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Eupecaria_B	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00390000010779.a.b.b	ENSGT00390000002038 #9	ENSGT00390000005599	ENSGT01020000230438.B.a.b #10	ENSGT00940000155868.e #11	ENSGT01050000244955.a.a #12	ENSGT01050000244897.a.b.b.a.b #13	ENSGT00950000183159.b.c.a ##14	ENSGT00940000161074.b #15	ENSGT00690000101915.i.b #16	ENSGT00940000156459.k #17	ENSGT00940000154490.a.b #18	ENSGT00940000153665.b.a.a #19	ENSGT00940000157981.a.a.a #20	ENSGT00940000159836 #21	ENSGT00940000165234 #22	ENSGT00940000159757 #23	ENSGT00550000074901 #24	ENSGT00730000112371 #25	ENSGT00390000008295.a #26	ENSGT00940000159573 #27	ENSGT00940000160432 #28	ENSGT00940000162264 #29	ENSGT00940000157787 #30	ENSGT00510000047505	ENSGT00940000161325 #31	ENSGT00950000183176.b.e #32	ENSGT00940000157000 #33	ENSGT00940000160118 #34	ENSGT00940000156329 #35	ENSGT00940000155966 #36
Perciformes	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00530000063596.A.i #8	ENSGT00390000002038 #9	ENSGT00390000005599	ENSGT01020000230438.B.a.b #10	ENSGT00940000155868.e #11	ENSGT01050000244955.a.a #12	ENSGT01050000244897.a.b.b.a.b #13	ENSGT00950000183159.b.c.a ##14	ENSGT00940000161074.b #15	ENSGT00690000101915.i.b #16	ENSGT00940000156459.k #17	ENSGT00940000154490.a.b #18	ENSGT00940000153665.b.a.a #19	ENSGT00940000157981.a.a.a #20	ENSGT00940000159836 #21	ENSGT00940000165234 #22	ENSGT00940000159757 #23	ENSGT00550000074901 #24	ENSGT00730000112371 #25	ENSGT00390000008295.a #26	ENSGT00940000159573 #27	ENSGT00940000160432 #28	ENSGT00940000162264 #29	ENSGT00940000157787 #30	ENSGT00510000047505	ENSGT00940000161325 #31	ENSGT00950000183176.b.e #32	ENSGT00940000157000 #33	ENSGT00940000160118 #34	ENSGT00940000156329 #35	ENSGT00940000155966 #36
Cottioidei	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00530000063596.A.i #8	ENSGT00390000002038 #9	ENSGT00390000005599	ENSGT01020000230438.B.a.b #10	ENSGT00940000155868.e #11	ENSGT01050000244955.a.a #12	ENSGT01050000244897.a.b.b.a.b #13	ENSGT00950000183159.b.c.a ##14	ENSGT00940000161074.b #15	ENSGT00690000101915.i.b #16	ENSGT00940000156459.k #17	ENSGT00940000154490.a.b #18	ENSGT00940000153665.b.a.a #19	ENSGT00940000157981.a.a.a #20	ENSGT00940000159836 #21	ENSGT00940000165234 #22	ENSGT00940000159757 #23	ENSGT00550000074901 #24	ENSGT00730000112371 #25	ENSGT00390000008295.a #26	ENSGT00940000159573 #27	ENSGT00940000160432 #28	ENSGT00940000162264 #29	ENSGT00940000157787 #30	ENSGT00510000047505	ENSGT00940000161325 #31	ENSGT00950000183176.b.e #32	ENSGT00940000157000 #33	ENSGT00940000160118 #34	ENSGT00940000156329 #35	ENSGT00940000155966 #36
Stickleback	MODERN SPECIES	1	cul4a (ENSGACG00000015356) #7	tgfbrap1 (ENSGACG00000015359) #8	mrpl16 (ENSGACG00000015363) #9	ENSGACG00000015365 #10	ENSGACG00000015366 #11	gpc5a (ENSGACG00000015368) #12	gpc6a (ENSGACG00000015374) #13	ENSGACG00000015375 #14	kctd12.2 (ENSGACG00000015376) #15	SLC5A7 (ENSGACG00000015378) #16	arl6 (ENSGACG00000015382) #17	EPHA6 (ENSGACG00000015384) #18	nsun3 (ENSGACG00000015388) #19	atp5mc3b (ENSGACG00000015390) #20	rrad (ENSGACG00000015391) #21	ENSGACG00000015392 #22	ca7 (ENSGACG00000015396) #23	nae1 (ENSGACG00000015403) #24	ENSGACG00000015415 #25	dync1li2 (ENSGACG00000015417) #26	cmtm4 (ENSGACG00000015419) #27	cmtm3 (ENSGACG00000015421) #28	ENSGACG00000015423 #29	galns (ENSGACG00000015424) #30	PABPN1L (ENSGACG00000015428) #31	CBFA2T3 (ENSGACG00000015432) #32	ACSF3 (ENSGACG00000015439) #33	cdh15 (ENSGACG00000015445) #34	SPG7 (ENSGACG00000015447) #35	ANKRD11 (ENSGACG00000015450) #36	SLC22A31 (ENSGACG00000015452) #37
