Chordata	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183101 #22
Vertebrata	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183101 #22
Gnathostomata	DUPLICATION
Gnathostomata	DUPLICATION
Gnathostomata	DUPLICATION
Gnathostomata	ANCESTRAL SPECIES	596													ENSGT00940000157685	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT01060000252408	ENSGT00940000156261 #23
Euteleostomi	ANCESTRAL SPECIES	70	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000168178	ENSGT00390000010743.b	ENSGT00910000145076	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000013765	ENSGT00940000156868	ENSGT00390000018089	ENSGT00390000008938	ENSGT00950000182969.A	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419
Sarcopterygii	ANCESTRAL SPECIES	71	ENSGT00940000159569	ENSGT00390000010743.b	ENSGT00910000145076	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000013765	ENSGT00940000156868	ENSGT00390000018089	ENSGT00390000008938	ENSGT00950000182969.A	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT01060000248575.C	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000172233	ENSGT00390000016384	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961
Tetrapoda	ANCESTRAL SPECIES	58	ENSGT00940000159569	ENSGT00390000010743.b	ENSGT00910000145076	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000013765	ENSGT00940000156868	ENSGT00390000018089	ENSGT00390000008938	ENSGT00950000182969.A	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT01060000248575.C	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000172233	ENSGT00390000016384	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961
Amniota	ANCESTRAL SPECIES	27	ENSGT00940000164999	ENSGT00390000008938	ENSGT00390000018089	ENSGT00940000156868	ENSGT00390000013765	ENSGT00390000005084	ENSGT00910000145076	ENSGT00390000010743.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000172233	ENSGT00390000016384	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
Mammalia	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00940000164999	ENSGT00390000008938	ENSGT00390000018089	ENSGT00940000156868	ENSGT00390000013765	ENSGT00390000005084	ENSGT00910000145076	ENSGT00390000010743.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000172233	ENSGT00390000016384	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
Theria	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00940000163103	ENSGT00940000162508	ENSGT00930000151076	ENSGT00940000161916	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
Eutheria	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00390000010743.b	ENSGT00940000164453	ENSGT00940000163223	ENSGT00940000161916	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
Boreoeutheria	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00900000141254	ENSGT00940000164453	ENSGT00940000163223	ENSGT00940000161916	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
Euarchontoglires	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00900000141254	ENSGT00940000164453	ENSGT00940000163223	ENSGT00940000161916	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
Euarchontoglires_A	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00930000151076	ENSGT00900000141254	ENSGT00940000163223	ENSGT00940000161916	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
Glires	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00900000141254	ENSGT00940000163223	ENSGT00940000161916	ENSGT00940000165463	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
Lagomorpha	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00730000111617	ENSGT00940000165929	ENSGT00940000163649	ENSGT00900000141254	ENSGT00940000163223	ENSGT00940000161916	ENSGT00940000165463	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
Pika	MODERN SPECIES	2066																CRB2 (ENSOPRG00000008501) #22	DENND1A (ENSOPRG00000008524) #23	ENSOPRG00000008555 #24
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Rodentia_B	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00730000111617	ENSGT00940000163649	ENSGT00930000151076	ENSGT00900000141254	ENSGT00940000161916	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.f	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763	ENSGT00940000154787
Myomorpha	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00730000111617	ENSGT00940000163649	ENSGT00930000151076	ENSGT00900000141254	ENSGT00940000161916	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.f	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763	ENSGT00940000154787
Muroidea	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00730000111617	ENSGT00940000163649	ENSGT00930000151076	ENSGT00900000141254	ENSGT00940000161916	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.f	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763	ENSGT00940000154787
Muroidea_A	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00730000111617	ENSGT00940000163649	ENSGT00930000151076	ENSGT00900000141254	ENSGT00940000161916	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.f.e.a	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961
Cricetidae	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00730000111617	ENSGT00940000163649	ENSGT00930000151076	ENSGT00900000141254	ENSGT00940000161916	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.f.e.a	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961
Cricetidae_B	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00730000111617	ENSGT00940000163649	ENSGT00930000151076	ENSGT00900000141254	ENSGT00940000161916	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.f.e.a	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961
Northern American deer mouse	MODERN SPECIES	17	Or1l8 (ENSPEMG00000009607)	Or1ak2 (ENSPEMG00000024654)	Or1q1 (ENSPEMG00000018345)	ENSPEMG00000005435	Or1b1 (ENSPEMG00000001255)	ENSPEMG00000003122	Or1af1 (ENSPEMG00000024284)	ENSPEMG00000024732	Or5c1 (ENSPEMG00000009385)	Pdcl (ENSPEMG00000031426)	Rc3h2 (ENSPEMG00000023441)	Zbtb6 (ENSPEMG00000031005)	ENSPEMG00000029320	Rabgap1 (ENSPEMG00000022679)	Strbp (ENSPEMG00000022984)	Crb2 (ENSPEMG00000023678) #22	Dennd1a (ENSPEMG00000001409) #23	Lhx2 (ENSPEMG00000023994) #24	Nek6 (ENSPEMG00000023305)	Psmb7 (ENSPEMG00000011436)	Nr5a1 (ENSPEMG00000018185)	Nr6a1 (ENSPEMG00000021698)	Olfml2a (ENSPEMG00000029944)	Wdr38 (ENSPEMG00000010623)	ENSPEMG00000021500	Arpc5l (ENSPEMG00000022681)	Golga1 (ENSPEMG00000014526)	Scai (ENSPEMG00000017936)	Ppp6c (ENSPEMG00000013119)
Prairie vole	MODERN SPECIES	12	Nrp1 (ENSMOCG00000002681)	Itgb1 (ENSMOCG00000019200)	ENSMOCG00000014584	ENSMOCG00000020281	ENSMOCG00000009744	Ccny (ENSMOCG00000022281)	Gjd4 (ENSMOCG00000004130)	Fzd8 (ENSMOCG00000010067)	Pdcl (ENSMOCG00000005925)	Rc3h2 (ENSMOCG00000009592)	Zbtb6 (ENSMOCG00000003885)	Zbtb26 (ENSMOCG00000005785)	Rabgap1 (ENSMOCG00000015881)	Gpr21 (ENSMOCG00000019492)	Strbp (ENSMOCG00000022231)	Crb2 (ENSMOCG00000017592) #22	ENSMOCG00000020847 #23	ENSMOCG00000005120 #23	Lhx2 (ENSMOCG00000018166) #24	Nek6 (ENSMOCG00000020840)	ENSMOCG00000019583	Nr5a1 (ENSMOCG00000022516)	ENSMOCG00000000723	Nr6a1 (ENSMOCG00000013647)	Olfml2a (ENSMOCG00000006167)	Wdr38 (ENSMOCG00000016384)	ENSMOCG00000010619	Arpc5l (ENSMOCG00000012044)	Golga1 (ENSMOCG00000001056)	Scai (ENSMOCG00000021543)	Ppp6c (ENSMOCG00000002091)
Cricetinae	ANCESTRAL SPECIES	57						ENSGT00940000161916	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.f.e.b	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961
Chinese hamster chok1gshd	MODERN SPECIES	318				ENSCGRG00001013979	ENSCGRG00001013906	Or1af1 (ENSCGRG00001013629)	ENSCGRG00001013584	ENSCGRG00001010875	Or5c1 (ENSCGRG00001013818)	Pdcl (ENSCGRG00001010795)	Rc3h2 (ENSCGRG00001010006)	ENSCGRG00001013848	Zbtb26 (ENSCGRG00001009545)	Rabgap1 (ENSCGRG00001008620)	Strbp (ENSCGRG00001006354)	Crb2 (ENSCGRG00001004582) #22	ENSCGRG00001004172	ENSCGRG00001013652	Dennd1a (ENSCGRG00001003432) #23	Lhx2 (ENSCGRG00001001336) #24	Nek6 (ENSCGRG00001000656)	Psmb7 (ENSCGRG00001020058)	Nr5a1 (ENSCGRG00001017535)	Nr6a1 (ENSCGRG00001017242)	Olfml2a (ENSCGRG00001016979)	Wdr38 (ENSCGRG00001016663)	ENSCGRG00001016006	Arpc5l (ENSCGRG00001015810)	Golga1 (ENSCGRG00001013164)	Scai (ENSCGRG00001011822)	Ttll11 (ENSCGRG00001010972)
Golden Hamster	MODERN SPECIES	739	Mrrf (ENSMAUG00000003771)	Ptgs1 (ENSMAUG00000006589)	ENSMAUG00000016503	Or1j19 (ENSMAUG00000006683)	Or1j21 (ENSMAUG00000019019)	Or1j4 (ENSMAUG00000016620)	Or1n2 (ENSMAUG00000005622)	Or1l8 (ENSMAUG00000006811)	Or5c1 (ENSMAUG00000006357)	Pdcl (ENSMAUG00000002651)	Rc3h2 (ENSMAUG00000003117)	Zbtb6 (ENSMAUG00000000804)	Zbtb26 (ENSMAUG00000001114)	Rabgap1 (ENSMAUG00000014606)	Strbp (ENSMAUG00000016102)	Crb2 (ENSMAUG00000017538) #22	ENSMAUG00000015217 #23	ENSMAUG00000016980 #23	Lhx2 (ENSMAUG00000000473) #24	Nek6 (ENSMAUG00000014034)	Psmb7 (ENSMAUG00000009541)	Nr5a1 (ENSMAUG00000011097)	Nr6a1 (ENSMAUG00000020320)	Olfml2a (ENSMAUG00000014419)	Wdr38 (ENSMAUG00000005054)	ENSMAUG00000001728	Arpc5l (ENSMAUG00000020262)	Golga1 (ENSMAUG00000017375)	Scai (ENSMAUG00000016374)	Ppp6c (ENSMAUG00000019280)	ENSMAUG00000021988
Murinae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000163451.b	ENSGT00940000163103	ENSGT00940000162739	ENSGT00730000111617	ENSGT00940000163649	ENSGT00930000151076.a	ENSGT00940000163456	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.f.e.a	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000157521.b	ENSGT00390000008033
Mus	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000163649	ENSGT00930000151076.a	ENSGT00930000151076.b.a	ENSGT00930000151076.b.b	ENSGT00900000141254	ENSGT00940000161916	ENSGT00940000163938	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.f.e.a	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000157521.b	ENSGT00390000008033
Mus_A	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00930000151076.a	ENSGT00930000151076.b.a	ENSGT00930000151076.b.b	ENSGT00900000141254	ENSGT00940000161916.i	ENSGT00940000161916.j	ENSGT00940000163938	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.f.e.a	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000157521.b	ENSGT00390000008033
Mus_B	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00930000151076.a	ENSGT00930000151076.b.a	ENSGT00930000151076.b.b	ENSGT00900000141254	ENSGT00940000161916.i	ENSGT00940000161916.j	ENSGT00940000163938	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.f.e.a	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000157521.b	ENSGT00390000008033
Mus_C	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00930000151076.a	ENSGT00930000151076.b.a	ENSGT00930000151076.b.b	ENSGT00900000141254	ENSGT00940000161916.i	ENSGT00940000161916.j	ENSGT00940000163938	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.f.e.a	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00390000012037.x	ENSGT00940000157521.b
spretus	MODERN SPECIES	11	Or12k5 (MGP_SPRETEiJ_G0024427)	Or12k7 (MGP_SPRETEiJ_G0024428)	Or12k8 (MGP_SPRETEiJ_G0024429)	Or1b1 (MGP_SPRETEiJ_G0024430)	Or1l4 (MGP_SPRETEiJ_G0024431)	Or1l4b (MGP_SPRETEiJ_G0024432)	Or1af1 (MGP_SPRETEiJ_G0024433)	Or5c1 (MGP_SPRETEiJ_G0024434)	Pdcl (MGP_SPRETEiJ_G0024435)	Rc3h2 (MGP_SPRETEiJ_G0024436)	Zbtb6 (MGP_SPRETEiJ_G0024437)	Zbtb26 (MGP_SPRETEiJ_G0024438)	Rabgap1 (MGP_SPRETEiJ_G0024439)	MGP_SPRETEiJ_G0024440	Gpr21 (MGP_SPRETEiJ_G0024441)	Crb2 (MGP_SPRETEiJ_G0024442) #22	Dennd1a (MGP_SPRETEiJ_G0024443) #23	Lhx2 (MGP_SPRETEiJ_G0024444) #24	Nek6 (MGP_SPRETEiJ_G0024445)	Psmb7 (MGP_SPRETEiJ_G0024446)	Nr5a1 (MGP_SPRETEiJ_G0024447)	Nr6a1 (MGP_SPRETEiJ_G0024448)	Olfml2a (MGP_SPRETEiJ_G0024449)	Wdr38 (MGP_SPRETEiJ_G0024450)	MGP_SPRETEiJ_G0024451	Arpc5l (MGP_SPRETEiJ_G0024452)	Golga1 (MGP_SPRETEiJ_G0024453)	Scai (MGP_SPRETEiJ_G0024454)	Ppp6c (MGP_SPRETEiJ_G0024455)	MGP_SPRETEiJ_G0024456	Lrp1b (MGP_SPRETEiJ_G0024457)
Steppe mouse	MODERN SPECIES	3157	Or1q1 (ENSMSIG00000001324)	Or12k5 (ENSMSIG00000001316)	Or12k7 (ENSMSIG00000001300)	Or1b1 (ENSMSIG00000001286)	Or1l4b (ENSMSIG00000001264)	Or1l4 (ENSMSIG00000001248)	ENSMSIG00000001220	Or1af1 (ENSMSIG00000001213)	Or5c1 (ENSMSIG00000001203)	Pdcl (ENSMSIG00000001175)	Rc3h2 (ENSMSIG00000001099)	Zbtb6 (ENSMSIG00000001048)	Zbtb26 (ENSMSIG00000001038)	Rabgap1 (ENSMSIG00000000948)	Strbp (ENSMSIG00000000857)	Crb2 (ENSMSIG00000000810) #22	Dennd1a (ENSMSIG00000000638) #23	Lhx2 (ENSMSIG00000000576) #24	Nek6 (ENSMSIG00000000470)	Psmb7 (ENSMSIG00000000365)	Nr5a1 (ENSMSIG00000000273)	Nr6a1 (ENSMSIG00000000135)	Olfml2a (ENSMSIG00000026578)	Wdr38 (ENSMSIG00000026555)	ENSMSIG00000026549	Arpc5l (ENSMSIG00000026537)	Golga1 (ENSMSIG00000026434)	Scai (ENSMSIG00000026395)	Ppp6c (ENSMSIG00000026363)
Mouse	MODERN SPECIES	11	Or12k5 (ENSMUSG00000075379)	Or12k7 (ENSMUSG00000083361)	Or12k8 (ENSMUSG00000075378)	Or1b1 (ENSMUSG00000075377)	Or1l4b (ENSMUSG00000078198)	Or1l4 (ENSMUSG00000059429)	Or1af1 (ENSMUSG00000068947)	Or5c1 (ENSMUSG00000049018)	Pdcl (ENSMUSG00000009030)	Rc3h2 (ENSMUSG00000075376)	Zbtb6 (ENSMUSG00000066798)	Zbtb26 (ENSMUSG00000050714)	Rabgap1 (ENSMUSG00000035437)	Strbp (ENSMUSG00000026915)	Gpr21 (ENSMUSG00000053164)	Crb2 (ENSMUSG00000035403) #22	Dennd1a (ENSMUSG00000035392) #23	Lhx2 (ENSMUSG00000000247) #24	Nek6 (ENSMUSG00000026749)	Psmb7 (ENSMUSG00000026750)	Nr5a1 (ENSMUSG00000026751)	Nr6a1 (ENSMUSG00000063972)	Olfml2a (ENSMUSG00000046618)	Wdr38 (ENSMUSG00000035295)	Rpl35 (ENSMUSG00000062997)	Arpc5l (ENSMUSG00000026755)	Golga1 (ENSMUSG00000026754)	Scai (ENSMUSG00000035236)	Ppp6c (ENSMUSG00000026753)	Lrp1b (ENSMUSG00000049252)	Kynu (ENSMUSG00000026866)
Ryukyu mouse	MODERN SPECIES	11	Or12k5 (MGP_CAROLIEiJ_G0023507)	Or12k7 (MGP_CAROLIEiJ_G0023508)	Or12k8 (MGP_CAROLIEiJ_G0023509)	Or1b1 (MGP_CAROLIEiJ_G0023510)	Or1l4b (MGP_CAROLIEiJ_G0023511)	Or1l4 (MGP_CAROLIEiJ_G0023512)	Or1af1 (MGP_CAROLIEiJ_G0023513)	Or5c1 (MGP_CAROLIEiJ_G0023514)	Pdcl (MGP_CAROLIEiJ_G0023515)	Rc3h2 (MGP_CAROLIEiJ_G0023516)	Zbtb6 (MGP_CAROLIEiJ_G0023517)	Zbtb26 (MGP_CAROLIEiJ_G0023518)	Rabgap1 (MGP_CAROLIEiJ_G0023519)	Strbp (MGP_CAROLIEiJ_G0023520)	Gpr21 (MGP_CAROLIEiJ_G0023521)	Crb2 (MGP_CAROLIEiJ_G0023522) #22	Dennd1a (MGP_CAROLIEiJ_G0023523) #23	Lhx2 (MGP_CAROLIEiJ_G0023524) #24	Nek6 (MGP_CAROLIEiJ_G0023525)	Psmb7 (MGP_CAROLIEiJ_G0023526)	Nr5a1 (MGP_CAROLIEiJ_G0023527)	Nr6a1 (MGP_CAROLIEiJ_G0023528)	Olfml2a (MGP_CAROLIEiJ_G0023529)	Wdr38 (MGP_CAROLIEiJ_G0023530)	MGP_CAROLIEiJ_G0023531	Arpc5l (MGP_CAROLIEiJ_G0023532)	Golga1 (MGP_CAROLIEiJ_G0023533)	Scai (MGP_CAROLIEiJ_G0023534)	Ppp6c (MGP_CAROLIEiJ_G0023535)	MGP_CAROLIEiJ_G0023536	Lrp1b (MGP_CAROLIEiJ_G0023537)
Shrew mouse	MODERN SPECIES	16	Or1ak2 (MGP_PahariEiJ_G0024960)	Or1q1 (MGP_PahariEiJ_G0024961)	Or12k5 (MGP_PahariEiJ_G0024962)	Or12k7 (MGP_PahariEiJ_G0024963)	Or12k8 (MGP_PahariEiJ_G0024964)	MGP_PahariEiJ_G0024965	Or1af1 (MGP_PahariEiJ_G0024966)	Or5c1 (MGP_PahariEiJ_G0024967)	Pdcl (MGP_PahariEiJ_G0024968)	Rc3h2 (MGP_PahariEiJ_G0024969)	Zbtb6 (MGP_PahariEiJ_G0024970)	Zbtb26 (MGP_PahariEiJ_G0024971)	Rabgap1 (MGP_PahariEiJ_G0024972)	Strbp (MGP_PahariEiJ_G0024973)	Gpr21 (MGP_PahariEiJ_G0024974)	Crb2 (MGP_PahariEiJ_G0024975) #22	Dennd1a (MGP_PahariEiJ_G0024976) #23	Lhx2 (MGP_PahariEiJ_G0024977) #24	Nek6 (MGP_PahariEiJ_G0024978)	Psmb7 (MGP_PahariEiJ_G0024979)	Nr5a1 (MGP_PahariEiJ_G0024980)	Nr6a1 (MGP_PahariEiJ_G0024981)	Olfml2a (MGP_PahariEiJ_G0024982)	MGP_PahariEiJ_G0024983	Arpc5l (MGP_PahariEiJ_G0024984)	Golga1 (MGP_PahariEiJ_G0024985)	Scai (MGP_PahariEiJ_G0024986)	Ppp6c (MGP_PahariEiJ_G0024987)	Lrp1b (MGP_PahariEiJ_G0024988)	Kynu (MGP_PahariEiJ_G0024989)	Arhgap15 (MGP_PahariEiJ_G0024990)
Rat	MODERN SPECIES	13	ENSRNOG00000065620	ENSRNOG00000068416	Elob-ps13 (ENSRNOG00000046568)	ENSRNOG00000066103	ENSRNOG00000069411	LOC100911251 (ENSRNOG00000062482)	ENSRNOG00000067722	Pdcl (ENSRNOG00000008484)	Rc3h2 (ENSRNOG00000009196)	Zbtb6 (ENSRNOG00000009340)	Zbtb26 (ENSRNOG00000009346)	Rabgap1 (ENSRNOG00000009402)	Gpr21 (ENSRNOG00000042269)	Strbp (ENSRNOG00000010150)	RGD1561137 (ENSRNOG00000030143)	Crb2 (ENSRNOG00000025498) #22	Dennd1a (ENSRNOG00000010526) #23	Lhx2 (ENSRNOG00000010551) #24	Nek6 (ENSRNOG00000010897)	Psmb7 (ENSRNOG00000011732)	ENSRNOG00000066446	Rps20 (ENSRNOG00000029627)	Nr5a1 (ENSRNOG00000012682)	Nr6a1 (ENSRNOG00000013232)	Olfml2a (ENSRNOG00000014034)	Wdr38 (ENSRNOG00000014102)	Rpl35 (ENSRNOG00000014272)	Arpc5l (ENSRNOG00000014317)	Golga1 (ENSRNOG00000014493)	Scai (ENSRNOG00000025278)	Ppp6c (ENSRNOG00000015145)
Upper Galilee mountains blind mole rat	MODERN SPECIES	513	ENSNGAG00000016244	Or1j4 (ENSNGAG00000019324)	ENSNGAG00000014893	ENSNGAG00000017161	ENSNGAG00000019594	ENSNGAG00000020457	ENSNGAG00000011280	Or5c1 (ENSNGAG00000015367)	Pdcl (ENSNGAG00000005582)	ENSNGAG00000009763	Zbtb6 (ENSNGAG00000021046)	Zbtb26 (ENSNGAG00000001562)	Rabgap1 (ENSNGAG00000017183)	Gpr21 (ENSNGAG00000009678)	Strbp (ENSNGAG00000014638)	Crb2 (ENSNGAG00000004692) #22	ENSNGAG00000011495 #23	ENSNGAG00000003822 #23	Lhx2 (ENSNGAG00000013721) #24	Nek6 (ENSNGAG00000017493)	Psmb7 (ENSNGAG00000016549)	Nr5a1 (ENSNGAG00000018329)	Nr6a1 (ENSNGAG00000019760)	Olfml2a (ENSNGAG00000006763)	ENSNGAG00000016210	ENSNGAG00000012132	Arpc5l (ENSNGAG00000004816)	Golga1 (ENSNGAG00000017928)	Scai (ENSNGAG00000009532)	ENSNGAG00000000167	Rabepk (ENSNGAG00000009850)
Lesser Egyptian jerboa	MODERN SPECIES	94	Or1j21 (ENSJJAG00000007756)	Or1j4 (ENSJJAG00000016748)	Or1j1 (ENSJJAG00000004843)	Or1l8 (ENSJJAG00000009930)	ENSJJAG00000002221	Or1q1 (ENSJJAG00000007797)	ENSJJAG00000011225	ENSJJAG00000024210	Pdcl (ENSJJAG00000011208)	Rc3h2 (ENSJJAG00000022376)	Zbtb6 (ENSJJAG00000007276)	ENSJJAG00000002859	Rabgap1 (ENSJJAG00000014056)	Gpr21 (ENSJJAG00000010982)	Strbp (ENSJJAG00000008449)	Crb2 (ENSJJAG00000019604) #22	ENSJJAG00000018640 #23	Lhx2 (ENSJJAG00000015440) #24	Nek6 (ENSJJAG00000015974)	ENSJJAG00000020212	Nr5a1 (ENSJJAG00000023318)	Nr6a1 (ENSJJAG00000016130)	Olfml2a (ENSJJAG00000017354)	Wdr38 (ENSJJAG00000008331)	ENSJJAG00000014897	Arpc5l (ENSJJAG00000013733)	Golga1 (ENSJJAG00000024183)	Scai (ENSJJAG00000020518)	ENSJJAG00000000698	ENSJJAG00000011633	Rabepk (ENSJJAG00000023084)
Kangaroo rat	MODERN SPECIES	374							ENSDORG00000029300	Or5c1 (ENSDORG00000025218)	Pdcl (ENSDORG00000029509)	Rc3h2 (ENSDORG00000006398)	Zbtb6 (ENSDORG00000025398)	Zbtb26 (ENSDORG00000006402)	Rabgap1 (ENSDORG00000012123)	Gpr21 (ENSDORG00000012136)	ENSDORG00000012137	Crb2 (ENSDORG00000002814) #22	Dennd1a (ENSDORG00000002817) #23	Lhx2 (ENSDORG00000025403) #24	ENSDORG00000025549	Nek6 (ENSDORG00000014518)	Psmb7 (ENSDORG00000014519)	Nr5a1 (ENSDORG00000028222)	Nr6a1 (ENSDORG00000013606)	Olfml2a (ENSDORG00000013607)	Wdr38 (ENSDORG00000012116)	ENSDORG00000012125	Arpc5l (ENSDORG00000027899)	Golga1 (ENSDORG00000012132)	Scai (ENSDORG00000012138)	ENSDORG00000028487	Rabepk (ENSDORG00000014417)
Rodentia_A	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000163451	ENSGT00930000151076	ENSGT00900000141254	ENSGT00940000161916	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.f	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
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Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000154381.i.a.b.a.a.b.a.a	ENSGT00930000151076	ENSGT00900000141254	ENSGT00940000161916	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990.j	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.f	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000154381.i.a.b.a.a.b.a.a	ENSGT00930000151076	ENSGT00900000141254	ENSGT00940000161916	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990.j	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.f	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	44	ENSUPAG00010012605	ENSUPAG00010012608	OR1B1 (ENSUPAG00010012614)	ENSUPAG00010012616	ENSUPAG00010012618	ENSUPAG00010012623	ENSUPAG00010012631	OR5C1 (ENSUPAG00010012749)	OR1K1 (ENSUPAG00010012753)	PDCL (ENSUPAG00010012754)	RC3H2 (ENSUPAG00010012762)	ZBTB6 (ENSUPAG00010012844)	ZBTB26 (ENSUPAG00010012848)	RABGAP1 (ENSUPAG00010012857)	STRBP (ENSUPAG00010012985)	CRB2 (ENSUPAG00010013102) #22	DENND1A (ENSUPAG00010013123) #23	LHX2 (ENSUPAG00010013245) #24	NEK6 (ENSUPAG00010013255)	PSMB7 (ENSUPAG00010013273)	ADGRD2 (ENSUPAG00010013284)	NR5A1 (ENSUPAG00010013310)	NR6A1 (ENSUPAG00010013329)	OLFML2A (ENSUPAG00010013389)	RPL35 (ENSUPAG00010013420)	WDR38 (ENSUPAG00010013438)	ARPC5L (ENSUPAG00010013460)	GOLGA1 (ENSUPAG00010013479)	SCAI (ENSUPAG00010013570)	PPP6C (ENSUPAG00010013600)	RABEPK (ENSUPAG00010013628)
Squirrel	MODERN SPECIES	87	ENSSTOG00000023654	ENSSTOG00000020170	OR1B1 (ENSSTOG00000027976)	ENSSTOG00000029710	ENSSTOG00000029733	ENSSTOG00000010646	ENSSTOG00000020056	ENSSTOG00000012187	OR1K1 (ENSSTOG00000010649)	PDCL (ENSSTOG00000010651)	RC3H2 (ENSSTOG00000010655)	ZBTB26 (ENSSTOG00000004739)	RABGAP1 (ENSSTOG00000004750)	GPR21 (ENSSTOG00000030817)	STRBP (ENSSTOG00000004790)	CRB2 (ENSSTOG00000021477) #22	DENND1A (ENSSTOG00000023765) #23	LHX2 (ENSSTOG00000000794) #24	NEK6 (ENSSTOG00000013817)	PSMB7 (ENSSTOG00000013826)	NR5A1 (ENSSTOG00000000396)	NR6A1 (ENSSTOG00000022764)	OLFML2A (ENSSTOG00000007852)	WDR38 (ENSSTOG00000007867)	RPL35 (ENSSTOG00000007901)	ARPC5L (ENSSTOG00000007907)	GOLGA1 (ENSSTOG00000007917)	SCAI (ENSSTOG00000007948)	PPP6C (ENSSTOG00000007971)	RABEPK (ENSSTOG00000011234)	Hspa5 (ENSSTOG00000011243)
Alpin marmot	MODERN SPECIES	47	ENSMMMG00000018559	OR1Q1 (ENSMMMG00000018554)	ENSMMMG00000018552	ENSMMMG00000018548	OR1B1 (ENSMMMG00000018546)	ENSMMMG00000018540	ENSMMMG00000018538	OR5C1 (ENSMMMG00000018535)	OR1K1 (ENSMMMG00000018530)	PDCL (ENSMMMG00000018517)	RC3H2 (ENSMMMG00000018470)	ZBTB6 (ENSMMMG00000018466)	ZBTB26 (ENSMMMG00000018454)	RABGAP1 (ENSMMMG00000018398)	STRBP (ENSMMMG00000018353)	CRB2 (ENSMMMG00000018308) #22	ENSMMMG00000018296	DENND1A (ENSMMMG00000018266) #23	ENSMMMG00000018209 #24	NEK6 (ENSMMMG00000018189)	PSMB7 (ENSMMMG00000018175)	NR5A1 (ENSMMMG00000018155)	NR6A1 (ENSMMMG00000018148)	OLFML2A (ENSMMMG00000018107)	WDR38 (ENSMMMG00000018077)	RPL35 (ENSMMMG00000018074)	ARPC5L (ENSMMMG00000018071)	GOLGA1 (ENSMMMG00000018029)	ENSMMMG00000018021	SCAI (ENSMMMG00000017999)	PPP6C (ENSMMMG00000017971)
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	6	ENSSVLG00005020049	ENSSVLG00005020070	OR1L3 (ENSSVLG00005020158)	ENSSVLG00005020173	ENSSVLG00005020189	ENSSVLG00005020203	ENSSVLG00005020225	OR5C1 (ENSSVLG00005020239)	OR1K1 (ENSSVLG00005020263)	PDCL (ENSSVLG00005020286)	RC3H2 (ENSSVLG00005020372)	ZBTB6 (ENSSVLG00005020741)	ZBTB26 (ENSSVLG00005020757)	RABGAP1 (ENSSVLG00005020789)	STRBP (ENSSVLG00005021011)	CRB2 (ENSSVLG00005021075) #22	DENND1A (ENSSVLG00005021227) #23	ENSSVLG00005021279	LHX2 (ENSSVLG00005021337) #24	NEK6 (ENSSVLG00005021363)	PSMB7 (ENSSVLG00005021459)	ADGRD2 (ENSSVLG00005021497)	NR5A1 (ENSSVLG00005021643)	NR6A1 (ENSSVLG00005021745)	ENSSVLG00005022017	OLFML2A (ENSSVLG00005022068)	WDR38 (ENSSVLG00005022161)	RPL35 (ENSSVLG00005022293)	ARPC5L (ENSSVLG00005022345)	GOLGA1 (ENSSVLG00005022372)	SCAI (ENSSVLG00005022411)
Hystricomorpha	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000163103	ENSGT00940000162739	ENSGT00730000111617	ENSGT00940000163223	ENSGT00940000161916	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B.c	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00390000016384.f.e.a	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763	ENSGT00940000154787
Naked mole-rat female	MODERN SPECIES	3	ENSHGLG00000039540	ENSHGLG00000010749	OR1L3 (ENSHGLG00000020769)	ENSHGLG00000020733	ENSHGLG00000020543	ENSHGLG00000020650	OR5C1 (ENSHGLG00000018024)	PDCL (ENSHGLG00000038582)	ENSHGLG00000020904	RC3H2 (ENSHGLG00000012014)	ZBTB6 (ENSHGLG00000011851)	ZBTB26 (ENSHGLG00000011691)	GPR21 (ENSHGLG00000033657)	RABGAP1 (ENSHGLG00000010853)	ENSHGLG00000014962	CRB2 (ENSHGLG00000014737) #22	DENND1A (ENSHGLG00000014439) #23	LHX2 (ENSHGLG00000014024) #24	NEK6 (ENSHGLG00000013776)	PSMB7 (ENSHGLG00000013424)	NR5A1 (ENSHGLG00000042870)	NR6A1 (ENSHGLG00000012869)	OLFML2A (ENSHGLG00000012516)	ENSHGLG00000035609	ARPC5L (ENSHGLG00000012246)	GOLGA1 (ENSHGLG00000012081)	SCAI (ENSHGLG00000011703)	PPP6C (ENSHGLG00000037108)	RABEPK (ENSHGLG00000010878)	HSPA5 (ENSHGLG00000045279)	GAPVD1 (ENSHGLG00000012368)
Hystricomorpha_a	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000162508	ENSGT00940000162739	ENSGT00940000163103	ENSGT00930000151076	ENSGT00900000141254	ENSGT00940000161916	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B.c	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00390000016384.f.e.a	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763	ENSGT00940000154787
Guinea pig	MODERN SPECIES	27	ENSCPOG00000030587	ENSCPOG00000032036	ENSCPOG00000040622	ENSCPOG00000022961	OR1B1 (ENSCPOG00000021126)	ENSCPOG00000013079	ENSCPOG00000023130	ENSCPOG00000024385	OR5C1 (ENSCPOG00000001175)	PDCL (ENSCPOG00000009509)	RC3H2 (ENSCPOG00000008511)	ZBTB6 (ENSCPOG00000039487)	ZBTB26 (ENSCPOG00000032601)	RABGAP1 (ENSCPOG00000009811)	STRBP (ENSCPOG00000009817)	CRB2 (ENSCPOG00000010074) #22	DENND1A (ENSCPOG00000014548) #23	LHX2 (ENSCPOG00000022927) #24	NEK6 (ENSCPOG00000007827)	PSMB7 (ENSCPOG00000007839)	ADGRD2 (ENSCPOG00000027184)	NR5A1 (ENSCPOG00000022305)	NR6A1 (ENSCPOG00000005970)	OLFML2A (ENSCPOG00000003516)	RPL35 (ENSCPOG00000022811)	ARPC5L (ENSCPOG00000036902)	GOLGA1 (ENSCPOG00000014706)	SCAI (ENSCPOG00000001406)	PPP6C (ENSCPOG00000004898)	RABEPK (ENSCPOG00000026070)	ENSCPOG00000012520
Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000154381.h	ENSGT00940000154381.g.a	ENSGT00940000163027	ENSGT00940000163995	ENSGT00940000162508	ENSGT00940000162739	ENSGT00940000163223	ENSGT00940000161916	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B.c	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00390000016384.f.e.a	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763	ENSGT00940000154787	ENSGT00940000156611
Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	126	OR1N2 (ENSCLAG00000017933)	ENSCLAG00000016807	ENSCLAG00000015371	ENSCLAG00000017825	ENSCLAG00000014089	OR1L3 (ENSCLAG00000017806)	ENSCLAG00000017871	ENSCLAG00000018047	ENSCLAG00000017880	PDCL (ENSCLAG00000014566)	RC3H2 (ENSCLAG00000013261)	ZBTB6 (ENSCLAG00000016422)	ZBTB26 (ENSCLAG00000016744)	RABGAP1 (ENSCLAG00000010301)	STRBP (ENSCLAG00000010826)	CRB2 (ENSCLAG00000015580) #22	DENND1A (ENSCLAG00000010455) #23	LHX2 (ENSCLAG00000010277) #24	NEK6 (ENSCLAG00000009797)	PSMB7 (ENSCLAG00000013548)	NR5A1 (ENSCLAG00000012090)	NR6A1 (ENSCLAG00000012774)	OLFML2A (ENSCLAG00000014121)	RPL35 (ENSCLAG00000013142)	ARPC5L (ENSCLAG00000009936)	GOLGA1 (ENSCLAG00000011649)	SCAI (ENSCLAG00000013682)	PPP6C (ENSCLAG00000013734)	RABEPK (ENSCLAG00000011734)	HSPA5 (ENSCLAG00000009815)	GAPVD1 (ENSCLAG00000010577)
Degu	MODERN SPECIES	179				ENSODEG00000006064	ENSODEG00000006020	ENSODEG00000006008	PDCL (ENSODEG00000005932)	ENSODEG00000005918	ZBTB6 (ENSODEG00000019273)	ZBTB26 (ENSODEG00000005887)	ENSODEG00000019228	ENSODEG00000019246	RABGAP1 (ENSODEG00000004811)	ENSODEG00000004632	ENSODEG00000019097	CRB2 (ENSODEG00000004481) #22	DENND1A (ENSODEG00000004310) #23	LHX2 (ENSODEG00000004212) #24	ENSODEG00000004179	NEK6 (ENSODEG00000004126)	ENSODEG00000019019	ENSODEG00000004257	NR5A1 (ENSODEG00000004244)	ENSODEG00000004234	NR6A1 (ENSODEG00000004183)	OLFML2A (ENSODEG00000004138)	ENSODEG00000004120	ENSODEG00000004095	GOLGA1 (ENSODEG00000003980)	SCAI (ENSODEG00000003843)	ENSODEG00000003771
Primates	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000164453	ENSGT00940000163223	ENSGT00940000165463	ENSGT00940000161916	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.i.b	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
Haplorrhini	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00390000010743.b	ENSGT00940000163649	ENSGT00900000141254	ENSGT00940000164453	ENSGT00940000163223	ENSGT00940000165463	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000167867	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.i.a	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961
Simiiformes	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000165018	ENSGT00940000163649	ENSGT00900000141254	ENSGT00940000164453	ENSGT00940000163223	ENSGT00940000165463	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000167867	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.i.a	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000005811.w.b	ENSGT00390000009566
Catarrhini	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000165018	ENSGT00940000163649	ENSGT00900000141254	ENSGT00940000164453	ENSGT00940000163223	ENSGT00940000165463	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000167867	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.i.a	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00390000005811.w.b
Hominoidea	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000165018	ENSGT00940000163649	ENSGT00900000141254	ENSGT00940000164453	ENSGT00940000163223	ENSGT00940000165463	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000167867	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.i.a	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000005811.w.b	ENSGT00390000009566
Hominidae	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000163649	ENSGT00900000141254	ENSGT00940000164453	ENSGT00940000163223	ENSGT00940000165463.i	ENSGT00940000165463.j	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.i.a	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000005811.w.b	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961
Homo/Pan/Gorilla group	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000163649	ENSGT00900000141254	ENSGT00940000164453	ENSGT00940000163223	ENSGT00940000165463.i	ENSGT00940000165463.j	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00910000148777	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.i.a	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000005811.w.b	ENSGT00390000009566
Homo/Pan group	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000163649	ENSGT00900000141254	ENSGT00940000164453	ENSGT00940000163223	ENSGT00940000165463.i	ENSGT00940000165463.j	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00910000148777	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.i.a	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961
Pan	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000163649	ENSGT00940000164453	ENSGT00940000163223	ENSGT00940000165895	ENSGT00940000165463.i	ENSGT00940000165463.j	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00860000136276	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00910000148777	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00900000141073.s	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.i.a	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566
Chimpanzee	MODERN SPECIES	22	OR1Q1 (ENSPTRG00000021332)	OR1L1 (ENSPTRG00000021333)	OR1L3 (ENSPTRG00000021334)	ENSPTRG00000042835	OR1L4 (ENSPTRG00000021335)	OR1L6 (ENSPTRG00000021336)	OR5C1 (ENSPTRG00000021337)	OR1K1 (ENSPTRG00000029108)	PDCL (ENSPTRG00000021338)	RC3H2 (ENSPTRG00000021339)	ZBTB6 (ENSPTRG00000043021)	ZBTB26 (ENSPTRG00000021341)	RABGAP1 (ENSPTRG00000021342)	ENSPTRG00000044284	STRBP (ENSPTRG00000021346)	CRB2 (ENSPTRG00000021348) #22	DENND1A (ENSPTRG00000021349) #23	ENSPTRG00000044471	LHX2 (ENSPTRG00000021351) #24	NEK6 (ENSPTRG00000021352)	PSMB7 (ENSPTRG00000021354)	ADGRD2 (ENSPTRG00000021356)	NR5A1 (ENSPTRG00000021357)	NR6A1 (ENSPTRG00000051156)	ENSPTRG00000050508	OLFML2A (ENSPTRG00000021359)	WDR38 (ENSPTRG00000021360)	RPL35 (ENSPTRG00000021361)	ARPC5L (ENSPTRG00000021362)	GOLGA1 (ENSPTRG00000021364)	SCAI (ENSPTRG00000021366)
Bonobo	MODERN SPECIES	22	OR1L8 (ENSPPAG00000000690)	OR1Q1 (ENSPPAG00000003934)	OR1L3 (ENSPPAG00000000874)	ENSPPAG00000027783	OR1L4 (ENSPPAG00000005013)	OR1L6 (ENSPPAG00000005838)	OR5C1 (ENSPPAG00000006222)	OR1K1 (ENSPPAG00000005279)	PDCL (ENSPPAG00000026211)	RC3H2 (ENSPPAG00000036013)	ZBTB6 (ENSPPAG00000026095)	ZBTB26 (ENSPPAG00000005083)	RABGAP1 (ENSPPAG00000013688)	ENSPPAG00000034339	STRBP (ENSPPAG00000000242)	CRB2 (ENSPPAG00000030633) #22	DENND1A (ENSPPAG00000038800) #23	ENSPPAG00000028123	LHX2 (ENSPPAG00000034417) #24	NEK6 (ENSPPAG00000042047)	PSMB7 (ENSPPAG00000043451)	ADGRD2 (ENSPPAG00000029184)	NR5A1 (ENSPPAG00000033832)	NR6A1 (ENSPPAG00000027363)	ENSPPAG00000042042	OLFML2A (ENSPPAG00000036204)	WDR38 (ENSPPAG00000009033)	ENSPPAG00000026463	ARPC5L (ENSPPAG00000033849)	GOLGA1 (ENSPPAG00000039343)	SCAI (ENSPPAG00000035611)
Human	MODERN SPECIES	21	OR1Q1 (ENSG00000165202)	OR1B1 (ENSG00000280094)	OR1L1 (ENSG00000173679)	OR1L3 (ENSG00000171481)	OR1L4 (ENSG00000136939)	OR1L6 (ENSG00000171459)	OR5C1 (ENSG00000148215)	PDCL (ENSG00000136940)	OR1K1 (ENSG00000165204)	RC3H2 (ENSG00000056586)	ZBTB6 (ENSG00000186130)	ZBTB26 (ENSG00000171448)	RABGAP1 (ENSG00000011454)	GPR21 (ENSG00000188394)	STRBP (ENSG00000165209)	CRB2 (ENSG00000148204) #22	DENND1A (ENSG00000119522) #23	LHX2 (ENSG00000106689) #24	NEK6 (ENSG00000119408)	PSMB7 (ENSG00000136930)	ADGRD2 (ENSG00000180264)	NR5A1 (ENSG00000136931)	NR6A1 (ENSG00000148200)	OLFML2A (ENSG00000185585)	WDR38 (ENSG00000136918)	RPL35 (ENSG00000136942)	ARPC5L (ENSG00000136950)	GOLGA1 (ENSG00000136935)	SCAI (ENSG00000173611)	PPP6C (ENSG00000119414)	RABEPK (ENSG00000136933)
Gorilla	MODERN SPECIES	22	OR1N1 (ENSGGOG00000022170)	OR1N2 (ENSGGOG00000017004)	OR1Q1 (ENSGGOG00000005228)	OR1L1 (ENSGGOG00000004567)	OR1L3 (ENSGGOG00000013779)	OR1L4 (ENSGGOG00000005056)	OR5C1 (ENSGGOG00000016948)	PDCL (ENSGGOG00000013392)	RC3H2 (ENSGGOG00000017062)	ZBTB6 (ENSGGOG00000036621)	ZBTB26 (ENSGGOG00000015134)	RABGAP1 (ENSGGOG00000003890)	ENSGGOG00000042134	STRBP (ENSGGOG00000003901)	ENSGGOG00000039044	CRB2 (ENSGGOG00000016601) #22	DENND1A (ENSGGOG00000016611) #23	ENSGGOG00000036998	LHX2 (ENSGGOG00000008475) #24	NEK6 (ENSGGOG00000012155)	PSMB7 (ENSGGOG00000012164)	ADGRD2 (ENSGGOG00000008978)	NR5A1 (ENSGGOG00000008994)	NR6A1 (ENSGGOG00000009250)	OLFML2A (ENSGGOG00000004100)	WDR38 (ENSGGOG00000004105)	ENSGGOG00000004111	ARPC5L (ENSGGOG00000004115)	GOLGA1 (ENSGGOG00000004117)	ENSGGOG00000037553	SCAI (ENSGGOG00000034880)
Orangutan	MODERN SPECIES	22	OR1J4 (ENSPPYG00000033379)	OR1N1 (ENSPPYG00000019575)	OR1N2 (ENSPPYG00000019576)	OR1Q1 (ENSPPYG00000020060)	OR1B1 (ENSPPYG00000020064)	OR1L4 (ENSPPYG00000019579)	OR1L6 (ENSPPYG00000019580)	OR5C1 (ENSPPYG00000037493)	PDCL (ENSPPYG00000019582)	RC3H2 (ENSPPYG00000019583)	ZBTB6 (ENSPPYG00000030463)	ZBTB26 (ENSPPYG00000037988)	RABGAP1 (ENSPPYG00000019586)	ENSPPYG00000031287	STRBP (ENSPPYG00000019589)	CRB2 (ENSPPYG00000019880) #22	DENND1A (ENSPPYG00000019592) #23	LHX2 (ENSPPYG00000019593) #24	NEK6 (ENSPPYG00000019594)	PSMB7 (ENSPPYG00000019596)	ADGRD2 (ENSPPYG00000019598)	NR5A1 (ENSPPYG00000019599)	NR6A1 (ENSPPYG00000019600)	OLFML2A (ENSPPYG00000019601)	WDR38 (ENSPPYG00000019602)	RPL35 (ENSPPYG00000019603)	ARPC5L (ENSPPYG00000019604)	GOLGA1 (ENSPPYG00000019605)	SCAI (ENSPPYG00000019606)	PPP6C (ENSPPYG00000019607)	RABEPK (ENSPPYG00000019608)
Gibbon	MODERN SPECIES	23	ENSNLEG00000017177	PTGS1 (ENSNLEG00000017180)	OR1J1 (ENSNLEG00000018990)	ENSNLEG00000033985	OR1L8 (ENSNLEG00000018992)	ENSNLEG00000032722	OR1L1 (ENSNLEG00000018994)	OR1L3 (ENSNLEG00000018995)	PDCL (ENSNLEG00000029580)	RC3H2 (ENSNLEG00000017204)	ZBTB6 (ENSNLEG00000035883)	ZBTB26 (ENSNLEG00000017215)	RABGAP1 (ENSNLEG00000017216)	ENSNLEG00000030097	STRBP (ENSNLEG00000017223)	ENSNLEG00000017244 #22	DENND1A (ENSNLEG00000017247) #23	ENSNLEG00000034780	LHX2 (ENSNLEG00000028123) #24	NEK6 (ENSNLEG00000017263)	PSMB7 (ENSNLEG00000036020)	ENSNLEG00000033335	NR5A1 (ENSNLEG00000017282)	NR6A1 (ENSNLEG00000017287)	ENSNLEG00000035190	ENSNLEG00000033577	OLFML2A (ENSNLEG00000017289)	WDR38 (ENSNLEG00000017294)	ENSNLEG00000031655	ARPC5L (ENSNLEG00000017306)	GOLGA1 (ENSNLEG00000017311)
Cercopithecidae	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00910000145076.a	ENSGT00390000010743.b	ENSGT00940000163027	ENSGT00940000164453	ENSGT00940000165463	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00860000136276	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00910000147294	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000153288.a.b.a.b.l.a	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.i.b	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00390000005811.w.b
Cercopithecinae	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000163027	ENSGT00940000162508	ENSGT00940000163649	ENSGT00900000141254	ENSGT00940000165463	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00860000136276	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00910000147294	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000153288.a.b.a.b.l.a	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.i.b	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00390000005811.w.b
Cercopithecinae_a	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00910000145076.a	ENSGT00390000010743.b	ENSGT00940000163027	ENSGT00940000162508	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00910000147766	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00860000136276	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00910000147294	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000153288.a.b.a.b.l.a	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.i.b	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00390000005811.w.b
Macaca	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00390000005084	ENSGT00910000145076.a	ENSGT00390000010743.b	ENSGT00940000163027	ENSGT00940000162508	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00910000147766	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00860000136276	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.i.a	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00390000005811.w.b	ENSGT00950000182803.B.d.a.i.b
Pig-tailed macaque	MODERN SPECIES	317						OR1L1 (ENSMNEG00000028995)	ENSMNEG00000028406	PDCL (ENSMNEG00000035590)	ENSMNEG00000023235	RC3H2 (ENSMNEG00000031599)	ZBTB6 (ENSMNEG00000026626)	ZBTB26 (ENSMNEG00000028386)	RABGAP1 (ENSMNEG00000039246)	ENSMNEG00000039714	STRBP (ENSMNEG00000045088)	CRB2 (ENSMNEG00000040807) #22	DENND1A (ENSMNEG00000035856) #23	LHX2 (ENSMNEG00000038576) #24	NEK6 (ENSMNEG00000034029)	PSMB7 (ENSMNEG00000034519)	ADGRD2 (ENSMNEG00000034810)	NR5A1 (ENSMNEG00000037300)	NR6A1 (ENSMNEG00000032193)	OLFML2A (ENSMNEG00000013543)	WDR38 (ENSMNEG00000036703)	ENSMNEG00000044108	ARPC5L (ENSMNEG00000021442)	GOLGA1 (ENSMNEG00000015755)	ENSMNEG00000010083	SCAI (ENSMNEG00000039438)	ENSMNEG00000038470
Macaca_a	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00390000010743.b	ENSGT00940000163027	ENSGT00940000162508	ENSGT00940000163649	ENSGT00900000141254	ENSGT00940000165463	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00910000147766	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT01100000263577.a.a.b.a.a.a.b.b.a.a	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.i.a	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961.j
Rhesus	MODERN SPECIES	6	OR1J1 (ENSMMUG00000060428)	OR1J4 (ENSMMUG00000013711)	OR1Q1 (ENSMMUG00000060752)	OR1B1 (ENSMMUG00000058731)	ENSMMUG00000038944	ENSMMUG00000063639	OR5C1 (ENSMMUG00000056026)	OR1K1 (ENSMMUG00000039674)	PDCL (ENSMMUG00000006896)	ENSMMUG00000058722	RC3H2 (ENSMMUG00000021134)	ZBTB6 (ENSMMUG00000000496)	ZBTB26 (ENSMMUG00000000495)	RABGAP1 (ENSMMUG00000000670)	STRBP (ENSMMUG00000022919)	CRB2 (ENSMMUG00000006345) #22	DENND1A (ENSMMUG00000006348) #23	ENSMMUG00000049804	LHX2 (ENSMMUG00000003671) #24	NEK6 (ENSMMUG00000007354)	PSMB7 (ENSMMUG00000060033)	ADGRD2 (ENSMMUG00000014110)	NR5A1 (ENSMMUG00000014111)	NR6A1 (ENSMMUG00000011185)	OLFML2A (ENSMMUG00000011183)	ENSMMUG00000061871	WDR38 (ENSMMUG00000005259)	RPL35 (ENSMMUG00000005260)	ARPC5L (ENSMMUG00000043892)	GOLGA1 (ENSMMUG00000020631)	ENSMMUG00000064277
Crab-eating macaque	MODERN SPECIES	6	MRRF (ENSMFAG00000044303)	PTGS1 (ENSMFAG00000046283)	OR1J1 (ENSMFAG00000043292)	OR1J4 (ENSMFAG00000043044)	ENSMFAG00000053359	OR1Q1 (ENSMFAG00000058086)	OR1B1 (ENSMFAG00000049737)	ENSMFAG00000053458	ENSMFAG00000050310	PDCL (ENSMFAG00000049180)	ZBTB6 (ENSMFAG00000009223)	ZBTB26 (ENSMFAG00000009076)	RC3H2 (ENSMFAG00000035621)	RABGAP1 (ENSMFAG00000043446)	STRBP (ENSMFAG00000001745)	CRB2 (ENSMFAG00000042297) #22	ENSMFAG00000058067	DENND1A (ENSMFAG00000031585) #23	ENSMFAG00000057010	LHX2 (ENSMFAG00000028670) #24	ENSMFAG00000053849	NEK6 (ENSMFAG00000043882)	PSMB7 (ENSMFAG00000002588)	NR5A1 (ENSMFAG00000044244)	ENSMFAG00000050682	ENSMFAG00000055757	ENSMFAG00000059108	NR6A1 (ENSMFAG00000045408)	OLFML2A (ENSMFAG00000002383)	ENSMFAG00000062053	WDR38 (ENSMFAG00000038461)
Cercopithecinae_b	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00390000013765	ENSGT00910000145076.a	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000010743.b	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00910000147766	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00860000136276	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00910000147294	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000153288.a.b.a.b.l.a	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.i.b	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00390000005811.w.b
Olive baboon	MODERN SPECIES	4	DAB2IP (ENSPANG00000025828)	TTLL11 (ENSPANG00000025827)	NDUFA8 (ENSPANG00000042514)	MORN5 (ENSPANG00000034028)	LHX6 (ENSPANG00000025837)	RBM18 (ENSPANG00000025845)	MRRF (ENSPANG00000025844)	PTGS1 (ENSPANG00000025843)	OR5C1 (ENSPANG00000049750)	PDCL (ENSPANG00000033400)	RC3H2 (ENSPANG00000025840)	ZBTB6 (ENSPANG00000016323)	ZBTB26 (ENSPANG00000025839)	RABGAP1 (ENSPANG00000025838)	STRBP (ENSPANG00000025850)	CRB2 (ENSPANG00000025851) #22	DENND1A (ENSPANG00000025853) #23	LHX2 (ENSPANG00000025852) #24	PSMB7 (ENSPANG00000025855)	NEK6 (ENSPANG00000025854)	ADGRD2 (ENSPANG00000025863)	NR5A1 (ENSPANG00000025862)	NR6A1 (ENSPANG00000025861)	OLFML2A (ENSPANG00000025860)	WDR38 (ENSPANG00000007029)	RPL35 (ENSPANG00000032631)	ARPC5L (ENSPANG00000044193)	GOLGA1 (ENSPANG00000017415)	SCAI (ENSPANG00000011266)	PPP6C (ENSPANG00000024802)	ENSPANG00000024810
Cercopithecinae_d	ANCESTRAL SPECIES	56				ENSGT00940000164453	ENSGT00940000165463	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00910000147766	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00860000136276	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00910000147294	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000153288.a.b.a.b.l.a	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.i.b	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00390000005811.w.b
Sooty mangabey	MODERN SPECIES	489					OR1L1 (ENSCATG00000033251)	ENSCATG00000020376	PDCL (ENSCATG00000034896)	ENSCATG00000021126	RC3H2 (ENSCATG00000036655)	ZBTB6 (ENSCATG00000020390)	ZBTB26 (ENSCATG00000020299)	RABGAP1 (ENSCATG00000012197)	ENSCATG00000037945	STRBP (ENSCATG00000038868)	ENSCATG00000043981	CRB2 (ENSCATG00000033470) #22	DENND1A (ENSCATG00000034371) #23	LHX2 (ENSCATG00000018508) #24	ENSCATG00000044723	NEK6 (ENSCATG00000044368)	PSMB7 (ENSCATG00000033885)	ADGRD2 (ENSCATG00000044429)	NR5A1 (ENSCATG00000032967)	NR6A1 (ENSCATG00000030436)	OLFML2A (ENSCATG00000026827)	WDR38 (ENSCATG00000041965)	RPL35 (ENSCATG00000020241)	ARPC5L (ENSCATG00000037319)	ENSCATG00000034300	GOLGA1 (ENSCATG00000044682)	SCAI (ENSCATG00000011189)
Drill	MODERN SPECIES	1462						ENSMLEG00000028451	OR1K1 (ENSMLEG00000024612)	PDCL (ENSMLEG00000030097)	ENSMLEG00000015252	RC3H2 (ENSMLEG00000033809)	ZBTB6 (ENSMLEG00000000288)	ZBTB26 (ENSMLEG00000000689)	RABGAP1 (ENSMLEG00000027024)	ENSMLEG00000025366	STRBP (ENSMLEG00000043524)	CRB2 (ENSMLEG00000030682) #22	DENND1A (ENSMLEG00000043396) #23	LHX2 (ENSMLEG00000021612) #24	ENSMLEG00000037698
Vervet Monkey	MODERN SPECIES	3	MORN5 (ENSCSAG00000013336)	LHX6 (ENSCSAG00000013360)	RBM18 (ENSCSAG00000013373)	MRRF (ENSCSAG00000013379)	PTGS1 (ENSCSAG00000013388)	OR1B1 (ENSCSAG00000000478)	ENSCSAG00000013401	ENSCSAG00000000479	OR5C1 (ENSCSAG00000000480)	PDCL (ENSCSAG00000013404)	RC3H2 (ENSCSAG00000013416)	ZBTB6 (ENSCSAG00000019713)	ZBTB26 (ENSCSAG00000019712)	RABGAP1 (ENSCSAG00000013436)	STRBP (ENSCSAG00000013456)	CRB2 (ENSCSAG00000013494) #22	DENND1A (ENSCSAG00000013513) #23	LHX2 (ENSCSAG00000013520) #24	NEK6 (ENSCSAG00000013531)	PSMB7 (ENSCSAG00000013536)	ADGRD2 (ENSCSAG00000013549)	NR5A1 (ENSCSAG00000013558)	NR6A1 (ENSCSAG00000013563)	OLFML2A (ENSCSAG00000013568)	WDR38 (ENSCSAG00000013588)	ARPC5L (ENSCSAG00000013596)	GOLGA1 (ENSCSAG00000013605)	SCAI (ENSCSAG00000013617)	PPP6C (ENSCSAG00000013623)	RABEPK (ENSCSAG00000013629)	HSPA5 (ENSCSAG00000013633)
Rhinopithecus	ANCESTRAL SPECIES	140							ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00860000136276	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00910000147294	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261.g #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000153288.a.b.a.b.l.a	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.i.a.b	ENSGT00390000016384.f.i.b	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566
Golden snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	2356								OR1K1 (ENSRROG00000036444)	PDCL (ENSRROG00000039540)	RC3H2 (ENSRROG00000043784)	ZBTB6 (ENSRROG00000028671)	ZBTB26 (ENSRROG00000016225)	RABGAP1 (ENSRROG00000034114)	ENSRROG00000039474	STRBP (ENSRROG00000033417)	CRB2 (ENSRROG00000044022) #22	ENSRROG00000007367 #23
Black snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	491							OR1K1 (ENSRBIG00000038148)	PDCL (ENSRBIG00000041209)	RC3H2 (ENSRBIG00000032579)	ZBTB6 (ENSRBIG00000002621)	ZBTB26 (ENSRBIG00000037685)	RABGAP1 (ENSRBIG00000034532)	ENSRBIG00000006154	STRBP (ENSRBIG00000044535)	ENSRBIG00000040405	CRB2 (ENSRBIG00000040048) #22	DENND1A (ENSRBIG00000022086) #23	LHX2 (ENSRBIG00000035554) #24	ENSRBIG00000042581	NEK6 (ENSRBIG00000032831)	PSMB7 (ENSRBIG00000024252)	ADGRD2 (ENSRBIG00000002924)	NR5A1 (ENSRBIG00000034857)	NR6A1 (ENSRBIG00000034563)	OLFML2A (ENSRBIG00000029375)	WDR38 (ENSRBIG00000042146)	RPL35 (ENSRBIG00000036679)	ARPC5L (ENSRBIG00000042947)	GOLGA1 (ENSRBIG00000026783)	SCAI (ENSRBIG00000026974)	ENSRBIG00000036429
Platyrrhini	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000163995	ENSGT00940000162508	ENSGT00940000163451	ENSGT00940000163103	ENSGT00940000165018	ENSGT00940000163649	ENSGT00940000163223	ENSGT00940000165463	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.i.a	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000005811.w.b	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961
Cebidae	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000163995	ENSGT00940000162508	ENSGT00940000163451	ENSGT00940000163103	ENSGT00940000165018	ENSGT00940000163649	ENSGT00940000163223	ENSGT00940000165463	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.i.a	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000005811.w.b	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961
Marmoset	MODERN SPECIES		OR1N1 (ENSCJAG00000021773)	ENSCJAG00000066368	OR1N2 (ENSCJAG00000020076)	OR1L8 (ENSCJAG00000085216)	OR1Q1 (ENSCJAG00000040823)	OR1L3 (ENSCJAG00000020065)	ENSCJAG00000079179	ENSCJAG00000086095	OR5C1 (ENSCJAG00000022331)	PDCL (ENSCJAG00000087386)	RC3H2 (ENSCJAG00000020050)	ZBTB6 (ENSCJAG00000020049)	ZBTB26 (ENSCJAG00000021770)	RABGAP1 (ENSCJAG00000020027)	STRBP (ENSCJAG00000019997)	CRB2 (ENSCJAG00000006432) #22	DENND1A (ENSCJAG00000006461) #23	ENSCJAG00000085719	LHX2 (ENSCJAG00000006496) #24	NEK6 (ENSCJAG00000006507)	PSMB7 (ENSCJAG00000006541)	ADGRD2 (ENSCJAG00000040439)	NR5A1 (ENSCJAG00000006624)	NR6A1 (ENSCJAG00000006631)	ENSCJAG00000078726	OLFML2A (ENSCJAG00000006668)	ENSCJAG00000077082	WDR38 (ENSCJAG00000006695)	ENSCJAG00000006724	ENSCJAG00000006730	GOLGA1 (ENSCJAG00000006745)
Cebidae_a	ANCESTRAL SPECIES	68									ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00390000001319.z	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.i.b	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000005811.w.b	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961
Bolivian squirrel monkey	MODERN SPECIES	172								OR1L1 (ENSSBOG00000036082)	PDCL (ENSSBOG00000020323)	RC3H2 (ENSSBOG00000029100)	ZBTB6 (ENSSBOG00000017105)	ZBTB26 (ENSSBOG00000018243)	ENSSBOG00000028995	RABGAP1 (ENSSBOG00000019849)	STRBP (ENSSBOG00000003663)	CRB2 (ENSSBOG00000026890) #22	DENND1A (ENSSBOG00000033627) #23	LHX2 (ENSSBOG00000012275) #24	NEK6 (ENSSBOG00000028368)	PSMB7 (ENSSBOG00000028132)	ADGRD2 (ENSSBOG00000025524)	NR5A1 (ENSSBOG00000026963)	NR6A1 (ENSSBOG00000031223)	OLFML2A (ENSSBOG00000032661)	WDR38 (ENSSBOG00000030562)	RPL35 (ENSSBOG00000030899)	ARPC5L (ENSSBOG00000026457)	GOLGA1 (ENSSBOG00000035730)	ENSSBOG00000033641	SCAI (ENSSBOG00000029441)	PPP6C (ENSSBOG00000018030)
Capuchin	MODERN SPECIES	206								ENSCCAG00000013468	PDCL (ENSCCAG00000019775)	RC3H2 (ENSCCAG00000001404)	ZBTB6 (ENSCCAG00000020024)	ZBTB26 (ENSCCAG00000003111)	ENSCCAG00000033724	RABGAP1 (ENSCCAG00000024911)	STRBP (ENSCCAG00000027357)	CRB2 (ENSCCAG00000033115) #22	DENND1A (ENSCCAG00000020125) #23	LHX2 (ENSCCAG00000022112) #24	NEK6 (ENSCCAG00000019309)	PSMB7 (ENSCCAG00000025367)	ADGRD2 (ENSCCAG00000033790)	NR5A1 (ENSCCAG00000024659)	NR6A1 (ENSCCAG00000024096)	OLFML2A (ENSCCAG00000023075)	WDR38 (ENSCCAG00000024912)	ENSCCAG00000026875	ENSCCAG00000003039	ENSCCAG00000032926	GOLGA1 (ENSCCAG00000025942)	ENSCCAG00000034325	ENSCCAG00000018226
Mas night monkey	MODERN SPECIES	768	MORN5 (ENSANAG00000028589)	LHX6 (ENSANAG00000036902)	RBM18 (ENSANAG00000035441)	ENSANAG00000027637	ENSANAG00000026416	PTGS1 (ENSANAG00000029954)	PDCL (ENSANAG00000036396)	RC3H2 (ENSANAG00000030862)	ZBTB6 (ENSANAG00000020106)	ZBTB26 (ENSANAG00000036419)	RABGAP1 (ENSANAG00000022667)	ENSANAG00000001745	ENSANAG00000021222	STRBP (ENSANAG00000021993)	ENSANAG00000004458	CRB2 (ENSANAG00000030431) #22	DENND1A (ENSANAG00000034989) #23	LHX2 (ENSANAG00000018858) #24	NEK6 (ENSANAG00000029360)	PSMB7 (ENSANAG00000030640)	ADGRD2 (ENSANAG00000036641)	NR5A1 (ENSANAG00000027136)	NR6A1 (ENSANAG00000036986)	OLFML2A (ENSANAG00000028567)	WDR38 (ENSANAG00000033407)	RPL35 (ENSANAG00000032849)	ENSANAG00000021654	GOLGA1 (ENSANAG00000020513)	SCAI (ENSANAG00000024288)	ENSANAG00000005773	ENSANAG00000035375
Tarsier	MODERN SPECIES	2562																CRB2 (ENSTSYG00000033337) #22	ENSTSYG00000004782 #23
Strepsirrhini	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000156689	ENSGT00390000008938	ENSGT00390000018089	ENSGT00940000156868	ENSGT00390000013765	ENSGT00390000005084	ENSGT00910000145076	ENSGT00390000010743.b	ENSGT00940000162852.b.a	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.i.b	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
Lemuriformes	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00390000013765	ENSGT00390000005084	ENSGT00910000145076	ENSGT00390000010743.b	ENSGT00940000164886	ENSGT00940000165929	ENSGT00940000163649	ENSGT00930000151076	ENSGT00940000163223	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.i.b	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
Mouse lemur	MODERN SPECIES	1	MRRF (ENSMICG00000016168)	ENSMICG00000031629	PTGS1 (ENSMICG00000009196)	ENSMICG00000033883	ENSMICG00000045321	ENSMICG00000043496	ENSMICG00000043641	ENSMICG00000044928	ENSMICG00000035760	PDCL (ENSMICG00000003224)	RC3H2 (ENSMICG00000003227)	ZBTB6 (ENSMICG00000047456)	ZBTB26 (ENSMICG00000037770)	RABGAP1 (ENSMICG00000000821)	STRBP (ENSMICG00000000832)	CRB2 (ENSMICG00000000551) #22	DENND1A (ENSMICG00000000554) #23	LHX2 (ENSMICG00000009968) #24	NEK6 (ENSMICG00000009990)	PSMB7 (ENSMICG00000043101)	ADGRD2 (ENSMICG00000046284)	NR5A1 (ENSMICG00000002907)	NR6A1 (ENSMICG00000002911)	OLFML2A (ENSMICG00000002915)	WDR38 (ENSMICG00000038127)	RPL35 (ENSMICG00000002922)	ARPC5L (ENSMICG00000002925)	GOLGA1 (ENSMICG00000002928)	ENSMICG00000002934	SCAI (ENSMICG00000002936)	PPP6C (ENSMICG00000030309)
Lemuriformes_a	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000156868	ENSGT00390000013765	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000010743.b	ENSGT00940000164886	ENSGT00940000165929	ENSGT00940000163649	ENSGT00930000151076	ENSGT00940000163223	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.i.b	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
Coquerels sifaka	MODERN SPECIES	995	TTLL11 (ENSPCOG00000012570)	NDUFA8 (ENSPCOG00000025464)	MORN5 (ENSPCOG00000023443)	LHX6 (ENSPCOG00000019624)	RBM18 (ENSPCOG00000024474)	ENSPCOG00000026480	PTGS1 (ENSPCOG00000008151)	ENSPCOG00000019615	OR1L3 (ENSPCOG00000010946)	PDCL (ENSPCOG00000026496)	RC3H2 (ENSPCOG00000028817)	ZBTB6 (ENSPCOG00000003019)	ENSPCOG00000014220	RABGAP1 (ENSPCOG00000000532)	STRBP (ENSPCOG00000027563)	CRB2 (ENSPCOG00000025106) #22	DENND1A (ENSPCOG00000025342) #23	LHX2 (ENSPCOG00000004468) #24
Greater bamboo lemur	MODERN SPECIES	519	ENSPSMG00000000082	OR1Q1 (ENSPSMG00000000044)	ENSPSMG00000023005	ENSPSMG00000023002	ENSPSMG00000022999	ENSPSMG00000022994	ENSPSMG00000022993	OR5C1 (ENSPSMG00000022988)	OR1K1 (ENSPSMG00000022985)	PDCL (ENSPSMG00000022983)	RC3H2 (ENSPSMG00000022961)	ZBTB6 (ENSPSMG00000022921)	ZBTB26 (ENSPSMG00000022920)	RABGAP1 (ENSPSMG00000022917)	STRBP (ENSPSMG00000022889)	CRB2 (ENSPSMG00000022863) #22	DENND1A (ENSPSMG00000022823) #23	LHX2 (ENSPSMG00000022690) #24	ENSPSMG00000022686	NEK6 (ENSPSMG00000022654)	PSMB7 (ENSPSMG00000022579)	ADGRD2 (ENSPSMG00000022563)	NR5A1 (ENSPSMG00000022550)	NR6A1 (ENSPSMG00000022523)	OLFML2A (ENSPSMG00000022484)	WDR38 (ENSPSMG00000022469)	RPL35 (ENSPSMG00000022453)	ENSPSMG00000022444	GOLGA1 (ENSPSMG00000022419)	SCAI (ENSPSMG00000022368)
Bushbaby	MODERN SPECIES	129	ENSOGAG00000029409	OR1B1 (ENSOGAG00000006452)	ENSOGAG00000033185	ENSOGAG00000006455	ENSOGAG00000030138	ENSOGAG00000015770	ENSOGAG00000030362	OR5C1 (ENSOGAG00000006530)	ENSOGAG00000032872	PDCL (ENSOGAG00000011889)	RC3H2 (ENSOGAG00000010678)	ZBTB6 (ENSOGAG00000010682)	ZBTB26 (ENSOGAG00000010685)	RABGAP1 (ENSOGAG00000014722)	STRBP (ENSOGAG00000014739)	CRB2 (ENSOGAG00000031205) #22	DENND1A (ENSOGAG00000013851) #23	ENSOGAG00000024358	LHX2 (ENSOGAG00000003505) #24	NEK6 (ENSOGAG00000003510)	PSMB7 (ENSOGAG00000003513)	ADGRD2 (ENSOGAG00000003517)	NR5A1 (ENSOGAG00000017023)	NR6A1 (ENSOGAG00000030677)	OLFML2A (ENSOGAG00000008504)	WDR38 (ENSOGAG00000008507)	ENSOGAG00000008513	ARPC5L (ENSOGAG00000030099)	GOLGA1 (ENSOGAG00000008519)	SCAI (ENSOGAG00000008529)	PPP6C (ENSOGAG00000025294)
Laurasiatheria	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000164453	ENSGT00940000163223	ENSGT00940000165463	ENSGT00940000161916	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
Laurasiatheria_a	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000163223	ENSGT00940000161916	ENSGT00940000165463	ENSGT00940000165831	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
Artiodactyla	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000163223	ENSGT00940000161916	ENSGT00940000165463	ENSGT00940000165831	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
Suina	ANCESTRAL SPECIES	37			ENSGT00730000111617	ENSGT00940000163223	ENSGT00940000163456	ENSGT00940000162508.c.a.b	ENSGT00940000163038.a.b.o	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
Chacoan peccary	MODERN SPECIES	887	ENSCWAG00000017767	ENSCWAG00000017736	ENSCWAG00000017712	ENSCWAG00000017690	ENSCWAG00000017637	ENSCWAG00000017381	ENSCWAG00000017362	OR5C1 (ENSCWAG00000017342)	OR1K1 (ENSCWAG00000017328)	PDCL (ENSCWAG00000017304)	RC3H2 (ENSCWAG00000017257)	ZBTB6 (ENSCWAG00000017232)	ZBTB26 (ENSCWAG00000017216)	RABGAP1 (ENSCWAG00000017187)	STRBP (ENSCWAG00000017145)	CRB2 (ENSCWAG00000017032) #22	DENND1A (ENSCWAG00000016950) #23	LHX2 (ENSCWAG00000016921) #24	NEK6 (ENSCWAG00000016836)	PSMB7 (ENSCWAG00000016793)	ADGRD2 (ENSCWAG00000016668)	NR5A1 (ENSCWAG00000016562)	NR6A1 (ENSCWAG00000016277)	OLFML2A (ENSCWAG00000016191)	WDR38 (ENSCWAG00000016114)	ENSCWAG00000016078	ARPC5L (ENSCWAG00000016051)	GOLGA1 (ENSCWAG00000015995)	SCAI (ENSCWAG00000015880)	PPP6C (ENSCWAG00000015841)	RABEPK (ENSCWAG00000015788)
Pig	MODERN SPECIES		ENSSSCG00000055994	ENSSSCG00000035439	ENSSSCG00000056140	ENSSSCG00000059550	ENSSSCG00000055555	ENSSSCG00000055627	ENSSSCG00000044533	OR5C1 (ENSSSCG00000005578)	OR1K1 (ENSSSCG00000039297)	PDCL (ENSSSCG00000038554)	RC3H2 (ENSSSCG00000005575)	ZBTB6 (ENSSSCG00000005576)	ZBTB26 (ENSSSCG00000032575)	RABGAP1 (ENSSSCG00000020743)	STRBP (ENSSSCG00000005582)	CRB2 (ENSSSCG00000005584) #22	DENND1A (ENSSSCG00000005585) #23	LHX2 (ENSSSCG00000005586) #24	NEK6 (ENSSSCG00000005587)	PSMB7 (ENSSSCG00000005590)	ADGRD2 (ENSSSCG00000005591)	NR5A1 (ENSSSCG00000005588)	NR6A1 (ENSSSCG00000005589)	ENSSSCG00000058119	OLFML2A (ENSSSCG00000005593)	WDR38 (ENSSSCG00000005594)	RPL35 (ENSSSCG00000034227)	ARPC5L (ENSSSCG00000005596)	GOLGA1 (ENSSSCG00000005597)	SCAI (ENSSSCG00000005598)	PPP6C (ENSSSCG00000005600)
Artiodactyla_a	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000163223	ENSGT00940000161916	ENSGT00940000165463	ENSGT00940000165831	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
Camelidae	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000163649	ENSGT00900000141254	ENSGT00940000164453.b	ENSGT00940000163223	ENSGT00940000165463	ENSGT00940000163938	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
Arabian camel	MODERN SPECIES	30	OR1Q1 (ENSCDRG00005008121)	ENSCDRG00005008062	OR1B1 (ENSCDRG00005008054)	OR1L1 (ENSCDRG00005008045)	OR1L3 (ENSCDRG00005008027)	ENSCDRG00005008008	ENSCDRG00005007955	OR5C1 (ENSCDRG00005007927)	OR1K1 (ENSCDRG00005007911)	PDCL (ENSCDRG00005007891)	RC3H2 (ENSCDRG00005007722)	ZBTB6 (ENSCDRG00005007683)	ZBTB26 (ENSCDRG00005007665)	RABGAP1 (ENSCDRG00005007528)	STRBP (ENSCDRG00005007449)	CRB2 (ENSCDRG00005007355) #22	DENND1A (ENSCDRG00005006927) #23	ENSCDRG00005006859 #24	NEK6 (ENSCDRG00005006640)	PSMB7 (ENSCDRG00005006562)	ADGRD2 (ENSCDRG00005006465)	NR5A1 (ENSCDRG00005006378)	NR6A1 (ENSCDRG00005017082)	OLFML2A (ENSCDRG00005017022)	WDR38 (ENSCDRG00005016977)	ENSCDRG00005016937	ARPC5L (ENSCDRG00005016882)	GOLGA1 (ENSCDRG00005016743)	SCAI (ENSCDRG00005016671)	PPP6C (ENSCDRG00005016612)	RABEPK (ENSCDRG00005016565)
Artiodactyla_b	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000163223	ENSGT00940000161916	ENSGT00940000165463	ENSGT00940000165831	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
Cetacea	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000156868	ENSGT00390000013765	ENSGT00910000145076	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000010743.b	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000162852.b.a	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
Odontoceti	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00390000018089	ENSGT00940000156868	ENSGT00390000013765	ENSGT00910000145076	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000010743.b	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000162852.b.a	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763	ENSGT00940000154787
Odontoceti_a	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00390000008938	ENSGT00390000018089	ENSGT00940000156868	ENSGT00390000013765	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000010743.b	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000162852.b.a	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763	ENSGT00940000154787
Odontoceti_b	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000156689	ENSGT00390000008938	ENSGT00390000018089	ENSGT00940000156868	ENSGT00390000013765	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000010743.b	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000162852.b.a	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763	ENSGT00940000154787
Monodontidae	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000156689	ENSGT00390000008938	ENSGT00390000018089	ENSGT00940000156868	ENSGT00390000013765	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000010743.b	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000162852.b.a	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763	ENSGT00940000154787
Beluga whale	MODERN SPECIES	19	DAB2IP (ENSDLEG00000000870)	TTLL11 (ENSDLEG00000000788)	NDUFA8 (ENSDLEG00000000764)	MORN5 (ENSDLEG00000000753)	LHX6 (ENSDLEG00000000734)	RBM18 (ENSDLEG00000000722)	MRRF (ENSDLEG00000000707)	PTGS1 (ENSDLEG00000000675)	OR5C1 (ENSDLEG00000000653)	ENSDLEG00000000638	PDCL (ENSDLEG00000000624)	RC3H2 (ENSDLEG00000000584)	ZBTB26 (ENSDLEG00000000549)	RABGAP1 (ENSDLEG00000000486)	STRBP (ENSDLEG00000000427)	CRB2 (ENSDLEG00000000376) #22	ENSDLEG00000000352	ENSDLEG00000000331	DENND1A (ENSDLEG00000000198) #23	LHX2 (ENSDLEG00000000097) #24	NEK6 (ENSDLEG00000000066)	PSMB7 (ENSDLEG00000000050)	NR5A1 (ENSDLEG00000015804)	ENSDLEG00000015771	NR6A1 (ENSDLEG00000015711)	OLFML2A (ENSDLEG00000015685)	RPL35 (ENSDLEG00000015667)	ARPC5L (ENSDLEG00000015658)	GOLGA1 (ENSDLEG00000015625)	SCAI (ENSDLEG00000015503)	PPP6C (ENSDLEG00000015466)
Narwhal	MODERN SPECIES	312	ENSMMNG00015017437	DAB2IP (ENSMMNG00015017613)	TTLL11 (ENSMMNG00015017872)	NDUFA8 (ENSMMNG00015017957)	MORN5 (ENSMMNG00015017987)	LHX6 (ENSMMNG00015018081)	RBM18 (ENSMMNG00015018256)	MRRF (ENSMMNG00015018364)	PTGS1 (ENSMMNG00015018448)	PDCL (ENSMMNG00015018554)	RC3H2 (ENSMMNG00015018607)	ZBTB6 (ENSMMNG00015018659)	ZBTB26 (ENSMMNG00015018669)	RABGAP1 (ENSMMNG00015018694)	STRBP (ENSMMNG00015018777)	CRB2 (ENSMMNG00015018867) #22	DENND1A (ENSMMNG00015018918) #23	ENSMMNG00015018954	ENSMMNG00015018977	ENSMMNG00015018990 #24	NEK6 (ENSMMNG00015019045)	PSMB7 (ENSMMNG00015019159)	ADGRD2 (ENSMMNG00015019194)	NR5A1 (ENSMMNG00015019244)	NR6A1 (ENSMMNG00015019302)	OLFML2A (ENSMMNG00015019345)	RPL35 (ENSMMNG00015019387)	ARPC5L (ENSMMNG00015019410)	GOLGA1 (ENSMMNG00015019440)	SCAI (ENSMMNG00015019495)	PPP6C (ENSMMNG00015019538)
Vaquita	MODERN SPECIES	17	MORN5 (ENSPSNG00000018254)	LHX6 (ENSPSNG00000017880)	RBM18 (ENSPSNG00000017818)	MRRF (ENSPSNG00000017709)	PTGS1 (ENSPSNG00000017445)	ENSPSNG00000017400	OR5C1 (ENSPSNG00000017144)	ENSPSNG00000017078	PDCL (ENSPSNG00000017032)	RC3H2 (ENSPSNG00000016932)	ZBTB6 (ENSPSNG00000016879)	ZBTB26 (ENSPSNG00000016851)	RABGAP1 (ENSPSNG00000016790)	STRBP (ENSPSNG00000016661)	ENSPSNG00000016590	CRB2 (ENSPSNG00000016494) #22	ENSPSNG00000016443	DENND1A (ENSPSNG00000016381) #23	LHX2 (ENSPSNG00000016296) #24	NEK6 (ENSPSNG00000015982)	PSMB7 (ENSPSNG00000015876)	NR5A1 (ENSPSNG00000015697)	ENSPSNG00000015665	NR6A1 (ENSPSNG00000015414)	OLFML2A (ENSPSNG00000015295)	RPL35 (ENSPSNG00000015051)	ARPC5L (ENSPSNG00000014993)	GOLGA1 (ENSPSNG00000014918)	SCAI (ENSPSNG00000014857)	PPP6C (ENSPSNG00000014742)	RABEPK (ENSPSNG00000014628)
Dolphin	MODERN SPECIES	972																CRB2 (ENSTTRG00000011567) #22	DENND1A (ENSTTRG00000011581) #23
Sperm whale	MODERN SPECIES	20	GLT6D1 (ENSPCTG00005015920)	ENSPCTG00005015883	ENSPCTG00005015853	ENSPCTG00005015821	NDUFA8 (ENSPCTG00005015736)	RBM18 (ENSPCTG00005015688)	ENSPCTG00005015616	MRRF (ENSPCTG00005015426)	PTGS1 (ENSPCTG00005015161)	PDCL (ENSPCTG00005014807)	RC3H2 (ENSPCTG00005014694)	ZBTB6 (ENSPCTG00005014671)	ZBTB26 (ENSPCTG00005014658)	RABGAP1 (ENSPCTG00005014497)	STRBP (ENSPCTG00005014427)	CRB2 (ENSPCTG00005014259) #22	ENSPCTG00005014200	ENSPCTG00005014157	DENND1A (ENSPCTG00005013710) #23	LHX2 (ENSPCTG00005013579) #24	PSMB7 (ENSPCTG00005013513)	ENSPCTG00005013273	NR5A1 (ENSPCTG00005013087)	NR6A1 (ENSPCTG00005012676)	OLFML2A (ENSPCTG00005012507)	RPL35 (ENSPCTG00005012446)	ARPC5L (ENSPCTG00005012408)	GOLGA1 (ENSPCTG00005012337)	SCAI (ENSPCTG00005012153)	PPP6C (ENSPCTG00005012010)	RABEPK (ENSPCTG00005011943)
Blue whale	MODERN SPECIES	17	MORN5 (ENSBMSG00010001290)	LHX6 (ENSBMSG00010001363)	RBM18 (ENSBMSG00010001663)	MRRF (ENSBMSG00010001690)	PTGS1 (ENSBMSG00010001760)	ENSBMSG00010001916	ENSBMSG00010001927	ENSBMSG00010001936	OR1K1 (ENSBMSG00010001958)	PDCL (ENSBMSG00010001965)	RC3H2 (ENSBMSG00010002002)	ZBTB6 (ENSBMSG00010002076)	ZBTB26 (ENSBMSG00010002083)	RABGAP1 (ENSBMSG00010002113)	STRBP (ENSBMSG00010002189)	CRB2 (ENSBMSG00010002237) #22	DENND1A (ENSBMSG00010002298) #23	ENSBMSG00010002405	ENSBMSG00010002423	ENSBMSG00010002438 #24	NEK6 (ENSBMSG00010002464)	PSMB7 (ENSBMSG00010002486)	NR5A1 (ENSBMSG00010002525)	NR6A1 (ENSBMSG00010002572)	OLFML2A (ENSBMSG00010002654)	WDR38 (ENSBMSG00010002692)	RPL35 (ENSBMSG00010002712)	ARPC5L (ENSBMSG00010002727)	GOLGA1 (ENSBMSG00010002753)	SCAI (ENSBMSG00010002823)	PPP6C (ENSBMSG00010002860)
Pecora	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000164453.a	ENSGT00940000164453.b	ENSGT00940000163223	ENSGT00940000165463.a	ENSGT00940000161916.v	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
Percora_a	ANCESTRAL SPECIES	27	ENSGT00940000163223	ENSGT00940000165463.a	ENSGT00940000161916.u	ENSGT00940000165463.b	ENSGT00940000165831	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
Bovidae	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000163223	ENSGT00940000165463.a	ENSGT00940000161916.u	ENSGT00940000165463.b	ENSGT00940000165831	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
Bovinae	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000163223	ENSGT00940000165463.a	ENSGT00940000165831	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456.m	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00950000182922.a.b.e.a	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00390000003248.a.a.b	ENSGT00390000011666.h.a.a.b.a.a.b	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566
Bos	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000163223	ENSGT00940000165463.a	ENSGT00940000165831	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456.m	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00950000182922.a.b.e.a	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00390000003248.a.a.b	ENSGT00390000011666.h.a.a.b.a.a.b	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566
Bos_b	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000163456.n.a	ENSGT00940000161916.v.b	ENSGT00940000165831	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456.m	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00950000182922.a.b.e.a	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00390000003248.a.a.b	ENSGT00390000011666.h.a.a.b.a.a.b	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566
Hybrid Bos Indicus	MODERN SPECIES	2	OR1L1 (ENSBIXG00005003133)	OR1L3 (ENSBIXG00005019231)	ENSBIXG00005019218	ENSBIXG00005003131	ENSBIXG00005019201	OR5C1 (ENSBIXG00005019185)	OR1K1 (ENSBIXG00005019174)	PDCL (ENSBIXG00005019164)	RC3H2 (ENSBIXG00005019119)	ZBTB6 (ENSBIXG00005003085)	ZBTB26 (ENSBIXG00005018935)	RABGAP1 (ENSBIXG00005005857)	GPR21 (ENSBIXG00005018797)	ENSBIXG00005018783	STRBP (ENSBIXG00005003042)	CRB2 (ENSBIXG00005007721) #22	DENND1A (ENSBIXG00005018546) #23	ENSBIXG00005018414	ENSBIXG00005018399	LHX2 (ENSBIXG00005018376) #24	NEK6 (ENSBIXG00005018334)	ENSBIXG00005018237	ADGRD2 (ENSBIXG00005018218)	NR5A1 (ENSBIXG00005007287)	NR6A1 (ENSBIXG00005018129)	ENSBIXG00005017999	OLFML2A (ENSBIXG00005017994)	WDR38 (ENSBIXG00005017964)	ENSBIXG00005017947	ARPC5L (ENSBIXG00005017925)	GOLGA1 (ENSBIXG00005017888)
Cow	MODERN SPECIES	2	OR1L6C (ENSBTAG00000049303)	OR1L6 (ENSBTAG00000052523)	OR1AF3 (ENSBTAG00000038665)	OR1AF1 (ENSBTAG00000004667)	OR1AH6 (ENSBTAG00000030677)	OR5C1 (ENSBTAG00000038249)	OR1K1 (ENSBTAG00000030676)	PDCL (ENSBTAG00000030675)	RC3H2 (ENSBTAG00000023867)	ZBTB6 (ENSBTAG00000039815)	ZBTB26 (ENSBTAG00000038610)	RABGAP1 (ENSBTAG00000039172)	GPR21 (ENSBTAG00000040296)	ENSBTAG00000048537	STRBP (ENSBTAG00000021921)	CRB2 (ENSBTAG00000014391) #22	DENND1A (ENSBTAG00000003610) #23	ENSBTAG00000048688	ENSBTAG00000023860	LHX2 (ENSBTAG00000010990) #24	NEK6 (ENSBTAG00000019470)	PSMB7 (ENSBTAG00000003067)	ADGRD2 (ENSBTAG00000017576)	NR5A1 (ENSBTAG00000009017)	NR6A1 (ENSBTAG00000040585)	OLFML2A (ENSBTAG00000004848)	WDR38 (ENSBTAG00000039223)	RPL35 (ENSBTAG00000003205)	ARPC5L (ENSBTAG00000015278)	GOLGA1 (ENSBTAG00000015286)	SCAI (ENSBTAG00000015553)
Bos_a	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00930000151076	ENSGT00900000141254	ENSGT00940000164453.a	ENSGT00940000164453.b	ENSGT00940000165463.a	ENSGT00940000165831	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456.m	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763	ENSGT00940000154787
Domestic yak	MODERN SPECIES	28	OR1L1 (ENSBGRG00000014898)	ENSBGRG00000014921	ENSBGRG00000014945	ENSBGRG00000015062	ENSBGRG00000015143	ENSBGRG00000015272	OR5C1 (ENSBGRG00000015398)	OR1K1 (ENSBGRG00000015421)	RC3H2 (ENSBGRG00000015455)	ZBTB6 (ENSBGRG00000015653)	RABGAP1 (ENSBGRG00000015822)	ENSBGRG00000015941	GPR21 (ENSBGRG00000015959)	ENSBGRG00000016005	STRBP (ENSBGRG00000016080)	CRB2 (ENSBGRG00000016962) #22	DENND1A (ENSBGRG00000017060) #23	ENSBGRG00000017559	LHX2 (ENSBGRG00000017595) #24	NEK6 (ENSBGRG00000017708)	PSMB7 (ENSBGRG00000018037)	NR5A1 (ENSBGRG00000018297)	NR6A1 (ENSBGRG00000018410)	OLFML2A (ENSBGRG00000018998)	WDR38 (ENSBGRG00000019089)	ENSBGRG00000019233	ENSBGRG00000019299	ENSBGRG00000019352	GOLGA1 (ENSBGRG00000019407)	SCAI (ENSBGRG00000019665)	PPP6C (ENSBGRG00000019741)
Wild yak	MODERN SPECIES	534													ENSBMUG00000020791	RABGAP1 (ENSBMUG00000020782)	STRBP (ENSBMUG00000020756)	CRB2 (ENSBMUG00000020716) #22	DENND1A (ENSBMUG00000020652) #23	LHX2 (ENSBMUG00000020558) #24	NEK6 (ENSBMUG00000020547)	PSMB7 (ENSBMUG00000020516)	NR5A1 (ENSBMUG00000020509)	NR6A1 (ENSBMUG00000020485)	OLFML2A (ENSBMUG00000020472)	WDR38 (ENSBMUG00000020446)	RPL35 (ENSBMUG00000020431)	ARPC5L (ENSBMUG00000020410)	GOLGA1 (ENSBMUG00000020389)	SCAI (ENSBMUG00000020339)	PPP6C (ENSBMUG00000020319)	RABEPK (ENSBMUG00000020294)	HSPA5 (ENSBMUG00000020273)
American bison	MODERN SPECIES	3112	OR1L3 (ENSBBBG00000015356)	ENSBBBG00000003826	ENSBBBG00000015348	ENSBBBG00000007989	ENSBBBG00000015334	ENSBBBG00000003491	OR5C1 (ENSBBBG00000003497)	OR1K1 (ENSBBBG00000003504)	PDCL (ENSBBBG00000003806)	RC3H2 (ENSBBBG00000001251)	ZBTB6 (ENSBBBG00000001347)	RABGAP1 (ENSBBBG00000001355)	GPR21 (ENSBBBG00000001383)	ENSBBBG00000001391	STRBP (ENSBBBG00000001399)	CRB2 (ENSBBBG00000015282) #22	DENND1A (ENSBBBG00000003787) #23	ENSBBBG00000015103	ENSBBBG00000015098	LHX2 (ENSBBBG00000003743) #24	NEK6 (ENSBBBG00000015078)	PSMB7 (ENSBBBG00000015071)	ADGRD2 (ENSBBBG00000015057)	NR5A1 (ENSBBBG00000015038)	NR6A1 (ENSBBBG00000015024)	OLFML2A (ENSBBBG00000000806)	WDR38 (ENSBBBG00000003711)	RPL35 (ENSBBBG00000014980)	ARPC5L (ENSBBBG00000003705)	GOLGA1 (ENSBBBG00000014965)	SCAI (ENSBBBG00000014945)
Caprinae	ANCESTRAL SPECIES	27	ENSGT00940000163649	ENSGT00930000151076	ENSGT00900000141254	ENSGT00940000161916.u	ENSGT00940000165463.b	ENSGT00940000165831	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B.j	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
Goat	MODERN SPECIES	2	ENSCHIG00000016694	OR1Q1 (ENSCHIG00000012780)	ENSCHIG00000010834	ENSCHIG00000008809	ENSCHIG00000009580	OR1L1 (ENSCHIG00000013814)	ENSCHIG00000008677	OR5C1 (ENSCHIG00000003066)	PDCL (ENSCHIG00000023505)	RC3H2 (ENSCHIG00000019319)	ZBTB6 (ENSCHIG00000010695)	ZBTB26 (ENSCHIG00000002998)	RABGAP1 (ENSCHIG00000025375)	ENSCHIG00000024016	ENSCHIG00000018517	CRB2 (ENSCHIG00000026311) #22	DENND1A (ENSCHIG00000018070) #23	LHX2 (ENSCHIG00000024662) #24	NEK6 (ENSCHIG00000014014)	PSMB7 (ENSCHIG00000016023)	ADGRD2 (ENSCHIG00000015493)	NR5A1 (ENSCHIG00000020020)	NR6A1 (ENSCHIG00000023004)	ENSCHIG00000016762	OLFML2A (ENSCHIG00000023813)	WDR38 (ENSCHIG00000022520)	RPL35 (ENSCHIG00000012200)	ARPC5L (ENSCHIG00000015054)	GOLGA1 (ENSCHIG00000025077)	SCAI (ENSCHIG00000016265)	PPP6C (ENSCHIG00000002356)
Rambouillet Sheep	MODERN SPECIES	19	OR1L1 (ENSOARG00020013291)	OR1L3 (ENSOARG00020013265)	ENSOARG00020013229	ENSOARG00020013202	ENSOARG00020013104	ENSOARG00020013003	ENSOARG00020012939	ENSOARG00020012899	OR5C1 (ENSOARG00020012869)	PDCL (ENSOARG00020012771)	RC3H2 (ENSOARG00020012162)	ZBTB6 (ENSOARG00020012077)	ZBTB26 (ENSOARG00020012054)	RABGAP1 (ENSOARG00020011787)	STRBP (ENSOARG00020011671)	CRB2 (ENSOARG00020011470) #22	DENND1A (ENSOARG00020010453) #23	ENSOARG00020010373	ENSOARG00020010352	ENSOARG00020010288	ENSOARG00020010162 #24	NEK6 (ENSOARG00020009766)	PSMB7 (ENSOARG00020009676)	ADGRD2 (ENSOARG00020009282)	NR5A1 (ENSOARG00020009154)	NR6A1 (ENSOARG00020008843)	OLFML2A (ENSOARG00020008739)	WDR38 (ENSOARG00020008607)	RPL35 (ENSOARG00020008582)	ARPC5L (ENSOARG00020008562)	GOLGA1 (ENSOARG00020008027)
Siberian musk deer	MODERN SPECIES	1178	ENSMMSG00000016749	ENSMMSG00000016756	ENSMMSG00000016765	ENSMMSG00000016782	ENSMMSG00000016791	ENSMMSG00000016804	ENSMMSG00000016829	OR5C1 (ENSMMSG00000016896)	OR1K1 (ENSMMSG00000016908)	PDCL (ENSMMSG00000016923)	RC3H2 (ENSMMSG00000016952)	ZBTB6 (ENSMMSG00000017128)	ZBTB26 (ENSMMSG00000017133)	RABGAP1 (ENSMMSG00000017143)	STRBP (ENSMMSG00000017220)	CRB2 (ENSMMSG00000017268) #22	DENND1A (ENSMMSG00000017330) #23	LHX2 (ENSMMSG00000017407) #24	NEK6 (ENSMMSG00000017451)	PSMB7 (ENSMMSG00000017573)	ADGRD2 (ENSMMSG00000017611)	NR5A1 (ENSMMSG00000017732)	NR6A1 (ENSMMSG00000017835)	OLFML2A (ENSMMSG00000017889)	WDR38 (ENSMMSG00000017949)	ENSMMSG00000018016	ARPC5L (ENSMMSG00000018050)	GOLGA1 (ENSMMSG00000018093)	SCAI (ENSMMSG00000018254)	PPP6C (ENSMMSG00000018370)	RABEPK (ENSMMSG00000018434)
Yarkand deer	MODERN SPECIES	2	ENSCHYG00000009562	OR1L1 (ENSCHYG00000009579)	OR1L3 (ENSCHYG00000009607)	ENSCHYG00000009633	ENSCHYG00000009658	ENSCHYG00000009698	OR5C1 (ENSCHYG00000009759)	OR1K1 (ENSCHYG00000009782)	PDCL (ENSCHYG00000009804)	ENSCHYG00000009825	RC3H2 (ENSCHYG00000009870)	ZBTB6 (ENSCHYG00000010148)	ZBTB26 (ENSCHYG00000010162)	RABGAP1 (ENSCHYG00000010191)	ENSCHYG00000010458	CRB2 (ENSCHYG00000010614) #22	DENND1A (ENSCHYG00000010670) #23	LHX2 (ENSCHYG00000010827) #24	NEK6 (ENSCHYG00000010901)	PSMB7 (ENSCHYG00000011100)	ADGRD2 (ENSCHYG00000011162)	NR5A1 (ENSCHYG00000011305)	NR6A1 (ENSCHYG00000011423)	OLFML2A (ENSCHYG00000011623)	WDR38 (ENSCHYG00000011690)	RPL35 (ENSCHYG00000011873)	ARPC5L (ENSCHYG00000011918)	GOLGA1 (ENSCHYG00000011987)	SCAI (ENSCHYG00000012382)	PPP6C (ENSCHYG00000012715)	ENSCHYG00000012832
Laurasiatheria_b	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000163223	ENSGT00940000161916	ENSGT00940000165463	ENSGT00940000165831	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
Carnivora	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000164453	ENSGT00940000163223	ENSGT00940000165463	ENSGT00940000161916	ENSGT00940000165831	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
Caniformia	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00930000151076	ENSGT00900000141254	ENSGT00940000164453	ENSGT00940000163223	ENSGT00940000161916	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
Caniformia_b	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00930000151076	ENSGT00900000141254	ENSGT00940000164453	ENSGT00940000163223	ENSGT00940000161916	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456.p	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
Mustelinae	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00930000151076	ENSGT00900000141254	ENSGT00940000163223	ENSGT00940000161916	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456.p	ENSGT00940000163456.o	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
American mink	MODERN SPECIES	182								OR5C1 (ENSNVIG00000003045)	OR1K1 (ENSNVIG00000003072)	PHLP (ENSNVIG00000003114)	RC3H2 (ENSNVIG00000003205)	ZBTB6 (ENSNVIG00000003569)	ZBT26 (ENSNVIG00000003603)	RABGAP1 (ENSNVIG00000003705)	STRBP (ENSNVIG00000004078)	CRB2 (ENSNVIG00000004241) #22	DENND1A (ENSNVIG00000004449) #23	LHX2 (ENSNVIG00000005036) #24	NEK6 (ENSNVIG00000005066)	PSMB7 (ENSNVIG00000005110)	NR5A1 (ENSNVIG00000005527)	NR6A1 (ENSNVIG00000005633)	OLFML2A (ENSNVIG00000005683)	WDR38 (ENSNVIG00000005737)	RPL35 (ENSNVIG00000005757)	ARP5L (ENSNVIG00000005786)	GOLGA1 (ENSNVIG00000005806)	SCAI (ENSNVIG00000005835)	PPP6C (ENSNVIG00000005944)	RABEPK (ENSNVIG00000005963)	HSPA5 (ENSNVIG00000006019)
Ferret	MODERN SPECIES	218				ENSMPUG00000019263	ENSMPUG00000019259	ENSMPUG00000019255	ENSMPUG00000019253	ENSMPUG00000019248	OR5C1 (ENSMPUG00000019243)	OR1K1 (ENSMPUG00000019240)	PDCL (ENSMPUG00000014149)	RC3H2 (ENSMPUG00000014141)	ZBTB26 (ENSMPUG00000019237)	RABGAP1 (ENSMPUG00000014129)	STRBP (ENSMPUG00000014119)	CRB2 (ENSMPUG00000014059) #22	DENND1A (ENSMPUG00000014047) #23	LHX2 (ENSMPUG00000014042) #24	ENSMPUG00000014039	NEK6 (ENSMPUG00000013997)	PSMB7 (ENSMPUG00000013994)	ADGRD2 (ENSMPUG00000013976)	NR5A1 (ENSMPUG00000013973)	ENSMPUG00000013968	NR6A1 (ENSMPUG00000013965)	OLFML2A (ENSMPUG00000013962)	WDR38 (ENSMPUG00000013960)	RPL35 (ENSMPUG00000013950)	ENSMPUG00000013947	ARPC5L (ENSMPUG00000013924)	GOLGA1 (ENSMPUG00000013917)
Ursidae	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000163223	ENSGT01100000263600.a.a	ENSGT00940000165463	ENSGT00940000165831	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456.p	ENSGT00940000163456.o	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419.h	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
Giant Panda	MODERN SPECIES	17	OR1L1 (ENSAMEG00000016163)	OR1L3 (ENSAMEG00000019647)	ENSAMEG00000002589	ENSAMEG00000028985	ENSAMEG00000024438	ENSAMEG00000028263	ENSAMEG00000019631	OR5C1 (ENSAMEG00000018726)	OR1K1 (ENSAMEG00000018728)	PDCL (ENSAMEG00000024729)	RC3H2 (ENSAMEG00000006498)	ZBTB6 (ENSAMEG00000027846)	ZBTB26 (ENSAMEG00000030781)	RABGAP1 (ENSAMEG00000010958)	STRBP (ENSAMEG00000011017)	CRB2 (ENSAMEG00000011056) #22	DENND1A (ENSAMEG00000011077) #23	LHX2 (ENSAMEG00000011089) #24	NEK6 (ENSAMEG00000011113)	PSMB7 (ENSAMEG00000011136)	NR5A1 (ENSAMEG00000027142)	NR6A1 (ENSAMEG00000011212)	OLFML2A (ENSAMEG00000016521)	WDR38 (ENSAMEG00000029862)	RPL35 (ENSAMEG00000016537)	ENSAMEG00000016540	GOLGA1 (ENSAMEG00000016553)	SCAI (ENSAMEG00000026864)	PPP6C (ENSAMEG00000016567)	RABEPK (ENSAMEG00000016577)	HSPA5 (ENSAMEG00000016583)
Ursus	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000164453	ENSGT00940000163223.i	ENSGT01100000263600.a.a	ENSGT00940000161916	ENSGT00940000165831	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456.o	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419.h	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
American black bear	MODERN SPECIES	205																CRB2 (ENSUAMG00000017892) #22	DENND1A (ENSUAMG00000017889) #23	LHX2 (ENSUAMG00000017888) #24
Canidae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000005084	ENSGT00910000145076	ENSGT00390000010743.b	ENSGT00940000165018	ENSGT01100000264118	ENSGT00940000165463	ENSGT00940000163938	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00390000005534.b.b.c.b.a.a.b.a.b
Canis_lupus	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00910000145076	ENSGT00390000010743.b	ENSGT00940000162739	ENSGT01100000264118	ENSGT00940000165463	ENSGT00940000161916	ENSGT00940000163938	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00390000005534.b.b.c.b.a.a.b.a.b
Dingo	MODERN SPECIES	327	ENSCAFG00020015247	ENSCAFG00020015249	ENSCAFG00020015252	ENSCAFG00020015255	ENSCAFG00020015260	ENSCAFG00020015267	ENSCAFG00020015271	OR5C1 (ENSCAFG00020015275)	OR1K1 (ENSCAFG00020015278)	PDCL (ENSCAFG00020015282)	RC3H2 (ENSCAFG00020015288)	ZBTB6 (ENSCAFG00020015343)	ZBTB26 (ENSCAFG00020015344)	RABGAP1 (ENSCAFG00020015350)	STRBP (ENSCAFG00020015377)	CRB2 (ENSCAFG00020015541) #22	DENND1A (ENSCAFG00020015553) #23	LHX2 (ENSCAFG00020015565) #24	NEK6 (ENSCAFG00020015571)	PSMB7 (ENSCAFG00020015572)	NR5A1 (ENSCAFG00020015577)	NR6A1 (ENSCAFG00020015583)	OLFML2A (ENSCAFG00020015588)	WDR38 (ENSCAFG00020015590)	ENSCAFG00020015596	ARPC5L (ENSCAFG00020015602)	GOLGA1 (ENSCAFG00020015604)	SCAI (ENSCAFG00020015613)	PPP6C (ENSCAFG00020015642)	ENSCAFG00020015654	RABEPK (ENSCAFG00020015656)
Dog	MODERN SPECIES	37	MRRF (ENSCAFG00845013742)	PTGS1 (ENSCAFG00845013501)	OR1L8 (ENSCAFG00845013392)	ENSCAFG00845013345	OR1L6 (ENSCAFG00845013333)	OR1AF1 (ENSCAFG00845013294)	OR5C1 (ENSCAFG00845013286)	ENSCAFG00845013274	OR1K1 (ENSCAFG00845013262)	PDCL (ENSCAFG00845013251)	RC3H2 (ENSCAFG00845013141)	ZBTB6 (ENSCAFG00845013092)	GPR21 (ENSCAFG00845013055)	RABGAP1 (ENSCAFG00845012315)	STRBP (ENSCAFG00845011747)	CRB2 (ENSCAFG00845011628) #22	DENND1A (ENSCAFG00845011028) #23	LHX2 (ENSCAFG00845010906) #24	NEK6 (ENSCAFG00845010805)	PSMB7 (ENSCAFG00845010709)	ENSCAFG00845010600	NR5A1 (ENSCAFG00845010545)	NR6A1 (ENSCAFG00845010445)	OLFML2A (ENSCAFG00845010401)	WDR38 (ENSCAFG00845010303)	RPL35 (ENSCAFG00845010255)	ARPC5L (ENSCAFG00845010220)	GOLGA1 (ENSCAFG00845010046)	SCAI (ENSCAFG00845009946)	PPP6C (ENSCAFG00845009869)	ENSCAFG00845009818
Red fox	MODERN SPECIES	77	ENSVVUG00000009467	ENSVVUG00000009471	ENSVVUG00000009474	ENSVVUG00000009478	ENSVVUG00000009484	ENSVVUG00000009488	ENSVVUG00000009495	OR5C1 (ENSVVUG00000009500)	OR1K1 (ENSVVUG00000009503)	PDCL (ENSVVUG00000009506)	RC3H2 (ENSVVUG00000009519)	ZBTB6 (ENSVVUG00000009554)	ZBTB26 (ENSVVUG00000009562)	RABGAP1 (ENSVVUG00000009567)	STRBP (ENSVVUG00000009636)	CRB2 (ENSVVUG00000009672) #22	DENND1A (ENSVVUG00000009688) #23	LHX2 (ENSVVUG00000009751) #24	NEK6 (ENSVVUG00000009771)	PSMB7 (ENSVVUG00000009795)	NR5A1 (ENSVVUG00000009804)	NR6A1 (ENSVVUG00000009870)	OLFML2A (ENSVVUG00000009902)	WDR38 (ENSVVUG00000009939)	RPL35 (ENSVVUG00000009948)	ARPC5L (ENSVVUG00000009965)	GOLGA1 (ENSVVUG00000009974)	SCAI (ENSVVUG00000009995)	PPP6C (ENSVVUG00000010053)	ENSVVUG00000010058	RABEPK (ENSVVUG00000010062)
Felidae	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000163223.k	ENSGT00940000165463.e	ENSGT00940000161916	ENSGT00940000165463.f	ENSGT00940000165831	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000158501.y	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
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Tiger	MODERN SPECIES	473	ENSPTIG00000012515	ENSPTIG00000005970	OR1B1 (ENSPTIG00000005974)	OR1L1 (ENSPTIG00000005981)	ENSPTIG00000005983	ENSPTIG00000005987	ENSPTIG00000006001	OR5C1 (ENSPTIG00000006004)	OR1K1 (ENSPTIG00000006006)	PDCL (ENSPTIG00000014133)	RC3H2 (ENSPTIG00000014257)	ZBTB6 (ENSPTIG00000006037)	ZBTB26 (ENSPTIG00000006045)	RABGAP1 (ENSPTIG00000015522)	STRBP (ENSPTIG00000015831)	CRB2 (ENSPTIG00000016442) #22	DENND1A (ENSPTIG00000017243) #23	LHX2 (ENSPTIG00000017789) #24	NEK6 (ENSPTIG00000018068)	PSMB7 (ENSPTIG00000018529)	ADGRD2 (ENSPTIG00000018740)	NR5A1 (ENSPTIG00000018980)	NR6A1 (ENSPTIG00000019310)	OLFML2A (ENSPTIG00000000256)	WDR38 (ENSPTIG00000001191)	ENSPTIG00000003358	ENSPTIG00000004434	GOLGA1 (ENSPTIG00000005468)	SCAI (ENSPTIG00000006221)	PPP6C (ENSPTIG00000007118)	ENSPTIG00000009511
Panthera_a	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000163649	ENSGT00930000151076	ENSGT00900000141254	ENSGT00940000164453	ENSGT00940000163223.l	ENSGT00940000165463.e	ENSGT00940000165831	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000158501.y	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
leopard	MODERN SPECIES	83								OR5C1 (ENSPPRG00000017227)	OR1K1 (ENSPPRG00000017241)	PDCL (ENSPPRG00000005705)	RC3H2 (ENSPPRG00000008698)	ZBTB6 (ENSPPRG00000017301)	ZBTB26 (ENSPPRG00000017315)	RABGAP1 (ENSPPRG00000009610)	STRBP (ENSPPRG00000013039)	CRB2 (ENSPPRG00000013808) #22	DENND1A (ENSPPRG00000024434) #23	LHX2 (ENSPPRG00000024346) #24	NEK6 (ENSPPRG00000002216)	PSMB7 (ENSPPRG00000002455)	ADGRD2 (ENSPPRG00000003636)	NR5A1 (ENSPPRG00000004846)	NR6A1 (ENSPPRG00000007044)	OLFML2A (ENSPPRG00000008528)	WDR38 (ENSPPRG00000009371)	RPL35 (ENSPPRG00000009584)	ENSPPRG00000011416	GOLGA1 (ENSPPRG00000012551)	SCAI (ENSPPRG00000013250)	PPP6C (ENSPPRG00000016362)	RABEPK (ENSPPRG00000020336)
lion	MODERN SPECIES	13	ENSPLOG00000017348	OR1Q1 (ENSPLOG00000017333)	ENSPLOG00000017317	OR1B1 (ENSPLOG00000017302)	OR1L1 (ENSPLOG00000017277)	ENSPLOG00000017253	ENSPLOG00000016983	OR5C1 (ENSPLOG00000016939)	OR1K1 (ENSPLOG00000016918)	PDCL (ENSPLOG00000016803)	RC3H2 (ENSPLOG00000016679)	ZBTB6 (ENSPLOG00000016627)	ZBTB26 (ENSPLOG00000016607)	RABGAP1 (ENSPLOG00000016520)	STRBP (ENSPLOG00000016383)	CRB2 (ENSPLOG00000016222) #22	DENND1A (ENSPLOG00000015992) #23	LHX2 (ENSPLOG00000015889) #24	NEK6 (ENSPLOG00000015777)	PSMB7 (ENSPLOG00000015690)	ADGRD2 (ENSPLOG00000015510)	NR5A1 (ENSPLOG00000015373)	NR6A1 (ENSPLOG00000014966)	OLFML2A (ENSPLOG00000014824)	WDR38 (ENSPLOG00000014714)	RPL35 (ENSPLOG00000014664)	ENSPLOG00000014601	GOLGA1 (ENSPLOG00000014524)	SCAI (ENSPLOG00000014157)	ENSPLOG00000014063	PPP6C (ENSPLOG00000013892)
Cat	MODERN SPECIES	244	ENSFCAG00000037877	ENSFCAG00000042922	ENSFCAG00000043029	ENSFCAG00000040999	ENSFCAG00000031274	ENSFCAG00000053101	ENSFCAG00000022283	OR5C1 (ENSFCAG00000007372)	OR1K1 (ENSFCAG00000007373)	PDCL (ENSFCAG00000026121)	RC3H2 (ENSFCAG00000007375)	ZBTB6 (ENSFCAG00000039122)	ZBTB26 (ENSFCAG00000044625)	RABGAP1 (ENSFCAG00000004092)	ENSFCAG00000004095	CRB2 (ENSFCAG00000005042) #22	DENND1A (ENSFCAG00000005043) #23	LHX2 (ENSFCAG00000006890) #24	NEK6 (ENSFCAG00000014563)	PSMB7 (ENSFCAG00000014567)	ADGRD2 (ENSFCAG00000052526)	NR5A1 (ENSFCAG00000022552)	NR6A1 (ENSFCAG00000005507)	OLFML2A (ENSFCAG00000003257)	WDR38 (ENSFCAG00000028099)	RPL35 (ENSFCAG00000030388)	ENSFCAG00000028753	GOLGA1 (ENSFCAG00000003260)	SCAI (ENSFCAG00000003261)	PPP6C (ENSFCAG00000037922)	ENSFCAG00000035560
Laurasiatheria_c	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000163038.a.a	ENSGT00940000163649	ENSGT00900000141254	ENSGT00940000164453	ENSGT00940000163223	ENSGT00940000165463	ENSGT00940000161916	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
Equus	ANCESTRAL SPECIES	30	ENSGT00940000163649	ENSGT00900000141254	ENSGT00940000164453	ENSGT00940000163223	ENSGT00940000165463.c	ENSGT00940000163456	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
Donkey	MODERN SPECIES	1	OR1Q1 (ENSEASG00005021018)	OR1B1 (ENSEASG00005021015)	OR1L1 (ENSEASG00005021014)	OR1L3 (ENSEASG00005021012)	ENSEASG00005021051	ENSEASG00005021005	OR5C1 (ENSEASG00005030075)	OR1K1 (ENSEASG00005020997)	PDCL (ENSEASG00005027986)	RC3H2 (ENSEASG00005020897)	ZBTB6 (ENSEASG00005033263)	ZBTB26 (ENSEASG00005020877)	GPR21 (ENSEASG00005023908)	RABGAP1 (ENSEASG00005020868)	STRBP (ENSEASG00005020855)	CRB2 (ENSEASG00005020846) #22	DENND1A (ENSEASG00005020820) #23	LHX2 (ENSEASG00005020812) #24	NEK6 (ENSEASG00005020808)	PSMB7 (ENSEASG00005020802)	ADGRD2 (ENSEASG00005020796)	NR5A1 (ENSEASG00005020785)	NR6A1 (ENSEASG00005020778)	OLFML2A (ENSEASG00005020762)	WDR38 (ENSEASG00005020747)	ENSEASG00005035844	ARPC5L (ENSEASG00005020744)	GOLGA1 (ENSEASG00005020734)	SCAI (ENSEASG00005020664)	PPP6C (ENSEASG00005020651)	RABEPK (ENSEASG00005020648)
Horse	MODERN SPECIES	17	OR1L8 (ENSECAG00000047023)	ENSECAG00000057932	ENSECAG00000005623	ENSECAG00000028129	OR1L6E (ENSECAG00000047569)	ENSECAG00000041269	ENSECAG00000042374	ENSECAG00000039194	PDCL (ENSECAG00000021253)	RC3H2 (ENSECAG00000022176)	ZBTB6 (ENSECAG00000002222)	ZBTB26 (ENSECAG00000017397)	RABGAP1 (ENSECAG00000017729)	GPR21 (ENSECAG00000053059)	STRBP (ENSECAG00000008465)	CRB2 (ENSECAG00000021531) #22	DENND1A (ENSECAG00000022391) #23	ENSECAG00000027494	ENSECAG00000055062	LHX2 (ENSECAG00000009405) #24	NEK6 (ENSECAG00000009941)	PSMB7 (ENSECAG00000023415)	ADGRD2 (ENSECAG00000009351)	NR5A1 (ENSECAG00000013752)	NR6A1 (ENSECAG00000021324)	OLFML2A (ENSECAG00000023908)	ENSECAG00000045439	WDR38 (ENSECAG00000006383)	GOLGA1 (ENSECAG00000015124)	SCAI (ENSECAG00000024008)	PPP6C (ENSECAG00000015767)
Chiroptera	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000163027	ENSGT00940000163995	ENSGT00940000162508	ENSGT00940000163451	ENSGT00940000165929	ENSGT00930000151076	ENSGT00940000163456	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
Microchiroptera	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000162849.B.d	ENSGT00940000163038.a.b	ENSGT00940000163027	ENSGT00940000163995	ENSGT00940000162508	ENSGT00940000165929	ENSGT00930000151076	ENSGT00940000163456	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763	ENSGT00940000154787
Greater horseshoe bat	MODERN SPECIES	3	ENSRFEG00010020194	ENSRFEG00010020204	ENSRFEG00010020211	ENSRFEG00010020215	ENSRFEG00010020226	ENSRFEG00010020245	ENSRFEG00010020260	ENSRFEG00010020312	ENSRFEG00010020327	OR5C1 (ENSRFEG00010020346)	PDCL (ENSRFEG00010020362)	RC3H2 (ENSRFEG00010020390)	ZBTB6 (ENSRFEG00010020449)	RABGAP1 (ENSRFEG00010020470)	STRBP (ENSRFEG00010020509)	CRB2 (ENSRFEG00010020565) #22	DENND1A (ENSRFEG00010020653) #23	LHX2 (ENSRFEG00010020804) #24	NEK6 (ENSRFEG00010010318)	PSMB7 (ENSRFEG00010010524)	NR5A1 (ENSRFEG00010010595)	NR6A1 (ENSRFEG00010010735)	OLFML2A (ENSRFEG00010010880)	WDR38 (ENSRFEG00010010924)	RPL35 (ENSRFEG00010011212)	ARPC5L (ENSRFEG00010011262)	GOLGA1 (ENSRFEG00010011365)	SCAI (ENSRFEG00010011538)	PPP6C (ENSRFEG00010011691)	RABEPK (ENSRFEG00010011922)	HSPA5 (ENSRFEG00010012022)
Microbat	MODERN SPECIES	1110							RGS3 (ENSMLUG00000015873)	PDCL (ENSMLUG00000011422)	RC3H2 (ENSMLUG00000013992)	ZBTB6 (ENSMLUG00000014003)	ZBTB26 (ENSMLUG00000014009)	RABGAP1 (ENSMLUG00000003865)	STRBP (ENSMLUG00000003882)	GPR21 (ENSMLUG00000003878)	ENSMLUG00000024699	CRB2 (ENSMLUG00000024466) #22	DENND1A (ENSMLUG00000016076) #23	LHX2 (ENSMLUG00000016917) #24	NEK6 (ENSMLUG00000007482)	PSMB7 (ENSMLUG00000007496)	NR5A1 (ENSMLUG00000005775)	NR6A1 (ENSMLUG00000014714)	OLFML2A (ENSMLUG00000017669)	WDR38 (ENSMLUG00000024073)	RPL35 (ENSMLUG00000029323)	ARPC5L (ENSMLUG00000009429)	GOLGA1 (ENSMLUG00000009442)	SCAI (ENSMLUG00000015214)	ENSMLUG00000009537	HSPA5 (ENSMLUG00000009546)	PPP6C (ENSMLUG00000009516)
Megabat	MODERN SPECIES	766								OR5C1 (ENSPVAG00000017587)	PDCL (ENSPVAG00000017590)	RC3H2 (ENSPVAG00000017592)	ZBTB6 (ENSPVAG00000017594)	ZBTB26 (ENSPVAG00000017595)	RABGAP1 (ENSPVAG00000017596)	GPR21 (ENSPVAG00000017605)	STRBP (ENSPVAG00000017607)	CRB2 (ENSPVAG00000017616) #22	DENND1A (ENSPVAG00000017623) #23
Eulipotyphla	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183101.a.b.b #22
Hedgehog	MODERN SPECIES	16157																CRB2 (ENSEEUG00000011381) #22
Atlantogenata	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00930000151076	ENSGT00900000141254	ENSGT00940000164453	ENSGT00940000163223	ENSGT00940000161916	ENSGT00940000165831	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
Xenarthra	ANCESTRAL SPECIES	90									ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763	ENSGT00940000154787	ENSGT00940000156611
Armadillo	MODERN SPECIES	2027							ENSDNOG00000003471	PDCL (ENSDNOG00000044206)	ENSDNOG00000043976	RC3H2 (ENSDNOG00000014557)	ZBTB6 (ENSDNOG00000014591)	ZBTB26 (ENSDNOG00000045813)	ENSDNOG00000037259	RABGAP1 (ENSDNOG00000013366)	STRBP (ENSDNOG00000043330)	CRB2 (ENSDNOG00000038587) #22	DENND1A (ENSDNOG00000034926) #23	ENSDNOG00000045998	LHX2 (ENSDNOG00000000465) #24	NEK6 (ENSDNOG00000015320)	PSMB7 (ENSDNOG00000015332)	ADGRD2 (ENSDNOG00000015410)	NR5A1 (ENSDNOG00000040922)	ENSDNOG00000032252	NR6A1 (ENSDNOG00000017832)	ENSDNOG00000033680	OLFML2A (ENSDNOG00000040474)	WDR38 (ENSDNOG00000046480)	ENSDNOG00000033968	GOLGA1 (ENSDNOG00000000005)	SCAI (ENSDNOG00000000007)
Afrotheria	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00930000151076	ENSGT00900000141254	ENSGT00940000164453	ENSGT00940000163223	ENSGT00940000161916	ENSGT00940000165831	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
Afrotheria_a	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00930000151076	ENSGT00900000141254	ENSGT00940000164453	ENSGT00940000163223	ENSGT00940000161916	ENSGT00940000165831	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384.f	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
Elephant	MODERN SPECIES	472	ENSLAFG00000030694	ENSLAFG00000032331	ENSLAFG00000029058	ENSLAFG00000032551	ENSLAFG00000026441	ENSLAFG00000026810	ENSLAFG00000004410	ENSLAFG00000032586	OR1K1 (ENSLAFG00000004845)	PDCL (ENSLAFG00000011935)	RC3H2 (ENSLAFG00000003521)	ZBTB6 (ENSLAFG00000014046)	ZBTB26 (ENSLAFG00000012394)	RABGAP1 (ENSLAFG00000012397)	STRBP (ENSLAFG00000012408)	CRB2 (ENSLAFG00000000156) #22	DENND1A (ENSLAFG00000011628) #23	LHX2 (ENSLAFG00000007827) #24	NEK6 (ENSLAFG00000021394)	PSMB7 (ENSLAFG00000009265)	ENSLAFG00000018553	NR5A1 (ENSLAFG00000018557)	NR6A1 (ENSLAFG00000011676)	OLFML2A (ENSLAFG00000013500)	WDR38 (ENSLAFG00000010023)	RPL35 (ENSLAFG00000010031)	ARPC5L (ENSLAFG00000010034)	GOLGA1 (ENSLAFG00000010035)	SCAI (ENSLAFG00000010037)	PPP6C (ENSLAFG00000010043)	RABEPK (ENSLAFG00000010044)
Hyrax	MODERN SPECIES	3603																CRB2 (ENSPCAG00000015322) #22	DENND1A (ENSPCAG00000015424) #23
Marsupialia	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000162508.j	ENSGT00940000163649	ENSGT00930000151076.i	ENSGT00940000161916	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456.q	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763
Marsupialia_b	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000162508.j	ENSGT00940000163649	ENSGT00930000151076.i	ENSGT00940000161916	ENSGT00940000163938	ENSGT00940000163456.q	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261.d #23	ENSGT00940000158540.b #24	ENSGT00940000158540.a #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961
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Diprotodontia_a	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00900000141254.c	ENSGT00900000141254.d	ENSGT00940000164886	ENSGT00940000163103	ENSGT00930000151076.i	ENSGT00940000161916	ENSGT00940000163456.r	ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153683.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261.d #23	ENSGT00940000158540.a #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000162358	ENSGT00390000016384	ENSGT00940000158501.g	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763	ENSGT00940000154787
Common wonbat	DUPLICATION
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Common wonbat	MODERN SPECIES	1024	ENSVURG00010016945	ENSVURG00010016949	ENSVURG00010016951	ENSVURG00010016971	ENSVURG00010017025	ENSVURG00010017036	ENSVURG00010017041	ENSVURG00010017046	ENSVURG00010017055	ENSVURG00010017064	ENSVURG00010017076	ENSVURG00010017094	ENSVURG00010017097	ENSVURG00010017110	ENSVURG00010017151	ENSVURG00010017196 #22	ENSVURG00010017253 #23	ENSVURG00010017362 #24	ENSVURG00010017384	ENSVURG00010017394	ENSVURG00010017409	ENSVURG00010017416	ENSVURG00010017449	ENSVURG00010017466	ENSVURG00010017496	ENSVURG00010017501	ENSVURG00010017517	ENSVURG00010017537	ENSVURG00010017559	ENSVURG00010017575	ENSVURG00010017591
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Wallaby	MODERN SPECIES	5507																CRB2 (ENSMEUG00000013792) #22	ENSMEUG00000013838 #23
Opossum	MODERN SPECIES		ENSMODG00000037549	ENSMODG00000023548	ENSMODG00000040283	ENSMODG00000044320	ENSMODG00000019714	ENSMODG00000019717	ENSMODG00000019715	ENSMODG00000019718	OR1K1 (ENSMODG00000019721)	PDCL (ENSMODG00000048390)	RC3H2 (ENSMODG00000019725)	ZBTB6 (ENSMODG00000023551)	ZBTB26 (ENSMODG00000023552)	RABGAP1 (ENSMODG00000019729)	STRBP (ENSMODG00000019732)	ENSMODG00000019734 #22	DENND1A (ENSMODG00000019737) #23	LHX2 (ENSMODG00000019739) #24	NEK6 (ENSMODG00000019741)	PSMB7 (ENSMODG00000019742)	ENSMODG00000019744	NR5A1 (ENSMODG00000019746)	NR6A1 (ENSMODG00000019748)	OLFML2A (ENSMODG00000019750)	ENSMODG00000019752	RPL35 (ENSMODG00000019753)	ARPC5L (ENSMODG00000019755)	GOLGA1 (ENSMODG00000019758)	SCAI (ENSMODG00000019760)	ENSMODG00000029560	PPP6C (ENSMODG00000039439)
Platypus	MODERN SPECIES	15	TTLL11 (ENSOANG00000004693)	ENSOANG00000043821	NDUFA8 (ENSOANG00000044958)	ENSOANG00000004699	LHX6 (ENSOANG00000046061)	RBM18 (ENSOANG00000039349)	ENSOANG00000008199	ENSOANG00000039361	PTGS1 (ENSOANG00000008197)	PDCL (ENSOANG00000045648)	RC3H2 (ENSOANG00000008194)	ZBTB6 (ENSOANG00000040131)	ZBTB26 (ENSOANG00000051183)	RABGAP1 (ENSOANG00000044188)	STRBP (ENSOANG00000011875)	ENSOANG00000020908 #22	DENND1A (ENSOANG00000045046) #23	LHX2 (ENSOANG00000043102) #24	NEK6 (ENSOANG00000000382)	PSMB7 (ENSOANG00000048360)	ENSOANG00000012921	NR5A1 (ENSOANG00000012920)	NR6A1 (ENSOANG00000013303)	OLFML2A (ENSOANG00000013302)	RPL35 (ENSOANG00000036932)	ARPC5L (ENSOANG00000038645)	GOLGA1 (ENSOANG00000013299)	SCAI (ENSOANG00000013296)	PPP6C (ENSOANG00000038056)	RABEPK (ENSOANG00000013292)	HSPA5 (ENSOANG00000013291)
Sauria	ANCESTRAL SPECIES	33	ENSGT00940000164999	ENSGT00390000008938	ENSGT00390000018089	ENSGT00940000156868	ENSGT00390000013765	ENSGT00910000145076	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000010743.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00390000016384	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763	ENSGT00940000154787
Archelosauria	ANCESTRAL SPECIES	32	ENSGT00940000156689	ENSGT00940000164999	ENSGT00390000008938	ENSGT00390000018089	ENSGT00940000156868	ENSGT00390000013765	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000010743.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00390000016384	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763	ENSGT00940000154787
Archosauria	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00940000156689	ENSGT00940000164999	ENSGT00390000008938	ENSGT00390000018089	ENSGT00940000156868	ENSGT00390000013765	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000010743.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00390000016384	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763	ENSGT00940000154787
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Neognathae	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000164999	ENSGT00390000008938	ENSGT00390000018089	ENSGT00940000156868	ENSGT00390000013765	ENSGT00390000005084	ENSGT01100000264691	ENSGT00390000010743.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00390000016384	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763	ENSGT00940000154787
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Anatidae	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00390000000223	ENSGT00940000155853	ENSGT00940000156689	ENSGT00390000008938	ENSGT00390000018089	ENSGT00940000156868.b	ENSGT00390000013765	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000010743.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00390000016384	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763	ENSGT00940000154787
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Great tit	MODERN SPECIES	7	STOM (ENSPMJG00000000645)	DAB2IP (ENSPMJG00000000512)	TTLL11 (ENSPMJG00000000486)	ENSPMJG00000000458	NDUFA8 (ENSPMJG00000000445)	MORN5 (ENSPMJG00000000430)	LHX6 (ENSPMJG00000000419)	RBM18 (ENSPMJG00000000417)	MRRF (ENSPMJG00000000410)	PTGS1 (ENSPMJG00000000401)	RC3H2 (ENSPMJG00000000346)	ZBTB6 (ENSPMJG00000000344)	ZBTB26 (ENSPMJG00000000339)	RABGAP1 (ENSPMJG00000000285)	STRBP (ENSPMJG00000000230)	CRB2 (ENSPMJG00000000171) #22	DENND1A (ENSPMJG00000000071) #23	LHX2 (ENSPMJG00000019177) #24	NEK6 (ENSPMJG00000019176)	PSMB7 (ENSPMJG00000019175)	ADGRD2 (ENSPMJG00000019174)	NR5A1 (ENSPMJG00000019173)	NR6A1 (ENSPMJG00000019171)	OLFML2A (ENSPMJG00000019170)	RPL35 (ENSPMJG00000019169)	SCAI (ENSPMJG00000019168)	GOLGA1 (ENSPMJG00000019167)	ARPC5L (ENSPMJG00000019166)	PPP6C (ENSPMJG00000019165)	RABEPK (ENSPMJG00000019164)	HSPA5 (ENSPMJG00000019163)
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Passeriformes_g	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000164999	ENSGT00390000008938	ENSGT00390000018089	ENSGT00940000156868	ENSGT00390000013765	ENSGT00390000005084	ENSGT01100000264691	ENSGT00390000010743.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00390000016384	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763	ENSGT00940000154787
Medium ground finch	MODERN SPECIES	32	TTLL11 (ENSGFOG00000003947)	ENSGFOG00000003930	NDUFA8 (ENSGFOG00000003920)	MORN5 (ENSGFOG00000003910)	ENSGFOG00000003893	LHX6 (ENSGFOG00000003881)	RBM18 (ENSGFOG00000003875)	MRRF (ENSGFOG00000003864)	PTGS1 (ENSGFOG00000003848)	PDCL (ENSGFOG00000003838)	RC3H2 (ENSGFOG00000003800)	ZBTB6 (ENSGFOG00000003785)	ZBTB26 (ENSGFOG00000003774)	RABGAP1 (ENSGFOG00000003746)	STRBP (ENSGFOG00000003717)	CRB2 (ENSGFOG00000003494) #22	DENND1A (ENSGFOG00000003357) #23	LHX2 (ENSGFOG00000003318) #24	NEK6 (ENSGFOG00000003257)	PSMB7 (ENSGFOG00000003237)	ADGRD2 (ENSGFOG00000003184)	ENSGFOG00000003161	NR6A1 (ENSGFOG00000003136)	NR5A1 (ENSGFOG00000003120)	OLFML2A (ENSGFOG00000003090)	RPL35 (ENSGFOG00000003076)	SCAI (ENSGFOG00000002633)	GOLGA1 (ENSGFOG00000002568)	ARPC5L (ENSGFOG00000002550)	PPP6C (ENSGFOG00000002540)	HSPA5 (ENSGFOG00000002477)
Passeroidea	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000164999	ENSGT00390000008938	ENSGT00390000018089	ENSGT00940000156868	ENSGT00390000013765	ENSGT00390000005084	ENSGT01100000264691	ENSGT00390000010743.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00390000016384	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763	ENSGT00940000154787
Common canary	MODERN SPECIES	22	ENSSCAG00000000207	ENSSCAG00000000192	ENSSCAG00000000172	NDUFA8 (ENSSCAG00000000164)	MORN5 (ENSSCAG00000000147)	LHX6 (ENSSCAG00000016210)	RBM18 (ENSSCAG00000016209)	MRRF (ENSSCAG00000016205)	PTGS1 (ENSSCAG00000016199)	PDCL (ENSSCAG00000016197)	RC3H2 (ENSSCAG00000016190)	ZBTB6 (ENSSCAG00000016187)	ZBTB26 (ENSSCAG00000016184)	RABGAP1 (ENSSCAG00000016179)	STRBP (ENSSCAG00000016175)	CRB2 (ENSSCAG00000016174) #22	DENND1A (ENSSCAG00000016165) #23	LHX2 (ENSSCAG00000016158) #24	NEK6 (ENSSCAG00000016156)	PSMB7 (ENSSCAG00000016152)	ADGRD2 (ENSSCAG00000016150)	NR5A1 (ENSSCAG00000016149)	NR6A1 (ENSSCAG00000016146)	OLFML2A (ENSSCAG00000016141)	RPL35 (ENSSCAG00000016137)	SCAI (ENSSCAG00000016132)	GOLGA1 (ENSSCAG00000016125)	ARPC5L (ENSSCAG00000016122)	RABEPK (ENSSCAG00000016120)	PPP6C (ENSSCAG00000016119)	HSPA5 (ENSSCAG00000016115)
Zebra finch	MODERN SPECIES	8	TTLL11 (ENSTGUG00000006765)	ENSTGUG00000027059	ENSTGUG00000019874	MORN5 (ENSTGUG00000006779)	LHX6 (ENSTGUG00000006782)	RBM18 (ENSTGUG00000029059)	MRRF (ENSTGUG00000022064)	ENSTGUG00000006813	PTGS1 (ENSTGUG00000006822)	PDCL (ENSTGUG00000006880)	RC3H2 (ENSTGUG00000006889)	RABGAP1 (ENSTGUG00000006934)	ZBTB26 (ENSTGUG00000019106)	GPR21 (ENSTGUG00000021427)	STRBP (ENSTGUG00000006984)	CRB2 (ENSTGUG00000007009) #22	DENND1A (ENSTGUG00000007024) #23	LHX2 (ENSTGUG00000028408) #24	NEK6 (ENSTGUG00000007095)	PSMB7 (ENSTGUG00000007119)	ADGRD2 (ENSTGUG00000007153)	NR5A1 (ENSTGUG00000007170)	NR6A1 (ENSTGUG00000020793)	OLFML2A (ENSTGUG00000007193)	RPL35 (ENSTGUG00000007196)	SCAI (ENSTGUG00000007202)	GOLGA1 (ENSTGUG00000007238)	ARPC5L (ENSTGUG00000026340)	PPP6C (ENSTGUG00000007259)	RABEPK (ENSTGUG00000007274)	HSPA5 (ENSTGUG00000007279)
Neognathae_c	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00940000164999	ENSGT00390000008938	ENSGT00390000018089	ENSGT00940000156868	ENSGT00390000013765	ENSGT00390000005084	ENSGT01100000264691	ENSGT00390000010743.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00390000016384	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763	ENSGT00940000154787
Kakapo	MODERN SPECIES	9	TTLL11 (ENSSHBG00005013177)	ENSSHBG00005013187	NDUFA8 (ENSSHBG00005013195)	MORN5 (ENSSHBG00005013202)	LHX6 (ENSSHBG00005013209)	RBM18 (ENSSHBG00005013223)	MRRF (ENSSHBG00005013229)	PTGS1 (ENSSHBG00005013245)	PDCL (ENSSHBG00005013266)	RC3H2 (ENSSHBG00005013282)	ZBTB6 (ENSSHBG00005013304)	ZBTB26 (ENSSHBG00005013312)	RABGAP1 (ENSSHBG00005013325)	GPR21 (ENSSHBG00005013336)	STRBP (ENSSHBG00005013360)	CRB2 (ENSSHBG00005013392) #22	ENSSHBG00005013419 #23	ENSSHBG00005013441 #23	LHX2 (ENSSHBG00005013472) #24	NEK6 (ENSSHBG00005013489)	PSMB7 (ENSSHBG00005013508)	ADGRD2 (ENSSHBG00005013538)	NR5A1 (ENSSHBG00005013567)	NR6A1 (ENSSHBG00005013599)	OLFML2A (ENSSHBG00005013635)	RPL35 (ENSSHBG00005013653)	SCAI (ENSSHBG00005013683)	GOLGA1 (ENSSHBG00005013725)	ARPC5L (ENSSHBG00005013738)	PPP6C (ENSSHBG00005013749)	RABEPK (ENSSHBG00005013762)
Golden eagle	MODERN SPECIES	16	TTLL11 (ENSACCG00020014314)	ENSACCG00020014359	NDUFA8 (ENSACCG00020014392)	MORN5 (ENSACCG00020014413)	LHX6 (ENSACCG00020014440)	RBM18 (ENSACCG00020014466)	MRRF (ENSACCG00020014489)	ENSACCG00020014513	PTGS1 (ENSACCG00020014538)	PDCL (ENSACCG00020014568)	RC3H2 (ENSACCG00020014591)	ZBTB6 (ENSACCG00020014617)	ZBTB26 (ENSACCG00020014635)	RABGAP1 (ENSACCG00020014692)	STRBP (ENSACCG00020014859)	CRB2 (ENSACCG00020015097) #22	DENND1A (ENSACCG00020015213) #23	LHX2 (ENSACCG00020015247) #24	NEK6 (ENSACCG00020015262)	PSMB7 (ENSACCG00020015286)	ADGRD2 (ENSACCG00020015309)	NR5A1 (ENSACCG00020015352)	NR6A1 (ENSACCG00020015466)	OLFML2A (ENSACCG00020015705)	RPL35 (ENSACCG00020015720)	SCAI (ENSACCG00020015805)	GOLGA1 (ENSACCG00020015908)	ARPC5L (ENSACCG00020016251)	PPP6C (ENSACCG00020016300)	RABEPK (ENSACCG00020016384)	HSPA5 (ENSACCG00020016447)
African ostrich	MODERN SPECIES	107														ENSSCUG00000000306	STRBP (ENSSCUG00000000312)	CRB2 (ENSSCUG00000000316) #22	DENND1A (ENSSCUG00000000324) #23	LHX2 (ENSSCUG00000000334) #24	NEK6 (ENSSCUG00000000337)	PSMB7 (ENSSCUG00000000341)	ADGRD2 (ENSSCUG00000000351)
Australian saltwater crocodile	MODERN SPECIES	44	DAB2IP (ENSCPRG00005010455)	TTLL11 (ENSCPRG00005010496)	ENSCPRG00005010514	NDUFA8 (ENSCPRG00005010529)	MORN5 (ENSCPRG00005010533)	LHX6 (ENSCPRG00005010540)	RBM18 (ENSCPRG00005010550)	MRRF (ENSCPRG00005010554)	PTGS1 (ENSCPRG00005010557)	PDCL (ENSCPRG00005010586)	RC3H2 (ENSCPRG00005010607)	ZBTB6 (ENSCPRG00005010641)	ZBTB26 (ENSCPRG00005010664)	RABGAP1 (ENSCPRG00005010670)	STRBP (ENSCPRG00005010682)	CRB2 (ENSCPRG00005010693) #22	DENND1A (ENSCPRG00005010705) #23	LHX2 (ENSCPRG00005010736) #24	NEK6 (ENSCPRG00005010741)	PSMB7 (ENSCPRG00005010746)	ADGRD2 (ENSCPRG00005010747)	NR5A1 (ENSCPRG00005010753)	NR6A1 (ENSCPRG00005010754)	OLFML2A (ENSCPRG00005010769)	ENSCPRG00005010804	RPL35 (ENSCPRG00005010810)	SCAI (ENSCPRG00005010819)	GOLGA1 (ENSCPRG00005010842)	ARPC5L (ENSCPRG00005010854)	PPP6C (ENSCPRG00005010855)	RABEPK (ENSCPRG00005010858)
Cryptodira	ANCESTRAL SPECIES	33	ENSGT00940000156689.bb	ENSGT00940000164999	ENSGT00940000156689.cb	ENSGT00390000008938	ENSGT00390000018089	ENSGT00940000156868	ENSGT00390000013765	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000010743.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00390000016384	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763	ENSGT00940000154787
Testudinoidea	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00940000156689.bb	ENSGT00940000164999	ENSGT00940000156689.cb	ENSGT00390000008938	ENSGT00390000018089	ENSGT00940000156868	ENSGT00390000013765	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000010743.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00390000016384	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763.s	ENSGT00940000154787
Testudinidae	ANCESTRAL SPECIES	29	ENSGT00940000155853	ENSGT00940000156689.bb	ENSGT00940000156689.cb	ENSGT00390000008938	ENSGT00390000018089	ENSGT00940000156868	ENSGT00390000013765	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000010743.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00390000016384	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763.s	ENSGT00940000154787
Goode s thornscrub tortoise	MODERN SPECIES	7	DAB2IP (ENSGEVG00005005158)	ENSGEVG00005005273	ENSGEVG00005005297	NDUFA8 (ENSGEVG00005005313)	MORN5 (ENSGEVG00005005343)	LHX6 (ENSGEVG00005005392)	RBM18 (ENSGEVG00005005423)	MRRF (ENSGEVG00005005435)	PTGS1 (ENSGEVG00005005484)	PDCL (ENSGEVG00005005578)	RC3H2 (ENSGEVG00005005601)	ZBTB6 (ENSGEVG00005005638)	ZBTB26 (ENSGEVG00005005652)	RABGAP1 (ENSGEVG00005005698)	STRBP (ENSGEVG00005005803)	CRB2 (ENSGEVG00005005877) #22	DENND1A (ENSGEVG00005006000) #23	LHX2 (ENSGEVG00005006137) #24	NEK6 (ENSGEVG00005006167)	PSMB7 (ENSGEVG00005006184)	ADGRD2 (ENSGEVG00005006212)	NR5A1 (ENSGEVG00005006277)	NR6A1 (ENSGEVG00005006341)	OLFML2A (ENSGEVG00005006363)	RPL35 (ENSGEVG00005006381)	SCAI (ENSGEVG00005006414)	GOLGA1 (ENSGEVG00005006470)	ARPC5L (ENSGEVG00005006487)	PPP6C (ENSGEVG00005006512)	RABEPK (ENSGEVG00005006525)	HSPA5 (ENSGEVG00005006550)
Abingdon island giant tortoise	MODERN SPECIES	2600	DAB2IP (ENSCABG00000001692)	ENSCABG00000001688	ENSCABG00000001683	NDUFA8 (ENSCABG00000001677)	ENSCABG00000001674	LHX6 (ENSCABG00000001667)	RBM18 (ENSCABG00000001664)	MRRF (ENSCABG00000001662)	PTGS1 (ENSCABG00000001646)	PDCL (ENSCABG00000001644)	RC3H2 (ENSCABG00000001633)	ZBTB6 (ENSCABG00000001629)	ZBTB26 (ENSCABG00000001626)	RABGAP1 (ENSCABG00000001622)	STRBP (ENSCABG00000001615)	CRB2 (ENSCABG00000001608) #22	DENND1A (ENSCABG00000001004) #23	LHX2 (ENSCABG00000000963) #24	NEK6 (ENSCABG00000000924)	PSMB7 (ENSCABG00000000915)	ADGRD2 (ENSCABG00000000904)	NR5A1 (ENSCABG00000000895)	NR6A1 (ENSCABG00000000881)	OLFML2A (ENSCABG00000000874)	RPL35 (ENSCABG00000000871)	SCAI (ENSCABG00000000867)	GOLGA1 (ENSCABG00000000473)	ARPC5L (ENSCABG00000000431)	PPP6C (ENSCABG00000000418)	RABEPK (ENSCABG00000000406)	HSPA5 (ENSCABG00000000399)
Emydidae	ANCESTRAL SPECIES	29	ENSGT00940000155853	ENSGT00940000156689.bb	ENSGT00940000164999	ENSGT00390000008938	ENSGT00390000018089	ENSGT00940000156868	ENSGT00390000013765	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000010743.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00390000016384	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763.s	ENSGT00940000154787
painted turtle	MODERN SPECIES	720	DAB2IP (ENSCPBG00000009928)	TTLL11 (ENSCPBG00000009920)	ENSCPBG00000009911	NDUFA8 (ENSCPBG00000009908)	MORN5 (ENSCPBG00000009903)	LHX6 (ENSCPBG00000009892)	RBM18 (ENSCPBG00000009885)	MRRF (ENSCPBG00000009881)	PTGS1 (ENSCPBG00000009876)	PDCL (ENSCPBG00000009868)	RC3H2 (ENSCPBG00000009811)	ZBTB6 (ENSCPBG00000009796)	ZBTB26 (ENSCPBG00000009793)	RABGAP1 (ENSCPBG00000009786)	STRBP (ENSCPBG00000009770)	CRB2 (ENSCPBG00000009754) #22	DENND1A (ENSCPBG00000009676) #23	ENSCPBG00000009639	LRRCC1 (ENSCPBG00000009631)	E2F5 (ENSCPBG00000009625)	RBIS (ENSCPBG00000009621)	CA13 (ENSCPBG00000009615)	CA1 (ENSCPBG00000009610)	CA3 (ENSCPBG00000009607)	CA2 (ENSCPBG00000009602)	ATP6V0D2 (ENSCPBG00000009584)	WWP1 (ENSCPBG00000009574)	RMDN1 (ENSCPBG00000009563)	CPNE3 (ENSCPBG00000009552)	CNGB3 (ENSCPBG00000009543)	ENSCPBG00000009517
