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Sarcopterygii	ANCESTRAL SPECIES	71	ENSGT00940000159569	ENSGT00390000010743.b	ENSGT00910000145076	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000013765	ENSGT00940000156868	ENSGT00390000018089	ENSGT00390000008938	ENSGT00950000182969.A	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT01060000248575.C	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000172233	ENSGT00390000016384	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961
Tetrapoda	ANCESTRAL SPECIES	58	ENSGT00940000159569	ENSGT00390000010743.b	ENSGT00910000145076	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000013765	ENSGT00940000156868	ENSGT00390000018089	ENSGT00390000008938	ENSGT00950000182969.A	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT01060000248575.C	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000172233	ENSGT00390000016384	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961
Amniota	ANCESTRAL SPECIES	27	ENSGT00940000164999	ENSGT00390000008938	ENSGT00390000018089	ENSGT00940000156868	ENSGT00390000013765	ENSGT00390000005084	ENSGT00910000145076	ENSGT00390000010743.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000172233	ENSGT00390000016384	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
Mammalia	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00940000164999	ENSGT00390000008938	ENSGT00390000018089	ENSGT00940000156868	ENSGT00390000013765	ENSGT00390000005084	ENSGT00910000145076	ENSGT00390000010743.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000172233	ENSGT00390000016384	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
Theria	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00940000163103	ENSGT00940000162508	ENSGT00930000151076	ENSGT00940000161916	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
Eutheria	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00390000010743.b	ENSGT00940000164453	ENSGT00940000163223	ENSGT00940000161916	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
Boreoeutheria	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00900000141254	ENSGT00940000164453	ENSGT00940000163223	ENSGT00940000161916	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
Euarchontoglires	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00900000141254	ENSGT00940000164453	ENSGT00940000163223	ENSGT00940000161916	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
Primates	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000164453	ENSGT00940000163223	ENSGT00940000165463	ENSGT00940000161916	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.i.b	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
Haplorrhini	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00390000010743.b	ENSGT00940000163649	ENSGT00900000141254	ENSGT00940000164453	ENSGT00940000163223	ENSGT00940000165463	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000167867	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.i.a	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961
Tarsier	MODERN SPECIES	2562																CRB2 (ENSTSYG00000033337) #22	ENSTSYG00000004782 #23
Simiiformes	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000165018	ENSGT00940000163649	ENSGT00900000141254	ENSGT00940000164453	ENSGT00940000163223	ENSGT00940000165463	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000167867	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.i.a	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000005811.w.b	ENSGT00390000009566
Catarrhini	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000165018	ENSGT00940000163649	ENSGT00900000141254	ENSGT00940000164453	ENSGT00940000163223	ENSGT00940000165463	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000167867	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.i.a	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00390000005811.w.b
Hominoidea	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000165018	ENSGT00940000163649	ENSGT00900000141254	ENSGT00940000164453	ENSGT00940000163223	ENSGT00940000165463	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000167867	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.i.a	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000005811.w.b	ENSGT00390000009566
Hominidae	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000163649	ENSGT00900000141254	ENSGT00940000164453	ENSGT00940000163223	ENSGT00940000165463.i	ENSGT00940000165463.j	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.i.a	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000005811.w.b	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961
Homo/Pan/Gorilla group	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000163649	ENSGT00900000141254	ENSGT00940000164453	ENSGT00940000163223	ENSGT00940000165463.i	ENSGT00940000165463.j	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00910000148777	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.i.a	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000005811.w.b	ENSGT00390000009566
Homo/Pan group	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000163649	ENSGT00900000141254	ENSGT00940000164453	ENSGT00940000163223	ENSGT00940000165463.i	ENSGT00940000165463.j	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00910000148777	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.i.a	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961
Pan	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000163649	ENSGT00940000164453	ENSGT00940000163223	ENSGT00940000165895	ENSGT00940000165463.i	ENSGT00940000165463.j	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00860000136276	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00910000148777	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00900000141073.s	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.i.a	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566
Chimpanzee	MODERN SPECIES	22	OR1Q1 (ENSPTRG00000021332)	OR1L1 (ENSPTRG00000021333)	OR1L3 (ENSPTRG00000021334)	ENSPTRG00000042835	OR1L4 (ENSPTRG00000021335)	OR1L6 (ENSPTRG00000021336)	OR5C1 (ENSPTRG00000021337)	OR1K1 (ENSPTRG00000029108)	PDCL (ENSPTRG00000021338)	RC3H2 (ENSPTRG00000021339)	ZBTB6 (ENSPTRG00000043021)	ZBTB26 (ENSPTRG00000021341)	RABGAP1 (ENSPTRG00000021342)	ENSPTRG00000044284	STRBP (ENSPTRG00000021346)	CRB2 (ENSPTRG00000021348) #22	DENND1A (ENSPTRG00000021349) #23	ENSPTRG00000044471	LHX2 (ENSPTRG00000021351)	NEK6 (ENSPTRG00000021352)	PSMB7 (ENSPTRG00000021354)	ADGRD2 (ENSPTRG00000021356)	NR5A1 (ENSPTRG00000021357)	NR6A1 (ENSPTRG00000051156)	ENSPTRG00000050508	OLFML2A (ENSPTRG00000021359)	WDR38 (ENSPTRG00000021360)	RPL35 (ENSPTRG00000021361)	ARPC5L (ENSPTRG00000021362)	GOLGA1 (ENSPTRG00000021364)	SCAI (ENSPTRG00000021366)
Bonobo	MODERN SPECIES	22	OR1L8 (ENSPPAG00000000690)	OR1Q1 (ENSPPAG00000003934)	OR1L3 (ENSPPAG00000000874)	ENSPPAG00000027783	OR1L4 (ENSPPAG00000005013)	OR1L6 (ENSPPAG00000005838)	OR5C1 (ENSPPAG00000006222)	OR1K1 (ENSPPAG00000005279)	PDCL (ENSPPAG00000026211)	RC3H2 (ENSPPAG00000036013)	ZBTB6 (ENSPPAG00000026095)	ZBTB26 (ENSPPAG00000005083)	RABGAP1 (ENSPPAG00000013688)	ENSPPAG00000034339	STRBP (ENSPPAG00000000242)	CRB2 (ENSPPAG00000030633) #22	DENND1A (ENSPPAG00000038800) #23	ENSPPAG00000028123	LHX2 (ENSPPAG00000034417)	NEK6 (ENSPPAG00000042047)	PSMB7 (ENSPPAG00000043451)	ADGRD2 (ENSPPAG00000029184)	NR5A1 (ENSPPAG00000033832)	NR6A1 (ENSPPAG00000027363)	ENSPPAG00000042042	OLFML2A (ENSPPAG00000036204)	WDR38 (ENSPPAG00000009033)	ENSPPAG00000026463	ARPC5L (ENSPPAG00000033849)	GOLGA1 (ENSPPAG00000039343)	SCAI (ENSPPAG00000035611)
Human	MODERN SPECIES	21	OR1Q1 (ENSG00000165202)	OR1B1 (ENSG00000280094)	OR1L1 (ENSG00000173679)	OR1L3 (ENSG00000171481)	OR1L4 (ENSG00000136939)	OR1L6 (ENSG00000171459)	OR5C1 (ENSG00000148215)	PDCL (ENSG00000136940)	OR1K1 (ENSG00000165204)	RC3H2 (ENSG00000056586)	ZBTB6 (ENSG00000186130)	ZBTB26 (ENSG00000171448)	RABGAP1 (ENSG00000011454)	GPR21 (ENSG00000188394)	STRBP (ENSG00000165209)	CRB2 (ENSG00000148204) #22	DENND1A (ENSG00000119522) #23	LHX2 (ENSG00000106689)	NEK6 (ENSG00000119408)	PSMB7 (ENSG00000136930)	ADGRD2 (ENSG00000180264)	NR5A1 (ENSG00000136931)	NR6A1 (ENSG00000148200)	OLFML2A (ENSG00000185585)	WDR38 (ENSG00000136918)	RPL35 (ENSG00000136942)	ARPC5L (ENSG00000136950)	GOLGA1 (ENSG00000136935)	SCAI (ENSG00000173611)	PPP6C (ENSG00000119414)	RABEPK (ENSG00000136933)
Gorilla	MODERN SPECIES	22	OR1N1 (ENSGGOG00000022170)	OR1N2 (ENSGGOG00000017004)	OR1Q1 (ENSGGOG00000005228)	OR1L1 (ENSGGOG00000004567)	OR1L3 (ENSGGOG00000013779)	OR1L4 (ENSGGOG00000005056)	OR5C1 (ENSGGOG00000016948)	PDCL (ENSGGOG00000013392)	RC3H2 (ENSGGOG00000017062)	ZBTB6 (ENSGGOG00000036621)	ZBTB26 (ENSGGOG00000015134)	RABGAP1 (ENSGGOG00000003890)	ENSGGOG00000042134	STRBP (ENSGGOG00000003901)	ENSGGOG00000039044	CRB2 (ENSGGOG00000016601) #22	DENND1A (ENSGGOG00000016611) #23	ENSGGOG00000036998	LHX2 (ENSGGOG00000008475)	NEK6 (ENSGGOG00000012155)	PSMB7 (ENSGGOG00000012164)	ADGRD2 (ENSGGOG00000008978)	NR5A1 (ENSGGOG00000008994)	NR6A1 (ENSGGOG00000009250)	OLFML2A (ENSGGOG00000004100)	WDR38 (ENSGGOG00000004105)	ENSGGOG00000004111	ARPC5L (ENSGGOG00000004115)	GOLGA1 (ENSGGOG00000004117)	ENSGGOG00000037553	SCAI (ENSGGOG00000034880)
Orangutan	MODERN SPECIES	22	OR1J4 (ENSPPYG00000033379)	OR1N1 (ENSPPYG00000019575)	OR1N2 (ENSPPYG00000019576)	OR1Q1 (ENSPPYG00000020060)	OR1B1 (ENSPPYG00000020064)	OR1L4 (ENSPPYG00000019579)	OR1L6 (ENSPPYG00000019580)	OR5C1 (ENSPPYG00000037493)	PDCL (ENSPPYG00000019582)	RC3H2 (ENSPPYG00000019583)	ZBTB6 (ENSPPYG00000030463)	ZBTB26 (ENSPPYG00000037988)	RABGAP1 (ENSPPYG00000019586)	ENSPPYG00000031287	STRBP (ENSPPYG00000019589)	CRB2 (ENSPPYG00000019880) #22	DENND1A (ENSPPYG00000019592) #23	LHX2 (ENSPPYG00000019593)	NEK6 (ENSPPYG00000019594)	PSMB7 (ENSPPYG00000019596)	ADGRD2 (ENSPPYG00000019598)	NR5A1 (ENSPPYG00000019599)	NR6A1 (ENSPPYG00000019600)	OLFML2A (ENSPPYG00000019601)	WDR38 (ENSPPYG00000019602)	RPL35 (ENSPPYG00000019603)	ARPC5L (ENSPPYG00000019604)	GOLGA1 (ENSPPYG00000019605)	SCAI (ENSPPYG00000019606)	PPP6C (ENSPPYG00000019607)	RABEPK (ENSPPYG00000019608)
Gibbon	MODERN SPECIES	23	ENSNLEG00000017177	PTGS1 (ENSNLEG00000017180)	OR1J1 (ENSNLEG00000018990)	ENSNLEG00000033985	OR1L8 (ENSNLEG00000018992)	ENSNLEG00000032722	OR1L1 (ENSNLEG00000018994)	OR1L3 (ENSNLEG00000018995)	PDCL (ENSNLEG00000029580)	RC3H2 (ENSNLEG00000017204)	ZBTB6 (ENSNLEG00000035883)	ZBTB26 (ENSNLEG00000017215)	RABGAP1 (ENSNLEG00000017216)	ENSNLEG00000030097	STRBP (ENSNLEG00000017223)	ENSNLEG00000017244 #22	DENND1A (ENSNLEG00000017247) #23	ENSNLEG00000034780	LHX2 (ENSNLEG00000028123)	NEK6 (ENSNLEG00000017263)	PSMB7 (ENSNLEG00000036020)	ENSNLEG00000033335	NR5A1 (ENSNLEG00000017282)	NR6A1 (ENSNLEG00000017287)	ENSNLEG00000035190	ENSNLEG00000033577	OLFML2A (ENSNLEG00000017289)	WDR38 (ENSNLEG00000017294)	ENSNLEG00000031655	ARPC5L (ENSNLEG00000017306)	GOLGA1 (ENSNLEG00000017311)
Cercopithecidae	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00910000145076.a	ENSGT00390000010743.b	ENSGT00940000163027	ENSGT00940000164453	ENSGT00940000165463	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00860000136276	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00910000147294	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000153288.a.b.a.b.l.a	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.i.b	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00390000005811.w.b
Cercopithecinae	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000163027	ENSGT00940000162508	ENSGT00940000163649	ENSGT00900000141254	ENSGT00940000165463	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00860000136276	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00910000147294	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000153288.a.b.a.b.l.a	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.i.b	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00390000005811.w.b
Cercopithecinae_a	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00910000145076.a	ENSGT00390000010743.b	ENSGT00940000163027	ENSGT00940000162508	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00910000147766	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00860000136276	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00910000147294	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000153288.a.b.a.b.l.a	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.i.b	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00390000005811.w.b
Macaca	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00390000005084	ENSGT00910000145076.a	ENSGT00390000010743.b	ENSGT00940000163027	ENSGT00940000162508	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00910000147766	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00860000136276	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.i.a	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00390000005811.w.b	ENSGT00950000182803.B.d.a.i.b
Pig-tailed macaque	MODERN SPECIES	317						OR1L1 (ENSMNEG00000028995)	ENSMNEG00000028406	PDCL (ENSMNEG00000035590)	ENSMNEG00000023235	RC3H2 (ENSMNEG00000031599)	ZBTB6 (ENSMNEG00000026626)	ZBTB26 (ENSMNEG00000028386)	RABGAP1 (ENSMNEG00000039246)	ENSMNEG00000039714	STRBP (ENSMNEG00000045088)	CRB2 (ENSMNEG00000040807) #22	DENND1A (ENSMNEG00000035856) #23	LHX2 (ENSMNEG00000038576)	NEK6 (ENSMNEG00000034029)	PSMB7 (ENSMNEG00000034519)	ADGRD2 (ENSMNEG00000034810)	NR5A1 (ENSMNEG00000037300)	NR6A1 (ENSMNEG00000032193)	OLFML2A (ENSMNEG00000013543)	WDR38 (ENSMNEG00000036703)	ENSMNEG00000044108	ARPC5L (ENSMNEG00000021442)	GOLGA1 (ENSMNEG00000015755)	ENSMNEG00000010083	SCAI (ENSMNEG00000039438)	ENSMNEG00000038470
Macaca_a	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00390000010743.b	ENSGT00940000163027	ENSGT00940000162508	ENSGT00940000163649	ENSGT00900000141254	ENSGT00940000165463	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00910000147766	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT01100000263577.a.a.b.a.a.a.b.b.a.a	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.i.a	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961.j
Rhesus	MODERN SPECIES	6	OR1J1 (ENSMMUG00000060428)	OR1J4 (ENSMMUG00000013711)	OR1Q1 (ENSMMUG00000060752)	OR1B1 (ENSMMUG00000058731)	ENSMMUG00000038944	ENSMMUG00000063639	OR5C1 (ENSMMUG00000056026)	OR1K1 (ENSMMUG00000039674)	PDCL (ENSMMUG00000006896)	ENSMMUG00000058722	RC3H2 (ENSMMUG00000021134)	ZBTB6 (ENSMMUG00000000496)	ZBTB26 (ENSMMUG00000000495)	RABGAP1 (ENSMMUG00000000670)	STRBP (ENSMMUG00000022919)	CRB2 (ENSMMUG00000006345) #22	DENND1A (ENSMMUG00000006348) #23	ENSMMUG00000049804	LHX2 (ENSMMUG00000003671)	NEK6 (ENSMMUG00000007354)	PSMB7 (ENSMMUG00000060033)	ADGRD2 (ENSMMUG00000014110)	NR5A1 (ENSMMUG00000014111)	NR6A1 (ENSMMUG00000011185)	OLFML2A (ENSMMUG00000011183)	ENSMMUG00000061871	WDR38 (ENSMMUG00000005259)	RPL35 (ENSMMUG00000005260)	ARPC5L (ENSMMUG00000043892)	GOLGA1 (ENSMMUG00000020631)	ENSMMUG00000064277
Crab-eating macaque	MODERN SPECIES	6	MRRF (ENSMFAG00000044303)	PTGS1 (ENSMFAG00000046283)	OR1J1 (ENSMFAG00000043292)	OR1J4 (ENSMFAG00000043044)	ENSMFAG00000053359	OR1Q1 (ENSMFAG00000058086)	OR1B1 (ENSMFAG00000049737)	ENSMFAG00000053458	ENSMFAG00000050310	PDCL (ENSMFAG00000049180)	ZBTB6 (ENSMFAG00000009223)	ZBTB26 (ENSMFAG00000009076)	RC3H2 (ENSMFAG00000035621)	RABGAP1 (ENSMFAG00000043446)	STRBP (ENSMFAG00000001745)	CRB2 (ENSMFAG00000042297) #22	ENSMFAG00000058067	DENND1A (ENSMFAG00000031585) #23	ENSMFAG00000057010	LHX2 (ENSMFAG00000028670)	ENSMFAG00000053849	NEK6 (ENSMFAG00000043882)	PSMB7 (ENSMFAG00000002588)	NR5A1 (ENSMFAG00000044244)	ENSMFAG00000050682	ENSMFAG00000055757	ENSMFAG00000059108	NR6A1 (ENSMFAG00000045408)	OLFML2A (ENSMFAG00000002383)	ENSMFAG00000062053	WDR38 (ENSMFAG00000038461)
Cercopithecinae_b	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00390000013765	ENSGT00910000145076.a	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000010743.b	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00910000147766	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00860000136276	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00910000147294	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000153288.a.b.a.b.l.a	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.i.b	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00390000005811.w.b
Olive baboon	MODERN SPECIES	4	DAB2IP (ENSPANG00000025828)	TTLL11 (ENSPANG00000025827)	NDUFA8 (ENSPANG00000042514)	MORN5 (ENSPANG00000034028)	LHX6 (ENSPANG00000025837)	RBM18 (ENSPANG00000025845)	MRRF (ENSPANG00000025844)	PTGS1 (ENSPANG00000025843)	OR5C1 (ENSPANG00000049750)	PDCL (ENSPANG00000033400)	RC3H2 (ENSPANG00000025840)	ZBTB6 (ENSPANG00000016323)	ZBTB26 (ENSPANG00000025839)	RABGAP1 (ENSPANG00000025838)	STRBP (ENSPANG00000025850)	CRB2 (ENSPANG00000025851) #22	DENND1A (ENSPANG00000025853) #23	LHX2 (ENSPANG00000025852)	PSMB7 (ENSPANG00000025855)	NEK6 (ENSPANG00000025854)	ADGRD2 (ENSPANG00000025863)	NR5A1 (ENSPANG00000025862)	NR6A1 (ENSPANG00000025861)	OLFML2A (ENSPANG00000025860)	WDR38 (ENSPANG00000007029)	RPL35 (ENSPANG00000032631)	ARPC5L (ENSPANG00000044193)	GOLGA1 (ENSPANG00000017415)	SCAI (ENSPANG00000011266)	PPP6C (ENSPANG00000024802)	ENSPANG00000024810
Cercopithecinae_d	ANCESTRAL SPECIES	56				ENSGT00940000164453	ENSGT00940000165463	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00910000147766	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00860000136276	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00910000147294	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000153288.a.b.a.b.l.a	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.i.b	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00390000005811.w.b
Sooty mangabey	MODERN SPECIES	489					OR1L1 (ENSCATG00000033251)	ENSCATG00000020376	PDCL (ENSCATG00000034896)	ENSCATG00000021126	RC3H2 (ENSCATG00000036655)	ZBTB6 (ENSCATG00000020390)	ZBTB26 (ENSCATG00000020299)	RABGAP1 (ENSCATG00000012197)	ENSCATG00000037945	STRBP (ENSCATG00000038868)	ENSCATG00000043981	CRB2 (ENSCATG00000033470) #22	DENND1A (ENSCATG00000034371) #23	LHX2 (ENSCATG00000018508)	ENSCATG00000044723	NEK6 (ENSCATG00000044368)	PSMB7 (ENSCATG00000033885)	ADGRD2 (ENSCATG00000044429)	NR5A1 (ENSCATG00000032967)	NR6A1 (ENSCATG00000030436)	OLFML2A (ENSCATG00000026827)	WDR38 (ENSCATG00000041965)	RPL35 (ENSCATG00000020241)	ARPC5L (ENSCATG00000037319)	ENSCATG00000034300	GOLGA1 (ENSCATG00000044682)	SCAI (ENSCATG00000011189)
Drill	MODERN SPECIES	1462						ENSMLEG00000028451	OR1K1 (ENSMLEG00000024612)	PDCL (ENSMLEG00000030097)	ENSMLEG00000015252	RC3H2 (ENSMLEG00000033809)	ZBTB6 (ENSMLEG00000000288)	ZBTB26 (ENSMLEG00000000689)	RABGAP1 (ENSMLEG00000027024)	ENSMLEG00000025366	STRBP (ENSMLEG00000043524)	CRB2 (ENSMLEG00000030682) #22	DENND1A (ENSMLEG00000043396) #23	LHX2 (ENSMLEG00000021612)	ENSMLEG00000037698
Vervet Monkey	MODERN SPECIES	3	MORN5 (ENSCSAG00000013336)	LHX6 (ENSCSAG00000013360)	RBM18 (ENSCSAG00000013373)	MRRF (ENSCSAG00000013379)	PTGS1 (ENSCSAG00000013388)	OR1B1 (ENSCSAG00000000478)	ENSCSAG00000013401	ENSCSAG00000000479	OR5C1 (ENSCSAG00000000480)	PDCL (ENSCSAG00000013404)	RC3H2 (ENSCSAG00000013416)	ZBTB6 (ENSCSAG00000019713)	ZBTB26 (ENSCSAG00000019712)	RABGAP1 (ENSCSAG00000013436)	STRBP (ENSCSAG00000013456)	CRB2 (ENSCSAG00000013494) #22	DENND1A (ENSCSAG00000013513) #23	LHX2 (ENSCSAG00000013520)	NEK6 (ENSCSAG00000013531)	PSMB7 (ENSCSAG00000013536)	ADGRD2 (ENSCSAG00000013549)	NR5A1 (ENSCSAG00000013558)	NR6A1 (ENSCSAG00000013563)	OLFML2A (ENSCSAG00000013568)	WDR38 (ENSCSAG00000013588)	ARPC5L (ENSCSAG00000013596)	GOLGA1 (ENSCSAG00000013605)	SCAI (ENSCSAG00000013617)	PPP6C (ENSCSAG00000013623)	RABEPK (ENSCSAG00000013629)	HSPA5 (ENSCSAG00000013633)
Rhinopithecus	ANCESTRAL SPECIES	140							ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00860000136276	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00910000147294	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261.g #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000153288.a.b.a.b.l.a	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.i.a.b	ENSGT00390000016384.f.i.b	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566
Golden snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	2356								OR1K1 (ENSRROG00000036444)	PDCL (ENSRROG00000039540)	RC3H2 (ENSRROG00000043784)	ZBTB6 (ENSRROG00000028671)	ZBTB26 (ENSRROG00000016225)	RABGAP1 (ENSRROG00000034114)	ENSRROG00000039474	STRBP (ENSRROG00000033417)	CRB2 (ENSRROG00000044022) #22	ENSRROG00000007367 #23
Black snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	491							OR1K1 (ENSRBIG00000038148)	PDCL (ENSRBIG00000041209)	RC3H2 (ENSRBIG00000032579)	ZBTB6 (ENSRBIG00000002621)	ZBTB26 (ENSRBIG00000037685)	RABGAP1 (ENSRBIG00000034532)	ENSRBIG00000006154	STRBP (ENSRBIG00000044535)	ENSRBIG00000040405	CRB2 (ENSRBIG00000040048) #22	DENND1A (ENSRBIG00000022086) #23	LHX2 (ENSRBIG00000035554)	ENSRBIG00000042581	NEK6 (ENSRBIG00000032831)	PSMB7 (ENSRBIG00000024252)	ADGRD2 (ENSRBIG00000002924)	NR5A1 (ENSRBIG00000034857)	NR6A1 (ENSRBIG00000034563)	OLFML2A (ENSRBIG00000029375)	WDR38 (ENSRBIG00000042146)	RPL35 (ENSRBIG00000036679)	ARPC5L (ENSRBIG00000042947)	GOLGA1 (ENSRBIG00000026783)	SCAI (ENSRBIG00000026974)	ENSRBIG00000036429
Platyrrhini	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000163995	ENSGT00940000162508	ENSGT00940000163451	ENSGT00940000163103	ENSGT00940000165018	ENSGT00940000163649	ENSGT00940000163223	ENSGT00940000165463	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.i.a	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000005811.w.b	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961
Cebidae	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000163995	ENSGT00940000162508	ENSGT00940000163451	ENSGT00940000163103	ENSGT00940000165018	ENSGT00940000163649	ENSGT00940000163223	ENSGT00940000165463	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.i.a	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000005811.w.b	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961
Marmoset	MODERN SPECIES		OR1N1 (ENSCJAG00000021773)	ENSCJAG00000066368	OR1N2 (ENSCJAG00000020076)	OR1L8 (ENSCJAG00000085216)	OR1Q1 (ENSCJAG00000040823)	OR1L3 (ENSCJAG00000020065)	ENSCJAG00000079179	ENSCJAG00000086095	OR5C1 (ENSCJAG00000022331)	PDCL (ENSCJAG00000087386)	RC3H2 (ENSCJAG00000020050)	ZBTB6 (ENSCJAG00000020049)	ZBTB26 (ENSCJAG00000021770)	RABGAP1 (ENSCJAG00000020027)	STRBP (ENSCJAG00000019997)	CRB2 (ENSCJAG00000006432) #22	DENND1A (ENSCJAG00000006461) #23	ENSCJAG00000085719	LHX2 (ENSCJAG00000006496)	NEK6 (ENSCJAG00000006507)	PSMB7 (ENSCJAG00000006541)	ADGRD2 (ENSCJAG00000040439)	NR5A1 (ENSCJAG00000006624)	NR6A1 (ENSCJAG00000006631)	ENSCJAG00000078726	OLFML2A (ENSCJAG00000006668)	ENSCJAG00000077082	WDR38 (ENSCJAG00000006695)	ENSCJAG00000006724	ENSCJAG00000006730	GOLGA1 (ENSCJAG00000006745)
Cebidae_a	ANCESTRAL SPECIES	68									ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00390000001319.z	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.i.b	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000005811.w.b	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961
Bolivian squirrel monkey	MODERN SPECIES	172								OR1L1 (ENSSBOG00000036082)	PDCL (ENSSBOG00000020323)	RC3H2 (ENSSBOG00000029100)	ZBTB6 (ENSSBOG00000017105)	ZBTB26 (ENSSBOG00000018243)	ENSSBOG00000028995	RABGAP1 (ENSSBOG00000019849)	STRBP (ENSSBOG00000003663)	CRB2 (ENSSBOG00000026890) #22	DENND1A (ENSSBOG00000033627) #23	LHX2 (ENSSBOG00000012275)	NEK6 (ENSSBOG00000028368)	PSMB7 (ENSSBOG00000028132)	ADGRD2 (ENSSBOG00000025524)	NR5A1 (ENSSBOG00000026963)	NR6A1 (ENSSBOG00000031223)	OLFML2A (ENSSBOG00000032661)	WDR38 (ENSSBOG00000030562)	RPL35 (ENSSBOG00000030899)	ARPC5L (ENSSBOG00000026457)	GOLGA1 (ENSSBOG00000035730)	ENSSBOG00000033641	SCAI (ENSSBOG00000029441)	PPP6C (ENSSBOG00000018030)
Capuchin	MODERN SPECIES	206								ENSCCAG00000013468	PDCL (ENSCCAG00000019775)	RC3H2 (ENSCCAG00000001404)	ZBTB6 (ENSCCAG00000020024)	ZBTB26 (ENSCCAG00000003111)	ENSCCAG00000033724	RABGAP1 (ENSCCAG00000024911)	STRBP (ENSCCAG00000027357)	CRB2 (ENSCCAG00000033115) #22	DENND1A (ENSCCAG00000020125) #23	LHX2 (ENSCCAG00000022112)	NEK6 (ENSCCAG00000019309)	PSMB7 (ENSCCAG00000025367)	ADGRD2 (ENSCCAG00000033790)	NR5A1 (ENSCCAG00000024659)	NR6A1 (ENSCCAG00000024096)	OLFML2A (ENSCCAG00000023075)	WDR38 (ENSCCAG00000024912)	ENSCCAG00000026875	ENSCCAG00000003039	ENSCCAG00000032926	GOLGA1 (ENSCCAG00000025942)	ENSCCAG00000034325	ENSCCAG00000018226
Mas night monkey	MODERN SPECIES	768	MORN5 (ENSANAG00000028589)	LHX6 (ENSANAG00000036902)	RBM18 (ENSANAG00000035441)	ENSANAG00000027637	ENSANAG00000026416	PTGS1 (ENSANAG00000029954)	PDCL (ENSANAG00000036396)	RC3H2 (ENSANAG00000030862)	ZBTB6 (ENSANAG00000020106)	ZBTB26 (ENSANAG00000036419)	RABGAP1 (ENSANAG00000022667)	ENSANAG00000001745	ENSANAG00000021222	STRBP (ENSANAG00000021993)	ENSANAG00000004458	CRB2 (ENSANAG00000030431) #22	DENND1A (ENSANAG00000034989) #23	LHX2 (ENSANAG00000018858)	NEK6 (ENSANAG00000029360)	PSMB7 (ENSANAG00000030640)	ADGRD2 (ENSANAG00000036641)	NR5A1 (ENSANAG00000027136)	NR6A1 (ENSANAG00000036986)	OLFML2A (ENSANAG00000028567)	WDR38 (ENSANAG00000033407)	RPL35 (ENSANAG00000032849)	ENSANAG00000021654	GOLGA1 (ENSANAG00000020513)	SCAI (ENSANAG00000024288)	ENSANAG00000005773	ENSANAG00000035375
Strepsirrhini	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000156689	ENSGT00390000008938	ENSGT00390000018089	ENSGT00940000156868	ENSGT00390000013765	ENSGT00390000005084	ENSGT00910000145076	ENSGT00390000010743.b	ENSGT00940000162852.b.a	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.i.b	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
Lemuriformes	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00390000013765	ENSGT00390000005084	ENSGT00910000145076	ENSGT00390000010743.b	ENSGT00940000164886	ENSGT00940000165929	ENSGT00940000163649	ENSGT00930000151076	ENSGT00940000163223	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.i.b	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
Mouse lemur	MODERN SPECIES	1	MRRF (ENSMICG00000016168)	ENSMICG00000031629	PTGS1 (ENSMICG00000009196)	ENSMICG00000033883	ENSMICG00000045321	ENSMICG00000043496	ENSMICG00000043641	ENSMICG00000044928	ENSMICG00000035760	PDCL (ENSMICG00000003224)	RC3H2 (ENSMICG00000003227)	ZBTB6 (ENSMICG00000047456)	ZBTB26 (ENSMICG00000037770)	RABGAP1 (ENSMICG00000000821)	STRBP (ENSMICG00000000832)	CRB2 (ENSMICG00000000551) #22	DENND1A (ENSMICG00000000554) #23	LHX2 (ENSMICG00000009968)	NEK6 (ENSMICG00000009990)	PSMB7 (ENSMICG00000043101)	ADGRD2 (ENSMICG00000046284)	NR5A1 (ENSMICG00000002907)	NR6A1 (ENSMICG00000002911)	OLFML2A (ENSMICG00000002915)	WDR38 (ENSMICG00000038127)	RPL35 (ENSMICG00000002922)	ARPC5L (ENSMICG00000002925)	GOLGA1 (ENSMICG00000002928)	ENSMICG00000002934	SCAI (ENSMICG00000002936)	PPP6C (ENSMICG00000030309)
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Coquerels sifaka	MODERN SPECIES	995	TTLL11 (ENSPCOG00000012570)	NDUFA8 (ENSPCOG00000025464)	MORN5 (ENSPCOG00000023443)	LHX6 (ENSPCOG00000019624)	RBM18 (ENSPCOG00000024474)	ENSPCOG00000026480	PTGS1 (ENSPCOG00000008151)	ENSPCOG00000019615	OR1L3 (ENSPCOG00000010946)	PDCL (ENSPCOG00000026496)	RC3H2 (ENSPCOG00000028817)	ZBTB6 (ENSPCOG00000003019)	ENSPCOG00000014220	RABGAP1 (ENSPCOG00000000532)	STRBP (ENSPCOG00000027563)	CRB2 (ENSPCOG00000025106) #22	DENND1A (ENSPCOG00000025342) #23	LHX2 (ENSPCOG00000004468)
Greater bamboo lemur	MODERN SPECIES	519	ENSPSMG00000000082	OR1Q1 (ENSPSMG00000000044)	ENSPSMG00000023005	ENSPSMG00000023002	ENSPSMG00000022999	ENSPSMG00000022994	ENSPSMG00000022993	OR5C1 (ENSPSMG00000022988)	OR1K1 (ENSPSMG00000022985)	PDCL (ENSPSMG00000022983)	RC3H2 (ENSPSMG00000022961)	ZBTB6 (ENSPSMG00000022921)	ZBTB26 (ENSPSMG00000022920)	RABGAP1 (ENSPSMG00000022917)	STRBP (ENSPSMG00000022889)	CRB2 (ENSPSMG00000022863) #22	DENND1A (ENSPSMG00000022823) #23	LHX2 (ENSPSMG00000022690)	ENSPSMG00000022686	NEK6 (ENSPSMG00000022654)	PSMB7 (ENSPSMG00000022579)	ADGRD2 (ENSPSMG00000022563)	NR5A1 (ENSPSMG00000022550)	NR6A1 (ENSPSMG00000022523)	OLFML2A (ENSPSMG00000022484)	WDR38 (ENSPSMG00000022469)	RPL35 (ENSPSMG00000022453)	ENSPSMG00000022444	GOLGA1 (ENSPSMG00000022419)	SCAI (ENSPSMG00000022368)
Bushbaby	MODERN SPECIES	129	ENSOGAG00000029409	OR1B1 (ENSOGAG00000006452)	ENSOGAG00000033185	ENSOGAG00000006455	ENSOGAG00000030138	ENSOGAG00000015770	ENSOGAG00000030362	OR5C1 (ENSOGAG00000006530)	ENSOGAG00000032872	PDCL (ENSOGAG00000011889)	RC3H2 (ENSOGAG00000010678)	ZBTB6 (ENSOGAG00000010682)	ZBTB26 (ENSOGAG00000010685)	RABGAP1 (ENSOGAG00000014722)	STRBP (ENSOGAG00000014739)	CRB2 (ENSOGAG00000031205) #22	DENND1A (ENSOGAG00000013851) #23	ENSOGAG00000024358	LHX2 (ENSOGAG00000003505)	NEK6 (ENSOGAG00000003510)	PSMB7 (ENSOGAG00000003513)	ADGRD2 (ENSOGAG00000003517)	NR5A1 (ENSOGAG00000017023)	NR6A1 (ENSOGAG00000030677)	OLFML2A (ENSOGAG00000008504)	WDR38 (ENSOGAG00000008507)	ENSOGAG00000008513	ARPC5L (ENSOGAG00000030099)	GOLGA1 (ENSOGAG00000008519)	SCAI (ENSOGAG00000008529)	PPP6C (ENSOGAG00000025294)
Euarchontoglires_A	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00930000151076	ENSGT00900000141254	ENSGT00940000163223	ENSGT00940000161916	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
Glires	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00900000141254	ENSGT00940000163223	ENSGT00940000161916	ENSGT00940000165463	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
Rodentia	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000163649	ENSGT00930000151076	ENSGT00900000141254	ENSGT00940000161916	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.f	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
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Myomorpha	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00730000111617	ENSGT00940000163649	ENSGT00930000151076	ENSGT00900000141254	ENSGT00940000161916	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.f	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763	ENSGT00940000154787
Muroidea	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00730000111617	ENSGT00940000163649	ENSGT00930000151076	ENSGT00900000141254	ENSGT00940000161916	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.f	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763	ENSGT00940000154787
Muroidea_A	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00730000111617	ENSGT00940000163649	ENSGT00930000151076	ENSGT00900000141254	ENSGT00940000161916	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.f.e.a	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961
Cricetidae	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00730000111617	ENSGT00940000163649	ENSGT00930000151076	ENSGT00900000141254	ENSGT00940000161916	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.f.e.a	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961
Cricetidae_B	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00730000111617	ENSGT00940000163649	ENSGT00930000151076	ENSGT00900000141254	ENSGT00940000161916	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.f.e.a	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961
Northern American deer mouse	MODERN SPECIES	17	Or1l8 (ENSPEMG00000009607)	Or1ak2 (ENSPEMG00000024654)	Or1q1 (ENSPEMG00000018345)	ENSPEMG00000005435	Or1b1 (ENSPEMG00000001255)	ENSPEMG00000003122	Or1af1 (ENSPEMG00000024284)	ENSPEMG00000024732	Or5c1 (ENSPEMG00000009385)	Pdcl (ENSPEMG00000031426)	Rc3h2 (ENSPEMG00000023441)	Zbtb6 (ENSPEMG00000031005)	ENSPEMG00000029320	Rabgap1 (ENSPEMG00000022679)	Strbp (ENSPEMG00000022984)	Crb2 (ENSPEMG00000023678) #22	Dennd1a (ENSPEMG00000001409) #23	Lhx2 (ENSPEMG00000023994)	Nek6 (ENSPEMG00000023305)	Psmb7 (ENSPEMG00000011436)	Nr5a1 (ENSPEMG00000018185)	Nr6a1 (ENSPEMG00000021698)	Olfml2a (ENSPEMG00000029944)	Wdr38 (ENSPEMG00000010623)	ENSPEMG00000021500	Arpc5l (ENSPEMG00000022681)	Golga1 (ENSPEMG00000014526)	Scai (ENSPEMG00000017936)	Ppp6c (ENSPEMG00000013119)
Prairie vole	MODERN SPECIES	12	Nrp1 (ENSMOCG00000002681)	Itgb1 (ENSMOCG00000019200)	ENSMOCG00000014584	ENSMOCG00000020281	ENSMOCG00000009744	Ccny (ENSMOCG00000022281)	Gjd4 (ENSMOCG00000004130)	Fzd8 (ENSMOCG00000010067)	Pdcl (ENSMOCG00000005925)	Rc3h2 (ENSMOCG00000009592)	Zbtb6 (ENSMOCG00000003885)	Zbtb26 (ENSMOCG00000005785)	Rabgap1 (ENSMOCG00000015881)	Gpr21 (ENSMOCG00000019492)	Strbp (ENSMOCG00000022231)	Crb2 (ENSMOCG00000017592) #22	ENSMOCG00000020847 #23	ENSMOCG00000005120 #23	Lhx2 (ENSMOCG00000018166)	Nek6 (ENSMOCG00000020840)	ENSMOCG00000019583	Nr5a1 (ENSMOCG00000022516)	ENSMOCG00000000723	Nr6a1 (ENSMOCG00000013647)	Olfml2a (ENSMOCG00000006167)	Wdr38 (ENSMOCG00000016384)	ENSMOCG00000010619	Arpc5l (ENSMOCG00000012044)	Golga1 (ENSMOCG00000001056)	Scai (ENSMOCG00000021543)	Ppp6c (ENSMOCG00000002091)
Cricetinae	ANCESTRAL SPECIES	57						ENSGT00940000161916	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.f.e.b	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961
