Hominoidea	DUPLICATION
Hominoidea	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00650000095054	ENSGT00940000156955 #8	ENSGT00950000183145.E #9	ENSGT00390000012112 #10	ENSGT00390000005511 #11	ENSGT00940000154525.b.a #12	ENSGT00940000163005.d #13	ENSGT00390000017384.h #14	ENSGT00940000163005.c #15	ENSGT00390000017384.g #16	ENSGT00390000017554 #17	ENSGT00940000155035 #18	ENSGT00940000156525 #19	ENSGT00940000158286 #20	ENSGT00940000160392 #21	ENSGT00950000183091.A.a.g #22	ENSGT00950000183001.a.a #23	ENSGT00910000147603	ENSGT00940000156414 #24	ENSGT00390000004719 #25	ENSGT00630000089895.w #26	ENSGT00940000162535 #27	ENSGT00940000159002 #28	ENSGT00530000063371.B #29	ENSGT00390000013399 #30	ENSGT00530000063424.a #31	ENSGT00940000158045 #32	ENSGT00940000154430.f #33	ENSGT00500000045038.y.a.a	ENSGT00390000012491 #34	ENSGT00950000182987.c.a.a.db.b
Hominidae	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00650000095054	ENSGT00940000156955 #8	ENSGT00950000183145.E #9	ENSGT00390000012112 #10	ENSGT00390000005511 #11	ENSGT00940000154525.b.a #12	ENSGT00940000163005.d #13	ENSGT00390000017384.h #14	ENSGT00940000163005.c #15	ENSGT00390000017384.g #16	ENSGT00390000017554 #17	ENSGT00940000155035 #18	ENSGT00940000156525 #19	ENSGT00940000158286 #20	ENSGT00940000160392 #21	ENSGT00950000183091.A.a.g #22	ENSGT00950000183001.a.a #23	ENSGT00910000147603	ENSGT00940000156414 #24	ENSGT00390000004719 #25	ENSGT00630000089895.w #26	ENSGT00940000162535 #27	ENSGT00940000159002 #28	ENSGT00530000063371.B #29	ENSGT00390000013399 #30	ENSGT00530000063424.a #31	ENSGT00940000158045 #32	ENSGT00940000154430.f #33	ENSGT00500000045038.y.a.a	ENSGT00390000012491 #34	ENSGT00950000182987.c.a.a.db.b
Orangutan	MODERN SPECIES	1	PLEKHA1 (ENSPPYG00000002715) #7	HTRA1 (ENSPPYG00000002716) #8	ENSPPYG00000002717 #9	SPADH (ENSPPYG00000002718) #10	C10orf120 (ENSPPYG00000002719) #11	CUZD1 (ENSPPYG00000002722) #12	ENSPPYG00000030182 #13	ENSPPYG00000037859 #14	FAM24A (ENSPPYG00000002724) #15	C10orf88 (ENSPPYG00000002725) #16	PSTK (ENSPPYG00000002726) #17	IKZF5 (ENSPPYG00000038620) #18	ACADSB (ENSPPYG00000002728) #19	HMX3 (ENSPPYG00000002729) #20	HMX2 (ENSPPYG00000033793) #21	BUB3 (ENSPPYG00000002731) #22	GPR26 (ENSPPYG00000002734) #23	CPXM2 (ENSPPYG00000002735) #24	CHST15 (ENSPPYG00000002736) #25	OAT (ENSPPYG00000002737) #26	NKX1-2 (ENSPPYG00000039436) #27	LHPP (ENSPPYG00000002740) #28	FAM53B (ENSPPYG00000002741) #29	EEF1AKMT2 (ENSPPYG00000002742) #30	ABRAXAS2 (ENSPPYG00000033191) #31	ZRANB1 (ENSPPYG00000002745) #32	CTBP2 (ENSPPYG00000002746) #33	TEX36 (ENSPPYG00000002747) #34	ENSPPYG00000035256 #35	EDRF1 (ENSPPYG00000002749) #36	MMP21 (ENSPPYG00000002750) #37
