Hystricomorpha_a	ANCESTRAL SPECIES	26																ENSGT00950000183211.a.b #22	ENSGT00530000063631.a #23	ENSGT00390000011362	ENSGT00390000010779.a.a.h #26	ENSGT00550000076117 #28	ENSGT00390000002381.a #29	ENSGT00940000160858 #30	ENSGT00390000015641 #31	ENSGT00940000157616 #33	ENSGT00940000157071 #34	ENSGT00940000159356.a.a #35	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a #36	ENSGT00390000014772 #37	ENSGT00940000156787	ENSGT00940000160839	ENSGT00950000183051.a.a
Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES	21																ENSGT00950000183211.a.b #22	ENSGT00530000063631.a #23	ENSGT00390000011362	ENSGT00390000010779.a.a.h #26	ENSGT00550000076117 #28	ENSGT00390000002381.a #29	ENSGT00940000160858 #30	ENSGT00390000015641 #31	ENSGT00940000157616 #33	ENSGT00940000157071 #34	ENSGT00940000159356.a.a #35	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a #36	ENSGT00390000014772 #37	ENSGT00940000156787	ENSGT00940000160839	ENSGT00950000183051.a.a
Degu	MODERN SPECIES	161																PARD6G (ENSODEG00000003334) #22	ADNP2 (ENSODEG00000003303) #23	ENSODEG00000003281 #24	ENSODEG00000003240 #25	TXNL4A (ENSODEG00000003214) #26	ENSODEG00000018937 #27	HSBP1L1 (ENSODEG00000003188) #28	ENSODEG00000003181 #29	KCNG2 (ENSODEG00000003142) #30	CTDP1 (ENSODEG00000003029) #31	ENSODEG00000002960 #32	NFATC1 (ENSODEG00000002866) #33	ATP9B (ENSODEG00000002792) #34	SALL3 (ENSODEG00000002692) #35	GALR1 (ENSODEG00000002674) #36	MBP (ENSODEG00000002651) #37
Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	109																PARD6G (ENSCLAG00000008422) #22	ADNP2 (ENSCLAG00000010511) #23	ENSCLAG00000010655	RBFA (ENSCLAG00000012122)	ENSCLAG00000015664	ENSCLAG00000014203 #26	SLC66A2 (ENSCLAG00000008800) #29	KCNG2 (ENSCLAG00000007825) #30	CTDP1 (ENSCLAG00000011662) #31	ENSCLAG00000013642	NFATC1 (ENSCLAG00000009557) #33	ATP9B (ENSCLAG00000010218) #34	SALL3 (ENSCLAG00000007727) #35	GALR1 (ENSCLAG00000013020) #36	MBP (ENSCLAG00000014151) #37	ZNF236 (ENSCLAG00000007793)
Guinea pig	MODERN SPECIES	105															ENSCPOG00000007537	PARD6G (ENSCPOG00000032338) #22	ADNP2 (ENSCPOG00000035899) #23	RBFA (ENSCPOG00000000170)	TXNL4A (ENSCPOG00000035909) #26	HSBP1L1 (ENSCPOG00000032487) #28	SLC66A2 (ENSCPOG00000019883) #29	ENSCPOG00000030362 #30	CTDP1 (ENSCPOG00000002613) #31	NFATC1 (ENSCPOG00000003999) #33	ATP9B (ENSCPOG00000015118) #34	SALL3 (ENSCPOG00000008546) #35	GALR1 (ENSCPOG00000000125) #36	MBP (ENSCPOG00000008430) #37	ZNF236 (ENSCPOG00000008424)	ZNF516 (ENSCPOG00000020183)