Chinese hamster chok1gshd	MODERN SPECIES	318				ENSCGRG00001013979	ENSCGRG00001013906	Or1af1 (ENSCGRG00001013629)	ENSCGRG00001013584	ENSCGRG00001010875	Or5c1 (ENSCGRG00001013818)	Pdcl (ENSCGRG00001010795)	Rc3h2 (ENSCGRG00001010006)	ENSCGRG00001013848	Zbtb26 (ENSCGRG00001009545)	Rabgap1 (ENSCGRG00001008620)	Strbp (ENSCGRG00001006354)	Crb2 (ENSCGRG00001004582) #22	ENSCGRG00001004172	ENSCGRG00001013652	Dennd1a (ENSCGRG00001003432) #23	Lhx2 (ENSCGRG00001001336)	Nek6 (ENSCGRG00001000656)	Psmb7 (ENSCGRG00001020058)	Nr5a1 (ENSCGRG00001017535)	Nr6a1 (ENSCGRG00001017242)	Olfml2a (ENSCGRG00001016979)	Wdr38 (ENSCGRG00001016663)	ENSCGRG00001016006	Arpc5l (ENSCGRG00001015810)	Golga1 (ENSCGRG00001013164)	Scai (ENSCGRG00001011822)	Ttll11 (ENSCGRG00001010972)
Golden Hamster	MODERN SPECIES	739	Mrrf (ENSMAUG00000003771)	Ptgs1 (ENSMAUG00000006589)	ENSMAUG00000016503	Or1j19 (ENSMAUG00000006683)	Or1j21 (ENSMAUG00000019019)	Or1j4 (ENSMAUG00000016620)	Or1n2 (ENSMAUG00000005622)	Or1l8 (ENSMAUG00000006811)	Or5c1 (ENSMAUG00000006357)	Pdcl (ENSMAUG00000002651)	Rc3h2 (ENSMAUG00000003117)	Zbtb6 (ENSMAUG00000000804)	Zbtb26 (ENSMAUG00000001114)	Rabgap1 (ENSMAUG00000014606)	Strbp (ENSMAUG00000016102)	Crb2 (ENSMAUG00000017538) #22	ENSMAUG00000015217 #23	ENSMAUG00000016980 #23	Lhx2 (ENSMAUG00000000473)	Nek6 (ENSMAUG00000014034)	Psmb7 (ENSMAUG00000009541)	Nr5a1 (ENSMAUG00000011097)	Nr6a1 (ENSMAUG00000020320)	Olfml2a (ENSMAUG00000014419)	Wdr38 (ENSMAUG00000005054)	ENSMAUG00000001728	Arpc5l (ENSMAUG00000020262)	Golga1 (ENSMAUG00000017375)	Scai (ENSMAUG00000016374)	Ppp6c (ENSMAUG00000019280)	ENSMAUG00000021988
Murinae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000163451.b	ENSGT00940000163103	ENSGT00940000162739	ENSGT00730000111617	ENSGT00940000163649	ENSGT00930000151076.a	ENSGT00940000163456	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.f.e.a	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000157521.b	ENSGT00390000008033
Mus	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000163649	ENSGT00930000151076.a	ENSGT00930000151076.b.a	ENSGT00930000151076.b.b	ENSGT00900000141254	ENSGT00940000161916	ENSGT00940000163938	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.f.e.a	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000157521.b	ENSGT00390000008033
Mus_A	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00930000151076.a	ENSGT00930000151076.b.a	ENSGT00930000151076.b.b	ENSGT00900000141254	ENSGT00940000161916.i	ENSGT00940000161916.j	ENSGT00940000163938	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.f.e.a	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000157521.b	ENSGT00390000008033
Mus_B	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00930000151076.a	ENSGT00930000151076.b.a	ENSGT00930000151076.b.b	ENSGT00900000141254	ENSGT00940000161916.i	ENSGT00940000161916.j	ENSGT00940000163938	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.f.e.a	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000157521.b	ENSGT00390000008033
Mus_C	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00930000151076.a	ENSGT00930000151076.b.a	ENSGT00930000151076.b.b	ENSGT00900000141254	ENSGT00940000161916.i	ENSGT00940000161916.j	ENSGT00940000163938	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.f.e.a	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00390000012037.x	ENSGT00940000157521.b
spretus	MODERN SPECIES	11	Or12k5 (MGP_SPRETEiJ_G0024427)	Or12k7 (MGP_SPRETEiJ_G0024428)	Or12k8 (MGP_SPRETEiJ_G0024429)	Or1b1 (MGP_SPRETEiJ_G0024430)	Or1l4 (MGP_SPRETEiJ_G0024431)	Or1l4b (MGP_SPRETEiJ_G0024432)	Or1af1 (MGP_SPRETEiJ_G0024433)	Or5c1 (MGP_SPRETEiJ_G0024434)	Pdcl (MGP_SPRETEiJ_G0024435)	Rc3h2 (MGP_SPRETEiJ_G0024436)	Zbtb6 (MGP_SPRETEiJ_G0024437)	Zbtb26 (MGP_SPRETEiJ_G0024438)	Rabgap1 (MGP_SPRETEiJ_G0024439)	MGP_SPRETEiJ_G0024440	Gpr21 (MGP_SPRETEiJ_G0024441)	Crb2 (MGP_SPRETEiJ_G0024442) #22	Dennd1a (MGP_SPRETEiJ_G0024443) #23	Lhx2 (MGP_SPRETEiJ_G0024444)	Nek6 (MGP_SPRETEiJ_G0024445)	Psmb7 (MGP_SPRETEiJ_G0024446)	Nr5a1 (MGP_SPRETEiJ_G0024447)	Nr6a1 (MGP_SPRETEiJ_G0024448)	Olfml2a (MGP_SPRETEiJ_G0024449)	Wdr38 (MGP_SPRETEiJ_G0024450)	MGP_SPRETEiJ_G0024451	Arpc5l (MGP_SPRETEiJ_G0024452)	Golga1 (MGP_SPRETEiJ_G0024453)	Scai (MGP_SPRETEiJ_G0024454)	Ppp6c (MGP_SPRETEiJ_G0024455)	MGP_SPRETEiJ_G0024456	Lrp1b (MGP_SPRETEiJ_G0024457)
Steppe mouse	MODERN SPECIES	3157	Or1q1 (ENSMSIG00000001324)	Or12k5 (ENSMSIG00000001316)	Or12k7 (ENSMSIG00000001300)	Or1b1 (ENSMSIG00000001286)	Or1l4b (ENSMSIG00000001264)	Or1l4 (ENSMSIG00000001248)	ENSMSIG00000001220	Or1af1 (ENSMSIG00000001213)	Or5c1 (ENSMSIG00000001203)	Pdcl (ENSMSIG00000001175)	Rc3h2 (ENSMSIG00000001099)	Zbtb6 (ENSMSIG00000001048)	Zbtb26 (ENSMSIG00000001038)	Rabgap1 (ENSMSIG00000000948)	Strbp (ENSMSIG00000000857)	Crb2 (ENSMSIG00000000810) #22	Dennd1a (ENSMSIG00000000638) #23	Lhx2 (ENSMSIG00000000576)	Nek6 (ENSMSIG00000000470)	Psmb7 (ENSMSIG00000000365)	Nr5a1 (ENSMSIG00000000273)	Nr6a1 (ENSMSIG00000000135)	Olfml2a (ENSMSIG00000026578)	Wdr38 (ENSMSIG00000026555)	ENSMSIG00000026549	Arpc5l (ENSMSIG00000026537)	Golga1 (ENSMSIG00000026434)	Scai (ENSMSIG00000026395)	Ppp6c (ENSMSIG00000026363)
Mouse	MODERN SPECIES	11	Or12k5 (ENSMUSG00000075379)	Or12k7 (ENSMUSG00000083361)	Or12k8 (ENSMUSG00000075378)	Or1b1 (ENSMUSG00000075377)	Or1l4b (ENSMUSG00000078198)	Or1l4 (ENSMUSG00000059429)	Or1af1 (ENSMUSG00000068947)	Or5c1 (ENSMUSG00000049018)	Pdcl (ENSMUSG00000009030)	Rc3h2 (ENSMUSG00000075376)	Zbtb6 (ENSMUSG00000066798)	Zbtb26 (ENSMUSG00000050714)	Rabgap1 (ENSMUSG00000035437)	Strbp (ENSMUSG00000026915)	Gpr21 (ENSMUSG00000053164)	Crb2 (ENSMUSG00000035403) #22	Dennd1a (ENSMUSG00000035392) #23	Lhx2 (ENSMUSG00000000247)	Nek6 (ENSMUSG00000026749)	Psmb7 (ENSMUSG00000026750)	Nr5a1 (ENSMUSG00000026751)	Nr6a1 (ENSMUSG00000063972)	Olfml2a (ENSMUSG00000046618)	Wdr38 (ENSMUSG00000035295)	Rpl35 (ENSMUSG00000062997)	Arpc5l (ENSMUSG00000026755)	Golga1 (ENSMUSG00000026754)	Scai (ENSMUSG00000035236)	Ppp6c (ENSMUSG00000026753)	Lrp1b (ENSMUSG00000049252)	Kynu (ENSMUSG00000026866)
Ryukyu mouse	MODERN SPECIES	11	Or12k5 (MGP_CAROLIEiJ_G0023507)	Or12k7 (MGP_CAROLIEiJ_G0023508)	Or12k8 (MGP_CAROLIEiJ_G0023509)	Or1b1 (MGP_CAROLIEiJ_G0023510)	Or1l4b (MGP_CAROLIEiJ_G0023511)	Or1l4 (MGP_CAROLIEiJ_G0023512)	Or1af1 (MGP_CAROLIEiJ_G0023513)	Or5c1 (MGP_CAROLIEiJ_G0023514)	Pdcl (MGP_CAROLIEiJ_G0023515)	Rc3h2 (MGP_CAROLIEiJ_G0023516)	Zbtb6 (MGP_CAROLIEiJ_G0023517)	Zbtb26 (MGP_CAROLIEiJ_G0023518)	Rabgap1 (MGP_CAROLIEiJ_G0023519)	Strbp (MGP_CAROLIEiJ_G0023520)	Gpr21 (MGP_CAROLIEiJ_G0023521)	Crb2 (MGP_CAROLIEiJ_G0023522) #22	Dennd1a (MGP_CAROLIEiJ_G0023523) #23	Lhx2 (MGP_CAROLIEiJ_G0023524)	Nek6 (MGP_CAROLIEiJ_G0023525)	Psmb7 (MGP_CAROLIEiJ_G0023526)	Nr5a1 (MGP_CAROLIEiJ_G0023527)	Nr6a1 (MGP_CAROLIEiJ_G0023528)	Olfml2a (MGP_CAROLIEiJ_G0023529)	Wdr38 (MGP_CAROLIEiJ_G0023530)	MGP_CAROLIEiJ_G0023531	Arpc5l (MGP_CAROLIEiJ_G0023532)	Golga1 (MGP_CAROLIEiJ_G0023533)	Scai (MGP_CAROLIEiJ_G0023534)	Ppp6c (MGP_CAROLIEiJ_G0023535)	MGP_CAROLIEiJ_G0023536	Lrp1b (MGP_CAROLIEiJ_G0023537)
Shrew mouse	MODERN SPECIES	16	Or1ak2 (MGP_PahariEiJ_G0024960)	Or1q1 (MGP_PahariEiJ_G0024961)	Or12k5 (MGP_PahariEiJ_G0024962)	Or12k7 (MGP_PahariEiJ_G0024963)	Or12k8 (MGP_PahariEiJ_G0024964)	MGP_PahariEiJ_G0024965	Or1af1 (MGP_PahariEiJ_G0024966)	Or5c1 (MGP_PahariEiJ_G0024967)	Pdcl (MGP_PahariEiJ_G0024968)	Rc3h2 (MGP_PahariEiJ_G0024969)	Zbtb6 (MGP_PahariEiJ_G0024970)	Zbtb26 (MGP_PahariEiJ_G0024971)	Rabgap1 (MGP_PahariEiJ_G0024972)	Strbp (MGP_PahariEiJ_G0024973)	Gpr21 (MGP_PahariEiJ_G0024974)	Crb2 (MGP_PahariEiJ_G0024975) #22	Dennd1a (MGP_PahariEiJ_G0024976) #23	Lhx2 (MGP_PahariEiJ_G0024977)	Nek6 (MGP_PahariEiJ_G0024978)	Psmb7 (MGP_PahariEiJ_G0024979)	Nr5a1 (MGP_PahariEiJ_G0024980)	Nr6a1 (MGP_PahariEiJ_G0024981)	Olfml2a (MGP_PahariEiJ_G0024982)	MGP_PahariEiJ_G0024983	Arpc5l (MGP_PahariEiJ_G0024984)	Golga1 (MGP_PahariEiJ_G0024985)	Scai (MGP_PahariEiJ_G0024986)	Ppp6c (MGP_PahariEiJ_G0024987)	Lrp1b (MGP_PahariEiJ_G0024988)	Kynu (MGP_PahariEiJ_G0024989)	Arhgap15 (MGP_PahariEiJ_G0024990)
Rat	MODERN SPECIES	13	ENSRNOG00000065620	ENSRNOG00000068416	Elob-ps13 (ENSRNOG00000046568)	ENSRNOG00000066103	ENSRNOG00000069411	LOC100911251 (ENSRNOG00000062482)	ENSRNOG00000067722	Pdcl (ENSRNOG00000008484)	Rc3h2 (ENSRNOG00000009196)	Zbtb6 (ENSRNOG00000009340)	Zbtb26 (ENSRNOG00000009346)	Rabgap1 (ENSRNOG00000009402)	Gpr21 (ENSRNOG00000042269)	Strbp (ENSRNOG00000010150)	RGD1561137 (ENSRNOG00000030143)	Crb2 (ENSRNOG00000025498) #22	Dennd1a (ENSRNOG00000010526) #23	Lhx2 (ENSRNOG00000010551)	Nek6 (ENSRNOG00000010897)	Psmb7 (ENSRNOG00000011732)	ENSRNOG00000066446	Rps20 (ENSRNOG00000029627)	Nr5a1 (ENSRNOG00000012682)	Nr6a1 (ENSRNOG00000013232)	Olfml2a (ENSRNOG00000014034)	Wdr38 (ENSRNOG00000014102)	Rpl35 (ENSRNOG00000014272)	Arpc5l (ENSRNOG00000014317)	Golga1 (ENSRNOG00000014493)	Scai (ENSRNOG00000025278)	Ppp6c (ENSRNOG00000015145)
Upper Galilee mountains blind mole rat	MODERN SPECIES	513	ENSNGAG00000016244	Or1j4 (ENSNGAG00000019324)	ENSNGAG00000014893	ENSNGAG00000017161	ENSNGAG00000019594	ENSNGAG00000020457	ENSNGAG00000011280	Or5c1 (ENSNGAG00000015367)	Pdcl (ENSNGAG00000005582)	ENSNGAG00000009763	Zbtb6 (ENSNGAG00000021046)	Zbtb26 (ENSNGAG00000001562)	Rabgap1 (ENSNGAG00000017183)	Gpr21 (ENSNGAG00000009678)	Strbp (ENSNGAG00000014638)	Crb2 (ENSNGAG00000004692) #22	ENSNGAG00000011495 #23	ENSNGAG00000003822 #23	Lhx2 (ENSNGAG00000013721)	Nek6 (ENSNGAG00000017493)	Psmb7 (ENSNGAG00000016549)	Nr5a1 (ENSNGAG00000018329)	Nr6a1 (ENSNGAG00000019760)	Olfml2a (ENSNGAG00000006763)	ENSNGAG00000016210	ENSNGAG00000012132	Arpc5l (ENSNGAG00000004816)	Golga1 (ENSNGAG00000017928)	Scai (ENSNGAG00000009532)	ENSNGAG00000000167	Rabepk (ENSNGAG00000009850)
Lesser Egyptian jerboa	MODERN SPECIES	94	Or1j21 (ENSJJAG00000007756)	Or1j4 (ENSJJAG00000016748)	Or1j1 (ENSJJAG00000004843)	Or1l8 (ENSJJAG00000009930)	ENSJJAG00000002221	Or1q1 (ENSJJAG00000007797)	ENSJJAG00000011225	ENSJJAG00000024210	Pdcl (ENSJJAG00000011208)	Rc3h2 (ENSJJAG00000022376)	Zbtb6 (ENSJJAG00000007276)	ENSJJAG00000002859	Rabgap1 (ENSJJAG00000014056)	Gpr21 (ENSJJAG00000010982)	Strbp (ENSJJAG00000008449)	Crb2 (ENSJJAG00000019604) #22	ENSJJAG00000018640 #23	Lhx2 (ENSJJAG00000015440)	Nek6 (ENSJJAG00000015974)	ENSJJAG00000020212	Nr5a1 (ENSJJAG00000023318)	Nr6a1 (ENSJJAG00000016130)	Olfml2a (ENSJJAG00000017354)	Wdr38 (ENSJJAG00000008331)	ENSJJAG00000014897	Arpc5l (ENSJJAG00000013733)	Golga1 (ENSJJAG00000024183)	Scai (ENSJJAG00000020518)	ENSJJAG00000000698	ENSJJAG00000011633	Rabepk (ENSJJAG00000023084)
Kangaroo rat	MODERN SPECIES	374							ENSDORG00000029300	Or5c1 (ENSDORG00000025218)	Pdcl (ENSDORG00000029509)	Rc3h2 (ENSDORG00000006398)	Zbtb6 (ENSDORG00000025398)	Zbtb26 (ENSDORG00000006402)	Rabgap1 (ENSDORG00000012123)	Gpr21 (ENSDORG00000012136)	ENSDORG00000012137	Crb2 (ENSDORG00000002814) #22	Dennd1a (ENSDORG00000002817) #23	Lhx2 (ENSDORG00000025403)	ENSDORG00000025549	Nek6 (ENSDORG00000014518)	Psmb7 (ENSDORG00000014519)	Nr5a1 (ENSDORG00000028222)	Nr6a1 (ENSDORG00000013606)	Olfml2a (ENSDORG00000013607)	Wdr38 (ENSDORG00000012116)	ENSDORG00000012125	Arpc5l (ENSDORG00000027899)	Golga1 (ENSDORG00000012132)	Scai (ENSDORG00000012138)	ENSDORG00000028487	Rabepk (ENSDORG00000014417)
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Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000154381.i.a.b.a.a.b.a.a	ENSGT00930000151076	ENSGT00900000141254	ENSGT00940000161916	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990.j	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.f	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
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Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	44	ENSUPAG00010012605	ENSUPAG00010012608	OR1B1 (ENSUPAG00010012614)	ENSUPAG00010012616	ENSUPAG00010012618	ENSUPAG00010012623	ENSUPAG00010012631	OR5C1 (ENSUPAG00010012749)	OR1K1 (ENSUPAG00010012753)	PDCL (ENSUPAG00010012754)	RC3H2 (ENSUPAG00010012762)	ZBTB6 (ENSUPAG00010012844)	ZBTB26 (ENSUPAG00010012848)	RABGAP1 (ENSUPAG00010012857)	STRBP (ENSUPAG00010012985)	CRB2 (ENSUPAG00010013102) #22	DENND1A (ENSUPAG00010013123) #23	LHX2 (ENSUPAG00010013245)	NEK6 (ENSUPAG00010013255)	PSMB7 (ENSUPAG00010013273)	ADGRD2 (ENSUPAG00010013284)	NR5A1 (ENSUPAG00010013310)	NR6A1 (ENSUPAG00010013329)	OLFML2A (ENSUPAG00010013389)	RPL35 (ENSUPAG00010013420)	WDR38 (ENSUPAG00010013438)	ARPC5L (ENSUPAG00010013460)	GOLGA1 (ENSUPAG00010013479)	SCAI (ENSUPAG00010013570)	PPP6C (ENSUPAG00010013600)	RABEPK (ENSUPAG00010013628)
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Guinea pig	MODERN SPECIES	27	ENSCPOG00000030587	ENSCPOG00000032036	ENSCPOG00000040622	ENSCPOG00000022961	OR1B1 (ENSCPOG00000021126)	ENSCPOG00000013079	ENSCPOG00000023130	ENSCPOG00000024385	OR5C1 (ENSCPOG00000001175)	PDCL (ENSCPOG00000009509)	RC3H2 (ENSCPOG00000008511)	ZBTB6 (ENSCPOG00000039487)	ZBTB26 (ENSCPOG00000032601)	RABGAP1 (ENSCPOG00000009811)	STRBP (ENSCPOG00000009817)	CRB2 (ENSCPOG00000010074) #22	DENND1A (ENSCPOG00000014548) #23	LHX2 (ENSCPOG00000022927)	NEK6 (ENSCPOG00000007827)	PSMB7 (ENSCPOG00000007839)	ADGRD2 (ENSCPOG00000027184)	NR5A1 (ENSCPOG00000022305)	NR6A1 (ENSCPOG00000005970)	OLFML2A (ENSCPOG00000003516)	RPL35 (ENSCPOG00000022811)	ARPC5L (ENSCPOG00000036902)	GOLGA1 (ENSCPOG00000014706)	SCAI (ENSCPOG00000001406)	PPP6C (ENSCPOG00000004898)	RABEPK (ENSCPOG00000026070)	ENSCPOG00000012520
Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000154381.h	ENSGT00940000154381.g.a	ENSGT00940000163027	ENSGT00940000163995	ENSGT00940000162508	ENSGT00940000162739	ENSGT00940000163223	ENSGT00940000161916	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B.c	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00390000016384.f.e.a	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763	ENSGT00940000154787	ENSGT00940000156611
Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	126	OR1N2 (ENSCLAG00000017933)	ENSCLAG00000016807	ENSCLAG00000015371	ENSCLAG00000017825	ENSCLAG00000014089	OR1L3 (ENSCLAG00000017806)	ENSCLAG00000017871	ENSCLAG00000018047	ENSCLAG00000017880	PDCL (ENSCLAG00000014566)	RC3H2 (ENSCLAG00000013261)	ZBTB6 (ENSCLAG00000016422)	ZBTB26 (ENSCLAG00000016744)	RABGAP1 (ENSCLAG00000010301)	STRBP (ENSCLAG00000010826)	CRB2 (ENSCLAG00000015580) #22	DENND1A (ENSCLAG00000010455) #23	LHX2 (ENSCLAG00000010277)	NEK6 (ENSCLAG00000009797)	PSMB7 (ENSCLAG00000013548)	NR5A1 (ENSCLAG00000012090)	NR6A1 (ENSCLAG00000012774)	OLFML2A (ENSCLAG00000014121)	RPL35 (ENSCLAG00000013142)	ARPC5L (ENSCLAG00000009936)	GOLGA1 (ENSCLAG00000011649)	SCAI (ENSCLAG00000013682)	PPP6C (ENSCLAG00000013734)	RABEPK (ENSCLAG00000011734)	HSPA5 (ENSCLAG00000009815)	GAPVD1 (ENSCLAG00000010577)
Degu	MODERN SPECIES	179				ENSODEG00000006064	ENSODEG00000006020	ENSODEG00000006008	PDCL (ENSODEG00000005932)	ENSODEG00000005918	ZBTB6 (ENSODEG00000019273)	ZBTB26 (ENSODEG00000005887)	ENSODEG00000019228	ENSODEG00000019246	RABGAP1 (ENSODEG00000004811)	ENSODEG00000004632	ENSODEG00000019097	CRB2 (ENSODEG00000004481) #22	DENND1A (ENSODEG00000004310) #23	LHX2 (ENSODEG00000004212)	ENSODEG00000004179	NEK6 (ENSODEG00000004126)	ENSODEG00000019019	ENSODEG00000004257	NR5A1 (ENSODEG00000004244)	ENSODEG00000004234	NR6A1 (ENSODEG00000004183)	OLFML2A (ENSODEG00000004138)	ENSODEG00000004120	ENSODEG00000004095	GOLGA1 (ENSODEG00000003980)	SCAI (ENSODEG00000003843)	ENSODEG00000003771
Lagomorpha	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00730000111617	ENSGT00940000165929	ENSGT00940000163649	ENSGT00900000141254	ENSGT00940000163223	ENSGT00940000161916	ENSGT00940000165463	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
Pika	MODERN SPECIES	2066																CRB2 (ENSOPRG00000008501) #22	DENND1A (ENSOPRG00000008524) #23	ENSOPRG00000008555
Laurasiatheria	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000164453	ENSGT00940000163223	ENSGT00940000165463	ENSGT00940000161916	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
Laurasiatheria_a	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000163223	ENSGT00940000161916	ENSGT00940000165463	ENSGT00940000165831	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
Artiodactyla	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000163223	ENSGT00940000161916	ENSGT00940000165463	ENSGT00940000165831	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
Suina	ANCESTRAL SPECIES	37			ENSGT00730000111617	ENSGT00940000163223	ENSGT00940000163456	ENSGT00940000162508.c.a.b	ENSGT00940000163038.a.b.o	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
Chacoan peccary	MODERN SPECIES	887	ENSCWAG00000017767	ENSCWAG00000017736	ENSCWAG00000017712	ENSCWAG00000017690	ENSCWAG00000017637	ENSCWAG00000017381	ENSCWAG00000017362	OR5C1 (ENSCWAG00000017342)	OR1K1 (ENSCWAG00000017328)	PDCL (ENSCWAG00000017304)	RC3H2 (ENSCWAG00000017257)	ZBTB6 (ENSCWAG00000017232)	ZBTB26 (ENSCWAG00000017216)	RABGAP1 (ENSCWAG00000017187)	STRBP (ENSCWAG00000017145)	CRB2 (ENSCWAG00000017032) #22	DENND1A (ENSCWAG00000016950) #23	LHX2 (ENSCWAG00000016921)	NEK6 (ENSCWAG00000016836)	PSMB7 (ENSCWAG00000016793)	ADGRD2 (ENSCWAG00000016668)	NR5A1 (ENSCWAG00000016562)	NR6A1 (ENSCWAG00000016277)	OLFML2A (ENSCWAG00000016191)	WDR38 (ENSCWAG00000016114)	ENSCWAG00000016078	ARPC5L (ENSCWAG00000016051)	GOLGA1 (ENSCWAG00000015995)	SCAI (ENSCWAG00000015880)	PPP6C (ENSCWAG00000015841)	RABEPK (ENSCWAG00000015788)
Pig	MODERN SPECIES		ENSSSCG00000055994	ENSSSCG00000035439	ENSSSCG00000056140	ENSSSCG00000059550	ENSSSCG00000055555	ENSSSCG00000055627	ENSSSCG00000044533	OR5C1 (ENSSSCG00000005578)	OR1K1 (ENSSSCG00000039297)	PDCL (ENSSSCG00000038554)	RC3H2 (ENSSSCG00000005575)	ZBTB6 (ENSSSCG00000005576)	ZBTB26 (ENSSSCG00000032575)	RABGAP1 (ENSSSCG00000020743)	STRBP (ENSSSCG00000005582)	CRB2 (ENSSSCG00000005584) #22	DENND1A (ENSSSCG00000005585) #23	LHX2 (ENSSSCG00000005586)	NEK6 (ENSSSCG00000005587)	PSMB7 (ENSSSCG00000005590)	ADGRD2 (ENSSSCG00000005591)	NR5A1 (ENSSSCG00000005588)	NR6A1 (ENSSSCG00000005589)	ENSSSCG00000058119	OLFML2A (ENSSSCG00000005593)	WDR38 (ENSSSCG00000005594)	RPL35 (ENSSSCG00000034227)	ARPC5L (ENSSSCG00000005596)	GOLGA1 (ENSSSCG00000005597)	SCAI (ENSSSCG00000005598)	PPP6C (ENSSSCG00000005600)
Artiodactyla_a	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000163223	ENSGT00940000161916	ENSGT00940000165463	ENSGT00940000165831	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
Camelidae	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000163649	ENSGT00900000141254	ENSGT00940000164453.b	ENSGT00940000163223	ENSGT00940000165463	ENSGT00940000163938	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
Arabian camel	MODERN SPECIES	30	OR1Q1 (ENSCDRG00005008121)	ENSCDRG00005008062	OR1B1 (ENSCDRG00005008054)	OR1L1 (ENSCDRG00005008045)	OR1L3 (ENSCDRG00005008027)	ENSCDRG00005008008	ENSCDRG00005007955	OR5C1 (ENSCDRG00005007927)	OR1K1 (ENSCDRG00005007911)	PDCL (ENSCDRG00005007891)	RC3H2 (ENSCDRG00005007722)	ZBTB6 (ENSCDRG00005007683)	ZBTB26 (ENSCDRG00005007665)	RABGAP1 (ENSCDRG00005007528)	STRBP (ENSCDRG00005007449)	CRB2 (ENSCDRG00005007355) #22	DENND1A (ENSCDRG00005006927) #23	ENSCDRG00005006859	NEK6 (ENSCDRG00005006640)	PSMB7 (ENSCDRG00005006562)	ADGRD2 (ENSCDRG00005006465)	NR5A1 (ENSCDRG00005006378)	NR6A1 (ENSCDRG00005017082)	OLFML2A (ENSCDRG00005017022)	WDR38 (ENSCDRG00005016977)	ENSCDRG00005016937	ARPC5L (ENSCDRG00005016882)	GOLGA1 (ENSCDRG00005016743)	SCAI (ENSCDRG00005016671)	PPP6C (ENSCDRG00005016612)	RABEPK (ENSCDRG00005016565)
Artiodactyla_b	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000163223	ENSGT00940000161916	ENSGT00940000165463	ENSGT00940000165831	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
Cetacea	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000156868	ENSGT00390000013765	ENSGT00910000145076	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000010743.b	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000162852.b.a	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
Odontoceti	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00390000018089	ENSGT00940000156868	ENSGT00390000013765	ENSGT00910000145076	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000010743.b	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000162852.b.a	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763	ENSGT00940000154787
Odontoceti_a	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00390000008938	ENSGT00390000018089	ENSGT00940000156868	ENSGT00390000013765	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000010743.b	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000162852.b.a	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763	ENSGT00940000154787
Odontoceti_b	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000156689	ENSGT00390000008938	ENSGT00390000018089	ENSGT00940000156868	ENSGT00390000013765	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000010743.b	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000162852.b.a	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763	ENSGT00940000154787
Monodontidae	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000156689	ENSGT00390000008938	ENSGT00390000018089	ENSGT00940000156868	ENSGT00390000013765	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000010743.b	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000162852.b.a	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763	ENSGT00940000154787
Beluga whale	MODERN SPECIES	19	DAB2IP (ENSDLEG00000000870)	TTLL11 (ENSDLEG00000000788)	NDUFA8 (ENSDLEG00000000764)	MORN5 (ENSDLEG00000000753)	LHX6 (ENSDLEG00000000734)	RBM18 (ENSDLEG00000000722)	MRRF (ENSDLEG00000000707)	PTGS1 (ENSDLEG00000000675)	OR5C1 (ENSDLEG00000000653)	ENSDLEG00000000638	PDCL (ENSDLEG00000000624)	RC3H2 (ENSDLEG00000000584)	ZBTB26 (ENSDLEG00000000549)	RABGAP1 (ENSDLEG00000000486)	STRBP (ENSDLEG00000000427)	CRB2 (ENSDLEG00000000376) #22	ENSDLEG00000000352	ENSDLEG00000000331	DENND1A (ENSDLEG00000000198) #23	LHX2 (ENSDLEG00000000097)	NEK6 (ENSDLEG00000000066)	PSMB7 (ENSDLEG00000000050)	NR5A1 (ENSDLEG00000015804)	ENSDLEG00000015771	NR6A1 (ENSDLEG00000015711)	OLFML2A (ENSDLEG00000015685)	RPL35 (ENSDLEG00000015667)	ARPC5L (ENSDLEG00000015658)	GOLGA1 (ENSDLEG00000015625)	SCAI (ENSDLEG00000015503)	PPP6C (ENSDLEG00000015466)
Narwhal	MODERN SPECIES	312	ENSMMNG00015017437	DAB2IP (ENSMMNG00015017613)	TTLL11 (ENSMMNG00015017872)	NDUFA8 (ENSMMNG00015017957)	MORN5 (ENSMMNG00015017987)	LHX6 (ENSMMNG00015018081)	RBM18 (ENSMMNG00015018256)	MRRF (ENSMMNG00015018364)	PTGS1 (ENSMMNG00015018448)	PDCL (ENSMMNG00015018554)	RC3H2 (ENSMMNG00015018607)	ZBTB6 (ENSMMNG00015018659)	ZBTB26 (ENSMMNG00015018669)	RABGAP1 (ENSMMNG00015018694)	STRBP (ENSMMNG00015018777)	CRB2 (ENSMMNG00015018867) #22	DENND1A (ENSMMNG00015018918) #23	ENSMMNG00015018954	ENSMMNG00015018977	ENSMMNG00015018990	NEK6 (ENSMMNG00015019045)	PSMB7 (ENSMMNG00015019159)	ADGRD2 (ENSMMNG00015019194)	NR5A1 (ENSMMNG00015019244)	NR6A1 (ENSMMNG00015019302)	OLFML2A (ENSMMNG00015019345)	RPL35 (ENSMMNG00015019387)	ARPC5L (ENSMMNG00015019410)	GOLGA1 (ENSMMNG00015019440)	SCAI (ENSMMNG00015019495)	PPP6C (ENSMMNG00015019538)
Vaquita	MODERN SPECIES	17	MORN5 (ENSPSNG00000018254)	LHX6 (ENSPSNG00000017880)	RBM18 (ENSPSNG00000017818)	MRRF (ENSPSNG00000017709)	PTGS1 (ENSPSNG00000017445)	ENSPSNG00000017400	OR5C1 (ENSPSNG00000017144)	ENSPSNG00000017078	PDCL (ENSPSNG00000017032)	RC3H2 (ENSPSNG00000016932)	ZBTB6 (ENSPSNG00000016879)	ZBTB26 (ENSPSNG00000016851)	RABGAP1 (ENSPSNG00000016790)	STRBP (ENSPSNG00000016661)	ENSPSNG00000016590	CRB2 (ENSPSNG00000016494) #22	ENSPSNG00000016443	DENND1A (ENSPSNG00000016381) #23	LHX2 (ENSPSNG00000016296)	NEK6 (ENSPSNG00000015982)	PSMB7 (ENSPSNG00000015876)	NR5A1 (ENSPSNG00000015697)	ENSPSNG00000015665	NR6A1 (ENSPSNG00000015414)	OLFML2A (ENSPSNG00000015295)	RPL35 (ENSPSNG00000015051)	ARPC5L (ENSPSNG00000014993)	GOLGA1 (ENSPSNG00000014918)	SCAI (ENSPSNG00000014857)	PPP6C (ENSPSNG00000014742)	RABEPK (ENSPSNG00000014628)
Dolphin	MODERN SPECIES	972																CRB2 (ENSTTRG00000011567) #22	DENND1A (ENSTTRG00000011581) #23
Sperm whale	MODERN SPECIES	20	GLT6D1 (ENSPCTG00005015920)	ENSPCTG00005015883	ENSPCTG00005015853	ENSPCTG00005015821	NDUFA8 (ENSPCTG00005015736)	RBM18 (ENSPCTG00005015688)	ENSPCTG00005015616	MRRF (ENSPCTG00005015426)	PTGS1 (ENSPCTG00005015161)	PDCL (ENSPCTG00005014807)	RC3H2 (ENSPCTG00005014694)	ZBTB6 (ENSPCTG00005014671)	ZBTB26 (ENSPCTG00005014658)	RABGAP1 (ENSPCTG00005014497)	STRBP (ENSPCTG00005014427)	CRB2 (ENSPCTG00005014259) #22	ENSPCTG00005014200	ENSPCTG00005014157	DENND1A (ENSPCTG00005013710) #23	LHX2 (ENSPCTG00005013579)	PSMB7 (ENSPCTG00005013513)	ENSPCTG00005013273	NR5A1 (ENSPCTG00005013087)	NR6A1 (ENSPCTG00005012676)	OLFML2A (ENSPCTG00005012507)	RPL35 (ENSPCTG00005012446)	ARPC5L (ENSPCTG00005012408)	GOLGA1 (ENSPCTG00005012337)	SCAI (ENSPCTG00005012153)	PPP6C (ENSPCTG00005012010)	RABEPK (ENSPCTG00005011943)
Blue whale	MODERN SPECIES	17	MORN5 (ENSBMSG00010001290)	LHX6 (ENSBMSG00010001363)	RBM18 (ENSBMSG00010001663)	MRRF (ENSBMSG00010001690)	PTGS1 (ENSBMSG00010001760)	ENSBMSG00010001916	ENSBMSG00010001927	ENSBMSG00010001936	OR1K1 (ENSBMSG00010001958)	PDCL (ENSBMSG00010001965)	RC3H2 (ENSBMSG00010002002)	ZBTB6 (ENSBMSG00010002076)	ZBTB26 (ENSBMSG00010002083)	RABGAP1 (ENSBMSG00010002113)	STRBP (ENSBMSG00010002189)	CRB2 (ENSBMSG00010002237) #22	DENND1A (ENSBMSG00010002298) #23	ENSBMSG00010002405	ENSBMSG00010002423	ENSBMSG00010002438	NEK6 (ENSBMSG00010002464)	PSMB7 (ENSBMSG00010002486)	NR5A1 (ENSBMSG00010002525)	NR6A1 (ENSBMSG00010002572)	OLFML2A (ENSBMSG00010002654)	WDR38 (ENSBMSG00010002692)	RPL35 (ENSBMSG00010002712)	ARPC5L (ENSBMSG00010002727)	GOLGA1 (ENSBMSG00010002753)	SCAI (ENSBMSG00010002823)	PPP6C (ENSBMSG00010002860)
Pecora	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000164453.a	ENSGT00940000164453.b	ENSGT00940000163223	ENSGT00940000165463.a	ENSGT00940000161916.v	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
Percora_a	ANCESTRAL SPECIES	27	ENSGT00940000163223	ENSGT00940000165463.a	ENSGT00940000161916.u	ENSGT00940000165463.b	ENSGT00940000165831	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
Bovidae	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000163223	ENSGT00940000165463.a	ENSGT00940000161916.u	ENSGT00940000165463.b	ENSGT00940000165831	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
Bovinae	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000163223	ENSGT00940000165463.a	ENSGT00940000165831	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456.m	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00950000182922.a.b.e.a	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00390000003248.a.a.b	ENSGT00390000011666.h.a.a.b.a.a.b	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566
Bos	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000163223	ENSGT00940000165463.a	ENSGT00940000165831	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456.m	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00950000182922.a.b.e.a	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00390000003248.a.a.b	ENSGT00390000011666.h.a.a.b.a.a.b	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566
Bos_b	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000163456.n.a	ENSGT00940000161916.v.b	ENSGT00940000165831	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456.m	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00950000182922.a.b.e.a	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00390000003248.a.a.b	ENSGT00390000011666.h.a.a.b.a.a.b	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566
Hybrid Bos Indicus	MODERN SPECIES	2	OR1L1 (ENSBIXG00005003133)	OR1L3 (ENSBIXG00005019231)	ENSBIXG00005019218	ENSBIXG00005003131	ENSBIXG00005019201	OR5C1 (ENSBIXG00005019185)	OR1K1 (ENSBIXG00005019174)	PDCL (ENSBIXG00005019164)	RC3H2 (ENSBIXG00005019119)	ZBTB6 (ENSBIXG00005003085)	ZBTB26 (ENSBIXG00005018935)	RABGAP1 (ENSBIXG00005005857)	GPR21 (ENSBIXG00005018797)	ENSBIXG00005018783	STRBP (ENSBIXG00005003042)	CRB2 (ENSBIXG00005007721) #22	DENND1A (ENSBIXG00005018546) #23	ENSBIXG00005018414	ENSBIXG00005018399	LHX2 (ENSBIXG00005018376)	NEK6 (ENSBIXG00005018334)	ENSBIXG00005018237	ADGRD2 (ENSBIXG00005018218)	NR5A1 (ENSBIXG00005007287)	NR6A1 (ENSBIXG00005018129)	ENSBIXG00005017999	OLFML2A (ENSBIXG00005017994)	WDR38 (ENSBIXG00005017964)	ENSBIXG00005017947	ARPC5L (ENSBIXG00005017925)	GOLGA1 (ENSBIXG00005017888)
Cow	MODERN SPECIES	2	OR1L6C (ENSBTAG00000049303)	OR1L6 (ENSBTAG00000052523)	OR1AF3 (ENSBTAG00000038665)	OR1AF1 (ENSBTAG00000004667)	OR1AH6 (ENSBTAG00000030677)	OR5C1 (ENSBTAG00000038249)	OR1K1 (ENSBTAG00000030676)	PDCL (ENSBTAG00000030675)	RC3H2 (ENSBTAG00000023867)	ZBTB6 (ENSBTAG00000039815)	ZBTB26 (ENSBTAG00000038610)	RABGAP1 (ENSBTAG00000039172)	GPR21 (ENSBTAG00000040296)	ENSBTAG00000048537	STRBP (ENSBTAG00000021921)	CRB2 (ENSBTAG00000014391) #22	DENND1A (ENSBTAG00000003610) #23	ENSBTAG00000048688	ENSBTAG00000023860	LHX2 (ENSBTAG00000010990)	NEK6 (ENSBTAG00000019470)	PSMB7 (ENSBTAG00000003067)	ADGRD2 (ENSBTAG00000017576)	NR5A1 (ENSBTAG00000009017)	NR6A1 (ENSBTAG00000040585)	OLFML2A (ENSBTAG00000004848)	WDR38 (ENSBTAG00000039223)	RPL35 (ENSBTAG00000003205)	ARPC5L (ENSBTAG00000015278)	GOLGA1 (ENSBTAG00000015286)	SCAI (ENSBTAG00000015553)
Bos_a	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00930000151076	ENSGT00900000141254	ENSGT00940000164453.a	ENSGT00940000164453.b	ENSGT00940000165463.a	ENSGT00940000165831	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456.m	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763	ENSGT00940000154787
Domestic yak	MODERN SPECIES	28	OR1L1 (ENSBGRG00000014898)	ENSBGRG00000014921	ENSBGRG00000014945	ENSBGRG00000015062	ENSBGRG00000015143	ENSBGRG00000015272	OR5C1 (ENSBGRG00000015398)	OR1K1 (ENSBGRG00000015421)	RC3H2 (ENSBGRG00000015455)	ZBTB6 (ENSBGRG00000015653)	RABGAP1 (ENSBGRG00000015822)	ENSBGRG00000015941	GPR21 (ENSBGRG00000015959)	ENSBGRG00000016005	STRBP (ENSBGRG00000016080)	CRB2 (ENSBGRG00000016962) #22	DENND1A (ENSBGRG00000017060) #23	ENSBGRG00000017559	LHX2 (ENSBGRG00000017595)	NEK6 (ENSBGRG00000017708)	PSMB7 (ENSBGRG00000018037)	NR5A1 (ENSBGRG00000018297)	NR6A1 (ENSBGRG00000018410)	OLFML2A (ENSBGRG00000018998)	WDR38 (ENSBGRG00000019089)	ENSBGRG00000019233	ENSBGRG00000019299	ENSBGRG00000019352	GOLGA1 (ENSBGRG00000019407)	SCAI (ENSBGRG00000019665)	PPP6C (ENSBGRG00000019741)
Wild yak	MODERN SPECIES	534													ENSBMUG00000020791	RABGAP1 (ENSBMUG00000020782)	STRBP (ENSBMUG00000020756)	CRB2 (ENSBMUG00000020716) #22	DENND1A (ENSBMUG00000020652) #23	LHX2 (ENSBMUG00000020558)	NEK6 (ENSBMUG00000020547)	PSMB7 (ENSBMUG00000020516)	NR5A1 (ENSBMUG00000020509)	NR6A1 (ENSBMUG00000020485)	OLFML2A (ENSBMUG00000020472)	WDR38 (ENSBMUG00000020446)	RPL35 (ENSBMUG00000020431)	ARPC5L (ENSBMUG00000020410)	GOLGA1 (ENSBMUG00000020389)	SCAI (ENSBMUG00000020339)	PPP6C (ENSBMUG00000020319)	RABEPK (ENSBMUG00000020294)	HSPA5 (ENSBMUG00000020273)
American bison	MODERN SPECIES	3112	OR1L3 (ENSBBBG00000015356)	ENSBBBG00000003826	ENSBBBG00000015348	ENSBBBG00000007989	ENSBBBG00000015334	ENSBBBG00000003491	OR5C1 (ENSBBBG00000003497)	OR1K1 (ENSBBBG00000003504)	PDCL (ENSBBBG00000003806)	RC3H2 (ENSBBBG00000001251)	ZBTB6 (ENSBBBG00000001347)	RABGAP1 (ENSBBBG00000001355)	GPR21 (ENSBBBG00000001383)	ENSBBBG00000001391	STRBP (ENSBBBG00000001399)	CRB2 (ENSBBBG00000015282) #22	DENND1A (ENSBBBG00000003787) #23	ENSBBBG00000015103	ENSBBBG00000015098	LHX2 (ENSBBBG00000003743)	NEK6 (ENSBBBG00000015078)	PSMB7 (ENSBBBG00000015071)	ADGRD2 (ENSBBBG00000015057)	NR5A1 (ENSBBBG00000015038)	NR6A1 (ENSBBBG00000015024)	OLFML2A (ENSBBBG00000000806)	WDR38 (ENSBBBG00000003711)	RPL35 (ENSBBBG00000014980)	ARPC5L (ENSBBBG00000003705)	GOLGA1 (ENSBBBG00000014965)	SCAI (ENSBBBG00000014945)
Caprinae	ANCESTRAL SPECIES	27	ENSGT00940000163649	ENSGT00930000151076	ENSGT00900000141254	ENSGT00940000161916.u	ENSGT00940000165463.b	ENSGT00940000165831	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B.j	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
Goat	MODERN SPECIES	2	ENSCHIG00000016694	OR1Q1 (ENSCHIG00000012780)	ENSCHIG00000010834	ENSCHIG00000008809	ENSCHIG00000009580	OR1L1 (ENSCHIG00000013814)	ENSCHIG00000008677	OR5C1 (ENSCHIG00000003066)	PDCL (ENSCHIG00000023505)	RC3H2 (ENSCHIG00000019319)	ZBTB6 (ENSCHIG00000010695)	ZBTB26 (ENSCHIG00000002998)	RABGAP1 (ENSCHIG00000025375)	ENSCHIG00000024016	ENSCHIG00000018517	CRB2 (ENSCHIG00000026311) #22	DENND1A (ENSCHIG00000018070) #23	LHX2 (ENSCHIG00000024662)	NEK6 (ENSCHIG00000014014)	PSMB7 (ENSCHIG00000016023)	ADGRD2 (ENSCHIG00000015493)	NR5A1 (ENSCHIG00000020020)	NR6A1 (ENSCHIG00000023004)	ENSCHIG00000016762	OLFML2A (ENSCHIG00000023813)	WDR38 (ENSCHIG00000022520)	RPL35 (ENSCHIG00000012200)	ARPC5L (ENSCHIG00000015054)	GOLGA1 (ENSCHIG00000025077)	SCAI (ENSCHIG00000016265)	PPP6C (ENSCHIG00000002356)
Rambouillet Sheep	MODERN SPECIES	19	OR1L1 (ENSOARG00020013291)	OR1L3 (ENSOARG00020013265)	ENSOARG00020013229	ENSOARG00020013202	ENSOARG00020013104	ENSOARG00020013003	ENSOARG00020012939	ENSOARG00020012899	OR5C1 (ENSOARG00020012869)	PDCL (ENSOARG00020012771)	RC3H2 (ENSOARG00020012162)	ZBTB6 (ENSOARG00020012077)	ZBTB26 (ENSOARG00020012054)	RABGAP1 (ENSOARG00020011787)	STRBP (ENSOARG00020011671)	CRB2 (ENSOARG00020011470) #22	DENND1A (ENSOARG00020010453) #23	ENSOARG00020010373	ENSOARG00020010352	ENSOARG00020010288	ENSOARG00020010162	NEK6 (ENSOARG00020009766)	PSMB7 (ENSOARG00020009676)	ADGRD2 (ENSOARG00020009282)	NR5A1 (ENSOARG00020009154)	NR6A1 (ENSOARG00020008843)	OLFML2A (ENSOARG00020008739)	WDR38 (ENSOARG00020008607)	RPL35 (ENSOARG00020008582)	ARPC5L (ENSOARG00020008562)	GOLGA1 (ENSOARG00020008027)
