15	COLEC12 (ENSANAG00000023670) #16	CLUL1 (ENSANAG00000027328) #18	TYMS (ENSANAG00000036799) #19	ENOSF1 (ENSANAG00000020979) #20	YES1 (ENSANAG00000034897) #21	ADCYAP1 (ENSANAG00000031400) #22	ENSANAG00000019405
Catarrhini	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00510000047245 #10	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT00390000008413	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00940000157209.jb #17	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00510000047760.y.b	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00940000165544	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.c.a	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230.fd	ENSGT00900000143817	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047
Hominoidea	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00510000047245 #10	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT00390000008413	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00940000157209.jb #17	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00510000047760.y.b	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00940000165544	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.c.a	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230.fd	ENSGT00900000143817	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047
Hominidae	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00510000047245 #10	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT00390000008413	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00940000157209.jb #17	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00510000047760.y.b	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00940000165544	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.c.a	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230.fd	ENSGT00900000143817	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047
Homo/Pan/Gorilla group	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00510000047245 #10	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT00390000008413	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00940000157209.jb #17	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00510000047760.y.b	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00940000165544	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.c.a	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230.fd	ENSGT00900000143817	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047
Gorilla	MODERN SPECIES	9	SNRPD1 (ENSGGOG00000041053) #10	ESCO1 (ENSGGOG00000001312) #11	GREB1L (ENSGGOG00000001933) #12	ENSGGOG00000027229	ROCK1 (ENSGGOG00000009574) #13	TUBB8B (ENSGGOG00000008143)	USP14 (ENSGGOG00000003003) #14	THOC1 (ENSGGOG00000003013) #15	COLEC12 (ENSGGOG00000001912) #16	CETN1 (ENSGGOG00000001323) #17	CLUL1 (ENSGGOG00000001325) #18	TYMS (ENSGGOG00000014000) #19	ENOSF1 (ENSGGOG00000009826) #20	YES1 (ENSGGOG00000000651) #21	ENSGGOG00000027261	ADCYAP1 (ENSGGOG00000036843) #22	ENSGGOG00000009010	METTL4 (ENSGGOG00000000937)	NDC80 (ENSGGOG00000000939)	SMCHD1 (ENSGGOG00000017005)	EMILIN2 (ENSGGOG00000000329)	LPIN2 (ENSGGOG00000000330)	MYOM1 (ENSGGOG00000044057)	MYL12A (ENSGGOG00000011429)	MYL12B (ENSGGOG00000004051)	ENSGGOG00000012694	DLGAP1 (ENSGGOG00000034891)	AKAIN1 (ENSGGOG00000040105)	ZBTB14 (ENSGGOG00000024397)	EPB41L3 (ENSGGOG00000012450)	ENSGGOG00000026491
Homo/Pan group	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00510000047245 #10	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT00390000008413	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00940000157209.jb #17	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00510000047760.y.b	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00940000165544	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.c.a	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230.fd	ENSGT00900000143817	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047
Pan	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00510000047245 #10	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT00390000008413	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00940000157209.jb #17	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00510000047760.y.b	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00940000165544	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000154174.t	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.c.a	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230.fd	ENSGT00900000143817	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a
Chimpanzee	MODERN SPECIES	9	ABHD3 (ENSPTRG00000009910) #9	SNRPD1 (ENSPTRG00000009909) #10	ESCO1 (ENSPTRG00000009908) #11	GREB1L (ENSPTRG00000009906) #12	ENSPTRG00000049852	ROCK1 (ENSPTRG00000009904) #13	USP14 (ENSPTRG00000009815) #14	THOC1 (ENSPTRG00000009816) #15	COLEC12 (ENSPTRG00000009818) #16	CETN1 (ENSPTRG00000029345) #17	CLUL1 (ENSPTRG00000009820) #18	TYMS (ENSPTRG00000009822) #19	ENOSF1 (ENSPTRG00000009823) #20	YES1 (ENSPTRG00000009824) #21	ENSPTRG00000048401	ADCYAP1 (ENSPTRG00000009825) #22	ENSPTRG00000050092	METTL4 (ENSPTRG00000009828)	NDC80 (ENSPTRG00000009829)	SMCHD1 (ENSPTRG00000009831)	EMILIN2 (ENSPTRG00000009832)	ENSPTRG00000048371	LPIN2 (ENSPTRG00000009833)	MYOM1 (ENSPTRG00000009834)	MYL12A (ENSPTRG00000009835)	MYL12B (ENSPTRG00000009836)	TGIF1 (ENSPTRG00000009838)	ENSPTRG00000044604	DLGAP1 (ENSPTRG00000009839)	AKAIN1 (ENSPTRG00000052521)	ZBTB14 (ENSPTRG00000029352)
Bonobo	MODERN SPECIES	9	ENSPPAG00000023886	ENSPPAG00000014788	AFG3L2 (ENSPPAG00000006484)	PRELID3A (ENSPPAG00000035268)	SPIRE1 (ENSPPAG00000034426)	CEP76 (ENSPPAG00000031163)	PSMG2 (ENSPPAG00000029877)	PTPN2 (ENSPPAG00000038680)	ENSPPAG00000040717	ENSPPAG00000037912	SEH1L (ENSPPAG00000006139)	CEP192 (ENSPPAG00000023155)	ENSPPAG00000039572	YES1 (ENSPPAG00000038900) #21	ENSPPAG00000042949	ADCYAP1 (ENSPPAG00000031943) #22	ENSPPAG00000032374	METTL4 (ENSPPAG00000030467)	NDC80 (ENSPPAG00000041112)	SMCHD1 (ENSPPAG00000037346)	EMILIN2 (ENSPPAG00000026444)	ENSPPAG00000043766	LPIN2 (ENSPPAG00000036687)	MYOM1 (ENSPPAG00000037926)	MYL12A (ENSPPAG00000037395)	MYL12B (ENSPPAG00000016699)	ENSPPAG00000034209	ENSPPAG00000036002	DLGAP1 (ENSPPAG00000032706)	ENSPPAG00000030574	ZBTB14 (ENSPPAG00000023957)
Human	MODERN SPECIES	9							TUBB8B (ENSG00000173213)	USP14 (ENSG00000101557) #14	THOC1 (ENSG00000079134) #15	COLEC12 (ENSG00000158270) #16	CETN1 (ENSG00000177143) #17	CLUL1 (ENSG00000079101) #18	TYMS (ENSG00000176890) #19	ENOSF1 (ENSG00000132199) #20	YES1 (ENSG00000176105) #21	ADCYAP1 (ENSG00000141433) #22	METTL4 (ENSG00000101574)	NDC80 (ENSG00000080986)	SMCHD1 (ENSG00000101596)	EMILIN2 (ENSG00000132205)	LPIN2 (ENSG00000101577)	MYOM1 (ENSG00000101605)	MYL12A (ENSG00000101608)	MYL12B (ENSG00000118680)	TGIF1 (ENSG00000177426)	DLGAP1 (ENSG00000170579)	AKAIN1 (ENSG00000231824)	ZBTB14 (ENSG00000198081)	EPB41L3 (ENSG00000082397)	TMEM200C (ENSG00000206432)	L3MBTL4 (ENSG00000154655)
Orangutan	MODERN SPECIES	9	MIB1 (ENSPPYG00000029422) #8	ABHD3 (ENSPPYG00000009056) #9	SNRPD1 (ENSPPYG00000025874) #10	ESCO1 (ENSPPYG00000009055) #11	GREB1L (ENSPPYG00000009054) #12	ENSPPYG00000009052	ROCK1 (ENSPPYG00000009051) #13	USP14 (ENSPPYG00000009050) #14	THOC1 (ENSPPYG00000009049) #15	COLEC12 (ENSPPYG00000009048) #16	CETN1 (ENSPPYG00000009047) #17	CLUL1 (ENSPPYG00000009046) #18	TYMS (ENSPPYG00000009045) #19	ENOSF1 (ENSPPYG00000009044) #20	YES1 (ENSPPYG00000009043) #21	ADCYAP1 (ENSPPYG00000041262) #22	ENSPPYG00000032286	ENSPPYG00000009000	METTL4 (ENSPPYG00000009040)	NDC80 (ENSPPYG00000009039)	SMCHD1 (ENSPPYG00000009037)	ENSPPYG00000035335	LPIN2 (ENSPPYG00000009036)	MYOM1 (ENSPPYG00000009034)	MYL12A (ENSPPYG00000009033)	MYL12B (ENSPPYG00000009032)	ENSPPYG00000009030	DLGAP1 (ENSPPYG00000009027)	AKAIN1 (ENSPPYG00000037539)	ZBTB14 (ENSPPYG00000009025)	EPB41L3 (ENSPPYG00000009024)
Gibbon	MODERN SPECIES	19	MIB1 (ENSNLEG00000006810) #8	ABHD3 (ENSNLEG00000030539) #9	SNRPD1 (ENSNLEG00000031430) #10	ESCO1 (ENSNLEG00000006826) #11	GREB1L (ENSNLEG00000006831) #12	ROCK1 (ENSNLEG00000006834) #13	ENSNLEG00000033133	USP14 (ENSNLEG00000026916) #14	THOC1 (ENSNLEG00000006835) #15	COLEC12 (ENSNLEG00000006846) #16	ENSNLEG00000035056 #17	CLUL1 (ENSNLEG00000006850) #18	ENSNLEG00000006854 #19	ENOSF1 (ENSNLEG00000030293) #20	YES1 (ENSNLEG00000006863) #21	ADCYAP1 (ENSNLEG00000006864) #22	ENSNLEG00000029289	METTL4 (ENSNLEG00000006868)	NDC80 (ENSNLEG00000006870)	SMCHD1 (ENSNLEG00000006877)	EMILIN2 (ENSNLEG00000006882)	LPIN2 (ENSNLEG00000006886)	ENSNLEG00000032827	MYOM1 (ENSNLEG00000006889)	MYL12A (ENSNLEG00000026933)	MYL12B (ENSNLEG00000032335)	ENSNLEG00000028451	DLGAP1 (ENSNLEG00000006910)	ENSNLEG00000035249	ENSNLEG00000006916	AKAIN1 (ENSNLEG00000028125)
Cercopithecidae	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00510000047245 #10	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00940000157209.jb #17	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920.j #21	ENSGT00510000047760.y.b	ENSGT00940000154920.i.b #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00910000148828	ENSGT00940000153607.c.a	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230.fd	ENSGT00900000143817	ENSGT00940000156220	ENSGT00940000165227	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a
Rhinopithecus	ANCESTRAL SPECIES	342	ENSGT00940000160814 #7	ENSGT00940000156781 #8	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00510000047245 #10	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00940000157209.jb #17	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920.j #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22
Golden snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	2969	GATA6 (ENSRROG00000004981) #7	MIB1 (ENSRROG00000026352) #8	ABHD3 (ENSRROG00000034609) #9	SNRPD1 (ENSRROG00000027640) #10	ESCO1 (ENSRROG00000040872) #11	GREB1L (ENSRROG00000036211) #12	ROCK1 (ENSRROG00000043694) #13	USP14 (ENSRROG00000034812) #14	THOC1 (ENSRROG00000044988) #15	COLEC12 (ENSRROG00000042375) #16	CETN1 (ENSRROG00000021979) #17	CLUL1 (ENSRROG00000037038) #18	TYMS (ENSRROG00000033528) #19	ENOSF1 (ENSRROG00000036777) #20	YES1 (ENSRROG00000033173) #21	ADCYAP1 (ENSRROG00000043497) #22
Black snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	449	GATA6 (ENSRBIG00000014475) #7	MIB1 (ENSRBIG00000039454) #8	ABHD3 (ENSRBIG00000027836) #9	SNRPD1 (ENSRBIG00000022996) #10	ESCO1 (ENSRBIG00000038379) #11	GREB1L (ENSRBIG00000029508) #12	ROCK1 (ENSRBIG00000028817) #13	USP14 (ENSRBIG00000044842) #14	THOC1 (ENSRBIG00000033738) #15	COLEC12 (ENSRBIG00000032206) #16	CETN1 (ENSRBIG00000006152) #17	CLUL1 (ENSRBIG00000030751) #18	TYMS (ENSRBIG00000040749) #19	ENOSF1 (ENSRBIG00000034196) #20	ENSRBIG00000040234 #21	ADCYAP1 (ENSRBIG00000033794) #22	ENSRBIG00000029162	FAF1 (ENSRBIG00000033052)	DMRTA2 (ENSRBIG00000031089)	ENSRBIG00000031795	ENSRBIG00000030797	ELAVL4 (ENSRBIG00000043810)
Cercopithecinae	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000156781 #8	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00510000047245 #10	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00940000157209.jb #17	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920.j #21	ENSGT00510000047760.y.b	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00910000148828	ENSGT00940000153607.c.a	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230.fd	ENSGT00900000143817	ENSGT00940000156220	ENSGT00940000165227	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a
Vervet Monkey	MODERN SPECIES	9	GATA6 (ENSCSAG00000017663) #7	MIB1 (ENSCSAG00000017659) #8	ABHD3 (ENSCSAG00000017658) #9	SNRPD1 (ENSCSAG00000017654) #10	ESCO1 (ENSCSAG00000017651) #11	GREB1L (ENSCSAG00000017642) #12	ROCK1 (ENSCSAG00000017637) #13	USP14 (ENSCSAG00000017633) #14	THOC1 (ENSCSAG00000017631) #15	COLEC12 (ENSCSAG00000017628) #16	CETN1 (ENSCSAG00000018575) #17	CLUL1 (ENSCSAG00000017625) #18	TYMS (ENSCSAG00000017621) #19	ENOSF1 (ENSCSAG00000017620) #20	YES1 (ENSCSAG00000017618) #21	ENSCSAG00000017615 #22	METTL4 (ENSCSAG00000017613)	NDC80 (ENSCSAG00000017610)	SMCHD1 (ENSCSAG00000017608)	EMILIN2 (ENSCSAG00000017605)	LPIN2 (ENSCSAG00000017604)	MYOM1 (ENSCSAG00000017602)	MYL12A (ENSCSAG00000017601)	MYL12B (ENSCSAG00000017599)	TGIF1 (ENSCSAG00000017597)	DLGAP1 (ENSCSAG00000017596)	ENSCSAG00000017594	AKAIN1 (ENSCSAG00000017591)	ZBTB14 (ENSCSAG00000017588)	EPB41L3 (ENSCSAG00000017587)	TMEM200C (ENSCSAG00000018576)
Cercopithecinae_a	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000156781 #8	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00510000047245 #10	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00940000157209.jb #17	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920.j #21	ENSGT00510000047760.y.b	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT01030000234866	ENSGT00940000154982	ENSGT00910000148828	ENSGT00940000153607.c.a	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230.fd	ENSGT00900000143817	ENSGT00940000156220	ENSGT00940000165227	ENSGT00560000078638
Macaca	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000156781 #8	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00510000047245 #10	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00940000157209.jb #17	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920.j #21	ENSGT00510000047760.y.b	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT01030000234866	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.c.a	ENSGT00940000155230.fd	ENSGT00900000143817	ENSGT00940000156220	ENSGT00940000165227	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047
Pig-tailed macaque	MODERN SPECIES	88	ENSMNEG00000041318	ABHD3 (ENSMNEG00000038243) #9	SNRPD1 (ENSMNEG00000041296) #10	ESCO1 (ENSMNEG00000038858) #11	GREB1L (ENSMNEG00000033906) #12	ROCK1 (ENSMNEG00000037793) #13	USP14 (ENSMNEG00000043410) #14	THOC1 (ENSMNEG00000040177) #15	COLEC12 (ENSMNEG00000041994) #16	CETN1 (ENSMNEG00000016581) #17	CLUL1 (ENSMNEG00000037833) #18	TYMS (ENSMNEG00000039303) #19	ENOSF1 (ENSMNEG00000013256) #20	YES1 (ENSMNEG00000034699) #21	ENSMNEG00000043359	ADCYAP1 (ENSMNEG00000034056) #22
Macaca_a	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000160814 #7	ENSGT00940000156781 #8	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00510000047245 #10	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00940000157209.jb #17	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920.j #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT01030000234866	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.c.a	ENSGT00940000155230.fd	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT01030000240171	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00530000063698.a.b
Rhesus	MODERN SPECIES	9	MIB1 (ENSMMUG00000055822) #8	ABHD3 (ENSMMUG00000004382) #9	SNRPD1 (ENSMMUG00000051922) #10	ESCO1 (ENSMMUG00000012987) #11	GREB1L (ENSMMUG00000003974) #12	ROCK1 (ENSMMUG00000004656) #13	USP14 (ENSMMUG00000004660) #14	THOC1 (ENSMMUG00000004662) #15	COLEC12 (ENSMMUG00000004663) #16	CETN1 (ENSMMUG00000012130) #17	CLUL1 (ENSMMUG00000004045) #18	TYMS (ENSMMUG00000004046) #19	ENOSF1 (ENSMMUG00000004051) #20	YES1 (ENSMMUG00000004054) #21	ENSMMUG00000057387	ADCYAP1 (ENSMMUG00000062768) #22	ENSMMUG00000063067	METTL4 (ENSMMUG00000018950)	NDC80 (ENSMMUG00000018952)	ENSMMUG00000053753	SMCHD1 (ENSMMUG00000005461)	EMILIN2 (ENSMMUG00000017546)	LPIN2 (ENSMMUG00000017548)	ENSMMUG00000061540	MYOM1 (ENSMMUG00000019892)	MYL12B (ENSMMUG00000019893)	ENSMMUG00000063593	ENSMMUG00000063768	TGIF1 (ENSMMUG00000005086)	DLGAP1 (ENSMMUG00000001471)	AKAIN1 (ENSMMUG00000059913)
Crab-eating macaque	MODERN SPECIES	9	ABHD3 (ENSMFAG00000045155) #9	ENSMFAG00000061267	SNRPD1 (ENSMFAG00000042080) #10	ESCO1 (ENSMFAG00000037398) #11	GREB1L (ENSMFAG00000037135) #12	ENSMFAG00000053845	ROCK1 (ENSMFAG00000003564) #13	USP14 (ENSMFAG00000001226) #14	THOC1 (ENSMFAG00000041520) #15	COLEC12 (ENSMFAG00000000357) #16	CETN1 (ENSMFAG00000055277) #17	CLUL1 (ENSMFAG00000038811) #18	TYMS (ENSMFAG00000039357) #19	ENOSF1 (ENSMFAG00000031046) #20	YES1 (ENSMFAG00000003203) #21	ADCYAP1 (ENSMFAG00000050015) #22	ENSMFAG00000052217	METTL4 (ENSMFAG00000046183)	NDC80 (ENSMFAG00000001170)	SMCHD1 (ENSMFAG00000038628)	ENSMFAG00000056542	EMILIN2 (ENSMFAG00000037105)	LPIN2 (ENSMFAG00000038540)	ENSMFAG00000044192	MYOM1 (ENSMFAG00000041420)	MYL12A (ENSMFAG00000036992)	TGIF1 (ENSMFAG00000003221)	DLGAP1 (ENSMFAG00000031490)	ENSMFAG00000065343	AKAIN1 (ENSMFAG00000031861)	ENSMFAG00000057315
Cercopithecinae_b	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00940000156781 #8	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00510000047245 #10	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00940000157209.jb #17	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920.j #21	ENSGT00510000047760.y.b	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT01030000234866	ENSGT00940000154982	ENSGT00910000148828	ENSGT00940000153607.c.a	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230.fd	ENSGT00900000143817	ENSGT00940000156220	ENSGT00940000165227	ENSGT00560000078638
Olive baboon	MODERN SPECIES	10	MIB1 (ENSPANG00000024471) #8	ABHD3 (ENSPANG00000026024) #9	SNRPD1 (ENSPANG00000047224) #10	ESCO1 (ENSPANG00000012867) #11	GREB1L (ENSPANG00000006963) #12	ENSPANG00000051345	ENSPANG00000042581	ROCK1 (ENSPANG00000023561) #13	USP14 (ENSPANG00000025940) #14	THOC1 (ENSPANG00000008665) #15	COLEC12 (ENSPANG00000026218) #16	CLUL1 (ENSPANG00000023232) #18	TYMS (ENSPANG00000016982) #19	ENOSF1 (ENSPANG00000019754) #20	YES1 (ENSPANG00000005606) #21	ADCYAP1 (ENSPANG00000042268) #22	ENSPANG00000051273	METTL4 (ENSPANG00000021862)	NDC80 (ENSPANG00000003124)	SMCHD1 (ENSPANG00000021485)	EMILIN2 (ENSPANG00000003125)	ENSPANG00000041277	LPIN2 (ENSPANG00000010436)	MYOM1 (ENSPANG00000001638)	MYL12A (ENSPANG00000014852)	ENSPANG00000045052	TGIF1 (ENSPANG00000012318)	DLGAP1 (ENSPANG00000019969)	ENSPANG00000042694	AKAIN1 (ENSPANG00000009807)	ZBTB14 (ENSPANG00000003128)
Cercopithecinae_d	ANCESTRAL SPECIES	40	ENSGT00940000156781 #8	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00510000047245 #10	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00940000157209.jb #17	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920.j #21	ENSGT00510000047760.y.b	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00910000148828	ENSGT00940000153607.c.a	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230.fd	ENSGT00900000143817	ENSGT00940000156220	ENSGT00940000165227	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a
Sooty mangabey	MODERN SPECIES	628	MIB1 (ENSCATG00000029399) #8	ABHD3 (ENSCATG00000044817) #9	SNRPD1 (ENSCATG00000039978) #10	ESCO1 (ENSCATG00000030504) #11	GREB1L (ENSCATG00000033346) #12	ROCK1 (ENSCATG00000031747) #13	USP14 (ENSCATG00000012708) #14	THOC1 (ENSCATG00000028180) #15	COLEC12 (ENSCATG00000032423) #16	CETN1 (ENSCATG00000016934) #17	CLUL1 (ENSCATG00000045077) #18	TYMS (ENSCATG00000030133) #19	ENOSF1 (ENSCATG00000034332) #20	YES1 (ENSCATG00000036813) #21	ENSCATG00000029055	ADCYAP1 (ENSCATG00000039535) #22	METTL4 (ENSCATG00000011642)	NDC80 (ENSCATG00000030394)	SMCHD1 (ENSCATG00000042044)	EMILIN2 (ENSCATG00000032093)	LPIN2 (ENSCATG00000037884)	MYOM1 (ENSCATG00000018194)	ENSCATG00000041600	MYL12A (ENSCATG00000041341)	MYL12B (ENSCATG00000031984)	TGIF1 (ENSCATG00000000628)	DLGAP1 (ENSCATG00000017819)	ENSCATG00000030025	ENSCATG00000039667	AKAIN1 (ENSCATG00000023216)	ZBTB14 (ENSCATG00000038080)
Drill	MODERN SPECIES	1203		ABHD3 (ENSMLEG00000029456) #9	SNRPD1 (ENSMLEG00000028659) #10	ESCO1 (ENSMLEG00000034894) #11	GREB1L (ENSMLEG00000037540) #12	ROCK1 (ENSMLEG00000042706) #13	USP14 (ENSMLEG00000029366) #14	THOC1 (ENSMLEG00000034201) #15	COLEC12 (ENSMLEG00000028000) #16	CETN1 (ENSMLEG00000025015) #17	CLUL1 (ENSMLEG00000024995) #18	TYMS (ENSMLEG00000033083) #19	ENOSF1 (ENSMLEG00000029800) #20	YES1 (ENSMLEG00000033031) #21	ENSMLEG00000038566	ADCYAP1 (ENSMLEG00000041063) #22	METTL4 (ENSMLEG00000036729)	NDC80 (ENSMLEG00000034205)	SMCHD1 (ENSMLEG00000042656)	EMILIN2 (ENSMLEG00000041789)	LPIN2 (ENSMLEG00000039895)	ENSMLEG00000039724	MYOM1 (ENSMLEG00000031580)	MYL12A (ENSMLEG00000027689)	MYL12B (ENSMLEG00000022144)	ENSMLEG00000033712	TGIF1 (ENSMLEG00000044111)	ENSMLEG00000021320	ENSMLEG00000034137	DLGAP1 (ENSMLEG00000033071)	ENSMLEG00000031857
Euarchontoglires_A	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000156781 #8	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00510000047245 #10	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT00390000008413	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00940000157209.jb #17	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.c.a	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230	ENSGT00900000143817	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00530000063698.a.b
Glires	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00940000156781 #8	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00510000047245 #10	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT00390000008413	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00940000157209.jb #17	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.c.a	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230	ENSGT00900000143817	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00530000063698.a.b
Rodentia	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00940000156781 #8	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00510000047245 #10	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000008413	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00940000157209.jb #17	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.c.a	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230	ENSGT00900000143817	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00530000063698.a.b
Rodentia_B	ANCESTRAL SPECIES	27	ENSGT00940000160814 #7	ENSGT00940000156781 #8	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00510000047245 #10	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00940000157209.jb #17	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.c.a	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230	ENSGT00900000143817	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00530000063698.a.b
Myomorpha	ANCESTRAL SPECIES	45	ENSGT00940000160814 #7	ENSGT00940000156781 #8	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00510000047245 #10	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00940000157209.jb #17	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.c.a	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230	ENSGT00900000143817	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00530000063698.a.b
Muroidea	ANCESTRAL SPECIES	46	ENSGT00940000160814 #7	ENSGT00940000156781 #8	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00510000047245 #10	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00940000157209.jb #17	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.c.a	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230	ENSGT00900000143817	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00530000063698.a.b
Muroidea_A	ANCESTRAL SPECIES	19												ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.c.a	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230	ENSGT00900000143817	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00530000063698.a.b
Murinae	ANCESTRAL SPECIES	9													ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.c.a	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00530000063698.a.b	ENSGT00940000158264.a
Mus	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00390000008095	ENSGT00950000182980.a.b.b.b	ENSGT00390000018245.c	ENSGT00550000074867	ENSGT00940000161424	ENSGT00550000075024	ENSGT00530000063425.a.b	ENSGT00940000159118	ENSGT00390000006820	ENSGT00940000158817	ENSGT00940000163055	ENSGT00940000157364.C	ENSGT00940000158952	ENSGT00940000154292.a.b	ENSGT00860000135827	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237
Mus_A	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00390000008095	ENSGT00950000182980.a.b.b.b.cb	ENSGT00390000018245.c	ENSGT00550000074867	ENSGT00940000161424	ENSGT00550000075024	ENSGT00530000063425.a.b	ENSGT00940000159118	ENSGT00390000006820	ENSGT00940000158817	ENSGT00940000163055	ENSGT00940000157364.C	ENSGT00940000158952	ENSGT00940000154292.a.b	ENSGT00860000135827	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237
Ryukyu mouse	MODERN SPECIES	8	Stpg4 (MGP_CAROLIEiJ_G0021946)	Calm2 (MGP_CAROLIEiJ_G0021947)	Epcam (MGP_CAROLIEiJ_G0021948)	Msh2 (MGP_CAROLIEiJ_G0021949)	Kcnk12 (MGP_CAROLIEiJ_G0021950)	Msh6 (MGP_CAROLIEiJ_G0021951)	Fbxo11 (MGP_CAROLIEiJ_G0021952)	Foxn2 (MGP_CAROLIEiJ_G0021953)	Ppp1r21 (MGP_CAROLIEiJ_G0021954)	MGP_CAROLIEiJ_G0021955	Gtf2a1l (MGP_CAROLIEiJ_G0021956)	Lhcgr (MGP_CAROLIEiJ_G0021957)	Fshr (MGP_CAROLIEiJ_G0021958)	Nrxn1 (MGP_CAROLIEiJ_G0021959)	MGP_CAROLIEiJ_G0021961	Adcyap1 (MGP_CAROLIEiJ_G0021962) #22	Mettl4 (MGP_CAROLIEiJ_G0021963)
Mus_B	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00390000008095	ENSGT00950000182980.a.b.b.b.cb	ENSGT00390000018245.c	ENSGT00550000074867	ENSGT00940000161424	ENSGT00550000075024	ENSGT00530000063425.a.b	ENSGT00940000159118	ENSGT00390000006820	ENSGT00940000158817	ENSGT00940000163055	ENSGT00940000157364.C	ENSGT00940000158952	ENSGT00940000154292.a.b	ENSGT00860000135827	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237
Mouse	MODERN SPECIES	8	Stpg4 (ENSMUSG00000036557)	Calm2 (ENSMUSG00000036438)	Epcam (ENSMUSG00000045394)	Msh2 (ENSMUSG00000024151)	Kcnk12 (ENSMUSG00000050138)	Msh6 (ENSMUSG00000005370)	Fbxo11 (ENSMUSG00000005371)	Foxn2 (ENSMUSG00000034998)	Ppp1r21 (ENSMUSG00000034709)	Ston1 (ENSMUSG00000033855)	Gtf2a1l (ENSMUSG00000024154)	Lhcgr (ENSMUSG00000024107)	Fshr (ENSMUSG00000032937)	Gm10184 (ENSMUSG00000066878)	Nrxn1 (ENSMUSG00000024109)	Adcyap1 (ENSMUSG00000024256) #22	Mettl4 (ENSMUSG00000055660)
Mus_C	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00390000008095	ENSGT00950000182980.a.b.b.b.cb	ENSGT00390000018245.c	ENSGT00550000074867	ENSGT00940000161424	ENSGT00550000075024	ENSGT00530000063425.a.b	ENSGT00940000159118	ENSGT00390000006820	ENSGT00940000158817	ENSGT00940000163055	ENSGT00940000157364.C	ENSGT00940000158952	ENSGT00940000154292.a.b	ENSGT00860000135827	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237
Steppe mouse	MODERN SPECIES	3358			Foxn2 (ENSMSIG00000000446)	Ppp1r21 (ENSMSIG00000000304)	Ston1 (ENSMSIG00000000231)	Gtf2a1l (ENSMSIG00000000118)	Lhcgr (ENSMSIG00000031112)	ENSMSIG00000031111	Fshr (ENSMSIG00000031109)	ENSMSIG00000031104	Nrxn1 (ENSMSIG00000031017)	ENSMSIG00000031015	ENSMSIG00000031014	ENSMSIG00000031011	ENSMSIG00000031009	Adcyap1 (ENSMSIG00000031006) #22	Mettl4 (ENSMSIG00000030995)	ENSMSIG00000030988	ENSMSIG00000030987
spretus	MODERN SPECIES	8	Calm2 (MGP_SPRETEiJ_G0022863)	Epcam (MGP_SPRETEiJ_G0022864)	Msh2 (MGP_SPRETEiJ_G0022865)	Kcnk12 (MGP_SPRETEiJ_G0022866)	MGP_SPRETEiJ_G0022867	Msh6 (MGP_SPRETEiJ_G0022868)	MGP_SPRETEiJ_G0022869	Foxn2 (MGP_SPRETEiJ_G0022870)	Ppp1r21 (MGP_SPRETEiJ_G0022871)	Ston1 (MGP_SPRETEiJ_G0022872)	Gtf2a1l (MGP_SPRETEiJ_G0022873)	Lhcgr (MGP_SPRETEiJ_G0022874)	Fshr (MGP_SPRETEiJ_G0022875)	Nrxn1 (MGP_SPRETEiJ_G0022876)	MGP_SPRETEiJ_G0022877	Adcyap1 (MGP_SPRETEiJ_G0022878) #22	Mettl4 (MGP_SPRETEiJ_G0022879)
Shrew mouse	MODERN SPECIES	9	Stpg4 (MGP_PahariEiJ_G0020936)	Calm2 (MGP_PahariEiJ_G0020937)	Epcam (MGP_PahariEiJ_G0020938)	Msh2 (MGP_PahariEiJ_G0020939)	Kcnk12 (MGP_PahariEiJ_G0020940)	Msh6 (MGP_PahariEiJ_G0020941)	Fbxo11 (MGP_PahariEiJ_G0020942)	Foxn2 (MGP_PahariEiJ_G0020943)	Ppp1r21 (MGP_PahariEiJ_G0020944)	Ston1 (MGP_PahariEiJ_G0020945)	MGP_PahariEiJ_G0020946	Lhcgr (MGP_PahariEiJ_G0020947)	Fshr (MGP_PahariEiJ_G0020948)	Nrxn1 (MGP_PahariEiJ_G0020949)	MGP_PahariEiJ_G0020950	Adcyap1 (MGP_PahariEiJ_G0020951) #22	Mettl4 (MGP_PahariEiJ_G0020952)
Rat	MODERN SPECIES	19	LOC103693502 (ENSRNOG00000066982)	ENSRNOG00000069319	ENSRNOG00000063904	ENSRNOG00000067205	Tipinl1 (ENSRNOG00000037221)	ENSRNOG00000066827	ENSRNOG00000067790	LOC120094815 (ENSRNOG00000067344)	LOC100911813 (ENSRNOG00000067276)	ENSRNOG00000067845	LOC108348229 (ENSRNOG00000069907)	ENSRNOG00000070300	Clul1 (ENSRNOG00000059237) #18	Tyms (ENSRNOG00000037225) #19	Yes1 (ENSRNOG00000037227) #21	Adcyap1 (ENSRNOG00000049882) #22	Ppidl1 (ENSRNOG00000037230)	ENSRNOG00000068876	Fam114a1l1 (ENSRNOG00000002110)	Mettl4 (ENSRNOG00000026280)	ENSRNOG00000069721	Ndc80 (ENSRNOG00000013727)	ENSRNOG00000066469	Smchd1 (ENSRNOG00000014319)	Emilin2 (ENSRNOG00000014837)	Lpin2 (ENSRNOG00000014876)	Myom1 (ENSRNOG00000057701)	Myl12b (ENSRNOG00000015278)	Tgif1 (ENSRNOG00000015906)	Dlgap1 (ENSRNOG00000016196)	ENSRNOG00000069381 ##23
Cricetidae	ANCESTRAL SPECIES	19												ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.c.a	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230	ENSGT00900000143817	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00530000063698.a.b
Cricetinae	ANCESTRAL SPECIES	3												ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.c.a	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00530000063698.a.b	ENSGT00940000158264.a
Chinese hamster chok1gshd	MODERN SPECIES	1												ENSCGRG00001011242 #18	ENSCGRG00001007642 #19	ENSCGRG00001007268 #20	Yes1 (ENSCGRG00001012390) #21	Adcyap1 (ENSCGRG00001007071) #22	ENSCGRG00001010839	ENSCGRG00001012413	ENSCGRG00001010099	Mettl4 (ENSCGRG00001005723)	ENSCGRG00001009792	Ndc80 (ENSCGRG00001011888)	Smchd1 (ENSCGRG00001011971)	Emilin2 (ENSCGRG00001005288)	Lpin2 (ENSCGRG00001012322)	Myom1 (ENSCGRG00001012204)	Myl12a (ENSCGRG00001011344)	Myl12b (ENSCGRG00001011388)	Tgif1 (ENSCGRG00001007018)	Dlgap1 (ENSCGRG00001010521)	Akain1 (ENSCGRG00001011277)
Golden Hamster	MODERN SPECIES	684														Tyms (ENSMAUG00000007623) #19	Yes1 (ENSMAUG00000022131) #21	Adcyap1 (ENSMAUG00000022205) #22	Ssh2 (ENSMAUG00000020745)	Coro6 (ENSMAUG00000011994)	ENSMAUG00000007819	Git1 (ENSMAUG00000017744)	Trp53i13 (ENSMAUG00000020444)	ENSMAUG00000008115	Abhd15 (ENSMAUG00000012533) ##9	Taok1 (ENSMAUG00000019446)	Nufip2 (ENSMAUG00000005650)	Cryba1 (ENSMAUG00000009942)	Gm10277 (ENSMAUG00000021008)	Myo18a (ENSMAUG00000015981)	Pipox (ENSMAUG00000020672)	Sez6 (ENSMAUG00000017320)	Dhrs13 (ENSMAUG00000003034)
Cricetidae_B	ANCESTRAL SPECIES	62												ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.c.a	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230	ENSGT00900000143817	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00530000063698.a.b
Prairie vole	MODERN SPECIES	150															Yes1 (ENSMOCG00000002556) #21	Adcyap1 (ENSMOCG00000003306) #22	ENSMOCG00000004125
Northern American deer mouse	MODERN SPECIES	4	Col4a4 (ENSPEMG00000023902)	Col4a3 (ENSPEMG00000022581)	Mff (ENSPEMG00000013271)	Tm4sf20 (ENSPEMG00000009177)	Agfg1 (ENSPEMG00000024218)	Slc19a3 (ENSPEMG00000021706)	Gm47969 (ENSPEMG00000027248)	Krtap28-13 (ENSPEMG00000026790)	Ccl20 (ENSPEMG00000023283)	Daw1 (ENSPEMG00000013917)	Sphkap (ENSPEMG00000023700)	ENSPEMG00000029175 #18	Tyms (ENSPEMG00000022684) #19	ENSPEMG00000023960 #20	ENSPEMG00000030907 #21	Adcyap1 (ENSPEMG00000026939) #22	ENSPEMG00000021079	ENSPEMG00000021564	ENSPEMG00000012275	Ndc80 (ENSPEMG00000011873)	Smchd1 (ENSPEMG00000010741)	Emilin2 (ENSPEMG00000000648)	Lpin2 (ENSPEMG00000016819)	Myom1 (ENSPEMG00000010271)	Myl12a (ENSPEMG00000021243)	Myl12b (ENSPEMG00000022144)	ENSPEMG00000026379	ENSPEMG00000031236	Dlgap1 (ENSPEMG00000020719)	ENSPEMG00000027160	ENSPEMG00000025947
Upper Galilee mountains blind mole rat	MODERN SPECIES	536	Gata6 (ENSNGAG00000019766) #7	Mib1 (ENSNGAG00000023747) #8	ENSNGAG00000021505	Abhd3 (ENSNGAG00000020720) #9	Snrpd1 (ENSNGAG00000023946) #10	Esco1 (ENSNGAG00000000995) #11	Greb1l (ENSNGAG00000023971) #12	Rock1 (ENSNGAG00000013091) #13	Usp14 (ENSNGAG00000018694) #14	ENSNGAG00000001401 #15	Colec12 (ENSNGAG00000017872) #16	Cetn1 (ENSNGAG00000012639) #17	Tyms (ENSNGAG00000024065) #19	ENSNGAG00000020252 #20	Yes1 (ENSNGAG00000024151) #21	Adcyap1 (ENSNGAG00000021652) #22
Lesser Egyptian jerboa	MODERN SPECIES	55	Rbbp8 (ENSJJAG00000023640)	Gata6 (ENSJJAG00000007856) #7	Mib1 (ENSJJAG00000014732) #8	Abhd3 (ENSJJAG00000010354) #9	Snrpd1 (ENSJJAG00000017698) #10	ENSJJAG00000024289 #11	Greb1l (ENSJJAG00000019827) #12	Rock1 (ENSJJAG00000012599) #13	Usp14 (ENSJJAG00000001720) #14	ENSJJAG00000014893 #15	Colec12 (ENSJJAG00000014240) #16	Cetn1 (ENSJJAG00000010533) #17	Tyms (ENSJJAG00000020713) #19	ENSJJAG00000019240 #20	Yes1 (ENSJJAG00000006110) #21	Adcyap1 (ENSJJAG00000024315) #22	Ndc80 (ENSJJAG00000020131)	Zfp516 (ENSJJAG00000016237)	ENSJJAG00000017663	Zadh2 (ENSJJAG00000013604)	Cndp1 (ENSJJAG00000022953)	Cndp2 (ENSJJAG00000013882)	Cyb5a (ENSJJAG00000020003)	Neto1 (ENSJJAG00000024284)	Cbln2 (ENSJJAG00000021520)	Socs6 (ENSJJAG00000017873)	ENSJJAG00000016953	ENSJJAG00000023825	Dok6 (ENSJJAG00000017009)	ENSJJAG00000011145	Dsel (ENSJJAG00000013330)
Kangaroo rat	MODERN SPECIES	344	Mib1 (ENSDORG00000009847) #8	Abhd3 (ENSDORG00000024920) #9	Snrpd1 (ENSDORG00000008349) #10	Esco1 (ENSDORG00000025246) #11	ENSDORG00000023581	Greb1l (ENSDORG00000015358) #12	ENSDORG00000029933 #24	Rock1 (ENSDORG00000010078) #13	Usp14 (ENSDORG00000008059) #14	Thoc1 (ENSDORG00000008060) #15	Colec12 (ENSDORG00000003553) #16	Cetn1 (ENSDORG00000003995) #17	Tyms (ENSDORG00000015072) #19	ENSDORG00000015074 #20	Yes1 (ENSDORG00000002603) #21	Adcyap1 (ENSDORG00000026095) #22	ENSDORG00000029047
Rodentia_A	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00940000156781 #8	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00510000047245 #10	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000008413	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00940000157209.jb #17	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.c.a	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00530000063698.a.b	ENSGT00940000158264.a
Hystricomorpha	ANCESTRAL SPECIES	32	ENSGT00940000156781 #8	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00510000047245 #10	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000008413	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00940000157209.jb #17	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920.o.a.b #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.c.a	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00530000063698.a.b	ENSGT00940000158929
Hystricomorpha_a	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00940000160814 #7	ENSGT00940000156781 #8	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00510000047245 #10	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00940000157209.jb #17	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920.o.a.b #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.c.a	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00530000063698.a.b	ENSGT00940000158929
Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000160814 #7	ENSGT00940000156781 #8	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00510000047245 #10	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00940000157209.jb #17	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920.o.a.b #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.c.a	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00940000158929	ENSGT00940000157124
Degu	MODERN SPECIES	116	MIB1 (ENSODEG00000005087) #8	ABHD3 (ENSODEG00000005394) #9	SNRPD1 (ENSODEG00000005764) #10	ENSODEG00000019279	ENSODEG00000004902 #11	GREB1L (ENSODEG00000006122) #12	ROCK1 (ENSODEG00000006532) #13	ENSODEG00000005831 #14	THOC1 (ENSODEG00000006623) #15	ENSODEG00000019254	COLEC12 (ENSODEG00000007701) #16	CETN1 (ENSODEG00000019340) #17	ENSODEG00000006402 #19	ENOSF1 (ENSODEG00000005113) #20	YES1 (ENSODEG00000005726) #21	ADCYAP1 (ENSODEG00000007089) #22	ENSODEG00000007303	ENSODEG00000019310	METTL4 (ENSODEG00000006068)	NDC80 (ENSODEG00000006479)	ENSODEG00000006655	SMCHD1 (ENSODEG00000006113)	EMILIN2 (ENSODEG00000007278)	LPIN2 (ENSODEG00000005432)	ENSODEG00000006584	MYOM1 (ENSODEG00000006774)	MYL12A (ENSODEG00000006110)	ENSODEG00000005356	TGIF1 (ENSODEG00000005910)	DLGAP1 (ENSODEG00000006056)	ENSODEG00000008032
Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	109	GATA6 (ENSCLAG00000007033) #7	MIB1 (ENSCLAG00000008780) #8	ABHD3 (ENSCLAG00000009009) #9	SNRPD1 (ENSCLAG00000008691) #10	ESCO1 (ENSCLAG00000007066) #11	GREB1L (ENSCLAG00000009372) #12	ROCK1 (ENSCLAG00000012548) #13	USP14 (ENSCLAG00000008514) #14	THOC1 (ENSCLAG00000009117) #15	COLEC12 (ENSCLAG00000008952) #16	CETN1 (ENSCLAG00000017717) #17	CLUL1 (ENSCLAG00000011935) #18	TYMS (ENSCLAG00000011426) #19	ENOSF1 (ENSCLAG00000008600) #20	YES1 (ENSCLAG00000007748) #21	ADCYAP1 (ENSCLAG00000007209) #22	ENSCLAG00000007052	ENSCLAG00000011958	METTL4 (ENSCLAG00000011739)	NDC80 (ENSCLAG00000011120)	SMCHD1 (ENSCLAG00000008351)	EMILIN2 (ENSCLAG00000007221)	LPIN2 (ENSCLAG00000016431)	MYOM1 (ENSCLAG00000009876)	MYL12A (ENSCLAG00000011666)	MYL12B (ENSCLAG00000008854)	TGIF1 (ENSCLAG00000008448)	DLGAP1 (ENSCLAG00000007165)	AKAIN1 (ENSCLAG00000012253)	ZBTB14 (ENSCLAG00000015733)	EPB41L3 (ENSCLAG00000009191)
Guinea pig	MODERN SPECIES	14	MIB1 (ENSCPOG00000005351) #8	ENSCPOG00000033037	ABHD3 (ENSCPOG00000002099) #9	SNRPD1 (ENSCPOG00000004679) #10	ENSCPOG00000002728 #11	GREB1L (ENSCPOG00000023625) #12	ROCK1 (ENSCPOG00000010474) #13	USP14 (ENSCPOG00000000958) #14	THOC1 (ENSCPOG00000000959) #15	COLEC12 (ENSCPOG00000010983) #16	CETN1 (ENSCPOG00000022066) #17	CLUL1 (ENSCPOG00000015573) #18	TYMS (ENSCPOG00000015574) #19	ENOSF1 (ENSCPOG00000015576) #20	YES1 (ENSCPOG00000015578) #21	ADCYAP1 (ENSCPOG00000015151) #22	ENSCPOG00000006064
Naked mole-rat female	MODERN SPECIES	9	ENSHGLG00000006069	SNRPD1 (ENSHGLG00000007152) #10	ESCO1 (ENSHGLG00000011303) #11	GREB1L (ENSHGLG00000017223) #12	ENSHGLG00000003509 #13	ENSHGLG00000040346	USP14 (ENSHGLG00000006110) #14	THOC1 (ENSHGLG00000003712) #15	COLEC12 (ENSHGLG00000004045) #16	CETN1 (ENSHGLG00000050145) #17	CLUL1 (ENSHGLG00000007174) #18	TYMS (ENSHGLG00000003556) #19	ENOSF1 (ENSHGLG00000004003) #20	ENSHGLG00000005389 #21	ENSHGLG00000037949	ADCYAP1 (ENSHGLG00000034296) #22	ENSHGLG00000046692	ENSHGLG00000041049	ENSHGLG00000035395	ENSHGLG00000038851	ENSHGLG00000004061	ENSHGLG00000004250	ENSHGLG00000033709	ENSHGLG00000006458	SMCHD1 (ENSHGLG00000003560)	ENSHGLG00000044239	LPIN2 (ENSHGLG00000007840)	MYOM1 (ENSHGLG00000014511)	MYL12A (ENSHGLG00000040455)	MYL12B (ENSHGLG00000034781)	TGIF1 (ENSHGLG00000018765)
Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES	31	ENSGT00940000160814 #7	ENSGT00940000156781 #8	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00510000047245 #10	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00940000157209.jb #17	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786.gb #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.c.a	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00530000063698.a.b	ENSGT00940000158264.a
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	31	ENSGT00940000160814 #7	ENSGT00940000156781 #8	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00510000047245 #10	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00940000157209.jb #17	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786.gb #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.c.a	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000162721	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00530000063698.a.b
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	195																ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.c.a	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00390000002886.b.b	ENSGT00940000162359	ENSGT00940000164798	ENSGT00940000162721
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	880																ADCYAP1 (ENSUPAG00010023280) #22
Squirrel	MODERN SPECIES	272																ADCYAP1 (ENSSTOG00000011453) #22	ENSSTOG00000024466	METTL4 (ENSSTOG00000004283)	NDC80 (ENSSTOG00000013062)	SMCHD1 (ENSSTOG00000022898)	EMILIN2 (ENSSTOG00000026733)	LPIN2 (ENSSTOG00000005772)	MYOM1 (ENSSTOG00000005796)	MYL12A (ENSSTOG00000027658)	MYL12B (ENSSTOG00000019788)	TGIF1 (ENSSTOG00000027485)	DLGAP1 (ENSSTOG00000001728)
Alpin marmot	MODERN SPECIES	10	ESCO1 (ENSMMMG00000010226) #11	ENSMMMG00000010274	GREB1L (ENSMMMG00000010290) #12	ENSMMMG00000010344	ROCK1 (ENSMMMG00000010370) #13	USP14 (ENSMMMG00000010444) #14	THOC1 (ENSMMMG00000010509) #15	COLEC12 (ENSMMMG00000010551) #16	ENSMMMG00000010565	ENSMMMG00000010580	CETN1 (ENSMMMG00000010586) #17	CLUL1 (ENSMMMG00000010598) #18	TYMS (ENSMMMG00000010633) #19	ENOSF1 (ENSMMMG00000010652) #20	YES1 (ENSMMMG00000010661) #21	ADCYAP1 (ENSMMMG00000010782) #22	METTL4 (ENSMMMG00000010797)	NDC80 (ENSMMMG00000010813)	SMCHD1 (ENSMMMG00000010857)	EMILIN2 (ENSMMMG00000011901)	LPIN2 (ENSMMMG00000011908)	MYOM1 (ENSMMMG00000011990)	MYL12A (ENSMMMG00000012076)	MYL12B (ENSMMMG00000012089)	TGIF1 (ENSMMMG00000012104)	DLGAP1 (ENSMMMG00000012118)	AKAIN1 (ENSMMMG00000012852)	ENSMMMG00000012857	ZBTB14 (ENSMMMG00000012859)	EPB41L3 (ENSMMMG00000012882)	L3MBTL4 (ENSMMMG00000013328)
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	4	ENSSVLG00005005395	ENSSVLG00005005351	ENSSVLG00005023520	ENSSVLG00005023492	ENSSVLG00005023478	ROCK1 (ENSSVLG00005023445) #13	USP14 (ENSSVLG00005023043) #14	THOC1 (ENSSVLG00005022810) #15	ENSSVLG00005022749	COLEC12 (ENSSVLG00005022720) #16	CETN1 (ENSSVLG00005022708) #17	CLUL1 (ENSSVLG00005022648) #18	ENSSVLG00005022566 #19	ENOSF1 (ENSSVLG00005022213) #20	ENSSVLG00005022001 #21	ADCYAP1 (ENSSVLG00005021960) #22	ENSSVLG00005021938	ENSSVLG00005021834	NDC80 (ENSSVLG00005021715)	ENSSVLG00005021684	SMCHD1 (ENSSVLG00005021629)	EMILIN2 (ENSSVLG00005021595)	LPIN2 (ENSSVLG00005021537)	MYOM1 (ENSSVLG00005020656)	MYL12A (ENSSVLG00005020518)	MYL12B (ENSSVLG00005020487)	TGIF1 (ENSSVLG00005020396)	DLGAP1 (ENSSVLG00005019856)	ENSSVLG00005019491	AKAIN1 (ENSSVLG00005019389)	ENSSVLG00005019313