Three-toed box turtle	MODERN SPECIES	113	ENSTMTG00000015418	ENSTMTG00000015437	ENSTMTG00000015447	NDUFA8 (ENSTMTG00000015460)	MORN5 (ENSTMTG00000015471)	LHX6 (ENSTMTG00000015494)	RBM18 (ENSTMTG00000015513)	MRRF (ENSTMTG00000015521)	PTGS1 (ENSTMTG00000015538)	PDCL (ENSTMTG00000015546)	RC3H2 (ENSTMTG00000015560)	ZBTB6 (ENSTMTG00000015606)	ZBTB26 (ENSTMTG00000015625)	RABGAP1 (ENSTMTG00000015634)	STRBP (ENSTMTG00000015690)	CRB2 (ENSTMTG00000015799) #22	DENND1A (ENSTMTG00000015853) #23	LHX2 (ENSTMTG00000015920) #24	NEK6 (ENSTMTG00000015931)	PSMB7 (ENSTMTG00000015950)	ADGRD2 (ENSTMTG00000015979)	NR5A1 (ENSTMTG00000016018)	NR6A1 (ENSTMTG00000016050)	OLFML2A (ENSTMTG00000016138)	RPL35 (ENSTMTG00000016153)	SCAI (ENSTMTG00000016173)	GOLGA1 (ENSTMTG00000016257)	ARPC5L (ENSTMTG00000016343)	PPP6C (ENSTMTG00000016358)	ENSTMTG00000016384	HSPA5 (ENSTMTG00000016414)
Chinese turtle	MODERN SPECIES	996								ENSPSIG00000004819	PTGS1 (ENSPSIG00000004843)	PDCL (ENSPSIG00000005382)	RC3H2 (ENSPSIG00000005393)	ZBTB6 (ENSPSIG00000001016)	ZBTB26 (ENSPSIG00000001041)	RABGAP1 (ENSPSIG00000005734)	STRBP (ENSPSIG00000005799)	CRB2 (ENSPSIG00000006404) #22	DENND1A (ENSPSIG00000004571) #23	LHX2 (ENSPSIG00000004916) #24	NEK6 (ENSPSIG00000004968)	PSMB7 (ENSPSIG00000005319)	ADGRD2 (ENSPSIG00000005660)	NR5A1 (ENSPSIG00000006131)	NR6A1 (ENSPSIG00000006445)
Lepidosauria	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000164999	ENSGT00390000008938	ENSGT00390000018089	ENSGT00940000156868	ENSGT00390000013765	ENSGT00910000145076	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000010743.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00390000016384	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763	ENSGT00940000154787
Episquamata	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000164999	ENSGT00390000008938	ENSGT00390000018089	ENSGT00940000156868	ENSGT00390000013765	ENSGT00910000145076	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000010743.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000156662.d.b	ENSGT00390000012903	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000000224	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084
Laterata	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000164999	ENSGT00390000008938	ENSGT00390000018089	ENSGT00940000156868	ENSGT00390000013765	ENSGT00910000145076	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000010743.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000156662.d.b	ENSGT00390000012903	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000000224	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084
Common wall lizard	MODERN SPECIES	419	LHX6 (ENSPMRG00000023138)	RBM18 (ENSPMRG00000023130)	ENSPMRG00000023128	MRRF (ENSPMRG00000023124)	ENSPMRG00000023113	ENSPMRG00000023104	ENSPMRG00000023100	ENSPMRG00000023095	ENSPMRG00000023093	RC3H2 (ENSPMRG00000023084)	ZBTB6 (ENSPMRG00000023078)	ZBTB26 (ENSPMRG00000023076)	GPR21 (ENSPMRG00000023073)	RABGAP1 (ENSPMRG00000023062)	STRBP (ENSPMRG00000023046)	CRB2 (ENSPMRG00000023040) #22	DENND1A (ENSPMRG00000023031) #23	LHX2 (ENSPMRG00000023023) #24	NEK6 (ENSPMRG00000023018)	PSMB7 (ENSPMRG00000023012)	ADGRD2 (ENSPMRG00000022995)	ENSPMRG00000022990	NR5A1 (ENSPMRG00000022986)	NR6A1 (ENSPMRG00000022963)
Argentine black and white tegu	MODERN SPECIES	52	ENSSMRG00000011514	NDUFA8 (ENSSMRG00000011511)	MORN5 (ENSSMRG00000011506)	LHX6 (ENSSMRG00000011499)	RBM18 (ENSSMRG00000011491)	MRRF (ENSSMRG00000011490)	PTGS1 (ENSSMRG00000011488)	ENSSMRG00000011487	ENSSMRG00000011486	PDCL (ENSSMRG00000011485)	RC3H2 (ENSSMRG00000011484)	ZBTB6 (ENSSMRG00000011483)	ZBTB26 (ENSSMRG00000011482)	RABGAP1 (ENSSMRG00000011478)	STRBP (ENSSMRG00000011471)	CRB2 (ENSSMRG00000011466) #22	DENND1A (ENSSMRG00000011462) #23	LHX2 (ENSSMRG00000011455) #24	NEK6 (ENSSMRG00000011428)	PSMB7 (ENSSMRG00000011425)	ADGRD2 (ENSSMRG00000011422)	NR5A1 (ENSSMRG00000011420)	NR6A1 (ENSSMRG00000011400)	OLFML2A (ENSSMRG00000011397)	ENSSMRG00000011395	DYNC2I2 (ENSSMRG00000011392)	SPTAN1 (ENSSMRG00000011381)	GLE1 (ENSSMRG00000011380)	ODF2 (ENSSMRG00000011379)	PTGES2 (ENSSMRG00000011378)	BBLN (ENSSMRG00000011377)
Toxicofera	ANCESTRAL SPECIES	33									ENSGT00390000010743.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000156662.d.b	ENSGT00940000156662.d.a	ENSGT00390000012903	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000000224	ENSGT00390000001761
Elapidae	ANCESTRAL SPECIES	18									ENSGT00390000010743.b	ENSGT00940000159569	ENSGT00940000157685.c	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000156662.d.b	ENSGT00390000012903	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000000224	ENSGT00390000001761	ENSGT00940000166869
Elapidae_a	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183101.a.b.b #22
Acanthophiinae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183101.a.b.b #22
Eastern brown snake	DUPLICATION
Eastern brown snake	MODERN SPECIES	583																ENSPTXG00000015808 #22
Eastern brown snake	MODERN SPECIES	582																ENSPTXG00000015807 #22
Mainland tiger snake	MODERN SPECIES	803																ENSNSUG00000005010 #22
Blue-lipped sea krait	MODERN SPECIES	5382																CRB2 (ENSLLTG00000017214) #22
Indian cobra	MODERN SPECIES	8	ENSNNAG00000009870	ENSNNAG00000009884	ENSNNAG00000009966	GARNL3 (ENSNNAG00000010108)	SLC2A8 (ENSNNAG00000012548)	FBXW2 (ENSNNAG00000012587)	ENSNNAG00000012616	ENSNNAG00000012621	ENSNNAG00000012633	PTGS1 (ENSNNAG00000012718)	RC3H2 (ENSNNAG00000012766)	ZBTB6 (ENSNNAG00000013051)	ZBTB26 (ENSNNAG00000013061)	RABGAP1 (ENSNNAG00000013110)	STRBP (ENSNNAG00000013632)	CRB2 (ENSNNAG00000013681) #22	DENND1A (ENSNNAG00000013708) #23	LHX2 (ENSNNAG00000013790) #24	NEK6 (ENSNNAG00000013809)	PSMB7 (ENSNNAG00000013841)	ADGRD2 (ENSNNAG00000013875)	NR5A1 (ENSNNAG00000013903)	NR6A1 (ENSNNAG00000013915)	DYNC2I2 (ENSNNAG00000013945)	SPTAN1 (ENSNNAG00000014617)	GLE1 (ENSNNAG00000018191)	ODF2 (ENSNNAG00000018197)	PTGES2 (ENSNNAG00000018202)	BBLN (ENSNNAG00000018207)	ENSNNAG00000018209	DNM1 (ENSNNAG00000018402)
Anura	ANCESTRAL SPECIES	127			ENSGT00940000159569	ENSGT00390000010743.b	ENSGT00390000005084	ENSGT00390000013765	ENSGT00940000156868	ENSGT00390000018089	ENSGT00390000008938	ENSGT00950000182969.A	ENSGT00940000157920.a	ENSGT00940000161459	ENSGT00940000163543	ENSGT00940000157216	ENSGT00940000154687.B	ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261.a #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00390000016384	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158763	ENSGT00940000154787
Frog	MODERN SPECIES	8	slc31a2 (ENSXETG00000025574)	niban2 (ENSXETG00000014260)	stxbp1 (ENSXETG00000014261)	akna (ENSXETG00000036617)	whrn (ENSXETG00000014264)	atp6v1g1 (ENSXETG00000043091)	tmem268 (ENSXETG00000039386)	flna (ENSXETG00000014268)	ENSXETG00000046651	ENSXETG00000041897	gpr21 (ENSXETG00000045500)	rabgap1 (ENSXETG00000032226)	strbp (ENSXETG00000007590)	ENSXETG00000045953	ENSXETG00000038153	crb2 (ENSXETG00000002514) #22	ENSXETG00000041683	dennd1a (ENSXETG00000045382) #23	lhx2 (ENSXETG00000020776) #24	ereg (ENSXETG00000011464)	psmb7 (ENSXETG00000042236)	kif14l (ENSXETG00000011461)	adgrd2 (ENSXETG00000011460)	ENSXETG00000042998	nr5a1 (ENSXETG00000011456)	ENSXETG00000044240	nr6a1 (ENSXETG00000008578)	olfml2a (ENSXETG00000008581)	wdr38 (ENSXETG00000016844)	rpl35 (ENSXETG00000016843)	arpc5l (ENSXETG00000044845)
Leishan spiny toad	MODERN SPECIES	12	ENSLLEG00000011693	ENSLLEG00000011705	ENSLLEG00000011717	ENSLLEG00000011741	ENSLLEG00000011807	ZBTB26 (ENSLLEG00000011941)	ZBTB6 (ENSLLEG00000011965)	ENSLLEG00000011983	RABGAP1 (ENSLLEG00000012034)	STRBP (ENSLLEG00000012560)	ENSLLEG00000012676	ENSLLEG00000012686	ENSLLEG00000012716	ENSLLEG00000012741	ENSLLEG00000012760	CRB2 (ENSLLEG00000020099) #22	ENSLLEG00000020201	ENSLLEG00000020398	ENSLLEG00000020455 #23	ENSLLEG00000020786	ENSLLEG00000020809	ENSLLEG00000020832	ENSLLEG00000020911 #23	ENSLLEG00000020979	ENSLLEG00000020993	LHX2 (ENSLLEG00000021028) #24	ENSLLEG00000021149	NEK6 (ENSLLEG00000021188)	PSMB7 (ENSLLEG00000021620)	ENSLLEG00000021753	ADGRD2 (ENSLLEG00000021775)
Coelacanth	MODERN SPECIES	233													ENSLACG00000018975	RABGAP1 (ENSLACG00000018954)	STRBP (ENSLACG00000018943)	CRB2 (ENSLACG00000018905) #22	DENND1A (ENSLACG00000018855) #23	LHX2 (ENSLACG00000018819) #24	ENSLACG00000022513	NEK6 (ENSLACG00000018764)	PSMB7 (ENSLACG00000018747)	ENSLACG00000018734	ADGRD2 (ENSLACG00000018696)	NR5A1 (ENSLACG00000018683)	NR6A1 (ENSLACG00000018630)	olfml2a (ENSLACG00000018514)	ENSLACG00000018402	RPL35 (ENSLACG00000018394)	ARPC5L (ENSLACG00000018386)	GOLGA1 (ENSLACG00000018351)	ENSLACG00000018347
Actinopterygii	ANCESTRAL SPECIES	545																ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419
Neopterygii	ANCESTRAL SPECIES	180																ENSGT00950000183101.a.b.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT01060000248575.C	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000172233	ENSGT00940000166116	ENSGT00390000016384	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961
Spotted gar	MODERN SPECIES	660	cfap77 (ENSLOCG00000005588)	ttf1.1 (ENSLOCG00000005572)	stom (ENSLOCG00000005541)	gsna (ENSLOCG00000005526)	rab14 (ENSLOCG00000005509)	ENSLOCG00000005496	C5 (ENSLOCG00000005479)	ABL1 (ENSLOCG00000005460)	prdm12b (ENSLOCG00000005429)	fubp3 (ENSLOCG00000005411)	ASS1 (ENSLOCG00000005378)	surf4 (ENSLOCG00000005358)	surf2 (ENSLOCG00000005343)	fpgs (ENSLOCG00000005327)	cdk9 (ENSLOCG00000005311)	CRB2 (ENSLOCG00000005298) #22	DENND1A (ENSLOCG00000005271) #23	lhx2b (ENSLOCG00000005257) #24	NEK6 (ENSLOCG00000005235)	psmb7 (ENSLOCG00000005208)	ENSLOCG00000005193	ADGRD2 (ENSLOCG00000005172)	nr5a1a (ENSLOCG00000005158)	nr6a1a (ENSLOCG00000005138)	olfml2a (ENSLOCG00000005109)	ENSLOCG00000005093	rpl35 (ENSLOCG00000005076)	arpc5lb (ENSLOCG00000005063)	golga1 (ENSLOCG00000005040)	SCAI (ENSLOCG00000005027)	ppp6c (ENSLOCG00000005012)
Osteoglossocephalai	DUPLICATION
Osteoglossocephalai	DUPLICATION
Osteoglossocephalai	ANCESTRAL SPECIES	49						ENSGT00940000164907.b.a	ENSGT00620000089226	ENSGT00940000154394.b.a.b	ENSGT00940000154394.b.a.a.a.a.b	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a	ENSGT00940000154394.a	ENSGT00390000020276	ENSGT00940000165492.a.a	ENSGT00940000155373	ENSGT00390000016526	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT01060000248575.C	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000172233	ENSGT00940000166116	ENSGT00390000016384	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000165669	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000156261 #23
Clupeocephala	ANCESTRAL SPECIES	292					ENSGT00940000155151.a.a.a	ENSGT00940000164907.b.a	ENSGT00620000089226	ENSGT00940000154394.a	ENSGT00390000020276	ENSGT00940000165492.a.a	ENSGT01060000248575.C	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000155373	ENSGT00390000016526	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000153391.c.b.a.i	ENSGT00940000157194	ENSGT00390000016384.m	ENSGT00940000158501.d.b	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00550000074961.a	ENSGT00940000167171
Otomorpha	ANCESTRAL SPECIES	61	ENSGT00940000153181	ENSGT00940000177481	ENSGT00940000158674	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00390000000224	ENSGT00530000063497.a.b	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000153877.a.a.a	ENSGT00940000156902.a	ENSGT00940000157207.a.b	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000156811.a	ENSGT00990000204366	ENSGT00940000155841.c.a	ENSGT00940000163383	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000164360.A	ENSGT00390000001041	ENSGT00940000158897.e.a	ENSGT00940000153612.B	ENSGT00940000158557.k	ENSGT00940000157442	ENSGT01030000234517.E.d	ENSGT00940000157272.g	ENSGT00940000160241	ENSGT00940000155578.e.a.a.a	ENSGT00390000011937.g.b	ENSGT00390000005767.b	ENSGT01050000245010	ENSGT00940000165298.a.b	ENSGT00950000182950.D
Otophysi	ANCESTRAL SPECIES	74	ENSGT00390000001618	ENSGT00390000003682	ENSGT01030000234626.D	ENSGT00390000010239	ENSGT00390000002511	ENSGT00390000012903	ENSGT00530000065225	ENSGT00940000153877.a.a.a	ENSGT00940000156902.a	ENSGT00940000157207.a.b	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000156811.a	ENSGT00990000204366	ENSGT00940000155841.c.a	ENSGT00940000163383	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000164360.A	ENSGT00390000001041	ENSGT00940000158897.e.a	ENSGT00940000153612.B	ENSGT00940000158557.k	ENSGT00940000157442	ENSGT01030000234517.E.d	ENSGT00940000157272.g	ENSGT00940000160241	ENSGT00940000155578.e.a.a.a	ENSGT00390000011937.g.b	ENSGT00390000005767.b	ENSGT00390000003948	ENSGT00390000012485.a.a
Characiphysae	ANCESTRAL SPECIES	43	ENSGT00940000156918	ENSGT00390000003682	ENSGT01030000234626.D	ENSGT00390000010239	ENSGT00390000002511	ENSGT00390000012903	ENSGT00530000065225	ENSGT00940000153877.a.a.a	ENSGT00940000156902.a	ENSGT00940000157207.a.b	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000156811.a	ENSGT00990000204366	ENSGT00940000155841.c.a	ENSGT00940000163383	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000164360.A.a	ENSGT00390000001041	ENSGT00940000158897.e.a	ENSGT00940000153612.B	ENSGT00940000158557.k	ENSGT00940000157442	ENSGT01030000234517.E.d	ENSGT00940000157272.g	ENSGT00940000160241	ENSGT00940000155578.e.a.a.a	ENSGT00390000011937.g.b	ENSGT00390000005767.b	ENSGT00390000003948	ENSGT00390000012485.a.a
Channel catfish	MODERN SPECIES	24	eif2d (ENSIPUG00000012330)	FMOD (ENSIPUG00000012434)	pabpc1l (ENSIPUG00000012602)	143b1 (ENSIPUG00000012694)	CYC1 (ENSIPUG00000012748)	eif2s2 (ENSIPUG00000012763)	chmp4b (ENSIPUG00000012809)	ENSIPUG00000012831	PXN (ENSIPUG00000012844)	GCN1 (ENSIPUG00000012886)	serpind1 (ENSIPUG00000013123)	naif1 (ENSIPUG00000013136)	seta (ENSIPUG00000013161)	gle1 (ENSIPUG00000013197)	ENSIPUG00000013286	ENSIPUG00000013305 #22	ENSIPUG00000013360	lhx2b (ENSIPUG00000018065) #24	ENSIPUG00000018073	snap29 (ENSIPUG00000019884)	GAPVD1 (ENSIPUG00000019951)	Vgll4 (ENSIPUG00000020201)	DGCR6 (ENSIPUG00000020222)	rpl6 (ENSIPUG00000020213)	dynll1 (ENSIPUG00000020243)	ENSIPUG00000020259	acaa2 (ENSIPUG00000020272)	Mrpl40 (ENSIPUG00000020288)	vsig8b (ENSIPUG00000020301)	snrnp200 (ENSIPUG00000020309)	ENSIPUG00000020358
Characiphysae_b	ANCESTRAL SPECIES	42	ENSGT00390000000378.d.a.o.b	ENSGT00390000003682	ENSGT01030000234626.D	ENSGT00390000010239	ENSGT00390000002511	ENSGT00390000012903	ENSGT00530000065225	ENSGT00940000153877.a.a.a	ENSGT00940000156902.a	ENSGT00940000157207.a.b	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000156811.a	ENSGT00990000204366	ENSGT00940000155841.c.a	ENSGT00940000163383	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000164360.A.a	ENSGT00390000001041	ENSGT00940000158897.e.a	ENSGT00940000153612.B	ENSGT00940000158557.k	ENSGT00940000157442	ENSGT01030000234517.E.d	ENSGT00940000157272.g	ENSGT00940000160241	ENSGT00940000155578.e.a.a.a	ENSGT00390000011937.g.b	ENSGT00390000005767.b	ENSGT00390000003948	ENSGT00390000012485.a.a
Electric eel	MODERN SPECIES	870	dynll1 (ENSEEEG00000015208)	ENSEEEG00000015204	rpl6 (ENSEEEG00000015200)	acaa2 (ENSEEEG00000015176)	mrpl40 (ENSEEEG00000015175)	si:ch211-51h9.6 (ENSEEEG00000015174)	gle1 (ENSEEEG00000015094)	seta (ENSEEEG00000015089)	zdhhc12a (ENSEEEG00000015088)	ENSEEEG00000014829	naif1 (ENSEEEG00000014811)	EEIG1 (ENSEEEG00000014807)	ENSEEEG00000014806	sh3glb2a (ENSEEEG00000014803)	ENSEEEG00000014802	ENSEEEG00000014801 #22
Characoidei	ANCESTRAL SPECIES	59	ENSGT00390000000378.d.b	ENSGT00390000003682	ENSGT01030000234626.D	ENSGT00390000010239	ENSGT00390000002511	ENSGT00390000012903	ENSGT00530000065225	ENSGT00940000153877.a.a.a	ENSGT00940000156902.a	ENSGT00940000157207.a.b	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000156811.a	ENSGT00990000204366	ENSGT00940000155841.c.a	ENSGT00940000163383	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000164360.A.a	ENSGT00390000001041	ENSGT00940000158897.e.a	ENSGT00940000153612.B	ENSGT00940000158557.k	ENSGT00940000157442	ENSGT01030000234517.E.d	ENSGT00940000157272.g	ENSGT00940000160241	ENSGT00940000155578.e.a.a.a	ENSGT00390000011937.g.b	ENSGT00390000005767.b	ENSGT00390000003948	ENSGT00390000012485.a.a
Red-bellied piranha	DUPLICATION
Red-bellied piranha	MODERN SPECIES	1912															ENSPNAG00000009956 #22	ENSPNAG00000009940 #22	ENSPNAG00000009935 #23
Red-bellied piranha	MODERN SPECIES	2697																ENSPNAG00000012285 #22
Mexicana tetra	MODERN SPECIES	21	rpl6 (ENSAMXG00000012854)	acaa2 (ENSAMXG00000035892)	si:ch211-51h9.6 (ENSAMXG00000033396)	mrpl40 (ENSAMXG00000029691)	gle1 (ENSAMXG00000012542)	si:ch211-51h9.7 (ENSAMXG00000012480)	seta (ENSAMXG00000010484)	zdhhc12a (ENSAMXG00000012374)	slc25a25a (ENSAMXG00000042479)	naif1 (ENSAMXG00000039603)	EEIG1 (ENSAMXG00000012124)	ENSAMXG00000029716	sh3glb2a (ENSAMXG00000012086)	ENSAMXG00000036574	ENSAMXG00000038206	ENSAMXG00000012030 #22	lhx2b (ENSAMXG00000035303) #24	ENSAMXG00000024914	ctu1 (ENSAMXG00000039534)	PXN (ENSAMXG00000029345)	GCN1 (ENSAMXG00000011852)	rab35b (ENSAMXG00000039865)	BICDL1 (ENSAMXG00000011718)	si:dkey-190g11.3 (ENSAMXG00000042409)	plk2b (ENSAMXG00000011555)	mier3b (ENSAMXG00000011464)	mrps36 (ENSAMXG00000011445)	cenph (ENSAMXG00000040830)	pola2 (ENSAMXG00000011308)	dimt1l (ENSAMXG00000011186)	kif2a (ENSAMXG00000011099)
Cyprinoidei	ANCESTRAL SPECIES	32	ENSGT00390000001618	ENSGT00390000003682	ENSGT01030000234626.D	ENSGT00390000010239	ENSGT00390000002511	ENSGT00390000012903	ENSGT00530000065225	ENSGT00940000153877.a.a.a	ENSGT00940000156902.a	ENSGT00940000157207.a.b	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000156811.a	ENSGT00990000204366	ENSGT00940000155841.c.a	ENSGT00940000163383	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000164360.A	ENSGT00390000001041	ENSGT00940000158897.e.a	ENSGT00940000153612.B	ENSGT00940000158557.k	ENSGT00940000157442	ENSGT01030000234517.E.d	ENSGT00940000157272.g.a	ENSGT00940000160241	ENSGT00940000155578.e.a.a.a.b	ENSGT00390000011937.g.b	ENSGT00390000005767.b	ENSGT00390000003948	ENSGT00390000012485.a.a
Cyprininae	DUPLICATION
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	136							ENSGT00390000012903.c	ENSGT00940000153877.a.a.a	ENSGT00940000156902.a	ENSGT00940000157207.a.b.a	ENSGT00450000040324.b.j.b	ENSGT00940000156811.a.b	ENSGT00990000204366	ENSGT00940000155841.c.a.a.a	ENSGT00940000163383	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a.c #22	ENSGT00940000158540.q.a #24	ENSGT00940000164360.A.f	ENSGT00390000001041	ENSGT00940000158897.e.a.d	ENSGT00940000158897.e.a.c.b	ENSGT00940000153612.B.e	ENSGT00940000158557.k.b.b	ENSGT00940000157442.q	ENSGT01030000234517.E.d.e	ENSGT00940000157272.g.a.a.a	ENSGT00940000158897.e.a.c.a	ENSGT00940000153612.B.f	ENSGT00940000158557.k.b.a	ENSGT00940000157442.r	ENSGT01030000234517.E.d.f
Goldfish	MODERN SPECIES	26	ENSCARG00000012826	gatd3l (ENSCARG00000012817)	ENSCARG00000012785	tmem230b (ENSCARG00000012763)	ENSCARG00000012741	rpl6 (ENSCARG00000012734)	mrpl40 (ENSCARG00000012726)	gle1 (ENSCARG00000012718)	ENSCARG00000012708	seta (ENSCARG00000012703)	zdhhc12a (ENSCARG00000012701)	slc25a25a (ENSCARG00000012512)	EEIG1 (ENSCARG00000012500)	ENSCARG00000012492	ENSCARG00000012487	CRB2 (ENSCARG00000012445) #22	lhx2b (ENSCARG00000012423) #24	ENSCARG00000012412	ENSCARG00000012406	ctu1 (ENSCARG00000012398)	PXN (ENSCARG00000012275)	GCN1 (ENSCARG00000011793)	rab35b (ENSCARG00000011753)	BICDL1 (ENSCARG00000011718)	CIT (ENSCARG00000009951)	mtmr3 (ENSCARG00000006718)	ENSCARG00000006485	myl2b (ENSCARG00000006460)	pptc7a (ENSCARG00000006438)	ENSCARG00000006344	dhx37 (ENSCARG00000006130)
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	221	ENSGT00950000182937.A.b.f	ENSGT00950000182869.e.b.g.a.a	ENSGT00940000153866.B	ENSGT00940000156918.d	ENSGT00390000003682.b	ENSGT00390000010239.m	ENSGT00390000012903.c	ENSGT00940000153877.a.a.a	ENSGT00940000156902.a	ENSGT00940000157207.a.b.a	ENSGT00450000040324.b.j.b	ENSGT00940000156811.a.b	ENSGT00990000204366	ENSGT00940000155841.c.a.a.a	ENSGT00940000163383.a	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a.c #22	ENSGT00940000158540.q.a #24	ENSGT00940000164360.A.f	ENSGT00940000158897.e.a.c.a	ENSGT00940000153612.B.f	ENSGT00940000158557.k.b.a	ENSGT00940000157442.r	ENSGT01030000234517.E.d.f	ENSGT00940000157272.g.a.a.b	ENSGT00940000160241	ENSGT00940000155578.e.a.a.a.b.a.a	ENSGT00390000011937.g.b.a	ENSGT00390000012485.a.a.a	ENSGT00550000074985.e	ENSGT00530000064244.b	ENSGT00940000159913.a.a.c
Common carp reference	MODERN SPECIES	17	ENSCCRG00000013750	dynll1 (ENSCCRG00000013754)	ENSCCRG00000059675	rpl6 (ENSCCRG00000039880)	acaa2 (ENSCCRG00000072948)	mrpl40 (ENSCCRG00000039944)	gle1 (ENSCCRG00000013852)	seta (ENSCCRG00000015723)	zdhhc12a (ENSCCRG00000041851)	slc25a25a (ENSCCRG00000080316)	naif1 (ENSCCRG00000015730)	EEIG1 (ENSCCRG00000041864)	ENSCCRG00000041867	sh3glb2a (ENSCCRG00000010610)	ENSCCRG00000055340	ENSCCRG00000049409 #22	ENSCCRG00000081956	lhx2b (ENSCCRG00000048661) #24	ENSCCRG00000068242	ENSCCRG00000078643	PXN (ENSCCRG00000012068)	GCN1 (ENSCCRG00000034818)	rab35b (ENSCCRG00000075918)	BICDL1 (ENSCCRG00000026042)	CIT (ENSCCRG00000026230)	mtmr3 (ENSCCRG00000028578)	ENSCCRG00000017117	myl2b (ENSCCRG00000030023)	pptc7a (ENSCCRG00000081676)	ENSCCRG00000030055	dhx37 (ENSCCRG00000030096)
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	706	enkd1 (ENSSGRG00000042552)	ENSSGRG00000042556	dynll1 (ENSSGRG00000042558)	rpl6 (ENSSGRG00000042577)	mrpl40 (ENSSGRG00000042578)	si:ch211-51h9.6 (ENSSGRG00000042579)	gle1 (ENSSGRG00000042580)	seta (ENSSGRG00000042589)	zdhhc12a (ENSSGRG00000042675)	slc25a25a (ENSSGRG00000042698)	naif1 (ENSSGRG00000043603)	EEIG1 (ENSSGRG00000043604)	ENSSGRG00000043605	sh3glb2a (ENSSGRG00000043606)	ENSSGRG00000043619	CRB2 (ENSSGRG00000043620) #22	lhx2b (ENSSGRG00000043621) #24	ENSSGRG00000043622
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	1447																ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a.d #22	ENSGT00940000158540.r #24
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	1100																ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a.d #22	ENSGT00940000158540.r #24
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	1203														sh3glb2a (ENSSGRG00000017931)	ENSSGRG00000017952	ENSSGRG00000017953 #22	lhx2b (ENSSGRG00000017965) #24
Zebrafish	MODERN SPECIES	23	ENSDARG00000092379	dynll1 (ENSDARG00000058454)	rpl6 (ENSDARG00000058451)	acaa2 (ENSDARG00000038881)	mrpl40 (ENSDARG00000043554)	si:ch211-51h9.6 (ENSDARG00000092360)	gle1 (ENSDARG00000043559)	si:ch211-51h9.7 (ENSDARG00000074720)	seta (ENSDARG00000031495)	zdhhc12a (ENSDARG00000076632)	slc25a25a (ENSDARG00000010572)	naif1 (ENSDARG00000062753)	EEIG1 (ENSDARG00000102566)	ENSDARG00000101753	sh3glb2a (ENSDARG00000008983)	ENSDARG00000060081 #22	lhx2b (ENSDARG00000031222) #24	fut9b.1 (ENSDARG00000067524)	fut9b.2 (ENSDARG00000058299)	fut9b.3 (ENSDARG00000027699)	fut9b.4 (ENSDARG00000086603)	fut9b.5 (ENSDARG00000102426)	fut9b.6 (ENSDARG00000102554)	ENSDARG00000100247	ctu1 (ENSDARG00000020986)	PXN (ENSDARG00000060766)	GCN1 (ENSDARG00000058419)	rab35b (ENSDARG00000058425)	BICDL1 (ENSDARG00000074761)	CIT (ENSDARG00000088825)	mtmr3 (ENSDARG00000098201)
Clupeiformes	ANCESTRAL SPECIES	55	ENSGT00530000063156.a.a.b	ENSGT00440000038585.c	ENSGT00940000153181	ENSGT00940000158674	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00390000000224	ENSGT00530000063497.a.b	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000153877.a.a.a	ENSGT00940000156902.a	ENSGT00940000157207.a.b	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000156811.a	ENSGT00940000155841.c.a	ENSGT00940000163383	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000164360.A	ENSGT00390000001041	ENSGT00940000158897.e.a	ENSGT00940000153612.B	ENSGT00940000158557.k	ENSGT00940000157442	ENSGT01030000234517.E.d	ENSGT00940000157272.g	ENSGT00940000160241	ENSGT00940000155578.e.a.a.a	ENSGT00390000011937.g.b	ENSGT00390000005767.b	ENSGT01050000245010	ENSGT00940000165298.a.b	ENSGT00950000182950.D
Denticle herring	MODERN SPECIES	2	MMP11 (ENSDCDG00000022435)	derl3 (ENSDCDG00000022432)	smarcb1a (ENSDCDG00000022363)	ralgds (ENSDCDG00000022351)	ptgesl (ENSDCDG00000022349)	odf2b (ENSDCDG00000022347)	gle1 (ENSDCDG00000022125)	seta (ENSDCDG00000022113)	zdhhc12a (ENSDCDG00000022112)	slc25a25a (ENSDCDG00000021957)	naif1 (ENSDCDG00000021938)	EEIG1 (ENSDCDG00000021932)	ENSDCDG00000021928	sh3glb2a (ENSDCDG00000021710)	ENSDCDG00000021693	ENSDCDG00000021689 #22	lhx2b (ENSDCDG00000021686) #24	fut9b.4 (ENSDCDG00000021680)	ctu1 (ENSDCDG00000021677)	PXN (ENSDCDG00000021670)	GCN1 (ENSDCDG00000021017)	rab35b (ENSDCDG00000020978)	BICDL1 (ENSDCDG00000020973)	mtmr3 (ENSDCDG00000013313)	ENSDCDG00000013124	myl2b (ENSDCDG00000013040)	pptc7a (ENSDCDG00000013019)	rad9b (ENSDCDG00000012970)	ENSDCDG00000012946	ENSDCDG00000012930	anapc7 (ENSDCDG00000012912)
Atlantic herring	MODERN SPECIES	23	tsc1a (ENSCHAG00000014348)	ENSCHAG00000014365	CEL (ENSCHAG00000014578)	grin1b (ENSCHAG00000014649)	ralgds (ENSCHAG00000014852)	ptgesl (ENSCHAG00000015273)	odf2b (ENSCHAG00000015291)	gle1 (ENSCHAG00000015330)	seta (ENSCHAG00000015839)	zdhhc12a (ENSCHAG00000015883)	ENSCHAG00000015968	ENSCHAG00000015986	EEIG1 (ENSCHAG00000016127)	SH3GLB2 (ENSCHAG00000016391)	ENSCHAG00000016483	ENSCHAG00000016513 #22	SLC16A13 (ENSCHAG00000016669)	lhx2b (ENSCHAG00000016710) #24	fut9b.4 (ENSCHAG00000016738)	ctu1 (ENSCHAG00000016772)	PXN (ENSCHAG00000016789)	GCN1 (ENSCHAG00000016932)	rab35b (ENSCHAG00000021052)	BICDL1 (ENSCHAG00000021069)	CIT (ENSCHAG00000021124)	MTMR3 (ENSCHAG00000021964)	ENSCHAG00000024338	MYL2 (ENSCHAG00000024362)	pptc7a (ENSCHAG00000024380)	ENSCHAG00000024389	ENSCHAG00000024393
Euteleosteomorpha	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000159838	ENSGT00940000155422.bb	ENSGT00940000155275.c.b.b	ENSGT00940000156002.a.b	ENSGT00940000166440	ENSGT01080000257442	ENSGT00390000012665	ENSGT01100000263542.B.b.a.b	ENSGT00940000167390	ENSGT00530000064286	ENSGT00940000155151.a.a.a	ENSGT00940000164907.b.a	ENSGT00620000089226	ENSGT00940000154394.a	ENSGT00390000020276	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT01060000248575.C	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00390000016384.m	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00550000074961.a	ENSGT00940000165424.a.b.b	ENSGT01060000248544.b	ENSGT00940000155841.c.a	ENSGT00940000158633.b	ENSGT00990000204366	ENSGT00940000156811.a
Acanthomorphata	ANCESTRAL SPECIES	46	ENSGT00940000159838	ENSGT00940000155422.bb	ENSGT00940000155275.c.b.b	ENSGT00940000156002.a.b	ENSGT00940000166440	ENSGT01080000257442	ENSGT00390000012665	ENSGT01100000263542.B.b.a.b	ENSGT00940000167390	ENSGT00530000064286	ENSGT00940000155151.a.a.a	ENSGT00940000164907.b.a	ENSGT00620000089226	ENSGT00940000154394.a	ENSGT00390000020276	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT01060000248575.C	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00390000016384.m	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00550000074961.a	ENSGT00940000167171	ENSGT01060000248544.b	ENSGT00940000155841.c.a	ENSGT00940000158633.b
Euacanthomorphacea	ANCESTRAL SPECIES	81	ENSGT00940000159838	ENSGT00940000155422.bb	ENSGT00940000155275.c.b.b	ENSGT00940000156002.a.b	ENSGT00940000166440	ENSGT01080000257442	ENSGT00390000012665	ENSGT01100000263542.B.b.a.b	ENSGT00940000167390	ENSGT00530000064286	ENSGT00940000155151.a.a.a	ENSGT00940000164907.b.a	ENSGT00620000089226	ENSGT00940000154394.a	ENSGT00940000165492.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT01060000248575.C	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00390000016384.m	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00550000074961.a	ENSGT00940000167171	ENSGT01060000248544.b	ENSGT00940000155841.c.a	ENSGT00940000158633.b
Pinecone sodierfish	MODERN SPECIES	23	tncb (ENSMMDG00005005961)	ENSMMDG00005007681	ENSMMDG00005007683	ENSMMDG00005007689	nsmfb (ENSMMDG00005007693)	PNPLA7 (ENSMMDG00005007709)	mrpl41 (ENSMMDG00005007865)	dph7 (ENSMMDG00005007866)	fgf17 (ENSMMDG00005007870)	FKBP15 (ENSMMDG00005008231)	ccn1l2 (ENSMMDG00005009668)	ENSMMDG00005009682	ENSMMDG00005009684	tubb2b (ENSMMDG00005009685)	ENSMMDG00005009691	ENSMMDG00005009757 #22	lhx2b (ENSMMDG00005009768) #24	ENSMMDG00005009770	nr5a1a (ENSMMDG00005009771)	nr6a1a (ENSMMDG00005009822)	olfml2a (ENSMMDG00005009830)	rpl35 (ENSMMDG00005009835)	golga1 (ENSMMDG00005009863)	PPP6C (ENSMMDG00005009882)	ENSMMDG00005009884	ENSMMDG00005009886	sh3glb2a (ENSMMDG00005009900)	PIP5KL1 (ENSMMDG00005010059)	ptar1 (ENSMMDG00005010061)	APBA1 (ENSMMDG00005010064)	ENSMMDG00005010068
Percomorphaceae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000159838	ENSGT00940000155422.bb	ENSGT00940000155275.c.b.b	ENSGT00940000156002.a.b	ENSGT00940000166440	ENSGT01080000257442	ENSGT00390000012665	ENSGT01100000263542.B.b.a.b	ENSGT00940000167390	ENSGT00530000064286	ENSGT00940000155151.a.a.a	ENSGT00940000164907.b.a	ENSGT00620000089226	ENSGT00940000154394.a	ENSGT00940000165492.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT01060000248575.C	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00990000203759	ENSGT00390000016384.m	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00550000074961.a	ENSGT00940000167171	ENSGT01060000248544.b	ENSGT00940000155841.c.a	ENSGT00390000018644	ENSGT00390000013158
Tiger tail seahorse	MODERN SPECIES	515	fgf17 (ENSHCOG00000001834)	FKBP15 (ENSHCOG00000001827)	ENSHCOG00000001816	sub1b (ENSHCOG00000001809)	ENSHCOG00000001803	RABL6 (ENSHCOG00000001802)	imp4 (ENSHCOG00000001797)	araf (ENSHCOG00000001790)	zgc:64051 (ENSHCOG00000001777)	ccn1l2 (ENSHCOG00000001770)	ENSHCOG00000001760	ENSHCOG00000001755	ENSHCOG00000001748	ENSHCOG00000001744	ENSHCOG00000001740	ENSHCOG00000001723 #22	lhx2b (ENSHCOG00000001700) #24	ENSHCOG00000001694	ENSHCOG00000001690	nr5a1a (ENSHCOG00000001682)	nr6a1a (ENSHCOG00000001676)	olfml2a (ENSHCOG00000001668)	ENSHCOG00000001661	rpl35 (ENSHCOG00000001654)	golga1 (ENSHCOG00000001647)	PPP6C (ENSHCOG00000001623)	ENSHCOG00000001613	ENSHCOG00000001606	ENSHCOG00000001601	sh3glb2a (ENSHCOG00000001595)	dph7 (ENSHCOG00000001585)
Percomorphaceae_B	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000159838	ENSGT00940000155422.bb	ENSGT00940000155275.c.b.b	ENSGT00940000156002.a.b	ENSGT00940000166440	ENSGT01080000257442	ENSGT00390000012665	ENSGT01100000263542.B.b.a.b	ENSGT00940000167390	ENSGT00530000064286	ENSGT00940000155151.a.a.a	ENSGT00940000164907.b.a	ENSGT00620000089226	ENSGT00940000154394.a	ENSGT00940000165492.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT01060000248575.C	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00990000203759	ENSGT00390000016384.m	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00550000074961.a	ENSGT00940000167171	ENSGT01060000248544.b	ENSGT00940000172113	ENSGT00940000171469	ENSGT00940000155841.c.a
Percomorphaceae_C	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000159838	ENSGT00940000155422.bb	ENSGT00940000155275.c.b.b	ENSGT00940000156002.a.b	ENSGT00940000166440	ENSGT01080000257442	ENSGT00390000012665	ENSGT01100000263542.B.b.a.b	ENSGT00940000167390	ENSGT00530000064286	ENSGT00940000155151.a.a.a	ENSGT00940000164907.b.a	ENSGT00620000089226	ENSGT00940000154394.a	ENSGT00940000165492.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00990000203759	ENSGT00390000016384.m	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00550000074961.a	ENSGT00940000165424.a.b.b	ENSGT00940000167171	ENSGT00940000171469	ENSGT00940000155841.c.a	ENSGT00390000018644	ENSGT00390000013158
Eupercaria	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000159838	ENSGT00940000155422.bb	ENSGT00940000155275.c.b.b	ENSGT00940000156002.a.b	ENSGT00940000166440	ENSGT01080000257442	ENSGT00390000012665	ENSGT01100000263542.B.b.a.b	ENSGT00940000167390	ENSGT00530000064286	ENSGT00940000155151.a.a.a	ENSGT00940000164907.b.a	ENSGT00620000089226	ENSGT00940000154394.a	ENSGT00940000165492.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00990000203759	ENSGT00390000016384.m	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00550000074961.a	ENSGT00940000165424.a.b.b	ENSGT00940000172113	ENSGT00940000171469	ENSGT00940000155841.c.a	ENSGT00390000018644	ENSGT00390000013158
Tetraodontidae	ANCESTRAL SPECIES	322																ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540 #24
Fugu	MODERN SPECIES	13	ENSTRUG00000024169	isl1a (ENSTRUG00000013818)	ENSTRUG00000032436	ccdc125 (ENSTRUG00000002108)	rad17 (ENSTRUG00000002152)	zgc:86811 (ENSTRUG00000003164)	ube2l3b (ENSTRUG00000003392)	ydjc (ENSTRUG00000003710)	ENSTRUG00000024474	tncb (ENSTRUG00000003805)	TRAF2 (ENSTRUG00000004769)	ENSTRUG00000004135	imp4 (ENSTRUG00000003784)	araf (ENSTRUG00000001926)	zgc:64051 (ENSTRUG00000001861)	ENSTRUG00000001637 #22	lhx2b (ENSTRUG00000001385) #24	ENSTRUG00000032723	ppm1f (ENSTRUG00000004222)	ENSTRUG00000028634	gfpt1 (ENSTRUG00000003278)	nfu1 (ENSTRUG00000002994)	zgc:103692 (ENSTRUG00000002376)	ENSTRUG00000025805	adgra2 (ENSTRUG00000008432)	ENSTRUG00000008324	adrb3a (ENSTRUG00000025310)	ENSTRUG00000029785	ENSTRUG00000026018	AAK1 (ENSTRUG00000002601)	ENSTRUG00000032509
Tetraodon	MODERN SPECIES	26	npr3 (ENSTNIG00000002699)	ENSTNIG00000002698	si:dkey-3h3.3 (ENSTNIG00000002697)	ccdc125 (ENSTNIG00000000550)	rad17 (ENSTNIG00000010602)	zgc:86811 (ENSTNIG00000010601)	ube2l3b (ENSTNIG00000010600)	ydjc (ENSTNIG00000010599)	ENSTNIG00000010598	tncb (ENSTNIG00000010597)	TRAF2 (ENSTNIG00000010596)	RABL6 (ENSTNIG00000010595)	imp4 (ENSTNIG00000010594)	araf (ENSTNIG00000010593)	zgc:64051 (ENSTNIG00000010592)	CRB2 (ENSTNIG00000010591) #22	lhx2b (ENSTNIG00000010590) #24	ADGRD2 (ENSTNIG00000010589)	nr5a1a (ENSTNIG00000010588)	nr6a1a (ENSTNIG00000010587)	TCF4 (ENSTNIG00000010330)	ENSTNIG00000010329	RAB27B (ENSTNIG00000010328)	BRCC3 (ENSTNIG00000010327)	ENSTNIG00000010326	pum3 (ENSTNIG00000010325)	KCNV2 (ENSTNIG00000010324)	cables1 (ENSTNIG00000010323)	vldlr (ENSTNIG00000010322)	ENSTNIG00000007214	spp1 (ENSTNIG00000000575)
Eupecaria_A	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000159838	ENSGT00940000155422.bb	ENSGT00940000155275.c.b.b	ENSGT00940000156002.a.b	ENSGT00940000166440	ENSGT01080000257442	ENSGT00390000012665	ENSGT01100000263542.B.b.a.b	ENSGT00940000167390	ENSGT00530000064286	ENSGT00940000155151.a.a.a	ENSGT00940000164907.b.a	ENSGT00620000089226	ENSGT00940000154394.a	ENSGT00940000165492.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00990000203759	ENSGT00390000016384.m	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00550000074961.a	ENSGT00940000165424.a.b.b	ENSGT01060000248544.b	ENSGT00940000172113	ENSGT00940000171469	ENSGT00940000155841.c.a	ENSGT00390000018644
Ballan wrasse	MODERN SPECIES	238										ENSLBEG00000028755	ccn1l2 (ENSLBEG00000028754)	ENSLBEG00000028752	ENSLBEG00000028749	tubb2b (ENSLBEG00000028751)	ENSLBEG00000028748	ENSLBEG00000028746 #22	lhx2b (ENSLBEG00000028745) #24	ENSLBEG00000028743	ADGRD2 (ENSLBEG00000028742)	nr5a1a (ENSLBEG00000028740)	nr6a1a (ENSLBEG00000028739)	olfml2a (ENSLBEG00000028738)	ENSLBEG00000028736	rpl35 (ENSLBEG00000028735)	golga1 (ENSLBEG00000028734)	PPP6C (ENSLBEG00000028732)	ENSLBEG00000028731	ENSLBEG00000028729
Eupecaria_B	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000159838	ENSGT00940000155422.bb	ENSGT00940000155275.c.b.b	ENSGT00940000156002.a.b	ENSGT00940000166440	ENSGT01080000257442	ENSGT00390000012665	ENSGT01100000263542.B.b.a.b	ENSGT00940000167390	ENSGT00530000064286	ENSGT00940000155151.a.a.a	ENSGT00940000164907.b.a	ENSGT00620000089226	ENSGT00940000154394.a	ENSGT00940000165492.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00990000203759	ENSGT00390000016384.m	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00550000074961.a	ENSGT00940000165424.a.b.b	ENSGT01060000248544.b	ENSGT00940000172113	ENSGT00940000171469	ENSGT00940000155841.c.a	ENSGT00390000018644
Perciformes	ANCESTRAL SPECIES	33	ENSGT00940000159838	ENSGT00940000155422.bb	ENSGT00940000155275.c.b.b	ENSGT00940000156002.a.b	ENSGT00940000166440	ENSGT01080000257442	ENSGT00390000012665	ENSGT01100000263542.B.b.a.b	ENSGT00940000167390	ENSGT00530000064286	ENSGT00940000155151.a.a.a	ENSGT00940000164907.b.a	ENSGT00620000089226	ENSGT00940000154394.a	ENSGT00940000165492.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT01060000248575.C	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00990000203759	ENSGT00390000016384.m	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00550000074961.a	ENSGT00940000165424.a.b.b	ENSGT01060000248544.b	ENSGT00940000172113	ENSGT00940000171469	ENSGT00940000155841.c.a	ENSGT00390000018644
Perciformes_a	ANCESTRAL SPECIES	31	ENSGT00940000159838	ENSGT00940000155422.bb	ENSGT00940000155275.c.b.b	ENSGT00940000156002.a.b	ENSGT00940000166440	ENSGT01080000257442	ENSGT00390000012665	ENSGT01100000263542.B.b.a.b	ENSGT00940000167390	ENSGT00530000064286	ENSGT00940000155151.a.a.a	ENSGT00940000164907.b.a	ENSGT00620000089226	ENSGT00940000154394.b.a.a.a.b.b	ENSGT00940000165492.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00990000203759	ENSGT00390000016384.m	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00550000074961.a	ENSGT00940000165424.a.b.b	ENSGT01060000248544.b	ENSGT00940000172113	ENSGT00940000171469	ENSGT00940000155841.c.a	ENSGT00390000018644
Pike perch	MODERN SPECIES	16	man1b1b (ENSSLUG00000011026)	ENSSLUG00000011004	cacna1ba (ENSSLUG00000010977)	ehmt1a (ENSSLUG00000005703)	arrdc1a (ENSSLUG00000005377)	ENSSLUG00000005370	nelfb (ENSSLUG00000005333)	entpd2a.1 (ENSSLUG00000005304)	fgf17 (ENSSLUG00000005289)	FKBP15 (ENSSLUG00000005202)	ccn1l2 (ENSSLUG00000005178)	ENSSLUG00000005171	ENSSLUG00000005161	ENSSLUG00000023950	ENSSLUG00000023910	ENSSLUG00000023894 #22	lhx2b (ENSSLUG00000023891) #24	ADGRD2 (ENSSLUG00000023884)	nr5a1a (ENSSLUG00000023874)	nr6a1a (ENSSLUG00000023866)	olfml2a (ENSSLUG00000023860)	ENSSLUG00000023854	atad1a (ENSSLUG00000023848)	ENSSLUG00000023816	piwil2 (ENSSLUG00000021186)	ENSSLUG00000021040	tnksb (ENSSLUG00000019568)	IDUA (ENSSLUG00000019501)	rbp4l (ENSSLUG00000019497)	ENSSLUG00000019493	kcnv2b (ENSSLUG00000019490)
Channel bull blenny	MODERN SPECIES	23	man1b1b (ENSCGOG00000011214)	ENSCGOG00000011203	ENSCGOG00000011198	ENSCGOG00000011194	ehmt1a (ENSCGOG00000011001)	arrdc1a (ENSCGOG00000010987)	nelfb (ENSCGOG00000010747)	entpd2a.1 (ENSCGOG00000010739)	fgf17 (ENSCGOG00000010697)	FKBP15 (ENSCGOG00000010671)	ccn1l2 (ENSCGOG00000010662)	ENSCGOG00000010655	ENSCGOG00000010636	tubb2b (ENSCGOG00000010642)	ENSCGOG00000010608	ENSCGOG00000010599 #22	lhx2b (ENSCGOG00000010594) #24	ENSCGOG00000010589	nr5a1a (ENSCGOG00000010466)	olfml2a (ENSCGOG00000010452)	ENSCGOG00000010449	rpl35 (ENSCGOG00000010439)	golga1 (ENSCGOG00000010391)	PPP6C (ENSCGOG00000010385)	ENSCGOG00000010383	ENSCGOG00000010381	ENSCGOG00000010378	sh3glb2a (ENSCGOG00000008886)	mrpl41 (ENSCGOG00000008796)	dph7 (ENSCGOG00000008790)	ENSCGOG00000008769
Cottioidei	ANCESTRAL SPECIES	63	ENSGT00530000063843.a	ENSGT00940000159838	ENSGT00940000155422.bb	ENSGT00940000155275.c.b.b	ENSGT00940000156002.a.b	ENSGT00940000166440	ENSGT00390000012665	ENSGT01100000263542.B.b.a.b	ENSGT00940000167390	ENSGT00530000064286	ENSGT00940000155151.a.a.a	ENSGT00940000164907.b.a	ENSGT00620000089226	ENSGT00940000154394.a	ENSGT00940000165492.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT01060000248575.C	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00390000016384.m	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00550000074961.a	ENSGT00940000165424.a.b.b	ENSGT01060000248544.b	ENSGT00940000172113	ENSGT00940000171469	ENSGT00940000155841.c.a	ENSGT00390000018644	ENSGT00390000013158
Lumpfish	MODERN SPECIES	24	noxa1 (ENSCLMG00005016790)	dpp7 (ENSCLMG00005016799)	man1b1b (ENSCLMG00005016953)	cacna1ba (ENSCLMG00005016965)	ehmt1a (ENSCLMG00005016997)	arrdc1a (ENSCLMG00005017808)	nelfb (ENSCLMG00005017813)	entpd2a.1 (ENSCLMG00005017836)	fgf17 (ENSCLMG00005017838)	FKBP15 (ENSCLMG00005017983)	ccn1l2 (ENSCLMG00005018003)	ENSCLMG00005018004	ENSCLMG00005018007	tubb2b (ENSCLMG00005018010)	ENSCLMG00005018016	ENSCLMG00005018046 #22	lhx2b (ENSCLMG00005018059) #24	ENSCLMG00005018060	nr5a1a (ENSCLMG00005018062)	nr6a1a (ENSCLMG00005018098)	OLFML2A (ENSCLMG00005018104)	ENSCLMG00005018105	tcima (ENSCLMG00005018107)	fam151b (ENSCLMG00005018109)	KLHL10 (ENSCLMG00005000128)	ENSCLMG00005000136	dhfr (ENSCLMG00005000149)	gtf2h2 (ENSCLMG00005000193)	oclnb (ENSCLMG00005000219)	marveld2b (ENSCLMG00005000223)	sdf2l1 (ENSCLMG00005000226)
Stickleback	MODERN SPECIES	12	stxbp1b (ENSGACG00000003228)	WHRN (ENSGACG00000003297)	ENSGACG00000003309	dpp7 (ENSGACG00000003313)	man1b1b (ENSGACG00000003326)	cacna1ba (ENSGACG00000003335)	ehmt1a (ENSGACG00000003353)	arrdc1a (ENSGACG00000003366)	nelfb (ENSGACG00000003381)	fgf17 (ENSGACG00000003432)	FKBP15 (ENSGACG00000003433)	ccn1l2 (ENSGACG00000003446)	ENSGACG00000003456	tubb2b (ENSGACG00000003471)	ENSGACG00000003503	ENSGACG00000003512 #22	lhx2b (ENSGACG00000003520) #24	nr5a1a (ENSGACG00000003539)	nr6a1a (ENSGACG00000003560)	olfml2a (ENSGACG00000003569)	rpl35 (ENSGACG00000003574)	golga1 (ENSGACG00000003576)	PPP6C (ENSGACG00000003583)	ENSGACG00000003617	ENSGACG00000003618	sh3glb2a (ENSGACG00000003622)	dph7 (ENSGACG00000003634)	mrpl41 (ENSGACG00000003642)	PNPLA7 (ENSGACG00000003644)	zgc:64051 (ENSGACG00000003653)	araf (ENSGACG00000003668)
Eupecaria_C	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000159838	ENSGT00940000155422.bb	ENSGT00940000155275.c.b.b	ENSGT00940000156002.a.b	ENSGT00940000166440	ENSGT01080000257442	ENSGT00390000012665	ENSGT01100000263542.B.b.a.b	ENSGT00940000167390	ENSGT00530000064286	ENSGT00940000155151.a.a.a	ENSGT00940000164907.b.a	ENSGT00620000089226	ENSGT00940000154394.a	ENSGT00940000165492.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00990000203759	ENSGT00390000016384.m	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00550000074961.a	ENSGT00940000162514	ENSGT00940000171469	ENSGT00940000155841.c.a	ENSGT00390000018644	ENSGT00390000013158	ENSGT00940000156763.b.b
Eupercaria_incertae_sedis	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000159838	ENSGT00940000155422.bb	ENSGT00940000155275.c.b.b	ENSGT00940000156002.a.b	ENSGT00940000166440	ENSGT01080000257442	ENSGT00390000012665	ENSGT01100000263542.B.b.a.b	ENSGT00940000167390	ENSGT00530000064286	ENSGT00940000155151.a.a.a	ENSGT00940000164907.b.a	ENSGT00620000089226	ENSGT00940000154394.a	ENSGT00940000165492.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00990000203759	ENSGT00390000016384.m	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00550000074961.a	ENSGT00940000171469	ENSGT00940000155841.c.a	ENSGT00390000018644	ENSGT00390000013158	ENSGT00940000156763.b.b	ENSGT00940000159669.a
European seabass	MODERN SPECIES	13	dpp7 (ENSDLAG00005003764)	man1b1b (ENSDLAG00005003943)	ENSDLAG00005026590	cacna1ba (ENSDLAG00005004861)	ehmt1a (ENSDLAG00005019593)	ENSDLAG00005020342	nelfb (ENSDLAG00005020349)	entpd2a.1 (ENSDLAG00005020413)	ENSDLAG00005027557	ENSDLAG00005020475	ccn1l2 (ENSDLAG00005030907)	ENSDLAG00005030282	ENSDLAG00005020893	tubb2b (ENSDLAG00005028428)	ENSDLAG00005020898	ENSDLAG00005020905 #22	ENSDLAG00005028139 #24	ENSDLAG00005034611	ADGRD2 (ENSDLAG00005020947)	NR5A1 (ENSDLAG00005020977)	nr6a1a (ENSDLAG00005021108)	OLFML2A (ENSDLAG00005021279)	ENSDLAG00005033531	ENSDLAG00005021295	GOLGA1 (ENSDLAG00005021316)	ENSDLAG00005031828	PPP6C (ENSDLAG00005021350)	ENSDLAG00005028754	ENSDLAG00005021366	ENSDLAG00005021390	dph7 (ENSDLAG00005021410)
Large yellow croaker	MODERN SPECIES	2	man1b1b (ENSLCRG00005020341)	cacna1ba (ENSLCRG00005006563)	ehmt1a (ENSLCRG00005003960)	arrdc1a (ENSLCRG00005003945)	ENSLCRG00005003944	nelfb (ENSLCRG00005003932)	entpd2a.1 (ENSLCRG00005003930)	fgf17 (ENSLCRG00005003929)	FKBP15 (ENSLCRG00005001899)	ccn1l2 (ENSLCRG00005001696)	ENSLCRG00005001686	ENSLCRG00005001680	ENSLCRG00005001675	ENSLCRG00005001629	ENSLCRG00005001622	ENSLCRG00005001607 #22	lhx2b (ENSLCRG00005001597) #24	ADGRD2 (ENSLCRG00005001548)	nr5a1a (ENSLCRG00005020785)	nr6a1a (ENSLCRG00005020780)	olfml2a (ENSLCRG00005020778)	ENSLCRG00005020776	rpl35 (ENSLCRG00005020775)	golga1 (ENSLCRG00005020762)	PPP6C (ENSLCRG00005020759)	ENSLCRG00005020757	ENSLCRG00005020755	SH3GLB2 (ENSLCRG00005020493)	dph7 (ENSLCRG00005020485)	mrpl41 (ENSLCRG00005020484)	PNPLA7 (ENSLCRG00005019404)
Gilthead seabream	MODERN SPECIES	19	cacna1ba (ENSSAUG00010017740)	ENSSAUG00010026316	ehmt1a (ENSSAUG00010026321)	ENSSAUG00010026451	arrdc1a (ENSSAUG00010026452)	ENSSAUG00010026453	nelfb (ENSSAUG00010026454)	entpd2a.1 (ENSSAUG00010026455)	fgf17 (ENSSAUG00010026626)	FKBP15 (ENSSAUG00010026469)	ccn1l2 (ENSSAUG00010026627)	ENSSAUG00010026628	ENSSAUG00010026629	ENSSAUG00010026630	ENSSAUG00010026632	ENSSAUG00010026634 #22	lhx2b (ENSSAUG00010004073) #24	ENSSAUG00010004097	ADGRD2 (ENSSAUG00010004139)	nr5a1a (ENSSAUG00010004224)	nr6a1a (ENSSAUG00010004453)	olfml2a (ENSSAUG00010004462)	ENSSAUG00010004465	rpl35 (ENSSAUG00010004470)	PPP6C (ENSSAUG00010004488)	ENSSAUG00010004491	ENSSAUG00010004495	sh3glb2a (ENSSAUG00010004543)	dph7 (ENSSAUG00010005910)	mrpl41 (ENSSAUG00010005912)	PNPLA7 (ENSSAUG00010005944)
Percomorphaceae_D	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000159838	ENSGT00940000155422.bb	ENSGT00940000155275.c.b.b	ENSGT00940000156002.a.b	ENSGT00940000166440	ENSGT01080000257442	ENSGT00390000012665	ENSGT01100000263542.B.b.a.b	ENSGT00940000167390	ENSGT00530000064286	ENSGT00940000155151.a.a.a	ENSGT00940000164907.b.a	ENSGT00620000089226	ENSGT00940000154394.a	ENSGT00940000165492.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00990000203759	ENSGT00390000016384.m	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00550000074961.a	ENSGT00940000167171	ENSGT00940000171469	ENSGT00940000155841.c.a	ENSGT00390000018644	ENSGT00390000013158	ENSGT00940000156763.b.b
Carangaria	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00940000159838	ENSGT00940000155422.bb	ENSGT00940000155275.c.b.b	ENSGT00940000156002.a.b	ENSGT00940000166440	ENSGT01080000257442	ENSGT00390000012665	ENSGT01100000263542.B.b.a.b	ENSGT00940000167390	ENSGT00530000064286	ENSGT00940000155151.a.a.a	ENSGT00940000164907.b.a	ENSGT00620000089226	ENSGT00940000154394.a	ENSGT00940000165492.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00990000203759	ENSGT00390000016384.m	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00550000074961.a	ENSGT00940000167171	ENSGT00940000171469	ENSGT00940000155841.c.a	ENSGT00940000155290.C	ENSGT01030000234773	ENSGT00390000008802.a.a
Pleuronectoidei	ANCESTRAL SPECIES	69															ENSGT00940000165492.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00990000203759	ENSGT00390000016384.m	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00550000074961.a	ENSGT00940000167171	ENSGT00940000171469	ENSGT00940000155841.c.a	ENSGT00940000155290.C	ENSGT01030000234773	ENSGT00390000008802.a.a
Turbot	MODERN SPECIES	21														ENSSMAG00000000532	ENSSMAG00000027597	ENSSMAG00000000527 #22	LHX2 (ENSSMAG00000000521) #24	ADGRD2 (ENSSMAG00000000491)	NR5A1 (ENSSMAG00000000482)	ENSSMAG00000000478	nr6a1a (ENSSMAG00000000466)	OLFML2A (ENSSMAG00000000459)	ENSSMAG00000000454	GOLGA1 (ENSSMAG00000000398)	PPP6C (ENSSMAG00000000381)	ENSSMAG00000000378	ENSSMAG00000000373	ENSSMAG00000000340	zfr (ENSSMAG00000000320)	ENSSMAG00000000318	ENSSMAG00000000313
Tongue sole	MODERN SPECIES	398	HECTD4 (ENSCSEG00000016640)	ENSCSEG00000016713	ENSCSEG00000016761	ENSCSEG00000016781	ENSCSEG00000016786	vps33a (ENSCSEG00000016817)	ENSCSEG00000016836	bnip3la (ENSCSEG00000016851)	ENSCSEG00000016866	adra1aa (ENSCSEG00000016882)	tmem230b (ENSCSEG00000016891)	tmem230b (ENSCSEG00000016900)	ENSCSEG00000016907	ENSCSEG00000016975	ENSCSEG00000017004	ENSCSEG00000017065 #22	lhx2b (ENSCSEG00000017106) #24	ADGRD2 (ENSCSEG00000017117)	nr5a1a (ENSCSEG00000017180)	nr6a1a (ENSCSEG00000017225)	ENSCSEG00000017243	ipo11 (ENSCSEG00000017257)	ENSCSEG00000017336	ENSCSEG00000017346	rgs7bpa (ENSCSEG00000017358)	ENSCSEG00000017370	plcxd3 (ENSCSEG00000017392)	oxct1a (ENSCSEG00000017403)	rimoc1 (ENSCSEG00000017432)	FBXO4 (ENSCSEG00000017441)	ghr (ENSCSEG00000017457)
Carangaria_A	ANCESTRAL SPECIES	50			ENSGT00940000155275.c.b.b	ENSGT00940000156002.a.b	ENSGT00940000166440	ENSGT01080000257442	ENSGT00390000012665	ENSGT01100000263542.B.b.a.b	ENSGT00940000167390	ENSGT00530000064286	ENSGT00940000155151.a.a.a	ENSGT00940000164907.b.a	ENSGT00620000089226	ENSGT00940000154394.a	ENSGT00940000165492.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT01060000248575.C	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00390000016384.m	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00550000074961.a	ENSGT00940000171469	ENSGT00940000155841.c.a	ENSGT00940000155290.C	ENSGT01030000234773	ENSGT00390000008802.a.a	ENSGT01090000260132.b.a	ENSGT00440000033872
Barramundi perch	MODERN SPECIES	95	PNPLA7 (ENSLCAG00010024578)	cacna1ba (ENSLCAG00010025823)	ehmt1a (ENSLCAG00010027055)	arrdc1a (ENSLCAG00010027129)	ENSLCAG00010027136	nelfb (ENSLCAG00010027153)	entpd2a.1 (ENSLCAG00010027167)	fgf17 (ENSLCAG00010027172)	ENSLCAG00010027194	ccn1l2 (ENSLCAG00010027198)	ENSLCAG00010027204	ENSLCAG00010027206	tubb2b (ENSLCAG00010027211)	ENSLCAG00010027216	FPGS (ENSLCAG00010027220)	ENSLCAG00010027224 #22	lhx2b (ENSLCAG00010027228) #24	ENSLCAG00010027230	nr5a1a (ENSLCAG00010027244)	nr6a1a (ENSLCAG00010027256)	olfml2a (ENSLCAG00010027266)	ENSLCAG00010027272	golga1 (ENSLCAG00010027286)	ENSLCAG00010027294	PPP6C (ENSLCAG00010027298)	ENSLCAG00010027304	sh3glb2a (ENSLCAG00010027311)	zfr (ENSLCAG00010027324)	ENSLCAG00010027333	ENSLCAG00010027334	npr3 (ENSLCAG00010027335)
Seriola	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00530000063843.a	ENSGT00940000155422.bb	ENSGT00940000159838	ENSGT00940000155275.c.b.b	ENSGT00940000156002.a.b	ENSGT00940000166440	ENSGT00390000012665	ENSGT01100000263542.B.b.a.b	ENSGT00940000167390	ENSGT00530000064286	ENSGT00940000155151.a.a.a	ENSGT00940000164907.b.a	ENSGT00620000089226	ENSGT00940000154394.a	ENSGT00940000165492.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT01060000248575.C	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00390000016384.m	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00550000074961.a	ENSGT00940000167171	ENSGT01060000248544.b	ENSGT00940000155841.c.a	ENSGT00940000155290.C	ENSGT01030000234773	ENSGT00390000008802.a.a
Greater amberjack	MODERN SPECIES	6	dpp7 (ENSSDUG00000009953)	cacna1ba (ENSSDUG00000009992)	ENSSDUG00000010101	ENSSDUG00000010115	ENSSDUG00000010136	arrdc1a (ENSSDUG00000010155)	nelfb (ENSSDUG00000010179)	entpd2a.1 (ENSSDUG00000010214)	fgf17 (ENSSDUG00000010245)	FKBP15 (ENSSDUG00000010366)	ccn1l2 (ENSSDUG00000010401)	ENSSDUG00000010418	tubb2b (ENSSDUG00000010437)	ENSSDUG00000010468	ENSSDUG00000010476	ENSSDUG00000010516 #22	lhx2b (ENSSDUG00000010678) #24	ENSSDUG00000010699	fzd1 (ENSSDUG00000010707)	cdk14 (ENSSDUG00000010726)	ENSSDUG00000010823	ENSSDUG00000010833	ENSSDUG00000010846	ENSSDUG00000010860	ENSSDUG00000010886	ENSSDUG00000010900	ENSSDUG00000010911	HACE1 (ENSSDUG00000010931)	ENSSDUG00000011013	ENSSDUG00000011015	ENSSDUG00000011022
Yellowtail amberjack	DUPLICATION
Yellowtail amberjack	MODERN SPECIES	3287	man1b1b (ENSSLDG00000009801)	dpp7 (ENSSLDG00000009771)	cacna1ba (ENSSLDG00000009661)	ENSSLDG00000009598	ENSSLDG00000009572	arrdc1a (ENSSLDG00000009550)	nelfb (ENSSLDG00000009508)	entpd2a.1 (ENSSLDG00000009096)	fgf17 (ENSSLDG00000009011)	FKBP15 (ENSSLDG00000008939)	ccn1l2 (ENSSLDG00000008922)	ENSSLDG00000008908	ENSSLDG00000008862	tubb2b (ENSSLDG00000008880)	ENSSLDG00000008854	CRB2 (ENSSLDG00000008823) #22	lhx2b (ENSSLDG00000008803) #24	ENSSLDG00000008774	nr5a1a (ENSSLDG00000008750)	nr6a1a (ENSSLDG00000008702)	olfml2a (ENSSLDG00000008632)	ENSSLDG00000008604	rpl35 (ENSSLDG00000008581)	golga1 (ENSSLDG00000008465)	PPP6C (ENSSLDG00000008421)	ENSSLDG00000008397	ENSSLDG00000008386	ENSSLDG00000008378
Yellowtail amberjack	DUPLICATION
Yellowtail amberjack	MODERN SPECIES	1339																ENSSLDG00000010071 #22
Yellowtail amberjack	MODERN SPECIES	1433																ENSSLDG00000011813 #22
Anabantaria	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00530000063843.a	ENSGT00940000159838	ENSGT00940000155422.bb	ENSGT00940000155275.c.b.b	ENSGT00940000156002.a.b	ENSGT00940000166440	ENSGT00390000012665	ENSGT01100000263542.B.b.a.b	ENSGT00940000167390	ENSGT00530000064286	ENSGT00940000155151.a.a.a	ENSGT00940000164907.b.a	ENSGT00620000089226	ENSGT00940000154394.b.a.a.a.a.a.b	ENSGT00940000165492.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00990000203759	ENSGT00390000016384.m	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00550000074961.a	ENSGT01060000248544.b	ENSGT00940000155841.c.a	ENSGT00390000018644	ENSGT00390000013158	ENSGT00940000156763.b.b	ENSGT00940000159669.a
Zig-zag eel	MODERN SPECIES	23	ENTREP1 (ENSMAMG00000018522)	ENSMAMG00000018534	cacna1ba (ENSMAMG00000018547)	ENSMAMG00000018630	arrdc1a (ENSMAMG00000018649)	ENSMAMG00000018652	nelfb (ENSMAMG00000018660)	ENSMAMG00000018679	ENSMAMG00000018696	ENSMAMG00000018712	ENSMAMG00000018738	ENSMAMG00000018745	ENSMAMG00000024865	ENSMAMG00000018796	ENSMAMG00000028722	ENSMAMG00000018806 #22	ENSMAMG00000018972	ENSMAMG00000018974 #24	ENSMAMG00000018991	NR5A1 (ENSMAMG00000018995)	NR6A1 (ENSMAMG00000019017)	OLFML2A (ENSMAMG00000019044)	ENSMAMG00000019066	RPL35 (ENSMAMG00000019074)	GOLGA1 (ENSMAMG00000019096)	PPP6C (ENSMAMG00000019206)	ENSMAMG00000019223	ENSMAMG00000019229	ENSMAMG00000019244	dph7 (ENSMAMG00000019299)	ENSMAMG00000019315
Anabantoidei	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000155305.b.a	ENSGT00940000155127.a.b	ENSGT00530000063843.a	ENSGT00940000159838	ENSGT00940000155422.bb	ENSGT00940000155275.c.b.b	ENSGT00940000156002.a.b	ENSGT00940000166440	ENSGT00390000012665	ENSGT00940000167390	ENSGT00530000064286	ENSGT00940000155151.a.a.a	ENSGT00940000164907.b.a	ENSGT00940000154394.a	ENSGT00940000165492.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00990000203759	ENSGT00390000016384.m	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00550000074961.a	ENSGT00940000162514	ENSGT01060000248544.b	ENSGT00940000155841.c.a	ENSGT00940000155290.C	ENSGT01050000246882	ENSGT00390000008802.a.a
Climbing perch	MODERN SPECIES	22	man1b1b (ENSATEG00000009156)	dpp7 (ENSATEG00000009170)	cacna1ba (ENSATEG00000009195)	ehmt1a (ENSATEG00000026279)	arrdc1a (ENSATEG00000009354)	nelfb (ENSATEG00000009371)	ENSATEG00000027081	ENSATEG00000028984	ENSATEG00000009489	ENSATEG00000009511	ccn1l2 (ENSATEG00000009534)	ENSATEG00000009539	tubb2b (ENSATEG00000009569)	ENSATEG00000009615	ENSATEG00000009601	ENSATEG00000009637 #22	ENSATEG00000009870 #24	ADGRD2 (ENSATEG00000009895)	NR5A1 (ENSATEG00000009916)	nr6a1a (ENSATEG00000025519)	OLFML2A (ENSATEG00000009973)	ENSATEG00000009979	RPL35 (ENSATEG00000009996)	GOLGA1 (ENSATEG00000010023)	PPP6C (ENSATEG00000010159)	ENSATEG00000010225	ENSATEG00000010235	ENSATEG00000010251	ENSATEG00000010271	ENSATEG00000028598	ENSATEG00000025825
Siamese fighting fish	MODERN SPECIES	9	ENSBSLG00000019413	fscn2b (ENSBSLG00000019243)	ENSBSLG00000019194	ENSBSLG00000019189	stxbp1b (ENSBSLG00000018256)	hdr (ENSBSLG00000017963)	cyb561a3a (ENSBSLG00000017947)	loxl2b (ENSBSLG00000017023)	GOLGA7 (ENSBSLG00000016933)	sfrp1a (ENSBSLG00000016913)	nelfb (ENSBSLG00000016699)	ENSBSLG00000016577	FKBP15 (ENSBSLG00000015632)	ENSBSLG00000015576	tubb2b (ENSBSLG00000015516)	ENSBSLG00000015484 #22	lhx2b (ENSBSLG00000015462) #24	ENSBSLG00000015451	ENSBSLG00000015432	nr5a1a (ENSBSLG00000015205)	nr6a1a (ENSBSLG00000014740)	olfml2a (ENSBSLG00000014715)	ENSBSLG00000014709	rpl35 (ENSBSLG00000024526)	golga1 (ENSBSLG00000024481)	PPP6C (ENSBSLG00000024443)	ENSBSLG00000024421	ENSBSLG00000024337	SH3GLB2 (ENSBSLG00000024138)	zfr (ENSBSLG00000023503)	ENSBSLG00000023431
Ovalentaria	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000159838	ENSGT00940000155422.bb	ENSGT00940000155275.c.b.b	ENSGT00940000156002.a.b	ENSGT00940000166440	ENSGT01080000257442	ENSGT00390000012665	ENSGT01100000263542.B.b.a.b	ENSGT00940000167390	ENSGT00530000064286	ENSGT00940000155151.a.a.a	ENSGT00940000164907.b.a	ENSGT00620000089226	ENSGT00940000154394.a	ENSGT00940000165492.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT01060000248575.C	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00990000203759	ENSGT00390000016384.m	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00550000074961.a	ENSGT00940000167171	ENSGT00940000171469	ENSGT00940000155841.c.a	ENSGT00390000018644	ENSGT00390000013158
Atherinomorphae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000159838	ENSGT00940000155422.bb	ENSGT00940000155275.c.b.b	ENSGT00940000156002.a.b	ENSGT00940000166440	ENSGT01080000257442	ENSGT00390000012665	ENSGT01100000263542.B.b.a.b	ENSGT00940000167390	ENSGT00530000064286	ENSGT00940000155151.a.a.a	ENSGT00940000164907.b.a	ENSGT00620000089226	ENSGT00940000154394.a	ENSGT00940000165492.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT01060000248575.C	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00990000203759	ENSGT00390000016384.m	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00550000074961.a	ENSGT00940000167171	ENSGT00940000171469	ENSGT00940000155841.c.a	ENSGT00390000018644	ENSGT00390000013158
Cyprinodontiformes	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000159838	ENSGT00940000155422.bb	ENSGT00940000155275.c.b.b	ENSGT00940000156002.a.b	ENSGT00940000166440	ENSGT01080000257442	ENSGT00390000012665	ENSGT01100000263542.B.b.a.b	ENSGT00940000167390	ENSGT00530000064286	ENSGT00940000155151.a.a.a	ENSGT00940000164907.b.a	ENSGT00620000089226	ENSGT00940000154394.a	ENSGT00940000165492.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT01060000248575.C	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00990000203759	ENSGT00390000016384.m	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00550000074961.a	ENSGT00940000167171	ENSGT00940000171469	ENSGT00940000155841.c.a	ENSGT00390000018644	ENSGT00390000013158
Aplocheiloidei	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22
Mangrove rivulus	MODERN SPECIES	520												tmem216 (ENSKMAG00000012776)	ENSKMAG00000012801	TMED9 (ENSKMAG00000012837)	b4galt7 (ENSKMAG00000012872)	ENSKMAG00000012897 #22
Turquoise killifish	MODERN SPECIES	184														ENSNFUG00015017654	ENSNFUG00015017615	ENSNFUG00015017596 #22
Cyprinodontoidei	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00950000183002.B.a.a	ENSGT00530000063843.a	ENSGT00940000159838	ENSGT00940000155422.bb	ENSGT00940000155275.c.b.b	ENSGT00940000156002.a.b	ENSGT00940000166440	ENSGT01080000257442	ENSGT00390000012665	ENSGT01100000263542.B.b.a.b	ENSGT00940000167390	ENSGT00530000064286	ENSGT00940000164907.b.a	ENSGT00940000154394.a	ENSGT00940000165492.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00990000203759	ENSGT00390000016384.m	ENSGT00940000153772.B	ENSGT01060000248544.b	ENSGT00940000155841.c.a	ENSGT00390000018644	ENSGT00390000013158	ENSGT00940000156763.b.b	ENSGT00940000159669.a	ENSGT00940000159633
Poeciliinae	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00950000183002.B.a.a	ENSGT00530000063843.a	ENSGT00940000159838	ENSGT00940000155422.bb	ENSGT00940000155275.c.b.b	ENSGT00940000156002.a.b	ENSGT00940000166440	ENSGT01080000257442	ENSGT00390000012665	ENSGT01100000263542.B.b.a.b	ENSGT00940000167390	ENSGT00530000064286	ENSGT00940000164907.b.a	ENSGT00940000154394.a	ENSGT00940000165492.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00990000203759	ENSGT00390000016384.m	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000171469	ENSGT00940000155841.c.a	ENSGT00390000018644	ENSGT00390000013158	ENSGT00940000156763.b.b	ENSGT00940000159669.a	ENSGT00940000159633
Poecilia	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00950000183002.B.a.a	ENSGT00530000063843.a	ENSGT00940000159838	ENSGT00940000155422.bb	ENSGT00940000155275.c.b.b	ENSGT00940000156002.a.b	ENSGT00940000166440	ENSGT01080000257442	ENSGT00390000012665	ENSGT01100000263542.B.b.a.b	ENSGT00940000167390	ENSGT00530000064286	ENSGT00940000164907.b.a	ENSGT00940000154394.a	ENSGT00940000165492.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT01060000248575.C	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00390000016384.m	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000171469	ENSGT00940000155841.c.a	ENSGT00390000018644	ENSGT00390000013158	ENSGT00940000156763.b.b	ENSGT00940000159669.a	ENSGT00940000159633	ENSGT00940000153231.A
NAME_6	ANCESTRAL SPECIES	112	ENSGT00950000183002.B.a.a	ENSGT00530000063843.a	ENSGT00940000159838	ENSGT00940000155422.bb	ENSGT00940000155275.c.b.b	ENSGT00940000156002.a.b	ENSGT00940000166440	ENSGT01080000257442	ENSGT00390000012665	ENSGT01100000263542.B.b.a.b	ENSGT00940000167390	ENSGT00530000064286	ENSGT00940000164907.b.a	ENSGT00940000154394.a	ENSGT00940000165492.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00390000016384.m	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00550000074961.a	ENSGT00940000167171	ENSGT00940000171469	ENSGT00940000155841.c.a	ENSGT00390000018644	ENSGT00390000013158	ENSGT00940000156763.b.b	ENSGT00940000159669.a
Amazon molly	MODERN SPECIES	342	dpp7 (ENSPFOG00000008743)	man1b1b (ENSPFOG00000008603)	ENSPFOG00000020372	cacna1ba (ENSPFOG00000007325)	ehmt1a (ENSPFOG00000007154)	arrdc1a (ENSPFOG00000007087)	ENSPFOG00000022938	nelfb (ENSPFOG00000007019)	entpd2a.1 (ENSPFOG00000006909)	ENSPFOG00000020371	fgf17 (ENSPFOG00000006860)	FKBP15 (ENSPFOG00000006662)	ENSPFOG00000006615	tubb2b (ENSPFOG00000006572)	ENSPFOG00000006550	ENSPFOG00000006286 #22	lhx2b (ENSPFOG00000006215) #24	ADGRD2 (ENSPFOG00000005986)	nr5a1a (ENSPFOG00000023617)	nr6a1a (ENSPFOG00000005783)	olfml2a (ENSPFOG00000005632)	rpl35 (ENSPFOG00000005604)	golga1 (ENSPFOG00000005215)	PPP6C (ENSPFOG00000005095)	ENSPFOG00000005050	ENSPFOG00000022010	sh3glb2a (ENSPFOG00000004935)	dph7 (ENSPFOG00000004831)	mrpl41 (ENSPFOG00000020370)	PNPLA7 (ENSPFOG00000003884)	zgc:64051 (ENSPFOG00000003814)
Sailfin molly	MODERN SPECIES	1093											fgf17 (ENSPLAG00000012249)	FKBP15 (ENSPLAG00000012261)	ENSPLAG00000012285	tubb2b (ENSPLAG00000012303)	ENSPLAG00000012317	ENSPLAG00000000272 #22
Guppy	MODERN SPECIES	461					ENSPREG00000013245	ENSPREG00000013260	ENSPREG00000013278	arrdc1a (ENSPREG00000013290)	ENSPREG00000013299	nelfb (ENSPREG00000013311)	entpd2a.1 (ENSPREG00000013366)	fgf17 (ENSPREG00000013415)	ENSPREG00000013432	tubb2b (ENSPREG00000013438)	ENSPREG00000013446	ENSPREG00000013459 #22	lhx2b (ENSPREG00000013480) #24	ENSPREG00000013497	nr6a1a (ENSPREG00000013517)	olfml2a (ENSPREG00000013536)	rpl35 (ENSPREG00000013542)	golga1 (ENSPREG00000013565)	PPP6C (ENSPREG00000013630)	ENSPREG00000013653	ENSPREG00000013677	dph7 (ENSPREG00000013831)	mrpl41 (ENSPREG00000013847)	PNPLA7 (ENSPREG00000013878)	araf (ENSPREG00000013979)	zgc:64051 (ENSPREG00000014053)	imp4 (ENSPREG00000014067)
Platyfish	MODERN SPECIES	2	noxa1 (ENSXMAG00000029661)	dpp7 (ENSXMAG00000004228)	man1b1b (ENSXMAG00000004209)	cacna1ba (ENSXMAG00000004029)	ENSXMAG00000024871	ENSXMAG00000028227	arrdc1a (ENSXMAG00000004012)	ENSXMAG00000019563	nelfb (ENSXMAG00000003997)	entpd2a.1 (ENSXMAG00000003981)	fgf17 (ENSXMAG00000003974)	FKBP15 (ENSXMAG00000003947)	ENSXMAG00000023710	tubb2b (ENSXMAG00000003936)	ENSXMAG00000003934	ENSXMAG00000003917 #22	lhx2b (ENSXMAG00000003908) #24	ADGRD2 (ENSXMAG00000004769)	nr5a1a (ENSXMAG00000023834)	nr6a1a (ENSXMAG00000009061)	olfml2a (ENSXMAG00000026342)	ENSXMAG00000027238	rpl35 (ENSXMAG00000002921)	golga1 (ENSXMAG00000002925)	PPP6C (ENSXMAG00000002940)	ENSXMAG00000020951	ENSXMAG00000028923	sh3glb2a (ENSXMAG00000005038)	dph7 (ENSXMAG00000028457)	mrpl41 (ENSXMAG00000019576)	PNPLA7 (ENSXMAG00000004935)
NAME_4	ANCESTRAL SPECIES	302					ENSGT00940000155275.c.b.b	ENSGT00940000156002.a.b	ENSGT00940000166440	ENSGT01080000257442	ENSGT00390000012665	ENSGT01100000263542.B.b.a.b	ENSGT00940000167390	ENSGT00530000064286	ENSGT00940000164907.b.a	ENSGT00940000154394.a	ENSGT00940000165492.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22
Mummichog	MODERN SPECIES	351				cacna1ba (ENSFHEG00000011557)	ENSFHEG00000011618	arrdc1a (ENSFHEG00000011628)	ENSFHEG00000011635	ENSFHEG00000011655	ENSFHEG00000011670	fgf17 (ENSFHEG00000011677)	FKBP15 (ENSFHEG00000011747)	ENSFHEG00000011763	tubb2b (ENSFHEG00000011779)	ENSFHEG00000011792	ENSFHEG00000011819	ENSFHEG00000012013 #22	ENSFHEG00000012078
Sheepshead minnow	MODERN SPECIES	1323																ENSCVAG00000016835 #22
Oryzias	ANCESTRAL SPECIES	54	ENSGT00390000016002.o.a	ENSGT00940000156621.e.a	ENSGT00400000024875.c.a.a.b.a.b.i.b.a	ENSGT00940000157147.c.a	ENSGT00980000198604	ENSGT00940000162790.b	ENSGT00940000159244.a	ENSGT00940000159734	ENSGT00940000160428.b.b	ENSGT00550000075041	ENSGT00940000164784	ENSGT00390000014148.f	ENSGT00940000156231.o.b	ENSGT00940000159868.b	ENSGT00940000158016.c.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT01060000248575.C	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00990000203759	ENSGT00390000016384.m	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000153246.b	ENSGT00940000160570	ENSGT00940000160404	ENSGT00940000158049	ENSGT00940000156235.d	ENSGT00940000153601.a.a.e.b.b
Oryzias_a	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000155596.q	ENSGT00940000160987	ENSGT00940000159729	ENSGT00390000020276.t.b	ENSGT00940000154394.a	ENSGT00390000020276.t.a	ENSGT00940000154394.b.a.a.a.a.a.b.d	ENSGT00530000064286	ENSGT00940000159717	ENSGT00940000154076.C.c	ENSGT00940000154076.C.d	ENSGT00390000014148.f	ENSGT00940000156231.o.b	ENSGT00940000159868.b	ENSGT00940000158016.c.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT01060000248575.C	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00990000203759	ENSGT00390000016384.m	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000153246.b	ENSGT00940000160570	ENSGT00940000160404	ENSGT00940000158049	ENSGT00940000156235.d	ENSGT00940000153601.a.a.e.b.b
Japanese Medaka HdrR	MODERN SPECIES	23	ENSORLG00000022378	ENSORLG00000016308	FKBP15 (ENSORLG00000016322)	ENSORLG00000029387	ENSORLG00000010320	ENSORLG00000027510	ENSORLG00000022178	ENSORLG00000029089	ENSORLG00000021848	ENSORLG00000030565	ENSORLG00000016407	ENSORLG00000030177	ENSORLG00000016428	ENSORLG00000022012	ENSORLG00000016452	ENSORLG00000016462 #22	ENSORLG00000024201	lhx2b (ENSORLG00000016465) #24	ENSORLG00000027244	ENSORLG00000028742	ADGRD2 (ENSORLG00000025166)	nr5a1 (ENSORLG00000016486)	nr6a1a (ENSORLG00000027378)	ENSORLG00000027372	olfml2a (ENSORLG00000016507)	ENSORLG00000023324	rpl35 (ENSORLG00000016513)	golga1 (ENSORLG00000016525)	ENSORLG00000012783	ENSORLG00000028991	ENSORLG00000028690
Chinese medaka	MODERN SPECIES	223	cyb561a3a (ENSOSIG00000005163)	hdr (ENSOSIG00000005131)	UNC5D (ENSOSIG00000005004)	tm2d2 (ENSOSIG00000004991)	lman2lb (ENSOSIG00000004988)	endog (ENSOSIG00000004982)	ENSOSIG00000004979	ENSOSIG00000004977	tubb2b (ENSOSIG00000004915)	FKBP15 (ENSOSIG00000004648)	DNAH17 (ENSOSIG00000002522)	ENSOSIG00000002434	CEL (ENSOSIG00000002308)	ENSOSIG00000002263	GRIN1 (ENSOSIG00000000305)	ENSOSIG00000000220 #22	lhx2b (ENSOSIG00000000152) #24	ENSOSIG00000000120	nr5a1a (ENSOSIG00000020203)	nr6a1a (ENSOSIG00000020151)	olfml2a (ENSOSIG00000020139)	ENSOSIG00000020136	rpl35 (ENSOSIG00000020130)	golga1 (ENSOSIG00000020114)	ENSOSIG00000020095	pomt1 (ENSOSIG00000020088)	ENSOSIG00000020085	ENSOSIG00000020082	ENSOSIG00000020080	ENSOSIG00000020077	ENSOSIG00000020073
Oryzias_b	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000153231.A	ENSGT00390000016002.o.a	ENSGT00940000156621.e.a	ENSGT00400000024875.c.a.a.b.a.b.i.b.a	ENSGT00940000157147.c.a	ENSGT00980000198604	ENSGT00940000162790.b	ENSGT00940000159244.a	ENSGT00940000159734	ENSGT00550000075041	ENSGT00940000164784	ENSGT00390000014148.f	ENSGT00940000156231.o.b	ENSGT00940000159868.b	ENSGT00940000158016.c.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00990000203759	ENSGT00390000016384.m	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000153246.b	ENSGT00940000160570	ENSGT00940000160404	ENSGT00940000158049	ENSGT00940000156235.d	ENSGT00940000153601.a.a.e.b.b
Indian medaka	MODERN SPECIES	11	ENSOMEG00000004718	ENSOMEG00000004708	ENSOMEG00000004694	brd3b (ENSOMEG00000004686)	ENSOMEG00000004655	QSOX2 (ENSOMEG00000004633)	ENSOMEG00000004610	ENSOMEG00000004600	ENSOMEG00000004570	ENSOMEG00000004556	ENSOMEG00000004550	ENSOMEG00000004542	CEL (ENSOMEG00000004525)	ENSOMEG00000004507	GRIN1 (ENSOMEG00000004485)	ENSOMEG00000004415 #22	lhx2b (ENSOMEG00000004399) #24	ENSOMEG00000004385	ADGRD2 (ENSOMEG00000004377)	nr5a1a (ENSOMEG00000004343)	ENSOMEG00000004335	nr6a1a (ENSOMEG00000004316)	olfml2a (ENSOMEG00000004267)	ENSOMEG00000004253	rpl35 (ENSOMEG00000004245)	golga1 (ENSOMEG00000004228)	ENSOMEG00000004181	snapc4 (ENSOMEG00000004166)	pomt1 (ENSOMEG00000004116)	ENSOMEG00000004051	NTNG2 (ENSOMEG00000003985)
Javanese ricefish	MODERN SPECIES	23	araf (ENSOJAG00000009546)	imp4 (ENSOJAG00000009579)	TRAF2 (ENSOJAG00000009732)	ENSOJAG00000010024	ENSOJAG00000010052	ENSOJAG00000010125	ENSOJAG00000010168	QSOX2 (ENSOJAG00000010178)	ENSOJAG00000010219	ENSOJAG00000010237	ENSOJAG00000010783	ENSOJAG00000010829	CEL (ENSOJAG00000010973)	ENSOJAG00000011121	GRIN1 (ENSOJAG00000011216)	ENSOJAG00000012391 #22	lhx2b (ENSOJAG00000012446) #24	nr5a1a (ENSOJAG00000012493)	nr6a1a (ENSOJAG00000012646)	olfml2a (ENSOJAG00000012907)	ENSOJAG00000012928	ENSOJAG00000012944	rpl35 (ENSOJAG00000012953)	golga1 (ENSOJAG00000012999)	ENSOJAG00000013066	ENSOJAG00000013100	ENSOJAG00000013164	pomt1 (ENSOJAG00000013239)	ENSOJAG00000013718	NTNG2 (ENSOJAG00000013735)	nelfb (ENSOJAG00000016769)
Ovalentaria_B	ANCESTRAL SPECIES	9					ENSGT00940000166440	ENSGT01080000257442	ENSGT00390000012665	ENSGT01100000263542.B.b.a.b	ENSGT00940000167390	ENSGT00530000064286	ENSGT00940000155151.a.a.a	ENSGT00940000164907.b.a	ENSGT00620000089226	ENSGT00940000154394.a	ENSGT00940000165492.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00990000203759	ENSGT00390000016384.m	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00550000074961.a	ENSGT00940000167171	ENSGT01060000248544.b	ENSGT00940000155841.c.a	ENSGT00390000018644	ENSGT00390000013158	ENSGT00940000156763.b.b
Pomacentridae	ANCESTRAL SPECIES	162					ENSGT00940000155127.a.b	ENSGT00940000166440	ENSGT00390000012665	ENSGT01100000263542.B.b.a.b	ENSGT00940000167390	ENSGT00530000064286	ENSGT00940000155151.a.a.a	ENSGT00940000164907.b.a	ENSGT00620000089226	ENSGT00940000154394.a	ENSGT00940000165492.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT01060000248575.C	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00990000203759
Bicolor damselfish	MODERN SPECIES	322	FUT7 (ENSSPAG00000001102)	ENSSPAG00000001091	niban2b (ENSSPAG00000001009)	stxbp1b (ENSSPAG00000000938)	arrdc1a (ENSSPAG00000000897)	nelfb (ENSSPAG00000000848)	ENTPD2 (ENSSPAG00000000830)	fgf17 (ENSSPAG00000000815)	FKBP15 (ENSSPAG00000000799)	ccn1l2 (ENSSPAG00000000778)	ENSSPAG00000000752	ENSSPAG00000000715	tubb2b (ENSSPAG00000000729)	ENSSPAG00000000700	ENSSPAG00000000668	ENSSPAG00000000525 #22
Pomacentridae_A	ANCESTRAL SPECIES	170			ENSGT00940000163587.a.b.b.f	ENSGT00550000074961.a	ENSGT00940000155127.a.b	ENSGT00940000166440	ENSGT00390000012665	ENSGT01100000263542.B.b.a.b	ENSGT00940000167390	ENSGT00530000064286	ENSGT00940000155151.a.a.a	ENSGT00940000164907.b.a	ENSGT00620000089226	ENSGT00940000154394.a	ENSGT00940000165492.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT01060000248575.C	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00990000203759
Amphiprion	ANCESTRAL SPECIES	200			ENSGT00940000163587.a.b.b.f	ENSGT00550000074961.a	ENSGT00940000155127.a.b	ENSGT00940000166440	ENSGT00390000012665	ENSGT01100000263542.B.b.a.b	ENSGT00940000167390	ENSGT00530000064286	ENSGT00940000155151.a.a.a	ENSGT00940000164907.b.a	ENSGT00620000089226	ENSGT00940000154394.a	ENSGT00940000165492.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT01060000248575.C	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00990000203759
Clown anemonefish	MODERN SPECIES	669							nelfb (ENSAOCG00000012396)	entpd2a.1 (ENSAOCG00000012429)	fgf17 (ENSAOCG00000012451)	FKBP15 (ENSAOCG00000012526)	ccn1l2 (ENSAOCG00000000771)	ENSAOCG00000012609	ENSAOCG00000012635	tubb2b (ENSAOCG00000012623)	ENSAOCG00000012672	ENSAOCG00000012923 #22	lhx2b (ENSAOCG00000012997) #24
Orange clownfish	MODERN SPECIES	19	ENSAPEG00000015337	ENSAPEG00000015310	ENSAPEG00000015287	PPP6C (ENSAPEG00000015262)	stxbp1b (ENSAPEG00000015131)	arrdc1a (ENSAPEG00000015114)	nelfb (ENSAPEG00000015068)	entpd2a.1 (ENSAPEG00000015050)	fgf17 (ENSAPEG00000015027)	FKBP15 (ENSAPEG00000014994)	ccn1l2 (ENSAPEG00000014948)	ENSAPEG00000014925	ENSAPEG00000014882	tubb2b (ENSAPEG00000014896)	ENSAPEG00000014825	ENSAPEG00000014566 #22	lhx2b (ENSAPEG00000014488) #24	ENSAPEG00000014429	nr5a1a (ENSAPEG00000014395)	nr6a1a (ENSAPEG00000014356)	olfml2a (ENSAPEG00000014334)	ENSAPEG00000014304	ENSAPEG00000014276	ENSAPEG00000014221	cacna1ba (ENSAPEG00000014062)	paxx (ENSAPEG00000014017)	ABCA2 (ENSAPEG00000013735)	FUT7 (ENSAPEG00000013697)	ENSAPEG00000013595	niban2b (ENSAPEG00000013567)	golga1 (ENSAPEG00000013421)
Spiny chromis	DUPLICATION
Spiny chromis	MODERN SPECIES	2312																ENSAPOG00000017224 #22	ENSAPOG00000017209 #22
Spiny chromis	MODERN SPECIES	2312															ENSAPOG00000017224 #22	ENSAPOG00000017209 #22
Cichlidae	ANCESTRAL SPECIES	29			ENSGT00940000166440	ENSGT01080000257442	ENSGT00390000012665	ENSGT01100000263542.B.b.a.b	ENSGT00940000167390	ENSGT00530000064286	ENSGT00940000155151.a.a.a	ENSGT00940000164907.b.a	ENSGT00620000089226	ENSGT00940000154394.a	ENSGT00940000178161	ENSGT00940000154394.b.a.a.a.b.b	ENSGT00940000165492.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00990000203759	ENSGT00390000016384.m	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00550000074961.a	ENSGT00940000156003.k	ENSGT01060000248544.b	ENSGT00940000155841.c.a	ENSGT00390000018644	ENSGT00390000013158	ENSGT00940000156763.b.b
Midas cichlid	MODERN SPECIES	439								ENTPD2 (ENSACIG00000011944)	fgf17 (ENSACIG00000011934)	FKBP15 (ENSACIG00000011830)	ccn1l2 (ENSACIG00000011469)	ENSACIG00000011419	ENSACIG00000011403	ENSACIG00000011394	ENSACIG00000011386	ENSACIG00000011254 #22	lhx2b (ENSACIG00000011239) #24	ENSACIG00000011211	nr5a1a (ENSACIG00000011191)	nr6a1a (ENSACIG00000011176)	olfml2a (ENSACIG00000011135)	ENSACIG00000011130	rpl35 (ENSACIG00000011118)	golga1 (ENSACIG00000011035)	PPP6C (ENSACIG00000011006)	ENSACIG00000010989	ENSACIG00000010984	sh3glb2a (ENSACIG00000010955)	dph7 (ENSACIG00000010915)	mrpl41 (ENSACIG00000010909)	PNPLA7 (ENSACIG00000010839)
Pseudocrenilabrinae	ANCESTRAL SPECIES	37			ENSGT00940000166440	ENSGT01080000257442	ENSGT00390000012665	ENSGT01100000263542.B.b.a.b	ENSGT00940000167390	ENSGT00530000064286	ENSGT00940000155151.a.a.a	ENSGT00940000164907.b.a	ENSGT00620000089226	ENSGT00940000154394.a	ENSGT00940000178161	ENSGT00940000154394.b.a.a.a.b.b	ENSGT00940000165492.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00990000203759	ENSGT00390000016384.m	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00550000074961.a	ENSGT00940000159838	ENSGT00530000063843.a	ENSGT00950000183002.B.a.a	ENSGT00940000155127.a.b	ENSGT00940000154149.a.b	ENSGT00440000038604.j
Nile tilapia	MODERN SPECIES	3	ENSONIG00000032671	ENSONIG00000034062	arrdc1a (ENSONIG00000020231)	ENSONIG00000020230	nelfb (ENSONIG00000020229)	fgf17 (ENSONIG00000020227)	FKBP15 (ENSONIG00000020226)	ccn1l2 (ENSONIG00000038451)	ENSONIG00000020224	ENSONIG00000037430	ENSONIG00000032695	ENSONIG00000029706	ENSONIG00000042260	ENSONIG00000031245	ENSONIG00000037610	ENSONIG00000020222 #22	ENSONIG00000030564	lhx2b (ENSONIG00000039898) #24	ENSONIG00000029209	ADGRD2 (ENSONIG00000020219)	nr5a1 (ENSONIG00000020218)	ENSONIG00000027725	nr6a1a (ENSONIG00000020217)	olfml2a (ENSONIG00000020216)	ENSONIG00000041333	rpl35 (ENSONIG00000034874)	golga1 (ENSONIG00000020214)	ppp6c (ENSONIG00000011254)	ENSONIG00000032953	dpp7 (ENSONIG00000020212)	noxa1 (ENSONIG00000020211)
Pseudocrenilabrinae_A	ANCESTRAL SPECIES	28	ENSGT00530000063723.a	ENSGT00900000143393	ENSGT00390000015977	ENSGT00940000155794.h.g.b.a.a.a.a.b	ENSGT00940000166440	ENSGT01080000257442	ENSGT00390000012665	ENSGT01100000263542.B.b.a.b	ENSGT00940000167390	ENSGT00530000064286	ENSGT00940000155151.a.a.a	ENSGT00940000164907.b.a	ENSGT00620000089226	ENSGT00940000154394.b.a.a.a.b.b	ENSGT00940000165492.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00990000203759	ENSGT00390000016384.m	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00550000074961.a	ENSGT00940000159838	ENSGT00530000063843.a	ENSGT00950000183002.B.a.a	ENSGT00940000155127.a.b	ENSGT00940000154149.a.b	ENSGT00440000038604.j
Haplochromini	ANCESTRAL SPECIES	30	ENSGT00530000063723.a	ENSGT00900000143393	ENSGT00390000015977	ENSGT00940000155794.h.g.b.a.a.a.a.b	ENSGT00940000166440	ENSGT01080000257442	ENSGT00390000012665	ENSGT01100000263542.B.b.a.b	ENSGT00940000167390	ENSGT00530000064286	ENSGT00940000155151.a.a.a	ENSGT00940000164907.b.a	ENSGT00620000089226	ENSGT00940000154394.b.a.a.a.b.b	ENSGT00940000165492.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00990000203759	ENSGT00390000016384.m	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00550000074961.a	ENSGT00940000159838	ENSGT00530000063843.a	ENSGT00950000183002.B.a.a	ENSGT00940000155127.a.b	ENSGT00940000154149.a.b	ENSGT00440000038604.j
Haplochromini_A	ANCESTRAL SPECIES	32	ENSGT00530000063723.a	ENSGT00900000143393	ENSGT00390000015977	ENSGT00940000155794.h.g.b.a.a.a.a.b	ENSGT00940000166440	ENSGT01080000257442	ENSGT00390000012665	ENSGT01100000263542.B.b.a.b	ENSGT00940000167390	ENSGT00530000064286	ENSGT00940000155151.a.a.a	ENSGT00940000164907.b.a	ENSGT00620000089226	ENSGT00940000154394.b.a.a.a.b.b	ENSGT00940000165492.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00990000203759	ENSGT00390000016384.m	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00550000074961.a	ENSGT00940000159838	ENSGT00530000063843.a	ENSGT00950000183002.B.a.a	ENSGT00940000155127.a.b	ENSGT00940000154149.a.b	ENSGT00440000038604.j
Haplochromini_B	ANCESTRAL SPECIES	44	ENSGT00390000015977	ENSGT00940000155794.h.g.b.a.a.a.a.b	ENSGT00940000166440	ENSGT01080000257442	ENSGT00390000012665	ENSGT01100000263542.B.b.a.b	ENSGT00940000167390	ENSGT00530000064286	ENSGT00940000155151.a.a.a	ENSGT00940000164907.b.a	ENSGT00620000089226	ENSGT00940000154394.a	ENSGT00940000178161.a	ENSGT00390000020276.z.a	ENSGT00940000165492.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00990000203759	ENSGT00390000016384.m	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00550000074961.a	ENSGT00940000159838	ENSGT00530000063843.a	ENSGT00950000183002.B.a.a	ENSGT00940000180886	ENSGT00940000155127.a.b	ENSGT00940000154149.a.b
Zebra mbuna	MODERN SPECIES	1094												ENSMZEG00005017657	ENSMZEG00005017660	ENSMZEG00005017668	ENSMZEG00005017673	ENSMZEG00005017678 #22	lhx2b (ENSMZEG00005017695) #24	ADGRD2 (ENSMZEG00005017706)	nr5a1a (ENSMZEG00005017716)	nr6a1a (ENSMZEG00005017725)	olfml2a (ENSMZEG00005017754)	ENSMZEG00005017758	rpl35 (ENSMZEG00005017762)	golga1 (ENSMZEG00005017765)	PPP6C (ENSMZEG00005017775)	dpp7 (ENSMZEG00005017784)	noxa1 (ENSMZEG00005017794)	WHRN (ENSMZEG00005017800)	ENSMZEG00005017806	stxbp1b (ENSMZEG00005017808)	niban2b (ENSMZEG00005017814)
Eastern happy	MODERN SPECIES	3	entpd2a.1 (ENSACLG00000019573)	fgf17 (ENSACLG00000019521)	ENSACLG00000019509	FKBP15 (ENSACLG00000019322)	ccn1l2 (ENSACLG00000019277)	ENSACLG00000019242	ENSACLG00000019223	ENSACLG00000019210	ENSACLG00000019182	ENSACLG00000019171	ENSACLG00000019159	ENSACLG00000019124	ENSACLG00000019105	ENSACLG00000019082	ENSACLG00000019045	ENSACLG00000019037 #22	lhx2b (ENSACLG00000018962) #24	ADGRD2 (ENSACLG00000018926)	nr5a1a (ENSACLG00000018895)	ENSACLG00000018888	nr6a1a (ENSACLG00000018803)	olfml2a (ENSACLG00000018754)	ENSACLG00000018725	rpl35 (ENSACLG00000018708)	ENSACLG00000018704	golga1 (ENSACLG00000018552)	PPP6C (ENSACLG00000018501)	golga1 (ENSACLG00000018421)	rpl35 (ENSACLG00000018408)	ENSACLG00000018389	dpp7 (ENSACLG00000018297)
P. nyererei	MODERN SPECIES	348	trmt2a (ENSPNYG00000004441)	ENSPNYG00000004480	dgcr8 (ENSPNYG00000004486)	ENSPNYG00000004549	ENSPNYG00000004753	ENSPNYG00000004761	nelfb (ENSPNYG00000004780)	ENSPNYG00000004868	ENSPNYG00000005167	fgf17 (ENSPNYG00000005177)	FKBP15 (ENSPNYG00000005209)	ccn1l2 (ENSPNYG00000005275)	ENSPNYG00000005357	ENSPNYG00000005370	ENSPNYG00000005392	ENSPNYG00000005430 #22	lhx2b (ENSPNYG00000005547) #24	ENSPNYG00000005562	ENSPNYG00000005575	nr5a1a (ENSPNYG00000005588)	nr6a1a (ENSPNYG00000005611)	olfml2a (ENSPNYG00000005649)	ENSPNYG00000005660	rpl35 (ENSPNYG00000005682)	golga1 (ENSPNYG00000005715)	ENSPNYG00000005751	dpp7 (ENSPNYG00000005776)	noxa1 (ENSPNYG00000005827)	stxbp1b (ENSPNYG00000005853)	niban2b (ENSPNYG00000005900)	ENSPNYG00000005970
Burton s mouthbrooder	MODERN SPECIES	540																ENSHBUG00000003260 #22	lhx2b (ENSHBUG00000003247) #24	ENSHBUG00000003229	nr5a1a (ENSHBUG00000003219)	nr6a1a (ENSHBUG00000003195)	olfml2a (ENSHBUG00000003124)	ENSHBUG00000003114	rpl35 (ENSHBUG00000003110)	golga1 (ENSHBUG00000003088)	PPP6C (ENSHBUG00000003044)
Lyretail cichlid	MODERN SPECIES	127																ENSNBRG00000000205 #22
Cod	MODERN SPECIES	19	prdm8b (ENSGMOG00000033457)	ENSGMOG00000029016	antxr2a (ENSGMOG00000015589)	ENSGMOG00000036466	paqr3a (ENSGMOG00000015085)	ENSGMOG00000036689	ENSGMOG00000025876	ENSGMOG00000029293	fras1 (ENSGMOG00000006027)	ENSGMOG00000036907	PPP6C (ENSGMOG00000012092)	ENSGMOG00000012087	RPL35 (ENSGMOG00000012084)	ENSGMOG00000030536	ENSGMOG00000034054	ENSGMOG00000000137 #22	ENSGMOG00000030488	ENSGMOG00000023514	ENSGMOG00000000538	ENSGMOG00000028301	ENSGMOG00000028087	ENSGMOG00000026679	ENSGMOG00000016553	ENSGMOG00000007243	ENSGMOG00000023430	ENSGMOG00000012519	ENSGMOG00000028899	ENSGMOG00000024416	ENSGMOG00000037147	gatc (ENSGMOG00000008742)	ENSGMOG00000008748
Protacanthopterygii	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000165701	ENSGT00990000204854	ENSGT00940000155293.a.a	ENSGT00390000008727.a.a.d	ENSGT00940000166602.B	ENSGT00990000208446	ENSGT00390000003939	ENSGT00940000162787.c	ENSGT00940000157565	ENSGT00940000157935.b	ENSGT00940000158276	ENSGT00390000002581	ENSGT00940000155081.D	ENSGT00950000183136.b.a.a	ENSGT00940000160615.a.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a #22	ENSGT00940000165329	ENSGT00940000155080	ENSGT00940000157081	ENSGT01050000244843.d.f.b	ENSGT00940000177700	ENSGT00940000155337.ab	ENSGT00940000166587	ENSGT00950000183050.b.b.b.a.a.a.a	ENSGT01100000263516.a.b.b.b.b.a.a.b.b.a.a.b	ENSGT00940000153464.B.z.b	ENSGT00530000063410.a.q.a	ENSGT00390000016551	ENSGT00940000161234.c	ENSGT00940000157597	ENSGT00940000155345.q
Salmoninae	DUPLICATION
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	17																ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a.i #22	ENSGT00940000158540.z.a #24	ENSGT01060000248575.C.d	ENSGT00940000161534.pb.b	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a.a	ENSGT00940000157936.k.a	ENSGT00940000157194.b	ENSGT00390000016384.l.b.b	ENSGT00940000153772.B.k	ENSGT00550000074961.a.d	ENSGT00940000165424.a.b.b.b	ENSGT01000000215397.A.b	ENSGT00940000163383	ENSGT00940000155841.c.a.f	ENSGT00940000158633.b.c	ENSGT00990000204366
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	31																ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a.i #22	ENSGT00940000158540.z.a #24	ENSGT00940000161534.pb.b	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a.a	ENSGT00940000157936.k.a	ENSGT00940000157194.b	ENSGT00390000016384.l.b.b	ENSGT00940000153772.B.k	ENSGT00550000074961.a.d	ENSGT00940000165424.a.b.b.b	ENSGT01000000215397.A.b	ENSGT00940000163383	ENSGT00940000155841.c.a.f	ENSGT00940000158633.b.c	ENSGT00990000204366	ENSGT00940000156811.a.e
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	19																ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a.i #22	ENSGT00940000158540.z.a #24	ENSGT00940000161534.pb.b	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a.a	ENSGT00940000157936.k.a	ENSGT00940000157194.b	ENSGT00390000016384.l.b.b	ENSGT00940000153772.B.k	ENSGT00550000074961.a.d	ENSGT00940000165424.a.b.b.b	ENSGT01000000215397.A.b	ENSGT00940000163383	ENSGT00940000155841.c.a.f	ENSGT00940000158633.b.c	ENSGT00990000204366	ENSGT00940000156811.a.e
River trout	MODERN SPECIES	39	man1b1b (ENSSTUG00000018604)	cacna1ba (ENSSTUG00000018726)	ehmt1a (ENSSTUG00000021036)	arrdc1a (ENSSTUG00000021140)	ENSSTUG00000021145	nelfb (ENSSTUG00000021155)	ENTPD2 (ENSSTUG00000021428)	fgf17 (ENSSTUG00000021462)	FKBP15 (ENSSTUG00000021489)	ccn1l2 (ENSSTUG00000021631)	ENSSTUG00000021644	ENSSTUG00000021665	ENSSTUG00000021681	ENSSTUG00000021692	FPGS (ENSSTUG00000021783)	CRB2 (ENSSTUG00000023209) #22	lhx2b (ENSSTUG00000023228) #24	ENSSTUG00000023255	NR5A1 (ENSSTUG00000023289)	nr6a1a (ENSSTUG00000023380)	olfml2a (ENSSTUG00000023830)	ENSSTUG00000023842	RPL35 (ENSSTUG00000023853)	golga1 (ENSSTUG00000023883)	PPP6C (ENSSTUG00000024002)	ENSSTUG00000024043	ENSSTUG00000024066	ENSSTUG00000024083	sh3glb2a (ENSSTUG00000024121)	PIP5KL1 (ENSSTUG00000005921)	ENSSTUG00000005931
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	12	ENSSSAG00000098478	arrdc1a (ENSSSAG00000074053)	ENSSSAG00000106615	nelfb (ENSSSAG00000072439)	ENSSSAG00000118121	ENSSSAG00000098312	ENSSSAG00000074256	ENSSSAG00000074285	ENSSSAG00000117780	ENSSSAG00000074498	ENSSSAG00000074499	ENSSSAG00000117241	ENSSSAG00000074508	ENSSSAG00000074529	ENSSSAG00000102406	ENSSSAG00000075255 #22	ENSSSAG00000085026 #24	ADGRD2 (ENSSSAG00000075294)	ENSSSAG00000100039	NR5A1 (ENSSSAG00000075313)	nr6a1a (ENSSSAG00000072271)	ENSSSAG00000096143	olfml2a (ENSSSAG00000075396)	RPL35 (ENSSSAG00000075399)	GOLGA1 (ENSSSAG00000075418)	ENSSSAG00000065522	ENSSSAG00000075536	ENSSSAG00000075541	ENSSSAG00000075544	ENSSSAG00000075738	ENSSSAG00000075747
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000158199.l	ENSGT00940000157157.b.a.a.e	ENSGT00940000155422.bb.b	ENSGT00940000155275.c.b.b.e	ENSGT00940000166440	ENSGT01080000257442.c.b	ENSGT00390000012665.j	ENSGT01100000263542.B.b.a.b.e	ENSGT00940000167390.c	ENSGT00530000064286.c.a	ENSGT00940000155151.a.a.a.d	ENSGT00940000164907.b.a.c	ENSGT00620000089226	ENSGT00940000154394.b.a.a.a.a.a.b	ENSGT00390000020276.lb	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a.i #22	ENSGT00940000158540.z.a #24	ENSGT00940000161534.pb.b	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a.a	ENSGT00940000157936.k.a	ENSGT00940000157194.b	ENSGT00940000168933	ENSGT00390000016384.l.b.b	ENSGT00940000153772.B.k	ENSGT00550000074961.a.d	ENSGT00940000165424.a.b.b.b	ENSGT01000000215397.A.b	ENSGT00940000163383	ENSGT00940000155841.c.a.f	ENSGT00940000158633.b.c	ENSGT00990000204366
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000156724.k	ENSGT00940000158199.l	ENSGT00940000157157.b.a.a.e	ENSGT00940000155422.bb.b	ENSGT00940000155275.c.b.b.e	ENSGT00940000166440	ENSGT01080000257442.c.b	ENSGT00390000012665.j	ENSGT01100000263542.B.b.a.b.e	ENSGT00940000167390.c	ENSGT00530000064286.c.a	ENSGT00940000155151.a.a.a.d	ENSGT00940000164907.b.a.c	ENSGT00940000154394.b.a.a.a.a.a.b	ENSGT00390000020276.lb	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a.i #22	ENSGT00940000158540.z.a #24	ENSGT00940000161534.pb.b	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a.a	ENSGT00940000157936.k.a	ENSGT00940000157194.b	ENSGT00940000168933	ENSGT00390000016384.l.b.b	ENSGT00940000153772.B.k	ENSGT00550000074961.a.d	ENSGT00940000165424.a.b.b.b	ENSGT01000000215397.A.b	ENSGT00940000163383	ENSGT00940000155841.c.a.f	ENSGT00940000158633.b.c	ENSGT00990000204366
Chinook salmon	MODERN SPECIES	3	ENSOTSG00005010937	pmpca (ENSOTSG00005009796)	inpp5e (ENSOTSG00005009781)	notch1b (ENSOTSG00005009635)	man1b1b (ENSOTSG00005046690)	cacna1ba (ENSOTSG00005045082)	arrdc1a (ENSOTSG00005045057)	nelfb (ENSOTSG00005044540)	ENTPD2 (ENSOTSG00005044538)	fgf17 (ENSOTSG00005044537)	FKBP15 (ENSOTSG00005044042)	ccn1l2 (ENSOTSG00005044034)	ENSOTSG00005044033	ENSOTSG00005044031	ENSOTSG00005044025	ENSOTSG00005043734 #22	lhx2b (ENSOTSG00005043733) #24	ADGRD2 (ENSOTSG00005043732)	nr5a1a (ENSOTSG00005043720)	ENSOTSG00005043718	nr6a1a (ENSOTSG00005043717)	olfml2a (ENSOTSG00005043714)	ENSOTSG00005043712	RPL35 (ENSOTSG00005043711)	golga1 (ENSOTSG00005043710)	ENSOTSG00005043709	ENSOTSG00005043708	PPP6C (ENSOTSG00005043707)	ENSOTSG00005043706	sh3glb2a (ENSOTSG00005043552)	PIP5KL1 (ENSOTSG00005043550)
Coho salmon	MODERN SPECIES	28	pmpca (ENSOKIG00005050081)	inpp5e (ENSOKIG00005050049)	notch1b (ENSOKIG00005049913)	MAN1B1 (ENSOKIG00005049871)	cacna1ba (ENSOKIG00005047148)	arrdc1a (ENSOKIG00005046737)	ENSOKIG00005046731	nelfb (ENSOKIG00005046649)	ENTPD2 (ENSOKIG00005046613)	fgf17 (ENSOKIG00005046602)	FKBP15 (ENSOKIG00005046028)	ENSOKIG00005045974	ENSOKIG00005045969	ENSOKIG00005045958	ENSOKIG00005045953	ENSOKIG00005045302 #22	LHX2 (ENSOKIG00005045190) #24	ADGRD2 (ENSOKIG00005045172)	nr5a1a (ENSOKIG00005045103)	nr6a1a (ENSOKIG00005044956)	olfml2a (ENSOKIG00005044924)	ENSOKIG00005044913	RPL35 (ENSOKIG00005044889)	golga1 (ENSOKIG00005044844)	PPP6C (ENSOKIG00005044835)	ENSOKIG00005044831	ENSOKIG00005044822	ENSOKIG00005044814	sh3glb2a (ENSOKIG00005044772)	PIP5KL1 (ENSOKIG00005044754)	ENSOKIG00005044747
Rainbow trout	MODERN SPECIES	2	ENSOMYG00000008306	man1b1b (ENSOMYG00000009283)	cacna1ba (ENSOMYG00000011876)	arrdc1a (ENSOMYG00000038634)	ENSOMYG00000038647	ENSOMYG00000038658	nelfb (ENSOMYG00000038706)	entpd2a.1 (ENSOMYG00000038734)	ENSOMYG00000038777	ENSOMYG00000039134	ENSOMYG00000039622	ENSOMYG00000039634	ENSOMYG00000039656	ENSOMYG00000039709	ENSOMYG00000039750	ENSOMYG00000039974 #22	ENSOMYG00000040543 #24	ftz-f1 (ENSOMYG00000040590)	ENSOMYG00000068514	NR6A1 (ENSOMYG00000040636)	olfml2a (ENSOMYG00000040641)	ENSOMYG00000040645	ENSOMYG00000076142	RPL35 (ENSOMYG00000055069)	ENSOMYG00000040657	GOLGA1 (ENSOMYG00000040675)	ENSOMYG00000040695	ENSOMYG00000040703	ENSOMYG00000040708	ENSOMYG00000040716	sh3glb2a (ENSOMYG00000040743)
Huchen	MODERN SPECIES	1275															FPGS (ENSHHUG00000040329)	ENSHHUG00000040343 #22	lhx2b (ENSHHUG00000040356) #24	ENSHHUG00000040363	ENSHHUG00000040379	ENSHHUG00000040389	nr6a1a (ENSHHUG00000040545)
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	54	ENSGT00940000155422.bb.a	ENSGT00940000166112.h	ENSGT00940000155275.c.b.b.f	ENSGT00940000156002.a.b.lb.a	ENSGT00940000159652.j	ENSGT01080000257442.d	ENSGT01080000257442.c.a	ENSGT00390000012665.i	ENSGT01100000263542.B.b.a.b.f	ENSGT00940000167390.d	ENSGT00530000064286.c.b	ENSGT00940000155151.a.a.a.c	ENSGT00940000164907.b.a.d	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a	ENSGT00940000154394.a.e.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a.j #22	ENSGT00940000158540.z.b #24	ENSGT01060000248575.C.c	ENSGT00940000161534.pb.a	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a.b	ENSGT00940000157936.k.b	ENSGT00940000157194.a	ENSGT00390000016384.l.b.a	ENSGT00390000016384.m	ENSGT00940000153772.B.l	ENSGT00550000074961.a.c	ENSGT00940000167067	ENSGT00390000011466.e.a	ENSGT00440000033468.k.a.b	ENSGT00940000154256.ac.c	ENSGT01000000215397.A.a
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000155422.bb.a	ENSGT00940000166112.h	ENSGT00940000155275.c.b.b.f	ENSGT00940000156002.a.b.lb.a	ENSGT00940000159652.j	ENSGT01080000257442.d	ENSGT01080000257442.c.a	ENSGT00390000012665.i	ENSGT01100000263542.B.b.a.b.f	ENSGT00940000167390.d	ENSGT00530000064286.c.b	ENSGT00940000155151.a.a.a.c	ENSGT00940000164907.b.a.d	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a	ENSGT00940000154394.b.a.a.a.a.b.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a.j #22	ENSGT00940000158540.z.b #24	ENSGT01060000248575.C.c	ENSGT00940000161534.pb.a	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a.b	ENSGT00940000157936.k.b	ENSGT00940000157194.a	ENSGT00390000016384.l.b.a	ENSGT00390000016384.m	ENSGT00940000153772.B.l	ENSGT00550000074961.a.c	ENSGT00940000167067	ENSGT00390000011466.e.a	ENSGT00440000033468.k.a.b	ENSGT00940000154256.ac.c	ENSGT01000000215397.A.a
Salmo	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000155422.bb.a	ENSGT00940000166112.h	ENSGT00940000155275.c.b.b.f	ENSGT00940000156002.a.b.lb.a	ENSGT00940000159652.j	ENSGT01080000257442.d	ENSGT01100000263537.b.a.b.e.b	ENSGT00390000012665.i	ENSGT01100000263542.B.b.a.b.f	ENSGT00940000167390.d	ENSGT00530000064286.c.b	ENSGT00940000155151.a.a.a.c	ENSGT00940000164907.b.a.d	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a	ENSGT00940000154394.b.a.a.a.a.b.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a.j #22	ENSGT00940000158540.z.b #24	ENSGT01060000248575.C.c	ENSGT00940000161534.pb.a	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a.b	ENSGT00940000157936.k.b	ENSGT00940000157194.a	ENSGT00390000016384.m	ENSGT00940000153772.B.l	ENSGT00550000074961.a.c	ENSGT00940000165424.a.b.b.a	ENSGT00390000011466.e.a	ENSGT01000000215397.A.a	ENSGT00940000155841.c.a.e	ENSGT00940000158633.b.d	ENSGT01060000251815
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	16	dpp7 (ENSSSAG00000120719)	man1b1b (ENSSSAG00000052998)	ENSSSAG00000092968	cacna1ba (ENSSSAG00000072846)	ehmt1a (ENSSSAG00000074046)	ARRDC1 (ENSSSAG00000072523)	ENSSSAG00000116526	nelfb (ENSSSAG00000074069)	ENSSSAG00000072431	ENSSSAG00000097050	ENSSSAG00000072399	ENSSSAG00000072385	ENSSSAG00000109409	TBB1 (ENSSSAG00000072377)	ENSSSAG00000072367	ENSSSAG00000072364 #22	ENSSSAG00000072360 #24	ENSSSAG00000072348	ADGRD2 (ENSSSAG00000090783)	NR5A1 (ENSSSAG00000072340)	ENSSSAG00000116267	nr6a1a (ENSSSAG00000075354)	ENSSSAG00000072261	olm2a (ENSSSAG00000072257)	RPL35 (ENSSSAG00000072189)	GOLGA1 (ENSSSAG00000072220)	ENSSSAG00000109298	ENSSSAG00000119018	ENSSSAG00000072196	ENSSSAG00000110621	shlb2 (ENSSSAG00000071861)
River trout	MODERN SPECIES	19	ENSSTUG00000039610	ENSSTUG00000039602	cacna1ba (ENSSTUG00000029587)	ehmt1a (ENSSTUG00000028064)	ARRDC1 (ENSSTUG00000028005)	ENSSTUG00000027997	ENSSTUG00000027994	nelfb (ENSSTUG00000027637)	ENSSTUG00000027617	fgf17 (ENSSTUG00000027546)	FKBP15 (ENSSTUG00000025645)	ccn1l2 (ENSSTUG00000025569)	ENSSTUG00000025557	bcl2l16 (ENSSTUG00000025552)	ENSSTUG00000025546	ENSSTUG00000025454 #22	ENSSTUG00000025443	lhx2b (ENSSTUG00000025427) #24	ADGRD2 (ENSSTUG00000025388)	nr5a1a (ENSSTUG00000025342)	nr6a1a (ENSSTUG00000025026)	ENSSTUG00000025000	olfml2a (ENSSTUG00000024972)	RPL35 (ENSSTUG00000024943)	golga1 (ENSSTUG00000024853)	PPP6C (ENSSTUG00000024826)	ENSSTUG00000024818	ENSSTUG00000024806	ENSSTUG00000024794	sh3glb2a (ENSSTUG00000023185)	PIP5KL1 (ENSSTUG00000023107)
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000159838	ENSGT00940000155422.bb.a	ENSGT00940000155275.c.b.b.f	ENSGT00940000156002.a.b.lb.a	ENSGT00940000159652.j	ENSGT01080000257442.d	ENSGT01080000257442.c.a	ENSGT00390000012665.i	ENSGT01100000263542.B.b.a.b.f	ENSGT00940000167390.d	ENSGT00530000064286.c.b	ENSGT00940000155151.a.a.a.c	ENSGT00940000164907.b.a.d	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a	ENSGT00940000154394.b.a.a.a.a.b.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a.j #22	ENSGT00940000158540.z.b #24	ENSGT00940000161534.pb.a	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a.b	ENSGT00940000157936.k.b	ENSGT00940000157194.a	ENSGT00390000016384.l.b.a	ENSGT00940000153772.B.l	ENSGT00550000074961.a.c	ENSGT00940000167067	ENSGT01000000215397.A.a	ENSGT00940000155841.c.a.e	ENSGT00940000158633.b.d	ENSGT00940000156811.a.f	ENSGT00940000159428.f.a.a	ENSGT00940000156902.a
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000155275.c.b.b.f	ENSGT00940000156002.a.b.lb.a	ENSGT00940000159652.j	ENSGT01080000257442.d	ENSGT01080000257442.c.a	ENSGT00390000012665.i	ENSGT01100000263542.B.b.a.b.f	ENSGT00940000167390.d	ENSGT00530000064286.c.b	ENSGT00940000155151.a.a.a.c	ENSGT00940000164907.b.a.d	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a	ENSGT00940000154394.b.a.a.a.b.a.a.a.a	ENSGT00950000183136.b.a.a	ENSGT00940000160615.a.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a.j #22	ENSGT00940000158540.z.b #24	ENSGT00940000161534.pb.a	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a.b	ENSGT00940000157936.k.b	ENSGT00940000157194.a	ENSGT00390000016384.l.b.a	ENSGT00940000153772.B.l	ENSGT00550000074961.a.c	ENSGT00940000167067	ENSGT00390000011466.e.b	ENSGT01000000215397.A.a	ENSGT00940000155841.c.a.e	ENSGT00940000158633.b.d	ENSGT00940000156811.a.f	ENSGT00940000157207.a.b
Coho salmon	MODERN SPECIES	22	ENSOKIG00005002302	cacna1ba (ENSOKIG00005003648)	ehmt1a (ENSOKIG00005028420)	ENSOKIG00005033359	ARRDC1 (ENSOKIG00005033365)	ENSOKIG00005033383	ENSOKIG00005033387	nelfb (ENSOKIG00005033416)	ENTPD2 (ENSOKIG00005034210)	ENSOKIG00005034323	FKBP15 (ENSOKIG00005034416)	ccn1l2 (ENSOKIG00005036321)	ENSOKIG00005036347	bcl2l16 (ENSOKIG00005036390)	ENSOKIG00005036398	ENSOKIG00005036431 #22	lhx2b (ENSOKIG00005036496) #24	ADGRD2 (ENSOKIG00005036523)	NR5A1 (ENSOKIG00005036595)	nr6a1a (ENSOKIG00005036775)	olfml2a (ENSOKIG00005036964)	RPL35 (ENSOKIG00005036982)	GOLGA1 (ENSOKIG00005037060)	PPP6C (ENSOKIG00005037163)	ENSOKIG00005037188	ENSOKIG00005037199	ENSOKIG00005037206	ENSOKIG00005037258	PIP5KL1 (ENSOKIG00005037443)	EEIG1 (ENSOKIG00005039898)	seta (ENSOKIG00005039985)
Chinook salmon	MODERN SPECIES	28	bco2l (ENSOTSG00005037982)	ENSOTSG00005039320	LZTS1 (ENSOTSG00005000235)	PDE4D (ENSOTSG00005000243)	ENSOTSG00005000426	rchy1 (ENSOTSG00005000428)	ENSOTSG00005000432	ENSOTSG00005000435	fgf17 (ENSOTSG00005000438)	FKBP15 (ENSOTSG00005000457)	ccn1l2 (ENSOTSG00005005246)	ENSOTSG00005005248	bcl2l16 (ENSOTSG00005005250)	ENSOTSG00005005251	ENSOTSG00005005253	ENSOTSG00005005254 #22	ENSOTSG00005005255	ENSOTSG00005005256	MEX3C (ENSOTSG00005005259)	SMAD4 (ENSOTSG00005005261)	elac1 (ENSOTSG00005005263)	aptx (ENSOTSG00005005264)	me2 (ENSOTSG00005005270)	mapk4 (ENSOTSG00005006847)	tspan36 (ENSOTSG00005006869)	si:ch211-103n10.5 (ENSOTSG00005006870)	ENSOTSG00005006871	mpeg1.2 (ENSOTSG00005006872)	prf1.5 (ENSOTSG00005006873)	HPGDS (ENSOTSG00005006874)	smarcad1a (ENSOTSG00005006882)
Rainbow trout	MODERN SPECIES	27	ENSOMYG00000013769	dpp7 (ENSOMYG00000017676)	man1b1b (ENSOMYG00000017764)	cacna1ba (ENSOMYG00000018918)	ehmt1a (ENSOMYG00000043578)	ARRDC1 (ENSOMYG00000045458)	p2ry2 (ENSOMYG00000045470)	ENSOMYG00000045472	ENSOMYG00000045493	ENSOMYG00000045551	ENSOMYG00000045585	ccn1l2 (ENSOMYG00000045649)	ENSOMYG00000045655	bcl2l16 (ENSOMYG00000045660)	ENSOMYG00000045666	ENSOMYG00000048411 #22	ENSOMYG00000045674 #24	ADGRD2 (ENSOMYG00000045677)	NR5A1 (ENSOMYG00000045698)	nr6a1a (ENSOMYG00000045717)	OLFML2A (ENSOMYG00000045784)	RPL35 (ENSOMYG00000045792)	GOLGA1 (ENSOMYG00000045811)	ENSOMYG00000045867	ENSOMYG00000045876	ENSOMYG00000045895	ENSOMYG00000045923	ENSOMYG00000046043	ENSOMYG00000046048	ENSOMYG00000046069	ENSOMYG00000046099
Huchen	MODERN SPECIES	698	man1b1b (ENSHHUG00000045266)	ENSHHUG00000045285	cacna1ba (ENSHHUG00000045289)	ehmt1a (ENSHHUG00000045332)	ARRDC1 (ENSHHUG00000045749)	ENSHHUG00000045755	ENSHHUG00000045758	nelfb (ENSHHUG00000045762)	ENSHHUG00000045839	fgf17 (ENSHHUG00000045843)	FKBP15 (ENSHHUG00000045851)	ccn1l2 (ENSHHUG00000045897)	ENSHHUG00000045901	bcl2l16 (ENSHHUG00000045908)	tubb2b (ENSHHUG00000045913)	CRB2 (ENSHHUG00000045925) #22
Northern pike	MODERN SPECIES	12	notch1b (ENSELUG00000002143)	dpp7 (ENSELUG00000002133)	man1b1b (ENSELUG00000002128)	cacna1ba (ENSELUG00000002116)	ENSELUG00000002101	ENSELUG00000002099	nelfb (ENSELUG00000002087)	fgf17 (ENSELUG00000002082)	ENSELUG00000002078	ccn1l2 (ENSELUG00000002050)	ENSELUG00000002048	bcl2l16 (ENSELUG00000002045)	tubb2b (ENSELUG00000002042)	ENSELUG00000002037	FPGS (ENSELUG00000002033)	CRB2 (ENSELUG00000002023) #22	lhx2b (ENSELUG00000000056) #24	ADGRD2 (ENSELUG00000002011)	nr5a1a (ENSELUG00000002007)	nr6a1a (ENSELUG00000002004)	olfml2a (ENSELUG00000002000)	RL35 (ENSELUG00000001990)	PPP6C (ENSELUG00000001963)	ENSELUG00000001961	ENSELUG00000001960	PRRT1B (ENSELUG00000001955)	sh3glb2a (ENSELUG00000001953)	PIP5KL1 (ENSELUG00000001951)	ENSELUG00000001949	EEIG1 (ENSELUG00000001947)	ENSELUG00000001944
Osteoglossiformes	DUPLICATION
Osteoglossiformes	ANCESTRAL SPECIES	164	ENSGT00530000064359.d	ENSGT00940000154645.B.a	ENSGT00940000160451	ENSGT01060000248556.A.a.a.a.b.a	ENSGT00900000141021.b.a.c.b	ENSGT00390000008371.b	ENSGT00930000151050	ENSGT00530000064286.b	ENSGT00930000151044	ENSGT00390000006922	ENSGT00940000164386	ENSGT00940000155151.a.a.a	ENSGT00940000164907.b.b	ENSGT00390000016526.g	ENSGT00940000155373	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a.k #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990.g	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a.g	ENSGT00940000157194.e	ENSGT00940000172233	ENSGT00940000158501.b	ENSGT00390000009566.c	ENSGT00550000074961.a.b
P. kingsleyae	MODERN SPECIES	324										ENSPKIG00000021398	fpgs (ENSPKIG00000021358)	cdk9 (ENSPKIG00000021317)	ENSPKIG00000021293	ENSPKIG00000021277	ENSPKIG00000021240	CRB2 (ENSPKIG00000021213) #22	ENSPKIG00000021192	EGR3 (ENSPKIG00000021178)	ENSPKIG00000021166	ENSPKIG00000021143	wdr45 (ENSPKIG00000021102)	trim69 (ENSPKIG00000021074)	bmp1b (ENSPKIG00000021030)	npffr1l1 (ENSPKIG00000021008)	kansl3 (ENSPKIG00000020921)	ANTXR1 (ENSPKIG00000020856)	AAK1 (ENSPKIG00000020694)	anxa4 (ENSPKIG00000020622)	adrb3b (ENSPKIG00000020608)	ENSPKIG00000020596	brf2 (ENSPKIG00000020580)
Asian bonytongue	MODERN SPECIES	21	NCS1 (ENSSFOG00015032851)	gpr107 (ENSSFOG00015013755)	crata (ENSSFOG00015013784)	IER5L (ENSSFOG00015027039)	ntmt1 (ENSSFOG00015013835)	ndor1 (ENSSFOG00015013852)	lrsam1 (ENSSFOG00015013925)	RPL12 (ENSSFOG00015029067)	pole3 (ENSSFOG00015014086)	ENSSFOG00015014104	ENSSFOG00015014116	ENSSFOG00015015629	ENSSFOG00015014320	fpgs (ENSSFOG00015014398)	cdk9 (ENSSFOG00015014527)	CRB2 (ENSSFOG00015014561) #22	DENND1A (ENSSFOG00015014700) #23	lhx2b (ENSSFOG00015014773) #24	NEK6 (ENSSFOG00015014790)	psmb7 (ENSSFOG00015014825)	NR5A1 (ENSSFOG00015029487)	ENSSFOG00015028783	nr6a1a (ENSSFOG00015014862)	OLFML2A (ENSSFOG00015033126)	ENSSFOG00015032130	ARPC5L (ENSSFOG00015025966)	ENSSFOG00015027501	ENSSFOG00015027511	ENSSFOG00015031547	SCAI (ENSSFOG00015015027)	PPP6C (ENSSFOG00015026875)
Osteoglossiformes	ANCESTRAL SPECIES	75		ENSGT00930000151016	ENSGT01060000248556.A.a.a.a.b.b	ENSGT00940000158379	ENSGT00390000011500	ENSGT00900000141021.b.a.c.a	ENSGT00390000006784	ENSGT00530000064286.a	ENSGT00940000155151.a.a.b	ENSGT00940000164907.b.a	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a	ENSGT00940000154394.a	ENSGT00940000154394.b.a.a.a.b.b	ENSGT00940000165492.a.a	ENSGT00390000016526.h	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a.l #22	ENSGT00940000153391.c.b.a.h	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194.f	ENSGT00390000016384	ENSGT00940000158501.a	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566.d	ENSGT00550000074961.a.a	ENSGT00940000167171	ENSGT01060000248544.b	ENSGT00940000155841	ENSGT00940000158633.a.b	ENSGT00990000204366	ENSGT00940000156811.a	ENSGT00450000040324.b.g
Asian bonytongue	MODERN SPECIES	8	ENSSFOG00015003976	NCS1 (ENSSFOG00015016804)	CRAT (ENSSFOG00015016764)	ENSSFOG00015016722	ptpa (ENSSFOG00015016682)	IER5L (ENSSFOG00015030523)	asb6 (ENSSFOG00015016641)	FKBP15 (ENSSFOG00015016577)	rpl12 (ENSSFOG00015031530)	ENSSFOG00015016467	ENSSFOG00015016442	bcl2l16 (ENSSFOG00015016433)	ENSSFOG00015011323	ENSSFOG00015016374	FPGS (ENSSFOG00015016349)	CRB2 (ENSSFOG00015016231) #22	lhx2b (ENSSFOG00015008780) #24	NEK6 (ENSSFOG00015032992)	NR5A1 (ENSSFOG00015008707)	nr6a1a (ENSSFOG00015008672)	OLFML2A (ENSSFOG00015008626)	rpl35 (ENSSFOG00015008582)	ARPC5L (ENSSFOG00015008543)	golga1 (ENSSFOG00015008493)	SCAI (ENSSFOG00015008413)	PPP6C (ENSSFOG00015008382)	ENSSFOG00015026015	ENSSFOG00015008262	SH3GLB2 (ENSSFOG00015008180)	PIP5KL1 (ENSSFOG00015008125)	ENSSFOG00015008089
P. kingsleyae	MODERN SPECIES	36	ENSPKIG00000024542	ENSPKIG00000024531	zgc:154046 (ENSPKIG00000024502)	ADAMTS13 (ENSPKIG00000024467)	ptpa (ENSPKIG00000024438)	IER5L (ENSPKIG00000024424)	asb6 (ENSPKIG00000024415)	FKBP15 (ENSPKIG00000024375)	ccn1l1 (ENSPKIG00000024360)	ENSPKIG00000024343	bcl2l16 (ENSPKIG00000024322)	tubb2b (ENSPKIG00000024313)	ENSPKIG00000024304	ENSPKIG00000024292	FPGS (ENSPKIG00000024268)	CRB2 (ENSPKIG00000024247) #22	ENSPKIG00000024237	lhx2b (ENSPKIG00000024197) #24	ENSPKIG00000024188	NEK6 (ENSPKIG00000024170)	ADGRD2 (ENSPKIG00000024114)	NR5A1 (ENSPKIG00000024096)	nr6a1a (ENSPKIG00000024074)	OLFML2A (ENSPKIG00000024055)	rpl35 (ENSPKIG00000024042)	ARPC5L (ENSPKIG00000024028)	golga1 (ENSPKIG00000023995)	SCAI (ENSPKIG00000023949)	PPP6C (ENSPKIG00000023917)	ENSPKIG00000023901	ENSPKIG00000023896
Osteoglossocephalai	ANCESTRAL SPECIES	49	ENSGT00940000163762.b	ENSGT00940000155945.i.a	ENSGT00940000154645.B	ENSGT00940000160451	ENSGT01060000248556.A.a.a.a.b.a	ENSGT00390000011500	ENSGT00900000141021.b.a.d	ENSGT00390000008371.b	ENSGT00930000151050	ENSGT00530000064286	ENSGT00930000151044	ENSGT00390000006922	ENSGT00940000164386	ENSGT00940000155151.a.a.b	ENSGT00940000164907.b.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000165669	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00390000016384	ENSGT00940000166116	ENSGT00940000172233	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT01060000248575.C
Clupeocephala	ANCESTRAL SPECIES	195	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000155946.c.b	ENSGT00930000151016	ENSGT01060000248556.A.a.a.a.b.a	ENSGT00390000011500	ENSGT00900000141021.b.a.d	ENSGT00390000008371.b	ENSGT00930000151050	ENSGT00530000064286	ENSGT00930000151044	ENSGT00390000006922	ENSGT00940000164386	ENSGT00940000155151.a.a.b	ENSGT00940000164907.b.b	ENSGT00940000154394.b.a.a.b.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.b	ENSGT00940000165669	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000158501.d.a	ENSGT00390000016384.l.a	ENSGT00940000166116
Otomorpha	ANCESTRAL SPECIES	193	ENSGT00930000151016	ENSGT00940000154645.B	ENSGT00940000160451	ENSGT01060000248556.A.a.a.a.b.a	ENSGT00390000011500	ENSGT00900000141021.b.a.d	ENSGT00390000008371.b	ENSGT00930000151050	ENSGT00930000151044	ENSGT00390000006922	ENSGT00940000164386	ENSGT00940000155151.a.a.b	ENSGT00940000164907.b.b	ENSGT00390000016526	ENSGT00940000155373	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.b
Clupeiformes	ANCESTRAL SPECIES	105	ENSGT00940000160451	ENSGT01060000248556.A.a.a.a.b.a	ENSGT00390000011500	ENSGT00900000141021.b.a.d.a	ENSGT00390000008371.b	ENSGT00930000151050	ENSGT00930000151044	ENSGT00390000006922	ENSGT00940000164386	ENSGT00940000155151.a.a.b	ENSGT00940000164907.b.b	ENSGT00940000154394.b.a.a.a.a.a.b	ENSGT00390000020276.mb.b	ENSGT00390000016526	ENSGT00940000155373	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.b	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194.d	ENSGT00390000016384.l.a	ENSGT00940000158501.d.a	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961.b	ENSGT00940000155841.c.b	ENSGT00940000158633.a	ENSGT00390000001098	ENSGT00940000156811.b
Atlantic herring	MODERN SPECIES	3	gpr107 (ENSCHAG00000003724)	crata (ENSCHAG00000003848)	ptpa (ENSCHAG00000004320)	ier5l (ENSCHAG00000004832)	ntmt1 (ENSCHAG00000004859)	ndor1 (ENSCHAG00000004879)	lrsam1 (ENSCHAG00000005132)	rpl12 (ENSCHAG00000005485)	pole3 (ENSCHAG00000005619)	ccn1l1 (ENSCHAG00000005656)	lmo4a (ENSCHAG00000005730)	ENSCHAG00000005749	ENSCHAG00000005894	fpgs (ENSCHAG00000006452)	cdk9 (ENSCHAG00000007237)	CRB2 (ENSCHAG00000007287) #22	DENND1A (ENSCHAG00000007433) #23	LHX2 (ENSCHAG00000009120) #24	NEK6 (ENSCHAG00000009167)	psmb7 (ENSCHAG00000009649)	nr5a1b (ENSCHAG00000009743)	NR6A1 (ENSCHAG00000009757)	OLFML2A (ENSCHAG00000009877)	rpl35 (ENSCHAG00000009913)	arpc5lb (ENSCHAG00000009956)	SCAI (ENSCHAG00000010110)	ppp6c (ENSCHAG00000010333)	ENSCHAG00000010356	ENSCHAG00000010369	sh3glb2b (ENSCHAG00000010417)	PIP5KL1 (ENSCHAG00000011429)
Denticle herring	MODERN SPECIES	13	crata (ENSDCDG00000027328)	ptpa (ENSDCDG00000027993)	ier5l (ENSDCDG00000028362)	ntmt1 (ENSDCDG00000028367)	ndor1 (ENSDCDG00000028380)	lrsam1 (ENSDCDG00000028407)	rpl12 (ENSDCDG00000028508)	pole3 (ENSDCDG00000028534)	ENSDCDG00000028537	ccn1l1 (ENSDCDG00000028541)	lmo4a (ENSDCDG00000028675)	ENSDCDG00000028678	ENSDCDG00000028697	fpgs (ENSDCDG00000028799)	cdk9 (ENSDCDG00000029739)	CRB2 (ENSDCDG00000029740) #22	DENND1A (ENSDCDG00000029744) #23	LHX2 (ENSDCDG00000013115) #24	NEK6 (ENSDCDG00000013125)	psmb7 (ENSDCDG00000013357)	nr5a1b (ENSDCDG00000013415)	NR6A1 (ENSDCDG00000013420)	OLFML2A (ENSDCDG00000013436)	ENSDCDG00000013448	rpl35 (ENSDCDG00000013468)	arpc5lb (ENSDCDG00000013501)	SCAI (ENSDCDG00000013542)	ppp6c (ENSDCDG00000013582)	ENSDCDG00000013593	ENSDCDG00000013605	sh3glb2b (ENSDCDG00000013620)
Otophysi	ANCESTRAL SPECIES	248																ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.b	ENSGT01050000244840.A.a.b.f	ENSGT01050000244840.A.a.a.h.a	ENSGT01050000244840.A.a.a.h.b	ENSGT00940000163793.A.a	ENSGT00940000161125	ENSGT00390000001362.b	ENSGT00730000111121	ENSGT00940000157817	ENSGT00390000017026	ENSGT00940000159952.a.b	ENSGT00390000009710
Cyprinoidei	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	447										ENSGT00390000018810.b	ENSGT00950000183015.D.k	ENSGT00940000153692.A.e	ENSGT00940000155133.b.u	ENSGT00390000010355.d	ENSGT00940000153232.b.h	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000156261.gb #23	ENSGT00940000159990.e	ENSGT00940000157419.v	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.b.b	ENSGT00940000157936.o.b	ENSGT00940000157194.d.a	ENSGT01050000244840.A.a.b.f.n.b	ENSGT01050000244840.A.a.b.f.m.b.a.a.a	ENSGT01050000244840.A.a.b.f.m.b.a.a.b	ENSGT01050000244840.A.a.a.h.a.r	ENSGT01050000244840.A.a.a.h.b.c	ENSGT00940000163793.A.a.d	ENSGT00940000161125	ENSGT00390000001362.b.a	ENSGT00940000157817.c.a.b
