Ovalentaria	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00640000091492.a.d	ENSGT00940000178275	ENSGT00940000158052.b	ENSGT00940000157047.m.a.b	ENSGT00530000063698.a.b.d.a	ENSGT00940000155020.u.b	ENSGT00940000161019	ENSGT00940000165403.b.b	ENSGT00940000168621	ENSGT00940000159301.c.b	ENSGT00940000156210.c	ENSGT00950000183110.b.b.k.b	ENSGT00940000155624.a.b	ENSGT00940000156998.j.b #19	ENSGT00940000154535.D.vb.b.b #21	ENSGT00940000163532 #22	ENSGT00940000163518 #23	ENSGT00940000154802	ENSGT00940000153601.a.b.d	ENSGT00940000155252.fb.b	ENSGT00950000182900.D	ENSGT00390000014590	ENSGT00520000060044	ENSGT00390000010157.a	ENSGT00390000002727	ENSGT00390000008279.a	ENSGT00390000014384	ENSGT00940000158291	ENSGT00940000155060.C.a.a	ENSGT00940000165636	ENSGT00950000182993.A.a.j
Atherinomorphae	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00640000091492.a.d	ENSGT00940000178275	ENSGT00940000158052.b	ENSGT00940000157047.m.a.b	ENSGT00530000063698.a.b.d.a	ENSGT00940000155020.u.b	ENSGT00940000161019	ENSGT00940000165403.b.b	ENSGT00940000168621	ENSGT00940000159301.c.b	ENSGT00940000156210.c	ENSGT00950000183110.b.b.k.b	ENSGT00940000155624.a.b	ENSGT00940000156998.j.b #19	ENSGT00940000154535.D.vb.b.b #21	ENSGT00940000163532 #22	ENSGT00940000163518 #23	ENSGT00940000154802	ENSGT00940000153601.a.b.d	ENSGT00940000155252.fb.b	ENSGT00950000182900.D	ENSGT00390000014590	ENSGT00520000060044	ENSGT00390000010157.a	ENSGT00390000002727	ENSGT00390000008279.a	ENSGT00390000014384	ENSGT00940000158291	ENSGT00940000155060.C.a.a	ENSGT00940000165636	ENSGT00950000182993.A.a.j
Cyprinodontiformes	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00640000091492.a.d	ENSGT00940000178275	ENSGT00940000158052.b	ENSGT00940000157047.m.a.b	ENSGT00530000063698.a.b.d.a	ENSGT00940000155020.u.b	ENSGT00940000161019	ENSGT00940000165403.b.b	ENSGT00940000168621	ENSGT00940000159301.c.b	ENSGT00940000156210.c	ENSGT00950000183110.b.b.k.b	ENSGT00940000155624.a.b	ENSGT00940000156998.j.b #19	ENSGT00940000154535.D.vb.b.b #21	ENSGT00940000163532 #22	ENSGT00940000163518 #23	ENSGT00940000154802	ENSGT00940000153601.a.b.d	ENSGT00940000155252.fb.b	ENSGT00950000182900.D	ENSGT00390000014590	ENSGT00520000060044	ENSGT00390000010157.a	ENSGT00390000002727	ENSGT00390000008279.a	ENSGT00390000014384	ENSGT00940000158291	ENSGT00940000155060.C.a.a	ENSGT00940000165636	ENSGT00950000182993.A.a.j
Cyprinodontoidei	ANCESTRAL SPECIES	276																ENSGT00940000163532 #22	ENSGT00940000163518.ab #23
NAME_4	ANCESTRAL SPECIES	112	ENSGT01030000234767.b	ENSGT00640000091492.a.d	ENSGT00940000158052.b	ENSGT00940000157047.m.a.b	ENSGT00530000063698.a.b.d.a	ENSGT00940000155020.u.b	ENSGT00940000161019	ENSGT00940000165403.b.b	ENSGT00940000168621	ENSGT00940000159301.c.b	ENSGT00940000156210.c	ENSGT00950000183110.b.b.k.b	ENSGT00940000155624.a.b	ENSGT00940000156998.j.b #19	ENSGT00940000154535.D.vb.b.b #21	ENSGT00940000163532 #22	ENSGT00940000163518.ab #23
Sheepshead minnow	MODERN SPECIES	1030													ENSCVAG00000016140 #19	col11a1b (ENSCVAG00000000410) #20	ENSCVAG00000016084 #21	amy2a (ENSCVAG00000016066) #22	ENSCVAG00000016013 #23	ENSCVAG00000014319 #24	sdcbp2 (ENSCVAG00000000364) #25	fkbp1ab (ENSCVAG00000014298) #26
Oryzias	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000163532 #22