Lagomorpha	ANCESTRAL SPECIES	41	ENSGT00940000156781 #8	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00510000047245 #10	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT00390000008413	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00940000157209.jb #17	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n.p	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.c.a	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000164798	ENSGT00940000162721	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047
Pika	MODERN SPECIES	8662																ENSOPRG00000010958 #22
Rabbit	MODERN SPECIES	20	MIB1 (ENSOCUG00000005755) #8	ENSOCUG00000009176 #9	SNRPD1 (ENSOCUG00000023761) #10	ESCO1 (ENSOCUG00000009587) #11	GREB1L (ENSOCUG00000010962) #12	ENSOCUG00000033695	ROCK1 (ENSOCUG00000004848) #13	USP14 (ENSOCUG00000011595) #14	THOC1 (ENSOCUG00000011601) #15	COLEC12 (ENSOCUG00000022216) #16	CETN1 (ENSOCUG00000009188) #17	CLUL1 (ENSOCUG00000008658) #18	ENSOCUG00000008667 #19	ENOSF1 (ENSOCUG00000008678) #20	YES1 (ENSOCUG00000005874) #21	ADCYAP1 (ENSOCUG00000009463) #22	ENSOCUG00000024410	METTL4 (ENSOCUG00000022390)	NDC80 (ENSOCUG00000015410)	SMCHD1 (ENSOCUG00000000020)	EMILIN2 (ENSOCUG00000002553)	LPIN2 (ENSOCUG00000009433)	MYOM1 (ENSOCUG00000008571)	ENSOCUG00000021304	TGIF1 (ENSOCUG00000013752)	ENSOCUG00000037037	ENSOCUG00000029174	DLGAP1 (ENSOCUG00000013763)	AKAIN1 (ENSOCUG00000035231)	ENSOCUG00000023402	ZBTB14 (ENSOCUG00000004131)
Laurasiatheria	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00940000156781 #8	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00510000047245 #10	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT00390000008413	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00940000157209.jb #17	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.c.a	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230	ENSGT00900000143817	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00530000063698.a.b
Eulipotyphla	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183154.b.a.b #22
Common shrew	MODERN SPECIES	9898																ADCYAP1 (ENSSARG00000003394) #22
Laurasiatheria_a	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00510000047245 #10	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT00940000158528.y.b	ENSGT00390000008413	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00940000157209.jb #17	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.c.a.d	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230	ENSGT00900000143817	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00530000063698.a.b
Artiodactyla	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00510000047245 #10	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT00940000158528.y.b	ENSGT00390000008413	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00940000157209.jb #17	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.c.a.d	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230	ENSGT00900000143817	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00530000063698.a.b
Suina	ANCESTRAL SPECIES	40	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00510000047245 #10	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT00940000158528.y.b	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000008413	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00940000157209.jb #17	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.c.a.d	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000162721	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00530000063698.a.b
Pig	MODERN SPECIES	14	ENSSSCG00000054355	ESCO1 (ENSSSCG00000003700) #11	GREB1L (ENSSSCG00000003699) #12	ENSSSCG00000058549	ENSSSCG00000026051	ROCK1 (ENSSSCG00000021893) #13	USP14 (ENSSSCG00000022559) #14	THOC1 (ENSSSCG00000025653) #15	COLEC12 (ENSSSCG00000040397) #16	CETN1 (ENSSSCG00000028613) #17	CLUL1 (ENSSSCG00000039398) #18	TYMS (ENSSSCG00000040678) #19	ENOSF1 (ENSSSCG00000027169) #20	YES1 (ENSSSCG00000031942) #21	ENSSSCG00000040699	ADCYAP1 (ENSSSCG00000035186) #22	ENSSSCG00000059038	METTL4 (ENSSSCG00000034816)	ENSSSCG00000020888	NDC80 (ENSSSCG00000003697)	SMCHD1 (ENSSSCG00000029030)	EMILIN2 (ENSSSCG00000003694)	LPIN2 (ENSSSCG00000038494)	MYOM1 (ENSSSCG00000003693)	ENSSSCG00000003691	MYL12B (ENSSSCG00000058470)	TGIF1 (ENSSSCG00000024174)	DLGAP1 (ENSSSCG00000003690)	AKAIN1 (ENSSSCG00000056207)	ZBTB14 (ENSSSCG00000033032)	ENSSSCG00000036800
Chacoan peccary	MODERN SPECIES	862	ABHD3 (ENSCWAG00000006170) #9	SNRPD1 (ENSCWAG00000006264) #10	ESCO1 (ENSCWAG00000006297) #11	GREB1L (ENSCWAG00000006367) #12	ENSCWAG00000006707	ROCK1 (ENSCWAG00000006719) #13	ENSCWAG00000006766	USP14 (ENSCWAG00000006785) #14	THOC1 (ENSCWAG00000006881) #15	COLEC12 (ENSCWAG00000006994) #16	CETN1 (ENSCWAG00000007027) #17	CLUL1 (ENSCWAG00000007055) #18	TYMS (ENSCWAG00000007139) #19	ENOSF1 (ENSCWAG00000007242) #20	YES1 (ENSCWAG00000007475) #21	ADCYAP1 (ENSCWAG00000007502) #22	METTL4 (ENSCWAG00000007542)	NDC80 (ENSCWAG00000007581)	SMCHD1 (ENSCWAG00000007610)	EMILIN2 (ENSCWAG00000007714)	LPIN2 (ENSCWAG00000007732)	MYOM1 (ENSCWAG00000007790)	MYL12A (ENSCWAG00000008049)	TGIF1 (ENSCWAG00000008192)	DLGAP1 (ENSCWAG00000008322)	AKAIN1 (ENSCWAG00000010892)	ENSCWAG00000010946	ZBTB14 (ENSCWAG00000011021)	EPB41L3 (ENSCWAG00000011105)	TMEM200C (ENSCWAG00000012298)	ARHGAP28 (ENSCWAG00000012324)
Artiodactyla_a	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00510000047245 #10	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT00940000158528.y.b	ENSGT00390000008413	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00940000157209.jb #17	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.c.a.d	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230	ENSGT00900000143817	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00530000063698.a.b
Artiodactyla_b	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00510000047245 #10	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT00940000158528.y.b	ENSGT00390000008413	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00940000157209.jb #17	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.c.a.d	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230	ENSGT00900000143817	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00530000063698.a.b
Cetacea	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000156781 #8	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00510000047245 #10	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT00390000008413	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00940000157209.jb #17	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.c.a.d	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230	ENSGT00940000156220	ENSGT01010000224919	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00530000063698.a.b	ENSGT00940000158264.a
Odontoceti	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00510000047245 #10	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00940000155294.l	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT00390000008413	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00940000157209.jb #17	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000001347.v.o.b.b	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.c.a.d	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230	ENSGT00940000156220	ENSGT01010000224919	ENSGT00550000074618.a.b.`b	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000162721
Odontoceti_a	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00510000047245 #10	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00940000155294.l	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000008413	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00940000157209.jb #17	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000001347.v.o.b.b	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.c.a.d	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230	ENSGT00940000156220	ENSGT01010000224919	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000162721	ENSGT00940000158052.a
Dolphin	MODERN SPECIES	5359																ADCYAP1 (ENSTTRG00000012319) #22
Odontoceti_b	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00510000047245 #10	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00940000155294.l	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000008413	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00940000157209.jb #17	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000001347.v.o.b.b	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.c.a.d	ENSGT00940000155230	ENSGT00940000156220	ENSGT01010000224919	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000162721	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047
Monodontidae	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000156781 #8	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00510000047245 #10	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00940000155294.l	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00940000157209.jb #17	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000001347.v.o.b.b	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.c.a.d	ENSGT00940000155230	ENSGT00940000156220	ENSGT01010000224919	ENSGT00940000162721	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00530000063698.a.b
Beluga whale	MODERN SPECIES	11	ABHD3 (ENSDLEG00000002699) #9	ENSDLEG00000002691	ESCO1 (ENSDLEG00000002679) #11	ENSDLEG00000002664	GREB1L (ENSDLEG00000002648) #12	ROCK1 (ENSDLEG00000001559) #13	USP14 (ENSDLEG00000001356) #14	THOC1 (ENSDLEG00000001319) #15	COLEC12 (ENSDLEG00000001294) #16	CETN1 (ENSDLEG00000001281) #17	ENSDLEG00000001276	CLUL1 (ENSDLEG00000001237) #18	TYMS (ENSDLEG00000001214) #19	ENOSF1 (ENSDLEG00000001162) #20	YES1 (ENSDLEG00000001143) #21	ADCYAP1 (ENSDLEG00000001127) #22
Narwhal	MODERN SPECIES	295	ABHD3 (ENSMMNG00015002649) #9	SNRPD1 (ENSMMNG00015002697) #10	ESCO1 (ENSMMNG00015002715) #11	GREB1L (ENSMMNG00015002756) #12	ENSMMNG00015002781	ROCK1 (ENSMMNG00015002800) #13	USP14 (ENSMMNG00015002856) #14	THOC1 (ENSMMNG00015002926) #15	COLEC12 (ENSMMNG00015002996) #16	CETN1 (ENSMMNG00015003008) #17	ENSMMNG00015003019	CLUL1 (ENSMMNG00015003042) #18	TYMS (ENSMMNG00015003074) #19	ENOSF1 (ENSMMNG00015003115) #20	YES1 (ENSMMNG00015003176) #21	ADCYAP1 (ENSMMNG00015003197) #22	ENSMMNG00015003209	METTL4 (ENSMMNG00015003242)	NDC80 (ENSMMNG00015003275)	SMCHD1 (ENSMMNG00015003318)	EMILIN2 (ENSMMNG00015003399)	LPIN2 (ENSMMNG00015003446)	MYOM1 (ENSMMNG00015003548)	MYL12A (ENSMMNG00015003634)	TGIF1 (ENSMMNG00015003660)	DLGAP1 (ENSMMNG00015003747)	ENSMMNG00015003903	ENSMMNG00015003912	ENSMMNG00015003932	ENSMMNG00015003955	ENSMMNG00015003965
Vaquita	MODERN SPECIES	5	ENSPSNG00000010390 #10	ESCO1 (ENSPSNG00000010476) #11	GREB1L (ENSPSNG00000010662) #12	ENSPSNG00000011306	ENSPSNG00000011344	ROCK1 (ENSPSNG00000011400) #13	ENSPSNG00000011473	USP14 (ENSPSNG00000011553) #14	THOC1 (ENSPSNG00000011756) #15	COLEC12 (ENSPSNG00000012020) #16	CETN1 (ENSPSNG00000012140) #17	CLUL1 (ENSPSNG00000012188) #18	TYMS (ENSPSNG00000012361) #19	ENOSF1 (ENSPSNG00000012510) #20	YES1 (ENSPSNG00000009957) #21	ADCYAP1 (ENSPSNG00000010057) #22	ENSPSNG00000010128	METTL4 (ENSPSNG00000010163)	NDC80 (ENSPSNG00000010241)	SMCHD1 (ENSPSNG00000010317)	EMILIN2 (ENSPSNG00000010385)	LPIN2 (ENSPSNG00000010441)	MYOM1 (ENSPSNG00000010586)	ENSPSNG00000010695	MYL12A (ENSPSNG00000010765)	ENSPSNG00000010881	TGIF1 (ENSPSNG00000010898)	DLGAP1 (ENSPSNG00000011076)	ENSPSNG00000012311	ENSPSNG00000012349	ENSPSNG00000012382
Sperm whale	MODERN SPECIES	10	ABHD3 (ENSPCTG00005021217) #9	SNRPD1 (ENSPCTG00005021051) #10	ESCO1 (ENSPCTG00005020846) #11	ENSPCTG00005020753	GREB1L (ENSPCTG00005020618) #12	ENSPCTG00005020445	ROCK1 (ENSPCTG00005019865) #13	USP14 (ENSPCTG00005019421) #14	THOC1 (ENSPCTG00005018960) #15	COLEC12 (ENSPCTG00005018845) #16	CETN1 (ENSPCTG00005018754) #17	CLUL1 (ENSPCTG00005018544) #18	TYMS (ENSPCTG00005018401) #19	ENOSF1 (ENSPCTG00005017789) #20	YES1 (ENSPCTG00005017702) #21	ADCYAP1 (ENSPCTG00005017646) #22	ENSPCTG00005017589	ENSPCTG00005017559	METTL4 (ENSPCTG00005017412)	NDC80 (ENSPCTG00005017125)	SMCHD1 (ENSPCTG00005016939)	EMILIN2 (ENSPCTG00005016847)	LPIN2 (ENSPCTG00005016430)	MYOM1 (ENSPCTG00005016147)	MYL12A (ENSPCTG00005015983)	TGIF1 (ENSPCTG00005015886)	DLGAP1 (ENSPCTG00005014046)	ENSPCTG00005013911	ENSPCTG00005013869	AKAIN1 (ENSPCTG00005013812)	ENSPCTG00005013791
Blue whale	MODERN SPECIES	5	ABHD3 (ENSBMSG00010013129) #9	SNRPD1 (ENSBMSG00010013103) #10	ESCO1 (ENSBMSG00010013074) #11	GREB1L (ENSBMSG00010012948) #12	ENSBMSG00010012914	ROCK1 (ENSBMSG00010012890) #13	USP14 (ENSBMSG00010012847) #14	THOC1 (ENSBMSG00010012796) #15	COLEC12 (ENSBMSG00010012758) #16	CETN1 (ENSBMSG00010012744) #17	ENSBMSG00010012735	CLUL1 (ENSBMSG00010012683) #18	ENSBMSG00010012644 #19	ENOSF1 (ENSBMSG00010012605) #20	YES1 (ENSBMSG00010012578) #21	ADCYAP1 (ENSBMSG00010012565) #22	METTL4 (ENSBMSG00010012557)	NDC80 (ENSBMSG00010012545)	SMCHD1 (ENSBMSG00010012525)	EMILIN2 (ENSBMSG00010012492)	LPIN2 (ENSBMSG00010012467)	ENSBMSG00010012448	MYOM1 (ENSBMSG00010012336)	MYL12A (ENSBMSG00010012284)	TGIF1 (ENSBMSG00010012268)	ENSBMSG00010012252	DLGAP1 (ENSBMSG00010012009)	ENSBMSG00010011936	ENSBMSG00010011932	ENSBMSG00010011908	ENSBMSG00010011894
Pecora	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00510000047245 #10	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT00940000158528.y.b	ENSGT00390000008413	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00940000157209.jb #17	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.c.a.d	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230	ENSGT00900000143817	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00530000063698.a.b
Yarkand deer	MODERN SPECIES	19	ABHD3 (ENSCHYG00000020338) #9	ENSCHYG00000020240 #10	ESCO1 (ENSCHYG00000020069) #11	GREB1L (ENSCHYG00000019949) #12	ENSCHYG00000019921	ENSCHYG00000019893	ROCK1 (ENSCHYG00000019635) #13	USP14 (ENSCHYG00000019218) #14	THOC1 (ENSCHYG00000018198) #15	COLEC12 (ENSCHYG00000017963) #16	ENSCHYG00000017911 #17	CLUL1 (ENSCHYG00000017782) #18	TYMS (ENSCHYG00000017585) #19	ENOSF1 (ENSCHYG00000016711) #20	YES1 (ENSCHYG00000016589) #21	ADCYAP1 (ENSCHYG00000016541) #22	ENSCHYG00000016472	METTL4 (ENSCHYG00000016298)	NDC80 (ENSCHYG00000016070)	SMCHD1 (ENSCHYG00000015325)	EMILIN2 (ENSCHYG00000015216)	ENSCHYG00000014880	ENSCHYG00000014825	MYOM1 (ENSCHYG00000014067)	ENSCHYG00000026009	MYL12B (ENSCHYG00000025995)	TGIF1 (ENSCHYG00000025940)	DLGAP1 (ENSCHYG00000025662)	ENSCHYG00000025600	ENSCHYG00000025583	ENSCHYG00000025565
Percora_a	ANCESTRAL SPECIES	28	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00510000047245 #10	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT00940000158528.y.b	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000008413	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00940000157209.jb #17	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.c.a.d	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230	ENSGT00900000143817	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00530000063698.a.b
Bovidae	ANCESTRAL SPECIES	28	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00510000047245 #10	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT00940000158528.y.b	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000008413	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00940000157209.jb #17	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.c.a.d	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230	ENSGT00900000143817	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00530000063698.a.b
Bovinae	ANCESTRAL SPECIES	28	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00510000047245.w.a.a #10	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT00940000158528.y.b	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000008413	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00940000157209.jb #17	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.c.a.d	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230	ENSGT00900000143817	ENSGT00940000156220.i	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00530000063698.a.b
Bos	ANCESTRAL SPECIES	29	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00510000047245.w.a.a.a #10	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT00940000158528.y.b	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000008413	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00940000157209.jb #17	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786.s #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.c.a.d	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230	ENSGT00940000156220.i	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00530000063698.a.b	ENSGT00940000158929
Bos_a	ANCESTRAL SPECIES	28	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00510000047245.w.a.a.a #10	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT00940000158528.y.b	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000008413	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00940000157209.jb #17	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786.s #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.c.a.d	ENSGT00940000155230	ENSGT00940000156220.i	ENSGT01050000245099	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00940000158929	ENSGT00940000157124
Wild yak	MODERN SPECIES	800																ADCYAP1 (ENSBMUG00000021635) #22	ENSBMUG00000021659
Domestic yak	MODERN SPECIES	13	ABHD3 (ENSBGRG00000015775) #9	ENSBGRG00000015913 #10	ESCO1 (ENSBGRG00000016049) #11	GREB1L (ENSBGRG00000016253) #12	ENSBGRG00000017126	ROCK1 (ENSBGRG00000017206) #13	USP14 (ENSBGRG00000018352) #14	THOC1 (ENSBGRG00000018777) #15	COLEC12 (ENSBGRG00000019242) #16	ENSBGRG00000019349 #17	CETN1 (ENSBGRG00000019384) #17	CLUL1 (ENSBGRG00000019406) #18	ENSBGRG00000019538 #19	ENOSF1 (ENSBGRG00000019894) #20	YES1 (ENSBGRG00000020429) #21	ADCYAP1 (ENSBGRG00000020763) #22	METTL4 (ENSBGRG00000020859)	NDC80 (ENSBGRG00000021015)	SMCHD1 (ENSBGRG00000021081)	ENSBGRG00000021468	EMILIN2 (ENSBGRG00000021481)	LPIN2 (ENSBGRG00000021549)	MYOM1 (ENSBGRG00000022019)	MYL12A (ENSBGRG00000022681)	ENSBGRG00000022793	TGIF1 (ENSBGRG00000022806)	DLGAP1 (ENSBGRG00000022857)	ENSBGRG00000023385	ZBTB14 (ENSBGRG00000023412)	EPB41L3 (ENSBGRG00000023492)	ENSBGRG00000023895
Bos_b	ANCESTRAL SPECIES	34	ENSGT00510000047245.w.a.a.a #10	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT00940000158528.y.b	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000008413	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT01100000263480.a.a.b.b.b.a.a.b.a.a.b.b.a.a.a.b	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00940000157209.jb #17	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786.s #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.c.a.d	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230	ENSGT00940000156220.i	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00530000063698.a.b	ENSGT00940000158929
Cow	MODERN SPECIES	16	SNRPD1 (ENSBTAG00000008292) #10	ESCO1 (ENSBTAG00000017597) #11	GREB1L (ENSBTAG00000008275) #12	MGC133647 (ENSBTAG00000019199)	ROCK1 (ENSBTAG00000008403) #13	ENSBTAG00000053971	USP14 (ENSBTAG00000019214) #14	ENSBTAG00000050160	THOC1 (ENSBTAG00000019215) #15	COLEC12 (ENSBTAG00000007705) #16	CETN1 (ENSBTAG00000012320) #17	CLUL1 (ENSBTAG00000014012) #18	TYMS (ENSBTAG00000007003) #19	ENOSF1 (ENSBTAG00000007000) #20	YES1 (ENSBTAG00000001523) #21	ADCYAP1 (ENSBTAG00000020650) #22	METTL4 (ENSBTAG00000021668)	NDC80 (ENSBTAG00000021673)	SMCHD1 (ENSBTAG00000003354)	EMILIN2 (ENSBTAG00000003880)	LPIN2 (ENSBTAG00000012060)	MYOM1 (ENSBTAG00000019585)	MYL12A (ENSBTAG00000016024)	MYL12B (ENSBTAG00000026266)	TGIF1 (ENSBTAG00000007718)	DLGAP1 (ENSBTAG00000005372)	ENSBTAG00000053533	ZBTB14 (ENSBTAG00000038970)	EPB41L3 (ENSBTAG00000019251)	TMEM200C (ENSBTAG00000046396)	ARHGAP28 (ENSBTAG00000019036)
Hybrid Bos Indicus	MODERN SPECIES	16	ESCO1 (ENSBIXG00005002128) #11	GREB1L (ENSBIXG00005014753) #12	ENSBIXG00005005636	ROCK1 (ENSBIXG00005014500) #13	ENSBIXG00005014411	USP14 (ENSBIXG00005014390) #14	ENSBIXG00005014256	THOC1 (ENSBIXG00005014244) #15	COLEC12 (ENSBIXG00005014170) #16	ENSBIXG00005014136	CETN1 (ENSBIXG00005001842) #17	CLUL1 (ENSBIXG00005014105) #18	TYMS (ENSBIXG00005001829) #19	ENOSF1 (ENSBIXG00005014007) #20	YES1 (ENSBIXG00005013763) #21	ADCYAP1 (ENSBIXG00005013724) #22	ENSBIXG00005013699	METTL4 (ENSBIXG00005013634)	NDC80 (ENSBIXG00005007711)	SMCHD1 (ENSBIXG00005013581)	EMILIN2 (ENSBIXG00005013554)	LPIN2 (ENSBIXG00005013528)	MYOM1 (ENSBIXG00005013491)	MYL12A (ENSBIXG00005013437)	MYL12B (ENSBIXG00005007006)	TGIF1 (ENSBIXG00005006727)	DLGAP1 (ENSBIXG00005013290)	AKAIN1 (ENSBIXG00005012720)	ZBTB14 (ENSBIXG00005012690)	EPB41L3 (ENSBIXG00005012607)	ENSBIXG00005012473
American bison	MODERN SPECIES	3353	ABHD3 (ENSBBBG00000021029) #9	ENSBBBG00000021043 #10	ESCO1 (ENSBBBG00000021071) #11	GREB1L (ENSBBBG00000021225) #12	ENSBBBG00000021246	ENSBBBG00000021252	ROCK1 (ENSBBBG00000021280) #13	USP14 (ENSBBBG00000021442) #14	THOC1 (ENSBBBG00000021526) #15	COLEC12 (ENSBBBG00000021543) #16	CETN1 (ENSBBBG00000021550) #17	CLUL1 (ENSBBBG00000005743) #18	TYMS (ENSBBBG00000021622) #19	ENOSF1 (ENSBBBG00000021739) #20	YES1 (ENSBBBG00000021791) #21	ADCYAP1 (ENSBBBG00000021821) #22	ENSBBBG00000021828
Caprinae	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00510000047245 #10	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT00940000158528.y.b	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000008413	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00940000157209.jb #17	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.c.a.d	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00530000063698.a.b	ENSGT00940000158929
Rambouillet Sheep	MODERN SPECIES	15	SNRPD1 (ENSOARG00020006388) #10	ESCO1 (ENSOARG00020006426) #11	GREB1L (ENSOARG00020006670) #12	ENSOARG00020007128	ROCK1 (ENSOARG00020007167) #13	ENSOARG00020007491	USP14 (ENSOARG00020007526) #14	THOC1 (ENSOARG00020007727) #15	ENSOARG00020008122	COLEC12 (ENSOARG00020008142) #16	CETN1 (ENSOARG00020008212) #17	CLUL1 (ENSOARG00020008252) #18	TYMS (ENSOARG00020008409) #19	ENOSF1 (ENSOARG00020008665) #20	YES1 (ENSOARG00020009131) #21	ADCYAP1 (ENSOARG00020009231) #22	ENSOARG00020009340	METTL4 (ENSOARG00020009416)	NDC80 (ENSOARG00020009483)	SMCHD1 (ENSOARG00020009606)	LPIN2 (ENSOARG00020010928)	MYOM1 (ENSOARG00020011271)	MRCL3 (ENSOARG00020012194)	MYL12B (ENSOARG00020012316)	tgif1 (ENSOARG00020012393)	DLGAP1 (ENSOARG00020012505)	ENSOARG00020015037	AKAIN1 (ENSOARG00020015062)	ZBTB14 (ENSOARG00020015102)	EPB41L3 (ENSOARG00020015184)	TMEM200C (ENSOARG00020016296)
Goat	MODERN SPECIES	16	ESCO1 (ENSCHIG00000016783) #11	GREB1L (ENSCHIG00000025994) #12	ENSCHIG00000009159	ENSCHIG00000008866	ROCK1 (ENSCHIG00000016132) #13	ENSCHIG00000001073	USP14 (ENSCHIG00000006538) #14	THOC1 (ENSCHIG00000015399) #15	COLEC12 (ENSCHIG00000019421) #16	CETN1 (ENSCHIG00000006822) #17	CLUL1 (ENSCHIG00000012461) #18	TYMS (ENSCHIG00000000075) #19	ENOSF1 (ENSCHIG00000000109) #20	YES1 (ENSCHIG00000000143) #21	ENSCHIG00000000177	ADCYAP1 (ENSCHIG00000000212) #22	METTL4 (ENSCHIG00000000254)	NDC80 (ENSCHIG00000000360)	SMCHD1 (ENSCHIG00000000392)	EMILIN2 (ENSCHIG00000000425)	ENSCHIG00000000471	LPIN2 (ENSCHIG00000010140)	MYOM1 (ENSCHIG00000014135)	MYL12A (ENSCHIG00000016398)	MYL12B (ENSCHIG00000009461)	TGIF1 (ENSCHIG00000011164)	DLGAP1 (ENSCHIG00000017982)	ZBTB14 (ENSCHIG00000004440)	EPB41L3 (ENSCHIG00000023908)	TMEM200C (ENSCHIG00000004586)	ARHGAP28 (ENSCHIG00000022452)
Siberian musk deer	MODERN SPECIES	133	ABHD3 (ENSMMSG00000011048) #9	ENSMMSG00000011024 #10	ESCO1 (ENSMMSG00000010978) #11	GREB1L (ENSMMSG00000010597) #12	ENSMMSG00000010539	ENSMMSG00000010533	ROCK1 (ENSMMSG00000010339) #13	USP14 (ENSMMSG00000010140) #14	THOC1 (ENSMMSG00000010050) #15	COLEC12 (ENSMMSG00000009983) #16	CETN1 (ENSMMSG00000009976) #17	CLUL1 (ENSMMSG00000009855) #18	TYMS (ENSMMSG00000009666) #19	ENOSF1 (ENSMMSG00000009429) #20	YES1 (ENSMMSG00000009357) #21	ADCYAP1 (ENSMMSG00000009322) #22
Camelidae	ANCESTRAL SPECIES	84											ENSGT00940000157209.jb #17	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.c.a.d	ENSGT00940000155230	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00530000063698.a.b	ENSGT00940000158264.a	ENSGT00940000158929
Arabian camel	MODERN SPECIES	16	ABHD3 (ENSCDRG00005019951) #9	ENSCDRG00005019965	SNRPD1 (ENSCDRG00005019969) #10	ESCO1 (ENSCDRG00005019991) #11	GREB1L (ENSCDRG00005020029) #12	ENSCDRG00005020064	ROCK1 (ENSCDRG00005020081) #13	ENSCDRG00005020152	USP14 (ENSCDRG00005020182) #14	THOC1 (ENSCDRG00005020293) #15	COLEC12 (ENSCDRG00005020320) #16	CLUL1 (ENSCDRG00005020348) #18	ENSCDRG00005020370 #19	ENOSF1 (ENSCDRG00005020452) #20	YES1 (ENSCDRG00005020509) #21	ADCYAP1 (ENSCDRG00005020536) #22	METTL4 (ENSCDRG00005020546)	NDC80 (ENSCDRG00005008870)	SMCHD1 (ENSCDRG00005009045)	EMILIN2 (ENSCDRG00005009377)	LPIN2 (ENSCDRG00005009560)	MYOM1 (ENSCDRG00005009826)	MYL12A (ENSCDRG00005010206)	TGIF1 (ENSCDRG00005010359)	DLGAP1 (ENSCDRG00005010492)	AKAIN1 (ENSCDRG00005012508)	ZBTB14 (ENSCDRG00005012548)	EPB41L3 (ENSCDRG00005012623)	L3MBTL4 (ENSCDRG00005013404)	ARHGAP28 (ENSCDRG00005013537)	LAMA1 (ENSCDRG00005013670)
Alpaca	MODERN SPECIES	2171												CETN1 (ENSVPAG00000005631) #17	CLUL1 (ENSVPAG00000005634) #18	TYMS (ENSVPAG00000005636) #19	YES1 (ENSVPAG00000005639) #21	ENSVPAG00000005641 #22
Laurasiatheria_b	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00510000047245 #10	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT00940000158528.y.b	ENSGT00390000008413	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00940000157209.jb #17	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.c.a.d	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230	ENSGT00900000143817	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00530000063698.a.b
Carnivora	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00510000047245 #10	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT00940000158528.y.b	ENSGT00390000008413	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00940000173400	ENSGT00940000157209.jb #17	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.c.a.d	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230	ENSGT00900000143817	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00530000063698.a.b
Caniformia	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00510000047245 #10	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT00940000158528.y.b	ENSGT00390000008413	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00940000173400	ENSGT00940000157209.jb #17	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.c.a.d	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00530000063698.a.b	ENSGT00940000158264.a
Caniformia_b	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00510000047245 #10	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT00940000158528.y.b	ENSGT00390000008413	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00940000173400	ENSGT00940000157209.jb #17	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.c.a.d	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00530000063698.a.b	ENSGT00940000158264.a
Ursidae	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00510000047245 #10	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT00940000158528.y.b	ENSGT00390000008413	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00940000173400	ENSGT00940000157209.jb #17	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.c.a.d	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00940000158264.a	ENSGT00940000158929
Ursus	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00510000047245 #10	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT00390000008413	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00940000173400	ENSGT00940000157209.jb #17	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.c.a.d	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00940000158264.a	ENSGT00940000158929
American black bear	MODERN SPECIES	3666																ADCYAP1 (ENSUAMG00000016381) #22
Polar bear	MODERN SPECIES	96	SNRPD1 (ENSUMAG00000019740) #10	ESCO1 (ENSUMAG00000019729) #11	GREB1L (ENSUMAG00000019718) #12	ENSUMAG00000019713	ROCK1 (ENSUMAG00000019708) #13	USP14 (ENSUMAG00000019700) #14	THOC1 (ENSUMAG00000019693) #15	COLEC12 (ENSUMAG00000019688) #16	ENSUMAG00000019685	CETN1 (ENSUMAG00000019682) #17	CLUL1 (ENSUMAG00000019680) #18	TYMS (ENSUMAG00000019677) #19	ENOSF1 (ENSUMAG00000019674) #20	YES1 (ENSUMAG00000019673) #21	ENSUMAG00000019669	ADCYAP1 (ENSUMAG00000019664) #22	METTL4 (ENSUMAG00000019651)	NDC80 (ENSUMAG00000019602)	SMCHD1 (ENSUMAG00000019575)	EMILIN2 (ENSUMAG00000019556)	LPIN2 (ENSUMAG00000019544)	MYOM1 (ENSUMAG00000019140)	MYL12A (ENSUMAG00000019097)	MYL12B (ENSUMAG00000019096)	TGIF1 (ENSUMAG00000019091)	DLGAP1 (ENSUMAG00000018976)	AKAIN1 (ENSUMAG00000018955)	ZBTB14 (ENSUMAG00000018942)	EPB41L3 (ENSUMAG00000018925)	L3MBTL4 (ENSUMAG00000018879)	ARHGAP28 (ENSUMAG00000018815)
Giant Panda	MODERN SPECIES	5	SNRPD1 (ENSAMEG00000002576) #10	ESCO1 (ENSAMEG00000002565) #11	ENSAMEG00000002529 #12	ENSAMEG00000030689	ENSAMEG00000025006	ENSAMEG00000006719 #13	ENSAMEG00000006687 #14	THOC1 (ENSAMEG00000006645) #15	COLEC12 (ENSAMEG00000006640) #16	CETN1 (ENSAMEG00000019837) #17	CLUL1 (ENSAMEG00000006626) #18	ENSAMEG00000025934	TYMS (ENSAMEG00000006607) #19	ENOSF1 (ENSAMEG00000006581) #20	YES1 (ENSAMEG00000006544) #21	ADCYAP1 (ENSAMEG00000006537) #22	METTL4 (ENSAMEG00000010116)	NDC80 (ENSAMEG00000010069)	SMCHD1 (ENSAMEG00000010022)	EMILIN2 (ENSAMEG00000009998)	LPIN2 (ENSAMEG00000009951)	MYOM1 (ENSAMEG00000010570)	MYL12A (ENSAMEG00000026960)	MYL12B (ENSAMEG00000028707)	TGIF1 (ENSAMEG00000012674)	DLGAP1 (ENSAMEG00000012677)	AKAIN1 (ENSAMEG00000020013)	ZBTB14 (ENSAMEG00000020014)	EPB41L3 (ENSAMEG00000000602)	L3MBTL4 (ENSAMEG00000006857)	ARHGAP28 (ENSAMEG00000006845)
Mustelinae	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00510000047245 #10	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT00940000158528.y.b	ENSGT00390000008413	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00940000157209.jb #17	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.c.a.d	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00530000063698.a.b	ENSGT00940000158264.a
American mink	MODERN SPECIES	1	SNRPD1 (ENSNVIG00000017733) #10	ENSNVIG00000017721	ENSNVIG00000017713 #11	GREB1L (ENSNVIG00000017531) #12	ENSNVIG00000017507	ENSNVIG00000017499	ROCK1 (ENSNVIG00000017449) #13	USP14 (ENSNVIG00000017207) #14	THOC1 (ENSNVIG00000017093) #15	COLEC12 (ENSNVIG00000017013) #16	CETN1 (ENSNVIG00000017007) #17	CLUL1 (ENSNVIG00000016951) #18	ENSNVIG00000016905 #19	ENOF1 (ENSNVIG00000016781) #20	YES1 (ENSNVIG00000016753) #21	PACA (ENSNVIG00000016719) #22
Ferret	MODERN SPECIES	170	MIB1 (ENSMPUG00000005601) #8	ENSMPUG00000005594	ABHD3 (ENSMPUG00000005583) #9	ENSMPUG00000005567 #10	ESCO1 (ENSMPUG00000005547) #11	GREB1L (ENSMPUG00000005516) #12	ENSMPUG00000019884	ROCK1 (ENSMPUG00000005488) #13	USP14 (ENSMPUG00000005469) #14	THOC1 (ENSMPUG00000005448) #15	COLEC12 (ENSMPUG00000005437) #16	CLUL1 (ENSMPUG00000005429) #18	TYMS (ENSMPUG00000005419) #19	ENOSF1 (ENSMPUG00000005407) #20	YES1 (ENSMPUG00000005394) #21	ADCYAP1 (ENSMPUG00000005386) #22	ENSMPUG00000019883	METTL4 (ENSMPUG00000005375)	NDC80 (ENSMPUG00000005356)	SMCHD1 (ENSMPUG00000005190)	EMILIN2 (ENSMPUG00000005128)	LPIN2 (ENSMPUG00000005110)	MYOM1 (ENSMPUG00000005090)	MYL12A (ENSMPUG00000005057)	ENSMPUG00000005055	MYL12B (ENSMPUG00000005011)	TGIF1 (ENSMPUG00000005004)	DLGAP1 (ENSMPUG00000004995)	ZBTB14 (ENSMPUG00000004990)	EPB41L3 (ENSMPUG00000004981)	ENSMPUG00000019882
Canidae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000156781 #8	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00510000047245 #10	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT00940000158528.y.b	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00940000157209.jb #17	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016292.i.b	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.c.a.d	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00530000063698.a.b
Canis_lupus	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000156781 #8	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00510000047245 #10	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT00940000158528.y.b	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00940000157209.jb #17	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016292.i.b	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.c.a.d	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155458.pc	ENSGT00940000155230	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047
Dingo	MODERN SPECIES	271	MIB1 (ENSCAFG00020015643) #8	ABHD3 (ENSCAFG00020015911) #9	SNRPD1 (ENSCAFG00020015914) #10	ESCO1 (ENSCAFG00020015918) #11	GREB1L (ENSCAFG00020015929) #12	ENSCAFG00020015952	ROCK1 (ENSCAFG00020016061) #13	USP14 (ENSCAFG00020017885) #14	THOC1 (ENSCAFG00020017894) #15	COLEC12 (ENSCAFG00020017907) #16	CETN1 (ENSCAFG00020017909) #17	CLUL1 (ENSCAFG00020017912) #18	TYMS (ENSCAFG00020017917) #19	ENOSF1 (ENSCAFG00020017932) #20	YES1 (ENSCAFG00020018034) #21	ADCYAP1 (ENSCAFG00020020268) #22	ENSCAFG00020020280	ENSCAFG00020020296	ENSCAFG00020020307	ENSCAFG00020020312	METTL4 (ENSCAFG00020020313)	NDC80 (ENSCAFG00020020317)	SMCHD1 (ENSCAFG00020020366)	EMILIN2 (ENSCAFG00020020531)	LPIN2 (ENSCAFG00020020533)	MYOM1 (ENSCAFG00020020583)	ENSCAFG00020020906	MYL12B (ENSCAFG00020020908)	ENSCAFG00020020914 ##23	TGIF1 (ENSCAFG00020020919)	DLGAP1 (ENSCAFG00020020947)
Dog	MODERN SPECIES	35	ABHD3 (ENSCAFG00845015891) #9	SNRPD1 (ENSCAFG00845015945) #10	ESCO1 (ENSCAFG00845016045) #11	GREB1L (ENSCAFG00845016277) #12	ENSCAFG00845001401	ENSCAFG00845001409	ROCK1 (ENSCAFG00845001454) #13	USP14 (ENSCAFG00845001582) #14	THOC1 (ENSCAFG00845001637) #15	COLEC12 (ENSCAFG00845001676) #16	CETN1 (ENSCAFG00845001709) #17	CLUL1 (ENSCAFG00845001733) #18	TYMS (ENSCAFG00845001914) #19	ENOSF1 (ENSCAFG00845002065) #20	YES1 (ENSCAFG00845002202) #21	ADCYAP1 (ENSCAFG00845002272) #22	ENSCAFG00845002314	ENSCAFG00845002328	ENSCAFG00845002349	METTL4 (ENSCAFG00845002376)	NDC80 (ENSCAFG00845002475)	SMCHD1 (ENSCAFG00845002514)	EMILIN2 (ENSCAFG00845002641)	LPIN2 (ENSCAFG00845002673)	MYOM1 (ENSCAFG00845002811)	ENSCAFG00845002989	MYL12B (ENSCAFG00845003004)	ENSCAFG00845003014 #23	TGIF1 (ENSCAFG00845003025)	DLGAP1 (ENSCAFG00845003202)	AKAIN1 (ENSCAFG00845003415)
Red fox	MODERN SPECIES	59	GREB1L (ENSVVUG00000004065) #12	ENSVVUG00000004252	ROCK1 (ENSVVUG00000004269) #13	ENSVVUG00000004342	ENSVVUG00000004347	USP14 (ENSVVUG00000004357) #14	THOC1 (ENSVVUG00000004384) #15	COLEC12 (ENSVVUG00000004412) #16	CETN1 (ENSVVUG00000004447) #17	CLUL1 (ENSVVUG00000004454) #18	TYMS (ENSVVUG00000004462) #19	ENOSF1 (ENSVVUG00000004471) #20	YES1 (ENSVVUG00000004481) #21	ENSVVUG00000004488	ENSVVUG00000004490	ADCYAP1 (ENSVVUG00000004505) #22	ENSVVUG00000004522	ENSVVUG00000004538	ENSVVUG00000004556	ENSVVUG00000004565	PCDH19 (ENSVVUG00000004597)	ENSVVUG00000004607	TNMD (ENSVVUG00000004612)	TSPAN6 (ENSVVUG00000004622)	SRPX2 (ENSVVUG00000004667)	SYTL4 (ENSVVUG00000004704)	ENSVVUG00000004708	ENSVVUG00000004711	CSTF2 (ENSVVUG00000004717)	NOX1 (ENSVVUG00000004727)	ENSVVUG00000004818
Felidae	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00510000047245 #10	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00940000158528.y.b	ENSGT00390000008413	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00940000173400.b	ENSGT00940000157209.jb #17	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016988.a.a.a.a.a.b	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.c.a.d	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230	ENSGT00900000143817	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047
Panthera	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT00950000182922.a.a.a.b.a.b.a.b.b.c.a ##23	ENSGT00940000158528.y.b	ENSGT00390000008413	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00940000173400.b	ENSGT00940000157209.jb #17	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016988.a.a.a.a.a.b	ENSGT00730000110997.k.a	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.c.a.d	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047
Panthera_a	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT00950000182922.a.a.a.b.a.b.a.b.b.c.a ##23	ENSGT00940000158528.y.b	ENSGT00390000008413	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00940000173400.b	ENSGT00940000157209.jb #17	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016988.a.a.a.a.a.b	ENSGT00730000110997.k.a	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.c.a.d	ENSGT00940000155230	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00530000063698.a.b
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Cat	MODERN SPECIES	243	SNRPD1 (ENSFCAG00000012352) #10	ESCO1 (ENSFCAG00000012351) #11	GREB1L (ENSFCAG00000012349) #12	ENSFCAG00000034509	ENSFCAG00000052865	ENSFCAG00000035846	ROCK1 (ENSFCAG00000031506) #13	USP14 (ENSFCAG00000015756) #14	THOC1 (ENSFCAG00000022454) #15	COLEC12 (ENSFCAG00000015762) #16	CETN1 (ENSFCAG00000009226) #17	CLUL1 (ENSFCAG00000009228) #18	TYMS (ENSFCAG00000009230) #19	ENOSF1 (ENSFCAG00000009233) #20	YES1 (ENSFCAG00000009235) #21	ADCYAP1 (ENSFCAG00000039710) #22	ENSFCAG00000032982	ENSFCAG00000039848	METTL4 (ENSFCAG00000019392)	NDC80 (ENSFCAG00000030389)	SMCHD1 (ENSFCAG00000029639)	EMILIN2 (ENSFCAG00000027624)	LPIN2 (ENSFCAG00000027974)	MYOM1 (ENSFCAG00000001020)	MYL12A (ENSFCAG00000022871)	TGIF1 (ENSFCAG00000029898)	ENSFCAG00000047431	DLGAP1 (ENSFCAG00000011418)	AKAIN1 (ENSFCAG00000041689)	ZBTB14 (ENSFCAG00000023573)	EPB41L3 (ENSFCAG00000011079)
Laurasiatheria_c	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00510000047245 #10	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT00940000158528.y.b	ENSGT00390000008413	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00940000157209.jb #17	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.c.a.d	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00390000004226	ENSGT00390000002886.b.b	ENSGT00940000162359	ENSGT01020000231229
Chiroptera	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00510000047245 #10	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT00940000158528.y.b	ENSGT00390000008413	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00940000157209.jb #17	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.c.a.d	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00390000004226	ENSGT00390000002886.b.b	ENSGT00940000162359	ENSGT01020000231229
Microchiroptera	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00510000047245 #10	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT00940000158528.y.b	ENSGT00390000008413	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00940000157209.jb #17	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.d	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000162359	ENSGT01020000231229	ENSGT00940000164798	ENSGT00940000162721
Greater horseshoe bat	MODERN SPECIES	10	MIB1 (ENSRFEG00010019282) #8	ABHD3 (ENSRFEG00010019220) #9	SNRPD1 (ENSRFEG00010019168) #10	ESCO1 (ENSRFEG00010019062) #11	GREB1L (ENSRFEG00010018468) #12	ENSRFEG00010018417	ENSRFEG00010018390	ROCK1 (ENSRFEG00010018350) #13	USP14 (ENSRFEG00010018267) #14	THOC1 (ENSRFEG00010018020) #15	COLEC12 (ENSRFEG00010017902) #16	CETN1 (ENSRFEG00010017876) #17	CLUL1 (ENSRFEG00010017641) #18	TYMS (ENSRFEG00010017484) #19	YES1 (ENSRFEG00010017283) #21	ADCYAP1 (ENSRFEG00010017231) #22	ENSRFEG00010017213	ENSRFEG00010017153	ENSRFEG00010017105	ENSRFEG00010017086	METTL4 (ENSRFEG00010017011)	NDC80 (ENSRFEG00010016810)	SMCHD1 (ENSRFEG00010016132)	EMILIN2 (ENSRFEG00010016098)	LPIN2 (ENSRFEG00010016004)	MYOM1 (ENSRFEG00010014872)	ENSRFEG00010014795	MYL12B (ENSRFEG00010014767)	TGIF1 (ENSRFEG00010014659)	DLGAP1 (ENSRFEG00010014146)	AKAIN1 (ENSRFEG00010014046)
Microbat	MODERN SPECIES	1338											CETN1 (ENSMLUG00000006456) #17	CLUL1 (ENSMLUG00000010424) #18	TYMS (ENSMLUG00000009587) #19	ENOSF1 (ENSMLUG00000009615) #20	YES1 (ENSMLUG00000023608) #21	ADCYAP1 (ENSMLUG00000009643) #22
Megabat	MODERN SPECIES	2492											CETN1 (ENSPVAG00000000698) #17	CLUL1 (ENSPVAG00000000699) #18	TYMS (ENSPVAG00000000701) #19	ENOSF1 (ENSPVAG00000000703) #20	YES1 (ENSPVAG00000000705) #21	ADCYAP1 (ENSPVAG00000000706) #22
Equus	ANCESTRAL SPECIES	36	ENSGT01100000263995.a.b	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00510000047245 #10	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT00940000158528.y.b	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00940000157209.jb #17	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313.i	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.c.a.d	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000155638	ENSGT00950000182917.b	ENSGT00390000000444
Donkey	MODERN SPECIES	27	ABHD3 (ENSEASG00005002421) #9	ENSEASG00005023455	ENSEASG00005028649	ESCO1 (ENSEASG00005002439) #11	GREB1L (ENSEASG00005002449) #12	ENSEASG00005002473	ENSEASG00005002481 #13	ENSEASG00005002507 #14	THOC1 (ENSEASG00005002549) #15	COLEC12 (ENSEASG00005002701) #16	CETN1 (ENSEASG00005037157) #17	CLUL1 (ENSEASG00005002706) #18	TYMS (ENSEASG00005002710) #19	ENOSF1 (ENSEASG00005002713) #20	YES1 (ENSEASG00005002715) #21	ENSEASG00005002719 #22	ENSEASG00005035753	ENSEASG00005003917	ENSEASG00005025966	ENSEASG00005003913	ERO1A (ENSEASG00005003909)	PSMC6 (ENSEASG00005003903)	STYX (ENSEASG00005025850)	GNPNAT1 (ENSEASG00005028931)	FERMT2 (ENSEASG00005003881)	DDHD1 (ENSEASG00005003386)	BMP4 (ENSEASG00005003287)	CDKN3 (ENSEASG00005003194)	CNIH1 (ENSEASG00005003178)	ENSEASG00005035414	CGRRF1 (ENSEASG00005003172)