Siberian musk deer	MODERN SPECIES	1178	ENSMMSG00000016749	ENSMMSG00000016756	ENSMMSG00000016765	ENSMMSG00000016782	ENSMMSG00000016791	ENSMMSG00000016804	ENSMMSG00000016829	OR5C1 (ENSMMSG00000016896)	OR1K1 (ENSMMSG00000016908)	PDCL (ENSMMSG00000016923)	RC3H2 (ENSMMSG00000016952)	ZBTB6 (ENSMMSG00000017128)	ZBTB26 (ENSMMSG00000017133)	RABGAP1 (ENSMMSG00000017143)	STRBP (ENSMMSG00000017220)	CRB2 (ENSMMSG00000017268) #22	DENND1A (ENSMMSG00000017330) #23	LHX2 (ENSMMSG00000017407)	NEK6 (ENSMMSG00000017451)	PSMB7 (ENSMMSG00000017573)	ADGRD2 (ENSMMSG00000017611)	NR5A1 (ENSMMSG00000017732)	NR6A1 (ENSMMSG00000017835)	OLFML2A (ENSMMSG00000017889)	WDR38 (ENSMMSG00000017949)	ENSMMSG00000018016	ARPC5L (ENSMMSG00000018050)	GOLGA1 (ENSMMSG00000018093)	SCAI (ENSMMSG00000018254)	PPP6C (ENSMMSG00000018370)	RABEPK (ENSMMSG00000018434)
Yarkand deer	MODERN SPECIES	2	ENSCHYG00000009562	OR1L1 (ENSCHYG00000009579)	OR1L3 (ENSCHYG00000009607)	ENSCHYG00000009633	ENSCHYG00000009658	ENSCHYG00000009698	OR5C1 (ENSCHYG00000009759)	OR1K1 (ENSCHYG00000009782)	PDCL (ENSCHYG00000009804)	ENSCHYG00000009825	RC3H2 (ENSCHYG00000009870)	ZBTB6 (ENSCHYG00000010148)	ZBTB26 (ENSCHYG00000010162)	RABGAP1 (ENSCHYG00000010191)	ENSCHYG00000010458	CRB2 (ENSCHYG00000010614) #22	DENND1A (ENSCHYG00000010670) #23	LHX2 (ENSCHYG00000010827)	NEK6 (ENSCHYG00000010901)	PSMB7 (ENSCHYG00000011100)	ADGRD2 (ENSCHYG00000011162)	NR5A1 (ENSCHYG00000011305)	NR6A1 (ENSCHYG00000011423)	OLFML2A (ENSCHYG00000011623)	WDR38 (ENSCHYG00000011690)	RPL35 (ENSCHYG00000011873)	ARPC5L (ENSCHYG00000011918)	GOLGA1 (ENSCHYG00000011987)	SCAI (ENSCHYG00000012382)	PPP6C (ENSCHYG00000012715)	ENSCHYG00000012832
Laurasiatheria_b	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000163223	ENSGT00940000161916	ENSGT00940000165463	ENSGT00940000165831	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
Carnivora	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000164453	ENSGT00940000163223	ENSGT00940000165463	ENSGT00940000161916	ENSGT00940000165831	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
Caniformia	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00930000151076	ENSGT00900000141254	ENSGT00940000164453	ENSGT00940000163223	ENSGT00940000161916	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
Caniformia_b	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00930000151076	ENSGT00900000141254	ENSGT00940000164453	ENSGT00940000163223	ENSGT00940000161916	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456.p	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
Mustelinae	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00930000151076	ENSGT00900000141254	ENSGT00940000163223	ENSGT00940000161916	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456.p	ENSGT00940000163456.o	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
American mink	MODERN SPECIES	182								OR5C1 (ENSNVIG00000003045)	OR1K1 (ENSNVIG00000003072)	PHLP (ENSNVIG00000003114)	RC3H2 (ENSNVIG00000003205)	ZBTB6 (ENSNVIG00000003569)	ZBT26 (ENSNVIG00000003603)	RABGAP1 (ENSNVIG00000003705)	STRBP (ENSNVIG00000004078)	CRB2 (ENSNVIG00000004241) #22	DENND1A (ENSNVIG00000004449) #23	LHX2 (ENSNVIG00000005036)	NEK6 (ENSNVIG00000005066)	PSMB7 (ENSNVIG00000005110)	NR5A1 (ENSNVIG00000005527)	NR6A1 (ENSNVIG00000005633)	OLFML2A (ENSNVIG00000005683)	WDR38 (ENSNVIG00000005737)	RPL35 (ENSNVIG00000005757)	ARP5L (ENSNVIG00000005786)	GOLGA1 (ENSNVIG00000005806)	SCAI (ENSNVIG00000005835)	PPP6C (ENSNVIG00000005944)	RABEPK (ENSNVIG00000005963)	HSPA5 (ENSNVIG00000006019)
Ferret	MODERN SPECIES	218				ENSMPUG00000019263	ENSMPUG00000019259	ENSMPUG00000019255	ENSMPUG00000019253	ENSMPUG00000019248	OR5C1 (ENSMPUG00000019243)	OR1K1 (ENSMPUG00000019240)	PDCL (ENSMPUG00000014149)	RC3H2 (ENSMPUG00000014141)	ZBTB26 (ENSMPUG00000019237)	RABGAP1 (ENSMPUG00000014129)	STRBP (ENSMPUG00000014119)	CRB2 (ENSMPUG00000014059) #22	DENND1A (ENSMPUG00000014047) #23	LHX2 (ENSMPUG00000014042)	ENSMPUG00000014039	NEK6 (ENSMPUG00000013997)	PSMB7 (ENSMPUG00000013994)	ADGRD2 (ENSMPUG00000013976)	NR5A1 (ENSMPUG00000013973)	ENSMPUG00000013968	NR6A1 (ENSMPUG00000013965)	OLFML2A (ENSMPUG00000013962)	WDR38 (ENSMPUG00000013960)	RPL35 (ENSMPUG00000013950)	ENSMPUG00000013947	ARPC5L (ENSMPUG00000013924)	GOLGA1 (ENSMPUG00000013917)
Ursidae	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000163223	ENSGT01100000263600.a.a	ENSGT00940000165463	ENSGT00940000165831	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456.p	ENSGT00940000163456.o	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419.h	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
Giant Panda	MODERN SPECIES	17	OR1L1 (ENSAMEG00000016163)	OR1L3 (ENSAMEG00000019647)	ENSAMEG00000002589	ENSAMEG00000028985	ENSAMEG00000024438	ENSAMEG00000028263	ENSAMEG00000019631	OR5C1 (ENSAMEG00000018726)	OR1K1 (ENSAMEG00000018728)	PDCL (ENSAMEG00000024729)	RC3H2 (ENSAMEG00000006498)	ZBTB6 (ENSAMEG00000027846)	ZBTB26 (ENSAMEG00000030781)	RABGAP1 (ENSAMEG00000010958)	STRBP (ENSAMEG00000011017)	CRB2 (ENSAMEG00000011056) #22	DENND1A (ENSAMEG00000011077) #23	LHX2 (ENSAMEG00000011089)	NEK6 (ENSAMEG00000011113)	PSMB7 (ENSAMEG00000011136)	NR5A1 (ENSAMEG00000027142)	NR6A1 (ENSAMEG00000011212)	OLFML2A (ENSAMEG00000016521)	WDR38 (ENSAMEG00000029862)	RPL35 (ENSAMEG00000016537)	ENSAMEG00000016540	GOLGA1 (ENSAMEG00000016553)	SCAI (ENSAMEG00000026864)	PPP6C (ENSAMEG00000016567)	RABEPK (ENSAMEG00000016577)	HSPA5 (ENSAMEG00000016583)
Ursus	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000164453	ENSGT00940000163223.i	ENSGT01100000263600.a.a	ENSGT00940000161916	ENSGT00940000165831	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456.o	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419.h	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
American black bear	MODERN SPECIES	205																CRB2 (ENSUAMG00000017892) #22	DENND1A (ENSUAMG00000017889) #23	LHX2 (ENSUAMG00000017888)
Canidae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000005084	ENSGT00910000145076	ENSGT00390000010743.b	ENSGT00940000165018	ENSGT01100000264118	ENSGT00940000165463	ENSGT00940000163938	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00390000005534.b.b.c.b.a.a.b.a.b
Canis_lupus	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00910000145076	ENSGT00390000010743.b	ENSGT00940000162739	ENSGT01100000264118	ENSGT00940000165463	ENSGT00940000161916	ENSGT00940000163938	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00390000005534.b.b.c.b.a.a.b.a.b
Dingo	MODERN SPECIES	327	ENSCAFG00020015247	ENSCAFG00020015249	ENSCAFG00020015252	ENSCAFG00020015255	ENSCAFG00020015260	ENSCAFG00020015267	ENSCAFG00020015271	OR5C1 (ENSCAFG00020015275)	OR1K1 (ENSCAFG00020015278)	PDCL (ENSCAFG00020015282)	RC3H2 (ENSCAFG00020015288)	ZBTB6 (ENSCAFG00020015343)	ZBTB26 (ENSCAFG00020015344)	RABGAP1 (ENSCAFG00020015350)	STRBP (ENSCAFG00020015377)	CRB2 (ENSCAFG00020015541) #22	DENND1A (ENSCAFG00020015553) #23	LHX2 (ENSCAFG00020015565)	NEK6 (ENSCAFG00020015571)	PSMB7 (ENSCAFG00020015572)	NR5A1 (ENSCAFG00020015577)	NR6A1 (ENSCAFG00020015583)	OLFML2A (ENSCAFG00020015588)	WDR38 (ENSCAFG00020015590)	ENSCAFG00020015596	ARPC5L (ENSCAFG00020015602)	GOLGA1 (ENSCAFG00020015604)	SCAI (ENSCAFG00020015613)	PPP6C (ENSCAFG00020015642)	ENSCAFG00020015654	RABEPK (ENSCAFG00020015656)
Dog	MODERN SPECIES	37	MRRF (ENSCAFG00845013742)	PTGS1 (ENSCAFG00845013501)	OR1L8 (ENSCAFG00845013392)	ENSCAFG00845013345	OR1L6 (ENSCAFG00845013333)	OR1AF1 (ENSCAFG00845013294)	OR5C1 (ENSCAFG00845013286)	ENSCAFG00845013274	OR1K1 (ENSCAFG00845013262)	PDCL (ENSCAFG00845013251)	RC3H2 (ENSCAFG00845013141)	ZBTB6 (ENSCAFG00845013092)	GPR21 (ENSCAFG00845013055)	RABGAP1 (ENSCAFG00845012315)	STRBP (ENSCAFG00845011747)	CRB2 (ENSCAFG00845011628) #22	DENND1A (ENSCAFG00845011028) #23	LHX2 (ENSCAFG00845010906)	NEK6 (ENSCAFG00845010805)	PSMB7 (ENSCAFG00845010709)	ENSCAFG00845010600	NR5A1 (ENSCAFG00845010545)	NR6A1 (ENSCAFG00845010445)	OLFML2A (ENSCAFG00845010401)	WDR38 (ENSCAFG00845010303)	RPL35 (ENSCAFG00845010255)	ARPC5L (ENSCAFG00845010220)	GOLGA1 (ENSCAFG00845010046)	SCAI (ENSCAFG00845009946)	PPP6C (ENSCAFG00845009869)	ENSCAFG00845009818
Red fox	MODERN SPECIES	77	ENSVVUG00000009467	ENSVVUG00000009471	ENSVVUG00000009474	ENSVVUG00000009478	ENSVVUG00000009484	ENSVVUG00000009488	ENSVVUG00000009495	OR5C1 (ENSVVUG00000009500)	OR1K1 (ENSVVUG00000009503)	PDCL (ENSVVUG00000009506)	RC3H2 (ENSVVUG00000009519)	ZBTB6 (ENSVVUG00000009554)	ZBTB26 (ENSVVUG00000009562)	RABGAP1 (ENSVVUG00000009567)	STRBP (ENSVVUG00000009636)	CRB2 (ENSVVUG00000009672) #22	DENND1A (ENSVVUG00000009688) #23	LHX2 (ENSVVUG00000009751)	NEK6 (ENSVVUG00000009771)	PSMB7 (ENSVVUG00000009795)	NR5A1 (ENSVVUG00000009804)	NR6A1 (ENSVVUG00000009870)	OLFML2A (ENSVVUG00000009902)	WDR38 (ENSVVUG00000009939)	RPL35 (ENSVVUG00000009948)	ARPC5L (ENSVVUG00000009965)	GOLGA1 (ENSVVUG00000009974)	SCAI (ENSVVUG00000009995)	PPP6C (ENSVVUG00000010053)	ENSVVUG00000010058	RABEPK (ENSVVUG00000010062)
Felidae	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000163223.k	ENSGT00940000165463.e	ENSGT00940000161916	ENSGT00940000165463.f	ENSGT00940000165831	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000158501.y	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
Panthera	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000165929	ENSGT00940000163649	ENSGT00930000151076	ENSGT00900000141254	ENSGT00940000164453	ENSGT00940000163223.k	ENSGT00940000165463.e	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000158501.y	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
Tiger	MODERN SPECIES	473	ENSPTIG00000012515	ENSPTIG00000005970	OR1B1 (ENSPTIG00000005974)	OR1L1 (ENSPTIG00000005981)	ENSPTIG00000005983	ENSPTIG00000005987	ENSPTIG00000006001	OR5C1 (ENSPTIG00000006004)	OR1K1 (ENSPTIG00000006006)	PDCL (ENSPTIG00000014133)	RC3H2 (ENSPTIG00000014257)	ZBTB6 (ENSPTIG00000006037)	ZBTB26 (ENSPTIG00000006045)	RABGAP1 (ENSPTIG00000015522)	STRBP (ENSPTIG00000015831)	CRB2 (ENSPTIG00000016442) #22	DENND1A (ENSPTIG00000017243) #23	LHX2 (ENSPTIG00000017789)	NEK6 (ENSPTIG00000018068)	PSMB7 (ENSPTIG00000018529)	ADGRD2 (ENSPTIG00000018740)	NR5A1 (ENSPTIG00000018980)	NR6A1 (ENSPTIG00000019310)	OLFML2A (ENSPTIG00000000256)	WDR38 (ENSPTIG00000001191)	ENSPTIG00000003358	ENSPTIG00000004434	GOLGA1 (ENSPTIG00000005468)	SCAI (ENSPTIG00000006221)	PPP6C (ENSPTIG00000007118)	ENSPTIG00000009511
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Equus	ANCESTRAL SPECIES	30	ENSGT00940000163649	ENSGT00900000141254	ENSGT00940000164453	ENSGT00940000163223	ENSGT00940000165463.c	ENSGT00940000163456	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
Donkey	MODERN SPECIES	1	OR1Q1 (ENSEASG00005021018)	OR1B1 (ENSEASG00005021015)	OR1L1 (ENSEASG00005021014)	OR1L3 (ENSEASG00005021012)	ENSEASG00005021051	ENSEASG00005021005	OR5C1 (ENSEASG00005030075)	OR1K1 (ENSEASG00005020997)	PDCL (ENSEASG00005027986)	RC3H2 (ENSEASG00005020897)	ZBTB6 (ENSEASG00005033263)	ZBTB26 (ENSEASG00005020877)	GPR21 (ENSEASG00005023908)	RABGAP1 (ENSEASG00005020868)	STRBP (ENSEASG00005020855)	CRB2 (ENSEASG00005020846) #22	DENND1A (ENSEASG00005020820) #23	LHX2 (ENSEASG00005020812)	NEK6 (ENSEASG00005020808)	PSMB7 (ENSEASG00005020802)	ADGRD2 (ENSEASG00005020796)	NR5A1 (ENSEASG00005020785)	NR6A1 (ENSEASG00005020778)	OLFML2A (ENSEASG00005020762)	WDR38 (ENSEASG00005020747)	ENSEASG00005035844	ARPC5L (ENSEASG00005020744)	GOLGA1 (ENSEASG00005020734)	SCAI (ENSEASG00005020664)	PPP6C (ENSEASG00005020651)	RABEPK (ENSEASG00005020648)
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Chiroptera	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000163027	ENSGT00940000163995	ENSGT00940000162508	ENSGT00940000163451	ENSGT00940000165929	ENSGT00930000151076	ENSGT00940000163456	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
Microchiroptera	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000162849.B.d	ENSGT00940000163038.a.b	ENSGT00940000163027	ENSGT00940000163995	ENSGT00940000162508	ENSGT00940000165929	ENSGT00930000151076	ENSGT00940000163456	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763	ENSGT00940000154787
Greater horseshoe bat	MODERN SPECIES	3	ENSRFEG00010020194	ENSRFEG00010020204	ENSRFEG00010020211	ENSRFEG00010020215	ENSRFEG00010020226	ENSRFEG00010020245	ENSRFEG00010020260	ENSRFEG00010020312	ENSRFEG00010020327	OR5C1 (ENSRFEG00010020346)	PDCL (ENSRFEG00010020362)	RC3H2 (ENSRFEG00010020390)	ZBTB6 (ENSRFEG00010020449)	RABGAP1 (ENSRFEG00010020470)	STRBP (ENSRFEG00010020509)	CRB2 (ENSRFEG00010020565) #22	DENND1A (ENSRFEG00010020653) #23	LHX2 (ENSRFEG00010020804)	NEK6 (ENSRFEG00010010318)	PSMB7 (ENSRFEG00010010524)	NR5A1 (ENSRFEG00010010595)	NR6A1 (ENSRFEG00010010735)	OLFML2A (ENSRFEG00010010880)	WDR38 (ENSRFEG00010010924)	RPL35 (ENSRFEG00010011212)	ARPC5L (ENSRFEG00010011262)	GOLGA1 (ENSRFEG00010011365)	SCAI (ENSRFEG00010011538)	PPP6C (ENSRFEG00010011691)	RABEPK (ENSRFEG00010011922)	HSPA5 (ENSRFEG00010012022)
Microbat	MODERN SPECIES	1110							RGS3 (ENSMLUG00000015873)	PDCL (ENSMLUG00000011422)	RC3H2 (ENSMLUG00000013992)	ZBTB6 (ENSMLUG00000014003)	ZBTB26 (ENSMLUG00000014009)	RABGAP1 (ENSMLUG00000003865)	STRBP (ENSMLUG00000003882)	GPR21 (ENSMLUG00000003878)	ENSMLUG00000024699	CRB2 (ENSMLUG00000024466) #22	DENND1A (ENSMLUG00000016076) #23	LHX2 (ENSMLUG00000016917)	NEK6 (ENSMLUG00000007482)	PSMB7 (ENSMLUG00000007496)	NR5A1 (ENSMLUG00000005775)	NR6A1 (ENSMLUG00000014714)	OLFML2A (ENSMLUG00000017669)	WDR38 (ENSMLUG00000024073)	RPL35 (ENSMLUG00000029323)	ARPC5L (ENSMLUG00000009429)	GOLGA1 (ENSMLUG00000009442)	SCAI (ENSMLUG00000015214)	ENSMLUG00000009537	HSPA5 (ENSMLUG00000009546)	PPP6C (ENSMLUG00000009516)
Megabat	MODERN SPECIES	766								OR5C1 (ENSPVAG00000017587)	PDCL (ENSPVAG00000017590)	RC3H2 (ENSPVAG00000017592)	ZBTB6 (ENSPVAG00000017594)	ZBTB26 (ENSPVAG00000017595)	RABGAP1 (ENSPVAG00000017596)	GPR21 (ENSPVAG00000017605)	STRBP (ENSPVAG00000017607)	CRB2 (ENSPVAG00000017616) #22	DENND1A (ENSPVAG00000017623) #23
Eulipotyphla	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183101.a.b.b #22
Hedgehog	MODERN SPECIES	16157																CRB2 (ENSEEUG00000011381) #22
Atlantogenata	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00930000151076	ENSGT00900000141254	ENSGT00940000164453	ENSGT00940000163223	ENSGT00940000161916	ENSGT00940000165831	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
Xenarthra	ANCESTRAL SPECIES	90									ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763	ENSGT00940000154787	ENSGT00940000156611
Armadillo	MODERN SPECIES	2027							ENSDNOG00000003471	PDCL (ENSDNOG00000044206)	ENSDNOG00000043976	RC3H2 (ENSDNOG00000014557)	ZBTB6 (ENSDNOG00000014591)	ZBTB26 (ENSDNOG00000045813)	ENSDNOG00000037259	RABGAP1 (ENSDNOG00000013366)	STRBP (ENSDNOG00000043330)	CRB2 (ENSDNOG00000038587) #22	DENND1A (ENSDNOG00000034926) #23	ENSDNOG00000045998	LHX2 (ENSDNOG00000000465)	NEK6 (ENSDNOG00000015320)	PSMB7 (ENSDNOG00000015332)	ADGRD2 (ENSDNOG00000015410)	NR5A1 (ENSDNOG00000040922)	ENSDNOG00000032252	NR6A1 (ENSDNOG00000017832)	ENSDNOG00000033680	OLFML2A (ENSDNOG00000040474)	WDR38 (ENSDNOG00000046480)	ENSDNOG00000033968	GOLGA1 (ENSDNOG00000000005)	SCAI (ENSDNOG00000000007)
Afrotheria	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00930000151076	ENSGT00900000141254	ENSGT00940000164453	ENSGT00940000163223	ENSGT00940000161916	ENSGT00940000165831	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
Afrotheria_a	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00930000151076	ENSGT00900000141254	ENSGT00940000164453	ENSGT00940000163223	ENSGT00940000161916	ENSGT00940000165831	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
Elephant	MODERN SPECIES	472	ENSLAFG00000030694	ENSLAFG00000032331	ENSLAFG00000029058	ENSLAFG00000032551	ENSLAFG00000026441	ENSLAFG00000026810	ENSLAFG00000004410	ENSLAFG00000032586	OR1K1 (ENSLAFG00000004845)	PDCL (ENSLAFG00000011935)	RC3H2 (ENSLAFG00000003521)	ZBTB6 (ENSLAFG00000014046)	ZBTB26 (ENSLAFG00000012394)	RABGAP1 (ENSLAFG00000012397)	STRBP (ENSLAFG00000012408)	CRB2 (ENSLAFG00000000156) #22	DENND1A (ENSLAFG00000011628) #23	LHX2 (ENSLAFG00000007827)	NEK6 (ENSLAFG00000021394)	PSMB7 (ENSLAFG00000009265)	ENSLAFG00000018553	NR5A1 (ENSLAFG00000018557)	NR6A1 (ENSLAFG00000011676)	OLFML2A (ENSLAFG00000013500)	WDR38 (ENSLAFG00000010023)	RPL35 (ENSLAFG00000010031)	ARPC5L (ENSLAFG00000010034)	GOLGA1 (ENSLAFG00000010035)	SCAI (ENSLAFG00000010037)	PPP6C (ENSLAFG00000010043)	RABEPK (ENSLAFG00000010044)
Hyrax	MODERN SPECIES	3603																CRB2 (ENSPCAG00000015322) #22	DENND1A (ENSPCAG00000015424) #23
Marsupialia	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000162508.j	ENSGT00940000163649	ENSGT00930000151076.i	ENSGT00940000161916	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456.q	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
Marsupialia_b	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000162508.j	ENSGT00940000163649	ENSGT00930000151076.i	ENSGT00940000161916	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456.q	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261.d #23	ENSGT00940000158540.b	ENSGT00940000158540.a	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961
Diprotodontia	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000164886	ENSGT00940000163103	ENSGT00930000151076.i	ENSGT00940000161916	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456.q	ENSGT00940000163456.r	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261.d #23	ENSGT00940000158540.b	ENSGT00940000158540.a	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
Diprotodontia_a	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00900000141254.c	ENSGT00900000141254.d	ENSGT00940000164886	ENSGT00940000163103	ENSGT00930000151076.i	ENSGT00940000161916	ENSGT00940000163456.r	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261.d #23	ENSGT00940000158540.a	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384	ENSGT00940000158501.g	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763	ENSGT00940000154787
Common wonbat	DUPLICATION
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Common wonbat	MODERN SPECIES	1024	ENSVURG00010016945	ENSVURG00010016949	ENSVURG00010016951	ENSVURG00010016971	ENSVURG00010017025	ENSVURG00010017036	ENSVURG00010017041	ENSVURG00010017046	ENSVURG00010017055	ENSVURG00010017064	ENSVURG00010017076	ENSVURG00010017094	ENSVURG00010017097	ENSVURG00010017110	ENSVURG00010017151	ENSVURG00010017196 #22	ENSVURG00010017253 #23	ENSVURG00010017362	ENSVURG00010017384	ENSVURG00010017394	ENSVURG00010017409	ENSVURG00010017416	ENSVURG00010017449	ENSVURG00010017466	ENSVURG00010017496	ENSVURG00010017501	ENSVURG00010017517	ENSVURG00010017537	ENSVURG00010017559	ENSVURG00010017575	ENSVURG00010017591
koala	MODERN SPECIES	177	MORN5 (ENSPCIG00000025518)	LHX6 (ENSPCIG00000025520)	RBM18 (ENSPCIG00000025526)	MRRF (ENSPCIG00000025530)	PTGS1 (ENSPCIG00000025538)	ENSPCIG00000025547	ENSPCIG00000023414	ENSPCIG00000008140	ENSPCIG00000034510	PDCL (ENSPCIG00000015845)	RC3H2 (ENSPCIG00000025559)	ZBTB6 (ENSPCIG00000025564)	ZBTB26 (ENSPCIG00000025565)	RABGAP1 (ENSPCIG00000025568)	STRBP (ENSPCIG00000025588)	ENSPCIG00000026360 #22	DENND1A (ENSPCIG00000035239) #23	LHX2 (ENSPCIG00000010082)	ENSPCIG00000020547	NEK6 (ENSPCIG00000020553)	PSMB7 (ENSPCIG00000020558)	NR5A1 (ENSPCIG00000020567)	NR6A1 (ENSPCIG00000020572)	OLFML2A (ENSPCIG00000020590)	ENSPCIG00000020599	ENSPCIG00000020603	ENSPCIG00000020607	GOLGA1 (ENSPCIG00000028441)	SCAI (ENSPCIG00000028448)	PPP6C (ENSPCIG00000018281)	RABEPK (ENSPCIG00000018279)
Wallaby	MODERN SPECIES	5507																CRB2 (ENSMEUG00000013792) #22	ENSMEUG00000013838 #23
Opossum	MODERN SPECIES		ENSMODG00000037549	ENSMODG00000023548	ENSMODG00000040283	ENSMODG00000044320	ENSMODG00000019714	ENSMODG00000019717	ENSMODG00000019715	ENSMODG00000019718	OR1K1 (ENSMODG00000019721)	PDCL (ENSMODG00000048390)	RC3H2 (ENSMODG00000019725)	ZBTB6 (ENSMODG00000023551)	ZBTB26 (ENSMODG00000023552)	RABGAP1 (ENSMODG00000019729)	STRBP (ENSMODG00000019732)	ENSMODG00000019734 #22	DENND1A (ENSMODG00000019737) #23	LHX2 (ENSMODG00000019739)	NEK6 (ENSMODG00000019741)	PSMB7 (ENSMODG00000019742)	ENSMODG00000019744	NR5A1 (ENSMODG00000019746)	NR6A1 (ENSMODG00000019748)	OLFML2A (ENSMODG00000019750)	ENSMODG00000019752	RPL35 (ENSMODG00000019753)	ARPC5L (ENSMODG00000019755)	GOLGA1 (ENSMODG00000019758)	SCAI (ENSMODG00000019760)	ENSMODG00000029560	PPP6C (ENSMODG00000039439)
Platypus	MODERN SPECIES	15	TTLL11 (ENSOANG00000004693)	ENSOANG00000043821	NDUFA8 (ENSOANG00000044958)	ENSOANG00000004699	LHX6 (ENSOANG00000046061)	RBM18 (ENSOANG00000039349)	ENSOANG00000008199	ENSOANG00000039361	PTGS1 (ENSOANG00000008197)	PDCL (ENSOANG00000045648)	RC3H2 (ENSOANG00000008194)	ZBTB6 (ENSOANG00000040131)	ZBTB26 (ENSOANG00000051183)	RABGAP1 (ENSOANG00000044188)	STRBP (ENSOANG00000011875)	ENSOANG00000020908 #22	DENND1A (ENSOANG00000045046) #23	LHX2 (ENSOANG00000043102)	NEK6 (ENSOANG00000000382)	PSMB7 (ENSOANG00000048360)	ENSOANG00000012921	NR5A1 (ENSOANG00000012920)	NR6A1 (ENSOANG00000013303)	OLFML2A (ENSOANG00000013302)	RPL35 (ENSOANG00000036932)	ARPC5L (ENSOANG00000038645)	GOLGA1 (ENSOANG00000013299)	SCAI (ENSOANG00000013296)	PPP6C (ENSOANG00000038056)	RABEPK (ENSOANG00000013292)	HSPA5 (ENSOANG00000013291)
Sauria	ANCESTRAL SPECIES	33	ENSGT00940000164999	ENSGT00390000008938	ENSGT00390000018089	ENSGT00940000156868	ENSGT00390000013765	ENSGT00910000145076	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000010743.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00390000016384	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763	ENSGT00940000154787
Archelosauria	ANCESTRAL SPECIES	32	ENSGT00940000156689	ENSGT00940000164999	ENSGT00390000008938	ENSGT00390000018089	ENSGT00940000156868	ENSGT00390000013765	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000010743.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00390000016384	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763	ENSGT00940000154787
Archosauria	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00940000156689	ENSGT00940000164999	ENSGT00390000008938	ENSGT00390000018089	ENSGT00940000156868	ENSGT00390000013765	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000010743.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00390000016384	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763	ENSGT00940000154787
Aves	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000156689	ENSGT00940000164999	ENSGT00390000008938	ENSGT00390000018089	ENSGT00940000156868	ENSGT00390000013765	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000010743.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00390000016384	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763	ENSGT00940000154787
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Galloanserae	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000164999	ENSGT00390000008938	ENSGT00390000018089	ENSGT00940000156868.b	ENSGT00390000013765	ENSGT00390000005084	ENSGT01100000264691	ENSGT00390000010743.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00390000016384	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763	ENSGT00940000154787
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Medium ground finch	MODERN SPECIES	32	TTLL11 (ENSGFOG00000003947)	ENSGFOG00000003930	NDUFA8 (ENSGFOG00000003920)	MORN5 (ENSGFOG00000003910)	ENSGFOG00000003893	LHX6 (ENSGFOG00000003881)	RBM18 (ENSGFOG00000003875)	MRRF (ENSGFOG00000003864)	PTGS1 (ENSGFOG00000003848)	PDCL (ENSGFOG00000003838)	RC3H2 (ENSGFOG00000003800)	ZBTB6 (ENSGFOG00000003785)	ZBTB26 (ENSGFOG00000003774)	RABGAP1 (ENSGFOG00000003746)	STRBP (ENSGFOG00000003717)	CRB2 (ENSGFOG00000003494) #22	DENND1A (ENSGFOG00000003357) #23	LHX2 (ENSGFOG00000003318)	NEK6 (ENSGFOG00000003257)	PSMB7 (ENSGFOG00000003237)	ADGRD2 (ENSGFOG00000003184)	ENSGFOG00000003161	NR6A1 (ENSGFOG00000003136)	NR5A1 (ENSGFOG00000003120)	OLFML2A (ENSGFOG00000003090)	RPL35 (ENSGFOG00000003076)	SCAI (ENSGFOG00000002633)	GOLGA1 (ENSGFOG00000002568)	ARPC5L (ENSGFOG00000002550)	PPP6C (ENSGFOG00000002540)	HSPA5 (ENSGFOG00000002477)
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Kakapo	MODERN SPECIES	9	TTLL11 (ENSSHBG00005013177)	ENSSHBG00005013187	NDUFA8 (ENSSHBG00005013195)	MORN5 (ENSSHBG00005013202)	LHX6 (ENSSHBG00005013209)	RBM18 (ENSSHBG00005013223)	MRRF (ENSSHBG00005013229)	PTGS1 (ENSSHBG00005013245)	PDCL (ENSSHBG00005013266)	RC3H2 (ENSSHBG00005013282)	ZBTB6 (ENSSHBG00005013304)	ZBTB26 (ENSSHBG00005013312)	RABGAP1 (ENSSHBG00005013325)	GPR21 (ENSSHBG00005013336)	STRBP (ENSSHBG00005013360)	CRB2 (ENSSHBG00005013392) #22	ENSSHBG00005013419 #23	ENSSHBG00005013441 #23	LHX2 (ENSSHBG00005013472)	NEK6 (ENSSHBG00005013489)	PSMB7 (ENSSHBG00005013508)	ADGRD2 (ENSSHBG00005013538)	NR5A1 (ENSSHBG00005013567)	NR6A1 (ENSSHBG00005013599)	OLFML2A (ENSSHBG00005013635)	RPL35 (ENSSHBG00005013653)	SCAI (ENSSHBG00005013683)	GOLGA1 (ENSSHBG00005013725)	ARPC5L (ENSSHBG00005013738)	PPP6C (ENSSHBG00005013749)	RABEPK (ENSSHBG00005013762)
Golden eagle	MODERN SPECIES	16	TTLL11 (ENSACCG00020014314)	ENSACCG00020014359	NDUFA8 (ENSACCG00020014392)	MORN5 (ENSACCG00020014413)	LHX6 (ENSACCG00020014440)	RBM18 (ENSACCG00020014466)	MRRF (ENSACCG00020014489)	ENSACCG00020014513	PTGS1 (ENSACCG00020014538)	PDCL (ENSACCG00020014568)	RC3H2 (ENSACCG00020014591)	ZBTB6 (ENSACCG00020014617)	ZBTB26 (ENSACCG00020014635)	RABGAP1 (ENSACCG00020014692)	STRBP (ENSACCG00020014859)	CRB2 (ENSACCG00020015097) #22	DENND1A (ENSACCG00020015213) #23	LHX2 (ENSACCG00020015247)	NEK6 (ENSACCG00020015262)	PSMB7 (ENSACCG00020015286)	ADGRD2 (ENSACCG00020015309)	NR5A1 (ENSACCG00020015352)	NR6A1 (ENSACCG00020015466)	OLFML2A (ENSACCG00020015705)	RPL35 (ENSACCG00020015720)	SCAI (ENSACCG00020015805)	GOLGA1 (ENSACCG00020015908)	ARPC5L (ENSACCG00020016251)	PPP6C (ENSACCG00020016300)	RABEPK (ENSACCG00020016384)	HSPA5 (ENSACCG00020016447)
African ostrich	MODERN SPECIES	107														ENSSCUG00000000306	STRBP (ENSSCUG00000000312)	CRB2 (ENSSCUG00000000316) #22	DENND1A (ENSSCUG00000000324) #23	LHX2 (ENSSCUG00000000334)	NEK6 (ENSSCUG00000000337)	PSMB7 (ENSSCUG00000000341)	ADGRD2 (ENSSCUG00000000351)
Australian saltwater crocodile	MODERN SPECIES	44	DAB2IP (ENSCPRG00005010455)	TTLL11 (ENSCPRG00005010496)	ENSCPRG00005010514	NDUFA8 (ENSCPRG00005010529)	MORN5 (ENSCPRG00005010533)	LHX6 (ENSCPRG00005010540)	RBM18 (ENSCPRG00005010550)	MRRF (ENSCPRG00005010554)	PTGS1 (ENSCPRG00005010557)	PDCL (ENSCPRG00005010586)	RC3H2 (ENSCPRG00005010607)	ZBTB6 (ENSCPRG00005010641)	ZBTB26 (ENSCPRG00005010664)	RABGAP1 (ENSCPRG00005010670)	STRBP (ENSCPRG00005010682)	CRB2 (ENSCPRG00005010693) #22	DENND1A (ENSCPRG00005010705) #23	LHX2 (ENSCPRG00005010736)	NEK6 (ENSCPRG00005010741)	PSMB7 (ENSCPRG00005010746)	ADGRD2 (ENSCPRG00005010747)	NR5A1 (ENSCPRG00005010753)	NR6A1 (ENSCPRG00005010754)	OLFML2A (ENSCPRG00005010769)	ENSCPRG00005010804	RPL35 (ENSCPRG00005010810)	SCAI (ENSCPRG00005010819)	GOLGA1 (ENSCPRG00005010842)	ARPC5L (ENSCPRG00005010854)	PPP6C (ENSCPRG00005010855)	RABEPK (ENSCPRG00005010858)
Cryptodira	ANCESTRAL SPECIES	33	ENSGT00940000156689.bb	ENSGT00940000164999	ENSGT00940000156689.cb	ENSGT00390000008938	ENSGT00390000018089	ENSGT00940000156868	ENSGT00390000013765	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000010743.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00390000016384	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763	ENSGT00940000154787
Testudinoidea	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00940000156689.bb	ENSGT00940000164999	ENSGT00940000156689.cb	ENSGT00390000008938	ENSGT00390000018089	ENSGT00940000156868	ENSGT00390000013765	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000010743.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00390000016384	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763.s	ENSGT00940000154787
Testudinidae	ANCESTRAL SPECIES	29	ENSGT00940000155853	ENSGT00940000156689.bb	ENSGT00940000156689.cb	ENSGT00390000008938	ENSGT00390000018089	ENSGT00940000156868	ENSGT00390000013765	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000010743.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00390000016384	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763.s	ENSGT00940000154787
Goode s thornscrub tortoise	MODERN SPECIES	7	DAB2IP (ENSGEVG00005005158)	ENSGEVG00005005273	ENSGEVG00005005297	NDUFA8 (ENSGEVG00005005313)	MORN5 (ENSGEVG00005005343)	LHX6 (ENSGEVG00005005392)	RBM18 (ENSGEVG00005005423)	MRRF (ENSGEVG00005005435)	PTGS1 (ENSGEVG00005005484)	PDCL (ENSGEVG00005005578)	RC3H2 (ENSGEVG00005005601)	ZBTB6 (ENSGEVG00005005638)	ZBTB26 (ENSGEVG00005005652)	RABGAP1 (ENSGEVG00005005698)	STRBP (ENSGEVG00005005803)	CRB2 (ENSGEVG00005005877) #22	DENND1A (ENSGEVG00005006000) #23	LHX2 (ENSGEVG00005006137)	NEK6 (ENSGEVG00005006167)	PSMB7 (ENSGEVG00005006184)	ADGRD2 (ENSGEVG00005006212)	NR5A1 (ENSGEVG00005006277)	NR6A1 (ENSGEVG00005006341)	OLFML2A (ENSGEVG00005006363)	RPL35 (ENSGEVG00005006381)	SCAI (ENSGEVG00005006414)	GOLGA1 (ENSGEVG00005006470)	ARPC5L (ENSGEVG00005006487)	PPP6C (ENSGEVG00005006512)	RABEPK (ENSGEVG00005006525)	HSPA5 (ENSGEVG00005006550)
Abingdon island giant tortoise	MODERN SPECIES	2600	DAB2IP (ENSCABG00000001692)	ENSCABG00000001688	ENSCABG00000001683	NDUFA8 (ENSCABG00000001677)	ENSCABG00000001674	LHX6 (ENSCABG00000001667)	RBM18 (ENSCABG00000001664)	MRRF (ENSCABG00000001662)	PTGS1 (ENSCABG00000001646)	PDCL (ENSCABG00000001644)	RC3H2 (ENSCABG00000001633)	ZBTB6 (ENSCABG00000001629)	ZBTB26 (ENSCABG00000001626)	RABGAP1 (ENSCABG00000001622)	STRBP (ENSCABG00000001615)	CRB2 (ENSCABG00000001608) #22	DENND1A (ENSCABG00000001004) #23	LHX2 (ENSCABG00000000963)	NEK6 (ENSCABG00000000924)	PSMB7 (ENSCABG00000000915)	ADGRD2 (ENSCABG00000000904)	NR5A1 (ENSCABG00000000895)	NR6A1 (ENSCABG00000000881)	OLFML2A (ENSCABG00000000874)	RPL35 (ENSCABG00000000871)	SCAI (ENSCABG00000000867)	GOLGA1 (ENSCABG00000000473)	ARPC5L (ENSCABG00000000431)	PPP6C (ENSCABG00000000418)	RABEPK (ENSCABG00000000406)	HSPA5 (ENSCABG00000000399)
Emydidae	ANCESTRAL SPECIES	29	ENSGT00940000155853	ENSGT00940000156689.bb	ENSGT00940000164999	ENSGT00390000008938	ENSGT00390000018089	ENSGT00940000156868	ENSGT00390000013765	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000010743.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00390000016384	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763.s	ENSGT00940000154787
painted turtle	MODERN SPECIES	720	DAB2IP (ENSCPBG00000009928)	TTLL11 (ENSCPBG00000009920)	ENSCPBG00000009911	NDUFA8 (ENSCPBG00000009908)	MORN5 (ENSCPBG00000009903)	LHX6 (ENSCPBG00000009892)	RBM18 (ENSCPBG00000009885)	MRRF (ENSCPBG00000009881)	PTGS1 (ENSCPBG00000009876)	PDCL (ENSCPBG00000009868)	RC3H2 (ENSCPBG00000009811)	ZBTB6 (ENSCPBG00000009796)	ZBTB26 (ENSCPBG00000009793)	RABGAP1 (ENSCPBG00000009786)	STRBP (ENSCPBG00000009770)	CRB2 (ENSCPBG00000009754) #22	DENND1A (ENSCPBG00000009676) #23	ENSCPBG00000009639	LRRCC1 (ENSCPBG00000009631)	E2F5 (ENSCPBG00000009625)	RBIS (ENSCPBG00000009621)	CA13 (ENSCPBG00000009615)	CA1 (ENSCPBG00000009610)	CA3 (ENSCPBG00000009607)	CA2 (ENSCPBG00000009602)	ATP6V0D2 (ENSCPBG00000009584)	WWP1 (ENSCPBG00000009574)	RMDN1 (ENSCPBG00000009563)	CPNE3 (ENSCPBG00000009552)	CNGB3 (ENSCPBG00000009543)	ENSCPBG00000009517
Three-toed box turtle	MODERN SPECIES	113	ENSTMTG00000015418	ENSTMTG00000015437	ENSTMTG00000015447	NDUFA8 (ENSTMTG00000015460)	MORN5 (ENSTMTG00000015471)	LHX6 (ENSTMTG00000015494)	RBM18 (ENSTMTG00000015513)	MRRF (ENSTMTG00000015521)	PTGS1 (ENSTMTG00000015538)	PDCL (ENSTMTG00000015546)	RC3H2 (ENSTMTG00000015560)	ZBTB6 (ENSTMTG00000015606)	ZBTB26 (ENSTMTG00000015625)	RABGAP1 (ENSTMTG00000015634)	STRBP (ENSTMTG00000015690)	CRB2 (ENSTMTG00000015799) #22	DENND1A (ENSTMTG00000015853) #23	LHX2 (ENSTMTG00000015920)	NEK6 (ENSTMTG00000015931)	PSMB7 (ENSTMTG00000015950)	ADGRD2 (ENSTMTG00000015979)	NR5A1 (ENSTMTG00000016018)	NR6A1 (ENSTMTG00000016050)	OLFML2A (ENSTMTG00000016138)	RPL35 (ENSTMTG00000016153)	SCAI (ENSTMTG00000016173)	GOLGA1 (ENSTMTG00000016257)	ARPC5L (ENSTMTG00000016343)	PPP6C (ENSTMTG00000016358)	ENSTMTG00000016384	HSPA5 (ENSTMTG00000016414)
Chinese turtle	MODERN SPECIES	996								ENSPSIG00000004819	PTGS1 (ENSPSIG00000004843)	PDCL (ENSPSIG00000005382)	RC3H2 (ENSPSIG00000005393)	ZBTB6 (ENSPSIG00000001016)	ZBTB26 (ENSPSIG00000001041)	RABGAP1 (ENSPSIG00000005734)	STRBP (ENSPSIG00000005799)	CRB2 (ENSPSIG00000006404) #22	DENND1A (ENSPSIG00000004571) #23	LHX2 (ENSPSIG00000004916)	NEK6 (ENSPSIG00000004968)	PSMB7 (ENSPSIG00000005319)	ADGRD2 (ENSPSIG00000005660)	NR5A1 (ENSPSIG00000006131)	NR6A1 (ENSPSIG00000006445)
Lepidosauria	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000164999	ENSGT00390000008938	ENSGT00390000018089	ENSGT00940000156868	ENSGT00390000013765	ENSGT00910000145076	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000010743.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00390000016384	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763	ENSGT00940000154787
Episquamata	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000164999	ENSGT00390000008938	ENSGT00390000018089	ENSGT00940000156868	ENSGT00390000013765	ENSGT00910000145076	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000010743.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000156662.d.b	ENSGT00390000012903	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000000224	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084