Goldfish	MODERN SPECIES	40	ENSCARG00000020838	uqcr10 (ENSCARG00000020832)	rpl35 (ENSCARG00000020825)	ENSCARG00000020820	ENSCARG00000020817	ENSCARG00000020811	ENSCARG00000020737	esm1 (ENSCARG00000020422)	ARHGAP24 (ENSCARG00000020380)	mapk10 (ENSCARG00000017060)	ptpn13 (ENSCARG00000016696)	sdad1 (ENSCARG00000016405)	ENSCARG00000016395	ENSCARG00000016392	ENSCARG00000016386	CRB2 (ENSCARG00000016368) #22	DENND1A (ENSCARG00000015942) #23	NEK6 (ENSCARG00000015728)	psmb7 (ENSCARG00000015702)	nr5a1b (ENSCARG00000015694)	nr6a1b (ENSCARG00000015425)	OLFML2A (ENSCARG00000015409)	F2R (ENSCARG00000015398)	F2R (ENSCARG00000015385)	F2R (ENSCARG00000015381)	F2R (ENSCARG00000015375)	F2R (ENSCARG00000015371)	f2rl1.1 (ENSCARG00000015365)	f2rl1.2 (ENSCARG00000015363)	ch25hl2 (ENSCARG00000015358)	s100z (ENSCARG00000015351)
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	81	ENSGT00940000160524.e	ENSGT00940000154437.h.a	ENSGT00940000174898.b	ENSGT00940000166467.b	ENSGT00950000182938.b.b.b.b.b.b.i.b.b.b.a	ENSGT00940000159146.b	ENSGT00390000014907.B.a	ENSGT00940000158207.t	ENSGT00940000166813	ENSGT00390000018810.b	ENSGT00950000183015.D.k	ENSGT00940000153692.A.e	ENSGT00940000155133.b.u	ENSGT00390000010355.d	ENSGT00940000153232.b.h	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000156261.gb #23	ENSGT00940000158821.r.b	ENSGT00940000159990.f	ENSGT00940000157419.v	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.b.b	ENSGT00940000157936.o.b	ENSGT00940000157194.d.a	ENSGT01050000244840.A.a.b.f.n.b	ENSGT01050000244840.A.a.b.f.m.b.a.a.a	ENSGT01050000244840.A.a.b.f.m.b.a.a.b	ENSGT01050000244840.A.a.b.f.m.a.b.a	ENSGT01050000244840.A.a.a.h.a.r	ENSGT01050000244840.A.a.a.h.b.c	ENSGT00940000163793.A.a.d	ENSGT01050000244840.A.a.b.f.m.a.b.b
Common carp reference	MODERN SPECIES	38	ENSCCRG00000058820	rx3 (ENSCCRG00000013148)	CPLX4 (ENSCCRG00000013016)	lman1 (ENSCCRG00000013306)	ccbe1 (ENSCCRG00000031028)	ENSCCRG00000072830	ENSCCRG00000071047	esm1 (ENSCCRG00000011343)	ARHGAP24 (ENSCCRG00000004310)	mapk10 (ENSCCRG00000002559)	ptpn13 (ENSCCRG00000004583)	sdad1 (ENSCCRG00000052504)	ENSCCRG00000077647	ENSCCRG00000054544	ENSCCRG00000023244	ENSCCRG00000023239 #22	ENSCCRG00000023193 #23	lhx2a (ENSCCRG00000046488)	psmb7 (ENSCCRG00000074098)	NEK6 (ENSCCRG00000046205)	nr5a1b (ENSCCRG00000016558)	nr6a1b (ENSCCRG00000041881)	ENSCCRG00000074926	F2R (ENSCCRG00000059546)	F2R (ENSCCRG00000077171)	F2R (ENSCCRG00000037167)	ENSCCRG00000055039	f2rl1.1 (ENSCCRG00000081208)	S100Z (ENSCCRG00000058180)	ch25hl2 (ENSCCRG00000059117)	aggf1 (ENSCCRG00000036413)
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	60	ENSSGRG00000049269	ENSSGRG00000049270	rx3 (ENSSGRG00000049271)	cplx4a (ENSSGRG00000049272)	lman1 (ENSSGRG00000049273)	ccbe1 (ENSSGRG00000049325)	HCN1 (ENSSGRG00000049327)	ENSSGRG00000049334	esm1 (ENSSGRG00000049337)	ARHGAP24 (ENSSGRG00000049340)	ENSSGRG00000049372	mapk10 (ENSSGRG00000049430)	ptpn13 (ENSSGRG00000051041)	sdad1 (ENSSGRG00000051393)	ENSSGRG00000051556	CRB2 (ENSSGRG00000051557) #22	DENND1A (ENSSGRG00000051566) #23	lhx2a (ENSSGRG00000051632)	NEK6 (ENSSGRG00000051636)	psmb7 (ENSSGRG00000051638)	nr5a1b (ENSSGRG00000051754)	nr6a1b (ENSSGRG00000051757)	OLFML2A (ENSSGRG00000051767)	F2R (ENSSGRG00000051768)	F2R (ENSSGRG00000051769)	F2R (ENSSGRG00000051770)	f2rl1.1 (ENSSGRG00000051772)	f2rl1.2 (ENSSGRG00000051773)	ch25hl2 (ENSSGRG00000051774)	s100z (ENSSGRG00000051775)	crhbp (ENSSGRG00000000115)
Euteleosteomorpha	ANCESTRAL SPECIES	331																ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.b	ENSGT00940000165669	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000158501.d.a	ENSGT00390000016384.l.a
Protacanthopterygii	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000164386	ENSGT00390000006922	ENSGT00930000151044	ENSGT00940000165492.b	ENSGT00940000154394.a.e.b	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a	ENSGT00940000164907.b.a	ENSGT00940000155151.a.a.a	ENSGT00530000064286	ENSGT00930000151050	ENSGT00390000008371.b	ENSGT00900000141021.b.a.d	ENSGT00390000011500	ENSGT01060000248556.A.a.a.a.b.a	ENSGT00940000155373	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000158540 #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.b	ENSGT00930000151016	ENSGT00940000155742.a.a	ENSGT01030000234582.f.b.b.b	ENSGT00940000154412.A	ENSGT00390000003837	ENSGT00940000157703	ENSGT00390000014940	ENSGT00940000159206.a	ENSGT00940000157199	ENSGT00940000166580
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	134	ENSGT00940000165492.a.a	ENSGT00940000154394.b.a.a.b.b	ENSGT00940000164907.b.b.d.a	ENSGT00940000155151.a.a.b	ENSGT00940000164386	ENSGT00390000006922	ENSGT00930000151044	ENSGT00530000064286.d	ENSGT00930000151050	ENSGT00390000008371.b	ENSGT00900000141021.b.a.d.e	ENSGT00390000011500.k	ENSGT01060000248556.A.a.a.a.b.a	ENSGT00940000155373	ENSGT00940000160615.a.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000156261.db.a #23	ENSGT00940000158540.y.a #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419.x	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.b	ENSGT00940000157936.l	ENSGT00930000151016.cb	ENSGT00940000155742.a.a.c	ENSGT01030000234582.f.b.b.b	ENSGT00940000154412.A	ENSGT00390000003837	ENSGT00940000157703	ENSGT00980000199984.B	ENSGT00950000182977.B.b.b.c.b.a	ENSGT00390000014940
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000154394.b.a.b.q	ENSGT00940000154394.b.a.a.b.b	ENSGT00940000164907.b.b.d.a	ENSGT00940000155151.a.a.b	ENSGT00940000164386	ENSGT00390000006922	ENSGT00930000151044	ENSGT00530000064286.d	ENSGT00930000151050	ENSGT00390000008371.b	ENSGT00900000141021.b.a.d.e	ENSGT00390000011500.k	ENSGT01060000248556.A.a.a.a.b.a	ENSGT00940000155373	ENSGT00940000160615.a.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000156261.db.a #23	ENSGT00940000158540.y.a #24	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419.x	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.b	ENSGT00940000157936.l	ENSGT01100000263520.a.a.a.a.b.a.c.b.a.a	ENSGT01030000234576.D.a.b.a.a.a.a.b.a	ENSGT00930000151016.cb	ENSGT00940000155742.a.a.c	ENSGT00940000154412.A	ENSGT01030000234582.f.b.b.b	ENSGT00390000003837	ENSGT00940000157703	ENSGT00980000199984.B
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000160451	ENSGT00390000016526	ENSGT00940000165492.a.a	ENSGT00940000164907.b.b.d.a	ENSGT00940000155151.a.a.b	ENSGT00940000164386	ENSGT00390000006922	ENSGT00930000151044	ENSGT00530000064286.d	ENSGT00930000151050	ENSGT00390000008371.b	ENSGT00900000141021.b.a.d.e	ENSGT00390000011500.k	ENSGT01060000248556.A.a.a.a.b.a	ENSGT00940000155373	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000156261.db.a #23	ENSGT00940000158540.y.a #24	ENSGT00940000159990.d	ENSGT00940000157419.x	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.b	ENSGT00940000157936.l	ENSGT01100000263520.a.a.a.a.b.a.c.b.a.a	ENSGT01100000263541.b	ENSGT00950000182890.A.b	ENSGT01030000234576.D.a.b.a.a.a.a.b.a	ENSGT00930000151016.cb	ENSGT00940000155742.a.a.c	ENSGT01030000234582.f.b.b.b	ENSGT00940000154412.A	ENSGT00390000003837
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000160451	ENSGT00390000016526	ENSGT00940000165492.a.a	ENSGT00940000164907.b.b.d.a	ENSGT00940000155151.a.a.b	ENSGT00940000164386	ENSGT00390000006922	ENSGT00930000151044	ENSGT00530000064286.d	ENSGT00930000151050	ENSGT00390000008371.b	ENSGT00900000141021.b.a.d.e	ENSGT00390000011500.k	ENSGT01060000248556.A.a.a.a.b.a	ENSGT00940000155373	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000156261.db.a #23	ENSGT00940000158540.y.a #24	ENSGT00940000159990.d	ENSGT00940000157419.x	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.b	ENSGT00940000157936.l	ENSGT01100000263520.a.a.a.a.b.a.c.b.a.a	ENSGT01100000263541.b	ENSGT00950000182890.A.b	ENSGT00930000151016.cb	ENSGT00940000155742.a.a.c	ENSGT00940000154412.A	ENSGT01030000234582.f.b.b.b	ENSGT00390000003837	ENSGT00940000157703
Chinook salmon	MODERN SPECIES	12	ENSOTSG00005047687	TUBB4B (ENSOTSG00005047686)	ENSOTSG00005047684	lmo4a (ENSOTSG00005047683)	ccn1l1 (ENSOTSG00005047682)	ENSOTSG00005047681	pole3 (ENSOTSG00005047680)	rpl12 (ENSOTSG00005047672)	lrsam1 (ENSOTSG00005047670)	ENSOTSG00005047669	ndor1 (ENSOTSG00005047666)	ntmt1 (ENSOTSG00005047665)	ier5l (ENSOTSG00005047663)	ptpa (ENSOTSG00005047657)	crata (ENSOTSG00005047465)	CRB2 (ENSOTSG00005047456) #22	DENND1A (ENSOTSG00005047332) #23	LHX2 (ENSOTSG00005047331) #24	NEK6 (ENSOTSG00005047329)	psmb7 (ENSOTSG00005047328)	nr5a1b (ENSOTSG00005047326)	NR6A1 (ENSOTSG00005047324)	ENSOTSG00005047323	ccng2 (ENSOTSG00005047322)	ATP8B1 (ENSOTSG00005047320)	WDR7 (ENSOTSG00005047319)	ENSOTSG00005047318	ENSOTSG00005047314	ENSOTSG00005047312	ENSOTSG00005047310	ENSOTSG00005047308
Huchen	MODERN SPECIES	8328																ENSHHUG00000006113 #22	ENSHHUG00000006097 #23
Northern pike	MODERN SPECIES	13	ENSELUG00000020184	ENSELUG00000024741	ENSELUG00000030475	TUBB4B (ENSELUG00000020007)	lmo4a (ENSELUG00000019991)	ccn1l1 (ENSELUG00000019976)	pole3 (ENSELUG00000001285)	rpl12 (ENSELUG00000019938)	lrsam1 (ENSELUG00000019893)	ntmt1 (ENSELUG00000019833)	ENSELUG00000034166	ier5l (ENSELUG00000019814)	ptpa (ENSELUG00000000869)	crata (ENSELUG00000019745)	cdk9 (ENSELUG00000019692)	CRB2 (ENSELUG00000019522) #22	DENND1A (ENSELUG00000000844) #23	LHX2 (ENSELUG00000019408) #24	NEK6 (ENSELUG00000019344)	psmb7 (ENSELUG00000019284)	nr5a1b (ENSELUG00000019192)	NR6A1 (ENSELUG00000019147)	ENSELUG00000029906	ENSELUG00000019008	ENSELUG00000018970	ENSELUG00000018960	fbxw2 (ENSELUG00000018951)	slc12a2 (ENSELUG00000018889)	mogat3b (ENSELUG00000018837)	CTXN3 (ENSELUG00000018841)	prrc1 (ENSELUG00000018828)
Acanthomorphata	ANCESTRAL SPECIES	82	ENSGT00940000164790.a	ENSGT00940000153877.a.a.b	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00530000063497.a.a	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961.b	ENSGT00940000156340.a.d	ENSGT00440000038585.c	ENSGT00530000063156.a.a.a	ENSGT00940000157955.d.a	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000155946.c.b	ENSGT00930000151016	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.b	ENSGT00940000159700	ENSGT00940000161073	ENSGT00940000155742.a.a	ENSGT00940000154412.A	ENSGT00390000003837	ENSGT00940000157703	ENSGT00390000014940	ENSGT00940000159206.a	ENSGT00940000157199	ENSGT00940000154938	ENSGT00390000006753.B
Euacanthomorphacea	ANCESTRAL SPECIES	54	ENSGT00940000164790.a	ENSGT00940000153877.a.a.b	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00530000063497.a.a	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961.b	ENSGT00940000156340.a.d	ENSGT00440000038585.c	ENSGT00530000063156.a.a.a	ENSGT00940000157955.d.a	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000155946.c.b	ENSGT00930000151016	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.b	ENSGT00940000159700	ENSGT00940000161073	ENSGT00940000155742.a.a	ENSGT00940000154412.A	ENSGT00390000003837	ENSGT00940000157703	ENSGT00390000014940	ENSGT00940000159206.a	ENSGT00940000157199	ENSGT00940000154938	ENSGT00390000006753.B
Percomorphaceae	ANCESTRAL SPECIES	42	ENSGT00940000153464.A.a	ENSGT00940000156902.b	ENSGT00940000164790.a	ENSGT00940000153877.a.a.b	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000156662.d.f	ENSGT00530000063497.a.a	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961.b	ENSGT00940000156340.a.d	ENSGT00440000038585.c	ENSGT00530000063156.a.a.a	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000155946.c.b	ENSGT00930000151016	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.b	ENSGT00940000157955.d.a	ENSGT00940000155945.i.a	ENSGT00390000000642	ENSGT00390000016543.d	ENSGT00530000063851.b	ENSGT00940000155742.a.a	ENSGT00940000159700	ENSGT00940000154412.A	ENSGT00390000003837	ENSGT00940000161073	ENSGT00940000157703
Percomorphaceae_B	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000153464.A.a	ENSGT00940000156902.b	ENSGT00940000164790.a	ENSGT00940000153877.a.a.b	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000156662.d.f	ENSGT00530000063497.a.a	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961.b	ENSGT00940000156340.a.d	ENSGT00440000038585.c	ENSGT00530000063156.a.a.a	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000155946.c.b	ENSGT00930000151016	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000178133	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.b	ENSGT00940000157955.d.a	ENSGT00940000155945.i.a	ENSGT00390000000642	ENSGT00390000016543.d	ENSGT00530000063851.b	ENSGT00940000155742.a.a	ENSGT00940000159700	ENSGT00940000154412.A	ENSGT00390000003837	ENSGT00940000161073
Ovalentaria	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00550000074961.b	ENSGT00390000009566	ENSGT00530000063497.a.a	ENSGT00940000156662.d.f	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000153877.a.a.b	ENSGT00940000164790.a	ENSGT00940000156902.b	ENSGT00940000153464.A.a	ENSGT00940000157207.a.a	ENSGT00440000038585.c	ENSGT00530000063156.a.a.a	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000155946.c.b	ENSGT00930000151016	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000178133	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.b	ENSGT00940000157955.d.a	ENSGT00940000155945.i.a	ENSGT00390000000642	ENSGT00390000016543.d	ENSGT00530000063851.b	ENSGT00940000155742.a.a	ENSGT00940000159700	ENSGT00940000154412.A	ENSGT00390000003837	ENSGT00940000161073
Ovalentaria_B	ANCESTRAL SPECIES	37													ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000155946.c.b	ENSGT00930000151016	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000178133	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.b	ENSGT00940000157955.d.a	ENSGT00940000155945.i.a	ENSGT00390000000642	ENSGT00390000016543.d	ENSGT00530000063851.b	ENSGT00940000155742.a.a	ENSGT00940000159700	ENSGT00940000157199	ENSGT00940000154412.A	ENSGT00390000003837
Pomacentridae	ANCESTRAL SPECIES	97	ENSGT00940000155945.i.a	ENSGT00940000157955.d.a	ENSGT00390000018878	ENSGT00940000155826	ENSGT00390000006096.a.b	ENSGT00940000157006	ENSGT01030000234542.b.b.a.a.a.a	ENSGT00390000003837	ENSGT00940000154412.A	ENSGT00940000157199	ENSGT00940000159700	ENSGT00940000155742.a.a	ENSGT00530000063851.b	ENSGT00390000016543.d	ENSGT00930000151016	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000178133	ENSGT00940000156261.y #23	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.b	ENSGT01100000263514.B	ENSGT00940000161047	ENSGT00940000155603.A.a.a.a	ENSGT00950000183162.b	ENSGT00390000005646	ENSGT00940000157326	ENSGT00940000156510.h	ENSGT00390000004945	ENSGT00940000156369	ENSGT00530000064469	ENSGT00390000005782
Pomacentridae_A	ANCESTRAL SPECIES	46	ENSGT00940000157955.d.a.e	ENSGT00390000018878	ENSGT00940000155826	ENSGT00390000006096.a.b	ENSGT00940000157006	ENSGT01030000234542.b.b.a.a.a.a	ENSGT01030000234542.b.b.a.a.b	ENSGT00390000003837	ENSGT00940000154412.A	ENSGT00940000157199	ENSGT00940000159700	ENSGT00940000155742.a.a	ENSGT00530000063851.b	ENSGT00390000016543.d	ENSGT00930000151016	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000178133	ENSGT00940000156261.y #23	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.b	ENSGT01100000263514.B	ENSGT00940000161047	ENSGT00940000155603.A.a.a.a	ENSGT00950000183162.b	ENSGT00390000005646	ENSGT00940000157326	ENSGT00940000156510.h	ENSGT00390000004945	ENSGT00940000156369	ENSGT00530000064469	ENSGT00390000005782
Amphiprion	ANCESTRAL SPECIES	41	ENSGT00940000155945.i.a	ENSGT00940000157955.d.a.e	ENSGT00390000018878	ENSGT00940000155826	ENSGT00390000006096.a.b	ENSGT00940000157006	ENSGT01030000234542.b.b.a.a.a.a	ENSGT00390000003837	ENSGT00940000154412.A	ENSGT00940000157199	ENSGT00940000159700	ENSGT00940000155742.a.a	ENSGT00530000063851.b	ENSGT00390000016543.d	ENSGT00930000151016	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000178133	ENSGT00940000156261.y #23	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.b	ENSGT01100000263514.B	ENSGT00940000161047	ENSGT00940000155603.A.a.a.a	ENSGT00950000183162.b	ENSGT00390000005646	ENSGT00940000157326	ENSGT00940000156510.h	ENSGT00390000004945	ENSGT00940000156369	ENSGT00530000064469	ENSGT00390000005782
Clown anemonefish	MODERN SPECIES	2003										MTRR (ENSAOCG00000015981)	cct5 (ENSAOCG00000015952)	cmbl (ENSAOCG00000015887)	MINAR2 (ENSAOCG00000015860)	AJM1 (ENSAOCG00000015833)	fbxw2 (ENSAOCG00000001938)	ENSAOCG00000002412 #22	ENSAOCG00000015721
Orange clownfish	MODERN SPECIES	7	mvb12ba (ENSAPEG00000015128)	LMX1B (ENSAPEG00000015086)	dcp2 (ENSAPEG00000015029)	YTHDC2 (ENSAPEG00000014873)	hmgcs1 (ENSAPEG00000014803)	tln1 (ENSAPEG00000014632)	tpm2 (ENSAPEG00000014536)	prrc1 (ENSAPEG00000014517)	CTXN3 (ENSAPEG00000014497)	lmnb1 (ENSAPEG00000014461)	slc27a6 (ENSAPEG00000014420)	slc12a2 (ENSAPEG00000014310)	MINAR2 (ENSAPEG00000014275)	AJM1 (ENSAPEG00000014268)	fbxw2 (ENSAPEG00000014230)	CRB2 (ENSAPEG00000014211) #22	ENSAPEG00000014203	ENSAPEG00000014165 #23	psmb7 (ENSAPEG00000014128)	nr5a1b (ENSAPEG00000014096)	selenoh (ENSAPEG00000014076)	psmb10 (ENSAPEG00000014042)	ENSAPEG00000014012	PURG (ENSAPEG00000014003)	slc38a9 (ENSAPEG00000013900)	nrg1 (ENSAPEG00000013845)	ENSAPEG00000013803	pomk (ENSAPEG00000013769)	PAM (ENSAPEG00000013709)	ENSAPEG00000013680	macir (ENSAPEG00000013672)
Cichlidae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22
Pseudocrenilabrinae	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00940000158444	ENSGT00940000158973.a.b	ENSGT00950000183125.b.a.a.a.a.a	ENSGT00390000003652.d	ENSGT01030000234539.b.b.a.i	ENSGT00940000165717	ENSGT00940000158107.a.a	ENSGT00550000074946	ENSGT00940000158323.g	ENSGT00940000166967	ENSGT00390000010474	ENSGT00940000164321.d	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000155946.c.b	ENSGT00930000151016	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00440000038585.c	ENSGT00530000063156.a.a.a	ENSGT01060000248556.A.a.a.a.b.a.b.i.b	ENSGT01060000248556.A.a.a.a.b.a.b.i.a	ENSGT01030000234542.b.b.a.a.b	ENSGT00940000157006	ENSGT00390000006096.a.b	ENSGT00940000155826	ENSGT00390000018878	ENSGT01100000263514.B	ENSGT00940000161047	ENSGT00940000155603.A.a.a.a
Pseudocrenilabrinae_A	ANCESTRAL SPECIES	34	ENSGT00940000158444	ENSGT00940000158973.a.b	ENSGT00950000183125.b.a.a.a.a.a	ENSGT00390000003652.d	ENSGT01030000234539.b.b.a.i	ENSGT00940000165717	ENSGT00940000158107.a.a	ENSGT00550000074946	ENSGT00940000158323.g	ENSGT00940000166967	ENSGT00390000010474	ENSGT00940000164321.d	ENSGT00940000155946.c.b	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00930000151016	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00440000038585.c	ENSGT00530000063156.a.a.a	ENSGT01060000248556.A.a.a.a.b.a.b.i.b	ENSGT01060000248556.A.a.a.a.b.a.b.i.a	ENSGT01030000234542.b.b.a.a.a.a	ENSGT00940000157006	ENSGT00390000006096.a.b	ENSGT00940000155826	ENSGT00390000018878	ENSGT01100000263514.B	ENSGT00940000161047	ENSGT00940000155603.A.a.a.a
Haplochromini	ANCESTRAL SPECIES	68				ENSGT01030000234539.b.b.a.i	ENSGT00940000178267	ENSGT00940000165717	ENSGT00940000158107.a.a	ENSGT00550000074946	ENSGT00940000158323.g	ENSGT00940000166967	ENSGT00390000010474	ENSGT00940000164321.d	ENSGT00940000155946.c.b	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00930000151016	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00440000038585.c	ENSGT00530000063156.a.a.a	ENSGT01060000248556.A.a.a.a.b.a.b.i.b	ENSGT01060000248556.A.a.a.a.b.a.b.i.a	ENSGT01030000234542.b.b.a.a.b	ENSGT00940000157006	ENSGT00390000006096.a.b	ENSGT00940000160436.A.d.p	ENSGT00940000155826	ENSGT00390000018878	ENSGT01100000263514.B	ENSGT00940000161047
Burton s mouthbrooder	MODERN SPECIES	841				ZMIZ2 (ENSHBUG00000015156)	ENSHBUG00000015176	ENSHBUG00000015194	DUSP26 (ENSHBUG00000015203)	ddx56 (ENSHBUG00000015246)	aebp1a (ENSHBUG00000015357)	pnx (ENSHBUG00000015383)	ash2l (ENSHBUG00000015480)	grk5 (ENSHBUG00000015504)	ENSHBUG00000015512	ralgps1 (ENSHBUG00000015605)	fbxw2 (ENSHBUG00000015642)	ENSHBUG00000015692 #22
Haplochromini_A	ANCESTRAL SPECIES	74				ENSGT01030000234539.b.b.a.i	ENSGT00940000178267	ENSGT00940000165717	ENSGT00940000158107.a.a	ENSGT00550000074946	ENSGT00940000158323.g	ENSGT00940000166967	ENSGT00390000010474	ENSGT00940000164321.d	ENSGT00940000155946.c.b	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00930000151016	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00440000038585.c	ENSGT00530000063156.a.a.a	ENSGT01060000248556.A.a.a.a.b.a.b.i.b	ENSGT01060000248556.A.a.a.a.b.a.b.i.a	ENSGT01030000234542.b.b.a.a.b	ENSGT00940000157006	ENSGT00390000006096.a.b	ENSGT00940000160436.A.d.p	ENSGT00940000155826	ENSGT00390000018878	ENSGT01100000263514.B	ENSGT00940000161047
P. nyererei	MODERN SPECIES	692				ZMIZ2 (ENSPNYG00000019063)	ENSPNYG00000019153	ENSPNYG00000019172	DUSP26 (ENSPNYG00000019194)	ddx56 (ENSPNYG00000019212)	aebp1a (ENSPNYG00000019258)	pnx (ENSPNYG00000019316)	ash2l (ENSPNYG00000019346)	grk5 (ENSPNYG00000019414)	ralgps1 (ENSPNYG00000019494)	angptl2a (ENSPNYG00000019543)	fbxw2 (ENSPNYG00000019551)	ENSPNYG00000019572 #22
Haplochromini_B	ANCESTRAL SPECIES	30	ENSGT00940000165986	ENSGT00940000165958	ENSGT00940000163989.a.a.h.a	ENSGT01030000234539.b.b.a.i	ENSGT00940000178267	ENSGT00940000165717	ENSGT00940000158107.a.a	ENSGT00550000074946	ENSGT00940000158323.g	ENSGT00940000166967	ENSGT00390000010474	ENSGT00940000164321.d	ENSGT00940000155946.c.b	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00930000151016	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00440000038585.c	ENSGT00530000063156.a.a.a	ENSGT01060000248556.A.a.a.a.b.a.b.i.b	ENSGT01060000248556.A.a.a.a.b.a.b.i.a	ENSGT01030000234542.b.b.a.a.b	ENSGT00940000157006	ENSGT00390000006096.a.b	ENSGT00940000160436.A.d.p	ENSGT00940000155826	ENSGT00390000018878	ENSGT01100000263514.B	ENSGT00940000161047
Eastern happy	MODERN SPECIES	19	snrkb (ENSACLG00000020434)	ENSACLG00000020397	ENSACLG00000020388	ZMIZ2 (ENSACLG00000020256)	ENSACLG00000020198	ENSACLG00000020164	DUSP26 (ENSACLG00000020154)	ddx56 (ENSACLG00000020113)	aebp1a (ENSACLG00000020067)	pnx (ENSACLG00000020051)	ash2l (ENSACLG00000019934)	grk5 (ENSACLG00000019883)	angptl2a (ENSACLG00000019858)	ralgps1 (ENSACLG00000019723)	fbxw2 (ENSACLG00000019642)	ENSACLG00000019606 #22	NEK6 (ENSACLG00000019574)	ENSACLG00000019529 #23	ENSACLG00000019519	pomk (ENSACLG00000019507)	ENSACLG00000019465	ENSACLG00000019453	ENSACLG00000019446	nrg1 (ENSACLG00000019440)	ENSACLG00000019386	slc38a9 (ENSACLG00000019331)	ENSACLG00000019246	psmb10 (ENSACLG00000019216)	selenoh (ENSACLG00000019200)	dcp2 (ENSACLG00000019153)	YTHDC2 (ENSACLG00000019069)
Zebra mbuna	MODERN SPECIES	1110	ano10b (ENSMZEG00005009944)	snrkb (ENSMZEG00005009926)	ENSMZEG00005009908	ZMIZ2 (ENSMZEG00005009867)	ENSMZEG00005009855	ENSMZEG00005009841	DUSP26 (ENSMZEG00005009832)	ddx56 (ENSMZEG00005009813)	aebp1a (ENSMZEG00005009780)	pnx (ENSMZEG00005009765)	ash2l (ENSMZEG00005009740)	grk5 (ENSMZEG00005009703)	ENSMZEG00005009678	ralgps1 (ENSMZEG00005009656)	fbxw2 (ENSMZEG00005009617)	CRB2 (ENSMZEG00005009561) #22	DENND1A (ENSMZEG00005009539) #23	NEK6 (ENSMZEG00005009505)	psmb7 (ENSMZEG00005009482)	smarcb1b (ENSMZEG00005009461)	derl2 (ENSMZEG00005009450)	crata (ENSMZEG00005009438)	crata (ENSMZEG00005009404)	ENSMZEG00005009378	tln1 (ENSMZEG00005009313)	hmgcs1 (ENSMZEG00005009284)	ENSMZEG00005009238	YTHDC2 (ENSMZEG00005009153)	dcp2 (ENSMZEG00005009123)	ENSMZEG00005009092	psmb10 (ENSMZEG00005009082)
Lyretail cichlid	MODERN SPECIES	339	nudcd3 (ENSNBRG00000003736)	CAMK2B (ENSNBRG00000003328)	OGDH (ENSNBRG00000003225)	ZMIZ2 (ENSNBRG00000003156)	ENSNBRG00000002801	ENSNBRG00000002761	DUSP26 (ENSNBRG00000002740)	ddx56 (ENSNBRG00000002656)	aebp1a (ENSNBRG00000002577)	pnx (ENSNBRG00000002565)	ash2l (ENSNBRG00000002548)	grk5 (ENSNBRG00000002505)	ENSNBRG00000002468	ralgps1 (ENSNBRG00000002406)	fbxw2 (ENSNBRG00000002381)	ENSNBRG00000002299 #22	DENND1A (ENSNBRG00000002249) #23	ENSNBRG00000002231 #23	NEK6 (ENSNBRG00000002159)	psmb7 (ENSNBRG00000001547)	smarcb1b (ENSNBRG00000001478)	derl2 (ENSNBRG00000001444)	crata (ENSNBRG00000001271)	crata (ENSNBRG00000001147)	tpm2 (ENSNBRG00000001126)	tln1 (ENSNBRG00000000953)	hmgcs1 (ENSNBRG00000000879)	YTHDC2 (ENSNBRG00000000762)	dcp2 (ENSNBRG00000000726)	selenoh (ENSNBRG00000000649)	psmb10 (ENSNBRG00000000626)
Nile tilapia	MODERN SPECIES	19	ENSONIG00000030849	ENSONIG00000011491	ENSONIG00000011496	ZMIZ2 (ENSONIG00000011498)	ENSONIG00000011504	dusp26 (ENSONIG00000031216)	ddx56 (ENSONIG00000011509)	aebp1a (ENSONIG00000011513)	pnx (ENSONIG00000041082)	ash2l (ENSONIG00000011518)	grk5 (ENSONIG00000011525)	ralgps1 (ENSONIG00000011540)	ENSONIG00000032068	ENSONIG00000011544	fbxw2 (ENSONIG00000011549)	CRB2 (ENSONIG00000011551) #22	ENSONIG00000029215	DENND1A (ENSONIG00000011555) #23	NEK6 (ENSONIG00000011562)	psmb7 (ENSONIG00000042918)	smarcb1b (ENSONIG00000011574)	derl2 (ENSONIG00000011576)	crata (ENSONIG00000011577)	crata (ENSONIG00000011580)	ENSONIG00000011584	tln1 (ENSONIG00000011589)	hmgcs1 (ENSONIG00000011599)	YTHDC2 (ENSONIG00000011601)	dcp2 (ENSONIG00000033239)	ENSONIG00000031888	psmb10 (ENSONIG00000011604)
Atherinomorphae	ANCESTRAL SPECIES	74	ENSGT00940000156340.a.d	ENSGT00550000074961.b	ENSGT00390000009566	ENSGT00530000063497.a.a	ENSGT00940000156662.d.f	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000153877.a.a.b	ENSGT00940000164790.a	ENSGT00940000156902.b	ENSGT00940000153464.A.a	ENSGT00940000157207.a.a	ENSGT00440000038585.c	ENSGT00530000063156.a.a.a	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00930000151016	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22
Cyprinodontiformes	ANCESTRAL SPECIES	159															ENSGT00930000151016	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22
Cyprinodontoidei	ANCESTRAL SPECIES	36	ENSGT00940000158866	ENSGT00940000161769.b.b	ENSGT00940000159913.a.b	ENSGT00940000177258	ENSGT00940000156031.f	ENSGT00940000155411.d	ENSGT00940000157492.a	ENSGT00940000157995	ENSGT00940000159267	ENSGT00940000156102.r	ENSGT00940000166544.a	ENSGT00950000183041.C	ENSGT00940000154856.B.c	ENSGT00940000155657	ENSGT00930000151016	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000165329	ENSGT00940000156369	ENSGT00390000004945	ENSGT00940000156510.h	ENSGT00530000064469	ENSGT00940000157873	ENSGT00410000025802	ENSGT00390000005989.b.b	ENSGT00940000155860.b	ENSGT00390000009948.d	ENSGT00940000155782	ENSGT00940000164226.a.b	ENSGT00390000011010.a.a	ENSGT00940000156732.a.a	ENSGT00390000004874.a.b
Poeciliinae	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000160516	ENSGT00940000158866	ENSGT00940000161769.b.b	ENSGT00940000159913.a.b	ENSGT00940000177258	ENSGT00940000156031.f	ENSGT00940000155411.d	ENSGT00940000157492.a	ENSGT00940000159267	ENSGT00940000156102.r	ENSGT00940000166544.a	ENSGT00950000183041.C	ENSGT00940000154856.B.c	ENSGT00940000155657	ENSGT00930000151016	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000165329	ENSGT00940000156369	ENSGT00390000004945	ENSGT00940000156510.h	ENSGT00530000064469	ENSGT00940000157873	ENSGT00410000025802	ENSGT00390000005989.b.b	ENSGT00940000155860.b	ENSGT00390000009948.d.g	ENSGT00940000155782	ENSGT00940000164226.a.b	ENSGT00390000011010.a.a	ENSGT00940000156732.a.a	ENSGT00390000004874.a.b
Poecilia	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000160516	ENSGT00940000158866	ENSGT00940000161769.b.b	ENSGT00940000159913.a.b	ENSGT00940000177258	ENSGT00940000156031.f	ENSGT00940000155411.d	ENSGT00940000157492.a	ENSGT00940000159267	ENSGT00940000156102.r	ENSGT00940000166544.a	ENSGT00950000183041.C	ENSGT00940000154856.B.c	ENSGT00940000155657	ENSGT00930000151016	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000165329	ENSGT00940000156369	ENSGT00390000004945	ENSGT00940000156510.h	ENSGT00530000064469	ENSGT00940000157873	ENSGT00410000025802	ENSGT00390000005989.b.b	ENSGT00940000155860.b	ENSGT00390000009948.d.g	ENSGT00940000155782	ENSGT00940000164226.a.b	ENSGT00390000011010.a.a.m	ENSGT00390000011010.a.a.n	ENSGT00940000156732.a.a
NAME_6	ANCESTRAL SPECIES	111											ENSGT00940000166544.a	ENSGT00950000183041.C	ENSGT00940000154856.B.c	ENSGT00940000155657	ENSGT00930000151016	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000165329	ENSGT00940000156369	ENSGT00390000004945	ENSGT00940000156510.h	ENSGT00530000064469	ENSGT00940000157873	ENSGT00410000025802	ENSGT00390000005989.b.b	ENSGT00940000155860.b	ENSGT00390000009948.d.g	ENSGT00940000155782	ENSGT00940000164226.a.b	ENSGT00390000011010.a.a.m	ENSGT00390000011010.a.a.n	ENSGT00940000156732.a.a
Amazon molly	MODERN SPECIES	557											ENSPFOG00000004294	zcchc9 (ENSPFOG00000004364)	ENSPFOG00000004418	wdr45 (ENSPFOG00000004450)	fbxw2 (ENSPFOG00000004564)	ENSPFOG00000004668 #22	pomk (ENSPFOG00000004795)	TSHR (ENSPFOG00000004844)	ENSPFOG00000005127	reep5 (ENSPFOG00000005207)	ENSPFOG00000005275	stc1l (ENSPFOG00000005286)	FGFR1 (ENSPFOG00000005362)	marchf5l (ENSPFOG00000005642)	actr1b (ENSPFOG00000005649)	npy8ar (ENSPFOG00000005748)	COX5B (ENSPFOG00000005799)	COX5B (ENSPFOG00000005827)	ENSPFOG00000005850	hpse (ENSPFOG00000005950)	ppp3ccb (ENSPFOG00000006179)
NAME_4	ANCESTRAL SPECIES	257												ENSGT00950000183041.C	ENSGT00940000154856.B.c	ENSGT00940000155657	ENSGT00930000151016	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000156369	ENSGT00390000004945	ENSGT00940000156510.h	ENSGT00530000064469	ENSGT00940000157873	ENSGT00410000025802	ENSGT00390000005989.b.b	ENSGT00940000155860.b	ENSGT00390000009948.d	ENSGT00940000155782	ENSGT00940000164226.a.b
Mummichog	MODERN SPECIES	452										zcchc9 (ENSFHEG00000012337)	ENSFHEG00000012282	spata4 (ENSFHEG00000012255)	ENSFHEG00000012242	wdr45 (ENSFHEG00000012212)	fbxw2 (ENSFHEG00000012154)	ENSFHEG00000012090 #22	PAM (ENSFHEG00000011873)	pomk (ENSFHEG00000011853)	ENSFHEG00000011840	ENSFHEG00000011807	reep5 (ENSFHEG00000011777)	ENSFHEG00000011760	stc1l (ENSFHEG00000011730)	FGFR1 (ENSFHEG00000011699)	ENSFHEG00000011647	marchf5l (ENSFHEG00000011630)	actr1b (ENSFHEG00000011585)	npy8ar (ENSFHEG00000011547)
Sheepshead minnow	MODERN SPECIES	891																ENSCVAG00000002799 #22	PAM (ENSCVAG00000002753)	pomk (ENSCVAG00000000084)	ENSCVAG00000002741	ENSCVAG00000000082	ENSCVAG00000002733	reep5 (ENSCVAG00000002731)	ENSCVAG00000002723	stc1l (ENSCVAG00000002722)
Aplocheiloidei	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22
Turquoise killifish	MODERN SPECIES	1611	ATP6V1B2 (ENSNFUG00015003929)	DUSP11 (ENSNFUG00015003839)	ENSNFUG00015003835	Nfu_g_1_010854 (ENSNFUG00015003828)	HELQ (ENSNFUG00015003789)	MRPS18C (ENSNFUG00015003779)	abraxas1 (ENSNFUG00015003777)	ENSNFUG00015003774	gpat3 (ENSNFUG00015003772)	ENSNFUG00015003766	ENSNFUG00015003765	NKX6-3 (ENSNFUG00015003764)	rpl17 (ENSNFUG00015003759)	MFHAS1 (ENSNFUG00015003754)	NRG1 (ENSNFUG00015003752)	ENSNFUG00015003745 #22	ROR2 (ENSNFUG00015003741)	ENSNFUG00015003740	ENSNFUG00015003739	Nfu_g_1_010837 (ENSNFUG00015003737)	ENSNFUG00015003735	PAM (ENSNFUG00015003692)	nfil3 (ENSNFUG00015003675)	auh (ENSNFUG00015003670)	SYK (ENSNFUG00015003624)	chd1 (ENSNFUG00015002385)	SLC38A9 (ENSNFUG00015001806)	PURG (ENSNFUG00015001742)	ENSNFUG00015001720	dcp2 (ENSNFUG00015001711)	ENSNFUG00015001706
Oryzias	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00390000000642	ENSGT00940000155945.i.a	ENSGT00940000157955.d.a	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.b	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT01030000234542.b.b.a.a.a.a	ENSGT00940000157006	ENSGT00390000006096.a.b	ENSGT00940000157207.a.a	ENSGT00440000038585.c	ENSGT00530000063156.a.a.a	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00930000151016	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000153464.A.a	ENSGT00940000156902.b	ENSGT00940000164790.a	ENSGT00940000153877.a.a.b	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000156662.d.f	ENSGT00530000063497.a.a	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961.b	ENSGT00940000156340.a.d	ENSGT00390000007918	ENSGT00390000011873.f	ENSGT01030000234614.B.a.a.a.t	ENSGT00940000155591.j	ENSGT00950000182864.a.b.b.a.a.a
Oryzias_b	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000000642	ENSGT00940000155945.i.a	ENSGT00940000157955.d.a	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.b	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT01030000234542.b.b.a.a.a.a	ENSGT00940000157006	ENSGT00390000006096.a.b	ENSGT00940000157207.a.a	ENSGT00440000038585.c	ENSGT00530000063156.a.a.a	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00930000151016	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000153464.A.a	ENSGT00940000156902.b	ENSGT00940000164790.a	ENSGT00940000153877.a.a.b	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000156662.d.f	ENSGT00530000063497.a.a	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961.b	ENSGT00940000156340.a.d	ENSGT00390000007918	ENSGT00390000011873.f	ENSGT00940000160428.b.b	ENSGT01030000234614.B.a.a.a.t	ENSGT00940000155591.j
Javanese ricefish	MODERN SPECIES	3	mvb12ba (ENSOJAG00000003389)	lmx1ba (ENSOJAG00000003410)	ENSOJAG00000003418	nr5a1b (ENSOJAG00000003424)	psmb7 (ENSOJAG00000003441)	NEK6 (ENSOJAG00000003578)	DENND1A (ENSOJAG00000004452) #23	tpm2 (ENSOJAG00000005132)	tln1 (ENSOJAG00000005590)	hmgcs1 (ENSOJAG00000007951)	slc25a25b (ENSOJAG00000008215)	smarcb1b (ENSOJAG00000008974)	derl2 (ENSOJAG00000009021)	ralgps1 (ENSOJAG00000009088)	fbxw2 (ENSOJAG00000009386)	ENSOJAG00000009406 #22	uap1l1 (ENSOJAG00000009419)	zdhhc12b (ENSOJAG00000009441)	ENSOJAG00000009570	setb (ENSOJAG00000010833)	dync2i2 (ENSOJAG00000010843)	ENSOJAG00000015391	SCAI (ENSOJAG00000015411)	ppp6c (ENSOJAG00000015594)	MMP11 (ENSOJAG00000015610)	skp2 (ENSOJAG00000015640)	GTF3C4 (ENSOJAG00000015654)	barhl1a (ENSOJAG00000015664)	stom (ENSOJAG00000015697)	gsna (ENSOJAG00000015905)	ppp2r2ab (ENSOJAG00000017346)
Indian medaka	MODERN SPECIES	677																ENSOMEG00000019960 #22	uap1l1 (ENSOMEG00000020003)	zdhhc12b (ENSOMEG00000020031)	ENSOMEG00000020078	setb (ENSOMEG00000020148)	dync2i2 (ENSOMEG00000020274)	ENSOMEG00000020320	ENSOMEG00000020337	ENSOMEG00000020347	ENSOMEG00000020367	ODF2 (ENSOMEG00000020421)	SCAI (ENSOMEG00000000534)
Oryzias_a	ANCESTRAL SPECIES	126												ENSGT00440000038585.c	ENSGT00530000063156.a.a.a	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00930000151016	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000153464.A.a	ENSGT00940000156902.b	ENSGT00940000164790.a	ENSGT00940000153877.a.a.b	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000156662.d.f	ENSGT00530000063497.a.a
Chinese medaka	MODERN SPECIES	343													derl2 (ENSOSIG00000021501)	ralgps1 (ENSOSIG00000021166)	fbxw2 (ENSOSIG00000021101)	ENSOSIG00000021100 #22	uap1l1 (ENSOSIG00000021097)	zdhhc12b (ENSOSIG00000021096)	ENSOSIG00000017902	setb (ENSOSIG00000017687)
Percomorphaceae_C	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000153464.A.a	ENSGT00940000156902.b	ENSGT00940000164790.a	ENSGT00940000153877.a.a.b	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000156662.d.f	ENSGT00530000063497.a.a	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961.b	ENSGT00940000156340.a.d	ENSGT00440000038585.c	ENSGT00530000063156.a.a.a	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000155946.c.b	ENSGT00930000151016	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000178133	ENSGT00940000155152.e	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.b	ENSGT00940000157955.d.a	ENSGT00940000155945.i.a	ENSGT00390000000642	ENSGT00390000016543.d	ENSGT00530000063851.b	ENSGT00940000155742.a.a	ENSGT00940000159700	ENSGT00940000159206.a	ENSGT00940000157199
Percomorphaceae_D	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000153464.A.a	ENSGT00940000156902.b	ENSGT00940000164790.a	ENSGT00940000153877.a.a.b	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000156662.d.f	ENSGT00530000063497.a.a	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961.b	ENSGT00940000156340.a.d	ENSGT00440000038585.c	ENSGT00530000063156.a.a.a	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000155946.c.b	ENSGT00930000151016	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000178133	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.b	ENSGT00940000157955.d.a	ENSGT00940000155945.i.a	ENSGT00390000000642	ENSGT00390000016543.d	ENSGT00530000063851.b	ENSGT00940000155742.a.a	ENSGT00940000159700	ENSGT00940000159206.a	ENSGT00940000157199	ENSGT00940000154412.A
Carangaria	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000153464.A.a	ENSGT00940000156902.b	ENSGT00940000164790.a	ENSGT00940000153877.a.a.b	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000156662.d.f	ENSGT00530000063497.a.a	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961.b	ENSGT00940000156340.a.d	ENSGT00440000038585.c	ENSGT00530000063156.a.a.a	ENSGT00940000155946.c.b	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00930000151016	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000178133	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.b	ENSGT00940000157955.d.a	ENSGT00940000155945.i.a	ENSGT00390000000642	ENSGT00390000016543.d	ENSGT00530000063851.b	ENSGT00940000155742.a.a	ENSGT00940000159700	ENSGT00940000159206.a	ENSGT00940000157199	ENSGT00940000154412.A
Carangaria_A	ANCESTRAL SPECIES	43	ENSGT00940000153464.A.a	ENSGT00940000156902.b	ENSGT00940000164790.a	ENSGT00940000153877.a.a.b	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000156662.d.f	ENSGT00530000063497.a.a	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961.b	ENSGT00940000156340.a.d	ENSGT00440000038585.c	ENSGT00530000063156.a.a.a	ENSGT00940000155946.c.b	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00930000151016	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000178133	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.b	ENSGT00940000157955.d.a	ENSGT00940000155945.i.a	ENSGT00390000000642	ENSGT00390000016543.d	ENSGT00530000063851.b	ENSGT00940000155742.a.a	ENSGT00940000159700	ENSGT00940000159206.a	ENSGT00940000157199	ENSGT00940000154412.A
Seriola	ANCESTRAL SPECIES	33	ENSGT00940000153464.A.a	ENSGT00940000156902.b	ENSGT00940000164790.a	ENSGT00940000153877.a.a.b	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000156662.d.f	ENSGT00530000063497.a.a	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961.b	ENSGT00940000156340.a.d	ENSGT00440000038585.c	ENSGT00530000063156.a.a.a	ENSGT00940000155946.c.b	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00930000151016	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000178133	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.b	ENSGT00940000157955.d.a	ENSGT00940000155945.i.a	ENSGT00390000000642	ENSGT00390000016543.d	ENSGT00530000063851.b	ENSGT00940000155742.a.a	ENSGT00940000159700	ENSGT00940000157199	ENSGT00940000154412.A	ENSGT00390000003837
Greater amberjack	MODERN SPECIES	34	ENSSDUG00000020309	setb (ENSSDUG00000020263)	dync2i2 (ENSSDUG00000020218)	sptan1 (ENSSDUG00000020131)	ODF2 (ENSSDUG00000020101)	SCAI (ENSSDUG00000020037)	ppp6c (ENSSDUG00000020000)	MMP11 (ENSSDUG00000019979)	smarcb1b (ENSSDUG00000019943)	derl2 (ENSSDUG00000019927)	ENSSDUG00000019917	ENSSDUG00000019909	angptl2a (ENSSDUG00000019900)	ralgps1 (ENSSDUG00000019795)	fbxw2 (ENSSDUG00000019749)	CRB2 (ENSSDUG00000019694) #22	DENND1A (ENSSDUG00000019675) #23	NEK6 (ENSSDUG00000019649)	psmb7 (ENSSDUG00000019641)	nr5a1b (ENSSDUG00000019262)	lmx1ba (ENSSDUG00000019211)	mvb12ba (ENSSDUG00000019178)	MAPKAP1 (ENSSDUG00000019126)	AJM1 (ENSSDUG00000019112)	ENSSDUG00000019093	slc12a2 (ENSSDUG00000018956)	slc27a6 (ENSSDUG00000018919)	lmnb1 (ENSSDUG00000018889)	CTXN3 (ENSSDUG00000018881)	prrc1 (ENSSDUG00000018839)	ENSSDUG00000018810
Yellowtail amberjack	MODERN SPECIES	3288	ENSSLDG00000022274	setb (ENSSLDG00000022255)	dync2i2 (ENSSLDG00000022199)	sptan1 (ENSSLDG00000022130)	ODF2 (ENSSLDG00000022094)	SCAI (ENSSLDG00000022050)	ppp6c (ENSSLDG00000022033)	MMP11 (ENSSLDG00000022020)	smarcb1b (ENSSLDG00000021986)	derl2 (ENSSLDG00000021972)	ENSSLDG00000021963	ENSSLDG00000021951	angptl2a (ENSSLDG00000021944)	ralgps1 (ENSSLDG00000021826)	fbxw2 (ENSSLDG00000021797)	CRB2 (ENSSLDG00000021781) #22	ENSSLDG00000021771	DENND1A (ENSSLDG00000021751) #23	ENSSLDG00000021744 #23	NEK6 (ENSSLDG00000021730)	psmb7 (ENSSLDG00000021700)	nr5a1b (ENSSLDG00000021687)	lmx1ba (ENSSLDG00000021678)	mvb12ba (ENSSLDG00000021657)	ENSSLDG00000021650	MAPKAP1 (ENSSLDG00000021610)	AJM1 (ENSSLDG00000021604)	ENSSLDG00000021597	slc12a2 (ENSSLDG00000018176)	slc27a6 (ENSSLDG00000017700)	lmnb1 (ENSSLDG00000017637)
Barramundi perch	MODERN SPECIES	391														ENSLCAG00010012020	fbxw2 (ENSLCAG00010012026)	CRB2 (ENSLCAG00010012038) #22	DENND1A (ENSLCAG00010012068) #23	NEK6 (ENSLCAG00010012107)	psmb7 (ENSLCAG00010012139)	nr5a1b (ENSLCAG00010012152)	LMX1B (ENSLCAG00010012158)	mvb12ba (ENSLCAG00010012165)	naif1 (ENSLCAG00010012177)	eeig1b (ENSLCAG00010012183)	dpm2 (ENSLCAG00010012191)	PIP5KL1 (ENSLCAG00010012193)
Anabantaria	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000153464.A.a	ENSGT00940000156902.b	ENSGT00940000164790.a	ENSGT00940000153877.a.a.b	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000156662.d.f	ENSGT00530000063497.a.a	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961.b	ENSGT00940000156340.a.d	ENSGT00440000038585.c	ENSGT00530000063156.a.a.a	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000155946.c.b	ENSGT00930000151016	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.b	ENSGT00940000157955.d.a	ENSGT00940000155945.i.a	ENSGT00390000000642	ENSGT00390000016543.d	ENSGT00530000063851.b	ENSGT00940000155742.a.a	ENSGT00940000159700	ENSGT00940000157199	ENSGT00940000154412.A	ENSGT00390000003837	ENSGT00940000161073
Zig-zag eel	MODERN SPECIES	3	uap1l1 (ENSMAMG00000022652)	ENSMAMG00000022654	setb (ENSMAMG00000022655)	dync2i2 (ENSMAMG00000022658)	sptan1 (ENSMAMG00000022659)	ODF2 (ENSMAMG00000022664)	ENSMAMG00000022666	ENSMAMG00000022668	ENSMAMG00000022669	ENSMAMG00000022671	ENSMAMG00000022672	ENSMAMG00000022674	ENSMAMG00000024754	ENSMAMG00000022679	ENSMAMG00000022682	CRB2 (ENSMAMG00000022685) #22	DENND1A (ENSMAMG00000022689) #23	ENSMAMG00000025869	NEK6 (ENSMAMG00000022697)	psmb7 (ENSMAMG00000025130)	nr5a1b (ENSMAMG00000022705)	ENSMAMG00000022708	ENSMAMG00000022748	ENSMAMG00000022749	ENSMAMG00000022750	ENSMAMG00000022751	syk (ENSMAMG00000022757)	auh (ENSMAMG00000022759)	nfil3 (ENSMAMG00000025536)	ROR2 (ENSMAMG00000022766)	sptlc1 (ENSMAMG00000022776)
Eupercaria	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000153464.A.a	ENSGT00940000156902.b	ENSGT00940000164790.a	ENSGT00940000153877.a.a.b	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000156662.d.f	ENSGT00530000063497.a.a	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961.b	ENSGT00940000156340.a.d	ENSGT00440000038585.c	ENSGT00530000063156.a.a.a	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000155946.c.b	ENSGT00930000151016	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.b	ENSGT00940000157955.d.a	ENSGT00940000155945.i.a	ENSGT00390000000642	ENSGT00390000016543.d	ENSGT00530000063851.b	ENSGT00940000155742.a.a	ENSGT00940000159700	ENSGT00940000159206.a	ENSGT00940000157199	ENSGT00940000154412.A	ENSGT00390000003837
Eupecaria_A	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000153464.A.a	ENSGT00940000156902.b	ENSGT00940000164790.a	ENSGT00940000153877.a.a.b	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000156662.d.f	ENSGT00530000063497.a.a	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961.b	ENSGT00940000156340.a.d	ENSGT00440000038585.c	ENSGT00530000063156.a.a.a	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000155946.c.b	ENSGT00930000151016	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.b	ENSGT00940000157955.d.a	ENSGT00940000155945.i.a	ENSGT00390000000642	ENSGT00390000016543.d	ENSGT00530000063851.b	ENSGT00940000155742.a.a	ENSGT00940000159700	ENSGT00940000159206.a	ENSGT00940000157199	ENSGT00940000154412.A	ENSGT00390000003837
Ballan wrasse	MODERN SPECIES	329															fbxw2 (ENSLBEG00000023061)	CRB2 (ENSLBEG00000023108) #22	ENSLBEG00000023181	ENSLBEG00000023203	DENND1A (ENSLBEG00000023238) #23	NEK6 (ENSLBEG00000023285)	psmb7 (ENSLBEG00000023359)	nr5a1b (ENSLBEG00000023404)	lmx1ba (ENSLBEG00000023424)	mvb12ba (ENSLBEG00000023456)	ENSLBEG00000023566	MAPKAP1 (ENSLBEG00000023756)	AJM1 (ENSLBEG00000023812)	ENSLBEG00000023824	slc12a2 (ENSLBEG00000023886)	slc27a6 (ENSLBEG00000024020)	ENSLBEG00000024065
Eupecaria_B	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000153464.A.a	ENSGT00940000156902.b	ENSGT00940000164790.a	ENSGT00940000153877.a.a.b	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000156662.d.f	ENSGT00530000063497.a.a	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961.b	ENSGT00940000156340.a.d	ENSGT00440000038585.c	ENSGT00530000063156.a.a.a	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000155946.c.b	ENSGT00930000151016	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.b	ENSGT00940000157955.d.a	ENSGT00940000155945.i.a	ENSGT00390000000642	ENSGT00390000016543.d	ENSGT00530000063851.b	ENSGT00940000155742.a.a	ENSGT00940000159700	ENSGT00940000159206.a	ENSGT00940000157199	ENSGT00940000154412.A	ENSGT00390000003837
Perciformes	ANCESTRAL SPECIES	32													ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000155946.c.b	ENSGT00930000151016	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.b	ENSGT00940000157955.d.a	ENSGT00940000155945.i.a	ENSGT00390000000642	ENSGT00390000016543.d	ENSGT00530000063851.b	ENSGT00940000155742.a.a	ENSGT00940000159700	ENSGT00940000157199	ENSGT00390000003837	ENSGT00940000161073	ENSGT00940000157703
Cottioidei	ANCESTRAL SPECIES	31	ENSGT00940000157778	ENSGT00940000155212.bb	ENSGT00940000156081.j	ENSGT00950000182925.B.b	ENSGT00390000013355	ENSGT01100000263541.a.b.k	ENSGT00940000166301	ENSGT00940000158867	ENSGT00940000153832	ENSGT00950000183005.a.b	ENSGT00390000008823	ENSGT00940000155053.c.b	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000155946.c.b	ENSGT00930000151016	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.b	ENSGT00940000157955.d.a	ENSGT00940000155945.i.a	ENSGT00390000000642	ENSGT00390000016543.d	ENSGT00530000063851.b	ENSGT00940000155742.a.a	ENSGT00940000159700	ENSGT00940000157199	ENSGT00390000003837	ENSGT00940000161073	ENSGT00940000157703
Stickleback	MODERN SPECIES	13	ENSGACG00000018267	SHROOM3 (ENSGACG00000018269)	ENSGACG00000018275	ENSGACG00000018277	ENSGACG00000018280	dnajc25 (ENSGACG00000018282)	zgc:113625 (ENSGACG00000018283)	dcc (ENSGACG00000018284)	ENSGACG00000018288	LYZ (ENSGACG00000018290)	mbd2 (ENSGACG00000018294)	ENSGACG00000018301	ralgps1 (ENSGACG00000018302)	angptl2a (ENSGACG00000018304)	fbxw2 (ENSGACG00000018305)	CRB2 (ENSGACG00000018306) #22	DENND1A (ENSGACG00000018307) #23	NEK6 (ENSGACG00000018308)	psmb7 (ENSGACG00000018309)	nr5a1b (ENSGACG00000018317)	lmx1ba (ENSGACG00000018323)	mvb12ba (ENSGACG00000018329)	MAPKAP1 (ENSGACG00000018335)	AJM1 (ENSGACG00000018340)	ENSGACG00000018342	slc12a2 (ENSGACG00000018343)	slc27a6 (ENSGACG00000018349)	lmnb1 (ENSGACG00000018353)	prrc1 (ENSGACG00000018363)	SLC27A3 (ENSGACG00000018368)	wdr91 (ENSGACG00000018369)
Eupecaria_C	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000153464.A.a	ENSGT00940000156902.b	ENSGT00940000164790.a	ENSGT00940000153877.a.a.b	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000156662.d.f	ENSGT00530000063497.a.a	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961.b	ENSGT00940000156340.a.d	ENSGT00440000038585.c	ENSGT00530000063156.a.a.a	ENSGT00940000155946.c.b	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00930000151016	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.b	ENSGT00940000157955.d.a	ENSGT00940000155945.i.a	ENSGT00940000164541	ENSGT00390000000642	ENSGT00390000016543.d	ENSGT00530000063851.b	ENSGT00940000155742.a.a	ENSGT00940000159700	ENSGT00940000159206.a	ENSGT00940000157199	ENSGT00940000154412.A
Eupercaria_incertae_sedis	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000153464.A.a	ENSGT00940000156902.b	ENSGT00940000164790.a	ENSGT00940000153877.a.a.b	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000156662.d.f	ENSGT00530000063497.a.a	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961.b	ENSGT00940000156340.a.d	ENSGT00440000038585.c	ENSGT00530000063156.a.a.a	ENSGT00940000155946.c.b	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00930000151016	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.b	ENSGT00940000157955.d.a	ENSGT00940000155945.i.a	ENSGT00940000164541	ENSGT00390000000642	ENSGT00390000016543.d	ENSGT00530000063851.b	ENSGT00940000155742.a.a	ENSGT00940000159700	ENSGT00940000159206.a	ENSGT00940000157199	ENSGT00940000154412.A
European seabass	MODERN SPECIES	9	zdhhc12b (ENSDLAG00005004355)	ENSDLAG00005004547	setb (ENSDLAG00005010991)	dync2i2 (ENSDLAG00005033129)	sptan1 (ENSDLAG00005007570)	ODF2 (ENSDLAG00005009791)	ENSDLAG00005009820	ENSDLAG00005031144	ENSDLAG00005009963	ENSDLAG00005010024	ENSDLAG00005010086	ENSDLAG00005011315	ENSDLAG00005011403	ENSDLAG00005011408	ENSDLAG00005011480	CRB2 (ENSDLAG00005011489) #22	DENND1A (ENSDLAG00005033425) #23	NEK6 (ENSDLAG00005031059)	psmb7 (ENSDLAG00005011418)	nr5a1b (ENSDLAG00005011809)	mvb12ba (ENSDLAG00005033573)	lmx1ba (ENSDLAG00005030396)	ENSDLAG00005011816	ENSDLAG00005011847	ENSDLAG00005029794	ENSDLAG00005031125	ENSDLAG00005012023	SLC27A6 (ENSDLAG00005032671)	ENSDLAG00005028031	ENSDLAG00005021598	ENSDLAG00005019921
Large yellow croaker	MODERN SPECIES		zdhhc12b (ENSLCRG00005023435)	ENSLCRG00005023415	setb (ENSLCRG00005023412)	dync2i2 (ENSLCRG00005023410)	sptan1 (ENSLCRG00005023399)	ODF2 (ENSLCRG00005023382)	SCAI (ENSLCRG00005023378)	ppp6c (ENSLCRG00005023374)	MMP11 (ENSLCRG00005023372)	smarcb1b (ENSLCRG00005023360)	derl2 (ENSLCRG00005023358)	ENSLCRG00005023345	angptl2a (ENSLCRG00005023341)	ralgps1 (ENSLCRG00005023340)	fbxw2 (ENSLCRG00005023339)	CRB2 (ENSLCRG00005023337) #22	DENND1A (ENSLCRG00005023332) #23	NEK6 (ENSLCRG00005023319)	psmb7 (ENSLCRG00005023309)	nr5a1b (ENSLCRG00005023306)	lmx1ba (ENSLCRG00005023305)	mvb12ba (ENSLCRG00005023304)	ENSLCRG00005023303	ENSLCRG00005023302	MAPKAP1 (ENSLCRG00005023301)	AJM1 (ENSLCRG00005023300)	ENSLCRG00005023299	slc12a2 (ENSLCRG00005022832)	slc27a6 (ENSLCRG00005022814)	ENSLCRG00005022813	lmnb1 (ENSLCRG00005022800)
Gilthead seabream	MODERN SPECIES	3	zdhhc12b (ENSSAUG00010024384)	ENSSAUG00010022795	setb (ENSSAUG00010022693)	dync2i2 (ENSSAUG00010022677)	sptan1 (ENSSAUG00010022637)	ODF2 (ENSSAUG00010022606)	SCAI (ENSSAUG00010022449)	ppp6c (ENSSAUG00010022438)	MMP11 (ENSSAUG00010022437)	smarcb1b (ENSSAUG00010022435)	derl2 (ENSSAUG00010022432)	ENSSAUG00010021889	ENSSAUG00010021852	ralgps1 (ENSSAUG00010021810)	fbxw2 (ENSSAUG00010021793)	CRB2 (ENSSAUG00010021782) #22	DENND1A (ENSSAUG00010021584) #23	NEK6 (ENSSAUG00010021447)	psmb7 (ENSSAUG00010021443)	ENSSAUG00010021440	nr5a1b (ENSSAUG00010021437)	LMX1B (ENSSAUG00010021436)	MAPKAP1 (ENSSAUG00010021431)	mvb12ba (ENSSAUG00010021415)	ENSSAUG00010021411	slc12a2 (ENSSAUG00010013884)	slc27a6 (ENSSAUG00010013692)	megf10 (ENSSAUG00010012160)	pomk (ENSSAUG00010012096)	PAM (ENSSAUG00010012089)	ENSSAUG00010012086
Tetraodontidae	ANCESTRAL SPECIES	88												ENSGT00440000038585.c	ENSGT00530000063156.a.a.a	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00930000151016	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.b #22	ENSGT00940000156261 #23	ENSGT00940000157419	ENSGT00550000074961.b	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000156662.d.f	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000153877.a.a.b	ENSGT00940000164790.a	ENSGT00940000156902.b	ENSGT00940000153464.A.a	ENSGT00940000157207.a.a	ENSGT00450000040324.b.n	ENSGT00390000001098	ENSGT00940000158633.a	ENSGT00940000155841.c.b
Fugu	MODERN SPECIES	18	ENSTRUG00000012403	tjp2a (ENSTRUG00000012412)	pip5k1ba (ENSTRUG00000012638)	EFNA5 (ENSTRUG00000026115)	GADD45G (ENSTRUG00000012876)	gadd45gb.1 (ENSTRUG00000012938)	ENSTRUG00000012990	ENSTRUG00000023362	ghrb (ENSTRUG00000013005)	c7b (ENSTRUG00000013142)	c6 (ENSTRUG00000013404)	SMARCB1 (ENSTRUG00000013792)	derl2 (ENSTRUG00000024229)	ralgps1 (ENSTRUG00000013875)	fbxw2 (ENSTRUG00000013978)	ENSTRUG00000014027 #22	DENND1A (ENSTRUG00000014090) #23	phyhd1 (ENSTRUG00000031352)	psmb7 (ENSTRUG00000014190)	ppp6c (ENSTRUG00000014295)	SCAI (ENSTRUG00000014341)	sptan1 (ENSTRUG00000014072)	dync2i2 (ENSTRUG00000014025)	setb (ENSTRUG00000013980)	ENSTRUG00000013819	zdhhc12b (ENSTRUG00000013790)	uap1l1 (ENSTRUG00000013698)	slc25a25b (ENSTRUG00000013603)	naif1 (ENSTRUG00000013589)	dpm2 (ENSTRUG00000013567)	ENSTRUG00000030413
Pinecone sodierfish	MODERN SPECIES	3	lrsam1 (ENSMMDG00005003533)	ndor1 (ENSMMDG00005003596)	ntmt1 (ENSMMDG00005003721)	ier5l (ENSMMDG00005003728)	ptpa (ENSMMDG00005003748)	crata (ENSMMDG00005003884)	AJM1 (ENSMMDG00005006679)	ENSMMDG00005006683	MAPKAP1 (ENSMMDG00005006687)	mvb12ba (ENSMMDG00005006693)	lmx1ba (ENSMMDG00005006698)	zbtb43 (ENSMMDG00005006700)	ralgps1 (ENSMMDG00005006729)	angptl2a (ENSMMDG00005008993)	fbxw2 (ENSMMDG00005009051)	ENSMMDG00005009053 #22	ENSMMDG00005009057 #23	ENSMMDG00005009060	NEK6 (ENSMMDG00005009066)	psmb7 (ENSMMDG00005009472)	nr5a1b (ENSMMDG00005009495)	slc27a6 (ENSMMDG00005009790)	SLC27A3 (ENSMMDG00005009841)	slc12a2 (ENSMMDG00005010053)	CTXN3 (ENSMMDG00005011303)	prrc1 (ENSMMDG00005011305)	megf10 (ENSMMDG00005011308)	C5orf63 (ENSMMDG00005011315)	ENSMMDG00005011319	aldh7a1 (ENSMMDG00005011351)	isoc1 (ENSMMDG00005011970)
Cod	MODERN SPECIES	17	NAIF1 (ENSGMOG00000008831)	slc25a25b (ENSGMOG00000008812)	uap1l1 (ENSGMOG00000008793)	zdhhc12b (ENSGMOG00000008781)	ENSGMOG00000008752	ENSGMOG00000008739	dync2i2 (ENSGMOG00000008718)	SPTAN1 (ENSGMOG00000008663)	ODF2 (ENSGMOG00000008644)	ENSGMOG00000008631	ENSGMOG00000008624	ENSGMOG00000008614	ENSGMOG00000008607	ENSGMOG00000006711	ENSGMOG00000006730	CRB2 (ENSGMOG00000006738) #22	ENSGMOG00000006766 #23	PSMB7 (ENSGMOG00000006798)	nr5a1b (ENSGMOG00000032636)	slc27a6 (ENSGMOG00000003965)	ENSGMOG00000003986	slc12a2 (ENSGMOG00000004314)	prrc1 (ENSGMOG00000004373)	megf10 (ENSGMOG00000013000)	C5orf63 (ENSGMOG00000028433)	ENSGMOG00000013628	ENSGMOG00000013593	ENSGMOG00000013544	ENSGMOG00000013540	sptlc1 (ENSGMOG00000013388)	ROR2 (ENSGMOG00000011137)
Osteoglossocephalai	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183101.a.b.b.b #22
Clupeocephala	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183101.a.b.b.b #22
Euteleosteomorpha	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183101.a.b.b.b #22
Acanthomorphata	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183101.a.b.b.b #22
Euacanthomorphacea	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183101.a.b.b.b #22
Percomorphaceae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183101.a.b.b.b #22
Percomorphaceae_B	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183101.a.b.b.b #22
Ovalentaria	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183101.a.b.b.b #22
Ovalentaria_B	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183101.a.b.b.b #22
Cichlidae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183101.a.b.b.b #22
Pseudocrenilabrinae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183101.a.b.b.b #22
Pseudocrenilabrinae_A	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183101.a.b.b.b #22
Lyretail cichlid	MODERN SPECIES	382								ENTPD2 (ENSNBRG00000011023)	fgf17 (ENSNBRG00000011007)	FKBP15 (ENSNBRG00000010885)	ccn1l2 (ENSNBRG00000010788)	ENSNBRG00000010766	ENSNBRG00000010749	tubb2b (ENSNBRG00000010731)	ENSNBRG00000010715	ENSNBRG00000010700 #22	lhx2b (ENSNBRG00000010642) #24	ENSNBRG00000010591	nr5a1a (ENSNBRG00000010564)	nr6a1a (ENSNBRG00000010537)	olfml2a (ENSNBRG00000010522)	ENSNBRG00000010505	rpl35 (ENSNBRG00000010485)	golga1 (ENSNBRG00000010429)	PPP6C (ENSNBRG00000010420)	dpp7 (ENSNBRG00000010388)	noxa1 (ENSNBRG00000010365)	ENSNBRG00000010330	ENSNBRG00000010303	stxbp1b (ENSNBRG00000010196)	niban2b (ENSNBRG00000010154)
Protacanthopterygii	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183101.a.b.b.b #22
Northern pike	MODERN SPECIES	10	ENSELUG00000022847	ppap2d (ENSELUG00000022841)	tnfsf18 (ENSELUG00000022795)	tnfsf14 (ENSELUG00000022789)	tmed1a (ENSELUG00000022785)	dnm2a (ENSELUG00000022776)	qtrt1 (ENSELUG00000022711)	ENSELUG00000022671	ENSELUG00000022510	gipc1 (ENSELUG00000022496)	dnajb1a (ENSELUG00000022433)	TECR (ENSELUG00000022407)	ENSELUG00000022357	prkacaa (ENSELUG00000022350)	asf1ba (ENSELUG00000022338)	ENSELUG00000032997 #22	ENSELUG00000022300	ENSELUG00000031082	ENSELUG00000026953	ENSELUG00000022251	RRN3 (ENSELUG00000022239)	asic2 (ENSELUG00000022180)	ENSELUG00000022146	ENSELUG00000022131	asb16 (ENSELUG00000022103)	tmub2 (ENSELUG00000022078)	atxn7l3a (ENSELUG00000022068)	ubtf (ENSELUG00000022011)	slc4a1a (ENSELUG00000021990)	selenow2a (ENSELUG00000021964)	MIEN1 (ENSELUG00000021956)
Otomorpha	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183101.a.b.b.b #22
Otophysi	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183101.a.b.b.b #22
Characiphysae	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00940000164486.f	ENSGT01030000237053	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a.f.d	ENSGT00940000158445.f	ENSGT00940000155764.A.a	ENSGT00530000063679.B	ENSGT00940000166551.d	ENSGT00940000166524	ENSGT00970000193390.c.b.b.b.a	ENSGT00390000003420.a.a	ENSGT00940000164566.b	ENSGT00950000182886.a.a.b.t	ENSGT00530000063936.a.b	ENSGT00940000163111.a.a	ENSGT00390000004692.d.a.n	ENSGT00950000183101.a.b.b.b #22	ENSGT01030000234583.a.a.c.a.b.a.a	ENSGT00940000165036.a	ENSGT00940000154394.b.a.a.b.a.a.b	ENSGT00970000193390.c.b.b.a	ENSGT00940000156783.l	ENSGT00390000000190	ENSGT00390000010750.b	ENSGT00940000158297	ENSGT00940000164791.a.a	ENSGT00940000166596	ENSGT00940000167682	ENSGT00390000011216	ENSGT00940000165021.a	ENSGT00940000158217.a.a.h	ENSGT00730000111327
Channel catfish	MODERN SPECIES	16	ENSIPUG00000008294	ppap2d (ENSIPUG00000008277)	ENSIPUG00000008258	tnfsf14 (ENSIPUG00000008253)	dnm2 (ENSIPUG00000008156)	qtrt1 (ENSIPUG00000008090)	ENSIPUG00000007843	ENSIPUG00000007784	Gipc1 (ENSIPUG00000007766)	dnajb1a (ENSIPUG00000007751)	ENSIPUG00000007744	TECR (ENSIPUG00000007700)	ENSIPUG00000007676	prkacaa (ENSIPUG00000007588)	asf1ba (ENSIPUG00000007531)	ENSIPUG00000007521 #22	ENSIPUG00000007491	ENSIPUG00000007472	gcgr (ENSIPUG00000007429)	Mrpl12 (ENSIPUG00000007392)	hgs (ENSIPUG00000007313)	CLDN6 (ENSIPUG00000007299)	btr02 (ENSIPUG00000007245)	ENSIPUG00000007290	ENSIPUG00000007214	ENSIPUG00000007208	rsad1 (ENSIPUG00000007167)	ENSIPUG00000007097	arl16 (ENSIPUG00000007077)	ENSIPUG00000006877	ptger1c (ENSIPUG00000006841)
Characiphysae_b	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT01030000237053	ENSGT00940000176155.g	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a.f.d	ENSGT00940000158445.f	ENSGT00940000155764.A.a	ENSGT00530000063679.B	ENSGT00940000166551.d	ENSGT00940000166524	ENSGT00970000193390.c.b.b.b.a	ENSGT00390000003420.a.a	ENSGT00940000164566.b	ENSGT00950000182886.a.a.b.t	ENSGT00530000063936.a.b	ENSGT00940000163111.a.a	ENSGT00390000004692.d.a.n	ENSGT00950000183101.a.b.b.b #22	ENSGT00940000154394.b.a.a.b.a.a.b	ENSGT00970000193390.c.b.b.a	ENSGT00940000165036.a	ENSGT00940000156783.l	ENSGT00390000000190	ENSGT00390000010750.b	ENSGT00940000158297	ENSGT00940000164791.a.a	ENSGT00940000166596	ENSGT00940000167682	ENSGT00390000011216	ENSGT00940000165021.a	ENSGT00940000158217.a.a.h	ENSGT00940000167007	ENSGT00940000155095.i.b.b.u
Characoidei	ANCESTRAL SPECIES	33	ENSGT01030000237053	ENSGT00940000176155.g	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a.f.d	ENSGT00940000158445.f	ENSGT00940000155764.A.a	ENSGT00530000063679.B	ENSGT00940000166551.d	ENSGT00940000166524	ENSGT00970000193390.c.b.b.b.a	ENSGT00390000003420.a.a	ENSGT00940000164566.b	ENSGT00950000182886.a.a.b.t	ENSGT00530000063936.a.b	ENSGT00940000163111.a.a	ENSGT00390000004692.d.a.n	ENSGT00950000183101.a.b.b.b #22	ENSGT00940000154394.b.a.a.b.a.a.b	ENSGT00970000193390.c.b.b.a	ENSGT00940000165036.a	ENSGT00940000156783.l	ENSGT00390000000190	ENSGT00390000010750.b	ENSGT00940000158297	ENSGT00940000164791.a.a	ENSGT00940000166596	ENSGT00940000167682	ENSGT00390000011216	ENSGT00940000158217.a.a.h	ENSGT00940000167007	ENSGT00940000155095.i.b.b.u	ENSGT00940000160578
Red-bellied piranha	MODERN SPECIES	1912																ENSPNAG00000009956 #22	ENSPNAG00000009940 #22	ENSPNAG00000009935 #23
Mexicana tetra	MODERN SPECIES	99	ppap2d (ENSAMXG00000016674)	ENSAMXG00000030185	ENSAMXG00000034440	tmed1a (ENSAMXG00000030718)	dnm2a (ENSAMXG00000037846)	qtrt1 (ENSAMXG00000030233)	ENSAMXG00000033780	ENSAMXG00000041011	zgc:92161 (ENSAMXG00000017069)	gipc1 (ENSAMXG00000017092)	dnajb1a (ENSAMXG00000037130)	TECR (ENSAMXG00000017137)	ENSAMXG00000043634	prkacaa (ENSAMXG00000017190)	asf1ba (ENSAMXG00000017225)	ENSAMXG00000025837 #22	ENSAMXG00000036690	ENSAMXG00000031400	ENSAMXG00000037851	SLC25A10 (ENSAMXG00000017328)	mrpl12 (ENSAMXG00000032543)	zgc:103625 (ENSAMXG00000032843)	hgs (ENSAMXG00000035257)	btr02 (ENSAMXG00000037899)	ENSAMXG00000032380	ENSAMXG00000035141	rsad1 (ENSAMXG00000038257)	EPN3 (ENSAMXG00000036366)	ENSAMXG00000035138	ARL16 (ENSAMXG00000030575)	ENSAMXG00000017450
Elephant shark	MODERN SPECIES	1721												ENSCMIG00000014722	RC3H2 (ENSCMIG00000014728)	RABGAP1 (ENSCMIG00000014764)	STRBP (ENSCMIG00000014816)	CRB2 (ENSCMIG00000014859) #22	ENSCMIG00000014862	DENND1A (ENSCMIG00000014864) #23
Gnathostomata	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22
Euteleostomi	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22
Sarcopterygii	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22
Tetrapoda	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00530000063615.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00940000154396.b.a	ENSGT01050000244879.a.b	ENSGT00390000011987	ENSGT00940000162059	ENSGT00390000009595.b	ENSGT00950000183135.A.b	ENSGT00940000162102	ENSGT00390000011740	ENSGT00390000013732	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573
Amniota	ANCESTRAL SPECIES	36									ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000163693	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000154394.b.a.a.b.b	ENSGT00730000111343	ENSGT00940000154394.b.a.b	ENSGT00940000164486	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000165414	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354	ENSGT00940000162163	ENSGT00940000163334
Mammalia	ANCESTRAL SPECIES	64	ENSGT00390000016177	ENSGT00940000162906.c.b	ENSGT00940000153846.a.b	ENSGT00940000156166.b	ENSGT00940000154382.a.a	ENSGT00940000159311.c	ENSGT00940000158914	ENSGT00530000063861.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000163693	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000154394.b.a.a.b.b	ENSGT00940000164486	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000165414	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354	ENSGT00940000162163	ENSGT00940000163334
Platypus	MODERN SPECIES	84	ENSOANG00000030515	ENSOANG00000036950	ENSOANG00000036052	ENSOANG00000041203	LRRC8E (ENSOANG00000043083)	ENSOANG00000049040	MAP2K7 (ENSOANG00000015355)	CLPP (ENSOANG00000012221)	ALKBH7 (ENSOANG00000045418)	ENSOANG00000000620	GTF2F1 (ENSOANG00000006110)	ENSOANG00000044176	ENSOANG00000000264	ENSOANG00000000261	SLC25A23 (ENSOANG00000001661)	ENSOANG00000042448 ##22	ENSOANG00000008407	ENSOANG00000044041	ENSOANG00000041505	ENSOANG00000051104	ENSOANG00000039080	ENSOANG00000006581	ENSOANG00000006107	ENSOANG00000006102	ENSOANG00000006101	GPR108 (ENSOANG00000045248)	VAV1 (ENSOANG00000014870)	ENSOANG00000011238	ENSOANG00000037657	ENSOANG00000030077	ENSOANG00000009307
Theria	ANCESTRAL SPECIES	41	ENSGT00390000007212	ENSGT00940000162442	ENSGT00940000158588	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A	ENSGT00940000158800	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000163693	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000154394.b.a.a.b.b	ENSGT00940000164486	ENSGT00390000006244	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000165414	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354	ENSGT00940000162163	ENSGT00940000163334
Marsupialia	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000162442	ENSGT00940000158588	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A.o	ENSGT00940000155332.A.p	ENSGT00940000158800	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00940000163693	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000154394.b.a.a.b.b	ENSGT00940000164486	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000165414	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354	ENSGT00940000162163	ENSGT00940000163334
Marsupialia_b	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000162442	ENSGT00940000158588	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A.o	ENSGT00940000155332.A.p	ENSGT00940000158800	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000163693	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000154394.b.a.a.b.b	ENSGT00940000164486	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000165414	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354	ENSGT00940000162163	ENSGT00940000163334
Diprotodontia	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000162442	ENSGT00940000158588	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A.o	ENSGT00940000155332.A.p	ENSGT00940000158800	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000163693	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000154394.b.a.a.b.b	ENSGT00940000164486	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000165414	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354	ENSGT00940000162163	ENSGT00940000163037
Diprotodontia_a	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000162442	ENSGT00940000158588.q	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A.o	ENSGT00940000155332.A.p	ENSGT00940000158800	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032.hb	ENSGT00940000163693	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000154394.b.a.a.b.b	ENSGT00940000164486	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000165414	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354	ENSGT00940000162163	ENSGT00940000163037
koala	MODERN SPECIES	214	CAPS (ENSPCIG00000008456)	ENSPCIG00000008455	RFX2 (ENSPCIG00000008454)	ENSPCIG00000013268	ENSPCIG00000019691	MLLT1 (ENSPCIG00000032521)	ACER1 (ENSPCIG00000016619)	CLPP (ENSPCIG00000016621)	ALKBH7 (ENSPCIG00000016623)	ENSPCIG00000034364	ENSPCIG00000003850	ENSPCIG00000004565	KHSRP (ENSPCIG00000025516)	SLC25A41 (ENSPCIG00000016624)	SLC25A23 (ENSPCIG00000016625)	CRB3 (ENSPCIG00000033282) ##22	ENSPCIG00000016632	ENSPCIG00000016640	ENSPCIG00000016641	TNFSF14 (ENSPCIG00000016643)	C3 (ENSPCIG00000016648)	ENSPCIG00000016656	GPR108 (ENSPCIG00000016658)	TRIP10 (ENSPCIG00000016659)	SH2D3A (ENSPCIG00000016660)	VAV1 (ENSPCIG00000016668)	ADGRE1 (ENSPCIG00000028194)
Common wonbat	MODERN SPECIES	651	DSCC1 (ENSVURG00010016837)	TAF2 (ENSVURG00010016853)	ENPP2 (ENSVURG00010016906)	CCN3 (ENSVURG00010016997)	MAL2 (ENSVURG00010017007)	ENSVURG00010017012	COLEC10 (ENSVURG00010017061)	TNFRSF11B (ENSVURG00010017074)	SAMD12 (ENSVURG00010017096)	EXT1 (ENSVURG00010017119)	MED30 (ENSVURG00010017131)	RAD21 (ENSVURG00010017148)	UTP23 (ENSVURG00010017165)	EIF3H (ENSVURG00010017172)	TRPS1 (ENSVURG00010017201)	ENSVURG00010017248 ##22	ENSVURG00010017260	CSMD3 (ENSVURG00010017335)	ENSVURG00010017491	ENSVURG00010017514	KCNV1 (ENSVURG00010017526)	ENSVURG00010017536	SYBU (ENSVURG00010017544)	ENSVURG00010017571	PKHD1L1 (ENSVURG00010017660)	ENY2 (ENSVURG00010018031)	NUDCD1 (ENSVURG00010018036)	TRHR (ENSVURG00010018042)
Tasmanian devil	MODERN SPECIES		CAPS (ENSSHAG00000021620)	RANBP3 (ENSSHAG00000027846)	RFX2 (ENSSHAG00000005810)	ENSSHAG00000008517	ENSSHAG00000008859	MLLT1 (ENSSHAG00000009440)	CLPP (ENSSHAG00000010777)	ALKBH7 (ENSSHAG00000026703)	ENSSHAG00000029162	ENSSHAG00000010846	ENSSHAG00000030352	ENSSHAG00000022420	KHSRP (ENSSHAG00000011383)	SLC25A41 (ENSSHAG00000011643)	SLC25A23 (ENSSHAG00000011678)	ENSSHAG00000023441 ##22	DENND1C (ENSSHAG00000011768)	ENSSHAG00000020579	ENSSHAG00000025838	ENSSHAG00000024632	C3 (ENSSHAG00000028091)	ENSSHAG00000003735	GPR108 (ENSSHAG00000003841)	TRIP10 (ENSSHAG00000004338)	SH2D3A (ENSSHAG00000004505)	VAV1 (ENSSHAG00000004661)	ENSSHAG00000006305	ENSSHAG00000006472	ENSSHAG00000023408	ENSSHAG00000005806	ENSSHAG00000003996
Eutheria	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00390000007212	ENSGT00940000162442	ENSGT00940000158588	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A	ENSGT00940000158800	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000163693	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000161972	ENSGT00940000164486	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354	ENSGT00940000162163	ENSGT00950000183069	ENSGT00950000183216
Boreoeutheria	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000162442	ENSGT00940000158588	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A	ENSGT00940000164043	ENSGT00940000158800	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000163693	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000161972	ENSGT00940000164486	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354	ENSGT00940000162163	ENSGT00950000183069.b	ENSGT00940000155404
Laurasiatheria	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000162442	ENSGT00940000158588	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A	ENSGT00940000164043	ENSGT00940000158800	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000163693	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000161972	ENSGT00940000164486	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354	ENSGT00940000162163	ENSGT00950000183069.b	ENSGT00940000154431.f
Laurasiatheria_a	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000162442	ENSGT00940000158588	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A	ENSGT00940000164043	ENSGT00940000158800	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000163693	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000161972	ENSGT00940000164486	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354	ENSGT00940000162163	ENSGT00950000183005.b.c.b	ENSGT00950000183005.b.c.a
Laurasiatheria_b	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000162442	ENSGT00940000158588	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A	ENSGT00940000164043	ENSGT00940000158800	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000163693	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000161972	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354	ENSGT00940000162163	ENSGT00950000183005.b.c.b	ENSGT01090000260018.B.a.b	ENSGT00940000163012
Carnivora	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000162442	ENSGT00940000158588	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A	ENSGT00940000164043	ENSGT00940000158800	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000163693	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000161972	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354	ENSGT00940000162163	ENSGT00950000183005.b.c.b	ENSGT01090000260018.B.a.b	ENSGT00940000163012
Felidae	DUPLICATION
Felidae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183101.a.b.a.a ##22
Panthera	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183101.a.b.a.a ##22
Panthera_a	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183101.a.b.a.a ##22
leopard	MODERN SPECIES	134	VMAC (ENSPPRG00000001830)	CAPS (ENSPPRG00000002279)	RANBP3 (ENSPPRG00000004053)	RFX2 (ENSPPRG00000004939)	ACSBG2 (ENSPPRG00000006197)	ENSPPRG00000006490	MLLT1 (ENSPPRG00000006767)	ACER1 (ENSPPRG00000007111)	ENSPPRG00000007143	ALKBH7 (ENSPPRG00000007447)	PSPN (ENSPPRG00000007687)	GTF2F1 (ENSPPRG00000007816)	KHSRP (ENSPPRG00000008001)	SLC25A41 (ENSPPRG00000008078)	SLC25A23 (ENSPPRG00000008786)	ENSPPRG00000008866 ##22	CRB3 (ENSPPRG00000009994) ##22	DENND1C (ENSPPRG00000011124)	ENSPPRG00000011364	ENSPPRG00000011682	TNFSF9 (ENSPPRG00000012095)	CD70 (ENSPPRG00000013825)	TNFSF14 (ENSPPRG00000013892)
Felidae	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00390000007212	ENSGT00940000162442	ENSGT00940000158588	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A	ENSGT00940000164043	ENSGT00940000158800	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a.b ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000161972	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b.bc.b	ENSGT00940000154063.C.a.b.bc.a	ENSGT00940000154063.C.a.b.cc	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354	ENSGT00940000162163	ENSGT00950000183005.b.c.b
Panthera	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00390000007212	ENSGT00940000162442	ENSGT00940000158588	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A	ENSGT00940000164043	ENSGT00940000158800	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a.b ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000161972	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b.bc.a	ENSGT00940000154063.C.a.b.cc	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354	ENSGT00940000162163	ENSGT00950000183005.b.c.b	ENSGT01090000260018.B.a.b
Panthera_a	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000007212	ENSGT00940000162442	ENSGT00940000158588	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A	ENSGT00940000164043	ENSGT00940000158800	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a.b ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000161972	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b.bc.b	ENSGT00940000154063.C.a.b.bc.a	ENSGT00940000154063.C.a.b.cc	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354	ENSGT00940000162163	ENSGT00950000183005.b.c.b
leopard	MODERN SPECIES	134	CAPS (ENSPPRG00000002279)	RANBP3 (ENSPPRG00000004053)	RFX2 (ENSPPRG00000004939)	ACSBG2 (ENSPPRG00000006197)	ENSPPRG00000006490	MLLT1 (ENSPPRG00000006767)	ACER1 (ENSPPRG00000007111)	ENSPPRG00000007143	ALKBH7 (ENSPPRG00000007447)	PSPN (ENSPPRG00000007687)	GTF2F1 (ENSPPRG00000007816)	KHSRP (ENSPPRG00000008001)	SLC25A41 (ENSPPRG00000008078)	SLC25A23 (ENSPPRG00000008786)	ENSPPRG00000008866 ##22	CRB3 (ENSPPRG00000009994) ##22	DENND1C (ENSPPRG00000011124)	ENSPPRG00000011364	ENSPPRG00000011682	TNFSF9 (ENSPPRG00000012095)	CD70 (ENSPPRG00000013825)	TNFSF14 (ENSPPRG00000013892)
lion	MODERN SPECIES	2	VMAC (ENSPLOG00000007244)	CAPS (ENSPLOG00000007257)	RANBP3 (ENSPLOG00000007325)	RFX2 (ENSPLOG00000007424)	ACSBG2 (ENSPLOG00000007544)	ENSPLOG00000007717	MLLT1 (ENSPLOG00000008040)	ACER1 (ENSPLOG00000008130)	CLPP (ENSPLOG00000008162)	ALKBH7 (ENSPLOG00000008230)	PSPN (ENSPLOG00000008290)	GTF2F1 (ENSPLOG00000008314)	KHSRP (ENSPLOG00000008352)	SLC25A41 (ENSPLOG00000008462)	SLC25A23 (ENSPLOG00000008518)	CRB3 (ENSPLOG00000008561) ##22	DENND1C (ENSPLOG00000008616)	TUBB4A (ENSPLOG00000008766)	CD70 (ENSPLOG00000008810)	TNFSF14 (ENSPLOG00000008844)	GPR108 (ENSPLOG00000008896)	TRIP10 (ENSPLOG00000000029)	SH2D3A (ENSPLOG00000000042)	VAV1 (ENSPLOG00000000054)	ADGRE1 (ENSPLOG00000000168)	ENSPLOG00000000398	ENSPLOG00000000477	OR2Z1 (ENSPLOG00000000490)	ACTL9 (ENSPLOG00000000500)	NFILZ (ENSPLOG00000000510)	ADAMTS10 (ENSPLOG00000000533)
Cat	MODERN SPECIES	1	ENSFCAG00000025259	NDUFA11 (ENSFCAG00000016347)	ENSFCAG00000045490	RANBP3 (ENSFCAG00000012502)	RFX2 (ENSFCAG00000012504)	ACSBG2 (ENSFCAG00000012505)	ENSFCAG00000027464	MLLT1 (ENSFCAG00000023537)	ACER1 (ENSFCAG00000040566)	CLPP (ENSFCAG00000012509)	ALKBH7 (ENSFCAG00000012510)	PSPN (ENSFCAG00000043004)	GTF2F1 (ENSFCAG00000012512)	KHSRP (ENSFCAG00000003731)	SLC25A41 (ENSFCAG00000025463)	CRB3 (ENSFCAG00000041058) ##22	DENND1C (ENSFCAG00000012514)	TUBB4A (ENSFCAG00000010269)	TNFSF9 (ENSFCAG00000038600)	CD70 (ENSFCAG00000028989)	TNFSF14 (ENSFCAG00000005040)	ENSFCAG00000046278	GPR108 (ENSFCAG00000018222)	ENSFCAG00000048073	TRIP10 (ENSFCAG00000005047)	SH2D3A (ENSFCAG00000026188)	VAV1 (ENSFCAG00000005052)	ADGRE1 (ENSFCAG00000005054)	ENSFCAG00000000243	OR2Z1 (ENSFCAG00000052785)	ACTL9 (ENSFCAG00000027714)
Caniformia	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000158588	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A	ENSGT00950000185519	ENSGT00940000164043	ENSGT00940000158800	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000163693	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000161972	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354	ENSGT00940000162163	ENSGT00950000183005.b.c.b	ENSGT01090000260018.B.a.b	ENSGT00940000163012
Canidae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000158588	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A	ENSGT00950000185519	ENSGT00940000164043	ENSGT00940000158800	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000163693	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000161972	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354	ENSGT00940000162163	ENSGT00950000183005.b.c.b	ENSGT01090000260018.B.a.b	ENSGT00940000163012
Red fox	MODERN SPECIES	278	VMAC (ENSVVUG00000026915)	RANBP3 (ENSVVUG00000026909)	RFX2 (ENSVVUG00000026908)	ACSBG2 (ENSVVUG00000026905)	ENSVVUG00000026901	MLLT1 (ENSVVUG00000026899)	ACER1 (ENSVVUG00000026897)	CLPP (ENSVVUG00000026895)	ALKBH7 (ENSVVUG00000026894)	PSPN (ENSVVUG00000026892)	GTF2F1 (ENSVVUG00000026891)	ENSVVUG00000026889	KHSRP (ENSVVUG00000026737)	SLC25A41 (ENSVVUG00000026725)	SLC25A23 (ENSVVUG00000026718)	CRB3 (ENSVVUG00000026716) ##22	DENND1C (ENSVVUG00000026697)	ENSVVUG00000026690	ENSVVUG00000026683	ENSVVUG00000026681	CD70 (ENSVVUG00000026679)	TNFSF14 (ENSVVUG00000026672)	C3 (ENSVVUG00000022719)	GPR108 (ENSVVUG00000022222)	TRIP10 (ENSVVUG00000020538)	SH2D3A (ENSVVUG00000020490)	VAV1 (ENSVVUG00000016047)	ADGRE1 (ENSVVUG00000015900)
Canis_lupus	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000158588	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A	ENSGT00950000185519	ENSGT00940000164043	ENSGT00940000158800	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000163693	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000161972	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354	ENSGT00940000162163	ENSGT00950000183005.b.c.b	ENSGT01090000260018.B.a.b	ENSGT00940000163012
Dog	MODERN SPECIES	12	CAPS (ENSCAFG00845012225)	RANBP3 (ENSCAFG00845012047)	RFX2 (ENSCAFG00845011818)	ACSBG2 (ENSCAFG00845011716)	ENSCAFG00845011637	MLLT1 (ENSCAFG00845011430)	ACER1 (ENSCAFG00845011353)	CLPP (ENSCAFG00845011300)	ALKBH7 (ENSCAFG00845011262)	PSPN (ENSCAFG00845011239)	GTF2F1 (ENSCAFG00845011192)	ENSCAFG00845011160	KHSRP (ENSCAFG00845011000)	SLC25A41 (ENSCAFG00845010943)	SLC25A23 (ENSCAFG00845010879)	CRB3 (ENSCAFG00845010829) ##22	DENND1C (ENSCAFG00845010702)	TUBB4A (ENSCAFG00845010611)	ENSCAFG00845010584	CD70 (ENSCAFG00845010526)	TNFSF14 (ENSCAFG00845010429)	C3 (ENSCAFG00845010104)	GPR108 (ENSCAFG00845009759)	TRIP10 (ENSCAFG00845009583)	SH2D3A (ENSCAFG00845009408)	VAV1 (ENSCAFG00845008896)	ADGRE1 (ENSCAFG00845007962)	EMR4 (ENSCAFG00845007349)	ENSCAFG00845007201	ENSCAFG00845007164	OR2Z1 (ENSCAFG00845007117)
Dingo	MODERN SPECIES	112	RFX2 (ENSCAFG00020019038)	ENSCAFG00020019048	ENSCAFG00020019050	ENSCAFG00020019051	ENSCAFG00020019056	MLLT1 (ENSCAFG00020019087)	ACER1 (ENSCAFG00020019092)	CLPP (ENSCAFG00020019094)	ALKBH7 (ENSCAFG00020019096)	PSPN (ENSCAFG00020019098)	GTF2F1 (ENSCAFG00020019099)	ENSCAFG00020019100	KHSRP (ENSCAFG00020019133)	SLC25A41 (ENSCAFG00020019291)	SLC25A23 (ENSCAFG00020019295)	CRB3 (ENSCAFG00020019301) ##22	DENND1C (ENSCAFG00020019317)	TUBB4A (ENSCAFG00020019365)	TNFSF9 (ENSCAFG00020019371)	ENSCAFG00020019376	TNFSF14 (ENSCAFG00020019380)	C3 (ENSCAFG00020019526)	GPR108 (ENSCAFG00020021851)	TRIP10 (ENSCAFG00020021855)	SH2D3A (ENSCAFG00020021858)	VAV1 (ENSCAFG00020021863)	ADGRE1 (ENSCAFG00020021872)	ENSCAFG00020021878	ENSCAFG00020021884	OR2Z1 (ENSCAFG00020021885)	ACTL9 (ENSCAFG00020021887)
Caniformia_b	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00940000158588	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A	ENSGT00950000185519	ENSGT00940000164043	ENSGT00940000158800	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000163693	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000161972	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354	ENSGT00940000162163	ENSGT00950000183005.b.c.b	ENSGT01090000260018.B.a.b	ENSGT00940000163012
Ursidae	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000158588	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A.v	ENSGT00950000185519	ENSGT00940000164043	ENSGT00940000158800	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000163693	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000161972	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354	ENSGT00940000162163	ENSGT00950000183005.b.c.b	ENSGT01090000260018.B.a.b	ENSGT00940000163012
Ursus	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000158588	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A.v	ENSGT00950000185519	ENSGT00940000164043	ENSGT00940000158800	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000163693	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000161972	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354	ENSGT00940000162163	ENSGT00950000183005.b.c.b	ENSGT01090000260018.B.a.b	ENSGT00940000163012
American black bear	MODERN SPECIES	1088													KHSRP (ENSUAMG00000023100)	SLC25A41 (ENSUAMG00000023101)	SLC25A23 (ENSUAMG00000023102)	CRB3 (ENSUAMG00000023103) ##22	ENSUAMG00000023104	ENSUAMG00000023107	TUBB4A (ENSUAMG00000023108)	CD70 (ENSUAMG00000023109)	TNFSF14 (ENSUAMG00000023112)	C3 (ENSUAMG00000023143)	GPR108 (ENSUAMG00000024090)	TRIP10 (ENSUAMG00000024128)	SH2D3A (ENSUAMG00000024134)	ENSUAMG00000024136	VAV1 (ENSUAMG00000024146)
Giant Panda	MODERN SPECIES	14	VMAC (ENSAMEG00000007913)	CAPS (ENSAMEG00000007894)	RFX2 (ENSAMEG00000007745)	ACSBG2 (ENSAMEG00000006804)	ENSAMEG00000006856	MLLT1 (ENSAMEG00000006860)	ACER1 (ENSAMEG00000023660)	CLPP (ENSAMEG00000029863)	ALKBH7 (ENSAMEG00000006925)	PSPN (ENSAMEG00000006930)	GTF2F1 (ENSAMEG00000006933)	ENSAMEG00000006968	KHSRP (ENSAMEG00000006978)	SLC25A41 (ENSAMEG00000007032)	SLC25A23 (ENSAMEG00000007035)	CRB3 (ENSAMEG00000007097) ##22	DENND1C (ENSAMEG00000007101)	TUBB4A (ENSAMEG00000029200)	TNFSF9 (ENSAMEG00000024527)	CD70 (ENSAMEG00000007138)	TNFSF14 (ENSAMEG00000028779)	C3 (ENSAMEG00000007161)	GPR108 (ENSAMEG00000007302)	TRIP10 (ENSAMEG00000007327)	SH2D3A (ENSAMEG00000007379)	VAV1 (ENSAMEG00000007416)	ADGRE1 (ENSAMEG00000003896)	ENSAMEG00000003987	ENSAMEG00000018992	ENSAMEG00000018965	ACTL9 (ENSAMEG00000018946)
Mustelinae	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000162442	ENSGT00940000158588	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A	ENSGT00940000164043	ENSGT00940000158800	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000163693	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000161972	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a.d	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354	ENSGT00940000162163	ENSGT00950000183005.b.c.b	ENSGT01090000260018.B.a.b	ENSGT00940000163012
American mink	MODERN SPECIES	175	RANBP3 (ENSNVIG00000014853)	RFX2 (ENSNVIG00000015069)	ACSBG2 (ENSNVIG00000015209)	ENSNVIG00000015289	MLLT1 (ENSNVIG00000015422)	ACER1 (ENSNVIG00000015426)	ENSNVIG00000015434	ALKBH7 (ENSNVIG00000015449)	ENSNVIG00000015472	PSPN (ENSNVIG00000015490)	GTF2F1 (ENSNVIG00000015498)	ENSNVIG00000015514	KHSRP (ENSNVIG00000015567)	SLC25A41 (ENSNVIG00000015722)	SLC25A23 (ENSNVIG00000015735)	CRB3 (ENSNVIG00000015751) ##22	DENND1C (ENSNVIG00000015781)	TUBB4A (ENSNVIG00000015845)	TNFSF9 (ENSNVIG00000015851)	CD70 (ENSNVIG00000015860)	TNFSF14 (ENSNVIG00000015869)	C3 (ENSNVIG00000015877)	GPR108 (ENSNVIG00000015936)	TRIP10 (ENSNVIG00000015973)	SH2D3A (ENSNVIG00000016062)	VAV1 (ENSNVIG00000016115)	ADGRE1 (ENSNVIG00000016424)	ENSNVIG00000016773	ENSNVIG00000016792	ENSNVIG00000016802	ENSNVIG00000016819
Ferret	MODERN SPECIES	326	VMAC (ENSMPUG00000006261)	CAPS (ENSMPUG00000006269)	ENSMPUG00000019705	RANBP3 (ENSMPUG00000006306)	RFX2 (ENSMPUG00000006329)	ACSBG2 (ENSMPUG00000006350)	ENSMPUG00000006513	MLLT1 (ENSMPUG00000006527)	ACER1 (ENSMPUG00000006546)	CLPP (ENSMPUG00000006553)	GTF2F1 (ENSMPUG00000006566)	ENSMPUG00000006584	KHSRP (ENSMPUG00000006615)	SLC25A41 (ENSMPUG00000006890)	SLC25A23 (ENSMPUG00000006918)	CRB3 (ENSMPUG00000006930) ##22	DENND1C (ENSMPUG00000006946)	TUBB4A (ENSMPUG00000006958)	TNFSF9 (ENSMPUG00000006964)	CD70 (ENSMPUG00000006973)	TNFSF14 (ENSMPUG00000006977)	C3 (ENSMPUG00000006984)	ENSMPUG00000019706	TRIP10 (ENSMPUG00000007008)	GPR108 (ENSMPUG00000007018)	SH2D3A (ENSMPUG00000007030)	VAV1 (ENSMPUG00000007069)	ADGRE1 (ENSMPUG00000007088)	ENSMPUG00000007102	ENSMPUG00000007161	OR2Z1 (ENSMPUG00000019707)
Laurasiatheria_c	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000162442	ENSGT00940000158588	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A	ENSGT00940000164043	ENSGT00940000158800	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000163693	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000161972	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354	ENSGT00940000162163	ENSGT00950000183069.b	ENSGT00940000155404	ENSGT00940000154146.b.b.b
Equus	ANCESTRAL SPECIES	34	ENSGT00390000007212	ENSGT00940000162442	ENSGT00940000158588	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A	ENSGT00940000164043	ENSGT00940000158800	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000163693	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000161972	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b.`c	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354	ENSGT00940000162163	ENSGT00950000183069.b.h	ENSGT00940000155404	ENSGT00940000154146.b.b.b
Horse	MODERN SPECIES	28	RANBP3 (ENSECAG00000024789)	RFX2 (ENSECAG00000020379)	ACSBG2 (ENSECAG00000017087)	ENSECAG00000047643	ENSECAG00000029780	MLLT1 (ENSECAG00000015555)	ACER1 (ENSECAG00000022733)	CLPP (ENSECAG00000023054)	ALKBH7 (ENSECAG00000023627)	PSPN (ENSECAG00000001763)	GTF2F1 (ENSECAG00000000246)	ENSECAG00000016799	KHSRP (ENSECAG00000018305)	SLC25A41 (ENSECAG00000018003)	SLC25A23 (ENSECAG00000020970)	CRB3 (ENSECAG00000010143) ##22	DENND1C (ENSECAG00000010964)	TUBB4A (ENSECAG00000037214)	TNFSF9 (ENSECAG00000022714)	ENSECAG00000058070	TNFSF14 (ENSECAG00000017522)	C3 (ENSECAG00000057145)	GPR108 (ENSECAG00000014466)	TRIP10 (ENSECAG00000017817)	SH2D3A (ENSECAG00000012075)	VAV1 (ENSECAG00000014896)	ADGRE1 (ENSECAG00000017237)	ENSECAG00000015885	ENSECAG00000036129	INSR (ENSECAG00000010127)	ENSECAG00000059814
Donkey	MODERN SPECIES	12	ENSEASG00005029851	VMAC (ENSEASG00005035944)	ENSEASG00005036092	RANBP3 (ENSEASG00005023100)	RFX2 (ENSEASG00005023101)	ACSBG2 (ENSEASG00005023104)	MLLT1 (ENSEASG00005023105)	ACER1 (ENSEASG00005023107)	CLPP (ENSEASG00005023108)	ALKBH7 (ENSEASG00005027385)	PSPN (ENSEASG00005023110)	GTF2F1 (ENSEASG00005023112)	ENSEASG00005028550	SLC25A41 (ENSEASG00005023116)	SLC25A23 (ENSEASG00005000075)	CRB3 (ENSEASG00005030191) ##22	DENND1C (ENSEASG00005000214)	TUBB4A (ENSEASG00005027092)	TNFSF9 (ENSEASG00005028605)	CD70 (ENSEASG00005000353)	TNFSF14 (ENSEASG00005025378)	ENSEASG00005038643	ENSEASG00005000728	GPR108 (ENSEASG00005011473)	TRIP10 (ENSEASG00005011533)	SH2D3A (ENSEASG00005011718)	VAV1 (ENSEASG00005011821)	ADGRE1 (ENSEASG00005013682)	ENSEASG00005013698	ENSEASG00005002163	INSR (ENSEASG00005013740)
Chiroptera	ANCESTRAL SPECIES	31	ENSGT00390000007212	ENSGT00940000162442	ENSGT00940000158588.w	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A	ENSGT00940000158800	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000163693	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000161972	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354	ENSGT00940000162163	ENSGT00940000164108.b	ENSGT00940000158404	ENSGT00940000158870
Megabat	MODERN SPECIES	480						MLLT1 (ENSPVAG00000007239)	ACER1 (ENSPVAG00000007242)	CLPP (ENSPVAG00000007243)	ALKBH7 (ENSPVAG00000007246)	PSPN (ENSPVAG00000007247)	GTF2F1 (ENSPVAG00000007249)	ENSPVAG00000007250	KHSRP (ENSPVAG00000007251)	ENSPVAG00000007252	SLC25A23 (ENSPVAG00000007253)	CRB3 (ENSPVAG00000007255) ##22	DENND1C (ENSPVAG00000007256)	TUBB4A (ENSPVAG00000007258)	TNFSF9 (ENSPVAG00000007259)
Microchiroptera	ANCESTRAL SPECIES	30	ENSGT00390000012434	ENSGT00390000007212	ENSGT00940000162442	ENSGT00940000158588.w	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A	ENSGT00940000158800	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000163693	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000161972	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354	ENSGT00940000162163	ENSGT00940000164108.b	ENSGT00940000158404	ENSGT00940000158870
Greater horseshoe bat	MODERN SPECIES	9	VMAC (ENSRFEG00010016520)	CAPS (ENSRFEG00010016476)	RANBP3 (ENSRFEG00010016304)	RFX2 (ENSRFEG00010016196)	ENSRFEG00010016123	ENSRFEG00010015957	MLLT1 (ENSRFEG00010015888)	ACER1 (ENSRFEG00010015824)	CLPP (ENSRFEG00010015771)	ALKBH7 (ENSRFEG00010015638)	PSPN (ENSRFEG00010015585)	GTF2F1 (ENSRFEG00010015531)	ENSRFEG00010015355	KHSRP (ENSRFEG00010015266)	SLC25A23 (ENSRFEG00010014934)	CRB3 (ENSRFEG00010014851) ##22	DENND1C (ENSRFEG00010014718)	TUBB4A (ENSRFEG00010014530)	TNFSF9 (ENSRFEG00010014511)	CD70 (ENSRFEG00010014470)	TNFSF14 (ENSRFEG00010014416)	C3 (ENSRFEG00010013799)	GPR108 (ENSRFEG00010013722)	TRIP10 (ENSRFEG00010013094)	SH2D3A (ENSRFEG00010012944)	VAV1 (ENSRFEG00010012766)	ADGRE1 (ENSRFEG00010011348)	ENSRFEG00010010435	ENSRFEG00010013846	ADAMTS10 (ENSRFEG00010013786)	MYO1F (ENSRFEG00010013682)
Microbat	MODERN SPECIES	1278	NRTN (ENSMLUG00000007178)	NDUFA11 (ENSMLUG00000027443)	VMAC (ENSMLUG00000014883)	CAPS (ENSMLUG00000014884)	ENSMLUG00000014888	RFX2 (ENSMLUG00000017439)	ACSBG2 (ENSMLUG00000014216)	MLLT1 (ENSMLUG00000014230)	ENSMLUG00000014237	CLPP (ENSMLUG00000007981)	PSPN (ENSMLUG00000015527)	GTF2F1 (ENSMLUG00000015530)	KHSRP (ENSMLUG00000015543)	SLC25A23 (ENSMLUG00000015572)	SLC25A41 (ENSMLUG00000015564)	CRB3 (ENSMLUG00000015582) ##22	DENND1C (ENSMLUG00000015589)	TUBB4A (ENSMLUG00000015607)	TNFSF9 (ENSMLUG00000011161)	ENSMLUG00000022835	CD70 (ENSMLUG00000007323)	TNFSF14 (ENSMLUG00000003450)	ENSMLUG00000027221	ENSMLUG00000025160	ENSMLUG00000007422
Artiodactyla	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00390000007212	ENSGT00940000162442	ENSGT00940000158588	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A	ENSGT00940000158800	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000163693	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000161972	ENSGT00940000164486	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354	ENSGT00940000162163	ENSGT00950000183005.b.c.b	ENSGT01090000260018.B.a.b
Suina	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00390000012434	ENSGT00390000007212	ENSGT00940000162442	ENSGT00940000158588	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A	ENSGT00940000158800	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000161972	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354	ENSGT00940000162163	ENSGT00950000183005.b.c.b	ENSGT00940000154431.f.e.b	ENSGT00940000155404
Chacoan peccary	MODERN SPECIES	770	NDUFA11 (ENSCWAG00000016483)	VMAC (ENSCWAG00000016538)	CAPS (ENSCWAG00000016575)	RANBP3 (ENSCWAG00000016644)	RFX2 (ENSCWAG00000016768)	ACSBG2 (ENSCWAG00000016992)	MLLT1 (ENSCWAG00000017206)	ACER1 (ENSCWAG00000017254)	CLPP (ENSCWAG00000017303)	ALKBH7 (ENSCWAG00000017346)	PSPN (ENSCWAG00000017389)	GTF2F1 (ENSCWAG00000017421)	KHSRP (ENSCWAG00000017455)	SLC25A41 (ENSCWAG00000007889)	SLC25A23 (ENSCWAG00000007971)	CRB3 (ENSCWAG00000008071) ##22	DENND1C (ENSCWAG00000008209)	TUBB4A (ENSCWAG00000008574)	TNFSF9 (ENSCWAG00000008641)	CD70 (ENSCWAG00000008679)	TNFSF14 (ENSCWAG00000008731)	C3 (ENSCWAG00000008783)	GPR108 (ENSCWAG00000009134)	TRIP10 (ENSCWAG00000009207)	SH2D3A (ENSCWAG00000009467)	VAV1 (ENSCWAG00000009741)	ADGRE1 (ENSCWAG00000010899)	ENSCWAG00000011207	ENSCWAG00000011348	ENSCWAG00000011389	INSR (ENSCWAG00000011448)
Pig	MODERN SPECIES	10	NDUFA11 (ENSSSCG00000027307)	VMAC (ENSSSCG00000031764)	CAPS (ENSSSCG00000013532)	RANBP3 (ENSSSCG00000013533)	RFX2 (ENSSSCG00000035403)	ACSBG2 (ENSSSCG00000013536)	MLLT1 (ENSSSCG00000013534)	ACER1 (ENSSSCG00000023969)	CLPP (ENSSSCG00000038079)	PSPN (ENSSSCG00000013540)	ALKBH7 (ENSSSCG00000024254)	GTF2F1 (ENSSSCG00000013539)	KHSRP (ENSSSCG00000013538)	SLC25A41 (ENSSSCG00000032785)	SLC25A23 (ENSSSCG00000013550)	CRB3 (ENSSSCG00000051897) ##22	DENND1C (ENSSSCG00000013546)	TUBB4A (ENSSSCG00000013545)	TNFSF9 (ENSSSCG00000022370)	CD70 (ENSSSCG00000031115)	ENSSSCG00000060067	ENSSSCG00000024275	TNFSF14 (ENSSSCG00000026695)	C3 (ENSSSCG00000013551)	GPR108 (ENSSSCG00000013552)	TRIP10 (ENSSSCG00000013554)	SH2D3A (ENSSSCG00000022380)	VAV1 (ENSSSCG00000013553)	ENSSSCG00000013556	ENSSSCG00000040016	ENSSSCG00000050577
Artiodactyla_a	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00390000007212	ENSGT00940000162442	ENSGT00940000158588	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A	ENSGT00940000158800	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000163693	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000161972	ENSGT00940000164486	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354	ENSGT00940000162163	ENSGT00950000183005.b.c.b	ENSGT01090000260018.B.a.b
Camelidae	ANCESTRAL SPECIES	61															ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000161972	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354	ENSGT00940000162163	ENSGT00940000154431.e.a.a.a	ENSGT00950000183005.b.c.b	ENSGT00940000155404	ENSGT00940000157375
Arabian camel	MODERN SPECIES	14	VMAC (ENSCDRG00005021959)	CAPS (ENSCDRG00005021958)	RANBP3 (ENSCDRG00005021957)	RFX2 (ENSCDRG00005021955)	ACSBG2 (ENSCDRG00005021953)	MLLT1 (ENSCDRG00005021952)	ACER1 (ENSCDRG00005021951)	CLPP (ENSCDRG00005021950)	ALKBH7 (ENSCDRG00005021949)	PSPN (ENSCDRG00005021948)	GTF2F1 (ENSCDRG00005021947)	ENSCDRG00005021946	KHSRP (ENSCDRG00005021945)	SLC25A41 (ENSCDRG00005021944)	SLC25A23 (ENSCDRG00005021943)	CRB3 (ENSCDRG00005021942) ##22	DENND1C (ENSCDRG00005021941)	TUBB4A (ENSCDRG00005021940)	CD70 (ENSCDRG00005021939)	TNFSF14 (ENSCDRG00005021938)	C3 (ENSCDRG00005018821)	GPR108 (ENSCDRG00005017978)	TRIP10 (ENSCDRG00005017930)	SH2D3A (ENSCDRG00005017906)	VAV1 (ENSCDRG00005017664)	ADGRE1 (ENSCDRG00005017351)	ENSCDRG00005017246	ENSCDRG00005017166	ENSCDRG00005017145	ENSCDRG00005017114	INSR (ENSCDRG00005016879)
Artiodactyla_b	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00390000007212	ENSGT00940000162442	ENSGT00940000158588	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A	ENSGT00940000158800	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000163693	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000161972	ENSGT00940000164486	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354	ENSGT00940000162163	ENSGT00950000183005.b.c.b	ENSGT00940000160844
Pecora	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000012434	ENSGT00390000007212	ENSGT00940000162442	ENSGT00940000158588	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A	ENSGT00940000158800	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000161972	ENSGT00940000164486	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354	ENSGT00940000162163	ENSGT00950000183005.b.c.b.ab	ENSGT00940000154431.e.a.a.a.b
Yarkand deer	MODERN SPECIES	32	NDUFA11 (ENSCHYG00000021871)	VMAC (ENSCHYG00000021843)	CAPS (ENSCHYG00000021783)	RANBP3 (ENSCHYG00000021150)	RFX2 (ENSCHYG00000020941)	ENSCHYG00000020848	ACSBG2 (ENSCHYG00000020499)	MLLT1 (ENSCHYG00000020253)	ACER1 (ENSCHYG00000020198)	CLPP (ENSCHYG00000020020)	ALKBH7 (ENSCHYG00000019961)	PSPN (ENSCHYG00000019928)	ENSCHYG00000019841	KHSRP (ENSCHYG00000017189)	SLC25A23 (ENSCHYG00000016841)	CRB3 (ENSCHYG00000016801) ##22	DENND1C (ENSCHYG00000016610)	TUBB4A (ENSCHYG00000016548)	ENSCHYG00000016483	ENSCHYG00000016453	CD70 (ENSCHYG00000016394)	TNFSF14 (ENSCHYG00000016323)	C3 (ENSCHYG00000015491)	GPR108 (ENSCHYG00000014861)	TRIP10 (ENSCHYG00000014436)	SH2D3A (ENSCHYG00000014306)	VAV1 (ENSCHYG00000013476)	ADGRE1 (ENSCHYG00000013389)	ENSCHYG00000013324	ENSCHYG00000013160	ENSCHYG00000012824
Percora_a	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000012434	ENSGT00390000007212	ENSGT00940000162442	ENSGT00940000158588	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A	ENSGT00940000158800	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000161972	ENSGT00940000164486	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354	ENSGT00940000162163	ENSGT00950000183005.b.c.b.ab	ENSGT00940000154431.e.a.a.a.b
Siberian musk deer	DUPLICATION
Siberian musk deer	MODERN SPECIES	355	ENSMMSG00000023443	IP6K3 (ENSMMSG00000023458)	LEMD2 (ENSMMSG00000023465)	MLN (ENSMMSG00000023475)	GRM4 (ENSMMSG00000023487)	HMGA1 (ENSMMSG00000023513)	SMIM29 (ENSMMSG00000023520)	NUDT3 (ENSMMSG00000023528)	RPS10 (ENSMMSG00000023536)	ENSMMSG00000023552	PACSIN1 (ENSMMSG00000023558)	SPDEF (ENSMMSG00000023570)	ENSMMSG00000023583	SNRPC (ENSMMSG00000023609)	BLTP3A (ENSMMSG00000023628)	ENSMMSG00000023647 ##22	TAF11 (ENSMMSG00000023653)	ANKS1A (ENSMMSG00000023673)	TCP11 (ENSMMSG00000023721)	SCUBE3 (ENSMMSG00000023749)	ZNF76 (ENSMMSG00000023755)	DEF6 (ENSMMSG00000023768)	PPARD (ENSMMSG00000023777)	FANCE (ENSMMSG00000004572)	ENSMMSG00000004639	TEAD3 (ENSMMSG00000004692)	TULP1 (ENSMMSG00000004824)	FKBP5 (ENSMMSG00000005251)	ARMC12 (ENSMMSG00000005327)	CLPSL2 (ENSMMSG00000005400)	CLPS (ENSMMSG00000005439)
Siberian musk deer	MODERN SPECIES	99	VMAC (ENSMMSG00000009134)	CAPS (ENSMMSG00000009082)	RANBP3 (ENSMMSG00000008928)	ENSMMSG00000008883	RFX2 (ENSMMSG00000008753)	ACSBG2 (ENSMMSG00000008549)	MLLT1 (ENSMMSG00000008480)	ACER1 (ENSMMSG00000008449)	CLPP (ENSMMSG00000008431)	ALKBH7 (ENSMMSG00000008382)	PSPN (ENSMMSG00000008350)	GTF2F1 (ENSMMSG00000008317)	KHSRP (ENSMMSG00000008232)	SLC25A41 (ENSMMSG00000008181)	SLC25A23 (ENSMMSG00000008146)	ENSMMSG00000008095 ##22	DENND1C (ENSMMSG00000007861)	TUBB4A (ENSMMSG00000007812)	ENSMMSG00000007773	TNFSF9 (ENSMMSG00000007760)	ENSMMSG00000007741	ENSMMSG00000007708	CD70 (ENSMMSG00000007672)	TNFSF14 (ENSMMSG00000007629)	C3 (ENSMMSG00000007580)	GPR108 (ENSMMSG00000007474)	TRIP10 (ENSMMSG00000007373)	SH2D3A (ENSMMSG00000007295)	VAV1 (ENSMMSG00000006975)	ENSMMSG00000006913	ADGRE1 (ENSMMSG00000006398)
Bovidae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000012434	ENSGT00390000007212	ENSGT00940000162442	ENSGT00940000158588	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A	ENSGT00940000158800	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000161972	ENSGT00940000164486	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354	ENSGT00940000162163	ENSGT00950000183005.b.c.b.ab	ENSGT00940000154431.e.a.a.a.b
Caprinae	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00390000012434	ENSGT00390000007212	ENSGT00940000162442	ENSGT00940000158588	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A	ENSGT00940000158800	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000161972	ENSGT00940000164486	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a.c	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a.d	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354	ENSGT00940000162163	ENSGT00940000154431.e.a.a.a.b
Rambouillet Sheep	MODERN SPECIES	21	VMAC (ENSOARG00020020817)	CAPS (ENSOARG00020020769)	RANBP3 (ENSOARG00020020564)	RFX2 (ENSOARG00020020257)	ACSBG2 (ENSOARG00020020054)	ENSOARG00020020028	MLLT1 (ENSOARG00020019921)	ACER1 (ENSOARG00020019869)	CLPP (ENSOARG00020019811)	ALKBH7 (ENSOARG00020019744)	PSPN (ENSOARG00020019711)	GTF2F1 (ENSOARG00020019647)	KHSRP (ENSOARG00020019494)	SLC25A41 (ENSOARG00020019425)	SLC25A23 (ENSOARG00020019333)	CRB3 (ENSOARG00020019269) ##22	DENND1C (ENSOARG00020019197)	TUBB4A (ENSOARG00020019161)	ENSOARG00020019106	ENSOARG00020019063	CD70 (ENSOARG00020019022)	ENSOARG00020018946	ENSOARG00020017608	ENSOARG00020016859	ENSOARG00020016803	C3 (ENSOARG00020016763)	GPR108 (ENSOARG00020016672)	TRIP10 (ENSOARG00020016180)	SH2D3A (ENSOARG00020016038)	VAV1 (ENSOARG00020015323)	ENSOARG00020015222
Goat	MODERN SPECIES	26	VMAC (ENSCHIG00000004574)	CAPS (ENSCHIG00000022459)	RANBP3 (ENSCHIG00000021064)	RFX2 (ENSCHIG00000023052)	ACSBG2 (ENSCHIG00000016276)	MLLT1 (ENSCHIG00000022842)	ENSCHIG00000016868	ACER1 (ENSCHIG00000008361)	CLPP (ENSCHIG00000023189)	ALKBH7 (ENSCHIG00000024761)	PSPN (ENSCHIG00000018638)	ENSCHIG00000011986	KHSRP (ENSCHIG00000027053)	SLC25A41 (ENSCHIG00000017363)	SLC25A23 (ENSCHIG00000008013)	CRB3 (ENSCHIG00000023021) ##22	DENND1C (ENSCHIG00000017569)	TUBB4A (ENSCHIG00000020195)	ENSCHIG00000004302	ENSCHIG00000026611	TNFSF14 (ENSCHIG00000020880)	C3 (ENSCHIG00000008320)	GPR108 (ENSCHIG00000009700)	TRIP10 (ENSCHIG00000022584)	SH2D3A (ENSCHIG00000025393)	VAV1 (ENSCHIG00000011155)	ADGRE1 (ENSCHIG00000021647)	ENSCHIG00000026329	ENSCHIG00000022235	ENSCHIG00000015838	ENSCHIG00000015823
Bovinae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000012434	ENSGT00390000007212	ENSGT00940000162442	ENSGT00940000158588	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A	ENSGT00940000158800	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT01100000263474.a.b.b.e.a.a.a.a.u.b.b	ENSGT00940000161972	ENSGT00940000164486	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354	ENSGT00940000162163	ENSGT00950000183005.b.c.b.ab
Bos	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00390000012434	ENSGT00390000007212	ENSGT00940000162442	ENSGT00940000158588	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A	ENSGT00940000158800	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT01100000263474.a.b.b.e.a.a.a.a.u.b.b	ENSGT00940000161972	ENSGT00940000164486	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354	ENSGT00940000162163	ENSGT00950000183005.b.c.b.ab
Bos_b	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000012434	ENSGT00390000007212	ENSGT00940000162442	ENSGT00940000158588	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A	ENSGT00940000158800	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT01100000263474.a.b.b.e.a.a.a.a.u.b.b	ENSGT00940000161972	ENSGT00940000164486	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354	ENSGT00940000162163	ENSGT00390000018316.b.b.h
Hybrid Bos Indicus	MODERN SPECIES	26	ENSBIXG00005001267	NDUFA11 (ENSBIXG00005012200)	ENSBIXG00005000272	RFX2 (ENSBIXG00005012097)	ENSBIXG00005011901	ACSBG2 (ENSBIXG00005001189)	MLLT1 (ENSBIXG00005001179)	ACER1 (ENSBIXG00005005477)	CLPP (ENSBIXG00005011763)	ALKBH7 (ENSBIXG00005011712)	PSPN (ENSBIXG00005011696)	GTF2F1 (ENSBIXG00005001151)	KHSRP (ENSBIXG00005011664)	SLC25A41 (ENSBIXG00005011565)	SLC25A23 (ENSBIXG00005011521)	CRB3 (ENSBIXG00005000466) ##22	DENND1C (ENSBIXG00005011411)	TUBB4A (ENSBIXG00005001091)	ENSBIXG00005011344	ENSBIXG00005001088	TNFSF9 (ENSBIXG00005001080)	CD70 (ENSBIXG00005011321)	TNFSF14 (ENSBIXG00005011303)	C3 (ENSBIXG00005001069)	GPR108 (ENSBIXG00005011263)	TRIP10 (ENSBIXG00005001055)	SH2D3A (ENSBIXG00005011216)	VAV1 (ENSBIXG00005001021)	ENSBIXG00005010956	ENSBIXG00005000932	ENSBIXG00005010532
Cow	MODERN SPECIES	26	VMAC (ENSBTAG00000006067)	CAPS (ENSBTAG00000006069)	RANBP3 (ENSBTAG00000006070)	RFX2 (ENSBTAG00000017661)	ACSBG2 (ENSBTAG00000009105)	ENSBTAG00000049278	MLLT1 (ENSBTAG00000002277)	ACER1 (ENSBTAG00000008095)	CLPP (ENSBTAG00000014712)	ALKBH7 (ENSBTAG00000025540)	PSPN (ENSBTAG00000031794)	GTF2F1 (ENSBTAG00000021016)	KHSRP (ENSBTAG00000021018)	SLC25A41 (ENSBTAG00000020017)	SLC25A23 (ENSBTAG00000003491)	CRB3 (ENSBTAG00000051530) ##22	DENND1C (ENSBTAG00000031809)	ENSBTAG00000051810	TUBB4A (ENSBTAG00000021013)	ENSBTAG00000054505	TNFSF9 (ENSBTAG00000046266)	CD70 (ENSBTAG00000009752)	TNFSF14 (ENSBTAG00000012223)	C3 (ENSBTAG00000017280)	GPR108 (ENSBTAG00000017291)	TRIP10 (ENSBTAG00000047424)	SH2D3A (ENSBTAG00000013857)	VAV1 (ENSBTAG00000039160)	ADGRE1 (ENSBTAG00000007901)	ENSBTAG00000038981	ENSBTAG00000049797
Bos_a	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000012434	ENSGT00390000007212	ENSGT00940000162442	ENSGT00940000158588	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A	ENSGT00940000158800	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT01100000263474.a.b.b.e.a.a.a.a.u.b.b	ENSGT00940000161972	ENSGT00940000164486	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354	ENSGT00940000162163	ENSGT00950000183005.b.c.b.ab
Domestic yak	MODERN SPECIES	27	CAPS (ENSBGRG00000001193)	RANBP3 (ENSBGRG00000000978)	ENSBGRG00000000938	RFX2 (ENSBGRG00000000923)	ACSBG2 (ENSBGRG00000000844)	ENSBGRG00000000819	MLLT1 (ENSBGRG00000000789)	ACER1 (ENSBGRG00000000765)	CLPP (ENSBGRG00000000753)	ALKBH7 (ENSBGRG00000000719)	PSPN (ENSBGRG00000000694)	GTF2F1 (ENSBGRG00000000661)	KHSRP (ENSBGRG00000000517)	SLC25A41 (ENSBGRG00000000480)	SLC25A23 (ENSBGRG00000000430)	CRB3 (ENSBGRG00000000409) ##22	DENND1C (ENSBGRG00000000393)	ENSBGRG00000000364	TUBB4A (ENSBGRG00000026030)	ENSBGRG00000026022	ENSBGRG00000026014	CD70 (ENSBGRG00000026005)	TNFSF14 (ENSBGRG00000025997)	C3 (ENSBGRG00000025983)	GPR108 (ENSBGRG00000025958)	TRIP10 (ENSBGRG00000025920)	SH2D3A (ENSBGRG00000025904)	VAV1 (ENSBGRG00000025777)	ADGRE1 (ENSBGRG00000025588)	ENSBGRG00000025483	ENSBGRG00000025464
Wild yak	MODERN SPECIES	1315								ACER1 (ENSBMUG00000026018)	CLPP (ENSBMUG00000026023)	ALKBH7 (ENSBMUG00000026025)	PSPN (ENSBMUG00000026028)	GTF2F1 (ENSBMUG00000026031)	KHSRP (ENSBMUG00000026034)	SLC25A41 (ENSBMUG00000026037)	SLC25A23 (ENSBMUG00000000133)	CRB3 (ENSBMUG00000000168) ##22	DENND1C (ENSBMUG00000000321)	TUBB4A (ENSBMUG00000000367)	ENSBMUG00000000375	ENSBMUG00000000397	ENSBMUG00000000418	CD70 (ENSBMUG00000000433)	TNFSF14 (ENSBMUG00000000453)
American bison	MODERN SPECIES	3349	NDUFA11 (ENSBBBG00000021309)	ENSBBBG00000021299	CAPS (ENSBBBG00000008402)	RANBP3 (ENSBBBG00000021259)	RFX2 (ENSBBBG00000007387)	ACSBG2 (ENSBBBG00000021028)	MLLT1 (ENSBBBG00000020959)	ENSBBBG00000005623	CLPP (ENSBBBG00000020882)	ENSBBBG00000008371	ALKBH7 (ENSBBBG00000020847)	GTF2F1 (ENSBBBG00000020826)	KHSRP (ENSBBBG00000008202)	SLC25A41 (ENSBBBG00000020681)	SLC25A23 (ENSBBBG00000020672)	CRB3 (ENSBBBG00000020657) ##22	DENND1C (ENSBBBG00000007187)	ENSBBBG00000020590	TUBB4A (ENSBBBG00000000506)	ENSBBBG00000007050	CD70 (ENSBBBG00000020534)	TNFSF14 (ENSBBBG00000007961)	C3 (ENSBBBG00000008781)	ENSBBBG00000005466	TRIP10 (ENSBBBG00000005456)	SH2D3A (ENSBBBG00000020159)	VAV1 (ENSBBBG00000020126)	ADGRE1 (ENSBBBG00000007466)	ENSBBBG00000019855	ENSBBBG00000019840	ENSBBBG00000019818
Cetacea	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000007212	ENSGT00940000162442	ENSGT00940000158588	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A	ENSGT00940000158800	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000163693	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000161972	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354	ENSGT00950000183005.b.c.b	ENSGT00940000160844.d	ENSGT00940000155404	ENSGT00940000157375
Blue whale	MODERN SPECIES	14	VMAC (ENSBMSG00010003235)	CAPS (ENSBMSG00010003225)	RANBP3 (ENSBMSG00010003161)	RFX2 (ENSBMSG00010003099)	ACSBG2 (ENSBMSG00010003047)	MLLT1 (ENSBMSG00010003015)	ACER1 (ENSBMSG00010002999)	CLPP (ENSBMSG00010002982)	ALKBH7 (ENSBMSG00010002973)	PSPN (ENSBMSG00010002965)	GTF2F1 (ENSBMSG00010002943)	ENSBMSG00010002906	KHSRP (ENSBMSG00010002829)	SLC25A41 (ENSBMSG00010002804)	SLC25A23 (ENSBMSG00010002792)	CRB3 (ENSBMSG00010002780) ##22	DENND1C (ENSBMSG00010002755)	TUBB4A (ENSBMSG00010002735)	TNFSF9 (ENSBMSG00010002721)	CD70 (ENSBMSG00010002710)	TNFSF14 (ENSBMSG00010002703)	C3 (ENSBMSG00010002651)	GPR108 (ENSBMSG00010002591)	TRIP10 (ENSBMSG00010002548)	SH2D3A (ENSBMSG00010002526)	VAV1 (ENSBMSG00010002016)	ADGRE1 (ENSBMSG00010001551)	ENSBMSG00010001459	INSR (ENSBMSG00010001431)	ARHGEF18 (ENSBMSG00010001356)	PEX11G (ENSBMSG00010001311)
Odontoceti	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000012434	ENSGT00390000007212	ENSGT00940000162442	ENSGT00940000158588	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A	ENSGT00940000158800	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000163693	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000161972	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354	ENSGT00950000183005.b.c.b	ENSGT00940000160844.d	ENSGT00940000155404	ENSGT00940000157375
Sperm whale	MODERN SPECIES	381															SLC25A23 (ENSPCTG00005010982)	CRB3 (ENSPCTG00005010902) ##22	DENND1C (ENSPCTG00005010606)	TUBB4A (ENSPCTG00005010551)
Odontoceti_a	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000012434	ENSGT00390000007212	ENSGT00940000162442	ENSGT00940000158588	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A	ENSGT00940000158800	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000163693	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000161972	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354	ENSGT00950000183005.b.c.b	ENSGT00940000160844.d	ENSGT00940000155404	ENSGT00940000157375
Dolphin	MODERN SPECIES	173															SLC25A23 (ENSTTRG00000007759)	CRB3 (ENSTTRG00000007785) ##22	DENND1C (ENSTTRG00000007794)	TUBB4A (ENSTTRG00000007829)
Odontoceti_b	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000012434	ENSGT00390000007212	ENSGT00940000162442	ENSGT00940000158588	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A	ENSGT00940000158800	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000163693	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000161972	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000157061.b	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354	ENSGT00950000183005.b.c.b	ENSGT00940000160844.d	ENSGT00940000155404