Horse	MODERN SPECIES	29	ESCO1 (ENSECAG00000016120) #11	GREB1L (ENSECAG00000019278) #12	ENSECAG00000006661	ROCK1 (ENSECAG00000021002) #13	ENSECAG00000059989	ENSECAG00000047314	ENSECAG00000057356	USP14 (ENSECAG00000022985) #14	THOC1 (ENSECAG00000009267) #15	COLEC12 (ENSECAG00000018963) #16	CETN1 (ENSECAG00000058680) #17	CLUL1 (ENSECAG00000022352) #18	TYMS (ENSECAG00000023203) #19	ENOSF1 (ENSECAG00000012547) #20	YES1 (ENSECAG00000021666) #21	ADCYAP1 (ENSECAG00000033061) #22	METTL4 (ENSECAG00000006301)	NDC80 (ENSECAG00000008827)	SMCHD1 (ENSECAG00000014144)	EMILIN2 (ENSECAG00000057052)	LPIN2 (ENSECAG00000006280)	MYOM1 (ENSECAG00000013468)	MYL12A (ENSECAG00000051472)	MYL12B (ENSECAG00000038682)	TGIF1 (ENSECAG00000011078)	DLGAP1 (ENSECAG00000013739)	AKAIN1 (ENSECAG00000033364)	ZBTB14 (ENSECAG00000019218)	LAMA3 (ENSECAG00000021277)	ENSECAG00000054828	ENSECAG00000043961
Atlantogenata	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000160814 #7	ENSGT00940000156781 #8	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00510000047245 #10	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00940000157209.jb #17	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.c.a	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230	ENSGT00940000156220	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00530000063698.a.b	ENSGT00940000158264.a	ENSGT00940000158929
Xenarthra	ANCESTRAL SPECIES	676										ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00940000157209.jb #17	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22
Armadillo	MODERN SPECIES	362									COLEC12 (ENSDNOG00000000800) #16	CETN1 (ENSDNOG00000049655) #17	CLUL1 (ENSDNOG00000037140) #18	TYMS (ENSDNOG00000045272) #19	ENSDNOG00000036496	ENOSF1 (ENSDNOG00000017739) #20	YES1 (ENSDNOG00000017741) #21	ENSDNOG00000009096 #22
Sloth	MODERN SPECIES	13669																ADCYAP1 (ENSCHOG00000008471) #22
Afrotheria	ANCESTRAL SPECIES	169													ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.c.a	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230	ENSGT00940000156220	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00530000063698.a.b	ENSGT00940000158929
Afrotheria_a	ANCESTRAL SPECIES	171													ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.c.a	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230	ENSGT00940000156220	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00530000063698.a.b	ENSGT00940000158929
Elephant	MODERN SPECIES	375	PPP4R1 (ENSLAFG00000012326)	RALBP1 (ENSLAFG00000032643)	TWSG1 (ENSLAFG00000001054)	ANKRD12 (ENSLAFG00000010524)	NDUFV2 (ENSLAFG00000010520)	MTCL1 (ENSLAFG00000003048)	ENSLAFG00000020748	ENSLAFG00000028095	PTPRM (ENSLAFG00000008057)	LRRC30 (ENSLAFG00000029684)	LAMA1 (ENSLAFG00000012697)	ENSLAFG00000029660	TYMS (ENSLAFG00000014910) #19	ENOSF1 (ENSLAFG00000014922) #20	YES1 (ENSLAFG00000002384) #21	ADCYAP1 (ENSLAFG00000014384) #22	METTL4 (ENSLAFG00000004505)	NDC80 (ENSLAFG00000004506)	ENSLAFG00000009375	ENSLAFG00000009381	EMILIN2 (ENSLAFG00000023146)	LPIN2 (ENSLAFG00000009393)	MYOM1 (ENSLAFG00000014655)	MYL12A (ENSLAFG00000011627)	MYL12B (ENSLAFG00000004353)	ENSLAFG00000030231	TGIF1 (ENSLAFG00000002354)	DLGAP1 (ENSLAFG00000002355)	ENSLAFG00000028371	ZBTB14 (ENSLAFG00000004952)	ENSLAFG00000026951
Tenrec	MODERN SPECIES	15822																ADCYAP1 (ENSETEG00000002193) #22
Marsupialia	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00530000063835.b	ENSGT00940000160814 #7	ENSGT00940000156781 #8	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00510000047245 #10	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786.m.a #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.c.a	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00940000166801	ENSGT00530000063698.a.b
Marsupialia_b	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00530000063835.b	ENSGT00940000160814 #7	ENSGT00940000156781 #8	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00510000047245 #10	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786.m.a #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.c.a	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00940000166801	ENSGT00530000063698.a.b
Diprotodontia	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00530000063835.b	ENSGT00940000160814 #7	ENSGT00940000156781 #8	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00510000047245 #10	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786.m.a #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.c.a	ENSGT00940000155230	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00530000063698.a.b	ENSGT00940000158264.a	ENSGT00940000158929
Diprotodontia_a	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00530000063835.b	ENSGT00940000160814 #7	ENSGT00940000156781 #8	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00510000047245 #10	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786.m.a.a #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.c.a	ENSGT00940000155230	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00530000063698.a.b	ENSGT00940000158264.a	ENSGT00940000158929
Common wonbat	DUPLICATION
Common wonbat	MODERN SPECIES	1048	ENSVURG00010023245 #7	ENSVURG00010023241 #8	ENSVURG00010023239 #9	ENSVURG00010023238 #10	ENSVURG00010023236 #11	ENSVURG00010023228 #12	ENSVURG00010023215 #13	ENSVURG00010023206 #14	ENSVURG00010023192 #15	ENSVURG00010023188 #16	ENSVURG00010023183 #18	ENSVURG00010023168 #19	ENSVURG00010023157 #20	ENSVURG00010023153	ENSVURG00010023149 #21	ENSVURG00010023146 #22	ENSVURG00010023144	ENSVURG00010023135	ENSVURG00010023131	ENSVURG00010023124	ENSVURG00010023117	ENSVURG00010023083	ENSVURG00010023064	ENSVURG00010023043	ENSVURG00010023030	ENSVURG00010023018	ENSVURG00010022798	ENSVURG00010022752	ENSVURG00010022745	ENSVURG00010022705	ENSVURG00010022676
Common wonbat	MODERN SPECIES	1199	ENSVURG00010010081 #8	ENSVURG00010010124 #9	ENSVURG00010010158 #10	ENSVURG00010010171 #10	ENSVURG00010010179 #11	ENSVURG00010010198 #12	ENSVURG00010010269 #13	ENSVURG00010010300 #14	ENSVURG00010010326 #15	ENSVURG00010010357 #16	ENSVURG00010010370 #18	ENSVURG00010010437 #19	ENSVURG00010010669 #20	ENSVURG00010010688 #21	ENSVURG00010010705	ENSVURG00010010724 #22	ENSVURG00010010765	ENSVURG00010010802	ENSVURG00010010870	ENSVURG00010010889	ENSVURG00010010920	ENSVURG00010010980	ENSVURG00010011114	ENSVURG00010011130	MYOM1 (ENSVURG00010011183)	ENSVURG00010011282	ENSVURG00010011329	ENSVURG00010011423	ENSVURG00010012456	ENSVURG00010012467	ENSVURG00010012515
koala	MODERN SPECIES	207	ENSPCIG00000034674 #8	ABHD3 (ENSPCIG00000020327) #9	SNRPD1 (ENSPCIG00000020320) #10	ENSPCIG00000020308 #11	GREB1L (ENSPCIG00000020291) #12	ENSPCIG00000027060	ROCK1 (ENSPCIG00000027055) #13	USP14 (ENSPCIG00000027054) #14	THOC1 (ENSPCIG00000026942) #15	COLEC12 (ENSPCIG00000016565) #16	CLUL1 (ENSPCIG00000015630) #18	ENSPCIG00000031228 #19	ENSPCIG00000015639 #19	ENOSF1 (ENSPCIG00000015652) #20	YES1 (ENSPCIG00000015661) #21	ENSPCIG00000015925 #22	METTL4 (ENSPCIG00000016096)	NDC80 (ENSPCIG00000016100)	SMCHD1 (ENSPCIG00000016236)	EMILIN2 (ENSPCIG00000016780)	LPIN2 (ENSPCIG00000016789)	MYOM1 (ENSPCIG00000016799)	MYL12A (ENSPCIG00000016806)	TGIF1 (ENSPCIG00000016809)	ENSPCIG00000032039
Wallaby	MODERN SPECIES	11924																ADCYAP1 (ENSMEUG00000002307) #22
Tasmanian devil	MODERN SPECIES		MIB1 (ENSSHAG00000010077) #8	ABHD3 (ENSSHAG00000011407) #9	SNRPD1 (ENSSHAG00000011791) #10	ENSSHAG00000001904 #11	GREB1L (ENSSHAG00000012108) #12	ENSSHAG00000010920	ENSSHAG00000031782	ENSSHAG00000014424 #13	ENSSHAG00000014711 #14	ENSSHAG00000014829 #15	COLEC12 (ENSSHAG00000015149) #16	CLUL1 (ENSSHAG00000001520) #18	ENSSHAG00000003102 #19	ENOSF1 (ENSSHAG00000028284) #20	YES1 (ENSSHAG00000024195) #21	ADCYAP1 (ENSSHAG00000007533) #22	METTL4 (ENSSHAG00000025630)	NDC80 (ENSSHAG00000000858)	SMCHD1 (ENSSHAG00000002525)	EMILIN2 (ENSSHAG00000006785)	LPIN2 (ENSSHAG00000007520)	MYOM1 (ENSSHAG00000008942)	MYL12A (ENSSHAG00000025915)	MYL12B (ENSSHAG00000023112)	TGIF1 (ENSSHAG00000030511)	DLGAP1 (ENSSHAG00000012019)	ENSSHAG00000024123	AKAIN1 (ENSSHAG00000021908)	EPB41L3 (ENSSHAG00000007294)	ENSSHAG00000028600	TMEM200C (ENSSHAG00000021490)
Opossum	MODERN SPECIES	2	ENSMODG00000043428	ENSMODG00000038336	SNRPD1 (ENSMODG00000021487) #10	ENSMODG00000021486 #11	GREB1L (ENSMODG00000021485) #12	ROCK1 (ENSMODG00000021484) #13	USP14 (ENSMODG00000021483) #14	THOC1 (ENSMODG00000021482) #15	COLEC12 (ENSMODG00000021481) #16	CLUL1 (ENSMODG00000021480) #18	ENSMODG00000041341 #19	ENSMODG00000021479 #19	ENOSF1 (ENSMODG00000025620) #20	ENSMODG00000021477 #21	ENSMODG00000041633	ADCYAP1 (ENSMODG00000046330) #22	METTL4 (ENSMODG00000021472)	NDC80 (ENSMODG00000021471)	ENSMODG00000021469	EMILIN2 (ENSMODG00000021467)	LPIN2 (ENSMODG00000021466)	ENSMODG00000036642	MYOM1 (ENSMODG00000021465)	MYL12A (ENSMODG00000049524)	MYL12B (ENSMODG00000043700)	ENSMODG00000049373	ENSMODG00000021462	DLGAP1 (ENSMODG00000021461)	ENSMODG00000029291	ENSMODG00000043430	ENSMODG00000046796
Platypus	MODERN SPECIES	16	ENSOANG00000045242	ENSOANG00000043850	ENSOANG00000036738	ENSOANG00000036149	ENSOANG00000036688	SLC4A5 (ENSOANG00000043914)	MTHFD2 (ENSOANG00000039674)	MOB1A (ENSOANG00000045826)	ENSOANG00000042482	TET3 (ENSOANG00000039284)	ENSOANG00000007694	ENSOANG00000000460	ENSOANG00000050199	ENSOANG00000040047	ENSOANG00000021882	ENSOANG00000048785 #22	METTL4 (ENSOANG00000010844)	NDC80 (ENSOANG00000010845)	SMCHD1 (ENSOANG00000002708)	EMILIN2 (ENSOANG00000008916)	LPIN2 (ENSOANG00000008912)	MYOM1 (ENSOANG00000039529)	ENSOANG00000048757	TGIF1 (ENSOANG00000014153)	DLGAP1 (ENSOANG00000036705)	ENSOANG00000002065	AKAIN1 (ENSOANG00000046211)	ZBTB14 (ENSOANG00000037703)	EPB41L3 (ENSOANG00000003826)	ENSOANG00000041734	ENSOANG00000051289
Sauria	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00530000063835.b	ENSGT00940000160814 #7	ENSGT00940000156781 #8	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT00390000008413	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.d	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00940000166801	ENSGT00530000063698.a.b
Lepidosauria	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00530000063835.b	ENSGT00940000160814 #7	ENSGT00940000156781 #8	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT00390000008413	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.d	ENSGT00940000155230	ENSGT00940000156220	ENSGT01050000245099	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00530000063698.a.b	ENSGT00940000158929	ENSGT00940000157124
Episquamata	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00530000063835.b	ENSGT00940000160814 #7	ENSGT00940000156781 #8	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT00390000008413	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.d	ENSGT00940000155230	ENSGT00940000156220	ENSGT01050000245099	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00530000063698.a.b	ENSGT00940000158929	ENSGT00940000157124
Toxicofera	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00530000063835.b	ENSGT00940000160814 #7	ENSGT00940000156781 #8	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT00390000008413	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.d	ENSGT00940000155230	ENSGT00940000156220	ENSGT01050000245099	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00530000063698.a.b	ENSGT00940000158929	ENSGT00940000157124
Elapidae	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00400000022086.a	ENSGT00530000063835.b.tb.a	ENSGT00940000160814 #7	ENSGT00940000156781 #8	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT00390000008413	ENSGT01030000234517.A.i #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.m.a	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.d	ENSGT00940000155230	ENSGT00940000156220	ENSGT01050000245099	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00530000063698.a.b	ENSGT00940000158929	ENSGT00940000157124
Elapidae_a	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00400000022086.a	ENSGT00530000063835.b.tb.a	ENSGT00940000160814 #7	ENSGT00940000156781 #8	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT00390000008413	ENSGT01030000234517.A.i #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.m.a	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.d	ENSGT00940000155230	ENSGT00940000156220	ENSGT01050000245099	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00530000063698.a.b	ENSGT00940000158929	ENSGT00940000157124
Acanthophiinae	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00400000022086.a	ENSGT00530000063835.b.tb.a	ENSGT00940000160814 #7	ENSGT00940000156781 #8	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT00390000008413	ENSGT01030000234517.A.i #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.m.a	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.d	ENSGT00940000155230	ENSGT00940000156220	ENSGT01050000245099	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00530000063698.a.b	ENSGT00940000158929	ENSGT00940000157124
Eastern brown snake	MODERN SPECIES	11	ENSPTXG00000005641	ENSPTXG00000005642	GATA6 (ENSPTXG00000005644) #7	MIB1 (ENSPTXG00000005648) #8	ABHD3 (ENSPTXG00000005651) #9	ESCO1 (ENSPTXG00000005653) #11	GREB1L (ENSPTXG00000005655) #12	ROCK1 (ENSPTXG00000005691) #13	ENSPTXG00000007027	USP14 (ENSPTXG00000007029) #14	THOC1 (ENSPTXG00000007030) #15	COLEC12 (ENSPTXG00000007031) #16	TYMS (ENSPTXG00000007032) #19	ENOSF1 (ENSPTXG00000007033) #20	YES1 (ENSPTXG00000007034) #21	ADCYAP1 (ENSPTXG00000007035) #22	ENSPTXG00000007036	METTL4 (ENSPTXG00000007037)	NDC80 (ENSPTXG00000007038)	SMCHD1 (ENSPTXG00000007039)	ENSPTXG00000007040	EMILIN2 (ENSPTXG00000007041)	LPIN2 (ENSPTXG00000007245)	MYOM1 (ENSPTXG00000007247)	ENSPTXG00000007831	TGIF1 (ENSPTXG00000007832)	DLGAP1 (ENSPTXG00000007834)	ENSPTXG00000007858	ZBTB14 (ENSPTXG00000007859)	EPB41L3 (ENSPTXG00000007862)	TMEM200C (ENSPTXG00000007865)
Mainland tiger snake	MODERN SPECIES	32	CABLES1 (ENSNSUG00000019723)	ENSNSUG00000019722	ENSNSUG00000019721	GATA6 (ENSNSUG00000019720) #7	MIB1 (ENSNSUG00000019718) #8	ESCO1 (ENSNSUG00000019717) #11	GREB1L (ENSNSUG00000019716) #12	ENSNSUG00000019715	ROCK1 (ENSNSUG00000019518) #13	USP14 (ENSNSUG00000019408) #14	THOC1 (ENSNSUG00000019349) #15	COLEC12 (ENSNSUG00000019348) #16	TYMS (ENSNSUG00000019347) #19	ENOSF1 (ENSNSUG00000019346) #20	YES1 (ENSNSUG00000019330) #21	ADCYAP1 (ENSNSUG00000019329) #22	METTL4 (ENSNSUG00000019328)
Blue-lipped sea krait	MODERN SPECIES	2963																ADCYAP1 (ENSLLTG00000010986) #22
Indian cobra	MODERN SPECIES	2	RBBP8 (ENSNNAG00000008109)	GATA6 (ENSNNAG00000008083) #7	MIB1 (ENSNNAG00000007990) #8	ABHD3 (ENSNNAG00000007942) #9	ENSNNAG00000007832 #11	ENSNNAG00000007797 #11	GREB1L (ENSNNAG00000007560) #12	ENSNNAG00000017389	ROCK1 (ENSNNAG00000017342) #13	USP14 (ENSNNAG00000017327) #14	THOC1 (ENSNNAG00000017309) #15	COLEC12 (ENSNNAG00000017287) #16	TYMS (ENSNNAG00000017269) #19	ENOSF1 (ENSNNAG00000017263) #20	YES1 (ENSNNAG00000017256) #21	ADCYAP1 (ENSNNAG00000017250) #22	METTL4 (ENSNNAG00000017245)	NDC80 (ENSNNAG00000017213)	ENSNNAG00000016346	LPIN2 (ENSNNAG00000016225)	MYOM1 (ENSNNAG00000016151)	EMILIN2 (ENSNNAG00000016113)	TGIF1 (ENSNNAG00000016102)	DLGAP1 (ENSNNAG00000016020)	ENSNNAG00000016002	ZBTB14 (ENSNNAG00000015997)	EPB41L3 (ENSNNAG00000015972)	TMEM200C (ENSNNAG00000015955)	ARHGAP28 (ENSNNAG00000015909)	LAMA1 (ENSNNAG00000015780)	LRRC30 (ENSNNAG00000015764)
Lizard	MODERN SPECIES	3	GATA6 (ENSACAG00000007786) #7	ENSACAG00000041309	MIB1 (ENSACAG00000007815) #8	ABHD3 (ENSACAG00000007887) #9	ESCO1 (ENSACAG00000007912) #11	GREB1L (ENSACAG00000007913) #12	ROCK1 (ENSACAG00000007990) #13	ENSACAG00000039375	USP14 (ENSACAG00000008213) #14	THOC1 (ENSACAG00000008307) #15	COLEC12 (ENSACAG00000008396) #16	CLUL1 (ENSACAG00000008429) #18	TYMS (ENSACAG00000008456) #19	ENOSF1 (ENSACAG00000008487) #20	YES1 (ENSACAG00000008639) #21	ADCYAP1 (ENSACAG00000008729) #22	ENSACAG00000037933	ENSACAG00000040963	METTL4 (ENSACAG00000008742)	NDC80 (ENSACAG00000008766)	ENSACAG00000022405	ENSACAG00000039577	ENSACAG00000025593	ENSACAG00000010074	ENSACAG00000010062	ENSACAG00000041056	ENSACAG00000027747	ENSACAG00000010061	TMEM200C (ENSACAG00000009890)	ENSACAG00000036653	ENSACAG00000039557
Laterata	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000160814 #7	ENSGT00940000156781 #8	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT00960000189334	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000008413	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.d	ENSGT00940000155230	ENSGT00940000156220	ENSGT01050000245099	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00530000063698.a.b	ENSGT00940000158929	ENSGT00940000157124
Common wall lizard	MODERN SPECIES	15	CABLES1 (ENSPMRG00000005285)	RBBP8 (ENSPMRG00000005295)	GATA6 (ENSPMRG00000005306) #7	MIB1 (ENSPMRG00000005318) #8	ABHD3 (ENSPMRG00000005341) #9	ESCO1 (ENSPMRG00000005365) #11	GREB1L (ENSPMRG00000005424) #12	ROCK1 (ENSPMRG00000005592) #13	ENSPMRG00000005620	USP14 (ENSPMRG00000005636) #14	THOC1 (ENSPMRG00000005726) #15	CLUL1 (ENSPMRG00000005750) #18	TYMS (ENSPMRG00000005762) #19	ENOSF1 (ENSPMRG00000005780) #20	YES1 (ENSPMRG00000005808) #21	ADCYAP1 (ENSPMRG00000005832) #22	METTL4 (ENSPMRG00000005852)	NDC80 (ENSPMRG00000005868)	SMCHD1 (ENSPMRG00000005912)	EMILIN2 (ENSPMRG00000006032)	LPIN2 (ENSPMRG00000006055)	ENSPMRG00000006094	MYOM1 (ENSPMRG00000006111)	ENSPMRG00000006137	ENSPMRG00000006141	TGIF1 (ENSPMRG00000006145)	DLGAP1 (ENSPMRG00000006151)	ENSPMRG00000006183	ZBTB14 (ENSPMRG00000006191)	EPB41L3 (ENSPMRG00000006201)	TMEM200C (ENSPMRG00000006235)
Argentine black and white tegu	MODERN SPECIES	4	RBBP8 (ENSSMRG00000012281)	GATA6 (ENSSMRG00000012313) #7	MIB1 (ENSSMRG00000012328) #8	ABHD3 (ENSSMRG00000012330) #9	ESCO1 (ENSSMRG00000012331) #11	GREB1L (ENSSMRG00000012352) #12	ROCK1 (ENSSMRG00000012388) #13	ENSSMRG00000016588	USP14 (ENSSMRG00000016589) #14	THOC1 (ENSSMRG00000016593) #15	COLEC12 (ENSSMRG00000016596) #16	CLUL1 (ENSSMRG00000016597) #18	TYMS (ENSSMRG00000016598) #19	ENOSF1 (ENSSMRG00000016599) #20	YES1 (ENSSMRG00000016600) #21	ADCYAP1 (ENSSMRG00000016604) #22	METTL4 (ENSSMRG00000016614)	ENSSMRG00000016615	SMCHD1 (ENSSMRG00000016617)	EMILIN2 (ENSSMRG00000016621)	LPIN2 (ENSSMRG00000016622)	MYOM1 (ENSSMRG00000016623)	ENSSMRG00000016626	TGIF1 (ENSSMRG00000016627)	ENSSMRG00000016628	DLGAP1 (ENSSMRG00000016629)	ENSSMRG00000016631	ZBTB14 (ENSSMRG00000016632)	EPB41L3 (ENSSMRG00000016633)	TMEM200C (ENSSMRG00000016635)	ARHGAP28 (ENSSMRG00000016636)
tuatara	MODERN SPECIES	1149					ABHD3 (ENSSPUG00000007523) #9	ENSSPUG00000007495 #11	GREB1L (ENSSPUG00000007465) #12	ROCK1 (ENSSPUG00000007337) #13	USP14 (ENSSPUG00000007282) #14	THOC1 (ENSSPUG00000007238) #15	COLEC12 (ENSSPUG00000007225) #16	CLUL1 (ENSSPUG00000007200) #18	ENSSPUG00000007173 #19	ENOSF1 (ENSSPUG00000007155) #20	YES1 (ENSSPUG00000007137) #21	ADCYAP1 (ENSSPUG00000007129) #22
Archelosauria	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00530000063835.b	ENSGT00940000160814 #7	ENSGT00940000156781 #8	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT00960000189334	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.d	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00940000166801	ENSGT00530000063698.a.b
Cryptodira	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00530000063835.b	ENSGT00940000160814 #7	ENSGT00940000156781 #8	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT00960000189334	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386.k	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.d	ENSGT00940000155230	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00940000166801	ENSGT00530000063698.a.b	ENSGT00940000158929
Testudinoidea	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00530000063835.b	ENSGT00940000160814 #7	ENSGT00940000156781 #8	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT00960000189334	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232.o #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386.k	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.d	ENSGT00940000155230	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00530000063698.a.b	ENSGT00940000158929	ENSGT00940000157124
Emydidae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00530000063835.b	ENSGT00940000160814 #7	ENSGT00940000156781 #8	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT00960000189334	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232.o #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386.k	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.d	ENSGT00940000155230	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00530000063698.a.b	ENSGT00940000158929	ENSGT00940000157124
Three-toed box turtle	MODERN SPECIES	24	GATA6 (ENSTMTG00000020728) #7	MIB1 (ENSTMTG00000020696) #8	ABHD3 (ENSTMTG00000020678) #9	ESCO1 (ENSTMTG00000020669) #11	GREB1L (ENSTMTG00000020626) #12	ENSTMTG00000020620	ENSTMTG00000020613	ROCK1 (ENSTMTG00000020574) #13	USP14 (ENSTMTG00000020563) #14	THOC1 (ENSTMTG00000020553) #15	COLEC12 (ENSTMTG00000020542) #16	CLUL1 (ENSTMTG00000020534) #18	TYMS (ENSTMTG00000020516) #19	ENOSF1 (ENSTMTG00000020509) #20	YES1 (ENSTMTG00000020501) #21	ADCYAP1 (ENSTMTG00000020494) #22	METTL4 (ENSTMTG00000020489)	NDC80 (ENSTMTG00000020470)	SMCHD1 (ENSTMTG00000020008)	EMILIN2 (ENSTMTG00000019915)	LPIN2 (ENSTMTG00000019888)	MYOM1 (ENSTMTG00000019821)	ENSTMTG00000019802	TGIF1 (ENSTMTG00000019792)	DLGAP1 (ENSTMTG00000019718)	ENSTMTG00000019702	ZBTB14 (ENSTMTG00000019697)	EPB41L3 (ENSTMTG00000014178)	TMEM200C (ENSTMTG00000013816)	ENSTMTG00000013814	ENSTMTG00000013806
painted turtle	MODERN SPECIES	2367	ENSCPBG00000027616	GATA6 (ENSCPBG00000027614) #7	MIB1 (ENSCPBG00000027607) #8	ABHD3 (ENSCPBG00000027604) #9	ESCO1 (ENSCPBG00000027599) #11	GREB1L (ENSCPBG00000027577) #12	ENSCPBG00000027568	ROCK1 (ENSCPBG00000027564) #13	USP14 (ENSCPBG00000027561) #14	THOC1 (ENSCPBG00000027558) #15	COLEC12 (ENSCPBG00000027554) #16	CLUL1 (ENSCPBG00000027553) #18	TYMS (ENSCPBG00000027552) #19	ENOSF1 (ENSCPBG00000027551) #20	YES1 (ENSCPBG00000027548) #21	ADCYAP1 (ENSCPBG00000027547) #22	DYNC2H1 (ENSCPBG00000027489)	DCUN1D5 (ENSCPBG00000027458)	ENSCPBG00000027454	MMP13 (ENSCPBG00000027449)	ENSCPBG00000027446	ENSCPBG00000027444	ENSCPBG00000027443	MMP27 (ENSCPBG00000027441)	ENSCPBG00000027439	TMEM123 (ENSCPBG00000027438)	ENSCPBG00000027435	YAP1 (ENSCPBG00000027430)	CEP126 (ENSCPBG00000027420)	ANGPTL5 (ENSCPBG00000027415)	TRPC6 (ENSCPBG00000027413)
Testudinidae	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00530000063835.b	ENSGT00940000160814 #7	ENSGT00940000156781 #8	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT00960000189334	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232.p #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386.k	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.d	ENSGT00940000155230	ENSGT00940000156220	ENSGT01050000245099	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00530000063698.a.b	ENSGT00940000158929
Abingdon island giant tortoise	MODERN SPECIES	1640																ADCYAP1 (ENSCABG00000016026) #22
Goode s thornscrub tortoise	MODERN SPECIES	11	RBBP8 (ENSGEVG00005004748)	GATA6 (ENSGEVG00005004708) #7	MIB1 (ENSGEVG00005004619) #8	ABHD3 (ENSGEVG00005004566) #9	ESCO1 (ENSGEVG00005004530) #11	GREB1L (ENSGEVG00005004300) #12	ENSGEVG00005004228	ROCK1 (ENSGEVG00005004030) #13	USP14 (ENSGEVG00005003993) #14	ENSGEVG00005003959 #15	COLEC12 (ENSGEVG00005003905) #16	CLUL1 (ENSGEVG00005003891) #18	TYMS (ENSGEVG00005003881) #19	ENOSF1 (ENSGEVG00005020337) #20	YES1 (ENSGEVG00005020327) #21	ADCYAP1 (ENSGEVG00005020320) #22	METTL4 (ENSGEVG00005020306)	NDC80 (ENSGEVG00005020277)	SMCHD1 (ENSGEVG00005020243)	EMILIN2 (ENSGEVG00005020109)	LPIN2 (ENSGEVG00005020051)	MYOM1 (ENSGEVG00005019599)	ENSGEVG00005019502	ENSGEVG00005019498	TGIF1 (ENSGEVG00005019490)	DLGAP1 (ENSGEVG00005019404)	ENSGEVG00005019379	ZBTB14 (ENSGEVG00005019369)	EPB41L3 (ENSGEVG00005019335)	TMEM200C (ENSGEVG00005019313)	ARHGAP28 (ENSGEVG00005019229)
Chinese turtle	MODERN SPECIES	2237		RBBP8 (ENSPSIG00000009068)	GATA6 (ENSPSIG00000008999) #7	MIB1 (ENSPSIG00000008755) #8	ABHD3 (ENSPSIG00000008750) #9	ESCO1 (ENSPSIG00000008735) #11	GREB1L (ENSPSIG00000008559) #12	ROCK1 (ENSPSIG00000007946) #13	USP14 (ENSPSIG00000007936) #14	THOC1 (ENSPSIG00000007691) #15	COLEC12 (ENSPSIG00000007643) #16	CLUL1 (ENSPSIG00000007587) #18	TYMS (ENSPSIG00000007582) #19	ENOSF1 (ENSPSIG00000007577) #20	YES1 (ENSPSIG00000007281) #21	ADCYAP1 (ENSPSIG00000007275) #22	METTL4 (ENSPSIG00000007210)	NDC80 (ENSPSIG00000006812)	SMCHD1 (ENSPSIG00000006146)	EMILIN2 (ENSPSIG00000006081)	LPIN2 (ENSPSIG00000005769)	MYOM1 (ENSPSIG00000005684)	ENSPSIG00000005666	ENSPSIG00000005662	TGIF1 (ENSPSIG00000005650)	DLGAP1 (ENSPSIG00000005548)	ENSPSIG00000001687	ZBTB14 (ENSPSIG00000005537)	EPB41L3 (ENSPSIG00000005287)	ENSPSIG00000005265	TMEM200C (ENSPSIG00000001683)
Archosauria	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00530000063835.b	ENSGT00940000160814 #7	ENSGT00940000156781 #8	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT00960000189334	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.d	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00940000166801	ENSGT00530000063698.a.b
Aves	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00530000063835.b	ENSGT00940000160814 #7	ENSGT00940000156781 #8	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT00960000189334	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.d	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230	ENSGT00990000213402	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00940000166801
Neognathae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00400000022086.a	ENSGT00530000063835.b	ENSGT00940000160814 #7	ENSGT00940000156781 #8	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT00960000189334	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.d	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230	ENSGT00990000213402	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00940000166801
Galloanserae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00510000048348	ENSGT00400000022086.a	ENSGT00530000063835.b	ENSGT00940000160814 #7	ENSGT00940000156781 #8	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.d	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230	ENSGT00990000213402	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00940000166801
Anatidae	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00510000048348	ENSGT00400000022086.a	ENSGT00530000063835.b	ENSGT00940000160814 #7	ENSGT00940000156781 #8	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.c.a	ENSGT00940000153607.d	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT01050000245099	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047
Duck	MODERN SPECIES	10	TMEM241 (ENSAPLG00000006386)	CABLES1 (ENSAPLG00000006339)	RBBP8 (ENSAPLG00000005872)	GATA6 (ENSAPLG00000005868) #7	MIB1 (ENSAPLG00000005158) #8	ABHD3 (ENSAPLG00000004876) #9	ESCO1 (ENSAPLG00000004761) #11	GREB1L (ENSAPLG00000004077) #12	ROCK1 (ENSAPLG00000002696) #13	USP14 (ENSAPLG00000000901) #14	THOC1 (ENSAPLG00000016149) #15	COLEC12 (ENSAPLG00000015987) #16	CLUL1 (ENSAPLG00000015948) #18	TYMS (ENSAPLG00000015661) #19	YES1 (ENSAPLG00000015182) #21	ADCYAP1 (ENSAPLG00000028139) #22	METTL4 (ENSAPLG00000015046)	NDC80 (ENSAPLG00000014505)	SMCHD1 (ENSAPLG00000013237)	EMILIN2 (ENSAPLG00000013210)	LPIN2 (ENSAPLG00000012547)	MYOM1 (ENSAPLG00000010648)	ENSAPLG00000010564	MYL12B (ENSAPLG00000022070)	TGIF1 (ENSAPLG00000010541)	DLGAP1 (ENSAPLG00000010212)	ENSAPLG00000022695	ZBTB14 (ENSAPLG00000011548)	EPB41L3 (ENSAPLG00000012505)	ENSAPLG00000025812	TMEM200C (ENSAPLG00000027090)
Pink-footed goose	MODERN SPECIES	13	TMEM241 (ENSABRG00000016931)	CABLES1 (ENSABRG00000016944)	RBBP8 (ENSABRG00000016963)	GATA6 (ENSABRG00000016989) #7	MIB1 (ENSABRG00000017001) #8	ABHD3 (ENSABRG00000017074) #9	ENSABRG00000017079 #11	GREB1L (ENSABRG00000017084) #12	ROCK1 (ENSABRG00000017265) #13	USP14 (ENSABRG00000018751) #14	THOC1 (ENSABRG00000019176) #15	COLEC12 (ENSABRG00000019303) #16	CLUL1 (ENSABRG00000019308) #18	TYMS (ENSABRG00000019312) #19	YES1 (ENSABRG00000019314) #21	ADCYAP1 (ENSABRG00000019320) #22	METTL4 (ENSABRG00000019330)	NDC80 (ENSABRG00000019332)	SMCHD1 (ENSABRG00000019351)	EMILIN2 (ENSABRG00000019602)	LPIN2 (ENSABRG00000019611)	MYOM1 (ENSABRG00000019644)	ENSABRG00000019670	TGIF1 (ENSABRG00000019672)	DLGAP1 (ENSABRG00000019680)	AKAIN1 (ENSABRG00000019692)
Phasianidae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00510000048348	ENSGT00400000022086.a	ENSGT00530000063835.b	ENSGT00940000160814 #7	ENSGT00940000156781 #8	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.d	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230	ENSGT00990000213402	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00940000166801
Japanese quail	MODERN SPECIES	11	CABLES1 (ENSCJPG00005009275)	RBBP8 (ENSCJPG00005009274)	GATA6 (ENSCJPG00005009273) #7	MIB1 (ENSCJPG00005009268) #8	ABHD3 (ENSCJPG00005009267) #9	ESCO1 (ENSCJPG00005009266) #11	GREB1L (ENSCJPG00005009265) #12	ROCK1 (ENSCJPG00005009264) #13	USP14 (ENSCJPG00005009263) #14	THOC1 (ENSCJPG00005009262) #15	ENSCJPG00005009261	COLEC12 (ENSCJPG00005009259) #16	CLUL1 (ENSCJPG00005009258) #18	TYMS (ENSCJPG00005009257) #19	YES1 (ENSCJPG00005009256) #21	ADCYAP1 (ENSCJPG00005009254) #22	METTL4 (ENSCJPG00005009246)	NDC80 (ENSCJPG00005009037)	ENSCJPG00005009036	EMILIN2 (ENSCJPG00005008950)	ENSCJPG00005008949	ENSCJPG00005008948	MYOM1 (ENSCJPG00005008718)	ENSCJPG00005008717	TGIF1 (ENSCJPG00005008716)	ENSCJPG00005008706	DLGAP1 (ENSCJPG00005008680)	ENSCJPG00005008659	ZBTB14 (ENSCJPG00005008602)	EPB41L3 (ENSCJPG00005008600)	ENSCJPG00005008599
Phasianidae_b	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00510000048348	ENSGT00400000022086.a	ENSGT00530000063835.b	ENSGT00940000160814 #7	ENSGT00940000156781 #8	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.d	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00940000166801	ENSGT00530000063698.a.b
Chicken	MODERN SPECIES	11	TMEM241 (ENSGALG00010004244)	CABLES1 (ENSGALG00010004191)	RBBP8 (ENSGALG00010004142)	GATA6 (ENSGALG00010005127) #7	MIB1 (ENSGALG00010005119) #8	ABHD3 (ENSGALG00010005109) #9	ESCO1 (ENSGALG00010005092) #11	GREB1L (ENSGALG00010005081) #12	ROCK1 (ENSGALG00010005048) #13	USP14 (ENSGALG00010005033) #14	THOC1 (ENSGALG00010005025) #15	COLEC12 (ENSGALG00010003921) #16	CLUL1 (ENSGALG00010003873) #18	TYMS (ENSGALG00010003884) #19	YES1 (ENSGALG00010003874) #21	ADCYAP1 (ENSGALG00010004036) #22	METTL4 (ENSGALG00010001507)	NDC80 (ENSGALG00010001457)	SMCHD1 (ENSGALG00010001364)	EMILIN2 (ENSGALG00010001313)	LPIN2 (ENSGALG00010001279)	MYOM1 (ENSGALG00010001347)	MYL12A (ENSGALG00010001297)	MYL12B (ENSGALG00010002352)	TGIF1 (ENSGALG00010001288)	DLGAP1 (ENSGALG00010001274)	AKAIN1 (ENSGALG00010001595)	ZBTB14 (ENSGALG00010001586)	EPB41L3 (ENSGALG00010001556)	ENSGALG00010001175	TMEM200C (ENSGALG00010001172)
Turkey	MODERN SPECIES	1131																ENSMGAG00000019334 #22
Neognathae_b	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00400000022086.a	ENSGT00530000063835.b	ENSGT00940000160814 #7	ENSGT00940000156781 #8	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT00960000189334	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.d	ENSGT00940000155230	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00940000166801	ENSGT00530000063698.a.b	ENSGT00940000158929
Neognathae_c	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00530000063835.a	ENSGT00530000063835.b	ENSGT00940000160814 #7	ENSGT00940000156781 #8	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00960000189334	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.d	ENSGT00940000155230	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00530000063698.a.b	ENSGT00940000158929	ENSGT00940000157124
Golden eagle	MODERN SPECIES	20	RBBP8 (ENSACCG00020006990)	GATA6 (ENSACCG00020007003) #7	MIB1 (ENSACCG00020007024) #8	ABHD3 (ENSACCG00020007071) #9	ESCO1 (ENSACCG00020007087) #11	GREB1L (ENSACCG00020007108) #12	ROCK1 (ENSACCG00020007131) #13	ENSACCG00020007273	USP14 (ENSACCG00020007294) #14	THOC1 (ENSACCG00020007317) #15	COLEC12 (ENSACCG00020007348) #16	CLUL1 (ENSACCG00020007379) #18	TYMS (ENSACCG00020007407) #19	ENSACCG00020007423	YES1 (ENSACCG00020007451) #21	ADCYAP1 (ENSACCG00020007471) #22	ENSACCG00020007486	ENSACCG00020007495	METTL4 (ENSACCG00020007504)	NDC80 (ENSACCG00020007587)	SMCHD1 (ENSACCG00020007610)	EMILIN2 (ENSACCG00020007675)	LPIN2 (ENSACCG00020007735)	ENSACCG00020007754	MYOM1 (ENSACCG00020007787)	ENSACCG00020007822	TGIF1 (ENSACCG00020007830)	DLGAP1 (ENSACCG00020007855)	AKAIN1 (ENSACCG00020007871)	ZBTB14 (ENSACCG00020007885)	EPB41L3 (ENSACCG00020008915)
Kakapo	MODERN SPECIES		ENSSHBG00005009144	RBBP8 (ENSSHBG00005009167)	GATA6 (ENSSHBG00005009187) #7	MIB1 (ENSSHBG00005009195) #8	ABHD3 (ENSSHBG00005009221) #9	ESCO1 (ENSSHBG00005009231) #11	GREB1L (ENSSHBG00005009244) #12	ROCK1 (ENSSHBG00005009325) #13	ENSSHBG00005009390	USP14 (ENSSHBG00005009402) #14	THOC1 (ENSSHBG00005009432) #15	COLEC12 (ENSSHBG00005009472) #16	CLUL1 (ENSSHBG00005009500) #18	TYMS (ENSSHBG00005009541) #19	YES1 (ENSSHBG00005009549) #21	ADCYAP1 (ENSSHBG00005009604) #22	METTL4 (ENSSHBG00005009622)	NDC80 (ENSSHBG00005009637)	SMCHD1 (ENSSHBG00005009701)	EMILIN2 (ENSSHBG00005009847)	LPIN2 (ENSSHBG00005009886)	MYOM1 (ENSSHBG00005009940)	ENSSHBG00005010016	TGIF1 (ENSSHBG00005010058)	DLGAP1 (ENSSHBG00005010073)	ENSSHBG00005010098	ENSSHBG00005010107	ZBTB14 (ENSSHBG00005010118)	EPB41L3 (ENSSHBG00005010140)	TMEM200C (ENSSHBG00005010241)	ARHGAP28 (ENSSHBG00005010310)
Passeriformes	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00400000022086.a	ENSGT00530000063835.b	ENSGT00940000160814 #7	ENSGT00940000156781 #8	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT00960000189334	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.d	ENSGT00940000155230	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00940000166801	ENSGT00530000063698.a.b	ENSGT00940000158929
Great tit	MODERN SPECIES	11	CABLES1 (ENSPMJG00000014693)	RBBP8 (ENSPMJG00000014691)	GATA6 (ENSPMJG00000014688) #7	MIB1 (ENSPMJG00000014685) #8	ABHD3 (ENSPMJG00000014684) #9	ESCO1 (ENSPMJG00000014683) #11	GREB1L (ENSPMJG00000014682) #12	ENSPMJG00000014680	ROCK1 (ENSPMJG00000014679) #13	USP14 (ENSPMJG00000014678) #14	THOC1 (ENSPMJG00000014677) #15	COLEC12 (ENSPMJG00000014676) #16	CLUL1 (ENSPMJG00000014675) #18	TYMS (ENSPMJG00000014674) #19	YES1 (ENSPMJG00000014673) #21	ADCYAP1 (ENSPMJG00000014671) #22	METTL4 (ENSPMJG00000014667)	ENSPMJG00000014666	ENSPMJG00000014665	EMILIN2 (ENSPMJG00000014664)	LPIN2 (ENSPMJG00000014663)	MYOM1 (ENSPMJG00000014662)	ENSPMJG00000014661	TGIF1 (ENSPMJG00000014660)	DLGAP1 (ENSPMJG00000014657)	AKAIN1 (ENSPMJG00000014655)	ZBTB14 (ENSPMJG00000014654)	EPB41L3 (ENSPMJG00000014653)	ENSPMJG00000014651	TMEM200C (ENSPMJG00000014650)	ARHGAP28 (ENSPMJG00000014648)
Passeriformes_d	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00400000022086.a	ENSGT00530000063835.b	ENSGT00940000160814 #7	ENSGT00940000156781 #8	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT00960000189334	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.d	ENSGT00940000155230	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00940000166801	ENSGT00530000063698.a.b	ENSGT00940000158929
Flycatcher	MODERN SPECIES	11	TMEM241 (ENSFALG00000006149)	CABLES1 (ENSFALG00000026437)	RBBP8 (ENSFALG00000006154)	GATA6 (ENSFALG00000006157) #7	MIB1 (ENSFALG00000006165) #8	ABHD3 (ENSFALG00000006167) #9	ESCO1 (ENSFALG00000006168) #11	GREB1L (ENSFALG00000006173) #12	ROCK1 (ENSFALG00000006185) #13	USP14 (ENSFALG00000028057) #14	THOC1 (ENSFALG00000006194) #15	COLEC12 (ENSFALG00000006224) #16	CLUL1 (ENSFALG00000006234) #18	TYMS (ENSFALG00000006240) #19	YES1 (ENSFALG00000023811) #21	ADCYAP1 (ENSFALG00000028660) #22	METTL4 (ENSFALG00000006257)	ENSFALG00000006264	SMCHD1 (ENSFALG00000006275)	EMILIN2 (ENSFALG00000006279)	LPIN2 (ENSFALG00000006288)	MYOM1 (ENSFALG00000006302)	ENSFALG00000028607	TGIF1 (ENSFALG00000025737)	DLGAP1 (ENSFALG00000006315)	ENSFALG00000006321	ZBTB14 (ENSFALG00000029022)	EPB41L3 (ENSFALG00000006324)	TMEM200C (ENSFALG00000014191)	ARHGAP28 (ENSFALG00000006329)	LAMA1 (ENSFALG00000006330)
Passeriformes_g	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00400000022086.a	ENSGT00530000063835.b	ENSGT00940000160814 #7	ENSGT00940000156781 #8	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT00960000189334	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.d	ENSGT00940000153607.c.b	ENSGT00940000155230	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00940000166801	ENSGT00530000063698.a.b
Passeroidea	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00400000022086.a	ENSGT00530000063835.b	ENSGT00940000160814 #7	ENSGT00940000156781 #8	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT00960000189334	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000018386	ENSGT00390000006950.n	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607.d	ENSGT00940000155230	ENSGT00940000156220	ENSGT00560000078638	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00940000166801	ENSGT00530000063698.a.b	ENSGT00940000158929
Zebra finch	MODERN SPECIES	12	CABLES1 (ENSTGUG00000010373)	RBBP8 (ENSTGUG00000010362)	GATA6 (ENSTGUG00000010356) #7	MIB1 (ENSTGUG00000010324) #8	ABHD3 (ENSTGUG00000010308) #9	ESCO1 (ENSTGUG00000027328) #11	GREB1L (ENSTGUG00000010297) #12	ENSTGUG00000016989	ROCK1 (ENSTGUG00000010253) #13	USP14 (ENSTGUG00000010223) #14	THOC1 (ENSTGUG00000010204) #15	COLEC12 (ENSTGUG00000010195) #16	CLUL1 (ENSTGUG00000010187) #18	TYMS (ENSTGUG00000010173) #19	YES1 (ENSTGUG00000010159) #21	ADCYAP1 (ENSTGUG00000021936) #22	METTL4 (ENSTGUG00000010144)	NDC80 (ENSTGUG00000010126)	SMCHD1 (ENSTGUG00000010092)	EMILIN2 (ENSTGUG00000019550)	LPIN2 (ENSTGUG00000010074)	MYOM1 (ENSTGUG00000010031)	ENSTGUG00000010026	TGIF1 (ENSTGUG00000021525)	DLGAP1 (ENSTGUG00000010015)	AKAIN1 (ENSTGUG00000026309)	ZBTB14 (ENSTGUG00000026034)	EPB41L3 (ENSTGUG00000009980)	ENSTGUG00000025068	TMEM200C (ENSTGUG00000025257)	ARHGAP28 (ENSTGUG00000009964)
Common canary	MODERN SPECIES		TMEM241 (ENSSCAG00000010342)	CABLES1 (ENSSCAG00000010334)	RBBP8 (ENSSCAG00000010311)	MIB1 (ENSSCAG00000010291) #8	ABHD3 (ENSSCAG00000010290) #9	ESCO1 (ENSSCAG00000010285) #11	GREB1L (ENSSCAG00000010274) #12	ENSSCAG00000010266	ROCK1 (ENSSCAG00000010251) #13	USP14 (ENSSCAG00000010244) #14	THOC1 (ENSSCAG00000010017) #15	COLEC12 (ENSSCAG00000009939) #16	CLUL1 (ENSSCAG00000009935) #18	TYMS (ENSSCAG00000009929) #19	YES1 (ENSSCAG00000009919) #21	ADCYAP1 (ENSSCAG00000009910) #22	METTL4 (ENSSCAG00000009903)	NDC80 (ENSSCAG00000009901)	SMCHD1 (ENSSCAG00000009893)	EMILIN2 (ENSSCAG00000009886)	LPIN2 (ENSSCAG00000009880)	MYOM1 (ENSSCAG00000009651)	ENSSCAG00000009601	ENSSCAG00000009591	TGIF1 (ENSSCAG00000009584)	DLGAP1 (ENSSCAG00000009525)	ENSSCAG00000009479	ZBTB14 (ENSSCAG00000009472)	EPB41L3 (ENSSCAG00000009458)	TMEM200C (ENSSCAG00000009443)	ARHGAP28 (ENSSCAG00000009422)
Medium ground finch	MODERN SPECIES	8	CABLES1 (ENSGFOG00000005494)	RBBP8 (ENSGFOG00000005486)	GATA6 (ENSGFOG00000005470) #7	MIB1 (ENSGFOG00000005438) #8	ABHD3 (ENSGFOG00000004954) #9	ESCO1 (ENSGFOG00000004931) #11	GREB1L (ENSGFOG00000004871) #12	ENSGFOG00000004864	ROCK1 (ENSGFOG00000004833) #13	USP14 (ENSGFOG00000004818) #14	THOC1 (ENSGFOG00000004582) #15	COLEC12 (ENSGFOG00000004526) #16	CLUL1 (ENSGFOG00000004502) #18	TYMS (ENSGFOG00000004489) #19	YES1 (ENSGFOG00000004474) #21	ADCYAP1 (ENSGFOG00000004443) #22	METTL4 (ENSGFOG00000004006)	NDC80 (ENSGFOG00000003969)	SMCHD1 (ENSGFOG00000003902)	EMILIN2 (ENSGFOG00000003888)	LPIN2 (ENSGFOG00000003847)	MYOM1 (ENSGFOG00000003776)	MYL12B (ENSGFOG00000003744)	TGIF1 (ENSGFOG00000003724)	DLGAP1 (ENSGFOG00000003709)
African ostrich	MODERN SPECIES	328	RMC1 (ENSSCUG00000005329)	RIOK3 (ENSSCUG00000005331)	TMEM241 (ENSSCUG00000005336)	CABLES1 (ENSSCUG00000005338)	RBBP8 (ENSSCUG00000005339)	MIB1 (ENSSCUG00000005340) #8	ABHD3 (ENSSCUG00000005344) #9	ESCO1 (ENSSCUG00000005346) #11	GREB1L (ENSSCUG00000005348) #12	ENSSCUG00000005357	COLEC12 (ENSSCUG00000005359) #16	CLUL1 (ENSSCUG00000005362) #18	TYMS (ENSSCUG00000005364) #19	ENOSF1 (ENSSCUG00000005365) #20	YES1 (ENSSCUG00000005366) #21	ADCYAP1 (ENSSCUG00000005367) #22	METTL4 (ENSSCUG00000005369)	NDC80 (ENSSCUG00000005371)	ENSSCUG00000005374	SMCHD1 (ENSSCUG00000005384)	EMILIN2 (ENSSCUG00000005455)	LPIN2 (ENSSCUG00000005459)	MYOM1 (ENSSCUG00000005467)	ENSSCUG00000005474	MYL12B (ENSSCUG00000005477)	TGIF1 (ENSSCUG00000005480)	ENSSCUG00000005485	DLGAP1 (ENSSCUG00000005488)	ENSSCUG00000005492	ENSSCUG00000005495	ZBTB14 (ENSSCUG00000005497)
Australian saltwater crocodile	MODERN SPECIES		RBBP8 (ENSCPRG00005014217)	GATA6 (ENSCPRG00005014212) #7	MIB1 (ENSCPRG00005014199) #8	ABHD3 (ENSCPRG00005014186) #9	ESCO1 (ENSCPRG00005014179) #11	GREB1L (ENSCPRG00005014165) #12	ENSCPRG00005014152	ROCK1 (ENSCPRG00005013104) #13	USP14 (ENSCPRG00005012821) #14	THOC1 (ENSCPRG00005012815) #15	COLEC12 (ENSCPRG00005012805) #16	CLUL1 (ENSCPRG00005012760) #18	TYMS (ENSCPRG00005012757) #19	ENOSF1 (ENSCPRG00005012735) #20	YES1 (ENSCPRG00005012732) #21	ADCYAP1 (ENSCPRG00005012688) #22	METTL4 (ENSCPRG00005012598)	NDC80 (ENSCPRG00005012579)	SMCHD1 (ENSCPRG00005011951)	EMILIN2 (ENSCPRG00005011842)	LPIN2 (ENSCPRG00005011838)	MYOM1 (ENSCPRG00005011737)	ENSCPRG00005011730	ENSCPRG00005011726	TGIF1 (ENSCPRG00005011653)	DLGAP1 (ENSCPRG00005011650)	ENSCPRG00005011531	ZBTB14 (ENSCPRG00005011530)	EPB41L3 (ENSCPRG00005010517)	TMEM200C (ENSCPRG00005010341)	ARHGAP28 (ENSCPRG00005010248)