Laterata	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000164999	ENSGT00390000008938	ENSGT00390000018089	ENSGT00940000156868	ENSGT00390000013765	ENSGT00910000145076	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000010743.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000156662.d.b	ENSGT00390000012903	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000000224	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084
Common wall lizard	MODERN SPECIES	419	LHX6 (ENSPMRG00000023138)	RBM18 (ENSPMRG00000023130)	ENSPMRG00000023128	MRRF (ENSPMRG00000023124)	ENSPMRG00000023113	ENSPMRG00000023104	ENSPMRG00000023100	ENSPMRG00000023095	ENSPMRG00000023093	RC3H2 (ENSPMRG00000023084)	ZBTB6 (ENSPMRG00000023078)	ZBTB26 (ENSPMRG00000023076)	GPR21 (ENSPMRG00000023073)	RABGAP1 (ENSPMRG00000023062)	STRBP (ENSPMRG00000023046)	CRB2 (ENSPMRG00000023040) #22	DENND1A (ENSPMRG00000023031) #23	LHX2 (ENSPMRG00000023023)	NEK6 (ENSPMRG00000023018)	PSMB7 (ENSPMRG00000023012)	ADGRD2 (ENSPMRG00000022995)	ENSPMRG00000022990	NR5A1 (ENSPMRG00000022986)	NR6A1 (ENSPMRG00000022963)
Argentine black and white tegu	MODERN SPECIES	52	ENSSMRG00000011514	NDUFA8 (ENSSMRG00000011511)	MORN5 (ENSSMRG00000011506)	LHX6 (ENSSMRG00000011499)	RBM18 (ENSSMRG00000011491)	MRRF (ENSSMRG00000011490)	PTGS1 (ENSSMRG00000011488)	ENSSMRG00000011487	ENSSMRG00000011486	PDCL (ENSSMRG00000011485)	RC3H2 (ENSSMRG00000011484)	ZBTB6 (ENSSMRG00000011483)	ZBTB26 (ENSSMRG00000011482)	RABGAP1 (ENSSMRG00000011478)	STRBP (ENSSMRG00000011471)	CRB2 (ENSSMRG00000011466) #22	DENND1A (ENSSMRG00000011462) #23	LHX2 (ENSSMRG00000011455)	NEK6 (ENSSMRG00000011428)	PSMB7 (ENSSMRG00000011425)	ADGRD2 (ENSSMRG00000011422)	NR5A1 (ENSSMRG00000011420)	NR6A1 (ENSSMRG00000011400)	OLFML2A (ENSSMRG00000011397)	ENSSMRG00000011395	DYNC2I2 (ENSSMRG00000011392)	SPTAN1 (ENSSMRG00000011381)	GLE1 (ENSSMRG00000011380)	ODF2 (ENSSMRG00000011379)	PTGES2 (ENSSMRG00000011378)	BBLN (ENSSMRG00000011377)
Toxicofera	ANCESTRAL SPECIES	33									ENSGT00390000010743.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000156662.d.b	ENSGT00940000156662.d.a	ENSGT00390000012903	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000000224	ENSGT00390000001761
Elapidae	ANCESTRAL SPECIES	18									ENSGT00390000010743.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685.c	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000156662.d.b	ENSGT00390000012903	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000000224	ENSGT00390000001761	ENSGT00940000166869
Elapidae_a	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183101.a.b.b #22
Acanthophiinae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183101.a.b.b #22
Eastern brown snake	DUPLICATION
Eastern brown snake	MODERN SPECIES	583																ENSPTXG00000015808 #22
Eastern brown snake	MODERN SPECIES	582																ENSPTXG00000015807 #22
Mainland tiger snake	MODERN SPECIES	803																ENSNSUG00000005010 #22
Blue-lipped sea krait	MODERN SPECIES	5382																CRB2 (ENSLLTG00000017214) #22
Indian cobra	MODERN SPECIES	8	ENSNNAG00000009870	ENSNNAG00000009884	ENSNNAG00000009966	GARNL3 (ENSNNAG00000010108)	SLC2A8 (ENSNNAG00000012548)	FBXW2 (ENSNNAG00000012587)	ENSNNAG00000012616	ENSNNAG00000012621	ENSNNAG00000012633	PTGS1 (ENSNNAG00000012718)	RC3H2 (ENSNNAG00000012766)	ZBTB6 (ENSNNAG00000013051)	ZBTB26 (ENSNNAG00000013061)	RABGAP1 (ENSNNAG00000013110)	STRBP (ENSNNAG00000013632)	CRB2 (ENSNNAG00000013681) #22	DENND1A (ENSNNAG00000013708) #23	LHX2 (ENSNNAG00000013790)	NEK6 (ENSNNAG00000013809)	PSMB7 (ENSNNAG00000013841)	ADGRD2 (ENSNNAG00000013875)	NR5A1 (ENSNNAG00000013903)	NR6A1 (ENSNNAG00000013915)	DYNC2I2 (ENSNNAG00000013945)	SPTAN1 (ENSNNAG00000014617)	GLE1 (ENSNNAG00000018191)	ODF2 (ENSNNAG00000018197)	PTGES2 (ENSNNAG00000018202)	BBLN (ENSNNAG00000018207)	ENSNNAG00000018209	DNM1 (ENSNNAG00000018402)
Anura	ANCESTRAL SPECIES	127			ENSGT00940000159569	ENSGT00390000010743.b	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000013765	ENSGT00940000156868	ENSGT00390000018089	ENSGT00390000008938	ENSGT00950000182969.A	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261.a #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00390000016384	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763	ENSGT00940000154787
Frog	MODERN SPECIES	8	slc31a2 (ENSXETG00000025574)	niban2 (ENSXETG00000014260)	stxbp1 (ENSXETG00000014261)	akna (ENSXETG00000036617)	whrn (ENSXETG00000014264)	atp6v1g1 (ENSXETG00000043091)	tmem268 (ENSXETG00000039386)	flna (ENSXETG00000014268)	ENSXETG00000046651	ENSXETG00000041897	gpr21 (ENSXETG00000045500)	rabgap1 (ENSXETG00000032226)	strbp (ENSXETG00000007590)	ENSXETG00000045953	ENSXETG00000038153	crb2 (ENSXETG00000002514) #22	ENSXETG00000041683	dennd1a (ENSXETG00000045382) #23	lhx2 (ENSXETG00000020776)	ereg (ENSXETG00000011464)	psmb7 (ENSXETG00000042236)	kif14l (ENSXETG00000011461)	adgrd2 (ENSXETG00000011460)	ENSXETG00000042998	nr5a1 (ENSXETG00000011456)	ENSXETG00000044240	nr6a1 (ENSXETG00000008578)	olfml2a (ENSXETG00000008581)	wdr38 (ENSXETG00000016844)	rpl35 (ENSXETG00000016843)	arpc5l (ENSXETG00000044845)
Leishan spiny toad	MODERN SPECIES	12	ENSLLEG00000011693	ENSLLEG00000011705	ENSLLEG00000011717	ENSLLEG00000011741	ENSLLEG00000011807	ZBTB26 (ENSLLEG00000011941)	ZBTB6 (ENSLLEG00000011965)	ENSLLEG00000011983	RABGAP1 (ENSLLEG00000012034)	STRBP (ENSLLEG00000012560)	ENSLLEG00000012676	ENSLLEG00000012686	ENSLLEG00000012716	ENSLLEG00000012741	ENSLLEG00000012760	CRB2 (ENSLLEG00000020099) #22	ENSLLEG00000020201	ENSLLEG00000020398	ENSLLEG00000020455 #23	ENSLLEG00000020786	ENSLLEG00000020809	ENSLLEG00000020832	ENSLLEG00000020911 #23	ENSLLEG00000020979	ENSLLEG00000020993	LHX2 (ENSLLEG00000021028)	ENSLLEG00000021149	NEK6 (ENSLLEG00000021188)	PSMB7 (ENSLLEG00000021620)	ENSLLEG00000021753	ADGRD2 (ENSLLEG00000021775)
Coelacanth	MODERN SPECIES	233													ENSLACG00000018975	RABGAP1 (ENSLACG00000018954)	STRBP (ENSLACG00000018943)	CRB2 (ENSLACG00000018905) #22	DENND1A (ENSLACG00000018855) #23	LHX2 (ENSLACG00000018819)	ENSLACG00000022513	NEK6 (ENSLACG00000018764)	PSMB7 (ENSLACG00000018747)	ENSLACG00000018734	ADGRD2 (ENSLACG00000018696)	NR5A1 (ENSLACG00000018683)	NR6A1 (ENSLACG00000018630)	olfml2a (ENSLACG00000018514)	ENSLACG00000018402	RPL35 (ENSLACG00000018394)	ARPC5L (ENSLACG00000018386)	GOLGA1 (ENSLACG00000018351)	ENSLACG00000018347
Actinopterygii	ANCESTRAL SPECIES	545																ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419
Neopterygii	ANCESTRAL SPECIES	180																ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT01060000248575.C	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000172233	ENSGT00940000166116	ENSGT00390000016384	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961
Spotted gar	MODERN SPECIES	660	cfap77 (ENSLOCG00000005588)	ttf1.1 (ENSLOCG00000005572)	stom (ENSLOCG00000005541)	gsna (ENSLOCG00000005526)	rab14 (ENSLOCG00000005509)	ENSLOCG00000005496	C5 (ENSLOCG00000005479)	ABL1 (ENSLOCG00000005460)	prdm12b (ENSLOCG00000005429)	fubp3 (ENSLOCG00000005411)	ASS1 (ENSLOCG00000005378)	surf4 (ENSLOCG00000005358)	surf2 (ENSLOCG00000005343)	fpgs (ENSLOCG00000005327)	cdk9 (ENSLOCG00000005311)	CRB2 (ENSLOCG00000005298) #22	DENND1A (ENSLOCG00000005271) #23	lhx2b (ENSLOCG00000005257)	NEK6 (ENSLOCG00000005235)	psmb7 (ENSLOCG00000005208)	ENSLOCG00000005193	ADGRD2 (ENSLOCG00000005172)	nr5a1a (ENSLOCG00000005158)	nr6a1a (ENSLOCG00000005138)	olfml2a (ENSLOCG00000005109)	ENSLOCG00000005093	rpl35 (ENSLOCG00000005076)	arpc5lb (ENSLOCG00000005063)	golga1 (ENSLOCG00000005040)	SCAI (ENSLOCG00000005027)	ppp6c (ENSLOCG00000005012)
Osteoglossocephalai	DUPLICATION
Osteoglossocephalai	DUPLICATION
Osteoglossocephalai	ANCESTRAL SPECIES	49						ENSGT00940000164907.b.a	ENSGT00620000089226	ENSGT00940000154394.b.a.b	ENSGT00940000154394.b.a.a.a.a.b	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a	ENSGT00940000154394.a	ENSGT00390000020276	ENSGT00940000165492.a.a	ENSGT00940000155373	ENSGT00390000016526	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT01060000248575.C	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000172233	ENSGT00940000166116	ENSGT00390000016384	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000165669	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000156261 #23
Clupeocephala	ANCESTRAL SPECIES	292					ENSGT00940000155151.a.a.a	ENSGT00940000164907.b.a	ENSGT00620000089226	ENSGT00940000154394.a	ENSGT00390000020276	ENSGT00940000165492.a.a	ENSGT01060000248575.C	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000155373	ENSGT00390000016526	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000153391.c.b.a.i	ENSGT00940000157194	ENSGT00390000016384.m	ENSGT00940000158501.d.b	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00550000074961.a	ENSGT00940000167171
Otomorpha	ANCESTRAL SPECIES	61	ENSGT00940000153181	ENSGT00940000177481	ENSGT00940000158674	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00390000000224	ENSGT00530000063497.a.b	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000153877.a.a.a	ENSGT00940000156902.a	ENSGT00940000157207.a.b	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000156811.a	ENSGT00990000204366	ENSGT00940000155841.c.a	ENSGT00940000163383	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000164360.A	ENSGT00390000001041	ENSGT00940000158897.e.a	ENSGT00940000153612.B	ENSGT00940000158557.k	ENSGT00940000157442	ENSGT01030000234517.E.d	ENSGT00940000157272.g	ENSGT00940000160241	ENSGT00940000155578.e.a.a.a	ENSGT00390000011937.g.b	ENSGT00390000005767.b	ENSGT01050000245010	ENSGT00940000165298.a.b	ENSGT00950000182950.D
Otophysi	ANCESTRAL SPECIES	74	ENSGT00390000001618	ENSGT00390000003682	ENSGT01030000234626.D	ENSGT00390000010239	ENSGT00390000002511	ENSGT00390000012903	ENSGT00530000065225	ENSGT00940000153877.a.a.a	ENSGT00940000156902.a	ENSGT00940000157207.a.b	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000156811.a	ENSGT00990000204366	ENSGT00940000155841.c.a	ENSGT00940000163383	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000164360.A	ENSGT00390000001041	ENSGT00940000158897.e.a	ENSGT00940000153612.B	ENSGT00940000158557.k	ENSGT00940000157442	ENSGT01030000234517.E.d	ENSGT00940000157272.g	ENSGT00940000160241	ENSGT00940000155578.e.a.a.a	ENSGT00390000011937.g.b	ENSGT00390000005767.b	ENSGT00390000003948	ENSGT00390000012485.a.a
Characiphysae	ANCESTRAL SPECIES	43	ENSGT00940000156918	ENSGT00390000003682	ENSGT01030000234626.D	ENSGT00390000010239	ENSGT00390000002511	ENSGT00390000012903	ENSGT00530000065225	ENSGT00940000153877.a.a.a	ENSGT00940000156902.a	ENSGT00940000157207.a.b	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000156811.a	ENSGT00990000204366	ENSGT00940000155841.c.a	ENSGT00940000163383	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000164360.A.a	ENSGT00390000001041	ENSGT00940000158897.e.a	ENSGT00940000153612.B	ENSGT00940000158557.k	ENSGT00940000157442	ENSGT01030000234517.E.d	ENSGT00940000157272.g	ENSGT00940000160241	ENSGT00940000155578.e.a.a.a	ENSGT00390000011937.g.b	ENSGT00390000005767.b	ENSGT00390000003948	ENSGT00390000012485.a.a
Channel catfish	MODERN SPECIES	24	eif2d (ENSIPUG00000012330)	FMOD (ENSIPUG00000012434)	pabpc1l (ENSIPUG00000012602)	143b1 (ENSIPUG00000012694)	CYC1 (ENSIPUG00000012748)	eif2s2 (ENSIPUG00000012763)	chmp4b (ENSIPUG00000012809)	ENSIPUG00000012831	PXN (ENSIPUG00000012844)	GCN1 (ENSIPUG00000012886)	serpind1 (ENSIPUG00000013123)	naif1 (ENSIPUG00000013136)	seta (ENSIPUG00000013161)	gle1 (ENSIPUG00000013197)	ENSIPUG00000013286	ENSIPUG00000013305 #22	ENSIPUG00000013360	lhx2b (ENSIPUG00000018065)	ENSIPUG00000018073	snap29 (ENSIPUG00000019884)	GAPVD1 (ENSIPUG00000019951)	Vgll4 (ENSIPUG00000020201)	DGCR6 (ENSIPUG00000020222)	rpl6 (ENSIPUG00000020213)	dynll1 (ENSIPUG00000020243)	ENSIPUG00000020259	acaa2 (ENSIPUG00000020272)	Mrpl40 (ENSIPUG00000020288)	vsig8b (ENSIPUG00000020301)	snrnp200 (ENSIPUG00000020309)	ENSIPUG00000020358
Characiphysae_b	ANCESTRAL SPECIES	42	ENSGT00390000000378.d.a.o.b	ENSGT00390000003682	ENSGT01030000234626.D	ENSGT00390000010239	ENSGT00390000002511	ENSGT00390000012903	ENSGT00530000065225	ENSGT00940000153877.a.a.a	ENSGT00940000156902.a	ENSGT00940000157207.a.b	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000156811.a	ENSGT00990000204366	ENSGT00940000155841.c.a	ENSGT00940000163383	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000164360.A.a	ENSGT00390000001041	ENSGT00940000158897.e.a	ENSGT00940000153612.B	ENSGT00940000158557.k	ENSGT00940000157442	ENSGT01030000234517.E.d	ENSGT00940000157272.g	ENSGT00940000160241	ENSGT00940000155578.e.a.a.a	ENSGT00390000011937.g.b	ENSGT00390000005767.b	ENSGT00390000003948	ENSGT00390000012485.a.a
Electric eel	MODERN SPECIES	870	dynll1 (ENSEEEG00000015208)	ENSEEEG00000015204	rpl6 (ENSEEEG00000015200)	acaa2 (ENSEEEG00000015176)	mrpl40 (ENSEEEG00000015175)	si:ch211-51h9.6 (ENSEEEG00000015174)	gle1 (ENSEEEG00000015094)	seta (ENSEEEG00000015089)	zdhhc12a (ENSEEEG00000015088)	ENSEEEG00000014829	naif1 (ENSEEEG00000014811)	EEIG1 (ENSEEEG00000014807)	ENSEEEG00000014806	sh3glb2a (ENSEEEG00000014803)	ENSEEEG00000014802	ENSEEEG00000014801 #22
Characoidei	ANCESTRAL SPECIES	59	ENSGT00390000000378.d.b	ENSGT00390000003682	ENSGT01030000234626.D	ENSGT00390000010239	ENSGT00390000002511	ENSGT00390000012903	ENSGT00530000065225	ENSGT00940000153877.a.a.a	ENSGT00940000156902.a	ENSGT00940000157207.a.b	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000156811.a	ENSGT00990000204366	ENSGT00940000155841.c.a	ENSGT00940000163383	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000164360.A.a	ENSGT00390000001041	ENSGT00940000158897.e.a	ENSGT00940000153612.B	ENSGT00940000158557.k	ENSGT00940000157442	ENSGT01030000234517.E.d	ENSGT00940000157272.g	ENSGT00940000160241	ENSGT00940000155578.e.a.a.a	ENSGT00390000011937.g.b	ENSGT00390000005767.b	ENSGT00390000003948	ENSGT00390000012485.a.a
Red-bellied piranha	DUPLICATION
Red-bellied piranha	MODERN SPECIES	1912															ENSPNAG00000009956 #22	ENSPNAG00000009940 #22	ENSPNAG00000009935 #23
Red-bellied piranha	MODERN SPECIES	2697																ENSPNAG00000012285 #22
Mexicana tetra	MODERN SPECIES	21	rpl6 (ENSAMXG00000012854)	acaa2 (ENSAMXG00000035892)	si:ch211-51h9.6 (ENSAMXG00000033396)	mrpl40 (ENSAMXG00000029691)	gle1 (ENSAMXG00000012542)	si:ch211-51h9.7 (ENSAMXG00000012480)	seta (ENSAMXG00000010484)	zdhhc12a (ENSAMXG00000012374)	slc25a25a (ENSAMXG00000042479)	naif1 (ENSAMXG00000039603)	EEIG1 (ENSAMXG00000012124)	ENSAMXG00000029716	sh3glb2a (ENSAMXG00000012086)	ENSAMXG00000036574	ENSAMXG00000038206	ENSAMXG00000012030 #22	lhx2b (ENSAMXG00000035303)	ENSAMXG00000024914	ctu1 (ENSAMXG00000039534)	PXN (ENSAMXG00000029345)	GCN1 (ENSAMXG00000011852)	rab35b (ENSAMXG00000039865)	BICDL1 (ENSAMXG00000011718)	si:dkey-190g11.3 (ENSAMXG00000042409)	plk2b (ENSAMXG00000011555)	mier3b (ENSAMXG00000011464)	mrps36 (ENSAMXG00000011445)	cenph (ENSAMXG00000040830)	pola2 (ENSAMXG00000011308)	dimt1l (ENSAMXG00000011186)	kif2a (ENSAMXG00000011099)
Cyprinoidei	ANCESTRAL SPECIES	32	ENSGT00390000001618	ENSGT00390000003682	ENSGT01030000234626.D	ENSGT00390000010239	ENSGT00390000002511	ENSGT00390000012903	ENSGT00530000065225	ENSGT00940000153877.a.a.a	ENSGT00940000156902.a	ENSGT00940000157207.a.b	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000156811.a	ENSGT00990000204366	ENSGT00940000155841.c.a	ENSGT00940000163383	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000164360.A	ENSGT00390000001041	ENSGT00940000158897.e.a	ENSGT00940000153612.B	ENSGT00940000158557.k	ENSGT00940000157442	ENSGT01030000234517.E.d	ENSGT00940000157272.g.a	ENSGT00940000160241	ENSGT00940000155578.e.a.a.a.b	ENSGT00390000011937.g.b	ENSGT00390000005767.b	ENSGT00390000003948	ENSGT00390000012485.a.a
Cyprininae	DUPLICATION
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	136							ENSGT00390000012903.c	ENSGT00940000153877.a.a.a	ENSGT00940000156902.a	ENSGT00940000157207.a.b.a	ENSGT00450000040324.b.j.b	ENSGT00940000156811.a.b	ENSGT00990000204366	ENSGT00940000155841.c.a.a.a	ENSGT00940000163383	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a.c #22	ENSGT00940000158540.q.a	ENSGT00940000164360.A.f	ENSGT00390000001041	ENSGT00940000158897.e.a.d	ENSGT00940000158897.e.a.c.b	ENSGT00940000153612.B.e	ENSGT00940000158557.k.b.b	ENSGT00940000157442.q	ENSGT01030000234517.E.d.e	ENSGT00940000157272.g.a.a.a	ENSGT00940000158897.e.a.c.a	ENSGT00940000153612.B.f	ENSGT00940000158557.k.b.a	ENSGT00940000157442.r	ENSGT01030000234517.E.d.f
Goldfish	MODERN SPECIES	26	ENSCARG00000012826	gatd3l (ENSCARG00000012817)	ENSCARG00000012785	tmem230b (ENSCARG00000012763)	ENSCARG00000012741	rpl6 (ENSCARG00000012734)	mrpl40 (ENSCARG00000012726)	gle1 (ENSCARG00000012718)	ENSCARG00000012708	seta (ENSCARG00000012703)	zdhhc12a (ENSCARG00000012701)	slc25a25a (ENSCARG00000012512)	EEIG1 (ENSCARG00000012500)	ENSCARG00000012492	ENSCARG00000012487	CRB2 (ENSCARG00000012445) #22	lhx2b (ENSCARG00000012423)	ENSCARG00000012412	ENSCARG00000012406	ctu1 (ENSCARG00000012398)	PXN (ENSCARG00000012275)	GCN1 (ENSCARG00000011793)	rab35b (ENSCARG00000011753)	BICDL1 (ENSCARG00000011718)	CIT (ENSCARG00000009951)	mtmr3 (ENSCARG00000006718)	ENSCARG00000006485	myl2b (ENSCARG00000006460)	pptc7a (ENSCARG00000006438)	ENSCARG00000006344	dhx37 (ENSCARG00000006130)
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	221	ENSGT00950000182937.A.b.f	ENSGT00950000182869.e.b.g.a.a	ENSGT00940000153866.B	ENSGT00940000156918.d	ENSGT00390000003682.b	ENSGT00390000010239.m	ENSGT00390000012903.c	ENSGT00940000153877.a.a.a	ENSGT00940000156902.a	ENSGT00940000157207.a.b.a	ENSGT00450000040324.b.j.b	ENSGT00940000156811.a.b	ENSGT00990000204366	ENSGT00940000155841.c.a.a.a	ENSGT00940000163383.a	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a.c #22	ENSGT00940000158540.q.a	ENSGT00940000164360.A.f	ENSGT00940000158897.e.a.c.a	ENSGT00940000153612.B.f	ENSGT00940000158557.k.b.a	ENSGT00940000157442.r	ENSGT01030000234517.E.d.f	ENSGT00940000157272.g.a.a.b	ENSGT00940000160241	ENSGT00940000155578.e.a.a.a.b.a.a	ENSGT00390000011937.g.b.a	ENSGT00390000012485.a.a.a	ENSGT00550000074985.e	ENSGT00530000064244.b	ENSGT00940000159913.a.a.c
Common carp reference	MODERN SPECIES	17	ENSCCRG00000013750	dynll1 (ENSCCRG00000013754)	ENSCCRG00000059675	rpl6 (ENSCCRG00000039880)	acaa2 (ENSCCRG00000072948)	mrpl40 (ENSCCRG00000039944)	gle1 (ENSCCRG00000013852)	seta (ENSCCRG00000015723)	zdhhc12a (ENSCCRG00000041851)	slc25a25a (ENSCCRG00000080316)	naif1 (ENSCCRG00000015730)	EEIG1 (ENSCCRG00000041864)	ENSCCRG00000041867	sh3glb2a (ENSCCRG00000010610)	ENSCCRG00000055340	ENSCCRG00000049409 #22	ENSCCRG00000081956	lhx2b (ENSCCRG00000048661)	ENSCCRG00000068242	ENSCCRG00000078643	PXN (ENSCCRG00000012068)	GCN1 (ENSCCRG00000034818)	rab35b (ENSCCRG00000075918)	BICDL1 (ENSCCRG00000026042)	CIT (ENSCCRG00000026230)	mtmr3 (ENSCCRG00000028578)	ENSCCRG00000017117	myl2b (ENSCCRG00000030023)	pptc7a (ENSCCRG00000081676)	ENSCCRG00000030055	dhx37 (ENSCCRG00000030096)
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	706	enkd1 (ENSSGRG00000042552)	ENSSGRG00000042556	dynll1 (ENSSGRG00000042558)	rpl6 (ENSSGRG00000042577)	mrpl40 (ENSSGRG00000042578)	si:ch211-51h9.6 (ENSSGRG00000042579)	gle1 (ENSSGRG00000042580)	seta (ENSSGRG00000042589)	zdhhc12a (ENSSGRG00000042675)	slc25a25a (ENSSGRG00000042698)	naif1 (ENSSGRG00000043603)	EEIG1 (ENSSGRG00000043604)	ENSSGRG00000043605	sh3glb2a (ENSSGRG00000043606)	ENSSGRG00000043619	CRB2 (ENSSGRG00000043620) #22	lhx2b (ENSSGRG00000043621)	ENSSGRG00000043622
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	1447																ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a.d #22	ENSGT00940000158540.r
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	1100																ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a.d #22	ENSGT00940000158540.r
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	1203														sh3glb2a (ENSSGRG00000017931)	ENSSGRG00000017952	ENSSGRG00000017953 #22	lhx2b (ENSSGRG00000017965)
Zebrafish	MODERN SPECIES	23	ENSDARG00000092379	dynll1 (ENSDARG00000058454)	rpl6 (ENSDARG00000058451)	acaa2 (ENSDARG00000038881)	mrpl40 (ENSDARG00000043554)	si:ch211-51h9.6 (ENSDARG00000092360)	gle1 (ENSDARG00000043559)	si:ch211-51h9.7 (ENSDARG00000074720)	seta (ENSDARG00000031495)	zdhhc12a (ENSDARG00000076632)	slc25a25a (ENSDARG00000010572)	naif1 (ENSDARG00000062753)	EEIG1 (ENSDARG00000102566)	ENSDARG00000101753	sh3glb2a (ENSDARG00000008983)	ENSDARG00000060081 #22	lhx2b (ENSDARG00000031222)	fut9b.1 (ENSDARG00000067524)	fut9b.2 (ENSDARG00000058299)	fut9b.3 (ENSDARG00000027699)	fut9b.4 (ENSDARG00000086603)	fut9b.5 (ENSDARG00000102426)	fut9b.6 (ENSDARG00000102554)	ENSDARG00000100247	ctu1 (ENSDARG00000020986)	PXN (ENSDARG00000060766)	GCN1 (ENSDARG00000058419)	rab35b (ENSDARG00000058425)	BICDL1 (ENSDARG00000074761)	CIT (ENSDARG00000088825)	mtmr3 (ENSDARG00000098201)
Clupeiformes	ANCESTRAL SPECIES	55	ENSGT00530000063156.a.a.b	ENSGT00440000038585.c	ENSGT00940000153181	ENSGT00940000158674	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00390000000224	ENSGT00530000063497.a.b	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000153877.a.a.a	ENSGT00940000156902.a	ENSGT00940000157207.a.b	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000156811.a	ENSGT00940000155841.c.a	ENSGT00940000163383	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000164360.A	ENSGT00390000001041	ENSGT00940000158897.e.a	ENSGT00940000153612.B	ENSGT00940000158557.k	ENSGT00940000157442	ENSGT01030000234517.E.d	ENSGT00940000157272.g	ENSGT00940000160241	ENSGT00940000155578.e.a.a.a	ENSGT00390000011937.g.b	ENSGT00390000005767.b	ENSGT01050000245010	ENSGT00940000165298.a.b	ENSGT00950000182950.D
Denticle herring	MODERN SPECIES	2	MMP11 (ENSDCDG00000022435)	derl3 (ENSDCDG00000022432)	smarcb1a (ENSDCDG00000022363)	ralgds (ENSDCDG00000022351)	ptgesl (ENSDCDG00000022349)	odf2b (ENSDCDG00000022347)	gle1 (ENSDCDG00000022125)	seta (ENSDCDG00000022113)	zdhhc12a (ENSDCDG00000022112)	slc25a25a (ENSDCDG00000021957)	naif1 (ENSDCDG00000021938)	EEIG1 (ENSDCDG00000021932)	ENSDCDG00000021928	sh3glb2a (ENSDCDG00000021710)	ENSDCDG00000021693	ENSDCDG00000021689 #22	lhx2b (ENSDCDG00000021686)	fut9b.4 (ENSDCDG00000021680)	ctu1 (ENSDCDG00000021677)	PXN (ENSDCDG00000021670)	GCN1 (ENSDCDG00000021017)	rab35b (ENSDCDG00000020978)	BICDL1 (ENSDCDG00000020973)	mtmr3 (ENSDCDG00000013313)	ENSDCDG00000013124	myl2b (ENSDCDG00000013040)	pptc7a (ENSDCDG00000013019)	rad9b (ENSDCDG00000012970)	ENSDCDG00000012946	ENSDCDG00000012930	anapc7 (ENSDCDG00000012912)
Atlantic herring	MODERN SPECIES	23	tsc1a (ENSCHAG00000014348)	ENSCHAG00000014365	CEL (ENSCHAG00000014578)	grin1b (ENSCHAG00000014649)	ralgds (ENSCHAG00000014852)	ptgesl (ENSCHAG00000015273)	odf2b (ENSCHAG00000015291)	gle1 (ENSCHAG00000015330)	seta (ENSCHAG00000015839)	zdhhc12a (ENSCHAG00000015883)	ENSCHAG00000015968	ENSCHAG00000015986	EEIG1 (ENSCHAG00000016127)	SH3GLB2 (ENSCHAG00000016391)	ENSCHAG00000016483	ENSCHAG00000016513 #22	SLC16A13 (ENSCHAG00000016669)	lhx2b (ENSCHAG00000016710)	fut9b.4 (ENSCHAG00000016738)	ctu1 (ENSCHAG00000016772)	PXN (ENSCHAG00000016789)	GCN1 (ENSCHAG00000016932)	rab35b (ENSCHAG00000021052)	BICDL1 (ENSCHAG00000021069)	CIT (ENSCHAG00000021124)	MTMR3 (ENSCHAG00000021964)	ENSCHAG00000024338	MYL2 (ENSCHAG00000024362)	pptc7a (ENSCHAG00000024380)	ENSCHAG00000024389	ENSCHAG00000024393
Euteleosteomorpha	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000159838	ENSGT00940000155422.bb	ENSGT00940000155275.c.b.b	ENSGT00940000156002.a.b	ENSGT00940000166440	ENSGT01080000257442	ENSGT00390000012665	ENSGT01100000263542.B.b.a.b	ENSGT00940000167390	ENSGT00530000064286	ENSGT00940000155151.a.a.a	ENSGT00940000164907.b.a	ENSGT00620000089226	ENSGT00940000154394.a	ENSGT00390000020276	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540	ENSGT01060000248575.C	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00390000016384.m	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00550000074961.a	ENSGT00940000165424.a.b.b	ENSGT01060000248544.b	ENSGT00940000155841.c.a	ENSGT00940000158633.b	ENSGT00990000204366	ENSGT00940000156811.a
Acanthomorphata	ANCESTRAL SPECIES	46	ENSGT00940000159838	ENSGT00940000155422.bb	ENSGT00940000155275.c.b.b	ENSGT00940000156002.a.b	ENSGT00940000166440	ENSGT01080000257442	ENSGT00390000012665	ENSGT01100000263542.B.b.a.b	ENSGT00940000167390	ENSGT00530000064286	ENSGT00940000155151.a.a.a	ENSGT00940000164907.b.a	ENSGT00620000089226	ENSGT00940000154394.a	ENSGT00390000020276	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540	ENSGT01060000248575.C	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00390000016384.m	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00550000074961.a	ENSGT00940000167171	ENSGT01060000248544.b	ENSGT00940000155841.c.a	ENSGT00940000158633.b
Euacanthomorphacea	ANCESTRAL SPECIES	81	ENSGT00940000159838	ENSGT00940000155422.bb	ENSGT00940000155275.c.b.b	ENSGT00940000156002.a.b	ENSGT00940000166440	ENSGT01080000257442	ENSGT00390000012665	ENSGT01100000263542.B.b.a.b	ENSGT00940000167390	ENSGT00530000064286	ENSGT00940000155151.a.a.a	ENSGT00940000164907.b.a	ENSGT00620000089226	ENSGT00940000154394.a	ENSGT00940000165492.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540	ENSGT01060000248575.C	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00390000016384.m	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00550000074961.a	ENSGT00940000167171	ENSGT01060000248544.b	ENSGT00940000155841.c.a	ENSGT00940000158633.b
Pinecone sodierfish	MODERN SPECIES	23	tncb (ENSMMDG00005005961)	ENSMMDG00005007681	ENSMMDG00005007683	ENSMMDG00005007689	nsmfb (ENSMMDG00005007693)	PNPLA7 (ENSMMDG00005007709)	mrpl41 (ENSMMDG00005007865)	dph7 (ENSMMDG00005007866)	fgf17 (ENSMMDG00005007870)	FKBP15 (ENSMMDG00005008231)	ccn1l2 (ENSMMDG00005009668)	ENSMMDG00005009682	ENSMMDG00005009684	tubb2b (ENSMMDG00005009685)	ENSMMDG00005009691	ENSMMDG00005009757 #22	lhx2b (ENSMMDG00005009768)	ENSMMDG00005009770	nr5a1a (ENSMMDG00005009771)	nr6a1a (ENSMMDG00005009822)	olfml2a (ENSMMDG00005009830)	rpl35 (ENSMMDG00005009835)	golga1 (ENSMMDG00005009863)	PPP6C (ENSMMDG00005009882)	ENSMMDG00005009884	ENSMMDG00005009886	sh3glb2a (ENSMMDG00005009900)	PIP5KL1 (ENSMMDG00005010059)	ptar1 (ENSMMDG00005010061)	APBA1 (ENSMMDG00005010064)	ENSMMDG00005010068
Percomorphaceae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000159838	ENSGT00940000155422.bb	ENSGT00940000155275.c.b.b	ENSGT00940000156002.a.b	ENSGT00940000166440	ENSGT01080000257442	ENSGT00390000012665	ENSGT01100000263542.B.b.a.b	ENSGT00940000167390	ENSGT00530000064286	ENSGT00940000155151.a.a.a	ENSGT00940000164907.b.a	ENSGT00620000089226	ENSGT00940000154394.a	ENSGT00940000165492.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540	ENSGT01060000248575.C	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00990000203759	ENSGT00390000016384.m	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00550000074961.a	ENSGT00940000167171	ENSGT01060000248544.b	ENSGT00940000155841.c.a	ENSGT00390000018644	ENSGT00390000013158
Tiger tail seahorse	MODERN SPECIES	515	fgf17 (ENSHCOG00000001834)	FKBP15 (ENSHCOG00000001827)	ENSHCOG00000001816	sub1b (ENSHCOG00000001809)	ENSHCOG00000001803	RABL6 (ENSHCOG00000001802)	imp4 (ENSHCOG00000001797)	araf (ENSHCOG00000001790)	zgc:64051 (ENSHCOG00000001777)	ccn1l2 (ENSHCOG00000001770)	ENSHCOG00000001760	ENSHCOG00000001755	ENSHCOG00000001748	ENSHCOG00000001744	ENSHCOG00000001740	ENSHCOG00000001723 #22	lhx2b (ENSHCOG00000001700)	ENSHCOG00000001694	ENSHCOG00000001690	nr5a1a (ENSHCOG00000001682)	nr6a1a (ENSHCOG00000001676)	olfml2a (ENSHCOG00000001668)	ENSHCOG00000001661	rpl35 (ENSHCOG00000001654)	golga1 (ENSHCOG00000001647)	PPP6C (ENSHCOG00000001623)	ENSHCOG00000001613	ENSHCOG00000001606	ENSHCOG00000001601	sh3glb2a (ENSHCOG00000001595)	dph7 (ENSHCOG00000001585)
Percomorphaceae_B	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000159838	ENSGT00940000155422.bb	ENSGT00940000155275.c.b.b	ENSGT00940000156002.a.b	ENSGT00940000166440	ENSGT01080000257442	ENSGT00390000012665	ENSGT01100000263542.B.b.a.b	ENSGT00940000167390	ENSGT00530000064286	ENSGT00940000155151.a.a.a	ENSGT00940000164907.b.a	ENSGT00620000089226	ENSGT00940000154394.a	ENSGT00940000165492.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540	ENSGT01060000248575.C	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00990000203759	ENSGT00390000016384.m	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00550000074961.a	ENSGT00940000167171	ENSGT01060000248544.b	ENSGT00940000172113	ENSGT00940000171469	ENSGT00940000155841.c.a
Percomorphaceae_C	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000159838	ENSGT00940000155422.bb	ENSGT00940000155275.c.b.b	ENSGT00940000156002.a.b	ENSGT00940000166440	ENSGT01080000257442	ENSGT00390000012665	ENSGT01100000263542.B.b.a.b	ENSGT00940000167390	ENSGT00530000064286	ENSGT00940000155151.a.a.a	ENSGT00940000164907.b.a	ENSGT00620000089226	ENSGT00940000154394.a	ENSGT00940000165492.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00990000203759	ENSGT00390000016384.m	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00550000074961.a	ENSGT00940000165424.a.b.b	ENSGT00940000167171	ENSGT00940000171469	ENSGT00940000155841.c.a	ENSGT00390000018644	ENSGT00390000013158
Eupercaria	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000159838	ENSGT00940000155422.bb	ENSGT00940000155275.c.b.b	ENSGT00940000156002.a.b	ENSGT00940000166440	ENSGT01080000257442	ENSGT00390000012665	ENSGT01100000263542.B.b.a.b	ENSGT00940000167390	ENSGT00530000064286	ENSGT00940000155151.a.a.a	ENSGT00940000164907.b.a	ENSGT00620000089226	ENSGT00940000154394.a	ENSGT00940000165492.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00990000203759	ENSGT00390000016384.m	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00550000074961.a	ENSGT00940000165424.a.b.b	ENSGT00940000172113	ENSGT00940000171469	ENSGT00940000155841.c.a	ENSGT00390000018644	ENSGT00390000013158
Tetraodontidae	ANCESTRAL SPECIES	322																ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540
Fugu	MODERN SPECIES	13	ENSTRUG00000024169	isl1a (ENSTRUG00000013818)	ENSTRUG00000032436	ccdc125 (ENSTRUG00000002108)	rad17 (ENSTRUG00000002152)	zgc:86811 (ENSTRUG00000003164)	ube2l3b (ENSTRUG00000003392)	ydjc (ENSTRUG00000003710)	ENSTRUG00000024474	tncb (ENSTRUG00000003805)	TRAF2 (ENSTRUG00000004769)	ENSTRUG00000004135	imp4 (ENSTRUG00000003784)	araf (ENSTRUG00000001926)	zgc:64051 (ENSTRUG00000001861)	ENSTRUG00000001637 #22	lhx2b (ENSTRUG00000001385)	ENSTRUG00000032723	ppm1f (ENSTRUG00000004222)	ENSTRUG00000028634	gfpt1 (ENSTRUG00000003278)	nfu1 (ENSTRUG00000002994)	zgc:103692 (ENSTRUG00000002376)	ENSTRUG00000025805	adgra2 (ENSTRUG00000008432)	ENSTRUG00000008324	adrb3a (ENSTRUG00000025310)	ENSTRUG00000029785	ENSTRUG00000026018	AAK1 (ENSTRUG00000002601)	ENSTRUG00000032509
Tetraodon	MODERN SPECIES	26	npr3 (ENSTNIG00000002699)	ENSTNIG00000002698	si:dkey-3h3.3 (ENSTNIG00000002697)	ccdc125 (ENSTNIG00000000550)	rad17 (ENSTNIG00000010602)	zgc:86811 (ENSTNIG00000010601)	ube2l3b (ENSTNIG00000010600)	ydjc (ENSTNIG00000010599)	ENSTNIG00000010598	tncb (ENSTNIG00000010597)	TRAF2 (ENSTNIG00000010596)	RABL6 (ENSTNIG00000010595)	imp4 (ENSTNIG00000010594)	araf (ENSTNIG00000010593)	zgc:64051 (ENSTNIG00000010592)	CRB2 (ENSTNIG00000010591) #22	lhx2b (ENSTNIG00000010590)	ADGRD2 (ENSTNIG00000010589)	nr5a1a (ENSTNIG00000010588)	nr6a1a (ENSTNIG00000010587)	TCF4 (ENSTNIG00000010330)	ENSTNIG00000010329	RAB27B (ENSTNIG00000010328)	BRCC3 (ENSTNIG00000010327)	ENSTNIG00000010326	pum3 (ENSTNIG00000010325)	KCNV2 (ENSTNIG00000010324)	cables1 (ENSTNIG00000010323)	vldlr (ENSTNIG00000010322)	ENSTNIG00000007214	spp1 (ENSTNIG00000000575)
Eupecaria_A	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000159838	ENSGT00940000155422.bb	ENSGT00940000155275.c.b.b	ENSGT00940000156002.a.b	ENSGT00940000166440	ENSGT01080000257442	ENSGT00390000012665	ENSGT01100000263542.B.b.a.b	ENSGT00940000167390	ENSGT00530000064286	ENSGT00940000155151.a.a.a	ENSGT00940000164907.b.a	ENSGT00620000089226	ENSGT00940000154394.a	ENSGT00940000165492.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00990000203759	ENSGT00390000016384.m	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00550000074961.a	ENSGT00940000165424.a.b.b	ENSGT01060000248544.b	ENSGT00940000172113	ENSGT00940000171469	ENSGT00940000155841.c.a	ENSGT00390000018644
Ballan wrasse	MODERN SPECIES	238										ENSLBEG00000028755	ccn1l2 (ENSLBEG00000028754)	ENSLBEG00000028752	ENSLBEG00000028749	tubb2b (ENSLBEG00000028751)	ENSLBEG00000028748	ENSLBEG00000028746 #22	lhx2b (ENSLBEG00000028745)	ENSLBEG00000028743	ADGRD2 (ENSLBEG00000028742)	nr5a1a (ENSLBEG00000028740)	nr6a1a (ENSLBEG00000028739)	olfml2a (ENSLBEG00000028738)	ENSLBEG00000028736	rpl35 (ENSLBEG00000028735)	golga1 (ENSLBEG00000028734)	PPP6C (ENSLBEG00000028732)	ENSLBEG00000028731	ENSLBEG00000028729
