Bilateria DUPLICATION Bilateria DUPLICATION Bilateria DUPLICATION Bilateria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183168.B #22 Chordata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183168.B #22 Vertebrata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183168.B #22 Gnathostomata DUPLICATION Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES 971 ENSGT00940000160073 #11 ENSGT00950000183168.B.a #22 ENSGT00390000003312 #23 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 641 ENSGT01060000248564.b.a.a.a ENSGT00950000182962.b.a #7 ENSGT00940000160073 #11 ENSGT00950000183168.B.a #22 ENSGT00390000003312 #23 Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 55 ENSGT00390000004191 ENSGT00390000015719.c ENSGT00940000155361 ENSGT00390000016565 ENSGT00950000182900.B ENSGT00390000007371 ENSGT00940000154868.a.b ENSGT00940000160932 ENSGT00940000156338 ENSGT01060000248564.b.a.a.a ENSGT00950000182962.b.a #7 ENSGT00390000018883 #8 ENSGT00940000157554 #9 ENSGT00940000163923 ENSGT00940000160073 #11 ENSGT00950000183168.B.a #22 ENSGT00390000003312 #23 ENSGT00940000157582 #24 ENSGT00940000155543 #25 ENSGT00940000157669 #32 ENSGT00940000155393.d ENSGT00940000157034 ENSGT00940000165326 ENSGT00940000160992 ENSGT00940000160504 ENSGT00940000167209 ENSGT00940000156761 #30 ENSGT00410000025596.a.b #29 ENSGT00390000002144 #28 ENSGT00940000164873 ENSGT00940000159933 Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT00960000189819 ENSGT00940000160747 ENSGT00940000156338 ENSGT00950000182900.B ENSGT00390000007371 ENSGT00940000154868.a.b ENSGT00940000160932 ENSGT00940000159398 ENSGT00940000157531 ENSGT01060000248564.b.a.a.a ENSGT00950000182962.b.a #7 ENSGT00390000018883 #8 ENSGT00940000157554 #9 ENSGT00940000163923 ENSGT00940000160073 #11 ENSGT00950000183168.B.a #22 ENSGT00390000003312 #23 ENSGT00940000157582 #24 ENSGT00940000155543 #25 ENSGT00940000157669 #32 ENSGT00940000155393.d ENSGT00940000157034 ENSGT00940000165326 ENSGT00940000160992 ENSGT00940000160504 ENSGT00940000167209 ENSGT00940000156761 #30 ENSGT00410000025596.a.b #29 ENSGT00390000002144 #28 ENSGT00940000164873 ENSGT00940000156139 #26 Amniota ANCESTRAL SPECIES 47 ENSGT00950000183168.B.a #22 ENSGT00390000003312 #23 ENSGT00940000157582 #24 ENSGT00940000155543 #25 ENSGT00940000157669 #32 ENSGT00940000157034 ENSGT00940000161085 ENSGT00940000160992 ENSGT00940000160504 ENSGT00940000167209 ENSGT00940000156761 #30 ENSGT01100000263839 ENSGT00410000025596.a.b #29 ENSGT00390000002144 #28 ENSGT00940000164873 ENSGT00940000162094 #27 Mammalia ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00950000182962.b.a #7 ENSGT00390000018883 #8 ENSGT00940000157554 #9 ENSGT00940000163923 ENSGT00940000160073 #11 ENSGT01000000214440.A.a.b.a #12 ENSGT00940000156115 #13 ENSGT00530000063770.c.a #14 ENSGT00390000010045 #15 ENSGT00950000183182.a.a ENSGT01090000260093.b #16 ENSGT00950000182978.B #17 ENSGT01060000248589.D #18 ENSGT00390000012569.a #20 ENSGT00390000006264 #21 ENSGT00950000183168.B.a #22 ENSGT00390000003312 #23 ENSGT00940000157582 #24 ENSGT00940000155543 #25 ENSGT00940000156139 #26 ENSGT00940000162094 #27 ENSGT00940000164873 ENSGT00390000002144 #28 ENSGT00410000025596.a.b #29 ENSGT01100000263839 ENSGT00940000156761 #30 ENSGT00940000160504 ENSGT00940000160992 ENSGT00940000161085 ENSGT00940000157034 ENSGT00940000153587.b Theria ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT01060000248564.b.a.a.a ENSGT00950000182962.b.a #7 ENSGT00390000018883 #8 ENSGT00940000157554 #9 ENSGT00940000160073 #11 ENSGT01000000214440.A.a.b.a #12 ENSGT00940000156115 #13 ENSGT00530000063770.c.a #14 ENSGT00390000010045 #15 ENSGT00950000183182.a.a ENSGT01090000260093.b #16 ENSGT00950000182978.B #17 ENSGT01060000248589.D #18 ENSGT00390000012569.a #20 ENSGT00390000006264 #21 ENSGT00950000183168.B.a #22 ENSGT00390000003312 #23 ENSGT00940000157582 #24 ENSGT00940000155543 #25 ENSGT00940000156139 #26 ENSGT00940000162094 #27 ENSGT00940000164873 ENSGT00390000002144 #28 ENSGT00410000025596.a.b #29 ENSGT01100000263839 ENSGT00940000156761 #30 ENSGT00940000157669 #32 ENSGT00940000157833 #33 ENSGT00530000063698.b #34 ENSGT00940000156213 #35 ENSGT00940000156592 #36 Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182962.b.a #7 ENSGT00390000018883 #8 ENSGT00940000157554 #9 ENSGT00940000163178 #10 ENSGT00940000160073 #11 ENSGT01000000214440.A.a.b.a #12 ENSGT00940000156115 #13 ENSGT00530000063770.c.a #14 ENSGT00390000010045 #15 ENSGT00950000183182.a.a ENSGT01090000260093.b #16 ENSGT00950000182978.B #17 ENSGT01060000248589.D #18 ENSGT00390000012569.a #20 ENSGT00390000006264 #21 ENSGT00950000183168.B.a #22 ENSGT00390000003312 #23 ENSGT00940000157582 #24 ENSGT00940000155543 #25 ENSGT00940000156139 #26 ENSGT00940000162094 #27 ENSGT00940000164873 ENSGT00390000002144 #28 ENSGT00410000025596.a.b #29 ENSGT01100000263839 ENSGT00940000156761 #30 ENSGT00940000157669 #32 ENSGT00940000157833 #33 ENSGT00530000063698.b #34 ENSGT00940000156213 #35 ENSGT00940000156592 #36 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182962.b.a #7 ENSGT00390000018883 #8 ENSGT00940000157554 #9 ENSGT00940000163178 #10 ENSGT00940000160073 #11 ENSGT01000000214440.A.a.b.a #12 ENSGT00940000156115 #13 ENSGT00530000063770.c.a #14 ENSGT00390000010045 #15 ENSGT00950000183182.a.a ENSGT01090000260093.b #16 ENSGT00950000182978.B #17 ENSGT01060000248589.D #18 ENSGT00390000012569.a #20 ENSGT00390000006264 #21 ENSGT00950000183168.B.a #22 ENSGT00390000003312 #23 ENSGT00940000157582 #24 ENSGT00940000155543 #25 ENSGT00940000156139 #26 ENSGT00940000162094 #27 ENSGT00940000164873 ENSGT00390000002144 #28 ENSGT00410000025596.a.b #29 ENSGT01100000263839 ENSGT00940000156761 #30 ENSGT00940000157669 #32 ENSGT00940000157833 #33 ENSGT00530000063698.b #34 ENSGT00940000156213 #35 ENSGT00940000156592 #36 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182962.b.a #7 ENSGT00390000018883 #8 ENSGT00940000157554 #9 ENSGT00940000163178 #10 ENSGT00940000160073 #11 ENSGT01000000214440.A.a.b.a #12 ENSGT00940000156115 #13 ENSGT00530000063770.c.a #14 ENSGT00390000010045 #15 ENSGT00950000183182.a.a ENSGT01090000260093.b #16 ENSGT00950000182978.B #17 ENSGT01060000248589.D #18 ENSGT00390000012569.a #20 ENSGT00390000006264 #21 ENSGT00950000183168.B.a #22 ENSGT00390000003312 #23 ENSGT00940000157582 #24 ENSGT00940000155543 #25 ENSGT00940000156139 #26 ENSGT00940000162094 #27 ENSGT00940000164873 ENSGT00390000002144 #28 ENSGT00410000025596.a.b #29 ENSGT00940000156761 #30 ENSGT00940000157669 #32 ENSGT00940000157833 #33 ENSGT00530000063698.b #34 ENSGT00940000156213 #35 ENSGT00940000156592 #36 ENSGT00940000157151 #37 Primates ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00950000182962.b.a #7 ENSGT00390000018883 #8 ENSGT00940000157554 #9 ENSGT00940000163178 #10 ENSGT00940000160073 #11 ENSGT01000000214440.A.a.b.a #12 ENSGT00940000156115 #13 ENSGT00530000063770.c.a #14 ENSGT00390000010045 #15 ENSGT00950000183182.a.a ENSGT01090000260093.b #16 ENSGT00950000182978.B #17 ENSGT01060000248589.D #18 ENSGT00390000012569.a #20 ENSGT00390000006264 #21 ENSGT00950000183168.B.a #22 ENSGT00390000003312 #23 ENSGT00940000157582 #24 ENSGT00940000155543 #25 ENSGT00940000156139 #26 ENSGT00940000162094 #27 ENSGT00940000164873 ENSGT00390000002144 #28 ENSGT00410000025596.a.b #29 ENSGT00940000156761 #30 ENSGT00940000157669 #32 ENSGT00940000157833 #33 ENSGT00530000063698.b #34 ENSGT00940000156213 #35 ENSGT00940000156592 #36 ENSGT00940000157151 #37 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00950000182962.b.a #7 ENSGT00390000018883 #8 ENSGT00940000157554 #9 ENSGT00940000163178 #10 ENSGT00940000160073 #11 ENSGT01000000214440.A.a.b.a #12 ENSGT00940000156115 #13 ENSGT00530000063770.c.a #14 ENSGT00390000010045 #15 ENSGT00950000183182.a.a ENSGT01090000260093.b #16 ENSGT00950000182978.B #17 ENSGT01060000248589.D #18 ENSGT00390000012569.a #20 ENSGT00390000006264 #21 ENSGT00950000183168.B.a #22 ENSGT00390000003312 #23 ENSGT00940000157582 #24 ENSGT00940000155543 #25 ENSGT00940000156139 #26 ENSGT00940000162094 #27 ENSGT00390000002144 #28 ENSGT00410000025596.a.b #29 ENSGT00940000156761 #30 ENSGT00940000157669 #32 ENSGT00940000157833 #33 ENSGT00530000063698.b #34 ENSGT00940000156213 #35 ENSGT00940000156592 #36 ENSGT00940000157151 #37 ENSGT00940000159638 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000018883 #8 ENSGT00940000157554 #9 ENSGT00940000163178 #10 ENSGT00940000160073 #11 ENSGT01000000214440.A.a.b.a #12 ENSGT00940000156115 #13 ENSGT00530000063770.c.a #14 ENSGT00390000010045.g.b #15 ENSGT00950000183182.a.a ENSGT01090000260093.b #16 ENSGT00950000182978.B #17 ENSGT01060000248589.D #18 ENSGT00390000012569.a.fb.b.a ##20 ENSGT00390000012569.a.fb.b.b.a #20 ENSGT00390000006264 #21 ENSGT00950000183168.B.a #22 ENSGT00390000003312 #23 ENSGT00940000157582 #24 ENSGT00940000155543 #25 ENSGT00940000156139 #26 ENSGT00940000162094 #27 ENSGT00390000002144 #28 ENSGT00410000025596.a.b #29 ENSGT00940000156761 #30 ENSGT00940000157669 #32 ENSGT00940000157833 #33 ENSGT00530000063698.b #34 ENSGT00940000156213 #35 ENSGT00940000156592 #36 ENSGT00940000157151 #37 ENSGT00940000159638 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000163178 #10 ENSGT00940000160073 #11 ENSGT00390000001447.q ENSGT01000000214440.A.a.b.a #12 ENSGT00940000156115 #13 ENSGT00530000063770.c.a #14 ENSGT00390000010045.g.b #15 ENSGT00950000183182.a.a ENSGT01090000260093.b #16 ENSGT00950000182978.B #17 ENSGT00940000154861.d ENSGT01060000248589.D #18 ENSGT00390000012569.a.fb.b.a ##20 ENSGT00390000012569.a.fb.b.b.a #20 ENSGT00390000006264 #21 ENSGT00950000183168.B.a #22 ENSGT00390000003312 #23 ENSGT00940000157582 #24 ENSGT00940000155543 #25 ENSGT00940000156139 #26 ENSGT00940000162094 #27 ENSGT00390000002144 #28 ENSGT00410000025596.a.b #29 ENSGT00940000156761 #30 ENSGT00940000157669 #32 ENSGT00940000157833 #33 ENSGT00530000063698.b #34 ENSGT00940000156213 #35 ENSGT00940000156592 #36 ENSGT00940000157151 #37 ENSGT00940000159638 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000157554 #9 ENSGT00940000163178 #10 ENSGT00940000160073 #11 ENSGT01000000214440.A.a.b.a #12 ENSGT00940000156115 #13 ENSGT00530000063770.c.a #14 ENSGT00390000010045.g.b #15 ENSGT00950000183182.a.a ENSGT01090000260093.b #16 ENSGT00950000182978.B #17 ENSGT00940000154861.d ENSGT01060000248589.D #18 ENSGT00390000012569.a.fb.b.b.a.b #20 ENSGT00390000012569.a.fb.b.b.a.a ##20 ENSGT00390000006264 #21 ENSGT00950000183168.B.a #22 ENSGT00390000003312 #23 ENSGT00940000157582 #24 ENSGT00940000155543 #25 ENSGT00940000156139 #26 ENSGT00940000162094 #27 ENSGT00390000002144 #28 ENSGT00410000025596.a.b #29 ENSGT00940000156761 #30 ENSGT00940000157669 #32 ENSGT00940000157833 #33 ENSGT00530000063698.b #34 ENSGT00940000156213 #35 ENSGT00940000156592 #36 ENSGT00940000157151 #37 ENSGT00940000159638 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018883 #8 ENSGT00940000157554 #9 ENSGT00940000163178 #10 ENSGT00940000160073 #11 ENSGT01000000214440.A.a.b.a #12 ENSGT00940000156115 #13 ENSGT00530000063770.c.a #14 ENSGT00390000010045.g.b #15 ENSGT00950000183182.a.a ENSGT01090000260093.b #16 ENSGT00950000182978.B #17 ENSGT00940000154861.d ENSGT01060000248589.D #18 ENSGT00390000012569.a.fb.b.b.a.a ##20 ENSGT00390000006264.j ##21 ENSGT00950000183168.B.a #22 ENSGT00390000003312 #23 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ENSGT00940000157669 #32 ENSGT00940000157833 #33 ENSGT00530000063698.b #34 ENSGT00940000156213 #35 ENSGT00940000156592 #36 ENSGT00940000157151 #37 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018883 #8 ENSGT00940000157554 #9 ENSGT00940000163178 #10 ENSGT00940000160073 #11 ENSGT01000000214440.A.a.b.a #12 ENSGT00940000156115 #13 ENSGT00530000063770.c.a #14 ENSGT00390000010045.g.b #15 ENSGT00950000183182.a.a ENSGT01090000260093.b #16 ENSGT00950000182978.B #17 ENSGT00940000154861.d ENSGT01060000248589.D #18 ENSGT00390000012569.a.fb.b.b.a.a ##20 ENSGT00390000006264.i.a ##21 ENSGT00950000183168.B.a #22 ENSGT00390000003312 #23 ENSGT00940000157582 #24 ENSGT00940000155543 #25 ENSGT00940000156139 #26 ENSGT00390000018898.`b.b ENSGT00940000162094 #27 ENSGT00390000002144 #28 ENSGT00410000025596.a.b #29 ENSGT00940000156761 #30 ENSGT00940000157669 #32 ENSGT00390000010721.a.a.b ENSGT00940000157833 #33 ENSGT00530000063698.b #34 ENSGT00940000156213 #35 ENSGT00940000156592 #36 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES 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ENSGT00950000182978.B #17 ENSGT01060000248589.D #18 ENSGT00390000012569.a.`b #20 ENSGT00390000006264 #21 ENSGT00950000183168.B.a #22 ENSGT00390000003312 #23 ENSGT00940000157582 #24 ENSGT00940000155543 #25 ENSGT00940000156139 #26 ENSGT00940000162094 #27 ENSGT00940000164873 ENSGT00390000002144 #28 ENSGT00410000025596.a.b #29 ENSGT00940000156761 #30 ENSGT00940000157669 #32 ENSGT00940000157833 #33 ENSGT00530000063698.b #34 ENSGT00940000156213 #35 ENSGT00940000156592 #36 ENSGT00940000157151 #37 Coquerels sifaka MODERN SPECIES 344 CD164L2 (ENSPCOG00000008888) GPR3 (ENSPCOG00000007979) WASF2 (ENSPCOG00000018308) #7 AHDC1 (ENSPCOG00000012355) #8 FGR (ENSPCOG00000021101) #9 IFI6 (ENSPCOG00000019541) #10 FAM76A (ENSPCOG00000017956) #11 STX12 (ENSPCOG00000014712) #12 PPP1R8 (ENSPCOG00000013455) #13 THEMIS2 (ENSPCOG00000002667) #14 RPA2 (ENSPCOG00000023673) #15 SMPDL3B (ENSPCOG00000026165) XKR8 (ENSPCOG00000009916) #16 EYA3 (ENSPCOG00000009524) #17 ATP5IF1 (ENSPCOG00000028473) #21 SESN2 (ENSPCOG00000023322) #22 MED18 (ENSPCOG00000022541) #23 PHACTR4 (ENSPCOG00000015433) #24 RCC1 (ENSPCOG00000015509) #25 ENSPCOG00000027712 #26 RAB42 (ENSPCOG00000008605) #27 TAF12 (ENSPCOG00000017974) #28 GMEB1 (ENSPCOG00000028438) #29 YTHDF2 (ENSPCOG00000010131) #30 ENSPCOG00000020601 OPRD1 (ENSPCOG00000018592) #32 EPB41 (ENSPCOG00000021118) #33 SRSF4 (ENSPCOG00000027341) #35 MECR (ENSPCOG00000018330) #36 PTPRU (ENSPCOG00000025974) #37 Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 122 SMPDL3B (ENSPSMG00000010811) XKR8 (ENSPSMG00000010782) #16 EYA3 (ENSPSMG00000010772) #17 PTAFR (ENSPSMG00000010713) #18 DNAJC8 (ENSPSMG00000010707) #20 ATP5IF1 (ENSPSMG00000010696) #21 SESN2 (ENSPSMG00000010685) #22 MED18 (ENSPSMG00000010662) #23 PHACTR4 (ENSPSMG00000010641) #24 RCC1 (ENSPSMG00000010510) #25 TRNAU1AP (ENSPSMG00000010448) #26 RAB42 (ENSPSMG00000010409) #27 ENSPSMG00000010403 TAF12 (ENSPSMG00000010398) #28 GMEB1 (ENSPSMG00000010381) #29 ENSPSMG00000010343 YTHDF2 (ENSPSMG00000010340) #30 OPRD1 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ENSGT00940000162094 #27 ENSGT00390000002144 #28 ENSGT00410000025596.a.b #29 ENSGT00940000156761 #30 ENSGT00940000157669 #32 ENSGT00940000157833 #33 ENSGT00530000063698.b #34 ENSGT00940000156213 #35 ENSGT00940000156592 #36 ENSGT00940000157151 #37 ENSGT00940000159638 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00530000063929.a.b ENSGT01060000248564.b.a.a.a ENSGT00950000182962.b.a #7 ENSGT00390000018883 #8 ENSGT00940000157554 #9 ENSGT00940000160073 #11 ENSGT00940000156115 #13 ENSGT00530000063770.c.a #14 ENSGT00390000010045 #15 ENSGT00950000183182.a.a ENSGT01090000260093.b #16 ENSGT00950000182978.B #17 ENSGT01060000248589.D #18 ENSGT00940000164617 ENSGT00390000006264 #21 ENSGT00950000183168.B.a #22 ENSGT00940000157582 #24 ENSGT00940000155543 #25 ENSGT00940000156139 #26 ENSGT00940000162094 #27 ENSGT00390000002144 #28 ENSGT00410000025596.a.b #29 ENSGT00940000156761 #30 ENSGT00940000157669 #32 ENSGT00940000157833 #33 ENSGT00530000063698.b #34 ENSGT00940000156213 #35 ENSGT00940000156592 #36 ENSGT00940000157151 #37 ENSGT00940000159638 ENSGT00940000153446.a.b Rabbit MODERN SPECIES 4 WDTC1 (ENSOCUG00000016358) TMEM222 (ENSOCUG00000007371) SYTL1 (ENSOCUG00000002371) MAP3K6 (ENSOCUG00000002379) ENSOCUG00000007587 GPR3 (ENSOCUG00000027272) WASF2 (ENSOCUG00000002394) #7 AHDC1 (ENSOCUG00000008914) #8 FGR (ENSOCUG00000008922) #9 FAM76A (ENSOCUG00000014830) #11 PPP1R8 (ENSOCUG00000013594) #13 SMPDL3B (ENSOCUG00000012589) EYA3 (ENSOCUG00000008020) #17 PTAFR (ENSOCUG00000017831) #18 ENSOCUG00000017932 #21 SESN2 (ENSOCUG00000014896) #22 PHACTR4 (ENSOCUG00000027528) #24 ENSOCUG00000002346 #25 ENSOCUG00000002353 RAB42 (ENSOCUG00000003933) #27 TAF12 (ENSOCUG00000003935) #28 GMEB1 (ENSOCUG00000010893) #29 YTHDF2 (ENSOCUG00000010612) #30 OPRD1 (ENSOCUG00000001033) #32 ENSOCUG00000030120 EPB41 (ENSOCUG00000006641) #33 TMEM200B (ENSOCUG00000025757) #34 SRSF4 (ENSOCUG00000001837) #35 MECR (ENSOCUG00000012645) #36 PTPRU (ENSOCUG00000012661) #37 MATN1 (ENSOCUG00000008153) Pika MODERN SPECIES 4774 ENSOPRG00000018644 ENSOPRG00000019026 ENSOPRG00000012637 ENSOPRG00000012651 ATP5IF1 (ENSOPRG00000012668) #21 SESN2 (ENSOPRG00000012678) #22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT01060000248564.b.a.a.a ENSGT00950000182962.b.a #7 ENSGT00390000018883 #8 ENSGT00940000157554 #9 ENSGT00940000160073 #11 ENSGT01000000214440.A.a.b.a #12 ENSGT00940000156115 #13 ENSGT00530000063770.c.a #14 ENSGT00390000010045 #15 ENSGT00950000183182.a.a ENSGT01090000260093.b #16 ENSGT00950000182978.B #17 ENSGT01060000248589.D #18 ENSGT00390000012569.a #20 ENSGT00390000006264 #21 ENSGT00950000183168.B.a #22 ENSGT00390000003312 #23 ENSGT00940000157582 #24 ENSGT00940000155543 #25 ENSGT00940000156139 #26 ENSGT00940000162094 #27 ENSGT00390000002144 #28 ENSGT00410000025596.a.b #29 ENSGT00940000156761 #30 ENSGT00940000157669 #32 ENSGT00940000157833 #33 ENSGT00530000063698.b #34 ENSGT00940000156213 #35 ENSGT00940000156592 #36 ENSGT00940000157151 #37 ENSGT00940000159638 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES 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#28 ENSGT00410000025596.a.b #29 ENSGT00940000156761 #30 ENSGT00940000157669 #32 ENSGT00860000135912 ENSGT00940000157833 #33 ENSGT00530000063698.b #34 ENSGT00940000156213 #35 ENSGT00940000156592 #36 ENSGT00940000157151 #37 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00530000063929.a.b ENSGT01060000248564.b.a.a.a ENSGT00950000182962.b.a #7 ENSGT00390000018883 #8 ENSGT00940000157554 #9 ENSGT00940000160073 #11 ENSGT01000000214440.A.a.b.a #12 ENSGT00940000156115 #13 ENSGT00530000063770.c.a #14 ENSGT00390000010045 #15 ENSGT00950000183182.a.a ENSGT01090000260093.b #16 ENSGT00950000182978.B #17 ENSGT01060000248589.D #18 ENSGT00940000164617 ENSGT00950000183168.B.a #22 ENSGT00390000003312 #23 ENSGT00940000157582 #24 ENSGT00940000155543 #25 ENSGT00940000156139 #26 ENSGT00940000162094 #27 ENSGT00390000002144 #28 ENSGT00410000025596.a.b #29 ENSGT00940000156761 #30 ENSGT00940000157669 #32 ENSGT00860000135912 ENSGT00940000157833 #33 ENSGT00530000063698.b #34 ENSGT00940000156213 #35 ENSGT00940000156592 #36 ENSGT00940000157151 #37 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT01060000248564.b.a.a.a ENSGT00950000182962.b.a #7 ENSGT00390000018883 #8 ENSGT00940000157554 #9 ENSGT00940000160073 #11 ENSGT01000000214440.A.a.b.a #12 ENSGT00940000156115 #13 ENSGT00530000063770.c.a #14 ENSGT00390000010045 #15 ENSGT00950000183182.a.a ENSGT01090000260093.b #16 ENSGT00950000182978.B #17 ENSGT01060000248589.D #18 ENSGT00390000012569.a #20 ENSGT00390000006264 #21 ENSGT00950000183168.B.a #22 ENSGT00390000003312 #23 ENSGT00940000157582 #24 ENSGT00940000155543 #25 ENSGT00940000156139 #26 ENSGT00940000162094 #27 ENSGT00390000002144 #28 ENSGT00410000025596.a.b #29 ENSGT00940000156761 #30 ENSGT00940000157669 #32 ENSGT00860000135912 ENSGT00940000157833 #33 ENSGT00530000063698.b #34 ENSGT00940000156213 #35 ENSGT00940000156592 #36 ENSGT00940000157151 #37 Golden Hamster MODERN SPECIES 709 ENSMAUG00000011191 Gpr3 (ENSMAUG00000014246) Wasf2 (ENSMAUG00000012124) #7 Ahdc1 (ENSMAUG00000013108) #8 Fgr (ENSMAUG00000006765) #9 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ENSGT00940000160073 #11 ENSGT01000000214440.A.a.b.a #12 ENSGT00940000156115 #13 ENSGT00530000063770.c.a #14 ENSGT00390000010045 #15 ENSGT00950000183182.a.a ENSGT01090000260093.b #16 ENSGT00950000182978.B #17 ENSGT01060000248589.D #18 ENSGT00390000012569.a #20 ENSGT00390000006264 #21 ENSGT00950000183168.B.a #22 ENSGT00390000003312 #23 ENSGT00940000157582 #24 ENSGT00940000155543 #25 ENSGT00940000156139 #26 ENSGT00940000162094 #27 ENSGT00390000002144 #28 ENSGT00410000025596.a.b #29 ENSGT00940000156761.j #30 ENSGT00940000157669 #32 ENSGT00940000157833 #33 ENSGT00530000063698.b #34 ENSGT00940000156213 #35 ENSGT00940000156592 #36 ENSGT00940000157151 #37 ENSGT00940000159638 Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 159 GPR3 (ENSCLAG00000012893) WASF2 (ENSCLAG00000013958) #7 AHDC1 (ENSCLAG00000013754) #8 FGR (ENSCLAG00000014147) #9 FAM76A (ENSCLAG00000008844) #11 STX12 (ENSCLAG00000013795) #12 PPP1R8 (ENSCLAG00000011211) #13 THEMIS2 (ENSCLAG00000012140) #14 RPA2 (ENSCLAG00000010772) #15 SMPDL3B 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peccary MODERN SPECIES 808 GPR3 (ENSCWAG00000010389) WASF2 (ENSCWAG00000010410) #7 FGR (ENSCWAG00000010497) #9 IFI6 (ENSCWAG00000010588) #10 FAM76A (ENSCWAG00000010629) #11 STX12 (ENSCWAG00000010733) #12 PPP1R8 (ENSCWAG00000010777) #13 ENSCWAG00000010859 #14 RPA2 (ENSCWAG00000010943) #15 SMPDL3B (ENSCWAG00000011003) XKR8 (ENSCWAG00000011141) #16 EYA3 (ENSCWAG00000011224) #17 PTAFR (ENSCWAG00000011585) #18 DNAJC8 (ENSCWAG00000011604) #20 ATP5IF1 (ENSCWAG00000011697) #21 SESN2 (ENSCWAG00000011757) #22 MED18 (ENSCWAG00000011863) #23 PHACTR4 (ENSCWAG00000011905) #24 RCC1 (ENSCWAG00000012023) #25 TRNAU1AP (ENSCWAG00000012117) #26 RAB42 (ENSCWAG00000006902) #27 TAF12 (ENSCWAG00000006921) #28 GMEB1 (ENSCWAG00000006958) #29 YTHDF2 (ENSCWAG00000007018) #30 OPRD1 (ENSCWAG00000007029) #32 EPB41 (ENSCWAG00000007295) #33 TMEM200B (ENSCWAG00000015967) #34 SRSF4 (ENSCWAG00000015977) #35 MECR (ENSCWAG00000016005) #36 PTPRU (ENSCWAG00000016058) #37 MATN1 (ENSCWAG00000016130) Pig MODERN SPECIES 14 WASF2 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ENSGT00940000157669 #32 ENSGT00940000157833 #33 ENSGT00530000063698.b #34 ENSGT00940000156213 #35 ENSGT00940000156592 #36 ENSGT00940000157151 #37 ENSGT00940000159638 Siberian musk deer MODERN SPECIES 354 IFI6 (ENSMMSG00000018977) #10 ENSMMSG00000018954 FAM76A (ENSMMSG00000018778) #11 STX12 (ENSMMSG00000018678) #12 PPP1R8 (ENSMMSG00000018605) #13 ENSMMSG00000018593 #14 ENSMMSG00000018576 #14 RPA2 (ENSMMSG00000018523) #15 SMPDL3B (ENSMMSG00000018430) XKR8 (ENSMMSG00000018399) #16 ENSMMSG00000018375 EYA3 (ENSMMSG00000018084) #17 PTAFR (ENSMMSG00000018035) #18 DNAJC8 (ENSMMSG00000018002) #20 ENSMMSG00000017950 #21 SESN2 (ENSMMSG00000017873) #22 ENSMMSG00000017822 MED18 (ENSMMSG00000017791) #23 ENSMMSG00000017764 Bovidae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00950000182962.b.a #7 ENSGT00390000018883 #8 ENSGT00940000157554 #9 ENSGT00940000163178 #10 ENSGT00940000160073 #11 ENSGT01000000214440.A.a.b.a #12 ENSGT00940000156115 #13 ENSGT00530000063770.c.a #14 ENSGT00390000010045.k #15 ENSGT00950000183182.a.a 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ENSGT00940000157582 #24 ENSGT00940000155543 #25 ENSGT00940000156139 #26 ENSGT00940000162094 #27 ENSGT00390000002144 #28 ENSGT00410000025596.a.b #29 ENSGT00940000156761 #30 ENSGT00940000157669 #32 ENSGT00940000157833 #33 ENSGT00530000063698.b #34 ENSGT00940000156213 #35 ENSGT00940000156592 #36 ENSGT00940000157151 #37 ENSGT00940000159638 Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 11 WASF2 (ENSOARG00020021160) #7 AHDC1 (ENSOARG00020021138) #8 FGR (ENSOARG00020021091) #9 IFI6 (ENSOARG00020021024) #10 FAM76A (ENSOARG00020020517) #11 STX12 (ENSOARG00020020460) #12 PPP1R8 (ENSOARG00020020388) #13 THEMIS2 (ENSOARG00020020351) #14 RPA2 (ENSOARG00020020276) #15 SMPDL3B (ENSOARG00020020126) XKR8 (ENSOARG00020020079) #16 EYA3 (ENSOARG00020019284) #17 ENSOARG00020019236 DNAJC8 (ENSOARG00020019115) #20 ATP5IF1 (ENSOARG00020019017) #21 SESN2 (ENSOARG00020018898) #22 MED18 (ENSOARG00020018864) #23 PHACTR4 (ENSOARG00020018486) #24 RCC1 (ENSOARG00020018293) #25 TRNAU1AP (ENSOARG00020018238) #26 RAB42 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ENSGT00530000063698.b #34 ENSGT00940000156213 #35 ENSGT00940000156592 #36 ENSGT00940000157151 #37 Bos ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00950000182962.b.a #7 ENSGT00390000018883 #8 ENSGT00940000157554 #9 ENSGT00940000163178 #10 ENSGT00940000160073 #11 ENSGT01000000214440.A.a.b.a #12 ENSGT00940000156115 #13 ENSGT00530000063770.c.a #14 ENSGT00390000010045.k.b #15 ENSGT00950000183182.a.a ENSGT01090000260093.b #16 ENSGT00950000182978.B #17 ENSGT01060000248589.D #18 ENSGT00390000012569.a #20 ENSGT00390000006264.c #21 ENSGT00950000183168.B.a #22 ENSGT00390000003312 #23 ENSGT00390000015797.d.r.b.b ENSGT00390000006707.r.h ENSGT00940000157582 #24 ENSGT00940000155543 #25 ENSGT00940000156139 #26 ENSGT00940000162094 #27 ENSGT00390000002144.j #28 ENSGT00410000025596.a.b #29 ENSGT00940000156761 #30 ENSGT00940000157669 #32 ENSGT00940000157833 #33 ENSGT00530000063698.b #34 ENSGT00940000156213 #35 ENSGT00940000156592 #36 Bos_b ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00950000182962.b.a #7 ENSGT00390000018883 #8 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#16 ENSGT00950000182978.B #17 ENSGT01060000248589.D #18 ENSGT00390000012569.a #20 ENSGT00390000006264 #21 ENSGT00950000183168.B.a #22 ENSGT00390000003312 #23 ENSGT00940000157582 #24 ENSGT00940000155543 #25 ENSGT00940000156139 #26 ENSGT00940000162094 #27 ENSGT00390000002144 #28 ENSGT00410000025596.a.b #29 ENSGT00940000156761 #30 ENSGT00940000157669 #32 ENSGT00940000157833 #33 ENSGT00530000063698.b #34 ENSGT00940000156213 #35 ENSGT00940000156592 #36 ENSGT00940000157151 #37 ENSGT00940000159638 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00950000182962.b.a #7 ENSGT00390000018883 #8 ENSGT00940000157554 #9 ENSGT00940000163178 #10 ENSGT00940000160073 #11 ENSGT01000000214440.A.a.b.a #12 ENSGT00940000156115 #13 ENSGT00530000063770.c.a #14 ENSGT00390000010045 #15 ENSGT00950000183182.a.a ENSGT01090000260093.b #16 ENSGT00950000182978.B #17 ENSGT01060000248589.D #18 ENSGT00390000012569.a #20 ENSGT00390000006264 #21 ENSGT00950000183168.B.a #22 ENSGT00390000003312 #23 ENSGT00940000157582 #24 ENSGT00940000155543 #25 ENSGT00940000156139 #26 ENSGT00940000162094 #27 ENSGT00390000002144 #28 ENSGT00410000025596.a.b #29 ENSGT00940000156761 #30 ENSGT00940000157669 #32 ENSGT00940000157833 #33 ENSGT00530000063698.b #34 ENSGT00940000156213 #35 ENSGT00940000156592 #36 ENSGT00940000157151 #37 ENSGT00940000159638 Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 27 FGR (ENSRFEG00010006173) #9 IFI6 (ENSRFEG00010006222) #10 FAM76A (ENSRFEG00010006284) #11 STX12 (ENSRFEG00010006392) #12 PPP1R8 (ENSRFEG00010006439) #13 THEMIS2 (ENSRFEG00010006552) #14 RPA2 (ENSRFEG00010006599) #15 SMPDL3B (ENSRFEG00010006653) XKR8 (ENSRFEG00010006721) #16 EYA3 (ENSRFEG00010006785) #17 ENSRFEG00010006954 ENSRFEG00010006978 PTAFR (ENSRFEG00010007010) #18 DNAJC8 (ENSRFEG00010007033) #20 ATP5IF1 (ENSRFEG00010007102) #21 SESN2 (ENSRFEG00010007186) #22 MED18 (ENSRFEG00010007232) #23 PHACTR4 (ENSRFEG00010007281) #24 RCC1 (ENSRFEG00010007341) #25 TRNAU1AP (ENSRFEG00010007390) #26 RAB42 (ENSRFEG00010007467) #27 TAF12 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ENSGT00940000157582 #24 ENSGT00940000155543 #25 ENSGT00940000156139 #26 ENSGT00940000162094 #27 ENSGT00390000002144 #28 ENSGT00410000025596.a.b #29 ENSGT00940000156761 #30 ENSGT00940000157669 #32 ENSGT00940000157833 #33 ENSGT00530000063698.b #34 ENSGT00940000156213 #35 ENSGT00940000156592 #36 Armadillo MODERN SPECIES 1291 AHDC1 (ENSDNOG00000038844) #8 FGR (ENSDNOG00000014797) #9 ENSDNOG00000034433 FAM76A (ENSDNOG00000049213) #11 STX12 (ENSDNOG00000049359) #12 PPP1R8 (ENSDNOG00000033057) #13 THEMIS2 (ENSDNOG00000013968) #14 RPA2 (ENSDNOG00000023660) #15 SMPDL3B (ENSDNOG00000032579) XKR8 (ENSDNOG00000032960) #16 EYA3 (ENSDNOG00000044648) #17 PTAFR (ENSDNOG00000044017) #18 ENSDNOG00000042785 #20 ENSDNOG00000045464 #21 ENSDNOG00000038753 SESN2 (ENSDNOG00000017933) #22 MED18 (ENSDNOG00000012531) #23 ENSDNOG00000035347 PHACTR4 (ENSDNOG00000003784) #24 RCC1 (ENSDNOG00000042718) #25 ENSDNOG00000033009 #26 RAB42 (ENSDNOG00000010079) #27 TAF12 (ENSDNOG00000045864) #28 GMEB1 (ENSDNOG00000025258) #29 YTHDF2 (ENSDNOG00000033903) #30 OPRD1 (ENSDNOG00000046525) #32 EPB41 (ENSDNOG00000019472) #33 TMEM200B (ENSDNOG00000035804) #34 SRSF4 (ENSDNOG00000047961) #35 MECR (ENSDNOG00000048252) #36 Sloth MODERN SPECIES 2395 ENSCHOG00000004692 #22 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00950000182962.b.a #7 ENSGT00390000018883 #8 ENSGT00940000157554 #9 ENSGT00940000163178 #10 ENSGT00940000160073 #11 ENSGT01000000214440.A.a.b.a #12 ENSGT00940000156115 #13 ENSGT00530000063770.c.a #14 ENSGT00390000010045 #15 ENSGT00950000183182.a.a ENSGT01090000260093.b #16 ENSGT00950000182978.B #17 ENSGT01060000248589.D #18 ENSGT00390000012569.a #20 ENSGT00390000006264 #21 ENSGT00950000183168.B.a #22 ENSGT00390000003312 #23 ENSGT00940000157582 #24 ENSGT00940000155543 #25 ENSGT00940000156139 #26 ENSGT00390000002144 #28 ENSGT00410000025596.a.b #29 ENSGT00940000156761 #30 ENSGT00940000157669 #32 ENSGT00940000157833 #33 ENSGT00530000063698.b #34 ENSGT00940000156213 #35 ENSGT00940000156592 #36 ENSGT00940000157151 #37 ENSGT00940000159638 ENSGT00940000153446.a.b Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00950000182962.b.a #7 ENSGT00390000018883 #8 ENSGT00940000157554 #9 ENSGT00940000163178 #10 ENSGT00940000160073 #11 ENSGT01000000214440.A.a.b.a #12 ENSGT00940000156115 #13 ENSGT00530000063770.c.a #14 ENSGT00390000010045 #15 ENSGT00950000183182.a.a ENSGT01090000260093.b #16 ENSGT00950000182978.B #17 ENSGT01060000248589.D #18 ENSGT00390000012569.a #20 ENSGT00390000006264 #21 ENSGT00950000183168.B.a #22 ENSGT00390000003312 #23 ENSGT00940000157582 #24 ENSGT00940000155543 #25 ENSGT00940000156139 #26 ENSGT00390000002144 #28 ENSGT00410000025596.a.b #29 ENSGT00940000156761 #30 ENSGT00940000157669 #32 ENSGT00940000157833 #33 ENSGT00530000063698.b #34 ENSGT00940000156213 #35 ENSGT00940000156592 #36 ENSGT00940000157151 #37 ENSGT00940000159638 ENSGT00940000153446.a.b Elephant MODERN SPECIES 332 AHDC1 (ENSLAFG00000030861) #8 FGR (ENSLAFG00000011018) #9 ENSLAFG00000022930 #10 ENSLAFG00000023210 #10 FAM76A (ENSLAFG00000017824) #11 STX12 (ENSLAFG00000017828) #12 PPP1R8 (ENSLAFG00000017834) #13 THEMIS2 (ENSLAFG00000009492) #14 RPA2 (ENSLAFG00000014387) #15 SMPDL3B (ENSLAFG00000008605) XKR8 (ENSLAFG00000008610) #16 EYA3 (ENSLAFG00000008613) #17 PTAFR (ENSLAFG00000007791) #18 DNAJC8 (ENSLAFG00000005695) #20 ATP5IF1 (ENSLAFG00000005700) #21 SESN2 (ENSLAFG00000013698) #22 MED18 (ENSLAFG00000012511) #23 PHACTR4 (ENSLAFG00000007617) #24 RCC1 (ENSLAFG00000007626) #25 TRNAU1AP (ENSLAFG00000007628) #26 TAF12 (ENSLAFG00000014103) #28 GMEB1 (ENSLAFG00000011849) #29 YTHDF2 (ENSLAFG00000030451) #30 OPRD1 (ENSLAFG00000017219) #32 EPB41 (ENSLAFG00000002571) #33 TMEM200B (ENSLAFG00000031258) #34 SRSF4 (ENSLAFG00000002575) #35 MECR (ENSLAFG00000002576) #36 PTPRU (ENSLAFG00000010090) #37 ENSLAFG00000032386 MATN1 (ENSLAFG00000012878) Hyrax MODERN SPECIES 2196 SESN2 (ENSPCAG00000005588) #22 Marsupialia ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT01060000248564.b.a.a.a ENSGT00950000182962.b.a #7 ENSGT00390000018883 #8 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ENSGT00940000157582 #24 ENSGT00940000155543 #25 ENSGT00940000156139 #26 ENSGT00940000162094 #27 ENSGT00940000164873 ENSGT00390000002144 #28 ENSGT00410000025596.a.b #29 ENSGT00940000156761 #30 ENSGT00940000157669 #32 ENSGT00940000157833 #33 ENSGT00530000063698.b #34 ENSGT00940000156213 #35 ENSGT00940000156592 #36 ENSGT00940000157151 #37 Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT01060000248564.b.a.a.a ENSGT00950000182962.b.a #7 ENSGT00390000018883 #8 ENSGT00940000157554 #9 ENSGT00940000160073 #11 ENSGT01000000214440.A.a.b.a #12 ENSGT00940000156115 #13 ENSGT00530000063770.c.a #14 ENSGT00390000010045 #15 ENSGT00950000183182.a.a ENSGT01090000260093.b #16 ENSGT00950000182978.B #17 ENSGT01060000248589.D #18 ENSGT00390000012569.a #20 ENSGT00390000006264 #21 ENSGT00950000183168.B.a #22 ENSGT00390000003312 #23 ENSGT00940000158516.d ENSGT00940000157582 #24 ENSGT00940000155543 #25 ENSGT00940000156139 #26 ENSGT00940000162094 #27 ENSGT00940000164873 ENSGT00390000002144 #28 ENSGT00410000025596.a.b #29 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Laterata ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000156338 ENSGT00950000182900.B ENSGT00390000007371 ENSGT00940000154868.a.b ENSGT00940000160932 ENSGT00940000159398 ENSGT00940000157531 ENSGT00530000063929.a.b ENSGT01060000248564.b.a.a.a ENSGT00950000182962.b.a #7 ENSGT00390000018883 #8 ENSGT00940000163923.f ENSGT00940000163923.e ENSGT00940000163282.k.a ENSGT00940000160073 #11 ENSGT00950000183168.B.a #22 ENSGT00390000003312 #23 ENSGT00940000157582 #24 ENSGT00940000155543 #25 ENSGT00940000157669 #32 ENSGT00940000157034 ENSGT00940000161085 ENSGT00940000160992.b ENSGT00940000161879 ENSGT00940000160504 ENSGT00940000167209 ENSGT00940000156761 #30 ENSGT00410000025596.a.b #29 ENSGT00390000002144 #28 ENSGT00940000164873 ENSGT00940000162094 #27 Common wall lizard MODERN SPECIES 16 RCC1 (ENSPMRG00000008955) #25 ENSPMRG00000008962 SYTL1 (ENSPMRG00000008979) MAP3K6 (ENSPMRG00000008995) ENSPMRG00000009031 CD164L2 (ENSPMRG00000009039) GPR3 (ENSPMRG00000009045) WASF2 (ENSPMRG00000009056) #7 AHDC1 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MED18 (ENSSMRG00000002592) #23 PHACTR4 (ENSSMRG00000002722) #24 RCC1 (ENSSMRG00000002729) #25 OPRD1 (ENSSMRG00000002731) #32 ENSSMRG00000002734 ENSSMRG00000002735 ASAP3 (ENSSMRG00000002736) E2F2 (ENSSMRG00000002739) ENSSMRG00000002742 ID3 (ENSSMRG00000002801) ENSSMRG00000002803 YTHDF2 (ENSSMRG00000002820) #30 GMEB1 (ENSSMRG00000002821) #29 ENSSMRG00000002828 TAF12 (ENSSMRG00000002837) #28 tuatara MODERN SPECIES 531 SLC9A1 (ENSSPUG00000017949) WDTC1 (ENSSPUG00000017937) TMEM222 (ENSSPUG00000017932) SYTL1 (ENSSPUG00000017914) MAP3K6 (ENSSPUG00000017886) ENSSPUG00000017873 GPR3 (ENSSPUG00000017868) WASF2 (ENSSPUG00000017858) #7 AHDC1 (ENSSPUG00000017825) #8 FGR (ENSSPUG00000017811) #9 ENSSPUG00000017804 ENSSPUG00000017797 ENSSPUG00000017780 ENSSPUG00000017771 FAM76A (ENSSPUG00000017760) #11 SESN2 (ENSSPUG00000017749) #22 ENSSPUG00000017740 Anura ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183168.B.a #22 Leishan spiny toad MODERN SPECIES 5 GPATCH3 (ENSLLEG00000000641) NUDC (ENSLLEG00000000702) 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ENSGT00390000000916 ENSGT01030000234543.F Large yellow croaker MODERN SPECIES 484 fbxl2 (ENSLCRG00005015042) clasp2 (ENSLCRG00005011275) ubp1 (ENSLCRG00005010163) pdcd6ip (ENSLCRG00005010076) ENSLCRG00005010047 cyhr1 (ENSLCRG00005010045) ENSLCRG00005009725 fabp3 (ENSLCRG00005009677) zcchc17 (ENSLCRG00005009638) snrnp40 (ENSLCRG00005009485) nkain1 (ENSLCRG00005009472) pum1 (ENSLCRG00005008849) SDC3 (ENSLCRG00005008773) ENSLCRG00005008754 matn1 (ENSLCRG00005008752) sesn2 (ENSLCRG00005008731) #22 yrk (ENSLCRG00005007845) #9 ENSLCRG00005007783 ENSLCRG00005007780 wasf2 (ENSLCRG00005007773) #7 gpr3 (ENSLCRG00005007770) sytl1 (ENSLCRG00005007769) efcab1 (ENSLCRG00005007765) rbm48 (ENSLCRG00005007757) pex1 (ENSLCRG00005006972) elmo1 (ENSLCRG00005005097) rp9 (ENSLCRG00005004959) si:dkey-184p18.2 (ENSLCRG00005004946) poc1bl (ENSLCRG00005004871) ENSLCRG00005004712 gabbr2 (ENSLCRG00005004514) Gilthead seabream MODERN SPECIES 17 fbxl2 (ENSSAUG00010000374) clasp2 (ENSSAUG00010000585) ubp1 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minnow MODERN SPECIES 183 ENSCVAG00000007654 fbxl2 (ENSCVAG00000007633) clasp2 (ENSCVAG00000007610) ubp1 (ENSCVAG00000000202) pdcd6ip (ENSCVAG00000007264) ENSCVAG00000007202 cyhr1 (ENSCVAG00000007158) ENSCVAG00000007135 fabp3 (ENSCVAG00000007119) zcchc17 (ENSCVAG00000007112) snrnp40 (ENSCVAG00000007097) nkain1 (ENSCVAG00000007059) pum1 (ENSCVAG00000007043) SDC3 (ENSCVAG00000006999) matn1 (ENSCVAG00000006992) sesn2 (ENSCVAG00000006945) #22 yrk (ENSCVAG00000006923) #9 AHDC1 (ENSCVAG00000006908) #8 ENSCVAG00000006898 wasf2 (ENSCVAG00000006891) #7 gpr3 (ENSCVAG00000006879) sytl1 (ENSCVAG00000006868) efcab1 (ENSCVAG00000006841) rbm48 (ENSCVAG00000006833) pex1 (ENSCVAG00000006823) elmo1 (ENSCVAG00000006800) rp9 (ENSCVAG00000006669) si:dkey-184p18.2 (ENSCVAG00000006632) poc1bl (ENSCVAG00000006624) GALNT12 (ENSCVAG00000006598) gabbr2 (ENSCVAG00000006566) Mummichog MODERN SPECIES 270 clasp2 (ENSFHEG00000009148) ubp1 (ENSFHEG00000008116) pdcd6ip (ENSFHEG00000007980) ENSFHEG00000007936 cyhr1 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Mexicana tetra MODERN SPECIES 15 ubp1 (ENSAMXG00000020575) pdcd6ip (ENSAMXG00000020580) ENSAMXG00000020587 cyhr1 (ENSAMXG00000020589) ENSAMXG00000032506 ENSAMXG00000036806 fabp3 (ENSAMXG00000042510) zcchc17 (ENSAMXG00000020595) snrnp40 (ENSAMXG00000020599) nkain1 (ENSAMXG00000042549) pum1 (ENSAMXG00000020607) SDC3 (ENSAMXG00000020610) ENSAMXG00000037645 ENSAMXG00000037364 matn1 (ENSAMXG00000020612) sesn2 (ENSAMXG00000020616) #22 yrk (ENSAMXG00000020619) #9 AHDC1 (ENSAMXG00000025287) #8 wasf2 (ENSAMXG00000020622) #7 gpr3 (ENSAMXG00000036140) ENSAMXG00000020624 si:ch211-199g17.9 (ENSAMXG00000041603) fam83hb (ENSAMXG00000020626) KIAA0319L (ENSAMXG00000020627) cap1 (ENSAMXG00000020631) ppt1 (ENSAMXG00000036664) ENSAMXG00000020643 ENSAMXG00000029743 ENSAMXG00000020663 rpl11 (ENSAMXG00000034710) ENSAMXG00000030505 Electric eel MODERN SPECIES 637 zcchc17 (ENSEEEG00000018644) snrnp40 (ENSEEEG00000018626) nkain1 (ENSEEEG00000018617) pum1 (ENSEEEG00000018183) SDC3 (ENSEEEG00000018180) 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ENSCMIG00000016311 PTAFR (ENSCMIG00000016313) #18 dnajc8 (ENSCMIG00000016318) #20 atp5if1b (ENSCMIG00000016328) rpl13a (ENSCMIG00000016337) Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES 148 ENSGT00950000182962.b.b ##7 ENSGT01060000248564.b.a.a.b ENSGT00550000074943 ENSGT00740000115564 ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ##22 ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000157554 #9 ENSGT00390000018883 #8 ENSGT00390000002881 ENSGT00530000063583.b ENSGT00950000182962.b.b ##7 ENSGT01060000248564.b.a.a.b ENSGT00550000074943 ENSGT00740000115564 ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.b ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00390000007445 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ##22 ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b ENSGT00390000010827 ENSGT00390000009366 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES 132 ENSGT00940000160723 ENSGT00940000157554 #9 ENSGT00390000018883 #8 ENSGT00390000002881 ENSGT00530000063583.b ENSGT00950000182962.b.b ##7 ENSGT01060000248564.b.a.a.b ENSGT00550000074943 ENSGT00740000115564 ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.b ENSGT00940000163170 ENSGT00390000007445 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ##22 ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b ENSGT00390000010827 ENSGT00390000009366 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b Neopterygii ANCESTRAL SPECIES 107 ENSGT00940000160723 ENSGT00940000157554 #9 ENSGT00390000018883 #8 ENSGT00390000002881 ENSGT00530000063583.b ENSGT00950000182962.b.b ##7 ENSGT01060000248564.b.a.a.b ENSGT00550000074943 ENSGT00740000115564 ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.b ENSGT00940000163170 ENSGT00390000007445 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ##22 ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00940000174412 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b ENSGT00390000010827 ENSGT00390000009366 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000014904 ENSGT00950000182906.b.a.i.b ENSGT00510000048701.a ENSGT00940000156778.l ENSGT00530000063408.A ENSGT00940000160723 ENSGT00390000002881 ENSGT00530000063583.b ENSGT00950000182962.b.b ##7 ENSGT01060000248564.b.a.a.b ENSGT00550000074943 ENSGT00740000115564 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##22 ENSGT00390000000663 ENSGT00940000178331 ENSGT00940000161401 ENSGT00390000013227.a.b ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00940000153804.A ENSGT00940000155086.B ENSGT00530000063558.B ENSGT00390000011877 ENSGT00390000013931 ENSGT01030000234626.B ENSGT00550000074878 ENSGT00940000157723 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000158133 ENSGT00940000154481.a.b ENSGT00390000011642.e ENSGT00390000003560 ENSGT00390000004028 ENSGT00940000154531 ENSGT00390000007183 ENSGT00940000155913.d ENSGT00390000009045 ENSGT01030000234809 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000159266 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.b ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ##22 ENSGT00390000000663 ENSGT00940000161401 ENSGT00390000013227.a.b ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00940000153804.A ENSGT00940000155086.B ENSGT00530000063558.B ENSGT00390000011877 ENSGT00390000013931 ENSGT01030000234626.B ENSGT00550000074878 ENSGT00940000157723 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ENSMAMG00000007068 paplnb (ENSMAMG00000007053) Carangaria ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000176900.b ENSGT00940000154481.a.b.r.b ENSGT00390000011642.e ENSGT00390000003560 ENSGT00390000004028 ENSGT00940000154531 ENSGT00390000007183 ENSGT00940000155913.d ENSGT00390000009045 ENSGT01030000234809 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000159266 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.b ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ##22 ENSGT00390000000663 ENSGT00940000161401 ENSGT00390000013227.a.b ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00940000153804.A ENSGT00940000155086.B ENSGT00530000063558.B ENSGT00390000011877 ENSGT00390000013931 ENSGT01030000234626.B ENSGT00550000074878 ENSGT00940000157723 ENSGT00940000156891.a.b Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000176900.b ENSGT00940000154481.a.b.r.b ENSGT00390000011642.e ENSGT00390000003560 ENSGT00390000004028 ENSGT00940000154531 ENSGT00390000007183 ENSGT00940000155913.d ENSGT00390000009045 ENSGT01030000234809 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000159266 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.b ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ##22 ENSGT00390000000663 ENSGT00940000161401 ENSGT00390000013227.a.b ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00940000153804.A ENSGT00940000155086.B ENSGT00530000063558.B ENSGT00390000011877 ENSGT00390000013931 ENSGT01030000234626.B ENSGT00550000074878 ENSGT00940000157723 ENSGT00940000156891.a.b Turbot MODERN SPECIES 12 armt1 (ENSSMAG00000035125) esr1 (ENSSMAG00000016212) myct1a (ENSSMAG00000024885) serac1 (ENSSMAG00000016481) gtf2h5 (ENSSMAG00000023490) DYNLT1 (ENSSMAG00000024337) tmem181 (ENSSMAG00000016523) tulp4a (ENSSMAG00000016535) mrps10 (ENSSMAG00000016563) si:ch211-51e12.7 (ENSSMAG00000016566) msgn1 (ENSSMAG00000016578) ENSSMAG00000016588 PPIL6 (ENSSMAG00000016607) cd164 (ENSSMAG00000016703) cep57l1 (ENSSMAG00000016719) sesn1 (ENSSMAG00000016729) ##22 ARMC2 (ENSSMAG00000016776) foxo3b (ENSSMAG00000016818) afg1lb 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(ENSCSEG00000017335) mfsd4b (ENSCSEG00000017328) REV3L (ENSCSEG00000017283) ENSCSEG00000017263 ENSCSEG00000017248 FYN (ENSCSEG00000017233) Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000158133 ENSGT00940000154481.a.b.r.b ENSGT00390000011642.e ENSGT00390000003560 ENSGT00390000004028 ENSGT00940000154531 ENSGT00390000007183 ENSGT00940000155913.d ENSGT00390000009045 ENSGT01030000234809 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000159266 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.b ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ##22 ENSGT00390000000663 ENSGT00940000161401 ENSGT00390000013227.a.b ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00940000153804.A ENSGT00940000155086.B ENSGT00530000063558.B ENSGT00390000011877 ENSGT00390000013931 ENSGT01030000234626.B ENSGT00550000074878 ENSGT00940000157723 ENSGT00940000156891.a.b Barramundi perch MODERN SPECIES 168 armt1 (ENSLCAG00010006453) esr1 (ENSLCAG00010006104) ENSLCAG00010005971 myct1a (ENSLCAG00010005957) serac1 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ENSGT00940000153804.A ENSGT00940000155086.B ENSGT00530000063558.B ENSGT00390000011877 ENSGT00390000013931 ENSGT01030000234626.B ENSGT00550000074878 ENSGT00940000157723 ENSGT00940000180577 Greater amberjack MODERN SPECIES 10 ENSSDUG00000019298 myct1a (ENSSDUG00000019417) serac1 (ENSSDUG00000019422) gtf2h5 (ENSSDUG00000019485) DYNLT1 (ENSSDUG00000019503) tmem181 (ENSSDUG00000019510) tulp4a (ENSSDUG00000019540) mrps10 (ENSSDUG00000019559) si:ch211-51e12.7 (ENSSDUG00000019585) msgn1 (ENSSDUG00000019597) ENSSDUG00000019601 ENSSDUG00000019614 ppil6 (ENSSDUG00000019625) cd164 (ENSSDUG00000019642) cep57l1 (ENSSDUG00000019647) sesn1 (ENSSDUG00000019665) ##22 ARMC2 (ENSSDUG00000019699) foxo3b (ENSSDUG00000019718) afg1lb (ENSSDUG00000019727) snx3 (ENSSDUG00000019760) nr2e1 (ENSSDUG00000019776) OSTM1 (ENSSDUG00000019798) drc1 (ENSSDUG00000019839) otofa (ENSSDUG00000019875) FNDC1 (ENSSDUG00000019950) sod2 (ENSSDUG00000020057) wtap (ENSSDUG00000020070) acat2 (ENSSDUG00000000092) tcp1 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Gilthead seabream MODERN SPECIES 14 armt1 (ENSSAUG00010011723) esr1 (ENSSAUG00010010150) myct1a (ENSSAUG00010009891) serac1 (ENSSAUG00010009687) gtf2h5 (ENSSAUG00010009668) DYNLT1 (ENSSAUG00010009659) tmem181 (ENSSAUG00010009650) tulp4a (ENSSAUG00010009631) mrps10 (ENSSAUG00010009627) si:ch211-51e12.7 (ENSSAUG00010009624) msgn1 (ENSSAUG00010009621) ENSSAUG00010009615 ppil6 (ENSSAUG00010009611) cd164 (ENSSAUG00010009609) cep57l1 (ENSSAUG00010009608) sesn1 (ENSSAUG00010009605) ##22 ARMC2 (ENSSAUG00010009600) foxo3b (ENSSAUG00010009595) afg1lb (ENSSAUG00010009573) snx3 (ENSSAUG00010009568) nr2e1 (ENSSAUG00010009563) OSTM1 (ENSSAUG00010009560) drc1 (ENSSAUG00010009552) otofa (ENSSAUG00010009331) FNDC1 (ENSSAUG00010009326) sod2 (ENSSAUG00010009320) wtap (ENSSAUG00010009317) acat2 (ENSSAUG00010008737) tcp1 (ENSSAUG00010008729) PLEKHG1 (ENSSAUG00010016638) paplnb (ENSSAUG00010016633) Perciformes ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000158133 ENSGT00940000154481.a.b ENSGT00390000011642.e 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ENSGT00940000178331 ENSGT00940000161401 ENSGT00390000013227.a.b ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00940000155086.B ENSGT00530000063558.B ENSGT00390000011877 ENSGT00390000013931 ENSGT01030000234626.B ENSGT00550000074878 ENSGT00940000157723 ENSGT00940000173939 Lumpfish MODERN SPECIES 16 ENSCLMG00005016456 ENSCLMG00005016461 myct1a (ENSCLMG00005016478) serac1 (ENSCLMG00005016480) gtf2h5 (ENSCLMG00005016553) DYNLT1 (ENSCLMG00005016555) tmem181 (ENSCLMG00005016558) tulp4a (ENSCLMG00005016567) mrps10 (ENSCLMG00005016571) msgn1 (ENSCLMG00005016574) ENSCLMG00005016575 ENSCLMG00005016576 ppil6 (ENSCLMG00005016579) cd164 (ENSCLMG00005016582) cep57l1 (ENSCLMG00005016585) sesn1 (ENSCLMG00005016589) ##22 ARMC2 (ENSCLMG00005016590) ENSCLMG00005016591 foxo3b (ENSCLMG00005016594) afg1lb (ENSCLMG00005016596) snx3 (ENSCLMG00005016599) nr2e1 (ENSCLMG00005016608) OSTM1 (ENSCLMG00005016616) otofa (ENSCLMG00005016621) FNDC1 (ENSCLMG00005016626) sod2 (ENSCLMG00005016631) wtap 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ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000158133 ENSGT00940000154481.a.b ENSGT00390000011642.e ENSGT00390000003560 ENSGT00390000004028 ENSGT00940000154531 ENSGT00390000007183 ENSGT00940000155913.d ENSGT00390000009045 ENSGT01030000234809 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000159266 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.b ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ##22 ENSGT00390000000663 ENSGT00940000161401 ENSGT00390000013227.a.b ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00940000153804.A ENSGT00940000155086.B ENSGT00530000063558.B ENSGT00390000011877 ENSGT00390000013931 ENSGT01030000234626.B ENSGT00550000074878 ENSGT00940000157723 ENSGT00940000156891.a.b Pike perch MODERN SPECIES 4 armt1 (ENSSLUG00000006091) esr1 (ENSSLUG00000004654) SYNE1 (ENSSLUG00000003875) myct1a (ENSSLUG00000003747) serac1 (ENSSLUG00000003411) gtf2h5 (ENSSLUG00000003359) DYNLT1 (ENSSLUG00000007839) tmem181 (ENSSLUG00000007791) tulp4a (ENSSLUG00000007705) mrps10 (ENSSLUG00000007674) 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ENSGT00390000003316.c.a Tetraodon MODERN SPECIES 5 armt1 (ENSTNIG00000001188) esr1 (ENSTNIG00000012264) SYNE1 (ENSTNIG00000012265) serac1 (ENSTNIG00000012266) gtf2h5 (ENSTNIG00000012267) DYNLT1 (ENSTNIG00000012268) tmem181 (ENSTNIG00000012269) tulp4a (ENSTNIG00000012270) mrps10 (ENSTNIG00000012271) msgn1 (ENSTNIG00000001511) ENSTNIG00000012272 L3HYPDH (ENSTNIG00000012273) ppil6 (ENSTNIG00000012274) cd164 (ENSTNIG00000012275) cep57l1 (ENSTNIG00000012276) sesn1 (ENSTNIG00000012277) ##22 ARMC2 (ENSTNIG00000012278) ENSTNIG00000012279 afg1lb (ENSTNIG00000012280) snx3 (ENSTNIG00000012281) nr2e1 (ENSTNIG00000012282) ENSTNIG00000012283 otofa (ENSTNIG00000012284) ENSTNIG00000012285 ENSTNIG00000012286 sod2 (ENSTNIG00000012287) wtap (ENSTNIG00000012288) acat2 (ENSTNIG00000012289) tcp1 (ENSTNIG00000012290) PLEKHG1 (ENSTNIG00000012291) ENSTNIG00000012292 Fugu MODERN SPECIES 7 abracl (ENSTRUG00000032815) reps1 (ENSTRUG00000013302) clu (ENSTRUG00000002065) SCARA3 (ENSTRUG00000013231) gtf2h5 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ENSGT00940000158351 ENSGT00950000183056.A.b ENSGT00390000004915.b ENSGT00390000017888 ENSGT00940000157172 ENSGT00940000160412.a ENSGT00950000182963.a.a ENSGT00530000063651.a ENSGT00940000162190 ENSGT00390000003188 ENSGT00940000156058 ENSGT01030000234555.a.b.f.a ENSGT00940000167206 ENSGT00390000002143.b.a ENSGT00950000183168.B.b ##22 ENSGT00390000000663 ENSGT00940000161401 ENSGT00390000013227.a.b ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00940000176160 ENSGT00940000155086.B ENSGT00530000063558.B ENSGT00390000011877 ENSGT00390000013931 ENSGT01030000234626.B ENSGT00550000074878 ENSGT00940000157723 ENSGT00940000156891.a.b.e Javanese ricefish MODERN SPECIES 16 ACP1 (ENSOJAG00000017757) FAM110C (ENSOJAG00000017742) fbxo25 (ENSOJAG00000017701) ENSOJAG00000017671 cmtr1 (ENSOJAG00000017646) hebp2 (ENSOJAG00000017643) NHSL1 (ENSOJAG00000017623) acbd3 (ENSOJAG00000017592) mixl1 (ENSOJAG00000017579) lin9 (ENSOJAG00000017273) ENSOJAG00000017191 parp1 (ENSOJAG00000017082) 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ENSGT00550000074878.ib.a Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT01030000234595.A.b.a.b.a ENSGT00940000162477.c.e.b ENSGT00390000014904 ENSGT00950000182906.b.a.i.b.a ENSGT00510000048701.a.b ENSGT00510000048701.a.a.b.b ENSGT00940000156778.l.b ENSGT00530000063408.A.j ENSGT00940000160723.w ENSGT00390000002881.fc.a ENSGT00530000063583.b.b ENSGT00950000182962.b.b.g.a ##7 ENSGT01060000248564.b.a.a.b.d ENSGT00990000211334 ENSGT00530000063929.a.b.c ENSGT00950000183168.B.b.b ##22 ENSGT00390000000663 ENSGT00940000161401.m.b ENSGT00940000153609.b.eb.a.a ENSGT00940000156693.f ENSGT00390000012341.d ENSGT00940000157723.q.b Chinook salmon DUPLICATION Chinook salmon DUPLICATION Chinook salmon MODERN SPECIES 49 cdc40 (ENSOTSG00005031726) WASF1 (ENSOTSG00005031724) ##7 GPR6 (ENSOTSG00005031723) ENSOTSG00005031719 ENSOTSG00005031718 cd164 (ENSOTSG00005031717) sesn1 (ENSOTSG00005031388) ##22 ARMC2 (ENSOTSG00005031385) foxo3b (ENSOTSG00005031383) ENSOTSG00005031382 snx3 (ENSOTSG00005031379) nr2e1 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ENSGT00940000156693.f ENSGT00390000012341.d ENSGT00940000157723.q.b River trout MODERN SPECIES 28 GRM1 (ENSSTUG00000025908) rab32a (ENSSTUG00000025885) ADGB (ENSSTUG00000025805) stxbp5a (ENSSTUG00000023731) SAMD5 (ENSSTUG00000023642) SAMD5 (ENSSTUG00000023631) ENSSTUG00000023627 sash1a (ENSSTUG00000023413) usta (ENSSTUG00000023396) slc22a16 (ENSSTUG00000023388) METTL24 (ENSSTUG00000023383) cdc40 (ENSSTUG00000023272) WASF1 (ENSSTUG00000023176) ##7 GPR6 (ENSSTUG00000023163) cd164 (ENSSTUG00000023147) sesn1 (ENSSTUG00000022819) ##22 ARMC2 (ENSSTUG00000022755) foxo3b (ENSSTUG00000022742) snx3 (ENSSTUG00000022724) nr2e1 (ENSSTUG00000022609) OSTM1 (ENSSTUG00000022583) ENSSTUG00000022577 PLEKHG1 (ENSSTUG00000022487) ENSSTUG00000022477 Atlantic salmon MODERN SPECIES 6 SAMD5 (ENSSSAG00000054946) sash1a (ENSSSAG00000105883) usta (ENSSSAG00000054961) slc22a16 (ENSSSAG00000003207) METTL24 (ENSSSAG00000103123) ENSSSAG00000082756 ENSSSAG00000086151 ENSSSAG00000089359 ENSSSAG00000087570 cdc40 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(ENSIPUG00000002031) ENSIPUG00000002051 DUSP10 (ENSIPUG00000002118) taf1a (ENSIPUG00000002131) brox (ENSIPUG00000002149) aida (ENSIPUG00000002174) mia3 (ENSIPUG00000002203) disp1 (ENSIPUG00000002248) ENSIPUG00000002263 ccnk (ENSIPUG00000002276) cad (ENSIPUG00000002300) ift172 (ENSIPUG00000002377) ENSIPUG00000002577 SNW1 (ENSIPUG00000002587) armc2 (ENSIPUG00000002630) SESN1 (ENSIPUG00000002673) ##22 foxo3 (ENSIPUG00000002688) snx3 (ENSIPUG00000002696) nr2e1 (ENSIPUG00000002716) OSTM1 (ENSIPUG00000002728) cep57l1 (ENSIPUG00000002755) cd164 (ENSIPUG00000002767) GRM1 (ENSIPUG00000002784) rab32 (ENSIPUG00000002815) ENSIPUG00000002823 stxbp5a (ENSIPUG00000002839) ENSIPUG00000002866 Sec63 (ENSIPUG00000002882) SCML4 (ENSIPUG00000003000) Fam84a (ENSIPUG00000003012) nbas (ENSIPUG00000003091) Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 74 ENSGT00550000074943 ENSGT01060000248564.b.a.a.b ENSGT00950000182962.b.b ##7 ENSGT00530000063583.b.n ENSGT00390000002881 ENSGT00940000160723 ENSGT00530000063408.A 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ENSGT00390000013227.a.b ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00940000174412 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463.b ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00940000158432 ENSGT00390000018199.a ENSGT00390000003316.c.b.b.a Red-bellied piranha MODERN SPECIES 208 cdc40 (ENSPNAG00000008910) ENSPNAG00000008920 slc22a16 (ENSPNAG00000008933) usta (ENSPNAG00000008938) sash1a (ENSPNAG00000009027) SAMD5 (ENSPNAG00000009068) stxbp5a (ENSPNAG00000009133) ADGB (ENSPNAG00000009173) rab32a (ENSPNAG00000009186) GRM1 (ENSPNAG00000009235) cd164 (ENSPNAG00000009249) cep57l1 (ENSPNAG00000009281) sesn1 (ENSPNAG00000009309) ##22 ARMC2 (ENSPNAG00000009333) foxo3b (ENSPNAG00000009347) afg1lb (ENSPNAG00000009404) snx3 (ENSPNAG00000009427) nr2e1 (ENSPNAG00000006719) OSTM1 (ENSPNAG00000001319) ENSPNAG00000009489 sec63 (ENSPNAG00000009631) SCML4 (ENSPNAG00000009671) Mexicana tetra MODERN SPECIES 18 WASF1 (ENSAMXG00000013526) ##7 cdc40 (ENSAMXG00000013725) METTL24 (ENSAMXG00000014003) slc22a16 (ENSAMXG00000043872) usta (ENSAMXG00000036361) sash1a (ENSAMXG00000014324) SAMD5 (ENSAMXG00000036238) stxbp5a (ENSAMXG00000014359) ENSAMXG00000043974 ENSAMXG00000014390 ENSAMXG00000041135 rab32a (ENSAMXG00000037404) GRM1 (ENSAMXG00000014495) cd164 (ENSAMXG00000032268) cep57l1 (ENSAMXG00000014636) sesn1 (ENSAMXG00000014676) ##22 ENSAMXG00000040180 ARMC2 (ENSAMXG00000014733) foxo3b (ENSAMXG00000040459) afg1lb (ENSAMXG00000014836) snx3 (ENSAMXG00000038442) nr2e1 (ENSAMXG00000014961) OSTM1 (ENSAMXG00000032923) sec63 (ENSAMXG00000015120) SCML4 (ENSAMXG00000037611) lratd1 (ENSAMXG00000002045) nbas (ENSAMXG00000002065) DDX1 (ENSAMXG00000002100) mycn (ENSAMXG00000036444) anxa1a (ENSAMXG00000034547) smek1 (ENSAMXG00000002105) Electric eel MODERN SPECIES 243 ENSEEEG00000011578 slc22a16 (ENSEEEG00000011581) usta (ENSEEEG00000011584) sash1a (ENSEEEG00000011588) SAMD5 (ENSEEEG00000011595) stxbp5a (ENSEEEG00000011596) ENSEEEG00000011598 rab32a 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ENSGT00940000158432 ENSGT00390000018199.a ENSGT00390000003316.c.b.b.a Cyprininae DUPLICATION Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 271 ENSGT00940000166976 ENSGT00940000155086.B.c ENSGT00940000155646.n.a ENSGT00940000154645.A.i ENSGT00590000083139.d.b.fb.a ENSGT00940000160723.j ENSGT00530000063408.A.l.a ENSGT00940000156778.l.c ENSGT00510000048701.a.d ENSGT00950000182906.b.a.i.b.d ENSGT00390000014904.e ENSGT00940000162477.c.g.a ENSGT01030000234595.A.b.a.b.c ENSGT00530000063929.a.b.g.b ENSGT00530000063695.b.j ENSGT00950000183168.B.b.c ##22 ENSGT00390000000663.y ENSGT00940000161401.s.a ENSGT00390000013227.a.b ENSGT00940000153609.b.gb ENSGT00940000153609.b.fb.b ENSGT00940000156693.g ENSGT00390000012341.h.a ENSGT00390000001965.d.a.b ENSGT00940000156693.h ENSGT00390000012341.h.b ENSGT00940000174412.d ENSGT00390000001965.c ENSGT00940000157463.b.c ENSGT00940000161165.g ENSGT00390000012474.k Goldfish MODERN SPECIES 12 sod2 (ENSCARG00000029851) ENSCARG00000029838 otofa (ENSCARG00000029670) pdia6 (ENSCARG00000029220) hpcal1 (ENSCARG00000029173) apobb.1 (ENSCARG00000028946) slc22a16 (ENSCARG00000028907) usta (ENSCARG00000028867) sash1a (ENSCARG00000028744) stxbp5a (ENSCARG00000027250) ADGB (ENSCARG00000027197) rab32a (ENSCARG00000027172) GRM1 (ENSCARG00000027150) cd164 (ENSCARG00000027140) cep57l1 (ENSCARG00000027130) sesn1 (ENSCARG00000027028) ##22 ARMC2 (ENSCARG00000026998) foxo3b (ENSCARG00000026977) afg1lb (ENSCARG00000026845) snx3 (ENSCARG00000026823) nr2e1 (ENSCARG00000026787) ENSCARG00000026770 sec63 (ENSCARG00000025328) SCML4 (ENSCARG00000025241) rxrgb (ENSCARG00000024874) lmx1a (ENSCARG00000024850) selp (ENSCARG00000024840) sele (ENSCARG00000024793) scyl3 (ENSCARG00000024705) prg4b (ENSCARG00000024694) tprb (ENSCARG00000024470) Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 127 ENSGT00940000155086.B.c ENSGT00940000155646.n.a ENSGT00940000154645.A.i ENSGT00590000083139.d.b.fb.a ENSGT00940000160723.j ENSGT00530000063408.A.l.a ENSGT00940000156778.l.c ENSGT00510000048701.a.d ENSGT00950000182906.b.a.i.b.d ENSGT00390000014904.e ENSGT00940000162477.c.g.a ENSGT00940000162477.c.h ENSGT01030000234595.A.b.a.b.c ENSGT00530000063929.a.b.g.b ENSGT00530000063695.b.j ENSGT00950000183168.B.b.c ##22 ENSGT00390000000663.y ENSGT00940000161401.s.a ENSGT00390000013227.a.b ENSGT00940000153609.b.gb ENSGT00940000153609.b.fb.b ENSGT00940000156693.h ENSGT00390000012341.h.b ENSGT00940000174412.d ENSGT00390000001965.c ENSGT00940000157463.b.c Common carp reference MODERN SPECIES 34 otofa (ENSCCRG00000036895) pdia6 (ENSCCRG00000081509) hpcal1 (ENSCCRG00000075624) apobb.1 (ENSCCRG00000036877) slc22a16 (ENSCCRG00000035150) usta (ENSCCRG00000078488) sash1a (ENSCCRG00000076668) SAMD5 (ENSCCRG00000075853) stxbp5a (ENSCCRG00000016687) ADGB (ENSCCRG00000067547) ENSCCRG00000032833 rab32a (ENSCCRG00000039767) GRM1 (ENSCCRG00000048312) cd164 (ENSCCRG00000033662) cep57l1 (ENSCCRG00000020823) sesn1 (ENSCCRG00000047614) ##22 ARMC2 (ENSCCRG00000022181) foxo3b (ENSCCRG00000047603) afg1lb 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ENSSGRG00000031090 Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 717 ENSGT00510000048701.a.c ENSGT00950000182906.b.a.i.b.c ENSGT00390000014904.f ENSGT00940000162477.c.h ENSGT00940000162477.c.g.b ENSGT01030000234595.A.b.a.b.d ENSGT00530000063929.a.b.g.a ENSGT00530000063695.b.i ENSGT00950000183168.B.b.d ##22 ENSGT00390000000663.z ENSGT00940000161401.s.b ENSGT00940000153609.b.fb.a Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 86 ENSGT00530000063558.B.f ENSGT00990000210545 ENSGT00940000155646.n.b ENSGT00940000154645.A.j ENSGT00590000083139.d.b.fb.b ENSGT00940000160723.i ENSGT00530000063408.A.l.b ENSGT00940000156778.l.d ENSGT00510000048701.a.c ENSGT00950000182906.b.a.i.b.c ENSGT00390000014904.f ENSGT00940000162477.c.g.b ENSGT01030000234595.A.b.a.b.d ENSGT00530000063929.a.b.g.a ENSGT00530000063695.b.i ENSGT00950000183168.B.b.d ##22 ENSGT00390000000663.z ENSGT00940000161401.s.b ENSGT00940000153609.b.fb.a ENSGT00940000156693.g ENSGT00390000012341.g ENSGT00390000001965.d.a.a ENSGT00940000157463.b.d ENSGT00940000161165.h 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Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000018635.c ENSGT00390000002881 ENSGT00530000063583.b ENSGT00950000182962.b.b ##7 ENSGT01060000248564.b.a.a.b ENSGT00550000074943 ENSGT00740000115564 ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.b ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00390000007445 ENSGT00940000165946 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ##22 ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b ENSGT00390000010827 ENSGT00390000009366 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 Amniota ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000158213 ENSGT00940000160723 ENSGT00390000018635.c ENSGT00390000002881 ENSGT00530000063583.b ENSGT00950000182962.b.b ##7 ENSGT01060000248564.b.a.a.b ENSGT00550000074943 ENSGT00740000115564 ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a 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ENSGT00390000010827 ENSGT00390000009366 ENSGT00960000190953 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b Archelosauria ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000158213 ENSGT00940000160723 ENSGT00390000018635.c ENSGT00390000002881 ENSGT00530000063583.b ENSGT00950000182962.b.b ##7 ENSGT01060000248564.b.a.a.b ENSGT00550000074943 ENSGT00740000115564 ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00390000007445 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ##22 ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b ENSGT00390000010827 ENSGT00390000009366 ENSGT00960000190953 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b Archosauria ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000011776 ENSGT00940000158213 ENSGT00940000160723 ENSGT00390000018635.c ENSGT00390000002881 ENSGT00530000063583.b ENSGT00950000182962.b.b ##7 ENSGT01060000248564.b.a.a.b ENSGT00550000074943 ENSGT00740000115564 ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ##22 ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b ENSGT00390000010827 ENSGT00390000009366 ENSGT00960000190953 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b Aves ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000011776 ENSGT00940000158213 ENSGT00940000160723 ENSGT00390000018635.c ENSGT00390000002881 ENSGT00530000063583.b ENSGT00950000182962.b.b ##7 ENSGT01060000248564.b.a.a.b ENSGT00550000074943 ENSGT00740000115564 ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ##22 ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b 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ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ##22 ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b ENSGT00390000010827 ENSGT00390000009366 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 Golden eagle MODERN SPECIES 11 DSE (ENSACCG00020006515) ENSACCG00020006525 TRAPPC3L (ENSACCG00020006542) CALHM5 (ENSACCG00020006553) CALHM4 (ENSACCG00020006561) RWDD1 (ENSACCG00020006571) ENSACCG00020006579 ZUP1 (ENSACCG00020006610) KPNA5 (ENSACCG00020006648) FAM162B (ENSACCG00020006669) GPRC6A (ENSACCG00020006680) RFX6 (ENSACCG00020006700) VGLL2 (ENSACCG00020006724) ENSACCG00020006739 CEP57L1 (ENSACCG00020006757) SESN1 (ENSACCG00020006789) ##22 ARMC2 (ENSACCG00020006846) ENSACCG00020006878 AFG1L (ENSACCG00020006893) SNX3 (ENSACCG00020006910) NR2E1 (ENSACCG00020006946) OSTM1 (ENSACCG00020006965) SEC63 (ENSACCG00020006981) 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(ENSFALG00000011688) QRSL1 (ENSFALG00000011682) RTN4IP1 (ENSFALG00000027502) CRYBG1 (ENSFALG00000028843) ATG5 (ENSFALG00000011631) Passeriformes_g ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000007279 ENSGT00390000000510 ENSGT00390000011776 ENSGT00940000158213 ENSGT00940000160723 ENSGT00390000018635.c ENSGT00390000002881 ENSGT00530000063583.b ENSGT00950000182962.b.b ##7 ENSGT01060000248564.b.a.a.b ENSGT00550000074943 ENSGT00740000115564 ENSGT00940000159373 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ##22 ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00960000191023 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b ENSGT00390000010827 ENSGT00390000009366 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b Passeroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007279 ENSGT00390000000510 ENSGT00390000011776 ENSGT00940000158213 ENSGT00940000160723 ENSGT00390000018635.c ENSGT00390000002881 ENSGT00530000063583.b ENSGT00950000182962.b.b ##7 ENSGT01060000248564.b.a.a.b ENSGT00550000074943 ENSGT00740000115564 ENSGT00940000159373 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ##22 ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b ENSGT00390000010827 ENSGT00390000009366 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 Zebra finch MODERN SPECIES 23 RPF2 (ENSTGUG00000012034) GTF3C6 (ENSTGUG00000012040) AMD1 (ENSTGUG00000012045) CDK19 (ENSTGUG00000012053) SLC22A16 (ENSTGUG00000012062) DDO (ENSTGUG00000012065) METTL24 (ENSTGUG00000012070) CDC40 (ENSTGUG00000012071) WASF1 (ENSTGUG00000012072) ##7 GPR6 (ENSTGUG00000012077) FIG4 (ENSTGUG00000012079) AK9 (ENSTGUG00000012097) ZBTB24 (ENSTGUG00000012098) CD164 (ENSTGUG00000028695) CEP57L1 (ENSTGUG00000012107) SESN1 (ENSTGUG00000012113) ##22 ARMC2 (ENSTGUG00000012122) ENSTGUG00000012135 AFG1L (ENSTGUG00000012136) NR2E1 (ENSTGUG00000012147) SNX3 (ENSTGUG00000012141) OSTM1 (ENSTGUG00000012154) SEC63 (ENSTGUG00000012155) ENSTGUG00000012164 ENSTGUG00000027856 SOBP (ENSTGUG00000012167) PDSS2 (ENSTGUG00000012168) BEND3 (ENSTGUG00000012175) MTRES1 (ENSTGUG00000012177) QRSL1 (ENSTGUG00000012180) RTN4IP1 (ENSTGUG00000012187) Common canary MODERN SPECIES 1 RPF2 (ENSSCAG00000000033) GTF3C6 (ENSSCAG00000000034) AMD1 (ENSSCAG00000000040) CDK19 (ENSSCAG00000000050) SLC22A16 (ENSSCAG00000000060) DDO (ENSSCAG00000000067) METTL24 (ENSSCAG00000000070) CDC40 (ENSSCAG00000000073) WASF1 (ENSSCAG00000000081) ##7 GPR6 (ENSSCAG00000000088) FIG4 (ENSSCAG00000000109) AK9 (ENSSCAG00000000143) ZBTB24 (ENSSCAG00000000183) ENSSCAG00000000225 CEP57L1 (ENSSCAG00000000239) SESN1 (ENSSCAG00000000267) ##22 ARMC2 (ENSSCAG00000000302) ENSSCAG00000000367 AFG1L (ENSSCAG00000000396) SNX3 (ENSSCAG00000000476) NR2E1 (ENSSCAG00000000484) OSTM1 (ENSSCAG00000000492) SEC63 (ENSSCAG00000000504) SCML4 (ENSSCAG00000000531) ENSSCAG00000000536 SOBP (ENSSCAG00000000565) PDSS2 (ENSSCAG00000000586) BEND3 (ENSSCAG00000000615) MTRES1 (ENSSCAG00000000620) QRSL1 (ENSSCAG00000000635) RTN4IP1 (ENSSCAG00000000647) Medium ground finch MODERN SPECIES 9 RPF2 (ENSGFOG00000002811) GTF3C6 (ENSGFOG00000002784) AMD1 (ENSGFOG00000002740) CDK19 (ENSGFOG00000002694) SLC22A16 (ENSGFOG00000002665) DDO (ENSGFOG00000002652) METTL24 (ENSGFOG00000002639) CDC40 (ENSGFOG00000002624) WASF1 (ENSGFOG00000004983) ##7 GPR6 (ENSGFOG00000004972) FIG4 (ENSGFOG00000004953) ZBTB24 (ENSGFOG00000004946) AK9 (ENSGFOG00000004838) CD164 (ENSGFOG00000004802) CEP57L1 (ENSGFOG00000004778) SESN1 (ENSGFOG00000004752) ##22 ARMC2 (ENSGFOG00000004703) ENSGFOG00000004686 AFG1L (ENSGFOG00000004621) SNX3 (ENSGFOG00000004607) NR2E1 (ENSGFOG00000004562) OSTM1 (ENSGFOG00000004506) ENSGFOG00000004482 SEC63 (ENSGFOG00000004464) SCML4 (ENSGFOG00000004405) SOBP (ENSGFOG00000004389) PDSS2 (ENSGFOG00000004353) BEND3 (ENSGFOG00000004347) ENSGFOG00000004336 ADGRF5 (ENSGFOG00000004314) TNFRSF21 (ENSGFOG00000004293) Galloanserae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000011776 ENSGT00940000158213 ENSGT00940000160723 ENSGT00390000018635.c ENSGT00390000002881 ENSGT00530000063583.b ENSGT00950000182962.b.b ##7 ENSGT01060000248564.b.a.a.b ENSGT00550000074943 ENSGT00740000115564 ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ##22 ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b ENSGT00390000010827 ENSGT00390000009366 ENSGT00960000190953 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b Anatidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011776 ENSGT00940000158213 ENSGT00940000160723 ENSGT00390000018635.c ENSGT00390000002881 ENSGT00530000063583.b ENSGT00950000182962.b.b ##7 ENSGT01060000248564.b.a.a.b ENSGT00550000074943 ENSGT00740000115564 ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ##22 ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b ENSGT00390000010827 ENSGT00390000009366 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 Duck MODERN SPECIES 21 AMD1 (ENSAPLG00000014874) CDK19 (ENSAPLG00000014702) SLC22A16 (ENSAPLG00000014519) DDO (ENSAPLG00000014364) METTL24 (ENSAPLG00000014222) CDC40 (ENSAPLG00000013973) WASF1 (ENSAPLG00000013641) ##7 GPR6 (ENSAPLG00000013626) FIG4 (ENSAPLG00000013266) ENSAPLG00000013181 ENSAPLG00000013116 ZBTB24 (ENSAPLG00000012630) PPIL6 (ENSAPLG00000012560) ENSAPLG00000012348 ENSAPLG00000011913 SESN1 (ENSAPLG00000011647) ##22 ARMC2 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21 AMD1 (ENSCJPG00005009244) CDK19 (ENSCJPG00005009245) SLC22A16 (ENSCJPG00005009394) DDO (ENSCJPG00005009395) METTL24 (ENSCJPG00005009396) CDC40 (ENSCJPG00005009397) WASF1 (ENSCJPG00005009398) ##7 GPR6 (ENSCJPG00005009399) FIG4 (ENSCJPG00005009400) AK9 (ENSCJPG00005009402) ZBTB24 (ENSCJPG00005009404) PPIL6 (ENSCJPG00005009406) CD164 (ENSCJPG00005009407) ENSCJPG00005009408 ENSCJPG00005009411 SESN1 (ENSCJPG00005009414) ##22 ARMC2 (ENSCJPG00005009417) ENSCJPG00005009420 AFG1L (ENSCJPG00005009422) SNX3 (ENSCJPG00005009424) NR2E1 (ENSCJPG00005009425) SEC63 (ENSCJPG00005009426) SCML4 (ENSCJPG00005009429) SOBP (ENSCJPG00005009431) ENSCJPG00005009433 PDSS2 (ENSCJPG00005009434) BEND3 (ENSCJPG00005009435) MTRES1 (ENSCJPG00005009436) QRSL1 (ENSCJPG00005009439) RTN4IP1 (ENSCJPG00005009443) CRYBG1 (ENSCJPG00005009445) Phasianidae_b ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000000510 ENSGT00390000011776 ENSGT00940000158213 ENSGT00940000160723 ENSGT00390000018635.c ENSGT00390000002881 ENSGT00530000063583.b ENSGT00950000182962.b.b ##7 ENSGT01060000248564.b.a.a.b ENSGT00550000074943 ENSGT00740000115564 ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000165946 ENSGT00950000183168.B.b ##22 ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b ENSGT00390000010827 ENSGT00390000009366 ENSGT00960000190953 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b Chicken MODERN SPECIES 22 RPF2 (ENSGALG00010013760) GTF3C6 (ENSGALG00010013794) AMD1 (ENSGALG00010013814) CDK19 (ENSGALG00010013842) SLC22A16 (ENSGALG00010013930) METTL24 (ENSGALG00010013944) CDC40 (ENSGALG00010013976) WASF1 (ENSGALG00010014030) ##7 GPR6 (ENSGALG00010015168) FIG4 (ENSGALG00010014089) AK9 (ENSGALG00010014124) ZBTB24 (ENSGALG00010014135) PPIL6 (ENSGALG00010014142) CD164 (ENSGALG00010014156) ENSGALG00010014210 SESN1 (ENSGALG00010014244) ##22 ARMC2 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ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b ENSGT00390000010827 ENSGT00390000009366 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 Common wall lizard MODERN SPECIES 11 ENSPMRG00000003331 DDO (ENSPMRG00000003308) METTL24 (ENSPMRG00000003292) CDC40 (ENSPMRG00000003269) WASF1 (ENSPMRG00000003250) ##7 GPR6 (ENSPMRG00000003233) FIG4 (ENSPMRG00000003215) AK9 (ENSPMRG00000003106) ENSPMRG00000003071 ENSPMRG00000003063 ZBTB24 (ENSPMRG00000003047) PPIL6 (ENSPMRG00000003033) CD164 (ENSPMRG00000003020) ENSPMRG00000002961 CEP57L1 (ENSPMRG00000002944) SESN1 (ENSPMRG00000002928) ##22 ARMC2 (ENSPMRG00000002915) ENSPMRG00000002905 ENSPMRG00000002895 AFG1L (ENSPMRG00000002870) SNX3 (ENSPMRG00000002854) NR2E1 (ENSPMRG00000002845) OSTM1 (ENSPMRG00000002840) SEC63 (ENSPMRG00000002784) SCML4 (ENSPMRG00000002753) SOBP 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Toxicofera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000158213.a ENSGT00940000158213.b ENSGT00940000160723 ENSGT00390000018635.c ENSGT00390000002881 ENSGT00530000063583.b ENSGT00950000182962.b.b ##7 ENSGT01060000248564.b.a.a.b ENSGT00550000074943 ENSGT00740000115564 ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ##22 ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b ENSGT00390000010827 ENSGT00390000009366 ENSGT00960000190953 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b Elapidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011776 ENSGT00940000158213.a ENSGT00940000158213.b ENSGT00940000160723 ENSGT00390000018635.c ENSGT00530000063583.b ENSGT00950000182962.b.b ##7 ENSGT01060000248564.b.a.a.b ENSGT00550000074943 ENSGT00740000115564 ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159634 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(ENSSHAG00000002079) ##22 ARMC2 (ENSSHAG00000000930) ENSSHAG00000018299 AFG1L (ENSSHAG00000018044) SNX3 (ENSSHAG00000023627) NR2E1 (ENSSHAG00000017854) OSTM1 (ENSSHAG00000027777) SEC63 (ENSSHAG00000017510) SCML4 (ENSSHAG00000017079) SOBP (ENSSHAG00000029303) PDSS2 (ENSSHAG00000015599) BEND3 (ENSSHAG00000015283) MTRES1 (ENSSHAG00000015190) QRSL1 (ENSSHAG00000013597) RTN4IP1 (ENSSHAG00000013285) CRYBG1 (ENSSHAG00000012880) Opossum MODERN SPECIES 1 CDK19 (ENSMODG00000017926) SLC22A16 (ENSMODG00000017929) DDO (ENSMODG00000017932) METTL24 (ENSMODG00000017934) CDC40 (ENSMODG00000017939) WASF1 (ENSMODG00000017945) ##7 GPR6 (ENSMODG00000023352) FIG4 (ENSMODG00000017951) AK9 (ENSMODG00000017956) ZBTB24 (ENSMODG00000017966) MICAL1 (ENSMODG00000017968) PPIL6 (ENSMODG00000017973) ENSMODG00000017978 ENSMODG00000017983 CEP57L1 (ENSMODG00000017989) SESN1 (ENSMODG00000017990) ##22 ARMC2 (ENSMODG00000017993) ENSMODG00000017994 AFG1L (ENSMODG00000017996) SNX3 (ENSMODG00000044688) NR2E1 (ENSMODG00000018005) OSTM1 (ENSMODG00000018010) ENSMODG00000018012 SCML4 (ENSMODG00000018013) SOBP (ENSMODG00000018014) ENSMODG00000029480 PDSS2 (ENSMODG00000018016) BEND3 (ENSMODG00000018019) MTRES1 (ENSMODG00000018020) ENSMODG00000018021 CD24 (ENSMODG00000049099) Eutheria ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00740000115564 ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159117 ENSGT00950000185408 ENSGT00390000009166 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000165946 ENSGT00390000007445 ENSGT00940000165257 ENSGT00940000164734 ENSGT00390000002042 ENSGT01030000235833 ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ##22 ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b ENSGT00390000010827 ENSGT00390000009366 ENSGT00390000018829 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00740000115564 ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159117 ENSGT00950000185408 ENSGT00390000009166 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000165946 ENSGT00940000165257 ENSGT00940000164734 ENSGT00390000002042 ENSGT00390000007445 ENSGT01030000235833 ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ##22 ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00950000186137 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b ENSGT00390000010827 ENSGT00390000010020 ENSGT00390000009366 ENSGT00390000018829 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00930000151154 ENSGT00740000115564 ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159117 ENSGT00390000009166 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000165946 ENSGT00940000165257 ENSGT00940000164734 ENSGT00390000002042 ENSGT00390000007445 ENSGT01030000235833 ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ##22 ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00950000186137 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b ENSGT00390000010827 ENSGT00390000010020 ENSGT00390000009366 ENSGT00390000018829 Primates ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000018635.c ENSGT00390000002881 ENSGT00530000063583.b ENSGT00950000182962.b.b ##7 