Sauria ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000153120.n.b ENSGT00940000153307 ENSGT00940000153120.n.a.a.a ENSGT00940000162558 ENSGT00940000153120.n.a.a.b.b ENSGT00940000161517.D ENSGT00940000156298 ENSGT00940000161640 ENSGT00940000153120.m.a.b ENSGT00940000154179.bb.a.a ENSGT00940000153120.m.a.a ENSGT00940000154179.bb.b ENSGT00940000153120.m.b ENSGT00940000161517.C ENSGT00940000161808 #21 ENSGT00390000015147 #22 ENSGT00940000161345 ENSGT00940000156340.a #23 ENSGT00440000038585 #24 ENSGT00530000063156.a.a.b #25 ENSGT00940000161061.b #26 ENSGT00940000166177 #27 ENSGT00940000165145.A #29 ENSGT00940000165145.C #30 ENSGT00940000155608.w #32 ENSGT00550000075141 #33 ENSGT00940000163205 #34 ENSGT00940000167527 #35 ENSGT00940000156821 ENSGT00390000008529 #37 ENSGT00940000164254 Archelosauria ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000162536 ENSGT00390000009387 ENSGT00940000162226.e.a ENSGT00940000162226.e.b ENSGT00940000162226.f ENSGT00390000017655 ENSGT00940000162972 ENSGT00940000153120.n.b ENSGT00940000153307 ENSGT00940000153120.n.a.a.a ENSGT00940000153120.m.b ENSGT00940000154179.bb.b ENSGT00940000153934 ENSGT00940000161517.C ENSGT00940000161808 #21 ENSGT00390000015147 #22 ENSGT00940000161345 ENSGT00940000156340.a #23 ENSGT00440000038585 #24 ENSGT00530000063156.a.a.b #25 ENSGT00940000161061.b #26 ENSGT00940000166177 #27 ENSGT00940000165145.B #28 ENSGT00940000165145.A #29 ENSGT00940000165145.C #30 ENSGT00940000155608.x #31 ENSGT00940000155608.w #32 ENSGT00550000075141 #33 ENSGT00940000163205 #34 ENSGT00940000167527 #35 ENSGT00940000156821 Archosauria ANCESTRAL SPECIES 132 ENSGT00940000161808 #21 ENSGT00390000015147 #22 ENSGT00940000161345 Aves ANCESTRAL SPECIES 130 ENSGT00940000161808 #21 ENSGT00390000015147 #22 ENSGT00940000161345 Neognathae ANCESTRAL SPECIES 72 ENSGT00940000153307 ENSGT00940000153120.n.b.f ENSGT00390000012669.a.b.a ENSGT00940000161808 #21 ENSGT00390000015147 #22 ENSGT00940000161345 Neognathae_b ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00390000012669.a.b.a ENSGT00940000161808 #21 ENSGT00390000015147 #22 ENSGT00940000161345 ENSGT00940000156340.a #23 ENSGT00440000038585 #24 ENSGT00530000063156.a.a.b #25 ENSGT00940000161061.b #26 ENSGT00940000166177 #27 ENSGT00940000165145.B #28 ENSGT00940000165145.A #29 ENSGT00940000165145.C #30 ENSGT00940000155608.x #31 ENSGT00940000155608.w #32 ENSGT00550000075141 #33 ENSGT00940000163205 #34 ENSGT00940000167527 #35 ENSGT00940000156821 Passeriformes ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000154849.b ENSGT00940000154191 ENSGT00940000161716 ENSGT00940000160943 ENSGT00940000158715 ENSGT00890000139406.b #12 ENSGT00550000075072 #13 ENSGT00940000158519 #14 ENSGT00940000159357 #15 ENSGT00390000005653 #16 ENSGT00940000155845 #17 ENSGT00390000017221 #18 ENSGT00940000158419 #19 ENSGT00390000008031 #20 ENSGT00940000161808 #21 ENSGT00390000015147 #22 ENSGT00940000161345 ENSGT00940000156340.a #23 ENSGT00440000038585 #24 ENSGT00530000063156.a.a.b #25 ENSGT00940000161061.b #26 ENSGT00940000166177 #27 ENSGT00940000165145.B #28 ENSGT00940000165145.A #29 ENSGT00940000165145.C #30 