Perciformes_a	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00530000063596.A.i #8	ENSGT00390000002038 #9	ENSGT00390000005599	ENSGT01020000230438.B.a.b #10	ENSGT00940000155868.e #11	ENSGT01050000244955.a.a #12	ENSGT01050000244897.a.b.b.a.b #13	ENSGT00950000183159.b.c.a ##14	ENSGT00940000161074.b #15	ENSGT00690000101915.i.b #16	ENSGT00940000156459.k #17	ENSGT00940000154490.a.b #18	ENSGT00940000153665.b.a.a #19	ENSGT00940000157981.a.a.a #20	ENSGT00940000159836 #21	ENSGT00940000165234 #22	ENSGT00940000159757 #23	ENSGT00550000074901 #24	ENSGT00730000112371 #25	ENSGT00390000008295.a #26	ENSGT00940000159573 #27	ENSGT00940000160432 #28	ENSGT00940000162264 #29	ENSGT00940000157787 #30	ENSGT00510000047505	ENSGT00940000161325 #31	ENSGT00950000183176.b.e #32	ENSGT00940000157000 #33	ENSGT00940000160118 #34	ENSGT00940000156329 #35	ENSGT00940000155966 #36
Channel bull blenny	MODERN SPECIES	17	tgfbrap1 (ENSCGOG00000020008) #8	mrpl16 (ENSCGOG00000020085) #9	ENSCGOG00000020088	ENSCGOG00000020090 #10	efnb2b (ENSCGOG00000020092) #11	gpc5a (ENSCGOG00000020113) #12	gpc6a (ENSCGOG00000020122) #13	lmo7b (ENSCGOG00000020159) ##14	kctd12.2 (ENSCGOG00000020176) #15	SLC5A7 (ENSCGOG00000020184) #16	arl6 (ENSCGOG00000020212) #17	ENSCGOG00000020217	nsun3 (ENSCGOG00000020236) #19	atp5mc3b (ENSCGOG00000020241) #20	rrad (ENSCGOG00000020245) #21	ENSCGOG00000020250 #22	ca7 (ENSCGOG00000020254) #23	nae1 (ENSCGOG00000020359) #24	ENSCGOG00000021386 #25	dync1li2 (ENSCGOG00000021392) #26	cmtm4 (ENSCGOG00000021641) #27	cmtm3 (ENSCGOG00000021642) #28	CKLF (ENSCGOG00000021644) #29	galns (ENSCGOG00000021649) #30	trappc2l (ENSCGOG00000021672)	PABPN1L (ENSCGOG00000021695) #31	CBFA2T3 (ENSCGOG00000021697) #32	ACSF3 (ENSCGOG00000021699) #33	cdh15 (ENSCGOG00000021700) #34	SPG7 (ENSCGOG00000021725) #35	ENSCGOG00000022142
Eupecaria_C	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00390000010779.a.b.b	ENSGT00390000002038 #9	ENSGT00390000005599	ENSGT01020000230438.B.a.b #10	ENSGT00940000155868.e #11	ENSGT01050000244955.a.a #12	ENSGT01050000244897.a.b.b.a.b #13	ENSGT00950000183159.b.c.a ##14	ENSGT00940000161074.b #15	ENSGT00690000101915.i.b #16	ENSGT00940000156459.k #17	ENSGT00940000154490.a.b #18	ENSGT00940000153665.b.a.a #19	ENSGT00940000157981.a.a.a #20	ENSGT00940000159836 #21	ENSGT00940000165234 #22	ENSGT00940000159757 #23	ENSGT00550000074901 #24	ENSGT00390000008295.a #26	ENSGT00940000159573 #27	ENSGT00940000162264 #29	ENSGT00940000160432 #28	ENSGT00940000157787 #30	ENSGT00510000047505	ENSGT00940000161325 #31	ENSGT00950000183176.b.e #32	ENSGT00940000157000 #33	ENSGT00940000160118 #34	ENSGT00940000156329 #35	ENSGT00940000155966 #36	ENSGT00940000162670 #37
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Ballan wrasse	MODERN SPECIES	462						ENSLBEG00000010729 ##14	kctd12.2 (ENSLBEG00000010769) #15	SLC5A7 (ENSLBEG00000010803) #16	arl6 (ENSLBEG00000010881) #17	ENSLBEG00000010943 #18	ENSLBEG00000010975 #18	ENSLBEG00000011062 #18	nsun3 (ENSLBEG00000011096) #19	atp5mc3b (ENSLBEG00000011134) #20	rrad (ENSLBEG00000011162) #21	ENSLBEG00000011196 #22	ca7 (ENSLBEG00000011260) #23	nae1 (ENSLBEG00000011347) #24	ENSLBEG00000011466 #25	dync1li2 (ENSLBEG00000011486) #26	cmtm4 (ENSLBEG00000011506) #27	cmtm3 (ENSLBEG00000011528) #28	CKLF (ENSLBEG00000011555) #29	galns (ENSLBEG00000011579) #30	PABPN1L (ENSLBEG00000011647) #31	trappc2l (ENSLBEG00000011621)	CBFA2T3 (ENSLBEG00000011666) #32