Vaquita	MODERN SPECIES	14	NRTN (ENSPSNG00000017905)	NDUFA11 (ENSPSNG00000017931)	VMAC (ENSPSNG00000017974)	CAPS (ENSPSNG00000018005)	RANBP3 (ENSPSNG00000018114)	RFX2 (ENSPSNG00000018253)	ACSBG2 (ENSPSNG00000018336)	MLLT1 (ENSPSNG00000018623)	ACER1 (ENSPSNG00000018752)	CLPP (ENSPSNG00000018810)	ALKBH7 (ENSPSNG00000018862)	GTF2F1 (ENSPSNG00000018932)	ENSPSNG00000019013	KHSRP (ENSPSNG00000019110)	SLC25A23 (ENSPSNG00000019375)	CRB3 (ENSPSNG00000019435) ##22	DENND1C (ENSPSNG00000019480)	TUBB4A (ENSPSNG00000005996)	ENSPSNG00000006095	ENSPSNG00000006109	TNFSF14 (ENSPSNG00000006140)	ENSPSNG00000006157	C3 (ENSPSNG00000006189)	GPR108 (ENSPSNG00000006373)	TRIP10 (ENSPSNG00000006457)	SH2D3A (ENSPSNG00000006525)	VAV1 (ENSPSNG00000006761)	ADGRE1 (ENSPSNG00000007315)	ENSPSNG00000007810	ENSPSNG00000007855	INSR (ENSPSNG00000007930)
Monodontidae	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00390000012434	ENSGT00390000007212	ENSGT00940000162442	ENSGT00940000158588	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A	ENSGT00940000158800	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000163693	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000161972	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000157061.b	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354	ENSGT00950000183005.b.c.b	ENSGT00940000160844.d	ENSGT00940000155404
Narwhal	MODERN SPECIES	298	NDUFA11 (ENSMMNG00015004575)	VMAC (ENSMMNG00015004582)	CAPS (ENSMMNG00015004589)	RANBP3 (ENSMMNG00015004623)	RFX2 (ENSMMNG00015004665)	ACSBG2 (ENSMMNG00015004690)	MLLT1 (ENSMMNG00015015635)	ACER1 (ENSMMNG00015015665)	CLPP (ENSMMNG00015015685)	ALKBH7 (ENSMMNG00015015715)	PSPN (ENSMMNG00015015733)	GTF2F1 (ENSMMNG00015015754)	ENSMMNG00015015791	KHSRP (ENSMMNG00015015884)	SLC25A23 (ENSMMNG00015016105)	CRB3 (ENSMMNG00015016166) ##22	DENND1C (ENSMMNG00015016214)	TUBB4A (ENSMMNG00015016340)	TNFSF9 (ENSMMNG00015016367)	CD70 (ENSMMNG00015016394)	TNFSF14 (ENSMMNG00015016417)	ENSMMNG00015016434	C3 (ENSMMNG00015016478)	GPR108 (ENSMMNG00015016574)	TRIP10 (ENSMMNG00015016642)	SH2D3A (ENSMMNG00015016722)	VAV1 (ENSMMNG00015016847)	ADGRE1 (ENSMMNG00015017131)	ENSMMNG00015017521	ENSMMNG00015017548	INSR (ENSMMNG00015017616)
Beluga whale	MODERN SPECIES	62	NDUFA11 (ENSDLEG00000014563)	VMAC (ENSDLEG00000014555)	CAPS (ENSDLEG00000014540)	RANBP3 (ENSDLEG00000014487)	RFX2 (ENSDLEG00000014418)	ACSBG2 (ENSDLEG00000014214)	MLLT1 (ENSDLEG00000014165)	ACER1 (ENSDLEG00000014123)	CLPP (ENSDLEG00000014104)	ALKBH7 (ENSDLEG00000014092)	PSPN (ENSDLEG00000014081)	GTF2F1 (ENSDLEG00000014057)	ENSDLEG00000014038	KHSRP (ENSDLEG00000013980)	SLC25A23 (ENSDLEG00000013960)	CRB3 (ENSDLEG00000013951) ##22	ENSDLEG00000013892	ENSDLEG00000013828	TUBB4A (ENSDLEG00000013810)	ENSDLEG00000013807	ENSDLEG00000013797	CD70 (ENSDLEG00000013745)	TNFSF14 (ENSDLEG00000013733)	C3 (ENSDLEG00000013524)	GPR108 (ENSDLEG00000013487)	TRIP10 (ENSDLEG00000013465)	SH2D3A (ENSDLEG00000013440)	ENSDLEG00000017772	ADGRE1 (ENSDLEG00000017725)	ENSDLEG00000017698	ENSDLEG00000017691
Euarchontoglires	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000162442	ENSGT00940000158588	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A	ENSGT00940000164043	ENSGT00940000158800	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000163693	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000161972	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354	ENSGT00940000162163	ENSGT00950000183005.b.c.b	ENSGT00940000160844.b	ENSGT00940000155404
Euarchontoglires_A	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00940000162442	ENSGT00940000158588	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A	ENSGT00940000164043	ENSGT00940000158800	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000163693	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000161972	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125
Tree shrew	MODERN SPECIES	1117															ENSTBEG00000004307	CRB3 (ENSTBEG00000005390) ##22	DENND1C (ENSTBEG00000005629)	TNFSF9 (ENSTBEG00000007243)
Glires	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00940000162442	ENSGT00940000158588	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A	ENSGT00940000164043	ENSGT00940000158800	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000163693	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000161972	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125
Lagomorpha	ANCESTRAL SPECIES	291															ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000161972	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000160446
Pika	MODERN SPECIES	849															SLC25A23 (ENSOPRG00000017127)	CRB3 (ENSOPRG00000017136) ##22	DENND1C (ENSOPRG00000017139)	TUBB4A (ENSOPRG00000017153)
Rodentia	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000162442	ENSGT00940000158588	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A	ENSGT00940000164043	ENSGT00940000158800	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000163693	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000161972	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354	ENSGT00940000162163	ENSGT00950000183069.b.b.a.a	ENSGT00940000154431.f	ENSGT00940000155404
Rodentia_A	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000162442	ENSGT00940000158588	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A	ENSGT00940000164043	ENSGT00940000158800	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000163693	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000161972	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354	ENSGT00940000162163	ENSGT00950000183069.b.b.a.a	ENSGT00950000182788.a.b.b.b.e	ENSGT00940000155404
Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00940000162442	ENSGT00940000158588	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A	ENSGT00940000164043	ENSGT00940000158800	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000163693	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000161972	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354	ENSGT00940000162163	ENSGT00950000183069.b.b.a.a.b	ENSGT00950000183069.b.a.b	ENSGT00950000183069.b.b.a.a.a
Marmotini	DUPLICATION
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00940000162442	ENSGT00940000158588	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A	ENSGT00940000164043	ENSGT00940000158800	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000163693	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a.e ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000161972	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354	ENSGT00940000162163	ENSGT00950000183069.b.b.a.a.b	ENSGT00950000183069.b.a.b	ENSGT00950000183069.b.b.a.a.a	ENSGT00940000155404
Alpin marmot	MODERN SPECIES	88	CAPS (ENSMMMG00000019062)	RANBP3 (ENSMMMG00000019085)	ENSMMMG00000019101	RFX2 (ENSMMMG00000019107)	ACSBG2 (ENSMMMG00000019139)	ENSMMMG00000019196	MLLT1 (ENSMMMG00000019206)	ACER1 (ENSMMMG00000019214)	CLPP (ENSMMMG00000019216)	ALKBH7 (ENSMMMG00000019225)	PSPN (ENSMMMG00000019228)	ENSMMMG00000019249	KHSRP (ENSMMMG00000019257)	SLC25A41 (ENSMMMG00000019493)	SLC25A23 (ENSMMMG00000019504)	ENSMMMG00000019517 ##22	DENND1C (ENSMMMG00000019533)	TUBB4A (ENSMMMG00000019550)	TNFSF9 (ENSMMMG00000019570)	CD70 (ENSMMMG00000019578)	TNFSF14 (ENSMMMG00000019585)	GPR108 (ENSMMMG00000019821)	TRIP10 (ENSMMMG00000019830)	SH2D3A (ENSMMMG00000019845)	VAV1 (ENSMMMG00000019856)	ADGRE1 (ENSMMMG00000019994)	ENSMMMG00000020088	ENSMMMG00000020108	ENSMMMG00000020241	ENSMMMG00000020280	ENSMMMG00000020284
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000162442	ENSGT00940000158588	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A	ENSGT00940000164043	ENSGT00940000158800	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000163693	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a.e ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000161972	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744	ENSGT00390000014595.b.d	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354	ENSGT00940000162163	ENSGT00950000183069.b.b.a.a.b	ENSGT00950000183069.b.b.a.a.a	ENSGT00940000155404
Squirrel	MODERN SPECIES	188	ENSSTOG00000034262	RFX2 (ENSSTOG00000027723)	ENSSTOG00000007511	ENSSTOG00000019704	MLLT1 (ENSSTOG00000002340)	ENSSTOG00000022476	ACER1 (ENSSTOG00000002348)	CLPP (ENSSTOG00000028013)	ALKBH7 (ENSSTOG00000002368)	PSPN (ENSSTOG00000023397)	GTF2F1 (ENSSTOG00000025689)	ENSSTOG00000032166	KHSRP (ENSSTOG00000002371)	SLC25A41 (ENSSTOG00000023022)	SLC25A23 (ENSSTOG00000002387)	CRB3 (ENSSTOG00000029565) ##22	ENSSTOG00000002404	ENSSTOG00000032756	TUBB4A (ENSSTOG00000020465)	CD70 (ENSSTOG00000027620)	ENSSTOG00000029829	TNFSF14 (ENSSTOG00000021016)	ENSSTOG00000032813	GPR108 (ENSSTOG00000028930)	TRIP10 (ENSSTOG00000004959)	VAV1 (ENSSTOG00000010806)	ADGRE1 (ENSSTOG00000014756)	ENSSTOG00000028099	INSR (ENSSTOG00000001089)	ENSSTOG00000033747	ARHGEF18 (ENSSTOG00000009745)
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	301	CAPS (ENSUPAG00010023646)	RANBP3 (ENSUPAG00010023645)	RFX2 (ENSUPAG00010023647)	ACSBG2 (ENSUPAG00010023648)	ENSUPAG00010023649	MLLT1 (ENSUPAG00010023650)	ACER1 (ENSUPAG00010023651)	CLPP (ENSUPAG00010023652)	ALKBH7 (ENSUPAG00010023653)	PSPN (ENSUPAG00010023654)	GTF2F1 (ENSUPAG00010023655)	ENSUPAG00010023656	KHSRP (ENSUPAG00010023657)	SLC25A41 (ENSUPAG00010023658)	SLC25A23 (ENSUPAG00010023660)	ENSUPAG00010023661 ##22	DENND1C (ENSUPAG00010023662)	TUBB4A (ENSUPAG00010023665)	ENSUPAG00010023667	CD70 (ENSUPAG00010023668)	ENSUPAG00010023669	TNFSF14 (ENSUPAG00010023671)
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	92										ENSGT00940000155487	ENSGT00940000160425	ENSGT00390000001134.a.a	ENSGT00390000005954	ENSGT00390000013790	ENSGT00530000063106.C	ENSGT00950000183101.a.b.a.f ##22	ENSGT00390000015293	ENSGT00940000156711	ENSGT00940000158108	ENSGT00940000158486	ENSGT00390000018369	ENSGT00940000154925.d	ENSGT00950000183159.b	ENSGT00940000161074.a	ENSGT00390000015700.a	ENSGT00390000010065	ENSGT00940000159395	ENSGT00940000155756	ENSGT00530000063872.B	ENSGT00390000017860.a.b	ENSGT01100000263512.a.a.a.b
Alpin marmot	MODERN SPECIES	56	ENSMMMG00000017308	ENSMMMG00000017305	ENSMMMG00000017294	ENSMMMG00000017288	ENSMMMG00000017167	ENSMMMG00000017160	KLHL1 (ENSMMMG00000017142)	ENSMMMG00000017136	ENSMMMG00000017125	ENSMMMG00000017121	ENSMMMG00000017118	ENSMMMG00000017117	ENSMMMG00000017107	BORA (ENSMMMG00000017098)	DIS3 (ENSMMMG00000017087)	ENSMMMG00000017084 ##22	ENSMMMG00000017083	PIBF1 (ENSMMMG00000017073)	KLF5 (ENSMMMG00000017067)	KLF12 (ENSMMMG00000017051)	TBC1D4 (ENSMMMG00000017007)	ENSMMMG00000016998	COMMD6 (ENSMMMG00000016993)	UCHL3 (ENSMMMG00000016982)	LMO7 (ENSMMMG00000016928)	KCTD12 (ENSMMMG00000016922)	ACOD1 (ENSMMMG00000016910)	CLN5 (ENSMMMG00000016897)	FBXL3 (ENSMMMG00000016891)	MYCBP2 (ENSMMMG00000016377)	SGCG (ENSMMMG00000016342)
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	159									ENSGT00940000155487	ENSGT00940000160425	ENSGT00390000001134.a.a	ENSGT00900000143737	ENSGT00390000005954	ENSGT00390000013790	ENSGT00530000063106.C	ENSGT00950000183101.a.b.a.f ##22	ENSGT01020000230346.C.d.h	ENSGT00390000015293	ENSGT00940000156711	ENSGT00940000158108	ENSGT00940000158486	ENSGT00390000018369	ENSGT00940000154925.d	ENSGT00950000183159.b	ENSGT00940000161074.a	ENSGT00390000015700.a	ENSGT00390000010065	ENSGT00940000159395	ENSGT00940000155756	ENSGT00530000063872.B	ENSGT00390000017860.a.b
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	194												ENSUPAG00010012287	MZT1 (ENSUPAG00010012268)	BORA (ENSUPAG00010012241)	DIS3 (ENSUPAG00010012220)	ENSUPAG00010012209 ##22	ENSUPAG00010012207	PIBF1 (ENSUPAG00010012194)	KLF5 (ENSUPAG00010012182)	KLF12 (ENSUPAG00010012164)	TBC1D4 (ENSUPAG00010012131)
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	7	CAPS (ENSSVLG00005022099)	RANBP3 (ENSSVLG00005022208)	RFX2 (ENSSVLG00005022368)	ACSBG2 (ENSSVLG00005022613)	ENSSVLG00005022830	MLLT1 (ENSSVLG00005023111)	ACER1 (ENSSVLG00005023163)	CLPP (ENSSVLG00005023216)	ALKBH7 (ENSSVLG00005023240)	PSPN (ENSSVLG00005023279)	GTF2F1 (ENSSVLG00005023301)	ENSSVLG00005023383	KHSRP (ENSSVLG00005023444)	SLC25A41 (ENSSVLG00005023479)	SLC25A23 (ENSSVLG00005023541)	CRB3 (ENSSVLG00005023581) ##22	DENND1C (ENSSVLG00005023643)	TUBB4A (ENSSVLG00005023819)	TNFSF9 (ENSSVLG00005023843)	CD70 (ENSSVLG00005023872)	TNFSF14 (ENSSVLG00005023899)	C3 (ENSSVLG00005023985)	GPR108 (ENSSVLG00005024305)	TRIP10 (ENSSVLG00005024340)	SH2D3A (ENSSVLG00005024392)	VAV1 (ENSSVLG00005024496)	ADGRE1 (ENSSVLG00005024961)	ENSSVLG00005025028	ENSSVLG00005025094	ENSSVLG00005025148	ENSSVLG00005025293
Hystricomorpha	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000162442	ENSGT00940000158588	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A	ENSGT00940000164043	ENSGT00940000158800.b	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000163693	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000161972	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000162163	ENSGT00950000182755.b.a.a.a.a.a.a.b	ENSGT00390000016735	ENSGT00390000000053	ENSGT00940000159680	ENSGT00390000005147
Naked mole-rat female	MODERN SPECIES	21	ENSHGLG00000015081	ENSHGLG00000016971	ENSHGLG00000033621	ENSHGLG00000049858	ENSHGLG00000041157	ENSHGLG00000045808	ENSHGLG00000045280	ENSHGLG00000005716	ENSHGLG00000007120	ENSHGLG00000048812	ENSHGLG00000010702	ALKBH7 (ENSHGLG00000018436)	PSPN (ENSHGLG00000018421)	KHSRP (ENSHGLG00000013239)	SLC25A23 (ENSHGLG00000007588)	ENSHGLG00000048231 ##22	DENND1C (ENSHGLG00000038310)	TUBB4A (ENSHGLG00000038896)	ENSHGLG00000039660	ENSHGLG00000017930	ENSHGLG00000036699	ENSHGLG00000008762	ENSHGLG00000041462	CD70 (ENSHGLG00000013155)	ENSHGLG00000021141	TNFSF14 (ENSHGLG00000041682)	GPR108 (ENSHGLG00000010354)	TRIP10 (ENSHGLG00000006018)	SH2D3A (ENSHGLG00000030969)	ENSHGLG00000007716	ENSHGLG00000011025
Hystricomorpha_a	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000162442	ENSGT00940000158588	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A	ENSGT00940000164043	ENSGT00940000158800.b	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000163693	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000161972	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000162163	ENSGT00950000182755.b.a.a.a.a.a.a.b	ENSGT00390000016735	ENSGT00390000000053	ENSGT00940000159680	ENSGT00390000005147
Guinea pig	MODERN SPECIES	229	VMAC (ENSCPOG00000014675)	CAPS (ENSCPOG00000026058)	RANBP3 (ENSCPOG00000021646)	RFX2 (ENSCPOG00000024260)	ENSCPOG00000014317	ENSCPOG00000025754	MLLT1 (ENSCPOG00000001260)	ACER1 (ENSCPOG00000021961)	CLPP (ENSCPOG00000013954)	ALKBH7 (ENSCPOG00000013958)	PSPN (ENSCPOG00000038963)	GTF2F1 (ENSCPOG00000012632)	KHSRP (ENSCPOG00000005140)	SLC25A41 (ENSCPOG00000029988)	SLC25A23 (ENSCPOG00000011096)	CRB3 (ENSCPOG00000024888) ##22	DENND1C (ENSCPOG00000003232)	TUBB4A (ENSCPOG00000003237)	ENSCPOG00000022803
Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000162442	ENSGT00940000158588	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A	ENSGT00940000164043	ENSGT00940000158800.b	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000163693	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000161972	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000162163	ENSGT00950000182755.b.a.a.a.a.a.a.b	ENSGT00390000016735	ENSGT00390000000053	ENSGT00940000159680	ENSGT00390000005147
Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	202	CAPS (ENSCLAG00000013758)	RANBP3 (ENSCLAG00000011775)	RFX2 (ENSCLAG00000008242)	ACSBG2 (ENSCLAG00000007301)	ENSCLAG00000006362	MLLT1 (ENSCLAG00000011833)	ACER1 (ENSCLAG00000011663)	CLPP (ENSCLAG00000009974)	ALKBH7 (ENSCLAG00000017244)	PSPN (ENSCLAG00000016653)	GTF2F1 (ENSCLAG00000008779)	ENSCLAG00000007910	KHSRP (ENSCLAG00000007309)	SLC25A41 (ENSCLAG00000006414)	SLC25A23 (ENSCLAG00000015826)	ENSCLAG00000014016 ##22	DENND1C (ENSCLAG00000012303)	TUBB4A (ENSCLAG00000008831)	ENSCLAG00000009403	ENSCLAG00000009197	TNFSF14 (ENSCLAG00000008813)	C3 (ENSCLAG00000008464)	GPR108 (ENSCLAG00000012060)	TRIP10 (ENSCLAG00000009696)	SH2D3A (ENSCLAG00000009886)	VAV1 (ENSCLAG00000008423)	ENSCLAG00000011723	ZNF709 (ENSCLAG00000014910)	ACP5 (ENSCLAG00000013793)	ELOF1 (ENSCLAG00000013181)	CNN1 (ENSCLAG00000013547)
Degu	MODERN SPECIES	91	CAPS (ENSODEG00000016529)	RANBP3 (ENSODEG00000015257)	RFX2 (ENSODEG00000015368)	ENSODEG00000015714	ENSODEG00000015920	MLLT1 (ENSODEG00000014883)	ACER1 (ENSODEG00000015726)	CLPP (ENSODEG00000015485)	ALKBH7 (ENSODEG00000015141)	PSPN (ENSODEG00000014761)	GTF2F1 (ENSODEG00000014900)	ENSODEG00000015969	KHSRP (ENSODEG00000015021)	SLC25A41 (ENSODEG00000015990)	SLC25A23 (ENSODEG00000014916)	CRB3 (ENSODEG00000015295) ##22	ENSODEG00000015746	TUBB4A (ENSODEG00000015772)	ENSODEG00000015175	ENSODEG00000020289	TNFSF14 (ENSODEG00000015436)	C3 (ENSODEG00000015506)	GPR108 (ENSODEG00000016288)	TRIP10 (ENSODEG00000015929)	VAV1 (ENSODEG00000015478)	ENSODEG00000020296	ENSODEG00000015977	ENSODEG00000020329	ACP5 (ENSODEG00000015797)	ENSODEG00000015688	CNN1 (ENSODEG00000016009)
Rodentia_B	ANCESTRAL SPECIES	28	ENSGT00940000162442	ENSGT00940000158588	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A	ENSGT00940000164043	ENSGT00940000158800	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000163693	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000161972	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354	ENSGT00940000162163	ENSGT00950000183069.b.b.a.b	ENSGT00940000163012	ENSGT00940000164108.b
Kangaroo rat	MODERN SPECIES	383	Vmac (ENSDORG00000029939)	ENSDORG00000003143	Ranbp3 (ENSDORG00000003144)	Rfx2 (ENSDORG00000008083)	Acsbg2 (ENSDORG00000024853)	Acsbg3 (ENSDORG00000026047)	Mllt1 (ENSDORG00000006056)	Acer1 (ENSDORG00000013614)	Clpp (ENSDORG00000002435)	Alkbh7 (ENSDORG00000002441)	Pspn (ENSDORG00000002443)	Gtf2f1 (ENSDORG00000002445)	Gm17949 (ENSDORG00000002446)	Khsrp (ENSDORG00000002447)	Slc25a41 (ENSDORG00000002448)	Crb3 (ENSDORG00000002452) ##22	ENSDORG00000029765	Tubb4a (ENSDORG00000030020)	Tnfsf14 (ENSDORG00000028843)	C3 (ENSDORG00000009909)	Gpr108 (ENSDORG00000009208)	Trip10 (ENSDORG00000009210)	Vav1 (ENSDORG00000014409)	Plpp2 (ENSDORG00000028750)	Mier2 (ENSDORG00000008994)	ENSDORG00000028256	C2cd4c (ENSDORG00000012207)	Shc2 (ENSDORG00000001524)	Odf3l2 (ENSDORG00000029131)	Madcam1 (ENSDORG00000027477)	Tpgs1 (ENSDORG00000002913)
Myomorpha	ANCESTRAL SPECIES	27	ENSGT00550000075134	ENSGT00390000016128	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A	ENSGT00940000164043	ENSGT00940000158800	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000163693	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000161972	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354	ENSGT00940000162163	ENSGT00950000183069.b.b.a.b.c.a.b.b	ENSGT00940000163012	ENSGT00940000164108.b
Lesser Egyptian jerboa	MODERN SPECIES	55	Dus3l (ENSJJAG00000023742)	Prr22 (ENSJJAG00000020858)	Rfx2 (ENSJJAG00000009362)	Acsbg2 (ENSJJAG00000022623)	Acsbg3 (ENSJJAG00000021099)	Mllt1 (ENSJJAG00000017227)	Acer1 (ENSJJAG00000018285)	ENSJJAG00000019233	Alkbh7 (ENSJJAG00000023908)	Pspn (ENSJJAG00000023140)	Gtf2f1 (ENSJJAG00000016614)	Gm17949 (ENSJJAG00000017204)	Khsrp (ENSJJAG00000006370)	Slc25a41 (ENSJJAG00000009731)	Slc25a23 (ENSJJAG00000018390)	Crb3 (ENSJJAG00000017361) ##22	ENSJJAG00000023239	Tubb4a (ENSJJAG00000001103)	Cd70 (ENSJJAG00000019950)	Tnfsf14 (ENSJJAG00000004377)	C3 (ENSJJAG00000024349)	Gpr108 (ENSJJAG00000023696)	Trip10 (ENSJJAG00000011683)	Vav1 (ENSJJAG00000023634)
Muroidea	ANCESTRAL SPECIES	32	ENSGT00550000075134	ENSGT00390000016128	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A	ENSGT00940000164043	ENSGT00940000158800	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000163693	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000161972	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354	ENSGT00940000162163	ENSGT00950000183069.b.b.a.b.c.a.b.b	ENSGT00940000163012.g	ENSGT00940000164108.b
Muroidea_A	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00550000075134	ENSGT00390000016128	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A	ENSGT00940000164043	ENSGT00940000158800	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000163693	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000161972	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354	ENSGT00940000162163	ENSGT00390000018285.b	ENSGT00950000183069.b.b.a.b.c.a.b.b	ENSGT00940000163012.g
Cricetidae	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00550000075134	ENSGT00390000016128	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A	ENSGT00940000164043	ENSGT00940000158800	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000163693	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000161972	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354	ENSGT00940000162163	ENSGT00390000018285.b	ENSGT00950000183069.b.b.a.b.c.a.b.b	ENSGT00940000163012.g
Cricetinae	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00550000075134	ENSGT00390000016128	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A	ENSGT00940000164043	ENSGT00940000158800	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000163693	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000161972	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354	ENSGT00940000162163	ENSGT00390000018285.b	ENSGT00950000183069.b.b.a.b.c.a.b.b	ENSGT00940000163012.g	ENSGT00940000158404
Chinese hamster chok1gshd	MODERN SPECIES	2	Dus3l (ENSCGRG00001023361)	Prr22 (ENSCGRG00001022202)	Rfx2 (ENSCGRG00001008783)	Acsbg2 (ENSCGRG00001001208)	Acsbg3 (ENSCGRG00001021403)	Mllt1 (ENSCGRG00001018607)	Acer1 (ENSCGRG00001016857)	Clpp (ENSCGRG00001019808)	Alkbh7 (ENSCGRG00001019380)	Pspn (ENSCGRG00001017826)	Gtf2f1 (ENSCGRG00001006209)	Gm17949 (ENSCGRG00001006952)	Khsrp (ENSCGRG00001011031)	Slc25a41 (ENSCGRG00001000917)	Slc25a23 (ENSCGRG00001023449)	Crb3 (ENSCGRG00001021736) ##22	Dennd1c (ENSCGRG00001020022)	Tubb4a (ENSCGRG00001001011)	ENSCGRG00001022936	Cd70 (ENSCGRG00001022682)	Tnfsf14 (ENSCGRG00001017618)	C3 (ENSCGRG00001005133)	Gpr108 (ENSCGRG00001020593)	Trip10 (ENSCGRG00001018563)	Vav1 (ENSCGRG00001017169)	Adgre1 (ENSCGRG00001013011)	Adgre4 (ENSCGRG00001002286)	Pot1b (ENSCGRG00001024775)	ENSCGRG00001015185	Actl9 (ENSCGRG00001008637)	Adamts10 (ENSCGRG00001018715)
Golden Hamster	MODERN SPECIES	730	Dus3l (ENSMAUG00000008347)	Prr22 (ENSMAUG00000003201)	Rfx2 (ENSMAUG00000018587)	Acsbg2 (ENSMAUG00000017399)	Acsbg3 (ENSMAUG00000014035)	Mllt1 (ENSMAUG00000011374)	Acer1 (ENSMAUG00000012781)	Clpp (ENSMAUG00000021469)	Alkbh7 (ENSMAUG00000000800)	Pspn (ENSMAUG00000019121)	ENSMAUG00000015346	Gm17949 (ENSMAUG00000018260)	Khsrp (ENSMAUG00000018966)	Slc25a41 (ENSMAUG00000014724)	ENSMAUG00000000871	Crb3 (ENSMAUG00000019988) ##22	Dennd1c (ENSMAUG00000006409)	Tubb4a (ENSMAUG00000017901)	ENSMAUG00000021205	Cd70 (ENSMAUG00000019101)	ENSMAUG00000015229	Tnfsf14 (ENSMAUG00000020967)	C3 (ENSMAUG00000013599)	ENSMAUG00000020000	Trip10 (ENSMAUG00000005828)	Vav1 (ENSMAUG00000021145)	Adgre1 (ENSMAUG00000000651)	ENSMAUG00000007845	Adgre4 (ENSMAUG00000008688)	Pot1b (ENSMAUG00000020767)	ENSMAUG00000017172
Cricetidae_B	ANCESTRAL SPECIES	27	ENSGT00550000075134	ENSGT00390000016128	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A	ENSGT00940000164043	ENSGT00940000158800	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000163693	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000161972	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354
Prairie vole	MODERN SPECIES	181	Dus3l (ENSMOCG00000021796)	Prr22 (ENSMOCG00000007432)	Rfx2 (ENSMOCG00000012338)	Acsbg2 (ENSMOCG00000000050)	Acsbg3 (ENSMOCG00000008516)	Mllt1 (ENSMOCG00000020318)	Acer1 (ENSMOCG00000002295)	Clpp (ENSMOCG00000015784)	Alkbh7 (ENSMOCG00000004923)	Pspn (ENSMOCG00000014015)	Gtf2f1 (ENSMOCG00000000296)	Gm17949 (ENSMOCG00000016801)	Khsrp (ENSMOCG00000018305)	Slc25a41 (ENSMOCG00000013299)	Slc25a23 (ENSMOCG00000014701)	Crb3 (ENSMOCG00000000421) ##22	ENSMOCG00000001187	Tubb4a (ENSMOCG00000015551)	Tnfsf9 (ENSMOCG00000018705)	Cd70 (ENSMOCG00000021343)	Tnfsf14 (ENSMOCG00000016341)	C3 (ENSMOCG00000008114)	ENSMOCG00000018962	Trip10 (ENSMOCG00000013943)	Vav1 (ENSMOCG00000021139)
Northern American deer mouse	MODERN SPECIES	14	Dus3l (ENSPEMG00000020784)	Prr22 (ENSPEMG00000014824)	Rfx2 (ENSPEMG00000021291)	Acsbg2 (ENSPEMG00000014725)	Acsbg3 (ENSPEMG00000022840)	Mllt1 (ENSPEMG00000020708)	Acer1 (ENSPEMG00000021242)	Clpp (ENSPEMG00000009546)	Alkbh7 (ENSPEMG00000016536)	Pspn (ENSPEMG00000008246)	Gtf2f1 (ENSPEMG00000011236)	Gm17949 (ENSPEMG00000026776)	Khsrp (ENSPEMG00000022853)	Slc25a41 (ENSPEMG00000020675)	Slc25a23 (ENSPEMG00000021021)	Crb3 (ENSPEMG00000021919) ##22	Dennd1c (ENSPEMG00000023860)	Tubb4a (ENSPEMG00000028633)	Tnfsf9 (ENSPEMG00000020989)	Cd70 (ENSPEMG00000015587)	ENSPEMG00000011159	ENSPEMG00000015087	Tnfsf14 (ENSPEMG00000000292)	ENSPEMG00000001526	Gpr108 (ENSPEMG00000030315)	Trip10 (ENSPEMG00000017394)	ENSPEMG00000031058	Vav1 (ENSPEMG00000015943)	Adgre1 (ENSPEMG00000013357)	ENSPEMG00000008525	ENSPEMG00000028855
Murinae	ANCESTRAL SPECIES	38	ENSGT00550000075134	ENSGT00390000016128	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A	ENSGT00940000164043	ENSGT00940000158800	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000163693	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000161972	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354
Mus	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00550000075134	ENSGT00390000016128	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A	ENSGT00940000164043	ENSGT00940000158800	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000163693	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000161972	ENSGT01100000266942	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354	ENSGT00940000164023.c.a	ENSGT00530000064469	ENSGT00940000157592	ENSGT00940000157299
Mus_A	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00550000075134	ENSGT00390000016128	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A	ENSGT00940000164043	ENSGT00940000158800	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000163693	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000161972	ENSGT01100000266942	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354	ENSGT00960000186717.a.b	ENSGT00940000164023.c.a	ENSGT00530000064469	ENSGT00940000157592
Ryukyu mouse	MODERN SPECIES	8	Nrtn (MGP_CAROLIEiJ_G0021788)	Dus3l (MGP_CAROLIEiJ_G0021789)	Prr22 (MGP_CAROLIEiJ_G0021790)	Rfx2 (MGP_CAROLIEiJ_G0021791)	Acsbg2 (MGP_CAROLIEiJ_G0021792)	Acsbg3 (MGP_CAROLIEiJ_G0021793)	Mllt1 (MGP_CAROLIEiJ_G0021794)	Acer1 (MGP_CAROLIEiJ_G0021795)	Clpp (MGP_CAROLIEiJ_G0021796)	Alkbh7 (MGP_CAROLIEiJ_G0021797)	Pspn (MGP_CAROLIEiJ_G0021798)	Gtf2f1 (MGP_CAROLIEiJ_G0021799)	Khsrp (MGP_CAROLIEiJ_G0021800)	Slc25a41 (MGP_CAROLIEiJ_G0021801)	Slc25a23 (MGP_CAROLIEiJ_G0021802)	Crb3 (MGP_CAROLIEiJ_G0021803) ##22	Dennd1c (MGP_CAROLIEiJ_G0021804)	Tubb4a (MGP_CAROLIEiJ_G0021805)	MGP_CAROLIEiJ_G0021806	Tnfsf9 (MGP_CAROLIEiJ_G0021807)	Cd70 (MGP_CAROLIEiJ_G0021808)	Tnfsf14 (MGP_CAROLIEiJ_G0021809)	C3 (MGP_CAROLIEiJ_G0021810)	Gpr108 (MGP_CAROLIEiJ_G0021811)	Trip10 (MGP_CAROLIEiJ_G0021812)	Vav1 (MGP_CAROLIEiJ_G0021813)	Adgre1 (MGP_CAROLIEiJ_G0021814)	MGP_CAROLIEiJ_G0021815	MGP_CAROLIEiJ_G0021816	Cntnap5c (MGP_CAROLIEiJ_G0021817)	Pdzph1 (MGP_CAROLIEiJ_G0021818)
Mus_B	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00550000075134	ENSGT00390000016128	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A	ENSGT00940000164043	ENSGT00940000158800	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000163693	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000161972	ENSGT01100000266942	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354	ENSGT00960000186717.a.b	ENSGT00940000164023.c.a	ENSGT00530000064469	ENSGT00940000157592
Mouse	MODERN SPECIES	8	Dus3l (ENSMUSG00000007603)	Prr22 (ENSMUSG00000090273)	Rfx2 (ENSMUSG00000024206)	Acsbg2 (ENSMUSG00000024207)	Acsbg3 (ENSMUSG00000024209)	Mllt1 (ENSMUSG00000024212)	Acer1 (ENSMUSG00000045019)	Clpp (ENSMUSG00000002660)	Alkbh7 (ENSMUSG00000002661)	Pspn (ENSMUSG00000002664)	Gtf2f1 (ENSMUSG00000002658)	Gm17949 (ENSMUSG00000109739)	Khsrp (ENSMUSG00000007670)	Slc25a41 (ENSMUSG00000011486)	Slc25a23 (ENSMUSG00000046329)	Crb3 (ENSMUSG00000044279) ##22	Dennd1c (ENSMUSG00000002668)	Tubb4a (ENSMUSG00000062591)	Tnfsf9 (ENSMUSG00000035678)	Cd70 (ENSMUSG00000019489)	Tnfsf14 (ENSMUSG00000005824)	C3 (ENSMUSG00000024164)	Gpr108 (ENSMUSG00000005823)	Trip10 (ENSMUSG00000019487)	Vav1 (ENSMUSG00000034116)	Adgre1 (ENSMUSG00000004730)	Vmn2r120 (ENSMUSG00000090655)	Cntnap5c (ENSMUSG00000038048)	Pdzph1 (ENSMUSG00000024227)	Nudt12 (ENSMUSG00000024228)	Efna5 (ENSMUSG00000048915)
Mus_C	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00550000075134	ENSGT00390000016128	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A	ENSGT00940000164043	ENSGT00940000158800	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000163693	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000161972	ENSGT01100000266942	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354	ENSGT00960000186717.a.b	ENSGT00940000164023.c.a	ENSGT00530000064469	ENSGT00940000157592
spretus	MODERN SPECIES	8	Nrtn (MGP_SPRETEiJ_G0022699)	Dus3l (MGP_SPRETEiJ_G0022700)	Prr22 (MGP_SPRETEiJ_G0022701)	Rfx2 (MGP_SPRETEiJ_G0022702)	Acsbg2 (MGP_SPRETEiJ_G0022703)	Acsbg3 (MGP_SPRETEiJ_G0022704)	Mllt1 (MGP_SPRETEiJ_G0022705)	Acer1 (MGP_SPRETEiJ_G0022706)	Clpp (MGP_SPRETEiJ_G0022707)	Alkbh7 (MGP_SPRETEiJ_G0022708)	Pspn (MGP_SPRETEiJ_G0022709)	Gtf2f1 (MGP_SPRETEiJ_G0022710)	Khsrp (MGP_SPRETEiJ_G0022711)	Slc25a41 (MGP_SPRETEiJ_G0022712)	Slc25a23 (MGP_SPRETEiJ_G0022713)	Crb3 (MGP_SPRETEiJ_G0022714) ##22	MGP_SPRETEiJ_G0022715	Tubb4a (MGP_SPRETEiJ_G0022716)	MGP_SPRETEiJ_G0022717	Tnfsf9 (MGP_SPRETEiJ_G0022718)	Cd70 (MGP_SPRETEiJ_G0022719)	Tnfsf14 (MGP_SPRETEiJ_G0022720)	C3 (MGP_SPRETEiJ_G0022721)	Gpr108 (MGP_SPRETEiJ_G0022722)	Trip10 (MGP_SPRETEiJ_G0022723)	Vav1 (MGP_SPRETEiJ_G0022724)	Adgre1 (MGP_SPRETEiJ_G0022725)	MGP_SPRETEiJ_G0022726	MGP_SPRETEiJ_G0022727	Cntnap5c (MGP_SPRETEiJ_G0022728)	Pdzph1 (MGP_SPRETEiJ_G0022729)
Steppe mouse	MODERN SPECIES	2657	Dus3l (ENSMSIG00000022291)	Prr22 (ENSMSIG00000022272)	Rfx2 (ENSMSIG00000022188)	Acsbg2 (ENSMSIG00000022144)	Acsbg3 (ENSMSIG00000022123)	Mllt1 (ENSMSIG00000022050)	Acer1 (ENSMSIG00000022023)	Clpp (ENSMSIG00000022008)	Alkbh7 (ENSMSIG00000021986)	Pspn (ENSMSIG00000021975)	Gtf2f1 (ENSMSIG00000021940)	Gm17949 (ENSMSIG00000021931)	Khsrp (ENSMSIG00000021874)	Slc25a41 (ENSMSIG00000021849)	Slc25a23 (ENSMSIG00000021822)	Crb3 (ENSMSIG00000021794) ##22	Dennd1c (ENSMSIG00000021743)	Tubb4a (ENSMSIG00000021731)	Tnfsf9 (ENSMSIG00000021718)	Cd70 (ENSMSIG00000021712)	Tnfsf14 (ENSMSIG00000021706)	C3 (ENSMSIG00000021615)	Gpr108 (ENSMSIG00000021547)	Trip10 (ENSMSIG00000021462)	Vav1 (ENSMSIG00000021244)
Shrew mouse	MODERN SPECIES	9	Nrtn (MGP_PahariEiJ_G0020777)	Dus3l (MGP_PahariEiJ_G0020778)	Prr22 (MGP_PahariEiJ_G0020779)	Rfx2 (MGP_PahariEiJ_G0020780)	Acsbg2 (MGP_PahariEiJ_G0020781)	Acsbg3 (MGP_PahariEiJ_G0020782)	Mllt1 (MGP_PahariEiJ_G0020783)	Acer1 (MGP_PahariEiJ_G0020784)	Clpp (MGP_PahariEiJ_G0020785)	Alkbh7 (MGP_PahariEiJ_G0020786)	Pspn (MGP_PahariEiJ_G0020787)	Gtf2f1 (MGP_PahariEiJ_G0020788)	Khsrp (MGP_PahariEiJ_G0020789)	Slc25a41 (MGP_PahariEiJ_G0020790)	Slc25a23 (MGP_PahariEiJ_G0020791)	Crb3 (MGP_PahariEiJ_G0020792) ##22	Dennd1c (MGP_PahariEiJ_G0020793)	Tubb4a (MGP_PahariEiJ_G0020794)	MGP_PahariEiJ_G0020795	Tnfsf9 (MGP_PahariEiJ_G0020796)	Cd70 (MGP_PahariEiJ_G0020797)	Tnfsf14 (MGP_PahariEiJ_G0020798)	C3 (MGP_PahariEiJ_G0020799)	Gpr108 (MGP_PahariEiJ_G0020800)	Trip10 (MGP_PahariEiJ_G0020801)	Vav1 (MGP_PahariEiJ_G0020802)	Adgre1 (MGP_PahariEiJ_G0020803)	MGP_PahariEiJ_G0020804	MGP_PahariEiJ_G0020805	MGP_PahariEiJ_G0020806	Nudt12 (MGP_PahariEiJ_G0020807)
Rat	MODERN SPECIES	19	Dus3l (ENSRNOG00000050381)	Prr22 (ENSRNOG00000047295)	Rfx2 (ENSRNOG00000045846)	Acsbg2 (ENSRNOG00000045947)	Acsbg3 (ENSRNOG00000047549)	Mllt1 (ENSRNOG00000048736)	Acer1 (ENSRNOG00000047368)	Clpp (ENSRNOG00000047052)	Alkbh7 (ENSRNOG00000047089)	Pspn (ENSRNOG00000071190)	Gtf2f1 (ENSRNOG00000047134)	Gm17949 (ENSRNOG00000064877)	Khsrp (ENSRNOG00000047628)	Slc25a41 (ENSRNOG00000048853)	Slc25a23 (ENSRNOG00000047781)	Crb3 (ENSRNOG00000070099) ##22	Dennd1c (ENSRNOG00000046050)	Tubb4a (ENSRNOG00000047505)	Tnfsf9 (ENSRNOG00000045595)	Brcc3 (ENSRNOG00000048061)	Cd70 (ENSRNOG00000051015)	Tnfsf14 (ENSRNOG00000047730)	C3 (ENSRNOG00000046834)	Gpr108 (ENSRNOG00000046128)	Trip10 (ENSRNOG00000055524)	Vav1 (ENSRNOG00000050430)	Adgre1 (ENSRNOG00000046254)	Vom2r79 (ENSRNOG00000047337)	LOC120094604 (ENSRNOG00000062772)	ENSRNOG00000069918	LOC120094607 (ENSRNOG00000064862)
Upper Galilee mountains blind mole rat	MODERN SPECIES	975	Ndufa11 (ENSNGAG00000017779)	Nrtn (ENSNGAG00000021333)	Dus3l (ENSNGAG00000017157)	Prr22 (ENSNGAG00000023052)	Rfx2 (ENSNGAG00000018829)	Mllt1 (ENSNGAG00000015361)	Acer1 (ENSNGAG00000021750)	Clpp (ENSNGAG00000020943)	Alkbh7 (ENSNGAG00000018037)	Pspn (ENSNGAG00000022337)	Gtf2f1 (ENSNGAG00000023277)	Gm17949 (ENSNGAG00000023078)	Khsrp (ENSNGAG00000023093)	Slc25a41 (ENSNGAG00000019185)	Slc25a23 (ENSNGAG00000023065)	Crb3 (ENSNGAG00000023048) ##22	Dennd1c (ENSNGAG00000015322)	Tubb4a (ENSNGAG00000019498)	Cd70 (ENSNGAG00000013982)	Tnfsf14 (ENSNGAG00000023106)	C3 (ENSNGAG00000022830)	Gpr108 (ENSNGAG00000016378)	Trip10 (ENSNGAG00000014674)	Vav1 (ENSNGAG00000018348)	Adgre1 (ENSNGAG00000023217)	Adgre4 (ENSNGAG00000011964)	ENSNGAG00000013551
Primates	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000162442	ENSGT00940000158588	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A	ENSGT00940000164043	ENSGT00940000158800	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000163693	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000161972	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354	ENSGT00940000162163	ENSGT00950000183005.b.c.b	ENSGT00940000160844.b	ENSGT00940000155404
Haplorrhini	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00390000012434	ENSGT00390000007212	ENSGT00940000162442	ENSGT00940000158588	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A	ENSGT00940000158800	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000161972	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354	ENSGT00950000183005.b.c.b	ENSGT00940000160844.b	ENSGT00940000155404	ENSGT00940000154146.b.b.b
Simiiformes	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00390000012434	ENSGT00390000007212	ENSGT00940000162442	ENSGT00940000158588	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A	ENSGT00940000158800	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000161972	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354	ENSGT00940000162163	ENSGT00950000183005.b.c.b	ENSGT00940000160844.b	ENSGT00940000155404
Catarrhini	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000012434	ENSGT00390000007212	ENSGT00940000162442	ENSGT00940000158588	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A	ENSGT00940000158800	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000161972.d.a	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354	ENSGT00940000162163	ENSGT00950000183005.b.c.b	ENSGT00940000160844.b	ENSGT00940000155404
Hominoidea	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000012434	ENSGT00390000007212	ENSGT00940000162442	ENSGT00940000158588	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A	ENSGT00940000158800	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000161972.d.a	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354	ENSGT00940000162163	ENSGT00390000002019	ENSGT00950000183005.b.c.b	ENSGT00940000160844.b
Hominidae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000012434	ENSGT00390000007212	ENSGT00940000162442	ENSGT00940000158588	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A	ENSGT00940000158800	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000161972.d.a	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354	ENSGT00940000162163	ENSGT00390000002019	ENSGT00950000183005.b.c.b	ENSGT00940000160844.b
Homo/Pan/Gorilla group	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000007212	ENSGT00940000162442	ENSGT00940000158588	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A	ENSGT00940000158800	ENSGT00910000148057	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000161972.d.a	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354	ENSGT00940000162163	ENSGT00390000002019	ENSGT00950000183005.b.c.b.b	ENSGT00950000183005.b.c.b.a
Gorilla	MODERN SPECIES	10	VMAC (ENSGGOG00000038181)	ENSGGOG00000006292	RANBP3 (ENSGGOG00000006300)	RFX2 (ENSGGOG00000009633)	ACSBG2 (ENSGGOG00000026850)	MLLT1 (ENSGGOG00000010872)	ENSGGOG00000040780	ACER1 (ENSGGOG00000010886)	ENSGGOG00000011638	ALKBH7 (ENSGGOG00000027915)	PSPN (ENSGGOG00000000316)	GTF2F1 (ENSGGOG00000000318)	KHSRP (ENSGGOG00000007028)	ENSGGOG00000007048	SLC25A23 (ENSGGOG00000007058)	CRB3 (ENSGGOG00000007070) ##22	DENND1C (ENSGGOG00000007075)	TUBB4A (ENSGGOG00000027067)	TNFSF9 (ENSGGOG00000023927)	CD70 (ENSGGOG00000009206)	TNFSF14 (ENSGGOG00000015906)	C3 (ENSGGOG00000013159)	GPR108 (ENSGGOG00000013176)	ENSGGOG00000012222	SH2D3A (ENSGGOG00000012243)	VAV1 (ENSGGOG00000012257)	ADGRE1 (ENSGGOG00000007858)	ENSGGOG00000044153	ENSGGOG00000038257	ENSGGOG00000024592	ENSGGOG00000024776
Homo/Pan group	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000007212	ENSGT00940000162442	ENSGT00940000158588	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A	ENSGT00940000158800	ENSGT00910000148057	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000161972.d.a	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354	ENSGT00950000183005.b.c.b.a	ENSGT00940000160844.b	ENSGT00940000155404	ENSGT00940000154146.b.b.b
Pan	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00390000007212	ENSGT00940000162442	ENSGT00940000158588	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A	ENSGT00940000158800	ENSGT00910000148057	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000161972.d.a	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354	ENSGT00940000162163	ENSGT00390000002019	ENSGT00950000183005.b.c.b.b	ENSGT00940000160844.b
Bonobo	MODERN SPECIES	10	ENSPPAG00000024786	VMAC (ENSPPAG00000031186)	ENSPPAG00000022696	RANBP3 (ENSPPAG00000040739)	RFX2 (ENSPPAG00000041867)	ACSBG2 (ENSPPAG00000031354)	MLLT1 (ENSPPAG00000042286)	ACER1 (ENSPPAG00000041682)	CLPP (ENSPPAG00000041016)	ALKBH7 (ENSPPAG00000028564)	PSPN (ENSPPAG00000038423)	GTF2F1 (ENSPPAG00000006377)	ENSPPAG00000036398	SLC25A41 (ENSPPAG00000037155)	SLC25A23 (ENSPPAG00000040203)	CRB3 (ENSPPAG00000028757) ##22	DENND1C (ENSPPAG00000037306)	TUBB4A (ENSPPAG00000021486)	TNFSF9 (ENSPPAG00000043434)	CD70 (ENSPPAG00000029346)	TNFSF14 (ENSPPAG00000037246)	C3 (ENSPPAG00000035996)	GPR108 (ENSPPAG00000029432)	TRIP10 (ENSPPAG00000034017)	SH2D3A (ENSPPAG00000037810)	VAV1 (ENSPPAG00000036601)	ADGRE1 (ENSPPAG00000033638)	ENSPPAG00000031773	ENSPPAG00000012604	ENSPPAG00000042336	ZNF557 (ENSPPAG00000030881)
Chimpanzee	MODERN SPECIES	10	VMAC (ENSPTRG00000010349)	CAPS (ENSPTRG00000010350)	RANBP3 (ENSPTRG00000010351)	RFX2 (ENSPTRG00000010352)	ACSBG2 (ENSPTRG00000010354)	MLLT1 (ENSPTRG00000010356)	ENSPTRG00000045179	ACER1 (ENSPTRG00000010358)	CLPP (ENSPTRG00000010359)	ALKBH7 (ENSPTRG00000010360)	PSPN (ENSPTRG00000045539)	GTF2F1 (ENSPTRG00000010362)	KHSRP (ENSPTRG00000010364)	SLC25A41 (ENSPTRG00000010365)	SLC25A23 (ENSPTRG00000010366)	CRB3 (ENSPTRG00000010367) ##22	DENND1C (ENSPTRG00000029159)	TUBB4A (ENSPTRG00000010369)	TNFSF9 (ENSPTRG00000043305)	CD70 (ENSPTRG00000040770)	TNFSF14 (ENSPTRG00000010372)	C3 (ENSPTRG00000010373)	GPR108 (ENSPTRG00000010375)	TRIP10 (ENSPTRG00000010376)	SH2D3A (ENSPTRG00000010377)	VAV1 (ENSPTRG00000010378)	ADGRE1 (ENSPTRG00000010379)	ENSPTRG00000043646	ENSPTRG00000050085	ENSPTRG00000052340	ENSPTRG00000045284
Human	MODERN SPECIES	10	NDUFA11 (ENSG00000174886)	VMAC (ENSG00000187650)	CAPS (ENSG00000105519)	RANBP3 (ENSG00000031823)	RFX2 (ENSG00000087903)	ACSBG2 (ENSG00000130377)	MLLT1 (ENSG00000130382)	ACER1 (ENSG00000167769)	CLPP (ENSG00000125656)	ALKBH7 (ENSG00000125652)	PSPN (ENSG00000125650)	GTF2F1 (ENSG00000125651)	KHSRP (ENSG00000088247)	SLC25A41 (ENSG00000181240)	SLC25A23 (ENSG00000125648)	CRB3 (ENSG00000130545) ##22	DENND1C (ENSG00000205744)	TUBB4A (ENSG00000104833)	TNFSF9 (ENSG00000125657)	CD70 (ENSG00000125726)	TNFSF14 (ENSG00000125735)	C3 (ENSG00000125730)	GPR108 (ENSG00000125734)	TRIP10 (ENSG00000125733)	SH2D3A (ENSG00000125731)	VAV1 (ENSG00000141968)	ADGRE1 (ENSG00000174837)	MBD3L2B (ENSG00000196589)	MBD3L5 (ENSG00000237247)	MBD3L4 (ENSG00000205718)	MBD3L2 (ENSG00000230522)
Orangutan	MODERN SPECIES	10	FUT6 (ENSPPYG00000009437)	FUT5 (ENSPPYG00000009438)	ENSPPYG00000030201	ENSPPYG00000036062	RANBP3 (ENSPPYG00000009444)	RFX2 (ENSPPYG00000009445)	ACSBG2 (ENSPPYG00000009446)	MLLT1 (ENSPPYG00000009447)	ACER1 (ENSPPYG00000009448)	CLPP (ENSPPYG00000009449)	ALKBH7 (ENSPPYG00000033281)	PSPN (ENSPPYG00000009451)	KHSRP (ENSPPYG00000009454)	SLC25A41 (ENSPPYG00000009455)	SLC25A23 (ENSPPYG00000009456)	ENSPPYG00000009457 ##22	DENND1C (ENSPPYG00000009458)	TUBB4A (ENSPPYG00000041695)	TNFSF9 (ENSPPYG00000009459)	ENSPPYG00000009460	TNFSF14 (ENSPPYG00000031179)	C3 (ENSPPYG00000009461)	GPR108 (ENSPPYG00000009462)	TRIP10 (ENSPPYG00000009463)	SH2D3A (ENSPPYG00000009464)	VAV1 (ENSPPYG00000009465)	ADGRE1 (ENSPPYG00000009466)	ENSPPYG00000009467	ENSPPYG00000009469	ENSPPYG00000038664	ENSPPYG00000010518
Gibbon	MODERN SPECIES		CABP5 (ENSNLEG00000032429)	ENSNLEG00000001333	ENSNLEG00000001326	ENSNLEG00000000975	TPRX2 (ENSNLEG00000000972)	CAPS (ENSNLEG00000015702)	RANBP3 (ENSNLEG00000015710)	RFX2 (ENSNLEG00000015842)	ACSBG2 (ENSNLEG00000015883)	ENSNLEG00000015892	ACER1 (ENSNLEG00000015897)	ENSNLEG00000029103	GTF2F1 (ENSNLEG00000015909)	KHSRP (ENSNLEG00000015923)	ENSNLEG00000015935	CRB3 (ENSNLEG00000030283) ##22	DENND1C (ENSNLEG00000015941)	TUBB4A (ENSNLEG00000032392)	CD70 (ENSNLEG00000015993)	TNFSF14 (ENSNLEG00000016000)	C3 (ENSNLEG00000016006)	ENSNLEG00000000344	TRIP10 (ENSNLEG00000000351)	SH2D3A (ENSNLEG00000000371)	ENSNLEG00000032882	ADGRE1 (ENSNLEG00000000380)	ENSNLEG00000000394	INSR (ENSNLEG00000000403)	ENSNLEG00000028702	ENSNLEG00000026714	PEX11G (ENSNLEG00000000829)
Cercopithecidae	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00390000012434	ENSGT00390000007212	ENSGT00940000162442	ENSGT00940000158588	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A	ENSGT00940000158800	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032.q	ENSGT00940000156051.mc.a	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000161972.d.a	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000160446.c	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354	ENSGT00940000162163	ENSGT00950000183005.b.c.b	ENSGT00940000160844.b	ENSGT00940000155404
Rhinopithecus	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00390000007212	ENSGT00940000162442	ENSGT00940000158588	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A	ENSGT00940000158800	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00940000167406	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032.q	ENSGT00940000156051.mc.a	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000161972.d.a	ENSGT00390000006244	ENSGT00440000033329.a.a.b.c.b	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000160446.c	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354	ENSGT00950000183005.b.c.b	ENSGT00940000160844.b	ENSGT00940000155404
Golden snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	1318	FUT3 (ENSRROG00000032467)	NDUFA11 (ENSRROG00000001285)	VMAC (ENSRROG00000031275)	CAPS (ENSRROG00000043353)	RANBP3 (ENSRROG00000032677)	RFX2 (ENSRROG00000028821)	ACSBG2 (ENSRROG00000035513)	MLLT1 (ENSRROG00000042162)	ACER1 (ENSRROG00000022472)	CLPP (ENSRROG00000042048)	ALKBH7 (ENSRROG00000043210)	ENSRROG00000020433	KHSRP (ENSRROG00000031782)	SLC25A41 (ENSRROG00000044292)	SLC25A23 (ENSRROG00000009609)	CRB3 (ENSRROG00000035164) ##22	DENND1C (ENSRROG00000036222)	TUBB4A (ENSRROG00000010011)	TNFSF9 (ENSRROG00000043525)	ENSRROG00000007343	CD70 (ENSRROG00000040655)	TNFSF14 (ENSRROG00000041901)	C3 (ENSRROG00000044340)	ENSRROG00000038025	TRIP10 (ENSRROG00000037565)	SH2D3A (ENSRROG00000040767)	VAV1 (ENSRROG00000030844)
Black snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	631														KHSRP (ENSRBIG00000041605)	SLC25A23 (ENSRBIG00000031632)	CRB3 (ENSRBIG00000019680) ##22	DENND1C (ENSRBIG00000036859)	TUBB4A (ENSRBIG00000028889)	TNFSF9 (ENSRBIG00000029859)	ENSRBIG00000035725	CD70 (ENSRBIG00000042145)	ENSRBIG00000036454	C3 (ENSRBIG00000027932)	ENSRBIG00000044563	TRIP10 (ENSRBIG00000030391)	SH2D3A (ENSRBIG00000033277)	VAV1 (ENSRBIG00000040884)	ENSRBIG00000016719	ADGRE1 (ENSRBIG00000031436)	ENSRBIG00000041526	ZNF557 (ENSRBIG00000040024)
Cercopithecinae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000012434	ENSGT00390000007212	ENSGT00940000162442	ENSGT00940000158588	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A	ENSGT00940000158800	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032.q	ENSGT00940000156051.mc.a	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000161972.d.a	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000160446.c	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354	ENSGT00940000162163	ENSGT00950000183005.b.c.b	ENSGT00940000160844.b	ENSGT00940000155404
Vervet Monkey	MODERN SPECIES	25	ENSCSAG00000018824	ENSCSAG00000009786	RANBP3 (ENSCSAG00000009796)	ENSCSAG00000009781	RFX2 (ENSCSAG00000009771)	ACSBG2 (ENSCSAG00000009753)	MLLT1 (ENSCSAG00000009698)	ACER1 (ENSCSAG00000009688)	CLPP (ENSCSAG00000009679)	ALKBH7 (ENSCSAG00000009674)	PSPN (ENSCSAG00000009668)	ENSCSAG00000009656	KHSRP (ENSCSAG00000009626)	SLC25A41 (ENSCSAG00000009616)	SLC25A23 (ENSCSAG00000009602)	CRB3 (ENSCSAG00000009594) ##22	DENND1C (ENSCSAG00000009587)	TUBB4A (ENSCSAG00000009578)	TNFSF9 (ENSCSAG00000009573)	CD70 (ENSCSAG00000009543)	TNFSF14 (ENSCSAG00000009528)	C3 (ENSCSAG00000009476)	GPR108 (ENSCSAG00000009304)	TRIP10 (ENSCSAG00000009241)	SH2D3A (ENSCSAG00000009225)	VAV1 (ENSCSAG00000009214)	ADGRE1 (ENSCSAG00000009172)	ENSCSAG00000018825	ENSCSAG00000009106	ZNF557 (ENSCSAG00000009087)	INSR (ENSCSAG00000008965)
Cercopithecinae_a	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00390000012434	ENSGT00390000007212	ENSGT00940000162442	ENSGT00940000158588	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A	ENSGT00940000158800	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032.q	ENSGT00940000156051.mc.a	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000161972.d.a	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000160446.c	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354	ENSGT00940000162163	ENSGT00950000183005.b.c.b	ENSGT00940000160844.b	ENSGT00940000155404
Macaca	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00390000012434	ENSGT00390000007212	ENSGT00940000162442	ENSGT00940000158588	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A	ENSGT00940000158800	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032.q	ENSGT00940000156051.mc.a	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000161972.d.a	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000160446.c	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354	ENSGT00390000002019	ENSGT00950000183005.b.c.b	ENSGT00940000160844.b	ENSGT00940000155404
Pig-tailed macaque	MODERN SPECIES	76	NDUFA11 (ENSMNEG00000004413)	VMAC (ENSMNEG00000037094)	CAPS (ENSMNEG00000041627)	RANBP3 (ENSMNEG00000036230)	RFX2 (ENSMNEG00000030375)	ACSBG2 (ENSMNEG00000044133)	MLLT1 (ENSMNEG00000031529)	ACER1 (ENSMNEG00000029728)	ENSMNEG00000041705	ALKBH7 (ENSMNEG00000029223)	PSPN (ENSMNEG00000039281)	GTF2F1 (ENSMNEG00000038838)	KHSRP (ENSMNEG00000036982)	SLC25A41 (ENSMNEG00000031428)	SLC25A23 (ENSMNEG00000033667)	CRB3 (ENSMNEG00000040789) ##22	DENND1C (ENSMNEG00000029798)	TUBB4A (ENSMNEG00000038280)	TNFSF9 (ENSMNEG00000032348)	CD70 (ENSMNEG00000032223)	TNFSF14 (ENSMNEG00000041885)	C3 (ENSMNEG00000039015)	ENSMNEG00000027173	TRIP10 (ENSMNEG00000032693)	SH2D3A (ENSMNEG00000043229)	VAV1 (ENSMNEG00000033569)	ADGRE1 (ENSMNEG00000036876)	ENSMNEG00000018748	ENSMNEG00000023531	ENSMNEG00000029978	ZNF557 (ENSMNEG00000031152)
Macaca_a	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000012434	ENSGT00940000162442	ENSGT00940000158588	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A	ENSGT00940000158800	ENSGT01100000263508.A.d.e.a.b	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032.q	ENSGT00940000156051.mc.a	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000161972.d.a	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000160446.c	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354	ENSGT00390000002019	ENSGT00950000183005.b.c.b.h	ENSGT00950000183005.b.c.b.g	ENSGT00940000160844.b
Crab-eating macaque	MODERN SPECIES	10	ENSMFAG00000003802	CAPS (ENSMFAG00000044715)	RANBP3 (ENSMFAG00000031395)	RFX2 (ENSMFAG00000036589)	ACSBG2 (ENSMFAG00000033353)	MLLT1 (ENSMFAG00000039501)	ENSMFAG00000064713	ACER1 (ENSMFAG00000043465)	CLPP (ENSMFAG00000063171)	ALKBH7 (ENSMFAG00000045978)	GTF2F1 (ENSMFAG00000003355)	KHSRP (ENSMFAG00000000292)	ENSMFAG00000063742	SLC25A23 (ENSMFAG00000039503)	DENND1C (ENSMFAG00000031978)	CRB3 (ENSMFAG00000040330) ##22	TUBB4A (ENSMFAG00000059050)	CD70 (ENSMFAG00000041094)	TNFSF14 (ENSMFAG00000003750)	ENSMFAG00000044731	GPR108 (ENSMFAG00000038700)	TRIP10 (ENSMFAG00000039732)	SH2D3A (ENSMFAG00000002801)	VAV1 (ENSMFAG00000039752)	ADGRE1 (ENSMFAG00000039564)	ENSMFAG00000064065	ENSMFAG00000036004	ZNF557 (ENSMFAG00000039721)	INSR (ENSMFAG00000041609)	ENSMFAG00000042620	ENSMFAG00000064817
Rhesus	MODERN SPECIES	10	FUT5 (ENSMMUG00000050702)	NDUFA11 (ENSMMUG00000016665)	CAPS (ENSMMUG00000011963)	RANBP3 (ENSMMUG00000011964)	RFX2 (ENSMMUG00000011967)	ACSBG2 (ENSMMUG00000018937)	MLLT1 (ENSMMUG00000005697)	ENSMMUG00000063389	ACER1 (ENSMMUG00000005698)	CLPP (ENSMMUG00000028914)	ALKBH7 (ENSMMUG00000000054)	PSPN (ENSMMUG00000053244)	KHSRP (ENSMMUG00000005597)	SLC25A41 (ENSMMUG00000016526)	SLC25A23 (ENSMMUG00000005598)	CRB3 (ENSMMUG00000050193) ##22	DENND1C (ENSMMUG00000005600)	TUBB4A (ENSMMUG00000014216)	TNFSF9 (ENSMMUG00000001985)	CD70 (ENSMMUG00000011042)	TNFSF14 (ENSMMUG00000051945)	C3 (ENSMMUG00000008693)	ENSMMUG00000008695	TRIP10 (ENSMMUG00000008697)	SH2D3A (ENSMMUG00000008699)	VAV1 (ENSMMUG00000019314)	ADGRE1 (ENSMMUG00000001220)	ENSMMUG00000005589	ENSMMUG00000063988	ENSMMUG00000028908	ZNF557 (ENSMMUG00000019966)
Cercopithecinae_b	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00390000012434	ENSGT00390000007212	ENSGT00940000162442	ENSGT00940000158588	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A	ENSGT00940000158800	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032.q	ENSGT00940000156051.mc.a	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000161972.d.a	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000160446.c	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354	ENSGT00950000183005.b.c.b	ENSGT00940000160844.b	ENSGT00940000155404	ENSGT00940000154146.b.b.b
Olive baboon	MODERN SPECIES	12	ENSPANG00000042524	NRTN (ENSPANG00000010856)	ENSPANG00000032774	NDUFA11 (ENSPANG00000003098)	VMAC (ENSPANG00000032013)	CAPS (ENSPANG00000007003)	RANBP3 (ENSPANG00000031036)	RFX2 (ENSPANG00000012105)	ACSBG2 (ENSPANG00000009518)	MLLT1 (ENSPANG00000015038)	ACER1 (ENSPANG00000006330)	CLPP (ENSPANG00000047270)	ALKBH7 (ENSPANG00000035776)	PSPN (ENSPANG00000030010)	SLC25A23 (ENSPANG00000008553)	CRB3 (ENSPANG00000003084) ##22	DENND1C (ENSPANG00000004918)	TUBB4A (ENSPANG00000006306)	TNFSF9 (ENSPANG00000051412)	CD70 (ENSPANG00000000880)	TNFSF14 (ENSPANG00000030479)	GPR108 (ENSPANG00000022720)	TRIP10 (ENSPANG00000005035)	SH2D3A (ENSPANG00000013778)	VAV1 (ENSPANG00000007768)	ADGRE1 (ENSPANG00000000239)	ENSPANG00000044744	ZNF557 (ENSPANG00000045372)	INSR (ENSPANG00000022952)	ARHGEF18 (ENSPANG00000013226)	PEX11G (ENSPANG00000011045)
Cercopithecinae_d	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00390000012434	ENSGT00390000007212	ENSGT00940000162442	ENSGT00940000158588	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A	ENSGT00940000158800	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032.q	ENSGT00940000156051.mc.a	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000161972.d.a	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000160446.c	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354
Sooty mangabey	MODERN SPECIES	177	ENSCATG00000041060	VMAC (ENSCATG00000041336)	CAPS (ENSCATG00000030192)	RANBP3 (ENSCATG00000044346)	RFX2 (ENSCATG00000040945)	ACSBG2 (ENSCATG00000033762)	MLLT1 (ENSCATG00000036992)	ACER1 (ENSCATG00000026770)	CLPP (ENSCATG00000032343)	ALKBH7 (ENSCATG00000030199)	PSPN (ENSCATG00000035142)	ENSCATG00000034000	KHSRP (ENSCATG00000036458)	SLC25A41 (ENSCATG00000035228)	SLC25A23 (ENSCATG00000033633)	CRB3 (ENSCATG00000036281) ##22	DENND1C (ENSCATG00000016215)	TUBB4A (ENSCATG00000032861)	TNFSF9 (ENSCATG00000032350)	CD70 (ENSCATG00000013090)	TNFSF14 (ENSCATG00000034862)	C3 (ENSCATG00000021880)	ENSCATG00000040475	TRIP10 (ENSCATG00000039125)	SH2D3A (ENSCATG00000040346)	VAV1 (ENSCATG00000033046)	ADGRE1 (ENSCATG00000024272)
Drill	MODERN SPECIES	1534	NDUFA11 (ENSMLEG00000028488)	VMAC (ENSMLEG00000041920)	CAPS (ENSMLEG00000036098)	RANBP3 (ENSMLEG00000028374)	RFX2 (ENSMLEG00000025063)	ACSBG2 (ENSMLEG00000021100)	MLLT1 (ENSMLEG00000034524)	ACER1 (ENSMLEG00000042127)	CLPP (ENSMLEG00000022592)	ALKBH7 (ENSMLEG00000039193)	PSPN (ENSMLEG00000036794)	GTF2F1 (ENSMLEG00000027908)	KHSRP (ENSMLEG00000030501)	SLC25A41 (ENSMLEG00000033366)	SLC25A23 (ENSMLEG00000040513)	CRB3 (ENSMLEG00000034520) ##22	DENND1C (ENSMLEG00000039863)	TUBB4A (ENSMLEG00000030013)	CD70 (ENSMLEG00000016471)	TNFSF14 (ENSMLEG00000043307)	C3 (ENSMLEG00000030923)	ENSMLEG00000036455	TRIP10 (ENSMLEG00000037606)	SH2D3A (ENSMLEG00000043148)	VAV1 (ENSMLEG00000029419)	ADGRE1 (ENSMLEG00000028603)
Platyrrhini	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00390000012434	ENSGT00390000007212	ENSGT00940000162442.a	ENSGT00940000158588	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A	ENSGT00940000158800	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830.v	ENSGT00390000014585.k	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032.s	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000161972	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354	ENSGT00940000162163	ENSGT00950000183005.b.c.b.n	ENSGT00950000183005.b.c.b.m	ENSGT00940000160844.b
Cebidae	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00390000012434	ENSGT00390000007212	ENSGT00940000162442.a	ENSGT00940000158588	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A	ENSGT00940000158800	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830.v	ENSGT00390000014585.k	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032.s	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000161972	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354	ENSGT00950000183005.b.c.b.n	ENSGT00950000183005.b.c.b.m	ENSGT00940000160844.b	ENSGT00940000155404
Cebidae_a	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00390000012434	ENSGT00390000007212	ENSGT00940000162442.a	ENSGT00940000158588	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A	ENSGT00940000158800	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830.v	ENSGT00390000014585.k	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032.s	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000161972	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354	ENSGT00950000183005.b.c.b.m	ENSGT00940000160844.b	ENSGT00940000155404	ENSGT00940000154146.b.b.b
Bolivian squirrel monkey	MODERN SPECIES	150	NDUFA11 (ENSSBOG00000032051)	VMAC (ENSSBOG00000032055)	CAPS (ENSSBOG00000034784)	RANBP3 (ENSSBOG00000029392)	RFX2 (ENSSBOG00000017266)	ACSBG2 (ENSSBOG00000030379)	MLLT1 (ENSSBOG00000025950)	ACER1 (ENSSBOG00000028157)	CLPP (ENSSBOG00000036193)	ALKBH7 (ENSSBOG00000024563)	PSPN (ENSSBOG00000031809)	GTF2F1 (ENSSBOG00000033946)	KHSRP (ENSSBOG00000034871)	SLC25A41 (ENSSBOG00000020009)	SLC25A23 (ENSSBOG00000033178)	CRB3 (ENSSBOG00000030526) ##22	DENND1C (ENSSBOG00000030628)	TUBB4A (ENSSBOG00000019437)	TNFSF9 (ENSSBOG00000036008)	CD70 (ENSSBOG00000032929)	TNFSF14 (ENSSBOG00000023172)	C3 (ENSSBOG00000024226)	GPR108 (ENSSBOG00000034952)	TRIP10 (ENSSBOG00000007356)	SH2D3A (ENSSBOG00000017503)	VAV1 (ENSSBOG00000034405)	ENSSBOG00000032976	ADGRE1 (ENSSBOG00000035948)	ENSSBOG00000031783	ENSSBOG00000019851	INSR (ENSSBOG00000023439)
Capuchin	MODERN SPECIES	53	VMAC (ENSCCAG00000029347)	CAPS (ENSCCAG00000021578)	RANBP3 (ENSCCAG00000033247)	RFX2 (ENSCCAG00000028516)	ACSBG2 (ENSCCAG00000028068)	MLLT1 (ENSCCAG00000026378)	ACER1 (ENSCCAG00000030282)	ENSCCAG00000030606	CLPP (ENSCCAG00000037133)	ALKBH7 (ENSCCAG00000025999)	PSPN (ENSCCAG00000025813)	ENSCCAG00000037309	KHSRP (ENSCCAG00000025297)	SLC25A41 (ENSCCAG00000026520)	SLC25A23 (ENSCCAG00000022370)	CRB3 (ENSCCAG00000023680) ##22	DENND1C (ENSCCAG00000034905)	TUBB4A (ENSCCAG00000013999)	TNFSF9 (ENSCCAG00000029091)	CD70 (ENSCCAG00000029093)	TNFSF14 (ENSCCAG00000028792)	C3 (ENSCCAG00000029672)	GPR108 (ENSCCAG00000030348)	TRIP10 (ENSCCAG00000026415)	SH2D3A (ENSCCAG00000024880)	VAV1 (ENSCCAG00000033162)	ADGRE1 (ENSCCAG00000035307)	ENSCCAG00000026975	ENSCCAG00000023589	ENSCCAG00000019848	ZNF557 (ENSCCAG00000035545)
Marmoset	MODERN SPECIES	14	DUS3L (ENSCJAG00000016997)	NRTN (ENSCJAG00000016988)	NDUFA11 (ENSCJAG00000016923)	VMAC (ENSCJAG00000072555)	RANBP3 (ENSCJAG00000016791)	RFX2 (ENSCJAG00000016750)	ACSBG2 (ENSCJAG00000016734)	MLLT1 (ENSCJAG00000044059)	ACER1 (ENSCJAG00000016705)	CLPP (ENSCJAG00000046904)	ALKBH7 (ENSCJAG00000016691)	PSPN (ENSCJAG00000016688)	GTF2F1 (ENSCJAG00000016669)	KHSRP (ENSCJAG00000016627)	SLC25A23 (ENSCJAG00000016577)	CRB3 (ENSCJAG00000044939) ##22	DENND1C (ENSCJAG00000016543)	TUBB4A (ENSCJAG00000016534)	TNFSF9 (ENSCJAG00000016530)	CD70 (ENSCJAG00000081455)	TNFSF14 (ENSCJAG00000085938)	C3 (ENSCJAG00000016466)	GPR108 (ENSCJAG00000016419)	TRIP10 (ENSCJAG00000016334)	SH2D3A (ENSCJAG00000036290)	VAV1 (ENSCJAG00000016236)	ADGRE1 (ENSCJAG00000016187)	ENSCJAG00000038679	ENSCJAG00000016144	ENSCJAG00000085022	INSR (ENSCJAG00000016091)
Mas night monkey	DUPLICATION
Mas night monkey	MODERN SPECIES	771																ENSANAG00000022180 ##22
Mas night monkey	MODERN SPECIES	953															ENSANAG00000028009	ENSANAG00000029034 ##22	ENSANAG00000030940	ENSANAG00000024002	ENSANAG00000034297	ENSANAG00000023167	ENSANAG00000019400	FAM240B (ENSANAG00000027625)	CTSV (ENSANAG00000025241)	ENSANAG00000029914	ZNF782 (ENSANAG00000024951)	ZNF510 (ENSANAG00000030522)	ENSANAG00000037094	ENSANAG00000023875	ENSANAG00000023712	PRXL2C (ENSANAG00000034602)	ENSANAG00000020550
Tarsier	MODERN SPECIES	2544						MLLT1 (ENSTSYG00000031730)	ACER1 (ENSTSYG00000032476)	CLPP (ENSTSYG00000002878)	ALKBH7 (ENSTSYG00000026277)	ENSTSYG00000031904	GTF2F1 (ENSTSYG00000011531)	ENSTSYG00000036614	KHSRP (ENSTSYG00000011552)	SLC25A41 (ENSTSYG00000034857)	SLC25A23 (ENSTSYG00000031974)	CRB3 (ENSTSYG00000004610) ##22	DENND1C (ENSTSYG00000031145)
Strepsirrhini	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00940000162442	ENSGT00940000158588	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A	ENSGT00940000164043	ENSGT00940000158800	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000163693	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000161972	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354	ENSGT00940000162163	ENSGT00950000183005.b.c.b	ENSGT00940000155404
Bushbaby	MODERN SPECIES	242	NDUFA11 (ENSOGAG00000028410)	CAPS (ENSOGAG00000004255)	RANBP3 (ENSOGAG00000004258)	RFX2 (ENSOGAG00000004261)	ENSOGAG00000028426	MLLT1 (ENSOGAG00000008063)	ACER1 (ENSOGAG00000001804)	CLPP (ENSOGAG00000028227)	ALKBH7 (ENSOGAG00000030625)	PSPN (ENSOGAG00000033652)	ENSOGAG00000008070	ENSOGAG00000030767	KHSRP (ENSOGAG00000008073)	SLC25A41 (ENSOGAG00000034049)	SLC25A23 (ENSOGAG00000008076)	CRB3 (ENSOGAG00000008078) ##22	DENND1C (ENSOGAG00000034782)	TUBB4A (ENSOGAG00000027332)	TNFSF9 (ENSOGAG00000015299)	CD70 (ENSOGAG00000001157)	TNFSF14 (ENSOGAG00000000974)	C3 (ENSOGAG00000002028)	GPR108 (ENSOGAG00000026135)	TRIP10 (ENSOGAG00000026236)	ENSOGAG00000034187	VAV1 (ENSOGAG00000002034)	ADGRE1 (ENSOGAG00000028445)	ENSOGAG00000009354
Lemuriformes	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00390000007212	ENSGT00940000162442	ENSGT00940000158588	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A	ENSGT00940000164043	ENSGT00940000158800	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000161972	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354	ENSGT00950000183005.b.c.b	ENSGT00940000155404
Lemuriformes_a	DUPLICATION
Lemuriformes_a	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00390000007212	ENSGT00940000162442	ENSGT00940000158588	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A	ENSGT00940000164043	ENSGT00940000158800	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a.i ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000161972	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354	ENSGT00950000183005.b.c.b	ENSGT00940000155404	ENSGT00940000153686.s.a.a	ENSGT00940000153686.s.b
Coquerels sifaka	MODERN SPECIES	348	NDUFA11 (ENSPCOG00000020260)	VMAC (ENSPCOG00000019572)	CAPS (ENSPCOG00000026358)	RANBP3 (ENSPCOG00000021692)	RFX2 (ENSPCOG00000027982)	ACSBG2 (ENSPCOG00000027134)	MLLT1 (ENSPCOG00000014345)	ACER1 (ENSPCOG00000016715)	CLPP (ENSPCOG00000027215)	ALKBH7 (ENSPCOG00000028026)	PSPN (ENSPCOG00000025496)	GTF2F1 (ENSPCOG00000013474)	KHSRP (ENSPCOG00000027506)	SLC25A41 (ENSPCOG00000003363)	SLC25A23 (ENSPCOG00000001217)	CRB3 (ENSPCOG00000028855) ##22	DENND1C (ENSPCOG00000004246)	TUBB4A (ENSPCOG00000015978)	TNFSF9 (ENSPCOG00000014608)	CD70 (ENSPCOG00000015987)	TNFSF14 (ENSPCOG00000018066)	C3 (ENSPCOG00000018007)	GPR108 (ENSPCOG00000007215)	TRIP10 (ENSPCOG00000013866)	SH2D3A (ENSPCOG00000018681)	VAV1 (ENSPCOG00000019002)	ADGRE1 (ENSPCOG00000005255)	INSR (ENSPCOG00000025098)	ENSPCOG00000012646	ENSPCOG00000024249	ZNF317 (ENSPCOG00000017287)
Greater bamboo lemur	MODERN SPECIES	72	CRYGC (ENSPSMG00000007741)	CRYGD (ENSPSMG00000007725)	ENSPSMG00000007717	PLEKHM3 (ENSPSMG00000007709)	ENSPSMG00000007677	FZD5 (ENSPSMG00000007673)	ENSPSMG00000007649	METTL21A (ENSPSMG00000007593)	KLF7 (ENSPSMG00000007540)	CPO (ENSPSMG00000007503)	FASTKD2 (ENSPSMG00000007493)	MDH1B (ENSPSMG00000007477)	DYTN (ENSPSMG00000007453)	FAM237A (ENSPSMG00000007448)	ADAM23 (ENSPSMG00000007400)	ENSPSMG00000007324 ##22	ZDBF2 (ENSPSMG00000007318)
Lemuriformes_a	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183101.a.b.a.j ##22
Greater bamboo lemur	MODERN SPECIES	158													KHSRP (ENSPSMG00000010582)	SLC25A41 (ENSPSMG00000010572)	SLC25A23 (ENSPSMG00000010559)	ENSPSMG00000010533 ##22	DENND1C (ENSPSMG00000010519)	TUBB4A (ENSPSMG00000010210)	TNFSF9 (ENSPSMG00000010091)	CD70 (ENSPSMG00000010087)	TNFSF14 (ENSPSMG00000010082)	C3 (ENSPSMG00000010055)	GPR108 (ENSPSMG00000009999)	TRIP10 (ENSPSMG00000009927)	SH2D3A (ENSPSMG00000009873)	VAV1 (ENSPSMG00000009646)	ADGRE1 (ENSPSMG00000009291)
Mouse lemur	MODERN SPECIES	16	NRTN (ENSMICG00000044302)	NDUFA11 (ENSMICG00000033137)	VMAC (ENSMICG00000046967)	CAPS (ENSMICG00000004017)	RANBP3 (ENSMICG00000004018)	RFX2 (ENSMICG00000004022)	ACSBG2 (ENSMICG00000014476)	MLLT1 (ENSMICG00000006273)	ACER1 (ENSMICG00000006279)	ENSMICG00000006284	ALKBH7 (ENSMICG00000006288)	PSPN (ENSMICG00000044211)	GTF2F1 (ENSMICG00000006292)	KHSRP (ENSMICG00000007863)	SLC25A23 (ENSMICG00000034151)	CRB3 (ENSMICG00000034140) ##22	DENND1C (ENSMICG00000004586)	TUBB4A (ENSMICG00000014890)	TNFSF9 (ENSMICG00000046337)	CD70 (ENSMICG00000042047)	TNFSF14 (ENSMICG00000033223)	C3 (ENSMICG00000000921)	GPR108 (ENSMICG00000042263)	TRIP10 (ENSMICG00000000935)	SH2D3A (ENSMICG00000000937)	VAV1 (ENSMICG00000014001)	ADGRE1 (ENSMICG00000034364)	ENSMICG00000042948	INSR (ENSMICG00000011978)
Atlantogenata	ANCESTRAL SPECIES	124					ENSGT00940000155332.A	ENSGT00940000158800	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000163693	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354
Xenarthra	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22
Armadillo	MODERN SPECIES	757						ENSDNOG00000046889	MLLT1 (ENSDNOG00000045050)	ENSDNOG00000016623	CLPP (ENSDNOG00000040919)	ALKBH7 (ENSDNOG00000005049)	PSPN (ENSDNOG00000047434)	KHSRP (ENSDNOG00000046507)	SLC25A41 (ENSDNOG00000041952)	SLC25A23 (ENSDNOG00000044731)	DENND1C (ENSDNOG00000036339)	CRB3 (ENSDNOG00000016609) ##22	TUBB4A (ENSDNOG00000044946)	ENSDNOG00000034894
Afrotheria	ANCESTRAL SPECIES	182					ENSGT00940000155332.A	ENSGT00940000158800	ENSGT00730000110920.b.a.a	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000163693	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744
Afrotheria_a	ANCESTRAL SPECIES	223												ENSGT00940000163693	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000162419	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00390000006244	ENSGT00390000006744
Hyrax	MODERN SPECIES	1927															SLC25A23 (ENSPCAG00000016281)	CRB3 (ENSPCAG00000016358) ##22	DENND1C (ENSPCAG00000016381)
Elephant	MODERN SPECIES	46	SH2D3A (ENSLAFG00000010477)	TRIP10 (ENSLAFG00000010470)	C3 (ENSLAFG00000010462)	TNFSF14 (ENSLAFG00000021999)	ACSBG2 (ENSLAFG00000006705)	MLLT1 (ENSLAFG00000026589)	ACER1 (ENSLAFG00000012500)	CLPP (ENSLAFG00000027937)	ALKBH7 (ENSLAFG00000003852)	ENSLAFG00000003851	ENSLAFG00000030192	ENSLAFG00000020872	KHSRP (ENSLAFG00000002426)	SLC25A41 (ENSLAFG00000028633)	SLC25A23 (ENSLAFG00000013828)	CRB3 (ENSLAFG00000013740) ##22	TNFSF9 (ENSLAFG00000028534)	CD70 (ENSLAFG00000008781)	ENSLAFG00000027235	ENSLAFG00000013350	RANBP3 (ENSLAFG00000001841)	CAPS (ENSLAFG00000028433)	VMAC (ENSLAFG00000005431)	NDUFA11 (ENSLAFG00000028920)	ENSLAFG00000013441	ENSLAFG00000010081	ENSLAFG00000023311	NRTN (ENSLAFG00000000500)	DUS3L (ENSLAFG00000027552)	CATSPERD (ENSLAFG00000030723)	LONP1 (ENSLAFG00000031651)
Sauria	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00950000183135.A.b	ENSGT00390000009595.b	ENSGT00940000162059	ENSGT00390000011987	ENSGT01050000244879.a.b	ENSGT00940000154396.b.a	ENSGT00390000009016	ENSGT00940000154739.A	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000163693	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000167422	ENSGT00940000160312	ENSGT00390000003420.a.a	ENSGT01030000234559.a.a.b.a	ENSGT00940000166147	ENSGT00390000009916	ENSGT00940000154990	ENSGT00940000154912	ENSGT00940000160578	ENSGT00940000159684	ENSGT00390000004692.d.a	ENSGT00940000163111.a.b.a	ENSGT00530000063936.a	ENSGT00940000154382.a.a	ENSGT00940000153877
Lepidosauria	ANCESTRAL SPECIES	81	ENSGT00940000162102	ENSGT00950000183135.A.b	ENSGT00390000009595.b	ENSGT00940000162059	ENSGT00390000011987	ENSGT01050000244879.a.b	ENSGT00940000154396.b.a	ENSGT00940000154739.A	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000163693	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000154394.b.a.a.a.b	ENSGT00940000164486	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000165414	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354.a	ENSGT01030000234575.c.a.b
Episquamata	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000162102	ENSGT00950000183135.A.b	ENSGT00390000009595.b	ENSGT00940000162059	ENSGT00390000011987	ENSGT01050000244879.a.b	ENSGT00940000154396.b.a	ENSGT00940000154739.A	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000163693	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000154394.b.a.a.a.a.b	ENSGT00940000164486	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000165414	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000156887	ENSGT00390000002634.a	ENSGT00940000161856	ENSGT00940000158116	ENSGT00390000004872	ENSGT00390000006387	ENSGT00950000182915.b.b.a.a
Laterata	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000162102	ENSGT00950000183135.A.b	ENSGT00390000009595.b	ENSGT00940000162059	ENSGT00390000011987	ENSGT01050000244879.a.b	ENSGT00940000154396.b.a	ENSGT00940000154739.A	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000163693	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000154394.b.a.a.a.a.b	ENSGT00940000164486	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000165414	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000156887	ENSGT00390000002634.a	ENSGT00940000161856	ENSGT00940000158116	ENSGT00390000004872	ENSGT00390000006387	ENSGT00950000182915.b.b.a.a
Argentine black and white tegu	MODERN SPECIES	85	PODNL1 (ENSSMRG00000017021)	ENSSMRG00000017032	DCAF15 (ENSSMRG00000017041)	RFX1 (ENSSMRG00000017045)	RLN3 (ENSSMRG00000017065)	ENSSMRG00000017066	ENSSMRG00000017068	ENSSMRG00000017070	CLPP (ENSSMRG00000017071)	ALKBH7 (ENSSMRG00000017074)	PSPN (ENSSMRG00000017075)	GTF2F1 (ENSSMRG00000017079)	ENSSMRG00000017080	KHSRP (ENSSMRG00000017081)	SLC25A23 (ENSSMRG00000017083)	CRB3 (ENSSMRG00000017085) ##22	ENSSMRG00000017088	ENSSMRG00000017091	ENSSMRG00000017093	TNFSF14 (ENSSMRG00000017096)
Toxicofera	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00390000011740	ENSGT00940000162102	ENSGT00950000183135.A.b	ENSGT00390000009595.b	ENSGT00940000162059	ENSGT00390000011987	ENSGT01050000244879.a.b	ENSGT00940000154396.b.a	ENSGT00940000154739.A	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000163693	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000173726	ENSGT00940000154394.b.a.a.a.a.b	ENSGT00940000164486	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b	ENSGT00940000165414	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000156887	ENSGT00390000002634.a	ENSGT00940000161856	ENSGT00940000158116	ENSGT00390000004872
Elapidae	DUPLICATION
Elapidae	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000162102	ENSGT00950000183135.A.b	ENSGT00390000009595.b	ENSGT00940000162059	ENSGT00390000011987	ENSGT01050000244879.a.b	ENSGT00940000154396.b.a	ENSGT00940000154739.A	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000163693	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a.k ##22	ENSGT00940000154394.b.a.b	ENSGT00940000164486	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b.qb.a	ENSGT00940000154063.C.a.b.pb	ENSGT00940000165414	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00940000159125.d	ENSGT00940000156887	ENSGT00390000002634.a	ENSGT00940000161856	ENSGT00940000158116	ENSGT00390000004872	ENSGT00390000006387
Indian cobra	MODERN SPECIES	1	ZSWIM4 (ENSNNAG00000018999)	CC2D1A (ENSNNAG00000019016)	PODNL1 (ENSNNAG00000019023)	DCAF15 (ENSNNAG00000019025)	RFX1 (ENSNNAG00000019027)	RLN3 (ENSNNAG00000019028)	ENSNNAG00000019030	ENSNNAG00000007120	CLPP (ENSNNAG00000007375)	ALKBH7 (ENSNNAG00000007389)	PSPN (ENSNNAG00000007400)	GTF2F1 (ENSNNAG00000007411)	ENSNNAG00000007441	KHSRP (ENSNNAG00000007484)	ENSNNAG00000007536	CRB3 (ENSNNAG00000007632) ##22	ENSNNAG00000007666	ENSNNAG00000007760	ENSNNAG00000007830	ENSNNAG00000008112	ENSNNAG00000008178	ENSNNAG00000008657	ENSNNAG00000008828	ENSNNAG00000008895	TRIP10 (ENSNNAG00000009000)	SH2D3A (ENSNNAG00000009558)	VAV1 (ENSNNAG00000009811)	SMARCA4 (ENSNNAG00000011180)	DNASE2 (ENSNNAG00000011869)	KLF1 (ENSNNAG00000011895)	GCDH (ENSNNAG00000011936)
Elapidae_a	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00940000162102	ENSGT00950000183135.A.b	ENSGT00390000009595.b	ENSGT00940000162059	ENSGT00390000011987	ENSGT01050000244879.a.b	ENSGT00940000154396.b.a	ENSGT00940000154739.A	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000163693	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a.k ##22	ENSGT00940000154394.b.a.a.a.b	ENSGT00940000164486	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b.qb.a
Acanthophiinae	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00940000162102	ENSGT00950000183135.A.b	ENSGT00390000009595.b	ENSGT00940000162059	ENSGT00390000011987	ENSGT01050000244879.a.b	ENSGT00940000154396.b.a	ENSGT00940000154739.A	ENSGT00390000005830	ENSGT00390000014585	ENSGT00950000182993.B.b	ENSGT00440000038032	ENSGT00940000163693	ENSGT00940000156051	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a.k ##22	ENSGT00940000154394.b.a.a.a.b	ENSGT00940000164486	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b.qb.a
Mainland tiger snake	MODERN SPECIES	167	NANOS3 (ENSNSUG00000013277)	CC2D1A (ENSNSUG00000013279)	PODNL1 (ENSNSUG00000013309)	DCAF15 (ENSNSUG00000013311)	RFX1 (ENSNSUG00000013312)	RLN3 (ENSNSUG00000013313)	ENSNSUG00000013319	ENSNSUG00000013321	CLPP (ENSNSUG00000013322)	ALKBH7 (ENSNSUG00000013323)	PSPN (ENSNSUG00000013324)	GTF2F1 (ENSNSUG00000013325)	ENSNSUG00000013327	KHSRP (ENSNSUG00000013328)	SLC25A23 (ENSNSUG00000013332)	CRB3 (ENSNSUG00000013333) ##22	ENSNSUG00000013334	ENSNSUG00000013335	ENSNSUG00000013337	TNFSF14 (ENSNSUG00000013338)	ENSNSUG00000013339
Eastern brown snake	MODERN SPECIES	52	ZSWIM4 (ENSPTXG00000004034)	NANOS3 (ENSPTXG00000004029)	CC2D1A (ENSPTXG00000004028)	PODNL1 (ENSPTXG00000004027)	DCAF15 (ENSPTXG00000004026)	RFX1 (ENSPTXG00000004025)	RLN3 (ENSPTXG00000003968)	ENSPTXG00000003932	CLPP (ENSPTXG00000003924)	PSPN (ENSPTXG00000006836)	ALKBH7 (ENSPTXG00000006835)	GTF2F1 (ENSPTXG00000006834)	ENSPTXG00000006833	KHSRP (ENSPTXG00000006832)	SLC25A23 (ENSPTXG00000006831)	CRB3 (ENSPTXG00000006829) ##22	ENSPTXG00000006828	ENSPTXG00000006827	ENSPTXG00000006826	TNFSF14 (ENSPTXG00000006825)
Blue-lipped sea krait	MODERN SPECIES	7341																ENSLLTG00000016061 ##22
Elapidae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183101.a.b.a.l ##22
Elapidae_a	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183101.a.b.a.l ##22
Blue-lipped sea krait	MODERN SPECIES	5097						ENSLLTG00000009266	RTN4RL1 (ENSLLTG00000009261)	RPA1 (ENSLLTG00000009223)	SMYD4 (ENSLLTG00000009209)	SERPINF1 (ENSLLTG00000009193)	SERPINF2 (ENSLLTG00000009170)	WDR81 (ENSLLTG00000009080)	ENSLLTG00000009056	PRPF8 (ENSLLTG00000008439)	RILP (ENSLLTG00000008383)	ENSLLTG00000008309 ##22	SLC43A2 (ENSLLTG00000008266)	PITPNA (ENSLLTG00000008244)	ENSLLTG00000008225
Archelosauria	ANCESTRAL SPECIES	178															ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22
Cryptodira	ANCESTRAL SPECIES	39	ENSGT00940000159680	ENSGT01010000222313.A.b.a.c	ENSGT00390000005147	ENSGT00940000160257	ENSGT00940000160389	ENSGT00510000047770.c.a	ENSGT00940000153116.C.b	ENSGT00940000161935	ENSGT00940000160315	ENSGT00390000007170	ENSGT00940000158145	ENSGT00390000008201	ENSGT00390000016298.a	ENSGT00940000157552	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573	ENSGT00940000154394.b.a.a.b.b	ENSGT00940000164486	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b.hb.b	ENSGT00940000154063.C.a.b.hb.a	ENSGT00940000154063.C.a.b.ib	ENSGT00940000165414	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a.a	ENSGT00940000154130.a.a.a.b	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354.a	ENSGT00940000162163.f
Testudinoidea	ANCESTRAL SPECIES	36	ENSGT00940000159680	ENSGT01010000222313.A.b.a.c	ENSGT00390000005147	ENSGT00940000160257	ENSGT00940000160389	ENSGT00510000047770.c.a	ENSGT00940000153116.C.b	ENSGT00940000161935	ENSGT00940000160315	ENSGT00390000007170	ENSGT00940000158145	ENSGT00390000008201	ENSGT00390000016298.a	ENSGT00940000157552	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b.hb.b.c	ENSGT00940000154063.C.a.b.hb.a	ENSGT00940000154063.C.a.b.ib	ENSGT00940000165414	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354.a	ENSGT01030000234575.c.a.b.a.b
Testudinidae	ANCESTRAL SPECIES	54	ENSGT00940000159680	ENSGT01010000222313.A.b.a.c	ENSGT00390000005147	ENSGT00940000160257	ENSGT00940000160389	ENSGT00510000047770.c.a	ENSGT00940000153116.C.b	ENSGT00940000161935	ENSGT00940000160315	ENSGT00390000007170	ENSGT00940000158145	ENSGT00390000008201	ENSGT00390000016298.a	ENSGT00940000157552	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000154394.b.a.b	ENSGT00940000164486	ENSGT00390000016573.c.b	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b.hb.b.c	ENSGT00940000154063.C.a.b.hb.a.d	ENSGT00940000154063.C.a.b.hb.a.c.a	ENSGT00940000154063.C.a.b.ib	ENSGT00940000165414	ENSGT00940000160446	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000154130.a.a.a.a	ENSGT00940000159125	ENSGT00940000161354.a	ENSGT01030000234575.c.a.b.a.b
Goode s thornscrub tortoise	MODERN SPECIES	152	CNN1 (ENSGEVG00005019391)	ENSGEVG00005019399	ECSIT (ENSGEVG00005019407)	ZNF653 (ENSGEVG00005019421)	ELAVL3 (ENSGEVG00005019440)	PRKCSH (ENSGEVG00005019511)	ODAD3 (ENSGEVG00005019517)	RGL3 (ENSGEVG00005013372)	EPOR (ENSGEVG00005013419)	SWSAP1 (ENSGEVG00005013469)	PLPPR2 (ENSGEVG00005013540)	CCDC159 (ENSGEVG00005013994)	TMEM205 (ENSGEVG00005014029)	RAB3D (ENSGEVG00005014050)	SLC25A23 (ENSGEVG00005014073)	CRB3 (ENSGEVG00005014096) ##22
Abingdon island giant tortoise	MODERN SPECIES	99	ELOF1 (ENSCABG00000003032)	CNN1 (ENSCABG00000003041)	ENSCABG00000003049	ECSIT (ENSCABG00000003090)	ZNF653 (ENSCABG00000003093)	ELAVL3 (ENSCABG00000003103)	PRKCSH (ENSCABG00000003210)	ENSCABG00000003213	ENSCABG00000003217	EPOR (ENSCABG00000003220)	ENSCABG00000003222	ENSCABG00000003225	TMEM205 (ENSCABG00000003230)	ENSCABG00000003233	SLC25A23 (ENSCABG00000003235)	CRB3 (ENSCABG00000003238) ##22	ENSCABG00000003241	ENSCABG00000003246	ENSCABG00000003705	ENSCABG00000003912	TNFSF14 (ENSCABG00000003918)	ENSCABG00000003937
Emydidae	ANCESTRAL SPECIES	48	ENSGT00390000013719	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.b.b	ENSGT00390000016735	ENSGT00390000000053	ENSGT00940000159680	ENSGT01010000222313.A.b.a.c	ENSGT00390000005147	ENSGT00940000160257	ENSGT00940000160389	ENSGT00510000047770.c.a	ENSGT00940000153116.C.b	ENSGT00960000189790	ENSGT00390000016298.a	ENSGT00940000157552	ENSGT00940000159428	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000154394.a	ENSGT00940000164486	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154063.C.a.b.hb.b.c
painted turtle	MODERN SPECIES	931												ENSCPBG00000013980	TMEM205 (ENSCPBG00000013984)	ENSCPBG00000013985	SLC25A23 (ENSCPBG00000013986)	CRB3 (ENSCPBG00000013987) ##22	ENSCPBG00000013989	ENSCPBG00000013991	ENSCPBG00000013993	ENSCPBG00000013995	ENSCPBG00000013997	ENSCPBG00000013998	TNFSF14 (ENSCPBG00000013999)	ENSCPBG00000014003	ENSCPBG00000014084	ENSCPBG00000014190	ENSCPBG00000015613	ENSCPBG00000015622
Archosauria	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183101.a.b.a ##22
Australian saltwater crocodile	MODERN SPECIES	50	ENSCPRG00005015854	ENSCPRG00005015871	SMG6 (ENSCPRG00005015877)	HIC1 (ENSCPRG00005015880)	ENSCPRG00005015881	DPH1 (ENSCPRG00005015884)	RTN4RL1 (ENSCPRG00005015891)	RPA1 (ENSCPRG00005015893)	SMYD4 (ENSCPRG00005015896)	SERPINF1 (ENSCPRG00005015899)	SERPINF2 (ENSCPRG00005015901)	WDR81 (ENSCPRG00005015906)	ENSCPRG00005015913	ENSCPRG00005015915	PRPF8 (ENSCPRG00005015922)	ENSCPRG00005015972 ##22	SLC43A2 (ENSCPRG00005015982)	PITPNA (ENSCPRG00005016005)	INPP5K (ENSCPRG00005016011)	MYO1C (ENSCPRG00005016046)	YWHAE (ENSCPRG00005016192)	CRK (ENSCPRG00005016195)
Anura	ANCESTRAL SPECIES	577																ENSGT00950000183101.a.b.a ##22	ENSGT00940000161573
Frog	MODERN SPECIES	3	clpp (ENSXETG00000005576)	misp3 (ENSXETG00000038750)	palm3 (ENSXETG00000005574)	ENSXETG00000035478	rln3 (ENSXETG00000033085)	rfx1 (ENSXETG00000005567)	dcaf15 (ENSXETG00000005570)	ENSXETG00000037742	cc2d1a (ENSXETG00000005556)	NANOS3 (ENSXETG00000021874)	zswim4 (ENSXETG00000021870)	c19orf53 (ENSXETG00000038713)	mri1 (ENSXETG00000021867)	khsrp (ENSXETG00000021862)	slc25a23 (ENSXETG00000024509)	crb3 (ENSXETG00000024510) ##22	dennd1c (ENSXETG00000024511)	tubb4a (ENSXETG00000021860)	ENSXETG00000042646	c3p1 (ENSXETG00000048045)	ENSXETG00000045964	c3 (ENSXETG00000017270)	XB5961369 [provisional:plpp3] (ENSXETG00000017268)	ENSXETG00000034841	ENSXETG00000037171	ENSXETG00000032992	TNFSF14 (ENSXETG00000047773)	ENSXETG00000031312	ddx27 (ENSXETG00000017231)	arrb2 (ENSXETG00000044534)	pelp1 (ENSXETG00000017229)
Leishan spiny toad	MODERN SPECIES	6	ENSLLEG00000013842	NACC1 (ENSLLEG00000013805)	STX10 (ENSLLEG00000013744)	IER2 (ENSLLEG00000013715)	YJU2B (ENSLLEG00000013539)	ENSLLEG00000013312	ENSLLEG00000013269	CACNA1A (ENSLLEG00000013048)	ENSLLEG00000012941	ENSLLEG00000012514	ENSLLEG00000012469	ENSLLEG00000012200	ENSLLEG00000011916	SLC25A23 (ENSLLEG00000011578)	ENSLLEG00000011499	ENSLLEG00000011461 ##22	DENND1C (ENSLLEG00000011348)	ENSLLEG00000011260	KHSRP (ENSLLEG00000011156)	MRI1 (ENSLLEG00000011067)	ENSLLEG00000011033	ENSLLEG00000010795	NANOS3 (ENSLLEG00000010759)	ENSLLEG00000010735	ENSLLEG00000010700	ACHE (ENSLLEG00000010628)	ENSLLEG00000010606	C17orf49 (ENSLLEG00000010539)	RNASEK (ENSLLEG00000010493)	ENSLLEG00000010319	ARRB2 (ENSLLEG00000009872)
Gnathostomata	ANCESTRAL SPECIES	1213																ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b
Euteleostomi	ANCESTRAL SPECIES	371										ENSGT00950000182902.b.b.b	ENSGT00940000164941	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00940000170528	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538
Sarcopterygii	ANCESTRAL SPECIES	97	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT00950000182902.b.b.b	ENSGT00940000164941	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00940000170528	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b
Coelacanth	MODERN SPECIES	1497							SERPINF1 (ENSLACG00000002152)	SERPINF2 (ENSLACG00000003316)	WDR81 (ENSLACG00000004591)	ENSLACG00000006705	ENSLACG00000008979	TLCD2 (ENSLACG00000009472)	ENSLACG00000010056	PRPF8 (ENSLACG00000010479)	RILP (ENSLACG00000011193)	SCARF1 (ENSLACG00000011622) ##22	ENSLACG00000011926
Tetrapoda	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT00950000182902.b.b.b	ENSGT00940000164941	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b
Amniota	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT00940000165249	ENSGT00950000182902.b.b.b	ENSGT00940000164941	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00980000202327
Sauria	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT00940000165249	ENSGT00950000182902.b.b.b	ENSGT00940000164941	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00820000127055.a	ENSGT00970000194055
Lepidosauria	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT00940000164941	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT01090000260061.c.b
Episquamata	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000153571.a	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT00940000164941	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT01090000260061.c.b
Laterata	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00390000014591	ENSGT00940000153571.a	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT00940000164941	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000155101	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT01090000260061.c.b
Common wall lizard	MODERN SPECIES	6	TMEM199 (ENSPMRG00000017628)	POLDIP2 (ENSPMRG00000017654)	SMG6 (ENSPMRG00000017726)	ENSPMRG00000017789	OVCA2 (ENSPMRG00000017798)	DPH1 (ENSPMRG00000017805)	RTN4RL1 (ENSPMRG00000017823)	RPA1 (ENSPMRG00000017869)	SMYD4 (ENSPMRG00000018012)	SERPINF1 (ENSPMRG00000018032)	SERPINF2 (ENSPMRG00000018050)	WDR81 (ENSPMRG00000020584)	ENSPMRG00000020611	TLCD2 (ENSPMRG00000020629)	PRPF8 (ENSPMRG00000020662)	SCARF1 (ENSPMRG00000020789) ##22	SLC43A2 (ENSPMRG00000020824)	ENSPMRG00000020862	INPP5K (ENSPMRG00000020880)	MYO1C (ENSPMRG00000021007)	YWHAE (ENSPMRG00000021673)	CRK (ENSPMRG00000021684)	ENSPMRG00000021690	TLCD1 (ENSPMRG00000021701)	NEK8 (ENSPMRG00000021719)	TRAF4 (ENSPMRG00000021751)	FAM222B (ENSPMRG00000021770)	ENSPMRG00000021775	ERAL1 (ENSPMRG00000021793)	FLOT2 (ENSPMRG00000021864)	ENSPMRG00000021987
Argentine black and white tegu	MODERN SPECIES	215			CRK (ENSSMRG00000007637)	YWHAE (ENSSMRG00000007634)	MYO1C (ENSSMRG00000007627)	DPH1 (ENSSMRG00000007613)	RTN4RL1 (ENSSMRG00000007609)	RPA1 (ENSSMRG00000007606)	SERPINF1 (ENSSMRG00000007275)	SMYD4 (ENSSMRG00000007273)	SERPINF2 (ENSSMRG00000007269)	WDR81 (ENSSMRG00000007268)	ENSSMRG00000007266	TLCD2 (ENSSMRG00000007265)	ENSSMRG00000006997	SCARF1 (ENSSMRG00000006988) ##22	SLC43A2 (ENSSMRG00000006980)	PITPNA (ENSSMRG00000006976)	ENSSMRG00000006970	INPP5K (ENSSMRG00000006967)	OVCA2 (ENSSMRG00000006966)
Toxicofera	ANCESTRAL SPECIES	43	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT00940000165249	ENSGT00940000164941	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT01090000260061.c.b
Elapidae	ANCESTRAL SPECIES	44	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT00940000165249	ENSGT00940000164941	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT01090000260061.c.b
Elapidae_a	ANCESTRAL SPECIES	104	ENSGT00530000063751.b	ENSGT00390000014591	ENSGT00940000153571.a.w	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT01090000260061.c.b
Acanthophiinae	ANCESTRAL SPECIES	102	ENSGT00530000063751.b	ENSGT00390000014591	ENSGT00940000153571.a.w	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT01090000260061.c.b
Eastern brown snake	MODERN SPECIES	156	VTN (ENSPTXG00000011469)	TMEM199 (ENSPTXG00000011472)	POLDIP2 (ENSPTXG00000011473)	HIC1 (ENSPTXG00000011474)	OVCA2 (ENSPTXG00000011478)	DPH1 (ENSPTXG00000011482)	RTN4RL1 (ENSPTXG00000011484)	RPA1 (ENSPTXG00000011486)	SMYD4 (ENSPTXG00000011529)	SERPINF1 (ENSPTXG00000011549)	SERPINF2 (ENSPTXG00000011559)	ENSPTXG00000011579	ENSPTXG00000011584	PRPF8 (ENSPTXG00000011585)	RILP (ENSPTXG00000011586)	SCARF1 (ENSPTXG00000011587) ##22	SLC43A2 (ENSPTXG00000011604)	PITPNA (ENSPTXG00000011605)	INPP5K (ENSPTXG00000011607)	MYO1C (ENSPTXG00000011608)	YWHAE (ENSPTXG00000011610)	CRK (ENSPTXG00000011611)
Mainland tiger snake	MODERN SPECIES	484										ENSNSUG00000007022	WDR81 (ENSNSUG00000007021)	TLCD2 (ENSNSUG00000007019)	ENSNSUG00000007018	ENSNSUG00000007017	RILP (ENSNSUG00000007016)	SCARF1 (ENSNSUG00000007015) ##22	SLC43A2 (ENSNSUG00000006976)	PITPNA (ENSNSUG00000006957)	INPP5K (ENSNSUG00000006956)	MYO1C (ENSNSUG00000006316)	YWHAE (ENSNSUG00000006310)	CRK (ENSNSUG00000006309)
Indian cobra	MODERN SPECIES		HIC1 (ENSNNAG00000001035)	OVCA2 (ENSNNAG00000001012)	DPH1 (ENSNNAG00000000991)	RTN4RL1 (ENSNNAG00000000985)	RPA1 (ENSNNAG00000000955)	SMYD4 (ENSNNAG00000000926)	SERPINF1 (ENSNNAG00000000910)	SERPINF2 (ENSNNAG00000000900)	WDR81 (ENSNNAG00000000881)	ENSNNAG00000000858	ENSNNAG00000000836	ENSNNAG00000000822	PRPF8 (ENSNNAG00000000780)	RILP (ENSNNAG00000000752)	ENSNNAG00000000737	ENSNNAG00000000728 ##22	SLC43A2 (ENSNNAG00000000715)	PITPNA (ENSNNAG00000000688)	INPP5K (ENSNNAG00000000662)	MYO1C (ENSNNAG00000000564)	YWHAE (ENSNNAG00000000513)	CRK (ENSNNAG00000000479)	TLCD3A (ENSNNAG00000000461)	GEMIN4 (ENSNNAG00000000444)	GLOD4 (ENSNNAG00000000418)	ENSNNAG00000000408	ENSNNAG00000000404	ENSNNAG00000000382	NEK8 (ENSNNAG00000000352)	ENSNNAG00000000331	ENSNNAG00000000317
tuatara	MODERN SPECIES	1079	ENSSPUG00000007144	SMG6 (ENSSPUG00000007152)	HIC1 (ENSSPUG00000007168)	OVCA2 (ENSSPUG00000007174)	DPH1 (ENSSPUG00000007183)	RPA1 (ENSSPUG00000007223)	SMYD4 (ENSSPUG00000007262)	SERPINF1 (ENSSPUG00000007331)	SERPINF2 (ENSSPUG00000007353)	WDR81 (ENSSPUG00000007414)	ENSSPUG00000007430	ENSSPUG00000007441	TLCD2 (ENSSPUG00000007453)	PRPF8 (ENSSPUG00000007463)	RILP (ENSSPUG00000007481)	SCARF1 (ENSSPUG00000007503) ##22	ENSSPUG00000007541	ENSSPUG00000007548	ENSSPUG00000007561	PITPNA (ENSSPUG00000007575)	ENSSPUG00000007580	INPP5K (ENSSPUG00000007597)	MYO1C (ENSSPUG00000007626)	YWHAE (ENSSPUG00000007685)	CRK (ENSSPUG00000007698)	ENSSPUG00000007711	ENSSPUG00000007722	ENSSPUG00000007734	ENSSPUG00000007746	TRPV3 (ENSSPUG00000007777)	ASPA (ENSSPUG00000007939)
Archelosauria	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT00950000182902.b.b.b	ENSGT00940000164941	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00820000127055.a	ENSGT00970000194055
Cryptodira	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT00950000182902.b.b.b	ENSGT00940000164941	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00820000127055.a	ENSGT00970000194055
Testudinoidea	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT00950000182902.b.b.b	ENSGT00940000164941	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00820000127055.a	ENSGT00970000194055
Testudinidae	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000153195.A.y.a	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT00950000182902.b.b.b	ENSGT00940000164941	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT01090000260061.c.b
Goode s thornscrub tortoise	MODERN SPECIES	8	ENSGEVG00005008886	SRR (ENSGEVG00005008846)	SMG6 (ENSGEVG00005008805)	HIC1 (ENSGEVG00005008711)	DPH1 (ENSGEVG00005008684)	RTN4RL1 (ENSGEVG00005008658)	RPA1 (ENSGEVG00005008631)	SMYD4 (ENSGEVG00005008610)	SERPINF1 (ENSGEVG00005008590)	SERPINF2 (ENSGEVG00005008501)	WDR81 (ENSGEVG00005008470)	ENSGEVG00005008445	ENSGEVG00005008372	PRPF8 (ENSGEVG00005007995)	RILP (ENSGEVG00005007936)	SCARF1 (ENSGEVG00005007678) ##22	SLC43A2 (ENSGEVG00005007579)	PITPNA (ENSGEVG00005007505)	INPP5K (ENSGEVG00005007410)	MYO1C (ENSGEVG00005007274)	YWHAE (ENSGEVG00005007234)	CRK (ENSGEVG00005007211)
Emydidae	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725.a	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT00950000182902.b.b.b	ENSGT00940000164941	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT01090000260061.c.b
painted turtle	MODERN SPECIES	714	TSR1 (ENSCPBG00000020363)	SRR (ENSCPBG00000020367)	SMG6 (ENSCPBG00000020369)	DPH1 (ENSCPBG00000020374)	RTN4RL1 (ENSCPBG00000020375)	RPA1 (ENSCPBG00000020377)	SMYD4 (ENSCPBG00000020380)	SERPINF1 (ENSCPBG00000020382)	SERPINF2 (ENSCPBG00000020383)	WDR81 (ENSCPBG00000020386)	ENSCPBG00000020389	ENSCPBG00000020394	TLCD2 (ENSCPBG00000020397)	PRPF8 (ENSCPBG00000020409)	RILP (ENSCPBG00000020457)	SCARF1 (ENSCPBG00000020458) ##22	SLC43A2 (ENSCPBG00000020460)	PITPNA (ENSCPBG00000020463)	INPP5K (ENSCPBG00000020466)	MYO1C (ENSCPBG00000020489)
Three-toed box turtle	MODERN SPECIES	106	SRR (ENSTMTG00000009621)	SMG6 (ENSTMTG00000009645)	OVCA2 (ENSTMTG00000009740)	DPH1 (ENSTMTG00000009750)	RTN4RL1 (ENSTMTG00000009764)	RPA1 (ENSTMTG00000009788)	SMYD4 (ENSTMTG00000010031)	SERPINF1 (ENSTMTG00000010163)	SERPINF2 (ENSTMTG00000010180)	WDR81 (ENSTMTG00000010194)	ENSTMTG00000010213	ENSTMTG00000010239	ENSTMTG00000010265	PRPF8 (ENSTMTG00000010283)	ENSTMTG00000010351	SCARF1 (ENSTMTG00000010412) ##22	ENSTMTG00000010455	ENSTMTG00000010462	PITPNA (ENSTMTG00000010485)	INPP5K (ENSTMTG00000010549)	MYO1C (ENSTMTG00000010619)	YWHAE (ENSTMTG00000010767)	CRK (ENSTMTG00000010782)
Chinese turtle	MODERN SPECIES	1341												ENSPSIG00000000684	ENSPSIG00000015593	PRPF8 (ENSPSIG00000013393)	ENSPSIG00000013386	SCARF1 (ENSPSIG00000013380) ##22	SLC43A2 (ENSPSIG00000012910)	ENSPSIG00000012900	PITPNA (ENSPSIG00000011835)	INPP5K (ENSPSIG00000011689)	YWHAE (ENSPSIG00000011614)
Archosauria	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112.d	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT00950000182902.b.b.b	ENSGT00940000164941	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00820000127055.a	ENSGT00390000005712	ENSGT00940000161370	ENSGT00940000153883.b	ENSGT00940000154540.a	ENSGT00940000161327	ENSGT00390000006030.d.a.b	ENSGT00390000014189	ENSGT00950000183122.B	ENSGT00390000001752
Aves	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112.d	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT00940000164941	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00820000127055.a	ENSGT00390000005712	ENSGT00940000161370	ENSGT00940000153883.b	ENSGT00940000154540.a	ENSGT00940000161327	ENSGT00390000006030.d.a.b	ENSGT00390000014189	ENSGT00950000183122.B	ENSGT00390000001752
Neognathae	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112.d	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT00940000164941	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00820000127055.a	ENSGT00390000005712	ENSGT00940000161370	ENSGT00940000153883.b	ENSGT00940000154540.a	ENSGT00940000161327	ENSGT00390000006030.d.a.b	ENSGT00390000014189	ENSGT00950000183122.B.k	ENSGT00390000001752
Galloanserae	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112.d	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT00940000164941	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00820000127055.a	ENSGT00390000005712	ENSGT00940000161370	ENSGT00940000153883.b	ENSGT00940000154540.a	ENSGT00940000161327	ENSGT00390000006030.d.a.b	ENSGT00390000014189	ENSGT00950000183122.B.l	ENSGT00950000183122.B.k
Anatidae	ANCESTRAL SPECIES	27	ENSGT00940000153571.a	ENSGT00940000153195.A	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112.d	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT00940000164941	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00820000127055.a	ENSGT00390000005712	ENSGT00940000161370	ENSGT00940000153883.b	ENSGT00940000154540.a	ENSGT00940000161327	ENSGT00390000006030.d.a.b	ENSGT00390000014189	ENSGT00950000183122.B.l	ENSGT00950000183122.B.k
Duck	MODERN SPECIES	2258																SCARF1 (ENSAPLG00000022358) ##22
Pink-footed goose	MODERN SPECIES	38	TMEM199 (ENSABRG00000011446)	POLDIP2 (ENSABRG00000011440)	ENSABRG00000011436	SMG6 (ENSABRG00000011424)	HIC1 (ENSABRG00000011416)	DPH1 (ENSABRG00000011413)	RTN4RL1 (ENSABRG00000011407)	RPA1 (ENSABRG00000011400)	SMYD4 (ENSABRG00000011392)	SERPINF1 (ENSABRG00000011388)	SERPINF2 (ENSABRG00000011382)	WDR81 (ENSABRG00000011378)	ENSABRG00000011373	PRPF8 (ENSABRG00000011090)	RILP (ENSABRG00000011031)	SCARF1 (ENSABRG00000010994) ##22	SLC43A2 (ENSABRG00000010721)	ENSABRG00000010696	INPP5K (ENSABRG00000010640)	MYO1C (ENSABRG00000010284)	YWHAE (ENSABRG00000010257)	CRK (ENSABRG00000010250)	NCBP3 (ENSABRG00000010179)	LRRC75A (ENSABRG00000010155)	TMEM248 (ENSABRG00000010149)	RABGEF1 (ENSABRG00000010131)	KCTD7 (ENSABRG00000010119)	TPST1 (ENSABRG00000010110)	CRCP (ENSABRG00000010081)	ENSABRG00000009935	ENSABRG00000007205
Phasianidae	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112.d	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT00940000164941	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b.t	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00820000127055.a	ENSGT00390000005712	ENSGT00940000161370	ENSGT00940000153883.b	ENSGT00940000154540.a	ENSGT00940000161327	ENSGT00390000006030.d.a.b	ENSGT00390000014189	ENSGT00950000183122.B.l	ENSGT00950000183122.B.k
Phasianidae_b	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112.d	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039.a	ENSGT00940000164941	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b.t	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00820000127055.a	ENSGT00390000005712	ENSGT00940000161370	ENSGT00940000153883.b	ENSGT00940000154540.a	ENSGT00940000161327	ENSGT00390000006030.d.a.b	ENSGT00390000014189	ENSGT00950000183122.B.k	ENSGT00390000001752
Chicken	MODERN SPECIES	10	SRR (ENSGALG00010029404)	SMG6 (ENSGALG00010029402)	HIC1 (ENSGALG00010029401)	OVCA2 (ENSGALG00010029397)	DPH1 (ENSGALG00010029395)	RTN4RL1 (ENSGALG00010029392)	RPA1 (ENSGALG00010029390)	SMYD4 (ENSGALG00010029389)	SERPINF1 (ENSGALG00010029387)	SERPINF2 (ENSGALG00010029936)	WDR81 (ENSGALG00010029384)	ENSGALG00010029356	TLCD2 (ENSGALG00010029354)	PRPF8 (ENSGALG00010029347)	RILP (ENSGALG00010029345)	SCARF1 (ENSGALG00010029343) ##22	SLC43A2 (ENSGALG00010029341)	PITPNA (ENSGALG00010029339)	INPP5K (ENSGALG00010029338)	MYO1C (ENSGALG00010029337)	ENSGALG00010029333	YWHAE (ENSGALG00010029332)	CRK (ENSGALG00010029327)	NCBP3 (ENSGALG00010029326)	LRRC75A (ENSGALG00010029325)	TMEM248 (ENSGALG00010029673)	RABGEF1 (ENSGALG00010029966)	KCTD7 (ENSGALG00010029672)	TPST1 (ENSGALG00010029670)	CRCP (ENSGALG00010029668)	ASL1 (ENSGALG00010029665)
Turkey	MODERN SPECIES	13	ENSMGAG00000018811	ENSMGAG00000004610	ENSMGAG00000022183	ENSMGAG00000004630	ENSMGAG00000019348	ENSMGAG00000004660	ENSMGAG00000004685	ENSMGAG00000023022	ENSMGAG00000004706	ENSMGAG00000004918	ENSMGAG00000004712	ENSMGAG00000005047	ENSMGAG00000005086	ENSMGAG00000005172	RILP (ENSMGAG00000005154)	ENSMGAG00000005116 ##22	ENSMGAG00000018323	ENSMGAG00000005210	ENSMGAG00000020347	PRPF8 (ENSMGAG00000004769)	ENSMGAG00000019785	ENSMGAG00000005231	SMYD4 (ENSMGAG00000005301)	ENSMGAG00000005264	ENSMGAG00000005251	RPA1 (ENSMGAG00000005315)	RTN4RL1 (ENSMGAG00000022629)	ENSMGAG00000022373	ENSMGAG00000005365	ENSMGAG00000018713	SMG6 (ENSMGAG00000005401)
Neognathae_b	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112.d	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT00940000164941	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00820000127055.a	ENSGT00390000005712	ENSGT00940000161370	ENSGT00940000153883.b	ENSGT00940000154540.a	ENSGT00940000161327	ENSGT00390000006030.d.a.b	ENSGT00390000014189	ENSGT00950000183122.B.k	ENSGT00390000001752
Passeriformes	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112.d	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT00940000164941	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00820000127055.a	ENSGT00390000005712	ENSGT00940000161370	ENSGT00940000153883.b	ENSGT00940000154540.a	ENSGT00940000161327	ENSGT00390000006030.d.a.b	ENSGT00390000014189	ENSGT00950000183122.B.k.b	ENSGT00950000183122.B.k.a
Passeriformes_d	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112.d	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT00940000164941	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00820000127055.a	ENSGT00390000005712	ENSGT00940000161370	ENSGT00940000153883.b	ENSGT00940000154540.a	ENSGT00940000161327	ENSGT00390000006030.d.a.b	ENSGT00390000014189	ENSGT00950000183122.B.k.b	ENSGT00950000183122.B.k.a
Passeriformes_g	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112.d	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT00940000164941	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00820000127055.a	ENSGT00390000005712	ENSGT00940000161370	ENSGT00940000153883.b	ENSGT00940000154540.a	ENSGT00940000161327	ENSGT00390000006030.d.a.b	ENSGT00390000014189	ENSGT00950000183122.B.k.b	ENSGT00950000183122.B.k.a
Passeroidea	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112.d	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT00940000164941	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00820000127055.a	ENSGT00390000005712	ENSGT00940000161370	ENSGT00940000153883.b	ENSGT00940000154540.a	ENSGT00940000161327	ENSGT00390000006030.d.a.b	ENSGT00390000014189	ENSGT00950000183122.B.k.b	ENSGT00950000183122.B.k.a
Common canary	MODERN SPECIES	28	ENSSCAG00000007209	POLDIP2 (ENSSCAG00000007202)	TSR1 (ENSSCAG00000007189)	SRR (ENSSCAG00000007175)	SMG6 (ENSSCAG00000007165)	DPH1 (ENSSCAG00000007149)	RTN4RL1 (ENSSCAG00000007145)	RPA1 (ENSSCAG00000007140)	SMYD4 (ENSSCAG00000007137)	SERPINF1 (ENSSCAG00000007130)	SERPINF2 (ENSSCAG00000007126)	WDR81 (ENSSCAG00000007123)	ENSSCAG00000007115	TLCD2 (ENSSCAG00000007110)	PRPF8 (ENSSCAG00000007016)	SCARF1 (ENSSCAG00000006989) ##22	SLC43A2 (ENSSCAG00000006985)	PITPNA (ENSSCAG00000006978)	INPP5K (ENSSCAG00000006968)	MYO1C (ENSSCAG00000006945)	YWHAE (ENSSCAG00000006940)	CRK (ENSSCAG00000006934)	NCBP3 (ENSSCAG00000006892)	LRRC75A (ENSSCAG00000006883)	TMEM248 (ENSSCAG00000006881)	RABGEF1 (ENSSCAG00000006875)	KCTD7 (ENSSCAG00000006872)	TPST1 (ENSSCAG00000006865)	CRCP (ENSSCAG00000006859)	GUSB (ENSSCAG00000006694)	VKORC1L1 (ENSSCAG00000006675)
Zebra finch	MODERN SPECIES	10	SMG6 (ENSTGUG00000005836)	SRR (ENSTGUG00000005866)	HIC1 (ENSTGUG00000005835)	OVCA2 (ENSTGUG00000028974)	DPH1 (ENSTGUG00000005814)	RTN4RL1 (ENSTGUG00000025227)	RPA1 (ENSTGUG00000005775)	SMYD4 (ENSTGUG00000005762)	SERPINF1 (ENSTGUG00000005744)	SERPINF2 (ENSTGUG00000005737)	WDR81 (ENSTGUG00000005724)	ENSTGUG00000005712	TLCD2 (ENSTGUG00000005710)	PRPF8 (ENSTGUG00000005648)	RILP (ENSTGUG00000005643)	SCARF1 (ENSTGUG00000005622) ##22	SLC43A2 (ENSTGUG00000005580)	PITPNA (ENSTGUG00000005551)	INPP5K (ENSTGUG00000005518)	MYO1C (ENSTGUG00000005458)	YWHAE (ENSTGUG00000005435)	NCBP3 (ENSTGUG00000005396)	CRK (ENSTGUG00000027683)	LRRC75A (ENSTGUG00000022437)	TMEM248 (ENSTGUG00000005387)	RABGEF1 (ENSTGUG00000005373)	KCTD7 (ENSTGUG00000020956)	TPST1 (ENSTGUG00000005366)	CRCP (ENSTGUG00000005354)	ENSTGUG00000005304	ENSTGUG00000018246
Medium ground finch	MODERN SPECIES	90	POLDIP2 (ENSGFOG00000004527)	TSR1 (ENSGFOG00000004505)	SRR (ENSGFOG00000004469)	SMG6 (ENSGFOG00000004447)	DPH1 (ENSGFOG00000004411)	RTN4RL1 (ENSGFOG00000004392)	RPA1 (ENSGFOG00000004369)	SMYD4 (ENSGFOG00000004358)	SERPINF1 (ENSGFOG00000004349)	SERPINF2 (ENSGFOG00000004343)	WDR81 (ENSGFOG00000004317)	ENSGFOG00000004267	TLCD2 (ENSGFOG00000004258)	PRPF8 (ENSGFOG00000004111)	ENSGFOG00000004087	SCARF1 (ENSGFOG00000004079) ##22	SLC43A2 (ENSGFOG00000004027)	PITPNA (ENSGFOG00000004003)	INPP5K (ENSGFOG00000003971)	MYO1C (ENSGFOG00000003927)	YWHAE (ENSGFOG00000003909)	CRK (ENSGFOG00000003894)	NCBP3 (ENSGFOG00000003825)	LRRC75A (ENSGFOG00000003788)	TMEM248 (ENSGFOG00000003770)	RABGEF1 (ENSGFOG00000003742)	KCTD7 (ENSGFOG00000003722)	TPST1 (ENSGFOG00000003679)	ENSGFOG00000003632	ASL (ENSGFOG00000003487)	GUSB (ENSGFOG00000003460)
Flycatcher	MODERN SPECIES	9	SMG6 (ENSFALG00000006538)	HIC1 (ENSFALG00000022903)	ENSFALG00000006480	OVCA2 (ENSFALG00000015180)	DPH1 (ENSFALG00000006549)	RTN4RL1 (ENSFALG00000006561)	RPA1 (ENSFALG00000006575)	SMYD4 (ENSFALG00000006593)	SERPINF1 (ENSFALG00000006604)	SERPINF2 (ENSFALG00000006609)	WDR81 (ENSFALG00000006614)	ENSFALG00000006618	ENSFALG00000023130	PRPF8 (ENSFALG00000006628)	RILP (ENSFALG00000006633)	SCARF1 (ENSFALG00000006640) ##22	SLC43A2 (ENSFALG00000006646)	PITPNA (ENSFALG00000025969)	INPP5K (ENSFALG00000006671)	MYO1C (ENSFALG00000006676)	YWHAE (ENSFALG00000026378)	ENSFALG00000025189	ENSFALG00000006704	LRRC75A (ENSFALG00000024319)	ENSFALG00000015190	TMEM248 (ENSFALG00000006712)	RABGEF1 (ENSFALG00000006714)	KCTD7 (ENSFALG00000006717)	TPST1 (ENSFALG00000006719)	CRCP (ENSFALG00000006720)	ENSFALG00000006731
Great tit	MODERN SPECIES	9	TSR1 (ENSPMJG00000019049)	SRR (ENSPMJG00000019048)	SMG6 (ENSPMJG00000019047)	HIC1 (ENSPMJG00000019046)	DPH1 (ENSPMJG00000019044)	RTN4RL1 (ENSPMJG00000019043)	RPA1 (ENSPMJG00000019042)	SMYD4 (ENSPMJG00000019041)	SERPINF1 (ENSPMJG00000019040)	SERPINF2 (ENSPMJG00000019039)	WDR81 (ENSPMJG00000019038)	ENSPMJG00000019037	TLCD2 (ENSPMJG00000019036)	PRPF8 (ENSPMJG00000019035)	RILP (ENSPMJG00000019034)	SCARF1 (ENSPMJG00000019033) ##22	SLC43A2 (ENSPMJG00000019031)	PITPNA (ENSPMJG00000019030)	INPP5K (ENSPMJG00000019029)	MYO1C (ENSPMJG00000019028)	YWHAE (ENSPMJG00000019027)	CRK (ENSPMJG00000019026)	NCBP3 (ENSPMJG00000019025)	LRRC75A (ENSPMJG00000019022)	TMEM248 (ENSPMJG00000019021)	RABGEF1 (ENSPMJG00000019020)	KCTD7 (ENSPMJG00000019019)	TPST1 (ENSPMJG00000019018)	CRCP (ENSPMJG00000019017)	ENSPMJG00000019016	ASL (ENSPMJG00000019015)
Neognathae_c	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112.d	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT00940000164941	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00820000127055.a	ENSGT00390000005712	ENSGT00940000161370	ENSGT00940000153883.b	ENSGT00940000154540.a	ENSGT00940000161327	ENSGT00390000006030.d.a.b	ENSGT00390000014189	ENSGT00950000183122.B.k	ENSGT00390000001752
Kakapo	MODERN SPECIES	58	TSR1 (ENSSHBG00005006193)	SRR (ENSSHBG00005006228)	SMG6 (ENSSHBG00005006253)	HIC1 (ENSSHBG00005006279)	DPH1 (ENSSHBG00005006336)	RTN4RL1 (ENSSHBG00005006390)	RPA1 (ENSSHBG00005006416)	SMYD4 (ENSSHBG00005006445)	SERPINF1 (ENSSHBG00005006460)	SERPINF2 (ENSSHBG00005006516)	WDR81 (ENSSHBG00005006808)	ENSSHBG00005006845	TLCD2 (ENSSHBG00005006869)	PRPF8 (ENSSHBG00005006912)	RILP (ENSSHBG00005006950)	SCARF1 (ENSSHBG00005006967) ##22	SLC43A2 (ENSSHBG00005006996)	PITPNA (ENSSHBG00005007032)	INPP5K (ENSSHBG00005007074)	MYO1C (ENSSHBG00005007594)	YWHAE (ENSSHBG00005016004)	CRK (ENSSHBG00005016007)	NCBP3 (ENSSHBG00005016012)	LRRC75A (ENSSHBG00005016036)	TMEM248 (ENSSHBG00005016043)	RABGEF1 (ENSSHBG00005016047)	KCTD7 (ENSSHBG00005016052)	DHRS11 (ENSSHBG00005016056)	MRM1 (ENSSHBG00005016059)	LHX1 (ENSSHBG00005016063)	AATF (ENSSHBG00005016069)
Golden eagle	MODERN SPECIES	1	SMG6 (ENSACCG00020005398)	HIC1 (ENSACCG00020005382)	OVCA2 (ENSACCG00020005368)	DPH1 (ENSACCG00020005357)	RTN4RL1 (ENSACCG00020005343)	RPA1 (ENSACCG00020005332)	SMYD4 (ENSACCG00020005319)	SERPINF1 (ENSACCG00020005300)	SERPINF2 (ENSACCG00020005283)	WDR81 (ENSACCG00020005270)	ENSACCG00020005246	TLCD2 (ENSACCG00020005227)	ENSACCG00020005215	ENSACCG00020005194	RILP (ENSACCG00020005179)	SCARF1 (ENSACCG00020005166) ##22	SLC43A2 (ENSACCG00020005144)	PITPNA (ENSACCG00020005125)	INPP5K (ENSACCG00020005105)	MYO1C (ENSACCG00020005056)	YWHAE (ENSACCG00020005013)	CRK (ENSACCG00020005002)	NCBP3 (ENSACCG00020004987)	LRRC75A (ENSACCG00020004968)	TMEM248 (ENSACCG00020004959)	RABGEF1 (ENSACCG00020004939)	KCTD7 (ENSACCG00020004920)	TPST1 (ENSACCG00020004906)	CRCP (ENSACCG00020004888)	ENSACCG00020004871	ENSACCG00020004861
Mammalia	ANCESTRAL SPECIES	37	ENSGT00940000153195.A	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00940000156758	ENSGT00440000034248	ENSGT00440000038370	ENSGT00390000016836.b	ENSGT00390000015165	ENSGT01010000222313.A.b.b.b	ENSGT00390000012296	ENSGT00940000163490	ENSGT00390000012340
Theria	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00940000153195.A	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00940000156758	ENSGT00440000034248	ENSGT00440000038370	ENSGT00390000016836.b	ENSGT00390000015165	ENSGT01010000222313.A.b.b.b	ENSGT00390000012296	ENSGT00940000163490	ENSGT00390000012340
Eutheria	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000153195.A	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00940000156758	ENSGT00440000034248	ENSGT00440000038370	ENSGT00390000016836.b	ENSGT00390000015165	ENSGT01010000222313.A.b.b.b	ENSGT00390000012296	ENSGT00940000163490	ENSGT00390000012340
Atlantogenata	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000159315	ENSGT00940000153195.A	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00940000156758	ENSGT00440000034248	ENSGT00440000038370	ENSGT00390000016836.b	ENSGT00390000015165	ENSGT01010000222313.A.b.b.b	ENSGT00390000012296	ENSGT00940000163490	ENSGT00390000012340
Afrotheria	ANCESTRAL SPECIES	60	ENSGT00940000159315	ENSGT00940000153195.A	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00940000156758	ENSGT00440000034248	ENSGT00440000038370	ENSGT00390000016836.b	ENSGT00390000015165.b	ENSGT01010000222313.A.b.b.b	ENSGT00390000012296	ENSGT00940000163490	ENSGT00390000012340
Afrotheria_a	ANCESTRAL SPECIES	55	ENSGT00940000159315	ENSGT00940000153195.A	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00940000156758	ENSGT00440000034248	ENSGT00440000038370	ENSGT00390000016836.b	ENSGT00390000015165.b	ENSGT01010000222313.A.b.b.b	ENSGT00390000012296	ENSGT00940000163490	ENSGT00390000012340
Elephant	MODERN SPECIES	414	SGSM2 (ENSLAFG00000014571)	ENSLAFG00000022396	SRR (ENSLAFG00000032023)	SMG6 (ENSLAFG00000001261)	HIC1 (ENSLAFG00000001259)	DPH1 (ENSLAFG00000028831)	RTN4RL1 (ENSLAFG00000000917)	RPA1 (ENSLAFG00000015354)	SMYD4 (ENSLAFG00000015349)	SERPINF1 (ENSLAFG00000015345)	SERPINF2 (ENSLAFG00000009227)	WDR81 (ENSLAFG00000029493)	TLCD2 (ENSLAFG00000015458)	PRPF8 (ENSLAFG00000015445)	RILP (ENSLAFG00000031776)	SCARF1 (ENSLAFG00000015466) ##22	SLC43A2 (ENSLAFG00000012908)	PITPNA (ENSLAFG00000010065)	INPP5K (ENSLAFG00000010060)	MYO1C (ENSLAFG00000030443)	CRK (ENSLAFG00000010559)	YWHAE (ENSLAFG00000005965)	DOC2B (ENSLAFG00000016819)	RPH3AL (ENSLAFG00000002838)	ENSLAFG00000030206	RFLNB (ENSLAFG00000015948)	VPS53 (ENSLAFG00000015953)	TLCD3A (ENSLAFG00000017562)	GEMIN4 (ENSLAFG00000017567)	ENSLAFG00000017570	GLOD4 (ENSLAFG00000016643)
Hyrax	MODERN SPECIES	6486															PRPF8 (ENSPCAG00000008938)	SCARF1 (ENSPCAG00000008883) ##22
Tenrec	MODERN SPECIES	9001									RPA1 (ENSETEG00000017608)	SMYD4 (ENSETEG00000017605)	SERPINF1 (ENSETEG00000017603)	ENSETEG00000017600	ENSETEG00000017599	PRPF8 (ENSETEG00000017592)	ENSETEG00000017588	SCARF1 (ENSETEG00000017586) ##22
Xenarthra	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00510000048287	ENSGT00940000153195.A	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000159315	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000164396	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00940000156758	ENSGT00440000034248	ENSGT00910000146484	ENSGT00390000016836.b	ENSGT00390000015165	ENSGT01010000222313.A.b.b.b	ENSGT00390000012296	ENSGT00940000163490	ENSGT00390000012340
Armadillo	MODERN SPECIES	4634		MNT (ENSDNOG00000040019)	SGSM2 (ENSDNOG00000004719)	TSR1 (ENSDNOG00000004715)	SMG6 (ENSDNOG00000048283)	HIC1 (ENSDNOG00000049226)	DPH1 (ENSDNOG00000011203)	RTN4RL1 (ENSDNOG00000044606)	RPA1 (ENSDNOG00000017218)	SMYD4 (ENSDNOG00000004083)	SERPINF1 (ENSDNOG00000007000)	SERPINF2 (ENSDNOG00000008904)	WDR81 (ENSDNOG00000046392)	PRPF8 (ENSDNOG00000018471)	ENSDNOG00000038065	SCARF1 (ENSDNOG00000033044) ##22	SLC43A2 (ENSDNOG00000001390)	ENSDNOG00000045853	INPP5K (ENSDNOG00000049053)	MYO1C (ENSDNOG00000001375)	CRK (ENSDNOG00000042981)	YWHAE (ENSDNOG00000041350)	DOC2B (ENSDNOG00000049737)	RPH3AL (ENSDNOG00000035754)	ENSDNOG00000037107	RFLNB (ENSDNOG00000043125)	VPS53 (ENSDNOG00000001544)	TLCD3A (ENSDNOG00000044974)	GEMIN4 (ENSDNOG00000048322)	ENSDNOG00000004279	GLOD4 (ENSDNOG00000040540)
