Salmoninae	DUPLICATION
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	162	ENSGT00940000154301.a.a.b	ENSGT00940000159864.i	ENSGT00940000159693.b	ENSGT00940000163547.i	ENSGT00940000166051.c.b	ENSGT00940000165733.c	ENSGT00940000155017.b	ENSGT00940000156598.c.b.f	ENSGT00390000017845.m #15	ENSGT00940000165706 #16	ENSGT00940000157715.b #17	ENSGT00950000182844.a.b.g #18	ENSGT00390000016613.c.e.a.d.b #19	ENSGT00940000157118.c.a.d #20	ENSGT00390000004923.A.c.b.a.a #21	ENSGT00940000166262.d #22	ENSGT00390000009361.e #23	ENSGT00940000165880.b.f	ENSGT01000000216218	ENSGT01060000249387	ENSGT00390000017767.b.b.b.h	ENSGT00940000158613.l.f	ENSGT00390000005318.b.b.b.a.e	ENSGT01030000234567.A.a.a.a.a.a	ENSGT00940000154641.B.b.k.b	ENSGT01100000263652.c	ENSGT00950000182963.a.b	ENSGT00390000018108.b.d	ENSGT00390000018108.a	ENSGT00940000153375.e.b	ENSGT00390000003245.u
Huchen	MODERN SPECIES	1139									syf2 (ENSHHUG00000025419) #15	mgst3b (ENSHHUG00000025393) #16	tmem50a (ENSHHUG00000025372) #17	rhd (ENSHHUG00000025263) #18	maco1b (ENSHHUG00000025248) #19	ldlrap1b (ENSHHUG00000025236) #20	FNDC5 (ENSHHUG00000025229) #21	olig4 (ENSHHUG00000025220) #22	bsdc1 (ENSHHUG00000025055) #23
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000154301.a.a.b	ENSGT00940000159864.i	ENSGT00940000159693.b	ENSGT00940000163547.i	ENSGT00940000166051.c.b	ENSGT00940000165733.c	ENSGT00940000155017.b	ENSGT00940000156598.c.b.f	ENSGT00390000017845.m #15	ENSGT00940000165706 #16	ENSGT00940000157715.b #17	ENSGT00950000182844.a.b.g #18	ENSGT00390000016613.c.e.a.d.b #19	ENSGT00940000157118.c.a.d #20	ENSGT00390000004923.A.c.b.a.a #21	ENSGT00940000166262.d #22	ENSGT00390000009361.e #23	ENSGT00940000165880.b.f	ENSGT01000000216218	ENSGT01060000249387	ENSGT00390000017767.b.b.b.h	ENSGT00940000158613.l.f	ENSGT00390000005318.b.b.b.a.e	ENSGT01030000234567.A.a.a.a.a.a	ENSGT00940000154641.B.b.k.b	ENSGT01100000263652.c	ENSGT00950000182963.a.b.e	ENSGT00390000018108.a	ENSGT00940000153375.e.b	ENSGT00390000003245.u	ENSGT00940000155718.a.c
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000154301.a.a.b	ENSGT00940000159864.i	ENSGT00940000159693.b	ENSGT00940000163547.i	ENSGT00940000166051.c.b	ENSGT00940000165733.c	ENSGT00940000155017.b	ENSGT00940000156598.c.b.f	ENSGT00390000017845.m #15	ENSGT00940000165706 #16	ENSGT00940000157715.b #17	ENSGT00950000182844.a.b.g #18	ENSGT00390000016613.c.e.a.d.b #19	ENSGT00940000157118.c.a.d #20	ENSGT00390000004923.A.c.b.a.a #21	ENSGT00940000166262.d #22	ENSGT00390000009361.e #23	ENSGT00940000165880.b.f	ENSGT01000000216218	ENSGT01060000249387	ENSGT00390000017767.b.b.b.h	ENSGT00940000158613.l.f	ENSGT00390000005318.b.b.b.a.e	ENSGT01030000234567.A.a.a.a.a.a	ENSGT00940000154641.B.b.k.b	ENSGT01100000263652.c	ENSGT00390000018108.a	ENSGT00940000153375.e.b	ENSGT00390000003245.u	ENSGT00940000155718.a.c	ENSGT00390000018895.b.n.a