ENSGT01060000248564.b.a.a.b ENSGT00550000074943 ENSGT00740000115564 ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159117 ENSGT00390000009166 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00390000002042 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ##22 ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b ENSGT00390000010827 ENSGT00390000009366 ENSGT00390000018829 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b Strepsirrhini DUPLICATION Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183168.B.b.e ##22 Bushbaby MODERN SPECIES 367 RBMXL1 (ENSOGAG00000007839) ARHGEF6 (ENSOGAG00000004738) CD40LG (ENSOGAG00000005572) VGLL1 (ENSOGAG00000005571) HTATSF1 (ENSOGAG00000005565) BRS3 (ENSOGAG00000005561) ADGRG4 (ENSOGAG00000033881) ENSOGAG00000029993 MAP7D3 (ENSOGAG00000009956) FHL1 (ENSOGAG00000028911) ENSOGAG00000029465 SLC9A6 (ENSOGAG00000003464) ENSOGAG00000003462 INTS6L (ENSOGAG00000016870) ENSOGAG00000029369 ##22 ENSOGAG00000033559 ZNF449 (ENSOGAG00000003684) ENSOGAG00000033991 CT55 (ENSOGAG00000007138) ZNF75D (ENSOGAG00000032383) Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000018635.c ENSGT00390000002881 ENSGT00530000063583.b ENSGT00950000182962.b.b ##7 ENSGT01060000248564.b.a.a.b ENSGT00550000074943 ENSGT00740000115564 ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159117 ENSGT00390000009166 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00390000002042 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b.f ##22 ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b ENSGT00390000010827 ENSGT00390000009366 ENSGT00390000018829 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000160723 ENSGT00390000018635.c ENSGT00390000002881 ENSGT00530000063583.b ENSGT00950000182962.b.b ##7 ENSGT01060000248564.b.a.a.b ENSGT00550000074943 ENSGT00740000115564 ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159117 ENSGT00390000009166 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b.f ##22 ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b ENSGT00390000010827 ENSGT00390000009366 ENSGT00390000018829.ab ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b Mouse lemur MODERN SPECIES 28 METTL24 (ENSMICG00000041949) CDC40 (ENSMICG00000016200) WASF1 (ENSMICG00000032077) ##7 GPR6 (ENSMICG00000014562) FIG4 (ENSMICG00000014528) ENSMICG00000014512 ENSMICG00000046549 ENSMICG00000043195 ZBTB24 (ENSMICG00000014485) MICAL1 (ENSMICG00000014458) SMPD2 (ENSMICG00000014442) PPIL6 (ENSMICG00000014430) CD164 (ENSMICG00000014422) ENSMICG00000014404 CEP57L1 (ENSMICG00000014373) SESN1 (ENSMICG00000038030) ##22 ENSMICG00000042143 ENSMICG00000035769 AFG1L (ENSMICG00000014294) ENSMICG00000004669 SNX3 (ENSMICG00000043331) NR2E1 (ENSMICG00000014274) OSTM1 (ENSMICG00000027511) SEC63 (ENSMICG00000014221) SCML4 (ENSMICG00000004168) SOBP (ENSMICG00000030144) PDSS2 (ENSMICG00000032777) BEND3 (ENSMICG00000043137) ENSMICG00000004137 ENSMICG00000011517 ENSMICG00000029426 Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES 63 ENSGT00940000160723 ENSGT00390000018635.c ENSGT00390000002881 ENSGT00530000063583.b ENSGT00950000182962.b.b ##7 ENSGT01060000248564.b.a.a.b ENSGT00550000074943 ENSGT00740000115564 ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159117 ENSGT00390000009166 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b.f ##22 ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b ENSGT00390000010827 ENSGT00390000009366 ENSGT00390000018829.ab ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b Coquerels sifaka MODERN SPECIES 492 CDK19 (ENSPCOG00000027559) SLC22A16 (ENSPCOG00000015137) DDO (ENSPCOG00000003716) METTL24 (ENSPCOG00000020108) CDC40 (ENSPCOG00000015486) WASF1 (ENSPCOG00000011518) ##7 GPR6 (ENSPCOG00000023300) FIG4 (ENSPCOG00000021116) AK9 (ENSPCOG00000024677) ZBTB24 (ENSPCOG00000019170) MICAL1 (ENSPCOG00000001566) SMPD2 (ENSPCOG00000001714) PPIL6 (ENSPCOG00000016101) CD164 (ENSPCOG00000028678) CEP57L1 (ENSPCOG00000020909) SESN1 (ENSPCOG00000023817) ##22 ARMC2 (ENSPCOG00000027583) ENSPCOG00000024701 ENSPCOG00000018259 AFG1L (ENSPCOG00000014543) SNX3 (ENSPCOG00000020531) NR2E1 (ENSPCOG00000019521) OSTM1 (ENSPCOG00000025401) SEC63 (ENSPCOG00000021091) SCML4 (ENSPCOG00000022920) SOBP (ENSPCOG00000025980) PDSS2 (ENSPCOG00000005947) BEND3 (ENSPCOG00000017387) ENSPCOG00000027220 CD24 (ENSPCOG00000014613) ENSPCOG00000019397 Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 187 ENSPSMG00000002940 ##22 ARMC2 (ENSPSMG00000002952) ENSPSMG00000002963 AFG1L (ENSPSMG00000002975) ENSPSMG00000002992 NR2E1 (ENSPSMG00000003030) OSTM1 (ENSPSMG00000003042) SEC63 (ENSPSMG00000003081) SCML4 (ENSPSMG00000003119) SOBP (ENSPSMG00000003137) PDSS2 (ENSPSMG00000003161) ENSPSMG00000003169 BEND3 (ENSPSMG00000003180) MTRES1 (ENSPSMG00000003201) ENSPSMG00000003206 QRSL1 (ENSPSMG00000003285) Bushbaby MODERN SPECIES 117 DDO (ENSOGAG00000031387) METTL24 (ENSOGAG00000008632) CDC40 (ENSOGAG00000008627) WASF1 (ENSOGAG00000008623) ##7 GPR6 (ENSOGAG00000030800) FIG4 (ENSOGAG00000008339) ENSOGAG00000008336 ENSOGAG00000015522 ZBTB24 (ENSOGAG00000015518) MICAL1 (ENSOGAG00000015509) SMPD2 (ENSOGAG00000015505) CD164 (ENSOGAG00000015500) ENSOGAG00000015493 ENSOGAG00000015488 ENSOGAG00000015479 SESN1 (ENSOGAG00000015235) ##22 ARMC2 (ENSOGAG00000010324) ENSOGAG00000027196 ENSOGAG00000004119 SNX3 (ENSOGAG00000012282) NR2E1 (ENSOGAG00000011992) OSTM1 (ENSOGAG00000015357) SEC63 (ENSOGAG00000015346) SCML4 (ENSOGAG00000006345) SOBP (ENSOGAG00000006342) PDSS2 (ENSOGAG00000006339) BEND3 (ENSOGAG00000027957) MTRES1 (ENSOGAG00000008839) ENSOGAG00000024102 QRSL1 (ENSOGAG00000012707) RTN4IP1 (ENSOGAG00000012703) Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000160723 ENSGT00390000018635.c ENSGT00390000002881 ENSGT00530000063583.b ENSGT00950000182962.b.b ##7 ENSGT01060000248564.b.a.a.b ENSGT00550000074943 ENSGT00740000115564 ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159117 ENSGT00390000009166 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ##22 ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b ENSGT00390000010827 ENSGT00390000009366 ENSGT00390000018829.z ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000160723 ENSGT00390000018635.c ENSGT00390000002881 ENSGT00530000063583.b ENSGT00950000182962.b.b ##7 ENSGT01060000248564.b.a.a.b ENSGT00550000074943 ENSGT00740000115564 ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159117 ENSGT00390000009166 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ##22 ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00910000147202 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b ENSGT00390000010827 ENSGT00390000009366.c.a ENSGT00390000018829.z ENSGT00550000074866.i Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000160723 ENSGT00390000018635.c ENSGT00390000002881 ENSGT00530000063583.b ENSGT00950000182962.b.b ##7 ENSGT01060000248564.b.a.a.b ENSGT00550000074943 ENSGT00740000115564 ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159117 ENSGT00390000009166 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ##22 ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00910000147202 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b ENSGT00390000010827 ENSGT00390000009366.c.a ENSGT00390000018829.z ENSGT00550000074866.i Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000160723 ENSGT00390000018635.c ENSGT00390000002881 ENSGT00530000063583.b ENSGT00950000182962.b.b ##7 ENSGT01060000248564.b.a.a.b ENSGT00550000074943 ENSGT00740000115564 ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159117 ENSGT00390000009166 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b.a.a ENSGT00950000183168.B.b ##22 ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00910000147202 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b ENSGT00390000010827 ENSGT00390000009366.c.a ENSGT00390000018829.y.b ENSGT00550000074866.i Hominidae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000160723 ENSGT00390000018635.c ENSGT00390000002881 ENSGT00530000063583.b ENSGT00950000182962.b.b ##7 ENSGT01060000248564.b.a.a.b ENSGT00550000074943 ENSGT00740000115564 ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159117 ENSGT00390000009166 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b.a.a ENSGT00950000183168.B.b ##22 ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b ENSGT00390000010827 ENSGT00390000009366.c.a ENSGT00390000018829.y.b ENSGT00550000074866.i ENSGT00880000138028.b.b.a Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000160723 ENSGT00390000018635.c ENSGT00390000002881 ENSGT00530000063583.b ENSGT00950000182962.b.b ##7 ENSGT01060000248564.b.a.a.b ENSGT00550000074943 ENSGT00740000115564 ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159117 ENSGT00390000009166 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b.a.a ENSGT00950000183168.B.b ##22 ENSGT00510000046986.n.a.a.b ENSGT00390000000663 ENSGT00390000005306.v ENSGT00950000182895.a.a.a.a.b.k ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000017606.a.a.i.a.b.a.b.a.a.b ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b ENSGT00390000010827 Gorilla MODERN SPECIES 19 SLC22A16 (ENSGGOG00000001770) DDO (ENSGGOG00000016346) METTL24 (ENSGGOG00000021961) CDC40 (ENSGGOG00000002453) WASF1 (ENSGGOG00000007331) ##7 GPR6 (ENSGGOG00000013815) FIG4 (ENSGGOG00000015662) AK9 (ENSGGOG00000022458) ZBTB24 (ENSGGOG00000000430) MICAL1 (ENSGGOG00000003401) SMPD2 (ENSGGOG00000003394) PPIL6 (ENSGGOG00000039681) CD164 (ENSGGOG00000003383) ENSGGOG00000022034 CEP57L1 (ENSGGOG00000014982) SESN1 (ENSGGOG00000008196) ##22 ENSGGOG00000024963 ARMC2 (ENSGGOG00000008179) ENSGGOG00000043953 ENSGGOG00000040628 ENSGGOG00000003517 AFG1L (ENSGGOG00000004244) SNX3 (ENSGGOG00000043438) NR2E1 (ENSGGOG00000038410) ENSGGOG00000041051 OSTM1 (ENSGGOG00000009031) ENSGGOG00000026319 SEC63 (ENSGGOG00000002560) SCML4 (ENSGGOG00000006782) SOBP (ENSGGOG00000015284) PDSS2 (ENSGGOG00000040827) Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000160723 ENSGT00390000018635.c ENSGT00390000002881 ENSGT00530000063583.b ENSGT00950000182962.b.b ##7 ENSGT01060000248564.b.a.a.b ENSGT00550000074943 ENSGT00740000115564 ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159117 ENSGT00390000009166 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b.a.a ENSGT00950000183168.B.b ##22 ENSGT00510000046986.n.a.a.b ENSGT00390000000663 ENSGT00390000005306.v ENSGT00950000182895.a.a.a.a.b.k ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000017606.a.a.i.a.b.a.b.a.a.b ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b ENSGT00390000010827 Human MODERN SPECIES 18 CDK19 (ENSG00000155111) SLC22A16 (ENSG00000004809) DDO (ENSG00000203797) METTL24 (ENSG00000053328) CDC40 (ENSG00000168438) WASF1 (ENSG00000112290) ##7 GPR6 (ENSG00000146360) FIG4 (ENSG00000112367) AK9 (ENSG00000155085) ZBTB24 (ENSG00000112365) MICAL1 (ENSG00000135596) SMPD2 (ENSG00000135587) PPIL6 (ENSG00000185250) CD164 (ENSG00000135535) CEP57L1 (ENSG00000183137) SESN1 (ENSG00000080546) ##22 ARMC2 (ENSG00000118690) FOXO3 (ENSG00000118689) AFG1L (ENSG00000135537) SNX3 (ENSG00000112335) NR2E1 (ENSG00000112333) OSTM1 (ENSG00000081087) SEC63 (ENSG00000025796) SCML4 (ENSG00000146285) SOBP (ENSG00000112320) PDSS2 (ENSG00000164494) BEND3 (ENSG00000178409) MTRES1 (ENSG00000130349) CD24 (ENSG00000272398) QRSL1 (ENSG00000130348) RTN4IP1 (ENSG00000130347) Pan ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000160723 ENSGT00390000018635.c ENSGT00390000002881 ENSGT00530000063583.b ENSGT00950000182962.b.b ##7 ENSGT01060000248564.b.a.a.b ENSGT00550000074943 ENSGT00740000115564 ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159117 ENSGT00390000009166 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b.a.a ENSGT00950000183168.B.b ##22 ENSGT00510000046986.n.a.a.b ENSGT00390000000663 ENSGT00390000005306.v ENSGT00950000182895.a.a.a.a.b.k ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000017606.a.a.i.a.b.a.b.a.a.b ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b ENSGT00390000010827 Bonobo MODERN SPECIES 19 ENSPPAG00000036279 SLC22A16 (ENSPPAG00000034411) DDO (ENSPPAG00000035567) ENSPPAG00000027532 CDC40 (ENSPPAG00000042663) WASF1 (ENSPPAG00000004961) ##7 FIG4 (ENSPPAG00000016262) AK9 (ENSPPAG00000043771) ZBTB24 (ENSPPAG00000005762) MICAL1 (ENSPPAG00000040546) SMPD2 (ENSPPAG00000031363) PPIL6 (ENSPPAG00000043241) CD164 (ENSPPAG00000036863) ENSPPAG00000021752 CEP57L1 (ENSPPAG00000042916) SESN1 (ENSPPAG00000041767) ##22 ENSPPAG00000011766 ARMC2 (ENSPPAG00000029392) ENSPPAG00000031267 ENSPPAG00000037969 ENSPPAG00000000536 AFG1L (ENSPPAG00000019727) SNX3 (ENSPPAG00000032382) NR2E1 (ENSPPAG00000038954) OSTM1 (ENSPPAG00000043416) ENSPPAG00000033502 SEC63 (ENSPPAG00000011744) SCML4 (ENSPPAG00000020145) SOBP (ENSPPAG00000037988) PDSS2 (ENSPPAG00000035956) BEND3 (ENSPPAG00000039227) Chimpanzee MODERN SPECIES 19 SLC22A16 (ENSPTRG00000018499) DDO (ENSPTRG00000018498) METTL24 (ENSPTRG00000029448) CDC40 (ENSPTRG00000018495) WASF1 (ENSPTRG00000018494) ##7 GPR6 (ENSPTRG00000018493) FIG4 (ENSPTRG00000018492) AK9 (ENSPTRG00000018489) ZBTB24 (ENSPTRG00000018487) MICAL1 (ENSPTRG00000018486) SMPD2 (ENSPTRG00000018484) PPIL6 (ENSPTRG00000018483) CD164 (ENSPTRG00000018482) ENSPTRG00000046150 CEP57L1 (ENSPTRG00000018480) SESN1 (ENSPTRG00000018479) ##22 ENSPTRG00000045969 ARMC2 (ENSPTRG00000018477) ENSPTRG00000052234 ENSPTRG00000045358 FOXO3 (ENSPTRG00000018476) AFG1L (ENSPTRG00000018474) SNX3 (ENSPTRG00000018473) NR2E1 (ENSPTRG00000018472) OSTM1 (ENSPTRG00000018471) ENSPTRG00000049504 SEC63 (ENSPTRG00000018470) SCML4 (ENSPTRG00000018469) SOBP (ENSPTRG00000018467) PDSS2 (ENSPTRG00000018466) BEND3 (ENSPTRG00000018465) Orangutan MODERN SPECIES 19 SLC22A16 (ENSPPYG00000016922) DDO (ENSPPYG00000016921) METTL24 (ENSPPYG00000016920) CDC40 (ENSPPYG00000016919) WASF1 (ENSPPYG00000016918) ##7 GPR6 (ENSPPYG00000016917) FIG4 (ENSPPYG00000016916) ENSPPYG00000016914 AK9 (ENSPPYG00000016913) ZBTB24 (ENSPPYG00000016910) MICAL1 (ENSPPYG00000016909) SMPD2 (ENSPPYG00000016908) ENSPPYG00000016907 CD164 (ENSPPYG00000016906) CEP57L1 (ENSPPYG00000016901) SESN1 (ENSPPYG00000016900) ##22 ARMC2 (ENSPPYG00000016899) ENSPPYG00000016897 ENSPPYG00000016896 AFG1L (ENSPPYG00000016895) SNX3 (ENSPPYG00000016894) NR2E1 (ENSPPYG00000016893) OSTM1 (ENSPPYG00000016892) ENSPPYG00000031910 SEC63 (ENSPPYG00000016891) SCML4 (ENSPPYG00000016890) SOBP (ENSPPYG00000016889) PDSS2 (ENSPPYG00000016887) BEND3 (ENSPPYG00000016886) MTRES1 (ENSPPYG00000016885) CD24 (ENSPPYG00000016884) Gibbon MODERN SPECIES 18 DDO (ENSNLEG00000012794) METTL24 (ENSNLEG00000012789) ENSNLEG00000029013 CDC40 (ENSNLEG00000012759) WASF1 (ENSNLEG00000012748) ##7 GPR6 (ENSNLEG00000012747) FIG4 (ENSNLEG00000012708) AK9 (ENSNLEG00000012665) ZBTB24 (ENSNLEG00000033427) MICAL1 (ENSNLEG00000012588) SMPD2 (ENSNLEG00000012570) PPIL6 (ENSNLEG00000012561) CD164 (ENSNLEG00000012527) ENSNLEG00000012520 CEP57L1 (ENSNLEG00000012502) SESN1 (ENSNLEG00000012476) ##22 ARMC2 (ENSNLEG00000012451) ENSNLEG00000012446 AFG1L (ENSNLEG00000013680) SNX3 (ENSNLEG00000033323) NR2E1 (ENSNLEG00000013646) OSTM1 (ENSNLEG00000013621) SEC63 (ENSNLEG00000013526) SCML4 (ENSNLEG00000013516) ENSNLEG00000027102 SOBP (ENSNLEG00000013498) PDSS2 (ENSNLEG00000013484) BEND3 (ENSNLEG00000013464) MTRES1 (ENSNLEG00000013450) QRSL1 (ENSNLEG00000013383) RTN4IP1 (ENSNLEG00000013349) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000160723 ENSGT00390000018635.c ENSGT00390000002881 ENSGT00530000063583.b ENSGT00950000182962.b.b ##7 ENSGT01060000248564.b.a.a.b ENSGT00550000074943 ENSGT00740000115564 ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159117 ENSGT00390000009166 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ##22 ENSGT00390000000663 ENSGT00390000005306.v ENSGT00950000182895.a.a.a.a.b.k ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00910000147202 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b ENSGT00390000010827 ENSGT00390000009366.c.a Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000160723 ENSGT00390000018635.c ENSGT00390000002881 ENSGT00530000063583.b ENSGT00950000182962.b.b ##7 ENSGT01060000248564.b.a.a.b ENSGT00550000074943 ENSGT00740000115564 ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159117 ENSGT00390000009166 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ##22 ENSGT00390000000663 ENSGT00390000005306.v ENSGT00950000182895.a.a.a.a.b.k ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b ENSGT00390000010827 ENSGT00390000009366.c.a.a ENSGT00390000018829.z Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000160723 ENSGT00390000018635.c ENSGT00390000002881 ENSGT00530000063583.b ENSGT00950000182962.b.b ##7 ENSGT01060000248564.b.a.a.b ENSGT00550000074943 ENSGT00740000115564 ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159117 ENSGT00390000009166 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ##22 ENSGT00390000000663 ENSGT00390000005306.v ENSGT00950000182895.a.a.a.a.b.k ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00940000153052.c.b.b.b.g.a.b ENSGT00390000004172 ENSGT00940000157993 ENSGT00530000063558.B ENSGT00390000011877 ENSGT00390000013931.a.b.b.ab ENSGT00390000013931.a.b.b.`b.a Macaca ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000160723 ENSGT00390000018635.c ENSGT00390000002881 ENSGT00530000063583.b ENSGT00950000182962.b.b ##7 ENSGT01060000248564.b.a.a.b ENSGT00550000074943 ENSGT00740000115564 ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159117 ENSGT00390000009166 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ##22 ENSGT00390000000663 ENSGT00390000005306.v ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00940000153052.c.b.b.b.g.a.b ENSGT00390000004172 ENSGT00940000157993 ENSGT00910000148724 ENSGT00530000063558.B ENSGT00390000011877 ENSGT00940000163505.a.b.a.b ENSGT00390000013931.a.b.b.`b.a Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 186 CDK19 (ENSMNEG00000029849) SLC22A16 (ENSMNEG00000030961) DDO (ENSMNEG00000033657) METTL24 (ENSMNEG00000040901) CDC40 (ENSMNEG00000029399) WASF1 (ENSMNEG00000029371) ##7 FIG4 (ENSMNEG00000045307) AK9 (ENSMNEG00000041609) ZBTB24 (ENSMNEG00000037210) MICAL1 (ENSMNEG00000039173) SMPD2 (ENSMNEG00000042401) PPIL6 (ENSMNEG00000039500) CD164 (ENSMNEG00000036168) ENSMNEG00000017770 CEP57L1 (ENSMNEG00000004205) SESN1 (ENSMNEG00000032849) ##22 ARMC2 (ENSMNEG00000037523) ENSMNEG00000041536 ENSMNEG00000040158 AFG1L (ENSMNEG00000044043) SNX3 (ENSMNEG00000027766) NR2E1 (ENSMNEG00000034662) OSTM1 (ENSMNEG00000036298) ENSMNEG00000041823 RSPH3 (ENSMNEG00000038143) TAGAP (ENSMNEG00000029744) ENSMNEG00000021558 FNDC1 (ENSMNEG00000043137) SOD2 (ENSMNEG00000031749) ENSMNEG00000027147 ENSMNEG00000034307 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000160723 ENSGT00390000018635.c ENSGT00390000002881 ENSGT00530000063583.b ENSGT00950000182962.b.b ##7 ENSGT01060000248564.b.a.a.b ENSGT00550000074943 ENSGT00740000115564 ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159117 ENSGT00390000009166 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ##22 ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000004172 ENSGT00940000157993 ENSGT00910000148724 ENSGT00530000063558.B ENSGT00390000011877 ENSGT00940000163505.a.b.a.b ENSGT00390000013931.a.b.b.`b.a ENSGT01030000234626.B.w.a ENSGT00550000074878.`b.a.a.a Crab-eating macaque MODERN SPECIES 14 ENSMFAG00000048202 CDC40 (ENSMFAG00000002327) WASF1 (ENSMFAG00000002297) ##7 GPR6 (ENSMFAG00000002164) ENSMFAG00000054886 ENSMFAG00000051452 FIG4 (ENSMFAG00000031930) AK9 (ENSMFAG00000039019) ZBTB24 (ENSMFAG00000000893) MICAL1 (ENSMFAG00000042065) SMPD2 (ENSMFAG00000033236) PPIL6 (ENSMFAG00000041361) ENSMFAG00000034527 CD164 (ENSMFAG00000033671) CEP57L1 (ENSMFAG00000038962) SESN1 (ENSMFAG00000031220) ##22 ARMC2 (ENSMFAG00000000238) ENSMFAG00000033615 ENSMFAG00000060415 AFG1L (ENSMFAG00000041493) ENSMFAG00000065667 SNX3 (ENSMFAG00000039300) NR2E1 (ENSMFAG00000001910) OSTM1 (ENSMFAG00000002698) RSPH3 (ENSMFAG00000041726) TAGAP (ENSMFAG00000032965) ENSMFAG00000029234 FNDC1 (ENSMFAG00000000932) ENSMFAG00000059093 SOD2 (ENSMFAG00000046278) ENSMFAG00000053733 Rhesus MODERN SPECIES 14 DDO (ENSMMUG00000050899) METTL24 (ENSMMUG00000008184) CDC40 (ENSMMUG00000008182) WASF1 (ENSMMUG00000014764) ##7 GPR6 (ENSMMUG00000014763) FIG4 (ENSMMUG00000020538) AK9 (ENSMMUG00000020537) ZBTB24 (ENSMMUG00000003678) MICAL1 (ENSMMUG00000023221) SMPD2 (ENSMMUG00000050828) PPIL6 (ENSMMUG00000007020) CD164 (ENSMMUG00000007011) ENSMMUG00000007010 ENSMMUG00000056718 CEP57L1 (ENSMMUG00000012241) SESN1 (ENSMMUG00000018232) ##22 ARMC2 (ENSMMUG00000018231) ENSMMUG00000050903 FOXO3 (ENSMMUG00000020369) AFG1L (ENSMMUG00000020367) SNX3 (ENSMMUG00000020366) NR2E1 (ENSMMUG00000023767) OSTM1 (ENSMMUG00000022247) ENSMMUG00000061610 ENSMMUG00000064227 ENSMMUG00000057516 RSPH3 (ENSMMUG00000020011) TAGAP (ENSMMUG00000011994) FNDC1 (ENSMMUG00000000500) SOD2 (ENSMMUG00000050418) ENSMMUG00000056261 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000160723 ENSGT00390000018635.c ENSGT00390000002881 ENSGT00530000063583.b ENSGT00950000182962.b.b ##7 ENSGT01060000248564.b.a.a.b ENSGT00550000074943 ENSGT00740000115564 ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159117 ENSGT00390000009166 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ##22 ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00940000153052.c.b.b.b.g.a.b ENSGT00390000004172 ENSGT00940000157993 ENSGT00530000063558.B ENSGT00390000011877 ENSGT00390000013931.a.b.b.`b.a ENSGT01030000234626.B.w.a ENSGT00550000074878.`b.a.a.a ENSGT00390000006394 Olive baboon MODERN SPECIES 16 SLC22A16 (ENSPANG00000016951) DDO (ENSPANG00000006524) METTL24 (ENSPANG00000000582) CDC40 (ENSPANG00000023241) WASF1 (ENSPANG00000007144) ##7 GPR6 (ENSPANG00000008203) FIG4 (ENSPANG00000011216) ENSPANG00000008202 CEP57L1 (ENSPANG00000008201) ENSPANG00000039980 CD164 (ENSPANG00000030351) MICAL1 (ENSPANG00000014435) SMPD2 (ENSPANG00000024480) ZBTB24 (ENSPANG00000006918) ARMC2 (ENSPANG00000006019) SESN1 (ENSPANG00000012995) ##22 ENSPANG00000015284 AFG1L (ENSPANG00000007612) SNX3 (ENSPANG00000045017) ENSPANG00000017995 NR2E1 (ENSPANG00000016092) OSTM1 (ENSPANG00000024443) ENSPANG00000004075 ENSPANG00000044542 RSPH3 (ENSPANG00000015890) TAGAP (ENSPANG00000006087) ENSPANG00000043396 FNDC1 (ENSPANG00000024066) ENSPANG00000046898 ENSPANG00000043348 SOD2 (ENSPANG00000006178) Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 70 ENSGT00390000006350.m.a.c.b.a.b.b.a ENSGT00940000160723 ENSGT00390000018635.c ENSGT00390000002881 ENSGT00530000063583.b ENSGT00950000182962.b.b ##7 ENSGT00550000074943 ENSGT00740000115564 ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159117 ENSGT00390000009166 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ##22 ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00940000153052.c.b.b.b.g.a.b ENSGT00390000004172 ENSGT00940000157993 ENSGT00530000063558.B ENSGT00390000011877 ENSGT00390000013931.a.b.b.`b.a ENSGT01030000234626.B.w.a ENSGT00550000074878.`b.a.a.a ENSGT00390000006394 Sooty mangabey MODERN SPECIES 590 ENSCATG00000006691 SLC22A16 (ENSCATG00000036145) DDO (ENSCATG00000040509) METTL24 (ENSCATG00000037845) CDC40 (ENSCATG00000040070) WASF1 (ENSCATG00000029269) ##7 FIG4 (ENSCATG00000027130) AK9 (ENSCATG00000037888) ZBTB24 (ENSCATG00000039996) MICAL1 (ENSCATG00000032923) SMPD2 (ENSCATG00000015266) PPIL6 (ENSCATG00000042720) CD164 (ENSCATG00000038139) ENSCATG00000036188 CEP57L1 (ENSCATG00000029658) SESN1 (ENSCATG00000025577) ##22 ARMC2 (ENSCATG00000039753) ENSCATG00000039457 ENSCATG00000039123 AFG1L (ENSCATG00000009873) SNX3 (ENSCATG00000029122) NR2E1 (ENSCATG00000040877) OSTM1 (ENSCATG00000039725) ENSCATG00000038882 RSPH3 (ENSCATG00000037174) TAGAP (ENSCATG00000031180) FNDC1 (ENSCATG00000041959) SOD2 (ENSCATG00000041741) ENSCATG00000018577 ENSCATG00000032080 ENSCATG00000029973 Drill MODERN SPECIES 546 FIG4 (ENSMLEG00000009371) AK9 (ENSMLEG00000019200) ZBTB24 (ENSMLEG00000036578) MICAL1 (ENSMLEG00000031079) SMPD2 (ENSMLEG00000039457) PPIL6 (ENSMLEG00000043068) CD164 (ENSMLEG00000043297) ENSMLEG00000019287 ENSMLEG00000038718 CEP57L1 (ENSMLEG00000042256) SESN1 (ENSMLEG00000023202) ##22 ARMC2 (ENSMLEG00000028725) ENSMLEG00000035215 AFG1L (ENSMLEG00000042976) SNX3 (ENSMLEG00000009064) NR2E1 (ENSMLEG00000042106) OSTM1 (ENSMLEG00000042119) ENSMLEG00000034288 RSPH3 (ENSMLEG00000040694) TAGAP (ENSMLEG00000019766) FNDC1 (ENSMLEG00000036645) SOD2 (ENSMLEG00000031266) ENSMLEG00000036194 ACAT2 (ENSMLEG00000030278) ENSMLEG00000010006 MRPL18 (ENSMLEG00000009952) Vervet Monkey MODERN SPECIES 4 SLC22A16 (ENSCSAG00000015502) DDO (ENSCSAG00000015466) METTL24 (ENSCSAG00000015455) CDC40 (ENSCSAG00000015452) WASF1 (ENSCSAG00000015445) ##7 GPR6 (ENSCSAG00000018975) FIG4 (ENSCSAG00000015435) AK9 (ENSCSAG00000015381) ZBTB24 (ENSCSAG00000015347) MICAL1 (ENSCSAG00000015335) SMPD2 (ENSCSAG00000015322) PPIL6 (ENSCSAG00000015318) CD164 (ENSCSAG00000015315) ENSCSAG00000015288 CEP57L1 (ENSCSAG00000015274) SESN1 (ENSCSAG00000015254) ##22 ARMC2 (ENSCSAG00000015188) ENSCSAG00000015174 AFG1L (ENSCSAG00000015166) SNX3 (ENSCSAG00000015156) NR2E1 (ENSCSAG00000015143) OSTM1 (ENSCSAG00000015115) SEC63 (ENSCSAG00000015043) SCML4 (ENSCSAG00000014941) SOBP (ENSCSAG00000014908) ENSCSAG00000014888 PDSS2 (ENSCSAG00000014881) BEND3 (ENSCSAG00000014875) MTRES1 (ENSCSAG00000014865) QRSL1 (ENSCSAG00000014852) RTN4IP1 (ENSCSAG00000014845) Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 282 ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159117 ENSGT00390000009166 ENSGT00940000159634.a ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ##22 ENSGT00390000000663 ENSGT00390000005306.v ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00910000147202 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2360 ENSRROG00000000604 SESN1 (ENSRROG00000039007) ##22 ARMC2 (ENSRROG00000038321) ENSRROG00000015070 ENSRROG00000028438 AFG1L (ENSRROG00000028996) SNX3 (ENSRROG00000037899) NR2E1 (ENSRROG00000044660) OSTM1 (ENSRROG00000029748) SEC63 (ENSRROG00000035523) SCML4 (ENSRROG00000027116) ENSRROG00000024279 SOBP (ENSRROG00000039171) ENSRROG00000033386 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 611 ZBTB24 (ENSRBIG00000036515) MICAL1 (ENSRBIG00000037357) SMPD2 (ENSRBIG00000033388) PPIL6 (ENSRBIG00000039141) CD164 (ENSRBIG00000017887) ENSRBIG00000029996 CEP57L1 (ENSRBIG00000032920) SESN1 (ENSRBIG00000044534) ##22 ARMC2 (ENSRBIG00000039423) ENSRBIG00000041006 AFG1L (ENSRBIG00000043286) SNX3 (ENSRBIG00000036801) NR2E1 (ENSRBIG00000032455) OSTM1 (ENSRBIG00000033044) SEC63 (ENSRBIG00000029238) SCML4 (ENSRBIG00000042673) ENSRBIG00000027620 ENSRBIG00000017827 ENSRBIG00000044333 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000160723 ENSGT00390000018635.c ENSGT00390000002881 ENSGT00530000063583.b ENSGT00950000182962.b.b ##7 ENSGT01060000248564.b.a.a.b ENSGT00550000074943 ENSGT00740000115564 ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159117 ENSGT00390000009166 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ##22 ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00910000147202 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b ENSGT00390000010827 ENSGT00390000009366.d ENSGT00390000018829.z ENSGT00550000074866.i Cebidae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000160723 ENSGT00390000018635.c ENSGT00390000002881 ENSGT00530000063583.b ENSGT00950000182962.b.b ##7 ENSGT01060000248564.b.a.a.b ENSGT00550000074943 ENSGT00740000115564 ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159117 ENSGT00390000009166 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ##22 ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 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ANCESTRAL SPECIES 88 ENSGT00940000160723 ENSGT00390000018635.c ENSGT00390000002881 ENSGT00530000063583.b ENSGT00950000182962.b.b ##7 ENSGT01060000248564.b.a.a.b ENSGT00550000074943 ENSGT00740000115564 ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159117 ENSGT00390000009166 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ##22 ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b.e.a ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00910000147202 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b ENSGT00390000010827 ENSGT00390000009366.d ENSGT00390000018829.y.a.a ENSGT00550000074866.i Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 121 METTL24 (ENSSBOG00000030003) CDC40 (ENSSBOG00000026166) WASF1 (ENSSBOG00000026253) ##7 ENSSBOG00000011808 GPR6 (ENSSBOG00000022566) FIG4 (ENSSBOG00000024922) ENSSBOG00000035502 AK9 (ENSSBOG00000021717) ZBTB24 (ENSSBOG00000030961) MICAL1 (ENSSBOG00000021209) SMPD2 (ENSSBOG00000033929) PPIL6 (ENSSBOG00000013674) CD164 (ENSSBOG00000018127) ENSSBOG00000026390 CEP57L1 (ENSSBOG00000023842) SESN1 (ENSSBOG00000034887) ##22 ARMC2 (ENSSBOG00000034359) ENSSBOG00000025905 ENSSBOG00000026053 AFG1L (ENSSBOG00000032088) SNX3 (ENSSBOG00000028606) NR2E1 (ENSSBOG00000027068) ENSSBOG00000019719 OSTM1 (ENSSBOG00000018033) ENSSBOG00000035021 SEC63 (ENSSBOG00000020518) ENSSBOG00000022627 SCML4 (ENSSBOG00000023263) ENSSBOG00000012379 SOBP (ENSSBOG00000031278) PDSS2 (ENSSBOG00000021644) Capuchin MODERN SPECIES 231 SLC22A16 (ENSCCAG00000027034) DDO (ENSCCAG00000000005) METTL24 (ENSCCAG00000004299) CDC40 (ENSCCAG00000010517) WASF1 (ENSCCAG00000023365) ##7 GPR6 (ENSCCAG00000026698) FIG4 (ENSCCAG00000025196) AK9 (ENSCCAG00000028355) ZBTB24 (ENSCCAG00000021340) SMPD2 (ENSCCAG00000036357) MICAL1 (ENSCCAG00000019494) PPIL6 (ENSCCAG00000024554) CD164 (ENSCCAG00000018828) ENSCCAG00000025593 CEP57L1 (ENSCCAG00000024334) SESN1 (ENSCCAG00000025803) ##22 ARMC2 (ENSCCAG00000022560) Mas night monkey MODERN SPECIES 478 SLC22A16 (ENSANAG00000037609) DDO (ENSANAG00000033581) METTL24 (ENSANAG00000029394) CDC40 (ENSANAG00000018830) WASF1 (ENSANAG00000014957) ##7 GPR6 (ENSANAG00000024209) FIG4 (ENSANAG00000026338) AK9 (ENSANAG00000028754) ZBTB24 (ENSANAG00000023992) MICAL1 (ENSANAG00000034803) SMPD2 (ENSANAG00000028732) PPIL6 (ENSANAG00000023713) CD164 (ENSANAG00000012591) ENSANAG00000036298 CEP57L1 (ENSANAG00000031702) SESN1 (ENSANAG00000026899) ##22 ARMC2 (ENSANAG00000027283) ENSANAG00000023931 AFG1L (ENSANAG00000033061) SNX3 (ENSANAG00000028701) ENSANAG00000030536 NR2E1 (ENSANAG00000020325) ENSANAG00000037950 ENSANAG00000019987 SEC63 (ENSANAG00000022108) SCML4 (ENSANAG00000021645) ENSANAG00000025986 SOBP (ENSANAG00000034007) PDSS2 (ENSANAG00000015555) BEND3 (ENSANAG00000021126) ENSANAG00000037315 Tarsier MODERN SPECIES 2854 CEP57L1 (ENSTSYG00000010419) SESN1 (ENSTSYG00000004141) ##22 ARMC2 (ENSTSYG00000007385) Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00950000185357 ENSGT00740000115564 ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159117 ENSGT00390000009166 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000165946 ENSGT00940000165257 ENSGT00940000164734 ENSGT00390000002042 ENSGT00390000007445 ENSGT01030000235833 ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ##22 ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00950000186137 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b ENSGT00390000010827 ENSGT00390000010020 ENSGT00390000009366 ENSGT00390000018829 Tree shrew MODERN SPECIES 5127 ENSTBEG00000013409 CEP57L1 (ENSTBEG00000012835) SESN1 (ENSTBEG00000012275) ##22 ARMC2 (ENSTBEG00000010714) ENSTBEG00000010256 Glires ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00950000185357 ENSGT00740000115564 ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159117 ENSGT00390000009166 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000165946 ENSGT00940000165257 ENSGT00940000164734 ENSGT00390000002042 ENSGT00390000007445 ENSGT01030000235833 ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ##22 ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00950000186137 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b ENSGT00390000010827 ENSGT00390000010020 ENSGT00390000009366 ENSGT00390000018829 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00950000182962.b.b.b ##7 ENSGT01060000248564.b.a.a.b ENSGT00550000074943 ENSGT00740000115564 ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159117 ENSGT00390000009166 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00940000165257 ENSGT00940000164734 ENSGT00390000002042 ENSGT00390000007445 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ##22 ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 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MODERN SPECIES 563 CD164 (ENSOPRG00000014063) ENSOPRG00000014052 ENSOPRG00000014025 ENSOPRG00000014000 ENSOPRG00000013981 CEP57L1 (ENSOPRG00000013962) SESN1 (ENSOPRG00000013941) ##22 ARMC2 (ENSOPRG00000013907) Rodentia ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00950000182962.b.b.b ##7 ENSGT01060000248564.b.a.a.b ENSGT00550000074943 ENSGT00950000185357 ENSGT00740000115564 ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159117 ENSGT00390000009166 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000165946 ENSGT00390000007445 ENSGT01030000235833 ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ##22 ENSGT00940000168689 ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00950000186137 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b ENSGT00390000010827 ENSGT00390000009366 ENSGT00390000018829 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000018635.c ENSGT00390000002881 ENSGT00530000063583.b ENSGT00950000182962.b.b.b ##7 ENSGT01060000248564.b.a.a.b ENSGT00550000074943 ENSGT00950000185357 ENSGT00740000115564 ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159117 ENSGT00390000009166 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ##22 ENSGT00940000168689 ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00950000186137 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b ENSGT00390000010827 ENSGT00390000009366 ENSGT00390000018829 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES 41 ENSGT00390000000510 ENSGT00390000011776 ENSGT00940000158213 ENSGT00390000018635.c ENSGT00390000002881 ENSGT00530000063583.b ENSGT00950000182962.b.b.b ##7 ENSGT01060000248564.b.a.a.b ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159117 ENSGT00390000009166 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ##22 ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b ENSGT00390000010827 ENSGT00390000009366 ENSGT00390000018829 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES 46 ENSGT00390000000510 ENSGT00390000011776 ENSGT00940000158213 ENSGT00390000018635.c ENSGT00390000002881 ENSGT00530000063583.b ENSGT00950000182962.b.b.b ##7 ENSGT01060000248564.b.a.a.b ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159117 ENSGT00390000009166 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ##22 ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b ENSGT00390000010827 ENSGT00390000009366 ENSGT00390000018829 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES 41 ENSGT00390000000510 ENSGT00390000011776 ENSGT00940000158213 ENSGT00390000018635.c ENSGT00390000002881 ENSGT00530000063583.b ENSGT00950000182962.b.b.b ##7 ENSGT01060000248564.b.a.a.b ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159117 ENSGT00390000009166 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ##22 ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b ENSGT00390000010827 ENSGT00390000009366 ENSGT00390000018829 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 118 GTF3C6 (ENSCLAG00000009425) AMD1 (ENSCLAG00000009847) CDK19 (ENSCLAG00000010777) DDO (ENSCLAG00000009502) METTL24 (ENSCLAG00000012913) CDC40 (ENSCLAG00000009515) WASF1 (ENSCLAG00000009978) ##7 GPR6 (ENSCLAG00000009486) ZBTB24 (ENSCLAG00000011189) MICAL1 (ENSCLAG00000012170) SMPD2 (ENSCLAG00000009948) PPIL6 (ENSCLAG00000009714) CD164 (ENSCLAG00000009279) ENSCLAG00000009929 CEP57L1 (ENSCLAG00000010353) SESN1 (ENSCLAG00000012296) ##22 ENSCLAG00000009751 ENSCLAG00000009801 ENSCLAG00000010630 AFG1L (ENSCLAG00000012599) SNX3 (ENSCLAG00000011964) NR2E1 (ENSCLAG00000017092) OSTM1 (ENSCLAG00000014636) SEC63 (ENSCLAG00000010535) SCML4 (ENSCLAG00000009941) SOBP (ENSCLAG00000009567) PDSS2 (ENSCLAG00000011033) BEND3 (ENSCLAG00000009701) MTRES1 (ENSCLAG00000017356) CD24 (ENSCLAG00000011622) QRSL1 (ENSCLAG00000017367) Degu MODERN SPECIES 131 ENSODEG00000013529 GTF3C6 (ENSODEG00000013017) ENSODEG00000012898 CDK19 (ENSODEG00000012764) ENSODEG00000014327 ENSODEG00000012677 ENSODEG00000012903 METTL24 (ENSODEG00000013180) CDC40 (ENSODEG00000012990) WASF1 (ENSODEG00000012933) ##7 GPR6 (ENSODEG00000020143) ENSODEG00000020129 ZBTB24 (ENSODEG00000014058) MICAL1 (ENSODEG00000013443) ENSODEG00000013880 SESN1 (ENSODEG00000013348) ##22 ENSODEG00000014459 AFG1L (ENSODEG00000014385) ENSODEG00000013844 NR2E1 (ENSODEG00000014374) ENSODEG00000013551 ENSODEG00000014366 ENSODEG00000014125 SEC63 (ENSODEG00000012763) SOBP (ENSODEG00000014370) BEND3 (ENSODEG00000012604) ENSODEG00000013192 ENSODEG00000014020 ENSODEG00000014646 QRSL1 (ENSODEG00000012491) RTN4IP1 (ENSODEG00000012956) Guinea pig MODERN SPECIES 63 DDO (ENSCPOG00000031744) METTL24 (ENSCPOG00000010973) ENSCPOG00000010967 WASF1 (ENSCPOG00000004089) ##7 ZBTB24 (ENSCPOG00000003110) MICAL1 (ENSCPOG00000003105) SMPD2 (ENSCPOG00000003102) PPIL6 (ENSCPOG00000003098) CD164 (ENSCPOG00000034850) ENSCPOG00000012574 CEP57L1 (ENSCPOG00000035572) SESN1 (ENSCPOG00000013793) ##22 ARMC2 (ENSCPOG00000006505) ENSCPOG00000021906 AFG1L (ENSCPOG00000011326) SNX3 (ENSCPOG00000032088) NR2E1 (ENSCPOG00000000097) OSTM1 (ENSCPOG00000010183) SEC63 (ENSCPOG00000002486) SCML4 (ENSCPOG00000012909) SOBP (ENSCPOG00000012904) PDSS2 (ENSCPOG00000009293) BEND3 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ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00950000186137 