Boreoeutheria	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000153195.A	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00940000156758	ENSGT00440000034248	ENSGT00440000038370	ENSGT00390000016836.b	ENSGT00390000015165	ENSGT01010000222313.A.b.b.b	ENSGT00900000143173	ENSGT00390000012296	ENSGT00940000163490
Euarchontoglires	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000153195.A	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00940000156758	ENSGT00440000034248	ENSGT00440000038370	ENSGT00390000016836.b	ENSGT00390000015165	ENSGT01010000222313.A.b.b.b	ENSGT00900000143173	ENSGT00390000012296	ENSGT00940000163490
Primates	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000153195.A	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00940000156758	ENSGT00440000034248	ENSGT00440000038370	ENSGT00390000016836.b	ENSGT00390000015165	ENSGT01010000222313.A.b.b.b	ENSGT00390000012296	ENSGT00940000163490	ENSGT00390000012340
Strepsirrhini	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000153195.A	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT00940000165249	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00940000156758	ENSGT00440000034248	ENSGT00440000038370	ENSGT00390000016836.b	ENSGT00390000015165	ENSGT01010000222313.A.b.b.b	ENSGT00390000012296	ENSGT00940000163490	ENSGT00390000012340
Lemuriformes	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000153195.A	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT00940000165249	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00940000156758	ENSGT00440000034248	ENSGT00440000038370	ENSGT00390000016836.b	ENSGT00390000015165	ENSGT01010000222313.A.b.b.b	ENSGT00390000012296	ENSGT00940000163490	ENSGT00390000012340
Lemuriformes_a	ANCESTRAL SPECIES	138	ENSGT00940000159315	ENSGT00940000153195.A	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00940000156758	ENSGT00440000034248	ENSGT00440000038370
Coquerels sifaka	MODERN SPECIES	557	SGSM2 (ENSPCOG00000026216)	TSR1 (ENSPCOG00000017928)	ENSPCOG00000022013	SMG6 (ENSPCOG00000020925)	HIC1 (ENSPCOG00000023965)	OVCA2 (ENSPCOG00000016854)	DPH1 (ENSPCOG00000023620)	RTN4RL1 (ENSPCOG00000024211)	RPA1 (ENSPCOG00000001799)	SMYD4 (ENSPCOG00000013821)	SERPINF1 (ENSPCOG00000027109)	SERPINF2 (ENSPCOG00000002960)	WDR81 (ENSPCOG00000028729)	PRPF8 (ENSPCOG00000015182)	RILP (ENSPCOG00000028033)	SCARF1 (ENSPCOG00000005041) ##22	SLC43A2 (ENSPCOG00000027974)	PITPNA (ENSPCOG00000018905)	INPP5K (ENSPCOG00000028791)	MYO1C (ENSPCOG00000019765)	CRK (ENSPCOG00000021068)	YWHAE (ENSPCOG00000023837)	DOC2B (ENSPCOG00000019713)	RPH3AL (ENSPCOG00000023072)	ENSPCOG00000021302
Greater bamboo lemur	MODERN SPECIES	1039					HIC1 (ENSPSMG00000020467)	OVCA2 (ENSPSMG00000020474)	DPH1 (ENSPSMG00000020484)	RTN4RL1 (ENSPSMG00000020491)	RPA1 (ENSPSMG00000020517)	SMYD4 (ENSPSMG00000020540)	SERPINF1 (ENSPSMG00000020555)	SERPINF2 (ENSPSMG00000020587)	WDR81 (ENSPSMG00000020664)	PRPF8 (ENSPSMG00000020753)	RILP (ENSPSMG00000020793)	SCARF1 (ENSPSMG00000020851) ##22	SLC43A2 (ENSPSMG00000020884)
Mouse lemur	MODERN SPECIES	7	TSR1 (ENSMICG00000012943)	SRR (ENSMICG00000042689)	SMG6 (ENSMICG00000012913)	HIC1 (ENSMICG00000012908)	OVCA2 (ENSMICG00000047371)	DPH1 (ENSMICG00000012888)	RTN4RL1 (ENSMICG00000012885)	RPA1 (ENSMICG00000012867)	SMYD4 (ENSMICG00000000175)	SERPINF1 (ENSMICG00000000173)	SERPINF2 (ENSMICG00000000169)	WDR81 (ENSMICG00000000167)	ENSMICG00000000163	PRPF8 (ENSMICG00000010320)	RILP (ENSMICG00000034729)	SCARF1 (ENSMICG00000003881) ##22	SLC43A2 (ENSMICG00000003877)	PITPNA (ENSMICG00000003870)	INPP5K (ENSMICG00000003861)	MYO1C (ENSMICG00000003839)	CRK (ENSMICG00000043200)	YWHAE (ENSMICG00000003595)	DOC2B (ENSMICG00000026925)	RPH3AL (ENSMICG00000044522)	RFLNB (ENSMICG00000038370)	ENSMICG00000031740	VPS53 (ENSMICG00000009328)	TLCD3A (ENSMICG00000009347)	GEMIN4 (ENSMICG00000033667)	ENSMICG00000027145	GLOD4 (ENSMICG00000009361)
Bushbaby	MODERN SPECIES	260	MNT (ENSOGAG00000004499)	SGSM2 (ENSOGAG00000004495)	TSR1 (ENSOGAG00000004492)	SRR (ENSOGAG00000004488)	SMG6 (ENSOGAG00000004483)	HIC1 (ENSOGAG00000034845)	OVCA2 (ENSOGAG00000028370)	DPH1 (ENSOGAG00000006385)	RTN4RL1 (ENSOGAG00000005584)	ENSOGAG00000005581	SMYD4 (ENSOGAG00000012800)	SERPINF1 (ENSOGAG00000012799)	SERPINF2 (ENSOGAG00000012794)	ENSOGAG00000031132	ENSOGAG00000012785	SCARF1 (ENSOGAG00000002236) ##22	SLC43A2 (ENSOGAG00000006182)	PITPNA (ENSOGAG00000006178)	INPP5K (ENSOGAG00000006172)	MYO1C (ENSOGAG00000006161)	CRK (ENSOGAG00000006159)	YWHAE (ENSOGAG00000006155)	DOC2B (ENSOGAG00000031878)	RPH3AL (ENSOGAG00000016283)	ENSOGAG00000006725	RFLNB (ENSOGAG00000004621)
Haplorrhini	ANCESTRAL SPECIES	34	ENSGT00940000153195.A	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b
Tarsier	MODERN SPECIES	7126												WDR81 (ENSTSYG00000008214)	TLCD2 (ENSTSYG00000035301)	PRPF8 (ENSTSYG00000014120)	RILP (ENSTSYG00000031892)	SCARF1 (ENSTSYG00000031633) ##22	SLC43A2 (ENSTSYG00000014320)	PITPNA (ENSTSYG00000000151)	INPP5K (ENSTSYG00000027262)	MYO1C (ENSTSYG00000012833)	CRK (ENSTSYG00000035557)
Simiiformes	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00940000153195.A	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00940000160337	ENSGT00390000002453	ENSGT00940000153491.b.b.a	ENSGT00390000016067	ENSGT00940000161894	ENSGT00390000017317	ENSGT00390000012340	ENSGT00940000163490	ENSGT00390000012296
Platyrrhini	ANCESTRAL SPECIES	47	ENSGT00940000153195.A	ENSGT00550000075026.f	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00940000160337	ENSGT00390000002453	ENSGT00940000153491.b.b.a	ENSGT00390000016067	ENSGT00940000161894	ENSGT00390000017317	ENSGT00390000012340	ENSGT00390000012296	ENSGT01010000222313.A.b.b.b
Cebidae	ANCESTRAL SPECIES	42	ENSGT00940000153195.A	ENSGT00550000075026.f	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00940000160337	ENSGT00940000153491.b.b.a	ENSGT00390000016067	ENSGT00940000161894	ENSGT00390000017317	ENSGT00390000012340	ENSGT00390000012296	ENSGT01010000222313.A.b.b.b	ENSGT00390000015165.c
Cebidae_a	ANCESTRAL SPECIES	65	ENSGT00940000153195.A	ENSGT00550000075026.f	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00940000160337	ENSGT00940000153491.b.b.a	ENSGT00390000016067	ENSGT00940000161894	ENSGT00390000017317	ENSGT00390000012340	ENSGT00390000012296	ENSGT01010000222313.A.b.b.b	ENSGT00390000015165.c
Capuchin	MODERN SPECIES	136	TSR1 (ENSCCAG00000028962)	ENSCCAG00000035964	SMG6 (ENSCCAG00000035801)	HIC1 (ENSCCAG00000030944)	OVCA2 (ENSCCAG00000033750)	DPH1 (ENSCCAG00000015117)	RTN4RL1 (ENSCCAG00000027154)	RPA1 (ENSCCAG00000010981)	SMYD4 (ENSCCAG00000029544)	SERPINF1 (ENSCCAG00000030318)	SERPINF2 (ENSCCAG00000037096)	WDR81 (ENSCCAG00000021856)	TLCD2 (ENSCCAG00000026610)	ENSCCAG00000031983	RILP (ENSCCAG00000037172)	SCARF1 (ENSCCAG00000019308) ##22	SLC43A2 (ENSCCAG00000037132)	PITPNA (ENSCCAG00000028388)	INPP5K (ENSCCAG00000030656)	MYO1C (ENSCCAG00000034285)	CRK (ENSCCAG00000032085)	ENSCCAG00000027695	ENSCCAG00000034432	TRARG1 (ENSCCAG00000033358)	KDM4A (ENSCCAG00000025432)	PTPRF (ENSCCAG00000029349)	ENSCCAG00000036988	HYI (ENSCCAG00000027585)	SZT2 (ENSCCAG00000029453)	MED8 (ENSCCAG00000031645)	ELOVL1 (ENSCCAG00000027180)
Bolivian squirrel monkey	MODERN SPECIES	74							RTN4RL1 (ENSSBOG00000033247)	RPA1 (ENSSBOG00000030233)	SMYD4 (ENSSBOG00000026869)	SERPINF1 (ENSSBOG00000022026)	SERPINF2 (ENSSBOG00000002359)	WDR81 (ENSSBOG00000021169)	TLCD2 (ENSSBOG00000022562)	PRPF8 (ENSSBOG00000029717)	RILP (ENSSBOG00000025512)	SCARF1 (ENSSBOG00000032475) ##22	SLC43A2 (ENSSBOG00000020435)	PITPNA (ENSSBOG00000030753)	INPP5K (ENSSBOG00000033103)	MYO1C (ENSSBOG00000022478)	CRK (ENSSBOG00000033257)	YWHAE (ENSSBOG00000035601)	TRARG1 (ENSSBOG00000028075)	ENSSBOG00000011043	ENSSBOG00000027582	ENSSBOG00000034892	ENSSBOG00000031348	ABR (ENSSBOG00000026554)	TIMM22 (ENSSBOG00000020627)	ENSSBOG00000015215	MRM3 (ENSSBOG00000029574)
Marmoset	MODERN SPECIES	17	SGSM2 (ENSCJAG00000012412)	TSR1 (ENSCJAG00000012456)	SRR (ENSCJAG00000012478)	SMG6 (ENSCJAG00000001820)	HIC1 (ENSCJAG00000042739)	OVCA2 (ENSCJAG00000001837)	DPH1 (ENSCJAG00000039332)	RTN4RL1 (ENSCJAG00000001844)	RPA1 (ENSCJAG00000001848)	SMYD4 (ENSCJAG00000001865)	SERPINF1 (ENSCJAG00000001881)	SERPINF2 (ENSCJAG00000001889)	WDR81 (ENSCJAG00000001895)	PRPF8 (ENSCJAG00000001911)	RILP (ENSCJAG00000040878)	SCARF1 (ENSCJAG00000002011) ##22	SLC43A2 (ENSCJAG00000002031)	PITPNA (ENSCJAG00000002044)	ENSCJAG00000002060	MYO1C (ENSCJAG00000002077)	CRK (ENSCJAG00000002099)	ENSCJAG00000063239	ENSCJAG00000069767	YWHAE (ENSCJAG00000002109)	ENSCJAG00000081551	ENSCJAG00000079317	ENSCJAG00000070102	ENSCJAG00000086551	TRPV3 (ENSCJAG00000038771)	ENSCJAG00000083020	TRPV1 (ENSCJAG00000007063)
Mas night monkey	MODERN SPECIES	533	TSR1 (ENSANAG00000031071)	SRR (ENSANAG00000006935)	ENSANAG00000019545	SMG6 (ENSANAG00000035760)	HIC1 (ENSANAG00000037442)	OVCA2 (ENSANAG00000038221)	ENSANAG00000027814	RTN4RL1 (ENSANAG00000035858)	RPA1 (ENSANAG00000023456)	SMYD4 (ENSANAG00000032713)	SERPINF1 (ENSANAG00000003261)	SERPINF2 (ENSANAG00000024852)	WDR81 (ENSANAG00000030429)	PRPF8 (ENSANAG00000032629)	RILP (ENSANAG00000023205)	SCARF1 (ENSANAG00000030450) ##22	SLC43A2 (ENSANAG00000021220)	PITPNA (ENSANAG00000037441)	INPP5K (ENSANAG00000023521)	MYO1C (ENSANAG00000022534)	CRK (ENSANAG00000030093)	ENSANAG00000023878	ENSANAG00000023280	ENSANAG00000025644	ENSANAG00000025351	ENSANAG00000035168	SPATA22 (ENSANAG00000034559)	ASPA (ENSANAG00000020595)	TRPV3 (ENSANAG00000027038)	TRPV1 (ENSANAG00000028188)	SHPK (ENSANAG00000023502)
Catarrhini	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00910000147075	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00910000146989	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b.lg.b.b	ENSGT00940000160337	ENSGT00390000002453	ENSGT00940000153491.b.b.a	ENSGT00390000016067	ENSGT00940000161894	ENSGT00390000017317	ENSGT00390000012340	ENSGT00940000163490
Hominoidea	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00910000147075	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00910000146989	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b.lg.b.b.a	ENSGT00940000160337	ENSGT00390000002453	ENSGT00940000153491.b.b.a	ENSGT00390000016067	ENSGT00940000161894	ENSGT00390000017317	ENSGT00390000012340	ENSGT00940000163490
Hominidae	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00910000147075	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00910000146989	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b.lg.b.b.a	ENSGT00940000160337	ENSGT00390000002453	ENSGT00940000153491.b.b.a	ENSGT00390000016067	ENSGT00940000161894	ENSGT00390000017317	ENSGT00390000012340	ENSGT00940000163490
Homo/Pan/Gorilla group	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00910000147075	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00910000146989	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b.lg.b.b.a	ENSGT00940000160337	ENSGT00390000002453	ENSGT00940000153491.b.b.a	ENSGT00390000016067	ENSGT00940000161894	ENSGT00390000017317	ENSGT00390000012340	ENSGT00390000012296
Homo/Pan group	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00910000147075	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00910000146989	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b.lg.b.b.a	ENSGT00940000160337	ENSGT00390000002453	ENSGT00940000153491.b.b.a	ENSGT00390000016067	ENSGT00940000161894	ENSGT00390000017317	ENSGT00390000012340	ENSGT00390000012296
Pan	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00910000147075	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00910000146989	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b.lg.b.b.a	ENSGT00940000160337	ENSGT00390000002453	ENSGT00940000153491.b.b.a	ENSGT00390000016067	ENSGT00940000161894	ENSGT00390000017317	ENSGT00390000012340	ENSGT00390000012296
Chimpanzee	MODERN SPECIES	8	TSR1 (ENSPTRG00000008547)	SRR (ENSPTRG00000008546)	SMG6 (ENSPTRG00000008544)	HIC1 (ENSPTRG00000047506)	DPH1 (ENSPTRG00000008542)	RTN4RL1 (ENSPTRG00000008541)	ENSPTRG00000049332	RPA1 (ENSPTRG00000008539)	SMYD4 (ENSPTRG00000008538)	SERPINF1 (ENSPTRG00000008537)	SERPINF2 (ENSPTRG00000008536)	WDR81 (ENSPTRG00000008535)	TLCD2 (ENSPTRG00000008532)	PRPF8 (ENSPTRG00000039576)	RILP (ENSPTRG00000050009)	SCARF1 (ENSPTRG00000008529) ##22	SLC43A2 (ENSPTRG00000008527)	PITPNA (ENSPTRG00000008526)	ENSPTRG00000052487	INPP5K (ENSPTRG00000008525)	MYO1C (ENSPTRG00000008524)	CRK (ENSPTRG00000045379)	YWHAE (ENSPTRG00000008521)	TRARG1 (ENSPTRG00000008520)	BHLHA9 (ENSPTRG00000031017)	ABR (ENSPTRG00000008518)	TIMM22 (ENSPTRG00000008517)	NXN (ENSPTRG00000008513)	MRM3 (ENSPTRG00000008512)	GLOD4 (ENSPTRG00000008511)	GEMIN4 (ENSPTRG00000008509)
Bonobo	MODERN SPECIES	8	TSR1 (ENSPPAG00000036355)	SRR (ENSPPAG00000027694)	SMG6 (ENSPPAG00000043296)	OVCA2 (ENSPPAG00000040000)	DPH1 (ENSPPAG00000033985)	RTN4RL1 (ENSPPAG00000030057)	ENSPPAG00000023746	RPA1 (ENSPPAG00000039680)	SMYD4 (ENSPPAG00000037741)	SERPINF1 (ENSPPAG00000031887)	SERPINF2 (ENSPPAG00000040012)	WDR81 (ENSPPAG00000029411)	TLCD2 (ENSPPAG00000031792)	PRPF8 (ENSPPAG00000042753)	RILP (ENSPPAG00000027773)	SCARF1 (ENSPPAG00000033719) ##22	SLC43A2 (ENSPPAG00000027856)	PITPNA (ENSPPAG00000027318)	ENSPPAG00000015058	INPP5K (ENSPPAG00000042486)	MYO1C (ENSPPAG00000025962)	CRK (ENSPPAG00000029995)	YWHAE (ENSPPAG00000030251)	ENSPPAG00000038267	TRARG1 (ENSPPAG00000030478)	ABR (ENSPPAG00000029873)	TIMM22 (ENSPPAG00000035115)	ENSPPAG00000040300	MRM3 (ENSPPAG00000038493)	ENSPPAG00000040952	GEMIN4 (ENSPPAG00000030072)
Human	MODERN SPECIES	8	TSR1 (ENSG00000167721)	SRR (ENSG00000167720)	SMG6 (ENSG00000070366)	HIC1 (ENSG00000177374)	OVCA2 (ENSG00000262664)	DPH1 (ENSG00000108963)	RTN4RL1 (ENSG00000185924)	RPA1 (ENSG00000132383)	SMYD4 (ENSG00000186532)	SERPINF1 (ENSG00000132386)	SERPINF2 (ENSG00000167711)	WDR81 (ENSG00000167716)	TLCD2 (ENSG00000185561)	PRPF8 (ENSG00000174231)	RILP (ENSG00000167705)	SCARF1 (ENSG00000074660) ##22	SLC43A2 (ENSG00000167703)	PITPNA (ENSG00000174238)	INPP5K (ENSG00000132376)	MYO1C (ENSG00000197879)	CRK (ENSG00000167193)	YWHAE (ENSG00000108953)	TRARG1 (ENSG00000184811)	BHLHA9 (ENSG00000205899)	ABR (ENSG00000159842)	TIMM22 (ENSG00000177370)	NXN (ENSG00000167693)	MRM3 (ENSG00000171861)	GLOD4 (ENSG00000167699)	GEMIN4 (ENSG00000179409)	TLCD3A (ENSG00000167695)
Gorilla	MODERN SPECIES	8	SRR (ENSGGOG00000026411)	SMG6 (ENSGGOG00000017156)	HIC1 (ENSGGOG00000027584)	OVCA2 (ENSGGOG00000009369)	DPH1 (ENSGGOG00000009360)	RTN4RL1 (ENSGGOG00000039806)	ENSGGOG00000038386	RPA1 (ENSGGOG00000014186)	SMYD4 (ENSGGOG00000000244)	SERPINF1 (ENSGGOG00000000241)	SERPINF2 (ENSGGOG00000026220)	WDR81 (ENSGGOG00000016634)	TLCD2 (ENSGGOG00000010472)	PRPF8 (ENSGGOG00000005516)	RILP (ENSGGOG00000005513)	SCARF1 (ENSGGOG00000005507) ##22	SLC43A2 (ENSGGOG00000007383)	PITPNA (ENSGGOG00000007379)	ENSGGOG00000039984	INPP5K (ENSGGOG00000007373)	MYO1C (ENSGGOG00000009040)	CRK (ENSGGOG00000006758)	YWHAE (ENSGGOG00000016840)	ENSGGOG00000042847	ENSGGOG00000006670	BHLHA9 (ENSGGOG00000016493)	ABR (ENSGGOG00000016898)	TIMM22 (ENSGGOG00000038448)	ENSGGOG00000015520	MRM3 (ENSGGOG00000015518)	ENSGGOG00000015512
Orangutan	MODERN SPECIES	8	TSR1 (ENSPPYG00000007792)	SRR (ENSPPYG00000036461)	SMG6 (ENSPPYG00000007790)	HIC1 (ENSPPYG00000007789)	OVCA2 (ENSPPYG00000041722)	ENSPPYG00000007788	RTN4RL1 (ENSPPYG00000032586)	RPA1 (ENSPPYG00000036571)	SMYD4 (ENSPPYG00000007784)	SERPINF1 (ENSPPYG00000007783)	SERPINF2 (ENSPPYG00000007781)	WDR81 (ENSPPYG00000007780)	TLCD2 (ENSPPYG00000035806)	PRPF8 (ENSPPYG00000007777)	RILP (ENSPPYG00000007776)	SCARF1 (ENSPPYG00000007775) ##22	ENSPPYG00000032436	SLC43A2 (ENSPPYG00000007774)	PITPNA (ENSPPYG00000007773)	INPP5K (ENSPPYG00000007772)	MYO1C (ENSPPYG00000007771)	CRK (ENSPPYG00000007770)	YWHAE (ENSPPYG00000007769)	TRARG1 (ENSPPYG00000007768)	BHLHA9 (ENSPPYG00000007767)	ENSPPYG00000041294	ABR (ENSPPYG00000007766)	TIMM22 (ENSPPYG00000007765)	NXN (ENSPPYG00000007763)	MRM3 (ENSPPYG00000007762)	GLOD4 (ENSPPYG00000041102)
Gibbon	MODERN SPECIES	9	TSR1 (ENSNLEG00000017184)	SRR (ENSNLEG00000017181)	SMG6 (ENSNLEG00000017171)	ENSNLEG00000035047	DPH1 (ENSNLEG00000028959)	RTN4RL1 (ENSNLEG00000018844)	ENSNLEG00000034456	RPA1 (ENSNLEG00000017149)	SMYD4 (ENSNLEG00000017148)	SERPINF1 (ENSNLEG00000033264)	SERPINF2 (ENSNLEG00000017144)	WDR81 (ENSNLEG00000017139)	ENSNLEG00000017138	PRPF8 (ENSNLEG00000000897)	RILP (ENSNLEG00000000872)	SCARF1 (ENSNLEG00000000852) ##22	SLC43A2 (ENSNLEG00000000842)	PITPNA (ENSNLEG00000000804)	ENSNLEG00000034731	INPP5K (ENSNLEG00000000765)	MYO1C (ENSNLEG00000000738)	ENSNLEG00000000737	YWHAE (ENSNLEG00000031849)	TRARG1 (ENSNLEG00000000654)	ABR (ENSNLEG00000000612)	ENSNLEG00000000609	ENSNLEG00000000596	MRM3 (ENSNLEG00000033176)	ENSNLEG00000000533	ENSNLEG00000000532	GEMIN4 (ENSNLEG00000000531)
Cercopithecidae	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00910000147075	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00910000146989	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b.lg.b.b	ENSGT00940000160337	ENSGT00390000002453	ENSGT00940000153491.b.b.a	ENSGT00390000016067	ENSGT00940000161894	ENSGT01100000263493.a.b.a.a.b.b.b.a.a.a	ENSGT00390000017317	ENSGT00390000012340
Rhinopithecus	ANCESTRAL SPECIES	98	ENSGT00940000153195.A	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00910000147075	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00910000146989	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b.lg.b.b	ENSGT00940000160337	ENSGT00940000153491.b.b.a	ENSGT00390000016067	ENSGT00940000161894	ENSGT01100000263493.a.b.a.a.b.b.b.a.a.a	ENSGT00390000017317	ENSGT00390000012340	ENSGT00910000147455
Golden snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	1750						RTN4RL1 (ENSRROG00000019007)	ENSRROG00000031636	RPA1 (ENSRROG00000043278)	SMYD4 (ENSRROG00000025089)	SERPINF1 (ENSRROG00000013097)	SERPINF2 (ENSRROG00000010314)	WDR81 (ENSRROG00000042028)	TLCD2 (ENSRROG00000028778)	PRPF8 (ENSRROG00000038014)	RILP (ENSRROG00000000050)	SCARF1 (ENSRROG00000043935) ##22	SLC43A2 (ENSRROG00000045184)	PITPNA (ENSRROG00000045299)	ENSRROG00000040612	INPP5K (ENSRROG00000043460)	MYO1C (ENSRROG00000034181)	CRK (ENSRROG00000035466)	YWHAE (ENSRROG00000039739)	TRARG1 (ENSRROG00000026760)	ABR (ENSRROG00000033877)	TIMM22 (ENSRROG00000036599)	ENSRROG00000037432	NXN (ENSRROG00000031195)	MRM3 (ENSRROG00000041720)	GLOD4 (ENSRROG00000035753)	ENSRROG00000031360
Black snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	39	MNT (ENSRBIG00000045016)	SGSM2 (ENSRBIG00000031785)	TSR1 (ENSRBIG00000040016)	SRR (ENSRBIG00000028414)	SMG6 (ENSRBIG00000024746)	DPH1 (ENSRBIG00000034567)	RTN4RL1 (ENSRBIG00000042705)	ENSRBIG00000023934	RPA1 (ENSRBIG00000036587)	SMYD4 (ENSRBIG00000016078)	SERPINF1 (ENSRBIG00000037075)	SERPINF2 (ENSRBIG00000030594)	WDR81 (ENSRBIG00000042885)	PRPF8 (ENSRBIG00000031219)	RILP (ENSRBIG00000042377)	SCARF1 (ENSRBIG00000042668) ##22	SLC43A2 (ENSRBIG00000041402)	PITPNA (ENSRBIG00000014108)	ENSRBIG00000036155	INPP5K (ENSRBIG00000037118)	MYO1C (ENSRBIG00000040262)	CRK (ENSRBIG00000006454)	YWHAE (ENSRBIG00000039460)	TRARG1 (ENSRBIG00000030723)	ABR (ENSRBIG00000044627)	TIMM22 (ENSRBIG00000044331)	NXN (ENSRBIG00000044332)	ENSRBIG00000044241	MRM3 (ENSRBIG00000044238)	GLOD4 (ENSRBIG00000037041)	GEMIN4 (ENSRBIG00000042493)
Cercopithecinae	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403.d	ENSGT00910000147075	ENSGT00390000012403.c.a	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00910000146989	ENSGT00940000164396	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b.lg.b.b	ENSGT00940000160337	ENSGT00390000002453	ENSGT00940000153491.b.b.a	ENSGT00390000016067	ENSGT00940000161894	ENSGT01100000263493.a.b.a.a.b.b.b.a.a.a	ENSGT00390000017317
Vervet Monkey	MODERN SPECIES	7	SRR (ENSCSAG00000013794)	SMG6 (ENSCSAG00000013800)	HIC1 (ENSCSAG00000013805)	OVCA2 (ENSCSAG00000013814)	DPH1 (ENSCSAG00000013820)	RTN4RL1 (ENSCSAG00000013825)	RPA1 (ENSCSAG00000013833)	SMYD4 (ENSCSAG00000013840)	SERPINF1 (ENSCSAG00000013883)	SERPINF2 (ENSCSAG00000013894)	WDR81 (ENSCSAG00000013905)	ENSCSAG00000013908	TLCD2 (ENSCSAG00000013911)	PRPF8 (ENSCSAG00000013929)	RILP (ENSCSAG00000013947)	SCARF1 (ENSCSAG00000014005) ##22	SLC43A2 (ENSCSAG00000014025)	ENSCSAG00000014032	INPP5K (ENSCSAG00000014042)	MYO1C (ENSCSAG00000014058)	CRK (ENSCSAG00000014068)	YWHAE (ENSCSAG00000014074)	TRARG1 (ENSCSAG00000014084)	BHLHA9 (ENSCSAG00000019114)	ABR (ENSCSAG00000014173)	TIMM22 (ENSCSAG00000014203)	NXN (ENSCSAG00000014227)	MRM3 (ENSCSAG00000014247)	GLOD4 (ENSCSAG00000014254)	GEMIN4 (ENSCSAG00000014260)	TLCD3A (ENSCSAG00000014265)
Cercopithecinae_a	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403.d	ENSGT00910000147075	ENSGT00390000012403.c.a	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00910000146989	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT00980000203260	ENSGT01090000260061.c.b.lg.b.b	ENSGT00940000160337	ENSGT00390000002453	ENSGT00940000153491.b.b.a	ENSGT00390000016067	ENSGT00940000161894	ENSGT01100000263493.a.b.a.a.b.b.b.a.a.a	ENSGT00390000017317
Cercopithecinae_b	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00940000153195.A	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403.c.a	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT00980000203260	ENSGT01090000260061.c.b.lg.b.b	ENSGT00940000160337	ENSGT00390000002453	ENSGT00940000153491.b.b.a	ENSGT00390000016067	ENSGT00940000161894	ENSGT01100000263493.a.b.a.a.b.b.b.a.a.a	ENSGT00390000017317	ENSGT00390000012340
Olive baboon	MODERN SPECIES	8	MNT (ENSPANG00000032919)	SGSM2 (ENSPANG00000024465)	TSR1 (ENSPANG00000024463)	SRR (ENSPANG00000024462)	SMG6 (ENSPANG00000024588)	HIC1 (ENSPANG00000024595)	OVCA2 (ENSPANG00000024597)	DPH1 (ENSPANG00000024596)	RTN4RL1 (ENSPANG00000001706)	ENSPANG00000024592	SERPINF1 (ENSPANG00000024590)	SERPINF2 (ENSPANG00000024589)	WDR81 (ENSPANG00000024598)	TLCD2 (ENSPANG00000048560)	PRPF8 (ENSPANG00000024607)	SCARF1 (ENSPANG00000024605) ##22	SLC43A2 (ENSPANG00000024604)	PITPNA (ENSPANG00000024603)	INPP5K (ENSPANG00000024602)	MYO1C (ENSPANG00000024601)	CRK (ENSPANG00000024600)	YWHAE (ENSPANG00000024608)	TRARG1 (ENSPANG00000035252)	BHLHA9 (ENSPANG00000043287)	ABR (ENSPANG00000024616)	TIMM22 (ENSPANG00000024615)	NXN (ENSPANG00000024614)	MRM3 (ENSPANG00000024613)	GLOD4 (ENSPANG00000024612)	GEMIN4 (ENSPANG00000024610)	TLCD3A (ENSPANG00000024624)
Cercopithecinae_d	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000153195.A	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403.c.a	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT00980000203260	ENSGT01090000260061.c.b.lg.b.b	ENSGT00940000160337	ENSGT00940000153491.b.b.a	ENSGT00390000016067	ENSGT00940000161894	ENSGT01100000263493.a.b.a.a.b.b.b.a.a.a	ENSGT00390000017317	ENSGT00390000012340	ENSGT00390000012296
Sooty mangabey	MODERN SPECIES	111	TSR1 (ENSCATG00000044262)	SRR (ENSCATG00000038243)	SMG6 (ENSCATG00000031956)	HIC1 (ENSCATG00000037347)	DPH1 (ENSCATG00000038715)	OVCA2 (ENSCATG00000039461)	RTN4RL1 (ENSCATG00000039828)	ENSCATG00000041007	SMYD4 (ENSCATG00000041884)	SERPINF1 (ENSCATG00000031147)	SERPINF2 (ENSCATG00000033904)	WDR81 (ENSCATG00000030216)	TLCD2 (ENSCATG00000033773)	PRPF8 (ENSCATG00000038595)	RILP (ENSCATG00000034884)	SCARF1 (ENSCATG00000041644) ##22	SLC43A2 (ENSCATG00000033589)	PITPNA (ENSCATG00000021709)	INPP5K (ENSCATG00000042698)	MYO1C (ENSCATG00000042577)	ENSCATG00000041506	CRK (ENSCATG00000041862)	YWHAE (ENSCATG00000042667)	TRARG1 (ENSCATG00000039428)	ABR (ENSCATG00000044507)	TIMM22 (ENSCATG00000038076)	NXN (ENSCATG00000039476)	ENSCATG00000039544	MRM3 (ENSCATG00000032099)	GLOD4 (ENSCATG00000037534)	GEMIN4 (ENSCATG00000022135)
Drill	MODERN SPECIES	950	SGSM2 (ENSMLEG00000031728)	TSR1 (ENSMLEG00000036733)	SRR (ENSMLEG00000027641)	SMG6 (ENSMLEG00000029353)	OVCA2 (ENSMLEG00000041954)	DPH1 (ENSMLEG00000041378)	RTN4RL1 (ENSMLEG00000037844)	ENSMLEG00000038768	SMYD4 (ENSMLEG00000014043)	SERPINF1 (ENSMLEG00000039371)	SERPINF2 (ENSMLEG00000028849)	WDR81 (ENSMLEG00000041258)	ENSMLEG00000042572	PRPF8 (ENSMLEG00000037937)	RILP (ENSMLEG00000033580)	SCARF1 (ENSMLEG00000041926) ##22	SLC43A2 (ENSMLEG00000034253)	PITPNA (ENSMLEG00000029075)
Macaca	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00910000147075	ENSGT00390000012403.c.a	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00910000146989	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT00980000203260	ENSGT01090000260061.c.b.lg.b.b	ENSGT00940000160337	ENSGT00390000002453	ENSGT00940000153491.b.b.a	ENSGT00390000016067	ENSGT00940000161894	ENSGT01100000263493.a.b.a.a.b.b.b.a.a.a	ENSGT00390000017317
Pig-tailed macaque	MODERN SPECIES	94	SRR (ENSMNEG00000027328)	SMG6 (ENSMNEG00000044592)	HIC1 (ENSMNEG00000013172)	OVCA2 (ENSMNEG00000035582)	DPH1 (ENSMNEG00000035038)	RTN4RL1 (ENSMNEG00000040749)	ENSMNEG00000034543	ENSMNEG00000031632	SMYD4 (ENSMNEG00000009717)	SERPINF1 (ENSMNEG00000032039)	SERPINF2 (ENSMNEG00000044103)	WDR81 (ENSMNEG00000036661)	TLCD2 (ENSMNEG00000030678)	PRPF8 (ENSMNEG00000035713)	RILP (ENSMNEG00000029980)	SCARF1 (ENSMNEG00000035270) ##22	SLC43A2 (ENSMNEG00000040036)	PITPNA (ENSMNEG00000043212)	ENSMNEG00000005966	INPP5K (ENSMNEG00000035408)	MYO1C (ENSMNEG00000031081)	CRK (ENSMNEG00000039514)	YWHAE (ENSMNEG00000043038)	TRARG1 (ENSMNEG00000021061)	ABR (ENSMNEG00000037702)	TIMM22 (ENSMNEG00000029028)	NXN (ENSMNEG00000030279)	MRM3 (ENSMNEG00000032873)	GLOD4 (ENSMNEG00000043094)	ENSMNEG00000032391	GEMIN4 (ENSMNEG00000024138)
Macaca_a	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00510000048287	ENSGT00940000159315	ENSGT00940000153195.A	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403.c.a	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT00980000203260	ENSGT01090000260061.c.b.lg.b.b	ENSGT00940000160337	ENSGT00390000002453	ENSGT00940000161627.a.a.a.a.b.a.a.a.a.b.a.a.a.b.a.a	ENSGT00940000153491.b.b.a	ENSGT00390000016067	ENSGT00940000161894	ENSGT01100000263493.a.b.a.a.b.b.b.a.a.a	ENSGT00390000017317
Rhesus	MODERN SPECIES	7	SRR (ENSMMUG00000052387)	ENSMMUG00000054099	ENSMMUG00000060091	SMG6 (ENSMMUG00000023161)	HIC1 (ENSMMUG00000048710)	DPH1 (ENSMMUG00000010699)	RTN4RL1 (ENSMMUG00000063233)	ENSMMUG00000011604	SMYD4 (ENSMMUG00000022195)	ENSMMUG00000052847	SERPINF1 (ENSMMUG00000022194)	SERPINF2 (ENSMMUG00000002382)	WDR81 (ENSMMUG00000002380)	TLCD2 (ENSMMUG00000062386)	PRPF8 (ENSMMUG00000004820)	SCARF1 (ENSMMUG00000002376) ##22	SLC43A2 (ENSMMUG00000017561)	PITPNA (ENSMMUG00000040268)	ENSMMUG00000055241	INPP5K (ENSMMUG00000002373)	ENSMMUG00000050720	MYO1C (ENSMMUG00000002371)	ENSMMUG00000056053	CRK (ENSMMUG00000040390)	YWHAE (ENSMMUG00000019378)	TRARG1 (ENSMMUG00000057873)	ENSMMUG00000063406	TIMM22 (ENSMMUG00000008129)	ABR (ENSMMUG00000008130)	NXN (ENSMMUG00000011425)	ENSMMUG00000050172
Crab-eating macaque	MODERN SPECIES	7	SGSM2 (ENSMFAG00000000154)	TSR1 (ENSMFAG00000021330)	SRR (ENSMFAG00000042683)	ENSMFAG00000055957	SMG6 (ENSMFAG00000003394)	DPH1 (ENSMFAG00000046413)	ENSMFAG00000054890	RTN4RL1 (ENSMFAG00000042091)	RPA1 (ENSMFAG00000036138)	SMYD4 (ENSMFAG00000032240)	SERPINF1 (ENSMFAG00000044409)	SERPINF2 (ENSMFAG00000038758)	ENSMFAG00000038622	ENSMFAG00000062276	PRPF8 (ENSMFAG00000039995)	SCARF1 (ENSMFAG00000032062) ##22	ENSMFAG00000030102	PITPNA (ENSMFAG00000045283)	INPP5K (ENSMFAG00000030338)	MYO1C (ENSMFAG00000044455)	CRK (ENSMFAG00000000502)	ENSMFAG00000056902	YWHAE (ENSMFAG00000039687)	TRARG1 (ENSMFAG00000065706)	BHLHA9 (ENSMFAG00000065543)	ENSMFAG00000063599	ABR (ENSMFAG00000044480)	TIMM22 (ENSMFAG00000031269)	NXN (ENSMFAG00000041118)	ENSMFAG00000006775	MRM3 (ENSMFAG00000045382)
Euarchontoglires_A	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000153195.A	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00940000156758	ENSGT00440000034248	ENSGT00440000038370	ENSGT00390000016836.b	ENSGT00390000015165	ENSGT01010000222313.A.b.b.b	ENSGT00900000143173	ENSGT00390000012296	ENSGT00940000163490
Glires	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000153195.A	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00940000156758	ENSGT00440000034248	ENSGT00440000038370	ENSGT00390000016836.b	ENSGT00390000015165	ENSGT01010000222313.A.b.b.b	ENSGT00900000143173	ENSGT00390000012296	ENSGT00940000163490
Rodentia	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000153195.A	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00940000156758	ENSGT00440000034248	ENSGT00440000038370	ENSGT00390000016836.b	ENSGT00390000015165	ENSGT01010000222313.A.b.b.b	ENSGT00900000143173	ENSGT00390000012296	ENSGT00940000163490
Rodentia_B	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000153195.A	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00940000156758	ENSGT00440000034248	ENSGT00440000038370	ENSGT00390000016836.b	ENSGT00390000015165	ENSGT01010000222313.A.b.b.b	ENSGT00900000143173	ENSGT00390000012296	ENSGT00940000163490
Myomorpha	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000153195.A	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00940000156758	ENSGT00440000034248	ENSGT00440000038370	ENSGT00390000016836.b	ENSGT00390000015165	ENSGT01010000222313.A.b.b.b	ENSGT00900000143173	ENSGT00390000012296	ENSGT00940000163490
Muroidea	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000153195.A	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00940000156758	ENSGT00440000034248	ENSGT00440000038370	ENSGT00390000016836.b	ENSGT00390000015165	ENSGT01010000222313.A.b.b.b	ENSGT00900000143173	ENSGT00390000012296	ENSGT00940000163490
Muroidea_A	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000153195.A	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00940000156758	ENSGT00440000034248	ENSGT00440000038370	ENSGT00390000016836.b	ENSGT00390000015165	ENSGT01010000222313.A.b.b.b	ENSGT00900000143173	ENSGT00390000012296	ENSGT00940000163490
Cricetidae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000153195.A	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210.k	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b.eg.a	ENSGT00940000156758	ENSGT00440000034248	ENSGT00440000038370	ENSGT00390000016836.b	ENSGT00390000015165	ENSGT01010000222313.A.b.b.b	ENSGT00900000143173	ENSGT00390000012296	ENSGT00940000163490
Cricetidae_B	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000153195.A	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210.k	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b.eg.a	ENSGT00940000156758	ENSGT00440000034248	ENSGT00440000038370	ENSGT00390000016836.b	ENSGT00390000015165	ENSGT01010000222313.A.b.b.b	ENSGT00900000143173	ENSGT00390000012296	ENSGT00940000163490
Prairie vole	MODERN SPECIES	15	Srr (ENSMOCG00000014208)	ENSMOCG00000019924	Hic1 (ENSMOCG00000001275)	Ovca2 (ENSMOCG00000008168)	Dph1 (ENSMOCG00000017165)	Rtn4rl1 (ENSMOCG00000021572)	Rpa1 (ENSMOCG00000013019)	Smyd4 (ENSMOCG00000014637)	ENSMOCG00000002102	Serpinf1 (ENSMOCG00000013659)	Serpinf2 (ENSMOCG00000015426)	Wdr81 (ENSMOCG00000014819)	ENSMOCG00000004200	Prpf8 (ENSMOCG00000016838)	Rilp (ENSMOCG00000022637)	Scarf1 (ENSMOCG00000021999) ##22	Slc43a2 (ENSMOCG00000006980)	Pitpna (ENSMOCG00000014886)	Inpp5k (ENSMOCG00000005686)	Myo1c (ENSMOCG00000005404)	Crk (ENSMOCG00000005876)	Ywhae (ENSMOCG00000014128)	Doc2b (ENSMOCG00000013519)	ENSMOCG00000001677	ENSMOCG00000008254	1700016K19Rik (ENSMOCG00000012261)	Rflnb (ENSMOCG00000022116)	Vps53 (ENSMOCG00000022829)	Tlcd3a (ENSMOCG00000008958)	ENSMOCG00000006304	Dbil5 (ENSMOCG00000004108)
Northern American deer mouse	MODERN SPECIES	21	Sgsm2 (ENSPEMG00000021281)	Tsr1 (ENSPEMG00000018033)	Srr (ENSPEMG00000021069)	Smg6 (ENSPEMG00000020707)	Hic1 (ENSPEMG00000021229)	Ovca2 (ENSPEMG00000021292)	Dph1 (ENSPEMG00000022159)	Rtn4rl1 (ENSPEMG00000022669)	Rpa1 (ENSPEMG00000021061)	Smyd4 (ENSPEMG00000021819)	Serpinf1 (ENSPEMG00000022453)	Serpinf2 (ENSPEMG00000021335)	Wdr81 (ENSPEMG00000022885)	Prpf8 (ENSPEMG00000021699)	Rilp (ENSPEMG00000011201)	Scarf1 (ENSPEMG00000021038) ##22	Slc43a2 (ENSPEMG00000003908)	Pitpna (ENSPEMG00000020973)	Inpp5k (ENSPEMG00000015251)	Myo1c (ENSPEMG00000023045)	ENSPEMG00000030704	Ywhae (ENSPEMG00000006827)	Doc2b (ENSPEMG00000023568)	ENSPEMG00000024309	Rph3al (ENSPEMG00000000878)	1700016K19Rik (ENSPEMG00000016291)	Rflnb (ENSPEMG00000031305)	Vps53 (ENSPEMG00000023081)	Tlcd3a (ENSPEMG00000022199)	Glod4 (ENSPEMG00000023233)	Dbil5 (ENSPEMG00000022249)
Cricetinae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210.l	ENSGT00940000165249	ENSGT00390000015210.k	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b.eg.a	ENSGT00940000156758	ENSGT00440000038370	ENSGT00390000016836.b	ENSGT00390000015165.f	ENSGT01010000222313.A.b.b.b	ENSGT00900000143173	ENSGT00390000012296	ENSGT00940000163490	ENSGT00390000017317
Chinese hamster chok1gshd	MODERN SPECIES	155														ENSCGRG00001011538	Rilp (ENSCGRG00001010218)	Scarf1 (ENSCGRG00001008763) ##22	Slc43a2 (ENSCGRG00001007677)
Golden Hamster	MODERN SPECIES	627	Sgsm2 (ENSMAUG00000017273)	ENSMAUG00000010706	ENSMAUG00000014862	Srr (ENSMAUG00000017135)	ENSMAUG00000017203	Hic1 (ENSMAUG00000019881)	Dph1 (ENSMAUG00000018315)	Rtn4rl1 (ENSMAUG00000012849)	Rpa1 (ENSMAUG00000010474)	Smyd4 (ENSMAUG00000018960)	Serpinf1 (ENSMAUG00000013027)	Serpinf2 (ENSMAUG00000010228)	Wdr81 (ENSMAUG00000001591)	ENSMAUG00000020826	ENSMAUG00000014365	Scarf1 (ENSMAUG00000012062) ##22	Slc43a2 (ENSMAUG00000008412)	Pitpna (ENSMAUG00000018989)	ENSMAUG00000007460	Myo1c (ENSMAUG00000009020)	Crk (ENSMAUG00000020949)	Ywhae (ENSMAUG00000010444)	Doc2b (ENSMAUG00000013384)	ENSMAUG00000009155	1700016K19Rik (ENSMAUG00000007301)	Rflnb (ENSMAUG00000021462)	Vps53 (ENSMAUG00000014153)	Tlcd3a (ENSMAUG00000018028)	ENSMAUG00000007743	Dbil5 (ENSMAUG00000009815)	Gemin4 (ENSMAUG00000018640)
Murinae	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000153195.A	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00940000156758	ENSGT00440000034248	ENSGT00440000038370	ENSGT00390000016836.b	ENSGT00390000015165	ENSGT01010000222313.A.b.b.b	ENSGT00390000012296	ENSGT00940000163490	ENSGT00390000012340
Mus	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000153195.A	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00940000156758	ENSGT00440000034248	ENSGT00440000038370	ENSGT00390000016836.b	ENSGT00390000015165	ENSGT01010000222313.A.b.b.b	ENSGT00390000012296	ENSGT00940000163490	ENSGT00390000012340
Mus_A	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000153195.A	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00940000156758	ENSGT00440000034248	ENSGT00440000038370	ENSGT00390000016836.b	ENSGT00390000015165	ENSGT01010000222313.A.b.b.b	ENSGT00390000012296	ENSGT00940000163490	ENSGT00390000012340
Mus_B	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000153195.A	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00940000156758	ENSGT00440000034248	ENSGT00440000038370	ENSGT00390000016836.b	ENSGT00390000015165	ENSGT01010000222313.A.b.b.b	ENSGT00390000012296	ENSGT00940000163490	ENSGT00390000012340
Mus_C	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000153195.A	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00940000156758	ENSGT00440000034248	ENSGT00440000038370	ENSGT00390000016836.b	ENSGT00390000015165	ENSGT01010000222313.A.b.b.b	ENSGT00390000012296	ENSGT00900000143173	ENSGT00940000163490
spretus	MODERN SPECIES	2	Tsr1 (MGP_SPRETEiJ_G0017570)	Srr (MGP_SPRETEiJ_G0017571)	Smg6 (MGP_SPRETEiJ_G0017572)	Hic1 (MGP_SPRETEiJ_G0017573)	Ovca2 (MGP_SPRETEiJ_G0017574)	Dph1 (MGP_SPRETEiJ_G0017575)	Rtn4rl1 (MGP_SPRETEiJ_G0017576)	Rpa1 (MGP_SPRETEiJ_G0017577)	Smyd4 (MGP_SPRETEiJ_G0017578)	Serpinf1 (MGP_SPRETEiJ_G0017579)	Serpinf2 (MGP_SPRETEiJ_G0017580)	Wdr81 (MGP_SPRETEiJ_G0017581)	Tlcd2 (MGP_SPRETEiJ_G0017582)	Prpf8 (MGP_SPRETEiJ_G0017583)	Rilp (MGP_SPRETEiJ_G0017584)	Scarf1 (MGP_SPRETEiJ_G0017585) ##22	Slc43a2 (MGP_SPRETEiJ_G0017586)	Pitpna (MGP_SPRETEiJ_G0017587)	Inpp5k (MGP_SPRETEiJ_G0017588)	Myo1c (MGP_SPRETEiJ_G0017589)	Crk (MGP_SPRETEiJ_G0017590)	Ywhae (MGP_SPRETEiJ_G0017591)	Doc2b (MGP_SPRETEiJ_G0017592)	Rph3al (MGP_SPRETEiJ_G0017593)	1700016K19Rik (MGP_SPRETEiJ_G0017594)	Rflnb (MGP_SPRETEiJ_G0017595)	Vps53 (MGP_SPRETEiJ_G0017596)	Glod4 (MGP_SPRETEiJ_G0017597)	Tlcd3a (MGP_SPRETEiJ_G0017598)	Dbil5 (MGP_SPRETEiJ_G0017600)	Mrm3 (MGP_SPRETEiJ_G0017601)
Steppe mouse	MODERN SPECIES	3302	Tsr1 (ENSMSIG00000023593)	Srr (ENSMSIG00000023640)	Smg6 (ENSMSIG00000023782)	ENSMSIG00000023826	Hic1 (ENSMSIG00000023835)	Dph1 (ENSMSIG00000023847)	Rtn4rl1 (ENSMSIG00000023875)	Rpa1 (ENSMSIG00000023885)	Smyd4 (ENSMSIG00000023952)	Serpinf1 (ENSMSIG00000023993)	Serpinf2 (ENSMSIG00000024000)	Wdr81 (ENSMSIG00000024006)	ENSMSIG00000024029	Prpf8 (ENSMSIG00000024041)	Rilp (ENSMSIG00000024075)	Scarf1 (ENSMSIG00000024101) ##22	Slc43a2 (ENSMSIG00000024133)	Pitpna (ENSMSIG00000024169)	Inpp5k (ENSMSIG00000024224)	Myo1c (ENSMSIG00000024267)	Crk (ENSMSIG00000024436)	Ywhae (ENSMSIG00000024444)	Doc2b (ENSMSIG00000024467)	Rph3al (ENSMSIG00000024486)	1700016K19Rik (ENSMSIG00000024518)	ENSMSIG00000024526	Vps53 (ENSMSIG00000024533)	Tlcd3a (ENSMSIG00000024761)	Gemin4 (ENSMSIG00000024775)	ENSMSIG00000024822	Dbil5 (ENSMSIG00000024828)
Mouse	MODERN SPECIES	2	Tsr1 (ENSMUSG00000038335)	Srr (ENSMUSG00000001323)	Smg6 (ENSMUSG00000038290)	Hic1 (ENSMUSG00000043099)	Ovca2 (ENSMUSG00000038268)	Dph1 (ENSMUSG00000078789)	Rtn4rl1 (ENSMUSG00000045287)	Rpa1 (ENSMUSG00000000751)	Smyd4 (ENSMUSG00000018809)	Serpinf1 (ENSMUSG00000000753)	Serpinf2 (ENSMUSG00000038224)	Wdr81 (ENSMUSG00000045374)	Tlcd2 (ENSMUSG00000038217)	Prpf8 (ENSMUSG00000020850)	Rilp (ENSMUSG00000038195)	Scarf1 (ENSMUSG00000038188) ##22	Slc43a2 (ENSMUSG00000038178)	Pitpna (ENSMUSG00000017781)	Inpp5k (ENSMUSG00000006127)	Myo1c (ENSMUSG00000017774)	Crk (ENSMUSG00000017776)	Ywhae (ENSMUSG00000020849)	Doc2b (ENSMUSG00000020848)	Rph3al (ENSMUSG00000020847)	1700016K19Rik (ENSMUSG00000053783)	Rflnb (ENSMUSG00000020846)	Vps53 (ENSMUSG00000017288)	Glod4 (ENSMUSG00000017286)	Tlcd3a (ENSMUSG00000069808)	Gemin4 (ENSMUSG00000049396)	Dbil5 (ENSMUSG00000038057)
Ryukyu mouse	MODERN SPECIES	2	Tsr1 (MGP_CAROLIEiJ_G0016727)	Srr (MGP_CAROLIEiJ_G0016728)	Smg6 (MGP_CAROLIEiJ_G0016729)	Hic1 (MGP_CAROLIEiJ_G0016730)	Ovca2 (MGP_CAROLIEiJ_G0016731)	Dph1 (MGP_CAROLIEiJ_G0016732)	Rtn4rl1 (MGP_CAROLIEiJ_G0016733)	Rpa1 (MGP_CAROLIEiJ_G0016734)	Smyd4 (MGP_CAROLIEiJ_G0016735)	Serpinf1 (MGP_CAROLIEiJ_G0016736)	Serpinf2 (MGP_CAROLIEiJ_G0016737)	Wdr81 (MGP_CAROLIEiJ_G0016738)	Tlcd2 (MGP_CAROLIEiJ_G0016739)	Prpf8 (MGP_CAROLIEiJ_G0016740)	Rilp (MGP_CAROLIEiJ_G0016741)	Scarf1 (MGP_CAROLIEiJ_G0016742) ##22	Slc43a2 (MGP_CAROLIEiJ_G0016743)	Pitpna (MGP_CAROLIEiJ_G0016744)	Inpp5k (MGP_CAROLIEiJ_G0016745)	Myo1c (MGP_CAROLIEiJ_G0016746)	Crk (MGP_CAROLIEiJ_G0016747)	Ywhae (MGP_CAROLIEiJ_G0016748)	Doc2b (MGP_CAROLIEiJ_G0016749)	Rph3al (MGP_CAROLIEiJ_G0016750)	1700016K19Rik (MGP_CAROLIEiJ_G0016751)	Rflnb (MGP_CAROLIEiJ_G0016752)	Vps53 (MGP_CAROLIEiJ_G0016753)	Glod4 (MGP_CAROLIEiJ_G0016754)	Tlcd3a (MGP_CAROLIEiJ_G0016755)	Gemin4 (MGP_CAROLIEiJ_G0016756)	Dbil5 (MGP_CAROLIEiJ_G0016757)
Shrew mouse	MODERN SPECIES	5	Tsr1 (MGP_PahariEiJ_G0017864)	Srr (MGP_PahariEiJ_G0017865)	Smg6 (MGP_PahariEiJ_G0017866)	MGP_PahariEiJ_G0017867	Ovca2 (MGP_PahariEiJ_G0017868)	Dph1 (MGP_PahariEiJ_G0017869)	Rtn4rl1 (MGP_PahariEiJ_G0017870)	Rpa1 (MGP_PahariEiJ_G0017871)	Smyd4 (MGP_PahariEiJ_G0017872)	MGP_PahariEiJ_G0017873	Serpinf2 (MGP_PahariEiJ_G0017874)	Wdr81 (MGP_PahariEiJ_G0017875)	MGP_PahariEiJ_G0017876	Prpf8 (MGP_PahariEiJ_G0017877)	Rilp (MGP_PahariEiJ_G0017878)	Scarf1 (MGP_PahariEiJ_G0017879) ##22	Slc43a2 (MGP_PahariEiJ_G0017880)	Pitpna (MGP_PahariEiJ_G0017881)	Inpp5k (MGP_PahariEiJ_G0017882)	Myo1c (MGP_PahariEiJ_G0017883)	Crk (MGP_PahariEiJ_G0017884)	Ywhae (MGP_PahariEiJ_G0017885)	Doc2b (MGP_PahariEiJ_G0017886)	MGP_PahariEiJ_G0017887	1700016K19Rik (MGP_PahariEiJ_G0017888)	Rflnb (MGP_PahariEiJ_G0017889)	Vps53 (MGP_PahariEiJ_G0017890)	Glod4 (MGP_PahariEiJ_G0017891)	Tlcd3a (MGP_PahariEiJ_G0017892)	Gemin4 (MGP_PahariEiJ_G0017893)	Dbil5 (MGP_PahariEiJ_G0017894)
Rat	MODERN SPECIES	1	Tsr1 (ENSRNOG00000002980)	Srr (ENSRNOG00000002991)	Smg6 (ENSRNOG00000003041)	Hic1 (ENSRNOG00000057619)	Dph1 (ENSRNOG00000003116)	Rtn4rl1 (ENSRNOG00000003121)	Rpa1 (ENSRNOG00000003123)	Smyd4 (ENSRNOG00000026783)	Rpl37-ps4 (ENSRNOG00000061979)	Serpinf1 (ENSRNOG00000003172)	Serpinf2 (ENSRNOG00000003233)	Wdr81 (ENSRNOG00000003243)	Tlcd2 (ENSRNOG00000037275)	Prpf8 (ENSRNOG00000003495)	Rilp (ENSRNOG00000003784)	Scarf1 (ENSRNOG00000059618) ##22	Slc43a2 (ENSRNOG00000003835)	Pitpna (ENSRNOG00000003846)	Inpp5k (ENSRNOG00000056954)	Myo1c (ENSRNOG00000004072)	Crk (ENSRNOG00000025792)	Ywhae (ENSRNOG00000005290)	Doc2b (ENSRNOG00000060054)	Rph3al (ENSRNOG00000061429)	C10h17orf97 (ENSRNOG00000025287)	Rflnb (ENSRNOG00000006674)	Vps53 (ENSRNOG00000006895)	Rpl37l1 (ENSRNOG00000034180)	Tlcd3a (ENSRNOG00000007722)	Gemin4 (ENSRNOG00000007788)	Gemin4 (ENSRNOG00000055236)
Upper Galilee mountains blind mole rat	MODERN SPECIES	618	Srr (ENSNGAG00000000200)	Smg6 (ENSNGAG00000007287)	Hic1 (ENSNGAG00000020689)	Ovca2 (ENSNGAG00000020009)	Dph1 (ENSNGAG00000018594)	Rtn4rl1 (ENSNGAG00000016517)	Rpa1 (ENSNGAG00000004522)	ENSNGAG00000015246	Serpinf1 (ENSNGAG00000016129)	Serpinf2 (ENSNGAG00000012925)	Wdr81 (ENSNGAG00000012149)	ENSNGAG00000011721	ENSNGAG00000016869	Prpf8 (ENSNGAG00000005305)	Rilp (ENSNGAG00000020780)	Scarf1 (ENSNGAG00000016130) ##22	ENSNGAG00000012754	ENSNGAG00000002523	Pitpna (ENSNGAG00000016428)	Inpp5k (ENSNGAG00000010867)	Myo1c (ENSNGAG00000003685)	Crk (ENSNGAG00000000285)	ENSNGAG00000021041	Doc2b (ENSNGAG00000020897)	Rph3al (ENSNGAG00000015279)	1700016K19Rik (ENSNGAG00000013370)	Rflnb (ENSNGAG00000013007)	Vps53 (ENSNGAG00000012689)	Tlcd3a (ENSNGAG00000002868)	ENSNGAG00000001144	Gemin4 (ENSNGAG00000016650)
Kangaroo rat	MODERN SPECIES	350	Sgsm2 (ENSDORG00000016373)	ENSDORG00000016371	Srr (ENSDORG00000016370)	Smg6 (ENSDORG00000016614)	Hic1 (ENSDORG00000027749)	Ovca2 (ENSDORG00000006693)	Dph1 (ENSDORG00000006697)	Rtn4rl1 (ENSDORG00000011520)	Rpa1 (ENSDORG00000006199)	ENSDORG00000006198	Serpinf1 (ENSDORG00000006197)	Serpinf2 (ENSDORG00000006196)	Wdr81 (ENSDORG00000006194)	Prpf8 (ENSDORG00000006185)	Rilp (ENSDORG00000006184)	Scarf1 (ENSDORG00000006183) ##22	Slc43a2 (ENSDORG00000014793)	Pitpna (ENSDORG00000015751)	Inpp5k (ENSDORG00000015750)	Myo1c (ENSDORG00000015749)	Crk (ENSDORG00000004561)	Ywhae (ENSDORG00000026870)	Doc2b (ENSDORG00000024337)	Rph3al (ENSDORG00000002882)	1700016K19Rik (ENSDORG00000029781)	Rflnb (ENSDORG00000025643)	Vps53 (ENSDORG00000007544)	Tlcd3a (ENSDORG00000007546)	ENSDORG00000026359	Dbil5 (ENSDORG00000024622)	Gemin4 (ENSDORG00000007547)
Rodentia_A	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000153195.A	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00940000156758	ENSGT00440000034248	ENSGT00440000038370	ENSGT00390000016836.b	ENSGT00390000015165	ENSGT01010000222313.A.b.b.b	ENSGT00900000143173	ENSGT00390000012296	ENSGT00940000163490
Hystricomorpha	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000153195.A	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00940000156758	ENSGT00440000034248	ENSGT00440000038370	ENSGT00390000016836.b	ENSGT00390000015165	ENSGT01010000222313.A.b.b.b	ENSGT00900000143173	ENSGT00390000012296	ENSGT00940000163490
Hystricomorpha_a	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000153195.A	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00940000156758	ENSGT00440000034248	ENSGT00440000038370	ENSGT00390000016836.b	ENSGT00390000015165	ENSGT01010000222313.A.b.b.b	ENSGT00390000012296	ENSGT00940000163490	ENSGT00390000017317
Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000153195.A	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00940000156758	ENSGT00440000034248	ENSGT00440000038370	ENSGT00390000016836.b	ENSGT00390000015165	ENSGT01010000222313.A.b.b.b	ENSGT00390000012296	ENSGT00940000163490	ENSGT00390000017317
Degu	MODERN SPECIES	113	TSR1 (ENSODEG00000007910)	SRR (ENSODEG00000009767)	SMG6 (ENSODEG00000008038)	HIC1 (ENSODEG00000007964)	DPH1 (ENSODEG00000008054)	RTN4RL1 (ENSODEG00000008212)	RPA1 (ENSODEG00000009038)	SMYD4 (ENSODEG00000008338)	SERPINF1 (ENSODEG00000008415)	SERPINF2 (ENSODEG00000008213)	WDR81 (ENSODEG00000009088)	TLCD2 (ENSODEG00000007786)	ENSODEG00000008070	PRPF8 (ENSODEG00000008468)	RILP (ENSODEG00000007913)	SCARF1 (ENSODEG00000007941) ##22	ENSODEG00000011524	SLC43A2 (ENSODEG00000007969)	PITPNA (ENSODEG00000008726)	ENSODEG00000019549	INPP5K (ENSODEG00000008941)	MYO1C (ENSODEG00000013058)	CRK (ENSODEG00000008440)	DOC2B (ENSODEG00000008870)	RPH3AL (ENSODEG00000009403)	ENSODEG00000019546	ENSODEG00000019582	ENSODEG00000009733	ENSODEG00000009036	VPS53 (ENSODEG00000008148)	TLCD3A (ENSODEG00000010651)
Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	188	SRR (ENSCLAG00000013435)	TSR1 (ENSCLAG00000005567)	SMG6 (ENSCLAG00000006748)	HIC1 (ENSCLAG00000008072)	OVCA2 (ENSCLAG00000008500)	DPH1 (ENSCLAG00000009284)	RTN4RL1 (ENSCLAG00000009730)	ENSCLAG00000005185	SMYD4 (ENSCLAG00000007096)	SERPINF1 (ENSCLAG00000004364)	SERPINF2 (ENSCLAG00000005418)	WDR81 (ENSCLAG00000006184)	TLCD2 (ENSCLAG00000006248)	PRPF8 (ENSCLAG00000004388)	RILP (ENSCLAG00000005570)	SCARF1 (ENSCLAG00000007850) ##22	SLC43A2 (ENSCLAG00000008904)	PITPNA (ENSCLAG00000005817)	INPP5K (ENSCLAG00000006255)	MYO1C (ENSCLAG00000006861)	CRK (ENSCLAG00000005975)	YWHAE (ENSCLAG00000006497)	DOC2B (ENSCLAG00000006834)	RPH3AL (ENSCLAG00000004707)	ENSCLAG00000005764	RFLNB (ENSCLAG00000006406)	VPS53 (ENSCLAG00000010632)	TLCD3A (ENSCLAG00000007548)	GEMIN4 (ENSCLAG00000008139)	ENSCLAG00000007298	MRM3 (ENSCLAG00000008589)
Guinea pig	MODERN SPECIES	32	SGSM2 (ENSCPOG00000014836)	TSR1 (ENSCPOG00000014833)	SRR (ENSCPOG00000014830)	SMG6 (ENSCPOG00000014878)	HIC1 (ENSCPOG00000020382)	DPH1 (ENSCPOG00000027259)	RTN4RL1 (ENSCPOG00000032205)	RPA1 (ENSCPOG00000000035)	SMYD4 (ENSCPOG00000006737)	SERPINF1 (ENSCPOG00000010415)	SERPINF2 (ENSCPOG00000033575)	WDR81 (ENSCPOG00000012041)	TLCD2 (ENSCPOG00000034754)	PRPF8 (ENSCPOG00000010379)	RILP (ENSCPOG00000010367)	SCARF1 (ENSCPOG00000010362) ##22	SLC43A2 (ENSCPOG00000010361)	PITPNA (ENSCPOG00000036950)	INPP5K (ENSCPOG00000006879)	MYO1C (ENSCPOG00000019415)	CRK (ENSCPOG00000006877)	YWHAE (ENSCPOG00000034635)	DOC2B (ENSCPOG00000024219)	RPH3AL (ENSCPOG00000001101)	ENSCPOG00000036703	RFLNB (ENSCPOG00000009354)	VPS53 (ENSCPOG00000009355)	TLCD3A (ENSCPOG00000004305)	GEMIN4 (ENSCPOG00000004307)	ENSCPOG00000019350	MRM3 (ENSCPOG00000026540)
Naked mole-rat female	MODERN SPECIES	12	ENSHGLG00000037437	SMG6 (ENSHGLG00000012882)	OVCA2 (ENSHGLG00000042324)	DPH1 (ENSHGLG00000010101)	RTN4RL1 (ENSHGLG00000045207)	RPA1 (ENSHGLG00000008846)	ENSHGLG00000007504	SMYD4 (ENSHGLG00000010971)	SERPINF1 (ENSHGLG00000008614)	ENSHGLG00000032927	ENSHGLG00000048635	SERPINF2 (ENSHGLG00000006598)	ENSHGLG00000036476	PRPF8 (ENSHGLG00000012029)	RILP (ENSHGLG00000009632)	SCARF1 (ENSHGLG00000007269) ##22	SLC43A2 (ENSHGLG00000006362)	ENSHGLG00000043589	PITPNA (ENSHGLG00000018107)	INPP5K (ENSHGLG00000009859)	ENSHGLG00000012291	ENSHGLG00000010621	ENSHGLG00000010404	ENSHGLG00000013336	ENSHGLG00000012650	RPH3AL (ENSHGLG00000010855)	ENSHGLG00000039908	RFLNB (ENSHGLG00000049864)	VPS53 (ENSHGLG00000011774)	ENSHGLG00000037859	ENSHGLG00000020608
Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000159315	ENSGT00940000153195.A	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00940000156758	ENSGT00440000034248	ENSGT00440000038370	ENSGT00390000016836.b.c	ENSGT00390000015165	ENSGT01010000222313.A.b.b.b	ENSGT00390000012296	ENSGT00940000163490	ENSGT00390000012340
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	39	ENSGT00940000153195.A	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT00390000015210	ENSGT01060000250243	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00940000156758	ENSGT00440000034248	ENSGT00440000038370	ENSGT00390000016836.b.c	ENSGT00390000015165	ENSGT01010000222313.A.b.b.b	ENSGT00390000012296	ENSGT00940000163490	ENSGT00390000012340
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	34	ENSGT00940000153195.A	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT00390000015210	ENSGT01060000250243	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00940000156758	ENSGT00440000034248	ENSGT00440000038370	ENSGT00390000016836.b.c	ENSGT00390000015165	ENSGT01010000222313.A.b.b.b	ENSGT00390000012296	ENSGT00940000163490	ENSGT00390000012340
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	63	SRR (ENSUPAG00010017759)	SMG6 (ENSUPAG00010017845)	ENSUPAG00010017881	HIC1 (ENSUPAG00010017894)	DPH1 (ENSUPAG00010017906)	OVCA2 (ENSUPAG00010017915)	RTN4RL1 (ENSUPAG00010017921)	RPA1 (ENSUPAG00010017924)	ENSUPAG00010017972	SMYD4 (ENSUPAG00010017974)	SERPINF1 (ENSUPAG00010017988)	WDR81 (ENSUPAG00010018006)	PRPF8 (ENSUPAG00010018046)	ENSUPAG00010018103	RILP (ENSUPAG00010018108)	SCARF1 (ENSUPAG00010018115) ##22	SLC43A2 (ENSUPAG00010018128)	PITPNA (ENSUPAG00010018150)	INPP5K (ENSUPAG00010018169)	MYO1C (ENSUPAG00010018200)	CRK (ENSUPAG00010018266)	YWHAE (ENSUPAG00010018271)	DOC2B (ENSUPAG00010018288)	RPH3AL (ENSUPAG00010018306)	ENSUPAG00010018332	ENSUPAG00010018334	VPS53 (ENSUPAG00010018341)	ENSUPAG00010018498	TLCD3A (ENSUPAG00010018510)	GEMIN4 (ENSUPAG00010018533)	ENSUPAG00010018538
Squirrel	MODERN SPECIES	138	SGSM2 (ENSSTOG00000011842)	TSR1 (ENSSTOG00000011819)	ENSSTOG00000011814	SMG6 (ENSSTOG00000028127)	HIC1 (ENSSTOG00000011792)	OVCA2 (ENSSTOG00000022267)	DPH1 (ENSSTOG00000027477)	RTN4RL1 (ENSSTOG00000003608)	RPA1 (ENSSTOG00000022475)	SMYD4 (ENSSTOG00000003588)	SERPINF1 (ENSSTOG00000022726)	SERPINF2 (ENSSTOG00000005240)	WDR81 (ENSSTOG00000027982)	PRPF8 (ENSSTOG00000005128)	RILP (ENSSTOG00000033473)	SCARF1 (ENSSTOG00000005074) ##22	SLC43A2 (ENSSTOG00000005056)	PITPNA (ENSSTOG00000005039)	INPP5K (ENSSTOG00000005020)	MYO1C (ENSSTOG00000005117)	CRK (ENSSTOG00000005107)	YWHAE (ENSSTOG00000005084)	DOC2B (ENSSTOG00000022315)	RPH3AL (ENSSTOG00000009699)	ENSSTOG00000016417	ENSSTOG00000028488	VPS53 (ENSSTOG00000016418)	TLCD3A (ENSSTOG00000016422)	ENSSTOG00000022725	GEMIN4 (ENSSTOG00000027263)	MRM3 (ENSSTOG00000016426)
Alpin marmot	MODERN SPECIES	71	TSR1 (ENSMMMG00000024102)	SRR (ENSMMMG00000024105)	SMG6 (ENSMMMG00000024106)	OVCA2 (ENSMMMG00000024111)	DPH1 (ENSMMMG00000024112)	RTN4RL1 (ENSMMMG00000024113)	RPA1 (ENSMMMG00000024114)	ENSMMMG00000024115	SMYD4 (ENSMMMG00000024116)	SERPINF1 (ENSMMMG00000024117)	SERPINF2 (ENSMMMG00000024119)	WDR81 (ENSMMMG00000024120)	PRPF8 (ENSMMMG00000024122)	ENSMMMG00000024123	RILP (ENSMMMG00000024124)	SCARF1 (ENSMMMG00000024125) ##22	SLC43A2 (ENSMMMG00000024126)	PITPNA (ENSMMMG00000024127)	INPP5K (ENSMMMG00000024128)	MYO1C (ENSMMMG00000024129)	CRK (ENSMMMG00000024130)	ENSMMMG00000024131	ENSMMMG00000024132	ENSMMMG00000024133	RPH3AL (ENSMMMG00000024134)	ENSMMMG00000024135	ENSMMMG00000024136	VPS53 (ENSMMMG00000024137)	TLCD3A (ENSMMMG00000024140)	GEMIN4 (ENSMMMG00000024141)	ENSMMMG00000024142
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	12	SGSM2 (ENSSVLG00005022490)	TSR1 (ENSSVLG00005022634)	ENSSVLG00005022753	ENSSVLG00005022775	HIC1 (ENSSVLG00005022808)	DPH1 (ENSSVLG00005022854)	OVCA2 (ENSSVLG00005022996)	RTN4RL1 (ENSSVLG00005023024)	RPA1 (ENSSVLG00005023051)	SMYD4 (ENSSVLG00005023078)	SERPINF1 (ENSSVLG00005023118)	SERPINF2 (ENSSVLG00005023173)	WDR81 (ENSSVLG00005010792)	PRPF8 (ENSSVLG00005011009)	RILP (ENSSVLG00005011460)	SCARF1 (ENSSVLG00005011602) ##22	SLC43A2 (ENSSVLG00005011913)	PITPNA (ENSSVLG00005011975)	INPP5K (ENSSVLG00005012049)	MYO1C (ENSSVLG00005012175)	ENSSVLG00005012645	ENSSVLG00005012733	DOC2B (ENSSVLG00005012910)	RPH3AL (ENSSVLG00005013122)	ENSSVLG00005013219	VPS53 (ENSSVLG00005013330)	TLCD3A (ENSSVLG00005013497)	GEMIN4 (ENSSVLG00005013594)	ENSSVLG00005013645	GLOD4 (ENSSVLG00005013759)	MRM3 (ENSSVLG00005013823)
Lagomorpha	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000153195.A	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00940000156758	ENSGT00440000038370	ENSGT00440000034248	ENSGT00390000016836.b	ENSGT00390000015165	ENSGT01010000222313.A.b.b.b	ENSGT00390000012296	ENSGT00390000012340	ENSGT00940000164902	ENSGT00940000161894
Pika	MODERN SPECIES	1150									SMYD4 (ENSOPRG00000003314)	SERPINF1 (ENSOPRG00000003279)	SERPINF2 (ENSOPRG00000003246)	ENSOPRG00000003223	TLCD2 (ENSOPRG00000003197)	PRPF8 (ENSOPRG00000003102)	RILP (ENSOPRG00000003064)	SCARF1 (ENSOPRG00000003041) ##22	SLC43A2 (ENSOPRG00000003012)	PITPNA (ENSOPRG00000002984)	INPP5K (ENSOPRG00000002953)
Rabbit	MODERN SPECIES	10	ENSOCUG00000001979	SMG6 (ENSOCUG00000013018)	ENSOCUG00000024363	OVCA2 (ENSOCUG00000023775)	DPH1 (ENSOCUG00000013008)	RTN4RL1 (ENSOCUG00000001519)	RPA1 (ENSOCUG00000001504)	ENSOCUG00000001514	SMYD4 (ENSOCUG00000000093)	SERPINF1 (ENSOCUG00000000092)	SERPINF2 (ENSOCUG00000000091)	WDR81 (ENSOCUG00000000090)	TLCD2 (ENSOCUG00000000087)	PRPF8 (ENSOCUG00000000081)	RILP (ENSOCUG00000000077)	SCARF1 (ENSOCUG00000039340) ##22	SLC43A2 (ENSOCUG00000000076)	PITPNA (ENSOCUG00000000075)	INPP5K (ENSOCUG00000000073)	MYO1C (ENSOCUG00000000069)	YWHAE (ENSOCUG00000014607)	ENSOCUG00000007211	ENSOCUG00000025842	RFLNB (ENSOCUG00000023105)	VPS53 (ENSOCUG00000002194)	TLCD3A (ENSOCUG00000002202)	GEMIN4 (ENSOCUG00000002205)	ENSOCUG00000002208	ENSOCUG00000005189	ENSOCUG00000033243	MRM3 (ENSOCUG00000002219)
Laurasiatheria	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000153195.A	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000155101	ENSGT00940000164396	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00940000156758	ENSGT00440000034248	ENSGT00440000038370	ENSGT00390000016836.b	ENSGT00390000015165	ENSGT01010000222313.A.b.b.b	ENSGT00900000143173
Eulipotyphla	ANCESTRAL SPECIES	28								ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22
Hedgehog	MODERN SPECIES	7445														ENSEEUG00000012120	RILP (ENSEEUG00000012094)	SCARF1 (ENSEEUG00000012060) ##22
Common shrew	DUPLICATION
Common shrew	MODERN SPECIES	10152																ENSSARG00000007222 ##22
Common shrew	MODERN SPECIES	5599									SMYD4 (ENSSARG00000003242)	SERPINF1 (ENSSARG00000003217)	SERPINF2 (ENSSARG00000003125)	ENSSARG00000003030	TLCD2 (ENSSARG00000003014)	PRPF8 (ENSSARG00000002892)	ENSSARG00000002852	ENSSARG00000002825 ##22
Laurasiatheria_a	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000153195.A	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00940000156758	ENSGT00440000034248	ENSGT00440000038370	ENSGT00390000016836.b	ENSGT00390000015165	ENSGT01010000222313.A.b.b.b	ENSGT00900000143173	ENSGT00390000012296	ENSGT00940000163490
Artiodactyla	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000153195.A	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00940000156758	ENSGT00440000034248	ENSGT00440000038370	ENSGT00390000016836.b	ENSGT00390000015165	ENSGT01010000222313.A.b.b.b	ENSGT00900000143173	ENSGT00390000012296	ENSGT00940000163490
Suina	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000153195.A	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00940000156758	ENSGT00440000034248	ENSGT00440000038370	ENSGT00390000016836.b	ENSGT00390000015165	ENSGT01010000222313.A.b.b.b	ENSGT00390000012296	ENSGT00940000163490	ENSGT00390000017317
Pig	MODERN SPECIES	3	SGSM2 (ENSSSCG00000017829)	TSR1 (ENSSSCG00000038534)	SRR (ENSSSCG00000062531)	SMG6 (ENSSSCG00000017826)	HIC1 (ENSSSCG00000025717)	DPH1 (ENSSSCG00000028078)	RTN4RL1 (ENSSSCG00000039780)	RPA1 (ENSSSCG00000017822)	SERPINF1 (ENSSSCG00000017818)	SMYD4 (ENSSSCG00000017819)	SERPINF2 (ENSSSCG00000038745)	WDR81 (ENSSSCG00000040732)	TLCD2 (ENSSSCG00000040205)	PRPF8 (ENSSSCG00000017817)	RILP (ENSSSCG00000050487)	SCARF1 (ENSSSCG00000024071) ##22	SLC43A2 (ENSSSCG00000024108)	PITPNA (ENSSSCG00000025248)	INPP5K (ENSSSCG00000030707)	MYO1C (ENSSSCG00000021821)	CRK (ENSSSCG00000038989)	YWHAE (ENSSSCG00000062888)	DOC2B (ENSSSCG00000039412)	RPH3AL (ENSSSCG00000036705)	ENSSSCG00000017814	RFLNB (ENSSSCG00000038618)	VPS53 (ENSSSCG00000017812)	ENSSSCG00000057748	TLCD3A (ENSSSCG00000017810)	ENSSSCG00000063547	GEMIN4 (ENSSSCG00000017809)
Chacoan peccary	MODERN SPECIES	2	TSR1 (ENSCWAG00000001171)	SRR (ENSCWAG00000001216)	SMG6 (ENSCWAG00000001242)	HIC1 (ENSCWAG00000001277)	OVCA2 (ENSCWAG00000001299)	DPH1 (ENSCWAG00000001313)	RTN4RL1 (ENSCWAG00000001340)	RPA1 (ENSCWAG00000001357)	SMYD4 (ENSCWAG00000001390)	SERPINF1 (ENSCWAG00000001405)	SERPINF2 (ENSCWAG00000001432)	WDR81 (ENSCWAG00000001498)	TLCD2 (ENSCWAG00000001632)	PRPF8 (ENSCWAG00000001656)	RILP (ENSCWAG00000001675)	SCARF1 (ENSCWAG00000001688) ##22	SLC43A2 (ENSCWAG00000001709)	PITPNA (ENSCWAG00000001782)	INPP5K (ENSCWAG00000001803)	MYO1C (ENSCWAG00000001868)	CRK (ENSCWAG00000002046)	YWHAE (ENSCWAG00000002054)	DOC2B (ENSCWAG00000002072)	RPH3AL (ENSCWAG00000002089)	RFLNB (ENSCWAG00000002106)	VPS53 (ENSCWAG00000002129)	TLCD3A (ENSCWAG00000002177)	GEMIN4 (ENSCWAG00000002194)	GLOD4 (ENSCWAG00000002208)	ENSCWAG00000002226	NXN (ENSCWAG00000002248)
Artiodactyla_a	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000153195.A	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00940000156758	ENSGT00440000034248	ENSGT00440000038370	ENSGT00390000016836.b	ENSGT00390000015165	ENSGT01010000222313.A.b.b.b	ENSGT00900000143173	ENSGT00390000012296	ENSGT00940000163490
Artiodactyla_b	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000153195.A	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119.c.a	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT00390000016760.c.a.a.a	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00940000156758	ENSGT00440000034248	ENSGT00440000038370	ENSGT00390000016836.b	ENSGT00390000015165	ENSGT01010000222313.A.b.b.b	ENSGT00900000143173	ENSGT00390000012296
Cetacea	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000153195.A	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119.c.a	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT00390000016760.c.a.a.a	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00940000156758	ENSGT00440000034248	ENSGT00440000038370	ENSGT00390000016836.b	ENSGT00390000015165	ENSGT01010000222313.A.b.b.b	ENSGT00390000012296	ENSGT00390000012340
Odontoceti	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000153195.A	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119.c.a	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00940000156758	ENSGT00440000034248	ENSGT00440000038370	ENSGT00390000016836.b	ENSGT00390000015165	ENSGT01010000222313.A.b.b.b	ENSGT00390000012296	ENSGT00390000012340	ENSGT00390000017317
Odontoceti_a	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000153195.A	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119.c.a	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00940000156758	ENSGT00440000034248	ENSGT00440000038370	ENSGT00390000016836.b	ENSGT00390000015165	ENSGT01010000222313.A.b.b.b	ENSGT00390000012296	ENSGT00390000012340	ENSGT00390000017317
Odontoceti_b	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000153195.A	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119.c.a	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00940000156758	ENSGT00440000034248	ENSGT00440000038370	ENSGT00390000016836.b	ENSGT00390000015165	ENSGT01010000222313.A.b.b.b	ENSGT00390000012296	ENSGT00390000012340	ENSGT00390000017317
Monodontidae	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000153195.A	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119.c.a	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00940000156758	ENSGT00440000034248	ENSGT00390000016836.b	ENSGT00390000015165	ENSGT01010000222313.A.b.b.b	ENSGT00390000012296	ENSGT00390000012340	ENSGT00390000017317	ENSGT00940000161894
Narwhal	MODERN SPECIES	316	TSR1 (ENSMMNG00015020101)	SRR (ENSMMNG00015020159)	SMG6 (ENSMMNG00015020209)	HIC1 (ENSMMNG00015020274)	OVCA2 (ENSMMNG00015020300)	DPH1 (ENSMMNG00015020319)	RTN4RL1 (ENSMMNG00015020341)	RPA1 (ENSMMNG00015020362)	SMYD4 (ENSMMNG00015020409)	SERPINF1 (ENSMMNG00015020440)	SERPINF2 (ENSMMNG00015020476)	WDR81 (ENSMMNG00015020528)	TLCD2 (ENSMMNG00015020582)	PRPF8 (ENSMMNG00015020606)	RILP (ENSMMNG00015020664)	SCARF1 (ENSMMNG00015020684) ##22	SLC43A2 (ENSMMNG00015020725)	PITPNA (ENSMMNG00015020793)	INPP5K (ENSMMNG00015020843)	MYO1C (ENSMMNG00015020988)	CRK (ENSMMNG00015021205)	ENSMMNG00015021224	DOC2B (ENSMMNG00015021250)	RPH3AL (ENSMMNG00015021273)	RFLNB (ENSMMNG00015021289)	VPS53 (ENSMMNG00015021310)	TLCD3A (ENSMMNG00015021359)	GEMIN4 (ENSMMNG00015021379)	GLOD4 (ENSMMNG00015021396)	MRM3 (ENSMMNG00015021415)	NXN (ENSMMNG00015021423)
Beluga whale	MODERN SPECIES	43	TSR1 (ENSDLEG00000012164)	SRR (ENSDLEG00000012144)	SMG6 (ENSDLEG00000012095)	HIC1 (ENSDLEG00000012085)	OVCA2 (ENSDLEG00000012071)	DPH1 (ENSDLEG00000012036)	RTN4RL1 (ENSDLEG00000012020)	RPA1 (ENSDLEG00000011648)	SMYD4 (ENSDLEG00000011576)	SERPINF1 (ENSDLEG00000011557)	SERPINF2 (ENSDLEG00000011529)	WDR81 (ENSDLEG00000011483)	TLCD2 (ENSDLEG00000011457)	PRPF8 (ENSDLEG00000011389)	RILP (ENSDLEG00000011358)	SCARF1 (ENSDLEG00000011288) ##22	SLC43A2 (ENSDLEG00000011224)	ENSDLEG00000011185	INPP5K (ENSDLEG00000011071)	MYO1C (ENSDLEG00000011023)	CRK (ENSDLEG00000011015)	YWHAE (ENSDLEG00000007787)	DOC2B (ENSDLEG00000007782)	RPH3AL (ENSDLEG00000007777)	RFLNB (ENSDLEG00000007769)	VPS53 (ENSDLEG00000007623)	FAM57A (ENSDLEG00000007586)	GEMIN4 (ENSDLEG00000007580)	GLOD4 (ENSDLEG00000007561)	MRM3 (ENSDLEG00000007546)	NXN (ENSDLEG00000007537)
Vaquita	MODERN SPECIES	12	TSR1 (ENSPSNG00000020514)	SRR (ENSPSNG00000020575)	SMG6 (ENSPSNG00000020607)	HIC1 (ENSPSNG00000020686)	OVCA2 (ENSPSNG00000020854)	DPH1 (ENSPSNG00000020761)	RTN4RL1 (ENSPSNG00000020882)	SMYD4 (ENSPSNG00000021186)	SERPINF1 (ENSPSNG00000021207)	SERPINF2 (ENSPSNG00000021243)	WDR81 (ENSPSNG00000021327)	TLCD2 (ENSPSNG00000021439)	PRPF8 (ENSPSNG00000021481)	ENSPSNG00000021531	RILP (ENSPSNG00000021550)	SCARF1 (ENSPSNG00000021578) ##22	SLC43A2 (ENSPSNG00000021613)	PITPNA (ENSPSNG00000021669)	INPP5K (ENSPSNG00000021714)	MYO1C (ENSPSNG00000021834)	CRK (ENSPSNG00000021972)	YWHAE (ENSPSNG00000022007)	DOC2B (ENSPSNG00000022037)	RPH3AL (ENSPSNG00000022061)	ENSPSNG00000022073	RFLNB (ENSPSNG00000022085)	VPS53 (ENSPSNG00000022122)	TLCD3A (ENSPSNG00000022168)	GEMIN4 (ENSPSNG00000022192)	GLOD4 (ENSPSNG00000022203)	MRM3 (ENSPSNG00000022211)
Dolphin	MODERN SPECIES	2615										SERPINF1 (ENSTTRG00000006874)	SERPINF2 (ENSTTRG00000006873)	ENSTTRG00000006872	TLCD2 (ENSTTRG00000006870)	PRPF8 (ENSTTRG00000006869)	ENSTTRG00000006868	SCARF1 (ENSTTRG00000006867) ##22	SLC43A2 (ENSTTRG00000006866)	PITPNA (ENSTTRG00000006864)	INPP5K (ENSTTRG00000006862)	MYO1C (ENSTTRG00000006860)
Sperm whale	MODERN SPECIES	497																SCARF1 (ENSPCTG00005020705) ##22	ENSPCTG00005020789
Blue whale	MODERN SPECIES	12	TSR1 (ENSBMSG00010019761)	SRR (ENSBMSG00010019742)	SMG6 (ENSBMSG00010019710)	HIC1 (ENSBMSG00010019692)	OVCA2 (ENSBMSG00010019677)	DPH1 (ENSBMSG00010019648)	RTN4RL1 (ENSBMSG00010019628)	RPA1 (ENSBMSG00010019545)	SMYD4 (ENSBMSG00010019498)	SERPINF1 (ENSBMSG00010019477)	SERPINF2 (ENSBMSG00010019405)	WDR81 (ENSBMSG00010019233)	TLCD2 (ENSBMSG00010019174)	PRPF8 (ENSBMSG00010019132)	RILP (ENSBMSG00010019079)	SCARF1 (ENSBMSG00010019004) ##22	SLC43A2 (ENSBMSG00010018713)	PITPNA (ENSBMSG00010018661)	INPP5K (ENSBMSG00010018621)	MYO1C (ENSBMSG00010018460)	CRK (ENSBMSG00010018408)	ENSBMSG00010018391	YWHAE (ENSBMSG00010018353)	DOC2B (ENSBMSG00010018303)	RPH3AL (ENSBMSG00010018268)	ENSBMSG00010018247	RFLNB (ENSBMSG00010018232)	ENSBMSG00010018213	VPS53 (ENSBMSG00010018077)	TLCD3A (ENSBMSG00010018000)	GEMIN4 (ENSBMSG00010017959)
Pecora	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000153195.A	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119.c.a	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT00390000016760.c.a.a.a	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00940000156758	ENSGT00440000034248	ENSGT00440000038370	ENSGT00390000016836.b	ENSGT00390000015165	ENSGT01010000222313.A.b.b.b	ENSGT00900000143173	ENSGT00390000012296
Percora_a	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000153195.A	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119.c.a	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT00390000016760.c.a.a.a	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00940000156758	ENSGT00440000034248	ENSGT00440000038370	ENSGT00390000016836.b	ENSGT00390000015165	ENSGT01010000222313.A.b.b.b	ENSGT00900000143173	ENSGT00390000012296
Bovidae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000153195.A	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119.c.a	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT00390000016760.c.a.a.a	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00940000156758	ENSGT00440000034248	ENSGT00440000038370	ENSGT00390000016836.b	ENSGT00390000015165	ENSGT01010000222313.A.b.b.b	ENSGT00900000143173	ENSGT00390000012296
Caprinae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000153195.A	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119.c.a	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT00390000016760.c.a.a.a	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00940000156758	ENSGT00440000034248	ENSGT00390000016836.b	ENSGT00390000015165	ENSGT01010000222313.A.b.b.b	ENSGT00900000143173	ENSGT00390000012296	ENSGT00940000163490
Rambouillet Sheep	MODERN SPECIES	2	TSR1 (ENSOARG00020022133)	SRR (ENSOARG00020022257)	SMG6 (ENSOARG00020022320)	HIC1 (ENSOARG00020022398)	OVCA2 (ENSOARG00020022448)	DPH1 (ENSOARG00020022481)	RTN4RL1 (ENSOARG00020022541)	RPA1 (ENSOARG00020022558)	SMYD4 (ENSOARG00020022632)	SERPINF1 (ENSOARG00020022688)	SERPINF2 (ENSOARG00020022720)	WDR81 (ENSOARG00020022797)	TLCD2 (ENSOARG00020022960)	PRPF8 (ENSOARG00020022997)	RILP (ENSOARG00020023103)	SCARF1 (ENSOARG00020009976) ##22	SLC43A2 (ENSOARG00020010323)	ENSOARG00020010695	INPP5K (ENSOARG00020010781)	MYO1C (ENSOARG00020011010)	YWHAE (ENSOARG00020011717)	ENSOARG00020011865	DOC2B (ENSOARG00020011895)	RPH3AL (ENSOARG00020011967)	RFLNB (ENSOARG00020012025)	VPS53 (ENSOARG00020012072)	TLCD3A (ENSOARG00020012176)	ENSOARG00020012285	ENSOARG00020012330	GLOD4 (ENSOARG00020012356)	MRM3 (ENSOARG00020012429)
Goat	MODERN SPECIES	10	TSR1 (ENSCHIG00000023935)	SRR (ENSCHIG00000017780)	SMG6 (ENSCHIG00000021998)	HIC1 (ENSCHIG00000015829)	OVCA2 (ENSCHIG00000026274)	DPH1 (ENSCHIG00000004852)	RTN4RL1 (ENSCHIG00000026067)	RPA1 (ENSCHIG00000026308)	SMYD4 (ENSCHIG00000022107)	SERPINF1 (ENSCHIG00000026391)	SERPINF2 (ENSCHIG00000022372)	WDR81 (ENSCHIG00000026775)	TLCD2 (ENSCHIG00000022441)	PRPF8 (ENSCHIG00000017499)	RILP (ENSCHIG00000022404)	SCARF1 (ENSCHIG00000008354) ##22	SLC43A2 (ENSCHIG00000023042)	PITPNA (ENSCHIG00000019972)	INPP5K (ENSCHIG00000013342)	MYO1C (ENSCHIG00000023103)	ENSCHIG00000020930	CRK (ENSCHIG00000009252)	ENSCHIG00000008038	ENSCHIG00000023201	DOC2B (ENSCHIG00000009205)	RPH3AL (ENSCHIG00000009527)	RFLNB (ENSCHIG00000026623)	VPS53 (ENSCHIG00000012420)	TLCD3A (ENSCHIG00000016315)	ENSCHIG00000010602	GEMIN4 (ENSCHIG00000026226)
Bovinae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000153195.A	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119.c.a	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00940000156758	ENSGT00440000034248	ENSGT00440000038370	ENSGT00390000016836.b	ENSGT00390000015165	ENSGT01010000222313.A.b.b.b	ENSGT00390000012296	ENSGT00940000163490	ENSGT00390000012340
Bos	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000153195.A	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119.c.a	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00940000156758	ENSGT00440000034248	ENSGT00440000038370	ENSGT00390000016836.b	ENSGT00390000015165	ENSGT01010000222313.A.b.b.b	ENSGT00390000012296	ENSGT00940000163490	ENSGT00390000012340
Bos_a	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000153195.A	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119.c.a	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00940000156758	ENSGT00440000034248	ENSGT00440000038370	ENSGT00390000016836.b	ENSGT00390000015165	ENSGT01010000222313.A.b.b.b	ENSGT00390000012296	ENSGT00940000163490	ENSGT00390000012340
Domestic yak	MODERN SPECIES	10	SGSM2 (ENSBGRG00000023531)	TSR1 (ENSBGRG00000024191)	SRR (ENSBGRG00000024446)	SMG6 (ENSBGRG00000024485)	HIC1 (ENSBGRG00000024736)	DPH1 (ENSBGRG00000024791)	RTN4RL1 (ENSBGRG00000024867)	RPA1 (ENSBGRG00000024902)	SMYD4 (ENSBGRG00000025102)	SERPINF1 (ENSBGRG00000025121)	SERPINF2 (ENSBGRG00000010835)	WDR81 (ENSBGRG00000011155)	TLCD2 (ENSBGRG00000011712)	PRPF8 (ENSBGRG00000011763)	RILP (ENSBGRG00000011921)	SCARF1 (ENSBGRG00000012073) ##22	SLC43A2 (ENSBGRG00000012301)	ENSBGRG00000012484	INPP5K (ENSBGRG00000012831)	MYO1C (ENSBGRG00000012977)	ENSBGRG00000013863	YWHAE (ENSBGRG00000013928)	DOC2B (ENSBGRG00000014102)	ENSBGRG00000014237	RPH3AL (ENSBGRG00000014299)	ENSBGRG00000014382	RFLNB (ENSBGRG00000014402)	VPS53 (ENSBGRG00000014440)	TLCD3A (ENSBGRG00000014937)	ENSBGRG00000015145	ENSBGRG00000015788
Wild yak	MODERN SPECIES	137					ENSBMUG00000010443	OVCA2 (ENSBMUG00000010437)	DPH1 (ENSBMUG00000010427)	RTN4RL1 (ENSBMUG00000010412)	RPA1 (ENSBMUG00000010396)	SMYD4 (ENSBMUG00000010383)	SERPINF1 (ENSBMUG00000010374)	SERPINF2 (ENSBMUG00000010344)	WDR81 (ENSBMUG00000010298)	TLCD2 (ENSBMUG00000010266)	PRPF8 (ENSBMUG00000010239)	SCARF1 (ENSBMUG00000010143) ##22	SLC43A2 (ENSBMUG00000010129)	ENSBMUG00000010101	INPP5K (ENSBMUG00000010081)	MYO1C (ENSBMUG00000010010)	ENSBMUG00000009944	CRK (ENSBMUG00000009935)	YWHAE (ENSBMUG00000009922)	DOC2B (ENSBMUG00000009892)	RPH3AL (ENSBMUG00000009876)	ENSBMUG00000009849	RFLNB (ENSBMUG00000009843)	ENSBMUG00000009837	VPS53 (ENSBMUG00000009808)	TLCD3A (ENSBMUG00000009758)	GEMIN4 (ENSBMUG00000009722)
Bos_b	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000153195.A	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119.c.a	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00940000156758	ENSGT00440000034248	ENSGT00440000038370	ENSGT00390000016836.b	ENSGT01100000263480.a.b.a.a.a.b.b.b.b.a	ENSGT00390000015165	ENSGT01010000222313.A.b.b.b	ENSGT00390000012296	ENSGT00940000163490
Hybrid Bos Indicus	MODERN SPECIES	10	SGSM2 (ENSBIXG00005012564)	TSR1 (ENSBIXG00005012623)	SRR (ENSBIXG00005012671)	SMG6 (ENSBIXG00005012732)	HIC1 (ENSBIXG00005012750)	DPH1 (ENSBIXG00005012790)	RTN4RL1 (ENSBIXG00005012805)	RPA1 (ENSBIXG00005012827)	SMYD4 (ENSBIXG00005007109)	SERPINF1 (ENSBIXG00005012900)	SERPINF2 (ENSBIXG00005012951)	WDR81 (ENSBIXG00005013064)	TLCD2 (ENSBIXG00005013086)	PRPF8 (ENSBIXG00005013148)	RILP (ENSBIXG00005013165)	SCARF1 (ENSBIXG00005007482) ##22	SLC43A2 (ENSBIXG00005013236)	PITPNA (ENSBIXG00005013252)	INPP5K (ENSBIXG00005013268)	MYO1C (ENSBIXG00005013667)	ENSBIXG00005013849	DOC2B (ENSBIXG00005013913)	RPH3AL (ENSBIXG00005006216)	ENSBIXG00005013994	RFLNB (ENSBIXG00005014016)	ENSBIXG00005014029	VPS53 (ENSBIXG00005001818)	TLCD3A (ENSBIXG00005014089)	ENSBIXG00005014099	ENSBIXG00005014110	GEMIN4 (ENSBIXG00005014144)
Cow	MODERN SPECIES	10	TSR1 (ENSBTAG00000004225)	SRR (ENSBTAG00000004223)	SMG6 (ENSBTAG00000000267)	HIC1 (ENSBTAG00000025130)	OVCA2 (ENSBTAG00000047926)	DPH1 (ENSBTAG00000009376)	RTN4RL1 (ENSBTAG00000012302)	RPA1 (ENSBTAG00000009711)	SMYD4 (ENSBTAG00000009708)	SERPINF1 (ENSBTAG00000009705)	SERPINF2 (ENSBTAG00000020859)	WDR81 (ENSBTAG00000011491)	TLCD2 (ENSBTAG00000011490)	PRPF8 (ENSBTAG00000011488)	RILP (ENSBTAG00000038889)	SCARF1 (ENSBTAG00000011483) ##22	SLC43A2 (ENSBTAG00000011482)	PITPNA (ENSBTAG00000011480)	INPP5K (ENSBTAG00000011479)	MYO1C (ENSBTAG00000001332)	ENSBTAG00000049630	CRK (ENSBTAG00000005665)	YWHAE (ENSBTAG00000005664)	DOC2B (ENSBTAG00000025140)	RPH3AL (ENSBTAG00000039819)	C19H17orf97 (ENSBTAG00000046148)	RFLNB (ENSBTAG00000006606)	ENSBTAG00000054644	VPS53 (ENSBTAG00000018126)	TLCD3A (ENSBTAG00000046273)	DBIL5 (ENSBTAG00000013395)
American bison	MODERN SPECIES	3331	SGSM2 (ENSBBBG00000022734)	TSR1 (ENSBBBG00000022685)	SRR (ENSBBBG00000022646)	SMG6 (ENSBBBG00000022619)	OVCA2 (ENSBBBG00000005954)	DPH1 (ENSBBBG00000022553)	RTN4RL1 (ENSBBBG00000022515)	RPA1 (ENSBBBG00000022503)	SMYD4 (ENSBBBG00000005934)	SERPINF1 (ENSBBBG00000022443)	SERPINF2 (ENSBBBG00000022415)	ENSBBBG00000022346	TLCD2 (ENSBBBG00000022317)	PRPF8 (ENSBBBG00000005865)	RILP (ENSBBBG00000022144)	SCARF1 (ENSBBBG00000022124) ##22	SLC43A2 (ENSBBBG00000022077)	ENSBBBG00000022013	INPP5K (ENSBBBG00000021979)	MYO1C (ENSBBBG00000021875)	ENSBBBG00000005655	CRK (ENSBBBG00000021046)	YWHAE (ENSBBBG00000005648)	DOC2B (ENSBBBG00000020987)	RPH3AL (ENSBBBG00000020916)	ENSBBBG00000020880	RFLNB (ENSBBBG00000005614)	VPS53 (ENSBBBG00000007152)	ENSBBBG00000020744	TLCD3A (ENSBBBG00000020737)	GEMIN4 (ENSBBBG00000020708)
Siberian musk deer	MODERN SPECIES	1135	SRR (ENSMMSG00000006625)	SMG6 (ENSMMSG00000006392)	HIC1 (ENSMMSG00000006359)	OVCA2 (ENSMMSG00000006332)	DPH1 (ENSMMSG00000006304)	RTN4RL1 (ENSMMSG00000006285)	RPA1 (ENSMMSG00000006234)	SMYD4 (ENSMMSG00000006185)	SERPINF1 (ENSMMSG00000006137)	SERPINF2 (ENSMMSG00000006123)	WDR81 (ENSMMSG00000006059)	TLCD2 (ENSMMSG00000006040)	ENSMMSG00000006021	PRPF8 (ENSMMSG00000005860)	RILP (ENSMMSG00000005823)	SCARF1 (ENSMMSG00000005778) ##22	SLC43A2 (ENSMMSG00000005630)	PITPNA (ENSMMSG00000005547)	INPP5K (ENSMMSG00000005484)	MYO1C (ENSMMSG00000004809)	CRK (ENSMMSG00000004683)	ENSMMSG00000004663	ENSMMSG00000004642	YWHAE (ENSMMSG00000004582)	DOC2B (ENSMMSG00000012618)	RPH3AL (ENSMMSG00000012577)	ENSMMSG00000012564	RFLNB (ENSMMSG00000012551)	VPS53 (ENSMMSG00000012474)	TLCD3A (ENSMMSG00000012422)	GEMIN4 (ENSMMSG00000012398)
Yarkand deer	MODERN SPECIES	28	SRR (ENSCHYG00000013634)	SMG6 (ENSCHYG00000013168)	HIC1 (ENSCHYG00000013104)	OVCA2 (ENSCHYG00000013040)	DPH1 (ENSCHYG00000012962)	ENSCHYG00000012940	RTN4RL1 (ENSCHYG00000012919)	RPA1 (ENSCHYG00000012864)	SMYD4 (ENSCHYG00000012733)	SERPINF1 (ENSCHYG00000012630)	SERPINF2 (ENSCHYG00000012451)	WDR81 (ENSCHYG00000012153)	TLCD2 (ENSCHYG00000012095)	PRPF8 (ENSCHYG00000011798)	RILP (ENSCHYG00000011703)	SCARF1 (ENSCHYG00000011550) ##22	SLC43A2 (ENSCHYG00000011402)	PITPNA (ENSCHYG00000011308)	INPP5K (ENSCHYG00000011223)	MYO1C (ENSCHYG00000010415)	ENSCHYG00000010377	ENSCHYG00000010094	DOC2B (ENSCHYG00000009930)	RPH3AL (ENSCHYG00000009725)	ENSCHYG00000009679	VPS53 (ENSCHYG00000009171)	TLCD3A (ENSCHYG00000009025)	ENSCHYG00000008987	GEMIN4 (ENSCHYG00000008958)	GLOD4 (ENSCHYG00000008806)	MRM3 (ENSCHYG00000008755)
Camelidae	ANCESTRAL SPECIES	46	ENSGT00940000159315	ENSGT00940000153195.A	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00940000156758	ENSGT00440000034248	ENSGT00390000016836.b	ENSGT00390000015165	ENSGT01010000222313.A.b.b.b	ENSGT00390000012296	ENSGT00940000163490	ENSGT00390000012340	ENSGT00940000164902
Arabian camel	MODERN SPECIES	7	ENSCDRG00005009096	TSR1 (ENSCDRG00005009118)	SRR (ENSCDRG00005009211)	SMG6 (ENSCDRG00005009326)	HIC1 (ENSCDRG00005009504)	DPH1 (ENSCDRG00005009617)	RTN4RL1 (ENSCDRG00005009811)	RPA1 (ENSCDRG00005009881)	SMYD4 (ENSCDRG00005010223)	SERPINF1 (ENSCDRG00005010430)	SERPINF2 (ENSCDRG00005010483)	WDR81 (ENSCDRG00005010633)	TLCD2 (ENSCDRG00005010806)	PRPF8 (ENSCDRG00005010863)	RILP (ENSCDRG00005011127)	SCARF1 (ENSCDRG00005011199) ##22	SLC43A2 (ENSCDRG00005011286)	PITPNA (ENSCDRG00005011565)	INPP5K (ENSCDRG00005011674)	MYO1C (ENSCDRG00005011804)	CRK (ENSCDRG00005012661)	ENSCDRG00005012744	DOC2B (ENSCDRG00005012860)	RPH3AL (ENSCDRG00005012935)	RFLNB (ENSCDRG00005012996)	VPS53 (ENSCDRG00005013059)	TLCD3A (ENSCDRG00005013622)	GEMIN4 (ENSCDRG00005013702)	ENSCDRG00005013745	GLOD4 (ENSCDRG00005013761)	ENSCDRG00005013826
Laurasiatheria_b	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000153195.A	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00940000156758	ENSGT00440000034248	ENSGT00440000038370	ENSGT00390000016836.b	ENSGT00390000015165	ENSGT01010000222313.A.b.b.b	ENSGT00390000012296	ENSGT00940000163490	ENSGT00390000012340
Laurasiatheria_c	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000153195.A	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00940000156758	ENSGT00440000034248	ENSGT00440000038370	ENSGT00390000016836.b	ENSGT00390000015165	ENSGT01010000222313.A.b.b.b	ENSGT00390000012296	ENSGT00940000163490	ENSGT00390000012340
Equus	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000159315	ENSGT00940000153195.A	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT01090000263324	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00940000156758	ENSGT00440000034248	ENSGT00440000038370	ENSGT00390000016836.b	ENSGT00390000015165	ENSGT01010000222313.A.b.b.b	ENSGT00390000012296	ENSGT00940000163490	ENSGT00390000012340
Donkey	MODERN SPECIES	4	MNT (ENSEASG00005009163)	SGSM2 (ENSEASG00005009212)	TSR1 (ENSEASG00005009302)	SRR (ENSEASG00005009314)	SMG6 (ENSEASG00005009318)	HIC1 (ENSEASG00005032414)	RTN4RL1 (ENSEASG00005032983)	DPH1 (ENSEASG00005009331)	RPA1 (ENSEASG00005009372)	SMYD4 (ENSEASG00005009478)	SERPINF1 (ENSEASG00005009483)	ENSEASG00005024883	SERPINF2 (ENSEASG00005009486)	WDR81 (ENSEASG00005009490)	PRPF8 (ENSEASG00005009514)	SCARF1 (ENSEASG00005009559) ##22	SLC43A2 (ENSEASG00005009568)	PITPNA (ENSEASG00005009594)	INPP5K (ENSEASG00005009597)	MYO1C (ENSEASG00005009604)	CRK (ENSEASG00005009612)	ENSEASG00005009615	ENSEASG00005009623	ENSEASG00005009628	ENSEASG00005035835	RFLNB (ENSEASG00005023998)	ENSEASG00005009636	ENSEASG00005032440	GEMIN4 (ENSEASG00005009640)	TLCD3A (ENSEASG00005009639)	ENSEASG00005009643
Horse	MODERN SPECIES	2	SGSM2 (ENSECAG00000010959)	TSR1 (ENSECAG00000009114)	SRR (ENSECAG00000008058)	SMG6 (ENSECAG00000006519)	HIC1 (ENSECAG00000030580)	OVCA2 (ENSECAG00000005329)	RTN4RL1 (ENSECAG00000004384)	RPA1 (ENSECAG00000023886)	SERPINF1 (ENSECAG00000022279)	ENSECAG00000059429	SMYD4 (ENSECAG00000023756)	SERPINF2 (ENSECAG00000021794)	WDR81 (ENSECAG00000021606)	PRPF8 (ENSECAG00000021318)	RILP (ENSECAG00000040909)	SCARF1 (ENSECAG00000020764) ##22	ENSECAG00000050162	SLC43A2 (ENSECAG00000018324)	PITPNA (ENSECAG00000016884)	INPP5K (ENSECAG00000016734)	MYO1C (ENSECAG00000012020)	CRK (ENSECAG00000011550)	YWHAE (ENSECAG00000009536)	C11H17orf97 (ENSECAG00000008776)	RPH3AL (ENSECAG00000008782)	VPS53 (ENSECAG00000006437)	TLCD3A (ENSECAG00000040301)	GEMIN4 (ENSECAG00000006339)	ENSECAG00000043867	GLOD4 (ENSECAG00000024418)	MRM3 (ENSECAG00000024378)
Chiroptera	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000153195.A	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00940000156758	ENSGT00440000034248	ENSGT00440000038370	ENSGT00390000016836.b	ENSGT00390000015165	ENSGT01010000222313.A.b.b.b	ENSGT00390000012296	ENSGT00940000163490	ENSGT00390000012340
Microchiroptera	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000153195.A	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00940000156758	ENSGT00440000034248	ENSGT00440000038370	ENSGT00390000016836.b	ENSGT00390000015165	ENSGT01010000222313.A.b.b.b	ENSGT00390000012296	ENSGT00940000163490	ENSGT00390000012340
Greater horseshoe bat	MODERN SPECIES	13	TSR1 (ENSRFEG00010007204)	SRR (ENSRFEG00010007255)	SMG6 (ENSRFEG00010007305)	HIC1 (ENSRFEG00010007381)	DPH1 (ENSRFEG00010007431)	OVCA2 (ENSRFEG00010007522)	RTN4RL1 (ENSRFEG00010007549)	RPA1 (ENSRFEG00010007578)	SMYD4 (ENSRFEG00010007626)	SERPINF1 (ENSRFEG00010007660)	SERPINF2 (ENSRFEG00010007716)	WDR81 (ENSRFEG00010007803)	TLCD2 (ENSRFEG00010008006)	PRPF8 (ENSRFEG00010008080)	RILP (ENSRFEG00010008481)	SCARF1 (ENSRFEG00010008511) ##22	SLC43A2 (ENSRFEG00010008593)	PITPNA (ENSRFEG00010008637)	INPP5K (ENSRFEG00010008692)	MYO1C (ENSRFEG00010008814)	CRK (ENSRFEG00010009199)	ENSRFEG00010009226	YWHAE (ENSRFEG00010009253)	DOC2B (ENSRFEG00010009312)	RPH3AL (ENSRFEG00010009350)	ENSRFEG00010009384	RFLNB (ENSRFEG00010009391)	VPS53 (ENSRFEG00010009422)	TLCD3A (ENSRFEG00010010054)	GEMIN4 (ENSRFEG00010010123)	ENSRFEG00010010160
Microbat	MODERN SPECIES	1199	SRR (ENSMLUG00000003499)	ENSMLUG00000026216	SMG6 (ENSMLUG00000005739)	HIC1 (ENSMLUG00000010527)	OVCA2 (ENSMLUG00000028120)	ENSMLUG00000010501	RTN4RL1 (ENSMLUG00000024862)	RPA1 (ENSMLUG00000006113)	SMYD4 (ENSMLUG00000006108)	SERPINF1 (ENSMLUG00000006100)	SERPINF2 (ENSMLUG00000006093)	ENSMLUG00000002695	TLCD2 (ENSMLUG00000002684)	PRPF8 (ENSMLUG00000002666)	RILP (ENSMLUG00000002659)	SCARF1 (ENSMLUG00000002653) ##22	SLC43A2 (ENSMLUG00000002639)	ENSMLUG00000001827	INPP5K (ENSMLUG00000001819)	MYO1C (ENSMLUG00000001803)	CRK (ENSMLUG00000002723)	YWHAE (ENSMLUG00000001682)	DOC2B (ENSMLUG00000025045)	ENSMLUG00000025961	RFLNB (ENSMLUG00000012447)	VPS53 (ENSMLUG00000016566)	TLCD3A (ENSMLUG00000001491)	GEMIN4 (ENSMLUG00000001494)	ENSMLUG00000001497	GLOD4 (ENSMLUG00000001501)	MRM3 (ENSMLUG00000001504)
Carnivora	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000153195.A	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00940000156758	ENSGT00440000034248	ENSGT00440000038370	ENSGT00390000016836.b	ENSGT00390000015165	ENSGT01010000222313.A.b.b.b	ENSGT00390000012296	ENSGT00940000163490	ENSGT00390000012340
Felidae	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000153195.A.v	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00940000156758	ENSGT00440000034248	ENSGT00440000038370	ENSGT00390000016836.b	ENSGT00390000015165	ENSGT01010000222313.A.b.b.b	ENSGT00390000012296	ENSGT00940000163490	ENSGT00390000012340
Panthera	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000153195.A.v	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00940000156758	ENSGT00440000034248	ENSGT00440000038370	ENSGT00390000016836.b	ENSGT00390000015165	ENSGT01010000222313.A.b.b.b	ENSGT00390000012296	ENSGT00940000163490	ENSGT00390000012340
Tiger	MODERN SPECIES	76	SGSM2 (ENSPTIG00000011131)	TSR1 (ENSPTIG00000010608)	SRR (ENSPTIG00000010324)	SMG6 (ENSPTIG00000008925)	OVCA2 (ENSPTIG00000008686)	DPH1 (ENSPTIG00000008456)	RTN4RL1 (ENSPTIG00000008259)	RPA1 (ENSPTIG00000007898)	SMYD4 (ENSPTIG00000007484)	SERPINF1 (ENSPTIG00000007148)	SERPINF2 (ENSPTIG00000006191)	WDR81 (ENSPTIG00000002990)	TLCD2 (ENSPTIG00000001951)	PRPF8 (ENSPTIG00000019200)	ENSPTIG00000019060	SCARF1 (ENSPTIG00000017904) ##22	SLC43A2 (ENSPTIG00000016646)	PITPNA (ENSPTIG00000015633)	INPP5K (ENSPTIG00000015046)	MYO1C (ENSPTIG00000011615)	CRK (ENSPTIG00000011379)	ENSPTIG00000010466	DOC2B (ENSPTIG00000009903)	RPH3AL (ENSPTIG00000009088)	ENSPTIG00000009015	RFLNB (ENSPTIG00000008975)	VPS53 (ENSPTIG00000004825)	TLCD3A (ENSPTIG00000002065)	GEMIN4 (ENSPTIG00000021725)	ENSPTIG00000005542	GLOD4 (ENSPTIG00000021516)
Panthera_a	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000153195.A.v	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00940000156758	ENSGT00440000034248	ENSGT00440000038370	ENSGT00390000016836.b	ENSGT00390000015165	ENSGT01010000222313.A.b.b.b	ENSGT00390000012296	ENSGT00940000163490	ENSGT00390000012340
lion	MODERN SPECIES	14	TSR1 (ENSPLOG00000011746)	SRR (ENSPLOG00000011888)	SMG6 (ENSPLOG00000011985)	HIC1 (ENSPLOG00000012110)	OVCA2 (ENSPLOG00000012162)	DPH1 (ENSPLOG00000012207)	RTN4RL1 (ENSPLOG00000012392)	RPA1 (ENSPLOG00000012422)	SMYD4 (ENSPLOG00000012492)	SERPINF1 (ENSPLOG00000012549)	SERPINF2 (ENSPLOG00000012657)	WDR81 (ENSPLOG00000012820)	TLCD2 (ENSPLOG00000013002)	PRPF8 (ENSPLOG00000013087)	RILP (ENSPLOG00000013198)	SCARF1 (ENSPLOG00000013277) ##22	SLC43A2 (ENSPLOG00000013442)	PITPNA (ENSPLOG00000013692)	INPP5K (ENSPLOG00000013931)	MYO1C (ENSPLOG00000014370)	CRK (ENSPLOG00000015643)	ENSPLOG00000015727	DOC2B (ENSPLOG00000015864)	RPH3AL (ENSPLOG00000016015)	RFLNB (ENSPLOG00000016051)	VPS53 (ENSPLOG00000016153)	TLCD3A (ENSPLOG00000016553)	GEMIN4 (ENSPLOG00000016732)	GLOD4 (ENSPLOG00000016643)	ENSPLOG00000016763	MRM3 (ENSPLOG00000016790)
leopard	MODERN SPECIES	126	ENSPPRG00000015519	SRR (ENSPPRG00000014911)	SMG6 (ENSPPRG00000014581)	HIC1 (ENSPPRG00000013038)	OVCA2 (ENSPPRG00000012787)	DPH1 (ENSPPRG00000012686)	RTN4RL1 (ENSPPRG00000011872)	RPA1 (ENSPPRG00000011807)	SMYD4 (ENSPPRG00000011683)	SERPINF1 (ENSPPRG00000011123)	SERPINF2 (ENSPPRG00000010921)	WDR81 (ENSPPRG00000010182)	TLCD2 (ENSPPRG00000008777)	PRPF8 (ENSPPRG00000008746)	RILP (ENSPPRG00000008258)	SCARF1 (ENSPPRG00000007928) ##22	SLC43A2 (ENSPPRG00000007188)	PITPNA (ENSPPRG00000006010)	INPP5K (ENSPPRG00000005328)	MYO1C (ENSPPRG00000005022)	CRK (ENSPPRG00000002253)	YWHAE (ENSPPRG00000002073)	DOC2B (ENSPPRG00000001710)	RPH3AL (ENSPPRG00000001066)	ENSPPRG00000021800	RFLNB (ENSPPRG00000020133)	VPS53 (ENSPPRG00000017424)	TLCD3A (ENSPPRG00000010685)	GEMIN4 (ENSPPRG00000009427)	ENSPPRG00000015342	GLOD4 (ENSPPRG00000008216)
Cat	MODERN SPECIES	245	TSR1 (ENSFCAG00000006313)	SRR (ENSFCAG00000006312)	SMG6 (ENSFCAG00000028817)	HIC1 (ENSFCAG00000025756)	OVCA2 (ENSFCAG00000046075)	DPH1 (ENSFCAG00000006310)	RTN4RL1 (ENSFCAG00000027195)	RPA1 (ENSFCAG00000006306)	SMYD4 (ENSFCAG00000006304)	SERPINF1 (ENSFCAG00000006303)	SERPINF2 (ENSFCAG00000006301)	WDR81 (ENSFCAG00000024007)	TLCD2 (ENSFCAG00000006298)	PRPF8 (ENSFCAG00000006297)	RILP (ENSFCAG00000006296)	SCARF1 (ENSFCAG00000044300) ##22	SLC43A2 (ENSFCAG00000006294)	PITPNA (ENSFCAG00000006293)	INPP5K (ENSFCAG00000006292)	MYO1C (ENSFCAG00000006291)	CRK (ENSFCAG00000041566)	YWHAE (ENSFCAG00000011368)	DOC2B (ENSFCAG00000022608)	RPH3AL (ENSFCAG00000007952)	CE1H17orf97 (ENSFCAG00000043489)	RFLNB (ENSFCAG00000046712)	VPS53 (ENSFCAG00000001666)	TLCD3A (ENSFCAG00000001669)	GEMIN4 (ENSFCAG00000024115)	ENSFCAG00000001672	GLOD4 (ENSFCAG00000037165)
Caniformia	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000153195.A	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000164396	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00940000156758	ENSGT00440000034248	ENSGT00440000038370	ENSGT00390000016836.b	ENSGT00390000015165	ENSGT01010000222313.A.b.b.b	ENSGT00390000012296	ENSGT00940000163490
Canidae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000153195.A	ENSGT00550000075026.c	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000164396	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00940000156758	ENSGT00440000034248	ENSGT00440000038370	ENSGT00390000016836.b	ENSGT00390000015165	ENSGT01010000222313.A.b.b.b	ENSGT00390000012296	ENSGT00940000163490
Red fox	MODERN SPECIES	121	TSR1 (ENSVVUG00000021767)	SRR (ENSVVUG00000021765)	SMG6 (ENSVVUG00000021727)	HIC1 (ENSVVUG00000021725)	OVCA2 (ENSVVUG00000021722)	DPH1 (ENSVVUG00000021720)	RTN4RL1 (ENSVVUG00000021719)	ENSVVUG00000021718	RPA1 (ENSVVUG00000021715)	SMYD4 (ENSVVUG00000021711)	SERPINF1 (ENSVVUG00000021710)	SERPINF2 (ENSVVUG00000021708)	WDR81 (ENSVVUG00000021704)	PRPF8 (ENSVVUG00000021695)	RILP (ENSVVUG00000021692)	SCARF1 (ENSVVUG00000021680) ##22	SLC43A2 (ENSVVUG00000021676)	ENSVVUG00000021675	PITPNA (ENSVVUG00000021669)	INPP5K (ENSVVUG00000021666)	MYO1C (ENSVVUG00000021660)	CRK (ENSVVUG00000021658)	YWHAE (ENSVVUG00000021655)	DOC2B (ENSVVUG00000021650)	RPH3AL (ENSVVUG00000021641)	CUNH17orf97 (ENSVVUG00000021637)	RFLNB (ENSVVUG00000021633)	VPS53 (ENSVVUG00000021618)	TLCD3A (ENSVVUG00000021613)	GEMIN4 (ENSVVUG00000021612)	ENSVVUG00000021610
Canis_lupus	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000153195.A	ENSGT00550000075026.c	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000164396	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00940000156758	ENSGT00440000034248	ENSGT00390000013811.b.c.a	ENSGT00440000038370	ENSGT00390000016836.b	ENSGT00390000015165	ENSGT01010000222313.A.b.b.b	ENSGT00390000012296
Dingo	DUPLICATION
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Dingo	MODERN SPECIES	327	ENSCAFG00020009758	SMG6 (ENSCAFG00020009770)	HIC1 (ENSCAFG00020009802)	OVCA2 (ENSCAFG00020009817)	DPH1 (ENSCAFG00020009822)	RTN4RL1 (ENSCAFG00020009841)	RPA1 (ENSCAFG00020009847)	SMYD4 (ENSCAFG00020009856)	SERPINF1 (ENSCAFG00020009862)	SERPINF2 (ENSCAFG00020009870)	WDR81 (ENSCAFG00020009878)	TLCD2 (ENSCAFG00020009924)	PRPF8 (ENSCAFG00020009943)	RILP (ENSCAFG00020009971)	ENSCAFG00020009977 ##22	ENSCAFG00020009991 ##22	ENSCAFG00020009993	ENSCAFG00020009996	ENSCAFG00020010034	ENSCAFG00020010039	INPP5K (ENSCAFG00020010042)	MYO1C (ENSCAFG00020010049)	CRK (ENSCAFG00020010060)	YWHAE (ENSCAFG00020010063)	DOC2B (ENSCAFG00020010077)	RPH3AL (ENSCAFG00020010093)	ENSCAFG00020010100	ENSCAFG00020010104	RFLNB (ENSCAFG00020010107)	VPS53 (ENSCAFG00020010135)	ENSCAFG00020010950
Dog	MODERN SPECIES	37	TSR1 (ENSCAFG00845014370)	SGSM2 (ENSCAFG00845014157)	ENSCAFG00845014099	SMG6 (ENSCAFG00845014001)	HIC1 (ENSCAFG00845013956)	ENSCAFG00845013896	RTN4RL1 (ENSCAFG00845013861)	RPA1 (ENSCAFG00845013823)	SMYD4 (ENSCAFG00845013764)	SERPINF1 (ENSCAFG00845013723)	SERPINF2 (ENSCAFG00845014866)	WDR81 (ENSCAFG00845014755)	TLCD2 (ENSCAFG00845014687)	PRPF8 (ENSCAFG00845014531)	RILP (ENSCAFG00845014481)	SCARF1 (ENSCAFG00845014443) ##22	SLC43A2 (ENSCAFG00845014401)	PITPNA (ENSCAFG00845014360)	INPP5K (ENSCAFG00845014317)	MYO1C (ENSCAFG00845014192)	CRK (ENSCAFG00845014106)	YWHAE (ENSCAFG00845014071)	ENSCAFG00845013995	ENSCAFG00845013979	RPH3AL (ENSCAFG00845013947)	ENSCAFG00845013930	RFLNB (ENSCAFG00845013910)	VPS53 (ENSCAFG00845013795)	TLCD3A (ENSCAFG00845013713)	GEMIN4 (ENSCAFG00845013677)	ENSCAFG00845013664
Caniformia_b	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000153195.A	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000164396	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00940000156758	ENSGT00440000034248	ENSGT00440000038370	ENSGT00390000016836.b	ENSGT00390000015165	ENSGT01010000222313.A.b.b.b	ENSGT00390000012296	ENSGT00940000163490
Mustelinae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000153195.A	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00940000156758	ENSGT00440000034248	ENSGT00440000038370	ENSGT00390000016836.b	ENSGT00390000015165	ENSGT01010000222313.A.b.b.b	ENSGT00390000012296	ENSGT00940000163490	ENSGT00390000012340
American mink	MODERN SPECIES	323	SRR (ENSNVIG00000011802)	SMG6 (ENSNVIG00000011456)	HIC1 (ENSNVIG00000011393)	OVCA2 (ENSNVIG00000011341)	DPH1 (ENSNVIG00000011225)	RTN4RL1 (ENSNVIG00000011197)	RFA1 (ENSNVIG00000011043)	ENSNVIG00000011007	SMYD4 (ENSNVIG00000010900)	ENSNVIG00000010867	SERPINF2 (ENSNVIG00000010695)	WDR81 (ENSNVIG00000010570)	TLCD2 (ENSNVIG00000010552)	PRPF8 (ENSNVIG00000010137)	RILP (ENSNVIG00000010009)	SCARF1 (ENSNVIG00000009896) ##22	SLC43A2 (ENSNVIG00000009766)	PITPNA (ENSNVIG00000009640)	INPP5K (ENSNVIG00000009486)	MYO1C (ENSNVIG00000008750)	CRK (ENSNVIG00000008613)	YWHAE (ENSNVIG00000008509)	DOC2B (ENSNVIG00000008266)	RPH3AL (ENSNVIG00000008008)	ENSNVIG00000007961	RFLNB (ENSNVIG00000007867)	VPS53 (ENSNVIG00000007404)	TLCD3A (ENSNVIG00000007328)	GEMIN4 (ENSNVIG00000007293)	ACBP (ENSNVIG00000007277)	E7EMY5 (ENSNVIG00000007210)
Ferret	MODERN SPECIES	181	SGSM2 (ENSMPUG00000012881)	TSR1 (ENSMPUG00000013000)	SRR (ENSMPUG00000013011)	SMG6 (ENSMPUG00000013046)	HIC1 (ENSMPUG00000019502)	OVCA2 (ENSMPUG00000013056)	DPH1 (ENSMPUG00000013059)	RTN4RL1 (ENSMPUG00000013116)	RPA1 (ENSMPUG00000013119)	SMYD4 (ENSMPUG00000013128)	SERPINF1 (ENSMPUG00000013136)	SERPINF2 (ENSMPUG00000013140)	ENSMPUG00000013177	TLCD2 (ENSMPUG00000013221)	PRPF8 (ENSMPUG00000013227)	SCARF1 (ENSMPUG00000013245) ##22	SLC43A2 (ENSMPUG00000013273)	PITPNA (ENSMPUG00000013286)	INPP5K (ENSMPUG00000013429)	MYO1C (ENSMPUG00000013483)	CRK (ENSMPUG00000013702)	ENSMPUG00000013711	DOC2B (ENSMPUG00000013728)	RPH3AL (ENSMPUG00000013740)	ENSMPUG00000013743	RFLNB (ENSMPUG00000013745)	VPS53 (ENSMPUG00000013746)	TLCD3A (ENSMPUG00000013751)	GEMIN4 (ENSMPUG00000013757)	ENSMPUG00000019504	GLOD4 (ENSMPUG00000013761)
Ursidae	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000153195.A	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000164396	ENSGT00940000156538.j	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00940000156758	ENSGT00440000034248	ENSGT00440000038370	ENSGT00390000016836.b	ENSGT00390000015165	ENSGT01010000222313.A.b.b.b	ENSGT00390000012296	ENSGT00940000163490
Giant Panda	MODERN SPECIES	4	MNT (ENSAMEG00000007541)	SGSM2 (ENSAMEG00000007554)	TSR1 (ENSAMEG00000007599)	SMG6 (ENSAMEG00000007632)	HIC1 (ENSAMEG00000028716)	DPH1 (ENSAMEG00000007669)	RTN4RL1 (ENSAMEG00000018472)	RPA1 (ENSAMEG00000007706)	SMYD4 (ENSAMEG00000007774)	SERPINF1 (ENSAMEG00000007809)	SERPINF2 (ENSAMEG00000007857)	WDR81 (ENSAMEG00000007888)	TLCD2 (ENSAMEG00000027166)	PRPF8 (ENSAMEG00000007940)	RILP (ENSAMEG00000008003)	SCARF1 (ENSAMEG00000029343) ##22	SLC43A2 (ENSAMEG00000008028)	PITPNA (ENSAMEG00000030448)	INPP5K (ENSAMEG00000008066)	MYO1C (ENSAMEG00000008107)	CRK (ENSAMEG00000008194)	ENSAMEG00000028225	ENSAMEG00000008214	ENSAMEG00000008224	ENSAMEG00000008233	ENSAMEG00000029297	RFLNB (ENSAMEG00000008243)	VPS53 (ENSAMEG00000008244)	TLCD3A (ENSAMEG00000025727)	GEMIN4 (ENSAMEG00000018474)	ENSAMEG00000018475
Ursus	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000153195.A	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000164396	ENSGT00940000156538.j	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00940000156758	ENSGT00440000034248	ENSGT00440000038370	ENSGT00390000016836.b	ENSGT00390000015165	ENSGT01010000222313.A.b.b.b	ENSGT00390000012296	ENSGT00940000163490
Polar bear	MODERN SPECIES	192	SGSM2 (ENSUMAG00000009267)	TSR1 (ENSUMAG00000009294)	SRR (ENSUMAG00000009304)	SMG6 (ENSUMAG00000009306)	OVCA2 (ENSUMAG00000009315)	DPH1 (ENSUMAG00000009318)	RTN4RL1 (ENSUMAG00000009327)	RPA1 (ENSUMAG00000009328)	SMYD4 (ENSUMAG00000009336)	ENSUMAG00000009343	SERPINF1 (ENSUMAG00000009346)	SERPINF2 (ENSUMAG00000009348)	WDR81 (ENSUMAG00000009351)	TLCD2 (ENSUMAG00000009359)	PRPF8 (ENSUMAG00000009385)	ENSUMAG00000009554 ##22	SLC43A2 (ENSUMAG00000009561)	ENSUMAG00000009633	ENSUMAG00000009636	INPP5K (ENSUMAG00000009644)	MYO1C (ENSUMAG00000009705)	CRK (ENSUMAG00000009978)	YWHAE (ENSUMAG00000009987)	DOC2B (ENSUMAG00000010000)	RPH3AL (ENSUMAG00000010013)	RFLNB (ENSUMAG00000010022)	VPS53 (ENSUMAG00000010028)	TLCD3A (ENSUMAG00000010044)	GEMIN4 (ENSUMAG00000010047)	ENSUMAG00000010049	GLOD4 (ENSUMAG00000010051)
Marsupialia	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000153195.A	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00940000156758	ENSGT00440000034248	ENSGT00440000038370	ENSGT00390000016836.b	ENSGT00390000015165	ENSGT01010000222313.A.b.b.b	ENSGT00390000012296	ENSGT00940000163490	ENSGT00390000012340
Marsupialia_b	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000153195.A	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00940000156758	ENSGT00440000034248	ENSGT00440000038370	ENSGT00390000016836.b	ENSGT00390000015165	ENSGT01010000222313.A.b.b.b	ENSGT00390000012296	ENSGT00940000163490	ENSGT00390000012340
Diprotodontia	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000153195.A	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00940000156758	ENSGT00440000034248	ENSGT00440000038370	ENSGT00390000016836.b	ENSGT00390000015165	ENSGT01010000222313.A.b.b.b	ENSGT00390000012296	ENSGT00940000163490	ENSGT00390000012340
Diprotodontia_a	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000153195.A	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538.c	ENSGT00940000157915	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00940000156758	ENSGT00440000034248	ENSGT00440000038370	ENSGT00390000016836.b	ENSGT00390000015165	ENSGT01010000222313.A.b.b.b	ENSGT00390000012296	ENSGT00940000163490	ENSGT00390000012340
Common wonbat	MODERN SPECIES	1007	SGSM2 (ENSVURG00010007744)	TSR1 (ENSVURG00010007807)	SRR (ENSVURG00010007849)	SMG6 (ENSVURG00010007889)	HIC1 (ENSVURG00010007931)	OVCA2 (ENSVURG00010007963)	DPH1 (ENSVURG00010007952)	RTN4RL1 (ENSVURG00010007973)	RPA1 (ENSVURG00010007982)	SMYD4 (ENSVURG00010008001)	SERPINF1 (ENSVURG00010008019)	SERPINF2 (ENSVURG00010008042)	WDR81 (ENSVURG00010008053)	PRPF8 (ENSVURG00010008081)	ENSVURG00010008129	SCARF1 (ENSVURG00010008138) ##22	SLC43A2 (ENSVURG00010008145)	PITPNA (ENSVURG00010008176)	ENSVURG00010008204	MYO1C (ENSVURG00010008255)	YWHAE (ENSVURG00010008361)	DOC2B (ENSVURG00010008380)	RPH3AL (ENSVURG00010008431)	ENSVURG00010008459	VPS53 (ENSVURG00010008468)	TLCD3A (ENSVURG00010008496)	GEMIN4 (ENSVURG00010008503)	ENSVURG00010008513	GLOD4 (ENSVURG00010008535)	MRM3 (ENSVURG00010008551)	NXN (ENSVURG00010008559)
koala	MODERN SPECIES	117	TSR1 (ENSPCIG00000009357)	SRR (ENSPCIG00000009360)	ENSPCIG00000035880	HIC1 (ENSPCIG00000019061)	OVCA2 (ENSPCIG00000019057)	DPH1 (ENSPCIG00000019053)	RTN4RL1 (ENSPCIG00000019050)	RPA1 (ENSPCIG00000019049)	SMYD4 (ENSPCIG00000019048)	SERPINF1 (ENSPCIG00000019046)	SERPINF2 (ENSPCIG00000019044)	WDR81 (ENSPCIG00000022590)	TLCD2 (ENSPCIG00000022599)	PRPF8 (ENSPCIG00000022603)	ENSPCIG00000031153	ENSPCIG00000019043 ##22	SLC43A2 (ENSPCIG00000019041)	PITPNA (ENSPCIG00000017184)	INPP5K (ENSPCIG00000017183)	MYO1C (ENSPCIG00000017179)	CRK (ENSPCIG00000017174)	ENSPCIG00000017171	DOC2B (ENSPCIG00000017169)	RPH3AL (ENSPCIG00000017167)	ENSPCIG00000017166	ENSPCIG00000017164	VPS53 (ENSPCIG00000017163)	TLCD3A (ENSPCIG00000025720)	GEMIN4 (ENSPCIG00000025718)	ENSPCIG00000025710	GLOD4 (ENSPCIG00000025704)
Wallaby	MODERN SPECIES	7552											SERPINF2 (ENSMEUG00000016068)	ENSMEUG00000016044	ENSMEUG00000016033	PRPF8 (ENSMEUG00000015999)	ENSMEUG00000015986	SCARF1 (ENSMEUG00000015968) ##22
Tasmanian devil	MODERN SPECIES	3	SGSM2 (ENSSHAG00000011609)	TSR1 (ENSSHAG00000011394)	SRR (ENSSHAG00000011336)	SMG6 (ENSSHAG00000010045)	HIC1 (ENSSHAG00000027455)	DPH1 (ENSSHAG00000009857)	RTN4RL1 (ENSSHAG00000030464)	RPA1 (ENSSHAG00000007969)	SMYD4 (ENSSHAG00000007648)	SERPINF1 (ENSSHAG00000007410)	SERPINF2 (ENSSHAG00000029421)	WDR81 (ENSSHAG00000027079)	ENSSHAG00000030218	PRPF8 (ENSSHAG00000006167)	ENSSHAG00000022212	SCARF1 (ENSSHAG00000029674) ##22	SLC43A2 (ENSSHAG00000024832)	ENSSHAG00000029003	PITPNA (ENSSHAG00000003595)	MYO1C (ENSSHAG00000000752)	ENSSHAG00000027095	ENSSHAG00000020742	ENSSHAG00000031358	RPH3AL (ENSSHAG00000013249)	ENSSHAG00000012926	ENSSHAG00000025394	VPS53 (ENSSHAG00000012188)	TLCD3A (ENSSHAG00000025899)	GEMIN4 (ENSSHAG00000011771)	GLOD4 (ENSSHAG00000011687)	MRM3 (ENSSHAG00000011624)
Opossum	MODERN SPECIES	1	TSR1 (ENSMODG00000010658)	SRR (ENSMODG00000010639)	ENSMODG00000010622	HIC1 (ENSMODG00000010600)	OVCA2 (ENSMODG00000010582)	DPH1 (ENSMODG00000010575)	RTN4RL1 (ENSMODG00000010553)	RPA1 (ENSMODG00000010549)	SMYD4 (ENSMODG00000010537)	SERPINF1 (ENSMODG00000010515)	WDR81 (ENSMODG00000010501)	TLCD2 (ENSMODG00000010488)	SERPINF2 (ENSMODG00000043329)	PRPF8 (ENSMODG00000010480)	ENSMODG00000010382	SCARF1 (ENSMODG00000010372) ##22	SLC43A2 (ENSMODG00000010353)	PITPNA (ENSMODG00000008335)	INPP5K (ENSMODG00000010327)	MYO1C (ENSMODG00000010315)	ENSMODG00000048933	CRK (ENSMODG00000010187)	YWHAE (ENSMODG00000010174)	DOC2B (ENSMODG00000038227)	RPH3AL (ENSMODG00000010146)	VPS53 (ENSMODG00000010127)	TLCD3A (ENSMODG00000010047)	GEMIN4 (ENSMODG00000023170)	ENSMODG00000023171	GLOD4 (ENSMODG00000010038)	MRM3 (ENSMODG00000010029)
Platypus	MODERN SPECIES	8	ENSOANG00000042763	SGSM2 (ENSOANG00000008634)	TSR1 (ENSOANG00000008637)	SRR (ENSOANG00000008638)	ENSOANG00000030166	HIC1 (ENSOANG00000049991)	DPH1 (ENSOANG00000046311)	ENSOANG00000040071	RPA1 (ENSOANG00000010880)	SMYD4 (ENSOANG00000010879)	SERPINF1 (ENSOANG00000010878)	SERPINF2 (ENSOANG00000010877)	ENSOANG00000010875	TLCD2 (ENSOANG00000037643)	PRPF8 (ENSOANG00000004250)	SCARF1 (ENSOANG00000001373) ##22	SLC43A2 (ENSOANG00000002538)	PITPNA (ENSOANG00000002537)	ENSOANG00000002536	MYO1C (ENSOANG00000043475)	CRK (ENSOANG00000007759)	YWHAE (ENSOANG00000036824)	DOC2B (ENSOANG00000036409)	ENSOANG00000048900	ENSOANG00000002532	VPS53 (ENSOANG00000002530)	ENSOANG00000001522	ENSOANG00000009929	ENSOANG00000045550	ENSOANG00000043591	GLOD4 (ENSOANG00000049222)
Anura	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00550000075026	ENSGT00940000155300	ENSGT00940000161725	ENSGT00390000003541	ENSGT00940000153694.A	ENSGT00940000157112	ENSGT00390000012403	ENSGT00730000111079	ENSGT00940000158112	ENSGT00940000158386	ENSGT00930000151039	ENSGT00940000164941	ENSGT01010000222313.B.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000153576.c.b	ENSGT00940000157119	ENSGT00940000156538	ENSGT00940000157915	ENSGT01090000260061.c.b	ENSGT00820000127055.a	ENSGT01030000234566.e.a	ENSGT00940000154248.b	ENSGT00390000006344	ENSGT00390000005003	ENSGT00950000183191.a.b	ENSGT00940000159751	ENSGT00390000015354.c.b.b	ENSGT00940000167381	ENSGT00940000161716
Frog	MODERN SPECIES	2	sms (ENSXETG00000003857)	phex (ENSXETG00000038825)	ptchd1 (ENSXETG00000037296)	ppef1 (ENSXETG00000006754)	ENSXETG00000044429	phka1p1 (ENSXETG00000006756)	adgrg2 (ENSXETG00000037052)	wdr77 (ENSXETG00000006758)	atp5pb (ENSXETG00000022255)	ENSXETG00000033610	abhd15 (ENSXETG00000030092)	tlcd2 (ENSXETG00000044649)	prpf8 (ENSXETG00000022259)	ENSXETG00000047487	rilp (ENSXETG00000031653)	scarf1 (ENSXETG00000033180) ##22	ENSXETG00000047615	ENSXETG00000042167	slc43a2 (ENSXETG00000022279)	pitpna (ENSXETG00000031018)	ENSXETG00000045373	inpp5k (ENSXETG00000022881)	myo1c (ENSXETG00000022882)	ywhae (ENSXETG00000022893)	crk (ENSXETG00000022904)	nagpa (ENSXETG00000022907)	ENSXETG00000047961	ENSXETG00000043653	lrwd1 (ENSXETG00000005472)	alkbh4 (ENSXETG00000034559)	sh2b2 (ENSXETG00000005475)
Leishan spiny toad	MODERN SPECIES	5	OVCA2 (ENSLLEG00000011149)	DPH1 (ENSLLEG00000010998)	ENSLLEG00000010943	RTN4RL1 (ENSLLEG00000010910)	RPA1 (ENSLLEG00000010591)	SMYD4 (ENSLLEG00000010441)	SERPINF1 (ENSLLEG00000010328)	SERPINF2 (ENSLLEG00000010083)	WDR81 (ENSLLEG00000009982)	ENSLLEG00000009965	ENSLLEG00000009941	ENSLLEG00000009772	ENSLLEG00000009403	TLCD2 (ENSLLEG00000009334)	PRPF8 (ENSLLEG00000008055)	SCARF1 (ENSLLEG00000007976) ##22	SLC43A2 (ENSLLEG00000007769)	PITPNA (ENSLLEG00000007726)	INPP5K (ENSLLEG00000007520)	ENSLLEG00000007485	MYO1C (ENSLLEG00000007167)	ENSLLEG00000006943	ENSLLEG00000006907	CRK (ENSLLEG00000006856)	NAGPA (ENSLLEG00000006723)	ENSLLEG00000006666	LRWD1 (ENSLLEG00000006510)	ALKBH4 (ENSLLEG00000006478)	ENSLLEG00000006472	PRKRIP1 (ENSLLEG00000006388)	SH2B2 (ENSLLEG00000006323)
Actinopterygii	ANCESTRAL SPECIES	181			ENSGT00940000166715	ENSGT00390000007149	ENSGT00390000003413	ENSGT00950000183143.d	ENSGT00940000159315	ENSGT00390000006030.d.a.b	ENSGT00390000014189	ENSGT00950000183122.B	ENSGT00940000155690.a	ENSGT00940000157944	ENSGT00940000157588	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000161216	ENSGT00530000063751.b	ENSGT00390000004155	ENSGT00950000183096.a.a.c.a	ENSGT01030000234550.a.a.c.a.a	ENSGT00940000158029	ENSGT00390000014595.a.a.a	ENSGT00940000166151	ENSGT00940000159685	ENSGT00940000163253.a.b
Neopterygii	ANCESTRAL SPECIES	27	ENSGT00940000155797	ENSGT00940000166715	ENSGT00390000007149	ENSGT00390000003413	ENSGT00950000183143.d	ENSGT00940000159315	ENSGT00390000006030.d.a.b	ENSGT00390000014189	ENSGT00950000183122.B	ENSGT00940000155690.a	ENSGT00940000165264	ENSGT00940000157944	ENSGT00940000157588	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000161216	ENSGT00530000063751.b	ENSGT00390000004155	ENSGT00950000183096.a.a.c.a	ENSGT01030000234550.a.a.c.a.a	ENSGT00940000158029	ENSGT00390000014595.a.a.a	ENSGT00940000166151	ENSGT00940000159685	ENSGT00940000163253.a.b	ENSGT00940000156919	ENSGT00390000008688.k	ENSGT00940000160337	ENSGT00390000001289.b.b	ENSGT00950000182902.b.b.b
Osteoglossocephalai	ANCESTRAL SPECIES	177											ENSGT00940000157944	ENSGT00940000165264.b	ENSGT00940000157588	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00530000063751.b.j	ENSGT00390000004155	ENSGT00950000183096.a.a.c.a	ENSGT01030000234550.a.a.c.a.a.n	ENSGT00940000158029	ENSGT00390000014595.a.a.a	ENSGT00940000166151	ENSGT00940000159685	ENSGT00940000156919	ENSGT00390000008688.k	ENSGT00940000160337.e	ENSGT00390000001289.b.b	ENSGT00950000182902.b.b.b	ENSGT00950000184050	ENSGT00390000015205
Osteoglossiformes	ANCESTRAL SPECIES	106	ENSGT00390000010722	ENSGT00940000154169.A.g	ENSGT00940000155797	ENSGT00940000166715	ENSGT00390000007149	ENSGT00390000003413.bb	ENSGT00950000183143.d	ENSGT00940000159315	ENSGT00390000006030.d.a.b	ENSGT00390000014189	ENSGT00940000157944	ENSGT00940000165264.b	ENSGT00940000157588.k	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00940000161216	ENSGT00530000063751.b.j	ENSGT00390000004155	ENSGT00950000183096.a.a.c.a	ENSGT01030000234550.a.a.c.a.a.n	ENSGT00940000158029	ENSGT00390000014595.a.a.a	ENSGT00940000166151.b
P. kingsleyae	DUPLICATION
P. kingsleyae	MODERN SPECIES	1478																ENSPKIG00000002117 ##22
P. kingsleyae	MODERN SPECIES	1479																ENSPKIG00000005469 ##22
Asian bonytongue	MODERN SPECIES	1	tbx2b (ENSSFOG00015013196)	bcas3 (ENSSFOG00015013222)	ppm1da (ENSSFOG00015028658)	appbp2 (ENSSFOG00015013471)	USP6 (ENSSFOG00015013546)	tmem97 (ENSSFOG00015013659)	ift20 (ENSSFOG00015029843)	tnfaip1 (ENSSFOG00015026185)	SGSM2 (ENSSFOG00015013710)	tpst1 (ENSSFOG00015013766)	crcp (ENSSFOG00015013799)	aldh3a2a (ENSSFOG00015013809)	ULK2 (ENSSFOG00015013847)	prpf8 (ENSSFOG00015013905)	ENSSFOG00015029200	SCARF1 (ENSSFOG00015014014) ##22	ENSSFOG00015014078	VTN (ENSSFOG00015014105)	sarm1 (ENSSFOG00015014118)	slc46a1 (ENSSFOG00015030599)	SLC13A2 (ENSSFOG00015014152)	foxn1 (ENSSFOG00015014226)	UNC119 (ENSSFOG00015028291)	crybb1l3 (ENSSFOG00015014293)	cryba1a (ENSSFOG00015014332)	CPD (ENSSFOG00015014346)	gosr1 (ENSSFOG00015014396)	TRARG1 (ENSSFOG00015014426)	prss16 (ENSSFOG00015014443)	serpine2 (ENSSFOG00015014492)	wdfy1 (ENSSFOG00015014504)
Clupeocephala	ANCESTRAL SPECIES	42	ENSGT00940000167064	ENSGT00940000155772.a.a	ENSGT00940000155838.e	ENSGT00390000016584	ENSGT00940000161353	ENSGT00940000160099	ENSGT00390000009300.b	ENSGT00950000182849.A.f.a.a	ENSGT00940000159493	ENSGT00390000014712.a	ENSGT00940000157944	ENSGT00940000165264.b	ENSGT00940000157588	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00530000063751.b.j	ENSGT00390000004155	ENSGT00950000183096.a.a.c.a	ENSGT01030000234550.a.a.c.a.a.n	ENSGT00940000158029	ENSGT00390000014595.a.a.a	ENSGT00940000166151	ENSGT00940000159685	ENSGT00940000156919	ENSGT00390000008688.k	ENSGT00940000160337.e	ENSGT00390000001289.b.b	ENSGT00950000182902.b.b.b	ENSGT00950000184050	ENSGT00390000015205
Otomorpha	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000156995.a	ENSGT00390000011000	ENSGT00940000155768.B	ENSGT00390000010722	ENSGT00940000172043	ENSGT00390000007149	ENSGT00390000003413	ENSGT00950000183143.d	ENSGT00940000159315	ENSGT00390000006030.d.a.b	ENSGT00940000157944	ENSGT00940000165264.b	ENSGT00940000157588	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00530000063751.b.j	ENSGT00390000004155	ENSGT00950000183096.a.a.c.a	ENSGT01030000234550.a.a.c.a.a.n	ENSGT00940000158029	ENSGT00390000014595.a.a.a	ENSGT00940000166151	ENSGT00940000159685	ENSGT00940000156919	ENSGT00390000008688.k	ENSGT00940000160337.e	ENSGT00390000001289.b.b	ENSGT00950000182902.b.b.b	ENSGT00950000184050	ENSGT00390000015205
Clupeiformes	ANCESTRAL SPECIES	36	ENSGT00940000156995.b	ENSGT00390000011000	ENSGT00940000155768.B	ENSGT00390000010722.c	ENSGT00940000154169.A.g	ENSGT00390000007149	ENSGT00390000003413	ENSGT00950000183143.d	ENSGT00940000159315	ENSGT00390000006030.d.a.b	ENSGT00940000157944	ENSGT00940000165264.b	ENSGT00940000157588	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00530000063751.b.j	ENSGT00390000004155	ENSGT00950000183096.a.a.c.a	ENSGT01030000234550.a.a.c.a.a.n	ENSGT00940000158029	ENSGT00390000014595.a.a.a	ENSGT00940000166151	ENSGT00940000159685	ENSGT00940000156919	ENSGT00390000008688.k	ENSGT00940000160337.e	ENSGT00390000001289.b.b	ENSGT00950000184050	ENSGT00950000182902.b.b.b	ENSGT00390000015205
Atlantic herring	MODERN SPECIES	25	ENSCHAG00000012442	megf6 (ENSCHAG00000013080)	mffa (ENSCHAG00000013251)	mrpl44 (ENSCHAG00000013279)	agfg1a (ENSCHAG00000013291)	SLC19A3 (ENSCHAG00000013456)	sphkap (ENSCHAG00000013652)	ENSCHAG00000013741	slc19a3b (ENSCHAG00000013756)	ENSCHAG00000013771	ENSCHAG00000013821	ENSCHAG00000013865	ULK2 (ENSCHAG00000013893)	prpf8 (ENSCHAG00000014646)	ENSCHAG00000014708	SCARF1 (ENSCHAG00000014713) ##22	vtna (ENSCHAG00000014781)	sarm1 (ENSCHAG00000014789)	slc46a1 (ENSCHAG00000014845)	chm (ENSCHAG00000014854)	SLC13A2 (ENSCHAG00000014865)	foxn1 (ENSCHAG00000015140)	UNC119 (ENSCHAG00000015167)	crybb1l3 (ENSCHAG00000015218)	cryba1a (ENSCHAG00000015233)	CPD (ENSCHAG00000015297)	gosr1 (ENSCHAG00000015704)	TRARG1 (ENSCHAG00000001001)	AIPL1 (ENSCHAG00000001022)	ENSCHAG00000001043	ENSCHAG00000001060
Denticle herring	MODERN SPECIES	4	MYO18A (ENSDCDG00000005391)	appbp2 (ENSDCDG00000005350)	ENSDCDG00000005348	ENSDCDG00000004769	ENSDCDG00000004722	tmem97 (ENSDCDG00000004715)	ift20 (ENSDCDG00000004709)	tnfaip1 (ENSDCDG00000004708)	SGSM2 (ENSDCDG00000004417)	tpst1 (ENSDCDG00000004392)	ENSDCDG00000004021	aldh3a2a (ENSDCDG00000003968)	ULK2 (ENSDCDG00000003507)	prpf8 (ENSDCDG00000003352)	ENSDCDG00000003329	SCARF1 (ENSDCDG00000003305) ##22	sarm1 (ENSDCDG00000003277)	slc46a1 (ENSDCDG00000003272)	SLC13A2 (ENSDCDG00000003258)	foxn1 (ENSDCDG00000003244)	UNC119 (ENSDCDG00000003233)	crybb1l3 (ENSDCDG00000003228)	cryba1a (ENSDCDG00000003223)	CPD (ENSDCDG00000003189)	gosr1 (ENSDCDG00000003117)	TRARG1 (ENSDCDG00000003079)	AIPL1 (ENSDCDG00000003065)	ENSDCDG00000033645	ENSDCDG00000033643	exo5 (ENSDCDG00000033640)	rflnb (ENSDCDG00000033638)
Otophysi	ANCESTRAL SPECIES	23										ENSGT00940000157119.a	ENSGT00940000153576.c.b.w	ENSGT01100000263573.a.b	ENSGT00940000157915	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00530000063751.b.j	ENSGT00390000004155	ENSGT00950000183096.a.a.c.a	ENSGT00940000158029	ENSGT00390000014595.a.a.a	ENSGT00940000166151	ENSGT00940000159685	ENSGT00940000155599.j	ENSGT00940000164085.d.b	ENSGT00940000155672.g	ENSGT00950000182970.A.a	ENSGT00940000158882	ENSGT00940000158439.m	ENSGT00390000006454	ENSGT00390000009083.m.a