Rainbow trout	MODERN SPECIES	10	zgc:154055 (ENSOMYG00000032171)	tdh2 (ENSOMYG00000032155)	srrm1 (ENSOMYG00000032114)	clic4 (ENSOMYG00000032077)	ENSOMYG00000067345	runx3 (ENSOMYG00000031993)	syf2 (ENSOMYG00000031876) #15	mgst3b (ENSOMYG00000057234) #16	tmem50a (ENSOMYG00000031814) #17	rhd (ENSOMYG00000031777) #18	ENSOMYG00000059863	maco1b (ENSOMYG00000031751) #19	ENSOMYG00000052015	ldlrap1b (ENSOMYG00000031727) #20	ENSOMYG00000031692 #21	olig4 (ENSOMYG00000031679) #22	bsdc1 (ENSOMYG00000031655) #23	ENSOMYG00000077455	marcksl1a (ENSOMYG00000031584)	ENSOMYG00000058733	ENSOMYG00000060308	ENSOMYG00000031561	ENSOMYG00000031554	ENSOMYG00000031547	mycla (ENSOMYG00000031536)	mfsd2aa (ENSOMYG00000031139)	ENSOMYG00000031034	ENSOMYG00000031027	ENSOMYG00000031019	ENSOMYG00000031015	ENSOMYG00000030542
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000154301.a.a.b	ENSGT00940000159864.i	ENSGT00940000159693.b	ENSGT00940000163547.i	ENSGT00940000166051.c.b	ENSGT00940000165733.c	ENSGT00940000155017.b	ENSGT00940000156598.c.b.f	ENSGT00390000017845.m #15	ENSGT00940000165706 #16	ENSGT00940000157715.b #17	ENSGT00950000182844.a.b.g #18	ENSGT00390000016613.c.e.a.d.b #19	ENSGT00940000157118.c.a.d #20	ENSGT00390000004923.A.c.b.a.a #21	ENSGT00940000166262.d #22	ENSGT00390000009361.e #23	ENSGT00940000165880.b.f	ENSGT01000000216218	ENSGT01060000249387	ENSGT00390000017767.b.b.b.h	ENSGT00940000158613.l.f	ENSGT00390000005318.b.b.b.a.e	ENSGT01030000234567.A.a.a.a.a.a	ENSGT00940000154641.B.b.k.b	ENSGT01100000263652.c	ENSGT00390000018108.a	ENSGT00940000153375.e.b	ENSGT00390000003245.u	ENSGT00940000155718.a.c	ENSGT00390000018895.b.n.a
Chinook salmon	MODERN SPECIES	2	dnajc5ga (ENSOTSG00005008993)	uts1 (ENSOTSG00005008992)	mpv17 (ENSOTSG00005008991)	ENSOTSG00005008989	slc30a2 (ENSOTSG00005008987)	gtf3c2 (ENSOTSG00005008984)	ENSOTSG00005008983	ENSOTSG00005008981	syf2 (ENSOTSG00005008979) #15	mgst3b (ENSOTSG00005008978) #16	tmem50a (ENSOTSG00005008977) #17	rhd (ENSOTSG00005008956) #18	maco1b (ENSOTSG00005008952) #19	ldlrap1b (ENSOTSG00005008950) #20	FNDC5 (ENSOTSG00005008949) #21	olig4 (ENSOTSG00005008948) #22	bsdc1 (ENSOTSG00005008873) #23	CHRM3 (ENSOTSG00005008867)	CLDN20 (ENSOTSG00005008864)	tfb1m (ENSOTSG00005008863)	ENSOTSG00005008861	TMEM60 (ENSOTSG00005008860)	marcksl1a (ENSOTSG00005008858)	ENSOTSG00005008857	ENSOTSG00005008856	NT5C1A (ENSOTSG00005008854)	mycla (ENSOTSG00005008853)	mfsd2aa (ENSOTSG00005008771)	ENSOTSG00005008766	ENSOTSG00005008763	ENSOTSG00005008762
Coho salmon	MODERN SPECIES	27	ENSOKIG00005022425	zgc:154055 (ENSOKIG00005022389)	tdh2 (ENSOKIG00005022370)	srrm1 (ENSOKIG00005022286)	clic4 (ENSOKIG00005022238)	runx3 (ENSOKIG00005022104)	syf2 (ENSOKIG00005022053) #15	mgst3b (ENSOKIG00005022031) #16	ENSOKIG00005022024	tmem50a (ENSOKIG00005022014) #17	rhd (ENSOKIG00005021971) #18	maco1b (ENSOKIG00005021859) #19	ldlrap1b (ENSOKIG00005021820) #20	FNDC5 (ENSOKIG00005021813) #21	ENSOKIG00005021810	olig4 (ENSOKIG00005021804) #22	bsdc1 (ENSOKIG00005021622) #23	ENSOKIG00005021586	marcksl1a (ENSOKIG00005021576)	ENSOKIG00005021557	ENSOKIG00005021533	ENSOKIG00005021518	NT5C1A (ENSOKIG00005021497)	mycla (ENSOKIG00005021479)	mfsd2aa (ENSOKIG00005021091)	ENSOKIG00005021047	ENSOKIG00005021006	ENSOKIG00005020985	ENSOKIG00005020972	rbbp4 (ENSOKIG00005020257)	ZBTB8OS (ENSOKIG00005020211)