Homo/Pan/Gorilla group	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00650000095054	ENSGT00940000156955 #8	ENSGT00950000183145.E #9	ENSGT00390000012112 #10	ENSGT00390000005511 #11	ENSGT00940000154525.b.a #12	ENSGT00940000163005.d #13	ENSGT00390000017384.h #14	ENSGT00940000163005.c #15	ENSGT00390000017384.g #16	ENSGT00390000017554 #17	ENSGT00940000155035 #18	ENSGT00940000156525 #19	ENSGT00940000158286 #20	ENSGT00940000160392 #21	ENSGT00950000183091.A.a.g #22	ENSGT00950000183001.a.a #23	ENSGT00910000147603	ENSGT00940000156414 #24	ENSGT00390000004719 #25	ENSGT00630000089895.w #26	ENSGT00940000162535 #27	ENSGT00940000159002 #28	ENSGT00530000063371.B #29	ENSGT00390000013399 #30	ENSGT00530000063424.a #31	ENSGT00940000158045 #32	ENSGT00940000154430.f #33	ENSGT00500000045038.y.a.a	ENSGT00390000012491 #34	ENSGT00950000182987.c.a.a.db.b
Gorilla	MODERN SPECIES	1	BTBD16 (ENSGGOG00000004960)	PLEKHA1 (ENSGGOG00000005120) #7	ARMS2 (ENSGGOG00000037501)	HTRA1 (ENSGGOG00000004853) #8	C10orf120 (ENSGGOG00000026034) #11	CUZD1 (ENSGGOG00000007184) #12	FAM24B (ENSGGOG00000007190) #13	ENSGGOG00000006191 #14	FAM24A (ENSGGOG00000007194) #15	C10orf88 (ENSGGOG00000007191) #16	PSTK (ENSGGOG00000003866) #17	IKZF5 (ENSGGOG00000003823) #18	ACADSB (ENSGGOG00000003827) #19	HMX3 (ENSGGOG00000023271) #20	HMX2 (ENSGGOG00000039592) #21	BUB3 (ENSGGOG00000023971) #22	ENSGGOG00000037837 #23	ENSGGOG00000038946	CPXM2 (ENSGGOG00000007111) #24	CHST15 (ENSGGOG00000009734) #25	OAT (ENSGGOG00000000848) #26	NKX1-2 (ENSGGOG00000042370) #27	ENSGGOG00000009416 #28	FAM53B (ENSGGOG00000001653) #29	EEF1AKMT2 (ENSGGOG00000024976) #30	ABRAXAS2 (ENSGGOG00000014025) #31	ZRANB1 (ENSGGOG00000016848) #32	ENSGGOG00000036916 ##33	CTBP2 (ENSGGOG00000007304) #33	TEX36 (ENSGGOG00000007492) #34	ENSGGOG00000038821
Homo/Pan group	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00650000095054	ENSGT00940000156955 #8	ENSGT00950000183145.E #9	ENSGT00390000012112 #10	ENSGT00390000005511 #11	ENSGT00940000154525.b.a #12	ENSGT00940000163005.d #13	ENSGT00390000017384.h #14	ENSGT00940000163005.c #15	ENSGT00390000017384.g #16	ENSGT00390000017554 #17	ENSGT00940000155035 #18	ENSGT00940000156525 #19	ENSGT00940000158286 #20	ENSGT00940000160392 #21	ENSGT00950000183091.A.a.g #22	ENSGT00950000183001.a.a #23	ENSGT00910000147603	ENSGT00940000156414 #24	ENSGT00390000004719 #25	ENSGT00630000089895.w #26	ENSGT00940000162535 #27	ENSGT00940000159002 #28	ENSGT00530000063371.B #29	ENSGT00390000013399 #30	ENSGT00530000063424.a #31	ENSGT00940000158045 #32	ENSGT00940000154430.f #33	ENSGT00500000045038.y.a.a	ENSGT00390000012491 #34	ENSGT00950000182987.c.a.a.db.b
Human	MODERN SPECIES	1	PLEKHA1 (ENSG00000107679) #7	ARMS2 (ENSG00000254636)	HTRA1 (ENSG00000166033) #8	DMBT1 (ENSG00000187908) #9	SPADH (ENSG00000286135) #10	C10orf120 (ENSG00000183559) #11	CUZD1 (ENSG00000138161) #12	FAM24B (ENSG00000213185) #13	FAM24A (ENSG00000203795) #15	C10orf88 (ENSG00000119965) #16	PSTK (ENSG00000179988) #17	IKZF5 (ENSG00000095574) #18	ACADSB (ENSG00000196177) #19	HMX3 (ENSG00000188620) #20	HMX2 (ENSG00000188816) #21	BUB3 (ENSG00000154473) #22	GPR26 (ENSG00000154478) #23	CPXM2 (ENSG00000121898) #24	CHST15 (ENSG00000182022) #25	OAT (ENSG00000065154) #26	NKX1-2 (ENSG00000229544) #27	LHPP (ENSG00000107902) #28	FAM53B (ENSG00000189319) #29	EEF1AKMT2 (ENSG00000203791) #30	ABRAXAS2 (ENSG00000165660) #31	ZRANB1 (ENSG00000019995) #32	CTBP2 (ENSG00000175029) #33	TEX36 (ENSG00000175018) #34	EDRF1 (ENSG00000107938) #36	MMP21 (ENSG00000154485) #37	UROS (ENSG00000188690)