Characiphysae	ANCESTRAL SPECIES	39	ENSGT00940000164695.a	ENSGT00940000167260	ENSGT00940000165900	ENSGT00940000159399	ENSGT00970000193421.A	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.b	ENSGT00940000161295	ENSGT00390000012863	ENSGT00940000160655	ENSGT00940000157119.a	ENSGT00940000153576.c.b.w	ENSGT01100000263573.a.b	ENSGT00940000157915	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00530000063751.b.j	ENSGT00390000004155	ENSGT00950000183096.a.a.c.a	ENSGT00940000158029	ENSGT00390000014595.a.a.a	ENSGT00940000166151	ENSGT00940000159685	ENSGT00940000155599.j	ENSGT00940000164085.d.b	ENSGT00390000016199.a	ENSGT00980000199373	ENSGT00940000157010.m	ENSGT00390000016820.d	ENSGT00390000014900.b.a	ENSGT01100000266855
Channel catfish	MODERN SPECIES	8	ppm1na (ENSIPUG00000021724)	rtn2a (ENSIPUG00000021737)	Rhou (ENSIPUG00000023082)	rab4b (ENSIPUG00000023086)	ap2s1 (ENSIPUG00000023106)	arhgap35 (ENSIPUG00000023110)	ENSIPUG00000023117	tmem160 (ENSIPUG00000023123)	ENSIPUG00000023129	PITPNA (ENSIPUG00000023132)	slc43a2 (ENSIPUG00000023155)	ENSIPUG00000023166	MYO1C (ENSIPUG00000023174)	prpf8 (ENSIPUG00000023230)	rilp (ENSIPUG00000023256)	SCARF1 (ENSIPUG00000023263) ##22	VTN (ENSIPUG00000023271)	sarm1 (ENSIPUG00000023276)	slc46a1 (ENSIPUG00000023281)	foxn1 (ENSIPUG00000023292)	UNC119 (ENSIPUG00000023299)	crybb1l3 (ENSIPUG00000023322)	cryba1a (ENSIPUG00000023326)	dhrs13a.3 (ENSIPUG00000023331)	lhx1a (ENSIPUG00000023350)	bag6 (ENSIPUG00000023362)	tspan13 (ENSIPUG00000023383)	ANKMY2 (ENSIPUG00000023390)	sostdc1 (ENSIPUG00000023415)	ispd (ENSIPUG00000023418)	meox2 (ENSIPUG00000023430)
Characiphysae_b	ANCESTRAL SPECIES	38	ENSGT00940000164695.a	ENSGT00940000167260	ENSGT00940000165900	ENSGT00940000159399	ENSGT00970000193421.A	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.b	ENSGT00940000161295	ENSGT00390000012863	ENSGT00940000160655	ENSGT00940000157119.a	ENSGT00940000153576.c.b.w	ENSGT01100000263573.a.b	ENSGT00940000157915	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00530000063751.b.j	ENSGT00390000004155	ENSGT00950000183096.a.a.c.a	ENSGT00940000158029	ENSGT00390000014595.a.a.a	ENSGT00940000166151	ENSGT00940000159685	ENSGT00940000155599.j	ENSGT00940000164085.d.b	ENSGT00390000016199.a	ENSGT00980000199373	ENSGT00940000157010.m	ENSGT00390000016820.d	ENSGT00390000014900.b.a	ENSGT01100000266855
Electric eel	MODERN SPECIES	728									ENSEEEG00000009672	pitpnaa (ENSEEEG00000009665)	SLC43A2 (ENSEEEG00000009658)	ENSEEEG00000009653	myo1cb (ENSEEEG00000009413)	prpf8 (ENSEEEG00000009396)	ENSEEEG00000009390	SCARF1 (ENSEEEG00000009389) ##22	sarm1 (ENSEEEG00000009383)	slc46a1 (ENSEEEG00000009381)	foxn1 (ENSEEEG00000009380)	cryba1a (ENSEEEG00000009304)	dhrs13a.3 (ENSEEEG00000009298)
Characoidei	ANCESTRAL SPECIES	53	ENSGT00940000164695.a	ENSGT00940000167260	ENSGT00940000165900	ENSGT00940000159399	ENSGT00970000193421.A	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.b	ENSGT00940000161295	ENSGT00390000012863	ENSGT00940000160655	ENSGT00940000157119.a	ENSGT00940000153576.c.b.w	ENSGT01100000263573.a.b	ENSGT00940000157915	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00530000063751.b.j	ENSGT00390000004155	ENSGT00950000183096.a.a.c.a	ENSGT00940000158029	ENSGT00390000014595.a.a.a	ENSGT00940000166151	ENSGT00940000159685	ENSGT00940000155599.j	ENSGT00940000164085.d.b	ENSGT00390000016199.a	ENSGT00980000199373	ENSGT00940000157010.m	ENSGT00390000016820.d	ENSGT00390000014900.b.a	ENSGT01100000266855
Red-bellied piranha	MODERN SPECIES	46	ppm1na (ENSPNAG00000009674)	rtn2a (ENSPNAG00000009651)	rhoub (ENSPNAG00000009625)	rab4b (ENSPNAG00000009616)	ap2s1 (ENSPNAG00000009596)	ARHGAP35 (ENSPNAG00000009576)	NPAS1 (ENSPNAG00000009545)	tmem160 (ENSPNAG00000009494)	EGLN2 (ENSPNAG00000009484)	pitpnaa (ENSPNAG00000009460)	SLC43A2 (ENSPNAG00000009438)	ENSPNAG00000009368	myo1cb (ENSPNAG00000009340)	prpf8 (ENSPNAG00000009247)	ENSPNAG00000009147	SCARF1 (ENSPNAG00000009134) ##22	vtna (ENSPNAG00000009118)	sarm1 (ENSPNAG00000009102)	slc46a1 (ENSPNAG00000001284)	foxn1 (ENSPNAG00000009071)	UNC119 (ENSPNAG00000009021)	crybb1l3 (ENSPNAG00000001251)	cryba1a (ENSPNAG00000001241)	dhrs13a.3 (ENSPNAG00000008900)	lhx1a (ENSPNAG00000008895)	bag6 (ENSPNAG00000008885)	ENSPNAG00000008866	tspan13a (ENSPNAG00000008863)	ankmy2a (ENSPNAG00000008844)	sostdc1a (ENSPNAG00000001212)	ENSPNAG00000001210
Mexicana tetra	MODERN SPECIES		ENSAMXG00000035573	rtn2a (ENSAMXG00000041754)	rhoub (ENSAMXG00000033298)	rab4b (ENSAMXG00000020339)	ap2s1 (ENSAMXG00000041811)	ENSAMXG00000020331	ENSAMXG00000035527	tmem160 (ENSAMXG00000033513)	ENSAMXG00000029242	pitpnaa (ENSAMXG00000029804)	SLC43A2 (ENSAMXG00000034238)	ENSAMXG00000041565	myo1cb (ENSAMXG00000020294)	prpf8 (ENSAMXG00000020291)	ENSAMXG00000042382	SCARF1 (ENSAMXG00000033634) ##22	vtna (ENSAMXG00000032441)	tspan13a (ENSAMXG00000036610)	ENSAMXG00000025279	bag6 (ENSAMXG00000020231)	ENSAMXG00000034412	ENSAMXG00000010306	ENSAMXG00000032288	kcnh2a (ENSAMXG00000010316)	ENSAMXG00000043477	ENSAMXG00000010330	GIT1 (ENSAMXG00000010333)	ankrd13b (ENSAMXG00000038939)	SSH2 (ENSAMXG00000037181)	ENSAMXG00000033947	slc6a4a (ENSAMXG00000010342)
Cyprinoidei	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT01100000263537.b.b.c.a.a	ENSGT00450000040362	ENSGT00940000155573.h	ENSGT00390000001735	ENSGT00940000157855	ENSGT00940000179321	ENSGT00940000157430.a.b	ENSGT00950000182928.A.a.a	ENSGT00940000159604	ENSGT00940000157119.a	ENSGT00940000153576.c.b.w	ENSGT01100000263573.a.b	ENSGT00940000157915	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00530000063751.b.j	ENSGT00390000004155	ENSGT00950000183096.a.a.c.a	ENSGT00940000158029	ENSGT00390000014595.a.a.a	ENSGT00940000166151	ENSGT00940000159685	ENSGT00940000155599.j	ENSGT00940000164085.d.b	ENSGT00950000182970.A.a	ENSGT00940000158882	ENSGT00940000158439.m	ENSGT00390000006454	ENSGT00940000155672.g	ENSGT00530000063950.a.b
Cyprininae	DUPLICATION
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	249	ENSGT01100000263537.b.b.c.a.a.c.a	ENSGT00450000040362.d	ENSGT00940000155573.h.a	ENSGT00390000001735.r	ENSGT00940000157855.j	ENSGT00940000179321	ENSGT00940000157430.a.b.a	ENSGT00950000182928.A.a.a.k.a	ENSGT00940000159604.b	ENSGT00940000157119.a.j	ENSGT00940000153576.c.b.w.b	ENSGT01100000263573.a.b.c	ENSGT00940000157915.p	ENSGT00390000015210.v	ENSGT00940000161117.h	ENSGT00950000183101.a.a.g ##22	ENSGT00530000063751.b.j.f	ENSGT00390000004155.c	ENSGT00950000183096.a.a.c.a.o	ENSGT00940000158029.c.a	ENSGT00390000014595.a.a.a.b	ENSGT00940000159685.g	ENSGT00940000166151
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	41	ENSGT01100000263537.b.b.c.a.a.c.a	ENSGT00450000040362.d	ENSGT00940000155573.h.a	ENSGT00390000001735.r	ENSGT00940000157855.j	ENSGT00940000179321	ENSGT00940000157430.a.b.a	ENSGT00950000182928.A.a.a.k.a	ENSGT00940000159604.b	ENSGT00940000157119.a.j	ENSGT00940000153576.c.b.w.b	ENSGT01100000263573.a.b.c	ENSGT00940000157915.p	ENSGT00390000015210.v	ENSGT00940000161117.h	ENSGT00950000183101.a.a.g ##22	ENSGT00530000063751.b.j.f	ENSGT00390000004155.c	ENSGT00950000183096.a.a.c.a.o	ENSGT00940000158029.c.a	ENSGT00390000014595.a.a.a.b	ENSGT00940000166151	ENSGT00940000159685.g	ENSGT00940000164085.d.b.d	ENSGT00950000182970.A.a.o.b	ENSGT00940000158882.a	ENSGT00940000158439.m.a	ENSGT00390000006454.e.b	ENSGT00940000155672.g.h	ENSGT00530000063950.a.b.g
Common carp reference	MODERN SPECIES	26	eml2 (ENSCCRG00000021660)	ENSCCRG00000076278	polr1g (ENSCCRG00000068500)	blmh (ENSCCRG00000005040)	slc6a4a (ENSCCRG00000033597)	ENSCCRG00000071551	ENSCCRG00000074367	SSH2 (ENSCCRG00000014343)	ENSCCRG00000073783	pitpnaa (ENSCCRG00000051256)	ENSCCRG00000033763	ENSCCRG00000070666	myo1cb (ENSCCRG00000037491)	prpf8 (ENSCCRG00000037115)	ENSCCRG00000069663	SCARF1 (ENSCCRG00000045741) ##22	vtna (ENSCCRG00000045742)	sarm1 (ENSCCRG00000045747)	slc46a1 (ENSCCRG00000049339)	foxn1 (ENSCCRG00000047246)	ENSCCRG00000063043	cryba1a (ENSCCRG00000007599)	crybb1l3 (ENSCCRG00000047232)	ENSCCRG00000068892	lhx1a (ENSCCRG00000074241)	brip1 (ENSCCRG00000010742)	tbx4 (ENSCCRG00000071801)	tbx2b (ENSCCRG00000003877)	bcas3 (ENSCCRG00000021714)	ppm1da (ENSCCRG00000021690)	ccdc9 (ENSCCRG00000021685)
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	349	ENSSGRG00000043877	eml2 (ENSSGRG00000043292)	GPR4 (ENSSGRG00000043277)	nova2 (ENSSGRG00000043264)	blmh (ENSSGRG00000042822)	slc6a4a (ENSSGRG00000042435)	SSH2 (ENSSGRG00000042428)	ENSSGRG00000042424	ENSSGRG00000042422	GIT1 (ENSSGRG00000041666)	pitpnaa (ENSSGRG00000041424)	SLC43A2 (ENSSGRG00000041113)	myo1cb (ENSSGRG00000040990)	prpf8 (ENSSGRG00000040423)	ENSSGRG00000040403	SCARF1 (ENSSGRG00000040402) ##22	vtna (ENSSGRG00000040401)	sarm1 (ENSSGRG00000040384)	slc46a1 (ENSSGRG00000040383)	foxn1 (ENSSGRG00000040382)	UNC119 (ENSSGRG00000040381)	crybb1l3 (ENSSGRG00000040380)	cryba1a (ENSSGRG00000040378)	dhrs13a.3 (ENSSGRG00000040376)	lhx1a (ENSSGRG00000040335)	brip1 (ENSSGRG00000040332)	tbx4 (ENSSGRG00000040330)	tbx2b (ENSSGRG00000040327)	bcas3 (ENSSGRG00000038585)	ppm1da (ENSSGRG00000038578)	ccdc9 (ENSSGRG00000038577)
Goldfish	MODERN SPECIES	2797															ENSCARG00000067474	ENSCARG00000067450 ##22
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000153887.B.b	ENSGT01100000263537.b.b.c.a.a.c.b	ENSGT00450000040362.c	ENSGT00940000155573.h.b	ENSGT00390000001735.q	ENSGT00940000157855.i	ENSGT00940000157430.a.b.b	ENSGT00950000182928.A.a.a.k.b	ENSGT00940000159604.a	ENSGT00940000157119.a.i	ENSGT00940000153576.c.b.w.a	ENSGT01100000263573.a.b.d	ENSGT00940000157915.o	ENSGT00390000015210.u	ENSGT00940000161117.g	ENSGT00950000183101.a.a.h ##22	ENSGT00530000063751.b.j.e	ENSGT00390000004155.d	ENSGT00950000183096.a.a.c.a.p	ENSGT00940000158029.c.b	ENSGT00390000014595.a.a.a.a	ENSGT00940000159685.h	ENSGT00940000155599.j	ENSGT00940000164085.d.b.c	ENSGT00950000182970.A.a.o.a	ENSGT00940000158882.b	ENSGT00940000158439.m.b	ENSGT00390000006454.e.a.a	ENSGT00940000155672.g.g	ENSGT00530000063950.a.b.h	ENSGT00390000009714.l
Goldfish	MODERN SPECIES	34	eml2 (ENSCARG00000035095)	GPR4 (ENSCARG00000034880)	polr1g (ENSCARG00000034874)	nova2 (ENSCARG00000034851)	blmh (ENSCARG00000034786)	slc6a4a (ENSCARG00000033252)	SSH2 (ENSCARG00000033109)	ankrd13b (ENSCARG00000033027)	GIT1 (ENSCARG00000029391)	pitpnaa (ENSCARG00000028774)	SLC43A2 (ENSCARG00000028342)	ENSCARG00000028309	myo1cb (ENSCARG00000021861)	prpf8 (ENSCARG00000021445)	ENSCARG00000021428	SCARF1 (ENSCARG00000021362) ##22	sarm1 (ENSCARG00000021348)	slc46a1 (ENSCARG00000021339)	foxn1 (ENSCARG00000021324)	UNC119 (ENSCARG00000021308)	cryba1a (ENSCARG00000021298)	dhrs13a.3 (ENSCARG00000021282)	lhx1a (ENSCARG00000021265)	tbx4 (ENSCARG00000021246)	tbx2b (ENSCARG00000021216)	bcas3 (ENSCARG00000020994)	ppm1da (ENSCARG00000020962)	ccdc9 (ENSCARG00000020946)	PITPNM3 (ENSCARG00000020555)	ENSCARG00000020502	slc47a4 (ENSCARG00000020418)
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	28	ENSGT00940000157969.sb	ENSGT00940000153887.B.b	ENSGT01100000263537.b.b.c.a.a.c.b	ENSGT00450000040362.c	ENSGT00940000155573.h.b	ENSGT00390000001735.q	ENSGT00940000157855.i	ENSGT00940000157430.a.b.b	ENSGT00950000182928.A.a.a.k.b	ENSGT00940000159604.a	ENSGT00940000157119.a.i	ENSGT00940000153576.c.b.w.a	ENSGT00940000157915.o	ENSGT00390000015210.u	ENSGT00940000161117.g	ENSGT00950000183101.a.a.h ##22	ENSGT00530000063751.b.j.e	ENSGT00390000004155.d	ENSGT00950000183096.a.a.c.a.p	ENSGT00940000158029.c.b	ENSGT00390000014595.a.a.a.a	ENSGT00940000159685.h	ENSGT00940000155599.j	ENSGT00940000164085.d.b.c	ENSGT00950000182970.A.a.o.a	ENSGT00940000158882.b	ENSGT00940000158439.m.b	ENSGT00390000006454.e.a.a	ENSGT00940000155672.g.g	ENSGT00530000063950.a.b.h	ENSGT00390000009714.l
Common carp reference	MODERN SPECIES	39	eml2 (ENSCCRG00000019929)	ENSCCRG00000074921	polr1g (ENSCCRG00000013796)	nova2 (ENSCCRG00000076303)	blmh (ENSCCRG00000033184)	slc6a4a (ENSCCRG00000043729)	SSH2 (ENSCCRG00000049767)	ankrd13b (ENSCCRG00000023385)	GIT1 (ENSCCRG00000063318)	pitpnaa (ENSCCRG00000033736)	ENSCCRG00000059563	ENSCCRG00000066072	prpf8 (ENSCCRG00000037194)	RILP (ENSCCRG00000064564)	myo1cb (ENSCCRG00000035870)	SCARF1 (ENSCCRG00000037280) ##22	vtna (ENSCCRG00000037295)	sarm1 (ENSCCRG00000037301)	slc46a1 (ENSCCRG00000007615)	foxn1 (ENSCCRG00000007611)	ENSCCRG00000063728	cryba1a (ENSCCRG00000047229)	ENSCCRG00000064759	dhrs13a.3 (ENSCCRG00000078198)	lhx1a (ENSCCRG00000023250)	brip1 (ENSCCRG00000008965)	tbx4 (ENSCCRG00000008956)	tbx2b (ENSCCRG00000008945)	bcas3 (ENSCCRG00000002937)	ppm1da (ENSCCRG00000070707)	ccdc9 (ENSCCRG00000003064)
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Zebrafish	MODERN SPECIES	6	GPR4 (ENSDARG00000079479)	polr1g (ENSDARG00000090386)	nova2 (ENSDARG00000017673)	blmh (ENSDARG00000025977)	slc6a4a (ENSDARG00000061165)	ENSDARG00000097453	SSH2 (ENSDARG00000088440)	ankrd13b (ENSDARG00000014652)	GIT1 (ENSDARG00000039489)	pitpnaa (ENSDARG00000039490)	SLC43A2 (ENSDARG00000036848)	ENSDARG00000087736	myo1cb (ENSDARG00000061579)	prpf8 (ENSDARG00000026180)	ENSDARG00000074660	SCARF1 (ENSDARG00000077285) ##22	vtna (ENSDARG00000055388)	sarm1 (ENSDARG00000010610)	slc46a1 (ENSDARG00000026149)	foxn1 (ENSDARG00000011879)	UNC119 (ENSDARG00000034453)	crybb1l3 (ENSDARG00000007655)	cryba1a (ENSDARG00000041141)	dhrs13a.3 (ENSDARG00000041137)	ENSDARG00000099423	lhx1a (ENSDARG00000014018)	brip1 (ENSDARG00000074410)	tbx4 (ENSDARG00000030058)	tbx2b (ENSDARG00000006120)	bcas3 (ENSDARG00000090764)	ppm1da (ENSDARG00000009273)
Euteleosteomorpha	ANCESTRAL SPECIES	172														ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00530000063751.b.j	ENSGT00390000004155	ENSGT00950000183096.a.a.c.a	ENSGT01030000234550.a.a.c.a.a.n	ENSGT00940000158029	ENSGT00390000014595.a.a.a	ENSGT00940000166151	ENSGT00940000159685	ENSGT00940000156919	ENSGT00390000008688.k	ENSGT00940000160337.e	ENSGT00390000001289.b.b	ENSGT00950000184050	ENSGT00950000182902.b.b.b	ENSGT00390000015205
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Euacanthomorphacea	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00390000003115	ENSGT00950000183018.a.d.a	ENSGT00940000168646.a	ENSGT00940000156345.k.a	ENSGT00940000157152.A	ENSGT00510000048287.b	ENSGT00390000016694	ENSGT00940000155039.a.a	ENSGT00390000012485.a.b.a	ENSGT00430000031027.b.a	ENSGT01010000222313.B.b.b	ENSGT00940000164941	ENSGT00390000001742.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00530000063751.b.j	ENSGT00390000004155	ENSGT00950000183096.a.a.c.a	ENSGT01030000234550.a.a.c.a.a.n	ENSGT00940000158029	ENSGT00390000014595.a.a.a	ENSGT00940000166151	ENSGT00940000159685	ENSGT00940000180040	ENSGT00940000156919	ENSGT00390000008688.k	ENSGT00940000160337.e	ENSGT00390000001289.b.b	ENSGT01030000236779	ENSGT00950000184050
Percomorphaceae	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00390000003115	ENSGT00950000183018.a.d.a	ENSGT00940000168646.a	ENSGT00940000156345.k.a	ENSGT00940000157152.A	ENSGT00510000048287.b	ENSGT00390000016694	ENSGT00940000155039.a.a	ENSGT00390000012485.a.b.a	ENSGT00430000031027.b.a	ENSGT01010000222313.B.b.b	ENSGT00940000164941	ENSGT00390000001742.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00530000063751.b.j	ENSGT00390000004155	ENSGT00950000183096.a.a.c.a	ENSGT01030000234550.a.a.c.a.a.n	ENSGT00940000158029	ENSGT00390000014595.a.a.a	ENSGT00940000166151	ENSGT00940000159685	ENSGT00940000180040	ENSGT00940000156919	ENSGT00390000008688.k	ENSGT00940000160337.e	ENSGT00390000001289.b.b	ENSGT01030000236779	ENSGT00950000184050
Percomorphaceae_B	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00390000003115	ENSGT00950000183018.a.d.a	ENSGT00940000168646.a	ENSGT00940000156345.k.a	ENSGT00940000157152.A	ENSGT00510000048287.b	ENSGT00390000016694	ENSGT00940000155039.a.a	ENSGT00390000012485.a.b.a	ENSGT00430000031027.b.a	ENSGT01010000222313.B.b.b	ENSGT00940000164941	ENSGT00390000001742.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00530000063751.b.j	ENSGT00390000004155	ENSGT00950000183096.a.a.c.a	ENSGT01030000234550.a.a.c.a.a.n	ENSGT00940000158029	ENSGT00390000014595.a.a.a	ENSGT00940000166151	ENSGT00940000159685	ENSGT00940000180040	ENSGT00940000156919	ENSGT00390000008688.k	ENSGT00940000160337.e	ENSGT00390000001289.b.b	ENSGT01030000236779	ENSGT00950000182902.b.b.b
Percomorphaceae_C	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00390000003115	ENSGT00950000183018.a.d.a	ENSGT00940000168646.a	ENSGT00940000156345.k.a	ENSGT00940000157152.A	ENSGT00510000048287.b	ENSGT00390000016694	ENSGT00940000155039.a.a	ENSGT00390000012485.a.b.a	ENSGT00430000031027.b.a	ENSGT01010000222313.B.b.b	ENSGT00940000164941	ENSGT00390000001742.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00530000063751.b.j	ENSGT00390000004155	ENSGT00950000183096.a.a.c.a	ENSGT01030000234550.a.a.c.a.a.n	ENSGT00940000158029	ENSGT00390000014595.a.a.a	ENSGT00940000166151	ENSGT00940000159685	ENSGT00940000180040	ENSGT00940000156919	ENSGT00390000008688.k	ENSGT00940000160337.e	ENSGT00390000001289.b.b	ENSGT00950000182902.b.b.b	ENSGT00940000156628.c
Eupercaria	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00390000003115	ENSGT00950000183018.a.d.a	ENSGT00940000168646.a	ENSGT00940000156345.k.a	ENSGT00940000157152.A	ENSGT00510000048287.b	ENSGT00390000016694	ENSGT00940000155039.a.a	ENSGT00390000012485.a.b.a	ENSGT00430000031027.b.a	ENSGT01010000222313.B.b.b	ENSGT00940000164941	ENSGT00390000001742.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00530000063751.b.j	ENSGT00390000004155	ENSGT00950000183096.a.a.c.a	ENSGT01030000234550.a.a.c.a.a.n	ENSGT00940000158029	ENSGT00390000014595.a.a.a	ENSGT00940000166151	ENSGT00940000159685	ENSGT00940000156919	ENSGT00390000008688.k	ENSGT00940000160337.e	ENSGT00390000001289.b.b	ENSGT00950000182902.b.b.b	ENSGT00940000156628.c	ENSGT01080000257336.b.e.b.a.a.d
Tetraodontidae	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000158139	ENSGT00390000003115	ENSGT00950000183018.a.d.a	ENSGT00990000206296	ENSGT00940000156345.k.a	ENSGT00940000157152.A	ENSGT00510000048287.b	ENSGT00390000016694	ENSGT00940000155039.a.a	ENSGT00390000012485.a.b.a	ENSGT00430000031027.b.a	ENSGT01010000222313.B.b.b	ENSGT00940000164941	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00530000063751.b.j	ENSGT00390000004155	ENSGT00950000183096.a.a.c.a.j	ENSGT00950000183096.a.a.c.a.i	ENSGT00940000158029	ENSGT00390000014595.a.a.a	ENSGT00940000166151	ENSGT00940000159685	ENSGT00940000156919	ENSGT00390000008688.k	ENSGT00940000160337.e	ENSGT00390000001289.b.b	ENSGT00950000182902.b.b.b	ENSGT00940000156628.c	ENSGT01080000257336.b.e.b.a.a.d
Fugu	MODERN SPECIES	2	phkg1a (ENSTRUG00000015551)	psph (ENSTRUG00000015591)	NIPSNAP2 (ENSTRUG00000015612)	ENSTRUG00000027466	limk1a (ENSTRUG00000015653)	ENSTRUG00000015731	MNT (ENSTRUG00000022836)	mettl16 (ENSTRUG00000015815)	pafah1b1a (ENSTRUG00000015825)	cluha (ENSTRUG00000015850)	CCDC92B (ENSTRUG00000023208)	tlcd2 (ENSTRUG00000019582)	aifm4 (ENSTRUG00000015888)	prpf8 (ENSTRUG00000015906)	ENSTRUG00000015954	SCARF1 (ENSTRUG00000015971) ##22	vtna (ENSTRUG00000015987)	sarm1 (ENSTRUG00000016046)	slc46a1 (ENSTRUG00000016051)	slc46a1 (ENSTRUG00000021947)	slc46a1 (ENSTRUG00000016057)	ENSTRUG00000027345	UNC119 (ENSTRUG00000016070)	crybb1l3 (ENSTRUG00000016076)	cryba1a (ENSTRUG00000016104)	ENSTRUG00000028069	CPD (ENSTRUG00000016118)	gosr1 (ENSTRUG00000020599)	TRARG1 (ENSTRUG00000016162)	AIPL1 (ENSTRUG00000016169)	ENSTRUG00000024105
Tetraodon	MODERN SPECIES	1	ENSTNIG00000019262	sptb (ENSTNIG00000019261)	snap23.1 (ENSTNIG00000019260)	efna2a (ENSTNIG00000019259)	limk1a (ENSTNIG00000005813)	ENSTNIG00000005814	ENSTNIG00000005815	MNT (ENSTNIG00000005816)	mettl16 (ENSTNIG00000017967)	pafah1b1a (ENSTNIG00000017966)	cluha (ENSTNIG00000017965)	tlcd2 (ENSTNIG00000017964)	aifm4 (ENSTNIG00000017963)	prpf8 (ENSTNIG00000003460)	ENSTNIG00000003459	SCARF1 (ENSTNIG00000019589) ##22	vtna (ENSTNIG00000005560)	sarm1 (ENSTNIG00000005561)	slc46a1 (ENSTNIG00000005562)	slc46a1 (ENSTNIG00000005563)	cryba1a (ENSTNIG00000005564)	CPD (ENSTNIG00000005565)	gosr1 (ENSTNIG00000005566)	AIPL1 (ENSTNIG00000019492)	ENSTNIG00000006364	PDE3A (ENSTNIG00000006365)	slco1c1 (ENSTNIG00000006366)	bcap29 (ENSTNIG00000006367)	vps53 (ENSTNIG00000004476)	zgc:172282 (ENSTNIG00000005472)	zgc:162730 (ENSTNIG00000000183)
Eupecaria_A	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00390000003115	ENSGT00950000183018.a.d.a	ENSGT00940000168646.a	ENSGT00940000156345.k.a	ENSGT00940000157152.A	ENSGT00510000048287.b	ENSGT00390000016694	ENSGT00940000155039.a.a	ENSGT00390000012485.a.b.a	ENSGT00430000031027.b.a	ENSGT01010000222313.B.b.b	ENSGT00940000164941	ENSGT00390000001742.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00530000063751.b.j	ENSGT00390000004155	ENSGT00950000183096.a.a.c.a	ENSGT01030000234550.a.a.c.a.a.n	ENSGT00940000158029	ENSGT00390000014595.a.a.a	ENSGT00940000166151	ENSGT00940000159685	ENSGT00940000156919	ENSGT00390000008688.k	ENSGT00940000160337.e	ENSGT00390000001289.b.b	ENSGT00950000182902.b.b.b	ENSGT00940000156628.c	ENSGT01080000257336.b.e.b.a.a.d
Ballan wrasse	MODERN SPECIES	129	phkg1a (ENSLBEG00000026509)	psph (ENSLBEG00000026587)	NIPSNAP2 (ENSLBEG00000026570)	limk1a (ENSLBEG00000026633)	ENSLBEG00000026675	MNT (ENSLBEG00000026696)	mettl16 (ENSLBEG00000026712)	pafah1b1a (ENSLBEG00000026733)	cluha (ENSLBEG00000026785)	CCDC92B (ENSLBEG00000026824)	tlcd2 (ENSLBEG00000026835)	aifm4 (ENSLBEG00000026858)	zgc:153372 (ENSLBEG00000026885)	prpf8 (ENSLBEG00000026903)	ENSLBEG00000026973	SCARF1 (ENSLBEG00000026985) ##22	vtna (ENSLBEG00000027003)	sarm1 (ENSLBEG00000027019)	slc46a1 (ENSLBEG00000027040)	SLC13A2 (ENSLBEG00000027050)	UNC119 (ENSLBEG00000027069)	crybb1l3 (ENSLBEG00000027077)	cryba1a (ENSLBEG00000027121)	CPD (ENSLBEG00000027213)	gosr1 (ENSLBEG00000027281)	TRARG1 (ENSLBEG00000027306)	AIPL1 (ENSLBEG00000027317)	ENSLBEG00000027338
Eupecaria_B	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00390000003115	ENSGT00950000183018.a.d.a	ENSGT00940000168646.a	ENSGT00940000156345.k.a	ENSGT00940000157152.A	ENSGT00510000048287.b	ENSGT00390000016694	ENSGT00940000155039.a.a	ENSGT00390000012485.a.b.a	ENSGT00430000031027.b.a	ENSGT01010000222313.B.b.b	ENSGT00940000164941	ENSGT00390000001742.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00530000063751.b.j	ENSGT00390000004155	ENSGT00950000183096.a.a.c.a	ENSGT01030000234550.a.a.c.a.a.n	ENSGT00940000158029	ENSGT00390000014595.a.a.a	ENSGT00940000166151	ENSGT00940000159685	ENSGT00940000156919	ENSGT00390000008688.k	ENSGT00940000160337.e	ENSGT00390000001289.b.b	ENSGT00950000182902.b.b.b	ENSGT00940000156628.c	ENSGT01080000257336.b.e.b.a.a.d
Perciformes	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00390000003115	ENSGT00950000183018.a.d.a	ENSGT00940000168646.a	ENSGT00940000156345.k.a	ENSGT00940000157152.A	ENSGT00510000048287.b	ENSGT00390000016694	ENSGT00940000155039.a.a	ENSGT00390000012485.a.b.a	ENSGT00430000031027.b.a	ENSGT01010000222313.B.b.b	ENSGT00940000164941	ENSGT00390000001742.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00530000063751.b.j	ENSGT00390000004155	ENSGT00950000183096.a.a.c.a	ENSGT01030000234550.a.a.c.a.a.n	ENSGT00940000158029	ENSGT00390000014595.a.a.a	ENSGT00940000166151	ENSGT00940000159685	ENSGT00940000156919	ENSGT00390000008688.k	ENSGT00940000160337.e	ENSGT00390000001289.b.b	ENSGT00950000182902.b.b.b	ENSGT00940000156628.c	ENSGT01080000257336.b.e.b.a.a.d
Cottioidei	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000003115	ENSGT00950000183018.a.d.a	ENSGT00990000206296	ENSGT00940000156345.k.a	ENSGT00940000157152.A	ENSGT00510000048287.b	ENSGT00390000016694	ENSGT00940000155039.a.a	ENSGT00390000012485.a.b.a	ENSGT00430000031027.b.a	ENSGT01010000222313.B.b.b	ENSGT00940000164941	ENSGT00390000001742.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00530000063751.b.j	ENSGT00390000004155	ENSGT00950000183096.a.a.c.a	ENSGT01030000234550.a.a.c.a.a.n	ENSGT00940000158029	ENSGT00390000014595.a.a.a	ENSGT00940000166151	ENSGT00940000159685	ENSGT00940000156919	ENSGT00390000008688.k	ENSGT00940000160337.e	ENSGT00390000001289.b.b	ENSGT00950000182902.b.b.b	ENSGT00940000156628.c	ENSGT01080000257336.b.e.b.a.a.d
Lumpfish	MODERN SPECIES	4	chchd2 (ENSCLMG00005012807)	phkg1a (ENSCLMG00005012804)	psph (ENSCLMG00005012789)	NIPSNAP2 (ENSCLMG00005012777)	limk1a (ENSCLMG00005012766)	ENSCLMG00005011619	MNT (ENSCLMG00005011611)	mettl16 (ENSCLMG00005011610)	pafah1b1a (ENSCLMG00005011609)	cluha (ENSCLMG00005008144)	ENSCLMG00005008105	tlcd2 (ENSCLMG00005008102)	aifm4 (ENSCLMG00005008088)	zgc:153372 (ENSCLMG00005008002)	ENSCLMG00005007990	SCARF1 (ENSCLMG00005007989) ##22	vtna (ENSCLMG00005007941)	sarm1 (ENSCLMG00005007939)	slc46a1 (ENSCLMG00005007938)	SLC13A2 (ENSCLMG00005007928)	foxn1 (ENSCLMG00005007920)	UNC119 (ENSCLMG00005007918)	crybb1l3 (ENSCLMG00005007916)	cryba1a (ENSCLMG00005007911)	CPD (ENSCLMG00005007610)	gosr1 (ENSCLMG00005007411)	AIPL1 (ENSCLMG00005007353)	ENSCLMG00005007351	PDE3A (ENSCLMG00005007350)	slco1c1 (ENSCLMG00005007257)	bcap29 (ENSCLMG00005007251)
Stickleback	MODERN SPECIES		trappc6bl (ENSGACG00000008339)	zgc:114130 (ENSGACG00000008344)	zgc:162730 (ENSGACG00000008351)	ENSGACG00000008353	zgc:172282 (ENSGACG00000008355)	vps53 (ENSGACG00000008361)	rflnb (ENSGACG00000008380)	mettl16 (ENSGACG00000008387)	pafah1b1a (ENSGACG00000008413)	cluha (ENSGACG00000008439)	tlcd2 (ENSGACG00000008448)	aifm4 (ENSGACG00000008468)	zgc:153372 (ENSGACG00000008485)	prpf8 (ENSGACG00000008504)	ENSGACG00000008566	SCARF1 (ENSGACG00000008571) ##22	vtna (ENSGACG00000008584)	sarm1 (ENSGACG00000008602)	slc46a1 (ENSGACG00000008604)	SLC13A2 (ENSGACG00000008610)	foxn1 (ENSGACG00000008619)	UNC119 (ENSGACG00000008624)	crybb1l3 (ENSGACG00000008625)	cryba1a (ENSGACG00000008658)	CPD (ENSGACG00000008673)	gosr1 (ENSGACG00000008685)	TRARG1 (ENSGACG00000008718)	AIPL1 (ENSGACG00000008722)	ENSGACG00000008738	PDE3A (ENSGACG00000008742)	slco1c1 (ENSGACG00000008749)
Perciformes_a	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00390000003115	ENSGT00950000183018.a.d.a	ENSGT00940000168646.a	ENSGT00940000156345.k.a	ENSGT00940000157152.A	ENSGT00510000048287.b	ENSGT00390000016694	ENSGT00940000155039.a.a	ENSGT00390000012485.a.b.a	ENSGT00430000031027.b.a	ENSGT01010000222313.B.b.b	ENSGT00940000164941	ENSGT00390000001742.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00530000063751.b.j	ENSGT00390000004155	ENSGT00950000183096.a.a.c.a	ENSGT00940000158029	ENSGT00390000014595.a.a.a	ENSGT00940000166151	ENSGT00940000159685	ENSGT00940000156919	ENSGT00390000008688.k	ENSGT00940000160337.e	ENSGT00390000001289.b.b	ENSGT00950000182902.b.b.b	ENSGT00940000156628.c	ENSGT01080000257336.b.e.b.a.a.d	ENSGT00390000011863.d.a.a
Channel bull blenny	MODERN SPECIES	4	psph (ENSCGOG00000014815)	NIPSNAP2 (ENSCGOG00000013465)	ENSCGOG00000013425	limk1a (ENSCGOG00000011686)	ENSCGOG00000010591	MNT (ENSCGOG00000010545)	mettl16 (ENSCGOG00000010480)	pafah1b1a (ENSCGOG00000010217)	cluha (ENSCGOG00000007836)	ENSCGOG00000007787	tlcd2 (ENSCGOG00000007781)	aifm4 (ENSCGOG00000007760)	zgc:153372 (ENSCGOG00000007732)	prpf8 (ENSCGOG00000007366)	ENSCGOG00000007346	SCARF1 (ENSCGOG00000007316) ##22	vtna (ENSCGOG00000007282)	sarm1 (ENSCGOG00000007262)	slc46a1 (ENSCGOG00000007255)	ENSCGOG00000007252	ENSCGOG00000007250	UNC119 (ENSCGOG00000007244)	crybb1l3 (ENSCGOG00000007154)	cryba1a (ENSCGOG00000007151)	CPD (ENSCGOG00000006917)	gosr1 (ENSCGOG00000006821)	ENSCGOG00000006817	AIPL1 (ENSCGOG00000006809)	ENSCGOG00000006805	PDE3A (ENSCGOG00000006783)	slco1c1 (ENSCGOG00000006395)
Eupecaria_C	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00390000003115	ENSGT00950000183018.a.d.a	ENSGT00940000168646.a	ENSGT00940000156345.k.a	ENSGT00940000157152.A	ENSGT00510000048287.b	ENSGT00390000016694	ENSGT00940000155039.a.a	ENSGT00390000012485.a.b.a	ENSGT00430000031027.b.a	ENSGT01010000222313.B.b.b	ENSGT00940000164941	ENSGT00390000001742.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00530000063751.b.j	ENSGT00390000004155	ENSGT00950000183096.a.a.c.a	ENSGT01030000234550.a.a.c.a.a.n	ENSGT00940000158029	ENSGT00390000014595.a.a.a	ENSGT00940000166151	ENSGT00940000159685	ENSGT00940000156919	ENSGT00390000008688.k	ENSGT00940000160337.e	ENSGT00390000001289.b.b	ENSGT00950000182902.b.b.b	ENSGT00940000156628.c	ENSGT01080000257336.b.e.b.a.a.d
Eupercaria_incertae_sedis	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00390000003115	ENSGT00950000183018.a.d.a	ENSGT00940000168646.a	ENSGT00940000156345.k.a	ENSGT00940000157152.A	ENSGT00510000048287.b	ENSGT00390000016694	ENSGT00940000155039.a.a	ENSGT00390000012485.a.b.a	ENSGT00430000031027.b.a	ENSGT01010000222313.B.b.b	ENSGT00940000164941	ENSGT00390000001742.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00530000063751.b.j	ENSGT00390000004155	ENSGT00950000183096.a.a.c.a	ENSGT01030000234550.a.a.c.a.a.n	ENSGT00940000158029	ENSGT00390000014595.a.a.a	ENSGT00940000166151	ENSGT00940000159685	ENSGT00940000156919	ENSGT00390000008688.k	ENSGT00940000160337.e	ENSGT00390000001289.b.b	ENSGT00950000182902.b.b.b	ENSGT00940000156628.c	ENSGT01080000257336.b.e.b.a.a.d
Large yellow croaker	MODERN SPECIES	479	psph (ENSLCRG00005007974)	NIPSNAP2 (ENSLCRG00005006623)	ENSLCRG00005006605	limk1a (ENSLCRG00005003491)	ENSLCRG00005002237	MNT (ENSLCRG00005002222)	mettl16 (ENSLCRG00005002216)	pafah1b1a (ENSLCRG00005002209)	cluha (ENSLCRG00005001934)	ENSLCRG00005001898	tlcd2 (ENSLCRG00005001892)	aifm4 (ENSLCRG00005001883)	zgc:153372 (ENSLCRG00005001864)	prpf8 (ENSLCRG00005001801)	ENSLCRG00005001769	SCARF1 (ENSLCRG00005001736) ##22	vtna (ENSLCRG00005001703)	sarm1 (ENSLCRG00005001663)	slc46a1 (ENSLCRG00005001645)	SLC13A2 (ENSLCRG00005001634)	foxn1 (ENSLCRG00005001623)	UNC119 (ENSLCRG00005001613)	crybb1l3 (ENSLCRG00005001606)	cryba1a (ENSLCRG00005001600)	CPD (ENSLCRG00005001100)	gosr1 (ENSLCRG00005001022)	TRARG1 (ENSLCRG00005001010)	AIPL1 (ENSLCRG00005001006)	ENSLCRG00005001003	PDE3A (ENSLCRG00005000796)	slco1c1 (ENSLCRG00005000434)
European seabass	MODERN SPECIES	3	ENSDLAG00005030409	ENSDLAG00005008983	PHKG1 (ENSDLAG00005008951)	psph (ENSDLAG00005033999)	NIPSNAP2 (ENSDLAG00005028461)	limk1a (ENSDLAG00005008052)	ENSDLAG00005007727	ENSDLAG00005007680	mettl16 (ENSDLAG00005007596)	pafah1b1a (ENSDLAG00005033738)	cluha (ENSDLAG00005006919)	aifm4 (ENSDLAG00005006858)	ENSDLAG00005006831	prpf8 (ENSDLAG00005006792)	ENSDLAG00005030069	SCARF1 (ENSDLAG00005006766) ##22	vtna (ENSDLAG00005026341)	sarm1 (ENSDLAG00005006744)	slc46a1 (ENSDLAG00005006729)	ENSDLAG00005006721	foxn1 (ENSDLAG00005006715)	UNC119 (ENSDLAG00005026669)	crybb1l3 (ENSDLAG00005006694)	cryba1a (ENSDLAG00005006684)	ENSDLAG00005006536	gosr1 (ENSDLAG00005006411)	ENSDLAG00005006397	ENSDLAG00005006384	ENSDLAG00005006359	ENSDLAG00005006139	ENSDLAG00005005691
Gilthead seabream	MODERN SPECIES	11	phkg1a (ENSSAUG00010017962)	psph (ENSSAUG00010018049)	NIPSNAP2 (ENSSAUG00010018059)	limk1a (ENSSAUG00010018071)	ENSSAUG00010018322	MNT (ENSSAUG00010018597)	mettl16 (ENSSAUG00010018599)	pafah1b1a (ENSSAUG00010018601)	cluha (ENSSAUG00010018621)	CCDC92B (ENSSAUG00010021469)	tlcd2 (ENSSAUG00010021470)	aifm4 (ENSSAUG00010021471)	zgc:153372 (ENSSAUG00010021475)	prpf8 (ENSSAUG00010021479)	ENSSAUG00010021486	SCARF1 (ENSSAUG00010021490) ##22	vtna (ENSSAUG00010021492)	sarm1 (ENSSAUG00010021497)	slc46a1 (ENSSAUG00010021500)	SLC13A2 (ENSSAUG00010021509)	UNC119 (ENSSAUG00010021555)	crybb1l3 (ENSSAUG00010021557)	cryba1a (ENSSAUG00010021559)	CPD (ENSSAUG00010021569)	gosr1 (ENSSAUG00010021630)	TRARG1 (ENSSAUG00010021689)	AIPL1 (ENSSAUG00010021690)	ENSSAUG00010021692	ENSSAUG00010021693	PDE3A (ENSSAUG00010021694)	slco1c1 (ENSSAUG00010021713)
Percomorphaceae_D	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00390000003115	ENSGT00950000183018.a.d.a	ENSGT00940000168646.a	ENSGT00940000156345.k.a	ENSGT00940000157152.A	ENSGT00510000048287.b	ENSGT00390000016694	ENSGT00940000155039.a.a	ENSGT00390000012485.a.b.a	ENSGT00430000031027.b.a	ENSGT01010000222313.B.b.b	ENSGT00940000164941	ENSGT00390000001742.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00530000063751.b.j	ENSGT00390000004155	ENSGT00950000183096.a.a.c.a	ENSGT01030000234550.a.a.c.a.a.n	ENSGT00940000158029	ENSGT00390000014595.a.a.a	ENSGT00940000166151	ENSGT00940000159685	ENSGT00940000180040	ENSGT00940000156919	ENSGT00390000008688.k	ENSGT00940000160337.e	ENSGT00390000001289.b.b	ENSGT00950000182902.b.b.b	ENSGT00940000156628.c
Anabantaria	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00390000003115	ENSGT00950000183018.a.d.a	ENSGT00940000168646.a	ENSGT00940000156345.k.a	ENSGT00940000157152.A	ENSGT00510000048287.b	ENSGT00390000016694	ENSGT00940000155039.a.a	ENSGT00390000012485.a.b.a	ENSGT00430000031027.b.a	ENSGT01010000222313.B.b.b	ENSGT00940000164941	ENSGT00390000001742.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00530000063751.b.j	ENSGT00390000004155	ENSGT00950000183096.a.a.c.a	ENSGT00940000158029	ENSGT00390000014595.a.a.a	ENSGT00940000166151	ENSGT00940000159685	ENSGT00940000180040	ENSGT00940000156919	ENSGT00390000008688.k	ENSGT00940000160337.e	ENSGT00390000001289.b.b	ENSGT00950000182902.b.b.b	ENSGT00940000156628.c	ENSGT01080000257336.b.e.b.a.a.d
Zig-zag eel	MODERN SPECIES	4	PHKG1 (ENSMAMG00000009430)	psph (ENSMAMG00000009417)	NIPSNAP2 (ENSMAMG00000024589)	limk1a (ENSMAMG00000009334)	ENSMAMG00000009320	ENSMAMG00000009306	mettl16 (ENSMAMG00000009271)	pafah1b1a (ENSMAMG00000009240)	cluha (ENSMAMG00000009172)	ENSMAMG00000024900	tlcd2 (ENSMAMG00000009143)	aifm4 (ENSMAMG00000009081)	ENSMAMG00000009031	prpf8 (ENSMAMG00000008919)	ENSMAMG00000008911	SCARF1 (ENSMAMG00000008880) ##22	vtna (ENSMAMG00000008869)	sarm1 (ENSMAMG00000008841)	slc46a1 (ENSMAMG00000008832)	foxn1 (ENSMAMG00000008823)	ENSMAMG00000008792	crybb1l3 (ENSMAMG00000008765)	cryba1a (ENSMAMG00000008101)	ENSMAMG00000008001	gosr1 (ENSMAMG00000007980)	ENSMAMG00000007976	ENSMAMG00000007946	ENSMAMG00000007934	ENSMAMG00000007910	ENSMAMG00000007850	dus4l (ENSMAMG00000007717)
Carangaria	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000158139	ENSGT00390000003115	ENSGT00950000183018.a.d.a	ENSGT00940000156345.k.a	ENSGT00940000157152.A	ENSGT00510000048287.b	ENSGT00390000016694	ENSGT00940000155039.a.a	ENSGT00390000012485.a.b.a	ENSGT00430000031027.b.a	ENSGT01010000222313.B.b.b	ENSGT00940000164941	ENSGT00390000001742.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00530000063751.b.j	ENSGT00390000004155	ENSGT00950000183096.a.a.c.a	ENSGT01030000234550.a.a.c.a.a.n	ENSGT00940000158029	ENSGT00390000014595.a.a.a	ENSGT00940000166151	ENSGT00940000159685	ENSGT00940000156919	ENSGT00390000008688.k	ENSGT00940000160337.e	ENSGT00390000001289.b.b	ENSGT00950000182902.b.b.b	ENSGT00940000156628.c	ENSGT01080000257336.b.e.b.a.a.d
Carangaria_A	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000158139	ENSGT00390000003115	ENSGT00950000183018.a.d.a	ENSGT00940000156345.k.a	ENSGT00940000157152.A	ENSGT00510000048287.b	ENSGT00390000016694	ENSGT00940000155039.a.a	ENSGT00390000012485.a.b.a	ENSGT00430000031027.b.a	ENSGT01010000222313.B.b.b	ENSGT00940000164941	ENSGT00390000001742.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00530000063751.b.j	ENSGT00390000004155	ENSGT00950000183096.a.a.c.a	ENSGT01030000234550.a.a.c.a.a.n	ENSGT00940000158029	ENSGT00390000014595.a.a.a	ENSGT00940000166151	ENSGT00940000159685	ENSGT00940000156919	ENSGT00390000008688.k	ENSGT00940000160337.e	ENSGT00390000001289.b.b	ENSGT00950000182902.b.b.b	ENSGT00940000156628.c	ENSGT01080000257336.b.e.b.a.a.d
Seriola	ANCESTRAL SPECIES	50														ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00530000063751.b.j	ENSGT00390000004155	ENSGT00950000183096.a.a.c.a	ENSGT01030000234550.a.a.c.a.a.n	ENSGT00940000158029	ENSGT00390000014595.a.a.a	ENSGT00940000166151	ENSGT00940000159685	ENSGT00940000156919	ENSGT00390000008688.k	ENSGT00390000001289.b.b	ENSGT00950000182902.b.b.b	ENSGT00940000156628.c	ENSGT01080000257336.b.e.b.a.a.d	ENSGT00390000011863.d.a.a
Greater amberjack	MODERN SPECIES	54														prpf8 (ENSSDUG00000003029)	ENSSDUG00000003002	SCARF1 (ENSSDUG00000002964) ##22	vtna (ENSSDUG00000002935)	sarm1 (ENSSDUG00000002910)	slc46a1 (ENSSDUG00000002897)	SLC13A2 (ENSSDUG00000002876)	foxn1 (ENSSDUG00000002860)	UNC119 (ENSSDUG00000002840)	crybb1l3 (ENSSDUG00000002706)	cryba1a (ENSSDUG00000002674)	CPD (ENSSDUG00000002643)	gosr1 (ENSSDUG00000002617)	AIPL1 (ENSSDUG00000002585)	ENSSDUG00000002574	PDE3A (ENSSDUG00000002551)	slco1c1 (ENSSDUG00000002438)	dus4l (ENSSDUG00000002389)
Yellowtail amberjack	MODERN SPECIES	3061	ENSSLDG00000017498	gnmt (ENSSLDG00000017480)	ENSSLDG00000017470	SYT14 (ENSSLDG00000017452)	sdsl (ENSSLDG00000017434)	ppp1r13ba (ENSSLDG00000017348)	ptp4a2a (ENSSLDG00000017310)	gjb9a (ENSSLDG00000017296)	marcksl1a (ENSSLDG00000017284)	bsdc1 (ENSSLDG00000017231)	olig4 (ENSSLDG00000017211)	FNDC5 (ENSSLDG00000017194)	ENSSLDG00000017177	prpf8 (ENSSLDG00000017096)	ENSSLDG00000017067	SCARF1 (ENSSLDG00000017040) ##22	vtna (ENSSLDG00000017013)	sarm1 (ENSSLDG00000016978)	slc46a1 (ENSSLDG00000016953)	SLC13A2 (ENSSLDG00000016915)	foxn1 (ENSSLDG00000016894)	UNC119 (ENSSLDG00000016875)	crybb1l3 (ENSSLDG00000016850)	cryba1a (ENSSLDG00000016828)	CPD (ENSSLDG00000016747)	gosr1 (ENSSLDG00000016702)	AIPL1 (ENSSLDG00000016676)	ENSSLDG00000016635	ENSSLDG00000016622
Barramundi perch	MODERN SPECIES	392					MNT (ENSLCAG00010011532)	mettl16 (ENSLCAG00010011535)	pafah1b1a (ENSLCAG00010011542)	cluha (ENSLCAG00010011738)	CCDC92B (ENSLCAG00010012239)	tlcd2 (ENSLCAG00010012244)	aifm4 (ENSLCAG00010012251)	zgc:153372 (ENSLCAG00010012257)	ENSLCAG00010012264	prpf8 (ENSLCAG00010012282)	ENSLCAG00010012300	SCARF1 (ENSLCAG00010012313) ##22	vtna (ENSLCAG00010012322)	sarm1 (ENSLCAG00010012330)	slc46a1 (ENSLCAG00010012339)	SLC13A2 (ENSLCAG00010012345)	foxn1 (ENSLCAG00010012363)	UNC119 (ENSLCAG00010012377)	crybb1l3 (ENSLCAG00010012385)	cryba1a (ENSLCAG00010012391)	CPD (ENSLCAG00010012420)	gosr1 (ENSLCAG00010012520)	TRARG1 (ENSLCAG00010012542)	AIPL1 (ENSLCAG00010012556)
Pleuronectoidei	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000158139	ENSGT00390000003115	ENSGT00950000183018.a.d.a	ENSGT00940000156345.k.a	ENSGT00940000157152.A	ENSGT00510000048287.b	ENSGT00390000016694	ENSGT00940000155039.a.a	ENSGT00390000012485.a.b.a	ENSGT00430000031027.b.a	ENSGT01010000222313.B.b.b	ENSGT00940000164941	ENSGT00390000001742.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00530000063751.b.j	ENSGT00390000004155	ENSGT00950000183096.a.a.c.a	ENSGT01030000234550.a.a.c.a.a.n	ENSGT00940000158029	ENSGT00390000014595.a.a.a	ENSGT00940000166151	ENSGT00940000159685	ENSGT00940000156919	ENSGT00390000008688.k	ENSGT00940000160337.e	ENSGT00390000001289.b.b	ENSGT00950000182902.b.b.b	ENSGT00940000156628.c	ENSGT01080000257336.b.e.b.a.a.d
Tongue sole	MODERN SPECIES	14	PTGIR (ENSCSEG00000008173)	calm3a (ENSCSEG00000008164)	ENSCSEG00000008160	gemin7 (ENSCSEG00000008152)	bmp16 (ENSCSEG00000008137)	ENSCSEG00000008130	ppp1r37 (ENSCSEG00000008118)	ENSCSEG00000008107	mrpl28 (ENSCSEG00000008095)	ENSCSEG00000008061	clptm1 (ENSCSEG00000008044)	tbcb (ENSCSEG00000008024)	six5 (ENSCSEG00000008012)	prpf8 (ENSCSEG00000007905)	ENSCSEG00000007880	SCARF1 (ENSCSEG00000007859) ##22	vtna (ENSCSEG00000007841)	sarm1 (ENSCSEG00000007819)	slc46a1 (ENSCSEG00000007800)	SLC13A2 (ENSCSEG00000007787)	foxn1 (ENSCSEG00000007772)	crybb1l3 (ENSCSEG00000007768)	UNC119 (ENSCSEG00000007728)	CPD (ENSCSEG00000007685)	gosr1 (ENSCSEG00000007664)	ENSCSEG00000007656	AIPL1 (ENSCSEG00000007616)	ROBO1 (ENSCSEG00000007416)	APBB1 (ENSCSEG00000007371)	ilk (ENSCSEG00000007356)	ENSCSEG00000007330
Turbot	MODERN SPECIES	15	PHKG1 (ENSSMAG00000016659)	psph (ENSSMAG00000016706)	ENSSMAG00000016728	limk1a (ENSSMAG00000016758)	ENSSMAG00000016821	ENSSMAG00000022140	mettl16 (ENSSMAG00000017298)	pafah1b1a (ENSSMAG00000017470)	cluha (ENSSMAG00000017515)	ENSSMAG00000030675	tlcd2 (ENSSMAG00000017609)	aifm4 (ENSSMAG00000017617)	ENSSMAG00000017695	prpf8 (ENSSMAG00000017736)	ENSSMAG00000017985	SCARF1 (ENSSMAG00000018021) ##22	vtna (ENSSMAG00000018056)	sarm1 (ENSSMAG00000018070)	slc46a1 (ENSSMAG00000018103)	SLC13A2 (ENSSMAG00000018114)	ENSSMAG00000018147	ENSSMAG00000034741	crybb1l3 (ENSSMAG00000018206)	cryba1a (ENSSMAG00000018250)	ENSSMAG00000018272	gosr1 (ENSSMAG00000018353)	ENSSMAG00000032010	ENSSMAG00000018380	ENSSMAG00000018390	ENSSMAG00000018400	ENSSMAG00000018486
Ovalentaria	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000158139	ENSGT00390000003115	ENSGT00950000183018.a.d.a	ENSGT00940000156345.k.a	ENSGT00940000157152.A	ENSGT00510000048287.b	ENSGT00390000016694	ENSGT00940000155039.a.a	ENSGT00390000012485.a.b.a	ENSGT00430000031027.b.a	ENSGT01010000222313.B.b.b	ENSGT00940000164941	ENSGT00390000001742.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00530000063751.b.j	ENSGT00390000004155	ENSGT00950000183096.a.a.c.a	ENSGT01030000234550.a.a.c.a.a.n	ENSGT00940000158029	ENSGT00390000014595.a.a.a	ENSGT00940000166151	ENSGT00940000159685	ENSGT00940000180040	ENSGT00940000156919	ENSGT00390000008688.k	ENSGT00940000160337.e	ENSGT00390000001289.b.b	ENSGT01030000236779	ENSGT00950000182902.b.b.b
Atherinomorphae	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000158139	ENSGT00390000003115	ENSGT00950000183018.a.d.a	ENSGT00940000156345.k.a	ENSGT00940000157152.A	ENSGT00510000048287.b	ENSGT00390000016694	ENSGT00940000155039.a.a	ENSGT00390000012485.a.b.a	ENSGT00430000031027.b.a	ENSGT01010000222313.B.b.b	ENSGT00940000164941	ENSGT00390000001742.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00530000063751.b.j	ENSGT00390000004155	ENSGT00950000183096.a.a.c.a	ENSGT00940000158029	ENSGT00390000014595.a.a.a	ENSGT00940000166151	ENSGT00940000159685	ENSGT00940000156919	ENSGT00390000008688.k	ENSGT00940000160337.e	ENSGT00390000001289.b.b	ENSGT01030000236779	ENSGT00950000182902.b.b.b	ENSGT01030000234874.a	ENSGT00940000156628.c
Cyprinodontiformes	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000158139	ENSGT00390000003115	ENSGT00950000183018.a.d.a	ENSGT00940000156345.k.a	ENSGT00940000157152.A	ENSGT00510000048287.b	ENSGT00390000016694	ENSGT00940000155039.a.a	ENSGT00390000012485.a.b.a	ENSGT00430000031027.b.a	ENSGT01010000222313.B.b.b	ENSGT00940000164941	ENSGT00390000001742.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00530000063751.b.j	ENSGT00390000004155	ENSGT00950000183096.a.a.c.a	ENSGT00940000158029	ENSGT00390000014595.a.a.a	ENSGT00940000166151	ENSGT00940000159685	ENSGT00940000156919	ENSGT00390000008688.k	ENSGT00940000160337.e	ENSGT00390000001289.b.b	ENSGT01030000236779	ENSGT00950000182902.b.b.b	ENSGT01030000234874.a	ENSGT00940000156628.c
Cyprinodontoidei	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000158139	ENSGT00390000003115	ENSGT00950000183018.a.d.a	ENSGT00940000156345.k.a	ENSGT00940000157152.A	ENSGT00510000048287.b	ENSGT00390000016694	ENSGT00940000155039.a.a	ENSGT00390000012485.a.b.a	ENSGT00430000031027.b.a	ENSGT01010000222313.B.b.b	ENSGT00940000164941	ENSGT00390000001742.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00530000063751.b.j	ENSGT00390000004155	ENSGT00950000183096.a.a.c.a	ENSGT00940000158029	ENSGT00390000014595.a.a.a	ENSGT00940000166151	ENSGT00940000159685	ENSGT00940000156919	ENSGT00390000008688.k	ENSGT00940000160337.e	ENSGT00390000001289.b.b	ENSGT01030000236779	ENSGT00950000182902.b.b.b	ENSGT01030000234874.a	ENSGT00940000156628.c
Poeciliinae	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000158139	ENSGT00390000003115	ENSGT00950000183018.a.d.a	ENSGT00940000156345.k.a	ENSGT00940000157152.A	ENSGT00510000048287.b	ENSGT00390000016694	ENSGT00940000155039.a.a	ENSGT00390000012485.a.b.a	ENSGT00430000031027.b.a	ENSGT01010000222313.B.b.b	ENSGT00940000164941	ENSGT00390000001742.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00530000063751.b.j	ENSGT00390000004155	ENSGT00950000183096.a.a.c.a	ENSGT00940000158029	ENSGT00390000014595.a.a.a	ENSGT00940000166151	ENSGT00940000159685	ENSGT00940000156919	ENSGT00390000008688.k	ENSGT00940000160337.e	ENSGT00390000001289.b.b	ENSGT01030000236779	ENSGT00950000182902.b.b.b	ENSGT01030000234874.a	ENSGT00940000156628.c
Poecilia	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000003115	ENSGT00950000183018.a.d.a	ENSGT00940000156345.k.a	ENSGT00940000157152.A	ENSGT00510000048287.b	ENSGT00390000016694	ENSGT00940000155039.a.a	ENSGT00390000012485.a.b.a	ENSGT00430000031027.b.a	ENSGT01010000222313.B.b.b	ENSGT00940000164941	ENSGT00510000049866.h	ENSGT00390000001742.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00530000063751.b.j	ENSGT00390000004155	ENSGT00950000183096.a.a.c.a	ENSGT00940000158029	ENSGT00390000014595.a.a.a	ENSGT00940000166151	ENSGT00940000159685	ENSGT00940000156919	ENSGT00390000008688.k	ENSGT00940000160337.e	ENSGT00390000001289.b.b	ENSGT01030000236779	ENSGT00950000182902.b.b.b	ENSGT01030000234874.a	ENSGT00940000156628.c
NAME_6	ANCESTRAL SPECIES	81	ENSGT00390000003115	ENSGT00950000183018.a.d.a	ENSGT00940000156345.k.a	ENSGT00940000157152.A	ENSGT00510000048287.b	ENSGT00390000016694	ENSGT00940000155039.a.a	ENSGT00390000012485.a.b.a	ENSGT00430000031027.b.a	ENSGT01010000222313.B.b.b	ENSGT00940000164941	ENSGT00510000049866.h	ENSGT00390000001742.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00530000063751.b.j	ENSGT00390000004155	ENSGT00950000183096.a.a.c.a	ENSGT00940000158029	ENSGT00390000014595.a.a.a	ENSGT00940000166151	ENSGT00940000159685	ENSGT00940000156919	ENSGT00390000008688.k	ENSGT00940000160337.e	ENSGT00390000001289.b.b	ENSGT01030000236779	ENSGT00950000182902.b.b.b	ENSGT01030000234874.a	ENSGT00940000156628.c
Sailfin molly	MODERN SPECIES	269										ccr12a (ENSPLAG00000020610)	aifm4 (ENSPLAG00000020614)	ENSPLAG00000020625	zgc:153372 (ENSPLAG00000020657)	prpf8 (ENSPLAG00000020777)	ENSPLAG00000020795	SCARF1 (ENSPLAG00000020828) ##22	vtna (ENSPLAG00000020923)	sarm1 (ENSPLAG00000020959)	slc46a1 (ENSPLAG00000020982)	foxn1 (ENSPLAG00000021015)	UNC119 (ENSPLAG00000021034)	crybb1l3 (ENSPLAG00000021093)	cryba1a (ENSPLAG00000000773)	CPD (ENSPLAG00000021199)	gosr1 (ENSPLAG00000021250)	TRARG1 (ENSPLAG00000021263)	AIPL1 (ENSPLAG00000021280)	ENSPLAG00000021298	ENSPLAG00000021305	ENSPLAG00000021315	PDE3A (ENSPLAG00000021334)
Amazon molly	MODERN SPECIES	394										tlcd2 (ENSPFOG00000008095)	aifm4 (ENSPFOG00000007756)	ENSPFOG00000020663	zgc:153372 (ENSPFOG00000007565)	prpf8 (ENSPFOG00000007005)	ENSPFOG00000006961	SCARF1 (ENSPFOG00000006889) ##22	vtna (ENSPFOG00000006827)	sarm1 (ENSPFOG00000006701)	slc46a1 (ENSPFOG00000006630)	foxn1 (ENSPFOG00000006570)	UNC119 (ENSPFOG00000006506)	crybb1l3 (ENSPFOG00000006393)	cryba1a (ENSPFOG00000006152)	CPD (ENSPFOG00000005520)	gosr1 (ENSPFOG00000005359)	AIPL1 (ENSPFOG00000005326)	TRARG1 (ENSPFOG00000024117)	TRARG1 (ENSPFOG00000005313)	AIPL1 (ENSPFOG00000005182)	ENSPFOG00000005153	PDE3A (ENSPFOG00000004854)
Guppy	MODERN SPECIES	443	psph (ENSPREG00000022101)	NIPSNAP2 (ENSPREG00000022090)	limk1a (ENSPREG00000022063)	ENSPREG00000022047	MNT (ENSPREG00000022037)	mettl16 (ENSPREG00000022027)	pafah1b1a (ENSPREG00000022018)	cluha (ENSPREG00000022002)	CCDC92B (ENSPREG00000021992)	tlcd2 (ENSPREG00000021985)	aifm4 (ENSPREG00000021971)	ENSPREG00000021960	zgc:153372 (ENSPREG00000021951)	prpf8 (ENSPREG00000021902)	ENSPREG00000021870	SCARF1 (ENSPREG00000021847) ##22	vtna (ENSPREG00000021833)	sarm1 (ENSPREG00000021811)	slc46a1 (ENSPREG00000021788)	foxn1 (ENSPREG00000021778)	ENSPREG00000021770	UNC119 (ENSPREG00000021759)	crybb1l3 (ENSPREG00000021743)	cryba1a (ENSPREG00000021649)	CPD (ENSPREG00000021593)	gosr1 (ENSPREG00000021556)	TRARG1 (ENSPREG00000021541)	AIPL1 (ENSPREG00000021534)	ENSPREG00000021527	ENSPREG00000021520	PDE3A (ENSPREG00000021508)
Platyfish	MODERN SPECIES	9	phkg1a (ENSXMAG00000024057)	psph (ENSXMAG00000008711)	NIPSNAP2 (ENSXMAG00000008697)	limk1a (ENSXMAG00000008665)	ENSXMAG00000008630	MNT (ENSXMAG00000027838)	mettl16 (ENSXMAG00000008615)	pafah1b1a (ENSXMAG00000008604)	cluha (ENSXMAG00000008591)	CCDC92B (ENSXMAG00000026452)	tlcd2 (ENSXMAG00000008589)	aifm4 (ENSXMAG00000008576)	zgc:153372 (ENSXMAG00000008552)	prpf8 (ENSXMAG00000008505)	ENSXMAG00000028771	SCARF1 (ENSXMAG00000008501) ##22	vtna (ENSXMAG00000027290)	sarm1 (ENSXMAG00000008493)	slc46a1 (ENSXMAG00000008489)	ENSXMAG00000025388	ENSXMAG00000021683	foxn1 (ENSXMAG00000011786)	UNC119 (ENSXMAG00000007806)	crybb1l3 (ENSXMAG00000011760)	cryba1a (ENSXMAG00000011723)	CPD (ENSXMAG00000007942)	gosr1 (ENSXMAG00000028913)	TRARG1 (ENSXMAG00000008483)	AIPL1 (ENSXMAG00000008474)	ENSXMAG00000028656	ENSXMAG00000008472
NAME_4	ANCESTRAL SPECIES	152				ENSGT00940000156345.k.a	ENSGT00940000157152.A	ENSGT00510000048287.b	ENSGT00390000016694	ENSGT00940000155039.a.a	ENSGT00390000012485.a.b.a	ENSGT00430000031027.b.a	ENSGT01010000222313.B.b.b	ENSGT00940000164941	ENSGT00390000001742.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00530000063751.b.j	ENSGT00390000004155	ENSGT00950000183096.a.a.c.a	ENSGT00940000158029	ENSGT00390000014595.a.a.a	ENSGT00940000166151	ENSGT00940000159685	ENSGT00940000156919	ENSGT00390000008688.k	ENSGT00940000160337.e	ENSGT00390000001289.b.b	ENSGT00950000182902.b.b.b	ENSGT00940000156628.c	ENSGT01080000257336.b.e.b.a.a.d	ENSGT00390000011863.d.a.a
Sheepshead minnow	MODERN SPECIES	631											aifm4 (ENSCVAG00000009960)	zgc:153372 (ENSCVAG00000009973)	ENSCVAG00000009991	ENSCVAG00000010015	ENSCVAG00000010026	SCARF1 (ENSCVAG00000010109) ##22	vtna (ENSCVAG00000010122)	sarm1 (ENSCVAG00000010140)	slc46a1 (ENSCVAG00000010150)	foxn1 (ENSCVAG00000010161)	UNC119 (ENSCVAG00000010176)	crybb1l3 (ENSCVAG00000010190)	cryba1a (ENSCVAG00000010203)	CPD (ENSCVAG00000010278)	gosr1 (ENSCVAG00000010298)	TRARG1 (ENSCVAG00000010302)	AIPL1 (ENSCVAG00000010321)	ENSCVAG00000010327	PDE3A (ENSCVAG00000010349)	slco1c1 (ENSCVAG00000010457)	bcap29 (ENSCVAG00000010463)
Mummichog	MODERN SPECIES	2384				limk1a (ENSFHEG00000000534)	ENSFHEG00000021468	ENSFHEG00000021445	MNT (ENSFHEG00000021399)	pafah1b1a (ENSFHEG00000021359)	cluha (ENSFHEG00000021289)	CCDC92B (ENSFHEG00000021136)	tlcd2 (ENSFHEG00000021124)	aifm4 (ENSFHEG00000021115)	zgc:153372 (ENSFHEG00000021094)	prpf8 (ENSFHEG00000021084)	ENSFHEG00000020945	SCARF1 (ENSFHEG00000020936) ##22	vtna (ENSFHEG00000020838)	sarm1 (ENSFHEG00000020832)	ENSFHEG00000020807	foxn1 (ENSFHEG00000000518)	UNC119 (ENSFHEG00000020768)	crybb1l3 (ENSFHEG00000020752)	cryba1a (ENSFHEG00000020726)	CPD (ENSFHEG00000020699)	gosr1 (ENSFHEG00000000515)	TRARG1 (ENSFHEG00000020528)	AIPL1 (ENSFHEG00000020519)	ENSFHEG00000020503	ENSFHEG00000020497	slco1c1 (ENSFHEG00000020439)	bcap29 (ENSFHEG00000020132)
Aplocheiloidei	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000158139	ENSGT00390000003115	ENSGT00950000183018.a.d.a	ENSGT00940000156345.k.a	ENSGT00940000157152.A	ENSGT00510000048287.b	ENSGT00390000016694	ENSGT00940000155039.a.a	ENSGT00390000012485.a.b.a	ENSGT00430000031027.b.a	ENSGT01010000222313.B.b.b	ENSGT00940000164941	ENSGT00390000001742.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00530000063751.b.j	ENSGT00390000004155	ENSGT00950000183096.a.a.c.a	ENSGT00940000158029	ENSGT00390000014595.a.a.a	ENSGT00940000166151	ENSGT00940000159685	ENSGT00940000156919	ENSGT00390000008688.k	ENSGT00940000160337.e	ENSGT00390000001289.b.b	ENSGT00950000182902.b.b.b	ENSGT00940000156628.c	ENSGT01080000257336.b.e.b.a.a.d	ENSGT00390000011863.d.a.a
Mangrove rivulus	MODERN SPECIES	194	psph (ENSKMAG00000015608)	NIPSNAP2 (ENSKMAG00000015635)	limk1a (ENSKMAG00000015679)	ENSKMAG00000015750	MNT (ENSKMAG00000015785)	mettl16 (ENSKMAG00000015799)	ENSKMAG00000015838	pafah1b1a (ENSKMAG00000015884)	cluha (ENSKMAG00000015944)	CCDC92B (ENSKMAG00000016005)	tlcd2 (ENSKMAG00000016016)	aifm4 (ENSKMAG00000016032)	zgc:153372 (ENSKMAG00000016069)	prpf8 (ENSKMAG00000016118)	ENSKMAG00000016188	SCARF1 (ENSKMAG00000016212) ##22	vtna (ENSKMAG00000016233)	sarm1 (ENSKMAG00000016255)	slc46a1 (ENSKMAG00000016281)	foxn1 (ENSKMAG00000016294)	UNC119 (ENSKMAG00000016309)	crybb1l3 (ENSKMAG00000016319)	cryba1a (ENSKMAG00000016338)	CPD (ENSKMAG00000016363)	gosr1 (ENSKMAG00000016435)	AIPL1 (ENSKMAG00000016470)	ENSKMAG00000016501
Oryzias	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000158139	ENSGT00390000003115	ENSGT00950000183018.a.d.a	ENSGT00940000156345.k.a	ENSGT00940000157152.A	ENSGT00510000048287.b	ENSGT00390000016694	ENSGT00940000155039.a.a	ENSGT00390000012485.a.b.a	ENSGT00430000031027.b.a	ENSGT01010000222313.B.b.b	ENSGT00940000164941	ENSGT00390000001742.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00530000063751.b.j	ENSGT00390000004155.h	ENSGT00950000183096.a.a.c.a	ENSGT00940000158029	ENSGT00390000014595.a.a.a	ENSGT00940000166151	ENSGT00940000159685	ENSGT00940000156919	ENSGT00390000008688.k	ENSGT00940000160337.e	ENSGT00390000001289.b.b	ENSGT00950000182902.b.b.b	ENSGT00940000156628.c	ENSGT01080000257336.b.e.b.a.a.d	ENSGT00390000011863.d.a.a
Oryzias_b	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000158139	ENSGT00390000003115	ENSGT00950000183018.a.d.a	ENSGT00940000156345.k.a	ENSGT00940000157152.A	ENSGT00510000048287.b	ENSGT00390000016694	ENSGT00940000155039.a.a	ENSGT00390000012485.a.b.a	ENSGT00430000031027.b.a	ENSGT01010000222313.B.b.b	ENSGT00940000164941	ENSGT00390000001742.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00530000063751.b.j	ENSGT00390000004155.h	ENSGT00950000183096.a.a.c.a	ENSGT00940000158029	ENSGT00390000014595.a.a.a	ENSGT00940000166151	ENSGT00940000159685	ENSGT00940000156919	ENSGT00390000008688.k	ENSGT00940000160337.e	ENSGT00390000001289.b.b	ENSGT00950000182902.b.b.b	ENSGT00940000156628.c	ENSGT01080000257336.b.e.b.a.a.d	ENSGT00390000011863.d.a.a
Indian medaka	MODERN SPECIES	12	phkg1a (ENSOMEG00000016234)	psph (ENSOMEG00000016258)	NIPSNAP2 (ENSOMEG00000016291)	limk1a (ENSOMEG00000016382)	ENSOMEG00000016432	MNT (ENSOMEG00000016455)	mettl16 (ENSOMEG00000016534)	pafah1b1a (ENSOMEG00000016590)	cluha (ENSOMEG00000016673)	CCDC92B (ENSOMEG00000016692)	tlcd2 (ENSOMEG00000016708)	aifm4 (ENSOMEG00000016758)	zgc:153372 (ENSOMEG00000016783)	prpf8 (ENSOMEG00000016866)	ENSOMEG00000016912	SCARF1 (ENSOMEG00000016982) ##22	vtna (ENSOMEG00000017015)	sarm1 (ENSOMEG00000017036)	slc46a1 (ENSOMEG00000017051)	foxn1 (ENSOMEG00000017082)	UNC119 (ENSOMEG00000017116)	crybb1l3 (ENSOMEG00000017144)	cryba1a (ENSOMEG00000017164)	CPD (ENSOMEG00000017222)	gosr1 (ENSOMEG00000017292)	TRARG1 (ENSOMEG00000017318)	AIPL1 (ENSOMEG00000017359)	ENSOMEG00000017382	PDE3A (ENSOMEG00000017450)	slco1c1 (ENSOMEG00000017506)	bcap29 (ENSOMEG00000017538)
Javanese ricefish	MODERN SPECIES	4	phkg1a (ENSOJAG00000011950)	psph (ENSOJAG00000011902)	NIPSNAP2 (ENSOJAG00000011892)	limk1a (ENSOJAG00000009976)	ENSOJAG00000009142	MNT (ENSOJAG00000009068)	mettl16 (ENSOJAG00000009020)	pafah1b1a (ENSOJAG00000008962)	cluha (ENSOJAG00000006703)	CCDC92B (ENSOJAG00000006482)	tlcd2 (ENSOJAG00000006459)	aifm4 (ENSOJAG00000006427)	ENSOJAG00000006160	zgc:153372 (ENSOJAG00000006114)	ENSOJAG00000006045	SCARF1 (ENSOJAG00000005928) ##22	vtna (ENSOJAG00000005903)	sarm1 (ENSOJAG00000005745)	slc46a1 (ENSOJAG00000005718)	foxn1 (ENSOJAG00000005705)	UNC119 (ENSOJAG00000005676)	crybb1l3 (ENSOJAG00000005650)	cryba1a (ENSOJAG00000005626)	CPD (ENSOJAG00000005419)	gosr1 (ENSOJAG00000005166)	TRARG1 (ENSOJAG00000005140)	AIPL1 (ENSOJAG00000005136)	ENSOJAG00000005123	PDE3A (ENSOJAG00000005114)	slco1c1 (ENSOJAG00000003814)	bcap29 (ENSOJAG00000003460)
Oryzias_a	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000158139	ENSGT00390000003115	ENSGT00950000183018.a.d.a	ENSGT00940000156345.k.a	ENSGT00940000157152.A	ENSGT00510000048287.b	ENSGT00390000016694	ENSGT00940000155039.a.a	ENSGT00390000012485.a.b.a	ENSGT00430000031027.b.a	ENSGT01010000222313.B.b.b	ENSGT00940000164941	ENSGT00390000001742.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00530000063751.b.j	ENSGT00390000004155.h.a	ENSGT00950000183096.a.a.c.a	ENSGT01000000221902	ENSGT00940000158029	ENSGT00390000014595.a.a.a	ENSGT00940000166151	ENSGT00940000159685	ENSGT00940000156919	ENSGT00390000008688.k	ENSGT00940000160337.e	ENSGT00390000001289.b.b	ENSGT00950000182902.b.b.b	ENSGT00940000156628.c	ENSGT01080000257336.b.e.b.a.a.d
Chinese medaka	MODERN SPECIES	925	chchd2 (ENSOSIG00000017330)	phkg1a (ENSOSIG00000017320)	psph (ENSOSIG00000017313)	NIPSNAP2 (ENSOSIG00000016496)	limk1a (ENSOSIG00000015237)	ENSOSIG00000015114	MNT (ENSOSIG00000015107)	mettl16 (ENSOSIG00000014787)	pafah1b1a (ENSOSIG00000014780)	cluha (ENSOSIG00000014762)	CCDC92B (ENSOSIG00000014761)	tlcd2 (ENSOSIG00000014759)	aifm4 (ENSOSIG00000014756)	prpf8 (ENSOSIG00000014420)	ENSOSIG00000014416	SCARF1 (ENSOSIG00000014415) ##22	vtna (ENSOSIG00000014367)	foxn1 (ENSOSIG00000014362)	UNC119 (ENSOSIG00000014361)	crybb1l3 (ENSOSIG00000014360)	cryba1a (ENSOSIG00000014358)	CPD (ENSOSIG00000014317)	gosr1 (ENSOSIG00000014315)	TRARG1 (ENSOSIG00000014314)	ENSOSIG00000014313	AIPL1 (ENSOSIG00000014311)	ENSOSIG00000014310	PDE3A (ENSOSIG00000014309)	slco1c1 (ENSOSIG00000013952)	bcap29 (ENSOSIG00000013933)	dus4l (ENSOSIG00000013920)
Japanese Medaka HdrR	MODERN SPECIES	4	NIPSNAP2 (ENSORLG00000007821)	ENSORLG00000022615	ENSORLG00000027945	limk1a (ENSORLG00000007848)	ENSORLG00000007856	MNT (ENSORLG00000007865)	mettl16 (ENSORLG00000007892)	PAFAH1B1 (ENSORLG00000007910)	cluha (ENSORLG00000007948)	ENSORLG00000023112	tlcd2 (ENSORLG00000007956)	aifm4 (ENSORLG00000007999)	zgc:153372 (ENSORLG00000008013)	prpf8 (ENSORLG00000008036)	ENSORLG00000008043	SCARF1 (ENSORLG00000008065) ##22	vtna (ENSORLG00000008088)	sarm1 (ENSORLG00000008096)	slc46a1 (ENSORLG00000008111)	ENSORLG00000030553	foxn1 (ENSORLG00000008113)	UNC119 (ENSORLG00000008116)	crybb1l3 (ENSORLG00000008129)	cryba1a (ENSORLG00000008154)	CPD (ENSORLG00000008170)	gosr1 (ENSORLG00000008200)	TRARG1 (ENSORLG00000027719)	AIPL1 (ENSORLG00000008230)	ENSORLG00000030040	ENSORLG00000008246	slco1c1 (ENSORLG00000008279)
Ovalentaria_B	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000158139	ENSGT00390000003115	ENSGT00950000183018.a.d.a	ENSGT00940000156345.k.a	ENSGT00940000157152.A	ENSGT00510000048287.b	ENSGT00390000016694	ENSGT00940000155039.a.a	ENSGT00390000012485.a.b.a	ENSGT00430000031027.b.a	ENSGT01010000222313.B.b.b	ENSGT00940000164941	ENSGT00390000001742.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00530000063751.b.j	ENSGT00390000004155	ENSGT00950000183096.a.a.c.a	ENSGT01030000234550.a.a.c.a.a.n	ENSGT00940000158029	ENSGT00390000014595.a.a.a	ENSGT00940000166151	ENSGT00940000159685	ENSGT00940000180040	ENSGT00940000156919	ENSGT00390000008688.k	ENSGT00940000160337.e	ENSGT00390000001289.b.b	ENSGT00950000182902.b.b.b	ENSGT00940000156628.c
Cichlidae	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00940000158139	ENSGT00390000003115	ENSGT00950000183018.a.d.a	ENSGT00940000156345.k.a	ENSGT00940000157152.A	ENSGT00510000048287.b	ENSGT00390000016694	ENSGT00940000155039.a.a	ENSGT00390000012485.a.b.a	ENSGT00430000031027.b.a	ENSGT01010000222313.B.b.b	ENSGT00940000164941.i	ENSGT00390000001742.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00530000063751.b.j	ENSGT00390000004155	ENSGT00950000183096.a.a.c.a	ENSGT00940000158029	ENSGT00390000014595.a.a.a	ENSGT00940000166151	ENSGT00940000159685	ENSGT00940000180040	ENSGT00940000156919	ENSGT00390000008688.k	ENSGT00940000160337.e	ENSGT00390000001289.b.b	ENSGT00950000182902.b.b.b	ENSGT00940000156628.c	ENSGT01080000257336.b.e.b.a.a.d
Pseudocrenilabrinae	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000158139	ENSGT00390000003115	ENSGT00950000183018.a.d.a	ENSGT00940000156345.k.a	ENSGT00940000157152.A	ENSGT00510000048287.b	ENSGT00390000016694	ENSGT00940000155039.a.a	ENSGT00390000012485.a.b.a	ENSGT00430000031027.b.a	ENSGT01010000222313.B.b.b	ENSGT00940000164941.i	ENSGT00390000001742.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00530000063751.b.j	ENSGT00390000004155	ENSGT00950000183096.a.a.c.a	ENSGT00940000158029	ENSGT00390000014595.a.a.a	ENSGT00940000166151	ENSGT00940000159685	ENSGT00940000180040	ENSGT00940000156919	ENSGT00390000008688.k	ENSGT00940000160337.e	ENSGT00390000001289.b.b	ENSGT00950000182902.b.b.b	ENSGT00940000156628.c	ENSGT01080000257336.b.e.b.a.a.d
Pseudocrenilabrinae_A	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000158139	ENSGT00390000003115	ENSGT00950000183018.a.d.a	ENSGT00940000156345.k.a	ENSGT00940000157152.A	ENSGT00510000048287.b	ENSGT00390000016694	ENSGT00940000155039.a.a	ENSGT00390000012485.a.b.a	ENSGT00430000031027.b.a	ENSGT01010000222313.B.b.b	ENSGT00940000164941.i	ENSGT00390000001742.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00530000063751.b.j	ENSGT00390000004155	ENSGT00950000183096.a.a.c.a	ENSGT00940000158029	ENSGT00390000014595.a.a.a	ENSGT00940000166151	ENSGT00940000159685	ENSGT00940000156919	ENSGT00390000008688.k	ENSGT00940000160337.e	ENSGT00390000001289.b.b	ENSGT00950000182902.b.b.b	ENSGT00940000156628.c	ENSGT01080000257336.b.e.b.a.a.d	ENSGT00390000011863.d.a.a
Haplochromini	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000158139	ENSGT00390000003115	ENSGT00950000183018.a.d.a	ENSGT00940000156345.k.a	ENSGT00940000157152.A	ENSGT00510000048287.b	ENSGT00390000016694	ENSGT00940000155039.a.a	ENSGT00390000012485.a.b.a	ENSGT00430000031027.b.a	ENSGT01010000222313.B.b.b	ENSGT00940000164941.i	ENSGT00390000001742.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00530000063751.b.j	ENSGT00390000004155	ENSGT00950000183096.a.a.c.a	ENSGT00940000158029	ENSGT00390000014595.a.a.a	ENSGT00940000166151	ENSGT00940000159685	ENSGT00940000156919.h	ENSGT00390000008688.k	ENSGT00940000160337.e	ENSGT00390000001289.b.b	ENSGT00950000182902.b.b.b	ENSGT00940000156628.c	ENSGT01080000257336.b.e.b.a.a.d	ENSGT00390000011863.d.a.a
Haplochromini_A	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000158139	ENSGT00390000003115	ENSGT00950000183018.a.d.a	ENSGT00940000156345.k.a	ENSGT00940000157152.A	ENSGT00510000048287.b	ENSGT00390000016694	ENSGT00940000155039.a.a	ENSGT00390000012485.a.b.a	ENSGT00430000031027.b.a	ENSGT01010000222313.B.b.b	ENSGT00940000164941.i	ENSGT00390000001742.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00530000063751.b.j	ENSGT00390000004155	ENSGT00950000183096.a.a.c.a	ENSGT00940000158029	ENSGT00390000014595.a.a.a	ENSGT00940000166151	ENSGT00940000159685	ENSGT00940000156919.h	ENSGT00390000008688.k	ENSGT00940000160337.e	ENSGT00390000001289.b.b	ENSGT00950000182902.b.b.b	ENSGT00940000156628.c	ENSGT01080000257336.b.e.b.a.a.d	ENSGT00390000011863.d.a.a
Haplochromini_B	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000158139	ENSGT00390000003115	ENSGT00950000183018.a.d.a	ENSGT00940000156345.k.a	ENSGT00940000157152.A	ENSGT00510000048287.b	ENSGT00390000016694	ENSGT00940000155039.a.a	ENSGT00390000012485.a.b.a	ENSGT00430000031027.b.a	ENSGT01010000222313.B.b.b	ENSGT00940000164941.i	ENSGT00390000001742.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00530000063751.b.j	ENSGT00390000004155	ENSGT00950000183096.a.a.c.a	ENSGT00940000158029	ENSGT00390000014595.a.a.a	ENSGT00940000166151	ENSGT00940000159685	ENSGT00940000156919.h	ENSGT00390000008688.k	ENSGT00940000160337.e	ENSGT00390000001289.b.b	ENSGT00950000182902.b.b.b	ENSGT00940000156628.c	ENSGT01080000257336.b.e.b.a.a.d	ENSGT00390000011863.d.a.a
Eastern happy	MODERN SPECIES	5	phkg1a (ENSACLG00000020338)	psph (ENSACLG00000020446)	NIPSNAP2 (ENSACLG00000020371)	limk1a (ENSACLG00000020508)	ENSACLG00000020556	MNT (ENSACLG00000020567)	mettl16 (ENSACLG00000020590)	pafah1b1a (ENSACLG00000020631)	cluha (ENSACLG00000020677)	ENSACLG00000020750	tlcd2 (ENSACLG00000020786)	aifm4 (ENSACLG00000020799)	zgc:153372 (ENSACLG00000020820)	prpf8 (ENSACLG00000020858)	ENSACLG00000021123	SCARF1 (ENSACLG00000021148) ##22	vtna (ENSACLG00000021208)	sarm1 (ENSACLG00000021235)	slc46a1 (ENSACLG00000021298)	foxn1 (ENSACLG00000021314)	UNC119 (ENSACLG00000021340)	crybb1l3 (ENSACLG00000021424)	cryba1a (ENSACLG00000021439)	CPD (ENSACLG00000021455)	gosr1 (ENSACLG00000021555)	TRARG1 (ENSACLG00000021589)	AIPL1 (ENSACLG00000021602)	ENSACLG00000021676	PDE3A (ENSACLG00000021685)	slco1c1 (ENSACLG00000021797)	ENSACLG00000021814
Zebra mbuna	MODERN SPECIES	1096	phkg1a (ENSMZEG00005015334)	psph (ENSMZEG00005015319)	NIPSNAP2 (ENSMZEG00005015307)	limk1a (ENSMZEG00005015267)	ENSMZEG00005015238	MNT (ENSMZEG00005015219)	mettl16 (ENSMZEG00005015206)	pafah1b1a (ENSMZEG00005015190)	cluha (ENSMZEG00005015163)	ENSMZEG00005015142	tlcd2 (ENSMZEG00005015133)	aifm4 (ENSMZEG00005015124)	zgc:153372 (ENSMZEG00005015114)	prpf8 (ENSMZEG00005015073)	ENSMZEG00005015062	SCARF1 (ENSMZEG00005015052) ##22	vtna (ENSMZEG00005015038)	sarm1 (ENSMZEG00005015023)	slc46a1 (ENSMZEG00005015007)	foxn1 (ENSMZEG00005014996)	UNC119 (ENSMZEG00005014975)	crybb1l3 (ENSMZEG00005014929)	cryba1a (ENSMZEG00005014915)	CPD (ENSMZEG00005014892)	gosr1 (ENSMZEG00005014871)	AIPL1 (ENSMZEG00005014855)	ENSMZEG00005014812	ENSMZEG00005014795	PDE3A (ENSMZEG00005014759)	slco1c1 (ENSMZEG00005014724)	bcap29 (ENSMZEG00005014711)
P. nyererei	MODERN SPECIES	298	phkg1a (ENSPNYG00000016851)	psph (ENSPNYG00000016827)	NIPSNAP2 (ENSPNYG00000016800)	limk1a (ENSPNYG00000016749)	ENSPNYG00000016710	MNT (ENSPNYG00000016690)	mettl16 (ENSPNYG00000016660)	pafah1b1a (ENSPNYG00000016619)	cluha (ENSPNYG00000016540)	ENSPNYG00000016520	tlcd2 (ENSPNYG00000016513)	aifm4 (ENSPNYG00000016483)	zgc:153372 (ENSPNYG00000016454)	prpf8 (ENSPNYG00000016356)	ENSPNYG00000016321	SCARF1 (ENSPNYG00000016271) ##22	vtna (ENSPNYG00000016246)	sarm1 (ENSPNYG00000016222)	slc46a1 (ENSPNYG00000016190)	foxn1 (ENSPNYG00000016166)	UNC119 (ENSPNYG00000016112)	crybb1l3 (ENSPNYG00000016044)	cryba1a (ENSPNYG00000016021)	CPD (ENSPNYG00000015960)	gosr1 (ENSPNYG00000015922)	ENSPNYG00000015911	AIPL1 (ENSPNYG00000015887)	ENSPNYG00000015847	PDE3A (ENSPNYG00000015808)	slco1c1 (ENSPNYG00000015768)	bcap29 (ENSPNYG00000015752)
Burton s mouthbrooder	MODERN SPECIES	281	phkg1a (ENSHBUG00000016808)	psph (ENSHBUG00000016710)	NIPSNAP2 (ENSHBUG00000016760)	limk1a (ENSHBUG00000016663)	ENSHBUG00000001102	MNT (ENSHBUG00000016522)	mettl16 (ENSHBUG00000016510)	pafah1b1a (ENSHBUG00000016460)	cluha (ENSHBUG00000016381)	ENSHBUG00000016243	tlcd2 (ENSHBUG00000016228)	aifm4 (ENSHBUG00000016209)	zgc:153372 (ENSHBUG00000000824)	prpf8 (ENSHBUG00000016192)	ENSHBUG00000016021	SCARF1 (ENSHBUG00000015998) ##22	vtna (ENSHBUG00000015941)	sarm1 (ENSHBUG00000015863)	slc46a1 (ENSHBUG00000015835)	foxn1 (ENSHBUG00000015805)	UNC119 (ENSHBUG00000015731)	crybb1l3 (ENSHBUG00000015654)	cryba1a (ENSHBUG00000015641)	CPD (ENSHBUG00000015601)	gosr1 (ENSHBUG00000015443)	AIPL1 (ENSHBUG00000015435)	ENSHBUG00000015409	PDE3A (ENSHBUG00000015398)	slco1c1 (ENSHBUG00000015309)	bcap29 (ENSHBUG00000015263)	dus4l (ENSHBUG00000015255)
Lyretail cichlid	MODERN SPECIES	377											ENSNBRG00000013014	aifm4 (ENSNBRG00000013042)	zgc:153372 (ENSNBRG00000013084)	prpf8 (ENSNBRG00000013127)	ENSNBRG00000013247	SCARF1 (ENSNBRG00000013264) ##22	vtna (ENSNBRG00000013287)	sarm1 (ENSNBRG00000013296)	slc46a1 (ENSNBRG00000013310)	foxn1 (ENSNBRG00000013321)	UNC119 (ENSNBRG00000013342)	crybb1l3 (ENSNBRG00000013357)	cryba1a (ENSNBRG00000013366)	CPD (ENSNBRG00000013375)	gosr1 (ENSNBRG00000013416)	ENSNBRG00000013443	AIPL1 (ENSNBRG00000013451)	ENSNBRG00000013481	PDE3A (ENSNBRG00000013522)	slco1c1 (ENSNBRG00000013554)	bcap29 (ENSNBRG00000013576)
Nile tilapia	MODERN SPECIES	5	NIPSNAP2 (ENSONIG00000041150)	limk1a (ENSONIG00000032294)	ENSONIG00000008130	MNT (ENSONIG00000008133)	mettl16 (ENSONIG00000008135)	pafah1b1a (ENSONIG00000008729)	cluha (ENSONIG00000008146)	ENSONIG00000037737	tlcd2 (ENSONIG00000041447)	aifm4 (ENSONIG00000008148)	zgc:153372 (ENSONIG00000008149)	chchd2 (ENSONIG00000037093)	im:7138535 (ENSONIG00000006268)	prpf8 (ENSONIG00000008153)	ENSONIG00000040668	SCARF1 (ENSONIG00000008170) ##22	vtna (ENSONIG00000031256)	sarm1 (ENSONIG00000008177)	slc46a1 (ENSONIG00000008178)	foxn1 (ENSONIG00000008179)	UNC119 (ENSONIG00000008183)	crybb1l3 (ENSONIG00000008186)	cryba1a (ENSONIG00000008191)	ENSONIG00000041792	CPD (ENSONIG00000008197)	gosr1 (ENSONIG00000040026)	trarg1 (ENSONIG00000040944)	AIPL1 (ENSONIG00000004976)	ENSONIG00000041176	PDE3A (ENSONIG00000004981)	slco1c1 (ENSONIG00000004985)
Midas cichlid	MODERN SPECIES	190												aifm4 (ENSACIG00000018387)	zgc:153372 (ENSACIG00000018364)	prpf8 (ENSACIG00000018280)	ENSACIG00000018248	SCARF1 (ENSACIG00000018191) ##22	vtna (ENSACIG00000018090)	sarm1 (ENSACIG00000018049)	slc46a1 (ENSACIG00000018029)	foxn1 (ENSACIG00000018006)	UNC119 (ENSACIG00000017954)	crybb1l3 (ENSACIG00000017936)	cryba1a (ENSACIG00000017670)	CPD (ENSACIG00000017598)	gosr1 (ENSACIG00000017579)	TRARG1 (ENSACIG00000017568)	AIPL1 (ENSACIG00000017554)	ENSACIG00000017525	PDE3A (ENSACIG00000017495)	slco1c1 (ENSACIG00000017469)	bcap29 (ENSACIG00000017407)
Pomacentridae	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000158139	ENSGT00390000003115	ENSGT00950000183018.a.d.a	ENSGT00940000156345.k.a	ENSGT00940000157152.A	ENSGT00510000048287.b	ENSGT00390000016694	ENSGT00940000155039.a.a	ENSGT00390000012485.a.b.a	ENSGT00430000031027.b.a	ENSGT01010000222313.B.b.b	ENSGT00940000164941	ENSGT00390000001742.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00530000063751.b.j	ENSGT00390000004155	ENSGT00950000183096.a.a.c.a	ENSGT01030000234550.a.a.c.a.a.n	ENSGT00940000158029	ENSGT00390000014595.a.a.a	ENSGT00940000166151	ENSGT00940000159685	ENSGT00940000156919	ENSGT00390000008688.k	ENSGT00940000160337.e	ENSGT00390000001289.b.b	ENSGT00950000182902.b.b.b	ENSGT00940000156628.c	ENSGT01080000257336.b.e.b.a.a.d
Pomacentridae_A	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000158139	ENSGT00390000003115	ENSGT00950000183018.a.d.a	ENSGT00940000156345.k.a	ENSGT00940000157152.A	ENSGT00510000048287.b	ENSGT00390000016694	ENSGT00940000155039.a.a	ENSGT00390000012485.a.b.a	ENSGT00430000031027.b.a	ENSGT01010000222313.B.b.b	ENSGT00940000164941	ENSGT00390000001742.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00530000063751.b.j	ENSGT00390000004155	ENSGT00950000183096.a.a.c.a	ENSGT01030000234550.a.a.c.a.a.n	ENSGT00940000158029	ENSGT00390000014595.a.a.a	ENSGT00940000166151	ENSGT00940000159685	ENSGT00940000156919	ENSGT00390000008688.k	ENSGT00940000160337.e	ENSGT00390000001289.b.b	ENSGT00950000182902.b.b.b	ENSGT00940000156628.c	ENSGT01080000257336.b.e.b.a.a.d
Amphiprion	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000158139	ENSGT00390000003115	ENSGT00950000183018.a.d.a	ENSGT00940000156345.k.a	ENSGT00940000157152.A	ENSGT00510000048287.b	ENSGT00390000016694	ENSGT00940000155039.a.a	ENSGT00390000012485.a.b.a	ENSGT00430000031027.b.a	ENSGT01010000222313.B.b.b	ENSGT00940000164941	ENSGT00390000001742.b	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00530000063751.b.j	ENSGT00390000004155	ENSGT00950000183096.a.a.c.a	ENSGT01030000234550.a.a.c.a.a.n	ENSGT00940000158029	ENSGT00390000014595.a.a.a	ENSGT00940000166151	ENSGT00940000159685	ENSGT00940000156919	ENSGT00940000180040	ENSGT00390000008688.k	ENSGT00940000160337.e	ENSGT00390000001289.b.b	ENSGT00950000182902.b.b.b	ENSGT00940000156628.c
Orange clownfish	MODERN SPECIES	23	phkg1a (ENSAPEG00000013744)	psph (ENSAPEG00000013788)	NIPSNAP2 (ENSAPEG00000013822)	limk1a (ENSAPEG00000013835)	ENSAPEG00000013889	MNT (ENSAPEG00000013931)	mettl16 (ENSAPEG00000013965)	pafah1b1a (ENSAPEG00000014047)	cluha (ENSAPEG00000014127)	ENSAPEG00000014296	tlcd2 (ENSAPEG00000014313)	aifm4 (ENSAPEG00000014326)	zgc:153372 (ENSAPEG00000014375)	prpf8 (ENSAPEG00000014397)	ENSAPEG00000014534	SCARF1 (ENSAPEG00000014552) ##22	vtna (ENSAPEG00000014608)	sarm1 (ENSAPEG00000014621)	slc46a1 (ENSAPEG00000014680)	SLC13A2 (ENSAPEG00000014697)	ENSAPEG00000014747	UNC119 (ENSAPEG00000014764)	crybb1l3 (ENSAPEG00000014836)	cryba1a (ENSAPEG00000014865)	CPD (ENSAPEG00000014901)	ENSAPEG00000015032	gosr1 (ENSAPEG00000015051)	TRARG1 (ENSAPEG00000015087)	AIPL1 (ENSAPEG00000015101)	ENSAPEG00000015111	PDE3A (ENSAPEG00000015132)
Spiny chromis	MODERN SPECIES	1047												aifm4 (ENSAPOG00000009837)	zgc:153372 (ENSAPOG00000009903)	prpf8 (ENSAPOG00000010079)	ENSAPOG00000010094	SCARF1 (ENSAPOG00000010141) ##22	vtna (ENSAPOG00000010153)	sarm1 (ENSAPOG00000010203)	slc46a1 (ENSAPOG00000010230)	SLC13A2 (ENSAPOG00000010279)	foxn1 (ENSAPOG00000010313)	UNC119 (ENSAPOG00000010374)	crybb1l3 (ENSAPOG00000010403)	cryba1a (ENSAPOG00000010432)	CPD (ENSAPOG00000010538)	gosr1 (ENSAPOG00000010570)	ENSAPOG00000010587
Bicolor damselfish	MODERN SPECIES	68										ENSSPAG00000015775	epdr1 (ENSSPAG00000015761)	aifm4 (ENSSPAG00000015719)	zgc:153372 (ENSSPAG00000015711)	prpf8 (ENSSPAG00000015639)	ENSSPAG00000015611	SCARF1 (ENSSPAG00000015587) ##22	vtna (ENSSPAG00000015572)
Tiger tail seahorse	MODERN SPECIES	345	chchd2 (ENSHCOG00000017016)	phkg1a (ENSHCOG00000017011)	psph (ENSHCOG00000016969)	NIPSNAP2 (ENSHCOG00000016936)	limk1a (ENSHCOG00000016918)	ENSHCOG00000016706	MNT (ENSHCOG00000016685)	mettl16 (ENSHCOG00000016671)	pafah1b1a (ENSHCOG00000016601)	cluha (ENSHCOG00000016570)	CCDC92B (ENSHCOG00000016472)	tlcd2 (ENSHCOG00000016453)	aifm4 (ENSHCOG00000016435)	prpf8 (ENSHCOG00000016414)	ENSHCOG00000016331	SCARF1 (ENSHCOG00000016313) ##22	vtna (ENSHCOG00000016268)	sarm1 (ENSHCOG00000016259)	slc46a1 (ENSHCOG00000016236)	SLC13A2 (ENSHCOG00000016221)	foxn1 (ENSHCOG00000016211)	UNC119 (ENSHCOG00000016189)	crybb1l3 (ENSHCOG00000016168)	cryba1a (ENSHCOG00000016152)	CPD (ENSHCOG00000016130)	gosr1 (ENSHCOG00000016051)	TRARG1 (ENSHCOG00000016028)	AIPL1 (ENSHCOG00000016016)	ENSHCOG00000015993	ENSHCOG00000015992	slco1c1 (ENSHCOG00000015982)
Pinecone sodierfish	MODERN SPECIES	4	phkg1a (ENSMMDG00005007414)	psph (ENSMMDG00005007407)	NIPSNAP2 (ENSMMDG00005006499)	ENSMMDG00005006486	limk1a (ENSMMDG00005004858)	MNT (ENSMMDG00005004775)	mettl16 (ENSMMDG00005004759)	pafah1b1a (ENSMMDG00005004740)	cluha (ENSMMDG00005003898)	ENSMMDG00005003841	tlcd2 (ENSMMDG00005003831)	aifm4 (ENSMMDG00005003823)	zgc:153372 (ENSMMDG00005003813)	prpf8 (ENSMMDG00005003662)	ENSMMDG00005003632	SCARF1 (ENSMMDG00005003622) ##22	vtna (ENSMMDG00005003544)	sarm1 (ENSMMDG00005003535)	slc46a1 (ENSMMDG00005003532)	SLC13A2 (ENSMMDG00005003523)	foxn1 (ENSMMDG00005003512)	UNC119 (ENSMMDG00005003509)	crybb1l3 (ENSMMDG00005003495)	crybb1l3 (ENSMMDG00005003492)	cryba1a (ENSMMDG00005003487)	ENSMMDG00005003483	CPD (ENSMMDG00005003381)	gosr1 (ENSMMDG00005003309)	TRARG1 (ENSMMDG00005021713)	AIPL1 (ENSMMDG00005021712)	ENSMMDG00005021711
Cod	MODERN SPECIES	7	NIPSNAP2 (ENSGMOG00000011637)	limk1a (ENSGMOG00000011586)	ENSGMOG00000011574	ENSGMOG00000022433	mettl16 (ENSGMOG00000008443)	pafah1b1a (ENSGMOG00000027345)	cluha (ENSGMOG00000008445)	ENSGMOG00000033337	ENSGMOG00000035834	ENSGMOG00000025969	ENSGMOG00000034013	ENSGMOG00000001992	ENSGMOG00000002001	prpf8 (ENSGMOG00000002028)	ENSGMOG00000002096	SCARF1 (ENSGMOG00000032424) ##22	vtna (ENSGMOG00000002168)	sarm1 (ENSGMOG00000002197)	slc46a1 (ENSGMOG00000002229)	ENSGMOG00000002251	foxn1 (ENSGMOG00000033082)	UNC119 (ENSGMOG00000029000)	crybb1l3 (ENSGMOG00000002348)	cryba1a (ENSGMOG00000002364)	ENSGMOG00000002382	gosr1 (ENSGMOG00000002453)	ENSGMOG00000002480	ENSGMOG00000002494	ENSGMOG00000023110	ENSGMOG00000037073	ENSGMOG00000002518
Protacanthopterygii	ANCESTRAL SPECIES	103	ENSGT00530000064411.a	ENSGT00530000063860.b.c	ENSGT01060000248594.e.b.a	ENSGT00940000155313.g.b	ENSGT00940000155739	ENSGT00940000158173.f	ENSGT00940000155128.a.a.a.a	ENSGT00950000183040.A.a.c.b.f	ENSGT00940000163671.a.a.b	ENSGT00950000182970.A.a	ENSGT00940000158882	ENSGT00940000158439.m	ENSGT00390000006454	ENSGT00390000015210	ENSGT00940000161117	ENSGT00950000183101.a.a ##22	ENSGT00530000063751.b.j	ENSGT00390000004155	ENSGT00950000183096.a.a.c.a	ENSGT01030000234550.a.a.c.a.a.n	ENSGT00940000158029	ENSGT00390000014595.a.a.a	ENSGT00940000166151	ENSGT00940000159685	ENSGT00940000156919	ENSGT00390000008688.k	ENSGT00940000160337.e	ENSGT00390000001289.b.b	ENSGT00950000184050.b	ENSGT00950000182902.b.b.b	ENSGT00390000015205.a
Salmoninae	DUPLICATION
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	49	ENSGT00530000063860.b.c.d	ENSGT01060000248594.e.b.a.c	ENSGT00940000155313.g.b.f.b	ENSGT00940000155739.yb.a.b	ENSGT00940000158173.f.m	ENSGT00940000155128.a.a.a.a.c	ENSGT00950000183040.A.a.c.b.f.a	ENSGT00940000163671.a.a.b.d	ENSGT00950000182970.A.a.j	ENSGT00940000158882.c	ENSGT00940000158439.m.f	ENSGT00390000006454.l	ENSGT00390000006454.k.b.a	ENSGT00390000015210.t	ENSGT00940000161117.e	ENSGT00950000183101.a.a.i ##22	ENSGT00390000006454.k.b.b	ENSGT00390000001742.b.c	ENSGT00390000015210.s	ENSGT00940000161117.f	ENSGT00950000183101.a.a.j ##22	ENSGT00530000063751.b.j	ENSGT00390000004155.f	ENSGT01030000234550.a.a.c.a.a.n.d	ENSGT00940000158029.f	ENSGT00390000014595.a.a.a.d	ENSGT00940000166151.g	ENSGT00940000159685.e	ENSGT00940000156919.f	ENSGT00390000008688.k.c.a	ENSGT00940000160337.e.e
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00530000064411.a.d	ENSGT00530000063860.b.c.d	ENSGT01060000248594.e.b.a.c	ENSGT00940000155313.g.b.f.b	ENSGT00940000155739.yb.a.b	ENSGT00940000158173.f.m	ENSGT00940000155128.a.a.a.a.c	ENSGT00950000183040.A.a.c.b.f.a	ENSGT00940000163671.a.a.b.d	ENSGT00950000182970.A.a.j	ENSGT00940000158882.c	ENSGT00940000158439.m.f	ENSGT00390000006454.l	ENSGT00390000015210.t	ENSGT00940000161117.e	ENSGT00950000183101.a.a.i ##22	ENSGT00390000004155.e	ENSGT00950000183096.a.a.c.a	ENSGT01030000234550.a.a.c.a.a.n.c	ENSGT00940000158029.e	ENSGT00390000014595.a.a.a.c	ENSGT00940000166151.h	ENSGT00940000159685.f	ENSGT00940000153270.b.b.d	ENSGT00940000156919.e	ENSGT00390000008688.k.c.b	ENSGT00940000160337.e.f	ENSGT00390000001289.b.b.c	ENSGT00950000184050.a	ENSGT00950000182902.b.b.b.c	ENSGT00940000180301
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00530000064411.a.d	ENSGT00530000063860.b.c.d	ENSGT01060000248594.e.b.a.c	ENSGT00940000155313.g.b.f.b	ENSGT00940000155739.yb.a.b	ENSGT00940000158173.f.m	ENSGT00940000155128.a.a.a.a.c	ENSGT00950000183040.A.a.c.b.f.a	ENSGT00940000163671.a.a.b.d	ENSGT00950000182970.A.a.j	ENSGT00940000158882.c	ENSGT00940000158439.m.f	ENSGT00390000006454.l	ENSGT00390000015210.t	ENSGT00940000161117.e	ENSGT00950000183101.a.a.i ##22	ENSGT00390000004155.e	ENSGT00950000183096.a.a.c.a.m	ENSGT01030000234550.a.a.c.a.a.n.c	ENSGT00940000158029.e	ENSGT00390000014595.a.a.a.c	ENSGT00940000166151.h	ENSGT00940000159685.f	ENSGT00940000153270.b.b.d	ENSGT00940000156919.e	ENSGT00390000008688.k.d	ENSGT00940000160337.e.f	ENSGT00390000001289.b.b.c	ENSGT00950000182902.b.b.b.c	ENSGT00940000180301	ENSGT00390000016836.b.m
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	28	ENSSSAG00000043850	RSF1 (ENSSSAG00000043901)	postnb (ENSSSAG00000043962)	trpc4b (ENSSSAG00000044670)	frem2b (ENSSSAG00000046296)	ENSSSAG00000046962	ENSSSAG00000047165	ENSSSAG00000088807	ENSSSAG00000051381	ENSSSAG00000051481	tbx4 (ENSSSAG00000053630)	ENSSSAG00000086327	bcas3 (ENSSSAG00000053793)	prpf8 (ENSSSAG00000063849)	ENSSSAG00000063991	SCARF1 (ENSSSAG00000063999) ##22	sarm1 (ENSSSAG00000064075)	slc46a1 (ENSSSAG00000064085)	SLC13A2 (ENSSSAG00000054078)	foxn1 (ENSSSAG00000066151)	UNC119 (ENSSSAG00000105939)	cryba1a (ENSSSAG00000066172)	crybb1l3 (ENSSSAG00000111671)	ENSSSAG00000115393	ENSSSAG00000066249	gosr1 (ENSSSAG00000084837)	ENSSSAG00000116612	ENSSSAG00000122156	ENSSSAG00000119399	ENSSSAG00000098950	ENSSSAG00000066968
River trout	MODERN SPECIES	4	ENSSTUG00000045098	trpc4b (ENSSTUG00000045130)	frem2b (ENSSTUG00000045470)	ENSSTUG00000045972	TRIM3 (ENSSTUG00000046322)	ENSSTUG00000046406	arfip2b (ENSSTUG00000046421)	ENSSTUG00000046507	brip1 (ENSSTUG00000046703)	tbx4 (ENSSTUG00000046844)	tbx2b (ENSSTUG00000046859)	bcas3 (ENSSTUG00000046908)	ENSSTUG00000046967	prpf8 (ENSSTUG00000046974)	ENSSTUG00000047175	SCARF1 (ENSSTUG00000047185) ##22	sarm1 (ENSSTUG00000047199)	slc46a1 (ENSSTUG00000047224)	SLC13A2 (ENSSTUG00000047240)	foxn1 (ENSSTUG00000047320)	UNC119 (ENSSTUG00000047327)	crybb1l3 (ENSSTUG00000047333)	cryba1a (ENSSTUG00000047338)	GMNC (ENSSTUG00000047344)	CPD (ENSSTUG00000047355)	gosr1 (ENSSTUG00000047499)	ENSSTUG00000047621	ENSSTUG00000047630	ENSSTUG00000047632	rflnb (ENSSTUG00000047637)	vps53 (ENSSTUG00000047643)
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00390000010063.ob.b	ENSGT00530000064411.a.d	ENSGT00530000063860.b.c.d	ENSGT01060000248594.e.b.a.c	ENSGT00940000155313.g.b.f.b	ENSGT00940000155739.yb.a.b	ENSGT00940000158173.f.m	ENSGT00940000155128.a.a.a.a.c	ENSGT00950000183040.A.a.c.b.f.a	ENSGT00940000163671.a.a.b.d	ENSGT00940000158882.c	ENSGT00940000158439.m.f	ENSGT00390000006454.l	ENSGT00390000015210.t	ENSGT00940000161117.e	ENSGT00950000183101.a.a.i ##22	ENSGT00390000004155.e	ENSGT00950000183096.a.a.c.a	ENSGT01030000234550.a.a.c.a.a.n.c	ENSGT00940000158029.e	ENSGT00390000014595.a.a.a.c	ENSGT00940000166151.h	ENSGT00940000159685.f	ENSGT00940000153270.b.b.d	ENSGT00940000156919.e	ENSGT00390000008688.k.c.b	ENSGT00940000160337.e.f	ENSGT00390000001289.b.b.c	ENSGT00950000184050.a	ENSGT00950000182902.b.b.b.c	ENSGT00940000180301
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	32	ENSGT00530000064411.a.d	ENSGT00940000175310	ENSGT00530000063860.b.c.d	ENSGT01060000248594.e.b.a.c	ENSGT00940000155313.g.b.f.b	ENSGT00940000155739.yb.a.b	ENSGT00940000158173.f.m	ENSGT00940000155128.a.a.a.a.c	ENSGT00950000183040.A.a.c.b.f.a	ENSGT00940000163671.a.a.b.d	ENSGT00940000158882.c	ENSGT00940000158439.m.f	ENSGT00390000006454.l	ENSGT00390000015210.t	ENSGT00940000161117.e	ENSGT00950000183101.a.a.i ##22	ENSGT00390000004155.e	ENSGT00950000183096.a.a.c.a	ENSGT01030000234550.a.a.c.a.a.n.c	ENSGT00940000158029.e	ENSGT00390000014595.a.a.a.c	ENSGT00940000166151.h	ENSGT00940000159685.f	ENSGT00940000153270.b.b.d	ENSGT00940000156919.e	ENSGT00390000008688.k.c.b	ENSGT00940000160337.e.f	ENSGT00390000001289.b.b.c	ENSGT00950000184050.a	ENSGT00950000182902.b.b.b.c	ENSGT00940000180301
Chinook salmon	MODERN SPECIES	5	ENSOTSG00005001694	postnb (ENSOTSG00005001703)	trpc4b (ENSOTSG00005001716)	frem2b (ENSOTSG00005001728)	ENSOTSG00005001732	ENSOTSG00005001735	TRIM3 (ENSOTSG00005001748)	ENSOTSG00005001751	ARFIP2 (ENSOTSG00005001769)	ENSOTSG00005001928	tbx4 (ENSOTSG00005002497)	tbx2b (ENSOTSG00005002498)	bcas3 (ENSOTSG00005002512)	prpf8 (ENSOTSG00005002624)	ENSOTSG00005004298	SCARF1 (ENSOTSG00005004301) ##22	sarm1 (ENSOTSG00005004303)	slc46a1 (ENSOTSG00005004314)	SLC13A2 (ENSOTSG00005004316)	foxn1 (ENSOTSG00005004318)	UNC119 (ENSOTSG00005004319)	crybb1l3 (ENSOTSG00005004320)	cryba1a (ENSOTSG00005004322)	ENSOTSG00005004323	CPD (ENSOTSG00005004325)	gosr1 (ENSOTSG00005004442)	TRARG1 (ENSOTSG00005004597)	AIPL1 (ENSOTSG00005004599)	ENSOTSG00005005128	ENSOTSG00005005130	rflnb (ENSOTSG00005005136)
Coho salmon	MODERN SPECIES	9	ENSOKIG00005018515	postnb (ENSOKIG00005015318)	trpc4b (ENSOKIG00005015018)	frem2b (ENSOKIG00005014800)	ENSOKIG00005014710	ENSOKIG00005014676	TRIM3 (ENSOKIG00005013768)	ENSOKIG00005013653	ARFIP2 (ENSOKIG00005013577)	ENSOKIG00005012955	tbx4 (ENSOKIG00005012877)	TBX2 (ENSOKIG00005012824)	bcas3 (ENSOKIG00005012694)	prpf8 (ENSOKIG00005012589)	ENSOKIG00005012527	SCARF1 (ENSOKIG00005012493) ##22	ENSOKIG00005012482	sarm1 (ENSOKIG00005012422)	slc46a1 (ENSOKIG00005012397)	ENSOKIG00005012389	SLC13A2 (ENSOKIG00005012299)	foxn1 (ENSOKIG00005012276)	ENSOKIG00005012270	UNC119 (ENSOKIG00005012246)	crybb1l3 (ENSOKIG00005012241)	cryba1a (ENSOKIG00005012221)	ENSOKIG00005012213	CPD (ENSOKIG00005011321)	gosr1 (ENSOKIG00005011160)	TRARG1 (ENSOKIG00005011132)	AIPL1 (ENSOKIG00005011121)
Rainbow trout	MODERN SPECIES	16	postnb (ENSOMYG00000020373)	trpc4b (ENSOMYG00000020525)	frem2b (ENSOMYG00000020588)	ENSOMYG00000060933	ENSOMYG00000020906	ENSOMYG00000021050	ENSOMYG00000021101	ENSOMYG00000021188	tbx4 (ENSOMYG00000021245)	ENSOMYG00000021258	bcas3 (ENSOMYG00000021401)	ENSOMYG00000048416	ENSOMYG00000021445	prpf8 (ENSOMYG00000021519)	ENSOMYG00000021557	SCARF1 (ENSOMYG00000021571) ##22	ENSOMYG00000055468	sarm1 (ENSOMYG00000021611)	slc46a1 (ENSOMYG00000021638)	SLC13A2 (ENSOMYG00000021661)	foxn1 (ENSOMYG00000021676)	UNC119 (ENSOMYG00000021681)	crybb1l3 (ENSOMYG00000070519)	cryba1a (ENSOMYG00000021712)	ENSOMYG00000021731	ENSOMYG00000021796	GOSR1 (ENSOMYG00000022047)	ENSOMYG00000022134	ENSOMYG00000022146	ENSOMYG00000075879	ENSOMYG00000069749
Huchen	MODERN SPECIES	2006												bcas3 (ENSHHUG00000016719)	zgc:153372 (ENSHHUG00000016755)	prpf8 (ENSHHUG00000016796)	ENSHHUG00000016872	SCARF1 (ENSHHUG00000016880) ##22	vtna (ENSHHUG00000016884)	sarm1 (ENSHHUG00000016889)	slc46a1 (ENSHHUG00000016913)	SLC13A2 (ENSHHUG00000016930)
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	49	ENSGT00940000155128.a.a.a.a.c	ENSGT00950000183040.A.a.c.b.f.a	ENSGT00940000163671.a.a.b.d	ENSGT00950000182970.A.a.j	ENSGT00940000158882.c	ENSGT00940000158439.m.f	ENSGT00390000006454.l	ENSGT00390000006454.k.b.a	ENSGT00390000015210.t	ENSGT00940000161117.e	ENSGT00950000183101.a.a.i ##22	ENSGT00390000006454.k.b.b	ENSGT00390000001742.b.c	ENSGT00390000015210.s	ENSGT00940000161117.f	ENSGT00950000183101.a.a.j ##22	ENSGT00530000063751.b.j	ENSGT00390000004155.f	ENSGT01030000234550.a.a.c.a.a.n.d	ENSGT00940000158029.f	ENSGT00390000014595.a.a.a.d	ENSGT00940000166151.g	ENSGT00940000159685.e	ENSGT00940000156919.f	ENSGT00390000008688.k.c.a	ENSGT00940000160337.e.e	ENSGT00390000001289.b.b.d	ENSGT00950000182902.b.b.b.d	ENSGT00390000015205.a	ENSGT00390000016836.b.n	ENSGT00390000004155.e
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00530000063860.b.c.c	ENSGT01060000248594.e.b.a.d	ENSGT00940000155313.g.b.f.a	ENSGT00940000155739.yb.a.a	ENSGT00940000158173.f.n	ENSGT00940000155128.a.a.a.a.d	ENSGT00950000183040.A.a.c.b.f.b	ENSGT00940000163671.a.a.b.c	ENSGT00950000182970.A.a.i	ENSGT00940000158882.d	ENSGT00940000158439.m.e	ENSGT00390000006454.k.a	ENSGT00390000001742.b.c	ENSGT00390000015210.s	ENSGT00940000161117.f	ENSGT00950000183101.a.a.j ##22	ENSGT00530000063751.b.j	ENSGT00390000004155.f	ENSGT01030000234550.a.a.c.a.a.n.d	ENSGT00940000158029.f	ENSGT00390000014595.a.a.a.d	ENSGT00940000166151.g	ENSGT00940000159685.e	ENSGT00940000156919.f	ENSGT00390000008688.k.c.a	ENSGT00940000160337.e.e	ENSGT00390000001289.b.b.d	ENSGT00950000182902.b.b.b.d	ENSGT00390000015205.a	ENSGT00390000016836.b.n	ENSGT00390000015165.r
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT01060000248594.e.b.a.d	ENSGT00940000155313.g.b.f.a	ENSGT00940000155739.yb.a.a	ENSGT00940000158173.f.n	ENSGT00940000155128.a.a.a.a.d	ENSGT00950000183040.A.a.c.b.f.b	ENSGT00940000163671.a.a.b.c	ENSGT00950000182970.A.a.i	ENSGT00940000158882.d	ENSGT00940000158439.m.e	ENSGT00390000006454.k.b.b	ENSGT00390000006454.k.a	ENSGT00390000001742.b.c	ENSGT00390000015210.s	ENSGT00940000161117.f	ENSGT00950000183101.a.a.j ##22	ENSGT00530000063751.b.j	ENSGT00390000004155.f	ENSGT01030000234550.a.a.c.a.a.n.d	ENSGT00940000158029.f	ENSGT00390000014595.a.a.a.d	ENSGT00940000166151.g	ENSGT00940000159685.e	ENSGT00940000156919.f	ENSGT00390000008688.k.c.a	ENSGT00940000160337.e.e	ENSGT00390000001289.b.b.d	ENSGT00950000182902.b.b.b.d	ENSGT00390000015205.a	ENSGT00390000016836.b.n	ENSGT00390000015165.r
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT01060000248594.e.b.a.d	ENSGT00940000155313.g.b.f.a	ENSGT00940000155739.yb.a.a	ENSGT00940000158173.f.n	ENSGT00940000155128.a.a.a.a.d	ENSGT00950000183040.A.a.c.b.f.b	ENSGT00940000163671.a.a.b.c	ENSGT00950000182970.A.a.i	ENSGT00940000158882.d	ENSGT00940000158439.m.e	ENSGT00390000006454.k.b.b	ENSGT00390000006454.k.a	ENSGT00390000001742.b.c	ENSGT00390000015210.s	ENSGT00940000161117.f	ENSGT00950000183101.a.a.j ##22	ENSGT00530000063751.b.j	ENSGT00390000004155.f	ENSGT01030000234550.a.a.c.a.a.n.d	ENSGT00940000158029.f.a	ENSGT00390000014595.a.a.a.d	ENSGT00940000166151.g	ENSGT00940000159685.e	ENSGT00940000156919.f	ENSGT00390000008688.k.c.a	ENSGT00940000160337.e.e	ENSGT00390000001289.b.b.d	ENSGT00950000182902.b.b.b.d	ENSGT00390000015205.a	ENSGT00390000016836.b.n	ENSGT00390000015165.r.a
Chinook salmon	DUPLICATION
Chinook salmon	MODERN SPECIES	4	postnb (ENSOTSG00005008087)	trpc4b (ENSOTSG00005008146)	ENSOTSG00005008148	ENSOTSG00005008149	TRIM3 (ENSOTSG00005008167)	ENSOTSG00005008593	arfip2b (ENSOTSG00005008594)	ENSOTSG00005008621	brip1 (ENSOTSG00005008663)	tbx4 (ENSOTSG00005008671)	tbx2b (ENSOTSG00005008672)	bcas3 (ENSOTSG00005008677)	zgc:153372 (ENSOTSG00005008694)	prpf8 (ENSOTSG00005008695)	ENSOTSG00005008696	SCARF1 (ENSOTSG00005008697) ##22	vtna (ENSOTSG00005008698)	sarm1 (ENSOTSG00005008699)	SLC13A2 (ENSOTSG00005008701)	foxn1 (ENSOTSG00005008703)	UNC119 (ENSOTSG00005008704)	NIPSNAP2 (ENSOTSG00005008708)	psph (ENSOTSG00005009528)	cct6a (ENSOTSG00005009533)	phkg1a (ENSOTSG00005009551)	chchd2 (ENSOTSG00005009685)	ENSOTSG00005009686	ENSOTSG00005009687	ENSOTSG00005009688	ENSOTSG00005009689	ENSOTSG00005009690
Chinook salmon	MODERN SPECIES	74	postnb (ENSOTSG00005039815)	trpc4b (ENSOTSG00005039916)	ENSOTSG00005039929	ENSOTSG00005039934	TRIM3 (ENSOTSG00005039954)	ENSOTSG00005040402	arfip2b (ENSOTSG00005040403)	ENSOTSG00005040412	brip1 (ENSOTSG00005040455)	tbx4 (ENSOTSG00005040479)	tbx2b (ENSOTSG00005010742)	bcas3 (ENSOTSG00005010746)	zgc:153372 (ENSOTSG00005010792)	prpf8 (ENSOTSG00005010794)	ENSOTSG00005010798	SCARF1 (ENSOTSG00005010799) ##22	vtna (ENSOTSG00005010804)	sarm1 (ENSOTSG00005010805)	SLC13A2 (ENSOTSG00005010810)	foxn1 (ENSOTSG00005010812)	UNC119 (ENSOTSG00005010815)
Coho salmon	MODERN SPECIES	6	ENSOKIG00005015048	TRIM3 (ENSOKIG00005015376)	ENSOKIG00005015633	arfip2b (ENSOKIG00005015671)	ENSOKIG00005015755	brip1 (ENSOKIG00005015939)	tbx4 (ENSOKIG00005016004)	tbx2b (ENSOKIG00005016045)	bcas3 (ENSOKIG00005016095)	ENSOKIG00005016211	ENSOKIG00005016235	zgc:153372 (ENSOKIG00005016243)	ENSOKIG00005016255	prpf8 (ENSOKIG00005016265)	ENSOKIG00005016311	SCARF1 (ENSOKIG00005016329) ##22	vtna (ENSOKIG00005016351)	sarm1 (ENSOKIG00005016358)	SLC13A2 (ENSOKIG00005016390)	foxn1 (ENSOKIG00005016400)	UNC119 (ENSOKIG00005016407)	cryba1a (ENSOKIG00005016415)	crybb1l3 (ENSOKIG00005016426)	CPD (ENSOKIG00005016461)	gosr1 (ENSOKIG00005016869)	TRARG1 (ENSOKIG00005016955)	ENSOKIG00005016961	ENSOKIG00005016992	exo5 (ENSOKIG00005016999)	rflnb (ENSOKIG00005017011)	vps53 (ENSOKIG00005017124)
Rainbow trout	MODERN SPECIES	19	ENSOMYG00000052940	trpc4b (ENSOMYG00000042741)	frem2b (ENSOMYG00000042935)	ENSOMYG00000043016	ENSOMYG00000043131	ENSOMYG00000043156	ENSOMYG00000043167	ENSOMYG00000043195	brip1 (ENSOMYG00000043306)	tbx4 (ENSOMYG00000043351)	tbx2b (ENSOMYG00000043357)	bcas3 (ENSOMYG00000043411)	ENSOMYG00000043435	prpf8 (ENSOMYG00000043443)	ENSOMYG00000043455	SCARF1 (ENSOMYG00000043462) ##22	vtna (ENSOMYG00000043466)	sarm1 (ENSOMYG00000043485)	SLC13A2 (ENSOMYG00000043525)	ENSOMYG00000059818	foxn1 (ENSOMYG00000043623)	UNC119 (ENSOMYG00000043630)	crybb1l3 (ENSOMYG00000021693)	cryba1a (ENSOMYG00000043641)	ENSOMYG00000043739	gosr1 (ENSOMYG00000043891)	ENSOMYG00000069106	ENSOMYG00000059809	ENSOMYG00000071567	ENSOMYG00000043989	exo5 (ENSOMYG00000043995)
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00530000063860.b.c.c	ENSGT01060000248594.e.b.a.d	ENSGT00940000155313.g.b.f.a	ENSGT00940000155739.yb.a.a	ENSGT00940000158173.f.n	ENSGT00940000155128.a.a.a.a.d	ENSGT00950000183040.A.a.c.b.f.b	ENSGT00940000163671.a.a.b.c	ENSGT00950000182970.A.a.i	ENSGT00940000158882.d	ENSGT00940000158439.m.e	ENSGT00390000006454.k.a	ENSGT00390000001742.b.c	ENSGT00390000015210.s	ENSGT00940000161117.f	ENSGT00950000183101.a.a.j ##22	ENSGT00530000063751.b.j	ENSGT00390000004155.f	ENSGT00950000183096.a.a.c.a.n	ENSGT01030000234550.a.a.c.a.a.n.d	ENSGT00940000158029.f	ENSGT00390000014595.a.a.a.d	ENSGT00940000159685.e	ENSGT00940000166151.g	ENSGT00940000156919.f	ENSGT00390000008688.k.c.a	ENSGT00940000160337.e.e	ENSGT00390000001289.b.b.d.a	ENSGT00950000182902.b.b.b.d	ENSGT00390000015205.a	ENSGT00390000016836.b.n
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	12	trpc4b (ENSSSAG00000081732)	frem2b (ENSSSAG00000081733)	ENSSSAG00000120815	ENSSSAG00000046194	ENSSSAG00000046769	ENSSSAG00000051355	ENSSSAG00000007914	ENSSSAG00000053291	brip1 (ENSSSAG00000051666)	tbx4 (ENSSSAG00000051701)	tbx2b (ENSSSAG00000051709)	bcas3 (ENSSSAG00000051799)	ENSSSAG00000053707	prpf8 (ENSSSAG00000053727)	ENSSSAG00000053832	SCARF1 (ENSSSAG00000053838) ##22	vtna (ENSSSAG00000053696)	sarm1 (ENSSSAG00000053846)	slc46a1 (ENSSSAG00000053882)	SLC13A2 (ENSSSAG00000098270)	ENSSSAG00000054706	ENSSSAG00000054725	crybb1l3 (ENSSSAG00000090412)	ENSSSAG00000054760	gosr1 (ENSSSAG00000056490)	ENSSSAG00000056505	ENSSSAG00000056528	ENSSSAG00000097871	exo5 (ENSSSAG00000056991)	rflnb (ENSSSAG00000119389)	vps53 (ENSSSAG00000057051)
River trout	MODERN SPECIES	18	postnb (ENSSTUG00000018480)	trpc4b (ENSSTUG00000019246)	frem2b (ENSSTUG00000019347)	ENSSTUG00000019783	TRIM3 (ENSSTUG00000020306)	ENSSTUG00000021160	ARFIP2 (ENSSTUG00000021170)	ENSSTUG00000021252	brip1 (ENSSTUG00000021508)	tbx4 (ENSSTUG00000021548)	tbx2b (ENSSTUG00000021578)	bcas3 (ENSSTUG00000021635)	zgc:153372 (ENSSTUG00000021736)	prpf8 (ENSSTUG00000021750)	ENSSTUG00000021979	SCARF1 (ENSSTUG00000022000) ##22	vtna (ENSSTUG00000022025)	sarm1 (ENSSTUG00000022033)	ENSSTUG00000022066	SLC13A2 (ENSSTUG00000022083)	foxn1 (ENSSTUG00000022236)	UNC119 (ENSSTUG00000022256)	cryba1a (ENSSTUG00000035563)	crybb1l3 (ENSSTUG00000035567)	CPD (ENSSTUG00000035589)	gosr1 (ENSSTUG00000035806)	TRARG1 (ENSSTUG00000035830)	AIPL1 (ENSSTUG00000035837)	ENSSTUG00000035926	exo5 (ENSSTUG00000035937)	rflnb (ENSSTUG00000035970)
Huchen	MODERN SPECIES	929												bcas3 (ENSHHUG00000031619)	zgc:153372 (ENSHHUG00000031610)	prpf8 (ENSHHUG00000031574)	ENSHHUG00000031551	SCARF1 (ENSHHUG00000031507) ##22	vtna (ENSHHUG00000031499)	sarm1 (ENSHHUG00000031445)	SLC13A2 (ENSHHUG00000031313)	foxn1 (ENSHHUG00000031295)	UNC119 (ENSHHUG00000031291)	crybb1l3 (ENSHHUG00000031260)	cryba1a (ENSHHUG00000031248)	ENSHHUG00000031245	CPD (ENSHHUG00000031135)	GOSR1 (ENSHHUG00000031103)	ENSHHUG00000031096
Northern pike	MODERN SPECIES		ENSELUG00000006816	arfip2b (ENSELUG00000006852)	ENSELUG00000033648	ENSELUG00000006887	ENSELUG00000006903	ENSELUG00000006918	ENSELUG00000006928	ENSELUG00000000224	ENSELUG00000025400	brip1 (ENSELUG00000006941)	tbx4 (ENSELUG00000006961)	tbx2b (ENSELUG00000000236)	bcas3 (ENSELUG00000007045)	prpf8 (ENSELUG00000007120)	ENSELUG00000007146	SCARF1 (ENSELUG00000007177) ##22	vtna (ENSELUG00000007205)	sarm1 (ENSELUG00000007221)	slc46a1 (ENSELUG00000007232)	foxn1 (ENSELUG00000007259)	UNC119 (ENSELUG00000007287)	crybb1l3 (ENSELUG00000007308)	cryba1a (ENSELUG00000007327)	CPD (ENSELUG00000007362)	gosr1 (ENSELUG00000007420)	TRARG1 (ENSELUG00000007472)	AIPL1 (ENSELUG00000007492)	ENSELUG00000007516	ENSELUG00000007525	ENSELUG00000028039	exo5 (ENSELUG00000007544)
Reedfish	MODERN SPECIES	16	poldip2 (ENSECRG00000007722)	ENSECRG00000007752	tmem97 (ENSECRG00000007766)	ift20 (ENSECRG00000007787)	tnfaip1 (ENSECRG00000007809)	SGSM2 (ENSECRG00000007846)	tpst1 (ENSECRG00000007928)	crcp (ENSECRG00000007950)	asl (ENSECRG00000007973)	ca4c (ENSECRG00000008008)	ENSECRG00000008043	ALDH3A2 (ENSECRG00000008175)	ULK2 (ENSECRG00000008374)	prpf8 (ENSECRG00000008424)	ENSECRG00000008476	SCARF1 (ENSECRG00000008510) ##22	ENSECRG00000008592	ENSECRG00000008610	vtna (ENSECRG00000008628)	sarm1 (ENSECRG00000008647)	slc46a1 (ENSECRG00000008662)	slc13a2 (ENSECRG00000008676)	foxn1 (ENSECRG00000008696)	unc119b (ENSECRG00000008729)	crybb1l3 (ENSECRG00000008749)	cryba1a (ENSECRG00000008808)	ENSECRG00000008834	CENPV (ENSECRG00000008897)	PIGL (ENSECRG00000009081)	ENSECRG00000009099	NCOR1 (ENSECRG00000009114)
Elephant shark	MODERN SPECIES	1532	TRPV1 (ENSCMIG00000013598)	SHPK (ENSCMIG00000013579)	emc6 (ENSCMIG00000013575)	ENSCMIG00000013571	BLTP2 (ENSCMIG00000013494)	RSKR (ENSCMIG00000013460)	vtn (ENSCMIG00000013446)	sarm1 (ENSCMIG00000013437)	slc46a1 (ENSCMIG00000013433)	slc13a2 (ENSCMIG00000013422)	ENSCMIG00000013402	ENSCMIG00000013386	med31 (ENSCMIG00000013373)	ENSCMIG00000013367	ENSCMIG00000013363	SCARF1 (ENSCMIG00000013361) ##22	ENSCMIG00000013358	slc43a2b (ENSCMIG00000013354)	ENSCMIG00000013348	inpp5ka (ENSCMIG00000013341)	ENSCMIG00000013337	tekt1 (ENSCMIG00000013333)	ENSCMIG00000013317	SMTNL2 (ENSCMIG00000013304)	ncbp3 (ENSCMIG00000013297)	ywhae1 (ENSCMIG00000013294)	ENSCMIG00000013290	LRRC75A (ENSCMIG00000013287)	ENSCMIG00000013278	aldoca (ENSCMIG00000013268)	pigs (ENSCMIG00000013265)
Gnathostomata	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183101.b ##22
Euteleostomi	ANCESTRAL SPECIES	1241															ENSGT00940000160711	ENSGT00950000183101.b ##22
Sarcopterygii	ANCESTRAL SPECIES	748														ENSGT00390000006265.b	ENSGT00940000160711	ENSGT00950000183101.b ##22
Tetrapoda	ANCESTRAL SPECIES	259														ENSGT00940000160711	ENSGT00390000006265.b	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00390000017663	ENSGT00940000154637	ENSGT00940000173122	ENSGT00940000154297.B
Amniota	ANCESTRAL SPECIES	128														ENSGT00940000160711	ENSGT00390000006265.b	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00390000017663	ENSGT00940000154637	ENSGT00940000173122	ENSGT00940000154297.B	ENSGT01020000230351.F
Sauria	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000157987	ENSGT01050000244888.b.b.a.b	ENSGT00940000153998.b	ENSGT00940000161655	ENSGT00940000154284.b	ENSGT00960000189450	ENSGT00940000156855	ENSGT00940000161662	ENSGT00940000162007	ENSGT01020000230351.A	ENSGT00390000010194	ENSGT00950000185268	ENSGT00940000161539	ENSGT00940000160711	ENSGT00390000006265.b	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00390000017663	ENSGT00940000154637	ENSGT00940000173122	ENSGT00940000154297.B	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000153899.b.a	ENSGT00940000160448
Lepidosauria	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000163638	ENSGT00940000157987	ENSGT01050000244888.b.b.a.b	ENSGT00940000153998.b	ENSGT00940000154495.b.a.b	ENSGT00960000189450	ENSGT00940000156855	ENSGT00940000161662	ENSGT00510000046406.f.b.a.a.a.b	ENSGT00940000162007	ENSGT01020000230351.A	ENSGT00390000010194	ENSGT00940000161539	ENSGT00940000160711	ENSGT00390000006265.b	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00390000017663	ENSGT00940000154637	ENSGT00940000173122	ENSGT00940000154297.B	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000153899.b.a	ENSGT00940000160448	ENSGT00940000158891	ENSGT00940000160097.d	ENSGT00390000004807	ENSGT00940000154885.A	ENSGT00940000156515	ENSGT00940000154612	ENSGT00940000162087	ENSGT00390000018351
Episquamata	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000157987	ENSGT00940000161909	ENSGT01050000244888.b.b.a.b	ENSGT00940000153998.b	ENSGT00940000154495.b.a.b	ENSGT00960000189450	ENSGT00940000156855	ENSGT00940000161662	ENSGT00510000046406.f.b.b	ENSGT00940000162007	ENSGT01020000230351.A	ENSGT00390000010194	ENSGT00940000161539	ENSGT00940000160711	ENSGT00390000006265.b	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00390000017663	ENSGT00940000154637	ENSGT00940000173122	ENSGT00940000154297.B	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000153899.b.a	ENSGT00940000160448	ENSGT00940000158891	ENSGT00940000160097.d	ENSGT00390000004807	ENSGT00940000154885.A	ENSGT00940000156515	ENSGT00940000154612	ENSGT00940000162087	ENSGT00390000018351
Laterata	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000163638	ENSGT00940000157987	ENSGT00940000161909	ENSGT01050000244888.b.b.a.b	ENSGT00940000153998.b	ENSGT00960000189450	ENSGT00940000156855	ENSGT00940000161662	ENSGT00510000046406.f.b.b	ENSGT00940000162007	ENSGT01020000230351.A	ENSGT00390000010194	ENSGT00940000161539	ENSGT00940000160711	ENSGT00390000006265.b	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00390000017663	ENSGT00940000154637	ENSGT00940000154297.B	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000153899.b.a	ENSGT00940000160448	ENSGT00940000158891	ENSGT00940000160097.d	ENSGT00940000154885.A	ENSGT00940000156515.c	ENSGT00940000154612	ENSGT00940000162087	ENSGT00390000018351	ENSGT00940000156839	ENSGT00390000000378.d.b
Common wall lizard	MODERN SPECIES	7	ENSPMRG00000015463	ENSPMRG00000015464	MORC2 (ENSPMRG00000015489)	ENSPMRG00000015537	ENSPMRG00000015553	SELENOM (ENSPMRG00000015581)	INPP5J (ENSPMRG00000015591)	PLA2G3 (ENSPMRG00000015620)	ENSPMRG00000015647	P2RX2 (ENSPMRG00000015686)	POLE (ENSPMRG00000015970)	PXMP2 (ENSPMRG00000016641)	RTN4R (ENSPMRG00000016653)	ENSPMRG00000016686	ENSPMRG00000016806	SCARF2 (ENSPMRG00000016809) ##22	ENSPMRG00000016814	SLC7A4 (ENSPMRG00000016828)	LRRC74B (ENSPMRG00000016861)	P2RX6 (ENSPMRG00000016874)	ENSPMRG00000016879	AIFM3 (ENSPMRG00000016885)	SIRT4 (ENSPMRG00000016899)	ENSPMRG00000016903	ENSPMRG00000016908	PLA2G1B (ENSPMRG00000016918)	ENSPMRG00000016920	ENSPMRG00000016928	ENSPMRG00000016934	TRIAP1 (ENSPMRG00000016937)	ENSPMRG00000016939
Argentine black and white tegu	MODERN SPECIES	41															ENSSMRG00000005268	SCARF2 (ENSSMRG00000005278) ##22	ENSSMRG00000005284	ENSSMRG00000005287	SLC7A4 (ENSSMRG00000005290)	LRRC74B (ENSSMRG00000005294)	P2RX6 (ENSSMRG00000005302)	ENSSMRG00000005335	AIFM3 (ENSSMRG00000005338)	SIRT4 (ENSSMRG00000005351)	ENSSMRG00000005352	ENSSMRG00000005564	MSI1 (ENSSMRG00000005606)	ENSSMRG00000005618	TRIAP1 (ENSSMRG00000005620)	GATC (ENSSMRG00000005624)	SRSF9 (ENSSMRG00000005625)
Toxicofera	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000163638	ENSGT00940000157987	ENSGT00940000161909	ENSGT01050000244888.b.b.a.b	ENSGT00940000153998.b	ENSGT00940000154495.b.b	ENSGT00940000154284.b	ENSGT00940000156855	ENSGT00940000161662	ENSGT00510000046406.f.b.b	ENSGT00940000162007	ENSGT01020000230351.A	ENSGT00390000010194	ENSGT00940000160711	ENSGT00390000006265.b	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00390000017663	ENSGT00940000154637	ENSGT00940000173122	ENSGT00940000154297.B	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000153899.b.a	ENSGT00940000160448	ENSGT00940000158891	ENSGT00940000160097.d	ENSGT00390000004807	ENSGT00940000154885.A	ENSGT00940000156515	ENSGT00940000154612	ENSGT00940000162087	ENSGT00390000018351
Elapidae	ANCESTRAL SPECIES	34														ENSGT00940000160711	ENSGT00390000006265.b	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00390000017663	ENSGT00940000154637	ENSGT00940000173122	ENSGT00940000154297.B	ENSGT00940000153899.b.a	ENSGT00940000160448.a	ENSGT00940000158891	ENSGT00940000160097.d	ENSGT00940000156515	ENSGT00940000154612	ENSGT00940000162087	ENSGT00390000018351	ENSGT00940000156839	ENSGT00390000000378.d.b	ENSGT00390000001618
Elapidae_a	ANCESTRAL SPECIES	63														ENSGT00940000160711	ENSGT00390000006265.b	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00390000017663	ENSGT00940000154637	ENSGT00940000173122	ENSGT00940000154297.B	ENSGT00940000153899.b.a	ENSGT00940000160448.a	ENSGT00940000158891	ENSGT00940000160097.d	ENSGT00940000156515	ENSGT00940000154612	ENSGT00940000162087	ENSGT00390000018351	ENSGT00940000156839	ENSGT00390000000378.d.b	ENSGT00390000001618
Acanthophiinae	ANCESTRAL SPECIES	60														ENSGT00940000160711	ENSGT00390000006265.b	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00390000017663	ENSGT00940000154637	ENSGT00940000173122	ENSGT00940000154297.B	ENSGT00940000153899.b.a	ENSGT00940000160448.a	ENSGT00940000158891	ENSGT00940000160097.d	ENSGT00940000156515	ENSGT00940000162087	ENSGT00390000018351	ENSGT00940000156839	ENSGT00390000000378.d.b	ENSGT00390000001618	ENSGT00390000001654
Eastern brown snake	MODERN SPECIES	90														RTN4R (ENSPTXG00000011212)	ENSPTXG00000011211	SCARF2 (ENSPTXG00000011210) ##22	ENSPTXG00000011209	SLC7A4 (ENSPTXG00000011208)	ENSPTXG00000011207	ENSPTXG00000011206	ENSPTXG00000011205	ENSPTXG00000011203	SIRT4 (ENSPTXG00000011202)	ENSPTXG00000011201	ENSPTXG00000011199	MSI1 (ENSPTXG00000011148)	ENSPTXG00000011146	TRIAP1 (ENSPTXG00000011144)	GATC (ENSPTXG00000011143)	SRSF9 (ENSPTXG00000011141)	DYNLL1 (ENSPTXG00000011140)
Mainland tiger snake	MODERN SPECIES	215														RTN4R (ENSNSUG00000019001)	ENSNSUG00000019002	SCARF2 (ENSNSUG00000019003) ##22	ENSNSUG00000019004	SLC7A4 (ENSNSUG00000019005)	ENSNSUG00000019006
Indian cobra	MODERN SPECIES	16	GLT1D1 (ENSNNAG00000016691)	SLC15A4 (ENSNNAG00000016736)	TMEM132C (ENSNNAG00000016745)	TMEM132B (ENSNNAG00000016778)	ENSNNAG00000016866	ENSNNAG00000016900	BRI3BP (ENSNNAG00000016914)	DHX37 (ENSNNAG00000016938)	ENSNNAG00000017043	ENSNNAG00000017048	SCARB1 (ENSNNAG00000017060)	RFLNA (ENSNNAG00000017081)	RTN4R (ENSNNAG00000017084)	ENSNNAG00000017087	ENSNNAG00000017101	SCARF2 (ENSNNAG00000017126) ##22	ENSNNAG00000017133	SLC7A4 (ENSNNAG00000017136)	LRRC74B (ENSNNAG00000017139)	ENSNNAG00000017147	AIFM3 (ENSNNAG00000017155)	SIRT4 (ENSNNAG00000017182)	ENSNNAG00000017211	MSI1 (ENSNNAG00000017246)	ENSNNAG00000017255	SRSF9 (ENSNNAG00000017260)	GATC (ENSNNAG00000017266)	DYNLL1 (ENSNNAG00000017273)	COQ5 (ENSNNAG00000017279)	RNF10 (ENSNNAG00000017290)	POP5 (ENSNNAG00000017302)
Lizard	MODERN SPECIES	1029	ENSACAG00000009785	ENSACAG00000009791	OSBP2 (ENSACAG00000009795)	ENSACAG00000009898	ENSACAG00000009903	ENSACAG00000036241	SELENOM (ENSACAG00000010104)	INPP5J (ENSACAG00000010115)	PLA2G3 (ENSACAG00000010184)	ENSACAG00000010190	ENSACAG00000041012	ENSACAG00000034653	ENSACAG00000010305	ENSACAG00000023669	ENSACAG00000010604	ENSACAG00000010663 ##22	ENSACAG00000010700	ENSACAG00000010726	ENSACAG00000010740	ENSACAG00000010764	ENSACAG00000036753	ENSACAG00000011078
tuatara	MODERN SPECIES	188														RTN4R (ENSSPUG00000016004)	ENSSPUG00000015968	SCARF2 (ENSSPUG00000015910) ##22	ENSSPUG00000015895	SLC7A4 (ENSSPUG00000015885)	ENSSPUG00000015879	ENSSPUG00000015871	ENSSPUG00000015819	SIRT4 (ENSSPUG00000015797)	ENSSPUG00000015783	PLA2G1B (ENSSPUG00000015775)	MSI1 (ENSSPUG00000015741)	COX6A1 (ENSSPUG00000015718)	TRIAP1 (ENSSPUG00000015707)	GATC (ENSSPUG00000015693)	SRSF9 (ENSSPUG00000015680)	DYNLL1 (ENSSPUG00000015673)	COQ5 (ENSSPUG00000015661)
Archelosauria	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT01030000235175.b	ENSGT01050000244888.b.b.a.b	ENSGT00940000153998.b	ENSGT00940000161655	ENSGT00940000154284.b	ENSGT00960000189450	ENSGT00940000156855	ENSGT00940000161662	ENSGT00940000162007	ENSGT01020000230351.A	ENSGT00390000010194	ENSGT00950000185268	ENSGT00940000161539	ENSGT00940000160711	ENSGT00390000006265.b	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00390000017663	ENSGT00940000154637	ENSGT00940000154297.B	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000153899.b.a	ENSGT00940000160448
Cryptodira	ANCESTRAL SPECIES	34	ENSGT01030000235175.b	ENSGT01050000244888.b.b.a.b	ENSGT00940000153998.b	ENSGT00960000189450	ENSGT00940000156855	ENSGT00940000161662	ENSGT00510000046406.f.b.a.a.a.b	ENSGT00940000162007	ENSGT01020000230351.A	ENSGT00390000010194	ENSGT00950000185268	ENSGT00940000161539	ENSGT00830000128447.b	ENSGT00940000160711	ENSGT00390000006265.b	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00390000017663	ENSGT00940000154637	ENSGT00940000154297.B	ENSGT00940000160448	ENSGT00730000111354	ENSGT00940000158958	ENSGT00940000157433	ENSGT00530000063509.B	ENSGT00940000160172	ENSGT00940000160713	ENSGT00940000161536	ENSGT00840000129953	ENSGT00940000156506.b	ENSGT00940000158066	ENSGT00390000013680.a
Testudinoidea	ANCESTRAL SPECIES	31	ENSGT00940000161655	ENSGT00940000154284.b	ENSGT00960000189450	ENSGT00940000156855	ENSGT00940000161662	ENSGT00510000046406.f.b.a.a.a.a	ENSGT00510000046406.f.b.a.a.a.b	ENSGT00940000162007	ENSGT01020000230351.A	ENSGT00390000010194	ENSGT00950000185268	ENSGT00940000161539	ENSGT00830000128447.b	ENSGT00940000160711	ENSGT00390000006265.b	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00390000017663.h	ENSGT00940000154637	ENSGT00940000153899.b.a	ENSGT00940000160448	ENSGT00730000111354	ENSGT00940000158958	ENSGT00940000157433	ENSGT00530000063509.B	ENSGT00940000160172	ENSGT00940000160713	ENSGT00940000161536	ENSGT00840000129953	ENSGT00940000156506.b	ENSGT00940000158066	ENSGT00390000013680.a
Testudinidae	ANCESTRAL SPECIES	40	ENSGT00940000161655	ENSGT00940000154284.b	ENSGT00960000189450	ENSGT00940000156855	ENSGT00940000161662	ENSGT00510000046406.f.b.a.a.a.a	ENSGT00510000046406.f.b.a.a.a.b	ENSGT00940000162007	ENSGT01020000230351.A	ENSGT00390000010194	ENSGT00950000185268	ENSGT00940000161539	ENSGT00830000128447.b	ENSGT00940000160711	ENSGT00390000006265.b	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00390000017663.h	ENSGT00940000154637	ENSGT00940000153899.b.a	ENSGT00940000160448	ENSGT00730000111354	ENSGT00940000158958	ENSGT00940000157433	ENSGT00530000063509.B	ENSGT00940000160172	ENSGT00940000160713	ENSGT00940000161536	ENSGT00840000129953	ENSGT00940000156506.b	ENSGT00940000158066	ENSGT00390000013680.a
Abingdon island giant tortoise	MODERN SPECIES	2634	SELENOM (ENSCABG00000012428)	ENSCABG00000012425	ENSCABG00000012422	PLA2G3 (ENSCABG00000012419)	ENSCABG00000012409	ENSCABG00000012402	ISG15 (ENSCABG00000012397)	P2RX2 (ENSCABG00000012392)	POLE (ENSCABG00000011905)	PXMP2 (ENSCABG00000011851)	ENSCABG00000011850	ENSCABG00000011849	RTN4R (ENSCABG00000011848)	ENSCABG00000011846	ENSCABG00000011748	SCARF2 (ENSCABG00000011734) ##22	ENSCABG00000011729	ENSCABG00000011727	SLC7A4 (ENSCABG00000011723)	ENSCABG00000011721	ENSCABG00000011717	IQCD (ENSCABG00000011679)	TPCN1 (ENSCABG00000011305)	SLC8B1 (ENSCABG00000011295)
Goode s thornscrub tortoise	MODERN SPECIES	4	SMTN (ENSGEVG00005015773)	SELENOM (ENSGEVG00005015711)	INPP5J (ENSGEVG00005015550)	PLA2G3 (ENSGEVG00005015457)	ENSGEVG00005015433	ENSGEVG00005015328	ISG15 (ENSGEVG00005015307)	P2RX2 (ENSGEVG00005014916)	POLE (ENSGEVG00005011459)	ENSGEVG00005011117	PXMP2 (ENSGEVG00005011092)	ENSGEVG00005011054	ENSGEVG00005011009	RTN4R (ENSGEVG00005010958)	ENSGEVG00005009298	SCARF2 (ENSGEVG00005008693) ##22	ENSGEVG00005008661	SLC7A4 (ENSGEVG00005008634)	ENSGEVG00005008571	AIFM3 (ENSGEVG00005008351)	IQCD (ENSGEVG00005008213)	TPCN1 (ENSGEVG00005008135)	ENSGEVG00005008059	PLBD2 (ENSGEVG00005007605)	SDS (ENSGEVG00005007522)	SDSL (ENSGEVG00005007452)	LHX5 (ENSGEVG00005020133)	RBM19 (ENSGEVG00005020099)	TBX5 (ENSGEVG00005020077)	TBX3 (ENSGEVG00005020071)	MED13L (ENSGEVG00005020031)
Emydidae	ANCESTRAL SPECIES	44	ENSGT00940000161655	ENSGT00940000154284.b	ENSGT00960000189450	ENSGT00940000156855	ENSGT00940000161662	ENSGT00510000046406.f.b.a.a.a.a	ENSGT00510000046406.f.b.a.a.a.b	ENSGT00940000162007	ENSGT01020000230351.A	ENSGT00390000010194	ENSGT00950000185268	ENSGT00940000161539	ENSGT00830000128447.b	ENSGT00940000160711	ENSGT00390000006265.b	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00390000017663.h	ENSGT00940000154637	ENSGT00940000153899.b.a	ENSGT00940000160448	ENSGT00730000111354	ENSGT00940000158958	ENSGT00940000157433	ENSGT00530000063509.B	ENSGT00940000160172	ENSGT00940000160713	ENSGT00940000161536	ENSGT00840000129953	ENSGT00940000156506.b	ENSGT00940000158066	ENSGT00390000013680.a