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000154301.a.a.b	ENSGT00940000159864.i	ENSGT00940000159693.b	ENSGT00940000163547.i	ENSGT00940000166051.c.b	ENSGT00940000165733.c	ENSGT00940000155017.b	ENSGT00940000156598.c.b.f	ENSGT00390000017845.m #15	ENSGT00940000165706 #16	ENSGT00940000157715.b #17	ENSGT00950000182844.a.b.g #18	ENSGT00390000016613.c.e.a.d.b #19	ENSGT00940000157118.c.a.d #20	ENSGT00390000004923.A.c.b.a.a #21	ENSGT00940000166262.d #22	ENSGT00390000009361.e #23	ENSGT00940000165880.b.f	ENSGT01000000216218	ENSGT01060000249387	ENSGT00390000017767.b.b.b.h	ENSGT00940000158613.l.f	ENSGT00390000005318.b.b.b.a.e	ENSGT01030000234567.A.a.a.a.a.a	ENSGT00940000154641.B.b.k.b	ENSGT00950000182963.a.b.e	ENSGT00390000018108.a	ENSGT00940000153375.e.b	ENSGT00390000003245.u	ENSGT00940000155718.a.c	ENSGT00390000018895.b.n.a
River trout	MODERN SPECIES	26	tmem54a (ENSSTUG00000022400)	hdac1 (ENSSTUG00000022283)	lck (ENSSTUG00000021927)	ENSSTUG00000021910	zgc:154055 (ENSSTUG00000021772)	tdh2 (ENSSTUG00000021759)	srrm1 (ENSSTUG00000021678)	clic4 (ENSSTUG00000021664)	runx3 (ENSSTUG00000021564)	syf2 (ENSSTUG00000021495) #15	tmem50a (ENSSTUG00000021473) #17	rhd (ENSSTUG00000021453) #18	maco1b (ENSSTUG00000021432) #19	ldlrap1b (ENSSTUG00000021416) #20	FNDC5 (ENSSTUG00000021410) #21	olig4 (ENSSTUG00000021406) #22	bsdc1 (ENSSTUG00000021319) #23	marcksl1a (ENSSTUG00000021299)	ENSSTUG00000021290	ENSSTUG00000021274	ENSSTUG00000021261	NT5C1A (ENSSTUG00000021233)	mycla (ENSSTUG00000021223)	mfsd2aa (ENSSTUG00000020434)	ENSSTUG00000020391	ENSSTUG00000020386	ENSSTUG00000020355	ENSSTUG00000020333	rbbp4 (ENSSTUG00000019708)	zbtb8os (ENSSTUG00000019654)	KHDRBS1 (ENSSTUG00000019583)
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Rainbow trout	MODERN SPECIES	17	tdh2 (ENSOMYG00000043045)	ENSOMYG00000070782	srrm1 (ENSOMYG00000043066)	clic4 (ENSOMYG00000043123)	runx3 (ENSOMYG00000043137)	ENSOMYG00000043174	ENSOMYG00000043178 ##15	ENSOMYG00000069423	ENSOMYG00000062870	tmem50a (ENSOMYG00000043184) ##17	maco1b (ENSOMYG00000043187) ##19	ENSOMYG00000073404	ldlrap1b (ENSOMYG00000043191) ##20	ENSOMYG00000043199	ENSOMYG00000043208 ##21	olig4 (ENSOMYG00000065289) ##22	bsdc1 (ENSOMYG00000043226) ##23	ENSOMYG00000061430	marcksl1a (ENSOMYG00000043236)	ENSOMYG00000071101	ENSOMYG00000043241	ENSOMYG00000043256	mycla (ENSOMYG00000043284)	mfsd2aa (ENSOMYG00000043355)	ENSOMYG00000067165	ENSOMYG00000043558	ENSOMYG00000043573	ENSOMYG00000043616	ENSOMYG00000043779	ENSOMYG00000043788	ENSOMYG00000043794
Huchen	MODERN SPECIES	62													ENSHHUG00000039632	FNDC5 (ENSHHUG00000039617) ##21	ENSHHUG00000039616	olig4 (ENSHHUG00000039613) ##22	bsdc1 (ENSHHUG00000039549) ##23	marcksl1a (ENSHHUG00000039544)	ENSHHUG00000039511	ENSHHUG00000039508	NT5C1A (ENSHHUG00000039502)	MYCL (ENSHHUG00000039494)	mfsd2aa (ENSHHUG00000039445)	ENSHHUG00000039440	ENSHHUG00000039438	rbbp4 (ENSHHUG00000038798)	zbtb8os (ENSHHUG00000038752)	khdrbs1a (ENSHHUG00000038741)	tmem39b (ENSHHUG00000038723)	ccdc28b (ENSHHUG00000038720)	ENSHHUG00000038716