ENSGT00940000155608.x #31 ENSGT00940000155608.w #32 ENSGT00550000075141 #33 ENSGT00940000163205 #34 ENSGT00940000167527 #35 ENSGT00940000156821 Passeriformes_d ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000154849.b ENSGT00940000154191 ENSGT00940000161716 ENSGT00940000160943 ENSGT00940000158715 ENSGT00890000139406.b #12 ENSGT00550000075072 #13 ENSGT00940000158519 #14 ENSGT00940000159357 #15 ENSGT00390000005653 #16 ENSGT00940000155845 #17 ENSGT00390000017221 #18 ENSGT00940000158419 #19 ENSGT00390000008031 #20 ENSGT00940000161808 #21 ENSGT00390000015147 #22 ENSGT00940000161345 ENSGT00940000156340.a #23 ENSGT00440000038585 #24 ENSGT00530000063156.a.a.b #25 ENSGT00940000161061.b #26 ENSGT00940000166177 #27 ENSGT00940000165145.B #28 ENSGT00940000165145.A #29 ENSGT00940000165145.C #30 ENSGT00940000155608.x #31 ENSGT00940000155608.w #32 ENSGT00550000075141 #33 ENSGT00940000163205 #34 ENSGT00940000167527 #35 ENSGT00940000156821 Passeriformes_g ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000154849.b ENSGT00940000154191 ENSGT00940000161716 ENSGT00940000160943 ENSGT00940000158715 ENSGT00890000139406.b #12 ENSGT00550000075072 #13 ENSGT00940000158519 #14 ENSGT00940000159357 #15 ENSGT00390000005653 #16 ENSGT00940000155845 #17 ENSGT00390000017221 #18 ENSGT00940000158419 #19 ENSGT00390000008031 #20 ENSGT00940000161808 #21 ENSGT00390000015147 #22 ENSGT00940000161345 ENSGT00940000156340.a #23 ENSGT00440000038585 #24 ENSGT00530000063156.a.a.b #25 ENSGT00940000161061.b #26 ENSGT00940000166177 #27 ENSGT00940000165145.B #28 ENSGT00940000165145.A #29 ENSGT00940000165145.C #30 ENSGT00940000155608.x #31 ENSGT00940000155608.w #32 ENSGT00550000075141 #33 ENSGT00940000163205 #34 ENSGT00940000167527 #35 ENSGT00940000156821 Medium ground finch MODERN SPECIES 186 WSB2 (ENSGFOG00000009388) #12 RFC5 (ENSGFOG00000009398) #13 KSR2 (ENSGFOG00000009421) #14 NOS1 (ENSGFOG00000009684) #15 FBXO21 (ENSGFOG00000009832) #16 TESC (ENSGFOG00000009929) #17 FBXW8 (ENSGFOG00000009938) #18 RNFT2 (ENSGFOG00000009965) #19 SPRING1 (ENSGFOG00000009972) #20 VPREB3 (ENSGFOG00000009978) #21 C22orf15 (ENSGFOG00000009983) #22 MMP11 (ENSGFOG00000009987) #23 SMARCB1 (ENSGFOG00000009995) #24 DERL3 (ENSGFOG00000010003) #25 SLC2A11 (ENSGFOG00000010022) #26 ENSGFOG00000010048 #27 ENSGFOG00000010055 #28 ENSGFOG00000010061 #29 ENSGFOG00000010081 #30 ENSGFOG00000010087 #31 MIF (ENSGFOG00000010091) #32 DDX51 (ENSGFOG00000010105) #33 ENSGFOG00000010151 #34 ENSGFOG00000010290 #35 ENSGFOG00000010296 #36 CABIN1 (ENSGFOG00000010422) #37 Passeroidea ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000154849.b ENSGT00940000154191 ENSGT00940000161716 ENSGT00940000160943 ENSGT00940000158715 ENSGT00890000139406.b #12 ENSGT00550000075072 #13 ENSGT00940000158519 #14 ENSGT00940000159357 #15 ENSGT00390000005653 #16 ENSGT00940000155845 #17 ENSGT00390000017221 #18 ENSGT00940000158419.c #19 ENSGT00390000008031 #20 ENSGT00940000161808 #21 ENSGT00390000015147 #22 ENSGT00940000161345 ENSGT00940000156340.a #23 ENSGT00440000038585 #24 ENSGT00530000063156.a.a.b #25 ENSGT00940000161061.b #26 ENSGT00940000166177.a #27 ENSGT00940000165145.B #28 