painted turtle	MODERN SPECIES	912														RTN4R (ENSCPBG00000027115)	ENSCPBG00000027109	SCARF2 (ENSCPBG00000027101) ##22	ENSCPBG00000027099
Three-toed box turtle	MODERN SPECIES	410	SMTN (ENSTMTG00000003937)	SELENOM (ENSTMTG00000004016)	ENSTMTG00000004029	ENSTMTG00000004058	PLA2G3 (ENSTMTG00000004209)	ENSTMTG00000004272	ENSTMTG00000004281	ISG15 (ENSTMTG00000004292)	ENSTMTG00000004300	ENSTMTG00000004310	POLE (ENSTMTG00000004404)	PXMP2 (ENSTMTG00000005239)	ENSTMTG00000005254	RTN4R (ENSTMTG00000005286)	ENSTMTG00000005312	SCARF2 (ENSTMTG00000005330) ##22	ENSTMTG00000005349	ENSTMTG00000005359	SLC7A4 (ENSTMTG00000005370)	ENSTMTG00000005389	AIFM3 (ENSTMTG00000005406)	IQCD (ENSTMTG00000005460)	TPCN1 (ENSTMTG00000005493)	SLC8B1 (ENSTMTG00000005560)	PLBD2 (ENSTMTG00000005606)	SDS (ENSTMTG00000005642)	SDSL (ENSTMTG00000005681)	LHX5 (ENSTMTG00000005702)	RBM19 (ENSTMTG00000005728)	TBX5 (ENSTMTG00000005770)	TBX3 (ENSTMTG00000005799)
Chinese turtle	MODERN SPECIES	1718															ENSPSIG00000012403	SCARF2 (ENSPSIG00000014189) ##22
Archosauria	ANCESTRAL SPECIES	37	ENSGT00390000006208.b	ENSGT00940000157386	ENSGT00730000111077	ENSGT00390000013684	ENSGT00940000159671	ENSGT00940000160650	ENSGT00390000004019	ENSGT00950000182923.C	ENSGT00390000002626	ENSGT00530000063370.b	ENSGT00730000111291	ENSGT00940000163638	ENSGT00940000157987	ENSGT00940000160711	ENSGT00390000006265.b	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00390000017663	ENSGT00940000154637	ENSGT00940000154297.B	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000153899.b.a	ENSGT00940000160448	ENSGT01050000244888.b.b.a.b	ENSGT00940000153998.b	ENSGT00940000161655	ENSGT00940000154284.b	ENSGT00960000189450	ENSGT00940000156855	ENSGT00940000161662	ENSGT01020000230351.A	ENSGT00390000010194
Aves	ANCESTRAL SPECIES	48	ENSGT00940000157386	ENSGT00730000111077	ENSGT00390000013684	ENSGT00940000159671	ENSGT00940000160650	ENSGT00390000004019	ENSGT00950000182923.C	ENSGT00390000002626	ENSGT00530000063370.b	ENSGT00730000111291	ENSGT00940000163638	ENSGT00730000111354	ENSGT00940000157987	ENSGT00940000160711	ENSGT00390000006265.b	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00390000017663	ENSGT00940000154637	ENSGT00940000154297.B	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000153899.b.a	ENSGT00940000160448	ENSGT00830000128447.b	ENSGT00390000010194	ENSGT01020000230351.A	ENSGT00940000161662	ENSGT00940000156855	ENSGT00960000189450	ENSGT00940000154284.b	ENSGT00940000161655	ENSGT00940000153998.b
Neognathae	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000157386	ENSGT00730000111077	ENSGT00390000013684	ENSGT00940000159671	ENSGT00940000160650	ENSGT00390000004019	ENSGT00950000182923.C	ENSGT00390000002626	ENSGT00530000063370.b	ENSGT00730000111291	ENSGT00940000163638	ENSGT00730000111354	ENSGT00940000157987	ENSGT00940000160711	ENSGT00390000006265.b	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00390000017663	ENSGT00940000154637	ENSGT00940000154297.B	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000153899.b.a	ENSGT00940000160448	ENSGT00830000128447.b	ENSGT00390000010194	ENSGT01020000230351.A	ENSGT00940000161662	ENSGT00940000156855	ENSGT00960000189450	ENSGT00940000154284.b	ENSGT00940000161655	ENSGT00940000153998.b
Galloanserae	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00730000111077	ENSGT00390000013684	ENSGT00940000159671	ENSGT00940000160650	ENSGT00960000190318	ENSGT00390000004019	ENSGT00950000182923.C	ENSGT00390000002626	ENSGT00530000063370.b	ENSGT00730000111291	ENSGT00940000163638	ENSGT00730000111354	ENSGT00940000157987	ENSGT00940000160711	ENSGT00390000006265.b	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00390000017663	ENSGT00940000154637	ENSGT00940000154297.B	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000153899.b.a	ENSGT00940000160448	ENSGT00830000128447.b	ENSGT00390000010194	ENSGT01020000230351.A	ENSGT00940000161662	ENSGT00940000156855	ENSGT00940000154284.b	ENSGT00940000161655	ENSGT00940000153998.b	ENSGT01050000244888.b.b.a.b
Phasianidae	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00730000111077	ENSGT00390000013684	ENSGT00940000159671	ENSGT00940000160650.a	ENSGT00940000160650.b	ENSGT00960000190318	ENSGT00950000182923.C	ENSGT00390000002626	ENSGT00530000063370.b	ENSGT00730000111291	ENSGT00940000163638	ENSGT00730000111354	ENSGT00940000157987	ENSGT00940000160711	ENSGT00390000006265.b	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00390000017663	ENSGT00940000154637	ENSGT00940000154297.B	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000153899.b.a	ENSGT00940000160448	ENSGT00830000128447.b	ENSGT00390000010194	ENSGT01020000230351.A	ENSGT00940000161662	ENSGT00940000156855	ENSGT00940000154284.b	ENSGT00940000161655	ENSGT00940000153998.b	ENSGT01050000244888.b.b.a.b
Japanese quail	MODERN SPECIES	6	SF3A1 (ENSCJPG00005014846)	CCDC157 (ENSCJPG00005014845)	RNF215 (ENSCJPG00005014844)	ENSCJPG00005014843	ENSCJPG00005014842	ENSCJPG00005014841	GAL3ST1 (ENSCJPG00005014840)	PES1 (ENSCJPG00005014839)	TCN2 (ENSCJPG00005014838)	SLC35E4 (ENSCJPG00005014837)	DUSP21 (ENSCJPG00005014836)	IQCD (ENSCJPG00005014835)	OSBP2 (ENSCJPG00005014834)	RTN4R (ENSCJPG00005014826)	ENSCJPG00005014602	SCARF2 (ENSCJPG00005014601) ##22	ENSCJPG00005014600	SLC7A4 (ENSCJPG00005014599)	LRRC74B (ENSCJPG00005014598)	P2RX6 (ENSCJPG00005014597)	ENSCJPG00005014596	AIFM3 (ENSCJPG00005014595)	ENSCJPG00005014594	ENSCJPG00005014593	POLE (ENSCJPG00005014575)	P2RX2 (ENSCJPG00005014574)	PLA2G3 (ENSCJPG00005014573)	INPP5J (ENSCJPG00005014572)	SELENOM (ENSCJPG00005014571)	SMTN (ENSCJPG00005014570)	MORC2 (ENSCJPG00005014569)
Phasianidae_b	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00730000111077	ENSGT00390000013684	ENSGT00940000159671	ENSGT00940000160650.a	ENSGT00940000160650.b	ENSGT00960000190318	ENSGT00950000182923.C	ENSGT00940000174960	ENSGT00530000063370.b	ENSGT00730000111291	ENSGT00940000163638	ENSGT00730000111354	ENSGT00940000157987	ENSGT00940000160711	ENSGT00390000006265.b	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00390000017663	ENSGT00940000154637	ENSGT00940000154297.B	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000153899.b.a	ENSGT00940000160448	ENSGT00830000128447.b	ENSGT00390000010194	ENSGT01020000230351.A	ENSGT00940000161662	ENSGT00940000156855	ENSGT00940000154284.b	ENSGT00940000161655	ENSGT00940000153998.b	ENSGT01050000244888.b.b.a.b
Turkey	MODERN SPECIES	8	ENSMGAG00000009166	ENSMGAG00000009249	ENSMGAG00000020211	ENSMGAG00000019560	ENSMGAG00000009293	ENSMGAG00000009309	ENSMGAG00000009340	ENSMGAG00000009323	ENSMGAG00000009408	ENSMGAG00000009490	ENSMGAG00000009439	ENSMGAG00000009433	ENSMGAG00000009414	ENSMGAG00000009499	ENSMGAG00000009508	ENSMGAG00000009515 ##22	ENSMGAG00000009527	ENSMGAG00000021478	ENSMGAG00000015497	ENSMGAG00000009563	ENSMGAG00000020672	ENSMGAG00000016101	ENSMGAG00000014418	ENSMGAG00000014420	ENSMGAG00000014421	ENSMGAG00000022576	MTFP1 (ENSMGAG00000014423)	SF3A1 (ENSMGAG00000001330)	ENSMGAG00000001357	RNF215 (ENSMGAG00000001376)	ENSMGAG00000001279
Chicken	MODERN SPECIES	6	SF3A1 (ENSGALG00010000215)	CCDC157 (ENSGALG00010000210)	RNF215 (ENSGALG00010000205)	ENSGALG00010000202	ENSGALG00010000575	ENSGALG00010000201	GAL3ST1 (ENSGALG00010000200)	ENSGALG00010000303	TCN2 (ENSGALG00010000286)	SLC35E4 (ENSGALG00010000298)	DUSP21 (ENSGALG00010000294)	IQCD (ENSGALG00010000287)	OSBP2 (ENSGALG00010000281)	RTN4R (ENSGALG00010000271)	PRODH (ENSGALG00010000145)	SCARF2 (ENSGALG00010000143) ##22	DGCR6 (ENSGALG00010000442)	SLC7A4 (ENSGALG00010000441)	ENSGALG00010000440	P2RX6 (ENSGALG00010000435)	ENSGALG00010000433	AIFM3 (ENSGALG00010000431)	ENSGALG00010000423	POLE (ENSGALG00010022162)	P2RX2 (ENSGALG00010022145)	PLA2G3 (ENSGALG00010022128)	INPP5J (ENSGALG00010022097)	SELENOM (ENSGALG00010022084)	SMTN (ENSGALG00010022072)	MORC1 (ENSGALG00010021903)	APLNR2 (ENSGALG00010026683)
Anatidae	ANCESTRAL SPECIES	66	ENSGT00730000111077	ENSGT00390000013684	ENSGT00940000159671	ENSGT00940000160650	ENSGT00960000190318	ENSGT00390000004019	ENSGT00950000182923.C	ENSGT00390000002626	ENSGT00530000063370.b	ENSGT00730000111291	ENSGT00940000163638	ENSGT00730000111354	ENSGT00940000157987	ENSGT00940000160711	ENSGT00390000006265.b	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00390000017663	ENSGT00940000154637	ENSGT00940000154297.B	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000153899.b.a	ENSGT00940000160448	ENSGT00390000010194	ENSGT01020000230351.A	ENSGT00940000161662	ENSGT00940000156855	ENSGT00940000161655	ENSGT00940000153998.b	ENSGT01050000244888.b.b.a.b	ENSGT00390000007971
Pink-footed goose	MODERN SPECIES	272														RTN4R (ENSABRG00000003496)	ENSABRG00000003508	SCARF2 (ENSABRG00000003538) ##22	ENSABRG00000003549	SLC7A4 (ENSABRG00000003587)	ENSABRG00000003613	P2RX6 (ENSABRG00000003640)	ENSABRG00000003822	AIFM3 (ENSABRG00000003836)	POLE (ENSABRG00000003861)	P2RX2 (ENSABRG00000003970)	ENSABRG00000004154	INPP5J (ENSABRG00000004191)
Neognathae_b	ANCESTRAL SPECIES	31	ENSGT00940000157386	ENSGT00730000111077	ENSGT00390000013684	ENSGT00940000159671	ENSGT00940000160650	ENSGT00390000004019	ENSGT00950000182923.C	ENSGT00390000002626	ENSGT00530000063370.b	ENSGT00730000111291	ENSGT00940000163638	ENSGT00730000111354	ENSGT00940000157987	ENSGT00940000160711	ENSGT00390000006265.b	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00390000017663	ENSGT00940000154637	ENSGT00940000154297.B	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000153899.b.a	ENSGT00940000160448	ENSGT00830000128447.b	ENSGT00390000010194	ENSGT00940000161662	ENSGT00940000156855	ENSGT00960000189450	ENSGT00940000154495.b.a.b	ENSGT00940000153998.b	ENSGT00390000007971
Neognathae_c	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00390000006208.b	ENSGT00940000157386	ENSGT00730000111077	ENSGT00390000013684	ENSGT00940000159671	ENSGT00940000160650	ENSGT00950000182923.C	ENSGT00390000002626	ENSGT00530000063370.b	ENSGT00730000111291	ENSGT00940000163638	ENSGT00730000111354	ENSGT00940000157987	ENSGT00940000160711	ENSGT00390000006265.b	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00390000017663	ENSGT00940000154637	ENSGT00940000154297.B	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000153899.b.a	ENSGT00940000160448	ENSGT00830000128447.b	ENSGT00390000010194	ENSGT00940000161662	ENSGT00940000156855	ENSGT00940000154284.b	ENSGT00940000154495.b.b	ENSGT00940000153998.b	ENSGT00390000007971
Golden eagle	MODERN SPECIES	25	CASTOR1 (ENSACCG00020002269)	TBC1D10A (ENSACCG00020002296)	SF3A1 (ENSACCG00020002327)	CCDC157 (ENSACCG00020002344)	RNF215 (ENSACCG00020002362)	SEC14L2 (ENSACCG00020002400)	GAL3ST1 (ENSACCG00020002436)	PES1 (ENSACCG00020002517)	TCN2 (ENSACCG00020002576)	SLC35E4 (ENSACCG00020002602)	DUSP21 (ENSACCG00020002612)	IQCD (ENSACCG00020002628)	ENSACCG00020002679	RTN4R (ENSACCG00020002714)	ENSACCG00020002771	SCARF2 (ENSACCG00020002816) ##22	ENSACCG00020002835	SLC7A4 (ENSACCG00020002845)	LRRC74B (ENSACCG00020002870)	P2RX6 (ENSACCG00020002894)	ENSACCG00020002912	AIFM3 (ENSACCG00020002931)	ENSACCG00020002975	POLE (ENSACCG00020003141)	PLA2G3 (ENSACCG00020003312)	INPP5J (ENSACCG00020003348)	SELENOM (ENSACCG00020003378)	ENSACCG00020003391	MORC2 (ENSACCG00020003413)
Kakapo	MODERN SPECIES	3	SF3A1 (ENSSHBG00005017202)	ENSSHBG00005017204	ENSSHBG00005017209	RNF215 (ENSSHBG00005017212)	SEC14L2 (ENSSHBG00005017218)	GAL3ST1 (ENSSHBG00005000866)	PES1 (ENSSHBG00005005320)	TCN2 (ENSSHBG00005005346)	SLC35E4 (ENSSHBG00005005407)	IQCD (ENSSHBG00005005418)	OSBP2 (ENSSHBG00005005446)	ENSSHBG00005005498	RTN4R (ENSSHBG00005005550)	ENSSHBG00005005564	ENSSHBG00005005581	SCARF2 (ENSSHBG00005005607) ##22	ENSSHBG00005005622	SLC7A4 (ENSSHBG00005005640)	P2RX6 (ENSSHBG00005005662)	ENSSHBG00005005685	AIFM3 (ENSSHBG00005005713)	POLE (ENSSHBG00005005876)	ENSSHBG00005006422	MORC2 (ENSSHBG00005006449)	ENSSHBG00005006495	ENSSHBG00005006540	INPP5J (ENSSHBG00005006587)	PLA2G3 (ENSSHBG00005006613)	ENSSHBG00005006652	ENSSHBG00005006670	ENSSHBG00005006696
Passeriformes	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00390000006208.b	ENSGT00940000157386	ENSGT00730000111077	ENSGT00390000013684	ENSGT00940000159671	ENSGT00940000160650	ENSGT00390000004019	ENSGT00950000182923.C	ENSGT00390000002626	ENSGT00530000063370.b	ENSGT00730000111291	ENSGT00730000111354	ENSGT00940000157987	ENSGT00940000160711	ENSGT00390000006265.b	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00390000017663	ENSGT00940000154637	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000153899.b.a	ENSGT00940000160448	ENSGT00390000010194	ENSGT00940000161662	ENSGT00940000156855	ENSGT00960000189450	ENSGT00940000154495.b.a.b	ENSGT00940000153998.b
Great tit	MODERN SPECIES	6	TBC1D10A (ENSPMJG00000018914)	ENSPMJG00000018915	SF3A1 (ENSPMJG00000018916)	CCDC157 (ENSPMJG00000019085)	RNF215 (ENSPMJG00000019086)	SEC14L2 (ENSPMJG00000019087)	MTFP1 (ENSPMJG00000019088)	GAL3ST1 (ENSPMJG00000019090)	PES1 (ENSPMJG00000019091)	ENSPMJG00000019092	ENSPMJG00000019093	ENSPMJG00000019094	OSBP2 (ENSPMJG00000019095)	RTN4R (ENSPMJG00000019102)	ENSPMJG00000019103	SCARF2 (ENSPMJG00000019122) ##22	ENSPMJG00000019124	SLC7A4 (ENSPMJG00000019126)	P2RX6 (ENSPMJG00000019127)	ENSPMJG00000019128	AIFM3 (ENSPMJG00000019129)	POLE (ENSPMJG00000019130)	ENSPMJG00000019133	ENSPMJG00000019134	ENSPMJG00000019135	SELENOM (ENSPMJG00000019136)	ENSPMJG00000019137	MORC2 (ENSPMJG00000019138)	ENSPMJG00000019139
Passeriformes_d	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00390000006208.b	ENSGT00940000157386	ENSGT00730000111077	ENSGT00390000013684	ENSGT00940000159671	ENSGT00940000160650	ENSGT00390000004019	ENSGT00950000182923.C	ENSGT00390000002626	ENSGT00530000063370.b	ENSGT00730000111291	ENSGT00730000111354	ENSGT00940000157987	ENSGT00940000160711	ENSGT00390000006265.b	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00390000017663	ENSGT00940000154637	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000153899.b.a	ENSGT00940000160448	ENSGT00390000010194	ENSGT00940000161662	ENSGT00940000156855	ENSGT00940000154284.b	ENSGT00940000161655	ENSGT00940000153998.b
Passeriformes_g	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00390000006208.b	ENSGT00940000157386	ENSGT00730000111077	ENSGT00390000013684	ENSGT00940000159671	ENSGT00940000160650	ENSGT00390000004019	ENSGT00950000182923.C	ENSGT00390000002626	ENSGT00530000063370.b	ENSGT00730000111291	ENSGT00730000111354	ENSGT00940000157987	ENSGT00940000160711	ENSGT00390000006265.b	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00390000017663	ENSGT00940000154637	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000153899.b.a	ENSGT00940000160448	ENSGT00390000010194	ENSGT00940000161662	ENSGT00940000156855	ENSGT00940000154284.b	ENSGT00940000161655	ENSGT00940000153998.b
Passeroidea	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00390000006208.b	ENSGT00940000157386	ENSGT00730000111077	ENSGT00390000013684	ENSGT00940000159671	ENSGT00940000160650	ENSGT00390000004019	ENSGT00950000182923.C	ENSGT00390000002626	ENSGT00530000063370.b	ENSGT00730000111291	ENSGT00730000111354	ENSGT00940000157987	ENSGT00940000160711	ENSGT00390000006265.b	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00390000017663	ENSGT00940000154637	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000153899.b.a	ENSGT00940000160448	ENSGT00390000010194	ENSGT00940000161662	ENSGT00940000156855	ENSGT00940000154284.b	ENSGT00940000161655	ENSGT00940000153998.b
Common canary	MODERN SPECIES	18	LIF (ENSSCAG00000001701)	CASTOR1 (ENSSCAG00000001698)	TBC1D10A (ENSSCAG00000001693)	ENSSCAG00000001690	SF3A1 (ENSSCAG00000001394)	ENSSCAG00000001287	RNF215 (ENSSCAG00000001275)	SEC14L2 (ENSSCAG00000001239)	GAL3ST1 (ENSSCAG00000001227)	PES1 (ENSSCAG00000001203)	SLC35E4 (ENSSCAG00000001193)	ENSSCAG00000001188	OSBP2 (ENSSCAG00000001175)	RTN4R (ENSSCAG00000001161)	ENSSCAG00000000939	SCARF2 (ENSSCAG00000000867) ##22	ENSSCAG00000000859	SLC7A4 (ENSSCAG00000000851)	P2RX6 (ENSSCAG00000000841)	ENSSCAG00000000835	AIFM3 (ENSSCAG00000000803)	POLE (ENSSCAG00000000471)	ENSSCAG00000000371	INPP5J (ENSSCAG00000000310)	SELENOM (ENSSCAG00000000285)	ENSSCAG00000000253	MORC2 (ENSSCAG00000000216)
Zebra finch	MODERN SPECIES	6	TBC1D10A (ENSTGUG00000010542)	SF3A1 (ENSTGUG00000010547)	CCDC157 (ENSTGUG00000010559)	RNF215 (ENSTGUG00000021023)	SEC14L2 (ENSTGUG00000027525)	MTFP1 (ENSTGUG00000019026)	GAL3ST1 (ENSTGUG00000021634)	PES1 (ENSTGUG00000015553)	ENSTGUG00000024830	SLC35E4 (ENSTGUG00000023323)	IQCD (ENSTGUG00000010561)	OSBP2 (ENSTGUG00000010563)	ENSTGUG00000025289	ENSTGUG00000027845	ENSTGUG00000010576	SCARF2 (ENSTGUG00000010584) ##22	DGCR6L (ENSTGUG00000010597)	SLC7A4 (ENSTGUG00000010604)	P2RX6 (ENSTGUG00000010608)	ENSTGUG00000010630	AIFM3 (ENSTGUG00000010632)	ENSTGUG00000021252	POLE (ENSTGUG00000010645)	ENSTGUG00000010714	INPP5J (ENSTGUG00000010717)	ENSTGUG00000026759	SELENOM (ENSTGUG00000028886)	SMTN (ENSTGUG00000010726)	MORC2 (ENSTGUG00000010740)
Medium ground finch	MODERN SPECIES	151	CASTOR1 (ENSGFOG00000005067)	TBC1D10A (ENSGFOG00000005077)	SF3A1 (ENSGFOG00000005088)	CCDC157 (ENSGFOG00000005556)	RNF215 (ENSGFOG00000005565)	SEC14L2 (ENSGFOG00000005585)	MTFP1 (ENSGFOG00000005622)	GAL3ST1 (ENSGFOG00000005626)	PES1 (ENSGFOG00000005631)	TCN2 (ENSGFOG00000005643)	IQCD (ENSGFOG00000005649)	OSBP2 (ENSGFOG00000005657)	RTN4R (ENSGFOG00000005661)	ENSGFOG00000005665	ENSGFOG00000005681	SCARF2 (ENSGFOG00000005721) ##22	ENSGFOG00000005746	SLC7A4 (ENSGFOG00000005750)	P2RX6 (ENSGFOG00000005760)	ENSGFOG00000005772	AIFM3 (ENSGFOG00000005785)	POLE (ENSGFOG00000005817)	ENSGFOG00000005850	ENSGFOG00000005865	MORC2 (ENSGFOG00000005919)
Flycatcher	MODERN SPECIES	6	CCDC157 (ENSFALG00000006929)	ENSFALG00000006924	SEC14L2 (ENSFALG00000006919)	ENSFALG00000022992	GAL3ST1 (ENSFALG00000023819)	PES1 (ENSFALG00000027205)	TCN2 (ENSFALG00000006906)	SLC35E4 (ENSFALG00000024365)	ENSFALG00000006900	ENSFALG00000028809	OSBP2 (ENSFALG00000006894)	ENSFALG00000022965	ENSFALG00000014439	ENSFALG00000028236	ENSFALG00000006875	ENSFALG00000006869 ##22	ENSFALG00000026500	ENSFALG00000006867	ENSFALG00000006856	ENSFALG00000006843	ENSFALG00000006832	ENSFALG00000006825	ENSFALG00000026257	INPP5J (ENSFALG00000006809)	ENSFALG00000025625	SELENOM (ENSFALG00000026117)	MORC2 (ENSFALG00000006803)	ENSFALG00000006799
African ostrich	MODERN SPECIES	512														RTN4R (ENSSCUG00000006279)	ENSSCUG00000006274	SCARF2 (ENSSCUG00000006271) ##22	SLC7A4 (ENSSCUG00000006266)	P2RX6 (ENSSCUG00000006262)	ENSSCUG00000006261	AIFM3 (ENSSCUG00000006254)	ENSSCUG00000006246	POLE (ENSSCUG00000006231)
Mammalia	ANCESTRAL SPECIES	81	ENSGT00940000154816.a.b	ENSGT00390000018606	ENSGT00940000158832	ENSGT00940000155317.b	ENSGT00940000157027	ENSGT00390000012733	ENSGT00390000015977	ENSGT00970000193655	ENSGT00530000063723.a	ENSGT00940000154389.b	ENSGT01100000263932	ENSGT00900000141073	ENSGT00940000158044.a	ENSGT00940000160711	ENSGT00390000006265.b	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00390000017663	ENSGT00940000154637	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000154297.B
Theria	ANCESTRAL SPECIES	55	ENSGT00940000164254	ENSGT00940000160448	ENSGT00940000158190	ENSGT00730000111394	ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.a.b	ENSGT00940000154457.a.a	ENSGT00940000154297.B	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000154637	ENSGT00950000182825.B	ENSGT00390000014845	ENSGT00390000006044	ENSGT00390000007249	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00390000017663
Marsupialia	ANCESTRAL SPECIES	43	ENSGT00390000002259	ENSGT00940000160018	ENSGT00390000004807	ENSGT00940000156516	ENSGT00940000158884	ENSGT00940000156771	ENSGT00940000161453	ENSGT00940000153189.A	ENSGT00940000154637	ENSGT00950000182825.B	ENSGT00390000014845	ENSGT00390000006044	ENSGT00390000007249	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00390000017663
Marsupialia_b	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00390000002259	ENSGT00940000160018	ENSGT00390000004807	ENSGT00940000156516	ENSGT00940000158884	ENSGT00940000156771	ENSGT00940000161453	ENSGT00940000153189.A	ENSGT00940000154637	ENSGT00950000182825.B	ENSGT00390000014845	ENSGT00390000006044	ENSGT00390000007249	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00390000017663	ENSGT00940000153307	ENSGT00940000162558	ENSGT00940000153120
Diprotodontia	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00390000002259	ENSGT00940000160018	ENSGT00390000004807	ENSGT00940000156516	ENSGT00940000158884	ENSGT00940000156771	ENSGT00940000161453	ENSGT00940000153189.A	ENSGT00940000154637	ENSGT00950000182825.B	ENSGT00390000014845	ENSGT00390000006044	ENSGT00390000007249	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00390000017663
Diprotodontia_a	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00390000002259	ENSGT00940000160018	ENSGT00390000004807	ENSGT00940000156516	ENSGT00940000158884	ENSGT00940000156771	ENSGT00940000161453	ENSGT00940000153189.A	ENSGT00940000154637	ENSGT00950000182825.B	ENSGT00390000014845	ENSGT00390000006044	ENSGT00390000007249	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00390000017663
Common wonbat	MODERN SPECIES	1225	SDF2L1 (ENSVURG00010021784)	ENSVURG00010021788	TOP3B (ENSVURG00010021796)	PPM1F (ENSVURG00010021805)	MAPK1 (ENSVURG00010021810)	ENSVURG00010021815	YPEL1 (ENSVURG00010021818)	PPIL2 (ENSVURG00010021827)	SLC7A4 (ENSVURG00010021845)	TUBA3D (ENSVURG00010021849)	ENSVURG00010021856	SMPD4 (ENSVURG00010021870)	ENSVURG00010021907	ENSVURG00010021914	KLHL22 (ENSVURG00010021917)	SCARF2 (ENSVURG00010021921) ##22	ENSVURG00010021926
koala	MODERN SPECIES	64	SDF2L1 (ENSPCIG00000026737)	ENSPCIG00000023621	TOP3B (ENSPCIG00000026463)	PPM1F (ENSPCIG00000026456)	MAPK1 (ENSPCIG00000026450)	YPEL1 (ENSPCIG00000030743)	PPIL2 (ENSPCIG00000026443)	SLC7A4 (ENSPCIG00000026440)	TUBA3D (ENSPCIG00000026437)	ENSPCIG00000003168	SMPD4 (ENSPCIG00000012290)	ENSPCIG00000034692	ENSPCIG00000012292	ENSPCIG00000036086	KLHL22 (ENSPCIG00000012294)	ENSPCIG00000005534 ##22
Wallaby	MODERN SPECIES	811															KLHL22 (ENSMEUG00000012880)	SCARF2 (ENSMEUG00000012816) ##22
Eutheria	ANCESTRAL SPECIES	37	ENSGT00950000182843.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000160448	ENSGT00940000158190	ENSGT00730000111394	ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.a.b	ENSGT00940000154297.B	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000154637	ENSGT00950000182825.B	ENSGT00390000014845	ENSGT00390000006044	ENSGT00390000007249	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00940000162972	ENSGT00390000017655	ENSGT00940000163130	ENSGT00410000026913	ENSGT00940000162226	ENSGT00390000009387	ENSGT00940000162536	ENSGT00550000074856	ENSGT00950000183166.a.b	ENSGT00550000074919	ENSGT00390000010239	ENSGT00390000002511	ENSGT00390000002408	ENSGT00390000009662	ENSGT00940000161769
Boreoeutheria	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00950000182843.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000160448	ENSGT00940000158190	ENSGT00730000111394	ENSGT00950000182825.B	ENSGT00940000154637	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000154297.B	ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.a.b	ENSGT00390000014845	ENSGT00390000006044	ENSGT00390000007249	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00940000162000.d	ENSGT00940000162972	ENSGT00390000017655	ENSGT00940000163130	ENSGT00940000162226	ENSGT00410000026913	ENSGT00390000009387	ENSGT00940000162536	ENSGT00550000074856	ENSGT00950000183166.a.b	ENSGT00550000074919	ENSGT00390000010239	ENSGT00390000002511	ENSGT00390000002408	ENSGT00390000009662
Laurasiatheria	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00950000182843.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000160448	ENSGT00940000158190	ENSGT00730000111394	ENSGT00950000182825.B	ENSGT00940000154637	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000154297.B	ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.a.b	ENSGT00390000014845	ENSGT00390000006044	ENSGT00390000007249	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00940000162000.d	ENSGT00940000162972	ENSGT00390000017655	ENSGT00940000163130	ENSGT00940000162226	ENSGT00410000026913	ENSGT00390000009387	ENSGT00940000162536	ENSGT00550000074856	ENSGT00950000183166.a.b	ENSGT00550000074919	ENSGT00390000010239	ENSGT00390000002511	ENSGT00390000002408	ENSGT00390000009662
Eulipotyphla	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183101.b ##22
Hedgehog	MODERN SPECIES	325																ENSEEUG00000004507 ##22
Laurasiatheria_a	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00950000182843.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000160448	ENSGT00940000158190	ENSGT00730000111394	ENSGT00940000154297.B	ENSGT00940000166265	ENSGT00940000154637	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00950000182825.B	ENSGT00390000014845	ENSGT00390000006044	ENSGT00390000007249	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00940000163677.a.b.a.a.a.a	ENSGT00940000162000.d	ENSGT00940000162972	ENSGT00390000017655	ENSGT00940000163130	ENSGT00410000026913	ENSGT00940000162226	ENSGT00390000009387	ENSGT00940000162536	ENSGT00550000074856	ENSGT00950000183166.a.b	ENSGT00550000074919	ENSGT00390000010239	ENSGT00390000002511	ENSGT00390000002408
Laurasiatheria_b	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000158664	ENSGT00950000182843.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000160448	ENSGT00940000158190	ENSGT00730000111394	ENSGT00940000154297.B	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000154637	ENSGT00950000182825.B	ENSGT00390000014845	ENSGT00390000006044	ENSGT00390000007249	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00940000163677.a.b.a.a.a.a.b	ENSGT00940000162000.d	ENSGT00940000162972	ENSGT00390000017655	ENSGT00940000163130	ENSGT00940000162226	ENSGT00410000026913	ENSGT00390000009387	ENSGT00940000162536	ENSGT00550000074856	ENSGT00950000183166.a.b	ENSGT00550000074919	ENSGT00390000010239	ENSGT00390000002511	ENSGT00390000002408
Carnivora	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000158664	ENSGT00950000182843.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000160448	ENSGT00940000158190	ENSGT00730000111394	ENSGT00950000182825.B	ENSGT00940000154297.B	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000154637	ENSGT00390000014845	ENSGT00390000006044	ENSGT00390000007249	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00940000163677.a.b.a.a.a.a.b	ENSGT00940000162000.d	ENSGT00940000162972	ENSGT00390000017655	ENSGT00940000163130	ENSGT00940000162226	ENSGT00410000026913	ENSGT00390000009387	ENSGT00940000162536	ENSGT00550000074856	ENSGT00950000183166.a.b	ENSGT00550000074919	ENSGT00390000010239	ENSGT00390000002511	ENSGT00390000002408
Caniformia	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000158664	ENSGT00950000182843.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000160448	ENSGT00940000158190	ENSGT00730000111394	ENSGT00950000182825.B	ENSGT00940000154297.B	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000154637	ENSGT00390000014845	ENSGT00390000006044	ENSGT00390000007249	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00940000163677.a.b.a.a.a.a.b	ENSGT00940000162000.d	ENSGT00950000182890.D.c.b.a.a.b.a.a	ENSGT00940000162972	ENSGT00390000017655	ENSGT00940000163130	ENSGT00940000162226	ENSGT00410000026913	ENSGT00390000009387	ENSGT00940000162536	ENSGT00550000074856	ENSGT00950000183166.a.b	ENSGT00550000074919	ENSGT00390000010239	ENSGT00390000002511
Caniformia_b	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00940000158664	ENSGT00950000182843.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000160448	ENSGT00940000158190	ENSGT00730000111394	ENSGT00950000182825.B	ENSGT00940000154297.B	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000154637	ENSGT00390000014845	ENSGT00390000006044	ENSGT00390000007249	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00940000163677.a.b.a.a.a.a.b	ENSGT00940000162000.d	ENSGT00950000182890.D.c.b.a.a.b.a.a	ENSGT00940000162972	ENSGT00390000017655	ENSGT00940000163130	ENSGT00940000162226	ENSGT00410000026913	ENSGT00390000009387	ENSGT00940000162536	ENSGT00550000074856	ENSGT00950000183166.a.b	ENSGT00550000074919	ENSGT00390000010239	ENSGT00390000002511
Ursidae	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00550000074798.a.a	ENSGT00940000158664	ENSGT00950000182843.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000160448	ENSGT00940000158190	ENSGT00730000111394	ENSGT00950000182825.B	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000154637	ENSGT00390000014845	ENSGT00390000006044	ENSGT00390000007249	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00940000163677.a.b.a.a.a.a.b	ENSGT00940000162000.d	ENSGT00950000182890.D.c.b.a.a.b.a.a	ENSGT00940000162972	ENSGT00390000017655	ENSGT00940000163130	ENSGT00940000162226	ENSGT00410000026913	ENSGT00390000009387	ENSGT00550000074856	ENSGT00950000183166.a.b	ENSGT00550000074919	ENSGT00390000010239	ENSGT00390000002511	ENSGT00390000002408
Ursus	ANCESTRAL SPECIES	144								ENSGT00940000173122	ENSGT00950000182825.B	ENSGT01030000236088	ENSGT00390000014845	ENSGT00390000006044	ENSGT00390000007249	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00940000162000.d	ENSGT00950000182890.D.c.b.a.a.b.a.a	ENSGT00940000162972	ENSGT00390000017655	ENSGT00940000163130	ENSGT00940000162226	ENSGT00390000009387	ENSGT00550000074856	ENSGT00950000183166.a.b	ENSGT00550000074919	ENSGT00390000010239	ENSGT00390000002511	ENSGT00390000002408	ENSGT00390000009662	ENSGT00940000159913
American black bear	MODERN SPECIES	1376												ENSUAMG00000007660	MED15 (ENSUAMG00000007657)	ENSUAMG00000007655	KLHL22 (ENSUAMG00000007654)	SCARF2 (ENSUAMG00000007651) ##22	ZNF74 (ENSUAMG00000007649)
Giant Panda	MODERN SPECIES	5	SERPIND1 (ENSAMEG00000008780)	PI4KA (ENSAMEG00000008729)	SNAP29 (ENSAMEG00000008714)	CRKL (ENSAMEG00000024636)	AIFM3 (ENSAMEG00000008698)	LZTR1 (ENSAMEG00000008625)	ENSAMEG00000008616	ENSAMEG00000017289	ENSAMEG00000004106	ENSAMEG00000004113	ENSAMEG00000011051	ENSAMEG00000011059	ENSAMEG00000011114	ENSAMEG00000011118	KLHL22 (ENSAMEG00000011165)	ENSAMEG00000011182 ##22	ENSAMEG00000011202	ENSAMEG00000024031	ENSAMEG00000029516	ENSAMEG00000011203	ENSAMEG00000011211	ENSAMEG00000028481	TSSK2 (ENSAMEG00000019541)	ENSAMEG00000011246	ESS2 (ENSAMEG00000011256)	SLC25A1 (ENSAMEG00000011279)	CLTCL1 (ENSAMEG00000011289)	MRPL40 (ENSAMEG00000011421)	HIRA (ENSAMEG00000011366)	UFD1 (ENSAMEG00000011428)	CDC45 (ENSAMEG00000011443)
Mustelinae	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000158664	ENSGT00950000182843.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000160448	ENSGT00940000158190	ENSGT00730000111394	ENSGT00950000182825.B	ENSGT00940000154297.B	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000154637	ENSGT00390000014845	ENSGT00390000006044	ENSGT00390000007249	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00940000162000.d	ENSGT00940000162972	ENSGT00390000017655	ENSGT00940000163130	ENSGT00940000162226	ENSGT00390000009387	ENSGT00940000162536	ENSGT00550000074856	ENSGT00950000183166.a.b	ENSGT00550000074919	ENSGT00390000010239	ENSGT00390000002511	ENSGT00390000002408	ENSGT00390000009662	ENSGT00940000161769
American mink	MODERN SPECIES	969																SCARF2 (ENSNVIG00000007253) ##22
Ferret	MODERN SPECIES	170	SERPIND1 (ENSMPUG00000003614)	SNAP29 (ENSMPUG00000003621)	CRKL (ENSMPUG00000003629)	AIFM3 (ENSMPUG00000003634)	LZTR1 (ENSMPUG00000003647)	THAP7 (ENSMPUG00000003655)	TUBA3C (ENSMPUG00000003660)	LRRC74B (ENSMPUG00000003665)	P2RX6 (ENSMPUG00000003672)	SLC7A4 (ENSMPUG00000003679)	ENSMPUG00000003681	SMPD4 (ENSMPUG00000003686)	ENSMPUG00000003693	MED15 (ENSMPUG00000003709)	KLHL22 (ENSMPUG00000003732)	SCARF2 (ENSMPUG00000003736) ##22	ENSMPUG00000003743	ENSMPUG00000003747	DGCR2 (ENSMPUG00000003800)	TSSK1B (ENSMPUG00000019875)	TSSK2 (ENSMPUG00000019876)	ESS2 (ENSMPUG00000003809)	SLC25A1 (ENSMPUG00000003820)	CLTCL1 (ENSMPUG00000003829)	HIRA (ENSMPUG00000003849)	MRPL40 (ENSMPUG00000003865)	UFD1 (ENSMPUG00000003872)	CDC45 (ENSMPUG00000003884)	CLDN5 (ENSMPUG00000019877)	SEPTIN5 (ENSMPUG00000003893)	GP1BB (ENSMPUG00000019878)
Canidae	ANCESTRAL SPECIES	55	ENSGT00940000158664	ENSGT00950000182843.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000160448	ENSGT00940000158190	ENSGT00730000111394	ENSGT00940000154297.B	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000154637	ENSGT00950000182825.B	ENSGT00390000014845	ENSGT00390000006044	ENSGT00390000007249	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00940000162000.d	ENSGT00950000182890.D.c.b.a.a.b.a.a	ENSGT00940000162972	ENSGT00390000017655	ENSGT00940000163130	ENSGT00940000162226	ENSGT00390000009387	ENSGT00940000162536	ENSGT00550000074856	ENSGT00950000183166.a.b	ENSGT00550000074919	ENSGT00390000010239	ENSGT00390000002511	ENSGT00390000002408	ENSGT00390000009662
Canis_lupus	ANCESTRAL SPECIES	43	ENSGT00940000158664	ENSGT00950000182843.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000160448	ENSGT00940000158190	ENSGT00730000111394	ENSGT00940000154297.B	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000154637	ENSGT00950000182825.B	ENSGT00390000014845	ENSGT00390000006044	ENSGT00390000007249	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00940000162000.d	ENSGT00390000012635.a.b.a	ENSGT00950000182890.D.c.b.a.a.b.a.a	ENSGT00940000162972	ENSGT00390000017655	ENSGT00940000163130	ENSGT00940000162226	ENSGT00390000009387	ENSGT00940000162536	ENSGT00550000074856	ENSGT00950000183166.a.b	ENSGT00550000074919	ENSGT00390000010239	ENSGT00390000002511	ENSGT00390000002408
Dingo	MODERN SPECIES	108	ENSCAFG00020012206	ENSCAFG00020012193	LZTR1 (ENSCAFG00020012188)	THAP7 (ENSCAFG00020012183)	ENSCAFG00020012168	LRRC74B (ENSCAFG00020012155)	P2RX6 (ENSCAFG00020012143)	SLC7A4 (ENSCAFG00020012136)	ENSCAFG00020012126	ENSCAFG00020012117	SMPD4 (ENSCAFG00020011062)	ENSCAFG00020010925	ENSCAFG00020010918	ENSCAFG00020010913	KLHL22 (ENSCAFG00020010910)	SCARF2 (ENSCAFG00020010710) ##22	ENSCAFG00020010704	ENSCAFG00020010610	ENSCAFG00020010593	DGCR2 (ENSCAFG00020010588)	TSSK1B (ENSCAFG00020010585)	TSSK2 (ENSCAFG00020010581)	ESS2 (ENSCAFG00020010579)	GSC2 (ENSCAFG00020010577)	SLC25A1 (ENSCAFG00020010571)	CLTCL1 (ENSCAFG00020008131)	HIRA (ENSCAFG00020007998)	MRPL40 (ENSCAFG00020007995)	C22orf39 (ENSCAFG00020007992)	UFD1 (ENSCAFG00020007988)	CDC45 (ENSCAFG00020007915)
Dog	MODERN SPECIES	18	PI4KA (ENSCAFG00845025057)	SNAP29 (ENSCAFG00845024886)	CRKL (ENSCAFG00845024825)	LZTR1 (ENSCAFG00845023799)	THAP7 (ENSCAFG00845023578)	ENSCAFG00845023536	ENSCAFG00845023439	P2RX6 (ENSCAFG00845023336)	ENSCAFG00845023288	ENSCAFG00845023243	MZT2B (ENSCAFG00845023171)	SMPD4 (ENSCAFG00845022605)	ENSCAFG00845022358	ENSCAFG00845022178	KLHL22 (ENSCAFG00845030286)	ENSCAFG00845030267 ##22	ENSCAFG00845030240	ENSCAFG00845030233	ENSCAFG00845030223	ENSCAFG00845030201	TSSK1B (ENSCAFG00845030188)	ENSCAFG00845030168	TSSK2 (ENSCAFG00845030135)	ESS2 (ENSCAFG00845030127)	GSC2 (ENSCAFG00845030114)	SLC25A1 (ENSCAFG00845030106)	CLTCL1 (ENSCAFG00845030003)	HIRA (ENSCAFG00845029669)	ENSCAFG00845029562	C26H22orf39 (ENSCAFG00845029541)	UFD1 (ENSCAFG00845029515)
Red fox	MODERN SPECIES	174	SERPIND1 (ENSVVUG00000021340)	SNAP29 (ENSVVUG00000021344)	CRKL (ENSVVUG00000021350)	AIFM3 (ENSVVUG00000021362)	LZTR1 (ENSVVUG00000021553)	THAP7 (ENSVVUG00000021848)	LRRC74B (ENSVVUG00000021852)	ENSVVUG00000021854	ENSVVUG00000021856	SLC7A4 (ENSVVUG00000021858)	ENSVVUG00000021859	SMPD4 (ENSVVUG00000021879)	ENSVVUG00000023666	MED15 (ENSVVUG00000023668)	KLHL22 (ENSVVUG00000023676)	SCARF2 (ENSVVUG00000023682) ##22	ZNF74 (ENSVVUG00000023690)	ENSVVUG00000023756	ENSVVUG00000023757	DGCR2 (ENSVVUG00000023768)	TSSK1B (ENSVVUG00000023781)	TSSK2 (ENSVVUG00000023783)	ESS2 (ENSVVUG00000023785)	SLC25A1 (ENSVVUG00000023788)	CLTCL1 (ENSVVUG00000023881)	HIRA (ENSVVUG00000025357)	MRPL40 (ENSVVUG00000025360)	CUNH22orf39 (ENSVVUG00000025361)	UFD1 (ENSVVUG00000025364)	CDC45 (ENSVVUG00000025367)	CLDN5 (ENSVVUG00000025372)
Felidae	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00550000074798.a.a	ENSGT00950000182843.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000160448	ENSGT00940000158190	ENSGT00730000111394	ENSGT00940000154637	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000154297.B	ENSGT00950000182825.B	ENSGT00390000014845	ENSGT00390000006044	ENSGT00390000007249	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00940000162000.d	ENSGT00940000162972	ENSGT00390000017655	ENSGT00940000163130	ENSGT00940000162226	ENSGT00390000009387	ENSGT00940000162536	ENSGT00550000074856	ENSGT00950000183166.a.b	ENSGT00550000074919	ENSGT00390000010239	ENSGT00390000002511	ENSGT00390000002408	ENSGT00390000009662	ENSGT00940000161769
Panthera	ANCESTRAL SPECIES	35							ENSGT00940000154637	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000154297.B	ENSGT00950000182825.B	ENSGT00390000014845	ENSGT00390000006044	ENSGT00390000007249	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00940000162000.d	ENSGT00940000162972	ENSGT00390000017655	ENSGT00940000163130	ENSGT00940000162226	ENSGT00390000009387	ENSGT00940000162536	ENSGT00550000074856	ENSGT00950000183166.a.b	ENSGT00550000074919	ENSGT00390000010239	ENSGT00390000002511	ENSGT00390000002408	ENSGT00390000009662	ENSGT00940000161769
Panthera_a	ANCESTRAL SPECIES	62							ENSGT00940000154637	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000154297.B	ENSGT00950000182825.B	ENSGT00390000014845	ENSGT00390000006044	ENSGT00390000007249	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00940000162000.d	ENSGT00940000162972	ENSGT00390000017655	ENSGT00940000163130	ENSGT00940000162226	ENSGT00390000009387	ENSGT00940000162536	ENSGT00550000074856	ENSGT00950000183166.a.b	ENSGT00550000074919	ENSGT00390000010239	ENSGT00390000002511	ENSGT00390000002408	ENSGT00390000009662	ENSGT00940000161769
leopard	MODERN SPECIES	178							SLC7A4 (ENSPPRG00000010200)	P2RX6 (ENSPPRG00000010163)	LRRC74B (ENSPPRG00000010019)	ENSPPRG00000009980	ENSPPRG00000009954	SMPD4 (ENSPPRG00000009390)	ENSPPRG00000009248	MED15 (ENSPPRG00000008997)	KLHL22 (ENSPPRG00000008455)	SCARF2 (ENSPPRG00000008338) ##22	ZNF74 (ENSPPRG00000008009)	ENSPPRG00000007469	DGCR2 (ENSPPRG00000007393)	ESS2 (ENSPPRG00000006405)	GSC2 (ENSPPRG00000006381)	SLC25A1 (ENSPPRG00000006372)	CLTCL1 (ENSPPRG00000006295)	HIRA (ENSPPRG00000005445)	MRPL40 (ENSPPRG00000004672)	C22orf39 (ENSPPRG00000004565)	UFD1 (ENSPPRG00000004497)	CDC45 (ENSPPRG00000004159)	CLDN5 (ENSPPRG00000022046)	SEPTIN5 (ENSPPRG00000002930)	GP1BB (ENSPPRG00000002736)
lion	MODERN SPECIES	12	HIC2 (ENSPLOG00000013239)	ENSPLOG00000013261	PI4KA (ENSPLOG00000013363)	SERPIND1 (ENSPLOG00000013774)	SNAP29 (ENSPLOG00000013831)	CRKL (ENSPLOG00000013870)	AIFM3 (ENSPLOG00000013916)	LZTR1 (ENSPLOG00000014387)	THAP7 (ENSPLOG00000014573)	TUBA3C (ENSPLOG00000014642)	ENSPLOG00000014711	SMPD4 (ENSPLOG00000014860)	ENSPLOG00000015519	MED15 (ENSPLOG00000015641)	KLHL22 (ENSPLOG00000016103)	SCARF2 (ENSPLOG00000016145) ##22	ZNF74 (ENSPLOG00000016312)	ENSPLOG00000016329	ENSPLOG00000016353	ENSPLOG00000016370	DGCR2 (ENSPLOG00000016482)	TSSK1B (ENSPLOG00000016648)	TSSK2 (ENSPLOG00000016661)	ESS2 (ENSPLOG00000016681)	GSC2 (ENSPLOG00000016795)	ENSPLOG00000016834	SLC25A1 (ENSPLOG00000016874)	CLTCL1 (ENSPLOG00000016947)	HIRA (ENSPLOG00000017572)	MRPL40 (ENSPLOG00000018056)	C22orf39 (ENSPLOG00000018074)
Cat	MODERN SPECIES	243	THAP7 (ENSFCAG00000037302)	ENSFCAG00000045712	ENSFCAG00000053426	ENSFCAG00000041873	ENSFCAG00000040501	SLC7A4 (ENSFCAG00000030130)	ENSFCAG00000048455	ENSFCAG00000044689	ENSFCAG00000052851	ENSFCAG00000022091	ENSFCAG00000043689	SMPD4 (ENSFCAG00000033940)	ENSFCAG00000030668	MED15 (ENSFCAG00000005999)	KLHL22 (ENSFCAG00000005998)	SCARF2 (ENSFCAG00000019214) ##22	ZNF74 (ENSFCAG00000035533)	ENSFCAG00000050966	ENSFCAG00000045053	ENSFCAG00000051504	CA15 (ENSFCAG00000048855)	DGCR2 (ENSFCAG00000009527)	TSSK1B (ENSFCAG00000023621)	TSSK2 (ENSFCAG00000009531)	ESS2 (ENSFCAG00000029613)	GSC2 (ENSFCAG00000042776)	SLC25A1 (ENSFCAG00000009533)	CLTCL1 (ENSFCAG00000002747)	MRPL40 (ENSFCAG00000002752)	HIRA (ENSFCAG00000002750)	UFD1 (ENSFCAG00000004294)
Laurasiatheria_c	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000158664	ENSGT00950000182843.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000160448	ENSGT00940000158190	ENSGT00730000111394	ENSGT00940000154297.B	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000154637	ENSGT00950000182825.B	ENSGT00390000014845	ENSGT00390000006044	ENSGT00390000007249	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00940000162000.d	ENSGT00940000162972	ENSGT00390000017655	ENSGT00940000163130	ENSGT00940000162226	ENSGT00390000009387	ENSGT00940000162536	ENSGT00550000074856	ENSGT00950000183166.a.b	ENSGT00550000074919	ENSGT00390000010239	ENSGT00390000002511	ENSGT00390000002408	ENSGT00390000009662	ENSGT00940000161769
Chiroptera	ANCESTRAL SPECIES	74												ENSGT00390000006044	ENSGT00390000007249	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00940000162000.d	ENSGT00940000162972	ENSGT00390000017655	ENSGT00940000163130	ENSGT00940000162226	ENSGT00390000009387	ENSGT00940000162536	ENSGT00550000074856	ENSGT00950000183166.a.b	ENSGT00550000074919	ENSGT00390000010239	ENSGT00390000002511	ENSGT00390000002408	ENSGT00390000009662	ENSGT00940000161769
Microchiroptera	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000158664	ENSGT00950000182843.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000160448	ENSGT00940000158190	ENSGT00730000111394	ENSGT00940000154297.B	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000154637	ENSGT00950000182825.B	ENSGT00390000014845	ENSGT00390000006044	ENSGT00390000007249	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00940000162000.d	ENSGT00940000162972	ENSGT00390000017655	ENSGT00940000163130	ENSGT00940000162226	ENSGT00390000009387	ENSGT00940000162536	ENSGT00550000074856	ENSGT00950000183166.a.b	ENSGT00550000074919	ENSGT00390000010239	ENSGT00390000002511	ENSGT00390000002408	ENSGT00390000009662	ENSGT00940000161769
Greater horseshoe bat	MODERN SPECIES	17	SNAP29 (ENSRFEG00010018520)	CRKL (ENSRFEG00010018554)	AIFM3 (ENSRFEG00010018598)	LZTR1 (ENSRFEG00010018837)	THAP7 (ENSRFEG00010018865)	ENSRFEG00010018926	LRRC74B (ENSRFEG00010019094)	P2RX6 (ENSRFEG00010019163)	SLC7A4 (ENSRFEG00010019191)	ENSRFEG00010019238	ENSRFEG00010019435	SMPD4 (ENSRFEG00010019538)	ENSRFEG00010019986	MED15 (ENSRFEG00010020036)	KLHL22 (ENSRFEG00010020198)	SCARF2 (ENSRFEG00010020223) ##22	ZNF74 (ENSRFEG00010020268)	ENSRFEG00010020294	DGCR2 (ENSRFEG00010020348)	TSSK1B (ENSRFEG00010020420)	TSSK2 (ENSRFEG00010020429)	ESS2 (ENSRFEG00010020441)	GSC2 (ENSRFEG00010020469)	SLC25A1 (ENSRFEG00010020494)	CLTCL1 (ENSRFEG00010020555)	HIRA (ENSRFEG00010020801)	MRPL40 (ENSRFEG00010021001)	C22orf39 (ENSRFEG00010021008)	UFD1 (ENSRFEG00010021022)	CDC45 (ENSRFEG00010021045)	CLDN5 (ENSRFEG00010021064)
Microbat	MODERN SPECIES	1213	PI4KA (ENSMLUG00000011267)	SERPIND1 (ENSMLUG00000011373)	SNAP29 (ENSMLUG00000010037)	CRKL (ENSMLUG00000014960)	ENSMLUG00000014962	LZTR1 (ENSMLUG00000014974)	THAP7 (ENSMLUG00000026496)	ENSMLUG00000014995	LRRC74B (ENSMLUG00000024558)	ENSMLUG00000025724	ENSMLUG00000028948	SMPD4 (ENSMLUG00000028049)	ENSMLUG00000026079	ENSMLUG00000006939	KLHL22 (ENSMLUG00000006924)	ENSMLUG00000006894 ##22	DGCR2 (ENSMLUG00000007207)	ENSMLUG00000007238	TSSK2 (ENSMLUG00000007273)	ESS2 (ENSMLUG00000007286)	SLC25A1 (ENSMLUG00000030464)	HIRA (ENSMLUG00000002434)	ENSMLUG00000002456	ENSMLUG00000002466	CDC45 (ENSMLUG00000002478)	CLDN5 (ENSMLUG00000002502)	GP1BB (ENSMLUG00000024066)	SEPTIN5 (ENSMLUG00000002506)	GNB1L (ENSMLUG00000030309)	TXNRD2 (ENSMLUG00000014904)	COMT (ENSMLUG00000009290)
Megabat	MODERN SPECIES	8530															KLHL22 (ENSPVAG00000009164)	SCARF2 (ENSPVAG00000009163) ##22
Equus	ANCESTRAL SPECIES	63		ENSGT00940000153120.k.a.b.a.b	ENSGT00940000153120.k.a.a	ENSGT00940000153120.k.a.b.b.z.b.b	ENSGT00940000153934.a.a	ENSGT00940000153474.a.b.b.d.c	ENSGT00940000161640.e.a	ENSGT00950000182890.D.c.b.a.a.b.a.a.d	ENSGT00940000154297.B	ENSGT01020000230351.F.j	ENSGT00940000154637.m.b	ENSGT00390000006044.a	ENSGT00390000007249	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00940000158978.f	ENSGT00940000161017.c	ENSGT01030000234531.A.a.hb.a	ENSGT00940000153474.a.b.b.d.d	ENSGT00940000163531	ENSGT00500000044989	ENSGT00940000160353	ENSGT00940000159687	ENSGT00940000153491.b.a	ENSGT01000000215173	ENSGT00940000153592.B.b.b	ENSGT01030000234555.a.a.a.c.b	ENSGT00390000004906	ENSGT00390000000571	ENSGT00610000086153
Horse	MODERN SPECIES	29	ZNF74 (ENSECAG00000000104)	ENSECAG00000005614	ENSECAG00000039106	ENSECAG00000042325	ENSECAG00000004133	ENSECAG00000050782	ENSECAG00000037194	ENSECAG00000040117	ENSECAG00000007984	ENSECAG00000038616	SMPD4 (ENSECAG00000007248)	ENSECAG00000006414	MED15 (ENSECAG00000016841)	ENSECAG00000045796	KLHL22 (ENSECAG00000015363)	SCARF2 (ENSECAG00000007338) ##22	ENSECAG00000046658	ENSECAG00000012704	ENSECAG00000013459	ENSECAG00000030408	ENSECAG00000030011	ENSECAG00000051155	ENSECAG00000015213	RSPH14 (ENSECAG00000011312)	GNAZ (ENSECAG00000011443)	RAB36 (ENSECAG00000011912)	BCR (ENSECAG00000020125)	SPECC1L (ENSECAG00000014409)	ADORA2A (ENSECAG00000034739)	UPB1 (ENSECAG00000017804)	GUCD1 (ENSECAG00000020031)
Donkey	MODERN SPECIES	28	ENSEASG00005032393	ENSEASG00005034116	ENSEASG00005032122	ENSEASG00005012930	ENSEASG00005037127	ENSEASG00005024110	ENSEASG00005020915	ENSEASG00005020917	ENSEASG00005029210	ENSEASG00005020931	ENSEASG00005026486	ENSEASG00005020973	ENSEASG00005033718	ENSEASG00005021004	ENSEASG00005021031	ENSEASG00005021042 ##22	ENSEASG00005012957	ENSEASG00005019401	ENSEASG00005025133	ENSEASG00005026950	ENSEASG00005035402	ENSEASG00005036987	ENSEASG00005028884	ENSEASG00005025238	ENSEASG00005026633	ENSEASG00005018256	ENSEASG00005019909	ENSEASG00005019919	ENSEASG00005019920	RAB36 (ENSEASG00005019924)	ENSEASG00005020049
Artiodactyla	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000158664	ENSGT00950000182843.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000160448	ENSGT00940000158190	ENSGT00730000111394	ENSGT00940000154297.B	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000154637	ENSGT00950000182825.B	ENSGT00390000014845	ENSGT00390000006044	ENSGT00390000007249	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00940000163677.a.b.a.a.a.a	ENSGT00940000162000.d	ENSGT00940000162972	ENSGT00390000017655	ENSGT00940000163130	ENSGT00410000026913	ENSGT00940000162226	ENSGT00390000009387	ENSGT00940000162536	ENSGT00550000074856	ENSGT00550000074919	ENSGT00390000010239	ENSGT00390000002511	ENSGT00390000002408	ENSGT00390000009662
Suina	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000158664	ENSGT00950000182843.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000160448	ENSGT00940000158190	ENSGT00730000111394	ENSGT00940000154297.B	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000154637	ENSGT00950000182825.B	ENSGT00390000014845	ENSGT00390000006044	ENSGT00390000007249	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00940000162000.d	ENSGT00390000017655	ENSGT00940000163130	ENSGT00940000162226	ENSGT00390000009387	ENSGT00940000162536	ENSGT00550000074856	ENSGT00550000074919	ENSGT00390000010239	ENSGT00390000002511	ENSGT00390000002408	ENSGT00390000009662	ENSGT00940000161769	ENSGT00940000159913	ENSGT00530000064244.b
Chacoan peccary	MODERN SPECIES	812	PI4KA (ENSCWAG00000005811)	SNAP29 (ENSCWAG00000005769)	CRKL (ENSCWAG00000005749)	AIFM3 (ENSCWAG00000005549)	LZTR1 (ENSCWAG00000005460)	THAP7 (ENSCWAG00000005433)	LRRC74B (ENSCWAG00000005395)	P2RX6 (ENSCWAG00000005342)	SLC7A4 (ENSCWAG00000005314)	ENSCWAG00000005302	ENSCWAG00000005247	SMPD4 (ENSCWAG00000005152)	ENSCWAG00000005092	MED15 (ENSCWAG00000005041)	KLHL22 (ENSCWAG00000005007)	SCARF2 (ENSCWAG00000004980) ##22	ZNF74 (ENSCWAG00000004923)	DGCR2 (ENSCWAG00000004856)	TSSK1B (ENSCWAG00000004836)	TSSK2 (ENSCWAG00000004822)	ESS2 (ENSCWAG00000004769)	GSC2 (ENSCWAG00000004751)	SLC25A1 (ENSCWAG00000004726)	HIRA (ENSCWAG00000004646)	MRPL40 (ENSCWAG00000004614)	C22orf39 (ENSCWAG00000004586)	UFD1 (ENSCWAG00000004536)	CDC45 (ENSCWAG00000004361)	CLDN5 (ENSCWAG00000004333)	SEPTIN5 (ENSCWAG00000004243)	GP1BB (ENSCWAG00000004211)
Pig	MODERN SPECIES	5	SNAP29 (ENSSSCG00000010094)	CRKL (ENSSSCG00000010095)	AIFM3 (ENSSSCG00000010096)	LZTR1 (ENSSSCG00000010097)	THAP7 (ENSSSCG00000033301)	ENSSSCG00000052117	LRRC74B (ENSSSCG00000010100)	P2RX6 (ENSSSCG00000010101)	SLC7A4 (ENSSSCG00000010102)	TUBA3C (ENSSSCG00000052017)	ENSSSCG00000010104	SMPD4 (ENSSSCG00000010105)	ENSSSCG00000010106	MED15 (ENSSSCG00000010107)	KLHL22 (ENSSSCG00000010108)	SCARF2 (ENSSSCG00000010109) ##22	ZNF74 (ENSSSCG00000060069)	DGCR2 (ENSSSCG00000036280)	TSSK1B (ENSSSCG00000058838)	TSSK2 (ENSSSCG00000010113)	ESS2 (ENSSSCG00000010114)	GSC2 (ENSSSCG00000062065)	SLC25A1 (ENSSSCG00000010116)	ENSSSCG00000010117	HIRA (ENSSSCG00000010118)	MRPL40 (ENSSSCG00000034014)	C22orf39 (ENSSSCG00000040740)	UFD1 (ENSSSCG00000010121)	CDC45 (ENSSSCG00000010122)	CLDN5 (ENSSSCG00000041667)	SEPTIN5 (ENSSSCG00000010128)
Artiodactyla_a	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000160448	ENSGT00940000158190	ENSGT00730000111394.n.b	ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.a.b	ENSGT00940000154457.a.a.d	ENSGT00730000111394.m	ENSGT00940000154297.B	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000154637	ENSGT00950000182825.B	ENSGT00390000014845	ENSGT00390000006044	ENSGT00390000007249	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00940000163677.a.b.a.a.a.a	ENSGT00940000162000.d	ENSGT00940000162972	ENSGT00390000017655	ENSGT00940000163130	ENSGT00410000026913	ENSGT00940000162226	ENSGT00390000009387	ENSGT00940000162536	ENSGT00550000074856	ENSGT00550000074919	ENSGT00390000010239	ENSGT00390000002511	ENSGT00390000002408	ENSGT00390000009662
Camelidae	ANCESTRAL SPECIES	72	ENSGT00550000074798.a.a	ENSGT00950000182843.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000160448	ENSGT00940000158190	ENSGT00730000111394.n.b	ENSGT00940000154297.B	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000154637	ENSGT00950000182825.B	ENSGT00390000014845	ENSGT00390000006044	ENSGT00390000007249	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00940000162000.d	ENSGT00940000162972	ENSGT00390000017655	ENSGT00940000163130	ENSGT00940000162226	ENSGT00390000009387	ENSGT00550000074856	ENSGT00550000074919	ENSGT00390000010239	ENSGT00390000002511	ENSGT00390000002408	ENSGT00390000009662	ENSGT00940000161769	ENSGT00940000159913	ENSGT00530000064244.b
Arabian camel	MODERN SPECIES	25	AIFM3 (ENSCDRG00005011114)	LZTR1 (ENSCDRG00005010984)	THAP7 (ENSCDRG00005010955)	ENSCDRG00005010918	ENSCDRG00005010896	LRRC74B (ENSCDRG00005010834)	P2RX6 (ENSCDRG00005010617)	SLC7A4 (ENSCDRG00005010549)	ENSCDRG00005010513	ENSCDRG00005010429	ENSCDRG00005010312	SMPD4 (ENSCDRG00005010122)	ENSCDRG00005010075	MED15 (ENSCDRG00005009943)	KLHL22 (ENSCDRG00005009868)	SCARF2 (ENSCDRG00005009591) ##22	ENSCDRG00005009059	ENSCDRG00005019616	DGCR2 (ENSCDRG00005019475)	TSSK1B (ENSCDRG00005019438)	TSSK2 (ENSCDRG00005019423)	ESS2 (ENSCDRG00005019401)	SLC25A1 (ENSCDRG00005019345)	HIRA (ENSCDRG00005019217)	MRPL40 (ENSCDRG00005019190)	C22orf39 (ENSCDRG00005019176)	UFD1 (ENSCDRG00005019126)	CDC45 (ENSCDRG00005019061)	CLDN5 (ENSCDRG00005019043)	SEPTIN5 (ENSCDRG00005018840)	GP1BB (ENSCDRG00005018787)
Artiodactyla_b	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000158664	ENSGT00950000182843.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000160448	ENSGT00940000158190	ENSGT00730000111394.m	ENSGT00940000154297.B	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000154637	ENSGT00950000182825.B	ENSGT00390000014845	ENSGT00390000006044	ENSGT00390000007249	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00940000163677.a.b.a.a.a.a	ENSGT00940000162000.d	ENSGT00940000162972	ENSGT00390000017655	ENSGT00940000163130	ENSGT00410000026913	ENSGT00940000162226	ENSGT00390000009387	ENSGT00940000162536	ENSGT00550000074856	ENSGT00550000074919	ENSGT00390000010239	ENSGT00390000002511	ENSGT00390000002408	ENSGT00390000009662
Pecora	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000158664	ENSGT00950000182843.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000160448	ENSGT00940000158190	ENSGT00730000111394.m	ENSGT00940000154297.B	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000154637	ENSGT00950000182825.B	ENSGT00390000014845	ENSGT00390000006044	ENSGT00390000007249	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00940000162000.d	ENSGT01080000257897	ENSGT00390000017655	ENSGT00940000163130	ENSGT00410000026913	ENSGT00940000162226	ENSGT00390000009387	ENSGT00940000162536	ENSGT00550000074856	ENSGT00550000074919	ENSGT00390000010239	ENSGT00390000002511	ENSGT00390000002408	ENSGT00390000009662	ENSGT00940000161769
Percora_a	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000158664	ENSGT00950000182843.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000160448	ENSGT00940000158190	ENSGT00730000111394.m	ENSGT00940000154297.B	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000154637	ENSGT00950000182825.B	ENSGT00390000014845	ENSGT00390000006044	ENSGT00390000007249	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00940000162000.d	ENSGT01080000257897	ENSGT00390000017655	ENSGT00940000163130	ENSGT00940000162226	ENSGT00390000009387	ENSGT00940000162536	ENSGT00550000074856	ENSGT00550000074919	ENSGT00390000010239	ENSGT00390000002511	ENSGT00390000002408	ENSGT00390000009662	ENSGT00940000161769	ENSGT00940000159913
Bovidae	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000158664	ENSGT00950000182843.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000160448	ENSGT00940000158190	ENSGT00730000111394.m	ENSGT00940000154297.B	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000154637	ENSGT00950000182825.B	ENSGT00390000014845	ENSGT00390000006044	ENSGT00390000007249	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00940000162000.d	ENSGT00390000017655	ENSGT00940000163130	ENSGT00940000162226	ENSGT00390000009387	ENSGT00940000162536	ENSGT00550000074856	ENSGT00550000074919	ENSGT00390000010239	ENSGT00390000002511	ENSGT00390000002408	ENSGT00390000009662	ENSGT00940000161769	ENSGT00940000159913	ENSGT00530000064244.b
Caprinae	ANCESTRAL SPECIES	39	ENSGT00940000158664	ENSGT00950000182843.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000160448	ENSGT00940000158190	ENSGT00730000111394.m	ENSGT00940000154297.B	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000154637	ENSGT00950000182825.B	ENSGT00390000014845	ENSGT00390000006044	ENSGT00390000007249	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00940000162000.d	ENSGT00390000017655	ENSGT00940000163130	ENSGT00940000162226	ENSGT00390000009387	ENSGT00940000162536	ENSGT00550000074856	ENSGT00550000074919	ENSGT00390000010239.f	ENSGT00390000002511	ENSGT00390000002408	ENSGT00390000009662	ENSGT00940000161769	ENSGT00940000159913	ENSGT00530000064244.b
Rambouillet Sheep	MODERN SPECIES	8	CRKL (ENSOARG00020026086)	AIFM3 (ENSOARG00020026091)	LZTR1 (ENSOARG00020003335)	THAP7 (ENSOARG00020003400)	ENSOARG00020003431	LRRC74B (ENSOARG00020003486)	P2RX6 (ENSOARG00020003582)	SLC7A4 (ENSOARG00020004441)	TUBA3C (ENSOARG00020004465)	MZT2B (ENSOARG00020004493)	SMPD4 (ENSOARG00020004574)	ENSOARG00020005000	MED15 (ENSOARG00020005078)	ENSOARG00020005135	KLHL22 (ENSOARG00020005143)	SCARF2 (ENSOARG00020005161) ##22	ENSOARG00020005197	DGCR2 (ENSOARG00020005258)	TSSK1B (ENSOARG00020005555)	TSSK2 (ENSOARG00020005563)	ESS2 (ENSOARG00020005571)	GSC2 (ENSOARG00020005609)	SLC25A1 (ENSOARG00020005633)	HIRA (ENSOARG00020005695)	MRPL40 (ENSOARG00020005950)	C22orf39 (ENSOARG00020005967)	UFD1 (ENSOARG00020005997)	CDC45 (ENSOARG00020006078)	CLDN5 (ENSOARG00020006137)	SEPTIN5 (ENSOARG00020006157)	GP1BB (ENSOARG00020006258)
Goat	MODERN SPECIES	34							P2RX6 (ENSCHIG00000010143)	SLC7A4 (ENSCHIG00000014492)	TUBA3C (ENSCHIG00000018919)	ENSCHIG00000022833	SMPD4 (ENSCHIG00000015846)	ENSCHIG00000008775	MED15 (ENSCHIG00000000106)	ENSCHIG00000018844	KLHL22 (ENSCHIG00000000204)	SCARF2 (ENSCHIG00000000281) ##22	DGCR2 (ENSCHIG00000000347)	TSSK2 (ENSCHIG00000000447)	ESS2 (ENSCHIG00000008099)	GSC2 (ENSCHIG00000012877)	SLC25A1 (ENSCHIG00000015498)	HIRA (ENSCHIG00000023761)	ENSCHIG00000000131	C22orf39 (ENSCHIG00000000235)	UFD1 (ENSCHIG00000000340)	CDC45 (ENSCHIG00000015066)	CLDN5 (ENSCHIG00000020205)	SEPTIN5 (ENSCHIG00000000129)	GP1BB (ENSCHIG00000000234)	ENSCHIG00000000274	GNB1L (ENSCHIG00000000307)
Bovinae	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000158664	ENSGT00950000182843.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000160448	ENSGT00940000158190	ENSGT00730000111394.m	ENSGT00940000154297.B	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000154637	ENSGT00950000182825.B	ENSGT00390000014845	ENSGT00390000006044	ENSGT00390000007249	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00940000162000.d	ENSGT00390000017655	ENSGT00940000163130	ENSGT00940000162226	ENSGT00390000009387	ENSGT00940000162536	ENSGT00550000074856	ENSGT00550000074919	ENSGT00390000010239	ENSGT00390000002511	ENSGT00390000002408	ENSGT00390000009662	ENSGT00940000161769	ENSGT00940000159913	ENSGT00530000064244.b
Bos	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000158664	ENSGT00950000182843.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000160448	ENSGT00940000158190	ENSGT00730000111394.m	ENSGT00940000154297.B	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000154637	ENSGT00950000182825.B	ENSGT00390000014845	ENSGT00390000006044	ENSGT00390000007249	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00940000162000.d	ENSGT00390000017655	ENSGT00940000163130	ENSGT00940000162226	ENSGT00390000009387	ENSGT00940000162536	ENSGT00550000074856	ENSGT00550000074919	ENSGT00390000010239	ENSGT00390000002511	ENSGT00390000002408	ENSGT00390000009662	ENSGT00940000161769	ENSGT00940000159913	ENSGT00530000064244.b
Bos_a	ANCESTRAL SPECIES	56	ENSGT00940000158664	ENSGT00950000182843.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000160448	ENSGT00940000158190	ENSGT00730000111394.m	ENSGT00940000154297.B	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000154637	ENSGT00950000182825.B	ENSGT00390000014845	ENSGT00390000006044	ENSGT00390000007249	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00940000162000.d	ENSGT00390000017655	ENSGT00940000163130	ENSGT00940000162226	ENSGT00390000009387	ENSGT00940000162536	ENSGT00550000074856	ENSGT00550000074919	ENSGT00390000010239	ENSGT00390000002511	ENSGT00390000002408	ENSGT00390000009662	ENSGT00940000161769	ENSGT00940000159913	ENSGT00530000064244.b
Domestic yak	MODERN SPECIES	7	SNAP29 (ENSBGRG00000010834)	CRKL (ENSBGRG00000010939)	AIFM3 (ENSBGRG00000011035)	LZTR1 (ENSBGRG00000011784)	THAP7 (ENSBGRG00000012090)	LRRC74B (ENSBGRG00000012155)	P2RX6 (ENSBGRG00000012281)	ENSBGRG00000012728	TUBA3C (ENSBGRG00000013042)	ENSBGRG00000013136	SMPD4 (ENSBGRG00000013428)	ENSBGRG00000018063	MED15 (ENSBGRG00000018246)	ENSBGRG00000018506	KLHL22 (ENSBGRG00000018532)	SCARF2 (ENSBGRG00000018607) ##22	ZNF74 (ENSBGRG00000018898)	DGCR2 (ENSBGRG00000018919)	TSSK1B (ENSBGRG00000019032)	ENSBGRG00000019056	GSC2 (ENSBGRG00000019298)	SLC25A1 (ENSBGRG00000019365)	HIRA (ENSBGRG00000019430)	MRPL40 (ENSBGRG00000019620)	ENSBGRG00000019661	UFD1 (ENSBGRG00000019757)	CDC45 (ENSBGRG00000020248)	CLDN5 (ENSBGRG00000020524)	SEPTIN5 (ENSBGRG00000020562)	GP1BB (ENSBGRG00000020762)	TBX1 (ENSBGRG00000020801)
Bos_b	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000158664	ENSGT00950000182843.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000160448	ENSGT00940000158190	ENSGT00730000111394.m	ENSGT00940000154297.B	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000154637	ENSGT00950000182825.B	ENSGT00390000014845	ENSGT00390000006044	ENSGT00390000007249	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00940000162000.d	ENSGT00390000017655	ENSGT00940000163130	ENSGT00940000162226	ENSGT00390000009387	ENSGT00940000162536	ENSGT00550000074856	ENSGT00550000074919	ENSGT00390000010239	ENSGT00390000002511	ENSGT00390000002408	ENSGT00390000009662	ENSGT00940000161769	ENSGT00940000159913	ENSGT00530000064244.b
Hybrid Bos Indicus	MODERN SPECIES	8	SNAP29 (ENSBIXG00005016033)	CRKL (ENSBIXG00005016052)	AIFM3 (ENSBIXG00005016201)	LZTR1 (ENSBIXG00005016347)	THAP7 (ENSBIXG00005002611)	ENSBIXG00005016388	LRRC74B (ENSBIXG00005016405)	P2RX6 (ENSBIXG00005005648)	SLC7A4 (ENSBIXG00005016535)	ENSBIXG00005016561	ENSBIXG00005016585	SMPD4 (ENSBIXG00005016728)	ENSBIXG00005016765	MED15 (ENSBIXG00005016925)	KLHL22 (ENSBIXG00005016948)	SCARF2 (ENSBIXG00005017012) ##22	ZNF74 (ENSBIXG00005017026)	DGCR2 (ENSBIXG00005017055)	TSSK1B (ENSBIXG00005002774)	TSSK2 (ENSBIXG00005017076)	ESS2 (ENSBIXG00005017113)	GSC2 (ENSBIXG00005017143)	SLC25A1 (ENSBIXG00005017171)	HIRA (ENSBIXG00005017294)	MRPL40 (ENSBIXG00005017318)	ENSBIXG00005017342	UFD1 (ENSBIXG00005017395)	CDC45 (ENSBIXG00005017557)	CLDN5 (ENSBIXG00005002859)	SEPTIN5 (ENSBIXG00005017620)	GP1BB (ENSBIXG00005017653)
Cow	MODERN SPECIES	8	SNAP29 (ENSBTAG00000020760)	CRKL (ENSBTAG00000045548)	AIFM3 (ENSBTAG00000038132)	LZTR1 (ENSBTAG00000011292)	THAP7 (ENSBTAG00000044198)	TUBA3E (ENSBTAG00000030979)	LRRC74B (ENSBTAG00000053023)	P2RX6 (ENSBTAG00000019244)	SLC7A4 (ENSBTAG00000009145)	TUBA3C (ENSBTAG00000038258)	MZT2B (ENSBTAG00000014646)	SMPD4 (ENSBTAG00000002130)	ENSBTAG00000031018	MED15 (ENSBTAG00000018048)	KLHL22 (ENSBTAG00000020161)	SCARF2 (ENSBTAG00000019375) ##22	ZNF74 (ENSBTAG00000016257)	DGCR2 (ENSBTAG00000000429)	TSSK1B (ENSBTAG00000045955)	TSSK2 (ENSBTAG00000048123)	ESS2 (ENSBTAG00000018534)	GSC2 (ENSBTAG00000047526)	SLC25A1 (ENSBTAG00000008528)	HIRA (ENSBTAG00000019888)	MRPL40 (ENSBTAG00000019891)	ENSBTAG00000048885	UFD1 (ENSBTAG00000004284)	CDC45 (ENSBTAG00000004286)	CLDN5 (ENSBTAG00000022020)	SEPTIN5 (ENSBTAG00000008320)	GP1BB (ENSBTAG00000039059)
Siberian musk deer	MODERN SPECIES	1175	SNAP29 (ENSMMSG00000010202)	CRKL (ENSMMSG00000010178)	AIFM3 (ENSMMSG00000009799)	LZTR1 (ENSMMSG00000009732)	THAP7 (ENSMMSG00000009696)	ENSMMSG00000009677	LRRC74B (ENSMMSG00000009614)	ENSMMSG00000009598	SLC7A4 (ENSMMSG00000009583)	TUBA3C (ENSMMSG00000009467)	ENSMMSG00000009305	SMPD4 (ENSMMSG00000009178)	ENSMMSG00000009086	MED15 (ENSMMSG00000009025)	KLHL22 (ENSMMSG00000008981)	SCARF2 (ENSMMSG00000008927) ##22	ZNF74 (ENSMMSG00000008900)	ENSMMSG00000008882	DGCR2 (ENSMMSG00000008848)	TSSK1B (ENSMMSG00000008833)	TSSK2 (ENSMMSG00000008823)	ESS2 (ENSMMSG00000008789)	GSC2 (ENSMMSG00000008763)	SLC25A1 (ENSMMSG00000008735)	HIRA (ENSMMSG00000008682)	MRPL40 (ENSMMSG00000008630)	C22orf39 (ENSMMSG00000008603)	UFD1 (ENSMMSG00000008492)	CDC45 (ENSMMSG00000008266)	CLDN5 (ENSMMSG00000008238)	GP1BB (ENSMMSG00000008211)
Cetacea	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00950000182843.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000160448	ENSGT00940000158190	ENSGT00730000111394.n.b	ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.a.b	ENSGT00940000154297.B	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000154637	ENSGT00950000182825.B	ENSGT00390000014845.j.a	ENSGT00390000006044	ENSGT00390000007249	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00940000163677.a.b.a.a.a.a	ENSGT00940000162000.d	ENSGT00940000162972	ENSGT00390000017655	ENSGT00410000026913	ENSGT00390000009387	ENSGT00940000162536	ENSGT00550000074856	ENSGT00550000074919	ENSGT00390000010239	ENSGT00390000002511	ENSGT00390000002408	ENSGT00390000009662	ENSGT00940000161769	ENSGT00940000159913
Blue whale	MODERN SPECIES	5	SNAP29 (ENSBMSG00010015325)	CRKL (ENSBMSG00010015416)	AIFM3 (ENSBMSG00010015470)	LZTR1 (ENSBMSG00010015704)	THAP7 (ENSBMSG00010015785)	ENSBMSG00010015800	LRRC74B (ENSBMSG00010015830)	ENSBMSG00010015869	SLC7A4 (ENSBMSG00010015889)	TUBA3D (ENSBMSG00010015906)	ENSBMSG00010015927	SMPD4 (ENSBMSG00010016020)	ENSBMSG00010016490	MED15 (ENSBMSG00010016530)	ENSBMSG00010016547	SCARF2 (ENSBMSG00010016600) ##22	ZNF74 (ENSBMSG00010016713)	DGCR2 (ENSBMSG00010016761)	TSSK1B (ENSBMSG00010016809)	TSSK2 (ENSBMSG00010016818)	ESS2 (ENSBMSG00010016855)	GSC2 (ENSBMSG00010016908)	SLC25A1 (ENSBMSG00010016932)	ENSBMSG00010017015	MRPL40 (ENSBMSG00010017278)	ENSBMSG00010017317	UFD1 (ENSBMSG00010017349)	CDC45 (ENSBMSG00010017411)	CLDN5 (ENSBMSG00010017459)	SEPTIN5 (ENSBMSG00010017511)	GP1BB (ENSBMSG00010017581)
Odontoceti	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00950000182843.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000160448	ENSGT00940000158190	ENSGT00730000111394.n.b	ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.a.b	ENSGT00940000154297.B	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000154637	ENSGT00950000182825.B	ENSGT00390000014845.j.a	ENSGT00390000006044	ENSGT00390000007249	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00940000163677.a.b.a.a.a.a	ENSGT00940000162000.d	ENSGT00940000162972	ENSGT00390000017655	ENSGT00410000026913	ENSGT00390000009387	ENSGT00940000162536	ENSGT00550000074856	ENSGT00550000074919	ENSGT00390000010239	ENSGT00390000002511	ENSGT00390000002408	ENSGT00390000009662	ENSGT00940000161769	ENSGT00940000159913
Sperm whale	MODERN SPECIES	10	ENSPCTG00005013472	YDJC (ENSPCTG00005013305)	UBE2L3 (ENSPCTG00005013229)	AIFM3 (ENSPCTG00005012650)	LZTR1 (ENSPCTG00005012560)	THAP7 (ENSPCTG00005012510)	ENSPCTG00005012365	ENSPCTG00005012312	SLC7A4 (ENSPCTG00005012254)	TUBA3C (ENSPCTG00005012020)	MZT2B (ENSPCTG00005011918)	SMPD4 (ENSPCTG00005011226)	ENSPCTG00005010751	MED15 (ENSPCTG00005010479)	KLHL22 (ENSPCTG00005010407)	SCARF2 (ENSPCTG00005010140) ##22	ZNF74 (ENSPCTG00005010108)	ENSPCTG00005010005	DGCR2 (ENSPCTG00005009960)	HIRA (ENSPCTG00005009870)	CLDN5 (ENSPCTG00005009841)	ENSPCTG00005009699	TBX1 (ENSPCTG00005009547)	GNB1L (ENSPCTG00005009492)	ENSPCTG00005009452	TRMT2A (ENSPCTG00005009317)	ENSPCTG00005009225	ZDHHC8 (ENSPCTG00005009100)	ENSPCTG00005009045	ENSPCTG00005013482	RTN4R (ENSPCTG00005013415)
Odontoceti_a	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00950000182843.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000160448	ENSGT00940000158190	ENSGT00730000111394.n.b	ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.a.b	ENSGT00940000154297.B	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000154637	ENSGT00950000182825.B	ENSGT00390000014845.i	ENSGT00390000006044	ENSGT00390000007249	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00940000163677.a.b.a.a.a.a	ENSGT00940000162000.d	ENSGT00940000163130	ENSGT00940000162226	ENSGT01080000257897	ENSGT00390000017655	ENSGT00410000026913	ENSGT00390000009387	ENSGT00940000162536	ENSGT00550000074856.g	ENSGT00550000074919	ENSGT00390000010239	ENSGT00390000002511	ENSGT00390000002408	ENSGT00390000009662
Dolphin	MODERN SPECIES	2373														MED15 (ENSTTRG00000004700)	KLHL22 (ENSTTRG00000004694)	SCARF2 (ENSTTRG00000004660) ##22	ZNF74 (ENSTTRG00000004593)
Odontoceti_b	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00550000074798.a.a	ENSGT00950000182843.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000160448	ENSGT00940000158190	ENSGT00730000111394.n.b	ENSGT00940000154297.B	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000154637	ENSGT00950000182825.B	ENSGT00390000014845.i	ENSGT00390000006044	ENSGT00390000007249	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00940000163677.a.b.a.a.a.a	ENSGT00940000162000.d	ENSGT01080000257897	ENSGT00390000017655	ENSGT00940000163130	ENSGT00940000162226	ENSGT00390000009387	ENSGT00940000162536	ENSGT00550000074856.g	ENSGT00550000074919	ENSGT00390000010239	ENSGT00390000002511	ENSGT00390000002408	ENSGT00390000009662	ENSGT00940000161769
Vaquita	MODERN SPECIES	5	SNAP29 (ENSPSNG00000011748)	CRKL (ENSPSNG00000011696)	AIFM3 (ENSPSNG00000011432)	LZTR1 (ENSPSNG00000011334)	ENSPSNG00000011286	ENSPSNG00000011203	LRRC74B (ENSPSNG00000011040)	ENSPSNG00000010988	SLC7A4 (ENSPSNG00000010925)	ENSPSNG00000010860	ENSPSNG00000010725	SMPD4 (ENSPSNG00000010532)	ENSPSNG00000010378	MED15 (ENSPSNG00000010280)	KLHL22 (ENSPSNG00000010214)	SCARF2 (ENSPSNG00000010132) ##22	ENSPSNG00000010084	ZNF74 (ENSPSNG00000010064)	ENSPSNG00000010041	DGCR2 (ENSPSNG00000009976)	TSSK1B (ENSPSNG00000009934)	TSSK2 (ENSPSNG00000009893)	ESS2 (ENSPSNG00000009812)	GSC2 (ENSPSNG00000009743)	SLC25A1 (ENSPSNG00000009671)	HIRA (ENSPSNG00000022312)	MRPL40 (ENSPSNG00000022307)	C22orf39 (ENSPSNG00000022302)	UFD1 (ENSPSNG00000022294)	CDC45 (ENSPSNG00000022278)	CLDN5 (ENSPSNG00000022262)
Monodontidae	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000158664	ENSGT00550000074798.a.a	ENSGT00950000182843.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000158190	ENSGT00730000111394.n.b	ENSGT00950000182825.B	ENSGT00940000154297.B	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000154637	ENSGT00390000014845.i	ENSGT00390000006044	ENSGT00390000007249	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00940000162000.d	ENSGT00390000017655	ENSGT00940000163130	ENSGT00940000162226	ENSGT00390000009387	ENSGT00940000162536	ENSGT00550000074856.g	ENSGT00550000074919	ENSGT00390000010239	ENSGT00390000002511	ENSGT00390000002408	ENSGT00390000009662	ENSGT00940000161769	ENSGT00940000159913	ENSGT00530000064244.b
Beluga whale	MODERN SPECIES	60	SNAP29 (ENSDLEG00000015337)	CRKL (ENSDLEG00000015333)	LZTR1 (ENSDLEG00000015193)	THAP7 (ENSDLEG00000015169)	ENSDLEG00000015150	LRRC74B (ENSDLEG00000015145)	P2RX6 (ENSDLEG00000015082)	SLC7A4 (ENSDLEG00000015039)	TUBA3D (ENSDLEG00000015001)	MZT2B (ENSDLEG00000014981)	SMPD4 (ENSDLEG00000012818)	ENSDLEG00000012655	MED15 (ENSDLEG00000012511)	ENSDLEG00000012494	KLHL22 (ENSDLEG00000012474)	SCARF2 (ENSDLEG00000012337) ##22	ZNF74 (ENSDLEG00000012291)	DGCR2 (ENSDLEG00000012240)	TSSK1B (ENSDLEG00000012230)	TSSK2 (ENSDLEG00000012209)	ESS2 (ENSDLEG00000012187)	GSC2 (ENSDLEG00000012166)	ENSDLEG00000012143	HIRA (ENSDLEG00000011918)	MRPL40 (ENSDLEG00000011862)	C22orf39 (ENSDLEG00000020170)	UFD1 (ENSDLEG00000020167)	CDC45 (ENSDLEG00000020154)	CLDN5 (ENSDLEG00000020150)	GP1BB (ENSDLEG00000020147)	SEPT5 (ENSDLEG00000020145)
Narwhal	MODERN SPECIES	295	PI4KA (ENSMMNG00015003963)	SNAP29 (ENSMMNG00015003910)	CRKL (ENSMMNG00015003894)	LZTR1 (ENSMMNG00015003787)	THAP7 (ENSMMNG00015003726)	ENSMMNG00015003704	LRRC74B (ENSMMNG00015003680)	ENSMMNG00015003656	SLC7A4 (ENSMMNG00015003644)	ENSMMNG00015003629	ENSMMNG00015003603	SMPD4 (ENSMMNG00015003562)	ENSMMNG00015003534	MED15 (ENSMMNG00015003333)	KLHL22 (ENSMMNG00015003239)	SCARF2 (ENSMMNG00015003219) ##22	ZNF74 (ENSMMNG00015003194)	ENSMMNG00015003178	DGCR2 (ENSMMNG00015003147)	TSSK1B (ENSMMNG00015003130)	TSSK2 (ENSMMNG00015003121)	ESS2 (ENSMMNG00015003094)	GSC2 (ENSMMNG00015003081)	ENSMMNG00015003057	HIRA (ENSMMNG00015003001)	MRPL40 (ENSMMNG00015002968)	C22orf39 (ENSMMNG00015002959)	UFD1 (ENSMMNG00015002931)	CDC45 (ENSMMNG00015002864)	SEPTIN5 (ENSMMNG00015002817)	GP1BB (ENSMMNG00015002796)
Euarchontoglires	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000160448	ENSGT00940000158190	ENSGT00730000111394	ENSGT00940000154297.B	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000154637	ENSGT00950000182825.B	ENSGT00390000014845	ENSGT00940000166905	ENSGT00940000169219	ENSGT00390000006044	ENSGT00390000007249	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00940000162000.d	ENSGT00940000162972	ENSGT00390000017655	ENSGT00940000163130	ENSGT00940000162226	ENSGT00410000026913	ENSGT00390000009387	ENSGT00940000162536	ENSGT00550000074856	ENSGT00950000183166.a.b	ENSGT00550000074919	ENSGT00390000010239	ENSGT00390000002511	ENSGT00390000002408	ENSGT00390000009662
Primates	ANCESTRAL SPECIES	31	ENSGT00940000158664	ENSGT00950000182843.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000160448	ENSGT00940000158190	ENSGT00730000111394	ENSGT00940000154297.B	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000154637	ENSGT00950000182825.B	ENSGT00390000014845	ENSGT00390000006044	ENSGT00390000007249	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00940000162000.d	ENSGT00390000017655	ENSGT00940000163130	ENSGT00940000162226	ENSGT00410000026913	ENSGT00390000009387	ENSGT00940000162536	ENSGT00550000074856	ENSGT00950000183166.a.b	ENSGT00550000074919	ENSGT00390000010239	ENSGT00390000002511	ENSGT00390000002408	ENSGT00390000009662	ENSGT00940000161769
Strepsirrhini	ANCESTRAL SPECIES	39	ENSGT00940000158664	ENSGT00950000182843.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000160448	ENSGT00940000158190	ENSGT00730000111394	ENSGT00940000154297.B	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000154637	ENSGT00950000182825.B	ENSGT00390000014845	ENSGT00390000006044	ENSGT00390000007249	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00940000162000.d	ENSGT00390000017655	ENSGT00940000163130	ENSGT00940000162226	ENSGT00390000009387	ENSGT00940000162536	ENSGT00550000074856	ENSGT00950000183166.a.b.n	ENSGT00550000074919	ENSGT00390000010239	ENSGT00390000002511	ENSGT00390000002408	ENSGT00390000009662	ENSGT00940000161769	ENSGT00940000159913
Lemuriformes	ANCESTRAL SPECIES	57	ENSGT00550000074798.a.a	ENSGT00940000158664	ENSGT00950000182843.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000160448	ENSGT00940000158190	ENSGT00730000111394	ENSGT00950000182825.B	ENSGT00940000154297.B	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000154637	ENSGT00390000006044	ENSGT00390000007249	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00940000162000.d	ENSGT00390000017655	ENSGT00940000163130	ENSGT00940000162226	ENSGT00390000009387	ENSGT00940000162536	ENSGT00550000074856	ENSGT00950000183166.a.b.n	ENSGT00550000074919	ENSGT00390000010239	ENSGT00390000002511	ENSGT00390000002408	ENSGT00390000009662	ENSGT00940000161769	ENSGT00940000159913
Lemuriformes_a	ANCESTRAL SPECIES	140													ENSGT00390000007249	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00940000162000.d	ENSGT00390000017655	ENSGT00940000163130	ENSGT00940000162226	ENSGT00390000009387	ENSGT00940000162536	ENSGT00550000074856	ENSGT00950000183166.a.b.n	ENSGT00550000074919	ENSGT00390000010239	ENSGT00390000002511	ENSGT00390000002408	ENSGT00390000009662	ENSGT00940000161769	ENSGT00940000159913
Coquerels sifaka	MODERN SPECIES	837													ENSPCOG00000018102	MED15 (ENSPCOG00000023828)	KLHL22 (ENSPCOG00000015465)	SCARF2 (ENSPCOG00000014838) ##22	ZNF74 (ENSPCOG00000028455)	ENSPCOG00000017357	ENSPCOG00000014840	TSSK1B (ENSPCOG00000025576)
Greater bamboo lemur	MODERN SPECIES	431											ENSPSMG00000021043	ENSPSMG00000021022	ENSPSMG00000021016	MED15 (ENSPSMG00000020955)	KLHL22 (ENSPSMG00000020809)	SCARF2 (ENSPSMG00000020798) ##22	ZNF74 (ENSPSMG00000020774)	DGCR2 (ENSPSMG00000020759)	TSSK1B (ENSPSMG00000020739)	TSSK2 (ENSPSMG00000020736)	ESS2 (ENSPSMG00000020731)	GSC2 (ENSPSMG00000020701)	SLC25A1 (ENSPSMG00000020688)	ENSPSMG00000020634
Mouse lemur	MODERN SPECIES	131	AIFM3 (ENSMICG00000014580)	LZTR1 (ENSMICG00000014599)	THAP7 (ENSMICG00000014619)	ENSMICG00000033124	LRRC74B (ENSMICG00000027262)	P2RX6 (ENSMICG00000047036)	SLC7A4 (ENSMICG00000046734)	ENSMICG00000035498	ENSMICG00000047401	ENSMICG00000017717	SMPD4 (ENSMICG00000017716)	PIWIL3 (ENSMICG00000029782)	ENSMICG00000032509	MED15 (ENSMICG00000004712)	KLHL22 (ENSMICG00000004706)	SCARF2 (ENSMICG00000035306) ##22	ZNF74 (ENSMICG00000032821)	DGCR2 (ENSMICG00000011635)	TSSK2 (ENSMICG00000008686)	ESS2 (ENSMICG00000000068)	GSC2 (ENSMICG00000043796)	SLC25A1 (ENSMICG00000017090)	ENSMICG00000026758	HIRA (ENSMICG00000013496)	MRPL40 (ENSMICG00000046066)	C22orf39 (ENSMICG00000013560)	UFD1 (ENSMICG00000013566)	CDC45 (ENSMICG00000013589)	ENSMICG00000034772	SEPTIN5 (ENSMICG00000028407)	GP1BB (ENSMICG00000043691)
Bushbaby	MODERN SPECIES	333	ENSOGAG00000025159	ENSOGAG00000030441	YDJC (ENSOGAG00000029562)	ENSOGAG00000014989	SDF2L1 (ENSOGAG00000031396)	ENSOGAG00000026133	PPIL2 (ENSOGAG00000004060)	YPEL1 (ENSOGAG00000004061)	ENSOGAG00000011769	ENSOGAG00000009955	ENSOGAG00000025698	SMPD4 (ENSOGAG00000026106)	ENSOGAG00000027344	MED15 (ENSOGAG00000007782)	KLHL22 (ENSOGAG00000016014)	SCARF2 (ENSOGAG00000029177) ##22	ZNF74 (ENSOGAG00000025857)	DGCR2 (ENSOGAG00000001352)	TSSK1B (ENSOGAG00000032224)	TSSK2 (ENSOGAG00000007948)	ESS2 (ENSOGAG00000007950)	GSC2 (ENSOGAG00000029019)	SLC25A1 (ENSOGAG00000001361)	CLTCL1 (ENSOGAG00000001362)	HIRA (ENSOGAG00000015079)	MRPL40 (ENSOGAG00000030071)	C22orf39 (ENSOGAG00000015092)	UFD1 (ENSOGAG00000015095)	CDC45 (ENSOGAG00000015102)	CLDN5 (ENSOGAG00000024947)	SEPTIN5 (ENSOGAG00000026834)
Haplorrhini	ANCESTRAL SPECIES	64								ENSGT00950000182825.B	ENSGT00390000014845	ENSGT00940000166905	ENSGT01030000236088	ENSGT00390000006044	ENSGT00390000007249	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00940000162000.d
Tarsier	MODERN SPECIES	1556													ENSTSYG00000034237	MED15 (ENSTSYG00000037497)	KLHL22 (ENSTSYG00000006859)	SCARF2 (ENSTSYG00000001490) ##22
Simiiformes	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00900000143180	ENSGT00940000160622	ENSGT00530000063529.C	ENSGT01100000263518.B.a	ENSGT00940000157345.b	ENSGT00940000162302	ENSGT00940000162860	ENSGT00940000153231.A.j	ENSGT00390000012929	ENSGT00950000182825.B	ENSGT00390000014845	ENSGT00390000006044	ENSGT00390000007249	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00940000162000.d
Platyrrhini	ANCESTRAL SPECIES	67														ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00940000162000.d
Cebidae	ANCESTRAL SPECIES	44	ENSGT00940000161769	ENSGT00390000009662	ENSGT00390000002408.d	ENSGT00390000002511	ENSGT00390000010239	ENSGT00550000074919	ENSGT00950000183166.a.b	ENSGT00550000074856.o	ENSGT00940000162536	ENSGT00390000009387	ENSGT00940000162226	ENSGT00390000017655	ENSGT01080000257897	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00940000162000.d
Cebidae_a	ANCESTRAL SPECIES	97	ENSGT00530000064244.b	ENSGT00940000159913	ENSGT00390000009662	ENSGT00390000002408.c.b	ENSGT00390000002511	ENSGT00390000010239	ENSGT00550000074919	ENSGT00950000183166.a.b	ENSGT00550000074856.o	ENSGT00940000162536	ENSGT00390000009387	ENSGT00940000162226	ENSGT00390000017655	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00940000162000.d
Capuchin	MODERN SPECIES	461	CDC45 (ENSCCAG00000032172)	UFD1 (ENSCCAG00000011104)	C22orf39 (ENSCCAG00000027208)	MRPL40 (ENSCCAG00000037694)	HIRA (ENSCCAG00000025576)	CLTCL1 (ENSCCAG00000018635)	SLC25A1 (ENSCCAG00000037876)	GSC2 (ENSCCAG00000027479)	ESS2 (ENSCCAG00000021557)	ENSCCAG00000019387	DGCR2 (ENSCCAG00000030344)	GAB4 (ENSCCAG00000033617)	ENSCCAG00000037479	MED15 (ENSCCAG00000036908)	KLHL22 (ENSCCAG00000026151)	SCARF2 (ENSCCAG00000034816) ##22	ZNF74 (ENSCCAG00000028202)	ENSCCAG00000029166
Bolivian squirrel monkey	MODERN SPECIES	206	CRKL (ENSSBOG00000025677)	AIFM3 (ENSSBOG00000024530)	LZTR1 (ENSSBOG00000025324)	THAP7 (ENSSBOG00000019698)	P2RX6 (ENSSBOG00000034122)	SLC7A4 (ENSSBOG00000034115)	LRRC74B (ENSSBOG00000029095)	ENSSBOG00000026367	CLTCL1 (ENSSBOG00000030956)	SLC25A1 (ENSSBOG00000025287)	ESS2 (ENSSBOG00000032190)	TSSK2 (ENSSBOG00000009793)	DGCR2 (ENSSBOG00000024086)	MED15 (ENSSBOG00000028827)	KLHL22 (ENSSBOG00000022717)	SCARF2 (ENSSBOG00000021027) ##22	ZNF74 (ENSSBOG00000035690)	ENSSBOG00000033715	ENSSBOG00000013406	ENSSBOG00000030944	HIRA (ENSSBOG00000021149)	ENSSBOG00000013817	MRPL40 (ENSSBOG00000031050)	C22orf39 (ENSSBOG00000031146)	ENSSBOG00000027274	CDC45 (ENSSBOG00000018948)	SEPTIN5 (ENSSBOG00000027910)	GP1BB (ENSSBOG00000034037)	ENSSBOG00000003899	GNB1L (ENSSBOG00000029828)	TXNRD2 (ENSSBOG00000023176)
Marmoset	MODERN SPECIES		UFD1 (ENSCJAG00000001566)	ENSCJAG00000044605	MRPL40 (ENSCJAG00000001584)	HIRA (ENSCJAG00000001591)	ENSCJAG00000022184	CLTCL1 (ENSCJAG00000047873)	ENSCJAG00000001657	GSC2 (ENSCJAG00000065946)	ESS2 (ENSCJAG00000001679)	TSSK2 (ENSCJAG00000064480)	DGCR2 (ENSCJAG00000001699)	ENSCJAG00000068046	GRAMD4 (ENSCJAG00000078404)	MED15 (ENSCJAG00000016378)	KLHL22 (ENSCJAG00000016358)	SCARF2 (ENSCJAG00000016327) ##22	ZNF74 (ENSCJAG00000051713)	MGAT3 (ENSCJAG00000045381)	TAB1 (ENSCJAG00000016297)	SYNGR1 (ENSCJAG00000086031)	RPL3 (ENSCJAG00000012574)	PDGFB (ENSCJAG00000011366)	CBX7 (ENSCJAG00000012537)	APOBEC3H (ENSCJAG00000012524)	ENSCJAG00000085098	ENSCJAG00000080759	ENSCJAG00000012500	ENSCJAG00000073371	APOBEC3A (ENSCJAG00000011578)	CBX6 (ENSCJAG00000056228)	NPTXR (ENSCJAG00000041862)
Mas night monkey	MODERN SPECIES	759													MED15 (ENSANAG00000033174)	KLHL22 (ENSANAG00000011362)	ENSANAG00000028389	SCARF2 (ENSANAG00000031442) ##22	ZNF74 (ENSANAG00000021232)
Catarrhini	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00530000063529.C	ENSGT01100000263518.B.a	ENSGT00940000157345.b	ENSGT00940000162302	ENSGT00940000162860	ENSGT00940000153231.A.j	ENSGT00390000012929	ENSGT00950000182825.B	ENSGT00390000014845	ENSGT00390000006044	ENSGT00390000007249	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00910000146854.b	ENSGT00940000155199.mb	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00940000162000.d
Cercopithecidae	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00530000063529.C	ENSGT01100000263518.B.a	ENSGT00940000157345.b	ENSGT00940000162302	ENSGT00940000162860	ENSGT00940000153231.A.j	ENSGT00390000012929	ENSGT00950000182825.B	ENSGT00390000014845	ENSGT00390000006044	ENSGT00390000007249	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00910000146854.b	ENSGT00940000155199.mb	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00940000162000.d	ENSGT01100000263584.a.a
Rhinopithecus	ANCESTRAL SPECIES	214	ENSGT00950000182843.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000160448	ENSGT00940000158190	ENSGT00730000111394	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000154637	ENSGT00390000014845.x	ENSGT00940000155143.x	ENSGT00940000156298.s.d	ENSGT00940000166367	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00910000146854.b	ENSGT00940000155199.mb	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00940000162000.d	ENSGT01100000263584.a.a	ENSGT00390000017663.x.b	ENSGT00390000006265.b
Golden snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	1443			CRKL (ENSRROG00000043533)	AIFM3 (ENSRROG00000044919)	LZTR1 (ENSRROG00000038100)	THAP7 (ENSRROG00000040011)	P2RX6 (ENSRROG00000043854)	SLC7A4 (ENSRROG00000041966)	ENSRROG00000024731	ENSRROG00000040899	ENSRROG00000039621	ENSRROG00000040967	MED15 (ENSRROG00000033397)	KLHL22 (ENSRROG00000028572)	ENSRROG00000033134	SCARF2 (ENSRROG00000035088) ##22	ZNF74 (ENSRROG00000033894)	ENSRROG00000033076	ENSRROG00000042499
Black snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	706	CRKL (ENSRBIG00000038596)	AIFM3 (ENSRBIG00000041001)	LZTR1 (ENSRBIG00000042733)	THAP7 (ENSRBIG00000034069)	ENSRBIG00000036212	P2RX6 (ENSRBIG00000030145)	SLC7A4 (ENSRBIG00000039834)	ENSRBIG00000043817	ENSRBIG00000042018	ENSRBIG00000034826	ENSRBIG00000025235	MED15 (ENSRBIG00000019766)	KLHL22 (ENSRBIG00000022038)	ENSRBIG00000032158	ENSRBIG00000032284	SCARF2 (ENSRBIG00000039372) ##22	ZNF74 (ENSRBIG00000036711)	ENSRBIG00000042013
Cercopithecinae	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00530000063529.C	ENSGT01100000263518.B.a	ENSGT00940000157345.b	ENSGT00940000162302	ENSGT00940000162860	ENSGT00940000153231.A.j	ENSGT00390000012929	ENSGT00950000182825.B	ENSGT00390000014845	ENSGT00390000006044	ENSGT00390000007249	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00910000146854.b	ENSGT00940000155199.mb	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00940000162000.d	ENSGT01100000263584.a.a	ENSGT00390000017663.x.b.c	ENSGT00940000154297.B	ENSGT00940000154637	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00730000111394	ENSGT00940000158190	ENSGT00940000160448	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00950000182843.a.b	ENSGT00940000158664	ENSGT00550000074798.a.a	ENSGT00390000009363	ENSGT00940000159978
Vervet Monkey	MODERN SPECIES	10	HIC2 (ENSCSAG00000013356)	ENSCSAG00000013333	PI4KA (ENSCSAG00000013299)	SERPIND1 (ENSCSAG00000013260)	SNAP29 (ENSCSAG00000013252)	CRKL (ENSCSAG00000013224)	AIFM3 (ENSCSAG00000013188)	LZTR1 (ENSCSAG00000013060)	THAP7 (ENSCSAG00000012875)	P2RX6 (ENSCSAG00000012867)	SLC7A4 (ENSCSAG00000012813)	LRRC74B (ENSCSAG00000012796)	ENSCSAG00000012766	MED15 (ENSCSAG00000012582)	KLHL22 (ENSCSAG00000012359)	SCARF2 (ENSCSAG00000012308) ##22	ZNF74 (ENSCSAG00000012224)	ENSCSAG00000012221	ENSCSAG00000012215	ENSCSAG00000012202	RTN4R (ENSCSAG00000019271)	CCDC188 (ENSCSAG00000012178)	ZDHHC8 (ENSCSAG00000012164)	RANBP1 (ENSCSAG00000012086)	TRMT2A (ENSCSAG00000012001)	DGCR8 (ENSCSAG00000011993)	TANGO2 (ENSCSAG00000011981)	ARVCF (ENSCSAG00000011970)	COMT (ENSCSAG00000011940)	TXNRD2 (ENSCSAG00000011933)	GNB1L (ENSCSAG00000011917)
Cercopithecinae_a	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00530000063529.C	ENSGT01100000263518.B.a	ENSGT00940000157345.b	ENSGT00940000162302	ENSGT00940000162860	ENSGT00940000153231.A.j	ENSGT00390000012929	ENSGT00950000182825.B	ENSGT00390000014845	ENSGT00390000006044	ENSGT00390000007249	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00910000146854.b	ENSGT00940000155199.mb	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00940000162000.d	ENSGT01100000263584.a.a	ENSGT00390000017663.x.b.c
Macaca	ANCESTRAL SPECIES	27	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000160448	ENSGT00940000158190	ENSGT00730000111394	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000154637	ENSGT00940000154297.B	ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.a.b	ENSGT00940000155143.x	ENSGT00940000156298.s.d.a.b	ENSGT00940000166367	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00910000146854.b	ENSGT00940000155199.mb	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00940000163677.a.b.a.a.a.a	ENSGT00940000162000.d	ENSGT01100000263584.a.a	ENSGT00390000017663.x.b.c	ENSGT00390000006265.b.g	ENSGT00940000160711	ENSGT00940000153380.D.a.a	ENSGT00550000076205	ENSGT00940000153380.D.b	ENSGT00940000158044.a	ENSGT00900000141073.r	ENSGT00530000063723.a	ENSGT00390000015977	ENSGT00390000012733	ENSGT00940000157027
Pig-tailed macaque	MODERN SPECIES	564	SERPIND1 (ENSMNEG00000041968)	SNAP29 (ENSMNEG00000034530)	CRKL (ENSMNEG00000033647)	AIFM3 (ENSMNEG00000044567)	LZTR1 (ENSMNEG00000003490)	THAP7 (ENSMNEG00000034212)	P2RX6 (ENSMNEG00000043187)	SLC7A4 (ENSMNEG00000030753)	ENSMNEG00000030488	ENSMNEG00000025593	ENSMNEG00000027992	MED15 (ENSMNEG00000041022)	KLHL22 (ENSMNEG00000030220)	ENSMNEG00000035791	ENSMNEG00000038640	SCARF2 (ENSMNEG00000044672) ##22	ZNF74 (ENSMNEG00000032562)	ENSMNEG00000037360	ENSMNEG00000039558	RTN4R (ENSMNEG00000041125)	ENSMNEG00000045533	CCDC188 (ENSMNEG00000036140)	ZDHHC8 (ENSMNEG00000028007)	RANBP1 (ENSMNEG00000030353)	TRMT2A (ENSMNEG00000039235)	DGCR8 (ENSMNEG00000009733)	TANGO2 (ENSMNEG00000030656)	ARVCF (ENSMNEG00000031345)	COMT (ENSMNEG00000022654)	TXNRD2 (ENSMNEG00000035876)	GNB1L (ENSMNEG00000042672)
Macaca_a	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT01030000240302	ENSGT00940000164709.a.b.b.a.a.b.a.a.a.a.b.a.a.b.b	ENSGT00940000160448	ENSGT00940000158190	ENSGT00730000111394	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000154637	ENSGT00940000154297.B	ENSGT00940000155143.x	ENSGT00940000156298.s.d.a.b	ENSGT00940000166367	ENSGT00940000164709.a.b.b.a.a.b.a.a.a.a.b.a.a.b.a.b.a.a.a.b.b	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00910000146854.b	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00940000163677.a.b.a.a.a.a	ENSGT00390000017663.x.b.c	ENSGT00390000006265.b.g	ENSGT00940000160711	ENSGT00940000153380.D.a.a	ENSGT00940000158044.a	ENSGT00900000141073.r	ENSGT00530000063723.a	ENSGT00390000015977	ENSGT00390000012733	ENSGT00940000157027	ENSGT00940000155317.b	ENSGT00940000158832	ENSGT00940000166811	ENSGT00390000018606
Crab-eating macaque	MODERN SPECIES	1	ENSMFAG00000002747	ENSMFAG00000059641	ENSMFAG00000059543	AIFM3 (ENSMFAG00000009725)	LZTR1 (ENSMFAG00000002308)	THAP7 (ENSMFAG00000002469)	P2RX6 (ENSMFAG00000042492)	SLC7A4 (ENSMFAG00000038240)	ENSMFAG00000042759	ENSMFAG00000037246	ENSMFAG00000038987	ENSMFAG00000065220	MED15 (ENSMFAG00000037245)	KLHL22 (ENSMFAG00000000285)	ENSMFAG00000001895	SCARF2 (ENSMFAG00000045605) ##22	ENSMFAG00000002732	ENSMFAG00000064423	ENSMFAG00000042526	ENSMFAG00000036801	RTN4R (ENSMFAG00000002996)	ENSMFAG00000062391	CCDC188 (ENSMFAG00000039335)	RANBP1 (ENSMFAG00000045937)	TRMT2A (ENSMFAG00000038705)	DGCR8 (ENSMFAG00000033708)	TANGO2 (ENSMFAG00000004021)	ARVCF (ENSMFAG00000038042)	COMT (ENSMFAG00000030334)	TXNRD2 (ENSMFAG00000039502)	RTL10 (ENSMFAG00000033419)
Rhesus	MODERN SPECIES	1	SNAP29 (ENSMMUG00000020384)	ENSMMUG00000057885	ENSMMUG00000063457	AIFM3 (ENSMMUG00000020478)	LZTR1 (ENSMMUG00000020482)	THAP7 (ENSMMUG00000020483)	P2RX6 (ENSMMUG00000020476)	SLC7A4 (ENSMMUG00000063154)	ENSMMUG00000062410	ENSMMUG00000059339	ENSMMUG00000056022	ENSMMUG00000061040	ENSMMUG00000049130	ENSMMUG00000063914	MED15 (ENSMMUG00000023263)	SCARF2 (ENSMMUG00000017171) ##22	ZNF74 (ENSMMUG00000056760)	ENSMMUG00000053802	ENSMMUG00000050014	DGCR6L (ENSMMUG00000000560)	ENSMMUG00000041787	RTN4R (ENSMMUG00000011547)	ENSMMUG00000040386	ZDHHC8 (ENSMMUG00000020101)	RANBP1 (ENSMMUG00000020100)	TRMT2A (ENSMMUG00000020099)	DGCR8 (ENSMMUG00000020098)	TANGO2 (ENSMMUG00000020233)	ARVCF (ENSMMUG00000017153)	COMT (ENSMMUG00000054068)	TXNRD2 (ENSMMUG00000017147)
Cercopithecinae_b	ANCESTRAL SPECIES	53											ENSGT00940000166367	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00910000146854.b	ENSGT00940000155199.mb	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00940000162000.d	ENSGT01100000263584.a.a	ENSGT00940000160711	ENSGT00550000076205	ENSGT00940000153380.D.b	ENSGT00940000158044.a	ENSGT00900000141073.r	ENSGT00530000063723.a	ENSGT00390000015977	ENSGT00390000012733	ENSGT00940000157027	ENSGT00940000155317.b	ENSGT00940000158832	ENSGT00390000018606	ENSGT00940000154816.a.b
Cercopithecinae_d	ANCESTRAL SPECIES	110										ENSGT00940000155143.x	ENSGT00940000166367	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00910000146854.b	ENSGT00940000155199.mb	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00940000162000.d	ENSGT01100000263584.a.a	ENSGT00940000160711	ENSGT00550000076205	ENSGT00940000153380.D.b	ENSGT00940000158044.a	ENSGT00900000141073.r	ENSGT00530000063723.a	ENSGT00390000015977	ENSGT00390000012733	ENSGT00940000157027	ENSGT00940000155317.b	ENSGT00940000158832	ENSGT00390000018606	ENSGT00940000154816.a.b
Drill	MODERN SPECIES	932										ENSMLEG00000028495	ENSMLEG00000036364	MED15 (ENSMLEG00000004543)	ENSMLEG00000044040	ENSMLEG00000042749	KLHL22 (ENSMLEG00000034401)	SCARF2 (ENSMLEG00000034528) ##22	ZNF74 (ENSMLEG00000003487)	ENSMLEG00000032346	ENSMLEG00000030131	RTN4R (ENSMLEG00000042754)	ENSMLEG00000038471	CCDC188 (ENSMLEG00000032407)	ZDHHC8 (ENSMLEG00000002618)	RANBP1 (ENSMLEG00000038738)	TRMT2A (ENSMLEG00000034259)	DGCR8 (ENSMLEG00000030324)	TANGO2 (ENSMLEG00000038944)	ARVCF (ENSMLEG00000034443)	COMT (ENSMLEG00000031497)	TXNRD2 (ENSMLEG00000042607)	GNB1L (ENSMLEG00000040958)
Sooty mangabey	MODERN SPECIES	168										ENSCATG00000031007	ENSCATG00000044193	MED15 (ENSCATG00000042281)	KLHL22 (ENSCATG00000035495)	ENSCATG00000026012	ENSCATG00000032236	SCARF2 (ENSCATG00000045005) ##22	ZNF74 (ENSCATG00000042043)	ENSCATG00000032240	ENSCATG00000030197	USP18 (ENSCATG00000029495)	TUBA8 (ENSCATG00000030328)	PEX26 (ENSCATG00000037881)	ENSCATG00000033170	MICAL3 (ENSCATG00000030072)	BID (ENSCATG00000032461)	BCL2L13 (ENSCATG00000036326)	ATP6V1E1 (ENSCATG00000040548)	SLC25A18 (ENSCATG00000040300)	CECR2 (ENSCATG00000038099)	ENSCATG00000022842	ADA2 (ENSCATG00000043617)
Olive baboon	MODERN SPECIES	7	GP1BB (ENSPANG00000016740)	TBX1 (ENSPANG00000015763)	RTL10 (ENSPANG00000016401)	TXNRD2 (ENSPANG00000010339)	COMT (ENSPANG00000006826)	ARVCF (ENSPANG00000007369)	TANGO2 (ENSPANG00000017418)	DGCR8 (ENSPANG00000019987)	TRMT2A (ENSPANG00000024085)	RANBP1 (ENSPANG00000024087)	ZDHHC8 (ENSPANG00000015762)	RTN4R (ENSPANG00000019636)	ENSPANG00000050477	MED15 (ENSPANG00000024303)	KLHL22 (ENSPANG00000012339)	SCARF2 (ENSPANG00000031361) ##22	ZNF74 (ENSPANG00000022560)	ENSPANG00000047745	THAP7 (ENSPANG00000018658)	LZTR1 (ENSPANG00000026324)	SNAP29 (ENSPANG00000030800)	SERPIND1 (ENSPANG00000026011)	PI4KA (ENSPANG00000026010)	TMEM191B (ENSPANG00000026013)	HIC2 (ENSPANG00000024301)	ENSPANG00000019237	YDJC (ENSPANG00000011342)	CCDC116 (ENSPANG00000021769)	SDF2L1 (ENSPANG00000034744)	PPIL2 (ENSPANG00000020040)	YPEL1 (ENSPANG00000022265)
Hominoidea	ANCESTRAL SPECIES	31	ENSGT00390000009363	ENSGT00550000074798.a.a.b	ENSGT00940000158664	ENSGT00950000182843.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000160448	ENSGT00940000158190	ENSGT00730000111394	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000154637	ENSGT00940000166265	ENSGT00940000154297.B	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00940000155199.mb	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00940000162000.d	ENSGT00940000160711	ENSGT00550000076205	ENSGT00940000153380.D.b	ENSGT00940000158044.a	ENSGT00900000141073.r	ENSGT00530000063723.a	ENSGT00390000015977	ENSGT00390000012733	ENSGT00940000157027	ENSGT00940000155317.b	ENSGT00940000158832	ENSGT00940000166811	ENSGT00390000018606	ENSGT00940000154816.a.b
Gibbon	MODERN SPECIES	22	ATP6V1E1 (ENSNLEG00000030663)	BCL2L13 (ENSNLEG00000007840)	BID (ENSNLEG00000029261)	ENSNLEG00000032084	MICAL3 (ENSNLEG00000007851)	TUBA8 (ENSNLEG00000030385)	ENSNLEG00000030389	USP18 (ENSNLEG00000007885)	ENSNLEG00000007896	ENSNLEG00000034573	ENSNLEG00000036211	ENSNLEG00000032654	MED15 (ENSNLEG00000007907)	KLHL22 (ENSNLEG00000007910)	ENSNLEG00000028230	SCARF2 (ENSNLEG00000007911) ##22	ENSNLEG00000005737	ENSNLEG00000034901	ENSNLEG00000027550	RTN4R (ENSNLEG00000005706)	ENSNLEG00000032706	ZDHHC8 (ENSNLEG00000005693)	RANBP1 (ENSNLEG00000005684)	TRMT2A (ENSNLEG00000005670)	DGCR8 (ENSNLEG00000005643)	ENSNLEG00000005635	ARVCF (ENSNLEG00000005621)	COMT (ENSNLEG00000030236)	TXNRD2 (ENSNLEG00000005534)	RTL10 (ENSNLEG00000019209)	GNB1L (ENSNLEG00000005524)
Hominidae	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00910000147372	ENSGT00390000009363.b	ENSGT00550000074798.a.a.b	ENSGT00940000158664	ENSGT00950000182843.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000160448	ENSGT00940000158190	ENSGT00730000111394	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000154637	ENSGT00940000166265	ENSGT00940000154297.B	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00940000162000.d	ENSGT00940000164457.A.d	ENSGT00390000017663.x.b	ENSGT00940000160711	ENSGT00550000076205	ENSGT00940000153380.D.b	ENSGT00940000158044.a	ENSGT00900000141073.r	ENSGT00530000063723.a	ENSGT00390000015977	ENSGT00390000012733	ENSGT00940000157027	ENSGT00940000155317.b	ENSGT00940000158832	ENSGT00940000166811
Orangutan	MODERN SPECIES	13	HIC2 (ENSPPYG00000039173)	TMEM191B (ENSPPYG00000012024)	PI4KA (ENSPPYG00000012025)	SERPIND1 (ENSPPYG00000012026)	SNAP29 (ENSPPYG00000032205)	CRKL (ENSPPYG00000037078)	AIFM3 (ENSPPYG00000012030)	LZTR1 (ENSPPYG00000012031)	THAP7 (ENSPPYG00000012032)	ENSPPYG00000012036	SLC7A4 (ENSPPYG00000032303)	ENSPPYG00000033069	LRRC74B (ENSPPYG00000012039)	MED15 (ENSPPYG00000011601)	KLHL22 (ENSPPYG00000011600)	SCARF2 (ENSPPYG00000011599) ##22	ZNF74 (ENSPPYG00000011598)	ENSPPYG00000025952	RTN4R (ENSPPYG00000011597)	ENSPPYG00000011596	ENSPPYG00000040850	ZDHHC8 (ENSPPYG00000011594)	RANBP1 (ENSPPYG00000011593)	TRMT2A (ENSPPYG00000011592)	DGCR8 (ENSPPYG00000011591)	TANGO2 (ENSPPYG00000011590)	ARVCF (ENSPPYG00000011589)	ENSPPYG00000011588	TXNRD2 (ENSPPYG00000011587)	GNB1L (ENSPPYG00000011586)	RTL10 (ENSPPYG00000032970)
Homo/Pan/Gorilla group	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000154297.B	ENSGT00940000166265	ENSGT00940000154637	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00730000111394	ENSGT00940000158190	ENSGT00940000160448	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00950000182843.a.b	ENSGT00940000158664	ENSGT00550000074798.a.a.a	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000153309.c.b.a.b.b.b	ENSGT00940000155199.mb	ENSGT00940000159598	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00940000162000.d	ENSGT00390000017663.x.b.b	ENSGT00940000160711	ENSGT00550000076205	ENSGT00940000153380.D.b	ENSGT00940000158044.a	ENSGT00900000141073.r.a	ENSGT00530000063723.a	ENSGT00390000015977	ENSGT00390000012733	ENSGT00940000157027	ENSGT00940000155317.b	ENSGT00940000158832	ENSGT00940000166811	ENSGT00390000018606
Gorilla	MODERN SPECIES	13	P2RX6 (ENSGGOG00000003573)	THAP7 (ENSGGOG00000025383)	LZTR1 (ENSGGOG00000025822)	AIFM3 (ENSGGOG00000026427)	ENSGGOG00000041529	SNAP29 (ENSGGOG00000001007)	SERPIND1 (ENSGGOG00000025380)	ENSGGOG00000034851	PI4KA (ENSGGOG00000015922)	ENSGGOG00000036215	ENSGGOG00000000395	MED15 (ENSGGOG00000004182)	ENSGGOG00000025508	ENSGGOG00000043161	KLHL22 (ENSGGOG00000015856)	SCARF2 (ENSGGOG00000015838) ##22	ZNF74 (ENSGGOG00000015829)	ENSGGOG00000015817	ENSGGOG00000015940	DGCR6L (ENSGGOG00000006060)	RTN4R (ENSGGOG00000006055)	CCDC188 (ENSGGOG00000022917)	ZDHHC8 (ENSGGOG00000000785)	RANBP1 (ENSGGOG00000000784)	TRMT2A (ENSGGOG00000000783)	DGCR8 (ENSGGOG00000000780)	TANGO2 (ENSGGOG00000004830)	ARVCF (ENSGGOG00000006706)	COMT (ENSGGOG00000006699)	ENSGGOG00000001980	ENSGGOG00000038673
Homo/Pan group	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000154297.B	ENSGT00940000166265	ENSGT00940000154637	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00730000111394	ENSGT00940000158190	ENSGT00940000160448	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00950000182843.a.b	ENSGT00940000158664	ENSGT00550000074798.a.a.b	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000153309.c.b.a.b.b.b	ENSGT00940000155199.mb	ENSGT00940000159598	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00940000162000.d	ENSGT00390000017663.x.b.b	ENSGT00940000160711	ENSGT00550000076205	ENSGT00940000153380.D.b	ENSGT00940000158044.a	ENSGT00900000141073.r.a	ENSGT00530000063723.a	ENSGT00390000015977	ENSGT00390000012733	ENSGT00940000157027	ENSGT00940000155317.b	ENSGT00940000158832	ENSGT00940000166811	ENSGT00390000018606
Human	MODERN SPECIES	14	RIMBP3B (ENSG00000274600)	FAM246A (ENSG00000286102)	LRRC74B (ENSG00000187905)	SLC7A4 (ENSG00000099960)	P2RX6 (ENSG00000099957)	TUBA3FP (ENSG00000284130)	THAP7 (ENSG00000184436)	LZTR1 (ENSG00000099949)	AIFM3 (ENSG00000183773)	CRKL (ENSG00000099942)	SNAP29 (ENSG00000099940)	SERPIND1 (ENSG00000099937)	PI4KA (ENSG00000241973)	MED15 (ENSG00000099917)	KLHL22 (ENSG00000099910)	SCARF2 (ENSG00000244486) ##22	ZNF74 (ENSG00000185252)	DGCR6L (ENSG00000128185)	RTN4R (ENSG00000040608)	CCDC188 (ENSG00000234409)	ZDHHC8 (ENSG00000099904)	RANBP1 (ENSG00000099901)	TRMT2A (ENSG00000099899)	DGCR8 (ENSG00000128191)	TANGO2 (ENSG00000183597)	ARVCF (ENSG00000099889)	COMT (ENSG00000093010)	TXNRD2 (ENSG00000184470)	RTL10 (ENSG00000215012)	GNB1L (ENSG00000185838)	TBX1 (ENSG00000184058)
Pan	ANCESTRAL SPECIES	35	ENSGT00940000154297.B	ENSGT00940000166265	ENSGT00940000154637	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00730000111394	ENSGT00940000158190	ENSGT00940000160448	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00950000182843.a.b	ENSGT00940000158664	ENSGT00550000074798.a.a.b	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000153309.c.b.a.b.b.b	ENSGT00940000155199.mb	ENSGT00940000159598	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00940000162000.d	ENSGT00390000017663.x.b.b	ENSGT00940000160711	ENSGT00550000076205	ENSGT00940000153380.D.b	ENSGT00940000158044.a	ENSGT00900000141073.r.a	ENSGT00530000063723.a	ENSGT00390000015977	ENSGT00390000012733	ENSGT00940000157027	ENSGT00940000155317.b	ENSGT00940000158832	ENSGT00940000155193.a.b	ENSGT00390000018606
Chimpanzee	MODERN SPECIES	13	ENSPTRG00000048506	SLC7A4 (ENSPTRG00000014102)	P2RX6 (ENSPTRG00000014101)	THAP7 (ENSPTRG00000014098)	LZTR1 (ENSPTRG00000014097)	AIFM3 (ENSPTRG00000014095)	CRKL (ENSPTRG00000014094)	SNAP29 (ENSPTRG00000014093)	SERPIND1 (ENSPTRG00000014092)	PI4KA (ENSPTRG00000014090)	ENSPTRG00000043221	ENSPTRG00000045783	MED15 (ENSPTRG00000014087)	ENSPTRG00000043076	KLHL22 (ENSPTRG00000014085)	SCARF2 (ENSPTRG00000014084) ##22	ZNF74 (ENSPTRG00000014083)	ENSPTRG00000046891	DGCR6L (ENSPTRG00000014080)	RTN4R (ENSPTRG00000014079)	ENSPTRG00000038652	CCDC188 (ENSPTRG00000042466)	ZDHHC8 (ENSPTRG00000014077)	RANBP1 (ENSPTRG00000043450)	TRMT2A (ENSPTRG00000014074)	DGCR8 (ENSPTRG00000014073)	TANGO2 (ENSPTRG00000014072)	ARVCF (ENSPTRG00000014071)	COMT (ENSPTRG00000014070)	TXNRD2 (ENSPTRG00000014069)	ENSPTRG00000049410
Bonobo	MODERN SPECIES	13	LRRC74B (ENSPPAG00000041521)	ENSPPAG00000039619	SLC7A4 (ENSPPAG00000030114)	P2RX6 (ENSPPAG00000032797)	THAP7 (ENSPPAG00000027598)	LZTR1 (ENSPPAG00000032277)	AIFM3 (ENSPPAG00000027552)	CRKL (ENSPPAG00000016730)	SNAP29 (ENSPPAG00000041748)	SERPIND1 (ENSPPAG00000041060)	PI4KA (ENSPPAG00000035807)	MED15 (ENSPPAG00000028479)	ENSPPAG00000027529	ENSPPAG00000027009	KLHL22 (ENSPPAG00000029088)	ENSPPAG00000037889 ##22	ZNF74 (ENSPPAG00000035031)	RTN4R (ENSPPAG00000005770)	ENSPPAG00000006622	CCDC188 (ENSPPAG00000036009)	ZDHHC8 (ENSPPAG00000016192)	RANBP1 (ENSPPAG00000042966)	TRMT2A (ENSPPAG00000043781)	DGCR8 (ENSPPAG00000039507)	TANGO2 (ENSPPAG00000042205)	ARVCF (ENSPPAG00000027324)	COMT (ENSPPAG00000027543)	TXNRD2 (ENSPPAG00000042002)	ENSPPAG00000035063	GNB1L (ENSPPAG00000041675)	ENSPPAG00000032550
Euarchontoglires_A	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000160448	ENSGT00940000158190	ENSGT00730000111394	ENSGT00940000154297.B	ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.a.b	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000154637	ENSGT00950000182825.B	ENSGT00390000014845	ENSGT00940000166905	ENSGT00390000006044	ENSGT00390000007249	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00940000162000.d	ENSGT00940000162972	ENSGT00390000017655	ENSGT00940000163130	ENSGT00940000162226	ENSGT00410000026913	ENSGT00390000009387	ENSGT00940000162536	ENSGT00550000074856	ENSGT00950000183166.a.b	ENSGT00550000074919	ENSGT00390000010239	ENSGT00390000002511	ENSGT00390000002408	ENSGT00390000009662
Glires	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00950000182843.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000160448	ENSGT00940000158190	ENSGT00730000111394	ENSGT00940000154297.B	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000154637	ENSGT00950000182825.B	ENSGT00390000014845	ENSGT00940000166905	ENSGT00390000006044	ENSGT00390000007249	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00940000162000.d	ENSGT00940000162972	ENSGT00390000017655	ENSGT00940000163130	ENSGT00940000162226	ENSGT00410000026913	ENSGT00390000009387	ENSGT00940000162536	ENSGT00550000074856	ENSGT00950000183166.a.b	ENSGT00550000074919	ENSGT00390000010239	ENSGT00390000002511	ENSGT00390000002408	ENSGT00390000009662
Rodentia	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00950000182843.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000160448	ENSGT00940000158190	ENSGT00730000111394	ENSGT00950000182825.B	ENSGT00940000154297.B	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000154637	ENSGT00390000014845	ENSGT00940000166905	ENSGT00390000006044	ENSGT00390000007249	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00940000162000.d	ENSGT00940000162972	ENSGT00390000017655	ENSGT00940000163130	ENSGT00940000162226	ENSGT00390000009387	ENSGT00940000162536	ENSGT00550000074856	ENSGT00950000183166.a.b	ENSGT00550000074919	ENSGT00390000010239	ENSGT00390000002511	ENSGT00390000002408	ENSGT00390000009662	ENSGT00940000161769
Rodentia_B	ANCESTRAL SPECIES	44	ENSGT00950000182843.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000160448	ENSGT00940000158190	ENSGT00730000111394	ENSGT00950000182825.B	ENSGT00940000154297.B	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000154637	ENSGT00390000014845	ENSGT00390000006044	ENSGT00390000007249	ENSGT00940000169602	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00940000162972	ENSGT00390000017655	ENSGT00940000163130	ENSGT00940000162226	ENSGT00390000009387	ENSGT00940000162536	ENSGT00550000074856	ENSGT00550000074919	ENSGT00390000010239	ENSGT00390000002511	ENSGT00390000002408	ENSGT00390000009662	ENSGT00940000161769	ENSGT00940000159913	ENSGT00530000064244.b
Kangaroo rat	MODERN SPECIES	460	Crkl (ENSDORG00000025797)	Aifm3 (ENSDORG00000008091)	Lztr1 (ENSDORG00000008094)	Thap7 (ENSDORG00000008098)	Tuba3a (ENSDORG00000028053)	Lrrc74b (ENSDORG00000008102)	P2rx6 (ENSDORG00000026026)	Slc7a4 (ENSDORG00000028542)	ENSDORG00000023815	Mzt2 (ENSDORG00000029683)	Smpd4 (ENSDORG00000027060)	ENSDORG00000024874	Ccdc74a (ENSDORG00000024015)	ENSDORG00000005167	Klhl22 (ENSDORG00000003528)	Scarf2 (ENSDORG00000003527) ##22	Car15 (ENSDORG00000027426)	Dgcr2 (ENSDORG00000010097)	Tssk1 (ENSDORG00000024297)	Tssk2 (ENSDORG00000003783)	Ess2 (ENSDORG00000003784)	Gsc2 (ENSDORG00000003785)	Slc25a1 (ENSDORG00000025499)	Hira (ENSDORG00000002948)	Mrpl40 (ENSDORG00000002949)	ENSDORG00000006169	Ufd1 (ENSDORG00000006171)	Cdc45 (ENSDORG00000006172)	Cldn5 (ENSDORG00000028746)	Septin5 (ENSDORG00000013930)	Gp1bb (ENSDORG00000013931)
Myomorpha	ANCESTRAL SPECIES	57	ENSGT00550000074798.a.a	ENSGT00940000158664	ENSGT00950000182843.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000160448	ENSGT00940000158190	ENSGT00730000111394	ENSGT00940000154297.B	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000154637	ENSGT00390000014845	ENSGT00390000006044	ENSGT00390000007249	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00940000162972	ENSGT00390000017655	ENSGT00940000163130	ENSGT00940000162226	ENSGT00390000009387	ENSGT00940000162536	ENSGT00550000074856
Muroidea	ANCESTRAL SPECIES	61	ENSGT00390000009363	ENSGT00550000074798.a.a	ENSGT00940000158664	ENSGT00950000182843.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000160448	ENSGT00940000158190	ENSGT00730000111394	ENSGT00940000154297.B	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000154637	ENSGT00390000006044	ENSGT00390000007249	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00940000162972	ENSGT00390000017655	ENSGT00940000163130	ENSGT00940000162226	ENSGT00390000009387	ENSGT00940000162536	ENSGT00550000074856	ENSGT00390000017663	ENSGT00390000006265.b	ENSGT00940000160711	ENSGT00940000153380.D	ENSGT00940000158044.a	ENSGT00900000141073	ENSGT00530000063723.a	ENSGT00970000193655
Muroidea_A	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00390000009363	ENSGT00550000074798.a.a	ENSGT00940000158664	ENSGT00950000182843.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000160448	ENSGT00940000158190	ENSGT00730000111394	ENSGT00940000154297.B	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000154637	ENSGT00390000006044	ENSGT00390000007249	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00940000162972	ENSGT00390000017655	ENSGT00940000163130	ENSGT00940000162226	ENSGT00390000009387	ENSGT00940000162536	ENSGT00550000074856	ENSGT00390000017663	ENSGT00390000006265.b	ENSGT00940000160711	ENSGT00940000153380.D	ENSGT00940000158044.a	ENSGT00900000141073	ENSGT00530000063723.a	ENSGT00970000193655
Murinae	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00390000009363	ENSGT00550000074798.a.a	ENSGT00940000158664	ENSGT00950000182843.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000160448	ENSGT00940000158190	ENSGT00730000111394	ENSGT00940000154297.B	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000154637	ENSGT00390000006044	ENSGT00390000007249	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT01080000257897	ENSGT00940000162972	ENSGT00390000017655	ENSGT00940000163130	ENSGT00940000162226	ENSGT00390000009387	ENSGT00940000162536	ENSGT00550000074856	ENSGT00390000017663	ENSGT00390000006265.b	ENSGT00940000160711	ENSGT00940000153380.D	ENSGT00940000158044.a	ENSGT00900000141073	ENSGT00530000063723.a
Mus	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00390000009363	ENSGT00550000074798.a.a	ENSGT00940000158664	ENSGT00950000182843.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000160448	ENSGT00940000158190	ENSGT00730000111394	ENSGT00940000154297.B	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000154637	ENSGT00390000006044	ENSGT00390000007249	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT01080000257897	ENSGT00940000162972	ENSGT00390000017655.a	ENSGT00940000163130	ENSGT00940000162226	ENSGT00390000009387	ENSGT00940000162536	ENSGT00550000074856	ENSGT00390000017663	ENSGT00390000006265.b	ENSGT00940000160711	ENSGT00940000153380.D	ENSGT00940000158044.a	ENSGT00900000141073	ENSGT00530000063723.a
Mus_A	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00390000009363	ENSGT00550000074798.a.a	ENSGT00940000158664	ENSGT00950000182843.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000160448	ENSGT00940000158190	ENSGT00730000111394	ENSGT00940000154297.B	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000154637	ENSGT00390000006044	ENSGT00390000007249	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT01080000257897	ENSGT00940000162972	ENSGT00390000017655.a	ENSGT00940000163130	ENSGT00940000162226	ENSGT00390000009387	ENSGT00940000162536	ENSGT00550000074856	ENSGT00390000017663	ENSGT00390000006265.b	ENSGT00940000160711	ENSGT00940000153380.D	ENSGT00940000158044.a	ENSGT00900000141073	ENSGT00530000063723.a