Eupecaria_B	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000159838	ENSGT00940000155422.bb	ENSGT00940000155275.c.b.b	ENSGT00940000156002.a.b	ENSGT00940000166440	ENSGT01080000257442	ENSGT00390000012665	ENSGT01100000263542.B.b.a.b	ENSGT00940000167390	ENSGT00530000064286	ENSGT00940000155151.a.a.a	ENSGT00940000164907.b.a	ENSGT00620000089226	ENSGT00940000154394.a	ENSGT00940000165492.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00990000203759	ENSGT00390000016384.m	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00550000074961.a	ENSGT00940000165424.a.b.b	ENSGT01060000248544.b	ENSGT00940000172113	ENSGT00940000171469	ENSGT00940000155841.c.a	ENSGT00390000018644
Perciformes	ANCESTRAL SPECIES	33	ENSGT00940000159838	ENSGT00940000155422.bb	ENSGT00940000155275.c.b.b	ENSGT00940000156002.a.b	ENSGT00940000166440	ENSGT01080000257442	ENSGT00390000012665	ENSGT01100000263542.B.b.a.b	ENSGT00940000167390	ENSGT00530000064286	ENSGT00940000155151.a.a.a	ENSGT00940000164907.b.a	ENSGT00620000089226	ENSGT00940000154394.a	ENSGT00940000165492.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540	ENSGT01060000248575.C	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00990000203759	ENSGT00390000016384.m	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00550000074961.a	ENSGT00940000165424.a.b.b	ENSGT01060000248544.b	ENSGT00940000172113	ENSGT00940000171469	ENSGT00940000155841.c.a	ENSGT00390000018644
Perciformes_a	ANCESTRAL SPECIES	31	ENSGT00940000159838	ENSGT00940000155422.bb	ENSGT00940000155275.c.b.b	ENSGT00940000156002.a.b	ENSGT00940000166440	ENSGT01080000257442	ENSGT00390000012665	ENSGT01100000263542.B.b.a.b	ENSGT00940000167390	ENSGT00530000064286	ENSGT00940000155151.a.a.a	ENSGT00940000164907.b.a	ENSGT00620000089226	ENSGT00940000154394.b.a.a.a.b.b	ENSGT00940000165492.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00990000203759	ENSGT00390000016384.m	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00550000074961.a	ENSGT00940000165424.a.b.b	ENSGT01060000248544.b	ENSGT00940000172113	ENSGT00940000171469	ENSGT00940000155841.c.a	ENSGT00390000018644
Pike perch	MODERN SPECIES	16	man1b1b (ENSSLUG00000011026)	ENSSLUG00000011004	cacna1ba (ENSSLUG00000010977)	ehmt1a (ENSSLUG00000005703)	arrdc1a (ENSSLUG00000005377)	ENSSLUG00000005370	nelfb (ENSSLUG00000005333)	entpd2a.1 (ENSSLUG00000005304)	fgf17 (ENSSLUG00000005289)	FKBP15 (ENSSLUG00000005202)	ccn1l2 (ENSSLUG00000005178)	ENSSLUG00000005171	ENSSLUG00000005161	ENSSLUG00000023950	ENSSLUG00000023910	ENSSLUG00000023894 #22	lhx2b (ENSSLUG00000023891)	ADGRD2 (ENSSLUG00000023884)	nr5a1a (ENSSLUG00000023874)	nr6a1a (ENSSLUG00000023866)	olfml2a (ENSSLUG00000023860)	ENSSLUG00000023854	atad1a (ENSSLUG00000023848)	ENSSLUG00000023816	piwil2 (ENSSLUG00000021186)	ENSSLUG00000021040	tnksb (ENSSLUG00000019568)	IDUA (ENSSLUG00000019501)	rbp4l (ENSSLUG00000019497)	ENSSLUG00000019493	kcnv2b (ENSSLUG00000019490)
Channel bull blenny	MODERN SPECIES	23	man1b1b (ENSCGOG00000011214)	ENSCGOG00000011203	ENSCGOG00000011198	ENSCGOG00000011194	ehmt1a (ENSCGOG00000011001)	arrdc1a (ENSCGOG00000010987)	nelfb (ENSCGOG00000010747)	entpd2a.1 (ENSCGOG00000010739)	fgf17 (ENSCGOG00000010697)	FKBP15 (ENSCGOG00000010671)	ccn1l2 (ENSCGOG00000010662)	ENSCGOG00000010655	ENSCGOG00000010636	tubb2b (ENSCGOG00000010642)	ENSCGOG00000010608	ENSCGOG00000010599 #22	lhx2b (ENSCGOG00000010594)	ENSCGOG00000010589	nr5a1a (ENSCGOG00000010466)	olfml2a (ENSCGOG00000010452)	ENSCGOG00000010449	rpl35 (ENSCGOG00000010439)	golga1 (ENSCGOG00000010391)	PPP6C (ENSCGOG00000010385)	ENSCGOG00000010383	ENSCGOG00000010381	ENSCGOG00000010378	sh3glb2a (ENSCGOG00000008886)	mrpl41 (ENSCGOG00000008796)	dph7 (ENSCGOG00000008790)	ENSCGOG00000008769
Cottioidei	ANCESTRAL SPECIES	63	ENSGT00530000063843.a	ENSGT00940000159838	ENSGT00940000155422.bb	ENSGT00940000155275.c.b.b	ENSGT00940000156002.a.b	ENSGT00940000166440	ENSGT00390000012665	ENSGT01100000263542.B.b.a.b	ENSGT00940000167390	ENSGT00530000064286	ENSGT00940000155151.a.a.a	ENSGT00940000164907.b.a	ENSGT00620000089226	ENSGT00940000154394.a	ENSGT00940000165492.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540	ENSGT01060000248575.C	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00390000016384.m	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00550000074961.a	ENSGT00940000165424.a.b.b	ENSGT01060000248544.b	ENSGT00940000172113	ENSGT00940000171469	ENSGT00940000155841.c.a	ENSGT00390000018644	ENSGT00390000013158
Lumpfish	MODERN SPECIES	24	noxa1 (ENSCLMG00005016790)	dpp7 (ENSCLMG00005016799)	man1b1b (ENSCLMG00005016953)	cacna1ba (ENSCLMG00005016965)	ehmt1a (ENSCLMG00005016997)	arrdc1a (ENSCLMG00005017808)	nelfb (ENSCLMG00005017813)	entpd2a.1 (ENSCLMG00005017836)	fgf17 (ENSCLMG00005017838)	FKBP15 (ENSCLMG00005017983)	ccn1l2 (ENSCLMG00005018003)	ENSCLMG00005018004	ENSCLMG00005018007	tubb2b (ENSCLMG00005018010)	ENSCLMG00005018016	ENSCLMG00005018046 #22	lhx2b (ENSCLMG00005018059)	ENSCLMG00005018060	nr5a1a (ENSCLMG00005018062)	nr6a1a (ENSCLMG00005018098)	OLFML2A (ENSCLMG00005018104)	ENSCLMG00005018105	tcima (ENSCLMG00005018107)	fam151b (ENSCLMG00005018109)	KLHL10 (ENSCLMG00005000128)	ENSCLMG00005000136	dhfr (ENSCLMG00005000149)	gtf2h2 (ENSCLMG00005000193)	oclnb (ENSCLMG00005000219)	marveld2b (ENSCLMG00005000223)	sdf2l1 (ENSCLMG00005000226)
Stickleback	MODERN SPECIES	12	stxbp1b (ENSGACG00000003228)	WHRN (ENSGACG00000003297)	ENSGACG00000003309	dpp7 (ENSGACG00000003313)	man1b1b (ENSGACG00000003326)	cacna1ba (ENSGACG00000003335)	ehmt1a (ENSGACG00000003353)	arrdc1a (ENSGACG00000003366)	nelfb (ENSGACG00000003381)	fgf17 (ENSGACG00000003432)	FKBP15 (ENSGACG00000003433)	ccn1l2 (ENSGACG00000003446)	ENSGACG00000003456	tubb2b (ENSGACG00000003471)	ENSGACG00000003503	ENSGACG00000003512 #22	lhx2b (ENSGACG00000003520)	nr5a1a (ENSGACG00000003539)	nr6a1a (ENSGACG00000003560)	olfml2a (ENSGACG00000003569)	rpl35 (ENSGACG00000003574)	golga1 (ENSGACG00000003576)	PPP6C (ENSGACG00000003583)	ENSGACG00000003617	ENSGACG00000003618	sh3glb2a (ENSGACG00000003622)	dph7 (ENSGACG00000003634)	mrpl41 (ENSGACG00000003642)	PNPLA7 (ENSGACG00000003644)	zgc:64051 (ENSGACG00000003653)	araf (ENSGACG00000003668)
Eupecaria_C	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000159838	ENSGT00940000155422.bb	ENSGT00940000155275.c.b.b	ENSGT00940000156002.a.b	ENSGT00940000166440	ENSGT01080000257442	ENSGT00390000012665	ENSGT01100000263542.B.b.a.b	ENSGT00940000167390	ENSGT00530000064286	ENSGT00940000155151.a.a.a	ENSGT00940000164907.b.a	ENSGT00620000089226	ENSGT00940000154394.a	ENSGT00940000165492.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00990000203759	ENSGT00390000016384.m	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00550000074961.a	ENSGT00940000162514	ENSGT00940000171469	ENSGT00940000155841.c.a	ENSGT00390000018644	ENSGT00390000013158	ENSGT00940000156763.b.b
Eupercaria_incertae_sedis	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000159838	ENSGT00940000155422.bb	ENSGT00940000155275.c.b.b	ENSGT00940000156002.a.b	ENSGT00940000166440	ENSGT01080000257442	ENSGT00390000012665	ENSGT01100000263542.B.b.a.b	ENSGT00940000167390	ENSGT00530000064286	ENSGT00940000155151.a.a.a	ENSGT00940000164907.b.a	ENSGT00620000089226	ENSGT00940000154394.a	ENSGT00940000165492.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00990000203759	ENSGT00390000016384.m	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00550000074961.a	ENSGT00940000171469	ENSGT00940000155841.c.a	ENSGT00390000018644	ENSGT00390000013158	ENSGT00940000156763.b.b	ENSGT00940000159669.a
European seabass	MODERN SPECIES	13	dpp7 (ENSDLAG00005003764)	man1b1b (ENSDLAG00005003943)	ENSDLAG00005026590	cacna1ba (ENSDLAG00005004861)	ehmt1a (ENSDLAG00005019593)	ENSDLAG00005020342	nelfb (ENSDLAG00005020349)	entpd2a.1 (ENSDLAG00005020413)	ENSDLAG00005027557	ENSDLAG00005020475	ccn1l2 (ENSDLAG00005030907)	ENSDLAG00005030282	ENSDLAG00005020893	tubb2b (ENSDLAG00005028428)	ENSDLAG00005020898	ENSDLAG00005020905 #22	ENSDLAG00005028139	ENSDLAG00005034611	ADGRD2 (ENSDLAG00005020947)	NR5A1 (ENSDLAG00005020977)	nr6a1a (ENSDLAG00005021108)	OLFML2A (ENSDLAG00005021279)	ENSDLAG00005033531	ENSDLAG00005021295	GOLGA1 (ENSDLAG00005021316)	ENSDLAG00005031828	PPP6C (ENSDLAG00005021350)	ENSDLAG00005028754	ENSDLAG00005021366	ENSDLAG00005021390	dph7 (ENSDLAG00005021410)
Large yellow croaker	MODERN SPECIES	2	man1b1b (ENSLCRG00005020341)	cacna1ba (ENSLCRG00005006563)	ehmt1a (ENSLCRG00005003960)	arrdc1a (ENSLCRG00005003945)	ENSLCRG00005003944	nelfb (ENSLCRG00005003932)	entpd2a.1 (ENSLCRG00005003930)	fgf17 (ENSLCRG00005003929)	FKBP15 (ENSLCRG00005001899)	ccn1l2 (ENSLCRG00005001696)	ENSLCRG00005001686	ENSLCRG00005001680	ENSLCRG00005001675	ENSLCRG00005001629	ENSLCRG00005001622	ENSLCRG00005001607 #22	lhx2b (ENSLCRG00005001597)	ADGRD2 (ENSLCRG00005001548)	nr5a1a (ENSLCRG00005020785)	nr6a1a (ENSLCRG00005020780)	olfml2a (ENSLCRG00005020778)	ENSLCRG00005020776	rpl35 (ENSLCRG00005020775)	golga1 (ENSLCRG00005020762)	PPP6C (ENSLCRG00005020759)	ENSLCRG00005020757	ENSLCRG00005020755	SH3GLB2 (ENSLCRG00005020493)	dph7 (ENSLCRG00005020485)	mrpl41 (ENSLCRG00005020484)	PNPLA7 (ENSLCRG00005019404)
Gilthead seabream	MODERN SPECIES	19	cacna1ba (ENSSAUG00010017740)	ENSSAUG00010026316	ehmt1a (ENSSAUG00010026321)	ENSSAUG00010026451	arrdc1a (ENSSAUG00010026452)	ENSSAUG00010026453	nelfb (ENSSAUG00010026454)	entpd2a.1 (ENSSAUG00010026455)	fgf17 (ENSSAUG00010026626)	FKBP15 (ENSSAUG00010026469)	ccn1l2 (ENSSAUG00010026627)	ENSSAUG00010026628	ENSSAUG00010026629	ENSSAUG00010026630	ENSSAUG00010026632	ENSSAUG00010026634 #22	lhx2b (ENSSAUG00010004073)	ENSSAUG00010004097	ADGRD2 (ENSSAUG00010004139)	nr5a1a (ENSSAUG00010004224)	nr6a1a (ENSSAUG00010004453)	olfml2a (ENSSAUG00010004462)	ENSSAUG00010004465	rpl35 (ENSSAUG00010004470)	PPP6C (ENSSAUG00010004488)	ENSSAUG00010004491	ENSSAUG00010004495	sh3glb2a (ENSSAUG00010004543)	dph7 (ENSSAUG00010005910)	mrpl41 (ENSSAUG00010005912)	PNPLA7 (ENSSAUG00010005944)
Percomorphaceae_D	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000159838	ENSGT00940000155422.bb	ENSGT00940000155275.c.b.b	ENSGT00940000156002.a.b	ENSGT00940000166440	ENSGT01080000257442	ENSGT00390000012665	ENSGT01100000263542.B.b.a.b	ENSGT00940000167390	ENSGT00530000064286	ENSGT00940000155151.a.a.a	ENSGT00940000164907.b.a	ENSGT00620000089226	ENSGT00940000154394.a	ENSGT00940000165492.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00990000203759	ENSGT00390000016384.m	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00550000074961.a	ENSGT00940000167171	ENSGT00940000171469	ENSGT00940000155841.c.a	ENSGT00390000018644	ENSGT00390000013158	ENSGT00940000156763.b.b
Carangaria	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00940000159838	ENSGT00940000155422.bb	ENSGT00940000155275.c.b.b	ENSGT00940000156002.a.b	ENSGT00940000166440	ENSGT01080000257442	ENSGT00390000012665	ENSGT01100000263542.B.b.a.b	ENSGT00940000167390	ENSGT00530000064286	ENSGT00940000155151.a.a.a	ENSGT00940000164907.b.a	ENSGT00620000089226	ENSGT00940000154394.a	ENSGT00940000165492.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00990000203759	ENSGT00390000016384.m	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00550000074961.a	ENSGT00940000167171	ENSGT00940000171469	ENSGT00940000155841.c.a	ENSGT00940000155290.C	ENSGT01030000234773	ENSGT00390000008802.a.a
Pleuronectoidei	ANCESTRAL SPECIES	69															ENSGT00940000165492.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00990000203759	ENSGT00390000016384.m	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00550000074961.a	ENSGT00940000167171	ENSGT00940000171469	ENSGT00940000155841.c.a	ENSGT00940000155290.C	ENSGT01030000234773	ENSGT00390000008802.a.a
Turbot	MODERN SPECIES	21														ENSSMAG00000000532	ENSSMAG00000027597	ENSSMAG00000000527 #22	LHX2 (ENSSMAG00000000521)	ADGRD2 (ENSSMAG00000000491)	NR5A1 (ENSSMAG00000000482)	ENSSMAG00000000478	nr6a1a (ENSSMAG00000000466)	OLFML2A (ENSSMAG00000000459)	ENSSMAG00000000454	GOLGA1 (ENSSMAG00000000398)	PPP6C (ENSSMAG00000000381)	ENSSMAG00000000378	ENSSMAG00000000373	ENSSMAG00000000340	zfr (ENSSMAG00000000320)	ENSSMAG00000000318	ENSSMAG00000000313
Tongue sole	MODERN SPECIES	398	HECTD4 (ENSCSEG00000016640)	ENSCSEG00000016713	ENSCSEG00000016761	ENSCSEG00000016781	ENSCSEG00000016786	vps33a (ENSCSEG00000016817)	ENSCSEG00000016836	bnip3la (ENSCSEG00000016851)	ENSCSEG00000016866	adra1aa (ENSCSEG00000016882)	tmem230b (ENSCSEG00000016891)	tmem230b (ENSCSEG00000016900)	ENSCSEG00000016907	ENSCSEG00000016975	ENSCSEG00000017004	ENSCSEG00000017065 #22	lhx2b (ENSCSEG00000017106)	ADGRD2 (ENSCSEG00000017117)	nr5a1a (ENSCSEG00000017180)	nr6a1a (ENSCSEG00000017225)	ENSCSEG00000017243	ipo11 (ENSCSEG00000017257)	ENSCSEG00000017336	ENSCSEG00000017346	rgs7bpa (ENSCSEG00000017358)	ENSCSEG00000017370	plcxd3 (ENSCSEG00000017392)	oxct1a (ENSCSEG00000017403)	rimoc1 (ENSCSEG00000017432)	FBXO4 (ENSCSEG00000017441)	ghr (ENSCSEG00000017457)
Carangaria_A	ANCESTRAL SPECIES	50			ENSGT00940000155275.c.b.b	ENSGT00940000156002.a.b	ENSGT00940000166440	ENSGT01080000257442	ENSGT00390000012665	ENSGT01100000263542.B.b.a.b	ENSGT00940000167390	ENSGT00530000064286	ENSGT00940000155151.a.a.a	ENSGT00940000164907.b.a	ENSGT00620000089226	ENSGT00940000154394.a	ENSGT00940000165492.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540	ENSGT01060000248575.C	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00390000016384.m	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00550000074961.a	ENSGT00940000171469	ENSGT00940000155841.c.a	ENSGT00940000155290.C	ENSGT01030000234773	ENSGT00390000008802.a.a	ENSGT01090000260132.b.a	ENSGT00440000033872
Barramundi perch	MODERN SPECIES	95	PNPLA7 (ENSLCAG00010024578)	cacna1ba (ENSLCAG00010025823)	ehmt1a (ENSLCAG00010027055)	arrdc1a (ENSLCAG00010027129)	ENSLCAG00010027136	nelfb (ENSLCAG00010027153)	entpd2a.1 (ENSLCAG00010027167)	fgf17 (ENSLCAG00010027172)	ENSLCAG00010027194	ccn1l2 (ENSLCAG00010027198)	ENSLCAG00010027204	ENSLCAG00010027206	tubb2b (ENSLCAG00010027211)	ENSLCAG00010027216	FPGS (ENSLCAG00010027220)	ENSLCAG00010027224 #22	lhx2b (ENSLCAG00010027228)	ENSLCAG00010027230	nr5a1a (ENSLCAG00010027244)	nr6a1a (ENSLCAG00010027256)	olfml2a (ENSLCAG00010027266)	ENSLCAG00010027272	golga1 (ENSLCAG00010027286)	ENSLCAG00010027294	PPP6C (ENSLCAG00010027298)	ENSLCAG00010027304	sh3glb2a (ENSLCAG00010027311)	zfr (ENSLCAG00010027324)	ENSLCAG00010027333	ENSLCAG00010027334	npr3 (ENSLCAG00010027335)
Seriola	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00530000063843.a	ENSGT00940000155422.bb	ENSGT00940000159838	ENSGT00940000155275.c.b.b	ENSGT00940000156002.a.b	ENSGT00940000166440	ENSGT00390000012665	ENSGT01100000263542.B.b.a.b	ENSGT00940000167390	ENSGT00530000064286	ENSGT00940000155151.a.a.a	ENSGT00940000164907.b.a	ENSGT00620000089226	ENSGT00940000154394.a	ENSGT00940000165492.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540	ENSGT01060000248575.C	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00390000016384.m	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00550000074961.a	ENSGT00940000167171	ENSGT01060000248544.b	ENSGT00940000155841.c.a	ENSGT00940000155290.C	ENSGT01030000234773	ENSGT00390000008802.a.a
Greater amberjack	MODERN SPECIES	6	dpp7 (ENSSDUG00000009953)	cacna1ba (ENSSDUG00000009992)	ENSSDUG00000010101	ENSSDUG00000010115	ENSSDUG00000010136	arrdc1a (ENSSDUG00000010155)	nelfb (ENSSDUG00000010179)	entpd2a.1 (ENSSDUG00000010214)	fgf17 (ENSSDUG00000010245)	FKBP15 (ENSSDUG00000010366)	ccn1l2 (ENSSDUG00000010401)	ENSSDUG00000010418	tubb2b (ENSSDUG00000010437)	ENSSDUG00000010468	ENSSDUG00000010476	ENSSDUG00000010516 #22	lhx2b (ENSSDUG00000010678)	ENSSDUG00000010699	fzd1 (ENSSDUG00000010707)	cdk14 (ENSSDUG00000010726)	ENSSDUG00000010823	ENSSDUG00000010833	ENSSDUG00000010846	ENSSDUG00000010860	ENSSDUG00000010886	ENSSDUG00000010900	ENSSDUG00000010911	HACE1 (ENSSDUG00000010931)	ENSSDUG00000011013	ENSSDUG00000011015	ENSSDUG00000011022
Yellowtail amberjack	DUPLICATION
Yellowtail amberjack	MODERN SPECIES	3287	man1b1b (ENSSLDG00000009801)	dpp7 (ENSSLDG00000009771)	cacna1ba (ENSSLDG00000009661)	ENSSLDG00000009598	ENSSLDG00000009572	arrdc1a (ENSSLDG00000009550)	nelfb (ENSSLDG00000009508)	entpd2a.1 (ENSSLDG00000009096)	fgf17 (ENSSLDG00000009011)	FKBP15 (ENSSLDG00000008939)	ccn1l2 (ENSSLDG00000008922)	ENSSLDG00000008908	ENSSLDG00000008862	tubb2b (ENSSLDG00000008880)	ENSSLDG00000008854	CRB2 (ENSSLDG00000008823) #22	lhx2b (ENSSLDG00000008803)	ENSSLDG00000008774	nr5a1a (ENSSLDG00000008750)	nr6a1a (ENSSLDG00000008702)	olfml2a (ENSSLDG00000008632)	ENSSLDG00000008604	rpl35 (ENSSLDG00000008581)	golga1 (ENSSLDG00000008465)	PPP6C (ENSSLDG00000008421)	ENSSLDG00000008397	ENSSLDG00000008386	ENSSLDG00000008378
Yellowtail amberjack	DUPLICATION
Yellowtail amberjack	MODERN SPECIES	1339																ENSSLDG00000010071 #22
Yellowtail amberjack	MODERN SPECIES	1433																ENSSLDG00000011813 #22
Anabantaria	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00530000063843.a	ENSGT00940000159838	ENSGT00940000155422.bb	ENSGT00940000155275.c.b.b	ENSGT00940000156002.a.b	ENSGT00940000166440	ENSGT00390000012665	ENSGT01100000263542.B.b.a.b	ENSGT00940000167390	ENSGT00530000064286	ENSGT00940000155151.a.a.a	ENSGT00940000164907.b.a	ENSGT00620000089226	ENSGT00940000154394.b.a.a.a.a.a.b	ENSGT00940000165492.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00990000203759	ENSGT00390000016384.m	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00550000074961.a	ENSGT01060000248544.b	ENSGT00940000155841.c.a	ENSGT00390000018644	ENSGT00390000013158	ENSGT00940000156763.b.b	ENSGT00940000159669.a
Zig-zag eel	MODERN SPECIES	23	ENTREP1 (ENSMAMG00000018522)	ENSMAMG00000018534	cacna1ba (ENSMAMG00000018547)	ENSMAMG00000018630	arrdc1a (ENSMAMG00000018649)	ENSMAMG00000018652	nelfb (ENSMAMG00000018660)	ENSMAMG00000018679	ENSMAMG00000018696	ENSMAMG00000018712	ENSMAMG00000018738	ENSMAMG00000018745	ENSMAMG00000024865	ENSMAMG00000018796	ENSMAMG00000028722	ENSMAMG00000018806 #22	ENSMAMG00000018972	ENSMAMG00000018974	ENSMAMG00000018991	NR5A1 (ENSMAMG00000018995)	NR6A1 (ENSMAMG00000019017)	OLFML2A (ENSMAMG00000019044)	ENSMAMG00000019066	RPL35 (ENSMAMG00000019074)	GOLGA1 (ENSMAMG00000019096)	PPP6C (ENSMAMG00000019206)	ENSMAMG00000019223	ENSMAMG00000019229	ENSMAMG00000019244	dph7 (ENSMAMG00000019299)	ENSMAMG00000019315
Anabantoidei	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000155305.b.a	ENSGT00940000155127.a.b	ENSGT00530000063843.a	ENSGT00940000159838	ENSGT00940000155422.bb	ENSGT00940000155275.c.b.b	ENSGT00940000156002.a.b	ENSGT00940000166440	ENSGT00390000012665	ENSGT00940000167390	ENSGT00530000064286	ENSGT00940000155151.a.a.a	ENSGT00940000164907.b.a	ENSGT00940000154394.a	ENSGT00940000165492.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00990000203759	ENSGT00390000016384.m	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00550000074961.a	ENSGT00940000162514	ENSGT01060000248544.b	ENSGT00940000155841.c.a	ENSGT00940000155290.C	ENSGT01050000246882	ENSGT00390000008802.a.a
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Siamese fighting fish	MODERN SPECIES	9	ENSBSLG00000019413	fscn2b (ENSBSLG00000019243)	ENSBSLG00000019194	ENSBSLG00000019189	stxbp1b (ENSBSLG00000018256)	hdr (ENSBSLG00000017963)	cyb561a3a (ENSBSLG00000017947)	loxl2b (ENSBSLG00000017023)	GOLGA7 (ENSBSLG00000016933)	sfrp1a (ENSBSLG00000016913)	nelfb (ENSBSLG00000016699)	ENSBSLG00000016577	FKBP15 (ENSBSLG00000015632)	ENSBSLG00000015576	tubb2b (ENSBSLG00000015516)	ENSBSLG00000015484 #22	lhx2b (ENSBSLG00000015462)	ENSBSLG00000015451	ENSBSLG00000015432	nr5a1a (ENSBSLG00000015205)	nr6a1a (ENSBSLG00000014740)	olfml2a (ENSBSLG00000014715)	ENSBSLG00000014709	rpl35 (ENSBSLG00000024526)	golga1 (ENSBSLG00000024481)	PPP6C (ENSBSLG00000024443)	ENSBSLG00000024421	ENSBSLG00000024337	SH3GLB2 (ENSBSLG00000024138)	zfr (ENSBSLG00000023503)	ENSBSLG00000023431
Ovalentaria	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000159838	ENSGT00940000155422.bb	ENSGT00940000155275.c.b.b	ENSGT00940000156002.a.b	ENSGT00940000166440	ENSGT01080000257442	ENSGT00390000012665	ENSGT01100000263542.B.b.a.b	ENSGT00940000167390	ENSGT00530000064286	ENSGT00940000155151.a.a.a	ENSGT00940000164907.b.a	ENSGT00620000089226	ENSGT00940000154394.a	ENSGT00940000165492.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540	ENSGT01060000248575.C	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00990000203759	ENSGT00390000016384.m	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00550000074961.a	ENSGT00940000167171	ENSGT00940000171469	ENSGT00940000155841.c.a	ENSGT00390000018644	ENSGT00390000013158
Atherinomorphae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000159838	ENSGT00940000155422.bb	ENSGT00940000155275.c.b.b	ENSGT00940000156002.a.b	ENSGT00940000166440	ENSGT01080000257442	ENSGT00390000012665	ENSGT01100000263542.B.b.a.b	ENSGT00940000167390	ENSGT00530000064286	ENSGT00940000155151.a.a.a	ENSGT00940000164907.b.a	ENSGT00620000089226	ENSGT00940000154394.a	ENSGT00940000165492.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540	ENSGT01060000248575.C	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00990000203759	ENSGT00390000016384.m	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00550000074961.a	ENSGT00940000167171	ENSGT00940000171469	ENSGT00940000155841.c.a	ENSGT00390000018644	ENSGT00390000013158
Cyprinodontiformes	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000159838	ENSGT00940000155422.bb	ENSGT00940000155275.c.b.b	ENSGT00940000156002.a.b	ENSGT00940000166440	ENSGT01080000257442	ENSGT00390000012665	ENSGT01100000263542.B.b.a.b	ENSGT00940000167390	ENSGT00530000064286	ENSGT00940000155151.a.a.a	ENSGT00940000164907.b.a	ENSGT00620000089226	ENSGT00940000154394.a	ENSGT00940000165492.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540	ENSGT01060000248575.C	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00990000203759	ENSGT00390000016384.m	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00550000074961.a	ENSGT00940000167171	ENSGT00940000171469	ENSGT00940000155841.c.a	ENSGT00390000018644	ENSGT00390000013158
Aplocheiloidei	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22
Mangrove rivulus	MODERN SPECIES	520												tmem216 (ENSKMAG00000012776)	ENSKMAG00000012801	TMED9 (ENSKMAG00000012837)	b4galt7 (ENSKMAG00000012872)	ENSKMAG00000012897 #22
Turquoise killifish	MODERN SPECIES	184														ENSNFUG00015017654	ENSNFUG00015017615	ENSNFUG00015017596 #22
Cyprinodontoidei	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00950000183002.B.a.a	ENSGT00530000063843.a	ENSGT00940000159838	ENSGT00940000155422.bb	ENSGT00940000155275.c.b.b	ENSGT00940000156002.a.b	ENSGT00940000166440	ENSGT01080000257442	ENSGT00390000012665	ENSGT01100000263542.B.b.a.b	ENSGT00940000167390	ENSGT00530000064286	ENSGT00940000164907.b.a	ENSGT00940000154394.a	ENSGT00940000165492.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00990000203759	ENSGT00390000016384.m	ENSGT00940000153772.B	ENSGT01060000248544.b	ENSGT00940000155841.c.a	ENSGT00390000018644	ENSGT00390000013158	ENSGT00940000156763.b.b	ENSGT00940000159669.a	ENSGT00940000159633
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Poecilia	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00950000183002.B.a.a	ENSGT00530000063843.a	ENSGT00940000159838	ENSGT00940000155422.bb	ENSGT00940000155275.c.b.b	ENSGT00940000156002.a.b	ENSGT00940000166440	ENSGT01080000257442	ENSGT00390000012665	ENSGT01100000263542.B.b.a.b	ENSGT00940000167390	ENSGT00530000064286	ENSGT00940000164907.b.a	ENSGT00940000154394.a	ENSGT00940000165492.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540	ENSGT01060000248575.C	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00390000016384.m	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000171469	ENSGT00940000155841.c.a	ENSGT00390000018644	ENSGT00390000013158	ENSGT00940000156763.b.b	ENSGT00940000159669.a	ENSGT00940000159633	ENSGT00940000153231.A
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Amazon molly	MODERN SPECIES	342	dpp7 (ENSPFOG00000008743)	man1b1b (ENSPFOG00000008603)	ENSPFOG00000020372	cacna1ba (ENSPFOG00000007325)	ehmt1a (ENSPFOG00000007154)	arrdc1a (ENSPFOG00000007087)	ENSPFOG00000022938	nelfb (ENSPFOG00000007019)	entpd2a.1 (ENSPFOG00000006909)	ENSPFOG00000020371	fgf17 (ENSPFOG00000006860)	FKBP15 (ENSPFOG00000006662)	ENSPFOG00000006615	tubb2b (ENSPFOG00000006572)	ENSPFOG00000006550	ENSPFOG00000006286 #22	lhx2b (ENSPFOG00000006215)	ADGRD2 (ENSPFOG00000005986)	nr5a1a (ENSPFOG00000023617)	nr6a1a (ENSPFOG00000005783)	olfml2a (ENSPFOG00000005632)	rpl35 (ENSPFOG00000005604)	golga1 (ENSPFOG00000005215)	PPP6C (ENSPFOG00000005095)	ENSPFOG00000005050	ENSPFOG00000022010	sh3glb2a (ENSPFOG00000004935)	dph7 (ENSPFOG00000004831)	mrpl41 (ENSPFOG00000020370)	PNPLA7 (ENSPFOG00000003884)	zgc:64051 (ENSPFOG00000003814)
Sailfin molly	MODERN SPECIES	1093											fgf17 (ENSPLAG00000012249)	FKBP15 (ENSPLAG00000012261)	ENSPLAG00000012285	tubb2b (ENSPLAG00000012303)	ENSPLAG00000012317	ENSPLAG00000000272 #22
Guppy	MODERN SPECIES	461					ENSPREG00000013245	ENSPREG00000013260	ENSPREG00000013278	arrdc1a (ENSPREG00000013290)	ENSPREG00000013299	nelfb (ENSPREG00000013311)	entpd2a.1 (ENSPREG00000013366)	fgf17 (ENSPREG00000013415)	ENSPREG00000013432	tubb2b (ENSPREG00000013438)	ENSPREG00000013446	ENSPREG00000013459 #22	lhx2b (ENSPREG00000013480)	ENSPREG00000013497	nr6a1a (ENSPREG00000013517)	olfml2a (ENSPREG00000013536)	rpl35 (ENSPREG00000013542)	golga1 (ENSPREG00000013565)	PPP6C (ENSPREG00000013630)	ENSPREG00000013653	ENSPREG00000013677	dph7 (ENSPREG00000013831)	mrpl41 (ENSPREG00000013847)	PNPLA7 (ENSPREG00000013878)	araf (ENSPREG00000013979)	zgc:64051 (ENSPREG00000014053)	imp4 (ENSPREG00000014067)
Platyfish	MODERN SPECIES	2	noxa1 (ENSXMAG00000029661)	dpp7 (ENSXMAG00000004228)	man1b1b (ENSXMAG00000004209)	cacna1ba (ENSXMAG00000004029)	ENSXMAG00000024871	ENSXMAG00000028227	arrdc1a (ENSXMAG00000004012)	ENSXMAG00000019563	nelfb (ENSXMAG00000003997)	entpd2a.1 (ENSXMAG00000003981)	fgf17 (ENSXMAG00000003974)	FKBP15 (ENSXMAG00000003947)	ENSXMAG00000023710	tubb2b (ENSXMAG00000003936)	ENSXMAG00000003934	ENSXMAG00000003917 #22	lhx2b (ENSXMAG00000003908)	ADGRD2 (ENSXMAG00000004769)	nr5a1a (ENSXMAG00000023834)	nr6a1a (ENSXMAG00000009061)	olfml2a (ENSXMAG00000026342)	ENSXMAG00000027238	rpl35 (ENSXMAG00000002921)	golga1 (ENSXMAG00000002925)	PPP6C (ENSXMAG00000002940)	ENSXMAG00000020951	ENSXMAG00000028923	sh3glb2a (ENSXMAG00000005038)	dph7 (ENSXMAG00000028457)	mrpl41 (ENSXMAG00000019576)	PNPLA7 (ENSXMAG00000004935)
NAME_4	ANCESTRAL SPECIES	302					ENSGT00940000155275.c.b.b	ENSGT00940000156002.a.b	ENSGT00940000166440	ENSGT01080000257442	ENSGT00390000012665	ENSGT01100000263542.B.b.a.b	ENSGT00940000167390	ENSGT00530000064286	ENSGT00940000164907.b.a	ENSGT00940000154394.a	ENSGT00940000165492.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22
Mummichog	MODERN SPECIES	351				cacna1ba (ENSFHEG00000011557)	ENSFHEG00000011618	arrdc1a (ENSFHEG00000011628)	ENSFHEG00000011635	ENSFHEG00000011655	ENSFHEG00000011670	fgf17 (ENSFHEG00000011677)	FKBP15 (ENSFHEG00000011747)	ENSFHEG00000011763	tubb2b (ENSFHEG00000011779)	ENSFHEG00000011792	ENSFHEG00000011819	ENSFHEG00000012013 #22	ENSFHEG00000012078
Sheepshead minnow	MODERN SPECIES	1323																ENSCVAG00000016835 #22
Oryzias	ANCESTRAL SPECIES	54	ENSGT00390000016002.o.a	ENSGT00940000156621.e.a	ENSGT00400000024875.c.a.a.b.a.b.i.b.a	ENSGT00940000157147.c.a	ENSGT00980000198604	ENSGT00940000162790.b	ENSGT00940000159244.a	ENSGT00940000159734	ENSGT00940000160428.b.b	ENSGT00550000075041	ENSGT00940000164784	ENSGT00390000014148.f	ENSGT00940000156231.o.b	ENSGT00940000159868.b	ENSGT00940000158016.c.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540	ENSGT01060000248575.C	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00990000203759	ENSGT00390000016384.m	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000153246.b	ENSGT00940000160570	ENSGT00940000160404	ENSGT00940000158049	ENSGT00940000156235.d	ENSGT00940000153601.a.a.e.b.b
Oryzias_a	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000155596.q	ENSGT00940000160987	ENSGT00940000159729	ENSGT00390000020276.t.b	ENSGT00940000154394.a	ENSGT00390000020276.t.a	ENSGT00940000154394.b.a.a.a.a.a.b.d	ENSGT00530000064286	ENSGT00940000159717	ENSGT00940000154076.C.c	ENSGT00940000154076.C.d	ENSGT00390000014148.f	ENSGT00940000156231.o.b	ENSGT00940000159868.b	ENSGT00940000158016.c.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540	ENSGT01060000248575.C	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00990000203759	ENSGT00390000016384.m	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000153246.b	ENSGT00940000160570	ENSGT00940000160404	ENSGT00940000158049	ENSGT00940000156235.d	ENSGT00940000153601.a.a.e.b.b
Japanese Medaka HdrR	MODERN SPECIES	23	ENSORLG00000022378	ENSORLG00000016308	FKBP15 (ENSORLG00000016322)	ENSORLG00000029387	ENSORLG00000010320	ENSORLG00000027510	ENSORLG00000022178	ENSORLG00000029089	ENSORLG00000021848	ENSORLG00000030565	ENSORLG00000016407	ENSORLG00000030177	ENSORLG00000016428	ENSORLG00000022012	ENSORLG00000016452	ENSORLG00000016462 #22	ENSORLG00000024201	lhx2b (ENSORLG00000016465)	ENSORLG00000027244	ENSORLG00000028742	ADGRD2 (ENSORLG00000025166)	nr5a1 (ENSORLG00000016486)	nr6a1a (ENSORLG00000027378)	ENSORLG00000027372	olfml2a (ENSORLG00000016507)	ENSORLG00000023324	rpl35 (ENSORLG00000016513)	golga1 (ENSORLG00000016525)	ENSORLG00000012783	ENSORLG00000028991	ENSORLG00000028690
Chinese medaka	MODERN SPECIES	223	cyb561a3a (ENSOSIG00000005163)	hdr (ENSOSIG00000005131)	UNC5D (ENSOSIG00000005004)	tm2d2 (ENSOSIG00000004991)	lman2lb (ENSOSIG00000004988)	endog (ENSOSIG00000004982)	ENSOSIG00000004979	ENSOSIG00000004977	tubb2b (ENSOSIG00000004915)	FKBP15 (ENSOSIG00000004648)	DNAH17 (ENSOSIG00000002522)	ENSOSIG00000002434	CEL (ENSOSIG00000002308)	ENSOSIG00000002263	GRIN1 (ENSOSIG00000000305)	ENSOSIG00000000220 #22	lhx2b (ENSOSIG00000000152)	ENSOSIG00000000120	nr5a1a (ENSOSIG00000020203)	nr6a1a (ENSOSIG00000020151)	olfml2a (ENSOSIG00000020139)	ENSOSIG00000020136	rpl35 (ENSOSIG00000020130)	golga1 (ENSOSIG00000020114)	ENSOSIG00000020095	pomt1 (ENSOSIG00000020088)	ENSOSIG00000020085	ENSOSIG00000020082	ENSOSIG00000020080	ENSOSIG00000020077	ENSOSIG00000020073
Oryzias_b	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000153231.A	ENSGT00390000016002.o.a	ENSGT00940000156621.e.a	ENSGT00400000024875.c.a.a.b.a.b.i.b.a	ENSGT00940000157147.c.a	ENSGT00980000198604	ENSGT00940000162790.b	ENSGT00940000159244.a	ENSGT00940000159734	ENSGT00550000075041	ENSGT00940000164784	ENSGT00390000014148.f	ENSGT00940000156231.o.b	ENSGT00940000159868.b	ENSGT00940000158016.c.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00990000203759	ENSGT00390000016384.m	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000153246.b	ENSGT00940000160570	ENSGT00940000160404	ENSGT00940000158049	ENSGT00940000156235.d	ENSGT00940000153601.a.a.e.b.b
Indian medaka	MODERN SPECIES	11	ENSOMEG00000004718	ENSOMEG00000004708	ENSOMEG00000004694	brd3b (ENSOMEG00000004686)	ENSOMEG00000004655	QSOX2 (ENSOMEG00000004633)	ENSOMEG00000004610	ENSOMEG00000004600	ENSOMEG00000004570	ENSOMEG00000004556	ENSOMEG00000004550	ENSOMEG00000004542	CEL (ENSOMEG00000004525)	ENSOMEG00000004507	GRIN1 (ENSOMEG00000004485)	ENSOMEG00000004415 #22	lhx2b (ENSOMEG00000004399)	ENSOMEG00000004385	ADGRD2 (ENSOMEG00000004377)	nr5a1a (ENSOMEG00000004343)	ENSOMEG00000004335	nr6a1a (ENSOMEG00000004316)	olfml2a (ENSOMEG00000004267)	ENSOMEG00000004253	rpl35 (ENSOMEG00000004245)	golga1 (ENSOMEG00000004228)	ENSOMEG00000004181	snapc4 (ENSOMEG00000004166)	pomt1 (ENSOMEG00000004116)	ENSOMEG00000004051	NTNG2 (ENSOMEG00000003985)
Javanese ricefish	MODERN SPECIES	23	araf (ENSOJAG00000009546)	imp4 (ENSOJAG00000009579)	TRAF2 (ENSOJAG00000009732)	ENSOJAG00000010024	ENSOJAG00000010052	ENSOJAG00000010125	ENSOJAG00000010168	QSOX2 (ENSOJAG00000010178)	ENSOJAG00000010219	ENSOJAG00000010237	ENSOJAG00000010783	ENSOJAG00000010829	CEL (ENSOJAG00000010973)	ENSOJAG00000011121	GRIN1 (ENSOJAG00000011216)	ENSOJAG00000012391 #22	lhx2b (ENSOJAG00000012446)	nr5a1a (ENSOJAG00000012493)	nr6a1a (ENSOJAG00000012646)	olfml2a (ENSOJAG00000012907)	ENSOJAG00000012928	ENSOJAG00000012944	rpl35 (ENSOJAG00000012953)	golga1 (ENSOJAG00000012999)	ENSOJAG00000013066	ENSOJAG00000013100	ENSOJAG00000013164	pomt1 (ENSOJAG00000013239)	ENSOJAG00000013718	NTNG2 (ENSOJAG00000013735)	nelfb (ENSOJAG00000016769)
Ovalentaria_B	ANCESTRAL SPECIES	9					ENSGT00940000166440	ENSGT01080000257442	ENSGT00390000012665	ENSGT01100000263542.B.b.a.b	ENSGT00940000167390	ENSGT00530000064286	ENSGT00940000155151.a.a.a	ENSGT00940000164907.b.a	ENSGT00620000089226	ENSGT00940000154394.a	ENSGT00940000165492.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00990000203759	ENSGT00390000016384.m	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00550000074961.a	ENSGT00940000167171	ENSGT01060000248544.b	ENSGT00940000155841.c.a	ENSGT00390000018644	ENSGT00390000013158	ENSGT00940000156763.b.b
Pomacentridae	ANCESTRAL SPECIES	162					ENSGT00940000155127.a.b	ENSGT00940000166440	ENSGT00390000012665	ENSGT01100000263542.B.b.a.b	ENSGT00940000167390	ENSGT00530000064286	ENSGT00940000155151.a.a.a	ENSGT00940000164907.b.a	ENSGT00620000089226	ENSGT00940000154394.a	ENSGT00940000165492.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540	ENSGT01060000248575.C	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00990000203759