Pan	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000155157 #7	ENSGT00650000095054	ENSGT00940000156955 #8	ENSGT00950000183145.E #9	ENSGT00390000005511 #11	ENSGT00940000154525.b.a #12	ENSGT00940000163005.d #13	ENSGT00390000017384.h #14	ENSGT00940000163005.c #15	ENSGT00390000017384.g #16	ENSGT00390000017554 #17	ENSGT00940000155035 #18	ENSGT00940000156525 #19	ENSGT00940000158286 #20	ENSGT00940000160392 #21	ENSGT00950000183091.A.a.g #22	ENSGT00950000183001.a.a #23	ENSGT00910000147603	ENSGT00940000156414 #24	ENSGT00390000004719 #25	ENSGT00630000089895.w #26	ENSGT00940000162535 #27	ENSGT00940000159002 #28	ENSGT00530000063371.B #29	ENSGT00390000013399 #30	ENSGT00530000063424.a #31	ENSGT00940000158045 #32	ENSGT00940000154430.f #33	ENSGT00500000045038.y.a.a	ENSGT00390000012491 #34	ENSGT00950000182987.c.a.a.db.b
Bonobo	MODERN SPECIES	1	PLEKHA1 (ENSPPAG00000003709) #7	ARMS2 (ENSPPAG00000041770)	HTRA1 (ENSPPAG00000000055) #8	DMBT1 (ENSPPAG00000029246) #9	C10orf120 (ENSPPAG00000027128) #11	CUZD1 (ENSPPAG00000038806) #12	FAM24B (ENSPPAG00000030186) #13	ENSPPAG00000026413 #14	FAM24A (ENSPPAG00000029503) #15	C10orf88 (ENSPPAG00000040286) #16	PSTK (ENSPPAG00000030978) #17	IKZF5 (ENSPPAG00000032125) #18	ACADSB (ENSPPAG00000036912) #19	HMX3 (ENSPPAG00000043159) #20	ENSPPAG00000043570 #21	BUB3 (ENSPPAG00000030058) #22	ENSPPAG00000040773 #23	ENSPPAG00000024928	CPXM2 (ENSPPAG00000037917) #24	CHST15 (ENSPPAG00000037921) #25	OAT (ENSPPAG00000034558) #26	ENSPPAG00000037855 #27	LHPP (ENSPPAG00000041898) #28	FAM53B (ENSPPAG00000027228) #29	EEF1AKMT2 (ENSPPAG00000034943) #30	ABRAXAS2 (ENSPPAG00000031972) #31	ZRANB1 (ENSPPAG00000036455) #32	CTBP2 (ENSPPAG00000032942) #33	TEX36 (ENSPPAG00000034284) #34	EDRF1 (ENSPPAG00000028277) #36	MMP21 (ENSPPAG00000043548) #37
Chimpanzee	MODERN SPECIES	1	PLEKHA1 (ENSPTRG00000003010) #7	ARMS2 (ENSPTRG00000051999)	HTRA1 (ENSPTRG00000003011) #8	DMBT1 (ENSPTRG00000022758) #9	C10H10orf120 (ENSPTRG00000003012) #11	CUZD1 (ENSPTRG00000003015) #12	FAM24B (ENSPTRG00000034300) #13	ENSPTRG00000048474 #14	FAM24A (ENSPTRG00000029673) #15	C10H10orf88 (ENSPTRG00000003017) #16	PSTK (ENSPTRG00000003018) #17	IKZF5 (ENSPTRG00000003019) #18	ACADSB (ENSPTRG00000003020) #19	HMX3 (ENSPTRG00000046925) #20	HMX2 (ENSPTRG00000047334) #21	BUB3 (ENSPTRG00000044868) #22	GPR26 (ENSPTRG00000045403) #23	ENSPTRG00000043279	CPXM2 (ENSPTRG00000003027) #24	CHST15 (ENSPTRG00000023167) #25	OAT (ENSPTRG00000003028) #26	NKX1-2 (ENSPTRG00000046548) #27	LHPP (ENSPTRG00000003030) #28	FAM53B (ENSPTRG00000003031) #29	EEF1AKMT2 (ENSPTRG00000032571) #30	ABRAXAS2 (ENSPTRG00000003033) #31	ZRANB1 (ENSPTRG00000003034) #32	CTBP2 (ENSPTRG00000003035) #33	ENSPTRG00000050946	TEX36 (ENSPTRG00000003037) #34	ENSPTRG00000052584