Mus_B	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00390000009363	ENSGT00550000074798.a.a	ENSGT00940000158664	ENSGT00950000182843.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000160448	ENSGT00940000158190	ENSGT00730000111394	ENSGT00940000154297.B	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000154637	ENSGT00390000006044	ENSGT00390000007249	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT01080000257897	ENSGT00940000162972	ENSGT00390000017655.a	ENSGT00940000163130	ENSGT00940000162226	ENSGT00390000009387	ENSGT00940000162536	ENSGT00550000074856	ENSGT00390000017663	ENSGT00390000006265.b	ENSGT00940000160711	ENSGT00940000153380.D	ENSGT00940000158044.a	ENSGT00900000141073	ENSGT00530000063723.a
Mouse	MODERN SPECIES	7	Tmem191 (ENSMUSG00000055692)	Pi4ka (ENSMUSG00000041720)	Serpind1 (ENSMUSG00000022766)	Snap29 (ENSMUSG00000022765)	Crkl (ENSMUSG00000006134)	Aifm3 (ENSMUSG00000022763)	Lztr1 (ENSMUSG00000022761)	Thap7 (ENSMUSG00000022760)	Lrrc74b (ENSMUSG00000022759)	P2rx6 (ENSMUSG00000022758)	Slc7a4 (ENSMUSG00000022756)	Smpd4 (ENSMUSG00000005899)	Ccdc74a (ENSMUSG00000041617)	Med15 (ENSMUSG00000012114)	Klhl22 (ENSMUSG00000022750)	Scarf2 (ENSMUSG00000012017) ##22	B830017H08Rik (ENSMUSG00000116652)	Car15 (ENSMUSG00000090236)	Dgcr2 (ENSMUSG00000003166)	Tssk1 (ENSMUSG00000041566)	Tssk2 (ENSMUSG00000045521)	Ess2 (ENSMUSG00000003527)	Gsc2 (ENSMUSG00000022738)	Slc25a1 (ENSMUSG00000003528)	Vpreb1b (ENSMUSG00000059280)	Dgcr6 (ENSMUSG00000003531)	Prodh (ENSMUSG00000003526)	Rtn4r (ENSMUSG00000043811)	Ccdc188 (ENSMUSG00000090777)	Zdhhc8 (ENSMUSG00000060166)	Ranbp1 (ENSMUSG00000005732)
Mus_C	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00390000009363	ENSGT00550000074798.a.a	ENSGT00940000158664	ENSGT00950000182843.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000160448	ENSGT00940000158190	ENSGT00730000111394	ENSGT00940000154297.B	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000154637	ENSGT00390000006044	ENSGT00390000007249	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00940000162972	ENSGT00390000017655.a	ENSGT00940000163130	ENSGT00940000162226	ENSGT00390000009387	ENSGT00940000162536	ENSGT00550000074856	ENSGT00390000017663	ENSGT00390000006265.b	ENSGT00940000160711	ENSGT00940000153380.D	ENSGT00940000158044.a	ENSGT00900000141073	ENSGT00530000063723.a	ENSGT00970000193655
spretus	MODERN SPECIES	7	Tmem191 (MGP_SPRETEiJ_G0021406)	Pi4ka (MGP_SPRETEiJ_G0021407)	Serpind1 (MGP_SPRETEiJ_G0021408)	Snap29 (MGP_SPRETEiJ_G0021409)	Crkl (MGP_SPRETEiJ_G0021410)	Aifm3 (MGP_SPRETEiJ_G0021411)	Lztr1 (MGP_SPRETEiJ_G0021412)	Thap7 (MGP_SPRETEiJ_G0021413)	Lrrc74b (MGP_SPRETEiJ_G0021414)	P2rx6 (MGP_SPRETEiJ_G0021415)	Slc7a4 (MGP_SPRETEiJ_G0021416)	Smpd4 (MGP_SPRETEiJ_G0021417)	Ccdc74a (MGP_SPRETEiJ_G0021418)	Med15 (MGP_SPRETEiJ_G0021419)	Klhl22 (MGP_SPRETEiJ_G0021420)	Scarf2 (MGP_SPRETEiJ_G0021421) ##22	Car15 (MGP_SPRETEiJ_G0021422)	MGP_SPRETEiJ_G0021423	Dgcr2 (MGP_SPRETEiJ_G0021424)	Tssk1 (MGP_SPRETEiJ_G0021425)	Tssk2 (MGP_SPRETEiJ_G0021426)	Ess2 (MGP_SPRETEiJ_G0021427)	Gsc2 (MGP_SPRETEiJ_G0021428)	Slc25a1 (MGP_SPRETEiJ_G0021429)	Dgcr6 (MGP_SPRETEiJ_G0021430)	Prodh (MGP_SPRETEiJ_G0021431)	Rtn4r (MGP_SPRETEiJ_G0021432)	MGP_SPRETEiJ_G0021433	Zdhhc8 (MGP_SPRETEiJ_G0021434)	Ranbp1 (MGP_SPRETEiJ_G0021435)	Trmt2a (MGP_SPRETEiJ_G0021436)
Steppe mouse	MODERN SPECIES	3260	Pi4ka (ENSMSIG00000018157)	Serpind1 (ENSMSIG00000018333)	Snap29 (ENSMSIG00000018359)	ENSMSIG00000018376	Aifm3 (ENSMSIG00000018403)	Lztr1 (ENSMSIG00000018544)	Thap7 (ENSMSIG00000018638)	Lrrc74b (ENSMSIG00000018653)	P2rx6 (ENSMSIG00000018723)	Slc7a4 (ENSMSIG00000018786)	Smpd4 (ENSMSIG00000018855)	Ccdc74a (ENSMSIG00000019636)	Med15 (ENSMSIG00000019659)	ENSMSIG00000019844	Klhl22 (ENSMSIG00000019849)	Scarf2 (ENSMSIG00000019864) ##22	Car15 (ENSMSIG00000019878)	Dgcr2 (ENSMSIG00000019893)	ENSMSIG00000019948	Ess2 (ENSMSIG00000019953)	Gsc2 (ENSMSIG00000020007)	ENSMSIG00000020018	Slc25a1 (ENSMSIG00000020029)	Vpreb1b (ENSMSIG00000020055)	ENSMSIG00000020089	Dgcr6 (ENSMSIG00000020095)	Prodh (ENSMSIG00000020147)	Rtn4r (ENSMSIG00000020177)	Ccdc188 (ENSMSIG00000020194)	Zdhhc8 (ENSMSIG00000020222)	ENSMSIG00000020271
Ryukyu mouse	MODERN SPECIES	7	Tmem191 (MGP_CAROLIEiJ_G0020511)	MGP_CAROLIEiJ_G0020512	Serpind1 (MGP_CAROLIEiJ_G0020513)	Snap29 (MGP_CAROLIEiJ_G0020514)	Crkl (MGP_CAROLIEiJ_G0020515)	Aifm3 (MGP_CAROLIEiJ_G0020516)	Lztr1 (MGP_CAROLIEiJ_G0020517)	Thap7 (MGP_CAROLIEiJ_G0020518)	Lrrc74b (MGP_CAROLIEiJ_G0020519)	P2rx6 (MGP_CAROLIEiJ_G0020520)	Slc7a4 (MGP_CAROLIEiJ_G0020521)	Smpd4 (MGP_CAROLIEiJ_G0020522)	Ccdc74a (MGP_CAROLIEiJ_G0020523)	Med15 (MGP_CAROLIEiJ_G0020524)	Klhl22 (MGP_CAROLIEiJ_G0020525)	Scarf2 (MGP_CAROLIEiJ_G0020526) ##22	Car15 (MGP_CAROLIEiJ_G0020527)	MGP_CAROLIEiJ_G0020528	Dgcr2 (MGP_CAROLIEiJ_G0020529)	MGP_CAROLIEiJ_G0020530	MGP_CAROLIEiJ_G0020531	Ess2 (MGP_CAROLIEiJ_G0020532)	Gsc2 (MGP_CAROLIEiJ_G0020533)	Slc25a1 (MGP_CAROLIEiJ_G0020534)	Dgcr6 (MGP_CAROLIEiJ_G0020535)	Prodh (MGP_CAROLIEiJ_G0020536)	Rtn4r (MGP_CAROLIEiJ_G0020537)	MGP_CAROLIEiJ_G0020538	Zdhhc8 (MGP_CAROLIEiJ_G0020539)	Ranbp1 (MGP_CAROLIEiJ_G0020540)	Trmt2a (MGP_CAROLIEiJ_G0020541)
Shrew mouse	MODERN SPECIES	3	Tmem191 (MGP_PahariEiJ_G0016216)	MGP_PahariEiJ_G0016217	Serpind1 (MGP_PahariEiJ_G0016218)	Snap29 (MGP_PahariEiJ_G0016219)	Crkl (MGP_PahariEiJ_G0016220)	Aifm3 (MGP_PahariEiJ_G0016221)	Lztr1 (MGP_PahariEiJ_G0016222)	Thap7 (MGP_PahariEiJ_G0016223)	Lrrc74b (MGP_PahariEiJ_G0016224)	P2rx6 (MGP_PahariEiJ_G0016225)	Slc7a4 (MGP_PahariEiJ_G0016226)	Smpd4 (MGP_PahariEiJ_G0016227)	Ccdc74a (MGP_PahariEiJ_G0016228)	Med15 (MGP_PahariEiJ_G0016229)	Klhl22 (MGP_PahariEiJ_G0016230)	Scarf2 (MGP_PahariEiJ_G0016231) ##22	Car15 (MGP_PahariEiJ_G0016232)	MGP_PahariEiJ_G0016233	Dgcr2 (MGP_PahariEiJ_G0016234)	Tssk1 (MGP_PahariEiJ_G0016235)	Tssk2 (MGP_PahariEiJ_G0016236)	Ess2 (MGP_PahariEiJ_G0016237)	Gsc2 (MGP_PahariEiJ_G0016238)	Slc25a1 (MGP_PahariEiJ_G0016239)	Dgcr6 (MGP_PahariEiJ_G0016240)	Prodh (MGP_PahariEiJ_G0016241)	Rtn4r (MGP_PahariEiJ_G0016242)	MGP_PahariEiJ_G0016243	Zdhhc8 (MGP_PahariEiJ_G0016244)	Ranbp1 (MGP_PahariEiJ_G0016245)	Trmt2a (MGP_PahariEiJ_G0016246)
Rat	MODERN SPECIES	2	Tmem191c (ENSRNOG00000001864)	Serpind1 (ENSRNOG00000001865)	Pi4ka (ENSRNOG00000060045)	Snap29 (ENSRNOG00000001867)	Crkl (ENSRNOG00000001868)	Aifm3 (ENSRNOG00000037957)	Lztr1 (ENSRNOG00000001870)	Thap7 (ENSRNOG00000037967)	Lrrc74b (ENSRNOG00000001872)	P2rx6 (ENSRNOG00000001873)	Slc7a4 (ENSRNOG00000001874)	Smpd4 (ENSRNOG00000001875)	Ccdc74a (ENSRNOG00000001876)	Med15 (ENSRNOG00000001877)	Klhl22 (ENSRNOG00000001878)	Scarf2 (ENSRNOG00000000288) ##22	LOC120095536 (ENSRNOG00000070676)	Car15 (ENSRNOG00000037983)	Dgcr2 (ENSRNOG00000061814)	Tssk1b (ENSRNOG00000068894)	Ess2 (ENSRNOG00000000283)	Gsc2 (ENSRNOG00000000282)	Slc25a1 (ENSRNOG00000038001)	Vpreb2 (ENSRNOG00000001839)	Dgcr6 (ENSRNOG00000001880)	Prodh (ENSRNOG00000000281)	Rtn4r (ENSRNOG00000030920)	Ccdc188 (ENSRNOG00000042711)	Zdhhc8 (ENSRNOG00000021891)	Ranbp1 (ENSRNOG00000001884)	ENSRNOG00000066515
Cricetidae	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00390000009363	ENSGT00550000074798.a.a	ENSGT00940000158664	ENSGT00950000182843.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000160448	ENSGT00940000158190	ENSGT00730000111394	ENSGT00940000154297.B	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000154637	ENSGT00390000006044	ENSGT00390000007249	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00940000162972	ENSGT00390000017655	ENSGT00940000163130	ENSGT00940000162226	ENSGT00390000009387	ENSGT00940000162536	ENSGT00550000074856	ENSGT00390000017663	ENSGT00390000006265.b	ENSGT00940000160711	ENSGT00940000153380.D	ENSGT00940000158044.a	ENSGT00900000141073	ENSGT00530000063723.a	ENSGT00970000193655
Cricetinae	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00390000009363	ENSGT00550000074798.a.a	ENSGT00940000158664	ENSGT00950000182843.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000160448	ENSGT00940000158190	ENSGT00730000111394	ENSGT00940000154297.B	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000154637	ENSGT00390000006044	ENSGT00390000007249	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00940000162972	ENSGT00390000017655	ENSGT00940000163130	ENSGT00940000162226	ENSGT00390000009387	ENSGT00940000162536	ENSGT00550000074856	ENSGT00390000017663	ENSGT00390000006265.b	ENSGT00940000160711	ENSGT00940000153380.D	ENSGT00940000158044.a	ENSGT00900000141073	ENSGT00530000063723.a	ENSGT00970000193655
Chinese hamster chok1gshd	MODERN SPECIES	382	Serpind1 (ENSCGRG00001000940)	ENSCGRG00001017109	Snap29 (ENSCGRG00001018701)	Crkl (ENSCGRG00001019008)	Aifm3 (ENSCGRG00001021431)	Lztr1 (ENSCGRG00001021771)	Thap7 (ENSCGRG00001014822)	Lrrc74b (ENSCGRG00001018812)	P2rx6 (ENSCGRG00001017108)	Slc7a4 (ENSCGRG00001000906)	Smpd4 (ENSCGRG00001020016)	Ccdc74a (ENSCGRG00001016250)	Med15 (ENSCGRG00001018365)	ENSCGRG00001011349	Klhl22 (ENSCGRG00001013341)	Scarf2 (ENSCGRG00001020680) ##22	Car15 (ENSCGRG00001000273)	Dgcr2 (ENSCGRG00001010718)	Tssk1 (ENSCGRG00001010533)	Tssk2 (ENSCGRG00001010561)	Ess2 (ENSCGRG00001017846)	Gsc2 (ENSCGRG00001023953)	Slc25a1 (ENSCGRG00001024096)	Dgcr6 (ENSCGRG00001004677)	Prodh (ENSCGRG00001012080)	Rtn4r (ENSCGRG00001002500)	ENSCGRG00001012235	Zdhhc8 (ENSCGRG00001015576)	Ranbp1 (ENSCGRG00001019070)	Trmt2a (ENSCGRG00001016592)	ENSCGRG00001010886
Golden Hamster	MODERN SPECIES	690	Tmem191 (ENSMAUG00000012962)	Serpind1 (ENSMAUG00000011979)	Pi4ka (ENSMAUG00000009972)	Snap29 (ENSMAUG00000017470)	Crkl (ENSMAUG00000016703)	Aifm3 (ENSMAUG00000003426)	Lztr1 (ENSMAUG00000001583)	Thap7 (ENSMAUG00000019693)	Lrrc74b (ENSMAUG00000011724)	P2rx6 (ENSMAUG00000007491)	Slc7a4 (ENSMAUG00000017588)	Smpd4 (ENSMAUG00000014843)	Ccdc74a (ENSMAUG00000013662)	Med15 (ENSMAUG00000019738)	Klhl22 (ENSMAUG00000017434)	Scarf2 (ENSMAUG00000014375) ##22	Car15 (ENSMAUG00000013400)	Dgcr2 (ENSMAUG00000016026)	Tssk1 (ENSMAUG00000018111)	Tssk2 (ENSMAUG00000018133)	Ess2 (ENSMAUG00000012831)	Gsc2 (ENSMAUG00000012679)	Slc25a1 (ENSMAUG00000019420)	ENSMAUG00000018193	Dgcr6 (ENSMAUG00000017452)	Prodh (ENSMAUG00000013845)	Rtn4r (ENSMAUG00000004777)	ENSMAUG00000001223	Zdhhc8 (ENSMAUG00000000570)	Ranbp1 (ENSMAUG00000000530)	Trmt2a (ENSMAUG00000005655)
Cricetidae_B	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00390000009363	ENSGT00550000074798.a.a	ENSGT00940000158664	ENSGT00950000182843.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000160448	ENSGT00940000158190	ENSGT00730000111394	ENSGT00940000154297.B	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000154637	ENSGT00390000006044	ENSGT00390000007249	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00940000162972	ENSGT00390000017655	ENSGT00940000163130	ENSGT00940000162226	ENSGT00390000009387	ENSGT00940000162536	ENSGT00550000074856	ENSGT00390000017663	ENSGT00390000006265.b	ENSGT00940000160711	ENSGT00940000153380.D	ENSGT00940000158044.a	ENSGT00900000141073	ENSGT00530000063723.a	ENSGT00970000193655
Northern American deer mouse	MODERN SPECIES	3	Pi4ka (ENSPEMG00000018625)	Serpind1 (ENSPEMG00000012283)	Snap29 (ENSPEMG00000018463)	ENSPEMG00000027891	Aifm3 (ENSPEMG00000012830)	Lztr1 (ENSPEMG00000012696)	Thap7 (ENSPEMG00000000719)	Lrrc74b (ENSPEMG00000000382)	P2rx6 (ENSPEMG00000018486)	Slc7a4 (ENSPEMG00000019263)	ENSPEMG00000027051	Smpd4 (ENSPEMG00000010961)	Ccdc74a (ENSPEMG00000003665)	Med15 (ENSPEMG00000016018)	Klhl22 (ENSPEMG00000022157)	Scarf2 (ENSPEMG00000023474) ##22	Car15 (ENSPEMG00000020851)	Dgcr2 (ENSPEMG00000021594)	Tssk1 (ENSPEMG00000004261)	Tssk2 (ENSPEMG00000006590)	Ess2 (ENSPEMG00000021417)	Gsc2 (ENSPEMG00000022039)	Slc25a1 (ENSPEMG00000022415)	ENSPEMG00000010426	Dgcr6 (ENSPEMG00000012492)	Prodh (ENSPEMG00000005099)	Rtn4r (ENSPEMG00000014362)	ENSPEMG00000005605	Zdhhc8 (ENSPEMG00000012434)	Ranbp1 (ENSPEMG00000019257)	Trmt2a (ENSPEMG00000011013)
Prairie vole	MODERN SPECIES	151	Tmem191 (ENSMOCG00000013117)	Serpind1 (ENSMOCG00000021187)	Pi4ka (ENSMOCG00000012094)	Snap29 (ENSMOCG00000018142)	Crkl (ENSMOCG00000013292)	Aifm3 (ENSMOCG00000010553)	Lztr1 (ENSMOCG00000008743)	Thap7 (ENSMOCG00000021305)	Lrrc74b (ENSMOCG00000014643)	P2rx6 (ENSMOCG00000021850)	Slc7a4 (ENSMOCG00000006160)	Smpd4 (ENSMOCG00000021397)	Ccdc74a (ENSMOCG00000000139)	Med15 (ENSMOCG00000008452)	Klhl22 (ENSMOCG00000019418)	Scarf2 (ENSMOCG00000017341) ##22	Car15 (ENSMOCG00000012914)	Dgcr2 (ENSMOCG00000016234)	Tssk1 (ENSMOCG00000003194)	Tssk2 (ENSMOCG00000002817)	Ess2 (ENSMOCG00000019116)	Gsc2 (ENSMOCG00000000116)	ENSMOCG00000012573	ENSMOCG00000010728	Dgcr6 (ENSMOCG00000020153)	Prodh (ENSMOCG00000019417)	Rtn4r (ENSMOCG00000018155)	ENSMOCG00000017067	Zdhhc8 (ENSMOCG00000012177)	Ranbp1 (ENSMOCG00000000658)	Trmt2a (ENSMOCG00000002597)
Upper Galilee mountains blind mole rat	MODERN SPECIES	1188	Crkl (ENSNGAG00000015147)	Aifm3 (ENSNGAG00000016818)	Lztr1 (ENSNGAG00000002668)	Thap7 (ENSNGAG00000014463)	ENSNGAG00000014545	Lrrc74b (ENSNGAG00000016682)	P2rx6 (ENSNGAG00000018698)	Slc7a4 (ENSNGAG00000000026)	Coil (ENSNGAG00000000683)	ENSNGAG00000009748	ENSNGAG00000011051	Smpd4 (ENSNGAG00000012160)	Ccdc74a (ENSNGAG00000006468)	Med15 (ENSNGAG00000015903)	Klhl22 (ENSNGAG00000017539)	Scarf2 (ENSNGAG00000011235) ##22
Lesser Egyptian jerboa	MODERN SPECIES	194	Pi4ka (ENSJJAG00000011936)	Serpind1 (ENSJJAG00000012633)	Snap29 (ENSJJAG00000013257)	Crkl (ENSJJAG00000013573)	Aifm3 (ENSJJAG00000014987)	ENSJJAG00000016254	Lztr1 (ENSJJAG00000016284)	ENSJJAG00000018807	Mzt2 (ENSJJAG00000018911)	ENSJJAG00000020030	Smpd4 (ENSJJAG00000020428)	Ccdc74a (ENSJJAG00000020486)	Med15 (ENSJJAG00000021640)	ENSJJAG00000022497	Klhl22 (ENSJJAG00000022580)	Scarf2 (ENSJJAG00000023062) ##22	Car15 (ENSJJAG00000013542)	Dgcr2 (ENSJJAG00000022914)	Tssk1 (ENSJJAG00000013118)	Tssk2 (ENSJJAG00000012974)	Ess2 (ENSJJAG00000002400)	Gsc2 (ENSJJAG00000003618)	Slc25a1 (ENSJJAG00000011244)	ENSJJAG00000012038	Igll1 (ENSJJAG00000012207)	ENSJJAG00000012746	ENSJJAG00000013067	ENSJJAG00000013062	Trim27 (ENSJJAG00000022382)	ENSJJAG00000000066	Gpx6 (ENSJJAG00000000873)
Rodentia_A	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00950000182843.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000160448	ENSGT00940000158190	ENSGT00730000111394	ENSGT00950000182825.B	ENSGT00940000154297.B	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000154637	ENSGT00390000014845	ENSGT00940000166905	ENSGT00390000006044	ENSGT00390000007249	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00940000162000.d	ENSGT00940000162972	ENSGT00390000017655	ENSGT00940000163130	ENSGT00940000162226	ENSGT00390000009387	ENSGT00940000162536	ENSGT00550000074856	ENSGT00950000183166.a.b	ENSGT00550000074919	ENSGT00390000010239	ENSGT00390000002511	ENSGT00390000002408	ENSGT00390000009662	ENSGT00940000161769
Hystricomorpha	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000158664	ENSGT00950000182843.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000160448	ENSGT00940000158190	ENSGT00730000111394	ENSGT00940000154297.B	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000154637	ENSGT00950000182825.B	ENSGT00390000014845	ENSGT00940000166905	ENSGT00390000006044	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00940000162000.d	ENSGT00940000162972	ENSGT00390000017655	ENSGT00390000009387	ENSGT00940000162536	ENSGT00550000074856	ENSGT00950000183166.a.b	ENSGT00550000074919	ENSGT00390000010239	ENSGT00390000002511	ENSGT00390000002408	ENSGT00390000009662	ENSGT00940000161769	ENSGT00940000159913	ENSGT00530000064244.b
Hystricomorpha_a	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00550000074798.a.a	ENSGT00940000158664	ENSGT00950000182843.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000160448	ENSGT00940000158190	ENSGT00730000111394	ENSGT00940000154297.B	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000154637	ENSGT00950000182825.B	ENSGT00390000014845	ENSGT00390000006044	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00940000162000.d	ENSGT00940000162972	ENSGT00390000017655	ENSGT00390000009387	ENSGT00940000162536	ENSGT00550000074856	ENSGT00950000183166.a.b	ENSGT00550000074919	ENSGT00390000010239	ENSGT00390000002511	ENSGT00390000002408	ENSGT00390000009662	ENSGT00940000161769	ENSGT00940000159913	ENSGT00530000064244.b
Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000157699	ENSGT00550000074798.a.a	ENSGT00940000158664	ENSGT00950000182843.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000160448	ENSGT00940000158190	ENSGT00730000111394	ENSGT00940000154297.B	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000154637	ENSGT00390000014845	ENSGT00390000006044	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00940000162000.d	ENSGT00940000162972	ENSGT00390000017655	ENSGT00390000009387	ENSGT00940000162536	ENSGT00550000074856	ENSGT00950000183166.a.b	ENSGT00550000074919	ENSGT00390000010239	ENSGT00390000002511	ENSGT00390000002408	ENSGT00390000009662	ENSGT00940000161769	ENSGT00940000159913	ENSGT00530000064244.b
Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	149	SERPIND1 (ENSCLAG00000016913)	PI4KA (ENSCLAG00000016938)	SNAP29 (ENSCLAG00000016060)	CRKL (ENSCLAG00000015240)	AIFM3 (ENSCLAG00000014132)	LZTR1 (ENSCLAG00000016676)	THAP7 (ENSCLAG00000016570)	LRRC74B (ENSCLAG00000015989)	P2RX6 (ENSCLAG00000015399)	SLC7A4 (ENSCLAG00000013920)	ENSCLAG00000014729	SMPD4 (ENSCLAG00000015061)	MED15 (ENSCLAG00000014768)	ENSCLAG00000016055	KLHL22 (ENSCLAG00000016767)	SCARF2 (ENSCLAG00000015409) ##22	ZNF74 (ENSCLAG00000015439)	ENSCLAG00000017009	DGCR2 (ENSCLAG00000014962)	ESS2 (ENSCLAG00000015255)	GSC2 (ENSCLAG00000016210)	SLC25A1 (ENSCLAG00000016306)	CLTCL1 (ENSCLAG00000016811)	HIRA (ENSCLAG00000015724)	MRPL40 (ENSCLAG00000016629)	C22orf39 (ENSCLAG00000016842)	UFD1 (ENSCLAG00000015265)	CDC45 (ENSCLAG00000015752)	CLDN5 (ENSCLAG00000018017)	GP1BB (ENSCLAG00000016703)	SEPTIN5 (ENSCLAG00000015333)
Degu	MODERN SPECIES	62	ENSODEG00000016908	ENSODEG00000016825	SERPIND1 (ENSODEG00000016619)	SNAP29 (ENSODEG00000016957)	CRKL (ENSODEG00000016664)	AIFM3 (ENSODEG00000016949)	LZTR1 (ENSODEG00000016767)	THAP7 (ENSODEG00000016943)	LRRC74B (ENSODEG00000017245)	P2RX6 (ENSODEG00000016575)	SLC7A4 (ENSODEG00000016811)	ENSODEG00000016611	SMPD4 (ENSODEG00000016867)	MED15 (ENSODEG00000016533)	ENSODEG00000016373	SCARF2 (ENSODEG00000016305) ##22	ENSODEG00000016287	DGCR2 (ENSODEG00000016687)	ENSODEG00000020381	ENSODEG00000016401	SLC25A1 (ENSODEG00000016493)	CLTCL1 (ENSODEG00000016517)	HIRA (ENSODEG00000016444)	MRPL40 (ENSODEG00000017051)	C22orf39 (ENSODEG00000017124)	ENSODEG00000016396	CDC45 (ENSODEG00000016658)	CLDN5 (ENSODEG00000020395)	SEPTIN5 (ENSODEG00000016498)	GP1BB (ENSODEG00000016559)	TBX1 (ENSODEG00000016676)
Guinea pig	MODERN SPECIES	4	SERPIND1 (ENSCPOG00000012446)	SNAP29 (ENSCPOG00000003137)	CRKL (ENSCPOG00000034031)	AIFM3 (ENSCPOG00000003140)	LZTR1 (ENSCPOG00000003142)	THAP7 (ENSCPOG00000003147)	ENSCPOG00000039622	LRRC74B (ENSCPOG00000033459)	P2RX6 (ENSCPOG00000012907)	SLC7A4 (ENSCPOG00000023418)	ENSCPOG00000030016	ENSCPOG00000000809	SMPD4 (ENSCPOG00000008273)	MED15 (ENSCPOG00000005558)	KLHL22 (ENSCPOG00000024005)	SCARF2 (ENSCPOG00000027465) ##22	DGCR2 (ENSCPOG00000002706)	ESS2 (ENSCPOG00000004596)	GSC2 (ENSCPOG00000015708)	SLC25A1 (ENSCPOG00000001754)	CLTCL1 (ENSCPOG00000002261)	HIRA (ENSCPOG00000002264)	MRPL40 (ENSCPOG00000026802)	C22orf39 (ENSCPOG00000039279)	UFD1 (ENSCPOG00000002267)	CDC45 (ENSCPOG00000002270)	CLDN5 (ENSCPOG00000002274)	SEPTIN5 (ENSCPOG00000010483)	GP1BB (ENSCPOG00000021659)	TBX1 (ENSCPOG00000012532)	GNB1L (ENSCPOG00000020237)
Naked mole-rat female	MODERN SPECIES	15	SNAP29 (ENSHGLG00000047985)	CRKL (ENSHGLG00000044151)	AIFM3 (ENSHGLG00000001645)	LZTR1 (ENSHGLG00000000653)	THAP7 (ENSHGLG00000038188)	ENSHGLG00000048508	ENSHGLG00000000929	P2RX6 (ENSHGLG00000000605)	ENSHGLG00000005401	ENSHGLG00000035684	ENSHGLG00000041490	ENSHGLG00000039487	ENSHGLG00000019565	ENSHGLG00000000846	ENSHGLG00000003024	ENSHGLG00000001801 ##22	ENSHGLG00000003125	ENSHGLG00000033842	ENSHGLG00000034329	DGCR2 (ENSHGLG00000001472)	ENSHGLG00000000570	GSC2 (ENSHGLG00000000434)	ENSHGLG00000037206	ENSHGLG00000000262	ENSHGLG00000036303	ENSHGLG00000035369	ENSHGLG00000034352	ENSHGLG00000049637	CLCN7 (ENSHGLG00000001793)	CCDC154 (ENSHGLG00000001687)	PERCC1 (ENSHGLG00000042238)
Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES	42	ENSGT00940000158664	ENSGT00950000182843.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000160448	ENSGT00940000158190	ENSGT00730000111394	ENSGT00950000182825.B	ENSGT00940000154297.B	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000154637	ENSGT00390000014845	ENSGT00390000006044	ENSGT00390000007249	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00940000162000.d	ENSGT00960000190461	ENSGT00940000162972	ENSGT00390000017655	ENSGT00940000163130	ENSGT00940000162226	ENSGT00390000009387	ENSGT00940000162536	ENSGT00550000074856	ENSGT00950000183166.a.b	ENSGT00550000074919	ENSGT00390000010239	ENSGT00390000002511	ENSGT00390000002408	ENSGT00390000009662
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	53	ENSGT00950000182843.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000160448	ENSGT00940000158190	ENSGT00730000111394.j	ENSGT00950000182825.B	ENSGT00940000154297.B	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000154637	ENSGT00730000111394.i	ENSGT00390000014845	ENSGT00390000006044	ENSGT00390000007249	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00940000162000.d	ENSGT00960000190461	ENSGT00940000162972	ENSGT00390000017655	ENSGT00940000163130	ENSGT00940000162226	ENSGT00390000009387	ENSGT00940000162536	ENSGT00550000074856	ENSGT00950000183166.a.b	ENSGT00550000074919	ENSGT00390000010239	ENSGT00390000002511	ENSGT00390000002408	ENSGT00390000009662
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	54	ENSGT00940000158664	ENSGT00950000182843.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000160448	ENSGT00940000158190	ENSGT00730000111394.j	ENSGT00940000154297.B	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000154637	ENSGT00950000182825.B	ENSGT00390000014845	ENSGT00390000006044	ENSGT00390000007249	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00940000162000.d	ENSGT00960000190461	ENSGT00940000162972	ENSGT00390000017655	ENSGT00940000163130	ENSGT00940000162226	ENSGT00390000009387	ENSGT00940000162536	ENSGT00550000074856	ENSGT00950000183166.a.b	ENSGT00550000074919	ENSGT00390000010239	ENSGT00390000002511	ENSGT00390000002408	ENSGT00390000009662
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	252	SNAP29 (ENSUPAG00010013234)	CRKL (ENSUPAG00010013229)	AIFM3 (ENSUPAG00010013165)	LZTR1 (ENSUPAG00010013090)	ENSUPAG00010013074	TUBA3E (ENSUPAG00010013061)	LRRC74B (ENSUPAG00010012987)	P2RX6 (ENSUPAG00010012972)	SLC7A4 (ENSUPAG00010012962)	ENSUPAG00010012942	ENSUPAG00010012930	SMPD4 (ENSUPAG00010012108)	ENSUPAG00010012090	MED15 (ENSUPAG00010011965)	KLHL22 (ENSUPAG00010011955)	SCARF2 (ENSUPAG00010011926) ##22	ZNF74 (ENSUPAG00010011919)	ENSUPAG00010011913	ENSUPAG00010011898	DGCR2 (ENSUPAG00010011875)	TSSK1B (ENSUPAG00010011872)	TSSK2 (ENSUPAG00010011870)	ESS2 (ENSUPAG00010011854)	GSC2 (ENSUPAG00010011849)	SLC25A1 (ENSUPAG00010011833)	CLTCL1 (ENSUPAG00010011775)	HIRA (ENSUPAG00010011725)	MRPL40 (ENSUPAG00010011716)	C22orf39 (ENSUPAG00010011693)	UFD1 (ENSUPAG00010011672)	CDC45 (ENSUPAG00010011643)
Squirrel	MODERN SPECIES	219	PI4KA (ENSSTOG00000014951)	SERPIND1 (ENSSTOG00000014991)	SNAP29 (ENSSTOG00000014993)	CRKL (ENSSTOG00000008688)	AIFM3 (ENSSTOG00000008699)	LZTR1 (ENSSTOG00000015860)	LRRC74B (ENSSTOG00000027406)	P2RX6 (ENSSTOG00000015884)	SLC7A4 (ENSSTOG00000015893)	TUBA3C (ENSSTOG00000004693)	ENSSTOG00000026596	SMPD4 (ENSSTOG00000024043)	ENSSTOG00000024671	MED15 (ENSSTOG00000012218)	KLHL22 (ENSSTOG00000012406)	SCARF2 (ENSSTOG00000012396) ##22	ENSSTOG00000034842	ENSSTOG00000026367	DGCR2 (ENSSTOG00000002774)	TSSK1B (ENSSTOG00000027168)	TSSK2 (ENSSTOG00000027876)	ESS2 (ENSSTOG00000002817)	GSC2 (ENSSTOG00000021301)	SLC25A1 (ENSSTOG00000002825)	CLTCL1 (ENSSTOG00000002838)	HIRA (ENSSTOG00000002864)	MRPL40 (ENSSTOG00000002887)	C22orf39 (ENSSTOG00000023959)	UFD1 (ENSSTOG00000002896)	CDC45 (ENSSTOG00000002917)	CLDN5 (ENSSTOG00000023943)
Alpin marmot	MODERN SPECIES	67	LZTR1 (ENSMMMG00000001347)	ENSMMMG00000001468	ENSMMMG00000001496	LRRC74B (ENSMMMG00000001565)	P2RX6 (ENSMMMG00000001586)	SLC7A4 (ENSMMMG00000001649)	ENSMMMG00000001673	ENSMMMG00000001691	ENSMMMG00000001719	ENSMMMG00000001732	SMPD4 (ENSMMMG00000001779)	ENSMMMG00000002387	MED15 (ENSMMMG00000002419)	ENSMMMG00000002562	KLHL22 (ENSMMMG00000002569)	SCARF2 (ENSMMMG00000002588) ##22	ZNF74 (ENSMMMG00000002603)	ENSMMMG00000002607	ENSMMMG00000002612	DGCR2 (ENSMMMG00000002630)	TSSK1B (ENSMMMG00000002708)	TSSK2 (ENSMMMG00000002712)	ESS2 (ENSMMMG00000002719)	GSC2 (ENSMMMG00000002737)	SLC25A1 (ENSMMMG00000002744)	CLTCL1 (ENSMMMG00000002805)	HIRA (ENSMMMG00000003121)	MRPL40 (ENSMMMG00000003198)	C22orf39 (ENSMMMG00000003206)	UFD1 (ENSMMMG00000003233)	CDC45 (ENSMMMG00000003340)
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	17	LZTR1 (ENSSVLG00005007866)	ENSSVLG00005007920	ENSSVLG00005007963	ENSSVLG00005008044	ENSSVLG00005008071	LRRC74B (ENSSVLG00005008118)	P2RX6 (ENSSVLG00005008241)	SLC7A4 (ENSSVLG00005008494)	ENSSVLG00005008526	ENSSVLG00005008561	SMPD4 (ENSSVLG00005008654)	ENSSVLG00005009060	MED15 (ENSSVLG00005009183)	ENSSVLG00005009226	KLHL22 (ENSSVLG00005009244)	SCARF2 (ENSSVLG00005009294) ##22	ZNF74 (ENSSVLG00005009338)	ENSSVLG00005009371	ENSSVLG00005009418	DGCR2 (ENSSVLG00005009474)	TSSK1B (ENSSVLG00005009495)	TSSK2 (ENSSVLG00005009517)	ESS2 (ENSSVLG00005009535)	GSC2 (ENSSVLG00005009577)	SLC25A1 (ENSSVLG00005009628)	CLTCL1 (ENSSVLG00005009761)	ENSSVLG00005009831	HIRA (ENSSVLG00005009905)	MRPL40 (ENSSVLG00005010046)	C22orf39 (ENSSVLG00005010097)	ENSSVLG00005010133
Lagomorpha	ANCESTRAL SPECIES	454															ENSGT00940000159598	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00940000162000.d
Pika	MODERN SPECIES	4069															KLHL22 (ENSOPRG00000007629)	ENSOPRG00000007603 ##22	ENSOPRG00000007572
Atlantogenata	ANCESTRAL SPECIES	77	ENSGT00950000182843.a.b	ENSGT00820000127055.b	ENSGT00940000160448	ENSGT00940000158190	ENSGT00730000111394	ENSGT00940000154297.B	ENSGT01020000230351.F	ENSGT00940000154637	ENSGT00950000182825.B	ENSGT00390000014845	ENSGT00390000006044	ENSGT00940000168985	ENSGT00390000007249	ENSGT00730000111140	ENSGT00940000159598	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00940000162972	ENSGT00390000017655	ENSGT00940000163130	ENSGT00940000162226	ENSGT00390000009387	ENSGT00940000162536	ENSGT00550000074856	ENSGT00950000183166.a.b	ENSGT00550000074919	ENSGT00390000010239	ENSGT00390000002511	ENSGT00390000002408	ENSGT00390000009662	ENSGT00940000161769	ENSGT00940000159913
Afrotheria	ANCESTRAL SPECIES	312															ENSGT00940000159598	ENSGT00950000183101.b ##22
Afrotheria_a	ANCESTRAL SPECIES	312															ENSGT00940000159598	ENSGT00950000183101.b ##22
Hyrax	MODERN SPECIES	150															KLHL22 (ENSPCAG00000007091)	ENSPCAG00000007058 ##22
Tenrec	MODERN SPECIES	18200																ENSETEG00000017156 ##22
Platypus	MODERN SPECIES	13	ENSOANG00000044402	CDC45 (ENSOANG00000020977)	UFD1 (ENSOANG00000045527)	C22orf39 (ENSOANG00000046898)	ENSOANG00000039468	HIRA (ENSOANG00000040308)	PPIL2 (ENSOANG00000047102)	YPEL1 (ENSOANG00000029892)	DGCR8 (ENSOANG00000037809)	TRMT2A (ENSOANG00000041446)	ENSOANG00000043817	RANBP1 (ENSOANG00000014576)	ZDHHC8 (ENSOANG00000045746)	RTN4R (ENSOANG00000039830)	ENSOANG00000008974	SCARF2 (ENSOANG00000002349) ##22	ENSOANG00000038570	SLC7A4 (ENSOANG00000036433)	P2RX6 (ENSOANG00000007559)	ENSOANG00000049734	SLC25A1 (ENSOANG00000038333)	ENSOANG00000012938	ESS2 (ENSOANG00000049414)	TSSK2 (ENSOANG00000005303)	TSSK1B (ENSOANG00000042367)	DGCR2 (ENSOANG00000011155)
Anura	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000163530	ENSGT00940000156515	ENSGT00940000154885.A	ENSGT00940000180342	ENSGT00940000158891	ENSGT00940000158897	ENSGT00390000017839	ENSGT00940000153612.B	ENSGT00940000158557	ENSGT00940000157442	ENSGT01030000234517.E	ENSGT00940000155307.b	ENSGT00940000162372	ENSGT00940000160711.q	ENSGT00390000006265.b	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00390000017663	ENSGT00940000154637	ENSGT00940000154297.B	ENSGT00390000008206	ENSGT00800000124190	ENSGT00940000164243	ENSGT00940000156428	ENSGT00940000155101	ENSGT00390000001777	ENSGT01090000260045.C.e.b.e.b.b	ENSGT00940000165623	ENSGT00940000160372	ENSGT00940000160516	ENSGT00390000006030.d.b	ENSGT00390000012485.a.a
Frog	MODERN SPECIES		msi1 (ENSXETG00000012216)	pla2g1b (ENSXETG00000012207)	hsd11b1l.2 (ENSXETG00000012212)	pxn (ENSXETG00000012201)	rplp0 (ENSXETG00000026942)	gcn1 (ENSXETG00000012193)	rab35 (ENSXETG00000026943)	bicdl1 (ENSXETG00000012189)	cit (ENSXETG00000012183)	prkab1 (ENSXETG00000026945)	tmem233 (ENSXETG00000045548)	rtn4r (ENSXETG00000012179)	ENSXETG00000049298	ENSXETG00000045454	prodh (ENSXETG00000021664)	scarf2 (ENSXETG00000021660) ##22	dgcr6 (ENSXETG00000021658)	slc7a4 (ENSXETG00000021616)	lrrc74b (ENSXETG00000021614)	hscb (ENSXETG00000026948)	chek2 (ENSXETG00000021608)	slc2a7 (ENSXETG00000021580)	ttc28 (ENSXETG00000002263)	pitpnb.2 (ENSXETG00000002259)	mn1 (ENSXETG00000002258)	ENSXETG00000046900	ENSXETG00000048513	ENSXETG00000035350	ENSXETG00000040323	ENSXETG00000043757	ENSXETG00000004229
Leishan spiny toad	MODERN SPECIES		RAB35 (ENSLLEG00000000223)	ENSLLEG00000000260	BICDL1 (ENSLLEG00000000276)	ENSLLEG00000000302	ENSLLEG00000000309	CIT (ENSLLEG00000000407)	ENSLLEG00000000796	ENSLLEG00000000835	TMEM233 (ENSLLEG00000000849)	RTN4R (ENSLLEG00000000864)	ENSLLEG00000000886	ENSLLEG00000000902	ENSLLEG00000000914	ENSLLEG00000000980	ENSLLEG00000001000	SCARF2 (ENSLLEG00000001024) ##22	ENSLLEG00000001054	ENSLLEG00000001063	ENSLLEG00000001075	ENSLLEG00000001103	SLC7A4 (ENSLLEG00000001140)	ENSLLEG00000001146	ENSLLEG00000001156	ENSLLEG00000001184	CHEK2 (ENSLLEG00000001225)	ENSLLEG00000001338	ENSLLEG00000001409	ENSLLEG00000001427	ENSLLEG00000001442	TTC28 (ENSLLEG00000001532)	ENSLLEG00000001743
Coelacanth	MODERN SPECIES	381					ENSLACG00000017511	ENSLACG00000022187	P2RX2 (ENSLACG00000017398)	POLE (ENSLACG00000017229)	PXMP2 (ENSLACG00000022566)	PES1 (ENSLACG00000017116)	GAL3ST1 (ENSLACG00000017061)	ENSLACG00000016924	ENSLACG00000013795	ENSLACG00000011744	RTN4R (ENSLACG00000008757)	SCARF2 (ENSLACG00000003543) ##22
Actinopterygii	ANCESTRAL SPECIES	22				ENSGT00390000002626	ENSGT00950000182923.C	ENSGT00940000158190	ENSGT00940000161922	ENSGT00940000160448	ENSGT00500000045140.a.b	ENSGT00940000164243	ENSGT00940000165954	ENSGT00800000124190	ENSGT00390000008206	ENSGT00940000160711	ENSGT00390000006265.b	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00940000153899.b.a	ENSGT00980000199549	ENSGT00390000009869	ENSGT00940000159368	ENSGT01020000230354.B.b.a.b	ENSGT00390000005653	ENSGT00940000155845	ENSGT00390000017221	ENSGT00940000158419	ENSGT00390000008031	ENSGT00390000006208.b	ENSGT00950000183018.a.c	ENSGT00940000154297.B	ENSGT00940000159357	ENSGT00940000158519
Neopterygii	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00950000185268	ENSGT00390000010194	ENSGT01020000230351.A	ENSGT00390000002626	ENSGT00950000182923.C	ENSGT00940000158190	ENSGT00940000161922	ENSGT00940000160448	ENSGT00500000045140.a.b	ENSGT00940000164243	ENSGT00940000165954	ENSGT00800000124190	ENSGT00390000008206	ENSGT00940000160711	ENSGT00390000006265.b	ENSGT00950000183101.b ##22	ENSGT00940000153899.b.a	ENSGT00980000199549	ENSGT00390000009869	ENSGT00940000159368	ENSGT01020000230354.B.b.a.b	ENSGT00390000005653	ENSGT00940000155845.s	ENSGT00390000017221	ENSGT00940000158419	ENSGT00390000008031	ENSGT00390000006208.b	ENSGT00950000183018.a.c	ENSGT00940000154297.B	ENSGT00940000159357	ENSGT00940000158519
Osteoglossocephalai	DUPLICATION
Osteoglossocephalai	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00950000185268	ENSGT00390000010194	ENSGT01020000230351.A	ENSGT00390000002626	ENSGT00950000182923.C.a	ENSGT00940000158190	ENSGT00940000161922	ENSGT00940000160448	ENSGT00500000045140.a.b	ENSGT00940000164243	ENSGT00940000165954	ENSGT00800000124190	ENSGT00390000008206	ENSGT00940000160711	ENSGT00390000006265.b	ENSGT00950000183101.b.a ##22	ENSGT00940000153899.b.a	ENSGT00940000156014	ENSGT00940000165416	ENSGT01020000230354.B.b.a.b	ENSGT00390000005653	ENSGT00940000155845.s	ENSGT00390000017221	ENSGT00940000158419	ENSGT00390000008031	ENSGT00390000006208.b	ENSGT00950000183018.a.c	ENSGT00940000173122	ENSGT00940000154297.B	ENSGT00940000159357	ENSGT00940000158519
Clupeocephala	ANCESTRAL SPECIES	113		ENSGT00390000010194	ENSGT01020000230351.A	ENSGT00390000002626	ENSGT00950000182923.C.a	ENSGT00940000158190	ENSGT00940000161922	ENSGT00940000160448	ENSGT00500000045140.a.b	ENSGT00940000164243	ENSGT00940000165954	ENSGT00800000124190	ENSGT00390000008206	ENSGT00940000160711	ENSGT00390000006265.b.d	ENSGT00950000183101.b.a ##22	ENSGT00940000153899.b.a	ENSGT00940000159368.b	ENSGT01020000230354.B.b.a.b	ENSGT00390000005653	ENSGT00940000155845.s	ENSGT00390000017221	ENSGT00940000158419	ENSGT00390000008031	ENSGT00390000006208.b	ENSGT00950000183018.a.c	ENSGT00940000173122	ENSGT00940000154297.B	ENSGT00940000159357	ENSGT00940000158519	ENSGT00940000169488
Otomorpha	ANCESTRAL SPECIES	126		ENSGT00390000010194	ENSGT01020000230351.A	ENSGT00390000002626	ENSGT00950000182923.C.a	ENSGT00940000158190	ENSGT00940000161922	ENSGT00940000160448	ENSGT00500000045140.a.b	ENSGT00940000164243	ENSGT00940000165954	ENSGT00800000124190	ENSGT00390000008206	ENSGT00940000160711	ENSGT00390000006265.b.d	ENSGT00950000183101.b.a ##22	ENSGT00940000153899.b.a	ENSGT00940000159368.b	ENSGT01020000230354.B.b.a.b	ENSGT00390000005653	ENSGT00940000155845.s	ENSGT00390000017221	ENSGT00940000158419	ENSGT00390000008031	ENSGT00390000006208.b	ENSGT00950000183018.a.c	ENSGT00940000154297.B	ENSGT00940000159357	ENSGT00940000158519	ENSGT00550000075072	ENSGT00890000139406.b
Otophysi	ANCESTRAL SPECIES	67										ENSGT00940000164243	ENSGT00940000165954	ENSGT00800000124190	ENSGT00390000008206	ENSGT00940000160711	ENSGT00390000006265.b.d	ENSGT00950000183101.b.a ##22	ENSGT00940000153899.b.a	ENSGT00940000159368.b	ENSGT01020000230354.B.b.a.b	ENSGT00390000005653	ENSGT00940000155845.s	ENSGT00390000017221	ENSGT00940000158419	ENSGT00390000008031	ENSGT00390000006208.b	ENSGT00950000183018.a.c	ENSGT00940000154297.B	ENSGT00940000159357	ENSGT00940000158519	ENSGT00550000075072	ENSGT00890000139406.b
Characiphysae	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000160709	ENSGT00400000022306	ENSGT00940000158044.a	ENSGT00390000018806	ENSGT00940000159671	ENSGT00390000002024	ENSGT00940000156044	ENSGT00940000154702.b	ENSGT00550000074919	ENSGT00940000164243	ENSGT00940000165954	ENSGT00800000124190	ENSGT00390000008206	ENSGT00940000160711	ENSGT00390000006265.b.d	ENSGT00950000183101.b.a ##22	ENSGT00940000153899.b.a	ENSGT00940000159368.b	ENSGT01020000230354.B.b.a.b	ENSGT00390000005653	ENSGT00940000155845.s	ENSGT00390000017221	ENSGT00940000158419	ENSGT00390000008031	ENSGT00390000006208.b	ENSGT00950000183018.a.c	ENSGT00940000154297.B	ENSGT00940000159357	ENSGT00940000158519	ENSGT00550000075072	ENSGT00890000139406.b
Channel catfish	MODERN SPECIES	14	kremen1 (ENSIPUG00000018289)	susd2 (ENSIPUG00000018306)	slc39a14 (ENSIPUG00000018390)	piwil2 (ENSIPUG00000018436)	ENSIPUG00000019164	fbp1b (ENSIPUG00000019175)	ENSIPUG00000019229	ccdc117 (ENSIPUG00000019243)	tcn2 (ENSIPUG00000019255)	rabl6 (ENSIPUG00000019266)	si:ch211-102c2.4 (ENSIPUG00000019316)	Imp4 (ENSIPUG00000019326)	hscb (ENSIPUG00000019393)	rtn4r (ENSIPUG00000019461)	PRODH (ENSIPUG00000019471)	scarf2 (ENSIPUG00000019499) ##22	zgc:112294 (ENSIPUG00000019507)	CABP7 (ENSIPUG00000019518)	nf2 (ENSIPUG00000019531)	fbxo21 (ENSIPUG00000019617)	tesc (ENSIPUG00000019638)	fbxw8 (ENSIPUG00000019660)	RNFT2 (ENSIPUG00000019683)	c22h12orf49 (ENSIPUG00000019712)	gatsl3 (ENSIPUG00000019723)	nipsnap1 (ENSIPUG00000019755)	lrrc74b (ENSIPUG00000019800)	nos1 (ENSIPUG00000019819)	KSR2 (ENSIPUG00000019866)	rfc5 (ENSIPUG00000019902)	WSB2 (ENSIPUG00000019924)
Characiphysae_b	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000160709	ENSGT00400000022306	ENSGT00940000158044.a	ENSGT00390000018806	ENSGT00940000159671	ENSGT00390000002024	ENSGT00940000156044	ENSGT00940000154702.b	ENSGT00550000074919	ENSGT00940000164243	ENSGT00940000165954	ENSGT00800000124190	ENSGT00390000008206	ENSGT00940000160711	ENSGT00390000006265.b.d	ENSGT00950000183101.b.a ##22	ENSGT00940000153899.b.a	ENSGT00940000159368.b	ENSGT01020000230354.B.b.a.b	ENSGT00390000005653	ENSGT00940000155845.s	ENSGT00390000017221	ENSGT00940000158419	ENSGT00390000008031	ENSGT00390000006208.b	ENSGT00950000183018.a.c	ENSGT00940000154297.B	ENSGT00940000159357	ENSGT00940000158519	ENSGT00550000075072	ENSGT00890000139406.b
Electric eel	MODERN SPECIES	156		nsmfb (ENSEEEG00000009334)	ENSEEEG00000009336	zgc:194202 (ENSEEEG00000009340)	PNPLA7 (ENSEEEG00000009343)	mrpl41 (ENSEEEG00000009348)	dph7 (ENSEEEG00000009349)	ENSEEEG00000009350	ccdc117 (ENSEEEG00000009351)	tcn2 (ENSEEEG00000009354)	RABL6 (ENSEEEG00000009357)	imp4 (ENSEEEG00000009363)	hscb (ENSEEEG00000009550)	rtn4r (ENSEEEG00000009552)	ENSEEEG00000009556	SCARF2 (ENSEEEG00000009559) ##22	CABP7 (ENSEEEG00000009560)	ENSEEEG00000009562	nf2a (ENSEEEG00000009572)	FBXO21 (ENSEEEG00000009594)	tesca (ENSEEEG00000009603)	fbxw8 (ENSEEEG00000009607)	rnft2 (ENSEEEG00000009614)	spring1 (ENSEEEG00000009618)	CASTOR1 (ENSEEEG00000009620)	nipsnap1 (ENSEEEG00000009625)	ENSEEEG00000009634	nos1 (ENSEEEG00000009643)	KSR2 (ENSEEEG00000009891)	rfc5 (ENSEEEG00000009898)	wsb2 (ENSEEEG00000009927)
Characoidei	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000160709	ENSGT00400000022306.c	ENSGT00940000158044.a	ENSGT00390000018806	ENSGT00940000159671	ENSGT00390000002024	ENSGT00940000156044	ENSGT00940000154702.b	ENSGT00550000074919	ENSGT00940000164243	ENSGT00940000165954	ENSGT00800000124190	ENSGT00390000008206	ENSGT00940000160711	ENSGT00390000006265.b.d	ENSGT00950000183101.b.a ##22	ENSGT00940000153899.b.a	ENSGT00940000159368.b	ENSGT01020000230354.B.b.a.b	ENSGT00390000005653	ENSGT00940000155845.s	ENSGT00390000017221	ENSGT00940000158419	ENSGT00390000008031	ENSGT00390000006208.b	ENSGT00950000183018.a.c	ENSGT00940000154297.B	ENSGT00940000159357	ENSGT00940000158519	ENSGT00550000075072	ENSGT00890000139406.b
Red-bellied piranha	MODERN SPECIES	595															ENSPNAG00000028492	SCARF2 (ENSPNAG00000028514) ##22	zgc:112294 (ENSPNAG00000028526)	CABP7 (ENSPNAG00000005774)
Mexicana tetra	MODERN SPECIES	142					ENSAMXG00000019131	ENSAMXG00000038804	HIRA (ENSAMXG00000030536)	slc2a11b (ENSAMXG00000003776)	gstt2 (ENSAMXG00000003784)	chek2 (ENSAMXG00000003794)	hscb (ENSAMXG00000003811)	ENSAMXG00000041326	rtn4r (ENSAMXG00000034932)	ENSAMXG00000041398	ENSAMXG00000029658	SCARF2 (ENSAMXG00000003834) ##22	zgc:112294 (ENSAMXG00000038572)	CABP7 (ENSAMXG00000042925)	nf2a (ENSAMXG00000003852)	FBXO21 (ENSAMXG00000003873)	tesca (ENSAMXG00000033668)	fbxw8 (ENSAMXG00000003882)	rnft2 (ENSAMXG00000003886)	spring1 (ENSAMXG00000003892)	CASTOR1 (ENSAMXG00000043214)	nipsnap1 (ENSAMXG00000004552)	ENSAMXG00000004541
Cyprinoidei	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000164390.d.a	ENSGT00940000164390.d.b	ENSGT00940000159527	ENSGT00950000183191.b	ENSGT00940000166026	ENSGT00940000154842.a.a	ENSGT00390000003213	ENSGT00940000166999.A	ENSGT00910000144273	ENSGT00940000164243	ENSGT00940000165954.i	ENSGT00800000124190	ENSGT00390000008206	ENSGT00940000160711	ENSGT00390000006265.b.d	ENSGT00950000183101.b.a ##22	ENSGT00940000153899.b.a	ENSGT00940000159368.b	ENSGT01020000230354.B.b.a.b	ENSGT00390000005653	ENSGT00940000155845.s	ENSGT00390000017221	ENSGT00940000158419	ENSGT00390000008031	ENSGT00390000006208.b	ENSGT00950000183018.a.c	ENSGT00940000154297.B	ENSGT00940000159357	ENSGT00940000158519	ENSGT00550000075072	ENSGT00890000139406.b
Cyprininae	DUPLICATION
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00940000164390.d.a.b	ENSGT00940000164390.d.b	ENSGT00940000159527.r	ENSGT00950000183191.b.l	ENSGT00940000166026.d	ENSGT00940000154842.a.a.c	ENSGT00390000003213.e.a	ENSGT00940000166999.A.a	ENSGT00910000144273.a	ENSGT00940000164243.o	ENSGT00940000165954.i.a.a.b	ENSGT00800000124190.g	ENSGT00390000008206.a	ENSGT00940000160711.i	ENSGT00390000006265.b.d.a	ENSGT00950000183101.b.a.a ##22
Goldfish	MODERN SPECIES	51	ywhag1 (ENSCARG00000056390)	ENSCARG00000056393	ENSCARG00000056410	ENSCARG00000056517	ENSCARG00000056545	supt4h1 (ENSCARG00000056575)	ENSCARG00000056602	ENSCARG00000056611	MTMR4 (ENSCARG00000056858)	ENSCARG00000063500	ca4a (ENSCARG00000063541)	GUSB (ENSCARG00000063562)	vkorc1l1 (ENSCARG00000063723)	nupr1a (ENSCARG00000063739)	ENSCARG00000063756	SCARF2 (ENSCARG00000063777) ##22	brinp1 (ENSCARG00000063805)	ENSCARG00000063819	ENSCARG00000063830	ak1 (ENSCARG00000063860)	gpsm1b (ENSCARG00000063884)	LHX3 (ENSCARG00000063988)	TMEM250 (ENSCARG00000064048)	NACC2 (ENSCARG00000064057)	ENSCARG00000064098	fam78ab (ENSCARG00000064625)	PLPP7 (ENSCARG00000064628)	PRRC2B (ENSCARG00000064631)	sec14l8 (ENSCARG00000064674)	ENSCARG00000064892	ENSCARG00000064905
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	63	ENSGT00940000164390.d.b	ENSGT00940000159527.r	ENSGT00950000183191.b.l	ENSGT00940000166026.d	ENSGT00940000154842.a.a.c	ENSGT00390000003213.e.a	ENSGT00390000003213.f	ENSGT00950000182888.b.l.a.a	ENSGT00910000144273.a	ENSGT00940000164243.o	ENSGT00940000165954.i.a.a.b	ENSGT00800000124190.g	ENSGT00390000008206.a	ENSGT00940000160711.i	ENSGT00390000006265.b.d.a	ENSGT00950000183101.b.a.a ##22	ENSGT00940000153899.b.a.d	ENSGT00940000159368.b.b	ENSGT01020000230354.B.b.a.b.g	ENSGT00390000005653.h	ENSGT00940000155845.s.b	ENSGT00940000158419.e	ENSGT00390000008031.ab	ENSGT00390000006208.b.g	ENSGT00950000183018.a.c.q	ENSGT00940000173122	ENSGT00940000159357.c	ENSGT00940000158519.a	ENSGT00550000075072.b	ENSGT00890000139406.b.ab	ENSGT00990000209825.b
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Golden-line barbel	MODERN SPECIES	260														rtn4r (ENSSGRG00000041020)	ENSSGRG00000041019	SCARF2 (ENSSGRG00000041017) ##22	ENSSGRG00000041016	ENSSGRG00000041015	ENSSGRG00000041014	CABP7 (ENSSGRG00000041013)	nf2a (ENSSGRG00000039920)	FBXO21 (ENSSGRG00000039911)	tesca (ENSSGRG00000039909)	rnft2 (ENSSGRG00000039905)	spring1 (ENSSGRG00000039904)	CASTOR1 (ENSSGRG00000039845)	nipsnap1 (ENSSGRG00000039842)	nos1 (ENSSGRG00000039585)	KSR2 (ENSSGRG00000039576)	ENSSGRG00000039575	rfc5 (ENSSGRG00000039358)
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000164390.d.a.a	ENSGT00940000159527.q	ENSGT00950000183191.b.k	ENSGT00940000166026.c	ENSGT00940000154842.a.a.d	ENSGT00390000003213.e.b	ENSGT00950000182888.b.l	ENSGT00940000166999.A.b	ENSGT00910000144273.b	ENSGT00940000164243.p	ENSGT00940000165954.i.a.a.a	ENSGT00800000124190.h	ENSGT00390000008206.b	ENSGT00940000160711.j	ENSGT00390000006265.b.d.b	ENSGT00950000183101.b.a.b ##22	ENSGT00940000153899.b.a.c	ENSGT00940000159368.b.a	ENSGT01020000230354.B.b.a.b.h	ENSGT00390000005653.g	ENSGT00940000155845.s.a	ENSGT00390000017221	ENSGT00940000158419.f	ENSGT00390000008031.`b	ENSGT00390000006208.b.h	ENSGT00950000183018.a.c.r	ENSGT00940000154297.B	ENSGT00940000159357.d	ENSGT00940000158519.b	ENSGT00550000075072.a	ENSGT00890000139406.b.`b
Goldfish	MODERN SPECIES	44	ENSCARG00000030511	ENSCARG00000030499	ENSCARG00000030493	ENSCARG00000030414	zgc:158343 (ENSCARG00000030401)	ENSCARG00000030380	wdr31 (ENSCARG00000030375)	slc2a11b (ENSCARG00000030322)	gstt2 (ENSCARG00000030313)	chek2 (ENSCARG00000030272)	hscb (ENSCARG00000030218)	ENSCARG00000030213	ENSCARG00000030211	rtn4r (ENSCARG00000030207)	ENSCARG00000030188	SCARF2 (ENSCARG00000030177) ##22	zgc:112294 (ENSCARG00000030163)	CABP7 (ENSCARG00000030147)	nf2a (ENSCARG00000030073)	FBXO21 (ENSCARG00000029801)	tesca (ENSCARG00000029776)	fbxw8 (ENSCARG00000029744)	rnft2 (ENSCARG00000029699)	nipsnap1 (ENSCARG00000029644)	ENSCARG00000029623	nipsnap1 (ENSCARG00000029517)	spring1 (ENSCARG00000029489)	CASTOR1 (ENSCARG00000029387)	LRRC74B (ENSCARG00000027257)	nos1 (ENSCARG00000020556)	KSR2 (ENSCARG00000020282)
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00940000164390.d.a.a	ENSGT00940000159527.q	ENSGT00950000183191.b.k	ENSGT00940000166026.c	ENSGT00940000154842.a.a.d	ENSGT00390000003213.e.b	ENSGT00950000182888.b.l.a.b	ENSGT00940000166999.A.b	ENSGT00910000144273.b	ENSGT00940000164243.p	ENSGT00940000165954.i.a.a.a	ENSGT00940000165954.i.a.b	ENSGT00800000124190.h	ENSGT00390000008206.b	ENSGT00390000006265.b.d.b	ENSGT00950000183101.b.a.b ##22	ENSGT00940000153899.b.a.c	ENSGT00940000159368.b.a	ENSGT01020000230354.B.b.a.b.h	ENSGT00390000005653.g	ENSGT00940000155845.s.a	ENSGT00390000017221	ENSGT00940000158419.f	ENSGT00390000008031.`b	ENSGT00390000006208.b.h	ENSGT00950000183018.a.c.r	ENSGT00940000154297.B	ENSGT00940000159357.d	ENSGT00940000158519.b	ENSGT00550000075072.a	ENSGT00890000139406.b.`b
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Golden-line barbel	MODERN SPECIES	1075															ENSSGRG00000025259	SCARF2 (ENSSGRG00000025257) ##22	zgc:112294 (ENSSGRG00000025256)	CABP7 (ENSSGRG00000025254)	ENSSGRG00000025253	nf2a (ENSSGRG00000025252)	FBXO21 (ENSSGRG00000025249)	tesca (ENSSGRG00000025247)	zbtb11 (ENSSGRG00000025184)	DIPK1A (ENSSGRG00000025163)	rpl5b (ENSSGRG00000025158)	EVI5 (ENSSGRG00000023789)	gfi1ab (ENSSGRG00000023754)	glmnb (ENSSGRG00000023752)	C1orf146 (ENSSGRG00000023751)
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Clupeiformes	ANCESTRAL SPECIES	57	ENSGT00390000010194	ENSGT01020000230351.A	ENSGT00390000002626	ENSGT00950000182923.C.a	ENSGT00940000158190.g	ENSGT00940000161922	ENSGT00940000160448	ENSGT00500000045140.a.b	ENSGT00940000164243	ENSGT00940000165954	ENSGT00800000124190	ENSGT00390000008206	ENSGT00940000160711	ENSGT00390000006265.b.d	ENSGT00940000167451	ENSGT00950000183101.b.a ##22	ENSGT00940000153899.b.a	ENSGT00940000159368.b	ENSGT01020000230354.B.b.a.b	ENSGT00390000005653	ENSGT00940000155845.s	ENSGT00390000017221	ENSGT00940000158419	ENSGT00390000008031	ENSGT00390000006208.b	ENSGT00950000183018.a.c	ENSGT00940000154297.B	ENSGT00940000159357	ENSGT00940000158519	ENSGT00550000075072	ENSGT00890000139406.b
Atlantic herring	MODERN SPECIES	23	arsk (ENSCHAG00000027853)	nfu1 (ENSCHAG00000027854)	dnase2 (ENSCHAG00000027856)	stambpb (ENSCHAG00000027857)	ENSCHAG00000027858	ccn1l2 (ENSCHAG00000027859)	ENSCHAG00000000233	slc2a11b (ENSCHAG00000000277)	ENSCHAG00000000455	slc2a11b (ENSCHAG00000000598)	gstt2 (ENSCHAG00000000731)	chek2 (ENSCHAG00000000974)	hscb (ENSCHAG00000001422)	rtn4r (ENSCHAG00000001444)	ENSCHAG00000001489	SCARF2 (ENSCHAG00000001821) ##22	zgc:112294 (ENSCHAG00000001863)	CABP7 (ENSCHAG00000001885)	nf2a (ENSCHAG00000001980)	FBXO21 (ENSCHAG00000005307)	tesca (ENSCHAG00000005856)	ulk1a (ENSCHAG00000005888)	EP400 (ENSCHAG00000006077)	ncor2 (ENSCHAG00000008412)	rflna (ENSCHAG00000010145)	ORAI1 (ENSCHAG00000010157)	kdm2ba (ENSCHAG00000010206)	rnf34a (ENSCHAG00000010217)	anapc5 (ENSCHAG00000010301)	ENSCHAG00000011719	adam9 (ENSCHAG00000011732)
Euteleosteomorpha	ANCESTRAL SPECIES	82	ENSGT00390000010743.b.b	ENSGT00940000167162	ENSGT00940000156724	ENSGT00940000158199	ENSGT00940000157157.b.a.a	ENSGT00390000014658	ENSGT00950000182975.a.a.b.k	ENSGT00940000156880.c.b	ENSGT00940000162727.a.a	ENSGT00940000164473	ENSGT00940000163579	ENSGT00940000154043.A.j.a	ENSGT00390000008206	ENSGT00940000160711	ENSGT00390000006265.b.d	ENSGT00950000183101.b.a ##22	ENSGT00940000153899.b.a	ENSGT00940000159368.b	ENSGT01020000230354.B.b.a.b	ENSGT00390000005653	ENSGT00940000155845.s	ENSGT00390000017221	ENSGT00940000158419	ENSGT00390000008031	ENSGT00390000006208.b	ENSGT00950000183018.a.c	ENSGT00940000173122	ENSGT00940000154297.B	ENSGT00940000159357	ENSGT00940000158519	ENSGT00940000169488
Protacanthopterygii	ANCESTRAL SPECIES	75					ENSGT00950000182975.a.a.b.k	ENSGT00940000156880.c.b	ENSGT00940000162727.a.a	ENSGT00940000164473	ENSGT00940000163579	ENSGT00940000153189.B	ENSGT00940000154043.A.j.a	ENSGT00390000008206	ENSGT00940000160711	ENSGT00390000006265.b.d	ENSGT00940000167451	ENSGT00950000183101.b.a ##22	ENSGT00940000153899.b.a	ENSGT00940000159368.b	ENSGT01020000230354.B.b.a.b	ENSGT00390000005653	ENSGT00940000155845.s	ENSGT00390000017221	ENSGT00940000158419	ENSGT00390000008031	ENSGT00390000006208.b	ENSGT00950000183018.a.c	ENSGT00940000154297.B	ENSGT00940000159357	ENSGT00940000158519	ENSGT00940000165622.i.b	ENSGT00550000075072
Salmoninae	DUPLICATION
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	263						ENSGT00950000182975.a.a.b.k.f.a	ENSGT00940000169810	ENSGT00940000156880.c.b.e	ENSGT00940000155161.y.b	ENSGT00940000162727.a.a.a.a.b	ENSGT00940000164473	ENSGT00940000154043.A.j.a.c	ENSGT00390000008206.c	ENSGT00940000160711.g.a	ENSGT00390000006265.b.d	ENSGT00950000183101.b.a.c ##22	ENSGT00940000159368.b.c	ENSGT01020000230354.B.b.a.b	ENSGT00390000005653.i	ENSGT00940000155845.s.d	ENSGT00390000017221	ENSGT00390000008031.eb	ENSGT00390000006208.b.e	ENSGT00940000154297.B	ENSGT00940000159357.h.a	ENSGT00940000158519.f	ENSGT00940000165622.i.b	ENSGT00550000075072.h	ENSGT00890000139406.b	ENSGT00940000159876.a	ENSGT00990000210202
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	50	ENSGT00940000154149.a.b.c	ENSGT00940000155127.a.b.e	ENSGT00950000183002.B.a.a.i.a	ENSGT00530000063843.a.e	ENSGT00390000014658.l	ENSGT00950000182975.a.a.b.k.f.a	ENSGT00940000169810	ENSGT00940000156880.c.b.e	ENSGT00940000155161.y.b	ENSGT00940000162727.a.a.a.a.b	ENSGT00940000164473	ENSGT00940000154043.A.j.a.c	ENSGT00390000008206.c	ENSGT00940000160711.g.a	ENSGT00390000006265.b.d	ENSGT00950000183101.b.a.c ##22	ENSGT01000000218532	ENSGT00940000159368.b.c	ENSGT01020000230354.B.b.a.b	ENSGT00390000005653.i	ENSGT00940000155845.s.d	ENSGT00390000017221	ENSGT00390000008031.eb	ENSGT00390000006208.b.e	ENSGT00940000154297.B	ENSGT00940000159357.h.a	ENSGT00940000158519.f	ENSGT00940000165622.i.b.a	ENSGT00550000075072.h	ENSGT00890000139406.b	ENSGT00940000159876.a
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00440000038604.j.e	ENSGT00940000154149.a.b.c	ENSGT00940000155127.a.b.e	ENSGT00950000183002.B.a.a.i.a	ENSGT00530000063843.a.e	ENSGT00390000014658.l	ENSGT00950000182975.a.a.b.k.f.a	ENSGT00940000169810	ENSGT00940000156880.c.b.e	ENSGT00940000155161.y.b	ENSGT00940000162727.a.a.a.a.b	ENSGT00940000164473	ENSGT00940000154043.A.j.a.c	ENSGT00940000160711.g.a	ENSGT00390000006265.b.d	ENSGT00950000183101.b.a.c ##22	ENSGT01000000218532	ENSGT00940000159368.b.c	ENSGT01020000230354.B.b.a.b	ENSGT00390000005653.i	ENSGT00940000155845.s.d	ENSGT00390000017221	ENSGT00940000158419.h	ENSGT00390000008031.eb	ENSGT00390000006208.b.e	ENSGT00940000154297.B	ENSGT00940000159357.h.a	ENSGT00940000158519.f	ENSGT00940000165622.i.b.a	ENSGT00550000075072.h.a	ENSGT00890000139406.b
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000154149.a.b.c	ENSGT00940000155127.a.b.e	ENSGT01030000236783	ENSGT00950000183002.B.a.a.i.a	ENSGT00530000063843.a.e	ENSGT00390000014658.l	ENSGT00950000182975.a.a.b.k.f.a	ENSGT00940000169810	ENSGT00940000156880.c.b.e	ENSGT00940000162727.a.a.a.a.b	ENSGT00940000164473	ENSGT00940000154043.A.j.a.c	ENSGT01010000229661	ENSGT00940000160711.g.a	ENSGT00390000006265.b.d	ENSGT00950000183101.b.a.c ##22	ENSGT01000000218532	ENSGT00940000159368.b.c	ENSGT01020000230354.B.b.a.b	ENSGT00390000005653.i	ENSGT00940000155845.s.d	ENSGT00390000017221	ENSGT00390000008031.eb	ENSGT00390000006208.b.e	ENSGT00940000154297.B	ENSGT00940000159357.h.a	ENSGT00940000158519.f	ENSGT00940000165622.i.b.a	ENSGT00550000075072.h.b	ENSGT00550000075072.h.a	ENSGT00890000139406.b
Chinook salmon	MODERN SPECIES	28	stxbp1b (ENSOTSG00005011623)	ENSOTSG00005011724	WHRN (ENSOTSG00005011726)	ENSOTSG00005011727	noxa1 (ENSOTSG00005011728)	ubac1 (ENSOTSG00005011730)	camsap1b (ENSOTSG00005011731)	KCNT1 (ENSOTSG00005011744)	ENSOTSG00005020916	zgc:101858 (ENSOTSG00005020923)	LRRC8A (ENSOTSG00005020925)	ENSOTSG00005020927	ENSOTSG00005020929	rtn4r (ENSOTSG00005020933)	ENSOTSG00005020947	SCARF2 (ENSOTSG00005021007) ##22	ENSOTSG00005021088	CABP7 (ENSOTSG00005021091)	nf2a (ENSOTSG00005021100)	FBXO21 (ENSOTSG00005021115)	tesca (ENSOTSG00005021122)	fbxw8 (ENSOTSG00005021126)	spring1 (ENSOTSG00005021567)	CASTOR1 (ENSOTSG00005021574)	ENSOTSG00005021586	ENSOTSG00005021588	ENSOTSG00005021590	nos1 (ENSOTSG00005021619)	KSR2 (ENSOTSG00005033831)	ENSOTSG00005033832	wsb2 (ENSOTSG00005033833)
Coho salmon	MODERN SPECIES	22	ENSOKIG00005022808	niban2b (ENSOKIG00005022879)	stxbp1b (ENSOKIG00005023186)	ENSOKIG00005023454	WHRN (ENSOKIG00005023458)	UBAC1 (ENSOKIG00005023471)	camsap1b (ENSOKIG00005023543)	ENSOKIG00005024182	KCNT1 (ENSOKIG00005024263)	col27a1b (ENSOKIG00005025527)	zgc:101858 (ENSOKIG00005025618)	LRRC8A (ENSOKIG00005025649)	ENSOKIG00005025672	rtn4r (ENSOKIG00005025691)	ENSOKIG00005025730	SCARF2 (ENSOKIG00005026255) ##22	CABP7 (ENSOKIG00005026333)	nf2a (ENSOKIG00005026373)	FBXO21 (ENSOKIG00005026539)	tesca (ENSOKIG00005026566)	fbxw8 (ENSOKIG00005026599)	spring1 (ENSOKIG00005027180)	CASTOR1 (ENSOKIG00005027228)	ENSOKIG00005027331	nos1 (ENSOKIG00005027900)	KSR2 (ENSOKIG00005039469)	ENSOKIG00005039507	ENSOKIG00005039527	rfc5 (ENSOKIG00005039548)	wsb2 (ENSOKIG00005039593)	VSIG10 (ENSOKIG00005039604)
Rainbow trout	MODERN SPECIES	27	noxa1 (ENSOMYG00000038135)	ENSOMYG00000049273	ENSOMYG00000038149	camsap1b (ENSOMYG00000038224)	ENSOMYG00000076621	ENSOMYG00000039630	ENSOMYG00000059590	ENSOMYG00000043428	col27a1b (ENSOMYG00000043436)	ENSOMYG00000043441	ENSOMYG00000043448	ENSOMYG00000006587	ENSOMYG00000050523	rtn4r (ENSOMYG00000043459)	ENSOMYG00000043532	ENSOMYG00000043907 ##22	ENSOMYG00000043912	ENSOMYG00000073919	ENSOMYG00000043921	nf2a (ENSOMYG00000043946)	ENSOMYG00000064834	FBXO21 (ENSOMYG00000044014)	tesca (ENSOMYG00000044048)	fbxw8 (ENSOMYG00000044069)	rnft2 (ENSOMYG00000044094)	spring1 (ENSOMYG00000044102)	ENSOMYG00000056971	ENSOMYG00000044115	nos1 (ENSOMYG00000044219)	KSR2 (ENSOMYG00000045391)	ENSOMYG00000045399
Salmo	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000154149.a.b.c	ENSGT00940000155127.a.b.e	ENSGT00950000183002.B.a.a.i.a	ENSGT00530000063843.a.e	ENSGT00390000014658.l	ENSGT00950000182975.a.a.b.k.f.a	ENSGT00940000156880.c.b.e	ENSGT00940000155161.y.b	ENSGT00940000162727.a.a.a.b	ENSGT00940000164473	ENSGT00940000154043.A.j.a.c	ENSGT00390000008206.c	ENSGT00940000160711.g.a	ENSGT00390000006265.b.d	ENSGT00940000167451	ENSGT00950000183101.b.a.c ##22	ENSGT01000000218532	ENSGT00940000159368.b.c	ENSGT01020000230354.B.b.a.b	ENSGT00390000005653.i	ENSGT00940000155845.s.d	ENSGT00390000017221	ENSGT00390000008031.eb	ENSGT00390000006208.b.e	ENSGT00940000154297.B	ENSGT00940000159357.h.a	ENSGT00940000158519.f	ENSGT00940000165622.i.b.a	ENSGT00550000075072.h	ENSGT00890000139406.b	ENSGT00940000159876.a
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	16	noxa1 (ENSSSAG00000101747)	ENSSSAG00000022135	camsap1b (ENSSSAG00000015587)	ENSSSAG00000015509	ENSSSAG00000105373	ENSSSAG00000082948	ENSSSAG00000012970	ENSSSAG00000093907	ENSSSAG00000113304	col27a1b (ENSSSAG00000119376)	ENSSSAG00000011649	ENSSSAG00000009627	rtn4r (ENSSSAG00000011206)	ENSSSAG00000038450	ENSSSAG00000009835	ENSSSAG00000009792 ##22	ENSSSAG00000009781	ENSSSAG00000009770	ENSSSAG00000093842	nf2a (ENSSSAG00000009316)	ENSSSAG00000119093	FBXO21 (ENSSSAG00000009105)	tesca (ENSSSAG00000009069)	fbxw8 (ENSSSAG00000008671)	ENSSSAG00000078292	ENSSSAG00000098539	ENSSSAG00000106469	ENSSSAG00000106923	NOS1 (ENSSSAG00000070454)	KSR2 (ENSSSAG00000070201)	ENSSSAG00000109472
Huchen	MODERN SPECIES	991														rtn4r (ENSHHUG00000041662)	ENSHHUG00000041580	SCARF2 (ENSHHUG00000041559) ##22	CABP7 (ENSHHUG00000041553)
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	503	ENSGT00940000161618.b	ENSGT00440000038604.j.f	ENSGT00940000154149.a.b.d	ENSGT00940000155127.a.b.f	ENSGT00950000183002.B.a.a.i.b	ENSGT00530000063843.a.f	ENSGT00390000014658.m	ENSGT00950000182975.a.a.b.k.f.b	ENSGT00940000156880.c.b.f	ENSGT00940000155161.y.a	ENSGT00940000162727.a.a.b	ENSGT00940000153189.B	ENSGT00940000154043.A.j.a.d	ENSGT00390000008206.d	ENSGT00940000160711.g.b	ENSGT00950000183101.b.a.d ##22	ENSGT00940000153899.b.a	ENSGT00940000159368.b.d
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	50	ENSGT00940000161618.b	ENSGT00440000038604.j.f	ENSGT00940000154149.a.b.d	ENSGT00940000155127.a.b.f	ENSGT00950000183002.B.a.a.i.b	ENSGT00530000063843.a.f	ENSGT00390000014658.m	ENSGT00950000182975.a.a.b.k.f.b	ENSGT00940000156880.c.b.f	ENSGT00940000155161.y.a	ENSGT00940000162727.a.a.b	ENSGT00940000153189.B	ENSGT00940000154043.A.j.a.d	ENSGT00390000008206.d	ENSGT00940000160711.g.b	ENSGT00950000183101.b.a.d ##22	ENSGT00940000153899.b.a	ENSGT00940000159368.b.d	ENSGT00390000005653.j	ENSGT00940000155845.s.c	ENSGT00940000158419	ENSGT00390000008031.db	ENSGT01030000236816	ENSGT00390000006208.b.f	ENSGT00950000183018.a.c	ENSGT00940000159357.h.b	ENSGT00940000158519.e	ENSGT00940000165622.i.b.b	ENSGT00550000075072.g	ENSGT00940000159876.b	ENSGT00940000157251
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000161618.b	ENSGT00440000038604.j.f	ENSGT00940000154149.a.b.d	ENSGT00940000155127.a.b.f	ENSGT00950000183002.B.a.a.i.b	ENSGT00530000063843.a.f	ENSGT00390000014658.m	ENSGT00950000182975.a.a.b.k.f.b	ENSGT00940000156880.c.b.f	ENSGT00940000155161.y.a	ENSGT00940000162727.a.a.b	ENSGT00940000153189.B	ENSGT00940000154043.A.j.a.d	ENSGT00390000008206.d	ENSGT00940000160711.g.b	ENSGT00950000183101.b.a.d ##22	ENSGT00940000153899.b.a	ENSGT00940000159368.b.d	ENSGT00390000005653.j	ENSGT00940000155845.s.c	ENSGT00940000158419	ENSGT00390000008031.db	ENSGT01030000236816	ENSGT00390000006208.b.f	ENSGT00950000183018.a.c	ENSGT00940000159357.h.b	ENSGT00940000158519.e	ENSGT00940000165622.i.b.b	ENSGT00550000075072.g	ENSGT00940000159876.b	ENSGT00940000157251
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	12	ENSSSAG00000122120	ENSSSAG00000043113	cldn15lb (ENSSSAG00000006356)	atg16l1 (ENSSSAG00000006445)	sagb (ENSSSAG00000007516)	ENSSSAG00000007626	ENSSSAG00000007548	ENSSSAG00000008339	ENSSSAG00000110251	ENSSSAG00000111269	ENSSSAG00000009553	PPIL3 (ENSSSAG00000009591)	ENSSSAG00000120251	hscb (ENSSSAG00000009647)	rtn4r (ENSSSAG00000009675)	ENSSSAG00000009683 ##22	zgc:112294 (ENSSSAG00000098275)	ENSSSAG00000087830	FBXO21 (ENSSSAG00000009748)	tesc (ENSSSAG00000009827)	rnft2 (ENSSSAG00000104152)	ENSSSAG00000084962	spring1 (ENSSSAG00000093894)	ENSSSAG00000101343	nipsnap1 (ENSSSAG00000116598)	nos1 (ENSSSAG00000010828)	ENSSSAG00000089831	ENSSSAG00000068054	ENSSSAG00000087677	rfc5 (ENSSSAG00000068070)	VSIG10 (ENSSSAG00000110575)
River trout	MODERN SPECIES	39	niban2b (ENSSTUG00000020328)	stxbp1b (ENSSTUG00000020523)	ENSSTUG00000020873	ENSSTUG00000020883	noxa1 (ENSSTUG00000020899)	ubac1 (ENSSTUG00000020917)	camsap1b (ENSSTUG00000020976)	KCNT1 (ENSSTUG00000021279)	ENSSTUG00000026760	ENSSTUG00000026778	ENSSTUG00000026822	PPIL3 (ENSSTUG00000026833)	LRRC8A (ENSSTUG00000026850)	hscb (ENSSTUG00000026858)	rtn4r (ENSSTUG00000026867)	SCARF2 (ENSSTUG00000026870) ##22	zgc:112294 (ENSSTUG00000026881)	CABP7 (ENSSTUG00000026885)	FBXO21 (ENSSTUG00000026897)	tesca (ENSSTUG00000026958)	ENSSTUG00000026974	rnft2 (ENSSTUG00000026980)	spring1 (ENSSTUG00000026998)	ENSSTUG00000027012	CASTOR1 (ENSSTUG00000027027)	nipsnap1 (ENSSTUG00000027111)	nos1 (ENSSTUG00000027522)	KSR2 (ENSSTUG00000032590)	cirbpa (ENSSTUG00000032650)	rfc5 (ENSSTUG00000032671)	VSIG10 (ENSSTUG00000032792)
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000161618.b	ENSGT00440000038604.j.f	ENSGT00940000154149.a.b.d	ENSGT00940000155127.a.b.f	ENSGT00950000183002.B.a.a.i.b	ENSGT00530000063843.a.f	ENSGT00390000014658.m	ENSGT00950000182975.a.a.b.k.f.b	ENSGT00940000156880.c.b.f	ENSGT00940000155161.y.a	ENSGT00940000162727.a.a.b	ENSGT00940000153189.B	ENSGT00940000154043.A.j.a.d	ENSGT00390000008206.d	ENSGT00940000160711.g.b	ENSGT00950000183101.b.a.d ##22	ENSGT00940000153899.b.a	ENSGT00940000159368.b.d	ENSGT00390000005653.j	ENSGT00940000155845.s.c	ENSGT00940000158419.g	ENSGT00390000008031.db	ENSGT01030000236816	ENSGT00390000006208.b.f	ENSGT00950000183018.a.c	ENSGT00940000159357.h.b	ENSGT00940000158519.e	ENSGT00940000165622.i.b.b	ENSGT00550000075072.g	ENSGT00940000159876.b	ENSGT00940000157251
Rainbow trout	MODERN SPECIES	2	ENSOMYG00000069883	ENSOMYG00000025308	niban2b (ENSOMYG00000026086)	stxbp1b (ENSOMYG00000028858)	ENSOMYG00000029199	noxa1 (ENSOMYG00000029250)	ENSOMYG00000029888	camsap1b (ENSOMYG00000029735)	ENSOMYG00000030451	col27a1b (ENSOMYG00000065872)	ENSOMYG00000050168	ENSOMYG00000011684	ENSOMYG00000011707	hscb (ENSOMYG00000011732)	rtn4r (ENSOMYG00000011750)	ENSOMYG00000011756 ##22	zgc:112294 (ENSOMYG00000011766)	ENSOMYG00000011772	FBXO21 (ENSOMYG00000011810)	tesca (ENSOMYG00000011897)	ENSOMYG00000052881	rnft2 (ENSOMYG00000011909)	spring1 (ENSOMYG00000011917)	ENSOMYG00000011926	ENSOMYG00000044105	nipsnap1 (ENSOMYG00000012011)	nos1 (ENSOMYG00000012220)	ENSOMYG00000059382	KSR2 (ENSOMYG00000012609)	rfc5 (ENSOMYG00000012630)	ENSOMYG00000059698
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000161618.b	ENSGT00940000154149.a.b.d	ENSGT00940000155127.a.b.f	ENSGT00950000183002.B.a.a.i.b	ENSGT00530000063843.a.f	ENSGT00390000014658.m	ENSGT00950000182975.a.a.b.k.f.b	ENSGT00940000156880.c.b.f	ENSGT00940000155161.y.a	ENSGT00940000162727.a.a.b	ENSGT00940000153189.B	ENSGT00940000163579	ENSGT00940000154043.A.j.a.d	ENSGT00390000008206.d	ENSGT00940000160711.g.b	ENSGT00950000183101.b.a.d ##22	ENSGT00940000153899.b.a	ENSGT00940000159368.b.d	ENSGT00390000005653.j	ENSGT00940000155845.s.c	ENSGT00940000158419.g	ENSGT00390000008031.db	ENSGT01030000236816	ENSGT00390000006208.b.f	ENSGT00950000183018.a.c	ENSGT00940000159357.h.b	ENSGT00940000158519.e	ENSGT00940000165622.i.b.b	ENSGT00550000075072.g	ENSGT00940000159876.b	ENSGT00940000157251
Coho salmon	MODERN SPECIES	28	ABCA2 (ENSOKIG00005030990)	FUT7 (ENSOKIG00005030943)	niban2b (ENSOKIG00005024132)	stxbp1b (ENSOKIG00005021395)	WHRN (ENSOKIG00005021200)	noxa1 (ENSOKIG00005021180)	ubac1 (ENSOKIG00005021141)	camsap1b (ENSOKIG00005020910)	KCNT1 (ENSOKIG00005014410)	ENSOKIG00005014128	ENSOKIG00005014110	PPIL3 (ENSOKIG00005014086)	LRRC8A (ENSOKIG00005014071)	hscb (ENSOKIG00005014031)	rtn4r (ENSOKIG00005014023)	SCARF2 (ENSOKIG00005014012) ##22	zgc:112294 (ENSOKIG00005014000)	CABP7 (ENSOKIG00005013982)	FBXO21 (ENSOKIG00005013927)	tesca (ENSOKIG00005013916)	rnft2 (ENSOKIG00005013901)	spring1 (ENSOKIG00005013881)	ENSOKIG00005013872	CASTOR1 (ENSOKIG00005013850)	nipsnap1 (ENSOKIG00005013080)	nos1 (ENSOKIG00005003972)	KSR2 (ENSOKIG00005003509)	ENSOKIG00005003488	rfc5 (ENSOKIG00005003461)	VSIG10 (ENSOKIG00005003444)	pebp1 (ENSOKIG00005003431)
Chinook salmon	MODERN SPECIES	3	htr1aa (ENSOTSG00005011761)	ENSOTSG00005011760	FUT7 (ENSOTSG00005011757)	niban2b (ENSOTSG00005011553)	stxbp1b (ENSOTSG00005011291)	WHRN (ENSOTSG00005011287)	noxa1 (ENSOTSG00005011285)	ubac1 (ENSOTSG00005011282)	camsap1b (ENSOTSG00005011172)	KCNT1 (ENSOTSG00005010655)	ENSOTSG00005010652	ppil3 (ENSOTSG00005010646)	LRRC8A (ENSOTSG00005010645)	hscb (ENSOTSG00005010644)	rtn4r (ENSOTSG00005010643)	SCARF2 (ENSOTSG00005010642) ##22	zgc:112294 (ENSOTSG00005010641)	CABP7 (ENSOTSG00005010640)	FBXO21 (ENSOTSG00005010626)	tesca (ENSOTSG00005010621)	rnft2 (ENSOTSG00005010620)	spring1 (ENSOTSG00005010619)	ENSOTSG00005010618	ENSOTSG00005010617	nipsnap1 (ENSOTSG00005009637)	nos1 (ENSOTSG00005005201)	KSR2 (ENSOTSG00005005178)	cirbpa (ENSOTSG00005005173)	rfc5 (ENSOTSG00005005171)	VSIG10 (ENSOTSG00005005170)	pebp1 (ENSOTSG00005005169)
Huchen	MODERN SPECIES	2134																SCARF2 (ENSHHUG00000002408) ##22	zgc:112294 (ENSHHUG00000002448)	CABP7 (ENSHHUG00000002453)	ENSHHUG00000002466	gyg1b (ENSHHUG00000002472)
Northern pike	MODERN SPECIES	12	ENSELUG00000024708	ubac1 (ENSELUG00000003081)	camsap1b (ENSELUG00000003150)	ENSELUG00000003193	KCNT1 (ENSELUG00000003400)	ENSELUG00000000121	ENSELUG00000026303	ENSELUG00000003530	zgc:101858 (ENSELUG00000003546)	ppil3 (ENSELUG00000003563)	LRRC8A (ENSELUG00000003593)	hscb (ENSELUG00000003615)	rtn4r (ENSELUG00000004062)	ENSELUG00000004089	ENSELUG00000034004	ENSELUG00000004127 ##22	zgc:112294 (ENSELUG00000004142)	CABP7 (ENSELUG00000004155)	nf2a (ENSELUG00000004197)	upp1 (ENSELUG00000004220)	FBXO21 (ENSELUG00000004260)	tesca (ENSELUG00000004280)	fbxw8 (ENSELUG00000004303)	rnft2 (ENSELUG00000004324)	spring1 (ENSELUG00000004340)	CASTOR1 (ENSELUG00000004361)	nipsnap1 (ENSELUG00000004395)	ENSELUG00000004420	nos1 (ENSELUG00000004513)	KSR2 (ENSELUG00000004622)	ENSELUG00000004675
Acanthomorphata	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000156724	ENSGT00940000158199	ENSGT00940000157157.b.a.a	ENSGT00390000014658	ENSGT00950000182975.a.a.b.k	ENSGT00940000169810	ENSGT00940000156880.c.b	ENSGT00940000155161	ENSGT00940000162727.a.a	ENSGT00940000164473	ENSGT00940000163579	ENSGT00940000154043.A.j.a	ENSGT00390000008206	ENSGT00940000160711	ENSGT00390000006265.b.d	ENSGT00950000183101.b.a ##22	ENSGT00940000153899.b.a	ENSGT00940000159368.b	ENSGT01020000230354.B.b.a.b	ENSGT00390000005653	ENSGT00940000155845.s	ENSGT00390000017221	ENSGT00940000158419	ENSGT00390000008031	ENSGT00390000006208.b	ENSGT00950000183018.a.c	ENSGT00940000154297.B	ENSGT00940000159357	ENSGT00940000158519	ENSGT00940000169488	ENSGT00550000075072
Euacanthomorphacea	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000156724	ENSGT00940000158199	ENSGT00940000157157.b.a.a	ENSGT00390000014658	ENSGT00950000182975.a.a.b.k	ENSGT00940000169810	ENSGT00940000156880.c.b	ENSGT00940000155161	ENSGT00940000162727.a.a	ENSGT00940000164473	ENSGT00940000163579	ENSGT00940000154043.A.j.a	ENSGT00390000008206	ENSGT00940000160711	ENSGT00390000006265.b.d	ENSGT00950000183101.b.a ##22	ENSGT00940000153899.b.a	ENSGT00940000159368.b	ENSGT01020000230354.B.b.a.b	ENSGT00390000005653	ENSGT00940000155845.s	ENSGT00390000017221	ENSGT00940000158419	ENSGT00390000008031	ENSGT00390000006208.b	ENSGT00950000183018.a.c	ENSGT00940000154297.B	ENSGT00940000159357	ENSGT00940000158519	ENSGT00940000169488	ENSGT00550000075072
Percomorphaceae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000156724	ENSGT00940000158199	ENSGT00940000157157.b.a.a	ENSGT00390000014658	ENSGT00950000182975.a.a.b.k	ENSGT00940000169810	ENSGT00940000156880.c.b	ENSGT00940000155161	ENSGT00940000162727.a.a	ENSGT00940000164473	ENSGT00940000163579	ENSGT00940000154043.A.j.a	ENSGT00390000008206	ENSGT00940000160711	ENSGT00390000006265.b.d	ENSGT00950000183101.b.a ##22	ENSGT00940000153899.b.a	ENSGT00940000159368.b	ENSGT01020000230354.B.b.a.b	ENSGT00390000005653	ENSGT00940000155845.s	ENSGT00390000017221	ENSGT00940000158419	ENSGT00390000008031	ENSGT00940000177649	ENSGT00390000006208.b	ENSGT00950000183018.a.c	ENSGT00940000154297.B	ENSGT00940000159357	ENSGT00940000158519	ENSGT00940000169488
Percomorphaceae_B	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183101.b.a ##22
Percomorphaceae_C	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183101.b.a ##22
Eupercaria	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183101.b.a ##22
Eupecaria_A	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183101.b.a ##22
Eupecaria_B	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183101.b.a ##22
Perciformes	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183101.b.a ##22
Cottioidei	ANCESTRAL SPECIES	34	ENSGT00940000163149.a.b.c.b	ENSGT00940000157157.b.a.a	ENSGT00390000014658	ENSGT00950000182975.a.a.b.k	ENSGT00940000161826.B	ENSGT00940000156880.c.b	ENSGT00940000155161	ENSGT00940000162727.a.a	ENSGT00940000164473	ENSGT00940000153189.B	ENSGT00940000154043.A.j.a	ENSGT00390000008206	ENSGT00940000160711	ENSGT00390000006265.b.d	ENSGT00940000167451	ENSGT00950000183101.b.a ##22	ENSGT00940000153899.b.a	ENSGT00940000159368.b	ENSGT01020000230354.B.b.a.b	ENSGT00390000005653	ENSGT00940000155845.s	ENSGT00390000017221	ENSGT00940000158419	ENSGT00390000008031	ENSGT00390000006208.b	ENSGT00950000183018.a.c	ENSGT00940000154297.B	ENSGT00940000159357	ENSGT00940000158519	ENSGT00550000075072	ENSGT00890000139406.b
Stickleback	MODERN SPECIES	12	PTGS1 (ENSGACG00000013921)	pmpca (ENSGACG00000013937)	inpp5e (ENSGACG00000013962)	ENSGACG00000013964	notch1b (ENSGACG00000013973)	ubac1 (ENSGACG00000013983)	camsap1b (ENSGACG00000013987)	KCNT1 (ENSGACG00000013992)	ENSGACG00000014003	col27a1b (ENSGACG00000014007)	zgc:101858 (ENSGACG00000014039)	PPIL3 (ENSGACG00000014048)	LRRC8A (ENSGACG00000014056)	hscb (ENSGACG00000014058)	rtn4r (ENSGACG00000014064)	SCARF2 (ENSGACG00000014065) ##22	zgc:112294 (ENSGACG00000014067)	CABP7 (ENSGACG00000014070)	nf2a (ENSGACG00000014073)	FBXO21 (ENSGACG00000014080)	tesca (ENSGACG00000014094)	ENSGACG00000014100	fbxw8 (ENSGACG00000014103)	rnft2 (ENSGACG00000014106)	spring1 (ENSGACG00000014111)	CASTOR1 (ENSGACG00000014120)	nipsnap1 (ENSGACG00000014139)	ENSGACG00000014158	nos1 (ENSGACG00000014163)	KSR2 (ENSGACG00000014173)	rfc5 (ENSGACG00000014181)
Tetraodontidae	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000156724.i	ENSGT00940000158199	ENSGT00940000163149.a.b.c.b	ENSGT00940000157157.b.a.a	ENSGT00390000014658	ENSGT00950000182975.a.a.b.k	ENSGT00940000156880.c.b	ENSGT00940000162727.a.a	ENSGT00940000164473	ENSGT00940000153189.B	ENSGT00940000154043.A.j.a	ENSGT00390000008206	ENSGT00940000160711	ENSGT00390000006265.b.d	ENSGT00940000167451	ENSGT00950000183101.b.a ##22	ENSGT00940000153899.b.a	ENSGT00940000159368.b	ENSGT01020000230354.B.b.a.b	ENSGT00390000005653	ENSGT00940000155845.s	ENSGT00390000017221	ENSGT00940000158419	ENSGT00390000008031	ENSGT00390000006208.b	ENSGT00950000183018.a.c	ENSGT00940000154297.B	ENSGT00940000159357	ENSGT00940000158519	ENSGT00940000169488	ENSGT00550000075072
Tetraodon	MODERN SPECIES	3	ENSTNIG00000015586	krt1-c5 (ENSTNIG00000015587)	LHX6 (ENSTNIG00000015588)	PTGS1 (ENSTNIG00000001299)	PTGS1 (ENSTNIG00000015589)	ENSTNIG00000015590	notch1b (ENSTNIG00000015591)	ubac1 (ENSTNIG00000015592)	camsap1b (ENSTNIG00000015593)	KCNT1 (ENSTNIG00000015594)	col27a1b (ENSTNIG00000015595)	zgc:101858 (ENSTNIG00000015596)	PPIL3 (ENSTNIG00000015597)	LRRC8A (ENSTNIG00000015598)	hscb (ENSTNIG00000015599)	SCARF2 (ENSTNIG00000015600) ##22	zgc:112294 (ENSTNIG00000015601)	CABP7 (ENSTNIG00000015602)	nf2a (ENSTNIG00000015603)	FBXO21 (ENSTNIG00000015604)	tesca (ENSTNIG00000015605)	fbxw8 (ENSTNIG00000015606)	rnft2 (ENSTNIG00000015607)	CASTOR1 (ENSTNIG00000015608)	nipsnap1 (ENSTNIG00000015609)	nos1 (ENSTNIG00000015610)	KSR2 (ENSTNIG00000015611)	ENSTNIG00000015612	rfc5 (ENSTNIG00000015613)	wsb2 (ENSTNIG00000015614)	ENSTNIG00000015615
Ovalentaria	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183101.b.a ##22
Atherinomorphae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000156724	ENSGT00940000158199	ENSGT00940000163149.a.b.c.b	ENSGT00940000157157.b.a.a	ENSGT00390000014658	ENSGT00950000182975.a.a.b.k	ENSGT00940000169810	ENSGT00940000156880.c.b	ENSGT00940000162727.a.a	ENSGT00940000164473	ENSGT00940000153189.B	ENSGT00940000154043.A.j.a	ENSGT00390000008206	ENSGT00940000160711	ENSGT00390000006265.b.d	ENSGT00950000183101.b.a ##22	ENSGT00940000153899.b.a	ENSGT00940000159368.b	ENSGT01020000230354.B.b.a.b	ENSGT00390000005653	ENSGT00940000155845.s	ENSGT00390000017221	ENSGT00940000158419	ENSGT00390000008031	ENSGT00940000177649	ENSGT00390000006208.b	ENSGT00950000183018.a.c	ENSGT00940000154297.B	ENSGT00940000159357	ENSGT00940000158519	ENSGT00550000075072
Cyprinodontiformes	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000158199	ENSGT00940000163149.a.b.c.b	ENSGT00940000157157.b.a.a	ENSGT00390000014658	ENSGT00950000182975.a.a.b.k	ENSGT00940000169810	ENSGT00940000156880.c.b	ENSGT00940000162727.a.a	ENSGT00940000164473	ENSGT00940000163579	ENSGT00940000154043.A.j.a	ENSGT00390000008206	ENSGT00940000160711	ENSGT00390000006265.b.d	ENSGT00940000167451	ENSGT00950000183101.b.a ##22	ENSGT00940000153899.b.a	ENSGT00940000159368.b	ENSGT01020000230354.B.b.a.b	ENSGT00390000005653	ENSGT00940000155845.s	ENSGT00390000017221	ENSGT00940000158419	ENSGT00390000008031	ENSGT00940000177649	ENSGT00390000006208.b	ENSGT00950000183018.a.c	ENSGT00940000154297.B	ENSGT00940000159357	ENSGT00940000158519	ENSGT00550000075072
Cyprinodontoidei	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000163149.a.b.c.b	ENSGT00940000157157.b.a.a	ENSGT00390000014658	ENSGT00950000182975.a.a.b.k	ENSGT00940000171543	ENSGT00940000156880.c.b	ENSGT00940000163466.g.b	ENSGT00940000162727.a.a	ENSGT00940000164473	ENSGT00940000153189.B	ENSGT00940000154043.A.j.a	ENSGT00390000008206	ENSGT00940000160711	ENSGT00390000006265.b.d	ENSGT00940000167451	ENSGT00950000183101.b.a ##22	ENSGT00940000153899.b.a	ENSGT00940000159368.b	ENSGT01020000230354.B.b.a.b	ENSGT00390000005653	ENSGT00940000155845.s	ENSGT00390000017221	ENSGT00940000158419	ENSGT00390000008031	ENSGT00940000177649	ENSGT00390000006208.b	ENSGT00950000183018.a.c	ENSGT00940000173122	ENSGT00940000159357	ENSGT00940000158519	ENSGT00550000075072
Poeciliinae	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000158199	ENSGT00940000163149.a.b.c.b	ENSGT00940000157157.b.a.a	ENSGT00390000014658	ENSGT00950000182975.a.a.b.k	ENSGT00940000156880.c.b	ENSGT00940000163466.g.b	ENSGT00940000162727.a.a	ENSGT00940000164473	ENSGT00940000153189.B	ENSGT00940000154043.A.j.a	ENSGT00390000008206	ENSGT00940000160711	ENSGT00390000006265.b.d	ENSGT00940000167451	ENSGT00950000183101.b.a ##22	ENSGT00940000153899.b.a	ENSGT00940000159368.b	ENSGT01020000230354.B.b.a.b	ENSGT00390000005653	ENSGT00940000155845.s	ENSGT00390000017221	ENSGT00940000158419	ENSGT00390000008031	ENSGT00940000177649	ENSGT00390000006208.b	ENSGT00950000183018.a.c	ENSGT00940000173122	ENSGT00940000159357	ENSGT00940000158519	ENSGT00550000075072
Poecilia	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000156724	ENSGT00940000158199	ENSGT00940000163149.a.b.c.b	ENSGT00940000157157.b.a.a	ENSGT00390000014658	ENSGT00950000182975.a.a.b.k	ENSGT00940000156880.c.b	ENSGT00940000163466.g.b	ENSGT00940000162727.a.a	ENSGT00940000164473	ENSGT00940000153189.B	ENSGT00940000154043.A.j.a	ENSGT00390000008206	ENSGT00940000160711	ENSGT00390000006265.b.d	ENSGT00950000183101.b.a ##22	ENSGT00940000153899.b.a	ENSGT00940000159368.b	ENSGT01020000230354.B.b.a.b	ENSGT00390000005653	ENSGT00940000155845.s	ENSGT00390000017221	ENSGT00940000158419	ENSGT00390000008031	ENSGT00940000177649.a	ENSGT00390000006208.b	ENSGT00950000183018.a.c	ENSGT00940000173122	ENSGT00940000159357	ENSGT00940000158519	ENSGT00550000075072
NAME_6	ANCESTRAL SPECIES	140														ENSGT00940000160711	ENSGT00390000006265.b.d	ENSGT00950000183101.b.a ##22	ENSGT00940000153899.b.a	ENSGT00940000159368.b	ENSGT01020000230354.B.b.a.b	ENSGT00390000005653	ENSGT00940000155845.s	ENSGT00390000017221	ENSGT00940000158419	ENSGT00390000008031	ENSGT00940000177649.a	ENSGT00390000006208.b	ENSGT00950000183018.a.c	ENSGT00940000173122	ENSGT00940000159357	ENSGT00940000158519	ENSGT00550000075072
Amazon molly	MODERN SPECIES	272														rtn4r (ENSPFOG00000015819)	ENSPFOG00000015768	SCARF2 (ENSPFOG00000015698) ##22	zgc:112294 (ENSPFOG00000015683)	CABP7 (ENSPFOG00000015665)	nf2a (ENSPFOG00000015614)	FBXO21 (ENSPFOG00000015571)	tesca (ENSPFOG00000015541)	fbxw8 (ENSPFOG00000015504)	rnft2 (ENSPFOG00000015456)	spring1 (ENSPFOG00000015419)	CASTOR1 (ENSPFOG00000015348)	nipsnap1 (ENSPFOG00000015296)	nos1 (ENSPFOG00000015102)	KSR2 (ENSPFOG00000014927)	rfc5 (ENSPFOG00000014886)	wsb2 (ENSPFOG00000014858)	VSIG10 (ENSPFOG00000014836)
Guppy	MODERN SPECIES	461	inpp5e (ENSPREG00000006615)	ENSPREG00000006591	notch1b (ENSPREG00000006544)	ubac1 (ENSPREG00000006498)	camsap1b (ENSPREG00000006423)	ENSPREG00000006393	KCNT1 (ENSPREG00000005813)	ENSPREG00000005634	zgc:101858 (ENSPREG00000005620)	ppil3 (ENSPREG00000005601)	LRRC8A (ENSPREG00000005590)	hscb (ENSPREG00000005564)	rtn4r (ENSPREG00000005551)	ENSPREG00000005531	ENSPREG00000005518	ENSPREG00000005462 ##22	zgc:112294 (ENSPREG00000005438)	CABP7 (ENSPREG00000005417)	FBXO21 (ENSPREG00000005361)	tesca (ENSPREG00000005327)	fbxw8 (ENSPREG00000005291)	rnft2 (ENSPREG00000005244)	spring1 (ENSPREG00000005209)	ENSPREG00000005189	ENSPREG00000005181	CASTOR1 (ENSPREG00000005139)	nipsnap1 (ENSPREG00000005115)	nos1 (ENSPREG00000004934)	KSR2 (ENSPREG00000004818)	rfc5 (ENSPREG00000004775)	wsb2 (ENSPREG00000004736)
Aplocheiloidei	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000158199	ENSGT00940000163149.a.b.c.b	ENSGT00940000157157.b.a.a	ENSGT00390000014658	ENSGT00950000182975.a.a.b.k	ENSGT00940000169810	ENSGT00940000156880.c.b	ENSGT00940000162727.a.a	ENSGT00940000164473	ENSGT00940000163579	ENSGT00940000154043.A.j.a	ENSGT00390000008206	ENSGT00940000160711	ENSGT00390000006265.b.d	ENSGT00940000167451	ENSGT00950000183101.b.a ##22	ENSGT00940000153899.b.a	ENSGT00940000159368.b	ENSGT01020000230354.B.b.a.b	ENSGT00390000005653	ENSGT00940000155845.s	ENSGT00390000017221	ENSGT00940000158419	ENSGT00390000008031	ENSGT00940000177649	ENSGT00390000006208.b	ENSGT00950000183018.a.c	ENSGT00940000154297.B	ENSGT00940000159357	ENSGT00940000158519	ENSGT00550000075072
Mangrove rivulus	MODERN SPECIES	241														rtn4r (ENSKMAG00000008979)	ENSKMAG00000008947	SCARF2 (ENSKMAG00000008910) ##22	zgc:112294 (ENSKMAG00000008897)	CABP7 (ENSKMAG00000008865)	nf2a (ENSKMAG00000008808)	FBXO21 (ENSKMAG00000008758)	tesca (ENSKMAG00000008749)	fbxw8 (ENSKMAG00000008723)	rnft2 (ENSKMAG00000008687)	spring1 (ENSKMAG00000008660)	ENSKMAG00000008643	CASTOR1 (ENSKMAG00000008606)	nipsnap1 (ENSKMAG00000008556)	LRRC74B (ENSKMAG00000008534)	nos1 (ENSKMAG00000008323)
Oryzias	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000158199	ENSGT00940000163149.a.b.c.b	ENSGT00940000157157.b.a.a	ENSGT00390000014658	ENSGT00950000182975.a.a.b.k	ENSGT00940000156880.c.b	ENSGT00940000155199.p	ENSGT00940000167622.b	ENSGT00940000162727.a.a	ENSGT00940000164473	ENSGT00940000153189.B	ENSGT00940000154043.A.j.a	ENSGT00390000008206	ENSGT00940000160711	ENSGT00390000006265.b.d	ENSGT00950000183101.b.a ##22	ENSGT00940000153899.b.a	ENSGT00940000159368.b	ENSGT01020000230354.B.b.a.b	ENSGT00390000005653	ENSGT00940000155845.s	ENSGT00390000017221.c	ENSGT00940000158419	ENSGT00390000008031	ENSGT00390000006208.b	ENSGT00950000183018.a.c	ENSGT00940000159357	ENSGT00940000158519	ENSGT00550000075072	ENSGT00890000139406.b	ENSGT00940000159876
Oryzias_b	ANCESTRAL SPECIES	6								ENSGT00940000167622.b	ENSGT00940000162727.a.a	ENSGT00940000164473	ENSGT00940000153189.B	ENSGT00940000154043.A.j.a	ENSGT00390000008206	ENSGT00940000160711	ENSGT00390000006265.b.d	ENSGT00950000183101.b.a ##22	ENSGT00940000153899.b.a	ENSGT00940000159368.b	ENSGT01020000230354.B.b.a.b	ENSGT00390000005653	ENSGT00940000155845.s	ENSGT00390000017221.c	ENSGT00940000158419	ENSGT00390000008031	ENSGT00390000006208.b	ENSGT00950000183018.a.c	ENSGT00940000159357	ENSGT00940000158519	ENSGT00550000075072	ENSGT00890000139406.b	ENSGT00940000159876
Indian medaka	MODERN SPECIES	11	PPEF2 (ENSOMEG00000010931)	scarb2a (ENSOMEG00000010984)	ENSOMEG00000011029	CCNG2 (ENSOMEG00000011063)	RAB27B (ENSOMEG00000011093)	poli (ENSOMEG00000011149)	ENSOMEG00000011174	ENSOMEG00000011196	zgc:101858 (ENSOMEG00000011224)	PPIL3 (ENSOMEG00000011263)	LRRC8A (ENSOMEG00000011279)	hscb (ENSOMEG00000011302)	ENSOMEG00000011312	rtn4r (ENSOMEG00000011325)	ENSOMEG00000011375	SCARF2 (ENSOMEG00000011403) ##22	zgc:112294 (ENSOMEG00000011422)	CABP7 (ENSOMEG00000011440)	nf2a (ENSOMEG00000011488)	FBXO21 (ENSOMEG00000000757)	tesca (ENSOMEG00000011554)	fbxw8 (ENSOMEG00000011577)	rnft2 (ENSOMEG00000011618)	spring1 (ENSOMEG00000011661)	CASTOR1 (ENSOMEG00000011701)	nipsnap1 (ENSOMEG00000011729)	nos1 (ENSOMEG00000011900)	KSR2 (ENSOMEG00000012031)	rfc5 (ENSOMEG00000012118)	wsb2 (ENSOMEG00000012087)	ENSOMEG00000012141
Javanese ricefish	MODERN SPECIES	23	CNNM4 (ENSOJAG00000004395)	ENSOJAG00000004431	ENSOJAG00000004449	h2az2b (ENSOJAG00000004467)	purbb (ENSOJAG00000004556)	hs3st1l2 (ENSOJAG00000004561)	ENSOJAG00000004568	ENSOJAG00000004613	camk2b1 (ENSOJAG00000004833)	ENSOJAG00000005691	zgc:101858 (ENSOJAG00000005977)	LRRC8A (ENSOJAG00000005993)	hscb (ENSOJAG00000006020)	rtn4r (ENSOJAG00000006127)	ENSOJAG00000006142	SCARF2 (ENSOJAG00000006221) ##22	zgc:112294 (ENSOJAG00000006303)	CABP7 (ENSOJAG00000006336)	nf2a (ENSOJAG00000006383)	FBXO21 (ENSOJAG00000006617)	tesca (ENSOJAG00000006654)	fbxw8 (ENSOJAG00000006729)	rnft2 (ENSOJAG00000006826)	spring1 (ENSOJAG00000006894)	CASTOR1 (ENSOJAG00000006913)	nipsnap1 (ENSOJAG00000007038)	nos1 (ENSOJAG00000007559)	KSR2 (ENSOJAG00000010766)	rfc5 (ENSOJAG00000010815)	wsb2 (ENSOJAG00000010898)	ENSOJAG00000010919
Oryzias_a	ANCESTRAL SPECIES	67	ENSGT00940000156724	ENSGT00940000158199	ENSGT00940000163149.a.b.c.b	ENSGT00940000157157.b.a.a	ENSGT00390000014658	ENSGT00950000182975.a.a.b.k	ENSGT00940000156880.c.b	ENSGT00940000155199.p	ENSGT00940000162448	ENSGT00940000164473	ENSGT00940000153189.B	ENSGT00940000154043.A.j.a	ENSGT00390000008206	ENSGT00940000160711	ENSGT00390000006265.b.d	ENSGT00950000183101.b.a ##22	ENSGT00940000153899.b.a	ENSGT00940000159368.b	ENSGT01020000230354.B.b.a.b	ENSGT00390000005653	ENSGT00940000155845.s	ENSGT00390000017221.c	ENSGT00940000158419	ENSGT00390000008031	ENSGT00390000006208.b	ENSGT00950000183018.a.c	ENSGT00940000159357	ENSGT00940000158519	ENSGT00550000075072	ENSGT00890000139406.b	ENSGT00940000159876
Chinese medaka	MODERN SPECIES	217								ENSOSIG00000021114	zgc:101858 (ENSOSIG00000021112)	PPIL3 (ENSOSIG00000021111)	ENSOSIG00000021108	hscb (ENSOSIG00000021107)	ENSOSIG00000021105	rtn4r (ENSOSIG00000021104)	ENSOSIG00000021098	SCARF2 (ENSOSIG00000021088) ##22	zgc:112294 (ENSOSIG00000021083)	ENSOSIG00000021082	CABP7 (ENSOSIG00000021079)	nf2a (ENSOSIG00000021069)	FBXO21 (ENSOSIG00000021040)	tesca (ENSOSIG00000021016)	fbxw8 (ENSOSIG00000021013)	rnft2 (ENSOSIG00000021004)	CASTOR1 (ENSOSIG00000020989)	nipsnap1 (ENSOSIG00000020985)	nos1 (ENSOSIG00000018137)	KSR2 (ENSOSIG00000017894)	rfc5 (ENSOSIG00000017743)	wsb2 (ENSOSIG00000017731)	ENSOSIG00000017727
Japanese Medaka HdrR	MODERN SPECIES	23	ENSORLG00000000560	notch1b (ENSORLG00000000636)	ubac1 (ENSORLG00000000672)	camsap1b (ENSORLG00000000683)	KCNT1 (ENSORLG00000000733)	ENSORLG00000024131	ENSORLG00000014468	ENSORLG00000000741	ENSORLG00000028519	zgc:101858 (ENSORLG00000000791)	PPIL3 (ENSORLG00000000798)	ENSORLG00000000805	hscb (ENSORLG00000000816)	rtn4r (ENSORLG00000029641)	ENSORLG00000000830	SCARF2 (ENSORLG00000000843) ##22	zgc:112294 (ENSORLG00000000848)	ENSORLG00000000855	ENSORLG00000025260	nf2a (ENSORLG00000000897)	FBXO21 (ENSORLG00000000914)	tesca (ENSORLG00000000922)	fbxw8 (ENSORLG00000000928)	rnft2 (ENSORLG00000000944)	spring1 (ENSORLG00000000953)	CASTOR1 (ENSORLG00000000978)	nipsnap1 (ENSORLG00000001000)	nos1 (ENSORLG00000001050)	KSR2 (ENSORLG00000001059)	rfc5 (ENSORLG00000001071)	wsb2 (ENSORLG00000001084)
Ovalentaria_B	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183101.b.a ##22
Pomacentridae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183101.b.a ##22
Pomacentridae_A	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183101.b.a ##22
Amphiprion	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000156724	ENSGT00940000158199	ENSGT00940000163149.a.b.c.b	ENSGT00940000157157.b.a.a	ENSGT00390000014658	ENSGT00950000182975.a.a.b.k	ENSGT00940000156880.c.b	ENSGT00940000162727.a.a	ENSGT00940000164473	ENSGT00940000163579	ENSGT00940000154043.A.j.a	ENSGT00390000008206	ENSGT00940000160711	ENSGT00390000006265.b.d	ENSGT00940000167451	ENSGT00950000183101.b.a ##22	ENSGT00940000153899.b.a	ENSGT00940000159368.b	ENSGT01020000230354.B.b.a.b	ENSGT00390000005653	ENSGT00940000155845.s	ENSGT00390000017221	ENSGT00940000158419	ENSGT00390000008031	ENSGT00390000006208.b	ENSGT00950000183018.a.c	ENSGT00940000154297.B	ENSGT00940000159357	ENSGT00940000158519	ENSGT00550000075072	ENSGT00890000139406.b
Orange clownfish	MODERN SPECIES	19	pmpca (ENSAPEG00000009521)	inpp5e (ENSAPEG00000009581)	ENSAPEG00000009592	notch1b (ENSAPEG00000009619)	ubac1 (ENSAPEG00000009753)	camsap1b (ENSAPEG00000009768)	KCNT1 (ENSAPEG00000009839)	ENSAPEG00000009950	col27a1b (ENSAPEG00000009998)	zgc:101858 (ENSAPEG00000010085)	ppil3 (ENSAPEG00000010102)	LRRC8A (ENSAPEG00000010120)	hscb (ENSAPEG00000010132)	rtn4r (ENSAPEG00000010143)	ENSAPEG00000010154	SCARF2 (ENSAPEG00000010205) ##22	zgc:112294 (ENSAPEG00000010293)	CABP7 (ENSAPEG00000010310)	nf2a (ENSAPEG00000010331)	FBXO21 (ENSAPEG00000010440)	tesca (ENSAPEG00000010494)	fbxw8 (ENSAPEG00000010508)	rnft2 (ENSAPEG00000010517)	spring1 (ENSAPEG00000010546)	CASTOR1 (ENSAPEG00000010578)	nipsnap1 (ENSAPEG00000010626)	LRRC74B (ENSAPEG00000010654)	nos1 (ENSAPEG00000010750)	KSR2 (ENSAPEG00000010855)	rfc5 (ENSAPEG00000010922)	wsb2 (ENSAPEG00000010979)
Cod	MODERN SPECIES	2	CLIP1 (ENSGMOG00000013838)	ENSGMOG00000030207	ENSGMOG00000031315	ENSGMOG00000001617	ENSGMOG00000001663	ENSGMOG00000035048	ENSGMOG00000033526	zgc:101858 (ENSGMOG00000001791)	ENSGMOG00000001814	ENSGMOG00000001827	hscb (ENSGMOG00000001836)	ENSGMOG00000025831	ENSGMOG00000032287	rtn4r (ENSGMOG00000015478)	ENSGMOG00000015487	ENSGMOG00000015613 ##22	ENSGMOG00000023142	zgc:112294 (ENSGMOG00000002785)	ENSGMOG00000008029	ENSGMOG00000018399	ENSGMOG00000020511	ENSGMOG00000013720	ENSGMOG00000011730	ENSGMOG00000033737	imp4 (ENSGMOG00000013522)	araf (ENSGMOG00000012642)	zgc:64051 (ENSGMOG00000031208)	lman2lb (ENSGMOG00000012637)	ENSGMOG00000023031	tm2d2 (ENSGMOG00000034939)	ENSGMOG00000012656
Osteoglossiformes	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000161539	ENSGT00950000185268	ENSGT00390000010194	ENSGT01020000230351.A	ENSGT00390000002626	ENSGT00950000182923.C.a	ENSGT00940000158190	ENSGT00940000161922	ENSGT00940000160448	ENSGT00500000045140.a.b	ENSGT00940000164243	ENSGT00940000165954	ENSGT00800000124190	ENSGT00390000008206	ENSGT00940000160711.a	ENSGT00950000183101.b.a ##22	ENSGT00940000153899.b.a	ENSGT01020000230354.B.b.a.b	ENSGT00390000005653	ENSGT00940000155845.s	ENSGT00390000017221	ENSGT00940000158419	ENSGT00390000008031	ENSGT00390000006208.b	ENSGT00950000183018.a.c	ENSGT00940000173122	ENSGT00940000154297.B	ENSGT00940000159357	ENSGT00940000158519	ENSGT00550000075072	ENSGT00890000139406.b
Asian bonytongue	MODERN SPECIES	3	CXCR4 (ENSSFOG00015023648)	THSD7B (ENSSFOG00015023651)	hnmt (ENSSFOG00015023662)	ENSSFOG00015028710	ENSSFOG00015027504	rtn4r (ENSSFOG00015017660)	ENSSFOG00015026844	hscb (ENSSFOG00015017691)	chek2 (ENSSFOG00015017747)	gstt2 (ENSSFOG00015017871)	slc2a11b (ENSSFOG00015017888)	si:dkey-98f17.5 (ENSSFOG00015017965)	AIFM3 (ENSSFOG00015017994)	cldn26 (ENSSFOG00015018027)	lztr1 (ENSSFOG00015018046)	SCARF2 (ENSSFOG00015030067) ##22	zgc:112294 (ENSSFOG00015018181)	CABP7 (ENSSFOG00015030874)	ENSSFOG00015029578	nf2a (ENSSFOG00015018228)	FBXO21 (ENSSFOG00015018271)	tesca (ENSSFOG00015018306)	fbxw8 (ENSSFOG00015018319)	rnft2 (ENSSFOG00015018339)	spring1 (ENSSFOG00015018375)	CASTOR1 (ENSSFOG00015018398)	nipsnap1 (ENSSFOG00015018448)	ENSSFOG00015028742	ENSSFOG00015031836	nos1 (ENSSFOG00015018514)	KSR2 (ENSSFOG00015018653)
P. kingsleyae	MODERN SPECIES	244							ubr7 (ENSPKIG00000012157)	si:dkeyp-55f12.3 (ENSPKIG00000012200)	tmem251 (ENSPKIG00000012219)	slc2a11b (ENSPKIG00000012240)	gstt2 (ENSPKIG00000012330)	chek2 (ENSPKIG00000012294)	hscb (ENSPKIG00000012344)	ENSPKIG00000012361	rtn4r (ENSPKIG00000012374)	SCARF2 (ENSPKIG00000012399) ##22	zgc:112294 (ENSPKIG00000012425)	CABP7 (ENSPKIG00000012439)	nf2a (ENSPKIG00000012483)	FBXO21 (ENSPKIG00000012554)	tesca (ENSPKIG00000012583)	fbxw8 (ENSPKIG00000012605)	rnft2 (ENSPKIG00000012630)	spring1 (ENSPKIG00000012659)	ENSPKIG00000012678	CASTOR1 (ENSPKIG00000012702)	nipsnap1 (ENSPKIG00000012750)	LRRC74B (ENSPKIG00000012793)	nos1 (ENSPKIG00000012822)	KSR2 (ENSPKIG00000012876)
Osteoglossocephalai	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183101.b.b ##22
Clupeocephala	ANCESTRAL SPECIES	826															ENSGT00390000006265.b.c	ENSGT00950000183101.b.b ##22
Euteleosteomorpha	ANCESTRAL SPECIES	115	ENSGT00940000155292.db.a.d	ENSGT01100000263502.B.a.b.b	ENSGT00940000158504	ENSGT00950000182993.A.b.f	ENSGT00950000182993.A.b.e	ENSGT00390000015433	ENSGT00800000124150	ENSGT00530000063811.B.b	ENSGT00940000155182.a	ENSGT00940000156383.b	ENSGT00940000156871.p	ENSGT00940000163530	ENSGT00940000156839	ENSGT00950000182923.C.b	ENSGT00390000006265.b.c	ENSGT00950000183101.b.b ##22	ENSGT00390000014052	ENSGT00390000009869	ENSGT00940000159368.a	ENSGT00940000155845.t	ENSGT00420000029890	ENSGT00940000155735.r	ENSGT00940000155882.a.b.b	ENSGT00730000110943.B.d.b
Protacanthopterygii	ANCESTRAL SPECIES	74	ENSGT00940000155292.db.a.d	ENSGT01100000263502.B.a.b.b	ENSGT00940000158504	ENSGT00950000182993.A.b.e	ENSGT00390000015433	ENSGT00800000124150	ENSGT00530000063811.B.b	ENSGT00940000155182.a.c	ENSGT00940000156383.b	ENSGT00940000156871.p	ENSGT00940000163530	ENSGT00390000018351	ENSGT00940000156839	ENSGT00950000182923.C.b	ENSGT00390000006265.b.c	ENSGT00950000183101.b.b ##22	ENSGT00390000014052	ENSGT00390000009869.f	ENSGT00940000159368.a	ENSGT00940000155845.t	ENSGT00420000029890	ENSGT00940000155735.r	ENSGT00940000155882.a.b.b	ENSGT00730000110943.B.d.b
Salmoninae	DUPLICATION
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	73	ENSGT01100000263502.B.a.b.b	ENSGT00940000158504	ENSGT00950000182993.A.b.e.c	ENSGT00390000015433.h	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000004796.d.a	ENSGT00390000016767.r.a	ENSGT00530000063811.B.b.d	ENSGT00940000155182.a.d	ENSGT00940000156383.b.b	ENSGT00940000156871.p.d	ENSGT00940000163530.k.a	ENSGT00940000156839.j.a.a.a	ENSGT00940000160711.h.b	ENSGT00390000006265.b.c.f	ENSGT00950000183101.b.b.a ##22	ENSGT00390000014052.b	ENSGT00390000009869.e	ENSGT00940000159368.a.c	ENSGT00940000155845.t.c	ENSGT00420000029890.c	ENSGT00940000155735.r.a	ENSGT00940000155882.a.b.b.a	ENSGT00940000156599.g.a	ENSGT00940000160709.ab.a.a	ENSGT00950000183143.c.a.i.a	ENSGT00940000156430.b	ENSGT00940000158984.x.a	ENSGT00940000155403.b.c	ENSGT00940000156133.a.b.c	ENSGT00940000156488.a.a.c
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT01100000263502.B.a.b.b	ENSGT00940000158504	ENSGT00950000182993.A.b.e.c	ENSGT00390000015433.h	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000004796.d.a	ENSGT00390000016767.r.a	ENSGT00530000063811.B.b.d	ENSGT00940000155182.a.d	ENSGT00940000156383.b.b	ENSGT00940000156871.p.d	ENSGT00940000163530.k.a	ENSGT00940000156839.j.a.a.a	ENSGT00940000160711.h.b	ENSGT00390000006265.b.c.f	ENSGT00950000183101.b.b.a ##22	ENSGT00390000014052.b	ENSGT00390000009869.e	ENSGT00940000159368.a.c	ENSGT00940000155845.t.c	ENSGT00420000029890.c	ENSGT00940000155735.r.a	ENSGT00940000155882.a.b.b.a	ENSGT00940000156599.g.a	ENSGT00940000160709.ab.a.a	ENSGT00950000183143.c.a.i.a	ENSGT00940000156430.b	ENSGT00940000158984.x.a	ENSGT00940000155403.b.c	ENSGT00940000156133.a.b.c	ENSGT00940000156488.a.a.c
Salmo	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT01100000263502.B.a.b.b	ENSGT00940000158504	ENSGT00950000182993.A.b.e.c	ENSGT00390000015433.h	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000004796.d.a	ENSGT00390000016767.r.a	ENSGT00530000063811.B.b.d	ENSGT00940000155182.a.d	ENSGT00940000156383.b.b	ENSGT00940000156871.p.d	ENSGT00940000163530.k.a	ENSGT00940000156839.j.a.a.a	ENSGT00940000160711.h.b	ENSGT00390000006265.b.c.f	ENSGT00950000183101.b.b.a ##22	ENSGT00390000014052.b	ENSGT00390000009869.e	ENSGT00940000159368.a.c	ENSGT00940000155845.t.c	ENSGT00420000029890.c	ENSGT00940000155735.r.a	ENSGT00940000155882.a.b.b.a	ENSGT00940000156599.g.a	ENSGT00940000160709.ab.a.a	ENSGT00950000183143.c.a.i.a	ENSGT00940000156430.b.g	ENSGT00940000158984.x.a	ENSGT00940000155403.b.c	ENSGT00940000156133.a.b.c	ENSGT00940000156488.a.a.c
Atlantic salmon	MODERN SPECIES		EGFLAM (ENSSSAG00000114100)	gdnf (ENSSSAG00000002112)	WDR70 (ENSSSAG00000002232)	ENSSSAG00000115396	pgam5 (ENSSSAG00000002540)	ENSSSAG00000002555	ENSSSAG00000094785	ENSSSAG00000113795	ENSSSAG00000002757	ENSSSAG00000107446	ENSSSAG00000003903	ENSSSAG00000004530	srsf9 (ENSSSAG00000004540)	ENSSSAG00000004563	ENSSSAG00000004638	ENSSSAG00000005397 ##22	UQCR10 (ENSSSAG00000121536)	zmat5 (ENSSSAG00000005421)	CABP7 (ENSSSAG00000005442)	tescb (ENSSSAG00000097089)	m17 (ENSSSAG00000090891)	ENSSSAG00000088504	HSPB1 (ENSSSAG00000005477)	ENSSSAG00000005501	ENSSSAG00000005560	KCTD10 (ENSSSAG00000005570)	ENSSSAG00000005650	FOXN4 (ENSSSAG00000005861)	ENSSSAG00000005876	SSH1 (ENSSSAG00000099714)	cor1c (ENSSSAG00000005930)
River trout	MODERN SPECIES	15	opn4xa (ENSSTUG00000046836)	EGFLAM (ENSSTUG00000046854)	gdnfa (ENSSTUG00000046858)	WDR70 (ENSSTUG00000046890)	PGAM5 (ENSSTUG00000047186)	ENSSTUG00000047189	FAM222A (ENSSTUG00000047236)	ENSSTUG00000047242	git2b (ENSSTUG00000047303)	ENSSTUG00000048062	triap1 (ENSSTUG00000048728)	srsf9 (ENSSTUG00000048729)	RTN4R (ENSSTUG00000048738)	ENSSTUG00000048757	ENSSTUG00000048891	SCARF2 (ENSSTUG00000048893) ##22	uqcr10 (ENSSTUG00000048901)	zmat5 (ENSSTUG00000048903)	CABP7 (ENSSTUG00000048909)	tescb (ENSSTUG00000048919)	m17 (ENSSTUG00000048926)	ENSSTUG00000048929	hspb15 (ENSSTUG00000048935)	GALNT9 (ENSSTUG00000048940)	ENSSTUG00000048964	kctd10 (ENSSTUG00000048978)	MYO1H (ENSSTUG00000049012)	FOXN4 (ENSSTUG00000049280)	ENSSTUG00000049288	SSH1 (ENSSTUG00000049309)	ENSSTUG00000049445
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT01100000263502.B.a.b.b	ENSGT00940000158504	ENSGT00950000182993.A.b.e.c	ENSGT00390000015433.h	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000004796.d.a	ENSGT00390000016767.r.a	ENSGT00530000063811.B.b.d	ENSGT00940000155182.a.d	ENSGT00940000156383.b.b	ENSGT00940000156871.p.d	ENSGT00940000163530.k.a	ENSGT00940000156839.j.a.a.a	ENSGT00940000160711.h.b	ENSGT00390000006265.b.c.f	ENSGT00950000183101.b.b.a ##22	ENSGT00390000014052.b	ENSGT00390000009869.e	ENSGT00940000159368.a.c	ENSGT00940000155845.t.c	ENSGT00420000029890.c	ENSGT00940000155735.r.a	ENSGT00940000155882.a.b.b.a	ENSGT00940000156599.g.a	ENSGT00940000160709.ab.a.a	ENSGT00950000183143.c.a.i.a	ENSGT00940000156430.b.i	ENSGT00940000158984.x.a	ENSGT00940000155403.b.c	ENSGT00940000156133.a.b.c	ENSGT00940000156488.a.a.c
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT01100000263502.B.a.b.b	ENSGT00940000158504	ENSGT00950000182993.A.b.e.c	ENSGT00390000015433.h	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000004796.d.a	ENSGT00390000016767.r.a	ENSGT00530000063811.B.b.d	ENSGT00940000155182.a.d	ENSGT00940000156383.b.b	ENSGT00940000156871.p.d	ENSGT00940000163530.k.a	ENSGT00940000156839.j.a.a.a	ENSGT00940000160711.h.b	ENSGT00390000006265.b.c.f	ENSGT00950000183101.b.b.a ##22	ENSGT00390000014052.b	ENSGT00390000009869.e	ENSGT00940000159368.a.c	ENSGT00940000155845.t.c	ENSGT00420000029890.c	ENSGT00940000155735.r.a	ENSGT00940000155882.a.b.b.a	ENSGT00940000156599.g.a	ENSGT00940000160709.ab.a.a	ENSGT00950000183143.c.a.i.a	ENSGT00940000156430.b.i	ENSGT00940000158984.x.a	ENSGT00940000155403.b.c	ENSGT00940000156133.a.b.c	ENSGT00940000156488.a.a.c
Coho salmon	MODERN SPECIES	15	EGFLAM (ENSOKIG00005025368)	gdnfa (ENSOKIG00005025394)	WDR70 (ENSOKIG00005025420)	ENSOKIG00005025511	PGAM5 (ENSOKIG00005025522)	ANKLE2 (ENSOKIG00005025533)	FAM222A (ENSOKIG00005025590)	ENSOKIG00005025600	git2b (ENSOKIG00005025913)	ENSOKIG00005032880	triap1 (ENSOKIG00005006102)	srsf9 (ENSOKIG00005006125)	ENSOKIG00005006138	RTN4R (ENSOKIG00005006198)	ENSOKIG00005006273	SCARF2 (ENSOKIG00005006770) ##22	UQCR10 (ENSOKIG00005006786)	zmat5 (ENSOKIG00005006795)	CABP7 (ENSOKIG00005006808)	tescb (ENSOKIG00005006819)	m17 (ENSOKIG00005006839)	ENSOKIG00005006856	hspb15 (ENSOKIG00005006867)	GALNT9 (ENSOKIG00005006877)	ENSOKIG00005006915	KCTD10 (ENSOKIG00005007312)	MYO1H (ENSOKIG00005007371)	FOXN4 (ENSOKIG00005007511)	ENSOKIG00005007558	SSH1 (ENSOKIG00005007619)	ENSOKIG00005007865
Chinook salmon	MODERN SPECIES	12	pdlim5b (ENSOTSG00005038329)	opn4xa (ENSOTSG00005038325)	EGFLAM (ENSOTSG00005038318)	gdnfa (ENSOTSG00005038314)	WDR70 (ENSOTSG00005038161)	ENSOTSG00005038158	PGAM5 (ENSOTSG00005038156)	ENSOTSG00005038153	FAM222A (ENSOTSG00005038150)	git2b (ENSOTSG00005037644)	ENSOTSG00005037265	triap1 (ENSOTSG00005037252)	srsf9 (ENSOTSG00005037251)	RTN4R (ENSOTSG00005037250)	ENSOTSG00005036845	SCARF2 (ENSOTSG00005036839) ##22	zmat5 (ENSOTSG00005036838)	CABP7 (ENSOTSG00005036836)	tescb (ENSOTSG00005036835)	m17 (ENSOTSG00005036832)	ENSOTSG00005036829	hspb15 (ENSOTSG00005036827)	GALNT9 (ENSOTSG00005036821)	ENSOTSG00005036820	kctd10 (ENSOTSG00005036819)	ENSOTSG00005036758	FOXN4 (ENSOTSG00005036752)	ENSOTSG00005036681	SSH1 (ENSOTSG00005036680)	ENSOTSG00005036590	tmem119b (ENSOTSG00005036589)
Rainbow trout	MODERN SPECIES	26	ENSOMYG00000053593	WDR70 (ENSOMYG00000044352)	ENSOMYG00000044341	ENSOMYG00000044335	ENSOMYG00000044332	ENSOMYG00000044329	ENSOMYG00000037562	ENSOMYG00000033471	ENSOMYG00000032967	srsf9 (ENSOMYG00000032957)	ENSOMYG00000055307	ENSOMYG00000032935	ENSOMYG00000047946	ENSOMYG00000031980	ENSOMYG00000057742	ENSOMYG00000031707 ##22	ENSOMYG00000031681	zmat5 (ENSOMYG00000031675)	ENSOMYG00000031666	ENSOMYG00000061745	tescb (ENSOMYG00000031626)	ENSOMYG00000051770	m17 (ENSOMYG00000031591)	ENSOMYG00000031571	ENSOMYG00000031559	ENSOMYG00000050516	ENSOMYG00000031495	ENSOMYG00000057997	ENSOMYG00000031447	KCTD10 (ENSOMYG00000031413)	ENSOMYG00000030933
Huchen	MODERN SPECIES	624															ENSHHUG00000042947	SCARF2 (ENSHHUG00000042937) ##22	uqcr10 (ENSHHUG00000042930)	zmat5 (ENSHHUG00000042928)	CABP7 (ENSHHUG00000042927)	tescb (ENSHHUG00000042912)	m17 (ENSHHUG00000042910)	ENSHHUG00000042908	hspb15 (ENSHHUG00000042907)	GALNT9 (ENSHHUG00000042844)	ENSHHUG00000042839	ENSHHUG00000042805	kctd10 (ENSHHUG00000042778)	MYO1H (ENSHHUG00000042724)	FOXN4 (ENSHHUG00000042706)	ENSHHUG00000042557	SSH1 (ENSHHUG00000042538)
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	12														ENSGT00940000160711.h.a	ENSGT00390000006265.b.c.e	ENSGT00950000183101.b.b.b ##22	ENSGT00390000014052.a	ENSGT00390000009869.f	ENSGT00940000159368.a.d	ENSGT00940000155845.t.d	ENSGT00420000029890.d	ENSGT00940000155735.r.b	ENSGT00940000155882.a.b.b.b	ENSGT00730000110943.B.d.b	ENSGT00940000156599.g.b	ENSGT00940000160709.ab.a.b	ENSGT00390000006114	ENSGT00940000166058	ENSGT00950000183143.c.a.i.b	ENSGT00940000171590.a.b	ENSGT00940000158984.x.b
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00940000155292.db.b.b.b	ENSGT01100000263502.B.a.b.a.d	ENSGT00950000182993.A.b.e.d	ENSGT00390000015433.g.a.a	ENSGT00390000004796.d.b	ENSGT00390000016767.r.b	ENSGT00530000063811.B.b.c	ENSGT00940000155182.a.c	ENSGT00940000156383.b.a	ENSGT00940000156871.p.c	ENSGT00940000163530.k.b	ENSGT00940000156839.j.a.a.b	ENSGT00950000182923.C.b	ENSGT00940000160711.h.a	ENSGT00390000006265.b.c.e	ENSGT00950000183101.b.b.b ##22	ENSGT00390000014052.a	ENSGT00390000009869.f	ENSGT00940000159368.a.d	ENSGT00940000155845.t.d	ENSGT00420000029890.d	ENSGT00940000155735.r.b	ENSGT00940000155882.a.b.b.b	ENSGT00730000110943.B.d.b	ENSGT00940000156599.g.b	ENSGT00940000160709.ab.a.b	ENSGT00390000006114	ENSGT00940000166058	ENSGT00950000183143.c.a.i.b	ENSGT00940000158984.x.b	ENSGT00940000155403.b.d
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00950000182993.A.b.e.d	ENSGT00390000015433.g.a.a	ENSGT00390000004796.d.b	ENSGT00390000016767.r.b	ENSGT00530000063811.B.b.c	ENSGT00940000155182.a.c	ENSGT00940000156383.b.a	ENSGT00940000156871.p.c	ENSGT00940000163530.k.b	ENSGT00940000156839.j.a.b	ENSGT00940000163530.l.a	ENSGT00940000156839.j.a.a.b	ENSGT00950000182923.C.b	ENSGT00940000160711.h.a	ENSGT00390000006265.b.c.e	ENSGT00950000183101.b.b.b ##22	ENSGT00390000014052.a	ENSGT00390000009869.f	ENSGT00940000159368.a.d	ENSGT00940000155845.t.d	ENSGT00420000029890.d	ENSGT00940000155735.r.b	ENSGT00940000155882.a.b.b.b	ENSGT00730000110943.B.d.b	ENSGT00940000156599.g.b	ENSGT00940000160709.ab.a.b	ENSGT00390000006114	ENSGT00940000166058	ENSGT00950000183143.c.a.i.b	ENSGT00940000156430.b.h	ENSGT00940000158984.x.b
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	4	opn4xa (ENSSSAG00000054324)	gdnfa (ENSSSAG00000098062)	ENSSSAG00000093882	ENSSSAG00000054318	ENSSSAG00000054309	ENSSSAG00000087649	ENSSSAG00000054301	ENSSSAG00000010075	ENSSSAG00000006783	ENSSSAG00000119571	ENSSSAG00000083144	srsf9 (ENSSSAG00000080065)	ENSSSAG00000080063	ENSSSAG00000080050	ENSSSAG00000080013	ENSSSAG00000120649 ##22	zmat5 (ENSSSAG00000080002)	ENSSSAG00000100827	m17 (ENSSSAG00000086976)	tescb (ENSSSAG00000094208)	ENSSSAG00000090746	ENSSSAG00000106720	ENSSSAG00000112402	ENSSSAG00000079945	ENSSSAG00000079924	ENSSSAG00000079914	ENSSSAG00000111935	foxred1 (ENSSSAG00000079816)	ENSSSAG00000079794	ENSSSAG00000079786	ENSSSAG00000079776
River trout	MODERN SPECIES	6	bmpr1bb (ENSSTUG00000011743)	pdlim5b (ENSSTUG00000011721)	opn4xa (ENSSTUG00000011711)	gdnfa (ENSSTUG00000011702)	PGAM5 (ENSSTUG00000011683)	ENSSTUG00000011655	FAM222A (ENSSTUG00000011650)	ENSSTUG00000011640	git2b (ENSSTUG00000007930)	ENSSTUG00000005472	triap1 (ENSSTUG00000005359)	srsf9 (ENSSTUG00000005329)	GAL3ST1 (ENSSTUG00000005322)	ENSSTUG00000005316	ENSSTUG00000004956	SCARF2 (ENSSTUG00000004919) ##22	uqcr10 (ENSSTUG00000004911)	zmat5 (ENSSTUG00000004882)	CABP7 (ENSSTUG00000004872)	tescb (ENSSTUG00000004853)	m17 (ENSSTUG00000004844)	ENSSTUG00000004832	ENSSTUG00000004818	SUSD2 (ENSSTUG00000004535)	GALNT9 (ENSSTUG00000004491)	ENSSTUG00000004461	foxred1 (ENSSTUG00000003447)	cry5 (ENSSTUG00000003353)	kctd10 (ENSSTUG00000003289)	ENSSTUG00000003270	FOXN4 (ENSSTUG00000003233)
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000156896.d	ENSGT00950000182815.a.a.a.a.a.c.d	ENSGT00940000155919.b.b.b	ENSGT00940000155292.db.b.b.b	ENSGT01100000263502.B.a.b.a.d	ENSGT00950000182993.A.b.e.d	ENSGT00530000063811.B.b.c	ENSGT00940000155182.a.c	ENSGT00940000156383.b.a	ENSGT00940000156871.p.c	ENSGT00940000163530.k.b	ENSGT00940000156839.j.a.a.b	ENSGT00950000182923.C.b	ENSGT00940000160711.h.a	ENSGT00390000006265.b.c.e	ENSGT00950000183101.b.b.b ##22	ENSGT00390000014052.a	ENSGT00390000009869.f	ENSGT00940000159368.a.d	ENSGT00940000155845.t.d	ENSGT01100000263526.A.b.b.a.b.a.a.a.a.a.a.b.a.a.a.a.a.b	ENSGT00420000029890.d	ENSGT00940000155735.r.b	ENSGT00940000155882.a.b.b.b	ENSGT00730000110943.B.d.b	ENSGT00940000156599.g.b	ENSGT00940000160709.ab.a.b	ENSGT00390000006114	ENSGT00940000166058	ENSGT00950000183143.c.a.i.b	ENSGT00940000156430.b.j
Rainbow trout	MODERN SPECIES	3	pdlim5b (ENSOMYG00000028740)	opn4xa (ENSOMYG00000028749)	gdnfa (ENSOMYG00000028767)	ENSOMYG00000028796	gltp (ENSOMYG00000028810)	ENSOMYG00000029158	ENSOMYG00000052206	ENSOMYG00000030717	ENSOMYG00000033423	srsf9 (ENSOMYG00000033438)	ENSOMYG00000066280	ENSOMYG00000033449	ENSOMYG00000061995	ENSOMYG00000033456	ENSOMYG00000033570	ENSOMYG00000033804 ##22	ENSOMYG00000033813	ENSOMYG00000033830	ENSOMYG00000014704	tescb (ENSOMYG00000033844)	ENSOMYG00000033862	m17 (ENSOMYG00000033868)	ENSOMYG00000033874	ENSOMYG00000033886	ENSOMYG00000033932	ENSOMYG00000073679	ENSOMYG00000034275	ENSOMYG00000034285	ENSOMYG00000034336	ENSOMYG00000034621	ENSOMYG00000034634
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000156896.d	ENSGT00950000182815.a.a.a.a.a.c.d	ENSGT00940000155919.b.b.b	ENSGT00940000155292.db.b.b.b	ENSGT01100000263502.B.a.b.a.d	ENSGT00950000182993.A.b.e.d	ENSGT00530000063811.B.b.c	ENSGT00940000155182.a.c	ENSGT00940000156383.b.a	ENSGT00940000156871.p.c	ENSGT00940000163530.k.b	ENSGT00940000156839.j.a.a.b	ENSGT00950000182923.C.b	ENSGT00940000160711.h.a	ENSGT00390000006265.b.c.e	ENSGT00950000183101.b.b.b ##22	ENSGT00390000014052.a	ENSGT00390000009869.f	ENSGT00940000159368.a.d	ENSGT00940000155845.t.d	ENSGT01100000263526.A.b.b.a.b.a.a.a.a.a.a.b.a.a.a.a.a.b	ENSGT00420000029890.d	ENSGT00940000155735.r.b	ENSGT00940000155882.a.b.b.b	ENSGT00730000110943.B.d.b	ENSGT00940000156599.g.b	ENSGT00940000160709.ab.a.b	ENSGT00390000006114	ENSGT00940000166058	ENSGT00950000183143.c.a.i.b	ENSGT00940000156430.b.j
Coho salmon	MODERN SPECIES	26	bmpr1bb (ENSOKIG00005000475)	pdlim5b (ENSOKIG00005000574)	opn4xa (ENSOKIG00005000598)	gdnfa (ENSOKIG00005000606)	FAM222A (ENSOKIG00005000613)	ENSOKIG00005000617	ENSOKIG00005000729	ENSOKIG00005001029	ENSOKIG00005001127	srsf9 (ENSOKIG00005001135)	GAL3ST1 (ENSOKIG00005001146)	ENSOKIG00005001152	ENSOKIG00005001156	ENSOKIG00005001159	ENSOKIG00005001193	SCARF2 (ENSOKIG00005001285) ##22	uqcr10 (ENSOKIG00005001292)	zmat5 (ENSOKIG00005001298)	CABP7 (ENSOKIG00005001302)	tescb (ENSOKIG00005001307)	m17 (ENSOKIG00005001317)	ENSOKIG00005001319	ENSOKIG00005001325	ENSOKIG00005001338	GALNT9 (ENSOKIG00005001365)	ENSOKIG00005001372	ENSOKIG00005001375	foxred1 (ENSOKIG00005001411)	cry5 (ENSOKIG00005001528)	KCTD10 (ENSOKIG00005001537)	ENSOKIG00005001544
Huchen	MODERN SPECIES	1633													ENSHHUG00000046610	RTN4R (ENSHHUG00000046611)	ENSHHUG00000046622	SCARF2 (ENSHHUG00000046716) ##22	uqcr10 (ENSHHUG00000046724)
Northern pike	MODERN SPECIES	13	ENSELUG00000022587	ENSELUG00000030270	PGAM5 (ENSELUG00000022185)	ENSELUG00000022120	ENSELUG00000022033	FAM222A (ENSELUG00000022046)	ENSELUG00000022023	git2b (ENSELUG00000021986)	ENSELUG00000021787	triap1 (ENSELUG00000021682)	srsf9 (ENSELUG00000021669)	GAL3ST1 (ENSELUG00000021654)	ENSELUG00000033931	RTN4R (ENSELUG00000001554)	ENSELUG00000021630	SCARF2 (ENSELUG00000021601) ##22	UQCR10 (ENSELUG00000024693)	zmat5 (ENSELUG00000000943)	CABP7 (ENSELUG00000021535)	tescb (ENSELUG00000021520)	m17 (ENSELUG00000021500)	ENSELUG00000021471	hspb15 (ENSELUG00000021439)	SUSD2 (ENSELUG00000021432)	GALNT9 (ENSELUG00000021416)	ENSELUG00000021354	kctd10 (ENSELUG00000021327)	ENSELUG00000021290	FOXN4 (ENSELUG00000034525)	ENSELUG00000021233	SSH1 (ENSELUG00000021186)
Acanthomorphata	ANCESTRAL SPECIES	33	ENSGT00940000156896	ENSGT00950000182815.a.a.a.a.a.c	ENSGT00940000155919.b.b	ENSGT00940000155292.db.b.a	ENSGT01100000263502.B.a.b.a	ENSGT00950000182993.A.b.e	ENSGT00390000015433	ENSGT00800000124150	ENSGT00530000063811.B.b	ENSGT00940000155182.a	ENSGT00940000156383.b	ENSGT00940000156871.p	ENSGT00940000156839	ENSGT00950000182923.C.b	ENSGT00390000006265.b.c	ENSGT00950000183101.b.b ##22	ENSGT00390000014052	ENSGT00390000009869	ENSGT00940000159368.a	ENSGT00940000155845.t	ENSGT00420000029890	ENSGT00940000155735.r	ENSGT00940000155882.a.b.b	ENSGT00730000110943.B.d.b	ENSGT00940000156430.b	ENSGT00940000155403.b	ENSGT00940000156133.a.b	ENSGT00940000156488.a.a	ENSGT01030000234989.a	ENSGT00940000170719	ENSGT00390000017134
Cod	MODERN SPECIES	17	ENSGMOG00000028966	pip5k1ba (ENSGMOG00000010074)	ENSGMOG00000010084	ENSGMOG00000025430	ENSGMOG00000010122	ENSGMOG00000010144	ENSGMOG00000010164	ENSGMOG00000010182	ENSGMOG00000010203	ENSGMOG00000010211	ENSGMOG00000009254	ENSGMOG00000031465	ENSGMOG00000010224	ENSGMOG00000010241	ENSGMOG00000020523	ENSGMOG00000035121 ##22	UQCR10 (ENSGMOG00000012160)	zmat5 (ENSGMOG00000012163)	CABP7 (ENSGMOG00000034585)	tescb (ENSGMOG00000028081)	m17 (ENSGMOG00000005743)	ENSGMOG00000005749	ENSGMOG00000028276	myhc4 (ENSGMOG00000015700)	ENSGMOG00000026986	ENSGMOG00000024169	ENSGMOG00000036640	ENSGMOG00000025785	ENSGMOG00000029904	ENSGMOG00000024823	ENSGMOG00000026873
Spotted gar	MODERN SPECIES	659	pole (ENSLOCG00000003978)	p2rx2 (ENSLOCG00000003961)	pes (ENSLOCG00000003935)	gal3st1a (ENSLOCG00000003922)	lztr1 (ENSLOCG00000003881)	cldn26 (ENSLOCG00000018143)	AIFM3 (ENSLOCG00000003842)	si:dkey-98f17.5 (ENSLOCG00000003824)	slc2a11b (ENSLOCG00000003814)	gstt2 (ENSLOCG00000003799)	chek2 (ENSLOCG00000003771)	hscb (ENSLOCG00000003759)	rtn4r (ENSLOCG00000003749)	ENSLOCG00000018142	PRODH (ENSLOCG00000003730)	SCARF2 (ENSLOCG00000003698) ##22	zgc:112294 (ENSLOCG00000003686)	zmat5 (ENSLOCG00000003675)	CABP7 (ENSLOCG00000003661)	nf2a (ENSLOCG00000003628)	FBXO21 (ENSLOCG00000003589)	tescb (ENSLOCG00000003578)	fbxw8 (ENSLOCG00000003552)	rnft2 (ENSLOCG00000003534)	spring1 (ENSLOCG00000003526)	CASTOR1 (ENSLOCG00000003511)	nipsnap1 (ENSLOCG00000003492)	ENSLOCG00000003476	nos1 (ENSLOCG00000003433)	KSR2 (ENSLOCG00000003407)	wsb2 (ENSLOCG00000003373)
Reedfish	MODERN SPECIES	9	dcp1b (ENSECRG00000022381)	cacna1c (ENSECRG00000021841)	gpr19 (ENSECRG00000021653)	crebl2 (ENSECRG00000021647)	pes (ENSECRG00000021628)	gal3st1a (ENSECRG00000021621)	lztr1 (ENSECRG00000021573)	cldn26 (ENSECRG00000021549)	AIFM3 (ENSECRG00000021524)	slc2a11b (ENSECRG00000021481)	gstt2 (ENSECRG00000021447)	chek2 (ENSECRG00000021427)	hscb (ENSECRG00000021414)	rtn4r (ENSECRG00000021406)	PRODH (ENSECRG00000021392)	SCARF2 (ENSECRG00000021353) ##22	zgc:112294 (ENSECRG00000021161)	UQCR10 (ENSECRG00000021127)	ZMAT5 (ENSECRG00000021114)	CABP7 (ENSECRG00000021100)	nf2a (ENSECRG00000021068)	FBXO21 (ENSECRG00000021039)	tescb (ENSECRG00000021023)	fbxw8 (ENSECRG00000021004)	rnft2 (ENSECRG00000020982)	spring1 (ENSECRG00000020965)	ENSECRG00000020954	ENSECRG00000020925	nipsnap1 (ENSECRG00000020901)	ENSECRG00000020890	nos1 (ENSECRG00000020549)
Elephant shark	DUPLICATION
Elephant shark	MODERN SPECIES	87																ENSCMIG00000000143 ##22
Elephant shark	MODERN SPECIES	132																ENSCMIG00000000478 ##22
Cyclostomata	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183101 #22
Hagfish	MODERN SPECIES	333								ENSEBUG00000004282	grk3 (ENSEBUG00000006695)	rpl6 (ENSEBUG00000010510)	ENSEBUG00000010318	ENSEBUG00000002386	ENSEBUG00000003284	ENSEBUG00000008650	gpn3 (ENSEBUG00000017030)	ENSEBUG00000004017 #22	ENSEBUG00000006044	ENSEBUG00000004463	ENSEBUG00000007317
Ciona	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183101 #22
Ciona intestinalis	MODERN SPECIES	6	ENSCING00000006571	ENSCING00000020558	ENSCING00000019079	ENSCING00000020275	ENSCING00000018631	ENSCING00000006557	ENSCING00000023891	ENSCING00000006559	ENSCING00000006539	ENSCING00000007417	ENSCING00000018138	ENSCING00000024107	ENSCING00000011608	ENSCING00000007339	ENSCING00000007338	ENSCING00000019335 #22	ENSCING00000011609	ENSCING00000007310	ENSCING00000007420	ENSCING00000011604	ENSCING00000011605	deaf-1 (ENSCING00000007418)	ENSCING00000011606	ENSCING00000007421	ENSCING00000011600	ENSCING00000011601	ENSCING00000011603	ENSCING00000018535	ENSCING00000007429	ENSCING00000018799	ENSCING00000007422