Bicolor damselfish	MODERN SPECIES	322	FUT7 (ENSSPAG00000001102)	ENSSPAG00000001091	niban2b (ENSSPAG00000001009)	stxbp1b (ENSSPAG00000000938)	arrdc1a (ENSSPAG00000000897)	nelfb (ENSSPAG00000000848)	ENTPD2 (ENSSPAG00000000830)	fgf17 (ENSSPAG00000000815)	FKBP15 (ENSSPAG00000000799)	ccn1l2 (ENSSPAG00000000778)	ENSSPAG00000000752	ENSSPAG00000000715	tubb2b (ENSSPAG00000000729)	ENSSPAG00000000700	ENSSPAG00000000668	ENSSPAG00000000525 #22
Pomacentridae_A	ANCESTRAL SPECIES	170			ENSGT00940000163587.a.b.b.f	ENSGT00550000074961.a	ENSGT00940000155127.a.b	ENSGT00940000166440	ENSGT00390000012665	ENSGT01100000263542.B.b.a.b	ENSGT00940000167390	ENSGT00530000064286	ENSGT00940000155151.a.a.a	ENSGT00940000164907.b.a	ENSGT00620000089226	ENSGT00940000154394.a	ENSGT00940000165492.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540	ENSGT01060000248575.C	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00990000203759
Amphiprion	ANCESTRAL SPECIES	200			ENSGT00940000163587.a.b.b.f	ENSGT00550000074961.a	ENSGT00940000155127.a.b	ENSGT00940000166440	ENSGT00390000012665	ENSGT01100000263542.B.b.a.b	ENSGT00940000167390	ENSGT00530000064286	ENSGT00940000155151.a.a.a	ENSGT00940000164907.b.a	ENSGT00620000089226	ENSGT00940000154394.a	ENSGT00940000165492.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540	ENSGT01060000248575.C	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00990000203759
Clown anemonefish	MODERN SPECIES	669							nelfb (ENSAOCG00000012396)	entpd2a.1 (ENSAOCG00000012429)	fgf17 (ENSAOCG00000012451)	FKBP15 (ENSAOCG00000012526)	ccn1l2 (ENSAOCG00000000771)	ENSAOCG00000012609	ENSAOCG00000012635	tubb2b (ENSAOCG00000012623)	ENSAOCG00000012672	ENSAOCG00000012923 #22	lhx2b (ENSAOCG00000012997)
Orange clownfish	MODERN SPECIES	19	ENSAPEG00000015337	ENSAPEG00000015310	ENSAPEG00000015287	PPP6C (ENSAPEG00000015262)	stxbp1b (ENSAPEG00000015131)	arrdc1a (ENSAPEG00000015114)	nelfb (ENSAPEG00000015068)	entpd2a.1 (ENSAPEG00000015050)	fgf17 (ENSAPEG00000015027)	FKBP15 (ENSAPEG00000014994)	ccn1l2 (ENSAPEG00000014948)	ENSAPEG00000014925	ENSAPEG00000014882	tubb2b (ENSAPEG00000014896)	ENSAPEG00000014825	ENSAPEG00000014566 #22	lhx2b (ENSAPEG00000014488)	ENSAPEG00000014429	nr5a1a (ENSAPEG00000014395)	nr6a1a (ENSAPEG00000014356)	olfml2a (ENSAPEG00000014334)	ENSAPEG00000014304	ENSAPEG00000014276	ENSAPEG00000014221	cacna1ba (ENSAPEG00000014062)	paxx (ENSAPEG00000014017)	ABCA2 (ENSAPEG00000013735)	FUT7 (ENSAPEG00000013697)	ENSAPEG00000013595	niban2b (ENSAPEG00000013567)	golga1 (ENSAPEG00000013421)
Spiny chromis	DUPLICATION
Spiny chromis	MODERN SPECIES	2312																ENSAPOG00000017224 #22	ENSAPOG00000017209 #22
Spiny chromis	MODERN SPECIES	2312															ENSAPOG00000017224 #22	ENSAPOG00000017209 #22
Cichlidae	ANCESTRAL SPECIES	29			ENSGT00940000166440	ENSGT01080000257442	ENSGT00390000012665	ENSGT01100000263542.B.b.a.b	ENSGT00940000167390	ENSGT00530000064286	ENSGT00940000155151.a.a.a	ENSGT00940000164907.b.a	ENSGT00620000089226	ENSGT00940000154394.a	ENSGT00940000178161	ENSGT00940000154394.b.a.a.a.b.b	ENSGT00940000165492.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00990000203759	ENSGT00390000016384.m	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00550000074961.a	ENSGT00940000156003.k	ENSGT01060000248544.b	ENSGT00940000155841.c.a	ENSGT00390000018644	ENSGT00390000013158	ENSGT00940000156763.b.b
Midas cichlid	MODERN SPECIES	439								ENTPD2 (ENSACIG00000011944)	fgf17 (ENSACIG00000011934)	FKBP15 (ENSACIG00000011830)	ccn1l2 (ENSACIG00000011469)	ENSACIG00000011419	ENSACIG00000011403	ENSACIG00000011394	ENSACIG00000011386	ENSACIG00000011254 #22	lhx2b (ENSACIG00000011239)	ENSACIG00000011211	nr5a1a (ENSACIG00000011191)	nr6a1a (ENSACIG00000011176)	olfml2a (ENSACIG00000011135)	ENSACIG00000011130	rpl35 (ENSACIG00000011118)	golga1 (ENSACIG00000011035)	PPP6C (ENSACIG00000011006)	ENSACIG00000010989	ENSACIG00000010984	sh3glb2a (ENSACIG00000010955)	dph7 (ENSACIG00000010915)	mrpl41 (ENSACIG00000010909)	PNPLA7 (ENSACIG00000010839)
Pseudocrenilabrinae	ANCESTRAL SPECIES	37			ENSGT00940000166440	ENSGT01080000257442	ENSGT00390000012665	ENSGT01100000263542.B.b.a.b	ENSGT00940000167390	ENSGT00530000064286	ENSGT00940000155151.a.a.a	ENSGT00940000164907.b.a	ENSGT00620000089226	ENSGT00940000154394.a	ENSGT00940000178161	ENSGT00940000154394.b.a.a.a.b.b	ENSGT00940000165492.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00990000203759	ENSGT00390000016384.m	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00550000074961.a	ENSGT00940000159838	ENSGT00530000063843.a	ENSGT00950000183002.B.a.a	ENSGT00940000155127.a.b	ENSGT00940000154149.a.b	ENSGT00440000038604.j
Nile tilapia	MODERN SPECIES	3	ENSONIG00000032671	ENSONIG00000034062	arrdc1a (ENSONIG00000020231)	ENSONIG00000020230	nelfb (ENSONIG00000020229)	fgf17 (ENSONIG00000020227)	FKBP15 (ENSONIG00000020226)	ccn1l2 (ENSONIG00000038451)	ENSONIG00000020224	ENSONIG00000037430	ENSONIG00000032695	ENSONIG00000029706	ENSONIG00000042260	ENSONIG00000031245	ENSONIG00000037610	ENSONIG00000020222 #22	ENSONIG00000030564	lhx2b (ENSONIG00000039898)	ENSONIG00000029209	ADGRD2 (ENSONIG00000020219)	nr5a1 (ENSONIG00000020218)	ENSONIG00000027725	nr6a1a (ENSONIG00000020217)	olfml2a (ENSONIG00000020216)	ENSONIG00000041333	rpl35 (ENSONIG00000034874)	golga1 (ENSONIG00000020214)	ppp6c (ENSONIG00000011254)	ENSONIG00000032953	dpp7 (ENSONIG00000020212)	noxa1 (ENSONIG00000020211)
Pseudocrenilabrinae_A	ANCESTRAL SPECIES	28	ENSGT00530000063723.a	ENSGT00900000143393	ENSGT00390000015977	ENSGT00940000155794.h.g.b.a.a.a.a.b	ENSGT00940000166440	ENSGT01080000257442	ENSGT00390000012665	ENSGT01100000263542.B.b.a.b	ENSGT00940000167390	ENSGT00530000064286	ENSGT00940000155151.a.a.a	ENSGT00940000164907.b.a	ENSGT00620000089226	ENSGT00940000154394.b.a.a.a.b.b	ENSGT00940000165492.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00990000203759	ENSGT00390000016384.m	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00550000074961.a	ENSGT00940000159838	ENSGT00530000063843.a	ENSGT00950000183002.B.a.a	ENSGT00940000155127.a.b	ENSGT00940000154149.a.b	ENSGT00440000038604.j
Haplochromini	ANCESTRAL SPECIES	30	ENSGT00530000063723.a	ENSGT00900000143393	ENSGT00390000015977	ENSGT00940000155794.h.g.b.a.a.a.a.b	ENSGT00940000166440	ENSGT01080000257442	ENSGT00390000012665	ENSGT01100000263542.B.b.a.b	ENSGT00940000167390	ENSGT00530000064286	ENSGT00940000155151.a.a.a	ENSGT00940000164907.b.a	ENSGT00620000089226	ENSGT00940000154394.b.a.a.a.b.b	ENSGT00940000165492.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00990000203759	ENSGT00390000016384.m	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00550000074961.a	ENSGT00940000159838	ENSGT00530000063843.a	ENSGT00950000183002.B.a.a	ENSGT00940000155127.a.b	ENSGT00940000154149.a.b	ENSGT00440000038604.j
Haplochromini_A	ANCESTRAL SPECIES	32	ENSGT00530000063723.a	ENSGT00900000143393	ENSGT00390000015977	ENSGT00940000155794.h.g.b.a.a.a.a.b	ENSGT00940000166440	ENSGT01080000257442	ENSGT00390000012665	ENSGT01100000263542.B.b.a.b	ENSGT00940000167390	ENSGT00530000064286	ENSGT00940000155151.a.a.a	ENSGT00940000164907.b.a	ENSGT00620000089226	ENSGT00940000154394.b.a.a.a.b.b	ENSGT00940000165492.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00990000203759	ENSGT00390000016384.m	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00550000074961.a	ENSGT00940000159838	ENSGT00530000063843.a	ENSGT00950000183002.B.a.a	ENSGT00940000155127.a.b	ENSGT00940000154149.a.b	ENSGT00440000038604.j
Haplochromini_B	ANCESTRAL SPECIES	44	ENSGT00390000015977	ENSGT00940000155794.h.g.b.a.a.a.a.b	ENSGT00940000166440	ENSGT01080000257442	ENSGT00390000012665	ENSGT01100000263542.B.b.a.b	ENSGT00940000167390	ENSGT00530000064286	ENSGT00940000155151.a.a.a	ENSGT00940000164907.b.a	ENSGT00620000089226	ENSGT00940000154394.a	ENSGT00940000178161.a	ENSGT00390000020276.z.a	ENSGT00940000165492.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00990000203759	ENSGT00390000016384.m	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00550000074961.a	ENSGT00940000159838	ENSGT00530000063843.a	ENSGT00950000183002.B.a.a	ENSGT00940000180886	ENSGT00940000155127.a.b	ENSGT00940000154149.a.b
Zebra mbuna	MODERN SPECIES	1094												ENSMZEG00005017657	ENSMZEG00005017660	ENSMZEG00005017668	ENSMZEG00005017673	ENSMZEG00005017678 #22	lhx2b (ENSMZEG00005017695)	ADGRD2 (ENSMZEG00005017706)	nr5a1a (ENSMZEG00005017716)	nr6a1a (ENSMZEG00005017725)	olfml2a (ENSMZEG00005017754)	ENSMZEG00005017758	rpl35 (ENSMZEG00005017762)	golga1 (ENSMZEG00005017765)	PPP6C (ENSMZEG00005017775)	dpp7 (ENSMZEG00005017784)	noxa1 (ENSMZEG00005017794)	WHRN (ENSMZEG00005017800)	ENSMZEG00005017806	stxbp1b (ENSMZEG00005017808)	niban2b (ENSMZEG00005017814)
Eastern happy	MODERN SPECIES	3	entpd2a.1 (ENSACLG00000019573)	fgf17 (ENSACLG00000019521)	ENSACLG00000019509	FKBP15 (ENSACLG00000019322)	ccn1l2 (ENSACLG00000019277)	ENSACLG00000019242	ENSACLG00000019223	ENSACLG00000019210	ENSACLG00000019182	ENSACLG00000019171	ENSACLG00000019159	ENSACLG00000019124	ENSACLG00000019105	ENSACLG00000019082	ENSACLG00000019045	ENSACLG00000019037 #22	lhx2b (ENSACLG00000018962)	ADGRD2 (ENSACLG00000018926)	nr5a1a (ENSACLG00000018895)	ENSACLG00000018888	nr6a1a (ENSACLG00000018803)	olfml2a (ENSACLG00000018754)	ENSACLG00000018725	rpl35 (ENSACLG00000018708)	ENSACLG00000018704	golga1 (ENSACLG00000018552)	PPP6C (ENSACLG00000018501)	golga1 (ENSACLG00000018421)	rpl35 (ENSACLG00000018408)	ENSACLG00000018389	dpp7 (ENSACLG00000018297)
P. nyererei	MODERN SPECIES	348	trmt2a (ENSPNYG00000004441)	ENSPNYG00000004480	dgcr8 (ENSPNYG00000004486)	ENSPNYG00000004549	ENSPNYG00000004753	ENSPNYG00000004761	nelfb (ENSPNYG00000004780)	ENSPNYG00000004868	ENSPNYG00000005167	fgf17 (ENSPNYG00000005177)	FKBP15 (ENSPNYG00000005209)	ccn1l2 (ENSPNYG00000005275)	ENSPNYG00000005357	ENSPNYG00000005370	ENSPNYG00000005392	ENSPNYG00000005430 #22	lhx2b (ENSPNYG00000005547)	ENSPNYG00000005562	ENSPNYG00000005575	nr5a1a (ENSPNYG00000005588)	nr6a1a (ENSPNYG00000005611)	olfml2a (ENSPNYG00000005649)	ENSPNYG00000005660	rpl35 (ENSPNYG00000005682)	golga1 (ENSPNYG00000005715)	ENSPNYG00000005751	dpp7 (ENSPNYG00000005776)	noxa1 (ENSPNYG00000005827)	stxbp1b (ENSPNYG00000005853)	niban2b (ENSPNYG00000005900)	ENSPNYG00000005970
Burton s mouthbrooder	MODERN SPECIES	540																ENSHBUG00000003260 #22	lhx2b (ENSHBUG00000003247)	ENSHBUG00000003229	nr5a1a (ENSHBUG00000003219)	nr6a1a (ENSHBUG00000003195)	olfml2a (ENSHBUG00000003124)	ENSHBUG00000003114	rpl35 (ENSHBUG00000003110)	golga1 (ENSHBUG00000003088)	PPP6C (ENSHBUG00000003044)
Lyretail cichlid	MODERN SPECIES	127																ENSNBRG00000000205 #22
Cod	MODERN SPECIES	19	prdm8b (ENSGMOG00000033457)	ENSGMOG00000029016	antxr2a (ENSGMOG00000015589)	ENSGMOG00000036466	paqr3a (ENSGMOG00000015085)	ENSGMOG00000036689	ENSGMOG00000025876	ENSGMOG00000029293	fras1 (ENSGMOG00000006027)	ENSGMOG00000036907	PPP6C (ENSGMOG00000012092)	ENSGMOG00000012087	RPL35 (ENSGMOG00000012084)	ENSGMOG00000030536	ENSGMOG00000034054	ENSGMOG00000000137 #22	ENSGMOG00000030488	ENSGMOG00000023514	ENSGMOG00000000538	ENSGMOG00000028301	ENSGMOG00000028087	ENSGMOG00000026679	ENSGMOG00000016553	ENSGMOG00000007243	ENSGMOG00000023430	ENSGMOG00000012519	ENSGMOG00000028899	ENSGMOG00000024416	ENSGMOG00000037147	gatc (ENSGMOG00000008742)	ENSGMOG00000008748
Protacanthopterygii	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000165701	ENSGT00990000204854	ENSGT00940000155293.a.a	ENSGT00390000008727.a.a.d	ENSGT00940000166602.B	ENSGT00990000208446	ENSGT00390000003939	ENSGT00940000162787.c	ENSGT00940000157565	ENSGT00940000157935.b	ENSGT00940000158276	ENSGT00390000002581	ENSGT00940000155081.D	ENSGT00950000183136.b.a.a	ENSGT00940000160615.a.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000165329	ENSGT00940000155080	ENSGT00940000157081	ENSGT01050000244843.d.f.b	ENSGT00940000177700	ENSGT00940000155337.ab	ENSGT00940000166587	ENSGT00950000183050.b.b.b.a.a.a.a	ENSGT01100000263516.a.b.b.b.b.a.a.b.b.a.a.b	ENSGT00940000153464.B.z.b	ENSGT00530000063410.a.q.a	ENSGT00390000016551	ENSGT00940000161234.c	ENSGT00940000157597	ENSGT00940000155345.q
Salmoninae	DUPLICATION
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	17																ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a.i #22	ENSGT00940000158540.z.a	ENSGT01060000248575.C.d	ENSGT00940000161534.pb.b	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a.a	ENSGT00940000157936.k.a	ENSGT00940000157194.b	ENSGT00390000016384.l.b.b	ENSGT00940000153772.B.k	ENSGT00550000074961.a.d	ENSGT00940000165424.a.b.b.b	ENSGT01000000215397.A.b	ENSGT00940000163383	ENSGT00940000155841.c.a.f	ENSGT00940000158633.b.c	ENSGT00990000204366
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	31																ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a.i #22	ENSGT00940000158540.z.a	ENSGT00940000161534.pb.b	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a.a	ENSGT00940000157936.k.a	ENSGT00940000157194.b	ENSGT00390000016384.l.b.b	ENSGT00940000153772.B.k	ENSGT00550000074961.a.d	ENSGT00940000165424.a.b.b.b	ENSGT01000000215397.A.b	ENSGT00940000163383	ENSGT00940000155841.c.a.f	ENSGT00940000158633.b.c	ENSGT00990000204366	ENSGT00940000156811.a.e
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	19																ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a.i #22	ENSGT00940000158540.z.a	ENSGT00940000161534.pb.b	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a.a	ENSGT00940000157936.k.a	ENSGT00940000157194.b	ENSGT00390000016384.l.b.b	ENSGT00940000153772.B.k	ENSGT00550000074961.a.d	ENSGT00940000165424.a.b.b.b	ENSGT01000000215397.A.b	ENSGT00940000163383	ENSGT00940000155841.c.a.f	ENSGT00940000158633.b.c	ENSGT00990000204366	ENSGT00940000156811.a.e
River trout	MODERN SPECIES	39	man1b1b (ENSSTUG00000018604)	cacna1ba (ENSSTUG00000018726)	ehmt1a (ENSSTUG00000021036)	arrdc1a (ENSSTUG00000021140)	ENSSTUG00000021145	nelfb (ENSSTUG00000021155)	ENTPD2 (ENSSTUG00000021428)	fgf17 (ENSSTUG00000021462)	FKBP15 (ENSSTUG00000021489)	ccn1l2 (ENSSTUG00000021631)	ENSSTUG00000021644	ENSSTUG00000021665	ENSSTUG00000021681	ENSSTUG00000021692	FPGS (ENSSTUG00000021783)	CRB2 (ENSSTUG00000023209) #22	lhx2b (ENSSTUG00000023228)	ENSSTUG00000023255	NR5A1 (ENSSTUG00000023289)	nr6a1a (ENSSTUG00000023380)	olfml2a (ENSSTUG00000023830)	ENSSTUG00000023842	RPL35 (ENSSTUG00000023853)	golga1 (ENSSTUG00000023883)	PPP6C (ENSSTUG00000024002)	ENSSTUG00000024043	ENSSTUG00000024066	ENSSTUG00000024083	sh3glb2a (ENSSTUG00000024121)	PIP5KL1 (ENSSTUG00000005921)	ENSSTUG00000005931
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	12	ENSSSAG00000098478	arrdc1a (ENSSSAG00000074053)	ENSSSAG00000106615	nelfb (ENSSSAG00000072439)	ENSSSAG00000118121	ENSSSAG00000098312	ENSSSAG00000074256	ENSSSAG00000074285	ENSSSAG00000117780	ENSSSAG00000074498	ENSSSAG00000074499	ENSSSAG00000117241	ENSSSAG00000074508	ENSSSAG00000074529	ENSSSAG00000102406	ENSSSAG00000075255 #22	ENSSSAG00000085026	ADGRD2 (ENSSSAG00000075294)	ENSSSAG00000100039	NR5A1 (ENSSSAG00000075313)	nr6a1a (ENSSSAG00000072271)	ENSSSAG00000096143	olfml2a (ENSSSAG00000075396)	RPL35 (ENSSSAG00000075399)	GOLGA1 (ENSSSAG00000075418)	ENSSSAG00000065522	ENSSSAG00000075536	ENSSSAG00000075541	ENSSSAG00000075544	ENSSSAG00000075738	ENSSSAG00000075747
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000158199.l	ENSGT00940000157157.b.a.a.e	ENSGT00940000155422.bb.b	ENSGT00940000155275.c.b.b.e	ENSGT00940000166440	ENSGT01080000257442.c.b	ENSGT00390000012665.j	ENSGT01100000263542.B.b.a.b.e	ENSGT00940000167390.c	ENSGT00530000064286.c.a	ENSGT00940000155151.a.a.a.d	ENSGT00940000164907.b.a.c	ENSGT00620000089226	ENSGT00940000154394.b.a.a.a.a.a.b	ENSGT00390000020276.lb	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a.i #22	ENSGT00940000158540.z.a	ENSGT00940000161534.pb.b	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a.a	ENSGT00940000157936.k.a	ENSGT00940000157194.b	ENSGT00940000168933	ENSGT00390000016384.l.b.b	ENSGT00940000153772.B.k	ENSGT00550000074961.a.d	ENSGT00940000165424.a.b.b.b	ENSGT01000000215397.A.b	ENSGT00940000163383	ENSGT00940000155841.c.a.f	ENSGT00940000158633.b.c	ENSGT00990000204366
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000156724.k	ENSGT00940000158199.l	ENSGT00940000157157.b.a.a.e	ENSGT00940000155422.bb.b	ENSGT00940000155275.c.b.b.e	ENSGT00940000166440	ENSGT01080000257442.c.b	ENSGT00390000012665.j	ENSGT01100000263542.B.b.a.b.e	ENSGT00940000167390.c	ENSGT00530000064286.c.a	ENSGT00940000155151.a.a.a.d	ENSGT00940000164907.b.a.c	ENSGT00940000154394.b.a.a.a.a.a.b	ENSGT00390000020276.lb	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a.i #22	ENSGT00940000158540.z.a	ENSGT00940000161534.pb.b	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a.a	ENSGT00940000157936.k.a	ENSGT00940000157194.b	ENSGT00940000168933	ENSGT00390000016384.l.b.b	ENSGT00940000153772.B.k	ENSGT00550000074961.a.d	ENSGT00940000165424.a.b.b.b	ENSGT01000000215397.A.b	ENSGT00940000163383	ENSGT00940000155841.c.a.f	ENSGT00940000158633.b.c	ENSGT00990000204366
Chinook salmon	MODERN SPECIES	3	ENSOTSG00005010937	pmpca (ENSOTSG00005009796)	inpp5e (ENSOTSG00005009781)	notch1b (ENSOTSG00005009635)	man1b1b (ENSOTSG00005046690)	cacna1ba (ENSOTSG00005045082)	arrdc1a (ENSOTSG00005045057)	nelfb (ENSOTSG00005044540)	ENTPD2 (ENSOTSG00005044538)	fgf17 (ENSOTSG00005044537)	FKBP15 (ENSOTSG00005044042)	ccn1l2 (ENSOTSG00005044034)	ENSOTSG00005044033	ENSOTSG00005044031	ENSOTSG00005044025	ENSOTSG00005043734 #22	lhx2b (ENSOTSG00005043733)	ADGRD2 (ENSOTSG00005043732)	nr5a1a (ENSOTSG00005043720)	ENSOTSG00005043718	nr6a1a (ENSOTSG00005043717)	olfml2a (ENSOTSG00005043714)	ENSOTSG00005043712	RPL35 (ENSOTSG00005043711)	golga1 (ENSOTSG00005043710)	ENSOTSG00005043709	ENSOTSG00005043708	PPP6C (ENSOTSG00005043707)	ENSOTSG00005043706	sh3glb2a (ENSOTSG00005043552)	PIP5KL1 (ENSOTSG00005043550)
Coho salmon	MODERN SPECIES	28	pmpca (ENSOKIG00005050081)	inpp5e (ENSOKIG00005050049)	notch1b (ENSOKIG00005049913)	MAN1B1 (ENSOKIG00005049871)	cacna1ba (ENSOKIG00005047148)	arrdc1a (ENSOKIG00005046737)	ENSOKIG00005046731	nelfb (ENSOKIG00005046649)	ENTPD2 (ENSOKIG00005046613)	fgf17 (ENSOKIG00005046602)	FKBP15 (ENSOKIG00005046028)	ENSOKIG00005045974	ENSOKIG00005045969	ENSOKIG00005045958	ENSOKIG00005045953	ENSOKIG00005045302 #22	LHX2 (ENSOKIG00005045190)	ADGRD2 (ENSOKIG00005045172)	nr5a1a (ENSOKIG00005045103)	nr6a1a (ENSOKIG00005044956)	olfml2a (ENSOKIG00005044924)	ENSOKIG00005044913	RPL35 (ENSOKIG00005044889)	golga1 (ENSOKIG00005044844)	PPP6C (ENSOKIG00005044835)	ENSOKIG00005044831	ENSOKIG00005044822	ENSOKIG00005044814	sh3glb2a (ENSOKIG00005044772)	PIP5KL1 (ENSOKIG00005044754)	ENSOKIG00005044747
Rainbow trout	MODERN SPECIES	2	ENSOMYG00000008306	man1b1b (ENSOMYG00000009283)	cacna1ba (ENSOMYG00000011876)	arrdc1a (ENSOMYG00000038634)	ENSOMYG00000038647	ENSOMYG00000038658	nelfb (ENSOMYG00000038706)	entpd2a.1 (ENSOMYG00000038734)	ENSOMYG00000038777	ENSOMYG00000039134	ENSOMYG00000039622	ENSOMYG00000039634	ENSOMYG00000039656	ENSOMYG00000039709	ENSOMYG00000039750	ENSOMYG00000039974 #22	ENSOMYG00000040543	ftz-f1 (ENSOMYG00000040590)	ENSOMYG00000068514	NR6A1 (ENSOMYG00000040636)	olfml2a (ENSOMYG00000040641)	ENSOMYG00000040645	ENSOMYG00000076142	RPL35 (ENSOMYG00000055069)	ENSOMYG00000040657	GOLGA1 (ENSOMYG00000040675)	ENSOMYG00000040695	ENSOMYG00000040703	ENSOMYG00000040708	ENSOMYG00000040716	sh3glb2a (ENSOMYG00000040743)
Huchen	MODERN SPECIES	1275															FPGS (ENSHHUG00000040329)	ENSHHUG00000040343 #22	lhx2b (ENSHHUG00000040356)	ENSHHUG00000040363	ENSHHUG00000040379	ENSHHUG00000040389	nr6a1a (ENSHHUG00000040545)
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	54	ENSGT00940000155422.bb.a	ENSGT00940000166112.h	ENSGT00940000155275.c.b.b.f	ENSGT00940000156002.a.b.lb.a	ENSGT00940000159652.j	ENSGT01080000257442.d	ENSGT01080000257442.c.a	ENSGT00390000012665.i	ENSGT01100000263542.B.b.a.b.f	ENSGT00940000167390.d	ENSGT00530000064286.c.b	ENSGT00940000155151.a.a.a.c	ENSGT00940000164907.b.a.d	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a	ENSGT00940000154394.a.e.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a.j #22	ENSGT00940000158540.z.b	ENSGT01060000248575.C.c	ENSGT00940000161534.pb.a	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a.b	ENSGT00940000157936.k.b	ENSGT00940000157194.a	ENSGT00390000016384.l.b.a	ENSGT00390000016384.m	ENSGT00940000153772.B.l	ENSGT00550000074961.a.c	ENSGT00940000167067	ENSGT00390000011466.e.a	ENSGT00440000033468.k.a.b	ENSGT00940000154256.ac.c	ENSGT01000000215397.A.a
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000155422.bb.a	ENSGT00940000166112.h	ENSGT00940000155275.c.b.b.f	ENSGT00940000156002.a.b.lb.a	ENSGT00940000159652.j	ENSGT01080000257442.d	ENSGT01080000257442.c.a	ENSGT00390000012665.i	ENSGT01100000263542.B.b.a.b.f	ENSGT00940000167390.d	ENSGT00530000064286.c.b	ENSGT00940000155151.a.a.a.c	ENSGT00940000164907.b.a.d	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a	ENSGT00940000154394.b.a.a.a.a.b.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a.j #22	ENSGT00940000158540.z.b	ENSGT01060000248575.C.c	ENSGT00940000161534.pb.a	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a.b	ENSGT00940000157936.k.b	ENSGT00940000157194.a	ENSGT00390000016384.l.b.a	ENSGT00390000016384.m	ENSGT00940000153772.B.l	ENSGT00550000074961.a.c	ENSGT00940000167067	ENSGT00390000011466.e.a	ENSGT00440000033468.k.a.b	ENSGT00940000154256.ac.c	ENSGT01000000215397.A.a
Salmo	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000155422.bb.a	ENSGT00940000166112.h	ENSGT00940000155275.c.b.b.f	ENSGT00940000156002.a.b.lb.a	ENSGT00940000159652.j	ENSGT01080000257442.d	ENSGT01100000263537.b.a.b.e.b	ENSGT00390000012665.i	ENSGT01100000263542.B.b.a.b.f	ENSGT00940000167390.d	ENSGT00530000064286.c.b	ENSGT00940000155151.a.a.a.c	ENSGT00940000164907.b.a.d	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a	ENSGT00940000154394.b.a.a.a.a.b.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a.j #22	ENSGT00940000158540.z.b	ENSGT01060000248575.C.c	ENSGT00940000161534.pb.a	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a.b	ENSGT00940000157936.k.b	ENSGT00940000157194.a	ENSGT00390000016384.m	ENSGT00940000153772.B.l	ENSGT00550000074961.a.c	ENSGT00940000165424.a.b.b.a	ENSGT00390000011466.e.a	ENSGT01000000215397.A.a	ENSGT00940000155841.c.a.e	ENSGT00940000158633.b.d	ENSGT01060000251815
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	16	dpp7 (ENSSSAG00000120719)	man1b1b (ENSSSAG00000052998)	ENSSSAG00000092968	cacna1ba (ENSSSAG00000072846)	ehmt1a (ENSSSAG00000074046)	ARRDC1 (ENSSSAG00000072523)	ENSSSAG00000116526	nelfb (ENSSSAG00000074069)	ENSSSAG00000072431	ENSSSAG00000097050	ENSSSAG00000072399	ENSSSAG00000072385	ENSSSAG00000109409	TBB1 (ENSSSAG00000072377)	ENSSSAG00000072367	ENSSSAG00000072364 #22	ENSSSAG00000072360	ENSSSAG00000072348	ADGRD2 (ENSSSAG00000090783)	NR5A1 (ENSSSAG00000072340)	ENSSSAG00000116267	nr6a1a (ENSSSAG00000075354)	ENSSSAG00000072261	olm2a (ENSSSAG00000072257)	RPL35 (ENSSSAG00000072189)	GOLGA1 (ENSSSAG00000072220)	ENSSSAG00000109298	ENSSSAG00000119018	ENSSSAG00000072196	ENSSSAG00000110621	shlb2 (ENSSSAG00000071861)
River trout	MODERN SPECIES	19	ENSSTUG00000039610	ENSSTUG00000039602	cacna1ba (ENSSTUG00000029587)	ehmt1a (ENSSTUG00000028064)	ARRDC1 (ENSSTUG00000028005)	ENSSTUG00000027997	ENSSTUG00000027994	nelfb (ENSSTUG00000027637)	ENSSTUG00000027617	fgf17 (ENSSTUG00000027546)	FKBP15 (ENSSTUG00000025645)	ccn1l2 (ENSSTUG00000025569)	ENSSTUG00000025557	bcl2l16 (ENSSTUG00000025552)	ENSSTUG00000025546	ENSSTUG00000025454 #22	ENSSTUG00000025443	lhx2b (ENSSTUG00000025427)	ADGRD2 (ENSSTUG00000025388)	nr5a1a (ENSSTUG00000025342)	nr6a1a (ENSSTUG00000025026)	ENSSTUG00000025000	olfml2a (ENSSTUG00000024972)	RPL35 (ENSSTUG00000024943)	golga1 (ENSSTUG00000024853)	PPP6C (ENSSTUG00000024826)	ENSSTUG00000024818	ENSSTUG00000024806	ENSSTUG00000024794	sh3glb2a (ENSSTUG00000023185)	PIP5KL1 (ENSSTUG00000023107)
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000159838	ENSGT00940000155422.bb.a	ENSGT00940000155275.c.b.b.f	ENSGT00940000156002.a.b.lb.a	ENSGT00940000159652.j	ENSGT01080000257442.d	ENSGT01080000257442.c.a	ENSGT00390000012665.i	ENSGT01100000263542.B.b.a.b.f	ENSGT00940000167390.d	ENSGT00530000064286.c.b	ENSGT00940000155151.a.a.a.c	ENSGT00940000164907.b.a.d	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a	ENSGT00940000154394.b.a.a.a.a.b.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a.j #22	ENSGT00940000158540.z.b	ENSGT00940000161534.pb.a	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a.b	ENSGT00940000157936.k.b	ENSGT00940000157194.a	ENSGT00390000016384.l.b.a	ENSGT00940000153772.B.l	ENSGT00550000074961.a.c	ENSGT00940000167067	ENSGT01000000215397.A.a	ENSGT00940000155841.c.a.e	ENSGT00940000158633.b.d	ENSGT00940000156811.a.f	ENSGT00940000159428.f.a.a	ENSGT00940000156902.a
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000155275.c.b.b.f	ENSGT00940000156002.a.b.lb.a	ENSGT00940000159652.j	ENSGT01080000257442.d	ENSGT01080000257442.c.a	ENSGT00390000012665.i	ENSGT01100000263542.B.b.a.b.f	ENSGT00940000167390.d	ENSGT00530000064286.c.b	ENSGT00940000155151.a.a.a.c	ENSGT00940000164907.b.a.d	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a	ENSGT00940000154394.b.a.a.a.b.a.a.a.a	ENSGT00950000183136.b.a.a	ENSGT00940000160615.a.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a.j #22	ENSGT00940000158540.z.b	ENSGT00940000161534.pb.a	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a.b	ENSGT00940000157936.k.b	ENSGT00940000157194.a	ENSGT00390000016384.l.b.a	ENSGT00940000153772.B.l	ENSGT00550000074961.a.c	ENSGT00940000167067	ENSGT00390000011466.e.b	ENSGT01000000215397.A.a	ENSGT00940000155841.c.a.e	ENSGT00940000158633.b.d	ENSGT00940000156811.a.f	ENSGT00940000157207.a.b
Coho salmon	MODERN SPECIES	22	ENSOKIG00005002302	cacna1ba (ENSOKIG00005003648)	ehmt1a (ENSOKIG00005028420)	ENSOKIG00005033359	ARRDC1 (ENSOKIG00005033365)	ENSOKIG00005033383	ENSOKIG00005033387	nelfb (ENSOKIG00005033416)	ENTPD2 (ENSOKIG00005034210)	ENSOKIG00005034323	FKBP15 (ENSOKIG00005034416)	ccn1l2 (ENSOKIG00005036321)	ENSOKIG00005036347	bcl2l16 (ENSOKIG00005036390)	ENSOKIG00005036398	ENSOKIG00005036431 #22	lhx2b (ENSOKIG00005036496)	ADGRD2 (ENSOKIG00005036523)	NR5A1 (ENSOKIG00005036595)	nr6a1a (ENSOKIG00005036775)	olfml2a (ENSOKIG00005036964)	RPL35 (ENSOKIG00005036982)	GOLGA1 (ENSOKIG00005037060)	PPP6C (ENSOKIG00005037163)	ENSOKIG00005037188	ENSOKIG00005037199	ENSOKIG00005037206	ENSOKIG00005037258	PIP5KL1 (ENSOKIG00005037443)	EEIG1 (ENSOKIG00005039898)	seta (ENSOKIG00005039985)
Chinook salmon	MODERN SPECIES	28	bco2l (ENSOTSG00005037982)	ENSOTSG00005039320	LZTS1 (ENSOTSG00005000235)	PDE4D (ENSOTSG00005000243)	ENSOTSG00005000426	rchy1 (ENSOTSG00005000428)	ENSOTSG00005000432	ENSOTSG00005000435	fgf17 (ENSOTSG00005000438)	FKBP15 (ENSOTSG00005000457)	ccn1l2 (ENSOTSG00005005246)	ENSOTSG00005005248	bcl2l16 (ENSOTSG00005005250)	ENSOTSG00005005251	ENSOTSG00005005253	ENSOTSG00005005254 #22	ENSOTSG00005005255	ENSOTSG00005005256	MEX3C (ENSOTSG00005005259)	SMAD4 (ENSOTSG00005005261)	elac1 (ENSOTSG00005005263)	aptx (ENSOTSG00005005264)	me2 (ENSOTSG00005005270)	mapk4 (ENSOTSG00005006847)	tspan36 (ENSOTSG00005006869)	si:ch211-103n10.5 (ENSOTSG00005006870)	ENSOTSG00005006871	mpeg1.2 (ENSOTSG00005006872)	prf1.5 (ENSOTSG00005006873)	HPGDS (ENSOTSG00005006874)	smarcad1a (ENSOTSG00005006882)
Rainbow trout	MODERN SPECIES	27	ENSOMYG00000013769	dpp7 (ENSOMYG00000017676)	man1b1b (ENSOMYG00000017764)	cacna1ba (ENSOMYG00000018918)	ehmt1a (ENSOMYG00000043578)	ARRDC1 (ENSOMYG00000045458)	p2ry2 (ENSOMYG00000045470)	ENSOMYG00000045472	ENSOMYG00000045493	ENSOMYG00000045551	ENSOMYG00000045585	ccn1l2 (ENSOMYG00000045649)	ENSOMYG00000045655	bcl2l16 (ENSOMYG00000045660)	ENSOMYG00000045666	ENSOMYG00000048411 #22	ENSOMYG00000045674	ADGRD2 (ENSOMYG00000045677)	NR5A1 (ENSOMYG00000045698)	nr6a1a (ENSOMYG00000045717)	OLFML2A (ENSOMYG00000045784)	RPL35 (ENSOMYG00000045792)	GOLGA1 (ENSOMYG00000045811)	ENSOMYG00000045867	ENSOMYG00000045876	ENSOMYG00000045895	ENSOMYG00000045923	ENSOMYG00000046043	ENSOMYG00000046048	ENSOMYG00000046069	ENSOMYG00000046099
Huchen	MODERN SPECIES	698	man1b1b (ENSHHUG00000045266)	ENSHHUG00000045285	cacna1ba (ENSHHUG00000045289)	ehmt1a (ENSHHUG00000045332)	ARRDC1 (ENSHHUG00000045749)	ENSHHUG00000045755	ENSHHUG00000045758	nelfb (ENSHHUG00000045762)	ENSHHUG00000045839	fgf17 (ENSHHUG00000045843)	FKBP15 (ENSHHUG00000045851)	ccn1l2 (ENSHHUG00000045897)	ENSHHUG00000045901	bcl2l16 (ENSHHUG00000045908)	tubb2b (ENSHHUG00000045913)	CRB2 (ENSHHUG00000045925) #22
Northern pike	MODERN SPECIES	12	notch1b (ENSELUG00000002143)	dpp7 (ENSELUG00000002133)	man1b1b (ENSELUG00000002128)	cacna1ba (ENSELUG00000002116)	ENSELUG00000002101	ENSELUG00000002099	nelfb (ENSELUG00000002087)	fgf17 (ENSELUG00000002082)	ENSELUG00000002078	ccn1l2 (ENSELUG00000002050)	ENSELUG00000002048	bcl2l16 (ENSELUG00000002045)	tubb2b (ENSELUG00000002042)	ENSELUG00000002037	FPGS (ENSELUG00000002033)	CRB2 (ENSELUG00000002023) #22	lhx2b (ENSELUG00000000056)	ADGRD2 (ENSELUG00000002011)	nr5a1a (ENSELUG00000002007)	nr6a1a (ENSELUG00000002004)	olfml2a (ENSELUG00000002000)	RL35 (ENSELUG00000001990)	PPP6C (ENSELUG00000001963)	ENSELUG00000001961	ENSELUG00000001960	PRRT1B (ENSELUG00000001955)	sh3glb2a (ENSELUG00000001953)	PIP5KL1 (ENSELUG00000001951)	ENSELUG00000001949	EEIG1 (ENSELUG00000001947)	ENSELUG00000001944
Osteoglossiformes	DUPLICATION
Osteoglossiformes	ANCESTRAL SPECIES	164	ENSGT00530000064359.d	ENSGT00940000154645.B.a	ENSGT00940000160451	ENSGT01060000248556.A.a.a.a.b.a	ENSGT00900000141021.b.a.c.b	ENSGT00390000008371.b	ENSGT00930000151050	ENSGT00530000064286.b	ENSGT00930000151044	ENSGT00390000006922	ENSGT00940000164386	ENSGT00940000155151.a.a.a	ENSGT00940000164907.b.b	ENSGT00390000016526.g	ENSGT00940000155373	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a.k #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990.g	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a.g	ENSGT00940000157194.e	ENSGT00940000172233	ENSGT00940000158501.b	ENSGT00390000009566.c	ENSGT00550000074961.a.b
P. kingsleyae	MODERN SPECIES	324										ENSPKIG00000021398	fpgs (ENSPKIG00000021358)	cdk9 (ENSPKIG00000021317)	ENSPKIG00000021293	ENSPKIG00000021277	ENSPKIG00000021240	CRB2 (ENSPKIG00000021213) #22	ENSPKIG00000021192	EGR3 (ENSPKIG00000021178)	ENSPKIG00000021166	ENSPKIG00000021143	wdr45 (ENSPKIG00000021102)	trim69 (ENSPKIG00000021074)	bmp1b (ENSPKIG00000021030)	npffr1l1 (ENSPKIG00000021008)	kansl3 (ENSPKIG00000020921)	ANTXR1 (ENSPKIG00000020856)	AAK1 (ENSPKIG00000020694)	anxa4 (ENSPKIG00000020622)	adrb3b (ENSPKIG00000020608)	ENSPKIG00000020596	brf2 (ENSPKIG00000020580)
Asian bonytongue	MODERN SPECIES	21	NCS1 (ENSSFOG00015032851)	gpr107 (ENSSFOG00015013755)	crata (ENSSFOG00015013784)	IER5L (ENSSFOG00015027039)	ntmt1 (ENSSFOG00015013835)	ndor1 (ENSSFOG00015013852)	lrsam1 (ENSSFOG00015013925)	RPL12 (ENSSFOG00015029067)	pole3 (ENSSFOG00015014086)	ENSSFOG00015014104	ENSSFOG00015014116	ENSSFOG00015015629	ENSSFOG00015014320	fpgs (ENSSFOG00015014398)	cdk9 (ENSSFOG00015014527)	CRB2 (ENSSFOG00015014561) #22	DENND1A (ENSSFOG00015014700) #23	lhx2b (ENSSFOG00015014773)	NEK6 (ENSSFOG00015014790)	psmb7 (ENSSFOG00015014825)	NR5A1 (ENSSFOG00015029487)	ENSSFOG00015028783	nr6a1a (ENSSFOG00015014862)	OLFML2A (ENSSFOG00015033126)	ENSSFOG00015032130	ARPC5L (ENSSFOG00015025966)	ENSSFOG00015027501	ENSSFOG00015027511	ENSSFOG00015031547	SCAI (ENSSFOG00015015027)	PPP6C (ENSSFOG00015026875)
Osteoglossiformes	ANCESTRAL SPECIES	75		ENSGT00930000151016	ENSGT01060000248556.A.a.a.a.b.b	ENSGT00940000158379	ENSGT00390000011500	ENSGT00900000141021.b.a.c.a	ENSGT00390000006784	ENSGT00530000064286.a	ENSGT00940000155151.a.a.b	ENSGT00940000164907.b.a	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a	ENSGT00940000154394.a	ENSGT00940000154394.b.a.a.a.b.b	ENSGT00940000165492.a.a	ENSGT00390000016526.h	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a.l #22	ENSGT00940000153391.c.b.a.h	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194.f	ENSGT00390000016384	ENSGT00940000158501.a	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566.d	ENSGT00550000074961.a.a	ENSGT00940000167171	ENSGT01060000248544.b	ENSGT00940000155841	ENSGT00940000158633.a.b	ENSGT00990000204366	ENSGT00940000156811.a	ENSGT00450000040324.b.g
Asian bonytongue	MODERN SPECIES	8	ENSSFOG00015003976	NCS1 (ENSSFOG00015016804)	CRAT (ENSSFOG00015016764)	ENSSFOG00015016722	ptpa (ENSSFOG00015016682)	IER5L (ENSSFOG00015030523)	asb6 (ENSSFOG00015016641)	FKBP15 (ENSSFOG00015016577)	rpl12 (ENSSFOG00015031530)	ENSSFOG00015016467	ENSSFOG00015016442	bcl2l16 (ENSSFOG00015016433)	ENSSFOG00015011323	ENSSFOG00015016374	FPGS (ENSSFOG00015016349)	CRB2 (ENSSFOG00015016231) #22	lhx2b (ENSSFOG00015008780)	NEK6 (ENSSFOG00015032992)	NR5A1 (ENSSFOG00015008707)	nr6a1a (ENSSFOG00015008672)	OLFML2A (ENSSFOG00015008626)	rpl35 (ENSSFOG00015008582)	ARPC5L (ENSSFOG00015008543)	golga1 (ENSSFOG00015008493)	SCAI (ENSSFOG00015008413)	PPP6C (ENSSFOG00015008382)	ENSSFOG00015026015	ENSSFOG00015008262	SH3GLB2 (ENSSFOG00015008180)	PIP5KL1 (ENSSFOG00015008125)	ENSSFOG00015008089