ENSGT00940000165145.A #29 ENSGT00940000165145.C #30 ENSGT00940000155608.x #31 ENSGT00940000155608.w #32 ENSGT00550000075141 #33 ENSGT00940000163205 #34 ENSGT00940000167527 #35 ENSGT00940000156821 Zebra finch MODERN SPECIES 6 GAS2L1 (ENSTGUG00000024787) EWSR1 (ENSTGUG00000010419) ENSTGUG00000024685 DTX1 (ENSTGUG00000022586) RASAL1 (ENSTGUG00000015602) WSB2 (ENSTGUG00000015624) #12 RFC5 (ENSTGUG00000015633) #13 KSR2 (ENSTGUG00000010410) #14 NOS1 (ENSTGUG00000010372) #15 FBXO21 (ENSTGUG00000010359) #16 TESC (ENSTGUG00000019943) #17 FBXW8 (ENSTGUG00000010355) #18 RNFT2 (ENSTGUG00000010340) #19 SPRING1 (ENSTGUG00000010337) #20 VPREB3 (ENSTGUG00000010335) #21 ENSTGUG00000023053 #22 CHCHD10 (ENSTGUG00000026451) MMP11 (ENSTGUG00000010314) #23 SMARCB1 (ENSTGUG00000010296) #24 DERL3 (ENSTGUG00000010283) #25 SLC2A11 (ENSTGUG00000010259) #26 ENSTGUG00000022178 #27 ENSTGUG00000028858 #27 ENSTGUG00000010257 #29 ENSTGUG00000010254 #30 ENSTGUG00000023941 #31 MIF (ENSTGUG00000023536) #32 DDX51 (ENSTGUG00000010243) #33 ENSTGUG00000020411 #34 ENSTGUG00000028989 #35 DDT (ENSTGUG00000023551) Flycatcher MODERN SPECIES 6 NEFH (ENSFALG00000007081) AP1B1 (ENSFALG00000007083) EWSR1 (ENSFALG00000007089) ENSFALG00000028795 ENSFALG00000026840 WSB2 (ENSFALG00000024179) #12 RFC5 (ENSFALG00000023424) #13 KSR2 (ENSFALG00000007111) #14 NOS1 (ENSFALG00000007117) #15 FBXO21 (ENSFALG00000007121) #16 TESC (ENSFALG00000007133) #17 FBXW8 (ENSFALG00000007139) #18 RNFT2 (ENSFALG00000026438) #19 C12orf49 (ENSFALG00000023372) #20 VPREB3 (ENSFALG00000023892) #21 ENSFALG00000023621 #22 MMP11 (ENSFALG00000007167) #23 SMARCB1 (ENSFALG00000007182) #24 DERL3 (ENSFALG00000027261) #25 SLC2A11 (ENSFALG00000007192) #26 ENSFALG00000007193 #27 ENSFALG00000007195 #28 ENSFALG00000007198 #29 ENSFALG00000007203 #30 ENSFALG00000025183 MIF (ENSFALG00000023465) #32 ENSFALG00000007216 #33 ENSFALG00000025410 #34 ENSFALG00000023531 #35 ENSFALG00000007235 ENSFALG00000007241 #37 Galloanserae ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000153654 ENSGT00940000159978 ENSGT00940000158664 ENSGT00550000074798.a.a ENSGT00950000182843.a.b ENSGT00950000183166.a.b ENSGT00550000074856 ENSGT00390000008325.a ENSGT00940000165952 ENSGT00940000162536 ENSGT00390000009387 ENSGT00390000017655 ENSGT00940000162972 ENSGT00940000153307 ENSGT00940000153120.n.b.e.b.a ENSGT00390000015147 #22 ENSGT00440000038159.hc ENSGT00940000156340.a #23 ENSGT00440000038585 #24 ENSGT00530000063156.a.a.b #25 ENSGT00940000161061.b #26 ENSGT00940000166177 #27 ENSGT00940000165145.B #28 ENSGT00940000165145.A #29 ENSGT00940000165145.C #30 ENSGT00940000155608.x #31 ENSGT00940000155608.w #32 ENSGT00550000075141 #33 ENSGT00940000163205 #34 ENSGT00940000167527 #35 ENSGT00940000156821 Anatidae ANCESTRAL SPECIES 39 ENSGT00390000015147 #22 ENSGT00440000038159.hc ENSGT00940000156340.a #23 ENSGT00440000038585 #24 ENSGT00530000063156.a.a.b #25 ENSGT00940000161061.b #26 ENSGT00940000166177 #27 ENSGT00940000165145.B #28 ENSGT00940000165145.A.b #29 ENSGT00940000165145.C #30 ENSGT00940000155608.x #31 ENSGT00940000155608.w #32 ENSGT00550000075141 #33 ENSGT00940000163205 #34 