Anura	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00400000022086.a	ENSGT00530000063835.b	ENSGT00940000160814 #7	ENSGT00940000156781 #8	ENSGT00950000182902.a.c #9	ENSGT00940000157762 #11	ENSGT00390000008041.B #12	ENSGT01030000234517.A #13	ENSGT00390000009615 #14	ENSGT00390000016232 #15	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000006950	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607	ENSGT00940000155230	ENSGT00940000156220	ENSGT00940000158052.a	ENSGT00940000157047	ENSGT00530000063698.a.b	ENSGT00940000158929	ENSGT00940000157124	ENSGT00940000163916	ENSGT00940000155020
Leishan spiny toad	MODERN SPECIES	8	ENSLLEG00000015270	ENSLLEG00000015292	ESCO1 (ENSLLEG00000015346) #11	GREB1L (ENSLLEG00000015512) #12	ENSLLEG00000016219	ROCK1 (ENSLLEG00000016369) #13	USP14 (ENSLLEG00000018739) #14	THOC1 (ENSLLEG00000018959) #15	COLEC12 (ENSLLEG00000019574) #16	ENSLLEG00000019665	CLUL1 (ENSLLEG00000019704) #18	ENSLLEG00000019880	ENSLLEG00000019921 #19	ENOSF1 (ENSLLEG00000020156) #20	YES1 (ENSLLEG00000020600) #21	ADCYAP1 (ENSLLEG00000020917) #22	ENSLLEG00000021008	ENSLLEG00000021053	METTL4 (ENSLLEG00000021094)	SMCHD1 (ENSLLEG00000021224)	EMILIN2 (ENSLLEG00000022020)	LPIN2 (ENSLLEG00000022166)	MYOM1 (ENSLLEG00000022820)	ENSLLEG00000023832	ENSLLEG00000023887	TGIF1 (ENSLLEG00000023912)	DLGAP1 (ENSLLEG00000023955)	ENSLLEG00000024169	ENSLLEG00000024211	ENSLLEG00000024225	ZBTB14 (ENSLLEG00000024248)
Frog	MODERN SPECIES	6	gata6 (ENSXETG00000003144) #7	mib1 (ENSXETG00000003146) #8	abhd3 (ENSXETG00000003147) #9	esco1 (ENSXETG00000038883) #11	greb1l (ENSXETG00000003149) #12	ENSXETG00000036640	rock1 (ENSXETG00000003151) #13	usp14 (ENSXETG00000003152) #14	ENSXETG00000041690	thoc1 (ENSXETG00000003155) #15	colec12 (ENSXETG00000003154) #16	clul1 (ENSXETG00000036167) #18	tyms (ENSXETG00000003156) #19	enosf1 (ENSXETG00000003158) #20	yes1 (ENSXETG00000019176) #21	adcyap1 (ENSXETG00000039137) #22	mettl4 (ENSXETG00000037053)	smchd1 (ENSXETG00000001609)	emilin2 (ENSXETG00000001613)	lpin2 (ENSXETG00000001617)	myom1 (ENSXETG00000001619)	myl12b (ENSXETG00000025009)	tgif1 (ENSXETG00000046401)	dlgap1 (ENSXETG00000033741)	ENSXETG00000043658	zbtb14 (ENSXETG00000002279)	epb41l3 (ENSXETG00000004959)	ENSXETG00000049119	tmem200c (ENSXETG00000037936)	ENSXETG00000043421	ENSXETG00000004957
Coelacanth	MODERN SPECIES	494			GATA6 (ENSLACG00000002547) #7	MIB1 (ENSLACG00000007418) #8	ABHD3 (ENSLACG00000010168) #9	ESCO1 (ENSLACG00000010739) #11	GREB1L (ENSLACG00000011118) #12	ROCK1 (ENSLACG00000014120) #13	USP14 (ENSLACG00000014679) #14	THOC1 (ENSLACG00000014869) #15	COLEC12 (ENSLACG00000015268) #16	CLUL1 (ENSLACG00000016091) #18	TYMS (ENSLACG00000016303) #19	ENOSF1 (ENSLACG00000016341) #20	YES1 (ENSLACG00000016474) #21	ADCYAP1 (ENSLACG00000016776) #22
Actinopterygii	ANCESTRAL SPECIES	324											ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000006950	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607
Reedfish	MODERN SPECIES	14	ENSECRG00000004014	chmp5b (ENSECRG00000004004)	bag1 (ENSECRG00000003996)	FASTKD3 (ENSECRG00000003992)	ENSECRG00000003986	ENSECRG00000003983	dipk1c (ENSECRG00000003975)	afg3l2 (ENSECRG00000003957)	ENSECRG00000003943	ENSECRG00000003939	colec12 (ENSECRG00000003932) #16	clul1 (ENSECRG00000007243) #18	tyms (ENSECRG00000007222) #19	enosf1 (ENSECRG00000007183) #20	yes1 (ENSECRG00000007054) #21	adcyap1b (ENSECRG00000007021) #22	METTL4 (ENSECRG00000007005)	SMCHD1 (ENSECRG00000006977)	EMILIN2 (ENSECRG00000006948)	LPIN2 (ENSECRG00000006917)	myom1a (ENSECRG00000006894)	myl12.1 (ENSECRG00000006872)	tgif1 (ENSECRG00000006865)	dlgap1a (ENSECRG00000006841)	ENSECRG00000006824	ZBTB14 (ENSECRG00000006817)	epb41l3a (ENSECRG00000006784)	ENSECRG00000006768	ENSECRG00000006761	TMEM200C (ENSECRG00000006756)	L3MBTL4 (ENSECRG00000006730)
Neopterygii	ANCESTRAL SPECIES	179	ENSGT00440000033408.a	ENSGT00940000165597	ENSGT00940000157567	ENSGT00940000155370	ENSGT00950000182837.a.b.a	ENSGT00940000157914	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a	ENSGT00390000015525	ENSGT00940000157171	ENSGT00530000062962.a.b	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00530000063668.A #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000006950	ENSGT01030000234633.B.a	ENSGT00940000156313	ENSGT00940000154982	ENSGT00940000153607	ENSGT01030000234607.A.a.a.a.c	ENSGT00450000040296	ENSGT00550000074817
Spotted gar	MODERN SPECIES	675	ENSLOCG00000010839	ENSLOCG00000010847	arl8 (ENSLOCG00000010851)	NSUN6 (ENSLOCG00000010862)	CACNB2 (ENSLOCG00000010868)	SLC39A12 (ENSLOCG00000010889)	MRC1 (ENSLOCG00000010898)	tmem236 (ENSLOCG00000010926)	stam (ENSLOCG00000010930)	hacd1 (ENSLOCG00000010955)	colec12 (ENSLOCG00000010964) #16	clul1 (ENSLOCG00000010985) #18	tyms (ENSLOCG00000010997) #19	enosf1 (ENSLOCG00000011003) #20	yes1 (ENSLOCG00000011016) #21	adcyap1b (ENSLOCG00000011028) #22	ENSLOCG00000011035	METTL4 (ENSLOCG00000011054)	SMCHD1 (ENSLOCG00000011069)	EMILIN2 (ENSLOCG00000011086)	LPIN2 (ENSLOCG00000011093)	myom1a (ENSLOCG00000011117)	myl12.1 (ENSLOCG00000011144)	FASTKD3 (ENSLOCG00000011153)	bag1 (ENSLOCG00000011163)	chmp5b (ENSLOCG00000011176)	ENSLOCG00000011184	ENSLOCG00000011201	NFX1 (ENSLOCG00000011211)	asap1a (ENSLOCG00000011231)	eef1a1l3 (ENSLOCG00000011245)
Osteoglossocephalai	ANCESTRAL SPECIES	217	ENSGT00940000165597	ENSGT00940000157567	ENSGT00940000155370	ENSGT00950000182837.a.b.a	ENSGT00940000157914	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a	ENSGT00390000015525.a	ENSGT00940000157171	ENSGT00530000062962.a.b	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00530000063668.A.c #18	ENSGT00530000063668.A.d #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000006950	ENSGT01030000234633.B.a.c
Clupeocephala	ANCESTRAL SPECIES	93	ENSGT00940000162556.B	ENSGT00440000033408.a.a	ENSGT00940000165597	ENSGT00940000157567	ENSGT00940000155370	ENSGT00950000182837.a.b.a	ENSGT00940000157914	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a	ENSGT00390000015525.a	ENSGT00530000062962.a.b	ENSGT00950000183074.A.a.a #16	ENSGT00530000063668.A.d #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920.bb.b #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000006950	ENSGT01030000234633.B.a.c	ENSGT00940000156313.c.a	ENSGT00940000156313.d	ENSGT00940000154982.c	ENSGT00940000153607.a.b	ENSGT01030000234607.A.a.a.a.c	ENSGT00550000074817.u	ENSGT00940000157341.h	ENSGT00940000159123.b	ENSGT00940000154185	ENSGT00390000009040	ENSGT00940000166366	ENSGT00940000156694
Otomorpha	ANCESTRAL SPECIES	120	ENSGT00940000159257	ENSGT00940000162556.B	ENSGT00440000033408.a.a	ENSGT00940000165597	ENSGT00940000157567	ENSGT00940000155370	ENSGT00950000182837.a.b.a	ENSGT00940000157914	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a	ENSGT00390000015525.a	ENSGT00530000062962.a.b	ENSGT00950000183074.A.a.a #16	ENSGT00530000063668.A.d #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000006950	ENSGT01030000234633.B.a.c	ENSGT00940000156313.c.a	ENSGT00940000154982.c	ENSGT00940000153607.a.b	ENSGT01030000234607.A.a.a.a.c	ENSGT00550000074817.u	ENSGT00940000157341.h	ENSGT00940000159123.b	ENSGT00940000154185	ENSGT00390000009040	ENSGT00940000166366	ENSGT00940000156694	ENSGT00940000154242.b.h
Otophysi	ANCESTRAL SPECIES	81	ENSGT00940000158945.u.a	ENSGT00940000156325	ENSGT00440000033408.a.a	ENSGT00940000165597	ENSGT00940000157567	ENSGT00940000155370	ENSGT00950000182837.a.b.a	ENSGT00940000157914	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a	ENSGT00390000015525.a	ENSGT00530000062962.a.b	ENSGT00950000183074.A.a.a #16	ENSGT00530000063668.A.d #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000006950	ENSGT01030000234633.B.a.c	ENSGT00940000156313.c.a	ENSGT00940000154982.c	ENSGT00940000153607.a.b	ENSGT01030000234607.A.a.a.a.c	ENSGT00550000074817.u	ENSGT00940000157341.h	ENSGT00940000159123.b	ENSGT00940000154185	ENSGT00390000009040	ENSGT00940000166366	ENSGT00940000156694	ENSGT00940000154242.b.h
Characiphysae	ANCESTRAL SPECIES	103	ENSGT00940000156325	ENSGT00440000033408.a.a	ENSGT00940000165597	ENSGT00940000157567	ENSGT00940000155370	ENSGT00950000182837.a.b.a	ENSGT00940000157914	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a	ENSGT00390000015525.a	ENSGT00530000062962.a.b	ENSGT00950000183074.A.a.a #16	ENSGT00530000063668.A.d #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920.bb.a #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000006950	ENSGT01030000234633.B.a.c	ENSGT00940000156313.c.a	ENSGT00940000154982.c	ENSGT00940000153607.a.b	ENSGT01030000234607.A.a.a.a.c	ENSGT00550000074817.u	ENSGT00940000157341.h	ENSGT00940000159123.b	ENSGT00940000154185	ENSGT00390000009040	ENSGT00940000166366	ENSGT00940000156694	ENSGT00940000154242.b.h
Channel catfish	MODERN SPECIES	26	chpf2 (ENSIPUG00000005872)	Smarcd3 (ENSIPUG00000005904)	NFX1 (ENSIPUG00000005961)	Plxdc2 (ENSIPUG00000006018)	malrd1 (ENSIPUG00000006079)	arl5b (ENSIPUG00000006168)	nsun6 (ENSIPUG00000006281)	cacnb2 (ENSIPUG00000006349)	ENSIPUG00000006447	mrc1 (ENSIPUG00000006475)	TMEM236 (ENSIPUG00000006544)	hacd1 (ENSIPUG00000006557)	colec12 (ENSIPUG00000006596) #16	tyms (ENSIPUG00000006627) #19	enosf1 (ENSIPUG00000006647) #20	adcyap1a (ENSIPUG00000006776) #22	mettl4 (ENSIPUG00000006797)	SMCHD1 (ENSIPUG00000006819)	ENSIPUG00000006908	ENSIPUG00000006922	psmb5 (ENSIPUG00000006941)	ENSIPUG00000006975	ENSIPUG00000007003	ENSIPUG00000007006	ENSIPUG00000007014	ENSIPUG00000007035	si:ch211-51h9.6 (ENSIPUG00000007053)	ENSIPUG00000007045	carmil3 (ENSIPUG00000007075)	REM2 (ENSIPUG00000007149)	ENSIPUG00000007170
Characiphysae_b	ANCESTRAL SPECIES	64	ENSGT00940000156325	ENSGT00440000033408.a.a	ENSGT00940000165597	ENSGT00940000157567	ENSGT00940000155370	ENSGT00950000182837.a.b.a	ENSGT00940000157914	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a	ENSGT00390000015525.a	ENSGT00530000062962.a.b	ENSGT00950000183074.A.a.a #16	ENSGT00530000063668.A.d #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920.bb.a #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000006950	ENSGT01030000234633.B.a.c	ENSGT00940000156313.c.a	ENSGT00940000154982.c	ENSGT00940000153607.a.b	ENSGT01030000234607.A.a.a.a.c	ENSGT00550000074817.u	ENSGT00940000157341.h	ENSGT00940000159123.b	ENSGT00940000154185	ENSGT00390000009040	ENSGT00940000166366	ENSGT00940000156694	ENSGT00940000154242.b.h
Characoidei	ANCESTRAL SPECIES	125				ENSGT00940000157567	ENSGT00940000155370	ENSGT00950000182837.a.b.a	ENSGT00940000157914	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a	ENSGT00390000015525.a	ENSGT00530000062962.a.b	ENSGT00950000183074.A.a.a #16	ENSGT00530000063668.A.d #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920.bb.a #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000006950	ENSGT01030000234633.B.a.c	ENSGT00940000156313.c.a	ENSGT00940000154982.c	ENSGT00940000153607.a.b	ENSGT01030000234607.A.a.a.a.c	ENSGT00550000074817.u	ENSGT00940000157341.h	ENSGT00940000159123.b	ENSGT00940000154185	ENSGT00390000009040	ENSGT00940000166366	ENSGT00940000156694	ENSGT00940000154242.b.h
Red-bellied piranha	MODERN SPECIES	201																adcyap1a (ENSPNAG00000021530) #22	METTL4 (ENSPNAG00000021504)	SMCHD1 (ENSPNAG00000021489)	ENSPNAG00000021467	LPIN2 (ENSPNAG00000021442)	MYOM1 (ENSPNAG00000006092)	ENSPNAG00000021358	FASTKD3 (ENSPNAG00000021319)	chmp5b (ENSPNAG00000005851)	ENSPNAG00000021262	RGS20 (ENSPNAG00000021236)	lypla1 (ENSPNAG00000021225)	mrpl15 (ENSPNAG00000021174)	sox32 (ENSPNAG00000021154)	sox17 (ENSPNAG00000021143)	ENSPNAG00000021136
Mexicana tetra	MODERN SPECIES	7	abcf2b (ENSAMXG00000007008)	ENSAMXG00000037921	PRKDC (ENSAMXG00000007058)	garem (ENSAMXG00000007173)	ncf2 (ENSAMXG00000007179)	dph2 (ENSAMXG00000007185)	ENSAMXG00000033306	MRC1 (ENSAMXG00000007199)	TMEM236 (ENSAMXG00000007219)	hacd1 (ENSAMXG00000039794)	COLEC12 (ENSAMXG00000007230) #16	ENSAMXG00000007236 #18	tyms (ENSAMXG00000007245) #19	enosf1 (ENSAMXG00000007242) #20	YES1 (ENSAMXG00000007250) #21	adcyap1a (ENSAMXG00000007261) #22	METTL4 (ENSAMXG00000002844)	SMCHD1 (ENSAMXG00000002900)	ENSAMXG00000034441	LPIN2 (ENSAMXG00000031472)	ENSAMXG00000043648	ENSAMXG00000036899	ENSAMXG00000037397	ENSAMXG00000042808	ENSAMXG00000017775	ENSAMXG00000031153	ENSAMXG00000037354	ENSAMXG00000036222	ENSAMXG00000035923	ENSAMXG00000033518	ENSAMXG00000030755
Electric eel	MODERN SPECIES	197													tyms (ENSEEEG00000001289) #19	enosf1 (ENSEEEG00000001361) #20	YES1 (ENSEEEG00000001363) #21	adcyap1a (ENSEEEG00000001366) #22	METTL4 (ENSEEEG00000001367)	SMCHD1 (ENSEEEG00000001380)	ENSEEEG00000001391	MYOM1 (ENSEEEG00000001396)	ENSEEEG00000001423	FASTKD3 (ENSEEEG00000001450)	chmp5b (ENSEEEG00000001452)	ENSEEEG00000001457	RGS20 (ENSEEEG00000001481)	lypla1 (ENSEEEG00000001511)	mrpl15 (ENSEEEG00000001566)	sox32 (ENSEEEG00000001567)	sox17 (ENSEEEG00000001570)	ENSEEEG00000001573	ENSEEEG00000001598
Cyprinoidei	ANCESTRAL SPECIES	41	ENSGT00950000182924.A.b.a.b	ENSGT00940000158985	ENSGT00940000157235	ENSGT00940000160460	ENSGT00950000183137.b.a	ENSGT00940000155800.a.b	ENSGT00940000162224	ENSGT00390000015958.d	ENSGT00940000165054.A	ENSGT00940000157294.d	ENSGT00390000007332	ENSGT00940000157772	ENSGT00940000153289.a.a.b	ENSGT00730000110920.b.a.b.b	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000006950	ENSGT01030000234633.B.a.c	ENSGT00940000154982.c	ENSGT00940000153607.b	ENSGT00940000155458.f	ENSGT00940000155370	ENSGT00950000182837.a.b.a	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000004147	ENSGT00940000160644	ENSGT00940000160483.k.b	ENSGT00390000013315	ENSGT00390000013104	ENSGT00940000162219.x
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	188	ENSGT00950000183137.b.a.g	ENSGT00940000155800.a.b	ENSGT00940000162224.g.a	ENSGT00390000015958.d	ENSGT00940000165054.A.a	ENSGT00940000157294.d.k.a	ENSGT00390000007332	ENSGT00940000157772	ENSGT00940000153289.a.a.b.b	ENSGT00940000154404.b.i.b	ENSGT00730000110920.b.a.b.b.a.b	ENSGT00940000153289.a.a.b.a	ENSGT00940000154404.b.i.a	ENSGT00730000110920.b.a.b.b.a.a	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000006950.k	ENSGT01030000234633.B.a.c.c	ENSGT00940000154982.c.c	ENSGT00940000153607.b	ENSGT00390000006950.l	ENSGT01030000234633.B.a.c.d	ENSGT00940000154982.c.d	ENSGT00940000155458.f	ENSGT00940000155370	ENSGT00950000182837.a.b.a.o.b	ENSGT00950000182837.a.b.a.o.a	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000004147.h	ENSGT01090000260061.c.b.ud
Goldfish	DUPLICATION
Goldfish	MODERN SPECIES	47	SYNPO2 (ENSCARG00000067787)	sec24d (ENSCARG00000064536)	KCNIP4 (ENSCARG00000064167)	ADGRA3 (ENSCARG00000063837)	gba3 (ENSCARG00000063771)	ENSCARG00000063752	PPARGC1A (ENSCARG00000063351)	dhx15 (ENSCARG00000063047)	sod3a (ENSCARG00000063009)	ENSCARG00000062973	lgi2a (ENSCARG00000062932)	ENSCARG00000062925	ppp1r15a (ENSCARG00000062920)	ACER2 (ENSCARG00000062899)	tyms (ENSCARG00000062865) #19	adcyap1a (ENSCARG00000062847) #22	SMCHD1 (ENSCARG00000060669)	ENSCARG00000060513	MYOM1 (ENSCARG00000054786)	myl12.1 (ENSCARG00000054533)	ENSCARG00000054524	ENSCARG00000054374	cacnb2a (ENSCARG00000047584)	lrp4 (ENSCARG00000045769)	psmd9 (ENSCARG00000045701)	ywhae2 (ENSCARG00000045609)	ENSCARG00000045529	RASGRP2 (ENSCARG00000044820)	slc35c1 (ENSCARG00000044803)	tollip (ENSCARG00000044691)	ENSCARG00000044658
Goldfish	MODERN SPECIES	25	CDH8 (ENSCARG00000019299)	ENSCARG00000020346	cdh11 (ENSCARG00000020379)	ENSCARG00000020551	ADGRA3 (ENSCARG00000020576)	PPARGC1A (ENSCARG00000020917)	dhx15 (ENSCARG00000021356)	ccdc149a (ENSCARG00000021766)	lgi2a (ENSCARG00000021878)	sepsecs (ENSCARG00000021929)	ENSCARG00000022114	ACO1 (ENSCARG00000022132)	ENSCARG00000022429	ENSCARG00000022435	ppp1r15a (ENSCARG00000022446)	adcyap1a (ENSCARG00000022450) #22	METTL4 (ENSCARG00000022455)	SMCHD1 (ENSCARG00000022493)	ENSCARG00000022801	cacnb2a (ENSCARG00000022899)	lrp4 (ENSCARG00000026352)	psmd9 (ENSCARG00000027725)	ywhae2 (ENSCARG00000027749)	ENSCARG00000027850	SIPA1 (ENSCARG00000027900)	RASGRP2 (ENSCARG00000027971)	slc35c1 (ENSCARG00000028088)	tollip (ENSCARG00000028096)	ENSCARG00000028141	RPH3A (ENSCARG00000028220)	ENSCARG00000028369
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	358											ENSGT00940000178258	ENSGT00940000154404.b.i.b	ENSGT00730000110920.b.a.b.a	ENSGT00730000110920.b.a.b.b.a.b	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000006950.k	ENSGT01030000234633.B.a.c.c	ENSGT00940000154982.c.c	ENSGT00940000153607.b	ENSGT00950000182837.a.b.a.o.b	ENSGT00940000158287.a	ENSGT00390000004147.h	ENSGT01090000260061.c.b.ud.c.a	ENSGT01030000234532.A.a.a.a.a.a.a.a	ENSGT01030000234532.A.a.a.a.a.a.b	ENSGT00940000160644.c	ENSGT00940000160483.k.b.c	ENSGT00390000013315.a.b	ENSGT00390000013104.d.a
Common carp reference	MODERN SPECIES	6	dhx15 (ENSCCRG00000003352)	ENSCCRG00000069927	sod3a (ENSCCRG00000066357)	sod3a (ENSCCRG00000048918)	ENSCCRG00000056492	sod3a (ENSCCRG00000061811)	ENSCCRG00000004568	lgi2a (ENSCCRG00000005289)	sepsecs (ENSCCRG00000048219)	ENSCCRG00000016223	ENSCCRG00000053263	ppp1r15a (ENSCCRG00000076631)	ENSCCRG00000064777	ENSCCRG00000066462	tyms (ENSCCRG00000081381) #19	adcyap1a (ENSCCRG00000032905) #22	METTL4 (ENSCCRG00000026868)	ENSCCRG00000071654	ENSCCRG00000076711	SMCHD1 (ENSCCRG00000033743)	EMILIN2 (ENSCCRG00000044568)	MYOM1 (ENSCCRG00000044950)	myl12.1 (ENSCCRG00000067896)	cacnb2a (ENSCCRG00000011606)	lrp4 (ENSCCRG00000015632)	psmd9 (ENSCCRG00000081299)	ywhae2 (ENSCCRG00000065575)	ENSCCRG00000061648	ENSCCRG00000057719	ENSCCRG00000069042	slc35c1 (ENSCCRG00000066984)
Golden-line barbel	DUPLICATION
Golden-line barbel	DUPLICATION
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	299				ADGRA3 (ENSSGRG00000029477)	gba3 (ENSSGRG00000029478)	PPARGC1A (ENSSGRG00000029480)	dhx15 (ENSSGRG00000029505)	sod3a (ENSSGRG00000029821)	sod3a (ENSSGRG00000029823)	lgi2a (ENSSGRG00000029827)	sepsecs (ENSSGRG00000029828)	ACO1 (ENSSGRG00000029950)	ENSSGRG00000030229	ppp1r15a (ENSSGRG00000030230)	ENSSGRG00000030231	adcyap1a (ENSSGRG00000030233) #22	adcyap1a (ENSSGRG00000030240) #22	SMCHD1 (ENSSGRG00000030256)	ENSSGRG00000030310	MYOM1 (ENSSGRG00000030320)	myl12.1 (ENSSGRG00000030663)	ENSSGRG00000030728	ENSSGRG00000030733	ENSSGRG00000030735	lrp4 (ENSSGRG00000030740)	ENSSGRG00000030900	SIPA1 (ENSSGRG00000030902)	RASGRP2 (ENSSGRG00000031059)	slc35c1 (ENSSGRG00000031067)	tollip (ENSSGRG00000031069)	ENSSGRG00000031072
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	299			ADGRA3 (ENSSGRG00000029477)	gba3 (ENSSGRG00000029478)	PPARGC1A (ENSSGRG00000029480)	dhx15 (ENSSGRG00000029505)	sod3a (ENSSGRG00000029821)	sod3a (ENSSGRG00000029823)	lgi2a (ENSSGRG00000029827)	sepsecs (ENSSGRG00000029828)	ACO1 (ENSSGRG00000029950)	ENSSGRG00000030229	ppp1r15a (ENSSGRG00000030230)	ENSSGRG00000030231	adcyap1a (ENSSGRG00000030233) #22	adcyap1a (ENSSGRG00000030240) #22	SMCHD1 (ENSSGRG00000030256)	ENSSGRG00000030310	MYOM1 (ENSSGRG00000030320)	myl12.1 (ENSSGRG00000030663)	ENSSGRG00000030728	ENSSGRG00000030733	ENSSGRG00000030735	lrp4 (ENSSGRG00000030740)	ENSSGRG00000030900	SIPA1 (ENSSGRG00000030902)	RASGRP2 (ENSSGRG00000031059)	slc35c1 (ENSSGRG00000031067)	tollip (ENSSGRG00000031069)	ENSSGRG00000031072	ENSSGRG00000031074
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	704	sod3a (ENSSGRG00000026468)	sod3a (ENSSGRG00000026470)	sod3a (ENSSGRG00000026471)	sod3a (ENSSGRG00000026472)	ccdc149a (ENSSGRG00000026479)	ENSSGRG00000026525	ENSSGRG00000026526	lgi2a (ENSSGRG00000026529)	sepsecs (ENSSGRG00000026531)	ACO1 (ENSSGRG00000026557)	ENSSGRG00000026642	ENSSGRG00000026643	ppp1r15a (ENSSGRG00000026644)	ACER2 (ENSSGRG00000026645)	tyms (ENSSGRG00000026646) #19	adcyap1a (ENSSGRG00000026647) #22	METTL4 (ENSSGRG00000026648)	SMCHD1 (ENSSGRG00000026666)	ENSSGRG00000027086	MYOM1 (ENSSGRG00000027088)	MYL12B (ENSSGRG00000027090)	cacnb2a (ENSSGRG00000027098)
Zebrafish	MODERN SPECIES	22	KCNIP4 (ENSDARG00000088100)	ADGRA3 (ENSDARG00000073673)	gba3 (ENSDARG00000031150)	PPARGC1A (ENSDARG00000067829)	dhx15 (ENSDARG00000015392)	sod3a (ENSDARG00000070168)	ccdc149a (ENSDARG00000078829)	ENSDARG00000087767	lgi2a (ENSDARG00000111069)	sepsecs (ENSDARG00000033861)	ACO1 (ENSDARG00000026376)	ENSDARG00000101240	ppp1r15a (ENSDARG00000069135)	ACER2 (ENSDARG00000077782)	tyms (ENSDARG00000042894) #19	adcyap1a (ENSDARG00000004015) #22	METTL4 (ENSDARG00000088999)	SMCHD1 (ENSDARG00000104374)	ENSDARG00000102178	MYOM1 (ENSDARG00000104836)	myl12.1 (ENSDARG00000099766)	NSUN6 (ENSDARG00000103478)	cacnb2a (ENSDARG00000099045)	ENSDARG00000116356	lrp4 (ENSDARG00000116353)	psmd9 (ENSDARG00000006300)	ywhae2 (ENSDARG00000017014)	ENSDARG00000041086	SIPA1 (ENSDARG00000076697)	RASGRP2 (ENSDARG00000099092)	ENSDARG00000102247
Clupeiformes	ANCESTRAL SPECIES	350							ENSGT00940000155370	ENSGT00950000182837.a.b.a	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a	ENSGT00390000015525.a	ENSGT00530000062962.a.b	ENSGT00950000183074.A.a.a #16	ENSGT00530000063668.A.d #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT01060000248592.A.a	ENSGT01030000234627.a.a.c	ENSGT00390000014737	ENSGT00510000048685.g.a	ENSGT00950000183191.a.b
Denticle herring	MODERN SPECIES	11	picalmb (ENSDCDG00000018743)	ENSDCDG00000018711	ENSDCDG00000018641	hspa8b (ENSDCDG00000017795)	lim2.3 (ENSDCDG00000017773)	NSUN6 (ENSDCDG00000017772)	cacnb2a (ENSDCDG00000017316)	zgc:165518 (ENSDCDG00000015437)	MRC1 (ENSDCDG00000014996)	TMEM236 (ENSDCDG00000014944)	hacd1 (ENSDCDG00000014942)	COLEC12 (ENSDCDG00000014940) #16	ENSDCDG00000014936 #18	tyms (ENSDCDG00000014932) #19	enosf1 (ENSDCDG00000014928) #20	adcyap1a (ENSDCDG00000014925) #22	ENSDCDG00000014922	bud23 (ENSDCDG00000014918)	SH2B2 (ENSDCDG00000014916)	ENSDCDG00000013318	endou (ENSDCDG00000013240)	stat2 (ENSDCDG00000013221)	ENSDCDG00000013198	ENSDCDG00000013195	WNK2 (ENSDCDG00000013184)	itih3b.2 (ENSDCDG00000013174)	krt4 (ENSDCDG00000013060)	os9 (ENSDCDG00000012997)	ninj1 (ENSDCDG00000012967)	card19 (ENSDCDG00000012957)	BICD2 (ENSDCDG00000012933)
Atlantic herring	MODERN SPECIES	8											ENSCHAG00000005298	ENSCHAG00000005331	ENSCHAG00000005474 #18	tyms (ENSCHAG00000005494) #19	ENOSF1 (ENSCHAG00000005665) #20	adcyap1a (ENSCHAG00000005800) #22	ENSCHAG00000005814	ENSCHAG00000005993	bud23 (ENSCHAG00000006185)	DNAJC30 (ENSCHAG00000006759)	SH2B2 (ENSCHAG00000006836)	ENSCHAG00000006869	ENSCHAG00000007526	pigm (ENSCHAG00000007561)	ENSCHAG00000007573	ANKS6 (ENSCHAG00000007600)	RAMP3 (ENSCHAG00000007631)	zgc:162895 (ENSCHAG00000007643)	ENSCHAG00000007712	ENSCHAG00000007752	ENSCHAG00000007810
Euteleosteomorpha	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183154.b.a.b #22
Acanthomorphata	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183154.b.a.b #22
Euacanthomorphacea	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183154.b.a.b #22
Percomorphaceae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183154.b.a.b #22
Tiger tail seahorse	MODERN SPECIES	206									ENSHCOG00000013220	ENSHCOG00000013233	IMPA1 (ENSHCOG00000013375)	ENSHCOG00000013406	COLEC12 (ENSHCOG00000013412) #16	tyms (ENSHCOG00000013427) #19	YES1 (ENSHCOG00000013457) #21	adcyap1a (ENSHCOG00000013466) #22	METTL4 (ENSHCOG00000013475)
Cod	MODERN SPECIES	15	rnf32 (ENSGMOG00000005073)	lmbr1 (ENSGMOG00000005099)	nom1 (ENSGMOG00000005129)	mnx1 (ENSGMOG00000005155)	ube3c (ENSGMOG00000005168)	dnajb6b (ENSGMOG00000031737)	CACNB2 (ENSGMOG00000005230)	SLC39A12 (ENSGMOG00000005264)	MRC1 (ENSGMOG00000005302)	TMEM236 (ENSGMOG00000005361)	HACD1 (ENSGMOG00000005368)	ENSGMOG00000005392 #16	tyms (ENSGMOG00000005420) #19	ENOSF1 (ENSGMOG00000005433) #20	YES1 (ENSGMOG00000013026) #21	adcyap1a (ENSGMOG00000022319) #22	METTL4 (ENSGMOG00000005506)	SMCHD1 (ENSGMOG00000005549)	EMILIN2 (ENSGMOG00000029684)	LPIN2 (ENSGMOG00000005655)	MYOM1 (ENSGMOG00000005713)	myl12.1 (ENSGMOG00000005791)	ENSGMOG00000033963	ENSGMOG00000005820	ENSGMOG00000005841	lypla1 (ENSGMOG00000005853)	mrpl15 (ENSGMOG00000005882)	sox32 (ENSGMOG00000005898)	sox17 (ENSGMOG00000025225)	ENSGMOG00000026788	ENSGMOG00000032844 #11
Osteoglossiformes	ANCESTRAL SPECIES	29	ENSGT00440000033408.a.a	ENSGT00940000165597	ENSGT00940000157567	ENSGT00940000155370	ENSGT00950000182837.a.b.a	ENSGT00940000157914	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a	ENSGT00390000015525.a	ENSGT00940000157171	ENSGT00530000062962.a.b	ENSGT00950000183074.A #16	ENSGT00530000063668.A.c #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920 #21	ENSGT00950000183154.b.a.b #22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000006950	ENSGT01030000234633.B.a.c	ENSGT00940000156313.c.b	ENSGT00940000154982.c	ENSGT00940000153607.a.b	ENSGT01030000234607.A.a.a.a.c	ENSGT00450000040296	ENSGT00550000074817.x	ENSGT00940000157341.g	ENSGT00940000157341.h	ENSGT00390000003289	ENSGT00940000159123	ENSGT00940000155121	ENSGT00940000154185
P. kingsleyae	MODERN SPECIES	479		arl8 (ENSPKIG00000011377)	NSUN6 (ENSPKIG00000011356)	cacnb2a (ENSPKIG00000011240)	SLC39A12 (ENSPKIG00000011166)	MRC1 (ENSPKIG00000011081)	TMEM236 (ENSPKIG00000011055)	stam (ENSPKIG00000011002)	hacd1 (ENSPKIG00000010955)	colec12 (ENSPKIG00000010920) #16	clul1 (ENSPKIG00000010884) #18	tyms (ENSPKIG00000010770) #19	enosf1 (ENSPKIG00000010690) #20	ENSPKIG00000010648 #21	ENSPKIG00000010630 #21	ADCYAP1 (ENSPKIG00000010573) #22
Asian bonytongue	MODERN SPECIES	24	arl8 (ENSSFOG00015002122)	NSUN6 (ENSSFOG00015001941)	cacnb2a (ENSSFOG00015001855)	ENSSFOG00015027472	ENSSFOG00015001791	MRC1 (ENSSFOG00015001671)	MRC1 (ENSSFOG00015001559)	TMEM236 (ENSSFOG00015001541)	stam (ENSSFOG00015001483)	hacd1 (ENSSFOG00015001435)	colec12 (ENSSFOG00015001429) #16	clul1 (ENSSFOG00015001348) #18	tyms (ENSSFOG00015001297) #19	enosf1 (ENSSFOG00015001233) #20	yes1 (ENSSFOG00015001214) #21	ADCYAP1 (ENSSFOG00015001198) #22	METTL4 (ENSSFOG00015001178)	SMCHD1 (ENSSFOG00015001170)	EMILIN2 (ENSSFOG00015001133)	LPIN2 (ENSSFOG00015001062)	MYOM1 (ENSSFOG00015000918)	myl12.1 (ENSSFOG00015026869)	FASTKD3 (ENSSFOG00015000899)	bag1 (ENSSFOG00015024302)	ENSSFOG00015000875	oprk1 (ENSSFOG00015000854)	ENSSFOG00015002023	rgs20 (ENSSFOG00015029104)	tcea1 (ENSSFOG00015023217)	lypla1 (ENSSFOG00015023232)	mrpl15 (ENSSFOG00015023246)
Euteleostomi	DUPLICATION
Euteleostomi	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183154.b.a.a.a ##22
Actinopterygii	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183154.b.a.a.a ##22
Neopterygii	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183154.b.a.a.a ##22
Osteoglossocephalai	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183154.b.a.a.a ##22
Clupeocephala	ANCESTRAL SPECIES	988															ENSGT00940000154920.cb #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.a ##22
Euteleosteomorpha	ANCESTRAL SPECIES	31	ENSGT00940000162556.B	ENSGT00440000033408.a.a	ENSGT00940000165597	ENSGT00940000157567	ENSGT00940000155370	ENSGT00950000182837.a.b.a	ENSGT00940000157914	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a	ENSGT00390000015525.a	ENSGT00530000062962.a.b	ENSGT00950000183074.A.a.a #16	ENSGT00530000063668.A.d #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920.bb.b #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.a ##22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000006950	ENSGT01030000234633.B.a.c	ENSGT00940000156313.c.a	ENSGT00940000156313.d	ENSGT00940000154982.c	ENSGT00940000153607.a.b	ENSGT01030000234607.A.a.a.a.c	ENSGT00550000074817.u	ENSGT00940000157341.h	ENSGT00940000159123.b	ENSGT00940000154185	ENSGT00390000009040	ENSGT00940000166366	ENSGT00940000156694
Protacanthopterygii	ANCESTRAL SPECIES	49	ENSGT00940000162556.B	ENSGT00440000033408.a.a	ENSGT00940000165597	ENSGT00940000157567	ENSGT00940000155370	ENSGT00950000182837.a.b.a	ENSGT00940000157914	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a	ENSGT00390000015525.a	ENSGT00530000062962.a.b	ENSGT00950000183074.A.a.a #16	ENSGT00530000063668.A.d #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920.bb.b #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.a ##22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000006950	ENSGT01030000234633.B.a.c	ENSGT00940000156313.c.a	ENSGT00940000154982.c	ENSGT00940000153607.a.b	ENSGT01030000234607.A.a.a.a.c	ENSGT00550000074817.u	ENSGT01090000260029.a.a.a.a.a.a.b.b.b.a	ENSGT00940000157341.h	ENSGT00940000159123.b	ENSGT00940000154185	ENSGT00390000009040.v	ENSGT00940000166366	ENSGT00940000156694
Salmoninae	DUPLICATION
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	827								ENSGT00940000155370.d	ENSGT00950000182837.a.b.a.l	ENSGT00390000015525.a.a	ENSGT00530000062962.a.b.f	ENSGT00950000183074.A.a.a.a #16	ENSGT00390000014786.d #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920.bb.b.d #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.a.a ##22
Huchen	MODERN SPECIES	1195											hacd1 (ENSHHUG00000027130)	COLEC12 (ENSHHUG00000027124) #16	tyms (ENSHHUG00000027115) #19	enosf1 (ENSHHUG00000027085) #20	YES1 (ENSHHUG00000024273) #21	ADCYAP1 (ENSHHUG00000024227) ##22
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	32	ENSGT00940000156177.f	ENSGT00940000160993	ENSGT01030000234667.a.a.a.b.a.a	ENSGT00950000183138.a.a.b.u.c.b.a	ENSGT00390000005489.c	ENSGT00940000162556.B.c	ENSGT00440000033408.a.a.b	ENSGT00940000155370.d	ENSGT00950000182837.a.b.a.l	ENSGT00390000015525.a.a	ENSGT00530000062962.a.b.f	ENSGT00950000183074.A.a.a.a #16	ENSGT00390000014786.d #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920.bb.b.d #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.a.a ##22	ENSGT00390000006950.j	ENSGT01030000234633.B.a.c.a	ENSGT00940000156313.c.a.a	ENSGT00940000154982.c.b	ENSGT00940000153607.a.b	ENSGT01030000234607.A.a.a.a.c.b
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT01030000234667.a.a.a.b.a.a	ENSGT00950000183138.a.a.b.u.c.a.a	ENSGT00950000183138.a.a.b.u.c.b.a	ENSGT00390000005489.c	ENSGT00940000162556.B.c	ENSGT00440000033408.a.a.b	ENSGT00940000155370.d	ENSGT00950000182837.a.b.a.l	ENSGT00390000015525.a.a	ENSGT00530000062962.a.b.f	ENSGT00950000183074.A.a.a.a #16	ENSGT00970000193390.c.a.b.a.b	ENSGT00390000014786.d #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920.bb.b.d #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.a.a ##22	ENSGT00390000006950.j	ENSGT01030000234633.B.a.c.a	ENSGT00940000156313.c.a.a	ENSGT00940000154982.c.b	ENSGT00940000153607.a.b	ENSGT01030000234607.A.a.a.a.c.b	ENSGT00550000074817.u.f	ENSGT00940000157341.h.d	ENSGT00940000155605.a.b.a.b	ENSGT00940000159123.b.a	ENSGT00940000154185.gb	ENSGT00390000009040.v.a	ENSGT00940000166366.b	ENSGT00940000156694.e.a	ENSGT00940000154242.b.h.b
River trout	MODERN SPECIES	11	acad11 (ENSSTUG00000013842)	ackr4b (ENSSTUG00000014957)	ENSSTUG00000014981	myripb (ENSSTUG00000014991)	ENSSTUG00000015012	ENSSTUG00000015023	plxdc2b (ENSSTUG00000015057)	CACNB2 (ENSSTUG00000015348)	ENSSTUG00000015615	hacd1 (ENSSTUG00000015625)	COLEC12 (ENSSTUG00000015645) #16	ENSSTUG00000015659	tyms (ENSSTUG00000015720) #19	enosf1 (ENSSTUG00000015941) #20	YES1 (ENSSTUG00000016247) #21	ADCYAP1 (ENSSTUG00000018253) ##22	ENSSTUG00000018286	EMILIN2 (ENSSTUG00000018330)	LPIN2 (ENSSTUG00000018452)	MYOM1 (ENSSTUG00000019093)	MYL12B (ENSSTUG00000020019)	ENSSTUG00000020037	chmp5b (ENSSTUG00000020125)	OPRK1 (ENSSTUG00000020145)	RGS20 (ENSSTUG00000020166)	lypla1 (ENSSTUG00000020192)	mrpl15 (ENSSTUG00000020205)	sox32 (ENSSTUG00000020225)	sox17 (ENSSTUG00000020231)	ENSSTUG00000020243	ENSSTUG00000020250
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	10	ackr4b (ENSSSAG00000063130)	ENSSSAG00000063147	ENSSSAG00000063161	ENSSSAG00000063280	PLXDC2 (ENSSSAG00000063291)	ENSSSAG00000064158	CACNB2 (ENSSSAG00000064266)	ENSSSAG00000070669	ENSSSAG00000070671	ENSSSAG00000070680 #16	ENSSSAG00000107938	ENSSSAG00000070701	TYMS (ENSSSAG00000070708) #19	enosf1 (ENSSSAG00000070720) #20	YES1 (ENSSSAG00000070866) #21	ADCYAP1 (ENSSSAG00000074062) ##22	SMCHD1 (ENSSSAG00000115693)	EMILIN2 (ENSSSAG00000074068)	LPIN2 (ENSSSAG00000074165)	ENSSSAG00000091327	MYOM1 (ENSSSAG00000076408)	MLRN (ENSSSAG00000077005)	CHMP5 (ENSSSAG00000043519)	ENSSSAG00000105068	ENSSSAG00000088199	RGS20 (ENSSSAG00000095348)	lypla1 (ENSSSAG00000043602)	RM15 (ENSSSAG00000043628)	sox32 (ENSSSAG00000043641)	sox17 (ENSSSAG00000043665)	ENSSSAG00000084025
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	28	ENSGT00940000156177.f	ENSGT00940000160993.j	ENSGT00950000183138.a.a.b.u.c.b.a	ENSGT00390000005489.c	ENSGT00730000111180.n	ENSGT00940000162556.B.c	ENSGT00440000033408.a.a.b	ENSGT00950000182837.a.b.a.l	ENSGT00390000015525.a.a	ENSGT00530000062962.a.b.f	ENSGT00950000183074.A.a.a.a #16	ENSGT00390000014786.d #19	ENSGT00390000014290.h #20	ENSGT00940000154920.bb.b.d #21	ENSGT00940000177189.g.b.a	ENSGT00950000183154.b.a.a.a.a ##22	ENSGT01030000234633.B.a.c.a	ENSGT00940000156313.c.a.a	ENSGT00940000154982.c.b	ENSGT00940000153607.a.b	ENSGT01030000234607.A.a.a.a.c.b	ENSGT00940000157341.h.d	ENSGT00940000159123.b.a	ENSGT00940000154185.gb	ENSGT00390000009040.v.a	ENSGT00940000166366.b	ENSGT00940000156694.e.a	ENSGT00940000154242.b.h.b	ENSGT00940000178871.a.a	ENSGT00940000157762.k #11	ENSGT00390000000481.m
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00940000156177.f	ENSGT00940000160993.j	ENSGT00950000183138.a.a.b.u.c.b.a	ENSGT00390000005489.c	ENSGT00730000111180.n	ENSGT00940000162556.B.c	ENSGT00440000033408.a.a.b	ENSGT00950000182837.a.b.a.l	ENSGT00390000015525.a.a	ENSGT00530000062962.a.b.f	ENSGT00950000183074.A.a.a.a #16	ENSGT00390000014786.d #19	ENSGT00390000014290.h #20	ENSGT00940000154920.bb.b.d #21	ENSGT00940000177189.g.b.a	ENSGT00950000183154.b.a.a.a.a ##22	ENSGT01030000234633.B.a.c.a	ENSGT00940000156313.c.a.a	ENSGT00940000154982.c.b	ENSGT00940000153607.a.b	ENSGT00550000074817.u.f.b.b	ENSGT00940000157341.h.d	ENSGT00940000155393.d.tb	ENSGT00940000159123.b.a	ENSGT00940000154185.gb	ENSGT00390000009040.v.a	ENSGT00940000166366.b	ENSGT00940000156694.e.a	ENSGT00940000154242.b.h.b	ENSGT00940000157762.k #11	ENSGT00390000000481.m
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Chinook salmon	MODERN SPECIES	7	acad11 (ENSOTSG00005003111)	ENSOTSG00005005275	ENSOTSG00005005276	plxdc2b (ENSOTSG00005005277)	ENSOTSG00005005465	ENSOTSG00005005468	CACNB2 (ENSOTSG00005005494)	ENSOTSG00005009361	ENSOTSG00005009362	hacd1 (ENSOTSG00005009363)	COLEC12 (ENSOTSG00005009364) #16	tyms (ENSOTSG00005009365) #19	enosf1 (ENSOTSG00005009401) #20	YES1 (ENSOTSG00005010781) #21	ENSOTSG00005016115	ADCYAP1 (ENSOTSG00005016116) ##22	EMILIN2 (ENSOTSG00005016117)	LPIN2 (ENSOTSG00005016119)	MYOM1 (ENSOTSG00005016265)	MYL12B (ENSOTSG00005020423)	chmp5b (ENSOTSG00005020426)	OPRK1 (ENSOTSG00005020428)	ENSOTSG00005020430	lypla1 (ENSOTSG00005020431)	mrpl15 (ENSOTSG00005020432)	sox32 (ENSOTSG00005020433)	MEGF6 (ENSOTSG00005020435)	KCNAB2 (ENSOTSG00005020443)	ENSOTSG00005020444	park7 (ENSOTSG00005020445)	ENSOTSG00005020456
Rainbow trout	MODERN SPECIES	2	ENSOMYG00000070983	ENSOMYG00000016706	ENSOMYG00000016710	ENSOMYG00000016744	ENSOMYG00000017553	ENSOMYG00000053091	ENSOMYG00000017623	ENSOMYG00000067642	ENSOMYG00000059945	ENSOMYG00000017816	ENSOMYG00000017829 #16	ENSOMYG00000031141	ENOSF1 (ENSOMYG00000031240) #20	ENSOMYG00000032040 #21	ENSOMYG00000036469	ADCYAP1 (ENSOMYG00000036507) ##22	EMILIN2 (ENSOMYG00000036549)	LPIN2 (ENSOMYG00000036690)	MYOM1 (ENSOMYG00000037230)	mlrn (ENSOMYG00000037517)	ENSOMYG00000037533	ENSOMYG00000069577	ENSOMYG00000037506	ENSOMYG00000070848	ENSOMYG00000037559	RGS20 (ENSOMYG00000037591)	lypla1 (ENSOMYG00000037597)	mrpl15 (ENSOMYG00000037611)	sox32 (ENSOMYG00000037618)	sox17 (ENSOMYG00000037627)	ENSOMYG00000020949
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	88	ENSGT00940000162556.B.d	ENSGT00440000033408.a.a.a	ENSGT00940000165597	ENSGT00940000157567	ENSGT00940000155370.c	ENSGT00950000182837.a.b.a.k	ENSGT00940000157914	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a.d	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a.c	ENSGT00390000015525.a.b	ENSGT00530000062962.a.b.e	ENSGT00950000183074.A.a.a.b #16	ENSGT00530000063668.A.d #18	ENSGT00390000014786.c #19	ENSGT00940000154920.bb.b.c #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.a.b ##22	ENSGT00940000167904.b	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000006950.i	ENSGT01030000234633.B.a.c.b	ENSGT00940000156313.c.a.b	ENSGT00940000154982.c.a	ENSGT00940000153607.a.b	ENSGT01030000234607.A.a.a.a.c.b	ENSGT00940000155458.k	ENSGT01030000234607.A.a.a.a.c.a	ENSGT00550000074817.u.e	ENSGT01090000260029.a.a.a.a.a.a.b.b.b.a.a	ENSGT01090000260029.a.a.a.a.a.a.b.b.b.a.b	ENSGT00550000074817.u.f	ENSGT00940000157341.h.d
Huchen	MODERN SPECIES	506	ENSHHUG00000011755	malrd1 (ENSHHUG00000011741)	ENSHHUG00000011734	arl8 (ENSHHUG00000011716)	NSUN6 (ENSHHUG00000011686)	CACNB2 (ENSHHUG00000011384)	ENSHHUG00000011358	MRC1 (ENSHHUG00000011331)	MRC1 (ENSHHUG00000011291)	TMEM236 (ENSHHUG00000011276)	hacd1 (ENSHHUG00000011262)	COLEC12 (ENSHHUG00000011244) #16	CLUL1 (ENSHHUG00000011214) #18	tyms (ENSHHUG00000011139) #19	YES1 (ENSHHUG00000010621) #21	ADCYAP1 (ENSHHUG00000010589) ##22
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	69	ENSGT00940000162556.B.d	ENSGT00440000033408.a.a.a	ENSGT00940000165597	ENSGT00940000157567	ENSGT00950000182996.b.a.a.a.b	ENSGT00940000155370.c	ENSGT00950000182837.a.b.a.k	ENSGT00940000157914	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a.c	ENSGT00390000015525.a.b	ENSGT00530000062962.a.b.e	ENSGT00950000183074.A.a.a.b #16	ENSGT00530000063668.A.d #18	ENSGT00390000014786.c #19	ENSGT00940000154920.bb.b.c #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.a.b ##22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000006950.i	ENSGT01030000234633.B.a.c.b	ENSGT00940000156313.c.a.b	ENSGT00940000154982.c.a	ENSGT00940000155458.k	ENSGT01030000234607.A.a.a.a.c.a	ENSGT00550000074817.u.e	ENSGT01090000260029.a.a.a.a.a.a.b.b.b.a.a	ENSGT01090000260029.a.a.a.a.a.a.b.b.b.a.b	ENSGT00550000074817.u.f	ENSGT00940000157341.h.d	ENSGT00940000155393.d.tb	ENSGT00940000155605.a.b.a.b	ENSGT00940000159123.b.a
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	34	ENSGT00940000162556.B.d	ENSGT00440000033408.a.a.a	ENSGT00940000165597	ENSGT00940000157567	ENSGT00950000182996.b.a.a.a.b	ENSGT00940000155370.c	ENSGT00950000182837.a.b.a.k	ENSGT00940000157914	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a.c	ENSGT00390000015525.a.b	ENSGT00530000062962.a.b.e	ENSGT00950000183074.A.a.a.b #16	ENSGT00530000063668.A.d #18	ENSGT00390000014786.c #19	ENSGT00940000154920.bb.b.c #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.a.b ##22	ENSGT00940000167904.b	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000006950.i	ENSGT01030000234633.B.a.c.b	ENSGT00940000156313.c.a.b	ENSGT00940000154982.c.a	ENSGT00940000155458.k	ENSGT01030000234607.A.a.a.a.c.a	ENSGT00550000074817.u.e	ENSGT01090000260029.a.a.a.a.a.a.b.b.b.a.a	ENSGT01090000260029.a.a.a.a.a.a.b.b.b.a.b	ENSGT00940000157341.h.c	ENSGT00940000159123.b.b	ENSGT00940000154185.fb	ENSGT00390000009040.v.b
River trout	MODERN SPECIES	36	plxdc2b (ENSSTUG00000004524)	malrd1 (ENSSTUG00000003570)	ENSSTUG00000003475	arl8 (ENSSTUG00000003450)	ENSSTUG00000003428	NSUN6 (ENSSTUG00000003360)	CACNB2 (ENSSTUG00000003138)	SLC39A12 (ENSSTUG00000003109)	MRC1 (ENSSTUG00000000974)	TMEM236 (ENSSTUG00000000804)	hacd1 (ENSSTUG00000000800)	COLEC12 (ENSSTUG00000000793) #16	CLUL1 (ENSSTUG00000000375) #18	tyms (ENSSTUG00000000198) #19	YES1 (ENSSTUG00000042693) #21	ADCYAP1 (ENSSTUG00000042588) ##22	ENSSTUG00000042579	ENSSTUG00000042565	METTL4 (ENSSTUG00000042549)	SMCHD1 (ENSSTUG00000041432)	EMILIN2 (ENSSTUG00000041395)	LPIN2 (ENSSTUG00000040733)	MYOM1 (ENSSTUG00000038853)	myl12.1 (ENSSTUG00000038805)	FASTKD3 (ENSSTUG00000038790)	chmp5b (ENSSTUG00000038765)	ENSSTUG00000038752	ENSSTUG00000038665	OPRK1 (ENSSTUG00000038647)	RGS20 (ENSSTUG00000038630)	lypla1 (ENSSTUG00000038578)
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	21	ENSSSAG00000070377	plxdc2b (ENSSSAG00000070397)	malrd1 (ENSSSAG00000070649)	arl8 (ENSSSAG00000108044)	ENSSSAG00000070996	NSUN6 (ENSSSAG00000071007)	cacnb2a (ENSSSAG00000071149)	SLC39A12 (ENSSSAG00000073552)	mrc1 (ENSSSAG00000073565)	TMEM236 (ENSSSAG00000112518)	HACD1 (ENSSSAG00000073829)	COLEC12 (ENSSSAG00000073837) #16	clul1 (ENSSSAG00000073840) #18	tyms (ENSSSAG00000073844) #19	YES1 (ENSSSAG00000073876) #21	ADCYAP1 (ENSSSAG00000074440) ##22	ENSSSAG00000074443	mettl4 (ENSSSAG00000074445)	SMCHD1 (ENSSSAG00000074510)	EMILIN2 (ENSSSAG00000087562)	LPIN2 (ENSSSAG00000075262)	MYOM1 (ENSSSAG00000076839)	myl12.1 (ENSSSAG00000089518)	ENSSSAG00000008864	CHMP5 (ENSSSAG00000008886)	ENSSSAG00000118600	ENSSSAG00000098247	ENSSSAG00000043539	RGS20 (ENSSSAG00000008992)	lypla1 (ENSSSAG00000009036)	mrpl15 (ENSSSAG00000009177)
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	27	ENSGT00940000162556.B.d	ENSGT00440000033408.a.a.a	ENSGT00940000165597	ENSGT00940000157567	ENSGT00950000182996.b.a.a.a.b	ENSGT00940000155370.c	ENSGT00950000182837.a.b.a.k	ENSGT00940000157914	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a.c	ENSGT00390000015525.a.b	ENSGT00530000062962.a.b.e	ENSGT00950000183074.A.a.a.b #16	ENSGT00530000063668.A.d #18	ENSGT00390000014786.c #19	ENSGT00940000154920.bb.b.c #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.a.b ##22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000006950.i	ENSGT01030000234633.B.a.c.b	ENSGT00940000156313.c.a.b	ENSGT00940000154982.c.a	ENSGT00940000155458.k	ENSGT01030000234607.A.a.a.a.c.a	ENSGT00550000074817.u.f	ENSGT00550000074817.u.e	ENSGT01090000260029.a.a.a.a.a.a.b.b.b.a.a	ENSGT01090000260029.a.a.a.a.a.a.b.b.b.a.b	ENSGT00940000157341.h.c	ENSGT00940000159123.b.b	ENSGT00940000154185.fb	ENSGT00390000009040.v.b