P. kingsleyae	MODERN SPECIES	36	ENSPKIG00000024542	ENSPKIG00000024531	zgc:154046 (ENSPKIG00000024502)	ADAMTS13 (ENSPKIG00000024467)	ptpa (ENSPKIG00000024438)	IER5L (ENSPKIG00000024424)	asb6 (ENSPKIG00000024415)	FKBP15 (ENSPKIG00000024375)	ccn1l1 (ENSPKIG00000024360)	ENSPKIG00000024343	bcl2l16 (ENSPKIG00000024322)	tubb2b (ENSPKIG00000024313)	ENSPKIG00000024304	ENSPKIG00000024292	FPGS (ENSPKIG00000024268)	CRB2 (ENSPKIG00000024247) #22	ENSPKIG00000024237	lhx2b (ENSPKIG00000024197)	ENSPKIG00000024188	NEK6 (ENSPKIG00000024170)	ADGRD2 (ENSPKIG00000024114)	NR5A1 (ENSPKIG00000024096)	nr6a1a (ENSPKIG00000024074)	OLFML2A (ENSPKIG00000024055)	rpl35 (ENSPKIG00000024042)	ARPC5L (ENSPKIG00000024028)	golga1 (ENSPKIG00000023995)	SCAI (ENSPKIG00000023949)	PPP6C (ENSPKIG00000023917)	ENSPKIG00000023901	ENSPKIG00000023896
Osteoglossocephalai	ANCESTRAL SPECIES	49	ENSGT00940000163762.b	ENSGT00940000155945.i.a	ENSGT00940000154645.B	ENSGT00940000160451	ENSGT01060000248556.A.a.a.a.b.a	ENSGT00390000011500	ENSGT00900000141021.b.a.d	ENSGT00390000008371.b	ENSGT00930000151050	ENSGT00530000064286	ENSGT00930000151044	ENSGT00390000006922	ENSGT00940000164386	ENSGT00940000155151.a.a.b	ENSGT00940000164907.b.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000165669	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00390000016384	ENSGT00940000166116	ENSGT00940000172233	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT01060000248575.C
Clupeocephala	ANCESTRAL SPECIES	195	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000155946.c.b	ENSGT00930000151016	ENSGT01060000248556.A.a.a.a.b.a	ENSGT00390000011500	ENSGT00900000141021.b.a.d	ENSGT00390000008371.b	ENSGT00930000151050	ENSGT00530000064286	ENSGT00930000151044	ENSGT00390000006922	ENSGT00940000164386	ENSGT00940000155151.a.a.b	ENSGT00940000164907.b.b	ENSGT00940000154394.b.a.a.b.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.b	ENSGT00940000165669	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000158501.d.a	ENSGT00390000016384.l.a	ENSGT00940000166116
Otomorpha	ANCESTRAL SPECIES	193	ENSGT00930000151016	ENSGT00940000154645.B	ENSGT00940000160451	ENSGT01060000248556.A.a.a.a.b.a	ENSGT00390000011500	ENSGT00900000141021.b.a.d	ENSGT00390000008371.b	ENSGT00930000151050	ENSGT00930000151044	ENSGT00390000006922	ENSGT00940000164386	ENSGT00940000155151.a.a.b	ENSGT00940000164907.b.b	ENSGT00390000016526	ENSGT00940000155373	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.b
Clupeiformes	ANCESTRAL SPECIES	105	ENSGT00940000160451	ENSGT01060000248556.A.a.a.a.b.a	ENSGT00390000011500	ENSGT00900000141021.b.a.d.a	ENSGT00390000008371.b	ENSGT00930000151050	ENSGT00930000151044	ENSGT00390000006922	ENSGT00940000164386	ENSGT00940000155151.a.a.b	ENSGT00940000164907.b.b	ENSGT00940000154394.b.a.a.a.a.a.b	ENSGT00390000020276.mb.b	ENSGT00390000016526	ENSGT00940000155373	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.b	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194.d	ENSGT00390000016384.l.a	ENSGT00940000158501.d.a	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961.b	ENSGT00940000155841.c.b	ENSGT00940000158633.a	ENSGT00390000001098	ENSGT00940000156811.b
Atlantic herring	MODERN SPECIES	3	gpr107 (ENSCHAG00000003724)	crata (ENSCHAG00000003848)	ptpa (ENSCHAG00000004320)	ier5l (ENSCHAG00000004832)	ntmt1 (ENSCHAG00000004859)	ndor1 (ENSCHAG00000004879)	lrsam1 (ENSCHAG00000005132)	rpl12 (ENSCHAG00000005485)	pole3 (ENSCHAG00000005619)	ccn1l1 (ENSCHAG00000005656)	lmo4a (ENSCHAG00000005730)	ENSCHAG00000005749	ENSCHAG00000005894	fpgs (ENSCHAG00000006452)	cdk9 (ENSCHAG00000007237)	CRB2 (ENSCHAG00000007287) #22	DENND1A (ENSCHAG00000007433) #23	LHX2 (ENSCHAG00000009120)	NEK6 (ENSCHAG00000009167)	psmb7 (ENSCHAG00000009649)	nr5a1b (ENSCHAG00000009743)	NR6A1 (ENSCHAG00000009757)	OLFML2A (ENSCHAG00000009877)	rpl35 (ENSCHAG00000009913)	arpc5lb (ENSCHAG00000009956)	SCAI (ENSCHAG00000010110)	ppp6c (ENSCHAG00000010333)	ENSCHAG00000010356	ENSCHAG00000010369	sh3glb2b (ENSCHAG00000010417)	PIP5KL1 (ENSCHAG00000011429)
Denticle herring	MODERN SPECIES	13	crata (ENSDCDG00000027328)	ptpa (ENSDCDG00000027993)	ier5l (ENSDCDG00000028362)	ntmt1 (ENSDCDG00000028367)	ndor1 (ENSDCDG00000028380)	lrsam1 (ENSDCDG00000028407)	rpl12 (ENSDCDG00000028508)	pole3 (ENSDCDG00000028534)	ENSDCDG00000028537	ccn1l1 (ENSDCDG00000028541)	lmo4a (ENSDCDG00000028675)	ENSDCDG00000028678	ENSDCDG00000028697	fpgs (ENSDCDG00000028799)	cdk9 (ENSDCDG00000029739)	CRB2 (ENSDCDG00000029740) #22	DENND1A (ENSDCDG00000029744) #23	LHX2 (ENSDCDG00000013115)	NEK6 (ENSDCDG00000013125)	psmb7 (ENSDCDG00000013357)	nr5a1b (ENSDCDG00000013415)	NR6A1 (ENSDCDG00000013420)	OLFML2A (ENSDCDG00000013436)	ENSDCDG00000013448	rpl35 (ENSDCDG00000013468)	arpc5lb (ENSDCDG00000013501)	SCAI (ENSDCDG00000013542)	ppp6c (ENSDCDG00000013582)	ENSDCDG00000013593	ENSDCDG00000013605	sh3glb2b (ENSDCDG00000013620)
Otophysi	ANCESTRAL SPECIES	248																ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.b	ENSGT01050000244840.A.a.b.f	ENSGT01050000244840.A.a.a.h.a	ENSGT01050000244840.A.a.a.h.b	ENSGT00940000163793.A.a	ENSGT00940000161125	ENSGT00390000001362.b	ENSGT00730000111121	ENSGT00940000157817	ENSGT00390000017026	ENSGT00940000159952.a.b	ENSGT00390000009710
Cyprinoidei	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	447										ENSGT00390000018810.b	ENSGT00950000183015.D.k	ENSGT00940000153692.A.e	ENSGT00940000155133.b.u	ENSGT00390000010355.d	ENSGT00940000153232.b.h	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000156261.gb #23	ENSGT00940000159990.e	ENSGT00940000157419.v	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.b.b	ENSGT00940000157936.o.b	ENSGT00940000157194.d.a	ENSGT01050000244840.A.a.b.f.n.b	ENSGT01050000244840.A.a.b.f.m.b.a.a.a	ENSGT01050000244840.A.a.b.f.m.b.a.a.b	ENSGT01050000244840.A.a.a.h.a.r	ENSGT01050000244840.A.a.a.h.b.c	ENSGT00940000163793.A.a.d	ENSGT00940000161125	ENSGT00390000001362.b.a	ENSGT00940000157817.c.a.b
Goldfish	MODERN SPECIES	40	ENSCARG00000020838	uqcr10 (ENSCARG00000020832)	rpl35 (ENSCARG00000020825)	ENSCARG00000020820	ENSCARG00000020817	ENSCARG00000020811	ENSCARG00000020737	esm1 (ENSCARG00000020422)	ARHGAP24 (ENSCARG00000020380)	mapk10 (ENSCARG00000017060)	ptpn13 (ENSCARG00000016696)	sdad1 (ENSCARG00000016405)	ENSCARG00000016395	ENSCARG00000016392	ENSCARG00000016386	CRB2 (ENSCARG00000016368) #22	DENND1A (ENSCARG00000015942) #23	NEK6 (ENSCARG00000015728)	psmb7 (ENSCARG00000015702)	nr5a1b (ENSCARG00000015694)	nr6a1b (ENSCARG00000015425)	OLFML2A (ENSCARG00000015409)	F2R (ENSCARG00000015398)	F2R (ENSCARG00000015385)	F2R (ENSCARG00000015381)	F2R (ENSCARG00000015375)	F2R (ENSCARG00000015371)	f2rl1.1 (ENSCARG00000015365)	f2rl1.2 (ENSCARG00000015363)	ch25hl2 (ENSCARG00000015358)	s100z (ENSCARG00000015351)
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	81	ENSGT00940000160524.e	ENSGT00940000154437.h.a	ENSGT00940000174898.b	ENSGT00940000166467.b	ENSGT00950000182938.b.b.b.b.b.b.i.b.b.b.a	ENSGT00940000159146.b	ENSGT00390000014907.B.a	ENSGT00940000158207.t	ENSGT00940000166813	ENSGT00390000018810.b	ENSGT00950000183015.D.k	ENSGT00940000153692.A.e	ENSGT00940000155133.b.u	ENSGT00390000010355.d	ENSGT00940000153232.b.h	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000156261.gb #23	ENSGT00940000158821.r.b	ENSGT00940000159990.f	ENSGT00940000157419.v	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.b.b	ENSGT00940000157936.o.b	ENSGT00940000157194.d.a	ENSGT01050000244840.A.a.b.f.n.b	ENSGT01050000244840.A.a.b.f.m.b.a.a.a	ENSGT01050000244840.A.a.b.f.m.b.a.a.b	ENSGT01050000244840.A.a.b.f.m.a.b.a	ENSGT01050000244840.A.a.a.h.a.r	ENSGT01050000244840.A.a.a.h.b.c	ENSGT00940000163793.A.a.d	ENSGT01050000244840.A.a.b.f.m.a.b.b
Common carp reference	MODERN SPECIES	38	ENSCCRG00000058820	rx3 (ENSCCRG00000013148)	CPLX4 (ENSCCRG00000013016)	lman1 (ENSCCRG00000013306)	ccbe1 (ENSCCRG00000031028)	ENSCCRG00000072830	ENSCCRG00000071047	esm1 (ENSCCRG00000011343)	ARHGAP24 (ENSCCRG00000004310)	mapk10 (ENSCCRG00000002559)	ptpn13 (ENSCCRG00000004583)	sdad1 (ENSCCRG00000052504)	ENSCCRG00000077647	ENSCCRG00000054544	ENSCCRG00000023244	ENSCCRG00000023239 #22	ENSCCRG00000023193 #23	lhx2a (ENSCCRG00000046488)	psmb7 (ENSCCRG00000074098)	NEK6 (ENSCCRG00000046205)	nr5a1b (ENSCCRG00000016558)	nr6a1b (ENSCCRG00000041881)	ENSCCRG00000074926	F2R (ENSCCRG00000059546)	F2R (ENSCCRG00000077171)	F2R (ENSCCRG00000037167)	ENSCCRG00000055039	f2rl1.1 (ENSCCRG00000081208)	S100Z (ENSCCRG00000058180)	ch25hl2 (ENSCCRG00000059117)	aggf1 (ENSCCRG00000036413)
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	60	ENSSGRG00000049269	ENSSGRG00000049270	rx3 (ENSSGRG00000049271)	cplx4a (ENSSGRG00000049272)	lman1 (ENSSGRG00000049273)	ccbe1 (ENSSGRG00000049325)	HCN1 (ENSSGRG00000049327)	ENSSGRG00000049334	esm1 (ENSSGRG00000049337)	ARHGAP24 (ENSSGRG00000049340)	ENSSGRG00000049372	mapk10 (ENSSGRG00000049430)	ptpn13 (ENSSGRG00000051041)	sdad1 (ENSSGRG00000051393)	ENSSGRG00000051556	CRB2 (ENSSGRG00000051557) #22	DENND1A (ENSSGRG00000051566) #23	lhx2a (ENSSGRG00000051632)	NEK6 (ENSSGRG00000051636)	psmb7 (ENSSGRG00000051638)	nr5a1b (ENSSGRG00000051754)	nr6a1b (ENSSGRG00000051757)	OLFML2A (ENSSGRG00000051767)	F2R (ENSSGRG00000051768)	F2R (ENSSGRG00000051769)	F2R (ENSSGRG00000051770)	f2rl1.1 (ENSSGRG00000051772)	f2rl1.2 (ENSSGRG00000051773)	ch25hl2 (ENSSGRG00000051774)	s100z (ENSSGRG00000051775)	crhbp (ENSSGRG00000000115)
Euteleosteomorpha	ANCESTRAL SPECIES	331																ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.b	ENSGT00940000165669	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000158501.d.a	ENSGT00390000016384.l.a
Protacanthopterygii	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000164386	ENSGT00390000006922	ENSGT00930000151044	ENSGT00940000165492.b	ENSGT00940000154394.a.e.b	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a	ENSGT00940000164907.b.a	ENSGT00940000155151.a.a.a	ENSGT00530000064286	ENSGT00930000151050	ENSGT00390000008371.b	ENSGT00900000141021.b.a.d	ENSGT00390000011500	ENSGT01060000248556.A.a.a.a.b.a	ENSGT00940000155373	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.b	ENSGT00930000151016	ENSGT00940000155742.a.a	ENSGT01030000234582.f.b.b.b	ENSGT00940000154412.A	ENSGT00390000003837	ENSGT00940000157703	ENSGT00390000014940	ENSGT00940000159206.a	ENSGT00940000157199	ENSGT00940000166580
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	134	ENSGT00940000165492.a.a	ENSGT00940000154394.b.a.a.b.b	ENSGT00940000164907.b.b.d.a	ENSGT00940000155151.a.a.b	ENSGT00940000164386	ENSGT00390000006922	ENSGT00930000151044	ENSGT00530000064286.d	ENSGT00930000151050	ENSGT00390000008371.b	ENSGT00900000141021.b.a.d.e	ENSGT00390000011500.k	ENSGT01060000248556.A.a.a.a.b.a	ENSGT00940000155373	ENSGT00940000160615.a.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000156261.db.a #23	ENSGT00940000158540.y.a	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419.x	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.b	ENSGT00940000157936.l	ENSGT00930000151016.cb	ENSGT00940000155742.a.a.c	ENSGT01030000234582.f.b.b.b	ENSGT00940000154412.A	ENSGT00390000003837	ENSGT00940000157703	ENSGT00980000199984.B	ENSGT00950000182977.B.b.b.c.b.a	ENSGT00390000014940
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000154394.b.a.b.q	ENSGT00940000154394.b.a.a.b.b	ENSGT00940000164907.b.b.d.a	ENSGT00940000155151.a.a.b	ENSGT00940000164386	ENSGT00390000006922	ENSGT00930000151044	ENSGT00530000064286.d	ENSGT00930000151050	ENSGT00390000008371.b	ENSGT00900000141021.b.a.d.e	ENSGT00390000011500.k	ENSGT01060000248556.A.a.a.a.b.a	ENSGT00940000155373	ENSGT00940000160615.a.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000156261.db.a #23	ENSGT00940000158540.y.a	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419.x	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.b	ENSGT00940000157936.l	ENSGT01100000263520.a.a.a.a.b.a.c.b.a.a	ENSGT01030000234576.D.a.b.a.a.a.a.b.a	ENSGT00930000151016.cb	ENSGT00940000155742.a.a.c	ENSGT00940000154412.A	ENSGT01030000234582.f.b.b.b	ENSGT00390000003837	ENSGT00940000157703	ENSGT00980000199984.B
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000160451	ENSGT00390000016526	ENSGT00940000165492.a.a	ENSGT00940000164907.b.b.d.a	ENSGT00940000155151.a.a.b	ENSGT00940000164386	ENSGT00390000006922	ENSGT00930000151044	ENSGT00530000064286.d	ENSGT00930000151050	ENSGT00390000008371.b	ENSGT00900000141021.b.a.d.e	ENSGT00390000011500.k	ENSGT01060000248556.A.a.a.a.b.a	ENSGT00940000155373	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000156261.db.a #23	ENSGT00940000158540.y.a	ENSGT00940000159990.d	ENSGT00940000157419.x	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.b	ENSGT00940000157936.l	ENSGT01100000263520.a.a.a.a.b.a.c.b.a.a	ENSGT01100000263541.b	ENSGT00950000182890.A.b	ENSGT01030000234576.D.a.b.a.a.a.a.b.a	ENSGT00930000151016.cb	ENSGT00940000155742.a.a.c	ENSGT01030000234582.f.b.b.b	ENSGT00940000154412.A	ENSGT00390000003837
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000160451	ENSGT00390000016526	ENSGT00940000165492.a.a	ENSGT00940000164907.b.b.d.a	ENSGT00940000155151.a.a.b	ENSGT00940000164386	ENSGT00390000006922	ENSGT00930000151044	ENSGT00530000064286.d	ENSGT00930000151050	ENSGT00390000008371.b	ENSGT00900000141021.b.a.d.e	ENSGT00390000011500.k	ENSGT01060000248556.A.a.a.a.b.a	ENSGT00940000155373	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000156261.db.a #23	ENSGT00940000158540.y.a	ENSGT00940000159990.d	ENSGT00940000157419.x	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.b	ENSGT00940000157936.l	ENSGT01100000263520.a.a.a.a.b.a.c.b.a.a	ENSGT01100000263541.b	ENSGT00950000182890.A.b	ENSGT00930000151016.cb	ENSGT00940000155742.a.a.c	ENSGT00940000154412.A	ENSGT01030000234582.f.b.b.b	ENSGT00390000003837	ENSGT00940000157703
Chinook salmon	MODERN SPECIES	12	ENSOTSG00005047687	TUBB4B (ENSOTSG00005047686)	ENSOTSG00005047684	lmo4a (ENSOTSG00005047683)	ccn1l1 (ENSOTSG00005047682)	ENSOTSG00005047681	pole3 (ENSOTSG00005047680)	rpl12 (ENSOTSG00005047672)	lrsam1 (ENSOTSG00005047670)	ENSOTSG00005047669	ndor1 (ENSOTSG00005047666)	ntmt1 (ENSOTSG00005047665)	ier5l (ENSOTSG00005047663)	ptpa (ENSOTSG00005047657)	crata (ENSOTSG00005047465)	CRB2 (ENSOTSG00005047456) #22	DENND1A (ENSOTSG00005047332) #23	LHX2 (ENSOTSG00005047331)	NEK6 (ENSOTSG00005047329)	psmb7 (ENSOTSG00005047328)	nr5a1b (ENSOTSG00005047326)	NR6A1 (ENSOTSG00005047324)	ENSOTSG00005047323	ccng2 (ENSOTSG00005047322)	ATP8B1 (ENSOTSG00005047320)	WDR7 (ENSOTSG00005047319)	ENSOTSG00005047318	ENSOTSG00005047314	ENSOTSG00005047312	ENSOTSG00005047310	ENSOTSG00005047308
Huchen	MODERN SPECIES	8328																ENSHHUG00000006113 #22	ENSHHUG00000006097 #23
Northern pike	MODERN SPECIES	13	ENSELUG00000020184	ENSELUG00000024741	ENSELUG00000030475	TUBB4B (ENSELUG00000020007)	lmo4a (ENSELUG00000019991)	ccn1l1 (ENSELUG00000019976)	pole3 (ENSELUG00000001285)	rpl12 (ENSELUG00000019938)	lrsam1 (ENSELUG00000019893)	ntmt1 (ENSELUG00000019833)	ENSELUG00000034166	ier5l (ENSELUG00000019814)	ptpa (ENSELUG00000000869)	crata (ENSELUG00000019745)	cdk9 (ENSELUG00000019692)	CRB2 (ENSELUG00000019522) #22	DENND1A (ENSELUG00000000844) #23	LHX2 (ENSELUG00000019408)	NEK6 (ENSELUG00000019344)	psmb7 (ENSELUG00000019284)	nr5a1b (ENSELUG00000019192)	NR6A1 (ENSELUG00000019147)	ENSELUG00000029906	ENSELUG00000019008	ENSELUG00000018970	ENSELUG00000018960	fbxw2 (ENSELUG00000018951)	slc12a2 (ENSELUG00000018889)	mogat3b (ENSELUG00000018837)	CTXN3 (ENSELUG00000018841)	prrc1 (ENSELUG00000018828)
Acanthomorphata	ANCESTRAL SPECIES	82	ENSGT00940000164790.a	ENSGT00940000153877.a.a.b	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00530000063497.a.a	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961.b	ENSGT00940000156340.a.d	ENSGT00440000038585.c	ENSGT00530000063156.a.a.a	ENSGT00940000157955.d.a	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000155946.c.b	ENSGT00930000151016	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.b	ENSGT00940000159700	ENSGT00940000161073	ENSGT00940000155742.a.a	ENSGT00940000154412.A	ENSGT00390000003837	ENSGT00940000157703	ENSGT00390000014940	ENSGT00940000159206.a	ENSGT00940000157199	ENSGT00940000154938	ENSGT00390000006753.B
Euacanthomorphacea	ANCESTRAL SPECIES	54	ENSGT00940000164790.a	ENSGT00940000153877.a.a.b	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00530000063497.a.a	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961.b	ENSGT00940000156340.a.d	ENSGT00440000038585.c	ENSGT00530000063156.a.a.a	ENSGT00940000157955.d.a	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000155946.c.b	ENSGT00930000151016	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.b	ENSGT00940000159700	ENSGT00940000161073	ENSGT00940000155742.a.a	ENSGT00940000154412.A	ENSGT00390000003837	ENSGT00940000157703	ENSGT00390000014940	ENSGT00940000159206.a	ENSGT00940000157199	ENSGT00940000154938	ENSGT00390000006753.B
Percomorphaceae	ANCESTRAL SPECIES	42	ENSGT00940000153464.A.a	ENSGT00940000156902.b	ENSGT00940000164790.a	ENSGT00940000153877.a.a.b	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000156662.d.f	ENSGT00530000063497.a.a	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961.b	ENSGT00940000156340.a.d	ENSGT00440000038585.c	ENSGT00530000063156.a.a.a	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000155946.c.b	ENSGT00930000151016	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.b	ENSGT00940000157955.d.a	ENSGT00940000155945.i.a	ENSGT00390000000642	ENSGT00390000016543.d	ENSGT00530000063851.b	ENSGT00940000155742.a.a	ENSGT00940000159700	ENSGT00940000154412.A	ENSGT00390000003837	ENSGT00940000161073	ENSGT00940000157703
Percomorphaceae_B	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000153464.A.a	ENSGT00940000156902.b	ENSGT00940000164790.a	ENSGT00940000153877.a.a.b	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000156662.d.f	ENSGT00530000063497.a.a	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961.b	ENSGT00940000156340.a.d	ENSGT00440000038585.c	ENSGT00530000063156.a.a.a	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000155946.c.b	ENSGT00930000151016	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000178133	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.b	ENSGT00940000157955.d.a	ENSGT00940000155945.i.a	ENSGT00390000000642	ENSGT00390000016543.d	ENSGT00530000063851.b	ENSGT00940000155742.a.a	ENSGT00940000159700	ENSGT00940000154412.A	ENSGT00390000003837	ENSGT00940000161073
Ovalentaria	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00550000074961.b	ENSGT00390000009566	ENSGT00530000063497.a.a	ENSGT00940000156662.d.f	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000153877.a.a.b	ENSGT00940000164790.a	ENSGT00940000156902.b	ENSGT00940000153464.A.a	ENSGT00940000157207.a.a	ENSGT00440000038585.c	ENSGT00530000063156.a.a.a	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000155946.c.b	ENSGT00930000151016	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000178133	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.b	ENSGT00940000157955.d.a	ENSGT00940000155945.i.a	ENSGT00390000000642	ENSGT00390000016543.d	ENSGT00530000063851.b	ENSGT00940000155742.a.a	ENSGT00940000159700	ENSGT00940000154412.A	ENSGT00390000003837	ENSGT00940000161073
Ovalentaria_B	ANCESTRAL SPECIES	37													ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000155946.c.b	ENSGT00930000151016	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000178133	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.b	ENSGT00940000157955.d.a	ENSGT00940000155945.i.a	ENSGT00390000000642	ENSGT00390000016543.d	ENSGT00530000063851.b	ENSGT00940000155742.a.a	ENSGT00940000159700	ENSGT00940000157199	ENSGT00940000154412.A	ENSGT00390000003837
Pomacentridae	ANCESTRAL SPECIES	97	ENSGT00940000155945.i.a	ENSGT00940000157955.d.a	ENSGT00390000018878	ENSGT00940000155826	ENSGT00390000006096.a.b	ENSGT00940000157006	ENSGT01030000234542.b.b.a.a.a.a	ENSGT00390000003837	ENSGT00940000154412.A	ENSGT00940000157199	ENSGT00940000159700	ENSGT00940000155742.a.a	ENSGT00530000063851.b	ENSGT00390000016543.d	ENSGT00930000151016	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000178133	ENSGT00940000156261.y #23	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.b	ENSGT01100000263514.B	ENSGT00940000161047	ENSGT00940000155603.A.a.a.a	ENSGT00950000183162.b	ENSGT00390000005646	ENSGT00940000157326	ENSGT00940000156510.h	ENSGT00390000004945	ENSGT00940000156369	ENSGT00530000064469	ENSGT00390000005782
Pomacentridae_A	ANCESTRAL SPECIES	46	ENSGT00940000157955.d.a.e	ENSGT00390000018878	ENSGT00940000155826	ENSGT00390000006096.a.b	ENSGT00940000157006	ENSGT01030000234542.b.b.a.a.a.a	ENSGT01030000234542.b.b.a.a.b	ENSGT00390000003837	ENSGT00940000154412.A	ENSGT00940000157199	ENSGT00940000159700	ENSGT00940000155742.a.a	ENSGT00530000063851.b	ENSGT00390000016543.d	ENSGT00930000151016	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000178133	ENSGT00940000156261.y #23	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.b	ENSGT01100000263514.B	ENSGT00940000161047	ENSGT00940000155603.A.a.a.a	ENSGT00950000183162.b	ENSGT00390000005646	ENSGT00940000157326	ENSGT00940000156510.h	ENSGT00390000004945	ENSGT00940000156369	ENSGT00530000064469	ENSGT00390000005782
Amphiprion	ANCESTRAL SPECIES	41	ENSGT00940000155945.i.a	ENSGT00940000157955.d.a.e	ENSGT00390000018878	ENSGT00940000155826	ENSGT00390000006096.a.b	ENSGT00940000157006	ENSGT01030000234542.b.b.a.a.a.a	ENSGT00390000003837	ENSGT00940000154412.A	ENSGT00940000157199	ENSGT00940000159700	ENSGT00940000155742.a.a	ENSGT00530000063851.b	ENSGT00390000016543.d	ENSGT00930000151016	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000178133	ENSGT00940000156261.y #23	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.b	ENSGT01100000263514.B	ENSGT00940000161047	ENSGT00940000155603.A.a.a.a	ENSGT00950000183162.b	ENSGT00390000005646	ENSGT00940000157326	ENSGT00940000156510.h	ENSGT00390000004945	ENSGT00940000156369	ENSGT00530000064469	ENSGT00390000005782
Clown anemonefish	MODERN SPECIES	2003										MTRR (ENSAOCG00000015981)	cct5 (ENSAOCG00000015952)	cmbl (ENSAOCG00000015887)	MINAR2 (ENSAOCG00000015860)	AJM1 (ENSAOCG00000015833)	fbxw2 (ENSAOCG00000001938)	ENSAOCG00000002412 #22	ENSAOCG00000015721
Orange clownfish	MODERN SPECIES	7	mvb12ba (ENSAPEG00000015128)	LMX1B (ENSAPEG00000015086)	dcp2 (ENSAPEG00000015029)	YTHDC2 (ENSAPEG00000014873)	hmgcs1 (ENSAPEG00000014803)	tln1 (ENSAPEG00000014632)	tpm2 (ENSAPEG00000014536)	prrc1 (ENSAPEG00000014517)	CTXN3 (ENSAPEG00000014497)	lmnb1 (ENSAPEG00000014461)	slc27a6 (ENSAPEG00000014420)	slc12a2 (ENSAPEG00000014310)	MINAR2 (ENSAPEG00000014275)	AJM1 (ENSAPEG00000014268)	fbxw2 (ENSAPEG00000014230)	CRB2 (ENSAPEG00000014211) #22	ENSAPEG00000014203	ENSAPEG00000014165 #23	psmb7 (ENSAPEG00000014128)	nr5a1b (ENSAPEG00000014096)	selenoh (ENSAPEG00000014076)	psmb10 (ENSAPEG00000014042)	ENSAPEG00000014012	PURG (ENSAPEG00000014003)	slc38a9 (ENSAPEG00000013900)	nrg1 (ENSAPEG00000013845)	ENSAPEG00000013803	pomk (ENSAPEG00000013769)	PAM (ENSAPEG00000013709)	ENSAPEG00000013680	macir (ENSAPEG00000013672)
Cichlidae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22
Pseudocrenilabrinae	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00940000158444	ENSGT00940000158973.a.b	ENSGT00950000183125.b.a.a.a.a.a	ENSGT00390000003652.d	ENSGT01030000234539.b.b.a.i	ENSGT00940000165717	ENSGT00940000158107.a.a	ENSGT00550000074946	ENSGT00940000158323.g	ENSGT00940000166967	ENSGT00390000010474	ENSGT00940000164321.d	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000155946.c.b	ENSGT00930000151016	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00440000038585.c	ENSGT00530000063156.a.a.a	ENSGT01060000248556.A.a.a.a.b.a.b.i.b	ENSGT01060000248556.A.a.a.a.b.a.b.i.a	ENSGT01030000234542.b.b.a.a.b	ENSGT00940000157006	ENSGT00390000006096.a.b	ENSGT00940000155826	ENSGT00390000018878	ENSGT01100000263514.B	ENSGT00940000161047	ENSGT00940000155603.A.a.a.a
Pseudocrenilabrinae_A	ANCESTRAL SPECIES	34	ENSGT00940000158444	ENSGT00940000158973.a.b	ENSGT00950000183125.b.a.a.a.a.a	ENSGT00390000003652.d	ENSGT01030000234539.b.b.a.i	ENSGT00940000165717	ENSGT00940000158107.a.a	ENSGT00550000074946	ENSGT00940000158323.g	ENSGT00940000166967	ENSGT00390000010474	ENSGT00940000164321.d	ENSGT00940000155946.c.b	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00930000151016	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00440000038585.c	ENSGT00530000063156.a.a.a	ENSGT01060000248556.A.a.a.a.b.a.b.i.b	ENSGT01060000248556.A.a.a.a.b.a.b.i.a	ENSGT01030000234542.b.b.a.a.a.a	ENSGT00940000157006	ENSGT00390000006096.a.b	ENSGT00940000155826	ENSGT00390000018878	ENSGT01100000263514.B	ENSGT00940000161047	ENSGT00940000155603.A.a.a.a
Haplochromini	ANCESTRAL SPECIES	68				ENSGT01030000234539.b.b.a.i	ENSGT00940000178267	ENSGT00940000165717	ENSGT00940000158107.a.a	ENSGT00550000074946	ENSGT00940000158323.g	ENSGT00940000166967	ENSGT00390000010474	ENSGT00940000164321.d	ENSGT00940000155946.c.b	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00930000151016	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00440000038585.c	ENSGT00530000063156.a.a.a	ENSGT01060000248556.A.a.a.a.b.a.b.i.b	ENSGT01060000248556.A.a.a.a.b.a.b.i.a	ENSGT01030000234542.b.b.a.a.b	ENSGT00940000157006	ENSGT00390000006096.a.b	ENSGT00940000160436.A.d.p	ENSGT00940000155826	ENSGT00390000018878	ENSGT01100000263514.B	ENSGT00940000161047
Burton s mouthbrooder	MODERN SPECIES	841				ZMIZ2 (ENSHBUG00000015156)	ENSHBUG00000015176	ENSHBUG00000015194	DUSP26 (ENSHBUG00000015203)	ddx56 (ENSHBUG00000015246)	aebp1a (ENSHBUG00000015357)	pnx (ENSHBUG00000015383)	ash2l (ENSHBUG00000015480)	grk5 (ENSHBUG00000015504)	ENSHBUG00000015512	ralgps1 (ENSHBUG00000015605)	fbxw2 (ENSHBUG00000015642)	ENSHBUG00000015692 #22
Haplochromini_A	ANCESTRAL SPECIES	74				ENSGT01030000234539.b.b.a.i	ENSGT00940000178267	ENSGT00940000165717	ENSGT00940000158107.a.a	ENSGT00550000074946	ENSGT00940000158323.g	ENSGT00940000166967	ENSGT00390000010474	ENSGT00940000164321.d	ENSGT00940000155946.c.b	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00930000151016	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00440000038585.c	ENSGT00530000063156.a.a.a	ENSGT01060000248556.A.a.a.a.b.a.b.i.b	ENSGT01060000248556.A.a.a.a.b.a.b.i.a	ENSGT01030000234542.b.b.a.a.b	ENSGT00940000157006	ENSGT00390000006096.a.b	ENSGT00940000160436.A.d.p	ENSGT00940000155826	ENSGT00390000018878	ENSGT01100000263514.B	ENSGT00940000161047
P. nyererei	MODERN SPECIES	692				ZMIZ2 (ENSPNYG00000019063)	ENSPNYG00000019153	ENSPNYG00000019172	DUSP26 (ENSPNYG00000019194)	ddx56 (ENSPNYG00000019212)	aebp1a (ENSPNYG00000019258)	pnx (ENSPNYG00000019316)	ash2l (ENSPNYG00000019346)	grk5 (ENSPNYG00000019414)	ralgps1 (ENSPNYG00000019494)	angptl2a (ENSPNYG00000019543)	fbxw2 (ENSPNYG00000019551)	ENSPNYG00000019572 #22
Haplochromini_B	ANCESTRAL SPECIES	30	ENSGT00940000165986	ENSGT00940000165958	ENSGT00940000163989.a.a.h.a	ENSGT01030000234539.b.b.a.i	ENSGT00940000178267	ENSGT00940000165717	ENSGT00940000158107.a.a	ENSGT00550000074946	ENSGT00940000158323.g	ENSGT00940000166967	ENSGT00390000010474	ENSGT00940000164321.d	ENSGT00940000155946.c.b	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00930000151016	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00440000038585.c	ENSGT00530000063156.a.a.a	ENSGT01060000248556.A.a.a.a.b.a.b.i.b	ENSGT01060000248556.A.a.a.a.b.a.b.i.a	ENSGT01030000234542.b.b.a.a.b	ENSGT00940000157006	ENSGT00390000006096.a.b	ENSGT00940000160436.A.d.p	ENSGT00940000155826	ENSGT00390000018878	ENSGT01100000263514.B	ENSGT00940000161047
Eastern happy	MODERN SPECIES	19	snrkb (ENSACLG00000020434)	ENSACLG00000020397	ENSACLG00000020388	ZMIZ2 (ENSACLG00000020256)	ENSACLG00000020198	ENSACLG00000020164	DUSP26 (ENSACLG00000020154)	ddx56 (ENSACLG00000020113)	aebp1a (ENSACLG00000020067)	pnx (ENSACLG00000020051)	ash2l (ENSACLG00000019934)	grk5 (ENSACLG00000019883)	angptl2a (ENSACLG00000019858)	ralgps1 (ENSACLG00000019723)	fbxw2 (ENSACLG00000019642)	ENSACLG00000019606 #22	NEK6 (ENSACLG00000019574)	ENSACLG00000019529 #23	ENSACLG00000019519	pomk (ENSACLG00000019507)	ENSACLG00000019465	ENSACLG00000019453	ENSACLG00000019446	nrg1 (ENSACLG00000019440)	ENSACLG00000019386	slc38a9 (ENSACLG00000019331)	ENSACLG00000019246	psmb10 (ENSACLG00000019216)	selenoh (ENSACLG00000019200)	dcp2 (ENSACLG00000019153)	YTHDC2 (ENSACLG00000019069)
Zebra mbuna	MODERN SPECIES	1110	ano10b (ENSMZEG00005009944)	snrkb (ENSMZEG00005009926)	ENSMZEG00005009908	ZMIZ2 (ENSMZEG00005009867)	ENSMZEG00005009855	ENSMZEG00005009841	DUSP26 (ENSMZEG00005009832)	ddx56 (ENSMZEG00005009813)	aebp1a (ENSMZEG00005009780)	pnx (ENSMZEG00005009765)	ash2l (ENSMZEG00005009740)	grk5 (ENSMZEG00005009703)	ENSMZEG00005009678	ralgps1 (ENSMZEG00005009656)	fbxw2 (ENSMZEG00005009617)	CRB2 (ENSMZEG00005009561) #22	DENND1A (ENSMZEG00005009539) #23	NEK6 (ENSMZEG00005009505)	psmb7 (ENSMZEG00005009482)	smarcb1b (ENSMZEG00005009461)	derl2 (ENSMZEG00005009450)	crata (ENSMZEG00005009438)	crata (ENSMZEG00005009404)	ENSMZEG00005009378	tln1 (ENSMZEG00005009313)	hmgcs1 (ENSMZEG00005009284)	ENSMZEG00005009238	YTHDC2 (ENSMZEG00005009153)	dcp2 (ENSMZEG00005009123)	ENSMZEG00005009092	psmb10 (ENSMZEG00005009082)
Lyretail cichlid	MODERN SPECIES	339	nudcd3 (ENSNBRG00000003736)	CAMK2B (ENSNBRG00000003328)	OGDH (ENSNBRG00000003225)	ZMIZ2 (ENSNBRG00000003156)	ENSNBRG00000002801	ENSNBRG00000002761	DUSP26 (ENSNBRG00000002740)	ddx56 (ENSNBRG00000002656)	aebp1a (ENSNBRG00000002577)	pnx (ENSNBRG00000002565)	ash2l (ENSNBRG00000002548)	grk5 (ENSNBRG00000002505)	ENSNBRG00000002468	ralgps1 (ENSNBRG00000002406)	fbxw2 (ENSNBRG00000002381)	ENSNBRG00000002299 #22	DENND1A (ENSNBRG00000002249) #23	ENSNBRG00000002231 #23	NEK6 (ENSNBRG00000002159)	psmb7 (ENSNBRG00000001547)	smarcb1b (ENSNBRG00000001478)	derl2 (ENSNBRG00000001444)	crata (ENSNBRG00000001271)	crata (ENSNBRG00000001147)	tpm2 (ENSNBRG00000001126)	tln1 (ENSNBRG00000000953)	hmgcs1 (ENSNBRG00000000879)	YTHDC2 (ENSNBRG00000000762)	dcp2 (ENSNBRG00000000726)	selenoh (ENSNBRG00000000649)	psmb10 (ENSNBRG00000000626)
Nile tilapia	MODERN SPECIES	19	ENSONIG00000030849	ENSONIG00000011491	ENSONIG00000011496	ZMIZ2 (ENSONIG00000011498)	ENSONIG00000011504	dusp26 (ENSONIG00000031216)	ddx56 (ENSONIG00000011509)	aebp1a (ENSONIG00000011513)	pnx (ENSONIG00000041082)	ash2l (ENSONIG00000011518)	grk5 (ENSONIG00000011525)	ralgps1 (ENSONIG00000011540)	ENSONIG00000032068	ENSONIG00000011544	fbxw2 (ENSONIG00000011549)	CRB2 (ENSONIG00000011551) #22	ENSONIG00000029215	DENND1A (ENSONIG00000011555) #23	NEK6 (ENSONIG00000011562)	psmb7 (ENSONIG00000042918)	smarcb1b (ENSONIG00000011574)	derl2 (ENSONIG00000011576)	crata (ENSONIG00000011577)	crata (ENSONIG00000011580)	ENSONIG00000011584	tln1 (ENSONIG00000011589)	hmgcs1 (ENSONIG00000011599)	YTHDC2 (ENSONIG00000011601)	dcp2 (ENSONIG00000033239)	ENSONIG00000031888	psmb10 (ENSONIG00000011604)
Atherinomorphae	ANCESTRAL SPECIES	74	ENSGT00940000156340.a.d	ENSGT00550000074961.b	ENSGT00390000009566	ENSGT00530000063497.a.a	ENSGT00940000156662.d.f	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000153877.a.a.b	ENSGT00940000164790.a	ENSGT00940000156902.b	ENSGT00940000153464.A.a	ENSGT00940000157207.a.a	ENSGT00440000038585.c	ENSGT00530000063156.a.a.a	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00930000151016	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22
Cyprinodontiformes	ANCESTRAL SPECIES	159															ENSGT00930000151016	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22
Cyprinodontoidei	ANCESTRAL SPECIES	36	ENSGT00940000158866	ENSGT00940000161769.b.b	ENSGT00940000159913.a.b	ENSGT00940000177258	ENSGT00940000156031.f	ENSGT00940000155411.d	ENSGT00940000157492.a	ENSGT00940000157995	ENSGT00940000159267	ENSGT00940000156102.r	ENSGT00940000166544.a	ENSGT00950000183041.C	ENSGT00940000154856.B.c	ENSGT00940000155657	ENSGT00930000151016	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000165329	ENSGT00940000156369	ENSGT00390000004945	ENSGT00940000156510.h	ENSGT00530000064469	ENSGT00940000157873	ENSGT00410000025802	ENSGT00390000005989.b.b	ENSGT00940000155860.b	ENSGT00390000009948.d	ENSGT00940000155782	ENSGT00940000164226.a.b	ENSGT00390000011010.a.a	ENSGT00940000156732.a.a	ENSGT00390000004874.a.b
Poeciliinae	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000160516	ENSGT00940000158866	ENSGT00940000161769.b.b	ENSGT00940000159913.a.b	ENSGT00940000177258	ENSGT00940000156031.f	ENSGT00940000155411.d	ENSGT00940000157492.a	ENSGT00940000159267	ENSGT00940000156102.r	ENSGT00940000166544.a	ENSGT00950000183041.C	ENSGT00940000154856.B.c	ENSGT00940000155657	ENSGT00930000151016	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000165329	ENSGT00940000156369	ENSGT00390000004945	ENSGT00940000156510.h	ENSGT00530000064469	ENSGT00940000157873	ENSGT00410000025802	ENSGT00390000005989.b.b	ENSGT00940000155860.b	ENSGT00390000009948.d.g	ENSGT00940000155782	ENSGT00940000164226.a.b	ENSGT00390000011010.a.a	ENSGT00940000156732.a.a	ENSGT00390000004874.a.b
Poecilia	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000160516	ENSGT00940000158866	ENSGT00940000161769.b.b	ENSGT00940000159913.a.b	ENSGT00940000177258	ENSGT00940000156031.f	ENSGT00940000155411.d	ENSGT00940000157492.a	ENSGT00940000159267	ENSGT00940000156102.r	ENSGT00940000166544.a	ENSGT00950000183041.C	ENSGT00940000154856.B.c	ENSGT00940000155657	ENSGT00930000151016	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000165329	ENSGT00940000156369	ENSGT00390000004945	ENSGT00940000156510.h	ENSGT00530000064469	ENSGT00940000157873	ENSGT00410000025802	ENSGT00390000005989.b.b	ENSGT00940000155860.b	ENSGT00390000009948.d.g	ENSGT00940000155782	ENSGT00940000164226.a.b	ENSGT00390000011010.a.a.m	ENSGT00390000011010.a.a.n	ENSGT00940000156732.a.a