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b ENSGT00390000010827 ENSGT00390000009366 ENSGT00390000018829.u.a.b Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 86 ENSGT00390000002881 ENSGT00530000063583.b ENSGT00950000182962.b.b.b ##7 ENSGT01060000248564.b.a.a.b ENSGT00550000074943 ENSGT00950000185357 ENSGT00740000115564 ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159117 ENSGT00390000009166 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000165946 ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ##22 ENSGT00940000168689 ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00950000186137 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b ENSGT00390000010827 ENSGT00390000009366 ENSGT00390000018829.u.a.b Squirrel MODERN SPECIES 164 CDK19 (ENSSTOG00000024165) DDO (ENSSTOG00000006021) METTL24 (ENSSTOG00000006015) CDC40 (ENSSTOG00000024426) ENSSTOG00000005949 ##7 GPR6 (ENSSTOG00000011502) FIG4 (ENSSTOG00000011494) ENSSTOG00000030456 ENSSTOG00000011481 ZBTB24 (ENSSTOG00000011460) MICAL1 (ENSSTOG00000011447) SMPD2 (ENSSTOG00000028661) PPIL6 (ENSSTOG00000011426) ENSSTOG00000011417 CEP57L1 (ENSSTOG00000019505) SESN1 (ENSSTOG00000011391) ##22 ENSSTOG00000000896 ENSSTOG00000032092 ENSSTOG00000021457 ENSSTOG00000022339 AFG1L (ENSSTOG00000001115) SNX3 (ENSSTOG00000007274) NR2E1 (ENSSTOG00000007248) ENSSTOG00000012195 SEC63 (ENSSTOG00000009628) SCML4 (ENSSTOG00000004682) SOBP (ENSSTOG00000025137) PDSS2 (ENSSTOG00000015790) BEND3 (ENSSTOG00000026766) MTRES1 (ENSSTOG00000015779) ENSSTOG00000030850 Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 70 DDO (ENSUPAG00010011172) METTL24 (ENSUPAG00010011195) CDC40 (ENSUPAG00010011201) WASF1 (ENSUPAG00010011212) ##7 GPR6 (ENSUPAG00010011220) FIG4 (ENSUPAG00010011226) ENSUPAG00010011244 ENSUPAG00010011248 ZBTB24 (ENSUPAG00010011264) MICAL1 (ENSUPAG00010011267) SMPD2 (ENSUPAG00010011331) PPIL6 (ENSUPAG00010011347) ENSUPAG00010011356 ENSUPAG00010011362 CEP57L1 (ENSUPAG00010011576) SESN1 (ENSUPAG00010011586) ##22 ARMC2 (ENSUPAG00010011607) ENSUPAG00010011642 AFG1L (ENSUPAG00010011647) SNX3 (ENSUPAG00010011668) NR2E1 (ENSUPAG00010011686) OSTM1 (ENSUPAG00010011701) SEC63 (ENSUPAG00010011708) SCML4 (ENSUPAG00010011728) ENSUPAG00010011737 SOBP (ENSUPAG00010011741) PDSS2 (ENSUPAG00010011770) MTRES1 (ENSUPAG00010011795) ENSUPAG00010011806 ENSUPAG00010011822 QRSL1 (ENSUPAG00010011831) Alpin marmot MODERN SPECIES 2 METTL24 (ENSMMMG00000014600) CDC40 (ENSMMMG00000014580) ENSMMMG00000014554 ##7 GPR6 (ENSMMMG00000014540) FIG4 (ENSMMMG00000014523) ENSMMMG00000014502 ENSMMMG00000014484 ENSMMMG00000014463 ZBTB24 (ENSMMMG00000014455) MICAL1 (ENSMMMG00000014375) SMPD2 (ENSMMMG00000014360) PPIL6 (ENSMMMG00000014353) ENSMMMG00000014239 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ENSSVLG00005006799 SNX3 (ENSSVLG00005006830) NR2E1 (ENSSVLG00005006886) OSTM1 (ENSSVLG00005006950) SEC63 (ENSSVLG00005006987) SCML4 (ENSSVLG00005007050) SOBP (ENSSVLG00005007145) PDSS2 (ENSSVLG00005007210) BEND3 (ENSSVLG00005007266) MTRES1 (ENSSVLG00005007294) ENSSVLG00005007327 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00390000002881 ENSGT00530000063583.b ENSGT00950000182962.b.b.b ##7 ENSGT01060000248564.b.a.a.b ENSGT00550000074943 ENSGT00740000115564 ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159117 ENSGT00390000009166 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00940000165946 ENSGT00390000007445 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ##22 ENSGT00940000168689 ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00950000186137 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b ENSGT00390000010827 ENSGT00390000009366 ENSGT00390000018829 Kangaroo rat MODERN SPECIES 381 Cdk19 (ENSDORG00000003302) Ddo (ENSDORG00000025140) Mettl24 (ENSDORG00000000126) Cdc40 (ENSDORG00000000123) Wasf1 (ENSDORG00000009800) ##7 Gpr6 (ENSDORG00000006811) Fig4 (ENSDORG00000016449) ENSDORG00000006493 Zbtb24 (ENSDORG00000006492) Mical1 (ENSDORG00000006489) Smpd2 (ENSDORG00000006485) Ppil6 (ENSDORG00000006483) Cd164 (ENSDORG00000006481) Ccdc162 (ENSDORG00000025217) Cep57l1 (ENSDORG00000016514) Sesn1 (ENSDORG00000016747) ##22 Armc2 (ENSDORG00000016746) Foxo3 (ENSDORG00000029794) Afg1l (ENSDORG00000014557) ENSDORG00000027527 Snx3 (ENSDORG00000024533) ENSDORG00000007523 Ostm1 (ENSDORG00000025626) Sec63 (ENSDORG00000002266) ENSDORG00000012141 ENSDORG00000028096 ENSDORG00000030234 ENSDORG00000023606 Pdss2 (ENSDORG00000001388) Bend3 (ENSDORG00000013215) Mtres1 (ENSDORG00000014894) Myomorpha ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00390000002881 ENSGT00530000063583.b ENSGT00950000182962.b.b.b ##7 ENSGT01060000248564.b.a.a.b ENSGT00550000074943 ENSGT00740000115564 ENSGT00940000159373 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ENSGT00940000157463.y.a ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b ENSGT00390000010827 ENSGT00390000009366 ENSGT00390000018829.g.b Bovidae ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00390000018635.c ENSGT00390000002881 ENSGT00530000063583.b ENSGT00950000182962.b.b ##7 ENSGT01060000248564.b.a.a.b ENSGT00550000074943 ENSGT00950000185357 ENSGT00740000115564 ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159117 ENSGT00390000009166 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ##22 ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00940000158886.g.b ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463.z ENSGT00950000186137 ENSGT00940000157463.y.a ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b ENSGT00390000010827 ENSGT00390000009366 Bovinae ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000160723 ENSGT00390000018635.c ENSGT00390000002881 ENSGT00530000063583.b ENSGT00950000182962.b.b ##7 ENSGT01060000248564.b.a.a.b ENSGT00550000074943 ENSGT00740000115564 ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159117 ENSGT00390000009166 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ##22 ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00390000005569.x.a.b.b.b ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00940000158886.g.b ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463.z ENSGT00950000186137 ENSGT00940000157463.y.a ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b ENSGT00390000010827 Bos ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00390000018635.c ENSGT00390000002881 ENSGT00530000063583.b.r ENSGT01100000263481.n.a.a.b.b.b.a.a.b.b.a ENSGT00950000182962.b.b ##7 ENSGT01060000248564.b.a.a.b ENSGT00550000074943 ENSGT00740000115564 ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159117 ENSGT00390000009166 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ##22 ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00390000005569.x.a.b.b.b ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00940000158886.g.b ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463.z ENSGT00950000186137 ENSGT00940000157463.y.a ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b ENSGT00390000010827 Bos_a ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00390000018635.c ENSGT00390000002881 ENSGT00530000063583.b.r ENSGT01100000263481.n.a.a.b.b.b.a.a.b.b.a ENSGT00950000182962.b.b ##7 ENSGT01060000248564.b.a.a.b ENSGT00550000074943 ENSGT00740000115564 ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159117 ENSGT00390000009166 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ##22 ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00390000005569.x.a.b.b.b ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00940000158886.g.b ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463.z ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b ENSGT00390000010827 ENSGT00390000009366 ENSGT00390000018829.g.b Wild yak MODERN SPECIES 1836 AK9 (ENSBMUG00000017187) ZBTB24 (ENSBMUG00000017102) MICAL1 (ENSBMUG00000017071) SMPD2 (ENSBMUG00000017006) PPIL6 (ENSBMUG00000016998) CD164 (ENSBMUG00000016961) ENSBMUG00000016865 CEP57L1 (ENSBMUG00000016776) SESN1 (ENSBMUG00000016686) ##22 ARMC2 (ENSBMUG00000016656) Domestic yak MODERN SPECIES 1 METTL24 (ENSBGRG00000010132) CDC40 (ENSBGRG00000010004) ENSBGRG00000009977 WASF1 (ENSBGRG00000009881) ##7 GPR6 (ENSBGRG00000009859) FIG4 (ENSBGRG00000009603) ENSBGRG00000009563 AK9 (ENSBGRG00000009411) ZBTB24 (ENSBGRG00000009379) MICAL1 (ENSBGRG00000008908) SMPD2 (ENSBGRG00000008790) PPIL6 (ENSBGRG00000008618) CD164 (ENSBGRG00000008478) ENSBGRG00000008378 CEP57L1 (ENSBGRG00000008020) SESN1 (ENSBGRG00000007696) ##22 ARMC2 (ENSBGRG00000007272) ENSBGRG00000007174 AFG1L (ENSBGRG00000007086) ENSBGRG00000007070 ENSBGRG00000006976 NR2E1 (ENSBGRG00000006910) ENSBGRG00000006887 OSTM1 (ENSBGRG00000006844) SEC63 (ENSBGRG00000006724) SCML4 (ENSBGRG00000006677) SOBP (ENSBGRG00000006590) PDSS2 (ENSBGRG00000006508) ENSBGRG00000006478 MTRES1 (ENSBGRG00000006439) ENSBGRG00000006411 Bos_b ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00390000018635.c ENSGT00390000002881 ENSGT00530000063583.b.r ENSGT01100000263481.n.a.a.b.b.b.a.a.b.b.a ENSGT00950000182962.b.b ##7 ENSGT01060000248564.b.a.a.b ENSGT00550000074943 ENSGT00740000115564 ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159117 ENSGT00390000009166 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ##22 ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00390000005569.x.a.b.b.b ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00940000158886.g.b ENSGT00390000012341 ENSGT00390000013102.e.b ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463.z ENSGT00950000186137 ENSGT00940000157463.y.a ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 28 METTL24 (ENSBIXG00005008932) ENSBIXG00005008887 WASF1 (ENSBIXG00005008790) ##7 ENSBIXG00005008724 GPR6 (ENSBIXG00005008717) FIG4 (ENSBIXG00005008671) ENSBIXG00005008588 AK9 (ENSBIXG00005008574) ZBTB24 (ENSBIXG00005008537) MICAL1 (ENSBIXG00005008498) SMPD2 (ENSBIXG00005008416) PPIL6 (ENSBIXG00005008387) CD164 (ENSBIXG00005008319) ENSBIXG00005008275 CEP57L1 (ENSBIXG00005008200) SESN1 (ENSBIXG00005008131) ##22 ARMC2 (ENSBIXG00005008081) ENSBIXG00005008024 ENSBIXG00005008006 AFG1L (ENSBIXG00005007990) ENSBIXG00005007977 SNX3 (ENSBIXG00005007963) ENSBIXG00005007943 NR2E1 (ENSBIXG00005007933) ENSBIXG00005000025 OSTM1 (ENSBIXG00005007909) ENSBIXG00005007898 SEC63 (ENSBIXG00005007877) SCML4 (ENSBIXG00005029296) ENSBIXG00005029333 SOBP (ENSBIXG00005029342) Cow MODERN SPECIES 28 DDO (ENSBTAG00000033367) METTL24 (ENSBTAG00000033365) CDC40 (ENSBTAG00000000409) WASF1 (ENSBTAG00000016627) ##7 GPR6 (ENSBTAG00000002868) FIG4 (ENSBTAG00000005827) AK9 (ENSBTAG00000010116) ENSBTAG00000050418 ZBTB24 (ENSBTAG00000010113) MICAL1 (ENSBTAG00000008147) SMPD2 (ENSBTAG00000008145) PPIL6 (ENSBTAG00000008144) CD164 (ENSBTAG00000017992) ENSBTAG00000026637 CEP57L1 (ENSBTAG00000019410) SESN1 (ENSBTAG00000003015) ##22 ARMC2 (ENSBTAG00000036087) FOXO3 (ENSBTAG00000011234) AFG1L (ENSBTAG00000014592) ENSBTAG00000045504 SNX3 (ENSBTAG00000018801) NR2E1 (ENSBTAG00000013991) ENSBTAG00000010148 OSTM1 (ENSBTAG00000010134) ENSBTAG00000023792 SEC63 (ENSBTAG00000016562) SCML4 (ENSBTAG00000005699) SOBP (ENSBTAG00000019175) ENSBTAG00000052829 PDSS2 (ENSBTAG00000021859) BEND3 (ENSBTAG00000012534) American bison MODERN SPECIES 3287 SLC22A16 (ENSBBBG00000011259) DDO (ENSBBBG00000011247) METTL24 (ENSBBBG00000011242) CDC40 (ENSBBBG00000011225) WASF1 (ENSBBBG00000011194) ##7 GPR6 (ENSBBBG00000011177) FIG4 (ENSBBBG00000007647) AK9 (ENSBBBG00000011151) ZBTB24 (ENSBBBG00000011104) MICAL1 (ENSBBBG00000011094) SMPD2 (ENSBBBG00000011057) PPIL6 (ENSBBBG00000011044) CD164 (ENSBBBG00000011010) ENSBBBG00000010975 CEP57L1 (ENSBBBG00000001939) SESN1 (ENSBBBG00000001906) ##22 ARMC2 (ENSBBBG00000001902) ENSBBBG00000010823 AFG1L (ENSBBBG00000009042) ENSBBBG00000001898 SNX3 (ENSBBBG00000010797) NR2E1 (ENSBBBG00000010790) ENSBBBG00000010783 OSTM1 (ENSBBBG00000010779) ENSBBBG00000010776 SEC63 (ENSBBBG00000010770) SCML4 (ENSBBBG00000001886) ENSBBBG00000001880 ENSBBBG00000010739 PDSS2 (ENSBBBG00000010733) BEND3 (ENSBBBG00000001878) Caprinae ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00390000018635.c ENSGT00390000002881 ENSGT00530000063583.b ENSGT00950000182962.b.b ##7 ENSGT01060000248564.b.a.a.b ENSGT00550000074943 ENSGT00950000185357 ENSGT00740000115564 ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159117 ENSGT00390000009166 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ##22 ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00940000158886.g.b ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463.z ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b ENSGT00390000010827 ENSGT00390000009366 ENSGT00390000018829.g.b ENSGT00550000074866.c Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 24 SLC22A16 (ENSOARG00020006357) METTL24 (ENSOARG00020006706) CDC40 (ENSOARG00020006768) ENSOARG00020006882 WASF1 (ENSOARG00020006922) ##7 GPR6 (ENSOARG00020006994) FIG4 (ENSOARG00020007040) AK9 (ENSOARG00020007722) ZBTB24 (ENSOARG00020008227) MICAL1 (ENSOARG00020008299) SMPD2 (ENSOARG00020008673) PPIL6 (ENSOARG00020008709) CD164 (ENSOARG00020008950) ENSOARG00020009174 CEP57L1 (ENSOARG00020009709) SESN1 (ENSOARG00020009820) ##22 ARMC2 (ENSOARG00020009986) FOXO3 (ENSOARG00020010382) AFG1L (ENSOARG00020010438) SNX3 (ENSOARG00020010555) NR2E1 (ENSOARG00020010722) OSTM1 (ENSOARG00020010926) SEC63 (ENSOARG00020011009) SCML4 (ENSOARG00020011208) SOBP (ENSOARG00020011474) PDSS2 (ENSOARG00020011577) BEND3 (ENSOARG00020011619) MTRES1 (ENSOARG00020011697) CD24 (ENSOARG00020011839) QRSL1 (ENSOARG00020011934) RTN4IP1 (ENSOARG00020012231) Goat MODERN SPECIES 28 METTL24 (ENSCHIG00000016378) CDC40 (ENSCHIG00000017603) ENSCHIG00000024447 WASF1 (ENSCHIG00000012119) ##7 GPR6 (ENSCHIG00000009972) FIG4 (ENSCHIG00000015141) ENSCHIG00000011551 ENSCHIG00000025955 ZBTB24 (ENSCHIG00000024294) MICAL1 (ENSCHIG00000016425) SMPD2 (ENSCHIG00000022563) PPIL6 (ENSCHIG00000003703) CD164 (ENSCHIG00000021803) ENSCHIG00000013583 CEP57L1 (ENSCHIG00000015261) SESN1 (ENSCHIG00000017822) ##22 ARMC2 (ENSCHIG00000014666) ENSCHIG00000018293 AFG1L (ENSCHIG00000015722) SNX3 (ENSCHIG00000003391) NR2E1 (ENSCHIG00000020755) ENSCHIG00000023983 OSTM1 (ENSCHIG00000017859) SEC63 (ENSCHIG00000021240) SCML4 (ENSCHIG00000010706) SOBP (ENSCHIG00000007832) PDSS2 (ENSCHIG00000015163) BEND3 (ENSCHIG00000010728) MTRES1 (ENSCHIG00000005527) CD24 (ENSCHIG00000015151) ENSCHIG00000017313 Siberian musk deer MODERN SPECIES 56 CDK19 (ENSMMSG00000006989) ENSMMSG00000007077 METTL24 (ENSMMSG00000007180) CDC40 (ENSMMSG00000007218) WASF1 (ENSMMSG00000007262) ##7 GPR6 (ENSMMSG00000007280) FIG4 (ENSMMSG00000007332) AK9 (ENSMMSG00000007486) ZBTB24 (ENSMMSG00000007824) MICAL1 (ENSMMSG00000007853) SMPD2 (ENSMMSG00000007933) PPIL6 (ENSMMSG00000007997) CD164 (ENSMMSG00000008120) ENSMMSG00000008198 CEP57L1 (ENSMMSG00000008586) SESN1 (ENSMMSG00000008745) ##22 ARMC2 (ENSMMSG00000008874) Yarkand deer MODERN SPECIES 20 SLC22A16 (ENSCHYG00000014996) DDO (ENSCHYG00000015156) METTL24 (ENSCHYG00000015290) CDC40 (ENSCHYG00000015430) WASF1 (ENSCHYG00000015597) ##7 GPR6 (ENSCHYG00000015711) FIG4 (ENSCHYG00000015765) AK9 (ENSCHYG00000016101) ZBTB24 (ENSCHYG00000016755) MICAL1 (ENSCHYG00000016852) SMPD2 (ENSCHYG00000017327) PPIL6 (ENSCHYG00000017457) ENSCHYG00000017708 CD164 (ENSCHYG00000017778) CEP57L1 (ENSCHYG00000018844) SESN1 (ENSCHYG00000019343) ##22 ARMC2 (ENSCHYG00000019746) ENSCHYG00000019977 AFG1L (ENSCHYG00000020011) SNX3 (ENSCHYG00000020227) NR2E1 (ENSCHYG00000020431) ENSCHYG00000020616 ENSCHYG00000020693 OSTM1 (ENSCHYG00000020769) SEC63 (ENSCHYG00000020896) SCML4 (ENSCHYG00000021381) SOBP (ENSCHYG00000021447) PDSS2 (ENSCHYG00000021575) ENSCHYG00000021717 BEND3 (ENSCHYG00000021757) MTRES1 (ENSCHYG00000021800) Camelidae ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000160723 ENSGT00390000018635.c ENSGT00390000002881 ENSGT00530000063583.b ENSGT00950000182962.b.b ##7 ENSGT01060000248564.b.a.a.b ENSGT00550000074943 ENSGT00740000115564 ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159117 ENSGT00390000009166 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ##22 ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463.z ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b ENSGT00390000010827 ENSGT00390000009366 ENSGT00390000018829.g.b ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b Arabian camel MODERN SPECIES 34 SLC22A16 (ENSCDRG00005004397) METTL24 (ENSCDRG00005004497) CDC40 (ENSCDRG00005004549) WASF1 (ENSCDRG00005004609) ##7 GPR6 (ENSCDRG00005006404) FIG4 (ENSCDRG00005006506) ENSCDRG00005006596 ENSCDRG00005006740 ZBTB24 (ENSCDRG00005006796) MICAL1 (ENSCDRG00005006865) SMPD2 (ENSCDRG00005007239) PPIL6 (ENSCDRG00005007281) ENSCDRG00005007462 ENSCDRG00005007597 CEP57L1 (ENSCDRG00005007702) SESN1 (ENSCDRG00005008310) ##22 ARMC2 (ENSCDRG00005008518) ENSCDRG00005008590 ENSCDRG00005008617 AFG1L (ENSCDRG00005008669) SNX3 (ENSCDRG00005008756) NR2E1 (ENSCDRG00005008907) OSTM1 (ENSCDRG00005009034) SEC63 (ENSCDRG00005009103) SCML4 (ENSCDRG00005009375) ENSCDRG00005009503 PDSS2 (ENSCDRG00005009549) BEND3 (ENSCDRG00005009651) MTRES1 (ENSCDRG00005009712) ENSCDRG00005009820 QRSL1 (ENSCDRG00005009875) Alpaca MODERN SPECIES 2964 FIG4 (ENSVPAG00000000831) ENSVPAG00000000830 ENSVPAG00000000829 ENSVPAG00000000828 ZBTB24 (ENSVPAG00000000827) SMPD2 (ENSVPAG00000000826) PPIL6 (ENSVPAG00000000825) CD164 (ENSVPAG00000000824) ENSVPAG00000000822 ENSVPAG00000000821 CEP57L1 (ENSVPAG00000000820) SESN1 (ENSVPAG00000000819) ##22 ARMC2 (ENSVPAG00000000818) ENSVPAG00000000815 AFG1L (ENSVPAG00000000813) SNX3 (ENSVPAG00000000812) NR2E1 (ENSVPAG00000000807) OSTM1 (ENSVPAG00000000804) Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000018635.c ENSGT00390000002881 ENSGT00530000063583.b ENSGT00950000182962.b.b ##7 ENSGT01060000248564.b.a.a.b ENSGT00550000074943 ENSGT00740000115564 ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159117 ENSGT00950000185408 ENSGT00390000009166 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ##22 ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463.y.b ENSGT00940000157463.z ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b ENSGT00390000010827 ENSGT00390000010020 ENSGT00390000009366 ENSGT00390000018829 Carnivora ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000018635.c ENSGT00390000002881 ENSGT00530000063583.b ENSGT00950000182962.b.b ##7 ENSGT01060000248564.b.a.a.b ENSGT00550000074943 ENSGT00740000115564 ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159117 ENSGT00950000185408 ENSGT00390000009166 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ##22 ENSGT00390000000663 ENSGT00940000164355 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463.y.b ENSGT00940000157463.z ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b ENSGT00390000010827 ENSGT00390000010020 ENSGT00390000009366 Caniformia ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000018635.c ENSGT00390000002881 ENSGT00530000063583.b ENSGT00950000182962.b.b ##7 ENSGT01060000248564.b.a.a.b ENSGT00550000074943 ENSGT00740000115564 ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159117 ENSGT00950000185408 ENSGT00390000009166 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ##22 ENSGT00390000000663 ENSGT00940000164355 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463.y.b ENSGT00940000157463.z ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b ENSGT00390000010827 ENSGT00390000010020 ENSGT00390000009366 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000018635.c ENSGT00390000002881 ENSGT00530000063583.b ENSGT00950000182962.b.b ##7 ENSGT01060000248564.b.a.a.b ENSGT00550000074943 ENSGT00740000115564 ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159117 ENSGT00950000185408 ENSGT00390000009166 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ##22 ENSGT00390000000663 ENSGT00940000164355 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463.y.b ENSGT00940000157463.z ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b ENSGT00390000010827 ENSGT00390000010020 ENSGT00390000009366 Ursidae ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00390000018635.c ENSGT00390000002881 ENSGT00530000063583.b ENSGT00950000182962.b.b ##7 ENSGT01060000248564.b.a.a.b ENSGT00550000074943 ENSGT00740000115564 ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159117 ENSGT00950000185408 ENSGT00390000009166 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ##22 ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463.y.b ENSGT00940000157463.y.a ENSGT00940000157463.z ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b ENSGT00390000010827 ENSGT00390000010020 ENSGT00390000009366 Ursus ANCESTRAL SPECIES 159 ENSGT00940000160723 ENSGT00390000018635.c ENSGT00390000002881 ENSGT00530000063583.b ENSGT00950000182962.b.b ##7 ENSGT00550000074943 ENSGT00740000115564 ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159117 ENSGT00950000185408 ENSGT00390000009166 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ##22 ENSGT00390000000663 American black bear MODERN SPECIES 6159 SESN1 (ENSUAMG00000000986) ##22 Polar bear MODERN SPECIES 286 METTL24 (ENSUMAG00000025494) ENSUMAG00000025495 CDC40 (ENSUMAG00000025496) WASF1 (ENSUMAG00000025497) ##7 FIG4 (ENSUMAG00000025498) ENSUMAG00000025499 ENSUMAG00000025500 ZBTB24 (ENSUMAG00000025501) MICAL1 (ENSUMAG00000025502) PPIL6 (ENSUMAG00000025504) SMPD2 (ENSUMAG00000025505) CD164 (ENSUMAG00000025512) ENSUMAG00000025513 CEP57L1 (ENSUMAG00000025519) ENSUMAG00000025520 SESN1 (ENSUMAG00000025521) ##22 ARMC2 (ENSUMAG00000025526) Giant Panda MODERN SPECIES 1 DDO (ENSAMEG00000003452) ENSAMEG00000030768 METTL24 (ENSAMEG00000003450) CDC40 (ENSAMEG00000016306) WASF1 (ENSAMEG00000016334) ##7 GPR6 (ENSAMEG00000016351) FIG4 (ENSAMEG00000016354) AK9 (ENSAMEG00000016379) ZBTB24 (ENSAMEG00000016387) MICAL1 (ENSAMEG00000016390) SMPD2 (ENSAMEG00000016431) PPIL6 (ENSAMEG00000016447) CD164 (ENSAMEG00000016459) ENSAMEG00000016463 CEP57L1 (ENSAMEG00000008220) SESN1 (ENSAMEG00000008179) ##22 ARMC2 (ENSAMEG00000008162) ENSAMEG00000008158 AFG1L (ENSAMEG00000008150) SNX3 (ENSAMEG00000008145) NR2E1 (ENSAMEG00000008117) OSTM1 (ENSAMEG00000008114) SEC63 (ENSAMEG00000008074) SCML4 (ENSAMEG00000008065) SOBP (ENSAMEG00000008061) ENSAMEG00000025863 PDSS2 (ENSAMEG00000008056) BEND3 (ENSAMEG00000008053) ENSAMEG00000023827 MTRES1 (ENSAMEG00000008052) CD24 (ENSAMEG00000031404) Mustelinae ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00390000013951.fb.a ENSGT00390000018635.c ENSGT00390000002881 ENSGT00530000063583.b ENSGT00950000182962.b.b ##7 ENSGT01060000248564.b.a.a.b ENSGT00550000074943 ENSGT00740000115564 ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159117 ENSGT00390000009166 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ##22 ENSGT00390000000663 ENSGT00940000164355 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463.y.b ENSGT00940000157463.z ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b ENSGT00390000010827 ENSGT00390000010020 ENSGT00390000009366 American mink MODERN SPECIES 4 METTL24 (ENSNVIG00000005328) PRP17 (ENSNVIG00000005223) WASF1 (ENSNVIG00000005181) ##7 GPR6 (ENSNVIG00000005173) FIG4 (ENSNVIG00000005098) ENSNVIG00000005076 ENSNVIG00000005043 ENSNVIG00000005025 ZBTB24 (ENSNVIG00000005004) C9JLN4 (ENSNVIG00000004826) NSMA (ENSNVIG00000004777) PPIL6 (ENSNVIG00000004754) CD164 (ENSNVIG00000004672) ENSNVIG00000004647 CEP57L1 (ENSNVIG00000004602) SESN1 (ENSNVIG00000004555) ##22 ARMC2 (ENSNVIG00000004503) ENSNVIG00000004489 ENSNVIG00000004481 LACE1 (ENSNVIG00000004442) SNX3 (ENSNVIG00000004406) NR2E1 (ENSNVIG00000004390) OSTM1 (ENSNVIG00000004375) ENSNVIG00000004361 SEC63 (ENSNVIG00000004305) ENSNVIG00000004288 ENSNVIG00000004283 SOBP (ENSNVIG00000004254) ENSNVIG00000004244 PDSS2 (ENSNVIG00000004192) BEND3 (ENSNVIG00000004176) Ferret MODERN SPECIES 201 METTL24 (ENSMPUG00000010099) CDC40 (ENSMPUG00000010089) WASF1 (ENSMPUG00000010079) ##7 GPR6 (ENSMPUG00000019117) GNG5B (ENSMPUG00000019111) FIG4 (ENSMPUG00000010064) AK9 (ENSMPUG00000010040) ZBTB24 (ENSMPUG00000010015) MICAL1 (ENSMPUG00000009991) SMPD2 (ENSMPUG00000010005) PPIL6 (ENSMPUG00000009953) CD164 (ENSMPUG00000009933) ENSMPUG00000009880 ENSMPUG00000019106 CEP57L1 (ENSMPUG00000009869) SESN1 (ENSMPUG00000009860) ##22 ARMC2 (ENSMPUG00000009852) ENSMPUG00000009848 ENSMPUG00000009847 AFG1L (ENSMPUG00000009823) ENSMPUG00000009816 SNX3 (ENSMPUG00000009812) NR2E1 (ENSMPUG00000009805) OSTM1 (ENSMPUG00000009774) ENSMPUG00000009757 SEC63 (ENSMPUG00000009752) ENSMPUG00000009747 SCML4 (ENSMPUG00000009746) SOBP (ENSMPUG00000009696) ENSMPUG00000009693 PDSS2 (ENSMPUG00000009682) Canidae ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000160723 ENSGT00390000018635.c ENSGT00390000002881 ENSGT00530000063583.b ENSGT00950000182962.b.b ##7 ENSGT01060000248564.b.a.a.b ENSGT00550000074943 ENSGT00740000115564 ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159117 ENSGT00390000009166 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ##22 ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b.w.a ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463.y.b ENSGT00940000157463.y.a ENSGT00940000157463.z ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b ENSGT00390000010827 ENSGT00390000010020 ENSGT00390000009366 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000160723 ENSGT00390000018635.c ENSGT00390000002881 ENSGT00530000063583.b ENSGT00950000182962.b.b ##7 ENSGT01060000248564.b.a.a.b ENSGT00550000074943 ENSGT00740000115564 ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159117 ENSGT00390000009166 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ##22 ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b.w.a ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463.y.b ENSGT00940000157463.y.a ENSGT00940000157463.z ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b ENSGT00390000010827 ENSGT00390000010020 ENSGT00390000009366 Dingo MODERN SPECIES 370 DDO (ENSCAFG00020018488) METTL24 (ENSCAFG00020018485) CDC40 (ENSCAFG00020018083) WASF1 (ENSCAFG00020018061) ##7 GPR6 (ENSCAFG00020018059) FIG4 (ENSCAFG00020018049) ENSCAFG00020018036 ENSCAFG00020018027 ZBTB24 (ENSCAFG00020018017) MICAL1 (ENSCAFG00020018003) ENSCAFG00020018001 PPIL6 (ENSCAFG00020017980) ENSCAFG00020017976 ENSCAFG00020017941 CEP57L1 (ENSCAFG00020017933) SESN1 (ENSCAFG00020017928) ##22 ARMC2 (ENSCAFG00020017910) ENSCAFG00020017905 AFG1L (ENSCAFG00020017899) ENSCAFG00020017882 NR2E1 (ENSCAFG00020017858) OSTM1 (ENSCAFG00020017831) SEC63 (ENSCAFG00020017827) ENSCAFG00020017824 ENSCAFG00020017819 SOBP (ENSCAFG00020017814) PDSS2 (ENSCAFG00020017808) BEND3 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ENSGT01060000248564.b.a.a.b ENSGT00550000074943 ENSGT00740000115564 ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159117 ENSGT00390000009166 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000165946 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ##22 ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463.y.a ENSGT00940000157463.z ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b ENSGT00390000010827 ENSGT00390000010020 ENSGT00390000009366 ENSGT00390000018829.b Donkey MODERN SPECIES 16 DDO (ENSEASG00005032270) METTL24 (ENSEASG00005028041) CDC40 (ENSEASG00005006693) WASF1 (ENSEASG00005006690) ##7 GPR6 (ENSEASG00005006688) FIG4 (ENSEASG00005006686) ENSEASG00005031809 ENSEASG00005006679 ZBTB24 (ENSEASG00005006677) MICAL1 (ENSEASG00005006519) SMPD2 (ENSEASG00005006484) PPIL6 (ENSEASG00005033540) CD164 (ENSEASG00005006477) ENSEASG00005006467 CEP57L1 (ENSEASG00005006465) SESN1 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ENSPVAG00000000615 ENSPVAG00000000613 CEP57L1 (ENSPVAG00000000612) SESN1 (ENSPVAG00000000611) ##22 ARMC2 (ENSPVAG00000000610) Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000002881 ENSGT00530000063583.b ENSGT00950000182962.b.b ##7 ENSGT01060000248564.b.a.a.b ENSGT00550000074943 ENSGT00740000115564.de.b ENSGT00930000151154 ENSGT00740000115564.de.a ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159117 ENSGT00390000009166 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ##22 ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463.z ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b ENSGT00390000010827 ENSGT00390000009366 ENSGT00390000018829 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b Microbat MODERN SPECIES 1315 ENSMLUG00000003816 ZBTB24 (ENSMLUG00000029884) ENSMLUG00000029807 MICAL1 (ENSMLUG00000003799) SMPD2 (ENSMLUG00000003793) PPIL6 (ENSMLUG00000003789) ENSMLUG00000023748 CD164 (ENSMLUG00000003783) ENSMLUG00000003777 CEP57L1 (ENSMLUG00000005850) SESN1 (ENSMLUG00000006886) ##22 ARMC2 (ENSMLUG00000006860) ENSMLUG00000002590 AFG1L (ENSMLUG00000002580) ENSMLUG00000017530 Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 21 METTL24 (ENSRFEG00010014431) CDC40 (ENSRFEG00010014302) WASF1 (ENSRFEG00010014255) ##7 GPR6 (ENSRFEG00010014168) FIG4 (ENSRFEG00010014070) ENSRFEG00010013561 ENSRFEG00010013513 ENSRFEG00010013423 ZBTB24 (ENSRFEG00010013373) MICAL1 (ENSRFEG00010012969) SMPD2 (ENSRFEG00010012782) PPIL6 (ENSRFEG00010012502) CD164 (ENSRFEG00010012454) ENSRFEG00010012005 CEP57L1 (ENSRFEG00010011653) SESN1 (ENSRFEG00010011576) ##22 ARMC2 (ENSRFEG00010011463) ENSRFEG00010011401 AFG1L (ENSRFEG00010011287) SNX3 (ENSRFEG00010011106) NR2E1 (ENSRFEG00010010957) OSTM1 (ENSRFEG00010010906) SEC63 (ENSRFEG00010010840) SCML4 (ENSRFEG00010010598) SOBP (ENSRFEG00010010519) PDSS2 (ENSRFEG00010010408) BEND3 (ENSRFEG00010010319) MTRES1 (ENSRFEG00010003814) ENSRFEG00010003796 QRSL1 (ENSRFEG00010003777) CRYBG1 (ENSRFEG00010003739) Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES 914 ENSGT00950000183168.B.b ##22 ENSGT00390000000663 Common shrew MODERN SPECIES 1409 SESN1 (ENSSARG00000006392) ##22 ENSSARG00000006368 Hedgehog MODERN SPECIES 1992 ENSEEUG00000005187 ##22 ARMC2 (ENSEEUG00000004985) Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00550000074943 ENSGT00740000115564.kc ENSGT00930000151154 ENSGT00740000115564.jc ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159117 ENSGT00390000009166 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT01030000235833 ENSGT00940000163170 ENSGT00940000165257 ENSGT00940000164734 ENSGT00390000002042 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ##22 ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b ENSGT00390000010827 ENSGT00390000009366 ENSGT00390000018829 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00950000182962.b.b ##7 ENSGT01060000248564.b.a.a.b ENSGT00550000074943 ENSGT00740000115564.kc ENSGT00930000151154 ENSGT00740000115564.jc ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159117 ENSGT00390000009166 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000165257 ENSGT00940000164734 ENSGT00390000002042 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ##22 ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b ENSGT00390000010827 ENSGT00390000009366 ENSGT00390000018829 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00950000182962.b.b ##7 ENSGT01060000248564.b.a.a.b ENSGT00550000074943 ENSGT00740000115564.kc ENSGT00930000151154 ENSGT00740000115564.jc ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159117 ENSGT00390000009166 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000165257 ENSGT00940000164734 ENSGT00390000002042 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ##22 ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b ENSGT00390000010827 ENSGT00390000009366 ENSGT00390000018829 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b Elephant MODERN SPECIES 1 CDC40 (ENSLAFG00000010103) WASF1 (ENSLAFG00000001004) ##7 GPR6 (ENSLAFG00000027378) FIG4 (ENSLAFG00000030889) ENSLAFG00000013767 ENSLAFG00000014097 ENSLAFG00000023295 ZBTB24 (ENSLAFG00000026719) MICAL1 (ENSLAFG00000003301) SMPD2 (ENSLAFG00000003298) CD164 (ENSLAFG00000003292) ENSLAFG00000003291 ENSLAFG00000003290 ENSLAFG00000021442 CEP57L1 (ENSLAFG00000003209) SESN1 (ENSLAFG00000021864) ##22 ARMC2 (ENSLAFG00000005972) ENSLAFG00000005834 AFG1L (ENSLAFG00000005829) SNX3 (ENSLAFG00000018131) NR2E1 (ENSLAFG00000013583) OSTM1 (ENSLAFG00000000313) SEC63 (ENSLAFG00000017896) ENSLAFG00000013674 SOBP (ENSLAFG00000013670) PDSS2 (ENSLAFG00000013247) BEND3 (ENSLAFG00000005298) MTRES1 (ENSLAFG00000005301) CD24 (ENSLAFG00000007742) QRSL1 (ENSLAFG00000012887) RTN4IP1 (ENSLAFG00000006744) Hyrax MODERN SPECIES 1532 SESN1 (ENSPCAG00000010387) ##22 ARMC2 (ENSPCAG00000010243) Tenrec MODERN SPECIES 8478 SESN1 (ENSETEG00000004025) ##22 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES 155 ENSGT00550000074943 ENSGT00740000115564.jc ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159117 ENSGT00390000009166 ENSGT00940000159634 ENSGT01030000235833 ENSGT00940000163170 ENSGT00390000002042 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ##22 ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c Armadillo MODERN SPECIES 2549 ENSDNOG00000047475 FIG4 (ENSDNOG00000001610) AK9 (ENSDNOG00000038218) ZBTB24 (ENSDNOG00000038726) MICAL1 (ENSDNOG00000003962) SMPD2 (ENSDNOG00000003948) ENSDNOG00000034075 ENSDNOG00000047626 ENSDNOG00000003743 CEP57L1 (ENSDNOG00000025700) ENSDNOG00000044166 SESN1 (ENSDNOG00000040263) ##22 ARMC2 (ENSDNOG00000006058) ENSDNOG00000005257 AFG1L (ENSDNOG00000018390) SNX3 (ENSDNOG00000041063) NR2E1 (ENSDNOG00000015478) OSTM1 (ENSDNOG00000036723) SEC63 (ENSDNOG00000044041) SCML4 (ENSDNOG00000000279) SOBP (ENSDNOG00000032220) ENSDNOG00000031932 Sloth MODERN SPECIES 1709 SESN1 (ENSCHOG00000006069) ##22 ARMC2 (ENSCHOG00000006016) Platypus MODERN SPECIES 10 ENSOANG00000038242 SESN1 (ENSOANG00000015028) ##22 ARMC2 (ENSOANG00000000766) ENSOANG00000000768 AFG1L (ENSOANG00000000769) SNX3 (ENSOANG00000000772) NR2E1 (ENSOANG00000000775) OSTM1 (ENSOANG00000000776) SEC63 (ENSOANG00000000777) SCML4 (ENSOANG00000036521) SOBP (ENSOANG00000048313) PDSS2 (ENSOANG00000000783) BEND3 (ENSOANG00000050605) ENSOANG00000000784 QRSL1 (ENSOANG00000003897) RTN4IP1 (ENSOANG00000003898) ENSOANG00000003899 Anura ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000011776 ENSGT00940000158213 ENSGT00940000160723 ENSGT00390000018635.c ENSGT00390000002881 ENSGT00530000063583.b ENSGT00950000182962.b.b ##7 ENSGT01060000248564.b.a.a.b ENSGT00550000074943 ENSGT00740000115564 ENSGT00940000159373 ENSGT00940000159634 ENSGT00530000063929.a.b ENSGT00940000165946 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ##22 ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT00940000157463 ENSGT00940000154164.c ENSGT00940000153498.B.b ENSGT00390000010827 ENSGT00390000009366 ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00940000155695 Frog MODERN SPECIES 5 cdk19 (ENSXETG00000021324) slc22a16 (ENSXETG00000021318) ddo (ENSXETG00000021315) mettl24 (ENSXETG00000021314) cdc40 (ENSXETG00000021312) wasf1 (ENSXETG00000021311) ##7 gpr6 (ENSXETG00000033829) fig4 (ENSXETG00000030893) XB5897337 [provisional] 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ENSCSAVG00000010672 ENSCSAVG00000010686 ENSCSAVG00000010691 ENSCSAVG00000010694 ENSCSAVG00000010698 ENSCSAVG00000010700 ENSCSAVG00000010703 ENSCSAVG00000010716 ENSCSAVG00000010718 ENSCSAVG00000010719 ENSCSAVG00000010730 Ciona intestinalis MODERN SPECIES 3 ENSCING00000014226 ENSCING00000018443 ENSCING00000025089 ENSCING00000021288 ENSCING00000020643 ENSCING00000014221 ENSCING00000021115 ENSCING00000021633 ENSCING00000009998 ENSCING00000007665 ENSCING00000000700 ENSCING00000012728 ENSCING00000022001 ENSCING00000007663 ENSCING00000014254 ENSCING00000007668 #22 ENSCING00000007667 ENSCING00000022315 ENSCING00000007666 ENSCING00000007672 ENSCING00000014252 ENSCING00000014253 ENSCING00000024424 ENSCING00000020087 ENSCING00000021470 ENSCING00000014249 ENSCING00000007675 ENSCING00000007673 ENSCING00000021442 ENSCING00000021955 ENSCING00000024447 Ecdysozoa ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183168.B #22 Fruitfly MODERN SPECIES 17 Eglp3 (FBgn0034884) Eglp4 (FBgn0034885) retn (FBgn0004795) Pde8 (FBgn0266377) St1 (FBgn0034887) St3 (FBgn0265052) l(2)efl (FBgn0011296) Pal2 (FBgn0262728) CG30183 (FBgn0050183) angel (FBgn0016762) mRpL43 (FBgn0034893) sigmar (FBgn0034894) l(2)dtl (FBgn0013548) Alg3 (FBgn0011297) CG5504 (FBgn0002174) Sesn (FBgn0034897) #22 CG46429 (FBgn0286932) CG18128 (FBgn0034898) egl (FBgn0000562) CG13560 (FBgn0034899) CG34105 (FBgn0083941) CG12491 (FBgn0034900) CG11300 (FBgn0034901) CG5532 (FBgn0034902) sona (FBgn0034903) CG15800 (FBgn0034904) CG30177 (FBgn0050177) CG13561 (FBgn0034906) CG5539 (FBgn0034907) Ssrp (FBgn0010278) CG5543 (FBgn0034908) Bilateria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183168.C ##22 Chordata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183168.C ##22 Vertebrata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183168.C ##22 Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES 311 ENSGT00940000164309 ENSGT00950000183168.C ##22 ENSGT00940000159334 ENSGT00940000153609.a ENSGT00390000002414 ENSGT00940000156163 ENSGT01030000234513.B.a ENSGT01030000235750 ENSGT01050000244864.B.a ENSGT00940000160693 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 495 ENSGT00940000164309 ENSGT00510000049291 ENSGT00950000183168.C ##22 ENSGT00940000159334 ENSGT00940000153609.a ENSGT00940000154651 ENSGT00390000000155.a.b ENSGT00940000159429 Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 110 ENSGT00940000164309 ENSGT00510000049291 ENSGT00950000183168.C ##22 ENSGT00940000159334 ENSGT00940000153609.a ENSGT00940000154651 ENSGT00390000000155.a.b ENSGT00940000165859 ENSGT00940000159565 ENSGT00940000175781 ENSGT00940000159625 ENSGT00940000158195 ENSGT00940000153222.a.b.b.b.b ENSGT00940000163684 ENSGT00950000182887.C.b.b ENSGT00940000166245 ENSGT01030000234621.C.a.a.a ENSGT00390000002414 Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 72 ENSGT00440000040163 ENSGT00940000155085 ENSGT00940000155242 ENSGT00940000163331 ENSGT00940000155128.a.a.b ENSGT00940000159429 ENSGT00940000167446 ENSGT00940000154442 ENSGT00940000160693 ENSGT01050000244864.B.a ENSGT01030000235750 ENSGT01030000234513.B.a ENSGT01100000265889 ENSGT00940000164309 ENSGT00510000049291 ENSGT00950000183168.C ##22 ENSGT00940000159334 ENSGT00940000153609.a ENSGT00940000154651 ENSGT00390000000155.a.b ENSGT00940000165859 ENSGT00940000159565 ENSGT00940000175781 ENSGT00940000159625 ENSGT00940000158195 ENSGT00940000153222.a.b.b.b.b ENSGT00940000174692 ENSGT00940000157424 ENSGT00510000047611 ENSGT00940000163684 ENSGT00950000182887.C.b.b Amniota ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00440000040163 ENSGT00940000155085.b ENSGT00940000155242 ENSGT00940000163331 ENSGT00940000159429 ENSGT00940000167446 ENSGT00940000154442 ENSGT00940000160693 ENSGT01050000244864.B.a ENSGT01030000235750 ENSGT01030000234513.B.a ENSGT00940000159580 ENSGT00440000037505.b ENSGT00940000164309 ENSGT00510000049291 ENSGT00950000183168.C ##22 ENSGT00940000159334 ENSGT00940000153609.a ENSGT00940000154651 ENSGT00390000000155.a.b ENSGT00940000165859 ENSGT00940000159565 ENSGT00940000175781 ENSGT00940000159625 ENSGT00940000158195 ENSGT00940000153222.a.b.b.b.b ENSGT00940000174692 ENSGT00940000157424 ENSGT00510000047611 ENSGT00940000163684 ENSGT00950000182887.C.b.b Sauria ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00440000040163 ENSGT00940000155085.b ENSGT00940000155242 ENSGT00940000163331 ENSGT00940000159429 ENSGT00940000167446 ENSGT00940000154442 ENSGT00940000160693 ENSGT01050000244864.B.a ENSGT01030000234513.B.a ENSGT01030000235750 ENSGT00940000159580 ENSGT00440000037505.b ENSGT00940000164309 ENSGT00510000049291 ENSGT00950000183168.C ##22 ENSGT00940000159334 ENSGT00940000153609.a ENSGT00940000154651 ENSGT00390000000155.a.b ENSGT00390000003197 ENSGT00950000183090.C ENSGT00390000006492 ENSGT00940000159565 ENSGT00940000175781 ENSGT00940000159625 ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159971 ENSGT00940000160039 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT00940000167413 Archelosauria ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00440000040163 ENSGT00940000155085.b ENSGT00940000155242 ENSGT00940000163331 ENSGT00940000159429 ENSGT00940000167446 ENSGT00940000154442 ENSGT00940000160693 ENSGT01050000244864.B.a ENSGT01030000234513.B.a ENSGT01030000235750 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ENSGT01030000235750 ENSGT00940000159580 ENSGT00440000037505.b ENSGT00940000164309 ENSGT00950000183168.C ##22 ENSGT00940000159334 ENSGT00940000153609.a ENSGT00940000154651 ENSGT00390000003197 ENSGT00390000006492 ENSGT00940000159565 ENSGT00960000188821 ENSGT00940000159625 ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159971 ENSGT00940000160039 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT00940000167413 ENSGT01050000244888.b.a.c.a ENSGT00940000159688 Passeriformes ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00390000006885 ENSGT00390000000360 ENSGT00440000040163 ENSGT00940000155085.b ENSGT00940000155242 ENSGT00940000163331 ENSGT00940000159429 ENSGT00940000154442 ENSGT00940000160693 ENSGT01050000244864.B.a ENSGT01030000234513.B.a ENSGT01030000235750 ENSGT00940000159580 ENSGT00440000037505.b ENSGT00940000164309 ENSGT00950000183168.C ##22 ENSGT00940000159334 ENSGT00940000153609.a ENSGT00940000154651 ENSGT00390000003197 ENSGT00390000006492 ENSGT00940000159565 ENSGT00960000188821 ENSGT00940000159625 ENSGT01050000244937.a.b.a 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ENSGT00390000000360 ENSGT00440000040163 ENSGT00940000155085.b ENSGT00940000155242 ENSGT00940000163331 ENSGT00940000159429 ENSGT00940000154442 ENSGT00940000160693 ENSGT01050000244864.B.a ENSGT01030000234513.B.a ENSGT01030000235750 ENSGT00940000159580 ENSGT00440000037505.b ENSGT00940000164309 ENSGT00950000183168.C ##22 ENSGT00940000159334 ENSGT00940000153609.a ENSGT00940000154651 ENSGT00390000003197 ENSGT00390000006492 ENSGT00940000159565 ENSGT00960000188821 ENSGT00940000159625 ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159971 ENSGT00940000160039 ENSGT00940000160971 ENSGT00940000161248 ENSGT00940000162226.e.a ENSGT00950000183189.a.b.b Flycatcher MODERN SPECIES 23 F8 (ENSFALG00000011595) FUNDC2 (ENSFALG00000025901) CMC4 (ENSFALG00000011670) ENSFALG00000011680 BRCC3 (ENSFALG00000011686) ENSFALG00000028456 OGT (ENSFALG00000011699) ENSFALG00000011723 ENSFALG00000028749 ITGB1BP2 (ENSFALG00000011761) ZMYM3 (ENSFALG00000011770) NONO (ENSFALG00000011765) NLGN3 (ENSFALG00000025390) MED12 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ENSSCAG00000016904 NONO (ENSSCAG00000016903) ZMYM3 (ENSSCAG00000016900) ENSSCAG00000016899 GJB1 (ENSSCAG00000016898) ENSSCAG00000016896 NLGN3 (ENSSCAG00000016894) MED12 (ENSSCAG00000016890) ENSSCAG00000016886 ENSSCAG00000016885 ##22 FOXO4 (ENSSCAG00000016884) SNX12 (ENSSCAG00000016883) SLC7A3 (ENSSCAG00000016881) ENSSCAG00000016880 DLG3 (ENSSCAG00000016837) ENSSCAG00000016800 GDPD2 (ENSSCAG00000016798) Zebra finch MODERN SPECIES 26 F8 (ENSTGUG00000006867) FUNDC2 (ENSTGUG00000023139) CMC4 (ENSTGUG00000020118) BRCC3 (ENSTGUG00000020804) OGT (ENSTGUG00000006944) ENSTGUG00000006988 ENSTGUG00000007027 ITGB1BP2 (ENSTGUG00000007031) NONO (ENSTGUG00000007048) ZMYM3 (ENSTGUG00000007078) ENSTGUG00000023842 GJB1 (ENSTGUG00000007127) NLGN3 (ENSTGUG00000007132) MED12 (ENSTGUG00000007167) ENSTGUG00000007242 ENSTGUG00000007251 ##22 FOXO4 (ENSTGUG00000026115) SNX12 (ENSTGUG00000007293) SLC7A3 (ENSTGUG00000007296) NCBP2 (ENSTGUG00000007323) TEX11 (ENSTGUG00000007329) DLG3 (ENSTGUG00000007374) GDPD2 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ENSGT00440000040163 ENSGT00940000155085.b ENSGT00940000155242 ENSGT00940000163331 ENSGT00940000159429 ENSGT00940000154442 ENSGT00940000160693 ENSGT01050000244864.B.a ENSGT01030000234513.B.a ENSGT01030000235750 ENSGT00940000159580 ENSGT00440000037505.b ENSGT00940000164309 ENSGT00950000183168.C ##22 ENSGT00940000159334 ENSGT00940000153609.a ENSGT00940000154651 ENSGT00390000003197 ENSGT01070000254044 ENSGT00940000165859 ENSGT00940000159565 ENSGT00940000159625 ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159971 ENSGT00940000160039 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT00940000167413 ENSGT01050000244888.b.a.c.a ENSGT00940000159688 Golden eagle MODERN SPECIES 13 CMC4 (ENSACCG00020014649) BRCC3 (ENSACCG00020014638) OGT (ENSACCG00020014611) ENSACCG00020014521 ENSACCG00020014483 ITGB1BP2 (ENSACCG00020014465) NONO (ENSACCG00020014457) ZMYM3 (ENSACCG00020014399) ENSACCG00020014365 ENSACCG00020014356 GJB1 (ENSACCG00020014346) NLGN3 (ENSACCG00020014327) MED12 (ENSACCG00020014227) ENSACCG00020014133 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SPECIES 99 ENSGT00940000164309 ENSGT00510000049291 ENSGT00950000183168.C ##22 Phasianidae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000000360 ENSGT00440000040163 ENSGT00940000155085.b ENSGT00940000155242 ENSGT00940000163331 ENSGT00940000159429 ENSGT00940000154442 ENSGT00940000160693 ENSGT01050000244864.B.a ENSGT01030000234513.B.a ENSGT01030000235750 ENSGT00940000159580 ENSGT00440000037505.b ENSGT00940000164309 ENSGT00510000049291 ENSGT00950000183168.C ##22 ENSGT00940000159334 ENSGT00940000153609.a ENSGT00940000154651 ENSGT00390000000155.a.b ENSGT00940000159565 ENSGT00940000159625 ENSGT00960000188821 ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159971 ENSGT00940000160039 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT00940000167413 ENSGT01050000244888.b.a.c.a ENSGT00940000159688 ENSGT00640000091497.a.p Japanese quail MODERN SPECIES 22 CMC4 (ENSCJPG00005011180) BRCC3 (ENSCJPG00005011181) ENSCJPG00005011183 OGT (ENSCJPG00005011185) ENSCJPG00005011210 ENSCJPG00005012033 ITGB1BP2 (ENSCJPG00005012034) NONO 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ENSGT00940000153609.a ENSGT00940000154651 ENSGT00390000000155.a.b ENSGT00390000003197 ENSGT00390000006492 ENSGT00940000159565 ENSGT00940000159625 ENSGT00960000188821 ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159971 ENSGT00940000160039 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT00940000167413 ENSGT01050000244888.b.a.c.a Chicken MODERN SPECIES 33 BRCC3 (ENSGALG00010016913) ENSGALG00010016923 OGT (ENSGALG00010016932) TAF1 (ENSGALG00010016946) RHOG2 (ENSGALG00010016989) ITGB1BP2 (ENSGALG00010016999) NONO (ENSGALG00010017010) ZMYM3 (ENSGALG00010017034) ENSGALG00010017083 GJB1 (ENSGALG00010017111) ENSGALG00010017126 NLGN3 (ENSGALG00010018372) MED12 (ENSGALG00010018395) IL2RG (ENSGALG00010018404) CXorf65 (ENSGALG00010018412) ENSGALG00010018422 ##22 FOXO4 (ENSGALG00010018436) SNX12 (ENSGALG00010018459) SLC7A3 (ENSGALG00010018489) ENSGALG00010018498 NCBP2 (ENSGALG00010018508) TEX11 (ENSGALG00010018523) DLG3 (ENSGALG00010018559) GDPD2 (ENSGALG00010018585) ENSGALG00010018603 HTR2C (ENSGALG00010018615) IL13RA2 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ENSABRG00000020293 ENSABRG00000020291 ENSABRG00000020289 NONO (ENSABRG00000020285) ZMYM3 (ENSABRG00000020281) ENSABRG00000020277 GJB1 (ENSABRG00000020272) ENSABRG00000020269 NLGN3 (ENSABRG00000020266) MED12 (ENSABRG00000019390) ENSABRG00000019298 ENSABRG00000019296 ##22 FOXO4 (ENSABRG00000019294) SNX12 (ENSABRG00000019287) SLC7A3 (ENSABRG00000019283) ENSABRG00000019276 ENSABRG00000019271 TEX11 (ENSABRG00000019264) DLG3 (ENSABRG00000019138) ENSABRG00000019090 GDPD2 (ENSABRG00000019068) HTR2C (ENSABRG00000019053) IL13RA2 (ENSABRG00000019045) LRCH2 (ENSABRG00000019021) ENSABRG00000019010 PLS3 (ENSABRG00000018991) ENSABRG00000018982 Australian saltwater crocodile MODERN SPECIES 36 CMC4 (ENSCPRG00005000126) BRCC3 (ENSCPRG00005000130) ENSCPRG00005000135 FAAH2 (ENSCPRG00005000145) OGT (ENSCPRG00005000298) ENSCPRG00005001070 ENSCPRG00005001422 ENSCPRG00005001425 NONO (ENSCPRG00005001433) ENSCPRG00005001447 ZMYM3 (ENSCPRG00005001453) GJB1 (ENSCPRG00005001475) NLGN3 (ENSCPRG00005001481) MED12 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MED12 (ENSNNAG00000010622) ENSNNAG00000010577 CXorf65 (ENSNNAG00000010531) ENSNNAG00000010504 ##22 ENSNNAG00000010324 ENSNNAG00000010251 ENSNNAG00000010227 SLC7A3 (ENSNNAG00000010187) SNX12 (ENSNNAG00000010163) FOXO4 (ENSNNAG00000018851) ENSNNAG00000018848 GDPD2 (ENSNNAG00000018841) HTR2C (ENSNNAG00000018833) LRCH2 (ENSNNAG00000018823) ENSNNAG00000018820 ENSNNAG00000018818 PLS3 (ENSNNAG00000018814) AGTR2 (ENSNNAG00000018813) ENSNNAG00000018771 Lizard MODERN SPECIES 2006 ENSACAG00000011219 ##22 ENSACAG00000044849 Coelacanth MODERN SPECIES 1179 CHID1 (ENSLACG00000001440) th (ENSLACG00000006317) ENSLACG00000008117 CXorf65 (ENSLACG00000022380) ENSLACG00000009225 ##22 FOXO4 (ENSLACG00000009595) SNX12 (ENSLACG00000010058) ENSLACG00000010304 zgc:113208 (ENSLACG00000010593) ITGB1BP2 (ENSLACG00000010709) ENSLACG00000010906 rhogc (ENSLACG00000011841) taf1 (ENSLACG00000011936) OGT (ENSLACG00000012695) ENSLACG00000013173 Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000155266 ENSGT00590000083134.b 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ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00390000016655.a.b ENSGT00940000155266 ENSGT00390000015476 ENSGT00940000155028.s ENSGT00950000182865.b.a.b.b.b.b ENSGT00390000004360.a.b.a.a.a ENSGT00940000178248 ENSGT01050000244955.a.b ENSGT01050000244897.a.b.a ENSGT00950000183071.a.b ENSGT00950000182897.B.a.b.a ENSGT00940000157245 ENSGT00510000047493 ENSGT00940000164309 ENSGT00510000049291 ENSGT00950000183168.C ##22 ENSGT00940000159334 ENSGT00940000153609.a ENSGT00940000154651.a ENSGT00940000154651.b ENSGT00390000004952.a.b ENSGT00390000000155.a.b ENSGT00390000018904 ENSGT00940000158132 ENSGT00940000165121 ENSGT00950000183068.a.a.a.a ENSGT00950000183068.a.a.a.b ENSGT00940000159429 ENSGT00940000164406 ENSGT01060000248564.b.a.b.b.b.a ENSGT00950000182962.a.b ##7 Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 35 ENSGT00390000016655.a.b ENSGT00940000155266 ENSGT00390000015476 ENSGT00940000155028.s ENSGT00950000182865.b.a.b.b.b.b ENSGT00390000004360.a.b.a.a.a ENSGT00940000178248 ENSGT01050000244955.a.b ENSGT01050000244897.a.b.a 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Atlantic herring MODERN SPECIES 12 ints6l (ENSCHAG00000010589) mospd1 (ENSCHAG00000010495) pabir2 (ENSCHAG00000010444) hprt1 (ENSCHAG00000010338) phf6 (ENSCHAG00000010255) cab39l1 (ENSCHAG00000010227) ENSCHAG00000010204 gpc3 (ENSCHAG00000010197) gpc4 (ENSCHAG00000010051) hs6st2 (ENSCHAG00000010042) mbnl3 (ENSCHAG00000009954) rap2c (ENSCHAG00000009930) zgc:92907 (ENSCHAG00000009923) il2rgb (ENSCHAG00000009910) CXorf65 (ENSCHAG00000009862) ENSCHAG00000009858 ##22 FOXO4 (ENSCHAG00000009856) SNX12 (ENSCHAG00000009817) SLC7A3 (ENSCHAG00000009723) ubl3b (ENSCHAG00000009674) ENSCHAG00000009671 cfl1 (ENSCHAG00000009664) atl3 (ENSCHAG00000007673) ENSCHAG00000007608 yif1a (ENSCHAG00000007578) fosl1a (ENSCHAG00000007568) ccdc85b (ENSCHAG00000007557) fibpa (ENSCHAG00000007503) efemp2a (ENSCHAG00000007478) npas4a (ENSCHAG00000007466) ENSCHAG00000007462 Denticle herring MODERN SPECIES 9 TBC1D9B (ENSDCDG00000014583) lect2.1 (ENSDCDG00000014919) F2RL3 (ENSDCDG00000014920) rnf130 (ENSDCDG00000014938) 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Efemp2 (ENSIPUG00000021557) Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000153460.c.b.c.a ENSGT00510000047104 ENSGT00390000016655.a.b ENSGT00940000155266 ENSGT00390000015476 ENSGT00940000155028.s ENSGT00950000182865.b.a.b.b.b.b ENSGT00390000004360.a.b.a.a.a ENSGT00940000178248 ENSGT01050000244955.a.b ENSGT01050000244897.a.b.a ENSGT00950000183071.a.b ENSGT00950000182897.B.a.b.a ENSGT00940000157245 ENSGT00510000047493 ENSGT00950000183168.C ##22 ENSGT00940000159334 ENSGT00940000178950 ENSGT00940000154651.b ENSGT00390000004952.a.b ENSGT00390000000155.a.b ENSGT00950000183000.c.a.a ENSGT00940000158566 ENSGT00940000166209 ENSGT00390000009423.a ENSGT00940000160034 ENSGT00940000162317 ENSGT00390000015815.g ENSGT00940000159437.c ENSGT00530000064165.a.d ENSGT00390000003153 Characoidei ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00510000047104 ENSGT00390000016655.a.b ENSGT00940000155266 ENSGT00390000015476 ENSGT00940000155028.s ENSGT00950000182865.b.a.b.b.b.b ENSGT00390000004360.a.b.a.a.a ENSGT00940000178248 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ENSGT00390000009423.a.f ENSGT00940000160034.d ENSGT00940000162317.d.a ENSGT00390000015815.g.g ENSGT00940000159437.c.c ENSGT00530000064165.a.d.c ENSGT00390000003866.b.a ENSGT00390000003153 Chinook salmon MODERN SPECIES 13 zgc:113425 (ENSOTSG00005007344) setd7 (ENSOTSG00005007342) mgst2 (ENSOTSG00005007341) SCOC (ENSOTSG00005007328) ENSOTSG00005007327 ENSOTSG00005007325 hars (ENSOTSG00005007095) dnd1 (ENSOTSG00005007089) ENSOTSG00005007087 ENSOTSG00005007085 gfra3 (ENSOTSG00005007083) ENSOTSG00005007080 ENSOTSG00005007078 zgc:92907 (ENSOTSG00005007072) CXorf65 (ENSOTSG00005007076) ENSOTSG00005007065 ##22 FOXO4 (ENSOTSG00005007062) SNX12 (ENSOTSG00005007058) SLC7A3 (ENSOTSG00005006938) ubl3b (ENSOTSG00005006933) ENSOTSG00005006932 atl3 (ENSOTSG00005006880) ENSOTSG00005006878 yif1a (ENSOTSG00005006668) fosl1a (ENSOTSG00005006667) ccdc85b (ENSOTSG00005006666) fibpa (ENSOTSG00005006664) efemp2a (ENSOTSG00005006663) npas4a (ENSOTSG00005006662) ENSOTSG00005006661 mrpl11 (ENSOTSG00005006660) 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(ENSOMYG00000032409) dnd1 (ENSOMYG00000032397) ENSOMYG00000074313 gfra3 (ENSOMYG00000032384) ENSOMYG00000032362 ENSOMYG00000063319 ENSOMYG00000032350 zgc:92907 (ENSOMYG00000032333) ENSOMYG00000032343 ENSOMYG00000032301 ##22 FOXO4 (ENSOMYG00000032284) SNX12 (ENSOMYG00000032102) SLC7A3 (ENSOMYG00000026994) ubl3b (ENSOMYG00000047013) ENSOMYG00000026842 atl3 (ENSOMYG00000026158) ENSOMYG00000025994 yif1a (ENSOMYG00000025958) fosl1a (ENSOMYG00000025915) ccdc85b (ENSOMYG00000025907) fibpa (ENSOMYG00000025774) efemp2a (ENSOMYG00000025714) npas4a (ENSOMYG00000025669) ENSOMYG00000025651 mrpl11 (ENSOMYG00000025631) Huchen MODERN SPECIES 69 mgst2 (ENSHHUG00000028998) SCOC (ENSHHUG00000029007) ENSHHUG00000029014 ENSHHUG00000029103 ENSHHUG00000029105 hars (ENSHHUG00000029119) dnd1 (ENSHHUG00000029136) ENSHHUG00000029145 gfra3 (ENSHHUG00000029148) ENSHHUG00000029163 ENSHHUG00000029166 ENSHHUG00000029177 rap2c (ENSHHUG00000029181) zgc:92907 (ENSHHUG00000029215) CXorf65 (ENSHHUG00000029224) 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ENSGT00940000158566.d ENSGT00940000166209.a ENSGT00390000009423.a.e ENSGT00940000160034.c ENSGT00940000162317.d.b ENSGT00390000015815.g.f ENSGT00940000159437.c.d ENSGT00530000064165.a.d.d ENSGT00940000167537 Huchen MODERN SPECIES 819 elf2a (ENSHHUG00000051111) ENSHHUG00000051123 naa15a (ENSHHUG00000051128) mlsl (ENSHHUG00000051344) rab33ba (ENSHHUG00000051354) ENSHHUG00000051358 SCOC (ENSHHUG00000051360) zgc:154054 (ENSHHUG00000051362) ENSHHUG00000051365 ENSHHUG00000030207 hars (ENSHHUG00000030212) ENSHHUG00000030295 gfra3 (ENSHHUG00000030302) rap2c (ENSHHUG00000030306) zgc:92907 (ENSHHUG00000030323) ENSHHUG00000030333 ##22 FOXO4 (ENSHHUG00000030342) SNX12 (ENSHHUG00000030343) SLC7A3 (ENSHHUG00000030369) ubl3b (ENSHHUG00000030387) ENSHHUG00000030393 cfl1 (ENSHHUG00000030398) atl3 (ENSHHUG00000030455) ENSHHUG00000030481 yif1a (ENSHHUG00000030484) fosl1a (ENSHHUG00000030494) ccdc85b (ENSHHUG00000030497) fibpa (ENSHHUG00000030504) efemp2a (ENSHHUG00000030535) Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 40 ENSGT00940000166427.h ENSGT00940000155249.h.d ENSGT00940000154953.a.d ENSGT00940000175899 ENSGT00950000183174.B.a.f.c.b ENSGT00390000002932 ENSGT00940000157090.g.f ENSGT00390000008828.fb.a.d ENSGT00940000156526.b.a ENSGT00510000050125.a.b ENSGT00940000159799.r ENSGT00390000005922.b.k.b ENSGT00940000165282.a.c ENSGT00940000157245.jb.b ENSGT00510000047493.s ENSGT00950000183168.C.d ##22 ENSGT00940000159334.e ENSGT00940000153609.a.q.b ENSGT00940000154651.b.b ENSGT00390000004952.a.b.b ENSGT00390000000155.a.b.d ENSGT00950000183000.c.a.a.g ENSGT00940000158566.d ENSGT00940000166209.a ENSGT00390000009423.a.e ENSGT00940000160034.c ENSGT00940000162317.d.b ENSGT00390000015815.g.f ENSGT00940000159437.c.d ENSGT00530000064165.a.d.d ENSGT00940000167537 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 39 ENSGT00940000166427.h ENSGT00940000155249.h.d ENSGT00940000154953.a.d ENSGT00940000175899 ENSGT00950000183174.B.a.f.c.b ENSGT00390000002932 ENSGT00940000157090.g.f ENSGT00390000008828.fb.a.d ENSGT00940000156526.b.a ENSGT00510000050125.a.b ENSGT00940000159799.r ENSGT00390000005922.b.k.b ENSGT00940000165282.a.c ENSGT00940000157245.jb.b ENSGT00510000047493.s ENSGT00950000183168.C.d ##22 ENSGT00940000159334.e ENSGT00940000153609.a.q.b ENSGT00940000154651.b.b ENSGT00390000004952.a.b.b ENSGT00390000000155.a.b.d ENSGT00950000183000.c.a.a.g ENSGT00940000158566.d ENSGT00940000166209.a ENSGT00390000009423.a.e ENSGT00940000160034.c ENSGT00940000162317.d.b ENSGT00390000015815.g.f ENSGT00940000159437.c.d ENSGT00530000064165.a.d.d ENSGT01000000215390 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 40 ENSGT00940000166427.h ENSGT00940000155249.h.d ENSGT00940000154953.a.d ENSGT00940000175899 ENSGT00950000183174.B.a.f.c.b ENSGT00390000002932 ENSGT00940000157090.g.f ENSGT00390000008828.fb.a.d ENSGT00940000156526.b.a ENSGT00510000050125.a.b ENSGT00940000159799.r ENSGT00390000005922.b.k.b ENSGT00940000165282.a.c ENSGT00940000157245.jb.b ENSGT00510000047493.s ENSGT00950000183168.C.d ##22 ENSGT00940000159334.e ENSGT00940000153609.a.q.b ENSGT00940000154651.b.b ENSGT00390000004952.a.b.b ENSGT00390000000155.a.b.d ENSGT00950000183000.c.a.a.g ENSGT00940000158566.d ENSGT00940000166209.a ENSGT00390000009423.a.e ENSGT00940000160034.c ENSGT00940000162317.d.b ENSGT00390000015815.g.f ENSGT00940000159437.c.d ENSGT00530000064165.a.d.d ENSGT01000000215390 Coho salmon MODERN SPECIES 6 ENSOKIG00005007260 ENSOKIG00005007191 elf2a (ENSOKIG00005007122) ENSOKIG00005007100 naa15a (ENSOKIG00005006903) mlsl (ENSOKIG00005006723) rab33ba (ENSOKIG00005006704) SCOC (ENSOKIG00005006681) ENSOKIG00005006676 ENSOKIG00005006664 ENSOKIG00005006651 ENSOKIG00005004593 ENSOKIG00005004289 rap2c (ENSOKIG00005004262) zgc:92907 (ENSOKIG00005031117) ENSOKIG00005031100 ##22 FOXO4 (ENSOKIG00005031081) SNX12 (ENSOKIG00005031024) SLC7A3 (ENSOKIG00005030938) ubl3b (ENSOKIG00005030916) ENSOKIG00005030902 cfl1 (ENSOKIG00005030843) atl3 (ENSOKIG00005026952) ENSOKIG00005026813 yif1a (ENSOKIG00005026753) fosl1a (ENSOKIG00005026742) ccdc85b 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ENSGT00390000000155.a.b ENSGT00950000183000.c.a.a ENSGT00940000158566 ENSGT00940000166209 ENSGT00390000009423.a ENSGT00940000160034 ENSGT00940000162317 ENSGT00390000015815.g ENSGT00940000159437.c ENSGT00530000064165.a.d ENSGT00390000003866.b ENSGT00390000003153 ENSGT00940000162883 Ballan wrasse MODERN SPECIES 81 ATG2A (ENSLBEG00000006104) trmt112 (ENSLBEG00000006581) ENSLBEG00000006605 KCNK4 (ENSLBEG00000006634) zgc:162144 (ENSLBEG00000006656) stx5a (ENSLBEG00000006682) ##12 ENSLBEG00000006786 dnajc4 (ENSLBEG00000006825) nudt22 (ENSLBEG00000006872) ENSLBEG00000006934 zgc:153018 (ENSLBEG00000007000) hs6st2 (ENSLBEG00000007025) mbnl3 (ENSLBEG00000007060) rap2c (ENSLBEG00000007095) zgc:92907 (ENSLBEG00000007119) ENSLBEG00000007154 ##22 FOXO4 (ENSLBEG00000007176) ubl3b (ENSLBEG00000007206) ENSLBEG00000007266 cfl1 (ENSLBEG00000007290) atl3 (ENSLBEG00000007329) ENSLBEG00000007386 yif1a (ENSLBEG00000007405) fosl1a (ENSLBEG00000007453) ccdc85b (ENSLBEG00000007470) fibpa (ENSLBEG00000007494) 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ENSGT01000000214440.C ##12 ENSGT00940000166453 ENSGT00510000048574 ENSGT00390000017869 ENSGT00940000160376 ENSGT00510000048283.c ENSGT00950000183071.a.b ENSGT00950000182897.B.a.b.a ENSGT00940000157245 ENSGT00510000047493 ENSGT00950000183168.C ##22 ENSGT00940000159334 ENSGT00390000004952.a.b ENSGT00390000000155.a.b ENSGT00950000183000.c.a.a ENSGT00940000158566 ENSGT00940000166209 ENSGT00390000009423.a ENSGT00940000160034 ENSGT00940000162317 ENSGT00390000015815.g ENSGT00940000159437.c ENSGT00530000064165.a.d ENSGT00390000003866.b ENSGT00390000003153 ENSGT00940000162883 Gilthead seabream MODERN SPECIES 9 trmt112 (ENSSAUG00010021132) ENSSAUG00010021133 ENSSAUG00010021134 KCNK4 (ENSSAUG00010021135) ENSSAUG00010021137 zgc:162144 (ENSSAUG00010021138) stx5a (ENSSAUG00010021141) ##12 dnajc4 (ENSSAUG00010021174) nudt22 (ENSSAUG00010021176) ENSSAUG00010021178 zgc:153018 (ENSSAUG00010021180) hs6st2 (ENSSAUG00010002569) mbnl3 (ENSSAUG00010002581) rap2c (ENSSAUG00010002601) zgc:92907 (ENSSAUG00010002604) ENSSAUG00010002610 ##22 FOXO4 (ENSSAUG00010002619) ubl3b (ENSSAUG00010002628) efemp2a (ENSSAUG00010002651) cfl1 (ENSSAUG00010002738) atl3 (ENSSAUG00010002931) ENSSAUG00010006582 yif1a (ENSSAUG00010006585) fosl1a (ENSSAUG00010006589) ccdc85b (ENSSAUG00010006591) fibpa (ENSSAUG00010006598) npas4a (ENSSAUG00010006603) mrpl11 (ENSSAUG00010006606) ENSSAUG00010006608 ENSSAUG00010006613 slc25a43 (ENSSAUG00010006615) Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000164608 ENSGT00940000166208 ENSGT00940000160310.a ENSGT00730000111187.a.a ENSGT00390000002089.a.a.b ENSGT01000000214440.C ##12 ENSGT00940000166453 ENSGT00510000048574 ENSGT00390000017869 ENSGT00940000160376 ENSGT00510000048283.c ENSGT00950000183071.a.b ENSGT00950000182897.B.a.b.a ENSGT00940000157245 ENSGT00510000047493 ENSGT00950000183168.C ##22 ENSGT00940000159334 ENSGT00390000004952.a.b ENSGT00390000000155.a.b ENSGT00950000183000.c.a.a ENSGT00940000158566 ENSGT00940000166209 ENSGT00390000009423.a ENSGT00940000160034 ENSGT00940000162317 ENSGT00390000015815.g ENSGT00940000159437.c ENSGT00530000064165.a.d ENSGT00390000003866.b ENSGT00390000003153 ENSGT00940000162883 European seabass MODERN SPECIES 12 ENSDLAG00005027298 nxf1a (ENSDLAG00005004439) ENSDLAG00005021234 ENSDLAG00005021186 ENSDLAG00005021173 zgc:162144 (ENSDLAG00005021167) stx5a (ENSDLAG00005021130) ##12 ENSDLAG00005034034 dnajc4 (ENSDLAG00005034177) ENSDLAG00005021119 ENSDLAG00005031170 hs6st2 (ENSDLAG00005031804) mbnl3 (ENSDLAG00005027604) rap2c (ENSDLAG00005027080) zgc:92907 (ENSDLAG00005021067) ENSDLAG00005021065 ##22 ENSDLAG00005021063 ubl3b (ENSDLAG00005033581) ENSDLAG00005021040 cfl1 (ENSDLAG00005021029) atl3 (ENSDLAG00005020740) yif1a (ENSDLAG00005020643) ccdc85b (ENSDLAG00005030995) fibpa (ENSDLAG00005020600) efemp2a (ENSDLAG00005020511) npas4a (ENSDLAG00005020496) ENSDLAG00005030121 mrpl11 (ENSDLAG00005020486) ENSDLAG00005020456 slc25a43 (ENSDLAG00005020446) lnx2b (ENSDLAG00005020434) Large yellow croaker MODERN SPECIES trmt112 (ENSLCRG00005019346) ENSLCRG00005019343 KCNK4 (ENSLCRG00005019341) ENSLCRG00005019340 zgc:162144 (ENSLCRG00005019338) stx5a (ENSLCRG00005019317) ##12 ENSLCRG00005019313 dnajc4 (ENSLCRG00005019310) nudt22 (ENSLCRG00005019307) ENSLCRG00005019290 zgc:153018 (ENSLCRG00005019289) hs6st2 (ENSLCRG00005019288) mbnl3 (ENSLCRG00005019286) rap2c (ENSLCRG00005019284) zgc:92907 (ENSLCRG00005019281) ENSLCRG00005019279 ##22 FOXO4 (ENSLCRG00005019278) ubl3b (ENSLCRG00005019277) ENSLCRG00005019276 atl3 (ENSLCRG00005019222) ENSLCRG00005019211 yif1a (ENSLCRG00005019209) fosl1a (ENSLCRG00005019206) ccdc85b (ENSLCRG00005019205) fibpa (ENSLCRG00005019204) efemp2a (ENSLCRG00005019136) npas4a (ENSLCRG00005019133) ENSLCRG00005019131 mrpl11 (ENSLCRG00005019129) ENSLCRG00005019122 slc25a43 (ENSLCRG00005019120) Perciformes ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000164608 ENSGT00940000166208 ENSGT00940000160310.a ENSGT00730000111187.a.a ENSGT00390000002089.a.a.b ENSGT01000000214440.C ##12 ENSGT00940000166453 ENSGT00510000048574 ENSGT00390000017869 ENSGT00940000160376 ENSGT00510000048283.c ENSGT00950000183071.a.b ENSGT00950000182897.B.a.b.a ENSGT00940000157245 ENSGT00510000047493 ENSGT00950000183168.C ##22 ENSGT00940000159334 ENSGT00390000004952.a.b ENSGT00390000000155.a.b ENSGT00950000183000.c.a.a ENSGT00940000158566 ENSGT00940000166209 ENSGT00390000009423.a ENSGT00940000160034 ENSGT00940000162317 ENSGT00390000015815.g ENSGT00940000159437.c ENSGT00530000064165.a.d ENSGT00390000003866.b ENSGT00390000003153 ENSGT00940000154622.a.b.n Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000164608 ENSGT00940000166208 ENSGT00940000160310.a ENSGT00730000111187.a.a ENSGT00390000002089.a.a.b ENSGT01000000214440.C ##12 ENSGT00940000166453 ENSGT00510000048574 ENSGT00390000017869 ENSGT00940000160376 ENSGT00510000048283.c ENSGT00950000183071.a.b ENSGT00950000182897.B.a.b.a ENSGT00940000157245 ENSGT00510000047493 ENSGT00950000183168.C ##22 ENSGT00940000159334 ENSGT00390000004952.a.b ENSGT00390000000155.a.b ENSGT00950000183000.c.a.a ENSGT00940000158566 ENSGT00940000166209 ENSGT00390000009423.a ENSGT00940000160034 ENSGT00940000162317 ENSGT00390000015815.g ENSGT00940000159437.c ENSGT00530000064165.a.d ENSGT00390000003866.b ENSGT00390000003153 ENSGT00940000154622.a.b.n Channel bull blenny MODERN SPECIES 1 ATG2A (ENSCGOG00000012128) trmt112 (ENSCGOG00000012086) ENSCGOG00000012084 KCNK4 (ENSCGOG00000012080) zgc:162144 (ENSCGOG00000012078) stx5a (ENSCGOG00000011635) ##12 ENSCGOG00000011621 dnajc4 (ENSCGOG00000011620) nudt22 (ENSCGOG00000011619) ENSCGOG00000011573 zgc:153018 (ENSCGOG00000011570) hs6st2 (ENSCGOG00000011568) mbnl3 (ENSCGOG00000011500) rap2c (ENSCGOG00000011492) zgc:92907 (ENSCGOG00000011489) ENSCGOG00000011485 ##22 FOXO4 (ENSCGOG00000011481) ubl3b (ENSCGOG00000011478) ENSCGOG00000011477 cfl1 (ENSCGOG00000011474) atl3 (ENSCGOG00000008204) ENSCGOG00000008129 yif1a (ENSCGOG00000008101) fosl1a (ENSCGOG00000008095) ccdc85b (ENSCGOG00000008093) fibpa 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9 ENSGT00940000164608 ENSGT00940000166208 ENSGT00940000160310.a ENSGT00940000177266 ENSGT00390000002089.a.a.b ENSGT01000000214440.C ##12 ENSGT00940000166453 ENSGT00510000048574 ENSGT00390000017869 ENSGT00940000160376 ENSGT00510000048283.c ENSGT00950000183071.a.b ENSGT00950000182897.B.a.b.a ENSGT00940000157245 ENSGT00510000047493 ENSGT00950000183168.C ##22 ENSGT00940000159334 ENSGT00390000004952.a.b ENSGT00390000000155.a.b ENSGT00950000183000.c.a.a ENSGT00940000158566 ENSGT00940000166209 ENSGT00390000009423.a ENSGT00940000160034 ENSGT00940000162317 ENSGT00390000015815.g ENSGT00940000159437.c ENSGT00530000064165.a.d ENSGT00390000003153 ENSGT00390000003866.b ENSGT00940000162883 Stickleback MODERN SPECIES 3 KCNK4 (ENSGACG00000016974) ENSGACG00000016977 zgc:162144 (ENSGACG00000016978) stx5a (ENSGACG00000016980) ##12 ENSGACG00000016999 dnajc4 (ENSGACG00000017001) nudt22 (ENSGACG00000017004) ENSGACG00000017006 zgc:153018 (ENSGACG00000017010) hs6st2 (ENSGACG00000017013) ENSGACG00000017014 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ENSGT00940000154174 Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES 367 ENSGT00940000153669.a ENSGT00530000063695.a ENSGT00940000159074 ENSGT00950000183168.D ##22 ENSGT00390000012084 ENSGT00940000160158 ENSGT00940000162506 ENSGT00390000003919 ENSGT00390000017288 ENSGT00940000153972.A Neopterygii ANCESTRAL SPECIES 52 ENSGT00940000156432.b ENSGT00940000161220 ENSGT00390000000938 ENSGT00950000183144.A ENSGT00940000156576 ENSGT00940000161147 ENSGT00390000012961 ENSGT00940000168882 ENSGT00510000047611 ENSGT00940000157424 ENSGT00940000174692 ENSGT00940000159817 ENSGT00940000153669.a ENSGT00530000063695.a ENSGT00940000159074 ENSGT00950000183168.D ##22 ENSGT00390000012084 ENSGT00940000160158 ENSGT00940000162506 ENSGT00390000003919 ENSGT00390000017288 ENSGT00940000153972.A Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 665 ENSGT00940000159074.f ENSGT00950000183168.D ##22 ENSGT00390000012084 Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00390000016789 ENSGT00940000156432.b ENSGT00940000161220 ENSGT00390000000938 ENSGT00950000183144.A ENSGT00940000156576 ENSGT00940000161147 ENSGT00390000012961 ENSGT00510000047611 ENSGT00940000157424 ENSGT00940000174692 ENSGT00940000159817 ENSGT00940000153669.a ENSGT00530000063695.a ENSGT00940000159074.e.a.a ENSGT00950000183168.D ##22 ENSGT00940000160158 ENSGT00940000162506 ENSGT00390000003919 ENSGT00390000017288 ENSGT00940000154336 ENSGT00940000153972.A.a ENSGT00940000158517 ENSGT00390000000303 ENSGT00940000157301.b.e ENSGT01030000234595.A.a.jb.b ENSGT00940000155336.g.b ENSGT01050000244891.B ENSGT00940000154174.db ENSGT00940000154981.bb.b Asian bonytongue DUPLICATION Asian bonytongue MODERN SPECIES 1 lrrc51 (ENSSFOG00015030124) lamtor1 (ENSSFOG00015032080) ENSSFOG00015026836 tomt (ENSSFOG00015016320) anapc15 (ENSSFOG00015033360) folr (ENSSFOG00015016286) inppl1a (ENSSFOG00015016243) phox2a (ENSSFOG00015026369) CLPB (ENSSFOG00015016160) stard10 (ENSSFOG00015024322) ARAP1 (ENSSFOG00015016004) PDE2A (ENSSFOG00015025589) mtmr2 (ENSSFOG00015015953) cep57 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(ENSPKIG00000022063) ENSPKIG00000022039 tekt1 (ENSPKIG00000021946) Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000156432.b ENSGT00940000161220 ENSGT00390000000938 ENSGT00950000183144.A ENSGT00940000156576 ENSGT00940000161147 ENSGT00390000012961 ENSGT00940000168882 ENSGT00510000047611 ENSGT00940000157424 ENSGT00940000174692 ENSGT00940000159817 ENSGT00530000063695.a ENSGT00940000153669.a ENSGT00940000159074.f ENSGT00950000183168.D ##22 ENSGT00390000012084 Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 133 ENSGT00940000153669.a ENSGT00940000159074.f ENSGT00950000183168.D ##22 ENSGT00390000012084 ENSGT00940000153972.A.b ENSGT00940000168284 ENSGT01030000234981 ENSGT00940000166539 ENSGT00940000154553.a.a.d ENSGT00940000155354.b ENSGT00940000155418.a.a.b ENSGT01030000234556.b.b.a.b ENSGT01030000234556.a.a.a.b ENSGT00950000183199.a.a ENSGT00940000174767 ENSGT00940000159470 ENSGT00940000155162.o.a ENSGT00940000153875.d.a Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT01040000240444.A.a.a.a.a.b 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DSCAML1 (ENSHHUG00000002204) fxyd2 (ENSHHUG00000002196) tmprss13b (ENSHHUG00000002176) tmprss4b (ENSHHUG00000002166) scn4bb (ENSHHUG00000002158) ENSHHUG00000002150 pafah1b2 (ENSHHUG00000002117) Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 212 ENSGT00520000059318 ENSGT00940000155242.c ENSGT00940000163331.a.a.a ENSGT01100000264281 ENSGT00390000006915.c.d.b.d ENSGT00940000167278.b ENSGT00940000153251.b.a ENSGT00940000156123.b.d ENSGT00710000106792.v ENSGT00950000182972.a.a.a.a.a.f.b ENSGT00940000157427.i.c ENSGT00940000157424.m.c.b ENSGT00940000159817.kb.a ENSGT00940000153669.a.r ENSGT00940000159074.f.a ENSGT00950000183168.D.d ##22 ENSGT00390000012084.a ENSGT00940000159677.a.a ENSGT00940000159677.a.b.w.a.b ENSGT00940000164866.d ENSGT00940000153972.A.b.i ENSGT00940000168284.e ENSGT01030000234981.e ENSGT00940000166539.b ENSGT00940000154553.a.a.d.a ENSGT00940000162008.e.b ENSGT00940000155354.b.b ENSGT00940000159197.g.b.b ENSGT01030000234556.b.b.a.b.b ENSGT01030000234556.b.a.a.b ENSGT00950000183199.a.a.u Huchen MODERN SPECIES 201 ENSHHUG00000034678 taf1 (ENSHHUG00000034566) rhogc (ENSHHUG00000034559) ENSHHUG00000034556 plp1b (ENSHHUG00000034534) nlgn3b (ENSHHUG00000034495) ENSHHUG00000034454 gria3a (ENSHHUG00000034166) thoc2 (ENSHHUG00000034075) STAG2 (ENSHHUG00000033152) ACSL4 (ENSHHUG00000033050) ARAP1 (ENSHHUG00000032998) PDE2A (ENSHHUG00000032964) mtmr2 (ENSHHUG00000032569) fam76b (ENSHHUG00000032528) sesn3 (ENSHHUG00000032509) ##22 cwc15 (ENSHHUG00000032469) ENSHHUG00000032398 ENSHHUG00000032395 ENSHHUG00000032334 panx1b (ENSHHUG00000032307) epd (ENSHHUG00000032262) ENSHHUG00000032257 myo1ca (ENSHHUG00000032214) ENSHHUG00000032193 ENSHHUG00000032182 DSCAML1 (ENSHHUG00000032106) Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00520000059318 ENSGT00940000155242.c ENSGT00940000163331.a.a.a ENSGT01100000264281 ENSGT00390000006915.c.d.b.d ENSGT00940000167278.b ENSGT00940000153251.b.a ENSGT00940000156123.b.d ENSGT00710000106792.v ENSGT00950000182972.a.a.a.a.a.f.b ENSGT00940000157427.i.c ENSGT00940000157424.m.c.b ENSGT00940000159817.kb.a ENSGT00940000153669.a.r ENSGT00940000159074.f.a ENSGT00950000183168.D.d ##22 ENSGT00390000012084.a ENSGT00940000159677.a.a ENSGT00940000159677.a.b.w.a.b ENSGT00940000164866.d ENSGT00940000153972.A.b.i ENSGT00940000168284.e ENSGT01030000234981.e ENSGT00940000166539.b ENSGT00940000154553.a.a.d.a ENSGT00940000162008.e.b ENSGT00940000155354.b.b ENSGT00940000159197.g.b.b ENSGT01030000234556.b.b.a.b.b ENSGT01030000234556.b.a.a.b ENSGT00950000183199.a.a.u Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00520000059318 ENSGT00940000155242.c ENSGT00940000163331.a.a.a ENSGT01100000264281 ENSGT00390000006915.c.d.b.d ENSGT00940000167278.b ENSGT00940000153251.b.a ENSGT00940000156123.b.d ENSGT00710000106792.v ENSGT00950000182972.a.a.a.a.a.f.b ENSGT00940000157427.i.c ENSGT00940000157424.m.c.b ENSGT00940000159817.kb.a ENSGT00940000153669.a.r ENSGT00940000159074.f.a ENSGT00950000183168.D.d ##22 ENSGT00390000012084.a ENSGT00940000159677.a.a ENSGT00940000159677.a.b.w.a.b ENSGT00940000164866.d ENSGT00940000168284.e ENSGT01030000234981.e ENSGT00940000166539.b ENSGT00940000154553.a.a.d.a ENSGT00940000162008.e.b ENSGT00940000155354.b.b ENSGT00940000159197.g.b.b ENSGT01030000234556.b.b.a.b.b ENSGT01030000234556.b.a.a.b ENSGT00950000183199.a.a.u ENSGT00940000159470.k Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00520000059318 ENSGT00940000155242.c ENSGT00940000163331.a.a.a ENSGT01100000264281 ENSGT00390000006915.c.d.b.d ENSGT00940000167278.b ENSGT00940000153251.b.a ENSGT00940000156123.b.d ENSGT00710000106792.v ENSGT00950000182972.a.a.a.a.a.f.b ENSGT00940000157427.i.c ENSGT00940000157424.m.c.b ENSGT00940000159817.kb.a ENSGT00940000153669.a.r ENSGT00940000159074.f.a ENSGT00950000183168.D.d ##22 ENSGT00390000012084.a ENSGT00940000159677.a.a ENSGT00940000159677.a.b.w.a.b ENSGT00940000164866.d ENSGT00940000168284.e ENSGT01030000234981.e ENSGT00940000166539.b ENSGT00940000154553.a.a.d.a ENSGT00940000155354.b.b ENSGT00940000159197.g.b.b ENSGT01030000234556.b.b.a.b.b ENSGT01030000234556.b.a.a.b ENSGT00950000183199.a.a.u ENSGT00940000174767 ENSGT00940000159470.k Chinook salmon MODERN SPECIES 33 znf711 (ENSOTSG00005028980) ENSOTSG00005028979 taf1 (ENSOTSG00005027907) rhogc (ENSOTSG00005027884) plp1b (ENSOTSG00005027882) nlgn3b (ENSOTSG00005027878) ENSOTSG00005027867 gria3a (ENSOTSG00005027807) thoc2 (ENSOTSG00005027701) STAG2 (ENSOTSG00005027210) ACSL4 (ENSOTSG00005026926) ARAP1 (ENSOTSG00005026924) PDE2A (ENSOTSG00005026830) mtmr2 (ENSOTSG00005023994) fam76b (ENSOTSG00005023981) sesn3 (ENSOTSG00005023973) ##22 cwc15 (ENSOTSG00005023972) ENSOTSG00005023970 ENSOTSG00005023895 ENSOTSG00005023890 epd (ENSOTSG00005023888) ENSOTSG00005023886 myo1ca (ENSOTSG00005012801) ENSOTSG00005012764 ENSOTSG00005012763 DSCAML1 (ENSOTSG00005012488) tmprss13b (ENSOTSG00005012471) scn4bb (ENSOTSG00005012470) ENSOTSG00005012469 pafah1b2 (ENSOTSG00005012468) ENSOTSG00005012452 Coho salmon MODERN SPECIES 26 znf711 (ENSOKIG00005024595) taf1 (ENSOKIG00005021931) rhogc (ENSOKIG00005021671) ENSOKIG00005021650 plp1b (ENSOKIG00005021612) nlgn3b (ENSOKIG00005021439) ENSOKIG00005021359 gria3a (ENSOKIG00005021011) THOC2 (ENSOKIG00005020622) STAG2 (ENSOKIG00005020054) ACSL4 (ENSOKIG00005019620) ARAP1 (ENSOKIG00005019452) PDE2A (ENSOKIG00005019412) MTMR2 (ENSOKIG00005019116) fam76b (ENSOKIG00005018705) ENSOKIG00005018643 ##22 cwc15 (ENSOKIG00005018621) UGT1A1 (ENSOKIG00005018604) ENSOKIG00005018594 epd (ENSOKIG00005018590) ENSOKIG00005018573 myo1ca (ENSOKIG00005014108) ENSOKIG00005013793 ENSOKIG00005013780 DSCAML1 (ENSOKIG00005012215) tmprss13b (ENSOKIG00005012078) scn4bb (ENSOKIG00005012046) ENSOKIG00005012038 PAFAH1B2 (ENSOKIG00005012031) ENSOKIG00005011949 tagln2 (ENSOKIG00005011911) Rainbow