Rainbow trout	MODERN SPECIES	6	ENSOMYG00000021846	plxdc2b (ENSOMYG00000020625)	malrd1 (ENSOMYG00000020351)	arl8 (ENSOMYG00000020297)	NSUN6 (ENSOMYG00000020288)	CACNB2 (ENSOMYG00000020040)	ENSOMYG00000077004	SLC39A12 (ENSOMYG00000019964)	MRC1 (ENSOMYG00000067787)	TMEM236 (ENSOMYG00000017807)	HACD1 (ENSOMYG00000018445)	COLEC12 (ENSOMYG00000018421) #16	CLUL1 (ENSOMYG00000018391) #18	tyms (ENSOMYG00000018372) #19	YES1 (ENSOMYG00000017136) #21	ADCYAP1 (ENSOMYG00000017026) ##22	METTL4 (ENSOMYG00000023827)	SMCHD1 (ENSOMYG00000022813)	EMILIN2 (ENSOMYG00000022516)	LPIN2 (ENSOMYG00000022219)	MYOM1 (ENSOMYG00000021528)	myl12.1 (ENSOMYG00000021116)	ENSOMYG00000021110	chmp5b (ENSOMYG00000021092)	ENSOMYG00000061164	ENSOMYG00000021059	ENSOMYG00000021031	ENSOMYG00000045503	RGS20 (ENSOMYG00000021011)	lypla1 (ENSOMYG00000020976)	mrpl15 (ENSOMYG00000020961)
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	27	ENSGT00940000159257	ENSGT00940000162556.B.d	ENSGT00440000033408.a.a.a	ENSGT00940000165597	ENSGT00940000157567	ENSGT00950000182996.b.a.a.a.b	ENSGT00940000155370.c	ENSGT00950000182837.a.b.a.k	ENSGT00940000157914	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a.c	ENSGT00390000015525.a.b	ENSGT00530000062962.a.b.e	ENSGT00950000183074.A.a.a.b #16	ENSGT00530000063668.A.d #18	ENSGT00940000154920.bb.b.c #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.a.b ##22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000006950.i	ENSGT01030000234633.B.a.c.b	ENSGT00940000156313.c.a.b	ENSGT00940000154982.c.a	ENSGT00940000155458.k	ENSGT01030000234607.A.a.a.a.c.a	ENSGT00550000074817.u.f.b.a	ENSGT01090000260029.a.a.a.a.a.a.b.b.b.a.b	ENSGT00940000157341.h.c	ENSGT00940000159123.b.b	ENSGT00940000154185.fb	ENSGT00390000009040.v.b	ENSGT00940000166366.a	ENSGT00940000156694.e.b
Coho salmon	MODERN SPECIES	2	ENSOKIG00005033315	plxdc2b (ENSOKIG00005033358)	malrd1 (ENSOKIG00005034117)	arl8 (ENSOKIG00005034717)	ENSOKIG00005034735	NSUN6 (ENSOKIG00005034747)	CACNB2 (ENSOKIG00005035065)	ENSOKIG00005038491	SLC39A12 (ENSOKIG00005038526)	MRC1 (ENSOKIG00005038628)	TMEM236 (ENSOKIG00005040363)	HACD1 (ENSOKIG00005040374)	COLEC12 (ENSOKIG00005040408) #16	ENSOKIG00005040436 #18	YES1 (ENSOKIG00005040587) #21	ADCYAP1 (ENSOKIG00005043513) ##22	METTL4 (ENSOKIG00005043558)	SMCHD1 (ENSOKIG00005043887)	EMILIN2 (ENSOKIG00005045397)	LPIN2 (ENSOKIG00005045445)	MYOM1 (ENSOKIG00005045559)	myl12.1 (ENSOKIG00005045988)	FASTKD3 (ENSOKIG00005045995)	chmp5b (ENSOKIG00005046004)	ENSOKIG00005046017	OPRK1 (ENSOKIG00005046038)	RGS20 (ENSOKIG00005046049)	lypla1 (ENSOKIG00005046065)	mrpl15 (ENSOKIG00005046196)	sox32 (ENSOKIG00005046215)	sox17 (ENSOKIG00005046220)
Chinook salmon	MODERN SPECIES	21	ENSOTSG00005007929	zfand1 (ENSOTSG00005007927)	chmp4c (ENSOTSG00005007923)	ENSOTSG00005007921	plxdc2b (ENSOTSG00005005120)	malrd1 (ENSOTSG00005003154)	arl8 (ENSOTSG00005002769)	NSUN6 (ENSOTSG00005002715)	CACNB2 (ENSOTSG00005034388)	SLC39A12 (ENSOTSG00005034379)	MRC1 (ENSOTSG00005031316)	TMEM236 (ENSOTSG00005031291)	COLEC12 (ENSOTSG00005031290) #16	ENSOTSG00005031289 #18	YES1 (ENSOTSG00005026315) #21	ADCYAP1 (ENSOTSG00005026305) ##22	METTL4 (ENSOTSG00005026304)	SMCHD1 (ENSOTSG00005024233)	ENSOTSG00005024212	LPIN2 (ENSOTSG00005023993)	MYOM1 (ENSOTSG00005022985)	myl12.1 (ENSOTSG00005022956)	FASTKD3 (ENSOTSG00005022953)	chmp5b (ENSOTSG00005022950)	ENSOTSG00005022947	OPRK1 (ENSOTSG00005022944)	RGS20 (ENSOTSG00005022941)	lypla1 (ENSOTSG00005022894)	mrpl15 (ENSOTSG00005022893)	sox32 (ENSOTSG00005022891)	sox17 (ENSOTSG00005022889)
Northern pike	MODERN SPECIES	20	malrd1 (ENSELUG00000022907)	arl8 (ENSELUG00000022956)	ENSELUG00000032490	NSUN6 (ENSELUG00000021983)	CACNB2 (ENSELUG00000021961)	SLC39A12 (ENSELUG00000021899)	MRC1 (ENSELUG00000021836)	ENSELUG00000032982	TMEM236 (ENSELUG00000008811)	hacd1 (ENSELUG00000008798)	ENSELUG00000001430	CLUL1 (ENSELUG00000008673) #18	tyms (ENSELUG00000008633) #19	enosf1 (ENSELUG00000008661) #20	YES1 (ENSELUG00000008554) #21	ADCYAP1 (ENSELUG00000008520) ##22	METTL4 (ENSELUG00000008466)	SMCHD1 (ENSELUG00000008441)	EMILIN2 (ENSELUG00000008396)	LPIN2 (ENSELUG00000008377)	MYOM1 (ENSELUG00000008339)	ENSELUG00000008282	myl12.1 (ENSELUG00000008263)	FASTKD3 (ENSELUG00000008158)	chmp5 (ENSELUG00000008132)	ENSELUG00000008063	OPRK1 (ENSELUG00000008032)	RGS20 (ENSELUG00000027608)	lypla1 (ENSELUG00000007987)	mrpl15 (ENSELUG00000007952)	sox32 (ENSELUG00000007938)
Acanthomorphata	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000162556.B	ENSGT00440000033408.a.a	ENSGT00940000165597	ENSGT00940000157567	ENSGT00940000155370	ENSGT00950000182837.a.b.a	ENSGT00940000157914	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a	ENSGT00390000015525.a	ENSGT00530000062962.a.b	ENSGT00950000183074.A.a.a #16	ENSGT00530000063668.A.d #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920.bb.b #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.a ##22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000006950	ENSGT01030000234633.B.a.c	ENSGT00940000156313.c.a	ENSGT00940000156313.d	ENSGT00940000154982.c	ENSGT00940000153607.a.b	ENSGT01030000234607.A.a.a.a.c	ENSGT00550000074817.u	ENSGT00940000157341.h	ENSGT00940000159123.b	ENSGT00940000154185	ENSGT00390000009040	ENSGT00940000166366	ENSGT00940000156694
Euacanthomorphacea	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000162556.B	ENSGT00440000033408.a.a	ENSGT00940000165597	ENSGT00940000157567	ENSGT00940000155370	ENSGT00950000182837.a.b.a	ENSGT00940000157914	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a	ENSGT00390000015525.a	ENSGT00530000062962.a.b	ENSGT00950000183074.A.a.a #16	ENSGT00530000063668.A.d #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920.bb.b #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.a ##22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000006950	ENSGT01030000234633.B.a.c	ENSGT00940000156313.c.a	ENSGT00940000156313.d	ENSGT00940000154982.c	ENSGT00940000153607.a.b	ENSGT01030000234607.A.a.a.a.c	ENSGT00550000074817.u	ENSGT00940000157341.h	ENSGT00940000159123.b	ENSGT00940000154185	ENSGT00390000009040	ENSGT00940000166366	ENSGT00940000156694
Percomorphaceae	ANCESTRAL SPECIES	28				ENSGT00940000157567	ENSGT00940000155370	ENSGT00950000182837.a.b.a	ENSGT00940000157914	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a	ENSGT00390000015525.a	ENSGT00530000062962.a.b	ENSGT00950000183074.A.a.a #16	ENSGT00530000063668.A.d #18	ENSGT00390000014786 #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920.bb.b #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.a ##22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000006950	ENSGT01030000234633.B.a.c	ENSGT00940000156313.c.a	ENSGT00940000156313.d	ENSGT00940000154982.c	ENSGT00940000153607.a.b	ENSGT01030000234607.A.a.a.a.c	ENSGT00550000074817.u	ENSGT00940000157341.h	ENSGT00940000159123.b	ENSGT00940000154185	ENSGT00390000009040	ENSGT00940000166366	ENSGT00940000156694
Percomorphaceae_B	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000159257	ENSGT00730000111180	ENSGT00390000006896	ENSGT00940000157567	ENSGT00940000155370	ENSGT00950000182837.a.b.a	ENSGT00940000157914	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a	ENSGT00390000015525.a	ENSGT00530000062962.a.b	ENSGT00950000183074.A.a.a #16	ENSGT00530000063668.A.d #18	ENSGT00390000014786.f #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920.bb.b #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.a ##22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000006950	ENSGT01030000234633.B.a.c	ENSGT00940000156313.c.a	ENSGT00940000156313.d	ENSGT00940000154982.c	ENSGT00940000153607.a.b	ENSGT01030000234607.A.a.a.a.c	ENSGT00550000074817.u	ENSGT00940000157341.h	ENSGT00940000159123.b	ENSGT00940000154185	ENSGT00390000009040	ENSGT00940000166366	ENSGT00940000156694
Percomorphaceae_C	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000159257	ENSGT00730000111180	ENSGT00390000006896	ENSGT00940000157567	ENSGT00940000155370	ENSGT00950000182837.a.b.a	ENSGT00940000157914	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a	ENSGT00390000015525.a	ENSGT00530000062962.a.b	ENSGT00950000183074.A.a.a #16	ENSGT00530000063668.A.d #18	ENSGT00390000014786.f #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920.bb.b #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.a ##22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000006950	ENSGT01030000234633.B.a.c	ENSGT00940000156313.c.a	ENSGT00940000154982.c	ENSGT00940000153607.a.b	ENSGT01030000234607.A.a.a.a.c	ENSGT00550000074817.u	ENSGT00940000157341.h	ENSGT00940000159123.b	ENSGT00940000154185	ENSGT00390000009040	ENSGT00940000166366	ENSGT00940000156694	ENSGT00940000154242.b.h
Eupercaria	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000159257	ENSGT00730000111180	ENSGT00390000006896	ENSGT00940000157567	ENSGT00940000155370	ENSGT00950000182837.a.b.a	ENSGT00940000157914	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a	ENSGT00390000015525.a	ENSGT00530000062962.a.b	ENSGT00950000183074.A.a.a #16	ENSGT00530000063668.A.d #18	ENSGT00390000014786.f #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920.bb.b #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.a ##22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000006950	ENSGT01030000234633.B.a.c	ENSGT00940000156313.c.a	ENSGT00940000154982.c	ENSGT00940000153607.a.b	ENSGT01030000234607.A.a.a.a.c	ENSGT00550000074817.u	ENSGT00940000157341.h	ENSGT00940000159123.b	ENSGT00940000154185	ENSGT00390000009040	ENSGT00940000166366	ENSGT00940000156694	ENSGT00940000154242.b.h
Tetraodontidae	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000159257	ENSGT00730000111180	ENSGT00390000006896	ENSGT00940000157567	ENSGT00940000155370	ENSGT00950000182837.a.b.a	ENSGT00940000157914	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a	ENSGT00390000015525.a	ENSGT00530000062962.a.b	ENSGT00950000183074.A.a.a #16	ENSGT00530000063668.A.d #18	ENSGT00390000014786.f #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920.bb.b #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.a ##22	ENSGT00390000016237	ENSGT01030000234633.B.a.c	ENSGT00940000156313.c.a	ENSGT00940000154982.c	ENSGT00940000153607.a.b	ENSGT01030000234607.A.a.a.a.c	ENSGT00550000074817.u	ENSGT00940000157341.h	ENSGT00940000159123.b	ENSGT00940000154185	ENSGT00390000009040	ENSGT00940000166366	ENSGT00940000156694	ENSGT00940000154242.b.h	ENSGT00940000178871
Tetraodon	MODERN SPECIES	21	DYNC2I1 (ENSTNIG00000005845)	malrd1 (ENSTNIG00000005846)	plxdc2b (ENSTNIG00000005847)	ENSTNIG00000005848	chmp4c (ENSTNIG00000005849)	zfand1 (ENSTNIG00000005850)	maf1b (ENSTNIG00000005851)	arl8 (ENSTNIG00000005852)	NSUN6 (ENSTNIG00000017110)	cacnb2a (ENSTNIG00000017111)	SLC39A12 (ENSTNIG00000017112)	MRC1 (ENSTNIG00000017113)	ENSTNIG00000017114	enosf1 (ENSTNIG00000017115) #20	YES1 (ENSTNIG00000017116) #21	ADCYAP1 (ENSTNIG00000017117) ##22	METTL4 (ENSTNIG00000017118)	EMILIN2 (ENSTNIG00000017119)	LPIN2 (ENSTNIG00000017120)	MYOM1 (ENSTNIG00000017121)	MYL12B (ENSTNIG00000017122)	FASTKD3 (ENSTNIG00000017123)	ENSTNIG00000017124	OPRK1 (ENSTNIG00000017125)	RGS20 (ENSTNIG00000017126)	lypla1 (ENSTNIG00000017127)	sox32 (ENSTNIG00000017128)	sox17 (ENSTNIG00000017129)	ENSTNIG00000017130	ENSTNIG00000017131 #11	vps41 (ENSTNIG00000017132)
Eupecaria_A	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000159257	ENSGT00730000111180	ENSGT00390000006896	ENSGT00940000157567	ENSGT00940000155370	ENSGT00950000182837.a.b.a	ENSGT00940000157914	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a	ENSGT00390000015525.a	ENSGT00530000062962.a.b	ENSGT00950000183074.A.a.a #16	ENSGT00530000063668.A.d #18	ENSGT00390000014786.f #19	ENSGT00390000014290.b #20	ENSGT00940000154920.bb.b #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.a ##22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000006950	ENSGT01030000234633.B.a.c	ENSGT00940000156313.c.a	ENSGT00940000154982.c	ENSGT00940000153607.a.b	ENSGT01030000234607.A.a.a.a.c	ENSGT00550000074817.u	ENSGT00940000157341.h	ENSGT00940000159123.b	ENSGT00940000154185	ENSGT00390000009040	ENSGT00940000166366	ENSGT00940000156694	ENSGT00940000154242.b.h
Ballan wrasse	MODERN SPECIES	284	chmp4c (ENSLBEG00000017281)	zfand1 (ENSLBEG00000017229)	maf1b (ENSLBEG00000017190)	arl8 (ENSLBEG00000017173)	NSUN6 (ENSLBEG00000017133)	cacnb2a (ENSLBEG00000017022)	SLC39A12 (ENSLBEG00000016927)	ENSLBEG00000016858	TMEM236 (ENSLBEG00000016829)	hacd1 (ENSLBEG00000016812)	COLEC12 (ENSLBEG00000016793) #16	CLUL1 (ENSLBEG00000016753) #18	tyms (ENSLBEG00000016708) #19	enosf1 (ENSLBEG00000016626) #20	YES1 (ENSLBEG00000016096) #21	ADCYAP1 (ENSLBEG00000015916) ##22
Eupecaria_B	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000159257	ENSGT00730000111180	ENSGT00390000006896	ENSGT00940000157567	ENSGT00940000155370	ENSGT00950000182837.a.b.a	ENSGT00940000157914	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a	ENSGT00390000015525.a	ENSGT00530000062962.a.b	ENSGT00950000183074.A.a.a #16	ENSGT00530000063668.A.d #18	ENSGT00390000014786.f #19	ENSGT00390000014290.b #20	ENSGT00940000154920.bb.b #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.a ##22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000006950	ENSGT01030000234633.B.a.c	ENSGT00940000156313.c.a	ENSGT00940000154982.c	ENSGT00940000153607.a.b	ENSGT01030000234607.A.a.a.a.c	ENSGT00550000074817.u	ENSGT00940000157341.h	ENSGT00940000159123.b	ENSGT00940000154185	ENSGT00390000009040	ENSGT00940000166366	ENSGT00940000156694	ENSGT00940000154242.b.h
Eupecaria_C	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000159257	ENSGT00730000111180	ENSGT00390000006896	ENSGT00940000157567	ENSGT00940000155370	ENSGT00950000182837.a.b.a	ENSGT00940000157914	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a	ENSGT00390000015525.a	ENSGT00530000062962.a.b	ENSGT00950000183074.A.a.a #16	ENSGT00530000063668.A.d #18	ENSGT00390000014786.f #19	ENSGT00390000014290.b #20	ENSGT00940000154920.bb.b #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.a ##22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000006950	ENSGT01030000234633.B.a.c	ENSGT00940000156313.c.a	ENSGT00940000154982.c	ENSGT00940000153607.a.b	ENSGT01030000234607.A.a.a.a.c	ENSGT00550000074817.u	ENSGT00940000157341.h	ENSGT00940000159123.b	ENSGT00940000154185	ENSGT00390000009040	ENSGT00940000166366	ENSGT00940000156694	ENSGT00940000154242.b.h
Eupercaria_incertae_sedis	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000159257	ENSGT00730000111180	ENSGT00390000006896	ENSGT00940000157567	ENSGT00940000155370	ENSGT00950000182837.a.b.a	ENSGT00940000157914	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a	ENSGT00390000015525.a	ENSGT00530000062962.a.b	ENSGT00950000183074.A.a.a #16	ENSGT00530000063668.A.d #18	ENSGT00390000014786.f #19	ENSGT00390000014290.b #20	ENSGT00940000154920.bb.b #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.a ##22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000006950	ENSGT01030000234633.B.a.c	ENSGT00940000156313.c.a	ENSGT00940000154982.c	ENSGT00940000153607.a.b	ENSGT01030000234607.A.a.a.a.c	ENSGT00550000074817.u	ENSGT00940000157341.h	ENSGT00940000159123.b	ENSGT00940000154185	ENSGT00390000009040	ENSGT00940000166366	ENSGT00940000156694	ENSGT00940000154242.b.h
European seabass	MODERN SPECIES	8	ZFAND1 (ENSDLAG00005033862)	ARL5B (ENSDLAG00005013449)	NSUN6 (ENSDLAG00005033054)	CACNB2 (ENSDLAG00005013589)	ENSDLAG00005027760	ENSDLAG00005033852	SLC39A12 (ENSDLAG00005016066)	MRC1 (ENSDLAG00005016127)	TMEM236 (ENSDLAG00005030344)	HACD1 (ENSDLAG00005018856)	COLEC12 (ENSDLAG00005018862) #16	CLUL1 (ENSDLAG00005018881) #18	tyms (ENSDLAG00005018900) #19	ENOSF1 (ENSDLAG00005018953) #20	YES1 (ENSDLAG00005019225) #21	ADCYAP1 (ENSDLAG00005019829) ##22	METTL4 (ENSDLAG00005019846)	SMCHD1 (ENSDLAG00005019865)	EMILIN2 (ENSDLAG00005020280)	LPIN2 (ENSDLAG00005020298)	MYOM1 (ENSDLAG00005020579)	myl12.1 (ENSDLAG00005021974)	ENSDLAG00005021782	CHMP5 (ENSDLAG00005026401)	ENSDLAG00005027177	RGS20 (ENSDLAG00005021819)	LYPLA1 (ENSDLAG00005021821)	mrpl15 (ENSDLAG00005021825)	sox32 (ENSDLAG00005021835)	Sox17 (ENSDLAG00005021840)	ENSDLAG00005033061
Large yellow croaker	MODERN SPECIES	494	ENSLCRG00005022825	chmp4c (ENSLCRG00005022824)	zfand1 (ENSLCRG00005022822)	maf1b (ENSLCRG00005022821)	arl8 (ENSLCRG00005022820)	NSUN6 (ENSLCRG00005022818)	cacnb2a (ENSLCRG00005022815)	SLC39A12 (ENSLCRG00005022810)	MRC1 (ENSLCRG00005022335)	TMEM236 (ENSLCRG00005022281)	hacd1 (ENSLCRG00005022280)	ENSLCRG00005022279	CLUL1 (ENSLCRG00005022277) #18	tyms (ENSLCRG00005022270) #19	enosf1 (ENSLCRG00005022105) #20	ADCYAP1 (ENSLCRG00005022101) ##22	YES1 (ENSLCRG00005022084) #21	METTL4 (ENSLCRG00005022076)	SMCHD1 (ENSLCRG00005022050)	EMILIN2 (ENSLCRG00005022041)	LPIN2 (ENSLCRG00005021941)	MYOM1 (ENSLCRG00005021839)	ENSLCRG00005021833	FASTKD3 (ENSLCRG00005021832)	chmp5b (ENSLCRG00005021831)	OPRK1 (ENSLCRG00005021829)	RGS20 (ENSLCRG00005021827)	lypla1 (ENSLCRG00005021825)	mrpl15 (ENSLCRG00005021824)	sox32 (ENSLCRG00005021823)	sox17 (ENSLCRG00005021821)
Gilthead seabream	MODERN SPECIES	10	zfand1 (ENSSAUG00010012570)	chmp4c (ENSSAUG00010012566)	maf1b (ENSSAUG00010012565)	arl8 (ENSSAUG00010012560)	NSUN6 (ENSSAUG00010012557)	cacnb2a (ENSSAUG00010012021)	SLC39A12 (ENSSAUG00010011991)	MRC1 (ENSSAUG00010011496)	TMEM236 (ENSSAUG00010011477)	hacd1 (ENSSAUG00010011474)	COLEC12 (ENSSAUG00010011469) #16	CLUL1 (ENSSAUG00010011463) #18	tyms (ENSSAUG00010011461) #19	enosf1 (ENSSAUG00010011390) #20	YES1 (ENSSAUG00010009020) #21	PRP-PACAP (ENSSAUG00010008992) ##22	METTL4 (ENSSAUG00010008990)	SMCHD1 (ENSSAUG00010007948)	EMILIN2 (ENSSAUG00010007931)	LPIN2 (ENSSAUG00010007842)	MYOM1 (ENSSAUG00010002943)	myl12.1 (ENSSAUG00010002678)	FASTKD3 (ENSSAUG00010002671)	chmp5b (ENSSAUG00010002659)	OPRK1 (ENSSAUG00010002649)	ENSSAUG00010002637	lypla1 (ENSSAUG00010002627)	mrpl15 (ENSSAUG00010002618)	sox32 (ENSSAUG00010002613)	sox17 (ENSSAUG00010025902)	ENSSAUG00010025900
Perciformes	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000159257	ENSGT00730000111180	ENSGT00390000006896	ENSGT00940000157567	ENSGT00940000155370	ENSGT00950000182837.a.b.a	ENSGT00940000157914	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a	ENSGT00390000015525.a	ENSGT00530000062962.a.b	ENSGT00950000183074.A.a.a #16	ENSGT00530000063668.A.d #18	ENSGT00390000014786.f #19	ENSGT00390000014290.b #20	ENSGT00940000154920.bb.b #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.a ##22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000006950	ENSGT01030000234633.B.a.c	ENSGT00940000156313.c.a	ENSGT00940000154982.c	ENSGT00940000153607.a.b	ENSGT01030000234607.A.a.a.a.c	ENSGT00550000074817.u	ENSGT00940000157341.h	ENSGT00940000159123.b	ENSGT00940000154185	ENSGT00390000009040	ENSGT00940000166366	ENSGT00940000156694	ENSGT00940000154242.b.h
Cottioidei	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000159257	ENSGT00730000111180	ENSGT00390000006896	ENSGT00940000157567	ENSGT00940000155370	ENSGT00950000182837.a.b.a	ENSGT00940000157914	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a	ENSGT00390000015525.a	ENSGT00530000062962.a.b	ENSGT00950000183074.A.a.a #16	ENSGT00530000063668.A.d #18	ENSGT00390000014786.f #19	ENSGT00390000014290.b #20	ENSGT00940000154920.bb.b #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.a ##22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000006950	ENSGT01030000234633.B.a.c	ENSGT00940000156313.c.a	ENSGT00940000154982.c	ENSGT00940000153607.a.b	ENSGT01030000234607.A.a.a.a.c	ENSGT00550000074817.u	ENSGT00940000157341.h	ENSGT00940000159123.b	ENSGT00940000154185	ENSGT00390000009040	ENSGT00940000166366	ENSGT00940000156694	ENSGT00940000154242.b.h
Lumpfish	MODERN SPECIES	12	arl8 (ENSCLMG00005021946)	NSUN6 (ENSCLMG00005021942)	cacnb2a (ENSCLMG00005021920)	ENSCLMG00005021918	ENSCLMG00005021916	MRC1 (ENSCLMG00005021911)	TMEM236 (ENSCLMG00005021907)	hacd1 (ENSCLMG00005021902)	ENSCLMG00005021901	COLEC12 (ENSCLMG00005021883) #16	ENSCLMG00005021880	CLUL1 (ENSCLMG00005021879) #18	tyms (ENSCLMG00005021878) #19	enosf1 (ENSCLMG00005021863) #20	YES1 (ENSCLMG00005020789) #21	ADCYAP1 (ENSCLMG00005020762) ##22	METTL4 (ENSCLMG00005020755)	SMCHD1 (ENSCLMG00005020475)	EMILIN2 (ENSCLMG00005020470)	LPIN2 (ENSCLMG00005019319)	MYOM1 (ENSCLMG00005019225)	myl12.1 (ENSCLMG00005019219)	FASTKD3 (ENSCLMG00005019217)	chmp5b (ENSCLMG00005019196)	OPRK1 (ENSCLMG00005019194)	ENSCLMG00005019191	lypla1 (ENSCLMG00005019189)	mrpl15 (ENSCLMG00005019186)	sox32 (ENSCLMG00005019184)	sox17 (ENSCLMG00005019182)	ENSCLMG00005019181
Stickleback	MODERN SPECIES	20	chmp4c (ENSGACG00000004022)	zfand1 (ENSGACG00000004034)	maf1b (ENSGACG00000004036)	arl8 (ENSGACG00000004052)	NSUN6 (ENSGACG00000004059)	cacnb2a (ENSGACG00000004067)	SLC39A12 (ENSGACG00000004075)	MRC1 (ENSGACG00000004079)	TMEM236 (ENSGACG00000004092)	hacd1 (ENSGACG00000004096)	COLEC12 (ENSGACG00000004102) #16	CLUL1 (ENSGACG00000004107) #18	tyms (ENSGACG00000004111) #19	enosf1 (ENSGACG00000004128) #20	YES1 (ENSGACG00000004157) #21	ADCYAP1 (ENSGACG00000004163) ##22	METTL4 (ENSGACG00000004176)	ENSGACG00000004182	SMCHD1 (ENSGACG00000004186)	EMILIN2 (ENSGACG00000004197)	LPIN2 (ENSGACG00000004201)	MYOM1 (ENSGACG00000004209)	MYL12B (ENSGACG00000004252)	FASTKD3 (ENSGACG00000004261)	chmp5b (ENSGACG00000004275)	OPRK1 (ENSGACG00000004282)	RGS20 (ENSGACG00000004297)	lypla1 (ENSGACG00000004303)	mrpl15 (ENSGACG00000004336)	sox32 (ENSGACG00000004344)	sox17 (ENSGACG00000004347)
Perciformes_a	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000159257	ENSGT00730000111180	ENSGT00390000006896	ENSGT00940000157567	ENSGT00940000155370	ENSGT00950000182837.a.b.a	ENSGT00940000157914	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a	ENSGT00390000015525.a	ENSGT00530000062962.a.b	ENSGT00950000183074.A.a.a #16	ENSGT00530000063668.A.d #18	ENSGT00390000014786.f #19	ENSGT00390000014290.b #20	ENSGT00940000154920.bb.b #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.a ##22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000006950	ENSGT01030000234633.B.a.c	ENSGT00940000156313.c.a	ENSGT00940000154982.c	ENSGT00940000153607.a.b	ENSGT01030000234607.A.a.a.a.c	ENSGT00550000074817.u	ENSGT00940000157341.h	ENSGT00940000159123.b	ENSGT00940000154185	ENSGT00390000009040	ENSGT00940000166366	ENSGT00940000156694	ENSGT00940000154242.b.h
Pike perch	MODERN SPECIES	94	chmp4c (ENSSLUG00000024274)	zfand1 (ENSSLUG00000024266)	maf1b (ENSSLUG00000024258)	arl8 (ENSSLUG00000024251)	NSUN6 (ENSSLUG00000024243)	cacnb2a (ENSSLUG00000024183)	SLC39A12 (ENSSLUG00000024158)	MRC1 (ENSSLUG00000023957)	TMEM236 (ENSSLUG00000023903)	hacd1 (ENSSLUG00000023899)	COLEC12 (ENSSLUG00000023895) #16	ENSSLUG00000023887 #18	tyms (ENSSLUG00000023872) #19	enosf1 (ENSSLUG00000023553) #20	YES1 (ENSSLUG00000022296) #21	ADCYAP1 (ENSSLUG00000022157) ##22	METTL4 (ENSSLUG00000022134)	SMCHD1 (ENSSLUG00000021722)	EMILIN2 (ENSSLUG00000021617)	LPIN2 (ENSSLUG00000021324)	MYOM1 (ENSSLUG00000020557)	ENSSLUG00000020395	FASTKD3 (ENSSLUG00000020391)	chmp5b (ENSSLUG00000020380)	OPRK1 (ENSSLUG00000020365)	RGS20 (ENSSLUG00000020354)	lypla1 (ENSSLUG00000020344)	mrpl15 (ENSSLUG00000020332)	sox32 (ENSSLUG00000020322)	sox17 (ENSSLUG00000020318)	ENSSLUG00000020306
Channel bull blenny	MODERN SPECIES	12	zfand1 (ENSCGOG00000005505)	maf1b (ENSCGOG00000005509)	arl8 (ENSCGOG00000005523)	NSUN6 (ENSCGOG00000005536)	cacnb2a (ENSCGOG00000005583)	SLC39A12 (ENSCGOG00000006307)	MRC1 (ENSCGOG00000006322)	TMEM236 (ENSCGOG00000006761)	hacd1 (ENSCGOG00000006762)	COLEC12 (ENSCGOG00000006763) #16	ENSCGOG00000006767	CLUL1 (ENSCGOG00000006768) #18	tyms (ENSCGOG00000006776) #19	enosf1 (ENSCGOG00000006883) #20	YES1 (ENSCGOG00000007440) #21	ADCYAP1 (ENSCGOG00000014718) ##22	METTL4 (ENSCGOG00000014729)	SMCHD1 (ENSCGOG00000014733)	EMILIN2 (ENSCGOG00000014871)	LPIN2 (ENSCGOG00000014886)	MYOM1 (ENSCGOG00000016666)	myl12.1 (ENSCGOG00000017811)	FASTKD3 (ENSCGOG00000017819)	chmp5b (ENSCGOG00000017831)	OPRK1 (ENSCGOG00000017923)	RGS20 (ENSCGOG00000017925)	lypla1 (ENSCGOG00000017926)	mrpl15 (ENSCGOG00000017943)	sox32 (ENSCGOG00000017944)	sox17 (ENSCGOG00000017946)	ENSCGOG00000017949
Percomorphaceae_D	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000159257	ENSGT00730000111180	ENSGT00390000006896	ENSGT00940000157567	ENSGT00940000155370	ENSGT00950000182837.a.b.a	ENSGT00940000157914	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a	ENSGT00390000015525.a	ENSGT00530000062962.a.b	ENSGT00950000183074.A.a.a #16	ENSGT00530000063668.A.d #18	ENSGT00390000014786.f #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920.bb.b #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.a ##22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000006950	ENSGT01030000234633.B.a.c	ENSGT00940000156313.c.a	ENSGT00940000154982.c	ENSGT00940000153607.a.b	ENSGT01030000234607.A.a.a.a.c	ENSGT00550000074817.u	ENSGT00940000157341.h	ENSGT00940000159123.b	ENSGT00940000154185	ENSGT00390000009040	ENSGT00940000166366	ENSGT00940000156694	ENSGT00940000154242.b.h
Anabantaria	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000159257	ENSGT00730000111180	ENSGT00390000006896	ENSGT00940000157567	ENSGT00940000155370	ENSGT00950000182837.a.b.a	ENSGT00940000157914	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a	ENSGT00390000015525.a	ENSGT00530000062962.a.b	ENSGT00950000183074.A.a.a #16	ENSGT00530000063668.A.d #18	ENSGT00390000014786.f #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920.bb.b #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.a ##22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000006950	ENSGT01030000234633.B.a.c	ENSGT00940000156313.c.a	ENSGT00940000154982.c	ENSGT00940000153607.a.b	ENSGT01030000234607.A.a.a.a.c	ENSGT00550000074817.u	ENSGT00940000157341.h	ENSGT00940000159123.b	ENSGT00940000154185	ENSGT00390000009040	ENSGT00940000166366	ENSGT00940000156694	ENSGT00940000154242.b.h
Zig-zag eel	MODERN SPECIES	12	ENSMAMG00000004795	ENSMAMG00000004804	zfand1 (ENSMAMG00000004825)	ENSMAMG00000004840	ARL5B (ENSMAMG00000004884)	NSUN6 (ENSMAMG00000004915)	CACNB2 (ENSMAMG00000004958)	ENSMAMG00000005033	MRC1 (ENSMAMG00000005063)	TMEM236 (ENSMAMG00000005095)	HACD1 (ENSMAMG00000005113)	ENSMAMG00000005157 #16	tyms (ENSMAMG00000026111) #19	ENOSF1 (ENSMAMG00000005232) #20	YES1 (ENSMAMG00000005280) #21	ADCYAP1 (ENSMAMG00000005315) ##22	METTL4 (ENSMAMG00000005327)	SMCHD1 (ENSMAMG00000005337)	EMILIN2 (ENSMAMG00000005417)	LPIN2 (ENSMAMG00000005446)	MYOM1 (ENSMAMG00000005516)	ENSMAMG00000025971	ENSMAMG00000005577	KPNA1 (ENSMAMG00000026045)	ENSMAMG00000005645	mix23 (ENSMAMG00000005663)	ENSMAMG00000005677	ENSMAMG00000005694	ENSMAMG00000005707	ENSMAMG00000028230	ENSMAMG00000005750
Anabantoidei	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000159257	ENSGT00730000111180	ENSGT00390000006896	ENSGT00940000157567	ENSGT00940000155370	ENSGT00950000182837.a.b.a	ENSGT00940000157914	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a	ENSGT00390000015525.a	ENSGT00530000062962.a.b	ENSGT00950000183074.A.a.a #16	ENSGT00530000063668.A.d #18	ENSGT00390000014786.f #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920.bb.b #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.a ##22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000006950	ENSGT01030000234633.B.a.c	ENSGT00940000156313.c.a	ENSGT00940000154982.c	ENSGT00940000153607.a.b	ENSGT01030000234607.A.a.a.a.c	ENSGT00550000074817.u	ENSGT00940000157341.h	ENSGT00940000159123.b	ENSGT00940000154185	ENSGT00390000009040	ENSGT00940000166366	ENSGT00940000156694	ENSGT00940000154242.b.h
Climbing perch	MODERN SPECIES	11	ENSATEG00000004721	zfand1 (ENSATEG00000004687)	ENSATEG00000004656	ARL5B (ENSATEG00000004632)	NSUN6 (ENSATEG00000004585)	CACNB2 (ENSATEG00000004521)	SLC39A12 (ENSATEG00000029283)	MRC1 (ENSATEG00000004479)	TMEM236 (ENSATEG00000004443)	HACD1 (ENSATEG00000004413)	COLEC12 (ENSATEG00000004404) #16	CLUL1 (ENSATEG00000004358) #18	tyms (ENSATEG00000004331) #19	ENOSF1 (ENSATEG00000004238) #20	YES1 (ENSATEG00000004191) #21	ADCYAP1 (ENSATEG00000003918) ##22	METTL4 (ENSATEG00000003905)	SMCHD1 (ENSATEG00000003580)	EMILIN2 (ENSATEG00000003547)	LPIN2 (ENSATEG00000003541)	MYOM1 (ENSATEG00000003376)	MYL12B (ENSATEG00000003352)	ENSATEG00000003307	ENSATEG00000003315	ENSATEG00000002927	RGS20 (ENSATEG00000002862)	lypla1 (ENSATEG00000002817)	mrpl15 (ENSATEG00000002782)	sox32 (ENSATEG00000002737)	sox17 (ENSATEG00000002736)	ENSATEG00000030084
Siamese fighting fish	MODERN SPECIES	15	ENSBSLG00000002879	chmp4c (ENSBSLG00000002920)	zfand1 (ENSBSLG00000002936)	maf1b (ENSBSLG00000002945)	arl8 (ENSBSLG00000002953)	NSUN6 (ENSBSLG00000002957)	CACNB2 (ENSBSLG00000003950)	SLC39A12 (ENSBSLG00000004348)	MRC1 (ENSBSLG00000004360)	TMEM236 (ENSBSLG00000004446)	hacd1 (ENSBSLG00000004448)	COLEC12 (ENSBSLG00000004831) #16	tyms (ENSBSLG00000005117) #19	enosf1 (ENSBSLG00000005249) #20	YES1 (ENSBSLG00000005668) #21	ADCYAP1 (ENSBSLG00000006138) ##22	METTL4 (ENSBSLG00000006313)	SMCHD1 (ENSBSLG00000006431)	SMCHD1 (ENSBSLG00000006737)	SMCHD1 (ENSBSLG00000006972)	EMILIN2 (ENSBSLG00000007099)	LPIN2 (ENSBSLG00000007133)	MYOM1 (ENSBSLG00000007221)	ENSBSLG00000007317	ENSBSLG00000007723	ENSBSLG00000007775	ENSBSLG00000007833	RGS20 (ENSBSLG00000007869)	lypla1 (ENSBSLG00000007880)	mrpl15 (ENSBSLG00000007948)	sox32 (ENSBSLG00000007961)
Carangaria	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000159257	ENSGT00730000111180	ENSGT00390000006896	ENSGT00940000157567	ENSGT00940000155370	ENSGT00950000182837.a.b.a	ENSGT00940000157914	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a	ENSGT00390000015525.a	ENSGT00530000062962.a.b	ENSGT00950000183074.A.a.a #16	ENSGT00530000063668.A.d #18	ENSGT00390000014786.f #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920.bb.b #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.a ##22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000006950	ENSGT01030000234633.B.a.c	ENSGT00940000156313.c.a	ENSGT00940000154982.c	ENSGT00940000153607.a.b	ENSGT01030000234607.A.a.a.a.c	ENSGT00550000074817.u	ENSGT00940000157341.h	ENSGT00940000159123.b	ENSGT00940000154185	ENSGT00390000009040	ENSGT00940000166366	ENSGT00940000156694	ENSGT00940000154242.b.h
Pleuronectoidei	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000162556.B	ENSGT00940000159257	ENSGT00730000111180	ENSGT00390000006896	ENSGT00940000157567	ENSGT00940000155370	ENSGT00950000182837.a.b.a	ENSGT00940000157914	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a	ENSGT00390000015525.a	ENSGT00530000062962.a.b	ENSGT00950000183074.A.a.a #16	ENSGT00390000014786.f #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920.bb.b #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.a ##22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000006950	ENSGT01030000234633.B.a.c	ENSGT00940000156313.c.a	ENSGT00940000154982.c	ENSGT00940000153607.a.b	ENSGT01030000234607.A.a.a.a.c	ENSGT00550000074817.u	ENSGT00940000157341.h	ENSGT00940000159123.b	ENSGT00940000154185	ENSGT00390000009040	ENSGT00940000166366	ENSGT00940000156694	ENSGT00940000154242.b.h
Turbot	MODERN SPECIES	9	ENSSMAG00000017227	ENSSMAG00000017236	CDH7 (ENSSMAG00000016214)	ENSSMAG00000019247	ENSSMAG00000019308	ENSSMAG00000019324	ENSSMAG00000019355	ENSSMAG00000025844	ENSSMAG00000019384	ENSSMAG00000028100	ENSSMAG00000036267 #20	ENSSMAG00000022942 #19	ENSSMAG00000027078 #19	ENOSF1 (ENSSMAG00000017269) #20	YES1 (ENSSMAG00000017288) #21	ADCYAP1 (ENSSMAG00000017346) ##22	METTL4 (ENSSMAG00000017369)	SMCHD1 (ENSSMAG00000017428)	EMILIN2 (ENSSMAG00000017522)	LPIN2 (ENSSMAG00000017559)	MYOM1 (ENSSMAG00000017650)	myl12.1 (ENSSMAG00000029649)	ENSSMAG00000017809	ENSSMAG00000017822	ENSSMAG00000017849	RGS20 (ENSSMAG00000028766)	lypla1 (ENSSMAG00000017866)	mrpl15 (ENSSMAG00000017891)	sox32 (ENSSMAG00000017912)	sox17 (ENSSMAG00000017923)	ENSSMAG00000017932
Tongue sole	MODERN SPECIES	13	ENSCSEG00000000536	chmp4c (ENSCSEG00000000534)	zfand1 (ENSCSEG00000000531)	maf1b (ENSCSEG00000000526)	arl8 (ENSCSEG00000000522)	NSUN6 (ENSCSEG00000000514)	cacnb2a (ENSCSEG00000000509)	SLC39A12 (ENSCSEG00000000503)	MRC1 (ENSCSEG00000000463)	TMEM236 (ENSCSEG00000000454)	hacd1 (ENSCSEG00000000449)	ENSCSEG00000000426	tyms (ENSCSEG00000000420) #19	enosf1 (ENSCSEG00000000400) #20	YES1 (ENSCSEG00000000393) #21	ADCYAP1 (ENSCSEG00000000388) ##22	METTL4 (ENSCSEG00000000384)	SMCHD1 (ENSCSEG00000000365)	EMILIN2 (ENSCSEG00000000350)	LPIN2 (ENSCSEG00000000331)	MYOM1 (ENSCSEG00000000297)	MYL12B (ENSCSEG00000000261)	FASTKD3 (ENSCSEG00000000255)	chmp5b (ENSCSEG00000000253)	OPRK1 (ENSCSEG00000000251)	ENSCSEG00000000250	CDH10 (ENSCSEG00000000247)	ENSCSEG00000000246	CDH18 (ENSCSEG00000000244)	EPC1 (ENSCSEG00000000239)	ENSCSEG00000000235
Carangaria_A	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000159257	ENSGT00730000111180	ENSGT00390000006896	ENSGT00940000157567	ENSGT00940000155370	ENSGT00950000182837.a.b.a	ENSGT00940000157914	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a	ENSGT00390000015525.a	ENSGT00530000062962.a.b	ENSGT00950000183074.A.a.a #16	ENSGT00530000063668.A.d #18	ENSGT00390000014786.f #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920.bb.b #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.a ##22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000006950	ENSGT01030000234633.B.a.c	ENSGT00940000156313.c.a	ENSGT00940000154982.c	ENSGT00940000153607.a.b	ENSGT01030000234607.A.a.a.a.c	ENSGT00550000074817.u	ENSGT00940000157341.h.b	ENSGT00940000159123.b	ENSGT00940000154185	ENSGT00390000009040	ENSGT00940000166366	ENSGT00940000156694	ENSGT00940000154242.b.h
Barramundi perch	MODERN SPECIES	254						ENSLCAG00010005071	ENSLCAG00010005066	MRC1 (ENSLCAG00010005099)	TMEM236 (ENSLCAG00010005190)	hacd1 (ENSLCAG00010005195)	COLEC12 (ENSLCAG00010005201) #16	CLUL1 (ENSLCAG00010005204) #18	tyms (ENSLCAG00010005209) #19	enosf1 (ENSLCAG00010005245) #20	YES1 (ENSLCAG00010005405) #21	ADCYAP1 (ENSLCAG00010005446) ##22	METTL4 (ENSLCAG00010005451)	SMCHD1 (ENSLCAG00010005504)	EMILIN2 (ENSLCAG00010005723)	LPIN2 (ENSLCAG00010005737)	MYOM1 (ENSLCAG00010005895)	ENSLCAG00010006181	FASTKD3 (ENSLCAG00010006215)	chmp5b (ENSLCAG00010006227)	OPRK1 (ENSLCAG00010006238)	RGS20 (ENSLCAG00010006242)	lypla1 (ENSLCAG00010006247)	mrpl15 (ENSLCAG00010006256)	sox32 (ENSLCAG00010006265)	sox17 (ENSLCAG00010006270)	ENSLCAG00010006276
Seriola	ANCESTRAL SPECIES	27	ENSGT00940000159257	ENSGT00730000111180	ENSGT00390000006896	ENSGT00940000157567	ENSGT00940000155370	ENSGT00950000182837.a.b.a	ENSGT00940000157914	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a	ENSGT00390000015525.a	ENSGT00530000062962.a.b	ENSGT00950000183074.A.a.a #16	ENSGT00530000063668.A.d #18	ENSGT00390000014786.f #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920.bb.b #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.a ##22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000006950	ENSGT01030000234633.B.a.c	ENSGT00940000156313.c.a	ENSGT00940000154982.c	ENSGT00940000153607.a.b	ENSGT01030000234607.A.a.a.a.c	ENSGT00550000074817.u	ENSGT00940000157341.h.b	ENSGT00940000159123.b	ENSGT00940000154185	ENSGT00390000009040	ENSGT00940000166366	ENSGT00940000156694	ENSGT00940000154242.b.h
Yellowtail amberjack	MODERN SPECIES	3001	chmp4c (ENSSLDG00000021437)	zfand1 (ENSSLDG00000021422)	maf1b (ENSSLDG00000021397)	arl8 (ENSSLDG00000021379)	NSUN6 (ENSSLDG00000021347)	cacnb2a (ENSSLDG00000021222)	SLC39A12 (ENSSLDG00000021181)	MRC1 (ENSSLDG00000021144)	TMEM236 (ENSSLDG00000021124)	hacd1 (ENSSLDG00000021113)	COLEC12 (ENSSLDG00000021086) #16	CLUL1 (ENSSLDG00000021076) #18	tyms (ENSSLDG00000021053) #19	enosf1 (ENSSLDG00000021023) #20	YES1 (ENSSLDG00000020989) #21	ADCYAP1 (ENSSLDG00000020973) ##22
Greater amberjack	MODERN SPECIES	217	chmp4c (ENSSDUG00000007461)	zfand1 (ENSSDUG00000007473)	maf1b (ENSSDUG00000007489)	arl8 (ENSSDUG00000007515)	NSUN6 (ENSSDUG00000007541)	cacnb2a (ENSSDUG00000007603)	SLC39A12 (ENSSDUG00000007638)	MRC1 (ENSSDUG00000007670)	TMEM236 (ENSSDUG00000007784)	hacd1 (ENSSDUG00000007796)	COLEC12 (ENSSDUG00000007806) #16	CLUL1 (ENSSDUG00000007823) #18	tyms (ENSSDUG00000007843) #19	enosf1 (ENSSDUG00000007876) #20	YES1 (ENSSDUG00000007935) #21	ADCYAP1 (ENSSDUG00000007990) ##22	METTL4 (ENSSDUG00000008018)	SMCHD1 (ENSSDUG00000008107)	EMILIN2 (ENSSDUG00000008173)	LPIN2 (ENSSDUG00000008211)	MYOM1 (ENSSDUG00000008284)	FASTKD3 (ENSSDUG00000008377)	ENSSDUG00000008469	chmp5b (ENSSDUG00000008690)	OPRK1 (ENSSDUG00000008713)	RGS20 (ENSSDUG00000008724)	lypla1 (ENSSDUG00000008747)	mrpl15 (ENSSDUG00000008800)	sox32 (ENSSDUG00000008853)	sox17 (ENSSDUG00000008856)	ENSSDUG00000008866
Ovalentaria	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000159257	ENSGT00730000111180	ENSGT00390000006896	ENSGT00940000157567	ENSGT00940000155370	ENSGT00950000182837.a.b.a	ENSGT00940000157914	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a	ENSGT00390000015525.a	ENSGT00530000062962.a.b	ENSGT00950000183074.A.a.a #16	ENSGT00530000063668.A.d #18	ENSGT00390000014786.f #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920.bb.b #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.a ##22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000006950	ENSGT01030000234633.B.a.c	ENSGT00940000156313.c.a	ENSGT00940000156313.d	ENSGT00940000154982.c	ENSGT00940000153607.a.b	ENSGT01030000234607.A.a.a.a.c	ENSGT00550000074817.u	ENSGT00940000157341.h	ENSGT00940000159123.b	ENSGT00940000154185	ENSGT00390000009040	ENSGT00940000166366	ENSGT00940000156694
Atherinomorphae	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000159257	ENSGT00730000111180	ENSGT00390000006896	ENSGT00940000157567	ENSGT00940000155370	ENSGT00950000182837.a.b.a	ENSGT00940000157914	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a	ENSGT00390000015525.a	ENSGT00530000062962.a.b	ENSGT00950000183074.A.a.a #16	ENSGT00530000063668.A.d #18	ENSGT00390000014786.f #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920.bb.b #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.a ##22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000006950	ENSGT01030000234633.B.a.c	ENSGT00940000156313.c.a	ENSGT00940000156313.d	ENSGT00940000154982.c	ENSGT00940000153607.a.b	ENSGT01030000234607.A.a.a.a.c	ENSGT00550000074817.u	ENSGT00940000157341.h	ENSGT00940000159123.b	ENSGT00940000154185	ENSGT00390000009040	ENSGT00940000166366	ENSGT00940000156694
Cyprinodontiformes	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000159257	ENSGT00730000111180	ENSGT00390000006896	ENSGT00940000157567	ENSGT00940000155370	ENSGT00950000182837.a.b.a	ENSGT00940000157914	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a	ENSGT00390000015525.a	ENSGT00530000062962.a.b	ENSGT00950000183074.A.a.a #16	ENSGT00530000063668.A.d #18	ENSGT00390000014786.f #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920.bb.b #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.a ##22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000006950	ENSGT01030000234633.B.a.c	ENSGT00940000156313.c.a	ENSGT00940000156313.d	ENSGT00940000154982.c	ENSGT00940000153607.a.b	ENSGT01030000234607.A.a.a.a.c	ENSGT00550000074817.u	ENSGT00940000157341.h	ENSGT00940000159123.b	ENSGT00940000154185	ENSGT00390000009040	ENSGT00940000166366	ENSGT00940000156694
Aplocheiloidei	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000162556.B	ENSGT00940000159257	ENSGT00730000111180	ENSGT00390000006896	ENSGT00940000157567	ENSGT00940000155370	ENSGT00950000182837.a.b.a	ENSGT00940000157914	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a	ENSGT00390000015525.a	ENSGT00530000062962.a.b	ENSGT00950000183074.A.a.a #16	ENSGT00390000014786.f #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920.bb.b #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.a ##22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000006950	ENSGT01030000234633.B.a.c	ENSGT00940000156313.c.a	ENSGT00940000154982.c	ENSGT00940000153607.a.b	ENSGT01030000234607.A.a.a.a.c	ENSGT00550000074817.u	ENSGT00940000157341.h	ENSGT00940000159123.b	ENSGT00940000154185	ENSGT00390000009040	ENSGT00940000166366	ENSGT00940000156694	ENSGT00940000154242.b.h
Mangrove rivulus	MODERN SPECIES	7	ENSKMAG00000013472	chmp4c (ENSKMAG00000013490)	zfand1 (ENSKMAG00000013519)	maf1b (ENSKMAG00000013552)	arl8 (ENSKMAG00000013576)	NSUN6 (ENSKMAG00000013611)	cacnb2a (ENSKMAG00000013687)	ENSKMAG00000013817	MRC1 (ENSKMAG00000013862)	TMEM236 (ENSKMAG00000014019)	hacd1 (ENSKMAG00000014041)	COLEC12 (ENSKMAG00000014072) #16	tyms (ENSKMAG00000014156) #19	enosf1 (ENSKMAG00000014103) #20	YES1 (ENSKMAG00000014196) #21	ADCYAP1 (ENSKMAG00000014233) ##22	METTL4 (ENSKMAG00000014329)	SMCHD1 (ENSKMAG00000014502)	EMILIN2 (ENSKMAG00000014834)	LPIN2 (ENSKMAG00000014888)	MYOM1 (ENSKMAG00000014989)	myl12.1 (ENSKMAG00000015085)	FASTKD3 (ENSKMAG00000015153)	chmp5b (ENSKMAG00000015178)	OPRK1 (ENSKMAG00000015223)	RGS20 (ENSKMAG00000015246)	lypla1 (ENSKMAG00000015266)	mrpl15 (ENSKMAG00000015306)	sox32 (ENSKMAG00000015350)	sox17 (ENSKMAG00000015407)	ENSKMAG00000015419
Turquoise killifish	MODERN SPECIES	1617	plxdc2b (ENSNFUG00015017987)	CR753886.1 (ENSNFUG00015018888)	chmp4c (ENSNFUG00015018895)	ZFAND1 (ENSNFUG00015018898)	MAF1 (ENSNFUG00015018902)	ARL8 (ENSNFUG00015018907)	NSUN6 (ENSNFUG00015018911)	cacnb2a (ENSNFUG00015018963)	ENSNFUG00015019654	ENSNFUG00015019660	TMEM236 (ENSNFUG00015005731)	PTPLA (ENSNFUG00015005735)	COLEC12 (ENSNFUG00015005741) #16	tyms (ENSNFUG00015005744) #19	YES1 (ENSNFUG00015005781) #21	ADCYAP1 (ENSNFUG00015005898) ##22	METTL4 (ENSNFUG00015005902)	SMCHD1 (ENSNFUG00015005913)	EMILIN2 (ENSNFUG00015006065)	LPIN2 (ENSNFUG00015006120)	MYOM1 (ENSNFUG00015006290)	MRPL15 (ENSNFUG00015006382)	MYL12.2 (ENSNFUG00015006405)	FASTKD3 (ENSNFUG00015006421)	CHMP5B (ENSNFUG00015006435)	OPRK1 (ENSNFUG00015006448)	RGS20 (ENSNFUG00015006452)	lypla1 (ENSNFUG00015006459)	sox32 (ENSNFUG00015006467)	SOX17 (ENSNFUG00015006469)	ENSNFUG00015006471