NAME_6	ANCESTRAL SPECIES	111											ENSGT00940000166544.a	ENSGT00950000183041.C	ENSGT00940000154856.B.c	ENSGT00940000155657	ENSGT00930000151016	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000165329	ENSGT00940000156369	ENSGT00390000004945	ENSGT00940000156510.h	ENSGT00530000064469	ENSGT00940000157873	ENSGT00410000025802	ENSGT00390000005989.b.b	ENSGT00940000155860.b	ENSGT00390000009948.d.g	ENSGT00940000155782	ENSGT00940000164226.a.b	ENSGT00390000011010.a.a.m	ENSGT00390000011010.a.a.n	ENSGT00940000156732.a.a
Amazon molly	MODERN SPECIES	557											ENSPFOG00000004294	zcchc9 (ENSPFOG00000004364)	ENSPFOG00000004418	wdr45 (ENSPFOG00000004450)	fbxw2 (ENSPFOG00000004564)	ENSPFOG00000004668 #22	pomk (ENSPFOG00000004795)	TSHR (ENSPFOG00000004844)	ENSPFOG00000005127	reep5 (ENSPFOG00000005207)	ENSPFOG00000005275	stc1l (ENSPFOG00000005286)	FGFR1 (ENSPFOG00000005362)	marchf5l (ENSPFOG00000005642)	actr1b (ENSPFOG00000005649)	npy8ar (ENSPFOG00000005748)	COX5B (ENSPFOG00000005799)	COX5B (ENSPFOG00000005827)	ENSPFOG00000005850	hpse (ENSPFOG00000005950)	ppp3ccb (ENSPFOG00000006179)
NAME_4	ANCESTRAL SPECIES	257												ENSGT00950000183041.C	ENSGT00940000154856.B.c	ENSGT00940000155657	ENSGT00930000151016	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000156369	ENSGT00390000004945	ENSGT00940000156510.h	ENSGT00530000064469	ENSGT00940000157873	ENSGT00410000025802	ENSGT00390000005989.b.b	ENSGT00940000155860.b	ENSGT00390000009948.d	ENSGT00940000155782	ENSGT00940000164226.a.b
Mummichog	MODERN SPECIES	452										zcchc9 (ENSFHEG00000012337)	ENSFHEG00000012282	spata4 (ENSFHEG00000012255)	ENSFHEG00000012242	wdr45 (ENSFHEG00000012212)	fbxw2 (ENSFHEG00000012154)	ENSFHEG00000012090 #22	PAM (ENSFHEG00000011873)	pomk (ENSFHEG00000011853)	ENSFHEG00000011840	ENSFHEG00000011807	reep5 (ENSFHEG00000011777)	ENSFHEG00000011760	stc1l (ENSFHEG00000011730)	FGFR1 (ENSFHEG00000011699)	ENSFHEG00000011647	marchf5l (ENSFHEG00000011630)	actr1b (ENSFHEG00000011585)	npy8ar (ENSFHEG00000011547)
Sheepshead minnow	MODERN SPECIES	891																ENSCVAG00000002799 #22	PAM (ENSCVAG00000002753)	pomk (ENSCVAG00000000084)	ENSCVAG00000002741	ENSCVAG00000000082	ENSCVAG00000002733	reep5 (ENSCVAG00000002731)	ENSCVAG00000002723	stc1l (ENSCVAG00000002722)
Aplocheiloidei	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22
Turquoise killifish	MODERN SPECIES	1611	ATP6V1B2 (ENSNFUG00015003929)	DUSP11 (ENSNFUG00015003839)	ENSNFUG00015003835	Nfu_g_1_010854 (ENSNFUG00015003828)	HELQ (ENSNFUG00015003789)	MRPS18C (ENSNFUG00015003779)	abraxas1 (ENSNFUG00015003777)	ENSNFUG00015003774	gpat3 (ENSNFUG00015003772)	ENSNFUG00015003766	ENSNFUG00015003765	NKX6-3 (ENSNFUG00015003764)	rpl17 (ENSNFUG00015003759)	MFHAS1 (ENSNFUG00015003754)	NRG1 (ENSNFUG00015003752)	ENSNFUG00015003745 #22	ROR2 (ENSNFUG00015003741)	ENSNFUG00015003740	ENSNFUG00015003739	Nfu_g_1_010837 (ENSNFUG00015003737)	ENSNFUG00015003735	PAM (ENSNFUG00015003692)	nfil3 (ENSNFUG00015003675)	auh (ENSNFUG00015003670)	SYK (ENSNFUG00015003624)	chd1 (ENSNFUG00015002385)	SLC38A9 (ENSNFUG00015001806)	PURG (ENSNFUG00015001742)	ENSNFUG00015001720	dcp2 (ENSNFUG00015001711)	ENSNFUG00015001706
Oryzias	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00390000000642	ENSGT00940000155945.i.a	ENSGT00940000157955.d.a	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.b	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT01030000234542.b.b.a.a.a.a	ENSGT00940000157006	ENSGT00390000006096.a.b	ENSGT00940000157207.a.a	ENSGT00440000038585.c	ENSGT00530000063156.a.a.a	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00930000151016	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000153464.A.a	ENSGT00940000156902.b	ENSGT00940000164790.a	ENSGT00940000153877.a.a.b	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000156662.d.f	ENSGT00530000063497.a.a	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961.b	ENSGT00940000156340.a.d	ENSGT00390000007918	ENSGT00390000011873.f	ENSGT01030000234614.B.a.a.a.t	ENSGT00940000155591.j	ENSGT00950000182864.a.b.b.a.a.a
Oryzias_b	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000000642	ENSGT00940000155945.i.a	ENSGT00940000157955.d.a	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.b	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT01030000234542.b.b.a.a.a.a	ENSGT00940000157006	ENSGT00390000006096.a.b	ENSGT00940000157207.a.a	ENSGT00440000038585.c	ENSGT00530000063156.a.a.a	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00930000151016	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000153464.A.a	ENSGT00940000156902.b	ENSGT00940000164790.a	ENSGT00940000153877.a.a.b	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000156662.d.f	ENSGT00530000063497.a.a	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961.b	ENSGT00940000156340.a.d	ENSGT00390000007918	ENSGT00390000011873.f	ENSGT00940000160428.b.b	ENSGT01030000234614.B.a.a.a.t	ENSGT00940000155591.j
Javanese ricefish	MODERN SPECIES	3	mvb12ba (ENSOJAG00000003389)	lmx1ba (ENSOJAG00000003410)	ENSOJAG00000003418	nr5a1b (ENSOJAG00000003424)	psmb7 (ENSOJAG00000003441)	NEK6 (ENSOJAG00000003578)	DENND1A (ENSOJAG00000004452) #23	tpm2 (ENSOJAG00000005132)	tln1 (ENSOJAG00000005590)	hmgcs1 (ENSOJAG00000007951)	slc25a25b (ENSOJAG00000008215)	smarcb1b (ENSOJAG00000008974)	derl2 (ENSOJAG00000009021)	ralgps1 (ENSOJAG00000009088)	fbxw2 (ENSOJAG00000009386)	ENSOJAG00000009406 #22	uap1l1 (ENSOJAG00000009419)	zdhhc12b (ENSOJAG00000009441)	ENSOJAG00000009570	setb (ENSOJAG00000010833)	dync2i2 (ENSOJAG00000010843)	ENSOJAG00000015391	SCAI (ENSOJAG00000015411)	ppp6c (ENSOJAG00000015594)	MMP11 (ENSOJAG00000015610)	skp2 (ENSOJAG00000015640)	GTF3C4 (ENSOJAG00000015654)	barhl1a (ENSOJAG00000015664)	stom (ENSOJAG00000015697)	gsna (ENSOJAG00000015905)	ppp2r2ab (ENSOJAG00000017346)
Indian medaka	MODERN SPECIES	677																ENSOMEG00000019960 #22	uap1l1 (ENSOMEG00000020003)	zdhhc12b (ENSOMEG00000020031)	ENSOMEG00000020078	setb (ENSOMEG00000020148)	dync2i2 (ENSOMEG00000020274)	ENSOMEG00000020320	ENSOMEG00000020337	ENSOMEG00000020347	ENSOMEG00000020367	ODF2 (ENSOMEG00000020421)	SCAI (ENSOMEG00000000534)
Oryzias_a	ANCESTRAL SPECIES	126												ENSGT00440000038585.c	ENSGT00530000063156.a.a.a	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00930000151016	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000153464.A.a	ENSGT00940000156902.b	ENSGT00940000164790.a	ENSGT00940000153877.a.a.b	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000156662.d.f	ENSGT00530000063497.a.a
Chinese medaka	MODERN SPECIES	343													derl2 (ENSOSIG00000021501)	ralgps1 (ENSOSIG00000021166)	fbxw2 (ENSOSIG00000021101)	ENSOSIG00000021100 #22	uap1l1 (ENSOSIG00000021097)	zdhhc12b (ENSOSIG00000021096)	ENSOSIG00000017902	setb (ENSOSIG00000017687)
Percomorphaceae_C	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000153464.A.a	ENSGT00940000156902.b	ENSGT00940000164790.a	ENSGT00940000153877.a.a.b	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000156662.d.f	ENSGT00530000063497.a.a	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961.b	ENSGT00940000156340.a.d	ENSGT00440000038585.c	ENSGT00530000063156.a.a.a	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000155946.c.b	ENSGT00930000151016	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000178133	ENSGT00940000155152.e	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.b	ENSGT00940000157955.d.a	ENSGT00940000155945.i.a	ENSGT00390000000642	ENSGT00390000016543.d	ENSGT00530000063851.b	ENSGT00940000155742.a.a	ENSGT00940000159700	ENSGT00940000159206.a	ENSGT00940000157199
Percomorphaceae_D	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000153464.A.a	ENSGT00940000156902.b	ENSGT00940000164790.a	ENSGT00940000153877.a.a.b	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000156662.d.f	ENSGT00530000063497.a.a	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961.b	ENSGT00940000156340.a.d	ENSGT00440000038585.c	ENSGT00530000063156.a.a.a	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000155946.c.b	ENSGT00930000151016	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000178133	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.b	ENSGT00940000157955.d.a	ENSGT00940000155945.i.a	ENSGT00390000000642	ENSGT00390000016543.d	ENSGT00530000063851.b	ENSGT00940000155742.a.a	ENSGT00940000159700	ENSGT00940000159206.a	ENSGT00940000157199	ENSGT00940000154412.A
Carangaria	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000153464.A.a	ENSGT00940000156902.b	ENSGT00940000164790.a	ENSGT00940000153877.a.a.b	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000156662.d.f	ENSGT00530000063497.a.a	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961.b	ENSGT00940000156340.a.d	ENSGT00440000038585.c	ENSGT00530000063156.a.a.a	ENSGT00940000155946.c.b	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00930000151016	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000178133	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.b	ENSGT00940000157955.d.a	ENSGT00940000155945.i.a	ENSGT00390000000642	ENSGT00390000016543.d	ENSGT00530000063851.b	ENSGT00940000155742.a.a	ENSGT00940000159700	ENSGT00940000159206.a	ENSGT00940000157199	ENSGT00940000154412.A
Carangaria_A	ANCESTRAL SPECIES	43	ENSGT00940000153464.A.a	ENSGT00940000156902.b	ENSGT00940000164790.a	ENSGT00940000153877.a.a.b	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000156662.d.f	ENSGT00530000063497.a.a	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961.b	ENSGT00940000156340.a.d	ENSGT00440000038585.c	ENSGT00530000063156.a.a.a	ENSGT00940000155946.c.b	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00930000151016	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000178133	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.b	ENSGT00940000157955.d.a	ENSGT00940000155945.i.a	ENSGT00390000000642	ENSGT00390000016543.d	ENSGT00530000063851.b	ENSGT00940000155742.a.a	ENSGT00940000159700	ENSGT00940000159206.a	ENSGT00940000157199	ENSGT00940000154412.A
Seriola	ANCESTRAL SPECIES	33	ENSGT00940000153464.A.a	ENSGT00940000156902.b	ENSGT00940000164790.a	ENSGT00940000153877.a.a.b	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000156662.d.f	ENSGT00530000063497.a.a	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961.b	ENSGT00940000156340.a.d	ENSGT00440000038585.c	ENSGT00530000063156.a.a.a	ENSGT00940000155946.c.b	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00930000151016	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000178133	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.b	ENSGT00940000157955.d.a	ENSGT00940000155945.i.a	ENSGT00390000000642	ENSGT00390000016543.d	ENSGT00530000063851.b	ENSGT00940000155742.a.a	ENSGT00940000159700	ENSGT00940000157199	ENSGT00940000154412.A	ENSGT00390000003837
Greater amberjack	MODERN SPECIES	34	ENSSDUG00000020309	setb (ENSSDUG00000020263)	dync2i2 (ENSSDUG00000020218)	sptan1 (ENSSDUG00000020131)	ODF2 (ENSSDUG00000020101)	SCAI (ENSSDUG00000020037)	ppp6c (ENSSDUG00000020000)	MMP11 (ENSSDUG00000019979)	smarcb1b (ENSSDUG00000019943)	derl2 (ENSSDUG00000019927)	ENSSDUG00000019917	ENSSDUG00000019909	angptl2a (ENSSDUG00000019900)	ralgps1 (ENSSDUG00000019795)	fbxw2 (ENSSDUG00000019749)	CRB2 (ENSSDUG00000019694) #22	DENND1A (ENSSDUG00000019675) #23	NEK6 (ENSSDUG00000019649)	psmb7 (ENSSDUG00000019641)	nr5a1b (ENSSDUG00000019262)	lmx1ba (ENSSDUG00000019211)	mvb12ba (ENSSDUG00000019178)	MAPKAP1 (ENSSDUG00000019126)	AJM1 (ENSSDUG00000019112)	ENSSDUG00000019093	slc12a2 (ENSSDUG00000018956)	slc27a6 (ENSSDUG00000018919)	lmnb1 (ENSSDUG00000018889)	CTXN3 (ENSSDUG00000018881)	prrc1 (ENSSDUG00000018839)	ENSSDUG00000018810
Yellowtail amberjack	MODERN SPECIES	3288	ENSSLDG00000022274	setb (ENSSLDG00000022255)	dync2i2 (ENSSLDG00000022199)	sptan1 (ENSSLDG00000022130)	ODF2 (ENSSLDG00000022094)	SCAI (ENSSLDG00000022050)	ppp6c (ENSSLDG00000022033)	MMP11 (ENSSLDG00000022020)	smarcb1b (ENSSLDG00000021986)	derl2 (ENSSLDG00000021972)	ENSSLDG00000021963	ENSSLDG00000021951	angptl2a (ENSSLDG00000021944)	ralgps1 (ENSSLDG00000021826)	fbxw2 (ENSSLDG00000021797)	CRB2 (ENSSLDG00000021781) #22	ENSSLDG00000021771	DENND1A (ENSSLDG00000021751) #23	ENSSLDG00000021744 #23	NEK6 (ENSSLDG00000021730)	psmb7 (ENSSLDG00000021700)	nr5a1b (ENSSLDG00000021687)	lmx1ba (ENSSLDG00000021678)	mvb12ba (ENSSLDG00000021657)	ENSSLDG00000021650	MAPKAP1 (ENSSLDG00000021610)	AJM1 (ENSSLDG00000021604)	ENSSLDG00000021597	slc12a2 (ENSSLDG00000018176)	slc27a6 (ENSSLDG00000017700)	lmnb1 (ENSSLDG00000017637)
Barramundi perch	MODERN SPECIES	391														ENSLCAG00010012020	fbxw2 (ENSLCAG00010012026)	CRB2 (ENSLCAG00010012038) #22	DENND1A (ENSLCAG00010012068) #23	NEK6 (ENSLCAG00010012107)	psmb7 (ENSLCAG00010012139)	nr5a1b (ENSLCAG00010012152)	LMX1B (ENSLCAG00010012158)	mvb12ba (ENSLCAG00010012165)	naif1 (ENSLCAG00010012177)	eeig1b (ENSLCAG00010012183)	dpm2 (ENSLCAG00010012191)	PIP5KL1 (ENSLCAG00010012193)
Anabantaria	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000153464.A.a	ENSGT00940000156902.b	ENSGT00940000164790.a	ENSGT00940000153877.a.a.b	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000156662.d.f	ENSGT00530000063497.a.a	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961.b	ENSGT00940000156340.a.d	ENSGT00440000038585.c	ENSGT00530000063156.a.a.a	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000155946.c.b	ENSGT00930000151016	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.b	ENSGT00940000157955.d.a	ENSGT00940000155945.i.a	ENSGT00390000000642	ENSGT00390000016543.d	ENSGT00530000063851.b	ENSGT00940000155742.a.a	ENSGT00940000159700	ENSGT00940000157199	ENSGT00940000154412.A	ENSGT00390000003837	ENSGT00940000161073
Zig-zag eel	MODERN SPECIES	3	uap1l1 (ENSMAMG00000022652)	ENSMAMG00000022654	setb (ENSMAMG00000022655)	dync2i2 (ENSMAMG00000022658)	sptan1 (ENSMAMG00000022659)	ODF2 (ENSMAMG00000022664)	ENSMAMG00000022666	ENSMAMG00000022668	ENSMAMG00000022669	ENSMAMG00000022671	ENSMAMG00000022672	ENSMAMG00000022674	ENSMAMG00000024754	ENSMAMG00000022679	ENSMAMG00000022682	CRB2 (ENSMAMG00000022685) #22	DENND1A (ENSMAMG00000022689) #23	ENSMAMG00000025869	NEK6 (ENSMAMG00000022697)	psmb7 (ENSMAMG00000025130)	nr5a1b (ENSMAMG00000022705)	ENSMAMG00000022708	ENSMAMG00000022748	ENSMAMG00000022749	ENSMAMG00000022750	ENSMAMG00000022751	syk (ENSMAMG00000022757)	auh (ENSMAMG00000022759)	nfil3 (ENSMAMG00000025536)	ROR2 (ENSMAMG00000022766)	sptlc1 (ENSMAMG00000022776)
Eupercaria	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000153464.A.a	ENSGT00940000156902.b	ENSGT00940000164790.a	ENSGT00940000153877.a.a.b	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000156662.d.f	ENSGT00530000063497.a.a	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961.b	ENSGT00940000156340.a.d	ENSGT00440000038585.c	ENSGT00530000063156.a.a.a	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000155946.c.b	ENSGT00930000151016	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.b	ENSGT00940000157955.d.a	ENSGT00940000155945.i.a	ENSGT00390000000642	ENSGT00390000016543.d	ENSGT00530000063851.b	ENSGT00940000155742.a.a	ENSGT00940000159700	ENSGT00940000159206.a	ENSGT00940000157199	ENSGT00940000154412.A	ENSGT00390000003837
Eupecaria_A	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000153464.A.a	ENSGT00940000156902.b	ENSGT00940000164790.a	ENSGT00940000153877.a.a.b	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000156662.d.f	ENSGT00530000063497.a.a	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961.b	ENSGT00940000156340.a.d	ENSGT00440000038585.c	ENSGT00530000063156.a.a.a	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000155946.c.b	ENSGT00930000151016	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.b	ENSGT00940000157955.d.a	ENSGT00940000155945.i.a	ENSGT00390000000642	ENSGT00390000016543.d	ENSGT00530000063851.b	ENSGT00940000155742.a.a	ENSGT00940000159700	ENSGT00940000159206.a	ENSGT00940000157199	ENSGT00940000154412.A	ENSGT00390000003837
Ballan wrasse	MODERN SPECIES	329															fbxw2 (ENSLBEG00000023061)	CRB2 (ENSLBEG00000023108) #22	ENSLBEG00000023181	ENSLBEG00000023203	DENND1A (ENSLBEG00000023238) #23	NEK6 (ENSLBEG00000023285)	psmb7 (ENSLBEG00000023359)	nr5a1b (ENSLBEG00000023404)	lmx1ba (ENSLBEG00000023424)	mvb12ba (ENSLBEG00000023456)	ENSLBEG00000023566	MAPKAP1 (ENSLBEG00000023756)	AJM1 (ENSLBEG00000023812)	ENSLBEG00000023824	slc12a2 (ENSLBEG00000023886)	slc27a6 (ENSLBEG00000024020)	ENSLBEG00000024065
Eupecaria_B	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000153464.A.a	ENSGT00940000156902.b	ENSGT00940000164790.a	ENSGT00940000153877.a.a.b	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000156662.d.f	ENSGT00530000063497.a.a	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961.b	ENSGT00940000156340.a.d	ENSGT00440000038585.c	ENSGT00530000063156.a.a.a	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000155946.c.b	ENSGT00930000151016	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.b	ENSGT00940000157955.d.a	ENSGT00940000155945.i.a	ENSGT00390000000642	ENSGT00390000016543.d	ENSGT00530000063851.b	ENSGT00940000155742.a.a	ENSGT00940000159700	ENSGT00940000159206.a	ENSGT00940000157199	ENSGT00940000154412.A	ENSGT00390000003837
Perciformes	ANCESTRAL SPECIES	32													ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000155946.c.b	ENSGT00930000151016	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.b	ENSGT00940000157955.d.a	ENSGT00940000155945.i.a	ENSGT00390000000642	ENSGT00390000016543.d	ENSGT00530000063851.b	ENSGT00940000155742.a.a	ENSGT00940000159700	ENSGT00940000157199	ENSGT00390000003837	ENSGT00940000161073	ENSGT00940000157703
Cottioidei	ANCESTRAL SPECIES	31	ENSGT00940000157778	ENSGT00940000155212.bb	ENSGT00940000156081.j	ENSGT00950000182925.B.b	ENSGT00390000013355	ENSGT01100000263541.a.b.k	ENSGT00940000166301	ENSGT00940000158867	ENSGT00940000153832	ENSGT00950000183005.a.b	ENSGT00390000008823	ENSGT00940000155053.c.b	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000155946.c.b	ENSGT00930000151016	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.b	ENSGT00940000157955.d.a	ENSGT00940000155945.i.a	ENSGT00390000000642	ENSGT00390000016543.d	ENSGT00530000063851.b	ENSGT00940000155742.a.a	ENSGT00940000159700	ENSGT00940000157199	ENSGT00390000003837	ENSGT00940000161073	ENSGT00940000157703
Stickleback	MODERN SPECIES	13	ENSGACG00000018267	SHROOM3 (ENSGACG00000018269)	ENSGACG00000018275	ENSGACG00000018277	ENSGACG00000018280	dnajc25 (ENSGACG00000018282)	zgc:113625 (ENSGACG00000018283)	dcc (ENSGACG00000018284)	ENSGACG00000018288	LYZ (ENSGACG00000018290)	mbd2 (ENSGACG00000018294)	ENSGACG00000018301	ralgps1 (ENSGACG00000018302)	angptl2a (ENSGACG00000018304)	fbxw2 (ENSGACG00000018305)	CRB2 (ENSGACG00000018306) #22	DENND1A (ENSGACG00000018307) #23	NEK6 (ENSGACG00000018308)	psmb7 (ENSGACG00000018309)	nr5a1b (ENSGACG00000018317)	lmx1ba (ENSGACG00000018323)	mvb12ba (ENSGACG00000018329)	MAPKAP1 (ENSGACG00000018335)	AJM1 (ENSGACG00000018340)	ENSGACG00000018342	slc12a2 (ENSGACG00000018343)	slc27a6 (ENSGACG00000018349)	lmnb1 (ENSGACG00000018353)	prrc1 (ENSGACG00000018363)	SLC27A3 (ENSGACG00000018368)	wdr91 (ENSGACG00000018369)
Eupecaria_C	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000153464.A.a	ENSGT00940000156902.b	ENSGT00940000164790.a	ENSGT00940000153877.a.a.b	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000156662.d.f	ENSGT00530000063497.a.a	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961.b	ENSGT00940000156340.a.d	ENSGT00440000038585.c	ENSGT00530000063156.a.a.a	ENSGT00940000155946.c.b	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00930000151016	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.b	ENSGT00940000157955.d.a	ENSGT00940000155945.i.a	ENSGT00940000164541	ENSGT00390000000642	ENSGT00390000016543.d	ENSGT00530000063851.b	ENSGT00940000155742.a.a	ENSGT00940000159700	ENSGT00940000159206.a	ENSGT00940000157199	ENSGT00940000154412.A
Eupercaria_incertae_sedis	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000153464.A.a	ENSGT00940000156902.b	ENSGT00940000164790.a	ENSGT00940000153877.a.a.b	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000156662.d.f	ENSGT00530000063497.a.a	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961.b	ENSGT00940000156340.a.d	ENSGT00440000038585.c	ENSGT00530000063156.a.a.a	ENSGT00940000155946.c.b	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00930000151016	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.b	ENSGT00940000157955.d.a	ENSGT00940000155945.i.a	ENSGT00940000164541	ENSGT00390000000642	ENSGT00390000016543.d	ENSGT00530000063851.b	ENSGT00940000155742.a.a	ENSGT00940000159700	ENSGT00940000159206.a	ENSGT00940000157199	ENSGT00940000154412.A
European seabass	MODERN SPECIES	9	zdhhc12b (ENSDLAG00005004355)	ENSDLAG00005004547	setb (ENSDLAG00005010991)	dync2i2 (ENSDLAG00005033129)	sptan1 (ENSDLAG00005007570)	ODF2 (ENSDLAG00005009791)	ENSDLAG00005009820	ENSDLAG00005031144	ENSDLAG00005009963	ENSDLAG00005010024	ENSDLAG00005010086	ENSDLAG00005011315	ENSDLAG00005011403	ENSDLAG00005011408	ENSDLAG00005011480	CRB2 (ENSDLAG00005011489) #22	DENND1A (ENSDLAG00005033425) #23	NEK6 (ENSDLAG00005031059)	psmb7 (ENSDLAG00005011418)	nr5a1b (ENSDLAG00005011809)	mvb12ba (ENSDLAG00005033573)	lmx1ba (ENSDLAG00005030396)	ENSDLAG00005011816	ENSDLAG00005011847	ENSDLAG00005029794	ENSDLAG00005031125	ENSDLAG00005012023	SLC27A6 (ENSDLAG00005032671)	ENSDLAG00005028031	ENSDLAG00005021598	ENSDLAG00005019921
Large yellow croaker	MODERN SPECIES		zdhhc12b (ENSLCRG00005023435)	ENSLCRG00005023415	setb (ENSLCRG00005023412)	dync2i2 (ENSLCRG00005023410)	sptan1 (ENSLCRG00005023399)	ODF2 (ENSLCRG00005023382)	SCAI (ENSLCRG00005023378)	ppp6c (ENSLCRG00005023374)	MMP11 (ENSLCRG00005023372)	smarcb1b (ENSLCRG00005023360)	derl2 (ENSLCRG00005023358)	ENSLCRG00005023345	angptl2a (ENSLCRG00005023341)	ralgps1 (ENSLCRG00005023340)	fbxw2 (ENSLCRG00005023339)	CRB2 (ENSLCRG00005023337) #22	DENND1A (ENSLCRG00005023332) #23	NEK6 (ENSLCRG00005023319)	psmb7 (ENSLCRG00005023309)	nr5a1b (ENSLCRG00005023306)	lmx1ba (ENSLCRG00005023305)	mvb12ba (ENSLCRG00005023304)	ENSLCRG00005023303	ENSLCRG00005023302	MAPKAP1 (ENSLCRG00005023301)	AJM1 (ENSLCRG00005023300)	ENSLCRG00005023299	slc12a2 (ENSLCRG00005022832)	slc27a6 (ENSLCRG00005022814)	ENSLCRG00005022813	lmnb1 (ENSLCRG00005022800)
Gilthead seabream	MODERN SPECIES	3	zdhhc12b (ENSSAUG00010024384)	ENSSAUG00010022795	setb (ENSSAUG00010022693)	dync2i2 (ENSSAUG00010022677)	sptan1 (ENSSAUG00010022637)	ODF2 (ENSSAUG00010022606)	SCAI (ENSSAUG00010022449)	ppp6c (ENSSAUG00010022438)	MMP11 (ENSSAUG00010022437)	smarcb1b (ENSSAUG00010022435)	derl2 (ENSSAUG00010022432)	ENSSAUG00010021889	ENSSAUG00010021852	ralgps1 (ENSSAUG00010021810)	fbxw2 (ENSSAUG00010021793)	CRB2 (ENSSAUG00010021782) #22	DENND1A (ENSSAUG00010021584) #23	NEK6 (ENSSAUG00010021447)	psmb7 (ENSSAUG00010021443)	ENSSAUG00010021440	nr5a1b (ENSSAUG00010021437)	LMX1B (ENSSAUG00010021436)	MAPKAP1 (ENSSAUG00010021431)	mvb12ba (ENSSAUG00010021415)	ENSSAUG00010021411	slc12a2 (ENSSAUG00010013884)	slc27a6 (ENSSAUG00010013692)	megf10 (ENSSAUG00010012160)	pomk (ENSSAUG00010012096)	PAM (ENSSAUG00010012089)	ENSSAUG00010012086
Tetraodontidae	ANCESTRAL SPECIES	88												ENSGT00440000038585.c	ENSGT00530000063156.a.a.a	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00930000151016	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000157419	ENSGT00550000074961.b	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000156662.d.f	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000153877.a.a.b	ENSGT00940000164790.a	ENSGT00940000156902.b	ENSGT00940000153464.A.a	ENSGT00940000157207.a.a	ENSGT00450000040324.b.n	ENSGT00390000001098	ENSGT00940000158633.a	ENSGT00940000155841.c.b
Fugu	MODERN SPECIES	18	ENSTRUG00000012403	tjp2a (ENSTRUG00000012412)	pip5k1ba (ENSTRUG00000012638)	EFNA5 (ENSTRUG00000026115)	GADD45G (ENSTRUG00000012876)	gadd45gb.1 (ENSTRUG00000012938)	ENSTRUG00000012990	ENSTRUG00000023362	ghrb (ENSTRUG00000013005)	c7b (ENSTRUG00000013142)	c6 (ENSTRUG00000013404)	SMARCB1 (ENSTRUG00000013792)	derl2 (ENSTRUG00000024229)	ralgps1 (ENSTRUG00000013875)	fbxw2 (ENSTRUG00000013978)	ENSTRUG00000014027 #22	DENND1A (ENSTRUG00000014090) #23	phyhd1 (ENSTRUG00000031352)	psmb7 (ENSTRUG00000014190)	ppp6c (ENSTRUG00000014295)	SCAI (ENSTRUG00000014341)	sptan1 (ENSTRUG00000014072)	dync2i2 (ENSTRUG00000014025)	setb (ENSTRUG00000013980)	ENSTRUG00000013819	zdhhc12b (ENSTRUG00000013790)	uap1l1 (ENSTRUG00000013698)	slc25a25b (ENSTRUG00000013603)	naif1 (ENSTRUG00000013589)	dpm2 (ENSTRUG00000013567)	ENSTRUG00000030413
Pinecone sodierfish	MODERN SPECIES	3	lrsam1 (ENSMMDG00005003533)	ndor1 (ENSMMDG00005003596)	ntmt1 (ENSMMDG00005003721)	ier5l (ENSMMDG00005003728)	ptpa (ENSMMDG00005003748)	crata (ENSMMDG00005003884)	AJM1 (ENSMMDG00005006679)	ENSMMDG00005006683	MAPKAP1 (ENSMMDG00005006687)	mvb12ba (ENSMMDG00005006693)	lmx1ba (ENSMMDG00005006698)	zbtb43 (ENSMMDG00005006700)	ralgps1 (ENSMMDG00005006729)	angptl2a (ENSMMDG00005008993)	fbxw2 (ENSMMDG00005009051)	ENSMMDG00005009053 #22	ENSMMDG00005009057 #23	ENSMMDG00005009060	NEK6 (ENSMMDG00005009066)	psmb7 (ENSMMDG00005009472)	nr5a1b (ENSMMDG00005009495)	slc27a6 (ENSMMDG00005009790)	SLC27A3 (ENSMMDG00005009841)	slc12a2 (ENSMMDG00005010053)	CTXN3 (ENSMMDG00005011303)	prrc1 (ENSMMDG00005011305)	megf10 (ENSMMDG00005011308)	C5orf63 (ENSMMDG00005011315)	ENSMMDG00005011319	aldh7a1 (ENSMMDG00005011351)	isoc1 (ENSMMDG00005011970)
Cod	MODERN SPECIES	17	NAIF1 (ENSGMOG00000008831)	slc25a25b (ENSGMOG00000008812)	uap1l1 (ENSGMOG00000008793)	zdhhc12b (ENSGMOG00000008781)	ENSGMOG00000008752	ENSGMOG00000008739	dync2i2 (ENSGMOG00000008718)	SPTAN1 (ENSGMOG00000008663)	ODF2 (ENSGMOG00000008644)	ENSGMOG00000008631	ENSGMOG00000008624	ENSGMOG00000008614	ENSGMOG00000008607	ENSGMOG00000006711	ENSGMOG00000006730	CRB2 (ENSGMOG00000006738) #22	ENSGMOG00000006766 #23	PSMB7 (ENSGMOG00000006798)	nr5a1b (ENSGMOG00000032636)	slc27a6 (ENSGMOG00000003965)	ENSGMOG00000003986	slc12a2 (ENSGMOG00000004314)	prrc1 (ENSGMOG00000004373)	megf10 (ENSGMOG00000013000)	C5orf63 (ENSGMOG00000028433)	ENSGMOG00000013628	ENSGMOG00000013593	ENSGMOG00000013544	ENSGMOG00000013540	sptlc1 (ENSGMOG00000013388)	ROR2 (ENSGMOG00000011137)
Osteoglossocephalai	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183101.a.b.b.b #22
Clupeocephala	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183101.a.b.b.b #22
Euteleosteomorpha	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183101.a.b.b.b #22
Acanthomorphata	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183101.a.b.b.b #22
Euacanthomorphacea	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183101.a.b.b.b #22
Percomorphaceae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183101.a.b.b.b #22
Percomorphaceae_B	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183101.a.b.b.b #22
Ovalentaria	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183101.a.b.b.b #22
Ovalentaria_B	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183101.a.b.b.b #22
Cichlidae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183101.a.b.b.b #22
Pseudocrenilabrinae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183101.a.b.b.b #22
Pseudocrenilabrinae_A	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183101.a.b.b.b #22
Lyretail cichlid	MODERN SPECIES	382								ENTPD2 (ENSNBRG00000011023)	fgf17 (ENSNBRG00000011007)	FKBP15 (ENSNBRG00000010885)	ccn1l2 (ENSNBRG00000010788)	ENSNBRG00000010766	ENSNBRG00000010749	tubb2b (ENSNBRG00000010731)	ENSNBRG00000010715	ENSNBRG00000010700 #22	lhx2b (ENSNBRG00000010642)	ENSNBRG00000010591	nr5a1a (ENSNBRG00000010564)	nr6a1a (ENSNBRG00000010537)	olfml2a (ENSNBRG00000010522)	ENSNBRG00000010505	rpl35 (ENSNBRG00000010485)	golga1 (ENSNBRG00000010429)	PPP6C (ENSNBRG00000010420)	dpp7 (ENSNBRG00000010388)	noxa1 (ENSNBRG00000010365)	ENSNBRG00000010330	ENSNBRG00000010303	stxbp1b (ENSNBRG00000010196)	niban2b (ENSNBRG00000010154)
Protacanthopterygii	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183101.a.b.b.b #22
Northern pike	MODERN SPECIES	10	ENSELUG00000022847	ppap2d (ENSELUG00000022841)	tnfsf18 (ENSELUG00000022795)	tnfsf14 (ENSELUG00000022789)	tmed1a (ENSELUG00000022785)	dnm2a (ENSELUG00000022776)	qtrt1 (ENSELUG00000022711)	ENSELUG00000022671	ENSELUG00000022510	gipc1 (ENSELUG00000022496)	dnajb1a (ENSELUG00000022433)	TECR (ENSELUG00000022407)	ENSELUG00000022357	prkacaa (ENSELUG00000022350)	asf1ba (ENSELUG00000022338)	ENSELUG00000032997 #22	ENSELUG00000022300	ENSELUG00000031082	ENSELUG00000026953	ENSELUG00000022251	RRN3 (ENSELUG00000022239)	asic2 (ENSELUG00000022180)	ENSELUG00000022146	ENSELUG00000022131	asb16 (ENSELUG00000022103)	tmub2 (ENSELUG00000022078)	atxn7l3a (ENSELUG00000022068)	ubtf (ENSELUG00000022011)	slc4a1a (ENSELUG00000021990)	selenow2a (ENSELUG00000021964)	MIEN1 (ENSELUG00000021956)
Otomorpha	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183101.a.b.b.b #22
Otophysi	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183101.a.b.b.b #22
Characiphysae	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00940000164486.f	ENSGT01030000237053	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a.f.d	ENSGT00940000158445.f	ENSGT00940000155764.A.a	ENSGT00530000063679.B	ENSGT00940000166551.d	ENSGT00940000166524	ENSGT00970000193390.c.b.b.b.a	ENSGT00390000003420.a.a	ENSGT00940000164566.b	ENSGT00950000182886.a.a.b.t	ENSGT00530000063936.a.b	ENSGT00940000163111.a.a	ENSGT00390000004692.d.a.n	ENSGT00950000183101.a.b.b.b #22	ENSGT01030000234583.a.a.c.a.b.a.a	ENSGT00940000165036.a	ENSGT00940000154394.b.a.a.b.a.a.b	ENSGT00970000193390.c.b.b.a	ENSGT00940000156783.l	ENSGT00390000000190	ENSGT00390000010750.b	ENSGT00940000158297	ENSGT00940000164791.a.a	ENSGT00940000166596	ENSGT00940000167682	ENSGT00390000011216	ENSGT00940000165021.a	ENSGT00940000158217.a.a.h	ENSGT00730000111327
Channel catfish	MODERN SPECIES	16	ENSIPUG00000008294	ppap2d (ENSIPUG00000008277)	ENSIPUG00000008258	tnfsf14 (ENSIPUG00000008253)	dnm2 (ENSIPUG00000008156)	qtrt1 (ENSIPUG00000008090)	ENSIPUG00000007843	ENSIPUG00000007784	Gipc1 (ENSIPUG00000007766)	dnajb1a (ENSIPUG00000007751)	ENSIPUG00000007744	TECR (ENSIPUG00000007700)	ENSIPUG00000007676	prkacaa (ENSIPUG00000007588)	asf1ba (ENSIPUG00000007531)	ENSIPUG00000007521 #22	ENSIPUG00000007491	ENSIPUG00000007472	gcgr (ENSIPUG00000007429)	Mrpl12 (ENSIPUG00000007392)	hgs (ENSIPUG00000007313)	CLDN6 (ENSIPUG00000007299)	btr02 (ENSIPUG00000007245)	ENSIPUG00000007290	ENSIPUG00000007214	ENSIPUG00000007208	rsad1 (ENSIPUG00000007167)	ENSIPUG00000007097	arl16 (ENSIPUG00000007077)	ENSIPUG00000006877	ptger1c (ENSIPUG00000006841)
Characiphysae_b	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT01030000237053	ENSGT00940000176155.g	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a.f.d	ENSGT00940000158445.f	ENSGT00940000155764.A.a	ENSGT00530000063679.B	ENSGT00940000166551.d	ENSGT00940000166524	ENSGT00970000193390.c.b.b.b.a	ENSGT00390000003420.a.a	ENSGT00940000164566.b	ENSGT00950000182886.a.a.b.t	ENSGT00530000063936.a.b	ENSGT00940000163111.a.a	ENSGT00390000004692.d.a.n	ENSGT00950000183101.a.b.b.b #22	ENSGT00940000154394.b.a.a.b.a.a.b	ENSGT00970000193390.c.b.b.a	ENSGT00940000165036.a	ENSGT00940000156783.l	ENSGT00390000000190	ENSGT00390000010750.b	ENSGT00940000158297	ENSGT00940000164791.a.a	ENSGT00940000166596	ENSGT00940000167682	ENSGT00390000011216	ENSGT00940000165021.a	ENSGT00940000158217.a.a.h	ENSGT00940000167007	ENSGT00940000155095.i.b.b.u
Characoidei	ANCESTRAL SPECIES	33	ENSGT01030000237053	ENSGT00940000176155.g	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a.f.d	ENSGT00940000158445.f	ENSGT00940000155764.A.a	ENSGT00530000063679.B	ENSGT00940000166551.d	ENSGT00940000166524	ENSGT00970000193390.c.b.b.b.a	ENSGT00390000003420.a.a	ENSGT00940000164566.b	ENSGT00950000182886.a.a.b.t	ENSGT00530000063936.a.b	ENSGT00940000163111.a.a	ENSGT00390000004692.d.a.n	ENSGT00950000183101.a.b.b.b #22	ENSGT00940000154394.b.a.a.b.a.a.b	ENSGT00970000193390.c.b.b.a	ENSGT00940000165036.a	ENSGT00940000156783.l	ENSGT00390000000190	ENSGT00390000010750.b	ENSGT00940000158297	ENSGT00940000164791.a.a	ENSGT00940000166596	ENSGT00940000167682	ENSGT00390000011216	ENSGT00940000158217.a.a.h	ENSGT00940000167007	ENSGT00940000155095.i.b.b.u	ENSGT00940000160578
Red-bellied piranha	MODERN SPECIES	1912																ENSPNAG00000009956 #22	ENSPNAG00000009940 #22	ENSPNAG00000009935 #23
Mexicana tetra	MODERN SPECIES	99	ppap2d (ENSAMXG00000016674)	ENSAMXG00000030185	ENSAMXG00000034440	tmed1a (ENSAMXG00000030718)	dnm2a (ENSAMXG00000037846)	qtrt1 (ENSAMXG00000030233)	ENSAMXG00000033780	ENSAMXG00000041011	zgc:92161 (ENSAMXG00000017069)	gipc1 (ENSAMXG00000017092)	dnajb1a (ENSAMXG00000037130)	TECR (ENSAMXG00000017137)	ENSAMXG00000043634	prkacaa (ENSAMXG00000017190)	asf1ba (ENSAMXG00000017225)	ENSAMXG00000025837 #22	ENSAMXG00000036690	ENSAMXG00000031400	ENSAMXG00000037851	SLC25A10 (ENSAMXG00000017328)	mrpl12 (ENSAMXG00000032543)	zgc:103625 (ENSAMXG00000032843)	hgs (ENSAMXG00000035257)	btr02 (ENSAMXG00000037899)	ENSAMXG00000032380	ENSAMXG00000035141	rsad1 (ENSAMXG00000038257)	EPN3 (ENSAMXG00000036366)	ENSAMXG00000035138	ARL16 (ENSAMXG00000030575)	ENSAMXG00000017450