Gibbon	MODERN SPECIES	18	PLEKHA1 (ENSNLEG00000016991) #7	ARMS2 (ENSNLEG00000016999)	HTRA1 (ENSNLEG00000017001) #8	ENSNLEG00000017018 #9	C10orf120 (ENSNLEG00000017025) #11	CUZD1 (ENSNLEG00000017027) #12	FAM24B (ENSNLEG00000028659) #13	ENSNLEG00000017042 #14	FAM24A (ENSNLEG00000017045) #15	C10orf88 (ENSNLEG00000017047) #16	PSTK (ENSNLEG00000029733) #17	IKZF5 (ENSNLEG00000027055) #18	ACADSB (ENSNLEG00000026715) #19	HMX3 (ENSNLEG00000032860) #20	HMX2 (ENSNLEG00000033504) #21	BUB3 (ENSNLEG00000030093) #22	GPR26 (ENSNLEG00000030894) #23	ENSNLEG00000027584	CPXM2 (ENSNLEG00000017056) #24	ENSNLEG00000029527	CHST15 (ENSNLEG00000027714) #25	OAT (ENSNLEG00000000482) #26	LHPP (ENSNLEG00000000521) #28	FAM53B (ENSNLEG00000000535) #29	EEF1AKMT2 (ENSNLEG00000000539) #30	ABRAXAS2 (ENSNLEG00000000563) #31	ZRANB1 (ENSNLEG00000000584) #32	CTBP2 (ENSNLEG00000000608) #33	ENSNLEG00000035995	EDRF1 (ENSNLEG00000000623) #36	MMP21 (ENSNLEG00000000684) #37
Hominoidea	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183091.A.a.h ##22
Hominidae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183091.A.a.h ##22
Homo/Pan/Gorilla group	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183091.A.a.h ##22
Homo/Pan group	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183091.A.a.h ##22
Pan	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000155993	ENSGT00940000159404	ENSGT00940000158685	ENSGT00940000155480	ENSGT00940000157682.B	ENSGT00400000023684	ENSGT00890000139436.B	ENSGT00390000010382	ENSGT00390000005941	ENSGT00390000010292	ENSGT00390000013347.a	ENSGT00390000010852	ENSGT00940000155659	ENSGT00550000075044	ENSGT00940000160513	ENSGT00950000183091.A.a.h ##22	ENSGT00940000156246	ENSGT00940000162392.e	ENSGT00940000154738.a.k	ENSGT00910000148006	ENSGT00940000155419	ENSGT00940000162514	ENSGT00940000156003	ENSGT00550000074844	ENSGT01070000253775.a.d.a.a.a.b	ENSGT00510000047522	ENSGT01070000253775.a.d.a.a.a.a	ENSGT00390000011863.d	ENSGT00550000074907	ENSGT01050000244841.A.b.b.a	ENSGT00390000004586
Chimpanzee	DUPLICATION
Chimpanzee	MODERN SPECIES	20	TES (ENSPTRG00000023877)	TFEC (ENSPTRG00000047353)	MDFIC (ENSPTRG00000019609)	FOXP2 (ENSPTRG00000019608)	PPP1R3A (ENSPTRG00000019607)	SMIM30 (ENSPTRG00000051687)	ENSPTRG00000048811	BMT2 (ENSPTRG00000044767)	TMEM168 (ENSPTRG00000019604)	LSMEM1 (ENSPTRG00000019603)	IFRD1 (ENSPTRG00000019601)	ZNF277 (ENSPTRG00000024152)	DOCK4 (ENSPTRG00000019598)	LRRN3 (ENSPTRG00000028417)	IMMP2L (ENSPTRG00000019594)	ENSPTRG00000047546 ##22	DNAJB9 (ENSPTRG00000019593)	THAP5 (ENSPTRG00000019592)	PNPLA8 (ENSPTRG00000019590)	ENSPTRG00000044874	NRCAM (ENSPTRG00000019589)	LAMB4 (ENSPTRG00000019588)	LAMB1 (ENSPTRG00000019587)	DLD (ENSPTRG00000019585)	SLC26A3 (ENSPTRG00000022537)	CBLL1 (ENSPTRG00000019583)	SLC26A4 (ENSPTRG00000019581)	BCAP29 (ENSPTRG00000019580)	DUS4L (ENSPTRG00000019579)	GPR22 (ENSPTRG00000028426)	COG5 (ENSPTRG00000019577)