Cyprinodontoidei	ANCESTRAL SPECIES	27	ENSGT00940000159257	ENSGT00730000111180	ENSGT00390000006896	ENSGT00940000157567	ENSGT00940000155370	ENSGT00950000182837.a.b.a	ENSGT00940000157914	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a	ENSGT00390000015525.a	ENSGT00530000062962.a.b	ENSGT00950000183074.A.a.a #16	ENSGT00530000063668.A.d #18	ENSGT00390000014786.f #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920.bb.b #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.a ##22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000006950.a	ENSGT00390000006950.b	ENSGT01030000234633.B.a.c	ENSGT00940000156313.c.a	ENSGT00940000156313.d	ENSGT00940000154982.c	ENSGT00940000153607.a.b	ENSGT01030000234607.A.a.a.a.c	ENSGT00550000074817.u	ENSGT00940000157341.h	ENSGT00940000159123.b	ENSGT00940000154185	ENSGT00390000009040	ENSGT00940000166366
Poeciliinae	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000159257	ENSGT00730000111180	ENSGT00390000006896	ENSGT00940000157567	ENSGT00940000155370	ENSGT00950000182837.a.b.a	ENSGT00940000157914	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a	ENSGT00390000015525.a	ENSGT00530000062962.a.b	ENSGT00950000183074.A.a.a #16	ENSGT00530000063668.A.d #18	ENSGT00390000014786.f #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920.bb.b #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.a ##22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000006950.a.b	ENSGT00390000006950.b	ENSGT01030000234633.B.a.c	ENSGT00940000156313.c.a	ENSGT00940000154982.c	ENSGT00940000153607.a.b	ENSGT01030000234607.A.a.a.a.c	ENSGT00550000074817.u	ENSGT00940000157341.h	ENSGT00940000159123.b	ENSGT00940000154185	ENSGT00390000009040	ENSGT00940000166366	ENSGT00940000156694
Poecilia	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000159257	ENSGT00730000111180	ENSGT00390000006896	ENSGT00940000157567	ENSGT00940000155370	ENSGT00950000182837.a.b.a	ENSGT00940000157914	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a	ENSGT00390000015525.a	ENSGT00530000062962.a.b	ENSGT00950000183074.A.a.a #16	ENSGT00530000063668.A.d #18	ENSGT00390000014786.f #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920.bb.b #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.a ##22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000006950.a.b	ENSGT00390000006950.b	ENSGT01030000234633.B.a.c	ENSGT00940000156313.c.a	ENSGT00940000154982.c	ENSGT00940000153607.a.b	ENSGT01030000234607.A.a.a.a.c	ENSGT00550000074817.u	ENSGT00940000157341.h	ENSGT00940000159123.b	ENSGT00940000154185	ENSGT00390000009040	ENSGT00940000166366	ENSGT00940000156694
NAME_6	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000159257	ENSGT00730000111180	ENSGT00390000006896	ENSGT00940000157567	ENSGT00940000155370	ENSGT00950000182837.a.b.a	ENSGT00940000157914	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a	ENSGT00390000015525.a	ENSGT00530000062962.a.b	ENSGT00950000183074.A.a.a #16	ENSGT00530000063668.A.d #18	ENSGT00390000014786.f #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920.bb.b #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.a ##22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000006950.a.b
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NAME_4	ANCESTRAL SPECIES	38	ENSGT00940000159257	ENSGT00730000111180	ENSGT00390000006896	ENSGT00940000157567	ENSGT00940000155370	ENSGT00950000182837.a.b.a	ENSGT00940000157914	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a	ENSGT00390000015525.a	ENSGT00530000062962.a.b	ENSGT00950000183074.A.a.a #16	ENSGT00530000063668.A.d #18	ENSGT00390000014786.f #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920.bb.b #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.a ##22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000006950.a	ENSGT00390000006950.b	ENSGT01030000234633.B.a.c	ENSGT00940000156313.c.a	ENSGT00940000156313.d	ENSGT00940000154982.c	ENSGT00940000153607.a.b	ENSGT01030000234607.A.a.a.a.c	ENSGT00550000074817.u	ENSGT00940000157341.h	ENSGT00940000159123.b	ENSGT00940000154185	ENSGT00390000009040	ENSGT00940000166366
Sheepshead minnow	MODERN SPECIES	1300														tyms (ENSCVAG00000003211) #19	YES1 (ENSCVAG00000003198) #21	ADCYAP1 (ENSCVAG00000003136) ##22	METTL4 (ENSCVAG00000003121)
Mummichog	MODERN SPECIES	528	zfand1 (ENSFHEG00000014607)	maf1b (ENSFHEG00000014595)	ARL5B (ENSFHEG00000014538)	arl8 (ENSFHEG00000014532)	NSUN6 (ENSFHEG00000014522)	cacnb2a (ENSFHEG00000014381)	SLC39A12 (ENSFHEG00000012581)	MRC1 (ENSFHEG00000012571)	TMEM236 (ENSFHEG00000012504)	hacd1 (ENSFHEG00000012481)	COLEC12 (ENSFHEG00000012461) #16	ENSFHEG00000012449 #18	tyms (ENSFHEG00000012321) #19	enosf1 (ENSFHEG00000012304) #20	YES1 (ENSFHEG00000012200) #21	ADCYAP1 (ENSFHEG00000012163) ##22	METTL4 (ENSFHEG00000012147)	SMCHD1 (ENSFHEG00000012133)	SMCHD1 (ENSFHEG00000012020)	EMILIN2 (ENSFHEG00000011941)	LPIN2 (ENSFHEG00000011937)	ENSFHEG00000011894	MYOM1 (ENSFHEG00000011880)	ENSFHEG00000011787	FASTKD3 (ENSFHEG00000011778)	chmp5b (ENSFHEG00000011771)	ENSFHEG00000011736	RGS20 (ENSFHEG00000011720)	lypla1 (ENSFHEG00000011700)	mrpl15 (ENSFHEG00000011673)	sox32 (ENSFHEG00000011659)
Oryzias	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000159257	ENSGT00730000111180	ENSGT00390000006896	ENSGT00940000157567	ENSGT00940000155370	ENSGT00950000182837.a.b.a	ENSGT00940000157914	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a	ENSGT00390000015525.a	ENSGT00530000062962.a.b	ENSGT00950000183074.A.a.a #16	ENSGT00530000063668.A.d #18	ENSGT00390000014786.f #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920.bb.b #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.a ##22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000006950	ENSGT01030000234633.B.a.c	ENSGT00940000156313.c.a	ENSGT00940000154982.c	ENSGT00940000153607.a.b	ENSGT01030000234607.A.a.a.a.c	ENSGT00550000074817.u	ENSGT00940000157341.h	ENSGT00940000159123.b	ENSGT00940000154185	ENSGT00390000009040	ENSGT00940000166366	ENSGT00940000156694	ENSGT00940000154242.b.h
Oryzias_a	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000162556.B	ENSGT00940000159257	ENSGT00730000111180	ENSGT00390000006896	ENSGT00940000157567	ENSGT00940000155370	ENSGT00950000182837.a.b.a	ENSGT00940000157914	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a	ENSGT00390000015525.a	ENSGT00530000062962.a.b	ENSGT00950000183074.A.a.a #16	ENSGT00530000063668.A.d #18	ENSGT00390000014786.f #19	ENSGT00940000154920.bb.b #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.a ##22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000006950	ENSGT01030000234633.B.a.c	ENSGT00940000156313.c.a	ENSGT00940000154982.c	ENSGT00940000153607.a.b	ENSGT00550000074817.u	ENSGT01030000234607.A.a.a.a.c	ENSGT00940000157341.h	ENSGT00940000159123.b	ENSGT00940000154185	ENSGT00390000009040	ENSGT00940000166366	ENSGT00940000156694	ENSGT00940000154242.b.h
Chinese medaka	MODERN SPECIES	71	ENSOSIG00000007112	chmp4c (ENSOSIG00000007115)	zfand1 (ENSOSIG00000007117)	maf1b (ENSOSIG00000007119)	arl8 (ENSOSIG00000007123)	NSUN6 (ENSOSIG00000007125)	cacnb2a (ENSOSIG00000007150)	ENSOSIG00000011681	MRC1 (ENSOSIG00000011690)	TMEM236 (ENSOSIG00000012865)	hacd1 (ENSOSIG00000012873)	COLEC12 (ENSOSIG00000012878) #16	ENSOSIG00000012887 #18	tyms (ENSOSIG00000012893) #19	YES1 (ENSOSIG00000012901) #21	ADCYAP1 (ENSOSIG00000014531) ##22	METTL4 (ENSOSIG00000014533)	EMILIN2 (ENSOSIG00000014541)	LPIN2 (ENSOSIG00000014566)	MYOM1 (ENSOSIG00000014774)	ENSOSIG00000015113	FASTKD3 (ENSOSIG00000015115)	OPRK1 (ENSOSIG00000015116)	lypla1 (ENSOSIG00000015121)	RGS20 (ENSOSIG00000015124)	mrpl15 (ENSOSIG00000015126)	sox32 (ENSOSIG00000015127)	sox17 (ENSOSIG00000015131)	ENSOSIG00000015132	ENSOSIG00000015134	ENSOSIG00000015142 #11
Japanese Medaka HdrR	MODERN SPECIES	12	chmp4c (ENSORLG00000010806)	zfand1 (ENSORLG00000010815)	maf1b (ENSORLG00000010829)	arl8 (ENSORLG00000010847)	NSUN6 (ENSORLG00000010870)	cacnb2a (ENSORLG00000010896)	SLC39A12 (ENSORLG00000010930)	MRC1 (ENSORLG00000010988)	TMEM236 (ENSORLG00000010995)	hacd1 (ENSORLG00000011009)	COLEC12 (ENSORLG00000011026) #16	ENSORLG00000011032 #18	enosf1 (ENSORLG00000011101) #20	tyms (ENSORLG00000011063) #19	YES1 (ENSORLG00000011192) #21	ADCYAP1 (ENSORLG00000011205) ##22	METTL4 (ENSORLG00000011211)	SMCHD1 (ENSORLG00000011268)	EMILIN2 (ENSORLG00000011287)	ENSORLG00000011317	MYOM1 (ENSORLG00000011397)	ENSORLG00000011406	chmp5b (ENSORLG00000029884)	FASTKD3 (ENSORLG00000011410)	ENSORLG00000024140	lypla1 (ENSORLG00000011504)	RGS20 (ENSORLG00000011462)	mrpl15 (ENSORLG00000011523)	sox32 (ENSORLG00000011529)	sox17 (ENSORLG00000011542)	ENSORLG00000022333
Oryzias_b	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000159257	ENSGT00730000111180	ENSGT00390000006896	ENSGT00940000157567	ENSGT00940000155370	ENSGT00950000182837.a.b.a	ENSGT00940000157914	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a	ENSGT00390000015525.a	ENSGT00530000062962.a.b	ENSGT00950000183074.A.a.a #16	ENSGT00530000063668.A.d #18	ENSGT00390000014786.f #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920.bb.b #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.a ##22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000006950	ENSGT01030000234633.B.a.c	ENSGT00940000156313.c.a	ENSGT00940000154982.c	ENSGT00940000153607.a.b	ENSGT01030000234607.A.a.a.a.c	ENSGT00550000074817.u	ENSGT00940000157341.h	ENSGT00940000159123.b	ENSGT00940000154185	ENSGT00390000009040	ENSGT00940000166366	ENSGT00940000156694	ENSGT00940000154242.b.h
Indian medaka	MODERN SPECIES	14	chmp4c (ENSOMEG00000000079)	zfand1 (ENSOMEG00000003674)	maf1b (ENSOMEG00000003656)	arl8 (ENSOMEG00000003634)	NSUN6 (ENSOMEG00000003613)	cacnb2a (ENSOMEG00000003573)	SLC39A12 (ENSOMEG00000003515)	MRC1 (ENSOMEG00000003488)	TMEM236 (ENSOMEG00000003457)	hacd1 (ENSOMEG00000003440)	COLEC12 (ENSOMEG00000003417) #16	CLUL1 (ENSOMEG00000003388) #18	tyms (ENSOMEG00000003341) #19	enosf1 (ENSOMEG00000003301) #20	YES1 (ENSOMEG00000003245) #21	ADCYAP1 (ENSOMEG00000003204) ##22	SMCHD1 (ENSOMEG00000002848)	EMILIN2 (ENSOMEG00000002209)	LPIN2 (ENSOMEG00000002192)	MYOM1 (ENSOMEG00000002167)	ENSOMEG00000002128	chmp5b (ENSOMEG00000002103)	FASTKD3 (ENSOMEG00000002114)	OPRK1 (ENSOMEG00000002087)	RGS20 (ENSOMEG00000002080)	lypla1 (ENSOMEG00000002069)	mrpl15 (ENSOMEG00000002056)	sox32 (ENSOMEG00000002046)	sox17 (ENSOMEG00000002030)	ENSOMEG00000002024	ENSOMEG00000002012 #11
Javanese ricefish	MODERN SPECIES	12	plxdc2b (ENSOJAG00000017035)	ENSOJAG00000017024	chmp4c (ENSOJAG00000017019)	zfand1 (ENSOJAG00000017013)	maf1b (ENSOJAG00000016956)	arl8 (ENSOJAG00000016940)	cacnb2a (ENSOJAG00000016520)	SLC39A12 (ENSOJAG00000016485)	MRC1 (ENSOJAG00000015349)	TMEM236 (ENSOJAG00000015264)	hacd1 (ENSOJAG00000015246)	COLEC12 (ENSOJAG00000015243) #16	ENSOJAG00000015191 #18	tyms (ENSOJAG00000015137) #19	YES1 (ENSOJAG00000013424) #21	ADCYAP1 (ENSOJAG00000013308) ##22	METTL4 (ENSOJAG00000013276)	EMILIN2 (ENSOJAG00000013041)	MYL12B (ENSOJAG00000012155)	FASTKD3 (ENSOJAG00000012148)	chmp5b (ENSOJAG00000012117)	ENSOJAG00000012093	RGS20 (ENSOJAG00000012088)	lypla1 (ENSOJAG00000012074)	mrpl15 (ENSOJAG00000012044)	sox32 (ENSOJAG00000012009)	sox17 (ENSOJAG00000011994)	ENSOJAG00000011966	vps41 (ENSOJAG00000011510)	POU6F2 (ENSOJAG00000011465)	otulina (ENSOJAG00000011461)
Ovalentaria_B	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000159257	ENSGT00730000111180	ENSGT00390000006896	ENSGT00940000157567	ENSGT00940000155370	ENSGT00950000182837.a.b.a	ENSGT00940000157914	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a	ENSGT00390000015525.a	ENSGT00530000062962.a.b	ENSGT00950000183074.A.a.a #16	ENSGT00530000063668.A.d #18	ENSGT00390000014786.f #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920.bb.b #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.a ##22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000006950	ENSGT01030000234633.B.a.c	ENSGT00940000156313.c.a	ENSGT00940000154982.c	ENSGT00940000153607.a.b	ENSGT01030000234607.A.a.a.a.c	ENSGT00550000074817.u	ENSGT00940000157341.h	ENSGT00940000159123.b	ENSGT00940000154185	ENSGT00390000009040	ENSGT00940000166366	ENSGT00940000156694	ENSGT00940000154242.b.h
Pomacentridae	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000159257	ENSGT00730000111180	ENSGT00390000006896	ENSGT00940000157567	ENSGT00940000155370	ENSGT00950000182837.a.b.a	ENSGT00940000157914	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a	ENSGT00390000015525.a	ENSGT00530000062962.a.b	ENSGT00950000183074.A.a.a #16	ENSGT00530000063668.A.d #18	ENSGT00390000014786.f #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920.bb.b #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.a ##22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000006950	ENSGT01030000234633.B.a.c	ENSGT00940000156313.c.a	ENSGT00940000154982.c	ENSGT00940000153607.a.b	ENSGT01030000234607.A.a.a.a.c	ENSGT00550000074817.u	ENSGT00940000157341.h	ENSGT00940000159123.b	ENSGT00940000154185	ENSGT00390000009040	ENSGT00940000166366	ENSGT00940000156694	ENSGT00940000154242.b.h
Bicolor damselfish	MODERN SPECIES	1525						ENSSPAG00000010970	ENSSPAG00000010983	MRC1 (ENSSPAG00000010994)	TMEM236 (ENSSPAG00000011040)	hacd1 (ENSSPAG00000011061)	COLEC12 (ENSSPAG00000011112) #16	CLUL1 (ENSSPAG00000011148) #18	tyms (ENSSPAG00000011295) #19	enosf1 (ENSSPAG00000011359) #20	YES1 (ENSSPAG00000011409) #21	ADCYAP1 (ENSSPAG00000011447) ##22
Pomacentridae_A	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000159257	ENSGT00730000111180	ENSGT00390000006896	ENSGT00940000157567	ENSGT00940000155370	ENSGT00950000182837.a.b.a	ENSGT00940000157914	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a	ENSGT00390000015525.a	ENSGT00530000062962.a.b	ENSGT00950000183074.A.a.a #16	ENSGT00530000063668.A.d #18	ENSGT00390000014786.f #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920.bb.b #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.a ##22	ENSGT01090000260132.b.a.a	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000006950.c	ENSGT01030000234633.B.a.c	ENSGT00940000156313.c.a	ENSGT00940000154982.c	ENSGT00940000153607.a.b	ENSGT01030000234607.A.a.a.a.c	ENSGT00550000074817.u	ENSGT00940000157341.h	ENSGT00940000159123.b	ENSGT00940000154185	ENSGT00390000009040	ENSGT00940000166366	ENSGT00940000177207
Spiny chromis	MODERN SPECIES	250													tyms (ENSAPOG00000017049) #19	enosf1 (ENSAPOG00000017135) #20	YES1 (ENSAPOG00000017141) #21	ADCYAP1 (ENSAPOG00000017187) ##22	ENSAPOG00000017215	METTL4 (ENSAPOG00000017300)	SMCHD1 (ENSAPOG00000017574)	EMILIN2 (ENSAPOG00000000474)	LPIN2 (ENSAPOG00000017731)	MYOM1 (ENSAPOG00000018056)	ENSAPOG00000018074	FASTKD3 (ENSAPOG00000018083)	chmp5b (ENSAPOG00000018134)	OPRK1 (ENSAPOG00000018148)	RGS20 (ENSAPOG00000018182)	lypla1 (ENSAPOG00000018226)	mrpl15 (ENSAPOG00000018246)	sox32 (ENSAPOG00000018264)	ENSAPOG00000018269
Amphiprion	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000159257	ENSGT00730000111180	ENSGT00390000006896	ENSGT00940000157567	ENSGT00940000155370	ENSGT00950000182837.a.b.a	ENSGT00940000157914	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a	ENSGT00390000015525.a	ENSGT00530000062962.a.b	ENSGT00950000183074.A.a.a #16	ENSGT00530000063668.A.d #18	ENSGT00390000014786.f #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920.bb.b #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.a ##22	ENSGT01090000260132.b.a.a	ENSGT00950000182912.b.a.a.b.b.b.a.l.a	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000006950.c	ENSGT01030000234633.B.a.c	ENSGT00940000156313.c.a	ENSGT00940000154982.c	ENSGT00940000153607.a.b	ENSGT01030000234607.A.a.a.a.c	ENSGT00550000074817.u	ENSGT00940000157341.h	ENSGT00940000159123.b	ENSGT00940000154185	ENSGT00390000009040	ENSGT00940000166366
Orange clownfish	MODERN SPECIES	14	chmp4c (ENSAPEG00000015349)	zfand1 (ENSAPEG00000015340)	maf1b (ENSAPEG00000015308)	arl8 (ENSAPEG00000015271)	NSUN6 (ENSAPEG00000015212)	cacnb2a (ENSAPEG00000015139)	SLC39A12 (ENSAPEG00000015107)	MRC1 (ENSAPEG00000015082)	TMEM236 (ENSAPEG00000015061)	hacd1 (ENSAPEG00000015024)	COLEC12 (ENSAPEG00000015008) #16	CLUL1 (ENSAPEG00000014976) #18	tyms (ENSAPEG00000014960) #19	enosf1 (ENSAPEG00000014875) #20	YES1 (ENSAPEG00000014814) #21	ADCYAP1 (ENSAPEG00000014761) ##22	ENSAPEG00000014740	ENSAPEG00000014732	METTL4 (ENSAPEG00000014583)	SMCHD1 (ENSAPEG00000014438)	EMILIN2 (ENSAPEG00000014353)	LPIN2 (ENSAPEG00000014265)	MYOM1 (ENSAPEG00000013722)	ENSAPEG00000013649	FASTKD3 (ENSAPEG00000013632)	chmp5b (ENSAPEG00000013601)	OPRK1 (ENSAPEG00000013233)	RGS20 (ENSAPEG00000013180)	lypla1 (ENSAPEG00000013123)	mrpl15 (ENSAPEG00000013090)	sox32 (ENSAPEG00000013081)
Clown anemonefish	MODERN SPECIES	684			sass6 (ENSAOCG00000022484)	PIK3R3 (ENSAOCG00000022520)	ENSAOCG00000022532	ncaldb (ENSAOCG00000001641)	zgc:136493 (ENSAOCG00000022552)	psmg2 (ENSAOCG00000022571)	ptpn2b (ENSAOCG00000022592)	ENSAOCG00000022614	spag1a (ENSAOCG00000022626)	ENSAOCG00000022656 #18	tyms (ENSAOCG00000022666) #19	enosf1 (ENSAOCG00000022695) #20	YES1 (ENSAOCG00000022724) #21	ADCYAP1 (ENSAOCG00000022760) ##22	ENSAOCG00000022780
Cichlidae	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000159257	ENSGT00730000111180	ENSGT00390000006896	ENSGT00940000157567	ENSGT00940000155370	ENSGT00950000182837.a.b.a	ENSGT00940000157914	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a	ENSGT00390000015525.a	ENSGT00530000062962.a.b	ENSGT00950000183074.A.a.a #16	ENSGT00530000063668.A.d #18	ENSGT00390000014786.f #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920.bb.b #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.a ##22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000006950	ENSGT01030000234633.B.a.c	ENSGT00940000156313.c.a	ENSGT00940000154982.c	ENSGT00940000153607.a.b	ENSGT01030000234607.A.a.a.a.c	ENSGT00550000074817.u	ENSGT00940000157341.h	ENSGT00940000159123.b	ENSGT00940000154185	ENSGT00390000009040	ENSGT00940000166366	ENSGT00940000156694	ENSGT00940000154242.b.h
Midas cichlid	MODERN SPECIES	718	zfand1 (ENSACIG00000016700)	zfand1 (ENSACIG00000016680)	arl8 (ENSACIG00000016662)	NSUN6 (ENSACIG00000016632)	cacnb2a (ENSACIG00000016610)	ENSACIG00000016590	MRC1 (ENSACIG00000016518)	MRC1 (ENSACIG00000016449)	TMEM236 (ENSACIG00000016436)	hacd1 (ENSACIG00000016413)	COLEC12 (ENSACIG00000016362) #16	ENSACIG00000016341 #18	tyms (ENSACIG00000016229) #19	enosf1 (ENSACIG00000016071) #20	YES1 (ENSACIG00000016027) #21	ADCYAP1 (ENSACIG00000016014) ##22	METTL4 (ENSACIG00000015975)
Pseudocrenilabrinae	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000159257	ENSGT00730000111180	ENSGT00390000006896	ENSGT00940000157567	ENSGT00940000155370	ENSGT00950000182837.a.b.a	ENSGT00940000157914	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a	ENSGT00390000015525.a	ENSGT00530000062962.a.b	ENSGT00950000183074.A.a.a #16	ENSGT00530000063668.A.d #18	ENSGT00390000014786.f #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920.bb.b #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.a ##22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000006950	ENSGT01030000234633.B.a.c	ENSGT00940000156313.c.a	ENSGT00940000154982.c	ENSGT00940000153607.a.b	ENSGT01030000234607.A.a.a.a.c	ENSGT00550000074817.u	ENSGT00940000157341.h	ENSGT00940000159123.b	ENSGT00940000154185	ENSGT00390000009040	ENSGT00940000166366	ENSGT00940000156694	ENSGT00940000154242.b.h
Nile tilapia	MODERN SPECIES	21	zfand1 (ENSONIG00000006027)	maf1b (ENSONIG00000006030)	arl8 (ENSONIG00000006036)	NSUN6 (ENSONIG00000006038)	cacnb2a (ENSONIG00000006040)	SLC39A12 (ENSONIG00000006057)	MRC1 (ENSONIG00000006060)	TMEM236 (ENSONIG00000006071)	hacd1 (ENSONIG00000006072)	COLEC12 (ENSONIG00000006077) #16	CLUL1 (ENSONIG00000006081) #18	tyms (ENSONIG00000006083) #19	ENSONIG00000041839	enosf1 (ENSONIG00000006085) #20	YES1 (ENSONIG00000006089) #21	ADCYAP1 (ENSONIG00000006092) ##22	METTL4 (ENSONIG00000006094)	METTL4 (ENSONIG00000039791)	SMCHD1 (ENSONIG00000006096)	EMILIN2 (ENSONIG00000006101)	LPIN2 (ENSONIG00000006102)	MYOM1 (ENSONIG00000006105)	ENSONIG00000029189	FASTKD3 (ENSONIG00000006120)	chmp5b (ENSONIG00000006122)	OPRK1 (ENSONIG00000006128)	RGS20 (ENSONIG00000038958)	lypla1 (ENSONIG00000006132)	mrpl15 (ENSONIG00000006134)	sox32 (ENSONIG00000006139)	sox17 (ENSONIG00000006141)
Pseudocrenilabrinae_A	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000159257	ENSGT00730000111180	ENSGT00390000006896	ENSGT00940000157567	ENSGT00940000155370	ENSGT00950000182837.a.b.a	ENSGT00940000157914	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a	ENSGT00390000015525.a	ENSGT00530000062962.a.b	ENSGT00950000183074.A.a.a #16	ENSGT00530000063668.A.d #18	ENSGT00390000014786.f #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920.bb.b #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.a ##22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000006950	ENSGT01030000234633.B.a.c	ENSGT00940000156313.c.a	ENSGT00940000154982.c	ENSGT00940000153607.a.b	ENSGT01030000234607.A.a.a.a.c	ENSGT00550000074817.u	ENSGT00940000157341.h	ENSGT00940000159123.b	ENSGT00940000154185	ENSGT00390000009040	ENSGT00940000166366	ENSGT00940000156694	ENSGT00940000154242.b.h
Lyretail cichlid	MODERN SPECIES	325	ENSNBRG00000015926	chmp4c (ENSNBRG00000015918)	zfand1 (ENSNBRG00000015833)	maf1b (ENSNBRG00000015797)	arl8 (ENSNBRG00000015782)	ENSNBRG00000015771	cacnb2a (ENSNBRG00000015264)	SLC39A12 (ENSNBRG00000015148)	MRC1 (ENSNBRG00000015071)	hacd1 (ENSNBRG00000015050)	COLEC12 (ENSNBRG00000014992) #16	CLUL1 (ENSNBRG00000014966) #18	tyms (ENSNBRG00000014804) #19	enosf1 (ENSNBRG00000014769) #20	YES1 (ENSNBRG00000014747) #21	ADCYAP1 (ENSNBRG00000014740) ##22	METTL4 (ENSNBRG00000014728)	SMCHD1 (ENSNBRG00000014655)	EMILIN2 (ENSNBRG00000014627)	LPIN2 (ENSNBRG00000014589)	MYOM1 (ENSNBRG00000014495)	MYL12B (ENSNBRG00000014482)	FASTKD3 (ENSNBRG00000014435)	chmp5b (ENSNBRG00000014449)	OPRK1 (ENSNBRG00000014072)	RGS20 (ENSNBRG00000013954)	lypla1 (ENSNBRG00000013920)	mrpl15 (ENSNBRG00000013893)	sox32 (ENSNBRG00000013876)	sox17 (ENSNBRG00000013870)	ENSNBRG00000013854
Haplochromini	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000159257	ENSGT00730000111180	ENSGT00390000006896	ENSGT00940000157567	ENSGT00940000155370	ENSGT00950000182837.a.b.a	ENSGT00940000157914	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a	ENSGT00390000015525.a	ENSGT00530000062962.a.b	ENSGT00950000183074.A.a.a #16	ENSGT00530000063668.A.d #18	ENSGT00390000014786.f #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920.bb.b #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.a ##22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000006950	ENSGT01030000234633.B.a.c	ENSGT00940000156313.c.a	ENSGT00940000154982.c	ENSGT00940000153607.a.b	ENSGT01030000234607.A.a.a.a.c	ENSGT00550000074817.u	ENSGT00940000157341.h	ENSGT00940000159123.b	ENSGT00940000154185	ENSGT00390000009040	ENSGT00940000166366	ENSGT00940000156694	ENSGT00940000154242.b.h
Burton s mouthbrooder	MODERN SPECIES	319								MRC1 (ENSHBUG00000016874)	TMEM236 (ENSHBUG00000016817)	hacd1 (ENSHBUG00000016790)	COLEC12 (ENSHBUG00000016761) #16	CLUL1 (ENSHBUG00000016749) #18	enosf1 (ENSHBUG00000016734) #20	tyms (ENSHBUG00000016669) #19	YES1 (ENSHBUG00000016658) #21	ADCYAP1 (ENSHBUG00000016630) ##22	METTL4 (ENSHBUG00000016596)	SMCHD1 (ENSHBUG00000016557)	EMILIN2 (ENSHBUG00000016253)	LPIN2 (ENSHBUG00000016222)	MYOM1 (ENSHBUG00000016165)	MYL12B (ENSHBUG00000016121)	FASTKD3 (ENSHBUG00000016113)	chmp5b (ENSHBUG00000016103)	OPRK1 (ENSHBUG00000016074)	RGS20 (ENSHBUG00000016063)	lypla1 (ENSHBUG00000016035)	mrpl15 (ENSHBUG00000015988)	sox32 (ENSHBUG00000015975)	sox17 (ENSHBUG00000015949)	ENSHBUG00000015946
Haplochromini_A	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000159257	ENSGT00730000111180	ENSGT00390000006896	ENSGT00940000157567	ENSGT00940000155370	ENSGT00950000182837.a.b.a	ENSGT00940000157914	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a	ENSGT00390000015525.a	ENSGT00530000062962.a.b	ENSGT00950000183074.A.a.a #16	ENSGT00530000063668.A.d #18	ENSGT00390000014786.f #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920.bb.b #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.a ##22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000006950	ENSGT01030000234633.B.a.c	ENSGT00940000156313.c.a	ENSGT00940000154982.c	ENSGT00940000153607.a.b	ENSGT01030000234607.A.a.a.a.c	ENSGT00550000074817.u	ENSGT00940000157341.h	ENSGT00940000159123.b	ENSGT00940000154185	ENSGT00390000009040	ENSGT00940000166366	ENSGT00940000156694	ENSGT00940000154242.b.h
P. nyererei	MODERN SPECIES	382	zfand1 (ENSPNYG00000000596)	ENSPNYG00000000610	maf1b (ENSPNYG00000000616)	arl8 (ENSPNYG00000000635)	NSUN6 (ENSPNYG00000000646)	cacnb2a (ENSPNYG00000000672)	SLC39A12 (ENSPNYG00000000733)	MRC1 (ENSPNYG00000000778)	TMEM236 (ENSPNYG00000000884)	hacd1 (ENSPNYG00000000901)	COLEC12 (ENSPNYG00000000937) #16	CLUL1 (ENSPNYG00000000946) #18	tyms (ENSPNYG00000000985) #19	enosf1 (ENSPNYG00000001174) #20	YES1 (ENSPNYG00000001250) #21	ADCYAP1 (ENSPNYG00000001296) ##22	METTL4 (ENSPNYG00000001318)	SMCHD1 (ENSPNYG00000001333)	EMILIN2 (ENSPNYG00000001414)	LPIN2 (ENSPNYG00000001433)	MYOM1 (ENSPNYG00000001499)	MYL12B (ENSPNYG00000001547)	FASTKD3 (ENSPNYG00000001552)	chmp5b (ENSPNYG00000001561)	ENSPNYG00000001599	RGS20 (ENSPNYG00000001656)	lypla1 (ENSPNYG00000001679)	mrpl15 (ENSPNYG00000001724)	sox32 (ENSPNYG00000001745)	sox17 (ENSPNYG00000001755)	ENSPNYG00000001764
Haplochromini_B	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000159257	ENSGT00730000111180	ENSGT00390000006896	ENSGT00940000157567	ENSGT00940000155370	ENSGT00950000182837.a.b.a	ENSGT00940000157914	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a	ENSGT00390000015525.a	ENSGT00530000062962.a.b	ENSGT00950000183074.A.a.a #16	ENSGT00530000063668.A.d #18	ENSGT00390000014786.f #19	ENSGT00390000014290 #20	ENSGT00940000154920.bb.b #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.a ##22	ENSGT00390000016237	ENSGT00390000006950	ENSGT01030000234633.B.a.c	ENSGT00940000156313.c.a	ENSGT00940000154982.c	ENSGT00940000153607.a.b	ENSGT01030000234607.A.a.a.a.c	ENSGT00550000074817.u	ENSGT00940000157341.h	ENSGT00940000159123.b	ENSGT00940000154185	ENSGT00390000009040	ENSGT00940000166366	ENSGT00940000156694	ENSGT00940000154242.b.h
Eastern happy	MODERN SPECIES	21	chmp4c (ENSACLG00000000727)	zfand1 (ENSACLG00000000740)	maf1b (ENSACLG00000000767)	arl8 (ENSACLG00000000787)	NSUN6 (ENSACLG00000000803)	cacnb2a (ENSACLG00000000867)	SLC39A12 (ENSACLG00000001027)	MRC1 (ENSACLG00000001041)	TMEM236 (ENSACLG00000001069)	hacd1 (ENSACLG00000001077)	COLEC12 (ENSACLG00000001101) #16	CLUL1 (ENSACLG00000001106) #18	tyms (ENSACLG00000001127) #19	enosf1 (ENSACLG00000001151) #20	YES1 (ENSACLG00000001229) #21	ADCYAP1 (ENSACLG00000001273) ##22	METTL4 (ENSACLG00000001329)	SMCHD1 (ENSACLG00000001360)	EMILIN2 (ENSACLG00000001450)	LPIN2 (ENSACLG00000001467)	MYOM1 (ENSACLG00000001636)	MYL12B (ENSACLG00000002113)	FASTKD3 (ENSACLG00000002122)	chmp5b (ENSACLG00000002138)	OPRK1 (ENSACLG00000002193)	ENSACLG00000002680	ENSACLG00000002701	RGS20 (ENSACLG00000002719)	lypla1 (ENSACLG00000002728)	mrpl15 (ENSACLG00000002789)	sox32 (ENSACLG00000002828)
Zebra mbuna	MODERN SPECIES	1112	zfand1 (ENSMZEG00005000943)	maf1b (ENSMZEG00005000951)	arl8 (ENSMZEG00005000976)	NSUN6 (ENSMZEG00005000999)	cacnb2a (ENSMZEG00005001051)	SLC39A12 (ENSMZEG00005001304)	MRC1 (ENSMZEG00005001317)	ENSMZEG00005001364	TMEM236 (ENSMZEG00005001371)	hacd1 (ENSMZEG00005001380)	COLEC12 (ENSMZEG00005001401) #16	CLUL1 (ENSMZEG00005001408) #18	tyms (ENSMZEG00005001459) #19	enosf1 (ENSMZEG00005001419) #20	YES1 (ENSMZEG00005001467) #21	ADCYAP1 (ENSMZEG00005001484) ##22	METTL4 (ENSMZEG00005001519)	SMCHD1 (ENSMZEG00005001548)	EMILIN2 (ENSMZEG00005001644)	LPIN2 (ENSMZEG00005001676)	MYOM1 (ENSMZEG00005001720)	MYL12B (ENSMZEG00005001784)	FASTKD3 (ENSMZEG00005001794)	chmp5b (ENSMZEG00005001802)	OPRK1 (ENSMZEG00005001899)	RGS20 (ENSMZEG00005018231)	lypla1 (ENSMZEG00005018237)	mrpl15 (ENSMZEG00005018245)	sox32 (ENSMZEG00005018250)	sox17 (ENSMZEG00005018255)	ENSMZEG00005018258
Pinecone sodierfish	MODERN SPECIES	12	ENSMMDG00005007902	plxdc2b (ENSMMDG00005007900)	malrd1 (ENSMMDG00005007890)	arl8 (ENSMMDG00005007886)	NSUN6 (ENSMMDG00005007881)	cacnb2a (ENSMMDG00005007830)	SLC39A12 (ENSMMDG00005007818)	MRC1 (ENSMMDG00005007263)	TMEM236 (ENSMMDG00005007237)	hacd1 (ENSMMDG00005007235)	COLEC12 (ENSMMDG00005007231) #16	CLUL1 (ENSMMDG00005007227) #18	tyms (ENSMMDG00005007223) #19	enosf1 (ENSMMDG00005007166) #20	YES1 (ENSMMDG00005003159) #21	ADCYAP1 (ENSMMDG00005003017) ##22	METTL4 (ENSMMDG00005003006)	SMCHD1 (ENSMMDG00005002853)	EMILIN2 (ENSMMDG00005002780)	LPIN2 (ENSMMDG00005002752)	MYOM1 (ENSMMDG00005002584)	ENSMMDG00005002516	FASTKD3 (ENSMMDG00005022643)	chmp5b (ENSMMDG00005022642)	OPRK1 (ENSMMDG00005022641)	ENSMMDG00005022640	lypla1 (ENSMMDG00005022638)	mrpl15 (ENSMMDG00005022635)	sox32 (ENSMMDG00005022634)	sox17 (ENSMMDG00005022633)	ENSMMDG00005022632
Euteleostomi	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183154.b.a.a.b ##22
Sarcopterygii	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183154.b.a.a.b ##22
Tetrapoda	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183154.b.a.a.b ##22
Amniota	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183154.b.a.a.b ##22
Sauria	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183154.b.a.a.b ##22
Archelosauria	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183154.b.a.a.b ##22
Archosauria	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183154.b.a.a.b ##22
Aves	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183154.b.a.a.b ##22
Neognathae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183154.b.a.a.b ##22
Galloanserae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183154.b.a.a.b ##22
Anatidae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183154.b.a.a.b ##22
Duck	MODERN SPECIES	1407																ENSAPLG00000030993 ##22
Actinopterygii	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183154.b.a.a.b ##22
Neopterygii	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183154.b.a.a.b ##22
Osteoglossocephalai	ANCESTRAL SPECIES	139																ENSGT00950000183154.b.a.a.b ##22	ENSGT01030000234633.B.a.d	ENSGT00940000156313.c.b	ENSGT00940000153607.a.a	ENSGT00940000156313.c.a	ENSGT00940000156313.d	ENSGT00940000154982.d	ENSGT00940000154982.c	ENSGT00940000153607.a.b	ENSGT01030000234607.A.a.a.a.c	ENSGT00450000040296	ENSGT00550000074817	ENSGT00940000157341.g	ENSGT00940000157341.h	ENSGT00390000003289	ENSGT00940000159123
Osteoglossiformes	ANCESTRAL SPECIES	433														ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b	ENSGT00390000015525.b	ENSGT00950000183154.b.a.a.b ##22	ENSGT01030000234633.B.a.d	ENSGT00940000156313.c.a	ENSGT00940000156313.d	ENSGT00940000154982.d	ENSGT00940000155458.d	ENSGT00550000074817.w
P. kingsleyae	MODERN SPECIES	240			BSN (ENSPKIG00000004364)	ERC2 (ENSPKIG00000004451)	ENSPKIG00000004586	cacna1da (ENSPKIG00000004666)	ENSPKIG00000004734	ENSPKIG00000004756	BICD2 (ENSPKIG00000004784)	ENSPKIG00000004806	ENSPKIG00000004829	cacnb2b (ENSPKIG00000004849)	ENSPKIG00000004866	ENSPKIG00000004880	tmem236 (ENSPKIG00000004901)	adcyap1b (ENSPKIG00000004924) ##22	EMILIN2 (ENSPKIG00000004947)	LPIN2 (ENSPKIG00000004985)	ENSPKIG00000005009	myom1a (ENSPKIG00000005045)	CHMP5 (ENSPKIG00000005160)	myl12.2 (ENSPKIG00000005141)	OPRK1 (ENSPKIG00000005182)	atp6v1h (ENSPKIG00000005242)	rgs20 (ENSPKIG00000005342)	ENSPKIG00000005360	ENSPKIG00000005369	xkr4 (ENSPKIG00000005387)	tmem68 (ENSPKIG00000005404)	TGS1 (ENSPKIG00000005454)	sdr16c5a (ENSPKIG00000005543)
Asian bonytongue	MODERN SPECIES	22	DNAJB6 (ENSSFOG00015003963)	PTPRN2 (ENSSFOG00015003927)	ESYT2 (ENSSFOG00015003837)	vipr2 (ENSSFOG00015003570)	zmynd11 (ENSSFOG00015003470)	DIP2C (ENSSFOG00015003310)	larp4b (ENSSFOG00015026215)	gtpbp4 (ENSSFOG00015003167)	ACKR4 (ENSSFOG00015003149)	ENSSFOG00015003107	ENSSFOG00015003055	cacnb2b (ENSSFOG00015002832)	mrc1b (ENSSFOG00015002270)	tmem236 (ENSSFOG00015024952)	ENSSFOG00015002230	adcyap1b (ENSSFOG00015029381) ##22	EMILIN2 (ENSSFOG00015002198)	LPIN2 (ENSSFOG00015002109)	myom1a (ENSSFOG00015001892)	ENSSFOG00015001537	CHMP5 (ENSSFOG00015032141)	atp6v1h (ENSSFOG00015001452)	ENSSFOG00015033140	ENSSFOG00015024407	xkr4 (ENSSFOG00015001371)	TMEM68 (ENSSFOG00015001324)	TGS1 (ENSSFOG00015001308)	lyn (ENSSFOG00015014741)	sdr16c5a (ENSSFOG00015001258)	penka (ENSSFOG00015001210)	bpnt2 (ENSSFOG00015032506)
Clupeocephala	ANCESTRAL SPECIES	215	ENSGT00940000156252.qb	ENSGT00940000157353	ENSGT01030000234667.a.a.a.b.b	ENSGT00950000183138.a.a.b.v.b	ENSGT00440000033408.a.b	ENSGT00940000164732.B	ENSGT00940000163883.J	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b	ENSGT00950000182837.a.a.b	ENSGT00390000015525.b	ENSGT00940000157171	ENSGT00950000183074.A.a.b #16	ENSGT00940000178074	ENSGT00530000063668.A.c #18	ENSGT00940000154920.bb.a #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.b ##22	ENSGT01030000234633.B.a.d	ENSGT00940000156313.c.b	ENSGT00940000154982.d	ENSGT00940000153607.a.a	ENSGT00450000040296	ENSGT00550000074817.v	ENSGT00940000157341.g	ENSGT00390000003289	ENSGT00940000159123.a	ENSGT00940000155121	ENSGT00940000154242.b.g
Euteleosteomorpha	ANCESTRAL SPECIES	97	ENSGT00940000156252.qb	ENSGT00940000157353	ENSGT01030000234667.a.a.a.b.b	ENSGT00950000183138.a.a.b.v.b	ENSGT00440000033408.a.b	ENSGT00940000164732.B	ENSGT00940000163883.J	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b	ENSGT00950000182837.a.a.b	ENSGT00390000015525.b	ENSGT00940000157171	ENSGT00950000183074.A.a.b #16	ENSGT00940000178074	ENSGT00530000063668.A.c #18	ENSGT00940000154920.bb.a #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.b ##22	ENSGT01030000234633.B.a.d	ENSGT00940000156313.c.b	ENSGT00940000154982.d	ENSGT00940000153607.a.a	ENSGT00450000040296	ENSGT00550000074817.v	ENSGT00940000157341.g	ENSGT00390000003289	ENSGT00940000159123.a	ENSGT00940000155121	ENSGT00940000154242.b.g	ENSGT00940000156146.`b.b	ENSGT00940000155331.A.f	ENSGT00940000159827.e	ENSGT01090000260052.a.a.a.a
Acanthomorphata	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000156252.qb	ENSGT00940000157353	ENSGT01030000234667.a.a.a.b.b	ENSGT00950000183138.a.a.b.v.b	ENSGT00440000033408.a.b	ENSGT00940000164732.B	ENSGT00940000163883.J	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b	ENSGT00950000182837.a.a.b	ENSGT00390000015525.b	ENSGT00940000157171	ENSGT00950000183074.A.a.b #16	ENSGT00940000178074	ENSGT00530000063668.A.c #18	ENSGT00940000154920.bb.a #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.b ##22	ENSGT01030000234633.B.a.d	ENSGT00940000156313.c.b	ENSGT00940000154982.d	ENSGT00940000153607.a.a	ENSGT00450000040296	ENSGT00550000074817.v	ENSGT00940000157341.g	ENSGT00390000003289	ENSGT00940000159123.a	ENSGT00940000155121	ENSGT00940000154242.b.g	ENSGT00940000156146.`b.b	ENSGT00940000155331.A.f	ENSGT00940000159827.e	ENSGT01090000260052.a.a.a.a
Euacanthomorphacea	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000157353	ENSGT01030000234667.a.a.a.b.b	ENSGT00950000183138.a.a.b.v.b	ENSGT00440000033408.a.b	ENSGT00940000168373	ENSGT00940000164732.B	ENSGT00940000163883.J	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b	ENSGT00950000182837.a.a.b	ENSGT00390000015525.b	ENSGT00940000157171	ENSGT00940000178074	ENSGT00950000183074.A.a.b #16	ENSGT00530000063668.A.c #18	ENSGT00940000154920.bb.a #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.b ##22	ENSGT01030000234633.B.a.d	ENSGT00940000156313.c.b	ENSGT00940000154982.d	ENSGT00940000153607.a.a	ENSGT00450000040296	ENSGT00550000074817.v	ENSGT00940000157341.g	ENSGT00390000003289	ENSGT00940000159123.a	ENSGT00940000155121	ENSGT00940000154242.b.g	ENSGT00940000156146.`b.b	ENSGT00940000155331.A.f	ENSGT00940000159827.e	ENSGT01090000260052.a.a.b
Percomorphaceae	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000157353	ENSGT01030000234667.a.a.a.b.b	ENSGT00950000183138.a.a.b.v.b	ENSGT00440000033408.a.b	ENSGT00940000168373	ENSGT00940000164732.B	ENSGT00940000163883.J	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b	ENSGT00950000182837.a.a.b	ENSGT00390000015525.b	ENSGT00940000157171	ENSGT00940000178074	ENSGT00950000183074.A.a.b #16	ENSGT00530000063668.A.c #18	ENSGT00940000154920.bb.a #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.b ##22	ENSGT01030000234633.B.a.d	ENSGT00940000156313.c.b	ENSGT00940000154982.d	ENSGT00940000153607.a.a	ENSGT00450000040296	ENSGT00550000074817.v	ENSGT00940000157341.g	ENSGT00390000003289	ENSGT00940000159123.a	ENSGT00940000155121	ENSGT00940000154242.b.g	ENSGT00940000156146.`b.b	ENSGT00940000155331.A.f	ENSGT00940000159827.e	ENSGT01090000260052.a.a.b
Percomorphaceae_B	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000181423	ENSGT00440000033408.a.b	ENSGT00940000153311.b.b	ENSGT00940000164732.B	ENSGT00940000163883.J	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.g	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.h.b.b	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.h.b.a	ENSGT00950000182837.a.a.b	ENSGT00390000015525.b	ENSGT00940000157171	ENSGT00950000183074.A.a.b #16	ENSGT00940000178074	ENSGT00530000063668.A.c #18	ENSGT00940000154920.bb.a #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.b ##22	ENSGT01030000234633.B.a.d	ENSGT00940000156313.c.b	ENSGT00940000154982.d	ENSGT00940000153607.a.a	ENSGT00450000040296	ENSGT00550000074817.v	ENSGT00940000157341.g	ENSGT00390000003289	ENSGT00940000159123.a	ENSGT00940000155121	ENSGT00940000154242.b.g	ENSGT00940000156146.`b.b	ENSGT00940000155331.A.f	ENSGT00940000159827.e	ENSGT01090000260052.a.a.a.a
Percomorphaceae_C	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00440000033408.a.b	ENSGT00940000153311.b.b	ENSGT00940000164732.B	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.h.a	ENSGT00940000163883.J	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.g	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.h.b.b	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.h.b.a	ENSGT00950000182837.a.a.b	ENSGT00390000015525.b	ENSGT00940000157171	ENSGT00940000178074	ENSGT00950000183074.A.a.b #16	ENSGT00530000063668.A.c #18	ENSGT00940000154920.bb.a #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.b ##22	ENSGT01030000234633.B.a.d	ENSGT00940000156313.c.b	ENSGT00940000154982.d	ENSGT00940000153607.a.a	ENSGT00450000040296	ENSGT00550000074817.v	ENSGT00940000157341.g	ENSGT00390000003289	ENSGT00940000159123.a	ENSGT00940000155121	ENSGT00940000154242.b.g	ENSGT00940000156146.`b.b	ENSGT00940000155331.A.f	ENSGT00940000159827.e	ENSGT01090000260052.a.a.b
Percomorphaceae_D	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00440000033408.a.b	ENSGT00940000153311.b.b	ENSGT00940000164732.B	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.h.a	ENSGT00940000163883.J	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.g	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.h.b.b	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.h.b.a	ENSGT00950000182837.a.a.b	ENSGT00390000015525.b	ENSGT00940000157171	ENSGT00940000178074	ENSGT00950000183074.A.a.b #16	ENSGT00530000063668.A.c #18	ENSGT00940000154920.bb.a #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.b ##22	ENSGT01030000234633.B.a.d	ENSGT00940000156313.c.b	ENSGT00940000154982.d	ENSGT00940000153607.a.a	ENSGT00450000040296	ENSGT00550000074817.v	ENSGT00940000157341.g	ENSGT00390000003289	ENSGT00940000159123.a	ENSGT00940000155121	ENSGT00940000154242.b.g	ENSGT00940000156146.`b.b	ENSGT00940000155331.A.f	ENSGT00940000159827.e	ENSGT01090000260052.a.a.b
Carangaria	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00440000033408.a.b	ENSGT00940000153311.b.b	ENSGT00940000164732.B	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.h.a	ENSGT00940000163883.J	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.g	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.h.b.b	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.h.b.a	ENSGT00950000182837.a.a.b	ENSGT00390000015525.b	ENSGT00940000157171	ENSGT00940000178074	ENSGT00950000183074.A.a.b #16	ENSGT00530000063668.A.c #18	ENSGT00940000154920.bb.a #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.b ##22	ENSGT01030000234633.B.a.d	ENSGT00940000156313.c.b	ENSGT00940000154982.d	ENSGT00940000153607.a.a	ENSGT00450000040296	ENSGT00550000074817.v	ENSGT00940000157341.g	ENSGT00390000003289	ENSGT00940000159123.a	ENSGT00940000155121	ENSGT00940000154242.b.g	ENSGT00940000156146.`b.b	ENSGT00940000155331.A.f	ENSGT00940000159827.e	ENSGT01090000260052.a.a.b
Pleuronectoidei	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000157353	ENSGT01030000234667.a.a.a.b.b	ENSGT00950000183138.a.a.b.v.b	ENSGT00440000033408.a.b	ENSGT00940000153311.b.b	ENSGT00940000164732.B	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.g	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.h.a	ENSGT00950000182837.a.a.b	ENSGT00390000015525.b	ENSGT00940000157171	ENSGT00940000178074	ENSGT00950000183074.A.a.b #16	ENSGT00530000063668.A.c #18	ENSGT00940000154920.bb.a #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.b ##22	ENSGT01030000234633.B.a.d	ENSGT00940000156313.c.b	ENSGT00940000154982.d	ENSGT00940000153607.a.a	ENSGT00450000040296	ENSGT00550000074817.v	ENSGT00940000157341.g	ENSGT00390000003289	ENSGT00940000159123.a	ENSGT00940000155121	ENSGT00940000154242.b.g	ENSGT00940000178871	ENSGT00940000156146.`b.b	ENSGT00940000155331.A.f	ENSGT00940000159827.e
Turbot	MODERN SPECIES	19	ENSSMAG00000015907	ENSSMAG00000015948	e2f5 (ENSSMAG00000015995)	ENSSMAG00000016006	ENSSMAG00000016013	ENSSMAG00000016047	ENSSMAG00000036085	ENSSMAG00000016136	mrc1b (ENSSMAG00000016166)	cacnb2b (ENSSMAG00000016367)	tmem236 (ENSSMAG00000016420)	stam (ENSSMAG00000016445)	ENSSMAG00000016452	clul1 (ENSSMAG00000016463) #18	yes1 (ENSSMAG00000016470) #21	adcyap1b (ENSSMAG00000029615) ##22	EMILIN2 (ENSSMAG00000016495)	LPIN2 (ENSSMAG00000016517)	myom1a (ENSSMAG00000016537)	myl12.2 (ENSSMAG00000035817)	bag1 (ENSSMAG00000024840)	ENSSMAG00000016725	oprk1 (ENSSMAG00000033971)	atp6v1h (ENSSMAG00000016783)	rgs20 (ENSSMAG00000016842)	tcea1 (ENSSMAG00000016852)	ENSSMAG00000033807	viml (ENSSMAG00000016887)	ENSSMAG00000016898	neurod6b (ENSSMAG00000032005)	ENSSMAG00000016936