Oryzias_b	ANCESTRAL SPECIES	8												ENSGT00950000183110.b.b.k.b	ENSGT00940000155624.a.b	ENSGT00940000156998.j.b #19	ENSGT00940000154535.D.vb.b.b #21	ENSGT00940000163532 #22	ENSGT00940000153601.a.b.d	ENSGT00940000155252.fb.b.f	ENSGT00940000155252.fb.b.e	ENSGT00950000182900.D	ENSGT00390000014590	ENSGT00520000060044	ENSGT00390000010157.a	ENSGT00390000002727	ENSGT00390000008279.a	ENSGT00390000014384	ENSGT00940000158291	ENSGT00940000155060.C.a.a	ENSGT00940000165636	ENSGT00950000182993.A.a.j	ENSGT00940000158588
Javanese ricefish	MODERN SPECIES	8										PTPRM (ENSOJAG00000020718)	ENSOJAG00000020286	ENSOJAG00000020257	ACVR2B (ENSOJAG00000019802)	OLFM3 (ENSOJAG00000019448) #19	ENSOJAG00000019287	amy2a (ENSOJAG00000017147) #22	NTNG1 (ENSOJAG00000017138)	vav3b (ENSOJAG00000017011)	DCAF8 (ENSOJAG00000016951)	yipf1 (ENSOJAG00000016138)	lrrc42 (ENSOJAG00000016126)	tmem59 (ENSOJAG00000016084)	tceanc2 (ENSOJAG00000016076)	CDCP2 (ENSOJAG00000016073)	ENSOJAG00000016066	ENSOJAG00000016062	ENSOJAG00000010072	NRTN (ENSOJAG00000010045)	ranbp3b (ENSOJAG00000009934)	ENSOJAG00000009913	ENSOJAG00000009906
Ovalentaria_B	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000178275	ENSGT00940000158052.b	ENSGT00940000157047.m.a.b	ENSGT00530000063698.a.b.d.a	ENSGT00940000155020.u.b	ENSGT00940000161019	ENSGT00940000165403.b.b	ENSGT00940000168621	ENSGT00940000159301.c.b	ENSGT00940000156210.c	ENSGT00950000183110.b.b.k.b	ENSGT00940000155624.a.b	ENSGT00940000156998.j.b #19	ENSGT00940000154535.D.vb.b.b #21	ENSGT00940000163518 #23	ENSGT00940000163532 #22	ENSGT00940000154802	ENSGT00940000153601.a.b.d	ENSGT00940000155252.fb.b	ENSGT00950000182900.D	ENSGT00390000014590	ENSGT00520000060044	ENSGT00390000010157.a	ENSGT00390000002727	ENSGT00390000008279.a	ENSGT00390000014384	ENSGT00940000158291	ENSGT00940000155060.C.a.a	ENSGT00940000165636	ENSGT00950000182993.A.a.j	ENSGT00940000158588
Pomacentridae	ANCESTRAL SPECIES	45	ENSGT00640000091492.a.d	ENSGT00940000158052.b	ENSGT00940000157047.m.a.b	ENSGT00530000063698.a.b.d.a	ENSGT00940000155020.u.b	ENSGT00940000161019	ENSGT00940000165403.b.b	ENSGT00940000168621	ENSGT00940000159301.c.b	ENSGT00940000156210.c	ENSGT00950000183110.b.b.k.b	ENSGT00940000155624.a.b	ENSGT00940000156998.j.b #19	ENSGT00940000154535.D.vb.b.b #21	ENSGT00940000163518 #23	ENSGT00940000163532 #22	ENSGT00940000153601.a.b.d	ENSGT00940000155252.fb.b	ENSGT00950000182900.D	ENSGT00390000014590	ENSGT00520000060044	ENSGT00390000010157.a	ENSGT00390000002727	ENSGT00390000008279.a	ENSGT00390000014384	ENSGT00940000158291	ENSGT00940000155060.C.a.a	ENSGT00940000165636	ENSGT00950000182993.A.a.j	ENSGT00940000158588	ENSGT00900000141362.a.a
Bicolor damselfish	MODERN SPECIES	326	ENSSPAG00000005637	ENSSPAG00000005658	ENSSPAG00000005747	PTPRM (ENSSPAG00000005767)	ENSSPAG00000005859	ENSSPAG00000005867	ENSSPAG00000005900	crygn1 (ENSSPAG00000005912)	ACVR2B (ENSSPAG00000006024)	arhgap29b (ENSSPAG00000006056)	ABCA4 (ENSSPAG00000006122)	OLFM3 (ENSSPAG00000006194) #19	col11a1b (ENSSPAG00000006222) #21	ENSSPAG00000006306 #23	ENSSPAG00000006330 #23	amy2a (ENSSPAG00000006346) #22	NTNG1 (ENSSPAG00000006358)	vav3b (ENSSPAG00000006396)	DCAF8 (ENSSPAG00000006537)	ndc1 (ENSSPAG00000006604)	zgc:113691 (ENSSPAG00000006786)	yipf1 (ENSSPAG00000006806)	lrrc42 (ENSSPAG00000006844)
Pomacentridae_A	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000163532 #22
Spiny chromis	MODERN SPECIES	1270													OLFM3 (ENSAPOG00000013000) #19	col11a1b (ENSAPOG00000012962) #21	ENSAPOG00000012766 #23	amy2a (ENSAPOG00000012728) #22