Chimpanzee	MODERN SPECIES	594																ENSPTRG00000052746 ##22	ENSPTRG00000045196	ENSPTRG00000047287	ENSPTRG00000048977	ENSPTRG00000051601
Bonobo	MODERN SPECIES	20	ENSPPAG00000004955	ENSPPAG00000027647	FOXP2 (ENSPPAG00000030868)	PPP1R3A (ENSPPAG00000041499)	SMIM30 (ENSPPAG00000019976)	ENSPPAG00000039584	BMT2 (ENSPPAG00000031398)	TMEM168 (ENSPPAG00000042305)	LSMEM1 (ENSPPAG00000020364)	IFRD1 (ENSPPAG00000042969)	ZNF277 (ENSPPAG00000029852)	DOCK4 (ENSPPAG00000040634)	ENSPPAG00000028203	LRRN3 (ENSPPAG00000010425)	ENSPPAG00000035378	ENSPPAG00000039101 ##22	DNAJB9 (ENSPPAG00000031489)	THAP5 (ENSPPAG00000043232)	ENSPPAG00000004251	PNPLA8 (ENSPPAG00000029848)	NRCAM (ENSPPAG00000035215)	LAMB4 (ENSPPAG00000038537)	LAMB1 (ENSPPAG00000028669)	DLD (ENSPPAG00000034095)	SLC26A3 (ENSPPAG00000019561)	CBLL1 (ENSPPAG00000039435)	SLC26A4 (ENSPPAG00000034905)	ENSPPAG00000043021	DUS4L (ENSPPAG00000031482)	GPR22 (ENSPPAG00000003684)	COG5 (ENSPPAG00000034477)
Gorilla	MODERN SPECIES	20	TES (ENSGGOG00000016067)	TFEC (ENSGGOG00000009901)	ENSGGOG00000042671	FOXP2 (ENSGGOG00000027435)	PPP1R3A (ENSGGOG00000005621)	SMIM30 (ENSGGOG00000003081)	ENSGGOG00000042174	BMT2 (ENSGGOG00000027197)	TMEM168 (ENSGGOG00000017194)	LSMEM1 (ENSGGOG00000016165)	IFRD1 (ENSGGOG00000000718)	ZNF277 (ENSGGOG00000005587)	DOCK4 (ENSGGOG00000004313)	LRRN3 (ENSGGOG00000026541)	ENSGGOG00000043490	ENSGGOG00000037528 ##22	DNAJB9 (ENSGGOG00000010754)	ENSGGOG00000041229	PNPLA8 (ENSGGOG00000010179)	ENSGGOG00000039809	NRCAM (ENSGGOG00000012271)	LAMB4 (ENSGGOG00000016757)	LAMB1 (ENSGGOG00000010725)	DLD (ENSGGOG00000002567)	SLC26A3 (ENSGGOG00000006523)	CBLL1 (ENSGGOG00000004921)	SLC26A4 (ENSGGOG00000034830)	ENSGGOG00000016205	DUS4L (ENSGGOG00000003821)	GPR22 (ENSGGOG00000024246)	COG5 (ENSGGOG00000043482)
Gibbon	MODERN SPECIES	3	ENSNLEG00000033212	FOXP2 (ENSNLEG00000011394)	PPP1R3A (ENSNLEG00000011388)	SMIM30 (ENSNLEG00000030553)	ENSNLEG00000032204	ENSNLEG00000034107	BMT2 (ENSNLEG00000011360)	TMEM168 (ENSNLEG00000011346)	LSMEM1 (ENSNLEG00000011338)	IFRD1 (ENSNLEG00000011280)	ZNF277 (ENSNLEG00000011240)	DOCK4 (ENSNLEG00000011076)	LRRN3 (ENSNLEG00000018600)	IMMP2L (ENSNLEG00000011071)	ENSNLEG00000035270	ENSNLEG00000033818 ##22	DNAJB9 (ENSNLEG00000008287)	THAP5 (ENSNLEG00000035889)	ENSNLEG00000008309	PNPLA8 (ENSNLEG00000008297)	ENSNLEG00000035557	NRCAM (ENSNLEG00000008311)	LAMB4 (ENSNLEG00000008405)	LAMB1 (ENSNLEG00000008501)	DLD (ENSNLEG00000008579)	SLC26A3 (ENSNLEG00000008644)	ENSNLEG00000008660	SLC26A4 (ENSNLEG00000008663)	ENSNLEG00000008699	DUS4L (ENSNLEG00000008716)	COG5 (ENSNLEG00000008738)