Tongue sole	MODERN SPECIES	12	ENSCSEG00000014237	ENSCSEG00000014212	e2f5 (ENSCSEG00000014202)	ENSCSEG00000014122	ENSCSEG00000014103	ENSCSEG00000014085	mrc1b (ENSCSEG00000014064)	ENSCSEG00000014051	cacnb2b (ENSCSEG00000014040)	tmem236 (ENSCSEG00000014033)	stam (ENSCSEG00000014022)	ENSCSEG00000013975	ENSCSEG00000013969	colec12 (ENSCSEG00000013956) #16	clul1 (ENSCSEG00000013944) #18	prp/pacap (ENSCSEG00000013922) ##22	yes1 (ENSCSEG00000013873) #21	EMILIN2 (ENSCSEG00000013857)	LPIN2 (ENSCSEG00000013829)	ENSCSEG00000013824	myom1a (ENSCSEG00000013554)	bag1 (ENSCSEG00000013513)	ENSCSEG00000013511	ENSCSEG00000013498	oprk1 (ENSCSEG00000013293)	atp6v1h (ENSCSEG00000013242)	rgs20 (ENSCSEG00000013237)	tcea1 (ENSCSEG00000013218)	ENSCSEG00000013209	ENSCSEG00000013203	viml (ENSCSEG00000013186)
Carangaria_A	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00950000183138.a.a.b.v.b	ENSGT00440000033408.a.b	ENSGT00940000153311.b.b	ENSGT00940000164732.B	ENSGT00940000163883.J	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.g	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.h.b.b	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.h.b.a	ENSGT00950000182837.a.a.b	ENSGT00390000015525.b	ENSGT00940000157171	ENSGT00940000178074	ENSGT00950000183074.A.a.b #16	ENSGT00530000063668.A.c #18	ENSGT00940000154920.bb.a #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.b ##22	ENSGT01030000234633.B.a.d	ENSGT00940000156313.c.b	ENSGT00940000154982.d	ENSGT00940000153607.a.a	ENSGT00450000040296	ENSGT00550000074817.v	ENSGT00940000157341.g	ENSGT00390000003289	ENSGT00940000159123.a	ENSGT00940000155121	ENSGT00940000154242.b.g	ENSGT00940000156146.`b.b	ENSGT00940000155331.A.f	ENSGT00940000159827.e	ENSGT01090000260052.a.a.b
Seriola	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00950000183138.a.a.b.v.b	ENSGT00440000033408.a.b	ENSGT00940000153311.b.b	ENSGT00940000164732.B	ENSGT00940000163883.J	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.g	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.h.b.b	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.h.b.a.e	ENSGT00950000182837.a.a.b	ENSGT00390000015525.b	ENSGT00940000157171	ENSGT00940000178074	ENSGT00950000183074.A.a.b #16	ENSGT00530000063668.A.c #18	ENSGT00940000154920.bb.a #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.b ##22	ENSGT01030000234633.B.a.d	ENSGT00940000156313.c.b	ENSGT00940000154982.d	ENSGT00940000153607.a.a	ENSGT00450000040296	ENSGT00550000074817.v	ENSGT00940000157341.g	ENSGT00390000003289	ENSGT00940000159123.a	ENSGT00940000155121	ENSGT00940000154242.b.g	ENSGT00940000156146.`b.b	ENSGT00940000155331.A.f	ENSGT00940000159827.e	ENSGT01090000260052.a.a.b
Greater amberjack	MODERN SPECIES	99	ENSSDUG00000012591	ENSSDUG00000012633	ENSSDUG00000012671	ENSSDUG00000012690	ENSSDUG00000012717	mrc1b (ENSSDUG00000012813)	mrc1b (ENSSDUG00000013135)	mrc1b (ENSSDUG00000013198)	mrc1b (ENSSDUG00000013321)	cacnb2b (ENSSDUG00000013742)	tmem236 (ENSSDUG00000013769)	stam (ENSSDUG00000013780)	colec12 (ENSSDUG00000013800) #16	clul1 (ENSSDUG00000013821) #18	yes1 (ENSSDUG00000013870) #21	adcyap1b (ENSSDUG00000013896) ##22	EMILIN2 (ENSSDUG00000013909)	LPIN2 (ENSSDUG00000013934)	myom1a (ENSSDUG00000014020)	myl12.2 (ENSSDUG00000014070)	bag1 (ENSSDUG00000014089)	ENSSDUG00000014099	oprk1 (ENSSDUG00000014173)	atp6v1h (ENSSDUG00000014435)	rgs20 (ENSSDUG00000014532)	tcea1 (ENSSDUG00000014550)	ENSSDUG00000014577	viml (ENSSDUG00000014590)	PDE1C (ENSSDUG00000014624)	neurod6b (ENSSDUG00000014644)	ENSSDUG00000014650
Yellowtail amberjack	MODERN SPECIES	2803																adcyap1b (ENSSLDG00000016014) ##22	ENSSLDG00000015997	EMILIN2 (ENSSLDG00000015979)	LPIN2 (ENSSLDG00000015925)	myom1a (ENSSLDG00000015844)	myl12.2 (ENSSLDG00000015768)	bag1 (ENSSLDG00000015780)	ENSSLDG00000015745	oprk1 (ENSSLDG00000015731)	atp6v1h (ENSSLDG00000015673)	rgs20 (ENSSLDG00000015632)	tcea1 (ENSSLDG00000015590)	ENSSLDG00000015571	viml (ENSSLDG00000015495)	ENSSLDG00000015445	neurod6b (ENSSLDG00000015424)
Barramundi perch	MODERN SPECIES	69								ENSLCAG00010020014	mrc1b (ENSLCAG00010020084)	cacnb2b (ENSLCAG00010020160)	tmem236 (ENSLCAG00010020163)	stam (ENSLCAG00010020167)	colec12 (ENSLCAG00010020174) #16	clul1 (ENSLCAG00010020178) #18	yes1 (ENSLCAG00010020251) #21	adcyap1b (ENSLCAG00010020660) ##22	EMILIN2 (ENSLCAG00010020665)	LPIN2 (ENSLCAG00010020684)	myom1a (ENSLCAG00010020800)	myl12.2 (ENSLCAG00010021006)	bag1 (ENSLCAG00010021020)	ENSLCAG00010021028	oprk1 (ENSLCAG00010021043)	atp6v1h (ENSLCAG00010021067)	ENSLCAG00010021105	tcea1 (ENSLCAG00010021112)	ENSLCAG00010021117	viml (ENSLCAG00010021126)	ENSLCAG00010021193	neurod6b (ENSLCAG00010021488)	ENSLCAG00010000258
Anabantaria	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT01030000234667.a.a.a.b.b	ENSGT00950000183138.a.a.b.v.b	ENSGT00940000181423	ENSGT00440000033408.a.b	ENSGT00940000153311.b.b	ENSGT00940000168373	ENSGT00940000164732.B	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.g	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.h.b.a	ENSGT00950000182837.a.a.b	ENSGT00390000015525.b	ENSGT00940000157171	ENSGT00950000183074.A.a.b #16	ENSGT00530000063668.A.c #18	ENSGT00940000154920.bb.a #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.b ##22	ENSGT01030000234633.B.a.d	ENSGT00940000156313.c.b	ENSGT00940000154982.d	ENSGT00940000153607.a.a	ENSGT00450000040296	ENSGT00550000074817.v	ENSGT00940000157341.g	ENSGT00390000003289	ENSGT00940000159123.a	ENSGT00940000155121	ENSGT00940000154242.b.g	ENSGT00940000156146.`b.b	ENSGT00940000155331.A.f	ENSGT00940000159827.e	ENSGT01090000260052.a.a.a.a
Zig-zag eel	MODERN SPECIES	8	e2f5 (ENSMAMG00000024854)	ENSMAMG00000001574	ENSMAMG00000001562	ENSMAMG00000001554	ENSMAMG00000001511	ENSMAMG00000001256	ENSMAMG00000001185	mrc1b (ENSMAMG00000001092)	mrc1b (ENSMAMG00000001042)	cacnb2b (ENSMAMG00000000996)	tmem236 (ENSMAMG00000000980)	stam (ENSMAMG00000000965)	colec12 (ENSMAMG00000000950) #16	clul1 (ENSMAMG00000000937) #18	yes1 (ENSMAMG00000000919) #21	adcyap1b (ENSMAMG00000000881) ##22	EMILIN2 (ENSMAMG00000000820)	LPIN2 (ENSMAMG00000000709)	myom1a (ENSMAMG00000000465)	myl12.2 (ENSMAMG00000024555)	bag1 (ENSMAMG00000000427)	ENSMAMG00000017958	oprk1 (ENSMAMG00000017948)	atp6v1h (ENSMAMG00000017908)	ENSMAMG00000017897	tcea1 (ENSMAMG00000025641)	ENSMAMG00000027949	viml (ENSMAMG00000017824)	ENSMAMG00000017774	neurod6b (ENSMAMG00000017763)	ENSMAMG00000017749
Anabantoidei	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000164239.b.a	ENSGT00940000157414	ENSGT00940000157353	ENSGT01030000234667.a.a.a.b.b	ENSGT00950000183138.a.a.b.v.b	ENSGT00440000033408.a.b	ENSGT00940000153311.b.b	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.g	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.h.b.a	ENSGT00950000182837.a.a.b	ENSGT00390000015525.b	ENSGT00940000157171	ENSGT00950000183074.A.a.b #16	ENSGT00530000063668.A.c #18	ENSGT00940000154920.bb.a #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.b ##22	ENSGT01030000234633.B.a.d	ENSGT00940000156313.c.b	ENSGT00940000154982.d	ENSGT00940000155458	ENSGT00940000159849	ENSGT00940000153607.a.a	ENSGT00450000040296	ENSGT00550000074817.v	ENSGT00940000157341.g	ENSGT00390000003289	ENSGT00940000159123.a	ENSGT00940000155121	ENSGT00940000154242.b.g	ENSGT00940000156146.`b.b	ENSGT00940000155331.A.f
Siamese fighting fish	MODERN SPECIES	8	e2f5 (ENSBSLG00000026554)	ENSBSLG00000026555	ENSBSLG00000026556	ENSBSLG00000026557	ENSBSLG00000026558	ENSBSLG00000026560	ENSBSLG00000026561	mrc1b (ENSBSLG00000026565)	mrc1b (ENSBSLG00000026568)	cacnb2b (ENSBSLG00000026570)	tmem236 (ENSBSLG00000026571)	stam (ENSBSLG00000026573)	colec12 (ENSBSLG00000026574) #16	clul1 (ENSBSLG00000026575) #18	yes1 (ENSBSLG00000026576) #21	adcyap1b (ENSBSLG00000026577) ##22	EMILIN2 (ENSBSLG00000026578)	LPIN2 (ENSBSLG00000026589)	myl12.2 (ENSBSLG00000026598)	bag1 (ENSBSLG00000026599)	ENSBSLG00000026600	oprk1 (ENSBSLG00000014674)	atp6v1h (ENSBSLG00000014706)	rgs20 (ENSBSLG00000014916)	tcea1 (ENSBSLG00000014924)	ENSBSLG00000014957	viml (ENSBSLG00000015181)	PDE1C (ENSBSLG00000015314)	neurod6b (ENSBSLG00000015629)	ENSBSLG00000015634	ENSBSLG00000015642
Climbing perch	MODERN SPECIES	8	RALYL (ENSATEG00000023356)	ENSATEG00000022219	ENSATEG00000022230	e2f5 (ENSATEG00000022264)	ENSATEG00000022274	ENSATEG00000022281	ENSATEG00000000038	ENSATEG00000025954	mrc1b (ENSATEG00000000693)	cacnb2b (ENSATEG00000000715)	tmem236 (ENSATEG00000000762)	stam (ENSATEG00000000787)	colec12 (ENSATEG00000000797) #16	clul1 (ENSATEG00000000865) #18	yes1 (ENSATEG00000000988) #21	adcyap1b (ENSATEG00000001033) ##22	EMILIN2 (ENSATEG00000001069)	ENSATEG00000001083	myom1a (ENSATEG00000001179)	ENSATEG00000025884	bag1 (ENSATEG00000027338)	ENSATEG00000001517	oprk1 (ENSATEG00000001556)	atp6v1h (ENSATEG00000001581)	ENSATEG00000029589	tcea1 (ENSATEG00000001644)	ENSATEG00000001690	viml (ENSATEG00000001718)	ENSATEG00000001791	ENSATEG00000027009	ENSATEG00000001853
Eupercaria	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT01030000234667.a.a.a.b.b	ENSGT00950000183138.a.a.b.v.b	ENSGT00440000033408.a.b	ENSGT00940000153311.b.b	ENSGT00940000164732.B	ENSGT00940000163883.J	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.g	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.h.b.b	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.h.b.a	ENSGT00950000182837.a.a.b	ENSGT00390000015525.b	ENSGT00940000157171	ENSGT00950000183074.A.a.b #16	ENSGT00530000063668.A.c #18	ENSGT00940000154920.bb.a #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.b ##22	ENSGT01030000234633.B.a.d	ENSGT00940000156313.c.b	ENSGT00940000154982.d	ENSGT00940000153607.a.a	ENSGT00450000040296	ENSGT00550000074817.v	ENSGT00940000157341.g	ENSGT00390000003289	ENSGT00940000159123.a	ENSGT00940000155121	ENSGT00940000154242.b.g	ENSGT00940000156146.`b.b	ENSGT00940000155331.A.f	ENSGT00940000159827.e	ENSGT01090000260052.a.a.a.a
Tetraodontidae	ANCESTRAL SPECIES	53						ENSGT00940000168373	ENSGT00940000163883.J	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.g	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.h.b.a	ENSGT00950000182837.a.a.b	ENSGT00390000015525.b	ENSGT00940000157171	ENSGT00950000183074.A.a.b #16	ENSGT00530000063668.A.c #18	ENSGT00940000154920.bb.a #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.b ##22	ENSGT01030000234633.B.a.d	ENSGT00940000156313.c.b	ENSGT00940000154982.d	ENSGT00940000153607.a.a	ENSGT00450000040296	ENSGT00550000074817.v	ENSGT00940000157341.g	ENSGT00390000003289	ENSGT00940000159123.a	ENSGT00940000155121	ENSGT00940000154242.b.g	ENSGT00940000156146.`b.b	ENSGT00940000155331.A.f	ENSGT00940000159827.e	ENSGT01090000260052.a.a.a.a
Fugu	MODERN SPECIES	14	ENSTRUG00000022504	hnrnpc (ENSTRUG00000030090)	ENSTRUG00000030495	ENSTRUG00000027029	mrc1b (ENSTRUG00000008136)	ENSTRUG00000033123	mrc1b (ENSTRUG00000027366)	ENSTRUG00000029702	mrc1b (ENSTRUG00000032983)	cacnb2b (ENSTRUG00000008881)	tmem236 (ENSTRUG00000009142)	stam (ENSTRUG00000009163)	colec12 (ENSTRUG00000009450) #16	clul1 (ENSTRUG00000009690) #18	yes1 (ENSTRUG00000009803) #21	adcyap1b (ENSTRUG00000010059) ##22	EMILIN2 (ENSTRUG00000010123)	LPIN2 (ENSTRUG00000010192)	myom1a (ENSTRUG00000010610)	myl12.2 (ENSTRUG00000024958)	bag1 (ENSTRUG00000024576)	ENSTRUG00000011216	oprk1 (ENSTRUG00000011276)	atp6v1h (ENSTRUG00000011467)	rgs20 (ENSTRUG00000011639)	tcea1 (ENSTRUG00000011743)	ENSTRUG00000011850	viml (ENSTRUG00000011855)	ENSTRUG00000012166	ENSTRUG00000028566	neurod6b (ENSTRUG00000024488)
Tetraodon	MODERN SPECIES	26	acadm (ENSTNIG00000006383)	rps8a (ENSTNIG00000006382)	hectd3 (ENSTNIG00000006381)	ENSTNIG00000019460	ENSTNIG00000019611	ENSTNIG00000004078	ENSTNIG00000019733	ENSTNIG00000000577	ENSTNIG00000000045	cacnb2b (ENSTNIG00000018655)	tmem236 (ENSTNIG00000018654)	stam (ENSTNIG00000018653)	colec12 (ENSTNIG00000018652) #16	clul1 (ENSTNIG00000018651) #18	yes1 (ENSTNIG00000018650) #21	adcyap1b (ENSTNIG00000018649) ##22	EMILIN2 (ENSTNIG00000018648)	LPIN2 (ENSTNIG00000018647)	myom1a (ENSTNIG00000018646)	ENSTNIG00000018645	bag1 (ENSTNIG00000018644)	ENSTNIG00000018643	CHMP5 (ENSTNIG00000018642)	oprk1 (ENSTNIG00000018641)	atp6v1h (ENSTNIG00000018640)	ENSTNIG00000018639	tcea1 (ENSTNIG00000018638)	ENSTNIG00000018637	viml (ENSTNIG00000018636)	ENSTNIG00000018635	ENSTNIG00000018634
Eupecaria_A	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT01030000234667.a.a.a.b.b	ENSGT00950000183138.a.a.b.v.b	ENSGT00440000033408.a.b	ENSGT00940000153311.b.b	ENSGT00940000164732.B	ENSGT00940000163883.J	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.g	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.h.b.b	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.h.b.a	ENSGT00950000182837.a.a.b	ENSGT00390000015525.b	ENSGT00940000157171	ENSGT00950000183074.A.a.b #16	ENSGT00530000063668.A.c #18	ENSGT00940000154920.bb.a #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.b ##22	ENSGT01030000234633.B.a.d	ENSGT00940000156313.c.b	ENSGT00940000154982.d	ENSGT00940000153607.a.a	ENSGT00450000040296	ENSGT00550000074817.v	ENSGT00940000157341.g	ENSGT00390000003289	ENSGT00940000159123.a	ENSGT00940000155121	ENSGT00940000154242.b.g	ENSGT00940000178871	ENSGT00940000156146.`b.b	ENSGT00940000155331.A.f	ENSGT00940000159827.e
Ballan wrasse	MODERN SPECIES	76	prkci (ENSLBEG00000013658)	ENSLBEG00000013763	DAPK3 (ENSLBEG00000013792)	sppl2 (ENSLBEG00000013831)	arhgef18a (ENSLBEG00000013919)	ENSLBEG00000014013	ENSLBEG00000014031	mrc1b (ENSLBEG00000014215)	mrc1b (ENSLBEG00000014608)	cacnb2b (ENSLBEG00000015097)	tmem236 (ENSLBEG00000015155)	stam (ENSLBEG00000015183)	colec12 (ENSLBEG00000015242) #16	clul1 (ENSLBEG00000015318) #18	yes1 (ENSLBEG00000015357) #21	adcyap1b (ENSLBEG00000015420) ##22	EMILIN2 (ENSLBEG00000015465)	LPIN2 (ENSLBEG00000015498)	myom1a (ENSLBEG00000015595)	bag1 (ENSLBEG00000015740)	myl12.2 (ENSLBEG00000015709)	ENSLBEG00000015761	oprk1 (ENSLBEG00000015781)	atp6v1h (ENSLBEG00000015831)	rgs20 (ENSLBEG00000015934)	tcea1 (ENSLBEG00000015968)	ENSLBEG00000016005	viml (ENSLBEG00000016022)	ENSLBEG00000016066	neurod6b (ENSLBEG00000016118)	ENSLBEG00000016139
Eupecaria_B	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT01030000234667.a.a.a.b.b	ENSGT00950000183138.a.a.b.v.b	ENSGT00440000033408.a.b	ENSGT00940000153311.b.b	ENSGT00940000164732.B	ENSGT00940000163883.J	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.g	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.h.b.b	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.h.b.a	ENSGT00950000182837.a.a.b	ENSGT00390000015525.b	ENSGT00940000157171	ENSGT00950000183074.A.a.b #16	ENSGT00530000063668.A.c #18	ENSGT00940000154920.bb.a #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.b ##22	ENSGT01030000234633.B.a.d	ENSGT00940000156313.c.b	ENSGT00940000154982.d	ENSGT00940000153607.a.a	ENSGT00450000040296	ENSGT00550000074817.v	ENSGT00940000157341.g	ENSGT00390000003289	ENSGT00940000159123.a	ENSGT00940000155121	ENSGT00940000154242.b.g	ENSGT00940000178871	ENSGT00940000156146.`b.b	ENSGT00940000155331.A.f	ENSGT00940000159827.e
Perciformes	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000157353	ENSGT01030000234667.a.a.a.b.b	ENSGT00950000183138.a.a.b.v.b	ENSGT00440000033408.a.b	ENSGT00940000153311.b.b	ENSGT00940000164732.B	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.g	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.h.b.b	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.h.b.a	ENSGT00950000182837.a.a.b	ENSGT00390000015525.b	ENSGT00940000157171	ENSGT00950000183074.A.a.b #16	ENSGT00530000063668.A.c #18	ENSGT00940000154920.bb.a #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.b ##22	ENSGT01030000234633.B.a.d	ENSGT00940000156313.c.b	ENSGT00940000154982.d	ENSGT00940000153607.a.a	ENSGT00450000040296	ENSGT00550000074817.v	ENSGT00940000157341.g	ENSGT00390000003289	ENSGT00940000159123.a	ENSGT00940000155121	ENSGT00940000154242.b.g	ENSGT00940000156146.`b.b	ENSGT00940000155331.A.f	ENSGT00940000159827.e	ENSGT01090000260052.a.a.a.a
Cottioidei	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000156252.qb	ENSGT00940000157353	ENSGT01030000234667.a.a.a.b.b	ENSGT00950000183138.a.a.b.v.b	ENSGT00440000033408.a.b	ENSGT00940000153311.b.b	ENSGT00940000164732.B	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.g	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.h.b.a	ENSGT00950000182837.a.a.b	ENSGT00390000015525.b	ENSGT00940000157171	ENSGT00950000183074.A.a.b #16	ENSGT00530000063668.A.c #18	ENSGT00940000154920.bb.a #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.b ##22	ENSGT01030000234633.B.a.d	ENSGT00940000156313.c.b	ENSGT00940000154982.d	ENSGT00940000155458	ENSGT00940000159849	ENSGT00940000155308.d	ENSGT00450000040296	ENSGT00550000074817.v	ENSGT00940000157341.g	ENSGT00390000003289	ENSGT00940000159123.a	ENSGT00940000155121	ENSGT00940000154242.b.g	ENSGT00940000156146.`b.b	ENSGT00940000155331.A.f
Stickleback	MODERN SPECIES	2	ENSGACG00000017011	e2f5 (ENSGACG00000017016)	ENSGACG00000017019	ENSGACG00000017023	ENSGACG00000017025	ENSGACG00000017028	ENSGACG00000017043	mrc1b (ENSGACG00000017045)	ENSGACG00000017050	cacnb2b (ENSGACG00000017052)	tmem236 (ENSGACG00000017054)	stam (ENSGACG00000017055)	ENSGACG00000017058	clul1 (ENSGACG00000017065) #18	yes1 (ENSGACG00000017071) #21	adcyap1b (ENSGACG00000017084) ##22	EMILIN2 (ENSGACG00000017089)	LPIN2 (ENSGACG00000017090)	myom1a (ENSGACG00000017095)	ENSGACG00000017102	bag1 (ENSGACG00000017104)	ENSGACG00000017109	oprk1 (ENSGACG00000017114)	atp6v1h (ENSGACG00000017118)	rgs20 (ENSGACG00000017139)	tcea1 (ENSGACG00000017140)	ENSGACG00000017150	viml (ENSGACG00000017151)	ENSGACG00000017173	neurod6b (ENSGACG00000017176)	XCR1 (ENSGACG00000017177)
Lumpfish	MODERN SPECIES	8	ENSCLMG00005020373	ENSCLMG00005020372	ENSCLMG00005020371	ENSCLMG00005020370	ENSCLMG00005020369	ENSCLMG00005020367	ENSCLMG00005020366	mrc1b (ENSCLMG00005020274)	mrc1b (ENSCLMG00005020265)	cacnb2b (ENSCLMG00005020262)	tmem236 (ENSCLMG00005020261)	stam (ENSCLMG00005020084)	colec12 (ENSCLMG00005020001) #16	clul1 (ENSCLMG00005019994) #18	yes1 (ENSCLMG00005017281) #21	adcyap1b (ENSCLMG00005017262) ##22	EMILIN2 (ENSCLMG00005017261)	LPIN2 (ENSCLMG00005016686)	myom1a (ENSCLMG00005016649)	ENSCLMG00005016641	bag1 (ENSCLMG00005016639)	CHMP5 (ENSCLMG00005016637)	oprk1 (ENSCLMG00005016636)	atp6v1h (ENSCLMG00005016620)	ENSCLMG00005016610	tcea1 (ENSCLMG00005016607)	ENSCLMG00005016606	viml (ENSCLMG00005016035)	ENSCLMG00005016030	neurod6b (ENSCLMG00005016029)	ENSCLMG00005016028
Perciformes_a	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000157353	ENSGT01030000234667.a.a.a.b.b	ENSGT00950000183138.a.a.b.v.b	ENSGT00440000033408.a.b	ENSGT00940000153311.b.b	ENSGT00940000164732.B	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.g	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.h.b.b	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.h.b.a	ENSGT00950000182837.a.a.b	ENSGT00390000015525.b	ENSGT00940000157171	ENSGT00950000183074.A.a.b #16	ENSGT00530000063668.A.c #18	ENSGT00940000154920.bb.a #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.b ##22	ENSGT01030000234633.B.a.d	ENSGT00940000156313.c.b	ENSGT00940000154982.d	ENSGT00940000153607.a.a	ENSGT00450000040296	ENSGT00550000074817.v	ENSGT00940000157341.g	ENSGT00390000003289	ENSGT00940000159123.a	ENSGT00940000155121	ENSGT00940000154242.b.g	ENSGT00940000156146.`b.b	ENSGT00940000155331.A.f	ENSGT00940000159827.e	ENSGT01090000260052.a.a.a.a
Pike perch	MODERN SPECIES	12	e2f5 (ENSSLUG00000000269)	ENSSLUG00000000275	ENSSLUG00000000278	ENSSLUG00000000282	ENSSLUG00000000287	ENSSLUG00000000292	mrc1b (ENSSLUG00000000345)	mrc1b (ENSSLUG00000000463)	mrc1b (ENSSLUG00000000593)	cacnb2b (ENSSLUG00000000849)	tmem236 (ENSSLUG00000000855)	stam (ENSSLUG00000000915)	colec12 (ENSSLUG00000001064) #16	clul1 (ENSSLUG00000001070) #18	yes1 (ENSSLUG00000001175) #21	adcyap1b (ENSSLUG00000001648) ##22	EMILIN2 (ENSSLUG00000001666)	LPIN2 (ENSSLUG00000001876)	myom1a (ENSSLUG00000002190)	myl12.2 (ENSSLUG00000002452)	bag1 (ENSSLUG00000002465)	ENSSLUG00000002475	oprk1 (ENSSLUG00000002477)	atp6v1h (ENSSLUG00000002510)	rgs20 (ENSSLUG00000002590)	tcea1 (ENSSLUG00000002601)	ENSSLUG00000002625	viml (ENSSLUG00000002641)	ENSSLUG00000002664	neurod6b (ENSSLUG00000002670)	ENSSLUG00000002672
Channel bull blenny	MODERN SPECIES	8	ENSCGOG00000003329	e2f5 (ENSCGOG00000003369)	ENSCGOG00000003374	ENSCGOG00000003377	ENSCGOG00000003379	ENSCGOG00000003383	ENSCGOG00000003391	mrc1b (ENSCGOG00000003400)	mrc1b (ENSCGOG00000003598)	cacnb2b (ENSCGOG00000003609)	tmem236 (ENSCGOG00000003707)	stam (ENSCGOG00000003733)	colec12 (ENSCGOG00000004566) #16	clul1 (ENSCGOG00000004570) #18	yes1 (ENSCGOG00000004710) #21	adcyap1b (ENSCGOG00000009175) ##22	EMILIN2 (ENSCGOG00000009236)	LPIN2 (ENSCGOG00000009322)	myom1a (ENSCGOG00000011772)	myl12.2 (ENSCGOG00000012103)	bag1 (ENSCGOG00000012140)	ENSCGOG00000012157	ENSCGOG00000012303	oprk1 (ENSCGOG00000012408)	atp6v1h (ENSCGOG00000012439)	rgs20 (ENSCGOG00000013314)	tcea1 (ENSCGOG00000013316)	ENSCGOG00000013346	viml (ENSCGOG00000013356)	ENSCGOG00000013724	ENSCGOG00000013966
Eupecaria_C	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT01030000234667.a.a.a.b.b	ENSGT00950000183138.a.a.b.v.b	ENSGT00440000033408.a.b	ENSGT00940000153311.b.b	ENSGT00940000164732.B	ENSGT00940000163883.J	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.g	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.h.b.b	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.h.b.a	ENSGT00950000182837.a.a.b	ENSGT00390000015525.b	ENSGT00940000157171	ENSGT00950000183074.A.a.b #16	ENSGT00530000063668.A.c #18	ENSGT00940000154920.bb.a #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.b ##22	ENSGT01030000234633.B.a.d	ENSGT00940000156313.c.b	ENSGT00940000154982.d	ENSGT00940000153607.a.a	ENSGT00450000040296	ENSGT00550000074817.v	ENSGT00940000157341.g	ENSGT00390000003289	ENSGT00940000159123.a	ENSGT00940000155121	ENSGT00940000154242.b.g	ENSGT00940000178871	ENSGT00940000156146.`b.b	ENSGT00940000155331.A.f	ENSGT00940000159827.e
Gilthead seabream	MODERN SPECIES	13	ENSSAUG00010002935	ENSSAUG00010002944	ENSSAUG00010002948	mrc1b (ENSSAUG00010002989)	mrc1b (ENSSAUG00010003451)	ENSSAUG00010004306	ENSSAUG00010004311	mrc1b (ENSSAUG00010004364)	mrc1b (ENSSAUG00010004474)	cacnb2b (ENSSAUG00010004480)	tmem236 (ENSSAUG00010004485)	stam (ENSSAUG00010004518)	ENSSAUG00010005353	clul1 (ENSSAUG00010005357) #18	yes1 (ENSSAUG00010005434) #21	adcyap1b (ENSSAUG00010009027) ##22	EMILIN2 (ENSSAUG00010009032)	LPIN2 (ENSSAUG00010009040)	myom1a (ENSSAUG00010009312)	myl12.2 (ENSSAUG00010010018)	bag1 (ENSSAUG00010010020)	ENSSAUG00010010023	oprk1 (ENSSAUG00010010024)	atp6v1h (ENSSAUG00010010026)	rgs20 (ENSSAUG00010010039)	tcea1 (ENSSAUG00010010045)	ENSSAUG00010010052	ENSSAUG00010010053	viml (ENSSAUG00010010058)	ENSSAUG00010010106	neurod6b (ENSSAUG00010010275)
Eupercaria_incertae_sedis	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000157353	ENSGT01030000234667.a.a.a.b.b	ENSGT00950000183138.a.a.b.v.b	ENSGT00440000033408.a.b	ENSGT00940000153311.b.b	ENSGT00940000164732.B	ENSGT00940000163883.J	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.g	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.h.a	ENSGT00950000182837.a.a.b	ENSGT00390000015525.b	ENSGT00940000157171	ENSGT00950000183074.A.a.b #16	ENSGT00530000063668.A.c #18	ENSGT00940000154920.bb.a #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.b ##22	ENSGT01030000234633.B.a.d	ENSGT00940000156313.c.b	ENSGT00940000154982.d	ENSGT00940000153607.a.a	ENSGT00450000040296	ENSGT00550000074817.v	ENSGT00940000157341.g	ENSGT00390000003289	ENSGT00940000159123.a	ENSGT00940000155121	ENSGT00940000154242.b.g	ENSGT00940000156146.`b.b	ENSGT00940000155331.A.f	ENSGT00940000159827.e	ENSGT01090000260052.a.a.a.a
Large yellow croaker	MODERN SPECIES	1	ENSLCRG00005023690	LRRCC1 (ENSLCRG00005023692)	e2f5 (ENSLCRG00005023696)	ENSLCRG00005023698	ENSLCRG00005023699	ENSLCRG00005023701	ENSLCRG00005023702	ENSLCRG00005023703	mrc1b (ENSLCRG00005001775)	cacnb2b (ENSLCRG00005003079)	tmem236 (ENSLCRG00005003088)	stam (ENSLCRG00005003109)	colec12 (ENSLCRG00005003779) #16	clul1 (ENSLCRG00005003782) #18	yes1 (ENSLCRG00005003822) #21	adcyap1b (ENSLCRG00005006634) ##22	EMILIN2 (ENSLCRG00005006636)	LPIN2 (ENSLCRG00005006643)	myom1a (ENSLCRG00005006733)	myl12.2 (ENSLCRG00005008518)	bag1 (ENSLCRG00005008520)	ENSLCRG00005008521	ENSLCRG00005008523	ENSLCRG00005008525	ENSLCRG00005008526	oprk1 (ENSLCRG00005008528)	atp6v1h (ENSLCRG00005008531)	ENSLCRG00005008536	rgs20 (ENSLCRG00005008537)	tcea1 (ENSLCRG00005008538)	ENSLCRG00005008545
European seabass	MODERN SPECIES		ENSDLAG00005023942	ENSDLAG00005023927	ENSDLAG00005028522	ENSDLAG00005023907	ENSDLAG00005023887	ENSDLAG00005028737	ENSDLAG00005023866	ENSDLAG00005023847	mrc1b (ENSDLAG00005023708)	cacnb2b (ENSDLAG00005023661)	tmem236 (ENSDLAG00005023657)	stam (ENSDLAG00005023623)	colec12 (ENSDLAG00005023615) #16	clul1 (ENSDLAG00005023613) #18	yes1 (ENSDLAG00005022554) #21	adcyap1b (ENSDLAG00005022487) ##22	EMILIN2 (ENSDLAG00005022480)	LPIN2 (ENSDLAG00005022324)	myom1a (ENSDLAG00005022015)	myl12.2 (ENSDLAG00005021760)	bag1 (ENSDLAG00005021969)	ENSDLAG00005021959	oprk1 (ENSDLAG00005021950)	atp6v1h (ENSDLAG00005021830)	rgs20 (ENSDLAG00005031994)	tcea1 (ENSDLAG00005021812)	ENSDLAG00005021809	viml (ENSDLAG00005021400)	ENSDLAG00005020495	neurod6b (ENSDLAG00005029904)	ENSDLAG00005002973
Ovalentaria	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000181423	ENSGT00440000033408.a.b	ENSGT00940000153311.b.b	ENSGT00940000164732.B	ENSGT00940000163883.J	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.g	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.h.b.b	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.h.b.a	ENSGT00950000182837.a.a.b	ENSGT00390000015525.b	ENSGT00940000157171	ENSGT00950000183074.A.a.b #16	ENSGT00940000178074	ENSGT00530000063668.A.c #18	ENSGT00940000154920.bb.a #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.b ##22	ENSGT01030000234633.B.a.d	ENSGT00940000156313.c.b	ENSGT00940000154982.d	ENSGT00940000153607.a.a	ENSGT00450000040296	ENSGT00550000074817.v	ENSGT00940000157341.g	ENSGT00390000003289	ENSGT00940000159123.a	ENSGT00940000155121	ENSGT00940000154242.b.g	ENSGT00940000156146.`b.b	ENSGT00940000155331.A.f	ENSGT00940000159827.e	ENSGT01090000260052.a.a.a.a
Atherinomorphae	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000153311.b.b	ENSGT00940000164732.B	ENSGT00940000163883.J	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.g	ENSGT00940000177582	ENSGT01030000234575.c.b	ENSGT01050000244842.b	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.h.b.b	ENSGT00950000182837.a.a.b	ENSGT00390000015525.b	ENSGT00940000157171	ENSGT00950000183074.A.a.b #16	ENSGT00940000178074	ENSGT00530000063668.A.c #18	ENSGT00940000154920.bb.a #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.b ##22	ENSGT01030000234633.B.a.d	ENSGT00940000156313.c.b	ENSGT00940000154982.d	ENSGT00940000153607.a.a	ENSGT00450000040296	ENSGT00550000074817.v	ENSGT00940000157341.g	ENSGT00390000003289	ENSGT00940000159123.a	ENSGT00940000155121	ENSGT00940000154242.b.g	ENSGT00940000156146.`b.b	ENSGT00940000155331.A.f	ENSGT00940000159827.e	ENSGT01090000260052.a.a.a.a
Oryzias	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT01030000234667.a.a.a.b.b	ENSGT00950000183138.a.a.b.v.b	ENSGT00440000033408.a.b	ENSGT00940000153311.b.b	ENSGT00940000164732.B	ENSGT00940000163883.J	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.g	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.h.b.b	ENSGT00940000177582	ENSGT00950000182837.a.a.b	ENSGT00390000015525.b	ENSGT00940000157171	ENSGT00950000183074.A.a.b #16	ENSGT00530000063668.A.c #18	ENSGT00940000154920.bb.a #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.b ##22	ENSGT01030000234633.B.a.d	ENSGT00940000156313.c.b	ENSGT00940000154982.d	ENSGT00940000153607.a.a	ENSGT00450000040296	ENSGT00550000074817.v	ENSGT00940000157341.g	ENSGT00390000003289	ENSGT00940000155121	ENSGT00940000154242.b.g	ENSGT00940000156146.`b.b	ENSGT00940000155331.A.f	ENSGT00940000159827.e	ENSGT01090000260052.a.a.a.a	ENSGT01090000260052.a.b.i
Oryzias_a	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT01030000234667.a.a.a.b.b	ENSGT00950000183138.a.a.b.v.b	ENSGT00440000033408.a.b	ENSGT00940000153311.b.b	ENSGT00940000164732.B	ENSGT00940000163883.J	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.g	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.h.b.b	ENSGT00940000177582	ENSGT00950000182837.a.a.b	ENSGT00390000015525.b	ENSGT00940000157171	ENSGT00950000183074.A.a.b #16	ENSGT00530000063668.A.c #18	ENSGT00940000154920.bb.a #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.b ##22	ENSGT01030000234633.B.a.d	ENSGT00940000156313.c.b	ENSGT00940000154982.d	ENSGT00940000153607.a.a	ENSGT00450000040296	ENSGT00550000074817.v	ENSGT00940000157341.g	ENSGT00390000003289	ENSGT00940000155121	ENSGT00940000154242.b.g	ENSGT00940000156146.`b.b	ENSGT00940000155331.A.f	ENSGT00940000159827.e	ENSGT00940000154044.a.a.q.b	ENSGT00940000157362.c
Chinese medaka	MODERN SPECIES	853											tmem236 (ENSOSIG00000003250)	stam (ENSOSIG00000003258)	colec12 (ENSOSIG00000003265) #16	clul1 (ENSOSIG00000003272) #18	yes1 (ENSOSIG00000003285) #21	adcyap1b (ENSOSIG00000003339) ##22
Japanese Medaka HdrR	MODERN SPECIES	8	ENSORLG00000017918	ENSORLG00000017914	ENSORLG00000017911	ENSORLG00000029828	ENSORLG00000027586	ENSORLG00000024826	mrc1b (ENSORLG00000017906)	mrc1b (ENSORLG00000017901)	ENSORLG00000028984	cacnb2b (ENSORLG00000017898)	tmem236 (ENSORLG00000017893)	stam (ENSORLG00000017890)	colec12 (ENSORLG00000017886) #16	clul1 (ENSORLG00000017883) #18	yes1 (ENSORLG00000017875) #21	adcyap1b (ENSORLG00000024097) ##22	ENSORLG00000026099	EMILIN2 (ENSORLG00000017868)	ENSORLG00000017866	myom1a (ENSORLG00000017856)	bag1 (ENSORLG00000030377)	myl12.2 (ENSORLG00000023164)	ENSORLG00000025331	ENSORLG00000017844	oprk1 (ENSORLG00000017839)	atp6v1h (ENSORLG00000017832)	ENSORLG00000022961	tcea1 (ENSORLG00000017823)	ENSORLG00000030253	viml (ENSORLG00000017812)	adcyap1r1a (ENSORLG00000017774)
Oryzias_b	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000157414	ENSGT00940000157353	ENSGT01030000234667.a.a.a.b.b	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.g	ENSGT00940000163883.J	ENSGT00940000164732.B	ENSGT00940000153311.b.b	ENSGT00440000033408.a.b	ENSGT00940000181423	ENSGT00950000182837.a.a.b	ENSGT00390000015525.b	ENSGT00940000157171	ENSGT00950000183074.A.a.b #16	ENSGT00530000063668.A.c #18	ENSGT00940000154920.bb.a #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.b ##22	ENSGT01030000234633.B.a.d	ENSGT00940000156313.c.b	ENSGT00940000154982.d	ENSGT00450000040296	ENSGT00940000153607.a.a	ENSGT00550000074817.v	ENSGT00940000157341.g	ENSGT00390000003289	ENSGT00940000155121	ENSGT00940000154242.b.g	ENSGT00940000156146.`b.b	ENSGT00940000155331.A.f	ENSGT00940000159827.e	ENSGT01090000260052.a.a.a.a	ENSGT01090000260052.a.b.i
Javanese ricefish	MODERN SPECIES	8	e2f5 (ENSOJAG00000020753)	ENSOJAG00000020748	mrc1b (ENSOJAG00000020627)	mrc1b (ENSOJAG00000020570)	ENSOJAG00000020562	ENSOJAG00000020547	ENSOJAG00000020542	ENSOJAG00000020490	ENSOJAG00000020470	cacnb2b (ENSOJAG00000020447)	tmem236 (ENSOJAG00000020436)	stam (ENSOJAG00000020326)	colec12 (ENSOJAG00000020314) #16	clul1 (ENSOJAG00000020308) #18	yes1 (ENSOJAG00000019760) #21	adcyap1b (ENSOJAG00000019649) ##22	ENSOJAG00000019635	ENSOJAG00000019609	LPIN2 (ENSOJAG00000019554)	myl12.1 (ENSOJAG00000018695)	bag1 (ENSOJAG00000018688)	ENSOJAG00000018647	oprk1 (ENSOJAG00000018634)	atp6v1h (ENSOJAG00000018517)	ENSOJAG00000018481	tcea1 (ENSOJAG00000018449)	ENSOJAG00000018441	viml (ENSOJAG00000018433)	PDE1C (ENSOJAG00000017449)	ENSOJAG00000017315	XCR1 (ENSOJAG00000017308)
Indian medaka	MODERN SPECIES	10	ENSOMEG00000011778	e2f5 (ENSOMEG00000011726)	ENSOMEG00000011686	ENSOMEG00000011675	ENSOMEG00000011637	ENSOMEG00000011575	ENSOMEG00000011549	ENSOMEG00000011531	ENSOMEG00000011500	cacnb2b (ENSOMEG00000011423)	tmem236 (ENSOMEG00000011389)	stam (ENSOMEG00000011357)	colec12 (ENSOMEG00000011327) #16	clul1 (ENSOMEG00000011298) #18	yes1 (ENSOMEG00000011251) #21	adcyap1b (ENSOMEG00000011201) ##22	EMILIN2 (ENSOMEG00000011160)	LPIN2 (ENSOMEG00000011088)	myom1a (ENSOMEG00000010963)	bag1 (ENSOMEG00000010874)	myl12.2 (ENSOMEG00000010839)	ENSOMEG00000010816	oprk1 (ENSOMEG00000010781)	atp6v1h (ENSOMEG00000010734)	ENSOMEG00000010634	tcea1 (ENSOMEG00000010610)	ENSOMEG00000010578	viml (ENSOMEG00000000254)	PDE1C (ENSOMEG00000010508)	neurod6b (ENSOMEG00000010479)	FYCO1 (ENSOMEG00000010454)
Cyprinodontiformes	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00440000033408.a.b	ENSGT00940000153311.b.b	ENSGT00940000164732.B	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.g	ENSGT00940000177582	ENSGT01030000234575.c.b	ENSGT01050000244842.b	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.h.b.b	ENSGT00950000182837.a.a.b	ENSGT00390000015525.b	ENSGT00940000157171	ENSGT00950000183074.A.a.b #16	ENSGT00940000178074	ENSGT00530000063668.A.c #18	ENSGT00940000154920.bb.a #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.b ##22	ENSGT01030000234633.B.a.d	ENSGT00940000156313.c.b	ENSGT00940000154982.d	ENSGT00940000153607.a.a	ENSGT00450000040296	ENSGT00550000074817.v	ENSGT00940000157341.g	ENSGT00390000003289	ENSGT00940000159123.a	ENSGT00940000155121	ENSGT00940000154242.b.g	ENSGT00940000178871	ENSGT00940000156146.`b.b	ENSGT00940000155331.A.f	ENSGT00940000159827.e
Aplocheiloidei	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000157353	ENSGT01030000234667.a.a.a.b.b	ENSGT00950000183138.a.a.b.v.b	ENSGT00440000033408.a.b	ENSGT00940000153311.b.b	ENSGT00940000164732.B	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.g	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.h.b.b	ENSGT00950000182837.a.a.b	ENSGT00390000015525.b	ENSGT00940000157171	ENSGT00950000183074.A.a.b #16	ENSGT00940000178074	ENSGT00530000063668.A.c #18	ENSGT00940000154920.bb.a #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.b ##22	ENSGT01030000234633.B.a.d	ENSGT00940000156313.c.b	ENSGT00940000154982.d	ENSGT00940000153607.a.a	ENSGT00450000040296	ENSGT00550000074817.v	ENSGT00940000157341.g	ENSGT00390000003289	ENSGT00940000159123.a	ENSGT00940000155121	ENSGT00940000154242.b.g	ENSGT00940000178871	ENSGT00940000156146.`b.b	ENSGT00940000155331.A.f	ENSGT00940000159827.e
Mangrove rivulus	MODERN SPECIES	17	ENSKMAG00000000356	ENSKMAG00000000376	ENSKMAG00000000383	ENSKMAG00000000624	ENSKMAG00000000633	mrc1b (ENSKMAG00000000650)	ENSKMAG00000000660	ENSKMAG00000000684	mrc1b (ENSKMAG00000000748)	cacnb2b (ENSKMAG00000000881)	tmem236 (ENSKMAG00000000899)	stam (ENSKMAG00000000911)	colec12 (ENSKMAG00000000997) #16	clul1 (ENSKMAG00000001013) #18	yes1 (ENSKMAG00000001029) #21	adcyap1b (ENSKMAG00000001075) ##22	EMILIN2 (ENSKMAG00000001097)	LPIN2 (ENSKMAG00000001104)	myom1a (ENSKMAG00000001213)	myl12.2 (ENSKMAG00000001492)	ENSKMAG00000001517	oprk1 (ENSKMAG00000001553)	atp6v1h (ENSKMAG00000001589)	rgs20 (ENSKMAG00000001676)	tcea1 (ENSKMAG00000001723)	ENSKMAG00000001787	viml (ENSKMAG00000001799)	PDE1C (ENSKMAG00000001849)	neurod6b (ENSKMAG00000001954)	ENSKMAG00000001965	ENSKMAG00000001984
Turquoise killifish	MODERN SPECIES	1618	ACKR4 (ENSNFUG00015007888)	Nfu_g_1_020251 (ENSNFUG00015007894)	ENSNFUG00015007902	ENSNFUG00015007910	ENSNFUG00015007923	mrc1b (ENSNFUG00015008000)	cacnb2b (ENSNFUG00015008259)	ENSNFUG00015008270	ENSNFUG00015008280	tmem236 (ENSNFUG00015008290)	STAM (ENSNFUG00015008304)	COLEC12 (ENSNFUG00015008328) #16	ENSNFUG00015008332	clul1 (ENSNFUG00015008334) #18	yes1 (ENSNFUG00015008478) #21	ADCYAP1B (ENSNFUG00015010946) ##22	ENSNFUG00015010973	EMILIN2A (ENSNFUG00015010983)	LPIN2 (ENSNFUG00015011050)	myom1a (ENSNFUG00015011527)	myl12.2 (ENSNFUG00015012091)	BAG1 (ENSNFUG00015012099)	CHMP5 (ENSNFUG00015012102)	oprk1 (ENSNFUG00015012114)	ATP6V1H (ENSNFUG00015012131)	rgs20 (ENSNFUG00015012173)	TCEA1 (ENSNFUG00015012187)	ENSNFUG00015012256	ENSNFUG00015012262	VIML (ENSNFUG00015012268)	PDE1C (ENSNFUG00015012434)
Cyprinodontoidei	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000157353	ENSGT01030000234667.a.a.a.b.b	ENSGT00950000183138.a.a.b.v.b	ENSGT00440000033408.a.b	ENSGT00940000153311.b.b	ENSGT00940000164732.B	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.g	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.h.b.b	ENSGT00950000182837.a.a.b	ENSGT00390000015525.b	ENSGT00940000157171	ENSGT00950000183074.A.a.b #16	ENSGT00940000178074	ENSGT00530000063668.A.c #18	ENSGT00940000154920.bb.a #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.b ##22	ENSGT01030000234633.B.a.d	ENSGT00940000156313.c.b	ENSGT00940000154982.d	ENSGT00940000153607.a.a	ENSGT00450000040296	ENSGT00550000074817.v	ENSGT00940000157341.g	ENSGT00390000003289	ENSGT00940000159123.a	ENSGT00940000155121	ENSGT00940000154242.b.g	ENSGT00940000156146.`b.b	ENSGT00940000155331.A.f	ENSGT00940000159827.e	ENSGT01090000260052.a.a.a.a
NAME_4	ANCESTRAL SPECIES	282				ENSGT00950000183138.a.a.b.v.b	ENSGT00440000033408.a.b	ENSGT00940000153311.b.b	ENSGT00940000164732.B	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.g	ENSGT00940000177582	ENSGT00950000182837.a.a.b	ENSGT00390000015525.b	ENSGT00940000157171	ENSGT00950000183074.A.a.b #16	ENSGT00530000063668.A.c #18	ENSGT00940000154920.bb.a #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.b ##22
Sheepshead minnow	MODERN SPECIES	1032									mrc1b (ENSCVAG00000013558)	cacnb2b (ENSCVAG00000013591)	tmem236 (ENSCVAG00000013602)	stam (ENSCVAG00000013666)	colec12 (ENSCVAG00000013678) #16	clul1 (ENSCVAG00000013682) #18	yes1 (ENSCVAG00000013689) #21	adcyap1b (ENSCVAG00000013729) ##22
Mummichog	MODERN SPECIES	753												ENSFHEG00000018576	colec12 (ENSFHEG00000018559) #16	clul1 (ENSFHEG00000018548) #18	yes1 (ENSFHEG00000018541) #21	adcyap1b (ENSFHEG00000018526) ##22	ENSFHEG00000018503
Poeciliinae	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000157353	ENSGT01030000234667.a.a.a.b.b	ENSGT00950000183138.a.a.b.v.b	ENSGT00440000033408.a.b	ENSGT00940000153311.b.b	ENSGT00940000164732.B	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.g	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.h.b.b	ENSGT00950000182837.a.a.b	ENSGT00390000015525.b	ENSGT00940000157171	ENSGT00950000183074.A.a.b #16	ENSGT00940000178074	ENSGT00530000063668.A.c #18	ENSGT00940000154920.bb.a #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.b ##22	ENSGT01030000234633.B.a.d	ENSGT00940000156313.c.b	ENSGT00940000154982.d	ENSGT00940000153607.a.a	ENSGT00450000040296	ENSGT00550000074817.v	ENSGT00940000157341.g	ENSGT00390000003289	ENSGT00940000159123.a	ENSGT00940000155121	ENSGT00940000154242.b.g	ENSGT00940000156146.`b.b	ENSGT00940000155331.A.f	ENSGT00940000159827.e	ENSGT01090000260052.a.a.a.a
Platyfish	MODERN SPECIES	20	egfra (ENSXMAG00000016482)	MMP16 (ENSXMAG00000016541)	ENSXMAG00000028109	ENSXMAG00000026511	ENSXMAG00000016563	ENSXMAG00000016565	mrc1b (ENSXMAG00000016582)	mrc1b (ENSXMAG00000016592)	cacnb2b (ENSXMAG00000016609)	tmem236 (ENSXMAG00000028423)	stam (ENSXMAG00000016617)	colec12 (ENSXMAG00000016656) #16	ENSXMAG00000028487	clul1 (ENSXMAG00000016659) #18	yes1 (ENSXMAG00000016668) #21	adcyap1b (ENSXMAG00000021801) ##22	ENSXMAG00000021161	EMILIN2 (ENSXMAG00000016716)	LPIN2 (ENSXMAG00000016718)	ENSXMAG00000025296	myom1a (ENSXMAG00000016754)	myl12.2 (ENSXMAG00000027068)	bag1 (ENSXMAG00000021062)	ENSXMAG00000016811	oprk1 (ENSXMAG00000028909)	atp6v1h (ENSXMAG00000021915)	rgs20 (ENSXMAG00000017577)	tcea1 (ENSXMAG00000017586)	ENSXMAG00000023892	ENSXMAG00000016850	viml (ENSXMAG00000016853)
Poecilia	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000157414	ENSGT00940000157353	ENSGT01030000234667.a.a.a.b.b	ENSGT00950000183138.a.a.b.v.b	ENSGT00440000033408.a.b	ENSGT00940000153311.b.b	ENSGT00940000164732.B	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.g	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.h.b.b	ENSGT00950000182837.a.a.b	ENSGT00390000015525.b	ENSGT00940000157171	ENSGT00950000183074.A.a.b #16	ENSGT00530000063668.A.c #18	ENSGT00940000154920.bb.a #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.b ##22	ENSGT01030000234633.B.a.d	ENSGT00940000156313.c.b	ENSGT00940000154982.d	ENSGT00940000153607.a.a	ENSGT00450000040296	ENSGT00550000074817.v	ENSGT00940000157341.g	ENSGT00390000003289	ENSGT00940000159123.a	ENSGT00940000155121	ENSGT00940000154242.b.g	ENSGT00940000156146.`b.b	ENSGT00940000155331.A.f	ENSGT00940000159827.e	ENSGT01090000260052.a.a.a.a
Guppy	MODERN SPECIES	354																adcyap1b (ENSPREG00000006480) ##22
NAME_6	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000157414	ENSGT00940000157353	ENSGT01030000234667.a.a.a.b.b	ENSGT00950000183138.a.a.b.v.b	ENSGT00440000033408.a.b	ENSGT00940000153311.b.b	ENSGT00940000164732.B	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.g	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.h.b.b	ENSGT00950000182837.a.a.b	ENSGT00390000015525.b	ENSGT00940000157171	ENSGT00950000183074.A.a.b #16	ENSGT00530000063668.A.c #18	ENSGT00940000154920.bb.a #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.b ##22	ENSGT01030000234633.B.a.d	ENSGT00940000156313.c.b	ENSGT00940000154982.d	ENSGT00940000153607.a.a	ENSGT00450000040296	ENSGT00550000074817.v	ENSGT00940000157341.g	ENSGT00390000003289	ENSGT00940000159123.a	ENSGT00940000155121	ENSGT00940000154242.b.g	ENSGT00940000156146.`b.b	ENSGT00390000009586	ENSGT00940000155331.A.f	ENSGT00940000159827.e
Amazon molly	MODERN SPECIES	279			ENSPFOG00000001876	ENSPFOG00000001944	ENSPFOG00000002179	ENSPFOG00000002219	ENSPFOG00000002229	mrc1b (ENSPFOG00000002676)	mrc1b (ENSPFOG00000002937)	cacnb2b (ENSPFOG00000003051)	tmem236 (ENSPFOG00000003144)	stam (ENSPFOG00000003200)	colec12 (ENSPFOG00000003475) #16	clul1 (ENSPFOG00000003519) #18	yes1 (ENSPFOG00000003630) #21	adcyap1b (ENSPFOG00000003779) ##22	EMILIN2 (ENSPFOG00000003834)	LPIN2 (ENSPFOG00000021718)	myom1a (ENSPFOG00000003976)	myl12.2 (ENSPFOG00000004758)	bag1 (ENSPFOG00000004771)	ENSPFOG00000004775	oprk1 (ENSPFOG00000004780)	atp6v1h (ENSPFOG00000004825)	rgs20 (ENSPFOG00000005013)	tcea1 (ENSPFOG00000005100)	ENSPFOG00000022875	viml (ENSPFOG00000005176)	ENSPFOG00000023095	PDE1C (ENSPFOG00000005478)	neurod6b (ENSPFOG00000005949)