trout MODERN SPECIES 3 ENSOMYG00000022750 rhogc (ENSOMYG00000022534) ENSOMYG00000062468 ENSOMYG00000022524 ENSOMYG00000022424 ENSOMYG00000022350 ENSOMYG00000020858 ENSOMYG00000020560 ENSOMYG00000014012 ENSOMYG00000012956 ENSOMYG00000012280 ENSOMYG00000012158 ENSOMYG00000010695 ENSOMYG00000051972 fam76b (ENSOMYG00000060073) ENSOMYG00000010453 ##22 ENSOMYG00000010404 ENSOMYG00000071569 ENSOMYG00000010341 ENSOMYG00000069360 ENSOMYG00000010325 ENSOMYG00000010293 epd (ENSOMYG00000010264) il27a2 (ENSOMYG00000010247) myo1ca (ENSOMYG00000009011) ENSOMYG00000008185 ENSOMYG00000008089 ENSOMYG00000006990 ENSOMYG00000005725 scn4bb (ENSOMYG00000005665) ENSOMYG00000051872 Salmo ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00950000182803.B.d.a.n.s.a.a ENSGT00940000159611.h.b ENSGT00940000155242.c ENSGT00940000163331.a.a.a ENSGT00390000006915.c.d.b.d ENSGT00940000167278.b ENSGT00940000153251.b.a ENSGT00940000156123.b.d ENSGT00710000106792.v ENSGT00950000182972.a.a.a.a.a.f.b ENSGT00940000157427.i.c ENSGT00940000157424.m.c.b ENSGT00940000159817.kb.a ENSGT00940000153669.a.r ENSGT00940000159074.f.a ENSGT00950000183168.D.d ##22 ENSGT00390000012084.a ENSGT00940000159677.a.a ENSGT00940000159677.a.b.w.a.b ENSGT00940000164866.d ENSGT00940000153972.A.b.i ENSGT00940000168284.e ENSGT01030000234981.e ENSGT00940000166539.b ENSGT00940000154553.a.a.d.a ENSGT00940000162008.e.b ENSGT00940000155354.b.b ENSGT00940000159197.g.b.b ENSGT01030000234556.b.b.a.b.b ENSGT01030000234556.b.a.a.b ENSGT00950000183199.a.a.u Atlantic salmon MODERN SPECIES 4 ENSSSAG00000052311 prps1a (ENSSSAG00000052321) ENSSSAG00000052747 ENSSSAG00000052872 ENSSSAG00000119755 ENSSSAG00000078584 ENSSSAG00000066511 ENSSSAG00000090171 ENSSSAG00000081951 ENSSSAG00000070285 ENSSSAG00000071283 ENSSSAG00000072494 ENSSSAG00000088773 ENSSSAG00000118091 ENSSSAG00000073456 ENSSSAG00000052702 ##22 ENSSSAG00000073512 ENSSSAG00000073546 ENSSSAG00000073984 ENSSSAG00000073987 epd (ENSSSAG00000073991) ENSSSAG00000073994 myo1ca (ENSSSAG00000074022) ENSSSAG00000074243 ENSSSAG00000074248 ENSSSAG00000074284 ENSSSAG00000074848 mpzl2 (ENSSSAG00000074851) ENSSSAG00000074852 ENSSSAG00000099039 ENSSSAG00000090262 River trout MODERN SPECIES 6 znf711 (ENSSTUG00000002298) zgc:158432 (ENSSTUG00000002325) 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(ENSELUG00000007837) acsl4b (ENSELUG00000007875) ercc6l (ENSELUG00000007917) ARAP1 (ENSELUG00000007968) PDE2A (ENSELUG00000008010) mtmr2 (ENSELUG00000008035) fam76b (ENSELUG00000008046) sesn3 (ENSELUG00000008067) ##22 cwc15 (ENSELUG00000008086) panx1b (ENSELUG00000000298) epd (ENSELUG00000008157) ENSELUG00000008169 myo1ca (ENSELUG00000008302) ENSELUG00000001334 ENSELUG00000026412 PRLHR (ENSELUG00000031083) DSCAML1 (ENSELUG00000008480) ENSELUG00000026686 ENSELUG00000025238 ENSELUG00000008540 tmprss4b (ENSELUG00000008566) scn4bb (ENSELUG00000008602) mpzl2b (ENSELUG00000000326) Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 453 ENSGT00940000158347.y ENSGT00940000167197 ENSGT00940000159451 ENSGT01050000244864.B.a.f ENSGT01040000240566 ENSGT01030000234513.B.a.d ENSGT01100000265889 ENSGT00940000153669.a ENSGT00940000159074.f ENSGT00950000183168.D ##22 ENSGT00390000012084 Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 474 ENSGT00940000158347.y ENSGT00940000159451 ENSGT01050000244864.B.a.f ENSGT01030000234513.B.a.d ENSGT01100000265889 ENSGT00940000153669.a ENSGT00940000159074.f ENSGT00950000183168.D ##22 ENSGT00390000012084 Atlantic herring MODERN SPECIES 24 ENSCHAG00000008317 APBB3 (ENSCHAG00000008325) SRA1 (ENSCHAG00000008355) ENSCHAG00000008379 CSF1R (ENSCHAG00000008400) ENSCHAG00000008454 cdx1b (ENSCHAG00000009295) camk2a (ENSCHAG00000009354) ENSCHAG00000011254 ndufa2 (ENSCHAG00000011263) haus4 (ENSCHAG00000011280) ik (ENSCHAG00000011303) ENSCHAG00000000873 ENSCHAG00000001210 ENSCHAG00000001631 sesn3 (ENSCHAG00000002198) ##22 ENSCHAG00000002682 ENSCHAG00000002711 ENSCHAG00000002758 ENSCHAG00000002806 ENSCHAG00000002862 tbc1d8b (ENSCHAG00000002958) ENSCHAG00000003800 gja2 (ENSCHAG00000003843) acsl4b (ENSCHAG00000003962) stag2a (ENSCHAG00000007405) ENSCHAG00000009855 gria3a (ENSCHAG00000009947) nlgn3b (ENSCHAG00000012918) plp1b (ENSCHAG00000012955) ENSCHAG00000012993 Denticle herring MODERN SPECIES 16 ENSDCDG00000034782 ercc6l (ENSDCDG00000034783) acsl4b (ENSDCDG00000034796) stag2a 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(ENSCARG00000066937) agfg1a (ENSCARG00000066947) mrpl44 (ENSCARG00000066967) mffa (ENSCARG00000066981) MECOM (ENSCARG00000067066) NYAP2 (ENSCARG00000067361) ENSCARG00000067463 zgc:171927 (ENSCARG00000067465) or71at1 (ENSCARG00000067471) or71as2 (ENSCARG00000067475) or71ar1 (ENSCARG00000067479) or71ar1 (ENSCARG00000067484) ENSCARG00000067486 ENSCARG00000067490 Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 41 ENSGT00390000014900.b.a.f ENSGT00390000016820.d.a ENSGT00940000157010.m.c ENSGT00980000199373 ENSGT00390000016199.a.a ENSGT00990000205233.a ENSGT01060000248544.a.b.b.a.a ENSGT00940000157642.g.a ENSGT00390000018500.a.d.a.a ENSGT00390000018500.a.d.b ENSGT00530000063632.B.b.a ENSGT00940000166999.B.b ENSGT00940000158480.a ENSGT00950000183190.a.a.b.d.g.a ENSGT00940000169011.a ENSGT00950000183168.D.e ##22 ENSGT00390000008756.d ENSGT00950000183022.a.a.a.g.b ENSGT00940000155511.n.a.d ENSGT00390000016956.g ENSGT00390000009776.o.b ENSGT00940000157208.g ENSGT00890000139453.b.e.b.d ENSGT00940000161579.c.b ENSGT00390000010744.m.b ENSGT00510000047914.a.a.i.g ENSGT00510000047914.b.b ENSGT00950000183084.b.b.m ENSGT00390000001750.d ENSGT00940000153270.b.b.f ENSGT00940000162556.G.c.b.a.b.b.a.a Common carp reference MODERN SPECIES 39 crppa (ENSCCRG00000050617) sostdc1a (ENSCCRG00000050611) ankmy2a (ENSCCRG00000004143) tspan13a (ENSCCRG00000050605) ENSCCRG00000050603 bag6 (ENSCCRG00000049051) lta (ENSCCRG00000054574) tnfb (ENSCCRG00000001526) ENSCCRG00000004105 sh3bp5la (ENSCCRG00000070853) rnf183 (ENSCCRG00000058996) dhx16 (ENSCCRG00000078521) ENSCCRG00000079917 ENSCCRG00000003813 ENSCCRG00000028703 ENSCCRG00000028708 ##22 ENSCCRG00000065518 ENSCCRG00000028717 agfg1a (ENSCCRG00000028758) mrpl44 (ENSCCRG00000070414) mffa (ENSCCRG00000057546) ENSCCRG00000004181 NYAP2 (ENSCCRG00000063933) ENSCCRG00000019871 rhbdd1 (ENSCCRG00000019865) ENSCCRG00000019862 sst1.1 (ENSCCRG00000074143) ENSCCRG00000019457 ostn (ENSCCRG00000019453) ENSCCRG00000071722 ENSCCRG00000057124 Golden-line barbel MODERN SPECIES 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ENSGT00940000157208.h ENSGT00940000174694 ENSGT00890000139453.b.e.b.c ENSGT00940000161579.c.a ENSGT00390000010744.m.a ENSGT00940000153991.a.b.b ENSGT00940000166749 ENSGT00510000047914.b.a ENSGT00950000183084.b.b.l Golden-line barbel MODERN SPECIES 5 DGKB (ENSSGRG00000012046) agmo (ENSSGRG00000011941) MEOX2 (ENSSGRG00000011938) crppa (ENSSGRG00000011936) sostdc1a (ENSSGRG00000011930) ankmy2a (ENSSGRG00000011553) bag6 (ENSSGRG00000010451) lta (ENSSGRG00000010432) ENSSGRG00000010420 sh3bp5la (ENSSGRG00000010414) mgat1a (ENSSGRG00000010411) rnf183 (ENSSGRG00000010408) dhx16 (ENSSGRG00000007620) ENSSGRG00000007506 ENSSGRG00000007493 sesn3 (ENSSGRG00000007463) ##22 bloc1s3 (ENSSGRG00000007462) SLC19A3 (ENSSGRG00000007391) agfg1a (ENSSGRG00000007204) mrpl44 (ENSSGRG00000007201) mffa (ENSSGRG00000007199) megf6 (ENSSGRG00000007094) MECOM (ENSSGRG00000007066) ENSSGRG00000007065 NYAP2 (ENSSGRG00000007064) IRS1 (ENSSGRG00000007063) rhbdd1 (ENSSGRG00000007062) COL4A4 (ENSSGRG00000007061) ENSSGRG00000007052 sst1.1 (ENSSGRG00000007050) MASP1 (ENSSGRG00000007028) Common carp reference MODERN SPECIES 26 ENSCCRG00000004151 tspan13a (ENSCCRG00000026285) ankmy2a (ENSCCRG00000063421) bag6 (ENSCCRG00000049032) lta (ENSCCRG00000001076) tnfb (ENSCCRG00000007334) ENSCCRG00000001542 sh3bp5la (ENSCCRG00000004107) mgat1a (ENSCCRG00000004113) rnf183 (ENSCCRG00000075642) dhx16 (ENSCCRG00000058939) ppt2a.1 (ENSCCRG00000009221) ENSCCRG00000009213 ENSCCRG00000009206 ENSCCRG00000065386 sesn3 (ENSCCRG00000009201) ##22 ENSCCRG00000078851 ENSCCRG00000009196 agfg1a (ENSCCRG00000009188) mrpl44 (ENSCCRG00000038029) mffa (ENSCCRG00000056679) megf6 (ENSCCRG00000061464) ENSCCRG00000004224 NYAP2 (ENSCCRG00000065426) IRS1 (ENSCCRG00000057643) rhbdd1 (ENSCCRG00000078073) COL4A4 (ENSCCRG00000058609) ENSCCRG00000057232 sst1.1 (ENSCCRG00000033046) ENSCCRG00000033851 ostn (ENSCCRG00000034084) Zebrafish MODERN SPECIES 6 tnfb (ENSDARG00000013598) GABBR1 (ENSDARG00000018967) sh3bp5la (ENSDARG00000019160) 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(ENSLOCG00000007666) PDE2A (ENSLOCG00000007646) mtmr2 (ENSLOCG00000007628) cep57 (ENSLOCG00000007612) fam76b (ENSLOCG00000007600) sesn3 (ENSLOCG00000007583) ##22 cwc15 (ENSLOCG00000007570) AMOTL1 (ENSLOCG00000007548) FUT4 (ENSLOCG00000018021) ankrd49 (ENSLOCG00000007534) mre11a (ENSLOCG00000007516) GPR83 (ENSLOCG00000007502) panx1a (ENSLOCG00000007487) ENSLOCG00000007464 ENSLOCG00000007453 ENSLOCG00000007439 ENSLOCG00000007433 ENSLOCG00000007419 med17 (ENSLOCG00000007406) ENSLOCG00000007382 DEUP1 (ENSLOCG00000007351) Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 52 ENSGT00530000063929.b ENSGT00940000154175 ENSGT00510000046760.a ENSGT00510000047559 ENSGT00390000013786 ENSGT00940000161966 ENSGT01060000248588.a.d.a ENSGT00940000159713 ENSGT00940000155492.b ENSGT00950000183201.b.b.b.b.b.b.b ENSGT00940000153669.a ENSGT00530000063695.a ENSGT00940000159074 ENSGT00950000183168.D ##22 ENSGT00390000012084 ENSGT00940000160158 ENSGT00950000183200.A.a.a ENSGT00940000162506 ENSGT00390000003919 ENSGT00390000017288 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ENSGT00390000013786 ENSGT00940000161966 ENSGT01060000248588.a.d.a ENSGT00940000159713 ENSGT00940000155492.b ENSGT00940000158183 ENSGT00390000004986 ENSGT00940000175059 ENSGT00950000183201.a ENSGT00940000153669.a ENSGT00530000063695.a ENSGT00940000159074 ENSGT00950000183168.D ##22 ENSGT01030000234592.B ENSGT00390000012084 ENSGT00940000160158 ENSGT00950000183200.A.a.a ENSGT00940000162506 ENSGT00390000003919 ENSGT00390000017288 ENSGT00940000154336 ENSGT00940000153972.A ENSGT00940000158517 ENSGT00940000166029.a ENSGT01100000263551.b.a.b ENSGT00390000011810 ENSGT00940000153123.A ENSGT00390000015987 Frog MODERN SPECIES 2 ENSXETG00000046781 ENSXETG00000039901 panx1 (ENSXETG00000006428) gpr83.2 (ENSXETG00000041824) mre11 (ENSXETG00000006417) ankrd49 (ENSXETG00000037124) ankrd49 (ENSXETG00000006415) fut4 (ENSXETG00000025292) piwil4 (ENSXETG00000006411) ENSXETG00000047652 ENSXETG00000043087 amotl1 (ENSXETG00000006385) mtmr2 (ENSXETG00000007082) cep57 (ENSXETG00000007081) fam76b 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(ENSLLEG00000000894) MRE11 (ENSLLEG00000000758) ENSLLEG00000000746 GPR83 (ENSLLEG00000000726) ENSLLEG00000000696 PANX1 (ENSLLEG00000000668) ENSLLEG00000000585 ENSLLEG00000028296 ENSLLEG00000028258 Amniota ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183168.D ##22 Sauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183168.D ##22 Archelosauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183168.D ##22 Cryptodira ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183168.D ##22 Testudinoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183168.D ##22 Testudinidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183168.D ##22 Abingdon island giant tortoise MODERN SPECIES 658 NRP1 (ENSCABG00000000291) ENSCABG00000000241 ##22 ENSCABG00000000221 Coelacanth MODERN SPECIES 850 ENSLACG00000002975 MTMR2 (ENSLACG00000006349) CEP57 (ENSLACG00000007776) FAM76B (ENSLACG00000008459) ENSLACG00000011414 ##22 CWC15 (ENSLACG00000012239) AMOTL1 (ENSLACG00000013131) Bilateria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183168.A ##22 Chordata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183168.A ##22 Vertebrata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183168.A ##22 Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183168.A ##22 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183168.A ##22 Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183168.A ##22 Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183168.A ##22 Amniota ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154175 ENSGT00510000046760.a ENSGT00510000047559 ENSGT00390000013786 ENSGT00940000161966 ENSGT01060000248588.a.d.a ENSGT00940000159713 ENSGT00940000155492.b ENSGT00940000158183 ENSGT00390000004986 ENSGT00950000183201.a ENSGT01010000223591 ENSGT00940000153669.a ENSGT00530000063695.a ENSGT00940000159074 ENSGT00950000183168.A ##22 ENSGT01030000234592.B ENSGT00390000012084 ENSGT00940000160158 ENSGT00950000183200.A.a.a ENSGT00940000162506 ENSGT00520000058823 ENSGT00390000003919 ENSGT00390000017288 ENSGT00940000154336 ENSGT00940000153259.a.a.a ENSGT00940000153972.A ENSGT00940000157994 ENSGT01030000234590.A.a.b ENSGT00940000166029 ENSGT01100000263551.b.a.b Sauria ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000154175 ENSGT00510000046760.a ENSGT00510000047559 ENSGT00390000013786 ENSGT00940000161966 ENSGT01060000248588.a.d.a ENSGT00940000159713 ENSGT00940000155492.b ENSGT00940000158183 ENSGT00390000004986 ENSGT00950000183201.a ENSGT01010000223591 ENSGT00940000153669.a ENSGT00530000063695.a ENSGT00940000159074 ENSGT00950000183168.A ##22 ENSGT01030000234592.B ENSGT00390000012084 ENSGT00940000160158 ENSGT00950000183200.A.a.a ENSGT00940000162506 ENSGT00520000058823 ENSGT00390000003919 ENSGT00390000017288 ENSGT00940000154336 ENSGT00940000153972.A ENSGT00940000157994 ENSGT01030000234590.A.a.b ENSGT00940000166029 ENSGT01100000263551.b.a.b ENSGT00390000011810 Archelosauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154175 ENSGT00510000046760.a ENSGT00510000047559 ENSGT00390000013786 ENSGT00940000161966 ENSGT01060000248588.a.d.a ENSGT00940000159713 ENSGT00940000155492.b ENSGT00940000158183 ENSGT00390000004986 ENSGT00950000183201.a ENSGT01010000223591 ENSGT00940000153669.a ENSGT00530000063695.a ENSGT00940000159074 ENSGT00950000183168.A ##22 ENSGT01030000234592.B.`b ENSGT00390000012084 ENSGT00940000160158 ENSGT00950000183200.A.a.a ENSGT00940000162506 ENSGT00520000058823 ENSGT00390000003919 ENSGT00390000017288 ENSGT00940000154336 ENSGT00940000153972.A ENSGT00940000157994 ENSGT01030000234590.A.a.b ENSGT00940000166029.d ENSGT01100000263551.b.a.b ENSGT00390000011810 Archosauria ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00530000063929.b ENSGT00940000154175 ENSGT00510000046760.a ENSGT00510000047559 ENSGT00390000013786 ENSGT00940000161966 ENSGT01060000248588.a.d.a ENSGT00940000159713 ENSGT00940000155492.b ENSGT00940000158183 ENSGT00390000004986 ENSGT00950000183201.a ENSGT00940000153669.a ENSGT00530000063695.a ENSGT00940000159074 ENSGT00950000183168.A ##22 ENSGT01030000234592.B.`b ENSGT00390000012084 ENSGT00940000160158 ENSGT00950000183200.A.a.a ENSGT00940000162506 ENSGT00520000058823 ENSGT00390000003919 ENSGT00390000017288 ENSGT00940000154336 ENSGT00940000153972.A ENSGT00940000157994 ENSGT01030000234590.A.a.b ENSGT00940000166029.d ENSGT01100000263551.b.a.b ENSGT00390000011810 Aves ANCESTRAL SPECIES ENSGT00530000063929.b ENSGT00940000154175 ENSGT00510000046760.a ENSGT00510000047559 ENSGT00390000013786 ENSGT00940000161966 ENSGT01060000248588.a.d.a ENSGT00940000159713 ENSGT00940000155492.b ENSGT00940000158183 ENSGT00390000004986 ENSGT00950000183201.a ENSGT00940000153669.a ENSGT00530000063695.a ENSGT00940000159074 ENSGT00950000183168.A ##22 ENSGT01030000234592.B.`b ENSGT00390000012084 ENSGT00940000160158 ENSGT00940000162506 ENSGT00520000058823 ENSGT00390000003919 ENSGT00390000017288 ENSGT00940000154336 ENSGT00940000153972.A ENSGT00940000157994 ENSGT01030000234590.A.a.b ENSGT00940000166029.d ENSGT01100000263551.b.a.b ENSGT00390000011810 ENSGT00390000017214 Neognathae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00530000063929.b ENSGT00940000154175 ENSGT00510000046760.a ENSGT00510000047559 ENSGT00390000013786 ENSGT00940000161966 ENSGT01060000248588.a.d.a ENSGT00940000159713 ENSGT00940000155492.b ENSGT00940000158183 ENSGT00390000004986 ENSGT00950000183201.a ENSGT00940000153669.a ENSGT00530000063695.a ENSGT00940000159074 ENSGT00950000183168.A ##22 ENSGT01030000234592.B.`b ENSGT00390000012084 ENSGT00940000160158 ENSGT00940000162506 ENSGT00520000058823 ENSGT00390000003919 ENSGT00390000017288 ENSGT00940000154336 ENSGT00940000153972.A ENSGT00940000157994 ENSGT01030000234590.A.a.b ENSGT00940000166029.d ENSGT01100000263551.b.a.b ENSGT00390000011810 ENSGT00390000017214 Galloanserae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00530000063929.b ENSGT00940000154175 ENSGT00510000046760.a ENSGT00510000047559 ENSGT00390000013786 ENSGT00940000161966 ENSGT01060000248588.a.d.a ENSGT00940000159713 ENSGT00940000155492.b ENSGT00940000158183 ENSGT00390000004986 ENSGT00950000183201.a ENSGT00940000153669.a ENSGT00530000063695.a ENSGT00940000159074 ENSGT00950000183168.A ##22 ENSGT01030000234592.B.`b ENSGT00390000012084 ENSGT00940000160158 ENSGT00940000162506 ENSGT00520000058823 ENSGT00390000003919 ENSGT00390000017288 ENSGT00940000153972.A ENSGT00940000157994 ENSGT01030000234590.A.a.b ENSGT00940000166029.d ENSGT01100000263551.b.a.b ENSGT00390000011810 ENSGT00390000017214 ENSGT00390000009061 Anatidae ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00530000063929.b ENSGT00940000154175 ENSGT00510000046760.a ENSGT00510000047559 ENSGT00390000013786 ENSGT00940000161966 ENSGT01060000248588.a.d.a ENSGT00940000159713 ENSGT00940000155492.b ENSGT00940000158183 ENSGT00390000004986 ENSGT00950000183201.a ENSGT00940000153669.a ENSGT00530000063695.a ENSGT00940000159074 ENSGT00950000183168.A ##22 ENSGT01030000234592.B.`b ENSGT00390000012084 ENSGT00940000160158 ENSGT00940000162506 ENSGT00520000058823 ENSGT00390000003919 ENSGT00390000017288 ENSGT00940000153972.A ENSGT00940000157994 ENSGT01030000234590.A.a.b ENSGT00940000166029.d ENSGT01100000263551.b.a.b ENSGT00390000011810 ENSGT00390000017214 ENSGT00390000009061 Pink-footed goose MODERN SPECIES 69 CCDC82 (ENSABRG00000000801) MAML2 (ENSABRG00000000748) MTMR2 (ENSABRG00000022819) CEP57 (ENSABRG00000022815) FAM76B (ENSABRG00000022812) SESN3 (ENSABRG00000022806) ##22 ENDOD1 (ENSABRG00000022805) CWC15 (ENSABRG00000022800) AMOTL1 (ENSABRG00000022773) FUT4 (ENSABRG00000022765) C11orf97 (ENSABRG00000022763) ANKRD49 (ENSABRG00000022759) MRE11 (ENSABRG00000022756) GPR83 (ENSABRG00000022752) PANX1 (ENSABRG00000022749) ENSABRG00000022746 ENSABRG00000022745 ENSABRG00000022743 ENSABRG00000022742 VSTM5 (ENSABRG00000022741) MED17 (ENSABRG00000022726) Duck MODERN SPECIES ENSAPLG00000011925 SLITRK5 (ENSAPLG00000006873) ENSAPLG00000024179 SLITRK6 (ENSAPLG00000011486) ENSAPLG00000027660 ENSAPLG00000003316 ARHGAP42 (ENSAPLG00000016036) CNTN5 (ENSAPLG00000013194) ENSAPLG00000026412 ENSAPLG00000023904 CCDC82 (ENSAPLG00000004583) MAML2 (ENSAPLG00000004519) MTMR2 (ENSAPLG00000004052) CEP57 (ENSAPLG00000003812) FAM76B (ENSAPLG00000003717) SESN3 (ENSAPLG00000003440) ##22 ENDOD1 (ENSAPLG00000025860) CWC15 (ENSAPLG00000003221) AMOTL1 (ENSAPLG00000002742) FUT4 (ENSAPLG00000019961) C11orf97 (ENSAPLG00000019178) MRE11 (ENSAPLG00000021936) PANX1 (ENSAPLG00000016177) ENSAPLG00000027891 HEPHL1 (ENSAPLG00000015713) ENSAPLG00000015524 ENSAPLG00000015429 VSTM5 (ENSAPLG00000015398) MED17 (ENSAPLG00000015087) C11orf54 (ENSAPLG00000014882) ENSAPLG00000024522 Phasianidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154175 ENSGT00510000046760.a ENSGT00510000047559 ENSGT00390000013786 ENSGT00940000161966 ENSGT00950000182865.b.b.b.c.a.i.a.b.b ENSGT01060000248588.a.d.a ENSGT00940000159713 ENSGT00940000155492.b ENSGT00940000158183 ENSGT00390000004986 ENSGT00950000183201.a ENSGT00940000153669.a ENSGT00530000063695.a ENSGT00940000159074 ENSGT00950000183168.A ##22 ENSGT01030000234592.B.`b ENSGT00390000012084 ENSGT00940000160158 ENSGT00940000162506 ENSGT00520000058823 ENSGT00390000003919 ENSGT00390000017288 ENSGT00940000153972.A ENSGT00940000157994.b ENSGT01030000234590.A.a.b ENSGT00940000166029.d ENSGT01100000263551.b.a.b ENSGT00390000011810 ENSGT00390000017214 ENSGT00390000009061 Japanese quail MODERN SPECIES CFAP300 (ENSCJPG00005003768) ENSCJPG00005003770 ANGPTL5 (ENSCJPG00005003777) ENSCJPG00005003791 TRPC6 (ENSCJPG00005003793) PGR (ENSCJPG00005003805) ARHGAP42 (ENSCJPG00005003808) CNTN5 (ENSCJPG00005003828) ENSCJPG00005003843 CCDC82 (ENSCJPG00005003846) ENSCJPG00005003847 ENSCJPG00005003848 MTMR2 (ENSCJPG00005003852) CEP57 (ENSCJPG00005003853) FAM76B (ENSCJPG00005003854) SESN3 (ENSCJPG00005003931) ##22 ENDOD1 (ENSCJPG00005003932) CWC15 (ENSCJPG00005003933) AMOTL1 (ENSCJPG00005003951) FUT4 (ENSCJPG00005003953) C11orf97 (ENSCJPG00005003956) ANKRD49 (ENSCJPG00005003958) MRE11 (ENSCJPG00005003960) GPR83 (ENSCJPG00005003962) PANX1 (ENSCJPG00005003965) ENSCJPG00005003967 ENSCJPG00005003971 ENSCJPG00005003973 ENSCJPG00005003974 VSTM5 (ENSCJPG00005003975) MED17 (ENSCJPG00005003976) Phasianidae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154175 ENSGT00510000046760.a ENSGT00510000047559 ENSGT00390000013786 ENSGT00940000161966 ENSGT00950000182865.b.b.b.c.a.i.a.b.b ENSGT01060000248588.a.d.a ENSGT00940000159713 ENSGT00940000155492.b ENSGT00940000158183 ENSGT00390000004986 ENSGT00950000183201.a ENSGT00940000153669.a ENSGT00530000063695.a ENSGT00940000159074 ENSGT00950000183168.A ##22 ENSGT01030000234592.B.`b ENSGT00390000012084 ENSGT00940000160158 ENSGT00940000162506 ENSGT00520000058823 ENSGT00390000003919 ENSGT00390000017288 ENSGT00940000153972.A ENSGT00940000157994.b ENSGT01030000234590.A.a.b ENSGT00940000166029.d ENSGT01100000263551.b.a.b ENSGT00390000011810 ENSGT00390000017214 ENSGT00390000009061 Turkey MODERN SPECIES ENSMGAG00000015612 ENSMGAG00000015128 ENSMGAG00000021286 ENSMGAG00000015126 ENSMGAG00000022671 ENSMGAG00000015123 ENSMGAG00000015124 ZDHHC20 (ENSMGAG00000015122) MRPL57 (ENSMGAG00000015610) FGF9 (ENSMGAG00000021422) CCDC82 (ENSMGAG00000015184) MAML2 (ENSMGAG00000015186) MTMR2 (ENSMGAG00000015187) CEP57 (ENSMGAG00000015188) FAM76B (ENSMGAG00000015189) SESN3 (ENSMGAG00000015191) ##22 ENDOD1 (ENSMGAG00000020832) CWC15 (ENSMGAG00000015193) SMCO4 (ENSMGAG00000021417) ENSMGAG00000015214 C11orf54 (ENSMGAG00000015205) ENSMGAG00000015206 ENSMGAG00000015202 ENSMGAG00000015203 ENSMGAG00000015204 ENSMGAG00000015200 ENSMGAG00000015201 ANKRD49 (ENSMGAG00000015196) ENSMGAG00000015197 GPR83 (ENSMGAG00000015198) PANX1 (ENSMGAG00000015199) Chicken MODERN SPECIES ENSGALG00010007421 ENSGALG00010007362 ENSGALG00010007411 ENSGALG00010007295 ENSGALG00010007309 TRPC6 (ENSGALG00010007455) PGR (ENSGALG00010008178) ARHGAP42 (ENSGALG00010008218) CNTN5 (ENSGALG00010008242) CCDC82 (ENSGALG00010008258) MAML2 (ENSGALG00010008267) MTMR2 (ENSGALG00010008289) ENSGALG00010008302 CEP57 (ENSGALG00010008317) FAM76B (ENSGALG00010008339) SESN3 (ENSGALG00010008386) ##22 ENDOD1 (ENSGALG00010008395) CWC15 (ENSGALG00010008409) AMOTL1 (ENSGALG00010008453) FUT4 (ENSGALG00010009149) C11orf97 (ENSGALG00010008466) ANKRD49 (ENSGALG00010008492) MRE11 (ENSGALG00010008516) GPR83 (ENSGALG00010008529) PANX1 (ENSGALG00010008580) ENSGALG00010009160 HEPHL1 (ENSGALG00010008641) TM4SF1a (ENSGALG00010008664) ENSGALG00010008694 VSTM5 (ENSGALG00010008739) MED17 (ENSGALG00010008775) Neognathae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00530000063929.b ENSGT00940000154175 ENSGT00510000046760.a ENSGT00510000047559 ENSGT00390000013786 ENSGT00940000161966 ENSGT01060000248588.a.d.a ENSGT00940000159713 ENSGT00940000155492.b ENSGT00940000158183 ENSGT00390000004986 ENSGT00950000183201.a ENSGT00940000153669.a ENSGT00530000063695.a ENSGT00940000159074 ENSGT00950000183168.A ##22 ENSGT01030000234592.B.`b ENSGT00390000012084 ENSGT00940000160158 ENSGT00940000162506 ENSGT00520000058823 ENSGT00390000003919 ENSGT00390000017288 ENSGT00940000154336 ENSGT00940000153972.A ENSGT00940000157994 ENSGT01030000234590.A.a.b ENSGT00940000166029.d ENSGT01100000263551.b.a.b ENSGT00390000011810 ENSGT00390000017214 Neognathae_c ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00530000063929.b ENSGT00940000154175 ENSGT00510000046760.a ENSGT00510000047559 ENSGT00390000013786 ENSGT00940000161966 ENSGT01060000248588.a.d.a ENSGT00940000159713 ENSGT00940000155492.b ENSGT00940000158183 ENSGT00390000004986 ENSGT00950000183201.a ENSGT00940000153669.a ENSGT00530000063695.a ENSGT00940000159074 ENSGT00950000183168.A ##22 ENSGT01030000234592.B.`b ENSGT00390000012084 ENSGT00940000160158 ENSGT00940000162506 ENSGT00520000058823 ENSGT00390000003919 ENSGT00390000017288 ENSGT00940000154336 ENSGT00940000153972.A ENSGT00940000157994 ENSGT01030000234590.A.a.b ENSGT00940000166029.d ENSGT01100000263551.b.a.b ENSGT00390000011810 ENSGT00390000017214 Golden eagle MODERN SPECIES 10 TMEM123 (ENSACCG00020008603) ENSACCG00020008627 YAP1 (ENSACCG00020008686) CFAP300 (ENSACCG00020008702) CEP126 (ENSACCG00020008718) ANGPTL5 (ENSACCG00020008738) TRPC6 (ENSACCG00020008765) PGR (ENSACCG00020008798) ARHGAP42 (ENSACCG00020008871) CNTN5 (ENSACCG00020008929) CCDC82 (ENSACCG00020008966) MAML2 (ENSACCG00020008985) MTMR2 (ENSACCG00020009006) CEP57 (ENSACCG00020009041) FAM76B (ENSACCG00020009069) SESN3 (ENSACCG00020009081) ##22 ENDOD1 (ENSACCG00020009097) CWC15 (ENSACCG00020009107) AMOTL1 (ENSACCG00020009124) FUT4 (ENSACCG00020009150) C11orf97 (ENSACCG00020009174) ANKRD49 (ENSACCG00020009196) MRE11 (ENSACCG00020009228) GPR83 (ENSACCG00020009257) PANX1 (ENSACCG00020009270) HEPHL1 (ENSACCG00020009476) ENSACCG00020009612 ENSACCG00020009626 VSTM5 (ENSACCG00020007981) MED17 (ENSACCG00020007997) C11orf54 (ENSACCG00020008009) Kakapo MODERN SPECIES 11 TMEM123 (ENSSHBG00005002791) ENSSHBG00005002816 YAP1 (ENSSHBG00005002837) ENSSHBG00005002847 ENSSHBG00005002857 ANGPTL5 (ENSSHBG00005002883) TRPC6 (ENSSHBG00005002929) PGR (ENSSHBG00005002963) ARHGAP42 (ENSSHBG00005003000) CNTN5 (ENSSHBG00005003033) CCDC82 (ENSSHBG00005003090) MAML2 (ENSSHBG00005003105) MTMR2 (ENSSHBG00005003123) CEP57 (ENSSHBG00005003137) FAM76B (ENSSHBG00005003148) SESN3 (ENSSHBG00005003167) ##22 ENDOD1 (ENSSHBG00005003178) CWC15 (ENSSHBG00005003187) ENSSHBG00005003237 FUT4 (ENSSHBG00005003309) C11orf97 (ENSSHBG00005003322) ANKRD49 (ENSSHBG00005003336) MRE11 (ENSSHBG00005003350) GPR83 (ENSSHBG00005003385) PANX1 (ENSSHBG00005003411) HEPHL1 (ENSSHBG00005003506) ENSSHBG00005003748 ENSSHBG00005003769 VSTM5 (ENSSHBG00005003780) MED17 (ENSSHBG00005003790) TAF1D (ENSSHBG00005003808) Passeriformes ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00530000063929.b ENSGT00940000154175 ENSGT00510000046760.a ENSGT00510000047559 ENSGT00390000013786 ENSGT00940000161966 ENSGT01060000248588.a.d.a ENSGT00940000159713 ENSGT00940000155492.b ENSGT00940000158183 ENSGT00390000004986 ENSGT00950000183201.a ENSGT00940000153669.a ENSGT00530000063695.a ENSGT00940000159074 ENSGT00950000183168.A ##22 ENSGT01030000234592.B.`b ENSGT00390000012084 ENSGT00940000160158 ENSGT00940000162506 ENSGT00520000058823 ENSGT00390000003919 ENSGT00390000017288 ENSGT00940000154336 ENSGT00940000153972.A ENSGT00940000157994 ENSGT01030000234590.A.a.b ENSGT00940000166029.d ENSGT01100000263551.b.a.b ENSGT00390000011810 ENSGT00390000017214 Passeriformes_d ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00530000063929.b ENSGT00940000154175 ENSGT00510000046760.a ENSGT00510000047559 ENSGT00390000013786 ENSGT00940000161966 ENSGT01060000248588.a.d.a ENSGT00940000159713 ENSGT00940000155492.b ENSGT00940000158183 ENSGT00390000004986 ENSGT00950000183201.a ENSGT00940000153669.a ENSGT00530000063695.a ENSGT00940000159074 ENSGT00950000183168.A ##22 ENSGT01030000234592.B.`b ENSGT00390000012084 ENSGT00940000160158 ENSGT00940000162506 ENSGT00520000058823 ENSGT00390000003919 ENSGT00390000017288 ENSGT00940000154336 ENSGT00940000153972.A ENSGT00940000157994 ENSGT01030000234590.A.a.b ENSGT00940000166029.d ENSGT01100000263551.b.a.b ENSGT00390000011810 ENSGT00390000017214 Flycatcher MODERN SPECIES ENSFALG00000000371 ENSFALG00000000370 YAP1 (ENSFALG00000000364) CFAP300 (ENSFALG00000000361) ENSFALG00000000358 ANGPTL5 (ENSFALG00000000357) TRPC6 (ENSFALG00000000356) PGR (ENSFALG00000000354) ARHGAP42 (ENSFALG00000000353) CNTN5 (ENSFALG00000000348) CCDC82 (ENSFALG00000024899) MAML2 (ENSFALG00000000339) MTMR2 (ENSFALG00000000338) CEP57 (ENSFALG00000000337) FAM76B (ENSFALG00000000336) SESN3 (ENSFALG00000000333) ##22 ENDOD1 (ENSFALG00000000330) CWC15 (ENSFALG00000027709) AMOTL1 (ENSFALG00000000320) FUT4 (ENSFALG00000014231) ENSFALG00000020356 ANKRD49 (ENSFALG00000027188) MRE11 (ENSFALG00000000315) GPR83 (ENSFALG00000000313) PANX1 (ENSFALG00000000311) HEPHL1 (ENSFALG00000000307) ENSFALG00000025897 ENSFALG00000000300 VSTM5 (ENSFALG00000028517) MED17 (ENSFALG00000000295) C11orf54 (ENSFALG00000000294) Passeriformes_g ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00530000063929.b ENSGT00940000154175 ENSGT00510000046760.a ENSGT00510000047559 ENSGT00390000013786 ENSGT00940000161966 ENSGT01060000248588.a.d.a ENSGT00940000159713 ENSGT00940000155492.b ENSGT00940000158183 ENSGT00390000004986 ENSGT00950000183201.a ENSGT00940000153669.a ENSGT00530000063695.a ENSGT00940000159074 ENSGT00950000183168.A ##22 ENSGT01030000234592.B.`b ENSGT00390000012084 ENSGT00940000160158 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YAP1 (ENSTGUG00000012754) CFAP300 (ENSTGUG00000012760) ENSTGUG00000012764 ANGPTL5 (ENSTGUG00000024680) ENSTGUG00000022925 TRPC6 (ENSTGUG00000012766) PGR (ENSTGUG00000012778) ARHGAP42 (ENSTGUG00000012788) CNTN5 (ENSTGUG00000012792) CCDC82 (ENSTGUG00000012800) MAML2 (ENSTGUG00000012803) MTMR2 (ENSTGUG00000012806) CEP57 (ENSTGUG00000024409) FAM76B (ENSTGUG00000012811) SESN3 (ENSTGUG00000024822) ##22 ENDOD1 (ENSTGUG00000026431) CWC15 (ENSTGUG00000029544) AMOTL1 (ENSTGUG00000012818) FUT4 (ENSTGUG00000027501) C11orf97 (ENSTGUG00000022175) ANKRD49 (ENSTGUG00000012823) MRE11 (ENSTGUG00000012824) GPR83 (ENSTGUG00000026792) PANX1 (ENSTGUG00000012828) ENSTGUG00000012838 ENSTGUG00000012842 HEPHL1 (ENSTGUG00000012829) VSTM5 (ENSTGUG00000012843) MED17 (ENSTGUG00000012845) C11orf54 (ENSTGUG00000012850) Common canary MODERN SPECIES 4 ENSSCAG00000003981 YAP1 (ENSSCAG00000003972) CFAP300 (ENSSCAG00000003962) ENSSCAG00000003957 ANGPTL5 (ENSSCAG00000003952) TRPC6 (ENSSCAG00000003932) PGR 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ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000154175 ENSGT00510000046760.a ENSGT00510000047559 ENSGT00390000013786 ENSGT00940000161966 ENSGT01060000248588.a.d.a ENSGT00940000159713 ENSGT00940000155492.b ENSGT00940000158183 ENSGT00390000004986 ENSGT00950000183201.a ENSGT01010000223591 ENSGT00940000153669.a ENSGT00530000063695.a ENSGT00940000159074 ENSGT00950000183168.A ##22 ENSGT01030000234592.B ENSGT00390000012084 ENSGT00940000160158 ENSGT00950000183200.A.a.a ENSGT00940000162506 ENSGT00520000058823 ENSGT00390000003919 ENSGT00390000017288 ENSGT00940000153972.A ENSGT00940000157994.c ENSGT01030000234590.A.a.b ENSGT00940000166029 ENSGT01100000263551.b.a.b ENSGT00390000011810 ENSGT00390000017214 Elapidae ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000154175 ENSGT00510000046760.a ENSGT00510000047559 ENSGT00390000013786 ENSGT00940000161966 ENSGT01060000248588.a.d.a ENSGT00940000159713 ENSGT00940000155492.b ENSGT00940000158183 ENSGT00390000004986 ENSGT00950000183201.a ENSGT01010000223591 ENSGT00940000153669.a 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ENSGT00940000158183 ENSGT00940000161513 ENSGT00390000004986 ENSGT00950000183201.a ENSGT01010000223591 ENSGT00940000153669.a ENSGT00530000063695.a ENSGT00940000159074 ENSGT00950000183168.A ##22 ENSGT01030000234592.B ENSGT00940000162152 ENSGT00390000012084 ENSGT00940000160158 ENSGT00950000183200.A.a.a ENSGT00940000162506 ENSGT00520000058823 ENSGT00910000147289 ENSGT00390000003919 ENSGT00390000017288 ENSGT00940000154336.d ENSGT00950000183144.A.j ENSGT00940000153972.A ENSGT00940000157994 ENSGT01100000263551.b.a.b Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154175.i.a ENSGT00510000046760.a ENSGT00510000047559 ENSGT00390000013786 ENSGT00940000161966 ENSGT01060000248588.a.d.a ENSGT00940000159713 ENSGT00940000155492.b ENSGT00940000158183 ENSGT00940000161513 ENSGT00390000004986 ENSGT00950000183201.a ENSGT00940000153669.a ENSGT00530000063695.a ENSGT00940000159074 ENSGT00950000183168.A ##22 ENSGT01030000234592.B ENSGT00940000162152 ENSGT00390000012084 ENSGT00940000160158 ENSGT00950000183200.A.a.a 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ENSGT00910000147289 ENSGT00390000003919.e ENSGT00390000017288.c Hominidae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00510000047559 ENSGT00390000013786 ENSGT00940000161966 ENSGT01060000248588.a.d.a ENSGT00940000159713 ENSGT00390000009026 ENSGT00940000155492.b ENSGT00950000183087.A.a.b.b.g.e.b.a.a.a ENSGT00940000158183 ENSGT00940000161513 ENSGT00390000004986 ENSGT00950000183201.a ENSGT00940000153669.a ENSGT00530000063695.a ENSGT00940000159074 ENSGT00950000183168.A ##22 ENSGT01030000234592.B ENSGT00940000154883.g.a.a ENSGT00940000165078.b ENSGT00940000154883.g.a.b ENSGT00940000165078.a ENSGT00940000162152 ENSGT00390000012084 ENSGT00940000160158 ENSGT00950000183200.A.a.a ENSGT00940000162506 ENSGT00520000058823 ENSGT00390000003919.e ENSGT00390000017288.c ENSGT00940000154336.d ENSGT00950000183144.A.j Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000013786 ENSGT00940000161966 ENSGT01060000248588.a.d.a ENSGT00940000159713 ENSGT00390000009026 ENSGT00940000155492.b.c ENSGT00950000183087.A.a.b.b.g.e.b.a.a.a ENSGT00940000158183 ENSGT00940000162748.g ENSGT00940000161513 ENSGT00390000004986 ENSGT00950000183201.a ENSGT00940000153669.a ENSGT00530000063695.a ENSGT00940000159074 ENSGT00950000183168.A ##22 ENSGT01030000234592.B ENSGT00940000154883.g.a.a ENSGT00940000165078.b ENSGT00940000154883.g.a.b ENSGT00940000165078.a ENSGT00940000162152 ENSGT00390000012084 ENSGT00940000160158 ENSGT00950000183200.A.a.a ENSGT00940000162506 ENSGT00520000058823 ENSGT00390000003919.e ENSGT00390000017288.c ENSGT00940000154336.d ENSGT00950000183144.A.j Gorilla MODERN SPECIES 2 ENSGGOG00000005796 CFAP300 (ENSGGOG00000000989) CEP126 (ENSGGOG00000004641) ANGPTL5 (ENSGGOG00000008463) TRPC6 (ENSGGOG00000009198) PGR (ENSGGOG00000016358) ARHGAP42 (ENSGGOG00000011397) CNTN5 (ENSGGOG00000016800) ENSGGOG00000025493 JRKL (ENSGGOG00000000360) CCDC82 (ENSGGOG00000016752) MAML2 (ENSGGOG00000024120) MTMR2 (ENSGGOG00000010339) CEP57 (ENSGGOG00000013416) FAM76B (ENSGGOG00000013409) SESN3 (ENSGGOG00000004922) ##22 ENDOD1 (ENSGGOG00000024775) SRSF8 (ENSGGOG00000022679) KDM4D (ENSGGOG00000010102) CWC15 (ENSGGOG00000011926) AMOTL1 (ENSGGOG00000001033) PIWIL4 (ENSGGOG00000016276) C11orf97 (ENSGGOG00000036219) ANKRD49 (ENSGGOG00000008207) MRE11 (ENSGGOG00000008192) GPR83 (ENSGGOG00000007694) IZUMO1R (ENSGGOG00000014840) ENSGGOG00000037261 PANX (ENSGGOG00000005596) HEPHL1 (ENSGGOG00000000624) VSTM5 (ENSGGOG00000010409) Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000013786 ENSGT00940000161966 ENSGT01060000248588.a.d.a ENSGT00940000159713 ENSGT00390000009026 ENSGT00940000155492.b.c ENSGT00950000183087.A.a.b.b.g.e.b.a.a.a ENSGT00940000158183 ENSGT00940000162748.g ENSGT00940000161513 ENSGT00390000004986 ENSGT00950000183201.a ENSGT00940000153669.a ENSGT00530000063695.a ENSGT00940000159074 ENSGT00950000183168.A ##22 ENSGT01030000234592.B ENSGT00940000154883.g.a.a ENSGT00940000165078.b ENSGT00940000154883.g.a.b ENSGT00940000165078.a ENSGT00940000162152 ENSGT00390000012084 ENSGT00940000160158 ENSGT00950000183200.A.a.a ENSGT00940000162506 ENSGT00520000058823 ENSGT00390000003919.e ENSGT00390000017288.c ENSGT00940000154336.d ENSGT00950000183144.A.j Human MODERN SPECIES 2 BIRC3 (ENSG00000023445) YAP1 (ENSG00000137693) CFAP300 (ENSG00000137691) CEP126 (ENSG00000110318) ANGPTL5 (ENSG00000187151) TRPC6 (ENSG00000137672) PGR (ENSG00000082175) ARHGAP42 (ENSG00000165895) CNTN5 (ENSG00000149972) JRKL (ENSG00000183340) CCDC82 (ENSG00000149231) MAML2 (ENSG00000184384) MTMR2 (ENSG00000087053) CEP57 (ENSG00000166037) FAM76B (ENSG00000077458) SESN3 (ENSG00000149212) ##22 ENDOD1 (ENSG00000149218) SRSF8 (ENSG00000263465) KDM4F (ENSG00000255855) KDM4E (ENSG00000235268) KDM4D (ENSG00000186280) CWC15 (ENSG00000150316) AMOTL1 (ENSG00000166025) FUT4 (ENSG00000196371) PIWIL4 (ENSG00000134627) C11orf97 (ENSG00000257057) ANKRD49 (ENSG00000168876) MRE11 (ENSG00000020922) GPR83 (ENSG00000123901) IZUMO1R (ENSG00000183560) PANX1 (ENSG00000110218) Pan ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000013786 ENSGT00940000161966 ENSGT01060000248588.a.d.a ENSGT00940000159713 ENSGT00390000009026 ENSGT00940000155492.b.c ENSGT00950000183087.A.a.b.b.g.e.b.a.a.a ENSGT00940000158183 ENSGT00940000162748.g ENSGT00940000161513 ENSGT00390000004986 ENSGT00950000183201.a ENSGT00940000153669.a ENSGT00530000063695.a ENSGT00940000159074 ENSGT00950000183168.A ##22 ENSGT01030000234592.B ENSGT00940000154883.g.a.a ENSGT00940000165078.b ENSGT00940000154883.g.a.b ENSGT00940000165078.a ENSGT00940000162152 ENSGT00390000012084 ENSGT00940000160158 ENSGT00950000183200.A.a.a ENSGT00940000162506 ENSGT00520000058823 ENSGT00390000003919.e ENSGT00390000017288.c ENSGT00940000154336.d ENSGT00950000183144.A.j Chimpanzee MODERN SPECIES 2 ANGPTL5 (ENSPTRG00000004208) TRPC6 (ENSPTRG00000004207) PGR (ENSPTRG00000004206) ENSPTRG00000048308 ENSPTRG00000039214 ARHGAP42 (ENSPTRG00000004204) ENSPTRG00000045366 CNTN5 (ENSPTRG00000004201) ENSPTRG00000051433 JRKL (ENSPTRG00000028419) CCDC82 (ENSPTRG00000004198) MAML2 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ENSPPAG00000033651 KDM4E (ENSPPAG00000022047) CWC15 (ENSPPAG00000033609) AMOTL1 (ENSPPAG00000036699) PIWIL4 (ENSPPAG00000031181) FUT4 (ENSPPAG00000021481) C11orf97 (ENSPPAG00000031103) ANKRD49 (ENSPPAG00000037946) MRE11 (ENSPPAG00000034731) GPR83 (ENSPPAG00000039550) IZUMO1R (ENSPPAG00000041423) ENSPPAG00000026114 