ENSGT00940000167527 #35 ENSGT00940000156821 Pink-footed goose MODERN SPECIES 83 ENSABRG00000014938 ENSABRG00000014943 ENSABRG00000014959 ENSABRG00000014962 ENSABRG00000014964 #22 ENSABRG00000014969 MMP11 (ENSABRG00000014975) #23 SMARCB1 (ENSABRG00000014982) #24 DERL3 (ENSABRG00000014993) #25 SLC2A11 (ENSABRG00000014997) #26 ENSABRG00000015008 #27 ENSABRG00000015029 #28 ENSABRG00000015036 #29 ENSABRG00000015039 #30 ENSABRG00000015051 #31 MIF (ENSABRG00000015055) #32 DDX51 (ENSABRG00000015061) #33 ENSABRG00000015066 #34 ENSABRG00000015070 #35 ENSABRG00000015072 African ostrich MODERN SPECIES 1054 VPREB3 (ENSSCUG00000018852) #21 C22orf15 (ENSSCUG00000018854) #22 ENSSCUG00000018856 MMP11 (ENSSCUG00000018858) #23 SMARCB1 (ENSSCUG00000018859) #24 DERL3 (ENSSCUG00000018861) #25 SLC2A11 (ENSSCUG00000018868) #26 ENSSCUG00000018871 #27 ENSSCUG00000018872 #28 ENSSCUG00000018874 #29 ENSSCUG00000018875 #30 ENSSCUG00000018876 #31 MIF (ENSSCUG00000018878) #32 DDX51 (ENSSCUG00000018880) #33 ENSSCUG00000018881 #34 ENSSCUG00000018882 #35 CABIN1 (ENSSCUG00000018885) #37 Cryptodira ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00390000015147 #22 ENSGT00940000161345 ENSGT00940000156340.a #23 ENSGT00440000038585 #24 ENSGT00530000063156.a.a.b #25 ENSGT00940000161061.b #26 ENSGT00940000165145.B #28 ENSGT00940000165145.A #29 ENSGT00940000165145.C #30 ENSGT00940000155608.x #31 ENSGT00940000155608.w #32 ENSGT00550000075141 #33 ENSGT00940000163205 #34 ENSGT00940000167527 #35 ENSGT00960000191055 ENSGT00940000156821 Chinese turtle MODERN SPECIES 201 C22orf15 (ENSPSIG00000011976) #22 MMP11 (ENSPSIG00000012345) #23 SMARCB1 (ENSPSIG00000012384) #24 DERL3 (ENSPSIG00000012594) #25 Testudinoidea ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000161517.B.b ENSGT00940000154179.bb.b.b.a.b ENSGT00940000161517.C.a ENSGT00390000015147 #22 ENSGT00940000161345 ENSGT00940000156340.a #23 ENSGT00440000038585 #24 ENSGT00530000063156.a.a.b #25 ENSGT00940000161061.b #26 ENSGT00940000165145.B #28 ENSGT00940000165145.A #29 ENSGT00940000165145.C #30 ENSGT00940000155608.x #31 ENSGT00940000155608.w #32 ENSGT00550000075141 #33 ENSGT00940000163205 #34 ENSGT00940000167527 #35 ENSGT00960000191055 ENSGT00940000156821 Emydidae ANCESTRAL SPECIES 44 ENSGT00390000015147 #22 ENSGT00940000161345 ENSGT00940000156340.a #23 ENSGT00440000038585 #24 ENSGT00530000063156.a.a.b #25 ENSGT00940000161061.b #26 ENSGT00940000165145.B #28 ENSGT00940000165145.A #29 ENSGT00940000165145.C #30 ENSGT00940000155608.x #31 ENSGT00940000155608.w #32 ENSGT00550000075141 #33 ENSGT00940000167527 #35 ENSGT00940000163205 #34 ENSGT00940000156821 ENSGT00390000008529 #37 Three-toed box turtle MODERN SPECIES 378 ENSTMTG00000012091 C22orf15 (ENSTMTG00000012124) #22 CHCHD10 (ENSTMTG00000012145) MMP11 (ENSTMTG00000012152) #23 SMARCB1 (ENSTMTG00000012178) #24 DERL3 (ENSTMTG00000012189) #25 SLC2A11 (ENSTMTG00000012227) #26 ENSTMTG00000012401 #28 ENSTMTG00000012472 #30 ENSTMTG00000012511 #31 MIF (ENSTMTG00000012533) #32 DDX51 (ENSTMTG00000012548) #33 ENSTMTG00000012593 #35 ENSTMTG00000012655 #34 ENSTMTG00000012712 CABIN1 (ENSTMTG00000012731) #37 ENSTMTG00000012788