Sailfin molly	MODERN SPECIES	654							ENSPLAG00000006561	mrc1b (ENSPLAG00000006535)	ENSPLAG00000000609	cacnb2b (ENSPLAG00000006474)	tmem236 (ENSPLAG00000006440)	stam (ENSPLAG00000006409)	ENSPLAG00000006379	clul1 (ENSPLAG00000006250) #18	yes1 (ENSPLAG00000006200) #21	adcyap1b (ENSPLAG00000006157) ##22
Ovalentaria_B	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000181423	ENSGT00440000033408.a.b	ENSGT00940000168373	ENSGT00940000164732.B	ENSGT00940000163883.J	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.g	ENSGT00940000177582	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.h.b.b	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.h.b.a	ENSGT00950000182837.a.a.b	ENSGT00390000015525.b	ENSGT00940000157171	ENSGT00950000183074.A.a.b #16	ENSGT00530000063668.A.c #18	ENSGT00940000154920.bb.a #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.b ##22	ENSGT01030000234633.B.a.d	ENSGT00940000156313.c.b	ENSGT00940000154982.d	ENSGT00940000153607.a.a	ENSGT00450000040296	ENSGT00550000074817.v	ENSGT00940000157341.g	ENSGT00390000003289	ENSGT00940000159123.a	ENSGT00940000155121	ENSGT00940000154242.b.g	ENSGT00940000156146.`b.b	ENSGT00940000155331.A.f	ENSGT00940000159827.e	ENSGT01090000260052.a.a.a.a
Cichlidae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00950000183138.a.a.b.v.b	ENSGT00940000181423	ENSGT00440000033408.a.b	ENSGT00940000153311.b.b	ENSGT00940000164732.B	ENSGT00940000163883.J	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.g	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.h.b.b	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.h.b.a	ENSGT00950000182837.a.a.b	ENSGT00390000015525.b	ENSGT00940000157171	ENSGT00950000183074.A.a.b #16	ENSGT00530000063668.A.c #18	ENSGT00940000154920.bb.a #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.b ##22	ENSGT01030000234633.B.a.d	ENSGT00940000156313.c.b	ENSGT00940000154982.d	ENSGT00940000153607.a.a	ENSGT00450000040296	ENSGT00550000074817.v	ENSGT00940000157341.g	ENSGT00390000003289	ENSGT00940000159123.a	ENSGT00940000155121	ENSGT00940000154242.b.g	ENSGT00940000156146.`b.b	ENSGT00940000155331.A.f	ENSGT00940000159827.e	ENSGT01090000260052.a.a.a.a
Pseudocrenilabrinae	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00440000033408.a.b	ENSGT01090000260052.a.a.a.a.e.a.b	ENSGT00950000183126.a.p.b.o.a	ENSGT00940000153311.b.b	ENSGT00940000164732.B	ENSGT00940000163883.J	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.g	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.h.b.b	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.h.b.a	ENSGT00950000182837.a.a.b	ENSGT00390000015525.b	ENSGT00940000157171	ENSGT00950000183074.A.a.b #16	ENSGT00530000063668.A.c #18	ENSGT00940000154920.bb.a #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.b ##22	ENSGT01030000234633.B.a.d	ENSGT00940000156313.c.b	ENSGT00940000154982.d	ENSGT00940000153607.a.a	ENSGT00450000040296	ENSGT00550000074817.v	ENSGT00940000157341.g	ENSGT00390000003289	ENSGT00940000159123.a	ENSGT00940000155121	ENSGT00940000154242.b.g	ENSGT00940000156146.`b.b	ENSGT00940000155331.A.f	ENSGT00940000159827.e	ENSGT01090000260052.a.a.a.a.e.b.b.b
Pseudocrenilabrinae_A	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00950000183126.a.p.b.o.b	ENSGT00940000153311.b.b	ENSGT00940000164732.B	ENSGT00940000163883.J	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.g	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.h.b.b.c	ENSGT00940000177582	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.h.b.b.d	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.h.b.a	ENSGT00950000182837.a.a.b	ENSGT00390000015525.b	ENSGT00940000157171	ENSGT00950000183074.A.a.b #16	ENSGT00530000063668.A.c #18	ENSGT00940000154920.bb.a #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.b ##22	ENSGT01030000234633.B.a.d	ENSGT00940000156313.c.b	ENSGT00940000154982.d	ENSGT00940000155458	ENSGT00450000040296	ENSGT00550000074817.v	ENSGT00940000157341.g	ENSGT00390000003289	ENSGT00940000159123.a	ENSGT00940000155121	ENSGT00940000154242.b.g	ENSGT00940000178871	ENSGT00940000156146.`b.b	ENSGT00940000155331.A.f	ENSGT00940000159827.e
Haplochromini	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00950000183126.a.p.b.o.a	ENSGT00950000183126.a.p.b.o.b	ENSGT00940000153311.b.b	ENSGT00940000164732.B	ENSGT00940000163883.J	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.g	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.h.b.b.c	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.h.b.b.d	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.h.b.a	ENSGT00950000182837.a.a.b	ENSGT00390000015525.b	ENSGT00940000157171	ENSGT00950000183074.A.a.b #16	ENSGT00530000063668.A.c #18	ENSGT00940000154920.bb.a #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.b ##22	ENSGT01030000234633.B.a.d	ENSGT00940000156313.c.b	ENSGT00940000154982.d	ENSGT00940000155458	ENSGT00450000040296	ENSGT00550000074817.v	ENSGT00940000157341.g	ENSGT00390000003289	ENSGT00940000159123.a	ENSGT00940000155121	ENSGT00940000154242.b.g	ENSGT00940000178871	ENSGT00940000156146.`b.b	ENSGT00940000155331.A.f	ENSGT00940000159827.e
Burton s mouthbrooder	MODERN SPECIES	271					ENSHBUG00000014197	ENSHBUG00000014175	mrc1b (ENSHBUG00000014141)	mrc1b (ENSHBUG00000014071)	mrc1b (ENSHBUG00000013400)	mrc1b (ENSHBUG00000012416)	cacnb2b (ENSHBUG00000012332)	stam (ENSHBUG00000000342)	colec12 (ENSHBUG00000012248) #16	clul1 (ENSHBUG00000012221) #18	yes1 (ENSHBUG00000012210) #21	adcyap1b (ENSHBUG00000012153) ##22	EMILIN2 (ENSHBUG00000012093)	LPIN2 (ENSHBUG00000012079)	myom1a (ENSHBUG00000011975)	ENSHBUG00000011695	bag1 (ENSHBUG00000011684)	ENSHBUG00000011674	oprk1 (ENSHBUG00000011652)	atp6v1h (ENSHBUG00000011626)	rgs20 (ENSHBUG00000011491)	tcea1 (ENSHBUG00000011466)	ENSHBUG00000011439	ENSHBUG00000011428	viml (ENSHBUG00000011419)	ENSHBUG00000011362	neurod6b (ENSHBUG00000011214)
Haplochromini_A	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00950000183126.a.p.b.o.a.a	ENSGT00950000183126.a.p.b.o.b	ENSGT00940000168373	ENSGT00940000164732.B	ENSGT00940000163883.J	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.g	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.h.b.b.c	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.h.b.b.d	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.h.b.a	ENSGT00950000182837.a.a.b	ENSGT00390000015525.b	ENSGT00940000157171	ENSGT00950000183074.A.a.b #16	ENSGT00530000063668.A.c #18	ENSGT00940000154920.bb.a #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.b ##22	ENSGT01030000234633.B.a.d	ENSGT00940000156313.c.b	ENSGT00940000154982.d	ENSGT00940000155458	ENSGT00450000040296	ENSGT00550000074817.v	ENSGT00940000157341.g	ENSGT00390000003289	ENSGT00940000159123.a	ENSGT00940000155121	ENSGT00940000154242.b.g	ENSGT00940000156146.`b.b	ENSGT00940000155331.A.f	ENSGT00940000159827.e	ENSGT01090000260052.a.a.a.a.e.b.b.b
P. nyererei	MODERN SPECIES	416			ENSPNYG00000014778	ENSPNYG00000014792	ENSPNYG00000014809	mrc1b (ENSPNYG00000014837)	mrc1b (ENSPNYG00000014898)	mrc1b (ENSPNYG00000015203)	mrc1b (ENSPNYG00000015491)	cacnb2b (ENSPNYG00000015548)	tmem236 (ENSPNYG00000015575)	stam (ENSPNYG00000015591)	colec12 (ENSPNYG00000015608) #16	clul1 (ENSPNYG00000015621) #18	yes1 (ENSPNYG00000015680) #21	adcyap1b (ENSPNYG00000015712) ##22	EMILIN2 (ENSPNYG00000015732)	LPIN2 (ENSPNYG00000015760)	myom1a (ENSPNYG00000015845)	ENSPNYG00000015945	bag1 (ENSPNYG00000015954)	ENSPNYG00000015986	oprk1 (ENSPNYG00000016272)	atp6v1h (ENSPNYG00000016291)	rgs20 (ENSPNYG00000016353)	tcea1 (ENSPNYG00000016369)	ENSPNYG00000016395	viml (ENSPNYG00000016407)	ENSPNYG00000016423	neurod6b (ENSPNYG00000016452)	ENSPNYG00000016462
Haplochromini_B	ANCESTRAL SPECIES	35	ENSGT00950000183126.a.p.b.o.b	ENSGT00950000183126.a.p.b.o.a.b	ENSGT00940000168373	ENSGT00940000164732.B	ENSGT00940000163883.J	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.g	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.h.b.b.c	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.h.b.b.d	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.h.b.a	ENSGT00950000182837.a.a.b	ENSGT00390000015525.b	ENSGT00940000157171	ENSGT00950000183074.A.a.b #16	ENSGT00530000063668.A.c #18	ENSGT00940000154920.bb.a #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.b ##22	ENSGT01030000234633.B.a.d	ENSGT00940000156313.c.b	ENSGT00940000154982.d	ENSGT00940000155458	ENSGT00450000040296	ENSGT00550000074817.v	ENSGT00940000157341.g	ENSGT00390000003289	ENSGT00940000159123.a	ENSGT00940000155121	ENSGT00940000154242.b.g	ENSGT00940000156146.`b.b	ENSGT00940000155331.A.f	ENSGT00940000159827.e	ENSGT00940000174960.a
Eastern happy	MODERN SPECIES	9	ENSACLG00000012745	ENSACLG00000012773	ENSACLG00000012783	ENSACLG00000012795	ENSACLG00000012803	mrc1b (ENSACLG00000012834)	mrc1b (ENSACLG00000012903)	mrc1b (ENSACLG00000012929)	mrc1b (ENSACLG00000013001)	cacnb2b (ENSACLG00000013041)	tmem236 (ENSACLG00000013085)	stam (ENSACLG00000013142)	colec12 (ENSACLG00000013169) #16	clul1 (ENSACLG00000013198) #18	yes1 (ENSACLG00000013282) #21	adcyap1b (ENSACLG00000013303) ##22	EMILIN2 (ENSACLG00000013312)	LPIN2 (ENSACLG00000013320)	myom1a (ENSACLG00000013352)	ENSACLG00000013379	bag1 (ENSACLG00000013385)	ENSACLG00000013392	oprk1 (ENSACLG00000013409)	atp6v1h (ENSACLG00000013418)	rgs20 (ENSACLG00000013464)	tcea1 (ENSACLG00000013471)	ENSACLG00000013485	viml (ENSACLG00000013486)	ENSACLG00000013730	neurod6b (ENSACLG00000014017)	ENSACLG00000014022
Zebra mbuna	MODERN SPECIES	36			ENSMZEG00005020355	ENSMZEG00005020348	ENSMZEG00005020343	mrc1b (ENSMZEG00005020331)	mrc1b (ENSMZEG00005020222)	mrc1b (ENSMZEG00005020183)	mrc1b (ENSMZEG00005020167)	cacnb2b (ENSMZEG00005020157)	tmem236 (ENSMZEG00005020150)	stam (ENSMZEG00005020138)	colec12 (ENSMZEG00005020131) #16	clul1 (ENSMZEG00005020123) #18	yes1 (ENSMZEG00005020115) #21	adcyap1b (ENSMZEG00005020108) ##22	EMILIN2 (ENSMZEG00005020096)	LPIN2 (ENSMZEG00005020087)	myom1a (ENSMZEG00005020057)	ENSMZEG00005020041	bag1 (ENSMZEG00005020034)	ENSMZEG00005020029	oprk1 (ENSMZEG00005020023)
Lyretail cichlid	MODERN SPECIES	313	ENSNBRG00000010859	ENSNBRG00000010835	ENSNBRG00000010820	ENSNBRG00000010803	ENSNBRG00000010790	ENSNBRG00000010773	ENSNBRG00000010760	ENSNBRG00000010745	mrc1b (ENSNBRG00000010678)	cacnb2b (ENSNBRG00000010645)	tmem236 (ENSNBRG00000010608)	stam (ENSNBRG00000010399)	colec12 (ENSNBRG00000010246) #16	clul1 (ENSNBRG00000010221) #18	yes1 (ENSNBRG00000009820) #21	adcyap1b (ENSNBRG00000009770) ##22	EMILIN2 (ENSNBRG00000009729)	LPIN2 (ENSNBRG00000009629)	myom1a (ENSNBRG00000009320)	ENSNBRG00000009256	bag1 (ENSNBRG00000009227)	ENSNBRG00000009205	oprk1 (ENSNBRG00000009193)	atp6v1h (ENSNBRG00000009163)	rgs20 (ENSNBRG00000009132)	tcea1 (ENSNBRG00000009104)	ENSNBRG00000009097	viml (ENSNBRG00000009073)	PDE1C (ENSNBRG00000009029)	neurod6b (ENSNBRG00000009015)	ENSNBRG00000009000
Nile tilapia	MODERN SPECIES	9	ENSONIG00000009171	ENSONIG00000030638	ENSONIG00000039380	mrc1b (ENSONIG00000009176)	mrc1b (ENSONIG00000036225)	mrc1b (ENSONIG00000009179)	mrc1b (ENSONIG00000042419)	mrc1b (ENSONIG00000009182)	cacnb2b (ENSONIG00000009185)	tmem236 (ENSONIG00000009188)	stam (ENSONIG00000009189)	ENSONIG00000040444	colec12 (ENSONIG00000009194) #16	clul1 (ENSONIG00000009196) #18	yes1 (ENSONIG00000032220) #21	adcyap1b (ENSONIG00000009205) ##22	EMILIN2 (ENSONIG00000009207)	LPIN2 (ENSONIG00000009209)	myom1a (ENSONIG00000009215)	myl12.2 (ENSONIG00000037046)	bag1 (ENSONIG00000009222)	ENSONIG00000009226	oprk1 (ENSONIG00000041248)	atp6v1h (ENSONIG00000009230)	rgs20 (ENSONIG00000009235)	tcea1 (ENSONIG00000009237)	ENSONIG00000033534	viml (ENSONIG00000009246)	ENSONIG00000009251	neurod6b (ENSONIG00000032525)	ENSONIG00000021425
Midas cichlid	MODERN SPECIES	564						ENSACIG00000005334	ENSACIG00000005295	mrc1b (ENSACIG00000005239)	mrc1b (ENSACIG00000004883)	cacnb2b (ENSACIG00000004824)	tmem236 (ENSACIG00000004809)	stam (ENSACIG00000004778)	ENSACIG00000004758	clul1 (ENSACIG00000004695) #18	yes1 (ENSACIG00000004675) #21	adcyap1b (ENSACIG00000004663) ##22	EMILIN2 (ENSACIG00000004638)	LPIN2 (ENSACIG00000004591)	myom1a (ENSACIG00000004332)	myl12.2 (ENSACIG00000004311)	bag1 (ENSACIG00000004293)	ENSACIG00000004269	oprk1 (ENSACIG00000004263)	atp6v1h (ENSACIG00000004238)	rgs20 (ENSACIG00000004221)	tcea1 (ENSACIG00000004191)	ENSACIG00000004180	viml (ENSACIG00000004153)	ENSACIG00000004033	neurod6b (ENSACIG00000004008)
Pomacentridae	ANCESTRAL SPECIES	45	ENSGT00940000181423	ENSGT00440000033408.a.b	ENSGT00940000168373	ENSGT00940000164732.B	ENSGT00940000163883.J	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.g	ENSGT00940000177582	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.h.b.b	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.h.b.a	ENSGT00950000182837.a.a.b	ENSGT00390000015525.b	ENSGT00940000157171	ENSGT00950000183074.A.a.b #16	ENSGT00530000063668.A.c #18	ENSGT00940000154920.bb.a #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.b ##22	ENSGT01030000234633.B.a.d	ENSGT00940000156313.c.b	ENSGT00940000154982.d	ENSGT00940000153607.a.a	ENSGT00450000040296	ENSGT00550000074817.v	ENSGT00940000157341.g	ENSGT00390000003289	ENSGT00940000159123.a	ENSGT00940000155121	ENSGT00940000154242.b.g	ENSGT00940000156146.`b.b	ENSGT00940000155331.A.f	ENSGT00940000159827.e	ENSGT01090000260052.a.a.a.a
Pomacentridae_A	ANCESTRAL SPECIES	106	ENSGT00950000183138.a.a.b.v.b	ENSGT00940000181423	ENSGT00440000033408.a.b	ENSGT00940000168373	ENSGT00940000164732.B	ENSGT00940000163883.J	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.g	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.h.b.b	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.h.b.a	ENSGT00950000182837.a.a.b	ENSGT00390000015525.b	ENSGT00940000157171	ENSGT00950000183074.A.a.b #16	ENSGT00530000063668.A.c #18	ENSGT00940000154920.bb.a #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.b ##22	ENSGT01030000234633.B.a.d	ENSGT00940000156313.c.b	ENSGT00940000154982.d	ENSGT00940000153607.a.a	ENSGT00450000040296	ENSGT00550000074817.v	ENSGT00940000157341.g	ENSGT00390000003289	ENSGT00940000159123.a	ENSGT00940000155121	ENSGT00940000154242.b.g	ENSGT00940000156146.`b.b	ENSGT00940000155331.A.f	ENSGT00940000159827.e	ENSGT01090000260052.a.a.b.b
Amphiprion	ANCESTRAL SPECIES	121	ENSGT00950000183138.a.a.b.v.b	ENSGT00940000181423	ENSGT00440000033408.a.b	ENSGT00940000168373	ENSGT00940000164732.B	ENSGT00940000163883.J	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.g	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.h.b.b	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.h.b.a	ENSGT00950000182837.a.a.b	ENSGT00390000015525.b	ENSGT00940000157171	ENSGT00950000183074.A.a.b #16	ENSGT00530000063668.A.c #18	ENSGT00940000154920.bb.a #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.b ##22	ENSGT01030000234633.B.a.d	ENSGT00940000156313.c.b	ENSGT00940000154982.d	ENSGT00940000153607.a.a	ENSGT00450000040296	ENSGT00550000074817.v	ENSGT00940000157341.g	ENSGT00390000003289	ENSGT00940000159123.a	ENSGT00940000155121	ENSGT00940000154242.b.g	ENSGT00940000156146.`b.b	ENSGT00940000155331.A.f	ENSGT00940000159827.e	ENSGT01090000260052.a.a.b.b.a
Clown anemonefish	MODERN SPECIES	585									ENSAOCG00000010051	cacnb2b (ENSAOCG00000000614)	tmem236 (ENSAOCG00000009986)	stam (ENSAOCG00000009951)	colec12 (ENSAOCG00000000607) #16	clul1 (ENSAOCG00000009904) #18	yes1 (ENSAOCG00000009840) #21	adcyap1b (ENSAOCG00000009791) ##22
Orange clownfish	MODERN SPECIES	1	ENSAPEG00000023980	ENSAPEG00000023983	ENSAPEG00000023990	ENSAPEG00000024013	ENSAPEG00000024017	ENSAPEG00000024027	mrc1b (ENSAPEG00000024039)	mrc1b (ENSAPEG00000024074)	mrc1b (ENSAPEG00000024159)	cacnb2b (ENSAPEG00000024216)	tmem236 (ENSAPEG00000024218)	stam (ENSAPEG00000024222)	colec12 (ENSAPEG00000024243) #16	clul1 (ENSAPEG00000024264) #18	yes1 (ENSAPEG00000024280) #21	adcyap1b (ENSAPEG00000024293) ##22	EMILIN2 (ENSAPEG00000024303)	LPIN2 (ENSAPEG00000024316)	myom1a (ENSAPEG00000024379)	myl12.2 (ENSAPEG00000024444)	bag1 (ENSAPEG00000024448)	ENSAPEG00000024457	oprk1 (ENSAPEG00000024484)	atp6v1h (ENSAPEG00000024534)	rgs20 (ENSAPEG00000024553)	tcea1 (ENSAPEG00000024556)	ENSAPEG00000024560	viml (ENSAPEG00000024562)	PDE1C (ENSAPEG00000024569)	neurod6b (ENSAPEG00000024573)	ENSAPEG00000024576
Spiny chromis	MODERN SPECIES	219			ENSAPOG00000018682	ENSAPOG00000018746	ENSAPOG00000018757	ENSAPOG00000018802	mrc1b (ENSAPOG00000018822)	mrc1b (ENSAPOG00000019234)	mrc1b (ENSAPOG00000019291)	cacnb2b (ENSAPOG00000019364)	tmem236 (ENSAPOG00000019407)	stam (ENSAPOG00000019419)	colec12 (ENSAPOG00000019432) #16	clul1 (ENSAPOG00000000557) #18	yes1 (ENSAPOG00000019565) #21	adcyap1b (ENSAPOG00000019597) ##22	ENSAPOG00000019611
Bicolor damselfish	MODERN SPECIES	749											tmem236 (ENSSPAG00000000750)	stam (ENSSPAG00000000739)	colec12 (ENSSPAG00000000730) #16	clul1 (ENSSPAG00000000618) #18	yes1 (ENSSPAG00000000595) #21	adcyap1b (ENSSPAG00000000565) ##22	EMILIN2 (ENSSPAG00000000551)	LPIN2 (ENSSPAG00000000457)	myom1a (ENSSPAG00000000199)	myl12.2 (ENSSPAG00000000177)	bag1 (ENSSPAG00000000129)
Tiger tail seahorse	MODERN SPECIES	466				ENSHCOG00000006364	ENSHCOG00000006305	ENSHCOG00000006300	ENSHCOG00000006292	ENSHCOG00000006279	ENSHCOG00000006261	cacnb2b (ENSHCOG00000006249)	tmem236 (ENSHCOG00000006223)	stam (ENSHCOG00000006210)	colec12 (ENSHCOG00000006199) #16	clul1 (ENSHCOG00000006116) #18	yes1 (ENSHCOG00000006086) #21	adcyap1b (ENSHCOG00000006059) ##22	ENSHCOG00000006045	LPIN2 (ENSHCOG00000006036)	ENSHCOG00000005995	myom1a (ENSHCOG00000005978)	rps15 (ENSHCOG00000005948)	DPP9 (ENSHCOG00000005937)	angptl4 (ENSHCOG00000005874)	ENSHCOG00000005862	rps28 (ENSHCOG00000005849)
Pinecone sodierfish	MODERN SPECIES	8	ENSMMDG00005007422	ENSMMDG00005007421	ENSMMDG00005007416	ENSMMDG00005007391	ENSMMDG00005007366	ENSMMDG00005007362	mrc1b (ENSMMDG00005007109)	mrc1b (ENSMMDG00005007079)	cacnb2b (ENSMMDG00005007073)	tmem236 (ENSMMDG00005007070)	ENSMMDG00005007067	stam (ENSMMDG00005007055)	colec12 (ENSMMDG00005007005) #16	clul1 (ENSMMDG00005007000) #18	yes1 (ENSMMDG00005001905) #21	adcyap1b (ENSMMDG00005001702) ##22	EMILIN2 (ENSMMDG00005001690)	LPIN2 (ENSMMDG00005001490)	myom1a (ENSMMDG00005001371)	myl12.2 (ENSMMDG00005001317)	bag1 (ENSMMDG00005001296)	ENSMMDG00005001279	oprk1 (ENSMMDG00005001265)	atp6v1h (ENSMMDG00005012291)	rgs20 (ENSMMDG00005012282)	tcea1 (ENSMMDG00005012277)	ENSMMDG00005012273	ENSMMDG00005012266	ENSMMDG00005012260	ENSMMDG00005012256	viml (ENSMMDG00005012220)
Cod	MODERN SPECIES	21	tcea1 (ENSGMOG00000017136)	rgs20 (ENSGMOG00000034738)	atp6v1h (ENSGMOG00000017101)	ENSGMOG00000017078	bag1 (ENSGMOG00000017061)	ENSGMOG00000017050	ENSGMOG00000007054	mrc1b (ENSGMOG00000007075)	cacnb2b (ENSGMOG00000007090)	tmem236 (ENSGMOG00000026277)	stam (ENSGMOG00000007108)	ENSGMOG00000025649	colec12 (ENSGMOG00000007124) #16	clul1 (ENSGMOG00000007133) #18	yes1 (ENSGMOG00000007146) #21	adcyap1b (ENSGMOG00000007155) ##22	ENSGMOG00000032714	EMILIN2 (ENSGMOG00000036485)	ENSGMOG00000005291	myom1a (ENSGMOG00000005326)	ENSGMOG00000007370	ENSGMOG00000032975	ENSGMOG00000027155	e2f5 (ENSGMOG00000012711)	IGFBP1 (ENSGMOG00000013011)	ENSGMOG00000022250	TNS3 (ENSGMOG00000013032)	ENSGMOG00000013073	ENSGMOG00000032764	ENSGMOG00000035818	ENSGMOG00000013127
Protacanthopterygii	ANCESTRAL SPECIES	32											ENSGT00950000182837.a.a.b	ENSGT00390000015525.b	ENSGT00940000157171	ENSGT00950000183074.A.a.b #16	ENSGT00530000063668.A.c #18	ENSGT00950000183154.b.a.a.b ##22	ENSGT01030000234633.B.a.d	ENSGT00940000156313.c.b	ENSGT00940000154982.d	ENSGT00940000155458	ENSGT00450000040296	ENSGT00550000074817.v	ENSGT00940000157341.g	ENSGT00390000003289	ENSGT00940000159123.a	ENSGT00940000155121	ENSGT00940000154242.b.g	ENSGT00940000156146.`b.b	ENSGT00940000155331.A.f	ENSGT01090000260052.a.a.a.a	ENSGT01090000260052.a.b.i
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	1248														ENSGT00950000183074.A.a.b #16	ENSGT00530000063668.A.c #18	ENSGT00950000183154.b.a.a.b ##22
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	253														ENSGT00950000183074.A.a.b #16	ENSGT00530000063668.A.c #18	ENSGT00950000183154.b.a.a.b ##22	ENSGT00940000157171	ENSGT00390000015525.b
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	252															ENSGT00530000063668.A.c #18	ENSGT00950000183154.b.a.a.b ##22	ENSGT00940000157171	ENSGT00390000015525.b
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	371															ENSGT00530000063668.A.c #18	ENSGT00950000183154.b.a.a.b ##22	ENSGT00940000157171	ENSGT00390000015525.b
Coho salmon	MODERN SPECIES	23	ENSOKIG00005027943	pak1ip1 (ENSOKIG00005027905)	ENSOKIG00005027891	si:dkey-222f8.3 (ENSOKIG00005027870)	ENSOKIG00005027580	ENSOKIG00005027552	gipc2 (ENSOKIG00005027522)	DNAJB4 (ENSOKIG00005027494)	slc25a24l (ENSOKIG00005027441)	fubp1 (ENSOKIG00005026463)	miga1 (ENSOKIG00005026205)	usp33 (ENSOKIG00005026075)	zzz3 (ENSOKIG00005025988)	clul1 (ENSOKIG00005025970) #18	ENSOKIG00005025967	ENSOKIG00005025793 ##22	ENSOKIG00005048345	stam (ENSOKIG00005048283)	tmem236 (ENSOKIG00005048269)	ENSOKIG00005048266	ENSOKIG00005048262	ENSOKIG00005048254	ENSOKIG00005048251	ENSOKIG00005048244	ENSOKIG00005048240	ENSOKIG00005048232	ENSOKIG00005048229	ENSOKIG00005048226	ACVR2B (ENSOKIG00005048016)	ENSOKIG00005047982	arhgap29b (ENSOKIG00005047933)
Chinook salmon	MODERN SPECIES	592														ENSOTSG00005024271	clul1 (ENSOTSG00005024272) #18	adcyap1b (ENSOTSG00005024274) ##22	ENSOTSG00005024347	ENSOTSG00005024348	stam (ENSOTSG00005024349)	tmem236 (ENSOTSG00005024354)
Rainbow trout	MODERN SPECIES	29															ENSOMYG00000016291 #18	ENSOMYG00000016245 ##22	ENSOMYG00000059844	ENSOMYG00000016196	ENSOMYG00000016191	rgs20 (ENSOMYG00000058145)	ENSOMYG00000052368	atp6v1h (ENSOMYG00000007811)	oprk1 (ENSOMYG00000007897)	ENSOMYG00000049522	ENSOMYG00000053024	bag1 (ENSOMYG00000016179)	ENSOMYG00000016186	ENSOMYG00000007925	ENSOMYG00000007939	ENSOMYG00000007970	ENSOMYG00000055518
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	303														ENSGT00950000183074.A.a.b #16	ENSGT00530000063668.A.c #18	ENSGT00950000183154.b.a.a.b ##22	ENSGT00940000157171	ENSGT00390000015525.b
River trout	MODERN SPECIES	13	ENSSTUG00000007203	pecr (ENSSTUG00000007212)	ndufb3 (ENSSTUG00000007219)	ENSSTUG00000007229	ENSSTUG00000007272	XCR1 (ENSSTUG00000007283)	neurod6b (ENSSTUG00000007286)	bag1 (ENSSTUG00000007290)	ENSSTUG00000007301	oprk1 (ENSSTUG00000007346)	atp6v1h (ENSSTUG00000007406)	ENSSTUG00000007641	rgs20 (ENSSTUG00000007650)	colec12 (ENSSTUG00000007660) #16	clul1 (ENSSTUG00000007676) #18	adcyap1b (ENSSTUG00000007685) ##22	stam (ENSSTUG00000007833)	tmem236 (ENSSTUG00000008485)
Northern pike	MODERN SPECIES	2												cacnb2b (ENSELUG00000011358)	tmem236 (ENSELUG00000011324)	stam (ENSELUG00000011313)	clul1 (ENSELUG00000011291) #18	adcyap1b (ENSELUG00000011282) ##22	EMILIN2 (ENSELUG00000011245)	LPIN2 (ENSELUG00000011140)	ENSELUG00000030094	myom1a (ENSELUG00000010821)	ENSELUG00000000334	bag1 (ENSELUG00000008792)	ENSELUG00000008762	oprk1 (ENSELUG00000008712)	atp6v1h (ENSELUG00000008694)	rgs20 (ENSELUG00000008646)	tcea1 (ENSELUG00000008605)	ENSELUG00000031642	ENSELUG00000008416	ENSELUG00000032564	VIM (ENSELUG00000008389)
Otomorpha	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000157414	ENSGT00940000157353	ENSGT01030000234667.a.a.a.b.b	ENSGT00950000183138.a.a.b.v.b	ENSGT00440000033408.a.b	ENSGT00940000164732.B	ENSGT00940000163883.J	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b	ENSGT00950000182837.a.a.b	ENSGT00390000015525.b	ENSGT00940000157171	ENSGT00950000183074.A.a.b #16	ENSGT00940000178074	ENSGT00530000063668.A.c #18	ENSGT00940000154920.bb.a #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.b ##22	ENSGT01030000234633.B.a.d	ENSGT00940000156313.c.b	ENSGT00940000154982.d	ENSGT00940000153607.a.a	ENSGT00450000040296	ENSGT00550000074817.v	ENSGT00940000157341.g	ENSGT00390000003289	ENSGT00940000159123.a	ENSGT00940000155121	ENSGT00940000154242.b.g	ENSGT00390000001319	ENSGT00940000164667.b.a.b	ENSGT01030000234518.E.d	ENSGT00940000154952.a.b
Clupeiformes	ANCESTRAL SPECIES	70	ENSGT00940000164239.b.a.d	ENSGT00940000157414	ENSGT00940000157353	ENSGT01030000234667.a.a.a.b.b	ENSGT00950000183138.a.a.b.v.b	ENSGT00440000033408.a.b	ENSGT00940000164732.B	ENSGT00950000182996.b.a.a.a.a	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b	ENSGT00950000182837.a.a.b	ENSGT00390000015525.b	ENSGT00940000157171	ENSGT00950000183074.A.a.b #16	ENSGT00530000063668.A.c #18	ENSGT00940000154920.bb.a #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.b ##22	ENSGT01030000234633.B.a.d	ENSGT00940000156313.c.b	ENSGT00940000154982.d	ENSGT00940000157741	ENSGT00950000182972.a.a.a.b.l	ENSGT00940000153249.b.d.b	ENSGT00940000156601.s.a	ENSGT00910000144305	ENSGT00940000154674.q.a	ENSGT01050000244888.b.a.c.b.f	ENSGT00940000160269.e	ENSGT00940000158959.b.b	ENSGT00940000164492.a.a	ENSGT00940000164804.a	ENSGT00940000157050.i.a
Denticle herring	MODERN SPECIES	14	ltb4r2b (ENSDCDG00000029966)	NFATC4 (ENSDCDG00000029970)	ENSDCDG00000000363	ENSDCDG00000000534	MYADM (ENSDCDG00000000536)	ENSDCDG00000000542	mrc1b (ENSDCDG00000000602)	ENSDCDG00000000740	cacnb2b (ENSDCDG00000000753)	tmem236 (ENSDCDG00000000766)	stam (ENSDCDG00000000772)	colec12 (ENSDCDG00000000787) #16	ENSDCDG00000000790	clul1 (ENSDCDG00000000792) #18	yes1 (ENSDCDG00000000947) #21	adcyap1b (ENSDCDG00000001792) ##22	EMILIN2 (ENSDCDG00000001796)	LPIN2 (ENSDCDG00000001814)	myom1a (ENSDCDG00000001959)	pccb (ENSDCDG00000002613)	slc35g2a (ENSDCDG00000002767)	NCK1 (ENSDCDG00000002768)	HLTF (ENSDCDG00000002779)	gyg1a (ENSDCDG00000002792)	AGTR1 (ENSDCDG00000002795)	ENSDCDG00000002799	eif2b2 (ENSDCDG00000002807)	rab3aa (ENSDCDG00000002821)	ENSDCDG00000002838	mpv17l2 (ENSDCDG00000002860)	ifi30 (ENSDCDG00000002861)
Otophysi	ANCESTRAL SPECIES	35	ENSGT00940000157414	ENSGT00940000157353	ENSGT01030000234667.a.a.a.b.b	ENSGT00950000183138.a.a.b.v.b	ENSGT00440000033408.a.b	ENSGT00940000164732.B	ENSGT00940000163883.J	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b	ENSGT00950000182837.a.a.b	ENSGT00390000015525.b	ENSGT00940000157171	ENSGT00950000183074.A.a.b #16	ENSGT00940000178074	ENSGT00530000063668.A.c #18	ENSGT00940000154920.bb.a #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.b ##22	ENSGT01030000234633.B.a.d	ENSGT00940000156313.c.b	ENSGT00940000154982.d	ENSGT00940000153607.a.a	ENSGT00450000040296	ENSGT00550000074817.v	ENSGT00940000157341.g	ENSGT00390000003289	ENSGT00940000159123.a	ENSGT00940000155121	ENSGT00940000154242.b.g.a	ENSGT00940000154242.b.g.b	ENSGT00390000001319	ENSGT00940000164667.b.a.a	ENSGT00940000164667.a
Characiphysae	ANCESTRAL SPECIES	88	ENSGT00940000156907.p.a.a	ENSGT00940000164239.b.a	ENSGT00940000157414	ENSGT00940000157353	ENSGT01030000234667.a.a.a.b.b	ENSGT00950000183138.a.a.b.v.b	ENSGT00440000033408.a.b	ENSGT00940000164732.B	ENSGT00940000163883.J	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b	ENSGT00950000182837.a.a.b	ENSGT00390000015525.b	ENSGT00940000157171	ENSGT00950000183074.A.a.b #16	ENSGT00530000063668.A.c #18	ENSGT00950000183154.b.a.a.b ##22	ENSGT01030000234633.B.a.d	ENSGT00940000156313.c.b	ENSGT00940000154982.d	ENSGT00450000040296	ENSGT00550000074817.v	ENSGT00940000157341.g	ENSGT00390000003289	ENSGT00940000159123.a	ENSGT00940000155121.nb	ENSGT00940000154242.b.g.a	ENSGT00940000154242.b.g.b	ENSGT00940000154516.a.b.l	ENSGT00390000016016.A	ENSGT00390000001319	ENSGT00940000164667.b.a.b
Channel catfish	MODERN SPECIES	26	STARD3NL (ENSIPUG00000003313)	ENSIPUG00000003344	ENSIPUG00000003352	ENSIPUG00000003360	ACKR4 (ENSIPUG00000003368)	ENSIPUG00000003375	ENSIPUG00000003394	ENSIPUG00000003444	mrc1b (ENSIPUG00000003476)	cacnb2b (ENSIPUG00000003592)	tmem236 (ENSIPUG00000003614)	stam (ENSIPUG00000003624)	colec12 (ENSIPUG00000003647) #16	CLUL1 (ENSIPUG00000003663) #18	yes1 (ENSIPUG00000003691) #21	adcyap1b (ENSIPUG00000003741) ##22	EMILIN2 (ENSIPUG00000003774)	lpin2 (ENSIPUG00000003806)	myom1a (ENSIPUG00000003961)	bag1 (ENSIPUG00000004193)	CHMP5 (ENSIPUG00000004203)	Oprk1 (ENSIPUG00000004228)	atp6v1h (ENSIPUG00000004257)	rgs20 (ENSIPUG00000004329)	tcea1 (ENSIPUG00000004352)	ENSIPUG00000004380	ENSIPUG00000004386	sec61g (ENSIPUG00000004392)	si:dkey-94e7.2 (ENSIPUG00000004399)	GPR141 (ENSIPUG00000004413)	ctnnd2 (ENSIPUG00000004430)
Characiphysae_b	ANCESTRAL SPECIES	64	ENSGT00940000156907.p.a.a	ENSGT00940000164239.b.a	ENSGT00940000157414	ENSGT00940000157353	ENSGT01030000234667.a.a.a.b.b	ENSGT00950000183138.a.a.b.v.b	ENSGT00440000033408.a.b	ENSGT00940000164732.B	ENSGT00940000163883.J	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b	ENSGT00950000182837.a.a.b	ENSGT00390000015525.b	ENSGT00940000157171	ENSGT00950000183074.A.a.b #16	ENSGT00530000063668.A.c #18	ENSGT00950000183154.b.a.a.b ##22	ENSGT01030000234633.B.a.d	ENSGT00940000156313.c.b	ENSGT00940000154982.d	ENSGT00450000040296	ENSGT00550000074817.v	ENSGT00940000157341.g	ENSGT00390000003289	ENSGT00940000159123.a	ENSGT00940000155121.nb	ENSGT00940000154242.b.g.a	ENSGT00940000164667.b.a.b	ENSGT01030000234518.E.d	ENSGT00940000154952.a.b	ENSGT00500000044852.a.a.b	ENSGT00940000155171.a.b.d
Characoidei	ANCESTRAL SPECIES	107	ENSGT00940000166973	ENSGT00500000045505.a	ENSGT00940000164239.b.a	ENSGT00940000157414	ENSGT00940000157353	ENSGT01030000234667.a.a.a.b.b	ENSGT00950000183138.a.a.b.v.b	ENSGT00440000033408.a.b	ENSGT00940000164732.B	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b	ENSGT00950000182837.a.a.b	ENSGT00390000015525.b	ENSGT00940000157171	ENSGT00950000183074.A.a.b #16	ENSGT00530000063668.A.c #18	ENSGT00950000183154.b.a.a.b ##22	ENSGT01030000234633.B.a.d	ENSGT00940000156313.c.b	ENSGT00940000154982.d	ENSGT00450000040296	ENSGT00550000074817.v	ENSGT00940000157341.g	ENSGT00390000003289	ENSGT00940000159123.a	ENSGT00940000155121.nb	ENSGT00940000154242.b.g.a	ENSGT00940000164667.b.a.b	ENSGT01030000234518.E.d	ENSGT00940000154952.a.b	ENSGT00500000044852.a.a.b	ENSGT00940000155171.a.b.d
Mexicana tetra	MODERN SPECIES	7	mrc1b (ENSAMXG00000014441)	mrc1b (ENSAMXG00000004841)	mrc1b (ENSAMXG00000004651)	ENSAMXG00000035335	mrc1b (ENSAMXG00000013207)	cacnb2b (ENSAMXG00000013243)	tmem236 (ENSAMXG00000013260)	stam (ENSAMXG00000013269)	ENSAMXG00000035545	colec12 (ENSAMXG00000013281) #16	ENSAMXG00000031230	clul1 (ENSAMXG00000032408) #18	yes1 (ENSAMXG00000013306) #21	ENSAMXG00000038975	ENSAMXG00000041910	adcyap1b (ENSAMXG00000041898) ##22	ENSAMXG00000039038	EMILIN2 (ENSAMXG00000024917)	LPIN2 (ENSAMXG00000018088)	myom1a (ENSAMXG00000018158)	bag1 (ENSAMXG00000038556)	CHMP5 (ENSAMXG00000018188)	oprk1 (ENSAMXG00000018191)	atp6v1h (ENSAMXG00000018200)	rgs20 (ENSAMXG00000033141)	tcea1 (ENSAMXG00000018211)	ENSAMXG00000035867	si:dkey-94e7.2 (ENSAMXG00000018214)	GPR141 (ENSAMXG00000018220)	ctnnd2b (ENSAMXG00000018249)	ANKRD33B (ENSAMXG00000032907)
Red-bellied piranha	MODERN SPECIES	228	LRRCC1 (ENSPNAG00000004009)	e2f5 (ENSPNAG00000026145)	ACKR4 (ENSPNAG00000026151)	ENSPNAG00000026194	ENSPNAG00000005263	ENSPNAG00000026279	ENSPNAG00000005866	mrc1b (ENSPNAG00000026407)	cacnb2b (ENSPNAG00000026474)	tmem236 (ENSPNAG00000004063)	stam (ENSPNAG00000026518)	colec12 (ENSPNAG00000026534) #16	ENSPNAG00000026569	clul1 (ENSPNAG00000026582) #18	yes1 (ENSPNAG00000026593) #21	adcyap1b (ENSPNAG00000005423) ##22
Electric eel	MODERN SPECIES	10	gadd45bb (ENSEEEG00000006622)	gng7 (ENSEEEG00000006623)	diras1b (ENSEEEG00000006624)	zgc:101744 (ENSEEEG00000006625)	elavl1a (ENSEEEG00000006626)	pex19 (ENSEEEG00000006628)	copa (ENSEEEG00000006635)	apoda.1 (ENSEEEG00000006655)	mrc1b (ENSEEEG00000006684)	mrc1b (ENSEEEG00000006697)	cacnb2b (ENSEEEG00000006702)	tmem236 (ENSEEEG00000006706)	stam (ENSEEEG00000006712)	ENSEEEG00000006726	yes1 (ENSEEEG00000006803) #21	adcyap1b (ENSEEEG00000008321) ##22	ENSEEEG00000008325	LPIN2 (ENSEEEG00000008352)
Cyprinoidei	DUPLICATION
Cyprinoidei	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000157414	ENSGT00940000157353	ENSGT01030000234667.a.a.a.b.b	ENSGT00950000183138.a.a.b.v.b	ENSGT00440000033408.a.b	ENSGT00940000164732.B	ENSGT00940000163883.J	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b	ENSGT00950000182837.a.a.b	ENSGT00390000015525.b	ENSGT00940000157171	ENSGT00950000183074.A.a.b #16	ENSGT00940000178074	ENSGT00530000063668.A.c #18	ENSGT00940000154920.bb.a #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.b.a ##22	ENSGT01030000234633.B.a.d	ENSGT00940000156313.c.b	ENSGT00940000154982.d	ENSGT00940000153607.a.a	ENSGT00450000040296	ENSGT00550000074817.v	ENSGT00940000157341.g	ENSGT00390000003289	ENSGT00940000159123.a	ENSGT00940000155121	ENSGT00940000154242.b.g.a	ENSGT00940000164667.b.a.b	ENSGT01030000234518.E.d	ENSGT00500000044852.a.a.b	ENSGT00940000155171.a.b.c.a
Cyprininae	DUPLICATION
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Goldfish	MODERN SPECIES	11	ENSCARG00000000670	ENSCARG00000000666	e2f5 (ENSCARG00000000662)	ENSCARG00000000645	ENSCARG00000000618	ENSCARG00000000610	ENSCARG00000000607	mrc1b (ENSCARG00000000587)	ENSCARG00000000580	mrc1b (ENSCARG00000000478)	cacnb2b (ENSCARG00000000392)	stam (ENSCARG00000000316)	colec12 (ENSCARG00000000197) #16	clul1 (ENSCARG00000000134) #18	yes1 (ENSCARG00000068805) #21	adcyap1b (ENSCARG00000068752) ##22	EMILIN2 (ENSCARG00000068745)	LPIN2 (ENSCARG00000068608)	myl12.2 (ENSCARG00000068581)	bag1 (ENSCARG00000068575)	CHMP5 (ENSCARG00000068561)	oprk1 (ENSCARG00000068549)	atp6v1h (ENSCARG00000068425)	rgs20 (ENSCARG00000068401)	tcea1 (ENSCARG00000068370)	ENSCARG00000068359	ENSCARG00000068348	GPR141 (ENSCARG00000068340)	ctnnd2b (ENSCARG00000068001)	ENSCARG00000067959	marchf6 (ENSCARG00000067318)
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	197												ENSGT00940000157171.f	ENSGT00950000183074.A.a.b.b #16	ENSGT00530000063668.A.c.b #18	ENSGT00940000154920.bb.a.b #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.b.a.a ##22	ENSGT01030000234633.B.a.d.a	ENSGT00940000156313.c.b.b	ENSGT00940000154982.d.b	ENSGT00940000153607.a.a.b	ENSGT00450000040296.n	ENSGT00550000074817.v.g	ENSGT00940000157341.g.a	ENSGT00390000003289.j	ENSGT00940000159123.a.b	ENSGT00940000155121.qb	ENSGT00940000154242.b.g.a.b	ENSGT00940000164667.b.a.b.b	ENSGT01030000234518.E.d.n.b.b	ENSGT00940000154952.a.b.sb.a	ENSGT00500000044852.a.a.b.i
Common carp reference	MODERN SPECIES	21	rnf182 (ENSCCRG00000001597)	ENSCCRG00000048632	and2 (ENSCCRG00000048628)	ENSCCRG00000044084	ENSCCRG00000072875	e2f5 (ENSCCRG00000053650)	ENSCCRG00000044075	ENSCCRG00000044073	mrc1b (ENSCCRG00000074898)	cacnb2b (ENSCCRG00000064059)	tmem236 (ENSCCRG00000056617)	stam (ENSCCRG00000039285)	colec12 (ENSCCRG00000071289) #16	clul1 (ENSCCRG00000061469) #18	ENSCCRG00000014554 #21	adcyap1b (ENSCCRG00000015648) ##22	EMILIN2 (ENSCCRG00000068890)	LPIN2 (ENSCCRG00000013375)	myom1a (ENSCCRG00000012734)	myl12.2 (ENSCCRG00000002972)	bag1 (ENSCCRG00000010110)	ENSCCRG00000018678	oprk1 (ENSCCRG00000029369)	atp6v1h (ENSCCRG00000018150)	rgs20 (ENSCCRG00000073775)	tcea1 (ENSCCRG00000018683)	ENSCCRG00000018686	si:dkey-94e7.2 (ENSCCRG00000082833)	ENSCCRG00000067088	ctnnd2b (ENSCCRG00000010909)	ENSCCRG00000010824
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000157414.a	ENSGT00940000157353.hb.a	ENSGT01030000234667.a.a.a.b.b.b	ENSGT00950000183138.a.a.b.v.b.a	ENSGT00440000033408.a.b	ENSGT00940000164732.B	ENSGT00940000163883.J	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.f	ENSGT00950000182837.a.a.b.b	ENSGT00390000015525.b.d	ENSGT00940000157171.e	ENSGT00950000183074.A.a.b.a #16	ENSGT00940000178074	ENSGT00530000063668.A.c.a #18	ENSGT00940000154920.bb.a.a.a.a #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.b.a.b ##22	ENSGT01030000234633.B.a.d.b	ENSGT00940000156313.c.b.a	ENSGT00940000154982.d.a	ENSGT00940000153607.a.a.a	ENSGT00450000040296.m	ENSGT00550000074817.v.h	ENSGT00940000157341.g.b	ENSGT00390000003289.i	ENSGT00940000159123.a.a	ENSGT00940000155121.pb	ENSGT00940000154242.b.g.a.a	ENSGT00940000154242.b.g.b	ENSGT00940000164667.b.a.b.a	ENSGT01030000234518.E.d.n.b.a.b	ENSGT00940000154952.a.b.sb.b
Goldfish	DUPLICATION
Goldfish	MODERN SPECIES	19	grk7a (ENSCARG00000005448)	ENSCARG00000005445	fbxo36b (ENSCARG00000005434)	agfg1b (ENSCARG00000005386)	zgc:110269 (ENSCARG00000005357)	ENSCARG00000005181	sh3glb1b (ENSCARG00000004153)	selenoj (ENSCARG00000004020)	ENSCARG00000004005	vav3b (ENSCARG00000026204)	NTNG1 (ENSCARG00000026164)	ENSCARG00000026153	ENSCARG00000026020	col11a1b (ENSCARG00000025993)	DIS3L2 (ENSCARG00000025929)	adcyap1b (ENSCARG00000025876) ##22	ENSCARG00000025856	ENSCARG00000025850	ENSCARG00000025837	ENSCARG00000025829	ENSCARG00000025823	DUSP28 (ENSCARG00000025806)	WDR33 (ENSCARG00000025722)	sft2d3 (ENSCARG00000025710)	ENSCARG00000025702	ENSCARG00000025698	ENSCARG00000025354	ENSCARG00000025327	ENSCARG00000025269	phb2a (ENSCARG00000025194)	ENSCARG00000025160
Goldfish	MODERN SPECIES	19	ENSCARG00000014782	and2 (ENSCARG00000014793)	ENSCARG00000014801	LRRCC1 (ENSCARG00000014820)	e2f5 (ENSCARG00000014840)	ACKR4 (ENSCARG00000014854)	ENSCARG00000014862	ENSCARG00000014868	ENSCARG00000014879	ENSCARG00000014912	ENSCARG00000014926	mrc1b (ENSCARG00000014963)	cacnb2b (ENSCARG00000015250)	tmem236 (ENSCARG00000015361)	yes1 (ENSCARG00000015444) #21	adcyap1b (ENSCARG00000017433) ##22	EMILIN2 (ENSCARG00000017468)	LPIN2 (ENSCARG00000017508)	myom1a (ENSCARG00000017750)	myl12.2 (ENSCARG00000018007)	bag1 (ENSCARG00000018022)	ENSCARG00000018038	oprk1 (ENSCARG00000018067)	atp6v1h (ENSCARG00000018089)	rgs20 (ENSCARG00000018285)	tcea1 (ENSCARG00000018308)	ENSCARG00000018335	si:dkey-94e7.2 (ENSCARG00000018341)	ENSCARG00000018355	ENSCARG00000018378	ctnnd2b (ENSCARG00000018459)
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00440000033408.a.b	ENSGT00940000164732.B	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.f	ENSGT00950000182837.a.a.b.b	ENSGT00390000015525.b.c	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.e	ENSGT00950000182837.a.a.b.a	ENSGT00390000015525.b.d	ENSGT00940000157171.e	ENSGT00950000183074.A.a.b.a #16	ENSGT00940000178074	ENSGT00530000063668.A.c.a #18	ENSGT00940000154920.bb.a.a.a.a #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.b.b ##22	ENSGT00940000154920.bb.a.a.b #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.b.a.b ##22	ENSGT01030000234633.B.a.d.b	ENSGT00940000156313.c.b.a	ENSGT00940000154982.d.a	ENSGT00940000153607.a.a.a	ENSGT00450000040296.m	ENSGT00550000074817.v.h	ENSGT00940000157341.g.b	ENSGT00390000003289.i	ENSGT00940000159123.a.a	ENSGT00940000155121.pb	ENSGT00940000154242.b.g.a.a	ENSGT00940000164667.b.a.b.a	ENSGT01030000234518.E.d.n.b.a.a	ENSGT00940000154952.a.b.sb.b	ENSGT00500000044852.a.a.b.j
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	20	ranbp9 (ENSSGRG00000024049)	ENSSGRG00000024036	and2 (ENSSGRG00000024035)	ENSSGRG00000024034	ENSSGRG00000024033	LRRCC1 (ENSSGRG00000024030)	e2f5 (ENSSGRG00000024028)	ENSSGRG00000024026	ENSSGRG00000024025	mrc1b (ENSSGRG00000023980)	ENSSGRG00000023959	stam (ENSSGRG00000023472)	colec12 (ENSSGRG00000023463) #16	clul1 (ENSSGRG00000023462) #18	yes1 (ENSSGRG00000023461) #21	adcyap1b (ENSSGRG00000023460) ##22	EMILIN2 (ENSSGRG00000023459)	LPIN2 (ENSSGRG00000022626)	myom1a (ENSSGRG00000022388)	myl12.2 (ENSSGRG00000022276)	bag1 (ENSSGRG00000022274)	ENSSGRG00000022233	oprk1 (ENSSGRG00000022231)	atp6v1h (ENSSGRG00000021508)	ENSSGRG00000021485	tcea1 (ENSSGRG00000021446)	ENSSGRG00000021445	ENSSGRG00000021444	si:dkey-94e7.2 (ENSSGRG00000021443)	ENSSGRG00000021442	ENSSGRG00000021441
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Zebrafish	MODERN SPECIES	11	ENSDARG00000090292	LRRCC1 (ENSDARG00000078535)	e2f5 (ENSDARG00000038812)	ACKR4 (ENSDARG00000078729)	ENSDARG00000092920	ENSDARG00000077219	ENSDARG00000095059	ENSDARG00000075706	ENSDARG00000093629	mrc1b (ENSDARG00000038822)	cacnb2b (ENSDARG00000055565)	tmem236 (ENSDARG00000075715)	stam (ENSDARG00000002127)	colec12 (ENSDARG00000061140) #16	clul1 (ENSDARG00000055595) #18	adcyap1b (ENSDARG00000027740) ##22	yes1 (ENSDARG00000005941) #21	EMILIN2 (ENSDARG00000061196)	LPIN2 (ENSDARG00000061214)	myom1a (ENSDARG00000061249)	myl12.2 (ENSDARG00000025326)	bag1 (ENSDARG00000020895)	CHMP5 (ENSDARG00000038855)	oprk1 (ENSDARG00000006894)	atp6v1h (ENSDARG00000006370)	rgs20 (ENSDARG00000038859)	tcea1 (ENSDARG00000003531)	ENSDARG00000077687	si:dkey-94e7.2 (ENSDARG00000068474)	GPR141 (ENSDARG00000077026)	ctnnd2b (ENSDARG00000003779)
Cyprinoidei	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183154.b.a.a.b.b ##22
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183154.b.a.a.b.b ##22
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT01030000234667.a.a.a.b.b.b	ENSGT00950000183138.a.a.b.v.b.a	ENSGT00440000033408.a.b	ENSGT00940000164732.B	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.f	ENSGT00950000182837.a.a.b.b	ENSGT00390000015525.b.c	ENSGT01050000244842.a.a.b.b.b.e	ENSGT00950000182837.a.a.b.a	ENSGT00390000015525.b.d	ENSGT00940000157171.e	ENSGT00950000183074.A.a.b.a #16	ENSGT00940000178074	ENSGT00530000063668.A.c.a #18	ENSGT00940000154920.bb.a.a.a.a #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.b.b ##22	ENSGT00940000154920.bb.a.a.b #21	ENSGT00950000183154.b.a.a.b.a.b ##22	ENSGT01030000234633.B.a.d.b	ENSGT00940000156313.c.b.a	ENSGT00940000154982.d.a	ENSGT00940000153607.a.a.a	ENSGT00450000040296.m	ENSGT00550000074817.v.h	ENSGT00940000157341.g.b	ENSGT00390000003289.i	ENSGT00940000159123.a.a	ENSGT00940000155121.pb	ENSGT00940000154242.b.g.a.a	ENSGT00940000164667.b.a.b.a	ENSGT01030000234518.E.d.n.b.a.a
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