PANX1 (ENSPPAG00000040074) HEPHL1 (ENSPPAG00000040046) Orangutan MODERN SPECIES 2 YAP1 (ENSPPYG00000003806) ENSPPYG00000003805 CEP126 (ENSPPYG00000003804) ANGPTL5 (ENSPPYG00000003803) TRPC6 (ENSPPYG00000003802) PGR (ENSPPYG00000003801) ARHGAP42 (ENSPPYG00000003799) ENSPPYG00000041195 CNTN5 (ENSPPYG00000003797) JRKL (ENSPPYG00000003796) CCDC82 (ENSPPYG00000003795) MAML2 (ENSPPYG00000003793) MTMR2 (ENSPPYG00000003792) CEP57 (ENSPPYG00000003790) FAM76B (ENSPPYG00000003789) SESN3 (ENSPPYG00000003788) ##22 ENDOD1 (ENSPPYG00000040533) SRSF8 (ENSPPYG00000035224) KDM4F (ENSPPYG00000037461) KDM4E (ENSPPYG00000041335) CWC15 (ENSPPYG00000003785) AMOTL1 (ENSPPYG00000003784) PIWIL4 (ENSPPYG00000003783) FUT4 (ENSPPYG00000037042) ENSPPYG00000029760 ENSPPYG00000041706 MRE11 (ENSPPYG00000037469) GPR83 (ENSPPYG00000041687) IZUMO1R (ENSPPYG00000003780) PANX1 (ENSPPYG00000003779) HEPHL1 (ENSPPYG00000003778) Gibbon MODERN SPECIES 5 ENSNLEG00000027844 TRPC6 (ENSNLEG00000007157) ENSNLEG00000007154 ENSNLEG00000033273 ARHGAP42 (ENSNLEG00000007152) CNTN5 (ENSNLEG00000007147) ENSNLEG00000034421 ##15 ENSNLEG00000007146 JRKL (ENSNLEG00000007145) CCDC82 (ENSNLEG00000007144) ENSNLEG00000030751 ENSNLEG00000033879 MTMR2 (ENSNLEG00000007138) CEP57 (ENSNLEG00000007130) ENSNLEG00000031555 SESN3 (ENSNLEG00000007128) ##22 ENSNLEG00000035714 ENDOD1 (ENSNLEG00000007127) ENSNLEG00000031658 KDM4E (ENSNLEG00000007125) ENSNLEG00000035015 KDM4D (ENSNLEG00000019232) CWC15 (ENSNLEG00000031455) AMOTL1 (ENSNLEG00000007120) PIWIL4 (ENSNLEG00000007119) ENSNLEG00000007118 C11orf97 (ENSNLEG00000007117) ENSNLEG00000033459 ANKRD49 (ENSNLEG00000007115) MRE11 (ENSNLEG00000007111) GPR83 (ENSNLEG00000007109) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00510000047559 ENSGT00390000013786 ENSGT00940000161966 ENSGT01060000248588.a.d.a ENSGT00940000159713 ENSGT00940000155492.b ENSGT00390000010045.g.a ##15 ENSGT00940000155492.a.b ENSGT00940000158183 ENSGT00940000161513 ENSGT00390000004986 ENSGT00950000183201.a ENSGT00940000153669.a ENSGT00530000063695.a ENSGT00940000159074 ENSGT00950000183168.A ##22 ENSGT00910000147059 ENSGT01030000234592.B ENSGT00940000154883.g.a.a ENSGT00940000165078.b ENSGT00940000154883.g.a.b ENSGT00940000165078.a ENSGT00940000162152 ENSGT00390000012084 ENSGT00940000160158 ENSGT00950000183200.A.a.a ENSGT00940000162506 ENSGT00520000058823 ENSGT00910000147289 ENSGT00390000003919.e ENSGT00390000017288.c Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00510000047559 ENSGT00390000013786 ENSGT00940000161966 ENSGT01060000248588.a.d.a ENSGT00940000159713 ENSGT00940000155492.b ENSGT00390000010045.g.a ##15 ENSGT00940000155492.a.b ENSGT00940000158183 ENSGT00940000161513 ENSGT00390000004986 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ENSGT00910000147289 ENSGT00390000003919.e ENSGT00390000017288.c Macaca ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00510000047559 ENSGT00390000013786 ENSGT00940000161966 ENSGT01060000248588.a.d.a ENSGT00940000159713 ENSGT00940000155492.b ENSGT00940000158183 ENSGT00390000010045.g.a ##15 ENSGT00940000161513 ENSGT00860000135858 ENSGT00390000004986 ENSGT00950000183201.a ENSGT00940000153669.a ENSGT00530000063695.a ENSGT00940000159074 ENSGT00950000183168.A ##22 ENSGT00910000147059 ENSGT01030000234592.B ENSGT00940000154883.g.a.a ENSGT00940000165078.b ENSGT00940000165078.a ENSGT00940000162152 ENSGT00390000012084 ENSGT00940000160158 ENSGT00950000183200.A.a.a ENSGT00520000058823 ENSGT00910000147289 ENSGT00390000003919.e ENSGT00390000017288.c ENSGT00940000154336.d ENSGT00950000183144.A.j Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 109 ENSMNEG00000036289 CNTN5 (ENSMNEG00000043934) ENSMNEG00000035759 ##15 JRKL (ENSMNEG00000010862) CCDC82 (ENSMNEG00000036068) ENSMNEG00000033275 MAML2 (ENSMNEG00000042629) MTMR2 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ENSGT00940000165078.a ENSGT00940000162152 ENSGT00390000012084 ENSGT00940000160158 ENSGT00950000183200.A.a.a ENSGT00520000058823 ENSGT00390000003919.e ENSGT00390000017288.c ENSGT00950000183144.A.j ENSGT00940000153972.A ENSGT00940000157994 ENSGT01100000263551.b.a.b Crab-eating macaque MODERN SPECIES 5 ARHGAP42 (ENSMFAG00000000533) CNTN5 (ENSMFAG00000045865) ENSMFAG00000056178 ENSMFAG00000053298 ENSMFAG00000060346 ENSMFAG00000052366 ENSMFAG00000050345 ENSMFAG00000028681 JRKL (ENSMFAG00000030353) CCDC82 (ENSMFAG00000036325) MAML2 (ENSMFAG00000031735) MTMR2 (ENSMFAG00000040303) CEP57 (ENSMFAG00000003768) FAM76B (ENSMFAG00000042981) ENSMFAG00000048059 SESN3 (ENSMFAG00000040069) ##22 ENSMFAG00000055573 ENDOD1 (ENSMFAG00000055848) KDM4F (ENSMFAG00000059067) ENSMFAG00000040102 KDM4D (ENSMFAG00000024894) CWC15 (ENSMFAG00000044052) AMOTL1 (ENSMFAG00000032749) PIWIL4 (ENSMFAG00000042631) C11orf97 (ENSMFAG00000044586) ANKRD49 (ENSMFAG00000038557) MRE11 (ENSMFAG00000039328) IZUMO1R 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ENSGT00940000161966 ENSGT01060000248588.a.d.a ENSGT00940000159713 ENSGT00940000155492.b ENSGT00390000010045.g.a ##15 ENSGT00940000158183 ENSGT00940000161513 ENSGT00860000135858 ENSGT00390000004986 ENSGT00950000183201.a ENSGT00940000153669.a ENSGT00530000063695.a ENSGT00940000159074 ENSGT00950000183168.A ##22 ENSGT00910000147059 ENSGT01030000234592.B ENSGT00940000154883.g.a.a ENSGT00940000165078.b ENSGT00940000165078.a ENSGT00940000162152 ENSGT00390000012084 ENSGT00940000160158 ENSGT00950000183200.A.a.a ENSGT00940000162506 ENSGT00520000058823 ENSGT00910000147289 ENSGT00390000003919.e ENSGT00390000017288.c ENSGT00940000154336.d Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 45 ENSGT00510000047559 ENSGT00390000013786 ENSGT00940000161966 ENSGT01060000248588.a.d.a ENSGT00940000159713 ENSGT00940000155492.b ENSGT00390000010045.g.a ##15 ENSGT00940000158183 ENSGT00940000161513 ENSGT00860000135858 ENSGT00390000004986 ENSGT00950000183201.a ENSGT00940000153669.a ENSGT00530000063695.a ENSGT00940000159074 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(ENSPANG00000032291) KDM4F (ENSPANG00000038422) KDM4E (ENSPANG00000047397) KDM4D (ENSPANG00000000063) CWC15 (ENSPANG00000019125) AMOTL1 (ENSPANG00000018871) PIWIL4 (ENSPANG00000016066) ENSPANG00000046304 FUT4 (ENSPANG00000051031) ENSPANG00000032105 MRE11 (ENSPANG00000017475) ENSPANG00000040668 IZUMO1R (ENSPANG00000034439) ENSPANG00000040070 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 244 ENSGT00940000161513 ENSGT00390000004986 ENSGT00950000183201.a ENSGT00940000153669.a ENSGT00530000063695.a ENSGT00940000159074 ENSGT00950000183168.A ##22 ENSGT00910000147059 ENSGT01030000234592.B ENSGT00940000154883.g.a.a ENSGT00940000154883.g.a.b ENSGT00940000165078.a ENSGT00940000162152 ENSGT00390000012084 ENSGT00940000160158 ENSGT00950000183200.A.a.a ENSGT00940000162506 ENSGT00520000058823 ENSGT00910000147289 ENSGT00390000003919.e ENSGT00390000017288.c ENSGT00940000154336.d Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 3301 SESN3 (ENSRROG00000025289) ##22 ENSRROG00000027776 ENDOD1 (ENSRROG00000025221) SRSF8 (ENSRROG00000026503) ENSRROG00000043277 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 695 JRKL (ENSRBIG00000029080) CCDC82 (ENSRBIG00000030883) MAML2 (ENSRBIG00000001400) MTMR2 (ENSRBIG00000028147) CEP57 (ENSRBIG00000014037) FAM76B (ENSRBIG00000006024) SESN3 (ENSRBIG00000031220) ##22 ENSRBIG00000027014 ENDOD1 (ENSRBIG00000025792) ENSRBIG00000041837 ENSRBIG00000036245 ENSRBIG00000023300 KDM4E (ENSRBIG00000035068) KDM4D (ENSRBIG00000029429) CWC15 (ENSRBIG00000030781) AMOTL1 (ENSRBIG00000043234) PIWIL4 (ENSRBIG00000039745) C11orf97 (ENSRBIG00000041747) ENSRBIG00000026350 ANKRD49 (ENSRBIG00000043961) MRE11 (ENSRBIG00000034693) GPR83 (ENSRBIG00000043352) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00510000047559 ENSGT00390000013786 ENSGT00940000161966 ENSGT00390000000537.e ENSGT01060000248588.a.d.a ENSGT00940000159713 ENSGT00940000155492.b ENSGT00390000010045.g.a ##15 ENSGT00940000158183 ENSGT00940000161513 ENSGT00390000004986 ENSGT00950000183201.a ENSGT00940000153669.a ENSGT00530000063695.a ENSGT00940000159074 ENSGT00950000183168.A ##22 ENSGT00910000147059 ENSGT01030000234592.B ENSGT00940000154883.g.a ENSGT00940000165078 ENSGT00940000162152 ENSGT00390000012084 ENSGT00940000160158 ENSGT00950000183200.A.a.a ENSGT00940000162506 ENSGT00520000058823 ENSGT00390000003919 ENSGT00390000017288.c ENSGT00940000154336.d ENSGT00950000183144.A.j ENSGT00940000153972.A Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00510000046760.a ENSGT00510000047559 ENSGT00390000013786 ENSGT00940000161966 ENSGT00390000000537.e ENSGT01060000248588.a.d.a ENSGT00940000159713 ENSGT00940000155492.b ENSGT00940000158183 ENSGT00940000161513 ENSGT00390000004986 ENSGT00950000183201.a ENSGT00940000153669.a ENSGT00530000063695.a ENSGT00940000159074 ENSGT00950000183168.A ##22 ENSGT00910000147059 ENSGT01030000234592.B ENSGT00940000154883.g.a ENSGT00940000165078 ENSGT00940000162152 ENSGT00390000012084 ENSGT00940000160158.e.a ENSGT00940000160158.e.b ENSGT00950000183200.A.a.a ENSGT00940000162506 ENSGT00520000058823 ENSGT00390000003919 ENSGT00390000017288.c ENSGT00940000154336.d ENSGT00950000183144.A.j Marmoset DUPLICATION Marmoset MODERN SPECIES 2 ENSCJAG00000073241 CNTN5 (ENSCJAG00000000543) ENSCJAG00000078589 ENSCJAG00000068576 ENSCJAG00000073640 ENSCJAG00000023377 ENSCJAG00000074342 ENSCJAG00000074166 ENSCJAG00000069774 JRKL (ENSCJAG00000043270) CCDC82 (ENSCJAG00000004365) MAML2 (ENSCJAG00000004359) MTMR2 (ENSCJAG00000004327) CEP57 (ENSCJAG00000004281) FAM76B (ENSCJAG00000040122) ENSCJAG00000004220 ##22 ENDOD1 (ENSCJAG00000039825) ENSCJAG00000072491 KDM4D (ENSCJAG00000023319) CWC15 (ENSCJAG00000040352) AMOTL1 (ENSCJAG00000004124) ENSCJAG00000070716 ENSCJAG00000065220 PIWIL4 (ENSCJAG00000004075) FUT4 (ENSCJAG00000074794) C11orf97 (ENSCJAG00000087393) ANKRD49 (ENSCJAG00000083691) MRE11 (ENSCJAG00000003984) GPR83 (ENSCJAG00000003972) IZUMO1R (ENSCJAG00000003960) PANX1 (ENSCJAG00000003952) Marmoset MODERN SPECIES 4 FAM210A (ENSCJAG00000040371) RNMT (ENSCJAG00000041136) ENSCJAG00000085775 ENSCJAG00000077536 HGSNAT (ENSCJAG00000003561) ENSCJAG00000023305 POMK (ENSCJAG00000037203) FNTA (ENSCJAG00000003507) HOOK3 (ENSCJAG00000003487) RNF170 (ENSCJAG00000047550) THAP1 (ENSCJAG00000038318) CHRNA6 (ENSCJAG00000007684) ENSCJAG00000022714 CHRNB3 (ENSCJAG00000007709) ENSCJAG00000078082 ENSCJAG00000077828 ##22 AP3M2 (ENSCJAG00000007751) PLAT (ENSCJAG00000007769) IKBKB (ENSCJAG00000007805) POLB (ENSCJAG00000007917) DKK4 (ENSCJAG00000007996) VDAC3 (ENSCJAG00000008002) SLC20A2 (ENSCJAG00000008029) SMIM19 (ENSCJAG00000008061) ENSCJAG00000083868 ENSCJAG00000006505 ENSCJAG00000066704 ENSCJAG00000073426 ENSCJAG00000085434 KAT6A (ENSCJAG00000004274) ANK1 (ENSCJAG00000004219) Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000154175.i.a ENSGT00510000046760.a ENSGT00510000047559 ENSGT00390000013786 ENSGT00940000161966 ENSGT00390000000537.e.b ENSGT01060000248588.a.d.a ENSGT00940000159713 ENSGT00940000155492.b ENSGT00940000158183 ENSGT00390000004986 ENSGT00950000183201.a ENSGT00940000153669.a ENSGT00530000063695.a ENSGT00940000159074 ENSGT00950000183168.A ##22 ENSGT00910000147059 ENSGT01030000234592.B ENSGT00940000154883.g.a ENSGT00940000165078 ENSGT00390000012084.o ENSGT00940000160158.e.a Capuchin MODERN SPECIES 336 ENSCCAG00000019622 CCDC82 (ENSCCAG00000006142) ENSCCAG00000020935 MAML2 (ENSCCAG00000027721) MTMR2 (ENSCCAG00000035373) CEP57 (ENSCCAG00000023614) FAM76B (ENSCCAG00000023682) SESN3 (ENSCCAG00000031002) ##22 ENDOD1 (ENSCCAG00000036865) SRSF8 (ENSCCAG00000022864) ENSCCAG00000027439 CWC15 (ENSCCAG00000026289) ENSCCAG00000033319 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 270 SESN3 (ENSSBOG00000026319) ##22 ENSSBOG00000019556 ENDOD1 (ENSSBOG00000027148) SRSF8 (ENSSBOG00000029664) Mas night monkey MODERN SPECIES 278 YAP1 (ENSANAG00000029463) CFAP300 (ENSANAG00000023658) CEP126 (ENSANAG00000033095) ANGPTL5 (ENSANAG00000025830) TRPC6 (ENSANAG00000032595) PGR (ENSANAG00000036519) ARHGAP42 (ENSANAG00000033530) ENSANAG00000026824 ##15 CNTN5 (ENSANAG00000024170) ENSANAG00000022382 CCDC82 (ENSANAG00000025591) MAML2 (ENSANAG00000022462) MTMR2 (ENSANAG00000028178) CEP57 (ENSANAG00000033666) FAM76B (ENSANAG00000027519) SESN3 (ENSANAG00000032229) ##22 ENSANAG00000031662 ENDOD1 (ENSANAG00000036222) SRSF8 (ENSANAG00000031642) ENSANAG00000022615 CWC15 (ENSANAG00000020484) Tarsier MODERN SPECIES 1193 SESN3 (ENSTSYG00000001076) ##22 CWC15 (ENSTSYG00000000407) ENSTSYG00000028535 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000154175.i.a ENSGT00510000046760.a ENSGT00510000047559 ENSGT00390000013786 ENSGT00940000161966 ENSGT01060000248588.a.d.a ENSGT00940000159713 ENSGT00940000155492.b ENSGT00940000158183 ENSGT00940000161513 ENSGT00390000004986 ENSGT00950000183201.a ENSGT00940000153669.a ENSGT00530000063695.a ENSGT00940000159074 ENSGT00950000183168.A ##22 ENSGT01030000234592.B ENSGT00940000162152 ENSGT00390000012084 ENSGT00940000160158 ENSGT00950000183200.A.a.a ENSGT00940000162506 ENSGT00520000058823 ENSGT00390000003919 ENSGT00390000017288 ENSGT00940000154336.d ENSGT00950000183144.A.j ENSGT00940000153972.A ENSGT00940000157994 ENSGT01100000263551.b.a.b ENSGT00390000011810 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000154175.i.a ENSGT00510000046760.a ENSGT00510000047559 ENSGT00390000013786 ENSGT00940000161966 ENSGT01060000248588.a.d.a ENSGT00940000159713.d ENSGT00940000155492.b ENSGT00940000158183.m ENSGT00940000161513 ENSGT00390000004986 ENSGT00950000183201.a ENSGT00940000153669.a ENSGT00530000063695.a ENSGT00940000159074 ENSGT00950000183168.A ##22 ENSGT01030000234592.B ENSGT00940000162152 ENSGT00390000012084 ENSGT00940000160158 ENSGT00950000183200.A.a.a ENSGT00940000162506 ENSGT00520000058823 ENSGT00390000003919 ENSGT00390000017288 ENSGT00940000154336.d ENSGT00950000183144.A.j ENSGT00940000153972.A ENSGT00940000157994 ENSGT01100000263551.b.a.b ENSGT00390000011810 Mouse lemur MODERN SPECIES 27 CEP126 (ENSMICG00000009111) ANGPTL5 (ENSMICG00000031686) TRPC6 (ENSMICG00000010349) PGR (ENSMICG00000006331) ARHGAP42 (ENSMICG00000010758) ENSMICG00000015969 ENSMICG00000031298 ENSMICG00000029672 JRKL (ENSMICG00000041876) CCDC82 (ENSMICG00000009411) ENSMICG00000031831 MAML2 (ENSMICG00000009400) MTMR2 (ENSMICG00000009395) CEP57 (ENSMICG00000030559) FAM76B (ENSMICG00000036906) SESN3 (ENSMICG00000008178) ##22 CWC15 (ENSMICG00000042790) ENSMICG00000036230 AMOTL1 (ENSMICG00000001878) ENSMICG00000041717 PIWIL4 (ENSMICG00000006375) FUT4 (ENSMICG00000043071) C11orf97 (ENSMICG00000043866) ANKRD49 (ENSMICG00000013505) ENSMICG00000027455 GPR83 (ENSMICG00000028902) IZUMO1R (ENSMICG00000031112) PANX1 (ENSMICG00000006408) HEPHL1 (ENSMICG00000006401) VSTM5 (ENSMICG00000045625) ENSMICG00000014697 Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES 147 ENSGT00940000161513 ENSGT00390000004986 ENSGT00950000183201.a ENSGT00940000153669.a ENSGT00530000063695.a ENSGT00940000159074 ENSGT00950000183168.A ##22 ENSGT01030000234592.B ENSGT00940000162152.a ENSGT00390000012084 ENSGT00940000160158 ENSGT00950000183200.A.a.a ENSGT00940000162506 ENSGT00520000058823 ENSGT00390000003919 ENSGT00390000017288 ENSGT00940000154336.d ENSGT00950000183144.A.j ENSGT00940000153972.A ENSGT00940000157994 ENSGT00940000164415 ENSGT01100000263551.b.a.b Coquerels sifaka MODERN SPECIES 801 JRKL (ENSPCOG00000004471) MAML2 (ENSPCOG00000028333) MTMR2 (ENSPCOG00000011333) CEP57 (ENSPCOG00000019585) FAM76B (ENSPCOG00000016586) ENSPCOG00000017746 SESN3 (ENSPCOG00000017878) ##22 ENDOD1 (ENSPCOG00000008619) KDM4D (ENSPCOG00000024679) CWC15 (ENSPCOG00000023913) AMOTL1 (ENSPCOG00000024699) PIWIL4 (ENSPCOG00000022264) C11orf97 (ENSPCOG00000019915) ANKRD49 (ENSPCOG00000022576) MRE11 (ENSPCOG00000015583) GPR83 (ENSPCOG00000022870) IZUMO1R (ENSPCOG00000020918) PANX1 (ENSPCOG00000014659) ENSPCOG00000024084 HEPHL1 (ENSPCOG00000024694) ENSPCOG00000024602 ENSPCOG00000016651 Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 414 CEP57 (ENSPSMG00000020838) FAM76B (ENSPSMG00000020859) SESN3 (ENSPSMG00000020961) ##22 ENDOD1 (ENSPSMG00000021004) ENSPSMG00000021012 ENSPSMG00000021017 CWC15 (ENSPSMG00000021030) AMOTL1 (ENSPSMG00000021101) PIWIL4 (ENSPSMG00000021185) FUT4 (ENSPSMG00000021197) C11orf97 (ENSPSMG00000021201) ANKRD49 (ENSPSMG00000021206) MRE11 (ENSPSMG00000021306) ENSPSMG00000021347 GPR83 (ENSPSMG00000021362) IZUMO1R (ENSPSMG00000021373) PANX1 (ENSPSMG00000021384) HEPHL1 (ENSPSMG00000021408) Bushbaby MODERN SPECIES 116 ANGPTL5 (ENSOGAG00000009855) TRPC6 (ENSOGAG00000000765) PGR (ENSOGAG00000012310) ARHGAP42 (ENSOGAG00000012302) ENSOGAG00000029060 CNTN5 (ENSOGAG00000004704) ENSOGAG00000027962 ENSOGAG00000033517 JRKL (ENSOGAG00000029206) CCDC82 (ENSOGAG00000007288) ENSOGAG00000024191 MAML2 (ENSOGAG00000000360) MTMR2 (ENSOGAG00000005773) ENSOGAG00000005770 FAM76B (ENSOGAG00000005765) SESN3 (ENSOGAG00000014489) ##22 ENDOD1 (ENSOGAG00000026634) ENSOGAG00000029074 ENSOGAG00000028767 ENSOGAG00000025313 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00510000046760.a ENSGT00510000047559 ENSGT00390000013786 ENSGT00940000161966 ENSGT01060000248588.a.d.a ENSGT00940000159713 ENSGT00940000155492.b ENSGT00940000158183 ENSGT00940000161513 ENSGT00390000004986 ENSGT00950000183201.a ENSGT01010000223591 ENSGT00940000153669.a ENSGT00530000063695.a ENSGT00940000159074 ENSGT00950000183168.A ##22 ENSGT01030000234592.B ENSGT00940000162152 ENSGT00390000012084 ENSGT00940000160158 ENSGT00950000183200.A.a.a ENSGT00940000162506 ENSGT00520000058823 ENSGT00390000003919 ENSGT00390000017288 ENSGT00940000154336.d ENSGT00950000183144.A.j ENSGT00940000153972.A ENSGT00940000157994 ENSGT01100000263551.b.a.b ENSGT00390000011810 Tree shrew MODERN SPECIES 2430 SESN3 (ENSTBEG00000007864) ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00510000046760.a ENSGT00510000047559 ENSGT00390000013786 ENSGT00940000161966 ENSGT01060000248588.a.d.a ENSGT00940000159713 ENSGT00940000155492.b ENSGT00940000158183 ENSGT00940000161513 ENSGT00390000004986 ENSGT00950000183201.a ENSGT01010000223591 ENSGT00940000153669.a ENSGT00530000063695.a ENSGT00940000159074 ENSGT00950000183168.A ##22 ENSGT01030000234592.B ENSGT00940000162152 ENSGT00390000012084 ENSGT00940000160158 ENSGT00950000183200.A.a.a ENSGT00940000162506 ENSGT00520000058823 ENSGT00390000003919 ENSGT00390000017288 ENSGT00940000154336.d ENSGT00950000183144.A.j ENSGT00940000153972.A ENSGT00940000157994 ENSGT01100000263551.b.a.b ENSGT00390000011810 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00530000063929.b ENSGT00940000154175.i.b ENSGT00940000154175.i.a ENSGT00390000013786 ENSGT00940000161966 ENSGT01060000248588.a.d.a ENSGT00940000159713 ENSGT00940000155492.b ENSGT00940000158183 ENSGT00940000161513 ENSGT00390000004986 ENSGT00950000183201.a ENSGT00940000153669.a ENSGT00530000063695.a ENSGT00940000159074 ENSGT00950000183168.A ##22 ENSGT01030000234592.B ENSGT00940000162152 ENSGT00390000012084 ENSGT00940000160158 ENSGT00950000183200.A.a.a ENSGT00940000162506 ENSGT00520000058823 ENSGT00390000003919 ENSGT00390000017288 ENSGT00940000154336.d ENSGT00950000183144.A.j ENSGT00940000153972.A ENSGT00940000157994 ENSGT01100000263551.b.a.b ENSGT00390000011810 Rabbit MODERN SPECIES ENSOCUG00000037422 ENSOCUG00000007222 CNTN5 (ENSOCUG00000015047) ENSOCUG00000036924 ENSOCUG00000037475 ENSOCUG00000033547 ENSOCUG00000032795 ENSOCUG00000026047 JRKL (ENSOCUG00000024211) CCDC82 (ENSOCUG00000007312) MAML2 (ENSOCUG00000010820) MTMR2 (ENSOCUG00000014568) CEP57 (ENSOCUG00000014557) FAM76B (ENSOCUG00000014549) ENSOCUG00000036784 SESN3 (ENSOCUG00000026640) ##22 ENDOD1 (ENSOCUG00000014040) ENSOCUG00000038702 ENSOCUG00000035381 ENSOCUG00000031183 ENSOCUG00000032220 ENSOCUG00000001631 CWC15 (ENSOCUG00000001629) AMOTL1 (ENSOCUG00000001078) PIWIL4 (ENSOCUG00000002860) FUT4 (ENSOCUG00000014204) C11orf97 (ENSOCUG00000034472) ENSOCUG00000033194 ANKRD49 (ENSOCUG00000014912) MRE11 (ENSOCUG00000014899) GPR83 (ENSOCUG00000015502) Pika MODERN SPECIES 2114 SESN3 (ENSOPRG00000015933) ##22 ENDOD1 (ENSOPRG00000015928) Rodentia ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00510000046760.a ENSGT00510000047559 ENSGT00390000013786 ENSGT00940000161966 ENSGT01060000248588.a.d.a ENSGT00940000159713 ENSGT00940000155492.b ENSGT00940000158183 ENSGT00940000161513 ENSGT00390000004986 ENSGT00950000183201.a ENSGT01010000223591 ENSGT00940000153669.a ENSGT00530000063695.a ENSGT00940000159074 ENSGT00950000183168.A ##22 ENSGT01030000234592.B ENSGT00940000162152 ENSGT00390000012084 ENSGT00940000160158 ENSGT00950000183200.A.a.a ENSGT00940000162506 ENSGT00520000058823 ENSGT00390000003919 ENSGT00390000017288 ENSGT00940000154336.d ENSGT00950000183144.A.j ENSGT00940000169594 ENSGT00940000153972.A ENSGT00940000157994 ENSGT01100000263551.b.a.b Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00510000046760.a ENSGT00510000047559 ENSGT00390000013786 ENSGT00940000161966 ENSGT01060000248588.a.d.a ENSGT00940000159713 ENSGT00940000155492.b ENSGT00940000158183 ENSGT00940000161513 ENSGT00390000004986 ENSGT00950000183201.a ENSGT01010000223591 ENSGT00940000153669.a ENSGT00530000063695.a ENSGT00940000159074 ENSGT00950000183168.A ##22 ENSGT01030000234592.B ENSGT00940000162152 ENSGT00390000012084 ENSGT00940000160158 ENSGT00950000183200.A.a.a ENSGT00940000162506 ENSGT00520000058823 ENSGT00390000003919 ENSGT00390000017288 ENSGT00940000154336.d ENSGT00950000183144.A.j ENSGT00940000169594 ENSGT00940000153972.A ENSGT00940000157994 ENSGT01100000263551.b.a.b Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000154175.i.a ENSGT00510000046760.a ENSGT00510000047559 ENSGT00390000013786 ENSGT00940000161966 ENSGT01060000248588.a.d.a ENSGT00940000159713 ENSGT00940000155492.b ENSGT00940000158183 ENSGT00940000161513 ENSGT00390000004986 ENSGT00950000183201.a ENSGT00940000153669.a ENSGT00530000063695.a ENSGT00940000159074 ENSGT00950000183168.A ##22 ENSGT01030000234592.B ENSGT00940000162152.h ENSGT00940000162152.g.b ENSGT00940000162152.g.a ENSGT00390000012084 ENSGT00940000160158 ENSGT00950000183200.A.a.a ENSGT00940000162506 ENSGT00520000058823 ENSGT00390000003919 ENSGT00390000017288 ENSGT00940000154336.d ENSGT00950000183144.A.j ENSGT00940000153972.A ENSGT00940000157994 Marmotini ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000154175.i.a ENSGT00510000046760.a ENSGT00510000047559 ENSGT00390000013786 ENSGT00940000161966 ENSGT01060000248588.a.d.a ENSGT00940000159713 ENSGT00940000155492.b ENSGT00940000158183 ENSGT00940000161513 ENSGT00390000004986 ENSGT00950000183201.a ENSGT00940000153669.a ENSGT00530000063695.a ENSGT00940000159074 ENSGT00950000183168.A ##22 ENSGT01030000234592.B ENSGT00940000162152.h ENSGT00940000162152.g.b ENSGT00940000162152.g.a ENSGT00390000012084 ENSGT00940000160158 ENSGT00950000183200.A.a.a ENSGT00940000162506 ENSGT00520000058823 ENSGT00390000003919 ENSGT00390000017288 ENSGT00940000154336.d ENSGT00950000183144.A.j ENSGT00940000153972.A ENSGT00940000157994 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 155 ENSGT00940000161513 ENSGT00390000004986 ENSGT00950000183201.a ENSGT00940000153669.a ENSGT00530000063695.a ENSGT00940000159074 ENSGT00950000183168.A ##22 ENSGT01030000234592.B ENSGT00940000162152.g.b ENSGT00940000162152.g.a ENSGT00390000012084 ENSGT00940000160158 ENSGT00950000183200.A.a.a ENSGT00940000162506 ENSGT00520000058823 ENSGT00390000003919 ENSGT00390000017288 ENSGT00940000154336.d ENSGT00950000183144.A.j ENSGT00940000153972.A ENSGT00940000157994 ENSGT01100000263551.b.a.b Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 166 ENSUPAG00010002131 ENSUPAG00010002123 SESN3 (ENSUPAG00010002105) ##22 ENDOD1 (ENSUPAG00010002099) KDM4D (ENSUPAG00010002086) CWC15 (ENSUPAG00010002076) AMOTL1 (ENSUPAG00010002044) PIWIL4 (ENSUPAG00010001982) FUT4 (ENSUPAG00010001953) C11orf97 (ENSUPAG00010001935) ANKRD49 (ENSUPAG00010001896) MRE11 (ENSUPAG00010001790) GPR83 (ENSUPAG00010001763) IZUMO1R (ENSUPAG00010001756) ENSUPAG00010001744 PANX1 (ENSUPAG00010001730) HEPHL1 (ENSUPAG00010001691) VSTM5 (ENSUPAG00010001672) Squirrel MODERN SPECIES 300 ENSSTOG00000029995 JRKL (ENSSTOG00000026474) CCDC82 (ENSSTOG00000002309) ENSSTOG00000033445 MTMR2 (ENSSTOG00000002284) CEP57 (ENSSTOG00000002278) FAM76B (ENSSTOG00000023725) SESN3 (ENSSTOG00000000033) ##22 ENDOD1 (ENSSTOG00000000032) Alpin marmot MODERN SPECIES 25 CEP126 (ENSMMMG00000002769) ANGPTL5 (ENSMMMG00000002794) TRPC6 (ENSMMMG00000002831) PGR (ENSMMMG00000002898) ARHGAP42 (ENSMMMG00000002945) CNTN5 (ENSMMMG00000003014) ENSMMMG00000003243 JRKL (ENSMMMG00000003254) CCDC82 (ENSMMMG00000003266) ENSMMMG00000003341 ENSMMMG00000003357 MTMR2 (ENSMMMG00000003375) CEP57 (ENSMMMG00000003431) FAM76B (ENSMMMG00000003496) ENSMMMG00000003554 SESN3 (ENSMMMG00000003584) ##22 ENDOD1 (ENSMMMG00000003657) ENSMMMG00000003662 ENSMMMG00000003674 ENSMMMG00000003680 ENSMMMG00000003692 CWC15 (ENSMMMG00000003695) AMOTL1 (ENSMMMG00000003717) PIWIL4 (ENSMMMG00000003741) FUT4 (ENSMMMG00000003775) C11orf97 (ENSMMMG00000003791) ANKRD49 (ENSMMMG00000003801) MRE11 (ENSMMMG00000003822) GPR83 (ENSMMMG00000003939) IZUMO1R (ENSMMMG00000003960) PANX1 (ENSMMMG00000003980) Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 2 ANGPTL5 (ENSSVLG00005013174) ENSSVLG00005013071 TRPC6 (ENSSVLG00005012644) ENSSVLG00005012488 PGR (ENSSVLG00005012195) ARHGAP42 (ENSSVLG00005012065) CNTN5 (ENSSVLG00005011074) ENSSVLG00005010963 ENSSVLG00005010908 JRKL (ENSSVLG00005010894) CCDC82 (ENSSVLG00005010580) ENSSVLG00005010533 MTMR2 (ENSSVLG00005010367) CEP57 (ENSSVLG00005010241) ENSSVLG00005010116 SESN3 (ENSSVLG00005009932) ##22 ENDOD1 (ENSSVLG00005009881) ENSSVLG00005009855 KDM4D (ENSSVLG00005009838) CWC15 (ENSSVLG00005009802) AMOTL1 (ENSSVLG00005009738) PIWIL4 (ENSSVLG00005009583) FUT4 (ENSSVLG00005009540) C11orf97 (ENSSVLG00005009503) ANKRD49 (ENSSVLG00005009488) ENSSVLG00005009454 MRE11 (ENSSVLG00005009395) GPR83 (ENSSVLG00005009337) IZUMO1R (ENSSVLG00005009300) PANX1 (ENSSVLG00005009275) HEPHL1 (ENSSVLG00005009168) Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00510000046760.a ENSGT00510000047559 ENSGT00390000013786 ENSGT00940000161966 ENSGT01060000248588.a.d.a ENSGT00940000159713 ENSGT00940000155492.b ENSGT00940000158183 ENSGT00940000161513 ENSGT00390000004986 ENSGT00950000183201.a ENSGT01010000223591 ENSGT00940000153669.a ENSGT00530000063695.a ENSGT00940000159074 ENSGT00950000183168.A ##22 ENSGT01030000234592.B ENSGT00940000162152 ENSGT00390000012084.u ENSGT00940000160158 ENSGT00950000183200.A.a.a ENSGT00940000162506 ENSGT00520000058823 ENSGT00390000003919 ENSGT00390000017288 ENSGT00940000154336.d ENSGT00950000183144.A.j ENSGT00940000169594 ENSGT00940000153972.A ENSGT00940000157994 ENSGT01100000263551.b.a.b Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000154175.i.a ENSGT00510000046760.a ENSGT00510000047559 ENSGT00390000013786 ENSGT00940000161966 ENSGT01060000248588.a.d.a ENSGT00940000159713 ENSGT00940000155492.b ENSGT00940000158183 ENSGT00940000161513 ENSGT00390000004986 ENSGT00950000183201.a ENSGT00940000153669.a ENSGT00530000063695.a ENSGT00940000159074 ENSGT00950000183168.A ##22 ENSGT01030000234592.B ENSGT00940000162152 ENSGT00390000012084.u ENSGT00940000160158 ENSGT00950000183200.A.a.a ENSGT00940000162506 ENSGT00520000058823 ENSGT00390000003919 ENSGT00390000017288 ENSGT00940000154336.d ENSGT00950000183144.A.j ENSGT00940000169594 ENSGT00940000153972.A ENSGT00940000157994 ENSGT01100000263551.b.a.b Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000154175.i.b ENSGT00940000154175.i.a ENSGT00510000046760.a ENSGT00510000047559 ENSGT00390000013786 ENSGT01060000248588.a.d.a ENSGT00940000159713 ENSGT00940000155492.b ENSGT00940000158183 ENSGT00940000161513 ENSGT00390000004986 ENSGT00950000183201.a ENSGT00940000153669.a ENSGT00530000063695.a ENSGT00940000159074 ENSGT00950000183168.A ##22 ENSGT00940000162152 ENSGT00390000012084.u ENSGT00940000160158 ENSGT00950000183200.A.a.a ENSGT00520000058823 Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 119 BIRC3 (ENSCLAG00000010783) YAP1 (ENSCLAG00000011113) CFAP300 (ENSCLAG00000013914) CEP126 (ENSCLAG00000012819) TRPC6 (ENSCLAG00000011949) ENSCLAG00000013886 ARHGAP42 (ENSCLAG00000014100) CNTN5 (ENSCLAG00000010625) ENSCLAG00000018078 JRKL (ENSCLAG00000017853) CCDC82 (ENSCLAG00000014287) MAML2 (ENSCLAG00000014659) MTMR2 (ENSCLAG00000011747) ENSCLAG00000011257 FAM76B (ENSCLAG00000010250) SESN3 (ENSCLAG00000016066) ##22 Degu MODERN SPECIES 53 TRPC6 (ENSODEG00000014288) ENSODEG00000013619 ARHGAP42 (ENSODEG00000013928) ENSODEG00000013901 CNTN5 (ENSODEG00000014105) ENSODEG00000012986 ENSODEG00000014051 JRKL (ENSODEG00000020217) CCDC82 (ENSODEG00000012847) MAML2 (ENSODEG00000015630) ENSODEG00000020097 MTMR2 (ENSODEG00000013402) CEP57 (ENSODEG00000013214) FAM76B (ENSODEG00000013436) ENSODEG00000014506 SESN3 (ENSODEG00000014538) ##22 KDM4D (ENSODEG00000012937) ENSODEG00000014060 ENSODEG00000020081 AMOTL1 (ENSODEG00000013464) PIWIL4 (ENSODEG00000013015) ENSODEG00000020227 MRE11 (ENSODEG00000014786) ENSODEG00000013277 ENSODEG00000014210 Guinea pig MODERN SPECIES 19 BIRC2 (ENSCPOG00000010349) BIRC3 (ENSCPOG00000034907) YAP1 (ENSCPOG00000033105) CFAP300 (ENSCPOG00000011737) CEP126 (ENSCPOG00000001844) ANGPTL5 (ENSCPOG00000001842) TRPC6 (ENSCPOG00000005560) ENSCPOG00000030258 ARHGAP42 (ENSCPOG00000007842) CNTN5 (ENSCPOG00000011322) CCDC82 (ENSCPOG00000033086) MAML2 (ENSCPOG00000008516) MTMR2 (ENSCPOG00000008505) CEP57 (ENSCPOG00000008497) FAM76B (ENSCPOG00000040456) SESN3 (ENSCPOG00000019467) ##22 ENDOD1 (ENSCPOG00000002204) Naked mole-rat female DUPLICATION Naked mole-rat female MODERN SPECIES 24 ENSHGLG00000047684 MMP7 (ENSHGLG00000003863) ENSHGLG00000003570 ENSHGLG00000042812 ENSHGLG00000041631 ENSHGLG00000041058 CCDC82 (ENSHGLG00000013992) JRKL (ENSHGLG00000049214) ENSHGLG00000049135 MAML2 (ENSHGLG00000017672) ENSHGLG00000050231 ENSHGLG00000015893 ENSHGLG00000017903 FAM76B (ENSHGLG00000013754) ENSHGLG00000050488 ENSHGLG00000019419 ##22 ENSHGLG00000018327 ENSHGLG00000017774 ENSHGLG00000046281 ENSHGLG00000043269 ENSHGLG00000032452 ENSHGLG00000035638 ENSHGLG00000049265 AMOTL1 (ENSHGLG00000010959) ENSHGLG00000008729 PIWIL4 (ENSHGLG00000007416) ENSHGLG00000005671 FUT4 (ENSHGLG00000005608) ENSHGLG00000014136 ANKRD49 (ENSHGLG00000014039) MRE11A (ENSHGLG00000015754) Naked mole-rat female MODERN SPECIES 25 ENSHGLG00000005636 ENSHGLG00000004898 SARAF (ENSHGLG00000004133) ENSHGLG00000004030 ENSHGLG00000003828 ENSHGLG00000043902 ENSHGLG00000040893 ENSHGLG00000045110 ENSHGLG00000003279 ENSHGLG00000041340 PPP1R3B (ENSHGLG00000032439) ENSHGLG00000038493 ERI1 (ENSHGLG00000002928) ENSHGLG00000002892 ENSHGLG00000002808 ENSHGLG00000007100 ##22 ENSHGLG00000006746 CLDN23 (ENSHGLG00000037723) ENSHGLG00000041065 ENSHGLG00000006007 ENSHGLG00000005681 ENSHGLG00000010695 ENSHGLG00000040172 DLC1 (ENSHGLG00000004056) C8orf48 (ENSHGLG00000036967) ENSHGLG00000045911 SGCZ (ENSHGLG00000003835) ENSHGLG00000003696 ENSHGLG00000003503 ENSHGLG00000003353 MSR1 (ENSHGLG00000003185) Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000154175.i.b ENSGT00940000154175.i.a ENSGT00510000046760.a ENSGT00510000047559 ENSGT00390000013786 ENSGT01060000248588.a.d.a ENSGT00940000159713 ENSGT00940000155492.b ENSGT00940000158183 ENSGT00940000161513 ENSGT00390000004986 ENSGT00950000183201.a ENSGT00940000153669.a ENSGT00530000063695.a ENSGT00940000159074 ENSGT00950000183168.A ##22 ENSGT01030000234592.B ENSGT00940000162152 ENSGT00390000012084 ENSGT00940000160158 ENSGT00950000183200.A.a.a ENSGT00940000162506 ENSGT00520000058823 ENSGT00390000003919 ENSGT00390000017288 ENSGT00940000154336.d ENSGT00950000183144.A.j ENSGT00940000169594 ENSGT00940000153972.A ENSGT00940000157994 ENSGT01100000263551.b.a.b Kangaroo rat MODERN SPECIES 329 Mmp27 (ENSDORG00000015102) Mmp20 (ENSDORG00000015101) Mmp7 (ENSDORG00000001516) Birc2 (ENSDORG00000010334) Yap1 (ENSDORG00000023430) Cfap300 (ENSDORG00000003243) Cep126 (ENSDORG00000025333) Trpc6 (ENSDORG00000005456) Arhgap42 (ENSDORG00000014906) Jrkl (ENSDORG00000012234) Ccdc82 (ENSDORG00000016570) Maml2 (ENSDORG00000013901) Mtmr2 (ENSDORG00000001033) Cep57 (ENSDORG00000001032) Fam76b (ENSDORG00000004977) Sesn3 (ENSDORG00000014812) ##22 Cwc15 (ENSDORG00000011075) Amotl1 (ENSDORG00000006612) ENSDORG00000029165 ENSDORG00000027168 Ankrd49 (ENSDORG00000013373) Myomorpha ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000154175.i.b ENSGT00940000154175.i.a ENSGT00510000046760.a ENSGT00510000047559 ENSGT00390000013786 ENSGT01060000248588.a.d.a ENSGT00940000159713 ENSGT00940000155492.b ENSGT00940000158183 ENSGT00940000161513 ENSGT00390000004986 ENSGT00950000183201.a ENSGT00940000153669.a ENSGT00530000063695.a ENSGT00940000159074 ENSGT00950000183168.A ##22 ENSGT01030000234592.B ENSGT00940000162152 ENSGT00390000012084 ENSGT00940000160158 ENSGT00950000183200.A.a.a ENSGT00940000162506 ENSGT00520000058823 ENSGT00390000003919 ENSGT00390000017288 ENSGT00940000154336.d ENSGT00950000183144.A.j ENSGT00940000153972.A ENSGT00940000157994 ENSGT01100000263551.b.a.b ENSGT00390000011810 Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 87 ENSJJAG00000015982 Cfap300 (ENSJJAG00000022122) Cep126 (ENSJJAG00000014011) Trpc6 (ENSJJAG00000021679) ENSJJAG00000002569 Pgr (ENSJJAG00000015786) Arhgap42 (ENSJJAG00000023474) ENSJJAG00000000229 ENSJJAG00000007185 Jrkl (ENSJJAG00000000663) Ccdc82 (ENSJJAG00000017966) ENSJJAG00000002824 Mtmr2 (ENSJJAG00000009913) Cep57 (ENSJJAG00000013938) Fam76b (ENSJJAG00000017450) Sesn3 (ENSJJAG00000019262) ##22 ENSJJAG00000015656 ENSJJAG00000016968 Amotl1 (ENSJJAG00000000834) ENSJJAG00000002783 Fut4 (ENSJJAG00000015747) 1700012B09Rik (ENSJJAG00000020782) Ankrd49 (ENSJJAG00000023374) Mre11a (ENSJJAG00000009794) Izumo1r (ENSJJAG00000018637) Panx1 (ENSJJAG00000024378) Hephl1 (ENSJJAG00000015710) Vstm5 (ENSJJAG00000019443) Cep295 (ENSJJAG00000001043) Smco4 (ENSJJAG00000000940) Deup1 (ENSJJAG00000000219) Muroidea ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00940000154175.i.b ENSGT00940000154175.i.a ENSGT00510000046760.a ENSGT00510000047559 ENSGT00390000013786 ENSGT01060000248588.a.d.a ENSGT00940000159713 ENSGT00940000155492.b ENSGT00940000158183 ENSGT00940000161513 ENSGT00390000004986 ENSGT00950000183201.a ENSGT00940000153669.a ENSGT00530000063695.a ENSGT00940000159074 ENSGT00950000183168.A ##22 ENSGT01030000234592.B ENSGT00940000162152 ENSGT00390000012084 ENSGT00940000160158 ENSGT00950000183200.A.a.a ENSGT00940000162506 ENSGT00520000058823 ENSGT00390000003919 ENSGT00390000017288 ENSGT00940000154336.d ENSGT00950000183144.A.j ENSGT00940000153972.A ENSGT00940000157994 ENSGT01100000263551.b.a.b ENSGT00390000011810 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000154175.i.b ENSGT00940000154175.i.a ENSGT00510000046760.a ENSGT00510000047559 ENSGT00390000013786 ENSGT01060000248588.a.d.a ENSGT00940000159713 ENSGT00940000155492.b ENSGT00940000158183 ENSGT00940000161513 ENSGT00390000004986 ENSGT00950000183201.a ENSGT00940000153669.a ENSGT00530000063695.a ENSGT00940000159074 ENSGT00950000183168.A ##22 ENSGT01030000234592.B ENSGT00940000162152 ENSGT00390000012084 ENSGT00940000160158 ENSGT00950000183200.A.a.a ENSGT00940000162506 ENSGT00520000058823 ENSGT00390000003919 ENSGT00390000017288 ENSGT00940000154336.d ENSGT00950000183144.A.j ENSGT00940000153972.A ENSGT00940000157994 ENSGT01100000263551.b.a.b ENSGT00390000011810 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000154175.i.a ENSGT00510000046760.a ENSGT00510000047559 ENSGT00390000013786 ENSGT01060000248588.a.d.a ENSGT00940000159713 ENSGT00940000155492.b ENSGT00940000158183 ENSGT00940000161513 ENSGT00390000004986 ENSGT00940000167787 ENSGT00950000183201.a ENSGT00940000153669.a ENSGT00530000063695.a ENSGT00940000159074 ENSGT00950000183168.A ##22 ENSGT01030000234592.B ENSGT00940000162152 ENSGT00390000012084 ENSGT00940000160158 ENSGT00950000183200.A.a.a ENSGT00940000162506 ENSGT00520000058823 ENSGT00390000003919 ENSGT00390000017288 ENSGT00940000154336.d ENSGT00950000183144.A.j ENSGT00940000153972.A ENSGT00940000157994 ENSGT01100000263551.b.a.b ENSGT00390000011810 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES 45 ENSGT00940000154175.i.a ENSGT00510000046760.a ENSGT00510000047559 ENSGT00390000013786 ENSGT01060000248588.a.d.a ENSGT00940000159713 ENSGT00940000155492.b ENSGT00940000158183 ENSGT00940000161513 ENSGT00390000004986 ENSGT00940000167787 ENSGT00950000183201.a ENSGT00940000153669.a ENSGT00530000063695.a ENSGT00940000159074 ENSGT00950000183168.A ##22 ENSGT01030000234592.B ENSGT00940000162152 ENSGT00390000012084 ENSGT00940000160158 ENSGT00950000183200.A.a.a ENSGT00940000162506 ENSGT00520000058823 ENSGT00390000003919 ENSGT00390000017288 ENSGT00940000154336.d ENSGT00950000183144.A.j ENSGT00940000153972.A ENSGT00940000157994 ENSGT01100000263551.b.a.b ENSGT00390000011810 Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 202 Cfap300 (ENSCGRG00001021391) Cep126 (ENSCGRG00001023949) Trpc6 (ENSCGRG00001006368) Pgr (ENSCGRG00001019400) Arhgap42 (ENSCGRG00001000196) ENSCGRG00001007078 Cntn5 (ENSCGRG00001022628) ENSCGRG00001023105 Jrkl (ENSCGRG00001010876) Ccdc82 (ENSCGRG00001017832) ENSCGRG00001023836 Maml2 (ENSCGRG00001007799) Mtmr2 (ENSCGRG00001014347) Cep57 (ENSCGRG00001022050) Fam76b (ENSCGRG00001010539) Sesn3 (ENSCGRG00001021337) ##22 Endod1 (ENSCGRG00001000699) Golden Hamster MODERN SPECIES 778 Sesn3 (ENSMAUG00000009718) ##22 Endod1 (ENSMAUG00000010649) Kdm4d (ENSMAUG00000010975) Cwc15 (ENSMAUG00000011686) Amotl1 (ENSMAUG00000012162) Piwil4 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ENSGT00940000157994 ENSGT01100000263551.b.a.b ENSGT00390000011810 Mus_B ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00510000046760.a ENSGT00510000047559 ENSGT00390000013786 ENSGT01060000248588.a.d.a ENSGT00940000159713 ENSGT00860000136210 ENSGT00940000155492.b ENSGT00940000158183 ENSGT00940000161513 ENSGT00390000004986 ENSGT00900000143517 ENSGT00950000183201.a ENSGT00940000153669.a ENSGT00530000063695.a ENSGT00940000159074 ENSGT00950000183168.A ##22 ENSGT01030000234592.B ENSGT00940000162152 ENSGT00390000012084 ENSGT00940000160158 ENSGT00950000183200.A.a.a ENSGT00940000162506 ENSGT00520000058823 ENSGT00390000003919 ENSGT00390000017288 ENSGT00940000154336.d ENSGT00950000183144.A.j ENSGT00940000153972.A ENSGT00940000157994 ENSGT01100000263551.b.a.b ENSGT00390000011810 Mus_C ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00510000046760.a ENSGT00510000047559 ENSGT00390000013786 ENSGT01060000248588.a.d.a ENSGT00940000159713 ENSGT00860000136210 ENSGT00940000155492.b ENSGT00940000158183 ENSGT00940000161513 ENSGT00390000004986 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Arhgap42 (MGP_PahariEiJ_G0014646) MGP_PahariEiJ_G0014647 Jrkl (MGP_PahariEiJ_G0014648) Ccdc82 (MGP_PahariEiJ_G0014649) MGP_PahariEiJ_G0014650 Maml2 (MGP_PahariEiJ_G0014651) Mtmr2 (MGP_PahariEiJ_G0014652) Cep57 (MGP_PahariEiJ_G0014653) Fam76b (MGP_PahariEiJ_G0014654) Sesn3 (MGP_PahariEiJ_G0014655) ##22 Endod1 (MGP_PahariEiJ_G0014656) Kdm4d (MGP_PahariEiJ_G0014657) Cwc15 (MGP_PahariEiJ_G0014658) Amotl1 (MGP_PahariEiJ_G0014659) Piwil4 (MGP_PahariEiJ_G0014660) Fut4 (MGP_PahariEiJ_G0014661) 1700012B09Rik (MGP_PahariEiJ_G0014662) Ankrd49 (MGP_PahariEiJ_G0014663) Mre11a (MGP_PahariEiJ_G0014664) Gpr83 (MGP_PahariEiJ_G0014665) Izumo1r (MGP_PahariEiJ_G0014666) Panx1 (MGP_PahariEiJ_G0014667) MGP_PahariEiJ_G0014668 Vstm5 (MGP_PahariEiJ_G0014669) Med17 (MGP_PahariEiJ_G0014670) Rat MODERN SPECIES 18 Cep126 (ENSRNOG00000021839) ENSRNOG00000062568 LOC100362400 (ENSRNOG00000032531) Trpc6 (ENSRNOG00000006324) Pgr (ENSRNOG00000006831) Arhgap42 (ENSRNOG00000026821) ENSRNOG00000063507 Cntn5 (ENSRNOG00000007038) ENSRNOG00000064384 Jrkl (ENSRNOG00000047133) Ccdc82 (ENSRNOG00000005713) Maml2 (ENSRNOG00000005879) Mtmr2 (ENSRNOG00000005923) Cep57 (ENSRNOG00000006792) Fam76b (ENSRNOG00000024863) Sesn3 (ENSRNOG00000008173) ##22 Endod1 (ENSRNOG00000024757) LOC108348070 (ENSRNOG00000045905) Cwc15 (ENSRNOG00000008490) Amotl1 (ENSRNOG00000008990) Piwil4 (ENSRNOG00000009043) Fut4 (ENSRNOG00000009157) C8h11orf97 (ENSRNOG00000009203) Ankrd49 (ENSRNOG00000009233) Mre11 (ENSRNOG00000009506) Gpr83 (ENSRNOG00000030318) Izumo1r (ENSRNOG00000019894) Panx1 (ENSRNOG00000010060) Hephl1 (ENSRNOG00000056092) ENSRNOG00000062992 Vstm5 (ENSRNOG00000010480) Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 1827 Sesn3 (ENSNGAG00000007814) ##22 Endod1 (ENSNGAG00000019861) Kdm4d (ENSNGAG00000019223) Cwc15 (ENSNGAG00000016450) Amotl1 (ENSNGAG00000012913) Piwil4 (ENSNGAG00000022297) 1700012B09Rik (ENSNGAG00000013078) Ankrd49 (ENSNGAG00000012789) Mre11a (ENSNGAG00000010330) Gpr83 (ENSNGAG00000015036) Izumo1r (ENSNGAG00000009610) Panx1 (ENSNGAG00000014760) ENSNGAG00000004656 Hephl1 (ENSNGAG00000012499) Vstm5 (ENSNGAG00000008846) Med17 (ENSNGAG00000005765) Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000154175.i.a ENSGT00510000046760.a ENSGT00510000047559 ENSGT00390000013786 ENSGT00940000161966 ENSGT01060000248588.a.d.a ENSGT00940000159713 ENSGT00940000155492.b ENSGT00940000158183 ENSGT00940000161513 ENSGT00390000004986 ENSGT00950000183201.a ENSGT00940000153669.a ENSGT00530000063695.a ENSGT00940000159074 ENSGT00950000183168.A ##22 ENSGT01030000234592.B ENSGT00940000162152 ENSGT00390000012084 ENSGT00940000160158 ENSGT00950000183200.A.a.a ENSGT00940000162506 ENSGT00520000058823 ENSGT00910000147289 ENSGT00390000003919 ENSGT00390000017288 ENSGT00940000154336.d ENSGT00950000183144.A.j ENSGT00940000153972.A ENSGT00940000157994 ENSGT01100000263551.b.a.b Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183168.A ##22 Hedgehog MODERN SPECIES 13816 SESN3 (ENSEEUG00000015702) ##22 Common shrew MODERN SPECIES 3482 SESN3 (ENSSARG00000011011) ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000154175.i.a ENSGT00510000046760.a ENSGT00510000047559 ENSGT00390000013786 ENSGT00940000161966 ENSGT01060000248588.a.d.a ENSGT00940000159713 ENSGT00940000155492.b ENSGT00940000158183 ENSGT00940000161513 ENSGT00390000004986 ENSGT00950000183201.a ENSGT00940000153669.a ENSGT00530000063695.a ENSGT00940000159074 ENSGT00950000183168.A ##22 ENSGT01030000234592.B ENSGT00940000162152 ENSGT00390000012084 ENSGT00940000160158 ENSGT00950000183200.A.a.a ENSGT00940000162506 ENSGT00520000058823 ENSGT00910000147289 ENSGT00390000003919 ENSGT00390000017288 ENSGT00940000154336.d ENSGT00950000183144.A.j ENSGT00940000153972.A ENSGT00940000157994 ENSGT01100000263551.b.a.b Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000154175.i.a ENSGT00510000046760.a ENSGT00510000047559 ENSGT00390000013786 ENSGT00940000161966 ENSGT01060000248588.a.d.a ENSGT00940000159713 ENSGT00940000155492.b ENSGT00940000158183 ENSGT00940000161513 ENSGT00390000004986 ENSGT00950000183201.a ENSGT00940000153669.a ENSGT00530000063695.a ENSGT00940000159074 ENSGT00950000183168.A ##22 ENSGT01030000234592.B ENSGT00940000162152 ENSGT00390000012084 ENSGT00940000160158 ENSGT00950000183200.A.a.a ENSGT00940000162506 ENSGT00520000058823 ENSGT00910000147289 ENSGT00390000003919 ENSGT00390000017288 ENSGT00940000154336.d ENSGT00950000183144.A.j ENSGT00940000153972.A ENSGT00940000157994 ENSGT01100000263551.b.a.b Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000154175.i.a ENSGT00510000046760.a ENSGT00510000047559 ENSGT00390000013786 ENSGT00940000161966 ENSGT01060000248588.a.d.a ENSGT00940000159713 ENSGT00940000155492.b ENSGT00940000158183 ENSGT00940000161513 ENSGT00390000004986 ENSGT00950000183201.a ENSGT00940000153669.a ENSGT00530000063695.a ENSGT00940000159074 ENSGT00950000183168.A ##22 ENSGT01030000234592.B ENSGT00940000162152 ENSGT00390000012084 ENSGT00940000160158 ENSGT00950000183200.A.a.a ENSGT00940000162506 ENSGT00520000058823 ENSGT00390000003919 ENSGT00390000017288 ENSGT00940000154336.d ENSGT00950000183144.A.j ENSGT00940000153972.A ENSGT00940000157994 Equus ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00510000046760.a ENSGT00510000047559 ENSGT00390000013786 ENSGT00940000161966 ENSGT01060000248588.a.d.a ENSGT00940000159713 ENSGT00940000155492.b ENSGT00940000158183 ENSGT01010000229305 ENSGT00940000161513 ENSGT00390000004986 ENSGT00950000183201.a ENSGT00940000153669.a ENSGT00530000063695.a ENSGT00940000159074 ENSGT00950000183168.A ##22 ENSGT01030000234592.B ENSGT00940000162152.ab ENSGT00940000162152.`b ENSGT00390000012084 ENSGT00940000160158 ENSGT00950000183200.A.a.a ENSGT00940000162506 ENSGT00520000058823 ENSGT00390000003919 ENSGT00390000017288 ENSGT00940000154336.d ENSGT00950000183144.A.j ENSGT00940000153972.A ENSGT00940000157994 Donkey MODERN SPECIES 12 ANGPTL5 (ENSEASG00005011153) TRPC6 (ENSEASG00005011159) PGR (ENSEASG00005011167) ARHGAP42 (ENSEASG00005011181) CNTN5 (ENSEASG00005011200) ENSEASG00005011203 ENSEASG00005011207 ENSEASG00005011209 JRKL (ENSEASG00005035447) CCDC82 (ENSEASG00005011214) MAML2 (ENSEASG00005011221) ENSEASG00005036655 MTMR2 (ENSEASG00005011224) CEP57 (ENSEASG00005011227) FAM76B (ENSEASG00005011231) SESN3 (ENSEASG00005011270) ##22 ENDOD1 (ENSEASG00005028824) ENSEASG00005011277 ENSEASG00005028515 CWC15 (ENSEASG00005011279) AMOTL1 (ENSEASG00005011287) PIWIL4 (ENSEASG00005027983) FUT4 (ENSEASG00005011312) C11orf97 (ENSEASG00005011314) ANKRD49 (ENSEASG00005032651) MRE11 (ENSEASG00005011342) GPR83 (ENSEASG00005012119) IZUMO1R (ENSEASG00005035464) PANX1 (ENSEASG00005012200) HEPHL1 (ENSEASG00005012218) ENSEASG00005012238 Horse MODERN SPECIES 28 CEP126 (ENSECAG00000000666) ANGPTL5 (ENSECAG00000021029) TRPC6 (ENSECAG00000023421) PGR (ENSECAG00000011511) ARHGAP42 (ENSECAG00000005829) CNTN5 (ENSECAG00000000340) ENSECAG00000037608 ENSECAG00000021004 ENSECAG00000052632 JRKL (ENSECAG00000001856) CCDC82 (ENSECAG00000018064) MAML2 (ENSECAG00000014537) MTMR2 (ENSECAG00000018921) CEP57 (ENSECAG00000010938) FAM76B (ENSECAG00000005330) SESN3 (ENSECAG00000017743) ##22 ENSECAG00000030703 ENDOD1 (ENSECAG00000017667) ENSECAG00000036765 ENSECAG00000057140 CWC15 (ENSECAG00000013314) AMOTL1 (ENSECAG00000012681) FUT4 (ENSECAG00000024199) PIWIL4 (ENSECAG00000024385) ANKRD49 (ENSECAG00000024188) MRE11 (ENSECAG00000000295) GPR83 (ENSECAG00000020552) ANGPTL4 (ENSECAG00000018927) KANK3 (ENSECAG00000017445) NDUFA7 (ENSECAG00000014853) CD320 (ENSECAG00000013583) Chiroptera ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00940000154175.i.a ENSGT00510000046760.a ENSGT00510000047559 ENSGT00390000013786 ENSGT00940000161966 ENSGT01060000248588.a.d.a ENSGT00940000159713 ENSGT00940000155492.b ENSGT00940000158183 ENSGT00940000161513 ENSGT00390000004986 ENSGT00950000183201.a ENSGT00940000153669.a ENSGT00530000063695.a ENSGT00940000159074 ENSGT00950000183168.A ##22 ENSGT01030000234592.B ENSGT00940000162152 ENSGT00390000012084 ENSGT00940000160158 ENSGT00950000183200.A.a.a ENSGT00940000162506 ENSGT00520000058823 ENSGT00390000003919 ENSGT00390000017288 ENSGT00940000154336.d ENSGT00950000183144.A.j ENSGT00940000153972.A ENSGT00940000157994 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00940000154175.i.a ENSGT00510000046760.a ENSGT00510000047559 ENSGT00390000013786 ENSGT00940000161966 ENSGT01060000248588.a.d.a ENSGT00940000159713 ENSGT00940000155492.b ENSGT00940000158183 ENSGT00940000161513 ENSGT00390000004986 ENSGT00950000183201.a ENSGT00940000153669.a ENSGT00530000063695.a ENSGT00940000159074 ENSGT00950000183168.A ##22 ENSGT01030000234592.B ENSGT00940000162152 ENSGT00390000012084 ENSGT00940000160158 ENSGT00950000183200.A.a.a ENSGT00940000162506 ENSGT00520000058823 ENSGT00390000003919 ENSGT00390000017288 ENSGT00940000154336.d ENSGT00950000183144.A.j ENSGT00940000153972.A ENSGT00940000157994 Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 2 CFAP300 (ENSRFEG00010006073) CEP126 (ENSRFEG00010005996) ANGPTL5 (ENSRFEG00010005960) TRPC6 (ENSRFEG00010021416) PGR (ENSRFEG00010021367) ENSRFEG00010021353 ARHGAP42 (ENSRFEG00010021297) CNTN5 (ENSRFEG00010021161) ENSRFEG00010021116 JRKL (ENSRFEG00010021090) CCDC82 (ENSRFEG00010021069) MAML2 (ENSRFEG00010021043) MTMR2 (ENSRFEG00010021018) CEP57 (ENSRFEG00010020926) FAM76B (ENSRFEG00010020857) SESN3 (ENSRFEG00010020812) ##22 ENDOD1 (ENSRFEG00010020792) ENSRFEG00010020772 ENSRFEG00010020755 CWC15 (ENSRFEG00010020742) AMOTL1 (ENSRFEG00010020674) PIWIL4 (ENSRFEG00010020425) FUT4 (ENSRFEG00010020392) C11orf97 (ENSRFEG00010020369) ANKRD49 (ENSRFEG00010020343) MRE11 (ENSRFEG00010020173) GPR83 (ENSRFEG00010020113) IZUMO1R (ENSRFEG00010020055) PANX1 (ENSRFEG00010020003) HEPHL1 (ENSRFEG00010019856) ENSRFEG00010019751 Microbat MODERN SPECIES 1041 ENSMLUG00000028921 CEP57 (ENSMLUG00000013618) FAM76B (ENSMLUG00000013608) ENSMLUG00000027497 SESN3 (ENSMLUG00000014498) ##22 ENDOD1 (ENSMLUG00000014495) ENSMLUG00000026834 ENSMLUG00000025372 ENSMLUG00000028321 ENSMLUG00000002032 AMOTL1 (ENSMLUG00000002026) PIWIL4 (ENSMLUG00000002018) C11orf97 (ENSMLUG00000025421) ANKRD49 (ENSMLUG00000002017) MRE11 (ENSMLUG00000002006) GPR83 (ENSMLUG00000016975) IZUMO1R (ENSMLUG00000000463) PANX1 (ENSMLUG00000000460) HEPHL1 (ENSMLUG00000008248) ENSMLUG00000022473 Megabat MODERN SPECIES 1294 SESN3 (ENSPVAG00000017393) ##22 Carnivora ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00390000013297 ENSGT00940000157590 ENSGT00950000182942.b.a.b ENSGT00950000182942.b.a.a ENSGT00950000182942.b.b ENSGT00940000157165 ENSGT00940000159713 ENSGT00940000155492.b ENSGT00940000158183 ENSGT00940000161513 ENSGT00390000004986 ENSGT00950000183201.a ENSGT00940000153669.a ENSGT00530000063695.a ENSGT00940000159074 ENSGT00950000183168.A ##22 ENSGT01030000234592.B ENSGT00940000162152 ENSGT00390000012084 ENSGT00940000160158 ENSGT00950000183200.A.a.a ENSGT00940000162506 ENSGT00520000058823 ENSGT00910000147289 ENSGT00390000003919 ENSGT00390000017288 ENSGT00940000154336.d ENSGT00950000183144.A.j ENSGT00940000153972.A ENSGT00940000157994 ENSGT01100000263551.b.a.b Felidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157590 ENSGT00950000182942.b.a.b ENSGT00950000182942.b.a.a ENSGT00950000182942.b.b ENSGT00940000157165 ENSGT00940000159713 ENSGT00940000155492.b ENSGT00940000158183 ENSGT00940000153446.b.d ENSGT00940000161513 ENSGT00390000004986 ENSGT00950000183201.a ENSGT00940000153669.a ENSGT00530000063695.a ENSGT00940000159074 ENSGT00950000183168.A ##22 ENSGT01030000234592.B ENSGT00940000162152.t ENSGT00940000162152.s ENSGT00390000012084 ENSGT00940000160158 ENSGT00950000183200.A.a.a ENSGT00940000162506 ENSGT00520000058823 ENSGT00390000003919 ENSGT00390000017288 ENSGT00940000154336.d ENSGT00950000183144.A.j ENSGT00940000153972.A ENSGT00940000157994 ENSGT01100000263551.b.a.b Cat MODERN SPECIES 241 ENSFCAG00000045417 GLB1L2 (ENSFCAG00000013738) B3GAT1 (ENSFCAG00000013741) ENSFCAG00000044711 PGR (ENSFCAG00000041663) ARHGAP42 (ENSFCAG00000022220) CNTN5 (ENSFCAG00000013908) ENSFCAG00000052818 ENSFCAG00000048190 JRKL (ENSFCAG00000007462) CCDC82 (ENSFCAG00000027555) MAML2 (ENSFCAG00000012287) MTMR2 (ENSFCAG00000030514) CEP57 (ENSFCAG00000025537) FAM76B (ENSFCAG00000026051) SESN3 (ENSFCAG00000005081) ##22 ENDOD1 (ENSFCAG00000005079) ENSFCAG00000043892 ENSFCAG00000045743 CWC15 (ENSFCAG00000007826) AMOTL1 (ENSFCAG00000010915) PIWIL4 (ENSFCAG00000010914) FUT4 (ENSFCAG00000029438) CD1H11orf97 (ENSFCAG00000036846) ANKRD49 (ENSFCAG00000042246) MRE11 (ENSFCAG00000025219) GPR83 (ENSFCAG00000010910) IZUMO1R (ENSFCAG00000003023) PANX1 (ENSFCAG00000004470) HEPHL1 (ENSFCAG00000014735) VSTM5 (ENSFCAG00000023848) Panthera ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000157590 ENSGT00950000182942.b.a.b ENSGT00950000182942.b.a.a ENSGT00950000182942.b.b ENSGT00940000157165 ENSGT00940000159713 ENSGT00940000155492.b ENSGT00940000158183 ENSGT00940000153446.b.d ENSGT00940000161513 ENSGT00390000004986 ENSGT00950000183201.a ENSGT00940000153669.a ENSGT00530000063695.a ENSGT00940000159074 ENSGT00950000183168.A ##22 ENSGT01030000234592.B ENSGT00940000162152.s ENSGT00390000012084.y.b ENSGT00940000160158 ENSGT00950000183200.A.a.a ENSGT00940000162506 ENSGT00520000058823 ENSGT00390000003919 ENSGT00390000017288 ENSGT00940000154336.d ENSGT00950000183144.A.j ENSGT00940000153972.A ENSGT00940000157994 ENSGT01100000263551.b.a.b ENSGT00390000011810 Tiger MODERN SPECIES 123 ENSPTIG00000006982 ENSPTIG00000006956 ENSPTIG00000006712 JRKL (ENSPTIG00000010065) CCDC82 (ENSPTIG00000006366) MAML2 (ENSPTIG00000005913) MTMR2 (ENSPTIG00000005248) CEP57 (ENSPTIG00000002807) FAM76B (ENSPTIG00000000581) SESN3 (ENSPTIG00000000066) ##22 ENDOD1 (ENSPTIG00000021253) KDM4D (ENSPTIG00000021192) ENSPTIG00000021149 AMOTL1 (ENSPTIG00000021027) PIWIL4 (ENSPTIG00000020931) C11orf97 (ENSPTIG00000020857) ANKRD49 (ENSPTIG00000020842) MRE11 (ENSPTIG00000020482) GPR83 (ENSPTIG00000020384) IZUMO1R (ENSPTIG00000020317) PANX1 (ENSPTIG00000020245) HEPHL1 (ENSPTIG00000020126) VSTM5 (ENSPTIG00000020099) MED17 (ENSPTIG00000019841) C11orf54 (ENSPTIG00000019745) Panthera_a ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00950000182942.b.a.b ENSGT00950000182942.b.a.a ENSGT00950000182942.b.b ENSGT00940000157165 ENSGT00940000159713 ENSGT00940000155492.b ENSGT00940000158183 ENSGT00940000153446.b.d ENSGT00390000003897.s.b.a.b.a.a ENSGT00940000161513 ENSGT00390000004986 ENSGT00950000183201.a ENSGT00940000153669.a ENSGT00530000063695.a ENSGT00940000159074 ENSGT00950000183168.A ##22 ENSGT01030000234592.B ENSGT00940000162152.s.a ENSGT00390000012084.y.a.a ENSGT00940000160158 ENSGT00950000183200.A.a.a ENSGT00940000162506 ENSGT00520000058823 ENSGT00390000003919 ENSGT00390000017288 ENSGT00940000154336.d ENSGT00950000183144.A.j ENSGT00940000153972.A ENSGT00940000157994 ENSGT01100000263551.b.a.b ENSGT00390000011810 leopard MODERN SPECIES 17 PGR (ENSPPRG00000017879) ARHGAP42 (ENSPPRG00000021497) CNTN5 (ENSPPRG00000023167) ENSPPRG00000022878 ENSPPRG00000014839 JRKL (ENSPPRG00000014847) CCDC82 (ENSPPRG00000000337) MAML2 (ENSPPRG00000000602) MTMR2 (ENSPPRG00000002100) CEP57 (ENSPPRG00000003241) FAM76B (ENSPPRG00000003510) SESN3 (ENSPPRG00000003990) ##22 ENSPPRG00000004139 ENSPPRG00000004151 ENSPPRG00000014900 ENSPPRG00000014906 ENSPPRG00000014918 ENSPPRG00000005063 AMOTL1 (ENSPPRG00000007186) PIWIL4 (ENSPPRG00000007432) FUT4 (ENSPPRG00000014970) C11orf97 (ENSPPRG00000007748) ANKRD49 (ENSPPRG00000008157) MRE11 (ENSPPRG00000010728) GPR83 (ENSPPRG00000011279) IZUMO1R (ENSPPRG00000011844) PANX1 (ENSPPRG00000012085) lion MODERN SPECIES 10 ENSPLOG00000014293 GLB1L3 (ENSPLOG00000014476) GLB1L2 (ENSPLOG00000014685) B3GAT1 (ENSPLOG00000014881) PGR (ENSPLOG00000014975) ARHGAP42 (ENSPLOG00000015316) CNTN5 (ENSPLOG00000015817) ENSPLOG00000016751 ENSPLOG00000016802 JRKL (ENSPLOG00000016824) CCDC82 (ENSPLOG00000016852) MAML2 (ENSPLOG00000016912) MTMR2 (ENSPLOG00000016998) CEP57 (ENSPLOG00000017062) FAM76B (ENSPLOG00000017383) SESN3 (ENSPLOG00000017658) ##22 ENDOD1 (ENSPLOG00000017790) KDM4D (ENSPLOG00000017815) ENSPLOG00000017871 AMOTL1 (ENSPLOG00000017940) PIWIL4 (ENSPLOG00000018141) FUT4 (ENSPLOG00000010997) C11orf97 (ENSPLOG00000011026) ANKRD49 (ENSPLOG00000011102) MRE11 (ENSPLOG00000011192) GPR83 (ENSPLOG00000011474) IZUMO1R (ENSPLOG00000011548) PANX1 (ENSPLOG00000011611) HEPHL1 (ENSPLOG00000011658) ENSPLOG00000011835 VSTM5 (ENSPLOG00000011932) Caniformia ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00390000013297 ENSGT00940000157590 ENSGT00950000182942.b.a.b ENSGT00950000182942.b.a.a ENSGT00950000182942.b.b ENSGT00940000157165 ENSGT00940000159713 ENSGT00940000155492.b ENSGT00940000158183 ENSGT00940000161513 ENSGT00390000004986 ENSGT00950000183201.a ENSGT00940000153669.a ENSGT00530000063695.a ENSGT00940000159074 ENSGT00950000183168.A ##22 ENSGT01030000234592.B ENSGT00940000162152 ENSGT00390000012084 ENSGT00940000160158 ENSGT00950000183200.A.a.a ENSGT00940000162506 ENSGT00520000058823.b ENSGT00910000147289 ENSGT00520000058823.a ENSGT00390000003919 ENSGT00390000017288 ENSGT00940000154336.d ENSGT00950000183144.A.j ENSGT00940000153972.A ENSGT00940000157994 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000013297 ENSGT00940000157590 ENSGT00950000182942.b.a.b ENSGT00950000182942.b.a.a ENSGT00950000182942.b.b ENSGT00940000157165 ENSGT00940000159713 ENSGT00940000155492.b ENSGT00940000158183 ENSGT00940000161513 ENSGT00390000004986 ENSGT00950000183201.a ENSGT00940000153669.a ENSGT00530000063695.a ENSGT00940000159074 ENSGT00950000183168.A ##22 ENSGT01030000234592.B ENSGT00940000162152 ENSGT00390000012084 ENSGT00940000160158 ENSGT00950000183200.A.a.a ENSGT00940000162506 ENSGT00520000058823.a ENSGT00390000003919 ENSGT00390000017288 ENSGT00940000154336.d ENSGT00950000183144.A.j ENSGT00940000153972.A ENSGT00940000157994 ENSGT01100000263551.b.a.b ENSGT00390000011810 Ursidae ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000013297 ENSGT00940000157590 ENSGT00950000182942.b.a.b ENSGT00950000182942.b.a.a ENSGT00950000182942.b.b ENSGT00940000157165 ENSGT00940000159713 ENSGT00940000155492.b ENSGT00940000158183 ENSGT00940000161513 ENSGT00390000004986 ENSGT00950000183201.a ENSGT00940000153669.a ENSGT00530000063695.a ENSGT00940000159074 ENSGT00950000183168.A ##22 ENSGT01030000234592.B ENSGT00940000162152.u ENSGT00390000012084 ENSGT00940000160158 ENSGT00950000183200.A.a.a ENSGT00940000162506 ENSGT00520000058823.a ENSGT00390000003919 ENSGT00390000017288 ENSGT00940000154336.d ENSGT00950000183144.A.j ENSGT00940000153972.A ENSGT00940000157994 ENSGT01100000263551.b.a.b ENSGT00390000011810 Ursus ANCESTRAL SPECIES 157 ENSGT00940000159713 ENSGT00940000155492.b ENSGT00940000158183 ENSGT00940000161513 ENSGT00390000004986 ENSGT00950000183201.a ENSGT00940000153669.a ENSGT00530000063695.a ENSGT00940000159074 ENSGT00950000183168.A ##22 ENSGT01030000234592.B ENSGT00940000162152.u.b ENSGT00940000162152.u.a.a ENSGT00390000012084 ENSGT00940000160158 ENSGT00950000183200.A.a.a ENSGT00940000162506 ENSGT00390000003919 ENSGT00390000017288 ENSGT00940000154336.d ENSGT00950000183144.A.j ENSGT00940000153972.A ENSGT00940000157994 ENSGT01100000263551.b.a.b ENSGT00390000011810 Polar bear MODERN SPECIES 149 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(ENSNVIG00000005971) MTMR2 (ENSNVIG00000005888) CEP57 (ENSNVIG00000005774) FAM76B (ENSNVIG00000005739) SESN3 (ENSNVIG00000005698) ##22 ENDOD1 (ENSNVIG00000005691) ENSNVIG00000005674 ENSNVIG00000005671 CWC15 (ENSNVIG00000005664) AMOTL1 (ENSNVIG00000005602) PIWIL4 (ENSNVIG00000005560) FUT4 (ENSNVIG00000005553) C11orf97 (ENSNVIG00000005537) ANKRD49 (ENSNVIG00000005521) MRE11 (ENSNVIG00000005415) GPR83 (ENSNVIG00000005397) FOLR4 (ENSNVIG00000005363) PANX1 (ENSNVIG00000005347) HEPHL1 (ENSNVIG00000005290) VSTM5 (ENSNVIG00000005272) Canidae ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000159713 ENSGT00940000155492.b ENSGT00940000158183 ENSGT00940000161513 ENSGT00390000004986 ENSGT00950000183201.a ENSGT00940000153669.a ENSGT00530000063695.a ENSGT00940000159074 ENSGT00950000183168.A ##22 ENSGT01030000234592.B ENSGT00940000162152 ENSGT00390000012084 ENSGT00940000160158 ENSGT00950000183200.A.a.a ENSGT00940000162506 ENSGT00520000058823.b ENSGT00910000147289 ENSGT00390000003919 ENSGT00390000017288 ENSGT00940000154336.d ENSGT00950000183144.A.j ENSGT00940000153972.A ENSGT00940000157994 ENSGT01100000263551.b.a.b Red fox MODERN SPECIES 12 ENSVVUG00000012771 ENSVVUG00000012768 ARHGAP42 (ENSVVUG00000011940) ENSVVUG00000011935 CNTN5 (ENSVVUG00000011837) ENSVVUG00000011800 JRKL (ENSVVUG00000011782) CCDC82 (ENSVVUG00000011778) ENSVVUG00000011776 ENSVVUG00000011774 ENSVVUG00000011770 MTMR2 (ENSVVUG00000011747) ENSVVUG00000011726 FAM76B (ENSVVUG00000011705) SESN3 (ENSVVUG00000011684) ##22 ENDOD1 (ENSVVUG00000011659) KDM4D (ENSVVUG00000011656) ENSVVUG00000011648 ENSVVUG00000011644 AMOTL1 (ENSVVUG00000011602) PIWIL4 (ENSVVUG00000011577) FUT4 (ENSVVUG00000011573) ENSVVUG00000011567 ENSVVUG00000011564 ANKRD49 (ENSVVUG00000011561) MRE11 (ENSVVUG00000011537) GPR83 (ENSVVUG00000011530) ENSVVUG00000011513 PANX1 (ENSVVUG00000011503) HEPHL1 (ENSVVUG00000011481) Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000159713 ENSGT00940000155492.b ENSGT00390000003477.n ENSGT00940000158183 ENSGT00940000161257.f ENSGT01100000265450 ENSGT00940000154900.cb.b ENSGT00940000161513 ENSGT00390000004986 ENSGT00950000183201.a ENSGT00940000153669.a ENSGT00530000063695.a ENSGT00940000159074 ENSGT00940000162213.a.a.c.a.a ENSGT00950000183168.A ##22 ENSGT01030000234592.B ENSGT00940000162152.z ENSGT00940000162152.y ENSGT00390000012084 ENSGT00940000160158 ENSGT00950000183200.A.a.a ENSGT00940000162506 ENSGT00520000058823.b ENSGT00910000147289 ENSGT00390000003919 ENSGT00390000017288 ENSGT00940000154336.d ENSGT00950000183144.A.j ENSGT00940000153972.A ENSGT00940000157994 Dog MODERN SPECIES 13 PGR (ENSCAFG00845015739) ENSCAFG00845015949 ENSCAFG00845016310 ENSCAFG00845016498 ENSCAFG00845016836 ENSCAFG00845017020 ENSCAFG00845017193 JRKL (ENSCAFG00845017252) CCDC82 (ENSCAFG00845017278) MAML2 (ENSCAFG00845017403) MTMR2 (ENSCAFG00845017531) CEP57 (ENSCAFG00845017787) FAM76B (ENSCAFG00845018160) ENSCAFG00845018846 SESN3 (ENSCAFG00845018942) ##22 ENDOD1 (ENSCAFG00845019180) ENSCAFG00845019240 ENSCAFG00845019286 CWC15 (ENSCAFG00845019309) AMOTL1 (ENSCAFG00845019406) PIWIL4 (ENSCAFG00845019963) FUT4 (ENSCAFG00845020086) ENSCAFG00845020114 ENSCAFG00845020169 ANKRD49 (ENSCAFG00845020201) MRE11 (ENSCAFG00845020248) GPR83 (ENSCAFG00845020430) IZUMO1R (ENSCAFG00845020509) PANX1 (ENSCAFG00845020558) HEPHL1 (ENSCAFG00845020630) Dingo DUPLICATION Dingo MODERN SPECIES 245 ENSCAFG00020016048 JRKL (ENSCAFG00020016050) CCDC82 (ENSCAFG00020016052) ENSCAFG00020016054 MAML2 (ENSCAFG00020016057) MTMR2 (ENSCAFG00020016062) CEP57 (ENSCAFG00020016478) FAM76B (ENSCAFG00020016484) ENSCAFG00020016489 ENSCAFG00020016496 ##22 ENSCAFG00020016504 ENSCAFG00020016506 ENSCAFG00020016510 ENSCAFG00020016513 CWC15 (ENSCAFG00020016515) AMOTL1 (ENSCAFG00020016518) PIWIL4 (ENSCAFG00020016521) FUT4 (ENSCAFG00020016526) ANKRD49 (ENSCAFG00020016528) ENSCAFG00020016530 MRE11 (ENSCAFG00020016532) GPR83 (ENSCAFG00020016538) IZUMO1R (ENSCAFG00020016546) PANX1 (ENSCAFG00020016561) HEPHL1 (ENSCAFG00020016564) Dingo MODERN SPECIES 97 ENSCAFG00020005563 ##22 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000154175.i.a ENSGT00510000046760.a ENSGT00510000047559 ENSGT00390000013786 ENSGT00940000161966 ENSGT01060000248588.a.d.a ENSGT00940000159713 ENSGT00940000155492.b ENSGT00940000158183 ENSGT00940000161513 ENSGT00390000004986 ENSGT00950000183201.a ENSGT00940000153669.a ENSGT00530000063695.a ENSGT00940000159074 ENSGT00950000183168.A ##22 ENSGT01030000234592.B ENSGT00940000162152 ENSGT00390000012084 ENSGT00940000160158 ENSGT00950000183200.A.a.a ENSGT00940000162506 ENSGT00520000058823 ENSGT00390000003919 ENSGT00390000017288 ENSGT00940000154336.d ENSGT00950000183144.A.j ENSGT00940000153972.A ENSGT00940000157994 ENSGT01100000263551.b.a.b ENSGT00390000011810 Suina ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00510000046760.a ENSGT00510000047559 ENSGT00390000013786 ENSGT00940000161966 ENSGT01070000257273 ENSGT01060000248588.a.d.a ENSGT00940000159713 ENSGT00940000155492.b ENSGT00940000158183 ENSGT00940000161513 ENSGT00390000004986 ENSGT00950000183201.a ENSGT00940000153669.a ENSGT00530000063695.a ENSGT00940000159074 ENSGT00950000183168.A ##22 ENSGT01030000234592.B ENSGT00940000162152 ENSGT00390000012084 ENSGT00940000160158 ENSGT00950000183200.A.a.a ENSGT00940000162506 ENSGT00520000058823 ENSGT00390000003919 ENSGT00390000017288 ENSGT00940000154336.d ENSGT00950000183144.A.j ENSGT00940000153972.A ENSGT00940000157994 ENSGT01100000263551.b.a.b ENSGT00390000011810 Chacoan peccary MODERN SPECIES 30 JRKL (ENSCWAG00000001572) CCDC82 (ENSCWAG00000001593) MAML2 (ENSCWAG00000001702) MTMR2 (ENSCWAG00000001726) CEP57 (ENSCWAG00000001747) FAM76B (ENSCWAG00000001765) SESN3 (ENSCWAG00000001788) ##22 ENDOD1 (ENSCWAG00000001818) KDM4D (ENSCWAG00000001831) ENSCWAG00000001839 CWC15 (ENSCWAG00000001851) AMOTL1 (ENSCWAG00000001874) PIWIL4 (ENSCWAG00000001925) ENSCWAG00000001987 ENSCWAG00000001993 ANKRD49 (ENSCWAG00000002004) MRE11 (ENSCWAG00000002025) NACA2 (ENSCWAG00000002065) GPR83 (ENSCWAG00000002075) IZUMO1R (ENSCWAG00000002109) PANX1 (ENSCWAG00000002126) HEPHL1 (ENSCWAG00000002145) Pig MODERN SPECIES 17 TRPC6 (ENSSSCG00000024022) PGR (ENSSSCG00000014977) ARHGAP42 (ENSSSCG00000014976) CNTN5 (ENSSSCG00000014975) ENSSSCG00000054749 ENSSSCG00000055851 JRKL (ENSSSCG00000034924) CCDC82 (ENSSSCG00000014972) ENSSSCG00000042256 MAML2 (ENSSSCG00000034879) ENSSSCG00000056982 MTMR2 (ENSSSCG00000014970) ENSSSCG00000014969 FAM76B (ENSSSCG00000014967) ENSSSCG00000041491 SESN3 (ENSSSCG00000037015) ##22 ENDOD1 (ENSSSCG00000014965) ENSSSCG00000054911 ENSSSCG00000057445 ENSSSCG00000057084 ENSSSCG00000036400 ENSSSCG00000034794 ENSSSCG00000031376 CWC15 (ENSSSCG00000014961) AMOTL1 (ENSSSCG00000014960) PIWIL4 (ENSSSCG00000014959) ENSSSCG00000062029 C11orf97 (ENSSSCG00000014957) ANKRD49 (ENSSSCG00000014956) MRE11 (ENSSSCG00000014955) GPR83 (ENSSSCG00000022490) Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000154175.i.a ENSGT00510000046760.a ENSGT00510000047559 ENSGT00390000013786 ENSGT00940000161966 ENSGT01060000248588.a.d.a ENSGT00940000159713 ENSGT00940000155492.b ENSGT00940000158183 ENSGT00940000161513 ENSGT00390000004986 ENSGT00950000183201.a ENSGT00940000153669.a ENSGT00530000063695.a ENSGT00940000159074 ENSGT00950000183168.A ##22 ENSGT01030000234592.B ENSGT00940000162152 ENSGT00390000012084 ENSGT00940000160158 ENSGT00950000183200.A.a.a ENSGT00940000162506 ENSGT00520000058823 ENSGT00390000003919 ENSGT00390000017288 ENSGT00940000154336.d ENSGT00950000183144.A.j ENSGT00940000153972.A ENSGT00940000157994 ENSGT01100000263551.b.a.b ENSGT00390000011810 Camelidae ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00940000154175.i.a ENSGT00510000046760.a ENSGT00510000047559 ENSGT00390000013786 ENSGT00940000161966 ENSGT01060000248588.a.d.a ENSGT00940000159713 ENSGT00940000155492.b ENSGT00940000158183 ENSGT00940000161513 ENSGT00390000004986 ENSGT00950000183201.a ENSGT00940000153669.a ENSGT00530000063695.a ENSGT00940000159074 ENSGT00950000183168.A ##22 ENSGT01030000234592.B ENSGT00940000162152 ENSGT00390000012084 ENSGT00940000160158 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PIWIL4 (ENSCDRG00005015533) FUT4 (ENSCDRG00005015443) C11orf97 (ENSCDRG00005015394) ANKRD49 (ENSCDRG00005015366) MRE11 (ENSCDRG00005014968) GPR83 (ENSCDRG00005014899) IZUMO1R (ENSCDRG00005014865) PANX1 (ENSCDRG00005014832) HEPHL1 (ENSCDRG00005014678) ENSCDRG00005014573 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000154175.i.a ENSGT00510000046760.a ENSGT00510000047559 ENSGT00390000013786 ENSGT00940000161966 ENSGT01060000248588.a.d.a ENSGT00940000159713 ENSGT00940000155492.b ENSGT00940000158183 ENSGT00940000161513 ENSGT00390000004986 ENSGT00950000183201.a ENSGT00940000153669.a ENSGT00530000063695.a ENSGT00940000159074 ENSGT00950000183168.A ##22 ENSGT01030000234592.B ENSGT00940000162152 ENSGT00390000012084 ENSGT00940000160158 ENSGT00950000183200.A.a.a ENSGT00940000162506 ENSGT00520000058823 ENSGT00390000003919 ENSGT00390000017288 ENSGT00940000154336.d ENSGT00950000183144.A.j ENSGT00940000153972.A ENSGT00940000157994 ENSGT01100000263551.b.a.b ENSGT00390000011810 Cetacea ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000154175.i.a ENSGT00510000046760.a ENSGT00510000047559 ENSGT00390000013786 ENSGT00940000161966 ENSGT01060000248588.a.d.a ENSGT00940000159713 ENSGT00940000155492.b ENSGT00940000158183 ENSGT00940000161513 ENSGT00390000004986 ENSGT00950000183201.a ENSGT00940000153669.a ENSGT00530000063695.a ENSGT00940000159074 ENSGT00950000183168.A ##22 ENSGT01030000234592.B ENSGT00940000162152.n.a ENSGT00390000012084 ENSGT00940000160158 ENSGT00950000183200.A.a.a ENSGT00940000162506 ENSGT00520000058823 ENSGT00390000003919 ENSGT00390000017288 ENSGT00940000154336.d ENSGT00950000183144.A.j ENSGT00940000153972.A ENSGT00940000157994 ENSGT01100000263551.b.a.b ENSGT00390000011810 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000154175.i.a ENSGT00510000046760.a ENSGT00510000047559 ENSGT00390000013786 ENSGT00940000161966 ENSGT01060000248588.a.d.a ENSGT00940000159713 ENSGT00940000155492.b ENSGT00940000158183 ENSGT00940000161513 ENSGT00390000004986 ENSGT00950000183201.a ENSGT00940000153669.a 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ENSGT00940000154175.i.a ENSGT00510000046760.a ENSGT00510000047559 ENSGT00390000013786 ENSGT00940000161966 ENSGT01060000248588.a.d.a ENSGT00940000159713 ENSGT00940000155492.b ENSGT00940000158183 ENSGT00940000161513 ENSGT00390000004986 ENSGT00950000183201.a ENSGT00940000153669.a ENSGT00530000063695.a ENSGT00940000159074 ENSGT00950000183168.A ##22 ENSGT01030000234592.B ENSGT00940000162152.n.a.b ENSGT00390000012084.w ENSGT00940000160158 ENSGT00950000183200.A.a.a ENSGT00940000162506 ENSGT00390000003919 ENSGT00390000017288 ENSGT00940000154336.d ENSGT00950000183144.A.j ENSGT00940000153972.A ENSGT00940000157994 ENSGT00940000153309.d.g ENSGT01100000263551.b.a.b ENSGT00390000011810 Monodontidae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000154175.i.a ENSGT00510000046760.a ENSGT00510000047559 ENSGT00390000013786 ENSGT00940000161966 ENSGT01060000248588.a.d.a ENSGT00940000159713 ENSGT00940000155492.b ENSGT00940000158183 ENSGT00940000161513 ENSGT00390000004986 ENSGT00950000183201.a ENSGT00940000153669.a 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(ENSTTRG00000012998) Blue whale MODERN SPECIES 19 CFAP300 (ENSBMSG00010007148) CEP126 (ENSBMSG00010007195) ANGPTL5 (ENSBMSG00010007219) TRPC6 (ENSBMSG00010007259) PGR (ENSBMSG00010007436) ARHGAP42 (ENSBMSG00010007547) CNTN5 (ENSBMSG00010007654) ENSBMSG00010007759 ENSBMSG00010007767 JRKL (ENSBMSG00010007778) CCDC82 (ENSBMSG00010007784) MAML2 (ENSBMSG00010007807) MTMR2 (ENSBMSG00010007830) CEP57 (ENSBMSG00010007898) FAM76B (ENSBMSG00010007931) SESN3 (ENSBMSG00010007953) ##22 ENDOD1 (ENSBMSG00010007966) ENSBMSG00010007972 ENSBMSG00010007975 ENSBMSG00010007984 ENSBMSG00010007988 CWC15 (ENSBMSG00010007991) AMOTL1 (ENSBMSG00010007997) ENSBMSG00010008011 ENSBMSG00010008013 ENSBMSG00010008018 C11orf97 (ENSBMSG00010008028) ENSBMSG00010008035 ANKRD49 (ENSBMSG00010008053) MRE11 (ENSBMSG00010008081) GPR83 (ENSBMSG00010008125) Pecora ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000154175.i.a ENSGT00510000046760.a ENSGT00510000047559 ENSGT00390000013786 ENSGT00940000161966 ENSGT01060000248588.a.d.a 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(ENSCHYG00000002117) ENSCHYG00000002131 CWC15 (ENSCHYG00000002143) AMOTL1 (ENSCHYG00000002196) PIWIL4 (ENSCHYG00000002347) FUT4 (ENSCHYG00000002405) C11orf97 (ENSCHYG00000002417) CWF19L2 (ENSCHYG00000002441) ENSCHYG00000002475 ##19 GUCY1A2 (ENSCHYG00000002488) ENSCHYG00000002498 ENSCHYG00000002507 ALKBH8 (ENSCHYG00000002526) ELMOD1 (ENSCHYG00000002579) Percora_a ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000154175.i.a ENSGT00510000046760.a ENSGT00510000047559 ENSGT00390000013786 ENSGT00940000161966 ENSGT01060000248588.a.d.a ENSGT00940000159713 ENSGT00940000155492.b ENSGT00940000158183 ENSGT00940000161513 ENSGT00390000004986 ENSGT00950000183201.a ENSGT00940000153669.a ENSGT00530000063695.a ENSGT00940000159074 ENSGT00950000183168.A ##22 ENSGT01030000234592.B ENSGT00940000162152.k ENSGT00940000162152.l ENSGT00390000012084 ENSGT00940000160158 ENSGT00950000183200.A.a.a ENSGT00940000162506 ENSGT00520000058823 ENSGT00940000155627 ENSGT00940000157765 ENSGT00940000158563 ENSGT00940000168471 ENSGT00940000159782 ENSGT01040000240879 ENSGT00390000015655.a Bovidae ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000154175.i.a ENSGT00510000046760.a ENSGT00510000047559 ENSGT00390000013786 ENSGT00940000161966 ENSGT01060000248588.a.d.a ENSGT00940000159713 ENSGT00940000155492.b ENSGT00940000158183 ENSGT00940000161513 ENSGT00390000004986 ENSGT00950000183201.a ENSGT00940000153669.a ENSGT00530000063695.a ENSGT00940000159074 ENSGT00950000183168.A ##22 ENSGT01030000234592.B ENSGT00940000162152.k ENSGT00940000162152.l ENSGT00390000012084 ENSGT00940000160158 ENSGT00950000183200.A.a.a ENSGT00940000162506 ENSGT00520000058823 ENSGT00940000155627 ENSGT00940000157765 ENSGT00940000158563 ENSGT00940000168471 ENSGT00940000159782 ENSGT01040000240879 ENSGT00390000015655.a Caprinae ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00510000046760.a ENSGT00510000047559 ENSGT00390000013786 ENSGT00940000161966 ENSGT01060000248588.a.d.a ENSGT00940000159713 ENSGT00940000155492.b ENSGT00940000158183 ENSGT00940000153525.g.b.a.l ENSGT00940000161513 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SLC35F2 (ENSOARG00020010531) RAB39A (ENSOARG00020010714) Bovinae ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00510000047559 ENSGT00390000013786 ENSGT00940000161966 ENSGT01060000248588.a.d.a ENSGT00940000159713 ENSGT00940000155492.b ENSGT00390000003682.gb.a.d.a.b.a ENSGT00940000158183 ENSGT00940000161513 ENSGT00390000004986 ENSGT00950000183201.a ENSGT00940000153669.a ENSGT00530000063695.a ENSGT00940000159074 ENSGT00940000153117.B.c.b ENSGT00950000183168.A ##22 ENSGT01030000234592.B ENSGT00940000162152.k ENSGT00940000162152.l ENSGT00390000012084 ENSGT00940000160158 ENSGT00950000183200.A.a.a ENSGT00940000162506 ENSGT00520000058823 ENSGT00940000155627 ENSGT00940000157765 ENSGT00940000158563 ENSGT00940000168471 ENSGT00940000159782 ENSGT01040000240879 ENSGT00390000015655.a.g Bos ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00510000047559 ENSGT00390000013786 ENSGT00940000161966 ENSGT01060000248588.a.d.a ENSGT00940000159713 ENSGT00940000155492.b ENSGT00390000003682.gb.a.d.a.b.a ENSGT00940000158183 ENSGT00940000161513 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deer MODERN SPECIES 1172 CEP126 (ENSMMSG00000019297) ANGPTL5 (ENSMMSG00000019261) TRPC6 (ENSMMSG00000019068) PGR (ENSMMSG00000018992) ARHGAP42 (ENSMMSG00000018863) ENSMMSG00000018817 CNTN5 (ENSMMSG00000018181) ENSMMSG00000018121 JRKL (ENSMMSG00000018096) CCDC82 (ENSMMSG00000018018) ENSMMSG00000017987 MAML2 (ENSMMSG00000017946) MTMR2 (ENSMMSG00000017890) CEP57 (ENSMMSG00000017678) FAM76B (ENSMMSG00000017563) SESN3 (ENSMMSG00000017468) ##22 ENDOD1 (ENSMMSG00000017446) ENSMMSG00000017424 CWC15 (ENSMMSG00000017389) AMOTL1 (ENSMMSG00000017300) PIWIL4 (ENSMMSG00000017182) ENSMMSG00000017150 FUT4 (ENSMMSG00000017132) C11orf97 (ENSMMSG00000017113) CWF19L2 (ENSMMSG00000017060) ENSMMSG00000017036 ENSMMSG00000017016 GUCY1A2 (ENSMMSG00000016979) ENSMMSG00000016918 ELMOD1 (ENSMMSG00000016725) ENSMMSG00000016634 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 40 ENSGT00940000154175.i.a ENSGT00510000046760.a ENSGT00510000047559 ENSGT00390000013786 ENSGT00940000161966 ENSGT01060000248588.a.d.a ENSGT00940000159713 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(ENSDNOG00000003211) ##22 Platypus MODERN SPECIES 12 ENSOANG00000010486 YAP1 (ENSOANG00000010488) CFAP300 (ENSOANG00000010489) ENSOANG00000010490 ANGPTL5 (ENSOANG00000010491) TRPC6 (ENSOANG00000010492) ENSOANG00000010494 ARHGAP42 (ENSOANG00000010495) CNTN5 (ENSOANG00000010496) ENSOANG00000010497 ENSOANG00000043963 MAML2 (ENSOANG00000010498) MTMR2 (ENSOANG00000010499) CEP57 (ENSOANG00000040575) FAM76B (ENSOANG00000045559) SESN3 (ENSOANG00000010503) ##22 ENSOANG00000010505 ENSOANG00000010405 ENSOANG00000010404 AMOTL1 (ENSOANG00000010403) ENSOANG00000038002 ENSOANG00000029843 ANKRD49 (ENSOANG00000010402) MRE11 (ENSOANG00000010399) GPR83 (ENSOANG00000040634) PANX1 (ENSOANG00000011723) HEPHL1 (ENSOANG00000011719) VSTM5 (ENSOANG00000045898) MED17 (ENSOANG00000011716) C11orf54 (ENSOANG00000011715) ENSOANG00000011713 Ecdysozoa ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183168.A ##22 Caenorhabditis elegans MODERN SPECIES F53G12.8 (WBGene00018773) F53G12.9 (WBGene00018774) rpl-7 (WBGene00004418) rab-11.1 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